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|
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|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
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|
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|
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GenBank
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South Africa
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South Africa
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2019-02-19
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|
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|
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|
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|
19-2051
|
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|
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|
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|
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|
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South Africa
|
South Africa
|
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|
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|
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| 35,627
|
MT270393.1
|
Sweet potato virus G
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
|
2021-12-01
|
19-2052
|
Sweet potato virus G
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,799
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Ipomoea batatas
|
plant leaf
|
2019-02-19
| null | null |
Sweet potato virus G isolate 19-2052, complete genome
|
AAAGAACATCACAAATTTTTGAGCTTTTATTTACTGCAATCTATTTTCAAAATCAATATTTTGAAGCTTTTACATAATTGATAAGAAATGGCGTGTTTAGCGAATGGAAACGTAGCAGGTAAGAAAAAGAAGATGACATGGAAGGAGTGCTGCAACAAGTGGGGAAGAGCTGCCATGGAGCAGCAACAAGGAAGCAGGGGACCTTACACTATCGAAGTGGGAAAAGACCAACTGGCGGCGAATATATTCGCCTTCATACCTAACACTGAGTGGCATAAATATTATGTCGCTAGAATTGGGCTGTCATCTGAAGCCCTAAAACTCAAGTATGCCATAACCTTCGGTGAGGTATACGAGTTTGACAGCAGCTTCAACCGCTGCCCTGAGTGTGATTGTGCTATTGATGAGCACAGATGCGATGAATGCAGCATTCGATTCAAGAAATCGGATGATAATATCATGAAGAACATGAATGAAACCGCAAGGGCTCTGGGCGGTTGGGACAACTACTATGCAGCAACTTGGAAACAATTTGAAGCTGCAAAAGATGACATGTTGGAGGTTGCTCCAACAGCTGGCATGCTCGAGAAACGAGCTAGAGAAGCTGAAAAATTGCTTGGTAAGAAAGCCAAGCGTCATGAGGTTGCTGAGGTGCAACAACTATGGGAGGAATACGAAGAAGCAAAGGAGGCTGAGGCTGAAGGGGAGACTTTCTTTGAGCATGAGGCTAGTCTCCTTATGCAAGAGGCGCCGAAAACTTATGAGGATAACTTTCCTCAACTTGGTAAGGGGTCCAAAGCCACTCTAGTAGCGGAAAAGGAAGTGCCTGTCAAAGAAGCCTCCACAGGCTTCTTCTTTGGAGAAATCCCCGCCTTGGTGGAACTACCTAAAATTCCCATCCTGAAAATTCTACCAGCAGCTCCCGTGCTTAATCTGAATGGTGAGCTCAATGAACAGACTCAACCACAAAGAAAAGATGAATCTATTGATGAGGTTGAAAAAGATCAAGTAAAACCTGTGGCAATGATTCAGAGTGGGTTTAAGAAGTACGAGCTAGTTGGAAATTCATTCCAGCGAGCAAAGAAATTGCCCAAAACTCTGTACCCTTGGGGCGAGAAGTCACAAACACCTGACAAAGTTCAACACACTATGATCACTAAATGGGTCAGAAAGACCATGAATCAGCAAGCTGAGCGTGAGGAAAAAATTTGGAGTGCATGGGAGAGAACGAAAGAAACATTTTTTTCAAGGAGGGAAGAACTGAAAGTGAAATGGAGGTGGGGACTATACAAACTCGTGAAAAAGACGAAGAAAGACAACCAGAAGCAGCGGGCAAAAGCAAGGAAGAGCAAGCAGCAAATTCAATTGGAAGAACTACCCCCGCAAATTATCTCGACCATATCTATTGCAGGAGGAGTAGCTCCGAGCCAGATGGAGGAGAAGAAGCAACCGAGTGGGCAGATTTTCTCAACGCCTTCTTTGAAGAAGAAGAAAATTATGCCAAAGACCAAATTGACAGAACAACAGCAACAACAACTGACTCAAGCTGTACTAAAAATTGCGAAGAAGAAACAGCTATGCGTGGAAATTATTGGCAAGAAAGTGACAAAAAGCAAATTTACCAAGCACAAAGAATCAACATATTTGTGCCTTCGTGTAAAACACATGGAGGGTATCCGAAAACCCATAGATTTGTTTATCCACGGGCAAAATCTCCCTGTTGTCAAGCAAGCAGCTCAGCTTGCAGCATGGAAGAAAATTCACAGAACAGAGGAGATAGGAAAAGGAATGAGCGGTTTTGTGTTGAATCCGCAGAAAATCATAGGAGTACATGGTCACGCCCCAAAAGAACTTTTCGTGGTTCGTGGGGCTTTCAGAGGAGTGCTATATGATGCTCGTATGAAGATTGGACGGTCAATCCTACCCTACATGGAACAGTATTCAATGACCGGTGCAAGATTCTGGAGTGGCTTTGATGAAGGTTTTAGAAGTCTAATACCACCAGACAGGGATCATGTATGCACCTCTGATATTAAAGTGGAGGATGCGGGAAGGATGGCAGCACTAATCCATCACATAGTATTGCCTATGAATAGGACCACTTGTGGTACATGTGCGAGCAATGTGGCAGATATGAGTTTGGCAGAATGGGTAGCGCACGTAAGAAACTTTTTAGTGAAGTATCGCTCGCAATTAATGGCCAATGGGTCTCAATATGAACATTTCAACTGGCTGCTAGAAACACTTCCAAAAGCGCTGATCAACGAGAGTCCCAACACAAAAGCCTTCAGTGAAATACAACAAACAATTGGGGACAGATCAGACTCACCATTCTTACATGTTAATGAGATTAATAAAGTTTTAGTAAAAGGAGGACGTGCATCTAGTGGTGAATATACACAAGCTTTGGAGAATTTACTGGAAATTGCAAGATACTTGAGAAATAGAACTGAGAATATCAAAAAGGGCTCTCTTGTATCATTCAGAAATAAAATCTCACAAAAGGCTCATGTTAATTTGTCATTAATGTGCGACAATCAGCTTGATAAGAACGGGAATTTGATATGGGGAGAAAGGGGCTACCACTCCAAAAGATTCTTTGCAAATTATTTTGAAGTGGTAAATCCAGAGGAAGGATATAGTAAATACATAATTAGATCAAATCCCAATGGTTCTAGGAAGCTAGCAATTGGTAAGCTTATTGTCTCCACAAACTTCTCAGTGTTTCGGGAACAAATGAAGGGTGAACCGATCCCTAAACTTAAGTTGGATAAACATTGCACCAGTCTCAGAGATGGGAATTTTGTGTATCCATGCTGCTGTGTGACGCTGGATGATGGTACACCCGTGGAATCAGAGTTTAAGCTTCCTACAAAGAATCATCTGGTGATTGGAAATTCGGGCGATCCGAAATATGTAGATATGCCAGCAGAGATCAATAGGAAAATGTACATAGCGAAGGAAGGATATTGTTATGTGAATATATTTTTAGCCATGCTTGTGAATGTAAATGAGAGTGAAGCTAAAGATTTTACAAAGCAAGTAAGAGACGTTTTAATGGAAAAACTTGGCAAATGGCCTTCAATGTACGATGTGGCAACTGCGTGTGCTTTCATTTCAGTTTTCTATCCTGAGACAAGAAATGCTGAACTCCCAAGAATACTGATTGATCATTCTACAAAGACTATGCACGTAATTGATTCTTTTGGTTCGCTAACCACTGGTTACCACGTGCTAAAGGCGAATACTGTTAGCCAGTTAATTCAGTTAGCGAGTTCAAGTCTTGATTCTGAAATGAAGCATTACCTGGTCGGTGGAATGATAGGAGTTAACTCGTTTGAGGAAGGAAGTCTAAAGGCTATAATCAAAGGCATTTACAAACCTCAAATCCTGAGAAACATATTAGAAGAGGACCCATATGTTCTTTTACTAAGCATACTCTCTCCAAGAATCCTTCTGGCTATGTTCAACAGCGGTTCGTTGGATTATGCATTAGAGAAATGGATTACTAAGGACCAAGAAGTTGCAACTATCCTGGGCATCCTCTTGGAACTAAGTAAAAAGGTGACAGTTGCACGTACACTTAATGAACAAATGAATGTCATTGAAGCGCACGCTTCATACATGATTGATAATATGTGGGTGAATGGAAAACGAACTGTCGCCAATGCATTGTCCCACCAGATAATAAGAAACTTGGCGGCAAAAAGAGATGCAAATAGGAGCTTAATCGAACAAGGACACCGAGTCACTGCTTTTGCGACATCTCAAGAACTCCTGGAAAAAATTTGGGAAGGACACTTAGAGGAACAATGGGGAGGATTAACCTGGTTGGAAAAATTTTATGCAACAGCACGCTCGTTACGTTATGGAAGGTTTATTCGGATGCATTTGCCCCGGGTAAATCTCGAAGATTTGAGCGACAGAGCAAAAGACTCCTTTACTTCATTGCACACAAAGAGTAGCAATATTGGTAATATTTGTGTAAATACTTGTAAAAATAGGTTTGCATCTGTTTACACTTCCTTTATTTCTAAGTGTATAACATGTTCTCTCAATGCAGTTAGGTTTTTAATGCCTGATATCCTTAAGTTTGTAAATATGTTATTAGTCGTCAATTTATTGCTTCAAATTACGAAGACGATGAAGAGCATGGCACATAAAAATAATAAAATGAAAGCAGATCTGTCTGGATTTTTGCTTGACCAGGAAATTGATAAGATCAATGTGATTTATAGCTCATTGTGTAAAAAGACTGGTGAGATACCTACAGAAAAGGAATTCTTGGATCATGTTGAGTATATAAACCCGACCTTGTTGGGTACTGCAAAATGGTTGTTATATGTAGCTGATGATGAAGTCCAACACCAAGCAAAGGGTATGAAAGAGGCGAATTACGAACGGATTATTGCATTTATAGCTTTAATCCTCATGGTTGTCGATGCTGAACGTAGTGACTGCGTGTACAAAGCACTCAATAAACTGAAAGGTTTGATGAGTACTATTTGTGGAGGACCTGTGTATCATCAAAGTCTTGATGATATAACAAATGAGTTCGAGGAAAAGAAACTCACCATTGATTTTGAGTTACAAAGTGATGAGAGCCATATTAACCAAGAATGTGACGCAACATTTGACACATGGTGGAAGAACCAGCTTGCACGGAACAACACAATCCCACACTACAGAACGGAAGGCCACTTTATGGAGTTCACAAGAGCGAACGCAGTTTCTGTTGCCAACAACATAGCCACAGGACCACATAAAGACATTCTCATTCGTGGTGCCGTGGGCTCAGGTAAATCGACAGGCCTACCTTTCTATCTGAGTCGGAAAGGAAGGGTTCTATTGGTAGAACCAACACGACCACTAGCAGAGAACGTGCATAGACAGTTGGCTTGTGAACCATTCATGATTCAAGCCACTTTGCGTATGAGAGGGTTGTCTGTTTTTGGCTCAGCACCAATAACGGTCATGACTAGTGGTTATGCTTTCCAGTA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| 35,628
|
MT270394.1
|
Sweet potato virus G
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
|
2021-12-01
|
19-2053
|
Sweet potato virus G
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,730
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Ipomoea batatas
|
plant leaf
|
2019-02-19
| null | null |
Sweet potato virus G isolate 19-2053, complete genome
|
AAACACAACACAACACAACAAAGAACATCACAAATTTTTGAGCTTTTATTTACTGCAATCTATTTTCAAAATCAATATTTTGAAGCTTTTACATAATTGATAAGAAATGGCGTGTTTAGCGAATGGAAACGTAGCAGGTAAGAAAAAGAAGATGACATGGAAGGAGTGCTGCAACAAGTGGGGAAGAGCTGCCATGGAGCAGCAACAAGGAAGCAGGGGACCTTACACTATCGAAGTGGGAAAAGACCAACTGGCGGCGAATATATTCGCCTTCATACCTAACACTGAGTGGCATAAATATTATGTCGCTAGAATTGGGCTGTCATCTGAAGCCCTAAAACTCAAGTATGCCATAACCTTCGGTGAGGTATACGAGTTTGACAGCAGCTTCAACCGCTGCCCTGAGTGTGATTGTGCTATTGATGAGCACAGATGCGATGAATGCAGCATTCGATTCAAGAAATCGGATGATAATATCATGAAGAACATGAATGAAACCGCAAGGGCTCTGGGCGGTTGGGACAACTACTATGCAGCAACTTGGAAACAATTTGAAGCTGCAAAAGATGACATGTTGGAGGTTGCTCCAACAGCTGGCATGCTCGAGAAACGAGCTAGAGAAGCTGAAAAATTGCTTGGTAAGAAAGCCAAGCGTCATGAGGTTGCTGAGGTGCAACAACTATGGGAGGAATACGAAGAAGCAAAGGAGGCTGAGGCTGAAGGGGAGACTTTCTTTGAGCATGAGGCCAGTCTCCTTATGCAAGAGGCGCCGAAAACTTATGAGGATAACTTTCCTCAACTTGGTAAGGGGTCCAAAGCCACTCTAGTAGCGGAAAAGGAAGTGCCTGTCAAAGAAGCCTCCACAGGCTTCTTCTTTGGAGAAATCCCCGCCTTGGTGGAACTACCTAAAATTCCCATCCTGAAAATTCTACCAGCAGCTCCCGTGCTTAATCTGAATGGTGAGCTCAATGAACAGACTCAACCACAAAGAAAAGATGAATCTATTGATGAGGTTGAAAAAGATCAAGTAAAACCTGTGGCAATGATTCAGAGTGGGTTTAAGAAGTACGAGCTAGTTGGAAATTCATTCCAGCGAGCAAAGAAATTGCCCAAAACTCTGTACCCTTGGGGCGAGAAGTCACAAACACCTGACAAAGTTCAACACACTATGATCACTAAATGGGTCAGAAAGACCATGAATCAGCAAGCTGAGCGTGAGGAAAAAATTTGGAGTGCATGGGAGAGAACGAAAGAAACATTTTTTTCAAGGAGGGAAGAACTGAAAGTGAAATGGAGGTGGGGACTATACAAACTCGTGAAAAAGACGAAGAAAGACAACCAGAAGCAGCGGGCAAAAGCAAGGAAGAGCAAGCAGCAAATTCAATTGGAAGAACTACCCCCGCAAATTATCTCGACCATATCTATTGCAGGAGGAGTAGCTCCGAGCCAGATGGAGGAGAAGAAGCAACCGAGTGGGCAGATTTTCTCAACGCCTTCTTTGAAGAAGAAGAAAATTATGCCAAAGACCAAATTGACAGAACAACAGCAACAACAACTGACTCAAGCTGTACTAAAAATTGCGAAGAAGAAACAGCTATGCGTGGAAATTATTGGCAAGAAAGTGACAAAAAGCAAATTTACCAAGCACAAAGAATCAACATATTTGTGCCTTCGTGTAAAACACATGGAGGGTATCCGAAAACCCATAGATTTGTTTATCCACGGGCAAAATCTCCCTGTTGTCAAGCAAGCAGCTCAGCTTGCAGCATGGAAGAAAATTCACAGAACAGAGGAGATAGGAAAAGGAATGAGCGGTTTTGTGTTGAATCCGCAGAAAATCATAGGAGTACATGGTCACGCCCCAAAAGAACTTTTCGTGGTTCGTGGGGCTTTCAGAGGAGTGCTATATGATGCTCGTATGAAGATTGGACGGTCAATCCTACCCTACATGGAACAGTATTCAATGACCGGTGCAAGATTCTGGAGTGGCTTTGATGAAGGTTTTAGAAGTCTAATACCACCAGACAGGGATCATGTATGCACCTCTGATATTAAAGTGGAGGATGCGGGAAGGATGGCAGCACTAATCCATCACATAGTATTGCCTATGAATAGGACCACTTGTGGTACATGTGCGAGCAATGTGGCAGATATGAGTTTGGCAGAATGGGTAGCGCACGTAAGAAACTTTTTAGTGAAGTATCGCTCGCAATTAATGGCCAATGGGTCTCAATATGAACATTTCAACTGGCTGCTAGAAACACTTCCAAAAGCGCTGATTGACGAGAGTCCCAACACAAAAGCCTTCAGTGAAATACAACAAACAATTGGGGACAGATCAGACTCACCATTCTTACATGTTAATGAGATTAATAAAGTTTTAGTAAAAGGAGGACGTGCATCTAGTGGTGAATATACACAAGCTTTGGAGAATTTACTGGAAATTGCAAGATACTTGAGAAATAGAACTGAGAATATCAAAAAGGGCTCTCTCGTATCATTCAGAAATAAAATCTCACAAAAGGCTCATGTTAATTTGTCATTAATGTGCGACAATCAGCTTGATAAGAACGGGAATTTGATATGGGGAGAAAGGGGCTACCACTCCAAAAGATTCTTTGCAAATTATTTTGAAGTGGTAAATCCAGAGGAAGGATATAGTAAATACATAATTAGATCAAATCCCAATGGTTCTAGGAAGCTAGCAATTGGTAAGCTTATTGTCTCCACAAACTTCTCAGTGTTTCGGGAACAAATGAAGGGTGAACCGATCCCTAAACTTAAGTTGGATAAACATTGCACCAGTCTCAGAGATGGGAATTTTGTGTATCCATGCTGCTGTGTGACGCTGGATGATGGTACACCCGTGGAATCAGAGTTTAAGCTTCCTACAAAGAATCATCTGGTGATTGGAAATTCGGGCGATCCGAAATATGTAGATATGCCAGCAGAGATCAATAGGAAAATGTACATAGCGAAGGAAGGATATTGTTATGTGAATATATTTTTAGCCATGCTTGTGAATGTAAATGAGAGTGAAGCTAAAGATTTTACAAAGCAAGTAAGAGACGTTTTAATGGAAAAACTTGGCAAATGGCCTTCAATGTACGATGTGGCAACTGCGTGTGCTTTCATTTCAGTTTTCTATCCTGAGACAAGAAATGCTGAACTCCCAAGAATACTGATTGATCATTCTACAAAGACTATGCACGTAATTGATTCTTTTGGTTCGCTAACCACTGGTTACCACGTGCTAAAGGCGAATACTGTTAGCCAGTTAATTCAGTTTGCGAGTTCAAGTCTTGATTCTGAAATGAAGCATTACCTGGTCGGTGGAATGATAGGAGTTAACTCGTTTGAGGAAGGAAGTCTAAAGGCTATAATCAAAGGCATTTACAAACCTCAAATCCTGAGAAACATATTAGAAGAGGACCCATATGTTCTTTTACTAAGCATACTCTCTCCAAGAATCCTTCTGGCTATGTTCAACAGCGGTTCGTTGGATTATGCATTAGAGAAATGGATTACTAAGGACCAAGAAGTTGCAACTATCCTGGGCATCCTCTTGGAACTAAGTAAAAAGGTGACAGTTGCACGTACACTTAATGAACAAATGAATGTCATTGAAGCGCACGCTTCATACATGATTGATAATATGTGGGTGAATGGAAAACGAACTGTCGCCAATGCATTGTCCCACCAGATAATAAGAAACTTGGCGGCAAAAAGAGATGCAAATAGGAGCTTAATTGAACAAGGACACCGAGTCACTGCTTTTGCGACATCTCAAGAACTCCTGGAAAAAATTTGGGAAGGACACTTAGAGGAACAATGGGGAGGATTAACCTGGTTGGAAAAATTTTATGCAACAGCACGCTCGTTACGTTATGGAAGGTTTATTCGGATGCATTTGCCCCGGGTAAATCTCGAAGATTTGAGCGACAGAGCAAAAGACTCCTTTACTTCATTGCACACAAAGAGTAGCAATATTGGTAATATTTGTGTAAATACTTGTAAAAATAGGTTTGCATCTGTTTACACTTCCTTTATTTCTAAGTGTATAACATGTTCTCTCAATGCAGTTAGGTTTTTAATGCCTGATATCCTTAAGTTTGTAAATATGTTATTAGTCGTCAATTTATTGCTTCAAATTACGAAGACGATGAAGAGCATGGCACATAAAAATAATAAAATGAAAGCAGATCTGTCTGGATTTTTGCTTGACCAGGAAATTGATAAGATCAATGTGATTTATAGCTCATTGTGTAAAAAGACTGGTGAGATACCTACAGAAAAGGAATTCTTGGATCATGTTGAGTATATAAACCCGACCTTGTTGGGTACTGCAAAATGGTTGTTATATGTAGCTGATGATGAAGTCCAACACCAAGCAAAGGGTATGAAAGAGGCGAATTACGAACGGATTATTGCATTTATAGCTTTAATCCTCATGGTTGTCGATGCTGAACGTAGTGACTGCGTGTACAAAGCACTCAATAAACTGAAAGGTTTGATGAGTACTATTTGTGGAGGACCTGTGTATCATCAAAGTCTTGATGATATAACAAATGAGTTCGAGGAAAAGAAACTCACCATTGATTTTGAGTTACAAAGTGATGAGAGCCATATTAACCAAGAATGTGACGCAACATTTGACACATGGTGGAAGAACCAGCTTGCACGGAACAACACAATCCCACACTACAGAACGGAAGGCCACTTTATGGAGTTCACAAGAGCGAACGCAGTTTCTGTTGCCAACAACATAGCCACAGGACCACATAAAGACATTCTCATTCGTGGTGCCGTGGGCTCAGGTAAATCGACAGGCCTACCTTTCTATCTGAGTCGGAAAGGAAGGGTTCTATTGGTAGAACCAACACGACCACTAGCAGAGAACGTGCATAGACAGTTGGCTTGTGAACCATTCATGATTCAAGCCACTTTGCGTATGAGAGGGTTGTCTGTTTTTGGCTCAGCACCAATAACGGTCATGACTA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| 35,629
|
MT270395.1
|
Sweet potato virus G
|
Read,D.A., Thompson,G.D.
|
Agricultural Research Council, Biotechnology Platform
|
South Africa
|
2021-12-01
|
19-2054
|
Sweet potato virus G
|
Potyvirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 10,800
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Ipomoea batatas
|
plant leaf
|
2019-02-19
| null | null |
Sweet potato virus G isolate 19-2054, complete genome
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AAAATAACAAAACACAACACAACACAACAAAGAACATCACAAATTTTTGAGCTTTTATTTACTGCAATCTATTTTCAAAATCAATATTTTGAAGCTTTTACATAATTGATAAGAAATGGCGTGTTTAGCGAATGGAAACGTAGCAGGTAAGAAAAAGAAGATGACATGGAAGGAGTGCTGCAACAAGTGGGGAAGAGCTGCCATGGAGCAGCAACAAGGAAGCAGGGGACCTTACACTATCGAAGTGGGAAAAGACCAACTGGCGGCGAATATATTCGCCTTCATACCTAACACTGAGTGGCATAAATATTATGTCGCTAGAATTGGGCTGTCATCTGAAGCCCTAAAACTCAAGTATGCCATAACCTTCGGTGAGGTATACGAGTTTGACAGCAGCTTCAACCGCTGCCCTGAGTGTGATTGTGCTATTGATGAGCACAGATGCGATGAATGCAGCATTCGATTCAAGAAATCGGATGATAATATCATGAAGAACATGAATGAAACCGCAAGGGCTCTGGGCGGTTGGGACAACTACTATGCAGCAACTTGGAAACAATTTGAAGCTGCAAAAGATGACATGTTGGAGGTTGCTCCAACAGCTGGCATGCTCGAGAAACGAGCTAGAGAAGCTGAAAAATTGCTTGGTAAGAAAGCCAAGCGTCATGAGGTTGCTGAGGTGCAACAACTATGGGAGGAATACGAAGAAGCAAAGGAGGCTGAGGCTGAAGGGGAGACTTTCTTTGAGCATGAGGCCAGTCTCCTTATGCAAGAGGCGCCGAAAACTTATGAGGATAACTTTCCTCAACTTGGTAAGGGGTCCAAAGCCACTCTAGTAGCGGAAAAGGAAGTGCCTGTCAAAGAAGCCTCCACAGGCTTCTTCTTTGGAGAAATCCCCGCCTTGGTGGAACTACCTAAAATTCCCATCCTGAAAATTCTACCAGCAGCTCCCGTGCTTAATCTGAATGGTGAGCTCAATGAACAGACTCAACCACAAAGAAAAGATGAATCTATTGATGAGGTTGAAAAAGATCAAGTAAAACCTGTGGCAATGATTCAGAGTGGGTTTAAGAAGTACGAGCTAGTTGGAAATTCATTCCAGCGAGCAAAGAAATTGCCCAAAACTCTGTACCCTTGGGGCGAGAAGTCACAAACACCTGACAAAGTTCAACACACTATGATCACTAAATGGGTCAGAAAGACCATGAATCAGCAAGCTGAGCGTGAGGAAAAAATTTGGAGTGCATGGGAGAGAACGAAAGAAACATTTTTTTCAAGGAGGGAAGAACTGAAAGTGAAATGGAGGTGGGGACTATACAAACTCGTGAAAAAGACGAAGAAAGACAACCAGAAGCAGCGGGCAAAAGCAAGGAAGAGCAAGCAGCAAATTCAATTGGAAGAACTACCCCCGCAAATTATCTCGACCATATCTATTGCAGGAGGAGTAGCTCCGAGCCAGATGGAGGAGAAGAAGCAACCGAGTGGGCAGATTTTCTCAACGCCTTCTTTGAAGAAGAAGAAAATTATGCCAAAGACCAAATTGACAGAACAACAGCAACAACAACTGACTCAAGCTGTACTAAAAATTGCGAAGAAGAAACAGCTATGCGTGGAAATTATTGGCAAGAAAGTGACAAAAAGCAAATTTACCAAGCACAAAGAATCAACATATTTGTGCCTTCGTGTAAAACACATGGAGGGTATCCGAAAACCCATAGATTTGTTTATCCACGGGCAAAATCTCCCTGTTGTCAAGCAAGCAGCTCAGCTTGCAGCATGGAAGAAAATTCACAGAACAGAGGAGATAGGAAAAGGAATGAGCGGTTTTGTGTTGAATCCGCAGAAAATCATAGGAGTACATGGTCACGCCCCAAAAGAACTTTTCGTGGTTCGTGGGGCTTTCAGAGGAGTGCTATATGATGCTCGTATGAAGATTGGACGGTCAATCCTACCCTACATGGAACAGTATTCAATGACCGGTGCAAGATTCTGGAGTGGCTTTGATGAAGGTTTTAGAAGTCTAATACCACCAGACAGGGATCATGTATGCACCTCTGATATTAAAGTGGAGGATGCGGGAAGGATGGCAGCACTAATCCATCACATAGTATTGCCTATGAATAGGACCACTTGTGGTACATGTGCGAGCAATGTGGCAGATATGAGTTTGGCAGAATGGGTAGCGCACGTAAGAAACTTTTTAGTGAAGTATCGCTCGCAATTAATGGCCAATGGGTCTCAATATGAACATTTCAACTGGCTGCTAGAAACACTTCCAAAAGCGCTGATTGACGAGAGTCCCAACACAAAAGCCTTCAGTGAAATACAACAAACAATTGGGGACAGATCAGACTCACCATTCTTACATGTTAATGAGATTAATAAAGTTTTAGTAAAAGGAGGACGTGCATCTAGTGGTGAATATACACAAGCTTTGGAGAATTTACTGGAAATTGCAAGATACTTGAGAAATAGAACTGAGAATATCAAAAAGGGCTCTCTCGTATCATTCAGAAATAAAATCTCACAAAAGGCTCATGTTAATTTGTCATTAATGTGCGACAATCAGCTTGATAAGAACGGGAATTTGATATGGGGAGAAAGGGGCTACCACTCCAAAAGATTCTTTGCAAATTATTTTGAAGTGGTAAATCCAGAGGAAGGATATAGTAAATACATAATTAGATCAAATCCCAATGGTTCTAGGAAGCTAGCAATTGGTAAGCTTATTGTCTCCACAAACTTCTCAGTGTTTCGGGAACAAATGAAGGGTGAACCGATCCCTAAACTTAAGTTGGATAAACATTGCACCAGTCTCAGAGATGGGAATTTTGTGTATCCATGCTGCTGTGTGACGCTGGATGATGGTACACCCGTGGAATCAGAGTTTAAGCTTCCTACAAAGAATCATCTGGTGATTGGAAATTCGGGCGATCCGAAATATGTAGATATGCCAGCAGAGATCAATAGGAAAATGTACATAGCGAAGGAAGGATATTGTTATGTGAATATATTTTTAGCCATGCTTGTGAATGTAAATGAGAGTGAAGCTAAAGATTTTACAAAGCAAGTAAGAGACGTTTTAATGGAAAAACTTGGCAAATGGCCTTCAATGTACGATGTGGCAACTGCGTGTGCTTTCATTTCAGTTTTCTATCCTGAGACAAGAAATGCTGAACTCCCAAGAATACTGATTGATCATTCTACAAAGACTATGCACGTAATTGATTCTTTTGGTTCGCTAACCACTGGTTACCACGTGCTAAAGGCGAATACTGTTAGCCAGTTAATTCAGTTTGCGAGTTCAAGTCTTGATTCTGAAATGAAGCATTACCTGGTCGGTGGAATGATAGGAGTTAACTCGTTTGAGGAAGGAAGTCTAAAGGCTATAATCAAAGGCATTTACAAACCTCAAATCCTGAGAAACATATTAGAAGAGGACCCATATGTTCTTTTACTAAGCATACTCTCTCCAAGAATCCTTCTGGCTATGTTCAACAGCGGTTCGTTGGATTATGCATTAGAGAAATGGATTACTAAGGACCAAGAAGTTGCAACTATCCTGGGCATCCTCTTGGAACTAAGTAAAAAGGTGACAGTTGCACGTACACTTAATGAACAAATGAATGTCATTGAAGCGCACGCTTCATACATGATTGATAATATGTGGGTGAATGGAAAACGAACTGTCGCCAATGCATTGTCCCACCAGATAATAAGAAACTTGGCGGCAAAAAGAGATGCAAATAGGAGCTTAATTGAACAAGGACACCGAGTCACTGCTTTTGCGACATCTCAAGAACTCCTGGAAAAAATTTGGGAAGGACACTTAGAGGAACAATGGGGAGGATTAACCTGGTTGGAAAAATTTTATGCAACAGCACGCTCGTTACGTTATGGAAGGTTTATTCGGATGCATTTGCCCCGGGTAAATCTCGAAGATTTGAGCGACAGAGCAAAAGACTCCTTTACTTCATTGCACACAAAGAGTAGCAATATTGGTAATATTTGTGTAAATACTTGTAAAAATAGGTTTGCATCTGTTTACACTTCCTTTATTTCTAAGTGTATAACATGTTCTCTCAATGCAGTTAGGTTTTTAATGCCTGATATCCTTAAGTTTGTAAATATGTTATTAGTCGTCAATTTATTGCTTCAAATTACGAAGACGATGAAGAGCATGGCACATAAAAATAATAAAATGAAAGCAGATCTGTCTGGATTTTTGCTTGACCAGGAAATTGATAAGATCAATGTGATTTATAGCTCATTGTGTAAAAAGACTGGTGAGATACCTACAGAAAAGGAATTCTTGGATCATGTTGAGTATATAAACCCGACCTTGTTGGGTACTGCAAAATGGTTGTTATATGTAGCTGATGATGAAGTCCAACACCAAGCAAAGGGTATGAAAGAGGCGAATTACGAACGGATTATTGCATTTATAGCTTTAATCCTCATGGTTGTCGATGCTGAACGTAGTGACTGCGTGTACAAAGCACTCAATAAACTGAAAGGTTTGATGAGTACTATTTGTGGAGGACCTGTGTATCATCAAAGTCTTGATGATATAACAAATGAGTTCGAGGAAAAGAAACTCACCATTGATTTTGAGTTACAAAGTGATGAGAGCCATATTAACCAAGAATGTGACGCAACATTTGACACATGGTGGAAGAACCAGCTTGCACGGAACAACACAATCCCACACTACAGAACGGAAGGCCACTTTATGGAGTTCACAAGAGCGAACGCAGTTTCTGTTGCCAACAACATAGCCACAGGACCACATAAAGACATTCTCATTCGTGGTGCCGTGGGCTCAGGTAAATCGACAGGCCTACCTTTCTATCTGAGTCGGAAAGGAAGGGTTCTATTGGTAGAACCAACACGACCACTAGCAGAGAACGTGCATAGACAGTTGGCTTGTGAACCATTCATGATTCAAGCCACTTTGCGTATGAGAGGGTTGTCTGTTTTTGGCTCAGCACCAATAACGG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| 35,630
|
ON911569.1
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Sun,Y., Xing,J., Xu,Z.Y., Gao,H., Xu,S.J., Liu,J., Zhu,D.H., Guo,Y.F., Yang,B.S., Chen,X.N., Zheng,Z.Z., Wang,H., Lang,G., C Holmes,E., Zhang,G.H., Zhang,G.
|
South China Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
|
2022-11-09
|
SADS-CoV/Guangxi/2021
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,163
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2021
| null | null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus isolate SADS-CoV/Guangxi/2021, complete genome
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ACATGGGGACTTAAAGATATAATCTATCTGCCGATAGAGTCCTTATCTTTTTAGACTTTCCAGTCTACACTTCTCAACTAAACGAAATTTACGTCTTTTTGTGTCTGCTACGCATGCACAATTAGATGTGTATTTGAGATTTCGTTCCAGGTTGCCAGCCTTGTGTAACAAGTGTCGTGCTTCTAGGGGTTGCACTTGACGTGTTCCGTCACGTACTTGTGTCCTTAGTTGCCCCACGCTGTTCCGTCAGTGTGGTGTGAGAATATAGTGTTCCGTCACTATTGAAACCGATAACTGTGCACAATGGCTATCAACCAATTGACACTTGCAGTTGCAAGTGATCAGGAAATTTCAGCTCATGGCTATCCTACTATGTCTGATGCCGTTGAACATTTTAGTTCCTCCGCATCACACGGTTTTAAGGATTGCCGTTTTGTAGCCTTTGGGCTGCAGGACATTGTTATTGGAGTTGAACCCAGTGACTTTGTCGTGGCTTTGGAGGGTGACGAAATTCTCACTGCCTATATAGCCACTTTTGGAGCTAGACCTCGCTGTTTGCGCGGTTGGCTTATACCCTCTAATTCTAATTATGTTTTGGAGGAATTCCAAGTGATTTTTGGCAAGCGCGGCGGTAACGTTGTGTCTGTCGATAATTACATGTGCGGTGCTGATGGTAAACCGGCAGTTCCTAGCGAACAGTGGTCTTTTGTTGAGCACTTTGACGATGATACAGATGAGATCACCGTTAATGGTGTCACTTTTCGCCACGTATGGAATACCGTTCGCGCTGACGACCCTTATGAAAAACAGGGTCTTCTTTCTATTAAGTCTATAGAGTACATCTCCAATGTTCCTCACAAGTTGCCTAATGGTTCTGTCCTTGGTGTTGCCGGAACTCCTAAGAAGCGTAAGGCTATTGTGCTTGATGAAAAGTATAGTAAGCTTTATGATGCTTGTGGTGTTCCTTTTGTCACTAATGGCAAATCTATTTCAGAAGTTGTCCCTAAACCACTCTTTTTGCATGCTCTTGTTAAGTGCAAGTGCGATAATGAGTCTTGGACTGTTGGTGACTGGACTGGTTTTAAGACTACTTGTTGTGGTTCCACTGGTAAAGTTACGACTTTGGCAGTTGGCGATGTTACTCCGGGTGACATTGTCTTTACCACACTTGGTGCAGGTAAAGGCACTAAGTTCTTTTGTGGTCTTGTTCTCACCTTTGTTGACACACTTGAGGGTGTTTCCGCATGGCGTGTTGTTAAGGCCTATACAGTTGATAAGTTTGTTGCATCTTCTAACTTTGATGAACACAACCATGTTATGAGCTTGGATCAATGCTCATTTGACAACTTTAGTCCTATTAGCGTAGCACTGAAGTTCTCACTTTTGCGTGGTAATTGCTGTGACGACGTCAAGTTTGCTGTTGCAACTGGTGTGATTGACATTGGTCTTGGTGTCTTTGATGTTAATGATACTGTTTTTGAGAATGTACCATGGTTTGTTCAGAAGTTTGAGTTTTTGAAACCAGCATGGGATGCTCTAAAGCAGGCCATTATCAACCTTGGTGTAACATCTAAGGCTGTTTTGTCTTTTATTAAGTCACTGTGTAGTGCTGCATTCAGTGTTGTTGACGGCGTTCCAGTTATTGTCTGCACTGTTGCTGAGAGATTTTCTAAGGCTTTTACTGATTTTCTGAGTTACACCCGTGAATGCTTTACTGCCCTCTGTGATGACATCGTTGTGTTCGGTGTCAAGTGCAAAGCTGTTGGTGACTACATTATTTTTAATAATAGTGTCGTCAAAACTGTTAAAGCCAAAATAAAGGGTGTTAAAGAAGCTGGTCTTAAGACTATGACCTACACACAGTGTCTACTTGGATCTACCAAGCCTGTTAAGGTTAAGCGCGTTGAACGTAGTGTTGCACAGCTTAAAGTTGTTGACACTGCTGTACCATTAAAACAGGAAGGTGAATGTCTTGTTGTTGGTGGTCGTGCTATGTTTAGGTCTGATGGCTATTATAGGTTTATGGCTGATGCTGATGTTGTACTCGAGTCACCTGTTTTTACAGCTGGCTCTCAATACAATGTTGTGTTCGAAACTGATGCCCTATTCATAGCCCCAGAGATTAGCACTGTGTTTGAAGGTGACAACATTGACACTGTGGTTCAGACTGTTGCCAATAAAGTCCAAGCATTTAACAATAGATTCGTTGTTTACAACGCACATGTTGTTGATGGTGCTATTAATGTGTTTTGTGATTATAAGTTTACTTGTCCTGCTTTCTTGGATGGTTTTCCAGAGTGGTTTTCATTCTGTAAGAATCATTTTAAGGATGCCGGATTTGTTGAGTTTTATGACTGCATTATTAATAGTGACGGTACTTTTCAGACCACTTTTCAGCCTTATTTGGACCTTAAACCATCTGTTGATGCGTATTTAGGTCCTGAGATTGTACGAGCTGTTGATGGTGGTCGTCTGTGGCGTACTGTTATTAATGGCATTAGTGACGCTGTTAATTTTTGTAAGAATCTTAGGTTGCACTTCGATTTTGGTGAGCTTAAGGGTACTGTTGTTAAGCGTTTTAAGGGTATACTTAGGACGCTTCTTACAGTTTACAATGAGTTTATTCAAACTACTGTGTCTGTTCTTACTATCTGCGGCATTAGTGCCAAGTACTATGCTTTTGACAAGCCTATGCTTTGTATGCATGGTATTACAGAGCGTGTTACTAGTTTTGACATTACTAGTCTTGGAAAGCCTATTTTAGATGGTCTTTCTAGGTGTAATGTCTTTGCACGTGGTTCTACTGCAGTTGTAGTTGATTCTGTTGATCACGAACTTCTTGATCTTGAGGAGTGTGATTTTGTTGAACCTGCTAGTCATGGTGTGCTTGTCGTATCAGATGATTATGGCTTTTATTCTTGTGAAACTGGCATATATCCCTATGCTAGTGATGGTAAAGTTTTGCCATTGCGGTTTAGGAAAAAGGCTGGTGGTAAGAATGTTGCCTTTGATGACAATGTTACAGTTACTGAGATTGACCCTATTTTTAAGGTTAAACTGTCCTTTGAGTTTGAGGATGAAAAATTGATTGAACTTTGTAAGAAGGTTATTGGTAGCAAAGTTAAGTGTAGTTCCTGGTCCCAACTTGTTGAGATCATTGATACTGCTCTTACTGCAACTAAGTCATACTACAATGTTCCAGAATATTTTATCTATGATGAGGAAGGTGGTAATGACCTTAATTTGGATGTCATGATCTCTGAATGGCCTTTGCAGGTTGACGAGGTCAGTGAATTAGTTAGCACTGATGAGACAGTTGAAGAGCAAGCTGTTGAACAAGTAGAGCCAGTTGTTGAAGATGTAAGTGATATCATTGAGGTAAACAAGGCTTTTGCTATTGATGATTCACCAGAGAGAGCTATTAGTCCATTTGGTTTTGACACAAATGAGATTAATGGACGGCGTGTGCTTGTACAGTCTAACAACAACTGTTGGGTTAATGCTGCTTGTTATCAGTTACAAGTTCTAGGTTTTGACAGCCCAGCTATGGAACTTTATAGAGTTGGTGGCACACATAATCTTGTTAAGCAATGTTACGAGGCCACTGGTGCATTTTTAGGTTCTTTGGGTGATGTTGCACATTGTTTAGAGGTATTGCTTAAGGATGCTAAGACAGCCAAAGTTACTGTTGAAGTTACTTGTGATTGTTCATCTAACTTCGAAGAACTTAGCGGTGCTTTCTTTAGGTTTTTGCCTCTTAAGAGTAAGTTTGAATATGGTAGTTGCTTTGCTTGTCATGGCACTCGTTATTATCGTGTGTGTGGTATTGTTGGCTCTGCAATATTTTCACAGACTCTTAAGCCATTGGATTTCAATGACCTGATCTGTGATGTTGCTAGTGCTAGCGTCTTTCTTGGTGATGATTGTGGTCATTATTTAATTAATGACTACGACAAGAGACTATGTGTCGATGGTATGGGTGTTTACAAGATTAAGCATAACACCATTGACACAATAGTTGTTAAGGACGCCGATATTAAGCCTTCTACTGTGGCACCTTTTATCGAGTACTGTAATGTGAAGTTCTACCAGGGTGATTTTAAAGATCTTGCTGGTTTGTCTCATGACTTTGTAGTTAATGCAGCAAATTGCAACTTGGCCCACGGTGGTGGTGTAGCTAAGGCTATAGATCATCACACTGGTGGCAAGTTGCAAAAGCTTTCCACTTCTTTTGTTAAAAGGAACGGTAAGGTTGCAACTGGTGAGTGTGTTATGATTGATACTGGCAAGTTAAAAGTCCTTAATGCAGTTGGTCCCCGTAAGGGCAAGGATGCAGAGTCTTTATTAAATACTGTTTACACTAATATCTTTGCGCGTAAGGGTGTTCCCCTTATGCCTTTGATTAGTTGTGGTATTTTTGGCTTTGACATTAAAGACTCACTTAGGGCATTCTTGGATGCATGTGGTGATAGGCACGTTAAATGCTTTGTTTATTCTGACTCTGAAAGGGAGTCAGTTATGAAGTTCTTGACGACACCTTTTGAGGAACATGTTGCACCTATTGAAGAAATGCTTGAAACACCTGTGGTTGAAACAACAACTGATGTTGTTTCTCCATTTCACACTATTGGTTCTCATAAGTTTTATGATTGCAATAGTGTTGAGCCTATTTTAGGTCTAGGTGTTAAGAACATTGTTCTCTTCACAGACCAGGTGTTGTCTGTTAAAGATTTCGGTATTGTTGTTGATAAGTATCTCAATGGCTTGTTATCTGACATGTCCAACAAGTATGTTAATGATCATAAAGCTGTTCCTTTTGGTAACATTTTGTCACTTGATTGTGGTGCTTTTACTGTAGTGGATGCTGTGTCGCCTTTTGATGGTGCTAGCTTTGAGAAGCAGAGTGGTCGTACCATACGTAAATTGGCTAGATTGGATGGCAGCACATTATGTGTCTTACCTAATGCCATTGCATTATTTGACAAGCTCTTTGTGTTGGG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| 22,320
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OK078017.1
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Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
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Liu,J.
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Zhonghuineng Co., Ltd, Detection Department
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China
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2021-09-18
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SADS-CoV-CH-JX2/2018
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Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 27,188
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GenBank
| null |
China
|
China
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Sus scrofa
| null |
2018
| null | null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus isolate SADS-CoV-CH-JX2/2018, complete genome
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| 37,998
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OK078018.1
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Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
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Liu,J.
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Zhonghuineng Co., Ltd, Detection Department
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China
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2021-09-18
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SADS-CoV-CH-JX1/2018
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Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 27,188
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GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018
| null | null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus isolate SADS-CoV-CH-JX1/2018, complete genome
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| 37,999
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MT294722.1
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Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
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Zhang,F., Song,D., Li,K.
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College of Animal Science and Technology, Jiangxi Agricultural University, Department of Preventive Veterinary Medicine
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China
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2021-06-01
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SADS-CoV-JX-CH/2018
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Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 27,188
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GenBank
| null |
China
|
China
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Sus scrofa
| null |
2018
| null | null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus isolate SADS-CoV-JX-CH/2018, complete genome
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| 41,662
|
MT747186.1
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Zhou,P., Fan,H., Lan,T., Yang,X.L., Shi,W.F., Zhang,W., Zhu,Y., Zhang,Y.W., Xie,Q.M., Mani,S., Zheng,X.S., Li,B., Li,J.M., Guo,H., Pei,G.Q., An,X.P., Chen,J.W., Zhou,L., Mai,K.J., Wu,Z.X., Li,D., Anderson,D.E., Zhang,L.B., Li,S.Y., Mi,Z.Q., He,T.T., Cong,F., Guo,P.J., Huang,R., Luo,Y., Liu,X.L., Chen,J., Huang,Y., Sun,Q., Zhang,X.L., Wang,Y.Y., Xing,S.Z., Chen,Y.S., Sun,Y., Li,J., Daszak,P., Wang,L.F., Shi,Z.L., Tong,Y.G., Ma,J.Y., Ma,J.
|
South China Agriculture University, Animal Science College
|
China
|
2020-09-02
|
SADS-CoV/CN/GDDCD/2017
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Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 27,163
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GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
|
abdominal cavity
|
2017-02
| null | null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus isolate SADS-CoV/CN/GDDCD/2017, complete genome
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| 47,339
|
MT747187.1
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Zhou,P., Fan,H., Lan,T., Yang,X.L., Shi,W.F., Zhang,W., Zhu,Y., Zhang,Y.W., Xie,Q.M., Mani,S., Zheng,X.S., Li,B., Li,J.M., Guo,H., Pei,G.Q., An,X.P., Chen,J.W., Zhou,L., Mai,K.J., Wu,Z.X., Li,D., Anderson,D.E., Zhang,L.B., Li,S.Y., Mi,Z.Q., He,T.T., Cong,F., Guo,P.J., Huang,R., Luo,Y., Liu,X.L., Chen,J., Huang,Y., Sun,Q., Zhang,X.L., Wang,Y.Y., Xing,S.Z., Chen,Y.S., Sun,Y., Li,J., Daszak,P., Wang,L.F., Shi,Z.L., Tong,Y.G., Ma,J.Y., Ma,J.
|
South China Agriculture University, Animal Science College
|
China
|
2020-09-02
|
SADS-CoV/CN/GDDE/2017
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,163
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
|
abdominal cavity
|
2017-02
| null | null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus isolate SADS-CoV/CN/GDDE/2017, complete genome
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| 47,340
|
MT747188.1
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Zhou,P., Fan,H., Lan,T., Yang,X.L., Shi,W.F., Zhang,W., Zhu,Y., Zhang,Y.W., Xie,Q.M., Mani,S., Zheng,X.S., Li,B., Li,J.M., Guo,H., Pei,G.Q., An,X.P., Chen,J.W., Zhou,L., Mai,K.J., Wu,Z.X., Li,D., Anderson,D.E., Zhang,L.B., Li,S.Y., Mi,Z.Q., He,T.T., Cong,F., Guo,P.J., Huang,R., Luo,Y., Liu,X.L., Chen,J., Huang,Y., Sun,Q., Zhang,X.L., Wang,Y.Y., Xing,S.Z., Chen,Y.S., Sun,Y., Li,J., Daszak,P., Wang,L.F., Shi,Z.L., Tong,Y.G., Ma,J.Y., Ma,J.
|
South China Agriculture University, Animal Science College
|
China
|
2020-09-02
|
SADS-CoV/CN/GDST/2017
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,163
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
|
abdominal cavity
|
2017-02
| null | null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus isolate SADS-CoV/CN/GDST/2017, complete genome
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| 47,341
|
MT039231.1
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Edwards,C.E., Yount,B.L. Jr., Graham,R.L., Leist,S.R., Dinnon,K.H. III, Sims,A.C., Swanstrom,J., Gully,K., Scobey,T.D., Cooley,M.R., Currie,C.G., Randell,S.H., Baric,R.S.
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University of North Carolina at Chapel Hill, Epidemiology
|
USA
|
2020-06-15
| null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,171
|
GenBank
| null | null | null |
Sus scrofa
| null | null | null | null |
Mutant Swine acute diarrhea syndrome coronavirus strain icSADS, complete genome
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| 49,064
|
MT039232.1
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Edwards,C.E., Yount,B.L. Jr., Graham,R.L., Leist,S.R., Dinnon,K.H. III, Sims,A.C., Swanstrom,J., Gully,K., Scobey,T.D., Cooley,M.R., Currie,C.G., Randell,S.H., Baric,R.S.
|
University of North Carolina at Chapel Hill, Epidemiology
|
USA
|
2020-06-15
| null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
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Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 27,271
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GenBank
| null | null | null |
Sus scrofa
| null | null | null | null |
Mutant Swine acute diarrhea syndrome coronavirus strain icSADS-tRFP, complete genome
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| 49,065
|
MT199591.1
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Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Si,G., Li,J., Zhou,X., He,D.
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South China Agricultural University, College of Veterinary Medicine
|
China
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2020-05-04
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SADS-CoV/GDGL01/2016
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Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 27,162
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2016-04-08
| null | null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus isolate SADS-CoV/GDGL01/2016, complete genome
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| 50,644
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MT199592.1
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Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
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Si,G., Li,J., Zhou,X., He,D.
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South China Agricultural University, College of Veterinary Medicine
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China
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2020-05-04
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SADS-CoV/GDZJ02/2018
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Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 27,178
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GenBank
| null |
China
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China
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Sus scrofa
| null |
2018-09-09
| null | null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus isolate SADS-CoV/GDZJ02/2018, complete genome
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| 50,645
|
MK994934.1
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Sun,Y., Cheng,J., Luo,Y., Yan,X.L., Wu,Z.X., He,L.L., Tan,Y.R., Zhou,Z.H., Li,Q.N., Zhou,L., Wu,R.T., Lan,T., Ma,J.Y.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2020-03-03
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SADS-CoV/GDWT-P7
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Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 27,165
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
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Sus scrofa
| null |
2017
| null | null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus isolate SADS-CoV/GDWT-P7, complete genome
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| 53,679
|
MK994935.1
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Sun,Y., Cheng,J., Luo,Y., Yan,X.L., Wu,Z.X., He,L.L., Tan,Y.R., Zhou,Z.H., Li,Q.N., Zhou,L., Wu,R.T., Lan,T., Ma,J.Y.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2020-03-03
|
SADS-CoV/GDWT-P18
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,165
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018-03
| null | null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus isolate SADS-CoV/GDWT-P18, complete genome
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| 53,680
|
MK994936.1
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Sun,Y., Cheng,J., Luo,Y., Yan,X.L., Wu,Z.X., He,L.L., Tan,Y.R., Zhou,Z.H., Li,Q.N., Zhou,L., Wu,R.T., Lan,T., Ma,J.Y.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2020-03-03
|
SADS-CoV/GDWT-P48
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Alphacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,107
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018-07
| null | null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus isolate SADS-CoV/GDWT-P48, complete genome
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| 53,681
|
MK994937.1
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Sun,Y., Cheng,J., Luo,Y., Yan,X.L., Wu,Z.X., He,L.L., Tan,Y.R., Zhou,Z.H., Li,Q.N., Zhou,L., Wu,R.T., Lan,T., Ma,J.Y.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2020-03-03
|
SADS-CoV/GDWT-P83
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,109
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018-10
| null | null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus isolate SADS-CoV/GDWT-P83, complete genome
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| 53,682
|
MK651076.1
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Zhou,L., Li,Q.N., Su,J.N., Chen,G.H., Wu,Z.X., Luo,Y., Wu,R.T., Sun,Y., Lan,T., Ma,J.Y.
|
South China Agriculture University, Animal Science College
|
China
|
2019-06-26
| null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,163
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2019-02
| null | null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus strain GDLX/2019, complete genome
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| 62,087
|
MG605090.1
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Zhou,L., Sun,Y., Lan,T., Wu,R.T., Chen,J.W., Wu,Z.X., Xie,Q.M., Zhang,X.B., Ma,J.Y., Ma,J.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2018-09-16
|
SADS-CoV/CN/GDGL/2017
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Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 27,163
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2017-02-26
| null | null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus isolate SADS-CoV/CN/GDGL/2017, complete genome
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| 68,638
|
MG605091.1
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Zhou,L., Sun,Y., Lan,T., Wu,R.T., Chen,J.W., Wu,Z.X., Xie,Q.M., Zhang,X.B., Ma,J.Y., Ma,J.
|
South China Agricultural University, College of Animal Science
|
China
|
2018-09-16
|
SADS-CoV/CN/GDLS/2017
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,163
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2016-08-09
| null | null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus isolate SADS-CoV/CN/GDLS/2017, complete genome
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| 68,639
|
MH615810.1
|
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Li,K., Li,H., Bi,Z., Gu,J., Gong,W., Luo,S., Zhang,F., Song,D., Ye,Y., Tang,Y., Kai,L.
|
JiangXi Agricultural University, Department of Preventive Veterinary Medicine
| null |
2018-08-28
|
SADS-CoV-CH-FJWT-2018
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Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 27,184
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018-03
| null | null |
Swine acute diarrhea syndrome coronavirus isolate SADS-CoV-CH-FJWT-2018, complete genome
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Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
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Wuhan Institute of Virology, CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety
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China
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2018-03-18
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FarmA
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Swine acute diarrhea syndrome coronavirus
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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GenBank
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China
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China
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Swine acute diarrhea syndrome coronavirus isolate FarmA, complete genome
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| 71,746
|
NC_028806.1
|
Swine enteric coronavirus
|
Boniotti,M.B., Papetti,A., Lavazza,A., Alborali,G., Sozzi,E., Chiapponi,C., Faccini,S., Bonilauri,P., Cordioli,P., Marthaler,D.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2016-01-05
| null |
Alphacoronavirus 1
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,111
|
RefSeq
| 1
|
Italy
|
Italy
|
Sus scrofa
| null |
2009-09-04
| null |
PRJNA485481
|
Swine enteric coronavirus strain Italy/213306/2009, complete genome
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| 5,713
|
MT821905.1
|
Swine enteric coronavirus
|
Papetti,A., Bonilauri,P., Chiapponi,C., Boniotti,M.B.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale della Lombardia e dell'Emilia Romagna, Tecnologie Biologiche Applicate
|
Italy
|
2022-04-30
| null |
Alphacoronavirus 1
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,081
|
GenBank
| null |
Italy
|
Italy
|
Sus scrofa
| null |
2019-03-04
| null | null |
Swine enteric coronavirus strain Italy/77590/2019, complete genome
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| 31,010
|
MN692770.1
|
Swine enteric coronavirus
|
de Nova,P.J.G., Cortey,M., Diaz,I., Puente,H., Rubio,P., Martin,M., Carvajal,A., de Nova,P.J.
|
Faculty of Veterinary, Department of Animal Health
|
Spain
|
2020-06-24
|
SeCoV-1480-Murcia-Lorca
|
Alphacoronavirus 1
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,094
|
GenBank
| 1
|
Spain
|
Spain
|
Sus scrofa
| null |
2014-05-30
| null | null |
Swine enteric coronavirus isolate SeCoV-1480-Murcia-Lorca, complete genome
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| 48,889
|
LT545990.1
|
Swine enteric coronavirus
|
Hoeper,D.
|
Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
|
Germany
|
2016-05-14
|
SeCoV/GER/L00930/2012
|
Alphacoronavirus 1
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,050
|
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
|
Sus scrofa
| null |
2012
|
SAMEA3898260
|
PRJEB13040
|
Swine enteric coronavirus isolate SeCoV_GER_L00930_2012 genome assembly, complete genome: monopartite
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| 81,951
|
KR061459.1
|
Swine enteric coronavirus
|
Boniotti,M.B., Papetti,A., Lavazza,A., Alborali,G., Sozzi,E., Chiapponi,C., Faccini,S., Bonilauri,P., Cordioli,P., Marthaler,D.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale della Lombardia e dell'Emilia Romagna
|
Italy
|
2015-12-13
| null |
Alphacoronavirus 1
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 28,111
|
GenBank
| 1
|
Italy
|
Italy
|
Sus scrofa
| null |
2009-09-04
| null | null |
Swine enteric coronavirus strain Italy/213306/2009, complete genome
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| 84,581
|
ON226510.1
|
Swine hepatitis E virus
|
Zhang,B., Song,X.
|
College of Animal & Veterinary Sciences, Southwest Minzu University
|
China
|
2023-02-07
|
SMU/C2/2021
|
Paslahepevirus balayani
|
Paslahepevirus
|
Hepeviridae
|
ssRNA(+)
| 7,202
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2021-10
| null | null |
Swine hepatitis E virus isolate SMU/C2/2021, complete genome
|
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| 18,693
|
ON226511.1
|
Swine hepatitis E virus
|
Zhang,B., Song,X.
|
College of Animal & Veterinary Sciences, Southwest Minzu University
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China
|
2023-02-07
|
SMU/P2/2021
|
Paslahepevirus balayani
|
Paslahepevirus
|
Hepeviridae
|
ssRNA(+)
| 7,194
|
GenBank
| null |
China
|
China
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Sus scrofa
| null |
2021-10
| null | null |
Swine hepatitis E virus isolate SMU/P2/2021, complete genome
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GCAGACCACGTATGTGGTCGACGCCATGGAGGCCCATCAGTTCATAAAGGCTCCTGGCGTCACTACTGCTATTGAGCAGGCAGCTCTAGCAGCGGCCAACTCCGCCTTGGCGAATGCTGTGGTGGTTCGGCCCTTTTTATCCCGCCAACAGACAGAGATACTAATTAATCTGATGCAGCCCCGGCAGCTTGTTTTCCGGCCTGAAGTCTTGTGGAATCACCCTATCCAACGTGTGATCCACAATGAGCTCGAGCAGTACTGCCGAGCTCGCGCCGGCCGCTGCCTTGAAGTGGGTGCCCACCCACGCTCCATTAATGACAACCCCAATGTTTTGCATCGTTGTTTTCTTAAACCAGTCGGCCGTGACGTTCAGCGGTGGTATACTGCCCCCACCCGCGGCCCCGCGGCAAATTGCCGCCGGTCTGCCCTTCGTGGGCTCCCGCCTGTTGATCGTACATACTGCTTTGATGGTTTTTCTGGCTGCACCTTCGCCGCCGAGACAGGTATTGCTCTTTATTCACTGCACGATCTATGGCCCGCTGACGTCGCTGAGGCGATGGCCCGTCATGGGATGACCCGGCTCTATGCAGCCCTCCATCTCCCCCCTGAAGTGCTGTTACCCCCTGGTACATATCACACCACCTCATATCTATTGATTCATGATGGGGACCGTGCAGTGGTTACATATGAGGGGGATTCTAGTGCTGGATATAATCATGATGTCTCCATTCTGCGGGCGTGGATCCGCACCACCAAGGTCACCGGTGATCACCCGCTGGTGATTGAGCGAGTCCGCGCGGTGGGGTGCCACTTTGTGCTCCTCCTTACTGCCGCCCCTGAACCATCGCCGATGCCTTATGTTCCATATCCACGTTCGACCGAGGTTTATGTCCGGTCTATTTTCGGCCCTGGTGGCTCGCCATCGCTTTTTCCATCTGCCTGCTCTACTAAGTCAACATTTCACGCCGTCCCTGTGCACATATGGGATAGGCTTATGCTTTTTGGTGCGACCCTTGACGACCAAGCCTTCTGCTGTTCTAGGCTCATGACGTATCTCCGTGGCATTAGTTATAAGGTCACGGTAGGTGCCCTTGTTGCCAATGAGGGGTGGAACGCCTCTGAGGACGCGCTGACCGCCGTAATTACTGCGGCTTATCTTACTATTTGTCATCAGAGATACCTCCGCACGCAGGCTATCTCTAAGGGGATGAAAAGGTTGGAGCTCGAGCACGCACAGAAGTTTATAACACGCCTTTACAGTTGGTTATTTGAGAAGTCTGGGCGTGACTACATCCCCGGCCGCCAATTGCAGTTCTATGCTCAGTGCCGCCGGTGGCTATCTGCAGGTTTCCATCTTGACCCTCGTGTGCTCGTTTTTGATGAAGCCGCCCCCTGTCGCTGCCGGAGTTTTCTCCGTAAAGCCGCTCACAAGTTCTGCTGTTTTATGCGGTGGTTGGGTCAAGAGTGCACTTGTTTTCTTCAGCCTATTGAGGGGAGGGTCGGTGAGCAAGGTTATGATAATGAGGCGTTTGAAGGGTCAGACATCGACCCTGCTGAGGAAGCCACCGTGAGCATCTCCGGGTCATATATTGTTACTGGTCGTCAACTGCAGCCTTTATATCAAGCGCTCGGCATCCCGTCAGATCTTGCTGCGCGTGCCGGCCGGCTCGCCGCTACCGTTGAGGTCTCAGATGCTGACGGCCGCCTCTCCTGCAAGACCATCTTGGGTAACAAAACCTTTTCGACGGTATTCACTGATGGTGCTCAACTGGAGGCCAACGGGCCAGAGCAGTATGTTCTATCATTTGATCTGACTAAACAAACTATGGCTGCTGGCCCGCATAGTCTTAGCTACACTTTAACATCTGCAGGCCTTGAGGTGCACATTATTTCTGCCGGGCTCGACTGTAAAGCTGTTTTTCCACCTGGTGTTGCAGCCCCCTCTGCCTCTGGGGAGGTGTCTGCTTTTTGCTCAGCTCTTTACAGGTTTAACCGTTGTGTCCAGCGGCATTCCCTTATTGGAGGTCTGTGGTATTATCCTGAGAGCTTAGTCGGTTTGTTTCCACCGTTTTCCCCCGGTCATAGTTGGGAGTCTGCCAACCCTTTTTGCGGTGAGAGCACCCTTTATACTCGCACCTGGTCTGTGTCGGGCTTCTCTAGTTGTTTCTCCCCTTTTGAGCCTCATGCCTTGGAGCAGCCGTCCCCTGATGTTACCAATATGTCTGTAGCTGTTGATACCCCGGTATTGGCCCCCCCTATACAAACCCAGCCCTCAACCCCTGGTCAGGTGACGTCCCCGCCAGACTTGGCTGACGGTCGTGCTGGCCTTGGTTCGCCCAGCGCCTCCGTGGAGCCCCCGGCGTCCGTGCAGCCCGTAACCCAGCCCGGGCCCCGTCGACGATTGCTCCATACTTATCCCGACGGTTCGAAGGTGTATGCCGGGTCTCTTTTCGAGTCTGAGTGTACATGGCTGGTTAATGCCTCTAACCCGGGCCACCGCCCCGGCGGTGGTCTCTGCCATGCATTTTACCAGCGGTTTCCGGAGTCCTTCGACCCTGCTGAGTTCATTATGTCTGATGGGTTTGCAGCCTACACCCTGACGCCTCGGCCTATAATCCATGCTGTTGCCCCCGACTATCGGGTTGAACATAACCCTAAGCGGCTTGAGGCCGCTTATCGGGAGACGTGCTCTCGCCGTGGGACAGCAGCTTACCCTCTGCTCGGTGCTGGTATATACAGGGTCCCTGTCGGGCTGAGCTTTGATGCCTGGGAGCGTAACCATCGACCCGGGGACGAATTGTACTTGACCGAGCCGGCTATAGCCTGGTTTGAGGCCAACCGGCCCACCCTCCCTGCTTTAACTATCACTGAGGATACGGCGCGTACGGCCAACCTAGCCCTGGAATTGGATGCGGCCACTGAGGTTGGCCGGGCGTGTGCTGGCTGTCGTGTTGAACCCGGTGTGGTCCACTATCAGTTTACGGCTGGTGTCCCTGGCTCCGGTAAATCCCGGTCAATCCAACAAGGTGACGTGGACGTTATAGTGGTACCAACCCGTGAGCTACGCAATTCGTGGCGTCGCCGTGGGTTCGCAGCCTACACACCCCATACAGCAGCTCGGGTTACTCGTGGCCGTAGGGTTGTTATTGATGAGGCCCCCTCGCTTCCACCACACTTACTCCTGCTGCATATGCAGCGGGCCTCGTCAGTCCACCTCCTCGGCGACCCTAATCAAATCCCAGCCATTGATTTTGAGCACGCCGGTCTCGTTCCAGCAATCCGGCCTGAGTTGGTCCCAACTAAGTGGTGGCACCTCACCCATAGGTGCCCTGCGGATGTTTGTGAGCTGATCCGTGGTGCATACCCTAAGATTCAAACTGCAAGCCGTGTCCTCCGCTCTTTGTTCTGGGGGGAGCCTCCTGTGGGCCAGAAGCTGGTGTTCACTCAGGCAGCCAAGGCTGCTAACCCTGGTGCAATTACAGTCCATGAGGCACAGGGCGCGACATTCACCGAGACTACAATCATTGCCACGGCGGATGCTCGCGGGCTTATTCAGTCCTCTAGGGCTCATGCCATTGTGGCCCTAACTCGTCACACGGAGAAGTGCGTGGTAGTTGATGCCCCGGGGCTTCTTCGTGAGGTGGGCATCTCTGACGCTATTGTTAATAATTTCTTCCTCTCTGGTGGCGAGATTGGCCAGCATCGTCCGTCAGTTGTACCCCGTGGCACTATTAGCAGCAACGTCGACACGCTTGATGCATTCCCCCCTTCCTGCCAGTTTAGCGCGTATCACCAGCTGGCCGAAGAGCTCGGCCACCGACCCGCGCCGATTGCTGCCGTTTTGCCCCCCTGTCCGGAGCTTGAACAGGGCTTGCTTTATATGCCTCAGGAGTTAACTACATCAGACAGTGTTCTCACCTTTGAATTAACGGACATTGTACACTGTCGTATGGCGGCGCCTAGTCAACGTAAAGCGGTCCTGTCGACCCTTGTCGGCAGGTACGGCCGCCGCACGAAGCTGTACGAGGCTGCCCATGCAGACGTCCGTGGGTCTTTGAATCATTTCATTCCTGAGCTCGGCCCAATTAACGTTACCACCTGCGAGCTCTATGAGCTTGTAGAGGCCATGGTGGAGAAGGGCCAAGATGGCTCTGCAGTCCTAGAGCTCGACCTATATAATCGTGATGTGTCCCGGATAACCTTCTTTCAGAAAGACTGTAACAAATTTACAACAGGTGAAACGATAGCGCATGGCAAAGTCGGGCAGGGTATATCTGCGTGGAGTAAAACCTTCTGTGCTTTATTCGGCCCGTGGTTCCGCGCCATCGAGAAGGAGATTCTAGCAGCGCTTGCACCCAATATCTTCTATGGTGATGCTTATGAGGATACAGTTTTGGCCGCTGCTGTAGCGGGCGCCCCTGGCTGTAAGGTCTTTGAGAACGACTTCTCTGAGTTTGATAGCACCCAAAATAACTTTTCACTTGGGCTTGAGTGCATAATTATGGAGGAGTGCGGCATGCCGCAGTGGATGGTGCGGCTTTACCACCTTGTTCGCTCTGCCTGGGTCTTGCAGGCCCCAAAAGAGTCCCTGCGCGGCTTCTGGAAGAAGCACTCTGGCGAGCCCGGCACCCTGCTGTGGAATACCGTTTGGAACATGGCGGTTATAGCGCACTGTTACGAGTTCCGTGACCTTAAAGTTGCGGCATTTAAGGGAGATGACTCTGTTGTGCTTTGTAGCGATTACCGGCAGAGCCGTAATGCGGCTGCTTTAATCGCTGGGTGTGGGTTGAAGCTTAAAGTGGACTTTAGGCCTATTGGGCTGTATGCTGGTGTTGTTGTGGCCCCGGGTCTCGGTACCCTCCCTGATGTCGTTAGGTTTGCCGGGCGGCTTTCAGAAAAGAACTGGGGGCCGGGCTTGGAGAGGGCTGAGCAGCTCCGGCTGGCCGTTTGTGATTTCTTGCGAAAGTTGACGAATGTTGCTCAGGTCTGTGTGGATGTTG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| 18,694
|
ON226512.1
|
Swine hepatitis E virus
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Zhang,B., Song,X.
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College of Animal & Veterinary Sciences, Southwest Minzu University
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China
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2023-02-07
|
SMU/P3/2021
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Paslahepevirus balayani
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Paslahepevirus
|
Hepeviridae
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ssRNA(+)
| 7,209
|
GenBank
| null |
China
|
China
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Sus scrofa
| null |
2021-11
| null | null |
Swine hepatitis E virus isolate SMU/P3/2021, complete genome
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TGCAGACCAACGTATGTGGTCGACGCCATGGAGGCCCATCAGTTCATAAAGGCTCCTGGCGTCACTACTGCTATTGAGCAGGCAGCTCTAGCAGCGGCCAACTCCGCCTTGGCGAATGCTGTGGTGGTTCGGCCCTTTTTATCCCGCCAACAGACAGAGATACTAATTAATCTGATGCAGCCCCGGCAGCTTGTTTTCCGGCCTGAAGTCTTGTGGAATCACCCTATCCAACGTGTGATCCACAATGAGCTCGAGCAGTACTGCCGAGCTCGCGCCGGCCGCTGCCTTGAAGTGGGTGCCCACCCACGCTCCATTAATGACAACCCCAATGTTTTGCATCGTTGTTTTCTTAAACCAGTCGGCCGTGACGTTCAGCGGTGGTATACTGCCCCCACCCGCGGCCCCGCGGCAAATTGCCGCCGGTCTGCCCTTCGTGGGCTCCCGCCTGTTGATCGTACATACTGCTTTGATGGTTTTTCTGGCTGCACCTTCGCCGCCGAGACAGGTATTGCTCTTTATTCACTGCACGATCTATGGCCCGCTGACGTCGCTGAGGCGATGGCCCGTCATGGGATGACCCGGCTCTATGCAGCCCTCCATCTCCCCCCTGAAGTGCTGTTACCCCCTGGCACATATCACACCACCTCATATCTATTGATTCATGATGGGGACCGTGCAGTGGTTACATATGAGGGGGATTCTAGTGCTGGATATAATCATGATGTCTCCATTCTGCGGGCGTGGATCCGCACCACCAAGGTCACCGGTGATCACCCGCTGGTGATTGAGCGAGTCCGCGCGGTGGGGTGCCACTTTGTGCTCCTCCTTACTGCCGCCCCTGAACCATCGCCGATGCCTTATGTTCCATATCCACGTTCGACCGAGGTTTATGTCCGGTCTATTTTCGGCCCTGGTGGCTCGCCATCGCTTTTTCCATCTGCCTGCTCTACTAAGTCAACATTTCACGCCGTCCCTGTGCACATATGGGATAGGCTTATGCTTTTTGGTGCGACCCTTGACGACCAAGCCTTCTGCTGTTCTAGGCTCATGACGTATCTCCGTGGCATTAGTTATAAGGTCACGGTAGGTGCCCTTGTTGCCAATGAGGGGTGGAACGCCTCTGAGGACGCGCTGACCGCCGTAATTACTGCGGCTTATCTTACTATTTGTCATCAGAGATACCTCCGCACGCAGGCTATCTCTAAGGGGATGAAAAGGTTGGAGCTCGAGCACGCACAGAAGTTTATAACACGCCTTTACAGTTGGTTATTTGAGAAGTCCGGGCGTGACTACATCCCCGGCCGCCAATTGCAGTTCTATGCTCAGTGCCGCCGGTGGCTATCTGCAGGTTTCCATCTTGACCCTCGTGTGCTCGTTTTTGATGAAGCCGCCCCCTGTCGCTGCCGGAGTTTTCTCCGTAAAGCCGCTCATAAGTTCTGCTGTTTTATGCGGTGGTTGGGTCAAGATTGCACTTGTTTTCTTCAGCCTATTGAGGGGAGGGTCGGTGAGCAAGGTTATGATAATGAGGCGTTTGAAGGGTCAGACATCGACCCTGCTGAGGAAGCCACCGTGAGCATCTCCGGGTCATATATTGTTACTGGTCGTCAACTGCAGCCTTTATATCAAGCGCTCGGCATCCCGTCAGATCTTGCTGCGCGTGCCGGCCGGCTCGCCGCTACCGTTGAGGTCTCAGATGCTGACGGCCGCCTCTCCTGCAAGACCATCTTAGGTAACAAAACCTTTTCGACGGTATTCACTGATGGTGCTCAACTGGAGGCCAACGGGCCAGAGCAGTATGTTCTATCATTTGATCTGACTAAACAAACTATGGCTGCTGGCCCGCATAGTCTTAGCTACACTTTAACATCTGCAGGCCTTGAGGTGCACATTATTTCTGCCGGGCTCGACTGTAAAGCTGTTTTCCCACCTGGTGTTGCAGCCCCCTCTGCCTCTGGGGAGGTGTCTGCTTTTTGCTCAGCTCTTTACAGGTTTAACCGTTGTGTCCAGCGGCATTCCCTTATTGGAGGTCTGTGGTATTATCCTGAGAGCTTAGTCGGTTTGTTTCCACCGTTTTCCCCCGGTCATAGTTGGGAGTCTGCCAACCCTTTTTGCGGTGAGAGCACCCTTTATACTCGCACCTGGTCTGTGTCGGGCTTCTCTAGTTGTTTCTCCCCTTTCGAGCCTCATGCCTTGGAGCAGCCGTCCCCTGATGTTACCAACATGTCTGTAGCTGTTGATACCCCGGTATTGGCCCCCCCTATACAAACCCAGCCCTCAACCCCTGGTCAGGTGACGCCCCCGCGAGATTTGGCTGACGGTCGTGCTGGCCTTGGTTCGCCCAGCGCCTCCGTGGAGCCCCCGGCGTCCGTGCAGCCCGTAACCCAGCCCGGGCCCCGTCGACGATTGCTCCATACTTATCCCGACGGTTCGAAGGTGTATGCCGGGTCTCTTTTCGAGTCTGAGTGTACATGGCTGGTTAATGCCTCTAACCCGGGCCACCGCCCTGGCGGTGGTCTCTGCCATGCATTTTACCAGCGGTTTCCGGAGTCCTTCGACCCTGCTGAGTTCATTATGTCTGATGGGTTTGCAGCCTACACCCTGACGCCTCGGCCTATAATCCATGCTGTTGCCCCCGACTATCGGGTTGAACATAACCCTAAGCGGCTTGAGGCCGCTTATCGGGAGACGTGCTCTCGCCGTGGGACAGCAGCTTACCCTCTGCTCGGTGTTGGTATATACAAGGTCCCTGTCGGGCTGAGCTTTGATGCCTGGGAGCGTAACCATCGACCCGGGGACGAATTGTACTTGACCGAGCCGGCTATAGCCTGGTTTGAGGCCAACCGGCCTACCCTTCCTGCTTTAACTATCACTGAGGATACGGCGCGTACGGCCAACCTAGCCCTGGAATTGGATGCGGCCACTGAGGTTGGCCGGGCGTGTGCTGGCTGTCGTGTTGAACCCGGTGTGGTCCACTATCAGTTTACGGCTGGTGTCCCTGGCTCCGGTAAATCCCGGTCAATCCAACAAGGTGACGTGGACGTTATAGTGGTACCAACCCGTGAGCTACGCAATTCGTGGCGTCGCCGTGGGTTCGCAGCCTACACACCCCATACAGCAGCTCGGGTTACTCGTGGCCGTAGGGTTGTTATTGATGAGGCCCCCTCGCTTCCACCACACTTACTCCTGCTGCATATGCAGCGGGCCTCGTCAGTCCACCTCCTCGGCGACCCTAATCAAATCCCCGCCATTGATTTTGAGCACGCCGGTCTCGTTCCAGCAATCCGGCCTGAGTTGGTCCCAACTAAGTGGTGGCACCTCACCCATAGGTGCCCTGCGGATGTTTGTGAGCTGATCCGTGGTGCATACCCTAAGATTCAAACTGCAAGCCGTGTCCTCCGCTCTTTGTTCTGGGGGGAGCCTCCTGTGGGCCAGAAGCTGGTGTTCACTCAGGCAGCCAAGGCTGCTAACCCTGGTGCAATTACAGTCCATGAGGCACAGGGCGCGACATTCACCGAGACTACAATCATTGCCACGGCGGATGCTCGCGGGCTTATTCAGTCCTCTAGGGCTCATGCCATTGTGGCCCTAACTCGTCACACGGAGAAGTGCGTGGTAGTTGATGCCCCGGGGCTTCTTCGTGAGGTGGGCATCTCTGACGCTATTGTTAATAATTTCTTCCTCTCTGGCGGCGAGATTGGCCAGCATCGTCCGTCAGTTGTACCCCGTGGCACTATTAGCAGCAACGTCGACACGCTTGATGCATTCCCCCCTTCCTGCCAGTTTAGCGCGTATCACCAGCTGGCCGAAGAGCTCGGCCACCGACCCGCGCCGATTGCTGCCGTCTTGCCCCCCTGTCCGGAGCTTGAACAGGGCTTGCTTTATATGCCTCAGGAGTTAACTACATCAGACAGTGTTCTCACCTTTGAATTAACGGACATTGTACACTGTCGTATGGCGGCGCCTAGTCAACGTAAAGCGGTTCTGTCGACCCTTGTCGGCAGGTACGGCCGCCGCACGAAGCTGTACGAGGCTGCCCATGCAGACGTCCGTGGGTCTTTGAATCATTTCATTCCTGAGCTCGGCCCAATTAACGTTACCACCTGCGAGCTCTATGAGCTTGTAGAGGCCATGGTGGAGAAGGGCCAAGATGGCTCTGCAGTCCTAGAGCTCGACCTATATAATCGTGATGTGTCCCGGATAACCTTCTTTCAGAAAGACTGTAACAAATTTACAACAGGTGAAACGATAGCGCATGGCAAAGTCGGGCAGGGTATATCTGCGTGGAGTAAAACCTTCTGTGCTTTATTCGGCCCGTGGTTCCGCGCCATCGAGAAGGAGATTCTAGCAGCGCTTGCACCCAATATCTTCTATGGTGATGCTTATGAGGATACAGTTTTGGCCGCTGCTGTAGCGGGCGCCCCTGGCTGTAAGGTCTTTGAGAACGACTTCTCTGAGTTTGATAGCACCCAAAATAACTTTTCACTTGGGCTTGAGTGCATAATTATGGAGGAGTGCGGCATGCCGCAGTGGATGGTGCGGCTTTACCACCTTGTTCGCTCTGCCTGGGTCTTGCAGGCCCCAAAAGAGTCCCTGCGCGGCTTCTGGAAGAAGCACTCTGGCGAGCCCGGCACCCTGCTGTGGAATACCGTTTGGAACATGGCGGTTATAGCGCACTGTTACGAGTTCCGTGACCTTAAAGTTGCGGCATTTAAGGGAGATGACTCTGTTGTGCTTTGTAGCGATTACCGGCAGAGTCGTAATGCGGCTGCTTTAATCGCTGGGTGTGGGTTGAAGCTTAAAGTGGACTTTAGGCCTATTGGGCTGTATGCTGGTGTTGTTGTGGCCCCGGGTCTCGGTACCCTCCCTGATGTCGTTAGGTTTGCCGGGCGGCTTTCAGAAAAGAACTGGGGGCCGGGCTTGGAGAGGGCTGAGCAGCTCCGGCTGGCCGTTTGTGATTTCTTGCGAAAGTTGACGAATGTTGCTCAGGTCTGTGTGGATGT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| 18,695
|
ON226513.1
|
Swine hepatitis E virus
|
Zhang,B., Song,X.
|
College of Animal & Veterinary Sciences, Southwest Minzu University
|
China
|
2023-02-07
|
SMU/P52/2021
|
Paslahepevirus balayani
|
Paslahepevirus
|
Hepeviridae
|
ssRNA(+)
| 7,243
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2021-12
| null | null |
Swine hepatitis E virus isolate SMU/P52/2021, complete genome
|
GCAGACCACGTATGTGGTTGACGCCATGGAGGCCCATCAGTTCATAAAGGCTCCTGGCGTCACTACTGCTATTGAGCAGGCAGCTCTAGCAGCGGCCAACTCCGCCTTGGCGAATGCTGTGGTGGTTCGGCCCTTTTTATCCCGCCAACAGACAGAGATACTAATTAATCTGATGCAGCCCCGGCAGCTTGTTTTCCGGCCTGAAGTCTTGTGGAATCACCCTATCCAACGTGTGATCCACAATGAGCTCGAGCAGTACTGCCGAGCTCGCGCCGGCCGCTGCCTTGAAGTGGGTGCCCACCCACGCTCCATTAATGACAACCCCAATGTTTTGCATCGTTGTTTTCTTAAACCAGTCGGCCGTGACGTTCAGCGGTGGTATACTGCCCCCACCCGCGGCCCCGCGGCAAATTGCCGCCGGTCTGCCCTTCGTGGGCTCCCGCCTGTTGATCGTACATACTGCTTTGATGGTTTTTCTGGCTGCACCTTCGCCGCCGAGACAGGTATTGCTCTTTATTCACTGCACGATCTATGGCCCGCTGACGTCGCTGAGGCGATGGCCCGTCATGGGATGACCCGGCTCTATGCAGCCCTCCATCTCCCCCCTGAAGTGCTGTTACCCCCTGGTACATATCACACCACCTCATATCTATTGATTCATGATGGGGACCGTGCAGTGGTTACATATGAGGGGGATTCTAGTGCTGGATATAATCATGATGTCTCCATTCTGCGGGCGTGGATCCGCACCACCAAGGTCACCGGTGATCACCCGCTGGTGATTGAGCGAGTCCGCGCGGTGGGGTGCCACTTTGTGCTCCTCCTTACTGCCGCCCCTGAACCATCGCCGATGCCTTATGTTCCATATCCACGTTCGACCGAGGTTTATGTCCGGTCTATTTTCGGCCCTGGTGGCTCGCCATCGCTTTTTCCATCTGCCTGCTCTACTAAGTCAACATTTCACGCCGTCCCTGTGCACATATGGGATAGGCTTATGCTTTTTGGTGCGACCCTTGACGACCAAGCCTTCTGCTGTTCTAGGCTCATGACGTATCTCCGTGGCATTAGTTATAAGGTCACGGTAGGTGCCCTTGTTGCCAATGAGGGGTGGAACGCCTCTGAGGACGCGCTGACCGCCGTAATTACTGCGGCTTATCTTACTATTTGTCATCAGAGATACCTCCGCACGCAGGCTATCTCTAAGGGGATGAAAAGGTTGGAGCTCGAGCACGCACAGAAGTTTATAACACGCCTTTACAGTTGGTTATTTGAGAAGTCCGGGCGTGACTACATCCCCGGCCGCCAATTGCAGTTCTATGCTCAGTGCCGCCGGTGGCTATCTGCAGGTTTCCATCTTGACCCTCGTGTGCTCGTTTTTGATGAAGCCGCCCCCTGTCGCTGCCGGAGTTTTCTCCGTAAAGCCGCTCACAAGTTCTGCTGTTTTATGCGGTGGTTGGGTCAAGATTGCACTTGTTTTCTTCAGCCTATTGAGGGGAGGGTCGGTGAGCAAGGTTATGATAATGAGGCGTTTGAAGGGTCAGACATCGACCCTGCTGAGGAAGCCACCGTGAGCATCTCCGGGTCATATATTGTTACTGGTCGTCAACTGCAGCCTTTATATCAAGCGCTCGGCATCCCGTCAGATCTTGCTGCGCGTGCCGGCCGGCTCGCCGCTACCGTTGAGGTCTCAGATGCTGACGGCCGCCTCTCCTGCAAGACCATCTTGGGTAACAAAACCTTTTCGACGGTATTCACTGATGGTGCTCAACTGGAGGCCAACGGGCCAGAGCAGTATGTTCTATCATTTGATCTGACTAAACAAACTATGGCTGCTGGCCCGCATAGTCTTAGCTACACTTTAACATCTGCAGGCCTTGAGGTGCACATTATTTCTGCCGGGCTCGACTGTAAAGCTGTTTTTCCACCTGGTGTTGCAGCCCCCTCTGCCTCTGGGGAGGTGTCTGCTTTTTGCTCAGCTCTTTACAGGTTTAACCGTTGTGTCCAGCGGCATTCCCTTATTGGAGGTCTGTGGTATTATCCTGAGAGCTTAGTCGGTTTGTTCCCACCGTTTTCCCCCGGTCATAGTTGGGAGTCTGCCAACCCTTTTTGCGGTGAGAGCACCCTTTATACTCGCACCTGGTCTGTGTCGGGCTTCTCTAGTTGTTTCTCCCCTTTTGAGCCTCATGCCTTGGAGCAGCCGTCCCCTGATGTTACCAACATGTCTGTAGCTGTTGATACCCCGGTATTGGCCCCCCCTATACAAACCCAGCCCTCAACCCCTGGTCAGGTGACGCCCCCGCCAGACTTGGCTGACGGTCGTGCTGGCCTTGGTTCATCCAGCGCCTCCGTGGAGCCCCCGGCGTCCGTGCAGCCCGTAACCCAGCCCGGGCCCCGTCGACGATTGCTCCATACTTATCCCGACGGTTCGAAGGTGTATGCCGGGTCTCTTTTCGAGTCTGAGTGTACATGGCTGGTTAATGCCTCTAACCCGGGCCACCGCCCCGGCGGTGGTCTCTGCCATGCATTTTACCAGCGGTTTCCGGAGTCCTTCGACCCTGCTGAGTTCATTATGTCTGATGGGTTTGCAGCCTACACCCTGACGCCTCGGCCTATAATCCATGCTGTTGCCCCCGACTATCGGGTTGAACATAACCCTAAGCGGCTTGAGGCCGCTTATCGGGAGACGTGCTCTCGCCGTGGGACAGCAGCTTACCCTCTGCTCGGTGCTGGTATATACAAGGTCCCTGTCGGGCTGAGCTTTGATGCCTGGGAGCGTAACCATCGACCCGGGGACGAATTGTACTTGACCGAGCCGGCTATAGCCTGGTTTGAGGCCAACCGGCCCACCCTCCCTGCTTTAACTATCACTGAGGATACGGCGCGTACGGCCAACCTAGCCCTGGAATTGGATGCGGCCACTGAGGTTGGCCGGGCGTGTGCTGGCTGTCGTGTTGAACCCGGTGTGGTCCACTATCAGTTTACGGCTGGTGTCCCTGGCTCCGGTAAATCCCGGTCAATCCAACAAGGTGACGTGGACGTTATAGTGGTACCAACCCGTGAGCTACGCAATTCGTGGCGTCGCCGTGGGTTCGCAGCCTACACACCCCATACAGCAGCTCGGGTTACTCGTGGCCGTAGGGTTGTTATTGATGAGGCCCCCTCGCTTCCACCACACTTACTCCTGCTGCATATGCAGCGGGCCTCGTCAGTCCACCTCCTCGGCGACCCTAATCAAATCCCCGCCATTGATTTTGAGCACGCCGGTCTCGTTCCAGCAATCCGGCCTGAGTTGGTCCCAACTAAGTGGTGGCACCTCACCCATAGGTGCCCTGCGGATGTTTGTGAGCTGATCCGTGGTGCATACCCTAAGATTCAAACTGCAAGCCGTGTCCTCCGCTCTTTGTTCTGGGGGGAGCCTCCTGTGGGCCAGAAGCTGGTGTTCACTCAGGCAGCCAAGGCTGCTAACCCTGGTGCAATTACAGTCCATGAGGCACAGGGCGCGACATTCACCGAGACTACAATCATTGCCACGGCGGATGCTCGCGGGCTTATTCAGTCCTCTAGGGCTCATGCCATTGTGGCCCTAACTCGTCACACGGAGAAGTGCGTGGTAGTTGATGCCCCGGGGCTTCTTCGTGAGGTGGGCATCTCTGACGCTATTGTTAATAATTTCTTCCTCTCTGGCGGCGAGATTGGCCAGCATCGTCCGTCAGTTGTACCCCGTGGCACTATTAGCAGCAACGTCGACACGCTTGATGCATTCCCCCCTTCCTGCCAGTTTAGCGCGTATCACCAGCTGGCCGAAGAGCTCGGCCACCGACCCGCGCCGATTGCTGCCGTCTTGCCCCCCTGTCCGGAGCTTGAACAGGGCTTGCTTTATATGCCTCAGGAGTTAACTACATCGGACAGTGTTCTCACCTTTGAATTAACGGACATTGTACACTGTCGTATGGCGGCGCCTAGTCAACGTAAAGCGGTTCTGTCGACCCTTGTCGGCAGGTACGGCCGCCGCACGAAGCTGTACGAGGCTGCCCATGCAGACGTCCGTGGGTCTTTGAATCATTTCATTCCTGAGCTCGGCCCAATTAACGTTACCACCTGCGAGCTCTATGAGCTTGTAGAGGCCATGGTGGAGAAGGGCCAAGATGGCTCTGCAGTCCTAGAGCTCGACCTATATAATCGTGATGTGTCCCGGATAACCTTCTTTCAGAAAGACTGTAACAAATTTACAACAGGTGAAACGATAGCGCATGGCAAAGTCGGGCAGGGTATATCTGCGTGGAGTAAAACCTTCTGTGCTTTATTCGGCCCGTGGTTCCGCGCCATCGAGAAGGAGATTCTAGCAGCGCTTGCACCCAATATCTTCTATGGTGATGCTTATGAGGATACAGTTTTGGCCGCTGCTGTAGCGGGCGCCCCTGGCTGTAAGGTCTTTGAGAACGACTTCTCTGAGTTTGATAGCACCCAAAATAACTTTTCACTTGGGCTTGAGTGCATAATTATGGAGGAGTGCGGCATGCCGCAGTGGATGGTGCGGCTTTACCACCTTGTTCGCTCTGCCTGGGTCTTGCAGGCCCCAAAAGAGTCCCTGCGCGGCTTCTGGAAGAAGCACTCTGGCGAGCCCGGCACCCTGCTGTGGAATACCGTTTGGAACATGGCGGTTATAGCGCACTGTTACGAGTTCCGTGACCTTAAAGTTGCGGCATTTAAGGGAGATGACTCTGTTGTGCTTTGTAGCGATTACCGGCAGAGTCGTAATGCGGCTGCTTTAATCGCTGGGTGTGGGTTGAAGCTTAAAGTGGACTTTAGGCCTATTGGGCTGTATGCTGGTGTTGTTGTGGCCCCGGGTCTCGGTACCCTCCCTGATGTCGTTAGGTTTGCCGGGCGGCTTTCAGAAAAGAACTGGGGGCCGGGCTTGGAGAGGGCTGAGCAGCTCCGGCTGGCCGTTTGTGATTTCTTGCGAAAGTTGACGAATGTTGCTCAGGTCTGTGTGGATGTTG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| 18,696
|
ON226514.1
|
Swine hepatitis E virus
|
Zhang,B., Song,X.
|
College of Animal & Veterinary Sciences, Southwest Minzu University
|
China
|
2023-02-07
|
SMU/HP11/2021
|
Paslahepevirus balayani
|
Paslahepevirus
|
Hepeviridae
|
ssRNA(+)
| 7,235
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2021-04
| null | null |
Swine hepatitis E virus isolate SMU/HP11/2021, complete genome
|
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| 18,697
|
ON226515.1
|
Swine hepatitis E virus
|
Zhang,B., Song,X.
|
College of Animal & Veterinary Sciences, Southwest Minzu University
|
China
|
2023-02-07
|
SMU/HP8/2021
|
Paslahepevirus balayani
|
Paslahepevirus
|
Hepeviridae
|
ssRNA(+)
| 7,227
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2021-05
| null | null |
Swine hepatitis E virus isolate SMU/HP8/2021, complete genome
|
TTCGTATGTGGGTGACGCCATGGAGGCCCACCAGTTCATAAAGGCTCCTGGCGTCACTACTGCTATTGAGCAGGCAGCTCTAGCAGCGGCCAATTCTGCCTTGGCGAATGCTGTGGTGGTTCGGCCCTTTTTATCCCGCCAACAGACAGAGATACTAATTAACTTGATGCAACCCCGGCAGCTTGTTTTCCGGCCTGAGGTTCTGTGGAATCACCCCATCCAACGTGTGATCCACAATGAGCTAGAGCAGTACTGTCGAGCTCGTGCTGGCCGCTGCCTCGAAGTGGGTGCCCACCCACGTTCAATTAATGACAACCCTAATGTTTTGCATCGTTGTTTTCTTAAACCTGTCGGCCGTGATGTTCAGCGGTGGTATACCGCCCCCACCCGTGGCCCCGCGGCAAACTGCCGCCGGTCTGCTCTTCGTGGGCTCCCACCTGCTGACCGTACATACTGCTTTGACGGCTTCTCTGGCTGCACTTTTGCGGCCGAGACAGGCATCGCCCTTTACTCACTGCATGATTTGTGGCCCGCTGATGTTGCTGAGGCGATGGCCCGCCATGGGATGACTCGGCTCTATGCGGCCCTCCATCTCCCCCCTGAAGTGCTACTACCCCCTGGCACATACCACACCACTTCATATCTTTTAATTCATGATGGGGACCGTGCAGTGATTACATATGAGGGGGACTCCAGTGCTGGGTATAATCATGATGTGTCTATTTTGCGGGCATGGATCCGTACCACCAAAGTCACCGGTAACCACCCACTGGTGATTGAGCGGGTCCGGGCCGTGGGGTGTCATTTTGTGCTTCTACTTACAGCCGCTCCCGAACCGTCACCGATGCCCTATGTCCCATACCCACGCTCAACTGAGGTTTATGTCCGGTCTATCTTCGGCCCTGGAGGCTCGCCATCTCTCTTTCCGTCCGCCTGCTCTACTAAGTCAACATTTCATGCCGTCCCTGTGCACATATGGGATAGGCTTATGCTTTTTGGTGCGACTCTTGACGACCAAGCCTTTTGCTGCTCCAGACTCATGACGTACCTCCGTGGCATTAGTTATAAGGTTACGGTAGGTGCTCTTGTTGCCAATGAGGGCTGGAATGCCTCTGAGGATGCGCTGACCGCCGTAATCACTGCGGCTTATCTCACTATCTGCCATCAGAGGTACCTCCGTACGCAGGCTATTTCGAAGGGGATGAAAAGGTTGGAGCTAGAGCATGCACAGAAATTTATAACACGCCTTTACAGTTGGTTATTCGAAAAGTCTGGGCGTGACTATATCCCCGGCCGCCAACTGCAGTTTTATGCTCAGTGCCGCCGGTGGCTATCTGCAGGTTTCCACCTTGATCCTCGTGTGCTCGTTTTTGATGAGGCCGCCCCCTGCCGCTGTCGGAGCTTTCTGCGCAAAGCCGCCCACAAGTTTTGTTGCTTTATGCGGTGGCTAGGTCAAGACTGCACCTGCTTCCTTCAGCCTATTGAAGGGAGGGTTGGTGAACAAGGTTACGATAATGAGGCATTTGAGGGGTCGGATGTTGACCCTGCTGAGGAGGCCACCGTGAGCATTGCCGGGTCGTACATTGTTACCGGCCGCCAGCTGCAGCCTCTATACCAAGCGCTTGGCATACCATCTGATCTCGCTGCGCGTGCCGGTCGGCTTGCTGCCACCGTTGAAGTCTCAGATGCAGAGGGTCGTCTTACCTGCAAGACCATTTTGGGCAACAAAACTTTTTCAACGGTATTCACTGATGGTGCTCAGCTAGAGGCCAACGGGCCAGAGCAGTACGTTCTATCATTTGACTTGACTAAACAAACTATGGCTGCTGGCCCGCATAGTCTCAGTTACACCCTTACATCTGAAGGTCTTGAAGTGCATATTATTTCTGCTGGGCTCGATTGCAAGGCTGTTTTCCCGCCTGGCGTCGCAACCCCCTCCGCTTCCGGGGAGGTGTCTGCTTTTTGTTCAGCTCTTTACAGGTTTAACCGCTGCATTCAGCGGCATTCTCTTGTTGGAGGCTTGTGGTATTACCCTGAGAGTTTAGTTGGCTTGTTCCCACCGTTCTCACCTGGTCATAGCTGGGAGTCTACTAATCCTTTTTGCGGTGAGAGCACTCTCTATACTCGCACATGGTCTGTGTCGGGTTTTTCCAGCTGTTTCTCTCCCTTCGAACCTCGTACCCCGGAGCTGCCACCCTCTGGTAACATTGATATATCTGTAGATGTTGATACCCCGCCACCGGTTCCCCCTGCACAGACTCAACCCCCAACCTCCGGCCGCGTGGCGCTCCCGCTGGATCCGGCTGATGGTGGTGCTAGCCTCGGTTTGACTGGCGTCTCTGTGGCGCCTCCGGCGCCTGCGCAGCCTGTAACCCAACCCGGGCCCCGTCGCCGACTGCTTCACACTTACCCCGACGGCTCGAAGGTGTATGCCGGGTCTCTCTTTGAGTCCGAGTGTACATGGCTGGTCAATGCCTCTAACCCGGGCCACCGTCCCGGCGGTGGCCTCTGCCATGCATTTTTCCAGCGGTTTCCAGAGTCCTTCGACCCCGCTGAGTTCATCATGTCCGACGGGCTTGCAGCCTACACCCTGACGCCCCGGCCCATAATCCATGCTGTCGCTCCTGACTATCGGGTTGAACATAACCCCAAGCGACTTGAGGCAGCTTACCGGGAGACGTGCTCCCGCCGCGGGACAGCAGCTTACCCCTTGCTCGGCGCTGGTATATACAGGGTCCCCGTTGGGCTGAGTTTTGATGCCTGGGAACGTAACCACCGACCCGGGGACGAGTTGTATTTGACTGAGCCAGCTATAGCCTGGTTTGAAGCCAACCGGCCTACCCTTCCCGCTCTGACTATTACAGAGGACACAGCGCGCACGGCGAACCTAGCATTGGAGCTGGATGCGGCCACTGAGGTCGGCCGGGCGTGTGCTGGCTGTCGTGTTGAACCTGGTGTAGTTCATTATCAGTTCACAGCTGGTGTCCCTGGCTCTGGTAAATCCCGGTCAATTCAACAAGGAGATGTGGACGTAATAGTGGTACCAACCCGTGAGTTACGTAATTCGTGGCGCCGCCGCGGGTTTGCAGCTTACACACCCCATACTGCAGCTCGTGTTACCCGCGGCCGTAGAGTTGTTATTGACGAGGCCCCCTCGCTCCCACCACATTTACTTCTGCTGCATATGCAGCGGGCCTCGTCAGTCCACCTTCTTGGTGACCCTAATCAAATTCCTGCTATTGATTTCGAGCATGCCGGCCTTGTTCCAGCAATCCGGCCCGAGTTGGTTCCAACTAAGTGGTGGCATCTTACCCATAGGTGCCCTGCGGATGTCTGTGAGCTGATTCGTGGTGCATACCCAAAGATCCAAACTGCGAGCCGTGTCCTCCGCTCTTTGTTTTGGGGGGAGCCCCCTGTGGGCCAGAAGCTGGTGTTTACCCAGGCGGCCAAGGCCGCTAACCCCGGTGCAATTACAGTTCATGAAGCCCAGGGCGCAACATTCACCGAGACCACAATCATCGCCACGGCGGATGCCCGTGGGTTGATTCAGTCTTCTAGGGCTCATGCCATTGTGGCCCTAACTCGCCACACGGAGAAGTGTGTGGTAGTTGACGCCCCAGGGCTTCTCCGTGAGGTGGGTATCTCCGATGCTATTGTCAATAATTTCTTCCTTGCTGGCGGCGAAATTGGTCAGCATCGCCCGTCAGTCGTACCCCGTGGTACCATTAGCAGCAACGTTGACACGCTTGATGCATTCCCCCCTTCTTGCCAGTTTAGTGCGTACCATCAGCTGGCCGAAGAGCTTGGTCACCGGCCCGCGCCGATTGCTGCTGTTTTGCCCCCTTGTCCAGAGCTTGAACAGGGCTTGCTTTATATGCCTCAGGAGCTAACTACATCGGACAGTGTTCTCACCTTTGAACTGACGGACATTGTGCATTGCCGTATGGCGGCACCTAGCCAGCGTATGGCGGTCCTGTCGACTCTTGTCGGCAGGTATGGCCGCCGTACGAAGCTTTACGAGGCTGCACACGCGGATGTCCGCGGATCTCTGAATCATTTTATTCCTGAGCTTGGCCCTATTAATGTTACTACTTGCGAGCTCTATGAGCTTGTGGAGGCTATGGTAGAAAAGGGCCAAGACGGCTCTGCAGTTCTGGAGCTTGACCTATGTAATCGTGATGTGTCCCGGATAACCTTCTTCCAGAAAGACTGCAATAAATTCACAACGGGTGAGACGATTGCGCATGGTAAAGTCGGTCAGGGCATATCTGCATGGAGCAAGACCTTCTGCGCTTTATTTGGCCCGTGGTTCCGCGCTATTGAAAAGGAGATTTTGGCAGCGCTTGCACCCAATATCTTTTATGGTGATGCTTATGAAGACACAGTTTTGGCCGCTGCCGTTGCAGGCGCCTCAGGCTGTAAGGTCTTTGAGAACGACTTTTCTGAATTTGATAGCACCCAAAATAATTTCTCGCTTGGGCTTGAGTGTATAATTATGGAGGAGTGTGGCATGCCACAATGGATGGTGCGGCTTTACCATCTTGTCCGCTCCGCCTGGGTCTTGCAGGCCCCAAAAGAGTCCCTGCGCGGCTTCTGGAAGAAGCACTCTGGTGAGCCTGGTACCCTGCTGTGGAATACCGTCTGGAATATGGCGGTTATAGCACACTGTTATGAGTTTCGTGACCTCAAAGTTGCGGCATTTAAGGGGGATGACTCTGTTGTGCTTTGCAGCGATTACCGGCAGAGTCGTAATGCGGCTGCCTTGATTGCTGGGTGTGGGCTGAAGCTTAAGGTGGATTTCAGGCCTATTGGACTGTATGCTGGTGTTGTTGTGGCCCCGGGTCTTGGGACCCTTCCTGATGTTGTTAGGTTCGCTGGACGGCTCTCAGAGAAGAATTGGGGGCCAGGCCCGGAGAGGATGGAGCAGCTTCGGCTGGCCGTTTGTGACTTTTTGCGAAAGCTAACGAATGTGGCTCAGGTCTGTGTGGATGTTGTTTCGC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| 18,698
|
ON226516.1
|
Swine hepatitis E virus
|
Zhang,B., Song,X.
|
College of Animal & Veterinary Sciences, Southwest Minzu University
|
China
|
2023-02-07
|
SMU/HP5/2021
|
Paslahepevirus balayani
|
Paslahepevirus
|
Hepeviridae
|
ssRNA(+)
| 7,203
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2021-06
| null | null |
Swine hepatitis E virus isolate SMU/HP5/2021, complete genome
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| 18,699
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ON226517.1
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Swine hepatitis E virus
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Zhang,B., Song,X.
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College of Animal & Veterinary Sciences, Southwest Minzu University
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China
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2023-02-07
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SMU/HP32/2021
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Paslahepevirus balayani
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Paslahepevirus
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Hepeviridae
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ssRNA(+)
| 7,180
|
GenBank
| null |
China
|
China
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Sus scrofa
| null |
2021-07
| null | null |
Swine hepatitis E virus isolate SMU/HP32/2021, complete genome
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GTATGTGGTCGACGCCATGGAGGCCCATCAGTTTATAAAGGCTCCTGGCGTCACTACTGCTATTGAGCAGGCAGCTCTAGCAGCGGCCAACTCCGCCTTGGCGAATGCTGTGGTGGTTCGGCCTTTTTTATCCCGCCAACAGACAGAGATACTGATTAACTTGATGCAGCCCCGGCAGCTTGTTTTCCGGCCTGAGGTTCTGTGGAACCACCCTATTCAACGTGTGATCCACAATGAGCTCGAGCAGTATTGTCGAGCTCGTGCTGGCCGCTGCCTCGAAGTGGGCGCCCATCCACGTTCGATCAATGACAATCCTAATGTGTTGCATCGTTGTTTCCTTAAACCAGTTGGCCGTGATGTTCAGCGGTGGTATACTGCTCCCACCCGCGGCCCTGCAGCAAACTGTCGCCGGTCTGCTCTCCGCGGGCTTCCACCTGTAGATCGTACATACTGCTTTGACGGCTTCTCTGGCTGCACTTTTGCTGCCGAGACAGGTATTGCCCTCTATTCACTGCATGACCTATGGCCCGCTGATGTCGCTGAGGCGATGGCCCGCCATGGAATGACTCGGCTCTATGCAGCCCTCCACCTCCCCCCTGAGGTACTATTACCCCCTGGTACATACCATACTACCTCATATCTTTTAATCCACGATGGGGACCGTGCAGTGATTACATACGAGGGGGACTCCAGTGCAGGATATAACCATGATGTGTCCATTCTGCGGGCATGGATTCGTACCACCAAGGTCACCGGTGACCATCCGCTCGTGATTGAGCGAGTCCGAGCGGTGGGGTGTCACTTTGTGCTTCTCCTCACAGCTGCCCCCGAACCGTCGCCGATGCCCTATGTCCCATACCCACGCTCAACCGAGGTTTATGTCCGGTCTATTTTCGGCCCTGGTGGCTCTCCATCCCTTTTTCCATCTGCCTGCTCTACAAAGTCAACATTTCATGCCGTCCCTGTGCACATATGGGATAGGCTTATGCTTTTTGGTGCAACTCTTGACGACCAAGCCTTCTGTTGCTCCAGGCTCATGACGTACCTCCGTGGCATTAGTTATAAGGTTACGGTGGGTGCCCTCGTTGCCAATGAGGGCTGGAATGCTTCTGAGGATGCGCTGACTGCCGTAATTACTGCGGCCTATCTTACTATCTGCCATCAGAGGTACCTCCGTACGCAGGCCATTTCGAAGGGGATGAAAAGGCTGGAGCTCGAGCATGCGCAGAAGTTTATAACACGCCTTTATAGCTGGTTATTTGAAAAGTCCGGGCGTGACTATATCCCCGGCCGCCAACTGCAGTTCTATGCTCAGTGCCGCCGGTGGCTATCTGCAGGTTTTCACCTCGATCCTCGTGTGCTCGTTTTTGATGAAGCCGCCCCCTGCCGCTGCCGGAATTTCCTGCGCAAAGCCGCCCACAAGTTTTGCTGCTTTATGCGGTGGCTGGGTCAAGACTGCACCTGTTTTCTTCAGCCTATCGAGGGGAGGGTTGGTGAACAAGGTTACGATAATGAGGCATTTGAGGGGTCGGATGTTGACCCTGCTGAGGAGGCCACCGTGAGCATTGCCGGGTCTTATATTGTTACTGGCCGTCAGCTGCAGCCTTTATACCAAGCGCTTGGTATACCATCTGATCTTGCTGCACGTGCCGGTCGGCTTGCCGCTACCGTTGAGGTTTCAGATGCAGAGGGCCGCCTCACCTGTAAGACCATCTTGGGTAATAAAACCTTTACGACGGTATTCACTGATGGCGCTCAGCTGGAGGCCAACGGGCCAGAGCAGTATGTTTTATCATTTGATTTGACTAAGCAGGCTATGGCTGCCGGCCCGCATAGTCTTAGTTACACCCTAACATCAGAAGGCCTTGAGGTGCATATCATTTCCGCTGGGCTCGACTGCAGGGCTGTTTTCCCACCTGGTGTTGCAACCCCCTCAGCTTCTGGGGAGGTGTCTGCTTTTTGTTCAGCTCTTTACAGGTTTAACCGCTGTGTTCAGCGGCATTCCCTTATTGGAGGTTTGTGGTACTATCCTGAGAGTTTAGTTGGCTTGTTCCCACCGTTCTCACCCGGTCATAGCTGGGAGTCTACTAATCCTTTTTGCGGTGAAAGCACTCTTTATACCCGCACATGGTCTGTGTCGGGTTTCTCCAGCTGTTTCTCTCCTTTCGAACCTCGCGCCCTGGAGCCGCCACTCCCCGGTGACATTGATACATCTATAGATACTGATGCCCCGCCACTGGCTCCCCCTGCACAGACTCAGCCCCCAACCCCCAGTCATGTGGCGTCCCCACCAGACTTGGTTGACGGTGGTGCTGGCCTCGGTTTGGCTAGCGCCCTTGTGGTGCCCCCGGCGCCCGTGCAGCCTGTGATCCAGTTCGGGCCCCGTCGACGACTGCTTCATACTTACCCCGACGGCTCGAAAGTGTATGCCGGGTCTCTCTTTGAGTCCGAGTGCACATGGCTGGTTAATGCTTCCAACCCGGGCCACCGTCCCGGCGGTGGCCTCTGCCATGCATTCTACCAGCGGTTCCCAGAGTCCTTCGACCCCGCTGAGTTTATCATGTCCGACGGGCTTGCAGCCTATACCCTGACGCCCCGGCCCATAATCCATGCTGTCGCTCCTGACTATCGGGTTGAACATAACCCTAAGCGACTTGAGGCCGCCTACCGGGAGACGTGTTCCCGTCGCGGGACAGCAGCTTATCCCCTCCTCGGTGCTGGTATATACAAGGTCCCTGTCGGGCTGAGCTTTGATGCCTGGGAACGTAACCATCGACCTGGGGACGAGTTGTATTTGACTGAGCCGGCTATAGCTTGGTTTGAAGCCAACCGGCCCACCCTCCCCGCTCTGACTATTACTGAGGACACGGCGCGCACGGCGAACCTAGCATTAGAGCTAGATGCGGCCACCGAGGTCGGCCGCGCGTGCGCTGGTTGCCGTGTTGAACCTGGTGTAGTTCATTATCAATTTACAGCTGGTGTCCCTGGCTCTGGTAAATCCCGGTCAATCCAACAAGGAGATGTTGACGTAATAGTGGTACCAACTCGTGAGTTACGTAATTCGTGGCGCCGCCGCGGGTTTGCGGCTTACACGCCCCACACCGCAGCTCGCGTTACCCGTGGCCGTAGAGTTGTTATTGACGAGGCCCCTTCACTCCCACCACATCTACTTTTGTTGCATATGCAGCGGGCCTCGTCAGTCCATCTTCTTGGTGACCCTAACCAAATCCCTGCCATTGATTTCGAGCATGCAGGCCTTGTCCCAGCAATCCGGCCTGAGCTGGTCCCAACCAAGTGGTGGCATCTTACCCATAGGTGCCCTGCGGATGTCTGTGAGCTGATCCGTGGTGCATACCCAAAGATCCAAACTGCGAGCCGTGTCCTCCGCTCTTTGTTTTGGGGGGAGCCCCCTGTGGGCCAGAAGCTGGTATTCACCCAAGCAGCCAAGGCTGCAAACCCTGGTGCAATTACAGTCCATGAAGCCCAGGGCGCGACATTCACTGAGACCACGATCATTGCCACGGCGGATGCTCGTGGGCTGATTCAGTCCTCTAGGGCACACGCCATTGTGGCTCTGACTCGTCACACGGAGAAGTGTGTGGTAGTTGACGCCCCAGGGCTCCTCCGTGAGGTGGGTATCTCCGATGCCATTGTCAACAATTTCTTCCTCGCTGGCGGCGAGATTGGTCAGCACCGCCCATCAGTCGTACCTCGTGGTACTATTAGCAGCAACGTTGACACGCTTGATGCATTCCCCCCTTCCTGCCAGTTTAGCGCGTACCATCAGCTGGCCGAGGAGCTTGGCCACCGGCCCGCGCCGATTGCTGCTGTTTTGCCCCCCTGCCCAGAGCTTGAGCAGGGCTTGCTTTATATGCCTCAGGAGTTAACTACATCGGACAGTGTTCTTACGTTTGAACTGACGGACATCGTGCATTGTCGTATGGCAGCACCCAGCCAGCGTAGGGCAGTCCTGTCGACTCTTGTTGGCAGGTATGGCCGCCGTACGAAGCTGTATGAGGCTGCCCATGCAGATGTCCGTGGGTCCTTGAACCATTTTATTCCTGAGCTCAGCCCTATTAATGTCACCACCTGCGAGCTCTATGAGCTTGTAGAGGCTATGGTAGAAAAGGGCCAAGACGGCTCTGCAGTTCTGGAGCTTGACTTATGTAGCCGTGATGTGTCTCGGATAACTTTCTTCCAGAAAGACTGTAATAAATTCACAACCGGTGAGACGATAGCGCATGGTAAAGTCGGGCAGGGCATATCTGCATGGAGCAAAACCTTCTGCGCTTTATTCGGTCCGTGGTTCCGCGCTATTGAAAAGGAGATTTTGGCAGCGCTTGCACCCAATATCTTTTATGGCGATGCTTATGAGGACACAGTTTTGGCCGCTGCCGTTGCAGGCGCCTCTGGCTGTAAGGTCTTTGAGAACGATTTCTCTGAATTTGACAGCACCCAAAATAACTTTTCACTTGGGCTTGAGTGTATAATTATGGAGGAGTGTGGCATGCCGCAATGGATGGTGCGACTGTATCATCTTGTTCGTTCCGCCTGGGTCCTGCAGGCCCCAAAAGAGTCCCTGCGCGGCTTTTGGAAGAAGCACTCTGGTGAGCCTGGTACCCTGCTGTGGAATACCGTCTGGAACATGGCGGTTATAGCGCACTGTTATGAGTTCCGTGACCTTAAAGTTGCGGCATTCAAAGGGGACGACTCTGTTGTGCTTTGCAGCGATTACCGGCAGAGTCGTGATGCGGCTGCCTTAATCGCTGGGTGTGGGTTGAAGCTTAAGGTAGATTTTAGGCCTATTGGGCTGTATGCTGGTGTAGTTGTGGCCCCGGGTCTTGGGACCCTTCCTGATGTTGTCAGGTTTGCTGGGCGGCTCTCAGAGAAGAACTGGGGGCCAGGCCCGGAGAGGATGGAGCAGCTTCGGCTAGCCGTTTGTGATTTTCTGCGAAAGTTAACGAATGTGGCTCAGGTTTGTGTGGATGTCGTTTCGCAGG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| 18,700
|
ON226518.1
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Swine hepatitis E virus
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Zhang,B., Song,X.
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College of Animal & Veterinary Sciences, Southwest Minzu University
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China
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2023-02-07
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SMU/Z1/2022
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Paslahepevirus balayani
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Paslahepevirus
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Hepeviridae
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ssRNA(+)
| 7,218
|
GenBank
| null |
China
|
China
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Sus scrofa
| null |
2022-02
| null | null |
Swine hepatitis E virus isolate SMU/Z1/2022, complete genome
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| 18,701
|
MW365405.1
|
Swine hepatitis E virus
|
Cao,H., Zhang,B.
|
College of Animal & Veterinary Sciences, Southwest Minzu University
|
China
|
2022-04-13
| null |
Paslahepevirus balayani
|
Paslahepevirus
|
Hepeviridae
|
ssRNA(+)
| 7,244
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
|
feces
|
2019-07
| null | null |
Swine hepatitis E virus strain SWU/301/2019, complete genome
|
GCAGACCACGTATGTGGTCGACGCCATGGAGGCCCATCAGTTCATAAAAGCGCCTGGCGTCATAACTGCTATTGAGCAGGCAGCTCTAGCAGCGGCCAATTCTGCCTTGGCGAATGCTGTGGTGGTTCGGCCCTTTCTATCCCGCCAACAGACAGAGATACTAATTAACTTGATGCAACCCCGGCAGCTTGTTTTCCGGCCTGAGGTTCTGTGGAATCACCCCATCCAACGTGTGATCCACAATGAGCTAGAGCAGTACTGTCGAGCTCGTGCTGGCCGCTGCCTCGAAGTGGGTGCCCACCCACGTTCAATTAATGACAACCCTAATGTTTTGCATCGTTGTTTTCTTAAACCTGTCGGCCGTGATGTTCAGCGGTGGTATACCGCCCCCACCCGTGGCCCCGCGGCAAACTGCCGCCGGTCTGCTCTTCGTGGGCTCCCACCTGCTGACCGTACATACTGCTTTGACGGCTTCTCTGGCTGCACTTTTGCGGCCGAGACAGGCATCGCCCTTTACTCACTGCATGATTTGTGGCCCGCTGATGTTGCTGAGGCGATGGCCCGCCATGGGATGACTCGGCTCTATGCGGCCCTCCATCTCCCCCCTGAAGTGCTACTACCCCCTGGCACATACCACACCACTTCATATCTTTTAATTCATGATGGGGACCGTGCAGTGATTACATATGAGGGGGACTCCAGTGCTGGGTATAATCATGATGTGTCTATTTTGCGGGCATGGATCCGTACCACCAAAGTCACCGGTAACCACCCACTGGTGATTGAGCGGGTCCGGGCCGTGGGGTGTCATTTTGTGCTTCTACTTACAGCCGCTCCCGAACCGTCACCGATGCCCTATGTCCCATACCCACGCTCAACTGAGGTTTATGTCCGGTCTATCTTCGGCCCTGGAGGCTCGCCATCTCTCTTTCCATCCGCCTGCTCTACTAAGTCAACATTTCATGCCGTCCCTGTGCATATATGGGATAGGCTTATGCTTTTTGGTGCGACTCTTGACGACCAAGCCTTTTGCTGCTCCAGACTCATGACGTACCTCCGTGGCATTAGTTATAAGGTTACGGTAGGTGCTCTTGTTGCCAATGAGGGCTGGAATGCCTCTGAGGATGCGCTGACTGCCGTAATCACTGCGGCTTATCTTACTATCTGCCATCAGAGGTACCTCCGTACGCAGGCTATTTCGAAGGGGATGAAAAGGTTGGAGCTAGAGCATGCACAGAAATTTATAACACGCCTTTACAGTTGGTTATTCGAAAAGTCTGGGCGTGACTATATCCCCGGCCGCCAACTGCAGTTTTATGCTCAGTGCCGCCGGTGGCTATCTGCAGGTTTCCACCTTGATCCTCGTGTGCTCGTTTTTGATGAGGCCGCCCCCTGCCGCTGTCGGAGCTTTCTGCGCAAAGCCGCCCACAAGTTTTGTTGCTTTATGCGGTGGCTAGGTCAAGACTGCACCTGCTTCCTTCAGCCTATTGAAGGGAGGGTTGGTGAACAAGGTTACGATAATGAGGCATTTGAGGGGTCGGATGTTGACCCTGCTGAGGAGGCCACCGTGAGCATTGCCGGGTCGTACATTGTTACCGGCCGCCAGCTGCAGCCTCTATACCAAGCGCTTGGCATACCATCTGATCTCGCTGCGCGTGCCGGTCGGCTTGCTGCCACCGTTGAAGTCTCAGATGCAGAGGGTCGTCTTACCTGCAAGACTATTTTGGGCAACAAAACTTTTTCAACGGTATTCACTGATGGCGCTCAGCTAGAGGCCAACGGGCCAGAGCAGTACGTTCTATCATTTGACTTGACTAAACAAACTATGGCTGCTGGCCCGCATAGTCTCAGTTACACCCTTACATCTGAAGGTCTTGAAGTGCATATTATTTCTGCTGGGCTCGATTGCAAGGCTGTTTTCCCGCCTGGCGTCGCAACCCCCTCCGCTTCCGGGGAGGTGTCTGCTTTTTGTTCAGCTCTTTACAGGTTTAACCGTTGCATTCAGCGGCATTCTCTTGTTGGAGGCTTGTGGTATTACCCTGAGAGTTTAGTTGGCTTGTTCCCACCGTTCTCACCTGGTCATAGCTGGGAGTCTACTAATCCTTTTTGCGGTGAGAGCACTCTCTATACTCGCACATGGTCTGTGTCGGGTTTTTCCAGCTGTTTCTCTCCCTTCGAACCTCGTACCCCGGAGCTGCCACCCTCTGGTAACATTGATATATCTGTAGATGTTGATACCCCGCCACCGGTTCCCCCTGCACAGACTCAACCCCCAACCTCCGGCCACGTGGCGCTCCCGCTGGATTCGGCTGATGGTGGTGCTAGCCTCGGTTTGACTGGCGTCTCTGTGGCGCCTCCGGCGCCTGCGCAGCCTGTAACCCAACCCGGGCCTCGTCGCCGACTGCTTCACACTTACCCCGACGGCTCGAAGGTGTATGCCGGGTCTCTCTTTGAGTCCGAGTGTACATGGCTGGTCAATGCCTCTAACCCGGGCCACCGTCCCGGCGGTGGCCTCTGCCATGCATTTTTCCAGCGGTTTCCAGAGTCCTTCGACCCCGCTGAGTTTATCATGTCCGACGGGCTTGCAGCCTACACCCTGACGCCCCGGCCCATAATCCATGCCGTCGCTCCTGACTATCGGGTTGAACATAACCCCAAGCGACTTGAGGCAGCTTACCGGGAGACGTGCTCTCGCCGCGGGACAGCAGCTTACCCCCTGCTCGGCGCTGGTATATACAAGGTCCCCGTTGGGCTGAGTTTTGATGCCTGGCAACGTAACCACCGACCCGGGGCCGAGTTGTATTTGACTGAGCCAGCTATAGCCTGGTTTGAAGCCAACCGGCCTACCCTTCCCGCTCTGACTATTACAGAGGACACAGCGCGCACGGCGAACCTAGCATTGGAGCTGGATGCGGCCACTGAGGTCGGCCGGGCGTGTGCTGGCTGTCGTGTTGAACCTGGTGTAGTTCATTATCAGTTCACAGCTGGTGTCCCTGGCTCTGGTAAATCCCGGTCAATCCAACAAGGAGATGTGGACGTAATAGTGGTACCAACCCGTGAGTTACGTAACTCGTGGCGCCGCCGCGGGTTTGCAGCTTACACACCCCATACCGCAGCCCGTGTTACCCGCGGCCGTAGAGTTGTTATTGACGAGGCCCCCTCGCTCCCACCACATTTACTTCTGCTGCATATGCAGCGGGCCTCGTCAGTCCACCTTCTTGGTGACCCTAATCAAATTCCTGCTATTGATTTCGAGCATGCCGGCCTTGTTCCAGCAATCCGGCCCGAGTTGGTTCCAACTAAGTGGTGGCATCTTACCCATAGGTGCCCTGCGGATGTCTGTGAGCTGATTCGTGGTGCATACCCAAAGATCCAAACTGCGAGCCGTGTCCTCCGCTCTTTGTTTTGGGGGGAGCCCCCTGTGGGCCAGAAGCTGGTGTTTACCCAGGCGGCCAAGGCCGCTAACCCCGGTGCAATTACAGTTCATGAAGCCCAGGGCGCAACATTCACCGAGACCACAATCATCGCCACGGCGGATGCCCGTGGGTTGATTCAGTCTTCTAGGGCTCATGCCATTGTGGCCCTAACTCGCCACACGGAGAAGTGTGTGGTAGTTGACGCCCCAGGGCTTCTCCGTGAGGTGGGTATCTCCGATGCTATTGTCAATAATTTCTTCCTTGCTGGCGGCGAAATTGGTCAGCATCGCCCGTCAGTCGTACCCCGTGGTACCATTAGCAGCAACGTTGACACGCTTGATGCATTCCCCCCTTCCTGCCAGTTTAGTGCGTACCATCAGCTGGCCGAAGAGCTTGGTCACCGGCCCGCGCCGATTGCTGCTGTTTTGCCCCCTTGTCCAGAGCTTGAACAGGGCTTGCTTTATATGCCTCAGGAGCTAACTACATCGGACAGTGTTCTCACCTTTGAACTGACGGACATTGTGCATTGCCGTATGGCGGCACCTAGCCAGCGTAAGGCGGTCCTGTCGACTCTTGTCGGCAGGTATGGCCGCCGTACGAAGCTTTATGAGGCTGCACACGCGGATGTCCGCGGATCTCTGAATCATTTTATTCCTGAGCTTGGCCCTATTAATGTTACTACTTGCGAGCTCTATGAGCTTGTGGAGGCTATGGTAGAAAAGGGCCAAGACGGCTCTGCAGTTCTGGAGCTTGACCTATGTAATCGTGATGTGTCCCGGATAACCTTCTTCCAGAAAGACTGCAATAAATTCACAACGGGTGAGACGATTGCGCATGGTAAAGTCGGTCAGGGCATATCTGCATGGAGCAAGACCTTCTGCGCTTTATTTGGCCCGTGGTTCCGCGCTATTGAAAAGGAGATTTTGGCAGCGCTTGCACCCAATATCTTTTATGGTGATGCTTATGAAGACACAGTTTTGGCCGCTGCCGTTGCAGGCGCCTCAGGCTGTAAGGTCTTTGAGAACGACTTTTCTGAATTTGATAGCACCCAAAATAATTTCTCGCTTGGGCTTGAGTGTATAATTATGGAGGAGTGTGGCATGCCACAATGGATGGTGCGACTTTACCATCTTGTCCGCTCCGCCTGGGTCTTGCAGGCCCCAAAAGAGTCCCTGCGCGGCTTCTGGAAGAAGCACTCTGGTGAGCCTGGTACCCTGCTGTGGAATACCGTCTGGAATATGGCGGTTATAGCACACTGTTATGAGTTTCGTGACCTCAAAGTTGCGGCATTTAAGGGGGATGACTCTGTTGTGCTTTGCAGCGATTACCGGCAGAGTCGTAATGCGGCTGCCTTGATTGCTGGGTGTGGGCTGAAGCTTAAGGTGGATTTCAGGCCTATTGGACTGTATGCTGGTGTTGTTGTGGCCCCGGGTCTTGGGACCCTTCCTGATGTTGTTAGGTTCGCTGGACGGCTCTCAGAGAAGAATTGGGGGCCAGGTCCGGAGAGGATGGAGCAGCTTCGGCTGGCCGTTTGTGACTTTTTGCGAAAGCTAACGAATGTGGCTCAGGTCTGTGTGGATGTTG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| 31,315
|
MW365406.1
|
Swine hepatitis E virus
|
Cao,H., Zhang,B.
|
College of Animal & Veterinary Sciences, Southwest Minzu University
|
China
|
2022-04-13
| null |
Paslahepevirus balayani
|
Paslahepevirus
|
Hepeviridae
|
ssRNA(+)
| 7,223
|
GenBank
| null |
China
|
China
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Sus scrofa
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feces
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2020-08
| null | null |
Swine hepatitis E virus strain SWU/A/2020, complete genome
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| 31,316
|
MN614429.1
|
Swine hepatitis E virus
|
Chung,H., Nguyen,V.G., Park,B.K.
|
Research Institute for Veterinary Science, Seoul National University, Department of Veterinary Medicine Virology Laboratory, College of Veterinary Medicine
|
Korea
|
2020-10-31
|
F19
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Paslahepevirus balayani
|
Paslahepevirus
|
Hepeviridae
|
ssRNA(+)
| 7,239
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Sus scrofa
| null |
2019-01-25
| null | null |
Swine hepatitis E virus isolate F19, complete genome
|
ATGCCATGGAGGCCCATCAGTTCATTAAGGCTCCTGGCATTACTACTGCCATTGAGCAGGCTGCTCTGGCTGCGGCTAACTCCGCCTTGGCGAATGCTGTGGTGGTTCGGCCGTTTTTATCTCGTGTACAAACCGAGATTCTTATCAATTTGATGCAACCCCGGCAGTTGGTTTTCCGCCCTGAAGTGCTCTGGAACCATCCTATCCAGCGGGTTATACATAATGAATTAGAACAGTACTGCCGGGCCCGGGCTGGTCGCTGCTTGGAGGTCGGAGCCCACCCGAGATCCATTAATGACAACCCCAATGTCCTGCATCGGTGCTTTCTTCGACCGGTTGGCCGAGATGTCCAGCGCTGGTACTCTGCCCCCACCCGTGGCCCTGCGGCCAATTGTCGCCGCTCCGCGCTGCGTGGTCTCCCTCCTGTTGACCGCACTTACTGTTTTGATGGATTTTCCCGCTGTGCTTTTGCTGCAGAGACCGGTGTGGCCCTCTACTCCTTGCACGACCTCTGGCCAGCTGATGTTGCAGAGGCTATGGCTCGCCACGGGATGACACGCTTGTATGCCGCACTGCATCCTCCTCCCGAGGTGCTGTTACCACCCGGCACCTACCACACAACCTCGTATCTTTTGATTCACGACGGCAATCGTGCTGTTGTAACCTATGAGGGTGATACTAGTGCGGGCTATAATCATGATGTCTCCATACTCCGTGCGTGGATCCGTACTACTAAAATTGTTGGTGACCATCCGTTGGTCATAGAGCGTGTGCGGGCCATTGGATGTCATTTTGTGCTGCTGCTCACCGCTGCCCCTGAACCGTCACCTATGCCTTATGTCCCCTACCCCCGCTCAACGGAGGTGTATGTTCGATCTATATTTGGCCCTGGTGGCTCCCCATCCTTGTTTCCGTCAGCCTGCTCTACTAAATCCACCTTTCATGCTGTCCCGGTTCATATCTGGGATCGGCTCATGCTCTTTGGTGCCACTCTGGACGACCAGGCGTTCTGCTGTTCACGACTTATGACTTACCTCCGTGGTATTAGTTACAAGGTTACTGTTGGTGCGCTTGTTGCTAATGAGCACTGGAACGCCTCTGAGGACGCACTTACCGCAGTGATTACTGCGGCCTATCTGACTATCTGCCACCAGCGTTACCTCCGTACCCAGGCAATATCCAAGGGCATGCGCCGGTTAGAGGTTGAGCACGCCCAGAAATTTATTACAAGACTTTATAGTTGGCTTTTTGAGAAGTCTGGCCGTGATTACATCCCCGGCCGCCAGCTTCAGTTTTATGCACAGTGCCGACGGTGGCTATCTGCGGGCTTTCATCTAGACCCCAGGGTACTTGTCTTTGACGAGTCAGTGCCATGCCGTTGTAGGACATTTTTGAGGAAAGTCGCAGGTAAATTCTGCTGTTTCATGCGGTGGCTTGGGCAGGAGTGTACCTGCTTCCTTGAGCCGGCCGAGGGTTTAGTCGGCGACCAAGGTCATGATAACGAGGCCTATGAGGGTTCTGAGGTCGACCCGGCTGAACCCGCACATTTTGATATTTCGGGGACTTACGCCGTCCACGGGCACCAGCTTGAGGCCCTCTATAGAGCCCTTAATGTCCCACATGATATTGCCGCCCGAGCTTCCCGATTAACGGCAACTGTTGAGCTCGTTGCAAGCCCAGATCGCTTGGAGTGTCGTACCGTGCTTGGCAATAAGATCTTCCGGACGACGGTGGTTGATGGCGCCCATCTTGAGGTGAATGGCCCTGAACAGCATGTTTTATCATTTGATGCCTCCCGCCAGTCTATGGGGGCCGGGTCGCACAGTCTCACTTATGAGCTTACTCCTGCCGGTCTGCAGGTCAGGATTACATCTAATGGTCTGGACTGCACTGCTACGTTCCCCCCCGGCGGCGCCCCTAGCGCCGAGCCAGGAGAGGTGGCAGCTTTCTGCAGTGCCCTTTACAGATATAACAGGTTTACCCAACGGCACTCGCTGACCGGTGGATTATGGCTGCATCCTGAGGGGTTGCTGGGTATCTTCCCCCCTTTCTCCCCTGGGCATGTTTGGGAGTCTGCTAACCCCTTTTGCGGGGAGGGGACCTTGTACACCCGAACCTGGTCAACATCTGGTTTTTCTAGTGACTTCTCCCCCCCTGAGGCGGCTGCTCCTGCTCCTGCTGCTGCCTCGAGGTTGCCCCATCCTACTCCACCTGTGAGTGATATTTGGGTGTTACCACCGCCCTCAGTGGAGTCTCAGGTTGATGCGGCGTCTGTGCCCCCTGTCCCTGAGCCTGCCGGGCTGCCCAGCCCCATTGTAATTCCTCCCCTCCCCCCTCCCCCCCCGGTGCGTAAGCCACCAACGCCCCCGCCTTCCCGCACTCGCCGTCTTCTCTACACCTATCCCGACGGCGCCAAGGTGTATGCGGGGTCGTTGTTTGAGTCAGATTGCACCTGGCTGGTTAATGCTTCAAACCCGGGCCATCGCCCTGGAGGTGACCTTTGGCATGCCTTCTACCAACGCTTCCCAGAAGCGTTTTACCCAACCGAATTCATTATGCGCGAGGGCCTTGCAGCATACACCTTGACCCCGCGCCCTATCATTCATGCAGTGGCTCCCGATTACAGGGTTGAACAGAACCCGAAGAGGCTTGAGGCAGCGTACCGGGAAACCTGCTCCCGTCGTGGCACTGCTGCTTACCCGCTCTTGGGCTCGGGCATATACCAGGTTCCTGTCAGTCTTAGTTTTGATGCTTGGGAGCGTAACCACCGTCCCGGCGATGAGCTTTACCTGACTGAGCCTGCTGCAGCCTGGTTTGAGGCTAATAAGCCGGCGCAGCCGGCGCTCACTATAACTGAGGATACGGCCCGTACGGCCAACCTGGCATTAGAGATCGATGCCGCCACAGATGTTGGCCGTGCTTGCGCCGGCTGCACTGTCAGCCCTGGGGTTGTGCACTATCAGTTTACTGCCGGGGTCCCGGGCTCTGGTAAGTCAAGGTCCATACAACAAGGAGACGTCGATGTGGTGGTTGTACCCACCCGGGAGCTTCGTAATAGCTGGCGCCGCCGAGGTTTTGCAGCTTTTACACCTCACACAGCAGCCCGTGTCACTACTGGCCGCCGCGTTGTGATTGATGAGGCCCCATCCCTCCCACCACACCTGTTGCTGTTACACATGCAGCGGGCCTCCTCGGTCCATCTTCTCGGCGACCCAAACCAAATCCCTGCTATTGATTTTGAGCACGCCGGCCTGGTCCCCGCGATCCGCCCAGAGCTTGCGCCAACGAGCTGGTGGCATGTTACACACCGCTGCCCGGCCGATGTGTGCGAGCTCATACGTGGAGCTTACCCAAAGATTCAGACCACGAGCCGTGTGCTACGGTCCCTGTTTTGGAATGAGCCGGCTATCGGTCAGAAGTTGGTGTTCACGCAGGCTGCTAAGGCTGCCAACCCCGGCGCGATTACGGTACACGAGGCTCAGGGCGCCACTTTCACTGAGACTACAATTATAGCCACGGCTGATGCCAGGGGCCTCATTCAGTCATCCCGGGCCCATGCTATAGTTGCACTTACTCGCCATACCGAGAAGTGTGTTATTCTGGACGCTCCCGGTCTGCTGCGTGAGGTTGGCATTTCGGATGTGATTGTTAACAATTTCTTCCTTGCTGGTGGAGAAGTCGGTCACCACCGCCCTTCTGTGATACCCCGCGGTAACCCTGATCAGAATCTGGGGACTTTACAGGCCTTCCCGCCATCCTGCCAGATTAGCGCTTACCATCAGCTGGCTGAGGAGCTGGGCCACCGCCCGGCTCCTGTCGCCGCCGTCCTGCCCCCTTGCCCTGAGCTTGAGCAGGGCCTGCTTTATATGCCACAAGAGCTCACTGTGTCCGATAGTGTGCTGGTTTTTGAGCTCACGGACATAGTTCACTGTCGTATGGCCGCCCCAAGCCAGCGAAAGGCTGTCCTCTCAACACTTGTGGGTAGGTATGGCCGCAGAACGAAGTTATATGAGGCGGCGCATTCAGATGTTCGCGAGTCCCTAGCCAGGTTCATCCCCACTATTGGGCCTGTCCAGGCCACCACATGTGAGTTATATGAGTTGGTTGAAGCCATGGTGGAGAAGGGCCAAGACGGCTCTGCCGTTCTAGAGCTCGACCTTTGTAACCGTGACGTCTCGCGTATCACATTTTTCCAAAAGGATTGCAACAAGTTTACAACTGGCGAGACTATCGCCCATGGCAAGGTCGGTCAGGGCATATCGGCCTGGAGCAAGACCTTCTGCGCTCTGTTTGGCCCGTGGTTCCGCGCTATTGAAAAAGAAATACTCACCCTGCTCCCGCCCAATATCTTTTATGGCGACGCTTATGAGGAGTCAGTGTTTGCAGCCGCTGTGTCCGGGGCAGGGTCATGTATGGTGTTTGAAAATGACTTTTCTGAGTTTGACAGCACCCAGAATAATTTCTCCCTTGGCCTTGAGTGTGTAGTTATGGAGGAATGCGGCATGCCCCAATGGTTAATTAGGTTGTATCATCTGGTCCGGTCTGCCTGGATCCTGCAGGCGCCGAAGGAGTCTCTCAAAGGTTTCTGGAAGAAGCACTCTGGTGAGCCCGGCACCCTTCTTTGGAACACCGTCTGGAACATGGCGATTATAGCACATTGCTATGAGTTCCGTGACCTTCGTGTAGCTGCCTTCAAGGGCGATGACTCGGTGGTCCTCTGTAGTGACTACCGACAGAGCCGTAATGCAGCTGCCCTAATTGCAGGCTGTGGGCTCAAATTGAAGGTTGATTACCGCCCTATTGGGCTGTATGCTGGGGTGGTGGTGGCCCCTGGTTTGGGGACACTGCCCGATGTGGTCCGCTTTGCTGGCCGGTTGTCTGAGAAGAATTGGGGCCCCGGCCCGGAGCGTGCCGAGCAGCTGCGTCTTGCTGTTTGTGACTTCCTTCGAGGGTTGACGAATGTTGCGCAGGTCTGCGTTGATGTTGTGTCCCGTGTCTAT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| 46,190
|
MN614430.1
|
Swine hepatitis E virus
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Chung,H.C., Nguyen,V.G., Park,B.K., Chung,H.
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Research Institute for Veterinary Science, Seoul National University, Department of Veterinary Medicine Virology Laboratory, College of Veterinary Medicine
|
Korea
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2020-10-31
|
F20
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Paslahepevirus balayani
|
Paslahepevirus
|
Hepeviridae
|
ssRNA(+)
| 7,239
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
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Sus scrofa
| null |
2019-01-25
| null | null |
Swine hepatitis E virus isolate F20, complete genome
|
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| 46,191
|
MK410044.1
|
Swine hepatitis E virus
|
Zhou,K., Zhang,B.
|
College of Life Science and Technology, Southwest Minzu Universty
|
China
|
2019-07-23
| null |
Paslahepevirus balayani
|
Paslahepevirus
|
Hepeviridae
|
ssRNA(+)
| 7,214
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018-03
| null | null |
Swine hepatitis E virus strain SWU/D18/2018, complete genome
|
GCAGACCATCGTATGTGGGGTGACGCCATGGAGGCCCATCAGTTTATAAAGGCTCCTGGCGTCACTACTGCTATTGAGCAGGCAGCTCTAGCAGCGGCCAACTCAGCCTTGGCGAATGCTGTGGTGGTTCGGCCCTTTTTGTCCCGGCTTCAGACAGAGATTCTTATAAATTTGATGCAGCCCCGGCAGCTTGTTTTCCGGCCTGAGGTTTTGTGGAATCACCCAATCCAGCGTGTGATCCATAATGAGCTCGAGCAGTACTGCCGAGCCCGGGCTGGACGCTGTCTTGAGGTGGGTGCCCACCCACGTTCTATTAACGACAACCCTAACGTCCTGCACCGCTGCTTTCTTAAACCTGTCGGCCGCGATGTTCAGCGGTGGTATACCGCTCCTACCCGTGGCCCTGCAGCAAATTGTCGGCGGTCCGCCCTCCGCGGGCTTCCGCCTGTTGACCGGACTTACTGTTTTGATGGCTTTTCAGGTTGCACATTCGCCGCTGAGACGGGGATTGCACTCTATTCACTGCATGACTTGTGGCCCGCCGATGTTGCGGAGGCAATGGCCCGCCATGGCATGACTCGGCTGTATGCAGCCCTTCATCTTCCCCCGGAGGTACTACTCCCCCCAGGCACTTACCATACCACCTCATACCTCCTAATCCATGATGGGGATCGTGCAGTGATTACATATGAGGGGGACTCCAGTGCCGGGTATAATCATGATGTGTCCATCTTACGTGCTTGGATCCGCACGACTAAGGTCACCGGTGACCACCCGCTGGTGATTGAGCGGGTCCGGGCTGTGGGATGTCATTTTGTCCTCCTCCTCACGGCTGCACCTGAACCGTCGCCGATGCCTTACGTTCCATATCCTCGTTCGACCGAGGTTTATGTTCGCTCTATTTTCGGCCCTGGTGGCTCACCATCCCTTTTTCCATCTGCCTGCTCGACCAAGTCAACGTTTCATGCCGTCCCTGTGCATATATGGGACAGGCTTATGCTTTTTGGGGCGACCCTCGATGATCAGGCCTTCTGCTGTTCTCGGCTTATGACATACCTCCGCGGCATTAGTTACAAGGTCACGGTTGGCGCCCTTGTTGCTAATGAAGGTTGGAACGCCTCCGAAGATGCACTGACTGCTGTAATCACTGCAGCCTATTTAACCATTTGTCACCAGAGATACCTCCGTACTCAGGCTATTTCCAAAGGGATGAAGAGGCTGGAGCTTGAGCATGCACAGAAGTTTATAACACGCCTTTATAGTTGGTTATTTGAGAAGTCTGGGCGTGACTATATCCCCGGCCGCCAACTGCAGTTTTATGCTCAGTGTCGCCGGTGGCTGTCCGCCGGCTTCCATCTTGACCCCCGGGTACTCGTATTTGATGAGGCGGCCCCTTGCCGCTGTCGGAGTTTTCTCCGCAAGGCTGCCCACAGGTTTTGCTGTTTCATGCGGTGGCTCGGTCAGGATTGTACTTGTTTTCTTCAGCCCATTGAGGGGAGGGTCGGTGAGCAGGGTTATGACAATGAGGCATTTGAGGGCTCGGATGTTGACCCCGCTGAAGAAGCTGTTGTGAGTATCTCTGGGTCATATATTGTTACCGGCAGCCAGTTGCAGCCCCTCTACCAAGCACTCGGCCTACCCTCCGACCTTGCCGCTCGTGCGAGCCGACTTTCCGCCACGGTTGAGGTTTCTGATGCTGATGGCCGTCTCACCTGTAAGACCACCATGGGTAATAAGACTTTTATAACAGCCTTTACTGATGGTGCCCAACTTGAGGCCAATGGGCCGGAGCAGTATGTTTTGTCGCTTGACCTGGCGAAACAAACCATGGCAGCGGGCCCGCACAGCCTTAGCTATACTTCTGACACTGCGACCCAGACCGTGCATGTGGTCTCGGCTGGGCTTGATTGCAAGGCCGTCTTTCCGTCCGGCGTAGCGCCCCCCCCTGCTGCTGGGGAGGTAACTGCTTTCTGCTCGGCCTTGTACAGGTTTAACCGCTGTGTCCAACGGCACTCCCTTATCGGAGGTCTATGGTACCACCCTGAGGGGCTTGTTGGCCTGTTTCCACCGTTCTCTCCTGGTCATAGCTGGGAGTCTGCTAATCCTTTTTGTGGTGAAAGCACCCTCTACACCCGGACCTGGTCGGTCTCGGGCTTCTCTAGTTGCTTCTCACCACTTGAGCCCTGCGCCCCGAGCGAGTTGCCCCCCGTGGAGGCTAGTGAACCTGTAGTTTTAAAGACCTCACCTTTAGAGTCTGTGGAGCAAGCCCAGCCTCCGGCCCTTGAGCCGGTAGCACCTTTATCTGATTTAGTTGATAATAGTGTTAGCCCTACTCCTCCTAGTGCTCCCACTGTACCCCCGGCGTCGGCGTTGTCTGTAACCCGTCCGTCTGAGCCTCGCCGGCGGTTGCTTCATACCTACCCTGATGGCTCAAAAGTGTATGCCGGCTCTCTTTTTGATTCTGAGTGTACTTGGCTAGTTAATGCTTCCAACCCCGGTCACCGCCCTGGTGGCGGTCTCTGTCATGCCTTTTATCAACGGTTCCCAGAGTCGTTCGACCCCGCCGAGTTTGTCATGTCAGACGGGTTTGCAGCCTACACTCTGACCCCCCGGCCTATTATTCACGCTGTTGCCCCCGACTATCGGGTTGAACATAACCCTAAGCGGCTTGAGGCCGCCTATCGGGAGACATGCTCCCGACGGGGGACGGCTGCCTACCCCTTGCTCGGCGCCGGCATATATAGGGTCCCCGTTGGGTTGAGTTTCGACGCCTGGGAGCGTAACCATCGTCCTGGGGATGAACTGTACCTGACTGAGCCAGCCATAGCCTGGTTTGAGGCTAATCGGCCTACCCTCCCTGCCCTGACTATAACTGAGGATACGGCCCGCACAGCGAACCTGGCGCTCGAGCTGGATGCAGCCACTGAAGTAGGCCGTGCGTGCGCTGGCTGTCGTGTGGAGCCCGGCGTAGTTCACTACCAATTCACGGCGGGTGTCCCCGGCTCTGGTAAGTCCAGGTCGATTCAACAGGGGGATGTAGATGTGATAGTGGTGCCAACCCGTGAGCTGCGTAATTCCTGGCGTCGCCGTGGGTTTGCAGCCTATACACCCCACACGGCGGCCCGTGTGACCCGTGGCCGCAGGGTTGTTATCGATGAGGCCCCTTCACTTCCACCGCATCTGCTCCTGTTGCACATGCAGCGGGCCTCATCTGTTCACCTCCTCGGTGACCCTAACCAAATCCCTGCTATCGATTTTGAGCACGCCGGCCTCGTGCCAGCAATTCGGCCTGAGCTGGTTCCTACAAAGTGGTGGCACCTTACCCATAGATGTCCGGCGGATGTCTGTGAGCTAATTCGCGGCGCATACCCGAAGATTCAGACTGCAAGTCGCGTCCTCCGCTCTTTGTTTTGGGGGGAACCCCCTGTGGGTCAGAAGCTGGTATTTACTCAGGCGGCGAAGGCTGCAAACCCCGGTGCGATCACTGTCCATGAAGCTCAGGGTGCAACATTCACTGAGACTACGATTATTGCCACGGCAGATGCCCGCGGGCTGATCCAGTCTTCTAGAGCCCACGCAATTGTGGCCTTGACTCGCCATACGGAGAAGTGTGTGGTGGTTGATGCACCAGGGCTTCTCCGTGAGGTAGGTATCTCTGATGCTATTGTTAATAACTTTTTCCTTTCTGGCGGTCAGATCGGCCAGCACCGCCCATCGGTTATACCGCGTGGCACTATTGATAATAATGTTGATACACTTGATGCTTTCCCGCCTTCTTGTCAGTTTAGTGCTTACCATCAGCTAGCCGAGGAGCTCGGCCATCGGCCCGCCCCAATTGCAGCTGTTTTGCCCCCTTGCCCGGAGCTCGAGCAGGGCTTACTTTATATGCCTCAGGAACTAACAACATCTGATAGTGTGCTCACTTTTGAGCTCACGGACATAGTGCACTGTCGCATGGCAGCGCCCAGCCAGCGTAAAGCGGTTCTGTCAACCCTTGTTGGCAGGTACGGCCGCCGTACTAAATTGTACGAGGCCGCACACGCAGATGTTCGTGGGTCCCTGAATCACTTTATTCCTGAGCTCGGCCCCATTAATGTTACCACCTGTGAGCTTTATGAGCTCGTGGAGGCTATGGTAGAGAAGGGCCAGGATGGGTCTGCAGTCCTGGAGCTTGATTTGTGCAGACCTGATGTGTCTCGGATAACATTCTTCCAGAAGGATTGTAATAAGTTTACAACAGGTGAAACGATAGCACATGGTAAAGTCGGGCAGGGGATATCTGCATGGAGCAAGACCTTCTGTGCTCTGTTTGGCCCATGGTTCCGCGCTATTGAGAAAGAAATTCTGGCAGCGCTTGCACCTAACGTCTTCTACGGCGACGCATATGAGGATACAGTTCTGGCCGCTGCTGTCGCCGGTGCCCCTGGCTGCAAGGTCTTTGAGAGCGATTTCTCTGAGTTTGATAGCACTCAAAACAACTTTTCACTCGGGTTAGAGTGTATAATTATGGAGGAGTGCGGCATGCCGCACTGGATGATCCGGCTCTATCACCTCGTTCGTTCCGCCTGGGTTTTGCAGGCTCTGAAGGAATCTCTGCGAGGGTTCTGGAAGAAACACTCCGGTGAACCCGGCACTCTATTGTGGAACACCGTTTGGAACACGGCTGTCATAGCACACTGTTATGAGATCCGCGACCTCAAAGTGGCGGCACTTAAAGGGGAGGATTCTGTTGTATTTTGTAGCGATAATCGGCAGAGCCGCGACGCTGCTGCCCTGATTGCTGGTTGTGGGGGGAAGCTTAAAGTGGACATTAGGCCCATTGGGTTGTATGCTGGGGTGGGTGTGGCCCCACGCCCCGGGAGATTGCCCGATGTTGTTAGGTTTGCTGGCCGGCTCTCGGGGAAGAGAAGGGGGCCGGGCCCCGAGAGGGGGGAGCACATCCGAGTGGCCGTTTGTGAGTTTTTGCGAAAGTTAACGAATGTGGCTCAGGTGTGTGTGGA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| 61,636
|
MK410045.1
|
Swine hepatitis E virus
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Zhou,K., Zhang,B.
|
College of Life Science and Technology, Southwest Minzu Universty
|
China
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2019-07-23
| null |
Paslahepevirus balayani
|
Paslahepevirus
|
Hepeviridae
|
ssRNA(+)
| 7,261
|
GenBank
| null |
China
|
China
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Sus scrofa
| null |
2018-03
| null | null |
Swine hepatitis E virus strain SWU/E4/2018, complete genome
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| 61,637
|
MK410046.1
|
Swine hepatitis E virus
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Zhou,K., Zhang,B.
|
College of Life Science and Technology, Southwest Minzu Universty
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China
|
2019-07-23
| null |
Paslahepevirus balayani
|
Paslahepevirus
|
Hepeviridae
|
ssRNA(+)
| 7,208
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018-04
| null | null |
Swine hepatitis E virus strain SWU/31-12/2018, complete genome
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GCAGACCACGTATGTGGTCGACGCCATGGAGGCCCACCAGTTCATAAAGGCTCCTGGCGTCACTACTGCTATTGAGCAGGCAGCTCTAGCAGCGGCCAACTCTGCCTTGGCGAATGCTGTGGTGGTTCGGCCCTTTTTATCCCGCCAACAGACAGAGATACTAATTAACTTGATGCAACCCCGGCAGCTTGTTTTCCGGCCTGAGGTTCTGTGGAATCACCCCATCCAACGTGTGATCCACAATGAGCTAGAGCAGTACTGTCGAGCTCGTGCTGGCCGCTGCCTCGAAGTGGGTGCCCACCCACGTTCAATTAATGACAACCCTAATGTTTTGCATCGTTGTTTTCTTAAACCTGTCGGCCGTGATGTTCAGCGGTGGTATACCGCCCCCACCCGTGGCCCCGCGGCAAACTGCCGCCGGTCTGCTCTTCGTGGGCTCCCACCTGCTGACCGTACATACTGCTTTGACGGCTTCTCTGGCTGCACTTTTGCGGCCGAGACAGGCATCGCCCTTTACTCACTGCATGATTTGTGGCCCGCTGATGTTGCTGAGGCGATGGCCCGCCATGGGATGACTCGGCTCTATGCGGCCCTCCATCTCCCCCCTGAAGTGCTACTACCCCCTGGCACATACCACACCACTTCATATCTTTTAATTCATGATGGGGACCGTGCAGTGATTACATATGAGGGGGATTCCAGTGCGGGGTATAATCATGATGTGTCTATTTTGCGGGCGTGGATCCGTACCACCAAGGTCACCGGTGACCACCCGCTGGTGATTGAGCGGGTCCGGGCGGTGGGGTGCCACTTTGTGCTCCTCCTTACCGCCGCTCCTGAACCATCGCCGATGCCCTATGTTCCATATCCACGTTCGACCGAGGTTTATGTCCGGTCTATCTTCGGCCCTGGAGGCTCGCCATCTCTTTTTCCATCTGCCTGCTCTACTAAGTCAACATTTCATGCCGTCCCTGTGCATATATGGGATAGGCTTATGCTTTTTGGCGCGACTCTTGATGACCAAGCCTTTTGCTGTTCTAGACTTATGACGTATCTCCGTGGCATTAGTTATAAGGTCACGGTGGGTGCTCTTGTTGCCAATGAGGGGTGGAACGCCTCTGAGGATGCGCTGACTGCCGTAATTACTGCAGCTTATCTTACTATTTGCCATCAGAGGTATCTCCGCACGCAGGCTATCTCTAAGGGGATGAAAAGGTTGGAGCTCGAGCACGCACAGAAGTTTATAACACGCCTCTATAGTTGGTTATTTGAGAAGTCCGGGCGTGACTATATCCCCGGCCGCCAGCTGCAGTTTTATGCTCAGTGCCGCCGGTGGCTATCTGCTGATTTCATCTTGATCCCTCGTGTGCTCGTTTTTGATGAAGCCGCTCCCTGCTCCTGTCGGAGCTTTCTCCGCAAAACCGCTCACAAGTTCTGTTGCTTTATGCGGTGGCTGGGTCAAGATTGCACTTGTTTTCTTCAGCCCATTGAGGGGAGGGTCGGCGAGCAAGGTTATGATAATGAGGCGTTTGAGGGGTCAGATATTGACCCTGCTGAAGAAGCCACCGTGAGCATTTCCGGGTCATACATCGTCACCGGCCGTCAACTGCAGCCGTTATACCAAGCACTTGGCTTACCATCAGATCTTGCCGCGCGTGCCGGCCGGCTCGCCGCTACCGTTGAAGTTTCAGATGCAGACGGTCGCCTCACTTGCAAGACCATTTTGGGTAATAAAACCTTTTCATCGGTATTCACTGATGGTGCCCAACTGGAGGCCAACGGGCCAGAGCAGTACGTTCTATCATTTGATTTGACTAAACAAACCATGGCTGCTGGCTCGCATAGTCTCAGCTACACCTTAACATCTGCGGGTCTTGGAGTGCATATTATTTCTGCTGGGCTCGATTGCAAGGCTGTTTTCCCGCCTGGCGTCGCAACCCCCTCCGCTTCCGGGGAGGTGTCTGCTTTTTGTTCAGCTCTTTACAGGTTTAACCGTTGCATTCAGCGGCATTCTCTTGTTGGAGGCTTGTGGTATTACCCTGAGAGTTTAGTTGGCTTGTCCCCACCGTTCTCACCTGGTCATAGCTGGGAGTCTACTAATCCTTTTTGCGGTGAGAGCACTCTCTATACTCGCACATGGTCTGTGTCGGGTTTTTCCAGCTGTTTCTCTCCCTTCGAACCTCGTACCCCGGAGCTGCCACCCTCTGGTAACATTGATATATCTGTAGATGTTGATACCCCGCCACCGGTTCCCCCTGCACAGACTCAGCCCCCAGCCTCCGGCCACGTGGCGCTCCCGCTGGATTCGGCTGATGGTGGTGCTAGCCTCGGTTTGACTGGCGTCTCTGTGGCGCCTCCGGCGCCTGCGCAGCGTGTAACCCAGCCCGGGCCTCGTCGCCGACTGCTTCACACTTACCCCGACGGCTCGAAGGTGTATGCCGGGTCTCTCTTTGAGTCCGAGTGTACATGGCTGGTCAATGCCTCTAACCCGGGCCACCGTCCCGGCGGTGGCCTCTGCCATGCATTTTTCCAGCGGTTTCCAGAGTCCTTCGACCCCGCTGAGTTTATCATGTCCGACGGGCTTGCAGCCTACACCCTGACGCCCCGGCCCATAATCCATGCTGTCGCTCCTGACTATCGGGTTGAACATAACCCCAAGCGACTTGAGGCAGCTTACCGGGAGACGTGCTCTCGCCGCGGGACAGCAGCTTACCCCCTGCTCGGCGCTGGTATATACAAGGTCCCCGTTGGGCTGAGTTTTGATGCCTGGGAACGTAACCCCCGACCCGGGGACGAGTTGTATTTGACTGAGCCAGCTATAGCCTGGTTTGAGGCCAACCGGCCTACTCTCCCTGCTTTGACTATCACTGAGGATACGGCGCGCACGGCCAACCTAGCCTTGGAATTGGATGCGGCCACTGAGGTTGGCCGCGCGTGTGCTGGCTGTCGTGTTGAACCCGGTGTGATCCATTATCAGTTCACAGCTGGCGTCCCTGGTTCCGGTAAATCCCGGTCAATCCAACAAGGTGATGTGGACGTTATAGTGGTACCAACCCGTGAGCTACGCAATTCATGGCGCCGCCGTGGGTTCGCAGCCTACACACCCCATACTGCAGCTCGGGTTACTCGTGGCCGTAGGGTTGTTATTGATGAGGCCCCCTCGCTTCCACCGCACTTACTCCTGCTGCATATGCAGCGGGCCTCGTCAGTCCATCTCCTTGGTGACCCTAATCAAATTCCCGCCATCGACTTTGAACATGCCGGTCTCGTCCCAGCAATCCGGCCTGAGTTGGTCCCAACTAAATGGTGGCACCTTACTCATAGGTGCCCTGCGGATGTCTGTGAGTTGATCCGTGGTGCATACCCAAAGATCCAAACTGCAAGCCGTGTCCTCCGCTCTCTGTTTTGGGGGGAGCCCCCTGTGGGCCAGAAGCTGGTATTTACTCAGGCGGCCAAGGCAGCTAACCCGGGTGCAATTACAGTCCATGAAGCACAGGGCGCGACATTCACCGAGACCACAATCATCGCTACGGCGGATGCTCGCGGGCTGATCCAGTCCTCTAGGGCTCATGCCATTGTGGCCCTGACTCGTCACACGGAGAAGTGCGTGGTGGTTGATGCCCCGGGGCTTCTCCGTGAGGTAGGCATCTCTGATGCTATCGTTAATAATTTCTTCCTCTCTGGCGGTGAGATTGGCCAACATCGCCCGTCAGCTGTACCCCGTGGCACTATTAGCAGCAATGTCGACACGCTTGATGCATTCCCCCCCTCCTGCCAGTTTAGCGCGTACCACCAGCTGGCCGAAGAGCTCGGCCACCGACCCGCGCCGATTGCTGCTGTCTTGCCCCCTTGCCCGGAGCTTGAACAGGGTTTGCTTTATATGCCTCAGGAGTTGACTACATCGGACAGTGTTCTCACCTTTGAATTAACGGACATTGTACACTGCCGTATGGCGGCGCCTAGTCAACGTAAAGCGGTTCTGTCGACCCTTGTCGGCAGGTATGGCCGCCGCACGAAGCTGTACGAGGCCGCCCATGCAGACGTCCGCGGGTCTTTGAATCATTTCATTCCTGAGCTCGGCCCAATTAATGTTACCACCTGCGAGCTCTATGAGCTTGTAGAGGCCATGGTGGAGAAGGGCCAGGATGGCTCTGCAGTCCTAGAGCTCGACCTATGTAATCGTGATGTGTCCCGAATAACCTTCTTCCAGAGAGAGATTACAAATTCACACACAGGTGAAACGATAGCGCATGGCAAAGTCGGGCAGGGTATATCTGCGTGGAGTAAAACCTTCTGTGCCTTATTCGGCCCGTGGTTCCGCGCTATCGAGAAGGAGATTCTAGCAGCGCTTGCACCTAATATCTTTTATGGTGATGCTTATGAGGATACAGTCCTGGCCGCTGCTGTTGCAGGCGCCCCTGGCTGTAAGGTTTTTGAGAACGACTTCTCTGAGTTTGACAGCACTCAAAATAACTTTTCACTTGGGCTCGAGTGTATAATTATGGAGGAGTGCGGTATGCCGCACTGGATGGTGCGACTTTACCACCTTGTTCGCTCTGCCTGGGTCTTGCAGGCTCCAAAAGAGTCCCTGCGCGGGTTCTGGAAGAAGCACTCTGGCGAGCCCGGCACCCCGCTGTGGAATACCGTTTGGAACACGGCGGGTATAGCGCACTGTTATGAGTTCCGTGACCTCAAAGAGGCGGCACATAAAGGGAGAGAGTCTGTTGTGCTTTGTAGCGATTACCGGCAGAGTGGCAATGCGGGTGCCTTAATCGCTGGATGTGGGGGGAAGAGTAAGGTGGATATTAGGCCTATTGGGCTGTATGCTGGGGTGGTTGTGGCCCCGGGTCTCGGTACCCCCCCCGAGGTCGTTAGGTTTGCCGGGCGGCTTTCAGAAAAGAAAAGGGGGCCGGGCCCCGAGAGGGGTGAGCACATCCACCTGGCCCTCTGTGATTTCTTGCGAAAGATGACGAAGTGGGCTCACGTTTGTGTGGATGTGG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| 61,638
|
MK410047.1
|
Swine hepatitis E virus
|
Zhou,K., Zhang,B.
|
College of Life Science and Technology, Southwest Minzu Universty
|
China
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2019-07-23
| null |
Paslahepevirus balayani
|
Paslahepevirus
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Hepeviridae
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ssRNA(+)
| 7,240
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GenBank
| null |
China
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China
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Sus scrofa
| null |
2018-07
| null | null |
Swine hepatitis E virus strain SWU/ZX8/2018, complete genome
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TTTCGCAGGTCTATGGTGTTAGCCCCGGCTTGGTACATAACCTGATAGGAATGCTTCAAACCATTGCGAATGGCAAGGCGCACTTTCACTCGACGATCAAGCCCGTCCCTCCCTTACCAAACTCTATAGTATATCGGGTGGAATGAATAACATGTTCTTTTGCTCTCTGCATGGCGATGCCACCATGCGCTCTCGGGCTCTTCTGTTTTTGCTCCTCCTGTTTTTGCCTATGCTGCCCGCGCCACCGGCCGGTCAGCCGTCTGGCCGTCGTCGTGGGCGGCGCAGCGGCGGTGCCGGCGGTGGTTTCTGGGGTGACCGGGTTGATTCTCAGCCCTTCGCCCTCCCCTATATTCATCCAACCAACCCCTTCGCATCTGACATTTCAGCCACCGCCGGGGCTGGAGCTCGCCCTCGGCAGCCAGCCCGCCCACTCGGCTCCGCTTGGCGTGACCAATCCCAGCGCCCCGCCGCTCCCGCCCGTCGTCGATCTACCCCAGCTGGGGCTTCGCCGCTGACGGCTGTAGCTCCGGCTCCTGACACTGCTCCGGTCCCCGATGTTGACTCGCGTGGCGCTATATTTCGCCGTCAGTATAATTTGTCCACGTCCCCACTTACATCTACCATTGCCACTGGGACTAATCTTGTGCTAATATCTGCCCCTCTTAGCCCTCTACTCCCACTTCAGGATGGCACCAACACTCATATTATGGCTACTGAGGCTTCAAATTATGCCCAGTATCGTGTTGTCCGTGCCACCATTCGGTATCGTCCTTTGGTGCCGAATGCTGTCGGAGGGTATGCTATATCTATTTCTTTTTGGCCCCAAACAACTACCACCCCGACGTCCGTGGATATGAACTCCATCACTTCCACTGATGTGCGCATCCTCGTCCAACCCGGTATAGCCTCCGAGTTGGTGATTCCCAGTGAGCGCTTGCATTATCGCAACCAGGGTTGGCGCTCAGTTGAGACCTCCGGCGTTGCTGAGGAGGAGGCTACTTCCGGTCTTGTTATGCTTTGTATACATGGGTCACCTGTGAATTCCTACACTAATACACCTTACACTGGCGCCCTCGGCTTGCTCGATTTTGCGCTCGAGCTTGAGTTTCGCAATTTGACACCTGGCAATACAAACACGCGCGTCTCTCGTTATTCGAGTAGTGCGCGCCATAAATTGCGCCGAGGGGCCGATGGCACTGCTGAGTTAACTACTACTGCTGCCACACGGTTTATGAAGGATCTTCATTTTACAGGGACTAATGGCGTTGGTGAGGTTGGTCGTGGGATAGCGCTTACCTTGTTTAACCTTGCTGACACACTTCTCGGCGGGCTCCCGACAGAATTGATTTCGTCAGCTGGTGGCCAGTTGTTTTATTCCCGCCCCGTCGTCTCAGCCAATGGCGAGCCGACAGTGAAACTTTACACCTCAGTCGAGAATGCTCAGCAGGATAAGGGGATCGCTATCCCGCATGATATAGACCTTGGTGAGTCCCGAGTTGTTATTCAAGATTATGATAACCAACATGAGCAAGACCGCCCTACTCCCTCTCCTGCCCCTTCCCGTCCTTTTTCTGTGCTTCGTGCTAATGATGTACTTTGGCTTTCACTTACGGCTGCTGAGTATGATCAGACTACCTATGGCTCTTCTACTAACCCTATGTATGTTTCTGATACTGTAACGTTCGTCAATGTGGCTACCGGTGTTCAGGGGGTTTCGCGCTCCTTGGACTGGTCTAAGGTCACCCTTGATGGGCGCCCGCTAACTACTATTCAGCAGTATTCCAAGACTTTCTATGTTCTGCCCCTCCGTGGTAAGCTCTCTTTTTGGGAGGCGGGTACCACTAAGGCTGGCTATCCTTATAATTATAACACTACTGCTAGTGATCAGATCTTGATTGAGAATGCGGCAGGCCATCGGGTTTGCATTTCTACCTATACTACCAATTTGGGCTCTGGGCCTGTTTCTATCTCCGCTGTTGGTGTCCTCGCACCTCATTCTGCATTGGCTGCTTTAGAGGACACTGTTGATTATCCTGCCCGCGCTCACACTTTTGATGATTTCTGCCCTGAGTGCCGTGCGCTTGGTCTTCAGGGTTGTGCTTTTCAGTCAACTGTAGCTGAATTGCAGCGTCTTAAAATGAAGGTGGGTAAAACCCGGGAGTATTGATTTATTTTGCCTGTGCCTTCCTTCTGTTTCTTTCTTTTTATTCCTTTTTTCTGCGTTCCGCGCTCCCTGGAAA
| 61,639
|
MK410048.1
|
Swine hepatitis E virus
|
Zhou,K., Zhang,B.
|
College of Life Science and Technology, Southwest Minzu Universty
|
China
|
2019-07-23
| null |
Paslahepevirus balayani
|
Paslahepevirus
|
Hepeviridae
|
ssRNA(+)
| 7,205
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018-05
| null | null |
Swine hepatitis E virus strain SWU/42-5/2018, complete genome
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GCAGACCACGTATGGTCGACGCCATGGAGGCCCATCAGTTCATAAAGGCTCCTGGCGTCACTACTGCTATTGAGCAGGCAGCTCTAGCAGCGGCTAACTCCGCCTTGGCGAATGCTGTGGTGGTTCGGCCTTTTTTATCCCGGCTACAGACAGAAATTTTAATAAATTTGATGCAGCCACGGCAGCTTGTCTTCCGGCCCGAGGTTTTGTGGAACCACCCGATTCAGCGTGTGATCCACAATGAGCTCGAACAATACTGCCGAGCCCGAGCCGGCCGTTGCCTTGAAGTGGGTGCCCACCCACGTTCCATTAATGACAATCCCAATGTCTTGCACCGCTGCTTCTTGAAACCTGTTGGCCGCGATGTTCAGCGGTGGTATACAGCCCCCACCCGTGGCCCTGCAGCGAACTGCCGCCGGTCGGCCCTTCGTGGGCTCCCACCTGTTGACCGGACTTACTGCTTTGATGGTTTTTCCGGCTGTACATTTGCTGCTGAGACCGGGGTTGCTCTTTACTCCCTGCACGATCTCTGGCCTGCCGATGTCGCTGAGGCCATGGCCCGCCACGGCATGACTCGGCTGTATGCAGCTCTTCACCTCCCCCCGGAGGTGTTACTTCCCCCTGGTACTTACCATACTACCTCGTACCTCCTGATTCATGATGGGGACCGTGCTGTGATCACATATGAGGGGGACTCTAGTGCCGGGTATAATCATGATGTGTCTATCCTGCGTGCCTGGATCCGGACTACCAAAGTTACCGGTGATCATCCGCTGGTGATAGAGCGGGTCCGGGCAGTGGGGTGTCATTTTGTACTTCTCCTTACGGCCGCACCTGAGCCGTCACCAATGCCCTATGTCCCATACCCTCGCTCCACTGAGGTCTATGTCCGGTCCATTTTCGGCCCTGGCGGCTCGCCCTCTCTTTTTCCGTCTGCCTGCTCGACTAAGTCTACATTCCATGCCGTCCCTGTACACATCTGGGACAGGCTTATGCTTTTTGGTGCAACTCTTGACGACCAGGCCTTCTGCTGCTCGAGACTTATGACGTACCTCCGTGGTATTAGTTATAAGGTCACGGTCGGTGCCCTCGTCGCTAACGAGGGCTGGAATGCCTCAGAAGATGCACTGACAGCCGTGATTACCGCTGCTTACCTCACTATCTGCCACCAGAGGTATCTTCGCACCCAGGCCATCTCTAAGGGGATGAAGAGGTTAGAACTCGAGCATGCACAGAAGTTTATAACACGCCTCTATAGCTGGCTATTTGAGAAGTCCGGCCGTGACTACATCCCTGGCCGTCAATTGCAGTTTTATGCTCAGTGCCGTCGGTGGCTGTCTGCCGGTTTCCATCTTGACCCTCGTGTGCTCGTTTTTGATGAGGCAGCCCCTTGTCGCTGCCGCAGCTTCCTCCGCAGGGCAGCTCACAAGTTCTGCTGCTTCATGCGGTGGTTAGGTCAAGAGTGCACCTGTTTTCTTCAACCTATTGAGGGGAGGGTTGGTGAGCAGGGTTATGATAATGAGGCATTTGAGGGATCGGATGTTGACCCTGCCGAAGAGGCCATCGTTAGTATCTCTGGGTCATATATTGTCACCGGCAGTCAGTTACAACCCCTTTACCAGGCGCTCGGTATTCCTTCCGATCTTGCTGCTCGGGCTGCCCGGCTCACTGCTACTGTTGAAGTCTCAGACGTAGATGGCCGTCTGACTTGTAAGACTATTATAGGTAATAAAACTTTTTCAACAGTTTTCACCGACGGTGCCCAGTTAGAGGTTAACGGACCTGAGCAGTATGTGTTATCATTTGACCCAGCCAAACAAACTATGGCCGCCGGCCCACATAGCCTCAGTTATGTTCTAACGCCTGCAGGCCTCGAGGTACATGTTGTCTCTGCCGGGCTTGACTGTAAGGCCGTCTTTCCACCTGGGGTTGCGACCCCCTCCGCTCCCGGAGAGGTGTCTGCCTTTCTTTCAGCCTTATACAGGTTTAACCGCTGTGTTCAGCGGCACTCTCTCATCGGGGGCTTGTGGTATTATCCTGAAGGGCTGGTTGGCCTGTTTCCTCCTTTTTGCCCTGGCCATAGCTGGGAGTCAGCCAACCCCTTCTGTGGGGAGAGTACCCTTTACACCCGTACCTGGTCGGTGTCGGGCTTCTCCAGTTGTTTCTCCCCGCTTGAACCTTGTGCTCCGGACACACCATCTTTTGTTGAGACTAATACACCTGTGGTAGCTAATACCCCACCCCTAGCTGCTCCGGTGCGACCACATCCCCCGGCACCCGAACGGGTGGTGCCCATGCCGGATTTGGTTGATAAAGCCGGTCCGGCTCCACCTGGCGCCTCTAAGACGCCTCCAGCGCCAGTGCAGCCTGCAGCCCCTCCTCCCGGGCCCCGTCGGCGGTTGCTCCATACTTACCCTGACGGTTCTAAGGTGTATGCCGGCTCTTTATTTGAGTCTGAGTGTACTTGGTTGGTGAATGCGTCTAATCCTGGCCACCGTCCCGGCGGTGGCCTCTGTCATGCATTCTACCAGCGGTTTCCAGAGTCATTTGACCCCGCCGAGTTTGTCATGTCTGACGGGCTTGCGGCTTACACTCTGACCCCCCGGCCTATCATCCATGCTGTTGCCCCTGATTATCGGGTCGAACATAACCCCAAGAGGCTTGAGGCCGCTTATCGGGAGACCTGTTCCCGCCGCGGGACGGCTGCCTATCCTTTGCTCGGCGCTGGTATATATAAGGTGCCTGTTGGGTTGAGTTTTGACGCTTGGGAGCGTAATCACCGACCCGGGGATGAGCTGTATCTTACCGAGCCAGCGATTGCCTGGTTCGAGGCTAATCGGCCCACTCTTCCTGCTCTCACTATTACTGAGGATACAGCACGTACCGCGAATTTGGCACTAGAGCTGGACTCGGCCACTGAGGTTGGTCGTGCGTGTGCCGGCTGCCGCGTTGAGCCCGGTGTGGTCCATTATCAGTTTACAGCGGGAGTCCCTGGCTCCGGCAAGTCTCGTTCGATCCAGCAGGGCGAGGTTGACGTTGTGGTGGTGCCGACCCGTGAGCTGCGCAACTCATGGCGTCGTCGCGGATTTGCAGCTTATACACCTCACACTGCGGCCCGCGTCACCCGTGGCCGCAGGGTTGTCATTGATGAGGCCCCGTCCCTCCCTCCACATCTGCTCCTGCTGCATATGCAGAGGGCCGCTTCAGTCCATCTCCTTGGCGACCCTAATCAAATTCCAGCTATTGATTTTGAACATGCAGGCCTTGTTCCGGCGATTCGACCTGAGCTTGTCCCAACAAAGTGGTGGCATTTGACTCACAGATGTCCGGCAGATGTCTGTGAGTTGATTCGCGGTGCGTACCCAAAGATTCAGACTGCAAGCCGTGTCCTCCGCTCTCTGTTCTGGGGAGAGCCCCCTGTTGGCCAAAAGTTGGTATTTACCCAGGCGGCGAAGGCCGCCAACCCTGGCGCGATAACAGTCCATGAGGCCCAGGGTGCAACGTTTACTGAGACCACGATCATCGCCACGGCAGATGCCCGCGGGTTGATTCAATCCTCTAGGGCCCATGCAATTGTAGCCCTCACCCGCCACACGGAGAAGTGTGTGGTTGTTGACGCCCCGGGGCTTCTTCGTGAGGTTGGAATTTCTGATGCTATTGTTAATAACTTCTATCTCTCTGGTGGTCAGATCGGCCAGCACCGCCCGTCGGTTATTCCGCGTGGCACTGTTGACAACAATGTTGACACGCTTGATGCGTTCCCGCCTTCCTGTCAGTTCAGCGCTTACCACCAGCTTGCTGAGGAACTTGGCCATCGACCGGCCCCCGTTGCTGCTATTCTGCCCCCTTGTCCGGAGCTTGAGCAGGGCTTGCTCTATATGCCTCAAGAGTTAACTACATCTGATAGTGTGCTTGTCTTTGAGCTTACGGATATAGTACATTGTCGTATGGCGGCACCTAGCCAGCGTAAGGCGGTCCTGTCGACTCTCGTTGGCAGGTACGGCCGTCGCACAAAGCTGTATGAGGCTGCTCACGCAGATGTCCGTGAGTCTTTGAACCGTTTTATCCCTGAGCTCGGCCCTATTAGTGTCACCACCTGCGAGCTCTATGAGCTTGTGGAAGCTATGGTGGAGAAGGGTCAGGACGGCTCTGCAGTCTTGGAGCTGGACCTCTGCAGCCGCGATGTGTCCCGGATAACGTTTTTCCAGAAAGATTGCAACAAGTTTACAACAGGTGAGACAATAGCACACGGCAAAGTAGGGCAAGGGATATCTGCATGGAGTAAAACTTTTTGTGCTCTGTTTGGCCCCTGGTTTCGCGCCATTGAGAAGGAAATTTTGGCGGCGCTTGCGCCTAATGTGTTCTACGGTGACGCATACGAAGATACAGTTTTGGCCGCCGCTGTAGCCGGAACCCCTGGTAGTAAGGTTTTTGAAAATGATTTCTCCGAGTTTGACAGCACCCAGAATAATTTTTCACTTGGATTGGAGTGTGTGATCATGGAGGAGTGTGGCATGCCGCAGTGGATGATCCGCCTTTACCACCTCGTCCGTTCCGCTTGGGTCCTTCAGGCCCCGAAGGAGTCTTTGCGGGGGTTCTGGAAAAAACATTCTGGTGAGCCAGGCACTTTGTTGTGGAATACTGTCTGGAACATGGCCGTCATAGCACATTGCTATGAGTTCCGCGACTTTAAGGTTGCGGCGTTTAAAGGAGATGATTCTGTTGTGCTCTGCAGTGATTATCGGCAGAGCCGCAACGCAGCCGCCCTGATTGCCGGCTGTGGTTTGAAGCTTAAGGTGGATTTTAGGCCTATTGGGCTGTATGCTGGTGTCGTTGTGGCTCCGGGTCTCGGGACCCTCCCTGATGTTGTTAGGTTTGCTGGGCGGCTCACTGAGAAGAATTGGGGGCCTGCCCCGGAGAGGGCGGAGCAGCTACGGCTGGCTGTCTGTGATTTTCTGCGAAAGTTAACGAATGTGGCTCAGGTTTGTGTGGATGTTGTTTCTCAGGTTTATGGTGTTAGTCCTGGTTTGGTACATAACCTGATAGGGATGCTTCAGACCATTGCCGATGGCAAGGCGCACTTTACTGAGACAATTAAACCTGTCCTTGACCTTACCAATTCTATTATACACCGGGTGGAATGAATGAATAACATGTGCTCTTGCTCTGTGCATGGGGATGCCACCATGCGCTCTCGGGCTCTTCTGTTTTTGCTCTTCGTGCTTTTGCCTATGCTGCCCGCGCCACCGGCCGGTCAGCCGTCTGGCCGTCGCCGCGGGCGGCGCAGCGGCAGTGCCGGCGGTGGTTTCTGGGGTGACCGGGTTGATTCTCAGCCCTTCGCCATCCCCTATATTCATCCAACCAACCCCTTCGCATCTGATATATCAACCACAGCCGGGGCTGGAGCTCGCCCTCGGCAGCCAGTCCGTCCACTCGGCTCCGCTTGGCGCGACCAATCCCAGCGCCCCCCCGCTCCCGCCCGTCGTCGATCTGCCCCAACTGGGGCTTCGCCGTTGACGGCTGTGGCCCCAGCCCCTGATACAGCCCCAGTTCCAGATATTGACTCTCGCGGTGCGATATTGCGCCGCCAGTATAATCTCTCCACGTCCCCGCTTACATCTACTATTGCTACTGGTACTAATCTTGTGCTTTATGCTGCCCCATTGAGCCCCCTGCTTCCGCTCCAGGATGGGACTAATACCCATATTATGGCCACTGAGGCATCTAATTATGCTCAGTATCGCGTTGTCCGTGCCACTATTCGGTACCGTCCTCTGGTGCCGAACGCTGTTGGTGGGTATGCTATATCTATTTCTTTTTGGCCTCAGACAACAACCACCCCTACGTCTGTTGATATGAATTCTATCACCTCCACTGATGTTCGAATCCTTGTCCAGCCTGGTATCGCCTCTGAGCTTGTGATCCCCAGCGAGCGCCTGCATTATCGCAATCAGGGCTGGCGCTCGGTTGAGACCTCCGGTGTTGCGGAGGAGGAGGCGACCTCTGGTCTTGTTATGCTTTGCATTCATGGGTCGCCTGTGAACTCTTACACTAATACACCTTACACCGGTGCCCTCGGTTTGCTTGATTTTGCGCTCGAGCTCGAGTTTCGTAATTTGACACCTGGTAATACGAATACACGCGTATCTCGTTACTCGAGTAGCGCGCGCCACAAGTTGCGCCGTGGGGCCGATGGTACTGCTGAACTGACAACGACTGCTGCTACCCGTTTTATGAAGGACCTTCATTTTACAGGGACTAATGGTGTTGGAGAAGTTGGTCGTGGTATAGCATTAACCTTGTTTAATCTTGCTGATACACTTCTCGGCGGGCTTCCGACAGAATTGATTTCGTCGGCTGGCGGCCAGCTGTTTTACTCTCGCCCCGTCGTCTCAGCCAATGGCGAGCCGACAGTGAAACTCTATACTTCAGTCGAGAATGCCCAGCAGGATAAGGGAATAGCTATTCCACATGATATTGACCTTGGTGAGTCCCGAGTTGTTATTCAAGATTATGATAATCAACATGAGCAAGATCGCCCCACTCCTTCCCCTGCCCCCTCTCGTCCTTTTTCTGTCCTCCGCGCCAATGATGTGCTTTGGCTCTCGCTTACCGCTGCTGAGTATGATCAGACTACTTATGGTTCATCTACTAATCCTATGTATGTCTCTGATTCTGTGACATTTGTTAATGTGGCTACTGGTGCCCAGGGGGTTTCCCGCTCTCTGGACTGGTCTAAGGTTACCCTCGACGGGCGCCCGTTGACCACTATTCAGCAATATTCTAAGACTTTCTTTGTCTTGCCTCTTCGCGGTAAGCTTTCCTTTTGGGAGGCAGGCACTACTAAAGCTGGCTACCCCTATAATTATAACACCACTGCTAGTGACCACTGTTTGATTGAGAATGCGGCCGGCCACCGTGTTTGCATTTCGACTTATACTACTAATCTTGGCTCTGGCCCTGTTTCTATCTCTGCTGTTGGTGTCCTCGCACCCCACTCTGCTCTGGACGGTTTAGAGGACACTGTTGATTACCTGGCTCGTGCTCATACTTTTGATGATTTCTGCCCTGAGTGCCGTGCGCTTGCTCTTCAGGGCTGTGGCTTACAGTCTACGGTTGCTTGCGGAGAGCGTCTTAAAATGAAGGTGGGTAAAACCCGGGAGTTGTGATTATTAGCGTGTCGTCATCGAGTTGCTCCCTATCTT
| 61,640
|
MK410049.1
|
Swine hepatitis E virus
|
Zhou,K., Zhang,B.
|
College of Life Science and Technology, Southwest Minzu Universty
|
China
|
2019-07-23
| null |
Paslahepevirus balayani
|
Paslahepevirus
|
Hepeviridae
|
ssRNA(+)
| 7,252
|
GenBank
| null |
China
|
China
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Sus scrofa
| null |
2018-12
| null | null |
Swine hepatitis E virus strain SWU/B6/2018, complete genome
|
TGCAGACCCCAAGTATGTGGTCGACGCCATGGAGGCCCACCAGTTCATAAAGGCTCCTGGCGTCACTACTGCTATTGAGCAGGCAGCTCTAGCAGCGGCCAACTCTGCCTTGGCGAATGCTGTGGTGGTTCGGCCCTTTTTATCCCGCCAACAGACAGAGATACTAATTAACTTGATGCAACCCCGGCAGCTTGTTTTCCGGCCTGAGGTTCTGTGGAATCACCCCATCCAACGTGTGATCCACAATGAGCTAGAGCAGTACTGTCGAGCTCGTGCTGGCCGCTGCCTCGAAGTGGGTGCCCACCCACGTTCAATTAATGACAACCCTAATGTTTTGCATCGTTGTTTTCTTAAACCTGTCGGCCGTGATGTTCAGCGGTGGTATACCGCCCCCACCCGTGGCCCCGCGGCAAACTGCCGCCGGTCTGCTCTTCGTGGGCTCCCACCTGCTGACCGTACATACTGCTTTGACGGCTTCTCTGGCTGCACTTTTGCGGCCGAGACAGGCATCGCCCTTTACTCACTGCATGATTTGTGGCCCGCTGATGTTGCTGAGGCGATGGCCCGCCATGGGATGACTCGGCTCTATGCGGCCCTCCATCTCCCCCCTGAAGTGCTACTACCCCCTGGCACATACCACACCACTTCATATCTTTTAATTCATGATGGGGACCGTGCAGTGATTACATATGAGGGGGACTCCAGTTTGCGGGGTAATCATGATGTGTCTATTTTGCGGGCATGGATCCGTACCACCAAAGTCACCGGTAACCACCCACTGGTGATTGAGCGGGTCCGGGCCGTGGGGTGTCATTTTGTGCTTCTACTTACAGCCGCTCCCGAACCGTCACCGATGCCCTATGTCCCATACCCACGCTCAACTGAGGTTTATGTCCGGTCTATCTTCGGCCCTGGAGGCTCGCCATCTCTCTTTCCATCCGCCTGCTCTACTAAGTCAACATTTCATGCCGTCCCTGTGCATATATGGGATAGGCTTATGCTTTTTGGTGCGACTCTTGACGACCAAGCCTTTTGCTGCTCCAGACTCATGACGTACCTCCGTGGCATTAGTTATAAGGTTACGGTAGGTGCTCTTGTTGCCAATGAGGGCTGGAATGCCTCTGAGGATGCGCTGACTGCCGTAATCACTGCGGCTTATCTTACTATCTGCCATCAGAGGTACCTCCGTACGCAGGCTATTTCGAAGGGGATGAAAAGGTTGGAGCTAGAGCATGCACAGAAATTTATAACACGCCTTTACAGTTGGTTATTCGAAAAGTCTGGGCGTGACTATATCCCCGGCCGCCAACTGCAGTTTTATGCTCAGTGCCGCCGGTGGCTATCTGCAGGCTTCCACCTTGATCCTCGTGTGCTCGTTTTTGATGAGGCCGCCCCCTGCCGCTGTCGGAGCTTTCTGCGCAAAGCCGCCCACAAGTTTTGTTGCTTTATGCGGTGGCTAGGTCAAGACTGCACCTGCTTCCTTCAGCCTATTGAAGGGAGGGTTGGTGAACAAGGTTACGATAATGAGGCATTTGAGGGGTCGGATGTTGACCCTGCTGAGGAGGCCACCGTGAGCATTGCCGGGTCGTACATTGTTACCGGCCGCCAGCTGCAGCCTCTATACCAAGCGCTTGGCATACCATCTGATCTCGCTGCGCGTGCCGGTCGGCTTGCTGCCACCGTTGAAGTCTCAGATGCAGAGGGTCGTCTTACCTGCAAGACCATTTTGGGCAACAAAACTTTTTCAACGGTATTCACTGATGGCGCTCAGCTAGAGGCCAACGGGCCAGAGCAGTACGTTCTATCATTTGACTTGATGACTACAACTATGGCTGCTGGCCCGCATAGTCTCAGTTACACCCTTACATCTGAAGGTCTTGAAGTGCATATTATTTCTGCTGGGCTCGATTGCAAGGCTGTTTTCCCGCCTGGCGTCGCAACCCCCTCCGCTTCCGGGGAGGTGTCTGCTTTTTGTTCAGCTCTTTACAGGTTTAACCGTTGCATTCAGCGGCATTCTCTTGTTGGAGGCTTGTGGTATTACCCTGAGAGTTTAGTTGGCTTGTTCCCACCGTTCTCACCTGGTCATAGCTGGGAGTCTACTAATCCTTTTTGCGGTGAGAGCACTCTTTATACTCGCACATGGTCTGTGTCGGGTTTTTCCAGCTGTTTCTCTCCCTTCGAACCTCGTACCCCGGAGCTGCCACCCTCTGGTAACATTGATATATCTGTAGATGTTGATACCCCGCCACCGGTTCCCCCTGCACAGACTCAGCCCCCAACCTCCGGCCACGTGGTGCTCCCGCTGGATTCGGCTGATGGTGGTGCTAGCCTCGGTTTGACTGGCGTCTCTGTGGCGCCTCCGGCGCCTGCGCAGCCTGTAACCCAGCCCGGGCCTCGTCGCCGACTGCTTCACACTTACCCCGACGGCTCGAAGGTGTATGCCGGGTCTCTCTTTGAGTCCGAGTGTACATGGCTGGTCAATGCCTCTAACCCGGGCCACCGTCCCGGCGGTGGCCTCTGCCATGCATTTTTCCAGCGGTTTCCAGAGTCCTTCGACCCCGCTGAGTTTATCATGTCCGACGGGCTTGCAGCCTACACCCTGACGCCCCGGCCCATAATCCATGCTGTCGCTCCTGACTATCGGGTTGAACATAACCCCAAGCGACTTGAGGCAGCTTACCGGGAGACGTGCTCTCGCCGCGGGACAGCAGCTTACCCCCTGCTCGGCGCTGGTATATACAAGGTCCCCGTTGGGCTGAGTTTTGATGCCTGGGAACGTAACCACCGACCCGGGGACGAGTTGTATCACACTCAGCAATACTCAGAGCACATACGAGCCAACCGGCCTACCCTTCCCGCTCTGACTATTACAGAGGACACAGCGCGCACGGCGAACCTAGCATTGGAGCTGGATGCGGCCACTGAGGTCGGCCGGGCGTGTGCTGGCTGTCGTGTTGAACCTGGTGTAGTTCATTATCAGTTCACAGCTGGTGTCCCTGGCTCTGGTAAATCCCGGTCAATCCAACAAGGGGATGTGGACGTAATAGTGGTACCAACCCGTGAGTTACGTAACTCGTGGCGCCGCCGCGGGTTTGCAGCTTACACACCCCATACCGCAGCTCGTGTTACCCGCGGCCGTAGAGTTGTTATTGACGAGGCCCCCTCGCTCCCACCACATTTACTTCTGCTGCATATGCAGCGGGCCTCGTCAGTCCACCTTCTTGGTGACCCTAATCAAATTCCTGCTATTGATTTCGAGCATGCCGGCCTTGTTCCAGCAATCCGGCCCGAGTTGGTTCCAACTAAGTGGTGGCATCTTACCCATAGGTGCCCTGCGGATGTCTGTGAGCTGATTCGTGGTGCATACCCAAAGATCCAAACTGCGAGCCGTGTCCTCCGCTCTTTGTTTTGGGGGGAGCCCCCTGTGGGCCAGAAGCTGGTGTTTACCCAGGCGGCCAAGGCCGCTAACCCCGGTGCAATTACAGTTCATGAAGCCCAGGGCGCAACATTCACCGAGACCACAATCATCGCCACGGCGGATGCCCGTGGGTTGATTCAGTCTTCTAGGGCTCATGCCATTGTGGCCCTAACTCGCCACACGGAGAAGTGTGTGGTAGTTGACGCCCCAGGGCTTCTCCGTGAGGTGGGTATCTCCGATGCTATTGTCAATAATTTCTTCCTTGCTGGCGGCGAAATTGGTCAGCATCGCCCGTCAGTCGTACCCCGTGGTACCATTAGCAGCAACGTTGACACGCTTGATGCATTCCCCCCTTCCTGCCAGTTTAGTGCGTACCTACCGCTGGCCGAAGAGCTCGGCCACCGACCCGCGCCGATTGCTGCTGTCTTGCCCCCTTGCCCGGAGCTTGAACAGGGTTTGCTTTATATGCCTCAGGAGTTGACTACATCGGACAGTGTTCTCACCTTTGAATTAACGGACATTGTACACTGCCGTATGGCGGCGCCTAGTCAACGTAAAGCGGTTCTGTCGACCCTTGTCGGCAGGTATGGCCGCCGCACGAAGCTGTACGAGGCCGCCCATGCAGACGTCCGCGGGTCTTTGAATCATTTCATTCCTGAGCTCGGCCCAATTAATGTTACCACCTGCGAGCTCTATGAGCTTGTAGAGGCCATGGTGGAGAAGGGCCAGGATGGCTCTGCAGTCCTAGAGCTCGACCTATGTAATCGTGATGTGTCCCGAATAACCTTCTTCCAGAAGGATTGTAACAAATTCACAACAGGTGAAACGATAGCGCATGGCAAAGTCGGGCAGGGTATATCTGCGTGGAGTAAAACCTTCTGTGCCTTATTCGGCCCGTGGTTCCGCGCTATCGAGAAGGAGATTCTAGCAGCGCTTGCACCTAATATCTTTTATGGTGATGCTTATGAGGATACAGTCCTGGCCGCTGCTGTTGCAGGCGCCCCTGGCTGTAAGGTTTTTGAGAACGACTTCTCTGAGTTTGACAGCACTCAAAATAACTTTTCACTTGGGCTCGAGTGTATAATTATGGAGGAGTGCGGTATGCCGCAGTGGATGGTGCGACTTTACCACCTTGTTCGCTCTGCCTGGGTCTTGCAGGCTCCAAAAGAGTCCCTGCGCGGCTTCTGGAAGAAGCACTCTGGCGAGCCCGGCACCCTGCTGTGGAATACCGTTTGGAACATGGCGGTTATAGCGCACTGTTATGAGTTCCGTGACCTCAAAGTTGCGGCATTTAAGGGAGATGACTCTGTTGTGCTTTGTAGCGATTACCGGCAGAGTCGCAATGCGGCTGCCTTAATCGCTGGATGTGGGTTGAAGCTTAAGGTGGATTTTAGGCCTATTGGGCTGTATGCTGGTGTCGTTGTGGCTCCGGGTCTCGGGACCCTTCCTGATGTTGTTAGGTTTGCTGGACGGCTCTCAGAGAAGAATTGGGGGCCAGGCCCGGAGAGGATGGAGCAGCTTCGGCTGGCCGTTTGTGACTTTTTGCGAAAGCTAACGAATGTGGCTCAGGTCTGTGTGGATGTTGTTTCGCAGGTCTATGGTGTTAGCCCCGGTTTGGTACATAACCTGATAGGAATGCTTCAAACTATCGCGGATGGTAAAGCGCACTTCACCGAGACGATCAAGCCTGTTCTTGACCTTACTAACTCAATAGTATATCGGGTGGAATGAATAACATGTTTCTTTGCTCTTTGCATGGCGATGCCACCATGCGCTCTCGGGCTCTTCTGTTTTTGCTCCTCCTGCTTTTGCCTATGTTGCCCGCGCCACCGGCCGGTCAGCCGTCTGGCCGTCGTCGTGGGCGGCGCAGCGGCGGTGCCGGCGGTGGTTTCTGGGGTGACCGGGTTGATTCTCAGCCCTTCGCCCTCCCCTATATTCATCCAACCAACCCCTTCGCATCTGACATTTCAGCCACCGCCGGGGCTGGAGCTCGCCCTCGACAACCAGCCCGCCCACTCGGTTCCGCTTGGCGTGACCAATCCCAGCGCCCCGCCGCTTCCGCCCGTCGTCGACCTGCCCCAGCTGGGGCTTCGCCGCTAACAGCTGTAGCTCCGGCCCCTGACACTGCTCCGGTTCCTGATGTTGATTCGCGTGGCGCTATATTGCGCCGTCAGTATAATCTGTCCACGTCTCCACTCACATCCACCATTGCCACTGGGACTAACCTTGTGCTATATGCTGCCCCGCTTAACCCTCTACTCCCACTTCAGGATGGCACCAATACTCATATTATGGCTACTGAGGCTTCAAATTATGCCCAGTATCGTGGAGTTGTCGTGCTCATTCGGTCTCGTCCTTTGGTCCCGAATGCTGTTGGTGGGTATGCTATATCTATTTCTTTTTGGCCCCAAACAACTACCACCCCGACGTCCGTGGATATGAATTCCATCACTTCTACTGATGTCCGTATTCTTGTCCAACCCGGTATAGCCTCCGAGTTGGTGATTCCCAGTGAGCGCTTGCATTACCGCAATCAGGGCTGGCGCTCAGTTGAGACCTCTGGCGTTGCCGAGGAGGAGGCTACTTCAGGTCTTGTTATGCTTTGTATACATGGATCACCTGTGAACTCTTACACTAACACACCTTACACTGGTGCTCTTGGCCTGCTCGATTTTGCGCTTGAGCTTGAGTTTCGTAATCTGACACCTGGTAACACAAACACGCGCGTCTCTCGTTATTCGAGTAGTGCGCGCCATAAATTGCGCCGAGGGGCCGATGGTACTGCTGAGCTAACTACCACTGCTGCCACACGATTTATGAAGGATCTTCACTTTACAGGGACTAATGGCGTTGGTGAGGTTGGTCGTGGGATAGCGCTTACCTTGTTTAACCTTGCTGACACACTTCTCGGCGGGCTCCCGACAGAATTGATTTCGTCGGCTGGTGGCCAGTTGTTTTATTCCCGCCCCGTCGTCTCAGCCAATGGCGAGCCGACAGTGAAACTTTACACCTCAGTCGAGAATGCCCAGCAGGATAAGGGTATTGCTATCCCACATGATATTGATCTTGGTGAGTCCCGAGTTGTCATCCAGGATTATGACAATCAGCATGAGCAAGATCGCCCCACCCCCTCTCCTGCCCCCTCTCGTCCTTTTTCTGTGCTTCGTGCTAATGATGTACTTTGGCTCTCACTTACGGCTGCTGAGTATGATCAGACTACCTATGGCTCTTCTACCAACCCTATGTATGTCTCTGATACTGTGACGTTCGTCAATGTGGCTACCGGTGCCCAGGGGGTTTCGCGCTCCTTGGACTGGTCTAAGGTCACCCTTGATGGGCGCCCATTAACTACTATCCAGCAGTATTCTAAGACTTTCTATGTTTTGCCTCTACGTGGTAAGCTCTCTTTCTGGGAGGCGGGTACTACTAAGGCCGGCTACCCTTATAATTATAACACTACCGCCAGTGATCAGATCCTGATTGAGAATGCAGCTGGCCATCGGGTTTGTGTTTCTACCTATACTACTAATCTGGGCTCCGGGCCTGTTTCTATTTCCGCTGTCGGTGTCCTCGCACCTCATTCTGCTCTGGCTGCTTTAGAGGACACTGTTGATTATCCCGCCCGCGCCCACACTTTTGATGATTTCTGCCCTGAGTGCCGTGCACTCGGTCTTCAGGGTTGTGCTTTTCAGTCAACTGTAGCTGAATTGCAGCGTCTTAAAATGAAGGTGGGTAAAACCCGGGAGTATTGATTTATTCTGCCTGTGCCCCCCCTCTGTTTCTTTTCCTTTTACTTCTTTTTTCTGCGTTCTGCGCTCGCTGGAAAAAAAAAAA
| 61,641
|
MK410050.1
|
Swine hepatitis E virus
|
Zhou,K., Zhang,B.
|
College of Life Science and Technology, Southwest Minzu Universty
|
China
|
2019-07-23
| null |
Paslahepevirus balayani
|
Paslahepevirus
|
Hepeviridae
|
ssRNA(+)
| 7,246
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Sus scrofa
| null |
2018-12
| null | null |
Swine hepatitis E virus strain SWU/L9/2018, complete genome
|
GCAGACCACGTATGTGGTCGACGCCATGGAGGCCCATCAGTTCATAAAGGCTCCTGGCGTCACTACTGCTATTGAGCAGGCAGCTCTAGCAGCGGCCAACTCTGCCTTGGCGAATGCTGTGGTGGTTCGGCCCTTTTTATCCCGCCAACAGACAGAGATACTAATTAACTTGATGCAACCCCGGCAGCTTGTTTTCCGGCCTGAGGTTCTGTGGAATCACCCCATCCAACGTGTGATCCACAATGAGCTAGAGCAGTACTGTCGAGCTCGTGCTGGCCGCTGCCTCGAAGTGGGTGCCCACCCACGTTCAATTAATGACAACCCTAATGTTTTGCATCGTTGTTTTCTTAAACCTGTCGGCCGTGATGTTCAGCGGTGGTATACCGCCCCCACCCGTGGCCCCGCGGCAAACTGCCGCCGGTCTGCTCTTCGTGGGCTCCCACCTGCTGACCGTACATACTGCTTTGACGGCTTCTCTGGCTGCACTTTTGCGGCCGAGACAGGCATCGCCCTTTACTCACTGCATGATTTGTGGCCCGCTGATGTTGCTGAGGCGATGGCCCGCCATGGGATGACTCGGCTCTATGCGGCCCTCCATCTCCCCCCTGAAGTGCTACTACCCCCTGGCACATACCACACCACTTCATATCTTTTAATTCATGATGGGGACCGTGCAGTGATTACATATGAGGGGGACTCCAGTGCTGGGTATAATCATGATGTGTCTATTTTGCGGGCATGGATCCGTACCACCAAAGTCACCGGTAACCACCCACTGGTGATTGAGCGGGTCCGGGCCGTGGGGTGTCATTTTGTGCTTCTACTTACAGCCGCTCCCGAACCGTCACCGATGCCCTATGTCCCATACCCACGCTCAACTGAGGTTTATGTCCGGTCTATCTTCGGCCCTGGAGGCTCGCCATCTCTCTTTCCATCCGCCTGCTCTACTAAGTCAACATTTCATGCCGTCCCTGTGCATATATGGGATAGGCTTATGCTTTTTGGTGCGACTCTTGACGACCAAGCCTTTTGCTGCTCCAGACTCATGACGTACCTCCGTGGCATTAGTTATAAGGTTACGGTAGGTGCTCTTGTTGCCAATGAGGGCTGGAATGCCTCTGAGGATGCGCTGACTGCCGTAATCACTGCGGCTTATCTTACTATCTGCCATCAGAGGTACCTCCGTACGCAGGCTATTTCGAAGGGGATGAAAAGGTTGGAGCTAGAGCATGCACAGAAATTTATAACACGCCTTTACAGTTGGTTATTCGAAAAGTCTGGGCGTGACTATATCCCCGGCCGCCAACTGCAGTTTTATGCTCAGTGCCGCCGGTGGCTATCTGCAGGCTTCCACCTTGATCCTCGTGTGCTCGTTTTTGATGAGGCCGCCCCCTGCCGCTGTCGGAGCTTTCTGCGCAAAGCCGCCCACAAGTTTTGTTGCTTTATGCGGTGGCTAGGTCAAGACTGCACCTGCTTCCTTCAGCCTATTGAAGGGAGGGTTGGTGAACAAGGTTACGATAATGAGGCATTTGAGGGGTCGGATGTTGACCCTGCTGAGGAGGCCACCGTGAGCATTGCCGGGTCGTACATTGTTACCGGCCGCCAGCTGCAGCCTCTATACCAAGCGCTTGGCATACCATCTGATCTCGCTGCGCGTGCCGGTCGGCTTGCTGCCACCGTTGAAGTCTCAGATGCAGAGGGTCGTCTTACCTGCAAGACCATTTTGGGCAACAAAACTTTTTCAACGGTATTCACTGATGGCGCTCAGCTAGAGGCCAACGGGCCAGAGCAGTACGTTCTATCATTTGACTTGACTAAACAAACTATGGCTGCTGGCCCGCATAGTCTCAGTTACACCCTAACATCAGAAGGCCTTGAAGTGCATATTATTTCTGCTGGGCTCGATTGCAAGGCTGTTTTCCCGCCTGGCGTCGCAACCCCCTCCGCTTCCGGGGAGGTGTCTGCTTTTTGTTCAGCTCTTTACAGGTTTAACCGTTGCATTCAGCGGCATTCTCTTGTTGGAGGCTTGTGGTATTACCCTGAGAGTTTAGTTGGCTTGTTCCCACCGTTCTCACCTGGTCATAGCTGGGAGTCTACTAATCCTTTTTGCGGTGAGAGCACTCTCTATACTCGCACATGGTCTGTGTCGGGTTTTTCCAGCTGTTTCTCTCCCTTCGAACCTCGTACCCCGGAGCTGCCACCCTCTGGTAACATTGATATATCTGTAGATGTTGATACCCCGCCACCGGTTCCCCCTGCACAGACTCAACCCCCAACCTCCGGCCACGTGGCGCTCCCGCTGGATTCGGCTGATGGTGGTGCTAGCCTCGGTTTGACTGGCGTCTCTGTGGCGCCTCCGGCGCCTGCGCAGCCTGTAACCCAGCCTGGGCCTCGTCGCCGACTGCTTCACACTTACCCCGACGGCTCGAAGGTGTATGCCGGGTCTCTCTTTGAGTCCGAGTGTACATGGCTGGTCAATGCCTCTAACCCGGGCCACCGTCCCGGCGGTGGCCTCTGCCATGCATTTTTCCAGCGGTTTCCAGAGTCCTTCGACCCCGCTGAGTTTATCATGTCCGACGGGCTTGCAGCCTACACCCTGACGCCCCGGCCCATAATCCATGCTGTCGCTCCTGACTATCGGGTTGAACATAACCCCAAGCGACTTGAGGCAGCTTACCGGGAGACGTGCTCTCGCCGCGGGACAGCAGCTTACCCCCTGCTCGGCGCTGGTATATACAAGGTCCCCGTTGGGCTGAGTTTTGATGCCTGGGAACGTAACCCCCGACCCGGGGACGAGTTGTATTTGACTGAACCAGCTATAGCCTGGTTTGAAGCCAACCGGCCTACCCTTCCCGCTCTGACTATTACAGAGGACACAGCGCGCACGGCGAACCTAGCATTGGAGCTGGATGCGGCCACTGAGGTCGGCCGGGCGTGTGCTGGCTGTCGTGTTGAACCTGGTGTAGTTCATTATCAGTTCACAGCTGGTGTCCCTGGCTCTGGTAAATCCCGGTCAATCCAACAAGGGGATGTGGACGTAATAGTGGTACCAACCCGTGAGTTACGTAACTCGTGGCGCCGCCGCGGGTTTGCAGCTTACACACCCCATACCGCAGCTCGTGTTACCCGCGGCCGTAGAGTTGTTATTGACGAGGCCCCCTCGCTCCCACCACATTTACTTCTGCTGCATATGCAGCGGGCCTCGTCAGTCCACCTTCTTGGTGACCCTAATCAAATTCCTGCTATTGATTTCGAGCATGCCGGCCTTGTTCCAGCAATCCGGCCCGAGTTGGTTCCAACTAAGTGGTGGCATCTTACCCATAGGTGCCCTGCGGATGTCTGTGAGCTGATTCGTGGTGCATACCCAAAGATCCAAACTGCGAGCCGTGTCCTCCGCTCTTTGTTTTGGGGGGAGCCCCCTGTGGGCCAGAAGCTGGTGTTTACCCAGGCGGCCAAGGCCGCTAACCCCGGTGCAATTACAGTTCATGAAGCCCAGGGCGCAACATTCACCGAGACCACAATCATCGCCACGGCGGATGCCCGTGGGTTGATTCAGTCTTCTAGGGCTCATGCCATTGTGGCCCTAACTCGCCACACGGAGAAGTGTGTGGTAGTTGACGCCCCAGGGCTTCTCCGTGAGGTGGGTATCTCCGATGCTATTGTCAATAATTTCTTCCTTGCTGGCGGCGAAATTGGTCAGCATCGCCCGTCAGTCGTACCCCGTGGTACCATTAGCAGCAACGTTGACACGCTTGATGCATTCCCCCCTTCCTGCCAGTTTAGTGCGTACCATCAGCTGGCCGAAGAGCTTGGTCACCGGCCCGCGCCGATTGCTGCTGTTTTGCCCCCTTGTCCGGAGCTTGAACAGGGTTTGCTTTATATGCCTCAGGAGTTGACTACATCGGACAGTGTTCTCACCTTTGAATTAACGGACATTGTACACTGCCGTATGGCGGCGCCTAGTCAACGTAAAGCGGTTCTGTCGACCCTTGTCGGCAGGTATGGCCGCCGCACGAAGCTGTACGAGGCCGCCCATGCAGACGTCCGCGGGTCTTTGAATCATTTCATTCCTGAGCTCGGCCCAATTAATGTTACCACCTGCGAGCTCTATGAGCTTGTAGAGGCCATGGTGGAGAAGGGCCAGGATGGCTCTGCAGTCCTAGAGCTCGACCTATGTAATCGTGATGTGTCCCGAATAACCTTCTTCCAGAAGGATTGTAACAAATTCACAACAGGTGAAACGATAGCGCATGGCAAAGTCGGGCAGGGTATATCTGCGTGGAGTAAAACCTTCTGTGCCTTATTCGGCCCGTGGTTCCGCGCTATCGAGAAGGAGATTCTAGCAGCGCTTGCACCTAATATCTTTTATGGTGATGCTTATGAGGATACAGTCCTGGCCGCTGCTGTTGCAGGCGCCCCTGGCTGTAAGGTTTTTGAGAACGACTTCTCTGAGTTTGACAGCACTCAAAATAACTTTTCACTTGGGCTCGAGTGTATAATTATGGAGGAGTGCGGTATGCCGCAGTGGATGGTGCGACTTTACCACCTTGTTCGCTCTGCCTGGGTCTTGCAGGCTCCAAAAGAGTCCCTGCGCGGCTTCTGGAAGAAGCACTCTGGCGAGCCCGGCACCCTGCTGTGGAATACCGTTTGGAACATGGCGGTTATAGCGCACTGTTATGAGTTCCGTGACCTCAAAGTTGCGGCATTTAAGGGAGATGACTCTGTTGTGCTTTGTAGCGATTACCGGCAGAGTCGCAATGCGGCTGCCTTAATCGCTGGATGTGGGTTGAAGCTTAAGGTGGATTTTAGGCCTATTGGGCTGTATGCTGGTGTTGTTGTGGCCCCGGGTCTCGTGACCTTACATCCCGTTGTTAGGTTCGCTGGACGGCTCTCAGAGAAGAATTGGGGGCCAGGCCCGGAGAGGATGGAGCAGCTTCGGCTGGCCGTTTGTGACTTTTTGCGAAAGCTAACGAATGTGGCTCAGGTCTGTGTGGATGTTGTTTCGCAGGTCTATGGTGTTAGCCCCGGTTTGGTACATAACCTGATAGGAATGCTTCAAACTATCGCGGATGGTAAAGCGCACTTCACCGAGACGATCAAGCCTGTTCTTGACCTTACTAACTCAATAGTATATCGGGTGGAATGAATAACATGTTTCTTTGCTCTTTGCATGGCGATGCCACCATGCGCTCTCGGGCTCTTCTGTTTTTGCTCCTCCTGCTTTTGCCTATGTTGCCCGCGCCACCGGCCGGTCAGCCGTCTGGCCGTCGTCGTGGGCGGCGCAGCGGCGGTGCCGGCGGTGGTTTCTGGGGTGACCGGGTTGATTCTCAGCCCTTCGCCCTCCCCTATATTCATCCAACCAACCCCTTCGCATCTGACATTTCAGCCACCGCCGGGGCTGGAGCTCGCCCTCGACAACCAGCCCGCCCACTCGGTTCCGCTTGGCGTGACCAATCCCAGCGCCCCGCCGCTTCCGCCCGTCGTCGACCTGCCCCAGCTGGGGCTTCGCCGCTAACAGCTGTAGCTCCGGCCCCTGACACTGCTCCGGTTCCTGATGTTGATTCGCGTGGCGCTATATTGCGCCGTCAGTATAATCTGTCCACGTCTCCACTCACATCCACCATTGCCACTGGGACTAACCTTGTGCTATATGCTGCCCCGCTTAACCCTCTACTCCCACTTCAGGATGGCACCAATACTCATATTATGGCTACTGAGGCTTCAAATTATGCCCAGTATCGTGTTGTTCGTGCCACCATTCGGTATCGTCCTTTGGTCCCGAATGCTGTTGGTGGGTATGCTATATCTATTTCTTTTTGGCCCCAAACAACTACCACCCCGACGTCCGTGGATATGAATTCCATCACTTCTACTGATGTCCGTATTCTTGTCCAACCCGGTATAGCCTCCGAGTTGGTGATTCCCAGTGAGCGCTTGCATTACCGCAATCAGGGCTGGCGCTCAGTTGAGACCTCTGGCGTTGCCGAGGAGGAGGCTACTTCAGGTCTTGTTATGCTTTGTATACATGGATCACCTGTGAACTCTTACACTAACACACCTTACACTGGTGCTCTTGGCCTGCTCGATTTTGCGCTTGAGCTTGAGTTTCGTAATCTGACACCTGGTAACACAAACACGCGCGTCTCTCGTTATTCGAGTAGTGCGCGCCATAAATTGCGCCGAGGGGCCGATGGTACTGCTGAGCTAACTACCACTGCTGCCACACGATTTATGAAGGATCTTCACTTTACAGGGACTAATGGCGTTGGTGAGGTTGGTCGTGGGATAGCGCTTACCTTGTTTAACCTTGCTGACACACTTCTCGGCGGGCTCCCGACAGAATTGATTTCGTCGGCTGGTGGCCAGTTGTTTTATTCCCGCCCCGTCGTCTCAGCCAATGGCGAGCCGACAGTGAAACTTTACACCTCAGTCGAGAATGCCCAGCAGGATAAGGGTATTGCTATCCCACATGATATTGATCTTGGTGAGTCCCGAGTTGTCATCCAGGATTATGACAACCAGCATGAGCAAGATCGCCCCACCCCCTCTCCTGCCCCCTCCCGTCCTTTTTCTGTGCTTCGTGCTAATGATGTGCTTTGGCTCTCACTTACAGCTGCTGAATATGATCAGACTACTTATGGCTCTTCTACTAATCCTATGTATGTCTCTGACACCGTGACGTTTGTTAATGTGGCCACTGGTGCCCAGGGGGTGGCACGCTCCCTGGAATGGTCCAAGGTCACCCTTGATGGGCGCCCACTTACCACCATTCAGCAGTATTCTAAGACTTTCTTTGTTCTACCCCTCCGTGGTAAACTTTCTTTCTGGGAGGCCGGTACCACTAAAGCTGGCTATCCATATAATTATAATACTACTGCCAGTGACCAGATTTTGATTGAGAATGCGGCAGGTCATCGTGTCTGTATTTCTACTTACACCACCAATTTAGGTTCTGGACCTGTCTCCATTTCTGCTGTTGGTGTTTTAGCACCCCACTCTGCTTTGGCCGCTTTAGAGGACACGGTTGACTATCCAGCCCGTGCTCACACTTTTGATGACTTTTGCCCTGAGTGCCGCGCGCTCGGTCTCCAGGGCTGTGCTTTCCAATCTACTGTTGCTGAGCTACAACGTCTTAAAATGAAGGTGGGTAAAACCCGGGAGTATTGATTTATTTTCCTTGTGCCTTCCTTTGTACTGTTTCTTTTAATTTCTCTTTTCTGCGTTTCGCGCCTCCCCTGAAAAAAAA
| 61,642
|
ON408162.1
|
Tahe rhabdovirus 1
|
Wang,Z., Liu,Z.
|
Jilin University, The First Hospital of Jilin University
|
China
|
2022-10-11
| null |
Tahe rhabdovirus 1
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,348
|
GenBank
| null |
China: Tahe, Heilongjiang
|
China
|
Haemaphysalis concinna
| null |
2021-06-25
| null | null |
Tahe rhabdovirus 1 strain NE-TH1, complete genome
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| 23,643
|
ON408163.1
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Tahe rhabdovirus 1
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Wang,Z., Liu,Z.
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Jilin University, The First Hospital of Jilin University
|
China
|
2022-10-11
| null |
Tahe rhabdovirus 1
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,348
|
GenBank
| null |
China: Tahe, Heilongjiang
|
China
|
Haemaphysalis concinna
| null |
2021-06-25
| null | null |
Tahe rhabdovirus 1 strain NE-TH2, complete genome
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AGACAACAAATTGTATGACCTTTATGAATGCCTCAATACCTGAGAACCCTTAACAGACCTCCAATCAAAGGGCTTCAAGTAGTTTCGTGCACTTAGAGCCAAAGGTTCTTCTGCCTTAAGAACCCTCTGTGGATTGAAAAGGTCGCTCAAAAGCAAATTCGCCCGATGGCGGACGGCAATATCGACCCCCTCGATGAAGAGGCCCTCATCGCGCTGGGGGATATTCCCGTCTTTAATGACGAAGAAGGGCTGCACCAGCTCCATGGACCAGCCGCCGTGGCACAGGTGGACCCGGAATTCCCAGCAACGTGGTTTACTGCCCAGCAGACTAAGCCTCGGTTGAACTGCCCCACATTCCAATCCCTGACGCCAGAAGACCTCCGGAAGACGGTTCATGGTGGTCTCGCAGGAGGGGGGCTGCCCGCCGACTACGCCGTGCTGTTCCTGAAGGTCGCCGCGGCTCAAGTCAGGACCACACTGACTGCGGACCTCGTAAGCTTCGGCCAGACCGTCGGCGCAGCAAATGACGTCATCACCCCTCTGAGTCTGCTGACCGTCAGCGAGGAGCCCTTCGAGGGACAGAGGCCTGCCTGTGCCATGAAGGAGAACCCCCCATCAGATCTGGCCATGGTGGCAGGGATCGCTGTGAATTACCGACTGTGTGTGGCCCAGGGCCGAGGCGGTACAGAGACGTACCTGGGCGCCATCAAGGACCGGTGCATGGCACTGCTGGCCAATCCCCCGTTCCGCATGCCAGACGGCTACCTGGACAACTGGACCACTTGCGCTCCCTGGGCAAGTCACCGGGAGATCCAGGTCATCCTGGCGGCCTATGATATGTTGCTGTATCTGGATGGGAATCACGCGTACGGTGCCATCCGGGCGGGGACCCTCGTATGCCGCGGGAGAGACTGTGCCGTCCTGGGTGATCTTCAACGGGCAGGGAAGGCACTTGGCACCAAACCCACCGGTGTCTTCTACTGGTGCTTTTCGGAGTCCCTGGCCCCCGAGCTAAAACTGCTGACCACTCGGGGGCAGGAGCTTGGGAATGAACGAAGTTACTTCCACTACCTGGCTCCGATGGCACTGTCCCGACGATCTCCATACTCGGCCTCCATCTGCCCTGGGATCCATCTCATGTGCAACGCTGTGGCAGCCCTTCTCGGCATTGAAGAAGCCCAGAACACCCGCTACGTCGCCTGCAGCAGCCCCCACGCCGTCCTCACAAATGCCGCCATGGTGGCCTACGCCAACCGGGAGGGGTCCGGCTTCCGACAGATGGTCACGAAAGGGGCGGTGGCCGGTCGAGTGGCAAGAGCGGAGTGGATGGCCAGCCTGGGACGCCGGGATGCCGAAGAGGTGATAGACGGGTCTCGATTCCCCGGCTCCGCCAACCCGCTCCTGTGGTGCCAGTTCATGCGCCTCAAGGGCTGGTCACTGCCTGAGGAGATCAAGGACTGGGCCAGTGTGCGAGTCCAGACCTTCCACAGCGTTCGCGCTGGATCCGTGGCCGAGTTCGTGCGCAACCGCTTTGCCCGGGAGGCTTAAGTCCCCATGAAAAAAAGTAACAGACATCAACCATGGCAGGTACCAACGAGACCAACGACTTTGTTAGTGACCCGAATGTATTTTTCGCGTCCTTCGATCCGGAAGTTCTCGCGGATCTTGACAAGGCTGCGATCCTGCAGTCCCAGTCTGAGGCGGCCGAAAAGCTTCCGCATGACGATCACGCCGATGATCCGGCTCACGAGCGGGTACCCGGGTACAATGTAGACCCTGTTACGCCGCTGGATCCACCACAGGCAGAGCTGACCCAAGCAACTCTCGAGGAATTGGGTCTTGAGCAATTTGAGTGGGAAGGAGAAACAGAGGAGATGGCCCTGAGAGAGTCAATCGCCATCCGAAAATTTGCTGAGGACCTGGTCGCAAAGAAGGCCATTCATCTGGAATCGGTAGATGTGGTCAAGAATAAAGTAGTGACCAAATATCGTCCCTTTCGGGCGGCTCTATCGTCAGATAGCAGTTCGGGCGGAGAACCCCGACCCAAGCCGGTCATAAAGACCAACAAGCCGGCCTCGACACCCACTCCACCCGGGCTCCCTCGCTCTCCATCCAGACCAGCCCAAACTCCCTCCGCCCCCTCGACTTCCTCCAACCCCAGTCCGAGCTCAGATGACCGGACATCTGCACTGGAGTTCTGCAACACCAAGGTACTGATGAAGGGTTATGGCGGCAGCCAAATTGCCATCCAACTCAGCAATTATGACTGTTCTCCGGCCCTCGCCATTCAGTACACGGTGCATGGCGGGAAAGAGTCCTGGATGTTGGATCCATCTGTCCCTGTAGATAAAAAGGTGTACTGGCTCCTGACCCAACATCGCAAGGCTTCCACGGTGTTGAATGCCCTTTCGCCTCTTGCCTACCCGTAGGTCGCATGAAAAAAACTAACAGTCCTCACTATGAAGCGACTGTTTAAGAAGAAAGGAGGTTCAAAGTCTTCCCGCTCGTCTTCTAGCCGAGACGAAGAAGGGATGGACGGTGGAACCCTTTCTGGATGGGGTCAGCCCCTCGTCGGGCCGAGTGCTCCTCCGGCCAGGAGGGTCCTTGACACCCTGTCAAGGACGTACGATGTCGTTGGGGAACTCACTGTCTCGAGTCCCCGTCAAATCGAACATCAATCCTTCTTTGGTCGTATGAGTATGAACTTTCCCCACAGTTATCAGGGGGACGTGGCCATGAAGCCATTCCATACGACCATCTTTGCCGCCCTTGTATCGGGGCTGAAAGAGGGAAAGGTGTCAAATAAAGGGTGGGTCTACTCACATCGCCTGGCAGAATGCGTGACCTTTCAAGGGCAAGCGGCCCAGCTGCCCCAGGGGTCCTCTGTCCATTTTAAAGACACTTTTGTGTGGCAGTATAGAGGGGACTCCTACACCTGGGTGCTCAACATCACGTGGACCCTCTCCCACATGCCTGGGGTCCCCCTGCACACCTTCCTTCCTCCCCAGGTTAACCCATTGCTGGAGGTGCTGGGCGTGACCACAGTCTGGAACAAGGAGCAGCGGTTCCTGACCCTGATTGACTAGCGGCCATGGGGTCCATGAAAAAAACTAACAGACCTCACAATGCTGCTTCTCCTCGCCATTCTGTTTTTCCCGGTCTTGACCGGCGGTACATGGGAACCTGAGGCTACCTTTGTGGTCCCAGAGGATCGTCAGTATGTTTGGAAGAGGATCAACATCTCGTCCCTGGAGTGCCCCAACATCTACAGCGTCCCCCGCCTTGACCGGATTGCCCAAGTTGCTTTGATGAGGCCGGAATTCACCGGCAGTTTTGACGATGCCGTTCAGGGTTACATCTGTTCAAAGATAAAGATGTCTGTTAAATGTTCTGTGAACTTCTTTGGTTGGCGTTCCTTTGAACATCTTGTAGAGGATGTTGTTCCATCCCGACAGGAGTGCTTAGAGGGAGTCCGGACCCTTCAGACGGATGGGAAATTGGCTAGTCCAGCATTCCCGGCTCCCAACTGTGGATGGATGGATGACAGGTGGGCAGAAGATCTATTCCTGGTTCTGACCAGTCACCCCACCCATGGTGATCCATACTCCGGGGAGTTTATAGATAAGATATTTCCAGCCGGCCTGTGTGGAAGTGATGACTGTCCCACCATACACCACGGCTCGAGGTGGGTAACCACCACCCGGATACCATCCTCATGCACTCGATTTCAGACGTCCTGGGCAAACATAGGGAACCAGGAGGATCCACCCCATACGAGAGTCATATACTCCCCGGAGTTTGGTGTGAGATCACTCGAGGGATCCTGCACCATTCGTTTTTGCGGTAAATCTGGTTGGAGACTGGAGACAGGTGAGTTCTTCGTGCTGAGTCATCCAGGTGGGGCATCCTTGGGCACTCCTCCCTTGTGTGAACGAGGTGTAAAAATAGGTGAACTCAGCTTGCAGGGACAACTTGACTACACGCGTCTTGAGTTGCTTGATCAGGAGACTCGACTTCAGTGTTTGACCACCCTCGCCACTGTCGTCGCTACCAACAAGGTCAGTCCGTTTCAACTAGGAATGTTTAACCCCACACACCCCGGCAACGGAAGGGCTTACCGGATCAAACATCGGTTCTTAGAAGAGGCCCTGGTCCGATATGTAGGGGTGTCCAAACTTGATAGCAGACCGATGGGTAACAGGCTGGGGGTGGACCACCAGGGGAAACCTGTGACGTGGTCAGACTGGGTAGAAGTGCCCAACACTAACCGAACATTCGGACCTAATGGGATTCTTAAACTCCCTTCTGGTGAAATAGTGATTCCCAACAAAGAAATCCGGGCTCTGCGACACAATCTCCAAATGACAGTAGCCCAGGACATAGACCTGGTAGGACATCCTCATCGGGAGATCACACAGAATTTTTCCGATCAGGTCGGCTCCAGCTCGCGCAACACAGCCACCGATGGCGGGGTAGATCCATTTGGGTGGATTAAAAGCAAGTGGGGATCCCTCGGCGGTGGACTCACCACCCTAGCTGTGGCAGGACTGCTCCTCTGGCTCCTCAGTCGCTGCACCTGCAGACGCTCCTCATCCACCCCAGTCCCCACAATCAAACTCTCCACAAGGGACCGCAACTGGGAGAAGGTGGCGACGACCAGCGTGTAACCTTGAAAAAAACTAACAGACCTCCAAAATGACCTCTTATGAGGACAATCCCGAGGACGAGGTTCCCGGTCCCGCAGACGACTGGGATGCTTTCAGTGAAGTGGAGGCTGACCTGTTAAGTCCACTTAATGATCGTGAGCGGTCCAAAGTCAAGGGGGTTCTCAATTCGACCGACTACAACCTAAACTCGCCACTGATTAGTGATCACTCCGAAGCCGTCCTCGCCAGTCTGTCTGGAAGGGGACTCCCCGGTCGATACCTTCGGAGCCAAGAGATTGAGAGACAAAGACAAAGCCTGTCACATTTATCTTGTGATTGGAAGAAGCTCAAAGC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| 23,644
|
ON408164.1
|
Tahe rhabdovirus 1
|
Wang,Z., Liu,Z.
|
Jilin University, The First Hospital of Jilin University
|
China
|
2022-10-11
| null |
Tahe rhabdovirus 1
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,348
|
GenBank
| null |
China: Songling, Heilongjiang
|
China
|
Haemaphysalis concinna
| null |
2021-06-25
| null | null |
Tahe rhabdovirus 1 strain NE-SL1, complete genome
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AGACAACAAATTGTATGACCTTTATGAATGCCTCAATACCTGAGAACCCTTAACAGACCTCCAATCAAAGGGCTTCAAGTAGTTTCGTGCACTTAGAGCCAAAGGTTCTTCTGCCTTAAGAACCCTCTGTGGATTGAAAAGGTCGCTCAAAAGCAAATTCGCCCGATGGCGGACGGCAATATCGACCCCCTCGATGAAGAGGCCCTCATCGCGCTGGGGGATATTCCCGTCTTTAATGACGAAGAAGGGCTGCACCAGCTCCATGGACCAGCCGCCGTGGCACAGGTGGACCCGGAATTCCCAGCAACGTGGTTTACTGCCCAGCAGACTAAGCCTCGGTTGAACTGCCCCACATTCCAATCCCTGACGCCAGAAGACCTCCGGAAGACGGTTCATGGTGGTCTCGCAGGAGGGGGGCTGCCCGCCGACTACGCCGTGCTGTTCCTGAAGGTCGCCGCGGCTCAAGTCAGGACCACACTGACTGCGGACCTCGTAAGCTTCGGCCAGACCGTCGGCGCAGCAAATGACGTCATCACCCCTCTGAGTCTGCTGACCGTCAGCGAGGAGCCCTTCGAGGGACAGAGGCCCGCCTGTGCCATGAAGGAGAACCCCCCATCAGATCTGGCCATGGTGGCAGGGATCGCTGTGAATTACCGACTGTGTGTGGCCCAGGGCCGAGGCGGTACAGAGACGTACCTGGGCGCCATCAAGGACCGGTGCATGGCACTGCTGGCCAATCCCCCGTTCCGCATGCCAGACGGCTACCTGGACAACTGGACCACTTGCGCTCCCTGGGCAAGTCACCGGGAGATCCAGGTCATCCTGGCGGCCTATGATATGTTGCTGTATCTGGATGGGAATCACGCGTACGGTGCCATCCGGGCGGGGACCCTCGTATGCCGCGGGAGAGACTGTGCCGTCCTGGGTGATCTTCAACGGGCAGGGAAGGCACTTGGCACCAAACCCACCGGTGTCTTCTACTGGTGCTTTTCGGAGTCCCTGGCCCCCGAGCTAAAACTGCTGACCACTCGGGGGCAGGAGCTTGGGAATGAACGAAGTTACTTCCACTACCTGGCTCCGATGGCACTGTCCCGACGATCTCCATACTCGGCCTCCATCTGCCCTGGGATCCATCTCATGTGCAACGCTGTGGCAGCCCTTCTTGGCATTGAAGAAGCCCAGAACACCCGCTACGTCGCCTGCAGCAGCCCCCACGCCGTCCTCACAAATGCCGCCATGGTGGCCTACGCCAACCGGGAGGGGTCCGGCTTCCGACAGATGGTCACGAAAGGGGCGGTGGCCGGTCGAGTGGCAAGAGCGGAGTGGATGGCCAGCCTGGGACGCCGGGATGCCGAAGAGGTGATAGACGGGTCTCGATTCCCCGGCTCCGCAAACCCGCTCCTGTGGTGCCAGTTCATGCGCCTCAAGGGCTGGTCACTGCCTGAGGAGATCAAGGACTGGGCCAGTGTGCGAGTCCAGACCTTCCACAGCGTTCGCGCTGGATCCGTGGCCGAGTTCGTGCGCAACCGCTTTGCCCGGGAGGCTTAAGTCCCCATGAAAAAAAGTAACAGACATCAACCATGGCAGGTACCAACGAGACCAACGACTTTGTTAGTGACCCGAATGTATTTTTCGCGTCCTTCGATCCGGAGGTTCTCGCGGATCTTGACAAGGCTGCGATCCTGCAGTCCCAGTCTGAGGCGGCCGAAAAGCTTCCGCATGACGATCACGCTGATGATCCGGCTCACGAGCGGGTGCCCGGGTACAATGTAGACCCTGTTACGCCGCTGGATCCACCACAGGCAGAGCTGACCCAAGCAACTCTCGAGGAATTGGGTCTTGAGCAATTTGAGTGGGAAGGAGAAACAGAGGAGATGGCCCTGAGAGAGTCAATCGCCATCCGAAAATTTGCTGAGGACCTGGTCGCAAAGAAGGCCATTCATCTGGAATCGGTAGATGTGGTCAAGAATAAAGTAGTGACCAAATATCGTCCCTTTCGGGCGGCTCTATCGTCAGATAGCAGTTCGGGCGGAGAACCCCGACCCAAGCCGGTCATAAAGACCAACAAGCCGGCCTCGACACCCACTCCACCCGGGCTCCCTCGCTCTCCATCCAGACCAGGCCAAACTCCCTCCGCCCCCTCGACTTCCTCCAACCCCAGTCCGAGCTCAGATGACCGGACATCTGCACTGGAGTTCTGCAACACCAAGGTGCTGATGAAGGGTTATGGCGGCAGCCAAATTGCCATCCAACTCAGCAATTATGACTGTTCTCCGGCCCTCGCCATTCAGTACACAGTGCATGGCGGGAAAGAGTCCTGGATGTTGGATCCATCTGTCCCTGTGGATAAAAAGGTGTACTGGCTCCTGACCCAACATCGCAAGGCTTCCACAGTGTTGAATGCCCTTTCGCCTCTTGCCTACCCGTAGGTCGCATGAAAAAAACTAACAGTCCTCACTATGAAGCGACTGTTTAAGAAGAAAGGAGGTTCAAAGTCTTCCCGCTCGTCTTCTAGCCGAGACGAAGAAGGGATGGACGGTGGAACCCTTTCTGGATGGGGTCAGCCCCTCGTCGGGCCGAGTGCTCCTCCGGCCAGGAGGGTCCTTGACACCCTGTCAAGGACTTACGATGTCGTTGGGGAACTCACTGTCTCGAGTCCCCGTCAAATCGAACATCAATCCTTCTTTGGTCGTATGAGTATGAACTTTCCCCACAGTTATCAGGGGGACGTGGCCATGAAGCCCTTCCATACGACCATCTTTGCCGCCCTTGTATCGGGGCTGAAAGAGGGAAAGGTGTCAAATAAAGGGTGGGTCTACTCACATCGCCTGGCAGAATGCGTGACCTTTCAAGGGCAAGCGGCCCAGCTGCCCCAGGGGTCCTCTGTCCATTTTAAAGACACTTTTGTGTGGCAATATAGAGGGGACTCCTACACCTGGGTGCTCAACATCACGTGGACCCTCTCCCACATGCCTGGGGTCCCCCTGCACACCTTCCTTCCTCCCCAGGTTAACCCATTGCTGGAGGTGCTGGGCGTGACCACAGTCTGGAACAAGGAACAGCGGTTTCTAACCCTGATTGACTAGCGGCCATGGGGTCCATGAAAAAAACTAACAGACCTCACAATGCTGCTTCTCCTCGCCATTCTGTTTTTCCCGGTCTTGACCGGCGGTACATGGGAACCTGAGGCTACCTTTGTGGTCCCAGAGGATCGTCAGTATGTTTGGAAGAGGATCAACATCTCGTCCCTGGAGTGCCCCAACATCTACAGCGTCCCCCGCCTTGACCGGATTGCCCAAGTTGCTTTGATGAGGCCGGAATTCACCGGCAGTTTTGACGATGCTGTTCAGGGTTACATCTGTTCAAAGATAAAGATGTCTGTTAAATGTTCTGTGAACTTCTTCGGTTGGCGTTCCTTTGAACATCTTGTGGAGGATGTTGTTCCATCCCGACAGGAGTGCTTAGAGGGAGTCCGGACCCTCCAGACGGATGGGAAATTGGCCAGTCCAGCATTCCCGGCTCCCAACTGTGGATGGATGGATGACAGGTGGGCAGAAGATCTATTCCTGGTTCTGACCAGTCACCCCACCCATGGCGATCCATACTCGGGGGAGTTTATAGATAAGATATTTCCAGCTGGCTTGTGTGGAAGTGATGACTGTCCCACCATACACCACGGATCTAGGTGGGTGACCACCACCCGGATACCATCCTCATGCACTCGGTTTCAAACGTCCTGGGCAAACATAGGGAACCAAGAGGATCCACCCCACACTAGAGTCATATACTCCCCGGAGTTTGGTGTGAGATCACTCGAGGGATCCTGCACCATTCGCTTTTGCGGTAAATCTGGTTGGAGACTGGAGACAGGTGAGTTCTTCGTGCTGAGTCATCCAGGTGGGGCATCCTTGGGCACTCCTCCCTTGTGTGAACGAGGTGTAAAAATAGGTGAACTCAGCTTGCAGGGACAACTTGACTACACGCGTCTTGAGTTGCTTGATCAGGAGACTCGACTTCAGTGTTTGACCACCCTCGCCACTGTCGTCGCCACCAACAAGGTCAGTCCGTTTCAACTAGGAATGTTTAACCCCACACACCCCGGCAACGGAAGGGCTTACCGGATCAAACATCGGTTCTTAGAAGAGGCCCTGGTCCGATATGTAGGGGTGTCCAAACTTGATAGCAGACCGATGGGTAACAGGCTGGGGGTGGACCACCAGGGGAAACCTGTGACGTGGTCAGACTGGGTAGAAGTGCCCAACACTAACCGAACATTCGGACCTAATGGGATTCTTAAACTCCCTTCTGGTGAAATAGTGATTCCCAACAAAGAAATCCGGGCTCTGCGACACAATCTCCAAATGACAGTAGCCCAGGACATAGACCTGGTAGGACATCCTCATCGGGAGATCACACAGAATTTTTCCGATCAGGTCGGCTCCAGCTCGCGCAACACAGCCACCGATGGCGGGGTAGATCCATTTGGGTGGATTAAAAGCAAGTGGGGATCCCTCGGCGGTGGACTCACCACCCTAGCTGTGGCAGGACTGCTCCTCTGGCTCCTCAGTCGCTGCACCTGCAGACGCTCCTCATCTGCCTCAGTCCCCACAATCAAACTCTCCACAAGGGACCGCAACTGGGAGAAGGTGGCGACAACCAGCGTGTAACCTTGAAAAAAACTAACAGACCTCCAAAATGACCTCTTATGAGGACAATCCCGAGGACGAGGTTCCCGGTCCCGCAGACGACTGGGATGCTTTCAGTGAAGTAGAGGCTGACCTGTTAAGTCCACTTAATGATCGTGAGCGGTCCAAAGTCAAGGGGGTTCTCAATTCGACCGACTACAACCTAAACTCGCCACTGATTAGTGATCACTCCGAAGCTGTCCTCGCCAGTCTGTCCGGAAGGGGACTCCCCGGTCGATACCTTCGGAGCCAAGAGATTGAGAGACAAAGACAAAGCCTGTCACATTTATCTTGTGATTGGAAGAAGCTCAAAGC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| 23,645
|
ON408165.1
|
Tahe rhabdovirus 1
|
Wang,Z., Liu,Z.
|
Jilin University, The First Hospital of Jilin University
|
China
|
2022-10-11
| null |
Tahe rhabdovirus 1
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,348
|
GenBank
| null |
China: Songling, Heilongjiang
|
China
|
Haemaphysalis concinna
| null |
2021-06-25
| null | null |
Tahe rhabdovirus 1 strain NE-SL2, complete genome
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AGACAACAAATTGTATGACCTTTATGAATGCCTCAATACCTGAGAACCCTTAACAGACCTCCAATCAAAGGGCTTCAAGTAGTTTCGTGCACTTAGAGCCAAAGGTTCTTCTGCCTTAAGAACCCTCTGTGGATTGAAAAGGTCGCTCAAAAGCAAATTCGCCCGATGGCGGACGGCAATATCGACCCCCTCGATGAAGAGGCCCTCATCGCGCTGGGGGATATTCCCGTCTTTAATGACGAAGAAGGGCTGCACCAGCTCCATGGACCAGCCGCCGTGGCACAGGTGGACCCGGAATTCCCAGCAACGTGGTTTACTGCCCAGCAGACTAAGCCTCGGTTGAACTGCCCCACATTCCAATCCCTGACGCCAGAAGACCTCCGGAAGACGGTTCATGGTGGTCTCGCAGGAGGGGGGCTGCCCGCCGACTACGCCGTGCTGTTCCTGAAGGTCGCCGCGGCTCAAGTCAGGACCACACTGACTGCGGACCTCGTAAGCTTCGGCCAGACCGTCGGCGCAGCAAATGACGTCATCACCCCTCTGAGTCTGCTGACCGTCAGCGAGGAGCCCTTCGAGGGACAGAGGCCCGCCTGTGCCATGAAGGAGAACCCCCCATCAGATCTGGCCATGGTGGCAGGGATCGCTGTGAATTACCGACTGTGTGTGGCCCAGGGCCGAGGCGGTACAGAGACGTACCTGGGCGCCATCAAGGACCGGTGCATGGCACTGCTGGCCAATCCCCCGTTCCGCATGCCAGACGGCTACCTGGACAACTGGACCACTTGCGCTCCCTGGGCAAGTCACCGGGAGATCCAGGTCATCCTGGCGGCCTATGATATGTTGCTGTATCTGGATGGGAATCACGCGTACGGTGCCATCCGGGCGGGGACCCTCGTATGCCGCGGGAGAGACTGTGCCGTCCTGGGTGATCTTCAACGGGCAGGGAAGGCACTTGGCACCAAACCCACCGGTGTCTTCTACTGGTGCTTTTCGGAGTCCCTGGCCCCCGAGCTAAAACTGCTGACCACTCGGGGGCAGGAGCTTGGGAATGAACGAAGTTACTTCCACTACCTGGCTCCGATGGCACTGTCCCGACGATCTCCATACTCGGCCTCCATCTGCCCTGGGATCCATCTCATGTGCAACGCTGTGGCAGCCCTTCTCGGCATTGAAGAAGCCCAGAACACCCGCTACGTCGCCTGCAGCAGCCCCCACGCCGTCCTCACAAATGCCGCCATGGTGGCCTACGCCAACCGGGAGGGGTCCGGCTTCCGACAGATGGTCACGAAAGGGGCGGTGGCCGGTCGAGTGGCAAGAGCGGAGTGGATGGCCAGCCTGGGACGCCGGGATGCCGAAGAGGTGATAGACGGGTCTCGATTCCCCGGCTCCGCCAACCCGCTCCTGTGGTGCCAGTTCATGCGCCTCAAGGGCTGGTCACTGCCTGAGGAGATCAAGGACTGGGCCAGTGTGCGAGTCCAGACCTTCCACAGCGTTCGCGCTGGATCCGTGGCCGAGTTCGTGCGCAACCGCTTTGCCCGGGAGGCTTAAGTCCCCATGAAAAAAAGTAACAGACATCAACCATGGCAGGTACCAACGAGACCAACGACTTTGTTAGTGACCCGAATGTATTTTTCGCGTCCTTCGATCCGGAAGTTCTCGCGGATCTTGACAAGGCTGCGATCCTGCAGTCCCAGTCTGAGGCGGCCGAAAAGCTTCCGCATGACGATCACGCCGATGATCCGGCTCACGAGCGGGTACCCGGGTACAATGTAGACCCTGTTACGCCGCTGGATCCACCACAGGCAGAGCTGACCCAAGCAACTCTCGAGGAATTGGGTCTTGAGCAATTTGAGTGGGAAGGAGAAACAGAGGAGATGGCCCTGAGAGAGTCAATCGCCATCCGAAAATTTGCTGAGGACCTGGTCGCAAAGAAGGCCATTCATCTGGAATCGGTAGATGTGGTCAAGAATAAAGTAGTGACCAAATATCGTCCCTTTCGGGCGGCTCTATCGTCAGATAGCAGTTCGGGCGGAGAACCCCGACCCAAGCCGGTCATAAAGACCAACAAGCCGGCCTCGACACCCACTCCACCCGGGCTCCCTCGCTCTCCATCCAGACCAGCCCAAACTCCCTCCGCCCCCTCGACTTCCTCCAACCCCAGTCCGAGCTCAGATGACCGGACATCTGCACTGGAGTTCTGCAACACCAAGGTACTGATGAAGGGTTATGGCGGCAGCCAAATTGCCATCCAACTCAGCAATTATGACTGTTCTCCGGCCCTCGCCATTCAGTACACGGTGCATGGCGGGAAAGAGTCCTGGATGTTGGATCCATCTGTCCCTGTAGATAAAAAGGTGTACTGGCTCCTGACCCAACATCGCAAGGCTTCCACGGTGTTGAATGCCCTTTCGCCTCTTGCCTACCCGTAGGTCGCATGAAAAAAACTAACAGTCCTCACTATGAAGCGACTGTTTAAGAAGAAAGGAGGTTCAAAGTCTTCCCGCTCGTCTTCTAGCCGAGACGAAGAAGGGATGGACGGTGGAACCCTTTCTGGATGGGGTCAGCCCCTCGTCGGGCCGAGTGCTCCTCCGGCCAGGAGGGTCCTTGACACCCTGTCAAGGACGTACGATGTCGTTGGGGAACTCACTGTCTCGAGTCCCCGTCAAATCGAACATCAATCCTTCTTTGGTCGTATGAGTATGAACTTTCCCCACAGTTATCAGGGGGACGTGGCCATGAAGCCATTCCATACGACCATCTTTGCCGCCCTTGTATCGGGGCTGAAAGAGGGAAAGGTGTCAAATAAAGGGTGGGTCTACTCACATCGCCTGGCAGAATGCGTGACCTTTCAAGGGCAAGCGGCCCAGCTGCCCCAGGGGTCCTCTGTCCATTTTAAAGACACTTTTGTGTGGCAGTATAGAGGGGACTCCTACACCTGGGTGCTCAACATCACGTGGACCCTCTCCCACATGCCTGGGGTCCCCCTGCACACCTTCCTTCCTCCCCAGGTTAACCCATTGCTGGAGGTGCTGGGCGTGACCACAGTCTGGAACAAGGAGCAGCGGTTCCTGACCCTGATTGACTAGCGGCCATGGGGTCCATGAAAAAAACTAACAGACCTCACAATGCTGCTTCTCCTCGCCATTCTGTTTTTCCCGGTCTTGACCGGCGGTACATGGGAACCTGAGGCTACCTTTGTGGTCCCAGAGGATCGTCAGTATGTTTGGAAGAGGATCAACATCTCGTCCCTGGAGTGCCCCAACATCTACAGCGTCCCCCGCCTTGACCGGATTGCCCAAGTTGCTTTGATGAGGCCGGAATTCACCGGCAGTTTTGACGATGCCGTTCAGGGTTACATCTGTTCAAAGATAAAGATGTCTGTTAAATGTTCTGTGAACTTCTTTGGTTGGCGTTCCTTTGAACATCTTGTAGAGGATGTTGTTCCATCCCGACAGGAGTGCTTAGAGGGAGTCCGGACCCTTCAGACGGATGGGAAATTGGCTAGTCCAGCATTCCCGGCTCCCAACTGTGGATGGATGGATGACAGGTGGGCAGAAGATCTATTCCTGGTTCTGACCAGTCACCCCACCCATGGTGATCCATACTCCGGGGAGTTTATAGATAAGATATTTCCAGCCGGCCTGTGTGGAAGTGATGACTGTCCCACCATACACCACGGCTCGAGGTGGGTAACCACCACCCGGATACCATCCTCATGCACTCGATTTCAGACGTCCTGGGCAAACATAGGGAACCAGGAGGATCCACCCCATACGAGAGTCATATACTCCCCGGAGTTTGGTGTGAGATCACTCGAGGGATCCTGCACCATTCGTTTTTGCGGTAAATCTGGTTGGAGACTGGAGACAGGTGAGTTCTTCGTGCTGAGTCATCCAGGTGGGGCATCCTTGGGCACTCCTCCCTTGTGTGAACGAGGTGTAAAAATAGGTGAACTCAGCTTGCAGGGACAACTTGACTACACGCGTCTTGAGTTGCTTGATCAGGAGACTCGACTTCAGTGTTTGACCACCCTCGCCACTGTCGTCGCTACCAACAAGGTCAGTCCGTTTCAACTAGGAATGTTTAACCCCACACACCCCGGCAACGGAAGGGCTTACCGGATCAAACATCGGTTCTTAGAAGAGGCCCTGGTCCGATATGTAGGGGTGTCCAAACTTGATAGCAGACCGATGGGTAACAGGCTGGGGGTGGACCACCAGGGGAAACCTGTGACGTGGTCAGACTGGGTAGAAGTGCCCAACACTAACCGAACATTCGGACCTAATGGGATTCTTAAACTCCCTTCTGGTGAAATAGTGATTCCCAACAAAGAAATCCGGGCTCTGCGACACAATCTCCAAATGACAGTAGCCCAGGACATAGACCTGGTAGGACATCCTCATCGGGAGATCACACAGAATTTTTCCGATCAGGTCGGCTCCAGCTCGCGCAACACAGCCACCGATGGCGGGGTAGATCCATTTGGGTGGATTAAAAGCAAGTGGGGATCCCTCGGCGGTGGACTCACCACCCTAGCTGTGGCAGGACTGCTCCTCTGGCTCCTCAGTCGCTGCACCTGCAGACGCTCCTCATCCACCCCAGTCCCCACAATCAAACTCTCCACAAGGGACCGCAACTGGGAGAAGGTGGCGACGACCAGCGTGTAACCTTGAAAAAAACTAACAGACCTCCAAAATGACCTCTTATGAGGACAATCCCGAGGACGAGGTTCCCGGTCCCGCAGACGACTGGGATGCTTTCAGTGAAGTGGAGGCTGACCTGTTAAGTCCACTTAATGATCGTGAGCGGTCCAAAGTCAAGGGGGTTCTCAATTCGACCGACTACAACCTAAACTCGCCACTGATTAGTGATCACTCCGAAGCCGTCCTCGCCAGTCTGTCTGGAAGGGGACTCCCCGGTCGATACCTTCGGAGCCAAGAGATTGAGAGACAAAGACAAAGCCTGTCACATTTATCTTGTGATTGGAAGAAGCTCAAAGC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| 23,646
|
ON408166.1
|
Tahe rhabdovirus 1
|
Wang,Z., Liu,Z.
|
Jilin University, The First Hospital of Jilin University
|
China
|
2022-10-11
| null |
Tahe rhabdovirus 1
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,349
|
GenBank
| null |
China: Dunhua, Jilin
|
China
|
Haemaphysalis japonica
| null |
2020-05-05
| null | null |
Tahe rhabdovirus 1 strain NE-DH1, complete genome
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| 23,647
|
ON408167.1
|
Tahe rhabdovirus 1
|
Wang,Z., Liu,Z.
|
Jilin University, The First Hospital of Jilin University
|
China
|
2022-10-11
| null |
Tahe rhabdovirus 1
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,349
|
GenBank
| null |
China: Yichun, Heilongjiang
|
China
|
Haemaphysalis concinna
| null |
2021-06-20
| null | null |
Tahe rhabdovirus 1 strain NE-YC2, complete genome
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AGACAACAAATTGTATGATATTTATGACTGCCCCAATGCCTGAGAACCCTTAACAGACCTCCAATCAAAGGGCTTCCAGTGGTTTCGTACCCTTAGAGCCAACGACTTTCCCACCTTAAGGACTCTTTGTGGAGTGAGAGAAGGAACTCAAAAGCGAACTCGCCAAATGGCGGATGACCAAGATAACCTCGTTAACGAAGACCCTCTTCGAGAGCTGGTGGACGAACCCGTCTTCAACGATGCGGGCGGGCTATATCAGCTGCACGGACCAGCCGAGGTGGCTCGAGTGGCCCCAGAGTTTCCGGCCACATGGTTTGCAGCTCAGCGGAACAAGCCGCGACTTAACTGCCCCGTCTTCCAGGGGCTATCGCCAGAGGACCTCCGCAAGACGGTTCATGGTGGTCTTGCTGGAGGGAATTTACCCGCCGATTACGCTGTCTTGTTCCTGAAGGTGGCGGCAGTGAGTATCCAGACCACCCTGACTGCCGATCTGACGAGCTTCGGTCAAACCGTTGGCGCGGCAACTGATGTGATCAACCCGCTGAGTCTGCTGGACGTTCATGAAGAGCCATTTGCCGGAGAACGTCCTGCTTGCCCCATGAAGGACAACCCTCCTTCAGATGCGGCCATGGTGGCAGGCATTGCGGTGAACTATCGACTGTGTGTCGCTAAAGGTCGAGGCGGCACAGAAACATATCTGAACGCTATCAAGGACCGGTGTGTGGCCCTGCTGGCCAATCCGCCGTTCCGGATGCCAGAGGGCTACCTGGACAACTGGACCACCTGCGCACCGTGGACCAGTCACAGAGAGATTCAGGTCATCCTGGCAGCCTACGACATGCTGCTGTACCTAGATGGAAACCATGCATATGGTGCCATCCGGGCGGGGACCCTCGTGTGCCGAGGAAGAGACTGCGCCATTCTGGGCGATCTCCAACGAGCTGGGAGAGCACTGGGGACAGCACCAACTGGAGTTTTCTACTGGTGCTTCTCAGAATCACTGGCACCTGAGCTCAAGTTGCTGACTACTCGGGGTCAGGAGCTTGGTGACGACAGAAGTTACTACCACTACCTGGCTCCGATGGCTTTGTCTCGGCGGTCTCCCTACTCAGCGTCCATCTGCCCTGGGATCCATCTCATGTGCAATGCCGTAGCAGCCCTCCTCGGAATTGAAGAGGCCCAGAACACCCGCTACGTGGCTTGCAGCAGCCCGCATGCGGTTCTCACAAACGCTGCCATGGTCGCCTACGCCAACAGAGAAGGGACCGGCTTTCGCCAGATGGTGACCAAGGGGACAGCAGCCGGACGGGTTGCACGAACTGAATGGTTGGCCAGCCTGGGACGCCTGGCAGAGGAAGAGGTTGTGGACGGGACTCAGCTCCCCAGCACAGCTAGCCCACTCATGTGGTGTCAGTTCATGCGCCTCCGAGGATGGATGCTTCCTGAGGAGATCAAGGACTGGGCCAGTGTGCGGGTCCAAACCTTCCACAGTGTTCGCACCGGGTCCGTGGCTGAGTTTGTCCGCAACCGCTTTGCCCGGGAGGTCTGAATTCCCATGAAAAAAAGTAACAGACCTCCACTATGTCATCAGATAGCGAAGCAAGCGACTTTATCGACGACCCACACGCCTTTTTCGCTGGGCTAGATCCTGATGCCCTAGAAGAGCTAGATCGGGCTGCGGTGTTGCAGGCTCATTCAGAGGCGGCCGAAAAGCTTCCATCAGCCGGCCACACGGATGATCCAGCTCGAGAACGGGTTCCGGGATACAATGAGCTCCTGGTGGTGCCTCTAGATCAACCCCAGGCTGAACTGACCCAGGCCACTCTAGAAGAGCTGGGGTTGGAGCAGTTTGAGTGGGAGGGAGAGACGGAGGAGATGGCCCTGAGGGAGTCAATTGCCATCCGAAAGTTTGCGGAGGACTTGGTTGAGAAGAAGGCAATTCACCTGGAATCCGTTGACGTGGTCAAGAACAAAGTGGTGGCAAAATATCGGCCGTTTCGGGCAGCTCTCTCATCTGACAGCAGCTCAGGTGGGGAGCTTCGATCCAAGTCAGTCGCGAAGGCCAGTAAACCTGCCCCAGCCGCGGCCCCACCCAAGCTTCCACGCGTTCCACCCAAGCCAGTCCAGACGCCCTCAGCCTCATCGACCCCGTCCACCCTGACCCCAAGCTCAGATGACCAAACCGCCGCTCTCGGGTTCTGCAACACCAAAGTGCTGATGAAAGGGTACGGTGGAAGTCAGATAGCTGTCCAATTGAGCAACTACGACTGTTCACCGGCCCTCGCTGCTCAGTATACAGCTCACAGCGGAAGAGAGTCCTGGATGTTAGACCCTGCTGTCCCGGTGGACAAGAAGGTCTACTGGCTCTTGACCCAACATCGCAAAGCGTCGAAAGTGCTGAACGCCCTTTCCCCTCTTGCCTATCCTTAGGTCACATGAAAAAAACTAACAGTCCTCACTATGAAGCGACTGTTTAAGAAGAAGGGAGGGTCCAAGTCCTCCCGCACGTCTTCCAGCAAAGACGAGGAGGGAACGGACGGGGGAGCTCTCTCCGGGTGGGGTCAACCACTGGTTGGTCCAAGTGCTCCGCCGGCCAGGAGGGTCCTTGACTCCCTGTCAAGGACGTATGATGTTGTCGGGGAACTTACAGTGTCTAGTCCCCGTCAAATTGATCATCAATCCTTCTTTGGCCGCATGAGTATGAATTTCCCCCACAGTTACCAAGGGGATGTGGCCATGAAACCCTTCCACACGACCATCTTCGCTGCTCTTGTGTCGGGTCTGAAGGAGGGAAAGGTGTCCCACAAGGGCTGGATTTACTCGCATCGCCTGGCAGAATGTGTCACCTTCCAGGGGCAAGCTTCCCAATTACCCCAAGGGACCTCTGTTCACTTCAAGGACACCTTTGTCTGGCAATACAGAGGGGACTCCTACACCTGGGTAATCAACATCACCTGGACTTTGTCCCACATGCCTGGGATCCCCCTGCATGCCTTTCTTCCTCCCCAGGTGAATCCCCTCCTAGAAGTGCTGGGGGTAACAACCGTGTGGAACAAGGAGCAGCGTTTCCTGACACTGATTGACTAGTGGGGTGAAGTGCCCGTGAAAAAAACTAACAGACCTCAACATGTTGCTCCTTATCACAATTGTGTGCTTTCCCATATTGACTGGCGGTGTATGGGAGCCCGAAGCCACCTTTGTGGTTCCCGAGGATCGTCAGTATGTCTGGAAAAGGATCAACGTTTCTTCTCTGGAGTGTCCGAACATCTACAGCGTTCCACGGCTCAGCCGGATTGCACAAGTTGCACTATTGAGACCCGAGTTTACCGGCAGTTTTGATGACGCAGTACAGGGGTACATCTGCTCCAAGGTCAAAATGTCTGTCAAATGCTCTGTAAATTTCTTTGGCTGGCGTTCTTTCGAACATCTCGTTGAAGATGTTGTACCATCACGACAGGAGTGCCTGGAAGGGGTAAGGACTCTCCAGGTAGATGGAAAACTGTCGAGTCCGGCATTCCCTGCTCCCAACTGTGGATGGATGGATGATAGGTGGGCAGAAGATCTGTTTTTGATTCTGACCAGCCATCCAACCCATGGTGATCCATACACAGGGGACTTTATAGACAAGATTTTCCCGGCCGGTATATGCGGAACCGATGACTGTCCCACCATACACCACGGATCTAGGTGGGTAACTACTAACCGAACTCCATCTTCATGCACTCGATTTCAGACATCCTGGGCAAACATCGGGAACCAAGAGGATCCCCCTCATACCAGAGTGGTATACTCTCCAGAATTTGGGGTTAGATCGCTCGAGGGGTCTTGCACTATCCGCTTCTGCGGGAAATCCGGTTGGAGATTGGAAACAGGCGAATTTTTTGTGCTGAGCAGCCCAGGAGGAACGTCCCTGGGGATCCCTCCTCTGTGTGAACGGGGCGTGAAAATTGGGGAACTCAGCCTCCAGGGACAATTGGATTACACACGTCTAGAATTACTAGATCAGGAAACCCGGCTCCAATGTTTAACCACCCTTGCCACTATTGTCGCTACCAACAAAGTCAGCCCATTTCAACTCGGGATGTTCAATCCAACACACCCAGGCAACGGAAGGGCATACCGAATCAGGCAGAAGTTCCTAGAAGAGGCCCTGGTGCGATATGTTGGGGTGACCAAACTTGACGACAAGCCGCGGAACAACAGATTAGGTGTCGACCATCAAGGGAAACCTGTGATGTGGTCTGACTGGGTGGAGGTGCCCGGCACCAATCGGACCTTTGGACCTAACGGGCTTCTCAAATTACCCACCGGTGAAATAGTGATCCCCAATAAAGAGATTCGAGCATTGAGGCACAACCTTCAAATGACAGTGGCTCAAGACATAGACCTTGTGGGACATCCGCATCGGGAGATCACACAGAACTTTTCTGACCAAATCGGTCTCAGTTCCCGCAACACAGCAACTGACGGCGGAATAGATCCCTTTGGATGGATCAAAAGCAAATGGGGGTCACTCGGAGGAGGACTCACCACTTTGATTGTTGCGGGACTAATCCTCTGGCTCCTTAGTCGCTGCATTTGCAAACGCTCCCCCTCCAACTCAGTCCCCACAATCAAACTCTCCACCAGGGATCGCAACTGGGAGAAGGTGGCTACCACCAGTGTGTAACCTTGAAAAAAACTAACAGACCTCCAACATGACCTCTTACGAGGACGACCTCGAGGACGAGGTCCCTGGTCCCGTAGATGACTGGGACGCTTTTACAGAAGTAGAAATTGATCTGTTGAACCCGCTGAATGACCATGAAAGGTCAAGGGTCAAGGGAGTTCTCAATTCGACTGATTATAACCTGAACTCACCGCTGATCAGCGACCACTCAGATGCAGTACTCGCCAGTTTAGCTGGGAGAGGGCTTCCCGGTCGCTACCTTCGAAGCCAGGAAATCGAGCGACAACAACAAAGCCTGGCACACCTGTCCTGCGACTGGAACAAAATCCAA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| 23,648
|
ON408168.1
|
Tahe rhabdovirus 1
|
Wang,Z., Liu,Z.
|
Jilin University, The First Hospital of Jilin University
|
China
|
2022-10-11
| null |
Tahe rhabdovirus 1
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,349
|
GenBank
| null |
China: Shulan, Jilin
|
China
|
Dermacentor silvarum
| null |
2021-04-23
| null | null |
Tahe rhabdovirus 1 strain NE-ShL3, complete genome
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AGACAACAAATTGTATGATATTTATGACTGCCCCAATGCCTGAGAACCCTTAACAGACCTCCAATCAAAGGGCTTCCAGTGGTTTCGTACCCTTAGAGCCAACGATTTTCCCACCTTAAGGACTCTTTGTGGAGTGAGAGAAGGAACTCAAAAGCGAACTCGCCAAATGGCGGATGACCAAGATAACCTCGTCAACGAAGACCCTCTTCGAGAGCTGGTGGACGAACCCGTCTTCAACGATGCGGGCGGGTTATACCAGCTGCACGGACCAGCCGAGGTGGCTCGAGTGGCCCCAGAGTTTCCGGCCACGTGGTTTGCAGCTCAGCGGAACAAGCCGCGACTTAACTGCCCCGTCTTCCAGGGGCTATCGCCAGAGGACCTCCGCAAGACGGTTCATGGTGGTCTTGCTGGGGGGAATTTACCCGCCGATTACGCTGTCTTGTTCCTGAAGGTGGCGGCAGTGAGCATCCAGACCACCCTGACTGCCGATCTGACGAGCTTCGGTCAAACCGTTGGCGCGGCAACTGATGTGATCAACCCGCTGAGTCTGCTGGACGTTCATGAAGAGCCATTTGCCGGAGAACGTCCTGCTTGCCCCATGAAGGACAACCCTCCTTCAGATGCGGCCATGGTGGCAGGCATTGCGGTGAACTATCGACTGTGTGTCGCTAAAGGTCGAGGCGGCACAGAGACATATCTGAACGCTATCAAGGACCGGTGTGTGGCCCTGCTGGCCAATCCGCCATTCCGGATGCCAGAGGGCTACCTGGACAACTGGACCACCTGCGCACCGTGGACCAGTCACAGAGAGATTCAGGTCATCCTGGCAGCCTACGACATGCTGCTGTACCTAGATGGAAACCATGCATATGGTGCCATCCGGGCGGGGACCCTCGTGTGCCGAGGAAGAGACTGCGCCATTCTGGGCGATCTCCAACGAGCGGGGAGAGCACTGGGGACCGCACCAACTGGAGTTTTCTACTGGTGCTTCTCGGAATCACTGGCACCTGAGCTCAAGTTGCTGACTACTCGGGGTCAGGAGCTTGGTGACGACAGAAGTTACTACCACTACCTGGCTCCGATGGCTTTGTCTCGGCGGTCTCCCTACTCAGCGTCCATCTGCCCTGGGATCCATCTCATGTGCAATGCCGTAGCAGCCCTCCTCGGAATTGAAGAGGCCCAGAACACCCGCTACGTGGCTTGCAGCAGCCCGCATGCGGTTCTCACAAACGCTGCCATGGTCGCCTACGCCAACAGAGAAGGGACCGGCTTTCGCCAGATGGTGACCAAGGGGACAGCAGCCGGACGGGTTGCACGAACTGAATGGTTGGCCAGCCTGGGACGCCTGGCAGAGGAAGAGGTTGTGGACGGGACTCAGCTCCCCAGCACAGCTAGCCCACTCATGTGGTGTCAGTTCATGCGCCTCCGAGGATGGATGCTTCCTGAGGAGATCAAGGACTGGGCCAGTGTGCGGGTCCAAACCTTCCACAGTGTTCGCACCGGGTCCGTGGCTGAGTTTGTCCGCAACCGCTTTGCCCGGGAGGTCTGAATTCCCATGAAAAAAAGTAACAGACCTCCACTATGTCATCAGATAGCGAAGCAAGCGACTTTATCGACGACCCACACGCCTTTTTCGCTGGGCTAGATCCTGATGCCCTAGAAGAGCTAGATCGGGCTGCGGTGTTGCAGGGTCAGTCAGAGGCGGCCGAAAAGCTTCCGTCAGCCGGCCACACAGATGATCCAGCTCGAGAACGGGTTCCGGGATACAATGAGCTCCTGGTGGTGCCTCTAGATCAACCCCAGGCTGAACTGACCCAGGCCACTCTAGAAGAGCTGGGGTTGGAGCAGTTTGAGTGGGAGGGAGAGACGGAGGAGATGGCCCTGAGGGAGTCAATTGCCATCCGAAAGTTTGCGGAGGACTTGGTTGAGAAGAAGGCAATTCACCTGGAATCCGTTGACGTGGTCAAGAACAAAGTGGTGGCAAAATATCGGCCGTTTCGGGCAGCTCTCTCATCTGACAGCAGCTCAGGTGGGGAGCTTCGATCCAAGTCAGTCGCGAAGGCCAGTAAACCTGCCCCAGCCGCGGCCCCACCCAAGCTTCCACGCGTTCCACCCAAGCCAGTCCAGACGCCCTCAGCCCCATCGACCCCGTCCACCCTGACCCCAAGCTCAGATGACCAAACCGCCGCTCTCGGGTTCTGCAACACCAAAGTGCTGATGAAAGGGTACGGTGGAAGTCAGATAGCTGTCCAATTGAGCAACTACGACTGTTCACCGGCCCTCGCTGCTCAGTATACAGCTCACAGCGGAAGAGAGTCCTGGATGTTAGACCCTGCTGTCCCGGTGGACAAGAAGGTCTACTGGCTCTTGACCCAACATCGCAAAGCGTCGAAAGTGCTGAACGCCCTTTCCCCTCTTGCCTATCCTTAGGTCACATGAAAAAAACTAACAGTCCTCACCATGAAGCGACTGTTTAAGAGGAAGGGAGGGTCTAAGTCCTCCCGCACGTCTTCCAGCAAAGACGAGGAGGGAACGGACGGGGGAGCTCTCTCCGGGTGGGGTCAACCACTGGTTGGTCCAAGTGCTCCGCCGGCCAGGAGGGTCCTTGACTCCCTGTCAAGGACGTATGATGTTGTCGGGGAACTTACAGTGTCTAGTCCCCGTCAAATTGATCATCAATCCTTCTTTGGCCGCATGAGTATGAATTTCCCCCACAGTTACCAGGGGGATGTGGCCATGAAACCCTTCCACACGACCATCTTCGCTGCTCTTGTGTCGGGTCTGAAGGAGGGAAAGGTATCCCACAAGGGCTGGATTTACTCGCATCGCCTGGCAGAATGTGTCACCTTCCAGGGGCAAGCTTCCCAATTGCCCCAAGGGACCTCTGTCCACTTCAAGGACACCTTTGTCTGGCAATACAGAGGAGACTCCTACACCTGGGTGATCAACATCACCTGGACCTTGTCCCACATGCCTGGGATCCCCCTGCATGCCTTTCTTCCTCCCCAGGTGAATCCCCTCCTAGAAGTGCTGGGGGTAACAACTGTGTGGAACAAGGAGCAGCGTTTCCTGACACTGATTGACTAGTGGGGTGAAGTGCCCGTGAAAAAAACTAACAGACCTCAACATGTTGCTCCTTATCACAATCGTGTGCTTTCCCATATTGACTGGCGGTGTATGGGAGCCCGAAGCCACCTTTGTGGTTCCCGAGGATCGTCAGTATGTCTGGAAAAGGATCAACGTTTCTTCTCTGGAGTGTCCGAACATCTACAGCGTTCCACGGCTCAGCCGGATTGCACAAGTTGCACTATTGAGACCCGAGTTTACCGGCAGTTTTGATGACGCAGTACAGGGGTACATCTGCTCCAAGGTCAAAATGTCTGTCAAATGCTCTGTAAATTTCTTTGGCTGGCGTTCTTTCGAACATCTCGTTGAAGATGTTGTACCATCACGACAGGAGTGCCTGGAAGGGGTAAGGACTCTCCAGGTAGATGGAAAACTGTCGAGTCCGGCATTTCCTGCTCCCAACTGTGGATGGATGGATGATAGGTGGGCAGAAGATCTGTTTTTGATTCTGACCAGCCATCCAACCCATGGTGATCCATACACAGGGGACTTTATAGACAAGATTTTCCCGGCCGGTATATGCGGAACCGATGACTGTCCCACCATACACCACGGATCTAGGTGGGTAACTACTAACCGAACCCCATCTTCATGCACTCGATTTCAGACATCCTGGGCAAACATCGGGAACCAAGAGGATCCCCCTCATACCAGAGTGGTATACTCTCCAGAATTTGGGGTTAGATCCCTCGAGGGGTCCTGCACTATCCGCTTCTGCGGAAAATCCGGTTGGAGATTGGAAACAGGCGAATTTTTTGTGCTGAGCAGCCCAGGAGGAACGTCCCTGGGGATCCCTCCTCTGTGTGAACGGGGCGTAAAAATTGGGGAACTCAGCCTTCAGGGACAATTGGACTACACACGTCTAGAATTACTGGATCAGGAAACCCGGCTCCAATGTTTAACCACCCTTGCCACTATTGTCGCCACCAACAAAGTCAGCCCATTTCAACTCGGGATGTTCAATCCAACACACCCAGGCAACGGAAGGGCATACCGAATCAGGCAGAAGTTCCTAGAAGAGGCCCTGGTGCGATATGTTGGGGTGACCAGACTTGACGACAAGCCGCGGAACAACAGATTAGGTGTCGACCATCAAGGGAAACCTGTGATGTGGTCTGACTGGGTGGAGGTGCCCGGCACCAATCGGACCTTTGGACCTAACGGGCTTCTCAAATTACCCACCGGTGAAATAGTGATCCCCAATAAAGAGATTCGGGCATTGAGGCACAACCTTCAAATGACAGTGGCTCAAGACATAGACCTTGTGGGACATCCGCATCGGGAGATCACACAGAACTTTTCTGACCAAATCGGTCTCAGTTCCCGCAACACAGCAACTGACGGCGGAATAGATCCCTTTGGATGGATCAAAAGCAAATGGGGGTCACTCGGAGGAGGACTCACCACTTTGGTTGTTGCGGGACTAATCCTCTGGCTCCTTGGTCGCTGCATTTGCAAACGCTCCCCCTCCAACTCAGTCCCCACAATCAAACTCTCCACCAGGGATCGCAACTGGGAGAAGGTGGCTACCACCAGTGTGTAACCTTGAAAAAAACTAACAGACCTCCAACATGACCTCTTACGAGGACGACCTCGAGGACGAGGTCCCTGGTCCCGTAGATGACTGGGACGCTTTTACTGAAGTAGAAATTGATCTGTTGAACCCGCTGAATGACCATGAAAGGTCAAGGGTCAAAGGAGTTCTCAATTCGACTGATTATAACCTGAACTCACCGCTGATCAGCGACCACTCAGATGCAGTACTCGCCAGTTTAGCTGGGAGAGGGCTTCCCGGTCGCTACCTTCGAAGCCAGGAAATCGAGCGACAACAACAAAGCCTGGCACACCTGTCCTGCGACTGGAACAAAATCCAA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| 23,649
|
ON408169.1
|
Tahe rhabdovirus 1
|
Wang,Z., Liu,Z.
|
Jilin University, The First Hospital of Jilin University
|
China
|
2022-10-11
| null |
Tahe rhabdovirus 1
| null |
Rhabdoviridae
|
ssRNA(-)
| 11,349
|
GenBank
| null |
China: Ji'an, Jilin
|
China
|
Haemaphysalis japonica
| null |
2021-04-27
| null | null |
Tahe rhabdovirus 1 strain NE-JA, complete genome
|
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Tahyna virus
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Lu,Z., Fu,S., Liang,G.
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National Center for Biotechnology Information, NIH
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USA
|
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| null |
Orthobunyavirus tahynaense
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Orthobunyavirus
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Peribunyaviridae
|
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|
China
|
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| 1,816
|
OP727996.1
|
Tahyna virus
|
Cai,T., Liu,R., Jiang,T.Y., Jia,N., Jian,Y.X., Cheng,L.X., Song,L.F., Guo,X.X., Zhao,Y.T.
|
Institute of Microbiology and Epidemiology, Department of Vector Biology and Control
|
China
|
2023-02-12
| null |
Orthobunyavirus tahynaense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 7,022
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Aedes
| null |
2016
| null | null |
Tahyna virus strain PJ01 segment L, complete sequence
|
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| 18,389
|
KF361874.1
|
Tahyna virus
|
Kilian,P., Valdes,J.J., Lecina-Casas,D., Chrudimsky,T., Ruzek,D.
|
Institute of Parasitology, Laboratory of Parasite Immunology
|
Czech Republic
|
2013-11-04
| null |
Orthobunyavirus tahynaense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
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|
GenBank
| 1
|
Czechoslovakia
|
Czechoslovakia
|
Aedes vexans
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1963
| null | null |
Tahyna virus strain 29 segment L, complete sequence
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Tahyna virus
|
Kilian,P., Valdes,J.J., Lecina-Casas,D., Chrudimsky,T., Ruzek,D.
|
Institute of Parasitology, Laboratory of Parasite Immunology
|
Czech Republic
|
2013-11-04
| null |
Orthobunyavirus tahynaense
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Orthobunyavirus
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Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,976
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GenBank
| 1
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Czechoslovakia
|
Czechoslovakia
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Aedes vexans
| null |
1963
| null | null |
Tahyna virus strain 76 segment L, complete sequence
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| 92,754
|
KF361876.1
|
Tahyna virus
|
Kilian,P., Valdes,J.J., Lecina-Casas,D., Chrudimsky,T., Ruzek,D.
|
Institute of Parasitology, Laboratory of Parasite Immunology
|
Czech Republic
|
2013-11-04
| null |
Orthobunyavirus tahynaense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
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|
GenBank
| 1
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Czechoslovakia
|
Czechoslovakia
|
Aedes vexans
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1963
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Tahyna virus strain 89 segment L, complete sequence
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| 92,755
|
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Kilian,P., Valdes,J.J., Lecina-Casas,D., Chrudimsky,T., Ruzek,D.
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Institute of Parasitology, Laboratory of Parasite Immunology
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Czech Republic
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2013-11-04
| null |
Orthobunyavirus tahynaense
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Orthobunyavirus
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Peribunyaviridae
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ssRNA(-)
| 6,976
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GenBank
| 1
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Czechoslovakia
|
Czechoslovakia
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Ochlerotatus cantans
| null |
1963
| null | null |
Tahyna virus strain 94 segment L, complete sequence
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| 92,756
|
KF361878.1
|
Tahyna virus
|
Kilian,P., Valdes,J.J., Lecina-Casas,D., Chrudimsky,T., Ruzek,D.
|
Institute of Parasitology, Laboratory of Parasite Immunology
|
Czech Republic
|
2013-11-04
| null |
Orthobunyavirus tahynaense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
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|
GenBank
| 1
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Czechoslovakia
|
Czechoslovakia
|
Aedes vexans
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1962
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Tahyna virus strain 181 segment L, complete sequence
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Institute of Parasitology, Laboratory of Parasite Immunology
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Czech Republic
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2013-11-04
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Orthobunyavirus tahynaense
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Orthobunyavirus
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Peribunyaviridae
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Czechoslovakia
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Czechoslovakia
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1962
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Tahyna virus strain 181/57 segment L, complete sequence
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| 92,758
|
KF361880.1
|
Tahyna virus
|
Kilian,P., Valdes,J.J., Lecina-Casas,D., Chrudimsky,T., Ruzek,D.
|
Institute of Parasitology, Laboratory of Parasite Immunology
|
Czech Republic
|
2013-11-04
| null |
Orthobunyavirus tahynaense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,976
|
GenBank
| 1
|
Czechoslovakia
|
Czechoslovakia
|
Aedes vexans
| null |
1958
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Tahyna virus strain 236 segment L, complete sequence
|
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|
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Kilian,P., Valdes,J.J., Lecina-Casas,D., Chrudimsky,T., Ruzek,D.
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Institute of Parasitology, Laboratory of Parasite Immunology
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Czech Republic
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2013-11-04
| null |
Orthobunyavirus tahynaense
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Orthobunyavirus
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Peribunyaviridae
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ssRNA(-)
| 6,976
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GenBank
| 1
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Czechoslovakia
|
Czechoslovakia
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Aedes vexans
| null |
1964
| null | null |
Tahyna virus strain 1014 segment L, complete sequence
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| 92,760
|
KF361882.1
|
Tahyna virus
|
Kilian,P., Valdes,J.J., Lecina-Casas,D., Chrudimsky,T., Ruzek,D.
|
Institute of Parasitology, Laboratory of Parasite Immunology
|
Czech Republic
|
2013-11-04
| null |
Orthobunyavirus tahynaense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
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|
GenBank
| 1
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Czechoslovakia
|
Czechoslovakia
|
Aedes vexans
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1966
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Institute of Parasitology, Laboratory of Parasite Immunology
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Czech Republic
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2013-11-04
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Orthobunyavirus
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Peribunyaviridae
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ssRNA(-)
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GenBank
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Czechoslovakia
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Czechoslovakia
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Aedes vexans
| null |
1966
| null | null |
Tahyna virus strain 4034 segment L, complete sequence
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| 92,762
|
KF361884.1
|
Tahyna virus
|
Kilian,P., Valdes,J.J., Lecina-Casas,D., Chrudimsky,T., Ruzek,D.
|
Institute of Parasitology, Laboratory of Parasite Immunology
|
Czech Republic
|
2013-11-04
| null |
Orthobunyavirus tahynaense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,976
|
GenBank
| 1
|
Czechoslovakia
|
Czechoslovakia
|
Aedes vexans
| null |
1966
| null | null |
Tahyna virus strain 4057 segment L, complete sequence
|
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| 92,763
|
HM243137.1
|
Tahyna virus
|
Lu,Z., Fu,S.H., Wang,F.T., Nasci,R.S., Tang,Q., Liang,G.D.
|
Institute for Viral Disease Control and Prevention, China CDC, Viral Encephalitis
|
China
|
2011-09-18
| null |
Orthobunyavirus tahynaense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,978
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Aedes vexans
| null |
2007-07-11
| null | null |
Tahyna virus strain XJ0708 segment L, complete sequence
|
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| 98,254
|
HM243140.1
|
Tahyna virus
|
Lu,Z., Fu,S.H., Wang,F.T., Nasci,R.S., Tang,Q., Liang,G.D.
|
Institute for Viral Disease Control and Prevention, China CDC, Viral Encephalitis
|
China
|
2011-09-18
| null |
Orthobunyavirus tahynaense
|
Orthobunyavirus
|
Peribunyaviridae
|
ssRNA(-)
| 6,979
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Aedes vexans
| null |
2007-07-11
| null | null |
Tahyna virus strain XJ0710 segment L, complete sequence
|
AGTAGTGTGCTCCTATCTACAAAACTTACAAAAACTTCAGTTAAGAACCACTATAAGCATCATGGACCACCAAGAGTATCAGCAGTTCCTTGCTAGGATCAACGCTGCAAGAGATGCCTGCGTTGCAAAAGATATAGATGTAGACCTATTGATGGCTAGACATGATTATTTTGGGAAAGAATTGTGTAAATCATTAAACATAGAGTATAGAAATGATGTACCCTTCATAGACATAATCTTAGACATTAGACCAGAAGCAGATCCTTTAACAGTAGATGCTCCTCATATAACCCCAGATAATTATCTATATATAGACAATATATTGTATTTGATAGACTATAAAGTGTCTGTTTCTAATGAAAGTAGTATGATAACCTATGATAAATATTATGAGTTAACCAGAGATATATCTAGGAGAATGAACATTGAGATAGAAATAGTAATAATAAGAATAGACCCTGTAAGCAAAGAATTACATATAAGTTCTAACAGGTTTAAAGAGCTATACCCAGCATTAGTTGTAGACATAAACTTCAACCAGTTTTTTGACCTGAAACAACTACTTTACGAGAAATTTGGTGATGATGAGGAGTTCCTTCTTAAAGTGTCGCATGGTGACTTTACATTGACTGCCCCATGGTGCAAGGAGGGCTGCCCTGAATTCTGGAAGCACCCAATATACAAAGAATTCAAAATGAGCATGCCAGTCCCTGAGAGGCGGCTCTTTGAAGAGTCCGTAAAGTTTAATGCCTACGAATCAGAAAGGTGGAACACCAACCTGATAAAGATAAGAGAATATACAAAAAAAGATTACTCTGATTTCATAACCAAATCTGCAAAAGACATCTTCCTTGCAACAGGCTTTTATAAGCAACCAAATAAAAATGAAATAAGTGAGGGATGGGATTTGATGATAGAACGAGTCCATGAACAGAGGAATGTAACTAAGTCATTGCATGAGCAAAAACCAAGCATCCACTTCATATGGGGTCCTCATAATCCTGGGAATAGCAACAATTCAACCTTTAAACTAATTTTGTTGTCTAAATCTTTGCAAAGCATCAAAGGCTTGTCCACATATACTGAAGCGTTCAAATCACTTGGAAGGATGATGGACATAGGCGATAGAGCTACAGAGTATGAATCGCATTGTGAGAATTTAAAAAGCAAAGCAAGGGCTTCTTGGAAGCAAGTTATGAATAAGAAATTAGAACCTAAACAGATAAATACCGCTCTAGTGTTATGGGAGCAACAATTTATGGTCAACAACGAAATAATAGATAAAAATGATAGAATCAAGCTACTTAAGAACTTCTGCGGAATAGGTAAGCACAAGCAGTTCAAAAACAAGATGTTAGATGATATTGATAATTCTAAACCTACAATATTGGATTTTGATGATGAAAATGTATATCTAGCTAGTCTAACTATGATGGAACAAACAAAAAGGATACTATCGAAGCCTAGTGGTCTGAAAAGTGATAATTTCATATTAAATGAGTTTGGTTTAAGAATTAAAGACTGCAATAAAGATACATATGAGAACATGTATCAGATATTTGAAACAAGGTACTGGCAATGTATTTCAGATTTTTCTACCTTAATGAAAAATATATTATCAGTTTCTCAATATAATAGGCATAATACATTTAGAGTGGCAATGTGCGCTAATAACAATGTCTTTGCAATAGTATTCCCCTCTGCCGACATAAAAACAAAAAAGGCAACAGTAGTGTATAGCATTGTAGTATTGCACAAAGAGGAGAACAATGTATTGAACCCAGGATGTCTGCATGGCACCTTTAAGTGCATGAATGGATATATCTCAATTTCCCGAGCTATTAGATTAGACAAGGAAAGATGTCAACGAATAGTCTCATCTCCCGGATTATTCTTAACAACCTGCCTGTTGTTCAAACATGAAAACCCTACATTAGTCATGAATGACGTAATGAACTTCTCTATATATACTAGCTTATCTATAACAAAGAGTGTTTTGTCCCTTACAGAACCTGCTAGGTATATGATAATGAATTCGCTTGCCATCTCTAGTAACGTTAAGGCATACATTGCTGAAAAGTTCTCACCGTACACAAAGACATTATTCAGTGTTTATATGACAAAACTAATTAAGAATGCTTGCTTTGATGCCTATGGTCAAAGAGAAAGGGTTCAATTAAGGGATATTTACTTATCCGATTACGATATTACACAGAAGGGAATAAAAGATAATAGGGAATTGGTAAGCATATGGTTCCCAGGAAGTGTTACCCTTAAGGAGTATCTGACACAAGTTTATCTACCATTTTATTTTAATGCCAAGGGCCTGCACGAGAAACATCATGTGATGGTGGACCTTGCAAAAACCATACTAGAAATAGAAAGTGACCAAAGGGAGAATATTACTGAAATATGGTCAACTAATTGCACTAAGCAAACAGTCAATTTGAAAATTCTAATTCACTCATTGTGCAAGAATTTATTAGCTGATACATCTAGACACAATCATCTTAGGAATAGGATAGAAAACAGGAATAATTTCCGGAGATCCATCACTACAATATCAACTTTCACAAGTTCAAAATCTTGCTTAAAAATAGGAGATTTTAGAAAAGAGAAGGAGCTACAGAATGCTAAACAAAGGAAGCTTTTAGAAAATGAAAGTCGGAAAAGAAGATTAGCAAACCCTATCTTTGTAACAGATGAGCAGGTCAATTTGGAGGTTGGACATTGCAACTACAATATGCTCAGAGAAGCTATGCCTAACTATACAGATTATATATCAACTAAGGTTTTTGACAGATTATATGAGTTATTAGATACGAAAGTTCTAAGTGATAAGCCTGTAATAGAACAGATAATGGATATGATGGTGAACCATAAGAAATTTTACTTCACTTTTTTTAACAAGGGGCAAAAGACCTCAAAGGATAGGGAAATATTTGTAGGGGAGTACGAAGCCAAAATGTGCATGTATGCTGTTGAGAGAATTGCAAAAGAAAGGTGCAAATTGAACCCAGATGAAATGATATCTGAACCAGGTGATGGAAAACTTAAGGTACTCGAACAAAAATCAGAGCAAGAAATTAGATTCCTGGTAGAAACTACAAGGCAAAAAAATAGAGACATAGATGAAGCAATAAGCGCTTTAGCATCAGAAAATTTTGAAGATAATATAGAAAGAATAGAAAAGTTATCCAGAGGTAAATCAAGAGGACTAAAGATGGAAATAAATGCAGACATGTCCAAATGGAGCGCCCAGGATGTGTTCTACAAATATTTTTGGCTGATTGCATTAGACCCAATATTGTACCCGCAAGAGAAAGAAAGGATCTTGTTCTTCATGTGCAACTATATGCAAAAAGAACTTATTCTGCCTGATGAGCTATTATTTAATTTACTCGATCAGAAGATAACATACCAGAATGATATAATATCCACTATGACAAATCAATTGAACACCAATACAGTACCTATAAAAAGAAATTGGCTACAGGGAAACTTTAATTACACATCTAGTTATGTTCACAGCTGTGCTATGTCTGTGTATAAAGATATTTTAAAAGAAGCAATAACTCTGTTAGATGGCTCAATACTGGTTAATTCATTAGTCCACTCCGATGATAACCAAACGTCTATAACAATAGTGCAGGACAAGACAACCAACGAAATACTAATAGATTTTGCAATGAGAGAATTTGAAAAATCATGCTTGACCTTTGGATGTCAAGCTAATATGAAGAAAACATATGTAACTAATTGTATAAAAGAATTTGTATCTTTATTTAATCTATATGGTGAACCTTTTTCAATATATGGTCGTTTCTTACTGACCTCTGTAGGAGATTGTGCCTATATAGGGCCTTATGAGGACCTCGCCAGTAGGATATCTTCTGCACAAACAGCGATAAAGCATGGTTGCCCACCAAGCTTAGCATGGGTTTCCATAGCTATAAGCCACTGGATGACTTATTTGACCTACAATATGCTACCCGGCCAATCTAATGACCCAATTGATTATTTCCCAGCTGAGACCCGAAGGGAAATACCTATAGAATTGAATGGGATCTTAGATGCACCATTATCTATGATTAGCACCGTCGGATTAGAGGCTGGAAACTTAAACTTCTTAATTAATTTATTGAATAAATACACACCAGTTATGATGAAGAGAGAGTCTGTAGTTAATCAAATAGCTGAGGTAAGATCATGGAAAGTTGAAGATTTGACAGACAATGAAATATTCAGACTCAAGATACTAAGATTCTTGGTCCTAGATGCAGAAATGGATCCCAATGACATAATGGGGGAAACAAGTGACATGAGAGGGAGGTCATTGCTGACACCTAGGAAATTTACAACAGCAGGTAGTTTAAGAAAATTGTACTCATTTAGCAAGTATCAAGATAGATTATCAGCTCCTGGAGGGATGGAGGAACTGTTTGCATACCTATTAGAGAAGCCTGAACTATTAGTTACTAAAGGAGAGGATTCCAAAGATTATATGGAGTCTGTTATCTTCCGATACAACTCCAAAAGGTTCAAAGAAAGTCTATCAATCCAAAACCCTGCTCAGTTATTTATCGAGCAGATCTTGTTTTCACATAAGCCAGTTATAGACTTTTCCGGGATAAGAGACAAATACATAAATCTACATGATAGTAGAGCTATAGAAAAAGAGCCAGATATATTGGGGAAAGTAACATTCACAGAGGCTTATAGGATGCTGATGAAGGATTTATCTTCACTTGCCTTAACAAACGAAGATATACAAGTTATATATTCATATATTATACTCAATGACCCACTAATGATAACAATAGCAAACACCCATGTTCTGTCAATTTATGGCAGTCCCCAGAAAAGAATGGGAATGTCATGCTCCACTATGCCAGAATTTAGAAATTTGAAACTTATACACCATTCACCAGCATTAGTATTAAGAGCGTACAGCAAAAACAATCCAGATGTCCAGGGAGCTGACCCAACCGAGATGGCTA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| 98,255
|
NC_024071.1
|
Tanay virus
|
Nabeshima,T., Inoue,S., Okamoto,K., Posadas-Herrera,G., Yu,F., Uchida,L., Ichinose,A., Sakaguchi,M., Sunahara,T., Buerano,C.C., Tadena,F.P., Orbita,I.B., Natividad,F.F., Morita,K.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2014-05-05
|
11-2
|
Tanay virus
| null | null |
unknown
| 9,578
|
RefSeq
| 1
|
Philippines
|
Philippines
|
Culex quinquefasciatus
| null |
2005
| null |
PRJNA485481
|
Tanay virus isolate 11-2, complete genome
|
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| 6,534
|
MG551500.1
|
Tanay virus
|
Wang,J., Wu,J., Li,N., Cao,Y., He,Y., Lin,J., Li,H.
|
Yunnan Animal Science and Veterinary Institute, Yunnan Tropical and Subtropical Animal Viruses Disease Laboratory
|
China
|
2018-11-19
|
GX13M36
|
Tanay virus
| null | null |
unknown
| 9,590
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Culicidae
| null |
2013-07-01
| null | null |
Tanay virus isolate GX13M36, complete genome
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| 67,066
|
MG551501.1
|
Tanay virus
|
Wang,J., Wu,J., Li,N., Cao,Y., He,Y., Lin,J., Li,H.
|
Yunnan Animal Science and Veterinary Institute, Yunnan Tropical and Subtropical Animal Viruses Disease Laboratory
|
China
|
2018-11-19
|
GX13M44
|
Tanay virus
| null | null |
unknown
| 9,589
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Culicidae
| null |
2013-07-01
| null | null |
Tanay virus isolate GX13M44, complete genome
|
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| 67,067
|
MG551502.1
|
Tanay virus
|
Wang,J., Wu,J., Li,N., Cao,Y., He,Y., Lin,J., Li,H.
|
Yunnan Animal Science and Veterinary Institute, Yunnan Tropical and Subtropical Animal Viruses Disease Laboratory
|
China
|
2018-11-19
|
GX13M34
|
Tanay virus
| null | null |
unknown
| 9,589
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Culicidae
| null |
2013-07-01
| null | null |
Tanay virus isolate GX13M34, complete genome
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| 67,068
|
MG551503.1
|
Tanay virus
|
Wang,J., Wu,J., Li,N., Cao,Y., He,Y., Lin,J., Li,H.
|
Yunnan Animal Science and Veterinary Institute, Yunnan Tropical and Subtropical Animal Viruses Disease Laboratory
|
China
|
2018-11-19
|
GX13M50
|
Tanay virus
| null | null |
unknown
| 9,588
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Culicidae
| null |
2013-07-01
| null | null |
Tanay virus isolate GX13M50, complete genome
|
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| 67,069
|
MG551504.1
|
Tanay virus
|
Wang,J., Wu,J., Li,N., Cao,Y., He,Y., Lin,J., Li,H.
|
Yunnan Animal Science and Veterinary Institute, Yunnan Tropical and Subtropical Animal Viruses Disease Laboratory
|
China
|
2018-11-19
|
GX13M31
|
Tanay virus
| null | null |
unknown
| 9,591
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Culicidae
| null |
2013-07-01
| null | null |
Tanay virus isolate GX13M31, complete genome
|
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| 67,070
|
MG551505.1
|
Tanay virus
|
Wang,J., Wu,J., Li,N., Cao,Y., He,Y., Lin,J., Li,H.
|
Yunnan Animal Science and Veterinary Institute, Yunnan Tropical and Subtropical Animal Viruses Disease Laboratory
|
China
|
2018-11-19
|
GX13M52
|
Tanay virus
| null | null |
unknown
| 9,595
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Culicidae
| null |
2013-07-01
| null | null |
Tanay virus isolate GX13M52, complete genome
|
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| 67,071
|
MG551506.1
|
Tanay virus
|
Wang,J., Wu,J., Li,N., Cao,Y., He,Y., Lin,J., Li,H.
|
Yunnan Animal Science and Veterinary Institute, Yunnan Tropical and Subtropical Animal Viruses Disease Laboratory
|
China
|
2018-11-19
|
GX13M33
|
Tanay virus
| null | null |
unknown
| 9,591
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Culicidae
| null |
2013-07-01
| null | null |
Tanay virus isolate GX13M33, complete genome
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| 67,072
|
MG673930.1
|
Tanay virus
|
Zhao,L., Xia,H., Wang,Y., Yuan,Z., Zhang,Y.
|
Chinese Academy of Sciences, Wuhan Institute of Virology, Yunnan Provincial Institute of Endemic Disease Control and Prevention
|
China
|
2018-01-23
|
YN15_103_01
|
Tanay virus
| null | null |
unknown
| 9,587
|
GenBank
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China
|
China
|
Anopheles sinensis
| null |
2015-08-17
| null | null |
Tanay virus isolate YN15_103_01, complete genome
|
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| 72,562
|
KF425261.1
|
Tanay virus
|
Nabeshima,T., Inoue,S., Okamoto,K., Posadas-Herrera,G., Yu,F., Uchida,L., Ichinose,A., Sakaguchi,M., Sunahara,T., Buerano,C.C., Tadena,F.P., Orbita,I.B., Natividad,F.F., Morita,K.
|
Institute of Tropical Medicine, Nagasaki University, Department of Virology
|
Japan
|
2014-04-26
|
11-2
|
Tanay virus
| null | null |
unknown
| 9,578
|
GenBank
| 1
|
Philippines
|
Philippines
|
Culex quinquefasciatus
| null |
2005
| null | null |
Tanay virus isolate 11-2, complete genome
|
AATAAACAAAATATCGTTGCTTACTGTTTGGCTATCTGTCATCCTTGTGCTATCTACAACCAATAACACTATGGATAACCTCAACCAAGGTTTTGCTGGAATTAACCCTTCCTCTTCGCTTTACGCGGCAGAAATTGCCAAACATCTAGATGTAACACCCGACGAAGTCAAACAGCGCTTTGCTACTCGTATGTTGACCACTTCTAACCCGTTGTGCCAACACTATGAGTCGTTTGTTATTACAGCTGTTGGAGATCATATTGACACCGTGCGAAAACTCAAGAAAGAAGTGTTTCTTAACCAGAGACTTTCTGACACTGAAAAAGCACGTCTGTTACAATTGTTCTCTCCTCCCTACAGACTCGTCTTCGCCCATGATCCTTCTGATATTGGTGCGCATTTGTATTATCGAGCTTTAAATGAAATTGCTACTTACCGTTGTTACGATTTATTGGCTAAGGACTTGTACAATGATCCTAATTATGATTTGTTGATTAAAGAAATTGGTGCATCTGTGCCCAAGTTGGTCAAGTATAAACGCAACCACGTTCATGCTTGTACGCCCAACCTTAACATAGATGATACCATCCGTATTACTAATACGTTGTCAACATTGGATTATTACCAACGTAACGGAGATAAGGAGCAACGACATTTGGCTAAATTGTATATGAAAGATCCAAAATATCGATGTTATAATAAATCTCAATATTGTTTTATTCGATGCAAATTTTTGGTATTCGCTCACTCGAGCTATGATTGTACCTTAACTGACATAGCTAACATGATGGATTCCGCTGGCGCTATTAAGGCAATTGGTTTTATCCATTACTCTCCCAAAATTTTGTGTAACCTCACAAAAGGAAGTGATAACGGATTGAACTGGGAATTGACTATGCGGCATAAGAAATTCTTCATTACATTTTGGTTTGACAATGATTACCAAAATTCGTATCATCATGAATTGGACACGTATTTGGGAATTATTAAAACATCAATATGTACGTCATCGAATGGAAATTCATATATAATTCAACGCACGGAAGAGTTGGGAGGACTCTTGTTTTACACTATCTTGAAACCCGCGCGTGCTATTAATAAGTCTACTATTATTAGGAAATTACCGTTTTCTGACTCTGATGATATAATAGTTCACTATTACAATCTTCAGAGTGATCCAAGTAAATATAATTATCACGAACTGGTGCCCGTTAGGCTGGTTGTACCAAAGAAATTTTTCGAAAGATTGTATTACTATCTGCAAATTTTACCCGAAGGTAAATTTACAGTTCAAAACGCATTGAGTATGGCGTCTACTATGGCAAGTCGTACTATAGTAAACGGTGCGTATGTTTCGCAACCTTACAATCTGTCAATTGACTGTATTGATAACGTTGCGTATGCTGCTTATTTCATCGTTTACTGTAGACGGTATGACTATCTGGAAGTGTTAAAAACGTTGAAGAACTTTGAAGACATTAAACGAAATCCCACTTTTTTTAGAAAAATATGTTGCATATTTAATTCTTTGAAAAACTTTGTTTTGTCATCAAACTTTGATCCGTACATTCCGGAAGAAGAATTAGAACATGTCATTGCAAACGCTAAAAAGACCATCGTTCAAAACGAATCCTTGAAGCATTCACATAATGTGTTTCAGTGGTTGTTGAAACTTTTTAGAATTAACAATCGGTATGATGTTAGATTTTATCCGGTAACACGAGTAGTAACCGTTGAAGAAGACATCGAGGTTGTTAAGAGTGTCGTCACTACTTTGCCTATTATTTCTAATAATGATGAAATGGTCGAAAATTTCATAAAGGAACAATTGAAAATAACACGAGTTCGACCAGAAATGTGTCAGGTTGTTGAAAAAATTTGCAAAGAAAAGTTGTATGAAGTTAAGAACAACTATGAAACACAGTGTGTGTTAAAGTGTATTGCTAACGCTTTGAACCTTGATCTTACATTTGTTATCAATGCCTTGCGTAAATCGAAATTTCTCGAAGAAGTTTCTTTGTCTTTGAAAAATTCTTTGTTGCAATATATCAACGGCGATTTGGCCGAAGTTGAATTGTTTGAACTAGTTGCATGTGAGTTTGGTGTTAACGTGTGTGTGCATTTTGAAACCAAACATACGTTATATGACGTCGGAGCAACTATGACTTATCACTTTAATGTGGTGGATAATCATTGTACTGAAATGAGAGTGAGGTGTGCTTGCTCTCCTTTCGTCTTTGATTATGAAACCACAACTCGAAGGAACGTTTTTGATTTCGACGTTCTTAAGGAATGCAGTTCAAGATCACGCGCTGATAAATACAAACTTTACCCGGTTACATGTGATTACAAACCCTACGTTTGTCGTAGTGTTTTAAAATTACATGAAATAGATTGTCACTATAATGTGCTGTCTCACGGTAAAATTTGTGAATTTTCAGCGGCTCCCGGATCCTGGATGCAATATGTACGTAACATGTACACTAGTTCCAAGAGGTATTATACTCATTATGATGACGGATTACCTATCACCATAGATCAAAACGCTATATTGTTAAATCCGACGACTGATGGTGATTTGACTAAATATAACGTTAGGAGAGAAATCGAAGCGCAAATTGAGAAAAATGAATATATGGATACCGTGCTTTGCGATGCGGCTATAATGTCGCAAGATGATGTAGCCGATCGAGAAGCATTTCCAGATTTTCAGGATTACTTTTTTGGCAATTTGATTAATTTTCTAAATGATGGTGGTAATGTAGTCTTTAAATCGTTTTGTGAATTCGACCTAAGTGATGTTGTGAATTACGTTCTGAATCACTTTAAAGAAGTTTATTTCGTAAAACCCACTTTCTCTTCGGCGATATCGACCGAATATTATATTGTGGCTAAAGGATTAGATTCGAAACTAGTCGTTGATACGCCTGTTAATTATGCGCCTTATGTTTTGTCCGCTTTCGGGCGCGTCATGAAATATTGCAGTTTGTTACAGAAAAACATATTTCCTGTGCAAACTTCTTACGAATTACCCCGTTTGTTTTCGTATTGTGAACCCGTTAAATGTGTTATTGATGTAACTACTGTTGAAGTTGAACCCGAACCAGAACCAGACGGTGTTATAGATTGTAATACTTTTGAAAGTAATTTTATAAATATTTTCAATAAGTTTACTTTCCATGATAATGCCGTGTCTGGCTTTGAAGTTACTCAAGATCAAAAGGATATTAATCCGGATGTAGAAATACATTGTTACGACGGAGCACTATGCGATACCAACGGTGAATATACGGATTATTTATTTAATTCGCGTAATTTATCTATTCGATTGGATTTGAGTGCACAAAATAAGTTACGCGTACTCTCTATGATGTCACACGTGGCTAATAAACTGCAATGTTTGCGTTTGAAAGTTTACATTGACATATGTCACATTAATGATGCTGCAGATGCTAAAGAAATATTAGCATATATTAAACAAGCATTTGAAAGACATTATGTAGTAGTTGTGTCGTCTCATTTGGATTGTTCCTACAATATATCAGAATATAAAAGAGCTATTATTGAATACACCGATTATATTCATACATATCGAGGAAAGTGTTCAAATGAATACAGGTACTATTACAATATGTTTAAAAATGCTAATTTCACATTGTCTGTGTCGTTGATTAGCAATATCGCTAAGTTTACGGAACAAATATGCATATATCACGGTTCGGACATGATCTTTAAACACCCGAATCGCGAACCGGATGCTTACTCTCACTGTTTTGATGGAACTAATTTTATCAGAACATCCGAGATTCAAACCGGTCGTTATTATTTTGTGGGTAAATATACACACAAAATGTTTGATGATCATATTTTAGAAGCGATGTCACAAGTGGACGTCCGTTCTCTAGAAAATGTTCAATTTGTTTTGGTTCAGGGTGTAGCTGGTCATGGCAAGACCCGTGAAATCGTTGACTCTCATACCCCGTCTTTAAAATGCCAAATCGGAGGTGATTTAATATTGACTCCGACGACAGCTGGTAAACAAGTGTTAGTTGAACGTACGGTTTTGAGAAAAGAAATTGATCGTAACAACTTGGATATGTTGAAATACAGGACGATCAATTCGTTCTTGATCAACCGAAACACTTCAGCTGATAAGGTATATATAGACGAAGTTATGATGGTTCACGTCGCTTTAATTTTGACTGCAGCTTATCACGCTAAAGCAAAAACCGTATTTTTGTATGGTGATACTTTGCAAATCCCCGCGCACAGTCAATTAGGAGATTTTGAAATGCGATACAACTCACCTCTGTCGTTGTTTAAGGTTTCCGAAGTAAGACATAAGTCTTACAGAATACCCATGGATGTTGCTGCTGTTCTTAATGAAGAGTATGCTGCTGCTCATCGCAACTTCGGTTTTAACAAAGGTTTGGTTACAGCAAATAATCAGTTGCGTTCATTGCATGCAGTGAAAATAAACGCTGATTCGGCGATGAAAGATTATTTTAGCGCTGAATGTAAGTATTTAACGTTTACTCACACTGCGGCTTCAGAATTACGTAAAGTTAATCCTGCGTTTGAACCGAGCACGATAGCGGCCTTCCAAGGATCCGAAAACAAGGACATAGCGGTTGTTCGTTTTTCACCATCTCCGAGTGACCCTATATATAATAATATTCACATCTGTATTACAGCTATCACTAGGCATACCCGTTCGTTTACTTATTATACTACTTGTGAAAACGATATATTATACAATCTTATTAAAAAATCCAAATCCTTAAGCGATTTGGCCATACGCGAATTCGGTACGAGCGTAAATATAGGTTCAGTGTTACCTTTGATTTACCCTACCTCAGAGCCTGTTTCGTCGAATAGGTTTTTCGTCTCACGGAAAGCTTTCACTCACGAATATACGTTTGTAGATCACCGTAATTATGTCTCTGAAAAAGAATTTGTGATCGCGACCAAATCGATTACTAAGGATTTGTTTGTGGAAA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| 90,827
|
KF425262.1
|
Tanay virus
|
Nabeshima,T., Inoue,S., Okamoto,K., Posadas-Herrera,G., Yu,F., Uchida,L., Ichinose,A., Sakaguchi,M., Sunahara,T., Buerano,C.C., Tadena,F.P., Orbita,I.B., Natividad,F.F., Morita,K.
|
Institute of Tropical Medicine, Nagasaki University, Department of Virology
|
Japan
|
2014-04-26
|
11-3
|
Tanay virus
| null | null |
unknown
| 9,581
|
GenBank
| 1
|
Philippines
|
Philippines
|
Culex
| null |
2005
| null | null |
Tanay virus isolate 11-3, complete genome
|
AATAAACAAAATATCGTTGCTTACTGTTTGGCTATCTGTCATCCTTGTGCTATCTACAACCAATAACACTATGGATAACCTCAACCAAGGTTTTGCTGGAATTAACCCTTCCTCTTCGCTTTACGCGGCAGAAATTGCCAAACATCTAGATGTAACACCCGACGAAGTCAAACAGCGCTTTGCTACTCGTATGTTGACCACTTCTAACCCGTTGTGCCAACACTATGAGTCGTTTGTTATTACAGCTGTTGGAGATCATATTGACACCGTGCGAAAACTCAAGAAAGAAGTGTTTCTTAACCAGAGACTTTCTGACACTGAAAAAGCACGTCTGTTACAATTGTTCTCTCCTCCCTACAGACTCGTCTTCGCCCATGATCCTTCTGATATTGGTGCGCATTTGTATTATCGAGCTTTAAATGAAATTGCTACTTACCGTTGTTACGATTTATTGGCTAAGGACTTGTACAATGATCCTAATTATGATTTGTTGATTAAAGAAATTGGTGCATCTGTGCCCAAGTTGGTCAAGTATAAACGCAACCACGTTCATGCTTGTACGCCCAACCTTAACATAGATGATACCATCCGTATTACTAATACGTTGTCAACATTGGATTATTACCAACGTAACGGAGATAAGGAGCAACGACATTTGGCTAAATTGTATATGAAAGATCCAAAATATCGATGTTATAATAAATCTCAATATTGTTTTATTCGATGCAAATTTTTGGTATTCGCTCACTCGAGCTATGATTGTACCTTAACTGACATAGCTAACATGATGGATTCCGCTGGCGCTATTAAGGCAATTGGTTTTATCCATTACTCTCCCAAAATTTTGTGTAACCTCACAAAAGGAAGTGATAACGGATTGAACTGGGAATTGACTATGCGGCATAAGAAATTCTTCATTACATTTTGGTTTGACAATGATTACCAAAATTCGTATCATCATGAATTGGACACGTATTTGGGAATTATTAAAACATCAATATGTACGTCATCGAATGGAAATTCATATATAATTCAACGCACGGAAGAGTTGGGAGGACTCTTGTTTTACACTATCTTGAAACCCGCGCGTGCTATTAATAAGTCTACTATTATTAGGAAATTACCGTTTTCTGACTCTGATGATATAATAGTTCACTATTACAATCTTCAGAGTGATCCAAGTAAATATAATTATCACGAACTGGTGCCCGTTAGGCTGGTTGTACCAAAGAAATTTTTCGAAAGATTGTATTACTATCTGCAAATTTTACCCGAAGGTAAATTTACAGTTCAAAACGCATTGAGTATGGCGTCTACTATGGCAAGTCGTACTATAGTAAACGGTGCGTATGTTTCGCAACCTTACAATCTGTCAATTGACTGTATTGATAACGTTGCGTATGCTGCTTATTTCATCGTTTACTGTAGACGGTATGACTATCTGGAAGTGTTAAAAACGTTGAAGAACTTTGAAGACATTAAACGAAATCCCACTTTTTTTAGAAAAATATGTTGCATATTTAATTCTTTGAAAAACTTTGTTTTGTCATCAAACTTTGATCCGTACATTCCGGAAGAAGAATTAGAACATGTCATTGCAAACGCTAAAAAAACCATCGTTCAAAACGAATCCTTGAAGCATTCACATAATGTGTTTCAGTGGTTGTTGAAACTTTTTAGAATTAACAATCGGTATGATGTTAGATTTTATCCGGTAACACGAGTAGTAACCGTTGAAGAAGACATCGAGGTTGTTAAGAGTGTCGTCACTACTTTGCCTATTATTTCTAATAATGATGAAATGGTCGAAAATTTCATAAAGGAACAACTGAAAATAACACGAGTTCGACCAGAAATGTGTCAGGTTGTTGAAAAAATTTGCAAAGAAAAGTTGTATGAAGTTAAGAACAACTATGAAACACAGTGTGTGTTAAAGTGTATTGCTAACGCTTTGAACCTTGATCTTACATTTGTTATCAATGCCTTGCGTAAATCGAAATTTCTCGAAGAAGTTTCTTTGTCTTTGAAAAATTCTTTATTGCAATATATCAACGGCGATTTGGCCGAAGTTGAATTGTTTGAACTAGTTGCATGTGAGTTTGGTGTTAACGTGTGTGTGCATTTTGAAACCAAACATACGTTATATGACGTCGGAGCAACTATGACTTATCACTTTAATGTGGTGGATAATCATTGTACTGAAATGAGAGTGAGGTGTGTTTGCTCTCCTTTCGTCTTTGATTATGAAACCACAACTCGAAGGAACGTTTTTGATTTCGACGTTCTTAAGGAATGCAGTTCAAGATCACGCGCTGATAAATACAAACTTTACCCGGTTACATGTGATTACAAACCCTACGTTTGTCGTAGTGTTTTAAAATTACATGAAATAGATTGTCACTATAATGTGCTGTCTCACGGTAAAATTTGTGAATTTTCAGCGGCTCCCGGATCCTGGATGCAATATGTACGTAACATGTACACTAGTTCCAAGAGGTATTATACTCATTATGATGACGGATTACCTATCACCATAGATCAAGACGCTATATTGTTAAATCCGACGACTGATGGTGATTTGACTAAATATAACGTTAGGAGAGAAATCGAAGCGCAAATTGAGAAAAATGAATATATGGATACCGTGCTTTGCGATGCGGCTATAATGTCGCAAGATGATGTAGCCGATCGAGAAGCATTTCCAGATTTTCAGGATTACTTTTTTGGCAATTTGATTAATTTTCTAAATGATGGTGGTAATGTAGTCTTTAAATCGTTTTGTGAATTCGACCTAAGTGATGTTGTGAATTACGTTCTGAATCACTTTAAAGAAGTTTATTTCGTAAAACCTACTTTCTCTTCGGCGATATCGACCGAATATTATATTGTGGCTAAAGGATTAGATTCGAAACTAGTCGTTGATACGCCTGTTAATTATGCGCCTTATGTTTTGTCCGCTTTCGGGCGCGTCATGAAATATTGCAGTTTGTTACAGAAAAACATATTTCCTGTGCAAACTTCTTACGAATTACCCCGTTTGTTTTCGTATTGTGAACCCGTTAAATGTGTTATTGATGTAACTACTGTTGAAGTTGAACCCGAACCAGAACCAGACGGTGTTATAGATTGTAATACTTTTGAAAGTAATTTTATAAATATTTTCAATAAGTTTACTTTCCATGATAATGCCGTGTCTGGCTTTGAAGTTACTCAAGATCAAAAGGATATTAATCCGGATGTAGAAATACATTGTTACGACGGAGCACTATGCGATACCAACGGTGAATATACGGATTATTTATTTAATTCGCGTAATTTATCTATTCGATTGGATTTGAGTGCACAAAATAAGTTACGCGTACTCTCTATGATGTCACACGTGGCTAATAAACTGCAATGTTTGCGTTTGAAAGTTTACATTGACATAAGTCACATTAATGATGCTGCAGATGCTAAAGAAATATTAGCATATATTAAACAAGCATTTGAAAGACATTATGTAGTAGTTGTGTCGTCTCATTTGGATTGTTCCTACAATATATCAGAATATAAAAGAGCTATTATTGAATACACCGATTATATTCATACATATCGAGGAAAGTGTTCAAATGAATACAGGTACTATTACAATATGTTTAAAAATGCTAATTTCACATTGTCTGTGTCGTTGATTAGCAATATCGCTAAGTTTACGGAACAAATATGCATATATCACGGTTCGGACATGATCTTTAAACACCCGAATCGCGAACCGGATGCTTACTCTCACTGTTTTGATGGAACTAATTTTATCAGAACATCCGAGATTCAAACCGGTCGTTATTATTTTGTGGGTAAATATACACACAAAATGTTTGATGATCATATTTTAGAAGCGATGTCACAAGTGGACGTCCGTTCTCTAGAAAATGTTCAATTTGTTTTGGTTCAGGGTGTAGCTGGTCATGGCAAGACCCGTGAAATCGTTGACTCTCATACCCCGTCTTTAAAATGCCAAATCGGAGGTGATTTAATATTGACTCCGACGACAGCTGGTAAACAAGTGTTAGTTGAACGTACGGTTTTGAGAAAAGAAATTGATCGTAACAACTTGGATATGTTGAAATACAGGACGATCAATTCGTTCTTGATCAACCGAAACACTTCAGCTGATAAGGTATATATAGACGAAGTTATGATGGTTCACGTCGCTTTAATTTTGACTGCAGCTTATCACGCTAAAGCAAAAACCGTATTTTTGTATGGTGATACTTTGCAAATCCCCGCACACAGTCAATTAGGAGATTTTGAAATGCGATACAACTCACCTCTGTCGTTGTTTAAGGTTTCCGAAGTAAGACATAAGTCTTACAGAATACCCATGGATGTTGCTGCTGTTCTTAATGAAGAGTATGCTGCTGCTCATCGCAACTTCGGTTTTAACAAAGGTTTGGTTACAGCAAATAATCAGTTGCGTTCATTGCATGCAGTGAAAATAAACGCTGATTCGGCGATGAAAGATTATTTTAGCGCTGAATGTAAGTATTTAACGTTTACTCACACTGCGGCTTCAGAATTACGTAAAGTTAATCCTGCGTTTGAACCGAGCACGATAGCGGCCTTCCAAGGATCCGAAAACAAGGACATAGCGGTTGTTCGTTTTTCACCATCTCCGAGTGACCCTATATATAATAATATTCACATCTGTATTACAGCTATCACTAGGCATACCCGTTCGTTTACTTATTATACTACTTGTGAAAACGATATATTATATAATCTTATTAAAAAATCCAAATCCTTAAGCGATTTGGCCATACGCGAATTCGGTACGAGCGTAAATATAGGTTCAGTGTTACCTTTGATTTACCCTACCTCAGAGCCTGTTTCGTCGAATAGGTTTTTCGTCTCACGGAAAGCTTTCACTCACGAATATACGTTTGTAGATCACCGTAATTATGTCTCTGAAAAAGAATTTGTGATCGCGACCAAATCGATTACTAAGGATTTGTTTGTGGAAA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| 90,828
|
KF425263.1
|
Tanay virus
|
Nabeshima,T., Inoue,S., Okamoto,K., Posadas-Herrera,G., Yu,F., Uchida,L., Ichinose,A., Sakaguchi,M., Sunahara,T., Buerano,C.C., Tadena,F.P., Orbita,I.B., Natividad,F.F., Morita,K.
|
Institute of Tropical Medicine, Nagasaki University, Department of Virology
|
Japan
|
2014-04-26
|
11-4
|
Tanay virus
| null | null |
unknown
| 9,579
|
GenBank
| 1
|
Philippines
|
Philippines
|
Armigeres
| null |
2005
| null | null |
Tanay virus isolate 11-4, complete genome
|
AATAAACAAAATATCGTTGCTTACTGTTTGGCTATCTGTCATCCTTGTGCTATCTACAACCAATAACACTATGGATAACCTCAACCAAGGTTTTGCTGGAATTAACCCTTCCTCTTCGCTTTACGCGGCAGAAATTGCCAAACATCTAGATGTAACACCCGACGAAGTCAAACAGCGCTTTGCTACTCGTATGTTGACCACTTCTAACCCGTTGTGCCAACACTATGAGTCGTTTGTTATTACAGCTGTTGGAGATCATATTGACACCGTGCGAAAACTCAAGAAAGAAGTGTTTCTTAACCAGAGACTTTCTGACACTGAAAAAGCACGTCTGTTACAGTTGTTCTCTCCTCCCTACAGACTCGTCTTCGCCCATGATCCTTCTGATATTGGTGCGCATTTGTATTATCGAGCTTTAAATGAAATTGCTACTTACCGTTGTTACGATTTATTGGCTAAGGACTTGTACAATGATCCTAATTATGATTTGTTGATTAAAGAAATTGGTGCATCTGTGCCCAAGTTGGTCAAGTATAAACGCAACCACGTTCATGCTTGTACGCCCAACCTTAACATAGATGATACCATCCGTATTACTAATACGTTGTCAACATTGGATTATTACCAACGTAACGGAGATAAGGAGCAACGACATTTGGCTAAATTGTATATGAAAGATCCAAAATATCGATGTTATAATAAATCTCAATATTGTTTTATTCGATGCAAATTTTTGGTATTCGCTCACTCGAGCTATGATTGTACCTTAACTGACATAGCTAACATGATGGATTCCGCTGGCGCTATTAAGGCAATTGGTTTTATCCATTACTCTCCCAAAATTTTGTGTAACCTCACAAAAGGAAGTGATAACGGATTGAACTGGGAATTGACTATGCGGCATAAGAAATTCTTCATTACATTTTGGTTTGACAATGATTACCAAAATTCGTATCATCATGAATTGGACACGTATTTGGGAATTATTAAAACATCAATATGTACGTCATCGAATGGAAATTCATATATAATTCAACGCACGGAAGAGTTGGGAGGACTCTTGTTTTACACTATCTTGAAACCCGCGCGTGCTATTAATAAGTCTACTATTATTAGGAAATTACCGTTTTCTGACTCTGATGATATAATAGTTCACTATTACAATCTTCAGAGTGATCCAAGTAAATATAATTATCACGAACTGGTGCCCGTTAGGCTGGTTGTACCAAAGAAATTTTTCGAAAGATTGTATTACTATCTGCAAATTTTACCCGAAGGTAAATTTACAGTTCAAAACGCATTGAGTATGGCGTCTACTATGGCAAGTCGTACTATAGTAAACGGTGCGTATGTTTCGCAACCTTACAATCTGTCAATTGACTGTATTGATAACGTTGCGTATGCTGCTTATTTCATCGTTTACTGTAGACGGTATGACTATCTGGAAGTGTTAAAAACGTTGAAGAACTTTGAAGACATTAAACGAAATCCCACTTTTTTCAGAAAAATATGTTGCATATTTAATTCTTTGAAAAACTTTGTTTTGTCATCAAACTTTGATCCGTACATTCCGGAAGAAGAATTAGAACATGTCATTGCAAACGCTAAAAAGACCATCGTTCAAAACGAATCCTTGAAGCATTCACATAATGTGTTTCAGTGGTTGTTGAAACTTTTTAGAATTAACAATCGGTATGATGTTAGATTTTATCCGGTAACACGAGTAGTAACCGTTGAAGAAGACATCGAGGTTGTTAAGAGTGTCGTCACTACTTTGCCTATTATTTCTAATAATGATGAAATGGTCGAAAATTTCATAAAGGAACAATTGAAAATAACACGAGTTCGACCAGAGATGTGTCAGGTTGTTGAAAAAATTTGCAAAGAAAAGTTGTATGAAGTTAAGAACAACTATGAAACACAGTGTGTGTTAAAGTGTATTGCTAACGCTTTGAACCTTGATCTTACATTTGTTATCAATGCCTTGCGTAAATCGAAATTTCTCGAAGAAGTTTCTTTGTCTTTGAAAAATTCTTTATTGCAATATATCAACGGCGATTTGGCCGAAGTTGAATTGTTTGAACTAGTTGCATGTGAGTTTGGTGTTAACGTGTGTGTGCATTTTGAAACCAAACATACGTTATATGACGTCGGAGCAACTATGACTTATCACTTTAATGTGGTGGATAATCATTGTACTGAAATGAGAGTGAGGTGTGCTTGCTCTCCTTTCGTCTTTGATTATGAAACCACAACTCGAAGGAACGTTTTTGATTTCGACGTTCTTAAGGAATGCAGTTCAAGATCACGCGCTGATAAATACAAACTTTACCCGGTTACATGTGATTACAAACCCTACGTTTGTCGTAGTGTTTTAAAATTACATGAAATAGATTGTCACTATAATGTGCTGTCTCACGGTAAAATTTGTGAATTTTCAGCGGCTCCCGGATCCTGGATGCAATATGTACGTAACATGTACACTAGTTCCAAGAGGTATTATACTCATTATGATGACGGATTACCTATCACCATAGATCAAAACGCTATATTGTTAAATCCGACGACTGATGGTGATTTGACTAAATATAACGTTAGGAGAGAAATCGAAGCGCAAATTGAGAAAAATGAATATATGGATACCGTGCTTTGCGATGCGGCTATAATGTCGCAAGATGATGTAGCCGATCGAGAAGCATTTCCAGATTTTCAGGATTACTTTTTTGGCAATTTGATTAATTTTCTAAATGATGGTGGTAATGTAGTCTTTAAATCGTTTTGTGAATTCGACCTAAGTGATGTTGTGAATTACGTTCTGAATCACTTTAAAGAAGTTTATTTCGTAAAACCCACTTTCTCTTCGGCGATATCGACCGAATATTATATTGTGGCTAAAGGATTAGATTCGAAACTAGTCGTTGATACGCCTGTTAATTATGCGCCTTATGTTTTGTCCGCTTTCGGGCGCGTCATGAAATATTGCAGTTTGTTACAGAAAAACATATTTCCTGTGCAAACTTCTTATGAATTACCCCGTTTGTTTTCGTATTGTGAACCCGTTAAATGTGTTATTGATGTAACTACTGTTGAAGTTGAACCCGAACCAGAACCAGACGGTGTTATAGATTGTAATACTTTTGAAAGTAATTTTATAAATATTTTCAATAAGTTTACTTTCCATGATAATGCCGTGTCTGGCTTTGAAGTTACTCAAGATCAAAAGGATATTAATCCGGATGTAGAAATACATTGTTACGACGGAGCACTATGCGATACCAACGGTGAATATACGGATTATTTATTTAATTCACGTAATTTATCTATTCGATTGGATTTGAGTGCACAAAATAAGTTACGCGTACTCTCTATGATGTCACACGTGGCTAATAAACTGCAATGTTTGCGTTTGAAAGTTTACATTGACATAAGTCACATTAATGACGCTGCAGATGCTAAAGAAATATTAGCATATATTAAACAAGCATTTGAAAGACATTATGTAGTAGTTGTGTCGTCTCATTTGGATTGTTCCTACAATATATCAGAATATAAAAGAGCTATTATTGAATACACCGATTATATTCATACATATCGAGGAAAGTGTTCAAATGAATACAGGTACTATTACAATATGTTTAAAAATGCTAATTACACATTGTCTGTGTCGTTGATTAGCAATATCGCTAAGTTTACGGAACAAATATGCATATATCACGGTTCGGACATGATCTTTAAACACCCGAATCGCGAACCGGATGCTTACTCTCACTGTTTTGATGGAACTAATTTTATCAGAACATCCGAGATTCAAACCGGTCGTTATTATTTTGTGGGTAAATATACACACAAAATGTTTGATGATCATATTTTAGAAGCGATGTCACAAGTGGACGTTCGTTCTCTAGAAAATGTTCAATTTGTTTTGGTTCAGGGTGTAGCTGGTCATGGCAAGACCCGTGAAATCGTTGACTCTCATACCCCGTCTTTAAAATGCCAAATCGGAGGTGATTTAATATTGACTCCGACGACAGCTGGTAAACAAGTGTTAGTTGAACGTACGGTTTTGAGAAAAGAAATTGATCGTAACAACTTGGATATGTTGAAATACAGGACGATCAATTCGTTCTTGATCAACCGAAACACTTCAGCTGATAAGGTATATATAGACGAAGTTATGATGGTTCACGTCGCTTTAATTTTGACTGCAGCTTATCACGCTAAAGCAAAAACCGTATTTTTGTATGGTGATACTTTGCAAATCCCCGCGCACAGTCAATTAGGAGATTTTGAAATGCGATACAACTCACCTCTGTCGTTGTTTAAGGTTTCCGAAGTAAGACATAAGTCTTACAGAATACCCATGGATGTTGCTGCTGTTCTTAATGAAGAGTATGCTGCTGCTCATCGCAACTTCGGTTTTAACAAAGGTTTGGTTACAGCAAATAATCAGTTGCGTTCATTGCATGCAGTGAAAATAAACGCTGATTCGGCGATGAAAGATTATTTTAGCGCTGAATGTAAGTATTTAACGTTTACTCACACTGCGGCTTCAGAATTACGTAAAGTTAATCCTGCGTTTGAACCGAGCACGATAGCGGCCTTCCAAGGATCCGAAAACAAGGACATAGCGGTTGTTCGTTTTTCACCATCTCCGAGTGACCCTATATATAATAATATTCACATCTGTATTACAGCTATCACTAGGCATACCCGTTCGTTTACTTATTATACTACTTGTGAAAACGATATATTATATAATCTTATTAAAAAATCCAAATCCTTAAGCGATTTGGCCATACGCGAATTCGGTACGAGCGTAAATATAGGTTCAGTGTTACCTTTGATTTACCCTACCTCAGAGCCTGTTTCGTCGAATAGGTTTTTCGTCTCACGGAAAGCTTTCACTCACGAATATACGTTTGTAGATCACCGTAATTATGTCTCTGAAAAAGAATTTGTGATCGCGACCAAATCGATTACTAAGGATTTGTTTGTGGAAA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| 90,829
|
KF425264.1
|
Tanay virus
|
Nabeshima,T., Inoue,S., Okamoto,K., Posadas-Herrera,G., Yu,F., Uchida,L., Ichinose,A., Sakaguchi,M., Sunahara,T., Buerano,C.C., Tadena,F.P., Orbita,I.B., Natividad,F.F., Morita,K.
|
Institute of Tropical Medicine, Nagasaki University, Department of Virology
|
Japan
|
2014-04-26
|
11-5
|
Tanay virus
| null | null |
unknown
| 9,578
|
GenBank
| 1
|
Philippines
|
Philippines
|
Armigeres
| null |
2005
| null | null |
Tanay virus isolate 11-5, complete genome
|
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| 90,830
|
NC_026819.1
|
Taro bacilliform CH virus
|
Kazmi,S.A., Yang,Z., Hong,N., Wang,G., Wang,Y.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2015-04-16
|
TaBCHV-1
|
Badnavirus betacolocalasiae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,641
|
RefSeq
| 1
|
China
|
China
|
Colocasia esculenta
| null |
2011
| null |
PRJNA485481
|
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|
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| 6,184
|
ON086738.1
|
Taro bacilliform CH virus
|
Olmedo-Velarde,A., Loristo,J., Kong,A., Waisen,P., Wang,K.H., Hu,J., Melzer,M.
|
University of Hawaii at Manoa, Plant and Environmental Protection Sciences
|
USA
|
2022-08-10
|
PNG-K
|
Badnavirus betacolocalasiae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,671
|
GenBank
| 1
|
Papua New Guinea
|
Papua New Guinea
|
Colocasia esculenta
| null |
2019-05
| null | null |
Taro bacilliform CH virus isolate PNG-K, complete genome
|
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| 27,268
|
ON086739.1
|
Taro bacilliform CH virus
|
Olmedo-Velarde,A., Loristo,J., Kong,A., Waisen,P., Wang,K.H., Hu,J., Melzer,M.
|
University of Hawaii at Manoa, Plant and Environmental Protection Sciences
|
USA
|
2022-08-10
|
PNG-P
|
Badnavirus betacolocalasiae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,672
|
GenBank
| 1
|
Papua New Guinea
|
Papua New Guinea
|
Colocasia esculenta
| null |
2019-05
| null | null |
Taro bacilliform CH virus isolate PNG-P, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTTGTTTTTCAAAGAATCAGTATATAAAAAGCCGTTCTTTCAAAGGATAAGTTACGCTTATCTTGCGAAGAGCCGTTTGCGTGACTGGATGAATAATCCCTAAGTCCGCCAAGTACTGATGCGAAGAAATACCAAAGCTAGAGCTAAAGTCTTGAAAGACAACTGGAAAGGATAGAAAAGCCCGTCATCTAGTCAACAACCTGAGCGGAAAAAGGAAGACGGAGTTGTAGCAAGCCTAGGGACAAAAGACAGTAAGTAGGCTGAAGGAGAAAAGAAAGAAGCCGAAGAAAACTGTTGCGTCTAAGGAGAAAAACTTGTGAGTCCGAGCCTTTGGAGTAAGGGTTAATGAGTGATAGATGGGAAAATGCTGTACAAGAATGGTATTCCTCTAGAACTGCCAATCTTGAATATTTAGATCTATCAATTCCAGAAGATAAAAAGCCATCACAAAAGGAGTTAGCTCACAACCTGTCAGTTGTTTATGATCGTGTATGTCTATCTAGTAGAGTCCATCTAAAGAACTTCAAGTCAATCCTTGAAAGACTTGAAGCCTTAGAGTCAGAAAATCGAGAACTCAATCATAAGTTCTTGAAACTACAAAAATTCATTCAAGGTTTACCAATTCCATTAACGGGTTCCGAAGTGCATGCTCTTGTGAAGGAAATAGCAGCACAACCAAAGCTGGTAGAAGAACAAGCAATCCAGATCTCCCAAGAACTGGAAAAGAAGCTAGAACGAGTAGAGCACGTCTTAAAGAAGGTAGAAGAGTGGACTCGTTCATGAGTCACATAAATACTCAAGCTACTGAATCCTACACAACCGCTCTACAAGCTACTGAAGAAATAGAAGCACCAGCAGTCGGCTTTGCCAAACCTGCCGACAACAAAGGACCCAATTCAGGAACAACAACCTTAATCAAGCAGAACAACACTCAAATTGAGTTGCTTGTAAGGTTAACAGAGGAAGTGAAGGCTCTCAGACAGGAAGTAGCCCAACTACGAAAAGAGAAAAGCCAGGCATCATCTATTCCTGACGATCTTATTTCAGGACTGAAGAACCTGAAGCTGTCTGATCAAAAGACAAGAGAAGCACCTGGCAAGCTAAGGGTATTCAAAGACCCTTTAGAAGAATACAAGAAAGAAAAAGCAAGGAAGCCTTAAATGGCAACCTCAACTACAACTACCACAGCCAGAGCACAAGAACAACCTTCAACATCCCGAACAACTCCTCTGTTCGAGGATCAAATCCGCGACTACAGACGAAGGCAACGGCGGATGCACAATGCACGACAAACAGTGAATCGTCTACAAAGACGGATCACAGGAAGGAGCCAGCTCCATAATGAGACTTTGGAGCAACAAATTGACCCACAAGTTCAACTGACAAACTCTACGCAGGAACGAGCGGCGATTGTCCCTGCAGAAGTACTGTACCACTCTCGTCGAGATGATGTGCACCATCGGGTCTATGTGCACAGATCTGAAGAAGCCCTTCTCTGCACCGACAATCAACAGCAAGATCGCATCTTCATCCAAGAAGAGAGCTACAGACAGTTGCAGCGAAGCAGGATGCAGTTCATACACATCGGGGTGATGCAACTCCGAATACAAGCGCTGCATCGACAGGACGAAGGTACAATGGCTCTTGTTGTTTTCCGTGACAACAGGTGGCCAGATGATCGCTCCCTGTTCGCCACTATGGAAGTTGATCTAACACGGGGAAGCCAGTTGGTGTATGTAATCCCTGACACCATGATGACCATCGGGGATTTCTACAACAACGTACAAGTCTCGATCCTCACCCGAGGATATGAGAACTGGAGGGGAGAAGCAAATCTCCTCATCACCAGGGGATTAGTCGGGAGGCTGTCCAACACCCCAAATGTTGGATTTGCATATGAAGTACAAAGCGTGGTTGACTATTTAGTCAGTCATGGCGTTTCAGCAATCCTTGGAAGAAGAAGAACAGTCCAAGATCTTCAAGGTTGCAACTGGGTAGTAAGACCCACTCAAGCAAGCATCCCACGACAACCAACAGAAGTGGACACCCGCACCAATATTGATGGTACGATTTCTCTTCGCTTTGGTAATTATACCTTGGGAAGAACCTCTACCACAAGGCGGATCTCATACAACCTTCGAGATGAAGAAGTTCAAAGCGATGAAGAACAAATCATTGCCGTTTTCAAACTGGACTGTTACACGGAAGCCCAACCTGCTATTTGGGATACTTTAGGAGAACCTTCGGGCAAGTTCGACTACTATGCCAGGTATGACATGCCCGACAATCATCTCCAAATCCCCATTGAACACATCATTGCCACAGGCTGGGATGAGGACGATGAAACAACAACATCATCCTCTGATGAAGCAAGCTACCTACAGTACCTCTCTAATATTGAAGGTACCTCTGTATCTACTGAACAGGAACTCCCGTACCCTGTTCATATAAGCGACATGATAAATCCTTTCGCTTCCACAGAAGGTGGTGGGGATAATGCCCCTATTAATTTTCCTATTTTTGATCAATCTGATGAGGAAGAAGAAATTCTTCCGAATTCTGATTCCTGCGGGAAGGAAACAGTAAGCTATATAGCTGCAGCCTTCCCAGAAAATAATGCTGATAATGAGATAGATTATCCTCAATTAAGAAATCTTCAACAACATCTATATGCATCTCCATCAGCAACATCAAGTTATAATCCGCCAAGAGATGTAGCCATGGGTCCTCCAAATTATGGACCAGCACCATTACAAATGATCCAGCCAGGAGAAGTACCCTCAAAGCCAACATTTGAAGGCTACAAAACAGGAGGAGTCCGCTATAAAGCAAAAGACTACTCCGAATGGTGGAATCTACCCTCAGCACAACATGGCACTGGAGCCATCTTCGTGATTCCAACTCAACTCAATATGTTTAATGATACATTTATGAGGTGGGAATCAATCACCAAGAATCTTGTCTCACAACAAGGATTTACAGATCCCAATGACAAGATGGAATTCATAGAAAATCTACTTGGTGAAATTGAGAAAATAGCGTGGATGCAATGGAGGATGAATTATCCTAATGCCTTCACACAACTGATGGAATCGGCTGATGGAAGGCAAGGTACGCAAAACATTATATCTCAAATTCGTACAGTCTTCACTTTAGAAGACCCCTACCAAGGTTCCACAGCAGTACAAGAAGAAGCCCTAAGGGACTTGGAAAAATTGACCTGTCACAATATCAAAGATGTAGTAGCCTTCATGAATGAATATATGAGGCTAGCTTCCAAGACCGGAAGACTCTTCATCGACTCAGAACTTTCTGAAAAATTCTGGTTTAAATTACCCGGAGAACTCGGCCCAAGAATCAAAGCAGCTTATGAGGCCAGATATCCAGGTAACACTATTGGAGTCTTCCCAAGGGTTTTATTTGCTTATAAGTTCTTGGAAAATGAGTGCAGGGATGCAGCCTATAAAAGATCCCTCAAGAACTTATCATTCTGCAGTAGTATCCCTATTCCAGGATACTACAAATCAGAAAAGAAATACGGCGTGAGAAGGTCAAAGACCTATAAAGGCAAACCACATGCCTCCCATGCTCGTATAGAAAGAAGAAAGCACCTCCAGCGAAACAAAAGGTGCAAATGCTATCTCTGCGGCCAAGAAGGACACTTTGCCAGAGAGTGTCCCAATGATAGAAGAAGCATCAAAAGAGTCGCAATATTTGAAAATCTGGACCTGCCTGAGGACTGTGATATAGTCTCCGTCCAAGAAGGAGAAAATGAAAGTGATGCCATATACAGTATCTCAGAAGGAGAAGAAATGGAGGACTTATCAAAGTCCTTAAATGTCATGACGGTCTCAGAACATCTCTATTACTTCCGAGAAGAAGACCAGACATACTGGATCGGAGGGGAAGGTTACCGATCCATGATAAGGGCCACAAAAACCCAACATGACTGCAACCATGCTTGGGAATACAATGGCACAGGTTCCTCTAAATGTTTCTGCTGTAAAGTAGAAACATCAACCAACTACAGAATGCACTGCCCACAGTGCCTGATCACAACCTGCAACATCTGTGCCCTTTACTACTTTGAGCAAAAGGTACCAGCATCTCGCCCCAACCCTATACAATATAACCCTCTTTCTCTCATGCATGAACAGCAAGGGTATATTACATGGTGCGAAGCTGAAATCACAAGGCTCAAACAAGAGGTAGAGACTTCAAAACAGCAAACTGAATATTGGAAACAGAAGTATCTATCTACACAGGAAGAAGACCTCGAGAAAGAATTTAATGAATTGTACAAAGCAAAAGGCAAGGGGATAGAAATTCATGAAGAAACAAATGTGTTTCAACAAATTGAGACACAGAAAATCCTTTCACTAGCAAAGAACGAGCTCTCCCCACCAAAGAAAACCAGGAACATGCTGTACAATCTCGTCTTAGAACTCAACATTCCTGATGTTGCAAACTTCAGTATCCATGCCATTCTGGATACCGGAGCATCCACCTGCTGCATAAATGCTGAAGCAGTACCCGAAAATGCAGTTGAAGACAGCCCCTTTTTGGCAAGCTTCAGCGGCATTAACTCAAAAGTCTCAACCAGCAAAAGGCTAAGGTATGGAAAGATGATCATCGGAGAAAACATTTTTAGAATTCCATACACGTATGTCTTTCCTATGAAGCTAGGTGATGACATACAAATGATACTTGGATGCAACTTCATAAGAGCTATGCAAGGAGGAGTCCGAATTGAAGGTGACATAGTAACATTCTACAAAAACGTCACACAGATTCAGACTCAACAAACAGTTCCTATCATCGCAGCAATCGAAGAATTGGAACTTGAAGAAGAAGAATATATTTCTATAGCATCAATATGTGCCTATGGAGGTATGGAAATCTCTTCACCCTTCCAGTTCAGCTATCAAAAATTGATACAGGAACTAAAAGACATGGGCTACATAGGAGATGACCCCATGAAATATTGGTCATCCAACAAAATCACGTGCCAGCTGGAAATTAAAAATCCAGATTTAACTATTGAAGACAGGCCCCTGAAGCATATATCACCTCAATTGGAGGCATCATACAAACGACATACAGAGGCACTGCTCAAACTTGGCACTATTAGGCCCAGTAAAAGTAAGCATAGAACCACTGCAATAATCGTCAATTCCGGAACAACTATTGACCCTGTTACAGGAAAGGAGGTCAGAGGAAAGGAGCGAATGGTCTTCAACTACGAAAGGTTGAATGATAACACACACAAAGACCAATACAGTCTGCCCGGAATCAATACGATTATTCAAAAGGTCGGAAATAGCAAAATCTACTCTAAATTCGACCTAAAGAGTGGTTTTCACCAAGTCGCAATGCATCCAGACTCTATAGAATGGACAGCATTCTGGGTCCCACAAGGACTATATGAATGGCTGGCAATGCCATTCGGCCTTAAAAATGCTCCCGCAGTATTTCAAAGAAAAATGGATAACTGTTTCAAAGGTACGGAAAAATTCATTGCCGTATATATTGATGATATCCTTGTTTTCTCTGAAAATGAAAAAGAACATGCAAGGCACCTAGAAATCATGCTAGAAATATGCAAAAAGAATGGACTGATACTAAGCAATTCAAAGATGAAAATTGCAGTACCAACCATTGACTTCCTAGGAGCCACTATAGGTAACCGCAAAATAAAATTGCAGGAGCACATAATAAAGAAAATTGCGGATTACCCAGAAAAAGAACTCACAAATACCAAGGGATTAAGGTCATGGCTAGGAATCCTAAACTATGCCAGAAGCTATATCCCTTATCTGGGCAAACAGCTAGGCCCATTATACTCAAAAATCAGCCCAACGGGAGAAAAGAGAATGAACCAACAAGATTGGGCTATTGTAAAACAGATCAAGGAAAAGGTCCAAAACCTACCTGATCTAGAATTACCTCCTCCTGATTGCCACATCGTCCTAGAAACTGACGGATGTATGGACGGATGGGGAGGAGTATGCAAATGGAAGCCCCAAAGATGTGGTGGAAAAACAATGGAAAAAATATGTGCTTATGCCAGTGGAAAATTCAATCCACCCAAATCTACAATTGATGCAGAAATTCATGCAGTTATGAACAGCCTAAACAGCTTCAAGATTTATTATCTTGACAAAAAGGAGCTACTTATTAGAACAGATTGTCAAGCAATCATTAGCTTCTTTAACAAATCTGCACAGAACAAACCATCGAGGGTCAGATGGGTATCATTCACAGATTTCATAACCGGCACAGGCCTTGAAATCAGATTCCAGCACATTGATGGCAAAGACAACGCGCTAGCGGACGCATTATCTAGACTCATCCATAGTTTAGTCTCAAACCCGGATTCTTATTCGGATCAGACTATTCTACTGGCTGAACTAGCTATTGCGGAAGCTCGAGATAAACCCCAGCCTGGTAAGAATATGAAACTAACAAACTTGATTTTATCCTTAGCAGGTAATGGACAAAGCAGCAGACAAGTACTGCAGAATCTTAGGGGAAATGACGCAGCTTCCAAAGCCTCTCATGGAGTTGCATGAAATGTCAGGAGAAGCGTTCAGAGAAAGGCGAAAGGTGCAGGAGCAACTAGCTCTTGCAACTCAAGAAATGGAACAGTGCCTTATGGCACAATACTCATACTTCGCCAGATATGCAACCCGGGATAACTACTGGGGAGATCATCTGCAAGATCTCCGTGAACGTATGGACACATTCAGGAAACTCAAGATCAACATCCTGGAGTGTACCATGCACACAGCCTACCCATGAAGCAATGGTGGGCCCTACTGCTGAAGACGACGCTCGGCGTCTACACTGAGCCTTATCATGCCACCCTGGCACACCTTCCTTTCAATAGGAAAATGATAAGATTCTTAAAATCTTATCTCTATTGTCATCTTGTAAAAAGCATGAACAAGGGATGAATTATTCGAAGGACGATGGGGCCCAATGCGCACCCGCTTCGAAGAAGACATAACCCTTCACATGCCTTAAAGTAGAGTGTCTAAGACTTGACTTGAGCCTCGGGGAGCCGGTCGAGTCCTTGTCAAAACAGTCTGGCTAAAAAGAATCGATTTGAGCCTCGGGGAGCCGATCGAATCTTTCTTAGCCCGGGCCCCTGGTTTCCCAAAAACCACGGCGCCCCTGGTTTTATGCCCACGGTTTTCATTAACCAAGGTTTGATCAACCACGGTTAGAAGAACCAAAGGCCAGAGTCTTAGGGGCTCCTTATATCTATATAAGGAGTCCACCTCCCTCGTAACAAAACACACAAGCAAAACTTGGTTAAGGGTTGCTTGAGTCTAGCATCTCTTTGTTCCTCCAACCCTAGCATACAAGCCTCGTCTCTCGGCTTAGAAAGGAAGGGATTTCTATCTCAGTCCTAAAGCCAGACATAGCTTGTTTTGCAGGACCAGTGCGTCATCTGTAAGAAGTCTCCGGAGTGTCCCCCGGAACGTGTAAACAACCTCTCTGAAGGTATATAATATTTCCGCATTACGTTTCATTTCTCTCTGATTCTGCCTTCTCACCTTAGTCCATATTGGTTGGTGATCGAAGATGAGATCCATGTTTTGGAAGAAAAATTTCTTATTAAGGGTTTTACTTTCAAAATAAAGGGTATTATTTT
| 27,269
|
MG833014.1
|
Taro bacilliform CH virus
|
Kidanemariam,D.B., Sukal,A.C., Abraham,A.D., Stomeo,F., Dale,J.L., James,A.P., Harding,R.M.
|
Queensland University of Technology, Center for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
|
2018-11-12
|
Tz27
|
Badnavirus betacolocalasiae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,389
|
GenBank
| null |
Tanzania
|
Tanzania
|
Xanthosoma
| null |
2015-08-06
| null | null |
Taro bacilliform CH virus isolate Tz27, complete genome
|
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| 67,211
|
MG017324.1
|
Taro bacilliform CH virus
|
Kidanemariam,D.B., Sukal,A.C., Abraham,A.D., Stomeo,F., Dale,J.L., James,A.P., Harding,R.M.
|
Queensland University of Technology, Center for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
|
2018-10-08
|
Et17
|
Badnavirus betacolocalasiae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,610
|
GenBank
| null |
Ethiopia
|
Ethiopia
|
Colocasia esculenta
| null |
2015-05-07
| null | null |
Taro bacilliform CH virus isolate Et17, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTTGTTTTTCAAAGAATCAGTATATAAAAAGCCGTTCTTTCAAAGGATAATTTACGCTTATCTTGCGAAGAGCCGTTTGCGTGACTGGATGAATAATCCCTAGGTCCGCCAAGTACTGATGCGAAGAAATACCAAAGCTAGAGCTAAAGTCTTGAGAGACAACTGGAAAGGATAGAAAAGCCCATCATTTAGTCAATAACCTGAGCGGAAAAAGGAATACGGAGTTGTAGCAAGCCTGAGAGACAAAAGACAGTAAGTAGGCTGGAGAAGAAAAGAAAGAAGCCGAAGGAAGCTGTTGCGTCTAAGGAGAAAAACTTGTGAGTCCGAGCCTTTGGAGTAAGGGTTAATGAGTGATAGATGGGAAAATGCTGTACAAGAATGGTATTCCTCTAGAACTGCCAATCTTGAATATTTAGATCTATCAATTCCAGAAGACAAAAAGCCATCACAAAAGGAGTTAGCTCACAACCTGTCAGTCATTTATGATCGTGTATGTCTATCTAGTAGAGTCCATCTAAAGAACTTCAAGTCGATCCTTGAAAGACTTGAAGCCTTAGAGTCAGAAAATCAAGAACTCAATCATAAGTTCTTGAAACTACAAAAATTCATTCAAGGTTTGCCACTTCCATTAACGGGTTCCGAAGTGCATGCTCTTGTGAAGGAAATAGCAGCACAACCAAAGCTGGTAGAAGAACAAGCAATCCAGATCTCCCAAGAACTGGAAAAGAAGCTAGAACGAGTAGAGCACGTCTTAAAGAAGGTAGAAGAGTGGACTCGTTCATGAGTCACATAAACACTCAAGCTACTGACTCCTACACAACCGCTCTACAAGCTACTGAAGAAATAGAAGCACCAGCAGTCGGCTTTGCCAAACCTGCCGACAACAAAGGACCCAATTCAGGAACAACAACCTTAATCAAGCAAAACAACACTCAAATCGAGTTGCTTGTAAGGTTAACAGAGGAAGTGAAGGCTCTCAGACAGGAAATAGCCCAGCTACGAAAAGATAAAAGTCAGGCATCATCTATTCCTGACGACCTGATTTCAGGACTGAAGAACCTGAAGCTGTCTGACCAAAAGGCAAGAGAAGCGCCTGGCAAGCTAAGGGTATTCAAAGACCCTTTAGAAGAATACAAGAAAGAAAAAGCAAGGAAGCCATGAAAGAAATGGCAACCTCAACAACAACTACCATAGCCAGAGCACAAGAACAACCTTCAACATCCCGAACAACTCCTCTGTTCGAGGATCAAATCCGCGACTACAGACGAAGGCAACGGCGGATGCACAATGCACGACAAACAGTGAATCGTCTACAAAGACGGATCACAGGAAGGAGCCAGCTCCATAATGAGACTTTGGAGCAACAAATTGACCCACAAGTTCAACTGACAAACTCTATGCAGGAACGAGCGGCGATTGTCCCTGCAGAAGTACTGTACCACTCTCGTCGAGATGACGTGCACCATCGGGTCTATGTGCACAGATCTGAAGAAGCCCTTCTCTGCACCGACAATCAACAGCAAGATCGTATCTTCATCCAAGAAGATAGCTACAGACAGTTGCAGCGAAGCAGGATGCAGTTCATACACATCGGGGTGATGCAACTCCGAATACAAGCGCTGCATCGACAAGACGAAGGTACAATGGCTCTTGTTGTTTTCCGTGACAACAGGTGGCCAGATGATCGCTCCCTGTTCGCCACTATGGAAGTTGATCTAACACGGGGAAGCCAGTTGGTGTATGTAATTCCTGACACCATGATGACCATCGGGGATTTCTACAACAACGTGCAAGTCTCGATCCTCACCCGAGGATATGAGAACTGGAGGGGAGAAGCAAATCTCCTCATCACGGGGGGATTAGTCGGGAGGCTGTCCAACACCCCAAATGTTGGATTCGCATATGAAGTACAAAGTGTGGTTGACTATTTAGTCAGCCATGGCGTATCAGCAATCCCTGGAAGAAGAAGAACAGTCCAAGATCTTCAAGGTTACAACTGGGTCGTAAGACCTACTCAAGCAAGCATCCCGAGACAACCAACAGCAGTGGACACACACACCAACATTGACGGTACGATTTCTCTTCGCTTTGGTAATTATACCTCAGCAAGAACTTCTACCACCAGACGTATCACATACAACCTCCGGGATGAAGAAGTCCAGAGCGATGAGGAGCAAATCATCGCGGTCTTCAAACTGGACTGTTACACGGAACCTGCTACATGGGACCTTCTTGGAGAGCCCTCTGGGAGAAAATTTGACTACTATGTCAGGTATGATTTGCCTGACAACAATCTCCAAGTTCCCATAGAACATATAATTGCAACAGGATGGGATGATAATGATTCCCAGACATCATCTGATGAAATAAGCTACCTACAGTACCTCTCCAATATTGGAGGTACCCCTGTATCTACTGAACAGGAGCTCCCGTACCCTGTTCATATAAGCGACATGATAAATCCTTTCGCTTCTACGGAAGGTGGTGGGGATAAAGCCCCTGTAATTTCTGATTTTCCCATTTTTGATTCAACTGATGAGGAAGAAGAAATTCTTCCAAAATTTAATTCATACAGGAAGGAAACAGCAAATTATATTGCTGCAGCCTTCAAAGAAAACGATGCTGATGATGAGACAGACTATCCTCAGTTGAAGAATCTTCAACAACACTTGTATGCATCAGCAACATCAAGTTATAATCCACCAAGAGATGTAGCCATGGGTCCTCCAAATTATGGACCAGCACCATTACAAATGATCCAACCAGAAGCAGGACCTTCAAGGCCAACATTTGAAGGCTACAGATCAGGAGGAGTTCGCTACAAAGCAAAAGACTACTCCGAATGGTGGAATCTACCCTCAGCACAACATGGCACTGGAGCCATCTTCGTGATTCCTACTCAACTCAATATGTTTAATGATACATTCATGAGGTGGGAGTCAATCACCAAGAATCTTGTCTCACAACAAGGATTTACAGATCCTAATGACAAGATGGAGTTCATAGAGAATCTACTCGGTGAAGCTGAGAAAATAGCATGGATCCAATGGAGGATGACTTATCCTCAAGCTTTTCAACAATTAATGGAATCTGCTGATGGTAGGCAAGGTACGCAAAATATTATATCCCAAATACGTACAGTCTTCACCTTAGAAGACCCCTACCAAGGATCCACTGCAATACAAGAAGAAGCCCTAAGGGACTTGGAAAAATTATCCTGTCATAATATCAAGGATGTAGTAGCCTTCATGAATGAATATATGAGGCTAGCTTCCAAGACCGGAAGACTCTTTATCAACTCAGATCTCTCTGAAAAATTCTGGTTCAAATTGCCCGGAGAACTCGGCCCAAGAATCAAAGCAGCTTATGAGGCCAAATATCCAGGTAACACTATTGGAGTCTTCCCAAGGGTTTTATTTGCTTATAAGTTCTTGGAAAATGAGTGCAGGGATGCAGCCTATAAAAGATCCCTCAAGAACTTATCTTTCTGTAGTAGTATCCCTATTCCAGGATACTACAAATCAGAAAAGAAATACGGCGTGAGAAGGTCAAAGACCTATAAAGGCAAACCACATGCCTCCCATGCTCGTATAGAAAGAAGAAAGCACCTCCAACGAAACAAAAGGTGCAAATGCTATCTCTGCGGCCAGGAAGGACATTTTGCCAGAGAATGTCCCAATGATAAAAGAAGCATCAAAAGAGTCGCAATATTTGAAAATCTGGACCTGCCTGAGGACTGTGATATAGTCTCCGTCCAAGAAGGAGAAAATGAAAGTGACGCCATATACAGTATCTCAGAAGGAGAAGAGATGGAGGACTTATCAAAGTCCTTAAATGTTATGTCGGTTTCAGAACATCTCTATTACTTCCGAGAAGAAGACCAGACATACTGGATCGGAGGGGAAGGTTACCGATCCATGATTAAGGCCACAAAAACCCAACATGATTGCAACCATGCTTGGGAATATAATGGTGCAGGTTCATCTAAATGTTTCTGTTGTAAAGAAGAAACATCTACCAATTATAGGATGCACTGCCCACAGTGCCTCATTACAACCTGCAACATCTGTGCCCTTTACTACTTCGGACAAAAGGTACCAGCATCTCGCCCTAATCCTATACAATATAACCCTCTCTCTCTCATGCATGAACAGCAAGGGTATATTACATGGTGCGAAGCTGAAATCACAAGGCTCAAACAAGAGGTAGAAACTTCAAAGCAACAGACTGAATACTGGAAGCAGAAGTATCTATCCACACAGGAAGAAGCCTTTGAAAAAGAATTTGATGAATTGTACAAAGCAAAAGGCAAGGGGATAGAAATTCATGAAGAAACAAATGTGTTTCAACAAATTGAGACACAAAAGATCCTCTCTCTAGCAAAAAATGAACTTTCCCCGCCAAAGCAAACCAAGAATATGTTGTACAATCTTATTCTTGAACTCAACATTCCTGAGGTTGCAAACTTCAGTGTCCATGCCATTCTGGACACAGGAGCATCCACCTGCTGCATAAATTCTGAAGCAGTACCTGAAAATGCGATTGAAGATAGCCCCTTCTTGGCTAAATTCAGTGGCATCAATTCAAAAGTCTCAACCAGCAAAAAGCTAAGGTATGGAAAAATGATTATCGGTGATAACATTTTCAGAATTCCATACACATATGTCTTCCCTATGGAGCTAGGTGATAATATACAAATGATACTTGGATGCAACTTCATAAGAGCTATGCAAGGAGGAGTCCGAATTGAAGGTGACACAGTAACATTCTACAAAAATGTCACACAGATTCAGACTCAACAAACAGTTCCTATCATCGCAGCAATTGAAGAATTGGAACTTGAAGAAGAAGAATATATTTCTATAGCATCAATATGTGCCTATGGAGGTATGGAAATCTCTTCACCCTTTCAGTTCAGCTATCAAAAATTGATACAGGAACTAAAAGACATGGGCTACATAGGAGATGACCCCATGAAATACTGGTCA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| 67,939
|
MG017325.1
|
Taro bacilliform CH virus
|
Kidanemariam,D.B., Sukal,A.C., Abraham,A.D., Stomeo,F., Dale,J.L., James,A.P., Harding,R.M.
|
Queensland University of Technology, Center for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
|
2018-10-08
|
Ke43
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Badnavirus betacolocalasiae
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Badnavirus
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Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,647
|
GenBank
| null |
Kenya
|
Kenya
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Colocasia esculenta
| null |
2015-05-24
| null | null |
Taro bacilliform CH virus isolate Ke43, complete genome
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AAAATCCAGATTTAACTATTGAAGACAGGCCCCTGAAGCATATATCACCTCAATTGGAGGCATCATACAAACGACATACAGAGGCACTGCTCAAACTTGGCACTATCAGGCCCAGTAAAAGTAAGCATAGAACCACTGCAATAATCGTCAATTCTGGAACAACTATTGACCCTGTTACAGGAAAGGAGGTCAGAGGAAAGGAGCGAATGGTCTTCAACTACAAAAGGTTGAATGATAACACACACAAAGACCAATACAGTCTGCCCGGAATCAATACGATTATTCAAAAGGTCGGAAATAGCAAAATCTACTCTAAATTCGACCTAAAGAGTGGTTTTCACCAAGTCGCAATGCATCCAGACTCTATAGAATGGACAGCATTCTGGGTCCCACAAGGACTATATGAATGGCTGGCAATGCCATTCGGCCTTAAAAATGCTCCCGCAGTATTTCAGAGAAAGATGGATAACTGTTTTAAAGGTACGGAAAAATTTATTGCAGTATATATCGATGATATACTTGTTTTCTCTGAAAATGAAAAAGAACATGCCAGGCACCTAGAAATCATGCTAGAAATATGCAAAAAGAATGGATTAATACTGAGCAGTTCAAAAATGAAAATCGCAGTACCAACCATTGATTTCCTAGGAGCTATCATTGGTAACCGCAAAATAAAATTGCAGGAGCACATAATAAAGAAAATTGCGGATTACCCGGAAAAAGAACTTACAAATACCAAGGGATTAAGATCATGGCTAGGAATCCTAAACTATGCCAGAAGCTACATCCCTTATTTGGGCAAACAACTAGGCCCATTATACTCAAAAGTCAGCCCAACCGGAGAAAAGAAGATGAACCAACAAGATTGGGCTATTGTTCGACAGATCAAGGAAAAGGTTCAAAACCTTCCTGATCTAGAGTTACCGCCTCCTGATTGCCACATCGTCCTGGAAACCAACGGGTGTATCGACGGATGGGGAGGAGTATGCAAATGGAAGCCCCAAAGATGTGATGGAAAAACAGTGGAGAAAATATGTGCTTATGCCAGTGGAAAATTCAATCCACCCAAATCTACAATTGATGCAGAAATTCATGCAGTTGTGAACAGCCTAAACAGCTTCAAGATTTATTATCTTGACAAAAAGGAGCTACTTATTAGAACAGATTGTCAAGCAATCATCAGCTTCTTTAACAAATCTGCACAGAACAAACCATCAAGGGTCAGATGGGTATCATTCACAGATTTTATAACCGGCACAGGCCTTGAAATCAGATTCCAGCACATCGATGGCAAAGACAACGCGCTAGCGGACGCATTATCTAGACTCATCCATAGTTTAGTCTCAAACCCGGATTCTTATTCGGATCAGACTATTCTACTGGCTGAACTAGCTATTGCGGAAGCTCGAGATAAACCCCAGCCTGGTAAGAATATGAAACTAACAAACTTGATTTTATCCTTAGCAGGTAATGGACAAAGCAGCAGACAAGTACTGCAGAATCTTAAGGGAAATGACGCAGCTTCCAAAGCCTCTCACGGAGTTGCATGAAATGTCAGGAGAAGCGTTCAGAGAAAGGCGAAAGGTGCAGGAGCAACTAGCTCTTGCAACTCAAGAAATGGAACAATGCCTCATGGCACAATACTCATACTTCGCCAGATATGCAACCCGGGATAACTACTGGGGAGATCATCTGCAAGATCTCCGGGAACGTATGGACACATTCAGGAAACTCAAGATCAACATCCTGGAGTACACCATGCACACAGCCTACCCATGAAGCAATGGTGGGCCCTACTGCTGAAGACGACGCTCGGCGTCTACACCGAGCCTTATCATGCCACCGTGGCACACCTTCCTTTCAATAGGAAAATGATAAGATTCTTAAAATCTTATCTCTATTGTCATCTTGTAAAAAGCATAAACAAGGGATGAATTATTCGAAGGACGATGGGGCCCAATGCGCACCCGCTTCGAAGAAGACATAACCCTTCACATGCCTTAAAGTAGAATGTCTAAGACTTGACTTGAGCCTCGGGGAGCCGGTCGAGTCCTTGTCAAAACAGTCTGGCTAAAAAGAATCGATTTGAGCCTCGGGGAGCCGATCGAATCTTTCTTAGCCCGGGCCCCTGGTTTCCCAAAAACCACGGCGCCCCTGGTTTTATGCCCACGGTTTTTCATTAACCAAGGTTTGATCAACCACGGTTAGAAGAACCAAAGGCCAGAGTCTTAGGGGCTCCTTATATCTATATAAGGAGTCCACCTCCCTCGAAGCAACACACACAAGAAAAACTTGGTTAAGGGTTGCTTGAGTCTAGCATCTCTTTGTTCCTCCAACCCTAGCATACAAGCCTCGTCTCTCGGCTTAAAAAGGAAGGGATTTCTATCTCAGTCCTAAAGCCAGACATAGCTTGTCTTGCAGGACCAGTGCGTCATCTGTAAGAAGTCTCCGGAGTGTCCCCCGGAACGTGTAAACAACCTCTCTGAAGGTATATAATATTTCCGCATTACGTTTCATTTCTCTCTGATTCTTGCCTTCTCACCTTAGTCCATATTGGTTGGTGATCGAAGATGAGATCCATGTTTTGGAAGAAAAATTTCTTATTAAGGGTTTTACTTTCAAAATAAAGGGTTTTAATTCTTTGAAA
| 67,940
|
MG017326.1
|
Taro bacilliform CH virus
|
Kidanemariam,D.B., Sukal,A.C., Abraham,A.D., Stomeo,F., Dale,J.L., James,A.P., Harding,R.M.
|
Queensland University of Technology, Center for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
|
2018-10-08
|
Tz36
|
Badnavirus betacolocalasiae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,654
|
GenBank
| null |
Tanzania
|
Tanzania
|
Colocasia esculenta
| null |
2015-08-06
| null | null |
Taro bacilliform CH virus isolate Tz36, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTAGTTAATATTTCCGCATTACGTTTGATTCGAGACTATGGTGCCTTCTCACCTTAGTCCATATTGGTTGGTGATCGAAGATGAGATCCATGTTTTGGAAGAAAAATTTCTTATTAAGGGTTTTACTTTCAAAATAAAGGGTTTAAAACCCTTTATTTTGAAAGTAAAAACCCTTAATAAGAAATTTTTCTTTCAAAACATGGATCTCATCTTCGATCACCAACCAATATGGACTAAGGTGAGAAGGAGAATTGAATAATCCCTACGTCCGCCAAGTACTGATGCGAAGAAATACCAAAGCTAGAGCTAAAGTCTTGAAAGACAACTGGAAGGGATAGAAAAGCCCGTCATCTAGTCAACAGCCTGAGCGGAAAAAGGAATACGGAGTTGTAGCAAGCCTAGGGACAAAAGACAGTAAGTAGGCTGGAGAAGAAAAGAAAGAAGCCGAAGAAAGCTGTTGCGTCTAAGGAGAAAAACTTGTGAGTCCGAGCCTTTGGAGTAAGGGTTAATGAGTGATAGATGGGAAAATGCTGTACAAGAATGGTATTCCTCTAGAACTGCCAATCTTGAATATTTAGATCTATCAATTCCAGAAGATAAAAAGCCATCACAAAAGGAGTTAGCTCACAGCCTGTCAGTTGTTTATGATCGTGTATGTCTATCTAGTAGAGTCCATCTAAAGAACTTCAAGTCAATCCTTGAAAGACTTGAAGCCTTAGAGTCAGAAAATCGAGAACTCAATCATAAGTTCTTGAAACATACAAAAATTTATCCAAGGTTTGCCACTTCCATTAACGGGTTCCGAAGTGCATGCTCTTGTGAAGGAAATAGCAGCACAACCAAAGCTGGTAGAAGAACAAGCATCCAGATCTCCCAAGAACTGGAAAAGAAGCTAGAACGAGTAGAGCACGTCTTAAAGAAGGTAGAAGAGTGGACTCGTTCATGAGTCACATAAACACTCAAGCTACTGAATCCTACACAACCGCTCTACAAGCTACTGAAGAAATAGAAGCACCAGCAGTCGGCTTTGCCAACCTGCCGACAACAAGAGGACCCAATTCAGGAACAACAACCTTAATCAAGCAGAACAACACTCAAATTGAGTTGCTTGTAAGGTTAACAGAGGAAGTGAAGGCTCTTAGACAGGAAGTAGCCCAACTACGAAAAGAGAAAAGTCAGGCATCATCCATTCCTGACGATCTTATTTCAGGACTGAAGAACCTGAAGCTGTCTGATCAAAAGACAAGAGAAGCACCTGGCAAGCTAAGGGTATTTAAAGACCCTTTAGAAGAATACAAGAAAGAAAAAGCAAGGAAGCCTTGAAAGAAATGGCAACCTCAACTACAACTACCACAGCCAGAACACAAGAACAACCTTCAACATCCCGAACAACTCCTCTGTTCGAGGATCAAATCCGCGACTACAGACGAAGGCAACGGCGGATGCACAATGCACGACAAACAGTGAATCGTCTACAAAGACGGATCACAGGAAGGAGCCAGCTCCATAATGAGACTTTGGAGCAACAAATTGACCCACAAGTTCAACTGACAAACTCTATGCAGGAACGAGCGGCGATTGTCCCTGCAGAAGTACTGTACCACTCTCGTCGAGATGATGTGCACCATCGGGTCTATGTGCACAGATCTGAAGAAGCCCTTCTCTGCACCGACAATCAACAGCAAGATCGCATCTTCATCCAAGAAGGGAGCTACAGACAGTTGCAGCGAAGCAGGGTGCAGTTCATACACATCGGGGTGTTGCAACTCCGAATACAAGCGCTGCATCGACAGGACGAAGGTACAGTGGCTCTTGTTGTTTTCCGTGACGACAGGTGGCCAGATGATCGCTCCNTGTTCGCCACTTTGGGAANGTTGACTCTAACACGGGGAAGTGGTGTATGTAATCCCTGCACCGTGTTGACCAATCGGGGGATTCTACAACAACGTACAAAGTCTCTGATCCTCACCCGAGGATATGAGGGTGGAGGGGAGAAGCAAATCTCCTCATCACCAGGGGATTGTCGGCGAGGCTGTCCAACACCCCAACTGTTGGATTTGCATTTGAAGTACAAGAGTGTAGTTGACTATCTAGTCAGCCTGGCGTTTCAGCAATCCCCGGAAGAAGAAGATACAGTCCAAGATCTTCAAGGTTACAATTGGGTAGTAAGACCCACTCAGGCAAGCATCCCACGACAACCAACGGAGGTGGACACCCGCACTAATATTGATGGTACGATTTCCCTTCGCTTTGGAAATTATACCTTGGGAAGAACCTCTACTACAAGACGAATCTCCTACAACCTCCGGGATGAAGAAGTACAAAGCGATGAAGAACAAATTATTGCCGTTTTCAAATTGGACTGTTACACGGAAGCCCAACCTGCCATCTGGGATACCCTAGGAGAACCCTCGGGAAAATTTGACTACTATGCCAGGTATGATTTGCCTGACAATCATCTTCAAATCCCTGTTGAACATATTATTGCTACAGGATGGGACGAGGACGATGAAACAGCAACATCATCCTCTGATGAGACAAGCTACTTACAGTACCTCTCTAGTTATGGAAGTACCTCTGTAACTACTGAACAGGAACTCCCGTACCCCGACCTGATAAATCCTTTCGCTTCTACGGAAGGTGGTGGGGATAATGCCCCTATTATTTTTGATAAATCTGATGAGGAAGAAGAAATTCTTCCAAAATTTAATTCATACAGGAAGGAAACAGCAGATTATATTGCTGCAGCCTTCAAAGAAAATGATGCTGATGATGAGACAGATTATCCTCAATTGAAGAATCTTCAACAACATTTGTATGCATCAGCAACATCAAGTTATAATCCGCCAAGAGATGTAGCCTTGGGTCCTCCAAATTATGGACCAGCACCATTACAAGTGATCCAGTCAGGAGAAGTACCCTCAAAGCCAACATTTGAAGGCTACAAAACAGGAGGAGTCCGCTATAAAGCAAAAGACTACTCCGAATGGTGGAATCTACCCTCAGCACAACATGGCACCGGAGCCATCTTCGTGATTCCAACTCAACTCAATCTGTTCAATGATACATTTAGGAGGTGGGAATCAATCACCAAGAATCTTGTCTCACAACAAGGATTTACAGATCCCAATGACAAGTTGGAATTCATAGAAAATCTACTTGGTGAAATTGAGAAAATAGCGTGGTTGCAATGGAGGTTGAATTATCCTACTGCCTTCACGCAACTGAGGGAATCTGCTGATGGAAGACAAGGTACGCAAAACATTATATCTCAAATTCGTACAGTCTTCACTTTAGAAGACCCCTACCAAGGTTCCACAGCAGTACAAGAAGAAGCCCTAAGGGACTTGGAAAAATTGACCTGTCACAATATCAAAGATGTAGTAGCCTTCTTGAATGAATATCTGAGGCTAGCTTCCAAGACCGGAAGACTCTTCATCGACTCAGAACTTTCTGAAAAACTCTGGTTTAAATTACCCGGAGAACTCGGCCCAAGAATCAAAGCAGCTTATGAGGCCAGATATCCAGGTAACACTATTGGAGTCTTCCCAAGGGTTTTATTTGCTTATAAGTTCTTGGAAAATGAGTGCAGGGATGCAGCCTATAAAAGATCCCTCAAGAACTTATCATTCTGCAGTAGTATCCCTATTCCAGGATACTACAAATCAGAAAAGAAATACGGCGTGAGAAGGTCAAAGACCTATAAAGGCAAACCACATGCCTCCCATGCTCGTATAGAAAGAAGAAAGCACCTCCAGCGAAACAAAAGGTGCAAATGCTATCTCTGCGGCCAAGAAGGACACTTTGCCAGAGAGTGTCCCAATGATAGAAGAAGCATCAAAAGAGTCGCAATATTTGAAAATCTGGACCTGCCTGAGGACTGTGATATAGTCTCCGTCCAAGAAGGAGAAAATGAAAGTGATGCCATATACAGTATCTCAGAAGGAGAAGAAATAGAGGACTTATCAAAGTCCTTAAATGTCCTGACGGTCTCAGAACATCTCTATTACTTCCGAGAAGAAGACCAGACATACTGGATCGGAGGGAAAGGCTACCGATCCGTGATTAAGGCCACAAAAACCCAACATGACTGCAACCATGCTTGGGAATACAATGGCACAGGTTCCTCTAAATGTTTCTGCTGTAAAGCAGAAACATCAACCAACTACAGATTGCACTGCCCACAGTGCCTGATCACAACCTGCAACATCTGTGCCCTTTACTACTTTGAGCAAAAGGTACCAGCATCTCGCCCCAACCCTATACAATATAACCCTCTTTCTCTCGTGCATGAACAGCAAGGGTATATTACATGGTGCGAAGCTGAAATCACAAGGCTCAAACAAGAGGTAGAGACTTCAAAACAGCAAACTGAATATTGGAAACAGAAGTATCTATCTACACAGGAAGAAGACCTCGAGAAAGAATTTAATGAATTGTACAAAGCAAAAGGCAAGGGGATAGAAATTCATGAAGAAACAAATGTGTTTCAACAAATTGAGACACAGAAAATCCTTTCACTAGCAAAGAACGAGCTCTCCCCACCAAAGAAAACCAGGAACTTGCTGTACAATCTCGTCTTAGAACTCAACATTCCTGATGTTGCAAACTTCAGTATCCATGCCATTCTGGATACCGGAGCATCCACCTGCTGCATAAATGCTGAAGCAGTACCCGAAAATGCAGTTGAAGACAGCCCCTTTTTGGCAAGCTTCAGCGGCATTAACTCAAAAGTCTCAACCAGCAAAAGGCTAAGGTATGGAAAGTTGATCATCGGAGAAAACATTTTTAGAATTCCATACACATATGTCTTTCCCTTGAAGCTAGGTGATGACATACAAGTGATACTTGGATGCAACTTCATAAGAGCTCTGCAAGGAGGAGTCCGAATTGAAGGTGACATAGTAACATTCTACAAAAACGTCACACAGATTCAGACTCAACAAACAGTTCCTATCATCGCAGCAATCGAAGAATTGGAACTTGAA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| 67,941
|
MG017327.1
|
Taro bacilliform CH virus
|
Kidanemariam,D.B., Sukal,A.C., Abraham,A.D., Stomeo,F., Dale,J.L., James,A.P., Harding,R.M.
|
Queensland University of Technology, Center for Tropical Crops and Biocommodities
|
Australia
|
2018-10-08
|
Ug10
|
Badnavirus betacolocalasiae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,643
|
GenBank
| null |
Uganda
|
Uganda
|
Colocasia esculenta
| null |
2015-06-06
| null | null |
Taro bacilliform CH virus isolate Ug10, complete genome
|
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| 67,942
|
KY359389.1
|
Taro bacilliform CH virus
|
Wang,Y., Borth,W.B., Green,J.C., Hamim,I., Cao,K., Hu,J.S., Melzer,M.J.
|
University of Hawaii, Department of Plant and Environmental Protection Sciences
|
USA
|
2018-03-28
|
Hawaii
|
Badnavirus betacolocalasiae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,634
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Colocasia esculenta
|
plant leaf
|
2016-05-20
| null | null |
Taro bacilliform CH virus isolate Hawaii, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTTGTTTTTCTAACAATCAGTATATAAAAAGCCGTTCTTTCAAAGGTTAGGTTACGCCTTTCCTGCGAAGATCCGTTTGCGTGACTGGATGAATAATCCCTAGGTCCGCTAAGTACTGATGAGAAGAATAACATTGCTAGAGCTAAAGGACAACTGGAAAGGATAGAAAATGTTATTTTTGCATCAGCCAAAGCCCAATACACAATCAACAACCTGAGCTGAAAAAGGAATACGGAGTTGTAGCAAGCCTAAGGACGAAAGACAGTAAGTAGGCGAAAGAGGGAAAAAGAGAAGCCGAAAGAAGCTGTTGAGTCAGGAACCAAAACTTGTGAGTCCGAGCCTTTGAAGTAGAAAGGGTTAATGAGTGATAGATGGGAAAGTGCTGTACAAGAATGGTATTCCTCTAGAACTGCCAATCTTGAATACTTAGATCTGTCAATTCCAGAAGACAAAAAGCCCTCCCAAAAGGAGTTAGCTCACAACCCATCAGTTGTATATGACCGTGTATGTCTATCCAGTAGAGTCCATCTCAAAAACTTCAAGTCAATTCTTGAAAGGCTTGAAGCCTTAGAATTAGAAAACCGAGAGCTCAATCATAAGCTCTCAAAAATACAAAAATCTATTCAAGGTTTGCCACTTCCATTAACGGGTTCCGAAGTGCATGCTCTTGTGAAGGAAATAGCGGCACAACCAAAGCTGGTAGAAGAACAGGCAATCCAGATCTCCCAGGAACTGGAAAAGAAGCTAGAACGAGTAGAGCACGCCTTGAAGAAAGTAGAAGAGTGGACTCGCTCATGAGTCACATAAACACTCAAGCTACTGAAAGCTACACAGCAGCTCTACAAGCCACAGAAGAAATAGAAGCACCCGCAGTCAGCTTTGCCAAACCTGCCGACAACAAAGGACCCAACTCAGGAACTTCAACCTTAATCAAGCAAAACAACACTCAAATCGAGTTGCTTGTAAGGTTAACAGAGGAAGTGAAGGCTCTGAGAGAAGAGCTAGCTCAGTTCAGAAAGGAGAAAGGTCAGGTATCATCTATCCCTAACGATCTTATTTCAGGATTAAAGAACTTGAAGCTATCCGATCAGAAACCTAGAGAAGCTGCTGGCAAACTAAGGGTATTCAAGAACCCACTAGAAGAATACAAGAAAGAAAAAGCGAGGAAGTCTTGATGGAGATGACAACCTCGACTACAGCCAGAACTCAAGACCAACCTTCAACGTCCCGAACAACTCCACTGTTCGAGGATCAGATCCGCAACTATCGGCAAAGGCAGAGACGTCTACATAATGCACGTCAAGTAGTAGGACGTCTGCAACGACAGATCACTGGAAGGAGCCAGCGCCATAATCAAACTTTGGAGCAGCAAATTGATCCTCAGGTGCATCTGAGGAATTCTATGCAGGAACGAGCGGCGATCGTCCCAGCAGAAGTCCTGTACCACTCACGTCGTGATGATGAGCATCATCGAGTTTATGTACACAGATCGGAAGAAGCTATCCTCTGCACCGACAACCAGCAACAAGACATGATCTTCATCCAAGAAGACAGTTTTCGACAATTGCAGAGGAGCAGAATGCAGTTCATACATATTGGAGTGATTCAACTTCGAATTCAAGCGCTGCATCGGCATGACGAAGGTACGCTGGCTCTTGTTGTTTTCCGTGACAACAGGTGGCCAGATGATCGCTCCCTGTTCGCCACAATGGAGGTAGATCTGTCACAGGGAAGCCAGTTGGTGTATGTAATCCCTGACACAATGATGACAATCGGGGATTTCTACAACAACGTCCAAGTCTCGATCCTCACCAGAGGATATGAAGCCTGGAGAGGAGAAGCCAATCTCCTCATCACCAGAGGATTGGTTGGAAGACTATCCAACACCCCAAATGTTGGATTCGCATATGAAGTTCAGAGCGTGGTAGACTACTTAGTCAGCCACGGTGTTCAAGCAATCCCTGGAAAACAACGAACAGTCCAAGAGCTTCAAGACCACAACTGGGTAGTCAGACCCACCCAAGCGAGCATCCCGCGACAGCCAACAGAAGTGGATACCCGCACAAACATTGATGGTACGATTTTTCTTCGCTTTGGAAACTATACCTTAGCAAGAACTTCTACCACTAGGCGGATCGCATACAACCTCCGGGATGAAGAGATTCGAAGCGATGAAGAACAAATCATTGCAGTCTTTAAATTAGACTGTTATACAGAAGCCCAACCTGCTATCTGGGATACTCTTGGAGAACCCTCCGGGAAATTTGACTACTATGTCAGGTATGACATGCCCGATAATCATCTTCAAATCCCTGTTGAACATATTATTGCTACAGGATGGGACGAGGACGATGAAACAGCAACATCATCCTCTGATGAAACAAGCTACACACAGTACCTCTCTAATATTGGAGGTACATCTGTATCTACTGAACAGGAACTCCCGTACCCTGTTCCTATAAGCGACATGATAAATCCTTTCGCTTCCACGGAAGGTGGTGGGGATAAAGCCCCTATTATTTGTAATTTTCCAATTTTTGACAAATCTGATAAGGAAGAAGAAATTCTTCCAAATTCTGATTCTCACAGAAAGGATACAACAAACTATATAGCTGCGGCCTTCCCAGAAAATGATGCTGATGATGAGTCAGAATACCCGCAACTGAAGAAACTTCAGCAACACCTATATGCGTCTCTATCAGCAATCATCGGTTATAATCCACCACAAGATGTAGCCATGGGTCCTCCAAATTATGGACCAACACCACTACGAGTAATCCGACCCGAAGCAGGACCTTCAAGGCCGGCATTCGAAGGCTACAAACAAGGAGAAGTTCGTTACAAGACAAAGGGCTACTCCGAATGGTGGAACCTACCCTCAGCTCAGCATGGCACTGGAGCCATCTTCATAATTCCTACCCAACTTGGTATGTTTAATGACACATTTATGAGATGGGAATCAATCACCAAGAACCTTGTCTCGCAACAAGGATTCACAGATCCCAATGACAAGGTAGAATTCATAGAAAATCTACTTGGTGAAGCTGAGAAAATAGCATGGATCCAATGGAGGATGACATTCCCTGAAGCTTTCCAACAAATGCTTGAATCTGCTGACGGTAGGCAAGGCACACAAAACATCCTGTCCCAAATACGTAGGGTCTTTACTTTGGAAGACCCCTACCAAGGATCCACAGCAATGCAGGAGGAAGCCCTAAGAGATTTAGAGAAGCTATCCTGCCACAATCTCAAAGATATAGTGGCTTATATGAATGAATATACGAGACTCGCCTCCAAATCAGGAAGACTTTTCATTAATGAAGACCTTTCTGAAAAATTCTGGTTTAAAATGCCTGGTGAACTCGGTCCAAGGATCAAAGAGGCATATGAGGCCAGATATCCAGGTAACACTATTGGAGTCTTCCCAAGAGTTTTATTTGCTTACAAATTCTTGGAAAATGAGTGCAGGGATGCAGCACACAAACGCTCCCTCAAAAGCTTATCCTTCTGCAGTAGTATTCCCATCCTGGGATACTACAAAACAGAAAAGAAATACGGCGTGAGAAGATCAAGAATATACAAAGGCAAACCACATGCCTCTCATACTCGTATTGAAAGAAGAAAGCACCTTCAACGAAATAAAAGGTGCAAATGTTACTTATGCGGCCAAGAAGGACACTTCGCCAGAGAGTGCCCCAATGACAGAAGAAGCATCAAAAGGGTCGCTATATTTGAAAATCTGGACCTGCCTGAGGACTGTGATATAGTCTCTGTTCAAGAAGGAGATAATGAAAGTGACGCAATATACAGCACCTCAGAAGGTGAAGAAATGGAGGACTTAACAAAGTCCTTAAATGTCATGACTGTCTCCGAAAAACTTTATTATTTTCGGGAAGAAGATCAGACATATTGGATCGGAGGAGAAGGATACCGATCCATGATTCGAGCCACAAAAACCCAGCATGATTGCAACCATGCTTGGGAATACAACGGCGCAGGTTCTCTCAAGTGTTTTTGCTGCAGAGAAGAAACATCTATCAACTGCAGAATGCACTGCCCACAGTGCCTTATCACAACCTGCAACCTCTGTGCCCTCTACTACTTCGGGCAAAAGGTATCAGCATCTCGCCCTAAACCAATACAGTATAACCCCCTTTCTCTTATGCATGAACAACAGGGGTACATTACATGGTGCGAAGCTGAAATCACAAGGCTCAAACAAGAGGTAGAAACTTCCAAGCAACAAATTGAATACTGGAAGCAAAAATACCTCTCTACACAGGAAGATGTTTTCGAAAAAGAATTTGATGAATTGTACAAAGAAAAAGGCAAGGGAGTAGAAATTCACGAAGAAACAAATGTGTTTCGACAGATAGAAACACAAAGAATTCTTTCAATAGCAAAGAATGAACTCTCCCCGCCCAAGAAGACCAAGAATATGCTGTACAATCTTATCCTCGAAATCAATATTCCTGATGTTGCAAACTTCAGTGTTCATGCCATTCTGGACACAGGAGCATCTACCTGCTGCATAAACGCCGAAGCAGTGCCTGAAAATGCAGTTGAAGACAGCCCTTTTATGGCAAACTTTAGCGGCATTAATTCAAAAGTCTCAACCAACAAGAGACTAAGGTATGGAAAAATGATCATTGGTGACAATATTTTTAGAATTCCATACACATATGTCTTCCCTATGCAGCTAGGAGATGATATACAGATGATACTTGGATGCAATTTTATAAGAGCTATGCAAGGGGGAGTCCGAATTGAAGGAGATAGAGTAACATTTTACAAAAATGTTACCCAAATTCAGACTCAGCAAACAGTTCCTATTATCGCAGCAATTGAGGAATTGGAACTCGAAGAAGAAGAATATATTTCTATAGCAACACTATGTGCCTATGGAGGTATGGAAATCTCTTCACCATTCCAGTTCAAATATCAAAAACTGATACAGGAACTGAAGGACATGGGCTATATTGGGGATGATCCCATGAAATACTGGTCATCCAACAAAATTACATGCCAGATGGAAATCAAAAACCCAGACTTAAGCATTGAAGATAGGCCCCTAAAACACAGATCGCCTCAGATGGAAGCATCCTATAGGCGACATACAGAGGCACTACTCAAACTTGGCACTATTAGGCCCAGCAAAAACAAACATAGAACCACTGCTATCATCATCAATTCCGGAACAACCATCGACCCCATCACAGGAAAGGAGGTCAGAGGAAAAGAACGTATGTTCTTCAATTACAAGAGATTAAATGACAACACACACAAAGACCAATACAGTCTACCCGGAATTAACACAATTATTCAAAAGGTCGGAAATAGCAAAATCTACTCTAAATTCGACTTAAAAAGTGGTTTTCATCAGGTCGCAATGCATCCAGATTCCATTGAATGGACGGCATTCTGGGTCCCTCAGGGACTATACGAATGGCTGGCAATGCCATTCGGCCTTAAAAATGCTCCCGCAGTATTTCAGAGAAAAATGGACAATTGCTTCAAAGGTACGGAAAATTTTATTGTCGTATACATCGATGACATACTTGTTTTCTCTGAAACAGAAAAAGAACATGCAAGGCACCTAGAAATTATGCTAGAAATATGCAAGAAAAATGGATTGATACTAAGTAACTCAAAAATGAAAATCGCAGTACCAACCATTGAYTTCCTAGGAGCTACTATAGGTAACCGCAAAATCAAATTGCAGGAGCATATAATAAAGAAGATTGCGGATTATCCTGACATAGAGCTTATGAATACTAAGGGATTAAGATCATGGCTAGGAATTCTCAACTACGCCAGAAGTTACATCCCTTATCTGGGCAAACAATTAGGCCCACTGTACTCCAAAGTAAGCCCAACCGGAGAAAGAAAAATGAATCAACATGACTGGGCCATTGTAAAACAGATCAAGGAAAAGGTCCAAAACCTACCTGATCTAGAGTTACCTCCTCCTGATTGCCACATCGTCCTAGAGACTAACGGATGCATGGACGGATGGGGAGGAGTCTGCAAATGGAAGCCCCAGAAATGTGATGGAAGACAAATTGAGAAAATATGCGCTTACGCTAGTGGAAAGTTTAACCCACCAAAATCTACAATTGATGCAGAGATTCATGCCGTCATGAACAGCCTAAATAGTTTCAAGATCTATTATCTTGACAAGAAGGAGCTACTTATTAGAACAGATTGTCAGGCAATTATCAGCTTCTTCAACAAATCTGCAAAAAACAAGCCATCAAGGGTCAGATGGGTTTCTTTCACAGACTTCATAACTGGCACAGGCCTTGAAATCAGATTCCAGCACATTGACGAAAAGGACAACGCATTAGCTGATGCGTTATCTAGACTCGTCCATAGCTTAGTCTCAAAACCGGATTCTTATTCGGATCAGACTATTCTGCTGGTTGAACTAGCTATCGCAGAAGCTCAAGCCAAACCCCAGCCTGGTAAGAATTTTAAACTAACAAATTTGATCTTATCCTTAACAGGTGATGGAGAACGCAGCAAACAAATACTGCAGGATCCTAGGGGATATGGTACAGCTTCCAAAAACCTTGACGGCGTTGCATGAAATGTCCGGAGAAGCCATCAGAGAAAGGCGAAAGGTGCAGGGACAACTGGCTCTTGCATTACAAGAAATGGAACAATGCCTTCTGGCTCAATACTCCTACTTCGCCCAGCATGCAACAAAAGACAACTACTGGGGGACCACCTACAAGATCTTCAGGAACAGATGGAGGCATTCCACAAACTCACAATTAGCATTATGGAATGCACCCTACACACAGCTCACCCGTGAAGCAATGGTGGGCCCACTACTGAAGACGATGCTTGGCGTCGGTACCAAGCCTTATCGTGCTATCCTGGCACATCATTCAGGACCTCTTCTCTCAGTAGAAAGGATAAGATTCCTAAAATCTTATCACTTTTGTTGTTTTTTGTATACACGGACAAGGGATGCAATTACTCAAAGGACGATGGGGCCCCATGCGCACCCGCTTTGATAAAACATAACCCTTAAAGTGTAAAGAGTCTGTAAAGCGTCAAAAGATTCGACTTGAGCCCCGGGGAGCCGGTCGAGTCTCAGTCAGGGCCCCTGGTTTTCCAAAAACCACGGCGCCCACGGTATTCTGCCCACGGTTTTTGCCAACCAGGGTCTAATCAACCATGGTTAAAGAAACCAAAGGCTTCAGTCTAAACGGGCATCCTTGTCTATAAAAGGAACCCCTCGTCTCCTAAAAACACACACAAGCAATACTTGGTTAAGGGTTGCTTGAGTCTAGCTACCCCTTGTTCCTCCAACCCTAGCATACAAGCCTCGTTTCCTGGCTTAAAAAGGAAGGGATTTCTATCTCAGTCCTAAAGCCGAACATAGCTTGTTTTGCAGGACCAGTGAGTCTGTAAGCAGTCCTCCGGAGCGTCCCCCGGAACGTTGTAATCAACCTTCCCTCGAAGGTATATGTTATAAATTTCCGCATTTCATTTCTCTCTGATTCTACCTTCTCACCTTAGTCCATTTAGGTTGGTGATCGAAGATGAGATCCATATTTTTTGAGAAGAAGATCCGTTTAGGGGTTTCACTTTTCAAAATAAGGGCCTTATTT
| 71,509
|
KP710177.1
|
Taro bacilliform CH virus
|
Kazmi,S.A., Yang,Z., Hong,N., Wang,G., Wang,Y.
|
Huazhong Agricultural University, College of Plant Science and Technology
|
China
|
2015-04-04
|
TaBCHV-2
|
Badnavirus betacolocalasiae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,641
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Colocasia esculenta
| null |
2011
| null | null |
Taro bacilliform CH virus isolate TaBCHV-2, complete genome
|
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| 87,360
|
KP710178.1
|
Taro bacilliform CH virus
|
Kazmi,S.A., Yang,Z., Hong,N., Wang,G., Wang,Y.
|
Huazhong Agricultural University, College of Plant Science and Technology
|
China
|
2015-04-04
|
TaBCHV-1
|
Badnavirus betacolocalasiae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,641
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
|
Colocasia esculenta
| null |
2011
| null | null |
Taro bacilliform CH virus isolate TaBCHV-1, complete genome
|
TGGTATCAGAGCTTTGTTTTTCTAACAATCAGTATATAAAAAATTGTTCTTTCAAGGGTTAGGTTAAGCACTTTCCTATGAAGAACCATTTGCGTGACCGGATGAATGATCCCTAGGTCCGCCAAGTACTGATGAGAAGAATAACATTGCTTCTACAATAGAGCCAAAGTCTTTCAAAGACAGCTGGAAAGGATAGAATATATCAATCTTCTATCAACCTTAGCCCAATATACAGTCAACAACCTGAACTGAAAAAGGAACACGGAGTTGTAGCAAGCCTAAGGACAAAAGACAGTAAGTAGGCAAAAGGGGTATGAGAAAAGCCGAAAGAAGCTGTTGAGTCAAGGAAAAACTTGTGAGTCCCTTTGAAGCAGAAAGGGTTAATGAGTGATAGATGGGAAAGTGTTGTACAAGAATGGTATTCTACTAGAACTGCTAATCTTGAGTATTTAGATCTATCAATTCCAGAAGACAAAAAGCCATCCCAAAAGGAGTTAGCTCATAATCTGTCAGTTGTATATGATCGTGTATGTTTATCCAGTAGAGTACATCTCAAAAACTTCAAGTCAATTCTTGAAAGACTTGAAGCCTTAGAGTCAGAAAATCGAGAGCTCAATCATAAGCTCTCAAAACTACAAAAATTTATTCAAGGTTTGCCACTTCCATTAACGGGTTCCGAAGTGCATGCTCATGTGAAGGAAATAGCAGCACAACCAAAGCTAGTGAAAGAACAAGCGATCCAGATCTCCAAGGAACTGGAAAAGAAGCTAGAAAGAGTGGAGCACATCTTGAAGAAAGTAGAAGAGTGGACTCGTTCATGAGTCATATAAACACTCAGGATACTGAAACCTACACCTCCGCCCTACAGGCCACTGAAGAAATAGAAGCACCAGCAGTCAGCTTTGCCAAACCTGCCGACAACAAAGGACCCAACTCAGGAACTTCAACCTTAATCAAGCAAAACAACACTCAAATCGAGTTGCTTGTAAGGTTAACAGAGGAAGTGAAGGCTCTGAGAGAAGAGCTAGCTCAGTTCAGAAATGAGAAAGGTCAGGTATCATCTATCCCTGACGATCTTATTTCAGGATTAAAGAACTTGAAGCTATCCGATCAGAAGCCTAGAGAAGCTGCTGGCAAACTAAGGGTATTCAAGAACCCACTAGAAGAATACAAGAAAGAAAAAGCGAGGAAGTGTTGATGGAGATGACAACCTCGACTACAGCCAGAACTCAAGTCCAACCTTCAACGTCCCGAACAACTCCACTGTTCGAGGATCAGATCCGCAACTATCGGCAAAGGGAGAGACGTCTACATAATGCACGTCAAGTAGTAGGACGTCTGCACCGACGGATCACTGGAAGGAGCCAGCTCCATAATCAGACTTTGGAGCAGCAAATTGATCCTCAGGTGCATCTGAGGAATTCTATGCAGGAACGAGCGGCGATCGTCCCTGCAGAAGTCCTGTACCACTCACGTTGTGATGATGAGCATCATCGAGTTTATGTACACAGATCGGAAGAAGCTCTTCTCTGCACCGACAACCAACAACAAGATAGAATCTTCATCCAAGAAGAGAGTTTCAAGCAACTTCAGAGGAGCAGAATGCAGTTCATACACATTGGAGTAATCCAACTTCGAATTCAAGCACTGCATCGGCATGACGAAGGTACGCTGGCTCTTGTTGTTTTCCGTGACAACAGGTGGCCGGATGATCGCTCCCTGTTCGCCACAATGGAGGTAGACTTATCACAGGGAAGCCAGTTGGTGTATGTAATCCCTAACACAATGATGACAATTGGGGATTTTTACAACAACGTTCAAGTGTCAATCCTCACCAGAGGATATGAAGCATGGAGAGGAGAAGCCAATCTCCTCATCACCAGAGGATTGGTTGGAAGATTGTCCAACACCCCAAATGTTGGATTTGCATATGAAGTCCAGAGTGTGGTAGACTACTTAGTTAGCCATGGCGTTCAAGCAATCCCTGGAAGAAGACGAACAGTCCAAGAACTTCAAGGCTATAACTGGGTAGTTAGACCCACTCAAGCGAGCATCCCGCGACAGCCGACAGAAGTAGACACCCGCACAAACATTGATGGTACGATTTCTCTTCGCTTTGGAAATTACACCTCAGCAAGAACTTCTACCACTAGGCGGATTGCGTATAACCTCCGGGATGAAGAAATTCAAAGTGATGAAGAGCAAATCATCGCAGTCTTCAAATTGGACTGTTATGAAGCCCAACCTGCTATCTGGGATACTCTTGGAGAACCCTCTGGGAAATTTGGCTACTATGTCAGGTATGACACACATGATGATAATCTCCATATCCCTCTTGAACACATTATTGCTACAGGATGGGACGATGACGACGACGACTGCACAACGTCATCCTCGGATGAAGCAAGTTACCTACAGCACCTCTCAAACCTTGGGGGTACACCTGTACCTATAGAACAGGACCTCCCATATCCTGTTCCTATAAGCGACATGATAAATCCTTTCGCTTCCACGGAAGGTGGTGGGGATAAAGCCCCTATTAATAATTTTCCAATTTTTGATAAATCTGATGAGGAGGAAGAAATTCTTCCAAGTTCTGATTCCTGCAGGAAGGAAATAGCAAGCTATATAGCTGCAGCCTTCCCAGAAAATAATGCTGATGATGAGATAGATTATCCACAGTTGAAAAACCTACAACAACATCTATATGCATCTCCTTCAGCAATCACTGGTTACAAACCACCACAAGACGTAGCCATGGGTCCTCCAAATTATGGACCAACACCACTACGAGTAATCCGACCAGAAGCAGGACCTTTAAGGCCGGCATTCGAAGGCTACAAACCAGGAGAAGTTCGTTACAAGGCAAAGGACTACTCCGAATGGTGGAACCTACCCTCAGCTCAGCATGGCACTGGAGCCATCTTCATAATCCCTACTCAACTTGGTATGTTTAATGACACATTTATGAGGTGGGAATCAATCACCAAAAACCTAGTCTCGCAACAAGGATTCACAGATCCCAACGACAAGGTAGAATTCATAGAAAATCTACTTGGTGAAGCTGAGAAAATAGCATGGATCCAATGGAGGATGACATATCCTGAAGCCTTCCAACAAATGCTTGAATCTGCCGACGGTAGGCAAGGCACACAAAACATCCTATCCCAAATATATAGGGTCTTTACTCTGGAAGACCCCTACCAAGGATCCACAACAATGCAGGAGGAAGCCCTGAGAGATTTGGAGAAGCTATCCTGCCATAATCTTAAAGATATAGTGGCTTATATGAATGAATATATGAGACTCGCCTGCAAATCAAGAAGACTTTTCATTAATGCAGATCTTTCTGAAAAATTCTGGTTCAAAATGCCTGGTGAGCTCGGTCCAAGGATCAAAGAAGCATATGAAGCTAGATATCCAGGTAACACTATTGGAGTCTTCCCAAGAGTTTTATTTGCTTACAAATTCTTGGAAAATGAGTGCAGGGATGCAGCATACAAACGCTCCCTCAAGAATTTATCCTTCTGCAGTAGTATTCCCATCCCGGGATACTACAAAATAGAAAAGAAATACGGCGTGAGAAGATCAAGAACATACAAAGGCAAACCACATGCCTCTCATGCTCGTATTGAAAGAAGAAAGCACCTTCAACGAAATAAAAGGTGCAAATGTTACTTATGCGGCCAAGAAGGACACTTCGCCAGAGAGTGCCCCAATGACAGAAGGAGTATCAAAAGGGTTGCCATATTTGAAAATCTGGACCTGCCTGAGGACTGTGATATAGTTTCTGTTCAAGAAGGAGACAATGAAAGCGACGCTATATACAACATCTCAGAAGGAGAAGAAATGGAGGACTTAACAAAGTCCTTAAATGTTATGTCTGTCTCCGAACATCTCTATTACTTCCGAGAAGAAGACCAGACATACTGGATCGGAGGGGAAGGTTACCGATCCATGATTAAAGCCACAAAAACCCAACATGATTGCAACCATGTTTGGGAATACAATGGTGCAGGGTCTTTCAAATGTTTCTGCTGTAAAGAAGAAACATCTGTCAACTACAGAATGCACTGCCCACAGTGCCTTATCACAACCTGCAACCTCTGTGCCCTCTACTACTTTGGGCAAAAGGTACCAGCATCTCGCCCTAATCCAATACAATATAACCCTCTCTCTCTTATGCATGAACAACAGGGGTATATTACGTGGTGCGAAGCTGAAATCACAAGGCTCAAACAAGAGGTAGAAACTTCTAAGAAACAAGTTGAATATTGGAAACAGAAATACCTCTCCACACAGGAAGAAGTTTTCGAGAAGGAATTCGATGAATTGTACAAAGAAAAAGGCAAGGGAGTAGTTATACAAGAAGCAACAAATGTGTTTCGACAGATAGAAACACAGAGAATTCTTTCAATAGAAAAGAATGAGCTCTCCCCGCCCAAGAAAACAAAGAATATGCTGTACAACCTCATCCTTGAAATCAATATTCCTGATGTTGCAAACTTCAGTGTTCACGCCATTCTGGACACAGGAGCATCCACCTGCTGCATAAATGCTGGAGCAATACCTGAAAATGCAGTTGAAGAAAGCCCTTTTATGGCAAGCTCCAGCGGCATTAATTCAAAAGTATCAACCAACAAAAAGCTCAGGTATGGAAAAATGATCATTGGTGATAATGCCTTTCGAATTCCATACACATATGTCTTCCCGATGCAGCTGGGAGATGATATACAGATGATACTTGGGTGCAACTTTATAAGATCTATGCAAGGAGGAGTCCGAATCGAAGGAGACACAGTAACATTCTACAAAAATGTTACTCAGATTCAGACCCAACAAACAGTTCCTATCATTGCAGCAATTGAGGAATTGGAACTCGAAGAAGAAGAATATATTTCTATAGCAACAATATGTGCCTATGGAGGTATGGAAATCTCTTCACCTTTCCAGTTCAGCTATCAGAAACTGATACAGGAACTAAAAGACATGGGCTATATTGGGGATGATCCCATGAAATATTGGTCATCCAATAAAATTACGTGCCAACTGGAGATCAAAAATCCAGACTTAACCATTGAAGATAGGCCCCTGAAGCACATATCGCCTCAGATGGAAGCATCCTACAGGCGACATACGGAGGCAGTACTCAAACTTGGCACTATTAGGCCCAGCAAAAGCAAACATAGAACCACTGCAATCATCGTCAATTCCGGAACAACTATCGACCCCATCACAGGAAAGGAGGTCAGGGGAAAAGAACGAATGGTCTTCAATTACAAGAGGTTAAATGATAACACACACAAAGACCAATACAGCCTACCCGGAATTAACACAATTATTCAGAAGGTCGGAAATAGCAAAATCTACTCCAAATTCGACCTAAAAAGTGGTTTTCATCAGGTCGCAATGCATCCATATTCCATTGAATGGACGGCATTCTGGGTCCCTCAGGGACTATACGAATGGCTGGCAATGCCATTCGGCCTTAAAAATGCTCCCGCAGTATTTCAGAGAAAAATGGACAATTGCTTCAAAGGTACGGAAAATTTTATTGCCGTATACATTGATGACATACTTGTCTTCTCTGAAACAGAAAGAGAATATGCAAGGCACCTGGAAATTATGCTAGAAATATGTAAGAAAAATGGACTGATACTGAGTAACTCAAAAATGAAAATTGCAGTATCAACCATCGACTTCCTAGGAGCCACCATAGGTAACCGTAAAATTAAATTGCAGGAGCATATAATAAAGAAAATTGCGGATTACCCTGAAAAAGAGCTTATGAATGCTAAGGGATTAAGATCATGGCTAGGAATTCTCAACTATGCCAGAAGTTACATCCCTTATCTGGGCAAACAATTAGGCCCACTATACTCCAAAGTAAGCCCAACCGGAGAAAGAAAAATGAATCAACAGGACTGGGCTATTGTAAAACAGATCAAGGAAAAGGTCCAAAACCTACCTGATCTAGAATTACCTCCTCCTGATTGCCACATCGTCCTAGAGACTGACGGATGCATGGACGGATGGGGAGGAGTCTGCAAATGGAAGCCCCAGAAATGTGATGGAAGACAGATGGAGAAAATATGCGCTTATGCTAGTGGAAAGTTTAACCCACCAAAATCCACAATTGATGCAGAAATTCATGCCGTCATGAACAGCCTAAATAGCTTCAAGATTTATTATCTTGACAAGAAGGAGCTACTTATTAGAACAGATTGTCAAGCAATTATCAGCTTCTTCAACAAATCTGCAAAAAACAAACCATCAAGGGTCAGATGGGTTTCTTTCACAGACTTCATAACTGGCACAGGCCTTGAGATCAGATTCCAACACATTGACGAAAAAGACAACGCATTAGCTGATGCGCTATCTAGGCTCGTCCACGGTCTAGTCTCAAAACCAGATTTTCATTCGGATCAGACTATTCTGCTGGTAGAACTAGCTATCGCAGAAGCTCAAGCCAAACCCCAACCTGGTAAGAATTTTCAACTAACAAAATTGATTTCATCCTTAGCAGGTGATGGAAAACGCGGCAGACAACTACTGCAAAATACTAAAGGAAATGGCACAGCTTCCAAAACCCATGACATTGTTGCATGAGATGTCTCGGGAAGCACTTCTTGAAAGACGGAAGGTACAGAGCCAACTGACCCTTGCATTACAAGAAATGGAACAATGCCTTCTGGCTCAATACTCCTACTTCTCCCAGCATGCAACAAAAGACAACTACTGGGGAGACCACCTACAAGATCTTCAGGAACAGATGGAGGCATTCCACAAACTCACAATTAGCATTATGGAATGCACCCTACACACAGCTCACCCGTGAAGCAATGGTGGGCCCACTACTGAAGACGATGTTTGGCGTCGGTACCAAGCCTTATCGTGCTATCCTGGCACATCATTCAGGACCTCTTCTCTCAGTAGAAAGGATAAGATTCCTAAAATCTTATCACTTTTGTTGTTTTTTGTATACACAGACAAGGGATGCAATTACTCAAAGGACGATGGGGCCCCATGCGCACCCGCTTTGATAAAACATAACCCTTAAAGTGTAAAGAGTCTGTAAAGCGTCAAAAGATTCGACTTGAGCCCCGGGGAGCCGGTCGAGTCTCAGTCAGGGCCCCTGGTTTTCCAAAAACCACGGCGCCCACGGTATTCTGCCCACGGTTTTTGCCAACCAGGGTCTAATCAACCATGGTTAAAGAAACCAAAGGCTTCAGTCTAAACGGGCATCCTTGTCTATAAAAGGAACCCCTCGTCTCCTAAAAACACACACAAGCAATACTTGGTTAAGGGTTGCTTGAGTCTAGCTACCCCTTGTTCCTCCAACCCTAGCATACAAGCCTCGTTTCCTGGCTTAAAAAGGAAGGGATTTCTATCTCAGTCCTAAAGCCGAACATAGCTTGTTTTGCAGGACCAGTGAGTCTGTAAGCAGTCCTCCGGAGCGTCCCCCGGAACGTTGTAATCAACCTTCCCTCGAAGGTATATGTTATAAATTTCCGCATTTCATTTCTCTCTGATTCTACCTTCTCACCTTAGTCCATTTAGGTTGGTGATCGAAGATGAGATCCATATTTTTGAGAAGAAGATCCGTTTAGGGTTTCACTTTTCAAAATAAGGGCCTTATTT
| 87,361
|
NC_004450.1
|
Taro bacilliform virus
|
Yang,I.C., Hafner,G.J., Dale,J.L., Harding,R.M., Liew,S.C.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2002-12-18
| null |
Badnavirus alphacolocalasiae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,458
|
RefSeq
| 1
|
Papua New Guinea
|
Papua New Guinea
| null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Taro bacilliform virus complete genome
|
TGGTATCAGAGCTATGGTGATGTTTTCTATGGCTATGGCAGCGTAAACTTCTTCTGCTCAAGAGGGAAGTCTACCATGTCTTTTATTTGCTGATGCAACTTCATTTAATTTGCCTATATTTTGTTTGATATATCTCATTATTTGTAAGCCTCGTACTTACAGTACAGACCGATAACATAAGGTAAGCTAAGGTAGCAGGCAAAAGAGGGAACAAAGTAGCCGCAGGAGAAAGGCGAAGAAGTACCGTGAGTCTTCTACCCGAAACTTACTAAGTGTTATTTCTATCTGGGATAGTTTAGGTCTTGGAAAATAATGCGACCTTACAATTATATGATTTATATCACATTTTATGGCAAAGAAATTTGAAGCAGCTATTAAAGACTGGTATGATAACTCTCGACGAGCAGATCTTTCCTATCTTGACCTAGCCACCACTACAAAACCTTCTGCATCACAATTAGCTCATAATCTACAAGTCATTTTTGATAGATTATCCTTACATTCTTCAGTCTCCATTAAGGAACATTACGAAGTAGTTAGCAAACTTCATTCTTTGGAAAAATCTATAGAAGAATTAAAGTCTGAATTGACTACGGTCAAAAGGGCTTTAACTTCTATCCAAAAAGAAGTTTTCACCCACAAACCCCTCACAGCACAGGAAGTGCAAACCCTTGCACAAAGTCTGATCAAAGAACCTAAGCAAATAGAACAGCAGGCCGTATTTCTTCTAAAGGAGCTTAAAGAACAAACAGCAAAAATTCAAGCTTTGCTCCACGAGCTTAAAAGTTGATGTCTGTACCTAATTCCACATACCCAGGGTACATCAAAAGTTTAGAAGAAACAAAAGTCTTAGGAGATCCATCTGTAGGATTCTCTGAAATTCCTACCACTGCTATCGGAACCGCTACAGGTTTTTCAACTCTTTATAAGCAGAACAATACAATCATCAATCTGCTTATATCTCTTCATAAAAAGGTTGATAGCCTCTCCAAAAAGACAGACGTCGACGAGTTAGCCACTGAGTTGTCCAAACTCACAATCAAGGATACCCCAAAGGTTAAGGCTAAAACTCCTCTATACGTCTTCAAGAGTCCCCGTCTTATCCTCGAAGAGGAAAGATATAAAATCGGCCTTCCTCCTACCACTACCGATTGGACTTGGCCTGTAGGACATCCTTTTGCTCCTCCACCAAAAACATCCACAAAGGCATCCACCTCTTCTTAAAGATGTCTTTAGCAGTTCGTGATCGTGGTTCCAACCCTTCCACCTCTTCTACAGTCCCTAGTCAGCAGGACCAGATTCGGGATTATAGAAACATGCAAAGAGTTCGTCATACAGCGGAAAGAGCAGCAAGGAGAATCTTCCCTGGAAGATTCAATAGAACTCTGGAATCACAAATCAATCCAGAGGCAGAAATCCGTCTTTCTCAACAAAGACGAGCAGCAATGGTCCCAGCAGAAGTATTATACAATACTTCTCCATCAACAAGAAATCAGAAAGTGTATCAGCACTATTCTGAAGAAAGAATTCTTTGTACAGGACAAAATCAGCAATTAAATTTGCCATTTATTAATGAATCTTCTTACAGAGCCCTCAGAGAATCAGGTCAACAGCATCTTCACATAGGCCTGATCATGATTCGTGTACATCCTCTTCATCGGCGAAATGCAGGAACGACAGCTCTTATTGTCCCTCGAGACATAAGATGGAATGATGACAGATCTATCATTGGCACCATGGAGATAGATCTCAGCGCCGGATCCCAAATTGTTTATATTGCCCCAAATATCATGCTATCTGTTGAAGATTTTTATCGCAACATACAACTTGCGATTCAAACTCAGGGCTATGAAAACTGGAACTCTGCCGAGAGTAACTTGCTCATCTCTCGCGCTCTTATTGGTCGTCTGACAAACGACAGTTTTACAGGATTCCAGTACAATATCTCTAATGTTGCTGAGTACTTGCACAGTCATGGTGTGCAAGCTATTGAAGGACAAGCTCATCCAAGAACCCTCGGCAATCGATGGATCCTACAAGCACCAGCACCACCAAGGTCTCTCGTTCCACAAAACGTGGAGACCACCACTCTTCTGGATGGTAATGTGTCTATACGTTTCTCCAATTACCATCAAGCACCAGTTAATGATACTCAGGATAATTCTCATCCTGATATCCAAGAAGACGAAAACCAATTCATTGGTTTTCTTTCTGATTTGGGGGAAGAATATGAATTGGAGTATCCTTCTTTCACTCCAGTTCATGCAGATGAATTCATTTTTATAATCATTAATGGGGAAGAAATTCCCGATGATTTTGTCTCATCTTTTTGTTCCAATTTCTCTCCTCCACCAATTCCAGAACCAGAACCCACAGCCATTGAAGAAACAGCTTTTACTTTGGAAGAACAATTCAATGACCTGGACTATCCTACCCTCATTTCAATGGAAAAACAATTAGTCCAGTCTTCAGTTACTTCAGCTTACAACCCACCCACAGAACCTCTTATGGGTCAGGTAGTCTATCCACCAGCATCTGCACCTAGACCACAAGCTGAAACTTCTTCAACCTCTGAAAGATTCAAAAATTTCAGAGCAAAGCCATATAGTACCCCGACTATTTTCCTACCTCCAGCATACAATCAACAAGGGGCTATATTAGTTCTTCCTGATGACATTGGCTTATATGAAGATACCATTTCTCGTTGGGAGTCCATTACTCTCAACATGATGAATGAAAAGGTTTGGCCATCAAATGAAGCAAAGGCCAAATATATGGAAAATCTCTTAGGAGAAATGGAGAAGAAGACATGGATACAATGGAGGACCACATATGTATCCGAATATGATGCTTTGGTCCAACAAAGTGATGAAACACAGAACCTCCTGTCTCAGGTAAGGAGGATATTTCTGCTACAAGACCCATATCAAGGATCAACTGCGGAACAAGATCAGGCATATAATGATCTTGAAAGAATTTCTTGTGATAATATTAAGGATTTAATTCCTTATCTGATTCAGTTCCGCAATTTAGCTGCAAAATCTGGACGCTTGTTCTTAGGTCCAGAATTATCTGAAAAATTATTCAGAAAAATGCCGCCTCTAATAGGCAAAGAAATTGAAACAGCATTCATAGCAAAGCATGGTAATGCAAACATCACTGTTATGCCTCGCATTCATTTTGCTTACCATTATCTTGCTGAATTATGTAAAAAGGCAGCATTACAGAGATCATTGAAGGATCTCAGCTTCTGCAACCAGATTCCTCTCCCAGGAATCTATACAAAAGGCAACAAGAAGTTTGGTCTTCGAAAGGCCAGAACATACAAAGGAAAACCACATCCAACACATGTACGGGTATTCAAAAAGGCAAAATACCAGCGTACAAAGAAGTGCAAATGCTTTATATGTGGTGAACCAGGACATTTTGCTCGAGAATGCACAAAGCAAAGAGGAAATATTGTACGAGCAACAGTACATCAAGAACTGGCCATACCAGATAATTTTGATGTTGTTTCTGTGGATGCAGATGAATCTGACAGCTCTGGCATCTACAGTTATTCGGAAAATGAAGCTCCTCTGCAAGAAGTAAATTCTTTCATTCATGATGAAAATATCTTTTTCCTATCTGATGCAGACGAGTTTGAAAGCCCACAACAGCATCTTCATGAAACGGTAAATATGCTTCAATCTAGATCTGCTTATTTACCTCAAGTAGCTGTTGGAGAAGAAAAATTGAATTGTAGTCACATTTGGCTACAAGATGTTGATATTCCATCTGATAAGCACAAATGCCACACATGTAGAAGAGACACTCAGAAACATTACAGACTGGAATGTCAAAAATGCAAATTCTTGGTTTGCTCACTATGCACAATTCCATATCTCGGAATCACCATGCAATTCAGGCAAAAGCAAAAATCTCAGCCTGAAAACCCAAACTTAGTCCGAGAATTGTTAGAACATGCCATTTTTCTAGAAGAAAAATGCAAAAATCAAGAATTACTGTCAGAAACTCAGATAGAAAGGATAGTCAGTTCTGAAAAACAAGTCAAATTTTATGGCATCCTTCCTACAAAAAAGTCCAACAAATCTGCTGGGTATGACTTACAATCCAACATTGATATAGAAATCCCGCCAGGAAAATGTACAGTCATTTCTACTGGAACCTTTCTACAAATGCCTGACAACATGTATGGTAGACTTGTAGAAAGAACATCTTTGGCAATACAGGGGATTACAGTACAAGGAGGAGTCATTGACCCAGACTTCACAGGAGAAATACAGATTGTTCTCTTCAATCATAATACTGCTCCTTATCCTGTGAAGAAAACTTACAGATTGGCTCAAATTATCTTTGAGAAATTTTATACTCCAATCTTCATTCAAGAACCTTTCACTTCAACTCAACAAGGTTCTTCAAATTTTGGCAGTACAGCTAAACCTCTACAAATCACAGAAAATATAGAGGTTATGTCTGAAACAGTTGCAAATCAGGTTGCAAAATCTAGTGTGCTACCACGATTATATTCCATTCAAGCACATATTCATATTGCACCAGATATTGTTATTTCTACAACTGCCATCATTGATACAGGAGCAACAGTCTGTTGTATATCTGAAAAGATAGTACCAGAAGCAGCCAAAGAACAGCTCAATTACAAAGTTAACATTTCTGGTATTTCATCTCAACAGCAAATTCAGCATAGACTGAAAAGAGGTACATTAGAAATTGCATCAAATAAATATGCTCTACCATTGTGTTATATCATTGAACTCAATGATAAAGATGATTTTTCTATGATTCTTGGATGCAATTTCTTTAAACATATGGGGGGAGGAATGAGGTTTGAAGGACCTCATGTTACTTTTTACAAAGGAATTACTACCTTGAGCACCTCATATGCAAATACTGGTATCGATACTGAACATGAACAAATTACCAGTACAACCTCTCAGTCTTTTAAAGAAAGATTTTCTCCCTTAATGAATGAACTTAAA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| 8,547
|
OQ102045.1
|
Taro bacilliform virus
|
Knierim,D., Margaria,P., Menzel,W., Winter,S.
|
Leibniz Institute DSMZ - German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Plant Virus Department
|
Germany
|
2023-06-06
|
DSMZ PV-1158
|
Badnavirus alphacolocalasiae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,825
|
GenBank
| null |
Solomon Islands
|
Solomon Islands
|
Colocasia esculenta
| null | null | null | null |
Taro bacilliform virus isolate DSMZ PV-1158, complete genome
|
TGGTATCAGAGCCTTGTTGTGTTGATTTCTATGGCGATGGCAGCGTAAGCTCCTTCTGCTCAAGAGGGAAGTCTACCATGTTCTTATATCGTGGATGCAACTTCATTTAATTTGCTATTATTTGTTTATGAGTTGTTTGATATAATTCTATATTTGCAAGCATCGTACTTATCAGTACAAACCTGTAATACGAGGTAAGGCTAAGGTAGCAGGCAAAAGAGGGAACAGAGTAGCCGCAGGCAAGAGGCCGTTAGGCGAAGAAAGTACCGTGAGTCTACTACCTGAATCTTACCAAGTGTTATTTCTATCAGGGATAGTTTAAGGTTTCGGAACATAATATGATCTTGCATCTATATGTTTTATATCTGCAATTGACTAACATGTTTAATGGCGAAGAAATTTGAAGCTGCGATAAAGGACTGGTACGACAACTCTCGAAGAGCAGACCTCTCATACCTTGATCTAGCCACAGAATCTAAACCCACTGCTTCACAACTAGCTCACAACCTCCAAGTAATCTTTGATAGATTGTCTCTTCATAGTTCGGTTTCTATTAAAGAGCACTACGAAGTCATTAGCAGACTTCAATCCATAGAAAAATCCGTAGAAGATTTAAAGTCTGATTTGGCCTCGGTCAAAAAGGCTTTAACTTCTATTCAAAAAGAAGTTTTCTCCCACAAACCCTTGTCGGCTCAAGAAGTGCATTCCCTTGCACTTAGTCTCATCAAAGAGCCTAAACAGATCGAGCAGCAAGCTGTTCATCTGTTAAAAGAACTCAAAGAGCAGACCTCAAAGGTTCAAGCTCTTCTTCACGAAGTCAATAGTCTGATTAGAAGTTGATGTCCACTAATCCAGACTATTTAAAGGCCTTAGAAGAAACAAAATCCCTTGGTGAACCCGCGGTAGGTTTCTACGAAGTCCCCACTACCGTCGGTACCACAACAGGCCTATCAACCATCTTAAAGCAGAATAACGCAATCATCCATCTGCTTATTAGTCTGCACGAGAAGGTTGATAAACTCTCCAGCAAAGCCTCAGTAGACGATTTAGCCACTAAGCTTTCCAAGCTTAAAATTGAAGAAAAACCAGTGGTTAAACCTAAATCTCCCTTCTACGTCTACAAAAGTCCACGCCTTATTCTTGAAGAAGAAAGGCACAAAATCGGTCTGAAGCCCACTACAGACGATTGGACTTGGCCAGTAGGACACCCCTACGCCCCGAAGACATCTACATCAGCATCCTCTTCCTCTTCTAAATAAAGATGTCTTTATCAGTTAGAGAATCTTCCGGTGCTTCCACCTCCACCTCAACTGTCCCTAGCCAGCGGGATCAAATCCGCGATTACAGAAATGCACAAAGGCTTAGGCACACAGCAGAGAGAGCCACCAGAAGACTCTTTCCGGGCAGATTCAACAGGACTCTGGAATCCCAGCTAAATCCAGAGGCAGAGATCCGCCTATCTCAACAAAGACGAGCGGCCATGGTTCCGGCCGAAGTCTTGTATAATACATCCCCTTCTACCCGTAATCAGAAAGTGTACCAACACTATTCTGAAGAACGGATCCTTTGCACAGGGCATAATCAACAGCTTAATTTGCCCTTTATTAATGAAGTTTCTTACAGAGCTCTCAGAGAATCAGGCCAGCAACATATTCACATCGGCTTGATCATGATCAGAGTCCACCCACTGCACAGAAGAAACACAGGGACCACTGCTCTCATTGTCCCTCGTGACACCAGGTGGAATGATGATCGCTCCATTATCGGCACTATGGAAGTCGATCTCAGCGCAGGCTCACAGATAGTCTACATCGCTCCAAATATGATGCTATCTGTTGAAGACTTCTTCCGCAACATTCAACTTGCGATTCAGACGCAAGGATATGAAAATTGGAATTCTGCCGAGAGCAATCTGCTCATCTCTCGGGCTCTTATTGGTCGTTTAACTAACGACAGTTTTACAGGATTTCAATATAATATTTCAAATGTTGCTGAATATCTGCACAGCCAAGGAATTCAAGCCATCGAAGGACAAGCTCATCCTCGATCTCTTGGCAACCGCTGGATTCTGCAAGCACCAGCACCTCCTCGGTCTCTCGTACCTCAGAACGTGGAGACCACCACTCTACTTGATGGTAACGTTTCACTCAGGTTTTCTAATTACCATCAAGCTCCTCTTAACAGTGCTTCTCAGGATAATACACATCCTGATATTAATGAAGATGAAAACCAATTTATTGGTTTTCTTTTTGATGGGGAAGATGAGTTGGAGTACCCTTCTTTCGCTCCAATTCAAGAAGAATCAGTTTTTATTATCATTAATGGAGAAGAAATCCCAGATGAGGAAATACCGGAAGACTTTATCATTCCCTTCCGAAACCCTCCTCCTATAACACCTTCTTCTTCCACAGAACCCATCCAAGAGCTAGCACTGAACCTTGAAGATCAGCTCGGTGAACTGGATTACCCCACTCTTATCTCTATGGAAAAACAATTAGTCCAGTCATCAGTCACTTCAGCCTACAATCCACCTACTGAGCCTTTTATGGGCCAGATCTCTTACCCTCCAGCAGCTGAAGCCCGACCACAAGCTGAAACATCCTCCTCTGAAAGATTCAAAAATTTCAGAGCCAAGCCTTACAGCACCCCAAACATATTCCTACCACCTGCTTATAATCAACAGGGTGCCATACTTATCCTTCCAGATGATATAGGGCTTTATGAGGATACCATCTCTCGTTGGGAGTCAATTACTCTCAACATGATGAACGAGAAGATTTGGCCATCAAATGAAGCAAAGGCCAAATACATGGAAAATCTCCTCGGTGAGATGGAGAAAAAGACATGGATACAATGGCGGACCACATATGTATCCGAATACAATGCATTGGTCCAACAATCTGATGAAACACAGAACCTGCTATCGCAAGTGCGCAGGATCTTTTTATTACAAGACCCTTTTCAGGGATCTACTGCGGAACAAGATCAAGCCTATAATGATCTTGAGAGGCTTTCATGTGATAACATCAAGGATTTAATTCCTTATCTTATTCAATTCCGCAATCTGGCTGCAAAATCAGGACGGCTCTTCTTAGGTCCTGAATTATCTGAAAAATTATTTCGCAAAATGCCTGCTCTCATAGGCAAAGAAATTGAAGCAGCCTTCATCAGCAAACATGGTAATGCAAATATTACTGTGATGCCTCGCATCCATTTTACTTACCATTATTTGTCTGAATTATGCAAGAAAGCAGCACTACAGAGATCTCTTAAGGATCTCAGCTTCTGCAATCAAATTCCCATTCCGGGATATTATTCAAAAGGAAGCAAGAAGTACGGCCTCAGAAAAGCACGTACTTACAAAGGCAAGCCGCACCCAACACACGTCCGCGTCTTCAAGAAAGCAAAGTACCAGCGGACAAAGAAATGCAAATGCTTTATCTGCGGTGAACCAGGCCACTTTGCTCGTGAATGCAAAAAGCAAAGAGGCAACATAGTGCGAGCCACTGTACATCAAGAGCTGGCCATGCCAGACAACTTTGATGTGGTCTCAGTAGATGCCGACGAATCTGACAGCTCAGGCATCTACAGCTTTTCTGAAAATGAAGCCCCTCTTCAGGAATTCAATTCTATTATTCATGATGAAAATATTTTCTTATTATATCCTGACATTGAAGAGGACTTATCTGATGATGATTATGAAGAACCAGAAGAAGACCTCGAGGATTACTTCAACAGAACAGATCCTCACAGAAATGATCACCTATTCACATGGCATCAAGGTGATAATATTGAATTCGGTCTTCCTATTATTGATCAGATTATTACCCCAGATGCAGAATTAACAGAAGAACCCGAAGAATCTGATCAAGATCGAGATGAAGAGCCACCATCAAGGGTGGACAATTATTTACAAAATCTCCTGGCAGATCTGAGAAATGACCTCAGAGAATTAGAAGAAGGCTTCGAACAACTGGAAGAAAGCCTGGATCCAGAAAGCAACAAAGAAAATCAGGATCCAAACCAGCCATCTGCCTCAGATGAAGACGAGGAACTGGTAAATATGCTTCACTCTAAATCTGCTTATTTACCACAAGTCTTCATAGGAGATGAAAAGTTAAAATGTGATCACTCATGGTCACAAGACACTGACATTCCATATGACAGACATAGATGTCATACCTGTAAAAGAGAAACTCAGCAACATTACAGGTTAGAATGTCAAAAATGTAGATTCTTGGTATGTTCCCTATGCACTATTCCTTATCTCGGGATTACTATGCAATTCAAGCAAAAACAAAAGCAACCAGAAAATCCACAGCTAATCCGAGAATTAATGGAACATGCAATATTTCTTGAAGAAAAATGCAGAAACCAGGAATCACTGTCTGAACAAGCTATAGAAAGGATCGTCAGCTCAGAAAAACAGGTTAAATTCTCTGGCATCCTTCCTACCAAAAAATCAGAAAAATCAGCTGGATATGACTTAGCATCAACTATTGACACAGAAATTCCTCCAGGCAGAAGAGCTCTAATTCCTACAGGTATATTTTTACAAATGCCTGATAATGTGTATGGCAGAATTATTGAAAGATCCTCCTTAGCCATGCGAGGGATTACAGTCCAAGGTGGAGTCATAGATCCAGACTTTACAGGGGAAATACAGATTATTCTCTTTAATCATAATCTGGATGCTCCTTACCCTGTAAAGAAGACAGCAAGATTGGCGCAGATTATTTTTGAAAAATTTTATAATCCAATCTTTGTGCAAGAACCTTTCACTCCTACACAACGAGGTTCTTCAGGCTTCGGCAGTACAGATATTCAACCTGCACATTCTTCAGAAAATATTCAGGTTATATCAGAAATTGTGGCTAATCAGGTAGCCAAATCATCTGTTCTCGGCCGATTATATTCAATTCAAGCAGTTATTCATATTTCTCCTGATATTATCATCACAACAACTGCTATTATTGATACTGGAGCAACAGTCTGCTGTATATCAAAAAATATTGTCCCAGAAAATGCAGCTGAAGAATTAACCTACAAGGTTAATATTTCCGGGATTTCTTCTAAACAGCAAATACAGCACAGACTTAAAAGAGGTACATTAGAAATAGCATCCAATAAATATGCTTTACCTTTGTGTTATGTCATTGATCTCAATGATAATGAAGGTTTTTCAATGATTTTGGGATGCAATTTCTTTAAACACATGGGGGGAGGAATGAGGTTCGAAGGACCTCATGTTACCTTTTACAAAGGTATTACTACACTCAGTACCTCTTATGCAAATACTGGTATAGATCATTCTGAACAAATTACCAGTATATCATTCCCCTTATCTTTCAAAGATAGATTTTCTCCTCTGATAAATGAGCTGAAGGCAGCAGGCTATATAGGAGAAGATCCGATGAAGCACTGGTCCAAAAACAAAGTTACATGCAAATTGGACCTTAAAAATACAGAGATTACTATTCAAGACAAACCATTACGACATGTTACTCCTGCTCTAGAACAGTCGTTTGGTAGACATGTAGATGCTCTACTTAAGCTCAAGGTTATCCGACCTTCTAAAAGTAGACATCGTACAATGGCCTTCATAGTAAACTCTGGCACAACAGTTACAGCTGATGGCAAGGAAGTCAAAGGTAAAGAAAGAATGGTCTTCAATTACAAAGCACTGAATGACAACACTTATAAAGATCAGTACTCTTTACCAAATATTCAGCTTATACTGAAGAAGGTGATTAATAGCAATATTTATTCAAAATTTGATCTGAAATCTGGTTTTCATCAAGTTGCTATGGCACCTGAATCTGTGGAGTGGACTGCCTTCCACGTCCCACAAGGATTATTTGAATGGTTGGCAATGCCGTTCGGCATTAAAAATGCGCCAGCCATATTCCAAAGAAAAATGGACTCAGTATTCAAAGGGTGTGAAAAATTCCTCGCAGTATATATTGATGATATTCTGGTATTTTCTAACAACGAGGAAGAGCATGCAAAACACTTGACCATTATGCTACAACTCTGTAAAGAACATGGTCTTGTTCTATCACCCACCAAGATGAATATTGCAGTCAAAGAAGTTAATTTTCTCGGAGCTACTATTGGCAGCAGAAAAGTTAAGCTCCAGGAAAATATTATTAAAAAGATCTTAGACTTCAATGAAGAAAATCTTCAATCAAAAAAGGGTCTTCGGTCTTTCTTGGGAATTCTCAATTATGCCCGAAATCATATTCCTAATCTCGGGAAAATAGCTGGACCTCTTTATTCTAAGACTTCTGTCTATGGAGATATCAGATTTTCAGCATCTGATTGGAAGCTTATTAAAGAGATCAAGGCTATCGTGGAGAAACTCCCACCACTTGATTATCCACCAGAGCAAGCCTATATTATCATTGAATCTGACGGCTGTATGGATGGATGGGGCGCTATTTGCAAATGGAAGCTGGCTGAATACGACCCCAAATCAAGTGAACAGATCTGCGCATACGCTAGTGGTAAATTCTCTCCTATTAAATCCACTATTGATGCGGAGATTACTGCTGCAATGGAGGGACTTGAAGCTTTCAAGATCCATTATTTGGATAAAAGCAAGATTACCCTCCGTACTGATTGTCAAGCAATCATCTCCTTCTGCAACAAAACATCGGTACACAAACCTTCAAGAGTGAGATGGTTAAAGTTTATTGATTACATTACTAATACTGGCATTGATGTCAAATTTGAACATATTGATGCTAAAAACAATGTTTTAGCTGACACCTTGTCCAGGTTAGTCATGACCATGCAGGATTTACCCTGGCTTGACGATCCTCATCAGGAACAATCAGTCGCCCTGATGAAAGAAATTGAGGATGCACCCCTCACCATTAAGCAGCGTTCTTTAACCTGCTTACAAAGACTGATCTGTAGAAGCCTCATCGAGGAAGCTACAGAAGAAGAAGCTATCAACTATCTAACGGACGATGATGAAGCTCCCACCATGTCCTTAGAAGAATTCAGCAAACGAAGATCAACGGCTCACGATGATCTTCTGCAAAAATTCCAAGCGACGTTACAACAGATGACGGAGCTTGAAGAGGCGTTACAAGAAAGGACACTGACGTGTCAAAGATTCGCCACTAAGGATAACTACTGGGGAGACTGGCTACCGGAGATACGCAAAGATCTCCACCAAATGCAAGAAGCCAAAAACGCCGTCCAAAAGATTCGCGATCAGCTTCACCGCATATAAAAAGTGTGTATGCTTTTTCTTTTGAGTGTGAGTGGCGCACTTGCGCATTATGTAGTGAGGCATTATTGTACTTTTGCGCTAGACGCCACTTGGCTTTAGCTTTCTGTAATGGTCAGGTCACATCACTTTGACAAATTGAGCCTCGGGGAGCCGTTTGTCAAAAGTAGATGCTTATCTAGTCAGAATCAACTTTATTCGAGTTGAGCCTCGGGGAGCCGCTCGTTTAAAGAAGATGCGTGAAGCGACAGCTCTCGGTGCGCTGTCACTTCCCTTATCTCATAATGCACCCCGCATTATTGAGATTCCTCCTTATCCCTTACTGCCACCGCATAGGTTGCATTATTGGGATTCGTCTCGAGTCGAGGGACGAGGCCTCCACTATGTCTATAAAAAGGCCTTCACCCCCTCAGAAGTTCAACAAGTCGGGAAACCGGGAAATCGAGAAGTCGAGAACCCAACCCAGCCTTGTAGTTCTTCCTTAGTCTTTTCTTTCCTTCCTCTTGTATGTTCTAAGTCTTTCGAAGAACGACCACCGTGTCGTGAAGAAAGCCGATCCCTTATAATACCCGTTTATTTTTACTT
| 15,316
|
ON086737.1
|
Taro bacilliform virus
|
Olmedo-Velarde,A., Loristo,J., Kong,A., Waisen,P., Wang,K.H., Hu,J., Melzer,M.
|
University of Hawaii at Manoa, Plant and Environmental Protection Sciences
|
USA
|
2022-08-10
|
PNG-K
|
Badnavirus alphacolocalasiae
|
Badnavirus
|
Caulimoviridae
|
dsDNA-RT
| 7,825
|
GenBank
| 1
|
Papua New Guinea
|
Papua New Guinea
|
Colocasia esculenta
| null |
2019-05
| null | null |
Taro bacilliform virus isolate PNG-K, complete genome
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