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Documentation complète du modèle noise2void

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- # Noise2Void
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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3
- Modèle de débruitage d'images par auto-supervision (self-supervised denoising), entraîné avec la librairie [N2V](https://github.com/juglab/n2v) (TensorFlow/Keras).
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
4
 
5
  ## Fichiers
6
- - `weights_best.h5` : meilleurs poids (selon validation loss)
7
  - `weights_last.h5` : derniers poids de l'entraînement
8
- - `config.json` : configuration de l'entraînement N2V
 
9
 
10
  ## Utilisation
11
-
12
  ```python
13
- from n2v.models import N2V, N2VConfig
14
 
15
- config = N2VConfig(...) # ou charger depuis config.json
16
- model = N2V(config=config, name='n2v_model_test_1_data_gray', basedir='.')
17
  model.keras_model.load_weights('weights_best.h5')
 
 
 
18
  ```
19
 
20
- ## Reproductibilité
21
- Ce modèle a été entraîné dans le cadre d'un projet de recherche sur le débruitage d'images médicales. Voir `config.json` pour les hyperparamètres exacts utilisés lors de l'entraînement.
 
 
 
 
1
+ ---
2
+ language: fr
3
+ tags:
4
+ - denoising
5
+ - microscopy
6
+ - noise2void
7
+ - tensorflow
8
+ - keras
9
+ license: mit
10
+ ---
11
 
12
+ # Noise2Void Débruitage d'images microscopiques
13
+
14
+ Modèle de débruitage d'images microscopiques par auto-supervision (self-supervised denoising), entraîné avec la librairie [N2V](https://github.com/juglab/n2v) (TensorFlow/Keras), dans le cadre d'une thèse sur la drépanocytose.
15
+
16
+ ## Tâche
17
+ Débruitage d'images microscopiques de frottis sanguin colorées (MGG, Giemsa) avant analyse par les modèles de détection et classification.
18
+
19
+ ## Performance
20
+ | Métrique | Valeur |
21
+ |----------|--------|
22
+ | PSNR | 43.98 dB |
23
+ | SSIM | 0.98 |
24
 
25
  ## Fichiers
26
+ - `weights_best.h5` : meilleurs poids du modèle
27
  - `weights_last.h5` : derniers poids de l'entraînement
28
+ - `config.json` : configuration complète de l'entraînement
29
+ - `train_noise2void.ipynb` : notebook d'entraînement
30
 
31
  ## Utilisation
 
32
  ```python
33
+ from n2v.models import N2V
34
 
35
+ model = N2V(config=None, name='n2v_model_test_1_data_gray', basedir='.')
 
36
  model.keras_model.load_weights('weights_best.h5')
37
+
38
+ # Débruitage
39
+ denoised = model.predict(image, axes='YX')
40
  ```
41
 
42
+ ## Contexte
43
+ Ce modèle fait partie d'un pipeline de recherche sur la détection automatique de cellules falciformes (drépanocytose) à partir d'images de frottis sanguin. Il constitue l'étape de prétraitement du pipeline.
44
+
45
+ ## Auteur
46
+ **Abdourahmane BALDE** — [@abdourahmane01](https://huggingface.co/abdourahmane01)