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SARS coronavirus MA15 ExoN1
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Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d2ym1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
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|
Coronaviridae
|
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|
GenBank
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USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
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2008-10-08
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|
SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d2ym1, complete genome
|
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| 99,541
|
HQ890527.1
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d2ym2
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
| null |
2008-10-08
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d2ym2, complete genome
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| 99,542
|
HQ890528.1
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d2ym3
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
| null |
2008-10-08
| null |
PRJNA260063
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d2ym3, complete genome
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| 99,543
|
HQ890529.1
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d2ym4
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
| null |
2008-10-08
| null |
PRJNA260063
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d2ym4, complete genome
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| 99,544
|
HQ890530.1
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d2ym5
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
| null |
2008-10-08
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d2ym5, complete genome
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| 99,545
|
HQ890531.1
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d4ym1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,645
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
| null |
2008-10-10
| null |
PRJNA260063
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d4ym1, complete genome
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| 99,546
|
HQ890532.1
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d4ym2
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,645
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
| null |
2008-10-10
| null |
PRJNA260063
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d4ym2, complete genome
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| 99,547
|
HQ890533.1
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d4ym3
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
| null |
2008-10-10
| null |
PRJNA260063
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d4ym3, complete genome
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| 99,548
|
HQ890534.1
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d2om1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
| null |
2008-09-17
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d2om1, complete genome
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| 99,549
|
HQ890535.1
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d2om2
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
| null |
2008-09-17
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d2om2, complete genome
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| 99,550
|
HQ890536.1
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d2om3
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
| null |
2008-09-17
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d2om3, complete genome
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| 99,551
|
HQ890537.1
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d2om4
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
| null |
2008-09-17
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d2om4, complete genome
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| 99,552
|
HQ890538.1
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d2om5
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
| null |
2008-09-17
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d2om5, complete genome
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| 99,553
|
HQ890539.1
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d3om1
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
| null |
2008-09-18
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d3om1, complete genome
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| 99,554
|
HQ890540.1
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d3om2
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
| null |
2008-09-18
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d3om2, complete genome
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| 99,555
|
JF292902.1
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d4ym4
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
| null |
2008-10-10
| null |
PRJNA260063
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d4ym4, complete genome
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| 99,562
|
JF292903.1
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d4ym5
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,645
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
| null |
2008-10-10
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d4ym5, complete genome
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| 99,563
|
JF292904.1
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d3om3
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,645
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
| null |
2008-09-18
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d3om3, complete genome
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| 99,564
|
JF292905.1
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d3om4
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
| null |
2008-09-18
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d3om4, complete genome
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| 99,565
|
JF292906.1
|
SARS coronavirus MA15 ExoN1
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
d3om5
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
|
Mus musculus
| null |
2008-09-18
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus MA15 ExoN1 isolate d3om5, complete genome
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| 99,566
|
NC_004718.3
|
SARS coronavirus Tor2
|
He,R., Dobie,F., Ballantine,M., Leeson,A., Li,Y., Bastien,N., Cutts,T., Andonov,A., Cao,J., Booth,T.F., Plummer,F.A., Tyler,S., Baker,L., Li,X.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2003-04-14
|
Tor2
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,751
|
RefSeq
| 1
|
Canada: Toronto
|
Canada
|
Homo sapiens
| null | null | null |
PRJNA485481
|
SARS coronavirus Tor2, complete genome
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| 8,511
|
JX163923.1
|
SARS coronavirus Tor2
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Chen,H., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Powers,N., Grimes,S., Yamamoto,B., Robb,A., Wentworth,D.E., Noah,D.L.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2012-09-17
|
Tor2/FP1-10912
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
| null | null |
2010-02-10
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus Tor2 isolate Tor2/FP1-10912, complete genome
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| 96,232
|
JX163924.1
|
SARS coronavirus Tor2
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Chen,H., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Powers,N., Grimes,S., Yamamoto,B., Robb,A., Wentworth,D.E., Noah,D.L.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2012-09-17
|
Tor2/FP1-10851
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
| null | null |
2010-02-05
| null |
PRJNA260063
|
SARS coronavirus Tor2 isolate Tor2/FP1-10851, complete genome
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| 96,233
|
JX163925.1
|
SARS coronavirus Tor2
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Chen,H., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Powers,N., Grimes,S., Yamamoto,B., Robb,A., Wentworth,D.E., Noah,D.L.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2012-09-17
|
Tor2/FP1-10895
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
| null | null |
2010-02-05
| null |
PRJNA260063
|
SARS coronavirus Tor2 isolate Tor2/FP1-10895, complete genome
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| 96,234
|
JX163926.1
|
SARS coronavirus Tor2
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Chen,H., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Powers,N., Grimes,S., Yamamoto,B., Robb,A., Wentworth,D.E., Noah,D.L.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2012-09-17
|
Tor2/FP1-10912
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
| null | null |
2010-02-10
| null |
PRJNA260063
|
SARS coronavirus Tor2 isolate Tor2/FP1-10912, complete genome
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| 96,235
|
JX163927.1
|
SARS coronavirus Tor2
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Chen,H., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Powers,N., Grimes,S., Yamamoto,B., Robb,A., Wentworth,D.E., Noah,D.L.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2012-09-17
|
Tor2/FP1-10851
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
| null | null |
2010-02-05
| null |
PRJNA260063
|
SARS coronavirus Tor2 isolate Tor2/FP1-10851, complete genome
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| 96,236
|
JX163928.1
|
SARS coronavirus Tor2
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Chen,H., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Powers,N., Grimes,S., Yamamoto,B., Robb,A., Wentworth,D.E., Noah,D.L.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2012-09-17
|
Tor2/FP1-10895
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
| null | null |
2010-02-05
| null |
PRJNA260063
|
SARS coronavirus Tor2 isolate Tor2/FP1-10895, complete genome
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| 96,237
|
AY274119.3
|
SARS coronavirus Tor2
|
He,R., Dobie,F., Ballantine,M., Leeson,A., Li,Y., Bastien,N., Cutts,T., Andonov,A., Cao,J., Booth,T.F., Plummer,F.A., Tyler,S., Baker,L., Li,X.
|
British Columbia Cancer Research Centre, Genome Sciences Centre
|
Canada
|
2003-04-14
|
Tor2
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,751
|
GenBank
| 1
|
Canada: Toronto
|
Canada
|
Homo sapiens
| null | null | null | null |
SARS coronavirus Tor2, complete genome
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| 110,449
|
MT308984.1
|
SARS coronavirus Urbani
|
Menachery,V.D., Yount,B.L. Jr., Debbink,K., Agnihothram,S., Gralinski,L.E., Plante,J.A., Graham,R.L., Scobey,T., Ge,X.Y., Donaldson,E.F., Randell,S.H., Lanzavecchia,A., Marasco,W.A., Shi,Z.L., Baric,R.S., Ge,X.-Y., Shi,Z.-L.
|
University of North Carolina at Chapel Hill, Epidemiology
|
USA
|
2020-05-02
| null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,730
|
GenBank
| 1
| null | null |
Mus musculus
| null | null | null | null |
Mutant SARS coronavirus Urbani clone SARS-Urbani-MA_SHC014-spike, complete genome
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| 50,721
|
MK062179.1
|
SARS coronavirus Urbani
|
Graham,R.L., Deming,D.J., Deming,M.E., Yount,B.L., Baric,R.S.
|
University of North Carolina at Chapel Hill, Epidemiology
|
USA
|
2018-11-21
|
icSARS
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,727
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2017-05-27
| null | null |
SARS coronavirus Urbani isolate icSARS, complete genome
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| 67,046
|
MK062180.1
|
SARS coronavirus Urbani
|
Graham,R.L., Deming,D.J., Deming,M.E., Yount,B.L., Baric,R.S.
|
University of North Carolina at Chapel Hill, Epidemiology
|
USA
|
2018-11-21
|
icSARS-MA
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,727
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2017-05-28
| null | null |
SARS coronavirus Urbani isolate icSARS-MA, complete genome
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| 67,047
|
MK062181.1
|
SARS coronavirus Urbani
|
Graham,R.L., Deming,D.J., Deming,M.E., Yount,B.L., Baric,R.S.
|
University of North Carolina at Chapel Hill, Epidemiology
|
USA
|
2018-11-21
|
icSARS-C3
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,727
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2017-05-29
| null | null |
SARS coronavirus Urbani isolate icSARS-C3, complete genome
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| 67,048
|
MK062182.1
|
SARS coronavirus Urbani
|
Graham,R.L., Deming,D.J., Deming,M.E., Yount,B.L., Baric,R.S.
|
University of North Carolina at Chapel Hill, Epidemiology
|
USA
|
2018-11-21
|
icSARS-C3-MA
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,727
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2017-05-30
| null | null |
SARS coronavirus Urbani isolate icSARS-C3-MA, complete genome
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| 67,049
|
MK062183.1
|
SARS coronavirus Urbani
|
Graham,R.L., Deming,D.J., Deming,M.E., Yount,B.L., Baric,R.S.
|
University of North Carolina at Chapel Hill, Epidemiology
|
USA
|
2018-11-21
|
icSARS-C7
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,874
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2017-05-31
| null | null |
SARS coronavirus Urbani isolate icSARS-C7, complete genome
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| 67,050
|
MK062184.1
|
SARS coronavirus Urbani
|
Graham,R.L., Deming,D.J., Deming,M.E., Yount,B.L., Baric,R.S.
|
University of North Carolina at Chapel Hill, Epidemiology
|
USA
|
2018-11-21
|
icSARS-C7-MA
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,874
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2017-06-01
| null | null |
SARS coronavirus Urbani isolate icSARS-C7-MA, complete genome
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| 67,051
|
AY278741.1
|
SARS coronavirus Urbani
|
Rota,P.A., Oberste,M.S., Monroe,S.S., Nix,W.A., Campagnoli,R., Icenogle,J.P., Penaranda,S., Bankamp,B., Maher,K., Chen,M.H., Tong,S., Tamin,A., Lowe,L., Frace,M., DeRisi,J.L., Chen,Q., Wang,D., Erdman,D.D., Peret,T.C., Burns,C., Ksiazek,T.G., Rollin,P.E., Sanchez,A., Liffick,S., Holloway,B., Limor,J., McCaustland,K., Olsen-Rasmussen,M., Fouchier,R., Gunther,S., Osterhaus,A.D., Drosten,C., Pallansch,M.A., Anderson,L.J., Bellini,W.J., Campagnoli,R.P.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Division of Viral and Rickettsial Diseases
|
USA
|
2003-04-21
| null |
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,727
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
SARS coronavirus Urbani, complete genome
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| 110,441
|
KF514388.1
|
SARS coronavirus wtic-MB
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Motley,J., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Wentworth,D.E., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2013-08-17
|
c1.5P20
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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GenBank
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USA: Nashville, TN
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USA
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2010-10-01
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus wtic-MB strain SARS/VeroE6_lab/USA/WTic_c1.5P20/2010, complete genome
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| 93,415
|
KF514392.1
|
SARS coronavirus wtic-MB
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Motley,J., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Wentworth,D.E., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2013-08-17
|
c1.4P20
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
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|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
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USA
| null | null |
2010-10-01
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus wtic-MB strain SARS/VeroE6_lab/USA/WTic_c1.4P20/2010, complete genome
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|
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|
SARS coronavirus wtic-MB
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Motley,J., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Wentworth,D.E., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2013-08-17
|
c1P20
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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GenBank
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USA: Nashville, TN
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USA
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2009-07-08
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SARS coronavirus wtic-MB strain SARS/VeroE6_lab/USA/WTic_c1P20/2009, complete genome
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SARS coronavirus wtic-MB
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Motley,J., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Wentworth,D.E., Denison,M.R.
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J. Craig Venter Institute
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USA
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2013-08-17
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c3P10
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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GenBank
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USA: Nashville, TN
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USA
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SARS coronavirus wtic-MB strain SARS/VeroE6_lab/USA/WTic_c3P10/2009, complete genome
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|
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SARS coronavirus wtic-MB
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Motley,J., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Wentworth,D.E., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
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USA
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2013-08-17
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c2P10
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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GenBank
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USA: Nashville, TN
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USA
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SARS coronavirus wtic-MB strain SARS/VeroE6_lab/USA/WTic_c2P10/2009, complete genome
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| 93,424
|
KF514398.1
|
SARS coronavirus wtic-MB
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Motley,J., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Wentworth,D.E., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2013-08-17
|
c1.10P20
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
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GenBank
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USA: Nashville, TN
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USA
| null | null |
2010-10-01
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus wtic-MB strain SARS/VeroE6_lab/USA/WTic_c1.10P20/2010, complete genome
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| 93,425
|
KF514399.1
|
SARS coronavirus wtic-MB
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Motley,J., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Wentworth,D.E., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2013-08-17
|
c1.1P20
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
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|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
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USA
| null | null |
2010-10-01
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus wtic-MB strain SARS/VeroE6_lab/USA/WTic_c1.1P20/2010, complete genome
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|
SARS coronavirus wtic-MB
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Motley,J., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Wentworth,D.E., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
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2013-08-17
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c1.8P20
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
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GenBank
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USA
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SARS coronavirus wtic-MB strain SARS/VeroE6_lab/USA/WTic_c1.8P20/2010, complete genome
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|
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|
SARS coronavirus wtic-MB
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Motley,J., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Wentworth,D.E., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2013-08-17
|
c1.9P20
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
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GenBank
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USA: Nashville, TN
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USA
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SARS coronavirus wtic-MB strain SARS/VeroE6_lab/USA/WTic_c1.9P20/2010, complete genome
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|
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SARS coronavirus wtic-MB
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Motley,J., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Wentworth,D.E., Denison,M.R.
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J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2013-08-17
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c2P1
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
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GenBank
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USA: Nashville, TN
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USA
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2009-03-18
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SARS coronavirus wtic-MB strain SARS/VeroE6_lab/USA/WTic_c2P1/2009, complete genome
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|
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SARS coronavirus wtic-MB
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Motley,J., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Wentworth,D.E., Denison,M.R.
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J. Craig Venter Institute
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USA
|
2013-08-17
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c2P20
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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GenBank
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USA: Nashville, TN
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USA
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2009-07-08
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SARS coronavirus wtic-MB strain SARS/VeroE6_lab/USA/WTic_c2P20/2009, complete genome
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| 93,436
|
KF514413.1
|
SARS coronavirus wtic-MB
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Motley,J., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Wentworth,D.E., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2013-08-17
|
c1.6P20
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
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|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
| null | null |
2010-10-01
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus wtic-MB strain SARS/VeroE6_lab/USA/WTic_c1.6P20/2010, complete genome
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| 93,440
|
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|
SARS coronavirus wtic-MB
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Motley,J., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Wentworth,D.E., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2013-08-17
|
c1.7P20
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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GenBank
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USA: Nashville, TN
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USA
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| null |
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SARS coronavirus wtic-MB strain SARS/VeroE6_lab/USA/WTic_c1.7P20/2010, complete genome
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| 93,442
|
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SARS coronavirus wtic-MB
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Motley,J., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Wentworth,D.E., Denison,M.R.
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J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2013-08-17
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c3P1
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
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GenBank
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USA: Nashville, TN
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USA
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2009-03-18
| null |
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SARS coronavirus wtic-MB strain SARS/VeroE6_lab/USA/WTic_c3P1/2009, complete genome
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|
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SARS coronavirus wtic-MB
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Motley,J., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Wentworth,D.E., Denison,M.R.
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J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2013-08-17
|
c1P10
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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GenBank
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USA: Nashville, TN
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USA
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2009-05-19
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SARS coronavirus wtic-MB strain SARS/VeroE6_lab/USA/WTic_c1P10/2009, complete genome
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| 93,446
|
KF514421.1
|
SARS coronavirus wtic-MB
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Motley,J., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Wentworth,D.E., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2013-08-17
|
c1.2P20
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
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|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
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USA
| null | null |
2010-10-01
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus wtic-MB strain SARS/VeroE6_lab/USA/WTic_c1.2P20/2010, complete genome
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| 93,448
|
KF514422.1
|
SARS coronavirus wtic-MB
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Motley,J., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Wentworth,D.E., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2013-08-17
|
c1.3P20
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
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GenBank
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USA: Nashville, TN
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USA
| null | null |
2010-10-01
| null |
PRJNA260063
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SARS coronavirus wtic-MB strain SARS/VeroE6_lab/USA/WTic_c1.3P20/2010, complete genome
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|
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|
SARS coronavirus wtic-MB
|
Town,C.D., Halpin,R.A., Motley,J., Ransier,A., Fedorova,N., Overton,L., Tsitrin,T., Stockwell,T., Amedeo,P., Bishop,B., Edworthy,P., Gupta,N., Katzel,D., Li,K., Schobel,S., Shrivastava,S., Thovarai,V., Wang,S., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Wentworth,D.E., Denison,M.R.
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J. Craig Venter Institute
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USA
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2013-08-17
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c3P20
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Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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GenBank
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USA: Nashville, TN
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USA
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SARS coronavirus wtic-MB strain SARS/VeroE6_lab/USA/WTic_c3P20/2009, complete genome
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| 93,450
|
JF292921.1
|
SARS coronavirus wtic-MB
|
Town,C., Halpin,R., Motley,J., Hostetler,J., Fedorova,N., Overton,L., Stockwell,T., Katzel,D., Li,K., Axelrod,N., Amedeo,P., Schobel,S., Shrivastava,S., Wang,S., Resnick,A., Thovarai,V., Kim,M., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Donaldson,E.F., Lu,X., Graham,R.L., Baric,R.S., Denison,M.R.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2011-03-25
|
c1P1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 29,646
|
GenBank
| null |
USA: Nashville, TN
|
USA
| null | null |
2009-03-18
| null |
PRJNA260063
|
SARS coronavirus wtic-MB isolate c1P1, complete genome
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| 99,581
|
FJ882927.1
|
SARS coronavirus wtic-MB
|
Yount,B., Curtis,K.M., Fritz,E.A., Hensley,L.E., Jahrling,P.B., Prentice,E., Denison,M.R., Geisbert,T.W., Baric,R.S., Eckerle,L.D., Becker,M.M., Halpin,R.A., Li,K., Venter,E., Lu,X., Scherbakova,S., Graham,R.L., Stockwell,T.B., Spiro,D.J., Spiro,D., Halpin,R., McAllen,J., Wang,S., Hostetler,J., Hine,E., Overton,L., Tsitrin,T., Katzel,D., Sarmiento,M., Sitz,J., Amedeo,P., Caler,E., Lorenzi,H., Schobel,S., Sundaram,J.
|
J. Craig Venter Institute
|
USA
|
2009-12-13
|
P1pp1
|
Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,687
|
GenBank
| 2
|
USA: Tennessee
|
USA
| null | null |
2007-09-26
| null | null |
SARS coronavirus wtic-MB isolate P1pp1, complete genome
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| 101,541
|
NC_002066.1
|
Sacbrood virus
|
Ghosh,R.C., Ball,B.V., Willcocks,M.M., Carter,M.J.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1999-03-15
| null |
Iflavirus sacbroodi
|
Iflavirus
|
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,832
|
RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Sacbrood virus complete genome
|
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| 8,766
|
OM744330.1
|
Sacbrood virus
|
Li,N.
|
Institute of Apicultural Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences
|
China
|
2022-12-13
|
Tianjin/2019
|
Iflavirus sacbroodi
|
Iflavirus
|
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,780
|
GenBank
| null |
China: Tianjin
|
China
|
Apis cerana
| null |
2019
|
SAMN18146152
|
PRJNA706851
|
MAG: Sacbrood virus isolate Tianjin/2019, complete genome
|
ATACGAATCGTGATTCGATTCATTATTTCGCCTGAGTAAATCGAGATTTACTTTGACGGGGTTTGCTTGACGTTGCGTCAGACCCGTTATCCTTGTGAGTTATTAGGTTGTGAAGATTTATTCGTGAAGTTATTTAAATAGAAAGGTTATCTTACAGAAAGAAACATAATAAGTTTATTATGGAAGATATTCATCCCATTTTTTATGGATATGATAGAGGTACCAACCGAWTCCTCAGTAGTGGAGGAATTAGAAGAAATCAGTCTTCTGAATATAGCTCATGCGCCAGAACCTATAAAACCAAGCTGGAGGCGCATAATTGCGGAGTGGAAAGATTATCTACAATCCTTACCTCTTGTAAGAAGACATTTGATACAGTGGACTCTTATACCGATTTGTTTAATGGTTGGGTTTCTGGTATGTATGTTAACAARAACGTCCACTACACCGAAATGTCCAGTGATGAGAGTGGACGAAGAATCTGGAATGTTAGACGTGCGGTGTCAGTTAAGACCGCAGAAGGAACTATAGTATGGCGAAAAGTTATTACCTCTTACAGTTGCAAAGTGGCTTCAGAACTRGCAGCTAAGAGTATATTGGTGCAATTTGTAGGTCCAATAAGGACCCAGAGCGATGAGGTACCCTCGAAAGAATCTATTCAGGGGGACGCTACACAGCAAAGTTCCAAGGAAGAAAATACAATCGTTACAAGAGACCAGCAACAGACAGTTTCGGAGAAGATACCATCAACAGTTGGGGATTTGGTAATAGCATCTTCTGAACCAACGCAACAATTTAGGAGTTTAACTAATCGTTGGATGCCTGTTAATTCAATTAGAGTAACAGTAAATAGTAAAAGGAATGATTTGTTGGCACAATATTATATTCCAGAAGACTTTCTGACAACTCACGCYAAGTGTGCGCCCAATACCATACCATTTGAGACTTATGTGTATGGAAAATACGAGTTAGAAATGAAGTTTGTTGCTAATGGTAATAAGTTTCAGTGTGGGAAAGTTATTATTTCTGTTAAATTTGATAGTTATCAAGCTGACAATATTAATACAGGGTTTCAAGCAGCCTTATCTCGACCGCAYATTATGTTAGATTTGTCAACCAATAATGAAGGAGTTCTTAAAATACCGTTTAGGTATCACCGTGCCTTTGTTAGGAATCAAACACATAAAACAGCTACGGTGGGTATAAGACCYGGGAAGTTTGCTAGTATTTACGTACAAGTGYTGTCACCATTACAGACGGGAGAGGGAGGAGCGAACGATATGTTTATACGACCTTTTTATCGGTATACGCGTGCTGAATTTGCGGGAATGTCGTATAAAGTTCCACTGACCCAAATGGATGTTATAGGTACTTTAATATCCGGAGGACCAACACCAGCTCTTAAGGATATTTTAGTAGGTGTAGAGAGAACCTTGGATCAATTGGGTCGCAGTAATAATCAAGATAAACCGAAGGATATAAGTAGTATAACTATAATTCCGAAACCTCGTTTGGGCTTTCCCCACGGGAAAGGTAAAAGTGATGCAGTCGCTATGCGAGTAAATCCGGTGGCATTAACATCATTTCAGGAAGTGAATGCTTATCCTGATGAACCTCGTACTACGTTGGATATAGCTCGTATATGGGGTTTGAGAAGTACGTTTAATTGGGGATCAGGAGATGYACATGGTAAAGAGTTATTTAATACAGTTTTGGATCCATGTTTGAGATTCTATGACCAGGACTATGAAGGACAAATAACCCCAATGGAATATGTAACTGGTTTGTATAACTTTTGGTCAGGGCCTATAGAGTTACGTTTTGATTTTGTTTCCAACGCATTTCATACTGGAACTGTTATTATATCAGCGGAGTATAATCGATCATCTACCAATACAGATGAGTGTCAGTCTCACTCAACTTATACAAAAACGTTCCATTTAGGAGAACAAAAATCAGTACATTTTACTGTGCCTTATATATATGATACGGTTATGCGGAGAAATACGGCTAGCGCCTATTTGCCGGTTACTGATAATGATAAGGTAGATAATGTTAGTAAGGCGCAGGCTATGGGGGTTAGAGCAGAGTCTAAAATGAGAGTGAAAGTRAGAGTAGTTAATGTTTTAAGACCTGTAGCCTCTACGACATCAACAATAGAAGTTTTGGTGTACATGCGAGGAGGACAGAATTATGCATTACATGGTTTAAAACAGTCAACTTATTGGCCATCAAGAAGTGTGGTACCCATAGATAGTTTTCCACCTGATGGTTACGATCCAGTTAAGCCAGCAAATAGACCAAGAAGAGAATCAGACAATCCCCATAGATTCCTGCCCGCGAATRTGTCTAATAGTTGGAATGAGTACTCGAGTGCATATTTACCGCGAGTACAAATGGATACGGGAGCTAAAGAAGATGAAGATGAAACTGCTAATTTCAGTGATGGGGTTACTGCGATGGGTTTCCAATCTTTGGATACCCAAGTATCAATTAAGGATATTTTGCGTAGACCAGTGTTGTTGTTTAATCATGTAGTATTGGATCCTGGTTATACAGGTTTCTTTATACCTATAATGCCGCCTTCTAGAATGATGCAATATAAATCAGGAGATAGGGAAACATCTTTTCAGCGATTAATTGGTCGTACGCCCCAAGCAGCACTAATGAATTTATTTAGGTTTTGGAGAGGGTCACTGCGTTATACTATTATTATACATAGTACCGATGGTCATCCTATATACGTAACGCATGTACCCCACACGGGAAATAGAGTGTATGGTTTAATGAAAGTAAATAATTTGCACGAGTACACGAAGGTTCCTATTTTTGGGTGTGGTTTAACAACTGAAATGATTATTCCTAGCGTGAATCCGAGTATATGTGTAGAAGTACCATTTGATACTGAAAATAACTGGGCTGTGACCTTTGAGGAAGATGCTCAGCGGAACTATTCATGGAGAGACAAAGGCGATACTGTGACTGGACATTTGGTTGTAACACCTGTAGTGCCAGTTAAYATGTCTGTGTGGGTAGAAGCTGGGGATGATTTTGAGGTGTCTAACTTTTATGGGCCACCGACTGTTAAGACAAATGATTGGAAATATGCATTCTCTGATGAGCACGCGCGGGTTCAGATGGATGATAGTACAGAAAGAGTATATGATGAGGGAAACCAGGTGTATTACTATCCGGCCCCTAAGCCCGAGGGTTTTAGTTTGAACAATGTACGGACTTCGGTTAGTACGTTGTGTAATATGCTTGGAAAAGTAGTAACTCCTGAGCGCGCGATGAAAACAGCGTTGTGCGCAACACCYTATTTTGGGTCAGCGTATATGACAGCTACTACTCTTGATGCTATAGGCAGTATGCAGAACACTGTTACGGGAGCAGCACACCAGCTGACGGCATCTGTTGATGCGAGGTTAGAGCAACTGTCAGCTAAGTTTGGAGATTCAATTGACGTAATTACTACAGCTGTTAAGGAGGCTATAGGAAAAATTTCTTCTGGTATGTTTAACATGGTCAATTACACTGGTTACTGTATAGACGTGATATTGGATATATTAGTRGCTTGGATTGACCGAAGTTGGACTGCAGTTGGCGTAGGAATTATTCGATTTGTGACTAAGGTTTTGGGGCTGGGTGCAATTTCTAAAGTTATGAATATGGCTACGACTTTTGGGCAACTTATAGCTAGAGTTTATGAACCTCCACGCCCAGTCGTGCAAGCACCACCTCCTACAGAAGCTACGTTGACTGGAGCGCTGGCAGGTATACTGGGTACACTTATGGGGGTTTATATATCACCGTTGTCTGGAGGAAGCTATTTTAAAAATTTAATGCTGAGGATGACTAGTTCGGCTGGGCCTTCTTATTTGGTGGGGGTCTTACGTTTTGTTGAGGCAACTTTTAACACAGTAAAGGATATGACACTAAATGCTTTGGGTTATGTTTCTCCGGAGAATGCAGCGCTGAAAATGTTATCGGGAACATCGGCTACGATACAGAATTTTATAACTGACGCTCAGCTTATTACTACAGAAGCTAATGCGGCGCTAATGGGACATCCTAGTTTCCGTGCTAAGTACTGGAACACGGTAATGCAAGCATATCAAATACAGAAGTTATTGTTGACTGTTCCCCAGTCTAGTGCCTCTCCAATTTTATCTAGATTGTGTAGTGATGTTATACGTAATAGTAATGAGAAGTTTATTGACATTTCTTCGTCACCGGTGCGTTATGAACCTTTTGTGATTTGTATTGAGGGTCCAGCAGGTATTGGCAAGTCGGAAATAGTGGAAACTCTAGCCTCTGAATTATTGAAAGGAGTTAATTTAAAACGACCACATAGTGGGGCTACTTATTTTCGAATGCCAGGGTCTCGGTTTTGGTCTGGATATAGGGATCAACCAGTGGTGGTTTACGATGATTGGGCTAACTTAACGGAACCTCAAGCTTTAATGCAGCAAATTTCGGAATTATATCAGCTTAAATCAACTTCTACTTTTATTCCGGAAATGGCTCATTTAGAAGAAAAGAAGATTAGAGGTAATCCCCTCATTGTGATATTATTATGTAACCATGCCTTTCCGGATAGTGCAGTTACTAACATGTCTCTCGAACCCAGTGCAATTTATCGTAGGAGAGATGTGTTATTGTATGCAGAAAGAAAACCAGAATATGAGGGGGTTAGTTTGAGAGATATGAGTATTAACGAGCAAACAACATTTGCCCATTTGAATTTTTATAAATATAAGGATTCTACTAATTCATCCTCGTGCACATCTAAACCTGTTGGATATGAGTTGACTAAGGAGTGGCTAGTTGCGAAGTTTGCTAAATGGCACGCGCAGGAACAGATCAAAGTACAAAGACGTATGGAGAATATACGGGCAGGAATGTATGATGCTGAGGTGGGATCTTTGCGTTTGGAAGATCCATTTAGTTTATATTATTCGGTATCTAGTGAAGTTATTGAAAACAGTGAAGATGTTACG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| 21,163
|
ON620343.1
|
Sacbrood virus
|
Simenc,L., Toplak,I.
|
Veterinary faculty, University of Ljubljana, Institute for microbiology and parasithology, Virology Unit
|
Slovenia
|
2022-10-09
|
SBV LS20/2018
|
Iflavirus sacbroodi
|
Iflavirus
|
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,787
|
GenBank
| null |
Slovenia
|
Slovenia
|
Apis mellifera
| null |
2018-11-16
| null | null |
Sacbrood virus isolate SBV LS20/2018, complete genome
|
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Sacbrood virus
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|
Swedish University of Agricultural Sciences, Ecology
|
Sweden
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2021-12-15
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Sweden
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Sweden
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MAG: Sacbrood virus isolate SBV-MR-JUN15, complete genome
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MT636329.1
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Sacbrood virus
|
Thaduri,S., Marupakula,S., Terenius,O., Tellgren-Roth,C., Locke,B., De Miranda,J.R.
|
Swedish University of Agricultural Sciences, Ecology
|
Sweden
|
2021-12-15
|
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|
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Iflavirus
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Iflaviridae
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Sweden
|
Sweden
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Apis mellifera
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MAG: Sacbrood virus isolate SBV-MR-SEP15, complete genome
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MT636331.1
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Sacbrood virus
|
Thaduri,S., Marupakula,S., Terenius,O., Tellgren-Roth,C., Locke,B., De Miranda,J.R.
|
Swedish University of Agricultural Sciences, Ecology
|
Sweden
|
2021-12-15
|
SBV-MR-OCT15
|
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Iflavirus
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Iflaviridae
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Sweden
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Sweden
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Apis mellifera
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MAG: Sacbrood virus isolate SBV-MS-APR15, complete genome
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MT636333.1
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Sacbrood virus
|
Thaduri,S., Marupakula,S., Terenius,O., Tellgren-Roth,C., Locke,B., De Miranda,J.R.
|
Swedish University of Agricultural Sciences, Ecology
|
Sweden
|
2021-12-15
|
SBV-MS-JUN15
|
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Iflavirus
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Iflaviridae
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Sweden
|
Sweden
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Apis mellifera
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2015-06-15
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MAG: Sacbrood virus isolate SBV-MS-AUG15, complete genome
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|
MT636335.1
|
Sacbrood virus
|
Thaduri,S., Marupakula,S., Terenius,O., Tellgren-Roth,C., Locke,B., De Miranda,J.R.
|
Swedish University of Agricultural Sciences, Ecology
|
Sweden
|
2021-12-15
|
SBV-MS-SEP15
|
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|
Iflavirus
|
Iflaviridae
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ssRNA(+)
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GenBank
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Sweden
|
Sweden
|
Apis mellifera
| null |
2015-09-15
|
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PRJNA784528
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MAG: Sacbrood virus isolate SBV-MS-SEP15, complete genome
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MAG: Sacbrood virus isolate SBV-MS-OCT15, complete genome
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| 34,919
|
MT482477.1
|
Sacbrood virus
|
Roberts,J.M.K., Simbiken,N., Dale,C., Armstrong,J., Anderson,D.L.
|
Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation, Health and Biosecurity
|
Australia
|
2020-06-27
|
SBV/PNG-2014
|
Iflavirus sacbroodi
|
Iflavirus
|
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,835
|
GenBank
| 1
|
Papua New Guinea
|
Papua New Guinea
|
Apis mellifera
| null |
2014-05
| null | null |
Sacbrood virus isolate SBV/PNG-2014, complete genome
|
TACGAATCGTGATTCGATTCATTATTTCGCCTGAGTAAATCGAGATTTACCTTGACGGGGTTTGCTTGACGTTGCGTCAGACCCGTTTTCCTTGTGATTTTTAGGTTGTGAAGATTTATTCGAGAAAATTAATTAAACGGAAAGTTTATTATATATAAAAAGACATAATAAGTTTATTATGGATTACAGTTCTCCTATGTTTTATGGAGATGTTAGAAGTACCAACCGATTCCTCAATAGTGGAGGAATCAGAAGAAATCAGTCTTCTGAATATAGCTCACGCGCCAGAACCTATAAAACCAAGCTGGAAGCGCGTAATTGCGGAGTGGAAAGATTATCTACAATCCTTACCTCTAGTAAGAAGACATTTGATACAGTGGACTCTTATACCGATTTGTTTAATGGTTGGGTTTCTGGTATGTATGTTGACAAGAACGTCCACTACACCGAGATGTCCAGTGATGAGAGTGGACGAAGAATCTGGAATGTTAGACGCGCAGTGTCAATTAAGACCGCAGAAGGAACTATAGTGTGGCGAAAAGTTATTACCTCTTATAGTAGTAAGGTGGCTTCAGAGTTAGCTGCTAAAAGTATATTGGTGCAATTTTTAGGTCCAATAAGAACCCAGAGTGATGAGGTACCCTCGAAAGAATCTATTCAGGGGGACGCTACACAGCAAAGTTCCAAGGAGGAAAATACTATTATTACACGAGATCAGCAACAAACTGTTTCGGAAAAGATACCATCAACATTGGGGGACTTGGTAATAGCTTCTTCCGAACCGACGCAACAATTTAGGAGTTTAACTAATCGTTGGATGCCTATTAACTCAATTAAAGTAACAGTGAACGGTAAAAGGAATGACATCTTGGCACAGTATTATATCCCAGAAGATTTTCTATCAACTCATGCTAAGTGCGCGCCCAACACTATACCATTTGAGACTTACGTGTATGGAAAATATGAGTTAGAAATGAAGTTTGTCGCTAATGGTAATAAGTTTCAGTGTGGGAAAGTTATTATTTCTGTAAAGTTTGATAGCTACCAAGCAGACAATATAAATACAGGATTTCAAGCAGCATTATCGCGACCGCACATTATGTTGGATTTGTCAACTAATAATGAAGGAGTTCTTAAAATACCGTTTAGATACCACCGAGCTTTTGTTAGGAATCAAACGCATAAAACTGCTACGGCAGGTATAAGACCTGGGAAGTTTGCTAGTATTTATGTGCAAGTGTTGTCACCATTACAGACGGGAGAGGGAGGAGCGAATGATATGTTTATACGACCCTTTTACCGATATACGCGTGCTGAATTTGCGGGAATGTCGTATAAAGTCCCACTGACTCAGATGGATGTTATAGGTACTCTAATATCCGGGGGACCAACACCAGCCCTAAAGGATATACTAGTAGGCGTTGAAAGAACATTGGATCAATTGGGTCGAAGTAGTAATCAAGATAAACCGAAGGATATAAGTAGCATAACTATAATTCCGAAACCTCGCTTGGGTTTTCCTCATGGGAAAGGTAAGAGTGATGCGGTAGCTATGCGAGTAAATCCGGTAGCATTAACATCATTTCAAGAAGTGAGTGCTTATCCTGATGAGCCCCGTACTACGTTGGATATAGCTCGTATATGGGGTTTGAGAAGTACATTTAATTGGGGATCCGGAGATGAACATGGGAAAGAATTATTTAATACAGTTTTGGATCCAGGTTTGAGATTCTATGATCAAGATTATGAAGGGCAAATTACTCCGATGGAATATGTAACTGGGTTGTATAATTTTTGGTCAGGGCCAATAGAGTTACGTTTTGATTTTGTTTCAAATGCGTTTCATACAGGAACTGTAATTATATCAGCGGAGTATAATCGATCGTCTACCAATACAGATGAGTGCCAATCTCACTCAACTTATACAAAAACGTTTCACTTGGGAGAACAAAAATCAGTACATTTTACTGTACCTTATATATATGATACTGTAGTGCGGAGAAATACGGCTAGCGCTTATTTACCGGTGACTGATAATGATAATGTAGATAATGTTAGTAGGGCACAAGCTATGGGGGTTAGAGCAGAGTCTAAGATGAGAGTGAAAGTGCGAGTAGTTAATGTATTAAGGCCCGTAGCCTCTACTACCTCAACGATAGAAGTTTTGGTGTATATGCGAGGAGGAAGGAACTATGCATTGCATGGTTTAAAACAGTCGACTTATTGGCCGTCAAGAAGTGTGGTGCCTATAGACAGTTTTCCACCTGATGGTTATGATCCGGTTAAGCCACCAAATAGATCAAGAAGGGAGTTAGTATCTCCAGGCAGTGATGGGGGTAAGGGACAACCTGAGGTGGCAGCGACAGATAATCCACATAGGTTCCTGCCAGCGAATGTATCCAATCGTTGGAATGAATACTCTAGTTCTTATTTGCCACGTGTACAAATGGACACTGGGGCTAAGGAGGATGAAGATGAAACTGCGAATTTTAGTGATGGGGTTACTGCGATGGGTTTCCAATCTTTGGATACCCAGGTGTCAATTAAGGATATTCTGCGTAGACCAGTGTTGTTGTTTAATCACGTAGAATTGGATCCCGATTATACAGGTTTTTTTATACCTATAATGCCACCTTCTAGAATGATGCAATATAAATCAGGAGATAAGGAAACGTCTTTTCAGCGGTTAATTGGTCGGACTCCTCAAGCAGCACTAATGAATTTATTTAGGTTCTGGAGAGGATCATTGCGTTACACTATTATTATACATAGCACTGATGGTCATCCTATATATGTGACGCACGTGCCCCACACGGGAAATAGAGTGTATGGTTTAATGAAAGTAAATAACTTACACGAGTATACTAAGGTTCCAATTTTTGGGTGTGGATTAACAACTGAAATGATTATTCCTAGCGTGAACCCGAGTATATGTGTAGAAGTCCCATTTGATACTGAAAACAACTGGGCTGTGACATTTGAAGAAGATGCGCAAAGGAATTATTCATGGAGAGATAAAGGGGATACTGTGACCGGACATTTGGTTGTAACACCTGTAGTATCAGTTTATATGTCAGTGTGGGTAGAAGCTGGGGATGATTTTGAGGTATCTAACTTTTATGGGCCACCGATTGTAAAGACGAATGATTGGAACTATGCTTTTTCTGATGAGCATGTACAAGTTCAGATGGATGATAGTATAGAAAGGGTATATGATGAGGGAAACCAAGTGTATTACTATCCGCCCCCTAAACCAGAGGGTTTTAGTTTGAACAATGTACGGACTTCGGTTAGTACGTTGTGTAATATGCTTGGAAAAGTAGTAACTCCAGAGCGAGCGGTGAAAACAGCGTTGTGTGCTACTCCTTATTTTGGGTCAGCGTATATGACAGCTACCACCCTTGATGCTATAGGTAGTATGCAGAATACTGTTACGGGAGCAGCGCACCAGCTGACAGCATCTGTTGATGCGAGGTTAGAGCAACTGTCAGCTAAGTTTGGAGATTCAATTGACGTAATTACGACAGCGGTTAAGGAGGCTATAGGTAAAATATCTTCTGGTATGTTTAATATGGTTAACTATACTGGTTACTGTATAGATGTGATCCTGGATATACTGGTGGCGTGGATTGATCGAAGTTGGACTGCTGTCGGAGTAGGAATTATTCGATTTGTGACTAAGGTTTTGGGGTTGGGTGCAATTTCTAAAGTTATGAATATGGCTACAACCTTTGGGCAGCTTATAGCTAGAGTTTATGAGCCTCCACGCCCAGTTGTGCAAGCACCACCTCCCACAGAGGCTACATTGACTGGAGCTTTGGCAGGTATACTTGGTACGCTTATGGGGGTTTATATATCGCCGTTGTCTGGAGGAAGCTATTTTAAGAATTTGATGTTGAGAATGACTAGTTCGGCTGGTCCTTCTTATTTGGTGGGGGTTTTACGTTTTGTCGAGGCAACTTTTAATACAGTGAAGGATATGACATTGAATGCTTTGGGTTACGTGTCCCCAGAGAATGCGGCGCTTAAAATGCTGTCAGGAACATCGACTACTATACAGAATTTTATAACCGACGCTCAGCTCATCACTACGGAAGCTAATGCGGCACTAGTGGGACATCCCAGTTTTCGTGCTAAATATTGGAACACGGTAATGCAAGCATATCAAATACAGAAGTTATTGTTAACTGTCCCTCATTCTAGTGCCTCACCAATTTTATCTAGACTGTGTAGTGATGTTATACGTAACAGTAATGAAAAGTTTATTGATATTTCTTCTTCACCAGTGCGTTATGAACCTTTCGTGATCTGTATTGAGGGTCCAGCGGGCATAGGTAAATCGGAAATAGTGGAAACCTTGGCCTCTGAATTATTGAAAGGAGTTAGTTTAAAACGACCACACAGTGGGGCTACGTATTTTCGAATGCCAGGGTCTCGGTTTTGGTCTGGTTATAGGGATCAACCAGTAGTAGTTTATGATGATTGGGCTAATCTAACGGAACCACAAGCTTTAATGCAGCAAATTTCGGAATTGTATCAGCTTAAATCAACTTCTACTTTTATCCCGGAAATGGCTCATTTAGAGGAAAAGAAGATTAGGGGTAATCCCCTTATTGTAATACTATTGTGTAATCATGCTTTTCCCGATAGTGCAGTTACTAACATGTCTCTTGAACCTAGTGCTATTTACCGTAGGAGAGATGTGTTACTGTATGCGGAAAGAAAACCAGAATATGAGGGAGTTAGTTTGAGGGATATGAGTGTTAACGAACAAACTACGTTTGCTCATTTGAATTTTTACAAATATAAGGATTCTACTAATTCATCCTCGTGTACATCTAAACCTGTTGGATATGAATTGACTAGGGATTGGCTGGTTGCAAAGTTTGCTAAATGGCATGCTCAGGAACAGATTAAAGTACAGAGACGTATGGAGAACATCCGGGCAGGAATGTATGATGCTGAGGTGGGATCTTTGCGTTTGGAAGATCCATTTAGTT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| 48,838
|
MN082651.1
|
Sacbrood virus
|
Chang,J.-C., Chen,Y.-W., Nai,Y.-S.
|
National Ilan University, Department of Biotechnology and Animal Science
| null |
2020-02-12
|
AmSBV-TW
|
Iflavirus sacbroodi
|
Iflavirus
|
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,885
|
GenBank
| null |
Taiwan
|
Taiwan
|
Apis mellifera
| null |
2018-06-13
| null | null |
Sacbrood virus isolate AmSBV-TW, complete genome
|
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| 53,919
|
MN082652.1
|
Sacbrood virus
|
Chang,J.-C., Chen,Y.-W., Nai,Y.-S.
|
National Ilan University, Department of Biotechnology and Animal Science
| null |
2020-02-12
|
AcSBV-TW
|
Iflavirus sacbroodi
|
Iflavirus
|
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,776
|
GenBank
| null |
Taiwan
|
Taiwan
|
Apis cerana
| null |
2018-07-07
| null | null |
Sacbrood virus isolate AcSBV-TW, complete genome
|
TTTTGTGATTCGATTCATTATTTCGCCTGAGTAAATCGAGATTTACCTTGACGGGGTTTGCTTGACGTTGCGTCAGACCCGTTATCCTTGTGAGTTATTAGGTTGTGAAGATTTATTCGTGAAGTTGTTTAAGTAGAAAGGTTATCTTACAGAAAGAAACATAATAAGTTTATTATGGAAGATATTCATCCCATTTTTTATGGATATGATAGAGGTACCAACCGATTCCCCAGTAGTGGAGGAATTAGAGGAAATCAGTCTTTTGAATATAGCTCATGCGCCAGAACCTATAAAACCAAGTTGGAGGCGCATAATTGCGGAGTGGAAAGACTATCTACAATCCTTACCTCTTGTAAGAAGACATTTGATACAGTGGACTCTTATACCGATTTGTTTAATGGTTGGGTTTCTGGTATGTATGTTAACAAGAACGTCCACTACACCGAAATGTCCAGTGATGAGAGTGGACGAAGAATCTGGAATGTTAGACGTGCAGTGTCAGTTAAGACCGCAGAAGGAACTATAGTATGGCGAAAAGTTATTACCTCTTATAGTTGCAAAGTGGCTTCAGAATTAGCAGCTAAGAGTATATTGGTGCAATTTGTAGGTCCAATAAGGACCCAGAGCGATGAGGTACCCTCGAAAGAATCTATTCAGGGGGACGCTACACAGCAAAGTTCCAAGGAAGAAAACACAATAGTTACAAGAGACCAGCAACAGACTGTTTCGGAAAAGATACCATCAACGGTTGGGGATTTGGCAATAGCATCGTCTGAACCAACGCAACAATTTAGGAGTTTAACTAATCGTTGGATGCCTGTTAATTCAATTAGAGTAACAGTAAATAGTAAAAGGAATGATTTGTTGGCACAATATTATATCCCAGAAGATTTTCTGACAACTCATGCTAAGTGTGCGCCCAATACCATACCATTTGAGACTTACGTGTATGGAAAGTACGAGTTAGAAATGAAGTTTGTGGCTAATGGTAATAAGTTTCAGTGTGGGAAAGTTATTATTTCTGCAAAATTTGATAGTTATCAAGCTGATAATATTTATACAGGGTTTCAAGCAGCCTTATCTCGACCGCACATTATGTTAGATTTGTCAACCAATAATGAAGGAGTTCTTAAAATACCATTTAGGTATCACCGTGCCTTTGTTAGGAATCAAACACATAAAACAGCTACGGTGGGTATAAGACCTGGGAAGTTTGCTAGTATTTATGTACAAGTGCTGTCACCATTACAGACGGGAGAGGGAGGAGCGAACGATATGTTTATACGGCCTTTTTATCGGTATACGCGTGCCGAATTTGCGGGAATGTCGTATAAAGTTCCACTGACCCAAATGGATGTTATAGGTACTTTAATATCCGGAGGACCAACACCAGCTCTTAAGGATATTTTAGTAGGTGTAGAGAGAACCTTGGATCAATTGGGCCGAGGTAATAATCAAGATAAACCGAAGGATATAAGTAGTATAACTATAATTCCGAAACCTCGTTTGGCTTTCCCCATGGGAAAGGTAAAAGTGATGCAGTCGCTATGCGAGTGTCCGGTGGCACTAACATCATTTCAGGATGTGAATGCTTATCCGGATGAGACTCGTACTACGTTGGATATAGCTCGTATATGGGGTTTGAGAAGTACGTTTAATTGGGGATCAGGAGATGCACACGGTAAAGAATTATTTAATACAGTTTTGGATCCATGTTTGAGATTTTATGATCAGGATTACGAAGGACAAATAACCCCAATGGAATATGTAACTGGGTTGTATAACTTTTGGTCAGGGCCTATAGAGTTACGTTTTGATTTTGTTTCAAATGCGTTCCATACTGGAACAGTTATTATATCAGCGGAGTATAATCGATCATCTACCAATACAGATGAGTGCCAGTCTCACTCAACTTATACAAAAACGTTCCATTTAGGAGAGCAAAAATCAGTACATTTTACTGTGCCTTATATATATGATACGGTTATGCGGAGAAATACGGCTAGCGCCTATTTACCGGTCACTGATAACGATAAGGTAGATAATGTTAGTAGGGCGCAGGCTACGGGGGTTAGAGCAGAGTCTAAAATGAGAGTGAAAGTGAGAGTAGTTAATGTTTTAAGACCTGTAGCCTCTACGACATCGACTATAGAAGTTTTGGTGTATATGCGAGGAGGACAGAATTATGCATTACATGGTTTAAAACAGTCAACTTATTGGCCGTCAAGAAGTGTGGTACCCATAGATAGTTTTCCACCTGATGGTTACGATCCAGTTAAGCCAGCAAATAGACCAAGAAGAGAATCAGATAATCCCCATAGATTCTTACCCGCGAATGTATCTAATAGTTGGAATGAGTACTCGAGTGCATACTTACCGCGAGTACAAATGGATACTGGAGCTAAAGAAGATGAAGATGAAACTGCTAATTTCAGTGATGGGGTTACTGCGATGGGTTTCCAATCTTTGGATACTCAAGTATCAATTAAGGATATTTTGCGTAGACCAGTGTTGTTGTTTAATCACGTAGTATTGGATCCTGGTTATACAGGTTTTTTTATACCTGTGATGCCGCCTTCTAGAATGATGCAATATAAATCAGGAGATAAGGAAACATCTTTTCAGCGATTAATTGGTCGTACGCCCCAAGCAGCAATAATGAATTTATTTAGGTTTTGGAGAGGGTCATTGCGTTATACTATTATCATACATAGTACCGATGGTCATCCTATATACGTAACGCATGTACCCCATACGGGAAATAGAGTGTATGGTTTAATGAAAGTAAATAATTTGCACGAGTATACGAAGGTTCCTATTTTTGGGTGTGGTTTAACGACTGAAATGATTATTCCCAGCGTGAACCCGAGTATCTGTGTAGAAGTACCATTTGATACTGAAAATAACTGGGCTGTGACCTTTGAGGAGGATGCTCAGCGGAACTATTCGTGGAGAGATAAAGGCGATACTGTAACCGGACATTTGGTTGTAACACCTGTAGTGCCAGTTAACATGTCTGTGTGGGTAGAAGCTGGGGATGACTTTGAGGTGTCAAACTTTTATGGGCCACCGACTGTTAAGACGAATGATTGGAAATATGCTTTCTCTGATGAGCATGCGCGGGTTCAAATGGATGATAGTACAGAAAGAGTATATGATGAGGGAAACCAGGTGTATTACTATCCGGCCCCCAAGCCCGAGGGTTTTAGTTTGAACAATGTACGGACTTCGGTTAGTACGTTGTGTAATATGCTTGGAAAAGTAGTAACTCCCGAGCGCGCAGTGAAAACAGCGTTGTGCGCAACACCCTATTTTGGGTCAGCGTATATGACAGCAACTACTCTTGATGCTATAGGCAGTATGCAGAATACCGTTACGGGAGCAGCACACCAGCTGACGGCATCTGTTGATGCGAGGTTAGAGCAACTGTCAGCTAAGTTTGGAGATTCAATTGACGTAATTACTACAGCGGTTAAGGAGGCTATAGGAAAAATTTCTTCTGGTATGTTTAACATGGTCAATTACACTGGTTACTGTATAGACGTGATATTGGATATATTAGTGGCTTGGATTGATCGAAGTTGGACTGCAGTTGGAGTAGGAATAATTCGATTTGTGACTAAGGTTTTGGGGTTGGGTGCAATTTCGAAAGTTATGAATATGGCTACAACTTTTGGGCAACTTATAGCTAGAGTTTATATATCTCCACGCCCAGTCGTGCAAGCACCACCTCCTACAGAAGCTACGTTGACTGGAGCTCTTGCAGGTATACTGGGTACGCTTATGGGGGTTTATATATCACCGTTGTCTGGAGGAAGCTATTTTAAAAATTTAATGCTGAGGATGACTAGTTCGGCTGGGCCTTCTTATTTGGTGGGGGTCTTACGTTTTGTTGAGGCAACTTTTAATACAGTAAAGGATATGACACTAAATGCTTTGGGTTACGTTTCTCCAGAGAATGCAGCGCTGAAAATGTTATCGGGAACATCGGCTACGATACAGAATTTTATAACTGATGCTCAGCTTATTACTACAGAAGCTAATGCGGCGCTAGTGGGACATCCTAGTTTTCGTGCTAAGTACTGGAATACGGTAATGCAAGCCTATCAAATACAGAAATTATTATTGACTGTTCCTCAGTCTAGTGCCTCTCCAATTTTATCTAGATTGTGTAGCGATGTTATACGTAATAGTAATGAGAAGTTTATTGACATCTCTTCGTCACCGGTGCGTTATGAACCTTTTGTGATTTGTATTGAGGGTCCAGCAGGTATTGGCAAGTCGGAAATAGTGGAAACTCTAGCATCTGAATTATTGAAAGGGGTTAATTTAAAACGACCACATAGCGGGGCTACTTATTTTCGAATGCCAGGGTCTCGGTTTTGGTCTGGATACAGGGACCAACCAGTGGTGGTTTACGATGATTGGGCTAACTTAACGGAACCTCAAGCTTTAATGCAGCAAATTTCGGAACTATATCAGCTTAAATCAACTTCTACTTTTATTCCGGAAATGGCTCATTTGGAAGAAAAGAAGATTAGAGGTAATCCCCTTATTGTGATATTATTATGTAATCATGCCTTTCCGGATAGTGCAGTTACTAACATGTCTCTCGAACCCAGTGCAATTTATCGTAGGAGAGATGTGTTATTGTATGCAGAAAGAAAACCAGAATATGAGGGGGTTAGTTTGAGAGATATGAGTGTTAACGAGCAAACTACATTTGCTCATTTGAATTTTTATAAGTACAAGGATTCTACTAATTCATCCTCGTGCACATCTAAACCTGTTGGATATGAGTTGACTAAGGAGTGGCTAGTTGCGAAGTTTGCTAAATGGCACGCGCAGGAACAGATTAAAGTACAAAGACGTATGGAGAATATACGGGCAGGAATGTATGATGCTGAGGTGGGATCTTTGCGTTTGGAAGACCCATTCAGTTTATATTACTCAGTATCTAGTGAAGTTATTGAAAATAGTGAAGATGTTACGACTGGGTT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| 53,920
|
MN266898.1
|
Sacbrood virus
|
Ouyang,B., Yang,J., Peng,L.
|
Sichuan Agricultural University, College of Animal Science and Technology
|
China
|
2020-01-13
|
CSBV-WJ
|
Iflavirus sacbroodi
|
Iflavirus
|
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,824
|
GenBank
| null |
China: Sichuan, Wenjiang
|
China
|
Apis cerana
| null |
2018-04-15
| null | null |
Sacbrood virus isolate CSBV-WJ, complete genome
|
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| 54,710
|
MN266899.1
|
Sacbrood virus
|
Ouyang,B., Yang,J., Li,W.
|
Sichuan Agricultural University, College of Animal Science and Technology
|
China
|
2020-01-13
|
CSBV-WY
|
Iflavirus sacbroodi
|
Iflavirus
|
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,824
|
GenBank
| null |
China: Sichuan, Wanyuan
|
China
|
Apis cerana
| null |
2018-04-17
| null | null |
Sacbrood virus isolate CSBV-WY, complete genome
|
TACGAATCGTGATTCGATTCATTATTTCGCCTGAGTAAATCGAGATTTACCTTGACGGGGTTTGCTTGACGTTGCGTCAGACCCGTTTTCCTTGTGAGTTTGAGGTTGTGAAGATTTATTCGTGAAGTTAATTAAACAGAAAGTTTATTATATATAGAGAGATATAAGAAGTTTATTATGGAAGATATTCATCCTATCTTTTATGGATATGATAGAGGTACCAACCGATTCCCCAGTAGTGGAGGAATTAGAAGAAATCAGTCTTCTGAATATAGCTCATGCGCCAGAACCTATAAAACCAAGCTGGAGGCGCATAGTTGCGGAGTGGAAAGACTATCTACAATCCTTACCTCTTGTAAGAAGACATTTGATACAGTGGACTCTTATACCGATTTGTTTAATGGTTGGGTTTCTGGTATGTATGTTAACAAGAACGTCCACTACACCGAAATGTCCAGTGATGAGAGTGGACGAAGAATCTGGAATGTTAGACGCGCGGTGTCAGTTAAGACCGCAGAAGGAACTATAGTATGGCGAAAAATTATTACCTCTTACAGTTGCAAAGTGGCTTCAGAATTAGCAGCTAAGAGTATATTGGTGCAATTTGTAGGTCCAATAAGGACTCAGAGTGATGAGGTACCCTCGAAAGAATCTATTCAGGGGACCGCTACACAGCAAAGTTCCAAGGAAGAAAATACAATAGTTACAAGAGATCAGCAACAGACAGTTTCGGAAAAGATACCATCAACAGTTGGGGATTTGGTAATAGCATCTTCTGAACCAACGCAACAATTTAGGAGTTTAACTAATCGTTGGATGCCTGTTAATTCAATTAGAGTAACAGTAAATAGTAAAAGGAATGATTTGTTGGCACAATATTATATCCCAGAAGATTTTCTGACAACTCACGCTAAGTGTGCGCCCAATACCATACCATTTGAGACTTATGTGTATGGAAAATACGAGTTAGAAATGAAATTTGTGGCTAATGGTAATAAGTTTCAGTGTGGGAAAGTTATTATATCTGTAAAATTTGATAGTTATCAAGCTGACAATATTAATACAGGGTTTCAAGCAGCCTTATCTCGGCCGCACATTATGTTAGATTTGTCAACCAATAACGAAGGAGTTCTTAAAATACCATTTAGGTATCACCGCGCCTTTGTTAGGAATCAAACACATAAAACAGCTACGGTGGGTATAAGACCTGGGAAGTTTGCTAGTATTTATGTGCAAGTGCTGTCACCATTACAGACGGGAGAGGGCGGAGCGAACGATATGTTTATACGGCCTTTCTACCGGTATACGCGTGCTGAATTTGCGGGAATGTCGTATAAAGTTCCACTGACCCAAATGGATGTTATAGGTACTTTAATCTCCGGAGGACCAACACCAGCTCTTAAGGATATTTTAGTAGGTGTAGAGAGGACCTTGGATCAATTGGGCCGAAGTAATAATCAAGATAAACCGAAGGACATAAATAGTATAACTATAATTCCGAAACCTCGTTTGGGCTTTCCCCACGGGAAAGGTAAAAGTGATGCAGTTGCTATGCGAGTAAATCCGGTGGCATTAACATCATTTCAGGATGTGAATGCTTATCCTGATGAACCTCGTACTACATTGGATATAGCTCGTATATGGGGTTTGAGAAGTACGTTCAATTGGGGATCAGGAGATGCACATCTTAAAGAGTTATTTAATACAGTTTTGGATCCATGTTTGAGATTTTATGATCAGGACTACGAAGGACAAATAACCCCAATGGAATATGTAACTGGGTTGTATAATTTTTGGTCAGGGCCTATAGAGTTACGTTTTGATTTTGTTTCAAATGCGTTTCACACCGGAACTGTGATTATATCAGCGGAGTATAATCGTTCATCTACTAATACGGATGAGTGCCAGTCTCACTCAACTTATACAAAAACGTTCCACTTAGGAGAACAAAAATCAGTACATTTTACTGTGCCTTATATATATGATACGGTTATGCGGAGAAATACGGCTAGCGCCTATTTACCGGTTACTGATAATGATAAGGTAGATAATGTTAGTAAGGCGCAGGCTACGGGGGTTAGAGCAGAGTCTAAAATGAGAGTGAAAGTGAGAGTAGTTAATGTTTTAAGACCTGTAGCCTCTACAACATCAACTATAGAAGTTTTGGTGTATATGCGAGGAGGACAGAATTACGCATTACATGGTTTAAAACAGTCAACTTATTGGCCGTCAAGAAGTGTGGTACCCATAGATAGTTTTCCACCGGATGGTTACGATCCAGTTAAGCCAGCAAATAGCAATACCAAGAAGAGACAATCTGTGGTAGATAATCCCCACAGATTTCTGCCCGCGAATGTGTCTAATGGTTGGAATGAGTACTCGAGTGCATATTTACCGCGAGTACAAATGGATACTGGAGCTAAAGAAGATGAAGATGAAACTGCTAATTTCAGCGATGGGGTTACTGCGATGGGTTTCCAATCTTTGGATACCCAAGTATCAATTAAGGATATTTTACGTAGACCAGTGTTGTTGTTTAATCACGTAGTATTGGATCCTGGTTATACAGGTTTTTTTATACCTATAATGCCGCCTTCTAGAATGATGCAATATAAATCAGGAGATAAGGAAACATCTTTTCAGCGATTAATTGGTCGTACGCCCCAAGCAGCAATAATGAATCTATTTAGGTTTTGGAGAGGGTCATTGCGTTATACTATTATTATACACAGTACCGATGGTCATCCTATATATGTCACGCATGTACCCCACACGGGAAATAGAGTGTATGGTTTAATGAAAGTAAATAATTTGCACGAGTATACGAAGGTACCCATTTTTGGGTGTGGTTTAACAACTGAAATGATTATTCCTAGCGTGAATCCGAGTATATGTGTAGAAGTACCATTTGATACTGAAAATAACTGGGCTGTGACCTTTGAGGAAGATGCTCAGCGGAACTACTCATGGAGAGACAAAGGTGATACTGTGACCGGACATTTGGTTGTAACACCTGTAGTGCCAGTCAATATGTCCGTGTGGGTAGAAGCTGGGGATGATTTTGAGGTGTCTAATTTTTATGGGCCACCGACTGTTAAGACGAATGATTGGAAATACGCATTCTCTGATGAGCACGCGCGGGTTCAAATGGATGATGGTACTGAAAGAGTATACGATGAGGGAAACCAGGTGTATTATTATCCGGCCCCTAAGCCAGAGGGTTTTAGTTTGAACAATGTACGGACTTCGGTTAGTACGTTGTGTAATATGCTCGGTAAAGTAGTAACTCCTGAGCGCGCAGTGAAAACAGCGTTGTGCGCAACACCCTATTTTGGGCCAGCGTATATGACAGCTACTACTCTTGATGCAATAGGCAGTATGCAGAACACTGTTACGGGAGCAGCACACCAACTGACGGCATCTGTTGATGCGAGGTTAGAGCAATTGTCAGCTAAGTTTGGAGATTCAATTGACGTTATTACTACGGCAGTTAAGGAGGCTATAGGAAGGATTTCTTCTGGTATGTTTAACATGGTCAATTACACTGGTTACTGTATAGACGTAATATTGGATATATTAGTGGCTTGGATTGATCGAAGTTGGACTGCAGTTGGAGTAGGAATCATTCGATTTGTGACTAAGGTTTTGGGGTTGGGTGCAATTTCTAAAGTTATGAATATGGCTACGACTTTTGGGCAACTTATAGCTAGAGTTTATGAGCCTCCACGCCCAGTTGTGCAAGCACCACCTCCTACAGAAGCTACATTGACTGGAGCTCTGGCAGGTATACTGGGTACGCTTATGGGGGTTTATATATCACCGTTGTCTGGAGGAAGCTATTTTAAAAATTTAATGCTGAGGATGACTAGTTCGGCTGGGCCTTCTTATTTGGTGGGGGTCTTACGTTTTGTTGAGGCAACTTTTAATACAGTAAAGGATATGATACTAAATGCTTTGGGTTACGTTTCTCCGGAGAATGCTGCGCTGAAAATGTTATCGGGAACATCGGCTACGATACAAAATTTTATTACTGACGCTCAGATTATTACTACAGAAGCTAATGCGGCGCTAGTGGGACATCCTAGTTTCCGTGCTAAGTATTGGAACACGGTAATGCAAGCATATCAAATACAGAAATTACTATTGACTGTTCCTCAGTCTAGTGCTTCTCCAATTTTATCTAGACTGTGTAGTGATGTTATACGTAATAGTAATGAGAAGTTTATTGACATCTCTTCGTCACCGGTGCGTTATGAACCTTTTGTGATTTGTATTGAGGGTCCAGCAGGTATCGGCAAATCGGAAAGTGTGGAAACTCTAGCCTCTGAATTATTGAAAGGAGTTAATTTAAAACGACCACATAGTGGGGCTACTTATTTCCGGATGCCAGGGTCTCGGTTTTGGTCCGGATATAGGGATCAACCAGTGGTGGTTTATGATGATTGGGCTAACTTAACGGAACCCCAAGCTTTAATGCAGCAAATTTCGGAATTGTATCAACTTAAATCAACTTCTACTTTTATTCCGGAAATGGCTCATTTGGAAGAAAAGAAGATTAGAGGTAATCCCCTTATTGTGATATTATTATGTAACCATGCCTTTCCGGATAGCGCAGTTACGAACATGTCTCTCGAACCCAGTGCAATTTACCGTAGGAGAGATGTGTTATTGTACGCAGAAAGAAAACCAGAATATGAGGGGGTTAGTTTGAGAGATATGAGTGTTAATGAGCAAACTACATTTGCTCATTTGAATTTCTACAAGTATAAGGATTCTACTAAGTCATCCTCGTGTACAACTAAACCTGTTGGATATGAGTTGACTAAGGAGTGGCTAGTGGCGAAGTTTGCTAAATGGCATGCGCAGGAACAGATCAAAGTCCAAAGACGTATGGAGAATATACGGGCAGGAATGTACGATGCTGAGGTGGGATCTTTGCGTTTGGAAGACCCATTCAGTTTATATTACTCAGTATCTAGTGAAGTTATTGAAAATAGTGA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| 54,711
|
MK719542.1
|
Sacbrood virus
|
Ouyang,B., Peng,L., Yang,J.
|
Sichuan Agricultural University, College of Animal Science and Technology
|
China
|
2019-10-23
|
CSBV-SC/China/2018
|
Iflavirus sacbroodi
|
Iflavirus
|
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,863
|
GenBank
| null |
China: Sichuan, Aba, Maerkang
|
China
|
Apis cerana
| null |
2018-04-15
| null | null |
Sacbrood virus isolate CSBV-SC/China/2018, complete genome
|
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| 58,567
|
MH107056.1
|
Sacbrood virus
|
Mehmood,S., Huang,H.
|
Fujian Agriculture and Forestry University, College of Bee Science
|
China
|
2018-12-22
| null |
Iflavirus sacbroodi
|
Iflavirus
|
Iflaviridae
|
ssRNA(+)
| 9,735
|
GenBank
| null |
China
|
China
| null | null | null | null | null |
Mutant Sacbrood virus clone AcSBV-Fuzhou-IRES-EGFP, complete genome
|
TACGAATCGTGATTCGATTCATTATTTCGCCTGAGTAAATCGAGATTTACCTTGACGGGGTTTGCTTGACGTTGCGTCAGACCCGTTATCCTTGTGAGTTTTAGGTTGTGAAGATTTATTCGTGAAGTTAATTAAATAGAAAGTTTATCATATAGAAAGAAACATAATAAGTTTATTATGGAAGATATTTCTCCCATTTTTTATGGATATGATAGAGGTACCAACCGATTCCCCATTAGTGGAGGAATTAGAAGAAATCAGTCTTTTGAGTATAGCTCATGCGCCAGAACCTATAAAACCAAGTTGGAGGCGCATAATTGCGGAGTGGAAAGACTATCTACAATCCTTACCTCTTGTAAGAAGACATTTGATACAGTGGACTCTTATACCGATTTGTTTAATGGTTGGGTTTCTGGTATGTATGTTAACAAGAACGTCCACTATACCGAAATGTCCAGTGATGAAAGTGGACGAAGAATCTGGAATGTTAGACGTGCAGTGTCAGTTAAGACCGCAGAAGGAACTATAGTATGGCGAAAAGTTATTACCTCTTACAGTTGCAAAGTAGCTTCAGAATTAGCAGCTAAGAGTATATTGGTGCAATTTGTAGGTCCAATAAGGACCCAGAGCGATGAGGTACCCTCGAAAGAATCTATTCAGGGGGACGCTACACAGCAAAGTTCCAAGGAAGAAAATACAATAGTTACAAGAGACCAGCAACAGACAGTTTCGGAAAAGATACCATCAACAGTTGGGGATTTGGCAATAGCATCTTCTGAACCAACGCAACAATTTAGGAGTTTAACTAATCGTTGGATGCCTGTTAATTCAATTAGAGTAACAGTAAATAGTAAAAGGAATGATTTGTTAGCACAATATTATATTCCAGAAGATTTTCTTACAACTCACGCTAAGTGTGCGCCCAACACCATACCATTTGAGACTTATGTGTATGGAAAATACGAGTTAGAAATGAAGTTTGTGGCTAATGGTAATAAGTTTCAGTGTGGGAAAGTTATTATTTCTGTAAAATTTGATAGTTACCAAGCTGATAATATTAATACAGGGTTTCAAGCAGCCTTATCTCGACCGCACATTATGTTAGATTTGTCAACCAATAATGAAGGAGTTCTTAAAATACCATTTAGGTATCACCGTGCCTTTGTTAGGAATCAAACACATAAAACAGCTACGGTGGGTATAAGACCTGGGAAGTTTGCTAGTATTTACGTACAAGTGCTGTCACCATTACAGACGGGAGAAGGGGGAGCGAATGATACGTTTATACGACCGTTTTACCGGTATACGCGTGCTGAATTTGCGGGTATGTCGTACAAAGTTCCACTGACCCAAATGGATGTTATAGGTACTTTAATATCCGGAGGACCAACACCAGCTCTTAAGGATATTTTAGTAGGTGTAGAAAGAACCTTGGATCAATTGGGCCGAAGTAATAATCAAGATAAACCGAAGGATATAAGTAGTATAACTATAATTCCGAAACCTCGTTTGGGTTTCCCTCATGGGAAAGGTAAAAGTGATGCAGTCGCTATGCGAGTAAATCCGGTGGCACTAACATCATTTCAGGATGTGAATGCTTATCCTGATGAACCTCGTACTACGTTGGATATAGCTCGTATATGGGGTTTGAGAAGTACGTTTAATTGGGGATCAGGAGATGCACACGGTAAAGAGTTATTTAATACAGTTTTGGATCCATGTTTGAGATTTTATGATCAGGATTACGAAGGACAAATAACCCCAATGGAATATGTAACTGGGTTGTATAACTTTTGGTCAGGGCCTATAGAGTTACGTTTTGATTTTGTTTCAAATGCGTTTCATACTGGAACTGTTATTATATCAGCAGAGTATAATCGATCATCTACCAATACAGATGAGTGCCAGTCTCACTCAACTTATACAAAAACGTTCCATTTAGGAGAACAAAAATCAGTACATTTTACTGTGCCTTATATATATGATACGGTTATGCGGAGAAATACGGCTAGCGCCTATTTACCGGTCACTGATAATGATAAGGTAGATAATGTTAGTAGGGCGCACGCTACGGGGGTTAGAGCAGAGTCTAAAATGAGAGTGAAAGTGAGAGTAGTTAATGTTTTAAGACCTGTAGCCTCTACGACATCAACTATAGAAGTTTTGGTGTATATGCGAGGAGGACAGAATTATGCATTACATGGTTTAAAGCAGTCAACTTATTGGCCGTCAAGAAGTGTGGTACCAATAGATAGTTTTCCACCTGATGGTTACGATCCAGTTAAGCCAGCAAATAGCACCAGGAATAAGAGACAATCTGTGGTAGATAATCCGCACAGATTCCTGCCCGCGAATGTATCTAATCGTTGGAATGAGTATTCGAGTGCTTATTTACCGCGAGTACAAATGGACACTGGTGCTAAAGAAGATGAAGATGAAACTGCTAATTTCAGTGATGGGGTTACTGCGATGGGTTTCCAGTCTTTGGATACCCAAGTATCAATTAAGGATATTTTGCGTAGACCAGTGTTGTTGTTTAATCACGTAGTATTGGATCCTGGTTATACAGGTTTTTTTATACCTATAATGCCGCCTTCTAGAATGATGCAATATAAATCAGGAGATAAGGAAACATCTTTTCAGCGATTAATTGGTCGTACGCCCCAAGCAGCAATAATGAATTTATTTAGGTTTTGGAGAGGGTCATTGCGTTATACTATTATTATACATAGTACCGATGGTCATCCTATATACGTAACGCATGTACCCCACACGGGAAATAGAGTGTATGGTTTAATGAAAGTAAATAATTTGCACGAGTATACGAAGGTTCCTATCTTTGGGTGTGGTTTAACAACTGAAATGATTATTCCCAGCGTGAATCCGAGTATATGTGTAGAAGTACCATTTGATACTGAAAATAACTGGGCTGTGACCTTTGAGGAAGATGCTCAGCGGAACTATTCATGGAGAGACAAAGGTGATACTGTGACCGGACATTTGGTTGTAACACCTGTAGTACCAGTTAATATGTCTGTGTGGGTAGAAGCTGGGGATGATTTTGAGGTGTCTAACTTTTATGGGCCACCGACCGTTAAGACGAATGATTGGAAATACGCATTCTCTGATGAGCATGCGCGGGTTCAGATGGATGATAGTACAGAAAGAGTATACGATGAGGGAAACCAGGTGTATTACTATCCGGCCCCTAAGCCCGAGGGTTTTAGTTTGAACAATGTACGGACTTCGGTTAGTACGTTGTGTAATATGCTTGGAAAAGTAGTAACTCCTGAGCGCGCAGTGAAAACAGCGTTGTGCGCAACACCCTATTTTGGGTCAGCGTATATGACAGCAACTACTCTTGATGCTATAGGCAGTATGCAGAACACTGTTACGGGAGCAGCACACCAGCTGACGGCATCCGTTGATGCGAGGTTAGAGCAACTGTCAGCTAAGTTTGGAGATTCAATTGATGTAATTACTACAGCAGTTAAGGAGGCTATAGGAAAAATTTCTTCTGGTATGTTTAACATGGTCAATTACACTGGTTACTGTATAGACGTGATATTGGATATATTAGTGGCTTGGATTGATCGCAGTTGGACTGCAGTTGGAGTAGGAATCATTCGATTTGTGACTAAGGTTTTGGGGTTGGGTGCAATTTCTAAAGTTATGAATATGGCTACGACTTTTGGGCAACTTATAGCTAGGGTTTATGAGCCTCCACGCCCAGTCGTGCAAGCACCACCTCCTACAGAAGCTACGTTGACTGGAGCTCTTGCAGGTATACTGGGTACGCTTATGGGGGTTTATATATCACCGTTGTCTGGAGGAAGCTATTTTAAAAATTTAATGCTGAGGATGACTAGTTCGGCTGGGCCTTCTTATTTGGTGGGGGTCTTACGTTTTGTTGAGGCAACGTTCAATACAGTAAAGGATATGACACTAAATGCTTTGGGTTACGTTTCTCCGGAGAATGCAGCGCTGAAAATGTTATCGGGAACATCGGCTACAATACAGAATTTTATAACTGACGCTCAGCTCATTACTACAGAAGCTAATGCAGCGCTAGTGGGACATCCTAGTTTCCGTGCTAAGTACTGGAACACGGTAATGCAAGCATATCAAATACAGAAGTTATTATTGACTGTTCCTCAGTCTAGTGCCTCCCCAATTTTATCTAGATTGTGTAGTGATGTTATACGTAATAGTAATGAGAAGTTTATTGACATCTCTTCGTCACCGGTGCGTTATGAACCTTTTGTGATTTGTATTGAGGGTCCAGCAGGTATTGGCAAATCGGAAATAGTGGAAACTCTAGCCTCTGAATTATTAAAAGGAGTTAATTTAAAACGACCACATAGCGGGGCTACTTATTTTCGAATGCCAGGGTCTCGGTTTTGGTCTGGATATAGGGATCAACCAGTGGTGGTTTATGATGATTGGGCTAACTTAACGGAACCTCAAGCTTTAATGCAGCAAATTTCGGAGTTATATCAGCTTAAATCAACTTCTACTTTTATTCCGGAAATGGCTCATTTAGAAGAAAAGAAGATTAGAGGTAATCCCCTCATTGTGATATTATTATGTAACCATGCCTTTCCGGATAGTGCAGTTACTAACATGTCTCTCGAACCTAGTGCAATTTATCGTAGGAGAGATGTGTTATTGTATGCTGAAAGAAAACCAGAATATGAGGGGGTTAGTTTGAGAGATATGAGTGTTAATGAGCAAACTACATTTGCTCATTTGAATTTTTATAAGTATAAGGATTCTACTAATTCATCCTCGTGTACATCTAAACCTGTTGGATATGAGTTGACTAAGGAGTGGCTAGTTGCGAAGTTCGCTAAATGGCACGCGCAGGAACAGATTAAAGTACAAAGACGTATGGAGAATATACGGGCAGGAATGTACGATGCTGAGGTGGGATCTTTGCGTTTGGAAGACCCATTCAGTTTATATTACTCAGTATCTAGTGAAGTTATTGAAAATAGTGA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| 66,081
|
NC_009448.2
|
Saffold virus
|
Jones,M.S., Lukashov,V.V., Ganac,R.D., Schnurr,D.P., Jones,M.S. Jr.
|
David Grant USAF Medical Center, CIF
|
USA
|
2007-05-09
| null |
Cardiovirus B
|
Cardiovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,115
|
RefSeq
| 1
|
USA
|
USA
| null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Saffold virus, complete genome
|
TTTCAAAGGGGGCCCTGGGGTCTTTGTCGCGGAGATGCGCTAGCATCTTCGCGGTAAAGAACACCCCAGGGGTAACCCCTTTGAACGCGGGACTGCGATAGTGCCACCCCACGTCTTTCCCACTCCTAACCCGACTCCCACCTCGGGTCCAATGAAAGGACCAAATAATTCATCCCTTGAATGTTGGCTAATCAGAGGAAAGTCAGCATTTTCCGGCCCAGGCTAAGAGAAACATATAAGTTAGATTTGATTCAAATCCCTTGACGAATTCGAAACGAGATGTTCTCCCTCCCTTGCCGCTTGTTCACACCCATACATTTAATTCGGCCTCCTGTGACAAGCCCCTCGGTGAAAGAACCTCTCTCTTTTCGACGTGGTTGGAATTAACATCATTTCCGACGAAAGTGCTATCATGCCTCCCCGATTATGTGATGTTTTCTGCCCTGCTGGGCGGAGCATTCTCGGGTTGAGAAACCTTGAATCTTTTCCTTTGGAACCTTGGTTCCCCCGGTCTAAGCCGCTTGGAATATGACAGGGTTATTTTCTTTATCTTATTTCTACTTTCACGGGTTCTATCCGTGAAAAGGGTACGTGTTGCCCCTTCCTTCTTCGGAGAATTCACACGGCGGTCTTTCCGTCTCTCGACAAGTGTGAATGCAACATGCCGGAAACGGTGAAGAAAACAGTTTTCTGCGGAAGTCTAGAGTGCGCATCGAAACAGCTGTAGCGACCTCACAGTAGCAGCGGACTCCCCTCTTGGCGACAAGAGCCTCTGCGGCCAAAAGCCCCGTGGATAAGATCCACTGCTGTGAGCGGTGCAACCCCAGCACCCTGATTCGATGAACGTTCTTTACGGAACCAGAGGATGGTTTTCCTAAGCCCTCCGGTAGAGAAGCCAAGAATGTCCTGAAGGTACCCCGCGTGCGGGATCTGATCAGGAGACCAATTGACTGTGCTTTACACCGTCACTTTGGTTTAAAAACTGTCACAGCTTCTCCAAACCAAGTGGTCTTGGTTTTCCAATTTTATTAACTGGCAATATGGCGTGCAAGCACGGATATCCGTTTTTGTGCCCTCTTTGCACTGCTATTGACATCTCTGCAGATGGATCTTTTGCTTTACTATTTGACAATGAATGGTACCCGACTGACCTCCTTACTGTTGACCTGGACGACGACGTGTTTCATCCCCCGGATTGTGTTATGGAATGGACTGATCTACCATTGATTCAAGATGTGTTGATGGAACCACAAGGCAACTCCAACTCCTCGGACAAAAACAATTCTCAGTCGTCAGGTAATGAAGGTGTCATTATTAACAATTATTACTCAAACCAATATCAAAATTCAATTGACCTTTCCGCTAATGCTAACGGCGTTGGCAAAGAAAACACAAAACCACAAGGTCAACTAATGAATATCCTTGGAAGCGCGGCTGATGCATTCAAGAACATTGCTCCGCTTCTTATGGATCAAAACACTGAAGAAATGACCAACCTTTCTGACAGAGTGTCATCGGACACCGCAGGCAACACGGCTACAAACACTCAATCCACAGTGGGTCGTTTGTTTGCGTTTGGTTCGAGACACAAAGGAAAGCATCCCGCTTCCTGTGCAGACACCGCCACAGACAAGGTGCTTGCTGCAGAGAGGTATTACACTCTCAAATTGGTTACATGGACAACAACACAAAAACCTTTTGACCACGTTCGAATACCTCTTCCACATGTGCTGGCAGGCAAGCAGGGTGGAGTTTTTGGATCTACTCTTCGAAGACACTACCTTTGCAAGTGTGGCTGGCGCATACAAGTTCAATGCAATGCCTCTCAGTTTCATGCAGGATCATTACTAGTTTTTATGGCTCCAGAATTTGACACTTCCTCCTACTCTGCAGTCGACGACCCTATTGGAGAAGAGCCCTTTAAGGTTGATACTACATGGCAAACAGGTTCTCTTCGTGGACATTCTTACGAAGATAAGTCCACCCAAACTCTCCGGCCATTGGCACTCAACCACCAAAACTATTGGCAATGGACAGTTTATCCTCACCAAATTTTAAATTTGAGAACAAACACAACTTGTGACCTGGAAGTACCATACGTGAACATTTGCCCAACATCATCCTGGACACAGCATGCAAATTGGACCATTGTGGTGGCTGTTCTTTCCCCTTTGCAGTACGCTGCAGGCTCAGCCACGGAAGTGGACATTACTCTGTCCATACAACCTGTGAAACCAGTATTCAATGGCTTAAGACACTCAGTTTTGGAAGCAGACAGTCCAATACCGGTGACTGTCAGGGAACACGCAGGTACTTTCTATTCCACAACTCCAGATAATACTGTTCCAGTATATGGAAAAACAGTAGCAACACCATCTGACTACATGTGTGGAGAATTTACAGACTTGCTGTCATTATGTAAAATCCCAACCTTTCTTGGTAATGTGTCTTCAACACAAAGACTTCCTTATTTTTCAGCAACAAACACAGTCCCAAATAACGCTTTAGTGACATATCAAGTCTCTCTGTCCTGCTCTTGCATGGCCAATTCCATGCTAGCATCAGTTGCTAGGAATTTCAATCAATACAGAGGTTCTTTAAATTACTTGTTTGTCTTTACGGGTAGTGCTATGACAAAAGGAAAATTCTTGATATCGTACACACCACCTGGTGCAGGGAAACCAACGACTAGAGACCAAGCCATGCAAGCCACCTATGCTATTTGGGATCTAGGATTGAATTCTAGTTACAACTTCACTGTCCCTTTCATTTCCCCCACACATTATAGACAGACTTCATATACCACTCCATCCATTACTTCTGTAGATGGGTGGCTTTCTGTCTGGCAACTTACGCCTCTCACCTACCCTGTTGGTTGCCCTACTAATTCTGACATTCTTACACTCGTGTCGGGTGGGGATGACTTTACCCTCAGAATGCCAATTTCCCCAACCAAGTATACCCCTCAAGGTGTGGACAACGCTGAGAAAGGAAAAGTTTCAGATGATAACGCTTCAGCTGATTTTGTTGCCGTTCCAATTCAACTTCCTGAGAATCAGACTGAAGTTTCTTTCTTTTATGACAGAGCAGTTCTCGCTTCAGCCTTGGCTGTAGGCACAAACCAAGGCTTAAATAACTCTTTTTCTTTGGAATCTGCTTCAGGAGTTATGAACAATATTCTCTTGACACCATTGCCTAGTGACAGACTCAAGGAAAACGAGTTTGGTTTAGATGAGCAACATAGATGGTTAAGCTTTCAATCAGCAACTAGCTCAACCCCCCCTTATAGAACTAAACAAGACTGGAACTTTTTGATGTTTTCTCCTTTCACTTATTATAAGTGTGATCTGGAAGTAACCCTTTCTCTCAATTCGGGAAGTGCGGCTGGGGCTGTAGTCAGGTACGTACCTAGCGGTGCTCCGGTAGACATAACAACCCAAACAATGCCTTTCACTCCTTCTCTCGCAGACACTCGAGACCCACACATGTGGCTGGTTGGAGCTGGTTCTACGAATCAAATTTCGTTTGTTCTGCCTTATACTTCTCCACTATCTGTCCTACCTGCTGTTTGGTTTAACGGATTCTCTGACTTTTCTAACACCTCACGCTTTGGTGTTGCTCCAACATCTGACTTCGGAAGATTGTTTGTACAGGGATCTGATAGGTTTTCCGTACATTTCAGATACAAGAAAATGAGAGTCTTCTGCCCAAGGCCTACTGTTTACTTCCCTTGGCCTTCCGAATCTGTTTCAAAAATACATGCCAACACACCGGTTCAGATTTTGGAGCTTCAAGACCCTATTTCAATCTACAGAGTTGATTTGTTCATAAACTTCTCAGATGAAATCATTCAATTCACTTACAAGGTTCATGGCAGAACAGTTTGTCAATACGAAATTCCCGGTTTTGGTCTGTCTCGCTCTGGACGTCTTCTTGTGTGTATGGGCGAAAAACCTTGTCAGCTTCCCATCTCTACTCCTAAGTGTTTCTACCACATTGTCTTCACTGGCTCCAGAAACTCTTTTGGAGTGTCCATTTACAAAGCAAGATATAGACCTTGGAAACAGCCCCTTCATGATGAACTTTATGACTATGGGTTCTCTACTTTCACTGATTTTTTCAAAGCCGTTAGAGACTATCATGCTTCTTATTACAAACAGAGACTTCAACATGACGTTGAAACAAACCCTGGCCCTGTTCAGTCGGTTTTTCAGTTGCAAGGTGGGGTGCTAACTAAATCCCAAGCACCCATGTCTGGTTTACAAAGTATGTTACTGAGAGCAATTGGAATTGAAGCAGACTGTACTGAATTCACCAGAGCTGTAAACTTGATCACCGATCTTTGTAACACCTGGGAGAGCGCTAAAACAACATTGTCCTCTCCTGAATTCTGGACCAAAATGGTAATGAGAATTGTAAAAATGGTTGCTGCTTCAGTTCTTTATCTTCACAATCCAGATTTGACCACTACTGTCTGTCTGTCTTTGATGGCTGGAATTGACATTCTCACTAATGATAGTGTTTTTAACTGGCTGTCTTCTAAACTTTCCAAATTCTTCCATACCCCCGCCCCTCCTATTGTTCCTCTTCTCCAGCAACAGTCTCCTATTAGAGAAGCAAATGACAACTTTAACTTGGCAAAAAACATAGAATGGGCAATAAAAACAATTAAAAGAATAGTAGAATGGATTACTTCATGGTTCAAACAGGAAGAAACAAGTCCCCAAGCTAAACTAGACAAAATGTTGACAGACTTTCCAGAACACTGCGCCTCCATTTTGGCCATGAGAAATGGTAGAAAAGCATACACAGATTGTGCCAGTGCATTTAAGTATTTTGAACAACTCTACAATTTGGCAGTACAGTGCAAAAGAATATCATTAGCAACTTTGTGTGAAAAATTCAAAAACAAGCACGATCACGCCGTAGCTAGGCCAGAACCTGTGGTCGTTGTGTTGCGAGGAAACGCTGGTCAGGGAAAATCCGTGACTAGTCAAATCATCGCACAAGCAGTTTCTAAACTTTCATTTGGTCGCCAATCAGTTTACTCTCTCCCACCAGATTCTGATTATCTAGATGGTTACGAGAATCAGTACTCAGTGATTATGGATGATTTAGGACAAAATCCTGATGGAGAAGATTTCAAAGTATTCTGTCAAATGGTTTCAAGCACAAACTTTCTTCCAAATATGGCCCATTTAGAGAAGAAAGGCACTCCTTTCACTTCCAATTTTATAATAGCAACAACCAATCTTCCGAAGTTCCGGCCTGTTACCGTAGCACACTATCCAGCTGTTGATAGGAGAATCACTTTTGATCTGACTGTCGAGGCAGGAGATGAATGTATCACTCCTAATGGAATGTTGAATGTGGAAAAAGCTTTTGAGGAAATTTCAGGAAAACCACAATTGGATTGTTTCAATACTGATTGCAGGCTTCTCCACAAAAGAGGCGTGCGGTTTGTTTGCAACCGCACGAAGAATGTTTACAATCTTCAACAAGTGGTGAAAATGGTAAAAAATACTATTGATAACAAGGTGGAAAATCTAAAGAAAATGAACACATTGGTTGCCCAATCACCTGGTAATGACATGGACTATGTGTTGACTTGCCTGAGACAGACAAATGCTGCCCTACAGGATCAAATTGACGAACTCCAAGAAGCTTTCAATCAGGCCCAAGAAAGACAAAATTTCTTATCAGATTGGCTCAAAGTTTCAGCGATTGTTTTTGCATCCATTGCCTCTTTATCTGCGGTTTGTAAATTAGTTTCTAGATTTAAAAATTTGGTGTGTCCAACCCCAGTTCAGATACAGTTATCCGAGGGAGAACAAGCAGCTTACTCTGGAGGTAAGAAAGGTGAGAAACAAACGCTCCAGGTCTTGGATGTACAAGGAGGAGGAAAGATTGTAGCCCAGGCTGGAAACCCAGTCATGGACTATGAAGTAAACATTGCAAAGAACATGGTCACTCCTATCACTTTCTTTTATGCAGACAAGGCACAAGTTACACAATCCTGTTTGTTGGTCAAAGGACACCTCTTTGTGGTCAACAGACATGTAGCTGAAACAGATTGGTGCGCTTTTGAACTCAAAGGAACACGACACGAAAGAGATTCGGTGCAAATGAGATCGGTGAACAAATCTGGAATGGAAGTTGATTTGACTTTTGTAAAAGTTGTCAAAGGACCATTGTTTAAGGATAATTCTAAGAAATTTTGTTCTAAAAATGACGACTTCCCGGCTAGAAATGAGACTGTCACAGGAATTATGAATACTGGAGTACCCTTTGTCTTCACTGGAAAGTTTTTGGTAGGCAACCAACCGGTCAACACAACCACAGGTGCGTGCTTTAACCATTGTATTCATTACAGAGCTACAACACACCGAGGTTGGTGCGGATCAGCGCTCATATGCCATGTCAACGGCAAGAAGGCCGTTTACGCAATGCACTCGGCTGGTGGTGGCGGTATGGCTGCTGCTACGATAATCACTCAGGAAATGGTTGAAGCTGCTGAGAAGGCCTTAGATTGTCTAACTCCTCAAGGTGCAATAGTTGAAATTGGTATTGATACGGTTGTGCACGTTCCGCGAAAAACCAAACTACGCAGGACAGTAGCGCACCCCTGCTTCCAACCAAAGTTTGAACCTGCCGTCCTTTCACGTTACGACCCTAGGACTACAAAAGACGTAGACCAGGTCGCTTTCTCTAAGCACACAACTAATTTGGAAGAGCTTCCATCTGTTTTCTCCATGGTTGCAAAAGAATATGCTAATAGAGTGTTTACAACAATAGGCAAGGAAAACCAAATTCTGACTCCAGAACAAGCTATTTTAGGATTACCAGGTATGGACCCAATGGAAAAGGACACATCGCCCGGCTTGCCTTACACCCAACAAGGCTTAAAAAGGGCTCAGTTGGTGAATTTTGAACAAGGTACCATGGTACAAAATCTAAAAGAAGCACACACTAAATTGACCGAAGGTAATTATGAAGATATTTTGTACCAGAGCTTTTTGAAAGATGAAATTAGGCCCGTAGAAAAGATCCACGAAGCAAAGACTAGAATTGTGGACGTTCCCCCCTTTCACCACTGTATTTGGGGACGCCAACTGTTAGGACGCTTTGCATCTAGATTTCAAACAAACCCCGGCTTGGACCTTGGCTCAGCGATTGGCACTGACCCTGATACAGATTGGACTGCTTTCGCCTTCCAACTCTTACAGTACAAGTATGTCTACGATGTAGATTACTCTAACTTTGATGCCTCACACTCCACCGCAATGTTTGAAATTTTAATTGAAAATTTCTTTACACCAGAAAATGGATTTGATGAAAGAATAGGAGACTATCTAAGATCCCTTGCAGTTTCTCGACATGCTTTTGAAGAGAGAAGAGTTTTGGTTAGGGGTGGTCTCCCGTCAGGGTGCGCCGCCACGAGCATGTTGAACACAATTATAAATAATATAGTAATCAGAGCAGCACTACACTTGGCCTATTCCAATTTTGAATTCGATGACATCAAAGTTTTGTCCTATGGTGATGATTTACTCATCGCCACAAATTACCAAATAAATTTCAATCTTGTTAAACAAAGATTAGCCCCCTTCAATTATAAGATTACACCTGCTAACAAGACTGTTGAATTTCCTGAAACTTCTAATCTTTATGAGGTTACTTTTCTAAAAAGAAAATTTGTTAGACACAATTCTTGTTTGTTTAAACCTCAAATGGATACAGAAAATTTGAAAGCAATGGTTAGCTATTGTAGACCAGGTACTCTAAAGGAAAAGCTCAACTCTATCGCACTGCTGGCAGTGCATTCAGGGAAGAGTGTCTACGACGAGATTTTCGACCCATTTCGTCGTATCGGAATAATAGTCCCAGAACATAGTACCATGCTCTATAGATGGCTCAATCTATTTAGATGAACATCCTCTCGATCGGATCGCAACGTGTTACCCAGGAATCCACTTGGGTGTACGCGGCCGTTCTGACGTTGGAATTCTGTAGATGAAAGTTAGCTAGGAGCTTTTAATTGGAAATGAGAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 7,987
|
OL519583.1
|
Saffold virus
|
Mao,Q., Zhang,W.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2022-01-06
|
xz015-SAFV-2
|
Cardiovirus B
|
Cardiovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,976
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2018
|
SAMN23039864
|
PRJNA779483
|
MAG: Saffold virus isolate xz015-SAFV-2, complete genome
|
CGCGGGACCTGCGAGAGTGCCAACCCACGTCTTTCCTTGTTTTACCCCGATTCCCACCTCGGGTCCAATGAAAGGACCAAACATTTCATCCCTTGAATGCTGGCTAATCAGAGGAAAGTCAGCATTTTCCGGCCCAGGCTAAGAGAAACATATAAGTTAGATTTGATTTAAATCCCTTGACGAATTCGGAATGAGATGTCCTCCCTCCCTTGCCGCTTGTTCACACCCACTGTTCTGATTCGGCCCCTCGTGACAAGCCCCTTGGTGAAAGAACCTCTCTCTTTTCGACGTGGTTGGAATTAATATCACTTCCGACGAAAGTGCTATCATGCCTCCCCGATTATGTAATGTTTTCTGCCCTGCTGGGCGGAGCATTCTCGGGTTGAGAAACCTTGATTCTTTTCTTTTGGAACCTTGGTTCCCCCGGTCTAAGCCGCTTGGAATATGACAGGGTTATTTTCTTTATTCTTGATTCTACTTTTATGGGTTCTATCCATAAAAAGGGTATGTGCTGCCCCTTCCTTCTTTGGAGAATTCACACGACGGTCTTTCCGTCTCTCAACAAGTGTGAATGCAGCATGCCGGAAACGGTGAAGAAAACAGTTTTCTGTGGAAGTTTAGAGTGCACATCGAAACAGCTGTAGCGACCTCACAGTAGCAGCGGACCCCCCTCTTGGCGACAAGAGCCTCTGCGGCCAAAAGCCCCGTGGATAAGATCCACTGCTGTGAGCGGTGCAATCCCAGCACCCTGGTTCGATGGTCATTTTCTACGGAACCAGAGAATGGTTTTCTTAAGCCCTCCGGTAGAGAAGCCAAGAATGTCCTGAAGGTACCCCGCATGCGGGATCTGATCAGGAGACCAATTGGCAGTGCTTTACACTGTCGCTTTGGTTTAAAAACTGTCGCAGCTTCTCCAAACCAAGTGGTCTTGGTTTTCCAATTATATTTTATGGCAATATGGCGTGCAAACACGGATACCCGCTTTTGTGTCCTCTTTGCACTGCTATTGACACTACACAAGATGGCTCATTTACCTTACTGCTTGACAACGAATGGTATCCCACTGACCTCTTGACCGTTGATTTGGACGACGACGTGTTTTACCCGGTTGATTCTGATATGGATTGGACAGACCTGCCTTTGATTCGAGATGTTGTAATGGAACCACAAGGTAATTCAACTTCATCAGACAAAAACAATTCACAATCTTCGGGTAATGAGGGCGTGATAATTAACAATTATTACTCAAACCAATACCAAAACTCAATTGATCTCTCTGCCAATGCCAATGGTGTTGGAAAAGAAAACTCAAAACCACAAGGGCAGTTAATGAACATCCTTGGAAGCGCAGCAGACGCTTTCAAAAATATAGCACCTCTTCTCATGGACCAAGATACCGAAGAGATGACTAATCTTTCTGACAGAGTGTCTTCAGACACTGCAGGCAATACGGCCACAAACACTCAATCTACAGTAGGCCGTTTGTTTGCGTTTGGTTCGAGACACAAGGGCAAGCATCCAGCCTCTTGTGCTGACACAGCCACTGACAAGGTGCTCGCCGCTGAAAGATACTATACATTCAAAATTGCCACCTGGTCCACTCAAAAAGCATTTGATCATGTAAGAGTTCCCTTTCCTCACGTCTTGTCAGGAAGCAAGGGAGGCGTCTTTGGTTCTACCTTGAGACGTCACTATTTATGTAAGTGTGGTTGGAGAATACAAGTGCAATGCAATGCTTCACAATTCCATGCTGGCTCTTTGTTGGTTTTTATGGCTCCTGAATTTGACACATCACCTTACAATGCAACAACGGAGCCAACTAAGGCAGTCCCCTTCCAGATGGACACACAGTGGCAATCTGGCAAATTACTCGGACACTCATATGAAAGCACCACCTTGCAGAGCCTCAGGCCTCTTGCCCTGAACCATCAAAACTACTGGCAATGGACTGTCTACCCACATCAGATTCTCAACCTTAGGACCAACACCACATGTGACCTGGAAGTGCCTTATGTTAATATCTGTCCTACTTCCTCATGGACCCAGCACGCCAACTGGGTCTTAGTTGTGGCTGTCTTGTCTCCTCTACAATATTCCTCAGGTTCTTCTCCTAATGTAGACATCACTGTTTCTGTTCAGCCCGTAAAACCTGTCTTTAACGGTCTTAGACACACAGTTCTGGAAGATCAGAGCCCTATACCCGTAACAATTAGAGAACATGCTGGAACATTCTACTCCACTACTCCAGATACCACTGTTCCCATTTATGGGAAGACTGTTGCAACACCTTCAGACTACATGTGTGGTGAGTTTGATGACCTACTTTCTTTGTGTAAAATCCCTACTTTCTTGGGCAACCCGACAACGGACCAGAGACTACCCTACATCTCTGCTAACAACACGGTAGGTGATCAACCTCTTGCTACATATCAGGTCACCTTGTCATGCTCTTGCATGGCTAACTCGATGTTGGCTGCTGTGTCGAGAAATTTTAATCAGTATCGTGGGTCTCTAAATTACTTGTTTGTGTTCACGGGCAGTGCTATGGCGAAAGGTAAATTTCTAATCTCATACACTCCTCCAGGCGCGGGGAAACCAAAAGATAGAGAACAGGCTATGCAAGCAACATATGCAATTTGGGATTTAGGTCTCAATTCCAGCTATAATTTTACAGTCCCTTTCATATCCCCGACCCATTACAGACAGACTTCTTACACCACACCCTCTATAACCTCTGTTGACGGATGGCTCTCAATTTGGCAACTGACCCCGTTAACTTACCCAGCTAACACTCCACAAAGTGCAGATATATTGACCCTGGTTTCAGGAGGAAATGACTTTACTCTTAGGATGCCGGTGACTCCAAGTAAATACACTCCCCACGGCGTTGACAACGCTGAAAAAGGAAAAGTTGCTGATGACAACGCATCCGCAGATTTTGTGGCTGTTCCCATTGCTCTTCCTGAAAATCAAACAAAAGTGGCTTTCTTCTATGATAGAGCAGTGTTGGCATCTGCGCTTGTGAACGCACAAGATTTGAATTCTAGTTTTTCCCTTCAAGATTCGGCCAATGTTATGAATAATGCTCTTCTAACGCCACTACCTAGCAATCGTCTTGACGATTCTACTTACGGTCTGGCTGAACAACACAGATGGCTGTCTTATCCCACTGACACCAAGCAATCACCTCCTTATAAGACAAAGCAAGACTGGAACTTTTTAATGTTTTCACCTTTCACTTATTATAAGTGCGACTTGGAAGTCACTCTATCTCTAAATTCAAATGCGGCCATTGGTTCAGTGGTACGCTACACTCCCTGTGGAGCGCCAGTGGATCTTTCTGACCAAACTATTCCTTATACTCCATCTCTGGCAGACACTCGAGATCCGCATATGTGGGTAGCGGGACCTGGCACCACTAACCAAGTTTCCTTTGTGATTCCCTACACTTCTCCTTTATCTGTGTTGCCCGCAGTTTGGTTTAACGGTTTTTCAGACTTCGACAACAAAACACGCTTTGGCGTTGCCCCTAACGCAGATTTTGGACGCTTGTTCGTCCAAGGAGCAGACAGGTTTTCTGTTCATTACCGCTATAAAAAGATGAGAGTGTTTTGTCCTCGACCTACTGTGTTTTTCCCCTGGCCTGCTAATTCAGTATCCAAAATTAAGTCTGTCCGACCAACTCCAGTACTTGAATTGCAAAATCCTATCTCAATCTACAGAGTTGATTTGTTCATAAATTTCTCAGATGAGATCATTCAGTTTACATACAAAGTTCACGGCAGGACGGTCTGCCAATATGAGATTCCTGGTTTCGGTCTGTCCCGTTCTGGGCGCCTTCTTGTGTGTATGGGTGAAAAGCCATGTCAACTTCCTATCTCTACCCCCAAGTGTTTCTACCATATTGTCTTTACTGGTTCCAGAAACTCCTTTGGAGTATCCATTTACAAAGCAAGATACAGACCCTGGAAACAGCCTCTTCACGATGAACTCCACGATTATGGCTTTTCCACTTTCACTGACTTTTTCAAAGCTGTTAGAGACTACCATGCTTCTTACTACAAGCAAAGACTTCAACATGATATTGAAACAAACCCTGGACCTGTCCAGTCGGTTTTTCAATTACAAGGTGGGGTGCTAACTAAATCCCAAGCACCCATGTCAGGACTTCAAAGTATGTTACTGAGAGCAATTGGAATTGAAGCTGATTGTACAGAATTCACTAGAGCTGTAAACTTAATTACTGACCTGTGTAACACCTGGGAGAGTGCCAAAACAACACTGTCCTCTCCCGAATTTTGGACCAAAATGGTTATGAGAATTGTGAAAATGGTTGCTGCTTCAGTTCTTTACCTGCACAATCCAGATTTGACCACCACTGTCTGTCTGTCTTTGATGGCTGGAATCGACATTCTCACCAATGATAGTGTTTTTAATTGGTTGTCTTCTAAACTTTCCAAATTTTTCCATACTCCTGCCCCTCCTATTATACCTTTTCTCCAACAACAGTCTCCTATTAGAGAGGCAAACGACAACTTTAATTTGGCAAAGAACATAGAATGGGCAATAAAAACAATAAAAAGAATAGTTGAATGGATTACATCATGGTTTAAACAAGAAGAAACAAGTCCTCAGGCTAAGTTAGATAAAATGTTAGTAGATTTTCCAGAACATTGTAATTCCATTTTGGCTATGAGAAATGGCAGAAAAGCATACACAGATTGTGCTAGCGCCTTCAAATATTTTGAACAGCTTTACAACCTAGCAGTACAATGTAAAAGAATTCCATTGGCAACTCTGTGTGAGAAATTCAAGAACAAACATGACCATGCCGTGGCCAGACCAGAACCTGTGGTCGTTGTGTTGCGCGGAAATGCTGGTCAAGGTAAATCTGTGACTAGTCAAATAATCGCTCAGGCAGTTTCTAAACTCTCATTTGGCCGTCAATCAGTTTACTCTCTTCCACCAGACTCGGATTATTTAGATGGTTATGAAAATCA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| 34,004
|
KP972594.1
|
Saffold virus
|
Leguia,M., Loyola,S., Rios,J., Juarez,D., Silva,M., Guevara,C., Prieto,K., Wiley,M., Kasper,M., Palacios,G., Bausch,D.
|
U.S. Naval Medical Research Unit No. 6, Virology & Emerging Infections
|
Peru
|
2015-09-08
|
SAFV-3-Maynas-Loreto-Peru-2012
|
Cardiovirus B
|
Cardiovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,064
|
GenBank
| 1
|
Peru
|
Peru
|
Homo sapiens
| null |
2012
| null | null |
Saffold virus isolate SAFV-3-Maynas-Loreto-Peru-2012, complete genome
|
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| 85,864
|
AB983594.1
|
Saffold virus
|
Kotani,O., Naeem,A., Suzuki,T., Iwata,N., Sato,Y., Nakajima,N., Hosomi,T., Tsukagoshi,H., Kozawa,K., Hasegawa,H., Taguchi,F., Shimizu,H., Nagata,N.
|
Pathology; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2014-08-23
| null |
Cardiovirus B
|
Cardiovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,085
|
GenBank
| null |
Japan:Gunma
|
Japan
|
Homo sapiens
|
oronasopharynx
|
2008-07-09
| null | null |
Saffold virus gene for polyprotein, complete genome, strain: Gunma/176/2008
|
TTTCAAAGGGGGCCCTGGGGTCTTCGCCGCGGAGACGCGTTAGCGTCTTCGCGGTGAAGAACACCCCAGGGGTACCCCCTTTGAACGCGGGACCTGCGAAAGTGCCAACCCAAGTCTTTTCCTGTTCTTACCCTACTCCCTCCTTGGGTCCATTGGAAGGACCAACTATATTATCCCTTGGATGCTGGCTAATCAGAGGAAAGTCAGCATTTTCCGGCCCAGGCTAAGAGAAACATATAAGTTAGATATGATTTTAATCCCTTGACGAATTCAAAACTTGATGTTCTCCCTCCCTTGCCGCTTGATCACACCCACCTCTTAAATTCGGCCTTTTGTGACAAGCCCCTTGGTGAAAGGACCTCTCTTGTTTCGACGTGGTTGGAATTAACATCAATTCCGACGAAAGTGCTATCATGCCTCCCCGATTATGTGATGTTTTCTGCCCTGCTGGGCGGAGCACCCTCGGGTTGAGATACCTTGACTCTTTTCTTTTGGAACCTTGGTTCCCCCGGTCTAAGCCGCTTGGAATACGACAGGGTTATTTTCTATACTCTTATTTCTACTTTTACGGGTTCTATCCGTAAAAAGGGTATGTGTTGCCCCTTCCATCTTCGGAGAATCCACACGGCGGTCTTTCCGTCTCTCAAAAAGTGTGGATGCAACATGCCGGAAACGGTGAAGAAAGCAGTTTTCTGTGGAAATTTAGAATGGACATCGAAACAGCTGTAGCGACCTCACAGTAGCAGCGGACTCCCCTCTTGGTAACAAGAGCCTCTGCGGCCAAAAGCCCCGTGGATAAGATCCACTGCTGTGAGCGGTGCAACCCCAGCACCCTGGTTCGATGGCTACTCTCTATGGAACCAGAGAATGGTTTTCTCAAGCCCTCCGGTAGAGAAGCCAAGAATGTCCTGAAGGTACCCCGCGTGCGGGATCTGATCAGGAGACCGAATGGTAATGCTTTACATTATCACTTTGGTTTAAAAATTGTCACAGCTTCTCCAAACCAAGTGGTCTTGGTTTTCCTTTTTATCCACATGGCAAGATGGCGTGCAAACACGGATATCCGCTTTTGTGCCCTCTCTGCACTGCTTTGGATATTACTCCAGACGGATCTTTCACTCTCTTGTTTGATGATGAGTGGTATCCAACCGACCTTCTAACTGTCAACTTGGACGACGACGTGTTTTATCCTCCTGATACCAACATGGACTGGACCGATTTGCCACTGATTCAGGATATTGTGATGGAACCGCAAGGTAATTCAAATTCCTCAGATAAGAACAACTCACAGTCCTCAGGCAATGAAGGTGTCATTATAAACAATTATTACTCTAATCAATATCAAAATTCAATTGATCTCTCTGCCAATGCTAACGGCGTTGGGAAAGAAAATTCAAAACCACAAGGCCAACTAATGAACATTCTTGGTAGTGCTGCAGACGCTTTCAAAAACATTGCGCCTCTCCTCATGGATCAAAACACAGAGGAGATGACCAACCTGTCTGACAGAGTTTCGTCAGATACAGCTGGAAACACGGCCACAAACACTCAATCAACTGTAGGTCGTCTTTTCGGTTTCGGACAAAGACACAAAGGCAAACATCCTGCGTCTTGTGCCGACACTGCCACAGACAAAGTACTGGCTGCGGAAAGGTACTACACTATTAAATTGGCATCTTGGACAAAAACACAAGAAAGTTTTGACCATATTAGAGTGCCCTTACCGCATGCACTTGCTGGAGAGAATGGTGGAGTTTTCAGTTCCACCCTACGGCGTCACTACTTGTGTAAGTGTGGGTGGAGAATTCAAGTACAGTGCAATGCCTCACAGTTCCACGCAGGTTCTCTCTTGGTCTTCATGGCTCCCGAATTTGACACATCAAACCATTCAACTGAAGTGGAACCCAGAGCAGACACAGCATTTAAGGTTGATGCTAACTGGCAAAAGCACACCCAAATTCTAACAGGTCATGCTTACGTGAACACAACTACAAAGGTCAATGTGCCACTAGCTCTCAACCACCAAAACTTTTGGCAATGGACAACTTATCCCCATCAAATTCTCAACCTGCGTACCAATACTACGTGTGATTTGGAAGTGCCTTATGTTAATGTCTGCCCTACCTCCTCCTGGACTCAACATGCCAATTGGACTCTTGTTATTGCAGTTTTAACCCCTTTACAGTACTCTCAAGGCTCAGCAACCACTATTGAGATTACAGCTTCCATTCAACCAGTTAAGCCAGTATTTAATGGGCTTCGTCACACAGTGGTAAATCCACAAAGCCCCTTCCCTGTTACGGTCAGGGAACATGCTGGAACTTTCTTCTCTACCACTCCTGATACTACTGTGCCCGTCTACGGAAACACAATTTCAACCCCTTTTGACTACATGTGTGGTGAGTTTACTGATTTACTTTCTTTATGTAAAATCCCTACTTTTCTTGGAAATCTGGACTCTAACAAAAAGAGAATTCCCTACTTTTCCGCTACTAATTCAACACCAGCCACCCCTCTCGTTACTTACCAAGTCACACTCTCTTGTTCTTGCATGGCAAACTCAATGTTGGCTGCAGTGGCTAGAAATTTCAATCAGTATCGAGGCTCTCTCAATTATCTGTTTGTTTTTACTGGAAGCGCTATGACGAAAGGCAAATTCTTAATCTCTTACACTCCGCCTGGAGCAGGAGAACCCAAAACACTGGACCAAGCGATGCAAGCAACTTACGCCATTTGGGATCTTGGTTTGAATTCCAGTTACAATTTCACTGTGCCTTTCATCTCTCCTACCCATTACAGACAGACATCATACAACACCCCAACCATCACTTCAGTGGACGGATGGTTGACTGTATGGCAGCTTACACCGCTCACTTATCCACTTGGAGTGCCCAATGATTCCCACATCCTCACTCTAGTTTCGGGCGGAGACGATTTTACATTGAGAATGCCCGTGACATTTACAAAGTATGTTCCACAAGGTGTAGACAATGCTGAGAAAGGAAAGGTGTCAGATGACAATGCCTCAACAGACTTTGTAGCCGAGCCTGTTAAACTGCCCGAAAATCAAACAAGAGTTTCCTTCTTTTATGATCGCTCCACTCTCTCATCAGTCTTACACAGCACCTCAGATGTTTCTTCTAAGTTCACTCCTTCTACAGCGGAGAATTTGCAGAATTCCATCCTGCTGACCCCGCTTCCCTCAGACATTGTCAACAATTCCGTCTTGCCAGAACAAGAGCGGTGGATTTCTTTTGCCTCACCTACAACCCAAAAACCCCCTTACAAAACTAAACAGGATTGGAATTTCGTAATGTTCTCTCCGTTCACTTACTACAAATGTGATTTAGAAGTTACTCTATCAAAGAACGACAAAGAAACTATTAGCTCAGTAGTGCGATATGTTCCCTGTGGGGCGCCCTCAGACTTATCTGACCAAACCATGCCACAAACACCATCGCTTGCCGACACACGTGACCCACATATGTGGGTAGTTGGTCAGGGCACTACTAACCAGATATCCTTTGTTATTCCTTACACTTCCCCTCTCTCCGTCTTACCGTCAGTGTGGTTCAATGGATTTTCAAACTTTGACAATTCTTCTAGATTTGGAGTAGCTCCAAATGCCGACTTTGGAAGACTTCTGTTACAAGGTCAAGGCACTTTCTCAGTACACTACAGATACAAGAAAATGAGAGTTTTCTGTCCAAGACCCACTGTTTTCATACCGTGGCCGAACCCACAAGACACCAAAATCAAATCAGTCCGGCCGACTCCCACTCTAGAATTGCAGAATCCAATCTCAATCTACAGAGTTGATTTGTTCATAAACTTTTCTGATGAAATCATCCAATTCACTTACAAAGTTCATGGCAGAACAGTTTGCCAATATGAAATTCCCGGCTTCGGCCTGTCTCGCTCTGGACGCCTTCTCGTTTGCATGGGAGAGAAACCCTGTCAACTCCCCATTTCTACCCCTAAGTGTTTCTATCACATTGTCTTCACCGGCTCTAGAAACTCTTTTGGAGTGTCTATTTACAAAGCAAGATATAGACCCTGGAAACAGCCCCTTCATGACGAACTCCATGACCATGGCTTCTCCACTTTCACTGACTTCTTTAAAGCTGTTAGGGACTACCATGCCTCTTATTACAAACAAAGACTCCAACATGACATTGAAACAAACCCCGGCCCCGTTCAGTCGGTTTTTCAGTTGCAAGGTGGGGTGCTAACTAAATCCCAAGCACCCATGTCTGGTTTACAGAGTATGTTACTAAGGGCAATTGGCATCGAAGCAGACTGTACTGAATTCACCAGAGCCGTAAATTTGATCACTGACCTCTGTAACACTTGGGAGAGTGCTAAAACAACACTGTCCTCTCCCGAATTTTGGACTAAGATGGTAATGAGAATTGTAAAAATGGTTGCTGCCTCAGTTCTTTACCTACATAATCCAGACTTGACTACTACTGTCTGTCTATCTTTGATGGCTGGAATCGACATTCTCACCAATGATAGTGTTTTTAACTGGCTATCTACAAAACTCTCTAAGTTTTTCCACACCCCTGCTCCTCCTATTGTCCCACTTCTCCAACAACAATCTCCTATTAGAGAAGCCAATGATAACTTTAATTTGGCTAAGAACATAGAATGGGCAATAAAAACAATTAAAAGAATAGTAGAATGGATTACTTCATGGTTCAAACAAGAAGAAACAAGCCCTCAAGCTAAGCTAGACAAAATGTTAACAGACTTTCCAGAACACTGTAATTCCATTTTGGCCATGAGAAATGGCCGAAAAGCATACACAGATTGTGCTAGTGCTTTCAAGTATTTTGAACAACTTTACAACTTAGCAGTACAATGTAAAAGAATACCATTGGCAACTTTGTGTGAGAAATTTAAGAACAAACATGACCACGCCGTGGCCAGGCCAGAACCTGTGGTCGTTGTGTTGCGAGGAAATGCTGGCCAAGGTAAGTCTGTGACCAGCCAAATCA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| 89,142
|
AB983595.1
|
Saffold virus
|
Kotani,O., Suzuki,T., Iwata,N., Nakajima,N., Hosomi,T., Hasegawa,H., Taguchi,F., Shimizu,H., Nagata,N.
|
Pathology; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
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2014-08-23
| null |
Cardiovirus B
|
Cardiovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,082
|
GenBank
| null |
Japan
|
Japan
| null | null | null | null | null |
Saffold virus gene for polyprotein, complete genome, strain: JPN08-404 mouse-adapted
|
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| 89,143
|
HQ162476.1
|
Saffold virus
|
Chua,K.B., Voon,K., Yu,M., Ali,W.N., Kasri,A.R., Wang,L.F., Wang,L.-F.
|
CSIRO Australian Animal Health Laboratory, Emerging Viruses
|
Australia
|
2011-08-12
| null |
Cardiovirus B
|
Cardiovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,073
|
GenBank
| 1
|
Malaysia
|
Malaysia
|
Homo sapiens
| null |
2009-11-18
| null | null |
Saffold virus strain Penang, complete genome
|
TTTCAAAGGGGGCCCTGGGGTCTTTGTCGCGGATGTTCTTGGGGGTTTTGGTGAAGTTCTAATGTAAAACCGCAGGGCTGGGGAGCCGGAATCCTGGGGTCTTTTTCGCGGGACCTGCGAAAGTGCCAACCCAAGTCTTTTCCTGTTCTTACCCTATTTCCTCCTTGGGTCCATCGAAAGGACCAACTACATCATCCCTTGGATGCTGGCTAATCAGAGGAAAGTCAGCATTTTCCGGCCCAGGCTAAGAGAAACATATAAGTTAGATGTGATTTTAATCCCTTGACGAATTCAAAACTTGATGTTCTCCCTCCCTTGCCGCTTGATCACACCCACCTCTTAAATTCGGCCTTTTGTGACAAGCCCCTCGGTGAAAGAACCTCTCTTGTTTTGACGTGGTTGGAATTAACATCAATTCCGACGAAAGTGCTATCATGCCTCCCCGATTGTGTGATGTTTTCTGCCCTGCTGGGCGGAGCACCCTCGGGTTGAGATATCTTGACTCTTTTCTTTTGGAACCTTGGTTCCCCCGGTCTAAGCCGCTTGGAATACGACAGGGTTATTTTCTATACTCTTATTTCTACTTTTACGGGCTCTATCCGTAAAAAGGGTATGTGTTGCCCCTTCCATCTTCGGAGAATCCACACGGCGGTCTTTCCGTCTCTCAAAAAGTGTGGATGCAACATGCCGGAAACGGTGAAGAAAACAGTTTTCTGTGGAAATTTAGAATGGACATCGAAACAGCTGTAGCGACCTCACAGTAGCAGCGGACTCCCCTCTTGGCAACAAGAGCCTCTGCGGCCAAAAGCCCTGTGGATAAGATCCACTGCTGTGAGCGGTGCAACCCCAGCACCCTGGTTCGATGGCTACTCTCTATGGAAACAGAGAATGGTTTTCTTAAGCCCTCCGGTAGAGAAGCCAAGAATGTCCTGAAGGTACCCCGCGTGCGGGATCTGATCAGGAGACCGAATGGTAATGCTTTACATTATCACTTTGGTTTAAAAATTGTCACAGCTTCTCCAAACCAAGTGGTCTTGGTTTTCCTTTTTTACTCATATGACAAGATGGCGTGCAAACACGGATATCCGCTTTTGTGCCCTCTTTGCACTGCTTTGGATACTACTCCAGACGGATCTTTCACTCTCTTGTTTGATAATGAGTGGTATCCAACCGACCTTCTAACTGTCAACTTGGACGACGACGTGTTTTATCCTCCTGGTACCAACATGGACTGGACCGATTTGCCATTGATTCAGGATGTTGTGATGGAACCGCAAGGTAATTCAAATTCCTCAGATAAGAACAACTCACAGTCCTCAGGCAACGAAGGTGTCATTATAAACAATTATTACTCTAATCAATATCAAAATTCAATTGATCTCTCTGCCAATGCTAACGGCGTTGGGAAAGAAAATTCAAAACCACAAGGCCAACTAATGAACATTCTTGGTAGTGCTGCTGACGCTTTCAAGAACATTGCGCCTCTCCTCATGGATCAAAACACAGAGGAGATGACTAATCTGTCTGACAGAGTTTCGTCAGATACAGCTGGAAACACGGCCACAAACACTCAATCAACTGTAGGTCGTCTTTTCGGTTTCGGACAAAGACACAAAGGCAAACATCCTGCGTCTTGTGCCGACACTGCCACAGACAAAGTACTGGCTGCTGAAAGGTACTACACTATCAAATTGGCATCTTGGACAAAAACACAAGAAAGTTTTGACCACATTAGAGTGCCCTTACCGCATGCACTTGCCGGCGAGAATGGCGGAGTTTTCAGTTCCACCCTACGACGTCATTATTTGTGTAAGTGTGGGTGGAGGATCCAAGTACAGTGCAACGCCTCACAGTTCCACGCAGGTTCTCTCTTAGTTTTTATGGCTCCCGAATTTGACACATCAAATCATTCAACTGAAGTGGAACCCAGAGCAGACACAGCATTTAAGGTTGATGCTAATTGGCAAAAGCACACCCAAATTCTAACAGGTCATGCTTATGTGAACACAACCACAAAGGTCAATGTGCCGCTAGCTCTCAACCACCAAAACTTTTGGCAATGGACAACTTATCCCCACCAAATTCTCAACCTGCGTACCAATACCACGTGTGATTTGGAAGTGCCTTATGTTAATGTCTGCCCTACTTCCTCCTGGACTCAACATGCCAATTGGACTCTTGTTATTGCGGTTTTAACTCCTTTACAGTACTCTCAAGGCTCAGCAACTACTATTGAAATTACAGCTTCCATTCAACCAGTAAAGCCAGTATTTAATGGGCTCCGTCACACAGTGGTAAATCCACAAAGCCCCTTCCCTGTTACAGTCAGAGAACATGCTGGAACTTTTTTCTCTACTACTCCTGATACTACTGTGCCCGTTTACGGGAACACAATTTCAACCCCTTTTGACTACATGTGTGGTGAGTTTACTGATTTGCTCTCTTTATGTAAGATCCCTACTTTTCTTGGAAATTTGGACTCTAACAAAAAGAGAATTCCCTACTTTTCTGCTACTAATTCAACACCAACTACCCCTCTCGTTACTTACCAAGTCACACTCTCCTGTTCTTGCATGGCGAATTCAATGTTGGCTGCAGTGGCTAGAAATTTCAATCAGTATCGAGGCTCTCTCAATTACTTGTTTGTCTTTACTGGAAGCGCTATGACAAAAGGCAAATTCTTAATCTCTTACACTCCGCCTGGAGCAGGAGAACCCAAAACACTGGACCAGGCGATGCAAGCAACTTACGCAATTTGGGATCTTGGTTTGAATTCCAGTTATAATTTCACTGTGCCTTTCATCTCTCCTACCCATTACAGACAGACATCATACAACACTCCAACCATCACTTCAGTGGACGGATGGTTGACTGTTTGGCAGCTCACACCACTCACTTATCCACTTGGAGTGCCCAATGATTCCCACATCCTCACTCTAGTTTCGGGCGGAGACGATTTTACGTTGAGAATGCCCGTAACATTTACAAAGTATGTTCCACAAGGTGTAGATAATGCTGAGAAAGGAAAGGTGTCAGATGACAATGCTTCAACAGACTTTGTAGCCGAGCCTGTTAAACTGCCTGAAAATCAAACAAGAGTTTCTTTCTTTTATGATCGCTCCACTCTCGCATCAGTCTTACACAGCACCTCAGATGTTTCTTCCAAGTTTACTCCTTCTACAGCGAAGAACTTGCAGAATTCCATCCTACTGACCCCGCTCCCCTCAGACATCATCAACAATTCTGTCTTGCCAGAACAGGAGCGGTGGATCTCTTTTGCCTCACCTACAACCCAAAAACCCCCTTACAAAACTAAACAGGATTGGAATTTCGTAATGTTCTCTCCGTTCACTTACTACAAATGTGATCTAGAAGTTACTCTATCAAAGAATGACAAAGAAACTATTAGCTCTGTAGTGCGGTATGTTCCTTGTGGGGCGCCTTCAGACTTATCTGACCAAACCATGCCACAAACACCATCGCTTGCCGACACACGTGACCCGCACATGTGGGTAGTTGGTCAGGGCACTACTAATCAGATATCCTTTGTTATTCCTTACACTTCCCCTCTCTCCGTCTTACCGTCAGTGTGGTTCAATGGATTTTCAAACTTTGACAATTCTTCTAGATTTGGAGTGGCTCCAAATGCCGACTTTGGAAGACTTCTGTTACAAGGTCAAGGCACTTTCTCAGTACACTACAGATACAAGAAAATGAGAGTTTTCTGTCCAAGACCCACTGTTTTCATACCATGGCCGAACCCACAAGACACCAAGATCAAATCAGTTCGGCCGACTCCTACTCTAGAATTGCAAAATCCAATTTCAATTTACAGAGTTGATTTGTTCATAAACTTCTCTGATGAAATTATCCAATTCACTTACAAAGTTCACGGCAGAACAGTTTGTCAATATGAAATCCCCGGCTTCGGCCTGTCTCGCTCTGGACGTCTTCTCGTATGCATGGGAGAGAAACCCTGTCAACTCCCCATTTCCACCCCTAAGTGTTTCTACCACATTGTCTTTACCGGTTCTAGAAACTCTTTTGGAGTGTCTATTTACAAAGCAAGATATAGACCCTGGAAACAGCCCCTTCATGACGAACTCTATGATCATGGCTTCTCCACTTTCACTGACTTCTTTAAAGCTGTCAGGGACTATCATGCCTCTTATTACAAACAAAGACTCCAACACGATATTGAAACAAACCCCGGCCCCGTTCAGTCGGTTTTTCAGTTGCAAGGTGGGGTGCTAACTAAATCCCAAGCACCCATGTCCGGTTTGCAGAGTATGTTACTAAGGGCAATTGGTATCGAAGCAGACTGTACAGAATTTACCAGAGCCGTAAATTTGATCACTGACCTTTGCAACACTTGGGAGAGTGCTAAAACAACACTGTCCTCTCCCGAATTTTGGACTAAGATGGTAATGAGAATTGTAAAAATGGTTGCCGCCTCAGTTCTTTACCTACATAATCCAGACTTGACTACCACTGTCTGTCTATCTTTGATGGCAGGAATTGACATTCTCACCAATGATAGCGTCTTCAACTGGCTATCTACAAAACTTTCTAAGTTTTTCCACACCCCTGCTCCTCCTATTGTCCCGCTTCTCCAACAACAATCTCCTATTAGAGAAGCCAATGATAGTTTTAATTTGGCAAAGAACATAGAATGGGCAATAAAAACAATTAAAAGAATAGTAGAATGGATTACTTCATGGTTTAAACAAGAAGAAACAAGCCCTCAAGCTAAGCTGGACAAAATGTTAACAGACTTTCCAGAACACTGTAATTCCATTTTGGCTATGAGAAATGGCCGAAAAGCATACACAGATTGTGCTAGTGCTTTCAAGTATTTTGAACAACTTTACAACTTAGCAGTACAATGTAAAAGAATACCATTGGCAACTTTATGTGAGAAATTTAAGAACAAACATGACCACGCCGTGGCCAGGCCAGAACCTGTGGTCGTTGTGTTGCGAGGAAATGCTGGCCAAGGT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| 98,356
|
HQ902242.1
|
Saffold virus
|
Hosomi,T., Asif,N., Shimizu,H.
|
National Institute of Infectious Diseases, Virology II
|
Japan
|
2011-07-30
| null |
Cardiovirus B
|
Cardiovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,082
|
GenBank
| null |
Japan
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2008
| null | null |
Saffold virus strain JPN08-404, complete genome
|
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| 98,446
|
JF813004.1
|
Saffold virus
|
Hertzler,S., Liang,Z., Treso,B., Lipton,H.L., Hertzler,S.K., Balint,T.
|
University of Illinois at Chicago, Dept of Microbiology and Immunology
|
USA
|
2011-05-15
| null |
Cardiovirus B
|
Cardiovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,065
|
GenBank
| 1
|
Canada
|
Canada
|
Homo sapiens
|
oronasopharynx
|
2007
| null | null |
Saffold virus strain Can112051-06 adapted, complete genome
|
TTTCAAAGGGGGCCCTGGGGTCTTCGCCGCGGAGATGCGTTAGCATGTTCGCGGTGAAGAACACCCCAGGGGTACCCCCTTTGGACGCGGGACCTGCGACAGTGCCAACCCACGTCTCTTCCCACTATTATTATTCCGGTTCCCGCCTTAGGTCCATTGAAAAGACCAAATATGTCATCCCTTGGATGCTGGCTAATCAGAGGAAAGTCAGCATTTTCCGGCCCAGGCTAAGAGAAACATATAAGTTAGAAATGATTCTAATCCCTTGACGAATTCGGAACGAGAAGTTCTCCCTCCCTTGCTGCTTGTTCACACCCATCATTTAATTCGGCCCTTTGTGACAAGCCCCTTGGTGAAAGGACCTCTCTCTTTCCGACGTGGTTGGAATTAACATCTTTTCCGACGAAAGTGCTATCATGCCTCCCCGATTGTGTGATGTTTTCTGCCCTGCTGGGCGGAGCGTCCTCGGGTTGAGAAACCTTTAATCTTTTCCTTTGGAGCCTTGGCTCCCCCGGTCTAAGCCGCTTGGAATATGACAGGGTTATTTTCCAAACTCTTTATTTCTACTTTCATGGGTTCTATCCATGAAAAGGGTATGTGTTGCCCCTTCCTTCTTTGGAGAATCTGCGCGGCGGTCTTTCCGTCTCTCAACAAGCGTGGATGCAACATGCCGGAAACGGTGAAGAAAACAGTTTTCTGTGGAAATTTAGAGTGGACATCGAAACAGCTGTAGCGACCTCACAGTAGCAGCGGATTCCTCTCTTGGCGACAAGAGCCTCTGCGGCCAAAAGCCCCGTGGATAAGATCCACTGCTGTGAGCGGTGCAACCCCAGCACCCTGGTTCGATGGCCATTCTCTATGGAACCAGAGAATGGTTTTCTCAAGCCCTCCGGTAGAGAAGCCAAGAATGTCCTGAAGGTACCCCGCGCGCGGGATCTGATCAGGAGACCAATTGGCAGTGCTTTACGCTGCCACTTTGGTTTAAAAACTGTCACAGCTTCTCCAAACCAAGTGGTCTTGGTTTTCTAATTTTGTTGACTGGCAATATGGCGTGCAAACACGGATATCCGCTTATGTGCCCTCTTTGCACTGCTCTCGACAACACTTCGGACGGACTTTTCACCCTTCTGTTCGATAATGAATGGTACCCAACTGACCTATTGACTGTAGACCTAGAGGATGAAGTGTTTTATCCTGATGACCTCCATATGGAATGGACAGATCTACCACTGAATCAAGACATTGAAATGGAACCACAAGGTAATTCAAATTCATCTGACAAAAACAATTCACAGTCTTCAGGTAACGAAGGCGTAATCATCAATAACTACTATTCAAATCAATACCAAAACTCAATTGATCTTTCAGCCAATGCCAACGGTGTTGGAAAAGAAAATTCAAAACCGCAAGGTCAGTTGATGAATGTTCTTGGTAGCGCGGCGGATGCATTCAAGAACATCGCGCCTCTTCTCATGGACCAGGACACTGAAGAAATGACCAACCTTTCTGATAGAGTGTCTTCGGACACCGCAGGCAACACGGCCACAAACACTCAATCTACGGTAGGCCGTTTGTTTGCATTTGGTACAAGACACAAGGGTAAACATCCAGCTTCCTGTGCTGACACAGCCACTGACAAAGTACTCGCTGCCGAGAGGTACTACACCTTCAAAATAGCCACTTGGTCCACTCAAAAAGCATTTGATCATGTAAGGATTCCTTTTCCCCACGTCCTATCAGGAAGCAAAGGAGGCGTTTTTGGTTCTACTCTAAGACGCCACTACTTGTGTAAGTGTGGTTGGAGAATACAGGTACAGTGTAATGCTTCACAATTTCACGCAGGATCTTTGCTGGTTTTCATGGCTCCCGAATTTGACACCTCGCCTTACAATGCAACAACGGAGCCAACCAAAGCAGTCCCTTTCCAGATGGACACGCAATGGCAGTCTGGTAAACTGCTCGGACATTCTTACGAAAGCACCACTTTACAAGGTTTTAGACCTCTTGCCTTGAATCATCAGAATCATTGGCAGTGGACTGTCTATCCACATCAAATTCTTAACCTCAGGACTAACACTACGTGTGACTTAGAAGTGCCCTATGTTAACATTTGTCCCACGTCCTCGTGGACCCAACACGCTAACTGGGTTTTGGTAGTGGCTGTTTTGTCTCCTCTTCAATATTCTTCAGGTTCTTCCCCCAACGTAGACATTACTGTGTCTGTTCAACCCGTAAAGCCTGTCTTTAACGGTCTCAGACATACAGTTTTGGAGGACCAGAGCCCCATACCAGTCACAATTAGAGAGCATGCTGGAACATTCTATTCCACCACTCCAGACACTACCGTTCCCATATACGGGAAGACCATTGCAACACCTTCCGATTACATGTGTGGTGAGTTTGATGACCTGCTTTCTTTATGTAAGATTCCTACCTTCCTAGGTAACCCAACAACAGATCAGAGGCTGCCCTATATTTCTGCTAACAACACGGTTGGAGATCAGCCTCTTGCCACGTACCAGGTCACACCGTCATGTTCTTGTATGGCAAATTCAATGCTGGCTGCTGTTTCAAGGAACTTCAACCAGTATCGAGGGTCTCTTAATTATTTGTTTGTTTTTACAGGTAGTGCTATGGCAAAAGGAAAATTTTTAATTTCATACACTCCCCCAGGAGCAGGTAAACCAAAAGACAGAGAGCAAGCTATGCAAGCCACATATGCGATTTGGGACTTGGGCCTCAACTCTAGCTACAATTTCACCGTCCCATTCATTTCCCCGACACACTACCGCCAAACCTCTTATACAACTCCCTCAATCACTTCCGTTGACGGTTGGCTCTCGATTTGGCAACTAACCCCACTCACTTACCCAGCTAACACCCCACAGAGTGCCGATATACTAACTTTGGTTTCAGGTGGGGATGACTTTACTCTCAGAATGCCGGTGACTCCTAGTAAGTACACGCCCCATGGAGTAGATAACGCAGAAAAAGGCAAGGTTGCAAATGACAACGCTTCAGCAGACTTTGTAGCAGTCCCCATAGCTCTTCCTGAAAACCAGACAAAAGTGGCCTTCTTTTACGACAGGGCGGTCCTAGCGTCCGCCCTTGTCAATGCTCAGGACCTGAACTCAAACTTTTCTCTTCAAGACGCAGCAAATGTGATGAACAATGCACTTTTGACACCACTCCCAAGCAACCGTCTTGATGGCTCAACATATGGTCTTGCAGAACAACACAGATGGCTTTCTTTCCCTACTGCAAAGCGGATACCCCCTTACAAAACCAAACAGGATTGGAATTTCCTCATGTTTTCTCCTTTTACCTATTACAAGTGTGATCTAGAGGTTACTCTGTCTTTGAACTCAAGTGATGCTATAGGTTCAGTAGTGCGCTACACCCCATGTGGCGCGCCAGTGGATCTGTCTGAACAAACTATCCCCTACACTCCATCATTGTCAGATACCCGTGATCCACATATGTGGGTTGTTGGGCCCGGTGCTACTAATCAAATTTCTTTTGTCATTCCTTACACTTCTCCTTTGTCCGTATTACCAGCTGTTTGGTTTAATGGGTTTTCTGATTTTGACAACAAAACACGGTTTGGTGTTGCACCAAACGCTGACTTTGGTCGATTGTTCGTTCAGGGTGCAGACAGGTTCTCGGTTCACTACCGGTACAAAAAGATGAGAGTGTTTTGTCCAAGACCAACTGTGTTTTTCCCGTGGCCCGCCAACTCAGTGTCAAAGATCAAGTATGTTCGCCCGACCCCTGTTTTGGAGCTTCAAAACCCCATTTCAATGTATAGAGTTGATCTTTTCATAAATTTTTCAGATGAAATCATCCAATTTACTTACAAAGTGCATGGCAGAACAGTTTGCCAATATGAAATCCCTGGTTTTGGTTTATCCCGTTCTGGACGCCTTCTCGTCTGTATGGGCGAGAAGCCCTGTCAGCTTCCCATCTCTACTCCCAAGTGTTTCTACCACATCGTTTTTACTGGCTCCAGAAATTCCTTTGGTGTGTCCATCTACAGAGCTAGATACAGACCCTGGAAGCAGCCCCTTCACGATGAGTTGTACGACTGTGGCTTTTCTACTTTCACTGACTTCTTTAAAGCTGTTAGGGATTACCATGCCTCTTATTACAAACAAAGGCTTCAACATGACATTGAAGCAAACCCTGGCCCTGTCCAGTCGGTTTTTCAGTTGCAAGGTGGGGTGCTAACTAAATCCCAAGCACCCATGTCTGGTTTACAGAGTATGTTACTGAGAGCAATTGGAATCGAAGCGGATTGTACTGAATTCACCAGAGCGGTGAATTTGATCACTGACCTTTGTAACACCTGGGAGAGCGCCAAAACAACGTTGTCCTCCCCTGAATTTTGGACCAAAATGGTAATGAGAATTGTGAAAATGGTTGCTGCTTCAGTTCTTTACCTACACAATCCAGATTTGACCACTACTGTCTGTCTGTCTTTGATGGCTGGAATCGACGTTCTCACTAATGATAGTGTTTTTAACTGGCTGTCCACTAAACTATCCAAGTTCTTCCACACCCCTGCCCCTCCCATTGTTCCTCTTTTGCAACAACAGTCTCCTGTTAGAGAAGCTAATGATAATTTTAATTTGGCAAAGAACATAGAATGGGCAATAAAAACAATTAAAAGAATAGTAGAATGGATTACTTCATGGTTCAAACAGGAAGAAACAAGTCCTCAAGCTAAGTTAGATAAAATGTTAGCAGACTTTCCAGAACACTGTTCTTCCATTCTTGCTATGAGAAATGGTAGAAAAGCATATACGGATTGTGCTGGAGCATTCAAGTATTTTGAACAACTTTACAATTTGGCAGTACAATGTAAAAGAATACCATTGGCAGCTTTGTGTGAAAAATTTAAAAACAAACACGACCATGCTGTGGCTAGGCCAGAACCTGTGGTTGTTGTGCTGCGAGGGAATGCTGGACAAGGAAAGTCCGTGACCAGTCAAATCATCGCC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| 99,277
|
GU943513.1
|
Saffold virus
|
Wang,J., Ren,L., Gonzalez,R.
|
Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences, Dr. Christophe M Rieux Laboratory, IPB, CAMS-Fondation M Rieux
| null |
2010-10-12
| null |
Cardiovirus B
|
Cardiovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,054
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
|
oronasopharynx
|
2008-11-12
| null | null |
Saffold virus strain BCH1031, complete genome
|
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| 100,156
|
HM181997.1
|
Saffold virus
|
Svraka,S., Rosario,K., Duizer,E., van der Avoort,H., Breitbart,M., Koopmans,M., Koopmans,M.P.
|
University of South Florida, College of Marine Science
|
USA
|
2010-08-04
|
SAFV-3_NL2007-2686
|
Cardiovirus B
|
Cardiovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,989
|
GenBank
| 1
|
Netherlands
|
Netherlands
|
Homo sapiens
|
feces
|
2004-06-07
| null | null |
Saffold virus isolate SAFV-3_NL2007-2686, complete genome
|
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| 100,435
|
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|
Saffold virus
|
Svraka,S., Rosario,K., Duizer,E., van der Avoort,H., Breitbart,M., Koopmans,M., Koopmans,M.P.
|
University of South Florida, College of Marine Science
|
USA
|
2010-08-04
|
SAFV-3_NL2007-2690
|
Cardiovirus B
|
Cardiovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,991
|
GenBank
| 1
|
Netherlands
|
Netherlands
|
Homo sapiens
|
feces
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2004-11-10
| null | null |
Saffold virus isolate SAFV-3_NL2007-2690, complete genome
|
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| 100,436
|
HM181999.1
|
Saffold virus
|
Svraka,S., Rosario,K., Duizer,E., van der Avoort,H., Breitbart,M., Koopmans,M., Koopmans,M.P.
|
University of South Florida, College of Marine Science
|
USA
|
2010-08-04
|
SAFV-3_NL2005-1035
|
Cardiovirus B
|
Cardiovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,991
|
GenBank
| 1
|
Netherlands
|
Netherlands
|
Homo sapiens
|
feces
|
2005-04-20
| null | null |
Saffold virus isolate SAFV-3_NL2005-1035, complete genome
|
TTTGAACGCGGGACCTGCGATAGTGCCAACCCACGTCTTTTCCCACTCCTAACCCGGTTCCCACCTCGGGTCCATTGAAAGGACCAGATATATCATCCCTTGAATGCTGGCTAATCAGAGGAAAGTCAGCATTTTCCGGCCCAGGCTAAGAGAAACATATAAGTTAGAAATGATTCTAATCCCTTGACGAAATCAGAACGAGATGTTCTCCCTCCCTTGCCGCTTGTTCACACCCATTTTATTGATTCGGCCTTTTGTGACAAGCCCCTTGGTGAAAGGACCTCTCTCTTTCTGGCGTGGTTGGAATTAACATCCTTTCCGACGAAAGTGCTATCATGCCTCCCCGATTATGTGATGTTTTCTGCCCTGCTGGGCGGAGCATTCTCGGGTTGAGAAATCTCAGAACTTTTCCTTTGGAACTTTGGTTCCCCCGGTCTAAGCCGCTTGGAATATGACAGGGTTATTTTCTTAATCTTATTTCTACTTTTATGGGTTCTATCCATAAAAAGGGTATGTGCTGCCCCTTCCTTCTTTGGAGAATTCACACGGCGGTCTTTCCGTCTCTCAACAAGTGTGAATGCAGCATGCCGGAAACGGTGAAGAAAGCAGTTTTCTGCGGAAGTCTAGAGTGCACATCGAAACAGCTGTAGCGACCTCACAGTAGCAGCGGACTCCCCTCTTGGTGACAAGAGCCTCTGCGGCCAAAAGCCCCGTGGATAAGATCCACTGCTGTGAGCGGTGCAACCCCAGCACCCTGATTCGATGGTCATTCTCTACGGAACCAGAGAATGGTTTTCCTAAGCCCTCCGGTAGAGAAGCCAAGAATGTCCTGAAGGTACCCCGCGTGCGGGATCTGATCAGGAGACCAATTGACAGTGCTTTACACTGCCACTTTGGTTTAAAAAATGTCACAGCTTCTCCAAGCCAAGTGGTCTTGGTTTTCCAACTTTATTGAATGGCAATATGGCGTGCAAACACGGATACCCGTTTTTGTGCCCTCTTTGCACTGCTATTGACACCACTCATGACGGTTCGTTTACTTTGCTTATCGACAACGAATGGTATCCAACTGATCTTTTGACCGTTGATTTGGACGACGATGTATTTTACCCCAATGATTTTAGTATGGAATGGACTGACTTGCCGTTGATACAAGACGTCGTAATGGAACCACAGGGTAACTCCACCTCATCTGACAAAAACAATTCACAGTCCTCAGGAAATGAAGGCGTTATCATAAACAATTATTACTCTAACCAATATCAAAATTCAATTGATCTCTCTGCCAATGCTAACGGCGTTGGAAAAGAAAATTCAAAACCACAAGGTCAACTAATGAACATTCTTGGTAGTGCTGCAGACGCTTTCAAGAACATTGCACCTCTCCTCATGGATCAAAACACAGAGGAGATGACCAATCTGTCTGACAGAGTTTCGTCAGATACAGCTGGAAACACGGCCATAAACACTCAATCAACTGTAGGTCGTCTTTTCGGTTTTGGGCAGAGACACAAAGGCAAGCATCCTGCGTCTTGTGCCGACACTGCCACAGACAAAGTACTGGCTGCTGAAAGGTATTACACTATCAAATTGGCATCTTGGACAAAAACACAGGAAAGTTTTGACCACATTAGAGTGCCTTTACCGCATGCACTTGCTGGAGAGAATGGCGGAGTTTTCAGTTCTACTCTACGCCGCCACTACTTGTGTAAGTGTGGGTGGAGAATTCAGGTGCAGTGCAATGCCTCACAATTCCACGCAGGTTCTCTTTTGGTCTTCATGGCTCCCGAATTTGACACATCAAATCACTCGACTGAAGTCGAACCCAGAGCAGACACAGCATTTAAGGTTGATGCTAATTGGCAAAAACACACCCAGATTCTGACGGGCCATGCTTACGTGAATACAACCACAAAGGTCAATGTACCATTAGCTCTCAACCACCAAAACTTCTGGCAATGGACAACTTATCCTCATCAGATTCTCAACCTGCGTACCAATACTACGTGTGATTTGGAAGTGCCTTATGTTAATGTCTGCCCTACTTCCTCCTGGACTCAACATGCCAATTGGACTCTTGTCATTGCAGTTCTAACCCCTTTACAGTACTCTCAAGGCTCAGCAACTACTATTGAGATTACAGCCTCCATTCAACCAGTTAAGCCAGTATTTAATGGGCTTCGACACACAGTGGTAAATCCACAAAGTCCTTTCCCTGTTACGGTCAGGGAACATGCTGGAACCTTTTTCTCTACCACTCCTGACACTACTGTGCCTGTTTACGGGAACACAATTTCAACCCCTTTCGACTACATGTGTGGCGAGTTTACTGATTTGCTCTCATTGTGTAAAATCCCTACTTTTCTTGGAAATTTGGACTCTAACAAAAAGAGAATTCCCTACTTTTCCGCTACTAATTCAACACCAGCCACCCCTCTCGTTACTTACCAAGTCACTCTCTCCTGTTCTTGCATGGCAAATTCAATGTTGGCTGCAGTGGCTAGAAATTTTAATCAGTATAGAGGCTCTTTCAATTATCTGTTTGTTTTTACTGGAAGTGCCATGACAAAAGGTAAATTCCTAATCTCTTACACCCCGCCTGGAGCAGGAGAACCCAAAACACTGGACCAAGCAATGCAAGCAACTTACGCCATTTGGGATCTTGGTTTGAATTCCAGTTACAACTTCACTGTGCCTTTCATCTCTCCTACTCACTACAGACAGACATCATACAATACCCCTACCATTACTTCAGTGGATGGATGGCTGACCGTGTGGCAGCTCACACCACTTACTTATCCACTTGGAGTACCGAATGATTCCCACATCCTTACTTTAGTTTCAGGTGGAGACGATTTCACGTTGAGAATGCCCGTGACATTTACAAAGTATGTTCCACAAGGTGTAGATAATGCTGAGAAGGGAAAGGTGTCAGATGACAATGCCTCAACAGATTTTGTAGCCGAACCTGTCAAACTGCCTGAAAATCAAACAAGAGTTTCATTCTTTTATGATCGCTCCACTCTCTCGTCAGTCTTACGCAGCACCTCAGACGTTTCTTCCAAATTCACTCCTTCTACAGCGGAGAATCTGCAGAATTCCATTTTACTGACTCCGCTCCCCTCAGATATCGTCAACAATTCCGTCTTGCCAGAACAAGAACGGTGGATCTCTTTTGCTTCACCTACAACCCAAGCACCTCCTTATAAAACTAAACAGGATTGGAATTTTGTAATGTTCTCCCCGTTCACTTATTACAAATGTGATTTAGAGGTTACTCTATCAAAGAATGACAAAGGAACTATTAGCTCAGTAGTGCGATATGTTCCTTGCGGGGCTCCATCAGACTTATCTGACCAAACCATGCCACAAACACCATCGCTTGCCGATACACGTGACCCACATATGTGGGTAGTTGGCCAAGGCACTACTAACCAAATATCCTTTGTCATTCCTTATACTTCCCCTCTCTCTGTCTTACCGTCAGTGTGGTTCAATGGATTTTCAAATTTTGACAACTCTTCCAGATTTGGAGTGGCTCCAAATGCCGACTTTGGGAGACTTCTGTTACAAGGTCAAGGCACCTTCTCAGTACATTACAGATACAAGAAAATGAGAGTTTTCTGTCCAAGACCCACTGTATTCATACCGTGGCCAAACCCACAAGACACCAAAATCAAATCAGTCCGACCGACTCCCACTTTGGAGTTGCAAAATCCAGTCTCAATCTACAGAGTTGACTTGTTCATAAACTTCTCTGATGAAATCATTCAATTCACTTACAAAGTTCACGGCAGAACAGTTTGCCAATATGAAATTCCCGGCTTCGGTCTGTCTCGTTCTGGACGCCTTCTTGTGTGCATGGGAGAGAAACCTTGTCAACTCCCCATCTCTACTCCTAAGTGTTTTTATCACATTGTTTTCACTGGTTCCAGAAACTCTTTTGGAGTGTCCATTTACAAAGCTAGATACAGACCTTGGAAACAGCCTCTCCATGATGAATTGCACGATCATGGATTTTCTACTTTCAGTGATTTCTTTAAAGCTGTTAGAGACTATCATGCTTCTTATTACAAACAAAGACTTCAGCATGATATTGAAACAAACCCTGGACCTGTCCAGTCGGTTTTTCAGTTACAAGGTGGGGTGCTGACTAAATCCCAAGCACCCATGTCAGGGCTTCAAAGCATGTTGTTGAGAGCAATTGGAATTGAGGCAGACTGTACAGAATTCACCAGAGCTGTCAATTTGATTACTGACCTATGTAATACTTGGGAGAGTGCTAAAACAACACTGTCCTCTCCCGAATTTTGGACCAAAATGGTAATGAGAATTGTAAAAATGGTTGCTGCCTCGGTCCTTTACCTACACAACCCAGACTTGACCACCACTGTCTGTCTTTCTTTGATGGCAGGAATCGACATTCTCACCAACGACAGTGTTTTCAACTGGTTATCTTCCAAGCTTTCTAAATTTTTCTATACTCCCGCCCCTCCTATTATACCTCTTCTCCAACAGCAGTCTCCCATAAGAGAGGCAAATGACAACTTCAATTTGGCAAAGAACATAGAATGGGCAATAAAAACTATCAAAAGAATAGTAGAATGGATTACTTCATGGTTCAAACAGGAAGAAACAAGTCCTCAGGCCAAGCTAGATAAAATGTTAACAGACTTTCCAGAACACTGTAGTTCCATTTTGGCTATGAGAAACGGCAGAAAGGCATATACGGATTGTGCTAATGCTTTCAAGTATTTTGAACAACTTTACAATTTGGCAGTACAATGCAAAAGAATACCATTGGCAACTTTGTGTGAGAAATTTAAAAATAAACATGACCACGCTGTGGCCAGGCCAGAACCTGTGGTCGTTGTGTTGCGTGGAAATGCTGGTCAAGGTAAATCTGTGACCAGTCAAATTATCGCTCAAGCTGTTTCTAAACTCTCATTTGGCCGCCAATCAGTCTACTCTCTCCCGCCAGACTCAGATTATTTAGATGG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| 100,437
|
FM207487.1
|
Saffold virus
|
Zoll,J., Erkens Hulshof,S., Lanke,K., Verduyn Lunel,F., Melchers,W.J., Schoondermark-van de Ven,E., Roivainen,M., Galama,J.M., van Kuppeveld,F.J.
|
Zoll J., Medical Microbiology NCMLS, University Medical Centre St Radboud, PO Box 9101, 6500 HB Nijmegen
|
Netherlands
|
2009-03-26
| null |
Cardiovirus B
|
Cardiovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 8,051
|
GenBank
| 1
|
Netherlands
|
Netherlands
| null |
feces
|
2007-12-05
| null | null |
Saffold virus polyprotein, complete genome
|
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| 103,510
|
NC_007580.2
|
Saint Louis encephalitis virus
|
Ciota,A.T., Lovelace,A.O., Ngo,K.A., Le,A.N., Maffei,J.G., Franke,M.A., Payne,A.F., Jones,S.A., Kauffman,E.B., Kramer,L.D., Rice,C.M., Aebersold,R., Teplow,D.B., Pata,J., Bell,J.R., Vorndam,A.V., Trent,D.W., Brandriss,M.W., Schlesinger,J.J., Strauss,J.H., Kinney,R.M., Lenches,E.M., Dalgarno,L., Maffei,J.A.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2005-11-04
| null |
Orthoflavivirus louisense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,940
|
RefSeq
| 3
|
USA
|
USA
| null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Saint Louis encephalitis virus, complete genome
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| 8,188
|
MN413675.1
|
Saint Louis encephalitis virus
|
Rojo,G.L., Goya,S., Viegas,M., Nabaes Jodar,M.S., Alvarez Lopez,M.C., Mistchenko,A.S., Valinotto,L.E.
|
Ricardo Gutierrez Chidren's Hospital, Virology Laboratory
|
Argentina
|
2020-04-28
| null |
Orthoflavivirus louisense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,710
|
GenBank
| null |
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
| null |
2013-03-25
| null | null |
Saint Louis encephalitis virus strain SLEV/GIII/BuenosAires/Arg/001/2013, complete genome
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| 50,905
|
MH899073.1
|
Saint Louis encephalitis virus
|
Hughes,H.R., Russell,B.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Division of Vector-borne Diseases
|
USA
|
2019-04-29
|
95A49
|
Orthoflavivirus louisense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,929
|
GenBank
| null |
USA: Arizona
|
USA
|
Culicidae
| null |
1995
| null | null |
Saint Louis encephalitis virus isolate 95A49, complete genome
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| 63,014
|
KX258460.1
|
Saint Louis encephalitis virus
|
White,G.S., Symmes,K., Sun,P., Fang,Y., Garcia,S., Steiner,C., Smith,K., Reisen,W.K., Coffey,L.L., Steiner,C.D., White,G.
|
School of Veterinary Medicine, University of California, Davis, Department of Pathology, Microbiology and Immunology
|
USA
|
2016-12-03
|
43
|
Orthoflavivirus louisense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,768
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Culex tarsalis
| null |
2015-07-14
| null | null |
Saint Louis encephalitis virus isolate 43, complete genome
|
AACAGATTTCTTTTTTGGAGGATAACAACTTAACTTGATTGCGAACAGTTTTTTAGCAGGGAATTACCCAATGTCTAAAAAACCAGGAAAACCCGGTAAAAATCGGGTTGTCAATATGCTAAAACGCGGTGTATCCCGCGTAAACCCCTTGACGGGGTTGAAGAGGATACTTGGAAGTCTGCTGGATGGCCGTGGACCCGTGCGGTTCATACTAGCCATTCTGACATTCTTCCGATTTACAGCTCTACAGCCAACTGAGGCGCTGAAGCGCAGATGGAGGGCTGTAGATAAGAGAACGGCATTGAAACACTTAAACGGATTCAAACGTGATCTCGGATCCATGCTAGACACCATTAACCGGCGGCCAAGCAAAAAGAGAGGAGGGACCGGATCTTTGCTTGGATTGGCTGCGTTAATTGGACTGGCGAGTTCACTGCAATTGTCAACCTACCAGGGGAAAGTGTTAATGTCAATAAACAAGACCGACGCCCAAAGCGCTATTAACATCCCCAGTGCCAACGGAGCAAACACCTGCATTGTGAGGGCTCTAGATGTGGGGGTCATGTGCAAAGATGATATTACATACCTTTGCCCAGTTCTTTCAGCGGGAAATGATCCCGAGGACATTGACTGCTGGTGTGATGTTGAAGAGGTGTGGGTGCATTACGGCAGATGCACGCGCATGGGACATTCAAGGCGCAGCCGACGGTCGATCTCTGTGCAGCACCACGGAGACTCCACACTGGCAACAAAGAACACGCCATGGTTGGACACCGTGAAAACCACCAAGTACTTGACAAAAGTCGAAAACTGGGTTTTGCGCAATCCTGGATATGCCCTAGTTGCACTAGTGATTGGATGGATGCTGGGTAGCAACAACACACAGAGAGTGGTCTTTGTGATCATGCTGATGTTGATTGCCCCGGCATACAGCTTTAACTGTCTGGGAACATCAAACAGGGACTTCGTCGAAGGAGCCAGCGGGGCAACATGGATTGACTTGGTACTTGAAGGAGGAAGCTGTGTCACAGTAATGGCACCAGAGAAACCAACACTGGACTTCAAAGTGATGAAGATGGAGGCCACGGAGTTAGCCACTGTGCGTGAGTATTGCTACGAAGCATCCCTAGACACGCTGTCAACAGTGGCAAGATGCCCCACAACTGGAGAAGCTCACAACACCAAAAGGAGTGACCCAACATTTGTCTGCAAAAGAGATGTTGTGGACCGTGGATGGGGTAACGGATGTGGTTTGTTTGGAAAAGGAAGCATTGATACGTGCGCAAAGTTCACATGCAAAAACAAGGCAACAGGGAAGACAATCCTGAGGGAAAACATCAAGTACGAGGTTGCAATTTTCGTGCATGGCTCAACGGACTCCACGTCACATGGCAATTACTCTGAGCAAATTGGAAAAAACCAAGCAGCTAGATTCACCATAAGCCCGCAAGCACCGTCTTTCACGGCTAACATGGGCGAGTATGGGACAGTCACCATTGATTGTGAGGCAAGATCAGGAATCAACACAGAGGACTATTATGTCTTCACAGTTAAGGAGAAGTCATGGCTAGTAAACAGGGACTGGTTTCACGACTTGAACCTTCCATGGACGAGTCCTGCCACAACTGATTGGCGCAACAGAGAAACACTGGTGGAATTTGAAGAACCACATGCCACCAAGCAAACTGTGGTCGCCTTAGGCTCACAAGAAGGTGCTCTACACACAGCACTGGCCGGGGCCATTCCAGCCACTGTTAGCAGCTCCACCTTAACCTTGCAATCAGGGCACTTGAAGTGCAGAGCCAAGCTTGACAAGGTTAAAATCAAGGGGACGACTTATGGCATGTGTGACTCTGCTTTCACCTTCAGCAAGAACCCTGCTGACACAGGGCATGGGACAGTGATCGTGGAACTGCAGTACACTGGAAGCAACGGACCATGCCGGGTTCCCATTTCTGTGACTGCAAACCTCATGGACTTGACACCGGTTGGAAGATTGGTCACGGTCAATCCCTTTATTAGCACAGGGGGAGCGAACAACAAGGTCATGATCGAAGTTGAACCACCCTTTGGCGACTCTTATATCGTCGTCGGAAGAGGTACCACCCAGATCAACTACCACTGGCACAAAGAGGGAAGCAGCATTGGGAAAGCTTTGGCAACCACATGGAAAGGAGCCCAACGGCTAGCCGTTTTGGGGGACACAGCGTGGGACTTCGGATCTATTGGAGGAGTTTTCAATTCAATCGGCAAAGCTGTCCACCAAGTCTTTGGAGGGGCGTTCAGGACCCTGTTCGGGGGAATGTCTTGGATTACACAGGGACTACTTGGAGCCCTTCTCCTGTGGATGGGGTTGCAGGCCCGCGACAGGAGCATCTCGCTGACTCTACTGGCTGTTGGAGGGATTCTTATCTTTCTGGCGACCAGCGTGCAAGCTGATTCGGGATGTGCAATTGACCTGCAACGACGTGAATTGAAATGTGGAGGAGGCATCTTCGTGTACAACGACGTTGAGAAGTGGAAGAGTGACTACAAGTACTTTCCCCTGACTCCGACTGGACTTGCGCGTGTGATTCAAGAGGCGCATGCCAATGGCATCTGTGGCATCCGATCGACGTCACGTTTGGAGCACTTGATGTGGGAAAGCATACAGAAAGAGCTAAACGCGATCTTTGAAGACAATGAAATTGACTTGTCAGTTGTAGTGCAGGAAGATCCCAAATACTACAAAAGGGCTCCACGACGCCTGAAGAAGCTGGAAGATGAGCTGAACTACGGATGGAAAAAATGGGGAAAAACCCTGTTCATGGAACCCAAACTTGGAAACAACACATTTGTTGTTGATGGACCCGAAACCAAGGAATGTCCAACAGCAAACAGAGCATGGAACAGTTTCAAGGTGGAAGACTTTGGATTTGGCATGGTGTTCACGCGATTGTGGCTCACAATCCGGGAGGAAAACACAACAGAATGTGATTCGGCAATCATTGGCACAGCCATAAAAGGAGACAGAGCTGTTCACAGTGACCTATCGTATTGGATTGAGAGCAAAAAGAATGGAACATGGCAGCTGGAGCGAGCCGTTATGGGAGAAGTGAAGTCTTGCACCTGGCCAGAAACGCACACCCTATGGGGTGATGGCGTTGTTGAAAGCGAAATGATCATCCCGGTAACACTAGGCGGCCCTAAAAGCCATCACAACAAGAGAACCGGATATCACACACAGACAAAAGGACCCTGGAGTGAAGGAGAAATAACCCTGGACTTTGACTATTGCCCAGGAACAACAGTTACTGTCACAGAACATTGTGGAAACAGGGGAGCGTCACTGCGCACAACTACAGCGAGCGGCAAGCTGGTCACTGATTGGTGTTGCAGGAGCTGTTCCCTGCCACCACTGCGATACACCACAAAAGATGGATGTTGGTACGGAATGGAGATCCGGCCAGTGAAGGAGGAAGAAGCAAAACTTGTGAAATCTCGAGTGACAGCTGGAGTTGCGGGGGGGATGGAACCATTCCAACTTGGCCTCCTGGTAGCATTCATAGCCACCCAAGAAGTGCTGAAACGCAGATGGACTGGGAAGTTGACCCTGACCTCACTAGCAGTGTGTTTGGCACTACTGATTTTTGGAAATCTGACATACATGGATCTGGTGCGATACTTAGTCCTTGCTGGAACAGCTTTTGCGGAAATGAACACTGGAGGTGATGTGATCCACCTGGCGCTTGTTGCTGTCTTCAAAGTGCAACCAGCATTCTTAGCGGGTCTATTTTTTAGAATGCAATGGAGTAACCAGGAAAACATCTTGATGGTTATTGGAGCAGCTTTCCTTCAAATGGCAGCCAACGATCTGAAGCTTGAGGTCCTTCCGATTCTCAATGCCATGTCCATTGCATGGATGCTGATAAGGGCTATGAAAGAAGGTAAAGTGGCGATGTACGCTCTTCCCATCTTGTGTGCTCTGACTCCAGGAATGAGAATGGCCGGGCTTGACGTCATCAGATGTCTGTTGTTGATAATTGGAATTGTAACACTCCTGAATGAAAGAAGAGAAAGCGTGGCCAAGAAAAAAGGTGGCTACCTGCTTGCAGCAGCTCTCTGCCAGGCTGGATTGTGCAGTCCCTTGATCATGATGGGAGGTTTGATTTTGGCTCACCCTAATGGGAAAAGGAGTTGGCCAGCAAGTGAGGTCTTGACCGGAGTCGGATTGATGTGCGCTCTGGCAGGGGGCCTTCTCGAGTTTGAGGAGACCTCAATGGTGGTTCCCTTTGCAATAGCTGGACTGATGTACATCACATACACCGTCTCGGGAAGGGCCGCAGAGATGTGGATTGAGAAAGCAGCAGACATCACATGGGAACAGAATGCTGAGATCACCGGAACCAGCCCCAGGCTTGATGTTGACCTTGACTCACATGGTAACTTCAAGCTCCTGAACGATCCTGGAGCTCCAGTACATTTGTTCGCGTTGAGATTCATACTTCTGGGCTTGAGCGCACGGTTTCATTGGTTTATTCCATTTGGAGTACTGGGGTTTTGGTTGCTCGGAAAACACTCAAAGCGAGGAGGAGCATTGTGGGACGTGCCGTCACCAAAAGTATATCCAAAATGTGAGACAAAACCAGGAATCTATCGAATCATGACCAGGGGAATCCTGGGCACCTTTCAAGCTGGAGTTGGTGTGATGCATGAAGGAGTTTTTCACACAATGTGGCACGCAACTGAAGGAGCAGTCCTGCGAAACGGAGAAGGGAGACTAGATCCGTATGCAGGAGATGTCCGGAATGATCTGATCTCTTATGGAGGTCCCTGGAAGCTGAGTGCCACCTGGGATGGGATTGAGGAGGTCCAAATGATAGCAGTAGCTCCGGGAAAACCAGCCATCAATGTCCAGACAACACCAGGAGTGTTCAAGACCCCGTTTGGGACCATTGGAGCCGTGACTCTTGATTTCCCAAAAGGAACATCAGGTTCTCCAATCATCAATAAGAAAGGGG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GTCCCAGTCAACTGGGTTCCCACTGGACGCACTACATGGTCAATTCATGGAAAGGGTGAATGGATGACAACTGAAGACATGTTGAGTGTCTGGAACCGTGTGTGGATTGAAGAGAATGAATACATGAAAGATAAAACACCATTGGCGGCTTGGAACGACATTCCATACCTAGGAAAGAGAGAGGACATCTGGTGTGGAAGCCTAATTGGAACAAGGACCAGAGCCACCTGGGCTGAGAACATCTACGCTCCAATCATGCAGATCCGCAACCTCATCGGGGAGGAAGAGTATAGAGACTATATGGTTGCCCAAAACAGATTTGGCAGGGAAGAAACTCATGTGGTAGGAGGAGCGTTGTAGATTAAAATGTGAATAGTGTAAATAAATAAAATAGGTAAGTCAGGCCAATTAATTTTGCCACCGGATGTCAGGTAAACGGTGCTGTCTGTAACCTGGCCCCAGGTGACTGGGTTATCAAAGCCAATCTGGCTGAGTGCAAAGCCCCTCATTCCGACTCGGGAGGGTCCCTGGCACGTAGGCTGGAGAGGACGCAAAAGTCAGACCAGAAATGCCACCTGAAAGCATGCTAAAGGTGCTGTCTGTACATGCCCCAGGAGGACTGGGTTAACAAAGCTTAACAGCCCCAGCGGCCCAAACCATGGAGTGCGTGACCATGGCGTAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGCTGCAACTTGGCAAGGCCCAAACCCGCTCAAAGCTGTAGAGACGGGGGAAGGACTAGAGGT
| 79,188
|
KX258461.1
|
Saint Louis encephalitis virus
|
White,G.S., Symmes,K., Sun,P., Fang,Y., Garcia,S., Steiner,C., Smith,K., Reisen,W.K., Coffey,L.L., Steiner,C.D., White,G.
|
School of Veterinary Medicine, University of California, Davis, Department of Pathology, Microbiology and Immunology
|
USA
|
2016-12-03
|
2281
|
Orthoflavivirus louisense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,744
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
| null |
pooled insects
|
2015-07-28
| null | null |
Saint Louis encephalitis virus isolate 2281, complete genome
|
GATTGCGAACAGTTTTTTAGCAGGGAATTACCCAATGTCTAAAAAACCAGGAAAACCCGGTAAAAATCGGGTTGTCAATATGCTAAAACGCGGTGTATCCCGCGTAAACCCCTTGACGGGGTTGAAGAGGATACTTGGAAGTCTGCTGGATGGCCGTGGACCCGTGCGGTTCATACTAGCCATTCTGACATTCTTCCGATTTACAGCTCTACAGCCAACTGAGGCGCTGAAGCGCAGATGGAGGGCTGTAGATAAGAGAACGGCATTGAAACACTTAAACGGATTCAAACGTGATCTCGGATCCATGCTGGACACCATTAACCGGCGGCCAAGCAAAAAGAGAGGAGGGACCGGATCTTTGCTTGGATTGGCTGCGTTAATTGGACTGGCGAGTTCACTGCAATTGTCAACCTACCAGGGGAAAGTGTTAATGTCAATAAACAAGACCGACGCCCAAAGCGCTATTAATATCCCCAGTGCCAACGGAGCAAACACCTGCATTGTGAGGGCTCTAGATGTGGGGGTCATGTGCAAAGATGATATTACATACCTTTGCCCAGTTCTTTCAGCGGGAAATGATCCCGAGGACATTGACTGCTGGTGTGATGTTGAAGAGGTGTGGGTGCATTACGGTAGATGCACGCGCATGGGACATTCAAGGCGCAGCCGACGGTCGATCTCTGTGCAGCACCACGGAGACTCCACACTGGCAACAAAGAACACGCCATGGTTGGACACCGTGAAAACCACCAAGTACTTGACAAAAGTCGAAAACTGGGTTTTGCGCAATCCTGGATATGCCCTAGTTGCACTAGTGATTGGATGGATGCTGGGTAGCAACAACACACAGAGAGTGGTCTTTGTGATCATGCTGATGTTGATTGCCCCGGCATACAGCTTTAACTGTCTGGGAACATCAAACAGGGACTTCGTCGAAGGAGCCAGCGGGGCAACATGGATTGACTTGGTACTTGAAGGAGGAAGCTGTGTCACAGTAATGGCACCAGAGAAACCAACACTGGACTTCAAAGTGATGAAGATGGAGGCCACGGAGTTAGCCACTGTGCGTGAGTATTGCTACGAAGCATCCCTAGACACGCTGTCAACAGTGGCAAGATGCCCCACAACTGGAGAAGCTCACAACACCAAAAGGAGTGACCCAACATTTGTCTGCAAAAGAGATGTTGTGGACCGTGGATGGGGTAACGGATGTGGTTTGTTTGGAAAAGGAAGCATTGACACGTGCGCAAAGTTCACATGCAAAAACAAGGCAACAGGGAAGACAATCCTGAGGGAAAACATCAAGTACGAGGTTGCAATTTTCGTGCATGGCTCAACGGACTCCACGTCACATGGCAATTACTCTGAGCAAATTGGAAAAAACCAAGCAGCTAGATTCACCATAAGCCCGCAAGCACCGTCTTTCACGGCTAACATGGGCGAGTATGGGACAGTCACCATTGATTGTGAGGCAAGATCAGGAATCAACACAGAGGACTATTATGTCTTCACAGTTAAGGAGAAGTCATGGCTAGTAAACAGGGACTGGTTTCACGACTTGAACCTTCCATGGACGAGTCCTGCCACAACTGATTGGCGCAACAGAGAAACACTGGTGGAATTTGAAGAACCACATGCCACCAAGCAAACTGTGGTCGCCTTAGGCTCGCAAGAAGGTGCTCTACACACAGCACTGGCCGGGGCCATTCCAGCCACTGTTAGCAGCTCCACCTTAACCTTGCAATCAGGGCACTTGAAGTGCAGAGCCAAGCTTGACAAGGTTAAAATCAAGGGGACGACTTATGGCATGTGTGACTCTGCTTTCACCTTCAGCAAGAACCCTGCTGACACAGGGCATGGGACAGTGATCGTGGAACTGCAGTACACTGGAAGCAACGGACCATGCCGGGTTCCCATTTCTGTGACTGCAAACCTCATGGACTTGACACCGGTTGGAAGATTGGTCACGGTCAATCCCTTTATTAGCACAGGGGGAGCGAACAACAAGGTCATGATCGAAGTTGAACCACCCTTTGGCGACTCTTATATCGTCGTCGGAAGAGGTACCACCCAGATCAACTACCACTGGCACAAAGAGGGAAGCAGCATTGGGAAAGCTTTGGCAACCACATGGAAAGGAGCCCAACGGCTAGCCGTTTTGGGGGACACAGCGTGGGACTTCGGATCTATTGGAGGAGTTTTCAATTCAATCGGCAAAGCTGTCCACCAAGTCTTTGGAGGGGCGTTCAGGACCCTGTTCGGGGGAATGTCCTGGATTACACAGGGACTACTTGGAGCCCTTCTCCTGTGGATGGGGTTGCAGGCCCGCGACAGGAGCATCTCGCTGACTCTACTGGCTGTTGGAGGGATTCTTATCTTTCTGGCGACCAGCGTGCAAGCTGATTCGGGATGTGCAATTGACCTGCAACGACGTGAATTGAAATGTGGAGGAGGCATCTTCGTGTACAACGACGTTGAGAAGTGGAAGAGTGACTACAAGTACTTTCCCCTGACTCCGACTGGACTTGCGCGTGTGATTCAAGAGGCGCATGCCAATGGCATCTGTGGCATCCGATCGACGTCACGTTTGGAGCACTTAATGTGGGAGAGCATACAGAAAGAGCTAAACGCGATCTTTGAAGACAATGAAATTGACTTGTCAGTTGTAGTGCAGGAAGATCCCAAATACTACAAAAGGGCTCCACGACGCCTGAAGAAGCTGGAAGATGAGCTGAACTACGGATGGAAAAAATGGGGAAAAACCCTGTTCATGGAACCCAAACTTGGAAACAACACATTTGTTGTTGATGGACCCGAAACCAAGGAATGTCCAACAGCAAACAGAGCATGGAACAGTTTCAAGGTGGAAGACTTTGGATTTGGCATGGTGTTCACGCGATTGTGGCTCACAATCCGGGAGGAAAACACAACAGAATGTGATTCGGCAATCATTGGCACAGCCATAAAAGGAGACAGAGCTGTTCACAGTGACCTATCGTATTGGATTGAGAGCAAAAAGAATGGAACATGGCAGCTGGAGCGAGCCGTTATGGGAGAAGTGAAGTCTTGCACCTGGCCAGAAACGCACACCCTATGGGGTGATGGCGTTGTTGAAAGCGAAATGATCATCCCGGTAACACTAGGCGGCCCTAAAAGCCATCACAACAAGAGAACCGGATATCACACACAGACAAAAGGACCCTGGAGTGAAGGAGAAATAACCCTGGACTTTGACTATTGCCCAGGAACAACTGTTACTGTCACAGAACATTGTGGAAACAGGGGAGCGTCACTGCGCACAACTACAGCGAGCGGCAAGCTGGTCACTGATTGGTGTTGCAGGAGCTGTTCCCTGCCACCACTGCGATACACCACAAAAGATGGATGTTGGTACGGAATGGAGATCCGGCCAGTGAAGGAGGAAGAAGCAAAACTTGTGAAATCTCGAGTGACAGCTGGAGTTGCGGGGGGGATGGAACCATTCCAACTTGGCCTCCTGGTAGCATTCATAGCCACCCAAGAAGTGCTGAAACGCAGATGGACTGGGAAGTTGACCTTGACCTCACTAGCAGTGTGTTTGGCACTACTGATTTTTGGAAATCTGACATACATGGATCTGGTGCGATACTTAGTCCTTGTTGGAACAGCTTTTGCGGAAATGAACACTGGAGGTGATGTGATCCACCTGGCACTTGTTGCTGTCTTCAAAGTGCAACCAGCATTCTTAGCGGGTCTATTTTTTAGAATGCAATGGAGTAACCAGGAAAACATCTTGATGGTTATTGGAGCAGCTTTCCTTCAAATGGCAGCCAACGATCTGAAGCTTGAGGTCCTTCCGATTCTCAATGCCATGTCCATTGCATGGATGCTGATAAGGGCTATGAAAGAAGGTAAAGTGGCGATGTACGCTCTTCCCATCTTGTGTGCTCTGACTCCAGGAATGAGAATGGCCGGGCTTGACGTCATCAGATGTCTGTTGTTGATAATTGGAATTGTAACACTCCTGAATGAAAGAAGAGAAAGCGTGGCCAAGAAAAAAGGTGGCTACCTGCTTGCAGCAGCTCTCTGCCAGGCTGGATTGTGCAGTCCCTTGATCATGATGGGAGGTTTGATTTTGGCTCACCYTAATGGGAAAAGGAGTTGGCCAGCAAGTGAGGTCTTGACCGGAGTCGGATTGATGTGCGCTCTGGCAGGGGGCCTTCTCGAGTTTGAGGAGACCTCAATGGTGGTTCCCTTTGCAATAGCTGGACTGATGTACATCACATACACCGTCTCGGGAAGGGCCGCAGAGATGTGGATTGAGAAAGCAGCAGACATCACATGGGAACAGAATGCTGAGATCACCGGAACCAGCCCCAGGCTTGATGTTGACCTTGACTCACATGGTAACTTCAAGCTCCTGAACGATCCTGGAGCTCCAGTACATTTGTTCGCGTTGAGATTCATACTTCTGGGCTTGAGCGCACGGTTTCATTGGTTTATTCCATTTGGAGTACTGGGGTTTTGGTTGCTCGGAAAACACTCAAAGCGAGGAGGAGCATTGTGGGACGTGCCGTCACCAAAAGTATATCCAAAATGTGAGACAAAACCAGGAATCTATCGAATCATGACCAGGGGAATCCTGGGCACCTTTCAAGCTGGAGTTGGTGTGATGCATGAAGGAGTTTTTCACACAATGTGGCACGCAACTGAAGGAGCAGTCCTGCGAAACGGAGAAGGGAGACTAGATCCGTATGCAGGAGATGTCCGGAATGATCTGATCTCTTATGGAGGTCCCTGGAAGCTGAGTGCCACCTGGGATGGGATTGAGGAGGTCCAAATGATAGCAGTAGCTCCGGGAAAACCAGCCATCAATGTCCAGACAACACCAGGAGTGTTCAAGACCCCGTTTGGGACCATTGGAGCCGTGACTCTTGATTTCCCAAAAGGAACATCAGGTTCTCCAATCATCAATAAGAAAGGGGAGATCATTGGGCTCTATGGAAATGGGGTACTGATTG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TGGTCAATTCATGGAAAGGGTGAATGGATGACAACTGAAGACATGTTGAGTGTCTGGAACCGTGTGTGGATTGAAGAGAATGAATACATGAAAGATAAAACACCATTGGCGGCTTGGAACGACATTCCATACCTAGGAAAGAGAGAGGACATCTGGTGTGGAAGCCTAATTGGAACAAGGACCAGAGCCACCTGGGCTGAGAACATCTACGCTCCAATCATGCAGATCCGCAACCTCATCGGGGAGGAAGAGTATAGAGACTATATGGTTGCCCAAAACAGATTTGGCAGGGAAGAAACTCATGTGGTAGGAGGAGCGTTGTAGATTAAAATGTGAATAGTGTAAATAAATAAAATAGGTAAGTCAGGCCAATTAATTTTGCCACCGGATGTCAGGTAAACGGTGCTGTCTGTAACCTGGCCCCAGGTGACTGGGTTATCAAAGCCAATCTGGCTGAGTGCAAAGCCCCTCATTCCGACTCGGGAGGGTCCCTGGCACGTAGGCTGGAGAGGACGCAAAAGTCAGACCAGAAATGCCACCTGAAAGCATGCTAAAGGTGCTGTCTGTACATGCCCCAGGAGGACTGGGTTAACAAAGCTTAACAGCCCCAGCGGCCCAAACCATGGAGTGCGTGACCATGGCGTAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGCTGCAACTTGGCAAGGCCCAAACCCGCTCAAAGCTGTAGAGACGGGGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCC
| 79,189
|
KX258462.1
|
Saint Louis encephalitis virus
|
White,G.S., Symmes,K., Sun,P., Fang,Y., Garcia,S., Steiner,C., Smith,K., Reisen,W.K., Coffey,L.L., Steiner,C.D., White,G.
|
School of Veterinary Medicine, University of California, Davis, Department of Pathology, Microbiology and Immunology
|
USA
|
2016-12-03
|
39
|
Orthoflavivirus louisense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,762
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
| null |
pooled insects
|
2015-07-14
| null | null |
Saint Louis encephalitis virus isolate 39, complete genome
|
CAGTTTTTTAGCAGGGAATTACCCAATGTCTAAAAAACCAGGAAAACCCGGTAAAAATCGGGTTGTCAATATGCTAAAACGCGGTGTATCCCGCGTAAACCCCTTGACGGGGTTGAAGAGGATACTTGGAAGTCTGCTGGATGGCCGTGGACCCGTGCGGTTCATACTAGCCATTCTGACATTCTTCCGATTTACAGCTCTACAGCCAACTGAGGCGCTGAAGCGCAGATGGAGGGCTGTAGATAAGAGAACGGCATTGAAACACTTAAACGGATTCAAACGTGATCTCGGATCCATGCTGGACACCATTAACCGGCGGCCAAGCAAAAAGAGAGGAGGGACCGGATCTTTGCTTGGATTGGCTGCGTTAATTGGACTGGCGAGTTCACTGCAATTGTCAACCTACCAGGGGAAAGTGTTAATGTCAATAAACAAGACCGACGCCCAAAGCGCTATTAACATCCCCAGTGCCAACGGAGCAAACACCTGCATTGTGAGGGCTCTAGATGTGGGGGTCATGTGCAAAGATGATATTACATACCTTTGCCCAGTTCTTTCAGCGGGAAATGATCCCGAGGACATTGACTGCTGGTGTGATGTTGAAGAGGCGTGGGTGCATTACGGCAGATGCACGCGCATGGGACATTCAAGGCGCAGCCGACGGTCGATCTCTGTGCAGCACCACGGAGACTCCACACTGGCAACAAAGAACACGCCATGGTTGGACACCGTGAAAACCACCAAGTACTTGACAAAAGTCGAAAACTGGGTTTTGCGCAATCCTGGATATGCCCTAGTTGCACTAGTGATTGGATGGATGCTGGGTAGCAACAACACACAGAGAGTGGTCTTTGTGATCATGCTGATGTTGATTGCCCCGGCATACAGCTTTAACTGTCTGGGAACATCAAACAGGGACTTCGTCGAAGGAGCCAGCGGGGCAACATGGATTGACTTGGTACTTGAAGGAGGAAGCTGTGTCACAGTAATGGCACCAGAGAAACCAACACTGGACTTCAAAGTGATGAAGATGGAGGCCACGGAGTTAGCCACTGTGCGTGAGTATTGCTACGAAGCATCCCTAGACACGCTGTCAACAGTGGCAAGATGCCCCACAACTGGAGAAGCTCACAACACCAAAAGGAGTGACCCAACATTTGTCTGCAAAAGAGATGTTGTGGACCGTGGATGGGGTAACGGATGTGGTTTGTTTGGAAAAGGAAGCATTGATACGTGCGCAAAGTTCACATGCAAAAACAAGGCAACAGGGAAGACAATCCTGAGGGAAAACATCAAGTACGAGGTTGCAATTTTCGTGCATGGCTCAACGGACTCCACGTCACATGGCAATTACTCTGAGCAAATTGGAAAAAACCAAGCAGCTAGATTCACCATAAGCCCGCAAGCACCGTCTTTCACGGCTAACATGGGCGAGTATGGGACAGTCACCATTGATTGTGAGGCAAGATCAGGAATCAACACAGAGGACTATTATGTCTTCACAGTTAAGGAGAAGTCATGGCTAGTAAACAGGGACTGGTTTCACGACTTGAACCTTCCATGGACGAGTCCTGCCACAACTGATTGGCGCAACAGAGAAACACTGGTGGAATTTGAAGAACCACATGCCACCAAGCAAACTGTGGTCGCCTTAGGCTCGCAAGAAGGTGCTCTACACACAGCACTGGCCGGGGCCATTCCAGCCACTGTTAGCAGCTCCACCTTAACCTTGCAATCAGGGCACTTGAAGTGCAGAGCCAAGCTTGACAAGGTTAAAATCAAGGGGACGACTTATGGCATGTGTGACTCTGCTTTCACCTTCAGCAAGAACCCTGCTGACACAGGGCATGGGACAGTGATCGTGGAACTGCAGTACACTGGAAGCAACGGACCATGCCGGGTTCCCATTTCTGTGACTGCAAACCTCATGGACTTGACACCGGTTGGAAGATTGGTCACGGTCAATCCCTTTATTAGCACAGGGGGAGCGAACAACAAGGTCATGATCGAAGTTGAACCACCCTTTGGCGACTCTTATATCGTCGTCGGAAGAGGTACCACCCAGATCAACTACCACTGGCACAAAGAGGGAAGCAGCATTGGGAAAGCTTTGGCAACCACATGGAAAGGAGCCCAACGGCTAGCCGTTTTGGGGGACACAGCGTGGGACTTCGGATCTATTGGAGGAGTTTTCAATTCAATCGGCAAAGCTGTCCACCAAGTCTTTGGAGGGGCGTTCAGGACCCTGTTCGGGGGAATGTCCTGGATTACACAGGGACTACTTGGAGCCCTTCTCCTGTGGATGGGGTTGCAGGCCCGCGACAGGAGCATCTCGCTGACTCTACTGGCTGTTGGAGGGATTCTTATCTTTCTGGCGACCAGCGTGCAAGCTGATTCGGGATGTGCAATTGACCTGCAACGACGTGAATTGAAATGTGGAGGAGGCATCTTCGTGTACAACGACGTTGAGAAGTGGAAGAGTGACTACAAGTACTTTCCCCTGACTCCGACTGGACTTGCGCGTGTGATTCAAGAGGCGCATGCCAATGGCATCTGTGGCATCCGATCGACGTCACGTTTGGAGCACTTAATGTGGGAAAGCATACAGAAAGAGCTAAACGCGATCTTTGAAGACAATGAAATTGACTTGTCAGTTGTAGTGCAGGAAGATCCCAAATACTACAAAAGGGCTCCACGACGCCTGAAGAAGCTGGAAGATGAGCTGAACTACGGATGGAAAAAATGGGGAAAAACCCTGTTCATGGAACCCAAACTTGGAAACAACACATTTGTTGTTGATGGACCCGAAACCAAGGAATGTCCAACAGCAAACAGAGCATGGAACAGTTTCAAGGTGGAAGACTTTGGATTTGGCATGGTGTTCACGCGATTGTGGCTCACAATCCGGGAGGAAAACACAACAGAATGTGATTCGGCAATCATTGGCACAGCCATAAAAGGAGACAGAGCTGTTCACAGTGACCTATCGTATTGGATTGAGAGCAAAAAGAATGGAACATGGCAGCTGGAGCGAGCCGTTATGGGAGAAGTGAAGTCTTGCACCTGGCCAGAAACGCACACCCTATGGGGTGATGGCGTTGTTGAAAGCGAAATGATCATCCCGGTAACACTAGGCGGCCCTAAAAGCCATCACAACAAGAGAACCGGATATCACACACAGACAAAAGGACCCTGGAGTGAAGGAGAAATAACCCTGGACTTTGACTATTGCCCAGGAACAACAGTTACTGTCACAGAACATTGTGGAAACAGGGGAGCGTCACTGCGCACAACTACAGCGAGCGGCAAGCTGGTCACTGATTGGTGTTGCAGGAGCTGTTCCCTGCCACCACTGCGATACACCACAAAAGATGGATGTTGGTACGGAATGGAGATCCGGCCAGTGAAGGAGGAAGAAGCAAAACTTGTGAAATCTCGAGTGACAGCTGGAGTTGCGGGGGGGATGGAACCATTCCAACTTGGCCTCCTGGTAGCATTCATAGCCACCCAAGAAGTGCTGAAACGCAGATGGACTGGGAAGTTGACCCTGACCTCACTAGCAGTGTGTTTGGCACTACTGATTTTTGGAAATCTGACATACATGGATCTGGTGCGATACTTAGTCCTTGTTGGAACAGCTTTTGCGGAAATGAACACTGGAGGTGATGTGATCCACCTGGCACTTGTTGCTGTCTTCAAAGTGCAACCAGCATTCTTAGCGGGTCTATTTTTTAGAATGCAATGGAGTAACCAGGAAAACATCTTGATGGTTATTGGAGCAGCTTTCCTTCAAATGGCAGCCAACGATCTGAAGCTTGAGGTCCTTCCGATTCTCAATGCCATGTCCATTGCATGGATGCTGATAAGGGCTACGAAAGAAGGTAAAGTGGCGATGTACGCTCTTCCCATCTTGTGTGCTCTGACTCCAGGAATGAGAATGGCCGGGCTTGACGTCATCAGATGTCTGTTGTTGATAATTGGAATTGTAACACTCCTGAATGAAAGAAGAGAAAGCGTGGCCAAGAAAAAAGGTGGCTACCTGCTTGCAGCAGCTCTCTGCCAGGCTGGATTGTGCAGTCCCTTGATCATGATGGGAGGTTTGATTTTGGCTCACCCTAATGGGAAAAGGAGTTGGCCAGCAAGTGAGGTCTTGACCGGAGTCGGATTGATGTGCGCTCTGGCAGGGGGCCTTCTCGAGTTTGAGGAGACCTCAATGGTGGTTCCCTTTGCAATAGCTGGACTGATGTACATCACATACACCGTCTCGGGAAGGGCCGCAGAGATGTGGATTGAGAAAGCAGCAGACATCACATGGGAACAGAATGCTGAGATCACCGGAACCAGCCCCAGGCTTGATGTTGACCTTGACTCACATGGTAACTTCAAGCTCCTGAACGATCCTGGAGCTCCAGTACATTTGTTCGCGTTGAGATTCATACTTCTGGGCTTGAGCGCACGGTTTCATTGGTTTATTCCATTTGGAGTACTGGGGTTTTGGTTGCTCGGAAAACACTCAAAGCGAGGAGGAGCATTGTGGGACGTGCCGTCACCAAAAGTATATCCAAAATGTGAGACAAAACCAGGAATCTATCGAATCATGACCAGGGGAATCCTGGGCACCTTTCAAGCTGGAGTTGGTGTGATGCATGAAGGAGTTTTTCACACAATGTGGCACGCAACTGAAGGAGCAGTCCTGCGAAACGGAGAAGGGAGACTAGATCCGTATGCAGGAGATGTCCGGAATGATCTGATCTCTTATGGAGGTCCCTGGAAGCTGAGTGCCACCTGGGATGGGATTGAGGAGGTCCAAATGATAGCAGTAGCTCCGGGAAAACCAGCCATCAATGTCCAGACAACACCAGGAGTGTTCAAGACCCCGTTTGGGACCATTGGAGCCGTGACTCTTGATTTCCCAAAAGGAACATCAGGTTCTCCAATCATCAATAAGAAAGGGGAGATCATTGGGCTCTATGGAAATGGGGTACTGATTGGACAGGGTG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CATGGAAAGGGTGAATGGATGACAACTGAAGACATGTTGAGTGTCTGGAACCGTGTGTGGATTGAAGAGAATGAATACATGAAAGATAAAACACCATTGGCGGCTTGGAACGACATTCCATACCTAGGAAAGAGAGAGGACATCTGGTGTGGAAGCCTAATTGGAACAAGGACCAGAGCCACCTGGGCTGAGAACATCTACGCTCCAATCATGCAGATCCGCAACCTCATCGGGGAGGAAGAGTATAGAGACTATATGGTTGCCGCAAAGAGATTTGCCAGGGAAGAAACTCATGTGGTAGGAGGAGCGTTGTAGATTAAGATGTGAATAGTGTAAATAAATAAAATAGGTAAGTCAGGCCAATTAATTTTGCCACCGGATGTCAAGTAAACGGTGCTGTCTGTAACCTGGCCCCAGGTGACTGGGTTATCAAAGCCAATCTGGCTGAGTGCAAAACCCCTCATTCCGACTCGGGAGGGTCCCTGGCACGTACGCTGGAGAGGACGCAAAAGTCAGACCAGAAATGCCACCTGAAAGCATGCTAAAGGTGCTGTCTGTACATGCCCCAGGAGGACTGGGTTAACAAAGCTTAACAGCCCCAGCGGCCCAAACCATGGAGTGCGTGACCATGGCGTAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGCTGCAACTTGGCAAGGCCCAAACCCGCTCAAAGCTGTAGAGACGGGGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCTTGCCGTTAACGCAAACAACAGCATA
| 79,190
|
KM267635.1
|
Saint Louis encephalitis virus
|
Vedovello,D., Drumond,B.P., Marques,R.E., Ullmann,L.S., Favaro,E.A., Terzian,A.C., Figueiredo,L.T., Teixeira,M.M., Junior,J.P., Nogueira,M.L., Terzian,A.C.B., Figueiredo,L.T.M., Araujo,J.P. Jr.
|
Faculdade de Medicina de Sao Jose Do Rio Preto, Departamento de Doencas Dermatologicas, Infecciosas e Parasitarias
| null |
2014-11-18
|
BeH355964
|
Orthoflavivirus louisense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,892
|
GenBank
| 1
|
Brazil: Belem
|
Brazil
|
Homo sapiens
| null |
1978
| null | null |
St. Louis encephalitis virus isolate BeH355964, complete genome
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GTTCGCGTCGGTGAGCGGAGAGGAAACAGATTCTTTTTTGGAGGATAACAACTTAACTTGACTGCGAACAGTTTTTTAGCAGGGAATTACCCAATGTCTAAAAAACCAGGAAAGCCCGGTAGAAACCGGGTTGTCAATATGCTAAAACGCGGTGTATCCCGCGTGAACCCCTTGACGGGGTTGAAGAGGATACTTGGAAGTCTGCTAGACGGCCGTGGACCCGTGCGGTTCATATTGGCCATTCTGACATTCTTCCGATTTACAGCTCTACAGCCAACTGAGGCGCTGAAGCGCAGATGGAGGGCTGTAGATAAAAGAACGGCATTGAAACACCTGAACGGATTCAAACGTGATCTTGGATCTATGCTAGACACCATCAACCGGCGGCCAAGCAAAAAGAGAGGAGGGACCGGATCGTTGCTCGGACTGGCAGCACTAATAGGACTGGCGAGCTCATTGCAACTGTCAACCTACCAGGGAAAAGTGCTAATGTCAATAAACAAGACTGACGCCCAAAGCGCCATAAACATTCCCAGTGCCAACGGAGCAAACACTTGCATTGTGAGAGCTCTAGATGTGGGGGTCATGTGCAAAGATGATATCACATACCTGTGCCCAGTGCTTTCAGCGGGAAACGATCCTGAGGACATTGACTGTTGGTGTGATGTTGAAGAAGTGTGGGTGCACTATGGCAGATGCACGCGCATGGGACATTCAAGGCGTAGTCGGCGGTCAATTTCTGTGCAGCATCACGGAGACTCCACACTGGCAACAAAGAACACGCCATGGCTAGACACCGTGAAAACCACTAAGTACTTGACAAAAGTCGAAAACTGGGTTCTGCGCAATCCCGGATATGCCCTAGTTGCGCTGGCGATTGGATGGATGCTAGGCAGCAACAACACACAGAGAGTGGTTTTTGTGATCATGCTGATGTTGATTGCCCCGGCATACAGCTTTAATTGTCTGGGAACATCAAACAGGGACTTCGTCGAAGGAGCCAGCGGGGCAACATGGATTGACTTGGTACTTGAAGGAGGAAGCTGTGTCACAGTGATGGCACCAGAGAAACCAACATTGGACTTCAAAGTGATGAAGATGGAGGCCACGGAGTTAGCTACTGTGCGTGAGTATTGCTACGAAGCAACCTTGGACACGCTGTCAACAGTGGCAAGATGTCCCACAACGGGAGAAGCTCACAACACCAAGAGGAGTGACCTAACATTCGTCTGCAAAAGAGATGTTGTAGACCGTGGATGGGGTAACGGATGTGGTCTGTTTGGAAAAGGAAGCATTGACACATGCGCGAAGTTTACATGCAAGAACAAGGCAACAGGGAAGACAATCCTGAGGGAAAACATCAAGCACGAGGTCGCAATTTTTGTGCATGGTTCAACGGACTCCACGTCACACGGCAACTACTCTGAGCAAATTGGGAAAAACCAAGCGGCTAGATTCACCATAAGCCCACAAGCACCATCTTTCACGGCCAACATGGGTGAATATGGAACAGTCACCATTGACTGTGAAGCAAGATCAGGAATCAACACAGAAGACTATTATGTCTTCACAGTCAAGGAGAAGTCATGGCTAGTGAATAGGGACTGGTTTCACGATCTGAACCTTCCATGGACGAGCCCTGCCACAACTGATTGGCGCAACAGAGAAACACTGGTGGAATTTGAAGAACCACATGCCACCAAGCAAACTGTGGTTGCCCTAGGCTCGCAAGAAGGAGCCCTGCACACAGCACTGGCCGGAGCCATTCCAGCCACTGTTAGCAGCTCCACCTTAACCTTGCAATCAGGGCACTTGAAGTGCAGAGCCAAGCTTGACAAGGTCAAAATCAAAGGAACAACATATGGCATGTGTGACTCTGCGTTCACCTTCAGTAAGAACCCAGCTGACACAGGGCATGGGACAGTGATTGTGGAACTGCAGTACACTGGAAGCAACGGACCCTGTCGGGTTCCCATTTCCGTGACCGCAAACCTCATGGACTTGACACCGGTTGGAAGATTGGTTACGGTCAATCCCTTTATAAGCACAGGGGGAGCGAACAACAAGGTCATGATCGAAGTTGAGCCACCCTTCGGCGATTCTTACATCGTCGTCGGAAGAGGCACCACCCAAATCAACTACYACTGGCACAAAGAGGGAAGCAGCATTGGGAAGGCTTTGGCGACTACATGGAAAGGAGCTCAACGGCTAGCCGTCTTGGGGGACACAGCGTGGGACTTCGGATCCATTGGAGGAGTCTTCAATTCAATCGGCAAAGCTGTCCACCAAGTTTTTGGAGGGGCATTTAGGACCCTGTTCGGGGGAATGTCCTGGATCACACAGGGATTGCTTGGAGCCCTTCTCTTATGGATGGGGTTGCAGGCCCGCGACAGGAGCATCTCGTTGACCTTACTGGCTGTTGGAGGGATTCTAATCTTTCTAGCGACCAGCGTGCAAGCTGATTCGGGATGTGCAATTGACCTGCAACGACGTGAATTGAAATGCGGAGGAGGCATCTTCGTGTACAATGACGTCGAGAAGTGGAAGAGTGACTACAAGTATTTTCCCTTGACTCCAACTGGGCTCGCGCGCGTGATTCAAGAGGCGCACGCCAATGGCATCTGTGGCATCAGATCGACGTCACGTTTGGAGCATTTGATGTGGGAGAACATACAGAGAGAGCTGAACGCAATCTTTGAAGACAATGAAATAGACTTGTCAGTTGTAGTGCAGGAAGATCCCAAATACTACAAAAGAGCTCCCCAACGCTTGAAGAAACTGGAGGATGAGCTGGATTACGGATGGAAGAAATGGGGAAAAACCCTGTTCATGGAACCTAAACTTGGAAACAACACATTTGTTGTTGATGGACCAGAAACTAAGGAATGTCCAACAGCAAACAGAGCATGGAATAGTTTCAAGGTGGAAGACTTTGGATTTGGCATGGTGTTCACTCGATTGTGGCTCACAATCCGGGAGGAAAACACAACGGAATGCGATTCGGCAATCATTGGCACAGCCATAAAAGGAGATAGAGCTGTTCACAGTGACCTATCATATTGGATTGAGAGCAAGAAGAATGAAACATGGCAGCTGGAACGAGCTGTTATGGGAGAAGTGAAATCTTGCACCTGGCCAGAAACGCACACTCTGTGGGGTGATGGCGTTGTTGAGAGCGAAATGATTATTCCGGTGACATTAGGAGGCCCCAAAAGCCATCATAACAAGAGAACTGGATACCACACACAGACAAAAGGACCTTGGAGTGAAGGAGAAATAACCTTGGACTTTGACTATTGCCCAGGAACAACAGTCACTGTCACTGAACATTGTGGAAACAGGGGAGCATCACTGCGCACAACCACAGCGAGCGGCAAGCTGGTCACTGATTGGTGCTGCAGGAGCTGTTCCTTGCCACCACTGCGATACACCACAAAAGATGGATGCTGGTACGGAATGGAAATCCGGCCAGTGAAGGAGGAAGAAGCAAAACTTGTAAAATCTCGAGTGACAGCTGGAATCGCAGGGGGGATGGAACCATTCCAACTTGGTCTCTTGGTAGCATTCATAGCCACCCAAGAAGTGCTGAAACGCAGATGGACTGGGAAGTTGACCCTGACCTCATTGGCGGTATGCTTGGCACTATTAATTTTTGGAAACCTAACATACATGGATCTGGTGCGGTACCTGGTCCTTGTTGGAACCGCTTTCGCGGAAATGAACACCGGAGGCGATGTGATCCATCTGGCGCTTGTTGCTGTCTTCAAAGTGCAACCAGCATTCTTAGCAGGTCTGTTCTTGAGGATGCAGTGGAGTAACCAGGAAAACATCTTGATGGTTATTGGAGCAGCCTTCCTTCAAATGGCAGCCAACGACCTGAAACTTGAGGTCCTTCCGATTCTCAATGCCATGTCCATTGCGTGGATGCTAATAAGGGCAATGAAAGAAGGCAAAGTGGCGATGTACGCTCTTCCCATCTTGTGTGCTCTGACTCCAGGAATGAGAATGGCTGGGCTTGACGTCCTCAGATGCCTGTTGCTGATAATTGGTATTGTGACACTTCTGAATGAAAGAAGAGAAAGTGTGGCCAAGAAAAAAGGCGGCTACTTGCTCGCCGCAGCCCTCTGCCAAGCTGGATTGTGCAGTCCCTTGATCATGATGGGAGGCCTGATTTTGGCTCACCCTAATGGGAAAAGGAGTTGGCCAGCGAGTGAGGTCTTGACCGGAGTCGGCCTGATGTGCGCTCTAGCAGGAGGCCTTCTCGAGTTTGAGGAAACCTCAATGGTGGTCCCCTTTGCAATAGCTGGGTTGATGTACATCACATACACCGTCTCGGGAAAGGCCGCAGAAATGTGGATTGAGAAAGCAGCTGACATCACATGGGAACAAAATGCTGAGATCACCGGAACCAGCCCCAGGCTTGATGTTGACCTCGACTCGCATGGCAACTTCAAGCTTCTGAATGACCCTGGAGCTCCAGTGCACTTGTTTGCGCTGAGATTCATACTCTTGGGCTTGAGTGCACGGTTTCACTGGTTTATTCCATTTGGAGTATTGGGGTTTTGGTTGCTTGGAAAACACTCGAAGCGAGGAGGAGCATTGTGGGACGTGCCATCACCAAAAGTCTATCCAAAATGTGAGACAAAACCAGGAATCTATCGGATTATGACCAGAGGAATCCTGGGCACGTTTCAAGCTGGAGTTGGTGTGATGCATGAAGGAGTTTTCCACACAATGTGGCACGCAACTGAAGGGGCAGTCTTGCGAAACGGAGAAGGGAGACTAGATCCGTATGCAGGAGACGTCCGGAATGACCTGATCTCGTATGGAGGTCCCTGGAAACTGAGTGCCACTTGGGACGGGATTGAGGAAGTCCAAATGATTGCAGTAGCTCCAGGAAAACCAGCCATCAATGTTCAGACAACACCAGGAGTGTTCAAGACCCCATTTGGGACCATTGGAGCTGTGACTCTTGATTTCCCAAAAGGAACATCAGGTTC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TGATGGCAAATGCCATCTGTTCTGCCGTCCCAATCAACTGGGTCCCCACTGGACGTACTACATGGTCAATTCATGGAAAGGGTGAGTGGATGACAACTGAAGACATGTTGAGTGTCTGGAACCGTGTGTGGATTGAAGAGAATGAATACATGAAGGACAAAACACCATTGGCGGCCTGGAACGACATTCCATACCTAGGAAAGAGAGAGGACATCTGGTGCGGAAGCCTAATTGGAACAAGGACCAGAGCCACCTGGGCTGAGAACATCTATGCTCCAATCATGCAGATCCGCAACCTCATCGGGGAAGAGGAGTACAGAGACTACATGGTTGCCCAAAACAGATTTGGCAGGGAAGAAACTCATGTGGTAGGAGGAGTGTTGTAAATTAAAATGTAAATAGTGTAAATAAATAAAAACAGGTAAGTCAGGCCAATTAGCTTTGCCACCGGATGTCAGGTAAACGGTGCTGTCTGTAACCTGGCCCCAGGTGACTGGGTTATCAAAGCCAATCTGGCTGAGTGCAAAGCCCCTCATTCCGACTCGGGAGGGTCCCTGGCACGTAGGCTGGAGAGGACGCAAAAGTCAGACCAGAAATGCCACCTGAAAGCATGCTAAAGGTGCTGTCTGTACATGCCCCAGGAGGACTGGGTTAACAAAGCTTAACAGCCCCAGCGGCCCAAACCATGGAGTGCGTGACCATGGCGTAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGCTGCAACTTGGCAAGGCCCAAACCCGCTCGAAGCTGTAGAGACGGGGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCTTGCCGTTAACGCAAATAACAGCATATTGACACCTGGAAAGACAGGAGATCCCCTGCTTTTTCAACACCAGCCACAAGGCACAG
| 88,674
|
JQ957868.1
|
Saint Louis encephalitis virus
|
Kopp,A., Gillespie,T.R., Hobelsberger,D., Estrada,A., Harper,J.M., Miller,R.A., Eckerle,I., Muller,M.A., Podsiadlowski,L., Leendertz,F.H., Drosten,C., Junglen,S.
|
University of Bonn Medical Centre, Institute of Virology
|
Germany
|
2013-07-31
| null |
Orthoflavivirus louisense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,913
|
GenBank
| 1
|
Mexico
|
Mexico
|
Culex nigripalpus
| null |
2008
| null | null |
St. Louis encephalitis virus strain Palenque-C475, complete genome
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AGATGTTCGCGTTGGTGAGCGAGGAAGAAACGGATTTCTTTTTTGGAGGATTACAACTTAACTTGACTGCGAACAGTTTTTTAGCAGGGAATTACCCGATGTCTAAAAAACCAGGAAAACCCGGTAAAAACCGGGTTGTCAATATGCTAAAACGCGGTGTATCCCGCGTGAACCCCTTGATGGGGTTGAAGAGGATACTTGGAAGCTTGTTGGATGGTCGTGGGCCTATTCGGTTCATTTTAGCTATCTTAACATTTTTCCGATTTACAGCTCTACAGCCAACCGAAGCGCTTAAGCGCAGATGGAGGGCTGTGGATAAAAAAACAGCATTAAAACATCTGAACGGATTCAAACGTGACCTAGGATCAATGCTTGACACCATCAACCGACGTCCAAGTAAGAAGAAAGGAGGATCTGGATCACTGCTTGGATTGGCTGCGCTGGTGGGACTCGCAAGTTCTTTGCAGCTTTCGACATATCAAGGCAAGGTAATGATGTCGATAAATAAGACTGACGTTCAGAGCGCCATCAACATTCCCAGCACCAACGGTGCAAACACATGCATCGTTCGAGCACTTGACGTGGGGGTTATGTGCAAGGATGACATCACATATCTCTGTCCGGTACTCTCAGCCGGGAATGACCCGGAAGATATTGACTGTTGGTGTGATGTAGAAGAGGTGTGGGTGCACTATGGCAGGTGCACACGCATGGGACACTCTAGACGAAGCAGACGATCGATCTCTGTCCAACACCATGGAGATTCAACATTGGCAACAAAAAACACGCCATGGCTTGACACTGTGAAGACCTCTAAGTATCTAACAAAGGTTGAGAACTGGGTCCTACGCAATCCAGGGTACGCATTGGTTGCATTGGCCATCGGATGGATGCTAGGCAGCAACAACACACAGAAGGTAGTGTTTGTGATCATGCTAATGCTGATTGCACCTGCATATAGCTTCAACTGCCTGGGAACATCGAACCGTGATTTTGTTGAAGGAGCCACTGGGGCAACATGGATTGACTTAGTTCTTGAAGGGGGAAGTTGTGTTACGGTCATGGCACCAGAAAAACCAACACTGGACTTTAAGGTGATGAAGATGGAGGCCACGGAGCTGGCGACCGTACGTGAGTACTGCTATGAAGTGACCTTGGACACGCTGTCGACGGTGGCCAGGTGCCCAACAACCGGCGAAGCCCATAACACCAAGAGAAGCGACCCAGCATTTGTCTGCAAGAGAGACGTTGTGGACCGCGGATGGGGTAACGGGTGTGGTTTATTTGGGAAAGGAAGCATCGATACGTGCGCGAAGTTCACGTGTAAGAGTAAGGCAACAGGGAAAACGATCTTGAGAGAAAACATCAAATACGAAGTTGCTATCTTTGTCCATGGATCAACAGACTCCTCATCACATGGAAACTACTCTGAGCAAATTGGGAAAAATCAAGCAGCTAGGTTCACTATTAGCCCACAGGCACCATCCTTTACAGCCAACATGGGTGAGTACGGGACAGTGACCATTGATTGTGAAGCTAGGTCAGGAATAAACACAGAGGACTACTATGTCTTCACAGTCAAAGAGAAATCATGGCTTGTCAACCGAGACTGGTTCCATGATTTGAACCTCCCATGGACGAGCCCCGCTACGACTGATTGGCGAAATCGTGAAACACTTGTGGAATTTGAGGAACCCCATGCTACCAAACAAACTGTAGTTGCATTGGGGTCACAAGAAGGAGCGTTGCACACAGCATTGGCAGGAGCAATTCCAGCCACAGTCAGTAGTTCCACTCTGACTCTGCAGTCAGGACACCTTAAATGCAGAGCTAAATTAGACAAGGTAAAGATTAAGGGAACCACATATGGGATGTGTGGCTCGGCATTCACTTTTAGCAAGAATCCCACTGACACAGGACACGGGACAGTGATCGTGGAACTGCAGTACACAGGAAGTAATGGGCCTTGTAGAGTCCCCATCTCTGTTACAGCAAATCTCATGGACTTGACGCCAGTCGGCAGGTTAGTCACAGTTAACCCGTTTGTCAGCACGGGAGGAGCGAACAATAAGGTCATGGTTGAAGTTGAACCTCCTTTTGGCGACTCTTATATAGTTGTTGGAAGAGGCACCACCCAAATCAATTACCATTGGCACAAAGAGGGAAGCAGTATTGGGAAAGCTTTGGCGACCACATGGAAAGGCGCTCAAAGACTGGCGGTCTTGGGAGACACCGCATGGGACTTTGGTTCCATTGGGGGGGTGTTCAATTCAATTGGAAAAGCCGTGCATCAAGTTTTTGGAGGAGCGTTCAGAACACTGTTTGGAGGGATGTCATGGATAACGCAAGGACTACTTGGAGCCCTGCTCTTGTGGATGGGATTGCAAGCTCGTGACAGGAGCATCTCGCTAACCTTGCTGGCTGTCGGAGGAGTGCTCGTATTCTTAGCGACAAGTGTGCAGGCCGATTCGGGGTGTGCAATTGACTTGCAGCGCCGTGAATTGAAATGCGGGGGAGGCATCTTTGTCTACAACGATGTTGAAAAGTGGAAGAGTGGTTATAAGTATTTTCCACTCACTCCAACTGGACTTGCTCGCGTTATCCAAGAGGCGCATGCTTCTGGCATTTGCGGCATCCGATCAACCTCAAGACTGGAACATTTGATGTGGGACAACGTGCAACGGGAACTCAATGCGATCTTTGAAGACAATGAGATCGATTTGTCAATAGTGGTCCAAGAAGACCCAAAGTTTTACAGAAGAGCTCCAAAAAGGCTGAAGAAGCTGGAAGATGAACTGAATTATGGATGGAAGAAATGGGGAAAAACCTTATTTGTGGAACCTAAGCTGGGCAATAACACGTTCGTGATTGACGGTCCAGAAACCAGGGAATGCCCAACGACCAATAGAGCGTGGAATAGCTTTAAGGTGGAAGACTTTGGATTTGGCATGGTGTTCACTCGACTGTGGCTTACAATTCGAGAAGAAAACACCACAGAATGTGACTCAGCTATCATAGGCACAGCCATAAAAGGGGACAAGGCTGTGCATAGTGATTTGTCATACTGGATTGAAAGCAAGAAGAACGAAACATGGCAATTAGAACGGGCTGTCATGGGGGAAGTGAAATCTTGTACGTGGCCGGAGACACACACCTTGTGGGGCGATGGTGTTGTTGAAAGCGAGATGATCATTCCAGTCACTCTAGGTGGACCCAAGAGCCATCATAACAAGAGAGCTGGATACCACACCCAAACAAAGGGACCGTGGAGTGAGGGAGAGGTAACCTTGGACTTTGACTTCTGTCCCGGAACCACGGTAACTGTCACTGAACGTTGTGGTAACCGAGGGGCCTCACTGCGCACAACCACTGCAAGCGGAAAATTAGTCACAGACTGGTGCTGCAGAAGCTGCTCATTGCCACCATTGCGGTATGTCACCAAAGACGGCTGTTGGTATGGAATGGAGATTCGACCGACTAGAGAGGACGAAGCAAAGCTCGTGAAGTCTCGAGTAACGGCTGGAGTAGCGGGAGGAATGGAACCCTTTCAGCTCGGCTTGCTGGTGGCATTCATAGCCACGCAGGAAGTGCTAAAACGGAGATGGACTGGAAAATTGACATTGACATCATTGGCAGTCTGCTTGATGCTATTGATCACAGGAAACCTAACATACATGGATCTAGTGAGGTACTTGGTTCTTGTTGGAACAGCCTTCGCGGAAATGAACACGGGCGGTGATGTGATCCACCTAGCCCTAGTAGCTGTCTTCAAAGTGCAGCCTGCTTTTTTAACAGGCCTGTTCTTAAGGATGCAATGGAGCAATCAAGAAAGCATCCTGATGGTCATAGGAGCAGCTTTTCTACAGATGGCGGCAAATGACCTGGAGCTGGAGGTGCTTCCACTTCTTAACGCCATGTCTATTGCCTGGATGTTAATTCGAGCCATGAAAGAGGGAAAGGTGGCGATGTACGCTCTCCCTGCCCTGTGTGCCCTCACTCCCGGAATGAGAATGGCTGGACTGGATGTCATCAGATGCTTATTGCTAATTGTTGGAATCGTGACGCTCCTGAATGAAAGACGAGAAAGTGTGGCGAAAAAGAAAGGAGGATACCTACTTGCAGCTGCTTTATGCCAAGTGGGGCTGTGTTCTCCACTGATAATGATGGGAGGCCTGATTCTGGCCCACCCAAATGGGAAGAGAAGTTGGCCAGCAAGTGAGGTCCTGACCGGTGTTGGGCTGATGTGTGCTTTGACAGGAGGACTTTTGGAGTTTGAGGAGACCTCGATGGTGGTCCCCTTTGCCATTGCGGGGTTAATGTACATCACGTATACCGTCTCGGGAAGAGCGGCCGAAATGTGGATCGAGAAAGCGGCCGATATAACGTGGGAACAGAACGCAGAAATCACAGGAACCAGCCCTAGACTTGATGTTGATCTCGACTCACACGGCAATTTCAAACTCTTGAACGACCCAGGAGCTCCAGTGCACCTGTTTGCCTTGAGGCTCGTCCTCCTTGGCCTGAGCGCACGGTTTTACTGGTTTATCCCGTTTGGAGTACTGGGGTTTTTTCTGCTAGGAAAGCATTCAAAACGTGGGGGAGCTCTGTGGGATGTTCCGTCACCAAAGGTATACCCAAAGTGTGAAACCAAACCAGGAATTTACCGAATCATGACAAGAGGAATTCTAGGGACTTTCCAAGCTGGCGTTGGTGTGATGCACGAAGGAGTCTTTCATACAATGTGGCACGCCACCGAAGGGGCAGTTTTGCGAAATGGTGAGGGAAGAATGGATCCGTATACCGGAGATGTCCGCAATGACTTGATCTCGTACGGTGGTCCATGGAAACTGAGTGCCACATGGGACGGGGCTGAAGAAGTCCAAATGATAGCTGTCGCTCCGGGAAGACCGGCCGTGAACGTCCAAACGACACCAGGGGTATTCAAAACCCCTTTTGGGACCATTGGAGCAGTGACCTTAGATTTTCCAAAAGGAACATCG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| 93,557
|
JQ957869.1
|
Saint Louis encephalitis virus
|
Kopp,A., Gillespie,T.R., Hobelsberger,D., Estrada,A., Harper,J.M., Miller,R.A., Eckerle,I., Muller,M.A., Podsiadlowski,L., Leendertz,F.H., Drosten,C., Junglen,S.
|
University of Bonn Medical Centre, Institute of Virology
|
Germany
|
2013-07-31
| null |
Orthoflavivirus louisense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,938
|
GenBank
| 1
|
Mexico
|
Mexico
|
Culex nigripalpus
| null |
2008
| null | null |
St. Louis encephalitis virus strain Palenque-A770, complete genome
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AGATGTTCGCGTTGGTGAGCGAGGAAGAAACAGATTTCTTTTTTGGAGGATTACAACTTAACTTGACTGCGAACAGTTTTTTAGCAGGGAATTACCCGATGTCTAAAAAACCAGGAAAACCCGGTAAAAACCGGGTTGTCAATATGCTAAAACGCGGTGTATCCCGCGTGAACCCCTTGATGGGGTTGAAGAGGATACTTGGAAGCTTGTTGGATGGTCGTGGGCCTATTCGGTTCATTTTAGCCATCTTAACATTTTTCCGATTTACAGCTCTACAGCCGACCGAAGCGCTTAAGCGCAGATGGAGGGCTGTGGATAAAAAAACAGCATTAAAACATCTGAACGGATTCAAACGTGACCTAGGATCAATGCTTGACACCATCAATCGACGTCCAAGTAAGAAGAAAGGAGGATCTGGATCACTGCTTGGATTGGCTGCGATGGTGGGACTCGCAAGTTCTTTGCAGCTTTCGACATATCAAGGCAAGGTAATGATGTCGATAAATAAGACTGACGTTCAGAGCGCCATCAACATTCCCAGCACCAACGGTGCAAACACATGCATCGTTCGAGCACTTGACGTGGGGGTTATGTGCAAGGATGACATCACATATCTCTGTCCGGTACTCTCAGCCGGGAATGACCCGGAAGACATTGACTGTTGGTGTGATGTAGAAGAGGTGTGGGTGCACTATGGCAGGTGTACACGCATGGGACACTCTAGACGAAGCAGACGATCGATCTCTGTCCAACACCATGGAGATTCAACATTGGCTACAAAAAACACGCCATGGCTTGACACTGTGAAGACCTCTAAGTATCTAACAAAGGTTGAGAACTGGGTCCTACGCAATCCAGGGTACGCATTGGTTGCACTGGCCATCGGATGGATGCTAGGCAGTAACAACACACAGAAGGTAGTGTTTGTGATCATGCTAATGCTGATTGCACCTGCATATAGCTTCAACTGCCTGGGAACATCGAACCGTGATTTTGTTGAAGGAGCCACTGGGGCAACATGGATTGACTTAGTTCTTGAAGGGGGAAGTTGTGTTACGGTCATGGCACCAGAAAAACCGACACTGGACTTCAAGGTGATGAAGATGGAGGCCACGGAGCTGGCGACCGTACGTGAGTACTGCTATGAAGTGACCTTGGACACGCTGTCAACGGTGGCCAGGTGCCCAACAACCGGCGAAGCCCATAACACTAAGAGAAGCGACCCAGCATTTGTCTGCAAGAGAGACGTTGTGGACCGCGGATGGGGTAACGGGTGTGGTTTATTTGGGAAAGGAAGCATCGATACGTGCGCGAAGTTCACGTGTAAGAGCAAGGCAACAGGGAAAACGATCTTGAGAGAAAACATCAAATACGAAGTTGCCATCTTTGTTCATGGATCAACAGATTCCTCATCACATGGAAACTACTCTGAGCAAATTGGGAAAAATCAAGCAGCTAGGTTCACTATTAGCCCACAGGCACCATCCTTTACAGCCAACATGGGTGAATATGGGACAGTGACCATTGATTGTGAAGCTAGGTCAGGAATAAACACAGAGGACTACTATGTCTTCACAATCAAAGAGAAATCATGGCTTGTCAACCGAGACTGGTTCCATGATTTGAACCTCCCATGGACGAGCCCCGCTACGACTGATTGGCGAAATCGTGAAACACTTGTGGAATTTGAGGAACCCCATGCTACCAAACAAACTGTAGTTGCATTGGGGTCACAAGAAGGAGCGTTGCACACAGCATTGGCAGGAGCAATTCCAGCCACAGTCAGTAGTTCCACTCTGACTCTGCAGTCAGGACACCTTAAATGCAGAGCTAAATTAGACAAGGTAAAGATTAAGGGAACCACATATGGGATGTGTGACTCGGCATTCACTTTTAGCAAGAATCCCACTGACACAGGACACGGGACAGTGATCGTGGAACTGCAGTACACAGGAAGCAATGGACCTTGTAGAGTCCCCATCTCTGTTACAGCAAATCTCATGGACTTGACGCCAGTCGGCAGGTTAGTCACAGTTAACCCGTTTGTCAGCACGGGAGGAGCAAACAATAAGGTCATGGTTGAAGTTGAACCTCCTTTTGGCGACTCTTATATAGTTGTTGGAAGAGGCACCACCCAAATCAATTACCATTGGCACAAAGAGGGAAGCAGTATTGGGAAAGCTTTGGCGACCACATGGAAAGGTGCTCAAAGACTGGCGGTCTTGGGAGACACCGCATGGGACTTTGGTTCCATTGGGGGGGTGTTTAATTCAATTGGAAAAGCCGTGCATCAAGTTTTTGGAGGAGCGTTCAGAACACTGTTTGGAGGGATGTCATGGATAACTCAAGGACTACTTGGAGCCCTGCTCTTGTGGATGGGATTGCAAGCTCGTGACAGGAGCATCTCGCTAACCTTGCTGGCTGTCGGAGGAGTGCTCGTATTCTTAGCGACAAGTGTGCAGGCCGATTCGGGGTGTGCAATTGACTTGCAGCGCCGTGAATTGAAATGCGGGGGAGGCATCTTTGTCTACAACGATGTTGAAAAGTGGAAGAGTGGTTATAAGTATTTTCCACTCACTCCAACTGGACTTGCTCGTGTTATCCAAGAGGCGCATGCTTCTGGCATTTGCGGCATCCGATCAACCTCAAGACTGGAACATTTGATGTGGGACAACGTGCAACGGGAACTCAATGCGATCTTTGAAGACAATGAGATCGATTTGTCAATAGTGGTTCAAGAAGACCCAAAGTTTTACAGAAGAGCTCCAAAAAGGCTGAAGAAGCTGGAAGATGAACTGAATTATGGATGGAAGAAATGGGGAAAAACCTTATTTGTGGAACCTAAGCTGGGCAATAACACGTTCGTGATTGACGGTCCAGAAACCAGGGAATGCCCAACGACCAATAGAGCGTGGAATAGCTTTAAGGTGGAAGACTTTGGATTTGGCATGGTGTTCACTCGACTGTGGCTTACAATTCGAGAGGAAAACACCACAGAATGTGACTCAGCTATCATAGGCACAGCCATAAAAGGGGACAAGGCTGTGCATAGTGATTTGTCATACTGGATTGAAAGCAAGAAGAACGAAACATGGCAATTAGAACGGGCTGTCATGGGGGAAGTGAAATCTTGTACGTGGCCGGAGACACACACCCTTTGGGGCGATGGTGTTGTTGAAAGCGAGATGATCATCCCAGTTACTCTAGGTGGACCCAAGAGCCATCATAACAAGAGAGCTGGATACCACACCCAAACAAAGGGACCGTGGAGTGAGGGAGAGGTAACCTTGGACTTTGACTTCTGTCCCGGAACCACGGTAACTGTCACTGAACGTTGTGGTAACCGAGGGGCCTCACTGCGCACAACCACTGCAAGCGGAAAATTAGTCACAGACTGGTGCTGCAGAAGCTGCTCATTGCCACCATTGCGGTATGTCACCAAAGACGGCTGTTGGTATGGAATGGAGATCCGACCGACTAGAGAGGACGAAGCAAAGCTTGTGAAGTCTCGAGTAACGGCTGGAGTAGCGGGAGGAATGGAACCCTTTCAGCTCGGCTTGCTGGTGGCATTCATAGCCACACAGGAAGTGCTAAAACGGAGATGGACTGGAAAATTGACATTAACATCATTGGCAGTCTGCTTGATGCTATTGATCACAGGAAACCTAACATACATGGATCTAGTGAGGTACTTGGTTCTTGTTGGAACAGCCTTCGCGGAAATGAACACGGGCGGTGATGTGATCCACCTAGCCCTAGTAGCTGTCTTCAAAGTGCAGCCCGCTTTTTTAACAGGCCTGTTCTTAAGGATGCAATGGAGCAATCAAGAAAGCATCCTGATGGTCATAGGAGCAGCTTTTCTACAGATGGCGGCAAATGACTTGGAGCTGGAGGTGCTTCCACTTCTTAACGCCATGTCTATTGCCTGGATGTTAATCCGAGCCATGAAAGAGGGAAAGGTGGCGATGTACGCTCTCCCTGCCCTGTGTGCCCTCACTCCCGGAATGAGAATGGCTGGACTGGATGTCATCAGATGCCTATTGCTAATTGTTGGAATCGTGACGCTCCTGAATGAAAGACGAGAAAGTGTGGCGAAAAAGAAAGGAGGATATCTAATTGCAGCTGCTTTATGCCAAGTGGGGTTGTGTTCTCCACTGATAATGATGGGAGGCCTGATTCTGGCCCACCCAAATGGGAAGAGAAGTTGGCCAGCAAGTGAGGTCCTGACCGGTGTTGGGCTGATGTGTGCTTTGACAGGAGGGCTTTTGGAGTTTGAGGAGACATCGATGGTGGTCCCCTTTGCCATTGCGGGGTTAATGTACATCACGTATACCGTCTCGGGAAGAGCGGCCGAAATGTGGATCGAGAAAGCGGCCGACATAACGTGGGAACAGAACGCAGAAATCACAGGAACCAGCCCTAGACTTGATGTTGATCTCGACTCACACGGCAACTTCAAACTCTTGAACGACCCAGGAGCTCCAGTGCACCTGTTTGCCTTGAGGCTCGTCCTCCTTGGCCTGAGCGCACGGTTTTACTGGTTTATCCCGTTTGGAGTACTGGGGTTTTTTCTGCTAGGAAAGCATTCAAAACGTGGGGGAGCTCTGTGGGATGTCCCGTCACCAAAGGTATACCCAAAGTGTGAAACCAAACCAGGAATTTATCGAATTATGACAAGAGGAATTCTAGGGACTTTCCAAGCTGGCGTTGGTGTGATGCACGAAGGAGTCTTTCATACAATGTGGCACGCCACCGAAGGGGCAGTTTTGCGAAATGGTGAGGGAAGAATGGATCCGTATACCGGAGATGTCCGCAATGACTTGATCTCGTACGGTGGTCCATGGAAACTGAGTGCCACATGGGACGGGGCTGAAGAAGTCCAGATGATAGCTGTCGCTCCGGGAAGACCGGCCGTGAACGTTCAAACGACACCAGGGGTATTCAAAACCCCTTTTGGGACCATTGGAGCAGTGACCTTAGATTTTCCAAAAGGAACATCG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| 93,558
|
JF460774.1
|
Saint Louis encephalitis virus
|
Maharaj,P.D., Anishchenko,M., Langevin,S.A., Fang,Y., Reisen,W.K., Brault,A.C., Ramey,W.
|
Centers for Disease Control and Prevention, Division for Vector-Borne Diseases, Arbovirus Disease Branch
|
USA
|
2011-08-30
|
Imperial Valley
|
Orthoflavivirus louisense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,939
|
GenBank
| 1
|
USA: Imperial Valley, CA
|
USA
|
Culex tarsalis
| null |
2003
| null | null |
St. Louis encephalitis virus isolate Imperial Valley, complete genome
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AGATGTTCGCGTCGGTGAGCGGAGAGGAAACAGATTTCTTTTTTGGAGGATAACAACTTAACTTGACTGCGAACAGTTTTTTAGCAGGGAAACACCCAATGTCTAAAAAACCAGGAAAACCCGGTAGAAACCGGGTTGTCAATATGCTAAAACGCGGTGTATCCCGCGTGAATCCCTTAACGGGGTTAAAGAGGATACTTGGAAGTCTGCTAGATGGTCGTGGACCTGTGCGGTTCATACTGGCCATTCTGACATTCTTCCGATTCACAGCTCTACAGCCAACTGAGGCACTGAAGCGCAGATGGAGGGCTGTAGATAAAAGAACGGCATTGAAACACCTGAACGGATTCAAACGCGATCTCGGATCCATGCTAGACACCATCAATCGGCGGCCCAGCAAGAAGAGAGGAGGGACCGGATCGTTGCTCGGACTGGCAGCACTAATTGGACTGGCGAGCTCATTGCAACTTTCAACCTACCAGGGAAAAGTGCTAATGTCAATAAACAAGACTGACGCCCAAAGCGCCATAAACATTCCCAGTGCCAACGGAGCAAACACCTGCATTGTGAGAGCTCTAGACGTGGGAGTCATGTGCAAAGATGATATCACATACCTGTGCCCAGTGCTTTCAGCGGGAAACGATCCTGAGGACATTGACTGTTGGTGTGATGTTGAAGAAGTGTGGGTGCACTATGGTAGATGCACGCGCATGGGACATTCAAGGCGTAGTCGGCGGTCAATTTCTGTGCAGCATCACGGAGACTCCACACTGGCAACAAAGAACACGCCATGGCTGGACACCGTGAAAACCACCAAGTACTTGACAAAAGTTGAAAACTGGGTTCTGCGCAATCCTGGATATGCCCTAGTTGCACTGGCGATTGGATGGATGCTAGGCAGCAACAACACACAGAGAGTGGTCTTTGTGATCATGCTGATGTTGATTGCCCCGGCATACAGCTTCAATTGTTTGGGAACATCAAACAGGGATTTCGTCGAAGGGGCCAGCGGGGCAACATGGATCGACTTGGTACTTGAGGGAGGAAGCTGTGTCACAGTGATGGCACCAGAGAAACCAACATTGGACTTCAAAGTAATGAAGATGGAGGCCACGGACTTAGCTACTGTGCGTGAGTACTGCTACGAAGCAACCTTGGACACGCTGTCAACAGTGGCAAGATGTCCCACAACAGGAGAAGCTCACAACACCAAGAGGAGTGACCCAACATTTGTCTGCAAAAGAGATGTTGTGGACCGTGGATGGGGCAACGGATGTGGTCTGTTTGGAAAAGGAAGCATTGACACATGTGCGAAGTTCACTTGCAAGAACAAGGCAACAGGGAAGACAATCCTGAGGGAAAACATCAAGTACGAGGTCGCAATTTTTGTGCATGGTTCAACGGACTCCACGTCACATGGCAACTACTCTGAGCAAATTGGGAAAAACCAAGCAGCTAGATTCACCATAAGCCCGCAAGCACCATCTTTTACGGCTAACATGGGCGAGTATGGAACAGTCACCATTGACTGTGAAGCAAGATCAGGAATCAACACAGAAGACTATTATGTCTTTACAGTCAAGGAGAAGTCATGGCTGGTAAATAGGGATTGGTTTCACGACCTGAACCTTCCATGGACGAGCCCTGCCACAACTGACTGGCGTAACAGAGAAACACTGGTGGAATTTGAAGAACCACATGCCACCAAGCAAACTGTGGTTGCCCTAGGCTCGCAAGAAGGAGCCCTGCACACAGCATTGGCTGGAGCCATTCCAGCCACTGTTAGCAGCTCCACCTTAACCTTACAATCAGGGCACTTGAAGTGCAGAGCCAAGCTTGACAAGGTCAAAATCAAAGGAACAACATATGGCATGTGTGACTCTGCGTTTACCTTCAGCAAGAACCCAGCTGACACAGGGCATGGGACAGTGATTGTGGAACTGCAATACACTGGAAGCAACGGACCCTGCCGGGTTCCCATTTCCGTGACAGCAAACCTCATGGACTTGACACCGGTTGGAAGATTGGTTACGGTCAATCCCTTTATAAGCACAGGGGGAGCGAACAACAAGGTCATGATCGAAGTTGAACCACCCTTCGGTGACTCTTACATCGTCGTCGGAAGAGGCACAACCCAAATCAACTACCACTGGCACAAAGAGGGAAGCAGCATTGGGAAGGCTTTGGCGACTACATGGAAAGGAGCACAACGGCTAGCCGTTTTGGGGGACACAGCGTGGGACTTCGGATCCATTGGAGGAGTCTTCAATTCAATCGGCAAAGCTGTCCACCAAGTTTTTGGAGGGGCATTCAGGACTCTGTTCGGAGGAATGTCCTGGATCACACAGGGACTACTTGGAGCTCTTCTCTTGTGGATGGGATTGCAGGCTCGTGACAGGAGCATCTCGCTGACTCTACTGGCTGTTGGAGGGATTCTAATCTTTCTAGCGACCAGCGTGCAAGCTGATTCGGGATGTGCAATTGACTTACAACGACGTGAATTGAAATGTGGAGGAGGCATCTTCGTGTACAATGACGTCGAGAAGTGGAAAAGTGACTATAAGTATTTTCCTTTGACTCCAACTGGACTCGCGCGCGTGATTCAAGAAGCGCACGCCAACGGCATCTGTGGCATCAGATCGACGTCACGCTTGGAGCACTTGATGTGGGAGAACATACAGAGAGAGCTGAACGCAATCTTTGAAGACAACGAAATTGACTTGTCAGTTGTAGTGCAGGAAGATCCCAAACACTACAGAAGAGCTCCCCAACGCTTGAAGAAATTGGAGGATGAGCTGGATTACGGATGGAAGAAATGGGGGAAAACCCTGTTCATGGAACCTAAACTTGGAAACAACACATTTGTTGTTGACGGACCAGAAACCAAGGAATGTCCAACAGCAAACAGAGCATGGAACAGTTTCAAGGTGGAAGACTTTGGATTTGGCATGGTGTTCACTCGATTATGGCTCACAATCCGGGAGGGAAACACAACGGAATGCGATTCGGCAATCATTGGCACAGCCATAAAAGGAGACAGAGCTGTTCACAGTGACCTATCGTATTGGATTGAGAGCAAGAAGAATGGAACATGGCAGCTAGAACGAGCTGTTATGGGAGAAGTGAAATCTTGCACCTGGCCAGAAACGCACACTCTATGGGGTGATGGCGTTGTTGAGAGTGAAATGATCATTCCGGTAACATTAGGAGGCCCTAAAAGCCATCACAACAAGAGAACTGGATACCACACACAGACAAAAGGACCCTGGAGTGAAGGAGAAATAACCCTAGACTTTGATTATTGCCCAGGAACAACAGTGACTGTCACTGAACATTGTGGAAATAGGGGAGCGTCACTGCGCACAACCACAGCGAGCGGCAAGCTGGTCACTGATTGGTGCTGCAGGAGCTGTTCCTTGCCACCACTGCGATACACCACAAAAGATGGATGCTGGTACGGAATGGAAATTCGGCCAGTGAAGGAGGAAGAAGCAAAACTTGTAAAATCTCGAGTGACAGCTGGAGTCGCAGGGGGGATGGAACCATTCCAACTTGGTCTCTTGGTAGCATTCATAGCCACCCAAGAAGTGCTAAAACGCAGATGGACTGGGAAGTTGACCCTGACCTCATTGGCGGTATGTTTGGCACTATTAATTTTTGGAAACCTAACATACATGGATCTGGTGCGGTACCTGGTCCTTGTTGGAACTGCTTTTGCGGAAATGAACACTGGAGGCGATGTGATCCATCTGGCGCTTGTTGCTGTCTTCAAAGTGCAACCAGCATTCTTGGCGGGTTTGTTCTTGAGAATGCAGTGGAGCAATCAGGAAAACATCTTGATGGTCATTGGAGCAGCCTTCCTTCAAATGGCAGCCAACGACCTGAAGCTTGAGGTCCTCCCAATTCTCAATGCTATGTCCATTGCATGGATGCTAATAAGGGCAATGAAAGAAGGTAAAGTGGCGATGTGCGCTCTTCCCATCTTGTGTGCTCTGACTCCAGGAATGAGAATGGCCGGGCTTGACGTCATCAGATGCCTGCTGCTGATAATTGGGATTGTGACACTTCTGAATGAAAGAAGAGAAAGTGTGGCCAAGAAAAAAGGCGGCTACTTGCTCGCCGCAGCCCTCTGCCAAGCTGGATTGTGCAGTCCTTTGATCATGATGGGAGGCCTGATTTTGGCTCACCCTAATGGGAAAAGGAGCTGGCCAGCGAGTGAGGTCTTGACCGGAGTCGGACTGATGTGCGCTCTAGCAGGAGGCCTTCTCGAGTTTGAGGAAACCTCAATGGTGGTCCCCTTTGCAATAGCTGGGCTGATGTACATCACATACACCGTCTCGGGAAAGGCCGCAGAAATGTGGATTGAGAAAGCAGCTGACATCACATGGGAACAGAATGCTGAGATCACTGGAACCAGTCCCAGGCTTGATGTTGACCTCGACTCACATGGCAACTTCAAGCTTCTGAATGACCCTGGAGCTCCAGTGCACTTGTTTGCACTGAGATTCATACTCTTGGGCTTGAGTGCACGGTTCCATTGGTTTATTCCATTTGGAGTGTTGGGGTTTTGGTTGCTTGGAAAACACTCGAAGCGAGGAGGAGCATTGTGGGACGTGCCATCACCAAAGGTCTATCCAAAATGTGAGACAAAACCAGGAATTTACCGGATCATGACCAGAGGAATCCTGGGCACGTTTCAAGCTGGAGTTGGTGTGATGCATGAAGGAGTTTTTCACACAATGTGGCACGCAACTGAAGGGGCAGTCCTGCGAAACGGAGAAGGGAGGCTAGATCCGTATGCAGGGGATGTCCGAAATGATTTGATCTCGTATGGAGGTCCCTGGAAACTGAGTGCCACTTGGGATGGGATTGAGGAAGTTCAAATGATTGCAGTAGCTCCAGGAAAACCAGCCATCAATGTCCAGACAACACCAGGAGTGTTCAAGACCCAATTCGGGACCATCGGAGCTGTGACTCTTGATTTCCCAAAAGGAACATCA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| 98,302
|
FJ753286.2
|
Saint Louis encephalitis virus
|
Diaz,L.A., Nemeth,N.M., Bowen,R.A., Almiron,W.R., Contigiani,M.S., Logue,C., Singh,A., Powers,A., Contigiani,M.
|
Instituto de Virolog a Dr. J. M. Vanella, Facultad Ciencias M dicas, Universidad Nacional de Cordoba, Ciudad Universitaria, Laboratorio de Arbovirus
|
Argentina
|
2010-07-09
| null |
Orthoflavivirus louisense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,936
|
GenBank
| 1
|
Argentina
|
Argentina
|
Culex quinquefasciatus
| null |
2005
| null | null |
St. Louis encephalitis virus strain CbaAr-4005, complete genome
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AGATGTTCGTGTCGGTGAGCGGAGAGGAAACAGATTTCTTTTTTGGAGGATAACAACTTAACTTGATTGCGAACAGTTTTTTAGCAGGGAATTACCCAATGTCTAAAAAACCAGGAAAACCCGGTAAAAACCGGGTTGTCAATATGCTAAAACGCGGTGTATCCCGCGTAAACCCCTTGACGGGGTTGAAGAGGATACTTGGAAGTCTGCTGGATGGCCGTGGACCCGTGCGGTTCATACTAGCCATTCTGACATTCTTCCGATTTACAGCTCTACAGCCAACTGAGGCGCTGAAGCGCAGATGGAGGGCTGTAGATAAAAGAACGGCATTGAAACACTTAAACGGATTCAAACGTGATCTCGGATCCATGCTGGACACCATTAACCGGCGGCCAAGCAAAAAGAGAGGAGGGACCGGATCTTTGCTTGGATTGGCTGCGTTAATTGGACTGGCGAGTTCACTGCAATTGTCAACCTACCAGGGGAAAGTGTTAATGTCAATAAACAAGACCGACGCCCAAAGCGCTATTAACATTCCCAGTGCCAACGGAGCAAACACCTGCATTGTGAGGGCTCTAGATGTGGGGGTCATGTGCAAAGATGATATTACATACCTTTGCCCAGTTCTTTCAGCGGGAAATGATCCCGAGGACATTGACTGCTGGTGTGATGTTGAAGAGGTGTGGGTGCATTACGGCAGATGCACGCGCATGGGACATTCAAGGCGTAGCCGACGGTCAATCTCTGTGCAGCACCACGGAGACTCCACACTGGCAACAAAGAACACGCCATGGTTGGACACCGTGAAAACCACCAAGTACTTGACAAAAGTCGAAAACTGGGTTCTGCGCAATCCTGGATATGCCCTAGTTGCACTAGCGATTGGATGGATGCTGGGTAGCAACAACACACAGAGAGTGGTCTTTGTGATCATGCTGATGTTGATTGCCCCGGCATACAGCTTTAACTGTCTGGGAACATCAAACAGGGACTTCGTCGAAGGAGCCAGCGGGGCAACATGGATTGACTTGGTACTTGAAGGAGGAAGCTGTGTCACAGTAATGGCACCAGAGAAACCAACACTGGACTTCAAAGTGATGAAGATGGAGGCCACGGAGTTAGCCACTGTGCGTGAGTATTGCTACGAAGCATCCCTAGACACGCTGTCAACAGTGGCAAGATGCCCCACAACTGGAGAAGCTCACAACACCAAAAGGAGTGACCCAACATTTGTCTGCAAAAGAGATGTTGTGGACCGTGGATGGGGTAACGGATGTGGTTTGTTTGGAAAAGGAAGCATTGATACGTGCGCAAAGTTCACATGCAAAAACAAGGCAACAGGGAAGACAATCCTGAGGGAAAACATCAAGTACGAGGTTGCAATTTTCGTGCATGGCTCAACGGACTCCACGTCACATGGCAATTACTCTGAGCAAATTGGGAAAAACCAAGCAGCTAGATTCACCATAAGCCCGCAAGCACCGTCTTTCACGGCTAACATGGGCGAGTATGGGACAGTCACCATTGATTGTGAGGCAAGATCAGGAATCAACACAGAGGACTATTATGTCTTCACAGTTAAGGAGAAGTCATGGCTAGTAAACAGGGACTGGTTTCACGACTTGAACCTTCCATGGACGAGTCCTGCCACAACTGATTGGCGCAACAGAGAAACACTGGTGGAATTTGAAGAACCACATGCCACCAAGCAAACTGTGGTCGCCTTAGGCTCGCAAGAAGGTGCTCTGCACACAGCACTGGCCGGGGCCATTCCAGCCACTGTTAGCAGCTCCACCTTAACCTTGCAATCAGGGCACTTGAAGTGCAGAGCCAAGCTTGACAAGGTTAAAATCAAGGGGACGACTTATGGTATGTGTGACTCTGCTTTCACCTTCAGCAAGAACCCTGCTGACACAGGGCATGGGACAGTGATCGTGGAACTGCAGTACACTGGAAGCAACGGACCATGCCGGGTTCCCATTTCTGTGACTGCAAACCTCATGGACTTGACACCGGTTGGAAGACTGGTCACGGTCAATCCCTTTATTAGCACAGGGGGAGCGAACAACAAGGTCATGATCGAAGTTGAACCACCCTTTGGCGACTCTTATATCGTCGTCGGAAGAGGCACCACCCAGATCAACTACCACTGGCACAAAGAGGGAAGCAGCATTGGGAAAGCTTTGGCAACCACATGGAAAGGAGCCCAACGGCTAGCCGTTTTGGGGGACACAGCGTGGGACTTCGGATCTATTGGAGGAGTTTTCAATTCAATCGGCAAAGCTGTCCACCAAGTCTTTGGAGGGGCGTTCAGGACCCTGTTCGGGGGAATGTCCTGGATTACACAGGGACTACTTGGAGCCCTTCTCCTGTGGATGGGGTTGCAGGCCCGCGACAGGAGCATTTCGCTGACTCTACTGGCTGTTGGAGGGATTCTTATCTTTCTGGCGACCAGCGTGCAAGCTGATTCGGGATGTGCAATTGACCTGCAAAGACGTGAATTGAAATGTGGAGGAGGCATCTTCGTGTACAACGACGTTGAGAAGTGGAAGAGTGACTACAAGTACTTTCCCCTGACTCCAACTGGACTTGCGCGTGTGATTCAAGAGGCGCATGCCAATGGCATCTGTGGCATCCGATCGACGTCACGTTTGGAGCACTTAATGTGGGAGAGCATACAGAAAGAGCTAAACGCGATCTTTGAAGACAATGAAATTGACTTGTCAGTTGTAGTGCAGGAAGATCCCAAATACTACAAAAGGGCTCCACGACGCCTGAAGAAGCTGGAAGATGAGCTGAACTACGGATGGAAAAAATGGGGAAAAACCCTGTTCATGGAACCCAAACTTGGAAACAACACATTTGTTGTTGATGGACCCGAAACCAAGGAATGTCCAACAGCAAACAGAGCATGGAACAGTTTCAAGGTGGAAGACTTTGGATTTGGCATGGTGTTCACGCGATTGTGGCTCACAATCCGGGAGGAAAACACAACAGAATGTGATTCGGCAATCATTGGCACAGCCATAAAAGGAGACAGAGCTGTTCACAGTGACCTATCGTATTGGATTGAGAGCAAAAAGAATGGAACATGGCAGCTGGAGCGAGCCGTTATGGGAGAAGTGAAGTCTTGCACCTGGCCAGAAACGCACACCCTATGGGGTGATGGCGTTATTGAAAGCGAAATGATCATCCCGGTGACACTAGGCGGCCCTAAAAGCCATCACAACAAGAGAACCGGATATCACACACAGACAAAAGGACCCTGGAGTGAAGGAGAAATAACCCTGGACTTTGACTATTGCCCAGGAACAACAGTTACTGTCACAGAACATTGTGGAAACAGGGGAGCGTCACTGCGCACAACTACAGCGAGCGGCAAGCTGGTCACTGATTGGTGTTGCAGGAGCTGTTCCCTGCCACCACTGCGATACACCACAAAAGATGGATGTTGGTACGGAATGGAGATCCGGCCAGTGAAGGAGGAAGAAGCAAAACTTGTGAAATCTCGAGTGACAGCTGGAGTTGCGGGGGGGATGGAACCATTCCAACTTGGCCTCCTGGTAGCATTCATAGCCACCCAAGAAGTGCTGAAACGCAGATGGACTGGGAAGTTGACCCTGACCTCACTAGCAGTGTGTTTGGCACTACTGATTTTTGGAAATCTGACATACATGGATCTGGTGCGATACTTGGTCCTTGTTGGAACAGCTTTTGCGGAAATGAACACTGGAGGTGATGTGGTCCACTTGGCACTTGTTGCTGTCTTCAAAGTGCAACCAGCATTCTTAGCGGGTCTATTTTTTAGAATGCAATGGAGTAACCAGGAAAACATCTTGATGGTTATTGGAGCAGCTTTCCTTCAAATGGCAGCCAACGATCTGAAGCTTGAGGTCCTTCCGATTCTCAATGCCATGTCCATTGCATGGATGCTGATAAGGGCAATGAAAGAAGGTAAAGTGGCGATGTACGCTCTTCCCATCTTGTGTGCTCTGACTCCAGGAATGAGAATGGCCGGGCTTGACGTCATCAGATGTCTGTTGTTGATAATTGGAATTGTAACACTCCTGAATGAAAGAAGAGAAAGCGTGGCCAAGAAAAAAGGTGGCTACCTGCTTGCAGCAGCTCTCTGCCAGGCTGGATTGTGCAGTCCCTTGATCATGATGGGAGGTTTGATCTTGGCTCACCCTAATGGGAAAAGGAGTTGGCCAGCAAGTGAGGTCTTGACCGGAGTCGGATTGATGTGCGCTCTGGCAGGGGGCCTTCTCGAGTTTGAGGAGACCTCAATGGTGGTTCCCTTTGCAATAGCTGGACTGATGTATATCACATACACCGTCTCGGGAAGGGCCGCAGAGATGTGGATTGAGAAAGCAGCAGACATCACATGGGAACAGAATGCTGAGATCACCGGAACCAGCCCCAGGCTTGATGTTGACCTTGACTCACATGGTAACTTCAAGCTCCTGAACGATCCTGGAGCTCCAGTACATTTGTTCGCGTTGAGATTCATACTTCTGGGCTTGAGCGCACGGTTTCATTGGTTTATTCCATTTGGAGTACTGGGGTTTTGGTTGCTCGGAAAACACTCAAAGCGAGGAGGAGCATTGTGGGACGTGCCGTCACCAAAAGTATATCCAAAATGTGAGACAAAACCAGGAATCTATCGAATCATGACCAGGGGAATCCTGGGCACCTTTCAAGCTGGAGTTGGTGTGATGCATGAAGGAGTTTTTCACACAATGTGGCACGCAACTGAAGGAGCAGTCCTGCGAAACGGAGAAGGGAGACTAGATCCGTATGCAGGAGATGTCCGGAATGATCTGATCTCTTATGGAGGTCCCTGGAAGCTGAGTGCCACTTGGGATGGGATTGAGGAGGTCCAAATGATAGCAGTAGCTCCGGGAAAACCAGCCATCAATGTCCAGACAACACCAGGAGTGTTCAAGACCCCGTTTGGGACCATTGGAGCCGTGACTCTTGATTTCCCAAAAGGAACATCA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