PMCID string | Sentences string | ner list |
|---|---|---|
PMC11731161 | Collectively, these results indicate that SEL facilitates the depletion of XPO1 in MM cells through ubiquitin-proteasomal-mediated degradation pathway. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"ubiquitin-proteasomal-mediated",
"degradation",
"pathway",
"."
]
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] |
PMC11345828 | H NMR (CDCl3): δ 9.09 (s, 1H), 7.74 (d, J = 8.8 Hz, 1H), 7.30 (d, J = 8.8 Hz, 1H), 6.63 (s, 1H), 3.98 (t, J = 4.8 Hz, 2H), 3.72 (dd, J = 12.4, 3.6 Hz, 1H),3.60 (t, J = 4.8 Hz, 1H), 3.32–3.40 (m, 2H), 3.15 (dd, J = 12.4, 3.6 Hz, 1H), 2.39 (s, 3H), 2.33 (s, 6H), 2.20 (s, 6H), 1.02 (d, J = 6.8 Hz, 3H). | [
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"=",
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")",
"."
]
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PMC11705547 | CSF1R is a type III protein tyrosine kinase receptor that mediates polarization of TAMs to the pro-tumorigenic M2 phenotype . | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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] |
PMC11768281 | This review explores the potential of T cells as critical targets for malaria immunotherapy, emphasizing their diverse roles and mechanisms of action. | [
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"of",
"action",
"."
]
}
] |
PMC3675084 | To confirm that BPR0L075 is not a substrate for efflux pumps, we measured the intracellular BPR0L075 levels in the two pairs of cell lines OVCAR-3/OVCAR-3-TR and SKOV-3/SKOV-3-TR using a sensitive LC/MS/MS method (Figure 2B). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"2B",
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"."
]
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] |
PMC11593031 | Compared to Neuro-2a, Neuro-2a TR-beta has nine new derivative chromosomes, lacks eleven of the derivatives present in Neuro-2a, and duplicated one of the original derivatives (Figure 2). | [
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"B-CellLine",
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"2",
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"."
]
}
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PMC11727907 | We found that IGF-1 does not affect the amount of PKM2 in the cytosolic fraction (F1) but induces a time-dependent localization of PKM2 firstly in the soluble nuclear and then in the chromatin-bound fractions (F3, F4, Figure 9B,C). | [
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"."
]
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PMC9599726 | In cancer cells, iron is mainly imported via the TFRC, and this transmembrane receptor has been found to be overexpressed in many types of cancers, such as brain, breast, colon, ovarian, and lung cancers, as well as in leukemia . | [
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"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"cancers",
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"as",
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"leukemia",
"."
]
}
] |
PMC11473843 | Heatmap showing the expression profile of epithelial (KRT8,18) and mesenchymal markers of A549 cells treated as in (C). ( | [
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"O",
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")",
".",
"("
]
}
] |
PMC7582629 | In order to achieve the quality of cell sensing in terms of sensitivity and specificity, RS was combined with PCA, which provides a good separation between the representative clusters of each cell line (Figure 2b). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"2b",
")",
"."
]
}
] |
PMC11718109 | Since antibodies that yield reliable VMAT2 immunofluorescence were not available, expression of VMAT2 tagged at its C-terminus with either GFP or mCherry was used in this study. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
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"."
]
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] |
PMC11001582 | Graph, mean ± s.e.m., | [
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","
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] |
PMC9581083 | Modern pharmacology has revealed that H. cordata has antiviral, anti-inflammatory, and antioxidative activities (Muluye et al., 2014). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O"
],
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"Muluye",
"et",
"al.",
",",
"2014",
")",
"."
]
}
] |
PMC11694109 | Stephan and colleagues approach this question by harnessing the power of spectral flow cytometry (FC) to perform an extensive analysis of the immune background in TCL. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O"
],
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"and",
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")",
"to",
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"."
]
}
] |
PMC11188874 | To determine the direct effect of HDAC6 and HR23B on proteasome activity, RPMI-8226 cells were transfected with a plasmid that expressed FLAG-tagged PSMD14 which is an essential non-ATPase component of 26S proteasomes. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"B-CellLine",
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"."
]
}
] |
PMC9429973 | ASXL1 and TP53 mutations were enriched, occurring in 46% and 53% of patients. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
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",",
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"%",
"of",
"patients",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Key DDR elements include sensor proteins that detect damage (e.g. PARP1 and 2), mediators and signaling transducers (e.g. DNA-PK) that regulate downstream targets, and effector molecules (e.g. CHK1 and 2). | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"DDR",
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"include",
"sensor",
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")",
"that",
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"downstream",
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"and",
"effector",
"molecules",
"(",
"e.g.",
"CHK1",
"and",
"2",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Image: Summary/Conclusion: In the Netherlands, 42 cases of BIA-ALCL have been reported since 1997, with 24% of the patients diagnosed with stage II-IV. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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"tokens": [
"Image",
":",
"Summary/Conclusion",
":",
"In",
"the",
"Netherlands",
",",
"42",
"cases",
"of",
"BIA-ALCL",
"have",
"been",
"reported",
"since",
"1997",
",",
"with",
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"patients",
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"with",
"stage",
"II-IV",
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]
}
] |
PMC11363012 | J. et al.). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"J.",
"et",
"al.",
")",
"."
]
}
] |
PMC10850553 | Glomerulonephritis was induced in rats by the injection of anti-Thy1.1 antibody, and the kidney was harvested subjected to immunohistochemical analyses. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Glomerulonephritis",
"was",
"induced",
"in",
"rats",
"by",
"the",
"injection",
"of",
"anti-Thy1.1",
"antibody",
",",
"and",
"the",
"kidney",
"was",
"harvested",
"subjected",
"to",
"immunohistochemical",
"analyses",
"."
]
}
] |
PMC11742290 | LGR5 promoted cisplatin resistance of breast cancer cells (MCF-7) through PKA (Protein Kinase A) and LGR5-KD inhibited docetaxel drug resistance . | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"LGR5",
"promoted",
"cisplatin",
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"of",
"breast",
"cancer",
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"MCF-7",
")",
"through",
"PKA",
"(",
"Protein",
"Kinase",
"A",
")",
"and",
"LGR5-KD",
"inhibited",
"docetaxel",
"drug",
"resistance",
"."
]
}
] |
PMC11725127 | Figure 6 USP2 is a potential target in MM treatment. ( | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Figure",
"6",
"USP2",
"is",
"a",
"potential",
"target",
"in",
"MM",
"treatment",
".",
"("
]
}
] |
PMC11394730 | Another way to explain the effects of genistein anticancer activity on cancer cells is by deregulating the cell cycle to ensure the regulation of cell growth and cell cycle progression in cancer cells, modulating the expression of cell cycle-regulatory proteins to arrest the cycle in different phases. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Another",
"way",
"to",
"explain",
"the",
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"genistein",
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"is",
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"deregulating",
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"cell",
"cycle",
"to",
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"and",
"cell",
"cycle",
"progression",
"in",
"cancer",
"cells",
",",
"modulating",
"the",
"expression",
"of",
"cell",
"cycle-regulatory",
"proteins",
"to",
"arrest",
"the",
"cycle",
"in",
"different",
"phases",
"."
]
}
] |
PMC11721587 | In the case of Fu (or Ulk3)/CK1 sequential kinase assay, glutathione beads preabsorbed with GST or GST-fusion proteins were firstly incubated with either FuN or Ulk3 for 15 min and then centrifuged and washed thoroughly by 1× kinase assay buffer for three times. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"In",
"the",
"case",
"of",
"Fu",
"(",
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"Ulk3)/CK1",
"sequential",
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"proteins",
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"incubated",
"with",
"either",
"FuN",
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"min",
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"then",
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"thoroughly",
"by",
"1",
"×",
"kinase",
"assay",
"buffer",
"for",
"three",
"times",
"."
]
}
] |
PMC11658074 | Created with BioRender.com) To investigate whether the expression of CD151 on AT-EVs facilitates faster cellular uptake than that on ADSC-EVs, we isolated CD151-positive AT-EVs from CD151-negative AT-EVs via magnetic beads (Fig. 6e). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"Created",
"with",
"BioRender.com",
")",
"To",
"investigate",
"whether",
"the",
"expression",
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"CD151",
"on",
"AT-EVs",
"facilitates",
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"than",
"that",
"on",
"ADSC-EVs",
",",
"we",
"isolated",
"CD151-positive",
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"from",
"CD151-negative",
"AT-EVs",
"via",
"magnetic",
"beads",
"(",
"Fig.",
"6e",
")",
"."
]
}
] |
PMC10965680 | According to the autosomal-based PCA, PC1 accounted for 2.55% of the variation and effectively distinguished Jining goats from Xiangdong goats and the other breeds. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"distinguished",
"Jining",
"goats",
"from",
"Xiangdong",
"goats",
"and",
"the",
"other",
"breeds",
"."
]
}
] |
PMC3019555 | The oxygen-dependent proteasomal degradation of HIF-1α, mediated primarily by the von Hippel Lindau protein (pVHL), is a well-characterized pathway, and it is widely accepted that inhibition of pVHL results in HIF-1α protein accumulation during hypoxia (Jaakkola et al., 2001). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"oxygen-dependent",
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"the",
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"pVHL",
")",
",",
"is",
"a",
"well-characterized",
"pathway",
",",
"and",
"it",
"is",
"widely",
"accepted",
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"inhibition",
"of",
"pVHL",
"results",
"in",
"HIF-1α",
"protein",
"accumulation",
"during",
"hypoxia",
"(",
"Jaakkola",
"et",
"al.",
",",
"2001",
")",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Image: Summary/Conclusion: 6 cycles of R-CHOEP-14 followed by 2 cycles of DHAP and an autologous stem cell transplant is feasible and well tolerated with limited toxicity. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Image",
":",
"Summary/Conclusion",
":",
"6",
"cycles",
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"R-CHOEP-14",
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"2",
"cycles",
"of",
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"and",
"an",
"autologous",
"stem",
"cell",
"transplant",
"is",
"feasible",
"and",
"well",
"tolerated",
"with",
"limited",
"toxicity",
"."
]
}
] |
PMC11438317 | Blots were developed by the enhanced chemiluminescence technique with Pierce ECL Western Blotting substrate (Thermo Scientific, Rockford IL) according to the manufacturer’s instructions. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Blots",
"were",
"developed",
"by",
"the",
"enhanced",
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"with",
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"ECL",
"Western",
"Blotting",
"substrate",
"(",
"Thermo",
"Scientific",
",",
"Rockford",
"IL",
")",
"according",
"to",
"the",
"manufacturer",
"’s",
"instructions",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | Using fluorospot analysis after two doses, an overall T-cell response was observed in 88.3% (53/60) patients. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Using",
"fluorospot",
"analysis",
"after",
"two",
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",",
"an",
"overall",
"T-cell",
"response",
"was",
"observed",
"in",
"88.3",
"%",
"(",
"53/60",
")",
"patients",
"."
]
}
] |
PMC11686380 | Scale bar, 200 μm. ( | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
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"Scale",
"bar",
",",
"200",
"μm",
".",
"("
]
}
] |
PMC9429973 | We compared demographics, clinical characteristics, cell of origin (COO), and MYC rearrangements using Chi-square analysis. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"We",
"compared",
"demographics",
",",
"clinical",
"characteristics",
",",
"cell",
"of",
"origin",
"(",
"COO",
")",
",",
"and",
"MYC",
"rearrangements",
"using",
"Chi-square",
"analysis",
"."
]
}
] |
PMC11774251 | Principal Component Analysis (PCA) of RNA-Seq analysis revealed distinct mRNA profiles among the NC (non-treated), CON (TNF-α-treated), and Tan-I (TNF-α and Tan-I-treated) groups (Figure 4A). | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Principal",
"Component",
"Analysis",
"(",
"PCA",
")",
"of",
"RNA-Seq",
"analysis",
"revealed",
"distinct",
"mRNA",
"profiles",
"among",
"the",
"NC",
"(",
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")",
",",
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"(",
"TNF-α-treated",
")",
",",
"and",
"Tan-I",
"(",
"TNF-α",
"and",
"Tan-I-treated",
")",
"groups",
"(",
"Figure",
"4A",
")",
"."
]
}
] |
PMC6889484 | Supernatants were collected every 2 to 3 days for 21 days and measured by p24 CA ELISA to determine replication kinetics. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Supernatants",
"were",
"collected",
"every",
"2",
"to",
"3",
"days",
"for",
"21",
"days",
"and",
"measured",
"by",
"p24",
"CA",
"ELISA",
"to",
"determine",
"replication",
"kinetics",
"."
]
}
] |
PMC11394386 | This suggests that PI3K/AKT pathway’s positive regulation of the Wnt/β-catenin pathway in HeLa cells may be facilitated through HOTAIR expression. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"suggests",
"that",
"PI3K/AKT",
"pathway",
"’s",
"positive",
"regulation",
"of",
"the",
"Wnt/β-catenin",
"pathway",
"in",
"HeLa",
"cells",
"may",
"be",
"facilitated",
"through",
"HOTAIR",
"expression",
"."
]
}
] |
PMC11720808 | Briefly, after treatment with SCU at the indicated concentrations, cells were incubated with 20 μL EdU for 2 hours following the manufacturer’s instructions. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Briefly",
",",
"after",
"treatment",
"with",
"SCU",
"at",
"the",
"indicated",
"concentrations",
",",
"cells",
"were",
"incubated",
"with",
"20",
"μL",
"EdU",
"for",
"2",
"hours",
"following",
"the",
"manufacturer",
"’s",
"instructions",
"."
]
}
] |
PMC5261804 | Unsupervised Hierarchical Clustering of the 360 most essential PPIs across the 165 cell lines identifies 12 major clusters. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Unsupervised",
"Hierarchical",
"Clustering",
"of",
"the",
"360",
"most",
"essential",
"PPIs",
"across",
"the",
"165",
"cell",
"lines",
"identifies",
"12",
"major",
"clusters",
"."
]
}
] |
PMC11422497 | Three fields of view were captured at each time point, ensuring a comprehensive assessment of the wound healing process. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Three",
"fields",
"of",
"view",
"were",
"captured",
"at",
"each",
"time",
"point",
",",
"ensuring",
"a",
"comprehensive",
"assessment",
"of",
"the",
"wound",
"healing",
"process",
"."
]
}
] |
PMC9841531 | This effect of apparent partial inhibition has frequently been observed in independent studies. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"effect",
"of",
"apparent",
"partial",
"inhibition",
"has",
"frequently",
"been",
"observed",
"in",
"independent",
"studies",
"."
]
}
] |
PMC10093184 | As for the inner spheroid organization, a zonal structure has been proposed based on nutrients, oxygen, and waste transport . | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"As",
"for",
"the",
"inner",
"spheroid",
"organization",
",",
"a",
"zonal",
"structure",
"has",
"been",
"proposed",
"based",
"on",
"nutrients",
",",
"oxygen",
",",
"and",
"waste",
"transport",
"."
]
}
] |
PMC11802855 | Western blot analysis of the expression level of CXCL7 protein in the CXCL7-KD and NC U266 (H)/RPMI8226 (I) cell lines. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CellLine",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"Western",
"blot",
"analysis",
"of",
"the",
"expression",
"level",
"of",
"CXCL7",
"protein",
"in",
"the",
"CXCL7-KD",
"and",
"NC",
"U266",
"(H)/RPMI8226",
"(",
"I",
")",
"cell",
"lines",
"."
]
}
] |
PMC11732635 | NK, natural killer; IgM, immunoglobulin M; IgG, immunoglobulin G; EBV, Epstein-Barr virus; CT, computed tomography; FDG, fluorodeoxyglucose. | [
{
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"NK",
",",
"natural",
"killer",
";",
"IgM",
",",
"immunoglobulin",
"M",
";",
"IgG",
",",
"immunoglobulin",
"G",
";",
"EBV",
",",
"Epstein-Barr",
"virus",
";",
"CT",
",",
"computed",
"tomography",
";",
"FDG",
",",
"fluorodeoxyglucose",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | All thirteen patients showed gradual recovery over a period of 1 week to 2 months after the event. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
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"thirteen",
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"gradual",
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"period",
"of",
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"to",
"2",
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"after",
"the",
"event",
"."
]
}
] |
PMC3931643 | Cell death was also measured using Annexin V (Life Technologies, Grand Island, NY) and propidium iodide (PI) (Life Technologies, Grand Island, NY) staining. | [
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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")",
"(",
"Life",
"Technologies",
",",
"Grand",
"Island",
",",
"NY",
")",
"staining",
"."
]
}
] |
PMC11732523 | Sputum culture identified Pseudomonas aeruginosa, and SARS-CoV-2 RT-PCR (Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction) confirmed infection with cycle threshold (Ct) values of 29.56 (N gene) and 28.40 (ORF1ab gene). | [
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"N",
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"and",
"28.40",
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"ORF1ab",
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")",
"."
]
}
] |
PMC11609529 | After 48 h, luciferase assays were performed, and YAP1 promoter firefly luciferase activity was shown as fold activation relative to the basal level with an empty pCMV2 vector (n = 2, mean ± SD). | [
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"."
]
}
] |
PMC10840195 | The figure only marks the significance of 96 h drug treatment. | [
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"."
]
}
] |
PMC11678448 | IL-6, a significant pro-inflammatory factor, is produced by T lymphocytes, monocytes/macrophages, and vascular endothelial cells. | [
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"."
]
}
] |
PMC4355729 | However, no differences of CD44 and POU5F1 were observed between the wild type and mutant cells (Fig. 3d). | [
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"Fig.",
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"."
]
}
] |
PMC11468365 | The drug combination data is obtained from the extensive O’Neil cancer screening dataset. | [
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"."
]
}
] |
PMC11752767 | Natural killer cells (NK cells), originating from CD34+ hematopoietic progenitors, exert anti-tumor activity independent of TCR-MHC restriction, without the risk of causing graft-versus-host disease (GVHD). | [
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"."
]
}
] |
PMC11222184 | In conclusion, it shows that HSP90 inhibitors can be considered as a promising candidate in the treatment of neuroblastoma and resistance to chemotherapy. | [
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"."
]
}
] |
PMC6461034 | In Fig 6B and D, the kinase impact score for pTyr‐based and TiO2‐based phosphoproteomics data is shown as a function of the top‐N kinase activity list for all cell lines analyzed. | [
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"lines",
"analyzed",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | A. Ferrer, A. Mangaonkar, T. Lasho, M. Wylam, C. Finke, J. Fernandez, R. He, D. Viswanatha, M. Patnaik Division of Hematology; Center for Individualized Medicine; Division of Pulmonary and Critical Care Medicine; Department of Hematopathology, Mayo Clinic, Rochester, United States of America Background: Genetic variants in TERT, the gene that encodes telomerase reverse transcriptase, can result in accelerated telomere attrition. | [
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"O",
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"."
]
}
] |
PMC9429973 | Regarding risk, 72.7% were classified as ISS ≥2 and 18.7% of patients evaluated had high-risk cytogenetics (n=64). | [
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PMC9429973 | vWF:FVIII and FVIII were measured using a clotting assay with factors deficient plasma by fully automated coagulometer ACL Elite Pro (Instrumentation Laboratory). | [
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] |
PMC10818062 | These Ca responses were sufficient to activate caspase-3, indicative of apoptosis. | [
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PMC10154881 | We previously established a recombinant measles virus (rMV‐SLAMblind) that targets NECTIN4‐expressing cancer cells and demonstrated its antitumor effects using a xenograft model in an immunodeficient mouse. | [
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]
}
] |
PMC9429973 | Azacitidine was dosed at 75mg/m for seven days per cycle. | [
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]
}
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PMC10719213 | Data are expressed as the mtDNA abundance relative to the copy number of the nuclear-encoded 18S rRNA gene a.u. | [
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"a.u",
"."
]
}
] |
PMC11420784 | D, Western blotting of LC3-II in the vesicles containing bacteria from WT, ΔpldA, or ΔpldA+ infected 5637 cells. | [
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"infected",
"5637",
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"."
]
}
] |
PMC11705547 | In addition, ROS-responsive NPs can inhibit the activity of glutathione S-transferase (GST), reduce GSH-mediated cisplatin resistance, and improve the chemotherapeutic effect of cisplatin . | [
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"chemotherapeutic",
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"cisplatin",
"."
]
}
] |
PMC10887351 | In addition, the CA binds to β-ARs, localized on the immune cell surface in the TME, and regulates the innate and adaptive immunity . | [
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"regulates",
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"adaptive",
"immunity",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | S. Ringelstein-Harlev, T. Azoulay, I. Slouzkey, M. Karmona, M. Filatov, G. Sarig Rambam Health Care Campus; The Ruth and Bruce Rappaport Faculty of Medicine, Technion, Israel Institute of Technology, Haifa, Israel Background: Natural killer (NK) cells play a role in cancer cell elimination; however, modifications in their activity induced by malignant cells can lead to solid and hematological cancer immune evasion. | [
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"Ringelstein-Harlev",
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"T.",
"Azoulay",
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"I.",
"Slouzkey",
",",
"M.",
"Karmona",
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"M.",
"Filatov",
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"G.",
"Sarig",
"Rambam",
"Health",
"Care",
"Campus",
";",
"The",
"Ruth",
"and",
"Bruce",
"Rappaport",
"Faculty",
"of",
"Medicine",
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"Technion",
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"Israel",
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"Israel",
"Background",
":",
"Natural",
"killer",
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"NK",
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"in",
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"solid",
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"cancer",
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"evasion",
"."
]
}
] |
PMC11635087 | After osmium coating for 3 sec using an osmium coater (HPC-1SW; Vacuum Device Co., Ltd.), electron microscopic observation was performed using a field-emission scanning electron microscope (SU8220; Hitachi High-Tech) equipped with a highly sensitive backscatter-electron detector (YAG-BSE; Hitachi High-Tech) at an accelerating voltage of 5 kV. The photosynthetic quantum yield of chloroplasts was measured using imaging PAM microscopy (WALZ) at 25℃. | [
{
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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")",
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"The",
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"of",
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"using",
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"(",
"WALZ",
")",
"at",
"25",
"℃",
"."
]
}
] |
PMC9429973 | All pts who progressed after CT for SR1 (n=31) received NT for SR2; whereas 73% (n=11) of those progressing after NT for SR1 received CT for SR2. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"73",
"%",
"(",
"n=11",
")",
"of",
"those",
"progressing",
"after",
"NT",
"for",
"SR1",
"received",
"CT",
"for",
"SR2",
"."
]
}
] |
PMC4270159 | Cohort 3: KHM-3S cell line. | [
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"O",
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"."
]
}
] |
PMC8358176 | SWCNTs and MWCNTs functionalization were confirmed by FTIR spectroscopy. | [
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"spectroscopy",
"."
]
}
] |
PMC11637276 | To assess whether the ECM was trafficked together with β1 integrin, we assessed β1 integrin localisation in cells seeded on fluorescently labelled Matrigel. | [
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"labelled",
"Matrigel",
"."
]
}
] |
PMC7724160 | 60 µL of each sample was added to an appropriate well of a 96 well plate (Corning Life Sciences, Edison, NJ). | [
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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"Edison",
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"."
]
}
] |
PMC9429973 | The hemogram returned to normal after 48 days. | [
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"."
]
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] |
PMC10335954 | TRIP13-dependent JAK/STAT and NF-κB signaling cascade were found as two key pathways in the carcinogenesis of GC. | [
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"O",
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"O",
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"GC",
"."
]
}
] |
PMC11762280 | D Representative images of H&E staining and TUNEL staining of skin sections from Ac-DEVD-CHO or PBS treated mice after UVB irradiation. | [
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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],
"tokens": [
"D",
"Representative",
"images",
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"H&E",
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"staining",
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"Ac-DEVD-CHO",
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"UVB",
"irradiation",
"."
]
}
] |
PMC11488203 | GFP-labeled normal human mammary epithelial cells (HMEC) and MDA-MB-231 breast cancer cells (MDA) were treated with taxol-loaded exosomes (diluted 1:107 similar to the treatment described in Fig. 2) from three different MSC populations (MSC241111; MSC280416; MSC180314) or with taxol (0.1 nM; 1 nM) for 72 h. Thereafter, the viability was measured by fluoroscan assay and the percentage of viable GFP-positive cells was calculated according to corresponding untreated populations (medium control) after 72 h. The numbers above the stars of significance indicate the percentage of reduced viability. | [
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"O",
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"I-CellLine",
"I-CellLine",
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"O",
"B-CellLine",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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"O",
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"B-CellLine",
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"B-CellLine",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
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"O"
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"to",
"the",
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"Fig.",
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")",
"from",
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"(",
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";",
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")",
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";",
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"and",
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"to",
"corresponding",
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"control",
")",
"after",
"72",
"h.",
"The",
"numbers",
"above",
"the",
"stars",
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"significance",
"indicate",
"the",
"percentage",
"of",
"reduced",
"viability",
"."
]
}
] |
PMC3122064 | Importantly, an analogous Fas-dependent mechanism of apoptosis upon Nutlin-3 treatment is executed in wild-type p53 expressing Hodgkin lymphoma and acute myeloid leukaemia cell lines. | [
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"O",
"O"
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",",
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"analogous",
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"Hodgkin",
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"and",
"acute",
"myeloid",
"leukaemia",
"cell",
"lines",
"."
]
}
] |
PMC11770199 | All cells were incubated at 37 °C with 5% CO2 and 95% humidity. | [
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"5",
"%",
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"%",
"humidity",
"."
]
}
] |
PMC5035325 | R3m, 7A7 and 14F7 mAbs were visualized using the kit Universal Dako LSBA+ System-HRP (Dako, K0679) and the manufacturer’s recommendations were followed. | [
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"System-HRP",
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"Dako",
",",
"K0679",
")",
"and",
"the",
"manufacturer",
"’s",
"recommendations",
"were",
"followed",
"."
]
}
] |
PMC10674574 | Then, in order to demonstrate the suitability of the Caco-2 model, permeability studies of the tested compound should be performed in the presence of selected control drugs. | [
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"O",
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"studies",
"of",
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"be",
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"in",
"the",
"presence",
"of",
"selected",
"control",
"drugs",
"."
]
}
] |
PMC10968586 | Moreover, some of these natural compounds may have a cytotoxic effect, making them interesting alternatives to or candidates for integration into conventional therapeutic approaches . | [
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"O",
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"O",
"O",
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"O",
"O"
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"tokens": [
"Moreover",
",",
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",",
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"to",
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"candidates",
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"approaches",
"."
]
}
] |
PMC3931643 | Renilla luciferase activity was normalized to the cap independent firefly luciferase activity. | [
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"."
]
}
] |
PMC10506676 | Numerous cancers and EBV have been proven to be related thus far. | [
{
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"O",
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"O",
"O",
"O",
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"O",
"O",
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],
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"Numerous",
"cancers",
"and",
"EBV",
"have",
"been",
"proven",
"to",
"be",
"related",
"thus",
"far",
"."
]
}
] |
PMC11628309 | This lack of standardized differentiation conditions impacts result reproducibility and it makes it very difficult to compare the results obtained from different research groups. | [
{
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"O",
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
],
"tokens": [
"This",
"lack",
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"standardized",
"differentiation",
"conditions",
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"result",
"reproducibility",
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"it",
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"it",
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"to",
"compare",
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"results",
"obtained",
"from",
"different",
"research",
"groups",
"."
]
}
] |
PMC11747467 | These results revealed that the JAK/STAT3 pathway highly activated basal bladder cancer. | [
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"JAK/STAT3",
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"."
]
}
] |
PMC11726848 | After LDR irradiation, LD50 reached ~10.8 Gy and D37 ~20 Gy, while after HDR irradiation, LD50 was 3.4 Gy and D37 ~8 Gy. | [
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"O",
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"O",
"O",
"O",
"O",
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"O",
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],
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"irradiation",
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"LD50",
"was",
"3.4",
"Gy",
"and",
"D37",
"~8",
"Gy",
"."
]
}
] |
PMC6450504 | Size and zeta potential of the complexes were also verified to check for changes of these parameters after complexation with siRNA. | [
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"for",
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"of",
"these",
"parameters",
"after",
"complexation",
"with",
"siRNA",
"."
]
}
] |
PMC10969097 | Chemoresistance in cancer is the reduced sensibility or the resistance of cancer cells to the effects of chemotherapy . | [
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"O",
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"the",
"effects",
"of",
"chemotherapy",
"."
]
}
] |
PMC11478724 | After 24 h of treatment, the ROS production was 1.43 times higher than in control cells (P = 0.0337). | [
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"O",
"O",
"O",
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"O",
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PMC11025866 | Another strategy was to discover cellular genes that may play a role in directly repressing EBV lytic reactivation or may establish an environment that impacts the action of products of cellular genes. | [
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PMC11740399 | Bladder cancer is one of the most common malignancies of the urinary system. | [
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PMC11770746 | To explore whether the differences in the behavioral tests between cisplatin, cisplatin + paclitaxel, and cisPt(Pac)(OH) correlate with platinum accumulation in the DRG, we quantified the platinum in the DRG. | [
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PMC11718274 | Our findings highlight the selective and significant cytotoxicity of Y2O3NPs against human epidermoid A-431 cancer cells. | [
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PMC9966931 | Essential oils (EOs) are complex mixtures of secondary plant metabolites, including terpenoids, phenylpropanoids, and other aromatic compounds. | [
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PMC11240052 | Several studies have suggested that circular RNAs are up regulated or down regulated and act as tumor suppressors or oncogenes in almost all types of cancers, including ovarian cancer (17,18). | [
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PMC11700165 | These fusion kinases possess the same catalytic domain but different N-terminal region domains. | [
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PMC10490530 | ROIs were drawn over the tumor signal, and average radiance (photons/s/cm/sr) was quantified using the LivingImage (version 4.5.4) software. | [
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PMC9429973 | No current system permits long-term expansion of CLL cells in vitro due to difficulties of mimicking a physiological microenvironment. | [
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PMC11317131 | Further mutagenesis of the integrase coding sequence is achieved by expression from the MP6 plasmid resulting in decreased proofreading and increased error-prone bypass during phage replication (40). | [
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PMC9080589 | In addition, a study by Zhang et al. reported that ectopic expression of PCDH8 markedly promoted apoptosis in gastric cancer cells. | [
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PMC10243817 | To explore the specific MEX3B binding sites on TGFBR3 mRNA in HNECs, we designed specific primers for different structures of mature TGFBR3 mRNA and performed PCR assay after RNA IP with anti-MEX3B Ab in HNECs. | [
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PMC8041314 | Table 1 gives the prediction values for each class and computational approach. | [
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Subsets and Splits
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