Datasets:
File size: 2,623 Bytes
8c93514 | 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 | format spacetravlr_training_log v1
gene Acvr2a
seed_only false
per_cell_cnn_export true
cnn_epochs_config 10
learning_rate 0.0002
lasso_n_iter_max 100
lasso_tol 0.0001
# summary: cluster_id, n_cells, n_modulators, lasso_r2, lasso_train_mse, lasso_fista_iters, lasso_converged, cnn_epochs_ran, cnn_mse_first, cnn_mse_last
cluster_id n_cells n_modulators lasso_r2 lasso_train_mse lasso_fista_iters lasso_converged cnn_epochs_ran cnn_mse_first cnn_mse_last
0 263 636 0.956319 0.000235 100 false 10 0.000733 0.000323
1 752 636 0.708597 0.000059 100 false 10 0.000184 0.000078
2 4234 636 0.725168 0.000288 100 false 10 0.000970 0.000496
3 3435 636 0.565913 0.000080 100 false 10 0.000088 0.000085
4 77 636 0.196656 0.000017 100 false 10 0.000989 0.000096
5 220 636 0.648711 0.000046 100 false 10 0.000070 0.000051
6 2395 636 0.776468 0.000094 100 false 10 0.000190 0.000102
7 14 636 0.195357 0.000021 100 false 10 0.000269 0.000030
8 534 636 0.750437 0.000030 100 false 10 0.000099 0.000053
9 232 636 0.785258 0.000021 100 false 10 0.000025 0.000023
10 108 636 0.904967 0.000062 100 false 10 0.000073 0.000061
# cnn_mse_by_epoch: cluster_id, epoch, train_mse
cluster_id epoch train_mse
0 0 0.000733
0 1 0.000599
0 2 0.000501
0 3 0.000432
0 4 0.000386
0 5 0.000356
0 6 0.000337
0 7 0.000326
0 8 0.000322
0 9 0.000323
1 0 0.000184
1 1 0.000160
1 2 0.000139
1 3 0.000121
1 4 0.000107
1 5 0.000096
1 6 0.000089
1 7 0.000083
1 8 0.000080
1 9 0.000078
2 0 0.000970
2 1 0.000757
2 2 0.000598
2 3 0.000494
2 4 0.000443
2 5 0.000435
2 6 0.000455
2 7 0.000480
2 8 0.000495
2 9 0.000496
3 0 0.000088
3 1 0.000087
3 2 0.000087
3 3 0.000087
3 4 0.000086
3 5 0.000086
3 6 0.000086
3 7 0.000085
3 8 0.000085
3 9 0.000085
4 0 0.000989
4 1 0.000713
4 2 0.000472
4 3 0.000277
4 4 0.000136
4 5 0.000052
4 6 0.000020
4 7 0.000027
4 8 0.000059
4 9 0.000096
5 0 0.000070
5 1 0.000062
5 2 0.000056
5 3 0.000052
5 4 0.000051
5 5 0.000051
5 6 0.000051
5 7 0.000052
5 8 0.000052
5 9 0.000051
6 0 0.000190
6 1 0.000166
6 2 0.000145
6 3 0.000129
6 4 0.000117
6 5 0.000109
6 6 0.000104
6 7 0.000101
6 8 0.000101
6 9 0.000102
7 0 0.000269
7 1 0.000210
7 2 0.000156
7 3 0.000110
7 4 0.000074
7 5 0.000047
7 6 0.000031
7 7 0.000024
7 8 0.000024
7 9 0.000030
8 0 0.000099
8 1 0.000090
8 2 0.000082
8 3 0.000075
8 4 0.000070
8 5 0.000065
8 6 0.000061
8 7 0.000058
8 8 0.000055
8 9 0.000053
9 0 0.000025
9 1 0.000025
9 2 0.000024
9 3 0.000024
9 4 0.000024
9 5 0.000023
9 6 0.000023
9 7 0.000023
9 8 0.000023
9 9 0.000023
10 0 0.000073
10 1 0.000071
10 2 0.000069
10 3 0.000067
10 4 0.000066
10 5 0.000064
10 6 0.000063
10 7 0.000062
10 8 0.000061
10 9 0.000061
|