{
 "config": "EJ-ad+MV",
 "stage2_rule": "ens-es",
 "n_adapters": 3,
 "mode": "release",
 "created": "2026-10-28 07:05",
 "dims": {
  "mif": 512,
  "rna:hvg": 2000,
  "rna:tahoex1": 512,
  "rna:se600m": 2048,
  "rna:aidocell": 640,
  "text:keep": 768,
  "text:biomedclip": 512,
  "text:qwen3-0.6b": 1024
 },
 "adapter": "cat",
 "raw_encoders": [
  "rna:hvg",
  "text:biomedclip"
 ],
 "hvg_genes": [
  "A2M",
  "AAMP",
  "ABHD2",
  "ABLIM1",
  "ABR",
  "ACAA1",
  "ACAA2",
  "ACADVL",
  "ACAT1",
  "ACLY",
  "ACO2",
  "ACOT7",
  "ACSL1",
  "ACSL3",
  "ACSS1",
  "ACTA2",
  "ACTB",
  "ACTC1",
  "ACTG2",
  "ACTN1",
  "ACTN2",
  "ACTN4",
  "ACTR3",
  "ADAM15",
  "ADAM9",
  "ADAMTS1",
  "ADAR",
  "ADD1",
  "ADD3",
  "ADGRG1",
  "ADH5",
  "ADI1",
  "ADIRF",
  "ADNP",
  "ADRM1",
  "AEBP1",
  "AFDN",
  "AFF1",
  "AGAP3",
  "AGPAT2",
  "AGR2",
  "AGRN",
  "AGT",
  "AHCYL1",
  "AHNAK",
  "AHSA1",
  "AHSG",
  "AIDA",
  "AK1",
  "AKAP1",
  "AKAP12",
  "AKAP13",
  "AKAP9",
  "AKR1A1",
  "AKT1",
  "AKT2",
  "ALB",
  "ALDH1A1",
  "ALDH1L1",
  "ALDH2",
  "ALDH3A2",
  "ALDOB",
  "ALDOC",
  "ALKBH5",
  "ALKBH7",
  "ANAPC11",
  "ANAPC16",
  "ANAPC5",
  "ANG",
  "ANGPTL4",
  "ANK2",
  "ANKH",
  "ANKRD10",
  "ANKRD11",
  "ANKRD12",
  "ANP32A",
  "ANP32B",
  "ANP32E",
  "ANPEP",
  "ANXA1",
  "ANXA11",
  "ANXA2",
  "ANXA4",
  "ANXA5",
  "ANXA6",
  "ANXA7",
  "AP2A2",
  "AP2M1",
  "AP2S1",
  "AP3D1",
  "APBB1",
  "APEX1",
  "APH1A",
  "APLP2",
  "APMAP",
  "APOA2",
  "APOB",
  "APOC1",
  "APOC2",
  "APOD",
  "APOE",
  "APOL1",
  "APP",
  "APRT",
  "AQP1",
  "AQP3",
  "ARAP1",
  "ARCN1",
  "ARF1",
  "ARF3",
  "ARF4",
  "ARGLU1",
  "ARHGDIA",
  "ARHGDIB",
  "ARHGEF12",
  "ARL2",
  "ARL6IP4",
  "ARL6IP5",
  "ARPC1A",
  "ARPC1B",
  "ARPC2",
  "ARPC3",
  "ARPC4",
  "ARPC5",
  "ARPP19",
  "ARRDC3",
  "ASAH1",
  "ASPH",
  "ASS1",
  "ATF4",
  "ATN1",
  "ATOX1",
  "ATP1A1",
  "ATP1A2",
  "ATP1B1",
  "ATP2A2",
  "ATP2B4",
  "ATP2C1",
  "ATP5F1A",
  "ATP5F1B",
  "ATP5F1D",
  "ATP5F1E",
  "ATP5IF1",
  "ATP5MC2",
  "ATP5MC3",
  "ATP5ME",
  "ATP5MF",
  "ATP5MG",
  "ATP5MPL",
  "ATP5PB",
  "ATP5PD",
  "ATP5PF",
  "ATP6AP1",
  "ATP6AP2",
  "ATP6V0A1",
  "ATP6V0B",
  "ATP6V0D1",
  "ATP6V0E1",
  "ATP6V1A",
  "ATP6V1B2",
  "ATP6V1E1",
  "ATP6V1F",
  "ATP6V1G1",
  "ATP9A",
  "ATRAID",
  "ATRX",
  "ATXN10",
  "ATXN7L3B",
  "AUP1",
  "AURKAIP1",
  "AXIN2",
  "AZGP1",
  "AZIN1",
  "B2M",
  "B4GALT1",
  "BACE2",
  "BAD",
  "BAG1",
  "BAG6",
  "BANF1",
  "BCAM",
  "BCAP31",
  "BCL2L1",
  "BCL6",
  "BCL7C",
  "BEX3",
  "BEX4",
  "BGN",
  "BHLHE40",
  "BIN1",
  "BLCAP",
  "BLOC1S1",
  "BLVRB",
  "BNIP3L",
  "BPTF",
  "BRD2",
  "BRD4",
  "BRI3",
  "BRK1",
  "BSG",
  "BST2",
  "BTBD2",
  "BTF3",
  "BTG2",
  "BZW1",
  "C11orf58",
  "C11orf96",
  "C12orf57",
  "C19orf33",
  "C19orf48",
  "C19orf53",
  "C1QA",
  "C1QB",
  "C1QC",
  "C1QTNF1",
  "C1R",
  "C1S",
  "C1orf122",
  "C1orf198",
  "C1orf43",
  "C1orf61",
  "C3",
  "C4orf3",
  "C4orf48",
  "C6orf62",
  "C7",
  "C7orf50",
  "CA12",
  "CALCOCO2",
  "CALD1",
  "CALM3",
  "CALR",
  "CALU",
  "CAMK2N1",
  "CAMLG",
  "CAMTA1",
  "CANT1",
  "CANX",
  "CAP1",
  "CAPG",
  "CAPN1",
  "CAPN2",
  "CAPNS1",
  "CAPRIN1",
  "CAPS",
  "CAPZA2",
  "CAPZB",
  "CASC3",
  "CAST",
  "CAT",
  "CAV1",
  "CAV2",
  "CAVIN1",
  "CAVIN3",
  "CBR1",
  "CBX3",
  "CBX5",
  "CBX6",
  "CCDC12",
  "CCDC124",
  "CCDC47",
  "CCDC6",
  "CCDC80",
  "CCDC85B",
  "CCND1",
  "CCND2",
  "CCNI",
  "CCNL1",
  "CCNL2",
  "CCT2",
  "CCT3",
  "CCT4",
  "CCT8",
  "CD14",
  "CD151",
  "CD163",
  "CD164",
  "CD24",
  "CD36",
  "CD44",
  "CD46",
  "CD47",
  "CD55",
  "CD63",
  "CD68",
  "CD74",
  "CD81",
  "CD9",
  "CD99",
  "CDC123",
  "CDC34",
  "CDC42BPB",
  "CDC42EP1",
  "CDC42EP5",
  "CDC42SE1",
  "CDC42SE2",
  "CDH1",
  "CDIPT",
  "CDK4",
  "CDK6",
  "CDKN1A",
  "CDV3",
  "CEACAM5",
  "CEBPD",
  "CELF1",
  "CENPX",
  "CERCAM",
  "CERS2",
  "CES2",
  "CFB",
  "CFD",
  "CFH",
  "CFL2",
  "CFLAR",
  "CHCHD1",
  "CHCHD10",
  "CHCHD2",
  "CHD4",
  "CHGA",
  "CHI3L1",
  "CHID1",
  "CHMP1B",
  "CHMP2A",
  "CHMP3",
  "CHMP4B",
  "CHMP5",
  "CHN1",
  "CHP1",
  "CHPF",
  "CHTOP",
  "CHURC1",
  "CIB1",
  "CIRBP",
  "CISD3",
  "CKAP4",
  "CKB",
  "CKMT2",
  "CLDN3",
  "CLDN4",
  "CLDN5",
  "CLDN7",
  "CLIC1",
  "CLIC4",
  "CLIP1",
  "CLK1",
  "CLPTM1",
  "CLPTM1L",
  "CLSTN1",
  "CLTA",
  "CLTB",
  "CLTC",
  "CLU",
  "CLUH",
  "CMBL",
  "CMPK1",
  "CMYA5",
  "CNBP",
  "CNDP2",
  "CNN1",
  "CNN2",
  "CNN3",
  "CNP",
  "CNPY2",
  "COA3",
  "COA4",
  "COL16A1",
  "COL18A1",
  "COL1A1",
  "COL1A2",
  "COL3A1",
  "COL4A1",
  "COL4A2",
  "COL5A1",
  "COL5A2",
  "COL6A1",
  "COL6A2",
  "COL6A3",
  "COLGALT1",
  "COMMD6",
  "COMT",
  "COPA",
  "COPB2",
  "COPE",
  "COPG1",
  "COPS6",
  "COPS9",
  "COPZ1",
  "COQ8A",
  "CORO1C",
  "COTL1",
  "COX14",
  "COX17",
  "COX4I1",
  "COX5B",
  "COX6A1",
  "COX6B1",
  "COX6C",
  "COX7A1",
  "COX7A2",
  "COX7A2L",
  "COX7B",
  "COX7C",
  "COX8A",
  "CP",
  "CPE",
  "CPNE1",
  "CRABP2",
  "CREB3L1",
  "CREBZF",
  "CREG1",
  "CRELD2",
  "CRIM1",
  "CRIP1",
  "CRIP2",
  "CRISPLD2",
  "CRP",
  "CRTAP",
  "CRYAB",
  "CS",
  "CSDE1",
  "CSNK1D",
  "CSNK1G2",
  "CSNK2B",
  "CSRP3",
  "CST3",
  "CSTA",
  "CSTB",
  "CTDNEP1",
  "CTDSP1",
  "CTDSP2",
  "CTNNA1",
  "CTNNB1",
  "CTNNBIP1",
  "CTNND1",
  "CTSA",
  "CTSB",
  "CTSC",
  "CTSD",
  "CTSF",
  "CTSH",
  "CTSL",
  "CTSS",
  "CTSZ",
  "CTTN",
  "CTXN1",
  "CUTA",
  "CUX1",
  "CXCL12",
  "CXCL14",
  "CXCR4",
  "CYB5A",
  "CYB5B",
  "CYB5R3",
  "CYBA",
  "CYBRD1",
  "CYC1",
  "CYCS",
  "CYHR1",
  "CYP1B1",
  "CYP2C8",
  "CYP2E1",
  "CYSTM1",
  "CYTH2",
  "DAB2",
  "DAD1",
  "DAG1",
  "DAP",
  "DAZAP1",
  "DAZAP2",
  "DBI",
  "DBNL",
  "DCAF7",
  "DCAF8",
  "DCN",
  "DCTN1",
  "DCTN2",
  "DCTN3",
  "DCXR",
  "DDAH1",
  "DDAH2",
  "DDB1",
  "DDIT4",
  "DDR1",
  "DDRGK1",
  "DDT",
  "DDX1",
  "DDX17",
  "DDX21",
  "DDX23",
  "DDX24",
  "DDX39B",
  "DDX3X",
  "DDX5",
  "DDX6",
  "DECR1",
  "DEFB1",
  "DEGS1",
  "DEK",
  "DEPP1",
  "DES",
  "DHCR24",
  "DHRS3",
  "DHRS7",
  "DHX15",
  "DHX30",
  "DIDO1",
  "DKK3",
  "DLGAP4",
  "DMKN",
  "DMPK",
  "DNAJA1",
  "DNAJB1",
  "DNAJB2",
  "DNAJB6",
  "DNAJC15",
  "DNAJC7",
  "DNM1",
  "DNM2",
  "DNPEP",
  "DNPH1",
  "DPEP1",
  "DPM3",
  "DPP7",
  "DPYSL2",
  "DPYSL3",
  "DRAP1",
  "DSP",
  "DST",
  "DSTN",
  "DUS1L",
  "DUSP1",
  "DUSP23",
  "DUSP3",
  "DUT",
  "DYNC1H1",
  "DYNC1I2",
  "DYNC1LI2",
  "DYNLL1",
  "DYNLL2",
  "DYNLT1",
  "EBPL",
  "ECE1",
  "ECH1",
  "ECHDC2",
  "ECHS1",
  "ECI1",
  "EDF1",
  "EEF1A2",
  "EEF1B2",
  "EEF1G",
  "EEF2",
  "EFEMP1",
  "EFHD1",
  "EFHD2",
  "EFNA1",
  "EGFL7",
  "EGR1",
  "EHBP1L1",
  "EHD2",
  "EI24",
  "EID1",
  "EIF1",
  "EIF1AX",
  "EIF1B",
  "EIF2S2",
  "EIF2S3",
  "EIF3A",
  "EIF3B",
  "EIF3D",
  "EIF3E",
  "EIF3G",
  "EIF3H",
  "EIF3I",
  "EIF3L",
  "EIF3M",
  "EIF4A1",
  "EIF4A2",
  "EIF4B",
  "EIF4EBP2",
  "EIF4G1",
  "EIF4G2",
  "EIF4H",
  "EIF5",
  "EIF5B",
  "EIF6",
  "ELAVL1",
  "ELF3",
  "ELL2",
  "ELN",
  "ELOVL5",
  "EMC10",
  "EMC4",
  "EMILIN1",
  "EMP1",
  "EMP2",
  "EMP3",
  "ENAH",
  "ENC1",
  "ENG",
  "ENO1",
  "ENO2",
  "ENTPD6",
  "ENY2",
  "EPAS1",
  "EPCAM",
  "EPHX1",
  "EPN1",
  "EPS8L2",
  "ERBB2",
  "ERBB3",
  "ERGIC1",
  "ERGIC3",
  "ERH",
  "ERO1A",
  "ERP29",
  "ERRFI1",
  "ESD",
  "ESYT2",
  "ETFA",
  "ETFB",
  "ETHE1",
  "ETS2",
  "EVL",
  "EZR",
  "F2",
  "F3",
  "FABP1",
  "FABP4",
  "FABP5",
  "FAM107A",
  "FAM120A",
  "FAM162A",
  "FAM3C",
  "FAM3D",
  "FAM50A",
  "FARP1",
  "FASN",
  "FAT1",
  "FBLN1",
  "FBLN2",
  "FBN1",
  "FBP1",
  "FBXL5",
  "FBXW5",
  "FCER1G",
  "FCGBP",
  "FCGRT",
  "FDFT1",
  "FDPS",
  "FGA",
  "FGFRL1",
  "FGG",
  "FHL2",
  "FIS1",
  "FKBP10",
  "FKBP3",
  "FKBP5",
  "FKBP8",
  "FKBP9",
  "FLII",
  "FLNA",
  "FLNB",
  "FLNC",
  "FLOT1",
  "FLOT2",
  "FMOD",
  "FN1",
  "FNDC3B",
  "FOS",
  "FOSB",
  "FOXA1",
  "FOXN3",
  "FOXO3",
  "FOXP1",
  "FSTL1",
  "FTH1",
  "FTL",
  "FUNDC2",
  "FURIN",
  "FUS",
  "FXR1",
  "FXYD1",
  "FXYD2",
  "FXYD3",
  "FXYD5",
  "FXYD6",
  "G0S2",
  "G3BP2",
  "GAA",
  "GABARAP",
  "GABARAPL2",
  "GADD45B",
  "GADD45G",
  "GADD45GIP1",
  "GALNT2",
  "GAMT",
  "GANAB",
  "GAS6",
  "GATAD2A",
  "GATD1",
  "GATM",
  "GDF15",
  "GDI1",
  "GDI2",
  "GGT5",
  "GHITM",
  "GID8",
  "GIPC1",
  "GJA1",
  "GLG1",
  "GLO1",
  "GLRX5",
  "GLS",
  "GLUD1",
  "GLUL",
  "GM2A",
  "GNA11",
  "GNAI2",
  "GNAQ",
  "GNB1",
  "GNG11",
  "GNG5",
  "GNPTG",
  "GNS",
  "GOLGB1",
  "GOLM1",
  "GOLPH3",
  "GOT1",
  "GOT2",
  "GPAA1",
  "GPC1",
  "GPI",
  "GPM6A",
  "GPNMB",
  "GPRC5A",
  "GPRC5B",
  "GPS1",
  "GPX2",
  "GPX3",
  "GPX4",
  "GRHPR",
  "GRINA",
  "GRK2",
  "GRN",
  "GRSF1",
  "GSN",
  "GSPT1",
  "GSTK1",
  "GSTM3",
  "GSTO1",
  "GSTP1",
  "GTF2I",
  "GTF3A",
  "GTF3C1",
  "GTF3C6",
  "GUK1",
  "GYPC",
  "HADHA",
  "HADHB",
  "HAGH",
  "HAMP",
  "HBA2",
  "HCFC1R1",
  "HDAC1",
  "HDGF",
  "HDLBP",
  "HEBP2",
  "HERPUD1",
  "HES4",
  "HEXA",
  "HEXB",
  "HGS",
  "HIF1A",
  "HINT1",
  "HIPK2",
  "HIPK3",
  "HK1",
  "HM13",
  "HMG20B",
  "HMGA1",
  "HMGCS2",
  "HMGN3",
  "HMOX1",
  "HNRNPA0",
  "HNRNPA2B1",
  "HNRNPA3",
  "HNRNPC",
  "HNRNPD",
  "HNRNPDL",
  "HNRNPF",
  "HNRNPH3",
  "HNRNPK",
  "HNRNPR",
  "HNRNPU",
  "HNRNPUL1",
  "HNRNPUL2",
  "HOPX",
  "HP1BP3",
  "HPCAL1",
  "HPD",
  "HPX",
  "HRC",
  "HSBP1",
  "HSD11B2",
  "HSD17B10",
  "HSD17B4",
  "HSF1",
  "HSP90AA1",
  "HSP90AB1",
  "HSP90B1",
  "HSPA1A",
  "HSPA1B",
  "HSPA5",
  "HSPA8",
  "HSPA9",
  "HSPB1",
  "HSPB6",
  "HSPB7",
  "HSPB8",
  "HSPD1",
  "HSPE1",
  "HSPG2",
  "HSPH1",
  "HTRA1",
  "HUWE1",
  "ICAM1",
  "ID1",
  "ID2",
  "ID3",
  "ID4",
  "IDH2",
  "IDI1",
  "IDS",
  "IER2",
  "IER3",
  "IFI16",
  "IFI27",
  "IFI27L2",
  "IFI30",
  "IFI6",
  "IFITM2",
  "IFITM3",
  "IFNAR1",
  "IFNGR2",
  "IGFBP2",
  "IGFBP3",
  "IGFBP4",
  "IGFBP5",
  "IGFBP6",
  "IGFBP7",
  "IGHG1",
  "IGHG3",
  "IGHM",
  "IGKC",
  "IGLC1",
  "IL1R1",
  "IL32",
  "ILF2",
  "ILF3",
  "ILK",
  "IMPDH2",
  "INF2",
  "INSIG1",
  "INSR",
  "INTS1",
  "INTS11",
  "IP6K2",
  "IPO5",
  "IQGAP1",
  "IRAK1",
  "IRF1",
  "ISCU",
  "ISG15",
  "ISLR",
  "ITFG1",
  "ITGA3",
  "ITGA5",
  "ITGA6",
  "ITGAV",
  "ITGB1",
  "ITGB4",
  "ITGB5",
  "ITM2B",
  "ITM2C",
  "ITPK1",
  "IVNS1ABP",
  "JCHAIN",
  "JPT1",
  "JTB",
  "JUN",
  "JUNB",
  "JUP",
  "KANK2",
  "KCTD12",
  "KDELR1",
  "KDELR2",
  "KHDRBS1",
  "KHSRP",
  "KIAA1522",
  "KIF1B",
  "KIF1C",
  "KIF5B",
  "KLC1",
  "KLF5",
  "KLF6",
  "KLF9",
  "KLHDC3",
  "KLK2",
  "KLK4",
  "KPNA4",
  "KPNB1",
  "KRT1",
  "KRT10",
  "KRT14",
  "KRT16",
  "KRT6B",
  "KRT7",
  "KRT8",
  "KRTCAP2",
  "KTN1",
  "KXD1",
  "LAMA4",
  "LAMA5",
  "LAMB1",
  "LAMB2",
  "LAMC1",
  "LAMP1",
  "LAMP2",
  "LAMTOR1",
  "LAMTOR4",
  "LAP3",
  "LAPTM4A",
  "LAPTM4B",
  "LAPTM5",
  "LARP1",
  "LASP1",
  "LBH",
  "LCN2",
  "LDB3",
  "LENG8",
  "LGALS1",
  "LGALS3",
  "LGALS3BP",
  "LGALS4",
  "LGMN",
  "LIMS2",
  "LITAF",
  "LMAN1",
  "LMAN2",
  "LMNA",
  "LMO4",
  "LMO7",
  "LPCAT1",
  "LPP",
  "LRP1",
  "LRP10",
  "LRPAP1",
  "LRRC59",
  "LRRFIP1",
  "LSM14A",
  "LSM3",
  "LSM4",
  "LSM7",
  "LSP1",
  "LSR",
  "LTBP3",
  "LTBP4",
  "LTBR",
  "LTF",
  "LUC7L",
  "LUC7L2",
  "LUC7L3",
  "LUM",
  "LY6E",
  "LYZ",
  "MACF1",
  "MAF",
  "MAF1",
  "MAGED1",
  "MAGED2",
  "MAL2",
  "MANF",
  "MAOA",
  "MAP1B",
  "MAP1LC3A",
  "MAP2K2",
  "MAP2K3",
  "MAP3K20",
  "MAP4",
  "MAP7",
  "MAP7D1",
  "MAPK1",
  "MAPK1IP1L",
  "MAPK3",
  "MAPKAPK2",
  "MAPRE1",
  "MARCKS",
  "MARCKSL1",
  "MAT2A",
  "MAZ",
  "MB",
  "MBNL1",
  "MBNL2",
  "MBOAT7",
  "MBP",
  "MCAM",
  "MCL1",
  "MCM7",
  "MCRIP1",
  "MDH2",
  "MDK",
  "MDM4",
  "MEA1",
  "MEAF6",
  "METAP2",
  "METRN",
  "METRNL",
  "METTL26",
  "METTL9",
  "MFAP4",
  "MFGE8",
  "MFN2",
  "MFSD10",
  "MGAT1",
  "MGAT4B",
  "MGLL",
  "MGST1",
  "MGST3",
  "MICAL2",
  "MIDN",
  "MIEN1",
  "MIF",
  "MKNK2",
  "MLEC",
  "MLF2",
  "MLLT1",
  "MLLT6",
  "MLPH",
  "MMP14",
  "MMP2",
  "MMP24OS",
  "MMP7",
  "MOB1A",
  "MORF4L1",
  "MORF4L2",
  "MPC1",
  "MPC2",
  "MPRIP",
  "MPST",
  "MRC2",
  "MRFAP1L1",
  "MSI2",
  "MSN",
  "MSRB2",
  "MT1E",
  "MT1F",
  "MT1G",
  "MT1X",
  "MT2A",
  "MT3",
  "MTCH1",
  "MTDH",
  "MTPN",
  "MTURN",
  "MUC1",
  "MUC2",
  "MUC5B",
  "MVP",
  "MXD4",
  "MXRA7",
  "MXRA8",
  "MYADM",
  "MYBPC3",
  "MYC",
  "MYDGF",
  "MYH14",
  "MYH7",
  "MYH9",
  "MYL12A",
  "MYL12B",
  "MYL3",
  "MYL9",
  "MYLK",
  "MYO15B",
  "MYO1C",
  "MYO6",
  "MYOZ2",
  "N4BP2L2",
  "NAA38",
  "NAMPT",
  "NAP1L4",
  "NAPA",
  "NAXE",
  "NBL1",
  "NBR1",
  "NCAM1",
  "NCDN",
  "NCKAP1",
  "NCL",
  "NCOA4",
  "NCOA7",
  "NCOR1",
  "NCOR2",
  "NDFIP1",
  "NDRG1",
  "NDRG2",
  "NDRG4",
  "NDUFA1",
  "NDUFA10",
  "NDUFA11",
  "NDUFA12",
  "NDUFA13",
  "NDUFA2",
  "NDUFA3",
  "NDUFA4",
  "NDUFA4L2",
  "NDUFA6",
  "NDUFA7",
  "NDUFA8",
  "NDUFAB1",
  "NDUFAF3",
  "NDUFAF8",
  "NDUFB10",
  "NDUFB11",
  "NDUFB2",
  "NDUFB5",
  "NDUFB6",
  "NDUFB7",
  "NDUFB9",
  "NDUFC1",
  "NDUFC2",
  "NDUFS1",
  "NDUFS2",
  "NDUFS3",
  "NDUFS4",
  "NDUFS5",
  "NDUFS6",
  "NDUFS7",
  "NDUFS8",
  "NDUFV1",
  "NDUFV2",
  "NDUFV3",
  "NEBL",
  "NECTIN2",
  "NEDD8",
  "NENF",
  "NES",
  "NET1",
  "NEXN",
  "NFE2L1",
  "NFE2L2",
  "NFIA",
  "NFIB",
  "NFIC",
  "NFIX",
  "NFKBIA",
  "NHP2",
  "NID1",
  "NINJ1",
  "NIPSNAP2",
  "NISCH",
  "NKTR",
  "NME1",
  "NME2",
  "NME3",
  "NME4",
  "NNMT",
  "NONO",
  "NOP10",
  "NOP53",
  "NOTCH3",
  "NPC2",
  "NPDC1",
  "NPTN",
  "NQO1",
  "NR2F2",
  "NR2F6",
  "NR4A1",
  "NRGN",
  "NRP1",
  "NSA2",
  "NSMF",
  "NTRK2",
  "NUCB1",
  "NUCKS1",
  "NUDC",
  "NUDT3",
  "NUMA1",
  "NUPR1",
  "NUTF2",
  "OAF",
  "OAZ1",
  "OAZ2",
  "OBSL1",
  "OCIAD1",
  "OCIAD2",
  "ODC1",
  "OGA",
  "OGDH",
  "OGT",
  "OLFM1",
  "OLFM4",
  "OPTN",
  "ORM2",
  "ORMDL3",
  "OS9",
  "OST4",
  "OTUB1",
  "OXA1L",
  "P4HB",
  "PA2G4",
  "PABPC4",
  "PAFAH1B1",
  "PAFAH1B2",
  "PAIP2",
  "PALLD",
  "PAM",
  "PAPOLA",
  "PARVA",
  "PATJ",
  "PBX1",
  "PBXIP1",
  "PCBD1",
  "PCBP1",
  "PCBP2",
  "PCK1",
  "PCM1",
  "PCMT1",
  "PCOLCE",
  "PCP4",
  "PCSK1N",
  "PDCD4",
  "PDCD5",
  "PDCD6",
  "PDCD6IP",
  "PDGFRB",
  "PDHA1",
  "PDHB",
  "PDIA3",
  "PDIA4",
  "PDIA6",
  "PDK4",
  "PDLIM3",
  "PDLIM5",
  "PDLIM7",
  "PDS5A",
  "PDXK",
  "PDZK1IP1",
  "PEA15",
  "PEBP1",
  "PECAM1",
  "PER1",
  "PERP",
  "PET100",
  "PFDN2",
  "PFDN5",
  "PFKM",
  "PFKP",
  "PFN1",
  "PFN2",
  "PGAM1",
  "PGAM2",
  "PGD",
  "PGGHG",
  "PGK1",
  "PGLS",
  "PGRMC1",
  "PGRMC2",
  "PHB",
  "PHB2",
  "PHC2",
  "PHGDH",
  "PHGR1",
  "PHLDA1",
  "PHLDB1",
  "PHPT1",
  "PI3",
  "PI4KA",
  "PICALM",
  "PIEZO1",
  "PIGR",
  "PIGT",
  "PILRB",
  "PIM3",
  "PIN1",
  "PINK1",
  "PITPNA",
  "PJA2",
  "PKD1",
  "PKIG",
  "PLA2G2A",
  "PLAC9",
  "PLD3",
  "PLEC",
  "PLEKHB2",
  "PLEKHO1",
  "PLIN2",
  "PLN",
  "PLP1",
  "PLP2",
  "PLPP1",
  "PLPP3",
  "PLSCR1",
  "PLTP",
  "PLXNB1",
  "PLXNB2",
  "PLXND1",
  "PMEPA1",
  "PMP22",
  "PNISR",
  "PNKD",
  "PNN",
  "PNPLA2",
  "PNRC1",
  "PNRC2",
  "POLD2",
  "POLD4",
  "POLDIP2",
  "POLR1D",
  "POLR2A",
  "POLR2F",
  "POLR2G",
  "POLR2I",
  "POLR2K",
  "POLR2L",
  "POMP",
  "PON2",
  "POR",
  "POSTN",
  "PPDPF",
  "PPFIBP1",
  "PPIB",
  "PPIF",
  "PPM1G",
  "PPP1CA",
  "PPP1CB",
  "PPP1CC",
  "PPP1R12B",
  "PPP1R12C",
  "PPP1R14A",
  "PPP1R1A",
  "PPP1R1B",
  "PPP1R9B",
  "PPP2CB",
  "PPP2R5C",
  "PPP3CA",
  "PPP3CB",
  "PPP4C",
  "PPP4R2",
  "PPP6R2",
  "PRAP1",
  "PRB3",
  "PRDX3",
  "PRDX4",
  "PRDX5",
  "PRDX6",
  "PRELID3B",
  "PRELP",
  "PREPL",
  "PRKACA",
  "PRKCSH",
  "PRMT2",
  "PRNP",
  "PRPF6",
  "PRPF8",
  "PRRC2A",
  "PRRC2B",
  "PRRC2C",
  "PRSS23",
  "PRSS8",
  "PSAP",
  "PSENEN",
  "PSMA1",
  "PSMA2",
  "PSMA4",
  "PSMA5",
  "PSMA7",
  "PSMB1",
  "PSMB2",
  "PSMB3",
  "PSMB4",
  "PSMB5",
  "PSMB6",
  "PSMB7",
  "PSMB8",
  "PSMC3",
  "PSMC5",
  "PSMD11",
  "PSMD13",
  "PSMD2",
  "PSMD3",
  "PSMD4",
  "PSMD7",
  "PSME1",
  "PSME2",
  "PSMF1",
  "PTBP3",
  "PTEN",
  "PTGDS",
  "PTGES2",
  "PTGES3",
  "PTGR1",
  "PTK2",
  "PTMS",
  "PTN",
  "PTOV1",
  "PTP4A3",
  "PTPA",
  "PTPN12",
  "PTPRF",
  "PTTG1IP",
  "PUF60",
  "PYGB",
  "PYURF",
  "QDPR",
  "QKI",
  "QSOX1",
  "RAB10",
  "RAB11A",
  "RAB11B",
  "RAB13",
  "RAB14",
  "RAB18",
  "RAB1A",
  "RAB1B",
  "RAB21",
  "RAB25",
  "RAB2A",
  "RAB5A",
  "RAB5B",
  "RAB5C",
  "RAB5IF",
  "RAB7A",
  "RABAC1",
  "RABL6",
  "RAC1",
  "RACK1",
  "RAD21",
  "RAD23A",
  "RALY",
  "RAMP1",
  "RAP1A",
  "RARRES2",
  "RBCK1",
  "RBM17",
  "RBM25",
  "RBM3",
  "RBM39",
  "RBM42",
  "RBM47",
  "RBM5",
  "RBM6",
  "RBM8A",
  "RBP4",
  "RBPMS",
  "RBX1",
  "RCC2",
  "RCN1",
  "RCN2",
  "RDH11",
  "REEP5",
  "REG1A",
  "RELA",
  "REPIN1",
  "RER1",
  "RERE",
  "RETREG2",
  "REXO2",
  "RGCC",
  "RGS5",
  "RHBDD2",
  "RHOA",
  "RHOB",
  "RHOBTB3",
  "RHOQ",
  "RHOT2",
  "RIC8A",
  "RIDA",
  "RING1",
  "RMND5A",
  "RNASE1",
  "RNASEK",
  "RNASET2",
  "RNF10",
  "RNF11",
  "RNF114",
  "RNF130",
  "RNF145",
  "RNF187",
  "RNF213",
  "RNH1",
  "RNPS1",
  "ROMO1",
  "RPN1",
  "RPN2",
  "RRAD",
  "RRAS",
  "RSL1D1",
  "RSRP1",
  "RTF2",
  "RTL8C",
  "RTN1",
  "RTN4",
  "RTRAF",
  "RUNX1",
  "RUVBL2",
  "RWDD1",
  "RXRA",
  "S100A1",
  "S100A10",
  "S100A11",
  "S100A13",
  "S100A14",
  "S100A16",
  "S100A2",
  "S100A4",
  "S100A6",
  "S100A8",
  "S100A9",
  "S100B",
  "S100P",
  "SAFB",
  "SAFB2",
  "SAMHD1",
  "SAP18",
  "SAR1A",
  "SAT1",
  "SAT2",
  "SBDS",
  "SCAF11",
  "SCAMP2",
  "SCAND1",
  "SCARB2",
  "SCD",
  "SCGB2A2",
  "SCP2",
  "SDC1",
  "SDC2",
  "SDC3",
  "SDC4",
  "SDCBP",
  "SDF4",
  "SDHA",
  "SDHB",
  "SEC11A",
  "SEC11C",
  "SEC13",
  "SEC31A",
  "SEC61A1",
  "SEC61G",
  "SEC62",
  "SEL1L",
  "SELENBP1",
  "SELENOF",
  "SELENOH",
  "SELENOK",
  "SELENOM",
  "SELENON",
  "SELENOP",
  "SELENOW",
  "SEM1",
  "SEPHS2",
  "SERBP1",
  "SERF2",
  "SERINC1",
  "SERINC2",
  "SERINC3",
  "SERP1",
  "SERPINA1",
  "SERPINA3",
  "SERPINB1",
  "SERPINB6",
  "SERPINC1",
  "SERPINE1",
  "SERPINE2",
  "SERPINF1",
  "SERPINF2",
  "SERPING1",
  "SET",
  "SF1",
  "SF3B1",
  "SF3B2",
  "SF3B5",
  "SF3B6",
  "SFPQ",
  "SFRP2",
  "SFTPB",
  "SGK1",
  "SH3BGRL",
  "SH3BGRL3",
  "SH3GLB1",
  "SH3GLB2",
  "SHISA5",
  "SIGIRR",
  "SIVA1",
  "SLC12A2",
  "SLC1A2",
  "SLC1A3",
  "SLC22A17",
  "SLC25A1",
  "SLC25A11",
  "SLC25A39",
  "SLC25A4",
  "SLC2A1",
  "SLC2A4RG",
  "SLC38A1",
  "SLC38A10",
  "SLC38A2",
  "SLC39A1",
  "SLC39A14",
  "SLC39A6",
  "SLC39A7",
  "SLC3A2",
  "SLC40A1",
  "SLC44A1",
  "SLC44A2",
  "SLC44A4",
  "SLC45A3",
  "SLC9A3R1",
  "SLC9A3R2",
  "SLIRP",
  "SLPI",
  "SLTM",
  "SMARCA5",
  "SMARCC1",
  "SMARCE1",
  "SMCHD1",
  "SMDT1",
  "SMIM26",
  "SMIM4",
  "SMS",
  "SMTN",
  "SNAP25",
  "SND1",
  "SNRNP200",
  "SNRNP70",
  "SNRPB",
  "SNRPC",
  "SNRPD1",
  "SNRPE",
  "SNRPF",
  "SNRPG",
  "SNU13",
  "SNX1",
  "SNX17",
  "SNX3",
  "SOCS3",
  "SOD1",
  "SOD2",
  "SOD3",
  "SON",
  "SORBS1",
  "SORBS2",
  "SORBS3",
  "SORL1",
  "SORT1",
  "SOX4",
  "SPAG9",
  "SPARC",
  "SPARCL1",
  "SPATS2L",
  "SPCS1",
  "SPCS3",
  "SPDEF",
  "SPIN1",
  "SPINK1",
  "SPINK4",
  "SPINT1",
  "SPINT2",
  "SPON2",
  "SPP1",
  "SPSB3",
  "SPTAN1",
  "SPTBN1",
  "SQOR",
  "SQSTM1",
  "SREBF1",
  "SREBF2",
  "SRGN",
  "SRI",
  "SRM",
  "SRP9",
  "SRPRA",
  "SRRM2",
  "SRRT",
  "SRSF1",
  "SRSF11",
  "SRSF2",
  "SRSF3",
  "SRSF5",
  "SRSF7",
  "SRSF9",
  "SSBP1",
  "SSBP3",
  "SSR1",
  "SSR2",
  "SSR3",
  "SSR4",
  "SSU72",
  "ST13",
  "ST14",
  "ST6GAL1",
  "STAB1",
  "STARD10",
  "STARD7",
  "STAT1",
  "STAT2",
  "STAT3",
  "STAT6",
  "STAU1",
  "STEAP2",
  "STK25",
  "STMN1",
  "STOM",
  "STOML2",
  "STRAP",
  "STT3B",
  "STUB1",
  "STX16",
  "SUCLG1",
  "SULF1",
  "SULF2",
  "SUMF2",
  "SUMO3",
  "SUN2",
  "SUPT5H",
  "SURF4",
  "SVIL",
  "SYAP1",
  "SYNE2",
  "SYNGR2",
  "SYNM",
  "SYNPO",
  "SYNPO2",
  "SYPL1",
  "SZRD1",
  "TACC1",
  "TACSTD2",
  "TAF10",
  "TAF15",
  "TAF7",
  "TAGLN",
  "TAGLN2",
  "TALDO1",
  "TAP1",
  "TAPBP",
  "TAT",
  "TAX1BP1",
  "TAX1BP3",
  "TBC1D9B",
  "TBCB",
  "TBL1XR1",
  "TCAP",
  "TCEA3",
  "TCEAL4",
  "TCF25",
  "TCF4",
  "TCP1",
  "TERF2IP",
  "TF",
  "TFF1",
  "TFF3",
  "TFG",
  "TFPI",
  "TFRC",
  "TGFBI",
  "TGFBR2",
  "TGM2",
  "TGOLN2",
  "THBS1",
  "THBS2",
  "THOC7",
  "THRA",
  "THRAP3",
  "THY1",
  "TIMM13",
  "TIMM8B",
  "TIMP1",
  "TIMP2",
  "TIMP3",
  "TINAGL1",
  "TJP1",
  "TKT",
  "TLN1",
  "TM4SF1",
  "TM9SF2",
  "TM9SF3",
  "TMBIM1",
  "TMBIM4",
  "TMBIM6",
  "TMCO1",
  "TMED10",
  "TMED2",
  "TMED4",
  "TMED9",
  "TMEM109",
  "TMEM123",
  "TMEM134",
  "TMEM141",
  "TMEM147",
  "TMEM14C",
  "TMEM160",
  "TMEM165",
  "TMEM176A",
  "TMEM176B",
  "TMEM205",
  "TMEM219",
  "TMEM230",
  "TMEM248",
  "TMEM256",
  "TMEM258",
  "TMEM259",
  "TMEM30A",
  "TMEM50A",
  "TMEM54",
  "TMEM59",
  "TMEM63A",
  "TMEM9",
  "TMPRSS2",
  "TMSB4X",
  "TMX2",
  "TMX4",
  "TNC",
  "TNFRSF12A",
  "TNFRSF1A",
  "TNFSF10",
  "TNIP1",
  "TNNC1",
  "TNNI3",
  "TNNT2",
  "TNPO1",
  "TNS1",
  "TNXB",
  "TOB1",
  "TOLLIP",
  "TOMM20",
  "TOMM7",
  "TOP1",
  "TOP2B",
  "TP53I11",
  "TPD52",
  "TPD52L2",
  "TPM1",
  "TPM2",
  "TPP1",
  "TPPP3",
  "TRA2A",
  "TRA2B",
  "TRAM1",
  "TRAP1",
  "TRAPPC1",
  "TRAPPC5",
  "TRIM2",
  "TRIM28",
  "TRIM29",
  "TRIM8",
  "TRIOBP",
  "TRIP12",
  "TRIP6",
  "TRIR",
  "TRMT112",
  "TRPM4",
  "TSC22D1",
  "TSC22D3",
  "TSC22D4",
  "TSPAN1",
  "TSPAN13",
  "TSPAN3",
  "TSPAN4",
  "TSPAN7",
  "TSPAN8",
  "TSPO",
  "TSPYL1",
  "TST",
  "TSTA3",
  "TSTD1",
  "TTC3",
  "TTN",
  "TTR",
  "TUBA1B",
  "TUBA4A",
  "TUBB2A",
  "TUBB6",
  "TUFM",
  "TXN2",
  "TXNDC17",
  "TXNDC5",
  "TXNIP",
  "TXNL4A",
  "TYMP",
  "TYROBP",
  "UBA1",
  "UBA52",
  "UBB",
  "UBC",
  "UBE2B",
  "UBE2D2",
  "UBE2E3",
  "UBE2G2",
  "UBE2H",
  "UBE2I",
  "UBE2L3",
  "UBE2L6",
  "UBE2Q1",
  "UBE2R2",
  "UBE2V1",
  "UBL3",
  "UBL5",
  "UBQLN1",
  "UBTF",
  "UBXN1",
  "UBXN4",
  "UBXN6",
  "UCHL1",
  "UFC1",
  "UGDH",
  "UGP2",
  "UQCC2",
  "UQCC3",
  "UQCR11",
  "UQCRB",
  "UQCRC1",
  "UQCRC2",
  "UQCRFS1",
  "UQCRQ",
  "USF2",
  "USP22",
  "USP7",
  "UXT",
  "VAMP2",
  "VAMP5",
  "VAMP8",
  "VAPA",
  "VASP",
  "VAT1",
  "VCAN",
  "VCL",
  "VCP",
  "VDAC1",
  "VDAC2",
  "VDAC3",
  "VEGFB",
  "VIM",
  "VKORC1",
  "VMP1",
  "VOPP1",
  "VPS28",
  "VPS29",
  "VPS4A",
  "VSNL1",
  "VTN",
  "VWA1",
  "VWF",
  "WAC",
  "WASF2",
  "WBP2",
  "WDR1",
  "WDR13",
  "WDR26",
  "WDR45B",
  "WDR6",
  "WDR82",
  "WDR83OS",
  "WFDC2",
  "WFS1",
  "WLS",
  "WNK1",
  "WSB1",
  "WSB2",
  "XBP1",
  "XIRP1",
  "XRCC5",
  "XRCC6",
  "YBX1",
  "YIPF3",
  "YIPF4",
  "YME1L1",
  "YPEL3",
  "YPEL5",
  "YWHAB",
  "YWHAE",
  "YWHAG",
  "YWHAH",
  "YWHAQ",
  "YY1",
  "ZBTB7A",
  "ZEB2",
  "ZFP36",
  "ZFP36L1",
  "ZFP36L2",
  "ZKSCAN1",
  "ZMAT2",
  "ZMIZ1",
  "ZMIZ2",
  "ZNF106",
  "ZNF207",
  "ZNF358",
  "ZNF706",
  "ZRANB2",
  "ZYX"
 ],
 "c_mv": 0.24758127331733704,
 "split": "fold0 of splits/patient_5fold (ORION), splits/final/hest_fold0, tcga_fold0; train = train + test, val = val (early stopping)",
 "sizes": {
  "orion": {
   "train": 3000,
   "val": 187
  },
  "hest": {
   "train": 8938,
   "val": 546
  },
  "tcga_text": {
   "train": 5615,
   "val": 500
  }
 },
 "stage1_val_R@1": {
  "mif": 0.5508021116256714,
  "rna:hvg": 0.045787546783685684,
  "rna:tahoex1": 0.05860805884003639,
  "rna:se600m": 0.05219780281186104,
  "rna:aidocell": 0.056776560842990875,
  "text:keep": 0.0989583432674408,
  "text:biomedclip": 0.08750000596046448,
  "text:qwen3-0.6b": 0.09479167312383652
 },
 "es_steps": [
  200,
  200,
  900
 ],
 "seeds": [
  0,
  1000,
  2000
 ],
 "anchor": "UNI2-h CLS (1536-d), frozen",
 "image_extra": "MedVTok feats (1152-d), frozen",
 "mif_markers": "embed.MIF_MARKERS",
 "rna_encoders": [
  "hvg",
  "tahoex1",
  "se600m",
  "aidocell"
 ],
 "text_encoders": [
  "keep",
  "biomedclip",
  "qwen3-0.6b"
 ]
}