Hugging Face's logo

ChatterjeeLab
/
PIVOT

Model card Files
xet
 Community
1
PIVOT / experiments /results /replogle_k562_nom_improved.json
bryan7264's picture
bryan7264
pivot: code + trained checkpoints (norman, replogle k562)
3b4941f verified
Raw
History Blame
13.8 kB
{
 "dataset": "replogle_k562",
 "split": "perturbation",
 "reward": "cosine",
 "n_candidates": 1805,
 "n_targets": 120,
 "random_top5": 0.002770083102493075,
 "methods": {
 "PIVOT-ranking": {
 "top1": 0.0,
 "top5": 0.0,
 "ndcg": 0.0,
 "func_top5": 0.7416666666666667,
 "func_ndcg": 0.5503647310194125,
 "top5_ci": [
 0.0,
 0.0,
 0.0
 ],
 "_top5_per": [
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0
 ],
 "med_rank": 857.0
 },
 "PIVOT-guidance(random-init)": {
 "top1": 0.0,
 "top5": 0.0,
 "ndcg": 0.0,
 "func_top5": 0.7916666666666666,
 "func_ndcg": 0.5487322808181787,
 "top5_ci": [
 0.0,
 0.0,
 0.0
 ],
 "_top5_per": [
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0
 ],
 "med_rank": 866.0
 },
 "EndpointMLP+ranking": {
 "top1": 0.0,
 "top5": 0.0,
 "ndcg": 0.0,
 "func_top5": 0.7416666666666667,
 "func_ndcg": 0.5599157820889673,
 "top5_ci": [
 0.0,
 0.0,
 0.0
 ],
 "_top5_per": [
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0
 ],
 "med_rank": 761.0
 },
 "LinearResponse+ranking": {
 "top1": 0.0,
 "top5": 0.0,
 "ndcg": 0.0,
 "func_top5": 0.7416666666666667,
 "func_ndcg": 0.558927740279396,
 "top5_ci": [
 0.0,
 0.0,
 0.0
 ],
 "_top5_per": [
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0
 ],
 "med_rank": 839.0
 },
 "Additive+ranking": {
 "top1": 0.0,
 "top5": 0.0,
 "ndcg": 0.0,
 "func_top5": 0.7416666666666667,
 "func_ndcg": 0.5599157820889673,
 "top5_ci": [
 0.0,
 0.0,
 0.0
 ],
 "_top5_per": [
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0
 ],
 "med_rank": 844.5
 },
 "NearestPerturbationCentroid+ranking": {
 "top1": 0.0,
 "top5": 0.0,
 "ndcg": 0.0,
 "func_top5": 0.7416666666666667,
 "func_ndcg": 0.5599157820889673,
 "top5_ci": [
 0.0,
 0.0,
 0.0
 ],
 "_top5_per": [
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0
 ],
 "med_rank": 790.0
 },
 "Random+ranking": {
 "top1": 0.0,
 "top5": 0.0,
 "ndcg": 0.0,
 "func_top5": 0.7083333333333334,
 "func_ndcg": 0.3706553528381431,
 "top5_ci": [
 0.0,
 0.0,
 0.0
 ],
 "_top5_per": [
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0,
 0.0
 ],
 "med_rank": 955.0
 }
 },
 "significance": {
 "PIVOT-ranking_vs_PIVOT-guidance(random-init)": {
 "p": 1.0,
 "mean_diff_top5": 0.0
 },
 "PIVOT-ranking_vs_EndpointMLP+ranking": {
 "p": 1.0,
 "mean_diff_top5": 0.0
 },
 "PIVOT-ranking_vs_LinearResponse+ranking": {
 "p": 1.0,
 "mean_diff_top5": 0.0
 },
 "PIVOT-ranking_vs_Additive+ranking": {
 "p": 1.0,
 "mean_diff_top5": 0.0
 },
 "PIVOT-ranking_vs_NearestPerturbationCentroid+ranking": {
 "p": 1.0,
 "mean_diff_top5": 0.0
 },
 "PIVOT-ranking_vs_Random+ranking": {
 "p": 1.0,
 "mean_diff_top5": 0.0
 }
 }
}