Datasets:

Modalities:
Text
Formats:
json
Libraries:
Datasets
pandas
License:
Slovenian_name_entity_recognition / e3c_v3.0_sl_val.json
saeedfarzi's picture
Upload 3 files
0a0e803 verified
[
{
"text": "poročamo o primeru 63 - letne ženske z zelo majhnim ampularnim karcinoidnim tumorjem , ki je bil v premeru 7 mm , vendar je bil povezan z 2 peripankreatičnima limfnima vozliščema metastazama .",
"entities": [
{
"entity_text": "karcinoidnim tumorjem",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "limfnima vozliščema metastazama",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "blaga povišanja encimov jeter so bila odkrita na njenem rednem zdravstvenem pregledu .",
"entities": [
{
"entity_text": "povišanja encimov jeter",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "izračunana tomografija ( CT ) je razkrila močno razširjen skupni žolčni kanal ( CBD ) in dva povečana peripankreatična bezgavka .",
"entities": [
{
"entity_text": "razširjen skupni žolčni kanal",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "CBD",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "povečana peripankreatična bezgavka",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "endoskopija je pokazala , da je bila ampula rahlo povečana zaradi submukoznega tumorja .",
"entities": [
{
"entity_text": "tumorja",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "biopsijski vzorec je razkril tumorske celice , ki so kazale monotonno proliferacijo , kar nakazuje na karacinoidni tumor .",
"entities": [
{
"entity_text": "tumorske",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "karacinoidni tumor",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "je je opravila resekcijo whipple , ki ohranja pilorus , z resekcijo limfnega vozla dissekcijo .",
"entities": []
},
{
"text": "odstranjena lezija je bil majhen submukozni tumor ( 7 mm v premeru ) na ampuli , z metastazami v 2 peripankreatičnih bezgavkah , in je bil diagnoziran kot maligni karcinoidni tumor .",
"entities": [
{
"entity_text": "odstranjena lezija",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "pacientka je bila 35 - letna ženska , ki se je pojavila z pogostim uriniranjem že 2 meseca .",
"entities": [
{
"entity_text": "pogostim uriniranjem",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "njena pretekla zdravstvena zgodovina je pokazala , da ni kadila zgodovino in ni imela pomembne družinske zgodovine .",
"entities": []
},
{
"text": "fizični pregled je bil nezaznamenljiv .",
"entities": []
},
{
"text": "je bila zdravljena kot urinarna okužba okužba , vendar ni bilo izboljšanja njenih simptomov .",
"entities": [
{
"entity_text": "urinarna okužba",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "analiza urina in kultura sta bili večkrat izvedeni , kar je bilo negativno za infekcijo .",
"entities": [
{
"entity_text": "infekcijo",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "druge laboratorijske podatki so bili prav tako neznačilni .",
"entities": []
},
{
"text": "med rutinsko evalvacijo je ultrazvok urinarnega sistema ( US ) razkril leziijo mehurja v velikosti 7 mm .",
"entities": [
{
"entity_text": "leziijo mehurja",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "da bi potrdili diagnozo , so opravili magnetno resonančno slikanje ( MRI ) trebuha in medenične votline ; to je razkrilo lezijsko na vrhu mehurja .",
"entities": [
{
"entity_text": "lezijsko na vrhu mehurja",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "da bi potrdili diagnozo in opravili histopatološki pregled , je pacient aprila 2018 opravil transuretralno resekcijo tumorja mehurja ( TURBT ) v aprilu 2018 .",
"entities": [
{
"entity_text": "tumorja mehurja",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "pred začetkom postopka je bila sečnica razširjena do fr : 28 ; najprej je bila lokacija tumorja opredeljena z cistoskopijo .",
"entities": [
{
"entity_text": "tumorja",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "nato je bilo resektirano z monopolarno koagulacijo od površinskih do globljih delov z odstranitvijo mišičnih plasti .",
"entities": []
},
{
"text": "primerni krvavitelji so bili vzeti in uporabljen je bil trojni foley kateter za neprekinjeno irigacijo .",
"entities": []
},
{
"text": "pacient je bil premeščen v sobo za okrevanje z popolno stabilnostjo .",
"entities": []
},
{
"text": "izseki histopatologije slajdov prikazujejo dobro definirano maso , sestavljeno iz neopadljivih izgledajočih vretenastih celic .",
"entities": []
},
{
"text": "nadaljnja imunohistokemija ( IHC ) je bila opravljena , ki je pokazala difuzno imunoreaktivnost za S100 , vendar so bili drugi markerji , vključno z gladko mišično aktinom ( SMA ) , desminom , citokeratinom , CD34 in beta kateninom , negativni .",
"entities": []
},
{
"text": "ki67 je bil 2 - 3% , zato je bila diagnoza švanoma potrjena .",
"entities": []
},
{
"text": "nato so bili opravljeni računalniški tomografski ( CT ) pregledi vratu , trebuha , medenice in prsnega koša , ki so bili normalni .",
"entities": []
},
{
"text": "mozgan in hrbtenica MRI ter fizikalni pregled nista pokazala nobenih dokazov o drugih švanomih ali dokazov o nevrofibromatozi .",
"entities": [
{
"entity_text": "švanomih",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "nevrofibromatozi",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "ni imela zgodovine nevrofibromatoze v svoji družini .",
"entities": [
{
"entity_text": "nevrofibromatoze",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "koža je bila po pregledu normalna in ni imela madežev café au lait .",
"entities": [
{
"entity_text": "madežev café au lait",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "ona ni bila primer bolezni von recklinghausen .",
"entities": [
{
"entity_text": "bolezni von recklinghausen",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "12 - letno dekle je imelo bolečine v trebuhu , visoko vztrajno vročino ( 40 ° C ) in hudo utrujenost .",
"entities": [
{
"entity_text": "bolečine v trebuhu",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "vročino",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "utrujenost",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "fizični pregled je razkril bledico , hepatomegalijo in stopnjo III splenomegalijo .",
"entities": [
{
"entity_text": "bledico",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "hepatomegalijo",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "splenomegalijo",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "izsledki preiskave so pokazali povišano število belih krvnih celic ( število ) ( WBC ) : 545,000 / mm³ .",
"entities": [
{
"entity_text": "povišano število belih krvnih celic",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "PNN : 49,050 / mm³ , hemoglobin : 11.6g / dl , trombociti : 328,000 / mm³ .",
"entities": []
},
{
"text": "pacientov periferni krvni razmaz je razkril izrazito levkocitozo z velikim številom nezrelih mieloidnih predhodnikov in 21% blastov .",
"entities": [
{
"entity_text": "levkocitozo",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "analiza BCR-ABL pokaže 94% v periferni krvi .",
"entities": []
},
{
"text": "pacient je bil diagnoziran z CML .",
"entities": [
{
"entity_text": "CML .",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "prejela je protokol kemoterapije protokol , ki je bil sestavljen iz hiperalkalinizacije , alopurinola , hidroksiuree in zdravljenja na osnovi imatiniba v odmerku 400mg na dan .",
"entities": []
},
{
"text": "pacient je dosegel popolno hematološko remisijo v treh mesecih in popolno citogenetsko remisijo v 12 mesecih .",
"entities": []
},
{
"text": "pacient je bil ponovno sprejet v naš pediatrični oddelek z pritožbami o hudi glavobolu , bruhanju , bolečini in dvostranski izgubi vida že tri dni .",
"entities": [
{
"entity_text": "hudi glavobolu",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "bruhanju",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "bolečini",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "dvostranski izgubi vida",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "pri pregledu je bil pacient brez vročine in je deloval bledo .",
"entities": []
},
{
"text": "krvni tlak je bil 100 / 60mm / hg in srčni utrip 98 utripov / minuto .",
"entities": []
},
{
"text": "ni bilo limfadenopatije in živčni sistem je bil pri pregledu normalen .",
"entities": [
{
"entity_text": "limfadenopatije",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "testiranje intraokularnih mišic je bilo normalno ; vendar je bila prisotna eksoftalmija v obeh očeh .",
"entities": [
{
"entity_text": "eksoftalmija",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "zenica je bila počasna pri odzivanju na svetlobo .",
"entities": []
},
{
"text": "fundoskopija je razkrila bilateralni stadij III oteklino diska in krvavitve mrežnice .",
"entities": [
{
"entity_text": "bilateralni stadij III oteklino diska",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "krvavitve mrežnice",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "podvržena je bila računalniški tomografiji ( CT ) možganov pregledu zaradi suma na levkemično vpletenost ali kateri koli drug intrakranialni dogodek ( cerebralni edem ) ; vendar , nič ni bilo najdeno .",
"entities": [
{
"entity_text": "levkemično",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "edem ) ; vendar",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "nadaljnji pregled kostnega mozga je pokazal , da ni morfoloških ali molekularnih dokazov za CML ali akutno levkemijo .",
"entities": [
{
"entity_text": "CML",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "akutno levkemijo",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "citološka ocena likvorja ( CSF ) je bila tudi negativna .",
"entities": []
},
{
"text": "pacient ni imel nobene druge znane patologije , ki bi jo lahko pripisali odgovornosti za retino edem .",
"entities": [
{
"entity_text": "retino edem",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "predlagali smo , da je to stranski učinek imatiniba , zato je bilo njegovo dajanje začasno prekinjeno .",
"entities": []
},
{
"text": "pacient je bil postavljen na anti-edemsko terapijo ( manitol , deksametazon ) .",
"entities": []
},
{
"text": "vendar pa se je nekaj mesecev kasneje pacient pojavil v urgenci z glavobolom in hudo bruhanjem .",
"entities": [
{
"entity_text": "glavobolom",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "bruhanjem .",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "opisala je ponovitev glavobolov istega značaja , ki so bili spremljani z šibkostjo okončin in krči .",
"entities": [
{
"entity_text": "glavobolov",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "krči",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "nevrološki sistem pregled je razkril vratno togost , prisotnost meningealnih znakov in spodnjo okončino paraplegijo .",
"entities": [
{
"entity_text": "vratno togost",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "spodnjo okončino paraplegijo",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "CT možganov je razkril kronični subduralni hematom in serpentinasto gyriformno okrepitev okoli kontuzije v desnem parietalnem in okcipitalnem režnju .",
"entities": [
{
"entity_text": "kronični subduralni hematom",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "kontuzije",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "analiza odvzetega CSF je pokazala limfoblaste v WBC štetju 11000 celic / ml .",
"entities": []
},
{
"text": "tok citometrije CSF je pokazal , da so bile blastne celice pozitivne za skupino diferenciacijskih markerjev ( CD ) ( CD34 , CD19 , CD10 , CD22 in delno pozitivne za CD45 ) , kar potrjuje ekstramedularno limfoidno infiltracijo CNS .",
"entities": [
{
"entity_text": "infiltracijo",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "izvedena je bila aspiracija kostnega mozga , da bi ocenili stanje njene kronične mielogene levkemije in rezultat je bil skladen s kronično fazo .",
"entities": [
{
"entity_text": "kronične mielogene levkemije",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "pregled fundusa je pokazal dvostransko optično atrofijo . diagnoza ekstramedularne izolirane CNS blastne krize ( limfoidni tip ) temelji na prisotnosti blastov v CSF ( potrjeno z metodo citometrije ) .",
"entities": [
{
"entity_text": "dvostransko optično atrofijo",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "pacient je prejel sistemsko indukcijsko kemoterapijo visokega odmerka in intratekalno terapijo ( metotreksat , arabinosid in deksametazon ) .",
"entities": []
},
{
"text": "imatinib je bil zamenjan z dasatinibom v odmerku 100 mg na dan .",
"entities": []
},
{
"text": "ona je bila zdravljena z 24 gy celotnega obsevanja možganov terapije .",
"entities": []
},
{
"text": "alogenska presaditev matičnih celic presaditev ni bila izvedljiva .",
"entities": []
},
{
"text": "opazili smo hitro napredujoče izboljšanje njenega nevrološkega stanja po končanju sistemske kemoterapije in fizikalne terapije ; vendar pa pacientov vidni izgubi niso sledili znaki izboljšanja .",
"entities": []
},
{
"text": "opazili smo 29 - letno žensko probandko z epizodo venske tromboze pri 18 letih in družinsko anamnezo tromboze .",
"entities": [
{
"entity_text": "venske tromboze",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "tromboze",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "raven antitrombina pri našem pacientu je bila nizka , 44 - 48% ( pomanjkanje AT tipa I ) .",
"entities": []
},
{
"text": "novo genetsko varianto c .662G > C ( p.w221s ) v genu SERPINC1 so odkrili pri probandu in prizadetem očetu , vendar je bila odsotna pri zdravi sestri .",
"entities": []
},
{
"text": "uporabili smo in silico orodja za ocenjevanje možnega vpliva različice p.w221s na strukturo in funkcijo proteina .",
"entities": []
},
{
"text": "V mutiranem proteinu SERPINC1 se oblikuje novo n-vezano glikozilacijsko mesto , vendar je nejasno , ali je glikozilacija na mestu 219 - 221 mogoča .",
"entities": []
},
{
"text": "poročamo o primeru skoraj donošenega moškega novorojenčka z gestacijsko starostjo 35 tednov .",
"entities": []
},
{
"text": "on je bil tretji rojeni otrok 27 - letne matere brez pomembne pretekle zgodovine .",
"entities": []
},
{
"text": "on je bil izpeljan iz zakonske zveze tretje stopnje sorodstva .",
"entities": []
},
{
"text": "rodil se je z normalnim vaginalnim porodom z normalno ekstra-uterino prilagoditvijo .",
"entities": []
},
{
"text": "opazili so meconijem obarvano amniotsko tekočino .",
"entities": []
},
{
"text": "njegova rojstna teža je bila 3030g ( 75 . percentil ) .",
"entities": []
},
{
"text": "dojenček je imel normalen fizikalni pregled ob rojstvu , razen prehodne dihanja stiske .",
"entities": [
{
"entity_text": "dihanja stiske",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "on je bil hospitaliziran za štiri dni v zasebni kliniki , zaradi suma na materno-fetalno infekcijo , kjer je prejel antibiotike za 48 ur .",
"entities": [
{
"entity_text": "infekcijo",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "med njegovo hospitalizacijo ni razvil nobenih simptomov .",
"entities": []
},
{
"text": "teža izhoda je bila 2400g , kar pomeni izgubo 630g . ko se je vrnil domov , je prejemal izključno materino dojenje .",
"entities": []
},
{
"text": "na peti dan življenja je imel več rumenkasto-vodenih blat ( približno 12 - krat ) in je zavračal hranjenje v kontekstu apireksije .",
"entities": []
},
{
"text": "imel je klinične znake hude dehidracije brez vročine ali bruhanja .",
"entities": [
{
"entity_text": "dehidracije",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "vročine",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "bruhanja",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "on je izgubil 930g v primerjavi z rojstno težo .",
"entities": []
},
{
"text": "trebušna votlina ni bila ne občutljiva ne napihnjena , preostali del njegovega fizičnega pregleda je bil normalen .",
"entities": []
},
{
"text": "laboratorijske ugotovitve so razkrile hipernatremijo 152meq / L , hiperkalijemijo 7,8meq / L in hudo metabolično acidozo : kri PH : 7,1 , HCO3 : 4meq / L .",
"entities": [
{
"entity_text": "hipernatremijo",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "hiperkalijemijo",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "hudo metabolično acidozo :",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "osmotska vrzel je bila 45 .",
"entities": []
},
{
"text": "nobene levkocitoze ni bilo in raven c-reaktivnega proteina v serumu je bila normalna .",
"entities": [
{
"entity_text": "levkocitoze",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "dojenček je bil zdravljen z intravenskimi tekočinami in elektroliti ter antibiotiki po pridobitvi krvi in blata kultur , predpostavljajoč infekcijsko etiologijo .",
"entities": []
},
{
"text": "po 26 urah rehidracijske terapije se je dehidracija razrešila , vendar se je pojavila funkcionalna akutna ledvična okvara , zapletena z acidozo in hiperkalemijo .",
"entities": [
{
"entity_text": "dehidracija",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "funkcionalna akutna ledvična okvara",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "acidozo",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "hiperkalemijo",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "izvid rentgenskega posnetka prs je prikazal vzorec \" netopirjevih kril \" in kardiothorakalni indeks je bil 0 , 45 .",
"entities": []
},
{
"text": "ledvični ultrazvok je pokazal diskretno hiperehoično skorjo ledvic in odsotnost ledvičnih malformacij . na 11 . dan življenja je bil premeščen v pediatrično intenzivno nego .",
"entities": [
{
"entity_text": "ledvičnih malformacij",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "on je potreboval mehanično ventilacijo za tri dni in ekskluzivno parenteralno hranjenje preko centralnega katetra .",
"entities": []
},
{
"text": "izid evolucije je bil obremenjen s holestazo zaradi dolgotrajnega parenteralnega hranjenja in bolnišnične infekcije s staphylococcus epidermidis .",
"entities": [
{
"entity_text": "holestazo",
"type": "CLINENTITY"
},
{
"entity_text": "bolnišnične infekcije",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "od njegove sprejema je razvil sluzavo drisko s 3 do 4 blatom na dan .",
"entities": []
},
{
"text": "predstavil je obilno drisko med vsakim poskusom uvajanja enteralne prehrane s hidrolizirano mlečno formulo .",
"entities": [
{
"entity_text": "drisko",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "on je bil odpuščen po 32 dneh z izhodno težo 3250g . oesophago-gastro-duodenoskopija in duodenalna biopsija sta pokazali delno vilozno atrofijo , povezano z nepravilnostmi čopičastega roba .",
"entities": [
{
"entity_text": "delno vilozno atrofijo",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "periodično kislino schiff ( PAS ) barvilo je razkrilo nenormalnosti na čopičastem robu , ki so bile značilne zaradi izgube linearne sestavine enterocitov s prisotnostjo intracitoplazmatskega PAS + trakta v apikalnem polu enterocitov z neenakomerno debelino in včasih z vzorcem dvojnih kontur .",
"entities": [
{
"entity_text": "nenormalnosti",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "V podsluznici so bile številne brunnerjeve žleze .",
"entities": []
},
{
"text": "ugotavljamo obstoj številnih hemoragičnih sufuzij .",
"entities": [
{
"entity_text": "hemoragičnih sufuzij",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "CD10 imunobarvanje je bilo pozitivno .",
"entities": []
},
{
"text": "tako je bila postavljena diagnoza hipoteze MVID .",
"entities": [
{
"entity_text": "MVID",
"type": "CLINENTITY"
}
]
},
{
"text": "mikroskopski pregled je potrdil diagnozo . analiza mutacij vzorcev periferne krvi novorojenčka je razkrila mutacijo v homozigotnem statusu gena MYO5B .",
"entities": []
},
{
"text": "dojenček je umrl po 97 dneh življenja zaradi septičnega šoka in večorganske okvare .",
"entities": []
}
]