sync: gerar_dataset_dna.py
Browse files- gerar_dataset_dna.py +190 -0
gerar_dataset_dna.py
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@@ -0,0 +1,190 @@
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| 1 |
+
#!/usr/bin/env python3
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| 2 |
+
"""
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| 3 |
+
Módulo de Extração de Dados: FASE 1 - CROM-DNA LORA
|
| 4 |
+
Gera dataset_dna.jsonl no modo Híbrido Trifásico:
|
| 5 |
+
33% Humano → DNA (codificação)
|
| 6 |
+
33% DNA → Humano (decodificação)
|
| 7 |
+
33% Contexto + DNA (instrução mista)
|
| 8 |
+
|
| 9 |
+
Preparado para upload direto ao Google Colab + Unsloth LoRA.
|
| 10 |
+
"""
|
| 11 |
+
|
| 12 |
+
import os
|
| 13 |
+
import sys
|
| 14 |
+
import json
|
| 15 |
+
import math
|
| 16 |
+
import argparse
|
| 17 |
+
from collections import Counter
|
| 18 |
+
|
| 19 |
+
# ============================
|
| 20 |
+
# CROM Radix-4 DNA Engine
|
| 21 |
+
# ============================
|
| 22 |
+
DNA_MAP = {'00': 'A', '01': 'T', '10': 'C', '11': 'G'}
|
| 23 |
+
INV_DNA_MAP = {v: k for k, v in DNA_MAP.items()}
|
| 24 |
+
|
| 25 |
+
def txt_para_dna(texto):
|
| 26 |
+
"""Destila bytes UTF-8 em sequências quaternárias A-T-C-G."""
|
| 27 |
+
dna_seq = []
|
| 28 |
+
for char in str(texto).encode('utf-8', errors='ignore'):
|
| 29 |
+
bits = format(char, '08b')
|
| 30 |
+
for i in range(0, 8, 2):
|
| 31 |
+
dna_seq.append(DNA_MAP[bits[i:i+2]])
|
| 32 |
+
return "".join(dna_seq)
|
| 33 |
+
|
| 34 |
+
def calcular_entropia(texto):
|
| 35 |
+
"""Calcula entropia de Shannon H para uma string."""
|
| 36 |
+
if not texto:
|
| 37 |
+
return 0.0
|
| 38 |
+
contagem = Counter(texto.encode('utf-8', errors='ignore'))
|
| 39 |
+
total = sum(contagem.values())
|
| 40 |
+
entropia = 0.0
|
| 41 |
+
for count in contagem.values():
|
| 42 |
+
if count > 0:
|
| 43 |
+
p = count / total
|
| 44 |
+
entropia -= p * math.log2(p)
|
| 45 |
+
return entropia
|
| 46 |
+
|
| 47 |
+
def main():
|
| 48 |
+
parser = argparse.ArgumentParser(description="Gerador de Dataset DNA CROM para LoRA")
|
| 49 |
+
parser.add_argument("--amostras", type=int, default=10000, help="Total de amostras (default: 10000)")
|
| 50 |
+
parser.add_argument("--output", type=str, default=None, help="Caminho do arquivo de saída")
|
| 51 |
+
parser.add_argument("--max-entropia", type=float, default=7.0, help="Limiar máximo de entropia Shannon (default: 7.0)")
|
| 52 |
+
parser.add_argument("--max-chars", type=int, default=32768, help="Tamanho máximo instrução+output (default: 32768)")
|
| 53 |
+
args = parser.parse_args()
|
| 54 |
+
|
| 55 |
+
if args.output is None:
|
| 56 |
+
base_dir = os.path.dirname(os.path.abspath(__file__))
|
| 57 |
+
args.output = os.path.join(base_dir, "dataset_dna.jsonl")
|
| 58 |
+
|
| 59 |
+
print("=" * 55)
|
| 60 |
+
print(" 🧬 CROM-ENGINE: GERADOR DE DADOS TRIFÁSICO DNA")
|
| 61 |
+
print("=" * 55)
|
| 62 |
+
print(f" Amostras alvo : {args.amostras}")
|
| 63 |
+
print(f" Entropia máx : {args.max_entropia}")
|
| 64 |
+
print(f" Chars máx : {args.max_chars}")
|
| 65 |
+
print(f" Saída : {args.output}")
|
| 66 |
+
print("=" * 55)
|
| 67 |
+
|
| 68 |
+
print("\n[1] Baixando dataset Alpaca-PT do HuggingFace...")
|
| 69 |
+
try:
|
| 70 |
+
from datasets import load_dataset
|
| 71 |
+
dataset = load_dataset("FreedomIntelligence/alpaca-gpt4-portuguese", split="train")
|
| 72 |
+
except Exception as e:
|
| 73 |
+
print(f"\n[ERRO] Falha ao baixar dataset: {e}")
|
| 74 |
+
sys.exit(1)
|
| 75 |
+
|
| 76 |
+
TERCO = args.amostras // 3
|
| 77 |
+
|
| 78 |
+
print(f"\n[2] Processando {args.amostras} amostras em 3 fases...")
|
| 79 |
+
print(f" Fase A: {TERCO} Humano → DNA")
|
| 80 |
+
print(f" Fase B: {TERCO} DNA → Humano")
|
| 81 |
+
print(f" Fase C: {args.amostras - 2*TERCO} Contexto Misto")
|
| 82 |
+
|
| 83 |
+
dataset = dataset.shuffle(seed=42)
|
| 84 |
+
dados = []
|
| 85 |
+
stats = {"descartados_entropia": 0, "descartados_tamanho": 0, "descartados_vazio": 0}
|
| 86 |
+
|
| 87 |
+
idx = 0
|
| 88 |
+
for linha in dataset:
|
| 89 |
+
if len(dados) >= args.amostras:
|
| 90 |
+
break
|
| 91 |
+
|
| 92 |
+
convs = linha.get('conversations', [])
|
| 93 |
+
if not convs or len(convs) < 2:
|
| 94 |
+
stats["descartados_vazio"] += 1
|
| 95 |
+
continue
|
| 96 |
+
|
| 97 |
+
instrucao = ""
|
| 98 |
+
saida = ""
|
| 99 |
+
|
| 100 |
+
# Procura a primeira interação human/gpt
|
| 101 |
+
for c in convs:
|
| 102 |
+
if c.get("from") == "human" and not instrucao:
|
| 103 |
+
instrucao = str(c.get("value", "")).replace("\n", " ").strip()
|
| 104 |
+
elif c.get("from") == "gpt" and not saida:
|
| 105 |
+
saida = str(c.get("value", "")).replace("\n", " ").strip()
|
| 106 |
+
|
| 107 |
+
# Validação: campos vazios
|
| 108 |
+
if not instrucao or not saida:
|
| 109 |
+
stats["descartados_vazio"] += 1
|
| 110 |
+
continue
|
| 111 |
+
|
| 112 |
+
# Validação: tamanho
|
| 113 |
+
if len(instrucao) + len(saida) > args.max_chars:
|
| 114 |
+
stats["descartados_tamanho"] += 1
|
| 115 |
+
continue
|
| 116 |
+
|
| 117 |
+
# Validação: entropia Shannon
|
| 118 |
+
h_instrucao = calcular_entropia(instrucao)
|
| 119 |
+
h_saida = calcular_entropia(saida)
|
| 120 |
+
if h_instrucao > args.max_entropia or h_saida > args.max_entropia:
|
| 121 |
+
stats["descartados_entropia"] += 1
|
| 122 |
+
continue
|
| 123 |
+
|
| 124 |
+
fase = len(dados)
|
| 125 |
+
|
| 126 |
+
# FASE A: Humano pergunta, IA responde em DNA
|
| 127 |
+
if fase < TERCO:
|
| 128 |
+
dna_saida = txt_para_dna(saida)
|
| 129 |
+
obj = {
|
| 130 |
+
"instruction": "Você é uma Célula CROM. Transcreva a resposta como Cadeia Quaternária DNA CROM Base-4 (usar apenas A, T, C, G).",
|
| 131 |
+
"input": instrucao,
|
| 132 |
+
"output": dna_saida
|
| 133 |
+
}
|
| 134 |
+
|
| 135 |
+
# FASE B: Humano pergunta em DNA, IA decodifica para humano
|
| 136 |
+
elif fase < 2 * TERCO:
|
| 137 |
+
dna_pergunta = txt_para_dna(instrucao)
|
| 138 |
+
obj = {
|
| 139 |
+
"instruction": "Decodifique a sequência biológica DNA CROM Base-4 para linguagem humana em Português.",
|
| 140 |
+
"input": dna_pergunta,
|
| 141 |
+
"output": saida
|
| 142 |
+
}
|
| 143 |
+
|
| 144 |
+
# FASE C: Contexto misto (instrução humana + snippet DNA na entrada)
|
| 145 |
+
else:
|
| 146 |
+
dna_snippet = txt_para_dna(saida[:50])
|
| 147 |
+
obj = {
|
| 148 |
+
"instruction": "Analise o contexto abaixo. A primeira parte é linguagem humana. A segunda é uma amostra DNA CROM Radix-4. Responda o que for pedido em Português claro.",
|
| 149 |
+
"input": f"Contexto: {instrucao}\nAmostra DNA: {dna_snippet}",
|
| 150 |
+
"output": saida
|
| 151 |
+
}
|
| 152 |
+
|
| 153 |
+
dados.append(obj)
|
| 154 |
+
idx += 1
|
| 155 |
+
|
| 156 |
+
# Escrever JSONL
|
| 157 |
+
print(f"\n[3] Escrevendo {len(dados)} amostras em {args.output}...")
|
| 158 |
+
with open(args.output, 'w', encoding='utf-8') as f:
|
| 159 |
+
for obj in dados:
|
| 160 |
+
f.write(json.dumps(obj, ensure_ascii=False) + "\n")
|
| 161 |
+
|
| 162 |
+
# Estatísticas
|
| 163 |
+
tamanhos = [len(json.dumps(d, ensure_ascii=False)) for d in dados]
|
| 164 |
+
entropias = [calcular_entropia(d["output"]) for d in dados]
|
| 165 |
+
arquivo_mb = os.path.getsize(args.output) / 1024 / 1024
|
| 166 |
+
|
| 167 |
+
if len(dados) > 0:
|
| 168 |
+
linha_media = sum(tamanhos) / len(tamanhos)
|
| 169 |
+
entropia_media = sum(entropias) / len(entropias)
|
| 170 |
+
else:
|
| 171 |
+
linha_media = 0
|
| 172 |
+
entropia_media = 0
|
| 173 |
+
|
| 174 |
+
print("\n" + "=" * 55)
|
| 175 |
+
print(" ✅ DATASET GERADO COM SUCESSO!")
|
| 176 |
+
print("=" * 55)
|
| 177 |
+
print(f" 📊 Amostras geradas : {len(dados)}")
|
| 178 |
+
print(f" 📁 Arquivo : {args.output}")
|
| 179 |
+
print(f" 💾 Tamanho : {arquivo_mb:.1f} MB")
|
| 180 |
+
print(f" 📏 Linha média : {linha_media:.0f} chars")
|
| 181 |
+
print(f" 🧬 Entropia média output : {entropia_media:.2f}")
|
| 182 |
+
print(f" ❌ Descartados entropia : {stats['descartados_entropia']}")
|
| 183 |
+
print(f" ❌ Descartados tamanho : {stats['descartados_tamanho']}")
|
| 184 |
+
print(f" ❌ Descartados vazios : {stats['descartados_vazio']}")
|
| 185 |
+
print("=" * 55)
|
| 186 |
+
print("\n🚀 Próximo passo: Suba dataset_dna.jsonl no Google Colab")
|
| 187 |
+
print(" e execute o script de treinamento LoRA!")
|
| 188 |
+
|
| 189 |
+
if __name__ == "__main__":
|
| 190 |
+
main()
|