DAminoMuta / run.sh
auralray's picture
Upload folder using huggingface_hub
acbef3a verified
#!/bin/bash
# python main_simple.py --q-encoder lstm --channels 256 --fusion mlp
# python main_simple.py --q-encoder lstm --channels 256 --fusion att
# python main_simple.py --q-encoder lstm --channels 256 --fusion diff
# python main_simple.py --q-encoder mamba --channels 256 --fusion mlp
# python main_simple.py --q-encoder mamba --channels 256 --fusion att
# python main_simple.py --q-encoder mamba --channels 256 --fusion diff
# python main_simple.py --q-encoder mha --channels 256 --fusion mlp
# python main_simple.py --q-encoder mha --channels 256 --fusion att
# python main_simple.py --q-encoder mha --channels 256 --fusion diff
# python main_simple.py --q-encoder gru --channels 256 --fusion mlp
# python main_simple.py --q-encoder gru --channels 256 --fusion att
# python main_simple.py --q-encoder gru --channels 256 --fusion diff
# python main_simple.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion mlp
# python main_simple.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion att
# python main_simple.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion diff
# python main.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion mlp
# python main.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion att
# python main.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion diff
# python uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --side-enc mamba --fusion mlp --one-way --task cls --loss ce
# python main_simple.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion mlp --gpu 1 &
# python main_simple.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion mlp --pcs --gpu 0 &
# wait
# python main_simple.py --q-encoder rn18 --channels 16 --side-enc mamba --fusion mlp --pcs
# python uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --side-enc mamba --fusion diff --pcs --case r2 --gpu 0 &
# python uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --side-enc mamba --fusion diff --pcs --case r2
# python uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion att --simple --task cls --loss ce --case r2 --gpu 1 &
# wait
# python uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --side-enc mamba --fusion diff --pcs --case Indolicidin --gpu 0 &
# python uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion att --simple --task cls --loss ce --case Indolicidin --gpu 1 &
# wait
# python uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --side-enc mamba --fusion diff --pcs --case Temporin-A --gpu 0 &
# python uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion att --simple --task cls --loss ce --case Temporin-A --gpu 1 &
# wait
# python uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --side-enc mamba --fusion diff --pcs --case Anoplin --gpu 0 &
# python uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion att --simple --task cls --loss ce --case Anoplin --gpu 1 &
# wait
# python uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion att --simple --task cls --loss ce --case r2 --gpu 0 &
# python uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion att --simple --task cls --loss ce --case Indolicidin --gpu 1 &
# wait
# python uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion att --simple --task cls --loss ce --case Temporin-A --gpu 0 &
# python uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion att --simple --task cls --loss ce --case Anoplin --gpu 1 &
# wait
# python uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion att --simple --task cls --loss ce --case r2
# python uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion att --simple --task cls --loss ce --case Indolicidin
# python uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion att --simple --task cls --loss ce --case Temporin-A
# python uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion att --simple --task cls --loss ce --case Anoplin
# python infer_case_uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --side-enc mamba --fusion diff --pcs --task reg --loss mse --case r2
# python infer_case_uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --side-enc mamba --fusion diff --pcs --task reg --loss mse --case Indolicidin
# python infer_case_uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --side-enc mamba --fusion diff --pcs --task reg --loss mse --case Temporin-A
# python infer_case_uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --side-enc mamba --fusion diff --pcs --task reg --loss mse --case Anoplin
# python infer_case_uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion att --simple --task cls --loss ce --case r2
# python infer_case_uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion att --simple --task cls --loss ce --case Indolicidin
# python infer_case_uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion att --simple --task cls --loss ce --case Temporin-A
# python infer_case_uda.py --q-encoder rn18 --channels 16 --fusion att --simple --task cls --loss ce --case Anoplin
# python uda.py --task cls --loss ce --q-encoder rn18 --channels 16 --pcs --fusion diff
# python uda.py --task reg --loss mse --q-encoder rn18 --channels 16 --pcs --fusion diff
python uda.py --task cls --loss ce --q-encoder mamba --channels 256 --pcs --fusion diff
python uda.py --task reg --loss mse --q-encoder mamba --channels 256 --pcs --fusion diff