Koushul's picture
Add xenium_skin_mixed sample13 SpaceTravLR outputs (no perturbations) (part 8)
8c93514 verified
Raw
History Blame Contribute Delete
2.62 kB
format spacetravlr_training_log v1
gene Acss2
seed_only false
per_cell_cnn_export true
cnn_epochs_config 10
learning_rate 0.0002
lasso_n_iter_max 100
lasso_tol 0.0001
# summary: cluster_id, n_cells, n_modulators, lasso_r2, lasso_train_mse, lasso_fista_iters, lasso_converged, cnn_epochs_ran, cnn_mse_first, cnn_mse_last
cluster_id n_cells n_modulators lasso_r2 lasso_train_mse lasso_fista_iters lasso_converged cnn_epochs_ran cnn_mse_first cnn_mse_last
0 263 638 0.888955 0.000019 100 false 10 0.000028 0.000023
1 752 638 0.655055 0.000047 100 false 10 0.000191 0.000068
2 4234 638 0.828039 0.001152 100 false 10 0.019391 0.004795
3 3435 638 0.414833 0.000037 100 false 10 0.000040 0.000039
4 77 638 0.523794 0.000001 100 false 10 0.000013 0.000009
5 220 638 0.826337 0.000051 100 false 10 0.000095 0.000059
6 2395 638 0.304471 0.000039 100 false 10 0.000051 0.000042
7 14 638 0.256671 0.000005 100 false 10 0.000033 0.000007
8 534 638 0.968297 0.000280 100 false 10 0.000337 0.000297
9 232 638 0.914932 0.000023 100 false 10 0.000077 0.000035
10 108 638 0.783351 0.000040 100 false 10 0.000416 0.000067
# cnn_mse_by_epoch: cluster_id, epoch, train_mse
cluster_id epoch train_mse
0 0 0.000028
0 1 0.000027
0 2 0.000027
0 3 0.000026
0 4 0.000025
0 5 0.000024
0 6 0.000024
0 7 0.000023
0 8 0.000023
0 9 0.000023
1 0 0.000191
1 1 0.000155
1 2 0.000126
1 3 0.000103
1 4 0.000086
1 5 0.000076
1 6 0.000071
1 7 0.000068
1 8 0.000068
1 9 0.000068
2 0 0.019391
2 1 0.013505
2 2 0.008836
2 3 0.005490
2 4 0.003482
2 5 0.002694
2 6 0.002841
2 7 0.003511
2 8 0.004267
2 9 0.004795
3 0 0.000040
3 1 0.000039
3 2 0.000039
3 3 0.000039
3 4 0.000039
3 5 0.000039
3 6 0.000039
3 7 0.000039
3 8 0.000039
3 9 0.000039
4 0 0.000013
4 1 0.000012
4 2 0.000012
4 3 0.000011
4 4 0.000011
4 5 0.000011
4 6 0.000010
4 7 0.000010
4 8 0.000010
4 9 0.000009
5 0 0.000095
5 1 0.000088
5 2 0.000081
5 3 0.000075
5 4 0.000071
5 5 0.000067
5 6 0.000064
5 7 0.000062
5 8 0.000060
5 9 0.000059
6 0 0.000051
6 1 0.000049
6 2 0.000047
6 3 0.000046
6 4 0.000045
6 5 0.000044
6 6 0.000043
6 7 0.000042
6 8 0.000042
6 9 0.000042
7 0 0.000033
7 1 0.000028
7 2 0.000024
7 3 0.000021
7 4 0.000017
7 5 0.000014
7 6 0.000011
7 7 0.000009
7 8 0.000008
7 9 0.000007
8 0 0.000337
8 1 0.000317
8 2 0.000308
8 3 0.000305
8 4 0.000305
8 5 0.000304
8 6 0.000303
8 7 0.000301
8 8 0.000299
8 9 0.000297
9 0 0.000077
9 1 0.000070
9 2 0.000063
9 3 0.000057
9 4 0.000052
9 5 0.000047
9 6 0.000043
9 7 0.000040
9 8 0.000037
9 9 0.000035
10 0 0.000416
10 1 0.000347
10 2 0.000284
10 3 0.000230
10 4 0.000184
10 5 0.000146
10 6 0.000116
10 7 0.000094
10 8 0.000077
10 9 0.000067