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Human coronavirus NL63
|
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|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2023-02-21
|
HCoV-NL63/BIME068-56/2016
|
Human coronavirus NL63
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
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| 27,523
|
GenBank
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China
|
China
|
Homo sapiens
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2016
| null | null |
Human coronavirus NL63 isolate HCoV-NL63/BIME068-56/2016, complete genome
|
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| 17,918
|
ON553974.1
|
Human coronavirus NL63
|
Ye,R.-Z., Gong,C., Cui,X.-M., Liu,J.-Y., Fan,H., Xie,H., Wang,Q., Ren,Z.-Y., Zhang,Y.-W., Xia,L.-Y., Zhang,M.-Z., Li,Y.-Y., Li,Z.-H., Du,L.-F., Zhang,J., Cheng,N., Shi,W., Li,M.-Z., Zhao,L., Jiang,J.-F., Jia,N., Huang,F., Cao,W.-C.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2023-02-21
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HCoV-NL63/BIME070-61/2016
|
Human coronavirus NL63
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Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 27,503
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2016
| null | null |
Human coronavirus NL63 isolate HCoV-NL63/BIME070-61/2016, complete genome
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| 17,919
|
ON553975.1
|
Human coronavirus NL63
|
Ye,R.-Z., Gong,C., Cui,X.-M., Liu,J.-Y., Fan,H., Xie,H., Wang,Q., Ren,Z.-Y., Zhang,Y.-W., Xia,L.-Y., Zhang,M.-Z., Li,Y.-Y., Li,Z.-H., Du,L.-F., Zhang,J., Cheng,N., Shi,W., Li,M.-Z., Zhao,L., Jiang,J.-F., Jia,N., Huang,F., Cao,W.-C.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2023-02-21
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HCoV-NL63/BIME089-67/2016
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Human coronavirus NL63
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 27,464
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2016
| null | null |
Human coronavirus NL63 isolate HCoV-NL63/BIME089-67/2016, complete genome
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| 17,920
|
ON553976.1
|
Human coronavirus NL63
|
Ye,R.-Z., Gong,C., Cui,X.-M., Liu,J.-Y., Fan,H., Xie,H., Wang,Q., Ren,Z.-Y., Zhang,Y.-W., Xia,L.-Y., Zhang,M.-Z., Li,Y.-Y., Li,Z.-H., Du,L.-F., Zhang,J., Cheng,N., Shi,W., Li,M.-Z., Zhao,L., Jiang,J.-F., Jia,N., Huang,F., Cao,W.-C.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2023-02-21
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HCoV-NL63/BIME097-57/2016
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Human coronavirus NL63
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 27,530
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2016
| null | null |
Human coronavirus NL63 isolate HCoV-NL63/BIME097-57/2016, complete genome
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| 17,921
|
ON553977.1
|
Human coronavirus NL63
|
Ye,R.-Z., Gong,C., Cui,X.-M., Liu,J.-Y., Fan,H., Xie,H., Wang,Q., Ren,Z.-Y., Zhang,Y.-W., Xia,L.-Y., Zhang,M.-Z., Li,Y.-Y., Li,Z.-H., Du,L.-F., Zhang,J., Cheng,N., Shi,W., Li,M.-Z., Zhao,L., Jiang,J.-F., Jia,N., Huang,F., Cao,W.-C.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2023-02-21
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HCoV-NL63/BIME099-75/2016
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Human coronavirus NL63
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,517
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2016
| null | null |
Human coronavirus NL63 isolate HCoV-NL63/BIME099-75/2016, complete genome
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| 17,922
|
ON553978.1
|
Human coronavirus NL63
|
Ye,R.-Z., Gong,C., Cui,X.-M., Liu,J.-Y., Fan,H., Xie,H., Wang,Q., Ren,Z.-Y., Zhang,Y.-W., Xia,L.-Y., Zhang,M.-Z., Li,Y.-Y., Li,Z.-H., Du,L.-F., Zhang,J., Cheng,N., Shi,W., Li,M.-Z., Zhao,L., Jiang,J.-F., Jia,N., Huang,F., Cao,W.-C.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2023-02-21
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HCoV-NL63/BIME102-64/2016
|
Human coronavirus NL63
|
Alphacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,518
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2016
| null | null |
Human coronavirus NL63 isolate HCoV-NL63/BIME102-64/2016, complete genome
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| 17,923
|
ON553979.1
|
Human coronavirus NL63
|
Ye,R.-Z., Gong,C., Cui,X.-M., Liu,J.-Y., Fan,H., Xie,H., Wang,Q., Ren,Z.-Y., Zhang,Y.-W., Xia,L.-Y., Zhang,M.-Z., Li,Y.-Y., Li,Z.-H., Du,L.-F., Zhang,J., Cheng,N., Shi,W., Li,M.-Z., Zhao,L., Jiang,J.-F., Jia,N., Huang,F., Cao,W.-C.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2023-02-21
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HCoV-NL63/BIME103-65/2016
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Human coronavirus NL63
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 27,508
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2016
| null | null |
Human coronavirus NL63 isolate HCoV-NL63/BIME103-65/2016, complete genome
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| 17,924
|
ON553980.1
|
Human coronavirus NL63
|
Ye,R.-Z., Gong,C., Cui,X.-M., Liu,J.-Y., Fan,H., Xie,H., Wang,Q., Ren,Z.-Y., Zhang,Y.-W., Xia,L.-Y., Zhang,M.-Z., Li,Y.-Y., Li,Z.-H., Du,L.-F., Zhang,J., Cheng,N., Shi,W., Li,M.-Z., Zhao,L., Jiang,J.-F., Jia,N., Huang,F., Cao,W.-C.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2023-02-21
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HCoV-NL63/BIME104-66/2016
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Human coronavirus NL63
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 27,516
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2016
| null | null |
Human coronavirus NL63 isolate HCoV-NL63/BIME104-66/2016, complete genome
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| 17,925
|
ON553981.1
|
Human coronavirus NL63
|
Ye,R.-Z., Gong,C., Cui,X.-M., Liu,J.-Y., Fan,H., Xie,H., Wang,Q., Ren,Z.-Y., Zhang,Y.-W., Xia,L.-Y., Zhang,M.-Z., Li,Y.-Y., Li,Z.-H., Du,L.-F., Zhang,J., Cheng,N., Shi,W., Li,M.-Z., Zhao,L., Jiang,J.-F., Jia,N., Huang,F., Cao,W.-C.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2023-02-21
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HCoV-NL63/BIME106-68/2016
|
Human coronavirus NL63
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Alphacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 27,534
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2016
| null | null |
Human coronavirus NL63 isolate HCoV-NL63/BIME106-68/2016, complete genome
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| 17,926
|
NC_006213.1
|
Human coronavirus OC43
|
St-Jean,J.R., Jacomy,H., Desforges,M., Vabret,A., Freymuth,F., Talbot,P.J.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2019-02-21
| null |
Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,741
|
RefSeq
| 1
|
USA
|
USA
| null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Human coronavirus OC43 strain ATCC VR-759, complete genome
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CACAGTTCCCCATTCTTGCAGAACTCGCACCCACAGCTGGTGCGTTTTTCTTTGGATCAAGATTAGAGTTGGCCAAAGTGCAGAATTTATCTGGGAATCCTGACGAGCCCCAGAAGGATGTTTATGAATTGCGCTATAACGGCGCAATTAGGTTTGACAGTACACTTTCAGGTTTTGAGACCATAATGAAGGTGCTGAATGAGAATTTGAATGCCTATCAACAACAAGATGGTATGATGAATATGAGTCCAAAACCACAGCGTCAGCGTGGTCATAAGAATGGACAAGGAGAAAATGATAATATAAGTGTTGCAGTGCCCAAAAGCCGCGTGCAGCAAAATAAGAGTAGAGAGTTGACTGCAGAGGACATCAGCCTTCTTAAGAAGATGGATGAGCCCTATACTGAAGACACCTCAGAAATATAAGAGAATGAACCTTATGTCGGCATCTGGTGGTAACCCCTCGCAGAAAAGTCGAGATAAGGCACTCTCTATCAGAATGGATGTCTTGCTGCTATAATAGATAGAGAAGGTTATAGCAGACTATAGATTAATTAGTTGAAAGTTTTGTGTTGTAATGTATAGTGTTGGAGAAAGTGAAAGACTTGCGGAAGTAATTGCCGACAAGTGCCCAAGGGAAGAGCCAGCATGTTAAGTTACCACCCAGTAATTAGTAAATGAATGAAGTTAATTATGGCCAATTGGAAGAATCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
| 3,761
|
PP187315.1
|
Human coronavirus OC43
|
Goya,S., Xie,H., Sereewit,J., Greninger,A.L.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2024-01-30
|
OC43/USA/3SB2A9/2021
|
Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,697
|
GenBank
| null |
USA: WA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021-05-12
| null |
PRJNA1066815
|
Human coronavirus OC43 isolate OC43/USA/3SB2A9/2021, complete genome
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| 9,371
|
PP187316.1
|
Human coronavirus OC43
|
Goya,S., Xie,H., Sereewit,J., Greninger,A.L.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2024-01-30
|
OC43/USA/5MT6FT/2021
|
Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,725
|
GenBank
| null |
USA: WA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021-07-10
| null |
PRJNA1066815
|
Human coronavirus OC43 isolate OC43/USA/5MT6FT/2021, complete genome
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GAACTAGTGACCCACAGTTCCCCATTCTTGCAGAACTCGCACCCACAGCTGGTGCGTTTTTCTTTGGATCAAAATTAGAGTTGGCCAAAGTGCAGAATTTATCTGGGAATCCTGATGAGCCTCAGAAGGATGTTTATGAATTGCGCTATAACGGCGCAATTAGGTTTGACAGTACACTTTCAGGCTTTGAGACCATAATGAAGGTGCTGAGTGAGAATTTGAATGCCTATCAACAACAAGATGGTATGATGAATATGAGTCCAAAACCACAGCGTCAGCGTGGTCATAAGAATGGACAAGGAGAAAATGATAATATAAGTGTTGCAGTGCCCAAAAGCCGCGTGCAGCAAAATAAGAGTATAGAGTTGACTGCAGAGGACATCAGCCTTCTTAAGAAGATGGATGAGCCCTTTACTGAAGACACCTCAGAAATATAAGAGAATGAACCTTATGTCGGCATCTGGTGGTAACCCCTCGCAGAAAAGTCGAGATAAGGCACTCTCTATCAGAATGGATGTCTTGCTGCTATAATAGATAGAGAAGGTTATAGCAGACTATATATTAATTAGTTGAAAGTTTTGTGTTGTAATGTATAGTGTTGGAGAAAGTGAAAGACTTGCGGAAGTAATTGCCGACAAGTGCCAAAGGGAAGAGCCAGCATGTTAAGTTACTACCCAGTAATTAGTAAATGAATGAAGTTAATTATGGCCAATTGGAAGAATCAC
| 9,372
|
PP187317.1
|
Human coronavirus OC43
|
Goya,S., Xie,H., Sereewit,J., Greninger,A.L.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2024-01-30
|
OC43/USA/PTDPQ7/2021
|
Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,692
|
GenBank
| null |
USA: WA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021-05-25
| null |
PRJNA1066815
|
Human coronavirus OC43 isolate OC43/USA/PTDPQ7/2021, complete genome
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AACTCGCACCCACAGCTGGTGCGTTTTTCTTTGGATCAAAATTAGAGTTGGCCAAAGTGCAGAATTTATCTGGGAATCCTGATGAGCCTCAGAAGGATGTTTATGAATTGCGCTATAACGGCGCAATTAGGTTTGACAGTACACTTTCAGGCTTTGAGACCATAATGAAGGTGCTGAGTGAGAATTTGAATGCCTATCAACAACAAGATGGTATGATGAATATGAGTCCAAAACCACAGCGTCAGCGTGGTCATAAGAATGGACAAGGAGAAAATGATAATATAAGTGTTGCAGTGCCCAAAAGCCGCGTGCAGCAAAATAAGAGTATAGAGTTGACTGCAGAGGACATCAGCCTTCTTAAGAAGATGGATGAGCCCTTTACTGAAGACACCTCAGAAATATAAGAGAATGAACCTTATGTCGGCATCTGGTGGTAACCCCTCGCAGAAAAGTCGAGATAAGGCACTCTCTATCAGAATGGATGTCTTGCTGCTATAATAGATAGAGAAGGTTATAGCAGACTATATATTAATTAGTTGAAAGTTTTGTGTTGTAATGTATAGTGTTGGAGAAAGTGAAAGACTTGCGGAAGCAATTGCCGACAAGTGCCAAAGGGAAGAGCCAGCATGTTAAGTTACTACCCAGTAATTAGTAAATGAATGAAGTTAATTATGGCCAATTGGAAGAATCAC
| 9,373
|
PP187318.1
|
Human coronavirus OC43
|
Goya,S., Xie,H., Sereewit,J., Greninger,A.L.
|
UW Virology, DLMP
|
USA
|
2024-01-30
|
OC43/USA/VWPFHG/2021
|
Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,686
|
GenBank
| null |
USA: WA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2021-06-22
| null |
PRJNA1066815
|
Human coronavirus OC43 isolate OC43/USA/VWPFHG/2021, complete genome
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Jinhua Polytechnic, Agricultural College
|
China
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2023-07-01
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ZJHZ202202-1
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Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
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Coronaviridae
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GenBank
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China: Zhejiang
|
China
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Cricetinae
| null |
2022-02
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Human coronavirus OC43 isolate ZJHZ202202-1, complete genome
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| 14,833
|
OQ079159.1
|
Human coronavirus OC43
|
He,H., Sun,J.
|
Jinhua Polytechnic, Agricultural College
|
China
|
2023-07-01
|
ZJHZ202202-2
|
Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
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|
GenBank
| null |
China: Zhejiang
|
China
|
Cricetinae
| null |
2022-02
| null | null |
Human coronavirus OC43 isolate ZJHZ202202-2, complete genome
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| 14,834
|
OQ828657.1
|
Human coronavirus OC43
|
Sereewit,J., Hajian,P., Xie,H., Greninger,A.L.
|
UW Virology, Laboratory Medicine
|
USA
|
2023-05-01
|
HCoV/OC43/USA/7D7/2010
|
Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,558
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2010-11
|
SAMN34191007
|
PRJNA939200
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Human coronavirus OC43 isolate HCoV/OC43/USA/7D7/2010, complete genome
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| 16,311
|
LC756669.1
|
Human coronavirus OC43
|
Shirato,K., Suwa,R., Kawase,M., Kume,Y., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Sato,M., Sakuma,H., Suzuki,S., Hosoya,M., Hashimoto,K., Kawase,Y., Kume,M., Okabe,T.
|
Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-02-22
|
HCoVOC43_Fukushima_OR421_2021
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Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,752
|
GenBank
| null |
Japan: Fukushima
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2021
| null | null |
Human coronavirus OC43 HCoVOC43_Fukushima_OR421_2021 RNA, nearly complete genome
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| 17,894
|
LC756670.1
|
Human coronavirus OC43
|
Shirato,K., Suwa,R., Kawase,M., Kume,Y., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Sato,M., Sakuma,H., Suzuki,S., Hosoya,M., Hashimoto,K., Kawase,Y., Kume,M., Okabe,T.
|
Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-02-22
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HCoVOC43_Fukushima_OR427_2021
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Betacoronavirus 1
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Betacoronavirus
|
Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 30,733
|
GenBank
| null |
Japan: Fukushima
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2021
| null | null |
Human coronavirus OC43 HCoVOC43_Fukushima_OR427_2021 RNA, nearly complete genome
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| 17,895
|
ON554023.1
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Human coronavirus OC43
|
Ye,R.-Z., Gong,C., Cui,X.-M., Liu,J.-Y., Fan,H., Xie,H., Wang,Q., Ren,Z.-Y., Zhang,Y.-W., Xia,L.-Y., Zhang,M.-Z., Li,Y.-Y., Li,Z.-H., Du,L.-F., Zhang,J., Cheng,N., Shi,W., Li,M.-Z., Zhao,L., Jiang,J.-F., Jia,N., Huang,F., Cao,W.-C.
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Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2023-02-21
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HCoV-OC43/BIME001-45/2015
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Betacoronavirus 1
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 30,673
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2015
| null | null |
Human coronavirus OC43 isolate HCoV-OC43/BIME001-45/2015, complete genome
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| 17,966
|
ON554024.1
|
Human coronavirus OC43
|
Ye,R.-Z., Gong,C., Cui,X.-M., Liu,J.-Y., Fan,H., Xie,H., Wang,Q., Ren,Z.-Y., Zhang,Y.-W., Xia,L.-Y., Zhang,M.-Z., Li,Y.-Y., Li,Z.-H., Du,L.-F., Zhang,J., Cheng,N., Shi,W., Li,M.-Z., Zhao,L., Jiang,J.-F., Jia,N., Huang,F., Cao,W.-C.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2023-02-21
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HCoV-OC43/BIME016-70/2016
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Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 30,684
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2016
| null | null |
Human coronavirus OC43 isolate HCoV-OC43/BIME016-70/2016, complete genome
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| 17,967
|
ON554025.1
|
Human coronavirus OC43
|
Ye,R.-Z., Gong,C., Cui,X.-M., Liu,J.-Y., Fan,H., Xie,H., Wang,Q., Ren,Z.-Y., Zhang,Y.-W., Xia,L.-Y., Zhang,M.-Z., Li,Y.-Y., Li,Z.-H., Du,L.-F., Zhang,J., Cheng,N., Shi,W., Li,M.-Z., Zhao,L., Jiang,J.-F., Jia,N., Huang,F., Cao,W.-C.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2023-02-21
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HCoV-OC43/BIME019-62/2016
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Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,682
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2016
| null | null |
Human coronavirus OC43 isolate HCoV-OC43/BIME019-62/2016, complete genome
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| 17,968
|
ON554026.1
|
Human coronavirus OC43
|
Ye,R.-Z., Gong,C., Cui,X.-M., Liu,J.-Y., Fan,H., Xie,H., Wang,Q., Ren,Z.-Y., Zhang,Y.-W., Xia,L.-Y., Zhang,M.-Z., Li,Y.-Y., Li,Z.-H., Du,L.-F., Zhang,J., Cheng,N., Shi,W., Li,M.-Z., Zhao,L., Jiang,J.-F., Jia,N., Huang,F., Cao,W.-C.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2023-02-21
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HCoV-OC43/BIME020-63/2016
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Betacoronavirus 1
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 30,733
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2016
| null | null |
Human coronavirus OC43 isolate HCoV-OC43/BIME020-63/2016, complete genome
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| 17,969
|
ON554027.1
|
Human coronavirus OC43
|
Ye,R.-Z., Gong,C., Cui,X.-M., Liu,J.-Y., Fan,H., Xie,H., Wang,Q., Ren,Z.-Y., Zhang,Y.-W., Xia,L.-Y., Zhang,M.-Z., Li,Y.-Y., Li,Z.-H., Du,L.-F., Zhang,J., Cheng,N., Shi,W., Li,M.-Z., Zhao,L., Jiang,J.-F., Jia,N., Huang,F., Cao,W.-C.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2023-02-21
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HCoV-OC43/BIME021-51/2016
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Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,684
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2016
| null | null |
Human coronavirus OC43 isolate HCoV-OC43/BIME021-51/2016, complete genome
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| 17,970
|
ON554028.1
|
Human coronavirus OC43
|
Ye,R.-Z., Gong,C., Cui,X.-M., Liu,J.-Y., Fan,H., Xie,H., Wang,Q., Ren,Z.-Y., Zhang,Y.-W., Xia,L.-Y., Zhang,M.-Z., Li,Y.-Y., Li,Z.-H., Du,L.-F., Zhang,J., Cheng,N., Shi,W., Li,M.-Z., Zhao,L., Jiang,J.-F., Jia,N., Huang,F., Cao,W.-C.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2023-02-21
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HCoV-OC43/BIME022-58/2016
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Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 30,767
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2016
| null | null |
Human coronavirus OC43 isolate HCoV-OC43/BIME022-58/2016, complete genome
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| 17,971
|
ON554029.1
|
Human coronavirus OC43
|
Ye,R.-Z., Gong,C., Cui,X.-M., Liu,J.-Y., Fan,H., Xie,H., Wang,Q., Ren,Z.-Y., Zhang,Y.-W., Xia,L.-Y., Zhang,M.-Z., Li,Y.-Y., Li,Z.-H., Du,L.-F., Zhang,J., Cheng,N., Shi,W., Li,M.-Z., Zhao,L., Jiang,J.-F., Jia,N., Huang,F., Cao,W.-C.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2023-02-21
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HCoV-OC43/BIME023-59/2016
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Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,702
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2016
| null | null |
Human coronavirus OC43 isolate HCoV-OC43/BIME023-59/2016, complete genome
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CTCGCACCCACAGCTGGTGCGTTTTTCTTTGGATCAAAATTAGAGTTGGCCAAAGTGCAGAATTTATCTGGGAATCCTGATGAGCCTCAGAAGGATGTTTATGAATTGCGCTATAACGGCGCAATTAGGTTTGACAGTACACTTTCAGGCTTTGAGACCATAATGAAGGTGCTGAGTGAGAATTTGAATGCCTATCAACAACAAGATGGTATGATGAATATGAGTCCAAAACCACAGCGTCAGCGTGGTCATAAGAATGGACAAGGAGAAAATGATAATATAAGTGTTGCAGTGCCCAAAAGCCGCGTGCAGCAAAATAAGAGTATAGAGTTGACTGCAGAGGACATCAGCCTTCTTAAGAAGATGGATGAGCCCTTTACTGAAGATACCTCAGAAATATAAGAGAATGAACCTTATGTCGGCATCTGGTGGTAACCCCTCGCAGAAAAGTCGAGATAAGGCACTCTCTATCAGAATGGATGTCTTGCTGCTATAATAGATAGAGAAGGTTATAGCAGACTATATATTAATTAGTTGAAAGTTTTGTGTTGTAATGTATAGTGTTGGAGAAAGTGAAAGACTTGCGGAAGTAATTGCCGACAAGTGCCAAAGGGAAGAGCCAGCATGTTAAGTTACTACCCAGTAATTAGTAAATGAATGAAGTTAATTATGGCCAATTGGAAGAGCCAGCATGTTAAGTTA
| 17,972
|
ON554030.1
|
Human coronavirus OC43
|
Ye,R.-Z., Gong,C., Cui,X.-M., Liu,J.-Y., Fan,H., Xie,H., Wang,Q., Ren,Z.-Y., Zhang,Y.-W., Xia,L.-Y., Zhang,M.-Z., Li,Y.-Y., Li,Z.-H., Du,L.-F., Zhang,J., Cheng,N., Shi,W., Li,M.-Z., Zhao,L., Jiang,J.-F., Jia,N., Huang,F., Cao,W.-C.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2023-02-21
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HCoV-OC43/BIME041-68/2016
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Betacoronavirus 1
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,739
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2016
| null | null |
Human coronavirus OC43 isolate HCoV-OC43/BIME041-68/2016, complete genome
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| 17,973
|
ON554031.1
|
Human coronavirus OC43
|
Ye,R.-Z., Gong,C., Cui,X.-M., Liu,J.-Y., Fan,H., Xie,H., Wang,Q., Ren,Z.-Y., Zhang,Y.-W., Xia,L.-Y., Zhang,M.-Z., Li,Y.-Y., Li,Z.-H., Du,L.-F., Zhang,J., Cheng,N., Shi,W., Li,M.-Z., Zhao,L., Jiang,J.-F., Jia,N., Huang,F., Cao,W.-C.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
|
2023-02-21
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HCoV-OC43/BIME050-53/2016
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Betacoronavirus 1
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,692
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2016
| null | null |
Human coronavirus OC43 isolate HCoV-OC43/BIME050-53/2016, complete genome
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CCCATTCTTGCAGAACTCGCACCCACAGCTGGTGCGTTTTTCTTTGGATCAAAATTAGAGTTGGCCAAAGTGCAGAATTTATCTGGGAATCCTGATGAGCCTCAGAAGGATGTTTATGAATTACGCTATAACGGCGCAATTAGGTTTGACAGTACACTTTCAGGCTTTGAGACCATAATGAAGGTGCTGAGTGAGAATTTGAATGCCTATCAACAACAAGATGGTATGATGAATATGAGTCCAAAACCACAGCGTCAGCGTGGTCATAAGAATGGACAAGGAGAAAATGATAATATAAGTGTTGCAGTGCCCAAAAGCCGCGTGCAGCAAAATAAGAGTATAGAGTTGACTGCAGAGGACATCAGCCTTCTTAAGAAGATGGATGAGCCCTTTACTGAAGACACCTCAGAAATATAAGAGAATGAACCTTATGTCGGCATCTGGTGGTAACCCCTCGCAGAAAAGTCGAGATAAGGCACTCTCTATCAGAATGGATGTCTTGCTGCTATAATAGATAGAGAAGGTTATAGCAGACTATATATTAATTAGTTGAAAGTTTTGTGTTGTAATGTATAGTGTTGGAGAAAGTGAAAGACTTGCGGAAGTAATTGCCGACAAGTGCCAAAGGGAAGAGCCAGCATGTTAAGTTACTACCCAGTAATTAGTAAATGAATGAAGTTAATTATGGCCAA
| 17,974
|
ON554032.1
|
Human coronavirus OC43
|
Ye,R.-Z., Gong,C., Cui,X.-M., Liu,J.-Y., Fan,H., Xie,H., Wang,Q., Ren,Z.-Y., Zhang,Y.-W., Xia,L.-Y., Zhang,M.-Z., Li,Y.-Y., Li,Z.-H., Du,L.-F., Zhang,J., Cheng,N., Shi,W., Li,M.-Z., Zhao,L., Jiang,J.-F., Jia,N., Huang,F., Cao,W.-C.
|
Beijing Institute of Microbiology and Epidemiology, State Key Laboratory of Pathogen and Biosecurity
|
China
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2023-02-21
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HCoV-OC43/BIME060-48/2016
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Betacoronavirus 1
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 30,658
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2016
| null | null |
Human coronavirus OC43 isolate HCoV-OC43/BIME060-48/2016, complete genome
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| 17,975
|
KX513865.1
|
Human gut gokushovirus
|
Guo,L., Hua,X., Zhang,W., Yang,S., Shen,Q., Hu,H., Li,J., Liu,Z., Wang,X., Wang,H., Zhou,C., Cui,L.
|
School of Agrinculture and Biology, Shanghai Jiaotong University
|
China
|
2017-05-15
|
SH-CHD2
|
Human gut gokushovirus
| null |
Microviridae
|
ssDNA(+)
| 5,135
|
GenBank
| 1
|
China
|
China
| null | null | null | null | null |
Human gut gokushovirus isolate SH-CHD2, complete genome
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Guo,L., Hua,X., Zhang,W., Yang,S., Shen,Q., Hu,H., Li,J., Liu,Z., Wang,X., Wang,H., Zhou,C., Cui,L.
|
School of Agrinculture and Biology, Shanghai Jiaotong University
|
China
|
2017-05-15
|
SH-CHD4
|
Human gut gokushovirus
| null |
Microviridae
|
ssDNA(+)
| 5,018
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GenBank
| 1
|
China
|
China
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School of Agrinculture and Biology, Shanghai Jiaotong University
|
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|
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|
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|
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|
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|
China
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| 76,662
|
KX513872.1
|
Human gut gokushovirus
|
Guo,L., Hua,X., Zhang,W., Yang,S., Shen,Q., Hu,H., Li,J., Liu,Z., Wang,X., Wang,H., Zhou,C., Cui,L.
|
School of Agrinculture and Biology, Shanghai Jiaotong University
|
China
|
2017-05-15
|
SH-CHD9
|
Human gut gokushovirus
| null |
Microviridae
|
ssDNA(+)
| 5,024
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GenBank
| 1
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China
|
China
| null | null | null | null | null |
Human gut gokushovirus isolate SH-CHD9, complete genome
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School of Agrinculture and Biology, Shanghai Jiaotong University
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2017-05-15
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China
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School of Agrinculture and Biology, Shanghai Jiaotong University
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2017-05-15
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Human gut gokushovirus
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Guo,L., Hua,X., Zhang,W., Yang,S., Shen,Q., Hu,H., Li,J., Liu,Z., Wang,X., Wang,H., Zhou,C., Cui,L.
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School of Agrinculture and Biology, Shanghai Jiaotong University
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China
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2017-05-15
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SH-CHD14
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Human gut gokushovirus
| null |
Microviridae
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ssDNA(+)
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GenBank
| 1
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China
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China
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Human gut gokushovirus isolate SH-CHD14, complete genome
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| 76,668
|
LC416593.1
|
Human hepatitis A virus
|
Watanabe,S., Morimoto,N., Miura,K., Takaoka,Y., Nomoto,H., Tsukui,M., Isoda,N., Ohnishi,H., Nagashima,S., Takahashi,M., Okamoto,H., Yamamoto,H.
|
Division of Virology, Department of Infection and Immunity; 3311-1 Yakushiji, Shimotsuke, Tochigi 329-0498
|
Japan
|
2019-01-18
|
HA18-0500
|
Hepatovirus A
|
Hepatovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,494
|
GenBank
| 1
|
Japan:Tochigi
|
Japan
|
Homo sapiens
|
blood
|
2018-03-06
| null | null |
Human hepatitis A virus HA18-0500 RNA, complete genome
|
TTCAAGAGGGGTCTCCGGAGTTTTCCGGAGCCCCTCTTGGAAGTCCATGGTGAGGGGACTTGATACCTCACCGCCGTTTGCCTAGGCTATAGGCTAAGTTTCCCTTTCCCTGTCCCTTCCTTATTTCCCTTTGTCTTGTTTGTAAATATTAATTCCTGCAGGTTCAGGGTTCTTTAATCTGTTTCTCTATAAGAACACTCAATTTTCACGCTTTCTGTCTTCTTTCTTCCAGGGCTCTCCCCTTGCCCTAGGCTCTGGCCGTTGCGCCCGGCGGGGTCAACTTCATGATTAGCATGGAGCTGTAGGAGTCTAAATTGGGGACGCAGATGTTTGGGACGTCGCCTTGCAGTGTTAACTTGGCTCTCATGAACCTCTTTGATCTTCCATAAGGGGTAGGCTACGGGTGAAACTCCTTAGGCTAATACTTCTATGAAGAGATGCCTTGGATAGGGTAACAGCGGCGGATATTGGTGAGTTGTTAAGACAAAAACCATTCAACGCCGGAGGACTGGCTCTCATCCAGTGGATGCATTGAGTGAATTGATTGTCAGGGCTGTCTCTAGGTTTAATCTCAGACCTCTCTGTGCTTAGGGCAAACACTATTTGGCCTTAAATGGGATCCTGTGAGAGGGGGTCCCTCCATTGACAGCTGGACTGTTCTTTGGGGCCTTATGTAGTGTTTGCCTCTGAGGTACTCAGGGGCATTTAGGTTTTTCCTCATTCTTAAACAATAATGAATATGTCCAAACAAGGAATTTTCCAGACTGTTGGGAGTGGTCTTGACCACATCCTGTCTTTGGCAGATATTGAGGAAGAACAAATGATCCAGTCCGTTGATAGGACTGCAGTGACTGGTGCTTCTTATTTTACTTCTGTGGACCAATCTTCAGTTCACACTGCTGAGGTTGGTTCACATCAAATTGAACCTTTGAAAACCTCCGTTGATAAACCTGGTTCTAAGAAGACTCAGGGAGAGAAGTTTTTCTTGATCCATTCTGCGGACTGGCTCACTACACATGCTCTTTTTCATGAAGTTGCAAAATTGGATGTGGTGAAATTATTGTATAATGAGCAGTTTGCTGTCCAAGGCTTGTTGAGATACCATACATATGCAAGATTTGGCATTGAGATTCAAGTTCAGATAAATCCCACACCCTTTCAGCAAGGGGGATTGATTTGTGCCATGGTTCCTGGTGACCAAAGTTATGGTTCGATAGCATCCTTGACTGTTTATCCTCATGGTCTGTTAAATTGTAACATCAACAATGTAGTTAGAATAAAGGTTCCTTTTATTTATACTAGAGGTGCTTATCATTTTAAGGATCCACAGTACCCAGTTTGGGAATTAACAATTAGGGTTTGGTCAGAGTTGAATATTGGAACAGGAACTTCAGCTTACACTTCACTTAATGTTTTAGCTAGGTTTACAGATTTGGAGCTGCATGGGTTAACTCCTCTTTCTACACAGATGATGAGAAATGAATTTAGAGTTAGTACTACTGAAAATGTTGTAAATTTGTCAAATTATGAAGATGCAAGGGCAAAAATGTCCTTTGCTTTGGATCAGGAAGATTGGAAGTCTGATCCCTCTCAAGGCGGTGGAATTAGAATTACTCATTTTACTACTTGGACATCCATTCCAACCTTAGCTGCCCAGTTTCCATTCAATGCTTCAGATTCGGTTGGGCAACAAATTAAGGTTATTCCAGTGGACCCATATTTTTTCCAGATGACAAACACTAATCCTGATCAGAAATGTATAACTGCCCTGGCCTCCATTTGTCAGATGTTTTGTTTTTGGAGAGGAGATCTCGTTTTTGATTTTCAGGTTTTTCCAACCAAATATCATTCAGGTAGATTACTGTTTTGCTTTGTTCCTGGGAATGAGTTGATAGATGTTACTGGAATTACATTAAAGCAGGCAACCACTGCTCCTTGTGCAGTAATGGACATTACAGGAGTGCAATCAACCTTGAGATTTCGTGTTCCTTGGATTTCTGATACACCTTATCGAGTTAATAGGTACACGAAGTCAGCACATCAAAAAGGTGAGTACACTGCTATTGGAAAGCTTATTGTGTACTGTTATAATAGACTGACTTCTCCTTCTAATGTTGCTTCTCATGTTAGAGTTAATGTTTATCTTTCAGCAATTAATTTGGAATGTTTTGCTCCTCTTTATCATGCTATGGATGTTACCACACAGGTTGGAGATGATTCAGGAGGTTTTTCAACAACAGTTTCTACAGAGCAGAATGTTCCTGATCCCCAAGTAGGCATAACAACTATGAGGGACTTAAAAGGGAAAGCCAATAGGGGAAAGATGGATGTTTCAGGAGTGCAAGCACCTGTGGGAGCTATCACAACAATTGAGGATCCAGTTTTAGCAAAGAAAGTGCCTGAGACATTTCCTGAATTGAAGCCTGGAGAGTCCAGACATACATCAGATCATATGTCTATTTATAAATTTATGGGAAGGTCTCATTTTTTGTGTACTTTTACTTTTAATTCAAATAATAAAGAGTACACATTTCCAATAACTTTGTCTTCGACTTCTAATCCTCCTCATGGTTTACCATCAACATTAAGGTGGTTTTTCAATCTTTTTCAGTTGTATAGAGGACCATTGGATTTGACAATTATTATCACAGGAGCCACTGATGTAGATGGAATGGCCTGGTTCACTCCAGTAGGCCTTGCAGTTGACACCCCTTGGGTGGAAAAGGAGTCAGCTTTGTCTATTGATTATAAAACTGCTCTTGGAGCTGTTAGATTCAATACAAGAAGAACAGGAAACATTCAGATTAGATTGCCATGGTATTCTTATTTGTATGCTGTGTCTGGAGCACTGGATGGTTTAGGAGATAAGACAGATTCTACATTTGGATTGGTTTCTATTCAGATTGCAAATTACAATCATTCTGATGAATATTTGTCCTTTAGTTGCTATTTGTCTGTCACAGAACAATCAGAGTTCTATTTTCCTAGAGCTCCATTAAATTCAAATGCTATGTTGTCCACTGAGTCCATGATGAGTAGAATTGCAGCTGGAGACTTGGAATCATCAGTGGATGATCCTAGATCTGAGGAGGACAGAAGATTTGAGAGTCACATAGAATGTAGGAAACCATACAAAGAATTGAGATTGGAAGTTGGCAAACAAAGACTCAAATATGCTCAGGAAGAGTTGTCAAATGAAGTGCTTCCACCTCCTAGGAAAATGAAGGGGGTCTTTTCACAAGCAAAAATTTCTCTTTTTTATACTGAGGAGCATGAAATAATGAAATTTTCTTGGAGAGGAGTGACTGCTGATACTAGGGCTTTGAGAAGATTTGGATTTTCTATGGCTGCTGGTAGAAGTGTGTGGACTCTTGAGATGGATGCTGGAGTTCTTACTGGAAGATTGGTTAGATTGAATGATGAGAAATGGACAGAAATGAAGGATGACAAAATTGTTTCATTAATTGAAAAGTTCACAAGCAATAAATATTGGTCTAAAGTGAATTTTCCACATGGAATGTTGGATCTTGAAGAAATTGCTGCCAACTCTAAAGATTTTCCAAATATGTCTGAGACAGATTTGTGTTTCCTGTTGCATTGGTTAAATCCAAAGAAAATTAATTTAGCAGATAGAATGCTTGGATTATCTGGAGTGCAGGAAATTAAAGAACAGGGTGTTGGATTGATAGCAGAGTGCAGAACATTCTTGGATTCTATTGCCGGGACTCTGAAATCTATGATGTTTGGATTTCATCATTCTGTGACTGTTGAAATTATAAATACTGTACTTTGCTTTGTTAAGAGTGGAATCCTACTTTATGTCATACAACAATTGAACCAAGATGAGCATTCCCACATAATTGGTTTGTTGAGAGTTATGAATTATGCAGATATTGGCTGTTCAGTTATTTCATGTGGTAAAGTTTTTTCCAAAATGTTAGAAACAGTTTTTAATTGGCAAATGGACTCCAGAATGATGGAGTTGAGAACTCAGAGCTTTTCTAATTGGTTAAGGGACATTTGTTCAGGAATTACAATTTTTAAAAGTTTTAAGGATGCCATATATTGGCTATATACAAAATTGAAGGATTTTTATGAAGTAAATTATGGCAAGAAGAAGGATGTTCTTAATATTCTTAAAGACAACCAGCAAAAAATAGAAAAAGCTATTGAAGAAGCAGACAATTTCTGCATTTTGCAAATTCAAGATGTAGAGAAATTTGATCAGTATCAAAAAGGGGTTGATTTGATACAAAAGCTGAGAACTGTCCATTCAATGGCTCAAGTTGACCCTAAACTTGGGGTTCATTTGTCACCTCTTAGAGATTGTATAGCCAGAGTCCACCAAAAGCTCAAAAATCTTGGATCTATAAATCAGGCCATGGTGACAAGGTGTGAGCCAGTTGTTTGCTATTTATATGGCAAAAGAGGGGGAGGGAAAAGTTTGACTTCAATTGCATTGGCAACCAAAATTTGTAAACACTATGGTGTTGAACCTGAGAAAAATATTTACACCAAACCTGTGGCCTCAGATTATTGGGATGGTTACAGTGGACAATTGGTTTGCATTATTGATGATATTGGCCAAAATACAACAGATGAAGATTGGTCAGATTTTTGTCAATTAGTGTCAGGATGTCCAATGAGATTGAATATGGCTTCTCTTGAGGAGAAAGGTAGACATTTTTCTTCTCCTTTTATAATAGCAACTTCAAATTGGTCAAATCCAAGTCCAAAGACAGTTTATGTTAAGGAAGCAATTGATCGCAGGCTTCATTTTAAGGTTGAAGTTAAACCTGCTTCATTTTTTAAAAATCCTCACAATGATATGTTGAATGTTAATTTGGCTAAAACAAATGATGCAATTAAGGACATGTCTTGTGTTGATTTAATAATGGATGGACACAATATTTCATTGATGGATTTACTTAGTTCCTTAGTGATGACAGTTGAAATTAGGAAACAAAACATGAGTGAATTCATGGAGTTGTGGTCTCAGG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| 65,705
|
LC416594.1
|
Human hepatitis A virus
|
Watanabe,S., Morimoto,N., Miura,K., Takaoka,Y., Nomoto,H., Tsukui,M., Isoda,N., Ohnishi,H., Nagashima,S., Takahashi,M., Okamoto,H., Yamamoto,H.
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Division of Virology, Department of Infection and Immunity; 3311-1 Yakushiji, Shimotsuke, Tochigi 329-0498
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Japan
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2019-01-18
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HA18-0551
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Hepatovirus A
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Hepatovirus
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Picornaviridae
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ssRNA(+)
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GenBank
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Japan:Tochigi
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Japan
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Homo sapiens
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blood
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2018-04-19
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Human hepatitis A virus HA18-0551 RNA, complete genome
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| 65,706
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LC416595.1
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Human hepatitis A virus
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Watanabe,S., Morimoto,N., Miura,K., Takaoka,Y., Nomoto,H., Tsukui,M., Isoda,N., Ohnishi,H., Nagashima,S., Takahashi,M., Okamoto,H., Yamamoto,H.
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Division of Virology, Department of Infection and Immunity; 3311-1 Yakushiji, Shimotsuke, Tochigi 329-0498
|
Japan
|
2019-01-18
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HA18-0838
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Hepatovirus A
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Hepatovirus
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Picornaviridae
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ssRNA(+)
| 7,494
|
GenBank
| 1
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Japan:Tochigi
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Japan
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Homo sapiens
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blood
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2018-05-21
| null | null |
Human hepatitis A virus HA18-0838 RNA, complete genome
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TTCAAGAGGGGTCTCCGGAGTTTTCCGGAGCCCCTCTTGGAAGTCCATGGTGAGGGGACTTGATACCTCACCGCCGTTTGCCTAGGCTATAGGCTAAGTTTCCCTTTCCCTGTCCCTTCCTTATTTCCCTTTGTCTTGTTTGTAAATATTAATTCCTGCAGGTTCAGGGTTCTTTAATCTGTTTCTCTATAAGAACACTCAATTTTCACGCTTTCTGTCTTCTTTCTTCCAGGGCTCTCCCCTTGCCCTAGGCTCTGGCCGTTGCGCCCGGCGGGGTCAACTTCATGATTAGCATGGAGCTGTAGGAGTCTAAATTGGGGACGCAGATGTTTGGGACGTCGCCTTGCAGTGTTAACTTGGCTCTCATGAACCTCTTTGATCTTCCATAAGGGGTAGGCTACGGGTGAAACTCCTTAGGCTAATACTTCTATGAAGAGATGCCTTGGATAGGGTAACAGCGGCGGATATTGGTGAGTTGTTAAGACAAAAACCATTCAACGCCGGAGGACTGGCTCTCATCCAGTGGATGCATTGAGTGAATTGATTGTCAGGGCTGTCTCTAGGTTTAATCTCAGACCTCTCTGTGCTTAGGGCAAACACTATTTGGCCTTAAATGGGATCCTGTGAGAGGGGGTCCCTCCATTGACAGCTGGACTGTTCTTTGGGGCCTTATGTAGTGTTTGCCTCTGAGGTACTCAGGGGCATTTAGGTTTTTCCTCATTCTTAAACAATAATGAATATGTCCAAACAAGGAATTTTCCAGACTGTTGGGAGTGGTCTTGACCACATCCTGTCTTTGGCAGATATTGAGGAAGAACAAATGATCCAGTCCGTTGATAGGACTGCAGTGACTGGTGCTTCTTATTTTACTTCTGTGGACCAATCTTCAGTTCACACTGCTGAGGTTGGTTCACATCAAATTGAACCTTTGAAAACCTCCGTTGATAAACCTGGTTCTAAGAAGACTCAGGGAGAGAAGTTTTTCTTGATCCATTCTGCGGACTGGCTCACTACACATGCTCTTTTTCATGAAGTTGCAAAATTGGATGTGGTGAAATTATTGTATAATGAGCAGTTTGCTGTCCAAGGCTTGTTGAGATACCATACATATGCAAGATTTGGCATTGAGATTCAAGTTCAGATAAATCCCACACCCTTTCAGCAAGGGGGATTGATTTGTGCCATGGTTCCTGGTGACCAAAGTTATGGTTCGATAGCATCCTTGACTGTTTATCCTCATGGTCTGTTAAATTGTAACATCAACAATGTAGTTAGAATAAAGGTTCCTTTTATTTATACTAGAGGTGCTTATCATTTTAAGGATCCACAGTACCCAGTTTGGGAATTAACAATTAGGGTTTGGTCAGAGTTGAATATTGGAACAGGAACTTCAGCTTACACTTCACTTAATGTTTTAGCTAGGTTTACAGATTTGGAGCTGCATGGGTTAACTCCTCTTTCTACACAGATGATGAGAAATGAATTTAGAGTTAGTACTACTGAAAATGTTGTAAATTTGTCAAATTATGAAGATGCAAGGGCAAAAATGTCCTTTGCTTTGGATCAGGAAGATTGGAAGTCTGATCCCTCTCAAGGCGGTGGAATTAGAATTACTCATTTTACTACTTGGACATCCATTCCAACCTTAGCTGCCCAGTTTCCATTCAATGCTTCAGATTCGGTTGGGCAACAAATTAAGGTTATTCCAGTGGACCCATATTTTTTCCAGATGACAAACACTAATCCTGATCAGAAATGTATAACTGCCCTGGCCTCCATTTGTCAGATGTTTTGTTTTTGGAGAGGAGATCTCGTTTTTGATTTTCAGGTTTTTCCAACCAAATATCATTCAGGTAGATTACTGTTTTGCTTTGTTCCTGGGAATGAGTTGATAGATGTTACTGGAATTACATTAAAGCAGGCAACCACTGCTCCTTGTGCAGTAATGGACATTACAGGAGTGCAATCAACCTTGAGATTTCGTGTTCCTTGGATTTCTGATACACCTTATCGAGTTAATAGGTACACGAAGTCAGCACATCAAAAAGGTGAGTACACTGCTATTGGAAAGCTTATTGTGTACTGTTATAATAGACTGACTTCTCCTTCTAATGTTGCTTCTCATGTTAGAGTTAATGTTTATCTTTCAGCAATTAATTTGGAATGTTTTGCTCCTCTTTATCATGCTATGGATGTTACCACACAGGTTGGAGATGATTCAGGAGGTTTTTCAACAACAGTTTCTACAGAGCAGAATGTTCCTGATCCCCAAGTAGGCATAACAACTATGAGGGACTTAAAAGGGAAAGCCAATAGGGGAAAGATGGATATTTCAGGAGTGCAAGCACCTGTGGGAGCTATCACAACAATTGAGGATCCAGTTTTAGCAAAGAAAGTGCCTGAGACATTTCCTGAATTGAAGCCTGGAGAGTCCAGACATACATCAGATCATATGTCTATTTATAAATTTATGGGAAGGTCTCATTTTTTGTGTACTTTTACTTTTAATTCAAATAATAAAGAGTACACATTTCCAATAACTTTGTCTTCGACTTCTAATCCTCCTCATGGTTTACCATCAACATTAAGGTGGTTTTTCAATCTTTTTCAGTTGTATAGAGGACCATTGGATTTGACAATTATTATCACAGGAGCCACTGATGTAGATGGAATGGCCTGGTTCACTCCAGTAGGCCTTGCAGTTGACACCCCTTGGGTGGAAAAGGAGTCAGCTTTGTCTATTGATTATAAAACTGCTCTTGGAGCTGTTAGATTCAATACAAGAAGAACAGGAAACATTCAGATTAGATTGCCATGGTATTCTTATTTGTATGCTGTGTCTGGAGCACTGGATGGTTTAGGAGATAAGACAGATTCTACATTTGGATTGGTTTCTATTCAGATTGCAAATTACAATCATTCTGATGAATATTTGTCCTTTAGTTGCTATTTGTCTGTCACAGAACAATCAGAGTTCTATTTTCCTAGAGCTCCATTAAATTCAAATGCTATGTTGTCCACTGAGTCCATGATGAGTAGAATTGCAGCTGGAGACTTGGAATCATCAGTGGATGATCCTAGATCTGAGGAGGACAGAAGATTTGAGAGTCACATAGAATGTAGGAAACCATACAAAGAATTGAGATTGGAAGTTGGCAAACAAAGACTCAAATATGCTCAGGAAGAGTTGTCAAATGAAGTGCTTCCACCTCCTAGGAAAATGAAGGGGGTCTTTTCACAAGCAAAAATTTCTCTTTTTTATACTGAGGAGCATGAAATAATGAAATTTTCTTGGAGAGGAGTGACTGCTGATACTAGGGCTTTGAGAAGATTTGGATTTTCTATGGCTGCTGGTAGAAGTGTGTGGACTCTTGAGATGGATGCTGGAGTTCTTACTGGAAGATTGGTTAGATTGAATGATGAGAAATGGACAGAAATGAAGGATGACAAAATTGTTTCATTAATTGAAAAGTTCACAAGCAATAAATATTGGTCTAAAGTGAATTTTCCACATGGAATGTTGGATCTTGAAGAAATTGCTGCCAACTCTAAAGATTTTCCAAATATGTCTGAGACAGATTTGTGTTTCCTGTTGCATTGGTTAAATCCAAAGAAAATTAATTTAGCAGATAGAATGCTTGGATTATCTGGAGTGCAGGAAATTAAAGAACAGGGTGTTGGATTGATAGCAGAGTGCAGAACATTCTTGGATTCTATTGCCGGGACTCTGAAATCTATGATGTTTGGATTTCATCATTCTGTGACTGTTGAAATTATAAATACTGTACTTTGCTTTGTTAAGAGTGGAATCCTACTTTATGTCATACAACAATTGAACCAAGATGAGCATTCCCACATAATTGGTTTGTTGAGAGTTATGAATTATGCAGATATTGGCTGTTCAGTTATTTCATGTGGTAAAGTTTTTTCCAAAATGTTAGAAACAGTTTTTAATTGGCAAATGGACTCCAGAATGATGGAGTTGAGAACTCAGAGCTTTTCTAATTGGTTAAGGGACATTTGTTCAGGAATTACAATTTTTAAAAGTTTTAAGGATGCCATATATTGGCTATATACAAAATTGAAGGATTTTTATGAAGTAAATTATGGCAAGAAGAAGGATGTTCTTAATATTCTTAAAGACAACCAGCAAAAAATAGAAAAAGCTATTGAAGAAGCAGACAATTTCTGCATTTTGCAAATTCAAGATGTAGAGAAATTTGATCAGTATCAAAAAGGGGTTGATTTGATACAAAAGCTGAGAACTGTCCATTCAATGGCTCAAGTTGACCCTAACCTTGGGGTTCATTTGTCACCTCTTAGAGATTGTATAGCCAGAGTCCACCAAAAGCTCAAAAATCTTGGATCTATAAATCAGGCCATGGTGACAAGGTGTGAGCCAGTTGTTTGCTATTTATATGGCAAAAGAGGGGGAGGGAAAAGTTTGACTTCAATTGCATTGGCAACCAAAATTTGTAAACACTATGGTGTTGAACCTGAGAAAAATATTTACACCAAACCTGTGGCCTCAGATTATTGGGATGGTTACAGTGGACAATTGGTTTGCATTATTGATGATATTGGCCAAAATACAACAGATGAAGATTGGTCAGATTTTTGTCAATTAGTGTCAGGATGTCCAATGAGATTGAATATGGCTTCTCTTGAGGAGAAAGGTAGACATTTTTCTTCTCCTTTTATAATAGCAACTTCAAATTGGTCAAATCCAAGTCCAAAGACAGTTTATGTTAAGGAAGCAATTGATCGCAGGCTTCATTTTAAGGTTGAAGTTAAACCTGCTTCATTTTTTAAAAATCCTCACAATGATATGTTGAATGTTAATTTGGCTAAAACAAATGATGCAATTAAGGACATGTCTTGTGTTGATTTAATAATGGATGGACACAATATTTCATTGATGGATTTACTTAGTTCCTTAGTGATGACAGTTGAAATTAGGAAACAAAACATGAGTGAATTCATGGAGTTGTGGTCTCAGG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|
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Human hepatitis A virus
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Watanabe,S., Morimoto,N., Miura,K., Takaoka,Y., Nomoto,H., Tsukui,M., Isoda,N., Ohnishi,H., Nagashima,S., Takahashi,M., Okamoto,H., Yamamoto,H.
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Division of Virology, Department of Infection and Immunity; 3311-1 Yakushiji, Shimotsuke, Tochigi 329-0498
|
Japan
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2019-01-18
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Hepatovirus A
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Hepatovirus
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Picornaviridae
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Japan
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Human hepatitis A virus HA18-1053 RNA, complete genome
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| 65,708
|
LC435032.1
|
Human hepatitis A virus
|
Watanabe,S., Morimoto,N., Miura,K., Takaoka,Y., Nomoto,H., Tsukui,M., Isoda,N., Ohnishi,H., Nagashima,S., Takahashi,M., Okamoto,H., Yamamoto,H.
|
Division of Virology, Department of Infection and Immunity; 3311-1 Yakushiji, Shimotsuke, Tochigi 329-0498
|
Japan
|
2019-01-18
|
HA18-1167
|
Hepatovirus A
|
Hepatovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,494
|
GenBank
| 1
|
Japan:Tochigi
|
Japan
|
Homo sapiens
|
blood
|
2018-08-10
| null | null |
Human hepatitis A virus HA18-1167 RNA, complete genome
|
TTCAAGAGGGGTCTCCGGAGTTTTCCGGAGCCCCTCTTGGAAGTCCGTGGTGAGGGGACTTGATACCTCACCGCCGTTTGCCTAGGCTATAGGCTAAGTTTCCCTTTCCCTGTCCCTTCCTTATTTCCCTTTGTCTTGTTTGTAAATATTAATTCCTGCAGGTTCAGGGTTCTTTAATCTGTTTCTCTATAAGAACACTCAATTTTCACGCTTTCTGTCTTCTTTCTTCCAGGGCTCTCCCCTTGCCCTAGGCTCTGGCCGTTGCGCCCGGCGGGGTCAACTTCATGATTAGCATGGAGCTGTAGGAGTCTAAATTGGGGACGCAGATGTTTGGGACGTCGCCTTGCAGTGTTAACTTGGCTCTCATGAACCTCTTTGATCTTCCATAAGGGGTAGGCTACGGGTGAAACTCCTTAGGCTAATACTTCTATGAAGAGATGCCTTGGATAGGGTAACAGCGGCGGATATTGGTGAGTTGTTAAGACAAAAACCATTCAACGCCGGAGGACTGGCTCTCATCCAGTGGATGCATTGAGTGAATTGATTGTCAGGGCTGTCTCTAGGTTTAATCTCAGACCTCTCTGTGCTTAGGGCAAACACTATTTGGCCTTAAATGGGATCCTGTGAGAGGGGGTCCCTCCATTGACAGCTGGACTGTTCTTTGGGGCCTTATGTAGTGTTTGCCTCTGAGGTACTCAGGGGCATTTAGGTTTTTCCTCATTCTTAAACAATAATGAATATGTCCAAACAAGGAATTTTCCAGACTGTTGGGAGTGGTCTTGACCACATCCTGTCTTTGGCAGATATTGAGGAAGAACAAATGATCCAGTCCGTTGATAGGACTGCAGTGACTGGTGCTTCTTATTTTACTTCTGTGGACCAATCTTCAGTTCACACTGCTGAGGTTGGTTCACATCAAATTGAACCTTTGAAAACCTCCGTTGATAAACCTGGTTCTAAGAAGACTCAGGGAGAGAAGTTTTTCTTGATCCATTCTGCGGACTGGCTCACTACACATGCTCTTTTTCATGAAGTTGCAAAATTGGATGTGGTGAAATTATTGTATAATGAGCAGTTTGCTGTCCAAGGCTTGTTGAGATACCATACATATGCAAGATTTGGCATTGAGATTCAAGTTCAGATAAATCCCACACCCTTTCAGCAAGGGGGATTGATTTGTGCCATGGTTCCTGGTGACCAAAGTTATGGTTCGATAGCATCCTTGACTGTTTATCCTCATGGTCTGTTAAATTGTAACATCAACAATGTAGTTAGAATAAAGGTTCCTTTTATTTATACTAGAGGTGCTTATCATTTTAAGGATCCACAGTACCCAGTTTGGGAATTAACAATTAGGGTTTGGTCAGAGTTGAATATTGGAACAGGAACTTCAGCTTACACTTCACTTAATGTTTTAGCTAGGTTTACAGATTTGGAGCTGCATGGGTTAACTCCTCTTTCTACACAGATGATGAGAAATGAATTTAGAGTTAGTACTACTGAAAATGTTGTAAATTTGTCAAATTATGAAGATGCAAGGGCAAAAATGTCCTTTGCTTTGGATCAGGAAGATTGGAAGTCTGATCCCTCTCAAGGCGGTGGAATTAGAATTACTCATTTTACTACTTGGACATCCATTCCAACCTTAGCTGCCCAGTTTCCATTCAATGCTTCAGATTCGGTTGGGCAACAAATTAAGGTTATTCCAGTGGACCCATATTTTTTCCAGATGACAAACACTAATCCTGATCAGAAATGTATAACTGCCCTGGCCTCCATTTGTCAGATGTTTTGTTTTTGGAGAGGAGATCTCGTTTTTGATTTTCAGGTTTTTCCAACCAAATATCATTCAGGTAGATTACTGTTTTGCTTTGTTCCTGGGAATGAGTTGATAGATGTTACTGGAATTACATTAAAGCAGGCAACCACTGCTCCTTGTGCAGTAATGGACATTACAGGAGTGCAATCAACCTTGAGATTTCGTGTTCCTTGGATTTCTGATACACCTTATCGAGTTAATAGGTACACGAAGTCAGCACATCAAAAAGGTGAGTACACTGCTATTGGAAAGCTTATTGTGTACTGTTATAATAGACTGACTTCTCCTTCTAATGTTGCTTCTCATGTTAGAGTTAATGTTTATCTTTCAGCAATTAATTTGGAATGTTTTGCTCCTCTTTATCATGCTATGGATGTTACCACACAGGTTGGAGATGATTCAGGAGGTTTTTCAACAACAGTTTCTACCGAGCAGAATGTTCCTGATCCCCAAGTAGGCATAACAACTATGAGGGACTTAAAAGGGAAAGCCAATAGGGGAAAGATGGATGTTTCAGGAGTGCAAGCACCTGTGGGAGCTATCACAACAATTGAGGATCCAGTTTTAGCAAAGAAAGTGCCTGAGACATTTCCTGAATTGAAGCCTGGAGAGTCCAGACATACATCAGATCATATGTCTATTTATAAATTTATGGGAAGGTCTCATTTTTTGTGTACTTTTACTTTTAATTCAAATAATAAAGAGTACACATTTCCAATAACTTTGTCTTCGACTTCTAATCCTCCTCATGGTTTACCATCAACATTAAGGTGGTTTTTCAATCTTTTTCAGTTGTATAGAGGACCATTGGATTTGACAATTATTATCACAGGAGCCACTGATGTAGATGGAATGGCCTGGTTCACTCCAGTAGGCCTTGCAGTTGACACCCCTTGGGTGGAAAAGGAGTCAGCTTTGTCTATTGATTATAAAACTGCTCTTGGAGCTGTTAGATTCAATACAAGAAGAACAGGAAACATTCAGATTAGATTGCCATGGTATTCTTATTTGTATGCTGTGTCTGGAGCACTGGATGGTTTAGGAGATAAGACAGATTCTACATTTGGATTGGTTTCTATTCAGATTGCAAATTACAATCATTCTGATGAATATTTGTCCTTTAGTTGCTATTTGTCTGTCACAGAACAATCAGAGTTCTATTTTCCTAGAGCTCCATTAAATTCAAATGCTATGTTGTCCACTGAGTCCATGATGAGTAGAATTGCAGCTGGAGACTTGGAATCATCAGTGGATGATCCTAGATCTGAGGAGGACAGAAGATTTGAGAGTCACATAGAATGTAGGAAACCATACAAAGAATTGAGATTGGAAGTTGGCAAACAAAGACTCAAATATGCTCAGGAAGAGTTGTCAAATGAAGTGCTTCCACCTCCTAGGAAAATGAAGGGGGTCTTTTCACAAGCAAAAATTTCTCTTTTTTATACTGAGGAGCATGAAATAATGAAATTTTCTTGGAGAGGAGTGACTGCTGATACTAGGGCTTTGAGAAGATTTGGATTTTCTATGGCTGCTGGTAGAAGTGTGTGGACTCTTGAGATGGATGCTGGAGTTCTTACTGGAAGATTGGTTAGATTGAATGATGAGAAATGGACAGAAATGAAGGATGACAAAATTGTTTCATTAATTGAAAAGTTCACAAGCAATAAATATTGGTCTAAAGTGAATTTTCCACATGGAATGTTGGATCTTGAAGAAATTGCTGCCAACTCTAAAGATTTTCCAAATATGTCTGAGACAGATTTGTGTTTCCTGTTGCATTGGTTAAATCCAAAGAAAATTAATTTAGCAGATAGAATGTTTGGATTATCTGGAGTGCAGGAAATTAAAGAACAGGGTGTTGGATTGATAGCAGAGTGCAGAACATTCTTGGATTCTATTGCCGGGACTCTGAAATCTATGATGTTTGGATTTCATCATTCTGTGACTGTTGAAATTATAAATACTGTACTTTGCTTTGTTAAGAGTGGAATCCTACTTTATGTCATACAACAATTGAACCAAGATGAGCATTCCCACATAATTGGTTTGTTGAGAGTTATGAATTATGCAGATATTGGCTGTTCAGTTATTTCATGTGGTAAAGTTTTTTCCAAAATGTTAGAAACAGTTTTTAATTGGCAAATGGACTCCAGAATGATGGAGTTGAGAACTCAGAGCTTTTCTAATTGGTTAAGGGACATTTGTTCAGGAATTACAATTTTTAAAAGTTTTAAGGATGCCATATATTGGCTATATACAAAATTGAAGGATTTTTATGAAGTAAATTATGGCAAGAAGAAGGATGTTCTTAATATTCTTAAAGACAACCAGCAAAAAATAGAAAAAGCTATTGAAGAAGCAGACAATTTCTGCATTTTGCAAATTCAAGATGTGGAGAAATTTGATCAGTATCAAAAAGGGGTTGATTTGATACAAAAGCTGAGAACTGTCCATTCAATGGCTCAAGTTGACCCTAACCTTGGGGTTCATTTGTCACCTCTTAGAGATTGTATAGCCAGAGTCCACCAAAAGCTCAAAAATCTTGGATCTATAAATCAGGCCATGGTGACAAGGTGTGAGCCAGTTGTTTGCTATTTATATGGCAAAAGAGGGGGAGGGAAAAGTTTGACTTCAATTGCATTGGCAACCAAAATTTGTAAACACTATGGTGTTGAACCTGAGAAAAATATTTACACCAAACCTGTGGCCTCAGATTATTGGGATGGTTACAGTGGACAATTGGTTTGCATTATTGATGATATTGGCCAAAATACAACAGATGAAGATTGGTCAGATTTTTGTCAATTAGTGTCAGGATGTCCAATGAGATTGAATATGGCTTCTCTTGAGGAGAAAGGTAGACATTTTTCTTCTCCTTTTATAATAGCAACTTCAAATTGGTCAAATCCAAGTCCAAAGACAGTTTATGTTAAGGAAGCAATTGATCGCAGGCTTCATTTTAAGGTTGAAGTTAAACCTGCTTCATTTTTTAAAAATCCTCACAATGATATGTTGAATGTTAATTTGGCTAAAACAAATGATGCAATTAAGGACATGTCTTGTGTTGATTTAATAATGGATGGACACAATATTTCATTGATGGATTTACTTAGTTCCTTAGTGATGACAGTTGAAATTAGGAAACAAAACATGAGTGAATTCATGGAGTTGTGGTCTCAGG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| 65,709
|
MG546668.1
|
Human hepatitis A virus
|
Nejati,M., Timori,A., Taherkhani,R., Makvandi,M.
|
Bushehr University of Medical Sciences, Department of Microbiology and Parasitology
|
Iran
|
2018-10-27
|
Ahvaz
|
Hepatovirus A
|
Hepatovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,239
|
GenBank
| null |
Iran: Ahvaz
|
Iran
|
Homo sapiens
|
blood
|
2017-06-22
| null | null |
Human hepatitis A virus isolate Ahvaz polyprotein-like gene, complete sequence
|
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| 67,768
|
LC373510.1
|
Human hepatitis A virus
|
Saito,A., Saito,M., Shimoe,Y., Yoshimoto,T., Kawakami,M., Okamoto,H., Yoshikawa,K., Kusunoki,S., Kuriyama,M.
|
Division of Virology, Department of Infection and Immunity; 3311-1 Yakushiji, Shimotsuke, Tochigi 329-0498
|
Japan
|
2018-09-11
|
HA16-1496
|
Hepatovirus A
|
Hepatovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,498
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GenBank
| 1
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Japan:Hiroshima
|
Japan
|
Homo sapiens
|
blood
|
2014
| null | null |
Human hepatitis A virus HA16-1496 genomic RNA, complete genome
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TTCAAGAGGGGTCTCCGGAGTTTTCCGGAACCCCTCTTGGAAGTCCATGGTGAGGGGACTTGATACCTCACCGCCGTTTGCCTAGGCTATAGGCTAAATTTCCCTTTCCCTGTCCTTCCCCTATTTCCTTTTGTTTTGTTTGTAAATATTAATTCCTGCAGGTTCAGGGTTCTTTAATCTGTTTCTCTATAAGAACACTCAATTTTTCACGCTTTCTGTCTCCTTTCTTCCAGGGCTCTCCCCTTGCCCTAGGCTCTGGCCGTTGCGCCCGGCGGGGTCAACTCCATGATTAGCATGGAGCTGTAGGAGTCTAAATTGGGGACGCAGATGTTTGGGACGTCGCCTTGCAGTGTTAACTTGGCTTTCATGAACCTCTTTGATCTTCCACAAGGGGTAGGCTACGGGTGAAACCTCTTAGGCTAATACTTCAATGAAGAGATGCCTTGGATAGGGTAACAGCGGCGGATATTGGTGAGTTGTTAAGACAAAAACCATTCAACGCCGGAGGACTGGCTCTCATCCAGTGGATGCATTGAGGGAATTGATTGTCAGGGCTGTCTCTAGGTTTAATCTCAGACCTCTCTGTGCTTAGGGCAAACACTATTTGGCCTTAAATGGGATCCTGTGAGAGGGGGTCCCTCCATTGACAGCTGGACTGTTCTTTGGGGCCTTATGTGGTGTTTGCCTCTGAGGTACTCAGGGGCATTTAGGTTTTTCCTCATTCTTAAATAATAATGAATATGTCCAAACAAGGAATTTTCCAGACTGTTGGGAGTGGCCTTGACCACATCCTGTCTTTGGCAGATATTGAGGAAGAACAAATGATTCAGTCCGTTGATAGGACTGCAGTGACTGGTGCTTCTTATTTTACTTCTGTTGACCAATCTTCAGTTCACACTGCTGAGGTTGGTTCACATCAGATTGAACCTTTGAAAACCTCTGTTGATAAACCTGGTTCTAAGAAGACTCAGGGGGAAAAGTTTTTCCTGATTCATTCTGCTGATTGGCTCACTACACATGCTCTTTTTCATGAAGTTGCAAAATTGGATGTGGTAAAATTACTGTATAATGAGCAGTTTGCTGTTCAAGGTTTGTTGAGATACCATACATATGCAAGATTTGGCATTGAGATTCAAGTTCAGATAAACCCCACACCCTTTCAGCAAGGGGGATTAATCTGTGCCATGGTTCCTGGTGACCAAAGTTATGGTTCGATAGCATCCTTGACTGTTTATCCACATGGTCTGTTAAATTGTAACATCAATAATGTAGTTAGAATAAAGGTTCCATTTATTTATACTAGAGGTGCTTACCATTTTAAAGATCCACAATACCCAGTTTGGGAATTAACAATCAGAGTTTGGTCAGAGTTGAATATTGGAACAGGAACTTCAGCTTATACTTCACTTAATGTTTTGGCTAGGTTTACAGATTTGGAGTTGCATGGGTTGACTCCTCTTTCTACACAGATGATGAGAAATGAATTTAGAGTTAGTACTACTGAAAATGTTGTGAATTTGTCAAATTATGAAGATGCAAGGGCAAAAATGTCTTTTGCTTTGGATCAAGAAGATTGGAAGTCTGATCCTTCTCAAGGTGGTGGAATTAAAATCACTCATTTTACTACTTGGACATCTATTCCAACTTTAGCTGCCCAGTTTCCATTTAATGCTTCAGATTCAGTTGGGCAACAGATCAAAGTTATTCCAGTTGACCCATACTTTTTCCAGATGACAAACACTAATCCTGACCAGAAATGTATAACTGCCCTGGCCTCTATTTGTCAGATGTTTTGCTTTTGGAGGGGAGATCTTGTTTTTGATTTTCAGGTTTTTCCAACCAAATATCATTCAGGCAGATTATTGTTTTGTTTTGTTCCTGGAAATGAGTTAATAGATGTTACTGGAATTACATTAAAGCAAGCAACTACTGCCCCTTGTGCAGTAATGGACATTACAGGAGTGCAATCAACCTTGAGATTTCGTGTTCCTTGGATTTCTGATACACCCTATCGAGTAAATAGGTACACGAAGTCAGCACATCAAAAAGGTGAGTACACTGCCATTGGAAAGCTTATTGTGTATTGTTATAATAGACTGACTTCTCCTTCTAATGTTGCTTCTCATGTTAGAGTTAATGTTTATCTTTCAGCAATTAATTTGGAATGTTTTGCTCCCCTTTATCATGCTATGGATGTTACTACACAGGTTGGAGATGATTCAGGAGGTTTTTCAACAACAGTTTCTACAGAGCAGAATGTTCCTGATCCCCAAGTCGGCATAACAACCATGAGAGACTTAAAAGGGAAAGCCAATAGGGGAAAGATGGATGTTTCAGGAGTGCAAGCACCTGTGGGAGCTATTACAACAATTGAGGATCCAGTTTTAGCAAAGAAAGTGCCTGAGACATTTCCTGAATTGAAGCCTGGAGAGTCCAGACATACATCAGATCATATGTCTATTTATAAATTCATGGGAAGGTCTCACTTTCTGTGTACTTTTACCTTCAATTCAAACAATAAAGAGTACACATTTCCAATAACTCTGTCTTCGACTTCTAATCCTCCTCATGGTTTACCATCAACACTAAGGTGGTTTTTCAACCTGTTTCAGTTGTATAGAGGACCATTGGACTTGACAATTATTATCACAGGAGCCACTGATGTGGATGGTATGGCCTGGTTCACTCCAGTAGGCCTTGCTGTCGACACCCCTTGGGTGGAAAAGGAGTCAGCCTTATCTATTGATTACAAAACTGCCCTTGGAGCTGTTAGATTTAACACAAGAAGAACAGGGAACATTCAGATTAGATTGCCATGGTATTCTTATTTGTATGCCGTGTCCGGAGCACTGGATGGTTTGGGAGATAAGACAGATTCTACATTTGGATTGGTTTCTATTCAGATTGCAAATTACAATCATTCTGATGAATATTTGTCTTTTAGTTGTTATTTGTCTGTCACAGAACAATCAGAGTTTTATTTTCCTAGAGCTCCATTAAATTCAAATGCTATGTTGTCCACTGAGTCCATGATGAGTAGAATTGCAGCTGGAGATTTGGAGTCATCAGTGGATGATCCTAGATCAGAGGAGGACAGAAGATTTGAGAGTCATATAGAATGTAGGAAACCATACAAAGAATTGAGATTGGAGGTTGGCAAATCAAGACTCAAATATGCTCAGGAAGAGTTGTCAAATGAAGTGCTTCCACCTCCCAGGAAAATGAAGGGGCTATTTTCACAAGCTAAGATTTCTCTTTTTTACACTGAGGAGCATGAAATAATGAAATTCTCTTGGAGAGGAGTGACTGCTGATACTAGGGCTTTGAGAAGATTTGGATTCTCTATGGCCGCTGGTAGAAGTGTGTGGACTCTTGAGATGGATGCTGGAGTTCTTACTGGAAGACTAGTTAGATTGAATGATGAGAAATGGACAGAAATGAAGGATGATAAAATTGTTTCATTAATCGAAAAGTTCACAAGTAATAAATACTGGTCTAAAGTGAATTTTCCACATGGAATGTTGGATCTTGAAGAAATTGCTGCCAACTCTAAAGATTTTCCAAATATGTCTGAGACAGATTTGTGTTTCCTGTTGCATTGGCTGAATCCAAAGAAAATTAACTTAGCAGATAGAATGCTTGGATTGTCTGGAGTGCAGGAAATTAAAGAACAGGGTGTTGGATTGATAGCAGAGTGTAGAACTTTTCTGGATTCTATTGCTGGGACTCTGAAATCTATGATGTTTGGATTTCATCATTCTGTGACTGTTGAAATTATAAATACTGTACTTTGTTTTGTCAAGAGTGGAATCCTGCTTTATGTTATACAACAATTGAATCAAGATGAGCACTCTCACATAATTGGATTGTTGAGAGTTATGAATTATGCAGATATTGGCTGCTCAGTTATCTCATGTGGAAAAGTTTTTTCCAAAATGTTAGAAACTGTTTTTAATTGGCAAATGGATTCCAGAATGATGGAGCTGAGAACTCAGAGTTTTTCCAATTGGTTAAGAGACATTTGTTCAGGAATTACTATTTTTAAAAGTTTTAAGGATGCCATATATTGGCTATATACAAAATTGAAGGATTTTTATGAAGTAAATTATGGTAAGAAGAAGGATATTCTTAATATTCTTAAAGATAACCAACAAAAAATAGAAAAAGCCATTGAAGAAGCAGACAATTTTTGCATTTTGCAAATTCAAGATGTAGAGAAATTTGATCAGTATCAGAAAGGGGTTGATTTGATACAAAAACTGAGAACTGTCCATTCAATGGCTCAAGTCGACCCTAACCTGGGGGTTCATTTGTCACCTCTTAGAGATTGCATAGCCAGAGTCCATCAAAAGCTCAAGAATCTTGGATCTATAAATCAGGCCATGGTGACAAGATGTGAGCCAGTTGTCTGCTATTTATATGGCAAAAGAGGGGGAGGGAAGAGTTTGACTTCAATTGCATTGGCAACCAAAATTTGCAAACACTATGGTGTTGAACCGGAGAAAAATATTTACACTAAACCTGTGGCCTCAGATTATTGGGATGGTTATAGTGGACAATTGGTTTGCATCATTGATGATATTGGCCAAAACACAACAGATGAAGATTGGTCAGATTTTTGTCAATTAGTGTCAGGATGCCCAATGAGATTGAATATGGCCTCTCTTGAGGAGAAGGGCAGACATTTTTCCTCTCCTTTTATAATAGCAACTTCAAATTGGTCAAATCCAAGTCCAAAAACAGTTTATGTTAAGGAAGCAATTGATCGTAGGCTTCATTTTAAGGTTGAAGTTAAACCTGCTTCATTTTTTAAAAATCCTCACAATGATATGCTGAATGTTAATTTGGCTAAAACAAATGATGCAATTAAAGACATGTCTTGTGTTGATTTAATAATGGATGGACATAATATTTCATTGATGGACTTACTTAGTTCCTTAGTGATGACAGTTGAAATTAGGAAACAAAATATGAGTGAATTCATGGAGTTGTGGTCTCAG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| 68,669
|
KX228694.1
|
Human hepatitis A virus
|
Hamza,H., Abd-Elshafy,D.N., Fayed,S.A., Bahgat,M.M., El-Esnawy,N.A., Abdel-Mobdy,E.
|
National Research Centre, Environmental Virology Laboratory, Department of Water Pollution Research
|
Egypt
|
2016-11-23
|
HAV/Egy/BI-11/2015
|
Hepatovirus A
|
Hepatovirus
|
Picornaviridae
|
ssRNA(+)
| 7,323
|
GenBank
| 1
|
Egypt
|
Egypt
| null | null |
2014
| null | null |
Human hepatitis A virus isolate HAV/Egy/BI-11/2015, complete genome
|
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| 79,343
|
NC_038436.1
|
Human hepegivirus
|
Kapoor,A., Kumar,A., Simmonds,P., Bhuva,N., Singh Chauhan,L., Lee,B., Sall,A.A., Jin,Z., Morse,S.S., Shaz,B., Burbelo,P.D., Lipkin,W.I.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2018-08-24
|
AK-790
|
Pegivirus columbiaense
|
Pegivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 9,538
|
RefSeq
| 1
|
USA
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2015
| null |
PRJNA485481
|
Human hepegivirus isolate AK-790 polyprotein gene, complete cds
|
TGAACTGTTGTTGTAGCAATGCGCATATTGCTACTTCGGTACGCCTAATTGGTAGGCGCCCGGCCGACCGGCCCCGCAAGGGCCTAGTAGGACGTGTGACAATGCCATGAGGGATCATGACACTGGGGTGAGCGGAGGCAGCACCGAAGTCGGGTGAACTCGACTCCCAGTGCGACCACCTGGCTTGGTCGTTCATGGAGGGCATGCCCACGGGAACGCTGATCGTGCAAAGGGATGGGTCCCTGCACTGGTGCCATGCGCGGCACCACTCCGTACAGCCTGATAGGGTGGCGGCGGGCCCCCCCAGTGTGACGTCCGTGGAGCGCAACATGGGGTGTTCAACTGATCAAACCATTTGTTCTCCAGTCGTGGGGGCCGACTATAATACCTCCTCGGGCTGCCGGGCCTTAAATGGGAGCTACCACTGCGGTGGTGGCTCTTGCCGGTCACCAAGTCGTGTGCAGGTCGCGAGACGAGTCTTGTGGCTGTGCGCATTCCTTGCGCTGATCGGATCCGGTATGTGTTCGATCCGGTCCAAAACTGAAGGGCGCATTGAGTCGGGGCAAATATTGCAGTCTCAGCGCGCATGTTGGACTGGTGAGGGTTTTGCTTTCTTTTCTAACTGTTGCAATCAATCTGATATTATGTGGTGTTTGCACCGTTGGTGTGTGACAAGACCTGGCTGTTTAGTGTGCACGGGCAATGCCACTCATCCTGTCTGCTGGGACTATCTTGGGTCCGGTGTAAGTCGGCGGCCTGCGCGTCGAATGGGTGAGGGAGCTGAAGCGCTTCTTCGCTTGATCGGCATTGCAGGTTGGCTCGGGCTGTTAGCTGAGACTCTTGGTATGTCCGAAGTCTATGCAGCTATTCTTTGCTTTGGATTTATTGCTTGGTATGGCTGGGGTATACCTAAAGCACTGGTGTGCACAGTCTGCCCTGCAGTGAACATTTCTCCCTATAGCTTCTTATCTCCAGATACTATCGCATTTGGTACGTGGATACTACAACTACCTGGTCTTTTGTGGCAAATGTTTGTCAGCTTCCCTATACTTTACAGCACTTGGATTCTTTGGTTGTTGCTCAGCGGCAAGACTGTTGCTGTGATAGCGATCCTTCTGGCTAGTCCTACGGTTATGGCATACAAGCATCAATCTGAAAGCTACCTCAAATACTGTACCATAACCAATGCTTCAACTTCTATGAACTGTGACTGCCCCTTTGGAACCTTTACTCGCAATACTGAGTCTCGGTTCTCTATACCTAGATTCTGTCCTGTTAAAACTAATAGCTCTACATTTATCTGCTCATGGGGGTCGTGGTGGTGGTTTGCTGAGAACATCACGCGTCCATACTCGGACGTTGGCATGCCACCAGCACCGATTTCCGCTTTGTGCTATATCTATTCAAACAATGACCCACCTCCTTGGTATCATAACACAACTATCATACCTCAGAACTGTCGCAACTCTACGGTTGATCCTGCCACAGCTCCATGCCGTGACAAGTGGGGCAATGCAACTGCTTGTATTCTTGACCGCCGGTCGCGGTTCTGCGGGGACTGCTATGGCGGCTGTTTCTATACTAATGGTAGTCATGATCGATCCTGGGATCGATGCGGGATTGGTTACCGTGATGGACTCATAGAGTTCGTGCAGCTCGGTCAGATTCGACCTAATATCTCGAATACGACCATTGAGCTCCTCGCTGGCGCCTCGCTTGTGATTGCATCCGGTCTTCGGGCTGGGTATGGTTGCAGCCGAGCGCATGGCGTGGTGCACTGCTATAGGTGTCCTTCATACCGTGACCTTGAACAGTTTGGTCCCGGGCTTGGGAAATGGGTGCCATTGCCTGGCGAGCCTGTCCCGGAGTTGTGTATTAACCCTCAGTGGGCGAGGCGCGGCTTCCGGGTGTCTAACAATCCTTTAAGCTTGATGCAGACCTTCGTTGAGGACATTTTTCTAGCGCCTTTTTGCAATCCGACGCCTGGCCGTGTACGTGTGTGTAACAATACTGCTTTCTATCCGAAAGGAGGCGGTTTTGTGCAGCTCATCGGAGACGTCCAGGTGCTAACCCCTAACACTGCATCTTTACACTCTCTGCTGACTTTAATATCTCTTGTTTTGTTAGTGTGTGTTGTTTCTGGCGCGCGATTCGTCCCATTAATCATCATATTTTTCTGGAGCGTGCGCCACGTATATGCTTCTTGTTACTTAAGCTGTGATTGGGCTGTTTGCAACGATGCGTTCTGTTTCACATCTGGCACTTGTGCTACCTTCAATGACGTCTTGTGTCTGCCGGTTGCGATGCGCATATCGTCCTGTGGCCATGCTGTGCCGCCTCCCGACCGTGGTTGGGAGGTGCCCGCGGTGATGTCATGGGCGATTTCGCGGACTACTGGCTTGACGTTCGATGTCTTTTCCTTCGTCCAGTATCTTCCTACTGTGCCTGGCAACAACACCGATATCATTTACTGTGGTGAACCAACCTTCTTCGGGGACATCACGGGCATCTATTGGCCTTACTTTTTGCCTGGCGTGTTGCTCTTGTACTTGACTCCCTTCCTGGGTTTAAGGCTAATGCTTGCCGGCTTCAATATAGATGGCTTGTTTCCCGTACGGCATGCCACGGCTGCACTGAGGTTCTCGACTTCGCGTGTGACCTTGAGTGTCGTACTTGCTTTCCTAATCTATATATTATCTCACCCTGTTAATGCTGCGCTCAATAGAATGTTCCTAGCATCTGCAAATTTAGAGATGATCTTATCCTTTGATACCTATCATGAGACTGTTCTTTACATCGTTTGTCTATTGCTCTACCTCCAGGTGTCGCCCCGTGCGGGCTTGGCCGCTATGGTGGCCATCAAGCTATCTCGAGGCCTGTTATTCGCTGTGGTGTTGGCGCACGGAGTGTGCCGACCTGGGCGGGTATTTGGTCTTGAGGTTTGCGCGGACATCTCTTGGTTGGTGGAGTTTACTGGCAACTGCACTTGGTACATGTCCTGTGTCTTCTCTTTTTGGTGCGCAGTGTTTGCCTTCACCAGTCCACTTGGACGACAGTATAAGCTTCAGATCTACCGGTACTGGGCGCAGGCCTATGCCAGATTCGTCCTCGCTGTCGGTTGTGGTCCTCTCGGACGAGAGTTCCATTTCCGCGCAAGCGTGGGCGTGCTTTGGTGTGGTGCTTGCATGCTCTGGCCCCTTGAGTGCTCTGAAATCAGCTTGGTCTTCATTCTGTGTGCTCTGACAGTGGACACCATAGACACATGGTTAGTAGCGTGCTTGTCCGCAGGGCCGAGTGCGCGAAGCCTTGCAACTCTGGCCGATGACATGGCGCGCATTGGTGACCACCGGGCGTTGCGCGCCGTGTTGCGTTGCTTTGGATCACGTGGCACATACATATACAACCACATGGGCCAGGTCTCAGAACGGGTGGCGCAAGCAGTCAGGGATTTCGGCGGTTGCTTGGAACCAGTCGTGTTGGAGGAGCCCACCTTTACTGAGGTCGTGGATGATACAATGAGTTTGGTGTGTGGACAATTGCTTGGAGGTAAACCTGTGGTGGCCCGCTGCGGCACGCGTGTCTTGGTGGGACACCTCAACCCTGAAGATCTGCCGCCTGGTTTCCAGCTGAGTGCTCCGGTGGTTATTACCAAACCAAGCATTGGTACGTGGTCCTTCCTTAAGGCAACACTCACAGGGCGTGCTGAAACACCGGGATCCGGCCAGATCGTGGTGTTGTCTTCCCTGACAGGTCGGTCAATGGGTACCGCAGTGAATGGCACACTGTATGCGACCGGCCACGGTGCTGGTGCGCGTGGCCTAGCCACGTGCGCTGGTTTGAGGATGCCACTTTACACGGCGCTATCTGATGATGTCGTGGCCTATTCTTGCCTTCCGGGCATGAGTTCCCTGGAGCCCTGCCGCTGTTCGCCGAGCCGGGTTTGGGTGATGAACAACAACGGAGGGTTGGTGTGTGGCAGAGTGGAGAATGACGACGTCTGTTTGGACTGTCCCACGCACATAGATCAACTGCGGGGTGCTTCGGGGTCACCGGTTTTGTGTGATCACGGTCATGCATACGCGTTGATGCTCGGTGGTTACTCTACCAGTGGTATTTGTGCGCGTGTCCGGATAGTTCAGCCATGGCAGAACGCCTATTCCTCCTCAGGGGGGCAAGGCGGAATGCAGGCGCCAGCTGTGACACCAACATACTCTGAAATCACCTACTATGCCCCTACTGGTTCTGGTAAGTCAACAAAATATCCAGTGGACCTAGTCAAACAGGGACACAAAGTATTGGTCCTTTTACCAAGCGTGGCTGTCGTCAAAAGTATGGCCCCTTACATTAGGGAGACATATAACATTAGACCTGAAATTAGAGCTGGCACAGGCCCTGACGGTGTGACGGTCATCACTGGTGAGAGCTTGGCGTACATGACCTATGGCCGCTTCCTTGTGGATCCGGAGACGAATCTGCGGGGCTATGCCGTAGTCATTTGCGACGAGTGCCACGACACATCATCCACCACGCTACTCGGCATTGGCGCAGTGCGCATGTATGCCGAGAAAGCTGGAGTGAGGACCGTTGTATTCGCCACAGCCACTCCTGCTGGCATTCAAGTACAGCCACATCCCAACATTGATGAATATTTATTGACTGACACAGGCGACGTGGAATTCTACGGCGCCAAAATCAAATTGGACAACATCAGAACTGGTAGACATGCTATCTTTTGTCACTCGAAGGCCAGGTGTGCGGAACTAACGCAGCAGCTCTCCGGCCTTGGTGTTCGTGCAGTGAGTTTTTGGCGCGGCTGTGACATCAAAACCATTCCCGCCTCAGACTCTATTGTTGTAGTGACAACTGATGCATTGTCCACAGGCTACACAGGAAACTTTGATTCGGTCATCGACTGCGGGTGTTGCGTAGAGCAAACTGTGACAATTGACATGGACCCCACGTTCTCCATCTCGGCCCGAGTGGTGCCATGTACTGCTGCA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| 4,058
|
MF693137.1
|
Human hepegivirus
|
Wan,Z., Wang,H., Xu,R., Zhu,N., Fu,R., Zhang,F., Tang,S., Li,J., Bao,Z., Li,T.
|
Southern Medical University, School of Public Health
|
China
|
2018-05-02
|
H8-S725
|
Pegivirus columbiaense
|
Pegivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 9,496
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2015-05-21
| null | null |
Human hepegivirus isolate H8-S725, complete genome
|
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| 70,878
|
MG457178.1
|
Human hepegivirus
|
Wang,H., Wan,Z., Sun,Q., Zhu,N., Li,T., Ren,X., An,X., Deng,S., Wu,Y., Li,X., Li,L., Li,J., Tong,Y., Tang,S., Fu,R., Zhang,F.
|
Southern Medical University, School of Public Health
|
China
|
2018-05-02
|
SC-LS-01
|
Pegivirus columbiaense
|
Pegivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 9,481
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2016-11
| null | null |
Human hepegivirus isolate SC-LS-01, complete genome
|
TTATTGCTACTTCGGTACGCCTAATTGGTAGGCGCCCGGCCGACCGGCCCCGCAAGGGCCTAGTAGGACGTGTGACAATGCCATGAGGGATCATGACACTGGGGTGAGCGGAGGCAGCACCGAAGTCGGGTGAACTCGACTCCCAGTGCGACCACCTGGCTTGGTCGTTCATGGAGGGCATGCCCACGGGAACGCTGATCGTGCAAAGGGATGGGTCCCTGCACTGGTGCCATGCGCGGCACCACTCCGTACAGCCTGATAGGGTGGCGGCGGGCCCCCCCAGTGTGACGTCCGTGGAGCGCAACATGGGGTGTTCAACTGATCAAACCATTTGTTCTCCAGTCGTGGGGGCCGACTATAATACCTCCTCGGGCTGCCGGGCCTTAAATGGGAACAACCACTGCGGTGGTGGCTCCTGCCGGTCACCAAGTCGTGTGCAGGTTGCGAGACGAGTCTTGCAGCTGTGCGCATTCCTTGCGTTGATCGGATCCGGTATGTGTTCGATCCGGTCCAAAAATGAAGGGCGCATTGAGTCGGGGCAAATATTGCAGTCTCAGCGCGCATGTTGGACTGGTGAGGGTTTTGCTTTCTTTTCTAACTGTTGCAATCAGTCTGATATTATGTGGTGTTTGCACCGTTGGTGTGTGACAAGACCTGGCTGTTTAGTGTGCACGGGCAATGCCACTCATCCTGTCTGCTGGGACTACCTTGGGTCCGGTGTAAGCCGGCGGCCTGCGCGTCGAATGGGTGAGGGGGCTGAAACGCTTCTTCGCCTGATCGGTATTGCAGGATGGCTTGGGCTGTTAGCTGAGACTCTTGGTATGTCCGAATTCTATGCAGCTATCCTTTGCTTTGGATTTATTGCTTGGTATGGCTGGGGTATACCTAAAACGTTGGTGTGCACAGTCTGCCCTGCAGTAAACATCTCTCCCTATAGCTTCTTATCTCCAGACACTATCGCATTTGGTACGTGGATACTGCAACTACCTGGTCTTTTGTGGCAAATGTTTGTCAGCTTTCCTATACTGTACAGCACTTGGATTCTTTGGTTGTTGCTTAGCGGCAAGACTGTTGCTGTGATAGCGATCCTTTTGGCTAGTCCTACGGTTATGGCATACAAGCACCAATCTGATAGCTACCTCAAATACTGTACCATAACCAATACTTCAACTTCTATGAACTGTGACTGCCCCTTTGGAACCTTTACTCGCAATACTGAGTCTCGGTTCTCTATACCGAGATTCTGTCCCGTTAAAATTAATAGCTCTACATTTATCTGTTCTTGGGGGTCGTGGTGGTGGTTTGCTGAGAACATTACGCGTCCATACTCGGACGTTGGCATGCCACCAGCACCGATTTCCGCTTTGTGCTATATCTACTCAAACAATGACCCACCTCTTTGGTATCATAACACAACTATCATACCTCAGAACTGTCGCAACTCTACGGTTGATCCTACCACGGCTCCATGCCGTGACAAGTGGGGCAACGCAACTGCTTGCATTCTTGACCGCCGGTCGCGGTTCTGCGGGGACTGCTATGGCGGCTGCTTCTATACTAATGGTAGTCATGAACGATCCTGGGAGCGATGCGGGATTGGTTACCGTGATGGACTCATAGAGTTCGTGCAGCTCGGTCAGATTCGACCCAACATCTCGAATACGACCATTGAGCTCCTCGCTGGTGCCTCGCTTGTGATCGCATCCGGTCTTCGGGCTGGGTTTGGTTGCAGCCGAGCGCACGGCGTGGTGCACTGCTATAGGTGTCCTTCATACCGTGACCTTGAACAGTTCGGTCCCGGGCTCGGGAAATGGGTGCCGTTGCCTGGTGAGCCTGTCCCGGAGTTGTGTATTAACCCTCAATGGGCGAGGCGCGGCTTCCGGACGTCTAACAATCCTTTAAGCTTGATGCAGACCTTCGTTGAGGACATCTTCTTAGCGCCTTTCTGCAGTCCAACGCCTGGCCGTGTGCGTGTGTGCAATAACACTGCTTTCTACCCGAGAGGAGGCGGTTTTGTGCAGCTCATCGGAGACGTTCAGGTGCTGACCCCTAACACTGCATCTTTACATTCCCTGCTGACTTTGATATCTCTCATCTTATTAGTGTGTGTTGTTTCTGGCGCGCGGTTCGTCCCGTTATGCATTATATTCTTCTGGAGCGTGCGCCACGTATATGCTTCTTGTTACCTAAGCTGTGACTGGGCTGTTTGCAACGATGCGTTCTGTTTCACGTCTGGCACTTGCGCTACTGTCAATGACGTCTTGTGTCTGCCGGTTGCGACGCGTATATCGTCCTGTGGTCATGCTGTACCACCGCCCGACCGTGGTTGGGAGGTGCCTGCAGCGTTGTCGTGGGCGATTTCACGGACTACTGGCTTGACGTTTGATGTCTTTTCCTTCATTCAGTATTTTCCTACTATGCCTGGTAACAACAGCGGCATTATTTACTGTGGTGAACCAACCTTCTTCGGGGACATCACAGGCATCTATTGGCCTTACTTTTTGCCTGGCATGTTGCTCTTGTACTTGACTCCCTTCCTTGGTTTAAGATTAATGCTTGCCGGCTTCAATATAGATGGTTTGTTTCCCTTGCGGCATGCCACGGCTGCGCTGAGGTTCTCAACCTCACGTGTGACCATGAGTGTCGTAATTGCTTGCCTAATCTATATATTATCTCACCCTGTTAATGCTGCGCTCAATAGAATGTTCCTAGCGTCTGCAAATCTAGAGATGATCTCCAGCTTTGATACCTATCATGAGACCATCCTTTACATCATTTGTCTCTTGCTCTACCTCCAGGTGTCACCCCGTGCGGGCTTGGCCGCTATGGTGGCCATCAAGCTATCTCGAGGCCTGTTATTCGCTGTGGTGTTGGCGCACGGAGTGTGCCGACCCGGCCGGGTGTTTGGCCTTGAGGTTTGCGCGGACCTCACTTGGATGGTGGAATTTTCTGGCAACTGCACTTGGTATATGTCCTGTGTTTTCTCCTTCTGGTGCGTAGTATTTGCCCTTACCAGTCCACTTGGACGACAGTATAAGCTTCAGATCTACCGGTACTGGGCGCAGGTCTATGCTAGACTCATCCTTGCTGTCGGCTGTGGTCCTCTCGGACGGGAGTTCCATTTCCGTGCTAGCGTGGGTGTGCTTTGGTGTGGTGCTTGCATGCTTTGGCCGCGTGAGTGTTCTGAAATCAGCTTGGTCTTCATCCTGTGTGCTCTGACAGTGGACACCATAGACACATGGTTAGTAGCGTGCTTGTCCGCAGGGCCGAGCGCGCGAACACTTGCAACTCTGGCTGATGACATGGCGCGTATTGGTGACCACCGGGCGTTGCGCGCCGTGTTGTGTTGCTTTGGATCACGCGGCACATACATATACAACCACATGGGCCAGGTCTCAGAACGGGTGGCGCAAGCGGTCAGGGATTTCGGCGGTTGCTTGGAACCAGTCGTATTGGAGGAGCCCACCTTTACTGAGGTCGTGGAAGATACAATGAGTATAGTATGTGGACAACTGCTTGGAGGTAAGCCCGTGGTGGCCCGCTGCGGCACGCGTGTCTTGGTGGGGCACCTCAACCCTGAAGATCTGCCACCCGGTTTCCAGCTGAGTGCTCCAGTGGTTATTACGAAACCAGGCATTGGTGCGTGGTCCTTCCTTAAGGCGACACTCACAGGGCGTGCTGAAACACCGGGATCCGGCCAGATCGTGGTGTTGTCTTCCCTGACAGGTCGGTCAATGGGTACTGCAGTGAATGGCACACTGTACGCGACCGGCCATGGTGCTGGTGCGCGTGGCCTAGCCACATGCGCCGGCTTGAGGACGCCACTTTACACGGCATTATCTGATGATGTCGTGGCCTATTCTTGCCTTCCGGGCATGAGTTCCCTGGAGCCCTGCAGCTGTACGCCGAGCCGGGTTTGGGTGATGAACAACAGCGGAGGGTTGGTGTGTGGCAGAGTGGAGAATGATGATGTCTGTTTGGACTGTCCCACGCACATAGATCAACTGCGGGGTGCTTCGGGCTCACCAGTTTTGTGTGATCACGGTCATGCATACGGGTTGATGCTCGGCGGTTACTCTACCAGTGGTATTTGTGCGCGTGTGCGCATGGTCCAGCCATGGCGGAACGCCTATTCCTCCTCAGGGGGGCAAGGCGGAATGCAGGCGCCAGCTGTGACACCAACATACTCTGAAATCACCTACTATGCCCCTACTGGTTCTGGTAAGTCAACAAAATACCCAGTGGACCTAGTCAAACAGGGACACAAAGTATTGGTCCTCTTACCCAGCGTGGCTGTCGTCAAAAGTATGGCTCCTTATATTAAGGAGACATATAAAATCAGACCTGAAATTAGAGCTGGCACAGGCCCTGACGGTGTGACGGTCATCACTGGCGAGAACTTGGCGTACATGACCTACGGCCGCTTCCTTGTGGATCCGGAAACGAATCTGCGGGGTTATGCCGTAGTCATTTGCGACGAGTGCCACGACACAGCATCTTCCACGCTGCTCGGCATTGGCGCAGTGCGCATGCATGCCGAGAAAGCTGGAGTGAAGACCGTTGTATTCGCCACAGCCACTCCTGCTGGCATTCAAGTACAGCCACATCCCAACATTGATGAGTACATATTGACTGACACAGGCGACGTAGATTTCTATGGCGCCAAAATCAAATTGGACAACATCAGAACTGGTAGACATGCTATCTTTTGTCACTCGAAGGCTAGGTGTGCGGAACTAACGCAGCAGCTCTCCGGCCTTGGCATTCGTGCAGTGAGTTTTTGGCGCGGCTGTGACATCAAAAGCATTCCCGCCTCAGACTCTATTGTTGTGGTGACAACTGATGCATTGTCCACAGGCTACACAGGAAACTTTGATTCGGTCATTGACTGCGGGTGTTGCGTAGAGCAAACTGTGACAATTGACATGGACCCTACATTCTCCATCTCAGCCCGAGTGGTGCCATGCACTGCTGCATTGCGTATGCAGCGGCGCGGACGCACTGGTCGCGGCAGAAGGGGAGCGTACTACACAACCACTCCAGGAGCAGCACCCTGCGTCAGCGTTCCCGATGCTAACGTCTGGCAAGCAGTGGAGACAGCCATGGTCTTTTATGATTGGAATGCTGCCAGGATACAGCAGTGCTTGGCGGCATATCATGATTTAGGGTGTACCCCACGCATCAGTTGTGATCCACACACTCCAGTGCGGGTGATGGACACACTGAGGGCGTATCTGCGCAGACCTGAGGTGACGACTGCGGCTCTCGCAGGAGAGCAGTGGCCGCTGCTTTATGGTGTGCAGTTGTGCATCTGTAAAGAGACTGAGGCCCACGGTCCAGATGATGGCATCAAGTGGAAGTGCTTACTTAACAACACCAATAAAACACCCCTGTTGTATGCCTTAGACAATCCTACGCTGGAATTCACTACCTCACATGACTTGACTCGCCGTATAGCCGGCGCTTTATCGAGCACAGTGTTCGTGGAAGCAGGCTACGGCCCCATCCTCCTTGCTGGCGCCGTTATGGCAGCCTCCTTCGCCCTTGCGGGCGCCACTGGAGCCTTAGTGCCGTCGGCCGTTTGGAGTGTTGACAACGGGCTTGCTGGCGTAACCCGTCCCGACGCGACAGACGAGACCGCGGCCTACGCGCAGCGCTTGTACCAAGCCTGCGCAGATTCAGGAATTCTCGCCAGCTTGCAGGGCACAGCGTGTGCGGCGCTGAGTAAACTGGCCGATGCCAGTAGAGGTGCTAGTCAATATCTGGCAGCCGCGCCTCCCTCGCCCGCCCCCCTGGTGCAGGTGCTGCAGTTCCTTGAGACCAACTTTAGTTCCATTGCATCCTTCGGCTTGCTCTGTGCTGGTTGTCAGGCTGGTGAGTGCTTCACTGCACTTGCTGGTTTGGTGTCCGGTGCTACAGCTGGCTTGGGGGGTGCCCATAAGTGGCTGTTAGCTATTGCAGGAACTTGGCTAGTTAGTTTGCAGACCGGGCCCCGTGGCGGCATGGTTGCGGGTCTTTCGGTTCTGGCAGGCTGTTGCGTCGGCAGTGTCACCGGGCTTGACTTCCTGTTTGGGTGCCTTACAGGTTGGGAGGCCGTGGTCGGTGCTGCGGTTGCGACACAGAGGATCTTGTCTGGTACAGCTGACATGACCACTTTAGTAGATCTCTTACCTGCTTTGTTCTCCCCTGGCGCCGGCATAGCTGGCGTCGTGCTTGTCTTCATTCTAAGTAACTCAAGTGTAACCACGTGGGCTAATCGGCTATTGTCCATGTGCGCAAAGCAAACCCTTTGTGACAACTACTTCTTAACTGAGAATTTTGGCAAACAATTAAGCAAACTTTCCTTGTGGCGCGCTGTGTACTATTGGGCGCAGACACGTGAGGGATACACACAGTGTGGCGTGATCAGCGGGGTCTGGGGCTTGGTCTTGTGCGTTCTGCGTGCTGTGTGGGATTGGGCGGCCAAGCATGTGCCACGGTTCCGTGTGCCTATGATTGGCTGCTCACCTGCGTGGTGCGGGCGCTGGCTTGGTACTGGCACCTTGTTGACCACCTGTGGGTGTGGAGAACGTGTGTCCCTTCAGTGCCTCTGCTCAACATCTGACCCAATACTCAGTGTGGGCCGTTGGTGCCGATGTAGTTGGAGTGTTGGGTTTCCATTCAACCCGACCACGACAAGCACCGGCACCTTACGGCCGGACATCAGCGAGGCCACCAAATTGGGTTTCCGGTATGGCGTTGCTGAGATCGTGGAGCTAGAGCGACGGGACGGCAAATGGCACGTCTGTGCAGCATCATGTTGCTTGGACCAGGCTAGTGTTGCGTCCGCCGTGAAGGCCCCACCGGTCACGGCTAATGGTGTACCTATCAGTACCTTCTCTCCACCACAAACTTACAAACTCACTCTCTGTTCCTTTGATTCAGTTTGCATGTCTACTACTTTATCTAACCCAGCTAAGACTCTGAGTGTGTGCTCACAGGAGGCTGTTGAGCTGCTGGAAGAAACAGTCGATACGGCGCAAGTAATGATGTGTCAAAATCTGGAGGCGCGGAGACGCGCCGAGTATGATGCATGGCAAGTTCGCCAAGCAGTTGGTGACGAGTACACGCGTTTGGCAGACGAGGATGTTGACTCACTGACGTCGGTCAAACCCCCGGTAGCCAGGGCTGCTGTGGGTAGTTCGACGTTGGATGATGTTAGCGTGCTGACTGTCCTGCGCGAGCTCGGCGACCAATGCCAAAATGCTATCAAATTTGTAGTTCAGGCGGCTTCACGGTTTGTTCCACCAGTGCCCAGGCCGCGCACGCGTGTCTCGGGTGTGTTGGAGCGTGTGCGCATGTGTATGCGCACGCCACCAATCAAGTTTGAGGCCACTGCAGTACCAATTCATGATATAATTCCAGAAGAGTGTCATATTGTGCTACGCTGTACCGGCTGTAGCGACCAGGCCTTGACTGTTCCATACGGCACTTCCTCTCAGACTTTAATTAGGCATTTGACTAATAAACACAGCCACTACATTCCAAACCAGAAGATAGAGGAAGACACAGAAATAACTGTCATTTGCGCTGTACCAACAACACGCGCAAGTAAACTCATCACTTTCAGAGCAGGTGATCGATCAGTCTCATGTTGTCACCCCTTACAAACTCCTATTAGGGTCCTGCTTCAAAAGTACGGGTTACCTATGGGTAAGTGGGCCGACTGCAACGGCCCCCTTGGTGATGATGCCCGAGTCTGTGACGTCAATGGAGTAACAACTTATGAACCATGCATGCAATCCTACAGTTGGTTTCGACCAATTGTGGCACCAACAACCCCACCTTTGCCTGCAACCCGGAGCGTGGCTGGCATTTTGCGCGCAGACACATCGCGCGTTTACACCACAACGGCGGTTGACGTCTCCGAGCGGCAGGCTAAGGTCACAATTGATCAAAAGTCAGCCAAGGTGGATCCGTGTTTCCGAGACACATACAATTGCTGCCTTGCTAAGGCAAAAACCTTCAAACAATGTGGCATGTCATATGAGGATGCTGTGTCAAAGATGCGCGCAAACACCACGCGTGACCATAACACTGGCATCACTTATTCAGATTTGGTCAGTGGACGCGCAAAACCTGCCGTTCAGAAAATTGTAGATCAAATGCGTGCTGGAGTGTACGACGCTCCAATGCGCATCATCCCAAAACCTGAAGTGTTTCCTCGAGACAAGTCAACACGGAAGCCACCACGATTCATCGTTTTCCCTGGGTGTGCCGCTCGGGTTGCGGAGAAAATGATCCTAGGCGATCCTGGCGCGATAACCAAGCACGTGCTAGGTGATGCCTACGGGTTTGCCACTCCGCCGCATGAACGCGCGCGCCTATTGGAACAATGGTGGAACCGCGCAACGGAGCCACAAGCTATTGCGGTCGATGCGATCTGCTTTGATAGCACCATCACGGCAGAGGACATGGATCGCGAGGCCAACATCGTGGCTGCAGCGCACGCGGACCCTGAAGGTGTTCATGGCCTATACAATTATTACAAGAGAAGCCCCATGTGTGACATCACGGGGAATGTCGTCGGCATGCGTTGCTGTCGAGCCTCAGGTACGCTTACAACAAGCAGTGGCAACACGCTTACTTGCTACCTCAAGGTTCGTGCGGCTTGCACGCGCGCCGGCATTAAACCAATTGGCTTGTTAATTCATGGAGATGACACCCTTATCATCACAGAACGTTGCGCTCAAGAGACTCTCGACGAGTTCAGTTCCGCACTTGATGACTACGGGTTCCCTCACACCATTCAGGTGTCTGGGGACCTTTCGTCTGTCGAGTGCTGTAGCGCACGTGTGGATAGCATTTGCCTCAGGGGAGGTATGCGTCGCATGCTCGTGCCACAAGCTCGACGTGCGATTGCACGCGTTCTCGGGGAAAAGGGCGATCCATTGGGTGTTATCAGCAGCTATATTGTCATGTATCCCACTGCAGCCGTGACCGTCTACGTGCTACTGCCCCTGTTGTGCATGCTCATTCGGAATGAGCCATCGCAGACGGGGACATTGGTGACTCTGACGGTCCATGGTAACAGTGTGAGTGTGCCAGTGTGGCTGCTTCCAACTATCATTGCAAATTTACATGGCCGTGACGCACTACAGGTAGTTCGTCACAGTGCAGCTTCCATGGCGGAACTGTCATCAGCATTGGCCTTCTTTGGCATGAGAGGGCTGAACTGCTGGAGGCGGAGACGCCGCGCCATCAGAACTGACATGATCAAGCTGGGCGGGTGGAACGCGAATTTCGCACAGATGTTACTGTGGTCACCGGAGATAAGAACGCCACAGCCTGAACCAAAGGGCATGTGTCTCTTGCCACCGGAGCTATGGGAGCATCCATACGAAAATTTGCATTTGAGCACGATCGACCGCAATCGTGGTGCTAGCCGCTTACGGTTTTGGTTGGTTGCCAGTGCTATACTCGCTCTGCTTTGCTGGTAAAT
| 70,885
|
KX528230.1
|
Human hepegivirus
|
Wang,H., Wan,Z., Xu,R., Guan,Y., Zhu,N., Li,J., Xie,Z., Lu,A., Zhang,F., Fu,Y., Tang,S., Sun,Q., Li,T., Ren,X., An,X., Deng,S., Wu,Y., Ku,X., Li,L., Tong,Y., Li,X.
|
Southern Medical University, School of Public Health
|
China
|
2017-07-31
|
HCV121
|
Pegivirus columbiaense
|
Pegivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 9,505
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2015-03-16
| null | null |
Human hepegivirus isolate HCV121, complete genome
|
ATGCGCTATATTGCTACTTCGGTACGCCTAATTGGTAGGCGCCCGGCCGACCGGCCCCGCAAGGGCCTAGTAGGACGTGTGACAATGCCATGAGGGATTCTGACACTGGGGTGAGCGGAGGCAGCACCGAAGTCGGGTGAACTCGACTCCCAGTGCGACCACCTGGCTTGGTCGTTCATGGAGGGCATGCCCACGGGAACGCTGATCGTGCAAAGGGATGGGTCCCTGCACTGGTGCCATGCGCGGCACCACTCCGTACAGCCTGATAGGGTGGCGGCGGGCCCCCCCAGTGTGACGTCCGTGGAGCGCAACATGGGGTGTTCAACTGATCAAACCATTTGTTCTCCAGTCGTGGGGGCCGACTATAATACCTCCTCGGGCTGCCGGGCCTTAAATGGGAGTTACCACTGCGGTGGTAGCTCTTGCCGGTCACCAAGTCGTGTGCAGGCTGTGAGACGAGTCTTGCAGCTGTGCGCATTCCTTGCGTTGATCGGATCCGGTATGTGTTCGATCCGGTCCAAAACTGAAGGGCGCATTGAGTCAGGGCAAATATTGCAGTCTCAGCGCGCATGTTGGACTGGTGAGGGTTTTGCTTTCTTTTCTAACTGTTGCAATCAATCTGATATTATGTGGTGTTTGCACCGTTGGTGTGTGACGAGACCTGGCTGTTTGGTGTGCACGGGCAATGCCACTCATCCTGTCTGCTGGGACTATCTCGGGTCCGGTGTAAGCCGACGGCCTGCGCGTCGACTGGGTGAGGGAGCTGAAGTGCTTCTTCGCTTGATCGGCATCGCAGGCTGGCTTGGGCTGTTAGCTGATACCCTTGGTATGTCCGAAGTCTATGCAGCTATTCTATGCTTTGGGTTTATTGCTTGGTATGGTTGGGGTATACCTAAAACACTGGTGTGCACAGTCTGCCCTGCAGTGAACATTTCTCCCTATAGCTTTTTATCTCCAGACACTATCGCATTCGGTACGTGGATATTACAACTACCTGGTCTTCTGTGGCAAATGTTTGTGGGCTTCCCTATACTCTATAGCACTTGGATTCTTTGGTTGTTACTCAGCGGCAAGACTGTTGCTGTGATAGCAATCCTTTTGGCTAGTCCTACGGTTGTGGCATACAAGCACCAAGCTGATAGCTACCTCAAATACTGTACCATAACCAATGCTTCAACTGCTATGAATTGTGACTGCCCCTTTGGAACCTTTACTCGCAATACTGAGTCTCGTTTCACTATACCTAGATTCTGTCCTGTTAAAATTAATAGCTCCACATTTATCTGCTCGTGGGGGTCGTGGTGGTGGTTTGCTGAAAACATCACACGTCCATATTCGGACGTTGGCATGCCACCGGCTCCGATTTCCGCTTTGTGCTATATCTATTCAAACAATGACCCACCTCCTTGGTATCATAACACAACTATCATACCACAGAACTGTCGCAACTCTACGGCTGATCCTACCACGGCTCCATGCCGTGACAAGTGGGGCAATGCAACTGCTTGTATTCTTGACCGCCGGTCGCGGTTCTGCGGGGACTGCTATGGCGGCTGTTTCTATACTAATGGTAGTCATGATCGATCCTGGGATCGATGCGGGATTGGTTACCGTGATGGACTCATAGAGTTCGTGCAGCTCGGTCAAATTCGACCTAACATCTCGAATACAACCATTGAGCTCCTTGCTGGTGCCTCGCTTGTGATTGCATCCGGTCTTCGGCCTGGGTATGGTTGCAGCCGAGCGCATGGCGTGGTGCACTGCTATAAGTGTCCATCATACCGTGACCTTGAACGGTTCGGTCCCGGGCTCGGGAAATGGGTGCCATTGCCTGGTGAGCCTGTCCCGGAGTTGTGTATTAACCCTCAGTGGGCGAGGCGCGGCTTCCGGACGTCTAACAATCCTTTAAGCTTGATGCAAACTTTCGTTGAGGACATCTTCTTAGCGCCTTTTTGCAGTCCGACGCCTGGCCGTGTACGTGTCTGCAACAATACTGCTTTCTATCCGAGGGGAGGCGGCTTTGTGCAGCTCATTGGGGACGTCCAGGTGTTGACCCCCAACACCGCATCTTTACACTCTTTACTAACTTTGATATCCCTTATCCTATTAGTGTGTATTGTTTCTGGCGCGCGGTTCGTCCCATTAATCATCATATTTTTCTGGAGCGTGCGCCATGTATATGCTCCTTGTTACTTAAGCTGTGACTGGGCTGTTTGCAACGAAGCGTTCTGCTTCACTTCTGGTACTTGTGCTACTTTCAATGACGTCTTGTGTCTGCCGGTTGCGACGCGCATATCGTCTTGTGGCCATGCCGTACCGCCTGCCGACCGTGGTTGGGAGGTGCCCGCGGCGTTGTCATGGTTGATTGCGCGGACAACTGGTTTGACGTTCGATGTCTTTTCTTTCATCCAGTATTTCCCTACTGTGCCTGGCAACAACACTGATATTATTTTCTGTGGTGAACCAACCTTCTTCGGGGACATCACAGGCATCTATTGGCCATACTTTTTGCCTGGCATGTTGCTCTTGTACTTGACTCCTTTCTTAGGTTTAAGGTTGATGCTTGCCGGCTTCAATATAGATGGTTTGTTTCCCATACGGCATGCCACGGCTGCGCTGAGGTTCTCAACTTCACGTGTGACCTTGAGTGTCGTACTTGCTTTCCTAATCTATATATTATCTCATCCTGTTAATGCTGCGCTCAATAGAATGTTCCTAGCATCTGCAAATCTAGAGATGATCTTATCCTTTGATACTTATCATGAGACTATTCTTTATGTCACTTGTCTATTTCTCTACCTCCAGGTGTCGCCCCGTGCGGGCTTGGCTGCTATGGTGGCCATCAAGCTATCTCGAGGCCTGTTATTCGCCGTGGTGTTGGCGCACGGGGTGTGCCGACCTGGACGGGTATTTGGTCTTGAGGTTTGTGCGGACATCTCTTGGTTGGTGGAATTTTCTGGCAACTGCACTTGGTATATGTCCTGTGTCTTCTCCTTCTGGTGCGTAGTATTCGCCTTCACCAGTCCACTTGGACGACAGTATAAGCTTCAGATCTACCGGTACTGGGCACAGGTCTATGCCAGACTCATCCTTGCGGTCGGTTGTGGTCCTCTCGGACGAGAGTTCCATTTCCGCGCCGTCGTGGGCACGGTTTGGTGTGGTGCTTGTATGCTCTGGCCCCGTGAGTGTTCTGAAATCAGCTTGGTCTTCATTCTGTGTGCTCTGACAGTGGACACCATGGACACATGGTTAGTAGCGTGCTTGTCCGCAGGACCGAGTGCGCGAACACTTGCAACTCTGGCCGATGACATGGTGCGCATTGGTGACCACCGGGCGTTGCGCGCCGTGTTGTGTTGCTTTGGATCACGCGGCACATACATATACAACCACATGGGCCAGGTCTCAGAACGGGTGGCGCAAGCAGTCAGGGATCTCGGCGGTTGCTTGGAACCAGTCGTGTTGGAGGAGCCCACCTTTTCTGAGGTCGTGGAAGATACAATGACTTTAGTGTGTGGACAATTGCTTGGAGGTAAGCCAGTGGTGGCCCGCTGCGGCACACGTGTCCTAGTGGGTCACCTCAACCCTGAAGATCTGCCACCTGGTTTCCAGCTGAGTGCTCCGGTGGTTATTACTAAACCAAGCATTGGTACGTGGTCCTTTCTCAAGGCGACACTCACAGGGCGCGCTGAGACACCGGGATCCGGCCAGATCGTGGTGTTATCTTCCCTGACAGGCCGGTCGATGGGTACCGCAGTGAATGGCACACTGTATGCGACCGGCCATGGTGCCGGTGCGCGTGGCCTAGCCACGTGCGCCGGTTTGAGGACGCCACTCTACACGGCATTATCCGATGATGTCGTGGCCTATTCTTGCATTCCGGGCATGAGTTCCCTGGAGCCCTGCAGCTGTACGCCGAGCCGGGTTTGGGTAATGAACAACAATGGAGGGTTGGTGTGTGGCAGAGTGGAGAATGAAGACGTCTGTTTGGACTGTCCCACGCACATAGATCAACTGCGGGGTGCTTCGGGCTCACCGATTTTGTGTGATCACGGTCATGCATACGCGTTGATGCTCGGTGGTTACTCTACCAGTGGTATTTGTGCGCGCGTGCGCATAGTCCAGCCATGGCGGAACGCCTATTCCTCCTCAGGGGGGCAAGGCGGAATGCAGGCGCCAGCTGTGACACCAACATACTCTGAAATCACCTACTATGCCCCTACTGGTTCTGGTAAGTCAACAAAATATCCAGTGGACCTAGTCAAACAGGGACACAAAGTATTGGTTCTCATACCGAGTGTGGCTGTCGTCAAAAGTATGGCTCCTTATATTAAGGAGACCTATAATATTAGACCTGAAATTAGAGCTGGCACAGGGCCTGACGGTATAACGGTCATCACTGGCACGAACTTGGCGTACATGACCTATGGCCGCTTCCTTGTGGATCCGGAGACGAATCTGCGGGGTTATGCTGTAGTCATTTGCGACGAGTGCCACGACACATCATCTACCACGCTGCTCGGCATTGGCGCAGTGCGCATGTATGCCGAGAAAGCTGGAGTGAGGACCGTTGTATTCGCCACAGCCACTCCTGCTGGCATTCAAGTACAGCCACATCCCAACATTGATGAGTACTTATTGACTGACACAGGCGACGTGGACTTCTACGGCGCCAAAATCAAATTGGACACCATCAGAACTGGTAGACATGCTATCTTTTGCCACTCGAAAGCCAGGTGCGCGGAACTAACGCAGCAGCTCTCCGCCCTTGGTGTTCGTACAGTGAGTTTTTGGCGCGGTTGTGACATCAACAGCATTCCCGCCACAGGCTCTATTGTTGTAGTGTCAACTGATGCATTGTCCACAGGTTACACAGGGAATTTTGATTCGGTCATTGACTGCGGGTGTTGCGTAGAGCAAACTGTGACAATTGACATGGACCCCACGTTCTCCATCTCAGCTCGAGTGGTGCCAACCACTGCTGCATTGCGTATGCAGCGGCG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| 75,496
|
KX528231.1
|
Human hepegivirus
|
Wang,H., Wan,Z., Xu,R., Guan,Y., Zhu,N., Li,J., Xie,Z., Lu,A., Zhang,F., Fu,Y., Tang,S., Sun,Q., Li,T., Ren,X., An,X., Deng,S., Wu,Y., Ku,X., Li,L., Tong,Y., Li,X.
|
Southern Medical University, School of Public Health
|
China
|
2017-07-31
|
IDU31
|
Pegivirus columbiaense
|
Pegivirus
|
Flaviviridae
|
ssRNA(+)
| 9,502
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2015-03-16
| null | null |
Human hepegivirus isolate IDU31, complete genome
|
CGCTATATTGCTACTTCGGTACGCCTAATTGGTAGGCGCCCGGCCGACCGGCCCCGCAAGGGCCTAGTAGGACGTGTGACAATGCCATGAGGGATCATGACACTGGGGTGAGCGGAGGCAGCACCGAAGTCGGGTGAACTCGACTCCCAGTGCGACCACCTGGCTTGGTCGTTCATGGAGGGCATGCCCACGGGAACGCTGATCGTGCAAAGGGATGGGTCCCTGCACTGGTGCCATGCGCGGCACCACTCCGTACAGCCTGATAGGGTGGCGGCGGGCCCCCCCAGTGTGACGTCCGTGGAGCGCAACATGGGGTGTTCAACTGATCAAACCATTTGTTCTCCAGTCGTGGGGGCCGACTATAATACCTCCTCGGGCTGCCGGGCCTTAAATGGGAGCCACCACTGCGGTGGCGGCTCCTGCCGGTCACCAAGTCGTGTGCAGGTCGCGAGACGTGTCTTGCGGCTGTGCGCATTCCTTGCGTTGATCGGATCCGGTGTGTGTTCGATCCGGTCCAAAACTGAAGGGCGCATTGAGTCGGGGCAAATATTGCAGTCTCAGCGCGCATGTTGGACCGGTGAGGGTTTTGCTTTCTTTTCTAACTGTTGCAATCAAACTGATATTATGTGGTGTTTGCACCGTTGGTGTGTGACAAGACCTGGCTGTTTAGTGTGCACGGGCAATGCCACTCATCCTGTCTGCTGGGACTACCTTGGGTCTGGCGTAAGCCGGCGGCCTGCGCGTCGAACGGGTGAGGGAGCTGAAACGCTTCTTCGCTTGATCGGCATTGCGGGATGGCTTGGGCTGTTAGCTGAGACTCTTGGTATGTCCGAACTCTATGCAGCTATTCTTTGCTTCGGATTTATTGCTTGGTATGGCTGGGGTATACCAAAAACGTTGGTGTGCACAGTTTGCCCAGCGGTAAACATTTCTCCCTACAGCTTCTTATCTCCAGATACTATCGCATTCGGTACGTGGATACTACAACTACCTGGTCTTTTGTGGCAAATGTTTGTCAACTTTCCTATACTTTACAGCACTTGGATTCTTTGGTTGTTGCTTAGCGGCAAGACTGTTGCTGTGATAGCGATCCTATTGGCTAGTCCTACGGTTATGGCATACAAGCATCAATCTGAAAGCTACCTCAAATACTGTACCATAACCAATGCTTCAACTTCTATGAACTGTGACTGTCCCTTTGGAACCTTTACTCGCAATACTGAGTCTCGTTTCTCTATACCGAGATTCTGTCCTGTTAGAATCAATAGCTCTACATTTATTTGCTCTTGGGGGTCGTGGTGGTGGTTTGCTGAGAACATCACGCGTCCATACTCGGACGTTGGCATGCCACCGGCACCGATTTCCGCTTTGTGCTATATCTACTCAAACAATGACCCACCTTCTTGGTATCATAACACAACTATCATACCTCAGAACTGTCGCAACTCTACGGTTGATCCTACCACAGCCCCATGCCGCGACAAGTGGGGCAACGCAACTGCTTGCATTCTTGACCGCCGGTCGCGGTTCTGCGGGGACTGCTATGGCGGCTGTTTCTATACTAATGGTAGTCATGATCGGTCCTGGGAGCGATGTGGGATTGGTTACCGTGATGGACTCATAGAGTTTGTGCAGCTCGGTCAGATTCGACCCGACATCTCGAATACGACCATTGAGCTCCTCGCTGGCGCCTCGCTTGTGATTGCATCCGGTCTTCGGCCTGGGTATGGTTGCAGCCGAGCGCATGGCGTGGTGCACTGCTATAAGTGTCCTTCATACCGTGACCTTGAACAGTTTGGTCCCGGGCTCGGGAAATGGGTGCCATTGCCTGGCGAGCCTGTCCCGGAGTTGTGTATTAACCCTCAGTGGGCGAGGCGCGGCTTCCGGGTGTCTAACAATCCTCTAAGCTTGATACAGACCTTCGTTGAGGACATCTTTCTAGCACCTTTCTGCAACCCGACGCCTGGCCGTGTGCGTGTGTGTAACAATACTGCTTTCTATCCGAGAGGTGGCGGTTTTGTGCAGCTCATTGGAGACGTCCAGGTGCTAACTCCTAACACTGCATCTTTACACTCTCTGCTGACTTTAATATCCCTTGTCTTGTTAGTGTGTGTTGTTTCTGGCGCGCGGTTCGTCCCACTAATCATCATATTTTTCTGGAGCGTGCGCCATGTATATGCTTCTTGTTACTTAAGCTGTGATTGGTCTGTCTGCAATGATGCGTTCTGTCTCACATCTGGTACTTGTGCCACCTTCAGCGACGTCTTGTGTCTGCCGGTTGCGAAGCGTATATCGTCCTGTGGCCACGCTGTGCCACCTCCTGACCGCGGTTGGGAGGTGCCTGCAGCCATGTCATGGGTGATTTCGCGGACTACTGGCTTGACGTTCGATGTCTTTTCCTTCATTCAGTATTTTCCTACTGTGCCTGGCAATAATACTGACATTATTTACTGTGGTGAACCAACCTTCTTCGGGGACATCACGGGCATCTATTGGCCTTACTTTTTGCCTGGCATGTTGCTTTTGTACTTGACTCCTTTCCTGGGTTTAAGGTTAATGCTTGCCGGTTTTAATATAGATGGCTTGTTTCCCATACGGCACGCCACGGCTGCACTGAGGTTCTCGACTTCGCGTGTGACCTTGAGTGTCGTAGTTGCTTTCCTAATCTATATATTATCCCACCCTGTTAATGCTGCGCTCAATAGAATGTTTCTAGCATCTGCAAATTTAGAGATGATCTTATCCTTTGACAGCTATCATGAGACTATTCTTTACATCATCTGCCTGTTGCTCTATCTCCAGGTGTCGCCCCGTGCAGGCTTGGCTGCTATGGTGGCCGTCAAGCTATCTCGAGGCTTGTTATTCGCTGTGGTGTTGGCGCACGGCGTGTGCCGACCTGGGCGGGTATTTGGCCTTGAGGTTTGCGCGGACCTCACTTGGTTGGTGGAGTTTTCTGGCAACTGCACTTGGTACATGTCCTGTGTCTTCTCTTTTTGGTGCGCAGTGTTTGCCCTCACCAGTCCACTTGGACGACAGTATAAGCTTCAGATCTATCGGTACTGGGCGCAGGTGTATGCCAGACTCATCCTCGCTGTCGGTTGTGGTCCACTCGGGCGAGAGTTCCATTTCCGCGCAAGCGTGGGCGTGCTTTGGTGTGGTGCCTGCATGCTCTGGCCCCGCGAGTGCTCTGAAATCAGCTTGGTCTTCATTCTGTGTGCTCTAACAGTGGACACCATAGACACATGGTTAGTAGCATGCTTGTCCGCAGGGCCGAGCGTGCGAACCCTTGCAACTCTGGCCGATGACATGGCGCGCATTGGTGACCACCGGGCGTTGCGCGCTGTGTTGCGTTGCTTTGGATCACGTGGCACATACATATACAACCACATGGGCCAGGTCTCAGAACGGGTGGCGCAAGCAGTCAGGGACTTCGGCGGTTGCTTGGAACCAGTCGTGTTGGAGGAGCCCACCTTTACTGAGGTCGTGGATGATACAATGAGTATGGTGTGTGGACAATTGCTTGGAGGTAAACCTGTGGTGGCCCGCTGCGGCACACGTGTCTTAGTGGGACACCTCAACCCTGAAGATCTGCCACCTGGCTTCCAGCTGAGTGCTCCGGTGGTTATTACCAAACCAAGCATTGGTACGTGGTCCTTCCTTAAGGCGACACTCACAGGGCGTGCTGAAACACCGGGATCCGGCCAGATCGTGGTGTTGTCTTCCCTGACAGGTCGGTCAATGGGTACTGCAGTGAATGGCACACTGTATGCGACCGGCCATGGTGCTGGCGCGCGCGGCCTAGCCACGTGCGCTGGTTTGAGGACGCCACTTTACACGGCATTATCTGATGATGTCGTGGCCTATTCTTGCCTTCCGGGCATGAGCTCCCTGGAGCCCTGCGGCTGTTCGCCGAGCCGGGTTTGGGTGATGAACAACAACGGAGGGTTGGTGTGTGGCAGAGTGGAGAATGATGACGTCTGTTTGGATTGTCCCACGCACATAGATCAACTGCGGGGTGCCTCGGGTTCACCGGTCATGTGTGATTGCGGCCATGCATACGCGTTGATGCTCGGAGGTTACTCTACCAGTGGTATTTGTGCGCGTGTCCGGATAGTCCGGCCATGGCAGAACGCCTATTCCTCCTCAGGGGGGCAAGGCGGAATGCAGGCGCCAGCTGTGACACCAACATACTCTGAAATCACCTACTATGCCCCTACCGGTTCTGGTAAGTCAACAAAATATCCAGTGGACCTGGTCAAACAGGGACACAAAGTGCTGGTCCTTTTACCAAGTGTGTCTGTTGTCAAAAGTATGGCCCCTTACATTAAGGAGACATATAAAATTAGACCTGAAATTAGAGCTGGTACTGGCCCTGACGGTGTGACGGTCATCACTGGTGAGAACTTGGCGTACATGACCTATGGCCGCTTCCTCGTGGATCCGGAAACGAATCTGCGGGGCTATGCCGTAGTCATTTGCGACGAGTGTCACGATGTATCATCCACTACGGTACTCGGCATTGGCGCGGTGCGCATGTATGCCGAGAAGGCTGGAGTGAAGACCGTTGTATTCGCCACGGCCACACCTGCCGGCATTCAAGTGCAGTCACACCCCAACATTGATGAATATTTATTGACTGACACAGGCGACGTGGACTTCTACGGCGCCAAAATCAAATTGGACAACATCAGGACTGGTAGACATGCTATCTTTTGTCACTCGAAGGCCAGGTGCGCGGAACTAACGCAGCAGCTCTCCGGCCTTGGTATTCGTGCAGTGAGTTTTTGGCGGGGCTGTGACATCAAAACGATCCCCACTTCAGACTCTATTGTTGTAGTGACAACTGATGCATTGTCCACAGGCTACACAGGAAACTTTGATTCGGTCATTGACTGCGGGTGTTGCGTGGAGCAAACTGTAACAATTGACATGGACCCCACGTTCTCCATCTCGGCTCGAGTGGTGCCATGTACTGCTGCATTGCGTATGCAGCGGCGCGG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| 75,497
|
NC_001802.1
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Martoglio,B., Graf,R., Dobberstein,B., Petropoulos,C.J., Chappey,C.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1998-01-22
| null |
Human immunodeficiency virus 1
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 9,181
|
RefSeq
| 1
| null | null |
Homo sapiens
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Human immunodeficiency virus 1, complete genome
|
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| 8,819
|
PP056114.1
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Shi,P.
|
the Peoples Hospital of Baoding, Department of Clinical Laboratory Medicine
|
China
|
2024-01-23
|
BDL120
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,849
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
|
blood
|
2023
| null | null |
HIV-1 isolate BDL120 from China, complete genome
|
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| 9,517
|
PP056115.1
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Shi,P.
|
the Peoples Hospital of Baoding, Department of Clinical Laboratory Medicine
|
China
|
2024-01-23
|
BDX016
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,903
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
|
blood
|
2022
| null | null |
HIV-1 isolate BDX016 from China, complete genome
|
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| 9,518
|
PP056116.1
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Fan,W., Shi,P.
|
the Peoples Hospital of Baoding, Department of Clinical Laboratory Medicine
|
China
|
2024-01-23
|
BD093A
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 8,498
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
|
blood
|
2019
| null | null |
HIV-1 isolate BD093A from China, complete genome
|
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China
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HIV-1 isolate BDL104 from China, complete genome
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| 9,521
|
OR736069.1
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Totmenin,A.V., Halikov,M.R., Ekushov,V.E., Sklyar,L.F., Solovyova,N.P., Antonets,M.E., Tregubchak,T.V., Beniova,S.N., Ermolitskaya,S.A., Gorelova,I.S., Gashnikova,N.M.
|
State Research Center of Virology and Biotechnology "Vector", Department of Retroviruses
|
Russia
|
2023-11-11
|
Vlad4
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 9,747
|
GenBank
| null |
Russia: Vladivostok
|
Russia
|
Homo sapiens
| null |
2021-06
| null | null |
HIV-1 isolate Vlad4 from Russia, complete genome
|
TGGATGGGTTAATTTACTCTAAGCAAAGACAAGATATCCTAGATTTGTGGGTCTATAACACACAAGGCTACTTCCCTGATTGGCAAAACTACACACCGGGACCGGGAACCAGATTCCCACTGACCTTTGGATGGTGCTTCAAGCTAGAACCAGTTGACCCAGAAAAAGTGGAAGAGCTCAATAAGGAAGAGAACAGCTGTTTGCTGCACCCGATAAGTCTGCATGGAATGGAGGATGAAGACAGAGAAGTATTAGTGTGGAGATTTGACAGTAGCCTGGCACGCAGACACCTAGCCCGTGAGAAACATCCGGAGTTTTACAAAGACTGCTGACACAGACTGCTGACACAGAAGGGACTTTCCGCTGGGACTTTCCACTAGGGGCGTTCCAGGGGGAGAGGTCTGGGCGGGACTGGGAGTGGCCAACCCTCAGATGCTGCATATAAGCAGCTGCTTTTCGCTTGTACTGGGTCTCTCTAGGTAGACCAGATCTGAGCCTGGGAGCTCTCTGTCTATCTGGGGAACCCACTGCTTAAGCCTCAATAAAGCTTGCCTTGAGTGCTTTAAGTAGTGTGTGCCCGTCTGTTGTGTGACTCTGGTAACTAGAGATCCCTCAGACTTCTTTTGTCCGTGTGGAAAATCTCTAGCAGTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAAGTGAAAGTGAGACCAGAGGAGATCTCTCGACGCAGGACTCGGCTTGCTGAAGTGCACTCGGCAAGAGGCGAGAGAGGCGACTGGTGAGTACGCCATATTTGACTAGCGGAGGCTAGAAGGAGAGAGATGGGTGCGAGAGCGTCAGTATTAAGAGGCGAAAAATTAGATACCTGGGAAAGAATTAAGTTAAGACCAGGAGGGAAAAAATCATATATGCTAAAACATCTAGTATGGGCAAGCAGGGAGCTGGATAGATTTGCACTTAACCCTAGCCTTTTAGAAACATCAGAAGGCTGTCAACAAATATTAGGACAGCTACAGCCAGCTCTTAAGACAGGGACAGAGGAACTTAGATCATTATTTAACACAATAGCAGTCCTTTATTGTGTACATTCAGGGATAGGGGTACGAGACACCAAGGAAGCATTAGACAAGATAGAAGAAGAACAAAAGAAATGTCAGCAAAAAACACAGGAAACAGAAACAGTTGACAAAGGGAAGGTCAGTCAAAATTATCCTATAGTACAGAATGCCCAAGGGCAAATGGTACACCAGGCCATATCACCTAGGACCTTGAATGCATGGGTAAAAGTAATAGAAGAGAAGGCTTTTAGCCCAGAGGTAATACCCATGTTTACAGCATTATCAGAAGGAGCCACCCCACAAGATTTAAATACCATGTTAAATACAGTGGGGGGACATCAAGCAGCCATGCAAATGTTAAAAGATACCATTAATGAAGAGGCTGCAGAATGGGACAGAGTACATCCAGTGCATGCAGGACCGCCTGCACCAGGCCAACTAAGAGAACCAAGGGGAAGTGACATAGCAGGAACCACTAGTACCCTTCAGGAACAAATAGCATGGATGACAAATAACCCACCTGTCCCAGTGGGAGAAATCTATAAAAGATGGATAATTCTGGGGTTAAATAAAATAGTAAGAATGTATAGCCCTGTCAGCATTTTGGACATAAAACAAGGGCCAAAAGAACCCTTTAGAGATTATGTAGATCGGTTCTTTAAAACCTTAAGAGCTGAACAAGCTACTCAAGATGTAAAAAATTGGATGACAGACACCTTGTTGGTCCAAAATGCGAACCCAGATTGTAAGACCATTCTAAGAGCATTAGGGCCAGGGGCTACATTAGAAGAAATGATGACAGCATGTCAAGGAGTAGGAGGACCTGGCCACAAAGCAAGAGTGTTGGCTGAGGCGATGAGCCAAGTACACAGTACAAATGTAATGGTACAGAGAGGCAATTTTAAGGGCCCTAAAAGAACTATTAAATGTTTCAACTGTGGCAAGGAAGGACACCTAGCCAGAAATTGCAGGGCCCCTAGGAAGAGAGGCTGTTGGAAATGTGGAAAGGAAGGACATCAAATGAAAGACTGTAATGAAAGACAGACACAGGCTAATTTTTTAGGGAAAATCTGGCCTTCCCACAAGGGGAGGCCGGGAAATTTCCTTCAGAGCAGACCAGAGCCAACAGCCCCGCCAGCAGAGAGCTTCAGGTTCGAGGAGACAACACCCTCTCCGAGCCAGGAGCCGAGAGGCAAGGAACCATACAAGGAGCCCTTAACTGCCCTCAGATCACTCTTTGGCAGCGACCCCTTGTCACAATAAAAGTAGGGGGACAGTTAAGGGAGGCTCTTTTAGATACAGGAGCAGATGATACAGTATTAGAAGACATAGATTTGCCAGGAAAATGGAAACCAAAAATGATAGGAGGAATTGGAGGTTTTATTAAAGTAAAACAGTATGATCAAATACTTATAGAAATTTGTGAGAGAAAGGCTATAGGTACAGTATTGGTAGGACCCACACCTGTCAACATAATTGGAAGAAATATGTTGACTCAGATTGGATGCACACTAAATTTTCCAATTAGTCCTATTGAAACTGTACCAGTTAAATTAAAGCCAGGAATGGATGGCCCAAAAGTCAAGCAATGGCCATTAACAGAAGAGAAAATAAAAGCATTAACAGAGATTTGTACAGAAATGGAGAAGGAAGGAAAAATTTCAAAGATTGGGCCTGAAAATCCATATAACACTCCAGTGTTTGCTATAAAAAAGAAAGATAGTACTAAGTGGAGAAAATTAGTAGATTTCAGGGAACTCAATAAAAGAACTCAAGACTTTTGGGAAGTACAATTAGGGATACCACACCCAGCAGGGTTAAAAAAGAAAAAATCAGTGACAGTACTAGATGTGGGGGATGCATATTTCTCAGTTCCTTTACATGAGGACTTCAGGAAGTATACTGCATTCACCATACCTAGTATAAACAATGAAACACCAGGGATTAGATATCAATATAATGTGCTGCCACAGGGATGGAAGGGATCACCAGCAATATTCCAGAGTAGCATGATAAAAATCTTAGAACCCTTTAGGGCACGAAACCCAGAACTAGTTATCTATCAGTATATGGATGACTTGTATGTAGGATCTGATTTAGAAATAGAGCAACATAGAGCAAAAATAGAGCAGTTAAGAGAACATTTATTGAAGTGGGGATTAACCACACCAGACAAGAAGCATCAGAAAGAACCTCCATTTCTTTGGATGGGGTATGAACTTCATCCTGACAAATGGACAGTACAGCCTATACAGCTGCCAGAAAAGGAAAGCTGGACAGTCAATGATATACAAAAGTTAGTGGGAAAATTAAACTGGGCAAGTCAAATTTACCCAGGGATTAAAGTAAGGCAACTGTGTAAACTCCTTAGGGGAGCCAAAGCACTAACAGAAGTAGTAACACTGACTGAAGAAGCAGAACTAGAATTGGCAGAAAACAGGGAAATTCTAAAAGAACCAGTACATGGGGCATATTATGACCCTTCAAAAGACTTAATAGCTGAAATACAGAAACAAGGGGATGACCAGTGGACATATCAAATTTACCAAGAACCATTTAAAAATCTAAAGACAGGGAAGTATTCAAAAAGGAGAGCTGCCCACACTAATGATGTAAAACAACTAACAGAGGCAGTGCAAAAGATATCTACAGAAAGCATAGTAATATGGGGAAAAACTCCTAAATTTAGATTACCCATCCAAAAAGAAACATGGGAGTCATGGTGGACAGATTATTGGCAAGCCACCTGGATTCCTGAGTGGGAGTTTGTTAATACCCCTCCCCTAGTAAAATTATGGTACCAGCTGGAGAAAGAACCCATAATAGGGGCAGAAACTTTCTATGTAGATGGAGCAGCTAATAGGGAAACAAAAATAGGAAAGGCAGGGTATGTTACTGACAGAGGAAGGCAAAAAGTTGTTACTCTAAATGAAACAACAAATCAGAAGGCGGAATTACAAGCCATTCAGATAGCTTTACAGGATTCAGGATCAACAGTAAACATAGTAACAGACTCACAGTATGCATTAGGGATCATTCAAGCACAACCAGATAAAAGTGAATCAGAAATAGTCAATCAAATAATAGAACATTTAATAAAGAAGGAGGGGGTCTATCTGTCATGGGTACCAGCACATAAAGGAATTGGAGGTAATGAACAAGTAGATAAATTGGTAAGTAATGGAATCAGGAAAGTGCTATTTCTAGATGGAATAGATAAGGCTCAAGAAGAACATGAAAAATATCACAGCAACTGGAAAGCAATGGCTAGTGACTTTAATCTGCCACCCATAGTAGCAAAAGAAATAGTAGCTAGCTGTGATAAATGTCAACTAAAGGGGGAAGCCATGCATGGACAAGTAGATTGTAGTCCAGGGATATGGCAATTAGACTGTACACACTTAGAAGGAAAAATCATCCTGGTAGCAGTCCATGTAGCTAGTGGCTATATAGAAGCAGAGGTTATCCCAGCAGAAACAGGACAAGAAACTGCATACTTCCTACTAAAATTAGCAGGAAGGTGGCCAGTCAAGGTAATACATACAGACAATGGCAGTAATTTCACCAGTGCTGCGGTGAAAGCAGCCTGTTGGTGGGCAGGTATCAATCAGGAATTTGGGATTCCCTACAATCCCCAAAGTCAAGGAGTAGTAGAATCCATGAATAAAGAATTAAAGAAAATTATAGGACAGGTAAGAGAACAAGCTGAACACCTTAAGACAGCAGTACAAATGGCAGTATTCATTCACAATTTTAAAAGAAAAGGGGGGATTGGGGGGTACAGTGCAGGGGAAAGAATAATAGATATAATAGCAACAGACATACAGACTAAAGAACTACAAAAACAAATTTTAAAAATTCAAAATTTTCGGGTTTATTACAGAGACAGCAGAGACCCTATTTGGAAAGGACCAGCCAAACTACTCTGGAAAGGTGAAGGGGCAGTAGTAATACAAGATAACAG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| 11,128
|
OR736070.1
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Human immunodeficiency virus 1
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Totmenin,A.V., Halikov,M.R., Ekushov,V.E., Sklyar,L.F., Solovyova,N.P., Antonets,M.E., Tregubchak,T.V., Beniova,S.N., Ermolitskaya,S.A., Gorelova,I.S., Gashnikova,N.M.
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State Research Center of Virology and Biotechnology "Vector", Department of Retroviruses
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Russia
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2023-11-11
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Vlad28
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Human immunodeficiency virus 1
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Lentivirus
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Retroviridae
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ssRNA-RT
| 9,786
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GenBank
| null |
Russia: Vladivostok
|
Russia
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Homo sapiens
| null |
2021-06
| null | null |
HIV-1 isolate Vlad28 from Russia, complete genome
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| 11,130
|
OR736072.1
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Totmenin,A.V., Halikov,M.R., Ekushov,V.E., Sklyar,L.F., Solovyova,N.P., Antonets,M.E., Tregubchak,T.V., Beniova,S.N., Ermolitskaya,S.A., Gorelova,I.S., Gashnikova,N.M.
|
State Research Center of Virology and Biotechnology "Vector", Department of Retroviruses
|
Russia
|
2023-11-11
|
Vlad29
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 9,759
|
GenBank
| null |
Russia: Vladivostok
|
Russia
|
Homo sapiens
| null |
2021-06
| null | null |
HIV-1 isolate Vlad29 from Russia, complete genome
|
TGGATGGGTTAATTTACTCCAAGAAAAGACAAGAAATCCTTGATTTGTGGGTCTATCACACACAAGGATACTTCCCTGATTGGCAGAATTATACCCCAGGGCCAGGGACTAGATACCCACTAACATTTGGGTGGTGCTACAAGTTAGTACCAGTTGACCCAGATGAAGTAGAAGAGGCCACAAGGGGAGAGAACAACAGCCTATTACACCCTATATGCCAACACGGAATGGATGATGAGGAAAGAGAAGTGTTAATGTGGAAGTTTGACAGTCGCCTAGCTCTAACACACAGAGCCCGAGAGCTGCATCCGGAGTTCTACAAAGACTGCTGACACAGACTGCTGACATGAAGTTGCTGACGGGGACTTTCCGCGGGGACTTTCCAGGGGAGGTGTGGTGTGGGCGGAGTTGGGGAGTGGCTAACCCTCAGATGCTGCATATAAGCAGCTGCTTTTCGCTTGTACTGGGTCTCTCTAGGTAGACCAGATCTGAGCCCGGGAGCTCTCTGGCTATCTAGGGAACCCACTGCTTAAGCCTCAATAAAGCTTGCCTTGAGTGCTTTAAGTAGTGTGTGCCCGTCTGTTGTGTGACTCTGGTAACTAGAGATCCCTCAGACTTCATTTGTTTGTGTGGAAAATCTCTAGCAGTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAAGTGAAAGTAGAACCAGAGGAGATCTCTCGACGCAGGACTCGGCTTGCTGAAGTGCACTCGGCAAGAGGCGAGAGCGGCGACTGGTGAGTACGCCTAAAGATTTTTGACTAGCGGAGGCTAGAAGGAGAGAGATGGGTGCGAGAGCGTCAGTATTGAGCGGGGGAAAATTAGATAAATGGGAAAAAATTCGGTTAAGGCCAGGGGGAAAGAAAAAATATAGATTAAAACACTTAGTATGGGCAAGCAGGGAGCTGGAAAGATTCGCGCTTAACCCTGGCCTTTTAGAAACATCAGAAGGATGTCAACAAATACTRGAACAGTTACAACCATCTGTCAAGACAGGATCAGAAGAACTTAGATCATTATTCAATACAGTAGCAGTCCTCTATTGTGTACATCAACAGATAGAGATAAGAGACACCAAGGAAGCTTTAGATAAAATAGAGGAACTACAAAATAAGAGCAAGCAAAGGACCCAACAGGCAGCAACTGACACAGGAAAAGTCAGTCAAAATTACCCCATAGTGCAAAATGCACAAGGGCAAATGACATACCAGTCCATGTCACCTAGGACTTTGAATGCATGGGTAAAAGTAATAGAAGAAAAAGCCTTCAGCCCAGAAGTAATACCCATGTTTTCAGCATTGGCAGAGGGAGCCACCCCACAAGATTTAAACATGATGCTGAACATAGTGGGGGGACACCAGGCAGCTATGCAAATGTTGAAAGATACCATCAATGAGGAAGCTGCTGAATGGAATAGATTACATCCAGCACAAGCAGGGCCTTTACCACCAGGGCAGCTGAGAGAACCAAGGGGAAGTGACATAGCAGGAACTACTAGTACCCTACAAGAGCAAATAGGATGGATGACAAGCAACCCACCTATCCCAGTGGGAGAAATCTATAAAAGATGGATAATCCTAGGATTGAATAAGATAGTAAGAATGTATAGCCCTGTTAGCATTTTAGATATAAGACAGGGGCCAAAAGAACCATTTAGAGACTATGTAGATAGGTTCTTTAAAACTCTTAGAGCTGAGCAAGCTACACAGGATGTAAAGAACTGGATGACAGAGACCCTGCTGGTCCAAAATGCAAATCCAGATTGTAAAACCATTTTAAGAGCATTAGGACCAGGGGCTACATTAGAGGAAATGATGACAGCATGCCAGGGAGTGGGAGGACCCGGCCACAAAGCAAGGATTTTGGCTGAGGCAATGAGTCAAGTACAAAATACAAACGTAATGATGCAAAAAAGTAATTTTAGGGGCCCAAAAAGGATTAAGTGTTTCAATTGTGGCAAAGAAGGACACCTAGCCAGAAATTGCAGGGCCCCTAGGAAAAAGGGCTGTTGGAAATGTGGAAAGGAAGGCCATCAAATGAAAGACTGCACTGAGAGACAGGCTAATTTTTTAGGGAAAATTTGGCCTTCCAGCAAAGGGAGGCCAGGGAATTTCCTTCAGAGCAGACCAGAGCCAACAGCCCCACCAGCAGAGAGCTTCAAGTTCGAGGAGACAACACCCTCTCCGAACCAGGAGCCGAAAGACAAGGGACTATACAAGGAGCCCTTAACTGCCCTCAGATCACTCTTTGGCAGCGACCCCTTGTCACAATAAAAATAGGGGGACAGTTAAGGGAGGCTCTTTTAGACACAGGAGCAGATGATACAGTATTAGAAGACATAGATTTGCCAGGAAAATGGAAACCAAAAATGATAGGAGGAATTGGAGGTTTTATTAAAGTAAAACAGTATGAGCAAATACTTATAGAAATTTGTGGGAAAAAAGCTATAGGTACAGTATTAGTAGGACCCACACCTGTCAACATAATTGGAAGAAATATGTTGACTCAGATTGGATGTACACTAAATTTTCCAATTAGTCCTATTGAAACTGTACCAGTTAAACTGAAGCCAGGAATGGATGGCCCAAAAGTCAAGCAATGGCCATTAACAGAAGAGAAAATAAAAGCATTAAGAGAGATTTGTGACGAAATGGAGAAGGAAGGAAAAATTTCAAAGATTGGGCCTGAAAATCCATATAACACTCCAGTGTTTGCCATAAAAAAGAAAGACAGTACCAAGTGGAGAAAATTAGTAGATTTTAGGGAGCTCAATAAAAGAACTCAAGACTTTTGGGAAGTTCAATTAGGAATACCCCATCCAGCGGGTTTAAAAAAGAAAAAATCAGTAACAGTACTAGATGTGGGGGATGCATATTTTTCAGTTCCTTTAGATGAAAGCTTCAGAAAGTATACTGCATTCACTATACCAAGTATAAACAATGAGACACCAGGGATCAGATATCAGTACAATGTACTTCCACAGGGATGGAAAGGATCACCATCAATATTCCAGAGTAGCATGACAAAAATCTTAGAGCCCTTTAGAGRAAAAAATCCAGAAATAGTTATCTATCAATACATGGATGACTTGTATGTAGGCTCTGATTTAGAAATAGGGCAACATAGAACAAAAGTAGAGGAGTTAAGAGCTCATCTATTGAGCTGGGGATTTACCACACCAGACAAGAAGCATCAGAAAGAACCTCCATTTCTTTGGATGGGATATGAACTTCATCCTGATAAATGGACAGTACAGCCTATACAGCTGCCAGAAAAGGATAGCTGGACAATCAATGATATACAGAAGTTAGTGGGAAAATTAAACTGGGCAAGTCAAATTTACCCAGGGATTAAAGTAAAGCAACTGTGTAAACTCCTTAGGGGAGCCAAAGCACTAACAGACATAGTACCACTGACTGAAGAAGCAGAATTAGAATTGGCAGAAAACAGGGARATTCTAARAGAACCAGTACATGGGGTGTATTATGACCCTTCTAAGGACTTAATAGCTGAAATACAGAAACAGGGGTATGATCAGTGGACATATCAAATTTACCAAGAACCATTCAAAAATCTAAAGACAGGGAAGTATTCAAAAAGGAGGACTGCCCATACTAATGATGTAAAGCAATTAACAGAGGCAGTGCAAAAGATAGCCACAGAAAGCATAGTAATATGGGGAAAAACTCCTAAATTTAGATTACCCATACAAAGAGAAACATGGGAGGCATGGTGGACAGACTATTGGCAAGCCACCTGGATTCCTGAGTGGGAGTTTGTTAATACCCCTCCTCTAGTAAAATTATGGTACCAGCTGGAGAAAGAACCCATAACAGGGGCAGAAACTTTCTATGTAGATGGAGCAGCAAATAGGGAAATAAAAATAGGAAAGGCAGGGTATGTTACTGACAGAGGAAGACAGAAAATTGTTACTCTAAATGAAACAACAAATCAGAAGGCAGAATTACAAGCAATTCAGCTAGCTTTACAGGATTCAGGATCAGAAGTAAACATAGTAACAGACTCACAGTATGCATTAGGGATCATTCAAGCACAACCAGATAAGAGTGAATCAGAGATAGTCAATCAGATAATAGAACAGTTAATAAAGAAGGAAAGGGTATACCTGTCATGGGTACCAGCACATAAAGGAATTGGAGGTAATGAACAAGTAGATAAATTGGTGAGTACTGGAATCAGGAAAGTGCTATTTCTAGATGGAATAGATAAAGCTCAAGAAGAACATGAAAAATATCACAGCAATTGGAAAGCAATGGCTAGTGATTTTAATCTGCCACCTATAGTAGCAAAGGAAATAGTAGCCAGCTGTGATAAATGTCAACTAAAAGGGGAAGCTATGCATGGACAGGTAGACTGTAGTCCAGGGATGTGGCAATTAGATTGCACACATCTAGAAGGAAAAGTAATCATAGTAGCAGTCCATGTAGCCAGTGGCTATATAGAAGCAGAAGTTATCCCAGCAGAAACAGGACAGGAGACAGCATACTTTCTGCTAAAATTAGCAGGAAGATGGCCAGTAAAAGTAGTACACACAGATAATGGCCCCAATTTCACCAGCAGTGCAGTTAAGGCTGCCTGTTGGTGGGCAAATATCCAACAGGAATTTGGGATTCCCTACAATCCCCAAAGTCAAGGAGTAGTGGAGTCTATGAATAAGGAATTGAAGAAAATTATAGGGCAGGTAAGAGAGCAAGCTGAACACCTTAAGACAGCAGTACAAATGGCAGTATTCATTCACAATTTTAAAAGAAAAGGGGGGATTGGGGGGTATAGTGCAGGGGAAAGAATAATAGACATAATAGCAACAGACATACAAACTAAAGAATTACAAAAACAAATTATAAAAATTCAAAATTTTCGGGTTTATTACAGAGACAGCAGAGATCCAATTTGGAAAGGACCAGCAAAACTACTCTGGAAAGGTGAAGGGGCAGTGGTAATACAGGACCATAACGAGATAAA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| 11,131
|
OR736073.1
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Totmenin,A.V., Halikov,M.R., Ekushov,V.E., Sklyar,L.F., Solovyova,N.P., Antonets,M.E., Tregubchak,T.V., Beniova,S.N., Ermolitskaya,S.A., Gorelova,I.S., Gashnikova,N.M.
|
State Research Center of Virology and Biotechnology "Vector", Department of Retroviruses
|
Russia
|
2023-11-11
|
Vlad54
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 9,741
|
GenBank
| null |
Russia: Vladivostok
|
Russia
|
Homo sapiens
| null |
2021-07
| null | null |
HIV-1 isolate Vlad54 from Russia, complete genome
|
TGGATGGGTTAATTTACTCCAAGAAAAGACAAGAAATCCTTGATCTGTGGGTCTATCACACACAAGGATACTTCCCTGATTGGCAGAATTATACCCCAGGGCCAGGGGTTAGATTCCCGCTAACATTTGGGTGGTGCTACAAGTTAGTACCAGTTGACCCAGATGAAGTAGAAGAGGCCACAAAGGGAGAGAACAACAGCCTATTACACCCTATATGCCAACACGGAATGGATGATGAGGAAAGAGAAGTGTTAATGTGGAAGTTTGACAGTCGCCTAGCTCTAAGACACAGAGCCCGAGAAATGCATCCGGAGTTCTACAAAGACTGCTGACACAGACTGCTGACATGAAGTTGCTGACAGGGACTTTCCGCGGGGACTTTCCAGGGGAGGTGTGGTGTGGGCGGAGTTGGGGAGTGGCTAACCCTCAGATGCTGCATATAAGCAGCTGCTTTTCGCCTGTACTGGGTCTCTCTAGGTAGACCAGATCTGAGCCCGGGAGCTCTCTGGCTATCTAGGGAACCCACTGCTTAAGCCTCAATAAAGCTTGCCTTGAGTGCTTCAAGTAGTGTGTGCCCGTCTGTTGTGTGACTCTGGTAACTAGAGATCCCTCAGACATCATTCGTTTGTGTGGAAAATCTCTAGCAGTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAAGTGAAAGTAGGACCAGAGGAGATCTCTCGACGCAGGACTCGGCTTGCTGAAGTGCACTCGGCAAGAGGCGAGAGCGGCGACTGGTGAGTACGCCTAAAGATTTTTGACTAGCGGAGGCTAGAAGGAGAGAGATGGGTGCGAGAGCGTCAGTATTGAGCGGGGGAAAATTAGATGCATGGGAAAAAATTCGGTTAAGGCCAGGGGGAAAGAAACAATATAGAATAAAACACTTAGTATGGGCAAGCAGGGAGCTGGAAAGATTCGCGCTTAACCCTAGCCTTTTAGAAACATCAGAAGGATGTCAACAAATACTGGAACAGTTACAACCAGCTGTCAAGACAGGATCAGAAGAACTTAAATCATTATTCAATACAGTAGCAACCCTCTATTGTGTACATCAACGGATAGCGATAAAAGACACCAAGGAAGCTTTAGATAAAATAGAGGAACTACAAAATAAGAACAAGCAAAAGACCCAACAGGCAGTAACTGACACAGGAAATAGCAGCAAAGTCAGTCAAAATTACCCCATAGTGCAAAATGCACAAGGGCAAATGACATACCAGTCCATGTCACCTAGGACTTTAAATGCATGGGTGAAAGTAATAGAAGAAAAGGCCTTCAGCCCAGAAGTAATACCCATGTTTTCAGCATTGGCAGAGGGAGCCACCCCACAAGATTTAAACATGATGCTGAATATAGTGGGGGGACATCAGGCAGCTATGCAAATGTTGAAAGATACCATCAATGAGGAAGCTGCTGACTGGGATAGATTACATCCAGCACAGGCAGGGCCTTTACCACCAGGGCAGATAAGAGACCCAAGGGGAAGTGACATAGCAGGAACTACTAGTACCCTGCAAGAGCAAATAGGATGGATGACAAGCAACCCACCTATCCCAGTGGGAGAAATCTATAAAAGATGGATAATCCTAGGATTGAATAAGATAGTAAGAATGTATAGCCCTGTTAGCATTTTAGATATAAGACAGGGGCCAAAAGAACCATTTAGAGACTATGTAGATAGGTTTTTTAAAACTCTTAGAGCTGAGCAAGCTACACAGGATGTAAAGAACTGGATGACAGAGACCCTGCTGGTCCAAAATGCAAATCCAGATTGTAAAACCATTTTAAGAGCATTAGGACCAGGGGCTACATTAGAGGAAATGATGACAGCATGCCAGGGAGTGGGAGGACCCGGCCACAAAGCAAGGATTTTGGCTGAGGCAATGAGTCAAGTACAAAATACAAACGTAATGATGCAAAAAAGTAATTTTAGGGGTCCAAAAAGAATTAAGTGTTTCAACTGTGGCAAAGAAGGACACCTAGCCAGAAACTGCAGGGCCCCTAGGAAAAAGGGCTGTTGGAAATGTGGGAAGGAAGGCCATCAAATGAAAGACTGCACTGAGAGACAGGCTAATTTTTTAGGGAGAATTTGGCCTTCCAGCAAAGGGAGGCCAGGGAATTTCCTTCAGAGCAGACCAGAGCCAACAGCCCCACCAGCAGAGAGCTTCAGGTTCGAGGAGACAACACCCTCTCCGAACCAGGAGCCGAAAGACAAGGGACTATACAAGGAGCCCTTAACTGCCCTCAGATCACTCTTTGGCAGCGACCCCTTGTCTCAATAAAAATAGGGGGACAGTTAAGGGAGGCTCTTTTAGACACAGGAGCAGATGATACAGTATTAGAAGACATAGATTTGCCAGGAAAATGGAAACCAAAGATGATAGGAGGAATTGGAGGTTTTATTAAAGTAAGACAGTATGATCAAATACTTATAGAAATTTGTGGGAAAAAAGCTATAGGTACAGTATTAGTAGGACCCACACCTGTCAACATAATTGGAAGAAATATGTTGACTCAGATTGGATGTACACTAAATTTTCCAATTAGTCCTATTGAAACTGTACCAGTTAAACTGAAGCCAGGAATGGATGGCCCAAGAGTCAAGCAATGGCCATTAACAGAAGAGAAAATAAAAGCATTAAAAGAGATTTGTGACGAAATGGAGAAGGAAGGAAAAATTTCAAAGATTGGGCCTGAAAATCCATATAACACTCCAGTGTTTGCCATAAAAAAGAAGGACAGTACCAAGTGGAGAAAATTAGTAGATTTTAGGGAGCTCAATAAAAGAACTCAGGACTTTTGGGAAGTTCAATTAGGAATACCCCATCCAGCGGGTTTAAAAAAGAAAAAATCAGTAACAGTACTAGATGTGGGGGATGCATATTTTTCAGTTCCCTTAGATGAAAACTTCAGAAAGTATACTGCATTCACTATACCAAGTATAAACAATGAGACACCAGGGATCAGATATCAGTACAATGTACTTCCACAGGGATGGAAAGGATCACCATCAATATTCCAGTGTAGCATGACAAAAATCTTAGAGCCCTATAGATTAAAAAATCCAGAAATAGTTATCTATCAATACATGGATGACTTGTATGTAGGCTCTGATTTAGAAATAGGGCAACATAGAACAAAAATAGAGGAGTTAAGAGCTCATCTATTGAGCTGGGGATTTACCACACCAGACAAGAAACATCAGAAAGAACCTCCATTTCTTTGGATGGGATATGAACTTCATCCTGATAAATGGACAGTACAGCCTATACAGCTGCCAGAAAAGGATAACTGGACAGTCAATGATATACAGAAGTTAGTAGGAAAATTAAACTGGGCCAGTCAAATTTACCCAGGGATTAAAGTAAGGCAACTGTGTAAACTCCTTAGGGGAGCCAAAGCACTAACAGATATAGTACCGCTGACTGAAGAAGCAGAATTAGAATTGGCAGAAAACAGGGAAATTCTAAGAGAACCAGTACATGGGGTGTATTATGACCCTTCTAAGGACTTAATAGCTGAAATACAGAAACAGGGGTATGATCAGTGGACATATCAAATTTACCAAGAACCATTTAAAAATCTAAGGACAGGGAAATATTCAAGAAGGAGGACTGCCCATACTAATGATGTAAAGCAATTAACAGAGGCAGTACAAAAGATAGCCTCAGAAAGCATAATAATATGGGGAAAAACTCCTAAATTTAGATTACCCATACAAAAAGAAACATGGGAGGCATGGTGGACAGACTATTGGCAAGCCACCTGGATTCCTGAGTGGGAGTTTGTTAATACCCCTCCTCTAGTGAAATTATGGTACCAGCTGGAAAAAGAACCCATAACAGGGGCAGAAACTTTCTATGTAGATGGAGCAGCAAATAGGGAAATAAAAATAGGAAAGGCAGGGTATGTTACTGACAGAGGAAGACAGAAAATTGTTACTATCAATGAAACAACAAATCAGAAGGCAGAATTACAAGCAATTCAGCTAGCTTTACAGGATTCAGGATCAGAAGTAAACATAGTAACAGACTCACAGTATGCATTAGGGATCATTCAAGCACAACCAGATAAGAGTGAATCAGAGATAGTCAATCAGATGATAGAACAGTTAATAAAGAAGGAAAGGGTATACCTGTCATGGGTACCAGCACATAAAGGAATTGGAGGTAATGAACAAGTAGATAAATTGGTGAGTACTGGAGTCAGGAAAGTGCTATTTCTAGATGGAATAGATAAAGCTCAAGAAGAACATGAAAAATATCACAGCAATTGGAAAGCAATGGCTAGTGATTTTAATCTGCCACCTATAGTAGCAAAGGAAATAGTAGCCAGCTGTGATAAATGCCAACTAAAAGGGGAAGCTATGCATGGACAGGTAGACTGTAGTCCAGGGATATGGCAATTAGATTGCACACATCTAGAAGGAAAAGTAATCATAGTAGCAGTCCATGTAGCCAGTGGCTATATAGAAGCAGAAGTTATCCCAGCAGAAACAGGACAGGAGACAGCATACTTTCTGCTAAAATTAGCAGGAAGATGGCCAGTAAAAGTAGTACACACAGATAATGGCCCCAATTTCACCAGCAGTGCAGTTAAGGCTGCCTGCTGGTGGGCAAATATCCAACAAGAATTTGGGATTCCCTACAATCCCCAAAGTCAAGGAGTAGTGGAGTCTATGAATAAGGAATTAAAGAAAATCATAGGGCAGGTAAGAGAGCAAGCTGAACACCTTAAGACAGCAGTACAAATGGCAGTATTCATTCACAATTTTAAAAGAAAAGGGGGGATTGGGGGGTACAGTGCAGGGGAAAGAATAATAGACATAATAGCAACAGACATACAAACTAAAGAATTACAAAAACAAATTACAAAAATTCAAAATTTTCGGGTTTATTACAGAGACAGCAGAGATCCAATTTGGAAAGGACCAGCAAAACTACTCTGGAAAGGTGAAGGGGCAGTGGTAATACAGGACAATAA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| 11,132
|
OR736074.1
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Totmenin,A.V., Halikov,M.R., Ekushov,V.E., Sklyar,L.F., Solovyova,N.P., Antonets,M.E., Tregubchak,T.V., Beniova,S.N., Ermolitskaya,S.A., Gorelova,I.S., Gashnikova,N.M.
|
State Research Center of Virology and Biotechnology "Vector", Department of Retroviruses
|
Russia
|
2023-11-11
|
Vlad8-23
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 9,783
|
GenBank
| null |
Russia: Vladivostok
|
Russia
|
Homo sapiens
| null |
2023-04
| null | null |
HIV-1 isolate Vlad8-23 from Russia, complete genome
|
TGGATGGGTTAATTTACTCCAAGAAAAGACAAGAAATCCTTGATCTGTGGGTCTATCACACACAAGGATACTTCCCTGATTGGCAGAATTATACCCCAGGGCCAGGGACTAGATTCCCACTAACATTTGGGTGGTGCTACAAGTTAGTACCAGTTGACCCAGCTGAAGTAGAAGAGGCCACAGGAGGAGAGAACAACAGCCTACTACACCCTATATGCCAACACGGAATGGATGATGAGGAAGGAGAAGTGTTAATGTGGAAGTTTGACAGTCGCCTAGCTCTAAAACACAGAGCCCGAGAGCTGCATCCGGAGTTCTACAAAGACTGCTGACACAGACTGCTGACATGAAGTTGCTGACAGGGACTTTCCGCGGGGACTTTCCAGGGGAGGTGTGGTGTGGGCGGAGTTGGGGAGTGGCTAACCCTCAGATGCTGCATATAAGCAGCTGCTTTTCGCCTGTACTGGGTCTCTCTAGGTAGACCAGATCTGAGCCTGGGAGCTCTCTGGCTATCTAGGGAACCCACTGCTTAAGCCTCAATAAAGCTTGCCTTGAGTGCTTTAAGTAGTGTGTGCCCGTCTGTTGTGTGACTCTGGTAACTAGAGATCCCTCAGACTTCATTTGTTTGTGTGGAAAATCTCTAGCAGTGGCGCCCGAACAGGGACCCGAAAGTGAAAGTAGGACCAGAGGAGATCTCTCGACGCAGGACTCGGCTTGCTGAAGTGCACTCGGCAAGAGGCGAGAGCGGCGACTGGTGAGTACGCCTAAAGATTTTTGACTAGCGGAGGCTAGAAGGAGAGAGATGGGTGCGAGAGCGTCAGTATTGAGCGGGGGAAAATTAGATAAATGGGAAAGAATTCGGTTAAGGCCAGGGGGAAAGAAAAAATATAGATTAAAACACTTAGTATGGGCAAGCAGGGAGCTGGAAAGATTCGCGCTTAACCCTAGCCTTTTAGAAACAGCAGAAGGATGTCAACAAATACTGGAACAATTACAACCATCTGTCAAGACAGGATCAGAAGAACTTAAATCATTATTCAATACAGTAGCAACCCTCTATTGTGTACATCAACAGATAGAGATAAAAGACACCAAGGAAGCTTTAGATAAAATAGAGGAACTACAAAACAAGAGCAAGCAAAGGACCCAACAGGCAGTAACTGGCACAGGAAATAGCAGCAAAGCCAGTGTCAGTCAAAATTACCCCATAGTGCAAAATGCACAAGGGCAAATGGCATATCAGTCCATGTCACCTAGGACTTTGAATGCATGGGTGAAAGTAATAGAAGAAAAGGCCTTCAGCCCAGAAGTAATACCCATGTTTTCAGCATTGGCAGAGGGAGCCACCCCACAAGATTTAAACATGATGTTGAACATAGTGGGGGGACACCAGGCAGCTATGCAAATGTTGAAAGATACCATCAATGAGGAAGCTGCAGACTGGGATAGATTACATCCAGCACAGGCAGGGCCTTTACCACCAGGGCAGCAGAGAGAACCAAGGGGAAGTGACATAGCAGGAACTACTAGTACCCTGCAAGAGCAAATAGGATGGATGACAAACAACCCACCTATCCCAGTGGGAGAAATCTATAAAAGATGGATAATCCTAGGATTGAATAAGATAGTAAGAATGTACAGCCCTGTTAGCATTTTAGATATAAGACAAGGGCCAAAAGAACCATTTAGAGATTATGTAGATAGGTTCTTTAAAACTCTTAGAGCTGAGCAAGCTACACAGGAGGTAAAGAACTGGATGACAGAGACCCTGCTGGTCCAAAATGCAAATCCAGATTGTAAAAACATTTTAAGAGCATTAGGACCAGGGGCTACATTAGAGGAAATGATGACAGCATGCCAGGGAGTGGGAGGACCCAGCCACAAAGCAAGGGTTTTGGCTGAGGCAATGAGTCAAGCACAAGGTGCAACCGTAATGATGCAAAAAAGTAACTTCAGGGGCCCAAAAAGAATTAAGTGTTTCAACTGTGGCAAAGAAGGACACCTAGCCAGAAATTGCAGGGCCCCTAGGAAAAAGGGCTGTTGGAAATGTGGAAAGGAAGGCCATCAAATGAAAGACTGCACTGAGAGACAGGCTAATTTTTTAGGGAGAATTTGGCCTTCCAGCAAAGGGAGGCCAGGAAATTTCCCTCAGAGCAGACCAGAGCCAACAGCCCCACCAGCAGAGAGCTTCAGGTTCGAGGAGACAACACCCTCTCCGAACCAGGAGCCGAAAGACAAGGGACCATACAAGGAGCCCTTAACTGCCCTCAGATCACTCTTTGGCAGCGACCCCTTGTCACAATAAGAATAGGGGGACAGTTAAGGGAGGCTCTTTTAGATACAGGAGCAGATGATACAGTATTAGAAGACATAGATTTGCCAGGAAAATGGAAACCAAAAATGATAGGAGGAATTGGAGGTTTTATTAAAGTAAAACAGTATGATCAAATACTTATAGAAATTTGTGGGAAAAAAGCTATAGGTACAGTATTAGTAGGACCCACACCTGTCAACATAATTGGAAGAAATATGTTGACTCAGATTGGATGTACACTAAATTTTCCAATTAGTCCTATTGAAACTGTACCAGTTAAACTGAAGCCAGGAATGGATGGCCCAAAAGTCAAGCAATGGCCATTAACAGAAGAGAAAATAAAAGCATTAAGAGAGATTTGTGACGAAATGGAGAAGGAAGGAAAAATTTCAAAGATTGGGCCTGAAAATCCATATAACACTCCAGTGTTTGCCATAAAAAAGAAAGACAGTACCAAGTGGAGAAAATTAGTAGATTTTAGGGAACTCAATAAAAGAACTCAGGACTTTTGGGAAGTTCAATTAGGGATACCCCATCCAGCGGGTTTAAAAAAGAAGAAATCAGTAACAGTTCTAGATGTGGGGGATGCATATTTTTCAGTTCCTTTACATGAAGACTTCAGAAAGTATACTGCATTCACTATACCAAGTACAAACAATGAGACACCAGGGACCAGATATCAGTACAATGTACTTCCACAGGGATGGAAAGGATCACCATCAATATTCCAGAGTAGCATGATAAAAATCTTAGAGCCCTTTAGAATAAAAAATCCAGAAATAGTTATCTATCAATACATGGATGACTTGTATGTAGGCTCTGATTTAGAAATAGGGCAACATAGAACAAAAGTAGAGGAGTTAAGAGCTCATCTATTGAGCTGGGGATTAACCACACCAGACAAGAAGCATCAGAAAGAACCTCCATTTCTTTGGATGGGATATGAACTTCATCCTGATAAATGGACAGTACAGCCTATACAGCTGCCAGAAAAGGATAGCTGGACAGTCAATGATATACAGAAGTTAGTGGGAAAATTAAACTGGGCAAGTCAAATTTACCCAGGGATTAAAGTAAAGCAACTGTGTAAACTCCTTAGGGGAGCCAAAGCACTAACAGACATAGTACCGCTGACTGAAGAAGCAGAATTAGAATTGGCAGAAAACAGGGAAATTCTAAGAGAACCAGTACATGGGGTGTATTATGACCCTTCTAAGGACTTAATAGCTGAAATACAGAAACAGGGGAATGATCAGTGGACATATCAAATTTACCAAGAACCATTCAAAAATCTAAAGACAGGGAAGTATTCAAAAAGGAGGACTGCCCATACTAATGATGTAAAGCAATTAACAGAGGCAGTGCAAAAGATAGCCACAGAAAGCATAGTAATATGGGGAAAAACTCCTAAATTCAGATTACCCATACAAAAAGAAACATGGGAGGCATGGTGGACAGACTATTGGCAAGCCACCTGGATTCCTGAGTGGGAGTTTGTTAATACCCCTCCTCTAGTAAAATTATGGTACCAGCTGGAAAAAGAACCCATAATAGGGGCAGAAACTTTCTATGTAGATGGAGCAGCAAATAGGGAAATAAAAATAGGAAAGGCAGGGTATGTTACTGACAGAGGAAGACAGAAAATTGTTACTCTAAATGAAACAACAAATCAGAAGGCAGAATTACAAGCAATTCAGCTAGCTTTACAGGATTCAGGATCAGAAGTAAACATAGTAACAGACTCACAGTATGCATTAGGGATCATTCAAGCACAACCAGATAAGAGTGAATCAGAGATAGTCAATCAGATAATAGAACAGTTAATAGAGAAGGAAAGGGTATACCTGTCATGGGTACCAGCACATAAAGGAATTGGAGGTAATGAACAAGTAGACAAATTGGTGAGTACTGGAATCAGGAGAGTGCTATTTCTAGATGGAATAGATAAAGCTCAAGAAGAACATGAAAAATATCACAGCAATTGGAGAGCAATGGCTAGTGATTTTAATCTGCCACCTGTAATAGCAAAAGAAATAGTAGCCAGCTGTGATAAATGCCAACTAAAAGGGGAAGCTATGCATGGACAGGTAGACTGTAGTCCAGGGATATGGCAATTAGATTGCACACATCTAGAAGGAAAAGTAATCATAGTAGCAGTCCATGTAGCCAGTGGCTACATAGAAGCAGAAGTTATCCCAGCAGAAACAGGACAGGAGACAGCATACTTTCTGCTAAAATTAGCAGGAAGGTGGCCAGTAAAAGTAGTACACACAGATAATGGCCCCAATTTCACCAGCAGTGCAGTTAAGGCTGCCTGTTGGTGGGCAAATATCCAACAGGAATTTGGGATTCCCTACAATCCCCAAAGTCAAGGAGTAGTGGAGTCTATGAATAAGGAATTAAAGAAAATTATAGGGCAGGTAAGAGAGCAAGCTGAGCACCTTAAGACAGCAGTACAAATGGCAGTATTCATTCACAATTTTAAGAGAAAAGGGGGGATTGGGGGGTACAGTGCAGGGGAAAGAATAATAGACATAATAGCAACAGACATACAAACTAAAGAATTACAAAAACAAATCACAAAAATTCAAAATTTTCGGGTTTATTACAGAGACAGCAGAGATCCAATTTGGAAAGGACCAGCAAAACTACTCTGGAAAGGTGAAGGGGCAGTGGTAATACAGGA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| 11,133
|
OR736075.1
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Totmenin,A.V., Halikov,M.R., Ekushov,V.E., Sklyar,L.F., Solovyova,N.P., Antonets,M.E., Tregubchak,T.V., Beniova,S.N., Ermolitskaya,S.A., Gorelova,I.S., Gashnikova,N.M.
|
State Research Center of Virology and Biotechnology "Vector", Department of Retroviruses
|
Russia
|
2023-11-11
|
Vlad3
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 9,757
|
GenBank
| null |
Russia: Vladivostok
|
Russia
|
Homo sapiens
| null |
2021-06
| null | null |
HIV-1 isolate Vlad3 from Russia, complete genome
|
TGGATGGGCTAATTTACTCCAAGAAAAGACAAGAAATCCTTGATCTGTGGGTCTATCACACACAAGGCTACTTCCCTGATTGGCAGAATTATACCCCAGGGCCAGGGATTAGATTCCCACTAACATTTGGGTGGTGCTACAAACTAGTACCAGTTGACCCAAAGGAGGTAGAAGAGGCCACAGAGGGAGAGAACAACAGCCTATTACACCCCATATGCCAGCATGGAATGGAGGATGAGGACGGAGAAGTGTTAATGTGGAAGTTTGACAGTCACCTGGCTCTAAAACACAGAGCCCGAGAGCTGCATCCGGAGTACTACAAAGACTGCTGACATGGACTGCTGACATAAAGTTTCTGACAGGGGACTTTCCACGGGGACTTTCCAGGGGAGGCGTGGGGTGGGCGGAGTTGGGGAGTGGCTAACCCTCAGATGCTGCATATAAGCAGCTGCTTTTCGCCTGTACTGGGTCTCTCTGGTTAGACCAGGTTGAGCCTGGGAGCTCTCTGGCTAGCTAGGGAACCCACTGCTTAAGCCTCAATAAAGCTTGCCTTGAGTGCTAAAAGTAGTGTGTGCCCGTCTGTTGTGTGACTCTGGTAACTAGAGATCCCTCAGACCACTCTAGGCGGTGTAAAAATCTCTAGCAGTGGCGCCCGAACAGGGACTCGAAAGCGAAAGTTCCAGAGAAGTTCTCTAGACGCAGGACTCGGCTTGCTGAGGTGCACACAGCAAGAGGCGAGAGAGCGGCGACTGGTGAGTACGCCTAAAAAATTTTTGACTAGCGGAGGCTAGAAGGAGAGAGATGGGTGCGAGAGCGTCAGTATTAAGCGGGGGAAAATTAGATGCATGGGAAAAAATTCGGTTAAGGCCAGGGGGGAAGAAAAAATATAGAATAAAACACCTAGTATGGGCAAGCAGGGAGCTGGAAAGATTCGCGGTTAATCCTGGCCTTTTAGAAACAGCAGAAGGATGTCAGCAAATACTGGTACAGTTACAACCAAGTCTCCAGACAGGATCAGAAGAACTTAAATCATTATATAATACGGTAGCAACTCTCTATTGTGTACATCAGAGGATAGAGATAAAAGACACCAAGGAAGCTTTAGATAAAATAGAAGAAATACAAAAGAAAAGCAAGCAAAAGATCCAACAGACAGCAGCTGGCACAGGAAGCAGCAGTAGTGTCAGTCAAAATTATCCCATAGTGCAAAATGCACAAGGGCAAATGGTACATCAGTCCATGTCACCTAGGACTTTGAATGCATGGGTGAAAGTAATAGAAGAAAAGGCTTTCAGCCCAGAAGTAATACCCATGTTTTCAGCATTATCAGAGGGAGCCACCCCACAAGATTTAAACATGATGCTGAACATAGTGGGGGGACATCAGGCAGCTATGCAAATGTTAAAAGATACCATCAATGAGGAAGCTGCTGAATGGGATAGGTTACATCCAGCACAGGCAGGGCCTTTTCCAGCGGGGCAAATGAGAGAACCAAGGGGAAGTGACATAGCAGGAACTACTAGTACCCTTCAAGAACAAGTAGGATGGATGACAAGCAACCCACCTATCCCAGTGGGAGACATCTATAAAAGATGGATAATCCTGGGATTAAATAAGATAGTAAGAATGTATAGTCCTACTAGCATTTTAGACATAAAACAAGGGCCAAAAGAACCCTTCAGAGACTATGTAGATAGGTTCTTTAAAACTCTTAGAGCTGAGCAAGCTACACAGGAGGTAAAGAACTGGATGACAGACACCCTACTGGTTCAAAATGCAAATCCAGATTGTAAAACCATTTTAAGAGCATTAGGACCAGGGGCTACATTAGAAGAAATGATGACAGCATGCCAGGGAGTGGGAGGACCTGGCCATAAAGCAAGGGTTTTAGCTGAGGCAATGAGTCAAGTACAAAATACAAACATAATGATGCAGAAAGGTAATTTTAGGGGACCAAAAAGAATTAAGTGTTTCAACTGTGGCAAAGAAGGACACCTAGCCAAAAATTGCAGGGCCCCCAGGAAAAAGGGCTGTTGGAAATGTGGAAAGGAAGGCCATCAAATGAAAGACTGCAATGAGAGACAGGCTAATTTTTTAGGGAGAATTTGGCCTTCCAACAAAGGGAGGCCAGGAAATTTTCCTCAGAGCAGACCAGAACCATCAGCCCCACCAGCAGAATACTGTGGGATGGGGGAAGAGATAACCCCCTCCCTGAAACAGGAACAGGAGAACAGGGGACAGCCTCCTCCTTCAATCTCCCTCAAATCACTCTTTGGCAACGACCCCTTGTCACAGTAAAAGTAGGAGGACAGCTAAAAGAAGCTCTATTAGATACAGGAGCAGATGATACAGTATTAGAAGACATAAATTTGCCTGGAAAATGGAAACCAAAAATGATAGGGGGAATTGGAGGTTTTATCAAAGTAAAACAGTATGATCAGATACTTATAGAAATTTGTGGGAAAAAGGCTATAGGTACAGTATTAGTAGGACCTACCCCTGTCAACATAATTGGAAGAAATATGTTGACTCAAATTGGTTGTACTTTAAATTTTCCAATAAGTCCTATTGAAACTGTACCAGTAAAATTAAAGCCAGGAATGGATGGCCCAAAGATTAAACAATGGCCATTAACAGAAGAAAAAATAAAAGCATTAACAGAAATTTGTATGGAAATGGAAAAGGAAGGAAAAATTTCAAAAATTGGGCCTGAAAATCCATACAATACTCCAATATTTGCTATAAGGAAAAAGGACAGCACTAAGTGGAGAAAATTAGTAGATTTCAGGGAGCTCAATAAAAGAACTCAGGACTTTTGGGAAGTTCAATTAGGAATACCCCATCCAGCGGGTTTAAAAAAGAAAAAATCAGTAACAGTACTAGATGTAGGAGATGCATATTTTTCAGTTCCTTTAGATGAAAGCTTCAGAAAGTATACTGCATTCACTATACCAAGTACAAACAATGCGACACCAGGGATCAGATATCAGTACAATGTACTTCCACAAGGATGGAAAGGATCACCAGCAATATTCCAGAGTAGCATGACAAAAATCTTAGAGCCCTTTAGATCAAAAAATCCAGAAATAGTTATCTATCAGTACATGGATGACTTGTATGTAGGCTCTGATTTAGAAATAGGGCAACATAGAATAAAAGTAGAAGAGTTGAGAGCTCATCTATTGAGCTGGGGGTTTACTACACCAGACAAAAAGCATCAGAAAGAACCTCCATTTCTTTGGATGGGATATGAACTTCATCCTGACAAATGGACAGTCCAGCCTATAATACTGCCAGATAAAGACAGTTGGACTGTCAATGATATACAAAAATTAGTGGGAAAACTAAATTGGGCAAGTCAGATTTATCCAGGGATTAAGGTAAAGCAACTATGTAAGCTCCTCAGGGGAGCCAAGGCACTGACAGATATAGTGACACTGACTGAGGAAGCAGAATTAGAATTAGCAGAGAACAGAGAAATTCTAAAAACACCTGTGCATGGGGTATATTATGACCCATCAAAAGATTTAATAGCAGAAATACAGAAACAAGGACAAGGCCAATGGACATATCAAATTTATCAGGAGCCATTTAAGAATCTAAAAACAGGAAAATATGCAAAAACAGGGGCTGCTCACACTAATGATGTAAAACAATTAACAGCAGCGGTGCAAAAAGTGGCCACAGAAAGTATAGTATTATGGGGAAAGACTCCTAAATTTAGGCTACCCATACAAAAAGAAACATGGGAAGCATGGTGGATGGAGTACTGGCAGGCCACCTGGATCCCTGAATGGGAGTTTGTCAATACCCCTCCTCTAGTAAAACTATGGTACCAGTTGGAGACAGAACCCATAGTAGGAGCAGAGACCTTCTATGTAGATGGGGCAGCTAACAGAGAGACTAAGATAGGAAAAGCAGGATATGTCACTGACAGAGGAAGACAAAAGGTTGTTTCTCTAACCGAGACAACAAATCAAAAGACTGAATTACATGCCATCCATCTAGCTCTGCAAGATTCAGGATCAGATGTAAATATAGTAACAGACTCACAATATGCATTAGGAATTATTCAGGCACAACCAGATAGGAGTGAAACAGAAATAGTCAATAAAATAATAGAGAAATTAATAGAAAAAGACAGAGTCTACCTGTCATGGGTACCAGCACACAAGGGGATTGGAGGAAATGAACAAGTAGATAAATTAGTCAGTGCTGGAATCAGGAAGGTGTTATTTTTAGACGGGATAGATAAAGCTCAAGAAGAACATGAAAAATATCACAGCAATTGGAAAGCAATGGCTAGTGATTTTCATCTGCCACCTGTAGTAGCAAAAGAAATAGTAGCCAGCTGTGATAAATGTCAACTAAAAGGGGAAGCTATGCATGGACAGGTAGACTGTAGTCCAGGGATATGGCAAGTAGATTGCACACATCTAGAAGGAAAAGTAATCATAGTAGCAGTCCATGTAGCCAGTGGCTATATAGAAGCAGAAGTTATTCCAGCAGAAACAGGACAGGAGACAGCATACTTTCTGCTAAAATTAGCAGGAAGATGGCCAGTAAAAACAATACACACAGATAATGGCCCCAATTTCACCAGCAGTGCAGTTAAGGCTGCCTGTTGGTGGGCAAATATCCAGCAGGAATTTGGGATTCCCTACAATCCCCAAAGTCAAGGAGTAGTGGAGTCTATGAATAAGGAATTAAAGAAAATCATAGGGCAGGTAAGAGATCAAGCTGAATACCTTAAGACAGCAGTACAAATGGCAGTATTCATTCACAATTTTAAAAGAAAAGGGGGGATTGGGGGGTACAGTGCAGGGGAAAGAATAATAGACATAATAGCAACAGACATACAAACTAAAGAATTACAAAAACAAATTACAAAAATTCAAAATTTTCGGGTTTATTACAGAGACAGCAGAGATCCAATTTGGAAAGGACCAGCAAAACTACTCTGGAAAGGTGAAGGGGCAGTGGTAATACAGGACAATAAC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| 11,134
|
OR736076.1
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Totmenin,A.V., Halikov,M.R., Ekushov,V.E., Sklyar,L.F., Solovyova,N.P., Antonets,M.E., Tregubchak,T.V., Beniova,S.N., Ermolitskaya,S.A., Gorelova,I.S., Gashnikova,N.M.
|
State Research Center of Virology and Biotechnology "Vector", Department of Retroviruses
|
Russia
|
2023-11-11
|
Vlad8
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 9,731
|
GenBank
| null |
Russia: Vladivostok
|
Russia
|
Homo sapiens
| null |
2021-06
| null | null |
HIV-1 isolate Vlad8 from Russia, complete genome
|
TGGATGGGCTAATTTACTCCAAGAAAAGACAAGAAATCCTTGATCTGTGGGTCTATCACACACAAGGTTACTTCCCTGATTGGCAGAATTATACCCCAGGGCCAGGAATTAGATACCCACTAACATTTGGGTGGTGCTACAAGCTAGTACCAGTTGATCCAGTGGCAGTAGAAGAAGCCACAGAGGGAGAGAACAACAGCCTATTACACCCTATATGCCAACATGGAATGGATGATGATGAAAGAGAAGTGCTAATGTGGAAGTTTGACAGTCACCTGGCTCTAAGACACAGAGCCCGAGAGCTACATCCGGAGTTCTACAAAGACTGCTGACACAGACTGCTGACATGAAGTTGCTGACAGGGACTTTCCGCGGGGACTTTCCAGGGGAGGTGGGGTTTGGGGAGTGGCTAACCCTCAGATGCTGCATATAAGCAGCTGCTTCTCGCCTGTACTGGGTCTCTCTTGTTAGACCAGATCGAGCCTGGGAGCTCTCTGGCTAGCTAGAGAACCCACTGCTTAAGCCTCAATAAAGCTTGCCTTGAGTGCTTTAAGTAGTGTGTGCCCGTCTGTTGTTTGACTCTGGTAACTAGAGATCCCTCAGACCACTCTAGGCGGTGTAAAAATCTCTAGCAGTGGCGCCCGAACAGGGACTCGAAAGCGAAAGTTCCAGAGGAGTTCTCTCGACGCAGGACTCGGCTTGCTGAGGTGCGCACAGCAAGAGGCGAGGCGAGCGGCGACTGGTGAGTACGCCTAAGATTTTTGACTAGCGGAGGCTAGAAGGAGAGAGATGGGTGCGAGAGCGTCAGTATTAAGCGGGGGAAAATTAGATGCATGGGAAAAAATTCGGTTAAGGCCAGGGGGAAAGAAACAATATAGATTAAAACACCTAGTATGGGCAAGCAGGGAGCTGGAAAGATTCGCGCTTAACCCTGGCCTTTTAGAGACATCAGAAGGCTGTCAACAGATACTGGAACAGTTACAACCATCTCTCAAGACAGGATCAGAAGAACTTAAATCATTATTTAATACAGTAGCAACCCTCTATTGTGTACATCAAAGGATAGAGATAAAAGACACCAAGGAAGCTTTAGATAAAATAGAGGAAATACAAAATAAGAGCAAGCAAAAGACCCAACAGGCAGCAACTGGCATAGGAAACAGCAACCAGGTCAGTCAAAATTACCCCATAGTGCAAAATGCACAAGGGCAAATGACCTACCAGTCCATGTCACCTAGGACTTTGAATGCATGGGTGAAAGTAATAGAAGAGAAGGCTTTCAGCCCAGAAGTAATACCCATGTTTTCAGCATTGTCAGAAGGAGCCGCCCCCCAAGATTTAAACATGATGCTGAACATAGTGGGGGGACACCAGGCAGCTATGCAAATGTTGAAAGATACCATCAATGAGGAAGCTGCTGAATGGGATAGGTTACATCCAGCACAGGCAGGGCCTTTTCCAGCAGGGCAGATGAGAGACCCAAGGGGAAGTGATATAGCAGGAACTACTAGTACCCTTCAAGAACAAATAGGATGGATGACAAGCAACCCACCTATCCCAGTGGGAGACATCTACAAAAGATGGATAATCCTAGGATTAAATAAAATAGTAAGAATGTATAGCCCTACTAGCATTTTAGACATAAGACAAGGGCCAAAAGAACCCTTCAGAGACTATGTAGATAGGTTCTTTAAAACTCTTAGAGCTGAGCAAGCTACACAGGAAGTAAAGAACTGGATGACAGAAACCCTGCTGGTCCAAAATGCAAATCCAGATTGTAAAAATATTTTAAGAGCCTTAGGACCAGGGGCTACATTAGAAGAAATGATGACAGCATGCCAGGGAGTGGGAGGACCCGGCCATAAAGCAAGAGTTTTGGCTGAGGCAATGAGTCAAGTACAAAATACAAGCATAATGATGCAGAAAAGTAATTTTAAGGGCCCAAAAAGAATTAAGTGTTTCAACTGTGGCAAAGAAGGACACCTAGCCAGAAATTGCAGGGCCCCTAGGAAAAAGGGCTGTTGGAAATGTGGAAAGGAAGGCCATCAAATGAAAGATTGCACTGAGAGACAGGCTAATTTTTTAGGGAGAATTTGGCCTTCCAGCAAAGGGAGGCCAGGGAATTTTCCTCAGAGCAGACCAACACCATCAGCCCCACCAATGGAGAGCTTTGGAATGGGGGAAGAGATAACCCCCCCCTTGAAGCAGGAACAGAACAACGGGAACCAGCGTCCTCCTTCAGTTTCCCTCAAATCACTCTTTGGCAACGACCCCTTGTTACAGTAAAAATAGGAGGACAGCTAAAAGAAGCTCTATTAGATACAGGAGCAGATGATACAGTATTAGAAGATATAAATTTACCAGGAAAATGGAAACCAAAAATGATAGGGGGAATTGGAGGTTTTATCAAAGTAAGACAGTATGATCAGATACTTATAGAAATTTGTGGAAAAAAGGCTATAGGTACAGTATTAATAGGGCCTACCCCTGTCAACATAATTGGAAGAAATATGTTGACTCAGATTGGCTGCACTTTAAATTTTCCAATAAGTCCTATTGAAACTGTACCAGTAAAATTAAAGCCAGGAATGGATGGCCCAAGGGTTAAACAATGGCCATTAACAGAAGAAAAAATAAAAGCATTAACAGACATTTGTAATGAGATGGAGAAGGAGGGAAAAATCTCAAAAATTGGGCCTGAAAATCCATACAATACTCCAATATTTGCTATAAAGAAGAAAGATAGCACTAAGTGGAGGAAATTAGTAGATTTCAGAGAGCTCAATAAAAGAACTCAGGATTTTTGGGAAGTTCAATTGGGAATACCCCATCCAGCGGGGTTAAAAAAGAAAAAATCAGTAACAGTATTAGATGTGGGGGATGCATATTTTTCAGTCCCTTTAGATGAAAGCTTCAGAAAGTATACTGCATTCACTATACCAAGTACAAACAATGAGACACCAGGGATCAGATATCATTACAATGTACTTCCACAGGGATGGAAAGGATCACCAGCAATATTCCAAAGTAGTATGACAAAAATCTTGGAGCCATTTAGACTAAAAAATCCAGACATAGTTATTTATCAGTACATGGATGACTTGTATGTAGGCTCTGATTTAGAAATAAAGCAGCATAGAACAAAAATAGAAGAATTAAGAGCTCATCTATTGAGCTGGGGATTTACTACACCAGATAAAAAGCATCAGAAAGAACCTCCATTTCTTTGGATGGGATATGAACTCCATCCTGACAAATGGACAGTCCAGCCTATAATGTTACCAGATAAAGACAGCTGGACTGTCAATGATATACAGAAACTAGTGGGAAAACTAAATTGGGCAAGTCAGATTTATCCAGGGATTAAAGTAAGGCAATTATGTAAACTCCTCAGGGGAGCCAAAGCACTGACAGATATAGTGACATTGACTGAGGAAGCAGAGTTAGAATTGGCAGAGAACAGAGAGATTCTGAAAGAACCGGTGCATGGAGTATATTATGACCCATCAAAAGATTTAATAGCAGAGATACAGAAACAAGGACAAGGCCAATGGACATATCAGATTTATCAGGAGCCAGGTAAAAATCTGAAAACAGGAAAATATGGAAAAAGGGGGTCTGCTCATACTAATGATATAAAACAATTAACAGCAGTGGTGCAAAAAGTGGCCTCAGAAAGCATAATAATATGGGGAAAGACTCCTAAATTCAGACTACCCATACAAAAAGAAACATGGGAAGCATGGTGGACGGAGTACTGGCAGGCTACCTGGATCCCTGAATGGGAGTTTGTCAATACCCCTCCTCTAGTAAAACTATGGTACCAGTTAGAAAAAGAACCCATAGTAGGAGCAGAAACTTTCTATGTAGATGGGGCAGCTAACAGGGAGACTAAGATAGGGAAAGCAGGGTATGTTACTGACAGAGGAAGACAAAAGGTTGTTTCTCTAACTGAGACAACAAATCAAAAGACTGAATTACATGCAATCTATCTAGCTTTGCAGGATTCAGGATCAGAAGTAAATATAGTAACAGACTCACAGTATGCATTAGGAATTATTCAGGCACAACCAGACAGGAGTGAATCAGAGGTAGTCAATAACATAATAGAGAAGCTAATAGAAAAAGAAAAAGTCTACCTGTCATGGGTACCAGCACACAAGGGGATTGGAGGAAATGAACAAGTAGATAAATTAGTCAGTCAGGGAATCAGGAGGGTGTTATTTTTAGATGGGATAGATAAGGCTCAAGAAGACCATGAAAAATATCACAGCAATTGGAGAGCAATGGCTAGTGATTTTAATCTGCCACCTGTAATAGCAAAGGAAATAGTAGCCAGCTGTAATAAATGTCAATTAAAAGGGGAAGCTATGCATGGACAGGTAGACTGTAGTCCAGGGATATGGCAATTAGATTGCACACATCTAGAAGGAAAAGTAATCATAGTAGCAGTCCATGTAGCCAGTGGCTATATAGAAGCAGAAGTTATCCCAGCAGAAACAGGACAGGAGACAGCATACTTCCTGCTAAAATTAGCAGGAAGATGGCCAGTAAAAGTAGTACACACAGATAATGGCCCCAATTTCACCAGCAGTGCAGTTAAGGCTGCCTGTTGGTGGGCAGACATCCAACAGGAATTTGGAATTCCCTACAATCCCCAAAGTCAAGGAGTAGTGGAGTCTATGAATAAGGAATTAAAGAAAATCATAGGACAGGTAAGAGAGCAAGCTGAACACCTTAAGACAGCAGTACAAATGGCAGTATTCATTCACAATTTTAAAAGAAAAGGGGGGATTGGGGGGTACAGTGCAGGGGAAAGAATAATAGACATAATAGCAACAGACATACAAACTAAAGAACTACAAAAACAAATTATAAAAATTCAAAATTTTCGGGTTTATTACAGGGACAGCAGAGATCCAATTTGGAAAGGACCAGCAAAACTACTCTGGAAAGGTGAAGGGGCAGTGGTAATACAGGACAATAACGATATAAAAGTA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| 11,135
|
OR736077.1
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Totmenin,A.V., Halikov,M.R., Ekushov,V.E., Sklyar,L.F., Solovyova,N.P., Antonets,M.E., Tregubchak,T.V., Beniova,S.N., Ermolitskaya,S.A., Gorelova,I.S., Gashnikova,N.M.
|
State Research Center of Virology and Biotechnology "Vector", Department of Retroviruses
|
Russia
|
2023-11-11
|
Vlad13
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 9,776
|
GenBank
| null |
Russia: Vladivostok
|
Russia
|
Homo sapiens
| null |
2021-06
| null | null |
HIV-1 isolate Vlad13 from Russia, complete genome
|
TGGATGGGCTAATTTACTCCAGGAAAAGACAAGAAATCCTTGATCTGTGGATCTACCACACACAAGGCTACTTCCCTGATTGGCAGAATTATACCCCAGGGCCAGGGATTAGATACCCACTAACATTTGGGTGGTGCTACAAACTAGTACCAGTTGACCCAGCTGCTGTAGAAGAGGACACAGAGGGAGAGAACAACAGCCTACTACACCCCATGTGCCAACATGGAATGGAGGATGAGGACAGAGAAGTGTTAATGTGGAAGTTTGACAGTCGCCTGGCTCTAAGACACCTAGCCCGAGAGCAGCATCCGGAGTTCTACAAAGACTGCTGACATAGACTGTTGACATGAAGTTGCTGACTGGGACTTTCCGCGGGGACTTTCCAGGGGAGGTGTGGTTTGGGCGGAGTTGGGGAGTGGCCAGCCCTCAGATGCTGCATATAAGCAGCTGCTTTTCGCCTGTACTGGGTCTCTCTGGTTAAGCCAGGTTGAGCCTGGGAGCTCTCTGGCTAGCTAGGGAACCCACTGCTTAAGCCTCAATAAAGCTTGCCTTGAGTGCTGAAAGTAGTGTGTGCCCATCTGTTGTGTGACTCTGGTAACTAGAGATCCCTCAGACCACTCTAGGCGGTGTAAAAATCTCTAGCAGTGGCGCCCGAACAGGGACTCGAAAGCGAAAGTTACAGAGGAGATCTCTCGACGCAGGACTCGGCTTGCTGAGGTGCACACAGCAAGAGGCGAGAGCGGCGACTGGTGAGTACGCCTAAAGATTTTTGACTAGCGGAGGCTAGAAGGAGAGAGATGGGTGCGAGAGCGTCAATATTAAGCGGGGGAAAATTAGATACATGGGAAAAAATTCGGTTACGGCCAGGGGGAAAGAAACAATATAGAATAAAACACCTGGTATGGGCAAGCAGGGAGCTGGAAAGATTCGCGCTTAACCCTGGCCTTTTAGAAACAGCAGAAGGATGCCAGCAAATACTGGGACAGTTACAATCAAGTCTCAAGACAGGATCAGAAGAGCTTAAATCATTATATAATACAGTAGCAACTCTCTATTGTGTACATCAACGGATAGAGATAAGAGACACCAAGGAAGCTTTAGATAAAATAGAAGAAATACAAAATAAAAGCAAGCAAAAGACAGCAGCTGGCACAGGAAGCAGCAGTAGTGTCAGTCAAAATTATCCCATAGTGCAAAATGCACAAGGGCAAATGGTACATCAGTCCATGTCACCTAGGACTTTGAATGCATGGGTGAAAGTAATAGAAGAAAAGGCTTTCAGCCCAGAAGTAATACCCATGTTTACAGCATTATCAGAGGGAGCCACCCCACAAGATTTAAACATGATGCTGAACATAGTGGGGGGACATCAGGCAGCTATGCAAATGTTAAAAGATACCATCAATGAGGAAGCTGCTGAATGGGACAGGTTACATCCAGCACAGGCAGGGCCTTTTCCAGCAGGGCAAATGAGAGAACCAAGGGGAAGTGACATAGCAGGAACTACTAGTACCCTTCAAGAACAAATAGGATGGATGACAAGCAATCCACCTATCCCAGTGGGAGACATCTATAAAAGATGGATAATCCTGGGGTTAAATAAAATAGTAAGAATGTATAGCCCTGTTAGCATTTTAGACATAAAACAAGGGCCAAAGGAACCCTTCAGAGACTATGTAGATAGGTTCTTTAAAACTCTTAGAGCTGAGCAAGCTACACAGGATGTAAAGAATTGGATGACAGATACCCTACTGGTTCAAAATGCAAATCCAGATTGTAAAACCATTTTAAGAGCATTAGGACCAGGGGCTACATTAGAAGAAATGATGACAGCATGCCAGGGAGTGGGAGGACCTGGCCATAAAGCAAGGGTTTTAGCTGAGGCAATGAGTCAAGCACAAAGTACAAACATAATGATGATGCAGAAAAGTAATTTTAGAGGCCCAAAAAGAATTAAGTGTTTCAACTGTGGCAAAGACGGACACCTAGCCAGAAATTGCAGGGCCCCTAGGAAAAAGGGCTGTTGGAAATGTGGAAAGGAAGGCCATCAAATGAAAGACTGCACTGAGAGACAGGCTAATTTTTTAGGGAGAATTTGGCCTTCCAGCAAAGGGAGGCCAGGAAATTTTCCTCAGAGCAGACCAGAACCATCAGCCCCACCGGCAGAATACTGTGGGATGGGGGAAGAGACAACCCCCTCCCTGAAACAGGAACAGGAGAACAGGGAACAGCGTCCTCCCTCAGTCTCCCTCAAATCACTCTTTGGCAACGACCCGTTGTCACAGTAAAAGTAGAAGGACAGCTAAAAGAAGCTCTATTAGATACAGGAGCAGATGATACAGTATTAGAAGACATAAATTTGCCTGGAAAATGGAAACCAAAAATGATAGGGGGAATTGGAGGTTTTATCAAAGTAAAACAGTATGATCAGATACTTATAGAAATTTGTGGAAAAAAGGCTATAGGTACAGTATTAGTAGGACCTACCCCTGTCAACATAATTGGAAGAAATATGTTGACTCAGATTGGTTGTACTTTAAATTTTCCAATAAGTCCTATTGAAACTGTACCAGTAAAATTAAAGCCAGGAATGGATGGCCCAAAGGTTAAACAATGGCCATTAACAGAAGAAAAAATAAAAGCATTAACAGAAATTTGTAAAGAAATGGAACAGGAAGGAAAAATTTCAAAAATTGGGCCTGAAAATCCATACAATACTCCAATTTTTGCTATAAAGAAAAAGGACAGCACTAAGTGGAGAAAATTAGTAGATTTCAGGGAGCTCAATAAAAGAACTCAGGACTTTTGTGAAGTTCAATTAGGAATACCCCATCCAGCAGGTTTAAAAAAGAAAAAATCAGTAACAGTACTAGATGTGGGGGATGCATATTTTTCAGTCCCTTTAGATGAAAGCTTCAGAAAGTATACTGCATTCACTATACCAAGTACAAACAATGAGACACCAGGGATCAGATATCAGTACAATGTACTTCCACAAGGATGGAAAGGATCACCAGCAATATTCCAGAGTAGCATGATAAAAATCTTAGAGCCCTTTAGAATAAAAAATCCAGAAATAGTTATCTATCAGTACATGGATGACTTGTATGTAGGCTCAGACTTAGAAATAGGGCAACACAGAACAAAAATAGAGGAGTTAAGAGCTCATCTATTGAGCTGGGGGTTTACTACACCAGACAAAAAGCATCAGAAAGAACCTCCATTTCTTTGGATGGGATATGAACTCCATCCTGACAAATGGACAGTCCAGCCTATAATGCTGCCAGATAAAGACAGTTGGACTGTCAATGATATACAGAAATTAGTGGGAAAACTAAATTGGGCAAGTCAGATTTATCCAGGGATCAAGGTAAGGCAACTATGTAAGCTTCTCAGGGGAGCCAAGGCACTGACAGATATAGTGACACTGACTGAGGAAGCAGAATTAGAATTGGCAGAGAACAGAGAAATTCTAAAAACACCTGTGCATGGGGTATATTATGACCCATCAAAAGATTTAATAGCAGAAATACAGAAACAAGGACAAGGCCAATGGACATATCAGATTTATCAGGAGCCATTTAAGAATCTAAAAACAGGAAAATTTTCAAAAACAGGGGCTGCTCACACTAATGATGTAAAACAATTAACAGCAGCAGTGCAAAAGGTGGCCACAGAAAGCATAGTAATATGGGGAAAGACTCCTAAATTTAGGCTACCCATACAAAAAGAAACATGGGAAGCATGGTGGATGGAGTACTGGCAGGCCACCTGGATTCCTGAATGGGAGTTTGTCAATACCCCTCCTCTAGTAAAACTATGGTACCAGTTAGAGAAAGAACCCATAGCAGGAGCAGAGACCTTCTATGTAGATGGGGCAGCTAACAGAGAAACTAAGATAGGAAAAGCAGGATATGTCACTGACAGAGGAAGACAAAAGGTTGTTCATCTAACTGAGACAACAAATCAAAAGACTGAATTACATGCCATCCATCTAGCCCTGCAGGATTCAGGATCAGATGTAAATATAGTAACAGACTCACAATATGCATTAGGAATTATTCAGGCACAACCAGATAGCAGTGACACAGAAATAGTCAATAAAATAATAGAGAAATTAATAGAAAAAGACAGAGTCTACCTGTCATGGGTACCAGCACACAAAGGGATTGGAGGAAATGAACAAGTAGATAAATTAGTCAGTAATGGAATCAGGAAGGTGTTATTTTTAGATGGGATAGATAAAGCTCAAGAAGAACATGAAAAATATCACAGCAACTGGAAAGCAATGGCTAGTGATTTTCATCTGCCACCTATAGTAGCAAAGGAAATAGTAGCCAGCTGTGATAAATGTCAACTAAAAGGGGAAGCTATGCATGGACAGGTAGACTGTAGTCCAGGGATATGGCAATTAGATTGCACACATCTAGAAGGAAAAATAATCATAGTAGCAGTCCATGTAGCCAGTGGCTATATAGAAGCAGAAGTTATTCCAGCAGAAACAGGACAAGAGACAGCATACTTTCTGCTAAAATTAGCAGGAAGATGGCCAGTAAAAGTAATACACACAGATAATGGCCCCAATTTCACCAGCAGTGCAGTTAAGGCTGCCTGTTGGTGGGCAAATATCCAGCAGGAATTTGGGATTCCCTACAATCCCCAAAGTCAAGGAGTAGTGGAGTCTATGAATAAGGAATTAAAGAAAATCATAGGGCAGGTAAGAGAGCAAGCTGAACACCTTAAGACAGCAGTACAAATGGCAGTATTCATTCACAATTTTAAAAGAAAAGGGGGGATTGGGGGGTACAGTGCAGGGGAAAGAATAATAGACATAATAGCAACAGACATACAAACTAAAGAATTACAAAACCAAATTACAAAAATTCAAAATTTTCGGGTTTATTACAGAGACAGCAGAGATCCAATTTGGAAAGGACCAGCAAAACTACTCTGGAAAGGTGAAGGGGCAGTGGTAATACAGGACAATAACGATATAAAAG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| 11,136
|
OR736078.1
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Totmenin,A.V., Halikov,M.R., Ekushov,V.E., Sklyar,L.F., Solovyova,N.P., Antonets,M.E., Tregubchak,T.V., Beniova,S.N., Ermolitskaya,S.A., Gorelova,I.S., Gashnikova,N.M.
|
State Research Center of Virology and Biotechnology "Vector", Department of Retroviruses
|
Russia
|
2023-11-11
|
Vlad18
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 9,754
|
GenBank
| null |
Russia: Vladivostok
|
Russia
|
Homo sapiens
| null |
2021-06
| null | null |
HIV-1 isolate Vlad18 from Russia, complete genome
|
TGGATGGGCTAATTTACTCCACGAAAAGACGAGAAATCCTTGATCTGTGGGTCTATCACACACAAGGCTACTTCCCTGATTGGCAGAATTATACCCCAGGGCCAGGGATTAGGTACCCACTAACATTTGGGTGGTGCTACAAGCTAGTACCAGTTGACCCAGCTGAAGTAGAAGAGGACACAAAGGAAGAGAACAACAGCCTATTACACCCTATATGCCAACATGGGATGGATGATGAAGACAAAGAAGTGTTAATGTGGAAGTTTGACAGTCGCCTGGCTTTCACACACAAAGCCCGAGAGCTGCATCCGGAGTTCTACAAAGACTGCTGACACAGCTGTTGACTTGAAGTTGCTGACAGGGACTTTCCAGGGGACTTTCCAGGGGAGGTGTGGCTGGGGTGGAGTCGGGGAGTGGCTAACCCTCAGATGCTGCATATAAGCAGCTGCTTTTCGCCTGTACTGGGTCTCTCTGGTTAGACCAGATCGAGCCTGGGAGCTCTCTGGCTAGCTAGGGAACCCACTGCTTAAGCCTCAATAAAGCTTGCCTTGAGTGCTTAAAGTAGTGTGTGCCCGTCTGTTGTATTACTCTGGTAACTAGAGATCCCTCAGACCACTAAAGCGGAGTAAAAATCTCTAGCAGTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAAGCGAAAGTGTTCCAGAGAAGATCTCTCGACGCAGGACTCGGCTTGCTGAGGTGCACACAGCAAGAGGCGAGAGCGGCGACTGGTGAGTACGCCTAAAAATTTTTGACTAGCGGAGGCTAGAAGGAGAGAGATGGGTGCGAGAGCGTCAGTATTAAGCGGGGGAAAATTAGATGCATGGGAAAAAATTCGGCTAAGGCCAGGGGGAAAGAAAAAATATAGAATAAAACACCTAGTATGGGCAAGCAGGGAGCTGGAAAGATTCGCGCTTAACCCTAGCCTTTTAGAAACAGCGGAAGGATGTCAACAAATATTGGTACAGTTACAACCAGCTCTCAAGACAGGATCAGAAGAGCTTAAATCATTATATAATACAGTAGCAACCCTCTATTGTGTACATCAACGGATAGATATAAAAGACACCAAGGAAGCTTTAGATAAAATAGAGGAAATACAAAATAAGAGCAAGCAAAAAACTCAACAGGAAGCAACTGACACAAGAAGCAGCAGCCAGGTCAGTCAAAATTACCCCATAGTGCAAAATGCACAAGGGCAAATGATATACCAGTCCATGTCACCAAGGACTTTAAATGCATGGGTGAAAGCAATAGAAGAAAAGGCTTTCAGCCCAGAAATAATACCCATGTTTTCAGCATTATCAGAAGGAGCCGCCCCACAAGATTTAAACATGATGTTAAACATAGTGGGGGGACACCAGGCAGCTATGCAAATGTTAAAAGATGCCATCAATGAGGAAGCTGCTGAATGGGATAGGTTACATCCAACACAGGCAGGGCCTCTTCCACCAGGGCAGATGAGAGAACCAAGGGGAAGTGACATAGCAGGAACTACTAGTACCCTTCAAGAACAAATAGGATGGATGACAAGCAACCCACCTATCCCAGTGGGAGACATCTATAAAAGATGGATAATCCTAGGATTAAATAAAATAGTGAGAATGTATAGCCCTGTTAGCATTTTAGACATAAAACAAGGGCCAAAAGAACCCTTCAGAGACTATGTAGATAGGTTCTTTAAAGCTCTTAGAGCTGAGCAAGCAACACAGGATGTAAAGAACTGGATGACAGAAACCCTGCTGGTCCAAAATGCAAATCCAGATTGTAAAACCATTTTAAGAGGATTAGGATCAGGGGCTACATTAGAAGAAATGATGACAGCATGCCAGGGAGTGGGAGGACCCGGCCATAAAGCAAGGGTTTTGGCTGAGGCAATGAGTCAAGTACAAAATGCACACGTAATGATGCAGAAAAGTAATTTTAGGGGCCCGAAAAGAATTAAGTGTTTCAACTGTGGCAAAGAAGGACACCTAGCCAGAAATTGCAGGGCCCCTAGGAAAAAGGGCTGTTGGAAATGTGGAAAGGAAGGCCACCAAATGAAAGACTGCACTGAGAGACAGGCTAATTTTTTAGGGAGAATTTGGCCTTCCAGCAAGGGGAGGCCAGGGAATTTTCCTCAGAGCAGACCAGAGCCATCAGCCCCACCAGCAGAATACATGGGGATGGGGGAAGAGATAACCCCCTCCCTGAAACAGGAACAGAAAGACAGGGAACCTCCTTCAATTTCCCTCAAATCACTCTTTGGCAACGACCCCTTGTCACAATAAAAATAGAAGGACAGCTAAAAGAAGCTCTATTAGATACAGGAGCAGATGATACAGTACTAGAAGACATACATTTGCCAGGAAAATGGAAACCAAAAATGATAGGGGGAATTGGAGGTTTTATCAAAGTAAAACAGTATGATCAGATACTTATAGAAATTTGTGGAAAAAAGGCTGTAGGTACGGTATTAGTAGGACCTACCCCTGTCAACATAATTGGAAGGAATATGTTGACTCAACTTGGCTGTACTTTAAATTTTCCAATAAGTCCTATTAAAACTGTACCAGTAACATTAAAGCCAGGAATGGATGGCCCAAAGGTTAAACAGTGGCCATTAACAGAAGAAAAAATAAAAGCATTAACAGACATTTGTATGGAGATGGAAAAGGAAGGGAAAATTTCAAAAATTGGGCCTGAAAATCCATACAATACTCCAGTATTTGCCATAAAAAAGAAGGATGGCACTAAGTGGAGAAAATTAGTAGACTTCAGGGAACTCAATAAAAGAACTCAGGACTTTTGGGAAGTTCAATTAGGAATACCCCATCCAGCGGGTTTAAAAAAGAATAAATCAGTAACAGTACTGGATGTGGGGGATGCATATTTCTCAGTTCCTTTAGATGAAAGCTTCAGAAAATATACTGCATTCACTATACCAAGTATAAACAATGAGACACCAGGGATCAGATATCAGTACAATGTACTTCCACAAGGATGGAAAGGATCACCAGCAATATTCCAGTGTAGCATGACAAAAATCTTAGAGCCCTTTAGATTAAAAAATCCAGAACTAGTTATCTATCAATACATGGATGACTTGTATGTAGGCTCTGATTTAGAAATAGGGCAACATAGAGCAAAAATAGAGGAGTTAAGGGATCATCTATTGAGATGGGGATTTACTACACCAGACAAAAAGCATCAGAAAGAACCTCCATTTCTTTGGATGGGATATGAACTCCATCCTGATAAATGGACAGTCCAGCCTGTAGAACTGCCAGATAAAGACAGCTGGACTGTCAATGATATACAGAAATTAGTGGGAAAACTAAATTGGGCAAGTCAGATTTATCCAGGGATTAAAGTACAACAATTGTGTAAACTCCTCAGGGGAGCCAAAGCATTGACAGATATAGTAACACTGACTGAGGAAGCAGAACTAGAATTGGCAGAAAACAGAGAGATTCTAAAAGAACCTGTGCATGGAGTATATTATGACCCATCAAAAGATTTAGTAGCAGAAATACAGAAACAAGGACAAGACCAATGGACATATCAAATTTATCAGGAACCATTTAAGAATTTAAAAACAGGAAAATATGCAAAAAAGAGGTCTGCTCACACTAATGATGTAAAACAATTAACAGCCGTGGTGCAAAAAGTGTCCCAAGAAAGCATCATAATATGGGGAAAGACTCCTAAATTTAGACTACCCATACAAAAAGAAACATGGGAAACATGGTGGATGGAGTACTGGCAGGCTACCTGGATTCCTGAATGGGAGTTTGTCAATACCCCTCCTCTAGTAAAACTATGGTACCAGTTGGAGAGAGAACCCATAATAGGAGCAGAGACTTTCTATGTAGATGGGGCAGCTAACAGAGAAACTAAGCTAGGAAAAGCAGGGTATGTTACTGACAGAGGAAGACAAAAGGTTGTTCCTCTAACTGAGACAACAAATCAAAAGACTGAATTACATGCAATCCTCCTAGCTTTGCAGGAATCAGGAGCAGAAGTAAATATAGTAACAGACTCACAATATGCATTAGGAATTATTCAAGCACAACCAGACAGGAGTGACTCAGAGATAGTTAATAAAATAATAGAAAAGCTAATAGAAAAAGAAAGAGTCTACCTGTCATGGGTACCAGCGCATAAGGGGATTGGAGGAAATGAACAAGTAGATAAATTAGTCAGTAAGGGAATTAGGAGGGTATTATTTTTAGACGGGATAGATAAGGCTCAAGAAGAACATGAAAAATATCACAGCAATTGGAAAGCAATGGCTAGTGATTTTAATCTACCACCTGTAGTGGCAAAGGAAATAGTAGCCAGCTGTGATAAATGTCAACTAAAAGGGGAAGCTATGCATGGACAGGTAGACTGTAGTCCTGGGATATGGCAATTAGATTGCACACATCTAGAAGGAAAAGTGATCATAGTGGCAGTCCATGTAGCCAGTGGCTATATAGAAGCAGAAGTTATCCCAGCAGAAACAGGACAAGAGACAGCATACTTTCTGCTAAAATTAGCAGGAAGATGGCCAGTAAGAGTAGTCCATACAGATAATGGCCCCAATTTCACCAGCAATGCAGTAAAGGCTGCCTGTTGGTGGGCAAATATCCAACAGGAATTTGGGATTCCCTACAATCCCCAAAGTCAAGGAGTAGTGGAGTCTATGAATAAAGAATTAAAGAAAATTATAGGGCAGGTAAGAGAACAAGCTGAACACCTTAAGACAGCAGTACAAATGGCAGTATTCATTCACAATTTTAAAAGAAAAGGGGGGATTGGGGGGTACAGTGCAGGGGAAAGAATAGTAGACATAATAGCAACAGACATACAAACTAAAGAATTACAAAAACAAATTATAAAAATTCAAAATTTTCGGGTTTATTACAGAGACAGCAGAGATCCAATTTGGAAAGGACCAGCAAAACTACTCTGGAAAGGTGAAGGGGCAGTGGTAATACAGGACAATAATGATATAAAAGT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| 11,137
|
OR736079.1
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Totmenin,A.V., Halikov,M.R., Ekushov,V.E., Sklyar,L.F., Solovyova,N.P., Antonets,M.E., Tregubchak,T.V., Beniova,S.N., Ermolitskaya,S.A., Gorelova,I.S., Gashnikova,N.M.
|
State Research Center of Virology and Biotechnology "Vector", Department of Retroviruses
|
Russia
|
2023-11-11
|
Vlad27
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 9,733
|
GenBank
| null |
Russia: Vladivostok
|
Russia
|
Homo sapiens
| null |
2021-06
| null | null |
HIV-1 isolate Vlad27 from Russia, complete genome
|
TGGATGGGCTAGTTTACTCCAAGAAAAGACAAGAAATTCTTGATCTGTGGGTCTATCACACACAAGGCTACTTCCCTGATTGGCAGAATTACACCCCAGGGCCAGGGATTAGATTCCCACTAACATTTGGGTGGTGCTATAAGCTAGTACCACTTGAACCAGAGGAAATAGAAGAGGCCACAGAGGGAGAGAACAACAGCCTATTACACCCTATATGCCAACACGGAATGGATGATGAAGACAGAGAAGTGTTAATATGGAAGTTTGACAGTAAACTGGCTTTCACACACAAAGCCAGAGAGCTGCATCCGGAGTGGTACAAAAACTGATGACACAGACTGCTGACATGAAGTTGCTGACAGGGACTTTCCGCGGGGACTTTCCAGGGGAGGTGTGGATTGGGCGGAGTTGGGGAGTGGCTAACCCTCAGATGCTGCATATAAGCAGCTGCTTTTCGCCTGTACTGGGTCTCTCTGGTTAGGCCAGGTTGAGCCTGGGAGCTCTCTGGCTAGCTAGGGAACCCACTGCTTAAGCCTCAATAAAGCTTGCCTTGAGTGTTTTAAGTAGTGTGTGCCCATCTGTTGTGTGACTCTGGTAACTAGAGATCCCTCAGACCACTCTAGGCGGTGTAAAAATCTCTAGCAGTGGCGCCCGAACAGGGACTCGAAAGCGAAAGTGCCAGAGAAGTTCTCTCGACGCAGGACTCGGCTTGCTGAGGTGCACACAGCAAGAGGCGAGAGCGGCGACTGGTGAGTACGCCGATTTTTGACTAGCGGAGGCTAGAAGGAGAGAGATGGGTGCGAGAGCGTCAGTATTAAGCGGGGGAAAATTAGATGCATGGGAAAAAATTCGGTTAAGGCCAGGAGGAAAGAAAAAATATAGACTAAAACATATAGTATGGGCAAGCAGGGAACTGGAAAGATTCGCGCTTAACCCTGGCCTTTTAGAAACATCAGAAGGATGTCAGCAAATATTGGAACAGTTACAATCAAATCTCAAGACAGGATCAGAAGAAATTAAATCATTATATAATACAGTAGCAACCCTCTATTGTGTACATCAACGGATAGAGATAAAAGACACTAAGGAAGCTTTAGATAAAATAGAGGAAATACAAAATAAGAACAAGCAAAAGACTCAACAGGCAGCAACTGGCTGCAGTCAAAATTACCCCATAGTGCAAAATGCACAAGGGCAAATGGTACACCAGTCCATGTCACCTAGGACTTTGAATGCATGGGTGAAAGTAATAGAAGAAAAGGCTTTCAGCCCAGAAGTAATACCCATGTTTTCAGCATTGTCAGAAGGAGCCACCCCACAAGATTTAAACATGATGCTGAACATAGTGGGGGGACACCAGGCAGCTATGCAAATGCTGAAAGATACCATCAATGAGGAAGCTGCTGAATGGGATAGGTTACATCCAGCACAGGCAGGGCCTTTTCCACCAGGGCAGATGAGAGAACCAAGGGGAAGTGACATAGCAGGAACTACTAGTACTCTTCAAGAGCAAATAGGATGGATGACCAGCAACCCACCTATCCCAGTGGGAGATATCTATAGAAGATGGATAATCCTAGGATTAAATAAGATAGTAAGAATGTATAGTCCTATTAGTATTTTAGACATAAAACAAGGGCCAAAAGAATCCTTCAGAGACTATGTAGATAGGTTCTTTAAAACTCTTAGAGCTGAGCAAGCTACACAGGATGTAAAGAACTGGATGACAGAAACCCTACTGGTCCAAAATGCAAATCCAGACTGTAAAACCATTTTAAGAGGATTAGGATCAGGGGCTACATTAGAAGAGATGATGACAGCATGCCAGGGAGTGGGAGGACCCGGCCATAAGGCAAGGGTTTTGGCTGAGGCAATGAGTCAAGCACAAGGTGCAAACATAATGATGCAAAAAAGCAATTTTAGGGGCCCTAAAAGAATTAAATGTTTTAACTGTGGTAAAGAAGGACACCTAGCCAGAAATTGCAGGGCCCCCAGGAAAAAGGGCTGTTGGAAATGTGGAAAGGAAGGCCATCAAATGAAAGACTGCACTGAGAGACAGGCTAATTTTTTAGGGAGAATTTGGCCTTCCAGCAAAGGGAGGCCAGGAAATTTTCCTCAGAGCCGACCAGAGCCATCAGCCCCACCAGCAGAGAATTTTGGGATGGGGGAAGAGATAACCCCCTCCCAGAAACAGGAACAGAGAGACAGGGAGCATCCTCCTTCAGTTTCCCTCAAATCACTCTTTGGCAACGACCTCTTGTCACAATAAAAATAGGAGGACAGCTAAAAGAAGCTCTATTAGATACAGGAGCAGATGATACAGTATTAGAAGACATAAATTTACCAGGAAAATGGAAGCCAAAAATGATAGGGGGAATTGGAGGTTTCATCAAAGTAAGACAGTATGATCAGATACTTATAGAAATTTGTGGAAAAAAGGCTATAGGTACAGTATTAGTAGGACCTACCCCTGTCAACATAATTGGCAGAAATATGTTGACTCAGCTTGGTTGTACTTTAAATTTTCCAATAAGTCCTATTGAAACTGTACCAGTAACATTAAAGCCAGGAATGGATGGCCCAAAGGTTAAACAATGGCCATTGACAGAAGAAAAAATAAAAGCATTAATAGACATTTGTAAAGAGATGGAAGAGGAAGGAAAAATCTCAAAAGTAGGGCCTGAAAATCCATACAATACTCCAGTATTTGTAATAAAGAAAAAGGACAGTACTAAGTGGAGGAAATTAGTAGATTTCAGAGAGCTCAATAAAAGAACTCAGGACTTTTGGGAAGTTCAATTAGGAATACCCCATCCAGCAGGTTTAAAAAAGAAAAAATCAGTAACAGTACTAGATGTGGGGGATGCATATTTTTCAGTTCCTTTACATGAAAGTTTCAGAAAGTATACTGCATTCACTATACCAAGTACAAACAATGAGACACCAGGGATCAGATATCAATACAATGTACTTCCACAGGGATGGAAAGGATCACCATCAATATTCCAGAGTAGTATGACAAAAATCTTAGAGCCCTTTAGATCAAAAAATCCAGAAATAGTTATCTATCAATACATGGATGACTTGTATGTAGGCTCTGATTTAGAGATAGGGCAACATAGAACAAAAGTAGAGGAGTTAAGAGCTCATCTATTGAGCTGGGGATTTACTACACCAGACAAAAAGCATCAAAAGGAACCCCCATTTCTCTGGATGGGATATGAACTCCATCCTGACAAATGGACAGTACAGCCTATAATGCTGCCAGATAAAGACAGCTGGACTGTCAATGATATACAGAAATTAGTGGGAAAACTAAATTGGGCAAGTCAGATTTATCCAGGAATTAAAGTAAAGCAATTGTGTAAACTCCTCCGGGGAGCCAAAGCACTGACAGATATAGTGACACTGACTGAGGAAGCAGAATTAGAATTGGCAGAGAACAGGGAGATTCTAAAAGAACCTGTGCATGGAGTATATTATGACCCATCAAAAGATTTAGTAGCAGAAATACAGAAGCAAGGACAGGACCAATGGACATATCAAATTTATCAGGAACCATTTAAGAATCTAAAAACAGGAAAATATGCAAAAAAGGGGTCTGCTCACACTAATGATGTAAAACAATTAACAGCAGTGGTGCAAAAGGTGGCCACAGAAAGTATAATACTATGGGGGAAAACTCCTAAATTTAGACTGCCCATACAAAAAGAAACATGGGAAGCATGGTGGATGGAGTACTGGCAGGCTACCTGGATTCCTGAATGGGAGTTTGTCAATACCCCTCCTCTAGTAAAACTATGGTACCAGTTGGAAAAAGAACCCATAGCAGGAGCAGAGACTTTCTATGTAGATGGGGCAGCTAACAGGGAAACTAAGACAGGAAAAGCAGGGTATGTTACTGACAGAGGAAGACAAAAGGTTGTTCCTCTAACTGAGACAACAAATCAAAAGACTGAATTACATGCAATCCACCTAGCGTTGCAGGATTCAGAATCAGAAGTAAATATAGTAACAGACTCACAATATGCATTAGGAATTATTCAAGCACAACCAGACAGGAGTGAATCAGAGATAGTCAATAGCATAATAGAAAAATTAATAGAAAAAGAAAGAGTATACCTGTCATGGGTACCAGCACACAARGGGATTGGAGGAAATGAACAAGTAGATAAATTAGTCAGTAATGGGATCAGGAAGGTGTTATTTCTAGACGGGATAGATAAGGCTCAAGAAGAACATGAAAAATATCACAGCAATTGGAAAGCAATGGCTAGTGATTTTAATCTGCCACCGATAGTAGCAAAAGAAATAGTAGCCAGCTGTGATAAATGTCAACTAAAAGGGGAAGCTATGCATGGACAAGTAGACTGTAGTCCAGGGATATGGCAATTAGATTGCACACATCTAGAAGGAAAAGTAATCATAGTAGCAGTCCATGTAGCCAGTGGATATATAGAAGCAGAAGTTATCCCAGCAGAAACAGGACAGGAAACAGCATACTTTCTACTAAAATTAGCAGGAAGATGGCCAGTAAAAGTAGTACACACAGATAATGGCCCCAATTTCACCAGCAGTGCAGTTAAGGCTGCCTGTTGGTGGGCAAATATCCAACAGGAATTTGGAATTCCCTACAATCCCCAAAGTCAAGGAGTAGTGGAGTCTATGAATAAGGAATTAAAGAAAATCATAGGGCAGGTAAGAGAGCAAGCTGAACACCTTAAGACAGCAGTACAAATGGCAGTATTTATTCACAATTTTAAAAGAAAAGGGGGGATTGGGGGGTACAGTGCAGGGGAAAGAATAATAGATATAATAGCAACAGACATACAAACTAAAGAATTACAAAAACAAATTATAAAAATTCAAAATTTTCGGGTTTATTACAGAGACAGCAGAGATCCAATTTGGAAAGGACCAGCAAAACTACTCTGGAAAGGTGAAGGGGCAGTGGTAATACAGGACAATAACGATATAAAAGTAGTACCAAGAAGAAAAGC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| 11,138
|
OR736080.1
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Totmenin,A.V., Halikov,M.R., Ekushov,V.E., Sklyar,L.F., Solovyova,N.P., Antonets,M.E., Tregubchak,T.V., Beniova,S.N., Ermolitskaya,S.A., Gorelova,I.S., Gashnikova,N.M.
|
State Research Center of Virology and Biotechnology "Vector", Department of Retroviruses
|
Russia
|
2023-11-11
|
Vlad30
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 9,776
|
GenBank
| null |
Russia: Vladivostok
|
Russia
|
Homo sapiens
| null |
2021-06
| null | null |
HIV-1 isolate Vlad30 from Russia, complete genome
|
TGGATGGGCTAATTTACTCCAAGAGAAGACAAGAGATCCTTGATCTGTGGGTCTATCACACACAAGGCTACTTCCCTGATTGGCAGAATTACACCTCAGGGCCAGGGGTTAGATTCCCACTAACATTTGGGTGGTGCTACAAGCTAGTACCAGTTGACCCAGATGAGGTAGAAGAGGCCACAGAGGGAGAGAACAACAGCCTATTACACCCTATATGCCAGCATGGAATGGATGATGAAGAAAAAGAAGTGTTAATGTGGAAGTTTGACAGTCGCCTGGCTCTAAAACACAGAGCCCGAGAGCTGCATCCGGAGTACTACAAAGACTGCTGACACAGCTGCTGACATGAAGTTGCTGACAGGGACTTTCCACGGGGCTTTCCAGGGGAGGTGTGGTTTGGGCGGAGCTGGGGAGTGGCTAACCCTCAGATGCTGCATATAAGCAGCTGCTTCTCGCTTGTACTGGGTCTCTCTGGCTAGACCAGATTGAGCCTGGGAGCTCTCTGGATAGCTAGGGAACCCACTGCTTAAGCCTCAATAAAGCTTGCCTTGAGTGCTTCAAGTAGTGTGTGCCCGTCTGTTGTTTGACTCTGGTAACTAGAGATCCCTCAGACCACTCTAGGCGGTGTAAAAATCTCTAGCAGTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAAGTGAAAGTAATAGGGACTTGAAAGCGGAAGTTCCAGAGAAGCTCTCTCGACGCGGGACTCGGCTTGCTGAGGTGCACACAGCAAGAGGCGAGAGCGGCGACTGGTGAGTACGCCTAAGATTTTTGACTAGCGGAGGCTAGAAGGAGAGAGATGGGTGCGAGAGCGTCGGTATTAAGCGGGGGAAAATTAGATGCATGGGAAAGAATTCGGTTAAGGCCAGGGGGAAATAAAAAATATAGATTAAAACACATAGTATGGGCAAGCAGGGAGCTGGAAAGATTCGCGGTCAACCCTGGCCTTTTAGAAACATCAGGAGGATGTCAGCAAATATTGGAACAGTTACAACCAAGTCTCAAGACAGGATCAGAAGAACTTAAATCATTATATAATACAGTAGCAACCCTCTATTGTGTACATCAAAGGATAGACATAAAAGACACCAAGGAAGCTTTAGATAAAATAGAGGAGTTACAAAATAAGAGCAAGCAAAAGACCCAACAGGAAGCAACTGACTCAGGAAAAAGCAGCAAGGTCAGTCAAAATTACCCCATAGTGCAAAACGCACAAGGGCAAATGATACACCAGGCCATGTCACCTAGAACTTTAAATGCATGGGTAAAAGTAATAGAAGAAAAGGCTTTCAGCCCAGAAGTAATACCCATGTTTACAGCATTGTCAGAGGGAGCCACCCCACAAGATTTAAACATGATGCTGAACATAGTGGGGGGACATCAGGCAGCTATGCAAATGTTGAAAGATACCATCAATGAGGAAGCTGCTGAATGGGATAGGTTACATCCCGCACAAGCAGGGCCCTTCCCACCAGGGCAGATGAGAGAACCAAGGGGAAGTGACATAGCAGGAACTACTAGTACCCTTCAAGAACAAATAGGATGGATGACAAGCAATCCACCTATTCCAGTGGGAGAAATCTATAAAAGATGGATAATCCTAGGATTAAATAAAATAGTGAGAATGTATAGCCCTGTTGGCATTTTAGACATAAAACAAGGACCAAAAGAACCCTTCAGAGACTATGTAGATAGGTTCTTTAAAACTCTTAGAGCTGAGCAAGCTACACAGGAGGTTAAGAACTGGATGACAGAAACCCTGCTGGTCCAAAATGCAAATCCAGATTGTAAAAATATTTTAAGAGCACTAGGACCAGGGGCTACATTAGAAGAAATGATGACAGCATGCCAGGGAGTGGGAGGACCCGGCCATAAAGCAAGGGTTTTGGCCGAGGCAATGAGTCAAGTGCATAATACAAACATAATGATGCAGAAAAGTAATTTTAGGGGTCCAAGGAAAATTAAGTGTTTCAATTGTGGCAAAGAAGGGCACCTAGCCAAAAATTGCAGGGCCCCTAGGAAAAGGGGCTGTTGGAAATGTGGAAAGGAAGGCCACCAAATGAAAGACTGCACTGAGAGACAGGCTAATTTTTTAGGGAAAATTTGGCCTTCCAACAAAGGAAGGCCAGGGAATTTTCCTCAGAGCAGACCAGAGCCAACAGCCCCACCACTAGAGAGCTTGGGGATGGGGGAAGAGATAACCCCCTCCCTGAAACAGGAGCAGAAAGAGAGGGAACAGTATCCTCCCTCAGTTTCCCTCAAATCACTCTTTGGCAACGACCTATTGTCACAGTAAAAATAGGAGGACAGCTAAAAGAAGCTCTATTAGATACAGGAGCAGATGATACAGTATTAGAAGACATAAATTTGCCAGGGAAATGGAAGCCAAAAATGATAGGGGGAATTGGAGGTTTTATCAAAGTAAGACAGTATGATCAGATACTCATAGAAATTTGTGGAAAAAAGGCTATAGGTACAGTATTAGTAGGACCTACCCCTGTCAACATAATTGGAAGGAATATGTTGACTCAGATTGGTTGTACTTTAAATTTTCCAATAAGTCCTATTGAAACTGTACCAGTAACATTAAAGCCAGGAATGGATGGCCCAAAGGTTAAACAATGGCCATTAACAGAAGAGAAAATAAAAGCATTAACAGAAATTTGTAATGAAATGGAGAAGGAAGGAAAAATTTCAAGAATTGGGCCTGAAAATCCATACAATACTCCAGTATTTGCTATAAAGAAGAAGGATGGAAACAAGTGGAGGAAATTGGTAGATTTCAGGGAGCTCAATAAAAGAACTCAGGATTTTTGGGAAGTTCAATTAGGGATACCCCATCCAGCGGGTTTAAAAAAGAAAAAATCAGTAACAGTACTGGATGTGGGGGATGCATATTTTTCAGTTCCTTTAGATGAAAACTTCAGAAAGTATACTGCATTCACTATACCCAGTACAAATAATGAGACACCAGGGATCAGATATCAGTACAATGTACTCCCACAGGGATGGAAAGGATCACCAGCAATATTCCAGAGTAGCATGATAAAAATCTTAGAGCCATTCAGGTCAAAAAATCCAGAAATAGTTATCTATCAATACATGGATGACTTGTATGTAGGCTCTGATTTAGAGATAAAGCAGCATAGAGCAAAAATAGAGGAGTTAAGAGATCATCTATTGAGATGGGGACTCACCACACCAGACAAAAAGCATCAGAAAGAACCCCCATTTCTTTGGATGGGATATGAACTCCATCCTGACAAATGGACAGTCCAACCTATACAGCTACCAGATAAAGACAGCTGGACTGTCAATGATATACAGAAATTAGTGGGAAAATTAAATTGGGCAAGTCAGATTTATCCAGGAATTAAAGTAAAGCAATTGTGTAAACTCCTCAGGGGAGCCAAAGCACTGACAGATATAGTGACATTAACTGAGGAAGCAGAATTAGAATTGGCAGAGAACAGGGAAATTCTAAAAGAACCTGTGCATGGAGTATATTATGACCCATCAAAAGATTTAGTAGCAGAAATACAGAAACAAGGACAAGGCCAATGGACATATCAAATTTATCAGGAGCCATTTAAAAATTTAAAAACAGGAAAATATGCAAAAAAGGGATCTGCTCACACTAATGATGTAAGACAATTAACAGCAGTGGTGCAAAAAGTGACCACAGAAAGCATAATAATATGGGGAAAGACTCCTAAGTTTAGACTACCCATACAAAGAGAAACATGGGAAACATGGTGGATGGAGTATTGGCAGGCTACCTGGATTCCTGAATGGGAGTTTGTCAATACCCCTCCTCTAGTAAAGCTATGGTACCAGTTGGAAAAAGAACCCATTGTAGGAGCAGAGACTTTCTATGTAGATGGGGCAGCTAACAGGGAGACTAAGATAGGAAAAGCAGGGTATGTTACAGACAGAGGAAGACAGAAGGTTGTTCCTCTAACTGAGACAACAAATCAAAAGACTGAATTACATGCAATCCATCTAGCCTTGCAGGATTCAGGATCAGAAGTAAATATAGTAACAGACTCCCAATATGCATTAGGAATTATTCAGGCACAACCAGACAGTAGTGAATCAGAGATAGTCAATAAAATAATAGAGAAACTAATAGAAAAAGAAAGAGTCTACCTGTCATGGGTACCAGCACACAAAGGGATTGGAGGAAATGAACAAGTAGATAAATTAGTTAGTTCTGGAATCAGGAAGGTGTTATTTTTAGACGGGATAGATAAGGCTCAAGAAGAACATGAAAAATATCACAGCAATTGGAAAGCAATGGCAAGTGATTTTAATCTACCACCTATAGTAGCAAAGGAAATAGTAGCCAGCTGTGATAAATGTCAATTAAAAGGGGAAGCTATGCATGGACAGGTAGACTGTAGTCCAGGAATATGGCAATTAGATTGCACCCATCTAGAAGGAAAAGTAATCTTAGTAGCAGTCCATGTAGCCAGTGGCTATATAGAAGCAGAAGTTATCCCAGCAGAAACAGGACAGGAAACAGCATACTTTCTGCTAAAATTAGCAGGAAGATGGCCAGTAAAAGTAGTACATACAGATAATGGCCCCAATTTCACCAGTAATGCAGTTAAGGCTGCCTGTTGGTGGGCAAATATCCAACAGGAATTTGGAATTCCCTACAATCCCCAAAGTCAAGGAGTAGTGGAGTCTATGAACAAAGAATTAAAGAAAATCATAGGGCAAGTAAGAGAGCAAGCTGAACACCTTAAGACAGCAGTACAAATGGCAGTATTCATTCACAATTTTAAAAGAAAAGGGGGGATTGGGGGGTACAGTGCAGGGGAAAGAATAATAGACATAATAGCAACAGACATACAAACTAAAGAACTACAAAAACAAATTATAAAAATTCAAAATTTTCGGGTTTATTACAGAGACAGCAGAGACCCAATTTGGAAAGGACCAGCAAAACTACTCTGGAAAGGTGAAGGGGCAGTGGT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| 11,139
|
OR736081.1
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Totmenin,A.V., Halikov,M.R., Ekushov,V.E., Sklyar,L.F., Solovyova,N.P., Antonets,M.E., Tregubchak,T.V., Beniova,S.N., Ermolitskaya,S.A., Gorelova,I.S., Gashnikova,N.M.
|
State Research Center of Virology and Biotechnology "Vector", Department of Retroviruses
|
Russia
|
2023-11-11
|
Vlad37
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 9,729
|
GenBank
| null |
Russia: Vladivostok
|
Russia
|
Homo sapiens
| null |
2021-06
| null | null |
HIV-1 isolate Vlad37 from Russia, complete genome
|
TGGATGGGCTAATTTACTCCAAGAAAAGACAAGAGATCCTTGATCTGTGGGTCTATCACACACAAGGCTACTTCCCTGATTGGCAGAATTATACCCCAGGGCCAGGGATTAGATTCCCACTAACATTTGGGTGGTGCTACAAGCTAGTACCAGTGGACCCAGAGGAAGTAGAAGAGGCCACAGAGGGAGAGAACAACAGCCTACTGCACCCTATATGCCAACACGGAATGGATGATGAGGAAAGAGAAGTGTTAATGTGGAAGTTTGACAGTCGCCTGGCTCTAAAACACAGAGCCCGAGAGCTGCATCCGGAGTTCTACAAAGACTGCTGACACAGACTGCTGACATGAAGTTGCTGACAGGGACTTTCCGCGGGGACTTTCCAGGGGAGGTGTGGTTTGGGCGGAGTTGGGGAGTGGCTAACCCTCAGATGCTGCATATAAGCAGCTGCTTCTCGCCTGTACTGGGTCTCTCTGGTTGGACCAGATAGAGCCTGGGAGCTCTCTGGCTAGCTAGGGAACCCACTGCTTAAGCCTCAATAAAGCTTGCCTTGAGTGCTTTAAGTAGTGTGTGCCCGTCTGTTGTTTGACTCTGGTAACTAGAGATCCCTCAGACCACTCTAGACGGTGTAAAAATCTCTAGCAGTGGCGCCCGAACAGGGACTCGAAAGCGAAAGTGTTCCAGAGAAGCTCTCTCGACGCAAGGACTCGGCTTGCTGAGGTGCACACAGCAAGAGGCGAGAGCGGCGACTGGTGAGTACGCCTAAGATTTTGACTAGCGGAGGCTAGAAGGAGAGAGATGGGTGCGAGAGCGTCGGTATTAAGCGGGGGAAAATTAGATGCATGGGAAAAAATTCGGCTAAGGCCAGGGGGAAAGAAAAAATATAGAATAAAACACCTAGTATGGGCAAGCAGGGAGCTGGAAAGATTCGCGGTTAACCCTGGCCTTTTAGAAACAGCAGAGGGATGTCAACAAATATTAGAACAGTTACAGCCATCTCTCAAGACAGGATCAGAAGAACTTAAATCATTATTTAATACAGTAGCAGTCCTCTATTGTGTACAGCAAAGGATAGAAATAAGAGACACCAAGGATGCCTTAGATAAAATAGAGGAACTACAAAATAAGAGCAAGCAAAAGACCCAACAAGCAGCAACTGGCACAGGAGACAACAGCAATGTCAGTCAAAATTATCCCATAATGCAAAATGCACAAGGGCAAATGACATACCAGTCCATGTCACCTAGGATTTTGAATGCATGGGTGAAAGCAATAGAAGAAAAGGCTTTTAGCCCAGAAATAATACCCATGTTTACAGCATTGTCAGAGGGAGCCGCCCCACAAGATTTAAATATGATGCTGAACATAGTAGGGGGACACCAGGCAGCTATGCAAATGTTGAAAGATACCATCAATGAGGAAGCTGCTGAATGGGATAGGTTACACCCAGTACAGGCAGGGCCTGTTCAAGCAGGGCAGATGAGAGATCCAAGGGGAAGTGACATAGCAGGAACTACTAGTACCCTTCAAGAACAAATAAGATGGATGACAAGCACCCCTCCTATCCCAGTGGGAGACATCTATAAAAGATGGATAATCCTGGGATTAAATAAAATAGTAAGAATGTATTGCCCTACTAGCATTTTGGACATAAGACAAGGGCCAAAAGAACCCTTCAGGGACTATGTAGATAGGTTCTTTAAAACTCTTAGAGCTGAGCAAGCTTCGCAGGAGGTAAAGAACTGGATGACAGAAACCCTGATGGTCCAAAATGCAAACCCAGATTGCAAAGCTATTTTAAGAGCATTACCAGGGGCTACGTTAGAAGAAATGATGACAGCATGCCAGGGAGTGGGAGGACCCGGCCATAAAGCAAGGGTTTTGGCTGAGGCAATGAGTCAACTGCATAATACAAACATAATGATGCAGAAAAGTAATTTTAGGGGCCCAAAAAGAATTAAGTGTTTCAACTGTGGCAAAGAAGGACACCTAGCGAGGAATTGCAGGGCTCCTAGGAAAAAGGGCTGTTGGAAATGTGGAAAAGAAGGCCATCAGATGAAAGACTGCACTGAGAGACAGGCTAATTTTTTAGGGAGAATTTGGCCTTCCAGCAAGGGGAGGCCAGGAAATTTTCCTCAGAGCAGACCAGAGCCATCAGCCCCACCAGCAGAGAATTTTGGGATGGGGGAAGAGATAGCCCACTCCCTGAAACAGGAACAGAGAGACAGGGAACAGGGTCCTCCTTCAATTTCCCTCAAATCACTCTTTGGCAACGACCCATTGTCACAATAAAAATAGGAGGACAGCTAAAAGAAGCTCTATTAGATACAGGAGCAGATGATACAGTATTAGAAGACATAAATTTGCCAGGAAAATGGAAACCAAAAATGATAGGGGGAATTGGAGGTTTTATCAAAGTAAGACAGTATGATGAGATACCCATAGAAATTTGTGGAAAAAAGGCTATAGGTACAGTGTTAATAGGACCTACCCCTGTCAACATAATTGGAAGAAATATGTTGACTCAGCTTGGGTGTACTTTAAATTTTCCAATAAGTCCTATTGAAACTGTACCAGTAACATTAAAGCCAGGAATGGATGGGCCAAAGGTCAAACAATGGCCATTAACAGAAGAAAAAATAAAAGCATTAATAGACATTTGTAAGGAAATGGAAAAGGAAGGAAAAATTTCAAAAATTGGGCCTGAAAATCCATACAATACCCCAGTATTTGTTATAAAGAAAAAGGATAGCACTAAGTGGAGGAAATTAGTAGATTTCAGGGAGCTTAATAAAAGAACTCAGGACTTTTGGGAAGTCCAATTAGGAATACCCCATCCAGCAGGTTTGAAAAAGAAAAAATCAGTAACAGTATTAGATGTAGGGGATGCATATTTTTCAGTTCCTTTAGATGAAAACTTCAGAAAGTATACTGCATTCACTATACCAAGTATAAACAATGAGACACCAGGGATCAGATATCAGTACAATGTACTCCCACAGGGATGGAAAGGATCACCATCAATATTCCAGGCTAGCATGACAAAAATCTTAGAGCCATTTAGATTAAAAAACCCAGAAATAGTTATCTATCAATACATGGATGACTTGTATGTAGGCTCTGATTTAGAAATAGGACAACATAGAACAAAAATAGAGGAGTTAAGAGCCCATTTATTGAGCTGGGGGTTTACTACACCAGACAAAAAGCATCAGAAAGAACCTCCATTTCTTTGGATGGGATATGAACTCCATCCTGACAAGTGGACAGTCCAGCCTATAGTACTACCAGATAAAGACAGCTGGACTGTCAATGATATACAGAAATTAGTGGGAAAGCTAAATTGGGCAAGTCAGATTTATCCAGGGATTAAAGTGAAGCAATTGTGTAAACTCCTCAGGGGAGCCAAAGCACTGACAGATATAGTGACACTGACAGAGGAAGCAGAATTAGAATTGGCAGAGAACAGAGAGATTCTAAAAGAACCTGTACATGGAGTATATTATGACCCATCAAAAGATCTAGTAGCAGAAATACAGAAACAAGGACAAGACCAATGGACATATCAAATTTATCAGGAACCATTTAAAAATCTAAAAACAGGAAAATATGCAAAAAAGGGAGCTGCTCACACTAATGATGTAAAACAATTAACGGCAGTGGTGCAAAAGGTGTCCACAGAAAGCATAGTAATATGGGGAAAGACTCCTAAATTTAGACTACCCATACAAAAAGAAACATGGGAAGCATGGTGGATGGAGTACTGGCAAGCTACCTGGATTCCTGAATGGGAGTTTGTCAATACCCCTCCGCTAGTAAAACTCTGGTACCAGTTGGAAAAAGAACCCATAGTAGGAGCAGAGACTTTCTATGTAGATGGGGCAGCTAACAGAGAAACTAAGATAGGAAAAGCAGGGTATGTTACTGACAGAGGAAGACAAAAGGTTATCTCTCTAACTGAGACAACAAATCAGAAGACTGAATTACATGCAATACATCTAGCTCTGCAGGATTCAGGATCAGAAGTAAATATAGTAACAGACTCACAATATGCATTAGGAATTATTCAGGCACAACCAGACAGGAGTGAATCAGAGATAGTCAATAACATAATAGAGAAACTAATAGCAAAAGAAAAGGTATACCTGTCATGGGTTCCAGCACACAAGGGGATTGGAGGAAATGAACAAGTAGATAAATTAGTTAGTAATGGAATCAGGAGGGTGTTATTTTTAGAAGGGATAGATAAGGCTCAAGAAGAACATGAAAGATATCACAGCAATTGGAAAGCAATGGCCAGTGATTTTAATCTGCCACCTATAGTAGCAAAGGAAATAGTAGCCAGCTGTGATAAATGTCAATTAAAAGGAGAAGCTATGCATGGACAGGTAGACTGTAGCCCAGGGATATGGCAATTAGATTGCACACATCTAGAAGGAAAAGTAATCATAGTAGCAGTCCATGTAGCCAGTGGCTATATAGAAGCAGAAGTAATCCCAGCAGAAACAGGGCAGGAGACAGCATACTTTCTGCTAAAATTAGCAGGAAGATGGCCAGTAAAAGTAGTACACACAGACAATGGCCCCAATTTCACTAGCAGTGCAGTTAAGGCTGCCTGTTGGTGGGCAGATATCCAACAGGAATTTGGGATTCCCTACAATCCCCAAAGTCAAGGAGTAGTGGAGTCTATGAATAAAGAATTGAAGAAGATCATAGGGCAGGTAAGAGAGCAAGCAGAACACCTTAAGACAGCAGTACAAATGGCAGTATTCATTCACAATTTTAAAAGAAAAGGGGGGATTGGGGGGTACAGTGCAGGGGAAAGAATAATAGACATAATAGCAACAGACATACAAACTAAAGAACTACAAAAACAAATTATAAAAATTCAAAATTTTCGGGTTTATTACAGAGACAGCAGAGATCCAATTTGGAAAGGACCAGCAAAACTACTCTGGAAAGGTGAAGGGGCAGTAGTAATACAGGATAATAACGATATA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| 11,140
|
OR736082.1
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Totmenin,A.V., Halikov,M.R., Ekushov,V.E., Sklyar,L.F., Solovyova,N.P., Antonets,M.E., Tregubchak,T.V., Beniova,S.N., Ermolitskaya,S.A., Gorelova,I.S., Gashnikova,N.M.
|
State Research Center of Virology and Biotechnology "Vector", Department of Retroviruses
|
Russia
|
2023-11-11
|
Vlad43
|
Human immunodeficiency virus 1
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 9,710
|
GenBank
| null |
Russia: Vladivostok
|
Russia
|
Homo sapiens
| null |
2021-07
| null | null |
HIV-1 isolate Vlad43 from Russia, complete genome
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TGGATGGGCTAATTTACTCCAAGAAAAGACAAGAAATCCTTGATCTGTGGGTCTATCACACACAAGGTTACTTCCCTGATTGGCAGAATTACACCCCAGGGCCAGGGGTTAGATACCCACTGACATTTGGGTGGTGCTACAAACTAGTACCAGTTGACCCAGCTGATGTAGAAGAGGCCACAGTGGGAGAGAACAACAGCCTATTACACCCCATATGCCAACATGGAATGGATGATGAGGAAGGTGAAGTGTTAATGTGGAAGTTTGACAGTCACCTGGCTCTAAAACACAGAGCCCGAGAGCTGCATCCGGAGTACTACAAAGATTGCTGACATGACATAAAGTTGCTGACAGGGACTTTCCGCGGGGACTTTCCAGGGGAGGTGTGGTTTGGGCGGAGTTGGGGAGTGGCTAACCCTCAGATGCTGCATATAAGCAGCTGCTTTTCGCCTGTACTGGGTCTCTCTGGTTAGACCAGGTTGAGCCTGGGAGCTCTCTGGCTAGCTAGGGAACCCACTGCTTAAGCCTCAATAAAGCTTGCCTTGAGTGCTAAAGTAGTGTGTGCCCGTCTGTTGTGTGACTCTGGTAACTAGAGATCCCTCAGACCACGCTAGGCGGTGTAAAAATCTCTAGCAGTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAAGCGAAAGTTCCAGAGCAGATCTCTCGACGCAGGACTCGGCTTGCTGAGGTGCACACAGCAAGAGGCGAGAGAGGCGACTGGTGAGTACGCCTAAAGATTCTTGACTAGCGGAGGCTAGAAGGAGAGAGATGGGTGCGAGAGCGTCAATATTAAGCGGGGGAAAATTAGATGCATGGGAAAAAATTCGGTTAAGGCCAGGGGGGAAAAAACAATATAGAATAAAACACCTAGTATGGGCAAGCAGGGAACTGGAAAGATTCGCGCTTAACCCTGGCCTTTTAGAAACAGCAGAAGGATGTCAGCAAATACTGGTACAGATACAACCAAGTCTCAAGACAGGATCAGAAGAACTAAAATCATTATATAATACAGTAGCAACTCTCTATTGTGTACATCAGAGGATAGTGATAAGAGACACCAAGGAAGCTTTAGATAAAATAGAAGAAATACAAAACAAAAGCAAGCAAAAGACCCAACAAACAGCAGCTGGCACAGGAAGCAGCAGTAGTGTCAGTCAAAATTATCCCATAGTGCAAAATGCACAAGGGCAAATGGTACATCAGTCCATGTCACCTAGGACTTTGAATGCATGGGTGAAAGTAATAGAAGAAAAGGCTTTCAGCCCAGAAGTAATACCCATGTTTTCAGCACTATCAGAGGGAGCCACCCCACAAGATTTAAACATGATGCTGAACATAGTGGGGGGACATCAGGCAGCTATGCAAATGTTAAAAGATACCATCAATGAGGAAGCTGCTGACTGGGATAGGTTACATCCAGCACAGGCAGGGCCTTTTCCACCGGGGCAAATGAGAGAACCAAGGGGAAGTGACATAGCAGGAACTACTAGTACCCTTCAAGAACAAATAGGATGGATGACAAGCAACCCACCTATCCCAGTGGGAGACATCTATAAAAGATGGATAATCCTGGGATTAAATAAGATAGTAAGAATGTATAGCCCTACTAGCATTTTAGACATAAAACAAGGGCCAAAAGAACCCTTCAGAGACTATGTAGATAGGTTCTTTAAAGTTCTTAGAGCTGAGCAAGCTACACAGGATGTAAAGAACTGGATGACAGAAACCCTACTGGTTCAAAATGCAAATCCAGATTGTAAAACCATTTTAAGAGCATTAGGATCAGGGGCTACATTAGAGGAAATGATGACAGCATGCCAGGGAGTGGGAGGACCTGGCCATAAAGCAAGGGTTTTAGCTGAGGCAATGAGTCAAGTACAAAATACAAGCATAATGATGCAGAAAAGTAATTTTAGGGGCCCAAAAAGAATTAAGTGTTTCAACTGTGGCAAAGAAGGACACCTAGCCAGAAATTGCAGGGCCCCTAGGAAAAAGGGCTGTTGGAAATGTGGAAAGGAAGGCCATCAAATGAAAGACTGCACTGAGAGACAGGCTAATTTTTTAGGGAGAATTTGGCCTTCCAGCAAAGGGAGGCCAGGAAATTTCCCTCAGAGCAGACCAGAACCATCAGCCCCACCGGCAGAATACTGTGGGATGGGGGAAGAGACAACCCCCTCCCTGAAACAGGAACAGGAGAACAGGGACCAGCCTCCTCCTTCAATCTCCCTCAAATCACTCTTTGGCAACGACCCCTTGTCACAGTAAAAGTAGGAGGACAGCTAAAAGAAGCTCTATTAGATACAGGAGCAGATGATACAGTACTAGAAGACATAAATTTGCCTGGAAAATGGAAACCAAAAATGATAGGGGGAATTGGAGGTTTTATCAAAGTAAAACAGTATGATCAGATACTTATAGAAATTTGTGGGAAAAAGGCTATAGGTACAGTATTAGTAGGACCCACTCCTGTCAACATAATTGGAAGAAATATGTTGACTCAGATTGGTTGTACCTTAAATTTTCCAATAAGTCCTATTGAAACTGTACCAGTAAAATTAAAGCCAGGAATGGATGGCCCAAAGATTAAACAATGGCCATTAACAGAAGAAAAAATAAAAGCATTAACAGAAATTTGTATGGAAATGGAAAAGGAAGGAAAAATTTCAAAAATTGGGCCTGAAAATCCATACAATACTCCAATATTTGCTATAAAGAAAAAGGACAGCACTAAGTGGAGGAAATTAGTAGATTTCAGGGAGCTCAATAAAAGAACTCAGGACTTTTGGGAAGTTCAATTAGGAATACCCCATCCAGCGGGTTTAAAAAAGAAAAAATCAGTAACAGTACTGGATGTGGGGGATGCATATTTTTCAGTTCCTTTAGATGAAAGCTTCAGAAAGTATACTGCATTCACTATACCAAGTACAAACAATGAGACACCAGGGATCAGATATCAGTACAATGTACTTCCACAAGGATGGAAAGGATCACCAGCAATATTCCAGAGTAGCATGACAAAAATCTTAGAGCCCTTTAGATTAAAAAATCCAGAAATAGTTATCTATCAGTACATGGATGACTTGTATGTAGGCTCTGATTTAGAAATAGGGCAACATAGAACAAAAATAGAGCAGTTGAGAGCTCATCTATTGAGCTGGGGGTTTACTACACCAGACAAAAAGCATCAGAAAGAACCTCCATTTCTTTGGATGGGATATGAACTCCATCCTGACAAATGGACAGTCCAGCCTATAATGCTGCCAGATAAAGACAGTTGGACTGTCAATGATATACAGAAATTAGTGGGAAAACTAAATTGGGCAAGTCAGATTTATCCAGGGATTAAGGTAAGGCAACTATGTAAGCTCCTCAGGGGAGCCAAGGCACTGACAGATATAGTGACACTGACTGAGGAAGCAGAATTAGAATTGGCAGAGAACAGAGAAATTCTAAAAACACCTGTGCATGGGGTGTATTATGACCCATCAAAAGATTTAATAGCAGAAATACAGAAACAAGGACAAGGCCAATGGACATATCAAATTTATCAGGAGCCATTTAAGAATCTAAAAACAGGAAAATATGCAAAAACAGGGGCTGCTCACACTAATGATGTAAAACAATTAACAGCAGCGGTGCAAAAAGTGGCCACAGAAAGCATAGTAATATGGGGAAAGACTCCTAAATTTAGGCTACCCATACAAAAAGAAACATGGGAAGCATGGTGGATGGAGTACTGGCAGGCCACCTGGATTCCTGAATGGGAGTTTGTCAATACCCCTCCTCTAGTAAAACTATGGTACCAATTGGAGAAAGAACCCATAGTAGGAGCAGAGACCTTCTATGTAGATGGGGCAGCTAACAGAGAGACTAAGATAGGAAAAGCAGGATATGTCACTGACAGAGGAAGACAAAAGGTTGTTCCTCTAACAGAGACAACAAATCAAAAGACTGAATTACATGCCATCCATCTAGCTCTGCAGGATTCAGGATCAGATGTAAATATAGTAACAGACTCACAATATGCATTAGGAATTATTCAGGCACAACCAGATAGGAGTGAAGTAGAAATAGTCAATAAAATAATAGAGAAATTAATAGAAAAAGACAGAGTCTACCTGTCATGGGTACCAGCGCACAAAGGGATTGGAGGAAATGAACAAGTAGATAAATTAGTCAGTGCTGGAATCAGGAGGGTGTTATTTTTAGACGGGATAGACAAGGCTCAAGAAGAACATGAAAAATATCACAGCAATTGGAAAGCAATGGCTAGTGATTTTCATCTGCCACCTGTAGTAGCAAAGGAGATAGTAGCCAGCTGTGATAAATGTCAACTAAAAGGGGAAGCTATGCATGGACAGGTAGACTGTAGTCCAGGGATATGGCAATTAGATTGCACACATCTAGAAGGAAAAGTAATCATAGTAGCAGTCCATGTAGCCAGTGGCTATATAGAAGCAGAAGTTATTCCAGCAGAAACAGGACAGGAGACAGCATACTTTCTGCTAAAATTAGCAGGAAGATGGCCAGTAAAAGTAATACATACAGATAATGGCCCCAATTTCACCAGCAGTGCAGTTAAGGCTGCCTGTTGGTGGGCAAATATCCAGCAGGAATTTGGGATTCCCTACAATCCCCAAAGTCAAGGAGTAGTGGAGTCTATGAATAAGGAATTAAAGAAAATCATAGGGCAGGTAAGAGAGCAAGCTGAACACCTTAAGACAGCAGTACAAATGGCAGTATTCATTCACAATTTTAAAAGAAAAGGGGGGATTGGGGGGTACAGTGCAGGGGAAAGAATAATAGACATAATAGCAACAGACATACAAACTAAAGAATTACAAAAACAAATTACAAAACTTCAAAATTTTCGGGTTTATTACAGAGACAGCAGAGATCCAATTTGGAAAGGACCAGCAAAACTACTCTGGAAAGGTGAAGGGGCAGTAGTAATACAGGACAACAACGATATAAAAGTAG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| 11,141
|
NC_001722.1
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Kirchhoff,F., Jentsch,K.D., Bachmann,B., Stuke,A., Laloux,C., Luke,W., Stahl-Hennig,C., Schneider,J., Nieselt,K., Eigen,M., et al., Jentsch,K., Lueke,W., Stahl-Henning,C., Hunsmann,G.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1993-08-02
|
BEN
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,359
|
RefSeq
| 1
| null | null |
Homo sapiens
| null | null | null |
PRJNA485481
|
Human immunodeficiency virus 2, complete genome
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CTGGTGGGGAACGCCCTCATACTTACTGTATAAATGTACCCGCTTCTTGCATTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATCGAGCCCTGAGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTGGACTCTCACCAGTACTTGGCCGGTACTGGGCAGACGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGACCTCTTCAATAAAGCTGCCAGTTAGAAGCAAGTTAAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCATTCGGTGTTCATCTGAGTAACAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTCTCGCTTTGGGAATCCAAGGCAGGAAAATCCCTAGCA
| 9,005
|
MK686225.1
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Bender,A.M., Simonetti,F.R., Kumar,M.R., Fray,E.J., Bruner,K.M., Timmons,A.E., Tai,K.Y., Jenike,K.M., Antar,A.A.R., Liu,P.T., Ho,Y.C., Raugi,D.N., Seydi,M., Gottlieb,G.S., Okoye,A.A., Del Prete,G.Q., Picker,L.J., Mankowski,J.L., Lifson,J.D., Siliciano,J.D., Laird,G.M., Barouch,D.H., Clements,J.E., Siliciano,R.F., Bender,A., Siliciano,R.
|
Johns Hopkins University School of Medicine, Medicine
|
USA
|
2020-07-27
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Pt14D03
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Lentivirus
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Retroviridae
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ssRNA-RT
| 9,173
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GenBank
| 1
| null | null |
Homo sapiens
| null | null | null | null |
HIV-2 isolate Pt14D03, complete genome
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| 48,208
|
MK686247.1
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Human immunodeficiency virus 2
|
Bender,A.M., Simonetti,F.R., Kumar,M.R., Fray,E.J., Bruner,K.M., Timmons,A.E., Tai,K.Y., Jenike,K.M., Antar,A.A.R., Liu,P.T., Ho,Y.C., Raugi,D.N., Seydi,M., Gottlieb,G.S., Okoye,A.A., Del Prete,G.Q., Picker,L.J., Mankowski,J.L., Lifson,J.D., Siliciano,J.D., Laird,G.M., Barouch,D.H., Clements,J.E., Siliciano,R.F., Bender,A., Siliciano,R.
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Johns Hopkins University School of Medicine, Medicine
|
USA
|
2020-07-27
| null |
Human immunodeficiency virus 2
|
Lentivirus
|
Retroviridae
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ssRNA-RT
| 10,359
|
GenBank
| 1
| null | null |
Homo sapiens
| null | null | null | null |
HIV-2, complete genome
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| 48,209
|
KY025538.1
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Yamaguchi,J., Brennan,C.A., Alessandri-Gradt,E., Plantier,J.C., Cloherty,G.A., Berg,M.G., Plantier,J.-C.
|
Abbott Labs, 09-NC, Infectious Diseases Research and Virus Discovery
|
USA
|
2016-12-14
|
LA37
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,354
|
GenBank
| 1
|
Senegal
|
Senegal
|
Homo sapiens
| null |
1993-06-28
| null | null |
HIV-2 isolate LA37 from Senegal, complete genome
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TGGAAGGGATGTTTTACAGTGAGAGAAGACATAGAATCTTAGACATATACTTAGAAAGGGAAGAAGGGATAATTGCAGATTGGCAGAATTATACTTATGGGCCAGGAGTAAGATACCCAATGTTCTTTGGATGGCTATGGAAGCTGGTACCAGTAGAGGAGGCGGAGAGCAGTGACACCCACTGCTTGTTACACCCAGCACAAACAAACAAGCATGATGACCCACATGGAGAAACACTAGTGTGGGTGTTTGACTCCAGGCTGGCTTATGAGTACACGGCCTTTAATAAATACCCAGAGGAATTTGGGCATAAGTCAGGCATGCCAGAAGAAGAGTGGAAGGCAAAACTGAAAGCAAGAGGGATACCATACAGTGAGAGGCAGGAACAGCTATACTTGGTCATGGCAGGAAGTAGCTACTGAAAACAGCTGAGACTGCAGGGACTTTCCAGAAGGGGCTGTAACCAAGGGAGGGACATGGGAGGAGCTGGTGGGGAACGCCCTCATACTTTCTGTATAAATGTACCCGCTGCTTGCATTGTACTTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTGGACTCTCACCAGTGCTTGGCCGGCACTGGGCAGACGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGACCTCTTAATAAAGCTGCCATTTAGAAGCAAGTTAAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCATTCGGTGTTCAACTGAATAACAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTCTTGCTTTGGGAAACCGAGGCAGGAAAATCCCTAGCAGGTTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAGGAAGACTAAGAACACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACAAACCACGACGGAGTGCTCCTAGAAAGGCGCAGGCCGAGGTACCAAAGGCGGCGTGTGGAGCGGGAGTGAAAGAGGCCTCCGGGTGAAGGTAAGTACCTACACCAAAAACTGTAGCCGAAAGGGCTTGTTATCCTACCTTTAGACAGGTAGAAGATTGTGGGAGATGGGCGCGAGAAGCTCCGTCTTGAGAGGGAAAAAAGCAGATGAATTAGAAAGAATTAGGTTACGGCCCAACGGGAAGAAAAGATACAGATTAAAGCATATTGTGTGGGCAGCGAACGAATTGGATAAATTCGGATTAGCAGAGAGCCTGTTGGAATCAAAACAAGGTTGCCAAAAAATTCTTACAGTTCTAGATCCATTAGTGCCGACAGGTTCAGAAAATTTAAAAAGTCTTTTTAATACTGTCTGCGTAGTTTGGTGCATACACGCAGAAGAGAAAGTGAGAGATACTGAAGAAGCAAAACAGATAGTACAGAGACATCTAGCGGCAGAAACAGGAACTGCAGAGAAAATGCCAAATACAAGTAGACCAACAGCACCACCTAGTGGGAAAGGGGGAAACTTCCCCGTACAACAAGTAGCCGGCAACTATACCCATATGCCGCTAAGTCCCCGAACCCTAAATGCTTGGGTAAAATTAGTAGAAGAAAAGAAGTTCGGGGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTCTCAGAAGGCTGCACACCCTATGATATTAACCAAATGCTTAATTGTGTGGGTGACCACCAAGCAGCCATGCAAATAATTAGGGAAATTATCAATGAAGAAGCAGCAGATTGGGATACGCAGCATCCAATACCAGGCCCCTTACCAGCGGGGCAGCTTAGAGAACCAAGAGGATCTGACATAGCAGGGACGACAAGCACAGTAGAAGAGCAGATCCAGTGGATGTTTAGGGCACAAAATCCCGTACCAGTAGGGAACATCTATAGAAGATGGATCCAGATAGGGCTGCAAAAGTGCGTCAGGATGTATAATCCAACCAACATCCTAGACATAAAACAGGGACCAAAGGAATCGTTCCAAAGCTATGTAGATAGATTCTACAAAAGCTTGAGGGCAGAACAGACAGACCCAGCAGTGAAGAATTGGATGACCCAGACACTGCTGGTACAGAATGCCAACCCAGACTGTAAATTAGTACTAAAAGGACTAGGGATGAATCCTACCTTAGAAGAAATGCTAACTGCCTGTCAGGGGGTAGGTGGGCCAGGCCAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCCTAAAAGAGGCCATGGCACCAGTCCCTATCCCATTTGCAGCAGCCCAGCAGAGAAAGACAATCAAGTGCTGGAATTGCGGGAAGGAAGGACACACAGCAAGGCAATGCCGAGCACCTAGGAGACAGGGCTGCTGGAAATGTGGTAAGCTAGGACATATCATGACAAACTGCCCAGATAGACAGGCAGGTTTTTTAGGAATTGGCCCCTGGGGAAAGAAGCCCCGCAACTTCCCCGTGGCCCAAGTTCCGCAGGGGCTAACACCAACAGCACCCCCAGCACCCCCAGTGGATCCAGCAGTGGACCTACTGGAGAAATATATGCAGCAAGGGAAAAAGCAGAAGGAGCAGAGAGAGAGACCATACAAGGAAGTGACAGAGGACTTACTGCACCTCTGGCAGGGAGAGACACCATGCAAGGAGGCGACAGAGGACTCGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAAAAGACCAGTAGTCAGGGCATACATTGAGGGTCAGCCAGTAGAAGCTTTACTAGACACAGGGGCTGACGATTCAATAGTAGCAGGAATAGAGTTAGGGAGCAACTATAGTCCAAAAATAGTAGGGGGAATAGGGGGATTCATAAATACCAAAGAATATAAAAATGCAGAAATAGAAGTACTAGGCAAAAAGGTAAGAGCCACCATAATGACAGGTGATACCCCAATCAACATTTTTGGCAGAAATATTCTGACAGCCTTGGGCATGTCATTAAATCTACCAGTTGCCAAAATAGAACCAATAAAAGTAACACTGAAACCAGGGAAAGATGGACCAAAACTGAGACAATGGCCCTTAACAAAAGAGAAAATAGAAGCACTAAAAGAGATCTGTGAAAAAATGGAAAGAGAGGGCCAGCTAGAGGAAGCACCTCCGACCAATCCTTATAATACCCCCACATTTGTAATCAAGAAAAAGGACAAAAACAAATGGAGGATGCTAATAGATTTTAGAGAACTAAATAAGGTAACTCAAGAATTCACAGAAATCCAGTTAGGAATCCCACATCCAGCAGGATTAGCTAAGAAGAGAAGAATTAGTGTACTGGATGTAGGCGATGCTTACTTTTCCATACCACTACATGAGGACTTTAGACAGTATACTGCATTCACTCTACCATCAGTGAACAATGCAGAACCAGGTAAACGATATATATACAAAGTCTTGCCGCAGGGATGGAAGGGATCACCAACAATTTTTCAATACACAATGAGGCAGGTACTAGAACCATTCAGAAAAGCAAACCCAGATGTCATTATCATTCAGTATATGGATGATATCCTGATAGCCAGCGACAGGACAGATTTAGAACATGACAGAGTAGTCTTGCAGCTAAAGGAACTTCTAAATGGCCTAGGATTTTCTACCCCAGATGAGAAGTTCCAGAAAGACCCTCCATACCAATGGATGGGCTATGAACTGTGGCCAAATAAATGGAAGCTGCAAAAAATACAGTTACCCCAGAAAGAAAAATGGACAGTCAATGACATCCAAAAGCTAGTGGGTGTCCTAAATTGGGCAGCGCAACTCTACCCCGGGATAAAGACCAGACACTTATGTAGGTTAATTCGAGGGAAAATGACACTCACAGAAGAAGTACAGTGGACAGAGTTGGCGGAGGCAGAGCTAGAAGAAAACAAAATTATCTTAAGTCAGGAACAAGAGGGATGCTATTACCAAGAAGAAAAAGAATTAGAAGCAACAGTCCAAAAGGATCAAGACAATCAGTGGACATATAAAATACACCAGGGGGAGAAAGTCCTAAAGGTAGGAAAGTATGCAAAGATAAAAAATACCCATACCAATGGAGTCAGACTGTTAGCACAGGTAGTCCAAAAAATAGGAAAGGAAGCATTAGTCATTTGGGGAAGGATACCAAAATTTCACCTACCAGTAGAGAGAGAAACCTGGGAGCAGTGGTGGGATGACTACTGGCAAGTAACATGGATCCCAGACTGGGATTTTGTATCTACCCCACCACTGGTCAGGTTAGTATTTAACCTGGTAGGGGACCCTATACCAGGTGTAGAAACCTTCTACACAGATGGATCCTGCAATAGGCAATCAAAAGAAGGAAAAGCAGGATATATAACAGATAGAGGGAGAGACAAGGTGAGGATGTTAGAGCAGACTACCAATCAGCAAGCAGAACTAGAAGCCTTTGCAATGGCACTGACAGACTCAGGTCCAAAAGTCAATGTTATAGTAGACTCACAGTATGTAATGGGAATAGTGGCAGGCCAACCAACAGAATCAGAAAGTAAAATAGTAAATCAAATCATAAAAGAAATGATAAAAAAGGAAGCAATCTATGTTGCATGGGTCCCAGCCCATAAAGGCATAGGAGGAAATCAGGAAGTAGATCATCTAGTGAGTCAGGGCATCAGACAAGTATTGTTTCTGGAGAAAATAGAACCCGCTCAGGAAGAACATGAAAAATATCATAGCAATGTAAAAGAACTATCCCATAAATTTGGATTACCCCAACTGGTAGCAAGACAAATAGTAAACACATGTGCCCAATGCCAACAGAAAGGGGAGGCTATACATGGGCAAGTAAATGCAGAATTAGGCACTTGGCAAATGGACTGCACACACTTAGAAGGAAAAATCATTATAGTGGCAGTACATGTTGCAAGTGGGTTTATAGAAGCAGAAGTTATCCCACAGGAATCAGGAAGGCAAACAGCACTCTTCCTATTAAAGCTGGCTAGTAGATGGCCAATAACACACTTGCACACAGATAATGGTGCCAACTTCACTTCACAGGAAGTGAAGATGGTAGCATGGTGGGTAG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| 79,111
|
KY025541.1
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Yamaguchi,J., Brennan,C.A., Alessandri-Gradt,E., Plantier,J.C., Cloherty,G.A., Berg,M.G., Plantier,J.-C.
|
Abbott Labs, 09-NC, Infectious Diseases Research and Virus Discovery
|
USA
|
2016-12-14
|
LA40
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,334
|
GenBank
| 1
| null | null |
Homo sapiens
| null |
1996-02-14
| null | null |
HIV-2 isolate LA40, complete genome
|
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| 79,112
|
KY025543.1
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Yamaguchi,J., Brennan,C.A., Alessandri-Gradt,E., Plantier,J.C., Cloherty,G.A., Berg,M.G., Plantier,J.-C.
|
Abbott Labs, 09-NC, Infectious Diseases Research and Virus Discovery
|
USA
|
2016-12-14
|
LA42
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,306
|
GenBank
| 1
|
Senegal
|
Senegal
|
Homo sapiens
| null |
2001-06-12
| null | null |
HIV-2 isolate LA42 from Senegal, complete genome
|
TGGAAGGGATGTTTTACAGTGAGAGAAGACATAGAATCTTAGACATATACTTAGAAAGGGAAGAAGGGATAATTGCAGATTGGCAGAATTATACTTATGGGCCAGGAGTAAGATACCCAATGTTCTTTGGATGGCTATGGAAGCTGGTACCAGTAGAGGAGGCGGAGAGCAGTGACACCCACTGCTTGTTACACCCAGCACAAACAAACAAGTATGATGACCCACATGGAGAAACACTAGTGTGGGTGTTTGACTCCAGGCTGGCTTATGAGTACACGGCCTTTAATAAATACCCAGAGGAATTTGGGCATAAGTCAGGCATGCCAGAAGAAGAGTGGAAGGCAAAACTGAAAGCAAGAGGGATACCATATAGTTAAAGGCAGGAACAGCTATATTTGGTCAGGGCAGGAAGCAACTGCTGAAAACAGCTGAGACTGCAGGGACTTTCCAGTAGGGGCTGTAACCAGGGGAGGGACATGGGAGGAGTTGGTGGGGAACGCCCTCATACCTTCTGTATAAATGTACCCGCTGCTTGCCTTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATCGAGCCCTGAGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTGGACTCTCACCAGTGCTTGGCCGGCACTGGGCAGACGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGACCTCTTAATAAAGCTGCCAATTAGAAGCAAGTTAAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCATTCGGTGTTCACCTGAGTAACAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTCTTGCTTTGGGAAACCGGAGCAGGAAAATCCCTAGCAGGTTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGAAGACTGAAAAGCCTTGGAACACGGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACAAACCACGACGGAGTGCTCCTAGAAAGGCGCGGGCCGAGGTACCAAAGGCGGCGTGTGGAGCGGGAGTGAAGAGGCCTCCGGGTACAGGTAAGTACCTGTACCAAAAACTGTAGCCAGAGAAGGCTTGTTATCCTACCTTTAGACAGGTAGAAGATTGTGGGAGATGGGCGCGAGAAGCTCCGTCCTGAGAGGGAAAAAGCTAGATGAATTAGAAAAAATTAGGTTACGGCCCAACGGAAGGAAAAGGTACCGCTTAAAACATATTGTGTGGGCAGCGAACGAATTGGACAGATTCGGATTAGCAGAGAGCCTGTTGGAAACAAAAGAAGGTTGCCAAAAAATTATTTCGGTTTTAGATCCATTAGTGCCAACGGGGTCAGAAAATTTAAAGAGCCTCTTTAATACTGTCTGCGTCATTCGGTGCATACACGCAGAAGAGAAAGTGAAAGATACTGAGGAAGCAAGACAAATAATAAGGAGACATCTAGCGGCAGAAGCAGGAACTGCAGAGAAAATGCCGAGCACAAGTAGACCAACAGCACCACCTAGCGGGAACTTCCCCGTACAACAGATAGCTGGCAATTACACCCATGTGCCGCTGAGCCCCCGAACCTTAAATGCTTGGGTAAAATTAGTAGAAGAAAAGAAGTTCGGGGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTCTCAGAAGGCTGCACGCCCTATGATATTAATCAAATGCTTAATTGTGTGGGCGACCATCAAGCAGCTATGCAAATAATTAGGGAGATCATTAATGAAGAAGCAGCAGACTGGGATGTTGCACATCCCATACCAGGCCCCCTGCCAGCAGGACAGCTTAGAGAACCACGGGGGTCTGACATAGCAGGGACAACAAGCACAGTAGAGGAACAGATCCAGTGGATGTTTAGGGCACAAAATCCTGTACCCGTAGGAAACATCTATAGGAGATGGATCCAAATAGGGCTGCAAAAATGTGTCAGGATGTACAATCCAACCAACATCCTAGACATAAAACAGGGACCAAAAGAATCGTTCCAGAGCTATGTAGATAGGTTCTACAAAAGCTTGAGGGCAGAACAAACAGATCCAGCAGTGAAGAATTGGATGACCCAAACACTGCTAGTACAGAATGCCAACCCAGACTGTAAACTGGTACTAAAGGGACTAGGGATGAATCCCACCTTAGAGGAAATGCTAACCGCCTGTCAAGGGGTAGGTGGACCAGGCCAGAAGGCCAGGCTAATGGCGGAGGCCTTAAAAGAGGCCATGACACCAGCCCCTATCCCATTTGCAGCAGCACAGCAGAGAAAGGCAATTAAATGCTGGAATTGTGGAAAGGAGGGGCACTCGGCAAGACAATGCCGAGCACCTAGAAGACAGGGCTGCTGGAAATGTGGCAAGCCAGGACACATCATGGCAAATTGTCCAGATAGACAGGCTGGTTTTTTAGGGTTTGGCCCATGGGGAAAGAAGCCCCGCAACTTCCCCATGGCCCAAGTCCCGCAGGGGATAACACCAACAGCGCCCCCAATGGATCCAGCAGTGGATCTGCTGGAGAAATACATGCAGCAAGGGAAGAAGCAGAGAGAGCAGAGGCAGAGACCATACAAAGAAGTGACAGAGGACCTGTTGCACCTCGAGCAGGGGGAGACACCATGCAGGGAGGCGACAGAGGATTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAAAAGACCAGTAGTCACAGCACACATTGAGGGTCAGCCAGTAGAAGTTTTACTAGACACGGGAGCTGACGACTCAATAGTAGCAGGAATAGAGTTAGGGAGTGATTATAGTCCAAAAATAGTAGGGGGAATAGGGGGATTCATAAATACCAAGGAATATAAAAATGTAGAAATAAAAGTCCTAAACAAAAGGGTAAGAGCCACCATAATGACAGGTGATACCCCAATCAACATTTTTGGCAGAAACATTCTGACAGCCTTAGGCATGTCATTAAATCTACCGGTTGCCAAGATAGAACCAATAAAAGTAACACTGAAACCAGGGAAAGATGGACCAAGATTGAGGCAATGGCCATTAACGAAAGAAAAGATAGAGGCACTAAAAGAGATCTGTGAGAAAATGGAAAAAGAAGGCCAACTAGAGGAAGCACCTCCGACTAATCCTTATAATACCCCCACATTTGCAATGAGAAAAAAGGACAAAAACAAATGGAGGATGCTAATAGATTTTAGGGAACTAAACAAGGTAACTCAAGACTTCACAGAAATCCAGTTAGGAATTCCACACCCAGCAGGGTTAGCTAAAAAGAGAAGGATTACTGTACTAGATGTAGGAGATGCTTACTTTTCCATACCACTGCATGAAGATTTTAGGCAGTATACTGCATTTACTCTACCATCAGTAAACAATGCAGAGCCAGGAAAAAGATACATATACAAGGTCTTGCCACAGGGATGGAAAGGATCACCAGCAATTTTTCAATACACAATGAGGCAGGTTTTAGAACCATTCAGGAAAGCAAACCCAGATGTCATTATCATTCAGTACATGGATGACATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGATTTAGAACATGACAGAGTGGTCCTGCAGCTAAAGGAACTTCTAAATGGCCTAGGATTTTCCACCCCAGAGGAGAAGTTCCAAAAAGACCCTCCATACCAATGGATGGGCTATGAACTGTGGCCAACCAAATGGAAGCTGCAGAAGATACAACTGCCTCAAAGAGAAGTATGGACAGTCAATGACATCCAAAAACTAGTAGGTGTCCTAAATTGGGCAGCACAAATTTACCCAGGGATAAAGACCAAGCACTTATGTAGGCTAATCAGAGGAAAAATGACACTCACAGAAGAAATACAGTGGACAGAATTAGCAGAAGCAGAGCTAGAAGAAAACAAAATTATCTTAAGCCAGGAACAAGAGGGACACTATTACCAAGAGGAAAAAGAGTTAGAAGCAACAGTCCAAAAGGATCAGGACAATCAATGGACATATAAAGTACACCAGGGAGAAAAAATTCTGAAAGTAGGCAAATATGCAAAGATAAAAAACACCCATACCAATGGGGTCAGATTGTTAGCACAGGTAGTTCAGAAAATAGGAAAGGAAGCACTAGTCATTTGGGGACGAATACCAAAATTTCATTTGCCAGTAGAAAGAGAGACCTGGGAACAGTGGTGGGATGACTATTGGCAAGTGACATGGATCCCAGAATGGGACTTTGTGTCTACCCCACCACTGGTCAGGTTAGCATTTAACCTGGTAAAAGATCCTATACCAGGCGCAGAGACCTTCTACACAGATGGGTCCTGCAATAGACAATCAAAAGAAGGGAAAGCAGGATACATAACAGATAGGGGAAAGGACAAGGTAAGGGTATTAGAGCAAACTACCAATCAGCAAGCAGAATTAGAAGCCTTTGCAATGGCAGTAACAGACTCAGGTCCAAAAGTCAATATTATAGTAGATTCACAGTATGTAATGGGAATAGTAGCAGGCCAGCCAACAGAATCAGAAAGTAAAATAGTAAATAAAATCATAGAAGAAATGATAAAAAAGGAAGCAATCTATGTTGCATGGGTCCCAGCCCACAAAGGCATAGGAGGGAATCAGGAAGTAGATCATTTAGTAAGTCAGGGCATCAGACAAGTATTATTCCTAGAAAAAATAGAGCCTGCTCAGGAAGAACATGAAAAATATCATAGCAATGTAAAAGAACTATCCCATAAGTTTGGGTTGCCCAAACTGGTAGCAAGACAAATAGTAAACACATGTGCCCAGTGTCAACAGAAAGGGGAAGCTATACATGGGCAAGTAAATGCAGAATTAGGCACCTGGCAAATGGACTGCACACACTTAGAAGGAAAAATCATTATAGTGGCAGTACATGTTGCAAGTGGGTTTATAGAAGCAGAAGTCATCCCACAGGAATCAGGAAGACAAACAGCACTCTTCCTGTTAAAACTGGCCAGTAGGTGGCCAATAACACACTTGCACACAGATAATGGTGCCAACTTCACTTCACAGGAGGTAAAGATGGTAGCATGGTGGATAGGTATAGAACA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| 79,113
|
KY025544.1
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Yamaguchi,J., Brennan,C.A., Alessandri-Gradt,E., Plantier,J.C., Cloherty,G.A., Berg,M.G., Plantier,J.-C.
|
Abbott Labs, 09-NC, Infectious Diseases Research and Virus Discovery
|
USA
|
2016-12-14
|
LA43
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,277
|
GenBank
| 1
| null | null |
Homo sapiens
| null |
1998-02-02
| null | null |
HIV-2 isolate LA43, complete genome
|
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| 79,114
|
KY025545.1
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Yamaguchi,J., Brennan,C.A., Alessandri-Gradt,E., Plantier,J.C., Cloherty,G.A., Berg,M.G., Plantier,J.-C.
|
Abbott Labs, 09-NC, Infectious Diseases Research and Virus Discovery
|
USA
|
2016-12-14
|
LA44
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,312
|
GenBank
| 1
| null | null |
Homo sapiens
| null |
2000-07-20
| null | null |
HIV-2 isolate LA44, complete genome
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| 79,115
|
KX174311.1
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Hora,B., Chen,Y., Denny,T.N., Gao,F., Denny,T.
|
DHVI, Medicine
|
USA
|
2016-05-29
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DE20189CI001
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,301
|
GenBank
| null |
Cote d'Ivoire
|
Cote d'Ivoire
|
Homo sapiens
| null |
1989
| null | null |
HIV-2 isolate DE20189CI001 from Cote d'Ivoire, complete genome
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| 81,877
|
KX174312.1
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Hora,B., Chen,Y., Sugiura,W., Denny,T.N., Gao,F., Denny,T.
|
DHVI, Medicine
|
USA
|
2016-05-29
|
DE20107NG002
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,272
|
GenBank
| null |
Nigeria
|
Nigeria
|
Homo sapiens
| null |
2007
| null | null |
HIV-2 isolate DE20107NG002 from Nigeria, complete genome
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| 81,878
|
KX174313.1
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Hora,B., Chen,Y., Sugiura,W., Denny,T.N., Gao,F., Denny,T.
|
DHVI, Medicine
|
USA
|
2016-05-29
|
DE20108JP005
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,217
|
GenBank
| null |
Japan
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2008
| null | null |
HIV-2 isolate DE20108JP005 from Japan, complete genome
|
ACTGGAAGGGATTTTTTATAGTGAGGAAAGACATAGGATATTAGATACATACTTTGAGAATGAGGAAGGTATAGTCTCTGGATGGCAGAACTACACACATGGGCCAGGGGTAAGATATCCAAAGTGCTTTGGCTGGCTGTGGAAGCTAGTACCAATAAATGTGACAGCAGCAACCCAGGAGGAGGAGGAGACACATTGTCTAGTGCACCCAGCACAAACCTCTGCATGGGATGACCCCCATGGGGAGACTCTTGTCTGGCAGTTTGATCCCCTCCTGGCATATTCATATGAGGCCTTCAACAGGTTCCCAGAAGAGTTTGGGTATCAGTCAGGATTACCAGAGGAGGAATGGAAGGCGAGACTGAAAGCAAGAGGCATACCTACAGAGTAGACAGGAAAACAGCAGCATAAAGGGGAACTAGCTGGCACTGCATAAGAAAGGAAACTGGCTAACACTGCAGGGACTTTCCAGAAGGGGCTGTAACAGTGGGAGGGACATGGGAGGAGTTGGTGGGGAACGCCCATTAATTCTCTGTATAAATGTACCCGCTTCTTGCATTGTATTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGCACTTGGCCGGTGCTGGGCAGACGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAACCCTCTTAATAAAGCTGCCTATTAGAAGCAAGTCAAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTGGTCGCCGCCTGGTCATTCGGTGTCCAGCTTTAGGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTCTTGCTTTGGGAAACCTAAGCAGGAAAATCCCTAGCAGGTTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAGAAGAGTGAGAGTCTTCGGGACACAGCTGAGTGAAGGCAGTAAGGGCGGCAGGAATCAACCACGACGGAGCGCTCCTGTAAAGGCGCAGGCGGGTACCAAGCAGCGTGAGGAGCGAGAGGATAAGAGGCCTCTGGGAGTAAGGTAAGTACTCCAAAAATTTTGAATTGTCTACTCTAGAGGAGAGTAGGACATAAGTGGGAGATGGGCGCGAGAAGCTCCGTCCTGTCAGGGAAAAAGACAGATGAATTAGAAAAAGTTAGGTTACGGCCCGGCGCAAGGAAAAGGTACATGTTGAAACATGTAATATGGGCAGCAAATGAATTAGACAGATTTGGATTAGCAGAAAGCCTGTTGGAAACAAAAGAAGGATGTCAGAAAATTCTTACGGCCTTAGCTCCATTAATGCCAACAGGGTCAGAAAATGTAAAAAGCCTTTTTAATACTGTCTGCGTCATTTGGTGCTTGCACGCAGAAATGAAAGTGAAAGATACTGAGGAAGCAAAAAAGTTAGCACAGAGCCATCTAGCGGCAGCCACTGAAAAAGCACCAACTGCAGATAAACCAGCAGCGACATCTAGTGGCGGAAACTACCCAGTGCAACAAGTAGCTGGCAATTATGTCCATGTGCCACTAAGTCCCCGAACCCTAAATGCCTGGGTAAAATTAGTGGAAGAAAAGAAGTTCGGGGCAGAGATAGTACCAGGATTTCAGGCACTATCAGAGGGATGTACCCCTTATGACATCAATCAAATGCTAAATTGTGTAGGAGAACATCAGGCAGCCATGCAAGTCATTAGAGAAATAATCAATGAAGAGGCTGCAGACTGGGACCAGCAGCACCCGATACCGGGTCCACTGCCAGCAGGACAACTTAGAGACCCCAGAGGATCAGATATAGCGGGAACCACCAGCACAGTAGAGGAACAAATACAGTGGATGTACAGGGGTCAAAATTCCGTCCCAGTAGGGAACATTTATAGAAGATGGATTCAATTAGGATTGCAGAAATGTGTCAGGATGTACAATCCTACTAATATACTAGATGTAAAACAAGGGCCAAAAGAACCCTTCCAAAGCTATGTAGATAGATTCTACAAAAGCTTACGGGCAGAACAAACAGACCAGGCCGTGAGAGCATGGATGACAGAGACATTGCTGATCCAGAATGCTAACCCAGATTGCAAGCTAGTACTCAAGGGTCTGGGGCCACACCCCACCCTAGAGGAAATGCTGACGGCCTGCCAAGGGATAGGAGGCCCAGGGCAGAAAGCGAGATTAATGGCTGAGGCTTTAAAAGAAGCCTTAACGCCTGCACCCATACCATTCGCTGCTGCTCAACAGAAGGCAGGAAAGAGAGGGACATTGACATGCTGGAACTGTGGCAAAGGGGGACATACAGCCAGGCAATGCAGGGCCCCTAGAAGACAGGGGTGCTGGAAATGTGGAAAAACAGGACACAACATGGCAAATTGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGGTTTGGACCCTGGGGAAAGAAGCCTCGCAACTTCCCCGCGGCCCAAGTGCCTCAGGAGGTGGTGCCATCTGCACCCCCGATGGAAACAGCAGAGAGCAAGACATATCAGAGGGCGACACCATCTGCGCCCCCTGCAGATCCAGCAGTGGAGATGCTAAAGAACTACATGCAACTGGGGAGGCAACAGAGAGAGAAGCAAGAGAGACCCTACAAGGAGGTGACAGAGGACTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAGAAGACCAGTAGTCCAAGCATATATCGAGGGTCAGCCAGTAGAAGTACTACTAGACACAGGGGCTGACGACTCAATAGTAGCAGGGATAGAATTAGGAAGCAATTACACCCCAAAAATAGTAGGAGGGATAGGAGGGTTCATAAATACTAAAGAATACAAAGACATAGAAATAGAAGTAGTAGGAAAAAAGGTAAGAGCAACTATAATGACAGGAGACACCCCAATAAATATTTTTGGCAGAAATATCTTAAGTGCCTTAGGCATGAGTCTAAATTTCCCAATGGCAAAATTAGAGCCAGTGAAGGTCCAGTTAAAGCCTGGAAAGGACGGACCAAAAATCAGACAATGGCCACTATCTAAGGAGAAGATACTGGCCCTTAGAGAGATCTGTGAAAAAATGGAAAAGGAGGGGCAACTAGAAGAAGCACCTCCTACTAATCCATACAACACACCCACCTTCGCTGTAAGAAAAAAGGATAAAAACAAATGGAGAATGCTAATAGACTTCAGGGAATTAAATAAGGTAACCCAAGACTTTACAGAAGTCCAACTAGGTATTCCCCACCCAGCAGGATTGGCAGAAAGAAGGAGAATATCAGTGCTAGATGTAGGAGATGCCTACTTCAGTGTCCCACTAGATCCAGACTTCAGACAATATACAGCATTCACTTTACCATCAATAAATAATGCAGAGCCAGGAAAAAGGTACATTTACAAGGTCCTACCACAGGGATGGAAGGGATCCCCAGCAATCTTTCAACACACCATGAGAAAGGTACTAGACCCCTTCAGAAAGGCCAACAATGATGTCACCATAATCCAGTACATGGATGACATCCTTGTGGCAAGTGATAGAAGTGATTTAGAGCATGATAGAGTAGTATCTCAACTAAAAGAGTTGCTAAATGACATGGGATTTTCCACCCCAGAAGAGAAGTTCCAAAAGGACCCCCCATTCCAGTGGATGGGTTATGAGCTCTGGCCAAAAAAGTGGAAGCTGCAAAAAATACAAATACCAGAAAGGGAGGTTTGGACAGTAAATGACATTCAGAAACTAGTGGGAGTACTAAACTGGGCAGCTCAACTCTTCCCAGGAATCAAAACAAAACACATATGCAGACTGATCAGGGGAAAGATGACCCTGACAGAAGAGGTGCAGTGGACAGAACTAGCAGAGGCAGAGATGCAGGAAAACAAAATCATCCTGGAACAGGAACAGGAGGGATCCTATTACAAAGAAGGAGTACCTCTAGAAGCAACAGTGCAGAAAAACTTAGCAAACCAGTGGACATACAAAATTCATCAGGGAGATAAAATCCTAAAAGTAGGAAAATATGCAAAGGTCAAAAACACCCACACCAATGGAGTGAGAATACTAGCACATGTAATCCAAAAAATAGGAAAAGAAGCATTGGTTATTTGGGGACAAATACCAATGTTCCATTTGCCAGTAGAAAGAGAAACATGGGACCAATGGTGGACAGATTACTGGCAAGTAACTTGGATCCCAGAATGGGACTTTGTCTCAACCCCACCATTGGTAAGACTAGCCTACAACCTGGTCAAGGACCCCCTAGAAAAGGTAGAAACCTTCTACACAGATGGGTCCTGCAACAGAGTCTCAAAAGAAGGGAAGGCAGGGTATATCACAGACAGGGGAAGAGACAGGGTTAAACCATTAGAGCAGACAACAAACCAACAAGCAGAACTTGAGGCGTTTGCACTGGCACTACAGGATTCAGGGCCACAAGTCAATATCATAGTAGATTCACAATATGTCATGGGGATAATAGCCGGACAGCCAACAGAAACAGAATCATCAATAGTAAATAGAATAATTGAAGAAATGATCAAAAAGGAAGCAGTATATGTAGGATGGGTGCCAGCTCACAAAGGACTAGGTGGTAATCAGGAAGTAGACCACCTAGTAAGTCAAGGAATTAGACAAGTTCTATTTCTAGAAAAGATAGAACCAGCACAAGAAGAACATGAAAAATATCATGGCAATGTAAAAGAACTAGTTCATAAATTTGGACTTCCACACCTAGTGGCAAAACAAATAGTAAACTCCTGTGATAAATGTCAACAAAAAGGAGAAGCTATTCATGGACAGGTAAATGCAGAACTAGGGACATGGCAAATGGACTGTACACATTTAGAAGGAAAAATCATAATAGTAGCAGTCCATGTAGCCAGTGGATTCATAGAAGCAGAAGTAATACCCCAAGAGACAGGAAGACAAACAGCCCTCTTCCTGTTGAAGCTGGCAAGCAGATGGCCCATCACACACCTGCACACAGACAATGGTGCCAACTTTACCTCACAAGACGTAAAAATGGTGGCCTGGTGGGTAGGAAT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| 81,879
|
KU168287.1
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Berg,M.G., Yamaguchi,J., Alessandri-Gradt,E., Tell,R.W., Plantier,J.C., Brennan,C.A., Plantier,J.-C.
|
Abbott Labs, 09-NG
|
USA
|
2016-01-14
|
LA36GomM
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,364
|
GenBank
| 1
| null | null |
Homo sapiens
| null |
2002
| null | null |
HIV-2 isolate LA36GomM, complete genome
|
AAGGGATGTTTTACAGTGAGAGAAGACATAGGATTCTAGACATATACTTAGAAAAGGAGGAAGGGATAATTCCAGATTGGCAGAATTATACTCATGGGCCAGGAATAAGATACCCAATGTTCTTTGGGTGGCTGTGGAAGCTAGTGCCAGTAGACCTCCCAGAAGAGGGAGAGGATACTCACTGCTTAATGCACCCAGCACAAAAAAGGAGGTTTGATGACCAGCATGGGGAAACATTAGTCTGGAGGTTTGACCCCATGCTGGCCTATGATTACACAGCCTTCAAACTGTTCCCAGAGGAGTTTGGGCACAAGTCAGGTCTACCAGAAGAGGAATGGAAGGCGAAACTAAAAGCAAGGGGAATTCCATTCAGCTAAAAACAGGAACAGCTATATATGGTCTGGGCAGGAAGTAACTGCTAGAAACAGCTGAGACTGCAGGGACTTTCCAGAAGGGGCTGTAACCATGGGAGGGACATGGGAGGAGCTGGTGGGGAACGCCCTCATACTTTCTGTATAAATGTACCCGCTCTTGCATTGTATTTCAGTCGCTCTGCGGAGAGGCTGGCAGATTGAGCCCTGGGAGGTTCTCTCCAGCACTAGCAGGTAGAGCCTGGGTGTTCCCTGCTAGACTCTCACCAGTGCTTGGCCGGCACTGGGCAGACGGCTCCACGCTTGCTTGCTTAAAGACCTCTTAATAAAGCTGCCAATTAGAAGCAAGTTAAGTGTGTGCTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCATTCGGTGTTCACCTGAGTAACAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTCTTGCTTTGGGAAACCGAGGCAGGAAAATCCCTAGCAGGTTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGAAGACTGAAAAGCCTTGGAACACGGCTGAGTGAGGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACAAACCACGACGGAGTGCTCCTAGAAAAGCGCGGGCCGAGGTACCAAAGGCGGCGTGTGGAGCGGGAGTCAAAGAGGCCTCCGGGTGAAGGTAAGTACCTACACCAAAAACTATAGCCAAGAGGGCTAGTTATCCTACCTTTAGACAGGTAGAAGAATTGTGGGAGATGGGCGCGAGAAACTCCGTCTTGCGAGGGAAAAAAGCAGATGAATTAGAAACAATTAGGTTACGGCCCGGCGGGAAGAAAAAGTACAGACTAAAACATATTGTGTGGGCAGCGAATGAATTGGACAGATTCGGATTAGCAGAGAACCTGTTGGAGTCAAAAGAGGGTTGCCAAAAAATTATTACAGTTTTAGATCCATTAGTACCGACAGGTTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTTTAATACTGTCTGCGTCATTTGGTGCATACACGCAGAAGAGAAAGTGAAAGACACTGAAGCAGCAAAAAAGATAGTGCAGAGACATCTAGCGGCAGAAACAGAAACTGCAGAGAAAATGCCAAATACAAATAGACCAACAGCACCACCTAGCGGGAAAGGAGGAAATTACCCCGTGCAAAGCATAGCTGGCAATTACACCCACGTGCCGCTAAGTCCCCGAACCCTAAATGCTTGGGTAAAATTAGTGGAAGAAAAGAAGTTCGGGGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTCTCAGAAGGCTGCACGCCCTATGATATTAACCAAATGCTTAATTGTGTGGGCGACCATCAAGCAGCCATGCAAATAATCAGAGAAATTATTAATGAAGAAGCAGCAGACTGGGATACGCAACATCCAATACCAGGCCCCTTACCAGCAGGGCAGCTTAGGGAACCAAGAGGGTCTGACATTGCAGGGACAACAAGCACAGTGGAAGAACAGATCCAGTGGATGTTTAGAGCACAAAACCCTGTACCAGTAGGAAACATCTATAGAAGATGGATCCAGATAGGGTTGCAGAAGTGTGTCAGGATGTACAATCCAACCAACATCCTAGACATAAAACAGGGACCAAAAGAATCATTCCAGAGCTATGTAGATAGATTCTACAAGAGCCTGAGGGCAGAGCAAACAGATCCAGCAGTGAAGAATTGGATGACACAGACACTGCTGATACAAAATGCTAACCCAGACTGTAAGCTAGTGCTAAAAGGACTGGGAATGAACCCCACCTTAGAAGAAATGCTAACCGCCTGTCAGGGGGTAGGTGGGCCAGGCCAGAAGGCTAGATTAATGGCAGAAGCCTTAAAGGAGGCCATGGCACCAGCCCCTATCCCATTTGCAGCAGCCCAGCAGAGAAGGGCAATTAAGTGCTGGAATTGTGGAAAGGAGGGACACTCAGCAAGACAGTGCCGAGCACCTAGAAGACAGGGCTGCTGGAAGTGTGGTAAGCCAGGACATGTTATGGCAAATTGCCCAGACAGACAGGCGGGTTTTTTAGGAATTGGCCCTTGGGGAAAGAAGCCCCGCAACTTCCCCGTGGCCCAAGTTCCGCAGGGGCTAACACCAACAGCACCCCCAATAGATCCAGCAGTAGACCTACTGGAGAAATATATGCAGCAAGGGAGAAGGCAGAGGGAGCAGAGAGAGAGACCATACAAGGAAGTGACAGAGGACTTACTGCACCTCGAGCAGGGGGAGACACCATGCAGGGAGGCGACAGAGGACTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAAAAGACCAGTAGTCACAGCACACATTGAAGGTCAGCCAGTAGAAGTTTTGCTAGACACAGGGGCTGACGACTCAATAGTAGCAGGAATAGAGTTAGGGAGCAATTATAGTCCAAAAATAGTAGGGGGAATAGGGGGATTCATAAATACCAGGGAATATAAAAATGTAGAAATAGAAGTTCTAAGTAAAAGAGTAAAGGCCACTATAATGACAGGTGATACCCCAATCAACATTTTTGGCAGAAATATTCTGACAGCCTTAGGCATGTCATTAAATCTACCAGTTGCCAAGGTAGAACCAATAAAAGTAATGCTAAAGCCAGGAAAAGATGGACCGAAACTGAGACAGTGGCCCTTATCAAGAGAAAAGATAGAAGCACTAAAAGAGATCTGTGAAAAAATGGAGAGAGAAGGCCAGCTAGAGGAAGCACCTCCAACTAACCCTTATAATACCCCCACATTTGCAATCAGGAAGAAGGACAAAAACAAATGGAGGATGCTAATAGATTTCAGAGAGCTAAACAAGGTAACTCAAGATTTCACAGAAATTCAGTTAGGAATTCCACACCCAGCAGGGTTGGCTAAGAAGAGAAGAATCACTGTACTAGATGTAGGGGATGCTTACTTCTCCATACCACTAGATAAAGATTTTAGGCAGTACACTGCATTTACTTTACCATCAGTGAACAATTCAGAACCAGGAAAAAGATATATATATAAAGTCTTGCCACAAGGATGGAAGGGATCACCAGCAATTTTCCAACACACAATGAGGCAGATTTTAGAACCATTCAGAAAGGCAAACCAGGATGTCATTATCATTCAGTACATGGATGATATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACCTAGAGCATGACAGAGTAGTCCTGCAACTAAAGGAACTCCTAAATGGCCTAGGGTTTTCTACCCCAGATGATAAGTTCCAAAAAGACCCTCCATACCGCTGGATGGGCTATGAACTATGGCCAACTAAATGGAAGTTGCAGAAAATACAGTTGCCTCAAAAAGAAGTATGGACAGTCAATGACATCCAAAAGCTAGTGGGTGTCCTAAATTGGGCAGCACAAATCTACCCAGGAATAAAGACAAAACACTTATGCAGGTTAATTAGGGGAAGAATGACACTCACAGAAGAAATACAGTGGACAGACTTAGCAGAGGCGGAACTAGAAGAAAACAGAATTATCTTAAGCCAGGAACAAGAGGGACACTATTACCAGGAAGAAAAGGAATTAGAAGCAACAGTCCAGAAGGATCAAGACAATCAGTGGACATATAAGGTACACCAGGGAGACAAAATTCTAAAAGTAGGCAAATATGCAAAGGTAAAAAATACCCATACCAATGGAGTCAGATTGTTAGCACAGGTAGTTCAGAAAATAGGAAAAGAGGCTCTAGTCATTTGGGGACGGATACCAAAATTTCACTTACCAGTAGAGAGAGAAACCTGGGAGCAGTGGTGGGACAACTATTGGCAGGTGACATGGATCCCAGAATGGGACTTCGTGTCCACCCCACCACTGGTCAGGCTAGCATTCAACCTAGTAGGAGACCCCATACCAGGCGCAGAGACTTTCTACACAGATGGATCCTGCAATAGACAGTCAAAAGAAGGAAAAGCAGGATATGTAACAGATAGAGGGAGAGACAAGGTAAAGGTACTAGAGCAAACTACCAATCAACAAGCAGAATTAGAAGCCTTTGCAATGGCACTAACAGACTCAGGTCCAAAAGCTAATATTATAGTAGACTCACAATATGTAATGGGAATAGTGGCAGGCCAACCAACAGAATCGGAAAGCAGAATAGTAAATCAAATCATAAAAGAGATGATAAAAAAGGAAGCAATCTATGTTGCGTGGGTCCCAGCCCACAAAGGCATAGGAGGAAATCAGGAGGTAGACCATTTAGTGAGTCAAGGCATCAGACAAGTATTGTTCCTGGAGAAAATAGAGCCCGCTCAGGAAGAACATGAAAAATATCATAGCAATGTAAAAGAACTGTCCCATAAATTTGGAATACCCAACCTAGTAGCAAGACAGATAGTAAACACATGTGCCCAATGCCAACAGAAAGGGGAAGCTATACATGGGCAAGTAAATGCAGAATTAGGCACTTGGCAGATGGACTGCACACATTTAGAGGGAAAAGTCATTATAGTAGCAGTACATGTTGCAAGTGGATTTATAGAGGCAGAAGTCATTCCACAGGAAACAGGAAGGCAAACAGCACTCTTCCTGTTAAAACTGGCTAGCAGATGGCCAATAACACACCTGCACACAGATAATGGTGCCAACTTCACCTCACAGGAAGTGAAGATGGTGGCATGGTGGGTAG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| 84,188
|
KU179861.1
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Ham,C., Morris,C., Berry,N.
|
NIBSC, Virology
|
United Kingdom
|
2015-12-07
|
CAM2
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 9,496
|
GenBank
| 1
|
Guinea-Bissau
|
Guinea-Bissau
|
Homo sapiens
| null |
1987
| null | null |
HIV-2 isolate CAM2 from Guinea-Bissau, complete genome
|
AGTTAAGTGTGTGTTCCCATCTCTCCTAGTCGCCGCCTGGTCATTCGGTGTTCACCTGAATAACAAGACCCTGGTCTGTTAGGACCCTTCTTGCTTTGGGAAACCAAGGCAGGAAAATCCCTAGCAGGTTGGCGCCCGAACAGGGACTTGAAGAAGACTGAAAAGCCTTGGAACACGGCTGAGTGAGGGCAGTAAGGGCGGCAGGAACAAACCACGACGGAGTGCTCCAGTAAAGGCGCAGGCCGAGGTACCAAAGGCGGCGTGTGGAGCGGGAGTCAAGAGGCCTCCGGGTGAAGGTAAGTACCTACACCAAAAANCTGTAGCCTGAAAGGGCTTGTTATCCTACCTTTAGACAGGTAGAAGATTGTGGGAGATGGGCGCGAGAAACTCCGTCTTGAGAGGGAAAAAAGCAGACGAATTAGAAAAAGTTAGGTTACGGCCCGGCGGAAAGAAAAAATACAAGTTAAAACATATTGTGTGGGCAGCGAATGAATTGGACAGATTCGGATTAGCAGAGAGCCTGTTGGAATCAAAAGAAGGTTGCCAAAAAATTCTTAAAGTTTTAGATCCATTAGTACCGACAGGTTCAGAAAATTTAAAAAGCCTTTTTAATACTGTCTGCGTCATATGGTGCATACACGCAGAAGAGAAAGTGAAAGATACTGAAGAAGCAAAAAGAATAGCACTGAGACATCTAGCGGCAGAAACAGGAACTGCAGAGAAAATGCCAGATACAAGTAGACCAACAGCACCACCTAGTGGGAAGGGAGGAAATTACCCCGTGCAAAGCATAGGCGGCAACTATACTCATGTGCCGCTAAGTCCCCGAACTCTAAATGCTTGGGTAAAATTAGTAGAGGAAAAGAAGTTCGGGGCAGAAGTAGTGCCAGGATTTCAGGCACTCTCAGAAGGCTGCACGCCCTATGACATTAATCAAATGCTTAATTGTGTGGGCGACCATCAAGCAGCTATGCAAATAATCAGGGAGATTATTAATGAAGAAGCAGCAGACTGGGATGCCAATCATCCAATACCAGGCCCCTTACCAGCGGGGCAGCTCAGAGACCCAAGAGGGTCTGACATAGCAGGAACAACAAGCACAGTAGAAGAACAGATCCAGTGGATGTTTAGGGCACAAAATCCCGTACCAGTAGGGAACATCTATAGAAGATGGATCCAGATAGGGCTGCAGAAGTGTGTCAGGATGTACAACCCGACCAACATCCTAGACATAAAACAGGGACCAAAGGAGTCATTCCAAAGCTATGTAGATAGATTCTACAAAAGCTTGAGGGCAGAACAAACAGATCCAGCAGTAAAAAATTGGATGACCCAAACGCTGCTGGTACAGAATGCCAATCCAGACTGTAAATTAGTGCTAAAGGGATTAGGGATGAATCCTACCTTAGAAGAGATGCTAACCGCCTGTCAAGGAGTAGGTGGACCAGGCCAGAAAGCTAGACTAATGGCAGAAGCCTTAAAGGAGGCCATGGGACCACCCCCTATCCCATTCGCAGCAGCCCAGCAGAGAAGGACGATTAAATGCTGGAATTGTGGGAAGGAGGGGCACTCGGCAAGACAATGCCGAGCACCTAGAAGGCAGGGCTGCTGGAAGTGTGGCAAGCCAGGACACATCATGACAAATTGCCCTGATAGACAGGCGGGTTTTTTAGGGATTGGCCCCTGGGGAAAGAAGCCCCGCAATTTCCCCGTGGCCCAAGTTCCACAGGGGCTAACACCAACAGCACCCCCATTGGATCCAGCAGTGGATCTACTGGAGAAATATATGCAGCAAGGGAAAAGGCAGAGGGAGCAGAGACAGAGACCATACAAAGAGGTGACAGAGGACTTACTGCACCTCGAACAAGGAGAGGCCCCATGCAGGGAGACAACAGAGGACTTGCTGCACCTCAATTCTCTCTTTGGAAAAGACCAGTAGTCACAGCACACATTGAGGGTCAGCCAGTAGAAGTTTTGTTAGACACAGGGGCTGATGACTCAATAGTAGCAGGAATAGAATTAGGGAGCAATTATAGCCCAAAAATAGTGGGGGGAATAGGAGGATTCATAAATACCAAAGAATATAAAAATGTGGAAATAGAAGTTCTAGGTAAAAGGGTAAGGGCCACTATAATGACAGGCGACACCCCAATCAACATTTTTGGCAGAAATATTCTGACAGCCTTAGGCATGTCATTAAATCTACCAGTCGCCAAGATAGAACCAATAAAAATAATGCTAAAGCCAGGAAAAGATGGACCAAGATTGAGACAATGGCCCTTGACAAAAGAAAAAATAGAAGCACTAAAAGAGATCTGTGAAAAAATGGAAAAAGAAGGCCAGCTAGAGGAAGCACCTCCAACTAATCCTTATAATACCCCCACATTTGCAATCAGGAAAAAGGACAAGAACAAATGGAGGATGCTAATAGATTTTAGAGAGCTAAACAAAGTAACCCAAGATTTCACAGAAATCCAGTTAGGAATTCCACACCCAGCAGGATTAGCCAAAAAGAGAAGAATTACTGTACTAGATGTAGGGGATGCTTACTTTTCCATACCATTACATGAAGACTTTAGACAGTACACTGCATTTACTCTACCATCAGTGAACAATGCAGAACCAGGAAAAAGATACATATATAAAGTCTTACCGCAGGGGTGGAAAGGATCACCAGCAATTTTTCAGTACACAATGAGGCAGGTCTTAGAGCCATTCAGAAAAGCAAACTCAGATGTCATTATCATTCAGTACATGGATGATATCTTAATAGCTAGTGACAGGACAGACTTAGAACATGACAAAGTGGTTCTGCAGCTAAAGGAACTTCTAAATAACCTAGGATTCTCTACCCCAGATGAGAAGTTCCAAAAAGACCCTCCATACCGCTGGATGGGCTATGAACTGTGGCCAACTAAATGGAAGTTGCAGAAAATACAATTGCCCCAAAAGGAGGTGTGGACAGTCAATGACATCCAAAAGCTAGTAGGTGTCCTAAATTGGGCAGCACAAATCTACCCAGGGATAAAGACCAAACACTTGTGTAGATTAATTAGAGGAAAAATGACACTCACAGAAGAGGTACAATGGACAAAATTAGCAGAAGCAGAACTAGAAGAAAACAGAATTATCTTAAGCCAAGAACAAGAGGGACACTACTACCAGGAAGAAAAGGAGTTAGAAGCAACAGTTCAAAAGGATCAAGACAATCAGTGGACATATAAGATACACCAGGAAGAAAAAATTCTAAAAGTAGGAAAATATGCAAAAATAAAACATACCCATACCAATGGAGTCAAATTATTAGCACAGGTAGTTCAAAAAATAGGAAAAGAAGCACTAGTCATTTGGGGACGAATACCTAAATTTCACCTACCAGTAGAGAGAGAGGTCTGGGAGCAGTGGTGGGATAACTACTGGCAGGTGACATGGATCCCAGACTGGGACTTCGTGTCTACCCCACCGCTGGTCAGACTAGCATTTAACCTAGTAGGGGATCCTATACCAGGCACAGAGACCTTCTACACAGATGGATCCTGCAATAGGCAATCAAAAGAAGGAAAAGCAGGATATGTAACAGATAGAGGAAGAGACAAGGTAAAAATACTAGAGCAAACTACCAATCAGCAAGCAGAGTTAGAAGCCTTTGCGATGGCACTAACAGACTCAGGTCCAAAAGCTAATATTATAGTAGACTCACAGTATGTAATGGGAATAGTGGCAGGCCAACCAACAGAGTCAGAAAATAGAATAGTAAATCAAATCATAGAAGAAATGATAAAAAAGGAAGCAATCTATGTTGCATGGGTCCCAGCCCATAAAGGCATAGGGGGAAACCAGGAAGTAGATCATTTAGTGAGTCAAGGCATCAGACAAGTACTGTTCCTAGAAAAGATAGAGCCTGCTCAGGAAGAACATGAAAAATATCATACCAATGTAAAAGAGCTATGCCATAAATTTGATATACCCCAACTAGTGGCAAGACAAATAGTAAACACATGTGCCCAATGTCAACAGAAAGGGGAGGCTATACATGGGCAAGTAAATGCAGAAGTAGGCACCTGGCAAATGGACTGCACACATCTAGAGGGAAAAATCATCATAGTAGCAGTACATGTTGCAAGTGGATTTATAGAAGCAGAAGTCATCCCACAGGAATCAGGAAGGCAAACAGCACTCTTCCTATTAAAATTGGCTAGCAGGTGGCCAATAACACACTTACACACAGATAATGGTGCCAACTTCACTTCACAGGAAGTAAAGATGGTAGCATGGTGGGTAGGCATAGAACAAACCTTTGGAGTACCTTACAACCCACAAAGCCAAGGAGTAGTAGAAGCAATGAATCACCACCTAAAAAATCAGATAAGTAGAATTAGAGAACAGGCAAATACAGTAGAAACAATAGTACTAATGGCAGTTCATTGCATGAATTTTAAAAGAAGGGGAGGAATAGGGGATATGACTCCATCAGAAAGACTAATCAATATGATCACCACAGAACAAGAGATACAATTCCTCCAAGCCAAAAATTCAAAATTAAAAAATTTTCGGGTCTATTTCAGAGAAGGCAGAGATCAGTTGTGGAAAGGACCTGGGGAACTACTGTGGAAGGGAGACGGAGCAGTCATAGTCAAGGTAGGAACAGATATAAAAATAATACCAAGGAGGAAAGCCAAGATCATCAGAGACTATGGAGGAAGGCAAGAGCTGGATAGCAGTTCCCACCTGGAGGGTGCCAGGGAGAATGGAGAAGTGGCATAGCCTTGTCAAGTATCTAAAATACAAAACAGGAGATCTAGAACAGGTGTGCTATGTTCCCCACCATAAGGTGGGATGGGCATGGTGGACTTGCAGCAGGGTAATATTCCCATTAAGAGGAGACAGTCGTCTAGAGATACAGGCATATTGGAACTTAACACCAGAAAAAGGATGGCTCTCCTCTTATGCAGTAAGAATGACTTGGTACACAGAAAAGTTCTGGACAGATGTCACCCCAG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| 84,599
|
KP890355.1
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Bond,N.G., Lauck,M., Maness,N.J., O'Connor,D.H., Marx,P.A.
|
Tulane University School of Public Health and Tropical Medicine, Tropical Medicine
|
USA
|
2015-08-31
|
NWK08
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 9,480
|
GenBank
| null |
USA: Newark, NJ
|
USA
|
Homo sapiens
| null |
2008
| null | null |
HIV-2 isolate NWK08 from USA, complete genome
|
GCTACCAGGTAGAGCCCCGAGTGGATCCCTGGTAGCACTAGCAGGTGAGCCTGGGTGTTCCCTGTTAGACTCTCACTGGTACTTGGCCAGTACCAGGCAGACGGCTCCACGCTTGCTTGCTTGACTCTCAATAAAGCTGCCATTTAGAAGCAAGTCAGCGTGTGTTCCCATCTCTTCTAGTCGCCGCCTGGTCATTCGGTGTCCTGGCTCGAGGTCTCGGTATCAAGTCCCTGGAACTGTCAGAACCCTCTCACTAAGGGGCAACCCTGAGTGAAAAATCTCTGGCAGTTTGGCGCCCGAACAGGGACCCGAGAGACCTGAGAAAGCACACGGCTGAGTGAAGGCAGCAAGGGCGGCAGAGACCAACCGCGACGGAGGAAGACCCGGTGCCAGAGGGCTGAGCGGGACGTGAAGGTAAGAGAGGCCTTCGGGACAGATAGTCCAAAAGTTTGTGTAGCTATAGAGCTGTTTTCCTACCCTCAAGGAGGGTAGAAGTATAGCGGGAGATGGGCGCGAGATACTCCGTCTTGTCAGGGAAAAAAGCAGATGAATTAGAAAAAGTTAGGTTACGGCCCGGCGGAAAGAAAAAGTATATGTTAAAGCATATAATATGGGCAGCAAAAGAATTGGACAGATTCGGATTGGCAGAAGACCTGTTGGAAAACAAACAAGGATGTCAAAGAATATTAGAAGTTTTAACCCCATTAATGCCAACAGGCTCAGAAAATTTAAAGAGTTTGTATAATACTGTCTGCGTAGTTTGGTGTTTGCACGCAGAAGAGAAAGTGAAACACACAGAGGAAGCAAAGCAGTTGGTACAGAGACATCTAGTGGCAGAAACTAAAACTGCAGAAAAAATACCAGCAAAAAGTAGACCAACAGCTCCACCTAGTGGAGGAAATTATCCAGTGCAGCAAGTAGGTGGAAATTATGTCCACTTACCATTAAGCCCCAGAACTTTAAATGCCTGGGTAAAATTAGTAGAGGAAAAGAAATTTGGAGCAGAAGTAGTGCCAGGCTTTCAGGCACTGTCAGAAGGCTGCACACCTTATGATATTAATCAGATGCTAAATTGTGTAGGGGAACATCAAGCGGCTATGCAAATAATTAGAGAAATTATCAATGAGGAAGCAGCAGACTGGGACGCACAGCATCCAAGGCAGCTACCGGCACCTCCGGGGCTGCGCGACCCGTCAGGGTCAGATATAGCAGGAACCACCAGTACTGTAGAAGAGCAAATAGAGTGGATGTATAGACAAGGAAATCCTGTCCCAGTAGGACAAATTTACAGGAGATGGATTCAGCTAGGATTACAAAAATGTGTAAGAATGTACAATCCCACTAACATTCTAGACGTAAAGCAAGGTCCAAAAGAGCCATTCCAAGTTTATGTAGACAGGTTCTACAAAAGTTTGAGAGCAGAACAAACAGACCCAGCAGTGAAGAATTGGATGACCCAAACACTGCTGATCCAAAATGCCAACCCTGATTGCAAACTAGTATTAAAAGGATTGGGAATGAATCCCACCTTAGAAGAAATGTTAACAGCTTGTCAGGGAGTGGGAGGTCCTGGACAAAAGGCTAGGTTAATGGCCGAGGCAATGAAGGAAGCCTTTAATGGCTCCTTCGCGGCCGTGCAGATGAGAGGGAAACAACAGAAGGGGGCATCAACTATTAGATGCTTTAATTGTGGGAAACCAGGCCACACTGCCAGAAATTGCAGGGCACCAAGAAGAAAGGGGTGCTGGAAATGTGGAGAGGAAGGACACATGCAAGCAAACTGCCCAAACCAACGGGCGGGTTTTTTAGGGTTAGGACCATGGGGAAAGAAGCCTCGCAACTTCCCCATGAGACAGATGCCAGAGGGACTGACCCCATCAGCCCCTCCGGACCCAGCAGCAGAAATGCTCGAGGAGTATATGCAGAAGGGGAAAAGTCAGAGGGAGCAGAGGGAGAGACCTTACAAAGAGGTGACGGAGGACTTGCTGCACCTCAGTTCTCTCTTTGGAAAAGACCAGTAGTCACAGCATATATAGAGGATCAGCCAGTACAGGTACTGCTAGATACAGGAGCTGATGACTCTATAGTGGCAGGGATAGAATTAGGACTTAATTACAAGCCAAAAATAGTAGGGGGAATTGGAGGATTTATAAATACAAAAGAATACCATAAAGTAACAATTAGAGTATTAGGAAAAGAAATAAAAGCAACATTAATGACTGGGGAGACTCCAATAAATATTTTCGGCAGAAATATATTACAGCTATTAGGAATGACTTTAAATTGTCCATTGGCAAAAGTAGAGCCAATACCAGTACACTTAAAACCAGGAATGGATGGCCCCAGATTAAAACAGTGGCCCCTTTCAAAAGAAAAAATAGAAGCCTTGACAGAAATCTGCCAAAAAATGGAGAGAGAAGGACAGCTAGAGGAAGCTGCCCCCAACAACCCATATAACACTCCCACTTTTGCAATTAGGAAGAAGGACAAAAGTAAATGGAGAATGTTAATAGATTTCAGGGAGTTAAATAAGGCCACACAGAACTTCACAGAAGTACAGTTAGGGATTCCGCACCCAGCAGGCCTTCCAGAGAAAAACAGAATCACAGTTCTGGACATAGGGGACGCCTATTTTTCAGTACCCTTGTATGAAGGATTCAGGCAGTACACAGCCTTTACCTTGCCAGCAGTAAACAACATGAGGCCAGGTAAAAGGTATGTGTATAAAGTATTACCACAAGGGTGGAAGGGATCACCAGCCCTGTTCCAGGCCACAATGGCTACGGTACTGGAACCCTTCAGAAAAGCTAACCCAGATGTGATTCTGGTACAGTACATGGATGACCTGCTGATAGCAAGTGATAGGAACACAGCAGAACATGATCAGATGGTAATGCAGCTAAAAGACATGCTTAACAAGATAGGGTTTAGCACACCAGAAGAAAAGTATCAGAAAGAATATCCACTAAAGTGGATGGGGTATGAACTGTACCCTAAAAAATGGAAACTGCAGAAAATAACCCTACCAATAAAGGAAGAATGGACAGTTAATGATATTCAGAAACTGGTAGGAGTTCTTAATTGGGCAGCTCAGATATATCCAGGAATAAAGACAAAGCACCTCTGTAGAATGATCAGGGGAAAACAGACTCTCACAGAAAAGGTAGAATGGACAGAGCAGGCAGAAGCAGAACATGCAGAGAATAATATTATTCTACAACAAGAACAAGAGGGGAGATACTACAAGGAGGGAGAGCCACTTGAAGCAACAGTGGTAAAAGCACGAGACACCCAGTGGGGCTATAAAATACACCAAGGTTCCAGAATCCTAAAGGTAGGCAAGTTTGCAAAAGTCAAAAATACCCACACTAACGATCTCAGATTACTGGCCAGTGTAGTACAGAAAATAGGCAAGGAGAGCCTAGTAATATGGGGACAATTACCAATATTTCACCTACCAGTAGAGAGAGAAACTTGGGAATCATGGTGGACAGACTATTGGCAAGTCACGTGGATACCTGATTGGGATTTTATATCCACCCCACCATTGATAAGATTGGTATTCAATCTAGTAAAAGACCCTATACAAGGAGCAGAAACCTACTATGTAGATGGATCCTGCAACAGAAATAGCAAAGAAGGTAAAGCAGGATATATCACAGATCGAGGAAAAGAAAAGGTAAAAGTGCTGACTGAAACCACCAATCAACAGGCAGAGCTAGAAGCAATAAAAATGGCTTTAGAAGACTCAGGAGACAAAGTAAATATGGTCACAGACTCACAGTATGTCATAGGTATTTTATCAGGACAGCCTACAGAATCAGAATCTGAACTAGTACAACAAATTATAGAAAATATGATTAGAAAATCAGAAATTTATTTGGCCTGGGTGCCAGCCCATAAAGGAATAGGAGGGAATCAGGAAGTAGACAAACTAGTTAGCCAAGGGATAAGACAGGTACTGTTTCTAGAAAGCATAGAACCAGCTCAGGAAGAACATGAAAAATATCACAGCAATGTAAAGGAATTGACCCATAAATTTGGCATCCCACAGCTAGTGGCAAAACAAATAGTAAATACATGTCCCAAATGTCAACAAAAAGGAGAAGCAACACATGGGCAAGTAGATGCATCAGTAGGGACATGGCAGATGGATTGCACTCATTTAGAGGGAAAGATCATCATAGTAGCAGTCCACGTGGCCAGTGGCTACATAGAAGCAGAAGTAATCCCACAAGAGACAGGGAGACAAACAGCGCTCTTCCTATTAAAGTTAATTGCCAGATGGCCACTAACCCATTTACATACAGACAATGGAGCAAACTTCCAATCTAAAGAAGTGCAGATGGTAAACTGGTGGGCGGGGGTAGAACACTCATTCGGAGTGCCCTACAACCCACAAAGCCAAGGAGTTGTAGAAGCAATGAATCAACATCTGAAAAAACAGATAGATAGAATTAGGGAACAAGCAGAAACCGTAGAAACAATAGTACTGATGGCAGCTCATTGCATGAATTTTAAAAGAAGGGGAGGAATAGGGGATATGACTCCAGCAGAGAGGATAGTAAACATGATCTCCACAGAACAAGAAATACAATTCCAAAATTCACAAAACAAAAATTTTAAAAATTTTCGGGTCTATTACAGAGAAGGAAGAGATCAGCTCTGGAAAGGCCCAGCAGATCTCTTATGGAAAGGAGAAGGAGCAGTCATAATTAAGGTAGGGACAGACATAAAGGTTGTACCCAGAAGAAAAGCAAAAGTAATTAAAGACTATGGAGGAGGAAAAGAGGTGGATAGTAGTGCCAACATGGAGAATTGAGGGAAGGTTGGAAAGATGGCACTCTATAGTGAAATATTATAAACATAAAACAGGAGAGGCAAAAGAATGGCGCTACGTGCCCCACCACAAAGTGGGATGGGCATGGTGGACAGCATCAAGGGTAATCATACCCCTATTAGAAGGAGAGACTCTGGAAATACAGGCATATTGGAACCTA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| 86,060
|
AB731738.1
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Human immunodeficiency virus 2
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Umeki-Sakamoto,Y., Ibe,S., Hattori,J., Iwatani,Y., Yokomaku,Y., Sugiura,W., Tatsumi,M.
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AIDS Research Center; 1-23-1 Toyama, Shinjuku, Tokyo 162-8640
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Japan
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2013-01-16
| null |
Human immunodeficiency virus 2
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Lentivirus
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Retroviridae
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ssRNA-RT
| 10,222
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GenBank
| null |
Japan: Aichi, Nagoya
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Japan
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Homo sapiens
| null |
2004
| null | null |
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| 95,357
|
AB731740.1
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Umeki-Sakamoto,Y., Ibe,S., Hattori,J., Iwatani,Y., Yokomaku,Y., Sugiura,W., Tatsumi,M.
|
AIDS Research Center; 1-23-1 Toyama, Shinjuku, Tokyo 162-8640
|
Japan
|
2013-01-16
| null |
Human immunodeficiency virus 2
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,213
|
GenBank
| null |
Japan: Aichi, Nagoya
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2007
| null | null |
Human immunodeficiency virus 2 proviral DNA, complete genome, clone: 07JP_NMC716_clone_01
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| 95,358
|
AB731741.1
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Umeki-Sakamoto,Y., Ibe,S., Hattori,J., Iwatani,Y., Yokomaku,Y., Sugiura,W., Tatsumi,M.
|
AIDS Research Center; 1-23-1 Toyama, Shinjuku, Tokyo 162-8640
|
Japan
|
2013-01-16
| null |
Human immunodeficiency virus 2
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,213
|
GenBank
| null |
Japan: Aichi, Nagoya
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2007
| null | null |
Human immunodeficiency virus 2 proviral DNA, complete genome, clone: 07JP_NMC716_clone_03
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| 95,359
|
AB731742.1
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Umeki-Sakamoto,Y., Nagai,M., Ibe,S., Hattori,J., Iwatani,Y., Yokomaku,Y., Sugiura,W., Tatsumi,M.
|
AIDS Research Center; 1-23-1 Toyama, Shinjuku, Tokyo 162-8640
|
Japan
|
2013-01-16
| null |
Human immunodeficiency virus 2
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,301
|
GenBank
| null |
Japan: Aichi, Nagoya
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2008
| null | null |
Human immunodeficiency virus 2 proviral DNA, complete genome, clone: 08JP_NMC786_clone_41
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| 95,360
|
AB731743.1
|
Human immunodeficiency virus 2
|
Umeki-Sakamoto,Y., Nagai,M., Ibe,S., Hattori,J., Iwatani,Y., Yokomaku,Y., Sugiura,W., Tatsumi,M.
|
AIDS Research Center; 1-23-1 Toyama, Shinjuku, Tokyo 162-8640
|
Japan
|
2013-01-16
| null |
Human immunodeficiency virus 2
|
Lentivirus
|
Retroviridae
|
ssRNA-RT
| 10,301
|
GenBank
| null |
Japan: Aichi, Nagoya
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2008
| null | null |
Human immunodeficiency virus 2 proviral DNA, complete genome, clone: 08JP_NMC786_clone_43
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| 95,361
|
AC_000005.1
|
Human mastadenovirus A
|
Davison,A.J., Benko,M., Harrach,B., Sprengel,J., Schmitz,B., Heuss-Neitzel,D., Zock,C., Doerfler,W., Iselt,A., Juttermann,R., Weyer,U., Kimura,T., Sawada,Y., Shinawawa,M., Shimizu,Y., Shiroki,K., Shimojo,H., Sugisaki,H., Takanami,M., Uemizu,Y., Fujinaga,K.
|
MRC Virology Unit
| null |
2004-12-01
| null |
Human mastadenovirus A
|
Mastadenovirus
|
Adenoviridae
|
dsDNA
| 34,125
|
RefSeq
| 5
| null | null | null | null | null | null |
PRJNA485481
|
Human mastadenovirus A, complete genome
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| 8,332
|
NC_001460.1
|
Human mastadenovirus A
|
Sprengel,J., Schmitz,B., Heuss-Neitzel,D., Zock,C., Doerfler,W.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
1993-07-06
| null |
Human mastadenovirus A
|
Mastadenovirus
|
Adenoviridae
|
dsDNA
| 34,125
|
RefSeq
| 1
| null | null |
Homo sapiens
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PRJNA485481
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Human adenovirus A, complete genome
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HadVi/A31/Toronto.CAN/27.2012/Case20
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Human mastadenovirus A
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Mastadenovirus
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Adenoviridae
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dsDNA
| 33,796
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GenBank
| null |
Canada: Toronto
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Canada
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Homo sapiens
| null |
2021
| null | null |
Human mastadenovirus A strain A31CAN272012Case20, complete genome
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CATCATCAATAATATACCTTACACTGGATTTGAGCCAATATTAAAATGAAGTGGGCGGAGTGAATAGTTAATTGACCGTAGGCGTGGTTTGCAAGTTTGCCGAAGCCGGATGTGACGCGCGTGGGAGCCGGGCGCGCCGGATGTGACGTTTTAGTTGCCATTTTTATAGGAAATGACATGTTTTTTGGGCGTTGATGTGTAAGTTTTGTGTTTTTGGCGGTAAAAGTGATTTGCGGAAGTGAAAACTGTTTACGTCAGTTTTATTATAGGCGAGTAATATTTACCGAGGGCAAAGTGAACTTTGAGCCACTACGTGGTGGTTTCGATACGTGAGCGATAGGGAAACTCCACGTTGGTGTCCAAAGGACACGTTTATTGTTCTGTCAGCTGGGTATTTAATCCCGCTGCGTTTGTCAAGAGGCCACTCTTGAGTGCCAGCGAGAAGAGTTTTCTCTGCGAGCTGACATACGGCGCCATTATGAGAACTGAAATAACTCCTTTGGTGTTGTCCTATGAAGAAGCCGATGACATATTGGAGCATTTGGTGGAGAACTTTTTTAACGAGGTACCCAGCGATGATGATTTTTATGTTCCCTCGCTTCACGAACTGTATGATATTGATGTGGAGTCTGCCGGTGAGGATTGTAATGAACAGGCTGTGAATGATTTTTTTCCGGAATCGTTTATTTTAGCCGCTGCTGAAGGGGTAATATTACCGGAGCCCCCTGTGCTTTCTCCTATTTGTGAACCTATTGGTGGTGAATGTATGCCACAGTTGTGTTCTGAAGATATGGATTTGTTGTGTTATGAGGCGGCTTTTCCCTGTAGCGACTCTGAAGGTGAGCAAGACGAAAACGGAATGGCGCATGTTTCTGCAGCTGCAGCGGCGGCTGCTGCTAATAGAGAACGTGAGGAGTTTCAGTTAGACCATCCGGAGTTACCTGGACACGATTGTAAGTCCTGCGAGTACCACCGGAATAGTACTGGAAACACTGACTTAATGTGCTCTTTGTGTTATCTGCGAGCCTACAGCATGTTTATTTACAGTAAGTGCGCTATTTAGACGGTGGGAGGTGTATTTTTTATTTGTTCTTAGCAGTAAAGACTTTTTTGTTTTTAGGTCCTGTTTCTGACAATGAACCGGAACCGGACAGCACTACGGATGACAATGAGAGACCGTCGCCCCCAGAACTGGGAGATGTAGTTCCGGAAGGAGTAATGAAACCTGTACCTCAGCGGGTGACTGGGAGGCGACGTGCTGTGGAAAGTATTTTGGATTTGATCCAAGAGGAAGAATGTGAACAAACAGTGCCTGTTGATTTGTCAGTGAAACGCCCTAAATGTAATTAATGAACTTTGCACACCTGGCAATAAAATGGGAGTTTTGTGTGAGTCACGTATAATAAACTGTTTGCGTGTTTTATTTGGGCGTGGTTAGTAGGCATATAAAGGTGGGTTGGTGCTGCCTAGCATGAGATAGTGAAGAATGGAGCTAGAAGCTGTGTTGCAAAGTTTTCAGAGCGTTCGTCAGCTTCTGCAGTATACCTCTAAAAACACTTCAGGTTTTTGGAGATATCTGTTTGGTTCTATTTTAAGCAAGGTGGTACATAGGGTGAAGGAAGATTACAGAGAGGAATTTGAAAACATATTGGCCGACTGTCCAGGGCTTTTGGCTTCATTAGATCTTTGCCACCACTCTGTTTTTCAGGAAAGAGTGGTCAGATCTTTAGATTTTTCATCTTCTGGCCGAACGGTTGCTTCTATTGCTTTTTTGGCAACCGTGTTGGATAAATGGAGCGAGAGGTCCCACCTGAGCTGGGATTACATGCTGGATTACATGGCAATGCATTTGTGGAGGGCATGGCTGAAGAGGAGGGTTTGCATTTACTCGCTGGCGCGGCCTCTAACCATGCCGCCGTTGCAGGAGGAGCAGCAGAACCCTACGACGGAGGAGTAAACATGGAACCACAGGTGCAAGAAGGCCATGAACCTGACCCCGACGAAGGGCCTAGTTGTGCAGTTGTTAAAAAGCGGGAAAGAAAAGAAAGTTTAAAGGAAGCTGTGCTTAATAGGCTGACTGTTAACCTAATGTCTCGCCCGCGCTTGGAAACTGTATATTGGCAGGAATTACAGGATGAATTTAAGCAGGGACACATGCATCTACAATACAAGTACAGTTTTGAGCAGCTAAAAACCCACTGGCTAGAACCATGGGAGGATTTAGAGTGTGCTATTAAAGCTTTTGCTAAAGTAGCTTTACGCCCTGACTGTACTTATAAAATCTCTAAGACAGTAACTATTACGTCATGTACGTACATTATAGGCAATGGGGCAGTAGTTGAGGTGGACACTAGTGATAGAGTTGCTTTTAGGTGTCGTATGCAGGGCATGGGTCCGGGGGTGGTAGGTTTGGATGGCATTACATTTATGAATGTTAGGTTTGCTGGAGAAAAATTTAAGGGCATTATGTTTGAGGCTAACACAAGTGTTGTGTTGCATGGTGTGTACTTTCTTAACTTTAATAACACGTGTGTAGAGTGTTGGAATAAGGTTTCTGCCAGGGGTTGCACTTTTTATGGGTGTTGGAAGGCCTTGGTAGGTAGGCCCAAAAGTAAAATGTCTGTAAAAAAGTGCTTGTTTGAGAAATGCGTGCTTGCTTTAATTGTAGAAGGGGATGCACACATTAGACATAATGCAGCTTCAGAAAATACCTGTTTTATTCTACTGAAGGGAATGGCTATTTTAAAGCACAATATGGTTTGCGGGGTGTCTGATCAGACAATGCGACGGTTTGTCACCTGTGCTGATGGAAATTGTCACACTTTGAAAACTGTTCATATTGTGAGTCATGCTAGATATTGTTGGCCTGTGTGTGACCATAACATGTTTATGCGCTGCACAATACATTTGGGTCTCCGGCGGGGTGTGTTTAGACCTTCCCAGTGTAACTTTAGTCATTCAAATGTTTTGTTGGAGCCCGAGGCGTTTTCCAGAGTGAGTTTAAATGGGGTGTTTGATTTATCTGTGGAATTATGCAAGATTATCAGGTATGACGACGCTGCCCGTCATCGCTGCCGGCAGTGCGAATGTGGCAGTAGTCATCTAGAACTTCGCCCCGTCATGCTGAATGTAACTGAGGAGCTAAGAAGTGACCATCTTACCCTGTCTTGTCTGCGAACCGACTATGACTCTAGCGATGAAGACAACTAAGGTAAGTGGGCGGAGCTATGTGGGACTATAAAATGCTTAAAGGAATTGTAAAGTTGTTTTTGTTATTTTGGCAGCGCAATGAACGGAACTGCTGGGGACAACGCTGTGCTTTTTGATGGAGGGGTTTTTAGCCCTTATTTGACGTCAAGGTTACCGTATTGGGCCGGAGTGCGTCAGAATGTGGTAGGATCTACTCCAGACGGACGACCTGTAGCGCCTGCAAATTCGTCAACGTTAACCTATGCAACTGTGGGACCTTCGCCGTTGGATACCGCCGCCGCCGCTGCAGCTTCTGCGGCGGCTTGTACGGCTCGCAATATGGCAGCTGATTTTAGTCTCTACAGCCAATTGACATCGAATGCCGCAATGCGCACTGCAGTCCGAGGAGACATTTTAACTGTTATGCTTGCAAAGCTTGAGACCTTAACTGCTCAGCTAGAGGAGCTGTCGCATAAGGTTGAAGAATTAGCTGATGCTACCACTCCCACCCTACCACAACCTGTTAGTCAATAAAAAAAAAGCTTTAAATTGTATGCTGTTTGACTGTTTATTGATGTTTGTTTTTTCTGACATGGTAAGCTCTGGACCATCGTTCCCTATCATTAAGAACACGGTGAATGTATTCCAATATTTTGTAAAGGTGGGCTTGTATGTTAAGGTACATTGGCATAAGACCATCGGTGGGATGCAGGTAGGACCACTGTAGGGCTTCTTGTTCAGGGGTGGTGTTGTAAATAATCCAATCGTAGCAACAGCGCTGGGCATGGTGGTGAAATATATCTTTAAGCAACAAGCTGATTGCTAAGGGAAGACCTTTAGTGTAGGTATTTATAAAGCGGTTAAGCTGGGTGGGGTGCATACGGGGGGACATAATATGTAGTTTTGATTGTATTTTGAGATTGGCAATATTTCCTGCCAGATCTCTCCTTGGATTCATGTTGTGGAGAACCACAAAAACAGTGTAGCCAGTGCATTTGGGGAATTTATCATGAAGTTTGGAAGGAAAGGCATGAAAAAATTTGGAGACGCCTTTGTGGCTTCCCAGATTTTCCATACACTCATCCATTATTATAGCAATTGGCCCGCAAGCGGCGGCTTTCGCAAAAATGTTTTTTGGATCAGAAACATCATAGTTGTGGTCTAACGTTAAATCATCGTACGAGAGCTTAACAAATTTAGGGCAGAGCGTTCCGGACTGTGGAATAATGGTTCCCTGGGGTCCCGGGGCATAATTTCCCTCACAAATTTGCATTTCCCAAGATTTAATTTCCGAAGGCGGAATCATGTCCACTTGGGGAACAATAAAAAAAACAGTTTCTGGAGCAGGTGTGACCAGCTGGGCGGAAAGCAAGTTACGCAACAACTGAGATTTCCCACATCCAGTAGGTCCATAAATAACCCCAATAACTGGCTGCAAGTGATAGTTTAACGAGGTGCAGCTGCCGTCGTCGCGGAGAAGCGGAGCCACATCGTTCATCATTTGCTTGACTTGCATGTTTTGCTTGACAAGTTCCCTCAGAAGGCGTTCACCGCCCAAGGAGAGCAACTCTTGCAAAGAGTTGAAAGTTTTTAATGGTTTCAGACCGTCAGCCATTGGCATGTGGTCCAGGGTTTGTTTTAACAGTTGCAAGCGGTCCCATAGCTGAGTTATGTTTTCTATTCCATCTCGATCCAACAGACTTCCTCGTTGCGGGGATTGGGCTGGCTGTTGCTGTAAGGAACAAGGCGATGAGCATCCAAGTGCACCAGGGTTTTGTCCTTCCATGGACGTAAGGTGCGCGTCAAGGTTG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| 23,813
|
OM112281.1
|
Human mastadenovirus A
|
Fattouh,R., Stapleton,P.J., Eshaghi,A., Thomas,A., Science,M., Schechter-Finkelstein,T., Streitenberger,L., Hubacek,P., Brown,M., Graham,M.R., Gubbay,J.B., Campigotto,A., Patel,S.N., Richardson,S.E.
|
Public Health Ontario Laboratory, Microbiology
|
Canada
|
2022-10-04
|
HadVi/A31/Toronto.CAN/32.2021/Case21
|
Human mastadenovirus A
|
Mastadenovirus
|
Adenoviridae
|
dsDNA
| 33,791
|
GenBank
| null |
Canada: Toronto
|
Canada
|
Homo sapiens
| null |
2021
| null | null |
Human mastadenovirus A strain A31CAN322021Case21, complete genome
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| 23,814
|
OM112282.1
|
Human mastadenovirus A
|
Fattouh,R., Stapleton,P.J., Eshaghi,A., Thomas,A., Science,M., Schechter-Finkelstein,T., Streitenberger,L., Hubacek,P., Brown,M., Graham,M.R., Gubbay,J.B., Campigotto,A., Patel,S.N., Richardson,S.E.
|
Public Health Ontario Laboratory, Microbiology
|
Canada
|
2022-10-04
|
HadVi/A31/Toronto.CAN/39.2021/Case23
|
Human mastadenovirus A
|
Mastadenovirus
|
Adenoviridae
|
dsDNA
| 33,784
|
GenBank
| null |
Canada: Toronto
|
Canada
|
Homo sapiens
| null |
2021
| null | null |
Human mastadenovirus A strain A31CAN392021Case23, complete genome
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| 23,815
|
OM112283.1
|
Human mastadenovirus A
|
Fattouh,R., Stapleton,P.J., Eshaghi,A., Thomas,A., Science,M., Schechter-Finkelstein,T., Streitenberger,L., Hubacek,P., Brown,M., Graham,M.R., Gubbay,J.B., Campigotto,A., Patel,S.N., Richardson,S.E.
|
Public Health Ontario Laboratory, Microbiology
|
Canada
|
2022-10-04
|
HadVi/A31/Toronto.CAN/35.2021/Case22
|
Human mastadenovirus A
|
Mastadenovirus
|
Adenoviridae
|
dsDNA
| 33,790
|
GenBank
| null |
Canada: Toronto
|
Canada
|
Homo sapiens
| null |
2021
| null | null |
Human mastadenovirus A strain A31CAN352021Case22, complete genome
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| 23,816
|
MN901807.1
|
Human mastadenovirus A
|
Fattouh,R., Stapleton,P.J., Eshaghi,A., Thomas,A., Science,M., Schechter-Finkelstein,T., Streitenberger,L., Kajon,A.E., Fisher,B.T., Dean,J., Hubacek,P., Brown,M., Graham,M.R., Gubbay,J.B., Campigotto,A., Patel,S.N., Richardson,S.E.
|
Public Health Ontario Laboratory, Microbiology
|
Canada
|
2022-09-28
| null |
Human mastadenovirus A
|
Mastadenovirus
|
Adenoviridae
|
dsDNA
| 33,794
|
GenBank
| null |
Canada: Toronto
|
Canada
|
Homo sapiens
|
feces
|
2015-12
| null |
PRJNA598822
|
Human mastadenovirus A strain A31ONP09CU1DEC2015, complete genome
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| 23,919
|
MN901808.1
|
Human mastadenovirus A
|
Fattouh,R., Stapleton,P.J., Eshaghi,A., Thomas,A., Science,M., Schechter-Finkelstein,T., Streitenberger,L., Kajon,A.E., Fisher,B.T., Dean,J., Hubacek,P., Brown,M., Graham,M.R., Gubbay,J.B., Campigotto,A., Patel,S.N., Richardson,S.E.
|
Public Health Ontario Laboratory, Microbiology
|
Canada
|
2022-09-28
| null |
Human mastadenovirus A
|
Mastadenovirus
|
Adenoviridae
|
dsDNA
| 33,792
|
GenBank
| null |
USA: Philadelphia
|
USA
|
Homo sapiens
|
feces
|
2012
| null |
PRJNA598822
|
Human mastadenovirus A strain A31NMP03PR12012, complete genome
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| 23,920
|
MN901809.1
|
Human mastadenovirus A
|
Fattouh,R., Stapleton,P.J., Eshaghi,A., Thomas,A., Science,M., Schechter-Finkelstein,T., Streitenberger,L., Kajon,A.E., Fisher,B.T., Dean,J., Hubacek,P., Brown,M., Graham,M.R., Gubbay,J.B., Campigotto,A., Patel,S.N., Richardson,S.E.
|
Public Health Ontario Laboratory, Microbiology
|
Canada
|
2022-09-28
| null |
Human mastadenovirus A
|
Mastadenovirus
|
Adenoviridae
|
dsDNA
| 33,801
|
GenBank
| null |
Canada: Toronto
|
Canada
|
Homo sapiens
|
feces
|
2018-02
| null |
PRJNA598822
|
Human mastadenovirus A strain A31ONP17PR1FEB2018, complete genome
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| 23,921
|
MN901810.1
|
Human mastadenovirus A
|
Fattouh,R., Stapleton,P.J., Eshaghi,A., Thomas,A., Science,M., Schechter-Finkelstein,T., Streitenberger,L., Kajon,A.E., Fisher,B.T., Dean,J., Hubacek,P., Brown,M., Graham,M.R., Gubbay,J.B., Campigotto,A., Patel,S.N., Richardson,S.E.
|
Public Health Ontario Laboratory, Microbiology
|
Canada
|
2022-09-28
| null |
Human mastadenovirus A
|
Mastadenovirus
|
Adenoviridae
|
dsDNA
| 33,791
|
GenBank
| null |
Canada: Toronto
|
Canada
|
Homo sapiens
|
urine
|
2015-04
| null |
PRJNA598822
|
Human mastadenovirus A strain A31ONP04PR1APR2015, complete genome
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| 23,922
|
MN901811.1
|
Human mastadenovirus A
|
Fattouh,R., Stapleton,P.J., Eshaghi,A., Thomas,A., Science,M., Schechter-Finkelstein,T., Streitenberger,L., Kajon,A.E., Fisher,B.T., Dean,J., Hubacek,P., Brown,M., Graham,M.R., Gubbay,J.B., Campigotto,A., Patel,S.N., Richardson,S.E.
|
Public Health Ontario Laboratory, Microbiology
|
Canada
|
2022-09-28
| null |
Human mastadenovirus A
|
Mastadenovirus
|
Adenoviridae
|
dsDNA
| 33,802
|
GenBank
| null |
Czech Republic
|
Czech Republic
|
Homo sapiens
|
feces
|
2016-11
| null |
PRJNA598822
|
Human mastadenovirus A strain A31CZP03CU1NOV2016, complete genome
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