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|
Turnip yellow mosaic virus
|
Knierim,D., Margaria,P., Menzel,W., Winter,S.
|
Leibniz Institute DSMZ - German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Plant Virus Department
|
Germany
|
2023-01-09
|
DSMZ PV-0299
|
Tymovirus brassicae
|
Tymovirus
|
Tymoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,314
|
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Germany
|
Germany
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| 19,628
|
OP357951.1
|
Turnip yellow mosaic virus
|
Knierim,D., Margaria,P., Menzel,W., Winter,S.
|
Leibniz Institute DSMZ - German Collection of Microorganisms and Cell Cultures, Plant Virus Department
|
Germany
|
2022-11-21
|
DSMZ PV-1354
|
Tymovirus brassicae
|
Tymovirus
|
Tymoviridae
|
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|
Germany
|
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| 22,122
|
KP995414.1
|
Turnip yellow mosaic virus
|
Shin,J.C., Kim,M.K., Kwak,H.R., Seo,J.K., Kim,J.S., Cha,B.J., Choi,H.S.
|
National Academy of Agricultural Science, RDA, Crop Protection
| null |
2016-03-23
|
JC3
|
Tymovirus brassicae
|
Tymovirus
|
Tymoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,318
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Brassica rapa
| null |
2012
| null | null |
Turnip yellow mosaic virus isolate JC3, complete genome
|
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Turnip yellow mosaic virus
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National Academy of Agricultural Science, RDA, Crop Protection
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2016-03-23
|
HS1
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Tymovirus brassicae
|
Tymovirus
|
Tymoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,318
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
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2012
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National Academy of Agricultural Science, RDA, Crop Protection
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National Academy of Agricultural Science, RDA, Crop Protection
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2016-03-23
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JC1
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Tymovirus brassicae
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Tymovirus
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Tymoviridae
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ssRNA(+)
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South Korea
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South Korea
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2012
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Turnip yellow mosaic virus isolate JC1, complete genome
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China
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2015-08-31
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S
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Tymovirus
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United Kingdom
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| 86,059
|
KJ690173.1
|
Turnip yellow mosaic virus
|
Dullemans,A.M., Roenhorst,J.W., Van der Vlugt,R.A.A.
|
Wageningen University and Research Centre, Plant Research International BV
|
Netherlands
|
2014-07-08
|
DSMZ PV-0299
|
Tymovirus brassicae
|
Tymovirus
|
Tymoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,320
|
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
|
Brassica rapa subsp. pekinensis
| null |
1992
| null | null |
Turnip yellow mosaic virus isolate DSMZ PV-0299, complete genome
|
GGTAATCAACCACCAACTCCAGCTCTCTTTTGACAACTGGTTTTATACCCACTTTCCGTACACTTGCAACCCTCGTAAGACAATTGCAAATGAGTAATGGCCTTCCAATTAGCATTGGACGCCCTTGCACCCACGACTCACAGAGATCCTTCTCTGCATCCGATCCTCGAATCCACAGTAGATTCGATTCGCTCCTCGATACAGACCTACCCCTGGTCCATCCCGAAGGAACTTCTACCCCTACTCAACTCCTACGGCATCCCGACATCTGGTTTGGGGACCTCCCACCACCCCCACGCCGCCCACAAGACAATCGAGACTTTTCTCCTTTGCACCCACTGGTCTTTCCAGGCCACCACTCCCAGCTCCGTTATGTTCATGAAACCCAGCAAGTTCAACAAACTTGCCCAGGTAAACTCAAACTTTCGGGAACTGAAGAATTACCGCCTGCACCCCAACGACAGCACTCGTTACCCCTTCACATCACCAGACCTGCCCGTTTTCCCCACCATTTTCATGCACGACGCTCTGATGTACTACCATCCCTCCCAGATCATGGACCTGTTCTTGCAGAAACCAAACCTCGAACGCCTGTACGCCAGCCTCGTAGTGCCGCCCGAGGCCCATCTTTCAGACCAATCCTTCTTCCCGAAGTTGTACACGTACACAACGACCCGCCACACTCTTCACTACGTCCCAGAAGGTCACGAAGCCGGCAGCTACAACCAACCATCCGACGCCCACTCCTGGCTCCGAATCAATTCCATTCGCCTCGGCAACCACCACCTATCAGTGACAATCCTGGAATCCTGGGGCCCCGTCCACTCGCTCCTGATTCAACGAGGGACCCCCCCCCCCGATCCATCACTCCAGGCCCCTTCAACACTCATGGCGTCCGACCTCTTTCGGTCTTACCAAGAGCCCCGCCTCGACGTGGTCTCCTTCCGAATCCCCGACGCCATCGAACTTCCACAGGCCACATTCCTCCAACAACCACTTCGAGACCGACTGGTCCCCCGAGCCGTCTACAACGCCCTGTTCACCTACACCAGAGCGGTTCGCACACTCCGGACTTCAGACCCAGCAGCATTCGTGAGGATGCATTCCTCCAAACCGGACCACGACTGGGTCACCTCGAACGCCTGGGACAACCTGCAAACCTTCGCACTTCTGAACGTTCCCCTTCGACCAAACGTCGTCTACCACGTCCTTCAGAGCCCAATCGCCTCCCTAAGTCTTTACTTGAGGCAACATTGGCGCCGTCTTACCGCCACCGCCGTTCCTATCCTCTCCTTCCTAACCCTCCTGCAGCGCTTCCTTCCATTGCCTATACCTCTAGCAGAGGTAAGATCCATCACAGCCTTCCGAAGGGAGCTGTACCGCAAGAAGGACCCCCACCACCCCCTCGACGTCTTCCATCTCCAGCACCACGTACGCAATTACCACTCCGCGATCTCGGCCGTACGCCCAGCTTCCCCACCCCACCAAAGACTCCCACACGCGCTTCAGAAAGCTGCATTGCTTCTCCTCCGACCGATATCGCCCCTCTTGACAGCGACCCCGTTCTTTCGGTCCGAACAGAAGTCCATGCTCCCGAACGCCGAACTTTCATGGACCCTGAAGCGCTTCTCGCTGCCCTGGCAGGCCTCCCTAGTCCTCCTCGTCCTATCGGAATCATCCATACTACTTCACAAACTGCTCTCTCCGCCAACCCTCCAAGCCCAACACGACACCTACCACCGACATCTCCACCCTGGATCCTACAGTCTCCAGTGGGAGAGGACGCCATTGTCGATTCCGAGGACGACAGCATTTCTTCCTTTCATTCCCACGACTTCAACAGCCCCTCCGGACCGCTCCGAAGCCAGTCTCCCTCCCGCTTTCGCCTCCACCTCCGTTCTCCGTCCACCTCCAGCGGCATCGAGCCCTGGAGTCCAGCCTCCTACGACTACGGCAGCGCCCCCGACACCGATTGAACCCACCCAGCGCACCCATCAAAGCTCTAACCTCACGCTCGAAGTTTCAACCCCGACCGAACCCCCTCCACCCTCCATCCAATCCCCCGACGTCCCGCCCTCCGCGCCCGTTCTTTTTCCAGAAATCAACTCACCTCATCGGTTTCCCCCCCAACTTCCCGCCACACCCAATTTCGAACCCACCCTCGCTCCACCTCCACCCTTCATTCCGCATCAAGATTCTACTGACTCCTCGGACCCCTTGATGGGCTCCCACCTTCTGCACCATTCACTGCCTACACCTCCCACCCACCCTCTTCCATCTTCACAGCTCTTACCCGCACCCTTGACAAACGACCCCACCGCGATCGGCCCGGTACTCCCCTTTGAAGAACTCCACCCACGCAGATACCCTGAAAACACCGCCACCTTCCTCACAAGGCTCCGTTCACTACCTTCAAACCATCTTCCACAACCCACCTTGAATTGTCTCCTCTCCGCTGTCTCCGACCAAACCAAGGTTTCCGAGGAGCACCTTTGGGAGTCCCTACAGACAATTCTCCCAGATAGCCAACTCAGGAATGAAGAAACCAGCACTCTCGGGCTCTCAACTGAACACCTCACTGCGTTGGCCCACCTCTACAACTTCCAAGCGACCGTCTATTCCGATCGCGGTCCCATCCTCTTCGGCCCCTCCGACACCATCAAGAGAATCGACATCACCCACACCACCGGACCACCATCCCACTTTTCACCCGGCAAAAGACTTTTAGGCAGCCAACCCTCAGCTAAAGGCCATCCTTCCGACCCACTCATCAGAGCCATGAAGTCTTTCAAAGTGTCCGGCAACTACCTTCCCTTCTCTGAGGCCCACAACCATCCCACCTCCATTTCACATGCCAAGAACTTAATCTCAAACATGAAGAATGGATTCGACGGCGTCCTCTCCCTACTCGACGTCTCCACAGGCCAACGAACCGGACCCACCCCCAAAGAGCGAATCATTCAGATAGATCACTACCTCGACACCAACCCCGGCAAAACCACTCCAGTGGTGCACTTTGCCGGCTTCGCCGGCTGTGGAAAGACATATCCGATCCAACAGCTCCTCAAAACCAAACTCTTCAAAGACTTTCGCGTTTCCTGCCCCACCACAGAACTCCGAACTGAATGGAAGACCGCGATGGAACTCCATGGCTCCCAGTCATGGCGCTTTAACACTTGGGAGTCTTCCATTCTCAAGTCATCCAGAATTCTGGTCATCGATGAGATCTACAAAATGCCAAGAGGGTATCTCGACCTCTCTATTCTCGCTGACCCCGCCCTCGAACTCGTCATCATCCTTGGCGATCCTCTACAAGGCGAGTACCACTCTCAATCGAAAGACTCATCCAACCACCGCCTTCCCTCTGAAACTCTCAGGCTGCTACCATACATCGACATGTACTGTTGGTGGAGTTATCGCATCCCTCAATGCATCGCCCGACTCTTCCAAATTCACAGCTTCAATGCCTGGCAAGGAGTCATCGGCTCCGTTTCCACCCCCCATGATCAATCTCCCGTCCTCACCAACAGTCATGCCTCATCTCTCACTTTCAACAGCCTGGGATATCGCTCCTGCACGATCAGTTCTAGCCAAGGCCTCACATTCTGCGACCCTGCCATCATAGTCCTAGACAACTACACCAAGTGGCTTTCCTCAGCCAACGGCCTCGTCGCCCTTACCCGATCCAGATCAGGTGTCCAATTCATGGGCCCCTCTTCTTATGTCGGGGGAACCAACGGCTCTTCCGCCATGTTTTCTGACGCCTTCAACAACAGCCTCATCATCATGGATCGCTACTTCCCATCCCTGTTCCCACAACTCAAGCTCATCACTTCCCCCCTCACAACCCGCAGCCCCAAACTCAACGGGGCCACCCCCAGCGCGTCTCCCACCCACCGCTCACCAAACTTCCATCTCCCCCCACACATTCCCCTCTCTTATGATAGTGATTTTGTTACGGTAAACCCCACTCTCCCCGATCAAGGACCCGAAACAAGACTCGACACTCACTTCCTCCCACCTTCTCGTCTCCCGCTTCATTTCGATCTCCCACCAGCCATAACGCCTCCCCCGGCCTCTACAAGCGTCGACCCGCCACAAGCTAAAGCTAGCCCCGTCTATCCAGGCGAGTTCTTCGATTCTTTGGCGGCGTTCTTCCTACCAGCACATGACCCGTCGACAAGGGAAATCCTCCACAAAGACCAATCCAGCAACCAGTTCCCCTGGTTCGACCGACCCTTCAGCTTGTCCTGCCAGCCCTCAAGTCTGATTTCCGCAAAGCACGCACCCAACCATGATCCGACTCTTCTGCCGGCCTCCATCAACAAACGCTTGCGATTCAGACCCAGTGACGCACCGCACCAAATCACCGCGGACGACGTGGTCCTAGGCCTGCAACTCTTCCACTCTCTCTGCCGCGCCTACTCACGTCAACCCAACTGCACCGTTCCATTCAACCCTGAACTTTTCGCGGAATGCATCTCTCTGAACGAATACGCGCAACTCAGTTCCAAAACCCAATCCACCATAGTGGCCAACGCTTCACGCTCCGACCCAGACTGGCGACACACCACCGTCAAGATTTTTGCGAAAGCTCAACACAAAGTCAACGACGGCTCCATCTTCGGCTCATGGAAAGCCTGCCAGACCCTCGCACTCATGCACGATTACGTAATTCTGATTCTTGGACCCGTCAAGAAATATCAAAGGATCTTCGACAACGCTGACCGGCCACCTCACATCTACTCACACTGCGGCAAGACACCCAACCAACTTCGAGATTGGTGCCAGGAACATCTCACTCATTCCACCCCCAAGATCGCAAACGACTACACCGCCTTCGACCAATCCCAGCATGGAGAATCCGTGGTCCTTGAAGCACTCAAAATGAAGAGACTGAACATTCCCAGCCATCTGATTCAGCTCCACGTCCACCTCAAGACCAACGTCTCCACCCAGTTCGGCCCTCTCACATGCATGCGCCTGACCGGGGAACCCGG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| 89,600
|
AF035403.1
|
Turnip yellow mosaic virus
|
Skotnicki,M.L., Mackenzie,A.M., Gibbs,A.J., Keese,P., Osorio-Keese,M.E., Torronen,M., Ding,S.W., Howe,J., Srifah,P., Meek,A.
|
Australian National University, Research School of Biological Sciences
|
Australia
|
1997-12-27
|
Blue Lake
|
Tymovirus brassicae
|
Tymovirus
|
Tymoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,319
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Turnip yellow mosaic Blue Lake isolate, complete genome
|
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| 111,719
|
J04373.1
|
Turnip yellow mosaic virus
|
Keese,P., Mackenzie,A., Gibbs,A.
| null | null |
1993-08-02
| null |
Tymovirus brassicae
|
Tymovirus
|
Tymoviridae
|
ssRNA(+)
| 6,319
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Turnip yellow mosaic virus Club Lake isolate, complete genome
|
GTAATCAACTACCAATTCCAGCTCTCTTTTGACAACTGGTCTTATACCAACTTTCCGTACACTTGCAACCCTCGTAAGACAATTGCAAATGAGTAATGGCCTTCCAATTAGCATTGGACGCCCTTGCACCCACGACTCACAGAGATCCCTCTCTGCATCCGATTCTCGAATCCACAGTAGATTCGATTCGCTCCTCGATACAGACCTACCCATGGTCCATTCCGAAGGAACTTCTGCCCCTACTCAACTCCTACGGCATCCCAACATCTGGTTTGGGAACATCCCACCACCCCCACGCCGCCCACAAGACAATCGAGACTTTTCTCCTTTGCACCCACTGGTCTTTCCAGGCCACCACTCCCAGCTCCGTCATGTTCATGAAACCCAGCAAGTTCAACAAACTTGCCCAGGTGAACTCAAACTTTCGGGAATTGAAGAACTACCGCCTGCACCCCAACGACAGCACTCGTTACCCCTTCACATCACCAGACCTTCCCGTTTTCCCCACCATTTTCATGCACGACGCCCTGATGTACTACCATCCCTCCCAGATCATGGACCTGTTCTTGCAGAAACCAAACCTCGAACGTCTGTACGCCAGCCTCGTAGTACCACCCGAGGCCCATCTTTCCGACCAATCCTTCTTCCCGAAGTTGTACACGTACACGACGACCCGCCACACTCTTCACTACGTCCCGGAAGGTCACGAAGCCGGCAGCTACAACCAACCATCCGACGCCCACTCTTGGCTCCGAATCAATTCAATTCGCCTCGGCAACCACCACCTCTCAGTGACGATCCTGGAATCCTGGGGCCCTGTCCACTCGCTCCTAATTCAACGAGGGACCCCCCCCCCCGACCCATCACTCCAGGCCCCTTCAACACCCATGGCGTCCGACCTCTTTCGGTCTTACCAAGAGCCCCGCCTCGACGTGGTCTCCTTCCGAATCCCAGACGCCATCGAACTTCCACAGGCCACATTCCTTCAACAACCGCTTCGAGACCGACTGGTCCCCCGAGCCGTCTACAACGCCCTGTTCACCTACACCAGAGCGGTCCGCACACTCCGGACTTCAGACCCAGCGGCATTCGTAAGGATGCATTCCTCCAAACCGGACCACGATTGGGTCACCTCGAACGCCTGGGACAATCTGCAGACCTTCGCACTTCTGAACGTACCCCTTCGACCAAACGTCGTCTACCACGTCCTTCAGAGCCCAATTGCCTCCCTAGCTCTTTACCTGAGGCAACATTGGCGCCGTCTTACCGCCACCGCCGTTCCCATCCTCTCCTTCCTAACCCTCCTGCAGCGCTTCCTCCCATTGCCTATACCTCTGGCAGAGGTAAAATCCATCACAGCCTTCCGAAGGGAGCTCTACCGAAAGAAGGCCCCCCACCACCCCCTCGACGTCTTCCATCTCCAGCAACACCTCCGCAATCACCACTCCGCGATCTCGGCCGTACGCCCAGCTTCCCCACCCCACCAAAGACTTCCACACGCGCTCCAGAAAGCTGCATTGCTGCTCCTCCGACCGATATCGCCCCTCTTGACAGCGACCCCGTTCTTTCGGTCCGAACAGAAGTCCATGCTCCCGAACGCCGAACTTTCATGGACCCTGAAGCGCTTCGCGCTGCCTTGGCAGGCCTCCCTAGTCCTCCTCTCTCTGTCGGAATCATCCGTACTGCTTCACAAACTGTTCTCCCCACCAACTCTCCAAGCCCAACACGACACCTACCACCGACATCTTCACCCTGGATCCTACAGTCTCCAGTGGGAGAGGACGCCATTGTCGATTCCGAGGACGACAGCATTTCTTCCTTTCACTCCCACGACTTCAACAGCCCCTCCGGACCACTCCGAAGCCAGTCTCCCTCCCGCTTTCGCCTCCACCTCCGTTCCCCGTCCACCTCCAGTGGCATCGAGCCTTGGAGCCCAGCCTCCTACGACTACGGCAGCGCCCCCGACACCGATTGAACCCACCCAGCGCGCTCATCAAAATTCTGACCTCACGCTTGAAAGTTCAACCCCAATTGAACCCCCCCCACCCCCCATCCAATCCTCCGACATCCCGCCTTCCGCCCCCGTTCTTTTCCCAGAAATCAACTCACCGCATCGTTTTTCCCCCAAACTTCCCACCACACCCGATTTCGAACCCACCCGCACTTCACCCCCTCCTTCCACTTCGCATCAAGATTCGACTGACCCCGCGGACCCCCTGATGGGCTCCCACCTTCTGCACCATTCACTACCTGCACCTCCCACCCACCCGCTTCAATCTTCACAGCTCTTGCCCGCACCTTTGACAAACGACCCCACCGCGATCGGCCCGGTACTCCCCTTTGAAGAACTCCACCCACGCAGGTACCCCGAAAACACCGCCACTTTCCTCACGAGGCTCCGTTCACTTCCTTCAAACCATCTACCACAACCCACCCTGAATTGTCTCCTCTCTGCTGTCTCCGACCAAACCAAGGTTTCCGAGGATCACCTCTGGGAGTCCCTACAGACAATTCTCCCAGACAGCCAACTCAGGAACGAAGAGATCAACTCTCTCGGGCTTTCAACTGAACACCTCACTGCGTTGGCCCATCTTTACAACTTCCAGGCAACCATCTACTCCGATCGTGGTCCCATCCTCTTCGGCCCATCCGACACCATTAAGAGAATCGACATCACCCACACCACCGGACCGCCATCCCACTTTTCACCCGGCAAAAGACTTTTAGGCAGCCAACCCTCAGCTAAGGGCCATCCCTCCGACTCACTCATCAGAGCCATGAAGTCTTTCAAAGTATCCGGCAACTACCTTCCCTTCTCTGAGGCCCACAACCATCCCACCTCCATCTCACATGCCAAGAACTTGGTTTCAAACATGAAGAATGGATTCGACGGCATCCTCTCCCTTCTCGACGTCTCCACAGGCCAACGAACCGGACCCACCCCCAAAGACGCGATCATTCAGATAGACCACTACCTCGACACCAACCCCGGCAAAACCACCCCTGTGGTGCATTTTGCTGGTTTCGCTGGCTGTGGAAAGACATATCCGATCCAACAGCTCCTTAAAACTAAACTGTTCAAAGACTTTCGGGTCTCCTGCCCCACCACAGAACTCAGAACCGAATGGAAGACTGCGATGGAACTTCATGGCTCCCAGTCATGGCGCTTTAACACTTGGGAGTCTTCCATTCTCAAGTCATCCAGAATTCTGGTCATCGATGAAATCTACAAAATGCCAAGAGGGTACCTCGACCTTTCCATTCTCGCTGACCCCGCCCTCGAACTCGTCATAATTCTCGGTGATCCTCTCCAGGGCGAGTACCACTCTCAATCCAAAGACTCATCCAATCACCGCCTTCCCTCCGAAACTCTCAGGCTGCTACCATACATTGACATGTACTGCTGGTGGAGTTATCGCATTCCCCAATGTATCGCCCGACTCTTCCAAATTCACAGCTTCAATGCCTGGCAGGGAATCATCGGCTCCGTTTCAACTCCCCAGGATCAATCCCCCGTTCTCACCAACAGTCATGCCTCATCTCTCACCTTCAACAGCCTGGGATATCGCTCCTGCACGATCAGCTCTAGCCAAGGCCTCACATTCTGCGACCCTGCCATCATCGTCCTGGACAACTACACCAAGTGGCTCTCCTCGGCCAACGGCCTCGTCGCCCTCACCCGATCCAGATCAGGTGTCCAATTCATGGGCCCCTCTTCCTATGTCGGGGGAACCAACGGCTCTTCTGCCATGTTTTCTGACGCCTTCAACAACAGCCTCATCATCATGGATCGCTACTTCCCATCCCTGTTCCCACAACTCAAGCTCATCACCTCCCCCCTCACAACTCGCAGCCCCAAACTCAACGGGGCCACCCCCAGCGCATCTCCCACCCATCGCTCGCCAAACTTCCACCTCCCCCCACACATTCCCCTCTCTTATGATCGTGATTTCGTCACGGTCAACCCAACTCTCCCTGATCAGGGACCCGAAACAAGACTCGACACCCACTTCCTCCCACCTTCTCGGCTCCCGCTTCATTTCGATCTCCCACCAGCTATCACCCCCCCCCCGATTTCCACAAGCGTCGACCCGCCACAAGCTAAAGCTAGCCCCGTCTATCCAGGCGAGTTCTTCGATTCTCTGGCGGCGTTCTTCTTACCAGCACACGACCCATCAACAAGGGAAGTACTCCACAAAGATCAATCTAGCAACCAGTTCCCTTGGTTCGACCGACCCTTCAGCTTGTCCTGCCAGCCCTCAAGTTTAATTTCTGCCAAGCATGCACCCAACCACGATCCGACCCTTCTGCCTGCCTCCATCAATAAACGCTTGCGATTCAGACCCAGTGAAGCACCGCACCAAATCACCGCAGACGACGTGGTCCTAGGCCTGCAACTCTTCCACTCTCTCTGCCGCGCCTACTCACGTCAACCCAACATCACCGTTCCATTCAACCCTGAACTTTTCGCAGAATGTATCTCTCTGAATGAATACGCGCAGCTCAGTTCCAAAACCCAATCCACCATAGTGGCCAACGCTTCACGCTCCGACCCAGACTGGCGACACACCACCGTCAAGATTTTTGCGAAAGCTCAACACAAAGTCAACGACGGCTCCATCTTCGGTTCATGGAAGGCCTGCCAAACTCTCGCACTCATGCATGATTACGTAATTCTGGTTCTTGGACCCGTCAAGAAATATCAAAGAATCTTCGACAACGTTGATCGGCCATCTCACATCTACTCACACTGCGGCAAGACACCCAACCAACTTCGAGATTGGTGCCAGGAACATCTCACTCATTCCACCCCAAAAATCGCAAACGACTACACCGCCTTCGACCAATCCCAGCATGGAGAATCCGTGGTTCTTGAAGCCCTCAAAATGAAGAGACTGAACATTCCGAGCCATTTGATTCAGCTCCATGTCCACCTCAAGACCAACGTCTCCACCCAGTTCGGCCCCCTCACATGCATGCGCCTGACCGGGGAACCCGGA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| 112,007
|
NC_003743.1
|
Turnip yellows virus
|
Garcia,A., van Duin,J., Pleij,C.W., Veidt,I., Lot,H., Leiser,M., Scheidecker,D., Guilley,H., Richards,K., Jonard,G.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1988-11-17
|
FL1
|
Turnip yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,641
|
RefSeq
| 2
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Turnip yellows virus, complete genome
|
ACAAAAGAAACCAGGAGGGAATCCTTAGTTGATGCAATTTCTCGCTCACGATAACTTTCACACTTTGCAAGTCAAGAAAGTCCGATTCCTCCACCCTCAACAAGAAGTGTTTCTTTTAGCAGGTTTATTGCTCAATATAAAACAATTTGTACGAGCAATCAAAGAGCGCAATAATGTATTCAAAATTGATGTTTTTCTTCGCTCTTTGCTCTATCAGCTTCCTTTTCACCTCGGAAGCTGCTTCCACGATGCTCCTCGAGAGCTCATACCTGCCACTGAACCAGAGTTATGCGCCTGGTTTTCTTTACAAACGGGATATGCTCCCGCCTCCACTTCAGGCCGTGTTAACTTACACGTGCCCGGAACCAAGACCTCTCGCAGAAGAATCATACAACGATCTTTTGCGAGCGATTTCTCAGAAAAGCTCAAGCGATTTCCAGAATGCTTATTCGTTAGCCTTGAGCTTTTCCAGCGACTTCTATCAACATGGACTAAAGACGTTGAAAGACGTATCTTTTTTAGCTGTCGAGAAATTCCTCTGGGGTCTGACACGCTTATGGAGCTCGCTAATCTTGGCGAGTTTCTCCGCGTTATGGTGGTTGGTGAGCAATTTCACAACTCCCGTCTTCTGTCTCGCCTTGCTGTACACTGTTACAAAATATATGGTGAAGACGGTTTCATTTCTTTTTGGAGGATTGCCAATCTGGATCATTTCGATTGCTTTCTCACTCCTGAAGAAATCCTTTTCAGCTCTTCGGTCTACACCGAAATGTTTGTATGAAAAGGCCATAGACGGTTTCAAGAGTTTCACTATCCCGCAGAGTCCCCCAAAATCTTGCGTGATTCCCATCACCCACGCAAGCGGAAACCACGCTGGCTATGCCAGTTGTATCAAGCTATATAACGGAGAAAATGCTCTAATGACGGCAACTCACGTCCTACGTGATTGCCCCAACGCCGTGGCTGTTTCCGCCAAAGGACTCAAAACGCGGATTCCACTCGCAGAATTCAAAACAATCGCGAAATCCGACAAAGGTGATGTTACCCTCCTTCGCGGCCCCCCCAATTGGGAAGGACTGTTGGGCTGTAAAGCGGCCAACGTTATAACAGCTGCTAACCTAGCGAAATGCAAAGCATCCATATACTCTTTTGACAGAGATGGCTGGGTTAGCAGTTATGCCGAGATCGTAGGCTCAGAAGGTACAGATGTTATGGTTCTGAGCCATACGGAAGGAGGACACTCCGGAAGCCCCTACTTCAATGGTAAAACCATCTTGGGGGTTCATTCAGGTGCCAGTGCTACTGGAAATTACAATTTAATGGCACCAATCCCATCCCTCCCCGGACTTACTAGTCCGACTTATGTGTTCGAAACCACCGCACCACAAGGAAGAGTTTTCGCACAAGAAGATATCGCTGAAATCGAAGGCCTCTATGCACAAGTAATGAAAAGAGTTCAACAAGCGGAAGATTTCAAACCCAAAACTGGAAAGTATTGGGGTGATATGGAGGATGATGAAGACATTTTCTTCGAAAGCAAAGAAGATCTGTCGGGAAACGGAGTGCGCGGCACCGTCCGCGGAACAAACGGAGAAGGCAGCTCCACCCCAAAGACAAGCAACGTCGATGGGAAAGAGATGATGGAGAAAATAATCTCATCTCTAGTGGGAAAGATAAATCTCGAGAACATCGAGAGGAAAGTGATAGAGGAGATCTCCGCGAAAGCGATGAAAACTCCGAAATCCCGCCGCAGAAGAGCCCCAAAGAAACAGCCGGAGAGTTCGAAAGATACTTCTCCTCGCTCTACAACTGGGAAGTACCAACCTCCCCACGTGAGGTCCCCGGCTTCCGTCACTGCGGCAAACTGCCCCAATACTACCACCCCAAGCAAAAAGAAGAATCTAGCTGGGGGAAGACCCTCGTCGGGAACCATCCCGCGTTGGGTGAGAAAACAAGCGGCTTCGGCTGGCCCAAGTTCGGCCCCGAAGCAGAACTGAAGAGCCTGCGACTGCAGGCTTCACGGTGGCTGGAACGCGCCCAGTCCGCAGAAATACCCTCTGACGCTGAGAGGGAGCGTGTGATTCAAAAGACCGCAGATGTTTACCATCCTTGCCAAACAAATGGGCCTGCGGCAACCCGAGGAGGAACACTAACCTGGAACAACTTCATGATTGATTTCAAACAGGCAGTGTTCTCGCTGGAGTTCGATGCCGGAATCGAGCTCCCCTATATTGCCTATGGCAAGCCCACACACCGTGGGTGGGTTGAAGACCAGAAACTCCTTCCAATCCTAGCTCAATTGACCTTCTTCCGACTACAGAAGATGTTGGAGGTCAATTTCGAAGATATGGGACCTGAGGAGCTGGTCCGGAACGGTTTGTGTGATCCCATCCGATTATTCGTGAAGGGTGAGCCGCACAAGCAAGCGAAGCTCGATGAAGGCCGCTACCGCCTCATAATGAGCGTTTCCCTCGTGGATCAACTGGTAGCCCGGGTTCTGTTTCAAAATCAGAACAAGCGGGAAATTGCCCTGTGGAGGGCCATCCCCAGCAAACCCGGTTTTGGCTTGTCTACGGATGAGCAAGTGCTGGACTTTGTGGAAAGTCTGGCCCGTCAAGTAGGCACCACTACGACAGAGGTGGTTGCCAATTGGAAGAATTACTTGACGCCCACGGATTGCTCCGGTTTTGACTGGAGTGTTGCGGATTGGATGCTTCACGACGACATGATCGTCCGCAACAGACTTACCATCGACCTCAACCCCGCTACAGAAAGATTAAGATCTTGCTGGTTGAGGTGCATTTCAAACTCAGTATTGTGCCTGAGTGATGGCACCCTTTTAGCCCAAATTCATCCGGGCGTTCAGAAGAGTGGGAGCTATAATACATCAAGCTCCAACTCCCGGATCCGAGTTATGGCCGCCTTCCACACAGGTGCCATCTGGGCTATGGCGATGGGTGATGATGCCCTCGAGTCCAATCCCGCTGACCTAGCAGCGTACAAGAAACTAGGTTTCAAGGTTGAGGTTTCCGGACAACTGGAATTCTGCTCTCATATCTTTAGAGCGCCGGACCTCGCCCTCCCTGTGAACGAAAATAAGATGATCTACAAACTGATCTATGGCTATAATCCAGGGAGCGGAAACGCTGAGGTAGTTTCAAACTACTTGGCCGCTTGTTTCTCAGTTCTGAACGAGTTGCGGCATGATCCAGCGTCCGTTGAACTTCTTTACTCGTGGTTAGTCGATCCGGTGCTACCACAAAAGATACCAGGAGAGTAAAGAAGAAGAAAGTCAGCTTACATTGAAATTTTAAAGAGGTTTCTGCAACAGTAAGAGACTTAAGCAAACCCAATTAAAGATACAACGGATTACAAATTCCTAGCAGGCTTCGCCGCAGGCTTCGTTTCATCGATACCAATATCCGTGATCAGTATCTATTTCATCTACCTAAGAATCTCCAAACACGTACGCGAAATCGTTAATGAATACGGTCGTGGGTAGGAGAATTATCAATGGAAGAAGACGACCACGCAGGCAAACACGACGCGCTCAGCGCCCTCAGCCAGTGGTTGTGGTCCAAACCTCTCGGGCAACACAACGCCGACCTAGACGACGACGAAGAGGTAACAACCGGACAGGAAGAACTGTTCCTACCAGAGGAGCAGGTTCGAGCGAGACATTTGTTTTCTCAAAAGACAATCTCGCGGGAAGTTCCAGCGGAGCAATCACGTTCGGGCCGAGTCTATCAGACTGCCCGGCATTCTCTAATGGAATGCTCAAGGCCTACCATGAGTATAAAATCTCAATGGTCATTTTGGAGTTCGTCTCCGAAGCCTCTTCCCAAAATTCCGGTTCCATCGCTTACGAGCTGGACCCACACTGTAAACTCAACTCCCTTTCCTCAACTATCAACAAGTTCGGGATCACAAAGCCCGGGAAAAGGGCGTTTACAGCGTCTTACATCAACGGAACGGAATGGCACGACGTTGCCGAGGACCAATTCAGGATCCTCTACAAAGGCAATGGTTCTTCATCGATAGCTGGTTCTTTCAGAATCACCATTAAGTGTCAATTCCACAACCCCAAATAGGTAGACGAGGAACCCGGCCCTAGCCCAGGGCCTTCTCCCTCTCCACAACCCACACCCCAAAAGAAATATCGTTTTATCGTCTATACTGGAGTCCCCGTGACTCGTATAATGGCTCAATCTACGGATGATGCCATCTCTTTGTATGATATGCCGTCCCAACGGTTTCGCTACATAGAGGACGAGAACATGAACTGGACGAACCTCGATTCTCGATGGTATTCCCAGAATTCTTTGAAAGCCATCCCGATGATAATAGTGCCAGTCCCTCAAGGTGAGTGGACCGTGGAAATATCGATGGAGGGGTATCAACCAACCTCAAGCACCACAGATCCTAACAAGGACAAACAAGATGGTCTCATCGCCTACAACGATGATCTTAGTGAAGGTTGGAACGTGGGGATTTACAATAATGTGGAGATAACCAACAACAAGGCCGATAATACTTTGAAGTATGGCCACCCAGACATGGAACTCAATGGCTGTCATTTCAATCAAGGACAGTGTCTGGAAAGAGATGGAGATTTGACTTGTCATATCAAGACGACTGGTGACAATGCCTCCTTCTTTGTTGTTGGACCCGCTGTCCAGAAGCAATCTAAATATAATTACGCCGTTTCGTACGGAGCCTGGACAGATCGGATGATGGAGATAGGGATGATCGCCATAGCACTTGATGAACAAGGCTCATCCGGTTCCGTAAAGACAGAAAGACCAAAGAGAGTTGGGCACTCCATGGCAGTCTCAACCTGGGAGACTATAAAATTGCCGGAGAAGGGAAACTCCGAGGGATACGAAACCAGTCAAAGACAAGACTCTAAAACTCCTCCCACAGCTAGTGGGGGTTCTGACACGCTGGACGTCGAAGAAGGAGGCTTGCCCCTTCCTGTTGAAGAAGAGATCCCCGATTTTGTTGGGGATAACCCCTGGTCTGACTTATCGACTAAGAATTCACAGGAAGAAGAGGCTATGTCATCAGAGAGTGGTCTTAGACCCCAGTTGAAGCCTCCTGGTCTGCCAAAACCTCAACCGATCAGAACGATTCGAAACTTCGATCCAACACCGGATTTGGTTGAAGCGTGGCGACCCGATGTGAACCCCGGATATTCCAAAGCAGATGTGGCAGCCGCTACTATCATCGCCGGGGGTTCCATCAAAGACGGCCGTTCTATGATTGATAAACGAAATAAAGCTGTGTTAGACGGTCGCAAGAGTTGGGGTTCCTCCTTGGCTTCCTCCCTCACGGGTGGTACGCTCAAGGCCTCCGCCAAGTCGGAGAAGCTTGCCAAACTTACCACGAGTGAAAGGGCAAGGTATGAACGGATTAAGCGTCAGCAAGGCTCCACAAGAGCCTCGGAATTCCTAGAATCACTTCTAGCTGGCGAAGACCCCGACTCAAGGTTCTGAAGGGATACAACCTGACCCTTCCCGGTCCAGATGAACCCGTCCAAATCATCATCGTCAAGCCAGGGACTTTAAACTGGAACGAATCCGTTTTACGGATAGGCAACGAGTGTTTTACGCTGGGAGAAATCCCTACGGCACTTCGGTGT
| 9,081
|
OQ632303.1
|
Turnip yellows virus
|
Parrella,G., Kwak,M., Kil,E.-J.
|
Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto per la Protezione Sostenibile delle Piante
|
Italy
|
2023-12-20
|
TuYV-ITA1
|
Turnip yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,631
|
GenBank
| null |
Italy: Campania region
|
Italy
|
Phytolacca americana
|
plant leaf
|
2021-10-26
| null | null |
Turnip yellows virus isolate TuYV-ITA1, complete genome
|
CCAGGAGGGAATCCTTAGTTGATGCAATTTCTCGCTCACGATAACTTTCACACCTTGCAAGTTAAGAAAGTTCGATTCCTCCACTCTCAACAAGAAGCGTTTCTTTTAGCAGGTTTATTGCTTAACATAAAACAATTTGTACAAGCAATCAAAGAGCACAACAATGAATTCAAAATTGACGTTTTTCTTCGCTCTTTGCTTTATCAGCTTCCTTTCCACATCGGAAGCTGCTTCCACGATGCTCTTCGAGAGCACATACCTGCCCCTGAACCAGAGCTGTGCGCCTGGTTTTCTTTACAAACGGGATACGCTCCCGCCTCCACTACAGGCTGTGCTAACCTACACGTGCCCGGAACCAAGACCTCTCGCAGAAGAATCATACAACGATCTTTTGCGAGCGATTTCTCAGAAAAGCTCAAGCGATTTCCAGAATGCCTATTCGTTAGCCTTGAGTTTTTCCAGCGACTTCTATCAACATGGACTAAAGACATTGAAAGACGTGTCCTTTCTGGCTGTCGAGAAATTCCTTTGGGGTCTGACACGCTTATGGAGCTCGTTAATCTTGGCGAGCTTCTCCGCGTTATGGTGGTTGGTGAGCAATTTCACAACTCCCGTCTTCTGTCTCGCCTTGCTGTACACTGTTACAAGATTTATGGTGAAGACGGTTTCATTTCTTTTTGGAGGATTGCCAATCTGGATCATTTCGATTGCTTTCTCACTCCTGAAGAAATCCTTTTCAGCTCTTCGGTCTACACCGAAATGTTTGTATGAGAAGGCTATAGACGGTTTCAAGAGTTTCACTATCCCGCAGAGTCCTCCAAAATCTTGCGTGATTCCTATCACCCACGCAAGCGGAAACCACGCTGGTTATGCCAGTTGTGTCAAGCTGTACAACGGAGAAAATGCTTTAATGACGGCGACCCACGTTCTACGTGATTGTCCCAATGCCGTGGCTGTTTCCGCTAAAGGGCTCAAGACTCGGATTCCACTCGCTGAATTCAAAACAATCGCGAAATCCGACAAAGGTGATGTTACCCTCCTTCGCGGCCCCCCCAATTGGGAAGGACTGTTAGGCTGTAAAGCGGCCAACATCATAACTGCTGCTAACCTAGCGAAATGCAAAGCAACCATATACTCTTTTGACAGAGATGGCTGGGTTGGCAGTTATGCCGAGATTGTGGGCTCAGAAGGCACGGATGTTATGGTTCTGAGCCACACGGAAGGAGGACACTCCGGAAGCCCCTATTTCAATGGTAAAACCATTTTGGGGGTTCACTCAGGTGCCAGTGCTACTGGAAATTACAATTTAATGGCACCAATCCCATCCCTCCCCGGGCTTACCAGTCCGACTTATGTGTTCGAAACCACCGCACCACAAGGAAGAGTTTTCGCACAAGAAGATATCGCCGAAATCGAAGGCCTTTATGCGCAAGTAATGAAAAGAGTTCAACAAACGGAAGATTTCAAACCCAAAACTGGAAAGTACTGGGGTGATATGGAGGATGATGAAGACATTTTCTTCGAAAGCAAAGAAGATCTGTCGGGAAACGGAGTGCGCGGCACCGTCCGCGGAACAAACGGAGAAGGCAGCTCCACCCCAAAGACAAGCAACGTCGATGGGAAAGAGATGATGGAGAAAATAATCTCATCTCTAGTGGGAAAGATAAATCTCGAGAACATCGAGAGGAAAGTGATAGAGGAGATCTCCGCGAAAGCGATGAAAACTCCGAAATCTCGCCGCAGAAGAGCCCCAAAGAAACAGCCGGAGAGTTCGAAAGATACTTCTCCTCGCTCTACAATTGGGAAGTACCAACCTCCCCACGTGAGGTCCCCGGCTTCCGTCACTGCGGCAAGCTGCCCCAATACTACCACCCCAAGCAAAAAGAAGAATCCAGCTGGGGGAAGACCCTCGTCGGGAACCATCCCGCGTTGGGTGAGAAAACAAGCGGCTTCGGCTGGCCCAAGTTCGGCCCCGAAGCAGAACTGAAGAGCCTGCGTCTGCAGGCTTCAAGGTGGCTGGAACGCGCCCAGTCCGCAGAAATACCCTCTGACGCTGAGAGGGAGCGTGTGATTCAAAAGACCGCAGATGTTTACCATCCCTGCCAAACCAATGGACCTGCGGCAACCCGAGGAGGGACACTGACCTGGAACAACTTCATGATAGATTTCAAACAGGCTGTGTTCTCGCTGGAGTTCGACGCCGGAATAGGCGTCCCCTATATTGCTTATGGCAAGCCCACGCATCGTGGGTGGGTTGAAGATCAGAAACTCCTCCCAGTTCTAGCTCAATTGACCTTCATCCGATTACAGAAGATGTTGGAGGTCAATTTCGAAGATATGGAACCAGAGGAGCTGATCCGGAACGGTTTGTGCGACCCCATCCGATTATTCGTGAAGGGTGAGCCGCACAAGCAAGCGAAGCTCGATGAAGGCCGCTACCGCCTCATAATGAGCGTTTCCCTCGTGGATCAACTGGTAGCCCGGGTTCTGTTTCAAAATCAGAACAAGCGGGAAATTGCCCTGTGGAGGGCCATCCCCAGTAAACCCGGTTTTGGCTTGTCCACGGACGAGCAAGTGCTGGACTTCGTGGAAAGTCTGGCCCGTCAAGTAGGCACCACTACGACAGAGGTGGTTGCCAATTGGAAGAATTACTTGACGCCCACGGATTGCTCCGGCTTTGACTGGAGTGTTGCGGATTGGATGCTTCACGACGACATGATCGTCCGCAATAGACTTACCATCGACCTCAACCCCGCTACAGAAAGATTAAGATCCTGCTGGTTGAGGTGCATTTCGAACTCAGTATTGTGCCTGAGTGATGGTACCCTTTTAGCCCAAACTCATCCGGGCGTTCAGAAGAGTGGGAGCTACAACACATCAAGCTCCAACTCCCGGATCCGAGTTATGGCCGCCTTCCACACAGGTGCCATTTGGGCTATGGCGATGGGTGATGACGCCCTCGAGTCCAATCCCGCTGACCTAGCAGCGTACAAGAAACTAGGCTTCAAGGTTGAGGTTTCCGGACAACTGGAATTCTGCTCTCACATTTTTAGAGCGCCGGACCTCGCCCTCCCTGTGAACGAAAATAAGATGATCTACAAATTGATCTATGGCTATAATCCAGGGAGCGGAAACGCTGAGGTAGTTTCAAACTACTTGGCCGCTTGTTTCTCAGTTCTGAACGAGTTGCGGCATGATCCAGCGTCCGTTGAACTTCTTTACTCGTGGTTAGTCGATCCGGTGCTACCACAAAAGATACCAGGAGAGTAAAGAAGAAGAGAGTCAGCTTACATTGAAATTTTAAAGAGGTTTCTGCAACAGTAAGAGACTTAAGCAAACCCAATTAAAGATACAACGGATTACAAATTCCTAGCAGGTTTCGCCGCAGGCTTCGTTTCATCGATACCAATATCCGTAATCAGTATCTATTTCATCTACCTAAGAATCTCCAAACACGTACGCGAAATCGTTAATGAATACGGTCGTGGGTAGGAGAACAATCAATGGAAGAAGACGACCACGCAGGCAAACACGACGCGCTCAGCGCTCTCAGCCAGTGGTTGTGGTCCAAACCTCTCGGGCAACACAACGCCGACCTAGACGACGACGAAGAGGTAACAACCGGACAGGAAGAACTGTTCCTACCAGAGGAGCAGGTTCGAGCGAGACATTTGTTTTCTCAAAAGATAATCTCGCGGGAAGTTCCAGCGGAGCAATCACGTTCGGGCCGAGTCTATCAGACTGCCCGGCATTCTCTAATGGAATGCTCAAGGCCTACCATGAGTATAAAATCTCAATGGTCATTTTGGAGTTCGTCTCCGAAGCCTCTTCCCAAAATTCCGGTTCCATCGCTTACGAGCTGGACCCACACTGTAAACTCAACTCCCTTTCCTCAACTATCAACAAGTTCGGGATCACAAAGCCCGGGAAAAGGGCGTTTACAGCGTCTTACATCAATGGAACGGAATGGCACGACGTTGCCGAGGACCAATTCAGGATCCTCTACAAAGGCAATGGTTCTTCATCGATAGCTGGTTCTTTCAGAATCACCATTAAGTGTCAATTCCACAACCCCAAATAGGTAGACGAGGAACTCGGCCCTAGCCCAGGGCCTTCTCCCTCTCCACAACCCACACCCCAAAAGAAATATCGTTTTATCGTCTATACTGGAGTCCCCGTGACTCGTATAATGGCTCAATCTACGGATGATGCCATCTCTTTGTGTGATATGCCGTCCCAACGGTTCCGCTACATAGAGGACGAAAACATGAACTGGACGAACCTCGATTCTCGATGGTATTCCCAGAATTCTTTGAAAGCCATCCCGATGATAATAGTGCCAGTCCCTCAAGGTGAGTGGACTGTGGAAATTTCGATGGAGGGGTATCAACCAACCTCAAGCACCACAGATCCTAACAAGGACAAACAAGATGGTCTCATCGCTTACAACGATGATCTTAGTGAAGGTTGGAACGTGGGGATTTACAACAATGTGGAGATAACCAACAACAAGGCCGATAATACTTTGAAGTATGGCCACCCAGACATGGAACTCAATGGCTGTCATTTCAATCAAGGACAGTGTCTGGAAAGAGATGGAGATTTGACTTGTCATATCAAGACGACTGGTGACAATGCCTCCTTCTTTGTTGTTGGACCCGCTGTCCAGAAGCAATCTAAGTATAATTACGCCGTTTCGTACGGAGCCTGGACAGATCGGATGATGGAGATAGGGATGATCGCCATAGCACTTGATGAACAAGGCTCATCCGGTTCCGCAAAGACAGAAAGACCAAAGAGAGTTGGGCACTCCATGGCAGTCTCAACCTGGGAGACTATAAAATTGCCGGAGAAGGAAAACTCCGAGGGATGCGAAACCAGTCAAAGACAAGACTCTAAAACTCCTCCCACAGCTAGTGGGGGTTCCGACACGCTGGACGTCGAAAAAGGAGGCTTGCCCCTTCCTGTTGAAGAAGAAATCCCTGATTTTGTTGGGGATAACCCTTGGTCTGACTTATCGACTAAGAATTCACAGGAAGAAGAGGCTATGTCGTCAAAGAGTGGTCTTAGACCCCAGTTGCAGCCTCCTGGTCTGCCAAAACCTCAACCAATCAGAACGATTCGAAACTTCGATCCAACACCGGATTTGGTTGAAGCATGGCGACCCGATGTGAACCCCGGATATTCCAAAGCAGATGTGGCAGCTGCCACTGTCATCGTCGGGGGTTCCATCAAAGACGGCCGTTCTATGATTGATAAACGAAACAAAGCTGTGTTAGACGGTCGCAGGAGTTGGGGTTCCTCCTTGGCTTCCTCCCTCACGGGTGGAACGCTCAAGGCCTCCGCAAAGTCGGAGAAGCTTGCCAAACTTACCACGAGTGAAAGGGCAAGGTATGAACAGATTAAGCGTCAGCAAGGCTCCACAAGAGCCTCAGAATTCCTAGAATCACTTCTAGCTGGCGAAGACCCCGACTCAAGGTTCTGAAGGGATACAACTTGACCCTTCCCGGTCCAGATGAACCTGTCCAAATCATCATCGTCAAGCCAGGGACTTTAAACTGGAACGAATCCGTTTTACGGATAGGCAACGAGTGTTTTACGCTGGGAGAAATCCCTACGGCACTTCGGTGT
| 10,142
|
OQ632304.1
|
Turnip yellows virus
|
Parrella,G., Kwak,M., Kil,E.-J.
|
Consiglio Nazionale delle Ricerche, Istituto per la Protezione Sostenibile delle Piante
|
Italy
|
2023-12-20
|
TuYV-ITA2
|
Turnip yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,655
|
GenBank
| null |
Italy: Campania region
|
Italy
|
Phytolacca americana
|
plant leaf
|
2021-10-26
| null | null |
Turnip yellows virus isolate TuYV-ITA2, complete genome
|
CCAGGAGGGAATCCTAAGTAGATGCAATTTGTTGCTCACGATAACTTTCACACTCTAGAAGTCAGGAAAGTCAGATACCTCCATCCACAACAAGTATTGTTTCTTTTAGCAGGTTTATTGCTTAACATCAAACGATTTGTAAAAGCGATCCAAGAGCGTAACAATGAGTTCAAAACTGATGTTTTTCTTCGCTCTTTGCTTTATCAGCTTCCTTTCCACATCGGAAGCTGCTTCCACGATGCTCTTCGAGAGCACATACCTGCCCCTGAACCAGAGCTATGCGCCCGGTTTTCTTTACAAACGGGATATGCTCCCGCCTCCACCTCAGGCCGTATTGACTTACACGTGCCAGGAACCCAGACCTCTCGTAGAAGAATCATACAACGATCTTTTGCGAGCAATTTCTCAGAAAAGCTCAAGCGATTTCCAGAATGCTTATTCGTTAGCCTTGAGTTTTTCCAGCGATTTCTGTCAATCTGGACTAGAGACGCTGAAAGACGCCTCTTTTCTGGCTGTCGAGAAATTCCTGTGGGGTCTCACACGCTTGTGGAGCTCACTCATATTGGCGAGCTTCTCCATGATATGGTGGTTGGTGAGAAATTTCACGACTCCCGTCTTCTGTCTCGCCTTGCTGTACACTGTTACAAGATTTATGGCGAAGATGGTTTCATTTCTTTTTGGAGGATTGCCAATTTGGATCATCTCGATTATTTTCTCACTCCTGAAGAAATCCTTTTCAGCTCTTCGGTCTACGCCGAAATGTTTGTATGAAAAGGCTATAGACGGTTTTAAGAGTTTTACTATCCCGCAAAGCCCACCCAAATCTTGCGTGATTCCCATCACCCACGCAAGCGGAAACCACGCTGGTTATGCCAGCTGTGTGAAGCTGTACAATGGCGAGAATGCTTTGATGACGGCGACCCACGTTTTACGTGACTGCCCCAATGCTGTAGCTGTTTCCGCCAAAGGGCTCAAAACTCGGATCCCACTTGCTGAATTTAAAACGATTGCGAGATCCGACAAAGGTGATGTAACCCTCCTCCGTGGCCCCCCTAATTGGGAAGGATTGTTGGGCTGCAAAGCGGCCAACGTCATAACGGCCGCCAACCTAGCGAAATGCAAAGCGTCCATATACTCTTTCGAGAGAGACGGCTGGGTTAGCGGCTATGCTGAGATTGTAGGCTCTGATGGCACCGATGTTATGGTACTGAGCCACACGGAAGGAGGACACTCCGGAAGCCCCTACTTTAATGGCAAAACTATTTTGGGGGTCCACTCGGGTGCCAGTGCTACTGGAAACTACAACCTAATGGCACCAATCCCATCCATCCCCGGTCTTACAAGCCCCACTTATGTGTTTGAAACCACCGCACCACAAGGAAGAGTTTTCGCACAAGAAGATATCGCCGAAATCGAAGGCCTTTATGCGCAAGTAATGAAAAGAGTTCAACAAACGGAAGATTTCAAGTCCAAAACTGGAAAGAACTGGGCTGATGAGGATGATGATGATATCTTCTTCGAAAGCAAAGAAGATTTTTCGGGAAACGGAGTGCGCGGCGCCGACCGCGAAACAAACGGCGAAGGCAGCTCCACCCCAAAGACAAACAACGTCGATGGGAAAGAGATGATGGAGAAAATAATCTCGTCTCTAGTGGGAAAGATAAATCTCGAGAACATCGAGAAGAAAGTGGTCGAACAGATCTCCGCGAAAGCGATGAAGAAACCAAGACCCAGCCGCAGAAGAGCCCCAAAGAAACAGCCGGAGAGTTCCAAAGATACTTCTCCTCGCTCTACGACTGGGAAGTACCAACCTCCCCACGTGAGGTCTCCGGCTTCCGCCACTGCGGCAAGCTGCCCCAATACTACCACCCCAAGCAAAAAGAAGAATCAAGCTGGGGGAAAACCCTCGTCGGGAACCATCCCGCGTTGGGTGAGAAAACAAGCGGCTTCGGCTGGCCCAAGTTCGGTCCCGAAGCAGAATTGAAAAGCCTGCGTCTGCAGGCCTCAAGGTGGCTGGAACGCGCCCAGTCCGCAGAAATACCCTCTGACGCTGAGAGGGAGCGTGTGATTAAAAAGACCGCGGATGTTTACCATTCTTGCCAAACTAATGGACCCGCGGCGACCCGAGGAGGAGCACTGACCTGGAATAATTTTATGATTGATTTCAAACAGGCTGTGTTCTCGCTTGAGTTCGATGCTGGAATAGGCGTCCCCTATATTGCCTATGGCAAGCCCACGCATCGTGGGTGGGTTGAAGACCAGACACTCCTCCCAGTCCTAGCTCGATTGACCTTCATCCGACTACAGAAGATGTTGGAGGTTAATTTTGAAGATATGGGACCTGAGGAGCTGGTTCAGAACGGCTTGTGCGATCCAATCAGATTGTTCGTAAAAGGTGAACCCCACAAGCAAGCGAAGCTCGATGAAGGCCGCTACCGCCTCATTATGAGTGTTTCCCTCGTGGATCAATTGGTGGCCCGGGTTCTGTTTCAAAATCAGAACAAGCGGGAAATCGCCTTATGGAGGGCTATCCCCAGTAAACCCGGTTTTGGCTTGTCCACGGATGAGCAAGTGCTGGACTTTGTAAAAGGTCTGGCCCGTCAAGTAGGCACTACAACAGAAGATGTGGTTGCCAATTGGAACAATTACTTGACGCCCACGGATTGCTCTGGTTTTGACTGGAGTGTTGCGGATTGGATGCTTCATGATGATATGATCGTCCGCAACAGACTTACCATCGACCTCAACCCCGTAACAGAAAGATTAAGATCCTGTTGGTTGAGATGTATTTCAAACTCAGTTTTATGCTTGAGCGATGGTACCCTTTTAGCCCAAACCCATCCGGGCGTTCAGAAAAGTGGGAGCTACAACACATCAAGCTCCAACTCCCGGATCAGAGTTATGGCCGCCTTTCACACAGGTGCTGCCTGGGCTATGGCGATGGGTGACGACGCCCTCGAGTCCAATCCCGCTGACCTAGCAGCGTACAAAAGACTAGGATTCAAGGTAGAGGTTTCCGAACAACTGGAATTCTGCTCTCACATTTTTAGAGCGCCGGACCTCGCCCTCCCTGTGAATGAAAACAAAATGATCTACAAGTTGATCCATGGCTACAACCCAGGGAGCGGAAACGCCGAGGTAGTTTCCAACTACTTAGCCGCCTGTTTCTCAGTTCTGAACGAGTTGCGGCATGATCCGGCGTCCGTTGAACTTCTTTACTCGTGGTTAGTTGACCCAGTGCTACCACAAAAGATATCCAGAGAGTAAAGAAGCAAACAAGTCAGCTTACATTGAAATTCTAAAGAGGTTTCTGCAACAGTAAGAGACTTAAGCAAACCCACTGAAAGATACAACGGATTACAAATTCCTAGCAGGCTTTGCCGCAGGCTTCGTTTCATCGATACCAATATCCGTGATCAGTATCTATTTCATCTACCTAAGAATCTCCAAACACGTGCGCGAAATCGTTAATGAATACGGTCGTGGGTAGGAGAACAATAAATGGAAGAAGACGACCACGCAGGCAAACACGACGCGCTCAGCGCTCTCAGCCAGTGGTTGTGGTCCAAACCTCTCGGACAACACAACGCCGACCTAGACGACGACGAAGAGGTAACAACCGGACAGGAAGAACTGTTTCTACCAGAGGAGCAGGTTCGAGCGAGACATTTGTTTTCTCAAAAGACAATCTCGCGGGAAGTTCCAGCGGAGCAATCACGTTCGGGCCGAGTCTATCAGACTGCCCGGCATTCTCTAATGGAATGCTCAAGGCCTACCATGAGTATAAAATCTCAATGGTCATTTTGGAGTTCATCTCAGAGGCCTCTTCCCAAAGTTCCGGTTCCATCGCTTACGAGCTGGACCCACACTGTAAACTCAACTCCCTTTCCTCAACAATTAACAAATTCGGGATCACAAAGCCCGGGAAGAGGACGTTTACAGCGTCTTACATCAACGGGGCGGAATGGCACGACATTGCCGAGGACCAATTCAGGATCCTCTACAAAGGCAATGGTTCCTCATCGCCAGCCGGTTCTTTCAGGATCACCATAAGATGCCAATTCCACAACCCCAAATAGGTAGACGAGGAACCTAGCCCTAGTCCAGGGCCAAGCCCCCAACCAACACCAACACCAACCAAAGAGTACAGATGGATAGTTTACACTGGCGTCTGTAGAACTCTAATAAAAGCCCAGACAACGGACGATTCAATCTATCTGTACGATCTGGGTTCCCAACGCCTCCGGTATATTGAAAATGAAAACATGAACTGGACCAACGTGGACGCCCGCTGGTATTCAAACAGCAATGTTAAAGCGGTTCCCATGTATGTGTTTACAGTCCCGGAAGGAACATGGTCAGTTGAGATATCAACAGAAGGTTACCAACCTACAGCAAGTACCACTGACCCAAACAAGGGAAAGGTTGATGGCATGATTGCCTATTCTGATGATCAATCAGAAGTGTGGAATGTTGGAATAAATCAAAACTGTAACATCACAAACCTGAAAGCAGACAATTCCTGGAAGTATGGGCACCCTGATATGGAAATAAACAATTGCCACTTCAACCAGGGACAGGTATTGGAAATGGATGGTACAGTCTCCTTTCACGTTGAGACCACTGGTGACAATGCATCATTTTTCCTAGTTGGTCCGGCAGTCCAAAAGTTGTCAAAATACAATTACGCCGTCTCATATGGAGCGTGGACAGACCGTGATATGGAGTTGGGCTTGATCACAGTTTCTTTGGATGAAAGAGACGAGTCAAGAGGTTCCGCCCTGAAAAGACCTCGTCGAGAAGGACACTCGAAGGCAGTCTCCACCTGGGAGACTATAAACTTACCGGAGAAGGAAAACTCCGAGAAAACTGAAACCGGTCAAAGACAAGACCTTAAAACTCCTGTTTTAATCAAAACAGTGTCTGATTCTGGTTCAGACGCAGGTTCTGCACAGGACAATGAAATCCCTGACAACTTGGAAGATGATCCTTGGGGAGGCATCACGGAGGCTAGCAAGCGTCCTGAAACAGAAGATGATGTCCCTCCTCAAGAGACCAAGTCTATCGGTGCTCTTGAACGCTTCAAGCGGTCGGGCAAACCACCCTTAAGAGGCCCCAACCGAACAGTGACTACATTTCAACCCGAGAGTGATCTCTTGGAGGCTTGGGATCCACCACATTTCAACCCCGGTTATACCAAAGAAGACGTCGCAGCAGCGACGATCTTAGCGGGTGGAGATGTTTGGGATGGCAGGGAGATGCTTCAGAAACGAGATGATCAAATTCAAAGGAAGCGCAAATCCTGGGTTCCCTCTTTTGGAGGAAGTAAAACATCTACTCTTCAAGGTGGCTCTTTGCGACAAAGTAAAAACAGTGAGGCTTTATCTCACTTAACCACAGAGCAAAGACGCGAATATGAGGGAATTAAACGCCAGCAAGGTACGACACGAGCTTCAGAATTCTTAAAGCGGATTCTCGCTGGCAGTGAACCTTAACCTAAAACAGTTTCCACAGTACTCAACTGTGCTCGTTGGTAGTGATACGAGGCGAAAATCAAAACTACCCATTTTAGCATTAAATATTATAGCTAATAAAGTCAAGCCAGAGACATTAAACTGGAACGACTCCGCTTTGCGGATAGGCAACGAGTGTTTT
| 10,143
|
OR536957.1
|
Turnip yellows virus
|
Zamorano,A., Carevic,P., Gamboa,C., Cui,W., Curkovic,T., Cordova,P., Higuera,G., Fiore,N.
|
Universidad de Chile, Sanidad Vegetal
|
Chile
|
2023-12-18
|
TuYV_Cil_Cl
|
Turnip yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,679
|
GenBank
| null |
Chile
|
Chile
|
Coriandrum sativum
| null |
2020-03
|
SAMN37340031
|
PRJNA1014719
|
MAG: Turnip yellows virus isolate TuYV_Cil_Cl, complete genome
|
ACTGTATTTGACAAAAAGTGCAAAGGGAATCCTAAGTAGATGCAATTTGTTGCTCACGACAACTTTCACACTCTAGAAGTCAGGAAAGTCAGGTACCTCCATTCACGACAAGTAACGTTTCTTTTAGCAGGTCTTTTGCTTAATATCGAACAATTCGTAAAAGCAATCAAAGAGCGCAATAATGAATTCAAAATTGATGTTTTTCTTCGCTCTCTGCTCTATCAGCTTCCTCTCCACCTCGGAGACCACGTCCACGATGACGTTAGGAAGTCTTTACTTGTCCCCGAACCAGAGCTTTGTGCCTGGTTCTCTTTACAAACGGGATATGCTCCCGCCTCCACCTCAGGCCGTGTTAACTTATACGTGCCAGGAACCAAGACCTCTCGCAGACGAATCATACAACGATCTCTTGCGAGCAATTTCTCAGAAAAGTTCAAGCGATTTCAAGAATGTTTATTCGTTGGCCTTGAACATTTCCAGCGATTTCTGTCTATCTGGACTAGAGATGCTGAAAGACGCCTCTTTTCTGGCTGTCGAGAAATTCCTGTGGGGTCTCACACGCTTGTGGAGCTCGCTAATTTTGGCGAGCTTCTCCGCGTTATGGTGGCTAATGAGCAATTTCACAACTCCCGTCTTCTGTCTCGCCTTGCTGTACACTGTTACAAGATTTATGGTGAAGACGGTTTCATTTCTTTTTGGAGGATTGCCAATCTGGATTATCTCGATTGTTTTCTCACTCCTGAAGAAATCCTTTTCAGCTCTTCGGTCTACACCGAAATGTTTGTATGAGAAGGCTATAGACGGTTTTAAGAGTTTCACTATCCCGCAGAGCCCACCAAAATCTTGCGTGATCCCCATCACCCACGCAAGCGGAAACCACGCTGGCTACGCCAGCTGCGTCAAGCTGTACAATGGAGAAAATGCGTTGCTGACAGCGACACACGTCTTACGTGATTGTCCCAACGCTATAGCTGTTTCCGCCAGAGGGCTCCAAGCTCGGATTCCACTTGCTGAATTCAAAACAATCGCAAAATCCGACAAAGGTGATGTCACCCTTCTTCGCGGCCCCCCCAACTGGGAAGGACTGTTAGGCTGCAAAGCGGCCAACGTCATTACCGCTGCCAACCTTGCGAAATGCAAAGCAACTATTTACTCTCTTGAGAAGGACGGTTGGGCATGCGGCTATGCCGAGATAGTTGGTTCAGATGGCACTGATGCCACGGTTCTGAGCCAGACAGAAGAAGGACACTCCGGAAGCCCCTACTTTAATGGCAAAACCATTTTAGGGGTTCACTCAGGTGCAAGTAAGAAAAGAAATTACAATTTAATGGCACCAATCCCGTCCATCCCTGGGCTCACGAGCCCTACGTACGTGTTTGAGACAACCGCACCGCAAGGTCGGATTTTCGCACAAGAGGACATCGCTGAGATCGAGAATCTCTACTCAGAGTATAAACGATTACAAAATTTCAAGTCCAAAACTGGAATGACCTGGGGCGATGTAAGCGAGGATGACGACATCTTCTTCGAAAGCAAAGAAGATTTTTCGGGAAACGGAGTGCGCGGCGCCGACCGCGAAACAAACGGCGAAGGCAGCTCCACCCCAAAGACAAACAACGTCGATGGGAAAGAGATGATGGAGAAAATAATCTCGTCTCTAGTGGGAAAGATAAATCTCGAGAATATCGAGAAGAAAGTGGTCGAACAGATCTCCGCGAAAGCGATGAAGACACCAAGACCCAACCGCAGAAGAGCCCCAAAGAAACAGCCGGAGAGTTCGAAAGATACTTCTCCTCACTCTACGACTGGGAGGTATCAACCTCCCCATGTGAGGTCCCCGGCTTCCGTCACTGCGGCAAGCTGCCCCAATACTACCACCCCAAGCAAAAGGAAGAATCACGCTGGGGGAAGACGCTCATCGGGATCCATCCCGCATTGGGTGAGAAAACAAGCGGCTTCGGCTGGCCCAAGTTCGGCCCCGAAGCAGAACTAAAGAGCCTGCGACTGCAGGCTTCACGGTGGCTGGAACGCGCCCAGTCCGCAGAAATACCCTCTGACGCTGAGAGGGAGCGTGTGATTCAAAAGACCGCAGATGTTTACCATCCTTGCCAAACTAACGGACCTGCGGCAACCCGAGGAGGAACACTGACCTGGAACAACTTCATGATAGATTTCAAACAGGCCGTGTTCTCGCTAGAGTTCGATGCCGGAATAGGCGTCCCCTATATTGCCTATGGCAAACCCACGCATCGTGGGTGGGTAGAAGATCAGAGACTCCTCCCAGTCCTAGCTCAGTTGACCTTCATCCGACTACAGAAGATGTTGGAGGTTAACTTCGAAGCCATGGGACCTGAGGAGCTGATCCGGAACGGTTTGTGCGATCCCATCCGATTATTCGTGAAAGGTGAACCGCATAAACAAGCGAAGCTCGATGAAGGCCGCTACCGCCTCATCATGAGCGTTTCCCTCGTGGATCAATTGGTAGCCCGGGTACTGTTTCAAAACCAAAACAAGCGGGAAATTGCCTTATGGAGGGCCGTCCCCAGTAAACCCGGTTTTGGCTTGTCTACGGACGAGCAAGTGCTGGACTTCGTAAATTGTTTGGCCCGTCAAGTTGGAACTACAACGTCTGAAGTTATCACAAACTGGAAAGAGTACTTGACGCCTACGGATTGCTCCGGTTTTGACTGGAGTGTTGCGGACTGGATGCTCCAAGACGATATGATCGTCCGCAATAGACTTACCATCGACCTCAACCCTGTTACAGAAAGATTAAGATCCTGTTGGTTGAGATGTGTTTCAAACTCAGTTTTGTGTCTGAGTGATGGTACCCTTTTAGCCCAAACCTATCCGGGCGTTCAGAAAAGTGGGAGCTACAATACATCAAGCTCCAACTCCCGGATTAGAGTCATGGCCGCCTTTCACACAGGTGCTGCCTGGGCTATGGCGATGGGTGATGATGCCCTCGAGTCCAATCCCGCTGACCTAGCAGCGTATAAAAGACTAGGTTTCAAGGTTGAGGTTTCCGGACAACTGGAATTCTGCTCTCATATCTTTAGAGCGCCGGACCTCGCCCTCCCTGTGAATGAAAATAAGATGATCTACAAACTGATCTATGGCTACAATCCAGGGAGCGGAAACGCTGAGGTAGTTTCAAACTACTTGGCCGCTTGCTTCTCAGTTCTGAACGAGTTGCGGCATGATCCAGCGTCCGTTGAACTTCTTTACTCGTGGTTAGTCGACCCAGTGCTACCACAAAAGATATCCAGGGAGTAAAGAAGAAAGAAAGTTAGCTTACATTGAAATTTTAAAGAGATTTCTGCAACAGTAAGAGACTTAAGCAAATCCAACAAAAGATACAACGGATTACAAATTCCTAGCAGGTTTCACCGCAGGCTTCGTTTCATCGATACCAATATCCGTGATCAGTATCTACATAATCTACCTAAGAATCTCCAAACACGTGCGCGAAATTGTTAATGAATACGGTCGTGGGTAGGAGAACAATCAATGGAAGAAGACGACCACGGAGGCAAACACGACGCGCTCAGCGCTCTCAGCCAGTGGTTGTGGTCCAAACCTCTCGGGCAACACAACGCCGACCTAGACGACGACGAAGAGGTAATAACCGGACAAGAGGAACTGTTCCTACCAGAGGAGCAGGCTCAAGCGAGACATTTGTTTTCTCGAAAGACAATCTCGCGGGAAGTTCCAGCGGAGCAATCACGTTCGGGCCGAGTCTATCAGACTGCCCAGCATTCTCTAATGGAATACTCAAGGCCTACCATGAGTATAAAATCTCGATGGTCATTTTGGAGTTCGTCTCCGAAGCCTCTTCCCAAAACTCCGGTTCCATCGCTTACGAGCTGGACCCACACTGTAAACTCAACTCCCTTTCCTCAACTATCAACAAATTCGGGATCACAAAGCCCGGGAAAGCGGCGTTTACAGCGTCTTACATCAACGGAAAGGAATGGCACGACGTTGCCGAGGACCAATTCAGGATCCTCTACAAAGGCAATGGTTCTTCATCGATAGCTGGTTCTTTTAGAATCACCATCAAGTGCCAATTCCACAACCCCAAATAGGTAGACGAGGAACCCGGCCCTAGCCCAGGGCCTTCTCCCTCTCCACAACCCACACCCCCAAAGAAATATCGTTTTATCGTCTATACTGGAGTCCCAGTGACTCGTATAATGGCTCAATCCACGGATGATGCCATCTCTTTGTACGACATGCCGTCCCAACGGTTTCGTTACATAGAGGACGAGAACATGAACTGGACGAACCTCGATTCTCGATGGTATTCCCAGAATTCTTTAAAAGCCATCCCGATGATAATAGTACCAGTCCCTCAAGGTGAGTGGACTGTGGAAATTTCGATGGAGGGGTATCAGCCAACCTCAAGCACCACAGATCCTAATAAGGACAAACAAGACGGTCTCATCGCTTACAACGATGACCTCAGTGAAGGTTGGAATGTGGGGATTTACAATAATGTGGAGATAACCAACAACAAGGCCGACAACACTTTGAAATACGGCCACCCAGACATGGAACTTAACGGCTGTCACTTTAACCAAGGACAGTGTCTGGAGAGAGATGGAGATTTGACTTGTCACATCAAGACAACTGGTGACAATGCCTCCTTCTTTGTTGTTGGACCCGCTGTCCAGAAGCAATCCAAATATAATTATGCCGTTTCGTACGGAGCCTGGACAGATCGGATGATGGAGATAGGGATGATTGCCATAGCACTTGATGAACAAGGCTCATCCGGTTCCGCAAAGACAAAAAGACCAAAGAGAGTTGGGCACTCCATGGCAGTCTCAACCTGGGAGACTATAAACTTGCCGGAGAAGGAAAACTCCGAGGAAATTCAAACCAGTCAAAGACAAGACTTTAAAACTCCTCCCACAGCTGGTGGGGGTTCCGATATGCTGGATGTCGAAGGAGGAGGCTTGCCCCTTTCTGTTGAGGAGGAAATCCCCGATTTTGTTGGGGACAACCCTTGGTCTAACATAACGACCGAAAATTCACAGGAAGAAGAGGCTATGTCGTCAAAGAGTGGTCTTGCACCCCAGTTGAAGCCTCCCGGTCTGCCAAAACCACAACCGATCAGAAGACTCAAAAGTTTTGATGCAACAGCAGATTTGGTTGAAGCGTGGCGACCCGATGTGAACCCCGGATATTCTAAAGCCGATGTGGCAGCTGCCACTATCATTGCTGGGGGTTCTATTAAAGACGGCCGTTCTATGATCGATAAACGAGACAAAACTGTGTTAGACGGTCGCAAGAGTTGGGGTTCCTCCTTGGCTTCCTCCTTGATAGGTGGAACGCTTAAGGCCTCCGCAAAGTCGGAGAAGCTCGCCAAGCTCACTACAAGTGAAAGGGCGAGATTTGAACAAATAAAGCGTCAGCAAGGCTCTGTGCGAGCCTCGGAATTTCTCGAACAAATTTTAGCTGGCGAAGAACCCGACCCGAAGTTCTTAAGAACTCGATAGTTTCCACAGTACTCAACTGTGCTCGTTGGTAGTGATACGAGGCGAAAATCAAAACTACCCTTATCTAGCTTTATTAATATTTAGCTAATAAAGTCAAGCCAGAGACATTAAACTGGAACGACTCCGCTTTGCGGATAGGCAACGAGTGTTTTACGCTGGGATAACTCCCTACGGC
| 10,173
|
OQ377541.1
|
Turnip yellows virus
|
Filardo,F., Congdon,B., Sharman,M.
|
Queensland Department of Agriculture and Fisheries, Queensland Department of Agriculture and Fisheries
|
Australia
|
2023-06-05
|
5594
|
Turnip yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,632
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Brassica rapa subsp. pekinensis
| null |
2019-09-11
| null | null |
Turnip yellows virus isolate 5594, complete genome
|
CAGGAGGGAATCTTAAGTTGATGCAGTTTGTTGCTCACGATAACTTTCACACTCTAGAAGTAAGAAAAGTCAGATACCTCCATCCGCGACAAGTAACGTTTCTTTTAGCTGGTTTATTGCTTAACATCGAACAATTTGTAAAAGCAATCCGAGAGCGCAACAATGAATTCAAAATTGATGTTTTCCTTCGTTCTCTTCTTTACCAGCTTCCTCTATACCTCGGAGACCACATCCACGATGATGCTCGAGTTTCCGTACTTGTTGCTGAACCAGAGCTCTGTGCCTGGTTTTCATTACAAACGGGATACGCTCCCGCCTCCACCTCAGGCCGTGTTAACACACACGTGCCTGGAACCAAGACCTCTCGTAGAAGAATCATACAACGATCTTTTGCGAGCAATTTCTCAGAAAAGTTCAAGCGATTTCCAGAATGTTTATTCGTTAGCCTTGAACATTTCCAGCGACTTCTGTCAATCTGGACTAAAGACGCTGAAGAGCGCCTCTTTTCTGGCTGTCGAGAAATTTCTGTGGGGTCTCACACGCTTGTGGAGCTCGCTAATCTTGGCGAGCTTCTCCGCGTTATGGTGGCTGGTGAGCAATTTCACAACTCCCGTCTTCTGTCTCGCCTTGCTGTACACTGTTACAAGATTTATGGTGAAGACGGTTTCATTTCTTTTTGGAGGATTGCCAATCTGGATCATTTCGATTGCTTTCTCACTCCTGAAGAAATCCTTTTCAGCTCTTCGGTCTACACCGAAATGTTTGTATGAGAAGGCTATAGACGGTTTCAAGAGTTTCACTATCCCGCAAAGCCCCCCAAAATCTTGCGTGATTCCCATCACCCACGCAAGCGGAAACCACGCTGGCTACGCCAGCTGCGTCAAGCTGTACAATGGAGAAAATGCGTTGCTGACAGCGACACACGTTTTACGTGATTGTCCCAACGCTATAGCTGTTTCCGCCAGAGGGCTCCAAGCTCGGATTCCACTCGCAGAATTCAAAACAATCGCGAAATCCGACAAAGGTGATGTAACCCTTCTTCGCGGCCCCCCCAACTGGGAAGGACTGTTAGGCTGCAAAGCGGCCAACGTCATTACCGCAGCCAACCTTGCGAAATGCAAAGCAACTATTTACTCTCTTGAGAAGGATGGTTGGGCGTGCGGCTACGCCGAGATCGTCGGTTCAGACGGCACTGATGCCATGGTTCTGAGCCAGACGGAAGAAGGACACTCCGGAAGCCCCTACTTTAATGGAAAAACCATCCTAGGGGTTCACTCAGGTGCAAGCAGGAAAAGAAATTACAACTTAATGGCACCAATCCCGTCCATCCCTGGGCTCACGAGCCCTACATATGTGTTTGAGACAACCGCACCGCAAGGTCGAATTTTCGCACAAGAGGACATCGCCGAGATCGAGAATCTCTATTCAGAGTACAAACGATTGCAAAATTTCAAGTCCAAAACTGGAACGAACTGGGGCGATGTAAGCGAGGATGACGATATCTTCTTCGAAAGCAAAGAAGACTTTTCGGGAAACGGAGTGCGCGGCGCCGACCGCGAAACAAACGGCGAAGGCAGCTCCACCCCAAAGACAAACAACGTCGATGGGAAAGAGATGATGGAGAAAATAATCTCATCTCTAGTGGGAAAGATAAATCTCGAGAACATCGAGAAGAAAGTGGTCGAACAGATTTCCGCGAAAGCGATGAAGACACCAAGACCCCACCGCAGAAGAGCCCCAAAGAAACAGCCGGAGAGTTCGAAAGATACTTCTCCTCACTCTACGACTGGGAGGTACCAACCTCCCCATGTGAGGTCCCCGGCTTCCGTCACTGCGGCAAGCTGCCCCAGTACTACCACCCCAAGCAAAAGGAAGAATCACGCTGGGGGAAGACGCTCATCGGGATCCATCCCGCATTGGGTGAGAAAACAAGCGGCTTCGGCTGGCCCAAGTTCGGCCCCGAAGCAGAACTAAAGAGCCTGCGACTGCAGGCTTCACGGTGGCTGGAACGCGCCCAGTCCGCAAAAATACCCTCTGACGCTGAGAGGGAGCGTGTGATTCAAAAGACCGCAGATGTTTACCATCCTTGCCAAACTAATGGACCTGCGGCAACCCGAGGAGGAACACTGACCTGGAACAACTTCATGATAGATTTCAAACAGGCCGTGTTCTCGCTAGAGTTCGATGCCGGAATAGGCGTCCCCTATATTGCCTATGGCAAGCCCACGCATCGTGGGTGGGTAGAAGATCAGAGACTCCTCCCAGTCCTAGCTCAGTTGACCTTCATCCGACTACAGAAGATGTTGGAGGTTAACTTTGAAGCCATGGAACCTGAGGAGCTGATCCGGAACGGTTTGTGCGATCCCATCCGATTATTCGTGAAAGGTGAACCGCATAAACAAGCGAAGCTCGATGAAGGCCGCTACCGCCTCATCATGAGCGTTTCCCTCGTGGATCAACTGGTAGCCCGGGTTCTGTTTCAAAACCAAAACAAGCGGGAGATTGCCTTATGGAGGGCCGTCCCCAGCAAACCCGGTTTTGGCTTGTCTACGGACGAGCAAGTGCTGGACTTCGTAAAATGTCTGGCCCGTCAAGTTGGAACTACAACGTCTGAAGTTATCACAAACTGGAAAGATTACTTGACGCCTACGGATTGCTCCGGTTTTGACTGGAGTGTTGCGGACTGGATGCTCCAAGACGATATGATCGTCCGCAATAGACTTACCATTGACCTCAACCCCGTTACAGAAAGATTAAGATCCTGTTGGTTGAGATGTGTTTCAAACTCAGTTTTGTGTCTGAGCGATGGTACCCTTTTAGCCCAAACCCATCCGGGCGTTCAGAAAAGTGGGAGCTACAATACATCGAGCTCCAACTCCCGGATTAGAGTTATGGCCGCCTTTCATACAGGTGCTGCCTGGGCTATGGCGATGGGCGATGATGCCCTCGAGTCCAATCCCGCTGACCTAGCAGCGTATAAAAGACTAGGATTCAAGGTAGAGGTTTCCGGACAACTGGAATTCTGCTCTCACATCTTTAGAGCGCCGGACCTCGCCCTCCCTGTGAACGAAAATAAAATGATCTACAAATTGATCTTTGGCTACAACCCAGGGAGCGGAAACGCTGAGGTAGTTGCGAACTACTTGGCCGCTTGTTTCTCAGTTCTGAACGAGTTGCGGCATGATCCAGCGTCCGTTGAACTTCTTTACTCGTGGTTAGTCGACCCAGTGCTACCACAAAAGATATCCAGGGAGTAAAGAAGCATACCAGTCAGCTTACATTGAAATTCTAAAGAGTTTTCTGCAACAGTAAGAGACTTAAGTAAAACCACTCAAAGATACAACGGATTACAAATTCCTAGCAGGTTTCACCGCAGGCTTCGTTTCATCGATACCAATATCCGTGATCAGTATCTATTTCATCTACCTAAGAATCTCTAAACACGTACGCGAAATCGTTAATGAATACGGTCGTGGGTAGAAGAACAATCAATGGAAGAAGACGACCACGCAGGCAAACAAGGCGCATTCAGCGAAATCAGCCAGTGGTTGTGGTCCAAACCTCTCGGACAACACAACGCCGACCTAGACGACGACGAAGAGGTAACAACCGGACAGGAAGAACTGTTCCTACCAGAGGAGCAGGTTCAAGCGAGACATTTGTTTTCTCAAAAGACAATCTCGCGGGAAGTTCCAGCGGAGCAATCACGTTCGGGCCGAGTCTATCAGACTGCCCGGCATTCTCTAATGGAATACTCAAGGCCTACCATGAGTATAAAATCTCAATGGTCATTCTGGAGTTCGTCTCCGAAGCCTCTTCCCAAAATTCCGGTTCCATCGCTTACGAGCTGGACCCACACTGTAAACTCAATTCACTCTCCTCAACGATTAACAAATTCGGGATCACAAAGCCCGGGAGGAAAACGTTTACAGCGTCTTTCATCAACGGGATCGAATGGCATGACGTTGCCGAGGACCAATTCAGGATCCTCTACAAAGGCAATGGTTCTTCATCGATAGCTGGTTCTTTCAGAATCACCATAAAGTGCCAATTCCACAATCCCAAATAGGTAGACGAGGAACCTAGCCCCAGTCCAGGGCCAAGCCCCCAACCAACACCAACACCAACTAAAGAGTACAGATGGATAGTCTATACTGGCGTCTGTAGAACTCTGATCAAAGCCCAAACAACGGACGATTCTATTTATCTGTATGATTTGGGCTCCCAACGCCTCCGGTACATTGAGAATGAAAACATGAACTGGACCAACGTGGACGCCCGATGGTATTCAAGTAATAACGTCAAAGCGGTTCCCATGTATGTGTTTCCAGTCCCGGAAGGAACCTGGTCGGTTGAGATATCAACGGAAGGTTATCAACCTACAGCTAGTACCACCGACCCTAACAAGGGAAAAGTTGATGGCATGATTGCCTATTCTGATGATCAATCAGAAGTGTGGAATGTTGGAATAAATCAAAATTGTAACATCACTAACCTGAAAGCAGACAACTCATGGAAGTATGGGCACCCAGATATGGAAATTAACAATTGCCACTTCAATCAGGGACAGGTTCTAGAGATGGATGGTACAATCTCCTTTCACGTAGAGACCACCGGTTCGGACGCATCGTTCTTTCTGGTCGGTCCCGCTGTTCAAAAACAGTCGAAGTACAACTACGCCGTTTCATACGGAGCGTGGACAGATCGTGATATGGAGTTGGGCTTGATTTCCGTTTCTTTGGATGAGAAAGACGGATCCAGAGGTTCCGCTATGAAAAGACCTCGTCGAGAAGGACACTCGAAGGCAGTCTCAACCTGGGAGACTATAAACTTACCGGAGAAGGAAAACTCCGAGAAATCCATAACCAGTCAAAGACAAGACTCTAAAACTCAACCTAAACAAGGTTTCTCAGATGCTGGTTCTGAGGACAACAAGGAATGGGATTTCACACCCGGGACTCGAATGTTTCTTCCTGAAGACTTCGAGGAACCCCGTGAAGTTCAGAATGACGATCTTCTCAGAGATAGAGGAATTGTAGTAGACCCCTCCTTGTTGGAAATACCTGACTCACCTCCTCCGAGAGCGGACCATAAGGACACAGATCCTTGGGCTGAGGTCGAAAGATACAAATCTTCCCATAAAGCCCTTGTCGGCGAGGACACGCGTTCCCGACAATCATCCCTAACAGGAGGTTCGCTTGCTGGCGGCAGTCTTAGAAAACTGAAGCCAGTTACACCGGACGAGTATGAGCAGGCGAAGCTGAAAGATGAATCGAGGCTCCAGTACGAACAGGACCTGGCTGAGTACCACAGAAGTTTGAAAAGACCTTCAAGCGCGTTAATACCACGTGATGATGGTGAACTCATGGAAATGGATCCTTCTCAACGAAAGTTGATGAAAAACGCTGGAGTCAACCTTGATAAATATGGCCGACCAATTAAGAAAGGTTTTCTCTCTTTCAGGAAATAGTTTCCACAGTACTCAACTGTGCTCGTTGGTAGTGATACGAGGCGAAAATCAAAACTACCCTTATCTAGCTTTATTTATATTTAGCTAATAAAGTCAAGCCAGAGACATTAAACTGGAACGACTCCGCTTCGCGGATAGGCAACGAGTGTTCTACGCTGGGAG
| 15,333
|
OP183548.1
|
Turnip yellows virus
|
Hossain,R., Ahmad,M., Veronika,W., Varrelmann,M.
|
Institute of Sugar Beet Research, Phytopathology
| null |
2023-04-12
|
Goettingen
|
Turnip yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,681
|
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
|
Brassica napus
| null |
2017
| null | null |
Turnip yellows virus isolate Goettingen, complete genome
|
ACAAAAGAAACCAGGAGGGAATCCTAAGTAGATGCAATTTGTTGCTCACGACAACTTTCACACTCTAGAAGTCAGAAAAGTCAGGTACCTCCATTCACGACAAGTAACGTTTCTTTTAGCAGGTCTTTTGCTTAACATCGAACAATTCGTAAAAGCAATCAAAGAGCGCAACAATGAATTCAAAATTGATATTTTTCTTCGCTCTCTGCTCTATCAGCTTCCTCTCCACCTCGGAGACCACGTCCACGATGACGTCAGGAAGTCTTTACTTGTCCCCGAACCAGAGCTTTGTGCCTGGTTCTCTTTACAAACGGGATATGCTCCCGCCTCCACCTCAGGCCGTGTTAACTTATACGTGCCAGGAACCAAGACCTCTCGTAGAAGAATCGTACAACGATCTCTTGCGAGCAATTTCTCAGAAAAGTTCAAGCGATTTCCAGAATTTTTATTCGTTGGCCTTGAACATTTTCAGCGATTTCTGTCTATCTGGACTAGAGATGCTGAAAGACGCCTCTTTTCTGGCTGTCGAGAAATTCCTGTGGGGTCTCACACGCTTGTGGAGCTCGCTAATCTTGGCGAGCTTCTCCGCGTTATGGTGGCTAGTGAGCAATTTCACAACTCCCGTCTTCTGTCTCGCCTTGCTGTACACTGTTACAAGATTTATGGTGAAGACGGTTTCATTTCTTTTTGGAGGATTGCCAATCTGGATTATCTCGATTGCTTTCTCACTCCTGAAGAAATCCTTTTCAGCTCTTCGGTCTACACCGAAATGTTTGTATGAGAAGGCTATAGACGGTTTTAAGAGTTTCACTATCCCGCAAAGCCCCCCAAAAGATTGCGTGATTCCCATCACCCACGCAAGCGGAAACCACGCTGGCTACGCCAGCTGCGTCAAGCTGTACAATGGAGAAAATGCATTGTTGACAGCGACACACATCTTACGTGATTGTCCCAACGCTGTAGCCGTTTCCGCCAGAGGGCTCCAAACTCGGATTCCACTTGCTGAATTCAAAACAATCGCAAAATCCGACAAAGGTGATGTCACCCTTCTTCGCGGCCCCCCCAACTGGGAAGGACTGTTAGGCTGCAAAGCGGCCAACGTCATTACCGCTGCCAATCTTGCAAAATGCAAAGCAACTATTTACTCTCTTGAGAAAGACGGTTGGGCATGCGGCTATGCCGAGATAGTTGGTTCAGATGGCACTGATGCCACGGTTCTGAGCCAGACAGAAGAAGGACACTCCGGAAGCCCCTACTTTAATGGCAAAACCATCTTAGGGGTTCACTCAGGTGCAAGTAAGAATAGAAATTACAATCTAATGGCACCAATCCCGTCCATCCCAGGGCTCACGAGCCCTACGTACGTGTTTGAGACTACCGCGCCGCAAGGTCGGATTTTCGCACAAGAGGACATCGCCGAGATCGAGAATCTCTACTCAGAGTATAAACGATTGCAAAATTTCAAGTCCAAAACTGGAATGACCTGGGGCGATGTAAGCGAGGATGACGACATCTTCTTCGAAAGCAAAGAAGATTTTTCGGGAAACGGAGTGCGCGGAGCCGACCGCGAAACAAACGGCGAAGGCAGCTCCACCCCGAAGACAAGGAACGTCGATGGGAAAGAGATGATGGAGAAAATAATCTCGTCTCTAGTGGGAAAGATAAATCTCGAGAATATCGAGAAGAAAGTGGTCGAACAGATCTCCGCGAAAGCGATGAAGACACCAAGACCCTACCGCAGAAGAGCCCCAAAGAAACAGCCGGAGAGTTCAAAAGATACTTCTCCTCACTCTACGACTGGGAGGTACCAACCTCCCCATGTGAGGTCCCCGGCTTCCGTCACTGCGGCAAGCTGCCCCAATACTACCACCCCAAGCAAAAGGAAGAATCACGCTGGGGGAAGACGCTCATCGGGATACATCCCGCATTGGGTGAGAAAACAAGCGGCTTCGGCTGGCCCAAGTTCGGCCCCGAAGCAGAACTAAAGAGCCTGCGACTACAGGCTTCACGGTGGCTGGAACGCGCCCAGTCCGCAGAAATACCCTCTGACGCTGAGAGGGAGCGTGTGATTCAAAAGACCGCAGATGTTTACCATCCTTGCCAAACTAATGGACCTGCGGCAACCCGAGGAGGAACACTGACCTGGAACAATTTCATGATAGATTTCAAACAGGCCGTGTTCTCGCTAGAGTTCGATGCCGGAATAGGCGTCCCCTATGTTGCTTATGGCAAGCCCACGCACCGTGGGTGGGTAGAAGATCAGAGACTCCTCCCAGTTCTAGCTCAGTTGACCTTCATCCGACTACAGAAGATGTTGGAGGTTAACTTCGAAGCCATGGAACCTGAGGAGCTGATTCGGAACGGTTTGTGCGATCCCATCCGATTATTCGTGAAAGGTGAACCGCATAAACAAGCGAAGCTCGATGAAGGCCGCTACCGCCTCATCATGAGCGTTTCCCTCGTGGATCAATTGGTAGCCCGGGTACTGTTTCAAAACCAGAACAAGCGGGAAATTGCCTTATGGAGGGCCGTCCCCAGTAAACCCGGTTTTGGCTTGTCTACGGACGAGCAAGTGCTGGACTTCGTAAATTGTCTGGCCCGTCAAGTCGGAACTACAACGTCTGAAGTTATCATAAACTGGAAAGATTACTTGACGCCTACGGATTGCTCCGGTTTTGACTGGAGTGTTGCGGACTGGATGCTCCAAGACGATATGATCGTCCGCAATAGACTTACCATCGACCTCAACCCTGTTACAGAAAGATTAAGATCCTGTTGGTTGAGATGTGTTTCAAACTCAGTGTTATGCCTGAGTGATGGTACCCTTTTAGCCCAAACCCATCCGGGCGTTCAGAAAAGTGGGAGCTACAATACATCAAGCTCCAACTCCCGGATCAGAGTTATGGCCGCCTTTCATACAGGTGCCGCCTGGGCTATGGCGATGGGCGATGACGCTCTCGAGTCCAATCCCGCTGACCTAGCAGCGTACAAAAGACTAGGTTTCAAGGTTGAGGTTTCCGGACAACTGGAATTCTGCTCTCACATATTTAGAGCGCCGGACCTCGCCCTCCCTGTGAACGAAAATAAAATGATCTACAAATTGATCTATGGCTACAATCCAGGGAGCGGAAACGCTGAGGTAGTTTCAAACTACTTAGCCGCTTGTTTCTCAGTTCTGAACGAGTTGCGGCATGATCCAGCGTCCGTTGAACTTCTTTACTCGTGGTTAGTCGACCCAGTGCTACCACAAAAGATATCCAGGGAGTAAAGAAGAAAGAAAGTTAGCTTACATTGAAATTCTAAAGAGATTTCTGCAACAGTAAGAGACTTAAGCAAATCCAACAAAAGATACAACGGATTACAAATTCCTAGCAGGTTTCACCGCAGGCTTCGTTTCATCGATACCAATATCCGTGATTAGTATCTACATAATCTACCTAAGAATCTCCAAACACGTGCGCGAAATTGTTAATGAATACGGTCGTGGGTAGGAGAACAATCAATGGAAGAAGACGACCACGGAGGCAAACACGACGCGCTCAGCGCTCTCAGCCAGTGGTTGTGGTCCAAACCTCTCGGGCAACACAACGCCGACCTAGACGACGACGAAGAGGTAATAACCGGACAAGAGGAACTGTTCCTACCAGAGGAGCAGGCTCAAGCGAGACATTTGTTTTCTCGAAAGACAATCTCGCGGGAAGTTCCAGCGGAGCAATCACGTTCGGGCCGAGTCTATCAGACTGCCCAGCATTCTCTAATGGAATACTCAAGGCCTACCATGAGTATAAAATCTCGATGGTCATTTTGGAGTTCGTCTCCGAAGCCTCTTCCCAAAACTCCGGTTCCATCGCTTACGAGCTGGACCCACACTGTAAACTCAACTCCCTTTCCTCAACTATCAACAAGTTCGGGATCACAAAGCCCGGGAAAGCGGCGTTTACAGCGTCTTACATCAACGGAAAGGAATGGCACGACGTTGCCGAGGACCAATTCAGGATCCTCTACAAAGGCAATGGTTCTTCATCGATAGCTGGTTCTTTTAGAATCACCATCAAGTGCCAATTCCACAATCCCAAATAGGTAGACGAGGAACCCGGCCCTAGCCCAGGGCCTTCTCCCTCTCCACAACCCACCCCCCAAAAGAAATATCGTTTTATCGTCTATACTGGAGTCCCAGTGACTCGTATAATGGCTCAATCCACGGATGATGCCATCTCTTTGTACGACATGCCGTCTCAACGGTTCCGCTACATAGAGGACGAGAACATGAACTGGACGAACCTCGATTCTCGATGGTATTCCCAGAATTCTTTAAAAGCCATCCCGATGATAATAGTACCAGTCCCTCAAGGCGAGTGGACTGTGGAAATTTCGATGGAGGGGTATCAGCCAACCTCGAGCACTACAGATCCTAACAAGGACAAACAAGATGGTCTCATCGCTTACAACGATGACCTCAGTGAAGGTTGGAATGTGGGGATTTATAATAATGTGGAGATAACCAACAACAAGGCCGACAATACTTTGAAATACGGCCACCCAGACATGGAACTTAACGGCTGTCATTTTAACCAAGGACAGTGTCTGGAGAGAGATGGAGATTTGACTTGTCACATCAAGACGACTGGTGACAATGCCTCCTTCTTTGTTGTTGGACCCGCTGTCCAGAAGCAATCCAAATATAATTATGCCGTCTCGTACGGAGCCTGGACAGATCGGATGATGGAGATAGGGATGATTGCCATAGCACTTGATGAACAAGGCTCATCCGGTTCCGCAAAGACAAAAAGACCAAAGAGAGTTGGGCACTCCATGGCAGTCTCGACCTGGGAGACTATAAACTTGCCGGAGAAGGAAAACTCCGAGGAAATTCAAACCAGTCAAAGACAAGACTTTAAAACTCCTCCCACAGCTGGTGGGGGTTCCGATATGCTGGATGTCGAAGAAGGAGGCTTGCCCCTTTCTGTTGAAGAGGAAATCCCCGATTTCGTTGGGGACAACCCTTGGTCTAACATAACGACTGAAAATTCACAGAAAGAAGAGGCTATGTCGTCAAAGAGTGGTCTTACACCCCAGTTGAAGCCTCCCGGTCTGCCAAAACCACAACCGATCAGAAGACTCAAAAGTTTTGATGCAACAGCAGATTTGGTTGAAGCGTGGCGACCCGATGTGAACCCCGGATATTCCAAAGCCGATGTGGCAGCAGCCACTATCATTGCTGGGGGTTCTATTAAAGACGGCCGTTCTATGATCGATAAACGAGATAAAACTGTGTTAGACGGTCGCAAGAGTTGGGGTTCCTCCATAGCTTCCTCCTTGACAGGTGGAACGCTCAAGGCCTCCGCAAAGTCGGAGAAGCTTGCCAAGCTCACTACAAGTGAAAGGGCGAGATTTGAACAAATAAAGCGTCAGCAAGGCTCTGTGCGAGCCTCGGAATTTCTAGAACAAATTTTGGCTGGCGAAGACCCCGACCCGAAGTTCTTAAGAACTCGATAGTTTCCACAGTACTCAACTGTGCTCGTTGGTAGTGATACGAGGCGAAAATCAAAACTACCCTTATCTAGCTTTATTAATATTTAGCTAATAAAGTCAAGCCAGAGACATTAAACTGGAACGACTCCGCTTTGCGGATAGGCAACGAGTGTTTTACGCTGGGATAACTCCCTACGGCACTTCGGTGT
| 16,707
|
OP719311.1
|
Turnip yellows virus
|
Puthanveed,V., Singh,K., Poimenopoulou,E., Pettersson,J., Siddique,A.B., Kvarnheden,A.
|
Swedish University of Agricultural Sciences, Dept of Plant Biology
|
Sweden
|
2023-03-03
|
Karpalund
|
Turnip yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,661
|
GenBank
| 1
|
Sweden
|
Sweden
|
Brassica napus
|
plant leaf
|
2019
| null | null |
Turnip yellows virus isolate Karpalund, complete genome
|
CCAGGAGGGAATCCTAAGTTTGATGCAATTTGTTGCTCACGATAACTTTCACACTTTAGAAGTCAGGAAAGTCAGATACCTCCACCCAAAGCAAGTAACGTTTCTTCTAGCAGGTCTATTGCTTAACATTAAACAATTTGTCAAAGCAATCAAAGAGCGCAATAATGAATTCAAAACTGATGTTTTTCTTCGCTCTCTGCTCTATCAGCTTCCTCTCCACCTCGGAGACCACATCCACGACGATGTCAGGAAGTCCATACTTGCCCCTGAACCAGAGCTTTGTGCCTGGTTCTCTTTACAAACGGGATATGCTCCCGCCTCCACCTCAGGCCGTGTTAACTTATACGTGCCAGGAACCAAGACCTCTCGCGGAAGAATCTTACAACGATCTTTTGCGAGCGATTTCTCAGAAAAGCTCAAGCGATTTCCAGAATGCCTATTCGGTAGCCTTGAGTATTTCCAGCGATTTCTATCAACATGGACTAAAGACGTTGAAAGACGTATCTTTTCTCGCTGTCGAGAAATCCCTCTGGGGTCTGACACGCTTGTGGAGCTCGCTAATCTTGGCGAGCTTCTCCGCGTTATGGTGGTTGGTGAGCAATTTCACAACTCCCGTCTTCTGTCTCGCCTTGCTGTACACTGTTACAAGATTTATGGTGAAGACGGTTTCATTTCTTTTTGGAGGATTGCCAATCTGGATCATTTCGATTGCTTTCTCACTCCTGAAGAAATCCTTTTCAGCTCTTCGGTCTACACCGAAATGTTTGTATGAAAAGGCCATAGACGGTTTCAAGAGTTTCACTATCCCGCAGAGCCCCCCAAAATCTTGCGTGATTCCCATCACCCACGCAAGCGGAAACCACGCTGGTTACGCCAGCTGTGTTAAGCTATACAACGGCGAAAACGCTTTAATGACGGCAACTCACGTCCTACGTGACTGCCCCAATGCTGTAGCTATTTCCGCCAAAGGGCTTAAAACTCGGATTCCACTCGCTGAATTCAAAACAATTGCGAAATCCGACAAAGGTGATGTTACCCTCCTCCGCGGCCCCCCCAATTGGGAAGGACTGTTAGGCTGCAAAGCGGCCAACGTCATCACAGCTGCTAACCTAGCGAAATGCAAAGCATCCATATACTCTTTTGAGAGAGATGGCTGGGTTAGCGGTTATGCCGAGATTGTAGGCTCAGAAGGCACCGATGTTATGGTCCTGAGCCACACGGAAGGAGGACACTCCGGAAGCCCCTACTTCAATGGTAAAACCATCTTAGGGGTTCATTCAGGTGCCAGTGCCACAGGAAATTACAACTTAATGGCGCCAATCCCGTCCATCCCCGGGCTCACAAGTCCGACTTATGTGTTTGAAACCACCGCACCACAAGGAAGAGTTTTCGCACAAGAAGATGTCGCTCAGATTGAAAGCCTCTATGCGCAAGCAGTAGAGAGATCGAATCGAATGAAAAATTTCAAGTCCAAGACTGGAATAAACTGGGGCGATATGGATGACGATGAAGACATCTTCTTCGAAAGCAGAGAAGATCTGTCGGGAAACGGAGTGCGCGGCGCCGACCGCGAAACAAACGGAGAAGGCAGCTCCACCCCAAAGACAAACAACGTCGATGGGAAAGAGATGATGGAGAAAATAATCTCATCTCTGGTGGGGAAGATAAATCTCGAGAACATCGAGAAGAAAGTGATAGAGGAGATCTCCGCGAAAGCGTTGAAGGCTCCAAAGTCCCGCCGCAGAAGAGCCCCAAAGAAACAGCCGGAGAGTTCGAAAGATACTTCTCCTCACTCTACAACTGGGAGGTACCAACCTCCCCACGTGAGGTCCCCGGCTTCCGTCACTGCGGCAAGCTGCCCCAATACTACCACCCCAAGCAAAAAGAAGAATCCAGCTGGGGGAAAACCCTCGTCGGGAACCATCCCGCGTTGGGTGAAAAGACAAGCGGCTTCGGCTGGCCCAAGTTCGGCCCCGAAGCGGAACTGAAGAGCCTGCGACTGCAGGCTTCACGGTGGCTGGAACGCGCCCAGTCCGCAGAAATACCCTCTGACGCTGAGAGGGAGCGTGTGATTCAAAAGACCGCAGATGTTTACCATCCTTGCCAAACAAATGGACCTGCGGCAACCCGAGGAGGAACACTTACCTGGAACAACTTCATGATTGATTTCAAACAGGCGGTGTTCTCGCTGGAGTTCGATGCCGGAATCGGCGTCCCCTATATTGCCTATGGCAAGCCCACACACCGTGGGTGGGTAGAAGATCAGACACTCCTTCCGGTCCTAGCTCAATTGACCTTCATCCGACTACAGAAGATGTTGGAGGTTAGTTTCGAAGATATGGGACCAGAGGAGCTGATCCAGAACGGTTTGTGCGACCCCATCCGATTATTCGTGAAAGGGGAGCCCCACAAACAAGCGAAGCTCGATGAAGGCCGCTACCGCCTCATTATGAGCGTTTCCCTCGTGGATCAATTGGTGGCCCGGGTTCTGTTCCAAAACCAGAACAAGCGGGAAATTGCCCTTTGGAGGGCCATCCCCAGTAAACCCGGTTTTGGCTTGTCCACGGACGAGCAAGTGCTGGACTTTGTGAAAGGTTTGGCCCGTCAAGTAGGCACTACGACAACAGAGGTAGTTGCCAATTGGAAAAATTACTTGACGCCCACGGATTGCTCCGGTTTTGACTGGAGTGTTGCGGACTGGATGCTTCACGATGATATGATCGTCCGCAATAGACTTACCATCGACCTCAACCCTGTTACAGAAAGATTAAGATCCTGTTGGTTGAGGTGTGTTTCAAACTCAGTGCTATGCCTGAGTGATGGTACCCTTTTAGCCCAAACCCATCCGGGCGTTCAGAAAAGTGGGAGCTACAATACTTCAAGCTCCAACTCCCGGATCAGAGTTATGGCCGCCTTTCATACAGGTGCTGCCTGGGCTATGGCGATGGGCGATGACGCCCTCGAGTCCAATCCCGCTGACCTAGCAGCGTACAAAAGACTAGGTTTCAAGGTTGAGGTTTCCGGACAACTGGAATTCTGCTCTCACATATTTAGAGCGCCGGACCTCGCCCTCCCTGTGAATGAAAATAAAATGATCTACAAACTGATCTATGGCTACAATCCAGGGAGCGGAAACGCTGAGGTAGTTTCAAACTACTTAGCCGCTTGTTTCTCAGTTCTGAACGAGTTGCGGCACGATCCAGCGTCCGTTGAACTTCTTTACTCGTGGTTAGTCGACCCGGTGCTACCACAAAAGATACCAGGAGAGTAAAGAAGAAAGAAAGTTAGCTTACATTGAAATTTTAAAGAGATTTCTGCAACAGTAAGAGACTTAAGCAAATCCAACAAAAGATACAACGGATTACAAATTCCTAGCAGGTTTCACCGCAGGCTTCGTTTCATCGATACCAATATCCGTGATCAGTATCTACATAATCTACCTAAGAATCTCCAAACACGTGCGCGAAATTGTTAATGAATACGGTCGTGGGTAGGAGAACAATCAATGGAAGAAGACGACCACGGAGGCAAACACGACGCGCTCAGCGCTCTCAGCCAGTGGTTGTGGTCCAAGCCTCTCGGACAACACAACGCCGACCAAGACGACGACGAAGAGGCGGTAACCGGACAGGAAGAACTGTTCCTACCAGAGGAGCAGGTTCGAGCGAGACATTTGTTTTCTCAAAAGACAATCTCGCGGGAAGTTCCAGCGGAGCAATCACGTTCGGGCCGAGTCTATCAGACTGCCCGGCATTCGCTAATGGAATGCTCAAGGCCTACCATGAGTATAAAATCTCAATGGTCATTTTGGAGTTCATCTCCGAAGCCTCTTCCCAAAATTCCGGTTCCATCGCTTACGAGCTGGACCCACACTGTAAACTCAACTCCCTTTCCTCAACTATCAACAAGTTCGGGATCACAAAGCCCGGGAGGAGGGCGTTTACAGCGTCTTACATCAACGGGACAGAATGGCACGACGTTGCCGAGGACCAATTCAGGATCCTCTACAAAGGCAATGGTTCTTCATCGATAGCTGGTTCTTTCAGAATCACCATAAAGTGCCAATTCCACAATCCCAAATAGGTAGACGAGGAACCCGGCCCCAGCCCAGGGCCTTCTCCCTCTCCACAACCCACACCCCAAAAGAAATATCGTTTTATCGTCTATACTGGAGTCCCCGTGACTCGTATAATGGCTCAATCCACAGATGACGCCATCTCTTTGTACGACATGCCTTCCCAAAGGTTTCGCTACATAGAGGACGAGAACATGAACTGGACGAACCTCGATTCCCGATGGTATTCCCAGAATTCTTTGAAAGCCATCCCGATGATAATAGTACCAGTCCCTCAAGGTGAGTGGACTGTGGAAATTTCGATGGAGGGGTATCAACCAACCTCAAGTACCACAGATCCTAATAAGGACAAACAAGATGGTCTCATTGCATACAATGATGACCTCAAGGAGGGTTGGAATGTGGGGGTTTATAATAATGTGGAGATAACCAACAATAAGGCCGACAATACTCTCAAGTACGGCCACCCAGACATGGAACTCAATAGCTGTCATTTCAATCAAGGACAGTGTCTGGAAAGAGATGGAGATTTGACTTGTCACATCAAAACAACTGGTGATGACGCCTCCTTCTTTATTGTTGGACCCGCTGTCCAGAAGCAATCAAAGTACAATTACGCCGTTTCATACGGAGCTTGGACAGATCGGATGATGGAGATAGGATTGATAGCCATAGCACTTGATGAACAAGGCTCATCCGGTTCCACAAAGACAGAAAGACCAAAGAGAGTTGGGCACTCCATGGCAGTCTCGACCTGGGAGACTATAAACTTGCCGGAGAAGGAAAACTCCGAGGAAATTCAAACCAGTCAAAGACAAGACTTTAAAACTCCTCCCACAGCTGGTGGGGGTTCCGATACGCTGGATGTCGAAGAAGGAGGCTTGCCCCTTTCTGTTGAAGAGGAAATCCCCGATTTCGTTGGGGACAACCCTTGGTCTAATATAACGACTGAAAATTCACAGGAAGAAGAGGCTATGTCGTCAAAGAGTGGTCTTACACCCCAGTTGAAGCCTCCCGGTCTGCCAAAACCACAACCGATCAGAAAACTCAAAAGTTTTGATGCAACAGCAGATTTGGTTGAAGCGTGGCGACCCGATGTGAACCCCGGATATTCCAAAGCCGATGTGGCAGCTGCCACTATCATTGCTGGGGGTTCTATTAAAGATGGCCGTTCTATGATCGATAAACGAGATAAAACTGTGTTAGACGGTCGCAAGAGTTGGGGTTCCTCCTTGACTTCCTCCTTGACAGGTGGAACGCTCAAGGCCTCCGCAAAGTCGGAGAAGCTCGCCAAGCTCACTACAAGTGAAAGGGCGAGATTTGAACAAATAAAGCGTCAGCAAGGCTCTGTGCGAGCCTCGGAATTTCTAGAACAAATTTTGGCTGGCGAAGACCCCGACCCGAAGTTCTTAAGAACTCGGTAGTTTCCACAGTACTCAACTGTGCTCGTTGGTAGTGATACGAGGCGAAAATCAAAACTACCCTTATCTAGCTTTATTAATATTTAGCTAATAAAGTCAAGCCAGAGACATTAAACTGGAACGACTCCGCTTTGCGGATAGGCAACGAGTGTTTTACGCTGGGAT
| 17,721
|
OP797722.1
|
Turnip yellows virus
|
Fowkes,A.R., Duffy,S., McGreig,S., Vazquez-Iglesias,I., Alraiss,K., Barrett,B., Conyers,C., Webster,G., Ward,R., Chisnall,K., Mynett,M., Adams,I.P., Macarthur,R., Howard,B., Fox,A.
|
Fera Science Ltd, Virology
|
United Kingdom
|
2023-02-20
|
12842-TuYV
|
Turnip yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,634
|
GenBank
| null |
United Kingdom
|
United Kingdom
|
Pisum sativum
| null |
2021
| null | null |
Turnip yellows virus isolate 12842-TuYV, complete genome
|
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| 18,211
|
LC701523.1
|
Turnip yellows virus
|
Nurulita,S., Geering,A.D.W., Crew,K.S., Harper,S.M., Thomas,J.E.
|
Queensland Alliance for Agriculture and Food Innovation; Ecosciences Prescinct, 41 Boggo Road, Dutton Park, Brisbane, Queensland 4102
|
Australia
|
2022-06-09
|
5752
|
Turnip yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,063
|
GenBank
| null |
Australia
|
Australia
|
Allium sativum
|
plant leaf
|
2019-09-03
| null | null |
Turnip yellows virus 5752 RNA, nearly complete genome
|
GCTCCCGCCTCCACCTCAGGCCGTGTTAACTTATACGTGCCAGGAACCAAGACCTCTCGCAGACGAATCATACAACGATCTCTTGCGAGCGATTTCTCAGAAAAGCTCAAGCGATTTCCAGAATGCCTATTCGGTAGCCTTGAGTATTTCCAGCGACTTCTATCAACATGGACTAAAGACGTTGAAAGACGTATCTTTTCTCGCTGTCGAGAAATTCCTCTGGGGTCTGACACGCTTGTGGAGCTCGCTAATCTTGGCGAGCTTCTCCGCGTTATGGTGGTTGGTGAGCAATTTCACAACTCCCGTCTTCTGTCTCGCCTTGCTGTACACTGTTACAAGATTTATGGTGAAGACGGTTTCATTTCTTTTTGGAGGATTGCCAATCTGGATCATTTCGATTGCTTTCTCACTCCTGAAGAAATCCTTTTCAGCTCTTCGGTCTACACCGAAATGTTTGTATGAAAAGGCCATAGACGGTTTCAAGAGTTTCACTATCCCGCAGAGCCCCCCAAAATCTTGCGTGATTCCCATCACCCACGCAAGCGGAAATCACGCTGGCTACGCCAGCTGTGTCAAGCTATACAACGGTGAAAACGCTTTGATGACGGCAACTCACGTTCTACGTGACTGCCCCAATGCTGTGGCTATTTCCGCCAAAGGGCTTAAAACTCGGATTCCACTCGCTGAATTCAAAACAATCGCGAAATCCGACAAAGGTGATGTTACCCTCCTCCGCGGCCCCCCCAATTGGGAAGGACTGTTAGGCTGTAAAGCGGCCAACGTCATTACAGCCGCCAACCTAGCGAAATGCAAAGCATCCATATACTCTTTTGAGAGAGATGGCTGGGTTAGCGGTTATGCCGAGATTGTAGGCTCAGAAGGAACCGATGTTATGGTCCTGAGTCACACGGAAGGAGGACACTCCGGAAGCCCCTACTTCAATGGTAAAACCATTTTAGGGGTTCATTCAGGTGCCAGTGCTACAGGAAATTACAACTTGATGGCACCAATCCCGTCCCTCCCCGGACTCACAAGTCCGACTTATGTGTTTGAAACCACCGCACCACAAGGAAGAGTTTTCGCACAAGAAGATATCGCCGAGATCGAAAGCCTCTACGCGCAAGCAGTAGAGAGATCGAACAAAATGAAAAATTTCAAGTCCAAGACTGGAATGAACTGGGGTGATATGGAGGATGATGAAGACATCTTCTACGAAAGCAAAGAAGATTTTTCGGGAAACGGAGTGCGCGGCGCCGACCGCGAAACAAACGGCGAAGGCAGCTCCACCCCAAAGACAAACAACGTCGATGGGAAAGAGATGATGGAGAAAATAATCTCATCTCTAGTGGGAAAGATAAATCTCGAGAACATCGAGAAGAAAGTGGTCGAACAGATCTCCGCGAAAGCGATGAAGACACCAAGACCCAACCGCAGAAGAGCCCCAAAGAAACAGCCGGAGAGTTCGAAAGATACTTCTCCTCACTCTACAACTGGGAGGTATCAACCTCCTCATGTGAGGTCCCCGGCTTCCGTCACTGCGGCAAGCTGCCCCAATACTACCACCCCAAGCAAAAAGAAGAATCACGCTGGGGGAAGACGCTCATCGGGATCCATCCCGCATTGGGTGAGAAAACAAGCGGCTTCGGCTGGCCCAAGTTCGGCCCCGAAGCAGAACTAAAGAGCCTGCGATTGCAGGCTTCACGGTGGCTGGAACGCGCCCAGTCCGCAGAAATACCCTCTGACGCTGAGAGGGAGCGTGTGATTCAAAAGACCGCAGACGTTTACCATCCTTGCCAAACAAATGGACCTGCGGCAACCCGAGGAGGAACACTTACCTGGAACAACTTCATGATTGATTTCAAACAGGCAGTGTTCTCGCTGGAGTTCGATGCCGGAATCGGCGTCCCCTATATTGCCTATGGCAAGCCCACGCATCGTGGGTGGGTAGAAGATCAGAAACTCCTTCCAGTCCTAGCTCAATTGACCTTCATCCGACTACAGAAGATGTTGGAGGTTAATTTCGAAGATATGGGACCTGAGGAGTTGATCCAGAACGGCTTGTGTGACCCCATCCGATTATTCGTGAAGGGTGAACCCCACAAGCAAGCGAAGCTCGATGAAGGCCGCTACCGCCTCATAATGAGCGTTTCCCTCGTGGATCAATTGGTAGCCCGGGTTCTGTTCCAAAACCAGAACAAGCGGGAAATTGCCCTTTGGAGGGCCGTCCCCAGTAAACCCGGTTTTGGCTTGTCCACGGATGAGCAAGTGCTGGACTTTGTGAAAGGTCTGGCCCGTCAAGTAGGCACTACGCCAACAGAGGTAGTTGCCAATTGGAAAGATTACTTGACGCCCACGGATTGCTCCGGTTTCGACTGGAGTGTTGCGGACTGGATGCTTCACGATGATATGATCGTCCGCAATAGACTTACCATCGACCTCAACCCTGTTACAGAAAGRTTAAGATCCTGTTGGTTGAGATGTGTTTCAAACTCAGTGTTGTGCCTGAGTGATGGTACCCTTTTAGCCCAAACCCATCCGGGCGTTCAGAAAAGTGGGAGCTACAATACGTCAAGCTCCAACTCCCGGATCAGAGTTATGGCCGCCTTTCACACAGGTGCCGCCTGGGCTATGGCGATGGGCGACGACGCCCTCGAGTCCAATCCCGCTGACCTAGCAGCGTATAAAAGACTAGGTTTCAAGGTTGAGGTTTCCGGACAACTGGAATTCTGCTCTCATATATTTAGAGCGCCGGACCTCGCCCTCCCTGTGAACGAAAATAAAATGATCTACAAACTGATCTATGGCTACAATCCAGGGAGCGGAAACGCTGAGGTAGTTTCAAACTACTTAGCCGCTTGTTTCTCAGTTCTGAACGAGCTGCGGCATGATCCAGCGTCCGTTGAGCTTCTTTACTCGTGGTTAGTCGACCCGGTGCTACCACAAAAGATACCAGGAGAGTAAAGAAGAGAAGAAGTTAGCCCTACATACGTAAGTTGCAAGTAAGGGAAACAAAGTCTTACACCCGAGTATAAACATAGATTACAAGTTCTTAGCAGGCTTTTCCGCAGGATTCTTGTTGAGTATACCAGTTTCAACACTCGGATTATACATAGTCTACCTGAGAATTTCCACTCACCTGAGATCAATCGTTAATGAATACGGTCGTGGGTAGGAGAACAATCAATGGAAGAAGACGACCACGGAGGCAAGCACGACGCGCTCAGCGCTCTCAGCCAGTGGTTGTGGTCCAAGCCTCTCGGACAACACAACGCCGACCAAGACGACGACGAAGAGGCGGTAACCGGACAGGAAGAACTGTTCCTACCAGAGGAGCAGGTTCGAGCGAGACATTTGTTTTCTCAAAAGACAATCTCGCGGGAAGTTCCAGCGGAGCAATCACGTTCGGGCCGAGTCTATCAGACTGCCCGGCATTCGCTAATGGAATGCTCAAGGCCTACCATGAGTATAAAATCTCAATGGTCATTTTGGAGTTCATCTCCGAGGCCTCTTCCCAAAATTCCGGTTCCATCGCTTACGAGCTGGACCCACACTGTAAACTCAACTCCCTTTCCTCAACTATCAACAAATTCGGGATCACAAAGCCCGGGAGGAGGGCGTTTACAGCGTCTTACATCAACGGGACAGAATGGCACGACGTTGCCGAGGACCAATTCAGGATCCTCTACAAAGGCAATGGTTCTTCATCGATAGCTGGTTCTTTCAGAATCACCATCAAGTGTCAATTCCACAACCCGAAATAGGTAGACGAGGAACCCGGCCCTAGCCCAGGGCCTTCTCCCTCTCCACAACCCACACCCCAAAAGAAGTATCGTTTCATCGTCTATACTGGTGTCCCTGTGACCCGTATAATGGCTCAATCCACAGATGATGCCATCTCTTTGTACGACATGCCTTCTCAACGGTTTCGTTACATAGAAGACGAGAACATGAACTGGACGAACCTCGATTCCCGATGGTATTCCCAGAATTCTTTGAAAGCCATCCCGATGATAATAGTACCAGTCCCTCAAGGTGAGTGGACTGTGGAAATTTCGATGGAGGGGTATCAACCAACCTCAAGTACCACAGATCCTAATAAGGACAAACAAGATGGTCTCATTGCATACAATGATGACCTCAAGGAGGGTTGGAATGTGGGGGTTTATAATAATGTGGAGATAACCAACAATAAGGCCGATAATACTCTCAAGTACGGCCATCCAGACATGGAACTCAATGGATGTCATTTCAATCAAGGACAGTGTCTGGAAAGAGATGGAGATTTGACTTGTCACATCAAAACAACTGGTGATGACGCCTCCTTCTTTATTGTTGGGCCCGCTGTCCAAAAGCAATCAAAGTATAACTACGCCGTTTCATACGGAGCTTGGACAGATCGGATGATGGAGATAGGATTGATAGCCATAGCACTTGATGAACAAGGCTCATCCGGTTCCACAAAGACAGAAAGACCAAAGAGAGTTGGGCACTCCATGGCAGTCTCTACCTGGGAGACTATAAACTTGCCGGAGAAGGAAAACTCCGTGATATCCACAACCAGTCAAAGACAAGACTCTAAAACTCAACCTGAACAAGGTTTCTCAGATGCTGGTTCTGAAGACAACAAGGAATGGGATTTTACACCCGGGACTCGAATGTTTCTTCCTGAAGACTTCGAGGAACCCCGTGGGGTTCAGAATGACGATCTTCTCAGAGATAGAGGTATTGTAGTAGACCCCTCCTTGTTGGAAATACCTGACTCACCTCCTCCGAGAGCGGACCATAAGGACACAGATCCTTGGGCTGAGGTTGAAAGATTTAAATCTTCCCATAAAGCCCTTGTCGGCGAGGACACGCGTTCCCGACAATCATCCTTAACAGGAGGTTCACTTGCCGGCGGCAGTCTCAGAAAACTGAAGCCGGTTACACCGGACGAGTATGAGCAGGCGAAAATGAAAGATGAGTCGAGACTCCAGTATGAACAGGATCTCTCTGAGTATCACAGAAGTTTGAAAAGACCCGGAAGCGCGTTAATACCACGTGACGATGGTGAGCTCATGGAG
| 30,275
|
OK030750.1
|
Turnip yellows virus
|
Fowkes,A.R., McGreig,S., Pufal,H., Duffy,S., Howard,B., Adams,I.P., Macarthur,R., Fox,A.
|
Fera Science Ltd, Virology
|
United Kingdom
|
2021-12-15
|
Market Weighton TuYV IDT
|
Turnip yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,566
|
GenBank
| null |
United Kingdom
|
United Kingdom
|
Pisum sativum
| null |
2019
| null | null |
Turnip yellows virus isolate Market Weighton TuYV IDT, complete genome
|
CAGGAGGGAATCCTAAGTTGATGCAATTTGTYGCTCACGAYAACTTTCACACTCTAGAAGTCAGGAAAGTCAGRTACCTCCAYYCAMRRCAAGTAACGTTTCTTTTAGCAGGTCTWTTGCTTAACATYRAACAATTYGTAAAAGCAATCAAAGAGCGCAACAATGAATTCAAAAYTGATATTTTTCTTCGCTCTCTGCTCTATCAGCTTCCTCTCCACCTCGGAGACCACRTCCACGATGAYGTYAGGAAGTCYWTACTTGYCCCYGAACCAGAGCTTTGTGCCTGGTTCTCTTTACAAACGGGATATGCTCCCGCCTCCACCTCAGGCCGTGTTAACTTAYACGTGCCAGGAACCAAGACCTCTCGCRGAAGAATCATACAACGATCTYTTGCGAGCAATTTCTCAGAAAAGYTCAAGCGATTTCCAGAATGCYTATTCGKTRGCCTTGARYATTTCCAGCGATTTCTRTCWAYMTGGACTARAGAYGYTGAAAGACGYMTCTTTTCTSGCTGTCGAGAAATTCCTSTGGGGTCTSACACGCTTGTGGAGCTCGCTAATCTTGGCGAGCTTCTCCGCGTTATGGTGGYTGGTGAGCAATTTCACAACTCCCGTCTTCTGTCTCGCCTTGCTGTACACTGTTACAAGATTTATGGTGAAGACGGTTTCATTTCTTTTTGGAGGATTGCCAATCTGGATYATYTCGATTGYTTTCTCACTCCTGAAGAAATCCTTTTCAGCTCTTCGGTCTACACCGAAATGTTTGTATGARAAGGCYATAGACGGTTTYAAGAGTTTCACTATCCCGCARAGCCCCCCAAAAWCTTGCGTGATTCCCATCACCCACGCAAGCGGAAACCACGCTGGCTACGCCAGCTGYGTCAAGCTRTACAAYGGCGAAAACGCKTTRATGACGGCAACTCACGTCCTACGTGACTGCCCCAATGCTGTAGCTATTTCCGCCAAAGGGCTTAAGACTCGGATTCCACTCGCTGAATTCAAAACAATYGCGAAATCCGACAAAGGTGATGTTACCCTCCTCCGCGGCCCCCCCAAYTGGGAAGGACTGTTAGGCTGYAAAGCGGCCAACGTCATTACAGCYGCCAACCTAGCRAAATGCAAAGCATCCATATACTCTTTTGAGAGAGATGGCTGGGTTAGCGGTTATGCCGAGATTGTAGGCTCAGAAGGTACCGATGTTATGGTCCTGAGCCACACGGAAGRAGGACACTCCGGAAGCCCCTACTTTAATGGYAAAACCATYTTAGGGGTTCAYTCAGGTGCCAGTGCNACAGGAAATTACAAYYTRATGGCACCAATCCCGTCCATCCCCGGRCTCACAAGTCCGACTTATGTGTTTGAAACCACCGCACCACAAGGAAGAGTTTTCGCACAAGAAGATRTCGCCSAGATYGAAAGCCTCTATGCGCAAGCAGTAGAGAGATCGAATCGAAYGAAAAATTTCAAGTCYAAGACTGGAATAAAYTGGGGCGATATRGAKGACGATGAAGACATCTTCTTCGAAAGCARAGAAGATCTKTCGGGAAACGGAGTGCGCGGCGCCGACCGCGAAACAAACGGAGAAGGCAGCTCCACCCCAAAGACAAACAACGTCGATGGGAAAGAGATGATGGAGAAAATAATCTCATCTCTGGTGGGGAARATAAATCTCGAGAACATCGAGAAGAAAGTGATAGAGGAGATMTCCGCGAAAGCGWTGAARGCTCCAAAGTCCCGCCGCAGAAGAGCCCCAAAGAAACAGCCGGAGAGTTCGAAAGATACTTCTCCTCACTCTACAACTGGGAGGTACCAACCTCCCCACGTGAGGTCCCCGGCTTCCGTCACTGCGGCAAGCTGCCCCAATACTACCACCCCAAGCAAAAAGAAGAATCCAGCTGGGGGAAAACCCTCGTCGGGAACCATCCCGCGTTGGGTGAAAAGACAAGCGGCTTCGGCTGGCCCAAGTTCGGCCCCGAAGCGGAACTGAAGAGCCTGCGAYTGCAGGCTTCACGGTGGCTGGAACGCGCCCAGTCCGCAGAAATACCCTCTGACGCTGAGAGGGAGCGTGTGATTCAAAAGACCGCAGATGTTTACCATCCTTGCCAAACAAATGGACCTGCGGCAACCCGAGGAGGAACACTGACCTGGAACAACTTCATGATTGATTTCAAACAGGCGGTGTTCTCGCTGGAGTTCGATGCCGGAATCGGCGTCCCCTATATTGCCTATGGCAAGCCCACRCACCGTGGGTGGGTAGAAGATCAGACACTCCTTCCGGTCCTAGCTCAATTGACCTTCATCCGACTACAGAAGATGTTGGAGGTTARTTTCGAAGATATGGGACCAGAGGAGCTGATCCAGAACGGTTTGTGCGAYCCCATCCGATTATTCGTGAAAGGKGARCCCCACAAACAAGCGAAGCTCGATGAAGGCCGCTACCGCCTCATTATGAGCGTTTCCCTCGTGGATCAATTGGTRGCCCGGGTTCTGTTYCAAAACCAGAACAAGCGGGAAATTGCCCTNTGGAGGGCCRTCCCCAGTAAACCCGGTTTTGGCTTGTCCACGGACGAGCAAGTGCTGGACTTTGTRAAAGGTYTGGCCCGTCAAGTAGGCACTACGACRACAGAGGTAGTTGCCAATTGGAAARATTACTTGACGCCYACGGATTGCTCCGGTTTTGACTGGAGTGTTGCGGACTGGATGCTYCAMGAYGATATGATCGTCCGCAATAGACTTACCATCGACCTCAACCCTGTTACAGAAAGATTAAGATCCTGTTGGTTGAGRTGTGTTTCAAACTCAGTGYTRTGCCTGAGTGATGGTACCCTTTTAGCCCAAACCCATCCGGGCGTTCAGAAAAGTGGGAGCTACAATACWTCAAGCTCCAACTCCCGGATYAGAGTTATGGCCGCCTTTCAYACAGGTGCTGCCTGGGCTATGGCGATGGGCGAYGACGCCCTCGAGTCCAATCCCGCTGACCTAGCAGCGTAYAAAAGACTAGGTTTCAAGGTTGAGGTTTCCGGACAACTGGAATTCTGCTCTCAYATMTTTAGAGCGCCGGACCTCGCCCTCCCTGTGAATGAAAATAARATGATCTACAAACTGATCTATGGCTACAATCCAGGGAGCGGAAACGCTGAGGTAGTTTCAAACTACTTAGCCGCTTGYTTCTCAGTTCTGAACGAGTTGCGGCAYGATCCAGCGTCCGTTGAACTTCTTTACTCGTGGTTAGTCGACCCRGTGCTACCACAAAAGATACCAGGAGAGTAAAGAAGAAAGAAAGTTAGCTTACATTGAAATTTTAAAGAGATTTCTGCAACAGTAAGAGACTTAAGCAAATCCAACAAAAGATACAACGGATTACAAATTCCTAGCAGGTTTCACCGCAGGCTTCGTTTCATCGATACCAATATCCGTGATCAGTATCTACATAATCTACCTAAGAATCTCCAAACACGTGCGCGAAATTGTTAATGAATACGGTCGTGGGTAGRAGAACAATCAATGGAAGAAGACGACCACGGAGGCAAACACGACGCGCTCAGCGCTCTCAGCCAGTGGTTGTGGTCCAAACCTCTCGGGCAACACAACGCCGACCTAGACGACGACGAAGAGGTAATAACCGGACAAGAGGARCTGTTCCTACCAGAGGAGCAGGCTCAAGCGAGACATTTGTTTTCTCGAAAGACAATCTCGCGGGAAGTTCCAGCGGAGCAATCACGTTCGGGCCGAGTCTATCAGACTGCCCAGCATTCTCTAATGGAATACTCAAGGCCTACCATGAGTATAAAATCTCGATGGTCATTTTGGAGTTCGTCTCCGAAGCCTCTTCCCAAAACTCCGGTTCCATCGCTTACGAGCTGGACCCACACTGTAAACTCAACTCCCTTTCCTCAACTATCAACAAGTTCGGGATCACAAAGCCCGGGAAAGCGGCGTTTACAGCGTCTTACATCAACGGAAAGGAATGGCACGACGTTGCCGAGGACCAATTCAGGATCCTCTACAAAGGCAATGGTTCTTCATCGATAGCTGGTTCTTTTAGAATCACCATCAAGTGCCAATTCCACAATCCCAAATAGGTAGACGAGGAACCCGGCCCTAGCCCAGGGCCTTCTCCCTCTCCACAACCCACCCCCCAAAAGAAATATCGTTTTATCGTCTATACTGGAGTCCCAGTGACTCGTATAATGGCTCAATCCACGGATGATGCCATCTCTTTGTACGACATGCCGTCTCAACGGTTCCGCTACATAGAGGACGAGAACATGAACTGGACGAACCTCGATTCTCGATGGTATTCCCAGAATTCTTTAAAAGCCATCCCGATGATAATAGTACCAGTCCCTCAAGGCGAGTGGACTGTGGAAATTTCGATGGAGGGGTATCAGCCAACCTCAAGCACCACAGATCCTAATAAGGACAAACAAGATGGTCTCATYGCTTACAACGATGACCTCAGTGAAGGTTGGAATGTGGGGATTTATAATAATGTGGAGATAACCAACAACAAGGCCGACAATACTTTGAAATACGGCCACCCAGACATGGAACTTAACGGCTGTCATTTTAACCAAGGACAGTGTCTGGAGAGAGATGGAGATTTGACTTGTCACATCAAGACAACTGGTGACAATGCCTCCTTCTTTGTTGTTGGACCCGCTGTCCAGAAGCAATCCAAATATAATTATGCCGTTTCGTACGGAGCCTGGACAGATCGGATGATGGAGATAGGGATGATTGCCATAGCACTTGATGAACAAGGCTCATCCGGTTCCRCAAAGACAAAAAGACCAAAGAGAGTTGGGCACTCCATGGCAGTCTCRACCTGGGAGACTATAAACTTRCCGGAGAAGGAAAACTCCGAGRAAATYSAAACCAGTCAAAGACAAGACTTTAAAACTCCTCCCACAGCTGGTGGGGGTTCCGATATGCTGGATGTCGAAGAAGGAGGCTTGCCCCTTTCTGTTGAAGAGGAAATCCCCGATTTCGTTGGGGACA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| 34,934
|
OK030767.1
|
Turnip yellows virus
|
Fowkes,A.R., McGreig,S., Pufal,H., Duffy,S., Howard,B., Adams,I.P., Macarthur,R., Fox,A.
|
Fera Science Ltd, Virology
|
United Kingdom
|
2021-12-15
|
Canterbury TuYV
|
Turnip yellows virus
|
Polerovirus
|
Solemoviridae
|
ssRNA(+)
| 5,567
|
GenBank
| null |
United Kingdom
|
United Kingdom
|
Pisum sativum
| null |
2019
| null | null |
Turnip yellows virus isolate Canterbury TuYV, complete genome
|
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Fera Science Ltd, Virology
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United Kingdom
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2021-12-15
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Chatteris TuYV
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Turnip yellows virus
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Polerovirus
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Solemoviridae
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ssRNA(+)
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GenBank
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United Kingdom
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United Kingdom
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Pisum sativum
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2019
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Turnip yellows virus
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Fowkes,A.R., McGreig,S., Pufal,H., Duffy,S., Howard,B., Adams,I.P., Macarthur,R., Fox,A.
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Fera Science Ltd, Virology
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United Kingdom
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2021-12-15
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Langtoft TuYV
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Turnip yellows virus
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Polerovirus
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Solemoviridae
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GenBank
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United Kingdom
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United Kingdom
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Pisum sativum
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Turnip yellows virus
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Fowkes,A.R., McGreig,S., Pufal,H., Duffy,S., Howard,B., Adams,I.P., Macarthur,R., Fox,A.
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Fera Science Ltd, Virology
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United Kingdom
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2021-12-15
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Louth TuYV
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Turnip yellows virus
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Polerovirus
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United Kingdom
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United Kingdom
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Pisum sativum
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| null | null |
Turnip yellows virus isolate Louth TuYV, complete genome
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Fera Science Ltd, Virology
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United Kingdom
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Fera Science Ltd, Virology
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United Kingdom
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Turnip yellows virus isolate WNFT Symp TuYV, complete genome
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Polerovirus
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United Kingdom
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United Kingdom
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Fera Science Ltd, Virology
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Turnip yellows virus isolate LGN Symp TuYV, complete genome
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| 34,948
|
NC_009019.1
|
Tylonycteris bat coronavirus HKU4
|
Luo,C.M., Wang,N., Yang,X.L., Liu,H.Z., Zhang,W., Li,B., Hu,B., Peng,C., Geng,Q.B., Zhu,G.J., Li,F., Shi,Z.L., Woo,P.C., Lau,S.K., Li,K.S., Tsang,A.K., Yuen,K.Y., Woo,P.C.Y., Lau,S.K.P., Wang,M., Xu,H.F., Poon,R.W.S., Guo,R.T., Wong,B.H.L., Gao,K., Tsoi,H.W., Huang,Y., Li,K.S.M., Chan,K.H., Zheng,B.J.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2007-02-21
| null |
Tylonycteris bat coronavirus HKU4
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,286
|
RefSeq
| 3
|
China: Guangdong province
|
China
|
Chiroptera
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Tylonycteris bat coronavirus HKU4, complete genome
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| 8,002
|
MW218395.1
|
Tylonycteris bat coronavirus HKU4
|
Lau,S.K.P., Fan,R.Y.Y., Zhu,L., Li,K.S.M., Wong,A.C.P., Luk,H.K.H., Wong,E.Y.M., Lam,C.S.F., Lo,G.C.S., Fung,J., He,Z., Fok,F.C.H., Au-Yeung,R.K.H., Zhang,L., Kok,K.-H., Yuen,K.-Y., Woo,P.C.Y.
|
University of Hong Kong, Department of Microbiology
|
Hong Kong
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2020-12-27
|
SM3A
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Tylonycteris bat coronavirus HKU4
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 30,248
|
GenBank
| null |
Hong Kong
|
Hong Kong
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Tylonycteris pachypus
| null |
2010-08-16
| null | null |
Tylonycteris bat coronavirus HKU4 isolate SM3A, complete genome
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Chinese Academy of Sciences, Wuhan Institute of Virology
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GenBank
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Tylonycteris bat coronavirus HKU4 isolate CZ01, complete genome
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Tylonycteris bat coronavirus HKU4
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Chinese Academy of Sciences, Wuhan Institute of Virology
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China
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GenBank
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Tylonycteris bat coronavirus HKU4 isolate CZ07, complete genome
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Tylonycteris bat coronavirus HKU4
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Luo,C.M., Wang,N., Yang,X.L., Liu,H.Z., Zhang,W., Li,B., Hu,B., Peng,C., Zhu,G.J., Shi,Z.L.
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Chinese Academy of Sciences, Wuhan Institute of Virology
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China
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SZ140324
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Tylonycteris bat coronavirus HKU4
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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GenBank
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China
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China
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2014-04-23
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Tylonycteris bat coronavirus HKU4 isolate SZ140324, complete genome
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| 53,728
|
EF065505.1
|
Tylonycteris bat coronavirus HKU4
|
Woo,P.C., Wang,M., Lau,S.K., Xu,H., Poon,R.W., Guo,R., Wong,B.H., Gao,K., Tsoi,H.W., Huang,Y., Li,K.S., Lam,C.S., Chan,K.H., Zheng,B.J., Yuen,K.Y., Woo,P.C.Y., Lau,S.K.P., Xu,H.F., Poon,R.W.S., Guo,R.T., Wong,B.H.L., Li,K.S.M.
|
The University of Hong Kong, Microbiology
|
China
|
2007-02-07
| null |
Tylonycteris bat coronavirus HKU4
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,286
|
GenBank
| 1
|
China: Guangdong province
|
China
|
Chiroptera
| null | null | null | null |
Tylonycteris bat coronavirus HKU4, complete genome
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| 107,408
|
NC_014791.1
|
Ugandan cassava brown streak virus
|
Mbanzibwa,D.R., Tian,Y.P., Tugume,A.K., Patil,B.L., Yadav,J.S., Bagewadi,B., Abarshi,M.M., Alicai,T., Changadeya,W., Mkumbira,J., Muli,M.B., Mukasa,S.B., Tairo,F., Baguma,Y., Kyamanywa,S., Kullaya,A., Maruthi,M.N., Fauquet,C.M., Valkonen,J.P., Ogwok,E., Wagaba,H., Mohammed,I.U., Taylor,N.J., Kreuze,J.F.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2010-12-13
| null |
Ugandan cassava brown streak virus
|
Ipomovirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,070
|
RefSeq
| 2
|
Uganda
|
Uganda
|
Manihot esculenta
| null |
2004
| null |
PRJNA485481
|
Ugandan cassava brown streak virus, complete genome
|
AAAAATAAACATGACATAAGAATACATAAAAATACATCGCATACAAACACTGTGCATTCAAATTTGTGAGAAAGCAAGCTGTTACGAAAGTTTACGATACATTTTTATATATTTATAGCACTGAATACCTGCAGATGTCGACTATCCAGCTATTCAAGACTATCACCTTTGGTTCCTTTGAGCCTATCAAGCTTGATGAAGAGAACAACATTATAGAGAAAATTCCAACTGATCTTCTGGCAGGAAATGATGGCTCTGGTCCTGAGGGGCAATCAGAACAGAAATACCATAGGAAAGAAAGCGGTGAAAGTTGGCGGAAAGTAACTGACTTATATTCTGTAATTGGAAATTCTGTTTACTGCCGCAGTTATGTAGCAATGAAAAACTTCCTCAATGACACAAAGTGGGGAGGTCTTTTCAAGAATAAGAAGGGGCAAGAATTAAAGGCTGCTGCAAGGCTCAGAAGGGCTACAAGCTATGGATTCATGTATGATCCAGTTGCTTGTGCCTTTGAATGTCCTGTTTGTAGAACAAAAGCAACAGCATTGGAAGCGTTTACAAGCGATTGTGATCATTGTTTTGAAATCAAGCACATTGATGATGATAGGTTCGTTCAGACTGAAACAAAGTTTTATCCAATAAATCCTATTGAACTGGATGTTGAGGATAACTTAGTGGAAGCTGCATCGCTTGAGTGGTTGGGAAGTGATGTGGAAGAGAGAGTTGTAGACAGGGTTTTACTACTTGAGGATAAGGAGATTCGTGTTACGAAGAAAGCCCTAATTAAAAGAAGAGGTGAGACAAGACTCGTGGCAAATGTTTCTGATCTTACCAGGAAATTGACTGAAATTTGTTGTGAGTCTGGGATTCCTATCATTGATATTGATAATAGCAAGAGGAAAGCCATTCCAATGGTTAAACTCAAGCATATCTTTGGGAAAATTGAGTGTGATGACATGTTTGAAGAAGATCGGTATTTCTTGGAGCATAAAAATGCAGGAAAAATTTTCCGATCATGCGAGAAAATTACTTATAGGATGATTCGTCCTGGATGGAGCGGAGCGATCATTTTGAGAGACAATGTTCAGGGAGAGGATCGTGATAAGTTTGATTTTATCAACGACATTTGTGTTGTTCAAGGGAAGAGTCTGATTAGCAATAAAATTGAAAATGCCATGCGCGTTAAGACCAAAACAGAGGTGGACTTAATTGATTTATATTCTTTCAATCTTAGTTGGGCAAAATCGAAAGATAAGTTCATTAAGCACTTTGAAAGTGATATAACTCAATTAGTTAGATCATGTTGCACTCCTAGTACATTGTGGTTATACGCAAGGAAAGCCAGGTTTTACAAATTTGTAGATTACATGATCTTGAAGGGTAGTCCAATAATTGATATTCTAGTTAAAATGGAGTATGTTGGCAAGCATTTGGACATGTTCAATAGTGTCGAAGATGTGTGCACTGAGTATTCTCATTTTATGAAGGAGATAATTAGTGAAACTGTCAACGATAAATTGGATCCAGATGTGTTGCGCGTTAGAAATTTGATTAGAGCGCATTTTGAGTCAGTCTTAGAATATAACAAGTATGAGTTAATAGATAGAATAATTGAGAAAAAAACACAGTTAGAAGCACAAGAAATTATGTCTCGCGAGCTCATCAAACATCAGTACGGAGAGTTATTTTCTTGGCGCGAACGCTTGTGTTTGAAGCTAGGTATAGGCTCATCAAATCTCTATACGTACTGGGTGGAACGCGAGGAGAAACAATCAGAGAAATCGAGTGCAATCTCTTGCATCATTTCCAAACCGGGAATAGAGATGTTGATCAATTGGATCTCAGAAGTGTGTAAGAGTAAATACCATAGTCTTGTAAATTGTGTCGATAGTGGTATTTTATTCTTGTGGTCTAGAATAGTTCATTTAGCTAGAGTTTCAGTTTATGGTTATTGGAATCTTTGGTTTAGACAAGCGATGTGTGTGTTATTCATCTTTTTAGTTTCGAATTTTTCTAGTAAAATAGTTGGTTATCTTAAGAAATTAATTGTGAGTGAGAAGAAGCTAGCAATAAAGAATGAGGAAGGTTTTGTTGAAGTGCAAGGCCGAAAGGAAGAGTCTTTTGTCTTAAAATGGTGTGCCGCTGCGACTCTGTTTCTTAGTTTCCTAAACTATGACTGGGCAGTTGGATGTGTGTCAGCCATTGGAAAGATGAAAACAATATTTAGCGCACTAGGTCCAGATTTCATAGAAAAGCAAGATGGAGATGATGATCTAAAATTCACAACATTTGAGGTTGAGATTCCTGGAGATTCTAGAAGTTCAAGTGCACAAACATTTGGAGAATGGATTGAGCATTGTATTAAATACAATCTAGTTTCGATTGAGCCAACCACAAGTGGACCCATGTTAACTTTGGAACGTGGGAAAGCGAATGAATTAGCTGATCAGATAAATTGTTTGAATGCAACAGATATACGTGTTCACGGTGGAGTCGGAACGGGCAAGTCAACAACTCTACCATATGAGCTAATAAGGTACGGGGCAGTCCTTGTGTGTGTGCCTACGAGAGTTTTGGCAAATGCACTGCATGAGTCATTCATGAGCTTGTTTGGTTTTGATGTATCATTAGCTTATCGGGGTCGAGTCAGAACTGGTTCAAAACCAATTACTATCATGACATATGGGTATGCCTTGAATCATTTCCATCACAATCCCAGGAATTTAGCACAATTTCAATTCATAATAATGGATGAGGTTCACACATTTCCTGTTCATTTGAATCCTTTATTCTCATTGTTACGTGAGTTGAGCCCTGACAAGAAAATAATTAAGACATCGGCAACGCATGTTGGCCACAACGTTGATTTATCAACTAATCATAAAGTTGATATACACACACTTGAGGTAATGGATGTCAAGAAATGGGCTGAATTGCAGGGAACATCTGTGTTTGGTGATGTTACAAAGGAGTCTGGAAACATTTTGGTGTTTGTTGCATCATATAGGGATGTTGATGTTTGTGCAGATAAACTTAAGGACAAAGGATTTCCTGTAATTAAAGTTGATGGAAGAAATTTCAGGAAAAACACAGAAGTTCAGAAAATGGTGGACGGACTGCAAGGAGAGGTGAAGTTCATTGTCGCAACTAACATCATCGAGAATGGTGTTACCCTTGATGTTGATGTAGTTGTTGATTTTGGCGAACGCATAAGTCCAAATTTATGCTCAGAAGATAGGTGCATTCTAATGCAGAGGCAAAGAATTTCACAAGCTGAAAGGAAACAAAGATTTGGGAGAGTCGGGAGAATGAAGAGAGGCTCAGTGTACAAATTTGGAAGGGAGACGTTGCCTGATTCAATGAGAAGTAGAGTGGGGTCAACAGAGAGTGCATTAATTTGTTTTGCTTATGGTTTAAAACCAGTAGTTGATGATGTGGATATAGGGTCAGTTAGGAGTGTTACACAGAGGCAAGCTTTGACAGCATCTATGTTTGAAGCGAATTATATATTCACAGCTCACTTAGTAGATAAACAAGGTTTCATGCCGAGACCAGTTTTTGAGTTGATGAAAAGTCTTTTGCTACATACTGATGCGGTAGGGGTCAGTAGTACGTATTTAGCTACTAATATGAGTGGTTGGAGAAGGTTGAAAGAGTATATTAGAATTGACGATAGCTCACGTCATGTGCAAGAAGTTCAAATTCCGTGGTACTGCTCGGACATGAGTGATGATTTTATCGTTAAGTTAGCTGAGTGTGTCAAAGCTGCAAAGCCAAAATCGCAGTGTGGTTACAAAGTAGATAACGTTGATTTTCATACCGTAGCTCATAAAATAAGTATAGGAGAGTCAAATATAGATGAGTCAAGGGCGTTAGTGGCAACAATTTTAGATGAAGTCAAGCAGTGGAGAGATGGTATTACATACCATTCAAGTACACCCAGGAATAAGAGTTTGATGAGCTTGATGGTTGGGTGGATTCCAAGAAAAGCAGAGAAAACAAAAGAAATTCTTGACAACCGAATTCAGCGGCTCGAGTTACTCTTGAACCAGTTAAATGGAGTTAGAGGAATCGATGATTATGAATCTCTTGTTCGGTTTTTCAGTGAGAATCCTCATTCAGCAGAATATCTTGAATCACAATGTGCTAGTGATTATATTGAGGAGAAGGTTATGAGTGTTAAAAGAAATTACGATAAGTCACTAATTCTTGGTGTGGTTGGTCTAGCTGTTGCAACAGGCACGTTTGCTTACTGGTATATGAGGAGAAGTGCTGCAGTTGAACTCGTTGAAAAACAAGCGAAACACAAGTACAACAGAGATAAGCGAACAGGAAGATTGATGTTTGACATGGACGATCAAGAGACTTACGAGAATTTTGGTCCTGAGTACACAGATGATGTTATCTCTGCCAAGATGACAAAAGCTCAAAAAGAAAGGGATTCAAGGAAGAAAGGATGGAAAGCGGGGAAAATAAATCGACCTATGAGGGTATTTCATCAATTGTATGGAGTCAATCCTCTAGAATTCGATGAAGTTGTCATGAGAGTTGGTAAACTTGAGACTGAACCGTGGGATGTGAAAGAATTAAATGTTGATGCAATGATGATTGAATTGGATGATGATTATCATATTTTGCGGGATGATCGCATGTTTGGGAAGAAAGTTTCTTTAGCTTTCAGGAAAGAAGGGGCTGATGAGGAAACAATTGTTAATTTGACGCCACATCGGTCAAAAATGACGAGCAGCATGAGTTTAGCCCCAATGGGATTTCCAGAAGAAGAAGGTAGATGGAGGCAGACAGGTGCACCACTGATAAAGAAGACTGAAAAGGAAGATGAAGTTGAAGTTCAAGTTGCAAAACCAGAGCTAACAAATCCTTATGATCATATCTTGGTTAGACTTGGTAGAGCGCGTCTTGGGACTCGTGTACTAAATTGTTTCTTTCATGGGTCAAAATGCGTTATTCCATATCATTTAGCTGAGAAAGGAGATAGGGAA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| 7,541
|
MZ362878.1
|
Ugandan cassava brown streak virus
|
Wosula,E., Amour,M., Shirima,R.R., Mohammed,N.A., Hamza,A.A., Mouigni,H., Nouhou,S., Mchinda,N.M., Ceasar,G., Legg,J.P., Njukwe,E.
|
IITA-Tanzania, Virus Vector Ecology
|
Tanzania
|
2022-09-27
|
Comoros:Ngazidja19.5
|
Ugandan cassava brown streak virus
|
Ipomovirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,075
|
GenBank
| null |
Comoros
|
Comoros
|
Manihot esculenta
| null |
2019-07-02
| null | null |
Ugandan cassava brown streak virus strain AQHM2U, complete genome
|
AAAATAAACATGACATAAGAATACATAAAATTACATTGCATACCAATACAAAACGTCTAAACTCGCAAGAATTTGACACATTGCAAAAGGTTACAATTAAATTTTATCTATTTATAGCAAAGAGTACCTGAAGATGTCAACCATCCAGCTATTCAAGACTATTCAATTTGGATCCTTTGAGCCTGTCCAGCTCGACGAAGGTGACAAAACTATCCATAAAATCCCAGAGGATCTGCAGACAGTCCAAAATAGTTCCAGTCCTGAGGAACTATCAAAACATGGAAATCTGAGGATGATAAGCGGTGAAGGTCCAAAGAAGGAAAAAGTAATCGACTTATACTCCATAATTGGAAATTCTGTTTACTGCCGCAGTTATGTTGCGATGAAGAATTTTCTCAACGATACAAAGTGGGGAGGATTATTCAAAAATAAGAGAGGTCAAGAGTTAAAAGCAGCATCACGGTTACGGAGAGCTACTAGTTATGGGTTCATGTATGATCCTGTGGCATGTGCTTTTGAATGTCCTGTATGTCGTACAAAAGCAACAGCATTAGAGGCATTCACAAGTGATTGTGATCATTGTTTTGAGATCAAGCATATCGGTGACACTAGAACAGTTTTAACTGAAACAAAATTTTACTCAGTGAATCCAATTGAATTAGACTCAGATGATAGTGTGTTGGAGGCAGCGACTTCCGAGTGGGTTCGGGAGGGTGCACAGGAAGTGCTCATTGACAGAAATTTGGTTCTTGAAGATCGAGAGGTTAGGATTACTAAGAAAGCACTTGTCATTAAAAAGGAGAGGCCAAAAATTATTGCGAATGTTTCGAACCTGACAAGAGTGCTGACTGAAATTTGCTGTGAGTCAGGAATACCAATAATTGATATAGATAACCGCAAGCGAAAAGCTGTGCCTGTAGTGCGTTTGAAACATGTGTTTGGAAAGATTGAGAGTGATGACATGTTCCCTGAGGATAGGAATTTTCTGGAGCATCCAAATGCAAAGAAAGTGTTCCGCTCTTGGGAGAAAATTACTTATAGTATGATAAGACCTGGCTGGAGTGGAGCTATTGTGCTGAGAGATAATGTAGTTTTAGAGGACCATGATTGCTTTGATTTTGTTAATGACATGTGTGTGGTTCAAGGAAAGAATGAGAAGAGTGGTATCATTGAGAATGCTTTGCGTGTTAAAACGATGGATGAGTTAAGTCACATTGATTTATACTCTTTCAACTTGAGTTGGGCAAAATCACGGGAAAAATTCATAAAGCATTTTGAAGGAGATGTGAATAAGTTAGTGACCACCTGCTGCACTCCAAGCACATTGTGGCTTTATGCAAGAAAGGCAAGGTTTTATAAATTTGTTGATCACATGATTTTGAAAGGAAGTCCTATCATTGATATTCTTGTTAAAATGGAATACGTTGGTAAACACCTTGATATGTTTAATAGCATAGAGGATGTGTGTATCGAATATGCCCATTTTATGCAAGAATTAATTAGTGATACGATAACTGACAAGAGTGATGAAGGAATTCTTCGTGTTAAAAACATGATTCGGTCTCATTTTGATTCTATTTTAGAGTATAATAAGTATGAGTTAATAGATAGGATAATTGAGAAAAAAACACAGTTGCACGCACAAGAAGTTATGTCTCGCGAGCTCATCAGACACCAGTACGGAGAGTTATTTTCATGGCGCGAGCGTGTTTTAATCAAACTAGGTATCGGTTCATCAAGTTTGTCTACTTACTGGGAGGAACGCGAGAAGACACATTCAAAACAATTGAGTGCAATCTCTTGCATCATTTCCAAACCGGGAATAGAGGAGTTAACAAGATGGATCTTAGAAGTGTGTAGAAATAGATATCATGATGTTATTAATTGTGTAGATAATGGAGTTTTATTTTTATGGTCTAGGATTATGCACTTAGTTCGTATGTCAATTTATGGTTATTGGAATCTCTGGTTTAGGCAAGCAATATGTGTGTTTCTTGTTTTTATAGTTTCTACTTTTGCAAGTAAAATAGTTAGCTTCCTTAAGAAATTGATCACTAATGAGCGTAGGATTGCACTTAAGAATGAAGTTGATTTAGTAGAGGTGCAAGGGAGAAAAGAGGAGTCATTTGTTTTGAAGTGGTGTGCATTTGCAACACTTTTTCTTAGTTTTATAAACTATGATTGGGCTGTTGGATGCGTGTCAGCAATAGGGAAGATGAAAACGGTTTTTAGTGCACTAGGTCCTGAATTCATAGAAAAGCAAGATGGAGATGATGAGCTTAAATTCACAACATTTGAAGTTGAAATTCCAGGAGAAGTAGGATGCTCGAGTGCTCAGACATTTGGTGATTGGATTGAACATTGCATCAAATTTAATTTGACTGCTATTGAGCCAACAACGAGTGGACCATTGCTGACGCTTGAAAAAGAGAAATCAAGAGAATTAGCAGACCAGATCAATGGGATGAATGCGACTGATATACGAGTGCATGGAGGAGTTGGAACAGGGAAGTCAACATACTTACCTTACGAGCTCATACGATATGGTGCAGTGCTTGTTTGTGTTCCAACACGAGTTTTAGCGAATGCATTGCATGAATCTTTCATGAGCTTGTTTGGTTTTGATGTGTCGTTAGCGTATCGGGGACGAGTTAGAACAGGCTCGAAACCAATCACGATAATGACATATGGATATGCTCTAAATCATTTTCACCACAATCCAAAGAATCTGGCTCAATTTCAGTTTGTAATGATGGATGAAGTTCACACATTTCCAGTTCATTTGAATCCATTGTTCTCACTGTTAAAAGAGTTAAGTCCTGAGAAGAAGATTATCAAAACCTCAGCAACACATGTGGGGCATAACGTTGATCTGTCAACGAATTATAAAGTAGATATTCACACTCTTGGCCTTATGGATGTAAAGAAGTGGGCTGAGATTCAAGGAACTTCTGTTTTTGGTGATGTGACAAAAGAAGCAGGGAACGTTCTTGTCTTCGTGGCTTCATATAGTGATGTTGATAATTGTGCTAATACATTGAAGGACAAGGGCTTTCCGGTTCTTAAGGTTGACGGTAGGAACTTTAGGAAAAATACTGAAGTGCAAAAGCAAGTTGATGCGATGCAGGGTGAGACTAAATTCATTGTTGCGACCAACATAATCGAAAATGGAGTGACACTTGATGTTGATGTGGTCGTCGACTTCGGAGAGAAAATAAGCCCTAATTTGTGTTCAGAAGAAAGGTGCATTCTTTTGCAGAGACAGAGGATTTCACAAGCTGAGCGGAAACAGAGATTTGGTAGAGTTGGTCGAATGAAGAGAGGTGTTGTGTATAAGTTTGGAAAAGAGACTTTGCCAGATTCAATGAGAAATAGAGTAGGGTCTACTGAAAGCGCTCTTCTTTGTTTTGCTTATGGATTGAAGCCAGTTGTAGATGATGTTGATGTGTGTGCAGTGAGAACAGTAACTAAGAAGCAAGCACTTACAGCCTCAATGTTTGAAGCAAATTATATATTCACTGCTCATCTTGAGGACAAGCAAGGCTTTATGCCTAGGCCGGTTTATGAGCTGATGAAGAATCTTTTGTTGCATACAGACGCAGTAGGTGTGTGTAGTTCATATCTAGCAACTGACATGAGTGGATGGAGAAGAGTCAGAGAGTACATCAGGGTCAATGATGAATCACGTCATGTTCAAGAAGTGCGAATTCCATGGTATTGTTCAGACATGAGTGATGACTTCATCGTAAAGTTAGCTGAGTGTGTTAAAGCATCAAGACCCAAGTCTCAGTGTGGATATAAAGTTGATAATGTAGATTTTCATACAGTTGCACATAAAATAAGTGTAGGAGAGTCTAATATAGATGAGTCTAGAGCACTAGTTTCCACTGTTTTAGATGAAGTCAAAAGATGGAGGGATGGGATTACTTATCACTCGAGTACTCCACGGAACAAGAGCTTGATGAGTTTGATGGTTGGATGGATTCCGAGGAAAGCTGAGAGAACAAAAGAGATCTTGGACGATAGGATCCAGAGGCTTGAGCTGTTACTAAATCAGTTGAATGGTGTGCGTGGGATTGAAGATTATGAGTCTCTTGTCAGATTTTTCAGTGAAAATCCTCACTCTGCAGAGTATCTTGAGTCTCAATGTGCTAGTGACTATATTGAGGAAAAAGTGATGAGTGTGAATAAGAGTTATGATAAAGCACTAATCCTCAGTACAGTCGGCGTCGTTGTCGCAGCAGGTACATTTGCTTACTGGTATATGCGAAGAAGTGAATCAATGGAAAGGGTTGAGAAACAGGCTAAGCATAAGTACAATAGAGATAAGAGAACTGGTCGGCTTATGTTTGAAATGGATGACCGAGAAACGTATGAAACATTTGGTCCAGAGTATACAGATGATGTTATAATGGATAAAATGACAAAAGCACAAAAAGAAAGGGAATCACGAAAGAAAGGTTGGAAGGCTGGTAGAGTTAACCGACCAATGAGGGTGTTCAACCAGTTGTATGGAGTTAACCCACTTGAATTTGATGAAGTTGTTATGCGAGTGGGTAAGTGGGAGACTGAGCCATGGGACGTGAGAGAGATGAATATCGATGGCATGATGATCGAACTGAATGACGATTTTGGTATTTTGAGGGAAGATCGCATGCTTGGAAAGAAAGTGACACTTGCATTTAAGAAAGATGGGTCTGATGAAGAGACAATTGTCAATTTAACACCTCATCGATCAAAAATGACAAGTAGCATGAGTTTAGCACCAATGGGGTTCCCAGAAGAAGAAGGAAGGTGGAGACAGACAGGTGCACCATTTGTCAAGAAAGTGGACAAGATGGACGATGAAGTTGATGTGCAAGTTGCCAAGCCAGAGCCAACTAATCCATATGAGCATGTTCTAGTACGACTTGGGAGAGCGCATTTAGGGACGCGAGTTCTGAATTGTTTCTTCCATGGTACGAAGTGCATAATTCCATACCATTTGGCAGAAAAAGGAG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| 24,015
|
MK103391.1
|
Ugandan cassava brown streak virus
|
Scussel,S., Candresse,T., Marais,A., Claverie,S., Hoareau,M., Azali,H.A., Verdin,E., Tepfer,M., Filloux,D., Fernandez,E., Roumagnac,P., Robene,I., Lefeuvre,P., Jourda,C., Roux-Cuvelier,M., Lett,J.M., Lett,J.-M.
|
Cirad, UMR PVBMT
|
France
|
2019-05-30
|
Mayotte-Dembeni-Oussenitiva-2015
|
Ugandan cassava brown streak virus
|
Ipomovirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,076
|
GenBank
| 1
|
Mayotte: Dembeni
|
Mayotte
|
Manihot esculenta
| null |
2015-04-26
| null | null |
Ugandan cassava brown streak virus strain Comoros, complete genome
|
AAAAATAAACATGACATAAGAATACATAAAATTACATTGCAAACCAATACAAAACTTTAAAATTCGCAAGAATTCGACACATTGTAAAAGGTTACAATTAAATTTTATCTATTTCTAGCAAAGAGTATCTGAAGATGTCAACCATCCAGCTATTCAAGACTATTCAATTTGGATCCTTTGAGCCTGTCCAGCTCGACGAAGGTGACAAAACTATCTATAAAATCCCAGAGGATTTGCAGACAGTTCAGAATAGTTCTGGTCCTGAGGAACTATTAAAACATGAAAATCTGAGGATGATAAGCGGTGAAGGTCCGAAGAAGGAAAAAGTAATCGACTTATACTCCATAATTGGAAATTCTGTTTACTGCCGCAGTTATGTTGCGATGAAGAACTTTCTCAATGACACAAAGTGGGGAGGATTGTTCAAAAATAAGAGAGGTCAAGAGTTAAAAGCAGCGTCACGGTTACGGAGAGCTACTAGTTATGGTTTCATGTATGATCCCGTGGCATGTGCATTTGAGTGTCCTGTTTGTCGAACAAAAGCGACCGCACTAGAGGCATTCACAAGTGATTGTGATCATTGTTTTGAAATTAAGCATATTGGTGACACTAGAGCAGTTTTAACTGAAACAAAATTCTACTCAGTGAATCCAATTGAACTAGATTCAGATGATAGTGTGTTGGAGGCAGCGACCTCTGAGTGGATCCGGGAAGGTGCACAGGAAGTGCTCGTCGACAGGAACTTGGTTCTTGAAGATCGAGAGATTAGAATTACTAAGAAAGCACTTGTCATCAAAAAGGAGAGGCCGAAAATCGTTGCAAATGTTTCGAATTTGACAAGAGTGCTAACTGAGATCTGCTGTGAATCAGGAATACCAATAATTGATATAGATAACCGCAAGCGAAAAGCTGTGCCTGTGGTGCGTCTGAAACATGTGTTTGGAAAGATTGAGAGTGATGACATGTTCCCTGAGGATAGGAATTTTCTGGAGCATCCGAATGCAAGTAAAGTGTTCCGCTCTTGGGAGAGAATTACTTACAGCATGGTAAGACCTGGTTGGAGTGGAGCAATTGTGCTGAAAGATAATGTAGCTTTGGAGGACCATGAGTGCTTTGATTTTATTAATGACATGTGTGTGGTTCAAGGAAAGAATGAGAAGAGTGGTATCATCGAGAATGCTTTGCGAGTTAAGACGATGGATGAATTAAGTCACATTGATTTATACTCTTTTAACTTGAGTTGGGCAAAATCACGAGAAAAATTCATAAAGCATTTTGAAGGAGATGTGAACAAGTTAGTGACCACCTGCTGCACTCCTAGCACATTGTGGCTCTATGCAAGGAAGGCAAGGTTTTACAAGTTTGTTGATCATATGATTTTGAAAGGAAGTCCTATCATTGATATTCTTGTTAAAATGGAATATGTTGGTAAACACCTCGATATGTTTAATAGCATAGAGGATGTGTGTATTGAATATTCTCATTTTATGCAGGAGTTAATAAGTGATACGATAACCGACAAGAGTGATGAGGGAATTCTCCGTGTCAAGAATATGATTCGATCCCACTTTGATTCTGTCTTAGAGTATAATAAGTATGAATTAATAGATAGGATAATTGAGAAAAAAACACAGTTGCACGCACAAGAAGTTATGTCTCGCGAGCTCATCAGACATCAATACGGAGAGTTATTTTCATGGCGCGAGCGTGTTTTAATCAAACTAGGTATCGGTTCATCAAGTTTATCTACTTACTGGGAGGAACGCGAGAAGACACATTCAAAACAATTGAGTGCAATCTCTTGCATCATTTCCAAACCGGGAATGGAGGTGTTAACAAGATGGATCTCAGAAGTGTGTAGAAATAGATATCATGATGTTATTAATTGTGTAGATAATGGAGTTTTATTTTTATGGTCTAGGATTATGCATTTAGTTCGTATGTCAATTTATGGTTATTGGAATCTCTGGTTCAGGCAAGCAATATGTGTGTTTCTTGTTTTCTTAGTTTCTACTTTTGCAAGTAAAATAGTTAACTTTCTTAAGAAATTGATCACCAATGAGCGTAAAATTGCGCTTAAGAGCGAAGTGGATTTAGTGGAAGTGCAAGGGAGGAAAGAGGAGTCATTTGTCCTAAAGTGGTGTGCATTTGCAACACTGTTTCTTAGTTTTATAAACTATGATTGGGCTGTTGGGTGCGTGTCAGCAATTGGGAAGATGAAAACGGTTTTTAGTGCGTTAGGTCCTGAGTTCATAGAAAAGCAAGATGGAGATGATGAGCTTAAATTCACAACATTTGAAGTTGAAATCCCAGGAGAAGTAGGGTGTTCAAGCGTTCAGACATTTGGTGATTGGATTGAGCATTGCATTAAATTTAATTTAACTGCTATTGAGCCAACAACGAGTGGACCATTACTGACGCTTGAAAAAGAGAAATCAAGAGAATTAGCAGACCAGATCAATGGGATGAATGCAACTGATATACGAGTGCATGGAGGAGTTGGTACAGGGAAGTCAACATACTTGCCTTATGAGCTCATTCGATATGGTGCAGTGCTGATTTGTGTTCCAACACGAGTTTTAGCAAATGCATTGCATGAATCTTTCATGAGTTTGTTTGGCTTTGATGTTTCATTAGCGTATCGGGGACGAGTTAGAACAGGCTCGAAACCAATCACGATAATGACATATGGATATGCATTAAACCATTTTCACCATAATCCAAAGAATCTAGCTCAATTTCAGTTTGTGATGATGGATGAAGTTCACACATTTCCAATTCATCTGAATCCATTGTTCTCTCTGTTGCAAGAGTTAAGTCCTGAGAAGAAGATTATCAAAACTTCAGCAACACACGTGGGGCATAACGTTGATCTGTCAACGAATTATAGAGTTGATATTCACACTCTTAGCCTTATGGATGTGAAGAAATGGGCTGAGATGCAAGGGACATCTGTTTTTGGTGACGTGACAAAAGAAGCAGGGAACGTTCTTGTCTTCGTGGCTTCATACAGTGATGTCGATAATTGCACCAATGTGTTGAAGGATAAGGGCTTTCCGGTCCTTAAGGTTGATGGTAGAAACTTTAGGAAAAACACTGAGGTGCAAAAGCAAGTTGACGCGATGCAGGGCGAAACTAAATTTATCGTTGCGACCAACATAATCGAAAATGGAGTAACACTTGATGTTGATGTGGTCGTTGACTTTGGGGAGAAAATAAGCCCTAATTTGTGTTCAGAAGAAAGGTGCATTCTTTTGCAGAGACAGAGAATTTCACAAGCTGAGCGGAAACAGAGATTTGGTAGAGTTGGTCGAATGAAGAGAGGCGTTGTGTATAAGTTTGGAAAAGAGACTTTGCCGGATTCAATGAGGAGTAGAGTAGGATCAACTGAAAGTGCTCTTCTTTGTTTTGCTTATGGATTAAAGCCAGTTGTAGATGATGTTGATGTGTGTGCAGTGAGGACAGTAACTAAGAAGCAAGCACTTACAGCTTCAATGTTTGAAGCAAATTACATATTCACTGCTCATCTTGTGGATAAGCAAGGCTTTATGCCTAGACCGGTTTATGAGCTGATGAAGAATCTTTTGTTACATACTGATGCAGTAGGTGTGTGTAGTTCATATTTAGCAACTAATATGAGTGGATGGAGAAGAGTCAGAGAGTACATTAGGGTTGATGACGAATCACGTCATGTTCAAGAAGTACGAATTCCTTGGTATTGTTCTGATATGAGTGATGACTTCATTATAAAGTTAGCTGAGTGTGTCAAAGCGTCAAAACCCAAGTCTCAGTGCGGGTATAAAGTTGATAACGTAGATTTTCATACAGTTGCACATAAAATAAGTGTAGGAGAATCTAACATAGATGAGTCTAGAGCACTAGTTTCCACTGTCTTGGATGAAGTCAAAAGATGGAGAGATGGAATTACATATCATTCGAGCACTCCACGTAACAAGAGTTTGATGAGTTTGATGGTTGGATGGATTCCGAGGAAAGCTGAGAGAACGAAGGAGATTTTGGACAACAGGATCCAGAGGCTTGAGCTGTTATTAAATCAGTTGAATGGTGTGCGTGGGATTGAGGATTATGAGTCCCTTGTCAGATTTTTTAGTGAAAATCCTCATTCTGCAGAGTATCTTGAGTCTCAATGTGCTAGTGACTATATTGAGGAAAAAGTGATGAGTGTGAATAAGAGTTATGATAAGGCACTAATCCTTAGTACAGTCAGCATCGTTGTTGCAGCAGGTACATTTGCTTACTGGTATATGCGAAGGAGTGAATCAATGGAAAGAGTTGAGAAACAAGCTAAGCATAAATACAACAGAGACAAGAGAACTGGTCGGCTTATGTTTGATATGGATGATCGAGAAACGTTTGAAACGTTTGGTCCAGAGTATACAGACGATGTTATAATGGACAAAATGACAAAAGCACAAAAAGAAAGGGAGTCACGAAAGAAAGGTTGGAAGGCTGGTAAAGTTAACCGACCAATGAGGGTGTTCAACCAGTTGTATGGAGTTAATCCACTTGAGTTTGATGAAGTTGTTATGCGAGTGGGCAAGTGGGAGACTGAACCATGGGATGTGAGAGAGTTGAACATCGATGGCATGATGATTGAACTGAATGACGATTTTGGTATTTTGAGGGAAGATCGCATGCTTGGAAAGAAAGTGACACTTGCTTTTAAGAGAGATGGGTCTGATGAAGAGACAATTGTCAATTTAACACCTCATCGATCAAAAATGACAAGTAGCATGAGTCTAGCACCGATGGGATTCCCAGAGGAAGAAGGAAGGTGGAGACAGACAGGCGCACCATTTGTCAGGAAAGTGGATAAGATGGATGATGAAGTTGATGTGCAAGTTGCCAAACCAGAGCCAACTAATCCATATGAGCATGTTCTAGTACGACTTGGGAGGGCGCATTTAGGGACGCGAGTTCTAAATTGTTTCTTCCATGGTACAAAGTGCATAATTCCATATCATTTGGCAGAAAAAGGA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| 62,439
|
MF379362.1
|
Ugandan cassava brown streak virus
|
Mbewe,W., Winter,S., Mukasa,S., Tairo,F., Sseruwagi,P., Ndunguru,J., Duffy,S.
|
Bvumbwe Agriculture Research Station, Department of Agricultural Research Services
|
Malawi
|
2017-07-06
| null |
Ugandan cassava brown streak virus
|
Ipomovirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,070
|
GenBank
| null |
Malawi: Nkhatabay district
|
Malawi
|
Manihot esculenta
| null |
2013
| null | null |
Ugandan cassava brown streak virus strain Malawi, complete genome
|
TCACATACTCATGACATAAGAATACATAAAGATACATCGCATACAAACACTACGCATTCAAACTCGTGAGAAAGCAAGTTGTTACAAAGGTTTACGATACATCCTTATATATCCATAGCATTGAGTACCTGAAGATGTCAACTATCCAGCTATTCAAGACTATTACCTTCGGTTCCTTTGAGCCTGTCAAGCTTGATGAAGGAGACAACATTGTAGATAAGATCCCAACTGATCTTATGACAGGAAATGATAGCTTCGGTCCTGAGGAGCAATCAGTGCAGAAATACCATAGGAAAGAAAGTGGTGAAAGTTGGCGGAAAACGACCGACTTATATTCTGTAATTGGAAATTCTGTTTACTGTCGGAGTTACGTAGCAATGAAAAACTTCCTTAACGATACAAAGTGGGGAGGTTTATTTAAAAATAAGAAAGGGCAAGAACTGAAAGCTGCAGCAAGGCTTAGAAGAGCAACAAGTTATGGATTTATGTATGATCCGGTCGCTTGTGCCTTTGAATGCCCTGTTTGTAGAATGAAGGCTACAGCATTGGAAGCATTCACAAGTGATTGTGACCATTGCTTTGAGATCAAGCATATTGAGGATGATAGGATTGTTCAAACTGAAACAAAGTTTTATCCAATAAATCCTATTGAGTTGGATGTCGATGATGGGTTAGTTGAGGCAGCGTCGCTTGAATGGGTGAGAGGCGACGTGGAGGAAAGAGTTGTTGATAGGATGCTACTGCTTGAGGATAGAGAAATCCGTGTGACCAAGAGAGCTTTGATAAAGAGGAGAAGTGAAATGAAACTTGTGGTAAATGTTTCCGATCTCACAAGGAAACTAACTGAGATTTGCTGCGAGTCTGGAATCCCAATTATTGATATAGATAATTGCAAGAGAAAAGCCATTCCAATGGTGAAACTTAAGCATATCTTTGGGAAGATTGAGTGTGATGACATGTTTGAAGATGATCGATATTTCTTAGAGCATAAAAATGCGATTAAGATTTTCCGATCGTGTGAGAAGATCACTTATAAGATGATTCGTCCTGGATGGAGTGGGGCTATTATTCTTAAAGACAATGTGCAGAGGGAAGATCATGAAAAGTTTGATTTCATTAATGACATTTGTGTTGTTCAAGGAAAGAATTTGATTAACAATAGAATTGAGAATGCTATGCGTACTAAAACTGAGACAGAGATGGATTTGATTGATCTATACTCTTTTGATCTGAGTTGGGCAAAGTCGAAGAACAGGTTCATTAAGCATTTTGAAGATGATATAACCCAACTAATAAAGTCATGCTGCACCCCTAGTACGCTATGGTTGTATGCAAGGAAGGCTAGATTCTATAAGTTTGTGGATTATATGATCTTGAAGGGTAGTCCGATGATCGATATTCTTGTTAAGATGGAGTATGTAGGCAAACACCTAGAAATGTTCAATAGCATTGACGATGTGTGTATCGAATATGCTCATTTTATGAAGGAGTTGATCAGTGAGACTGTTAATGATAGATCAGATCCAGATGTGTTGCGTGTTAGAAATATAATTAGAGCACATTTTGAGTCAGTTTTAGAGTATAATAAGTATGAGTTGATTGATAGAATCATAGAGAAAAAAACACAATTAGAAGCACAAGAAATTATGTCTCGAGAGCTCATCAAACATCAATACGGAGAATTGTTTTCTTGGCGAGAACGCATATATATAAAATTAGGTATAGGATCATCAAATTTGCGTACATATTGGGAGGAACGAGAGGAGCAACATTCAGAGAGATCGAGAGCAATCTCCTTCATCATTTCCAAACCGGGAATAGAGATGTTGATCAATTGGGCCTCAGAAGTGTGTAGAAATAAATATCATAGCCTTGTAAATTGTGTTGACAGTGGTGTTTTGTTTTTGTGGTCTAGAATAGTCCATTTGATGAAAGCTTCAGTTTATGGTTATTGGAATCTTTGGTTTAGACAAGCAATGTGTGTGTTATTTGTTTTCATAATTTCGAACTTTTCTTGTAAATTAGTTAGTTATCTTAAGAAACTGATCATTAGCGAGAGGAAGTTAGCAATTAAGAATGAAGAAGGATTTGTTGAAGTGCAAGGTCGGAAAGAAGAGTCATTTGTCTTGAAATGGTGTGCTGTTGCAACCCTATTCCTCAGCTTCTTGAACTATGACTGGGCAGTAGGATGCGTGTCAGCTATTGGAAAGATGAAAACAATCTTTGGTGCACTTGGCCCAGATTTTATAGAAAAACAAGATGGAGATGATGATCTTAAGTTCACAACATTTGAAGTTGAAATTCCTGGAGATTCTAGGAGTTCGAGTGCACAAACTTTTGGGGAATGGATAGAGCATTGCATTAAATTCAATTTGGTTTCAATTGAGCCAACCACGAGTGGACCTATGTTAACTCTAGAGCGTGGGAAAGCTAATGAGCTAGCTGATCAAATCAATTGTTTGAATGCAACAGATATACGTGTGCACGGTGGAGTCGGGACGGGTAAGTCAACAGCTTTACCATATGAGCTAATAAGATATGGAGCGGTTCTTGTGTGCGTGCCAACAAGAGTTTTGGCAAATGCACTACATGAATCTTTCATGAGCTTATTTGGTTTTGATGTTTCATTGGCTTATCGAGGTCGGGTTAGAACAGGCTCAAAGCCTATTACAATCATGACATATGGATACGCTTTGAACCACTTTCATCATAATCCTAAGAATTTGGCGCAATTCCAATATGTGTTAATGGATGAAGTTCACACATTTCCTGTTCATTTGAATCCTCTGTTCTCACTATTACGTGAACTAAGTCCCGACAAGAAAATTATCAAGACATCAGCTACTCATGTTGGGCATAATGTTGATTTGTCGACTAATCATAAAGTTGACATTCATACACTTGAGATAATGGATGTGAAGAAATGGGCTGAACTACAAGGAACATCTGTGTTTGGTGATGTGACAAAGGAACATGGAAATGTTTTGGTCTTTGTTGCATCGTATAGAGATGTTGATGTATGTGCTGAAAAGTTGAAAGACAAAGGATTTCCTGTTATCAAGGTTGATGGGCGCAATTTTAGGAAGAACACGGAAGTCCAGAAGATGGTAGATGCAATGCAAGGAGAAGTGAAATTTATAGTTGCAACTAACATCATCGAGAATGGCATTACCCTTGATGTTGATGTGGTTGTCGACTTTGGTGAACGCATAAGTCCAAATTTGTGTTCAGAAGATAGATGCATCCTGATGCAAAGACAGAGAATCTCGCAGGCTGAGAGGAAGCAAAGATTTGGAAGAGTTGGGAGAATGAAGAGAGGCTCAGTGTATAAATTTGGAAGAGACACACTGCCTGATTCAATGAGGAGTAGAGTAGGGTCAACAGAGAGTGCGTTGATCTGCTTTGCTTATGGTCTGAAACCTGTAGTTGATGATGTAGATATAGGGTCAGTTAGGAGTGTGACGCAGAGACAAGCTTTAACAGCATCTATGTTTGAAGCAAATTATATATTCACAGCTCATTTGGTTGACAAACAAGGCTTTATGCCAAGACCAGTCTTTGAGTTGATGAAGAATCTTTTGTTGCATACAGATGCAGTAGGAGTAAGTAGTACGTATTTAGCTACTAATATGAGTGGTTGGAGAAGATTGAAGGAGTATGTTAGAATTGATGATAACTCACGTCATGTGCAAGAAGTCCAAATTCCATGGTATTGTTCAGATATGAGTGATGATTTTATCATTAAGTTAGCTGAGTGTGTGAAAGCCGCTAGGCCAAAATCGCAGTGTGGTTATAAGGTAGATAATGTAGATTTTCATACAGTAGCTCATAAGATAAGTGTAGGTGAGTCTAATATAGATGAGTCGAGAGCTTTAGTAGCAACAATTCTGGATGAGGTCAAGCAATGGAGAGATGGTATCACATATCACTCGAGTACTCCTAGAAACAAAAGCTTAATGAGTTTGATGGTTGGTTGGATTCCAAGGAAAGCGGAGAAAACAAAAGAAATTCTTGACAATAGAATTCAACGTCTCGAGTTACTCTTGAACCAATTAAATGGAGTGAGGGGAATCGATGACTATGAATCTCTTGTTCGATTTTTCAGCGAGAATCCACACTCAGCAGAATATCTCGAATCTCAATGTGCTAGTGATTACATCGAGGAAAAAGTGATGAATGTGAAAAGGAATTATGACAAATCACTAATTCTCGGTATGGTTGGGCTAGCTGTTGCAACAGGTACGTTTGCTTACTGGTATTTGAGAAGGAGTGCAGCAATAGAGCTAGTTGAGAAGCAAGCGAAGCATAAGTACAATAGAGATAAGAGAACAGGGAGGCTGATGTTTGACATGGATGATCAAGAAACATATGAAAATTTTGGCTCTGAATATGCTGATGATGTGATATCTGGAAAAATGACAAAAGCTCAGAAAGAAAGAGAGTCGAAGAAGAAAGGATGGAAAGCAGGTAAGGTTAATCGACCTATGAAAATCTTTCATCAATTGTATGGAGTTAACCCTCTAGAATTTGATGAGGTTGTCATGCGAGTTGGTAAGCTTGAGACTGAACCATGGGATGTGAAAGAGTTAAGTATTGATGGAATGTTGATCGAACTAGATGATGACCATCACATTTTGCGAGATGACCGAATGTATGGAAAGAAAGTTTCTTTGGCTTTCAAGAAGGAGGGATCAAATGAAGAAACGATCGTGAGTCTGACTCCACATCGATCAAAAATGGCAAGCAGCATGAGTTTGGCGCCAATGGGATTCCCAGAAGAAGAGGGTAGATGGAGACAAACAGGAGCGCCTGTGGTTAAGAAGATTGGGAAAGAAGATGAGGTTGAGGTTCAGGTTGCTAAGCCAGAGTCAACAAATCCTTATGATCATATCTTAGTTAGACTTGGTAGGGCACACCTTGGAACCCGTGTTTTGAACTGTTTCTTTCATGGGGCGAAATGTGTTATCCCATATCATTTAGCTGAGAAAGGGGATAGGGAA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| 75,926
|
KY825166.1
|
Ugandan cassava brown streak virus
|
Pasin,F., Bedoya,L.C., Bernabe-Orts,J.M., Gallo,A., Simon-Mateo,C., Orzaez,D., Garcia,J.A.
|
Centro Nacional de Biotecnologia (CNB-CSIC), Department of Plant Molecular Genetics
|
Spain
|
2017-07-05
|
Ke_125
|
Ugandan cassava brown streak virus
|
Ipomovirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,083
|
GenBank
| 1
| null | null |
Manihot esculenta
| null | null | null | null |
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Nanyiti,S., Foster,G.D., Bailey,A.M., Seal,S., Alicai,T., Mbanzibwa,D.R.
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University of Bristol, Biological Sciences
|
United Kingdom
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2017-05-17
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Kikombe
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Ugandan cassava brown streak virus
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Ipomovirus
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Potyviridae
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United Kingdom
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2017-05-17
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Kikombe-IC
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Ugandan cassava brown streak virus isolate Kikombe-IC, complete genome
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| 76,507
|
HG965222.1
|
Ugandan cassava brown streak virus
|
Beyene,G., Ilyas,M., Fauquet,C.M., Taylor,N., Alicai,T.
|
Ilyas M., IICI Trait Improvement Lab, Donald Danforth Plant Science Center, 975 N Warson Road, St. Louis, MO 63132
|
USA
|
2014-03-26
|
UCBSV-[UG;Kab;07]
|
Ugandan cassava brown streak virus
|
Ipomovirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,020
|
GenBank
| null |
Uganda:Kabanyoro
|
Uganda
|
Manihot esculenta
|
plant leaf
|
2007
| null | null |
Uganda cassava brown streak virus complete genome, isolate UCBSV-[UG;Kab;07]
|
TACGCACTCAAATTCGTGAGAAAGCAAGCTGTTACGAAAGTTTACGATACATCCTTATATATTCATAGCACTGAATACCTGCAGATGTCGACTATCCAGCTATTCAAGACTATTAGATTTGGTTCCTTTGAGCCTGTCAAGCTTGATGAAGGAAACAACGTTATAGAGAAGGTCCCAATTGATCTTCTGGCAGGAAATGATGGCTCTGGTCCTGAGGAGCAATCGGAACAGAAATACCATAGGAAAGAAAGCGGTGAAAGTTGGCGGAAAGTAACCGACTTATATTCTGTAATTGGAAATTCTGTTTACTGCCGCAGTTACGTAGCAATGAAAAACTTTCTCAATGATACAAAGTGGGGAGGTCTTTTCAAAAATAAGAAGGGGCAAGAACTAAAGGCTGCTGCAAGGCTCAGAAGGGCTACAAGCTATGGATTCATGTATGATCCAGTTGCTTGTGCCTTTGAATGCCCTGTTTGCAGAACAAAAGCTACAGCATTGGAAGCATTCACAAGCGATTGTGATCATTGTTTCGAAGTCAAGCACATTGATGACGATAGGATCGTTCAAACTGAAACAAAGTTTTATCCAATAAATCCTATTGAACTGGATGTTGAGGATAACTTAGTGGAAGCTGCATCGCTCGAATGGTTGAAAGGTGAAGTGGAGGAGAGAGTTGTAGACAGGGTTTTACTACTTGAGGACAAGGAGATTCGTGTTACAAAGAAAGCTCTAGTCAAAAGGAGAGCTGAGACAAAACTAGTGGCTAACGTTGCTGATCTTACCAAGAAATTGACTGAAATTTGCTGTGAGTCTGGTATCCCTATCATTGACATTGATAACAGCAAGAGGAAAGCCATTCCGATGGTCAAACTCAAGCATATCTTTGGGAAAATTGAGTGTGATGACATGTTTGGGGAAGATCGGTATTTCCTGGAGCATAGCAATGCAGGGAAAATTTTCCGATCATGTGAGAGAATTACTTATAGGATGATTCGTCCTGGATGGAGTGGAGCAATCATTCTAAGAGACAATGTTCAGGGAGAGGATCATGATAAGTTTGACTTTATCAATGATATTTGTGTTGTTCAAGGGAAGAATCTAATAAGCAACAAAATTGAGAACGCCATGCGCGTCAAGACTGAAACAGAAATGGACTTAATTGATTTGTATTCTTTCAATCTTAGTTGGGCGAAATCAAAAGATAAGTTCATTAAGCACTTTGAAAGTGATACAACTCAATTAATTAGATCGTGTTGCACTCCTAGTACATTGTGGTTGTACGCAAGGAAAGCCAGGTTTTACAAATTTGTGGATCACATGATCTTAAAGGGTAGTCCAATAATTGATATTCTAGTTAAAATGGAGTATGTTGGCAAACATTTGGATTTGTTTAATAGTGTCGAAGATGTGTGCACTGAGTATTCTCATTTCATGAAGGAGTTAATTAGTGAAACTGTCAACGATAAATCAGATCCAGATGTGTTGCGCGTTAGAAATTTGATAAGAGCGCATTTTGAGTCAGTCTTAGAATACAATAAGTATGAGTTGATAGATAGGATAATTGAGAAAAAAACTCAGTTAGAAGCACAAGAAATTATGTCTCGCGAGCTCATCAGACATCAGTACGGAGAGTTATTTTCTTGGCGCGAACGTTTGTATTTGAAACTAGGTATAGGCTCATCGAATCTCTATACATACTGGGTGGAACGCGAAGAGAAACAATCAGAGAAATCGAGTGCAATCTCTTGCATCATTTCCAAACCGGGAATAGAGATGTTGATCAATTGGGTCTCAGAAGTGTGTAAGAGTAAATATCATAGTCTTGTAAATTGTGTCGATAGTGGTATTTTGTTCTTGTGGTCTAGAATAGTTCATTTAGCGAGAGTTTCAGTTTATGGTTATTGGAATCTTTGGTTTAGACAAGCTATGTGTGTGTTATTCATTTTCTTAGTCTCAAATTTCTCTTGTAAAATAGTTAATTATCTTAAGACATTAATTGTGAATGAGAAGAAGCTAGCTATAAAGAATGAAGAAGGTTTCGTTGAAGTACAAGGCCGAAAAGAAGAGTCTTTTGTTTTAAAGTGGTGTGCTGCTGCAACTCTGTTTCTTAGTTTTCTAAACTATGATTGGGCAGTTGGATGTGTATCAGCCATTGGAAAGATGAAAACAATATTTAGTGCACTAGGTCCAGATTTCATAGAAAAGCAAGATGGGGATGATGATCTTAAATTCACAACATTTGAAGTTGAGATTCCTGGGGATTCTAGAAGTTCAAGTGCACAAACGTTTGGAGAATGGATTGAGCATTGCATTAAATTCAATTTAGTTTCAATTGAGCCAACTACGAGTGGGCCCATGCTAACTTTAGAGCGTGGGAAAGCGAATGAGTTAGCTGATCAGATAAATTGTTTAAATGCAACAGATATACGTGTGCACGGTGGAGTTGGAACGGGTAAGTCAACAGCTCTACCATATGAGCTAATAAGATACGGAGCAGTCCTTGTTTGTGTGCCTACGAGAGTTTTGGCAAATGCACTGCATGAGTCATTCATGAGCTTGTTTGGTTTTGATGTGTCATTAGCTTATCGGGGTCGAGTCAGAACTGGTTCAAAGCCAATTACTATCATGACATATGGATATGCCTTGAATCATTTCCATCACAATCCCAGGAACTTAGCACAATTTCAGTTCATAATAATGGATGAGGTTCACACATTTCCTGTTCATTTAAATCCTTTATTCTCATTGTTGCGTGAGTTGAGCCCTGACAAGAAAATAATCAAGACATCAGCAACGCATGTTGGCCACAATGTTGATTTATCAACTAATCATAAAGTTGATATACATACACTTGAGATAATGGATGTCAAGAAATGGGCTGAATTACAAGGAACATCTGTATTTGGTGATGTAACAAAGGAACCTGGAAATGTTTTGGTGTTCGTTGCATCATATAGGGATGTTGATGTTTGTGCAGAGAAGCTCAAGGATAAAGGATTTCCTGTAATTAAAGTTGATGGAAGAAATTTCAGGAAAAATACAGAAGTTCAGAAAATGGTGGACGGAATGATAGGAGAGGTGAAGTTCATTGTTGCAACTAATATCATCGAAAATGGTGTCACCCTTGACGTTGATGTAGTTGTTGATTTTGGTGAACGCATAAGTCCAAATCTATGCTCAGAAGATAGATGCATTTTAATGCAGAGGCAAAGAATCTCACAAGCTGAAAGAAAGCAGAGATTTGGAAGAGTTGGGAGAATGAAGAGAGGCTCAGTATACAAATTTGGAAGGGAGACGTTACCTGATTCAATGAGAAATAGAGTGGGGTCAACAGAGAGTGCATTAATTTGTTTTGCTTATGGTTTGAAACCAGTAGTTGATGATGTAGATATAGGGTCAGTTAGGGGCGTAACACAGAGACAAGCTTTGACAGCATCTATGTTTGAAGCAAATTATATATTCACAGCTCACTTAGTGGACAAACAAGGTTTCATGCCGAGACCAGTTTTTGAGTTGATGAAAAGTCTTTTGCTACATACTGATGCGGTTGGGGTCAGTAGTACGTATTTAGCTACTAATATGAGTGGTTGGAGAAGGTTGAAAGAGTATATTAAAATTGACGATAGCTCACGCCATGTGCAAGAAGTTCAAATTCCGTGGTACTGCTCAGACATGAGTGATGATTTTATCGTTAAGTTAGCTGAGTGTGTCAAAGCTGCAAAGCCAAAATCACAGTGTGGTTACAAAGTAGATAATGTAGATTTTCATACCGTAGCTCATAAAATAAGTGTAGGAGAGTCAAATATAGATGAGTCAAGGGCTTTAGTGGCAACAATTCTAGATGAAGTCAAGCAGTGGAGAGATGGCATCACATACCATTCAAGCACACCTAGGAACAAGAGTTTGATGAGTTTGATGGTTGGGTGGATTCCAAGGAAAGCAGAGAAAACAAAGGAAATTCTTGACAATCGGATTCAGCGTCTCGAGTTACTATTGAACCAGTTAAATGGAGTCAGAGGAATCGATGATTATGAATCCCTTGTTCGGTTTTTCAGCGAGAATCCTCATTCAGCGGAATATCTTGAATCACAATGCGCTAGTGATTATATCGAGGAGAAAGTTATGAGTGTCAAAAGAAATTATGATAAATCACTAATTCTTGGTATGGTTGGTCTAGCTGTTGCAACAGGCACGTTCGCTTACTGGTATATGAGGAGAAGTGCTGCGGTTGAGCTCGTTGAAAAACAAGCGAAACACAAGTATAACAGAGATAAGCGAACAGGGAGATTGTTGTTTGATATGGATGATCAAGAGACTTATGAAAATTTTGGTGCTGAATACACAGATGATGTTATCTCTGCCAAGATGACAAAAGCTCAGAAAGAGAGGGATTCAAAGAAGAAAGGATGGAAAGCAGGTAAAATAAATCGACCTATGAGAGTGTTTCATCAATTATATGGAGTTAATCCTCTTGAATTCGATGAAGTTGTCATGAGAGTTGGTAAACTTGAGACTGAACCGTGGGATGTGAAAGAACTAAATGTTGATGCAATGATGATTGAATTGGATGATGATTATCACATTTTACGGGATGATCGAATGTTTGGAAAGACAGTTTCTCTGGCTTTTAAGAAAGAAGGGGCTCACGAGGAAACAATTGTGAATTTGACTCCACATCGGTCAAAAATGGCAAGTAGCATGAGCTTAGCCCCAATGGGATTTCCAGAAGAAGAGGGTAGATGGAGGCAGACAGGAGCACCACTGATAAAGAAGATTAAAACGGAAGATGAAGTTGAAGTTCAAGTTGCAAAGCCAGAGCCAACAAATCCTTATGATCATATCTTGGTTAGACTTGGCAGAGCGCATCTTGGGACTCGTGTATTGAATTGTTTCTTCCATGGGTCAAAATGCGTTATTCCATATCATTTAGCTGAGAAAGGAGATAGGGAAGAGTCATTAGTTATTGCAACTACAAGAGGACAGTTTGATTTTGGACCAAT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| 91,290
|
HM181930.1
|
Ugandan cassava brown streak virus
|
Patil,B.L., Ogwok,E., Wagaba,H., Mohammed,I.U., Yadav,J.S., Bagewadi,B., Taylor,N.J., Kreuze,J.F., Maruthi,M.N., Alicai,T., Fauquet,C.M., Mbanzibwa,D.R., Tian,Y.P., Tugume,A.K., Abarshi,M.M., Changadeya,W., Mkumbira,J., Muli,M.B., Mukasa,S.B., Tairo,F., Baguma,Y., Kyamanywa,S., Kullaya,A., Valkonen,J.P.
|
Donald Danforth Plant Science Center, ILTAB
|
USA
|
2010-12-07
| null |
Ugandan cassava brown streak virus
|
Ipomovirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,070
|
GenBank
| 2
|
Uganda
|
Uganda
|
Manihot esculenta
| null |
2004
| null | null |
Ugandan cassava brown streak virus strain UG[Uganda:Namulonge:2004], complete genome
|
AAAAATAAACATGACATAAGAATACATAAAAATACATCGCATACAAACACTGTGCATTCAAATTTGTGAGAAAGCAAGCTGTTACGAAAGTTTACGATACATTTTTATATATTTATAGCACTGAATACCTGCAGATGTCGACTATCCAGCTATTCAAGACTATCACCTTTGGTTCCTTTGAGCCTATCAAGCTTGATGAAGAGAACAACATTATAGAGAAAATTCCAACTGATCTTCTGGCAGGAAATGATGGCTCTGGTCCTGAGGGGCAATCAGAACAGAAATACCATAGGAAAGAAAGCGGTGAAAGTTGGCGGAAAGTAACTGACTTATATTCTGTAATTGGAAATTCTGTTTACTGCCGCAGTTATGTAGCAATGAAAAACTTCCTCAATGACACAAAGTGGGGAGGTCTTTTCAAGAATAAGAAGGGGCAAGAATTAAAGGCTGCTGCAAGGCTCAGAAGGGCTACAAGCTATGGATTCATGTATGATCCAGTTGCTTGTGCCTTTGAATGTCCTGTTTGTAGAACAAAAGCAACAGCATTGGAAGCGTTTACAAGCGATTGTGATCATTGTTTTGAAATCAAGCACATTGATGATGATAGGTTCGTTCAGACTGAAACAAAGTTTTATCCAATAAATCCTATTGAACTGGATGTTGAGGATAACTTAGTGGAAGCTGCATCGCTTGAGTGGTTGGGAAGTGATGTGGAAGAGAGAGTTGTAGACAGGGTTTTACTACTTGAGGATAAGGAGATTCGTGTTACGAAGAAAGCCCTAATTAAAAGAAGAGGTGAGACAAGACTCGTGGCAAATGTTTCTGATCTTACCAGGAAATTGACTGAAATTTGTTGTGAGTCTGGGATTCCTATCATTGATATTGATAATAGCAAGAGGAAAGCCATTCCAATGGTTAAACTCAAGCATATCTTTGGGAAAATTGAGTGTGATGACATGTTTGAAGAAGATCGGTATTTCTTGGAGCATAAAAATGCAGGAAAAATTTTCCGATCATGCGAGAAAATTACTTATAGGATGATTCGTCCTGGATGGAGCGGAGCGATCATTTTGAGAGACAATGTTCAGGGAGAGGATCGTGATAAGTTTGATTTTATCAACGACATTTGTGTTGTTCAAGGGAAGAGTCTGATTAGCAATAAAATTGAAAATGCCATGCGCGTTAAGACCAAAACAGAGGTGGACTTAATTGATTTATATTCTTTCAATCTTAGTTGGGCAAAATCGAAAGATAAGTTCATTAAGCACTTTGAAAGTGATATAACTCAATTAGTTAGATCATGTTGCACTCCTAGTACATTGTGGTTATACGCAAGGAAAGCCAGGTTTTACAAATTTGTAGATTACATGATCTTGAAGGGTAGTCCAATAATTGATATTCTAGTTAAAATGGAGTATGTTGGCAAGCATTTGGACATGTTCAATAGTGTCGAAGATGTGTGCACTGAGTATTCTCATTTTATGAAGGAGATAATTAGTGAAACTGTCAACGATAAATTGGATCCAGATGTGTTGCGCGTTAGAAATTTGATTAGAGCGCATTTTGAGTCAGTCTTAGAATATAACAAGTATGAGTTAATAGATAGAATAATTGAGAAAAAAACACAGTTAGAAGCACAAGAAATTATGTCTCGCGAGCTCATCAAACATCAGTACGGAGAGTTATTTTCTTGGCGCGAACGCTTGTGTTTGAAGCTAGGTATAGGCTCATCAAATCTCTATACGTACTGGGTGGAACGCGAGGAGAAACAATCAGAGAAATCGAGTGCAATCTCTTGCATCATTTCCAAACCGGGAATAGAGATGTTGATCAATTGGATCTCAGAAGTGTGTAAGAGTAAATACCATAGTCTTGTAAATTGTGTCGATAGTGGTATTTTATTCTTGTGGTCTAGAATAGTTCATTTAGCTAGAGTTTCAGTTTATGGTTATTGGAATCTTTGGTTTAGACAAGCGATGTGTGTGTTATTCATCTTTTTAGTTTCGAATTTTTCTAGTAAAATAGTTGGTTATCTTAAGAAATTAATTGTGAGTGAGAAGAAGCTAGCAATAAAGAATGAGGAAGGTTTTGTTGAAGTGCAAGGCCGAAAGGAAGAGTCTTTTGTCTTAAAATGGTGTGCCGCTGCGACTCTGTTTCTTAGTTTCCTAAACTATGACTGGGCAGTTGGATGTGTGTCAGCCATTGGAAAGATGAAAACAATATTTAGCGCACTAGGTCCAGATTTCATAGAAAAGCAAGATGGAGATGATGATCTAAAATTCACAACATTTGAGGTTGAGATTCCTGGAGATTCTAGAAGTTCAAGTGCACAAACATTTGGAGAATGGATTGAGCATTGTATTAAATACAATCTAGTTTCGATTGAGCCAACCACAAGTGGACCCATGTTAACTTTGGAACGTGGGAAAGCGAATGAATTAGCTGATCAGATAAATTGTTTGAATGCAACAGATATACGTGTTCACGGTGGAGTCGGAACGGGCAAGTCAACAACTCTACCATATGAGCTAATAAGGTACGGGGCAGTCCTTGTGTGTGTGCCTACGAGAGTTTTGGCAAATGCACTGCATGAGTCATTCATGAGCTTGTTTGGTTTTGATGTATCATTAGCTTATCGGGGTCGAGTCAGAACTGGTTCAAAACCAATTACTATCATGACATATGGGTATGCCTTGAATCATTTCCATCACAATCCCAGGAATTTAGCACAATTTCAATTCATAATAATGGATGAGGTTCACACATTTCCTGTTCATTTGAATCCTTTATTCTCATTGTTACGTGAGTTGAGCCCTGACAAGAAAATAATTAAGACATCGGCAACGCATGTTGGCCACAACGTTGATTTATCAACTAATCATAAAGTTGATATACACACACTTGAGGTAATGGATGTCAAGAAATGGGCTGAATTGCAGGGAACATCTGTGTTTGGTGATGTTACAAAGGAGTCTGGAAACATTTTGGTGTTTGTTGCATCATATAGGGATGTTGATGTTTGTGCAGATAAACTTAAGGACAAAGGATTTCCTGTAATTAAAGTTGATGGAAGAAATTTCAGGAAAAACACAGAAGTTCAGAAAATGGTGGACGGACTGCAAGGAGAGGTGAAGTTCATTGTCGCAACTAACATCATCGAGAATGGTGTTACCCTTGATGTTGATGTAGTTGTTGATTTTGGCGAACGCATAAGTCCAAATTTATGCTCAGAAGATAGGTGCATTCTAATGCAGAGGCAAAGAATTTCACAAGCTGAAAGGAAACAAAGATTTGGGAGAGTCGGGAGAATGAAGAGAGGCTCAGTGTACAAATTTGGAAGGGAGACGTTGCCTGATTCAATGAGAAGTAGAGTGGGGTCAACAGAGAGTGCATTAATTTGTTTTGCTTATGGTTTAAAACCAGTAGTTGATGATGTGGATATAGGGTCAGTTAGGAGTGTTACACAGAGGCAAGCTTTGACAGCATCTATGTTTGAAGCGAATTATATATTCACAGCTCACTTAGTAGATAAACAAGGTTTCATGCCGAGACCAGTTTTTGAGTTGATGAAAAGTCTTTTGCTACATACTGATGCGGTAGGGGTCAGTAGTACGTATTTAGCTACTAATATGAGTGGTTGGAGAAGGTTGAAAGAGTATATTAGAATTGACGATAGCTCACGTCATGTGCAAGAAGTTCAAATTCCGTGGTACTGCTCGGACATGAGTGATGATTTTATCGTTAAGTTAGCTGAGTGTGTCAAAGCTGCAAAGCCAAAATCGCAGTGTGGTTACAAAGTAGATAACGTTGATTTTCATACCGTAGCTCATAAAATAAGTATAGGAGAGTCAAATATAGATGAGTCAAGGGCGTTAGTGGCAACAATTTTAGATGAAGTCAAGCAGTGGAGAGATGGTATTACATACCATTCAAGTACACCCAGGAATAAGAGTTTGATGAGCTTGATGGTTGGGTGGATTCCAAGAAAAGCAGAGAAAACAAAAGAAATTCTTGACAACCGAATTCAGCGGCTCGAGTTACTCTTGAACCAGTTAAATGGAGTTAGAGGAATCGATGATTATGAATCTCTTGTTCGGTTTTTCAGTGAGAATCCTCATTCAGCAGAATATCTTGAATCACAATGTGCTAGTGATTATATTGAGGAGAAGGTTATGAGTGTTAAAAGAAATTACGATAAGTCACTAATTCTTGGTGTGGTTGGTCTAGCTGTTGCAACAGGCACGTTTGCTTACTGGTATATGAGGAGAAGTGCTGCAGTTGAACTCGTTGAAAAACAAGCGAAACACAAGTACAACAGAGATAAGCGAACAGGAAGATTGATGTTTGACATGGACGATCAAGAGACTTACGAGAATTTTGGTCCTGAGTACACAGATGATGTTATCTCTGCCAAGATGACAAAAGCTCAAAAAGAAAGGGATTCAAGGAAGAAAGGATGGAAAGCGGGGAAAATAAATCGACCTATGAGGGTATTTCATCAATTGTATGGAGTCAATCCTCTAGAATTCGATGAAGTTGTCATGAGAGTTGGTAAACTTGAGACTGAACCGTGGGATGTGAAAGAATTAAATGTTGATGCAATGATGATTGAATTGGATGATGATTATCATATTTTGCGGGATGATCGCATGTTTGGGAAGAAAGTTTCTTTAGCTTTCAGGAAAGAAGGGGCTGATGAGGAAACAATTGTTAATTTGACGCCACATCGGTCAAAAATGACGAGCAGCATGAGTTTAGCCCCAATGGGATTTCCAGAAGAAGAAGGTAGATGGAGGCAGACAGGTGCACCACTGATAAAGAAGACTGAAAAGGAAGATGAAGTTGAAGTTCAAGTTGCAAAACCAGAGCTAACAAATCCTTATGATCATATCTTGGTTAGACTTGGTAGAGCGCGTCTTGGGACTCGTGTACTAAATTGTTTCTTTCATGGGTCAAAATGCGTTATTCCATATCATTTAGCTGAGAAAGGAGATAGGGAA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| 100,033
|
FJ185044.1
|
Ugandan cassava brown streak virus
|
Monger,W.A., Alicai,T., Ndunguru,J., Kinyua,Z.M., Potts,M., Reeder,R.H., Miano,D.W., Adams,I.P., Boonham,N., Glover,R.H., Smith,J.
|
Central Science Laboratory, Plant Health
| null |
2009-11-10
| null |
Ugandan cassava brown streak virus
|
Ipomovirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,070
|
GenBank
| 1
|
Uganda
|
Uganda
|
Manihot esculenta
| null |
2006
| null | null |
Ugandan cassava brown streak virus strain Ugandan, complete genome
|
AAAAATAAACATGACATAAGAATACATAAAAATACATCGCATACAAACACTGTGCATTCAAATTTGTGAGAAAGCAAGCTGTTACGAAAGTTTACGATACATTTTTATATATTTATAGCACTGAATACCTGCAGATGTCGACTATCCAGCTATTCAAGACTATCACCTTTGGTTCCTTTGAGCCTATCAAGCTTGATGAAGAGAACAACATTATAGAGAAAATTCCAACTGATCTTCTGGCAGGAAATGATGGCTCTGGTCCTGAGGGGCAATCAGAACAGAAATACCATAGGAAAGAAAGCGGTGAAAGTTGGCGGAAAGTAACTGACTTATATTCTGTAATTGGAAATTCTGTTTACTGCCGCAGTTATGTAGCAATGAAAAACTTCCTCAATGACACAAAGTGGGGAGGTCTTTTCAAGAATAAGAAGGGGCAAGAATTAAAGGCTGCTGCAAGGCTCAGAAGGGCTACAAGCTATGGATTCATGTATGATCCAGTTGCTTGTGCCTTTGAATGTCCTGTTTGTAGAACAAAAGCAACAGCATTGGAAGCGTTTACAAGCGATTGTGATCATTGTTTTGAAATCAAGCACATTGATGATGATAGGTTCGTTCAGACTGAAACAAAGTTTTATCCAATAAATCCTATTGAACTGGATGTTGAGGATAACTTAGTGGAAGCTGCATCGCTTGAGTGGTTGGGAAGTGATGTGGAAGAGAGAGTTGTAGACAGGGTTTTACTACTTGAGGATAAGGAGATTCGTGTTACGAAGAAAGCCCTAATTAAAAGAAGAGGTGAGACAAGACTCGTGGCAAATGTTTCTGATCTTACCAGGAAATTGACTGAAATTTGTTGTGAGTCTGGGATTCCTATCATTGATATTGATAATAGCAAGAGGAAAGCCATTCCAATGGTTAAACTCAAGCATATCTTTGGGAAAATTGAGTGTGATGACATGTTTGAAGAAGATCGGTATTTCTTGGAGCATAAAAATGCAGGAAAAATTTTCCGATCATGCGAGAAAATTACTTATAGGATGATTCGTCCTGGATGGAGCGGAGCGATCATTTTGAGAGACAATGTTCAGGGAGAGGATCGTGATAAGTTTGATTTTATCAACGACATTTGTGTTGTTCAAGGGAAGAGTCTGATTAGCAATAAAATTGAAAATGCCATGCGCGTTAAGACCAAAACAGAGGTGGACTTAATTGATTTATATTCTTTCAATCTTAGTTGGGCAAAATCGAAAGATAAGTTCATTAAGCACTTTGAAAGTGATATAACTCAATTAGTTAGATCATGTTGCACTCCTAGTACATTGTGGTTATACGCAAGGAAAGCCAGGTTTTACAAATTTGTAGATTACATGATCTTGAAGGGTAGTCCAATAATTGATATTCTAGTTAAAATGGAGTATGTTGGCAAGCATTTGGACATGTTCAATAGTGTCGAAGATGTGTGCACTGAGTATTCTCATTTTATGAAGGAGATAATTAGTGAAACTGTCAACGATAAATTGGATCCAGATGTGTTGCGCGTTAGAAATTTGATTAGAGCGCATTTTGAGTCAGTCTTAGAATATAACAAGTATGAGTTAATAGATAGAATAATTGAGAAAAAAACACAGTTAGAAGCACAAGAAATTATGTCTCGCGAGCTCATCAAACATCAGTACGGAGAGTTATTTTCTTGGCGCGAACGCTTGTGTTTGAAGCTAGGTATAGGCTCATCAAATCTCTATACGTACTGGGTGGAACGCGAGGAGAAACAATCAGAGAAATCGAGTGCAATCTCTTGCATCATTTCCAAACCGGGAATAGAGATGTTGATCAATTGGATCTCAGAAGTGTGTAAGAGTAAATACCATAGTCTTGTAAATTGTGTCGATAGTGGTATTTTATTCTTGTGGTCTAGAATAGTTCATTTAGCTAGAGTTTCAGTTTATGGTTATTGGAATCTTTGGTTTAGACAAGCGATGTGTGTGTTATTCATCTTTTTAGTTTCGAATTTTTCTAGTAAAATAGTTGGTTATCTTAAGAAATTAATTGTGAGTGAGAAGAAGCTAGCAATAAAGAATGAGGAAGGTTTTGTTGAAGTGCAAGGCCGAAAGGAAGAGTCTTTTGTCTTAAAATGGTGTGCCGCTGCGACTCTGTTTCTTAGTTTCCTAAACTATGACTGGGCAGTTGGATGTGTGTCAGCCATTGGAAAGATGAAAACAATATTTAGCGCACTAGGTCCAGATTTCATAGAAAAGCAAGATGGAGATGATGATCTAAAATTCACAACATTTGAGGTTGAGATTCCTGGAGATTCTAGAAGTTCAAGTGCACAAACATTTGGAGAATGGATTGAGCATTGTATTAAATACAATCTAGTTTCGATTGAGCCAACCACAAGTGGACCCATGTTAACTTTGGAACGTGGGAAAGCGAATGAATTAGCTGATCAGATAAATTGTTTGAATGCAACAGATATACGTGTTCACGGTGGAGTCGGAACGGGCAAGTCAACAACTCTACCATATGAGCTAATAAGGTACGGGGCAGTCCTTGTGTGTGTGCCTACGAGAGTTTTGGCAAATGCACTGCATGAGTCATTCATGAGCTTGTTTGGTTTTGATGTATCATTAGCTTATCGGGGTCGAGTCAGAACTGGTTCAAAACCAATTACTATCATGACATATGGGTATGCCTTGAATCATTTCCATCACAATCCCAGGAATTTAGCACAATTTCAATTCATAATAATGGATGAGGTTCACACATTTCCTGTTCATTTGAATCCTTTATTCTCATTGTTACGTGAGTTGAGCCCTGACAAGAAAATAATTAAGACATCGGCAACGCATGTTGGCCACAACGTTGATTTATCAACTAATCATAAAGTTGATATACACACACTTGAGGTAATGGATGTCAAGAAATGGGCTGAATTGCAGGGAACATCTGTGTTTGGTGATGTTACAAAGGAGTCTGGAAACATTTTGGTGTTTGTTGCATCATATAGGGATGTTGATGTTTGTGCAGATAAACTTAAGGACAAAGGATTTCCTGTAATTAAAGTTGATGGAAGAAATTTCAGGAAAAACACAGAAGTTCAGAAAATGGTGGACGGACTGCAAGGAGAGGTGAAGTTCATTGTCGCAACTAACATCATCGAGAATGGTGTTACCCTTGATGTTGATGTAGTTGTTGATTTTGGCGAACGCATAAGTCCAAATTTATGCTCAGAAGATAGGTGCATTCTAATGCAGAGGCAAAGAATTTCACAAGCTGAAAGGAAACAAAGATTTGGGAGAGTCGGGAGAATGAAGAGAGGCTCAGTGTACAAATTTGGAAGGGAGACGTTGCCTGATTCAATGAGAAGTAGAGTGGGGTCAACAGAGAGTGCATTAATTTGTTTTGCTTATGGTTTAAAACCAGTAGTTGATGATGTGGATATAGGGTCAGTTAGGAGTGTTACACAGAGGCAAGCTTTGACAGCATCTATGTTTGAAGCGAATTATATATTCACAGCTCACTTAGTAGATAAACAAGGTTTCATGCCGAGACCAGTTTTTGAGTTGATGAAAAGTCTTTTGCTACATACTGATGCGGTAGGGGTCAGTAGTACGTATTTAGCTACTAATATGAGTGGTTGGAGAAGGTTGAAAGAGTATATTAGAATTGACGATAGCTCACGTCATGTGCAAGAAGTTCAAATTCCGTGGTACTGCTCGGACATGAGTGATGATTTTATCGTTAAGTTAGCTGAGTGTGTCAAAGCTGCAAAGCCAAAATCGCAGTGTGGTTACAAAGTAGATAACGTTGATTTTCATACCGTAGCTCATAAAATAAGTATAGGAGAGTCAAATATAGATGAGTCAAGGGCGTTAGTGGCAACAATTTTAGATGAAGTCAAGCAGTGGAGAGATGGTATTACATACCATTCAAGTACACCCAGGAATAAGAGTTTGATGAGCTTGATGGTTGGGTGGATTCCAAGAAAAGCAGAGAAAACAAAAGAAATTCTTGACAACCGAATTCAGCGGCTCGAGTTACTCTTGAACCAGTTAAATGGAGTTAGAGGAATCGATGATTATGAATCTCTTGTTCGGTTTTTCAGTGAGAATCCTCATTCAGCAGAATATCTTGAATCACAATGTGCTAGTGATTATATTGAGGAGAAGGTTATGAGTGTTAAAAGAAATTACGATAAGTCACTAATTCTTGGTGTGGTTGGTCTAGCTGTTGCAACAGGCACGTTTGCTTACTGGTATATGAGGAGAAGTGCTGCAGTTGAACTCGTTGAAAAACAAGCGAAACACAAGTACAACAGAGATAAGCGAACAGGAAGATTGATGTTTGACATGGACGATCAAGAGACTTACGAGAATTTTGGTCCTGAGTACACAGATGATGTTATCTCTGCCAAGATGACAAAAGCTCAAAAAGAAAGGGATTCAAGGAAGAAAGGATGGAAAGCGGGGAAAATAAATCGACCTATGAGGGTATTTCATCAATTGTATGGAGTCAATCCTCTAGAATTCGATGAAGTTGTCATGAGAGTTGGTAAACTTGAGACTGAACCGTGGGATGTGAAAGAATTAAATGTTGATGCAATGATGATTGAATTGGATGATGATTATCATATTTTGCGGGATGATCGCATGTTTGGGAAGAAAGTTTCTTTAGCTTTCAGGAAAGAAGGGGCTGATGAGGAAACAATTGTTAATTTGACGCCACATCGGTCAAAAATGACGAGCAGCATGAGTTTAGCCCCAATGGGATTTCCAGAAGAAGAAGGTAGATGGAGGCAGACAGGTGCACCACTGATAAAGAAGACTGAAAAGGAAGATGAAGTTGAAGTTCAAGTTGCAAAACCAGAGCTAACAAATCCTTATGATCATATCTTGGTTAGACTTGGTAGAGCGCGTCTTGGGACTCGTGTACTAAATTGTTTCTTTCATGGGTCAAAATGCGTTATTCCATATCATTTAGCTGAGAAAGGAGATAGGGAA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| 101,927
|
FN434109.1
|
Ugandan cassava brown streak virus
|
Winter,S., Koerbler,M., Stein,B., Pietruszka,A., Paape,M., Butgereitt,A.
|
Winter S., DSMZ, Plant Virus Department, Messeweg 11/12, 38104
|
Germany
|
2009-08-18
|
Ug_23
|
Ugandan cassava brown streak virus
|
Ipomovirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,070
|
GenBank
| 1
|
Uganda:Namulonge
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Uganda
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Manihot esculenta
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plant leaf
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2007
| null | null |
Ugandan cassava brown streak virus, complete genome, isolate Ug_23
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AAAAATAAATATGACATAAGAATACATAAAGATACATCGCATACAAACACTACGCACTCAAATTCGTGAGAAAGCAAGCTGTTACGAAAGTTTACGATACATCCTTATATATTCATAGCACTGAATACCTGAAGATGTCAACTATCCAGCTATTCAAGACTATCAGATTTGGTTCCTTTGAGCCTGTTAAGCTCGATGAAGGAAACAATGTTGTAGAGAAGATCCCAGTTGACCTTCTGGCAGGAAATGATGGCTCTGGTCCTGAGGAGCAATCAGAACAGAAATACCATAGGAAAGAAAGTGGTGAAAGTTGGCGGAAAGTAACCGACTTATATTCTGTAATTGGAAATTCTGTCTACTGCCGCAGTTACGTAGCAATGAAAAACTTCCTCAATGACACAAAGTGGGGAGGTCTTTTCAAAAATAAGAAGGGGCAAGAATTAAAGGCTGCAGCAAGACTCAGAAGGGCTACAAGCTATGGATTCATGTATGATCCAGTCGCTTGTGCCTTTGAATGTCCTGTTTGCAGAACAAAAGCAACAGCACTAGAAGCGTTCACAAGTGATTGTGATCATTGTTTTGAAATCAAGCACATTGATGATAACAGGATCGTTCAGACTGAAACAAAGTTTTATCCAATAAATCCTATTGAACTGGATGTTGAAGATAACTTAGTGGAAGCTGCATCACTTGAATGGTTGAAAGGTGATGTAGAAGAGAAAATTGTAGACAGGGTCTTACTACTTGAGGATAAGGAAATCCGCGTCACAAAGAAAGCCCTAGTCAAAAGAAGAGCTGAGACAAAACTCGTGGCAAATGCTGCCGATCTTACCAAGAAATTGACTGAAATCTGTTGTGAATCTGGAATTCCTATCATCGATATTGATAATAGCAAGAGGAAAGCCATTCCAATGGCCAAACTCAAGCATATCTTTGGAAAAATTGAGTGTGATGACATGTTTGAAGAAGATCGGTATTTCCTGGAGCACAGCAATGCAGGGAAAATTTTCCGATCATGCGAGAAAACTACCTATAGGATGATTCGTCCTGGATGGAGTGGAGCAATCATTTTAAAAGATAATGTTCAGAGAGAGGATCATGATAAATTTGATTTTATCAATGATATTTGCGTTGTTCAAGGGAAGAATCTGATTAGCAACAAAATTGAGAATGCCATGCGCGTCAAGACTGAAACAGAAATGGACTTAATTGATTTGTACTCCTTCAATCTCAGTTGGGCAAAATCGAAAGATAAGTTCATTAAGCATTTTGAAAGTGATACAACTCAACTAGTTAGATCATGCTGCACTCCTAGCACATTATGGTTGTATGCAAGGAAAGCCAGGTTTTACAAATTTGTGGATCACATGATCTTAAAGGGTAGTCCAATAATTGATATCCTAGTTAAAATGGAGTATGTAGGCAAGCATCTAGACATGTTCAATAGTGTCGAAGATGTGTGCACTGAGTATTCTCATTTTATGAAGGAATTAATTAGCGAAACTGTTAATGACAAGTCAGATCCAGATGTGTTGCGCGTTAGAAATCTGATTAGAGCGCATTTTGAGTCAGTTTTAGAATACAATAAGTATGAGTTGATAGATAGGATAATAGAGAAAAAAACACAGTTAGAAGCACAAGAAATTATGTCTCGCGAGCTCATCAAACATCAGTACGGAGAGTTATTTTCTTGGCGCGAACGGTTATGTTTGAAACTAGGTATAGGCTCATCAAATCTCTATACATACTGGGTGGAACGAGAGGAAAAACAATCAGAGAAATCGAATGCAATCTCTTGCATCATTTCCAAACCGGGAATAGAGATGTTGATCAATTGGGTCTCAGAAGTGTGTAAGAGTAAATATCATAGTCTTGTAAATTGTGTCGATAGTGGTATTTTATTCTTGTGGTCTAGAATAGTTCATTTAGCGAGAGTTTCAGTTTATGGTTATTGGAATCTCTGGTTTAGACAAGCAATGTGTGTGTTATTCATTTTCTTAGTTTCAAATTTCTCTAGTAAAATAGTTAGTTATCTTAAGAAATTAATTGTGAGTGAGAAAAAGCTAGCCATAAAGAACGAAGAAGGTTTCGTTGAAGTGCAAGGCCGAAAGGAAGAGTCTTTTGTTCTAAAATGGTGCGCTGCTGCAACTCTGTTTCTTAGTTTCCTAAACTATGACTGGGCAGTTGGGTGTGTATCAGCCATTGGAAAGATGAAAACAATATTTAGCGCACTAGGTCCAGACTTCATAGAAAAGCAAGATGGGGACGATGATCTTAAATTCACAACATTTGAAGTTGAGATTCCTGGAGATTCTAGAAGTTCAAGCGCACAAACGTTTGGAGAATGGATTGAGCATTGCATTAAATTCAACTTAGTTTCAATTGAACCAACCACGAGTGGACCCATGCTAACTTTGGAGCGTGGGAAAGCGAATGAATTAGCTGACCAGATAAATTGTTTGAATGCAACAGACATACGTGTGCATGGTGGAGTTGGAACGGGTAAGTCAACAGCTCTACCATACGAGCTAATAAGGTACGGAGCAGTCCTCATGTGTGTGCCTACGAGAGTTCTGGCAAACGCATTGCATGAGTCATTCATGAGCTTGTTTGGATTTGATGTGTCATTAGCCTATCGGAGCCGAGTCAGAACTGGGTCAAAACCAATTACTATCATGACATATGGATATGCCCTGAATCATTTCCATCACAATCCCAGGAATTTAGCACAATTTCAATTCATAATAATGGATGAGGTCCACACATTCCCTGTTCATTTAAATCCTTTATTCTCATTGTTGCGTGAGTTGAGCCCTGACAAGAAAATAATCAAGACATCAGCAACACATGTTGGCCATAATGTTGATCTATCAACTAACCACAAAGTTGATATACACACACTTGAGATAATGGATGTCAAGAAATGGGCTGAATTACAAGGAACATCTGTGTTTGGTGATGTGACAAAGGAACCTGGAAATGTTTTGGTGTTCGTCGCATCATATAGGGATGTTGATGTTTGTGCAGAGAAGCTCAAGGATAAAGGATTCCCTGTAATTAAAGTTGATGGAAGAAATTTCAGGAAAAACACAGAAGTTCAGAAAATGGTGGACGGAATGCAAGGAGAGGTGAAATTCATTGTCGCAACTAATATCATCGAAAATGGTGTTACCCTTGACGTTGATGTAGTTGTGGATTTTGGCGAACGCATAAGTCCAAACTTATGCTCAGAAGATAGGTGCATTTTAATGCAGAGGCAAAGAATCTCACAAGCTGAAAGAAAACAAAGATTTGGGAGAGTCGGGAGAATGAAGAGAGGCTCAGTATACAAATTTGGAAGGGAGACGTTACCTGATTCAATGAGAAATAGAGTGGGGTCAACAGAGAGTGCATTAATTTGTTTTGCTTACGGTTTAAAACCAGTAGTTGATGATGTGGATATAGGGTCAGTCAGGAGTGTCACACAGAGGCAAGCTCTGACAGCATCTATGTTTGAAGCAAATTACATATTCACAGCCCACTTAGTGGACAAACAAGGTTTCATGCCGAGACCAGTTTTTGAGTTGATGAAAAATCTTCTGCTACACACAGATGCAGTTGGAGTCAGTAGTACATATTTAGCAACTAACATGAGTGGTTGGAGAAGGTTAAAAGAGTATATTAGAATTGACGATAACTCACGTCACGTGCAAGAAGTTCAAATTCCATGGTACTGTTCAGACATGAGTGACGATTTTATCGTTAAGTTAGCTGAGTGTGTCAAAGCTGCAAAGCCAAAATCACAGTGTGGGTACAAAGTAGATAACGTAGATCTTCATACCGTAGCTCATAAAATAAGTGTAGGAGAGTCAAACATAGATGAGTCAAGGGCTTTAGTGGCAACAATTTTAGATGAAGTCAAACAGTGGAGAGATGGTATCACATACCATTCAAGCACACCAAGGAATAAGAGCCTGATGAGTTTGATGGTTGGATGGATTCCAAGAAAAGCAGAGAAAACAAAGGAAATTCTTGACAATCGGATTCAGCGTCTCGAGTTACTCTTGAACCAATTAAATGGAGTCAGAGGAATCGATGATTATGAATCCCTTGTTCGGTTTTTCAGTGAGAATCCTCATTCAGCGGAATATCTTGAATCACAATGTGCTAGTGACTATATCGAGGAGAAGGTTATGAGTGTCAAAAGAAACTACGATAAGTCACTAATTCTTGGTATGGTTGGTTTAGCTGTTGCAACAGGCACGTTTGCTTACTGGTATATGAGGAGAAGTGCTGCGGTTGAACTCGTTGAAAAACAAGCGAAACACAAGTACAACAGAGATAAGCGAACAGGAAGATTGATGTTTGATATGGATGATCAAGAGACCTACGAGAATTTTGGTCCTGAATACACAGATGATGTTATCTCTGCCAAGATGACAAAAGCTCAGAAAGAAAGGGATTCAAAGAAGAAAGGATGGAAAGCAGGTAAAATAAATCGACCTATGAGAGTGTTTCATCAACTGTATGGAGTCAATCCCCTTGAATTCGATGAAGTTATCATGAGAGTTGGTAAACTTGAGACTGAACCGTGGGATGTGAAAGAATTAAATGTTGATGCAATGATGATCGAATTGGATGATGATTATCACATTTTACGGGATGATCGAATGTTTGGAAAGAAAGTTTCTTTAGCTTTCAAGAAAGAAGGGGCTGATGAGGAAACAATTGTAAATTTGACTCCACATCGATCAAAAATGGCAAGTAGCATGAGCTTAGCCCCAATGGGATTTCCAGAAGAAGAGGGTAGATGGAGGCAGACAGGAGCACCACTGATAAAGAAGATTAGGAAGGAAGATGAAGTTGAAGTTCAAGTTGCAAAGCCAGAGCCAACAAATCCTTATGACCATATCTTGGTTAGACTTGGTAGAGCACATCTTGGTACTCGTGTATTGAATTGTTTCTTTCATGGGTCAAAGTGCGTTATTCCATATCATTTAGCTGAGAAAGGAGACAGGGAA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| 102,411
|
FJ039520.1
|
Ugandan cassava brown streak virus
|
Mbanzibwa,D.R., Tian,Y., Mukasa,S.B., Valkonen,J.P., Tugume,A.K., Valkonen,J.P.T.
|
University of Helsinki, Applied Biology
|
Finland
|
2009-05-14
|
MLB3
|
Ugandan cassava brown streak virus
|
Ipomovirus
|
Potyviridae
|
ssRNA(+)
| 9,069
|
GenBank
| 1
|
Tanzania
|
Tanzania
|
Manihot esculenta
| null |
2007
| null | null |
Ugandan cassava brown streak virus isolate MLB3, complete genome
|
AAAAATAAACATGACATAAGAATACATAAAGATACATCGCATACAAACACTACGCATTCAAACTCGTGAGAAAGCAAGCTGTTCCAAAAGTTTACGATACATCCTTATATATTCATAGCACTGAGTACCTGAAGATGTCAACCATCCAGCTATTCAAGACTATCACCTTTGGTTCCTTTGAGCCTGTCAAGCTTGACGGAGAGGGCAACATTGTAGAGAAAATTCCAACTGATCTTATGACAGGAGATGATAGCTTCGGTCCTGAGGAGCAATCAAAACAGAAGCACCATAGGAAAGAAAGCGGTGAAAGTTGGCGGAAAGTAACCGATTTATATTCTGTAATTGGAAATTCTGTCTACTGTCGGAGTTACGTAGCAATGAAAAACTTCCTTAACGATACAAAGTGGGGAGGTCTTTTCAAAAACAAGAGAGGACAAGAACTGAAAGCTGCAGCAAGGCTTAGGAGAGCAACAAGCTATGGATTTATGTATGATCCGGTCGCTTGTGCCTTTGAATGCCCTGTTTGTAGAATGAAGGCTACAGCATTAGAAGCATTCACAAGTGATTGTGACCATTGCTTTGAAATTAAGCATATTGAGGACGACAGGATTGTTCAAACTGATACAAAGTTTTATCCAATAAATCCTATCGAGTTAGATGTCGATGATGGGTTAGTTGAGGCAGCGTCGCTCGAATGGATGAAAAGTGACGTGGAGGAAAAAGTTGTTGATAGGATGCTATTGCTTGAGGATAGAGAAATCCGTGTGACTAAGAAAGCTTTGATAAAGAGGAGAAGTGAAATGAAGCTTGTTGCAAATGTTTCTGATCTCACAAGGAAACTAACTGAGATTTGCTGCGAGTCAGGAATCCCAATTATCGATATAGATAATTGCAAGAGAAAAGCCATTCCAATGGTGAAACTTAAGCATATCTTTGGGAAAATTGAGTGTGATGACATGTTTGAAGATGATCGACATTTCTTAGAGCATGAAAATGCAAGTAAGATTTTCCGATCATGTGAGAGGATCACTTATAAGATGATTCGTCCTGGATGGAGTGGGGCAATTATTCTTAAAGACAATGTGCAGAGAGAAGATCATGAAAAGTTTGATTTCATTGATGATATTTGTGTTGTTCAAGGAAAGAATCTGATTGACAAGAGAATTGAGAATGCCATGCGCATTAAAACTGAAACAGAGATGGATTTGATTGATTTATACTCATTTGATCTGAGTTGGGCAAAGTCAAAGGATAAGTTCATTAAGCATTTTGAAGGTGATGCAACCCAACTAATAAAGTCATGTTGCACTCCTAGCACGCTATGGTTGTATGCAAGAAAGGCTAGATTCTATAAGTTTGTGGATCATATGATCTTGAAAGGTAGTCCGATAATTGATATTCTTGTTAAGATGGAGTATGTAGGCAAACATCTAGAAATGTTTAATAGCATTGATGATGTGTGTATTGAATATGCCCATTTTATGAAGGAGTTGATTAGCGAGACTGTCAATGATAAATCAGATCCAGAAGTGTTGCGTGTTAGGAACATAATTAGAGCACATTTTGAGTCAGTTTTAGAGTATAATAAGTATGAGCTGATTGATAGAGTCATAGAGAAAAAAACACAATTAGAAGCACAAGAAATTATGTCTCGAGAGCTCATCAAACATCAATACGGAGAATTATTTTCTTGGCGAGAACGTATATGTATAAAATTAGGTATAGGATCATCAAATCTATATACATATTGGGAGGAGCGAGAGGAGCAACATTTAGAGAGATCGAGAGCAATCTCCTTCATCATTTCCAAACCGGGAATAGAGATGTTGATCAACTGGGCCTCAGAAGTGTGTAAAAATAAATACCATAGCCTTGTAAATTGTGTTGATAGTGGTGTTTTGTTTTTGTGGTCTAGAATAGTTCATTTGATGAAAGCTTCAGTTTATGGATATTGGAATCTTTGGTTTAGGCAAGCAATGTGCGTGTTATTTGTTTTCTTAATTTCAAACTTTTCTGGTAAACTAGTTAGTTATCTTAAGAAATTGATTATTAATGAGAGGAAGTTAGCAATTAAGAATGAAGAAGGTTTTGTTGAAGTGCAAGGTCGGAAAGAAGAGTCATTTGTCTTGAAATGGTGTGCTGTTGCAACTCTATTCCTCAGTTTCTTGAACTATGATTGGGCAGTAGGGTGCGTGTCAGCTATTGGTAAGATGAAAACTATCTTTGGTGCACTTGGCCCAGATTTTATAGAGAGACAAGATGGAGATGATGATCTTAAGTTTACAACATTTGAAGTTGAAATTCCTGGAGATTCTAGGAGTTCGAGTGCACAAACTTTTGGAGAATGGATAGAACATTGCATTAAATTCAATTTGGTTTCAATTGAGCCAACCACGAGTGGACCTATGTTAACTTTAGAGCGTGGGAAGGCTAATGAGCTAGCTGATCAAATCAATTGTTTAAATGCAACAGATATACGTGTGCATGGTGGAGTTGGAACGGGTAAGTCAACATCTTTACCATATGAGCTAATAAGATATGGAGCAGTTCTTGTGTGTGTGCCAACAAGAGTTTTGGCAAATGCACTGCATGAATCTTTCATGAGCTTATTTGGCTTTGATGTTTCATTGGCTTATCGAGGTCGAGTTAGAACAGGCTCAAAGCCTATTACAATCATGACATATGGATACGCTTTGAACCACTTTCATCATAATCCTAAGAACTTGGCGCAATTCCAATTTGTGTTAATGGATGAAGTTCACACATTTCCTGTTCATTTGAATCCTCTGTTCTCACTGTTACGTGAATTAAGTCCTGACAAGAAAATTATTAAAACATCAGCTACCCATGTTGGGCATAATGTTGATTTGTCAACTAATCATAAAGTTGACATTCATACACTTGAGATGATGGACGTAAAGAAATGGGCTGAACTACAAGGAACATCTGTGTTCGGTGATGTGACAAAGGAACATGGAAATGTCTTGGTTTTTGTTGCATCGTACAGAGACGTTGATGTATGTGCTGAAAAGTTGAAGGACAAGGGGTTTCCCGTTATTAAGGTTGATGGGCGCAATTTCAGGAAGAACACGGAAGTTCAAAAGATGGTAGATGCAATGCAAGGAGAAGTGAAATTTATAGTTGCAACTAACATCATTGAAAATGGTGTAACTCTTGATGTTGATGTAGTTGTTGATTTTGGTGAACGCATAAGTCCAAATTTGTGTTCAGAAGAGAGATGCATCCTTATGCAAAGACAGAGAATCTCACAGGCTGAGAGGAAGCAAAGATTTGGAAGAGTTGGAAGAATGAAGAGAGGCTCAGTGTATAAATTTGGAAGAGATACATTACCTGATTCAATGAGGAGTAGAGTAGGGTCAACAGAAAGTGCATTGATTTGCTTTGCTTATGGTCTTAAACCTGTAGTTGATGATGTGGATATAGGGTCAGTTAGGAGCGTTACACAGAGGCAAGCTTTAACAGCGTCTATGTTTGAAGCAAATTATATATTCACAGCTCATTTGGTTGACAAACAAGGCTTTATGCCAAGACCAGTTTTTGAGTTGATGAAGAATCTTTTGTTGCATACAGATGCGGTTGGAGTAAGTAGTACATACTTAGCTACTAATATGAGTGGTTGGAGAAGATTGAAAGAGTATGTTAGAATTGATGATAGCTCACGTCATGTGCAAGAAGTCCAAATTCCATGGTATTGTTCAGATATGAGTGACGATTTTATCATTAAGTTAGCTGAGTGTGTGAAAGCTGCAAAGCCAAAATCGCAGTGTGGTTATAAGGTCGATAATGTAGATTTTCATACAGTAGCTCATAAAATAAGTGTAGGTGAGTCTAACATAGATGAGTCACGAGCTTTGGTAGCAACAATTCTAGATGAGGTTAAGCAATGGAGAGATGGCATCACGTATCATTCGAGCACTCCCAGAAATAAAAGCTTGATGAGTTTAATGGTTGGATGGATTCCAAGGAAAGCGGAAAAAACAAAAGAAATTCTTGATAATAGAGTTCAACGTCTTGAGTTACTCTTGAACCAATTAAATGGAGTGAGAGGAATCGATGACTATGAATCTCTTGTTCGGTTTTTCAGTGAGAATCCACACTCAGCAGAATATCTCGAATCTCAATGTGCTAGTGACTACATCGAGGAAAAAGTGATGAATGTAAAAAGGAATTATGACAAATCACTAATTCTCGGTATGGTTGGGCTAGCTGTTGCAACAGGAACGTTTGCTTACTGGTACATGAGAAGGGATGCAGCAATAGAGCTAGTTGAGAAGCAAGCGAAACATAAGTACAATAGAGACAAGAGGACAGGGAGACTGATGTTTGACATGGATGACCAAGAAACATATGAGAATTTTGGCTCTGAATATACTGATGATGTTATATCTGCAAAAATGACAAAAGCTCAAAAAGAAAGAGAGTCAAAGAAGAAAGGATGGAAAGCTGGCAAGGTGAATCGACCTATGAGAATCTTTCATCAGTTGTATGGAGTCAACCCTCTAGAATTTGATGAGGTTGTCATGCGAGTTGGTAAGCTTGAGACTGAACCATGGGATGTGAAAGAGTTAAATGTTGATGGAATGTTGATCGAACTAGATGATGACTATCACATCCTACGAGATGACCGAATGTATGGAAAGAAAGTATCTCTGGCTTTCAAGAAGGAAGGATCAAATGAAGAAACAATTGTGAGTCTGACTCCGCATCGATCGAAAATGGCAAGCAGTATGAGTTTGGCGCCAATGGGATTCCCAGAAGAAGAGGGTAGATGGAGACAAACAGGAGCACCTGTGGTCAAGAAAATTGAGAAAGAAGAGGAGGTTGAAGTTCAGGTTGCTAAGCCAGAGCCAACAAACCCTTATGACCATATCTTGGTTAGACTTGGTAGGGCACATCTTGGAACCCGTGTTTTGAATTGTTTCTTTCACGGGACGAAATGTGTTATCCCTTATCATTTAGCTGAGAAAGGGGATAGGGAG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| 103,094
|
NC_006551.1
|
Usutu virus
|
Moureau,G., Cook,S., Lemey,P., Nougairede,A., Forrester,N.L., Khasnatinov,M., Charrel,R.N., Firth,A.E., Gould,E.A., de Lamballerie,X., Melian,E.B., Hinzman,E., Nagasaki,T., Wills,N.M., Nouwens,A.S., Blitvich,B.J., Leung,J., Funk,A., Atkins,J.F., Hall,R., Khromykh,A.A., Bakonyi,T., Kolodziejek,J., Weissenbock,H., Nowotny,N., Url,A., Lussy,H., Rebel-Bauder,B.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2004-12-17
| null |
Orthoflavivirus usutuense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
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ssRNA(+)
| 11,066
|
RefSeq
| 4
|
Austria
|
Austria
| null | null | null | null |
PRJNA485481
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Usutu virus, complete cds
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ACAGAAGAGATCTGAGGCTGATGGCAAACGCCATCTGTTCAGCAGTCCCCAGCAATTGGGTTCCCACTGGCAGGACTTCATGGTCAGTGCATGCCACAGGTGAATGGATGACAACTGATGACATGTTGGAAGTGTGGAACAAAGTGTGGATCCAAGACAACGAATGGATGCTGGACAAGACCCCAGTTCAAAGCTGGACAGACATCCCTTACACCGGGAAGCGGGAAGACATATGGTGTGGAAGCCTGATAGGCACGCGAACACGGGCAACGTGGGCTGAAAACATCTACGCAGCCATTAACCAGGTGAGAGCCATTATTGGCCAGGAAAAATACAGGGATTACATGCTTTCACTTAGAAGATATGAAGAAGTTAATGTCCAGGAGGACAGGGTTTTGTAAATAAGTGTTTAGGGTTTTGCAATTTAATTAAATATGCAATGTAATTTAGTTGTAAATATTTGATTGTGTAGCTTTATTTAGCATTGTTTTAGGATAGTAGAAGTTAAGGTTTTATTTAGTTATTTTATTTAATTGAATTTGATAGTCAGGCCAGGGCAACCTGCCACCGGAAGTTGAGTAGACGGTGCTGCCTGCGACTCAACCCCAGGCGGACTGGGTTAACAAAGCTGACCGCTGATGATGGGAAAGCCCCTCAGAACCGTTTCGGAGAGGGACCCTGCCTATTGGAAGCGTCCAGCCCGTGTCAGGCCGCAAAGCGCCACTTCGCCAAGGAGTGCAGCCTGTACGGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGAAAGGCCCCCACGGCCCAAGCGAACAGACGGTGATGCGAACTGTTCGTGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGTGGAACTTAGGTGCGGCCCAAGCCGTTTCCGAAGCTGTAGGAACGGTGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGCATCATAAGCATCAAAAAAACAGCATATTGACACCTGGGAATTAGACTAGGAGATCTTCTGCTCTATTCCAACATCAACCACAAGGCACAGAGCGCCGAAAATTGTGGCTGGTGGGGAACTAGACCACAGGATCT
| 8,315
|
PP104383.1
|
Usutu virus
|
Savini,G., Monaco,F., Teodori,L., Amatori,G., Marcacci,M., Valleriani,F.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale 'G. Caporale', Viral Foreign Deseases of Animals
|
Italy
|
2024-02-02
|
TE.25180.1.2
|
Orthoflavivirus usutuense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,837
|
GenBank
| null |
Italy: Marche
|
Italy
|
Culex pipiens
| null |
2023-08-02
| null | null |
Usutu virus isolate TE.25180.1.2, complete genome
|
AGATGTTGGCCTGTGTGAGCTCTACTACTTAGTATTGTTTTTGGAGGATCGTGAGATTAACACAGTGCCGGCAGTTTCTTTGAGCGTTGATTTTCAATGTCTAAGAAACCAGGAGGGCCCGGAAGAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGCATACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTCATGGGCTTGTTGGATGGAAGAGGACCAGTGCGATTCGTGCTGGCCTTGATGACATTCTTCAAGTTCACCGCGCTTGCCCCGACGAAGGCCTTGCTAGGCCGTTGGAAGCGCATCAATAAGACCACGGCAATGAAACACCTGACTAGCTTTAAAAAGGAATTAGGAACAATGATCAACGTGGTTAACAATCGGGGCACAAAAAAGAAGAGAGGCAACAATGGACCAGGACTAGTGATGATCATAACACTCATGACGGTTGTTTCAATGGTTTCCTCTTTAAAGCTTTCCAACTTCCAGGGGAAAGTCATGATGACCATCAACGCGACTGACATGGCAGATGTCATTGTTGTTCCCACGCAACATGGGAAAAACCAGTGCTGGATTAGAGCTATGGATGTCGGGTACATGTGTGATGATACCATCACTTATGAATGCCCCAAACTGGATGCAGGAAATGACCCGGAAGACATTGACTGTTGGTGTGACAAACAACCTATGTATGTCCACTATGGAAGGTGCACAAGAACCAGACACTCGAAGCGGAGTCGGCGGTCGATCGCAGTGCAGACGCACGGGGAGAGTATGCTGGCTAACAAGAAGGATGCTTGGCTAGACTCAACCAAGGCTTCGAGATACCTGATGAAGACTGAGAATTGGATTATCAGGAATCCTGGGTATGCTTTTGTAGCTGTCCTCTTGGGCTGGATGCTGGGAAGCAACAATGGACAAAGGGTCGTTTTCGTCGTTCTCTTACTTCTCGTGGCGCCTGCTTACAGCTTCAACTGCCTTGGTATGAGCAACAGAGACTTCCTTGAGGGAGTCTCTGGTGCTACCTGGGTTGACGTGGTTTTGGAAGGTGACAGCTGCATAACCATCATGGCCAAGGACAAGCCGACCATTGACATTAAGATGATGGAAACTGAAGCCACGAACTTGGCTGAAGTGAGAAGCTACTGCTATCTAGCCACTGTCTCAGATGTTTCAACTGTCTCCAACTGTCCAACAACGGGGGAGGCCCACAATCCTAAGAGAGCTGAGGACACGTACGTGTGCAAAAGTGGTGTCACTGACAGGGGCTGGGGCAATGGTTGTGGACTATTTGGCAAAGGAAGTATAGACACGTGTGCCAACTTCACCTGCTCTCTGAAAGCGATGGGCCGGATGATCCAACCGGAAAATGTTAAGTATGAAGTGGGAATCTTCATACATGGTTCTACCAGCTCTGACACTCACGGCAACTATTCTTCACAACTAGGAGCATCACAGGCTGGGCGGTTTACCATCACTCCCAACTCCCCAGCCATCACTGTGAAGATGGGTGACTATGGAGAAATATCAGTTGAGTGTGAACCGAGAAACGGGTTGAACACCGAGGCATACTACATCATGTCAGTGGGCACTAAACACTTCCTTGTCCATAGGGAGTGGTTTAATGACTTGGCCCTCCCATGGACTTCACCGGCTAGTTCAAATTGGAGAAATAGAGAGATACTACTGGAGTTCGAAGAGCCCCATGCCACGAAGCAATCAGTTGTGGCGCTTGGTTCCCAGGAAGGTGCTTTGCACCAGGCCTTGGCAGGAGCTGTTCCAGTGTCTTTCTCGGGCAGTGTCAAGCTCACATCTGGTCATCTCAAGTGTCGAGTCAAGATGGAAAAGTTGACACTAAAAGGCACCACCTACAGCATGTGCACGGAAAAGTTTTCTTTTGCAAAAAATCCGGCTGACACGGGTCACGGCACTGTGGTCCTTGAACTGCAGTACACGGGATCTGACGGACCTTGCAAAATCCCAATTTCCATTGTGGCATCACTTTCCGATCTCACCCCCATTGGTAGAATGGTTACAGCAAACCCTTATGTGGCTTCATCCGAAGCCAACGCGAAAGTGTTGGTTGAGATGGAACCACCATTTGGAGACTCATACATTGTGGTTGGAAGAGGGGATAAGCAGATAAACCATCACTGGCACAAAGCAGGAAGCTCCATTGGAAAAGCGTTCATCACCACTATCAAAGGGGCACAGCGTCTAGCTGCCCTAGGTGACACAGCGTGGGACTTTGGGTCGGTCGGAGGGATTTTCAATTCTGTAGGAAAGGCGGTACATCAGGTCTTTGGAGGAGCCTTCAGAACTCTCTTCGGTGGCATGTCCTGGATCACCCAGGGTCTAATGGGAGCTCTGCTTCTATGGATGGGGGTGAATGCGAGAGATCGATCCATCGCACTGGTGATGTTAGCCACGGGAGGGGTGCTCCTCTTTCTCGCCACAAACGTCCATGCAGACTCGGGATGTGCGATAGACGTGGGAAGGAGAGAGTTGCGCTGTGGACAAGGGATTTTTATCCACAATGATGTTGAAGCGTGGGTCGACCGGTACAAATTTATGCCTGGAACACCAAGACAGCTGGCAAAGGTCATCGAGCAAGCCCACGCGAAAGGAATATGTGGATTGAGGTCCGTCTCACGTCTGGAACACGTGATGTGGGAGAACATCAGAGATGAACTCAATACCCTCCTCAGAGAGAATGCAGTAGATCTAAGTGTCGTGGTTGAGAAGCCAAAGGGAATGTACAAATCAGCACCACAGAGACTGGCACTCACATCTGAAGAGTTTGAGATTGGGTGGAAGGCTTGGGGAAAGAGCTTGGTGTTCGCACCAGAACTGGCCAACCACACTTTTGTGGTTGACGGGCCCGAGACCAAAGAATGTCCCGATGTAAAAAGAGCTTGGAACAGCCTTGAGATTGAAGATTTTGGATTTGGCATCATGTCCACCAGGGTTTGGCTGAAAGTCAGAGAACACAACACTACTGACTGTGACAGCTCAATAATTGGGACGGCTGTTAAAGGAGACATAGCTGTGCACAGTGACCTCTCCTACTGGATTGAAAGCCACAAGAACACGACATGGAGGCTCGAGAGGGCTGTCTTTGGAGAGATCAAATCATGCACGTGGCCTGAGACACACACTCTTTGGAGTGATGGCGTTGTCGAAAGTGATCTGGTTGTGCCAGTCACCCTCGCTGGACCAAAAAGCAATCACAACCGGCGTGAAGGTTACAAAGTCCAGAGCCAGGGGCCGTGGGACGAAGAAGACATTGTTCTCGACTTTGACTATTGCCCAGGTACCACCGTCACAATCACTGAAGCATGTGGGAAGAGAGGACCCTCCATAAGAACTACTACTAGCAGTGGTAGACTGGTCACAGACTGGTGCTGCCGGAGCTGCACCCTTCCCCCTTTGAGATACAGGACAAAAAATGGATGTTGGTATGGAATGGAGATAAGACCCATGAAACATGATGAGACGACGCTGGTAAAATCCAGCGTCAGTGCCTATCGGAGTGACATGATTGATCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACTGTTCCGGCTATTGTGGGAGCTCTACTCGTGCTGATTCTTGGGGGAATCACTTACACTGACCTGCTTAGGTATGTTCTTCTGGTTGGGGCGGCCTTCGCCGAAGCCAACAGCGGGGGTGACGTCGTTCATCTAGCTCTCATAGCCGCCTTCAAAATTCAACCAGGCTTTCTCGTAATGACATTTCTTAGGGGAAAGTGGACGAACCAAGAGAACATCCTGCTGACTCTGGGGGCAGCATTCTTTCAGATGGCGGTCACCGATTTGAACTTTTCTCTCCCAGGAATTCTCAATGCCACCGCCACAGCTTGGATGCTCCTGAGGGCTGCCACCCAGCCATCCACTTCAGCTATCGTCATGCCTTTGCTTTGCCTGCTGGCTCCTGGCATGAGACTGCTCTACCTGGACACGTATAGAATCACTCTCATCATCATCGGCACCTGCAGCCTGATAGGGGAGCGCCGTAGGGCGGCCGCAAAGAAGAAAGGGGCGGTACTGCTAGGGTTAGCACTAACATCAACAGGGCAGTTCTCTGCATCAGTTATGGCGGCTGGGCTCATGGCATGCAATCCCAACAAAAAGCGGGGATGGCCGGCCACAGAAGTTTTGACAGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTGGGTGGTCTAGCTGAGTTGGATGTTGATTCCATGTCCATTCCTTTTGTGTTAGCCGGGCTGATGGCAGTTTCTTACACCATTTCAGGCAAATCGACAGACTTGTGGCTTGAGAGAGCAGCTGACATAACATGGGAAACTGATGCGGCCATAACTGGAACCAGCCAACGCCTAGATGTAAAATTGGATGATGATGGTGACTTCCACCTTATTAACGACCCTGGAGTGCCGTGGAAGATATGGGTCATCCGTATGACGGCATTGGGATTCGCAGCCTGGACACCATGGGCAATAATACCTGCTGGAATAGGTTATTGGCTCACTGTCAAGTACGCAAAAAGAGGAGGCGTCTTTTGGGACACCCCGGCTCCAAGGACCTACCCCAAGGGTGACATTTCACCGGGAGTATACCGTATCATGAGCCGTTACATTTTGGGGACCTACCAGGCTGGAGTGGGCGTCATGTATGAAGGAGTTTTTCACACCCTGTGGCACACCACAAGAGGGGCAGCTATCAGAAGTGGTGAAGGAAGGCTCACTCCCTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGACAGGATCACCTATGGTGGGCCATGGAAGTTTGACAGGAAGTGGAATGGTCTCGATGATGTTCAGCTCATCGTAGTGGCTCCCGGAAAGGCAGCCATAAACATCCAAACCAAACCAGGCATCTTCAAAACGCCACAGGGGGAAATAGGAGCAGTCAGCCTGGACTATCCTGA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ACAGAAGAGATCTGAGGTTGATGGCAAACGCCATCTGTTCAGCAGTCCCCAGCAATTGGGTTCCCACTGGCAGGACGTCATGGTCAGTGCATGCCACAGGTGAATGGATGACAACTGATGACATGTTGGAAGTGTGGAACAAAGTGTGGATCCAAGACAATGAATGGATGCTGGACAAGACCCCAGTTCAAAGCTGGACAGACATCCCTTACACCGGGAAGCGGGAAGACATATGGTGTGGAAGCCTGATAGGCACGCGAACACGGGCAACGTGGGCTGAAAACATCTACGCAGCCATTAACCAGGTGAGGGCCATTATTGGCCAGGAAAAATACAGGGATTACATGCTTTCACTTAGAAGATATGAAGATGTTAATGTCCAGGAGGACAGGGTTCTGTAAATAAGTGTTTAGGGTTTTGTAATTTAATTAAATATGCAATGTAATTTAGTTGTAAATATTTGATTGTGTAGTTTTATTTAGCATTGTTTTAGGATAGTAGAAGTTAAGGTTTTGTTTAGTTATTTTATTTAATTGAATTTGATAGTCAGGCCAGGGCAACCTGCCACCGGAAGTTGAGTAGACGGTGCTGCCTGCGACTCAACCCCAGGCGGACTGGGTTAACAAAGCTGACCGCTGATGATGGGAAAGCCCCTCAGAACCGTTTCGGAGAGGGACCCTGCCCATTGGAAGCGTCCAGCCCGTGTCAGGCCGCAAAGCGCCACTTCGCCAAGGAGTGCAGCCTGTACGGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGAAAGGCCCCCACGGCCCAAGCGAACAGACGGTGATGCGAACTGTTCGTGGAAGGACTAG
| 9,196
|
PP104387.1
|
Usutu virus
|
Savini,G., Monaco,F., Teodori,L., Amatori,G., Marcacci,M., Valleriani,F.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale 'G. Caporale', Viral Foreign Deseases of Animals
|
Italy
|
2024-02-02
|
TE.25185.1.2
|
Orthoflavivirus usutuense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,826
|
GenBank
| null |
Italy: Umbria
|
Italy
|
Sturnus vulgaris
| null |
2023-09-13
| null | null |
Usutu virus isolate TE.25185.1.2, complete genome
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GGTGTGAGCTCTACTACTTAGTATTGTTTTTGGAGGATCGTGAGATTAACACAGTGCCGGCAGTTTCTTTGAGCGTTGATTTTCAATGTCTAAGAAACCAGGAGGGCCCGGAAGAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGCATACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTCATGGGCTTGTTGGATGGAAGAGGACCAGTGCGATTCGTGCTGGCCTTGATGACATTCTTCAAGTTCACCGCGCTTGCCCCGACGAAGGCCTTGCTAGGCCGTTGGAAGCGCATCAATAAGACCACGGCAATGAAACACCTGACTAGCTTTAAAAAGGAATTAGGAACAATGATCAACGTGGTTAACAATCGGGGCACAAAAAAGAAGAGAGGCAACAATGGACCAGGACTAGTGATGATCATAATACTCATGACGGTTGTTTCAATGGTTTCCTCTTTAAAGCTTTCCAACTTCCAGGGGAAAGTCATGATGACCATCAACGCGACTGACATGGCAGATGTCATTGTTGTTCCCACGCAACATGGGAAAAACCAGTGCTGGATTAGAGCTATGGATGTCGGGTACATGTGTGATGATACCATCACTTATGAATGCCCCAAACTGGATGCAGGAAATGACCCGGAAGACATTGACTGCTGGTGTGACAAACAACCTATGTATGTCCACTATGGAAGGTGCACAAGAACCAGACACTCGAAGCGGAGTCGGCGGTCGATCGCAGTGCAGACGCACGGGGAGAGTATGCTGGCTAACAAGAAGGATGCTTGGCTAGACTCAACCAAGGCTTCGAGATACCTGATGAAGACTGAGAATTGGATTATCAGGAATCCTGGGTATGCTTTTGTAGCTGTCCTCTTGGGCTGGATGCTGGGAAGCAACAATGGACAAAGGGTCGTTTTCGTCGTTCTCTTACTTCTCGTGGCGCCTGCTTACAGCTTCAACTGCCTTGGTATGAGCAACAGAGACTTCCTTGAGGGAGTCTCTGGTGCCACCTGGGTTGACGTGGTTTTGGAAGGTGACAGCTGCATAACCATCATGGCCAAGGATAAGCCGACCATTGACATTAAGATGATGGAAACTGAAGCCACGAACCTGGCTGAAGTGAGAAGCTACTGCTATCTAGCCACTGTCTCAGATGTTTCAACTGTCTCCAACTGTCCAACAACTGGGGAGGCCCACAATCCTAAGAGAGCTGAGGACACGTACGTGTGCAAAAGTGGTGTCACTGACAGAGGCTGGGGCAATGGTTGTGGACTATTTGGCAAAGGAAGTATAGACACGTGTGCCAACTTCACCTGCTCCCTGAAAGCGATGGGCCGGATGATCCAACCGGAAAATGTTAAGTATGAAGTGGGAATCTTCATACATGGTTCTACCAGCTCTGACACTCACGGCAACTATTCTTCACAACTAGGAGCATCACAGGCTGGGCGGTTTACCATCACTCCCAACTCCCCAGCCATCACTGTGAAGATGGGTGACTATGGAGAAATATCAGTTGAGTGTGAACCGAGAAACGGGTTGAACACCGAGGCATACTACATCATGTCAGTGGGCACTAAACACTTCCTTGTCCATAGGGAGTGGTTTAATGATTTGGCCCTCCCATGGACTTCACCAGCTAGTTCAAATTGGAGAAATAGAGAGATACTACTGGAGTTCGAAGAGCCCCATGCCACAAAGCAATCAGTTGTGGCGCTTGGTTCCCAGGAAGGTGCTTTGCACCAGGCCTTGGCAGGAGCTGTTCCAGTGTCTTTCTCGGGCAGTGTCAAGCTCACATCTGGTCATCTCAAGTGTCGAGTCAAGATGGAAAAGTTGACACTAAAAGGCACCACCTACAGCATGTGCACGGAAAAGTTTTCTTTTGCAAAAAATCCGGCTGACACGGGTCACGGCACTGTGGTCCTTGAACTGCAGTACACGGGATCTGACGGACCTTGCAAAATCCCAATTTCCATTGTGGCATCACTTTCCGATCTCACCCCCATTGGTAGAATGGTTACAGCAAACCCTTATGTGGCTTCATCCGAAGCCAACGCGAAAGTGTTGGTTGAGATGGAACCACCATTTGGAGACTCATACATTGTGGTTGGAAGAGGGGAAAAGCAGATAAACCATCACTGGCACAAAGCAGGAAGCTCCATTGGAAAAGCGTTCACCACCACTATCAAAGGGGCACAGCGTCTAGCTGCCCTAGGCGACACAGCGTGGGACTTTGGGTCGGTCGGAGGGATTTTCAATTCTGTAGGAAAGGCGGTACATCAGGTCTTTGGAGGAGCCTTCAGAACTCTCTTCGGTGGCATGTCCTGGATCACCCAGGGTCTAATGGGAGCTCTGCTTCTATGGATGGGGGTGAATGCGAGAGATCGATCCATCGCACTGGTGATGTTAGCCACGGGAGGGGTGCTCCTCTTTCTCGCCGCAAACGTCCATGCAGACTCGGGATGTGCGATAGACGTGGGAAGGAGAGAGTTGCGCTGTGGACAAGGGATCTTTATCCACAATGATGTTGAAGCGTGGGTCGACCGGTACAAATTTATGCCTGGAACACCAAAACAGCTGGCAAAGGTCATCGAGCAAGCCCACGCGAAAGGAATATGTGGATTGAGGTCCGTCTCACGTCTGGAACACGTGATGTGGGAGAACATCAGAGATGAACTCAACACCCTCCTCAGAGAGAATGCAGTAGATCTAAGTGTCGTGGTTGAGAAGCCAAAGGGAATGTACAAATCAGCACCACAGAGACTGGCACTCACATCTGAAGAGTTTGAGATTGGGTGGAAGGCTTGGGGAAAGAGCTTGGTGTTCGCACCAGAACTGGCCAACCACACTTTTGTGGTTGACGGGCCCGAGACCAAAGAATGTCCCGATGTAAAAAGAGCTTGGAACAGCCTTGAGATTGAAGATTTTGGATTTGGCATTATGTCCACCAGGGTTTGGCTGAAAGTCAGAGAACACAACACTACTGACTGTGACAGCTCAATAATTGGGACGGCTGTTAAAGGAGACATAGCTGTGCACAGTGACCTCTCCTACTGGATTGAAAGCCACAAGAACACGACATGGAGGCTCGAGAGGGCTGTCTTTGGAGAGATCAAATCATGCACGTGGCCTGAGACACACACTCTTTGGAGTGATGGCGTTGTTGAAAGTGATCTGGTTGTGCCAGTCACCCTCGCTGGACCAAAAAGCAATCACAACCGGCGTGAAGGTTACAAAGTCCAGAGCCAGGGGCCGTGGGACGAAGAAGACATTGTTCTCGACTTTGACTATTGCCCAGGTACCACCGTCACAATCACTGAAGCATGTGGGAAGAGAGGACCCTCCATAAGAACTACTACTAGCAGTGGTAGACTGGTCACAGACTGGTGCTGCCGGAGCTGCACCCTTCCCCCTTTGAGATACAGGACAAAAAATGGATGTTGGTATGGAATGGAGATAAGACCCATGAAACATGATGAGACGACGCTGGTAAAATCCAGCGTCAGTGCCTATCGGAGTGACATGATTGATCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACTGTTCCGGCTATTGTGGGAGCTCTACTCGTGCTGATTCTTGGGGGAATCACTTACACTGACCTGCTTAGGTATGTTCTTCTGGTTGGGGCGGCCTTCGCCGAAGCCAACAGCGGGGGTGACGTCGTTCATCTAGCTCTCATAGCCGCCTTTAAAATCCAACCAGGCTTTCTCGCAATGACATTTCTCAGGGGAAAGTGGACGAACCAAGAGAACATCCTGCTGACTCTGGGGGCAGCATTCTTTCAGATGGCGGCCACCGATTTGAATTTTTCTCTCCCAGGAATTCTCAATGCCACTGCCACAGCTTGGATGCTCCTGAGGGCTGCCACCCAGCCATCCACTTCAGCTATCGTCATGCCTTTGCTTTGCCTGCTGGCTCCTGGCATGAGACTGCTCTACCTGGACACGTATAGAATCACTCTCATCATCATCGGCACCTGCAGCCTGATAGGGGAGCGCCGTAGGGCGGCCGCAAAGAAGAAGGGGGCGGTACTGCTAGGGTTAGCACTAACATCAACAGGGCAGTTTTCTGCATCAGTTATGGCGGCTGGGCTCATGGCATGCAATCCCAACAAAAAGCGGGGATGGCCGGCCACAGAAGTTTTGACAGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTGGGTGGTCTAGCTGAGTTGGATGTTGATTCCATGTCCATTCCTTTTGTGTTAGCCGGGCTGATGGCAGTTTCCTACACCATTTCAGGCAAATCGACAGACTTGTGGCTTGAGAGAGCAGCTGACATAACATGGGAAACTGATGCAGCCATAACTGGAACCAGCCAACGCCTAGATGTAAAATTGGATGATGATGGTGACTTCCACCTTATTAACGACCCTGGAGTGCCGTGGAAGATATGGGTCATCCGTATGACGGCATTGGGATTCGCAGCCTGGACACCATGGGCAATAATACCTGCTGGAATAGGTTATTGGCTCACTGTCAAGTACGCAAAAAGAGGAGGCGTCTTTTGGGACACCCCGGCTCCAAGGACCTACCCCAAGGGTGACACCTCACCAGGAGTATACCGTATCATGAGCCGTTACATTTTGGGGACCTACCAGGCTGGAGTGGGCGTCATGTATGAAGGAGTTTTTCACACCCTGTGGCACACCACAAGAGGGGCGGCTATCAGAAGTGGTGAAGGAAGGCTCACTCCCTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGACAGGATCACCTATGGTGGGCCATGGAAGTTTGACAGGAAGTGGAATGGTCTCGATGATGTTCAGCTCATCGTAGTGGCTCCCGGAAAGGCAGCCATAAACATCCAAACCAAACCAGGCATCTTCAAAACGCCACAGGGGGAAATAGGAGCAATCAGCCTGGACTATCCTGAAGGGACCTCAG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CTGAGGCTGATGGCAAACGCCATCTGTTCAGCAGTCCCCAGCAATTGGGTTCCCACTGGCAGGACTTCATGGTCAGTGCATGCCACAGGTGAATGGATGACAACTGATGACATGCTGGAAGTGTGGAACAAAGTGTGGATCCAAGACAATGAATGGATGCTGGACAAGACCCCAGTTCAAAGCTGGACAGACATCCCTTACACCGGGAAGCGGGAAGACATATGGTGTGGAAGCCTGATAGGCACGCGAACACGGGCAACGTGGGCTGAAAACATCTACGCAGCCATTAACCAGGTGAGGGCCATTATTGGCCAGGAAAAATACAGGGATTACATGCTTTCACTTAGAAGATATGAAGATGTTAATGTCCAGGAGGACAGGGTTCTGTAAATAAGTGTTTAGGGTTTTGTAATTTAATTAAATATGCAATGTAATTTAGCTGTAAATATTTGATTGTGTAGCTTTATTTAGCATTGTTTTAGGATAGAAGAAGTTAAGGTTTTGTTTAGTTATTTTATTTAATTGAATTTGATAGTCAGGCCAGGGCAACCTGCCACCGGAAGTTGAGTAGACGGTGCTGCCTGCGACTCAACCCCAGGCGGACTGGGTTAACAAAGCTGACCGCTGATGATGGGAAAGCCCCTCAGAACCGTTTCGGAGAGGGACCCTGCCCATTGGAAGCGTCCAGCCCGTGTCAGGCCGCAAAGCGCCACTTCGCCAAGGAGTGCAGCCTGTACGGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGAAAGGCCCCCACGGCCCAAGCGAACAGACGGTGATGCGAACTGTTCGTGGAAGGACTAG
| 9,197
|
PP104388.1
|
Usutu virus
|
Savini,G., Monaco,F., Teodori,L., Amatori,G., Marcacci,M., Valleriani,F.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale 'G. Caporale', Viral Foreign Deseases of Animals
|
Italy
|
2024-02-02
|
TE.25186.1.2
|
Orthoflavivirus usutuense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,837
|
GenBank
| null |
Italy: Umbria
|
Italy
|
Turdus merula
| null |
2023-09-22
| null | null |
Usutu virus isolate TE.25186.1.2, complete genome
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AGATGTTGGCCTGTGTGAGCTCTACTACTTAGTATTGTTTTTGGAGGATCGTGAGATTAACACAGTGCCGGCAGTTTCTTTGAGCGTTGATTTTCAATGTCTAAGAAACCAGGAGGGCCCGGAAGAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGCATACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTCATGGGCTTGTTGGATGGAAGAGGACCAGTGCGATTCGTGCTGGCCTTGATGACATTCTTCAAGTTCACCGCGCTTGCCCCGACGAAGGCCTTGCTAGGCCGTTGGAAGCGCATCAATAAGACCACGGCAATGAAACACCTGACTAGCTTCAAAAAGGAATTAGGAACAATGATCAACGTGGTTAACAATCGGGGCACAAAAAAGAAGAGAGGCAACAATGGACCAGGACTAGTGATGATCATAATACTCATGACGGTTGTTTCAATGGTTTCCTCTTTAAAGCTTTCCAACTTCCAGGGGAAAGTCATGATGACCATCAACGCGACTGACATGGCAGATGTCATTGTTGTTCCCACGCAACATGGGAAAAACCAGTGCTGGATTAGAGCTATGGATGTCGGGTACATGTGTGATGATACCATCACTTATGAATGCCCCAAACTGGATGCAGGAAATGACCCGGAAGACATTGACTGCTGGTGTGACAAACAACCTATGTATGTCCACTATGGAAGGTGCACAAGAACCAGACACTCGAAGCGGAGTCGGCGGTCGATCGCAGTGCAGACGCACGGGGAGAGTATGCTGGCTAACAAGAAGGATGCTTGGCTAGACTCAACCAAGGCTTCGAGATACCTGATGAAGACTGAGAATTGGATTATCAGGAATCCTGGGTATGCTTTTGTAGCTGTCCTCTTGGGCTGGATGCTGGGAAGCAACAATGGACAAAGGGTCGTTTTCGTCGTTCTCTTACTTCTCGTGGCGCCTGCTTACAGCTTCAACTGCCTTGGTATGAGCAACAGAGACTTCCTTGAGGGAGTCTCTGGTGCCACCTGGGTTGACGTGGTTTTGGAAGGTGACAGCTGCATAACCATCATGGCCAAGGATAAGCCGACCATTGACATTAAGATGATGGAAACTGAAGCCACGAACCTGGCTGAAGTGAGAAGCTACTGCTATCTAGCCACTGTCTCAGATGTTTCAACTGTCTCCAACTGTCCAACAACTGGGGAGGCCCACAATCCTAAGAGAGCTGAGGACACGTACGTGTGCAAAAGTGGTGTCACTGACAGAGGCTGGGGCAATGGTTGTGGACTATTTGGCAAAGGAAGTATAGACACGTGTGCCAACTTCACCTGCTCCCTGAAAGCGATGGGCCGGATGATCCAACCGGAAAATGTTAAGTATGAAGTGGGAATCTTCATACATGGTTCTACCAGCTCTGACACTCACGGCAACTATTCTTCACAACTAGGAGCATCACAGGCTGGGCGGTTTACCATCACTCCCAACTCCCCAGCCATCACTGTGAAGATGGGTGACTATGGAGAAATATCAGTTGAGTGTGAACCGAGAAACGGGTTGAACACCGAGGCATACTACATCATGTCAGTGGGCACTAAACACTTCCTTGTCCATAGGGAGTGGTTTAATGATTTGGCCCTCCCATGGACTTCACCAGCTAGTTCAAATTGGAGAAATAGAGAGATATTACTGGAGTTCGAAGAGCCCCATGCCACAAAGCAATCAGTTGTGGCGCTTGGTTCCCAGGAAGGTGCTTTGCACCAGGCCTTGGCAGGAGCTGTTCCAGTGTCTTTCTCGGGCAGTGTCAAGCTCACATCTGGTCATCTCAAGTGTCGAGTCAAGATGGAAAAGTTGACACTAAAAGGCACCACCTACAGCATGTGCACGGAAAAGTTTTCTTTTGCAAAAAATCCGGCTGACACGGGTCACGGCACTGTGGTCCTTGAACTGCAGTACACGGGATCTGACGGACCTTGCAAAATCCCAATTTCCATTGTGGCATCACTTTCCGATCTCACCCCCATTGGTAGAATGGTTACAGCAAACCCTTATGTGGCTTCATCCGAAGCCAACGCGAAAGTGTTGGTTGAGATGGAACCACCATTTGGAGACTCATACATTGTGGTTGGAAGAGGGGAAAAGCAGATAAACCATCACTGGCACAAAGCAGGAAGCTCCATTGGAAAAGCGTTCATCACCACTATCAAAGGGGCACAGCGTCTAGCTGCCCTAGGCGACACAGCGTGGGACTTTGGGTCGGTCGGAGGGATTTTCAATTCTGTAGGAAAGGCGGTACATCAGGTCTTTGGAGGAGCCTTCAGAACTCTCTTCGGTGGCATGTCCTGGATCACCCAGGGTCTAATGGGAGCTCTGCTTCTATGGATGGGGGTGAATGCGAGAGATCGATCCATCGCACTGGTGATGTTAGCCACGGGAGGGGTGCTCCTCTTTCTCGCCACAAACGTCCATGCAGACTCGGGATGTGCGATAGACGTGGGAAGGAGAGAGTTGCGCTGTGGACAAGGGATCTTTATCCACAATGATGTTGAAGCGTGGGTCGACCGGTACAAATTTATGCCTGGAACACCAAAACAGCTGGCAAAGGTCATCGAGCAAGCCCACGCGAAAGGAATATGTGGATTGAGGTCCGTCTCACGTCTGGAACACGTGATGTGGGAGAACATCAGAGATGAACTCAACACCCTCCTCAGAGAGAATGCAGTAGATCTAAGTGTCGTGGTTGAGAAGCCAAAGGGAATGTACAAATCAGCACCACAGAGACTGGCACTCACATCTGAAGAGTTTGAGATTGGGTGGAAGGCTTGGGGAAAGAGCTTGGTGTTCGCACCAGAACTGGCCAACCACACTTTTGTGGTTGACGGGCCCGAGACCAAAGAATGTCCCGATGTAAAAAGAGCTTGGAACAGCCTTGAGATTGAAGATTTTGGATTTGGCATTATGTCCACCAGGGTTTGGCTGAAAGTCAGAGAACACAACACTACTGACTGTGACAGCTCAATAATTGGGACGGCTGTTAAAGGAGACATAGCTGTGCACAGTGACCTCTCCTACTGGATTGAAAGCCACAAGAACACGACATGGAGGCTCGAGAGGGCTGTCTTTGGAGAGATCAAATCATGCACGTGGCCTGAGACACACACTCTTTGGAGTGATGGCGTTGTTGAAAGTGATCTGGTTGTGCCAGTCACCCTCGCTGGACCAAAAAGCAATCACAACCGGCGTGAAGGTTACAAAGTCCAGAGCCAGGGGCCGTGGGACGAAGAAGACATTGTTCTCGACTTTGACTATTGCCCAGGTACCACCGTCACAATCACTGAAGCATGTGGGAAGAGAGGACCCTCCATAAGAACTACTACTAGCAGTGGTAGACTGGTCACAGACTGGTGCTGCCGGAGCTGCACCCTTCCCCCTTTGAGATACAGGACAAAAAATGGATGTTGGTATGGAATGGAGATAAGACCCATGAAACATGATGAGACGACGCTGGTAAAATCCAGCGTCAGTGCCTATCGGAGTGACATGATTGATCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACTGTTCCGGCTATTGTGGGAGCTCTACTCGTGCTGATTCTTGGGGGAATCACTTACACTGACCTGCTTAGGTATGTTCTTCTGGTTGGGGCGGCCTTCGCCGAAGCCAACAGCGGGGGTGACGTCGTTCATCTAGCTCTCATAGCCGCCTTTAAAATCCAACCAGGCTTTCTCGCAATGACATTTCTCAGGGGAAAGTGGACGAACCAAGAGAACATCCTGCTGACTCTGGGGGCAGCATTCTTTCAGATGGCGGCCACCGATTTGAACTTTTCTCTCCCAGGAATTCTCAATGCCACTGCCACAGCTTGGATGCTCCTGAGGGCTGCCACCCAGCCATCCACTTCAGCTATCGTCATGCCTTTGCTTTGCCTGCTGGCTCCTGGCATGAGACTGCTCCACCTGGACACGTATAGAATCACTCTCATCATCATCGGCACCTGCAGCCTGATAGGGGAGCGCCGTAGGGCGGCCGCAAAGAAGAAGGGGGCGGTACTGCTAGGGTTAGCACTAACATCAACAGGGCAGTTTTCTGCATCAGTTATGGCGGCTGGGCTCATGGCATGCAATCCCAACAAAAAGCGGGGATGGCCGGCCACAGAAGTTTTGACAGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTGGGTGGTCTAGCTGAGTTGGATGTTGATTCCATGTCCATTCCTTTTGTGTTAGCCGGGCTGATGGCAGTTTCTTACACCATTTCAGGCAAATCGACAGACTTGTGGCTTGAGAGAGCAGCTGACATAACATGGGAAACTGATGCAGCCATAACTGGAACCAGCCAACGCCTAGATGTAAAATTGGATGATGATGGTGACTTCCACCTTATTAACGACCCTGGAGTGCCGTGGAAGATATGGGTCATCCGTATGACGGCATTGGGATTCGCAGCCTGGACACCATGGGCAATAATACCTGCTGGAATAGGTTATTGGCTCACTGTCAAGTACGCAAAAAGAGGAGGCGTCTTTTGGGACACCCCGGCTCCAAGGACCTACCCCAAGGGTGACACCTCACCAGGAGTATACCGTATCATGAGCCGTTACATTTTGGGGACCTACCAGGCTGGAGTGGGCGTCATGTATGAAGGAGTTTTTCACACCCTGTGGCACACCACAAGAGGGGCGGCTATCAGAAGTGGTGAAGGAAGGCTCACTCCCTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGACAGGATCACCTATGGTGGGCCATGGAAGTTTGACAGGAAGTGGAATGGTCTCGATGATGTTCAGCTCATCGTAGTGGCTCCCGGAAAGGCAGCCATAAACATCCAAACCAAACCAGGCGTCTTCAAAACGCCACAGGGGGAAATAGGAGCAATCAGCCTGGACTATCCCGA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ACAGAAGAGATCTGAGGCTGATGGCAAACGCCATCTGTTCAGCAGTCCCCAGCAATTGGGTTCCCACTGGCAGGACTTCATGGTCAGTGCATGCCACAGGTGAATGGATGACAACTGATGACATGCTGGAAGTGTGGAACAAAGTGTGGATCCAAGACAATGAATGGATGCTGGACAAGACCCCAGTTCAAAGCTGGACAGACATCCCTTACACCGGGAAGCGGGAAGACATATGGTGTGGAAGCCTGATAGGCACGCGAACACGGGCAACGTGGGCTGAAAACATCTACGCAGCCATTAACCAGGTGAGGGCCATTATTGGCCAGGAAAAATACAGGGATTACATGCTTTCACTTAGAAGATATGAAGATGTTAATGTCCAGGAGGACAGGGTTCTGTAAATAAGTGTTTAGGGTTTTGTAATTTAATTAAATATGCAATGTAATTTAGCTGTAAATATTTGATTGTGTAGCTTTATTTAGCATTGTTTTAGGATAGAAGAAGTTAAGGTTTTGTTTAGTTATTTTATTTAATTGAATTTGATAGTCAGGCCAGGGCAACCTGCCACCGGAAGTTGAGTAGACGGTGCTGCCTGCGACTCAACCCCAGGCGGACTGGGTTAACAAAGCTGACCGCTGATGATGGGAAAGCCCCTCAGAACCGTTTCGGAGAGGGACCCTGCCCATTGGAAGCGTCCAGCCCGTGTCAGGCCGCAAAGCGCCACTTCGCCAAGGAGTGCAGCCTGTACGGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGAAAGGCCCCCACGGCCCAAGCGAACAGACGGTGATGCGAACTGTTCGTGGAAGGACTAG
| 9,198
|
PP104391.1
|
Usutu virus
|
Savini,G., Monaco,F., Teodori,L., Amatori,G., Marcacci,M., Valleriani,F.
|
Istituto Zooprofilattico Sperimentale 'G. Caporale', Viral Foreign Deseases of Animals
|
Italy
|
2024-02-02
|
TE.25189.1.2
|
Orthoflavivirus usutuense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,837
|
GenBank
| null |
Italy: EmiliaRomagna
|
Italy
|
Turdus merula
| null |
2023-09-07
| null | null |
Usutu virus isolate TE.25189.1.2, complete genome
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AGATGTTGGCCTGTGTGAGCTCTACTACTTAGTATTGTTTTTGGAGGATCGTGAGATTAACACAGTGCCGGCAGTTTCTTTGAGCGTTGATTTTCAATGTCTAAGAAACCAGGAGGGCCCGGAAGAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGCATACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTCATGGGCTTGTTGGATGGAAGAGGACCAGTGCGATTCGTGCTGGCCTTGATGACATTCTTCAAGTTCACCGCGCTTGCCCCGACGAAGGCCTTGCTAGGCCGTTGGAAGCGCATCAACAAGACCACGGCAATGAAACACCTGACTAGCTTTAAAAAGGAATTAGGAACAATGATCAACGTGGTTAACAATCGGGGCACAAAAAAGAAGAGAGGCAACAATGGACCAGGACTAGTAATGATCATAACACTCATGACGGTTGTTTCAATGGTTTCCTCTTTAAAGCTTTCCAACTTCCAGGGGAAAGTCATGATGACCATCAACGCGACTGACATGGCAGATGTCATTGTTGTTCCCACGCAACATGGGAAAAACCAGTGCTGGATTAGAGCTATGGATGTCGGGTACATGTGTGATGATACCATCACTTATGAATGCCCCAAACTGGATGCAGGAAATGACCCGGAAGACATTGACTGTTGGTGTGACAAACAACCTATGTATGTCCACTATGGAAGGTGCACAAGAACCAGACATTCGAAGCGGAGTCGGCGGTCGATCGCAGTGCAGACGCACGGGGAGAGTATGCTGGCTAACAAGAAGGATGCTTGGCTAGACTCAACCAAGGCTTCGAGATACCTGATGAAGACTGAGAATTGGATTATCAGGAATCCTGGGTATGCTTTTGTAGCTGTCCTCTTGGGCTGGATGCTGGGAAGCAACAATGGACAAAGGGTCGTTTTCGTCGTTCTCTTACTTCTCGTGGCGCCTGCTTACAGCTTCAACTGCCTTGGTATGAGCAACAGAGACTTCCTTGAGGGAGTCTCTGGTGCTACCTGGGTTGACGTAGTTTTGGAAGGTGACAGCTGCATAACCATCATGGCCAAGGACAAGCCGACCATTGACATTAAGATGATGGAAACTGAAGCCACGAACCTGGCTGAAGTGAGAAGCTACTGCTATCTAGCCACTGTCTCAGATGTTTCAACTGTCTCCAACTGTCCAACAACTGGGGAGGCCCACAATCCTAAGAGAGCTGAGGACACGTACGTGTGCAAAAGTGGTGTCACTGACAGGGGCTGGGGCAATGGCTGTGGACTATTTGGCAAAGGAAGTATAGACACGTGTGCCAACTTCACCTGCTCCCTGAAAGCGATGGGCCGGATGATCCAACCGGAAAATGTTAAGTATGAAGTGGGAATCTTCATACATGGTTCTACCAGCTCTGACACTCACGGCAACTATTCTTCACAACTAGGAGCATCACAGGCTGGGCGGTTTACCATCACTCCCAACTCCCCAGCCATCACTGTGAAGATGGGTGACTATGGAGAAATATCAGTTGAGTGTGAACCGAGAAACGGGTTGAACACCGAGGCATACTACATCATGTCAGTGGGCACTAAACACTTCCTTGTCCATAGGGAATGGTTTAATGACTTGGCCCTCCCATGGACTTCACCAGCTAGCTCAAATTGGAGAAATAGAGAGATACTACTGGAGTTCGAAGAGCCCCATGCCACAAAGCAATCAGTTGTGGCGCTTGGCTCCCAGGAAGGTGCTTTGCACCAGGCCTTGGCAGGAGCTGTTCCAGTGTCGTTCTCGGGCAGTGTCAAGCTCACATCTGGTCATCTCAAGTGTCGAGTCAAGATGGAAAAGTTGACACTAAAAGGCACCACCTACAGCATGTGCACGGAAAAGTTTTCTTTTGCAAAAAATCCGGCTGACACGGGTCACGGCACTGTGGTCCTTGAACTGCAGTACACGGGATCTGACGGACCTTGCAAAATCCCAATTTCCATTGTGGCATCACTTTCCGATCTCACCCCCATTGGTAGAATGGTTACAGCAAATCCTTATGTGGCTTCATCCGAAGCCAACGCGAAAGTGTTGGTTGAGATGGAACCACCATTTGGAGACTCATACATTGTGGTTGGAAGAGGGGATAAGCAGATAAACCACCATTGGCACAAAGCAGGAAGCTCCATTGGAAAAGCGTTCATCACCACTATCAAAGGGGCACAGCGTCTAGCTGCCCTAGGCGACACAGCGTGGGACTTTGGGTCGGTCGGAGGGATTTTCAATTCTGTAGGAAAGGCGGTACATCAGGTCTTTGGAGGAGCCTTCAGAACTCTCTTCGGTGGCATGTCCTGGATCACCCAGGGTCTAATGGGAGCTCTGCTTCTATGGATGGGGGTGAATGCGAGAGATCGATCTATCGCACTGGTGATGTTAGCCACGGGAGGGGTGCTCCTCTTTCTCGCCACAAACGTCCATGCAGACTCGGGATGTGCGATAGACGTGGGAAGGAGAGAGTTGCGCTGTGGACAAGGGATTTTTATCCACAATGATGTTGAAGCGTGGGTCGACCGGTACAAATTTATGCCTGGAACACCAAAACAGCTGGCAAAGGTCATCGAGCAAGCCCACGCGAAAGGAATATGTGGATTGAGGTCCGTCTCACGTCTGGAACACGTGATGTGGGAGAACATCAGAGATGAACTCAACACCCTCCTCAGAGAGAATGCAGTAGATCTAAGTGTCGTGGTTGAGAAGCCAAAGGGAATGTACAAATCAGCACCACAGAGATTGGCACTCACATCTGAAGAGTTTGAGATTGGGTGGAAGGCTTGGGGAAAGAGCTTGGTGTTTGCACCAGAACTGGCCAACCACACTTTTGTGGTTGACGGGCCCGAGACCAAAGAATGTCCCGATGTAAAAAGAGCTTGGAACAGCCTTGAGATTGAAGATTTTGGATTTGGCATCATGTCCACCAGGGTTTGGCTGAAAGTCAGAGAACACAACACTACTGACTGTGACAGCTCAATAATTGGGACGGCTGTTAAAGGAGACATAGCTGTGCACAGTGACCTCTCCTACTGGATTGAAAGCCACAAGAACACGACATGGAGGCTCGAGAGGGCTGTCTTTGGAGAGATCAAATCATGCACGTGGCCTGAGACACACACTCTTTGGAGTGATGGCGTTGTTGAAAGTGACCTGGTTGTGCCAGTCACCCTCGCTGGACCAAAAAGCAATCACAACCGGCGTGAAGGTTACAAAGTCCAGAGCCAGGGGCCGTGGGACGAAGAAGACATTGTTCTCGACTTTGACTATTGCCCAGGTACCACCGTCACAATCACTGAAGCATGTGGGAAGAGAGGACCCTCCATAAGAACTACTACTAGCAGTGGCAGACTGGTCACAGACTGGTGCTGCCGGAGCTGCACCCTTCCCCCTTTGAGATACAGGACAAAAAATGGATGTTGGTATGGAATGGAGATAAGACCCATGAAACATGATGAGACGACGCTGGTAAAATCCAGCGTCAGTGCCTATCGGAGTGACATGATTGATCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACTGTTCCGGCTATTGTGGGAGCTCTACTCGTGCTGATTCTTGGGGGAATCACTTACACTGACCTGCTTAGGTATGTTCTTCTGGTTGGGGCGGCCTTCGCCGAAGCCAACAGCGGGGGTGACGTCGTTCATCTAGCTCTCATAGCCGCCTTCAAAATTCAACCAGGCTTTCTCGCAATGACATTTCTTAGGGGAAAGTGGACGAACCAAGAGAACATCCTGCTGGCTCTGGGGGCAGCATTCTTTCAGATGGCGGCCACCGATTTGAACTTTTCTCTCCCAGGAATTCTCAATGCCACTGCCACAGCTTGGATGCTCCTGAGGGCTGCCACCCAGCCATCCACTTCAGCCATCGTCATGCCTTTGCTTTGCCTGCTGGCTCCTGGCATGAGACTGCTCTACCTGGACACGTATAGAATCACTCTCATCATCATCGGCACCTGCAGCCTGATAGGGGAGCGCCGTAGGGCGGCCGCAAAGAAGAAAGGGGCGGTACTGCTAGGGTTAGCACTAACATCAACAGGGCAGTTCTCTGCATCAGTTATGGCGGCTGGGCTCATGGCATGCAATCCCAACAAAAAGCGGGGATGGCCGGCCACAGAAGTTTTGACAGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTGGGTGGTCTAGCTGAGTTGGATGTTGATTCCATGTCCATTCCTTTTGTGTTAGCCGGGCTTATGGCAGTTTCTTACACCATTTCAGGCAAATCGACAGACTTGTGGCTTGAGAGAGCAGCTGACATAACATGGGAAACTGATGCAGCCATAACTGGAACCAGCCAACGCCTAGATGTAAAATTGGATGATGATGGTGACTTCCACCTTATTAACGACCCTGGAGTGCCGTGGAAGATATGGGTCATCCGTATGACGGCATTGGGATTCGCAGCCTGGACACCATGGGCAATAATACCCGCTGGAATAGGTTATTGGCTCACTGTCAAGTACGCAAAAAGAGGAGGCGTCTTTTGGGACACCCCGGCTCCAAGGACCTACCCCAAGGGTGACACTTCACCAGGAGTATACCGTATCATGAGCCGTTACATTTTGGGGACCTACCAGGCTGGAGTGGGCGTCATGTATGAAGGAGTTTTTCACACCCTGTGGCACACCACAAGAGGGGCAGCTATCAGAAGTGGTGAAGGAAGGCTCACTCCCTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGACAGGATCACCTATGGTGGGCCATGGAAGTTTGACAGGAAGTGGAATGGTCTCGATGATGTTCAGCTCATCGTAGTGGCCCCCGGAAAGGCAGCCATAAACATCCAAACCAAACCAGGCATCTTCAAAACGCCACAGGGGGAAATAGGAGCAGTCAGCCTGGACTATCCTGA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ACAGAAGAGATCTGAGGCTGATGGCAAACGCCATCTGTTCAGCAGTCCCCAGCAATTGGGTTCCCACTGGCAGGACTTCATGGTCAGTGCATGCCACAGGTGAATGGATGACGACTGATGACATGTTGGAAGTATGGAACAAAGTGTGGATCCAAGACAATGAATGGATGCTGGACAAGACCCCAGTTCAAAGCTGGACAGACATCCCTTACACCGGGAAGCGGGAAGACATATGGTGTGGAAGCCTGATAGGCACCCGAACACGGGCAACGTGGGCTGAAAACATCTATGCAGCCATTAACCAGGTGAGGGCCATTATTGGCCAGGAAAAATACAGGGATTACATGCTTTCACTTAGAAGATATGAAGATGTTAATGTCCAGGAGGACAGGGTTTTGTAAATAAGTGTTTAGGGTTTTGTAATTTAATTAAATATGCAATGTAATTTAGTTGTAAATATTTGATTGTGTAGTTTTATTTAGCATTGTTTTAGGATAGTGGAAGTTAAGGTTTTGTTTAGTTATTTTATTTAATTGAATTTGATAGTCAGGCCAGGGCAACCTGCCACCGGAAGTTGAGTAGACGGTGCTGCCTGCGACTCAACCCCAGGCGGACTGGGTTAACAAAGCTGACCGCTGATGATGGGAAAGCCCCTCAGAACCGTTTCGGAGAGGGACCCTGCCTATTGGAAGCGTCCAGCCCGTGTCAGGCCGCAAAGCGCCACTTCGCCAAGGAGTGCAGCCTGTACGGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGAAAGGCCCCCACGGCCCAAGCGAACAGACGGTGATGCGAACTGTTCGTGGAAGGACTAG
| 9,199
|
OR573992.1
|
Usutu virus
|
Giglia,G., Oude Munnink,B.B., Mencattelli,G., Agliani,G., Berends,A., Munger,E., Sikkema,R.S., Kik,M., Rijks,J.M., Koopmans,M.P.G., Mandara,M.T., Grone,A., van den Brand,J.M.A., Reusken,C.B.E.M., Savini,G.
|
Erasmus MC Rotterdam, Viroscience
|
Netherlands
|
2023-10-24
|
AS201700144
|
Orthoflavivirus usutuense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,728
|
GenBank
| null |
Netherlands: Limburg
|
Netherlands
|
Branta ruficollis
|
brain
|
2017-08-15
| null | null |
Usutu virus isolate AS201700144, complete genome
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ATGTCTAAGAAACCAGGAGGGCCCGGAAGAAGCCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGCATACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTCATGGGCTTGTTGGATGGAAGAGGACCAGTGCGATTCGTGCTGGCCTTGATGACATTCTTCAAGTTCACCGCGCTTGCCCCGACGAAGGCCTTGCTAGGCCGTTGGAAGCGCATCAACAAGACCACGGCAATGAAACACCTGACTAGCTTCAAAAAGGAATTAGGAACAATGATCAACGTGGTTAACAATCGGGGCACAAAAAAGAAGAGAGGCAACAATGGACCAGGACTAGTGATGATCATAACACTCATGACGGTTGTTTCAATGGTTTCCTCTTTAAAGCTTTCCAACTTCCAGGGGAAAGTCATGATGACCATCAACGCGACTGATATGGCAGATGTCATTGTTGTTCCCACGCAACATGGGAAAAACCAGTGCTGGATTAGAGCCATGGATGTCGGGTACATGTGTGATGATACCATCACTTATGAATGCCCCAAACTGGATGCAGGAAATGACCCAGAAGACATTGACTGTTGGTGTGACAAACAACCCATGTATGTCCACTATGGAAGGTGCACAAGAACCAGACACTCGAAGCGGAGTCGGCGGTCGATCGCAGTGCAGACGCACGGGGAGAGTATGCTGGCTAACAAGAAGGATGCTTGGCTAGACTCAACCAAGGCCTCGAGATACCTGATGAAGACTGAGAATTGGATTATCAGGAATCCTGGGTATGCTTTTGTAGCTGTCCTCTTGGGCTGGATGCTGGGAAGCAACAATGGACAAAGGGTCGTTTTCGTCGTTCTCTTGCTCCTTGTGGCGCCTGCTTATAGCTTCAACTGCCTTGGTATGAGCAACAGAGACTTCCTTGAGGGAGTCTCTGGTGCTACCTGGGTTGACGTGGTTTTGGAAGGTGACAGCTGCATAACCATCATGGCCAAGGACAAGCCGACCATTGACATTAAGATGATGGAAACTGAAGCCACGAACCTGGCTGAAGTGAGAAGCTACTGCTATCTAGCCACTGTCTCAGATGTTTCAACTGTCTCCAACTGTCCAACAACTGGGGAGGCCCACAATCCTAAGAGAGCTGAGGACACGTACGTGTGCAAAAGTGGTGTCACTGACAGGGGCTGGGGCAATGGCTGTGGACTATTTGGCAAAGGAAGTATAGACACGTGTGCCAACTTCACCTGCTCCCTGAAAGCGATGGGCCGGATGATCCAACCGGAAAATGTTAAGTATGAAGTGGGAATCTTTATACATGGTTCCACCAGCTCTGACACTCACGGCAACTATTCTTCACAACTAGGAGCATCACAGGCTGGGCGGTTTACCATCACTCCTAACTCCCCAGCCATCACTGTGAAGATGGGTGACTATGGAGAAATATCAGTTGAGTGTGAACCAAGAAACGGGTTGAACACCGAGGCATACTACATCATGTCAGTGGGCACCAAACACTTCCTTGTCCATAGAGAATGGTTTAATGACTTGGCCCTCCCATGGACTTCACCAGCTAGCTCAAATTGGAGAAATAGAGAGATACTACTAGAGTTCGAAGAGCCCCATGCCACAAAGCAATCAGTTGTGGCGCTTGGTTCCCAGGAAGGTGCTTTGCACCAGGCCTTGGCAGGAGCTGTTCCAGTGTCTTTCTCGGGCAGTGTCAAGCTCACATCTGGTCATCTCAAGTGTCGAGTCAAGATGGAAAAGTTGACACTAAAAGGCACCACCTACGGCATGTGCACGGAAAAGTTTTCTTTTGCAAAAAATCCGGCTGACACGGGTCACGGCACTGTGGTCCTTGAACTGCAGTACACGGGATCTGACGGACCTTGCAAAATCCCAATTTCCATTGTGGCATCACTTTCCGATCTCACCCCCATTGGTAGAATGGTTACAGCAAACCCTTATGTGGCTTCATCCGAAGCCAACGCGAAAGTGTTGGTTGAGATGGAACCACCATTTGGAGATTCATATATTGTGGTTGGAAGAGGGGATAAGCAGATAAACCATCACTGGCATAAAGCAGGAAGTTCCATTGGAAAAGCGTTCATCACCACTATCAAAGGGGCACAGCGTCTAGCTGCCCTAGGCGACACAGCGTGGGACTTTGGGTCGGTCGGAGGGATTTTCAATTCTGTAGGAAAGGCGGTACATCAGGTCTTTGGAGGAGCCTTCAGAACTCTCTTCGGTGGCATGTCCTGGATCACCCAGGGTCTAATGGGAGCTCTGCTTCTATGGATGGGGGTGAATGCGAGAGATCGATCCATCGCACTGGTGATGTTAGCCACGGGAGGGGTGCTCCTCTTTCTCGCCACAAACGTCCATGCAGACTCGGGATGTGCGATAGACGTGGGAAGGAGAGAGTTGCGCTGTGGACAAGGGATTTTTATCCACAATGATGTTGAAGCGTGGGTCGACCGGTACAAATTTATGCCTGAAACACCAAAACAGCTGGCAAAGGTCATCGAGCAAGCCCACGCGAAAGGAATATGTGGATTGAGGTCCGTCTCACGTCTGGAACACGTGATGTGGGAGAACATCAGAGATGAACTCAACACCCTCCTCAGAGAGAATGCAGTAGATCTAAGTGTCGTGGTTGAGAAGCCAAAAGGAATGTACAAATCAGCACCACAGAGATTGGCACTCACATCTGAAGAGTTTGAGATTGGGTGGAAGGCTTGGGGAAAGAGCTTGGTGTTCGCACCAGAACTGGCCAACCACACTTTTGTGGTTGACGGGCCCGAGACCAAAGAATGTCCCGATGTAAAAAGAGCTTGGAACAGCCTTGAGATTGAAGACTTTGGATTTGGCATCATGTCCACCAGGGTTTGGCTGAAAGTCAGAGAACACAACACTACTGACTGCGACAGCTCAATAATTGGGACGGCTGTTAAAGGAGACATAGCTGTGCACAGTGACCTCTCCTACTGGATTGAAAGCCACAAGAACACGACATGGAGGCTCGAAAGGGCTGTCTTTGGAGAGATCAAATCATGCACGTGGCCCGAGACACACACTCTTTGGAGTGATGGCGTTGTTGAAAGTGATCTGGTTGTGCCAGTCACCCTCGCTGGACCAAAAAGCAATCACAACCGGCGTGAAGGTTACAAAGTCCAGAGCCAGGGGCCGTGGGACGAAGAAGACATCGTTCTCGACTTTGACTATTGCCCAGGTACCACCGTCACAATCACTGAAGCATGTGGGAAGAGAGGACCCTCCATAAGAACTACCACTAGCAGTGGTAGACTGGTCACAGACTGGTGCTGCCGGAGCTGCACCCTTCCCCCTTTGAGATACAGGACAAAAAATGGATGTTGGTATGGAATGGAGATAAGACCCATGAAACATGATGAGACGACGCTGGTAAAATCCAGCGTCAGTGCCTATCGGAGTGACATGATTGACCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACTGTTCCGGCTATTGTGGGAGCTCTACTCGTGCTGATTCTTGGGGGAATCACTTACACTGACCTGCTTAGGTATGTTCTTCTGGTTGGGGCGGCTTTCGCCGAAGCCAACAGCGGGGGTGACATCGTTCATCTAGCTCTCATAGCCGCCTTCAAAATTCAACCAGGCTTTCTCGTAATGACATTTCTTAGGGGAAAGTGGACGAACCAAGAGAACATCCTGCTGGCTCTGGGGGCAGCATTCTTTCAGATGGCGGCCACCGATTTGAATTTTTCTCTCCCAGGAATTCTCAATGCCACTGCCACAGCTTGGATGCTCCTGAGGGCCGCCACCCAGCCATCCACTTCAGCCATCGTCATGCCTTTGCTTTGCCTGCTGGCTCCTGGCATGAGACTGCTCTACCTGGACACGTATAGAATCACTCTCATCATCATCGGCATCTGCAGCCTGATAGGGGAGCGCCGTAGGGCGGCCGCAAAGAAGAAAGGGGCGGTACTGCTAGGGTTAGCACTAACATCAACAGGGCAGTTCTCTGCATCAGTTATGGCGGCTGGGCTCATGGCATGCAATCCCAACAAAAAGCGGGGATGGCCGGCCACAGAAGTTTTGACAGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTGGGTGGTCTAGCTGAGTTGGATGTTGATTCTATGTCCATTCCCTTTGTGTTAGCCGGGCTGATGGCAGTTTCTTACACCATCTCAGGCAAATCGACAGACTTGTGGCTTGAGAGAGCAGCTGACATAACATGGGAAACTGATGCAGCCATAACTGGAACCAGCCAACGCCTAGATGTAAAATTGGATGATGATGGTGACTTCCACCTTATTAACGACCCTGGAGTGCCGTGGAAGATATGGGTCATCCGTATGACGGCATTGGGATTCGCAGCCTGGACACCATGGGCAATAATACCTGCTGGAATAGGTTATTGGCTCACTGTCAAGTACGCAAAAAGAGGAGGCGTCTTTTGGGACACCCCGGCTCCAAGGACCTACCCCAAGGGTGACACTTCACCAGGAGTATACCGTATCATGAGCCGTTACATTTTGGGGACCTACCAGGCTGGAGTGGGCGTCATGTATGAAGGAGTTTTTCACACCCTGTGGCACACCACAAGAGGGGCAGCCATCAGAAGTGGTGAAGGAAGGCTCACTCCCTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGACAGGATCACCTATGGTGGGCCATGGAAGTTTGACAGGAAGTGGAATGGTCTCGATGATGTTCAGCTCATCATAGTGGCCCCCGGAAAGGCAGCCATAAACATCCAAACCAAACCAGGCATCTTCAAAACGCCACAGGGGGAAATAGGAGCAGTCAGCCTGGACTATCCTGAAGGGACCTCAGGCTCCCCAATACTGGACAAGAATGGTGACATCGTGGGCTTGTACGGGAATGGAGTCATCTTGGGCAATGGCTCGTATGTCAGTGC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CAGGTGAATGGATGACAACTGATGACATGTTGGAAGTGTGGAACAAAGTGTGGATCCAAGACAACGAATGGATGCTGGACAAGACCCCAGTACAAAGCTGGACAGACATCCCTTACACCGGGAAGCGGGAAGACATATGGTGTGGAAGCCTGATAGGCACGCGAACACGGGCAACGTGGGCTGAAAACATCTACGCAGCCATTAACCAGGTGAGGGCCATTATTGGCCAGGAAAAATACAGGGATTACATGCTTTCACTTAGAAGATATGAAGAAGTTAATGTCCAGGAGGACAGGGTTTTGTAAATAAGTGTTTAGGGTTTTGCAATTTAATTAAATATGCAATGTAATTTAGTTGTAAATATTTGATTGTGTAGCTTTATTTAGCATTGTCTTAGGATAGTAGAAGTTAAGGCTTTGTTTAGTTATTTTATTTATTGAATTTGATAGTCAGGCCAGGGCAACCTGCCACCGGAAGTTGAGTAGACGGTGCTGCCTGCGACTCAACCCCAGGCGGACTGGGTTAGCAAAGCTGACCGCTGATGATGGGAAAGCCCCTCAGAACCGTTTCGGAGAGGGACCCTGCCTATTGGAAGCGTCCAGCCCGTGTCAGGCCGCAAAGCGCCACTTCGCCAAGGAGTGCAGCCTGTACGGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGAAAGGCCCCCACGGCCCAAGCGAACAGACGGTGATGCGAACTGTTCG
| 11,702
|
OR573993.1
|
Usutu virus
|
Giglia,G., Oude Munnink,B.B., Mencattelli,G., Agliani,G., Berends,A., Munger,E., Sikkema,R.S., Kik,M., Rijks,J.M., Koopmans,M.P.G., Mandara,M.T., Grone,A., van den Brand,J.M.A., Reusken,C.B.E.M., Savini,G.
|
Erasmus MC Rotterdam, Viroscience
|
Netherlands
|
2023-10-24
|
AS201700147
|
Orthoflavivirus usutuense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,728
|
GenBank
| null |
Netherlands: Limburg
|
Netherlands
|
Branta ruficollis
|
brain
|
2017-08-15
| null | null |
Usutu virus isolate AS201700147, complete genome
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ATGTCTAAGAAACCAGGAGGGCCCGGAAGAAGCCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGCATACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTCATGGGCTTGTTGGATGGAAGAGGACCAGTGCGATTCGTGCTGGCCTTGATGACATTCTTCAAGTTCACCGCGCTTGCCCCGACGAAGGCCTTGCTAGGCCGTTGGAAGCGCATCAACAAGACCACGGCAATGAAACACCTGACTAGCTTCAAAAAGGAATTAGGAACAATGATCAACGTGGTTAACAATCGGGGCACAAAAAAGAAGAGAGGCAACAATGGACCAGGACTAGTGATGATCATAACACTCATGACGGTTGTTTCAATGGTTTCCTCTTTAAAGCTTTCCAACTTCCAGGGGAAAGTCATGATGACCATCAACGCGACTGATATGGCAGATGTCATTGTTGTTCCCACGCAACATGGGAAAAACCAGTGCTGGATTAGAGCCATGGATGTCGGGTACATGTGTGATGATACCATCACTTATGAATGCCCCAAACTGGATGCAGGAAATGACCCAGAAGACATTGACTGTTGGTGTGACAAACAACCCATGTATGTCCACTATGGAAGGTGCACAAGAACCAGACACTCGAAGCGGAGTCGGCGGTCGATCGCAGTGCAGACGCACGGGGAGAGTATGCTGGCTAACAAGAAGGATGCTTGGCTAGACTCAACCAAGGCCTCGAGATACCTGATGAAGACTGAGAATTGGATTATCAGGAATCCTGGGTATGCTTTTGTAGCTGTCCTCTTGGGCTGGATGCTGGGAAGCAACAATGGACAAAGGGTCGTTTTCGTCGTTCTCTTGCTCCTTGTGGCGCCTGCTTATAGCTTCAACTGCCTTGGTATGAGCAACAGAGACTTCCTTGAGGGAGTCTCTGGTGCTACCTGGGTTGACGTGGTTTTGGAAGGTGACAGCTGCATAACCATCATGGCCAAGGACAAGCCGACCATTGACATTAAGATGATGGAAACTGAAGCCACGAACCTGGCTGAAGTGAGAAGCTACTGCTATCTAGCCACTGTCTCAGATGTTTCAACTGTCTCCAACTGTCCAACAACTGGGGAGGCCCACAATCCTAAGAGAGCTGAGGACACGTACGTGTGCAAAAGTGGTGTCACTGACAGGGGCTGGGGCAATGGCTGTGGACTATTTGGCAAAGGAAGTATAGACACGTGTGCCAACTTCACCTGCTCCCTGAAAGCGATGGGCCGGATGATCCAACCGGAAAATGTTAAGTATGAAGTGGGAATCTTTATACATGGTTCCACCAGCTCTGACACTCACGGCAACTATTCTTCACAACTAGGAGCATCACAGGCTGGGCGGTTTACCATCACTCCTAACTCCCCAGCCATCACTGTGAAGATGGGTGACTATGGAGAAATATCAGTTGAGTGTGAACCAAGAAACGGGTTGAACACCGAGGCATACTACATCATGTCAGTGGGCACCAAACACTTCCTTGTCCATAGAGAATGGTTTAATGACTTGGCCCTCCCATGGACTTCACCAGCTAGCTCAAATTGGAGAAATAGAGAGATACTACTAGAGTTCGAAGAGCCCCATGCCACAAAGCAATCAGTTGTGGCGCTTGGTTCCCAGGAAGGTGCTTTGCACCAGGCCTTGGCAGGAGCTGTTCCAGTGTCTTTCTCGGGCAGTGTCAAGCTCACATCTGGTCATCTCAAGTGTCGAGTCAAGATGGAAAAGTTGACACTAAAAGGCACCACCTACGGCATGTGCACGGAAAAGTTTTCTTTTGCAAAAAATCCGGCTGACACGGGTCACGGCACTGTGGTCCTTGAACTGCAGTACACGGGATCTGACGGACCTTGCAAAATCCCAATTTCCATTGTGGCATCACTTTCCGATCTCACCCCCATTGGTAGAATGGTTACAGCAAACCCTTATGTGGCTTCATCCGAAGCCAACGCGAAAGTGTTGGTTGAGATGGAACCACCATTTGGAGATTCATATATTGTGGTTGGAAGAGGGGATAAGCAGATAAACCATCACTGGCATAAAGCAGGAAGTTCCATTGGAAAAGCGTTCATCACCACTATCAAAGGGGCACAGCGTCTAGCTGCCCTAGGCGACACAGCGTGGGACTTTGGGTCGGTCGGAGGGATTTTCAATTCTGTAGGAAAGGCGGTACATCAGGTCTTTGGAGGAGCCTTCAGAACTCTCTTCGGTGGCATGTCCTGGATCACCCAGGGTCTAATGGGAGCTCTGCTTCTATGGATGGGGGTGAATGCGAGAGATCGATCCATCGCACTGGTGATGTTAGCCACGGGAGGGGTGCTCCTCTTTCTCGCCACAAACGTCCATGCAGACTCGGGATGTGCGATAGACGTGGGAAGGAGAGAGTTGCGCTGTGGACAAGGGATTTTTATCCACAATGATGTTGAAGCGTGGGTCGACCGGTACAAATTTATGCCTGAAACACCAAAACAGCTGGCAAAGGTCATCGAGCAAGCCCACGCGAAAGGAATATGTGGATTGAGGTCCGTCTCACGTCTGGAACACGTGATGTGGGAGAACATCAGAGATGAACTCAACACCCTCCTCAGAGAGAATGCAGTAGATCTAAGTGTCGTGGTTGAGAAGCCAAAAGGAATGTACAAATCAGCACCACAGAGATTGGCACTCACATCTGAAGAGTTTGAGATTGGGTGGAAGGCTTGGGGAAAGAGCTTGGTGTTCGCACCAGAACTGGCCAACCACACTTTTGTGGTTGACGGGCCCGAGACCAAAGAATGTCCCGATGTAAAAAGAGCTTGGAACAGCCTTGAGATTGAAGACTTTGGATTTGGCATCATGTCCACCAAGGTTTGGCTGAAAGTCAGAGAACACAACACTACTGACTGCGACAGCTCAATAATTGGGACGGCTGTTAAAGGAGACATAGCTGTGCACAGTGACCTCTCCTACTGGATTGAAAGCCACAAGAACACGACATGGAGGCTCGAAAGGGCTGTCTTTGGAGAGATCAAATCATGCACGTGGCCCGAGACACACACTCTTTGGAGTGATGGCGTTGTTGAAAGTGATCTGGTTGTGCCAGTCACCCTCGCTGGACCAAAAAGCAATCACAACCGGCGTGAAGGTTACAAAGTCCAGAGCCAGGGGCCGTGGGACGAAGAAGACATCGTTCTCGACTTTGACTATTGCCCAGGTACCACCGTCACAATCACTGAAGCATGTGGGAAGAGAGGACCCTCCATAAGAACTACCACTAGCAGTGGTAGACTGGTCACAGACTGGTGCTGCCGGAGCTGCACCCTTCCCCCTTTGAGATACAGGACAAAAAATGGATGTTGGTATGGAATGGAGATAAGACCCATGAAACATGATGAGACGACGCTGGTAAAATCCAGCGTCAGTGCCTATCGGAGTGACATGATTGACCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACTGTTCCGGCTATTGTGGGAGCTCTACTCGTGCTGATTCTTGGGGGAATCACTTACACTGACCTGCTTAGGTATGTTCTTCTGGTTGGGGCGGCTTTCGCCGAAGCCAACAGCGGGGGTGACATCGTTCATCTAGCTCTCATAGCCGCCTTCAAAATTCAACCAGGCTTTCTCGTAATGACATTTCTTAGGGGAAAGTGGACGAACCAAGAGAACATCCTGCTGGTTCTGGGGGCAGCATTCTTTCAGATGGCGGCCACCGATTTGAATTTTTCTCTCCCAGGAATTCTCAATGCCACTGCCACAGCTTGGATGCTCCTGAGGGCCGCCACCCAGCCATCCACTTCAGCCATCGTCATGCCTTTGCTTTGCCTGCTGGCTCCTGGCATGAGACTGCTCTACCTGGACACGTATAGAATCACTCTCATCATCATCGGCATCTGCAGCCTGATAGGGGAGCGCCGTAGGGCGGCCGCAAAGAAGAAAGGGGCGGTACTGCTAGGGTTAGCACTAACATCAACAGGGCAGTTCTCTGCATCAGTTATGGCGGCTGGGCTCATGGCATGCAATCCCAACAAAAAGCGGGGATGGCCGGCCACAGAAGTTTTGACAGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTGGGTGGTCTAGCTGAGTTGGATGTTGATTCTATGTCCATTCCCTTTGTGTTAGCCGGGCTGATGGCAGTTTCTTACACCATCTCAGGCAAATCGACAGACTTGTGGCTTGAGAGAGCAGCTGACATAACATGGGAAACTGATGCAGCCATAACTGGAACCAGCCAACGCCTAGATGTAAAATTGGATGATGATGGTGACTTCCACCTTATTAACGACCCTGGAGTGCCGTGGAAGATATGGGTCATCCGTATGACGGCATTGGGATTCGCAGCCTGGACACCATGGGCAATAATACCTGCTGGAATAGGTTATTGGCTCACTGTCAAGTACGCAAAAAGAGGAGGCGTCTTTTGGGACACCCCGGCTCCAAGGACCTACCCCAAGGGTGACACTTCACCAGGAGTATACCGTATCATGAGCCGTTACATTTTGGGGACCTACCAGGCTGGAGTGGGCGTCATGTATGAAGGAGTTTTTCACACCCTGTGGCACACCACAAGAGGGGCAGCCATCAGAAGTGGTGAAGGAAGGCTCACTCCCTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGACAGGATCACCTATGGTGGGCCATGGAAGTTTGACAGGAAGTGGAATGGTCTCGATGATGTTCAGCTCATCATAGTGGCCCCCGGAAAGGCAGCCATAAACATCCAAACCAAACCAGGCATCTTCAAAACGCCACAGGGGGAAATAGGAGCAGTCAGCCTGGACTATCCTGAAGGGACCTCAGGCTCCCCAATACTGGACAAGAATGGTGACATCGTGGGCTTGTACGGGAATGGAGTCATCTTGGGCAATGGCTCGTATGTCAGTGC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| 11,703
|
OR141530.2
|
Usutu virus
|
Bergmann,F., Holicki,C., Groschup,M.H., Sadeghi,B., Ziegler,U.
|
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Novel and Emerging Infectious Diseases
|
Germany
|
2023-09-05
|
ED-I-44/18
|
Orthoflavivirus usutuense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,053
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
Usutu virus isolate ED-I-44/18, complete genome
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GGCCTGTGTGAGCTCTACTACTTAGTATTGTTTTTGGAGGATCGTGAGATTAACACAGTGCCGGCAGTTTCTTTGAGCGTTGATTTTCAATGTCTAAGAAACCAGGAGGGCCCGGAAGAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGCATACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTCATGGGCTTGTTGGATGGAAGAGGACCAGTGCGATTCGTGCTGGCCTTGATGACATTCTTCAAGTTCACCGCGCTTGCCCCGACAAAGGCCTTGCTAGGCCGTTGGAAGCGCATCAACAAGACCACGGCAATGAAACACCTGACTAGCTTCAAAAAGGAATTGGGAACAATGATCAACGTGGTCAACAATCGGGGCACAAAAAAGAAGAGAAGCAACAATGGACCAGGACTATTGATGATTATAACACTCATGACGGCTGTTTCAATGGTTTCCTCTTTAAAGCTTTCCAACTTCCAGGGGAAAGTCATGATGACCATCAACGCGACTGACATGGCAGACGTCATTGTTGTTCCCACGCGACATGGGAAAAACCAGTGCTGGATTAGAGCCATGGATGTCGGGTACATGTGTGATGACACCATCACTTATGAATGCCCCAAGCTGGATGCAGGAAATGACCCAGAAGACATTGACTGTTGGTGTGACAAACAACCCATGTATGTCCACTATGGAAGGTGCACAAGAACCAGACATTCGAAGCGGAGTCGGCGGTCGATCGCAGTGCAGACGCACGGGGAAAGTATGCTGGCTAACAAGAAGGATGCCTGGCTAGACTCAACCAAGGCCTCGAGATACCTGATGAAGACTGAAAATTGGATTATCAGGAATCCTGGGTACGCTATTGTAGCTGTCCTCTTGGGCTGGATGCTGGGAAGCAACAATGGACAAAGGGTCGTTTTCGTCGTTCTTTTACTTCTTGTGGCGCCTGCTTACAGCTTCAACTGCCTTGGTATGAGCAACAGAGACTTCCTTGAGGGAGTCTCTGGTGCTACCTGGGTCGACGTGGTTTTGGAAGGTGACAGCTGCATAACCATCATGGCTAAGGACAAGCCGACCATTGACATTAAGATGATGGAAACTGAAGCCACGAGTTTGGCTGAAGTGAGAAGCTACTGCTATCTAGCCACTGTCTCAGATGTTTCAACTGTCTCCAACTGTCCAACAACTGGGGAGGCCCACAATCCTAAGAGAGCTGAGAACACGTATGTGTGCAAAAGTGGTGTCACTGACAGGGGCTGGGGCAATGGCTGTGGACTATTTGGCAAAGGAAGTATAGACACGTGCGCCAACTTCACCTGCTCCCTGAAAGCGGTGGGCCGGATGATCCAACCGGAAAATGTTAAGTATGAAGTGGGAATCTTCATACATGGTTCCACCAGCTCTGACACTCACGGCAACTATTCTTCACAACTAGGAGCATCACAGGCTGGGCGATTTACCATCACTCCCAACTCCCCAGCCATCACTGTGGAGATGGGTGACTATGGAGAAATATCAGTTGAGTGTGAACCAAGAAACGGGTTGAACACTGAGGCGTACTACATCATGTCAGTGGGCACCAAACACTTCCTTGTCCATAGAGAATGGTTTAACGACTTGGCCCTCCCATGGACTTCACCAGCTAGCTCAAATTGGAGAAATAGAGAGACACTACTAGAATTCGAAGAGCCCCATGCCACAAAGCAATCAGTTGTGGCGCTTGGTTCCCAGGAAGGTGCTTTGCACCAGGCCTTGGCAGGAGCTGTTCCAGTGTCTTTCTCGGGCAGTGTAAAGCTCACATCTGGTCATCTCAAGTGTCGAGTCAAGATGGAAAAGTTGACACTAAAAGGCACCACCTACGGCATGTGTACGGAAAAGTTTTCTTTTGCAAAAAATCCGGCTGACACGGGTCACGGCACTGTGGTCCTTGAACTGCAGTACACGGGATCTGATGGACCTTGCAAAATCCCAATTTCCATTGTGGCAACACTTTCCGATCTCACCCCCATTGGTAGAATGGTCACAGCAAACCCTTATGTAGCTTCATCCGAAGCTAACGCGAAAGTGCTGGTTGAGATGGAACCACCATTTGGAGATTCATACATTGTGGTTGGAAGAGGGGACAAGCAGATAAACCATCACTGGCACAAAGCAGGAAGCTCCATTGGAAAAGCGTTCATCACCACCATCAAAGGAGCACAGCGTCTAGCTGCCCTAGGCGACACGGCATGGGACTTTGGGTCGGTCGGAGGGATTTTCAACTCTGTAGGGAAGGCGGTGCATCAGGTCTTTGGAGGAGCCTTCAGAACTCTCTTCGGTGGCATGTCCTGGATCACCCAGGGTCTGATGGGAGCTCTGCTTCTGTGGATGGGGGTGAATGCGAGGGATCGATCCATCGCACTGGTGATGTTAGCCACGGGAGGGGTGCTTCTCTTTCTCGCCACAAACGTCCATGCAGACTCGGGATGTGCGATAGACGTGGGAAGGAGAGAGTTGCGCTGTGGACAAGGGATCTTCATCCACAATGATGTTGAAGCGTGGGTCGACCGGTACAAATTTATGCCTGAAACACCGAAACAGCTGGCAAAGGTCATCGAGCAAGCCCACGCGAAAGGAATATGTGGATTGAGGTCCGTCTCACGTCTGGAACACGTGATGTGGGAGAACATCAGAGATGAACTTAACACCCTCCTCAGAGAGAATGCAGTAGATCTAAGTGTCGTGGTTGAGAAGCCAAAAGGAATGTACAAATCAGCACCGCAGAGATTAGCACTCACATCTGAAGAGTTTGAGATTGGGTGGAAGGCTTGGGGAAAGAGCTTGGTGTTCGCACCAGAACTGGCCAACCACACTTTTGTGGTTGACGGGCCCGAGACCAAAGAATGTCCCGATGTAAAAAGAGCTTGGAACAGCCTTGAGATCGAAGACTTTGGATTTGGCATCATGTCCACTAGGGTTTGGCTGAAAGTCAGAGAGCACAACACTACTGACTGCGACAGCTCAATAATTGGGACGGCTGTTAAAGGAGACATAGCTGTGCACAGTGACCTCTCCTACTGGATTGAAAGCCACAAGAACACGACATGGAGGCTCGAGAGGGCTGTCTTTGGAGAGATCAAATCATGCACGTGGCCTGAAACACACACTCTTTGGAGTGATGGCGTTGTTGAAAGTGATCTGGTTGTGCCAGTCACCCTCGCTGGGCCAAAAAGCAATCACAACCGGCGTGAAGGTTACAAAGTCCAGAGCCAGGGGCCGTGGGACGAAGAAGACATCGTTCTCGACTTTGACTACTGCCCAGGCACCACCGTCACAATCACTGAAGCATGTGGGAAGAGAGGACCCTCCATAAGAACCACTACTAGCAGTGGTAGATTGGTCACAGACTGGTGCTGCCGGAGCTGCACCCTTCCCCCTTTGAGATACAGGACAAAAAATGGATGTTGGTATGGAATGGAGATAAGACCCATGAAGCATGATGAGACGACGTTGGTAAAATCCAGCGTCAGTGCCTACCGGAGTGACATGATTGATCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACTGTTCCGGCTATTGTGGGAGCTCTACTCGTGCTGATTCTTGGGGGAATTACTTACACTGACCTGCTTAGGTATGTTCTTCTGGTTGGGGCGGCCTTCGCCGAAGCCAACAGCGGGGGTGACGTCGTCCATCTAGCTCTCATAGCCGCCTTTAAAATTCAACCAGGCTTTCTCGCAATGACATTTCTTAGGGGAAAGTGGACGAACCAAGAGAACATCCTGCTGGCCCTGGGGGCAGCATTCTTTCAGATGGCGGCCACCGATTTGAACTTGTCTCTCCCAGGAATTCTCAATGCCACTGCTACAGCTTGGATGCTCCTGAGGGCTGTCACCCAGCCATCCACTTCTGCCATCGTCATGCCTTTGCTTTGCCTGCTGGCTCCTGGCATGAGACTGCTCTACCTGGACACGTATAGAATCACTCTCATCATCGTCGGCATTTGCAGCCTGATAGGGGAGCGCCGTAGGGTGGCCGCAAAGAAGAAAGGGGCGGTATTGCTAGGGTTAGCACTAACATCAACAGGGCAGTTCTCTGCGTCAGTTATGGCGGCTGGGCTCATGGCATGCAATCCCAACAAAAAGCGGGGATGGCCGGCTACAGAAGTTTTGACAGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTGGGTGGTCTAGCTGAGTTGGATGTTGATTCCATGTCCATTCCTTTTGTGTTGGCCGGGCTGATGGCAGTTTCTTACACCATTTCAGGCAAATCGACAGACTTGTGGCTTGAGAGAGCAGCTGACATAACATGGGAAACTGATGCAGCCATAACTGGAACCAGCCAACGCCTAGATGTGAAATTGGATGATGATGGTGACTTCCACCTTATCAACGACCCTGGAGTGCCGTGGAAGATATGGGTCATCCGCATGACGGCACTGGGGTTCGCAGCCTGGACACCATGGGCAATAATACCGGCTGGAATAGGCTATTGGCTCACTGTCAAGTACGCAAAAAGAGGAGGTGTCTTTTGGGACACTCCGGCTCCGAGGACCTACCCCAAGGGTGACACTTCACCAGGAGTATACCGTATCATGAGCCGTTACATTCTGGGGACCTACCAGGCTGGAGTGGGCGTCATGTATGAAGGAGTTTTTCACACCCTGTGGCATACCACAAGAGGGGCAGCTATCAGAAGTGGTGAAGGAAGGCTCACTCCCTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGATAGGATCACCTATGGTGGGCCATGGAAGTTTGATAGGAAGTGGAATGGTCTCGATGATGTTCAGCTCATCGTAGTGGCCCCCGGAAAGGCAGCCATAAACATCCAAACCAAACCAGGCATCTTCAAAACGCCACAGGGGGAAATAGGAGCAGTCAGCCTGGACTATCCTGAAGGGACT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| 13,080
|
OR141599.2
|
Usutu virus
|
Bergmann,F., Holicki,C., Groschup,M.H., Sadeghi,B., Ziegler,U.
|
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Novel and Emerging Infectious Diseases
|
Germany
|
2023-09-05
|
ED-I-249/21
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Orthoflavivirus usutuense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,063
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
UNVERIFIED: Usutu virus isolate ED-I-249/21, complete genome
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AGTCGTCCGACTGTTTAATCTCACGATCCTCCAAAAACAATACTAAGTAGTAGAGCTCACACAGTGCCGGCAGTTTCTTTGAGCGTTGATTTTCAATGTCTAAGAAACCAGGAGGGCCCGGAAGAAGCCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGCATACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTCATGGGCTTGTTGGATGGAAGAGGACCAGTGCGATTCGTGCTGGCCTTGATGACATTCTTCAAGTTCACCGCGCTTGCCCCGACGAAGGCCTTGCTAGGCCGTTGGAAGCGCATCAACAAGACCACGGCAATGAAACACCTGACTAGCTTCAGAAAGGAATTAGGAACAATGATCAACGTGGTTAACAATCGGGGTACAAAAAAGAAGAGAGGCAACAATGGACCAGGATTAGTGATGATCATAACACTCATGACGGTTGTTTCAATGGTTTCCTCTTTAAAGCTTTCCAACTTCCAGGGGAAAGTCATGATGACCATCAACGCGACTGATATGGCAGATGTCATTGTTATTCCCACGCAACATGGGAGAAACCAGTGCTGGATTAGAGCCATGGATGTCGGGTACATGTGTGATGATACCATCACTTATGAATGCCCCAAACTGGATGCAGGAAATGACCCAGAAGACATTGACTGTTGGTGTGACAAACAACCCATGTACGTCCACTATGGAAGGTGCACAAGAACCAGACACTCGAAGCGGAGTCGGCGGTCGATCGCAGTGCAGACGCACGGGGAGAGTATGCTGGCTAACAAGAAGGATGCTTGGCTAGACTCAACCAAGGCTTCGAGATACCTGATGAAGACTGAGAATTGGATTATCAGGAATCCTGGGTATGCTTTTGTAGCTGTCCTCTTGGGCTGGATGCTGGGAAGCAACAATGGACAAAGGGTCGTTTTCGTCGTTCTCTTGCTCCTCGTGGCGCCTGCTTATAGCTTCAACTGCCTTGGTATGAGCAACAGAGACTTCCTTGAGGGAGTCTCTGGTGCTACCTGGGTTGACGTGGTTTTGGAAGGTGACAGCTGCATAACCATCATGGCCAAGGACAAGCCGACCATTGACATTAAGATGATGGAAACTGAAGCCACGAACCTGGCTGAAGTGAGAAGCTACTGCTATCTAGCCACTGTCTCAGATGTTTCAACTGTCTCCAACTGTCCAACAACTGGGGAGGCCCACAATCCTAAGAGAGCTGAGGACACGTACGTGTGCAAAAGTGGTGTCACTGACAGGGGCTGGGGCAATGGCTGTGGACTATTCGGCAAAGGAAGTATAGACACGTGTGCCAACTTCACCTGCTCCCTGAAAGCGATGGGCCGGATGATCCAACCGGAAAATGTTAAGTATGAAGTGGGAATCTTCATACATGGTTCTACCAGCTCTGACACTCACGGCAACTATTCTTCACAACTAGGAGCATCACAGGCGGGGCGGTTTACCATCACTCCCAACTCCCCAGCCATCACTGTGAAGATGGGTGACTATGGAGAAATATCAGTTGAGTGTGAACCAAGAAACGGGTTGAACACCGAGGCATACTACATCATGTCAGTGGGCACCAAACACTTCCTTGTCCATAGAGAATGGTTTAATGACTTGGCCCTCCCATGGACTTCACCAGCTAGCTCAAATTGGAGAAATAGAGAGATACTACTAGAGTTCGAAGAGCCCCATGCCACAAAGCAATCAGTTGTGGCGCTTGGTTCCCAGGAAGGTGCTTTGCACCAGGCCTTGGCAGGAGCTGTTCCAGTGTCTTTCTCGGGCAGTGTCAAGCTCACATCTGGTCATCTCAAGTGTCGAGTCAAGATGGAAAAGTTGACACTAAAAGGCACCACCTACGGCATGTGCACGGAAAAGTTTTCTTTTGCAAAAAATCCGGCTGACACGGGTCACGGCACTGTGGTCCTTGAACTGCAGTACACGGGATCTGACGGACCTTGCAAAATCCCAATTTCCATTGTGGCATCACTTTCCGATCTCACCCCCATTGGTAGAATGGTTACAGCAAACCCTTATGTGGCTTCATCCGAAGCCAACGCGAAAGTGTTGGTTGAGATGGAACCACCATTTGGAGATTCATATATTGTGGTTGGAAGAGGGGATAAGCAGATAAACCATCACTGGCACAAAGCAGGAAGTTCCATTGGAAAAGCGTTCATCACCACTATCAAAGGGGCACAGCGTCTAGCTGCCCTAGGCGACACAGCGTGGGACTTTGGGTCGGTCGGAGGGATTTTCAATTCTGTAGGAAAGGCGGTACATCAGGTCTTTGGAGGAGCCTTCAGAACTCTCTTCGGTGGCATGTCCTGGATCACCCAGGGTCTAATGGGAGCTCTGCTTCTATGGATGGGGGTGAATGCGAGAGATCGATCCATCGCACTGGTGATGTTAGCCACGGGAGGGGTGCTCCTCTTTCTCGCCACAAACGTCCATGCAGACTCGGGATGTGCGATAGACGTGGGAAGGAGAGAGTTGCGCTGTGGACAAGGGATTTTTATCCACAATGATGTTGAAGCGTGGGTCGACCGGTACAAATTTATGCCTGAAACACCAAAACAGCTGGCAAAGGTCATCGAGCAAGCCCACGCGAAAGGAATATGTGGATTGAGGTCCGTCTCACGTCTGGAACACGTGATGTGGGAGAACATCAGAGATGAACTCAACACCCTCCTCAGAGAGAATGCAGTAGATCTAAGTGTCGTGGTTGAGAAGCCAAAAGGAATGTACAAATCAGCACCACAGAGATTGGCACTCACATCTGAAGAGTTTGAGATTGGGTGGAAGGCTTGGGGAAAGAGCTTGGTGTTCGCACCAGAACTGGCCAACCACACTTTTGTGGTTGACGGGCCCGAGACCAAAGAATGTCCCGATGTAAAAAGAGCTTGGAACAGCCTTGAGATTGAAGACTTTGGATTTGGCATCATGTCCACCAGGGTTTGGCTGAAAGTCAGAGAACACAACACTACTGACTGCGACAGCTCAATAATTGGGACGGCTGTTAAAGGAGACATAGCTGTGCACAGTGACCTCTCCTACTGGATTGAAAGCCACAAGAACACGACATGGAGGCTCGAGAGGGCTGTCTTTGGAGAGATCAAATCATGCACGTGGCCTGAGACACACACTCTTTGGAGTGATGGCGTTGTTGAAAGTGATCTGGTTGTGCCAGTCACCCTCGCTGGACCAAAAAGCAATCACAACCGGCGTGAAGGTTACAAAGTCCAGAGCCAGGGGCCGTGGGACGAAGAAGACATCGTTCTCGACTTTGACTATTGCCCAGGTACCACCGTCACAATCACTGAAGCATGTGGGAAGAGAGGACCCTCCATAAGAACTACTACTAGCAGTGGTAGACTGGTCACAGACTGGTGCTGCCGGAGCTGCACCCTTCCCCCTTTGAGATACAGGACAAAAAATGGATGTTGGTATGGAATGGAGATAAGACCCATGAAACATGATGAGACGACGCTGGTAAAATCCAGCGTCAGTGCCTATCGGAGTGACATGATTGATCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACTGTTCCGGCTATTGTGGGAGCTCTACTCGTGCTGATTCTTGGGGGAATCACTTACACTGACCTGCTTAGGTATGTTCTTCTGGTTGGGGCGGCCTTCGCCGAAGCCAACAGCGGGGGTGACATCGTTCATCTAGCTCTCATAGCCGCCTTCAAAATTCAACCAGGCTTTCTCGTAATGACATTTCTTAGGGGAAAGTGGACGAACCAAGAGAACATCCTGCTGGCTCTGGGGGCAGCATTCTTTCAGATGGCGGCCACCGATTTGAACTTTTCTCTCCCAGGAATTCTCAATGCCACTGCCACAGCTTGGATGCTCCTGAGGGCTGCCACCCAGCCATCCACTTCAGCCATCGTCATGCCTTTGCTTTGCCTGCTGGCTCCTGGCATGAGACTGCTCTACCTGGACACGTATAGAATCACTCTCATCATCATCGGCGTCTGCAGCCTGATAGGGGAGCGCCGTAGGGCGGCCGCAAAGAAGAAAGGGGCGGTACTGCTAGGGTTAGCACTAACATCAACAGGGCAGTTCTCAGCATCAGTTATGGCGGCTGGGCTCATGGCATGCAATCCCAACAAAAAGCGGGGATGGCCGGCCACAGAAGTTTTGACAGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTGGGTGGTTTAGCTGAGTTGGATGTTGATTCTATGTCCATTCCTTTTGTGTTAGCCGGGCTGATGGCAGTTTCTTACACCATCTCAGGCAAATCGACAGACTTGTGGCTTGAGAGAGCAGCTGACATAACATGGGAAACTGATGCAGCCATAACTGGAACCAGCCAACGCCTAGATGTAAGATTGGATGATGATGGTGACTTCCACCTTATTAACGACCCTGGAGTGCCGTGGAAGATATGGGTCATCCGTATGACGGCATTGGGATTCGCAGCCTGGACACCATGGGCAATAATACCTGCTGGAATAGGTTATTGGCTCACTGTCAAGTACGCAAAAAGAGGAGGCGTCTTTTGGGACACCCCGGCTCCAAGGACCTACCCCAAGGGTGACACTTCACCAGGAGTATACCGTATCATGAGCCGTTACATTTTGGGGACCTACCAGGCTGGAGTGGGCGTCATGTATGAAGGAGTTTTTCACACCCTGTGGCACACCACAAGAGGGGCAGCTATCAGAAGTGGTGAAGGAAGGCTCACTCCCTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGACAGGATCACCTATGGTGGGCCATGGAAGTTTGACAGGAAGTGGAATGGTCTCGATGATGTTCAGCTCATCATAGTGGCTCCCGGAAAGGCAGCCATAAACATCCAAACCAAACCAGGCATCTTCAAAACGCCACAGGGGGAAATAGGAGCAGTCAGCCTGGACTATCCTGAA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| 13,081
|
OR141600.2
|
Usutu virus
|
Bergmann,F., Holicki,C., Groschup,M.H., Sadeghi,B., Ziegler,U.
|
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Novel and Emerging Infectious Diseases
|
Germany
|
2023-09-05
|
ED-I-18/22
|
Orthoflavivirus usutuense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,932
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
UNVERIFIED: Usutu virus isolate ED-I-18/22, complete genome
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CCGGCAGTTTCTTTGAGCGTTGATTTTCAATGTCTAAGAAATCAGGAGGGCCCGGAAGAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGCATACCCCGCGTATTCCCATTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTCATGGGCTTGTTGGATGGAAGAGGACCAGTGCGATTTGTGCTGGCCTTGATGACATTCTTCAAGTTCACCGCGCTTGCCCCGACAAAGGCCTTGCTAGGCCGTTGGAAGCGCATCAACAAGACCACGGCAATGAAACACCTGACTAGCTTCAAAAAGGAATTAGGAACAATGATCAACGTGGTCAACAATCGGGGCACAAAAAAGAAGAGAAGCAACAATGGACCAGGACTATTGATGATTATAACACTCATGACGGCTGTTTCAATGGTTTCCTCTTTAAAGCTTTCCAACTTCCAGGGGAAAGTCATGATGACCATCAACGCGACTGACATGGCAGATGTCATTGTTGTTCCCACGCAACATGGGAAAAACCAGTGCTGGATTAGAGCCATGGATGTCGGGTACATGTGTGATGACACCATCACTTATGAATGCCCCAAGCTGGATGCAGGAAATGACCCAGAAGACATTGACTGTTGGTGTGATAAACAACCCATGTATGTCCACTATGGAAGGTGCACAAGAACCAGACATTCGAAGCGGAGTCGGCGGTCGATCGCAGTGCAGACGCACGGGGAAAGTATGCTGGCTAACAAGAAGGATGCCTGGCTAGACTCAACCAAGGCCTCGAGATACCTGATGAAGACTGAAAATTGGATTATCAGGAATCCTGGGTACGCTTTTGTAGCTGTCCTCTTGGGCTGGATGCTGGGAAGCAACAATGGACAAAGGGTCGTTTTCGTCGTTCTTTTACTTCTTGTGGCGCCTGCTTACAGCTTCAACTGCCTTGGCATGAGCAACAGAGACTTCCTTGAGGGAGTCTCTGGTGCTACCTGGGTCGACGTAGTTTTGGAAGGTGACAGCTGCATAACCATCATGGCTAAGGACAAGCCGACCATTGACATTAAGATGATGGAAACTGAAGCCACGAGTTTGGCTGAAGTGAGAAGCTACTGCTATCTAGCCACTGTCTCAGATGTTTCAACTGTCTCCAACTGTCCAACAACTGGGGAGGCCCACAATCCTAAGAGAGCTGAGAACACGTATGTGTGCAAAAGTGGTGTCACTGACAGGGGCTGGGGCAATGGCTGTGGACTATTTGGCAAAGGAAGTATAGACACGTGCGCCAACTTCACCTGCTCCCTGAAAGCGGTGGGCCGGATGATCCAACCGGAAAATGTTAAGTATGAAGTGGGAATCTTCATACATGGTTCCACCAGCTCTGACACTCACGGTAACTATTCTTCACAACTAGGAGCATCACAGGCTGGGCGATTTACCATCACTCCCAACTCCCCAGCCATCACTGTGGAGATGGGTGACTATGGAGAAATATCAGTTGAGTGTGAACCAAGAAACGGGTTGAACACTGAGGCGTACTACATCATGTCAGTGGGTACCAAACACTTCCTTGTCCATAGAGAATGGTTTAACGACTTGGCCCTCCCATGGACTTCACCAGCTAGCTTAAATTGGAGAAATAGAGAGACACTACTAGAATTCGAAGAGCCCCATGCCACAAAGCAATCAGTTGTGGCGCTTGGTTCCCAGGAAGGTGCTTTGCACCAGGCCTTGGCAGGAGCTGTTCCAGTGTCTTTCTCGGGCAGTGTAAAGCTCACATCTGGTCATCTCAAGTGTCGAGTCAAGATGGAAAAGTTGACACTAAAAGGCACCACCTACGGCATGTGTACGGAAAAGTTTTCTTTTGCAAAAAATCCGGCTGACACGGGTCACGGCACTGTGGTCCTTGAACTGCAGTACACGGGATCTGATGGACCTTGCAAAATCCCAATTTCCATTGTGGCAACACTTTCCGATCTCACCCCCATTGGTAGAATGGTCACAGCAAACCCTTATGTAGCTTCATCCGAAGCTAACGCGAAAGTGCTGGTTGAGATGGAACCACCATTTGGAGATTCATACATTGTGGTTGGAAGAGGGGACAAGCAGATAAACCATCACTGGCACAAAGCAGGAAGCTCCATTGGAAAAGCGTTCATCACCACCATCAAAGGAGCACAGCGTCTAGCTGCCCTGGGCGACACGGCATGGGACTTTGGGTCGGTCGGAGGGATTTTCAACTCTGTAGGGAAGGCGGTGCATCAGGTCTTTGGAGGAGCCTTCAGAACTCTCTTCGGTGGCATGTCCTGGATCACCCAGGGTCTAATGGGAGCTCTGCTTCTGTGGATGGGGGTGAATGCGAGAGATCGATCCATCGCACTGGTGATGTTAGCCACGGGAGGGGTGCTTCTCTTTCTCGCCACAAACGTCCATGCAGACTCGGGATGTGCGATAGACGTGGGAAGGAGAGAGTTGCGCTGTGGACAAGGGATCTTCATCCACAATGATGTTGAAGCGTGGGTCGACCGGTACAAATTTATGCCTGAAACACCGAAACAGCTGGCAAAGGTCATCGAGCAAGCCCACGCGAAAGGAATATGTGGATTGAGGTCCGTCTCACGTCTGGAACACGTGATGTGGGAGAACATCAGAGATGAACTTAATACCCTCCTCAGAGAGAATGCAGTAGATCTAAGTGTCGTGGTTGAGAAGCCAAAAGGAACGTACAAATCAGCACCGCAGAGATTAGCACTCACATCTGAAGAGTTTGAGATTGGGTGGAAGGCTTGGGGAAAGAGCTTGGTGTTCGCACCAGAACTGGCCAACCACACTTTTGTGGTTGACGGGCCCGAGACCAAAGAATGTCCCGATGTAAAAAGAGCTTGGAACAGCCTTGAGATCGAAGACTTTGGATTTGGCATCATGTCCACTAGGGTTTGGCTGAAAGTCAGAGAGCACAACACTACTGACTGCGACAGCTCAATAATTGGGACGGCTGTTAAAGGAGACATAGCTGTGCACAGTGACCTCTCCTACTGGATTGAAAGCCACAAGAACACGACATGGAGGCTCGAGAGGGCTGTCTTTGGAGAGATCAAATCATGCACGTGGCCTGAAACACACACTCTTTGGAGTGATGGCGTTGTTGAAAGTGATCTGATTGTGCCAGTCACCCTCGCTGGGCCAAAAAGCAATCACAACCGGCGTGAAGGTTACAAAGTCCAGAGCCAGGGGCCGTGGGACGAAGAAGACATCGTTCTCGACTTTGACTATTGCCCAGGCACCACCGTCACAATCACTGAAGCATGTGGGAAGAGAGGACCCTCCATAAGAACCACTACTAGTAGTGGTAGATTGGTCACAGACTGGTGCTGCCGGAGCTGCACCCTTCCCCCTTTGAGATACAGGACAAAAAATGGATGTTGGTATGGAATGGAGATAAGACCCATGAAGCATGATGAGACGACGTTGGTAAAATCCAGCGTCAGTGCCTACCGGAGTGACATGATTGATCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACTGTTCCGGCTATTGTGGGAGCTCTACTCGTGCTGATTCTTGGGGGAATTACTTACACTGACCTGCTTAGGTATGTTCTTCTGGTTGGGGCGGCCTTCGCCGAAGCCAACAGCGGGGGTGACGTCGTCCATCTAGCTCTCATAGCCGCCTTTAAAATTCAACCAGGCTTTCTCGCAATGACATTTCTTAGGGGAAAGTGGACGAACCAAGAGAACATCCTGCTGGCCCTGGGGGCAGCATTCTTTCAGATGGCGGCCACCGATTTGAACTTGTCTCTTCCAGGAATTCTCAATGCCACTGCTACAGCTTGGATGCTCCTGAGGGCTGTCACCCAGCCATCCACTTCTGCCATCGTCATGCCTCTGCTTTGCCTGCTGGCTCCTGGCATGAGACTGCTTTACCTGGACACGTATAGAATCACTCTCATCATCGTCGGCATTTGCAGCCTGATAGGGGAGCGCCGTAGGGTGGCCGCAAAGAAGAAAGGGGCGGTATTGCTAGGGTTAGCACTAACATCAACAGGGCAGTTCTCTGCGTCAGTTATGGCGGCTGGGCTCATGGCATGCAATCCCAACAAAAAGCGGGGATGGCCGGCTACAGAAGTTTTGACAGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTGGGTGGTCTAGCTGAGTTGGATGTTGATTCCATGTCCATTCCTTTTGTGTTGGCCGGGCTGATGGCAGTTTCTTACACCATTTCAGGCAGATCGACAGACTTGTGGCTTGAGAGAGCAGCTGACATAACATGGGAAACTGATGCAGCCATAACTGGAACCAGCCAACGCCTAGATGTGAAATTGGATGATGATGGTGACTTCCACCTTATCAACGACCCTGGAGTGCCGTGGAAGATATGGGTCATCCGCATGACGGCACTGGGGTTCGCAGCCTGGACACCATGGGCAATAATACCGGCTGGAATAGGCTATTGGCTCACTGTCAAGTACGCAAAAAGAGGAGGTGTCTTTTGGGACACTCCGGCTCCGAGGACTTACCCCAAGGGTGACACTTCACCAGGAGTATACCGTATCATGAGCCGTTACATTCTGGGGACCTACCAGGCTGGAGTGGGCGTCATGTATGAAGGAGTTTTTCACACCCTGTGGCATACCACAAGAGGGGCAGCCATCAGAAGTGGTGAAGGAAGGCTCACTCCCTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGATAGGATCACCTATGGTGGGCCATGGAAGTTTGATAGGAAGTGGAATGGTCTCGATGATGTTCAGCTCATCGTAGTGGCCCCCGGAAAGGCAGCCATAAACATCCAAACCAAACCAGGCATCTTCAAAACACCACAGGGGGAAATAGGAGCAGTCAGCCTGGACTATCCTGAAGGGACTTCAGGCTCCCCAATACTGGACAAGAATGGTGACATCGTGGGCTTGTACGGGAATGGAGTC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| 13,082
|
OR141601.2
|
Usutu virus
|
Bergmann,F., Holicki,C., Groschup,M.H., Sadeghi,B., Ziegler,U.
|
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Novel and Emerging Infectious Diseases
|
Germany
|
2023-09-05
|
ED-I-19/22
|
Orthoflavivirus usutuense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,065
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
UNVERIFIED: Usutu virus isolate ED-I-19/22, complete genome
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AGTCGTCCGACTGTTTAATCTCACGATCCTCCAAAAACAATACTAAGTAGTAGAGCTCACACAGTGCCGGCAGTTTCTTTGAGCGTTGATTTTCAATGTCTAAGAAACCAGGAGGGCCCGGAAGAAGCCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGCATACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTCATGGGCTTGTTGGATGGAAGAGGACCAGTGCGATTCGTGCTGGCCTTGATGACATTCTTCAAGTTCACCGCGCTTGCCCCGACGAAGGCCTTGCTAGGCCGTTGGAAGCGCATCAACAAGACCACGGCAATGAAACACCTGACTAGCTTCAGAAAGGAATTAGGAACAATGATCAACGTGGTTAACAATCGGGGTACAAAAAAGAAGAGAGGCAACAATGGACCAGGATTAGTGATGATCATAACACTCATGACGGTTGTTTCAATGGTTTCCTCTTTAAAGCTTTCCAACTTCCAGGGGAAAGTCATGATGACCATCAACGCGACTGATATGGCAGATGTCATTGTTATTCCCACGCAACATGGGAGAAACCAGTGCTGGATTAGAGCCATGGATGTCGGGTACATGTGTGATGATACCATCACTTATGAATGCCCCAAACTGGATGCAGGAAATGACCCAGAAGACATTGACTGTTGGTGTGACAAACAACCCATGTACGTCCACTATGGAAGGTGCACAAGAACCAGACACTCGAAGCGGAGTCGGCGGTCGATCGCAGTGCAGACGCACGGGGAGAGTATGCTGGCTAACAAGAAGGATGCTTGGCTAGACTCAACCAAGGCTTCGAGATACCTGATGAAGACTGAGAATTGGATTATCAGGAATCCTGGGTATGCTTTTGTAGCTGTCCTCTTGGGCTGGATGCTGGGAAGCAACAATGGACAAAGGGTCGTTTTCGTCGTTCTCTTGCTCCTCGTGGCGCCTGCTTATAGCTTCAACTGCCTTGGTATGAGCAACAGAGACTTCCTTGAGGGAGTCTCTGGTGCTACCTGGGTTGACGTGGTTTTGGAAGGTGACAGCTGCATAACCATCATGGCCAAGGACAAGCCGACCATTGACATTAAGATGATGGAAACTGAAGCCACGAACCTGGCTGAAGTGAGAAGCTACTGCTATCTAGCCACTGTCTCAGATGTTTCAACTGTCTCCAACTGTCCAACAACTGGGGAGGCCCACAATCCTAAGAGAGCTGAGGACACGTACGTGTGCAAAAGTGGTGTCACTGACAGGGGCTGGGGCAATGGCTGTGGACTATTCGGCAAAGGAAGTATAGACACGTGTGCCAACTTCACCTGCTCCCTGAAAGCGATGGGCCGGATGATCCAACCGGAAAATGTTAAGTATGAAGTGGGAATCTTCATACATGGTTCTACCAGCTCTGACACTCACGGCAACTATTCTTCACAACTAGGAGCATCACAGGCGGGGCGGTTTACCATCACTCCCAACTCCCCAGCCATCACTGTGAAGATGGGTGACTATGGAGAAATATCAGTTGAGTGTGAACCAAGAAACGGGTTGAACACCGAGGCATACTACATCATGTCAGTGGGCACCAAACACTTCCTTGTCCATAGAGAATGGTTTAATGACTTGGCCCTCCCATGGACTTCACCAGCTAGCTCAAATTGGAGAAATAGAGAGATACTACTAGAGTTCGAAGAGCCCCATGCCACAAAGCAATCAGTTGTGGCGCTTGGTTCCCAGGAAGGTGCTTTGCACCAGGCCTTGGCAGGAGCTGTTCCAGTGTCTTTCTCGGGCAGTGTCAAGCTCACATCTGGTCATCTCAAGTGTCGAGTCAAGATGGAAAAGTTGACACTAAAAGGCACCACCTACGGCATGTGCACGGAAAAGTTTTCTTTTGCAAAAAATCCGGCTGACACGGGTCACGGCACTGTGGTCCTTGAACTGCAGTACACGGGATCTGACGGACCTTGCAAAATCCCAATTTCCATTGTGGCATCACTTTCCGATCTCACCCCCATTGGTAGAATGGTTACAGCAAACCCTTATGTGGCTTCATCCGAAGCCAACGCGAAAGTGTTGGTTGAGATGGAACCACCATTTGGAGATTCATATATTGTGGTTGGAAGAGGGGATAAGCAGATAAACCATCACTGGCACAAAGCAGGAAGTTCCATTGGAAAAGCGTTCATCACCACTATCAAAGGGGCACAGCGTCTAGCTGCCCTAGGCGACACAGCGTGGGACTTTGGGTCGGTCGGAGGGATTTTCAATTCTGTAGGAAAGGCGGTACATCAGGTCTTTGGAGGAGCCTTCAGAACTCTCTTCGGTGGCATGTCCTGGATCACCCAGGGTCTAATGGGAGCTCTGCTTCTATGGATGGGGGTGAATGCGAGAGATCGATCCATCGCACTGGTGATGTTAGCCACGGGAGGGGTGCTCCTCTTTCTCGCCACAAACGTCCATGCAGACTCGGGATGTGCGATAGACGTGGGAAGGAGAGAGTTGCGCTGTGGACAAGGGATTTTTATCCACAATGATGTTGAAGCGTGGGTCGACCGGTACAAATTTATGCCTGAAACACCAAAACAGCTGGCAAAGGTCATCGAGCAAGCCCACGCGAAAGGAATATGTGGATTGAGGTCCGTCTCACGTCTGGAACACGTGATGTGGGAGAACATCAGAGATGAACTCAACACCCTCCTCAGAGAGAATGCAGTAGATCTAAGTGTCGTGGTTGAGAAGCCAAAAGGAATGTACAAATCAGCACCACAGAGATTGGCACTCACATCTGAAGAGTTTGAGATTGGGTGGAAGGCTTGGGGAAAGAGCTTGGTGTTCGCACCAGAACTGGCCAACCACACTTTTGTGGTTGACGGGCCCGAGACCAAAGAATGTCCCGATGTAAAAAGAGCTTGGAACAGCCTTGAGATTGAAGACTTTGGATTTGGCATCATGTCCACCAGGGTTTGGCTGAAAGTCAGAGAACACAACACTACTGACTGCGACAGCTCAATAATTGGGACGGCTGTTAAAGGAGACATAGCTGTGCACAGTGACCTCTCCTACTGGATTGAAAGCCACAAGAACACGACATGGAGGCTCGAGAGGGCTGTCTTTGGAGAGATCAAATCATGCACGTGGCCTGAGACACACACTCTTTGGAGTGATGGCGTTGTTGAAAGTGATCTGGTTGTGCCAGTCACCCTCGCTGGACCAAAAAGCAATCACAACCGGCGTGAAGGTTACAAAGTCCAGAGCCAGGGGCCGTGGGACGAAGAAGACATCGTTCTCGACTTTGACTATTGCCCAGGTACCACCGTCACAATCACTGAAGCATGTGGGAAGAGAGGACCCTCCATAAGAACTACTACTAGCAGTGGTAGACTGGTCACAGACTGGTGCTGCCGGAGCTGCACCCTTCCCCCTTTGAGATACAGGACAAAAAATGGATGTTGGTATGGAATGGAGATAAGACCCATGAAACATGATGAGACGACGCTGGTAAAATCCAGCGTCAGTGCCTATCGGAGTGACATGATTGATCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACTGTTCCGGCTATTGTGGGAGCTCTACTCGTGCTGATTCTTGGGGGAATCACTTACACTGACCTGCTTAGGTATGTTCTTCTGGTTGGGGCGGCCTTCGCCGAAGCCAACAGCGGGGGTGACATCGTTCATCTAGCTCTCATAGCCGCCTTCAAAATTCAACCAGGCTTTCTCGTAATGACATTTCTTAGGGGAAAGTGGACGAACCAAGAGAACATCCTGCTGGCTCTGGGGGCAGCATTCTTTCAGATGGCGGCCACCGATTTGAACTTTTCTCTCCCAGGAATTCTCAATGCCACTGCCACAGCTTGGATGCTCCTGAGGGCTGCCACCCAGCCATCCACTTCAGCCATCGTCATGCCTTTGCTTTGCCTGCTGGCTCCTGGCATGAGACTGCTCTACCTGGACACGTATAGAATCACTCTCATCATCATCGGCGTCTGCAGCCTGATAGGGGAGCGCCGTAGGGCGGCCGCAAAGAAGAAAGGGGCGGTACTGCTAGGGTTAGCACTAACATCAACAGGGCAGTTCTCAGCATCAGTTATGGCGGCTGGGCTCATGGCATGCAATCCCAACAAAAAGCGGGGATGGCCGGCCACAGAAGTTTTGACAGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTGGGTGGTTTAGCTGAGTTGGATGTTGATTCTATGTCCATTCCTTTTGTGTTAGCCGGGCTGATGGCAGTTTCTTACACCATCTCAGGCAAATCGACAGACTTGTGGCTTGAGAGAGCAGCTGACATAACATGGGAAACTGATGCAGCCATAACTGGAACCAGCCAACGCCTAGATGTAAGATTGGATGATGATGGTGACTTCCACCTTATTAACGACCCTGGAGTGCCGTGGAAGATATGGGTCATCCGTATGACGGCATTGGGATTCGCAGCCTGGACACCATGGGCAATAATACCTGCTGGAATAGGTTATTGGCTCACTGTCAAGTACGCAAAAAGAGGAGGCGTCTTTTGGGACACCCCGGCTCCAAGGACCTACCCCAAGGGTGACACTTCACCAGGAGTATACCGTATCATGAGCCGTTACATTTTGGGGACCTACCAGGCTGGAGTGGGCGTCATGTATGAAGGAGTTTTTCACACCCTGTGGCACACCACAAGAGGGGCAGCTATCAGAAGTGGTGAAGGAAGGCTCACTCCCTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGACAGGATCACCTATGGTGGGCCATGGAAGTTTGACAGGAAGTGGAATGGTCTCGATGATGTTCAGCTCATCATAGTGGCTCCCGGAAAGGCAGCCATAAACATCCAAACCAAACCAGGCATCTTCAAAACGCCACAGGGGGAAATAGGAGCAGTCAGCCTGGACTATCCTGAA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| 13,083
|
OR141602.2
|
Usutu virus
|
Bergmann,F., Holicki,C., Groschup,M.H., Sadeghi,B., Ziegler,U.
|
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Novel and Emerging Infectious Diseases
|
Germany
|
2023-09-05
|
ED-I-177/21
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Orthoflavivirus usutuense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,920
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
UNVERIFIED: Usutu virus isolate ED-I-177/21, complete genome
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CCGGCAGTTTCTTTGAGCGTTGATTTTCAATGTCTAAGAAACCAGGAGGGCCCGGAAGAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGCATACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTCATGGGCTTGTTGGATGGAAGAGGACCAGTGCGATTCGTGCTGGCCTTGATGACATTCTTCAAGTTCACCGCGCTTGCCCCGACAAAGGCCTTGCTAGGCCGTTGGAAGCGCATTAACAAGACCACGGCAATGAAACACCTGACTAGCTTCAAAAAGGAATTAGGAACAATGATCAACGTGGTCAACAATCGGGGCACAAAAAAGAAGAGAAGCAACAATGGACCAGGACTATTGATGATTATAACACTCATGACGGCTGTTTCAATGGTTTCCTCTTTAAAGCTTTCCAACTTCCAGGGGAAAGTCATGATGACCATCAACGCGACTGACATGGCAGATGTCATTGTTGTTCCCACGCAACATGGGAAAAACCAGTGCTGGATTAGAGCCATGGATGTCGGGTACATGTGTGATGACACCATCACTTATGAATGCCCCAAGCTGGATGCAGGGAATGACCCAGAAGACATTGACTGTTGGTGTGATAAACAACCCATGTATGTCCACTATGGAAGGTGCACAAGAACCAGACATTCGAAGCGGAGTCGGCGGTCGATCGCAGTGCAGACGCACGGGGAAAGTATGCTGGCTAACAAGAAGGATGCCTGGCTAGACTCAACCAAGGCCTCGAGATACCTGATGAAGACTGAAAATTGGATTATCAGGAATCCTGGGTACGCTTTTGTAGCTGTCCTCTTGGGCTGGATGCTGGGAAGCAACAATGGACAAAGGGTCGTTTTCGTCGTTCTTTTACTTCTTGTGGCGCCTGCTTACAGCTTCAACTGCCTTGGCATGAGCAACAGAGACTTCCTTGAGGGAGTCTCTGGTGCTACCTGGGTCGACGTGGTTTTGGAAGGTGACAGCTGCATAACCATCATGGCTAAGGACAAGCCGACCATTGACATTAAGATGATGGAAACTGAAGCCACGAGTTTGGCTGAAGTGAGAAGCTACTGCTATCTAGCCACTGTCTCAGATGTTTCAACTGTCTCCAACTGTCCAACAACTGGGGAGGCCCACAATCCTAAGAGAGCTGAGAACACGTATGTGTGCAAAAGTGGTGTCACTGACAGGGGCTGGGGCAATGGCTGTGGACTATTTGGCAAAGGAAGTATAGACACGTGCGCCAACTTCACCTGCTCCCTGAAAGCGGTGGGCCGGATGATCCAACCGGAAAATGTTAAGTATGAAGTGGGAATCTTCATACATGGTTCCACCAGCTCTGACACTCACGGTAACTATTCTTCACAACTAGGAGCATCACAGGCTGGGCGATTTACTATCACTCCCAACTCCCCAGCCATCACTGTGGAGATGGGTGACTATGGAGAAATATCAGTTGAGTGTGAACCAAGAAACGGGTTGAACACTGAGGCGTACTACATCATGTCAGTGGGCACCAAACACTTCCTTGTCCATAGAGAATGGTTTAACGACTTGGCCCTCCCATGGACTTCACCAGCCAGCTTAAATTGGAGAAATAGAGAGACACTACTAGAATTCGAAGAGCCCCATGCCACAAAGCAATCAGTTGTGGCGCTTGGTTCCCAGGAAGGTGCTTTGCACCAGGCCTTGGCAGGAGCTGTTCCAGTGTCTTTCTCGGGCAGTGTAAAGCTCACATCTGGTCATCTCAAGTGTCGAGTCAAGATGGAAAAGTTGACACTAAAAGGCACCACCTACGGCATGTGTACGGAAAAGTTTTCTTTTGCAAAAAATCCGGCTGACACGGGTCACGGCACTGTGGTCCTTGAACTGCAGTACACGGGATCTGATGGACCTTGCAAAATCCCAATTTCCATTGTGGCAACACTTTCCGATCTCACCCCCATTGGTAGAATGGTCACAGCAAACCCTTATGTAGCTTCATCCGAAGCTAACGCGAAAGTGCTGGTTGAGATGGAACCACCATTTGGAGATTCATACATTGTGGTTGGAAGAGGGGACAAGCAGATAAACCATCACTGGCACAAAGCAGGAAGCTCCATTGGAAAAGCGTTCATCACCACCATCAAAGGAGCACAGCGTCTAGCTGCCCTAGGCGACACGGCATGGGACTTTGGGTCGGTCGGAGGGATTTTCAACTCTGTAGGGAAGGCGGTGCATCAGGTCTTTGGAGGAGCCTTCAGAACTCTCTTCGGTGGCATGTCCTGGATCACCCAGGGTCTAATGGGAGCTCTGCTTCTGTGGATGGGGGTGAATGCGAGAGATCGATCCATCGCACTGGTGATGTTAGCCACGGGAGGGGTGCTTCTCTTTCTCGCCACAAACGTCCATGCAGACTCGGGATGTGCGATAGACGTGGGAAGGAGAGAGTTGCGCTGTGGACAAGGGATCTTCATCCACAATGATGTTGAAGCGTGGGTCGACCGGTACAAATTTATGCCTGAAACACCGAAACAGCTGGCAAAGGTCATCGAGCAAGCCTACGCGAAAGGAATATGTGGATTGAGGTCCGTCTCACGTCTGGAACACGTGATGTGGGAGAACATCAGAGATGAACTTAACACCCTCCTCAGAGAGAATGCAGTAGATCTAAGTGTCGTGGTTGAGAAGCCAAAAGGAATGTACAAATCAGCACCGCAGAGATTAGCACTCACATCTGAAGAGTTTGAGATTGGGTGGAAGGCTTGGGGAAAGAGCTTGGTGTTCGCACCAGAACTGGCCAACCACACTTTTGTGGTTGACGGGCCCGAGACCAAAGAATGTCCCGATGTAAAAAGAGCTTGGAACAGCCTTGAGATCGAAGACTTTGGATTTGGCATCATGTCCACTAGGGTTTGGCTGAAAGTCAGAGAGCACAACACTACTGACTGCGACAGCTCAATAATTGGGACGGCTGTTAAAGGAGACATAGCTGTGCACAGTGACCTCTCCTACTGGATTGAAAGCCACAAGAACACGACATGGAGGCTCGAGAGGGCTGTCTTTGGAGAGATCAAATCATGCACGTGGCCTGAAACACACACTCTTTGGAGTGATGGCGTTGTTGAAAGTGATCTGGTTGTGCCAGTCACCCTCGCTGGGCCAAAAAGCAATCACAACCGGCGTGAAGGTTACAAAGTCCAGAGCCAGGGGCCGTGGGACGAAGAAGACATCGTTCTTGACTTTGACTATTGCCCAGGCACCACCGTCACAATCACTGAAGCATGTGGGAAGAGAGGACCCTCCATAAGAACCACTACTAGCAGTGGTAGATTGGTCACAGACTGGTGCTGCCGGAGCTGCACCCTTCCCCCTTTGAGATACAGGACAAAAAATGGATGTTGGTATGGAATGGAGATAAGACCCATGAAGCATGATGAGACGACGTTGGTAAAATCCAGCGTCAGTGCCTACCGGAGTGACATGATTGATCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACTGTTCCGGCTATTGTGGGAGCTCTACTCGTGCTGATTCTTGGGGGAATTACTTACACTGACCTGCTTAGGTATGTTCTTCTGGTTGGGGCGGCCTTCGCCGAAGCCAACAGCGGGGGTGATGTCGTCCATCTAGCTCTCATAGCCGCCTTTAAAATTCAACCAGGCTTTCTCGCAATGACATTTCTTAGGGGAAAGTGGACGAACCAAGAGAACATCCTGCTGGCCCTGGGGGCAGCATTCTTTCAGATGGCGGCCACCGATTTGAACTTGTCTCTTCCAGGAATTCTCAATGCCACTGCTACAGCTTGGATGCTCCTGAGGGCTGTCACCCAGCCATCCACTTCTGCCATCGTCATGCCTCTGCTTTGCCTGCTGGCTCCTGGCATGAGACTGCTCTACCTGGACACGTATAGAATCACTCTCATCATCGTCGGCATTTGCAGCCTGATAGGGGAGCGCCGTAGGGTGGCCGCAAAGAAGAAAGGGGCGGTATTGCTAGGGTTAGCACTAACATCAACAGGGCAGTTCTCTGCGTCAGTTATGGCGGCTGGGCTCATGGCATGCAATCCCAACAAAAAGCGGGGATGGCCGGCTACAGAAGTTTTGACAGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTGGGTGGTCTAGCTGAGTTGGATGTTGATTCCATGTCCATTCCTTTTGTGTTGGCCGGGCTGATGGCAGTTTCTTACACCATTTCAGGCAAATCGACAGACTTGTGGCTTGAGAGAGCAGCTGACATAACATGGGAAACTGATGCAGCCATAACTGGAACCAGCCAACGCCTAGATGTGAAATTGGATGATGATGGTGACTTCCACCTTATCAACGACCCTGGAGTGCCGTGGAAGATATGGGTCATCCGCATGACGGCACTGGGGTTCGCAGCCTGGACACCATGGGCAATAATACCGGCTGGAATAGGCTATTGGCTCACTGTCAAGTACGCAAAAAGAGGAGGTGTCTTTTGGGACACTCCGGCTCCGAGGACCTACCCCAAGGGTGACACTTCACCAGGAGTATACCGTATCATGAGCCGTTACATTCTGGGGACCTACCAGGCTGGAGTGGGCGTCATGTATGAAGGAGTTTTTCACACCCTGTGGCATACCACAAGAGGGGCAGCTATTAGAAGTGGTGAAGGAAGGCTCACTCCCTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGATAGGATCACCTATGGTGGGCCATGGAAGTTTGATAGGAAGTGGAATGGTCTCGATGATGTTCAGCTCATCGTAGTGGCCCCCGGAAAGGCAGCCATAAACATCCAAACCAAACCAGGCATCTTCAAAACGCCACAGGGGGAAATAGGAGCAGTCAGCCTGGACTATCCTGAAGGGACTTCAGGCTCCCCAATATTGGACAAGAATGGTGACATCGTGGGCTTGTACGGGAATGGAGTC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| 13,084
|
OR141603.2
|
Usutu virus
|
Bergmann,F., Holicki,C., Groschup,M.H., Sadeghi,B., Ziegler,U.
|
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Novel and Emerging Infectious Diseases
|
Germany
|
2023-09-05
|
ED-I-178/21
|
Orthoflavivirus usutuense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,926
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
UNVERIFIED: Usutu virus isolate ED-I-178/21, complete genome
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GTTTCTTTGAGCGTTGATTTTCAATGTCTAAGAAACCAGGAGGGCCCGGAAGAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGCATACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTCATGGGCTTGTTGGATGGAAGAGGACCAGTGCGATTCGTGCTGGCCTTGATGACATTCTTCAAGTTCACCGCGCTTGCCCCGACAAAGGCCTTGCTAGGCCGTTGGAAGCGCATCAACAAGACCACGGCAATGAAACACCTGACTAGCTTCAAAAAGGAATTAGGAACAATGATCAACGTGGTCAACAATCGGGGCACAAAAAAGAAGAGAAGCAACAATGGACCAGGACTATTGATGATTATAACACTCATGACGGCTGTTTCAATGGTTTCCTCTTTAAAGCTTTCCAACTTCCAGGGGAAAGTCATGATGACCATCAACGCGACTGACATGGCAGATGTCATTGTTGTTCCCACGCAACATGGGAAAAACCAGTGCTGGATTAGAGCCATGGATGTCGGGTACATGTGTGATGACACCATCACTTATGAATGCCCCAAGCTGGATGCAGGGAATGACCCAGAAGACATTGACTGTTGGTGTGATAAACAACCCATGTATGTCCACTATGGAAGGTGCACAAGAACTAGACATTCGAAGCGGAGTCGGCGGTCGATCGCAGTGCAGACGCACGGGGAAAGTATGCTGGCTAACAAGAAGGATGCCTGGCTAGACTCAACCAAGGCCTCGAGATACCTGATGAAGACTGAAAATTGGATTATCAGGAATCCTGGGTACGCTTTTGTAGCTGTCCTCTTGGGCTGGATGCTGGGAAGCAACAATGGACAAAGGGTCGTTTTCGTCGTTCTTTTACTTCTTGTGGCGCCTGCTTACAGCTTCAACTGCCTTGGCATGAGCAACAGAGACTTCCTTGAGGGAGTCTCTGGTGCTACCTGGGTCGACGTGGTTTTGGAAGGTGACAGCTGCATAACCATCATGGCTAAGGACAAGCCGACCATTGACATTAAGATGATGGAAACTGAAGCCACGAGTTTGGCTGAAGTGAGAAGCTACTGCTATCTAGCCACTGTCTCAGATGTTTCAACTGTCTCTAACTGTCCAACAACTGGGGAGGCCCACAATCCTAAGAGAGCTGAGAACACGTATGTGTGCAAAAGTGGTGTCACTGACAGGGGCTGGGGCAATGGCTGTGGACTATTTGGCAAAGGAAGTATAGACACTTGCGCCAACTTCACCTGCTCCCTGAAAGCGGTGGGCCGGATGATCCAACCGGAAAATGTTAAGTATGAAGTGGGAATCTTCATACATGGTTCCACCAGCTCTGACACTCACGGTAACTATTCTTCACAACTAGGAGCATCACAGGCTGGGCGATTTACCATCACTCCCAACTCCCCAGCCATCACTGTGGAGATGGGTGACTATGGAGAAATATCAGTTGAGTGTGAACCAAGAAACGGGTTGAACACTGAGGCGTACTACATCATGTCAGTGGGCACCAAACACTTTCTTGTCCATAGAGAATGGTTTAACGATTTGGCCCTCCCATGGACTTCACCAGCCAGCTTAAATTGGAGAAATAGAGAGACACTACTAGAATTCGAAGAGCCCCATGCCACAAAGCAATCAGTTGTGGCGCTTGGTTCCCAGGAAGGTGCTTTGCACCAGGCCTTGGCAGGAGCTGTTCCAGTGTCTTTCTCGGGCAGTGTAAAGCTCACATCTGGTCATCTCAAGTGTCGAGTCAAGATGGAAAAGTTGACACTAAAAGGCACCACCTACGGCATGTGTACGGAAAAGTTTTCTTTTGCAAAAAATCCGGCTGACACGGGTCACGGCACTGTGGTCCTTGAACTGCAGTACACGGGATCTGATGGACCTTGCAAAATCCCAATTTCCATTGTGGCAACACTTTCCGATCTCACCCCCATTGGTAGAATGGTCACAGCAAACCCTTATGTAGCTTCATCTGAAGCTAACGCGAAAGTGCTGGTTGAGATGGAACCACCATTTGGAGATTCATACATTGTGGTTGGAAGAGGGGACAAGCAGATAAACCATCACTGGCACAAAGCAGGAAGCTCCATTGGAAAAGCGTTCATCACCACCATCAAAGGAGCACAGCGTCTAGCTGCCCTGGGCGACACGGCATGGGACTTTGGGTCGGTCGGAGGGATTTTCAACTCTGTAGGGAAGGCGGTGCATCAGGTCTTTGGAGGAGCCTTCAGAACTCTCTTCGGTGGCATGTCCTGGATCACCCAGGGTCTAATGGGAGCTCTGCTTCTGTGGATGGGGGTGAATGCGAGAGATCGATCCATCGCACTGGTGATGTTAGCCACGGGAGGGGTGCTTCTCTTTCTCGCCACAAACGTCCATGCAGACTCGGGATGTGCGATAGACGTGGGAAGGAGAGAGTTGCGCTGTGGACAAGGGATCTTCATCCACAATGATGTTGAAGCGTGGGTCGACCGGTACAAATTTATGCCTGAAACACCGAAACAGCTGGCAAAGGTCATCGAGCAAGCCTACGCGAAAGGAATATGTGGATTGAGGTCCGTCTCACGTCTGGAACACGTGATGTGGGAGAACATCAGAGATGAACTTAACACCCTCCTCAGAGAGAATGCAGTAGATCTAAGTGTCGTGGTTGAGAAGCCAAAAGGAATGTACAAATCAGCACCGCAGAGATTAGCACTCACATCTGAAGAGTTTGAGATTGGGTGGAAGGCTTGGGGAAAGAGCTTGGTGTTCGCACCAGAACTGGCCAACCACACTTTTGTGGTTGACGGGCCCGAGACCAAAGAATGTCCCGATGTAAAAAGAGCTTGGAACAGCCTTGAGATCGAAGACTTTGGATTTGGCATCATGTCCACTAGGGTTTGGCTGAAAGTCAGAGAGCACAACACTACTGACTGCGACAGCTCAATAATTGGGACGGCTGTTAAAGGAGACATAGCTGTGCACAGTGACCTCTCCTACTGGATTGAAAGCCACAAGAACACGACATGGAGGCTCGAGAGGGCTGTCTTTGGAGAGATCAAATCATGCACGTGGCCTGAAACACACACTCTTTGGAGTGATGGCGTTGTTGAAAGTGATCTGGTTGTGCCAGTCACCCTCGCTGGGCCAAAAAGCAATCACAACCGGCGTGAAGGTTACAAAGTCCAGAGCCAGGGGCCGTGGGACGAAGAAGACATCGTTCTTGACTTTGACTATTGCCCAGGCACCACCGTCACAATCACTGAAGCATGTGGGAAGAGAGGACCCTCCATAAGAACCACTACTAGCAGTGGTAGATTGGTCACAGACTGGTGCTGCCGGAGCTGCACCCTTCCCCCTTTGAGATACAGGACAAAAAATGGATGTTGGTATGGAATGGAGATAAGACCCATGAAGCATGATGAGACGACGTTGGTAAAATCCAGCGTCAGTGCCTACCGGAGTGACATGATTGATCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACTGTTCCGGCTATTGTGGGAGCTCTACTCGTGCTGATTCTTGGGGGAATTACTTACACTGACCTGCTTAGGTATGTTCTTCTGGTTGGGGCGGCCTTCGCCGAAGCCAACAGCGGGGGTGACGTCGTCCATCTAGCTCTCATAGCCGCCTTTAAAATTCAACCAGGCTTTCTCGCAATGACATTTCTTAGGGGAAAGTGGACGAACCAAGAGAACATCCTGCTGGCCCTGGGGGCAGCATTCTTTCAGATGGCGGCCACCGATTTGAACTTGTCTCTTCCAGGAATTCTCAATGCCACTGCTACAGCTTGGATGCTCCTGAGGGCTGTCACCCAGCCATCCACTTCTGCCATCGTCATGCCTCTGCTTTGCCTGCTGGCTCCTGGCATGAGACTGCTCTACCTGGACACGTATAGAATCACTCTCATTATCGTCGGCATTTGCAGCCTGATAGGGGAGCGCCGTAGGGTGGCCGCAAAGAAGAAAGGGGCGGTATTGCTAGGGTTAGCACTAACATCAACAGGGCAGTTCTCTGCGTCAGTTATGGCGGCTGGGCTCATGGCATGCAATCCCAACAAAAAGCGGGGATGGCCGGCTACAGAAGTTTTGACAGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTGGGTGGTCTAGCTGAGTTGGATGTTGATTCCATGTCCATTCCTTTTGTGTTGGCCGGGCTGATGGCAGTTTCTTACACCATTTCAGGCAAATCGACAGACTTGTGGCTTGAGAGAGCAGCTGACATAACATGGGAAACTGATGCAGCCATAACTGGAACCAGCCAACGCCTAGATGTGAAATTGGATGATGATGGTGACTTCCACCTTATCAACGACCCTGGAGTGCCGTGGAAGATATGGGTCATCCGCATGACGGCACTGGGGTTCGCAGCCTGGACACCATGGGCAATAATACCGGCTGGAATAGGCTATTGGCTCACTGTCAAGTACGCAAAAAGAGGAGGTGTCTTTTGGGACACTCCGGCTCCGAGGACCTACCCCAAGGGTGACACTTCACCAGGAGTATACCGTATCATGAGCCGTTACATTCTGGGGACCTACCAGGCTGGAGTGGGCGTCATGTATGAAGGAGTTTTTCACACCCTGTGGCATACCACAAGAGGGGCGGCTATTAGAAGTGGTGAAGGAAGGCTCACTCCCTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGATAGGATCACCTATGGTGGGCCATGGAAGTTTGATAGGAAGTGGAATGGTCTCGATGATGTTCAGCTCATCGTAGTGGCCCCCGGAAAGGCAGCCATAAACATCCAAACCAAACCAGGCATCTTCAAAACGCCACAGGGGGAAATAGGAGCAGTCAGCCTGGACTATCCTGAAGGGACTTCAGGCTCCCCAATACTGGACAAGAATGGTGACATCGTGGGCTTGTACGGGAATGGAGTCATCTTG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| 13,085
|
OR141604.2
|
Usutu virus
|
Bergmann,F., Holicki,C., Groschup,M.H., Sadeghi,B., Ziegler,U.
|
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Novel and Emerging Infectious Diseases
|
Germany
|
2023-09-05
|
ED-I-215/21
|
Orthoflavivirus usutuense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,062
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
UNVERIFIED: Usutu virus isolate ED-I-215/21, complete genome
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AGATGTTGGCCTGTGTGAGCTCTACTACTTAGTATTGTTTTTGGAGGATCGTGAGATTAACACAGTGCCGGCAGTTTCTTTGAGCGTTGATTTTCAATGTCTAAGAAACCAGGAGGGCCCGGAAGAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGCATACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTCATGGGCTTGTTGGATGGAAGAGGACCAGTGCGATTCGTGCTGGCCTTGATGACATTCTTCAAGTTCACCGCGCTTGCCCCGACAAAGGCCTTGCTAGGCCGTTGGAAGCGCATCAACAAGACCACGGCAATGAAACACCTGACTAGCTTCAAAAAGGAATTAGGAACAATGATCAACGTGGTCAACAATCGGGGCACAAAAAAGAAGAGAAGCAACAATGGACCAGGACTATTGATGATTATAACACTCATGACGGCTGTTTCAATGGTTTCCTCTTTAAAGCTTTCCAACTTCCAGGGGAAAGTCATGATGACCATCAACGCGACTGACATGGCAGATGTCATTGTTGTTCCCACGCAACATGGGAAAAACCAGTGCTGGATTAGAGCCATGGATGTCGGGTACATGTGTGATGACACCATCACTTATGAATGCCCCAAGCTGGATGCAGGGAATGACCCAGAAGACATTGACTGTTGGTGTGATAAACAACCCATGTATGTCCACTATGGAAGGTGCACAAGAACCAGACATTCGAAGCGGAGTCGGCGGTCGATCGCAGTGCAGACGCACGGGGAAAGTATGCTGGCTAACAAGAAGGATGCCTGGCTAGACTCAACCAAGGCCTCGAGAAACCTGATGAAGACTGAAAATTGGATTATCAGGAATCCTGGGTACGCTTTTGTAGCTGTCCTCTTGGGCTGGATGCTGGGAAGCAACAATGGACAAAGGGTCGTTTTCGTCGTTCTTTTACTTCTTGTGGCGCCTGCTTACAGCTTCAACTGCCTTGGCATGAGCAACAGAGACTTCCTTGAGGGAGTCTCTGGTGCTACCTGGGTCGACGTGGTTTTGGAAGGTGACAGCTGCATAACCATCATGGCTAAGGACAAGCCGACCATTGACATTAAGATGATGGAAACTGAAGCCACGAGTTTGGCTGAAGTGAGAAGCTACTGCTATCTAGCCACTGTCTCAGATGTTTCAACTGTCTCCAACTGTCCAACAACTGGGGAGGCCCACAATCCTAAGAGAGCTGAGAACACGTATGTGTGCAAAAGTGGTGTCACTGACAGGGGCTGGGGCAATGGCTGTGGACTATTTGGCAAAGGAAGTATAGACACGTGCGCCAACTTCACCTGCTCCCTGAAAGCGGTGGGCCGGATGATCCAACCGGAAAATGTTAAGTATGAAGTGGGAATCTTCATACATGGTTCCACCAGCTCTGACACTCACGGTAACTATTCTTCACAACTAGGAGCATCACAGGCTGGGCGATTTACCATCACTCCCAACTCCCCAGCCATCACTGTGGAGATGGGTGACTATGGAGAAATATCAGTTGAGTGTGAACCAAGAAACGGGTTGAACACTGAGGCGTACTACATCATGTCAGTGGGCACCAAACACTTCCTTGTCCATAGAGAATGGTTTAACGACTTGGCCCTCCCATGGACTTCACCAGCCAGCTTAAATTGGAGAAATAGAGAGACACTACTAGAATTCGAAGAGCCCCATGCCACAAAGCAATCAGTTGTGGCGCTTGGTTCCCAGGAAGGTGCTTTGCACCAGGCCTTGGCAGGAGCTGTTCCAGTGTCTTTCTCGGGCAGTGTAAAGCTCACATCTGGTCATCTCAAGTGTCGAGTCAAGATGGAAAAGTTGACACTAAAAGGCACCACCTACGGCATGTGTACGGAAAAGTTTTCTTTTGCAAAAAATCCGGCTGACACGGGTCACGGCACTGTGGTCCTTGAACTGCAGTACACGGGATCTGATGGACCTTGCAAAATCCCAATTTCCATTGTGGCAACACTTTCCGATCTCACCCCCATTGGTAGAATGGTCACAGCAAACCCTTATGTAGCTTCATCCGAAGCTAACGCGAAAGTGCTGGTTGAGATGGAACCACCATTTGGAGATTCATACATTGTGGTTGGAAGAGGGGACAAGCAGATAAACCATCACTGGCACAAAGCAGGAAGCTCCATTGGAAAAGCGTTCATCACCACCATCAAAGGAGCACAGCGTCTAGCTGCCCTGGGCGACACGGCATGGGACTTTGGGTCGGTCGGAGGGATTTTCAACTCTGTAGGGAAGGCGGTGCATCAGGTCTTTGGAGGAGCCTTCAGAACTCTCTTCGGTGGCATGTCCTGGATCACCCAGGGTCTAATGGGAGCTCTGCTTCTGTGGATGGGGGTGAATGCGAGAGATCGATCCATCGCACTGGTGATGTTAGCCACGGGAGGGGTGCTTCTCTTTCTCGCCACAAACGTCCATGCAGACTCGGGATGTGCGATAGACGTGGGGAGGAGAGAGTTGCGCTGTGGACAAGGGATCTTCATCCACAATGATGTTGAAGCGTGGGTCGACCGGTACAAATTTATGCCTGAAACACCGAAACAGCTGGCAAAGGTCATCGAGCAAGCCTACGCGAAAGGAATATGTGGATTGAGGTCCGTCTCACGTCTGGAACACGTGATGTGGGAGAACATCAGAGATGAACTTAACACCCTCCTCAGAGAGAATGCAGTAGATCTAAGTGTCGTGGTTGAGAAGCCAAAAGGAATGTACAAATCAGCACCGCAGAGATTAGCACTCACATCTGAAGAGTTTGAGATTGGGTGGAAGGCTTGGGGAAAGAGCTTGGTGTTCGCACCAGAACTGGCCAACCACACTTTTGTGGTTGACGGGCCCGAGACCAAAGAATGTCCCGATGTAAAAAGAGCTTGGAACAGCCTTGAGATCGAAGACTTTGGATTTGGCATCATGTCCACTAGGGTTTGGCTGAAAGTCAGAGAGCACAACACTACTGACTGCGACAGCTCAATAATTGGGACGGCTGTTAAAGGAGACATAGCTGTGCACAGTGACCTCTCCTACTGGATTGAAAGCCACAAGAACACGACATGGAGGCTCGAGAGGGCTGTCTTTGGAGAGATCAAATCATGCACGTGGCCTGAAACACACACTCTTTGGAGTGATGGCGTTGTTGAAAGTGATCTGGTTGTGCCAGTCACCCTCGCTGGGCCAAAAAGCAATCACAACCGGCGTGAAGGTTACAAAGTCCAGAGCCAGGGGCCGTGGGACGAAGAAGACATCGTTCTTGACTTTGACTATTGCCCAGGCACCACCGTCACAATCACTGAAGCATGTGGGAAGAGAGGACCCTCCATAAGAACCACTACTAGCAGTGGTAGATTGGTCACAGACTGGTGCTGCCGGAGCTGCACCCTTCCCCCTTTGAGATACAGGACAAAAAATGGATGTTGGTATGGAATGGAGATAAGACCCATGAAGCATGATGAGACGACGTTGGTAAAATCCAGCGTCAGTGCCTACCGGAGTGACATGATTGATCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACTGTTCCGGCTATTGTGGGAGCTCTACTCGTGCTGATTCTTGGGGGAATTACTTACACTGACCTGCTTAGGTATGTTCTTCTGGTTGGGGCGGCCTTCGCCGAAGCCAACAGCGGGGGTGACGTCGTCCATCTAGCTCTCATAGCCGCCTTTAAAATTCAACCAGGCTTTCTCGCAATGACATTTCTTAGGGGAAAGTGGACGAACCAAGAGAACATCCTGCTGGCCCTGGGGGCAGCATTCTTTCAGATGGCGGCCACCGATTTGAACTTGTCTCTTCCAGGAATTCTCAATGCCACTGCTACAGCTTGGATGCTCCTGAGGGCTGTCACCCAGCCATCCACTTCTGCCATCGTCATGCCTCTGCTTTGCCTGCTGGCTCCTGGCATGAGACTGCTCTACCTGGACACGTATAGAATCACTCTCATCATCGTCGGCATTTGCAGCCTGATAGGGGAGCGCCGTAGGGTGGCCGCAAAGAAGAAAGGGGCGGTATTGCTAGGGTTAGCACTAACATCAACAGGGCAGTTCTCTGCGTCAGTTATGGCGGCTGGGCTCATGGCATGCAATCCCAACAAAAAGCGGGGATGGCCGGCTACAGAAGTTTTGACAGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTGGGTGGTCTAGCTGAGTTGGATGTTGATTCCATGTCCATTCCTTTTGTGTTGGCCGGGCTGATGGCAGTTTCTTACACCATTTCAGGCAAATCGACAGACTTGTGGCTTGAGAGAGCAGCTGACATAACATGGGAAACTGATGCAGCCATAACTGGAACCAGCCAACGCCTAGATGTGAAATTGGATGATGATGGTGACTTCCACCTTATCAACGACCCTGGAGTGCCGTGGAAGATATGGGTCATCCGCATGACGGCACTGGGGTTCGCAGCCTGGACACCATGGGCAATAATACCGGCTGGAATAGGCTATTGGCTCACTGTCAAGTACGCAAAAAGAGGAGGTGTCTTTTGGGACACTCCGGCTCCGAGGACCTACCCCAAGGGTGACACTTCACCAGGAGTATACCGTATCATGAGCCGTTACATTCTGGGGACCTACCAGGCTGGAGTGGGCGTCATGTATGAAGGAGTTTTTCACACCCTGTGGCATACCACAAGAGGGGCAGCTATTAGAAGTGGTGAAGGAAGGCTCACTCCCTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGATAGGATCACCTATGGTGGGCCATGGAAGTTTGATAGGAAGTGGAATGGTCTCGATGATGTTCAGCTCATCGTTGTGGCCCCCGGAAAGGCAGCCATAAACATCCAAACCAAACCAGGCATCTTCAAAACGCCACAGGGGGAAATAGGAGCAGTCAGCCTGGACTATCCTGA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| 13,086
|
OR141605.2
|
Usutu virus
|
Bergmann,F., Holicki,C., Groschup,M.H., Sadeghi,B., Ziegler,U.
|
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Novel and Emerging Infectious Diseases
|
Germany
|
2023-09-05
|
ED-I-228/21
|
Orthoflavivirus usutuense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 11,062
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
UNVERIFIED: Usutu virus isolate ED-I-228/21, complete genome
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AGTCGTTCGTCTGCGTGAGCTCTACTACTTAGTATTGTTTTTGGAGGATCGTGAGATTAACACAGTGCCGGCAGTTTCTTTGAGCGTTGATTTTCAATGTCTAAGAAACCAGGAGGGCCCGGAAGAAGCCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGCATACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTCATGGGCTTGTTGGATGGAAGAGGACCAGTGCGATTCGTGCTGGCCTTGATGACATTCTTCAAGTTCACCGCGCTTGCCCCGACGAAGGCCTTGCTAGGCCGTTGGAAGCGCATCAACAAGACCACGGCAATGAAACACCTGACTAGCTTCAAAAAGGAATTAGGAACAATGATCAACGTGGTTAACAATCGGGGCACAAAAAAGAAGAGAGGCAACAATGGACCAGGACTAGTGATGATCATAACACTCATGACGGTTGTTTCAATGGTTTCCTCTTTAAAGCTTTCCAACTTCCAGGGGAAAGTCATGATGACCATCAACGCGACTGATATGGCAGATGTCATTGTTGTTCCCACGCAACATGGGAAAAACCAGTGCTGGATTAGAGCCATGGATGTCGGGTACATGTGTGATGATACCATCACTTATGAATGCCCCAAACTGGATGCAGGAAATGACCCAGAAGACATTGACTGTTGGTGTGACAAACAACCCATGTATGTCCACTATGGAAGGTGCACAAGAACCAGACACTCGAAGCGGAGTCGGCGGTCGATCGCAGTGCAGACGCACGGGGAGAGTATGCTGGCTAACAAGAAGGATGCTTGGCTAGACTCAACCAAGGCTTCGAGATACCTGATGAAGACTGAGAATTGGATTATCAGGAATCCTGGGTATGCTTTTGTAGCTGTCCTCTTGGGCTGGATGCTGGGAAGCAACAATGGACAAAGGGTCGTTTTCGTCGTTCTCTTGCTCCTTGTGGCGCCTGCTTATAGCTTCAACTGCCTTGGTATGAGCAACAGAGACTTCCTTGAGGGAGTCTCTGGTGCTACCTGGGTTGACGTGGTTTTGGAAGGTGACAGCTGCATAACCATCATGGCCAAGGACAAGCCGACCATTGACATCAAGATGATGGAAACTGAAGCCACGAACCTGGCTGAAGTGAGAAGCTACTGCTATCTAGCCACTGTCTCAGATGTTTCAACTGTCTCCAACTGTCCAACAACTGGGGAGGCCCACAATCCTAAGAGAGCTGAGGACACGTACGTGTGCAAAAGTGGTGTCACTGACAGGGGCTGGGGCAATGGCTGTGGACTATTTGGCAAAGGAAGTATAGACACGTGTGCCAACTTCACCTGCTCCCTGAAAGCGATGGGCCGGATGATCCAACCGGAAAATGTTAAGTATGAAGTGGGAATCTTCATACATGGTTCTACCAGCTCTGACACTCACGGCAACTATTCTTCACAACTAGGAGCATCACAGGCTGGGCGGTTTACCATCACTCCCAACTCCCCAGCCATCACTGTGAAGATGGGTGACTATGGAGAAATATCAGTTGAGTGTGAACCAAGAAACGGGTTGAACACCGAGGCATACTACATCATGTCAGTGGGCACCAAACACTTCCTTGTCCATAGAGAATGGTTTAATGACTTGGCCCTCCCATGGACTTCACCAGCTAGCTCAAATTGGAGAAATAGAGAGATACTACTAGAGTTCGAAGAGCCCCATGCCACAAAGCAATCAGTTGTGGCGCTTGGTTCCCAGGAAGGTGCTTTGCACCAGGCCTTGGCAGGAGCTGTTCCAGTGTCTTTCTCGGGCAGTGTCAAGCTCACATCTGGTCATCTCAAGTGTCGAGTCAAGATGGAAAAGTTGACACTAAAAGGCACCACCTACGGCATGTGCACGGAAAAGTTTTCTTTTGCAAAAAATCCGGCTGACACGGGTCACGGCACTGTGGTCCTTGAACTGCAGTACACGGGATCTGACGGACCTTGCAAAATCCCAATTTCCATTGTGGCATCACTTTCCGATCTCACCCCCATTGGTAGAATGGTTACAGCAAACCCTTATGTGGCTTCATCCGAAGCCAACGCGAAAGTGTTGGTTGAGATGGAACCACCATTTGGAGATTCATATATTGTGGTTGGAAGAGGGGATAAGCAGATAAACCATCACTGGCACAAAGCAGGAAGTTCCATTGGAAAAGCGTTCATCACCACTATCAAAGGGGCACAGCGTCTAGCTGCCCTAGGCGACACAGCGTGGGACTTTGGGTCGGTCGGAGGGATTTTCAATTCTGTAGGAAAGGCGGTACATCAGGTCTTTGGAGGAGCCTTCAGAACTCTCTTCGGTGGCATGTCCTGGATCACCCAGGGTCTAATGGGAGCTCTGCTTCTATGGATGGGGGTGAATGCGAGAGATCGATCCATCGCACTGGTGATGTTAGCCACGGGAGGGGTGCTCCTCTTTCTCGCCACAAACGTCCATGCAGACTCGGGATGTGCGATAGACGTGGGAAGGAGAGAGTTGCGCTGTGGACAAGGGATTTTTATCCACAATGATGTTGAAGCGTGGGTCGACCGGTACAAATTTATGCCTGAAACACCAAAACAGCTGGCAAAGGTCATCGAGCAAGCCCACGCGAAAGGAATATGTGGATTGAGGTCCGTCTCACGTCTGGAACACGTGATGTGGGAGAACATCAGAGATGAACTCAACACCCTCCTCAGAGAGAATGCAGTAGATCTAAGTGTCGTGGTTGAGAAGCCAAAAGGAATGTACAAATCAGCACCACAGAGATTGGCACTCACATCTGAAGAGTTTGAGATTGGGTGGAAGGCTTGGGGAAAGAGCTTGGTGTTCGCACCAGAACTGGCCAACCACACTTTTGTGGTTGACGGGCCCGAGACCAAAGAATGTCCCGATGTAAAAAGAGCTTGGAACAGCCTTGAGATTGAAGACTTTGGATTTGGCATCATGTCCACCAGGGTTTGGCTGAAAGTCAGAGAACACAACACTACTGACTGCGACAGCTCAATAATTGGGACGGCTGTTAAAGGAGACATAGCTGTGCACAGTGACCTCTCCTACTGGATTGAAAGCCACAAGAACACGACATGGAGGCTCGAGAGGGCTGTCTTTGGAGAGATCAAATCATGCACGTGGCCTGAGACACACACTCTTTGGAGTGATGGCGTTGTTGAAAGTGATCTGGTTGTGCCAGTCACCCTCGCTGGACCAAAAAGCAATCACAACCGGCGTGAAGGTTACAAAGTCCAGAGCCAGGGGCCGTGGGACGAAGAAGACATCGTTCTCGACTTTGACTATTGCCCAGGTACCACCGTCACAATCACTGAAGCATGTGGGAAGAGAGGACCCTCCATAAGAACTACCACTAGCAGTGGTAGACTGGTCACAGACTGGTGCTGCCGGAGCTGCACCCTTCCCCCTTTGAGATACAGGACAAAAAATGGATGTTGGTATGGAATGGAGATAAGACCCATGAAACATGATGAGACGACGCTGGTAAAATCCAGCGTCAGTGCCTATCGGAGTGACATGATTGATCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACTGTTCCGGCTATTGTGGGAGCTCTACTCGTGCTGATTCTTGGGGGAATCACTTACACTGACCTGCTTAGGTATGTTCTTCTGGTTGGGGCGGCCTTCGCCGAAGCCAACAGCGGGGGTGACATCGTTCATCTAGCTCTTATAGCCGCCTTCAAAATTCAACCAGGCTTTCTCGTAATGACATTTCTTAGGGGAAAGTGGACGAACCAAGAGAACATCCTGCTGGCTCTGGGGGCAGCATTCTTTCAGATGGCGGCCACCGATTTGAACTTTTCTCTCCCAGGAATTCTCAATGCCACTGCCACAGCTTGGATGCTCCTGAGGGCCGCCACCCAGCCATCCACTTCAGCCATCGTCATGCCTTTGCTTTGCCTGCTGGCTCCTGGCATGAGACTGCTCTACCTGGACACGTATAGAATCACTCTCATCATCATCGGCATCTGCAGCCTGATAGGGGAGCGCCGTAGGGCGGCCGCAAAGAAGAAAGGGGCGGTACTGCTAGGGTTAGCACTAACATCAACAGGGCAGTTCTCTGCATCAGTTATGGCGGCTGGGCTCATGGCATGCAATCCCAACAAAAAGCGGGGATGGCCGGCCACAGAAGTTTTGACAGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTGGGTGGTCTAGCTGAGTTGGATGTTGATTCTATGTCCATTCCCTTTGTGTTAGCCGGGCTGATGGCAGTTTCTTACACCATCTCAGGCAAATCGACAGACTTGTGGCTTGAGAGAGCAGCTGACATAACATGGGAAACTGATGCAGCCATAACTGGAACCAGCCAACGCCTAGATGTAAAATTGGATGATGATGGTGACTTCCACCTTATTAACGACCCTGGAGTGCCGTGGAAGATATGGGTCATCCGTATGACGGCATTGGGATTCGCAGCCTGGACACCATGGGCAATAATACCTGCTGGAATAGGTTATTGGCTCACTGTCAAGTACGCAAAAAGAGGAGGCGTCTTTTGGGACACCCCGGCTCCAAGGACCTACCCCAAGGGTGACACTTCACCAGGAGTATACCGTATCATGAGCCGTTACATTTTGGGGACCTACCAGGCTGGAGTGGGCGTCATGTATGAAGGAGTTTTTCACACCCTGTGGCACACCACAAGAGGGGCAGCCATCAGAAGTGGTGAAGGAAGGCTCACTCCCTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGACAGGATCACCTATGGTGGGCCATGGAAGTTTGACAGGAAGTGGAATGGTCTCGATGATGTTCAGCTCATCATAGTGGCTCCCGGAAAGGCAGCCATAAACATCCAAACCAAACCAGGCATCTTCAAAACGCCACAGGGGGAAATAGGAGCAGTCAGCCTGGACTATCCTGA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| 13,087
|
OR141606.2
|
Usutu virus
|
Bergmann,F., Holicki,C., Groschup,M.H., Sadeghi,B., Ziegler,U.
|
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Novel and Emerging Infectious Diseases
|
Germany
|
2023-09-05
|
M4509
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Orthoflavivirus usutuense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,932
|
GenBank
| null | null | null | null | null | null | null | null |
UNVERIFIED: Usutu virus isolate M4509, complete genome
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CCGGCAGTTTCTTTGAGCGTTGATTTTCAATGTCTAAGAAATCAGGAGGGCCCGGAAGAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGCATACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTCATGGGCTTGTTGGATGGAAGAGGACCAGTGCGATTCGTGCTGGCCTTGATGACATTCTTCAAGTTCACCGCGCTTGCCCCGACAAAGGCCTTGCTAGGCCGTTGGAAGCGCATCAACAAGACCACGGCAATGAAACACCTGACTAGCTTCAAAAAGGAATTAGGAACAATGATCAACGTGGTCAACAATCGGGGCACAAAAAAGAAGAGAAGCAACAATGGACCAGGACTATTGATGATTATAACACTCATGACGGCTGTTTCAATGGTTTCCTCTTTAAAGCTTTCCAACTTCCAGGGGAAAGTCATGATGACCATCAACGCGACTGACATGGCAGATGTCATTGTTGTTCCCACGCAACATGGGAAAAACCAGTGCTGGATTAGAGCCATGGATGTCGGGTACATGTGTGATGACACCATCACTTATGAATGCCCCAAGCTGGATGCAGGAAATGACCCAGAAGACATTGACTGTTGGTGTGATAAACAACCCATGTATGTCCACTATGGAAGGTGCACAAGAACCAGACATTCGAAGCGGAGTCGGCGGTCGATCGCAGTGCAGACGCACGGGGAAAGTATGCTGGCTAACAAGAAGGATGCCTGGCTAGACTCAACCAAGGCCTCGAGATACCTGATGAAGACTGAAAATTGGATTATCAGGAATCCTGGGTACGCTTTTGTAGCTGTCCTCTTGGGCTGGATGCTGGGAAGCAACAATGGACAAAGGGTCGTTTTCGTCGTTCTTTTACTTCTTGTGGCGCCTGCTTACAGCTTCAACTGCCTTGGCATGAGCAACAGAGACTTCCTTGAGGGAGTCTCTGGTGCTACCTGGGTCGACGTGGTTTTGGAAGGTGACAGCTGCATAACCATCATGGCTAAGGACAAGCCGACCATTGACATTAAGATGATGGAAACTGAAGCCACGAGTTTGGCTGAAGTGAGAAGCTACTGCTATCTAGCCACTGTCTCAGATGTTTCAACTGTCTCCAACTGTCCAACAACTGGGGAGGCCCACAATCCTAAGAGAGCTGAGAACACGTATGTGTGCAAAAGTGGTGTCACTGACAGGGGCTGGGGCAATGGCTGTGGACTATTTGGCAAAGGAAGTATAGACACGTGCGCCAACTTCACCTGCTCCCTGAAAGCGGTGGGCCGGATGATCCAACCGGAAAATGTTAAGTATGAAGTGGGAATCTTCATACATGGTTCCACCAGCTCTGACACTCACGGTAACTATTCTTCACAACTAGGAGCATCACAGGCTGGGCGATTTACCATCACTCCCAACTCCCCAGCCATCACTGTGGAGATGGGTGACTATGGAGAAATATCAGTTGAGTGTGAACCAAGAAACGGGTTGAACACTGAGGCGTACTACATCATGTCAGTGGGCACCAAACACTTCCTTGTCCATAGAGAATGGTTTAACGACTTGGCCCTCCCATGGACTTCACCAGCTAGCTTAAATTGGAGAAATAGAGAGACACTACTAGAATTCGAAGAGCCCCATGCCACAAAGCAATCAGTTGTGGCGCTTGGTTCCCAGGAAGGTGCTTTGCACCAGGCCTTGGCAGGAGCTGTTCCAGTGTCTTTCTCGGGCAGTGTAAAGCTCACATCTGGTCATCTCAAGTGTCGAGTCAAGATGGAAAAGTTGACACTAAAAGGCACCACCTACGGCATGTGTACGGAAAAGTTTTCTTTTGCAAAAAATCCGGCTGACACGGGTCACGGCACTGTGGTCCTTGAACTGCAGTACACGGGATCTGATGGACCTTGCAAAATCCCAATTTCCATTGTGGCAACACTTTCCGATCTCACCCCCATTGGTAGAATGGTCACAGCAAACCCTTATGTAGCTTCATCCGAAGCTAACGCGAAAGTGCTGGTTGAGATGGAACCACCATTTGGAGATTCATACATTGTGGTTGGAAGAGGGGACAAGCAGATAAACCATCACTGGCACAAAGCAGGAAGCTCCATTGGAAAAGCGTTCATCACCACCATCAAAGGAGCACAGCGTCTAGCTGCCCTGGGCGACACGGCATGGGACTTTGGGTCGGTCGGAGGGATTTTCAACTCTGTAGGGAAGGCGGTGCATCAGGTCTTTGGAGGAGCCTTCAGAACTCTCTTCGGTGGCATGTCCTGGATCACCCAGGGTCTAATGGGAGCTCTGCTTCTGTGGATGGGGGTGAATGCGAGAGATCGATCCATCGCACTGGTGATGTTAGCCACGGGAGGGGTGCTTCTCTTTCTCGCCACAAACGTCCATGCAGACTCGGGATGTGCGATAGACGTGGGAAGGAGAGAGTTGCGCTGTGGACAAGGGATCTTCATCCACAATGATGTTGAAGCGTGGGTCGACCGGTACAAATTTATGCCTGAAACACCGAAACAGCTGGCAAAGGTCATCGAGCAAGCCCACGCGAAAGGAATATGTGGATTGAGGTCCGTCTCACGTCTGGAACACGTGATGTGGGAGAACATCAGAGATGAACTTAATACCCTCCTCAGAGAGAATGCAGTAGATCTAAGTGTCGTGGTTGAGAAGCCAAAAGGAACGTACAAATCAGCACCGCAGAGATTAGCACTCACATCTGAAGAGTTTGAGATTGGGTGGAAGGCTTGGGGAAAGAGCTTGGTGTTCGCACCAGAACTGGCCAACCACACTTTTGTGGTTGACGGGCCCGAGACCAAAGAATGTCCCGATGTAAAAAGAGCTTGGAACAGCCTTGAGATCGAAGACTTTGGATTTGGCATCATGTCCACTAGGGTTTGGCTGAAAGTCAGAGAGCACAACACTACTGACTGCGACAGCTCAATAATTGGGACGGCTGTTAAAGGAGACATAGCTGTGCACAGTGACCTCTCCTACTGGATTGAAAGCCACAAGAACACGACATGGAGGCTCGAGAGGGCTGTCTTTGGAGAGATCAAATCATGCACGTGGCCTGAAACACACACTCTTTGGAGTGATGGCGTTGTTGAAAGTGATCTGATTGTGCCAGTCACCCTCGCTGGGCCAAAAAGCAATCACAACCGGCGTGAAGGTTACAAAGTCCAGAGCCAGGGGCCGTGGGACGAAGAAGACATCGTTCTCGACTTTGACTATTGCCCAGGCACCACCGTCACAATCACTGAAGCATGTGGGAAGAGAGGACCCTCCATAAGAACCACTACTAGCAGTGGTAGATTGGTCACAGACTGGTGCTGTCGGAGCTGCACCCTTCCCCCTTTGAGATACAGGACAAAAAATGGATGTTGGTATGGAATGGAGATAAGACCCATGAAGCATGATGAGACGACGTTGGTAAAATCCAGCGTCAGTGCCTACCGGAGTGACATGATTGATCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACTGTTCCGGCTATTGTGGGAGCTCTACTCGTGCTGATTCTTGGGGGAATTACTTACACTGACCTGCTTAGGTATGTTCTTCTGGTTGGGGCGGCCTTCGCCGAAGCCAACAGCGGGGGTGACGTCGTCCATCTAGCTCTCATAGCCGCCTTTAAAATTCAACCAGGCTTTCTCGCAATGACATTTCTTAGGGGAAAGTGGACGAACCAAGAGAACATCCTGCTGGCCCTGGGGGCAGCATTCTTTCAGATGGCGGCCACCGATTTGAACTTGTCTCTTCCAGGAATTCTCAATGCCACTGCTACAGCTTGGATGCTCCTGAGGGCTGTCACCCAGCCATCCACTTCTGCCATCGTCATGCCTCTGCTTTGCCTGCTGGCTCCTGGCATGAGACTGCTTTACCTGGACACGTATAGAATCACTCTCATCATCGTCGGCATTTGCAGCCTGATAGGGGAGCGCCGCAGGGTGGCCGCAAAGAAGAAAGGGGCGGTATTGCTAGGGTTAGCACTAACATCAACAGGGCAGTTCTCTGCGTCAGTTATGGCGGCTGGGCTCATGGCATGCAATCCCAACAAAAAGCGGGGATGGCCGGCTACAGAAGTTTTGACAGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTGGGTGGTCTAGCTGAGTTGGATGTTGATTCCATGTCCATTCCTTTTGTGTTGGCTGGGCTGATGGCAGTTTCTTACACCATTTCAGGCAGATCGACAGACTTGTGGCTTGAGAGAGCAGCTGACATAACATGGGAAACTGATGCAGCCATAACTGGAACCAGCCAACGCCTAGATGTGAAATTGGATGATGATGGTGACTTCCACCTTATCAACGACCCTGGAGTGCCGTGGAAGATATGGGTCATCCGCATGACGGCACTGGGGTTCGCAGCCTGGACACCATGGGCAATAATACCGGCTGGAATAGGCTATTGGCTCACTGTCAAGTACGCAAAAAGAGGAGGTGTCTTTTGGGACACTCCGGCTCCGAGGACCTACCCCAAGGGTGACACTTCACCAGGAGTATACCGTATCATGAGCCGTTACATTCTGGGGACCTACCAGGCTGGAGTGGGCGTCATGTATGAAGGAGTTTTTCACACCCTGTGGCATACCACAAGAGGGGCAGCTATCAGAAGTGGTGAAGGAAGGCTCACTCCCTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGATAGGATCACCTATGGTGGGCCATGGAAGTTTGATAGGAAGTGGAATGGTCTCGATGATGTTCAGCTCATCGTAGTGGCCCCCGGAAAGGCAGCCATAAACATCCAAACCAAACCAGGCATCTTCAAAACGCCACAGGGGGAAATAGGAGCAGTCAGCCTGGACTATCCTGAAGGGACTTCAGGCTCCCCAATACTGGACAAGAATGGTGACATCGTGGGCTTGTACGGGAATGGAGTC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TGGCAGGACTTCATGGTCAGTGCATGCCACAGGTGAATGGATGACAACTGATGACATGTTGGAAGTGTGGAACAAAGTGTGGATTCAAGACAATGAATGGATGCTGGACAAGACCCCAGTTCAAAGCTGGACAGACATCCCTTACACCGGGAAGCGGGAAGACATATGGTGTGGAAGCCTGATAGGCACGCGAACACGGGCAACGTGGGCTGAAAACATCTACGCGGCCATAAACCAGGTGAGGGCCATTATTGGCCAGGAAAAGTATAGGGATTACATGCTTTCACTTAGAAGATATGAAGAAGTTAGCGTCCAAGAGGACAGGGTTTTGTAAATAAGTGTTTAGGGTTTTGTAATTTAATTGAATATGCAATGTGATTTGGTTGTAAATAATTGATTGTGTAGCTTCATTTAGTATTATTTTAGGATAGTAGAAGTTAAGGCTTTATTTAGTTATTTTATTTAATTGAATTTGATAGTCAGGCCAGGGTAACCTGCCACCGGAAGTTGAGTAGACGGCGCTGCCTGCGACTCAACCCCAGGCGGACTGGGTTAACAAAGCTGACCGTTGATGATAGGAAAGCCCCTCAGAACCGTTTCGGAGAGGGACCCTGCTTATTGGAACCGTCCAGCCCGTGTCAGGCCGCAAAGCGCCACTTCGCCAAGGAGTGCAGCCTGTATGGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGAAAGGCCCCCACGGCCCAAGCGAACAGACGGTGATGCGAACTGTTCGTGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGTGGAACTTAGGTGCGGCCCTAGCCGTTTCCGAAGCTGTAGGAACGGTGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGCATCATAAGCATCAAGAAACAGCATATTGACACCTGGGAATTAGACTAGGAGATCTCCTGCTCTATTC
| 13,088
|
OQ630904.1
|
Usutu virus
|
Bergmann,F., Schmoock-Wellhausen,M., Fast,C., Holicki,C.M., Michel,F., Wysocki,P., Sadeghi,B., Groschup,M.H., Ziegler,U., Holicki,C.
|
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Novel and Emerging Infectious Diseases
|
Germany
|
2023-07-15
|
ED-I-58/18
|
Orthoflavivirus usutuense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,920
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Strix nebulosa
| null |
2018
| null | null |
Usutu virus isolate ED-I-58/18, complete genome
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CGTGTTTCTTTGAGCGTTGATTTTCAATGTCTAAGAAACCAGGAGGGCCCGGAAGAAGCCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGCATACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTCATGGGCTTGTTGGATGGAAGAGGACCAGTGCGATTCGTGCTGGCCTTGATGACATTCTTCAAGTTCACCGCGCTTGCCCCGACGAAGGCCTTGCTAGGCCGTTGGAAGCGCATCAACAAGACCACGGCAATGAAACACCTGACTAGCTTCAGAAAGGAATTAGGAACAATGATTAACGTGGTTAACAATCGGGGCACAAAAAAGAAGAGAGGCAACAATGGACCAGGATTAGTGATGATCATAACACTCATGACGGTTGTTTCAATGGTTTCCTCTTTAAAGCTTTCCAACTTCCAGGGGAAAGTCATGATGACCATCAACGCGACTGATATGGCAGATGTCATTGTTGTTCCCACGCAACATGGGAAAAACCAGTGCTGGATTAGAGCCATGGATGTCGGGTACATGTGTGATGATACCATCACTTATGAATGCCCCAAACTGGATGCAGGAAATGACCCAGAAGACATTGACTGTTGGTGTGACAAACAACCCATGTACGTCCACTATGGAAGGTGCACAAGAACCAGACACTCGAAGCGGAGTCGGCGGTCGATCGCAGTGCAGACGCACGGGGAGAGTATGCTGGCTAACAAGAAGGATGCTTGGCTAGACTCAACCAAGGCTTCGAGATACCTGATGAAGACTGAGAATTGGATTATCAGGAATCCTGGGTATGCTTTTGTAGCTGTCCTCTTGGGCTGGATGCTGGGAAGCAACAATGGACAAAGGGTCGTTTTCGTCGTTCTCCTGCTCCTTGTGGCGCCTGCTTATAGCTTCAACTGCCTTGGTATGAGCAACAGAGACTTCCTTGAGGGAGTCTCTGGTGCTACCTGGGTTGACGTGGTTTTGGAAGGTGACAGCTGCATAACCATCATGGCCAAGGACAAGCCGACCATTGACATTAAGATGATGGAAACTGAAGCCACGAACCTGGCTGAAGTGAGAAGCTACTGCTATTTAGCCACTGTCTCAGATGTTTCAACTGTCTCCAACTGTCCAACAACTGGGGAGGCCCACAACCCTAAGAGAGCTGAGGACACGTACGTGTGCAAAAGTGGTGTCACTGACAGGGGCTGGGGCAATGGCTGTGGACTATTTGGCAAAGGAAGTATAGACACGTGTGCCAACTTCACCTGCTCCCTGAAAGCGATAGGCCGGATGATCCAACCGGAAAATGTTAAGTATGAAGTGGGAATCTTCATACATGGTTCTACCAGCTCTGACACTCACGGCAACTATTCTTCACAACTAGGAGCATCACAGGCTGGGCGGTTTACCATCACTCCCAACTCCCCAGCCATCACTGTGAAGATGGGTGACTATGGAGAAATATCAGTTGAGTGTGAACCAAGAAACGGGTTGAACACCGAGGCATACTACATCATGTCAGTGGGCACCAAACACTTCCTTGTCCATAGAGAATGGTTTAATGACTTGGCCCTCCCATGGACTTCACCAGCTAGCTCAAATTGGAGAAATAGAGAGATACTACTAGAGTTCGAAGAGCCCCATGCCACAAAGCAATCAGTTGTGGCGCTTGGTTCCCAGGAAGGTGCTTTGCACCAGGCCTTGGCAGGAGCTGTTCCAGTGTCTTTCTCGGGCAGTGTCAAGCTCACATCTGGTCATCTCAAGTGTCGAGTCAAGATGGAAAAGTTGACACTAAAAGGCACCACCTACGGCATGTGCACGGAAAAGTTTTCTTTTGCAAAAAATCCGGCTGACACGGGTCACGGCACTGTGGTCCTTGAACTGCAGTACACGGGATCTGACGGACCTTGCAAAATCCCAATTTCCATTGTGGCATCACTTTCCGATCTCACCCCCATTGGTAGAATGGTCACAGCAAACCCTTATGTGGCTTCATCCGAAGCCAACGCGAAAGTGTTGGTTGAGATGGAACCACCATTTGGAGATTCATATATTGTGGTTGGAAGAGGGGATAAGCAGATAAACCATCACTGGCACAAAGCAGGAAGTTCCATTGGAAAAGCGTTCATCACCACTATCAAAGGGGCACAGCGTCTAGCTGCCCTAGGCGACACAGCGTGGGACTTTGGGTCGGTCGGAGGGATTTTCAATTCTGTAGGAAAGGCGGTACATCAGGTCTTTGGAGGAGCCTTCAGAACTCTCTTCGGTGGCATGTCCTGGATCACCCAGGGTCTAATGGGAGCTCTGCTTCTATGGATGGGGGTGAATGCGAGAGATCGATCCATCGCACTGGTGATGTTAGCCACGGGAGGGGTGCTTCTCTTTCTCGCCACAAACGTCCATGCAGACTCGGGATGTGCGATAGACGTGGGAAGGAGAGAGTTGCGCTGTGGACAAGGGATTTTTATCCACAATGATGTTGAAGCGTGGGTCGACCGGTACAAATTTATGCCTGAAACACCAAAACAGCTGGCAAAGGTCATCGAGCAAGCCCACGCGAAAGGAATATGTGGATTGAGGTCCGTCTCACGTCTGGAACACGTGATGTGGGAGAACATCAGAGATGAACTCAACACCCTCCTCAGAGAGAATGCAGTAGATCTAAGTGTCGTGGTTGAGAAGCCAAAAGGAATGTACAAATCAGCACCACAGAGATTGGCACTCACATCTGAAGAGTTTGAGATTGGGTGGAAGGCTTGGGGAAAGAGCTTGGTGTTCGCACCAGAACTGGCCAACCACACTTTTGTGGTTGACGGGCCCGAGACCAAAGAATGTCCCGATGTAAAAAGAGCTTGGAACAGCCTTGAGATTGAAGACTTTGGATTTGGCATCATGTCCACCAGGGTTTGGCTGAAAGTCAGAGAACACAACACTACTGACTGCGACAGCTCAATAATTGGGACGGCTGTTAAAGGAGACATAGCTGTGCACAGTGACCTCTCCTACTGGATTGAAAGCCACAAGAACACGACATGGAGGCTCGAGAGGGCTGTCTTTGGAGAGATCAAATCATGCACGTGGCCTGAGACACACACTCTTTGGAGTGATGGCGTTGTTGAAAGTGATCTGGTTGTGCCAGTCACCCTCGCTGGACCAAAAAGCAATCACAACCGGCGTGAAGGTTACAAAGTCCAGAGCCAGGGACCGTGGGACGAAGAAGACATCGTTCTCGACTTTGACTATTGCCCAGGTACCACCGTCACAATCACTGAAGCATGTGGGAAGAGAGGACCCTCCATAAGAACTACTACTAGCAGTGGTAGACTGGTCACAGACTGGTGCTGCCGGAGCTGCACCCTTCCCCCTTTGAGATACAGGACAAAAAATGGATGTTGGTATGGAATGGAGATAAGACCCATGAAACATGATGAGACGACGCTGGTAAAATCCAGCGTCAGTGCCTATCGGAGTGACATGATTGATCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACTGTTCCGGCTATTGTGGGAGCTCTACTCGTGCTGATTCTTGGGGGAATCACTTACACTGACCTGCTTAGGTATGTTCTTCTGGTTGGGGCGGCCTTCGCCGAAGCCAACAGCGGGGGTGACATCGTTCATCTAGCTCTCATAGCCGCCTTCAAAATTCAACCAGGCTTTCTCGTAATGACATTTCTTAGGGGAAAGTGGACGAACCAAGAGAACATCCTGCTGGCTCTGGGGGCAGCATTCTTTCAGATGGCGGCCACCGATTTGAACTTTTCTCTCCCAGGAATTCTCAATGCCACTGCCACAGCTTGGATGCTCCTGAGGGCTGCCACCCAGCCATCCACTTCAGCCATCGTCATGCCTTTGCTTTGCCTGCTGGCTCCTGGCATGAGACTGCTCTACCTGGACACGTATAGAATCACTCTCATCATCATCGGCATCTGCAGCCTGATAGGGGAGCGCCGTAGGGCGGCCGCAAAGAAGAAAGGGGCGGTACTGCTAGGGTTAGCACTAACATCAACAGGGCAGTTCTCAGCATCAGTTATGGCGGCTGGGCTCATGGCATGCAATCCCAACAAAAAGCGGGGATGGCCGGCCACAGAAGTTTTGACAGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTGGGTGGTCTAGCTGAGTTGGATGTTGACTCTATGTCCATTCCTTTTGTGTTAGCCGGGCTGATGGCAGTTTCTTACACCATCTCAGGCAAATCGACAGACTTGTGGCTTGAGAGAGCAGCTGACATAACATGGGAAACTGATGCAGCCATAACTGGAACCAGCCAACGCCTAGATGTAAAATTGGATGATGATGGTGACTTCCACCTTATTAACGACCCTGGAGTGCCGTGGAAGATATGGGTCATCCGTATGACGGCATTGGGATTCGCAGCCTGGACACCATGGGCAATAATACCTGCTGGAATAGGTTATTGGCTCACTGTCAAGTACGCAAAAAGAGGAGGCGTCTTTTGGGACACCCCGGCTCCAAGGACCTACCCCAAGGGTGACACTTCACCAGGAGTATACCGTATCATGAGCCGTTACATTTTGGGGACCTACCAGGCTGGAGTGGGCGTCATGTATGAAGGAGTTTTTCACACCCTGTGGCACACCACAAGAGGGGCAGCTATCAGAAGTGGTGAAGGAAGGCTCACTCCCTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGACAGGATCACCTATGGTGGGCCATGGAAGTTTGACAGGAAGTGGAATGGTCTCGATGATGTTCAGCTCATCATAGTGGCTCCCGGAAAGGCAGCCATAAACATCCAAACCAAACCAGGCATCTTCAAAACGCCACAGGGGGAAATAGGAGCAGTCAGCCTGGACTATCCTGAAGGGACCTCAGGCTCCCCAATACTGGACAAGAATGGTGACATCGTGGGCTTGTACGGGAATGGAGTCATC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CAGGACTTCATGGTCAGTGCATGCCACAGGTGAATGGATGACAACTGATGACATGTTGGAAGTGTGGAACAAAGTGTGGATCCAAGACAACGAATGGATGCTGGACAAGACCCCAGTTCAAAGCTGGACAGACATCCCTTACACCGGGAAGCGGGAAGACATATGGTGTGGAAGCCTGATAGGCACGCGAACACGGGCAACGTGGGCTGAAAACATCTACGCAGCCATTAACCAGGTGAGGGCCATTATTGGCCAGGAAAAATACAGGGATTACATGCTTTCACTTAGAAGATATGAAGAAGTTAATGTCCAGGAGGACAGGGTTTTGTAAATAAGTGTTTAGGGTTTTGCAATTTAATTAAATATGCAATGTAATTTAGTTGTAAATATTTGATTGTGTAGCTTTATTTAGCATTGTTTTAGGATAGTAGAAGTTAAGGTTTTATTTAGTTATTTTATTTAATTGAATTTGATAGTCAGGCCAGGGCAACCTGCCACCGGAAGTTGAGTAGACGGTGCTGCCTGCGACTCAACCCCAGGCGGACTGGGTTAGCAAAGCTGACCGCTGATGATGGGAAAGCCCCTCAGAACCGTTTCGGAGAGGGACCCTGCCTATTGGAAGCGTCCAGCCCGTGTCAGGCCGCAAAGCGCCACTTCGCCAAGGAGTGCAGCCTGTACGGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGAAAGGCCCCCACGGCCCAAGCGAACAGACGGTGATGCGAACTGTTCGTGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGTGGAACTTAGGTGCGGCCCAAGCCGTTTCCGAAGCTGTAGGAACGGTGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGCATCATGAGCATCAAAAAAACAGCATATTGACACCTGGGAATTAGACTAGGAGATCAAG
| 14,704
|
OQ630905.1
|
Usutu virus
|
Bergmann,F., Schmoock-Wellhausen,M., Fast,C., Holicki,C.M., Michel,F., Wysocki,P., Sadeghi,B., Groschup,M.H., Ziegler,U., Holicki,C.
|
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Novel and Emerging Infectious Diseases
|
Germany
|
2023-07-15
|
ED-I-86/18
|
Orthoflavivirus usutuense
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Orthoflavivirus
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Flaviviridae
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ssRNA(+)
| 10,850
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Strix nebulosa
| null |
2018
| null | null |
Usutu virus isolate ED-I-86/18, complete genome
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GTGAGATTAACACAGTGCCGGCAGTTTCTTTGAGCGTTGATTTTCAATGTCTAAGAAACCAGGAGGGCCCGGAAGAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGCATACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTCATGGGCTTGTTGGATGGAAGAGGACCAGTGCGATTCGTGCTGGCCTTGATGACATTCTTCAAGTTCACCGCGCTTGCCCCGACAAAGGCCTTGCTAGGCCGTTGGAAGCGCATCAACAAGACCACGGCAATGAAACACCTGACTAGCTTCAAAAAGGAATTAGGAACAATGATCAACGTGGTCAACAATCGGGGCACAAAAAAGAAGAGAAGCAACAATGGACCAGGACTATTGATGATTATAACACTCATGACGGCTGTTTCAATGGTTTCCTCTTTAAAGCTTTCCAACTTCCAGGGGAAAGTCATGATGACCATCAACGCGACTGACATGGCAGATGTCATTGTTGTTCCCACGCAACATGGGAAAAACCAGTGCTGGATTAGAGCCATGGATGTCGGGTACATGTGTGATGACACCATCACTTATGAATGCCCCAAGCTGGATGCAGGAAATGACCCAGAAGACATTGACTGTTGGTGTGATAAACAACCCATGTATGTCCACTATGGAAGGTGCACAAGAACCAGACATTCGAAGCGGAGTCGGCGGTCGATCGCAGTGCAGACGCACGGGGAAAGTATGCTGGCTAACAAGAAGGATGCCTGGCTAGACTCAACCAAGGCCTCGAGATACCTGATGAAGACTGAAAATTGGATTATCAGGAATCCTGGGTACGCTTTTGTAGCTGTCCTCTTGGGCTGGATGCTGGGAAGCAACAATGGACAAAGGGTCGTTTTCGTCGTTCTTTTACTTCTTGTGGCGCCTGCTTACAGCTTCAACTGCCTTGGCATGAGCAACAGAGACTTCCTTGAGGGAGTCTCTGGTGCTACCTGGGTCGACGTGGTTTTGGAAGGTGACAGCTGCATAACCATCATGGCTAAGGACAAGCCGACCATTGACATTAAGATGATGGAAACTGAAGCCACGAGTTTGGCTGAAGTGAGAAGCTACTGCTATCTAGCCACTGTCTCAGATGTTTCAACTGTCTCCAACTGTCCAACAACTGGGGAGGCCCACAATCCTAAGAGAGCTGAGAACACGTATGTGTGCAAAAGTGGTGTCACTGACAGGGGCTGGGGCAATGGCTGTGGACTATTTGGCAAAGGAAGTATAGACACGTGCGCCAACTTCACCTGCTCCCTGAAAGCGGTGGGCCGGATGATCCAACCGGAAAATGTTAAGTATGAAGTGGGAATCTTCATACATGGTTCCACCAGCTCTGACACTCACGGTAACTATTCTTCACAACTAGGAGCATCACAGGCTGGGCGATTTACCATCACTCCCAACTCCCCAGCCATCACTGTGGAGATGGGTGACTATGGAGAAATATCAGTTGAGTGTGAACCAAGAAACGGGTTGAACACTGAGGCGTACTACATCATGTCAGTGGGTACCAAACACTTCCTTGTCCATAGAGAATGGTTTAACGACTTGGCCCTCCCATGGACTTCACCAGCTAGCTTAAATTGGAGAAATAGAGAGACACTACTAGAATTCGAAGAGCCCCATGCCACAAAGCAATCAGTTGTGGCGCTTGGTTCCCAGGAAGGTGCTTTGCACCAGGCCTTGGCAGGAGCTGTTCCAGTGTCTTTCTCGGGCAGTGTAAAGCTCACATCTGGTCATCTCAAGTGTCGAGTCAAGATGGAAAAGTTGACACTAAAAGGCACCACCTACGGCATGTGCACGGAAAAGTTTTCTTTTGCAAAAAATCCGGCTGACACGGGTCACGGCACTGTGGTCCTTGAACTGCAGTACACGGGATCTGATGGACCTTGCAAAATCCCAATTTCCATTGTGGCAACACTTTCCGATCTCACCCCCATTGGTAGAATGGTCACAGCAAACCCTTATGTAGCTTCATCCGAAGCTAACGCGAAAGTGCTGGTTGAGATGGAACCACCATTTGGAGATTCATACATTGTGGTTGGAAGAGGGGACAAGCAGATAAACCATCACTGGCACAAAGCAGGAAGCTCCATTGGAAAAGCGTTCATCACCACCATCAAAGGAGCACAGCGTCTAGCTGCCCTGGGCGACACGGCATGGGACTTTGGGTCGGTCGGAGGGATTTTCAACTCTGTAGGGAAGGCGGTGCATCAGGTCTTTGGAGGAGCCTTCAGAACTCTCTTCGGTGGCATGTCCTGGATCACCCAGGGTCTAATGGGAGCTCTGCTTCTGTGGATGGGGGTGAATGCGAGAGATCGATCCATCGCACTGGTGATGTTAGCCACGGGAGGGGTGCTTCTCTTTCTCGCCACAAACGTCCATGCAGACTCGGGATGTGCGATAGACGTGGGAAGGAGAGAGTTGCGCTGTGGACAAGGGATCTTCATCCACAATGATGTTGAAGCGTGGGTCGACCGGTACAAATTTATGCCTGAAACACCGAAACAGCTGGCAAAGGTCATCGAGCAAGCCCACGCGAAAGGAATATGTGGATTGAGGTCCGTCTCACGTCTGGAACACGTGATGTGGGAGAACATCAGAGATGAACTTAACACCCTCCTTAGAGAGAATGCAGTAGATCTAAGTGTCGTGGTTGAGAAGCCAAAAGGAACGTACAAATCAGCACCGCAGAGATTAGCACTCACATCTGAAGAGTTTGAGATTGGGTGGAAGGCTTGGGGAAAGAGCTTGGTGTTCGCACCAGAACTGGCCAACCACACTTTTGTGGTTGACGGGCCCGAGACCAAAGAATGTCCCGATGTAAAAAGAGCTTGGAACAGCCTTGAGATCGAAGACTTTGGATTTGGCATCATGTCCACTAGGGTTTGGCTGAAAGTCAGAGAGCACAACACTACTGACTGCGACAGCTCAATAATTGGGACGGCTGTTAAAGGAGACATAGCTGTGCACAGTGACCTCTCCTACTGGATTGAAAGCCACAAGAACACGACATGGAGGCTCGAGAGGGCTGTCTTTGGAGAGATCAAATCATGCACGTGGCCTGAAACACACACTCTTTGGAGTGATGGCGTTGTTGAAAGTGATCTGATTGTGCCAGTCACCCTCGCTGGGCCAAAAAGCAATCACAACCGGCGTGAAGGTTACAAAGTCCAGAGCCAGGGGCCGTGGGACGAAGAAGACATCGTTCTCGACTTTGACTATTGCCCAGGCACCACCGTCACAATCACTGAAGCATGTGGGAAGAGAGGACCCTCCATAAGAACCACTACTAGCAGTGGTAGATTGGTTACAGACTGGTGCTGCCGGAGCTGCACCCTTCCCCCTTTGAGATACAGGACAAAAAATGGATGTTGGTATGGAATGGAGATAAGACCCATGAAGCATGATGAGACGACGTTGGTAAAATCCAGCGTCAGTGCCTACCGGAGTGACATGATTGATCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACTGTTCCGGCTATTGTGGGAGCTCTACTCGTGCTGATTCTTGGGGGAATTACTTACACTGACCTGCTTAGGTATGTTCTTCTGGTTGGGGCGGCCTTCGCCGAAGCCAACAGCGGGGGTGACGTCGTCCATCTAGCTCTCATAGCCGCCTTTAAAATTCAACCAGGCTTTCTCGCAATGACATTTCTTAGGGGAAAGTGGACGAACCAAGAGAACATCCTGCTGGCCCTGGGGGCAGCATTCTTTCAGATGGCGGCCACCGATTTGAACTTGTCTCTTCCAGGAATTCTCAATGCCACTGCTACAGCTTGGATGCTCCTGAGGGCTGTCACCCAGCCATCCACTTCTGCCATCGTCATGCCTCTGCTTTGCCTGCTGGCTCCTGGCATGAGACTGCTTTACCTGGACACGTATAGAATCACTCTCATCATCGTCGGCATTTGCAGCCTGATAGGGGAGCGCCGTAGGGTGGCCGCAAAGAAGAAAGGGGCGGTATTGCTAGGGTTAGCACTAACATCAACAGGGCAGTTCTCTGCGTCAGTTATGGCGGCTGGGCTCATGGCATGCAATCCCAACAAAAAGCGGGGATGGCCGGCTACAGAAGTTTTGACAGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTGGGTGGTCTAGCTGAGTTGGATGTTGATTCCATGTCCATTCCTTTTGTGTTGGCCGGGCTGATGGCAGTTTCTTACACCATTTCAGGCAGATCGACAGACTTGTGGCTTGAGAGAGCAGCTGACATAACATGGGAAACTGATGCAGCCATAACTGGAACCAGCCAACGCCTAGATGTGAAATTGGATGATGATGGTGACTTCCACCTTATCAACGACCCTGGAGTGCCGTGGAAGATATGGGTCATCCGCATGACGGCACTGGGGTTCGCAGCCTGGACACCATGGGCAATAATACCGGCTGGAATAGGCTATTGGCTCACTGTCAAGTACGCAAAAAGAGGAGGTGTCTTTTGGGACACTCCGGCTCCGAGGACCTACCCCAAGGGTGACACTTCACCAGGAGTATACCGTATCATGAGCCGTTACATTCTGGGGACCTACCAGGCTGGAGTGGGCGTCATGTATGAAGGAGTTTTTCACACCCTGTGGCATACCACAAGAGGGGCAGCTATCAGAAGTGGTGAAGGAAGGCTCACTCCCTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGATAGGATCACCTATGGTGGGCCATGGAAGTTTGATAGGAAGTGGAATGGTCTCGATGATGTTCAGCTCATCGTAGTGGCCCCCGGAAAGGCAGCCATAAACATCCAAACCAAACCAGGCATCTTCAAAACACCACAGGGGGAAATAGGAGCAGTCAGCCTGGACTATCCTGAAGGGACTTCAGGCTCCCCAATACTGGACAAGAATGGTGACATCGTGGGCT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| 14,705
|
OQ630906.1
|
Usutu virus
|
Bergmann,F., Schmoock-Wellhausen,M., Fast,C., Holicki,C.M., Michel,F., Wysocki,P., Sadeghi,B., Groschup,M.H., Ziegler,U., Holicki,C.
|
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Novel and Emerging Infectious Diseases
|
Germany
|
2023-07-15
|
ED-I-177/21
|
Orthoflavivirus usutuense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,925
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Strix nebulosa
| null |
2021
| null | null |
Usutu virus isolate ED-I-177/21, complete genome
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CGCAGTTTCTTTGAGCGTTGATTTTCAATGTCTAAGAAACCAGGAGGGCCCGGAAGAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGCATACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTCATGGGCTTGTTGGATGGAAGAGGACCAGTGCGATTCGTGCTGGCCTTGATGACATTCTTCAAGTTCACCGCGCTTGCCCCGACAAAGGCCTTGCTAGGCCGTTGGAAGCGCATCAACAAGACCACGGCAATGAAACACCTGACTAGCTTCAAAAAGGAATTAGGAACAATGATCAACGTGGTCAACAATCGGGGCACAAAAAAGAAGAGAAGCAACAATGGACCAGGACTATTGATGATTATAACACTCATGACGGCTGTTTCAATGGTTTTCTCTTTAAAGCTTTCCAACTTCCAGGGGAAAGTCATGATGACCATCAACGCGACTGACATGGCAGATGTCATTGTTGTTCCCACGCAACATGGGAAAAACCAGTGCTGGATTAGAGCCATGGATGTCGGGTACATGTGTGATGACACCATCACTTATGAATGCCCCAAGCTGGATGCAGGAAATGACCCAGAAGACATTGACTGTTGGTGTGATAAACAACCCATGTATGTCCACTATGGAAGGTGCACAAGAACCAGACATTCGAAGCGGAGTCGGCGGTCGATCGCAGTGCAGACGCACGGGGAAAGTATGCTGGCTAACAAGAAGGATGCCTGGCTAGACTCAACCAAGGCCTCGAGATACCTGATGAAGACTGAAAATTGGATTATCAGGAATCCTGGGTACGCTTTCGTAGCTGTCCTCTTGGGCTGGATGCTGGGAAGCAACAATGGACAAAGGGTCGTTTTCGTCGTTCTTTTACTTCTTGTGGCGCCTGCTTACAGCTTCAACTGCCTTGGCATGAGCAACAGAGACTTCCTTGAGGGAGTCTCTGGTGCTACCTGGGTCGACGTGGTTTTGGAAGGTGACAGCTGCATAACCATCATGGCTAAGGACAAGCCGACCATTGACATTAAGATGATGGAAACTGAAGCCACGAGTTTGGCTGAAGTGAGAAGCTACTGCTATCTAGCCACTGTCTCAGATGTTTCAACTGTCTCCAACTGTCCAACAACTGGGGAGGCCCACAATCCTAAGAGAGCTGAGAACACGTATGTGTGCAAAAGTGGTGTCACTGACAGGGGCTGGGGCAATGGCTGTGGACTATTTGGCAAAGGAAGTATAGACACGTGCGCCAACTTCACCTGCTCCCTGAAAGCGGTGGGCCGGATGATCCAACCGGAAAATGTTAAGTATGAAGTGGGAATCTTCATACATGGTTCCACCAGCTCTGACACTCACGGTAACTATTCTTCACAACTAGGAGCATCACAGGCTGGGCGATTTACCATCACTCCCAACTCCCCAGCCATCACTGTGGAGATGGGTGACTATGGAGAAATATCAGTTGAGTGTGAACCAAGAAACGGGTTGAACACTGAGGCGTACTACATCATGTCAGTGGGTACCAAACACTTCCTTGTCCATAGAGAATGGTTTAACGACTTGGCCCTCCCATGGACTTCACCAGCTAGCTTAAATTGGAGAAATAGAGAGACACTACTAGAATTCGAAGAGCCCCATGCCACAAAGCAATCAGTTGTGGCGCTTGGTTCCCAGGAAGGTGCTTTGCACCAGGCCTTGGCAGGAGCTGTTCCAGTGTCTTTCTCGGGCAGTGTAAAGCTCACATCTGGTCATCTCAAGTGTCGAGTCAAGATGGAAAAGTTGACACTAAAAGGCACCACCTACGGCATGTGTACGGAAAAGTTTTCTTTTGCAAAAAATCCGGCTGACACGGGTCACGGCACTGTGGTCCTTGAACTGCAGTACACGGGATCTGATGGACCTTGCAAAATCCCAATTTCCATTGTGGCAACACTTTCCGATCTCACCCCCATTGGTAGAATGGTCACAGCAAACCCTTATGTAGCTTCATCCGAAGCTAACGCGAAAGTGCTGGTTGAGATGGAACCACCATTTGGAGATTCATACATTGTGGTTGGAAGAGGGGACAAGCAGATAAACCATCACTGGCACAAAGCAGGAAGCTCCATTGGAAAAGCGTTCATCACCACCATCAAAGGAGCACAGCGTCTAGCTGCCCTGGGCGACACGGCATGGGACTTTGGGTCGGTCGGAGGGATTTTCAACTCTGTAGGGAAGGCGGTGCATCAGGTCTTTGGAGGAGCCTTCAGAACTCTCTTCGGTGGCATGTCCTGGATCACCCAGGGTCTAATGGGAGCTCTGCTTCTGTGGATGGGGGTGAATGCGAGAGATCGATCCATCGCACTGGTGATGTTAGCCACGGGAGGGGTGCTTCTCTTTCTCGCCACAAACGTCCATGCAGACTCGGGATGTGCGATAGACGTGGGAAGGAGAGAGTTGCGCTGTGGACAAGGGATCTTCATCCACAATGATGTTGAAGCGTGGGTCGACCGGTATAAATTTATGCCTGAAACACCGAAACAGCTGGCAAAGGTCATCGAGCAAGCCCACGCGAAAGGAATATGTGGATTGAGGTCCGTCTCACGTCTGGAACACGTGATGTGGGAGAACATCAGAGATGAACTTAACACCCTCCTCAGAGAGAATGCAGTAGATCTAAGTGTCGTGGTTGAGAAGCCAAAAGGAACGTACAAATCAGCACCGCAGAGATTAGCACTCACATCTGAAGAGTTTGAGATTGGGTGGAAGGCTTGGGGAAAGAGCTTGGTGTTCGCACCAGAACTGGCCAACCACACTTTTGTGGTTGACGGGCCCGAGACCAAAGAATGTCCCGATGTAAAAAGAGCTTGGAACAGCCTTGAGATCGAAGACTTTGGATTTGGCATCATGTCCACTAGGGTTTGGCTGAAAGTCAGAGAGCACAACACTACTGACTGCGACAGCTCAATAATTGGGACGGCTGTTAAAGGAGACATAGCTGTGCACAGTGACCTCTCCTACTGGATTGAAAGCCACAAGAACGCGACATGGAGGCTCGAGAGGGCTGTCTTTGGAGAGATCAAATCATGCACGTGGCCTGAAACACACACTCTTTGGAGTGATGGCGTTGTTGAAAGTGATCTGATTGTGCCAGTCACCCTCGCTGGGCCAAAAAGCAATCACAACCGGCGTGAAGGTTACAAAGTCCAGAGCCAGGGGCCGTGGGACGAAGAAGACATCGTTCTCGACTTTGACTATTGCCCAGGCACCACCGTCACAATCACTGAAGCATGTGGGAAGAGAGGACCCTCCATAAGAACCACTACTAGCAGTGGTAGATTGGTCACAGACTGGTGCTGCCGGAGCTGCACCCTTCCCCCTTTGAGATACAGGACAAAAAATGGATGTTGGTATGGAATGGAGATAAGACCCATGAAGCATGATGAGACGACGTTGGTAAAATCCAGCGTCAGTGCCTACCGGAGTGACATGATTGATCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACTGTTCCGGCTATTGTGGGAGCTCTACTCGTGCTGATTCTTGGGGGAATTACTTACACTGACCTGCTTAGGTATGTTCTTCTGGTTGGGGCGGCCTTCGCCGAAGCCAACAGCGGGGGTGACGTCGTCCATCTAGCTCTCATAGCCGCCTTTAAAATTCAACCAGGCTTTCTCGCAATGACATTTCTTAGGGGAAAGTGGACGAACCAAGAGAACATCCTGCTGGCCCTGGGGGCAGCATTCTTTCAGATGGCGGCCACCGATTTGAACTTGTCTCTTCCAGGAATTCTCAATGCCACTGCTACAGCTTGGATGCTCCTGAGGGCTGTCACCCAGCCATCCACTTCTGCCATCGTCATGCCTCTGCTTTGCCTGCTGGCTCCTGGCATGAGACTGCTTTACCTGGACACGTATAGAATCACTCTCATCATCGTCGGCATTTGCAGCCTGATAGGGGAGCGCCGTAGGGTGGCCGCAAAGAAGAAAGGGGCGGTATTGCTAGGGTTAGCACTAACATCAACAGGGCAGTTCTCTGCGTCAGTTATGGCGGCTGGGCTCATGGCATGCAATCCCAACAAAAAGCGGGGATGGCCGGCTACAGAAGTTTTGACAGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTGGGTGGTCTAGCTGAGTTGGATGTTGATTCCATGTCCATTCCTTTTGTGTTGGCCGGGCTGATGGCAGTTTCTTACACCATTTCAGGCAGATCGACAGACTTGTGGCTTGAGAGAGCAGCTGACATAACATGGGAAACTGATGCAGCCATAACTGGAACCAGCCAACGCCTAGATGTGAAATTGGATGATGATGGTGACTTCCACCTTATCAACGACCCTGGAGTACCGTGGAAGATATGGGTCATCCGCATGACGGCACTGGGGTTCGCAGCCTGGACACCATGGGCAATAATACCGGCTGGAATAGGCTATTGGCTCACTGTCAAGTACGCAAAAAGAGGAGGTGTCTTTTGGGACACTCCGGCTCCGAGGACCTACCCCAAGGGTGACACTTCACCAGGAGTATACCGTATCATGAGCCGTTACATTCTGGGGACCTACCAGGCTGGAGTGGGCGTCATGTATGAAGGAGTTTTTCACACCCTGTGGCATACCACAAGAGGGGCAGCTATCAGAAGTGGTGAAGGAAGGCTCACTCCCTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGATAGGATCACCTATGGTGGGCCATGGAAGTTTGATAGGAAGTGGAATGGTCTCGATGATGTTCAGCTCATCGTAGTGGCCCCCGGAAAGGCAGCCATAAACATCCAAACCAAACCAGGCATCTTCAAAACACCACAGGGGGAAATAGGAGCAGTCAGCCTGGACTATCCTGAAGGGACTTCAGGCTCCCCAATACTGGACAAGAATGGTGACATCGTGGGCTTGTACGGGAATGGAGTCAT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GCAGGACTTCATGGTCAGTGCATGCCACAGGTGAATGGATGACAACTGATGACATGTTGGAAGTGTGGAACAAAGTGTGGATTCAAGACAATGAATGGATGCTGGACAAGACCCCAGTTCAAAGCTGGACAGACATCCCTTACACCGGGAAGCGGGAAGACATATGGTGTGGAAGCCTGATAGGCACGCGAACACGGGCAACGTGGGCTGAAAACATCTACGCGGCCATAAACCAGGTGAGGGCCATTATTGGCCAGGAAAAGTACAGGGATTACATGCTTTCACTTAGAAGATATGAAGAAGTTAGCATCCAAGAGGACAGGGTTTTGTAAATAAGTGTTTAGGGTTTTGTAATTTAATTGAATATGCAATGTGATTTGGTTGTAAATAATTGATTGTGTAGCTTCATTTAGTATTATTTTAGGATAGTAGAAGTTAAGGCTTTATTTAGTTATTTTATTTAATTGAATTTGATAGTCAGGCCAGGGTAACCTGCCACCGGAAGTTGAGTAGACGGTGCTGCCTGCGACTCAACCCCAGGCGGACTGGGTTAACAAAGCTGACCGTTGATGATAGGAAAGCCCCTCAGAACCGTTTCGGAGAGGGACCCTGCCTATTGGAAGCGTCCAGCCCGTGTCAGGCCGCAAAGCGCCACTTCGCCAAGGAGTGCAGCCTGTATGGCCCCAGGAGGACTGGGTTACCAAAGCCGAAAGGCCCCCACGGCCCAAGCGAACAGACGGTGATGCGACCTGTTCGTGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGTGGAACTTAGGTGCGGCCCAAGCCGTTTCCGAAGCTGTAGGAACGGTGGAAGGACTAGAGGTTAGAGGAGACCCCGCATCATAAGCATCAAGAAACAGCATATTGACACCTGGGAATTAGACTAGGAGATCTTCTGCTC
| 14,706
|
OQ630907.1
|
Usutu virus
|
Bergmann,F., Schmoock-Wellhausen,M., Fast,C., Holicki,C.M., Michel,F., Wysocki,P., Sadeghi,B., Groschup,M.H., Ziegler,U., Holicki,C.
|
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Novel and Emerging Infectious Diseases
|
Germany
|
2023-07-15
|
ED-I-178/21
|
Orthoflavivirus usutuense
|
Orthoflavivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 10,920
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Strix nebulosa
| null |
2021
| null | null |
Usutu virus isolate ED-I-178/21, complete genome
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CCAGTTTCTTTGAGCGTTGATTTTCAATGTCTAAGAAACCAGGAGGGCCCGGAAGAAACCGGGCCATCAATATGCTGAAACGCGGCATACCCCGCGTATTCCCACTAGTGGGAGTGAAGAGGGTAGTCATGGGCTTGTTGGATGGAAGAGGACCAGTGCGATTCGTGCTGGCCTTGATGACATTCTTCAAGTTCACCGCGCTTGCCCCGACAAAGGCCTTGCTAGGCCGTTGGAAGCGCATCAACAAGACCACGGCAATGAAACACCTGACTAGCTTCAAAAAGGAATTAGGAACAATGATCAACGTGGTCAACAATCGGGGCACAAAAAAGAAGAGAAGCAACAATGGACCAGGACTATTGATGATTATAACACTCATGACGGCTGTTTCAATGGTTTCCTCTTTAAAGCTTTCCAACTTCCAGGGGAAAGTCATGATGACCATCAACGCGACTGACATGGCAGATGTCATTGTTGTTCCCACGCAACATGGGAAAAACCAGTGCTGGATTAGAGCCATGGATGTCGGGTACATGTGTGATGACACCATCACTTATGAATGCCCCAAGCTGGATGCAGGAAATGACCCAGAAGACATTGACTGTTGGTGTGATAAACAACCCATGTATGTCCACTATGGAAGGTGCACAAGAACCAGACATTCGAAGCGGAGTCGGCGGTCGATCGCAGTGCAGACGCACGGGGAAAGTATGCTGGCTAACAAGAAGGATGCCTGGCTAGACTCAACCAAGGCCTCGAGATACCTGATGAAGACTGAAAATTGGATTATCAGGAATCCTGGGTACGCTTTTGTAGCTGTCCTCTTGGGCTGGATGCTGGGAAGCAACAATGGACAAAGGGTCGTTTTCGTCGTTCTTTTACTTCTTGTGGCGCCTGCTTACAGCTTCAACTGCCTTGGCATGAGCAACAGAGACTTCCTTGAGGGAGTCTCTGGTGCTACCTGGGTCGACGTGGTTTTGGAAGGTGACAGCTGCATAACCATCATGGCTAAGGACAAGCCGACCATTGACATTAAGATGATGGAAACTGAAGCCACGAGTTTGGCTGAAGTGAGAAGCTACTGCTATCTAGCCACTATCTCAGATGTTTCAACTGTCTCCAACTGTCCAACAACTGGGGAGGCCCACAATCCTAAGAGAGCTGAGAACACGTATGTGTGCAAAAGTGGTGTCACTGACAGGGGCTGGGGCAATGGCTGTGGACTATTTGGCAAAGGAAGTATAGACACGTGCGCCAACTTCACCTGCTCCCTGAAAGCGGTGGGCCGGATGATCCAACCGGAAAATGTTAAGTATGAAGTGGGAATCTTCATACATGGTTCCACCAGCTCTGACACTCACGGTAACTATTCTTCACAACTAGGAGCATCACAGGCTGGGCGATTTACCATCACTCCCAACTCCCCAGCCATCACTGTGGAGATGGGTGACTATGGAGAAATATCAGTTGAGTGTGAACCAAGAAACGGGTTGAACACTGAGGCGTACTACATCATGTCAGTGGGCACCAAACACTTCCTTGTCCATAGAGAATGGTTTAACGACTTGGCCCTCCCATGGACTTCACCAGCTAGCTTAAATTGGAGAAATAGAGAGACACTACTAGAATTCGAAGAGCCCCATGCCACAAAGCAATCAGTTGTGGCGCTTGGTTCCCAGGAAGGTGCTTTGCACCAGGCCTTGGCAGGAGCTGTTCCAGTGTCTTTCTCGGGCAGTGTAAAGCTCACATCTGGTCATCTCAAGTGTCGAGTCAAGATGGAAAAGTTGACACTAAAAGGCACCACCTACGGCATGTGTACGGAAAAGTTTTCTTTTGCAAAAAATCCGGCTGACACGGGTCACGGCACTGTGGTCCTTGAACTGCAGTACACGGGATCTGATGGACCTTGCAAAATCCCAATTTCCATTGTGGCAACACTTTCCGATCTCACCCCCATTGGTAGAATGGTCACAGCAAACCCTTATGTAGCTTCATCCGAAGCTAACGCGAAAGTGCTGGTTGAGATGGAACCACCATTTGGAGATTCATACATTGTGGTTGGAAGAGGGGACAAGCAGATAAACCATCACTGGCACAAAGCAGGAAGCTCCATTGGAAAAGCGTTCATCACCACCATCAAAGGAGCACAGCGTCTAGCTGCCCTGGGCGACACGGCATGGGACTTTGGGTCGGTCGGAGGGATTTTCAACTCTGTAGGGAAGGCGGTGCATCAGGTCTTTGGAGGAGCCTTCAGAACTCTCTTCGGTGGCATGTCCTGGATCACCCAGGGTCTAATGGGAGCTCTGCTTCTGTGGATGGGGGTGAATGCGAGAGATCGATCCATCGCACTGGTGATGTTAGCCACGGGAGGGGTGCTTCTCTTTCTCGCCACAAACGTCCATGCAGACTCGGGATGTGCGATAGACGTGGGAAGGAGAGAGTTGCGCTGTGGACAAGGGATCTTCATCCACAATGATGTTGAAGCGTGGGTCGACCGGTACAAATTTATGCCTGAAACACCGAAACAGCTGGCAAAGGTCATCGAGCAAGCCCACGCGAAAGGAATATGTGGATTGAGGTCCGTCTCACGTCTGGAACACGTGATGTGGGAGAACATCAGAGATGAACTTAACACCCTCCTCAGAGAGAATGCAGTGGATCTAAGTGTCGTGGTTGAGAAGCCAAAAGGAACGTACAAATCAGCACCGCAGAGATTAGCACTCACATCTGAAGAGTTTGAGATTGGGTGGAAGGCTTGGGGAAAGAGCTTGGTGTTCGCACCAGAACTGGCCAACCACACTTTTGTGGTTGACGGGCCCGAGACCAAAGAATGTCCCGATGTAAAAAGAGCTTGGAACAGCCTTGAGATCGAAGACTTTGGATTTGGCATCATGTCCACTAGGGTTTGGCTGAAAGTCAGAGAGCACAACACTACTGACTGCGACAGCTCAATAATTGGGACGGCTGTTAAAGGAGACATAGCTGTGCACAGTGACCTCTCCTACTGGATTGAAAGCCACAAGAACACGACATGGAGGCTCGAGAGGGCTGTCTTTGGAGAGATCAAATCATGCACGTGGCCTGAAACACACACTCTTTGGAGTGATGGCGTTGTTGAAAGTGATCTGATTGTGCCAGTCACCCTCGCTGGGCCAAAAAGCAATCACAACCGGCGTGAAGGTTACAAAGTCCAGAGCCAGGGGCCGTGGGACGAAGAAGACATCGTTCTCGACTTTGACTATTGCCCAGGCACCACCGTCACAATCACTGAAGCATGTGGGAAGAGAGGACCCTCCATAAGAACCACCACTAGCAGTGGTAGATTGGTCACAGACTGGTGCTGCCGGAGCTGCACCCTTCCCCCTTTGAGATACAGGACAAAAAATGGATGTTGGTATGGAATGGAGATAAGACCCATGAAGCATGATGAGACGACGTTGGTAAAATCCAGCGTCAGTGCCTACCGGAGTGACATGATTGATCCTTTTCAGTTGGGCCTTCTGGTGATGTTTCTGGCCACCCAGGAGGTCCTGAGGAAGAGGTGGACGGCCAGATTGACTGTTCCGGCTATTGTGGGAGCTCTACTCGTGCTGATTCTTGGGGGAATTACTTACACTGACCTGCTTAGGTATGTTCTTCTGGTTGGGGCGGCCTTCGCCGAAGCCAACAGCGGGGGTGACGTCGTCCATCTAGCTCTCATAGCCGCCTTTAAAATTCAACCAGGCTTTCTCGCAATGACATTTCTTAGGGGAAAGTGGACGAACCAAGAGAACATCCTGCTGGCCCTGGGGGCAGCATTCTTTCAGATGGCGGCCACCGATTTGAACTTGTCTCTTCCAGGAATTCTCAATGCCACTGCTACAGCTTGGATGCTCCTGAGGGCTGTCACCCAGCCATCCACTTCTGCCATCGTCATGCCTCTGCTTTGTCTGCTGGCTCCTGGCATGAGACTGCTCTACCTGGACACGTATAGAATCACTCTCATCATCGTCGGCATTTGCAGCCTGATAGGGGAGCGCCGTAGGGTGGCCGCAAAGAAGAAAGGGGCGGTATTGCTAGGGTTAGCACTAACATCAACAGGGCAGTTCTCTGCGTCAGTTATGGCGGCTGGGCTCATGGCATGCAATCCCAACAAAAAGCGGGGATGGCCGGCTACAGAAGTTTTGACAGCAGTTGGATTGATGTTTGCCATCGTGGGTGGTCTAGCTGAGTTGGATGTTGATTCCATGTCCATTCCTTTTGTGTTGGCCGGGCTGATGGCAGTTTCTTACACCATTTCAGGCAGATCGACAGACTTGTGGCTTGAGAGAGCAGCTGACATAACATGGGAAACTGATGCAGCCATAACTGGAACCAGCCAACGCCTAGATGTGAAATTGGATGATGATGGTGACTTCCACCTTATCAACGACCCTGGAGTGCCGTGGAAGATATGGGTCATCCGCATGACGGCACTGGGGTTCGCAGCCTGGACACCATGGGCAATAATACCGGCTGGAATAGGCTATTGGCTCACTGTCAAGTACGCAAAAAGAGGAGGTGTCTTTTGGGACACTCCGGCTCCGAGGACCTACCCCAAGGGTGACACTTCACCAGGAGTATACCGTATCATGAGCCGTTACATTCTGGGGACCTACCAGGCTGGAGTGGGCGTCATGTATGAAGGAGTTTTTCACACCCTGTGGCATACCACAAGAGGGGCAGCTATCAGAAGTGGTGAAGGAAGGCTCACTCCCTACTGGGGTAGTGTGAAAGAAGATAGGATCACCTATGGTGGGCCATGGAAGTTTGATAGGAAGTGGAATGGTCTCGATGATGTTCAGCTCATCGTAGTGGCCCCCGGAAAGGCAGCCATAAACATCCAAACCAAACCAGGCATCTTTAAAACGCCACAGGGGGAAATAGGAGCAGTCAGCCTGGACTATCCTGAAGGGACTTCAGGCTCCCCAATACTGGACAAGAATGGTGACATCGTGGGCTTGTACGGGAATGGAGTCATC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| 14,707
|
NC_030701.1
|
Variegated squirrel bornavirus 1
|
Hoffmann,B., Tappe,D., Hoper,D., Herden,C., Boldt,A., Mawrin,C., Niederstrasser,O., Muller,T., Jenckel,M., van der Grinten,E., Lutter,C., Abendroth,B., Teifke,J.P., Cadar,D., Schmidt-Chanasit,J., Ulrich,R.G., Beer,M., Hoeper,D.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2016-08-01
|
squirrel brain
|
Orthobornavirus sciuri
|
Orthobornavirus
|
Bornaviridae
|
ssRNA(-)
| 8,798
|
RefSeq
| 1
| null | null |
Echinosciurus variegatoides
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Variegated squirrel bornavirus 1, complete genome
|
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| 5,524
|
MW234349.1
|
Variegated squirrel bornavirus 1
|
Cadar,D., Allendorf,V., Schulze,V., Ulrich,R.G., Schlottau,K., Ebinger,A., Hoffmann,B., Hoffmann,D., Rubbenstroth,D., Ismer,G., Kibbey,C., Marthaler,A., Rissland,J., Leypoldt,F., Stangel,M., Schmidt-Chanasit,J., Conraths,F.J., Beer,M., Homeier-Bachmann,T., Tappe,D.
|
Friedrich-Loeffler-Institut, Institute of Diagnostic Virology
|
Germany
|
2021-03-23
|
20_011
|
Orthobornavirus sciuri
|
Orthobornavirus
|
Bornaviridae
|
ssRNA(-)
| 8,892
|
GenBank
| 1
|
Germany
|
Germany
|
Callosciurus prevostii
| null |
2019
| null | null |
Variegated squirrel bornavirus 1 isolate 20_011, complete genome
|
CGATCACAACACACAATGAACATTACAATGCCACCCAAAAGACGTCTCCTAGAGGACCCCGACGTGATGGATGATCAAGAGCCCGAACCAACCTCTCCCCCGATGCCCAAACTCCCGGGCAAGTTCCTCCAATACACAGTTGGAGGATCTGACCCGCACCCTGGAATAGGAGAGGAAAAAGATATAAAACACAATGCTGTTGCCCTCCTTGATTCTTCCAGAAGAGATATGTTCCATCCAGTTACTCCAAGTCTTGTATTTTTGTGTTTATTAATCCCTGGATTACACGCTGCGTTTCTTCATGGTGGTGTCCCAAAGGAATCTTATCTGTCCACACCTATATCAAGGGGAGAACAAACGTTTGTAAAGGTTAGCCGATTCTATGGTGAACGAACAGCTTCACGGGAGCTAACTGAGCTGGAAATATCATCCATCTTTAACCATTGCTGCTCCTTGCTCATAGGAATTGTTATTGGGTCGTCGGCTAAAATCAGGGCCGGCGCAGAACAAATAAAGAAGCGCTTCAAAACCTTGATGGCCTCTCTCAACAGGCCATCACACGGGGAAACTGCAACTCTGCTGCAGATGTTCAACCCACATGAGGCAATCGATTGGATTAATGGACAGCCCTGGGTTGGATCATTAGTTCTGTCACTCCTAACAACTGATTTTGAATCTCCAGGGAAAGAGTTTATGGATCAAATTAAGCTTGTTGCCAGTTATGCCCAGATGACAACATATACCACTATAAAAGAATACCTGGCTGAATGTATGGATGCAACATTAATTATCCCTGCCGTGGCTCACGAGATACGTGAGTTTCTTGAGATCTCAGCGAAACTTAAGAATGAGCATGCTGAACTATTCCCATTTCTCGGAGCAATAAGGCACCCTGATGCCATCAAGCTAGCCCCACGTAGTTTTCCAAACCTAGCATCGGCTGCATTTTATTGGAGTAAGAAGGAAAATCCCACGATGGCTGGCTACCGGGCATCCACGATCCAGCCAGGGGCAACAGTTAAAGAGACTCAACTGGCGCGCTATCGCCGACGTGAGGTATCTAGAGGGGAAGACGGAGCGGAGCTTTCAGGTGAGATCTCTGATATTATGAAGATGATTGGAGTGACAGGGCTTGTTTAACAATAATCGAACATAACAATAAAAAATCATAACCACACCGCAAATCTCCGCATGTGGCATGAACTCGGATCTTCAGCTCACACTGCTTGAACTCATCAGACGGCTCAATGGCATCGCGCCCCTCGAGTCTAGTCGAGTCATTGGAGGACGAAGAGAGTCTCCAGACACCACGACGAGTCAGGTCTCGATCACCCCGGCCAAAGAGGATTCCACAAGATGCACTAACACAACCTGTGGACCGCCTTCTCAAGAACATAAAGAAGAACCCCTCCATGATCTCCGACCCAGAACAAAGGACCGGAAGGGAACAGCTGTCGAATGATGAACTCATCAAGCAACTTATCACCGAGCTAGCAGAAAATAGCATGATAGAGGCAGAAGGACTTCGAGGAGCGCTAGATGATATCTCATCAAAGGTTGACTCTGGATTAGAGTCAATCTCATCACTCCAGGTCGAGACACTCCAAACCGTACAGAAGACTGACTACGCTGACAGCATTAAGACCCTAGGAGAAAACATCAAAGTCCTAGATCGATCAATGAAGACAATGATGGAGACCATGCGATTGATGATGGAGAAGATTGATCTATTGTATGCATCAACTGCAATTGGCCAGAGCAACACCCCAATGCTTCCTTCACATCCTGCACAGCCAAGGCTTTACCCCACTCTTCCCAGTGCACCCACAGCCGATGAGTGGGATATACTACCATAAAAAAATCGAATCAAAATGAATTCTAAGCACACATACGTTGAGCTAAAGGACAAGGTAATTGTTCCCGGTTGGCCAACTCTCATGTTAGAAATTGATTTCGTTGGAGGGTCATCCAGAAACCAGTTTCTCAATATACCATTTCTTTCAGTTAAAGAACCACTGCAACTTCCCCGAGAGAAGCGATTGACGGACTACCTGACCATAGATGTTGAGCCTGCCGGGCACTCTCTTGTGAACATTTACTTGCAGATCGACGACTTCCTTGCCTTGACCCTGAACTCAATTTCAGTCTACAAGGAGCCAGTCAAGAAGTTCATGTACATCCGGCTAAACGAGGAACAGAGCAAGCATGCAATCAACGCAGCATTCAATGTCTTTTCCTATCGTCTGCGTAATATTGGGATCGGTCCTCTTGGTCCAGACATTCGAGCTTCGGGGCCTTAGATGCAACACCGACTCAACACCCGCGCTGGTTGATCTTGAGATTCGCCGATTGTGCCATACCCCGTCAGAAAATGTCATTTCATGCGAGGTTAGCTATTATAACCATTCACAGCAAAGCCTAGAAGCTCGACATACATCATGCTATAAATATCATTGTAAAACTTACTGGGGCTTTTTTGGAAGTTATAGTGCCGACAGGTTAGTCAGTCGTTACACTGGGGCATTTAATGTATGTAACAATGGATCGTTTCCGGATGACCCATATGAGTGTAACTGGTACTACTGTTGTTCAGCCTTAACCACAGAGATTTGCCGGTGCTCAATTAATAATGTCACAGTGGCTGTAAGAACGTTTCCCCCATTTATGTATTGCAGCTTTGCTGACTGCAGCACTGTAAGTCAATTAGAACTAACAACAGGGTTCGCAAGTTTAAGTGACGGGAGCGTACTGGAATTTGAGCCATGGAATATATCAAAGGAACTGATTAATGGTACCTTCAACGGCACCATCTTATGCAATTCTTCATCAAAAATAATATCATTCGATGAGTTTAGGCGCTCTTATTCATTAGTTAATGGAACCTATGTGAGTAGCTCTATAAACATTACTTGTTCATCGTATAATGGTACTTGTAGGGCGAAGCCTAGAAAAAAACGTGACCTATCACAAATAGAGTATTTAGTCCACAAATTGAGGCCCACATTGCGAGATGCATGGGAAGATTGTGAGATTCTTCAATCGCTTCTCTTAGGGGTTTTTGGAACTGGAATGGCAAGTGCCTCTCAATTCTTAAGGGAATGGTTAAATCAGACCAACATTGTAGGTTATGTTGTGAACGGAGTCGGGGTTGTTTGGCAGTGTGATTGGGTCAATGTTTCATTTTTGCCGTGGAACGAATCCACTTACTACCCCCCTGTTAACTTCTCAAACAGTAGATTGTACTTAAATGATGAGAGCAGACTTCAGACCAGCACGCCAGAGGCAAGGCCAGGCCTCAAGCGAGTTCTCTGGTTTGGCAGATATTTTCTTGGGACAGTCGGATCAGGAGTCAAACCTAGAAGAATTAGGTATAATAGAACATCACATGATTTTCACCTACAAGACTTTGATGCAAGTCTTAACTTAACACCTTCAATCAATCTAGCAACAGGGCACGAAACAGACCCAATAAATCACGCGTTTGGCACACAAGCCAACCTACTGCCCTATACCAGGTCCAACAACATCACATCAACCGATACTGGGTCTGGGTGGGTACATATTGGGTTGCCATCATTCGCTTTTCTCAACCCCCTTGGATGGCTCAGAGATATCTTTTCTTGGGCAGCATGGATTGGAGGGATACTATACTTAATCACATTATGTATTTCTCTCCCAGCCTCCTTCGCGAGGAGGAGACGCCTCGGCCGGTGGTAGGGATAAACCGAACAGATCAATCACTAAAGAACCCTCTACTTGGAACTGAAGTTGCATTTTGTCTTAACTCAAGTTTAATCCCTCACCATATACGAGCCCGCAGCTATGTTAAACCCAAGAATTTGCCATCTAAGGATTATTACCGCCTCTTCCGCCAAGTCGTTCTTCCATCAGAAATCTACCCACTTGGAGTTCTGATACGTGCTGCGGAAGCTATACTTCAAGTTATCATATCAACTTGGAAGCTTAATCATATGTCAAAACTCATTTCTGCTGCTATACGCTATGCTTTAACTAATCCGGAAATCAGGAGTCAACTTGAGTTACATATTGCTTATCAACGAATCATTAACCAGGTTTCCTACAGTAGAGAGGCTGATGTAGGACCAAAAAGGCTTGGAAATATGACTCTTATGTTTGTTCAATCACTAGTTGTTGCAATGATTGATGACACTAGTTGTTTAATGACATACAATCACTTTCTAGCTGCTGCTGACACCGCCAAAAGTAGATGTCACTTGTTTATCGCTTCTGTTATCCAAGGGGCTCTTTGGGAACAAGGATCATTTCTTGATCATATCCTTGATTTAACACATATAATAGACTCTATAATATTACCTCATGATGATTATTTTCAGATTATCAAGTCTATTTCCCCATACTCCCAAGGTTTAGTAATGGATCAGCATAATGTCACTGTCTCAACAAATTTTAAATCAATCTTTCCGATCCAAGAACTCTGTCCACCACTTGACAACTTACTTAAAAAACTATTATCAATTGACCCAGTGCTTCTTTTGGTAATAACCTCAGTTCAAAAATCATGGTACTTTCCAGAAATAAACATGTGTGACGGTTCTCGCGAACAACTAATGAAGATGCGCTTTGACTCAGAATCGCCTAAGGCCCTGCTATCGTATGGACAGACACTCCTCGCAATGTTCCGGGCTGAGTTCATCAAGGGCTATATCTCCAAGCATGGTAAATGGCCACCTGTTCATTTATTACCTACTTGTAACAGGTCAATAAGAAATGCACGTGAATTGGGAAGGTGGAGTCCATCACTTGATCGGAATTGGCAATGGTTCTCAGAAGTATTGATTCTTAAATTAACAGATCTTGACATGGATCCTGATTTTAATGATATTGTAAGTGATAAAGCAATTATTAATTCACGGGTAGATTGGTCATTTGAGTATAATGCAGCAGCATACCGCCAAAAGTATGGAGAGAAGCTGGAACGACCCTCTGTGAAATCTGGACCATCGAGACTGGTCAATGCC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| 43,413
|
MF597762.1
|
Variegated squirrel bornavirus 1
|
Schlottau,K.
|
Friedrich Loeffler Institut
|
Germany
|
2018-07-04
| null |
Orthobornavirus sciuri
|
Orthobornavirus
|
Bornaviridae
|
ssRNA(-)
| 8,786
|
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
|
Homo sapiens
| null |
2016-01
| null | null |
Variegated squirrel bornavirus 1 strain VSBV-1/BH55/16, complete genome
|
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|
KY488722.1
|
Variegated squirrel bornavirus 1
|
Schlottau,K., Hoffmann,B., Homeier-Bachmann,T., Ulrich,R.G., Beer,M., Hoffmann,D.
|
Friedrich Loeffler Institut
|
Germany
|
2017-05-30
|
BH22/16-38
|
Orthobornavirus sciuri
|
Orthobornavirus
|
Bornaviridae
|
ssRNA(-)
| 8,786
|
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
|
Callosciurus prevostii
| null |
2016
| null | null |
Variegated squirrel bornavirus 1 isolate BH22/16-38, complete genome
|
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Friedrich Loeffler Institut
|
Germany
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2017-05-30
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Orthobornavirus sciuri
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Orthobornavirus
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Germany
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Germany
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Callosciurus prevostii
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2016
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Variegated squirrel bornavirus 1 isolate BH22/16-37, complete genome
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|
KY488724.1
|
Variegated squirrel bornavirus 1
|
Schlottau,K., Hoffmann,B., Homeier-Bachmann,T., Ulrich,R.G., Beer,M., Hoffmann,D.
|
Friedrich Loeffler Institut
|
Germany
|
2017-05-30
|
BH22/16-36
|
Orthobornavirus sciuri
|
Orthobornavirus
|
Bornaviridae
|
ssRNA(-)
| 8,786
|
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
|
Callosciurus prevostii
| null |
2016
| null | null |
Variegated squirrel bornavirus 1 isolate BH22/16-36, complete genome
|
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| 76,319
|
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Variegated squirrel bornavirus 1
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Schlottau,K., Hoffmann,B., Homeier-Bachmann,T., Ulrich,R.G., Beer,M., Hoffmann,D.
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Friedrich Loeffler Institut
|
Germany
|
2017-05-30
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BH22/16-35
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Orthobornavirus sciuri
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Orthobornavirus
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Bornaviridae
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ssRNA(-)
| 8,786
|
GenBank
| null |
Germany
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Germany
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Callosciurus finlaysonii
| null |
2016
| null | null |
Variegated squirrel bornavirus 1 isolate BH22/16-35, complete genome
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Variegated squirrel bornavirus 1
|
Schlottau,K., Hoffmann,B., Homeier-Bachmann,T., Ulrich,R.G., Beer,M., Hoffmann,D.
|
Friedrich Loeffler Institut
|
Germany
|
2017-05-30
|
BH22/16-34
|
Orthobornavirus sciuri
|
Orthobornavirus
|
Bornaviridae
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ssRNA(-)
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|
GenBank
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Germany
|
Germany
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Callosciurus prevostii
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2016
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Variegated squirrel bornavirus 1 isolate BH22/16-34, complete genome
|
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Variegated squirrel bornavirus 1
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Schlottau,K., Hoffmann,B., Homeier-Bachmann,T., Ulrich,R.G., Beer,M., Hoffmann,D.
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Friedrich Loeffler Institut
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Germany
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2017-05-30
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Orthobornavirus sciuri
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Orthobornavirus
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Bornaviridae
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ssRNA(-)
| 8,786
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GenBank
| null |
Germany
|
Germany
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Tamiops swinhoei
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2016
| null | null |
Variegated squirrel bornavirus 1 isolate BH22/16-16, complete genome
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|
KY488728.1
|
Variegated squirrel bornavirus 1
|
Schlottau,K., Hoffmann,B., Homeier-Bachmann,T., Ulrich,R.G., Beer,M., Hoffmann,D.
|
Friedrich Loeffler Institut
|
Germany
|
2017-05-30
|
BH21/16
|
Orthobornavirus sciuri
|
Orthobornavirus
|
Bornaviridae
|
ssRNA(-)
| 8,786
|
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
|
Callosciurus prevostii
| null |
2016
| null | null |
Variegated squirrel bornavirus 1 isolate BH21/16, complete genome
|
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|
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Variegated squirrel bornavirus 1
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Schlottau,K., Hoffmann,B., Homeier-Bachmann,T., Ulrich,R.G., Beer,M., Hoffmann,D.
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Friedrich Loeffler Institut
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Germany
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2017-05-30
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BH12/16
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Orthobornavirus sciuri
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Orthobornavirus
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Bornaviridae
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ssRNA(-)
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GenBank
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Germany
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Germany
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Callosciurus prevostii
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2016
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Variegated squirrel bornavirus 1 isolate BH12/16, complete genome
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Variegated squirrel bornavirus 1
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Schlottau,K., Hoffmann,B., Homeier-Bachmann,T., Ulrich,R.G., Beer,M., Hoffmann,D.
|
Friedrich Loeffler Institut
|
Germany
|
2017-05-28
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Orthobornavirus sciuri
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Orthobornavirus
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Bornaviridae
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GenBank
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Germany
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Germany
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Callosciurus prevostii
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2016
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Friedrich Loeffler Institut
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2017-05-28
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Orthobornavirus
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Callosciurus prevostii
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Variegated squirrel bornavirus 1 isolate VSBV-1/DH6/16, complete genome
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|
Variegated squirrel bornavirus 1
|
Hoeper,D.
|
Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
|
Germany
|
2016-09-30
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BH_122-15-1
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Orthobornavirus sciuri
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Orthobornavirus
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Bornaviridae
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GenBank
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Germany
|
Germany
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Callosciurus prevostii
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2015
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|
Variegated squirrel bornavirus 1 isolate BH_122-15-1 genome assembly, complete genome: monopartite
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|
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|
Germany
|
2016-09-30
|
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Orthobornavirus sciuri
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Orthobornavirus
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Germany
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Variegated squirrel bornavirus 1 isolate BH_48-15-1 genome assembly, complete genome: monopartite
|
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| 79,888
|
LT594383.1
|
Variegated squirrel bornavirus 1
|
Hoeper,D.
|
Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
|
Germany
|
2016-09-30
|
BH_3-16-2
|
Orthobornavirus sciuri
|
Orthobornavirus
|
Bornaviridae
|
ssRNA(-)
| 8,786
|
GenBank
| null |
Netherlands
|
Netherlands
|
Callosciurus prevostii
| null |
2015
|
SAMEA3991708
|
PRJEB14065
|
Variegated squirrel bornavirus 1 isolate BH_3-16-2 genome assembly, complete genome: monopartite
|
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| 79,889
|
LT594384.1
|
Variegated squirrel bornavirus 1
|
Hoeper,D.
|
Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
|
Germany
|
2016-09-30
|
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|
Orthobornavirus sciuri
|
Orthobornavirus
|
Bornaviridae
|
ssRNA(-)
| 8,786
|
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
|
Echinosciurus variegatoides
| null |
2015
|
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|
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|
Variegated squirrel bornavirus 1 isolate BH_49-15-6 genome assembly, complete genome: monopartite
|
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|
LT594385.1
|
Variegated squirrel bornavirus 1
|
Hoeper,D.
|
Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
|
Germany
|
2016-09-30
|
BH_48-15-11
|
Orthobornavirus sciuri
|
Orthobornavirus
|
Bornaviridae
|
ssRNA(-)
| 8,786
|
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
|
Echinosciurus variegatoides
| null |
2015
|
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|
PRJEB14065
|
Variegated squirrel bornavirus 1 isolate BH_48-15-11 genome assembly, complete genome: monopartite
|
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|
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|
Variegated squirrel bornavirus 1
|
Hoeper,D.
|
Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
|
Germany
|
2016-09-30
|
BH_3-16-1
|
Orthobornavirus sciuri
|
Orthobornavirus
|
Bornaviridae
|
ssRNA(-)
| 8,786
|
GenBank
| null |
Netherlands
|
Netherlands
|
Callosciurus prevostii
| null |
2015
|
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|
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|
Variegated squirrel bornavirus 1 isolate BH_3-16-1 genome assembly, complete genome: monopartite
|
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| 79,892
|
LT594387.1
|
Variegated squirrel bornavirus 1
|
Hoeper,D.
|
Friedrich-Loeffler-Institute, Federal Research Institute for Animal Health, Institute of Diagnostic Virology, Suedufer 10, Greifswald - Insel Riems, Mecklenburg - Western Pomerania, 17493
|
Germany
|
2016-09-30
|
BH_122-15-2
|
Orthobornavirus sciuri
|
Orthobornavirus
|
Bornaviridae
|
ssRNA(-)
| 8,786
|
GenBank
| null |
Germany
|
Germany
|
Callosciurus prevostii
| null |
2015
|
SAMEA3991705
|
PRJEB14065
|
Variegated squirrel bornavirus 1 isolate BH_122-15-2 genome assembly, complete genome: monopartite
|
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| 79,893
|
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|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Kinney,R.M., Johnson,B.J., Welch,J.B., Tsuchiya,K.R., Trent,D.W., Kost,C.L., Brown,V.L., Kinney,R.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2023-05-04
|
donkey/Trinidad/1943
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,447
|
RefSeq
| 3
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Venezuelan equine encephalitis virus, complete genome
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| 307
|
NC_001449.1
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Venezuelan equine encephalitis virus
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Kinney,R.M., Tsuchiya,K.R., Sneider,J.M., Trent,D.W., Kinney,R.
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National Center for Biotechnology Information, NIH
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USA
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1993-06-11
| null |
Venezuelan equine encephalitis virus
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Alphavirus
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Togaviridae
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ssRNA(+)
| 11,444
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RefSeq
| 1
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
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Venezuelan equine encephalitis virus, complete genome
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TACGAGCACGCGACCACGATGCCGAGCCAAGCGGGAATCTCGTATAACACCATAGTCAACAGAGCAGGCTACGCGCCACTCCCTATCAGCATAACACCAACAAAGATCAAGCTGATACCCACAGTGAACTTGGAGTACGTCACCTGCCACTACAAAACAGGAATGGATTCACCAGCCATCAAATGCTGCGGATCTCAGGAATGTACTCCAACTAACAGGCCTGATGAACAGTGCAAAGTCTTCACAGGGGTTTACCCGTTCATGTGGGGAGGTGCATATTGCTTTTGCGACACTGAGAATACTCAGGTCAGCAAGGCCTACGTAATGAAATCTGACGACTGCCTTGCGGATCATGCTGAAGCATACAAAGCGCACACAGCCTCAGTGCAGGCGTTCCTCAACATCACAGTGGGGGAACACTCTATTGTGACCACCGTGTATGTGAATGGAGAAACTCCTGTGAACTTCAATGGGGTCAAACTAACTGCAGGTCCACTTTCCACAGCTTGGACACCCTTTGACAGAAAAATCGTGCAGTATGCCGGGGAGATCTATAATTACGATTTTCCTGAGTATGGGGCAGGACAACCAGGAGCATTTGGAGACATACAATCCAGAACAGTCTCAAGCTCAGATCTGTATGCCAATACCAACCTAGTGCTGCAGAGACCCAAAGCAGGAGCGATCCATGTGCCATACACTCAGGCACCATCGGGTTTTGAGCAATGGAAGAAAGATAAAGCTCCGTCATTGAAATTCACCGCCCCTTTCGGATGCGAAATATATACAAACCCCATTCGCGCCGAAAATTGTGCTGTAGGGTCAATTCCATTAGCCTTTGACATTCCCGACGCCTTGTTCACCAGGGTGTCAGAAACACCGACACTTTCAGCGGCCGAATGCACTCTTAACGAGTGCGTGTATTCATCCGACTTTGGCGGGATCGCCACGGTCAAGTATTCGGCCAGCAAGTCAGGCAAGTGCGCAGTCCATGTGCCATCAGGGACTGCTACCCTAAAAGAAGCAGCAGTCGAGCTAACCGAGCAAGGGTCGGCGACCATTCATTTCTCGACCGCAAATATCCACCCGGAGTTCAGGCTCCAAATATGCACATCATATGTCACGTGCAAAGGTGATTGTCACCCCCCGAAAGACCACATTGTGACACACCCCCAGTATCACGCCCAAACATTTACAGCCGCGGTGTCAAAAACCGCGTGGACGTGGTTAACATCCCTGCTGGGAGGATCGGCCGTAATTATTATAATTGGCTTAGTGCTGGCTACTATTGTGGCCATGTACGTGCTGACCAACCAGAAACATAATTGAACATAGCAGCAATTGGCAAGCTGCTTATATAGAACTTGCGGCGATTGGCATGCCGCTTTAAAATTTTATTTTATTTTCTTTTCTTTTCCGAATCGGATTTTGTTTTTAATATTTC
| 9,022
|
OR644785.1
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Carrera,J.-P., Arauz,D., Rojas,A., Cardozo,F., Stittleburg,V., Claro,I.M., Galue,Jf., Lezcano-Coba,C., Moreira,F.R.R., Felipe-Rivera,L., Chen-German,M., Moreno,B., Capitan-Barrios,Z., Lopez-Verges,S., Pascale,J.M., Sabino,E.C., Valderrama,A., Hanley,K.A., Donnelly,C.A., Vasilakis,N., Faria,N.R., Waggoner,J.J.
|
Imperial College London, School of Public Health
|
United Kingdom
|
2023-11-11
|
258379/Panama/2015
|
Venezuelan equine encephalitis virus
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Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,442
|
GenBank
| null |
Panama: Darien, Pinogana
|
Panama
|
Homo sapiens
| null |
2015
| null | null |
Venezuelan equine encephalitis virus isolate 258379/Panama/2015, complete genome
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ATGGGCGGCGCATGAGAGAAGCCCAAACCAATTACCTACCCAAAATGGAGAAAGTTCACGTTGACATCGAGGAAGACAGCCCATTCCTCAGAGCTTTGCAACGGAGCTTCCCGCAGTTTGAGGTAGAAGCCAAGCAGGTCACTGATAATGACCATGCTAATGCCAGAGCGTTTTCGCATCTGGCTTCAAAACTGATCGAAACGGAGGTGGACCCATCCGACACGATCCTTGACATTGGAAGTGCGCCCGCCCGCAGAATGTATTCTAAGCATAAGTACCATTGCATCTGTCCGATGAGATGTGCAGAAGATCCGGACAGATTGTACAAGTACGCAACTAAGCTGAAGAAAAACTGCAAGGAAATAACTGACAAGGAACTGGACAAGAAAATGAAGGAGCTCGCTGCCGTCATGAGCGACCCTGACCTGGAAACTGAAACTATGTGCCTCCACGACGACGAGTCGTGTCGCTATGAAGGGCAAGTCGCCGTTTACCAGGATGTATACGCGGTTGACGGACCGACAAGTCTCTACCATCAAGCCAACAAGGGAGTTAGAGTCGCCTACTGGATAGGCTTTGACACCACCCCTTTTATGTTCAAGAACTTGGCTGGAGCTTATCCATCATACTCTACCAACTGGGCCGACGAAACCGTGTTAACGGCTCGTAACATAGGCCTGTGCAGCTCCGACGTTATGGAGCGGTCACGTAGAGGGATGTCCATTCTTAGAAAGAAGTATCTGAAACCATCCAACAACGTCCTATTCTCCGTTGGCTCAACCATCTACCATGAGAAGAGGGACCTATTGAGGAGCTGGCACCTGCCGTCTGTATTTCACTTACGTGGCAAGCAAAATTACACATGTCGGTGTGAGACTATAGTTAGTTGCGACGGGTACGTCGTTAAAAGAATAGCTATTAGTCCAGGCCTGTATGGGAAGCCTTCAGGCTATGCTGCTACGATGCACCGCGAGGGATTCTTGTGCTGCAAAGTGACAGACACATTGAACGGGGAGAGGGTCTCTTTTCCCGTGTGCACGTATGTGCCAGCTACACTGTGCGACCAAATGACTGGCATACTGGCAACAGATGTCAGTGCAGACGACGCACAAAAACTGCTGGTTGGGCTCAACCAGCGTATAGTCGTCAACGGTCGCACCCAAAGAAACACCAATACCATGAAGAATTACCTTTTGCCAGTAGTGGCCCGGGCATTTGCTAGGTGGGCAAAGGAATATAAGGAAGATCAAGAAGATGAGAGGCCACTCGGACTACGAGACAGACAGTTAGTCATGGGGTGCTGTTGGGCTTTTAGAAGGCACAAGATAACATCTATTTACAAACGCCCGGACACCCAAACCATCATCAAAGTGAACAGCGATTTCCACTCATTTGTGCTGCCCAGAATAGGCAGTAACACGTTGGAGATCGGGCTGAGGACAAGAATCAGGAAAATGTTAGAAGAGCATAAGGAGCCGTCACCTCTCATTACTGCCGAGGATATACAAGAAGCTAAGTGCGCAGCCGATGAGGCTAAGGAGGTACGCGAAGCCGAGGAGTTGCGTGCAGCACTACCACCTTTGGCAGCCGATGTTGAGGAGCCCACTTTGGAAGCCGACGTCGACTTGATGTTGCAAGAGGCTGGGGCCGGCTCAGTGGAGACACCGCGTGGCTTGATAAAGGTTACAAGCTACGCCGGCGAGGATAAGATAGGCTCCTATGCAGTGCTCTCCCCGCAGGCTGTACTCAAGAGTGAAAAACTATCTTGTATCCACCCCCTCGCTGAACAAGTCATAGTGATAACACACTCTGGCCGAAAAGGGCGTTACGCCGTGGAACCCTATCATGGGAAAGTAGTCGTGCCAGAGGGACATGCAATACCCGTCCAGGACTTTCAAGCTCTGAGTGAAAGTGCTACCATCGTGTATAACGAGCGAGAGTTCGTAAACAGGTACCTGCACCATATTGCCACACACGGAGGAGCGCTGAACACAGACGAAGAATATTATAAAACTGTTAAGCCCAGTGAGCACGACGGCGAATACCTGTATGACATCGACAGGAAGCAGTGCGTCAAGAAAGAACTAGTCACTGGGCTAGGGCTCACCGGCGAACTGGTGGATCCTCCCTTCCATGAATTTGCCTACGAGAGTCTGAGAACACGACCTGCCGCTCCCTACCAAGTACCAACCATAGGGGTGTACGGCGTGCCAGGATCAGGCAAGTCTGGCATCATTAAAAGCGCGGTCACCAAAAAAGACCTGGTGGTGAGCGCCAAGAAAGAAAACTGCGCAGAAATAATAAGGGACGTCAAGAAAATAAAAGGGTTGGACGTCAATGCCAGGACTGTGGACTCGGTGCTCCTGAATGGATGCAAACACCCCGTAGAGACCCTGTATATTGACGAAGCTTTTGCTTGTCATGCAGGCACTCTTAGAGCGCTCATAGCCATCATAAGACCTAAAAAGGCAGTGCTCTGCGGGGATCCAAAACAGTGCGGCTTTTTCAACATGATGTGCCTGAAAGTGCACTTTAACCACGAGATTTGCACGCAAGTCTTCCACAAAAGCATTTCTCGTCGCTGCACTAAATCTGTGACTTCGGTCGTCTCAACTTTGTTTTACGACAAAAAGATGAGGACGACTAACCCGAAAGAGACTAAGATTGAGATTGACACTACCGGCAGTACCAAACCCAAGCAGGACGATCTCATTCTCACTTGTTTCAGAGGGTGGGTGAAGCAGTTGCAAATAGATTACAAAGGCAACGAAATAATGACGGCAGCTGCCTCCCAAGGGCTGACCCGTAAAGGCGTGTATGCCGTTCGGTACAAGGTGAATGAAAACCCTCTGTACGCACCCACCTCAGAACATGTGAACGTCCTGCTGACCCGCACGGAGGACCGCATCGTGTGGAAAACATTAGCCGGTGACCCATGGATAAAAACATTGACGGCCAAGTATCCTGGGAATTTCACTGCCACGATAGAAGAATGGCAAGCAGAGCATGACGCCATCATGAGGCACATCTTGGAGAAACCGGACCCCACCGACGTCTTCCAAAACAAGGCGAACGTGTGCTGGGCCAAGGCTCTGGTGCCGGTACTGAAGACTGCAGGTATAGACATGACCACTGAACAATGGAACACTGTGGATTACTTTGAGACGGACAAAGCTCACTCAGCAGAGATAGTATTGAACCAACTATGCGTGAGGTTCTTTGGACTCGACCTGGACTCCGGTCTTTTCTCTGCACCCACAGTTCCGTTATCCATTAGGAACAATCACTGGGATAATTCCCCGTCGCCTAACATGTACGGGCTGAATAAGGAAGTGGTCCGTCAGCTCTCCCGCAGGTACCCACAACTGCCTCGTGCAGTTACCACTGGAAGAGTTTATGACATGAATACTGGCACCTTGCGCAATTATGATCCGCGCATAAACCTAGTACCTGTGAACAGAAGACTGCCTCACGCTCTAGTCCTCCACCATAATGAACACCCACAGAGTGACTTTTCTTTATTCGTCAGCAAATTGAAGGGCAGAACTGTCCTGGTGGTCGGGGAGAAGCTGTCCGTCCCGGGCAAAACAGTTGATTGGCTGTCAGATCGGCCTGAGGCTACCTTCAGAGCTCGGCTGGATCTAGGCATCCCGAGTGACGTGCCCAAATATGACATAATATTCATTAATGTAAGGACTCCATATAAATACCATCACTACCAGCAGTGTGAAGACCATGCCATTAAGCTTAGCATGTTGACCAAGAAAGCTTGTCTGCATCTGAATCCCGGCGGAACCTGTGTCAGCATAGGTTACGGTTATGCCGACAGGGCCAGTGAAAGCATCATCGGCGCTATAGCTCGGCAGTTCAAGTTCTCCCGGGTATGTAAGCCGAAATCCTCACTTGAAGAGACAGAGGTTCTGTTTGTATTCATTGGGTACGATCGCAAGGCCCGTACGCACAATCCTTACAAGCTTTCATCCACCTTGACCAACATCTATACAGGTTCCAGACTCCATGAAGCCGGATGCGCACCCTCATATCACGTGGTGCGAGGGGACATTGCCACGGCCACCGAAGGAGTGATCATAAATGCTGCTAACAGCAAGGGACAACCTGGCGGAGGGGTGTGCGGAGCGCTGTACAAAAAATTTCCGGAAAGCTTCGATTTACAGCCAATCGAAGTGGGAAAAGCGCGACTGGTCAAAGGCGCAGCTAAACATATTATTCATGCTGTAGGGCCCAACTTCAATAAAGTATCGGAAATTGAAGGTGACAAACAGTTGGCAGAGGCTTATGAGTCTATCGCTAAGATTGTCAACGACAACCATTACAAGTCAGTAGCGATTCCACTGTTGTCCACCGGCATCTTTTCCGGGAACAAAGATCGACTAACTCAATCATTGAATCATTTGCTGACAGCTCTAGACACCACCGATGCAGATGTAGCCATATACTGCAGGGACAAGAAATGGGAAATGACTCTCAAGGAAGCAGTGGCTAGGAGAGAAGCTGTGGAGGAGATATGCATATCCGATGATTCATCGGTGACAGAACCGGATGCGGAGCTGGTGAGAGTGCATCCGAAGAGTTCTTTGGCAGGAAGGAAGGGCTATAGCACAAGTGATGGCAAGACTTTCTCGTATTTGGAAGGGACTAAATTCCACCAGGCGGCCAAGGATATAGCGGAAATTAATGCCATGTGGCCCGTCGCAACGGAGGCCAATGAGCAAGTATGCATGTATATCCTCGGAGAAAGTATGAGCAGCATCAGGTCGAAATGCCCCGTCGAAGAGTCGGAAGCTTCCACACCGCCTAGTACGCTGCCTTGCTTGTGCATCCACGCTATGACTCCAGAAAGAGTACAGCGCCTGAAAGCGTCACGCCCAGAACAAATTACTGTGTGCTCATCCTTTCCATTGCCGAAGTACAGAATCACTGGTGTGCAGAAGATCCAGTGCTCCCAGCCTATACTGTTTTCACCTAAAGTGCCTGCATAC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TACGAGCACGCGACCACGATGCCGAGCCAAGCGGGAATCTCGTATAACACCATAGTCAACAGAGCAGGCTACGCGCCACTCCCTATCAGCATAACACCAACAAAGATCAAGCTGATACCTACAGTGAACTTGGAGTACGTTACCTGCCACTACAAAACAGGAATGGATTCACCAGCCATTAAATGCTGCGGATCGCAGGAATGCACACCAACTTACAGGCCTGATGAACAATGCAAAGTCTTTACAGGGGTTTACCCGTTCATGTGGGGAGGGGCATATTGCTTTTGCGACACTGAAAATACCCAAGTCAGCAAGGCTTATGTAATGAAATCTGACGACTGCCTTGCGGATCATGCAGAAGCATACAAAGCGCACACAGCCTCAGTGCAGGCATTCCTCAACATCACAGTGGGTGAACATTCCATCGTGACCACCGTGTATGTGAATGGAGAAACTCCTGTGAACTTTAATGGGGTTAAATTAACTGCAGGCCCACTTTCCACAGCATGGACACCCTTTGACCGCAAAATTGTGCAGTATGCCGGGGAGATCTACAATTATGATTTTCCTGAGTATGGAGCAGGACAGCCAGGAGCATTCGGAGACATACAATCCAGAACAGTTTCAAGCTCAGATCTGTACGCCAACACCAACCTAGTGCTGCAGAGACCCAAAGCAGGAGCGATCCATGTGTCATACACGCAGGCACCATCGGGTTTTGAGCAATGGAAGAAAGATAAGGCCCCATCATTGAAATTTACAGCCCCTTTTGGATGTGAAATATATACAAACCCCATTCGCGCCGAAAATTGTGCTGTGGGGTCAATTCCATTAGCCTTTGACATCCCTGACGCCTTGTTCACCAGGGTGTCAGAAACACCGACACTTTCAGCGGCCGAATGCACTCTTAATGAGTGCGTATATTCATCCGACTTTGGCGGGATCGCCACGGTCAAGTATTCGGCCAGCAAGTCAGGCAAATGTGCAGTCCATGTGCCATCAGGGACAGCCACCCTAAAAGAAGCAGCAGTCGAGTTAACCGAGCAAGGGTCGGCGACTATTCATTTCTCGACTGCAAACATCCACCCGGAGTTCAGGCTCCAAATATGCACATCATACGTTACGTGCAAAGGTGATTGTCNNCCCCCGAAAGATCATATTGTGACACACCCCCAGTATCACGCCCAAACATTTACAGCCGCGGTGTCAAAAACCGCGTGGACGTGGTTAACATCCCTGCTGGGAGGATCAGCCGTAATTATTATAATTGGCTTAGTGCTGGCTACTATTGTGGCCATGTACGTGCTGACCAACCAGAAACATAATTGAACATAGCAGAAATCGGCAAGCTGCTCATATAGAATTCGCGGCTATTGGCATGCCGCTTTAAAATTTTATTTTATTTTCTTTTCTTTTCCGAATCGGATTTTGTTTTTAATATT
| 11,116
|
MZ399798.1
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Haese,N.N., May,N.A., Taft-Benz,S., Moukha-Chafiq,O., Madadi,N., Zhang,S., Karyakarte,S.D., Rodzinak,K.J., Nguyen,T.H., Denton,M., Streblow,A.D., Towers,N.A., Rasmussen,L., Bostwick,R.J., Maddry,J.A., Ananthan,S., Augelli-Szafran,C.E., Suto,M.J., Sanders,W., Moorman,N., DeFilippis,V., Heise,M.T., Pathak,A.K., Streblow,D.N., Morrison,T.E., Bostwick,R.
|
University of North Carolina, Chapel Hill, Department of Microbiology and Immunology
|
USA
|
2021-06-30
| null |
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,446
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2017-06-19
| null | null |
Venezuelan equine encephalitis virus strain TC-83, complete genome
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ATAGGCGGCGCATGAGAGAAGCCCAGACCAATTACCTACCCAAAATGGAGAAAGTTCACGTTGACATCGAGGAAGACAGCCCATTCCTCAGAGCTTTGCAGCGGAGCTTCCCGCAGTTTGAGGTAGAAGCCAAGCAGGTCACTGATAATGACCATGCTAATGCCAGAGCGTTTTCGCATCTGGCTTCAAAACTGATCGAAACGGAGGTGGACCCATCCGACACGATCCTTGACATTGGAAGTGCGCCCGCCCGCAGAATGTATTCTAAGCACAAGTATCATTGTATCTGTCCGATGAGATGTGCGGAAGATCCGGACAGATTGTATAAGTATGCAACTAAGCTGAAGAAAAACTGTAAGGAAATAACTGATAAGGAATTGGACAAGAAAATGAAGGAGCTGGCCGCCGTCATGAGCGACCCTGACCTGGAAACTGAGACTATGTGCCTCCACGACGACGAGTCGTGTCGCTACGAAGGGCAAGTCGCTGTTTACCAGGATGTATACGCGGTTGACGGACCGACAAGTCTCTATCACCAAGCCAATAAGGGAGTTAGAGTCGCCTACTGGATAGGCTTTGACACCACCCCTTTTATGTTTAAGAACTTGGCTGGAGCATATCCATCATACTCTACCAACTGGGCCGACGAAACCGTGTTAACGGCTCGTAACATAGGCCTATGCAGCTCTGACGTTATGGAGCGGTCACGTAGAGGGATGTCCATTCTTAGAAAGAAGTATTTGAAACCATCCAACAATGTTCTATTCTCTGTTGGCTCGACCATCTACCACGAGAAGAGGGACTTACTGAGGAGCTGGCACCTGCCGTCTGTATTTCACTTACGTGGCAAGCAAAATTACACATGTCGGTGTGAGACTATAGTTAGTTGCGACGGGTACGTCGTTAAAAGAATAGCTATCAGTCCAGGCCTGTATGGGAAGCCTTCAGGCTATGCTGCTACGATGCACCGCGAGGGATTCTTGTGCTGCAAAGTGACAGACACATTGAACGGGGAGAGGGTCTCTTTTCCCGTGTGCACGTATGTGCCAGCTACATTGTGTGACCAAATGACTGGCATACTGGCAACAGATGTCAGTGCGGACGACGCGCAAAAACTGCTGGTTGGGCTCAACCAGCGTATAGTCGTCAACGGTCGCACCCAGAGAAACACCAATACCATGAAAAATTACCTTTTGCCCGTAGTGGCCCAGGCATTTGCTAGGTGGGCAAAGGAATATAAGGAAGATCAAGAAGATGAAAGGCCACTAGGACTACGAGATAGACAGTTAGTCATGGGGTGTTGTTGGGCTTTTAGAAGGCACAAGATAACATCTATTTATAAGCGCCCGGATACCCAAACCATCATCAAAGTGAACAGCGATTTCCACTCATTCGTGCTGCCCAGGATAGGCAGTAACACATTGGAGATCGGGCTGAGAACAAGAATCAGGAAAATGTTAGAGGAGCACAAGGAGCCGTCACCTCTCATTACCGCCGAGGACGTACAAGAAGCTAAGTGCGCAGCCGATGAGGCTAAGGAGGTGCGTGAAGCCGAGGAGTTGCGCGCAGCTCTACCACCTTTGGCAGCTGATGTTGAGGAGCCCACTCTGGGAGCAGACGTCGACTTGATGTTACAAGAGGCTGGGGCCGGCTCAGTGGAGACACCTCGTGGCTTGATAAAGGTTACCAGCTACGATGGCGAGGACAAGATCGGCTCTTACGCTGTGCTTTCTCCGCAGGCTGTACTCAAGAGTGAAAAATTATCTTGCATCCACCCTCTCGCTGAACAAGTCATAGTGATAACACACTCTGGCCGAAAAGGGCGTTATGCCGTGGAACCATACCATGGTAAAGTAGTGGTGCCAGAGGGACATGCAATACCCGTCCAGGACTTTCAAGCTCTGAGTGAAAGTGCCACCATTGTGTACAACGAACGTGAGTTCGTAAACAGGTACCTGCACCATATTGCCACACATGGAGGAGCGCTGAACACTGATGAAGAATATTACAAAACTGTCAAGCCCAGCGAGCACGACGGCGAATACCTGTACGACATCGACAGGAAACAGTGCGTCAAGAAAGAACTAGTCACTGGGCTAGGGCTCACAGGCGAGCTGGTGGATCCTCCCTTCCATGAATTCGCCTACGAGAGTCTGAGAACACGACCAGCCGCTCCTTACCAAGTACCAACCATAGGGGTGTATGGCGTGCCAGGATCAGGCAAGTCTGGCATCATTAAAAGCGCAGTCACCAAAAAAGATCTAGTGGTGAGCGCCAAGAAAGAAAACTGTGCAGAAATTATAAGGGACGTCAAGAAAATGAAAGGGCTGGACGTCAATGCCAGAACTGTGGACTCAGTGCTCTTGAATGGATGCAAACACCCCGTAGAGACCCTGTATATTGACGAAGCTTTTGCTTGTCATGCAGGTACTCTCAGAGCGCTCATAGCCATTATAAGACCTAAAAAGGCAGTGCTCTGCGGGGATCCCAAACAGTGCGGTTTTTTTAACATGATGTGCCTGAAAGTGCATTTTAACCACGAGATTTGCACACAAGTCTTCCACAAAAGCATCTCTCGCCGTTGCACTAAATCTGTGACTTCGGTCGTCTCAACCTTGTTTTACGACAAAAAAATGAGAACGACGAATCCGAAAGAGACTAAGATTGTGATTGACACTACCGGCAGTACCAAACCTAAGCAGGACGATCTCATTCTCACTTGTTTCAGAGGGTGGGTGAAGCAGTTGCAAATAGATTACAAAGGCAACGAAATAATGACGGCAGCTGCCTCTCAAGGGCTGACCCGTAAAGGTGTGTATGCCGTTCGGTACAAGGTGAATGAAAATCCTCTGTACGCACCCACCTCAGAACATGTGAACGTCCTACTGACCCGCACGGAGGACCGCATCGTGTGGAAAACACTAGCCGGCGACCCATGGATAAAAACACTGACTGCCAAGTACCCTGGGAATTTCACTGCCACGATAGAGGAGTGGCAAGCAGAGCATGATGCCATCATGAGGCACATCTTGGAGAGACCGGACCCTACCGACGTCTTCCAGAATAAGGCAAACGTGTGTTGGGCCAAGGCTTTAGTGCCGGTGCTGAAGACCGCTGGCATAGACATGACCACTGAACAATGGAACACTGTGGATTATTTTGAAACGGACAAAGCTCACTCAGCAGAGATAGTATTGAACCAACTATGCGTGAGGTTCTTTGGACTCGATCTGGACTCCGGTCTATTTTCTGCACCCACTGTTCCGTTATCCATTAGGAATAATCACTGGGATAACTCCCCGTCGCCTAACATGTACGGGCTGAATAAAGAAGTGGTCCGTCAGCTCTCTCGCAGGTACCCACAACTGCCTCGGGCAGTTGCCACTGGAAGAGTCTATGACATGAACACTGGTACACTGCGCAATTATGATCCGCGCATAAACCTAGTACCTGTAAACAGAAGACTGCCTCATGCTTTAGTCCTCCACCATAATGAACACCCACAGAGTGACTTTTCTTCATTCGTCAGCAAATTGAAGGGCAGAACTGTCCTGGTGGTCGGGGAAAAGTTGTCCGTCCCAGGCAAAATGGTTGACTGGTTGTCAGACCGGCCTGAGGCTACCTTCAGAGCTCGGCTGGATTTAGGCATCCCAGGTGATGTGCCCAAATATGACATAATATTTGTTAATGTGAGGACCCCATATAAATACCATCACTATCAGCAGTGTGAAGACCATGCCATTAAGCTTAGCATGTTGACCAAGAAAGCTTGTCTGCATCTGAATCCCGGCGGAACCTGTGTCAGCATAGGTTATGGTTACGCTGACAGGGCCAGCGAAAGCATCATTGGTGCTATAGCGCGGCAGTTCAAGTTTTCCCGGGTATGCAAACCGAAATCCTCACTTGAAGAGACGGAAGTTCTGTTTGTATTCATTGGGTACGATCGCAAGGCCCGTACGCACAATCCTTACAAGCTTTCATCAACCTTGACCAACATTTATACAGGTTCCAGACTCCACGAAGCCGGATGTGCACCCTCATATCATGTGGTGCGAGGGGATATTGCCACGGCCACCGAAGGAGTGATTATAAATGCTGCTAACAGCAAAGGACAACCTGGCGGAGGGGTGTGCGGAGCGCTGTATAAGAAATTCCCGGAAAGCTTCGATTTACAGCCGATCGAAGTAGGAAAAGCGCGACTGGTCAAAGGTGCAGCTAAACATATCATTCATGCCGTAGGACCAAACTTCAACAAAGTTTCGGAGGTTGAAGGTGACAAACAGTTGGCAGAGGCTTATGAGTCCATCGCTAAGATTGTCAACGATAACAATTACAAGTCAGTAGCGATTCCACTGTTGTCCACCGGCATCTTTTCCGGGAACAAAGATCGACTAACCCAATCATTGAACCATTTGCTGACAGCTTTAGACACCACTGATGCAGATGTAGCCATATACTGCAGGGACAAGAAATGGGAAATGACTCTCAAGGAAGCAGTGGCTAGGAGAGAAGCAGTGGAGGAGATATGCATATCCGACGACTCTTCAGTGACAGAACCTGATGCAGAGCTGGTGAGGGTGCATCCGAAGAGTTCTTTGGCTGGAAGGAAGGGCTACAGCACAAGCGATGGCAAAACTTTCTCATATTTGGAAGGGACCAAGTTTCACCAGGCGGCCAAGGATATAGCAGAAATTAATGCCATGTGGCCCGTTGCAACGGAGGCCAATGAGCAGGTATGCATGTATATCCTCGGAGAAAGCATGAGCAGTATTAGGTCGAAATGCCCCGTCGAAGAGTCGGAAGCCTCCACACCACCTAGCACGCTGCCTTGCTTGTGCATCCATGCCATGACTCCAGAAAGAGTACAGCGCCTAAAAGCCTCACGTCCAGAACAAATTACTGTGTGCTCATCCTTTCCATTGCCGAAGTATAGAATCACTGGTGTGCAGAAGATCCAATGCTCCCAGCCTATATTGTTCTCACCGAAAGTGCCTGCGTAT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TACGAGCACGCGACCACGATGCCGAGCCAAGCGGGAATCTCGTATAACACTATAGTCAACAGAGCAGGCTACGCACCACTCCCTATCAGCATAACACCAACAAAGATCAAGCTGATACCTACAGTGAACTTGGAGTACGTCACCTGCCACTACAAAACAGGAATGGATTCACCAGCCATCAAATGCTGCGGATCTCAGGAATGCACTCCAACTTACAGGCCTGATGAACAGTGCAAAGTCTTCACAGGGGTTTACCCGTTCATGTGGGGTGGTGCATATTGCTTTTGCGACACTGAGAACACCCAAGTCAGCAAGGCCTACGTAATGAAATCTGACGACTGCCTTGCGGATCATGCTGAAGCATATAAAGCGCACACAGCCTCAGTGCAGGCGTTCCTCAACATCACAGTGGGAGAACACTCTATTGTGACTACCGTGTATGTGAATGGAGAAACTCCTGTGAATTTCAATGGGGTCAAAATAACTGCAGGTCCGCTTTCCACAGCTTGGACACCCTTTGATCGCAAAATCGTGCAGTATGCCGGGGAGATCTATAATTATGATTTTCCTGAGTATGGGGCAGGACAACCAGGAGCATTTGGAGATATACAATCCAGAACAGTCTCAAGCTCTGATCTGTATGCCAATACCAACCTAGTGCTGCAGAGACCCAAAGCAGGAGCGATCCACGTGCCATACACTCAGGCACCTTCGGGTTTTGAGCAATGGAAGAAAGATAAAGCTCCATCATTGAAATTTACCGCCCCTTTCGGATGCGAAATATATACAAACCCCATTCGCGCCGAAAACTGTGCTGTAGGGTCAATTCCATTAGCCTTTGACATTCCCGACGCCTTGTTCACCAGGGTGTCAGAAACACCGACACTTTCAGCGGCCGAGTGCACTCTTAACGAGTGCGTGTATTCTTCCGACTTTGGTGGGATCGCCACGGTCAAGTACTCGGCCAGCAAGTCAGGCAAGTGCGCAGTCCATGTGCCATCAGGGACTGCTACCCTAAAAGAAGCAGCAGTCGAGCTAACCGAGCAAGGGTCGGCGACTATCCATTTCTCGACCGCAAATATCCACCCGGAGTTCAGGCTCCAAATATGCACATCATATGTTACGTGCAAAGGTGATTGTCACCCCCCGAAAGACCATATTGTGACACACCCTCAGTATCACGCCCAAACATTTACAGCCGCGGTGTCAAAAACCGCGTGGACGTGGTTAACATCCCTGCTGGGAGGATCAGCCGTAATTATTATAATTGGCTTGGTGCTGGCTACTATTGTGGCCATGTACGTGCTGACCAACCAGAAACATAATTGAATACAGCAGCAATTGGCAAGCTGCTTACATAGAACTCGCGGCGATTGGCATGCCGCCTTAAAATTTTTATTTTATTTTTCTTTTCTTTTCCGAATCGGATTTTGTTTTTAATATTTC
| 40,891
|
MZ399799.1
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Haese,N.N., May,N.A., Taft-Benz,S., Moukha-Chafiq,O., Madadi,N., Zhang,S., Karyakarte,S.D., Rodzinak,K.J., Nguyen,T.H., Denton,M., Streblow,A.D., Towers,N.A., Rasmussen,L., Bostwick,R.J., Maddry,J.A., Ananthan,S., Augelli-Szafran,C.E., Suto,M.J., Sanders,W., Moorman,N., DeFilippis,V., Heise,M.T., Pathak,A.K., Streblow,D.N., Morrison,T.E., Bostwick,R.
|
University of North Carolina, Chapel Hill, Department of Microbiology and Immunology
|
USA
|
2021-06-30
| null |
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,446
|
GenBank
| 1
|
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2017-06-19
| null | null |
Venezuelan equine encephalitis virus strain TC-83, complete genome
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ATAGGCGGCGCATGAGAGAAGCCCAGACCAATTACCTACCCAAAATGGAGAAAGTTCACGTTGACATCGAGGAAGACAGCCCATTCCTCAGAGCTTTGCAGCGGAGCTTCCCGCAGTTTGAGGTAGAAGCCAAGCAGGTCACTGATAATGACCATGCTAATGCCAGAGCGTTTTCGCATCTGGCTTCAAAACTGATCGAAACGGAGGTGGACCCATCCGACACGATCCTTGACATTGGAAGTGCGCCCGCCCGCAGAATGTATTCTAAGCACAAGTATCATTGTATCTGTCCGATGAGATGTGCGGAAGATCCGGACAGATTGTATAAGTATGCAACTAAGCTGAAGAAAAACTGTAAGGAAATAACTGATAAGGAATTGGACAAGAAAATGAAGGAGCTGGCCGCCGTCATGAGCGACCCTGACCTGGAAACTGAGACTATGTGCCTCCACGACGACGAGTCGTGTCGCTACGAAGGGCAAGTCGCTGTTTACCAGGATGTATACGCGGTTGACGGACCGACAAGTCTCTATCACCAAGCCAATAAGGGAGTTAGAGTCGCCTACTGGATAGGCTTTGACACCACCCCTTTTATGTTTAAGAACTTGGCTGGAGCATATCCATCATACTCTACCAACTGGGCCGACGAAACCGTGTTAACGGCTCGTAACATAGGCCTATGCAGCTCTGACGTTATGGAGCGGTCACGTAGAGGGATGTCCATTCTTAGAAAGAAGTATTTGAAACCATCCAACAATGTTCTATTCTCTGTTGGCTCGACCATCTACCACGAGAAGAGGGACTTACTGAGGAGCTGGCACCTGCCGTCTGTATTTCACTTACGTGGCAAGCAAAATTACACATGTCGGTGTGAGACTATAGTTAGTTGCGACGGGTACGTCGTTAAAAGAATAGCTATCAGTCCAGGCCTGTATGGGAAGCCTTCAGGCTATGCTGCTACGATGCACCGCGAGGGATTCTTGTGCTGCAAAGTGACAGACACATTGAACGGGGAGAGGGTCTCTTTTCCCGTGTGCACGTATGTGCCAGCTACATTGTGTGACCAAATGACTGGCATACTGGCAACAGATGTCAGTGCGGACGACGCGCAAAAACTGCTGGTTGGGCTCAACCAGCGTATAGTCGTCAACGGTCGCACCCAGAGAAACACCAATACCATGAAAAATTACCTTTTGCCCGTAGTGGCCCAGGCATTTKCTAGGTGGGCAAAGGAATATAAGGAAGATCAAGAAGATGAAAGGCCACTAGGACTACGAGATAGACAGTTAGTCATGGGGTGTTGTTGGGCTTTTAGAAGGCACAAGATAACATCTATTTATAAGCGCCCGGATACCCAAACCATCATCAAAGTGAACAGCGATTTCCACTCATTCGTGCTGCCCAGGATAGGCAGTAACACATTGGAGATCGGGCTGAGAACAAGAATCAGGAAAATGTTAGAGGAGCACAAGGAGCCGTCACCTCTCATTACCGCCGAGGACGTACAAGAAGCTAAGTGCGCAGCCGATGAGGCTAAGGAGGTGCGTGAAGCCGAGGAGTTGCGCGCAGCTCTACCACCTTTGGCAGCTGATGTTGAGGAGCCCACTCTGGGAGCAGACGTCGACTTGATGTTACAAGAGGCTGGGGCCGGCTCAGTGGAGACACCTCGTGGCTTGATAAAGGTTACCAGCTACGATGGCGAGGACAAGATCGGCTCTTACGCTGTGCTTTCTCCGCAGGCTGTACTCAAGAGTGAAAAATTATCTTGCATCCACCCTCTCGCTGAACAAGTCATAGTGATAACACACTCTGGCCGAAAAGGGCGTTATGCCGTGGAACCATACCATGGTAAAGTAGTGGTGCCAGAGGGACATGCAATACCCGTCCAGGACTTTCAAGCTCTGAGTGAAAGTGCCACCATTGTGTACAACGAACGTGAGTTCGTAAACAGGTVCCTGCACCATATTGCCACACATGGAGGAGCGCTGAACACTGATGAAGAATATTACAAAACTGTCAAGCCCAGCGAGCACGACGGCGAATACCTGTACGACATCGACAGGAAACAGTGCGTCAAGAAAGAACTAGTCACTGGGCTAGGGCTCACAGGCGAGCTGGTGGATCCTCCCTTCCATGAATTCGCCTACGAGAGTCTGAGAACACGACCAGCCGCTCCTTACCAAGTACCAACCATAGGGGTGTATGGCGTGCCAGGATCAGGCAAGTCTGGCATCATTAAAAGCGCAGTCACCAAAAAAGATCTAGTGGTGAGCGCCAAGAAAGAAAACTGTGCAGAAATTATAAGGGACGTCAAGAAAATGAAAGGGCTGGACGTCAATGCCAGAACTGTGGACTCAGTGCTCTTGAATGGATGCAAACACCCCGTAGAGACCCTGTATATTGACGAAGCTTTTGCTTGTCATGCAGGTACTCTCAGAGCGCTCATAGCCATTATAAGACCTAAAAAGGCAGTGCTCTGCGGGGATCCCAAACAGTGCGGTTTTTTTAACATGATGTGCCTGAAAGTGCATTTTAACCACGAGATTTGCACACAAGTCTTCCACAAAAGCATCTCTCGCCGTTGCACTAAATCTGTGACTTCGGTCGTCTCAACCTTGTTTTACGACAAAAAAATGAGAACGACGAATCCGAAAGAGACTAAGATTGTGATTGACACTACCGGCAGTACCAAACCTAAGCAGGACGATCTCATTCTCACTTGTTTCAGAGGGTGGGTGAAGCAGTTGCAAATAGATTACAAAGGCAACGAAATAATGACGGCAGCTGCCTCTCAAGGGCTGACCCGTAAAGGTGTGTATGCCGTTCGGTACAAGGTGAATGAAAATCCTCTGTACGCACCCACCTCAGAACATGTGAACGTCCTACTGACCCGCACGGAGGACCGCATCGTGTGGAAAACACTAGCCGGCGACCCATGGATAAAAACACTGACTGCCAAGTACCCTGGGAATTTCACTGCCACGATAGAGGAGTGGCAAGCAGAGCATGATGCCATCATGAGGCACATCTTGGAGAGACCGGACCCTACCGACGTCTTCCAGAATAAGGCAAACGTGTGTTGGGCCAAGGCTTTAGTGCCGGTGCTGAAGACCGCTGGCATAGACATGACCACTGAACAATGGAACACTGTGGATTATTTTGAAACGGACAAAGCTCACTCAGCAGAGATAGTATTGAACCAACTATGCGTGAGGTTCTTTGGACTCGATCTGGACTCCGGTCTATTTTCTGCACCCACTGTTCCGTTATCCATTAGGAATAATCACTGGGATAACTCCCCGTCGCCTAACATGTACGGGCTGAATAAAGAAGTGGTCCGTCAGCTCTCTCGCAGGTACCCACAACTGCCTCGGGCAGTTGCCACTGGAAGAGTCTATGACATGAACACTGGTACACTGCGCAATTATGATCCGCGCATAAACCTAGTACCTGTAAACAGAAGACTGCCTCATGCTTTAGTCCTCCACCATAATGAACACCCACAGAGTGACTTTTCTTCATTCGTCAGCAAATTGAAGGGCAGAACTGTCCTGGTGGTCGGGGAAAAGTTGTCCGTCCCAGGCAAAATGGTTGACTGGTTGTCAGACCGGCCTGAGGCTACCTTCAGAGCTCGGCTGGATTTAGGCATCCCAGGTGATGTGCCCAAATATGACATAATATTTGTTAATGTGAGGACCCCATATAAATACCATCACTATCAGCAGTGTGAAGACCATGCCATTAAGCTTAGCATGTTGACCAAGAAAGCTTGTCTGCATCTGAATCCCGGCGGAACCTGTGTCAGCATAGGTTATGGTTACGCTGACAGGGCCAGCGAAAGCATCATTGGTGCTATAGCGCGGCAGTTCAAGTTTTCCCGGGTATGCAAACCGAAATCCTCACTTGAAGAGACGGAAGTTCTGTTTGTATTCATTGGGTACGATCGCAAGGCCCGTACGCACAATCCTTACAAGCTTTCATCAACCTTGACCAACATTTATACAGGTTCCAGACTCCACGAAGCCGGATGTGCACCCTCATATCATGTGGTGCGAGGGGATATTGCCACGGCCACCGAAGGAGTGATTATAAATGCTGCTAACAGCAAAGGACAACCTGGCGGAGGGGTGTGCGGAGCGCTGTATAAGAAATTCCCGGAAAGCTTCGATTTACAGCCGATCGAAGTAGGAAAAGCGCGACTGGTCAAAGGTGCAGCTAAACATATCATTCATGCCGTAGGACCAAACTTCAACAAAGTTTCGGAGGTTGAAGGTGACAAACAGTTGGCAGAGGCTTATGAGTCCATCGCTAAGATTGTCAACGATAACAATTACAAGTCAGTAGCGATTCCACTGTTGTCCACCGGCATCTTTTCCGGGAACAAAGATCGACTAACCCAATCATTGAACCATTTGCTGACAGCTTTAGACACCACTGATGCAGATGTAGCCATATACTGCAGGGACAAGAAATGGGAAATGACTCTCAAGGAAGCAGTGGCTAGGAGAGAAGCAGTGGAGGAGATATGCATATCCGACGACTCTTCAGTGACAGAACCTGATGCAGAGCTGGTGAGGGTGCATCCGAAGAGTTCTTTGGCTGGAAGGAAGGGCTACAGCACAAGCGATGGCAAAACTTTCTCATATTTGGAAGGGACCAAGTTTCACCAGGCGGCCAAGGATATAGCAGAAATTAATGCCATGTGGCCCGTTGCAACGGAGGCCAATGAGCAGGTATGCATGTATATCCTCGGAGAAAGCATGAGCAGTATTAGGTCGAAATGCCCCGTCGAAGAGTCGGAAGCCTCCACACCACCTAGCACGCTGCCTTGCTTGTGCATCCATGCCATGACTCCAGAAAGAGTACAGCGCCTAAAAGCCTCACGTCCAGAACAAATTACTGTGTGCTCATCCTTTCCATTGCCGAAGTATAGAATCACTGGTGTGCAGAAGATCCAATGCTCCCAGCCTATATTGTTCTCACCGAAAGTGCCTGCGTAT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TACGAGCACGCGACCACGATGCCGAGCCAAGCGGGAATCTCGTATAACACTATAGTCAACAGAGCAGGCTACGCACCACTCCCTATCAGCATAACACCAACAAAGATCAAGCTGATACCTACAGTGAACTTGGAGTACGTCACCTGCCACTACAAAACAGGAATGGATTCACCAGCCATCAAATGCTGCGGATCTCAGGAATGCACTCCAACTTACAGGCCTGATGAACAGTGCAAAGTCTTCACAGGGGTTTACCCGTTCATGTGGGGTGGTGCATATTGCTTTTGCGACACTGAGAACACCCAAGTCAGCAAGGCCTACGTAATGAAATCTGACGACTGCCTTGCGGATCATGCTGAAGCATATAAAGCGCACACAGCCTCAGTGCAGGCGTTCCTCAACATCACAGTGGGAGAACACTCTATTGTGACTACCGTGTATGTGAATGGAGAAACTCCTGTGAATTTCAATGGGGTCAAAATAACTGCAGGTCCGCTTTCCACAGCTTGGACACCCTTTGATCGCAAAATCGTGCAGTATGCCGGGGAGATCTATAATTATGATTTTCCTGAGTATGGGGCAGGACAACCAGGAGCATTTGGAGATATACAATCCAGAACAGTCTCAAGCTCTGATCTGTATGCCAATACCAACCTAGTGCTGCAGAGACCCAAAGCAGGAGCGATCCACGTGCCATACACTCAGGCACCTTCGGGTTTTGAGCAATGGAAGAAAGATAAAGCTCCATCATTGARATTTACCGCCCCTTTCGGATGCGAAATATATACAAACCCCATTCGCGCCGAAAACTGTGCTGTAGGGTCAATTCCATTAGCCTTTGACATTCCCGACGCCTTGTTCACCAGGGTGTCAGAAACACCGACACTTTCAGCGGCCGAGTGCACTCTTAACGAGTGCGTGTATTCTTCCGACTTTGGTGGGATCGCCACGGTCAAGTACTCGGCCAGCAAGTCAGGCAAGTGCGCAGTCCATGTGCCATCAGGGACTGCTACCCTAAAAGAAGCAGCAGTCGAGCTAACCGAGCAAGGGTCGGCGACTATCCATTTCTCGACCGCAAATATCCACCCGGAGTTCAGGCTCCAAATATGCACATCATATGTTACGTGCAAAGGTGATTGTCACCCCCCGAAAGACCATATTGTGACACACCCTCAGTATCACGCCCAAACATTTACAGCCGCGGTGTCAAAAACCGCGTGGACGTGGTTAACATCCCTGCTGGGAGGATCAGCCGTAATTATTATAATTGGCTTGGTGCTGGCTACTATTGTGGCCATGTACGTGCTGACCAACCAGAAACATAATTGAATACAGCAGCAATTGGCAAGCTGCTTACATAGAACTCGCGGCGATTGGCATGCCGCCTTAAAATTTTTATTTTATTTTTCTTTTCTTTTCCGAATCGGATTTTGTTTTTAATATTTC
| 40,892
|
MK796243.1
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Leon,B., Jimenez,C., Gonzalez-Barrientos,R., Ramirez,L.
|
Servicio Nacional de Salud Animal, SENASA, Veterinarian Diagnostic
|
Costa Rica
|
2019-06-19
|
LSE9010-15
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,440
|
GenBank
| null |
Costa Rica
|
Costa Rica
|
Equus caballus
|
brain
|
2015-10-22
| null | null |
Venezuelan equine encephalitis virus isolate LSE9010-15, complete genome
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TACCCAAAATGGAGAAAGTTCACGTTGACATCGAGGAAGACAGCCCCTTCCTCAGAGCATTACAACGGAGCTTCCCGCAGTTTGAGGTAGAAGCCAAGCAGGTCACAGATAATGACCATGCTAACGCCAGAGCGTTTTCGCATTTGGCATCAAAATTGATCGAGACGGAGGTGGAACCATCCGATACGATCTTAGACATTGGAAGTGCGCCTGCCCGCAGAATGTATTCCAAGCATAAATACCATTGCATCTGTCCGATGAAATGTGCAGAAGACCCGGACAGACTGTTTAAGTATGCAGCCAAGCTGAAGAAGAACTGTAAAGAGATTACAGATAAGGAACTGGACAAGAAGATGAAGGAGCTTTCGGAAGTCATGAGCGACCCTGATCTCGAAACTGAAACGATTTGCCTTCACGACGATGAAACCTGTCGATTTGAAGGTCAAGTCGCAGTGTATCAGGACGTGTACGCGGTTGACGGACCAACGAGCCTCTATCATCAGGCCAACAAAGGGGTCAGAGTCGCCTATTGGATAGGATTCGACACTACCCCCTTCATGTTCAAGAACTTGGCTGGAGCATATCCCTCCTATTCGACCAACTGGGCCGACGAGACCGTGTTAACGGCTCGTAATATAGGCCTGTGCAGCTCCGATGTGATGGAGCGGTCACGTAGAGGGATGTCCATCCTTAAAAAAAAATTTCTAAAACCATCCAATAACGTCTTGTTCTCTGTAGGATCTACCATCTACCACGAGAAGCGAGACTTACTTAGGAGTTGGCACCTACCGTCCGTTTTTCACCTACGTGGTAAGCAGAATTACACTTGTCGGTGTGAGACTATAGTTAGCTGCGACGGGTACGTCGTTAAAAGGATAGCTATTAGTCCAGGTCTGTACGGGAAACCGTCGGGCTATGCTGCCACGATGCACCGCGAGGGATTCTTGTGCTGCAAGGTGACGGACACGCTTAACGGAGAGAGGGTCTCTTTCCCCGTATGCACATACGTGCCGGCCACATTGTGCGACCAAATGACAGGCATTCTGGCAACAGATGTCAGTGCAGACGACGCACAGAAATTGTTGGTTGGGCTCAACCAGCGAATAGTCGTAAATGGTCGCACTCAAAGGAATACTAACACAATGAAGAACTATTTATTACCCGTCGTGGCACAAGCATTTGCCAGATGGGCAAAAGAGTACAAAGAAGATCAAGAAGATGAAAGACCATTGGGGCTCAGGGACCGCCAGTTGGTAATGGGGTGTTGTTGGGCGTTCAGGAAACACAAGATAACATCAGTGTATAAACGACCAGACACCCAAACGATCATTAAGGTAAACAGCGATTTCCACTCTTTCGTGCTGCCCAGAATTGGGAGCAGCACCTTGGAGATGGGGCTGAGGACCAGGATCAGAAAACTACTGGAGGAACCTGTGGATAGACCACCACTGATTACCGCCGACGACATACAGGAGGCCAAAAACGCGGCGGATGAGGCTAAGGAAGTCAAGGAGGCAGAAGAGCTCAGGGAAGCACTACCACCGCTGTCTGCCGATGTAGAGGAACCTGCACTGGAGGCTGACGTTGACTTAATGCTGCAGGAGGCGGGTGCGGGATCTGTCGAAACCCCTAGGGGGCTCATCAAAGTCACCAGCTACGCAGGAGAAGACAAAATTGGCTCGTATGCAGTGCTCTCCCCACAAGCGGTACTGCGAAGTGAAAAACTGACATGCATTCACCCGCTCGCAGAGCAAGTAATTGTAATCACACACTCTGGGAGGAAGGGTAGATATGCAGTTGAGCCTTACCACGGAAAAGTGGTAGTACCCGAGGGGCATGCTATACCTGTCCAAGACTTCCAAGCACTCAGTGAGAGCGCCACAATTGTGTACAACGAACGTGAGTTCGTGAATAGGTATTTACACCACATTGCTACGCACGGTGGAGCTCTGAACACAGACGAGGAGTATTACAGAGTGGTGAAACCCAGTGAACATGAAGGTGAGTACTTATATGATATTGACAAGAAACAGTGTGTGAAGAAAGAACTGGTTTCGGGACTAGGTTTGACAGGGGAACTTGTCGATCCCCCCTTCCATGAATTTGCATATGAAAGCTTGAGGACACGTCCTGCCGCACCTTATCAGGTACCAACTATAGGTGTGTATGGCGTTCCCGGGTCGGGGAAGTCTGGAATTATCAAGAGTGCAGTCACAAAGAAGGACTTGGTAGTGAGTGCTAAGAAGGAGAACTGCGCCGAGATAATAAGGGACGTCAAGAAGATGAAAGGGCTAGACGTCAATGCCCGGACAGTGGACTCAGTGCTGTTAAATGGATGTAAGCACCCGGTCGAGACTTTGTACATTGATGAAGCCTTCGCATGCCACGCTGGCACTCTCAGGGCCTTAATAGCTATTATACGCCCCAAGAAAGCAGTGCTGTGTGGTGACCCAAAGCAATGCGGCTTCTTTAACATGATGTGCTTAAAAGTGCACTTCAACCATGAAATATGCACTCAAGTCTTCCACAAAAGCATATCTCGTAGGTGTACCAAGTCAGTGACGTCGGTTGTGTCCACACTGTTTTACGACAAAAGAATGAGAACTACTAACCCAAGGGATTCCAAAATCGAAATTGACACAACAGGAAGTACTAAACCAAAAAAGGATGACTTGATTCTCACATGCTTTAGGGGATGGGTTAAGCAACTGCAAATAGACTACAAAGGAAATGAAATAATGACCGCGGCTGCCTCACAGGGATTGACGCGGAAAGGTGTCTATGCAGTTAGGTACAAGGTTAACGAGAACCCATTGTACGCACCCACCTCAGAGCATGTAAATGTGCTGTTGACCCGGACGGAAGACAAGATTGTGTGGAAGACTCTTGCAGGGGACCCGTGGATAAAGACGTTGACCGCGAAGTACCCCGGAGATTTCACCGCAACAATGGAAGAATGGCAGGCAGAACACGAGGCCATCATGAGACACATCCTGGAGAAACCGGATCCCACAGATGTCTTCCAAAATAAAGCTAATGTTTGTTGGGCAAAGGCACTTGTACCTGTGCTTAAGACAGCCGGGATAGATTTGACCGCAGAGCAGTGGAACACAGTGGACTACTTTAAGGAGGATAAGGCTCACTCAGCTGAAATCGTTCTGAATCAGCTGTGCGTGCGATTCTTCGGTCTAGACCTAGATTCTGGTTTGTTTTCCACCCCCACAGTTCCACTCTCTATTAGGAACAACCATTGGGACAACTCACCGTCACCCAACATGTATGGGTTGAACCATGAAGTGGTCAGGCAACTATCCCGCAGGTATCCTCAATTACCGCGTGCGGTGACCACTGGGAGAGTATACGACATGAACACCGGTACCTTGCGCAATTATGATCCGCGCATAAATTTAGTACCGGTGAACCGTCGTCTACCACATGCTCTCGTGACACAACATGCTGATTATCCCCCTAGTGATTTTTCCGCCTTTGTCAGTAAGCTTAAAGGCAGGACGGTCCTAGTAGTTGGTGAGAAGATGAGTATTTCAGGTAAGACGGTAGACTGGTTATCTGAAACACCTGATTCTACTTTCAGGGCGCGCCTAGACTTAGGTATACCCAATGAACTACCGAAGTACGACATCGTCTTCGTAAACGTAAGAACACAATACCGCTACCACCACTATCAGCAGTGTGAGGACCACGCCATTAAGTTGAGCATGTTGACTAAGAAGGCATGCCTGCACCTGAATCCCGGAGGAACTTGTGTGAGCATTGGTTACGGCTATGCGGACCGGGCCAGCGAAAGCATCATTGGTGCAGTGGCTCGGCAGTTTAAGTTCTCGAGGGTGTGCAAACCGAAGGTGTCTAAGGAGGAGACTGAAGTGCTATTTGTTTTCATTGGGTTCGATCGTAAAACGCGGACCCATAACCCATACAAGCTTTCCTCCACCTTGACCAATATCTACACCGGTTCGAGGCTCCATGAAGCTGGCTGCGCACCTTCGTATCATGTAGTGCGCGGGGACATTGCCACTGCCACGGAAGGAGTAATTGTCAATGCTGCCAACAGCAAGGGCCAGCCAGGCAGTGGGGTGTGCGGAGCTCTGTACCGGAAGTACCCCGAAAGCTTCGATCTACAACCAATAGAAGTGGGGAAAGCTAGATTGGTCAAAGGTAACTCAAAACATATCATTCATGCAGTGGGGCCGAATTTTAACAAAGTGTCTGAAGTGGAAGGTGACAAACAGCTGGCAGAAGCGTATGAATCTATAGCCAAGATTATTAATGATAACAATTACAGATCTGTGGCTATCCCGCTTCTGTCCACTGGAATATTTGCCGGAAACAAGGATAGGTTAATGCAATCCTTAAACCATCTGTTAACGGCATTGGACACAACAGACGCAGATGTGGCCATATACTGCAGAGACAAAAAATGGGAAGTGACGTTGAAAGAGGTCGTAGCCAGGAGAGAAGCGGTAGAGGAGATATGTATCTCCGATGATTCCTCCGTAGCAGAGCCGGATGCAGAGCTGGTTAGAGTTCACCCAAAGAGCTCCTTGGCCGGAAGGAAAGGCTACAGCACCAGTGATGGAAAGACTTTCTCATACCTCGAAGGAACCAAATTCCATCAAGCGGCGAAGGACATGGCAGAAATTAACGCTATGTGGCCCACCGCTACAGAGGCAAATGAGCAGGTGTGCTTGTACATTCTGGGTGAAAGTATGAGCAGTATAAGATCTAAGTGCCCCGTTGAGGAATCGGAGGCATCCACCCCACCAAGTACATTGCCTTGCCTGTGCATCCACGCTATGACCCCGGAACGTGTTCAGCGTTTGAAAGCCTCTCGCCCCGAACAAATTACAGTTTGTTCTTCCTTCCCATTGCCGAAGTACAGAATAACAGGAGTGCAGAAGATCCAATGCTCACATCCTATACTTTTCTCCCCTAAAGTACCTGAGTATATACATCCTAGAAAGTACCTTGCAGACGCAGCTTCC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| 62,136
|
MH086244.1
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Padilla,S.L., Prieto,K., Haddow,A.D., Watts,D.M., Klein,T.A., Turell,M.J., Lowen,R.G., Palacios,G.F., Pitt,M.L., Wiley,M.R., Nasar,F.
|
United States Army Medical Institute of Infectious Diseases, Center for Genome Scienes
|
USA
|
2019-04-16
|
PE40935
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,313
|
GenBank
| null |
Peru
|
Peru
|
Culex gnomatos
| null |
1997
|
SAMN08723478
|
PRJNA438670
|
Venezuelan equine encephalitis virus isolate PE40935, complete genome
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CGGCGCATGAGATTAGCCCAATACAATCACTACCCATTATGGAGAAAGTTCACGTTGATATCGAGGAGGATAGCCCCTTCCTCAGAGCTTTGCAACGGAGCTTCCCCCAGTTTGAGGTAGAAGCCAAGCAGGTCACCGACAATGACCATGCTAACGCTAGAGCGTTTTCGCATCTAGCTTCTAAATTGATCGAAACGGAGGTAGAACCATCCGATACGATCTTAGACATTGGAAGTGCGCCCGCTCGCAGAATGTACTCTAAACATAAGTACCACTGCATATGTCCCATGAAGTGCGCAGAAGACCCGGACAGACTATTCAAATATGCAGCCAAGTTAAAGAAAAACTGCAAGGACATCACAGACAAGGAGTTGGATAAGAAGATGGCAGAGCTCGCAGCCGTCATGGAGGACCCTGACCAGGAACAAGACACTATCTGCTTGCATGACGACGAATCTTGTCGCCATGAGGGGCAAGTGGCTGTCTACCAGGATGTCTATGCCGTGGACGGCCCCACCAGCCTCTATCACCAAGCAAATAAGGGAGTGAGAGTCGCCTACTGGATTGGCTTCGACACCACCCCTTTTATGTTTAAGAACCTGGCCGGAGCGTACCCATCCTACTCCACAAATTGGGCAGATGAGACGGTGCTAACAGCCCGCAACATTGGTCTATGCAGTTCAGACGTTATGGAGCAGTCTCGCAGAGGACTGTCTATACTAAGGAAAAAGTATCTAAAACCATCGAATAACGTCATATTTTCCGTGGGTTCCACCCTTTACCACGAAAAACGGGACCTACTAAAAAGCTGGCACTTACCATCAGTGTTTCACCTACGTGGCAGGCAAAATTACACATGTCGGTGTGAGACGATAGTGAGTTGCGACGGGTACGTCGTTAAAAGAATCGCTATCAGTCCCGGCCTGTACGGGAAACCGTCAGGCTACGCTGCCACTATGCACCGCGAGGGATTCTTGTGTTGCAAGGTAACGGACACGCTTAACGGGGAGAGGGTCTCTTTTCCTGTTTGCACATATGTGCCGGCGACACTATGCGACCAAATGACTGGCATCTTGGCTACAGACGTCAGTGCAGACGACGCACAAAAACTGCTGGTTGGGCTCAACCAGCGCATTGTCGTGAACGGCCGCACTCAGAGGAATACTAACACTATGAAAAACTACCTACTACCAGTAGTGGCCCAGGCGTTTGCACGGTGGGCCAAAGAGTACAAAGAAGATCAAGACGATGAAAGACCATTGGGATTGAGGGACAGACAGTTAGTAATGGGCTGTTGCTGGGCGTTTAAGAAACACAAAATCACATCTGTGTACAAACGCCCTGACACGCAGACCGTTATAAAAGTCCCCAGCGACTTCCATTCCTTTGTACTGCCTAGGCTTGGCAGTTGCTCATTGGAAATTGGGCTGAGGAGCAGAATAAAGAAGCTGCTCGCAGATAAGAAAGAACCACCGCCCCTGGTCACTCAGGAGGATGTCTCAGCGGCGAAAGAAGCGGCTGCAGAAGCCAAGGAGATCAAAGAGGCCGAGGAACTGCGCATCGCATTGCCCCCTATCGTTCCTGACGTGGAGGAACCGACACTAGAGGCTGATGTCGACCTAATGCTGCAGGAGGCCGGCGCGGGTTCCGTAGAGACTCCTCGTGGGCTTATAAAGGTAACCAGCTACTCCGGCGAAGACAAAATAGGCTCGTATGCTGTGCTATCACCCCAAGCCGTTCTTCGGAGCGAGAAGCTCTCCTGCATACACCCATTGGCTGAAGAAGCCATAGTCATCACCCATGCGGGTCGAAAAGGGCGTTACGCAGTCGAGCCATACCATGGCAAAGTGGTGGTTCCTGAGGGGCATGCGATTCCAGTTGCGGATTTCCAGGCACTTAGCGAGAGTGCTACCATCGTGTACAACGAAAGGGAATTCGTGAACAGGTATCTACATCATATCGCTGTTAACGGCGGAGCCTTAAACACTGATGAAGAGTACTACAAAGTAGTCAAGCCCAGCGAATATGAGGGAGAGTACCTGTACGACATTGACAAGAGGCAATGCGTCAAAAAGGATCAAGTGTCTGGTCTAGGCTTAACGGGCGAATTAGTGGAACCTCCGTTTCACGAGTTCGCGTATGAGAGCTTGAAAACCAGACCGGCAGCACCCTACCAGGTACCGACCATAGGCGTTTACGGCGTACCAGGGTCGGGTAAGTCAGGCATCATCAAGAGCGCTGTCACGAAACGAGACTTGGTGGTCAGCGCAAAGAAGGAGAACTGCGCTGAGATCATGCGTGATGTGAAGAGAATGCGAGGCTTGGACATAGTAGCGCGCACCGTTGACTCAGTGTTGTTAAACGGGTGTAAACACCCTGTTGACACGCTATACATCGACGAAGCGTTCGCATGTCACGCCGGGACTCTTCGCGCGCTGATCGCAATCATCAAACCTAAGAAAGCAGTGCTGTGTGGTGACCCGAAGCAGTGCGGCTTTTTCAATATGATGTGTCTTAAAGTGCACTTTAACCATGAAATTTGCACGCGGGTGTTCCACAAAAGCATCTCTCGTAGGTGCACCAAATCAGTCACGTCAGTCGTATCCACACTGTTTTACGACAAGAAAATGCGCACCACCAATCCAAAAGAGACGCAGATAGAAATCGACACCACTGGCAGTACGAAGCCTAAGAAAGACGACCTTATACTGACTTGCTTCAGAGGATGGGTAAAGCAGTTGCAAATAGATTACAAGGGTAACGAGATCATGACGGCAGCAGCATCCCAAGGCTTGACCCGAAAGGGGATCTACGCCGTCAGGTACAAAGTCAATGAGAACCCATTGTATGCACCCAACTCAGAACACGTCAATGTCCTGCTCACACGTACTGAGGACAGAATCGTATGGAAAACGTTGGCTGGAGATCCGTGGATCAAGACCCTCACGGCCAGATACCCAGGAGACTTTACTGCCACCCTTGAGGAGTGGCAACAGGAGCATGATGCTATTATGAGGCACATCCTGGAAAAACCAGACCCGGCAGATGTGTTCCAAAATAAAGCAAACGTGTGCTGGGCCAAGGCCTTAGTACCCGTATTGAGGACTGCCGGAATCGACATGACGGCGGACCATTGGAACACAGTCGCCCACTTTAAGGATGACAAGGCGCACTCGGCAGAAATCGTACTTAACCAACTGTGCGTCCGGTTCTTCGGGTTGGATTTAGATTCAGGGTTGTTTTCTGCGCCCACTGTCCCGTTATCGATCAAGAGCAATCACTGGGACAATTCACCATCACCGAATATGTACGGACTGAACAATGAGGTGGTCCGTCAGCTTTCCCGGCGTTACCCGCAACTGCCTCGAGCAGTGGCGACCGGTAGAGTCCTTGACATGAATACAGGAACGCTGCGCAGTTACGACCCGAGCATCAACCTCGTACCGGTTAACCGCAGACTACCTCATGCTTTAGTCACACACAGGCTAGAATACCCGCGGAGCGACTTTTCAACGTTCGCTAGTAAACTGAAAGGACGGACCGTTCTGGTAGTTGGCGACAAGATGAACATCACCGGGAAGACCGTCGACTGGTTATCCGAGAACCCGGAAGCCACTTACAAATCTCGACTGGATCTCGGTATTCCGAGCGAGCTGCCCAAATACGACATCGTGTTTGTGAATGTTCGAACGCCTTATAAGTATCATCACTATCAGCAGTGTGAGGATCACGCGATCAAGCTCAACATGCTGGCAAAGAAAGCATGCCTACACCTTAATCCTGGCGGGACTTGCGTCAGTATAGGTTACGGTTACGCAGATAGAGCCAGCGAAAGTATTATAGGAGCGATCGCACGACAGTTCAAGTTCTCTAGGGTGTGCAAGCCTAAAGCGTCACTGGAGGAGACAGAGGTCCTGTTCGTCTTCATAGGGTACGACCGGAGAACTCGCACGCACAATCCCTATAAGCTGTCTTCTACATTAACTAATATCTACACTGGGTCACATCTGCACGAAGCCGGATGTGCTCCTTCCTACCACGTGGTCCGGGGCGACATAGCTAACGCGGAGGAAGGGGTCATTGTCAACGCAGCAAACAGCAGAGGGCAGCCGGGCGGTGGGGTTTGTGGCGCCCTTTACAAGAAATTTCCCGAGAACTTTGACCTACAGCCAATCGACGTGGGAAAGTCTCGGCTTGTTAAGGGGGCGGCAAAGCACATCATACATGCTGTGGGACCCAATTTCAACAAAGTATCAGAAGTAGAGGGTGATAAGCAACTGGCAGATGCGTATGAGTCGGTCGCTAAAATAATCAATGACAACCACTACCGATCGGTGGCTATCCCACTCTTGTCAACAGGCATCTTTGCCGGTAACAAAGACAGACTTATGCAGTCGCTGAATCATCTGCTTACAGCGTTGGACACCACGGACGCAGATGTGGCTATCTACTGCAGGGACAAGAAATGGGAGACGACCCTAAAGGAAGTCATAGCTAGGAGAGAGGCGGTCGAAGAGATATGTATCTCCGAAGACGCGTCCCAAGCAGAACCCGACGTTGAACTGGTCAGGGTGCACCCAAAGAGCTCACTAGCGGGACGTAAAGGGTTTAGCACGACGGATGGAAAGACGTTTTCGTATCTCGAAGGGACAAAGTTTCACCAGGCAGCAAAGGACGTGGCCGAGATAAACGCAATGTGGCCGACCGCGACTGAAGCCAACGAACAGATATGCTTGTACATTCTGGGAGAAAGTATGAGTAGCATCCGGTCTAAGTGCCCTGTTGAGGAATCCGAAGCCTCTACACCACCTAGCACCCTGCCGTGCTTGTGTATACACTCAATGACACCTGAGCGAGTACACAGGCTTAAAGCAGCGCGTCCGGAGCAAATAACAGTGTGCTCGTCGTTTCCTCTGCCTAAGTACAGGATCACAGGGGTGCAGAAGATTCAGTGTGCGCACCCCATTCTCTTCCTCCCGAAGGTGCCCGAGTACATCCAT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| 63,292
|
MH086245.1
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Padilla,S.L., Prieto,K., Haddow,A.D., Watts,D.M., Klein,T.A., Turell,M.J., Lowen,R.G., Palacios,G.F., Pitt,M.L., Wiley,M.R., Nasar,F.
|
United States Army Medical Institute of Infectious Diseases, Center for Genome Scienes
|
USA
|
2019-04-16
|
PE21-0031
|
Venezuelan equine encephalitis virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,319
|
GenBank
| null |
Peru
|
Peru
|
Culex gnomatos
| null |
1999
|
SAMN08723483
|
PRJNA438670
|
Venezuelan equine encephalitis virus isolate PE21-0031, complete genome
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