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IBBI-bio
/

ibbi_test_data

@@ -84,269 +84,136 @@ The dataset contains a single split, which is used for testing and evaluation. A
 ### Species Distribution
-=============================================
 #### Total Object (Annotation) Count per Class
- (Most relevant for class imbalance)
-=============================================
-|
- Xylosandrus_compactus       : 1136 objects |
-|
- Euwallacea_fornicatus       : 854 objects |
-|
- Phloeosinus_dentatus        : 770 objects |
-|
- Pityophthorus_juglandis     : 745 objects |
-|
- Xyleborus_affinis           : 739 objects |
-|
- Hylesinus_varius            : 725 objects |
-|
- Xyleborinus_saxesenii       : 637 objects |
-|
- Xyleborus_glabratus         : 556 objects |
-|
- Ips_typographus             : 539 objects |
-|
- Coccotrypes_dactyliperda    : 531 objects |
-|
- Monarthrum_fasciatum        : 521 objects |
-|
- Cryptocarenus_heveae        : 502 objects |
-|
- Platypus_cylindrus          : 480 objects |
-|
- Coccotrypes_carpophagus     : 421 objects |
-|
- Scolytodes_glaber           : 417 objects |
-|
- Xylosandrus_crassiusculus   : 399 objects |
-|
- Euwallacea_perbrevis        : 391 objects |
-|
- Dendroctonus_valens         : 344 objects |
-|
- Ips_duplicatus              : 277 objects |
-|
- Platypus_koryoensis         : 264 objects |
-|
- Ips_acuminatus              : 244 objects |
-|
- Ctonoxylon_hagedorn         : 239 objects |
-|
- Coptoborus_ricini           : 239 objects |
-|
- Euplatypus_compositus       : 237 objects |
-|
- Dendroctonus_terebrans      : 235 objects |
-|
- Ips_sexdentatus             : 228 objects |
-|
- Pagiocerus_frontalis        : 225 objects |
-|
- Hypothenemus_hampei         : 224 objects |
-|
- Pycnarthrum_hispidium       : 214 objects |
-|
- Hylurgops_palliatus         : 207 objects |
-|
- Monarthrum_mali             : 199 objects |
-|
- Anisandrus_sayi             : 195 objects |
-|
- Ips_avulsus                 : 193 objects |
-|
- Myoplatypus_flavicornis     : 189 objects |
-|
- Hylesinus_toranio           : 181 objects |
-|
- Xyleborus_ferrugineus       : 177 objects |
-|
- Cnestus_mutilatus           : 166 objects |
-|
- Ips_calligraphus            : 151 objects |
-|
- Orthotomicus_erosus         : 129 objects |
-|
- Hylastes_salebrosus         : 127 objects |
-|
- Xylosandrus_morigerus       : 124 objects |
-|
- Hylurgus_ligniperda         : 122 objects |
-|
- Taphrorychus_bicolor        : 111 objects |
-|
- Hylastes_porculus           : 104 objects |
-|
- Tomicus_destruens           : 100 objects |
-|
- Anisandrus_dispar           : 96 objects |
-|
- Pityogenes_chalcographus    : 96 objects |
-|
- Cyclorhipidion_pelliculosum : 88 objects |
-|
- Hylesinus_crenatus          : 66 objects |
-|
- Scolytus_schevyrewi         : 61 objects |
-|
- Xylosandrus_amputatus       : 61 objects |
-|
- Xylosandrus_germanus        : 50 objects |
-|
- Ambrosiophilus_atratus      : 41 objects |
-|
- Trypodendron_domesticum     : 16 objects |
-|
- Xyleborus_celsus            : 15 objects |
-|
- Hylesinus_aculeatus         : 13 objects |
-|
- Dryocoetes_autographus      : 12 objects |
-|
- Ambrosiodmus_minor          : 11 objects |
-|
- Dendroctonus_rufipennis     : 10 objects |
-|
- Scolytus_multistriatus      : 9 objects |
-|
- Orthotomicus_caelatus       : 9 objects |
-|
- Ips_grandicollis            : 9 objects |
-|
- Euwallacea_validus          : 9 objects |
-|
-=============================================
 #### Unique Image Count per Class
- (How many images contain at least one)
-=============================================
-|
- Ambrosiodmus_minor          : 11 images |
-|
- Ambrosiophilus_atratus      : 11 images |
-|
- Anisandrus_dispar           : 12 images |
-|
- Anisandrus_sayi             : 7 images |
-|
- Cnestus_mutilatus           : 23 images |
-|
- Coccotrypes_carpophagus     : 8 images |
-|
- Coccotrypes_dactyliperda    : 30 images |
-|
- Coptoborus_ricini           : 10 images |
-|
- Cryptocarenus_heveae        : 16 images |
-|
- Ctonoxylon_hagedorn         : 12 images |
-|
- Cyclorhipidion_pelliculosum : 7 images |
-|
- Dendroctonus_rufipennis     : 9 images |
-|
- Dendroctonus_terebrans      : 46 images |
-|
- Dendroctonus_valens         : 264 images |
-|
- Dryocoetes_autographus      : 8 images |
-|
- Euplatypus_compositus       : 23 images |
-|
- Euwallacea_fornicatus       : 38 images |
-|
- Euwallacea_perbrevis        : 9 images |
-|
- Euwallacea_validus          : 9 images |
-|
- Hylastes_porculus           : 8 images |
-|
- Hylastes_salebrosus         : 13 images |
-|
- Hylesinus_aculeatus         : 13 images |
-|
- Hylesinus_crenatus          : 9 images |
-|
- Hylesinus_toranio           : 13 images |
-|
- Hylesinus_varius            : 78 images |
-|
- Hylurgops_palliatus         : 15 images |
-|
- Hylurgus_ligniperda         : 25 images |
-|
- Hypothenemus_hampei         : 7 images |
-|
- Ips_acuminatus              : 145 images |
-|
- Ips_avulsus                 : 11 images |
-|
- Ips_calligraphus            : 18 images |
-|
- Ips_duplicatus              : 14 images |
-|
- Ips_grandicollis            : 9 images |
-|
- Ips_sexdentatus             : 227 images |
-|
- Ips_typographus             : 314 images |
-|
- Monarthrum_fasciatum        : 42 images |
-|
- Monarthrum_mali             : 14 images |
-|
- Myoplatypus_flavicornis     : 19 images |
-|
- Orthotomicus_caelatus       : 9 images |
-|
- Orthotomicus_erosus         : 7 images |
-|
- Pagiocerus_frontalis        : 11 images |
-|
- Phloeosinus_dentatus        : 38 images |
-|
- Pityogenes_chalcographus    : 11 images |
-|
- Pityophthorus_juglandis     : 22 images |
-|
- Platypus_cylindrus          : 43 images |
-|
- Platypus_koryoensis         : 26 images |
-|
- Pycnarthrum_hispidium       : 11 images |
-|
- Scolytodes_glaber           : 14 images |
-|
- Scolytus_multistriatus      : 8 images |
-|
- Scolytus_schevyrewi         : 8 images |
-|
- Taphrorychus_bicolor        : 9 images |
-|
- Tomicus_destruens           : 9 images |
-|
- Trypodendron_domesticum     : 12 images |
-|
- Xyleborinus_saxesenii       : 41 images |
-|
- Xyleborus_affinis           : 29 images |
-|
- Xyleborus_celsus            : 15 images |
-|
- Xyleborus_ferrugineus       : 13 images |
-|
- Xyleborus_glabratus         : 18 images |
-|
- Xylosandrus_amputatus       : 10 images |
-|
- Xylosandrus_compactus       : 38 images |
-|
- Xylosandrus_crassiusculus   : 60 images |
-|
- Xylosandrus_germanus        : 11 images |
-|
- Xylosandrus_morigerus       : 11 images |
-|
 ## Dataset Creation

 ### Species Distribution
 #### Total Object (Annotation) Count per Class
+ Xylosandrus_compactus       : 1136 objects
+ Euwallacea_fornicatus       : 854 objects
+ Phloeosinus_dentatus        : 770 objects
+ Pityophthorus_juglandis     : 745 objects
+ Xyleborus_affinis           : 739 objects
+ Hylesinus_varius            : 725 objects
+ Xyleborinus_saxesenii       : 637 objects
+ Xyleborus_glabratus         : 556 objects
+ Ips_typographus             : 539 objects
+ Coccotrypes_dactyliperda    : 531 objects
+ Monarthrum_fasciatum        : 521 objects
+ Cryptocarenus_heveae        : 502 objects
+ Platypus_cylindrus          : 480 objects
+ Coccotrypes_carpophagus     : 421 objects
+ Scolytodes_glaber           : 417 objects
+ Xylosandrus_crassiusculus   : 399 objects
+ Euwallacea_perbrevis        : 391 objects
+ Dendroctonus_valens         : 344 objects
+ Ips_duplicatus              : 277 objects
+ Platypus_koryoensis         : 264 objects
+ Ips_acuminatus              : 244 objects
+ Ctonoxylon_hagedorn         : 239 objects
+ Coptoborus_ricini           : 239 objects
+ Euplatypus_compositus       : 237 objects
+ Dendroctonus_terebrans      : 235 objects
+ Ips_sexdentatus             : 228 objects
+ Pagiocerus_frontalis        : 225 objects
+ Hypothenemus_hampei         : 224 objects
+ Pycnarthrum_hispidium       : 214 objects
+ Hylurgops_palliatus         : 207 objects
+ Monarthrum_mali             : 199 objects
+ Anisandrus_sayi             : 195 objects
+ Ips_avulsus                 : 193 objects
+ Myoplatypus_flavicornis     : 189 objects
+ Hylesinus_toranio           : 181 objects
+ Xyleborus_ferrugineus       : 177 objects
+ Cnestus_mutilatus           : 166 objects
+ Ips_calligraphus            : 151 objects
+ Orthotomicus_erosus         : 129 objects
+ Hylastes_salebrosus         : 127 objects
+ Xylosandrus_morigerus       : 124 objects
+ Hylurgus_ligniperda         : 122 objects
+ Taphrorychus_bicolor        : 111 objects
+ Hylastes_porculus           : 104 objects
+ Tomicus_destruens           : 100 objects
+ Anisandrus_dispar           : 96 objects
+ Pityogenes_chalcographus    : 96 objects
+ Cyclorhipidion_pelliculosum : 88 objects
+ Hylesinus_crenatus          : 66 objects
+ Scolytus_schevyrewi         : 61 objects
+ Xylosandrus_amputatus       : 61 objects
+ Xylosandrus_germanus        : 50 objects
+ Ambrosiophilus_atratus      : 41 objects
+ Trypodendron_domesticum     : 16 objects
+ Xyleborus_celsus            : 15 objects
+ Hylesinus_aculeatus         : 13 objects
+ Dryocoetes_autographus      : 12 objects
+ Ambrosiodmus_minor          : 11 objects
+ Dendroctonus_rufipennis     : 10 objects
+ Scolytus_multistriatus      : 9 objects
+ Orthotomicus_caelatus       : 9 objects
+ Ips_grandicollis            : 9 objects
+ Euwallacea_validus          : 9 objects
 #### Unique Image Count per Class
+ Ambrosiodmus_minor          : 11 images
+ Ambrosiophilus_atratus      : 11 images
+ Anisandrus_dispar           : 12 images
+ Anisandrus_sayi             : 7 images
+ Cnestus_mutilatus           : 23 images
+ Coccotrypes_carpophagus     : 8 images
+ Coccotrypes_dactyliperda    : 30 images
+ Coptoborus_ricini           : 10 images
+ Cryptocarenus_heveae        : 16 images
+ Ctonoxylon_hagedorn         : 12 images
+ Cyclorhipidion_pelliculosum : 7 images
+ Dendroctonus_rufipennis     : 9 images
+ Dendroctonus_terebrans      : 46 images
+ Dendroctonus_valens         : 264 images
+ Dryocoetes_autographus      : 8 images
+ Euplatypus_compositus       : 23 images
+ Euwallacea_fornicatus       : 38 images
+ Euwallacea_perbrevis        : 9 images
+ Euwallacea_validus          : 9 images
+ Hylastes_porculus           : 8 images
+ Hylastes_salebrosus         : 13 images
+ Hylesinus_aculeatus         : 13 images
+ Hylesinus_crenatus          : 9 images
+ Hylesinus_toranio           : 13 images
+ Hylesinus_varius            : 78 images
+ Hylurgops_palliatus         : 15 images
+ Hylurgus_ligniperda         : 25 images
+ Hypothenemus_hampei         : 7 images
+ Ips_acuminatus              : 145 images
+ Ips_avulsus                 : 11 images
+ Ips_calligraphus            : 18 images
+ Ips_duplicatus              : 14 images
+ Ips_grandicollis            : 9 images
+ Ips_sexdentatus             : 227 images
+ Ips_typographus             : 314 images
+ Monarthrum_fasciatum        : 42 images
+ Monarthrum_mali             : 14 images
+ Myoplatypus_flavicornis     : 19 images
+ Orthotomicus_caelatus       : 9 images
+ Orthotomicus_erosus         : 7 images
+ Pagiocerus_frontalis        : 11 images
+ Phloeosinus_dentatus        : 38 images
+ Pityogenes_chalcographus    : 11 images
+ Pityophthorus_juglandis     : 22 images
+ Platypus_cylindrus          : 43 images
+ Platypus_koryoensis         : 26 images
+ Pycnarthrum_hispidium       : 11 images
+ Scolytodes_glaber           : 14 images
+ Scolytus_multistriatus      : 8 images
+ Scolytus_schevyrewi         : 8 images
+ Taphrorychus_bicolor        : 9 images
+ Tomicus_destruens           : 9 images
+ Trypodendron_domesticum     : 12 images
+ Xyleborinus_saxesenii       : 41 images
+ Xyleborus_affinis           : 29 images
+ Xyleborus_celsus            : 15 images
+ Xyleborus_ferrugineus       : 13 images
+ Xyleborus_glabratus         : 18 images
+ Xylosandrus_amputatus       : 10 images
+ Xylosandrus_compactus       : 38 images
+ Xylosandrus_crassiusculus   : 60 images
+ Xylosandrus_germanus        : 11 images
+ Xylosandrus_morigerus       : 11 images
 ## Dataset Creation