diff --git "a/BioMod/cell_annotation/module_data/module1_hallmarks.json" "b/BioMod/cell_annotation/module_data/module1_hallmarks.json" new file mode 100644--- /dev/null +++ "b/BioMod/cell_annotation/module_data/module1_hallmarks.json" @@ -0,0 +1,7424 @@ +{ + "HALLMARK_ADIPOGENESIS": [ + "ABCA1", + "ABCB8", + "ACAA2", + "ACADL", + "ACADM", + "ACADS", + "ACLY", + "ACO2", + "ACOX1", + "ADCY6", + "ADIG", + "ADIPOQ", + "ADIPOR2", + "AGPAT3", + "AIFM1", + "AK2", + "ALDH2", + "ALDOA", + "ANGPT1", + "ANGPTL4", + "APLP2", + "APOE", + "ARAF", + "ARL4A", + "ATL2", + "ATP1B3", + "ATP5PO", + "BAZ2A", + "BCKDHA", + "BCL2L13", + "BCL6", + "C3", + "CAT", + "CAVIN1", + "CAVIN2", + "CCNG2", + "CD151", + "CD302", + "CD36", + "CDKN2C", + "CHCHD10", + "CHUK", + "CIDEA", + "CMBL", + "CMPK1", + "COL15A1", + "COL4A1", + "COQ3", + "COQ5", + "COQ9", + "COX6A1", + "COX7B", + "COX8A", + "CPT2", + "CRAT", + "CS", + "CYC1", + "CYP4B1", + "DBT", + "DDT", + "DECR1", + "DGAT1", + "DHCR7", + "DHRS7", + "DHRS7B", + "DLAT", + "DLD", + "DNAJB9", + "DNAJC15", + "DRAM2", + "ECH1", + "ECHS1", + "ELMOD3", + "ELOVL6", + "ENPP2", + "EPHX2", + "ESRRA", + "ESYT1", + "ETFB", + "FABP4", + "FAH", + "FZD4", + "G3BP2", + "GADD45A", + "GBE1", + "GHITM", + "GPAM", + "GPAT4", + "GPD2", + "GPHN", + "GPX3", + "GPX4", + "GRPEL1", + "HADH", + "HIBCH", + "HSPB8", + "IDH1", + "IDH3A", + "IDH3G", + "IFNGR1", + "IMMT", + "ITGA7", + "ITIH5", + "ITSN1", + "JAGN1", + "LAMA4", + "LEP", + "LIFR", + "LIPE", + "LPCAT3", + "LPL", + "LTC4S", + "MAP4K3", + "MCCC1", + "MDH2", + "ME1", + "MGLL", + "MGST3", + "MIGA2", + "MRAP", + "MRPL15", + "MTARC2", + "MTCH2", + "MYLK", + "NABP1", + "NDUFA5", + "NDUFAB1", + "NDUFB7", + "NDUFS3", + "NKIRAS1", + "NMT1", + "OMD", + "ORM1", + "PDCD4", + "PEMT", + "PEX14", + "PFKFB3", + "PFKL", + "PGM1", + "PHLDB1", + "PHYH", + "PIM3", + "PLIN2", + "POR", + "PPARG", + "PPM1B", + "PPP1R15B", + "PRDX3", + "PREB", + "PTCD3", + "PTGER3", + "QDPR", + "RAB34", + "REEP5", + "REEP6", + "RETN", + "RETSAT", + "RIOK3", + "RMDN3", + "RNF11", + "RREB1", + "RTN3", + "SAMM50", + "SCARB1", + "SCP2", + "SDHB", + "SDHC", + "SLC19A1", + "SLC1A5", + "SLC25A1", + "SLC25A10", + "SLC27A1", + "SLC5A6", + "SLC66A3", + "SNCG", + "SOD1", + "SORBS1", + "SOWAHC", + "SPARCL1", + "SQOR", + "SSPN", + "STAT5A", + "STOM", + "SUCLG1", + "SULT1A1", + "TALDO1", + "TANK", + "TKT", + "TOB1", + "TST", + "UBC", + "UBQLN1", + "UCK1", + "UCP2", + "UQCR10", + "UQCR11", + "UQCRC1", + "UQCRQ", + "VEGFB", + "YWHAG" + ], + "HALLMARK_ALLOGRAFT_REJECTION": [ + "AARS1", + "ABCE1", + "ABI1", + "ACHE", + "ACVR2A", + "AKT1", + "APBB1", + "B2M", + "BCAT1", + "BCL10", + "BCL3", + "BRCA1", + "C2", + "CAPG", + "CARTPT", + "CCL11", + "CCL13", + "CCL19", + "CCL2", + "CCL22", + "CCL4", + "CCL5", + "CCL7", + "CCND2", + "CCND3", + "CCR1", + "CCR2", + "CCR5", + "CD1D", + "CD2", + "CD247", + "CD28", + "CD3D", + "CD3E", + "CD3G", + "CD4", + "CD40", + "CD40LG", + "CD47", + "CD7", + "CD74", + "CD79A", + "CD80", + "CD86", + "CD8A", + "CD8B", + "CD96", + "CDKN2A", + "CFP", + "CRTAM", + "CSF1", + "CSK", + "CTSS", + "CXCL13", + "CXCL9", + "CXCR3", + "DARS1", + "DEGS1", + "DYRK3", + "EGFR", + "EIF3A", + "EIF3D", + "EIF3J", + "EIF4G3", + "EIF5A", + "ELANE", + "ELF4", + "EREG", + "ETS1", + "F2", + "F2R", + "FAS", + "FASLG", + "FCGR2B", + "FGR", + "FLNA", + "FYB1", + "GALNT1", + "GBP2", + "GCNT1", + "GLMN", + "GPR65", + "GZMA", + "GZMB", + "HCLS1", + "HDAC9", + "HIF1A", + "HLA-A", + "HLA-DMA", + "HLA-DMB", + "HLA-DOA", + "HLA-DOB", + "HLA-DQA1", + "HLA-DRA", + "HLA-E", + "HLA-G", + "ICAM1", + "ICOSLG", + "IFNAR2", + "IFNG", + "IFNGR1", + "IFNGR2", + "IGSF6", + "IKBKB", + "IL10", + "IL11", + "IL12A", + "IL12B", + "IL12RB1", + "IL13", + "IL15", + "IL16", + "IL18", + "IL18RAP", + "IL1B", + "IL2", + "IL27RA", + "IL2RA", + "IL2RB", + "IL2RG", + "IL4", + "IL4R", + "IL6", + "IL7", + "IL9", + "INHBA", + "INHBB", + "IRF4", + "IRF7", + "IRF8", + "ITGAL", + "ITGB2", + "ITK", + "JAK2", + "KLRD1", + "KRT1", + "LCK", + "LCP2", + "LIF", + "LTB", + "LY75", + "LY86", + "LYN", + "MAP3K7", + "MAP4K1", + "MBL2", + "MMP9", + "MRPL3", + "MTIF2", + "NCF4", + "NCK1", + "NCR1", + "NLRP3", + "NME1", + "NOS2", + "NPM1", + "PF4", + "PRF1", + "PRKCB", + "PRKCG", + "PSMB10", + "PTPN6", + "PTPRC", + "RARS1", + "RIPK2", + "RPL39", + "RPL3L", + "RPL9", + "RPS19", + "RPS3A", + "RPS9", + "SIT1", + "SOCS1", + "SOCS5", + "SPI1", + "SRGN", + "ST8SIA4", + "STAB1", + "STAT1", + "STAT4", + "TAP1", + "TAP2", + "TAPBP", + "TGFB1", + "TGFB2", + "THY1", + "TIMP1", + "TLR1", + "TLR2", + "TLR3", + "TLR6", + "TNF", + "TPD52", + "TRAF2", + "TRAT1", + "UBE2D1", + "UBE2N", + "WARS1", + "WAS", + "ZAP70" + ], + "HALLMARK_ANDROGEN_RESPONSE": [ + "ABCC4", + "ABHD2", + "ACSL3", + "ACTN1", + "ADAMTS1", + "ADRM1", + "AKAP12", + "AKT1", + "ALDH1A3", + "ANKH", + "APPBP2", + "ARID5B", + "AZGP1", + "B2M", + "B4GALT1", + "BMPR1B", + "CAMKK2", + "CCND1", + "CCND3", + "CDC14B", + "CDK6", + "CENPN", + "DBI", + "DHCR24", + "DNAJB9", + "ELK4", + "ELL2", + "ELOVL5", + "FADS1", + "FKBP5", + "GNAI3", + "GPD1L", + "GSR", + "GUCY1A1", + "H1-0", + "HERC3", + "HMGCR", + "HMGCS1", + "HOMER2", + "HPGD", + "HSD17B14", + "IDI1", + "INPP4B", + "INSIG1", + "IQGAP2", + "ITGAV", + "KLK2", + "KLK3", + "KRT19", + "KRT8", + "LIFR", + "LMAN1", + "MAF", + "MAK", + "MAP7", + "MERTK", + "MYL12A", + "NCOA4", + "NDRG1", + "NGLY1", + "NKX3-1", + "PA2G4", + "PDLIM5", + "PGM3", + "PIAS1", + "PLPP1", + "PMEPA1", + "PTK2B", + "PTPN21", + "RAB4A", + "RPS6KA3", + "RRP12", + "SAT1", + "SCD", + "SEC24D", + "SELENOP", + "SGK1", + "SLC26A2", + "SLC38A2", + "SMS", + "SORD", + "SPCS3", + "SPDEF", + "SRF", + "SRP19", + "STEAP4", + "STK39", + "TARP", + "TMEM50A", + "TMPRSS2", + "TNFAIP8", + "TPD52", + "TSC22D1", + "UAP1", + "UBE2I", + "UBE2J1", + "VAPA", + "XRCC5", + "XRCC6", + "ZBTB10", + "ZMIZ1" + ], + "HALLMARK_ANGIOGENESIS": [ + "APOH", + "APP", + "CCND2", + "COL3A1", + "COL5A2", + "CXCL6", + "FGFR1", + "FSTL1", + "ITGAV", + "JAG1", + "JAG2", + "KCNJ8", + "LPL", + "LRPAP1", + "LUM", + "MSX1", + "NRP1", + "OLR1", + "PDGFA", + "PF4", + "PGLYRP1", + "POSTN", + "PRG2", + "PTK2", + "S100A4", + "SERPINA5", + "SLCO2A1", + "SPP1", + "STC1", + "THBD", + "TIMP1", + "TNFRSF21", + "VAV2", + "VCAN", + "VEGFA", + "VTN" + ], + "HALLMARK_APICAL_JUNCTION": [ + "ACTA1", + "ACTB", + "ACTC1", + "ACTG1", + "ACTG2", + "ACTN1", + "ACTN2", + "ACTN3", + "ACTN4", + "ADAM15", + "ADAM23", + "ADAM9", + "ADAMTS5", + "ADRA1B", + "AKT2", + "AKT3", + "ALOX15B", + "AMH", + "AMIGO1", + "AMIGO2", + "ARHGEF6", + "ARPC2", + "ATP1A3", + "B4GALT1", + "BAIAP2", + "BMP1", + "CADM2", + "CADM3", + "CALB2", + "CAP1", + "CD209", + "CD274", + "CD276", + "CD34", + "CD86", + "CD99", + "CDH1", + "CDH11", + "CDH15", + "CDH3", + "CDH4", + "CDH6", + "CDH8", + "CDK8", + "CDSN", + "CERCAM", + "CLDN11", + "CLDN14", + "CLDN15", + "CLDN18", + "CLDN19", + "CLDN4", + "CLDN5", + "CLDN6", + "CLDN7", + "CLDN8", + "CLDN9", + "CNN2", + "CNTN1", + "COL16A1", + "COL17A1", + "COL9A1", + "CRAT", + "CRB3", + "CTNNA1", + "CTNND1", + "CX3CL1", + "DHX16", + "DLG1", + "DMP1", + "DSC1", + "DSC3", + "EGFR", + "EPB41L2", + "EVL", + "EXOC4", + "FBN1", + "FLNC", + "FSCN1", + "FYB1", + "GAMT", + "GNAI1", + "GNAI2", + "GRB7", + "GTF2F1", + "HADH", + "HRAS", + "ICAM1", + "ICAM2", + "ICAM4", + "ICAM5", + "IKBKG", + "INPPL1", + "INSIG1", + "IRS1", + "ITGA10", + "ITGA2", + "ITGA3", + "ITGA9", + "ITGB1", + "ITGB4", + "JAM3", + "JUP", + "KCNH2", + "KRT31", + "LAMA3", + "LAMB3", + "LAMC2", + "LAYN", + "LDLRAP1", + "LIMA1", + "MADCAM1", + "MAP3K20", + "MAP4K2", + "MAPK11", + "MAPK13", + "MAPK14", + "MDK", + "MMP2", + "MMP9", + "MPZL1", + "MPZL2", + "MSN", + "MVD", + "MYH10", + "MYH9", + "MYL12B", + "MYL9", + "NECTIN1", + "NECTIN2", + "NECTIN3", + "NECTIN4", + "NEGR1", + "NEXN", + "NF1", + "NF2", + "NFASC", + "NHERF4", + "NLGN2", + "NLGN3", + "NRAP", + "NRTN", + "NRXN2", + "PALS1", + "PARD6G", + "PARVA", + "PBX2", + "PCDH1", + "PECAM1", + "PFN1", + "PIK3CB", + "PIK3R3", + "PKD1", + "PLCG1", + "PPP2R2C", + "PTEN", + "PTK2", + "PTPRC", + "RAC2", + "RASA1", + "RHOF", + "RRAS", + "RSU1", + "SDC3", + "SGCE", + "SHC1", + "SHROOM2", + "SIRPA", + "SKAP2", + "SLC30A3", + "SLIT2", + "SORBS3", + "SPEG", + "SRC", + "STX4", + "SYK", + "SYMPK", + "TAOK2", + "TGFBI", + "THBS3", + "THY1", + "TIAL1", + "TJP1", + "TMEM8B", + "TNFRSF11B", + "TRAF1", + "TRO", + "TSC1", + "TSPAN4", + "TUBG1", + "VASP", + "VAV2", + "VCAM1", + "VCAN", + "VCL", + "VWF", + "WASL", + "WNK4", + "YWHAH", + "ZYX" + ], + "HALLMARK_APICAL_SURFACE": [ + "ADAM10", + "ADIPOR2", + "AFAP1L2", + "AKAP7", + "APP", + "ATP6V0A4", + "ATP8B1", + "B4GALT1", + "BRCA1", + "CD160", + "CROCC", + "CRYBG1", + "CX3CL1", + "DCBLD2", + "EFNA5", + "EPHB4", + "FLOT2", + "GAS1", + "GATA3", + "GHRL", + "GSTM3", + "HSPB1", + "IL2RB", + "IL2RG", + "LYN", + "LYPD3", + "MAL", + "MDGA1", + "NCOA6", + "NTNG1", + "PCSK9", + "PKHD1", + "PLAUR", + "RHCG", + "RTN4RL1", + "SCUBE1", + "SHROOM2", + "SLC22A12", + "SLC2A4", + "SLC34A3", + "SRPX", + "SULF2", + "THY1", + "TMEM8B" + ], + "HALLMARK_APOPTOSIS": [ + "ADD1", + "AIFM3", + "ANKH", + "ANXA1", + "APP", + "ATF3", + "AVPR1A", + "BAX", + "BCAP31", + "BCL10", + "BCL2L1", + "BCL2L10", + "BCL2L11", + "BCL2L2", + "BGN", + "BID", + "BIK", + "BIRC3", + "BMF", + "BMP2", + "BNIP3L", + "BRCA1", + "BTG2", + "BTG3", + "CASP1", + "CASP2", + "CASP3", + "CASP4", + "CASP6", + "CASP7", + "CASP8", + "CASP9", + "CAV1", + "CCNA1", + "CCND1", + "CCND2", + "CD14", + "CD2", + "CD38", + "CD44", + "CD69", + "CDC25B", + "CDK2", + "CDKN1A", + "CDKN1B", + "CFLAR", + "CLU", + "CREBBP", + "CTH", + "CTNNB1", + "CYLD", + "DAP", + "DAP3", + "DCN", + "DDIT3", + "DFFA", + "DIABLO", + "DNAJA1", + "DNAJC3", + "DNM1L", + "DPYD", + "EBP", + "EGR3", + "EMP1", + "ENO2", + "ERBB2", + "ERBB3", + "EREG", + "ETF1", + "F2", + "F2R", + "FAS", + "FASLG", + "FDXR", + "FEZ1", + "GADD45A", + "GADD45B", + "GCH1", + "GNA15", + "GPX1", + "GPX3", + "GPX4", + "GSN", + "GSR", + "GSTM1", + "GUCY2D", + "H1-0", + "HGF", + "HMGB2", + "HMOX1", + "HSPB1", + "IER3", + "IFITM3", + "IFNB1", + "IFNGR1", + "IGF2R", + "IGFBP6", + "IL18", + "IL1A", + "IL1B", + "IL6", + "IRF1", + "ISG20", + "JUN", + "KRT18", + "LEF1", + "LGALS3", + "LMNA", + "LUM", + "MADD", + "MCL1", + "MGMT", + "MMP2", + "NEDD9", + "NEFH", + "PAK1", + "PDCD4", + "PDGFRB", + "PEA15", + "PLAT", + "PLCB2", + "PLPPR4", + "PMAIP1", + "PPP2R5B", + "PPP3R1", + "PPT1", + "PRF1", + "PSEN1", + "PSEN2", + "PTK2", + "RARA", + "RELA", + "RETSAT", + "RHOB", + "RHOT2", + "RNASEL", + "ROCK1", + "SAT1", + "SATB1", + "SC5D", + "SLC20A1", + "SMAD7", + "SOD1", + "SOD2", + "SPTAN1", + "SQSTM1", + "TAP1", + "TGFB2", + "TGFBR3", + "TIMP1", + "TIMP2", + "TIMP3", + "TNF", + "TNFRSF12A", + "TNFSF10", + "TOP2A", + "TSPO", + "TXNIP", + "VDAC2", + "WEE1", + "XIAP" + ], + "HALLMARK_BILE_ACID_METABOLISM": [ + "ABCA1", + "ABCA2", + "ABCA3", + "ABCA4", + "ABCA5", + "ABCA6", + "ABCA8", + "ABCA9", + "ABCD1", + "ABCD2", + "ABCD3", + "ABCG4", + "ABCG8", + "ACSL1", + "ACSL5", + "AGXT", + "AKR1D1", + "ALDH1A1", + "ALDH8A1", + "ALDH9A1", + "AMACR", + "APOA1", + "AQP9", + "AR", + "ATXN1", + "BBOX1", + "BCAR3", + "BMP6", + "CAT", + "CH25H", + "CROT", + "CYP27A1", + "CYP39A1", + "CYP46A1", + "CYP7A1", + "CYP7B1", + "CYP8B1", + "DHCR24", + "DIO1", + "DIO2", + "EFHC1", + "EPHX2", + "FADS1", + "FADS2", + "FDXR", + "GC", + "GCLM", + "GNMT", + "GNPAT", + "GSTK1", + "HACL1", + "HAO1", + "HSD17B11", + "HSD17B4", + "HSD17B6", + "HSD3B1", + "HSD3B7", + "IDH1", + "IDH2", + "IDI1", + "ISOC1", + "KLF1", + "LCK", + "LIPE", + "LONP2", + "MLYCD", + "NEDD4", + "NPC1", + "NR0B2", + "NR1H4", + "NR1I2", + "NR3C2", + "NUDT12", + "OPTN", + "PAOX", + "PECR", + "PEX1", + "PEX11A", + "PEX11G", + "PEX12", + "PEX13", + "PEX16", + "PEX19", + "PEX26", + "PEX6", + "PEX7", + "PFKM", + "PHYH", + "PIPOX", + "PNPLA8", + "PRDX5", + "PXMP2", + "RBP1", + "RETSAT", + "RXRA", + "RXRG", + "SCP2", + "SERPINA6", + "SLC22A18", + "SLC23A1", + "SLC23A2", + "SLC27A2", + "SLC27A5", + "SLC29A1", + "SLC35B2", + "SLCO1A2", + "SOAT2", + "SOD1", + "SULT1B1", + "SULT2B1", + "TFCP2L1", + "TTR" + ], + "HALLMARK_CHOLESTEROL_HOMEOSTASIS": [ + "ABCA2", + "ACAT2", + "ACSS2", + "ACTG1", + "ADH4", + "ALCAM", + "ALDOC", + "ANTXR2", + "ANXA13", + "ANXA5", + "ATF3", + "ATF5", + "ATXN2", + "AVPR1A", + "CBS", + "CD9", + "CHKA", + "CLU", + "CPEB2", + "CTNNB1", + "CXCL16", + "CYP51A1", + "DHCR7", + "EBP", + "ECH1", + "ERRFI1", + "ETHE1", + "FABP5", + "FADS2", + "FASN", + "FBXO6", + "FDFT1", + "FDPS", + "GLDC", + "GNAI1", + "GPX8", + "GSTM2", + "GUSB", + "HMGCR", + "HMGCS1", + "HSD17B7", + "IDI1", + "JAG1", + "LDLR", + "LGALS3", + "LGMN", + "LPL", + "LSS", + "MAL2", + "MVD", + "MVK", + "NFIL3", + "NIBAN1", + "NSDHL", + "PCYT2", + "PDK3", + "PLAUR", + "PLSCR1", + "PMVK", + "PNRC1", + "PPARG", + "S100A11", + "SC5D", + "SCD", + "SEMA3B", + "SQLE", + "SREBF2", + "STARD4", + "STX5", + "TM7SF2", + "TMEM97", + "TNFRSF12A", + "TP53INP1", + "TRIB3" + ], + "HALLMARK_COAGULATION": [ + "A2M", + "ACOX2", + "ADAM9", + "ANG", + "ANXA1", + "APOA1", + "APOC1", + "APOC2", + "APOC3", + "ARF4", + "BMP1", + "C1QA", + "C1R", + "C1S", + "C2", + "C3", + "C8A", + "C8B", + "C8G", + "C9", + "CAPN2", + "CAPN5", + "CASP9", + "CD9", + "CFB", + "CFD", + "CFH", + "CFI", + "CLU", + "COMP", + "CPB2", + "CPN1", + "CPQ", + "CRIP2", + "CSRP1", + "CTSB", + "CTSE", + "CTSH", + "CTSK", + "CTSO", + "CTSV", + "DCT", + "DPP4", + "DUSP14", + "DUSP6", + "F10", + "F11", + "F12", + "F13B", + "F2", + "F2RL2", + "F3", + "F8", + "F9", + "FBN1", + "FGA", + "FGG", + "FN1", + "FURIN", + "FYN", + "GDA", + "GNB2", + "GNG12", + "GP1BA", + "GP9", + "GSN", + "HMGCS2", + "HNF4A", + "HPN", + "HRG", + "HTRA1", + "ISCU", + "ITGA2", + "ITGB3", + "ITIH1", + "KLF7", + "KLK8", + "KLKB1", + "LAMP2", + "LEFTY2", + "LGMN", + "LRP1", + "LTA4H", + "MAFF", + "MASP2", + "MBL2", + "MEP1A", + "MMP1", + "MMP10", + "MMP11", + "MMP14", + "MMP15", + "MMP2", + "MMP3", + "MMP7", + "MMP8", + "MMP9", + "MSRB2", + "MST1", + "OLR1", + "P2RY1", + "PDGFB", + "PECAM1", + "PEF1", + "PF4", + "PLAT", + "PLAU", + "PLEK", + "PLG", + "PREP", + "PROC", + "PROS1", + "PROZ", + "PRSS23", + "RABIF", + "RAC1", + "RAPGEF3", + "RGN", + "S100A1", + "S100A13", + "SERPINA1", + "SERPINB2", + "SERPINC1", + "SERPINE1", + "SERPING1", + "SH2B2", + "SIRT2", + "SPARC", + "TF", + "TFPI2", + "THBD", + "THBS1", + "TIMP1", + "TIMP3", + "TMPRSS6", + "USP11", + "VWF", + "WDR1" + ], + "HALLMARK_COMPLEMENT": [ + "ACTN2", + "ADAM9", + "ADRA2B", + "AKAP10", + "ANG", + "ANXA5", + "APOA4", + "APOBEC3F", + "APOBEC3G", + "APOC1", + "ATOX1", + "BRPF3", + "C1QA", + "C1QC", + "C1R", + "C1S", + "C2", + "C3", + "C4BPB", + "C9", + "CA2", + "CALM1", + "CALM3", + "CASP1", + "CASP10", + "CASP3", + "CASP4", + "CASP5", + "CASP7", + "CASP9", + "CBLB", + "CCL5", + "CD36", + "CD40LG", + "CD46", + "CD55", + "CD59", + "CDA", + "CDH13", + "CDK5R1", + "CEBPB", + "CFB", + "CFH", + "CLU", + "COL4A2", + "CP", + "CPM", + "CPQ", + "CR1", + "CR2", + "CSRP1", + "CTSB", + "CTSC", + "CTSD", + "CTSH", + "CTSL", + "CTSO", + "CTSS", + "CTSV", + "CXCL1", + "DGKG", + "DGKH", + "DOCK10", + "DOCK4", + "DOCK9", + "DPP4", + "DUSP5", + "DUSP6", + "DYRK2", + "EHD1", + "ERAP2", + "F10", + "F2", + "F3", + "F5", + "F7", + "F8", + "FCER1G", + "FCN1", + "FDX1", + "FN1", + "FYN", + "GATA3", + "GCA", + "GMFB", + "GNAI2", + "GNAI3", + "GNB2", + "GNB4", + "GNG2", + "GNGT2", + "GP1BA", + "GP9", + "GPD2", + "GRB2", + "GZMA", + "GZMB", + "GZMK", + "HNF4A", + "HPCAL4", + "HSPA1A", + "HSPA5", + "IL6", + "IRF1", + "IRF2", + "IRF7", + "ITGAM", + "ITIH1", + "JAK2", + "KCNIP2", + "KCNIP3", + "KIF2A", + "KLK1", + "KLKB1", + "KYNU", + "L3MBTL4", + "LAMP2", + "LAP3", + "LCK", + "LCP2", + "LGALS3", + "LGMN", + "LIPA", + "LRP1", + "LTA4H", + "LTF", + "LYN", + "MAFF", + "ME1", + "MMP12", + "MMP13", + "MMP14", + "MMP15", + "MMP8", + "MSRB1", + "MT3", + "NOTCH4", + "OLR1", + "PCLO", + "PCSK9", + "PDGFB", + "PDP1", + "PFN1", + "PHEX", + "PIK3CA", + "PIK3CG", + "PIK3R5", + "PIM1", + "PLA2G4A", + "PLA2G7", + "PLAT", + "PLAUR", + "PLEK", + "PLG", + "PLSCR1", + "PPP2CB", + "PPP4C", + "PRCP", + "PRDM4", + "PREP", + "PRKCD", + "PRSS3", + "PRSS36", + "PSEN1", + "PSMB9", + "RABIF", + "RAF1", + "RASGRP1", + "RBSN", + "RCE1", + "RHOG", + "RNF4", + "S100A12", + "S100A13", + "S100A9", + "SCG3", + "SERPINA1", + "SERPINB2", + "SERPINC1", + "SERPINE1", + "SERPING1", + "SH2B3", + "SIRT6", + "SPOCK2", + "SRC", + "STX4", + "TFPI2", + "TIMP1", + "TIMP2", + "TMPRSS6", + "TNFAIP3", + "USP14", + "USP15", + "USP16", + "USP8", + "VCPIP1", + "WAS", + "XPNPEP1", + "ZEB1", + "ZFPM2" + ], + "HALLMARK_DNA_REPAIR": [ + "AAAS", + "ADA", + "ADCY6", + "ADRM1", + "AGO4", + "AK1", + "AK3", + "ALYREF", + "APRT", + "ARL6IP1", + "BCAM", + "BCAP31", + "BOLA2", + "BRF2", + "CANT1", + "CCNO", + "CDA", + "CETN2", + "CLP1", + "CMPK2", + "COX17", + "CSTF3", + "DAD1", + "DCTN4", + "DDB1", + "DDB2", + "DGCR8", + "DGUOK", + "DUT", + "EDF1", + "EIF1B", + "ELL", + "ELOA", + "ERCC1", + "ERCC2", + "ERCC3", + "ERCC4", + "ERCC5", + "ERCC8", + "FEN1", + "GMPR2", + "GPX4", + "GSDME", + "GTF2A2", + "GTF2B", + "GTF2F1", + "GTF2H1", + "GTF2H3", + "GTF2H5", + "GTF3C5", + "GUK1", + "HCLS1", + "HPRT1", + "IMPDH2", + "ITPA", + "LIG1", + "MPC2", + "MPG", + "MRPL40", + "NCBP2", + "NELFB", + "NELFCD", + "NELFE", + "NFX1", + "NME1", + "NME3", + "NME4", + "NPR2", + "NT5C", + "NT5C3A", + "NUDT21", + "NUDT9", + "PCNA", + "PDE4B", + "PDE6G", + "PNP", + "POLA1", + "POLA2", + "POLB", + "POLD1", + "POLD3", + "POLD4", + "POLE4", + "POLH", + "POLL", + "POLR1C", + "POLR1D", + "POLR1H", + "POLR2A", + "POLR2C", + "POLR2D", + "POLR2E", + "POLR2F", + "POLR2G", + "POLR2H", + "POLR2I", + "POLR2J", + "POLR2K", + "POLR3C", + "POLR3GL", + "POM121", + "PRIM1", + "RAD51", + "RAD52", + "RAE1", + "RALA", + "RBX1", + "REV3L", + "RFC2", + "RFC3", + "RFC4", + "RFC5", + "RNMT", + "RPA2", + "RPA3", + "RRM2B", + "SAC3D1", + "SDCBP", + "SEC61A1", + "SF3A3", + "SMAD5", + "SNAPC4", + "SNAPC5", + "SRSF6", + "SSRP1", + "STX3", + "SUPT4H1", + "SUPT5H", + "SURF1", + "TAF10", + "TAF12", + "TAF13", + "TAF1C", + "TAF6", + "TAF9", + "TARBP2", + "TK2", + "TMED2", + "TP53", + "TSG101", + "TYMS", + "UMPS", + "UPF3B", + "USP11", + "VPS28", + "VPS37B", + "VPS37D", + "XPC", + "ZNF707", + "ZWINT" + ], + "HALLMARK_E2F_TARGETS": [ + "AK2", + "ANP32E", + "ASF1A", + "ASF1B", + "ATAD2", + "AURKA", + "AURKB", + "BARD1", + "BIRC5", + "BRCA1", + "BRCA2", + "BRMS1L", + "BUB1B", + "CBX5", + "CCNB2", + "CCNE1", + "CCP110", + "CDC20", + "CDC25A", + "CDC25B", + "CDCA3", + "CDCA8", + "CDK1", + "CDK4", + "CDKN1A", + "CDKN1B", + "CDKN2A", + "CDKN2C", + "CDKN3", + "CENPE", + "CENPM", + "CHEK1", + "CHEK2", + "CIT", + "CKS1B", + "CKS2", + "CNOT9", + "CSE1L", + "CTCF", + "CTPS1", + "DCK", + "DCLRE1B", + "DCTPP1", + "DDX39A", + "DEK", + "DEPDC1", + "DIAPH3", + "DLGAP5", + "DNMT1", + "DONSON", + "DSCC1", + "DUT", + "E2F8", + "EED", + "EIF2S1", + "ESPL1", + "EXOSC8", + "EZH2", + "GINS1", + "GINS3", + "GINS4", + "GSPT1", + "H2AX", + "H2AZ1", + "HELLS", + "HMGA1", + "HMGB2", + "HMGB3", + "HMMR", + "HNRNPD", + "HUS1", + "ILF3", + "ING3", + "IPO7", + "JPT1", + "KIF18B", + "KIF22", + "KIF2C", + "KIF4A", + "KPNA2", + "LBR", + "LIG1", + "LMNB1", + "LUC7L3", + "LYAR", + "MAD2L1", + "MCM2", + "MCM3", + "MCM4", + "MCM5", + "MCM6", + "MCM7", + "MELK", + "MKI67", + "MLH1", + "MMS22L", + "MRE11", + "MSH2", + "MTHFD2", + "MXD3", + "MYBL2", + "MYC", + "NAA38", + "NAP1L1", + "NASP", + "NBN", + "NCAPD2", + "NME1", + "NOLC1", + "NOP56", + "NUDT21", + "NUP107", + "NUP153", + "NUP205", + "ORC2", + "ORC6", + "PA2G4", + "PAICS", + "PAN2", + "PCNA", + "PDS5B", + "PHF5A", + "PLK1", + "PLK4", + "PMS2", + "PNN", + "POLA2", + "POLD1", + "POLD2", + "POLD3", + "POLE", + "POLE4", + "POP7", + "PPM1D", + "PPP1R8", + "PRDX4", + "PRIM2", + "PRKDC", + "PRPS1", + "PSIP1", + "PSMC3IP", + "PTTG1", + "RACGAP1", + "RAD1", + "RAD21", + "RAD50", + "RAD51AP1", + "RAD51C", + "RAN", + "RANBP1", + "RBBP7", + "RFC1", + "RFC2", + "RFC3", + "RNASEH2A", + "RPA1", + "RPA2", + "RPA3", + "RRM2", + "SHMT1", + "SLBP", + "SMC1A", + "SMC3", + "SMC4", + "SMC6", + "SNRPB", + "SPAG5", + "SPC24", + "SPC25", + "SRSF1", + "SRSF2", + "SSRP1", + "STAG1", + "STMN1", + "SUV39H1", + "SYNCRIP", + "TACC3", + "TBRG4", + "TCF19", + "TFRC", + "TIMELESS", + "TIPIN", + "TK1", + "TMPO", + "TOP2A", + "TP53", + "TRA2B", + "TRIP13", + "TUBB", + "TUBG1", + "UBE2S", + "UBE2T", + "UBR7", + "UNG", + "USP1", + "WDR90", + "WEE1", + "XPO1", + "XRCC6", + "ZW10" + ], + "HALLMARK_EPITHELIAL_MESENCHYMAL_TRANSITION": [ + "ABI3BP", + "ACTA2", + "ADAM12", + "ANPEP", + "APLP1", + "AREG", + "BASP1", + "BDNF", + "BGN", + "BMP1", + "CADM1", + "CALD1", + "CALU", + "CAP2", + "CAPG", + "CCN1", + "CCN2", + "CD44", + "CD59", + "CDH11", + "CDH2", + "CDH6", + "COL11A1", + "COL12A1", + "COL16A1", + "COL1A1", + "COL1A2", + "COL3A1", + "COL4A1", + "COL4A2", + "COL5A1", + "COL5A2", + "COL5A3", + "COL6A2", + "COL6A3", + "COL7A1", + "COL8A2", + "COLGALT1", + "COMP", + "COPA", + "CRLF1", + "CTHRC1", + "CXCL1", + "CXCL12", + "CXCL6", + "CXCL8", + "DAB2", + "DCN", + "DKK1", + "DPYSL3", + "DST", + "ECM1", + "ECM2", + "EDIL3", + "EFEMP2", + "ELN", + "EMP3", + "ENO2", + "FAP", + "FAS", + "FBLN1", + "FBLN2", + "FBLN5", + "FBN1", + "FBN2", + "FERMT2", + "FGF2", + "FLNA", + "FMOD", + "FN1", + "FOXC2", + "FSTL1", + "FSTL3", + "FUCA1", + "FZD8", + "GADD45A", + "GADD45B", + "GAS1", + "GEM", + "GJA1", + "GLIPR1", + "GPC1", + "GPX7", + "GREM1", + "HTRA1", + "ID2", + "IGFBP2", + "IGFBP3", + "IGFBP4", + "IL15", + "IL32", + "IL6", + "INHBA", + "ITGA2", + "ITGA5", + "ITGAV", + "ITGB1", + "ITGB3", + "ITGB5", + "JUN", + "LAMA1", + "LAMA2", + "LAMA3", + "LAMC1", + "LAMC2", + "LGALS1", + "LOX", + "LOXL1", + "LOXL2", + "LRP1", + "LRRC15", + "LUM", + "MAGEE1", + "MATN2", + "MATN3", + "MCM7", + "MEST", + "MFAP5", + "MGP", + "MMP1", + "MMP14", + "MMP2", + "MMP3", + "MSX1", + "MXRA5", + "MYL9", + "MYLK", + "NID2", + "NNMT", + "NOTCH2", + "NT5E", + "NTM", + "OXTR", + "P3H1", + "PCOLCE", + "PCOLCE2", + "PDGFRB", + "PDLIM4", + "PFN2", + "PLAUR", + "PLOD1", + "PLOD2", + "PLOD3", + "PMEPA1", + "PMP22", + "POSTN", + "PPIB", + "PRRX1", + "PRSS2", + "PTHLH", + "PTX3", + "PVR", + "QSOX1", + "RGS4", + "RHOB", + "SAT1", + "SCG2", + "SDC1", + "SDC4", + "SERPINE1", + "SERPINE2", + "SERPINH1", + "SFRP1", + "SFRP4", + "SGCB", + "SGCD", + "SGCG", + "SLC6A8", + "SLIT2", + "SLIT3", + "SNAI2", + "SNTB1", + "SPARC", + "SPOCK1", + "SPP1", + "TAGLN", + "TFPI2", + "TGFB1", + "TGFBI", + "TGFBR3", + "TGM2", + "THBS1", + "THBS2", + "THY1", + "TIMP1", + "TIMP3", + "TNC", + "TNFAIP3", + "TNFRSF11B", + "TNFRSF12A", + "TPM1", + "TPM2", + "TPM4", + "VCAM1", + "VCAN", + "VEGFA", + "VEGFC", + "VIM", + "WIPF1", + "WNT5A" + ], + "HALLMARK_ESTROGEN_RESPONSE_EARLY": [ + "ABAT", + "ABCA3", + "ABHD2", + "ABLIM1", + "ADCY1", + "ADCY9", + "ADD3", + "AFF1", + "AKAP1", + "ALDH3B1", + "AMFR", + "ANXA9", + "AQP3", + "AR", + "AREG", + "ARL3", + "ASB13", + "B4GALT1", + "BAG1", + "BCL11B", + "BCL2", + "BHLHE40", + "BLVRB", + "CA12", + "CALB2", + "CALCR", + "CANT1", + "CBFA2T3", + "CCN5", + "CCND1", + "CD44", + "CELSR1", + "CELSR2", + "CHPT1", + "CISH", + "CLDN7", + "CLIC3", + "CXCL12", + "CYP26B1", + "DEPTOR", + "DHCR7", + "DHRS2", + "DHRS3", + "DLC1", + "DYNLT3", + "EEIG1", + "EGR3", + "ELF1", + "ELF3", + "ELOVL2", + "ELOVL5", + "ENDOD1", + "ESRP2", + "FARP1", + "FASN", + "FCMR", + "FDFT1", + "FHL2", + "FKBP4", + "FKBP5", + "FLNB", + "FOS", + "FOXC1", + "FRK", + "GAB2", + "GFRA1", + "GJA1", + "GLA", + "GREB1", + "HES1", + "HR", + "HSPB8", + "IGF1R", + "IGFBP4", + "IL17RB", + "IL6ST", + "INHBB", + "INPP5F", + "ISG20L2", + "ITPK1", + "JAK2", + "KAZN", + "KCNK15", + "KCNK5", + "KDM4B", + "KLF10", + "KLF4", + "KLK10", + "KRT13", + "KRT15", + "KRT18", + "KRT19", + "KRT8", + "LAD1", + "LRIG1", + "MAPT", + "MAST4", + "MED13L", + "MED24", + "MICB", + "MINDY1", + "MLPH", + "MPPED2", + "MREG", + "MSMB", + "MUC1", + "MYB", + "MYBBP1A", + "MYBL1", + "MYC", + "MYOF", + "NADSYN1", + "NAV2", + "NBL1", + "NCOR2", + "NHERF1", + "NPY1R", + "NRIP1", + "NXT1", + "OLFM1", + "OLFML3", + "OPN3", + "OVOL2", + "P2RY2", + "PAPSS2", + "PDLIM3", + "PDZK1", + "PEX11A", + "PGR", + "PLAAT3", + "PMAIP1", + "PODXL", + "PPIF", + "PRSS23", + "PTGES", + "RAB17", + "RAB31", + "RAPGEFL1", + "RARA", + "RASGRP1", + "RBBP8", + "REEP1", + "RET", + "RETREG1", + "RHOBTB3", + "RHOD", + "RPS6KA2", + "RRP12", + "SCARB1", + "SCNN1A", + "SEC14L2", + "SEMA3B", + "SFN", + "SH3BP5", + "SIAH2", + "SLC16A1", + "SLC19A2", + "SLC1A1", + "SLC1A4", + "SLC22A5", + "SLC24A3", + "SLC26A2", + "SLC27A2", + "SLC2A1", + "SLC37A1", + "SLC39A6", + "SLC7A2", + "SLC7A5", + "SNX24", + "SOX3", + "STC2", + "SULT2B1", + "SVIL", + "SYBU", + "SYNGR1", + "SYT12", + "TBC1D30", + "TFAP2C", + "TFF1", + "TFF3", + "TGIF2", + "TGM2", + "THSD4", + "TIAM1", + "TIPARP", + "TJP3", + "TMEM164", + "TMPRSS3", + "TOB1", + "TPBG", + "TPD52L1", + "TSKU", + "TTC39A", + "TUBB2B", + "UGCG", + "UNC119", + "WFS1", + "WWC1", + "XBP1", + "ZNF185" + ], + "HALLMARK_ESTROGEN_RESPONSE_LATE": [ + "ABCA3", + "ABHD2", + "ACOX2", + "ADD3", + "AFF1", + "AGR2", + "ALDH3A2", + "ALDH3B1", + "AMFR", + "ANXA9", + "AREG", + "ARL3", + "ASCL1", + "ASS1", + "ATP2B4", + "BAG1", + "BATF", + "BCL2", + "BLVRB", + "BTG3", + "CA12", + "CA2", + "CACNA2D2", + "CALCR", + "CAV1", + "CCN5", + "CCNA1", + "CCND1", + "CD44", + "CD9", + "CDC20", + "CDC6", + "CDH1", + "CELSR2", + "CHPT1", + "CHST8", + "CISH", + "CKB", + "CLIC3", + "COX6C", + "CPE", + "CXCL12", + "CXCL14", + "CYP26B1", + "CYP4F11", + "DCXR", + "DHCR7", + "DHRS2", + "DLG5", + "DNAJC1", + "DNAJC12", + "DUSP2", + "DYNLT3", + "EEIG1", + "EGR3", + "ELOVL5", + "EMP2", + "ETFB", + "FABP5", + "FARP1", + "FDFT1", + "FGFR3", + "FKBP4", + "FKBP5", + "FLNB", + "FOS", + "FOXC1", + "FRK", + "GAL", + "GALE", + "GFUS", + "GINS2", + "GJB3", + "GLA", + "GPER1", + "HMGCS2", + "HOMER2", + "HPRT1", + "HR", + "HSPA4L", + "HSPB8", + "ID2", + "IDH2", + "IGFBP4", + "IGSF1", + "IL17RB", + "IL6ST", + "IMPA2", + "ISG20", + "ITPK1", + "JAK1", + "JAK2", + "KCNK5", + "KIF20A", + "KLF4", + "KLK10", + "KLK11", + "KRT13", + "KRT19", + "LAMC2", + "LARGE1", + "LLGL2", + "LSR", + "LTF", + "MAPK13", + "MAPT", + "MDK", + "MEST", + "METTL3", + "MICB", + "MOCS2", + "MYB", + "MYOF", + "NAB2", + "NBL1", + "NCOR2", + "NHERF1", + "NMU", + "NPY1R", + "NRIP1", + "NXT1", + "OLFM1", + "OPN3", + "OVOL2", + "PAPSS2", + "PCP4", + "PDCD4", + "PDLIM3", + "PDZK1", + "PERP", + "PGR", + "PKP3", + "PLAAT3", + "PLAC1", + "PLK4", + "PLXNB1", + "PPIF", + "PRKAR2B", + "PRLR", + "PRSS23", + "PTGER3", + "PTGES", + "PTPN6", + "RAB31", + "RABEP1", + "RAPGEFL1", + "RBBP8", + "RET", + "RNASEH2A", + "RPS6KA2", + "S100A9", + "SCARB1", + "SCNN1A", + "SCUBE2", + "SEMA3B", + "SERPINA1", + "SERPINA3", + "SERPINA5", + "SFN", + "SGK1", + "SIAH2", + "SLC16A1", + "SLC1A4", + "SLC22A5", + "SLC24A3", + "SLC26A2", + "SLC27A2", + "SLC29A1", + "SLC2A8", + "SLC7A5", + "SNX10", + "SORD", + "SOX3", + "ST14", + "ST6GALNAC2", + "STIL", + "SULT2B1", + "TFAP2C", + "TFF1", + "TFF3", + "TFPI2", + "TH", + "TIAM1", + "TJP3", + "TMPRSS3", + "TNNC1", + "TOB1", + "TOP2A", + "TPBG", + "TPD52L1", + "TPSAB1", + "TRIM29", + "TSPAN13", + "TST", + "UGDH", + "UNC13B", + "WFS1", + "XBP1", + "XRCC3", + "ZFP36" + ], + "HALLMARK_FATTY_ACID_METABOLISM": [ + "AADAT", + "ACAA1", + "ACAA2", + "ACADL", + "ACADM", + "ACADS", + "ACADVL", + "ACAT2", + "ACO2", + "ACOT2", + "ACOT8", + "ACOX1", + "ACSL1", + "ACSL4", + "ACSL5", + "ACSM3", + "ACSS1", + "ADH1C", + "ADH7", + "ADIPOR2", + "ADSL", + "ALAD", + "ALDH1A1", + "ALDH3A1", + "ALDH3A2", + "ALDH9A1", + "ALDOA", + "AOC3", + "APEX1", + "AQP7", + "AUH", + "BCKDHB", + "BLVRA", + "BMPR1B", + "BPHL", + "CA2", + "CA4", + "CA6", + "CBR1", + "CBR3", + "CD1D", + "CD36", + "CEL", + "CIDEA", + "CPOX", + "CPT1A", + "CPT2", + "CRAT", + "CRYZ", + "CYP1A1", + "CYP4A11", + "CYP4A22", + "D2HGDH", + "DECR1", + "DHCR24", + "DLD", + "DLST", + "ECH1", + "ECHS1", + "ECI1", + "ECI2", + "EHHADH", + "ELOVL5", + "ENO2", + "ENO3", + "EPHX1", + "ERP29", + "ETFDH", + "FABP1", + "FABP2", + "FASN", + "FH", + "FMO1", + "G0S2", + "GABARAPL1", + "GAD2", + "GAPDHS", + "GCDH", + "GLUL", + "GPD1", + "GPD2", + "GRHPR", + "GSTZ1", + "H2AZ1", + "HADH", + "HADHB", + "HAO2", + "HCCS", + "HIBCH", + "HMGCL", + "HMGCS1", + "HMGCS2", + "HPGD", + "HSD17B10", + "HSD17B11", + "HSD17B4", + "HSD17B7", + "HSDL2", + "HSP90AA1", + "HSPH1", + "IDH1", + "IDH3B", + "IDH3G", + "IDI1", + "IL4I1", + "INMT", + "KMT5A", + "LDHA", + "LGALS1", + "LTC4S", + "MAOA", + "MCEE", + "MDH1", + "MDH2", + "ME1", + "METAP1", + "MGLL", + "MIF", + "MIX23", + "MLYCD", + "NBN", + "NCAPH2", + "NSDHL", + "NTHL1", + "ODC1", + "OSTC", + "PCBD1", + "PDHA1", + "PDHB", + "PPARA", + "PRDX6", + "PSME1", + "PTPRG", + "PTS", + "RAP1GDS1", + "RDH11", + "RDH16", + "REEP6", + "RETSAT", + "S100A10", + "SDHA", + "SDHC", + "SDHD", + "SERINC1", + "SLC22A5", + "SMS", + "SUCLA2", + "SUCLG1", + "SUCLG2", + "TDO2", + "TP53INP2", + "UBE2L6", + "UGDH", + "UROD", + "UROS", + "VNN1", + "XIST", + "YWHAH" + ], + "HALLMARK_G2M_CHECKPOINT": [ + "ABL1", + "AMD1", + "ARID4A", + "ATF5", + "ATRX", + "AURKA", + "AURKB", + "BARD1", + "BCL3", + "BIRC5", + "BRCA2", + "BUB1", + "BUB3", + "CASP8AP2", + "CBX1", + "CCNA2", + "CCNB2", + "CCND1", + "CCNF", + "CCNT1", + "CDC20", + "CDC25A", + "CDC25B", + "CDC27", + "CDC45", + "CDC6", + "CDC7", + "CDK1", + "CDK4", + "CDKN1B", + "CDKN2C", + "CDKN3", + "CENPA", + "CENPE", + "CENPF", + "CHAF1A", + "CHEK1", + "CHMP1A", + "CKS1B", + "CKS2", + "CTCF", + "CUL1", + "CUL3", + "CUL4A", + "CUL5", + "DBF4", + "DDX39A", + "DKC1", + "DMD", + "DR1", + "DTYMK", + "E2F1", + "E2F2", + "E2F3", + "E2F4", + "EFNA5", + "EGF", + "ESPL1", + "EWSR1", + "EXO1", + "EZH2", + "FANCC", + "FBXO5", + "FOXN3", + "G3BP1", + "GINS2", + "GSPT1", + "H2AX", + "H2AZ1", + "H2AZ2", + "H2BC12", + "HIF1A", + "HIRA", + "HMGA1", + "HMGB3", + "HMGN2", + "HMMR", + "HNRNPD", + "HNRNPU", + "HOXC10", + "HSPA8", + "HUS1", + "ILF3", + "INCENP", + "JPT1", + "KATNA1", + "KIF11", + "KIF15", + "KIF20B", + "KIF22", + "KIF23", + "KIF2C", + "KIF4A", + "KIF5B", + "KMT5A", + "KNL1", + "KPNA2", + "KPNB1", + "LBR", + "LIG3", + "LMNB1", + "MAD2L1", + "MAP3K20", + "MAPK14", + "MARCKS", + "MCM2", + "MCM3", + "MCM5", + "MCM6", + "MEIS1", + "MEIS2", + "MKI67", + "MNAT1", + "MT2A", + "MTF2", + "MYBL2", + "MYC", + "NASP", + "NCL", + "NDC80", + "NEK2", + "NOLC1", + "NOTCH2", + "NSD2", + "NUMA1", + "NUP50", + "NUP98", + "NUSAP1", + "ODC1", + "ODF2", + "ORC5", + "ORC6", + "PAFAH1B1", + "PBK", + "PDS5B", + "PLK1", + "PLK4", + "PML", + "POLA2", + "POLE", + "POLQ", + "PRC1", + "PRIM2", + "PRMT5", + "PRP4K", + "PTTG1", + "PTTG3P", + "PURA", + "RACGAP1", + "RAD21", + "RAD23B", + "RAD54L", + "RASAL2", + "RBL1", + "RBM14", + "RPA2", + "RPS6KA5", + "SAP30", + "SFPQ", + "SLC12A2", + "SLC38A1", + "SLC7A1", + "SLC7A5", + "SMAD3", + "SMARCC1", + "SMC1A", + "SMC2", + "SMC4", + "SNRPD1", + "SQLE", + "SRSF1", + "SRSF10", + "SRSF2", + "SS18", + "STAG1", + "STIL", + "STMN1", + "SUV39H1", + "SYNCRIP", + "TACC3", + "TENT4A", + "TFDP1", + "TGFB1", + "TLE3", + "TMPO", + "TNPO2", + "TOP1", + "TOP2A", + "TPX2", + "TRA2B", + "TRAIP", + "TROAP", + "TTK", + "UBE2C", + "UBE2S", + "UCK2", + "UPF1", + "WRN", + "XPO1", + "YTHDC1" + ], + "HALLMARK_GLYCOLYSIS": [ + "ABCB6", + "ADORA2B", + "AGL", + "AGRN", + "AK3", + "AK4", + "AKR1A1", + "ALDH7A1", + "ALDH9A1", + "ALDOA", + "ALDOB", + "ALG1", + "ANG", + "ANGPTL4", + "ANKZF1", + "ARPP19", + "ARTN", + "AURKA", + "B3GALT6", + "B3GAT1", + "B3GAT3", + "B3GNT3", + "B4GALT1", + "B4GALT2", + "B4GALT4", + "B4GALT7", + "BIK", + "BPNT1", + "CACNA1H", + "CAPN5", + "CASP6", + "CD44", + "CDK1", + "CENPA", + "CHPF", + "CHPF2", + "CHST1", + "CHST12", + "CHST2", + "CHST4", + "CHST6", + "CITED2", + "CLDN3", + "CLDN9", + "CLN6", + "COG2", + "COL5A1", + "COPB2", + "CTH", + "CXCR4", + "CYB5A", + "DCN", + "DDIT4", + "DEPDC1", + "DLD", + "DPYSL4", + "DSC2", + "ECD", + "EFNA3", + "EGFR", + "EGLN3", + "ELF3", + "ENO1", + "ENO2", + "ERO1A", + "EXT1", + "EXT2", + "FAM162A", + "FBP2", + "FKBP4", + "FUT8", + "G6PD", + "GAL3ST1", + "GALE", + "GALK1", + "GALK2", + "GAPDHS", + "GCLC", + "GFPT1", + "GFUS", + "GLCE", + "GLRX", + "GMPPA", + "GMPPB", + "GNE", + "GNPDA1", + "GOT1", + "GOT2", + "GPC1", + "GPC3", + "GPC4", + "GPR87", + "GUSB", + "GYS1", + "GYS2", + "HAX1", + "HDLBP", + "HK2", + "HMMR", + "HOMER1", + "HS2ST1", + "HS6ST2", + "HSPA5", + "IDH1", + "IDUA", + "IER3", + "IGFBP3", + "IL13RA1", + "IRS2", + "ISG20", + "KDELR3", + "KIF20A", + "KIF2A", + "LCT", + "LDHA", + "LDHC", + "LHPP", + "LHX9", + "MDH1", + "MDH2", + "ME1", + "ME2", + "MED24", + "MERTK", + "MET", + "MIF", + "MIOX", + "MPI", + "MXI1", + "NANP", + "NASP", + "NDST3", + "NDUFV3", + "NOL3", + "NSDHL", + "NT5E", + "P4HA1", + "P4HA2", + "PAM", + "PAXIP1", + "PC", + "PDK3", + "PFKFB1", + "PFKP", + "PGAM1", + "PGAM2", + "PGK1", + "PGLS", + "PGM2", + "PHKA2", + "PKM", + "PKP2", + "PLOD1", + "PLOD2", + "PMM2", + "POLR3K", + "PPFIA4", + "PPIA", + "PPP2CB", + "PRPS1", + "PSMC4", + "PYGB", + "PYGL", + "QSOX1", + "RARS1", + "RBCK1", + "RPE", + "RRAGD", + "SAP30", + "SDC1", + "SDC2", + "SDC3", + "SDHC", + "SLC16A3", + "SLC25A10", + "SLC25A13", + "SLC35A3", + "SLC37A4", + "SOD1", + "SOX9", + "SPAG4", + "SRD5A3", + "STC1", + "STC2", + "STMN1", + "TALDO1", + "TFF3", + "TGFA", + "TGFBI", + "TKTL1", + "TPBG", + "TPI1", + "TPST1", + "TXN", + "UGP2", + "VCAN", + "VEGFA", + "VLDLR", + "XYLT2", + "ZNF292" + ], + "HALLMARK_HEDGEHOG_SIGNALING": [ + "ACHE", + "ADGRG1", + "AMOT", + "CDK5R1", + "CDK6", + "CELSR1", + "CNTFR", + "CRMP1", + "DPYSL2", + "ETS2", + "GLI1", + "HEY1", + "HEY2", + "L1CAM", + "LDB1", + "MYH9", + "NF1", + "NKX6-1", + "NRCAM", + "NRP1", + "NRP2", + "OPHN1", + "PLG", + "PML", + "PTCH1", + "RASA1", + "RTN1", + "SCG2", + "SHH", + "SLIT1", + "THY1", + "TLE1", + "TLE3", + "UNC5C", + "VEGFA", + "VLDLR" + ], + "HALLMARK_HEME_METABOLISM": [ + "ABCB6", + "ABCG2", + "ACKR1", + "ACP5", + "ACSL6", + "ADD1", + "ADD2", + "ADIPOR1", + "AGPAT4", + "AHSP", + "ALAD", + "ALAS2", + "ALDH1L1", + "ALDH6A1", + "ANK1", + "AQP3", + "ARHGEF12", + "ARL2BP", + "ASNS", + "ATG4A", + "ATP6V0A1", + "BACH1", + "BCAM", + "BLVRA", + "BLVRB", + "BMP2K", + "BNIP3L", + "BPGM", + "BSG", + "BTG2", + "BTRC", + "C3", + "CA1", + "CA2", + "CAST", + "CAT", + "CCDC28A", + "CCND3", + "CDC27", + "CDR2", + "CIR1", + "CLCN3", + "CLIC2", + "CPOX", + "CROCCP2", + "CTNS", + "CTSB", + "CTSE", + "DAAM1", + "DCAF10", + "DCAF11", + "DCUN1D1", + "DMTN", + "E2F2", + "EIF2AK1", + "ELL2", + "ENDOD1", + "EPB41", + "EPB42", + "EPOR", + "ERMAP", + "EZH1", + "FBXO34", + "FBXO7", + "FBXO9", + "FECH", + "FN3K", + "FOXJ2", + "FOXO3", + "FTCD", + "GAPVD1", + "GATA1", + "GCLC", + "GCLM", + "GDE1", + "GLRX5", + "GMPS", + "GYPA", + "GYPB", + "GYPC", + "GYPE", + "H1-0", + "H4C3", + "HAGH", + "HBB", + "HBBP1", + "HBD", + "HBQ1", + "HBZ", + "HDGF", + "HEBP1", + "HMBS", + "HTATIP2", + "HTRA2", + "ICAM4", + "IGSF3", + "ISCA1", + "KAT2B", + "KDM7A", + "KEL", + "KHNYN", + "KLF1", + "KLF3", + "LAMP2", + "LMO2", + "LPIN2", + "LRP10", + "MAP2K3", + "MARCHF2", + "MARCHF8", + "MARK3", + "MBOAT2", + "MFHAS1", + "MGST3", + "MINPP1", + "MKRN1", + "MOCOS", + "MOSPD1", + "MPP1", + "MXI1", + "MYL4", + "NARF", + "NCOA4", + "NEK7", + "NFE2", + "NFE2L1", + "NNT", + "NR3C1", + "NUDT4", + "OPTN", + "OSBP2", + "P4HA2", + "PC", + "PDZK1IP1", + "PGLS", + "PICALM", + "PIGQ", + "PPOX", + "PPP2R5B", + "PRDX2", + "PSMD9", + "RAD23A", + "RANBP10", + "RAP1GAP", + "RBM38", + "RBM5", + "RCL1", + "RHAG", + "RHCE", + "RHD", + "RIOK3", + "RNF123", + "RNF19A", + "SDCBP", + "SEC14L1", + "SELENBP1", + "SIDT2", + "SLC10A3", + "SLC11A2", + "SLC22A4", + "SLC25A37", + "SLC25A38", + "SLC2A1", + "SLC30A1", + "SLC30A10", + "SLC4A1", + "SLC66A2", + "SLC6A8", + "SLC6A9", + "SLC7A11", + "SMOX", + "SNCA", + "SPTA1", + "SPTB", + "SYNJ1", + "TAL1", + "TCEA1", + "TENT5C", + "TFDP2", + "TFRC", + "TMCC2", + "TMEM9B", + "TNRC6B", + "TNS1", + "TOP1", + "TRAK2", + "TRIM10", + "TRIM58", + "TSPAN5", + "TSPO2", + "TYR", + "UBAC1", + "UCP2", + "UROD", + "UROS", + "USP15", + "VEZF1", + "XK", + "XPO7", + "YPEL5" + ], + "HALLMARK_HYPOXIA": [ + "ACKR3", + "ADM", + "ADORA2B", + "AK4", + "AKAP12", + "ALDOA", + "ALDOB", + "ALDOC", + "AMPD3", + "ANGPTL4", + "ANKZF1", + "ANXA2", + "ATF3", + "ATP7A", + "B3GALT6", + "B4GALNT2", + "BCAN", + "BCL2", + "BGN", + "BHLHE40", + "BNIP3L", + "BRS3", + "BTG1", + "CA12", + "CASP6", + "CAV1", + "CAVIN1", + "CAVIN3", + "CCN1", + "CCN2", + "CCN5", + "CCNG2", + "CDKN1A", + "CDKN1B", + "CDKN1C", + "CHST2", + "CHST3", + "CITED2", + "COL5A1", + "CP", + "CSRP2", + "CXCR4", + "DCN", + "DDIT3", + "DDIT4", + "DPYSL4", + "DTNA", + "DUSP1", + "EDN2", + "EFNA1", + "EFNA3", + "EGFR", + "ENO1", + "ENO2", + "ENO3", + "ERO1A", + "ERRFI1", + "ETS1", + "EXT1", + "F3", + "FAM162A", + "FBP1", + "FOS", + "FOSL2", + "FOXO3", + "GAA", + "GALK1", + "GAPDH", + "GAPDHS", + "GBE1", + "GCK", + "GCNT2", + "GLRX", + "GPC1", + "GPC3", + "GPC4", + "GPI", + "GRHPR", + "GYS1", + "HAS1", + "HDLBP", + "HEXA", + "HK1", + "HK2", + "HMOX1", + "HOXB9", + "HS3ST1", + "HSPA5", + "IDS", + "IER3", + "IGFBP1", + "IGFBP3", + "IL6", + "ILVBL", + "INHA", + "IRS2", + "ISG20", + "JMJD6", + "JUN", + "KDELR3", + "KDM3A", + "KIF5A", + "KLF6", + "KLF7", + "KLHL24", + "LALBA", + "LARGE1", + "LDHA", + "LDHC", + "LOX", + "LXN", + "MAFF", + "MAP3K1", + "MIF", + "MT1E", + "MT2A", + "MXI1", + "MYH9", + "NAGK", + "NCAN", + "NDRG1", + "NDST1", + "NDST2", + "NEDD4L", + "NFIL3", + "NOCT", + "NR3C1", + "P4HA1", + "P4HA2", + "PAM", + "PCK1", + "PDGFB", + "PDK1", + "PDK3", + "PFKFB3", + "PFKL", + "PFKP", + "PGAM2", + "PGF", + "PGK1", + "PGM1", + "PGM2", + "PHKG1", + "PIM1", + "PKLR", + "PKP1", + "PLAC8", + "PLAUR", + "PLIN2", + "PNRC1", + "PPARGC1A", + "PPFIA4", + "PPP1R15A", + "PPP1R3C", + "PRDX5", + "PRKCA", + "PYGM", + "RBPJ", + "RORA", + "RRAGD", + "S100A4", + "SAP30", + "SCARB1", + "SDC2", + "SDC3", + "SDC4", + "SELENBP1", + "SERPINE1", + "SIAH2", + "SLC25A1", + "SLC2A1", + "SLC2A3", + "SLC2A5", + "SLC37A4", + "SLC6A6", + "SRPX", + "STBD1", + "STC1", + "STC2", + "SULT2B1", + "TES", + "TGFB3", + "TGFBI", + "TGM2", + "TIPARP", + "TKTL1", + "TMEM45A", + "TNFAIP3", + "TPBG", + "TPD52", + "TPI1", + "TPST2", + "UGP2", + "VEGFA", + "VHL", + "VLDLR", + "WSB1", + "XPNPEP1", + "ZFP36", + "ZNF292" + ], + "HALLMARK_IL2_STAT5_SIGNALING": [ + "ABCB1", + "ADAM19", + "AGER", + "AHCY", + "AHNAK", + "AHR", + "ALCAM", + "AMACR", + "ANXA4", + "APLP1", + "ARL4A", + "BATF", + "BATF3", + "BCL2", + "BCL2L1", + "BHLHE40", + "BMP2", + "BMPR2", + "CA2", + "CAPG", + "CAPN3", + "CASP3", + "CCND2", + "CCND3", + "CCNE1", + "CCR4", + "CD44", + "CD48", + "CD79B", + "CD81", + "CD83", + "CD86", + "CDC42SE2", + "CDC6", + "CDCP1", + "CDKN1C", + "CISH", + "CKAP4", + "COCH", + "COL6A1", + "CSF1", + "CSF2", + "CST7", + "CTLA4", + "CTSZ", + "CXCL10", + "CYFIP1", + "DCPS", + "DENND5A", + "DHRS3", + "DRC1", + "ECM1", + "EEF1AKMT1", + "EMP1", + "ENO3", + "ENPP1", + "EOMES", + "ETFBKMT", + "ETV4", + "F2RL2", + "FAH", + "FGL2", + "FLT3LG", + "FURIN", + "GABARAPL1", + "GADD45B", + "GALM", + "GATA1", + "GBP4", + "GLIPR2", + "GPR65", + "GPR83", + "GPX4", + "GSTO1", + "GUCY1B1", + "HIPK2", + "HK2", + "HOPX", + "HUWE1", + "HYCC2", + "ICOS", + "IFITM3", + "IFNGR1", + "IGF1R", + "IGF2R", + "IKZF2", + "IKZF4", + "IL10", + "IL10RA", + "IL13", + "IL18R1", + "IL1R2", + "IL1RL1", + "IL2RA", + "IL2RB", + "IL3RA", + "IL4R", + "IRF4", + "IRF6", + "IRF8", + "ITGA6", + "ITGAE", + "ITGAV", + "ITIH5", + "KLF6", + "LCLAT1", + "LIF", + "LRIG1", + "LRRC8C", + "LTB", + "MAFF", + "MAP3K8", + "MAP6", + "MAPKAPK2", + "MUC1", + "MXD1", + "MYC", + "MYO1C", + "MYO1E", + "NCOA3", + "NCS1", + "NDRG1", + "NFIL3", + "NFKBIZ", + "NOP2", + "NRP1", + "NT5E", + "ODC1", + "P2RX4", + "P4HA1", + "PDCD2L", + "PENK", + "PHLDA1", + "PHTF2", + "PIM1", + "PLAGL1", + "PLEC", + "PLIN2", + "PLPP1", + "PLSCR1", + "PNP", + "POU2F1", + "PRAF2", + "PRKCH", + "PRNP", + "PTCH1", + "PTGER2", + "PTH1R", + "PTRH2", + "PUS1", + "RABGAP1L", + "RGS16", + "RHOB", + "RHOH", + "RNH1", + "RORA", + "RRAGD", + "S100A1", + "SCN9A", + "SELL", + "SELP", + "SERPINB6", + "SERPINC1", + "SH3BGRL2", + "SHE", + "SLC1A5", + "SLC29A2", + "SLC2A3", + "SLC39A8", + "SMPDL3A", + "SNX14", + "SNX9", + "SOCS1", + "SOCS2", + "SPP1", + "SPRED2", + "SPRY4", + "ST3GAL4", + "SWAP70", + "SYNGR2", + "SYT11", + "TGM2", + "TIAM1", + "TLR7", + "TNFRSF18", + "TNFRSF1B", + "TNFRSF21", + "TNFRSF4", + "TNFRSF8", + "TNFRSF9", + "TNFSF10", + "TNFSF11", + "TRAF1", + "TTC39B", + "TWSG1", + "UCK2", + "UMPS", + "WLS", + "XBP1" + ], + "HALLMARK_IL6_JAK_STAT3_SIGNALING": [ + "A2M", + "ACVR1B", + "ACVRL1", + "BAK1", + "CBL", + "CCL7", + "CCR1", + "CD14", + "CD36", + "CD38", + "CD44", + "CD9", + "CNTFR", + "CRLF2", + "CSF1", + "CSF2", + "CSF2RA", + "CSF2RB", + "CSF3R", + "CXCL1", + "CXCL10", + "CXCL11", + "CXCL13", + "CXCL3", + "CXCL9", + "DNTT", + "EBI3", + "FAS", + "GRB2", + "HAX1", + "HMOX1", + "IFNAR1", + "IFNGR1", + "IFNGR2", + "IL10RB", + "IL12RB1", + "IL13RA1", + "IL15RA", + "IL17RA", + "IL17RB", + "IL18R1", + "IL1B", + "IL1R1", + "IL1R2", + "IL2RA", + "IL2RG", + "IL3RA", + "IL4R", + "IL6", + "IL6ST", + "IL7", + "IL9R", + "INHBE", + "IRF1", + "IRF9", + "ITGA4", + "ITGB3", + "JUN", + "LEPR", + "LTB", + "LTBR", + "MAP3K8", + "MYD88", + "OSMR", + "PDGFC", + "PF4", + "PIK3R5", + "PIM1", + "PLA2G2A", + "PTPN1", + "PTPN11", + "PTPN2", + "REG1A", + "SOCS1", + "SOCS3", + "STAM2", + "STAT1", + "STAT2", + "STAT3", + "TGFB1", + "TLR2", + "TNF", + "TNFRSF12A", + "TNFRSF1A", + "TNFRSF1B", + "TNFRSF21", + "TYK2" + ], + "HALLMARK_INFLAMMATORY_RESPONSE": [ + "ABCA1", + "ABI1", + "ACVR1B", + "ACVR2A", + "ADGRE1", + "ADM", + "ADORA2B", + "ADRM1", + "AHR", + "APLNR", + "AQP9", + "ATP2A2", + "ATP2B1", + "ATP2C1", + "AXL", + "BDKRB1", + "BEST1", + "BST2", + "BTG2", + "C3AR1", + "C5AR1", + "CALCRL", + "CCL17", + "CCL2", + "CCL20", + "CCL22", + "CCL24", + "CCL5", + "CCL7", + "CCR7", + "CCRL2", + "CD14", + "CD40", + "CD48", + "CD55", + "CD69", + "CD70", + "CD82", + "CDKN1A", + "CHST2", + "CLEC5A", + "CMKLR1", + "CSF1", + "CSF3", + "CSF3R", + "CX3CL1", + "CXCL10", + "CXCL11", + "CXCL6", + "CXCL8", + "CXCL9", + "CXCR6", + "CYBB", + "DCBLD2", + "EBI3", + "EDN1", + "EIF2AK2", + "EMP3", + "EREG", + "F3", + "FFAR2", + "FPR1", + "FZD5", + "GABBR1", + "GCH1", + "GNA15", + "GNAI3", + "GP1BA", + "GPC3", + "GPR132", + "GPR183", + "HAS2", + "HBEGF", + "HIF1A", + "HPN", + "HRH1", + "ICAM1", + "ICAM4", + "ICOSLG", + "IFITM1", + "IFNAR1", + "IFNGR2", + "IL10", + "IL10RA", + "IL12B", + "IL15", + "IL15RA", + "IL18", + "IL18R1", + "IL18RAP", + "IL1A", + "IL1B", + "IL1R1", + "IL2RB", + "IL4R", + "IL6", + "IL7R", + "INHBA", + "IRAK2", + "IRF1", + "IRF7", + "ITGA5", + "ITGB3", + "ITGB8", + "KCNA3", + "KCNJ2", + "KCNMB2", + "KIF1B", + "KLF6", + "LAMP3", + "LCK", + "LCP2", + "LDLR", + "LIF", + "LPAR1", + "LTA", + "LY6E", + "LYN", + "MARCO", + "MEFV", + "MEP1A", + "MET", + "MMP14", + "MSR1", + "MXD1", + "MYC", + "NAMPT", + "NDP", + "NFKB1", + "NFKBIA", + "NLRP3", + "NMI", + "NMUR1", + "NOD2", + "NPFFR2", + "OLR1", + "OPRK1", + "OSM", + "OSMR", + "P2RX4", + "P2RX7", + "P2RY2", + "PCDH7", + "PDE4B", + "PDPN", + "PIK3R5", + "PLAUR", + "PROK2", + "PSEN1", + "PTAFR", + "PTGER2", + "PTGER4", + "PTGIR", + "PTPRE", + "PVR", + "RAF1", + "RASGRP1", + "RELA", + "RGS1", + "RGS16", + "RHOG", + "RIPK2", + "RNF144B", + "ROS1", + "RTP4", + "SCARF1", + "SCN1B", + "SELE", + "SELENOS", + "SELL", + "SEMA4D", + "SERPINE1", + "SGMS2", + "SLAMF1", + "SLC11A2", + "SLC1A2", + "SLC28A2", + "SLC31A1", + "SLC31A2", + "SLC4A4", + "SLC7A1", + "SLC7A2", + "SPHK1", + "SRI", + "STAB1", + "TACR1", + "TACR3", + "TAPBP", + "TIMP1", + "TLR1", + "TLR2", + "TLR3", + "TNFAIP6", + "TNFRSF1B", + "TNFRSF9", + "TNFSF10", + "TNFSF15", + "TNFSF9", + "TPBG", + "VIP" + ], + "HALLMARK_INTERFERON_ALPHA_RESPONSE": [ + "ADAR", + "B2M", + "BATF2", + "BST2", + "C1S", + "CASP1", + "CASP8", + "CCRL2", + "CD47", + "CD74", + "CMPK2", + "CMTR1", + "CNP", + "CSF1", + "CXCL10", + "CXCL11", + "DDX60", + "DHX58", + "EIF2AK2", + "ELF1", + "EPSTI1", + "GBP2", + "GBP4", + "GMPR", + "HELZ2", + "HERC6", + "HLA-C", + "IFI27", + "IFI30", + "IFI35", + "IFI44", + "IFI44L", + "IFIH1", + "IFIT2", + "IFIT3", + "IFITM1", + "IFITM2", + "IFITM3", + "IL15", + "IL4R", + "IL7", + "IRF1", + "IRF2", + "IRF7", + "IRF9", + "ISG15", + "ISG20", + "LAMP3", + "LAP3", + "LGALS3BP", + "LPAR6", + "LY6E", + "MOV10", + "MVB12A", + "MX1", + "NCOA7", + "NMI", + "NUB1", + "OAS1", + "OASL", + "OGFR", + "PARP12", + "PARP14", + "PARP9", + "PLSCR1", + "PNPT1", + "PROCR", + "PSMA3", + "PSMB8", + "PSMB9", + "PSME1", + "PSME2", + "RIPK2", + "RNF31", + "RSAD2", + "RTP4", + "SAMD9", + "SAMD9L", + "SELL", + "SLC25A28", + "SP110", + "STAT2", + "TAP1", + "TDRD7", + "TENT5A", + "TMEM140", + "TRAFD1", + "TRIM14", + "TRIM21", + "TRIM25", + "TRIM26", + "TRIM5", + "TXNIP", + "UBA7", + "UBE2L6", + "USP18", + "WARS1" + ], + "HALLMARK_INTERFERON_GAMMA_RESPONSE": [ + "ADAR", + "APOL6", + "ARID5B", + "ARL4A", + "AUTS2", + "B2M", + "BANK1", + "BATF2", + "BPGM", + "BST2", + "BTG1", + "C1R", + "C1S", + "CASP1", + "CASP3", + "CASP4", + "CASP7", + "CASP8", + "CCL2", + "CCL5", + "CCL7", + "CD274", + "CD38", + "CD40", + "CD69", + "CD74", + "CD86", + "CDKN1A", + "CFB", + "CFH", + "CIITA", + "CMKLR1", + "CMPK2", + "CMTR1", + "CSF2RB", + "CXCL10", + "CXCL11", + "CXCL9", + "DDX60", + "DHX58", + "EIF2AK2", + "EIF4E3", + "EPSTI1", + "FAS", + "FCGR1A", + "FGL2", + "FPR1", + "GBP4", + "GBP6", + "GCH1", + "GPR18", + "GZMA", + "HELZ2", + "HERC6", + "HIF1A", + "HLA-A", + "HLA-B", + "HLA-DMA", + "HLA-DQA1", + "HLA-DRB1", + "HLA-G", + "ICAM1", + "IDO1", + "IFI27", + "IFI30", + "IFI35", + "IFI44", + "IFI44L", + "IFIH1", + "IFIT1", + "IFIT2", + "IFIT3", + "IFITM2", + "IFITM3", + "IFNAR2", + "IL10RA", + "IL15", + "IL15RA", + "IL18BP", + "IL2RB", + "IL4R", + "IL6", + "IL7", + "IRF1", + "IRF2", + "IRF4", + "IRF5", + "IRF7", + "IRF8", + "IRF9", + "ISG15", + "ISG20", + "ISOC1", + "ITGB7", + "JAK2", + "KLRK1", + "LAP3", + "LATS2", + "LCP2", + "LGALS3BP", + "LY6E", + "LYSMD2", + "MARCHF1", + "MT2A", + "MTHFD2", + "MVP", + "MX1", + "MX2", + "MYD88", + "NAMPT", + "NCOA3", + "NFKB1", + "NFKBIA", + "NLRC5", + "NMI", + "NOD1", + "NUP93", + "OAS2", + "OAS3", + "OASL", + "OGFR", + "P2RY14", + "PARP12", + "PARP14", + "PDE4B", + "PELI1", + "PFKP", + "PIM1", + "PLA2G4A", + "PLSCR1", + "PML", + "PNP", + "PNPT1", + "PSMA2", + "PSMA3", + "PSMB10", + "PSMB2", + "PSMB8", + "PSMB9", + "PSME1", + "PSME2", + "PTGS2", + "PTPN1", + "PTPN2", + "PTPN6", + "RAPGEF6", + "RBCK1", + "RIGI", + "RIPK1", + "RIPK2", + "RNF213", + "RNF31", + "RSAD2", + "RTP4", + "SAMD9L", + "SAMHD1", + "SECTM1", + "SELP", + "SERPING1", + "SLAMF7", + "SLC25A28", + "SOCS1", + "SOCS3", + "SOD2", + "SP110", + "SPPL2A", + "SRI", + "SSPN", + "ST3GAL5", + "ST8SIA4", + "STAT1", + "STAT2", + "STAT3", + "STAT4", + "TAP1", + "TAPBP", + "TDRD7", + "TMT1B", + "TNFAIP2", + "TNFAIP3", + "TNFAIP6", + "TNFSF10", + "TOR1B", + "TRAFD1", + "TRIM14", + "TRIM21", + "TRIM25", + "TRIM26", + "TXNIP", + "UBE2L6", + "UPP1", + "USP18", + "VAMP5", + "VAMP8", + "VCAM1", + "WARS1", + "XAF1", + "XCL1", + "ZBP1", + "ZNFX1" + ], + "HALLMARK_KRAS_SIGNALING_DN": [ + "ABCB11", + "ABCG4", + "ACTC1", + "ADRA2C", + "AKR1B10", + "ALOX12B", + "AMBN", + "ARHGDIG", + "ARPP21", + "ASB7", + "ATP4A", + "ATP6V1B1", + "BARD1", + "BMPR1B", + "BRDT", + "BTG2", + "C5", + "CACNA1F", + "CACNG1", + "CALCB", + "CALML5", + "CAMK1D", + "CAPN9", + "CCDC106", + "CCNA1", + "CCR8", + "CD207", + "CD40LG", + "CD80", + "CDH16", + "CDKAL1", + "CELSR2", + "CHRNG", + "CHST2", + "CKM", + "CLDN16", + "CLDN8", + "CLPS", + "CLSTN3", + "CNTFR", + "COL2A1", + "COPZ2", + "COQ8A", + "CPA2", + "CPB1", + "CPEB3", + "CYP11B2", + "CYP39A1", + "DCC", + "DLK2", + "DTNB", + "EDAR", + "EDN1", + "EDN2", + "EFHD1", + "EGF", + "ENTPD7", + "EPHA5", + "FGF16", + "FGF22", + "FGFR3", + "FGGY", + "FSHB", + "GAMT", + "GDNF", + "GP1BA", + "GP2", + "GPR19", + "GPR3", + "GPRC5C", + "GRID2", + "GTF3C5", + "HNF1A", + "HSD11B2", + "HTR1B", + "HTR1D", + "IDUA", + "IFI44L", + "IFNG", + "IGFBP2", + "IL12B", + "IL5", + "INSL5", + "IRS4", + "ITGB1BP2", + "ITIH3", + "KCND1", + "KCNE2", + "KCNMB1", + "KCNN1", + "KCNQ2", + "KLHDC8A", + "KLK7", + "KLK8", + "KMT2D", + "KRT1", + "KRT13", + "KRT15", + "KRT4", + "KRT5", + "LFNG", + "LGALS7", + "LYPD3", + "MACROH2A2", + "MAGIX", + "MAST3", + "MEFV", + "MFSD6", + "MSH5", + "MTHFR", + "MX1", + "MYH7", + "MYO15A", + "MYOT", + "NGB", + "NOS1", + "NPHS1", + "NPY4R", + "NR4A2", + "NR6A1", + "NRIP2", + "NTF3", + "NUDT11", + "OXT", + "P2RX6", + "P2RY4", + "PAX3", + "PAX4", + "PCDHB1", + "PDCD1", + "PDE6B", + "PDK2", + "PKP1", + "PLAG1", + "PNMT", + "PRKN", + "PRODH", + "PROP1", + "PTGFR", + "PTPRJ", + "RGS11", + "RIBC2", + "RSAD2", + "RYR1", + "RYR2", + "SCGB1A1", + "SCN10A", + "SELENOP", + "SERPINA10", + "SERPINB2", + "SGK1", + "SHOX2", + "SIDT1", + "SKIL", + "SLC12A3", + "SLC16A7", + "SLC25A23", + "SLC29A3", + "SLC30A3", + "SLC38A3", + "SLC5A5", + "SLC6A14", + "SLC6A3", + "SMPX", + "SNCB", + "SNN", + "SOX10", + "SPHK2", + "SPRR3", + "SPTBN2", + "SSTR4", + "STAG3", + "SYNPO", + "TAS2R4", + "TCF7L1", + "TCL1A", + "TENM2", + "TENT5C", + "TEX15", + "TFAP2B", + "TFCP2L1", + "TFF2", + "TG", + "TGFB2", + "TGM1", + "THNSL2", + "THRB", + "TLX1", + "TNNI3", + "TSHB", + "UGT2B17", + "UPK3B", + "VPREB1", + "VPS50", + "WNT16", + "YBX2", + "YPEL1", + "ZBTB16", + "ZC2HC1C", + "ZNF112" + ], + "HALLMARK_KRAS_SIGNALING_UP": [ + "ABCB1", + "ACE", + "ADAM17", + "ADAM8", + "ADAMDEC1", + "ADGRA2", + "ADGRL4", + "AKAP12", + "AKT2", + "ALDH1A2", + "ALDH1A3", + "AMMECR1", + "ANGPTL4", + "ANKH", + "ANO1", + "ANXA10", + "APOD", + "ARG1", + "ATG10", + "AVL9", + "BIRC3", + "BMP2", + "BPGM", + "BTBD3", + "BTC", + "C3AR1", + "CA2", + "CAB39L", + "CBL", + "CBR4", + "CBX8", + "CCL20", + "CCND2", + "CCSER2", + "CD37", + "CDADC1", + "CFB", + "CFH", + "CFHR2", + "CIDEA", + "CLEC4A", + "CMKLR1", + "CPE", + "CROT", + "CSF2", + "CSF2RA", + "CTSS", + "CXCL10", + "CXCR4", + "DCBLD2", + "DNMBP", + "DOCK2", + "DUSP6", + "EMP1", + "ENG", + "EPB41L3", + "EPHB2", + "EREG", + "ERO1A", + "ETS1", + "ETV1", + "ETV4", + "ETV5", + "EVI5", + "F13A1", + "F2RL1", + "FBXO4", + "FCER1G", + "FGF9", + "FLT4", + "FUCA1", + "G0S2", + "GABRA3", + "GADD45G", + "GALNT3", + "GFPT2", + "GLRX", + "GNG11", + "GPNMB", + "GPRC5B", + "GUCY1A1", + "GYPC", + "H2BC3", + "HBEGF", + "HDAC9", + "HKDC1", + "HOXD11", + "HSD11B1", + "ID2", + "IGF2", + "IGFBP3", + "IKZF1", + "IL10RA", + "IL1B", + "IL1RL2", + "IL2RG", + "IL33", + "IL7R", + "INHBA", + "IRF8", + "ITGA2", + "ITGB2", + "ITGBL1", + "JUP", + "KCNN4", + "KIF5C", + "KLF4", + "LAPTM5", + "LAT2", + "LCP1", + "LIF", + "LY96", + "MAFB", + "MALL", + "MAP3K1", + "MAP4K1", + "MAP7", + "MMD", + "MMP10", + "MMP11", + "MMP9", + "MPZL2", + "MTMR10", + "MYCN", + "NAP1L2", + "NGF", + "NIN", + "NR0B2", + "NR1H4", + "NRP1", + "PCP4", + "PCSK1N", + "PDCD1LG2", + "PECAM1", + "PEG3", + "PIGR", + "PLAT", + "PLAU", + "PLAUR", + "PLEK2", + "PLVAP", + "PPBP", + "PPP1R15A", + "PRDM1", + "PRELID3B", + "PRKG2", + "PRRX1", + "PSMB8", + "PTBP2", + "PTCD2", + "PTGS2", + "PTPRR", + "RABGAP1L", + "RBM4", + "RBP4", + "RELN", + "RETN", + "RGS16", + "SATB1", + "SCG3", + "SCG5", + "SCN1B", + "SDCCAG8", + "SEMA3B", + "SERPINA3", + "SLPI", + "SNAP25", + "SNAP91", + "SOX9", + "SPARCL1", + "SPON1", + "SPP1", + "SPRY2", + "ST6GAL1", + "STRN", + "TFPI", + "TLR8", + "TMEM100", + "TMEM158", + "TMEM176A", + "TMEM176B", + "TNFAIP3", + "TNFRSF1B", + "TNNT2", + "TOR1AIP2", + "TPH1", + "TRAF1", + "TRIB1", + "TRIB2", + "TSPAN1", + "TSPAN13", + "TSPAN7", + "USH1C", + "USP12", + "VWA5A", + "WDR33", + "WNT7A", + "YRDC", + "ZNF277", + "ZNF639" + ], + "HALLMARK_MITOTIC_SPINDLE": [ + "ABI1", + "ABL1", + "ABR", + "ACTN4", + "AKAP13", + "ALMS1", + "ALS2", + "ANLN", + "APC", + "ARAP3", + "ARF6", + "ARFGEF1", + "ARFIP2", + "ARHGAP10", + "ARHGAP27", + "ARHGAP29", + "ARHGAP4", + "ARHGAP5", + "ARHGDIA", + "ARHGEF11", + "ARHGEF12", + "ARHGEF2", + "ARHGEF3", + "ARHGEF7", + "ARL8A", + "ATG4B", + "AURKA", + "BCAR1", + "BCL2L11", + "BCR", + "BIN1", + "BIRC5", + "BRCA2", + "BUB1", + "CAPZB", + "CCDC88A", + "CCNB2", + "CD2AP", + "CDC27", + "CDC42", + "CDC42BPA", + "CDC42EP1", + "CDC42EP2", + "CDC42EP4", + "CDK1", + "CDK5RAP2", + "CENPE", + "CENPF", + "CENPJ", + "CEP131", + "CEP192", + "CEP250", + "CEP57", + "CEP72", + "CKAP5", + "CLASP1", + "CLIP1", + "CLIP2", + "CNTRL", + "CNTROB", + "CSNK1D", + "CTTN", + "CYTH2", + "DLG1", + "DLGAP5", + "DOCK2", + "DOCK4", + "DST", + "DYNC1H1", + "DYNLL2", + "ECT2", + "EPB41", + "EPB41L2", + "ESPL1", + "EZR", + "FARP1", + "FBXO5", + "FGD4", + "FGD6", + "FLNA", + "FLNB", + "FSCN1", + "GEMIN4", + "GSN", + "HDAC6", + "HOOK3", + "INCENP", + "ITSN1", + "KATNA1", + "KATNB1", + "KIF11", + "KIF15", + "KIF1B", + "KIF20B", + "KIF22", + "KIF23", + "KIF2C", + "KIF3B", + "KIF3C", + "KIF4A", + "KIF5B", + "KIFAP3", + "KLC1", + "KNTC1", + "KPTN", + "LATS1", + "LLGL1", + "LMNB1", + "LRPPRC", + "MAP1S", + "MAP3K11", + "MAPRE1", + "MARCKS", + "MARK4", + "MID1", + "MID1IP1", + "MYH10", + "MYH9", + "MYO1E", + "MYO9B", + "NCK1", + "NCK2", + "NDC80", + "NEDD9", + "NEK2", + "NET1", + "NF1", + "NIN", + "NOTCH2", + "NUMA1", + "NUSAP1", + "OPHN1", + "PAFAH1B1", + "PALLD", + "PCGF5", + "PCM1", + "PCNT", + "PDLIM5", + "PIF1", + "PKD2", + "PLEKHG2", + "PLK1", + "PPP4R2", + "PRC1", + "PREX1", + "PXN", + "RAB3GAP1", + "RABGAP1", + "RACGAP1", + "RALBP1", + "RANBP9", + "RAPGEF5", + "RAPGEF6", + "RASA1", + "RASA2", + "RASAL2", + "RFC1", + "RHOF", + "RHOT2", + "RICTOR", + "ROCK1", + "SAC3D1", + "SASS6", + "SEPTIN9", + "SHROOM1", + "SHROOM2", + "SMC1A", + "SMC3", + "SMC4", + "SORBS2", + "SOS1", + "SPTAN1", + "SPTBN1", + "SSH2", + "STAU1", + "STK38L", + "SUN2", + "SYNPO", + "TAOK2", + "TBCD", + "TIAM1", + "TLK1", + "TOP2A", + "TPX2", + "TRIO", + "TSC1", + "TTK", + "TUBA4A", + "TUBD1", + "TUBGCP2", + "TUBGCP3", + "TUBGCP5", + "TUBGCP6", + "UXT", + "VCL", + "WASF1", + "WASF2", + "WASL", + "YWHAE" + ], + "HALLMARK_MTORC1_SIGNALING": [ + "ABCF2", + "ACACA", + "ACLY", + "ACSL3", + "ACTR2", + "ACTR3", + "ADD3", + "ADIPOR2", + "AK4", + "ALDOA", + "ARPC5L", + "ASNS", + "ATP2A2", + "ATP5MC1", + "ATP6V1D", + "AURKA", + "BCAT1", + "BHLHE40", + "BTG2", + "BUB1", + "CACYBP", + "CALR", + "CANX", + "CCNF", + "CCNG1", + "CCT6A", + "CD9", + "CDC25A", + "CDKN1A", + "CFP", + "COPS5", + "CORO1A", + "CTH", + "CTSC", + "CXCR4", + "CYB5B", + "CYP51A1", + "DAPP1", + "DDIT3", + "DDIT4", + "DDX39A", + "DHCR24", + "DHCR7", + "DHFR", + "EBP", + "EDEM1", + "EEF1E1", + "EGLN3", + "EIF2S2", + "ELOVL5", + "ELOVL6", + "ENO1", + "EPRS1", + "ERO1A", + "ETF1", + "FADS1", + "FADS2", + "FDXR", + "FGL2", + "FKBP2", + "G6PD", + "GAPDH", + "GBE1", + "GCLC", + "GGA2", + "GLA", + "GLRX", + "GMPS", + "GOT1", + "GPI", + "GSK3B", + "GSR", + "GTF2H1", + "HK2", + "HMBS", + "HMGCR", + "HMGCS1", + "HPRT1", + "HSP90B1", + "HSPA4", + "HSPA5", + "HSPA9", + "HSPD1", + "HSPE1", + "IDH1", + "IDI1", + "IFI30", + "IFRD1", + "IGFBP5", + "IMMT", + "INSIG1", + "ITGB2", + "LDHA", + "LDLR", + "LGMN", + "LTA4H", + "M6PR", + "MAP2K3", + "MCM2", + "MCM4", + "ME1", + "MLLT11", + "MTHFD2", + "MTHFD2L", + "NAMPT", + "NFIL3", + "NFKBIB", + "NFYC", + "NHERF1", + "NIBAN1", + "NMT1", + "NUFIP1", + "NUP205", + "NUPR1", + "P4HA1", + "PDAP1", + "PDK1", + "PFKL", + "PGK1", + "PGM1", + "PHGDH", + "PIK3R3", + "PITPNB", + "PLK1", + "PLOD2", + "PNO1", + "PNP", + "POLR3G", + "PPA1", + "PPIA", + "PPP1R15A", + "PRDX1", + "PSAT1", + "PSMA3", + "PSMA4", + "PSMB5", + "PSMC2", + "PSMC4", + "PSMC6", + "PSMD12", + "PSMD13", + "PSMD14", + "PSME3", + "PSMG1", + "PSPH", + "QDPR", + "RAB1A", + "RDH11", + "RIT1", + "RPA1", + "RPN1", + "RRM2", + "RRP9", + "SC5D", + "SCD", + "SDF2L1", + "SEC11A", + "SERP1", + "SERPINH1", + "SHMT2", + "SKAP2", + "SLA", + "SLC1A4", + "SLC1A5", + "SLC2A1", + "SLC2A3", + "SLC37A4", + "SLC6A6", + "SLC7A11", + "SLC7A5", + "SORD", + "SQLE", + "SQSTM1", + "SRD5A1", + "SSR1", + "STARD4", + "STC1", + "STIP1", + "SYTL2", + "TBK1", + "TCEA1", + "TES", + "TFRC", + "TM7SF2", + "TMEM97", + "TOMM40", + "TPI1", + "TRIB3", + "TUBA4A", + "TUBG1", + "TXNRD1", + "UBE2D3", + "UCHL5", + "UFM1", + "UNG", + "USO1", + "VLDLR", + "WARS1", + "XBP1", + "YKT6" + ], + "HALLMARK_MYC_TARGETS_V1": [ + "ABCE1", + "ACP1", + "AIMP2", + "AP3S1", + "APEX1", + "BUB3", + "C1QBP", + "CAD", + "CANX", + "CBX3", + "CCNA2", + "CCT2", + "CCT3", + "CCT4", + "CCT5", + "CCT7", + "CDC20", + "CDC45", + "CDK2", + "CDK4", + "CLNS1A", + "CNBP", + "COPS5", + "COX5A", + "CSTF2", + "CTPS1", + "CUL1", + "CYC1", + "DDX18", + "DDX21", + "DEK", + "DHX15", + "DUT", + "EEF1B2", + "EIF1AX", + "EIF2S1", + "EIF2S2", + "EIF3B", + "EIF3D", + "EIF3J", + "EIF4A1", + "EIF4E", + "EIF4G2", + "EIF4H", + "EPRS1", + "ERH", + "ETF1", + "EXOSC7", + "FAM120A", + "FBL", + "G3BP1", + "GLO1", + "GNL3", + "GOT2", + "GSPT1", + "H2AZ1", + "HDAC2", + "HDDC2", + "HDGF", + "HNRNPA1", + "HNRNPA2B1", + "HNRNPA3", + "HNRNPC", + "HNRNPD", + "HNRNPR", + "HNRNPU", + "HPRT1", + "HSP90AB1", + "HSPD1", + "HSPE1", + "IARS1", + "IFRD1", + "ILF2", + "IMPDH2", + "KARS1", + "KPNA2", + "KPNB1", + "LDHA", + "LSM2", + "LSM7", + "MAD2L1", + "MCM2", + "MCM4", + "MCM5", + "MCM6", + "MCM7", + "MRPL23", + "MRPL9", + "MRPS18B", + "MYC", + "NAP1L1", + "NCBP1", + "NCBP2", + "NDUFAB1", + "NHP2", + "NME1", + "NOLC1", + "NOP16", + "NOP56", + "NPM1", + "ODC1", + "ORC2", + "PA2G4", + "PABPC1", + "PABPC4", + "PCBP1", + "PCNA", + "PGK1", + "PHB1", + "PHB2", + "POLD2", + "POLE3", + "PPIA", + "PPM1G", + "PRDX3", + "PRDX4", + "PRPF31", + "PRPS2", + "PSMA1", + "PSMA2", + "PSMA4", + "PSMA6", + "PSMA7", + "PSMB2", + "PSMB3", + "PSMC4", + "PSMC6", + "PSMD1", + "PSMD14", + "PSMD3", + "PSMD7", + "PSMD8", + "PTGES3", + "PWP1", + "RACK1", + "RAD23B", + "RAN", + "RANBP1", + "RFC4", + "RNPS1", + "RPL14", + "RPL18", + "RPL22", + "RPL34", + "RPL6", + "RPLP0", + "RPS10", + "RPS2", + "RPS3", + "RPS5", + "RPS6", + "RRM1", + "RRP9", + "RSL1D1", + "RUVBL2", + "SERBP1", + "SET", + "SF3A1", + "SF3B3", + "SLC25A3", + "SMARCC1", + "SNRPA", + "SNRPA1", + "SNRPB2", + "SNRPD1", + "SNRPD2", + "SNRPD3", + "SNRPG", + "SRM", + "SRPK1", + "SRSF1", + "SRSF2", + "SRSF3", + "SRSF7", + "SSB", + "SSBP1", + "STARD7", + "SYNCRIP", + "TARDBP", + "TCP1", + "TFDP1", + "TOMM70", + "TRA2B", + "TRIM28", + "TUFM", + "TXNL4A", + "TYMS", + "U2AF1", + "UBA2", + "UBE2E1", + "UBE2L3", + "USP1", + "VBP1", + "VDAC1", + "VDAC3", + "XPO1", + "XPOT", + "XRCC6", + "YWHAE", + "YWHAQ" + ], + "HALLMARK_MYC_TARGETS_V2": [ + "AIMP2", + "BYSL", + "CBX3", + "CDK4", + "DCTPP1", + "DDX18", + "DUSP2", + "EXOSC5", + "FARSA", + "GNL3", + "GRWD1", + "HK2", + "HSPD1", + "HSPE1", + "IMP4", + "IPO4", + "LAS1L", + "MAP3K6", + "MCM4", + "MCM5", + "MPHOSPH10", + "MRTO4", + "MYBBP1A", + "MYC", + "NDUFAF4", + "NIP7", + "NOC4L", + "NOLC1", + "NOP16", + "NOP2", + "NOP56", + "NPM1", + "PA2G4", + "PES1", + "PHB1", + "PLK1", + "PLK4", + "PPAN", + "PPRC1", + "PRMT3", + "PUS1", + "RABEPK", + "RCL1", + "RRP12", + "RRP9", + "SLC19A1", + "SLC29A2", + "SORD", + "SRM", + "SUPV3L1", + "TBRG4", + "TCOF1", + "TFB2M", + "TMEM97", + "UNG", + "UTP20", + "WDR43", + "WDR74" + ], + "HALLMARK_MYOGENESIS": [ + "ABLIM1", + "ACHE", + "ACSL1", + "ACTA1", + "ACTC1", + "ACTN2", + "ACTN3", + "ADAM12", + "ADCY9", + "AEBP1", + "AGL", + "AGRN", + "AK1", + "AKT2", + "ANKRD2", + "APLNR", + "APOD", + "APP", + "ATP2A1", + "ATP6AP1", + "BAG1", + "BDKRB2", + "BHLHE40", + "BIN1", + "CACNA1H", + "CACNG1", + "CAMK2B", + "CASQ1", + "CASQ2", + "CAV3", + "CD36", + "CDH13", + "CDKN1A", + "CFD", + "CHRNA1", + "CHRNB1", + "CHRNG", + "CKB", + "CKM", + "CKMT2", + "CLU", + "CNN3", + "COL15A1", + "COL1A1", + "COL3A1", + "COL4A2", + "COL6A2", + "COL6A3", + "COX6A2", + "COX7A1", + "CRAT", + "CRYAB", + "CSRP3", + "CTF1", + "DAPK2", + "DENND2B", + "DES", + "DMD", + "DMPK", + "DTNA", + "EFS", + "EIF4A2", + "ENO3", + "EPHB3", + "ERBB3", + "FABP3", + "FDPS", + "FGF2", + "FHL1", + "FKBP1B", + "FLII", + "FOXO4", + "FST", + "FXYD1", + "GAA", + "GABARAPL2", + "GADD45B", + "GJA5", + "GNAO1", + "GPX3", + "GSN", + "HBEGF", + "HDAC5", + "HRC", + "HSPB2", + "HSPB8", + "IFRD1", + "IGF1", + "IGFBP3", + "IGFBP7", + "ITGA7", + "ITGB1", + "ITGB4", + "ITGB5", + "KCNH1", + "KCNH2", + "KIFC3", + "KLF5", + "LAMA2", + "LARGE1", + "LDB3", + "LPIN1", + "LSP1", + "MAPK12", + "MAPRE3", + "MB", + "MEF2A", + "MEF2C", + "MEF2D", + "MRAS", + "MYBPC3", + "MYBPH", + "MYF6", + "MYH1", + "MYH11", + "MYH2", + "MYH3", + "MYH4", + "MYH7", + "MYH8", + "MYH9", + "MYL1", + "MYL11", + "MYL2", + "MYL3", + "MYL4", + "MYL6B", + "MYL7", + "MYLK", + "MYO1C", + "MYOG", + "MYOM1", + "MYOM2", + "MYOZ1", + "NAV2", + "NCAM1", + "NOS1", + "NOTCH1", + "NQO1", + "OCEL1", + "PC", + "PDE4DIP", + "PDLIM7", + "PFKM", + "PGAM2", + "PICK1", + "PKIA", + "PLXNB2", + "PPFIA4", + "PPP1R3C", + "PRNP", + "PSEN2", + "PTGIS", + "PTP4A3", + "PVALB", + "PYGM", + "RB1", + "REEP1", + "RIT1", + "RYR1", + "SCD", + "SCHIP1", + "SGCA", + "SGCD", + "SGCG", + "SH2B1", + "SH3BGR", + "SIRT2", + "SLC6A8", + "SLN", + "SMTN", + "SOD3", + "SORBS1", + "SORBS3", + "SPARC", + "SPDEF", + "SPEG", + "SPHK1", + "SPTAN1", + "SSPN", + "STC2", + "SVIL", + "SYNGR2", + "TAGLN", + "TCAP", + "TEAD4", + "TGFB1", + "TNNC1", + "TNNC2", + "TNNI1", + "TNNI2", + "TNNT1", + "TNNT2", + "TNNT3", + "TPD52L1", + "TPM2", + "TPM3", + "TSC2", + "VIPR1", + "WWTR1" + ], + "HALLMARK_NOTCH_SIGNALING": [ + "APH1A", + "ARRB1", + "CCND1", + "CUL1", + "DLL1", + "DTX1", + "DTX2", + "DTX4", + "FBXW11", + "FZD1", + "FZD5", + "FZD7", + "HES1", + "HEYL", + "JAG1", + "KAT2A", + "LFNG", + "MAML2", + "NOTCH1", + "NOTCH2", + "NOTCH3", + "PPARD", + "PRKCA", + "PSEN2", + "PSENEN", + "RBX1", + "SAP30", + "SKP1", + "ST3GAL6", + "TCF7L2", + "WNT2", + "WNT5A" + ], + "HALLMARK_OXIDATIVE_PHOSPHORYLATION": [ + "ABCB7", + "ACAA1", + "ACAA2", + "ACADM", + "ACADSB", + "ACADVL", + "ACAT1", + "ACO2", + "AFG3L2", + "AIFM1", + "ALAS1", + "ALDH6A1", + "ATP1B1", + "ATP5F1A", + "ATP5F1B", + "ATP5F1C", + "ATP5F1D", + "ATP5F1E", + "ATP5MC1", + "ATP5MC2", + "ATP5MC3", + "ATP5ME", + "ATP5MF", + "ATP5MG", + "ATP5PB", + "ATP5PD", + "ATP5PF", + "ATP5PO", + "ATP6AP1", + "ATP6V0B", + "ATP6V0C", + "ATP6V0E1", + "ATP6V1C1", + "ATP6V1D", + "ATP6V1E1", + "ATP6V1F", + "ATP6V1G1", + "ATP6V1H", + "BAX", + "BCKDHA", + "BDH2", + "CASP7", + "COX10", + "COX11", + "COX15", + "COX17", + "COX4I1", + "COX5A", + "COX5B", + "COX6A1", + "COX6B1", + "COX6C", + "COX7A2", + "COX7A2L", + "COX7B", + "COX7C", + "COX8A", + "CPT1A", + "CS", + "CYB5A", + "CYB5R3", + "CYC1", + "CYCS", + "DECR1", + "DLAT", + "DLD", + "DLST", + "ECH1", + "ECHS1", + "ECI1", + "ETFA", + "ETFB", + "ETFDH", + "FDX1", + "FH", + "FXN", + "GLUD1", + "GOT2", + "GPI", + "GPX4", + "GRPEL1", + "HADHA", + "HADHB", + "HCCS", + "HSD17B10", + "HSPA9", + "HTRA2", + "IDH1", + "IDH2", + "IDH3A", + "IDH3B", + "IDH3G", + "IMMT", + "ISCA1", + "ISCU", + "LDHA", + "LDHB", + "LRPPRC", + "MAOB", + "MDH1", + "MDH2", + "MFN2", + "MGST3", + "MPC1", + "MRPL11", + "MRPL15", + "MRPL34", + "MRPL35", + "MRPS11", + "MRPS12", + "MRPS15", + "MRPS22", + "MRPS30", + "MTRF1", + "MTRR", + "MTX2", + "NDUFA1", + "NDUFA2", + "NDUFA3", + "NDUFA4", + "NDUFA5", + "NDUFA6", + "NDUFA7", + "NDUFA8", + "NDUFA9", + "NDUFAB1", + "NDUFB1", + "NDUFB2", + "NDUFB3", + "NDUFB4", + "NDUFB5", + "NDUFB6", + "NDUFB7", + "NDUFB8", + "NDUFC1", + "NDUFC2", + "NDUFS1", + "NDUFS2", + "NDUFS3", + "NDUFS4", + "NDUFS6", + "NDUFS7", + "NDUFS8", + "NDUFV1", + "NDUFV2", + "NNT", + "NQO2", + "OAT", + "OGDH", + "OPA1", + "OXA1L", + "PDHA1", + "PDHB", + "PDHX", + "PDK4", + "PDP1", + "PHB2", + "PHYH", + "PMPCA", + "POLR2F", + "POR", + "PRDX3", + "RETSAT", + "RHOT1", + "RHOT2", + "SDHA", + "SDHB", + "SDHC", + "SDHD", + "SLC25A11", + "SLC25A12", + "SLC25A20", + "SLC25A3", + "SLC25A4", + "SLC25A5", + "SLC25A6", + "SUCLA2", + "SUCLG1", + "SUPV3L1", + "SURF1", + "TCIRG1", + "TIMM10", + "TIMM13", + "TIMM17A", + "TIMM50", + "TIMM8B", + "TIMM9", + "TOMM22", + "TOMM70", + "UQCR10", + "UQCR11", + "UQCRB", + "UQCRC1", + "UQCRC2", + "UQCRFS1", + "UQCRH", + "UQCRQ", + "VDAC1", + "VDAC2", + "VDAC3" + ], + "HALLMARK_P53_PATHWAY": [ + "ABAT", + "ABCC5", + "ABHD4", + "ACVR1B", + "ADA", + "AEN", + "AK1", + "ALOX15B", + "ANKRA2", + "APAF1", + "APP", + "ATF3", + "BAIAP2", + "BAK1", + "BAX", + "BLCAP", + "BMP2", + "BTG1", + "BTG2", + "CASP1", + "CCND2", + "CCND3", + "CCNG1", + "CCNK", + "CCP110", + "CD81", + "CD82", + "CDH13", + "CDK5R1", + "CDKN1A", + "CDKN2A", + "CDKN2AIP", + "CDKN2B", + "CEBPA", + "CGRRF1", + "CLCA2", + "COQ8A", + "CSRNP2", + "CTSD", + "CTSF", + "CYFIP2", + "DCXR", + "DDB2", + "DDIT3", + "DDIT4", + "DEF6", + "DGKA", + "DNTTIP2", + "DRAM1", + "EI24", + "ELP1", + "EPHA2", + "EPHX1", + "EPS8L2", + "ERCC5", + "F2R", + "FAM162A", + "FAS", + "FBXW7", + "FDXR", + "FGF13", + "FOS", + "FOXO3", + "FUCA1", + "GADD45A", + "GLS2", + "GM2A", + "GPX2", + "H1-2", + "H2AC25", + "H2AJ", + "HBEGF", + "HDAC3", + "HEXIM1", + "HINT1", + "HMOX1", + "HRAS", + "HSPA4L", + "IER3", + "IER5", + "IFI30", + "IL1A", + "INHBB", + "IP6K2", + "IRAG2", + "IRAK1", + "ISCU", + "ITGB4", + "JAG2", + "JUN", + "KIF13B", + "KLF4", + "KLK8", + "KRT17", + "LDHB", + "LIF", + "MAPKAPK3", + "MDM2", + "MKNK2", + "MXD1", + "MXD4", + "NDRG1", + "NHLH2", + "NINJ1", + "NOL8", + "NOTCH1", + "NUDT15", + "NUPR1", + "OSGIN1", + "PCNA", + "PDGFA", + "PERP", + "PHLDA3", + "PIDD1", + "PITPNC1", + "PLK2", + "PLK3", + "PLXNB2", + "PMM1", + "POLH", + "POM121", + "PPM1D", + "PPP1R15A", + "PRKAB1", + "PRMT2", + "PROCR", + "PTPN14", + "PTPRE", + "PVT1", + "RAB40C", + "RACK1", + "RAD51C", + "RAD9A", + "RALGDS", + "RAP2B", + "RB1", + "RCHY1", + "RETSAT", + "RGS16", + "RHBDF2", + "RNF19B", + "RPL18", + "RPL36", + "RPS12", + "RPS27L", + "RRAD", + "RRP8", + "RXRA", + "S100A10", + "S100A4", + "SAT1", + "SDC1", + "SEC61A1", + "SERPINB5", + "SERTAD3", + "SESN1", + "SFN", + "SLC19A2", + "SLC35D1", + "SLC3A2", + "SLC7A11", + "SOCS1", + "SP1", + "SPHK1", + "ST14", + "STEAP3", + "STOM", + "TAP1", + "TAX1BP3", + "TCHH", + "TCN2", + "TGFA", + "TGFB1", + "TM4SF1", + "TM7SF3", + "TNFSF9", + "TNNI1", + "TOB1", + "TP53", + "TP63", + "TPD52L1", + "TPRKB", + "TRAF4", + "TRAFD1", + "TRIAP1", + "TRIB3", + "TSC22D1", + "TSPYL2", + "TXNIP", + "UPP1", + "VAMP8", + "VDR", + "VWA5A", + "WRAP73", + "WWP1", + "XPC", + "ZBTB16", + "ZFP36L1", + "ZMAT3", + "ZNF365" + ], + "HALLMARK_PANCREAS_BETA_CELLS": [ + "ABCC8", + "AKT3", + "CHGA", + "DCX", + "DPP4", + "ELP4", + "FOXA2", + "FOXO1", + "G6PC2", + "GCG", + "GCK", + "HNF1A", + "IAPP", + "INS", + "INSM1", + "ISL1", + "LMO2", + "MAFB", + "NEUROD1", + "NEUROG3", + "NKX2-2", + "NKX6-1", + "PAK3", + "PAX4", + "PAX6", + "PCSK1", + "PCSK2", + "PDX1", + "PKLR", + "SCGN", + "SEC11A", + "SLC2A2", + "SPCS1", + "SRP14", + "SRP9", + "SRPRB", + "SST", + "STXBP1", + "SYT13", + "VDR" + ], + "HALLMARK_PEROXISOME": [ + "ABCB1", + "ABCB4", + "ABCB9", + "ABCC5", + "ABCC8", + "ABCD1", + "ABCD2", + "ABCD3", + "ACAA1", + "ACOT8", + "ACOX1", + "ACSL1", + "ACSL4", + "ACSL5", + "ALB", + "ALDH1A1", + "ALDH9A1", + "ATXN1", + "BCL10", + "CACNA1B", + "CADM1", + "CAT", + "CDK7", + "CEL", + "CLN6", + "CLN8", + "CNBP", + "CRABP1", + "CRABP2", + "CRAT", + "CTBP1", + "CTPS1", + "DHCR24", + "DHRS3", + "DIO1", + "DLG4", + "ECH1", + "ECI2", + "EHHADH", + "ELOVL5", + "EPHX2", + "ERCC1", + "ERCC3", + "ESR2", + "FABP6", + "FADS1", + "FDPS", + "FIS1", + "GNPAT", + "GSTK1", + "HAO2", + "HMGCL", + "HRAS", + "HSD11B2", + "HSD17B11", + "HSD17B4", + "HSD3B7", + "IDE", + "IDH1", + "IDH2", + "IDI1", + "ISOC1", + "ITGB1BP1", + "LONP2", + "MLYCD", + "MSH2", + "MVP", + "NR1I2", + "NUDT19", + "PABPC1", + "PEX11A", + "PEX11B", + "PEX13", + "PEX14", + "PEX2", + "PEX5", + "PEX6", + "PRDX1", + "PRDX5", + "RDH11", + "RETSAT", + "RXRG", + "SCGB1A1", + "SCP2", + "SEMA3C", + "SERPINA6", + "SIAH1", + "SLC23A2", + "SLC25A17", + "SLC25A19", + "SLC25A4", + "SLC27A2", + "SLC35B2", + "SMARCC1", + "SOD1", + "SOD2", + "STS", + "SULT2B1", + "TOP2A", + "TSPO", + "TTR", + "UGT2B17", + "VPS4B", + "YWHAH" + ], + "HALLMARK_PI3K_AKT_MTOR_SIGNALING": [ + "ACACA", + "ACTR2", + "ACTR3", + "ADCY2", + "AKT1", + "AKT1S1", + "AP2M1", + "ARF1", + "ARHGDIA", + "ARPC3", + "ATF1", + "CAB39", + "CAB39L", + "CALR", + "CAMK4", + "CDK1", + "CDK2", + "CDK4", + "CDKN1A", + "CDKN1B", + "CFL1", + "CLTC", + "CSNK2B", + "CXCR4", + "DAPP1", + "DDIT3", + "DUSP3", + "E2F1", + "ECSIT", + "EGFR", + "EIF4E", + "FASLG", + "FGF17", + "FGF22", + "FGF6", + "GNA14", + "GNGT1", + "GRB2", + "GRK2", + "GSK3B", + "HRAS", + "HSP90B1", + "IL2RG", + "IL4", + "IRAK4", + "ITPR2", + "LCK", + "MAP2K3", + "MAP2K6", + "MAP3K7", + "MAPK1", + "MAPK10", + "MAPK8", + "MAPK9", + "MAPKAP1", + "MKNK1", + "MKNK2", + "MYD88", + "NCK1", + "NFKBIB", + "NGF", + "NOD1", + "PAK4", + "PDK1", + "PFN1", + "PIK3R3", + "PIKFYVE", + "PIN1", + "PITX2", + "PLA2G12A", + "PLCB1", + "PLCG1", + "PPP1CA", + "PPP2R1B", + "PRKAA2", + "PRKAG1", + "PRKAR2A", + "PRKCB", + "PTEN", + "PTPN11", + "RAC1", + "RAF1", + "RALB", + "RIPK1", + "RIT1", + "RPS6KA1", + "RPS6KA3", + "RPTOR", + "SFN", + "SLA", + "SLC2A1", + "SMAD2", + "SQSTM1", + "STAT2", + "TBK1", + "THEM4", + "TIAM1", + "TNFRSF1A", + "TRAF2", + "TRIB3", + "TSC2", + "UBE2D3", + "UBE2N", + "VAV3", + "YWHAB" + ], + "HALLMARK_PROTEIN_SECRETION": [ + "ABCA1", + "ADAM10", + "ANP32E", + "AP1G1", + "AP2B1", + "AP2M1", + "AP2S1", + "AP3B1", + "AP3S1", + "ARCN1", + "ARF1", + "ARFGAP3", + "ARFGEF1", + "ARFGEF2", + "ARFIP1", + "ATP1A1", + "ATP6V1B1", + "ATP6V1H", + "ATP7A", + "BET1", + "BNIP3", + "CAV2", + "CD63", + "CLCN3", + "CLN5", + "CLTA", + "CLTC", + "COG2", + "COPB1", + "COPB2", + "COPE", + "CTSC", + "DNM1L", + "DOP1A", + "DST", + "EGFR", + "ERGIC3", + "GALC", + "GBF1", + "GLA", + "GNAS", + "GOLGA4", + "GOSR2", + "ICA1", + "IGF2R", + "KIF1B", + "KRT18", + "LAMP2", + "LMAN1", + "M6PR", + "MAPK1", + "MON2", + "NAPA", + "NAPG", + "OCRL", + "PAM", + "PPT1", + "RAB14", + "RAB22A", + "RAB2A", + "RAB5A", + "RAB9A", + "RER1", + "RPS6KA3", + "SCAMP1", + "SCAMP3", + "SCRN1", + "SEC22B", + "SEC24D", + "SEC31A", + "SGMS1", + "SH3GL2", + "SNAP23", + "SNX2", + "SOD1", + "SSPN", + "STAM", + "STX12", + "STX16", + "STX7", + "TMED10", + "TMED2", + "TMX1", + "TOM1L1", + "TPD52", + "TSG101", + "TSPAN8", + "USO1", + "VAMP3", + "VAMP4", + "VAMP7", + "VPS45", + "VPS4B", + "YIPF6", + "YKT6", + "ZW10" + ], + "HALLMARK_REACTIVE_OXYGEN_SPECIES_PATHWAY": [ + "ABCC1", + "ATOX1", + "CAT", + "CDKN2D", + "EGLN2", + "ERCC2", + "FES", + "FTL", + "G6PD", + "GCLC", + "GCLM", + "GLRX", + "GLRX2", + "GPX3", + "GPX4", + "GSR", + "HHEX", + "HMOX2", + "IPCEF1", + "JUNB", + "LAMTOR5", + "LSP1", + "MBP", + "MGST1", + "MPO", + "MSRA", + "NDUFA6", + "NDUFB4", + "NDUFS2", + "NQO1", + "OXSR1", + "PDLIM1", + "PFKP", + "PRDX1", + "PRDX2", + "PRDX4", + "PRDX6", + "PRNP", + "PTPA", + "SBNO2", + "SCAF4", + "SELENOS", + "SOD1", + "SOD2", + "SRXN1", + "STK25", + "TXN", + "TXNRD1", + "TXNRD2" + ], + "HALLMARK_SPERMATOGENESIS": [ + "ACE", + "ACRBP", + "ACRV1", + "ACTL7B", + "ADAD1", + "ADAM2", + "ADCYAP1", + "AGFG1", + "AKAP4", + "ALOX15", + "ARL4A", + "ART3", + "AURKA", + "BRAF", + "BUB1", + "CAMK4", + "CCNA1", + "CCNB2", + "CCT6B", + "CDK1", + "CDKN3", + "CFTR", + "CHFR", + "CHRM4", + "CLGN", + "CLPB", + "CLVS1", + "CNIH2", + "COIL", + "CRISP2", + "CSNK2A2", + "CST8", + "DBF4", + "DCC", + "DDX25", + "DDX4", + "DMC1", + "DMRT1", + "DNAJB8", + "DPEP3", + "ELOVL3", + "EZH2", + "GAD1", + "GAPDHS", + "GFI1", + "GMCL1", + "GPR182", + "GRM8", + "GSG1", + "GSTM3", + "H1-6", + "HBZ", + "HOXB1", + "HSPA1L", + "HSPA2", + "HSPA4L", + "HTR5A", + "IDE", + "IFT88", + "IL12RB2", + "IL13RA2", + "IP6K1", + "JAM3", + "KIF2C", + "LDHC", + "LPIN1", + "MAP7", + "MAST2", + "MEP1B", + "MLF1", + "MLLT10", + "MTNR1A", + "MTOR", + "NAA11", + "NCAPH", + "NEFH", + "NEK2", + "NF2", + "NOS1", + "NPHP1", + "NPY5R", + "OAZ3", + "ODF1", + "PACRG", + "PAPOLB", + "PARP2", + "PCSK1N", + "PCSK4", + "PDHA2", + "PEBP1", + "PGK2", + "PGS1", + "PHF7", + "PHKG2", + "PIAS2", + "POMC", + "PRKAR2A", + "PRM2", + "PSMG1", + "RAD17", + "RFC4", + "RPL39L", + "SCG3", + "SCG5", + "SEPTIN4", + "SHE", + "SIRT1", + "SLC12A2", + "SLC2A5", + "SNAP91", + "SPATA6", + "SPMAP2", + "STAM2", + "STRBP", + "SYCP1", + "TALDO1", + "TCP11", + "TEKT2", + "TKTL1", + "TLE4", + "TNNI3", + "TNP1", + "TNP2", + "TOPBP1", + "TSN", + "TSSK2", + "TTK", + "TUBA3C", + "TULP2", + "VDAC3", + "YBX2", + "ZC2HC1C", + "ZC3H14", + "ZNRF4", + "ZPBP" + ], + "HALLMARK_TGF_BETA_SIGNALING": [ + "ACVR1", + "APC", + "ARID4B", + "BCAR3", + "BMP2", + "BMPR1A", + "BMPR2", + "CDH1", + "CDK9", + "CDKN1C", + "CTNNB1", + "ENG", + "FKBP1A", + "FNTA", + "FURIN", + "HDAC1", + "HIPK2", + "ID1", + "ID2", + "ID3", + "IFNGR2", + "JUNB", + "KLF10", + "LEFTY2", + "LTBP2", + "MAP3K7", + "NCOR2", + "NOG", + "PMEPA1", + "PPM1A", + "PPP1CA", + "PPP1R15A", + "RAB31", + "RHOA", + "SERPINE1", + "SKI", + "SKIL", + "SLC20A1", + "SMAD1", + "SMAD3", + "SMAD6", + "SMAD7", + "SMURF1", + "SMURF2", + "SPTBN1", + "TGFB1", + "TGFBR1", + "TGIF1", + "THBS1", + "TJP1", + "TRIM33", + "UBE2D3", + "WWTR1", + "XIAP" + ], + "HALLMARK_TNFA_SIGNALING_VIA_NFKB": [ + "ABCA1", + "ACKR3", + "AREG", + "ATF3", + "ATP2B1", + "B4GALT1", + "B4GALT5", + "BCL2A1", + "BCL3", + "BCL6", + "BHLHE40", + "BIRC2", + "BIRC3", + "BMP2", + "BTG1", + "BTG2", + "BTG3", + "CCL2", + "CCL20", + "CCL4", + "CCL5", + "CCN1", + "CCND1", + "CCNL1", + "CCRL2", + "CD44", + "CD69", + "CD80", + "CD83", + "CDKN1A", + "CEBPB", + "CEBPD", + "CFLAR", + "CLCF1", + "CSF1", + "CSF2", + "CXCL1", + "CXCL10", + "CXCL11", + "CXCL2", + "CXCL3", + "CXCL6", + "DENND5A", + "DNAJB4", + "DRAM1", + "DUSP1", + "DUSP2", + "DUSP4", + "DUSP5", + "EDN1", + "EFNA1", + "EGR1", + "EGR2", + "EGR3", + "EHD1", + "EIF1", + "ETS2", + "F2RL1", + "F3", + "FJX1", + "FOS", + "FOSB", + "FOSL1", + "FOSL2", + "FUT4", + "G0S2", + "GADD45A", + "GADD45B", + "GCH1", + "GEM", + "GFPT2", + "GPR183", + "HBEGF", + "HES1", + "ICAM1", + "ICOSLG", + "ID2", + "IER2", + "IER3", + "IER5", + "IFIH1", + "IFIT2", + "IFNGR2", + "IL12B", + "IL15RA", + "IL18", + "IL1A", + "IL1B", + "IL23A", + "IL6", + "IL6ST", + "IL7R", + "INHBA", + "IRF1", + "IRS2", + "JAG1", + "JUN", + "JUNB", + "KDM6B", + "KLF10", + "KLF2", + "KLF4", + "KLF6", + "KLF9", + "KYNU", + "LAMB3", + "LDLR", + "LIF", + "LITAF", + "MAFF", + "MAP2K3", + "MAP3K8", + "MARCKS", + "MCL1", + "MSC", + "MXD1", + "MYC", + "NAMPT", + "NFAT5", + "NFE2L2", + "NFIL3", + "NFKB1", + "NFKB2", + "NFKBIA", + "NFKBIE", + "NINJ1", + "NR4A1", + "NR4A2", + "NR4A3", + "OLR1", + "PANX1", + "PDE4B", + "PDLIM5", + "PER1", + "PFKFB3", + "PHLDA1", + "PHLDA2", + "PLAU", + "PLAUR", + "PLEK", + "PLK2", + "PLPP3", + "PMEPA1", + "PNRC1", + "PPP1R15A", + "PTGER4", + "PTGS2", + "PTPRE", + "PTX3", + "RCAN1", + "REL", + "RELA", + "RELB", + "RHOB", + "RIGI", + "RIPK2", + "RNF19B", + "SAT1", + "SDC4", + "SERPINB2", + "SERPINB8", + "SERPINE1", + "SGK1", + "SIK1", + "SLC16A6", + "SLC2A3", + "SLC2A6", + "SMAD3", + "SNN", + "SOCS3", + "SOD2", + "SPHK1", + "SPSB1", + "SQSTM1", + "STAT5A", + "TANK", + "TAP1", + "TGIF1", + "TIPARP", + "TLR2", + "TNC", + "TNF", + "TNFAIP2", + "TNFAIP3", + "TNFAIP6", + "TNFAIP8", + "TNFRSF9", + "TNFSF9", + "TNIP1", + "TNIP2", + "TRAF1", + "TRIB1", + "TRIP10", + "TSC22D1", + "TUBB2A", + "VEGFA", + "YRDC", + "ZBTB10", + "ZC3H12A", + "ZFP36" + ], + "HALLMARK_UNFOLDED_PROTEIN_RESPONSE": [ + "ALDH18A1", + "ARFGAP1", + "ASNS", + "ATF3", + "ATF4", + "ATF6", + "ATP6V0D1", + "BAG3", + "BANF1", + "CALR", + "CCL2", + "CEBPB", + "CEBPG", + "CHAC1", + "CKS1B", + "CNOT2", + "CNOT4", + "CNOT6", + "CXXC1", + "DCP1A", + "DCP2", + "DCTN1", + "DDIT4", + "DDX10", + "DKC1", + "DNAJA4", + "DNAJB9", + "DNAJC3", + "EDC4", + "EDEM1", + "EEF2", + "EIF2AK3", + "EIF2S1", + "EIF4A1", + "EIF4A2", + "EIF4A3", + "EIF4E", + "EIF4EBP1", + "EIF4G1", + "ERN1", + "ERO1A", + "EXOC2", + "EXOSC1", + "EXOSC10", + "EXOSC2", + "EXOSC4", + "EXOSC5", + "EXOSC9", + "FKBP14", + "FUS", + "GEMIN4", + "GOSR2", + "H2AX", + "HERPUD1", + "HSP90B1", + "HSPA5", + "HSPA9", + "HYOU1", + "IARS1", + "IFIT1", + "IGFBP1", + "IMP3", + "KDELR3", + "KHSRP", + "KIF5B", + "LSM1", + "LSM4", + "MTHFD2", + "MTREX", + "NABP1", + "NFYA", + "NFYB", + "NHP2", + "NOLC1", + "NOP14", + "NOP56", + "NPM1", + "PAIP1", + "PARN", + "PDIA5", + "PDIA6", + "POP4", + "PREB", + "PSAT1", + "RPS14", + "RRP9", + "SDAD1", + "SEC11A", + "SEC31A", + "SERP1", + "SHC1", + "SKIC3", + "SLC1A4", + "SLC30A5", + "SLC7A5", + "SPCS1", + "SPCS3", + "SRPRA", + "SRPRB", + "SSR1", + "STC2", + "TARS1", + "TATDN2", + "TSPYL2", + "TUBB2A", + "VEGFA", + "WFS1", + "WIPI1", + "XBP1", + "XPOT", + "YIF1A", + "YWHAZ", + "ZBTB17" + ], + "HALLMARK_UV_RESPONSE_DN": [ + "ABCC1", + "ACVR2A", + "ADD3", + "ADGRL2", + "ADORA2B", + "AGGF1", + "AKT3", + "AMPH", + "ANXA2", + "ANXA4", + "APBB2", + "ARHGEF9", + "ATP2B1", + "ATP2B4", + "ATP2C1", + "ATRN", + "ATRX", + "ATXN1", + "BCKDHB", + "BDNF", + "BHLHE40", + "BMPR1A", + "CACNA1A", + "CAP2", + "CAV1", + "CCN1", + "CDC42BPA", + "CDK13", + "CDKN1B", + "CDON", + "CELF2", + "CITED2", + "COL11A1", + "COL1A1", + "COL1A2", + "COL3A1", + "COL5A2", + "DAB2", + "DBP", + "DDAH1", + "DLC1", + "DLG1", + "DMAC2L", + "DUSP1", + "DYRK1A", + "EFEMP1", + "ERBB2", + "F3", + "FBLN5", + "FHL2", + "FYN", + "FZD2", + "GCNT1", + "GJA1", + "GRK5", + "HAS2", + "ICA1", + "ID1", + "IGF1R", + "IGFBP5", + "INPP4B", + "INSIG1", + "IRS1", + "ITGB3", + "KALRN", + "KCNMA1", + "KIT", + "LAMC1", + "LDLR", + "LPAR1", + "LTBP1", + "MAGI2", + "MAP1B", + "MAP2K5", + "MAPK14", + "MET", + "MGLL", + "MGMT", + "MIOS", + "MMP16", + "MRPS31", + "MT1E", + "MTA1", + "MYC", + "NEK7", + "NFIB", + "NFKB1", + "NIPBL", + "NOTCH2", + "NR1D2", + "NR3C1", + "NRP1", + "PDGFRB", + "PDLIM5", + "PEX14", + "PHF3", + "PIAS3", + "PIK3CD", + "PIK3R3", + "PLCB4", + "PLPP3", + "PMP22", + "PPARG", + "PRDM2", + "PRKAR2B", + "PRKCA", + "PRKCE", + "PTEN", + "PTGFR", + "PTPN21", + "PTPRM", + "RASA2", + "RBPMS", + "RGS4", + "RND3", + "RUNX1", + "RXRA", + "SCAF8", + "SCHIP1", + "SCN8A", + "SDC2", + "SERPINE1", + "SFMBT1", + "SIPA1L1", + "SLC22A18", + "SLC7A1", + "SMAD3", + "SMAD7", + "SNAI2", + "SPOP", + "SRI", + "SYNE1", + "SYNJ2", + "TENT4A", + "TFPI", + "TGFBR2", + "TGFBR3", + "TJP1", + "TOGARAM1", + "VAV2", + "VLDLR", + "WDR37", + "YTHDC1", + "ZMIZ1" + ], + "HALLMARK_UV_RESPONSE_UP": [ + "ABCB1", + "ACAA1", + "AGO2", + "ALAS1", + "ALDOA", + "AMD1", + "AP2S1", + "APOM", + "AQP3", + "ARRB2", + "ASNS", + "ATF3", + "ATP6V1C1", + "ATP6V1F", + "BAK1", + "BCL2L11", + "BID", + "BMP2", + "BSG", + "BTG1", + "BTG2", + "BTG3", + "C4BPB", + "CA2", + "CASP3", + "CCK", + "CCND3", + "CCNE1", + "CDC34", + "CDC5L", + "CDK2", + "CDKN1C", + "CDKN2B", + "CDO1", + "CEBPG", + "CHKA", + "CHRNA5", + "CLCN2", + "CLTB", + "CNP", + "COL2A1", + "CREG1", + "CTSV", + "CXCL2", + "CYB5B", + "CYB5R1", + "CYP1A1", + "DDX21", + "DGAT1", + "DLG4", + "DNAJA1", + "DNAJB1", + "E2F5", + "EIF2S3", + "EIF5", + "ENO2", + "EPCAM", + "EPHX1", + "FEN1", + "FGF18", + "FKBP4", + "FMO1", + "FOS", + "FOSB", + "FURIN", + "GAL", + "GCH1", + "GGH", + "GLS", + "GPX3", + "GRINA", + "GRPEL1", + "H2AX", + "HLA-F", + "HMOX1", + "HNRNPU", + "HSPA13", + "HSPA2", + "HTR7", + "HYAL2", + "ICAM1", + "IGFBP2", + "IL6", + "IL6ST", + "IRF1", + "JUNB", + "KCNH2", + "KLHDC3", + "LHX2", + "LYN", + "MAOA", + "MAPK8IP2", + "MARK2", + "MGAT1", + "MMP14", + "MRPL23", + "MSX1", + "NAT1", + "NFKBIA", + "NKX2-5", + "NPTX2", + "NPTXR", + "NR4A1", + "NTRK3", + "NUP58", + "NXF1", + "OLFM1", + "ONECUT1", + "PARP2", + "PDAP1", + "PDLIM3", + "PLCL1", + "POLE3", + "POLG2", + "POLR2H", + "PPAT", + "PPIF", + "PPP1R2", + "PPT1", + "PRKACA", + "PRKCD", + "PRPF3", + "PSMC3", + "PTPRD", + "RAB27A", + "RASGRP1", + "RET", + "RFC4", + "RHOB", + "RPN1", + "RRAD", + "RXRB", + "SELENOW", + "SHOX2", + "SIGMAR1", + "SLC25A4", + "SLC6A12", + "SLC6A8", + "SOD2", + "SPR", + "SQSTM1", + "STARD3", + "STIP1", + "STK25", + "SULT1A1", + "TACR3", + "TAP1", + "TARS1", + "TCHH", + "TFRC", + "TGFBRAP1", + "TMBIM6", + "TST", + "TUBA4A", + "TYRO3", + "UROD", + "WIZ", + "YKT6" + ], + "HALLMARK_WNT_BETA_CATENIN_SIGNALING": [ + "ADAM17", + "AXIN1", + "AXIN2", + "CCND2", + "CSNK1E", + "CTNNB1", + "CUL1", + "DKK1", + "DKK4", + "DLL1", + "DVL2", + "FRAT1", + "FZD1", + "FZD8", + "GNAI1", + "HDAC11", + "HDAC2", + "HDAC5", + "HEY1", + "HEY2", + "JAG1", + "JAG2", + "KAT2A", + "LEF1", + "MAML1", + "MYC", + "NCOR2", + "NCSTN", + "NKD1", + "NOTCH1", + "NOTCH4", + "NUMB", + "PPARD", + "PSEN2", + "PTCH1", + "RBPJ", + "SKP2", + "TCF7", + "TP53", + "WNT1", + "WNT5B", + "WNT6" + ], + "HALLMARK_XENOBIOTIC_METABOLISM": [ + "ABCC2", + "ABCC3", + "ABCD2", + "ABHD6", + "ACO2", + "ACOX1", + "ACOX2", + "ACOX3", + "ACP1", + "ACP2", + "ACSM1", + "ADH1C", + "ADH5", + "ADH7", + "AHCY", + "AKR1C2", + "AKR1C3", + "ALAS1", + "ALDH2", + "ALDH3A1", + "ALDH9A1", + "ANGPTL3", + "AOX1", + "AP4B1", + "APOE", + "AQP9", + "ARG1", + "ARG2", + "ARPP19", + "ASL", + "ATOH8", + "ATP2A2", + "BCAR1", + "BCAT1", + "BLVRB", + "BPHL", + "CA2", + "CASP6", + "CAT", + "CBR1", + "CCL25", + "CD36", + "CDA", + "CDO1", + "CES1", + "CFB", + "CNDP2", + "COMT", + "CROT", + "CRP", + "CSAD", + "CYB5A", + "CYFIP2", + "CYP17A1", + "CYP1A1", + "CYP1A2", + "CYP26A1", + "CYP27A1", + "CYP2C18", + "CYP2E1", + "CYP2J2", + "CYP2S1", + "CYP4F2", + "DCXR", + "DDAH2", + "DDC", + "DDT", + "DHPS", + "DHRS1", + "DHRS7", + "ECH1", + "ELOVL5", + "ENPEP", + "ENTPD5", + "EPHA2", + "EPHX1", + "ESR1", + "ETFDH", + "ETS2", + "F10", + "F11", + "FABP1", + "FAH", + "FAS", + "FBLN1", + "FBP1", + "FETUB", + "FMO1", + "FMO3", + "G6PC1", + "GABARAPL1", + "GAD1", + "GART", + "GCH1", + "GCKR", + "GCLC", + "GCNT2", + "GNMT", + "GSR", + "GSS", + "GSTA3", + "GSTM4", + "GSTO1", + "GSTT2", + "HACL1", + "HES6", + "HGFAC", + "HMOX1", + "HNF4A", + "HPRT1", + "HRG", + "HSD11B1", + "HSD17B2", + "ID2", + "IDH1", + "IGF1", + "IGFBP1", + "IGFBP4", + "IL1R1", + "IRF8", + "ITIH1", + "ITIH4", + "JUP", + "KARS1", + "KYNU", + "LCAT", + "LEAP2", + "LONP1", + "LPIN2", + "MAN1A1", + "MAOA", + "MARCHF6", + "MBL2", + "MCCC2", + "MPP2", + "MT2A", + "MTHFD1", + "NDRG2", + "NFS1", + "NINJ1", + "NMT1", + "NPC1", + "NQO1", + "PAPSS2", + "PC", + "PDK4", + "PDLIM5", + "PEMT", + "PGD", + "PGRMC1", + "PINK1", + "PLG", + "PMM1", + "POR", + "PPARD", + "PROS1", + "PSMB10", + "PTGDS", + "PTGES", + "PTGES3", + "PTGR1", + "PTS", + "PYCR1", + "RAP1GAP", + "RBP4", + "REG1A", + "RETSAT", + "SAR1B", + "SERPINA6", + "SERPINE1", + "SERTAD1", + "SHMT2", + "SLC12A4", + "SLC1A5", + "SLC22A1", + "SLC35B1", + "SLC35D1", + "SLC46A3", + "SLC6A12", + "SLC6A6", + "SMOX", + "SPINT2", + "SSR3", + "TAT", + "TDO2", + "TGFB2", + "TKFC", + "TMBIM6", + "TMEM176B", + "TMEM97", + "TNFRSF1A", + "TPST1", + "TTPA", + "TYR", + "UGDH", + "UPB1", + "UPP1", + "VNN1", + "VTN", + "XDH" + ] +} \ No newline at end of file