Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC10745221
Methionine addiction of cancer cells is a phenomenon where cancer cells require exogenous methionine to grow and are unable to survive when methionine in the culture medium is replaced with homocysteine, methionine’s precursor [1–6].
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methionine", "addiction", "of", "cancer", "cells", "is", "a", "phenomenon", "where", "cancer", "cells", "require", "exogenous", "methionine", "to", "grow", "and", "are", "unable", "to", "survive", "when", "methionine", "in", "the", "culture", "medium", "is", "replaced", "with", "homocysteine", ",", "methionine", "’s", "precursor", "[", "1–6", "]", "." ] } ]
PMC9429973
Synergy coefficient was calculated using the Excess over Bliss model with SynergyFinder.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Synergy", "coefficient", "was", "calculated", "using", "the", "Excess", "over", "Bliss", "model", "with", "SynergyFinder", "." ] } ]
PMC11748618
These variants were in perfect LD (r = 1.0) with rs72999655-A-G, and since there variants are inherited together, we assessed their functional as a single effect.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "variants", "were", "in", "perfect", "LD", "(", "r", "=", "1.0", ")", "with", "rs72999655-A-G", ",", "and", "since", "there", "variants", "are", "inherited", "together", ",", "we", "assessed", "their", "functional", "as", "a", "single", "effect", "." ] } ]
PMC11687167
PCSK9 is involved in inflammation through its interaction with LOX-1, and LDLR enhances lipid scavenging by pathogens and regulates the inflammatory state with the help of sirtuins and some proinflammatory cytokines.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "PCSK9", "is", "involved", "in", "inflammation", "through", "its", "interaction", "with", "LOX-1", ",", "and", "LDLR", "enhances", "lipid", "scavenging", "by", "pathogens", "and", "regulates", "the", "inflammatory", "state", "with", "the", "help", "of", "sirtuins", "and", "some", "proinflammatory", "cytokines", "." ] } ]
PMC10362265
We lastly measured the SASA of the other cysteine (C131) (Fig. 4b) that was reported to bind to the C74 .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "lastly", "measured", "the", "SASA", "of", "the", "other", "cysteine", "(", "C131", ")", "(", "Fig.", "4b", ")", "that", "was", "reported", "to", "bind", "to", "the", "C74", "." ] } ]
PMC11787355
g and l were analyzed with Spearman correlation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "g", "and", "l", "were", "analyzed", "with", "Spearman", "correlation", "." ] } ]
PMC11350568
Comparing the fluorescence intensity of CCRF-CEM treated with different concentrations of AptG-1, AptG-2, and Sgc8c∼lib for 30 min at 4 °C. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Comparing", "the", "fluorescence", "intensity", "of", "CCRF-CEM", "treated", "with", "different", "concentrations", "of", "AptG-1", ",", "AptG-2", ",", "and", "Sgc8c∼lib", "for", "30", "min", "at", "4", "°", "C", ".", "(" ] } ]
PMC9429973
Aims: In this study, we aimed at providing a ready-to-use and rapid strategy to evaluate the IGHV gene MS using NGS in routine practice.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Aims", ":", "In", "this", "study", ",", "we", "aimed", "at", "providing", "a", "ready-to-use", "and", "rapid", "strategy", "to", "evaluate", "the", "IGHV", "gene", "MS", "using", "NGS", "in", "routine", "practice", "." ] } ]
PMC11763764
Ovarian cancer cell lines KRCH31 (7 × 10 cells/injection) were injected subcutaneously into the dorsal region of anesthetized nude mice (5 mice/group).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Ovarian", "cancer", "cell", "lines", "KRCH31", "(", "7", "×", "10", "cells/injection", ")", "were", "injected", "subcutaneously", "into", "the", "dorsal", "region", "of", "anesthetized", "nude", "mice", "(", "5", "mice/group", ")", "." ] } ]
PMC11564322
Subsequently, the membranes were blocked using 1% BSA in TBST, followed by adding other antibodies specific for a certain target or the reference protein.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Subsequently", ",", "the", "membranes", "were", "blocked", "using", "1", "%", "BSA", "in", "TBST", ",", "followed", "by", "adding", "other", "antibodies", "specific", "for", "a", "certain", "target", "or", "the", "reference", "protein", "." ] } ]
PMC11271278
Furthermore, when we investigated whether copy number amplification had an impact HAPI gene metrics, we found that only a small proportion of the amplified genes are identified as HAPI genes in LNCaP cells (Fig. S1F).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "when", "we", "investigated", "whether", "copy", "number", "amplification", "had", "an", "impact", "HAPI", "gene", "metrics", ",", "we", "found", "that", "only", "a", "small", "proportion", "of", "the", "amplified", "genes", "are", "identified", "as", "HAPI", "genes", "in", "LNCaP", "cells", "(", "Fig.", "S1F", ")", "." ] } ]
PMC11380329
The abundance of the class was in the elution range (Rt 1–15 min).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "abundance", "of", "the", "class", "was", "in", "the", "elution", "range", "(", "Rt", "1–15", "min", ")", "." ] } ]
PMC11704135
Additionally, H-NMR spectrum (CDCl3) of compound 7 the chemical shift (δ = ppm) at 1.2 (s, 3H, tolyl methyl protons), at 2.48 (s, 6H, pyrimidine methyl protons), at 7.24 (s, 1H, aromatic protons of pyrimidine ring) and 7.27–7.82 (m, 4H, aromatic protons).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "H-NMR", "spectrum", "(", "CDCl3", ")", "of", "compound", "7", "the", "chemical", "shift", "(", "δ", "=", "ppm", ")", "at", "1.2", "(", "s", ",", "3H", ",", "tolyl", "methyl", "protons", ")", ",", "at", "2.48", "(", "s", ",", "6H", ",", "pyrimidine", "methyl", "protons", ")", ",", "at", "7.24", "(", "s", ",", "1H", ",", "aromatic", "protons", "of", "pyrimidine", "ring", ")", "and", "7.27–7.82", "(", "m", ",", "4H", ",", "aromatic", "protons", ")", "." ] } ]
PMC11343332
As a percentage of control cells grown in serum-free media, cell viability was calculated.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "a", "percentage", "of", "control", "cells", "grown", "in", "serum-free", "media", ",", "cell", "viability", "was", "calculated", "." ] } ]
PMC7987994
When testing Zn_SPS, we used two concentrations of FBS.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "When", "testing", "Zn_SPS", ",", "we", "used", "two", "concentrations", "of", "FBS", "." ] } ]
PMC11593713
The presented pilot study aimed to investigate the levels of oxidative stress markers in lung cells caused by different respiratory viruses causing the common cold.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "presented", "pilot", "study", "aimed", "to", "investigate", "the", "levels", "of", "oxidative", "stress", "markers", "in", "lung", "cells", "caused", "by", "different", "respiratory", "viruses", "causing", "the", "common", "cold", "." ] } ]
PMC9611901
The results of this pilot study confirmed that all tanning methods used in leather processing lead to primary DNA damage in HepG2 cells measurable by the alkaline comet assay.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "results", "of", "this", "pilot", "study", "confirmed", "that", "all", "tanning", "methods", "used", "in", "leather", "processing", "lead", "to", "primary", "DNA", "damage", "in", "HepG2", "cells", "measurable", "by", "the", "alkaline", "comet", "assay", "." ] } ]
PMC11519583
Scale bar: 100 μm.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Scale", "bar", ":", "100", "μm", "." ] } ]
PMC11365427
MM cells were cultured in 5% CO2 at 37 °C.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "MM", "cells", "were", "cultured", "in", "5", "%", "CO2", "at", "37", "°", "C", "." ] } ]
PMC11345828
The reaction mixture was stirred at 50 °C for 2 h. The reaction mixture was concentrated to 1/3 volume and diluted with ethyl acetate (100 mL) and washed with brine (3 × 50 mL).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "reaction", "mixture", "was", "stirred", "at", "50", "°", "C", "for", "2", "h.", "The", "reaction", "mixture", "was", "concentrated", "to", "1/3", "volume", "and", "diluted", "with", "ethyl", "acetate", "(", "100", "mL", ")", "and", "washed", "with", "brine", "(", "3", "×", "50", "mL", ")", "." ] } ]
PMC9622879
By using this special feature, the daily benefits of the different types of homes in the community with the proposed CEMS can be flexibly increased or decreased.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "By", "using", "this", "special", "feature", ",", "the", "daily", "benefits", "of", "the", "different", "types", "of", "homes", "in", "the", "community", "with", "the", "proposed", "CEMS", "can", "be", "flexibly", "increased", "or", "decreased", "." ] } ]
PMC11707577
In Hydra species VEGF and FGF homologues and their receptors VGFR2 and FGFR‐1 have been isolated and characterized. ,
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "Hydra", "species", "VEGF", "and", "FGF", "homologues", "and", "their", "receptors", "VGFR2", "and", "FGFR‐1", "have", "been", "isolated", "and", "characterized", ".", "," ] } ]
PMC9429973
Variants were classified into evidence levels A–D according to the AMP/ASCO/CAP 2017 guidelines.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Variants", "were", "classified", "into", "evidence", "levels", "A", "–", "D", "according", "to", "the", "AMP/ASCO/CAP", "2017", "guidelines", "." ] } ]
PMC11711871
After washing and equilibration, the vasoconstrictive properties of the vascular rings were assessed by the addition of cumulative doses of KCl (15–100 mM), angiotensin II (10 to 10 M), and phenylephrine (Phe, 10 to 10 M).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "washing", "and", "equilibration", ",", "the", "vasoconstrictive", "properties", "of", "the", "vascular", "rings", "were", "assessed", "by", "the", "addition", "of", "cumulative", "doses", "of", "KCl", "(", "15–100", "mM", ")", ",", "angiotensin", "II", "(", "10", "to", "10", "M", ")", ",", "and", "phenylephrine", "(", "Phe", ",", "10", "to", "10", "M", ")", "." ] } ]
PMC11389534
Functional regulation of UFMylation in adaptive immunity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Functional", "regulation", "of", "UFMylation", "in", "adaptive", "immunity", "." ] } ]
PMC11194678
Imaging was performed using a Leica TCS SP8 confocal microscope with a 64X oil-immersion lens.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Imaging", "was", "performed", "using", "a", "Leica", "TCS", "SP8", "confocal", "microscope", "with", "a", "64X", "oil-immersion", "lens", "." ] } ]
PMC11462673
According to the results from immunohistochemical (IHC) staining of Ki67 in liver and spleen tissues, it was verified that the knockdown of LDB1 exhibits a suppressive effect on tumor development (Fig. 3I and Fig. S3A).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "According", "to", "the", "results", "from", "immunohistochemical", "(", "IHC", ")", "staining", "of", "Ki67", "in", "liver", "and", "spleen", "tissues", ",", "it", "was", "verified", "that", "the", "knockdown", "of", "LDB1", "exhibits", "a", "suppressive", "effect", "on", "tumor", "development", "(", "Fig.", "3I", "and", "Fig.", "S3A", ")", "." ] } ]
PMC8567602
Metastasis was histologically confirmed in the lungs of five of the seven Myf5Cre-initiated combination genotype mice and none of the other two genotypes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Metastasis", "was", "histologically", "confirmed", "in", "the", "lungs", "of", "five", "of", "the", "seven", "Myf5Cre-initiated", "combination", "genotype", "mice", "and", "none", "of", "the", "other", "two", "genotypes", "." ] } ]
PMC11738017
Therefore, in patients with a high disease burden, strategies aimed at expanding the effector T-cell populations with immunomodulatory drugs or cereblon E3 ligase modulatory drugs (CELMoDs) or increasing disease debulking (with combinations of anti-BCMA TCEs and anti-CD38 antibodies or other non-BCMA-targeting TCEs) are likely to improve the therapeutic efficacy of anti-BCMA TCE.35, 36, 37, 38, 39 GSIs have been tested as a preclinical and clinical strategy to enhance the efficacy of BCMA-targeting molecules.22, 23, 24 To better define the subgroups of patients with MM who may benefit from GSIs, we examined their effect in anti-BCMA TCE–treated cells that stably expressed variable levels of BCMA.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "in", "patients", "with", "a", "high", "disease", "burden", ",", "strategies", "aimed", "at", "expanding", "the", "effector", "T-cell", "populations", "with", "immunomodulatory", "drugs", "or", "cereblon", "E3", "ligase", "modulatory", "drugs", "(", "CELMoDs", ")", "or", "increasing", "disease", "debulking", "(", "with", "combinations", "of", "anti-BCMA", "TCEs", "and", "anti-CD38", "antibodies", "or", "other", "non-BCMA-targeting", "TCEs", ")", "are", "likely", "to", "improve", "the", "therapeutic", "efficacy", "of", "anti-BCMA", "TCE.35", ",", "36", ",", "37", ",", "38", ",", "39", "GSIs", "have", "been", "tested", "as", "a", "preclinical", "and", "clinical", "strategy", "to", "enhance", "the", "efficacy", "of", "BCMA-targeting", "molecules.22", ",", "23", ",", "24", "To", "better", "define", "the", "subgroups", "of", "patients", "with", "MM", "who", "may", "benefit", "from", "GSIs", ",", "we", "examined", "their", "effect", "in", "anti-BCMA", "TCE", "–", "treated", "cells", "that", "stably", "expressed", "variable", "levels", "of", "BCMA", "." ] } ]
PMC7840816
Data are expressed as mean ± standard deviation (SD).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "are", "expressed", "as", "mean", "±", "standard", "deviation", "(", "SD", ")", "." ] } ]
PMC11653533
The ethnopharmacological significance of Ficus species is well-documented across various cultures, where these plants are traditionally used to treat a broad spectrum of ailments, ranging from gastrointestinal and respiratory issues to skin disorders and diabetes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "ethnopharmacological", "significance", "of", "Ficus", "species", "is", "well-documented", "across", "various", "cultures", ",", "where", "these", "plants", "are", "traditionally", "used", "to", "treat", "a", "broad", "spectrum", "of", "ailments", ",", "ranging", "from", "gastrointestinal", "and", "respiratory", "issues", "to", "skin", "disorders", "and", "diabetes", "." ] } ]
PMC11470999
After treating A375 cells with PF, whole‐cell lysates were incubated with different concentrations of proteinase K for 5 min, and then the amounts of CIP2A and reference proteins in these samples were detected by immunoblot assays. (
[ { "tags": [ "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "treating", "A375", "cells", "with", "PF", ",", "whole‐cell", "lysates", "were", "incubated", "with", "different", "concentrations", "of", "proteinase", "K", "for", "5", "min", ",", "and", "then", "the", "amounts", "of", "CIP2A", "and", "reference", "proteins", "in", "these", "samples", "were", "detected", "by", "immunoblot", "assays", ".", "(" ] } ]
PMC11413393
Figure (b) Created with BioRender.com released under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 4.0 International license.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Figure", "(", "b", ")", "Created", "with", "BioRender.com", "released", "under", "a", "Creative", "Commons", "Attribution-NonCommercial-NoDerivs", "4.0", "International", "license", "." ] } ]
PMC11321678
Removed the supernatant without disrupting the nuclei pellet, then resuspended pellet in chilled Diluted Nuclei Buffer (PN‐2000153, 10x Genomics).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Removed", "the", "supernatant", "without", "disrupting", "the", "nuclei", "pellet", ",", "then", "resuspended", "pellet", "in", "chilled", "Diluted", "Nuclei", "Buffer", "(", "PN‐2000153", ",", "10x", "Genomics", ")", "." ] } ]
PMC9841531
The second most potent MCT1 inhibitor, 30, had with −9.7 kcal·mol a similar free binding energy compared to lead MCT1 inhibitor 24, which is significantly lower compared to reference inhibitor 8 and comparable to reference inhibitor 7.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "second", "most", "potent", "MCT1", "inhibitor", ",", "30", ",", "had", "with", "−9.7", "kcal·mol", "a", "similar", "free", "binding", "energy", "compared", "to", "lead", "MCT1", "inhibitor", "24", ",", "which", "is", "significantly", "lower", "compared", "to", "reference", "inhibitor", "8", "and", "comparable", "to", "reference", "inhibitor", "7", "." ] } ]
PMC9429973
A. Ladungova, D. Busa, Y. Lodhi, J. Hyl, M. Culen, M. Smida Central European Institute of Technology, Masaryk University; National Centre for Biomolecular Research, Faculty of Science, Masaryk University; Department of Internal Medicine - Hematology and Oncology, Faculty of Medicine, Masaryk University; Department of Biology, Faculty of Medicine, Masaryk University; Department of Internal Medicine - Hematology and Oncology, University Hospital Brno, Brno, Czechia Background: Acute myeloid leukemia (AML) is a malignant disease derived from the bone marrow precursors of myeloid lineage.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A.", "Ladungova", ",", "D.", "Busa", ",", "Y.", "Lodhi", ",", "J.", "Hyl", ",", "M.", "Culen", ",", "M.", "Smida", "Central", "European", "Institute", "of", "Technology", ",", "Masaryk", "University", ";", "National", "Centre", "for", "Biomolecular", "Research", ",", "Faculty", "of", "Science", ",", "Masaryk", "University", ";", "Department", "of", "Internal", "Medicine", "-", "Hematology", "and", "Oncology", ",", "Faculty", "of", "Medicine", ",", "Masaryk", "University", ";", "Department", "of", "Biology", ",", "Faculty", "of", "Medicine", ",", "Masaryk", "University", ";", "Department", "of", "Internal", "Medicine", "-", "Hematology", "and", "Oncology", ",", "University", "Hospital", "Brno", ",", "Brno", ",", "Czechia", "Background", ":", "Acute", "myeloid", "leukemia", "(", "AML", ")", "is", "a", "malignant", "disease", "derived", "from", "the", "bone", "marrow", "precursors", "of", "myeloid", "lineage", "." ] } ]
PMC11240448
The rise of omics technologies has revived the systems view of classic physiology by emphasizing the fundamental challenge of understanding how a vast compendium of gene and protein expressions and activities is integrated in cellular networks that generate cell fate decisions and phenotypes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "rise", "of", "omics", "technologies", "has", "revived", "the", "systems", "view", "of", "classic", "physiology", "by", "emphasizing", "the", "fundamental", "challenge", "of", "understanding", "how", "a", "vast", "compendium", "of", "gene", "and", "protein", "expressions", "and", "activities", "is", "integrated", "in", "cellular", "networks", "that", "generate", "cell", "fate", "decisions", "and", "phenotypes", "." ] } ]
PMC9429973
The estimated 60-month PFS rates were 84% (A+O), 72% (A), and 21% (O+Clb).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "estimated", "60-month", "PFS", "rates", "were", "84", "%", "(", "A+O", ")", ",", "72", "%", "(", "A", ")", ",", "and", "21", "%", "(", "O+Clb", ")", "." ] } ]
PMC8584319
An increase in translation can be expected from the decrease in the level of 4E-BP1, which acts as an inhibitor of eIF4E.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "An", "increase", "in", "translation", "can", "be", "expected", "from", "the", "decrease", "in", "the", "level", "of", "4E-BP1", ",", "which", "acts", "as", "an", "inhibitor", "of", "eIF4E", "." ] } ]
PMC11394227
CHO-PAb and CHO-PAb-QS suspension cells were cultured in batches for about two weeks, and viable cell density (VCD), cell viability, and accumulated antibody production were measured daily.
[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "CHO-PAb", "and", "CHO-PAb-QS", "suspension", "cells", "were", "cultured", "in", "batches", "for", "about", "two", "weeks", ",", "and", "viable", "cell", "density", "(", "VCD", ")", ",", "cell", "viability", ",", "and", "accumulated", "antibody", "production", "were", "measured", "daily", "." ] } ]
PMC11730320
Fig. 4Flow cytometric analysis of T cell subsets.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fig.", "4Flow", "cytometric", "analysis", "of", "T", "cell", "subsets", "." ] } ]
PMC11803918
Further Elispot analysis for human IFN-γ-secreting cells in PBMCs confirmed the synergistic effect of hybrid exosomes on the IFN-γ production in human T-cells in vivo (Figure 8M).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Further", "Elispot", "analysis", "for", "human", "IFN-γ-secreting", "cells", "in", "PBMCs", "confirmed", "the", "synergistic", "effect", "of", "hybrid", "exosomes", "on", "the", "IFN-γ", "production", "in", "human", "T-cells", "in", "vivo", "(", "Figure", "8", "M", ")", "." ] } ]
PMC11678368
Antiproliferative activity was assessed using the sulforhodamine B (SRB) assay, as described by Skehan et al. .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Antiproliferative", "activity", "was", "assessed", "using", "the", "sulforhodamine", "B", "(", "SRB", ")", "assay", ",", "as", "described", "by", "Skehan", "et", "al.", "." ] } ]
PMC11698348
Consistent with these observations, immunofluorescence analysis confirmed that Elf5 expression increases and is more localised in the nucleus of PMEKs overtime during calcium induced keratinocyte differentiation, in vitro (Fig 4c). (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Consistent", "with", "these", "observations", ",", "immunofluorescence", "analysis", "confirmed", "that", "Elf5", "expression", "increases", "and", "is", "more", "localised", "in", "the", "nucleus", "of", "PMEKs", "overtime", "during", "calcium", "induced", "keratinocyte", "differentiation", ",", "in", "vitro", "(", "Fig", "4c", ")", ".", "(" ] } ]
PMC11352746
For instance, Snyder et al. utilized fluorescent microscopy to measure the cell viability of iPSC-derived neurons by adding a green fluorescent dye, CellEvent Caspase 3/7 Green Detection Reagent, to the cells at the start of the experiment and measuring its fluorescence at the end .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "instance", ",", "Snyder", "et", "al.", "utilized", "fluorescent", "microscopy", "to", "measure", "the", "cell", "viability", "of", "iPSC-derived", "neurons", "by", "adding", "a", "green", "fluorescent", "dye", ",", "CellEvent", "Caspase", "3/7", "Green", "Detection", "Reagent", ",", "to", "the", "cells", "at", "the", "start", "of", "the", "experiment", "and", "measuring", "its", "fluorescence", "at", "the", "end", "." ] } ]
PMC9429973
VEN was given at a dose of 400 mg daily on D1-14 of C1 and on D1-7 of C2-8.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "VEN", "was", "given", "at", "a", "dose", "of", "400", "mg", "daily", "on", "D1", "-", "14", "of", "C1", "and", "on", "D1", "-", "7", "of", "C2", "-", "8", "." ] } ]
PMC9398137
In our dataset, the level of BCL2 protein expression was variable in DLBCL, with approximately 30% of the tested cell lines showing no detectable BCL2 protein.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "our", "dataset", ",", "the", "level", "of", "BCL2", "protein", "expression", "was", "variable", "in", "DLBCL", ",", "with", "approximately", "30", "%", "of", "the", "tested", "cell", "lines", "showing", "no", "detectable", "BCL2", "protein", "." ] } ]
PMC11711663
Table 4Cox model fitting on the traning data.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Table", "4Cox", "model", "fitting", "on", "the", "traning", "data", "." ] } ]
PMC9429973
No dose-limiting toxicities occurred.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "No", "dose-limiting", "toxicities", "occurred", "." ] } ]
PMC11461874
The cell lysates were immunoblotted using antibodies indicated.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cell", "lysates", "were", "immunoblotted", "using", "antibodies", "indicated", "." ] } ]
PMC6181431
We also performed the converse experiment, in that we examined rapalog sensitivity of derivatives of a native PBRM1 null cell line (A704) expressing either empty vector (A704_EV), wild type PBRM1 (A704_WT), or a mutant Q1298* PBRM1 (A704_Q1298*) under regulation of doxycycline (Fig 2A).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "also", "performed", "the", "converse", "experiment", ",", "in", "that", "we", "examined", "rapalog", "sensitivity", "of", "derivatives", "of", "a", "native", "PBRM1", "null", "cell", "line", "(", "A704", ")", "expressing", "either", "empty", "vector", "(", "A704_EV", ")", ",", "wild", "type", "PBRM1", "(", "A704_WT", ")", ",", "or", "a", "mutant", "Q1298", "*", "PBRM1", "(", "A704_Q1298", "*", ")", "under", "regulation", "of", "doxycycline", "(", "Fig", "2A", ")", "." ] } ]
PMC11438317
LYP was eluted from the beads with a 3xFLAG peptide at 0.2 mg/mL in lysis buffer for 20 min at 4 ºC. Elution was done a total of 3 times, collecting a volume of 700–750 µL. Then, protein was concentrated by centrifugation with a filter Amicon Ultra-0.5 mL 30 K (Ultracel-30 K Membrane) up to a final volume of 25–30 μL. Protein was kept at 4 ºC for assays in the following days for a period no longer than a week.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "LYP", "was", "eluted", "from", "the", "beads", "with", "a", "3xFLAG", "peptide", "at", "0.2", "mg/mL", "in", "lysis", "buffer", "for", "20", "min", "at", "4", "ºC.", "Elution", "was", "done", "a", "total", "of", "3", "times", ",", "collecting", "a", "volume", "of", "700–750", "µL.", "Then", ",", "protein", "was", "concentrated", "by", "centrifugation", "with", "a", "filter", "Amicon", "Ultra-0.5", "mL", "30", "K", "(", "Ultracel-30", "K", "Membrane", ")", "up", "to", "a", "final", "volume", "of", "25–30", "μL.", "Protein", "was", "kept", "at", "4", "ºC", "for", "assays", "in", "the", "following", "days", "for", "a", "period", "no", "longer", "than", "a", "week", "." ] } ]
PMC10667689
Ethical approval was not required for the studies on humans in accordance with the local legislation and institutional requirements because only commercially available established cell lines were used.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Ethical", "approval", "was", "not", "required", "for", "the", "studies", "on", "humans", "in", "accordance", "with", "the", "local", "legislation", "and", "institutional", "requirements", "because", "only", "commercially", "available", "established", "cell", "lines", "were", "used", "." ] } ]
PMC11779960
Where available, original Cell Ranger outputs were utilised; otherwise, raw data were reprocessed using Cell Ranger 8.0.1 VDJ pipeline with the Human reference (GRCh38/Ensembl/10x).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Where", "available", ",", "original", "Cell", "Ranger", "outputs", "were", "utilised", ";", "otherwise", ",", "raw", "data", "were", "reprocessed", "using", "Cell", "Ranger", "8.0.1", "VDJ", "pipeline", "with", "the", "Human", "reference", "(", "GRCh38/Ensembl/10x", ")", "." ] } ]
PMC9429973
In our cohort, patients with trisomy 19 as sole abnormality or within a karyotype characterized by trisomies only had a high CR rate and better clinical outcome.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "our", "cohort", ",", "patients", "with", "trisomy", "19", "as", "sole", "abnormality", "or", "within", "a", "karyotype", "characterized", "by", "trisomies", "only", "had", "a", "high", "CR", "rate", "and", "better", "clinical", "outcome", "." ] } ]
PMC11583010
On each graph, the number of complete responses in the highest-dosed ETx-22 group is indicated.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "On", "each", "graph", ",", "the", "number", "of", "complete", "responses", "in", "the", "highest-dosed", "ETx-22", "group", "is", "indicated", "." ] } ]
PMC11705547
Therefore, elucidating the specific mechanism through which cisplatin activates anti-tumor CTLs could provide a basis for improving therapeutic effects.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "elucidating", "the", "specific", "mechanism", "through", "which", "cisplatin", "activates", "anti-tumor", "CTLs", "could", "provide", "a", "basis", "for", "improving", "therapeutic", "effects", "." ] } ]
PMC9429973
Table 1) The compilation was interspersed with an audio commentary by the first author and published as a podcast series comprising 8 podcasts over approximately 4 hours.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Table", "1", ")", "The", "compilation", "was", "interspersed", "with", "an", "audio", "commentary", "by", "the", "first", "author", "and", "published", "as", "a", "podcast", "series", "comprising", "8", "podcasts", "over", "approximately", "4", "hours", "." ] } ]
PMC9429973
Evaluation of tumors retrieved from mice after treatment revealed significant reduction in glycolysis rate.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Evaluation", "of", "tumors", "retrieved", "from", "mice", "after", "treatment", "revealed", "significant", "reduction", "in", "glycolysis", "rate", "." ] } ]
PMC11740207
Conversely, ADs preserve one stem daughter cell with maintained telomeric length, thereby delaying senescence.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Conversely", ",", "ADs", "preserve", "one", "stem", "daughter", "cell", "with", "maintained", "telomeric", "length", ",", "thereby", "delaying", "senescence", "." ] } ]
PMC10810426
Images were taken at 40X using the Z-stacking function on a Keyence BZ-X710 microscope and analyzed with the BZ-X analyzer.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Images", "were", "taken", "at", "40X", "using", "the", "Z-stacking", "function", "on", "a", "Keyence", "BZ-X710", "microscope", "and", "analyzed", "with", "the", "BZ-X", "analyzer", "." ] } ]
PMC11612315
GLP-1(7-36), liraglutide, exendin-4, exendin 9–39, exendin 20–29, His-tagged exendin 9–39, and FITC-tagged exendin 9–39 were purchased from Anygen Corp. (Gwangju, South Korea).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "GLP-1(7", "-", "36", ")", ",", "liraglutide", ",", "exendin-4", ",", "exendin", "9–39", ",", "exendin", "20–29", ",", "His-tagged", "exendin", "9–39", ",", "and", "FITC-tagged", "exendin", "9–39", "were", "purchased", "from", "Anygen", "Corp.", "(", "Gwangju", ",", "South", "Korea", ")", "." ] } ]
PMC11507371
A mixture of 246 μL Diluent C and 4 μL PKH26 dye was added to the cell suspension.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "mixture", "of", "246", "μL", "Diluent", "C", "and", "4", "μL", "PKH26", "dye", "was", "added", "to", "the", "cell", "suspension", "." ] } ]
PMC11611077
Clones with high fluorescent intensity (e.g. EF1α3D5) exhibited bell-shaped NLC.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Clones", "with", "high", "fluorescent", "intensity", "(", "e.g.", "EF1α3D5", ")", "exhibited", "bell-shaped", "NLC", "." ] } ]
PMC11441402
Until recently, the SRB assay has been used by the National Cancer Institute (NCI), USA, to screen drugs on the NCI-60 panel of cancer cell lines (Holbeck et al. 2010).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Until", "recently", ",", "the", "SRB", "assay", "has", "been", "used", "by", "the", "National", "Cancer", "Institute", "(", "NCI", ")", ",", "USA", ",", "to", "screen", "drugs", "on", "the", "NCI-60", "panel", "of", "cancer", "cell", "lines", "(", "Holbeck", "et", "al.", "2010", ")", "." ] } ]
PMC11705484
Transcript levels of TRMT61A and nuclear factor kappa B (NF‐κB) in bladder cancer (BLCA) (T) versus adjacent normal tissues (N) from 24 patients were examined by real‐time quantitative polymerase chain reaction (RT‐qPCR), and the correlation between TRMT61A and NF‐κB expression was examined by regression analysis. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Transcript", "levels", "of", "TRMT61A", "and", "nuclear", "factor", "kappa", "B", "(", "NF‐κB", ")", "in", "bladder", "cancer", "(", "BLCA", ")", "(", "T", ")", "versus", "adjacent", "normal", "tissues", "(", "N", ")", "from", "24", "patients", "were", "examined", "by", "real‐time", "quantitative", "polymerase", "chain", "reaction", "(", "RT‐qPCR", ")", ",", "and", "the", "correlation", "between", "TRMT61A", "and", "NF‐κB", "expression", "was", "examined", "by", "regression", "analysis", ".", "(" ] } ]
PMC7987994
Extraction of the tested materials should be performed at 37 °C on an orbital shaker.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Extraction", "of", "the", "tested", "materials", "should", "be", "performed", "at", "37", "°", "C", "on", "an", "orbital", "shaker", "." ] } ]
PMC10858941
C HIF-1α higher levels decrease patient survival (all gliomas; Rembrandt dataset).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "C", "HIF-1α", "higher", "levels", "decrease", "patient", "survival", "(", "all", "gliomas", ";", "Rembrandt", "dataset", ")", "." ] } ]
PMC10213179
aptamer injection.(C) Quantification of abdominal and tumoral radiance efficiency on aptamer-treated mice.(D) Mice free of surgery (Kaplan-Meier plots) of aptamers treatment on tumor-bearing mice (n = 20).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "aptamer", "injection.(C", ")", "Quantification", "of", "abdominal", "and", "tumoral", "radiance", "efficiency", "on", "aptamer-treated", "mice.(D", ")", "Mice", "free", "of", "surgery", "(", "Kaplan-Meier", "plots", ")", "of", "aptamers", "treatment", "on", "tumor-bearing", "mice", "(", "n", "=", "20", ")", "." ] } ]
PMC5025404
Intensive amplification may cause undesirable effects on cell growth and protein quality that countervail the benefits of high pcd.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Intensive", "amplification", "may", "cause", "undesirable", "effects", "on", "cell", "growth", "and", "protein", "quality", "that", "countervail", "the", "benefits", "of", "high", "pcd", "." ] } ]
PMC11244823
Therefore, data obtained with mock antigens were not included in the graph.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "data", "obtained", "with", "mock", "antigens", "were", "not", "included", "in", "the", "graph", "." ] } ]
PMC8427838
The median expression of ezrin mRNA in KIPAN was 12.4 versus 13.4 normal (Additional file 1: Figure S4C).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "median", "expression", "of", "ezrin", "mRNA", "in", "KIPAN", "was", "12.4", "versus", "13.4", "normal", "(", "Additional", "file", "1", ":", "Figure", "S4C", ")", "." ] } ]
PMC9250505
As observed in Supplementary Fig. 6G, NPB treatment of the control transfected PDO1 cells decreased phosphorylation of BADS99 compared to control transfected PDO1 cells treated with vehicle.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "observed", "in", "Supplementary", "Fig.", "6", "G", ",", "NPB", "treatment", "of", "the", "control", "transfected", "PDO1", "cells", "decreased", "phosphorylation", "of", "BADS99", "compared", "to", "control", "transfected", "PDO1", "cells", "treated", "with", "vehicle", "." ] } ]
PMC10571053
A673 G2 cells displayed increased resistance to SN-38.
[ { "tags": [ "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A673", "G2", "cells", "displayed", "increased", "resistance", "to", "SN-38", "." ] } ]
PMC11473750
All homozygote Th-MYCN mice develop neuroblastoma in sympathetic nervous tissue by 6 weeks postnatal.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "homozygote", "Th-MYCN", "mice", "develop", "neuroblastoma", "in", "sympathetic", "nervous", "tissue", "by", "6", "weeks", "postnatal", "." ] } ]
PMC6181431
SD: 10% shrinkage 434 somatic variants were identified in these six patients’ biopsies, including both pre-treatment and post-treatment samples (S1 Table).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "SD", ":", "10", "%", "shrinkage", "434", "somatic", "variants", "were", "identified", "in", "these", "six", "patients", "’", "biopsies", ",", "including", "both", "pre-treatment", "and", "post-treatment", "samples", "(", "S1", "Table", ")", "." ] } ]
PMC8992508
Many compounds were active, and derivatives 101 and 102 displayed the best activity (IC50 = 0.233 M and IC50 = 0.238 M respectively in the Hoechst 33342 assay).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Many", "compounds", "were", "active", ",", "and", "derivatives", "101", "and", "102", "displayed", "the", "best", "activity", "(", "IC50", "=", "0.233", "M", "and", "IC50", "=", "0.238", "M", "respectively", "in", "the", "Hoechst", "33342", "assay", ")", "." ] } ]
PMC11718109
Briefly, VMAT2 (SLC18A2), VGLUT1 (SLC17A7), VGLUT2 (SLC17A6) and SV2C were tagged at the c-terminus with EGFP, mCherry or 2xFLAG in the following destination vectors pDEST-eGFP-N1(#31796), pDEST-mCherry-N1 (#31907) and 2xFlag-pDEST-C (#118372), respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Briefly", ",", "VMAT2", "(", "SLC18A2", ")", ",", "VGLUT1", "(", "SLC17A7", ")", ",", "VGLUT2", "(", "SLC17A6", ")", "and", "SV2C", "were", "tagged", "at", "the", "c-terminus", "with", "EGFP", ",", "mCherry", "or", "2xFLAG", "in", "the", "following", "destination", "vectors", "pDEST-eGFP-N1(#31796", ")", ",", "pDEST-mCherry-N1", "(", "#", "31907", ")", "and", "2xFlag-pDEST-C", "(", "#", "118372", ")", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC9429973
Primary diagnosis: Portal vein thrombosis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Primary", "diagnosis", ":", "Portal", "vein", "thrombosis", "." ] } ]
PMC11755467
Methods: We studied the effect of Enoxacin on HIV-1 replication coupled with miRNA qRT-PCR analysis of HIV-1-related miRNAs in CEM-SS and MT-4 T-cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "B-CellLine", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "We", "studied", "the", "effect", "of", "Enoxacin", "on", "HIV-1", "replication", "coupled", "with", "miRNA", "qRT-PCR", "analysis", "of", "HIV-1-related", "miRNAs", "in", "CEM-SS", "and", "MT-4", "T-cells", "." ] } ]
PMC10440586
Processed RNA-seq and microarray data of bulk tissues from the TCGA and four other public datasets were obtained from the GlioVis website (http://gliovis.bioinfo.cnio.es/).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Processed", "RNA-seq", "and", "microarray", "data", "of", "bulk", "tissues", "from", "the", "TCGA", "and", "four", "other", "public", "datasets", "were", "obtained", "from", "the", "GlioVis", "website", "(", "http://gliovis.bioinfo.cnio.es/", ")", "." ] } ]
PMC10142392
Multi-arm architectures based on PCL have been explored in recent years as a strategy to enhance the drug delivery efficiency of nanoparticles .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Multi-arm", "architectures", "based", "on", "PCL", "have", "been", "explored", "in", "recent", "years", "as", "a", "strategy", "to", "enhance", "the", "drug", "delivery", "efficiency", "of", "nanoparticles", "." ] } ]
PMC11743975
The Opto-MitoA may thus provide a new strategy for light-induced mitochondrial aggregation and fusion and for the potential treatment of mitochondrial-related diseases.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "Opto-MitoA", "may", "thus", "provide", "a", "new", "strategy", "for", "light-induced", "mitochondrial", "aggregation", "and", "fusion", "and", "for", "the", "potential", "treatment", "of", "mitochondrial-related", "diseases", "." ] } ]
PMC10317042
Normal human dermal fibroblasts (NHDF) were purchased from Kurabo.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Normal", "human", "dermal", "fibroblasts", "(", "NHDF", ")", "were", "purchased", "from", "Kurabo", "." ] } ]
PMC11422150
Briefly, 7- to 9-week-old male C57BL/6J mice were housed under controlled 12-h light cycling conditions and had free access to water and food (CLEA Japan, Inc, Tokyo, Japan).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Briefly", ",", "7-", "to", "9-week-old", "male", "C57BL/6J", "mice", "were", "housed", "under", "controlled", "12-h", "light", "cycling", "conditions", "and", "had", "free", "access", "to", "water", "and", "food", "(", "CLEA", "Japan", ",", "Inc", ",", "Tokyo", ",", "Japan", ")", "." ] } ]
PMC11319300
This suggested that this enhancer might also be interacting with Ccnd1 in mice, which is located in a similar location as seen in humans (Supplementary Figure S9).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "suggested", "that", "this", "enhancer", "might", "also", "be", "interacting", "with", "Ccnd1", "in", "mice", ",", "which", "is", "located", "in", "a", "similar", "location", "as", "seen", "in", "humans", "(", "Supplementary", "Figure", "S9", ")", "." ] } ]
PMC11589157
Among the chromosomes of Hap1, the longest was Chr_03 (168.1 Mb), and the shortest was Chr_Y (16.1 M) (Table 3).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Among", "the", "chromosomes", "of", "Hap1", ",", "the", "longest", "was", "Chr_03", "(", "168.1", "Mb", ")", ",", "and", "the", "shortest", "was", "Chr_Y", "(", "16.1", "M", ")", "(", "Table", "3", ")", "." ] } ]
PMC9429973
The MM DNA probe panel was used.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "MM", "DNA", "probe", "panel", "was", "used", "." ] } ]
PMC11545737
One of the most studied GSDMD inhibitors is disulfiram, a drug currently in use for alcohol addiction, which inhibits the aldehyde dehydrogenase, and is subsequently found to inhibit GSDMD pore formation and therefore the pyroptosis without affecting the necroptosis .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "One", "of", "the", "most", "studied", "GSDMD", "inhibitors", "is", "disulfiram", ",", "a", "drug", "currently", "in", "use", "for", "alcohol", "addiction", ",", "which", "inhibits", "the", "aldehyde", "dehydrogenase", ",", "and", "is", "subsequently", "found", "to", "inhibit", "GSDMD", "pore", "formation", "and", "therefore", "the", "pyroptosis", "without", "affecting", "the", "necroptosis", "." ] } ]
PMC11615218
g TCR repertoire can be used as a surrogate for T-cell clonotype and expansion.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "g", "TCR", "repertoire", "can", "be", "used", "as", "a", "surrogate", "for", "T-cell", "clonotype", "and", "expansion", "." ] } ]
PMC11796104
These DEcircRNAs were widely distributed across almost all human chromosomes, including the sex chromosomes (Fig. 1B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "DEcircRNAs", "were", "widely", "distributed", "across", "almost", "all", "human", "chromosomes", ",", "including", "the", "sex", "chromosomes", "(", "Fig.", "1B", ")", "." ] } ]
PMC11641630
To evaluate anchorage independent growth, a bottom layer of CM with 0.6% bacteriological agar (Scharlab, Barcelona, Spain) was set in 6 well-culture plates (Nunclon, Denmark).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "evaluate", "anchorage", "independent", "growth", ",", "a", "bottom", "layer", "of", "CM", "with", "0.6", "%", "bacteriological", "agar", "(", "Scharlab", ",", "Barcelona", ",", "Spain", ")", "was", "set", "in", "6", "well-culture", "plates", "(", "Nunclon", ",", "Denmark", ")", "." ] } ]
PMC8345486
The cisplatin, carboplatin, DOX, PTX, and GEM concentration ranges were initially adjusted according to a cell line sensitivity evaluated using NR and MTT assays (0.001–100 µM, 0.01–200 µM, 0.0001–50 µM, 0.00001–10 µM, or 0.0001–10 µM, respectively).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cisplatin", ",", "carboplatin", ",", "DOX", ",", "PTX", ",", "and", "GEM", "concentration", "ranges", "were", "initially", "adjusted", "according", "to", "a", "cell", "line", "sensitivity", "evaluated", "using", "NR", "and", "MTT", "assays", "(", "0.001–100", "µM", ",", "0.01–200", "µM", ",", "0.0001–50", "µM", ",", "0.00001–10", "µM", ",", "or", "0.0001–10", "µM", ",", "respectively", ")", "." ] } ]
PMC11720107
The Morado garlic extract increased caspase-3 activity in the BJ cell line at all tested concentrations (0.062, 0.125, 0.250, 0.500, and 1.000 mg/mL) by 65.5%, 77.4%, 90.9%, 100.0%, and 96.7%, respectively, compared with the control (Figure 4D).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "Morado", "garlic", "extract", "increased", "caspase-3", "activity", "in", "the", "BJ", "cell", "line", "at", "all", "tested", "concentrations", "(", "0.062", ",", "0.125", ",", "0.250", ",", "0.500", ",", "and", "1.000", "mg/mL", ")", "by", "65.5", "%", ",", "77.4", "%", ",", "90.9", "%", ",", "100.0", "%", ",", "and", "96.7", "%", ",", "respectively", ",", "compared", "with", "the", "control", "(", "Figure", "4D", ")", "." ] } ]
PMC10852540
Also, the expression of Bcl-2 was decreased (Fig. 2b).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Also", ",", "the", "expression", "of", "Bcl-2", "was", "decreased", "(", "Fig.", "2b", ")", "." ] } ]
PMC9739791
For Phorbiplatin 8 and Rhodaplatins 15 and 16, it was shown that a reductant, namely, ascorbic acid is required to transfer an electron and reduce the ligand from the excited state.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "Phorbiplatin", "8", "and", "Rhodaplatins", "15", "and", "16", ",", "it", "was", "shown", "that", "a", "reductant", ",", "namely", ",", "ascorbic", "acid", "is", "required", "to", "transfer", "an", "electron", "and", "reduce", "the", "ligand", "from", "the", "excited", "state", "." ] } ]
PMC9243326
In recent years, with the rise of the Guangxi snail rice noodle industry in China, the demand for snails has increased, which has promoted the development of the snail industry from relying on natural fishing to artificial breeding (Qin.,
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "recent", "years", ",", "with", "the", "rise", "of", "the", "Guangxi", "snail", "rice", "noodle", "industry", "in", "China", ",", "the", "demand", "for", "snails", "has", "increased", ",", "which", "has", "promoted", "the", "development", "of", "the", "snail", "industry", "from", "relying", "on", "natural", "fishing", "to", "artificial", "breeding", "(", "Qin", ".", "," ] } ]
PMC11087055
Scale bars, 300 μm.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Scale", "bars", ",", "300", "μm", "." ] } ]
PMC6600592
H NMR (CDCl3) δ 7.55 (d, J = 8.2 Hz, 2H, H-2, 6), 7.19 (d, J = 8.0 Hz, 2H, H-3, 5), 4.80–4.73 (m, 1H, H-15), 3.99 (s, 3H, H-22), 3.06-3.03 (m, 2H, H-8), 2.56–2.53 (m, 2H, H-9), 2.38 (s, 3H, H-14), 1.83 (dd, J = 8.8, 3.8 Hz, 2H, H-20), 1.73 (dd, J = 9.0, 4.7 Hz, 2H, H-16), 1.55 (dd, J = 9.6, 6.5 Hz, 1H, H-18), 1.39 (dd, J = 22.4, 12.4 Hz, 4H, H-17, 19), 1.29–1.24 (m, 1H, H-18).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "H", "NMR", "(", "CDCl3", ")", "δ", "7.55", "(", "d", ",", "J", "=", "8.2", "Hz", ",", "2H", ",", "H-2", ",", "6", ")", ",", "7.19", "(", "d", ",", "J", "=", "8.0", "Hz", ",", "2H", ",", "H-3", ",", "5", ")", ",", "4.80–4.73", "(", "m", ",", "1H", ",", "H-15", ")", ",", "3.99", "(", "s", ",", "3H", ",", "H-22", ")", ",", "3.06", "-", "3.03", "(", "m", ",", "2H", ",", "H-8", ")", ",", "2.56–2.53", "(", "m", ",", "2H", ",", "H-9", ")", ",", "2.38", "(", "s", ",", "3H", ",", "H-14", ")", ",", "1.83", "(", "dd", ",", "J", "=", "8.8", ",", "3.8", "Hz", ",", "2H", ",", "H-20", ")", ",", "1.73", "(", "dd", ",", "J", "=", "9.0", ",", "4.7", "Hz", ",", "2H", ",", "H-16", ")", ",", "1.55", "(", "dd", ",", "J", "=", "9.6", ",", "6.5", "Hz", ",", "1H", ",", "H-18", ")", ",", "1.39", "(", "dd", ",", "J", "=", "22.4", ",", "12.4", "Hz", ",", "4H", ",", "H-17", ",", "19", ")", ",", "1.29–1.24", "(", "m", ",", "1H", ",", "H-18", ")", "." ] } ]
PMC4659567
Platinum-based anticancer agents (e.g. cisplatin, oxaliplatin and carboplatin) are widely used for treating of various types of cancer [1–3].
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Platinum-based", "anticancer", "agents", "(", "e.g.", "cisplatin", ",", "oxaliplatin", "and", "carboplatin", ")", "are", "widely", "used", "for", "treating", "of", "various", "types", "of", "cancer", "[", "1–3", "]", "." ] } ]