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"b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/TM.m" new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f27b909e4bb1a52996f90d546e0ffbffda7a43f7 --- /dev/null +++ "b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/TM.m" @@ -0,0 +1,218 @@ +function [M,e,rho,Ebin] = TM(Eh,bins) +% Transition matrix calculation method supplied with SA Tools. +% Copyright (c) 2002, by Richard Frost and Frost Concepts. +% See http://www.frostconcepts.com/software for information on SA Tools. +% +% [M,e,rho] = TM(Eh) ; +% +% INPUT: +% Eh = energy and temperature history +% i = 1, 1+(steps*walkers), etc. +% Eh(i,1) = index t of temperature step +% Eh(i,2) = T corresponding to t +% Eh(i,3) = equilibrium step #j at T +% Eh(i,4) = walker #k +% Eh(i,5) = energy E visited by walker k at step j during T +% Eh(i,6) = energy E' attempted from E by walker k at step j during T +% +% OUTPUT: +% M = Transition Matrix (see book section 12.2.1). +% e = estimate of relaxation time +% rho = estimate of equilibrium density of states +% Ebin = energy bin centroids, min, and max +% Ebin(1,:) are bin centroids. Ebin(1,b) is the centroid for rho(b). +% Ebin(2,:) are bin lower bounds +% Ebin(3,:) are bin upper bounds +% +M = [] ; +e = 0 ; +rho = [] ; +% +% get the energies of visited (Ej) and neighbor (Ei) states +% +Ej = Eh(:,5)' ; +Ei = Eh(:,6)' ; +% +% Create a sorted, unique list of all energies, E. +% k will be the number of unique energies. +% +A = sort(cat(2,Ej,Ei)) ; +L = numel(A) ; +k = 1 ; +E(k) = A(1) ; +for i=2:L + if A(i) ~= E(k) + k = k + 1 ; + E(k) = A(i) ; + end +end +% +% Need to have an energy for each bin. +% Create phony out-of-range energies for any remaining bins. +% +if k < bins + offset = (max(E) - min(E)) / bins ; + for i=(k+1):bins + E(i) = E(i-1) + offset ; + end + fullbins = k ; + k = bins ; +else + fullbins = bins ; +end +% +% Create partition locations within E for the bins +% +if k == bins + for b=1:(bins-1) + Part(b) = b + 1 ; + end +else + m = k / bins ; + for b=1:(bins-1) + Part(b) = ceil(b*m) ; + end +end +Part(bins) = k ; +% +% Find separation values for each bin +% +for b=1:(bins-1) + Epart(b) = 0.5*((E(Part(b)-1)) + E(Part(b))) ; +end +Epart(bins) = E(k) ; +% +% Find # values in each bin and compute sum of values for centroid computation. +% +Esum(1:bins) = 0 ; +Ecount(1:bins) = 0 ; +for i=1:L + for b=1:bins + if A(i) <= Epart(b) + Esum(b) = Esum(b) + A(i) ; + Ecount(b) = Ecount(b) + 1 ; + break ; + end + end +end +% +% Compute centroid +% +for b=1:fullbins % real bins + Ebin(1,b) = Esum(b) / Ecount(b) ; +end +for b=(fullbins+1):bins % phony bins + Ebin(1,b) = 0.5 * (Epart(b-1) + Epart(b)) ; +end +% +% Compute the min and max for the bins +% +Ebin(2,1) = E(1) ; +Ebin(3,1) = Epart(1) ; +for b=2:bins + Ebin(2,b) = Epart(b-1) ; + Ebin(3,b) = Epart(b) ; +end +clear A E Part ; +% +% Q matrix computation +% +Q(1:bins,1:bins) = 0 ; +L = numel(Ej) ; +for k=1:L + for b=1:bins + if Ej(k) <= Epart(b) + j = b ; + break ; + end + end + for b=1:bins + if Ei(k) <= Epart(b) + i = b ; + break ; + end + end + Q(i,j) = Q(i,j) + 1 ; +end +% +% P matrix computation +% +for j=1:bins + Qjsum(j) = 0 ; + for i=1:bins + Qjsum(j) = Qjsum(j) + Q(i,j) ; + end +end +for i=1:bins + for j=1:bins + if Qjsum(j) == 0 + P(i,j) = 0 ; + else + P(i,j) = Q(i,j) / Qjsum(j) ; + end + end +end +% +% Infinite temperature density of states estimation +% +[V,D] = eig(P) ; +D = abs(D) ; +maxe = D(1,1) ; +maxel = 1 ; +for b=2:bins + if D(b,b) > maxe + maxe = D(b,b) ; + maxel = b ; + end +end +principal(1:bins) = V(1:bins,maxel) ; +rho = principal/sum(principal) ; +clear V D ; +% +% Boltzmannized matrix computation +% +[Ehrows, Ehcols] = size(Eh) ; +T = Eh(Ehrows,2) ; +M(1:bins,1:bins) = 0 ; +for i=1:bins + for j=1:bins + if i ~= j + if Ebin(1,i) <= Ebin(1,j) + M(i,j) = P(i,j) ; + else + M(i,j) = P(i,j)*exp((Ebin(1,j) - Ebin(1,i))/T) ; + end + end + end +end +for i=1:bins + d = 1 - sum(M(:,i)) ; + M(i,i) = d ; +end +clear P ; +% +% Relaxation time estimation +% +[V,D] = eig(M) ; +lambda = sort(abs(diag(D))) ; % sorted eigenvalue magnitudes +maxlambda = lambda(bins) ; +b = bins - 1 ; +while (b > 0) + if lambda(b) == maxlambda + b = b - 1 ; + else + break ; + end +end +if b == 0 + e = Inf ; +elseif lambda(b) == 0 + e = 0 ; +else + loglambda2 = log(lambda(b)) ; + if loglambda2 >= 0 + e = Inf ; + else + e = -1 / loglambda2 ; + end +end diff --git "a/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/TfinalNstop.m" "b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/TfinalNstop.m" new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..336a7a0ae8999cfe3ff122e6816ad9ea63412500 --- /dev/null +++ "b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/TfinalNstop.m" @@ -0,0 +1,57 @@ +function b = TfinalNstop(W,Ew,t,Tt,Et,Etarget,ert,Kt,Ebsft,f) +% Final temperature determination method supplied with SA Tools. +% Copyright (c) 2002, by Richard Frost and Frost Concepts. +% See http://www.frostconcepts.com/software for information on SA Tools. +% +% b = TfinalNstop(W,Ew,t,Tt,Et,Etarget,ert,Kt,Ebsft,f) ; +% +% INPUTS: +% W = cell array of current states (size walkers) +% Ew = energies associated with W +% t = current temperature step index; i.e., current T = Tt(t). +% Tt = temperature history of simulation (so far) +% Et = mean energy history +% Etarget = target mean energy history +% ert = relaxation time history +% Kt = equilibrium step history +% Ebsft = Ebsf history +% f = [N, relerr] ; +% OUTPUT: +% b = true (equal to 1) when the last N mean energies are equal to within relerr. +% +% For i = (t+1-N) to t-1: abs((Et(i) - Et(t))/Et(t)) <= relerr. +% +N = f(1) ; +relerr = f(2) ; +if (t < N) | (N < 1) + b = 0 ; +elseif N == 1 + b = 1 ; +else + b = 1 ; + % + % handle special cases of zero and infinite denominators + % + if abs(Et(t)) == Inf + for i=(t+1-N):(t-1) + if Et(i) ~= Et(t) + b = 0 ; + break ; + end + end + elseif Et(t) == 0 + for i=(t+1-N):(t-1) + if abs(Et(i)) > relerr + b = 0 ; + break ; + end + end + else + for i=(t+1-N):(t-1) + if abs((Et(i) - Et(t))/Et(t)) > relerr + b = 0 ; + break ; + end + end + end +end diff --git "a/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/TinitAccept.m" "b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/TinitAccept.m" new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..509bf66b84cf8c61fbeabbf8718d7a2a2df1fde9 --- /dev/null +++ "b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/TinitAccept.m" @@ -0,0 +1,128 @@ +function [T0,W,Ew,Wbsf,Ebsf,Ea,Ev,steps] = TinitAccept(r, walkers, newstate, X, cost, moveclass) +% Acceptance ratio temperature initialization method supplied with SA Tools. +% Copyright (c) 2002, by Richard Frost and Frost Concepts. +% See http://www.frostconcepts.com/software for information on SA Tools. +% +% [T0,W,Ew,Wbsf,Ebsf,Ea,Ev,steps] = TinitAccept(r, walkers, newstate, X, cost, moveclass) ; +% +% INPUTS: +% r = [ratio, steps] where +% ratio = the fraction of uphill moves that T0 should accept (e.g., 0.5) +% steps = the number of random steps to determine T0 (e.g., 5) +% walkers = number of walkers. Must be positive integer. +% newstate = (handle to) user-defined method +% W0 = newstate(X) where +% X = user-defined problem domain or other data, +% behaviorally static. +% W0 = an initial user-defined state. +% X = user-defined problem domain or other data, behaviorally static. +% cost = (handle to) user-defined objective method (function) +% Ew = cost(X,W) where +% X = user-defined problem domain or other data. +% W = a user-defined state from 'newstate' or 'moveclass'. +% moveclass = (handle to) user-defined method, +% W = moveclass(X,W,Ea,T) where +% X = user-defined problem domain or other data. +% W = a user-defined state from 'newstate' or 'moveclass'. +% Ea = average energy at current temperature. +% T = current temperature (will be infinite in Tinit) +% OUTPUTS: +% T0 = initial temperature +% W = cell array of user-defined state(s) from 'newstate' or 'moveclass'. +% Ew = current energies corresponding to W (size walkers) +% Wbsf = array of best-so-far states of size 'walkers' +% Ebsf = array of best-so-far energies +% Ea = average energy +% Ev = energy (cost) history at T +% i = arbitrary index +% Ev(i,1) = step # +% Ev(i,2) = walker # +% Ev(i,3) = an energy visited during T +% Ev(i,4) = energy attempted from Ev(i,1:3) during T (will be infinite in Tinit) +% steps = # of steps taken by each walker during Tinit +% +% Sets T0 so that fraction r of the states examined in this function +% would be accepted by metropolis acceptance rule. +% +ratio = r(1) ; +if (ratio < 0) | (1 < ratio) + error(sprintf('Ratio in TinitAccept must be in range [0,1] (was: %g)', ratio)) ; +end +steps = r(2) ; +if steps <= 0 + error(sprintf('Steps in TinitAccept must be > 0 (was: %g)', steps)) ; +end +% +% take a random walk +% +[W,Ew,Wbsf,Ebsf,Ea,Ev] = randomwalk(steps, walkers, newstate, X, cost, moveclass) ; +% +% compute array dE containing the energy differences between neighbor states in the walk +% +L = steps*walkers ; +k = 0 ; +for i = 1:L + d = abs(Ev(i,3) - Ev(i,4)) ; + if d ~= 0 + k = k + 1 ; + dE(k) = d ; + end +end +if k == 0 + error('No difference in energies of states. TinitAccept cannot continue.') ; +end +% +% Will use bisection search to find value that satisfies acceptance ratio. +% The objective function is sum(exp(-dE/T)) + b. +% +b = ratio*k ; +% +% Find lower bound for bisection search. +% +Tmin = 1 ; +S = exp(-dE/Tmin) ; +fmin = sum(S) - b ; +while fmin > 0 + Tmin = 0.5 * Tmin ; + if Tmin == 0 + fmin = -b ; + else + S = exp(-dE/Tmin) ; + fmin = sum(S) - b ; + end +end +% +% Find upper bound for bisection search. +% +Tmax = Tmin ; +if Tmax == 0 + fmax = -b ; +else + S = exp(-dE/Tmax) ; + fmax = sum(S) - b ; +end +while fmax < 0 + Tmax = (2 * Tmax) + 1 ; + S = exp(-dE/Tmax) ; + fmax = sum(S) - b ; +end +% +% Perform bisection search with error tolerance of 10^-6. +% +T0 = 0.5 * (Tmin + Tmax) ; +relerr = abs((Tmax-Tmin)/Tmax) ; +errtol = 0.000001 ; +while relerr > errtol + S = exp(-dE/T0) ; + fmid = sum(S) - b ; + if (fmid < 0) + Tmin = T0 ; + fmin = fmid ; + else + Tmax = T0 ; + fmax = fmid ; + end + relerr = abs((Tmax-Tmin)/Tmax) ; + T0 = 0.5 * (Tmin + Tmax) ; +end +% diff --git "a/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/TinitT0.m" "b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/TinitT0.m" new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..461a672c35ae25f34c12c29561920ea349fd43f9 --- /dev/null +++ "b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/TinitT0.m" @@ -0,0 +1,48 @@ +function [T0,W,Ew,Wbsf,Ebsf,Ea,Ev,steps] = TinitT0(r, walkers, newstate, X, cost, moveclass) +% Fixed temperature initialization method supplied with SA Tools. +% Copyright (c) 2002, by Richard Frost and Frost Concepts. +% See http://www.frostconcepts.com/software for information on SA Tools. +% +% [T0,W,Ew,Wbsf,Ebsf,Ev,steps] = TinitT0(r, walkers, newstate, X, cost, moveclass) ; +% +% INPUTS: +% r = initial temperature T0 +% walkers = number of walkers. Must be positive integer. +% newstate = (handle to) user-defined method +% W0 = newstate(X) where +% X = user-defined problem domain or other data, +% behaviorally static. +% W0 = an initial user-defined state. +% X = user-defined problem domain or other data, behaviorally static. +% cost = (handle to) user-defined objective method (function) +% Ew = cost(X,W) where +% X = user-defined problem domain or other data. +% W = a user-defined state from 'newstate' or 'moveclass'. +% moveclass = (handle to) user-defined method, +% W = moveclass(X,W,Ea,T) where +% X = user-defined problem domain or other data. +% W = a user-defined state from 'newstate' or 'moveclass'. +% Ea = average energy at current temperature. +% T = current temperature (will be infinite in Tinit) +% OUTPUTS: +% T0 = initial temperature +% W = user-defined state(s) from 'newstate' or 'moveclass'. +% Ew = current energies corresponding to W (size walkers) +% Wbsf = array of best-so-far states of size 'walkers' +% Ebsf = array of best-so-far energies +% Ea = average energy +% Ev = energy (cost) history at T +% i = arbitrary index +% Ev(i,1) = step # +% Ev(i,2) = walker # +% Ev(i,3) = an energy visited during T +% Ev(i,4) = energy attempted from Ev(i,1:3) during T +% steps = # of steps taken by each walker during Tinit +% +% Sets T0 to the user supplied value. Calls ensembleInit(...). +% +[W,Ew,Wbsf,Ebsf,Ea] = ensembleInit(walkers, newstate, X, cost) ; +T0 = r ; +Ev = [] ; +steps = 0 ; + \ No newline at end of file diff --git "a/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/TinitWhite.m" "b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/TinitWhite.m" new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..96ec5be3429ab2c00808b7bdff9e8b24e2458103 --- /dev/null +++ "b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/TinitWhite.m" @@ -0,0 +1,68 @@ +function [T0,W,Ew,Wbsf,Ebsf,Ea,Ev,steps] = TinitWhite(r, walkers, newstate, X, cost, moveclass) +% White temperature initialization method supplied with SA Tools. +% Copyright (c) 2002, by Richard Frost and Frost Concepts. +% See http://www.frostconcepts.com/software for information on SA Tools. +% +% [T0,W,Ew,Wbsf,Ebsf,Ea,Ev,steps] = TinitWhite(r, walkers, newstate, X, cost, moveclass) ; +% +% INPUTS: +% r = [ratio, steps] where +% ratio = scale of stddev(E|infinity) to set initial temperature (e.g., 2.0) +% steps = the number of random steps to determine T0 (e.g., 5) +% walkers = number of walkers. Must be positive integer. +% newstate = (handle to) user-defined method +% W0 = newstate(X) where +% X = user-defined problem domain or other data, +% behaviorally static. +% W0 = an initial user-defined state. +% X = user-defined problem domain or other data, behaviorally static. +% cost = (handle to) user-defined objective method (function) +% Ew = cost(X,W) where +% X = user-defined problem domain or other data. +% W = a user-defined state from 'newstate' or 'moveclass'. +% moveclass = (handle to) user-defined method, +% W = moveclass(X,W,Ea,T) where +% X = user-defined problem domain or other data. +% W = a user-defined state from 'newstate' or 'moveclass'. +% Ea = average energy at current temperature. +% T = current temperature (will be infinite in Tinit) +% OUTPUTS: +% T0 = initial temperature +% W = cell array of user-defined state(s) from 'newstate' or 'moveclass'. +% Ew = current energies corresponding to W (size walkers) +% Wbsf = array of best-so-far states of size 'walkers' +% Ebsf = array of best-so-far energies +% Ea = average energy +% Ev = energy (cost) history at T +% i = arbitrary index +% Ev(i,1) = step # +% Ev(i,2) = walker # +% Ev(i,3) = an energy visited during T +% Ev(i,4) = energy attempted from Ev(i,1:3) during T (will be infinite in Tinit) +% steps = # of steps taken by each walker during Tinit +% +% Sets T0 to user supplied ratio of standard deviation of infinite temperature energies. +% Calls randomwalk(...). +% +ratio = r(1) ; +if ratio <= 0 + error(sprintf('Ratio in TinitWhite must be > 0 (was: %g)', ratio)) ; +end +steps = r(2) ; +if steps <= 0 + error(sprintf('Steps in TinitWhite must be > 0 (was: %g)', steps)) ; +end +N = steps*walkers ; +if N < 2 + error(sprintf('steps*walkers in TinitWhite must be > 1 (was: %g)', N)) ; +end +% +[W,Ew,Wbsf,Ebsf,Ea,Ev] = randomwalk(steps, walkers, newstate, X, cost, moveclass) ; +% +if walkers == 1 + E(1) = Ew(1) ; + E(2:(steps+1)) = Ev(:,3) ; + T0 = ratio * std(E) ; +else + T0 = ratio * std(Ew) ; +end diff --git "a/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/template_cost.txt" "b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/template_cost.txt" new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9427fed14461c1127ae17c9632285b6830b5a5fa --- /dev/null +++ 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W and X to compute Ew. diff --git "a/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/template_init.txt" "b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/template_init.txt" new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..dadefddfa608013062f610f93f6c7fdfff2e5534 --- /dev/null +++ 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"a/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/template_new.txt" 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Instantiates a new state. +% +W = [] ; % a typical application will put state specific data here diff --git "a/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/template_perturb.txt" "b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/template_perturb.txt" new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..73dd3a901fd03a419a4e585dd43b552ca9004a64 --- /dev/null +++ "b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/template_perturb.txt" @@ -0,0 +1,10 @@ +function W = PROBLEMNAME_perturb(X,W,Ea,T) +% W = PROBLEMNAME_perturb(X,W,Ea,T) +% +% X = behaviorally constant application data +% +% W = (on input) current state, (on output) next state. +% +% Ea = current average energy +% T = current temperature +% diff --git "a/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/template_try_me.txt" "b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/template_try_me.txt" new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d3da57166b293cecbe2df7566e3c5630ba9a654e --- /dev/null +++ "b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/template_try_me.txt" @@ -0,0 +1,51 @@ +function try_me +% Example SA Tools annealing for PROBLEMNAME. +% +% +rand('state',sum(100*clock)) ; +% +verbose = 1 ; +% +newstate = @PROBLEMNAME_new ; +X = PROBLEMNAME_init ; +cost = @PROBLEMNAME_cost ; +moveclass = @PROBLEMNAME_perturb ; +% +walkers = 16 ; +acceptrule = @metropolis ; +q = 0 ; +schedule = @thermospeedR ; +P = 0 ; +equilibrate = @hoffmann ; +C = 1.25 ; +maxsteps = 48 ; +Tinit = @TinitAccept ; +r = [0.5, 48] ; +Tfinal = @TfinalNstop ; +f = [4, 1e-3] ; +maxtemps = 10 ; +v = 0.2 ; +bins = 10 ; +e = Inf ; +% +disp(['--------------------------------start--------------------------------']) ; +% +% + [W,Ew,Wbsf,Ebsf,Tt,Et,Etarget,ert,Kt,Ebsft,Eh,M,rho,Ebin] = ... + anneal(verbose, ... + newstate, X, ... + cost, moveclass, ... + walkers, ... + acceptrule,q, ... + schedule, P, ... + equilibrate, C, maxsteps, ... + Tinit, r, ... + Tfinal, f, maxtemps, ... + v, bins, e) ; +% + dispMat(rho,'rho','%6.2f') ; + dispMat(Ebin,'Ebin','%6.2f') ; +% plotBins(Ebin,rho,'E','rho','equilibrium density of states') ; +% dispEh(Eh) ; +% +disp(['---------------------------------end---------------------------------']) ; diff --git "a/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/thermospeedHC.m" 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"b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/thermospeedHC.m" @@ -0,0 +1,30 @@ +function T = thermospeedHC(Ea,Estd,walkers,dEtgt,v,e,T,t,P) +% Heat capacity thermospeed temperature update method supplied with SA Tools. +% Copyright (c) 2002, by Richard Frost and Frost Concepts. +% See http://www.frostconcepts.com/software for information on SA Tools. +% +% T = thermospeedHC(Ea,Estd,walkers,dEtgt,v,e,T,t,P) ; +% +% Ea = (not used) average energy. +% Estd = standard deviation of energies +% walkers = (not used) number of walkers +% dEtgt = difference between present and previous target mean energy +% v = (not used) thermodynamic speed. +% e = (not used) estimate of relaxation time. +% T = current temperature. +% t = (not used) temperature step #. +% P = (not used) constant +% +% Temperature will not change if +% 1. Estd is zero +% 2. Input T is negative, zero, or infinite +% 3. The calculated temperature would be negative or infinite +% +if (Estd > 0) & (T > 0) & (T ~= Inf) + B = 1/T ; % use inverse temperature for stability + dB = -dEtgt / (Estd*Estd) ; + B = B + dB ; + if B > 0 % only change if stable + T = 1 / B ; + end +end diff --git "a/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/thermospeedR.m" "b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/thermospeedR.m" new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e320e6fbdaf9317e93a9fae446957f65eef69878 --- /dev/null +++ "b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/thermospeedR.m" @@ -0,0 +1,31 @@ +function T = thermospeedR(Ea,Estd,walkers,dEtgt,v,e,T,t,P) +% Heat capacity thermospeed temperature update method supplied with SA Tools. +% Copyright (c) 2002, by Richard Frost and Frost Concepts. +% See http://www.frostconcepts.com/software for information on SA Tools. +% +% T = thermospeedR(Ea,Estd,walkers,dEtgt,v,e,T,t,P) ; +% +% Ea = (not used) average energy. +% Estd = standard deviation of energies +% walkers = (not used) number of walkers +% dEtgt = (not used) difference between present and previous target mean energy +% v = thermodynamic speed. +% e = estimate of relaxation time. +% T = current temperature. +% t = (not used) temperature step #. +% P = (not used) constant +% +% Temperature will not change if +% 1. Estd or e are zero +% 2. Input T is negative, zero, or infinite +% 3. The calculated temperature would be negative +% +if (Estd == 0) | (e == 0) | (T <= 0) | (T == Inf) + dT = 0 ; +else + dT = -v*((T*T)/(e*Estd)) ; + if dT < -T + dT = 0 ; % do nothing if unstable + end +end +T = T + dT ; diff --git "a/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/threshold.m" "b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/threshold.m" new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6a87006a144b6f9aa7b6954342e758e7be55dec8 --- /dev/null +++ "b/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/threshold.m" @@ -0,0 +1,18 @@ +function a = threshold(dE,T,q) +% Threshold acceptance method supplied with SA Tools. +% Copyright (c) 2002, by Richard Frost and Frost Concepts. +% See http://www.frostconcepts.com/software for information on SA Tools. +% +% a = threshold(dE,T,q) ; +% +% dE = the difference in cost between a trial state and +% the current state: dE = Wtrial - W +% T = the current temperature. Must be positive. +% q = (not used) the "q" parameter of the acceptance rule +% a = 0 if trial is rejected, otherwise 1. +% +if (T > 0) & (dE <= T) + a = 1 ; +else + a = 0 ; +end diff --git "a/matlab\346\225\260\345\255\246\345\273\272\346\250\241\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\347\256\227\346\263\225@\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\357\274\210\347\256\227\346\263\225\347\256\200\344\273\213+\347\274\226\347\250\213\346\212\200\345\267\247+\345\267\245\345\205\267\347\256\261+\345\272\224\347\224\250\345\244\247\345\205\250\357\274\211\357\274\210\345\220\253\346\272\220\344\273\243\347\240\201\357\274\211/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225/\351\201\227\344\274\240\351\200\200\347\201\253\347\256\227\346\263\225\345\267\245\345\205\267\347\256\261\357\274\210\344\272\214\357\274\211/tsallis.m" 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in cost between a trial state and +% the current state: dE = Wtrial - W +% T = the current temperature +% q = the "q" parameter of the tsallis acceptance rule +% a = 0 if trial is rejected, otherwise 1. +% +a = 0 ; +if T > 0 + if (dE <= 0) | (q == 1) + a = 1 ; + else + D = (1 - q)*(dE/T) ; + if D <= 1 + if rand < (1 - D)^(1/(1-q)) + a = 1 ; + end + end + end +end diff --git "a/\344\270\212\346\234\272\350\257\276\344\273\266.rar" "b/\344\270\212\346\234\272\350\257\276\344\273\266.rar" new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d55de9b65293ec286cdc6023bba489711fa68acf --- /dev/null +++ "b/\344\270\212\346\234\272\350\257\276\344\273\266.rar" @@ -0,0 +1,3 @@ +version https://git-lfs.github.com/spec/v1 +oid sha256:31eae2b31ab0eb224cfd3cf9a4df32072b524a6095e0622bbdc71c97ac8fd69e +size 722513 diff --git "a/\344\270\212\346\234\272\350\257\276\344\273\266/\344\270\212\346\234\272\350\257\276\344\273\266/1.ppt" 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varargout = shiyan5_0(varargin) +% SHIYAN5_0 MATLAB code for shiyan5_0.fig +% SHIYAN5_0, by itself, creates a new SHIYAN5_0 or raises the existing +% singleton*. +% +% H = SHIYAN5_0 returns the handle to a new SHIYAN5_0 or the handle to +% the existing singleton*. +% +% SHIYAN5_0('CALLBACK',hObject,eventData,handles,...) calls the local +% function named CALLBACK in SHIYAN5_0.M with the given input arguments. +% +% SHIYAN5_0('Property','Value',...) creates a new SHIYAN5_0 or raises the +% existing singleton*. Starting from the left, property value pairs are +% applied to the GUI before shiyan5_0_OpeningFcn gets called. An +% unrecognized property name or invalid value makes property application +% stop. All inputs are passed to shiyan5_0_OpeningFcn via varargin. +% +% *See GUI Options on GUIDE's Tools menu. Choose "GUI allows only one +% instance to run (singleton)". +% +% See also: GUIDE, GUIDATA, GUIHANDLES + +% Edit the above text to modify the response to help shiyan5_0 + +% Last Modified by GUIDE v2.5 27-Nov-2023 15:04:34 + +% Begin initialization code - DO NOT EDIT +gui_Singleton = 1; +gui_State = struct('gui_Name', mfilename, ... + 'gui_Singleton', gui_Singleton, ... + 'gui_OpeningFcn', @shiyan5_0_OpeningFcn, ... + 'gui_OutputFcn', @shiyan5_0_OutputFcn, ... + 'gui_LayoutFcn', [] , ... + 'gui_Callback', []); +if nargin && ischar(varargin{1}) + gui_State.gui_Callback = str2func(varargin{1}); +end + +if nargout + [varargout{1:nargout}] = gui_mainfcn(gui_State, varargin{:}); +else + gui_mainfcn(gui_State, varargin{:}); +end +% End initialization code - DO NOT EDIT + + +% --- Executes just before shiyan5_0 is made visible. +function shiyan5_0_OpeningFcn(hObject, eventdata, handles, varargin) +% This function has no output args, see OutputFcn. +% hObject handle to figure +% eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB +% handles structure with handles and user data (see GUIDATA) +handles.peaks=peaks(35); +handles.membrane=membrane; +[x,y]=meshgrid(-8:0.3:8); +r=sqrt(x.^2+y.^2); +sinc=sin(r)./(r+eps); +handles.sinc=sinc; +handles.current_data=handles.sinc; +surf(handles.current_data)% varargin command line arguments to shiyan5_0 (see VARARGIN) + +% Choose default command line output for shiyan5_0 +handles.output = hObject; + +% Update handles structure +guidata(hObject, handles); + +% UIWAIT makes shiyan5_0 wait for user response (see UIRESUME) +% uiwait(handles.figure1); + + +% --- Outputs from this function are returned to the command line. +function varargout = shiyan5_0_OutputFcn(hObject, eventdata, handles) +% varargout cell array for returning output args (see VARARGOUT); +% hObject handle to figure +% eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB +% handles structure with handles and user data (see GUIDATA) + +% Get default command line output from handles structure +varargout{1} = handles.output; + + +% --- Executes on selection change in ChooseFun. +function ChooseFun_Callback(hObject, eventdata, handles) +% hObject handle to ChooseFun (see GCBO) +% eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB +str=get(hObject,'String'); +val=get(hObject,'Value'); +%设置用所选函数产生当前数据集 +switch str{val} +case 'Peaks' + handles.current_data=handles.peaks; + surf(handles.current_data) +case 'Membrane' + handles.current_data=handles.membrane; + surf(handles.current_data) +case 'Sinc' + handles.current_data=handles.sinc; +surf(handles.current_data) +end +% 保存句柄结构 +guidata(hObject,handles)% handles structure with handles and user data (see GUIDATA) + +% Hints: contents = cellstr(get(hObject,'String')) returns ChooseFun contents as cell array +% contents{get(hObject,'Value')} returns selected item from ChooseFun + + +% --- Executes during object creation, after setting all properties. +function ChooseFun_CreateFcn(hObject, eventdata, handles) +% hObject handle to ChooseFun (see GCBO) +% eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB +% handles empty - handles not created until after all CreateFcns called + +% Hint: listbox controls usually have a white background on Windows. +% See ISPC and COMPUTER. +if ispc && isequal(get(hObject,'BackgroundColor'), get(0,'defaultUicontrolBackgroundColor')) + set(hObject,'BackgroundColor','white'); +end + + +% --- Executes on button press in Mesh. +function Mesh_Callback(hObject, eventdata, handles) +mesh(handles.current_data) +% hObject handle to Mesh (see GCBO) +% eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB +% handles structure with handles and user data (see GUIDATA) + + +% --- Executes on button press in Contour3. +function Contour3_Callback(hObject, eventdata, handles) +contour3(handles.current_data) +% hObject handle to Contour3 (see GCBO) +% eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB +% handles structure with handles and user data (see GUIDATA) + + +% --- Executes on button press in Surf. +function Surf_Callback(hObject, eventdata, handles) +surf(handles.current_data) +% hObject handle to Surf (see GCBO) +% eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB +% handles structure with handles and user data (see GUIDATA) + + +% -------------------------------------------------------------------- +function Option_Callback(hObject, eventdata, handles) +% hObject handle to Option (see GCBO) +% eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB +% handles structure with handles and user data (see GUIDATA) + + +% -------------------------------------------------------------------- +function hgon_Callback(hObject, eventdata, handles) +% hObject handle to hgon (see GCBO) +% eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB +if strcmp(get(gcbo,'Checked'),'on') + set(gcbo,'Checked','off') + grid off +else + set(gcbo,'Checked','on') + grid on +end +% handles structure with handles and user data (see GUIDATA) + + +% -------------------------------------------------------------------- +function hbon_Callback(hObject, eventdata, handles) +if strcmp(get(gcbo,'Checked'),'on') + set(gcbo,'Checked','off') + box off +else + set(gcbo,'Checked','on') + box on +end +% hObject handle to hbon (see GCBO) +% eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB +% handles structure with handles and user data (see GUIDATA) + + +% -------------------------------------------------------------------- +function hwc_Callback(hObject, eventdata, handles) +% hObject handle to hwc (see GCBO) +% eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB +% handles structure with handles and user data (see GUIDATA) + + +% -------------------------------------------------------------------- +function hwcYellow_Callback(hObject, eventdata, handles) +% hObject handle to hwcYellow (see GCBO) +% eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB +% handles structure with handles and user data (see GUIDATA) +set(gcbf,'Color','y') +set(gcbo,'Checked','on') +set(handles.hwcBlue,'Checked','off') +set(handles.hwcWhite,'Checked','off') + +% -------------------------------------------------------------------- +function hwcBlue_Callback(hObject, eventdata, handles) +% hObject handle to hwcBlue (see GCBO) +% eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB +% handles structure with handles and user data (see GUIDATA) +set(gcbf,'Color','b') +set(gcbo,'Checked','on') +set(handles.hwcYellow,'Checked','off') +set(handles.hwcWhite,'Checked','off') + +% -------------------------------------------------------------------- +function hwcWhite_Callback(hObject, eventdata, handles) +% hObject handle to hwcWhite (see GCBO) +% eventdata reserved - to be defined in a future version of MATLAB +% handles structure with handles and user data (see GUIDATA) +set(gcbf,'Color','w') +set(gcbo,'Checked','on') +set(handles.hwcYellow,'Checked','off') +set(handles.hwcBlue,'Checked','off') \ No newline at end of file diff --git "a/\347\224\265\345\255\220\344\277\241\346\201\257\347\261\273/\351\202\265\351\246\250\347\221\266/\345\244\247\350\277\236\346\265\267\344\272\213\345\244\247\345\255\246\343\200\212MATLAB\345\237\272\347\241\200\344\270\216\345\272\224\347\224\250\343\200\2132017-2018\345\255\246\345\271\264\347\254\254\344\270\200\345\255\246\346\234\237\346\234\237\346\234\253\350\257\225\345\215\267.pdf" "b/\347\224\265\345\255\220\344\277\241\346\201\257\347\261\273/\351\202\265\351\246\250\347\221\266/\345\244\247\350\277\236\346\265\267\344\272\213\345\244\247\345\255\246\343\200\212MATLAB\345\237\272\347\241\200\344\270\216\345\272\224\347\224\250\343\200\2132017-2018\345\255\246\345\271\264\347\254\254\344\270\200\345\255\246\346\234\237\346\234\237\346\234\253\350\257\225\345\215\267.pdf" new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..88262f50eab250c9826ce25f723c022047aa9c53 --- /dev/null +++ "b/\347\224\265\345\255\220\344\277\241\346\201\257\347\261\273/\351\202\265\351\246\250\347\221\266/\345\244\247\350\277\236\346\265\267\344\272\213\345\244\247\345\255\246\343\200\212MATLAB\345\237\272\347\241\200\344\270\216\345\272\224\347\224\250\343\200\2132017-2018\345\255\246\345\271\264\347\254\254\344\270\200\345\255\246\346\234\237\346\234\237\346\234\253\350\257\225\345\215\267.pdf" @@ -0,0 +1,3 @@ +version https://git-lfs.github.com/spec/v1 +oid sha256:8b3c649d22f02d28a6f824f31eedd1a5d91f8f48cda22a28354b45117af7b6b4 +size 125179 diff --git 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