# Provenance: # Script: /media/drn2/External/TARA-Oceans/03_analyses/WorldModelApp/scripts/t21_pfam_module_zspace_projection_20260127_130000.py # Input1: /media/drn2/External/TARA-Oceans/03_analyses/WorldModelApp/results/phase2_embeddings.npz # Input2: /media/drn2/External/TARA-Oceans/03_analyses/WorldModelApp/data/module_mapping.json # Input3: /media/drn2/External/TARA-Oceans/03_analyses/ALGAGPT-based-analyses/env_pfam_manifold/data/pfam2go_mapping_20260124_101559.tsv # Date: 2026-01-27 12:20:29 # Integrity Check: PASSED - Real data only # # Sections: # module_embedding: Mean z_pfam for samples where module is abundant (20 modules x 32 dims) # function_embedding: Weighted average of module embeddings per metabolic function (13 functions x 32 dims) # dim_function_loading: Pearson r between module embeddings on each dim and function enrichment (32 dims x 13 categories) # For dim_function_loading rows, dim_0..dim_12 correspond to: photosynthesis, carbon_fixation, electron_transport, nitrogen_metabolism, lipid_metabolism, carbohydrate_metabolism, amino_acid_metabolism, nucleotide_metabolism, signal_transduction, transport, ribosome_translation, protein_folding, iron_homeostasis # section entity_id n_pfams n_abundant_samples median_abundance top_functions dim_0 dim_1 dim_2 dim_3 dim_4 dim_5 dim_6 dim_7 dim_8 dim_9 dim_10 dim_11 dim_12 dim_13 dim_14 dim_15 dim_16 dim_17 dim_18 dim_19 dim_20 dim_21 dim_22 dim_23 dim_24 dim_25 dim_26 dim_27 dim_28 dim_29 dim_30 dim_31 module_embedding module_1 370 905 95.500000 photosynthesis=8; carbohydrate_metabolism=6; transport=6 0.407507 0.501369 0.437048 0.536964 0.609354 0.295566 0.573001 0.130418 0.095693 0.248442 0.102217 0.527052 0.418555 0.606575 0.552413 0.159161 0.311610 0.492396 0.452325 0.371705 0.597765 0.183879 0.215647 0.263849 0.398344 0.189950 0.508722 0.349042 0.120555 0.403450 0.419852 0.068442 module_embedding module_2 417 905 549.500000 transport=12; ribosome_translation=10; amino_acid_metabolism=9 0.313856 0.292447 0.347742 0.355261 0.470040 0.310987 0.474610 0.089715 0.147179 0.108442 0.158273 0.363429 0.343239 0.480272 0.401259 0.191549 0.173984 0.426698 0.470473 0.278420 0.526645 0.108341 0.337907 0.341463 0.429575 0.248602 0.416362 0.401197 0.151825 0.431246 0.252847 0.057364 module_embedding module_3 402 905 808.000000 electron_transport=10; nucleotide_metabolism=10; amino_acid_metabolism=9 0.274970 0.230609 0.300670 0.299040 0.414148 0.296549 0.424841 0.081045 0.181492 0.073311 0.196093 0.306114 0.351254 0.423871 0.347317 0.214253 0.137899 0.384735 0.440909 0.239662 0.477030 0.091397 0.418597 0.403915 0.419036 0.269264 0.367380 0.401356 0.172479 0.419983 0.197954 0.064705 module_embedding module_4 754 905 1985.000000 nucleotide_metabolism=20; amino_acid_metabolism=16; ribosome_translation=16 0.253170 0.201094 0.278604 0.264971 0.380335 0.278061 0.388727 0.077881 0.204414 0.058936 0.233944 0.276279 0.353755 0.387455 0.317819 0.242202 0.121983 0.357152 0.428221 0.217916 0.443869 0.079782 0.475507 0.452327 0.422616 0.302085 0.339188 0.418589 0.197269 0.421860 0.169571 0.075168 module_embedding module_5 1713 905 95.500000 nucleotide_metabolism=19; signal_transduction=19; amino_acid_metabolism=13 0.258086 0.339614 0.284128 0.352757 0.410128 0.161667 0.359109 0.118467 0.236798 0.143966 0.247562 0.355518 0.424186 0.396874 0.383100 0.270887 0.215946 0.293708 0.249966 0.250129 0.375957 0.139998 0.493767 0.462708 0.250788 0.263664 0.323902 0.266062 0.214067 0.254930 0.274002 0.113661 module_embedding module_6 334 900 29.000000 electron_transport=8; photosynthesis=4; ribosome_translation=4 0.279235 0.404131 0.298659 0.386596 0.419442 0.140468 0.344799 0.151697 0.245142 0.214840 0.254235 0.399746 0.485371 0.395966 0.415801 0.270300 0.279168 0.284286 0.204200 0.263833 0.347620 0.183799 0.503477 0.468667 0.218624 0.245662 0.334555 0.230397 0.219328 0.204060 0.321749 0.126378 module_embedding module_7 594 903 287.000000 nucleotide_metabolism=16; ribosome_translation=15; signal_transduction=13 0.267238 0.265494 0.287860 0.309532 0.399409 0.251811 0.385134 0.098341 0.206126 0.106920 0.229490 0.316218 0.385438 0.397154 0.350699 0.241729 0.169744 0.355666 0.385254 0.233046 0.433004 0.111478 0.466480 0.444883 0.376681 0.280924 0.340980 0.376519 0.195666 0.373687 0.214088 0.082769 module_embedding module_8 994 902 274.000000 ribosome_translation=16; transport=15; amino_acid_metabolism=13 0.293179 0.288893 0.320018 0.348458 0.453425 0.285496 0.444847 0.080233 0.170985 0.105837 0.182392 0.351834 0.360010 0.455937 0.387367 0.200751 0.174671 0.406774 0.434834 0.257058 0.501776 0.097105 0.397867 0.382052 0.403979 0.255199 0.382681 0.385151 0.164718 0.403425 0.237122 0.055747 module_embedding module_9 530 890 22.000000 nucleotide_metabolism=9; lipid_metabolism=7; amino_acid_metabolism=6 0.353421 0.553414 0.379837 0.517496 0.539982 0.136973 0.452076 0.166866 0.191184 0.296015 0.155546 0.528788 0.504983 0.521086 0.539270 0.202453 0.360687 0.352284 0.228183 0.342444 0.433534 0.225870 0.357215 0.343060 0.199906 0.172146 0.431040 0.190725 0.162983 0.181328 0.453268 0.108893 module_embedding module_10 765 905 2640.000000 ribosome_translation=31; nucleotide_metabolism=25; electron_transport=20 0.239146 0.194224 0.260132 0.249265 0.356397 0.250218 0.355774 0.082358 0.221041 0.057554 0.265104 0.262097 0.364459 0.360494 0.303659 0.270248 0.119198 0.322283 0.381795 0.207367 0.404236 0.084270 0.513662 0.486952 0.383600 0.308067 0.314207 0.388947 0.215626 0.382563 0.162615 0.090205 module_embedding module_11 622 905 473.500000 ribosome_translation=19; signal_transduction=16; electron_transport=11 0.212731 0.223854 0.244143 0.235168 0.320902 0.175413 0.293904 0.110757 0.254814 0.080674 0.308326 0.265050 0.395162 0.314563 0.294770 0.319700 0.150470 0.251210 0.274678 0.194048 0.322092 0.118490 0.560088 0.531030 0.296718 0.324158 0.281271 0.341098 0.252301 0.295761 0.180946 0.122923 module_embedding module_12 506 905 3049.500000 signal_transduction=22; nucleotide_metabolism=18; transport=15 0.220901 0.180233 0.237068 0.209311 0.304940 0.209318 0.293366 0.099874 0.256654 0.059057 0.320907 0.239557 0.390353 0.300831 0.272293 0.325632 0.119532 0.256450 0.314169 0.193130 0.329671 0.109004 0.578516 0.548397 0.334672 0.334529 0.282217 0.366829 0.255197 0.334923 0.155870 0.120460 module_embedding module_13 598 903 154.000000 electron_transport=16; nucleotide_metabolism=12; iron_homeostasis=9 0.176550 0.199200 0.171030 0.201693 0.209506 0.144779 0.157293 0.256553 0.413931 0.175611 0.381461 0.189710 0.470362 0.181537 0.204727 0.398787 0.221876 0.146067 0.128852 0.189442 0.168018 0.243019 0.631811 0.579543 0.180719 0.338572 0.192935 0.238438 0.319761 0.209763 0.203851 0.281597 module_embedding module_14 621 896 40.000000 signal_transduction=20; electron_transport=11; ribosome_translation=8 0.171826 0.209154 0.189363 0.217537 0.265430 0.146459 0.225651 0.142053 0.317749 0.089953 0.379853 0.227979 0.416424 0.248270 0.248579 0.396876 0.161802 0.190797 0.180907 0.168294 0.245015 0.143456 0.654610 0.601963 0.226256 0.346677 0.215508 0.270584 0.309147 0.240686 0.166090 0.182557 module_embedding module_15 375 902 64.000000 ribosome_translation=8; carbohydrate_metabolism=4; nucleotide_metabolism=4 0.226324 0.369773 0.245572 0.335088 0.343081 0.097561 0.265696 0.153503 0.291708 0.195397 0.334768 0.347915 0.497764 0.315231 0.355852 0.349736 0.260723 0.206167 0.130502 0.219781 0.252199 0.188063 0.602618 0.556798 0.166101 0.299371 0.265936 0.206733 0.269914 0.164020 0.289981 0.162008 module_embedding module_16 1809 902 132.000000 ribosome_translation=22; signal_transduction=18; electron_transport=17 0.221932 0.350376 0.241232 0.332854 0.351255 0.113647 0.279934 0.141037 0.278861 0.164371 0.316590 0.337363 0.463289 0.328485 0.348976 0.334120 0.233898 0.232514 0.157906 0.221235 0.284712 0.162283 0.574147 0.529122 0.179023 0.288437 0.268354 0.210948 0.259620 0.172679 0.279652 0.150244 module_embedding module_17 622 900 66.000000 nucleotide_metabolism=10; ribosome_translation=10; electron_transport=9 0.203329 0.252222 0.203472 0.265410 0.285390 0.162676 0.234843 0.228000 0.363185 0.179884 0.313418 0.248043 0.449011 0.264366 0.266786 0.337306 0.242993 0.224879 0.193088 0.211230 0.262971 0.214146 0.556937 0.514849 0.202732 0.295418 0.231037 0.231562 0.270398 0.220870 0.218078 0.237811 module_embedding module_18 903 904 77.000000 signal_transduction=38; transport=12; ribosome_translation=9 0.169909 0.220174 0.187054 0.210932 0.252847 0.122676 0.204941 0.151144 0.331983 0.095676 0.401548 0.233537 0.436167 0.235118 0.249410 0.419537 0.169331 0.155489 0.144713 0.166625 0.211617 0.158837 0.684257 0.626429 0.194806 0.359967 0.212179 0.264455 0.325212 0.227441 0.175738 0.197963 module_embedding module_19 756 905 1038.500000 signal_transduction=30; electron_transport=25; transport=22 0.160193 0.117823 0.154910 0.133336 0.188434 0.176228 0.174591 0.168622 0.348158 0.066642 0.405327 0.147394 0.408155 0.177560 0.173721 0.423801 0.113205 0.158071 0.205927 0.151622 0.193695 0.161730 0.673661 0.625608 0.257465 0.379352 0.189977 0.334480 0.328804 0.289844 0.121651 0.211633 module_embedding module_20 153 905 451.500000 signal_transduction=6; transport=6; electron_transport=3 0.142113 0.151046 0.129358 0.149802 0.152082 0.139202 0.114528 0.189470 0.379701 0.098151 0.443689 0.136229 0.434945 0.133590 0.148037 0.464815 0.135187 0.117031 0.121825 0.140813 0.121889 0.188008 0.723894 0.659087 0.175780 0.385914 0.141189 0.276842 0.360537 0.234064 0.158506 0.245071 function_embedding photosynthesis 53 -1 -1.000000 top_module=M1(w=0.022) 0.303004 0.357226 0.325805 0.383297 0.452100 0.233208 0.417721 0.129283 0.195839 0.170988 0.206110 0.386049 0.415219 0.445086 0.412350 0.236764 0.234453 0.363475 0.345756 0.278669 0.445052 0.156287 0.405859 0.399731 0.329580 0.249434 0.379827 0.322370 0.187624 0.331391 0.298189 0.103140 function_embedding carbon_fixation 18 -1 -1.000000 top_module=M12(w=0.006) 0.230177 0.248004 0.246697 0.266487 0.332622 0.190336 0.301315 0.131303 0.268282 0.115721 0.299607 0.279769 0.418093 0.321990 0.306431 0.311607 0.176828 0.263102 0.271922 0.212246 0.327283 0.141757 0.550696 0.516368 0.290121 0.308036 0.287324 0.316587 0.247081 0.293115 0.209277 0.138778 function_embedding electron_transport 189 -1 -1.000000 top_module=M19(w=0.033) 0.232205 0.250824 0.246696 0.273003 0.334622 0.199486 0.305427 0.141065 0.268818 0.121723 0.293335 0.279015 0.413545 0.325056 0.305259 0.311940 0.181590 0.270373 0.276200 0.216194 0.331927 0.149910 0.535603 0.503695 0.290076 0.304138 0.288327 0.315770 0.246797 0.300288 0.214913 0.146982 function_embedding nitrogen_metabolism 43 -1 -1.000000 top_module=M10(w=0.007) 0.231972 0.253859 0.247461 0.273693 0.335396 0.195214 0.305391 0.135648 0.265216 0.118962 0.295443 0.281170 0.413178 0.326131 0.307012 0.314028 0.178739 0.268119 0.273787 0.215424 0.330276 0.146722 0.538980 0.506736 0.287745 0.305955 0.288555 0.316801 0.247784 0.298510 0.217200 0.142975 function_embedding lipid_metabolism 141 -1 -1.000000 top_module=M12(w=0.022) 0.249428 0.265100 0.269226 0.291957 0.366912 0.213596 0.341973 0.123579 0.241198 0.117602 0.267422 0.303060 0.403963 0.360810 0.331919 0.286005 0.180534 0.299846 0.311943 0.228266 0.372305 0.136483 0.503212 0.477383 0.316473 0.292669 0.316489 0.331512 0.226641 0.320448 0.223053 0.122359 function_embedding carbohydrate_metabolism 123 -1 -1.000000 top_module=M19(w=0.022) 0.242932 0.260656 0.259182 0.286183 0.352539 0.210607 0.326284 0.133309 0.252314 0.121497 0.279184 0.292297 0.407370 0.344922 0.319367 0.299925 0.182117 0.288893 0.297651 0.224075 0.354810 0.145097 0.513763 0.487262 0.305043 0.298485 0.303632 0.325622 0.236412 0.314951 0.222052 0.135447 function_embedding amino_acid_metabolism 156 -1 -1.000000 top_module=M19(w=0.024) 0.240138 0.245260 0.257353 0.274806 0.348617 0.215820 0.327230 0.126506 0.250643 0.108773 0.277737 0.283599 0.399361 0.343063 0.312699 0.296504 0.169636 0.290055 0.308514 0.220094 0.358660 0.136296 0.515968 0.487703 0.315331 0.300633 0.303661 0.335193 0.234556 0.323740 0.210408 0.129782 function_embedding nucleotide_metabolism 225 -1 -1.000000 top_module=M12(w=0.036) 0.236730 0.247673 0.253117 0.273442 0.343040 0.207063 0.318071 0.130129 0.257521 0.112899 0.284743 0.282292 0.406113 0.335823 0.310439 0.302184 0.173627 0.281288 0.295421 0.217721 0.347511 0.139942 0.526868 0.496717 0.305267 0.302571 0.297254 0.327808 0.239118 0.313162 0.211172 0.134784 function_embedding signal_transduction 259 -1 -1.000000 top_module=M12(w=0.043) 0.219420 0.230514 0.234531 0.251004 0.315556 0.193315 0.288883 0.132112 0.272639 0.102314 0.314487 0.261741 0.407538 0.306702 0.287788 0.332028 0.163518 0.253232 0.267625 0.202804 0.314867 0.140893 0.564283 0.529169 0.287085 0.319723 0.274192 0.321856 0.260565 0.301136 0.196546 0.147557 function_embedding transport 174 -1 -1.000000 top_module=M20(w=0.039) 0.232581 0.240975 0.247373 0.265933 0.332405 0.207698 0.308322 0.132173 0.260586 0.109731 0.295458 0.273608 0.404123 0.325088 0.300406 0.315006 0.168873 0.273935 0.290057 0.213706 0.336856 0.142334 0.535552 0.505555 0.301961 0.310115 0.289989 0.330312 0.247768 0.315636 0.208042 0.140583 function_embedding ribosome_translation 227 -1 -1.000000 top_module=M10(w=0.041) 0.244478 0.261495 0.264432 0.288233 0.361577 0.210686 0.335895 0.123428 0.244851 0.115614 0.272408 0.298268 0.404157 0.354848 0.327001 0.289758 0.179226 0.295784 0.306929 0.223976 0.366708 0.135070 0.510802 0.483725 0.313211 0.295748 0.309980 0.329539 0.229439 0.317318 0.218407 0.124073 function_embedding protein_folding 25 -1 -1.000000 top_module=M3(w=0.010) 0.263135 0.268478 0.284191 0.305125 0.386821 0.238085 0.369268 0.118887 0.223030 0.116761 0.247252 0.312971 0.393197 0.383706 0.343670 0.269269 0.179377 0.326242 0.346088 0.238713 0.403626 0.133590 0.469172 0.451737 0.343026 0.285545 0.336266 0.348744 0.212673 0.349249 0.228623 0.112406 function_embedding iron_homeostasis 84 -1 -1.000000 top_module=M13(w=0.015) 0.246646 0.265538 0.265011 0.291644 0.360507 0.211254 0.333305 0.135361 0.251534 0.125457 0.270987 0.298989 0.408414 0.352669 0.326628 0.291144 0.187637 0.293377 0.300070 0.228635 0.362299 0.146512 0.503995 0.478070 0.306708 0.292700 0.310610 0.322806 0.230830 0.313270 0.226136 0.134245 dim_function_loading latent_dim_0 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.723) 0.723327 -0.156613 -0.276621 -0.232798 0.203428 0.020394 -0.056490 -0.169000 -0.549833 -0.225965 0.064272 0.301757 0.106588 dim_function_loading latent_dim_1 -1 -1 -1.000000 signal_transduction(r=-0.666) 0.564269 -0.224220 -0.429891 -0.312989 -0.204988 -0.308142 -0.499786 -0.533566 -0.665943 -0.500686 -0.273051 -0.075251 -0.169486 dim_function_loading latent_dim_2 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.684) 0.684187 -0.148824 -0.315803 -0.244690 0.231445 -0.019481 -0.058425 -0.179838 -0.531617 -0.254212 0.115626 0.306367 0.108852 dim_function_loading latent_dim_3 -1 -1 -1.000000 signal_transduction(r=-0.679) 0.661997 -0.238439 -0.392574 -0.313024 -0.065222 -0.186421 -0.346921 -0.426888 -0.679103 -0.437462 -0.136004 0.087563 -0.060778 dim_function_loading latent_dim_4 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.665) 0.664529 -0.178662 -0.347098 -0.275320 0.175507 -0.069121 -0.118413 -0.235639 -0.571172 -0.324616 0.089451 0.257030 0.059459 dim_function_loading latent_dim_5 -1 -1 -1.000000 protein_folding(r=+0.598) 0.436729 -0.054964 0.123087 0.009190 0.510870 0.473017 0.529221 0.356650 -0.033790 0.287012 0.443691 0.597857 0.383652 dim_function_loading latent_dim_6 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.640) 0.640212 -0.153685 -0.262439 -0.216322 0.314346 0.068902 0.072052 -0.074013 -0.454225 -0.184675 0.222764 0.382453 0.150322 dim_function_loading latent_dim_7 -1 -1 -1.000000 ribosome_translation(r=-0.493) -0.106474 -0.080362 0.191458 -0.007722 -0.473663 -0.109698 -0.334561 -0.237368 -0.123084 -0.117303 -0.492622 -0.332489 -0.017829 dim_function_loading latent_dim_8 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=-0.583) -0.583037 0.118800 0.263871 0.151763 -0.357242 -0.113787 -0.131117 0.016639 0.304890 0.070021 -0.281321 -0.392550 -0.103940 dim_function_loading latent_dim_9 -1 -1 -1.000000 signal_transduction(r=-0.675) 0.466428 -0.193305 -0.248878 -0.265734 -0.372822 -0.290971 -0.573251 -0.538939 -0.674937 -0.484630 -0.439964 -0.201448 -0.132086 dim_function_loading latent_dim_10 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=-0.637) -0.636640 0.165675 0.229518 0.222509 -0.284681 -0.052240 -0.071005 0.069168 0.561540 0.229802 -0.189178 -0.351530 -0.182516 dim_function_loading latent_dim_11 -1 -1 -1.000000 signal_transduction(r=-0.635) 0.633362 -0.192375 -0.421429 -0.315481 0.001226 -0.214548 -0.327365 -0.403476 -0.635146 -0.438239 -0.088458 0.092431 -0.062572 dim_function_loading latent_dim_12 -1 -1 -1.000000 amino_acid_metabolism(r=-0.646) -0.038687 0.007780 -0.150728 -0.135091 -0.521591 -0.431216 -0.645717 -0.470233 -0.325556 -0.421883 -0.528304 -0.473820 -0.301829 dim_function_loading latent_dim_13 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.654) 0.653628 -0.174384 -0.323262 -0.252407 0.229933 -0.023312 -0.046830 -0.176463 -0.528287 -0.273892 0.139435 0.300843 0.086863 dim_function_loading latent_dim_14 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.642) 0.641970 -0.179281 -0.400976 -0.304488 0.069665 -0.174879 -0.259629 -0.343802 -0.620041 -0.412569 -0.020428 0.144171 -0.022873 dim_function_loading latent_dim_15 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=-0.585) -0.585069 0.097047 0.212827 0.210730 -0.337786 -0.041900 -0.103487 0.011321 0.551920 0.234629 -0.264020 -0.354908 -0.194821 dim_function_loading latent_dim_16 -1 -1 -1.000000 signal_transduction(r=-0.697) 0.465977 -0.209479 -0.318985 -0.324164 -0.359579 -0.348227 -0.608905 -0.586442 -0.696625 -0.555029 -0.406162 -0.198864 -0.141962 dim_function_loading latent_dim_17 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.633) 0.633073 -0.146531 -0.182686 -0.182967 0.349449 0.164233 0.157883 0.010851 -0.424847 -0.101716 0.282731 0.422972 0.198283 dim_function_loading latent_dim_18 -1 -1 -1.000000 lipid_metabolism(r=+0.544) 0.444218 -0.031427 -0.003495 -0.032191 0.543706 0.357623 0.455034 0.310953 -0.114006 0.170702 0.479751 0.542203 0.310426 dim_function_loading latent_dim_19 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.724) 0.724179 -0.203363 -0.306644 -0.272226 0.077890 -0.065506 -0.176033 -0.286489 -0.639576 -0.326951 -0.064480 0.213736 0.077189 dim_function_loading latent_dim_20 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.606) 0.606007 -0.129691 -0.209236 -0.191387 0.377365 0.131958 0.163543 0.013301 -0.395464 -0.118169 0.303092 0.426194 0.197370 dim_function_loading latent_dim_21 -1 -1 -1.000000 ribosome_translation(r=-0.584) 0.108381 -0.139923 0.009875 -0.090541 -0.513518 -0.195427 -0.482448 -0.404946 -0.288532 -0.233493 -0.584238 -0.318414 -0.104901 dim_function_loading latent_dim_22 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=-0.707) -0.707145 0.197835 0.206185 0.208899 -0.261456 -0.117420 -0.068841 0.091560 0.536150 0.174339 -0.154223 -0.386799 -0.214421 dim_function_loading latent_dim_23 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=-0.685) -0.684910 0.205388 0.216914 0.221620 -0.246246 -0.076352 -0.056925 0.106899 0.575437 0.211319 -0.136329 -0.358617 -0.200658 dim_function_loading latent_dim_24 -1 -1 -1.000000 lipid_metabolism(r=+0.592) 0.353592 0.037348 0.078393 0.028731 0.591547 0.407989 0.527544 0.401047 0.019834 0.254565 0.542999 0.561661 0.345497 dim_function_loading latent_dim_25 -1 -1 -1.000000 signal_transduction(r=+0.722) -0.634515 0.209067 0.316791 0.309175 -0.058292 0.151740 0.194784 0.294799 0.721594 0.433772 0.046791 -0.151757 -0.049100 dim_function_loading latent_dim_26 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.674) 0.674148 -0.137875 -0.272518 -0.220414 0.300225 0.037609 0.032213 -0.104637 -0.485892 -0.203099 0.170071 0.360676 0.153177 dim_function_loading latent_dim_27 -1 -1 -1.000000 amino_acid_metabolism(r=+0.644) 0.156344 0.103793 0.200435 0.185406 0.603244 0.501205 0.644478 0.545723 0.304768 0.469049 0.568866 0.526711 0.329851 dim_function_loading latent_dim_28 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=-0.598) -0.598353 0.113067 0.232194 0.213089 -0.328319 -0.057753 -0.097138 0.025612 0.531828 0.219445 -0.256172 -0.367359 -0.180175 dim_function_loading latent_dim_29 -1 -1 -1.000000 protein_folding(r=+0.577) 0.323542 -0.001975 0.136332 0.083496 0.550834 0.483479 0.572233 0.430909 0.133989 0.370833 0.500631 0.577422 0.347426 dim_function_loading latent_dim_30 -1 -1 -1.000000 signal_transduction(r=-0.668) 0.600061 -0.232746 -0.374869 -0.268635 -0.210498 -0.255843 -0.451364 -0.503298 -0.668048 -0.441158 -0.320749 -0.045042 -0.122697 dim_function_loading latent_dim_31 -1 -1 -1.000000 lipid_metabolism(r=-0.431) -0.405507 0.012684 0.248290 0.115290 -0.431364 -0.071852 -0.207253 -0.089657 0.231094 0.064159 -0.393964 -0.360834 -0.084825