Datasets:
OTAR3088
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BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
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1
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PMC11518702
In addition, human germinal center-associated lymphoma (HGAL) is alternatively designated as GCET2 (3, 18), GCSAM, and “M17” (mouse) (27).
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PMC9429973
This may indicate degradation in archival RNA and cDNA samples, while the level of genomic DNA decreases slightly.
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PMC11683240
Biochemistry-, cell culture-, and molecular modeling-based in vitro experimentation demonstrated that the α1AT mode of action is based on blocking PT-binding to the host target cell surface.
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PMC11528603
Potential extracts from screening and cytotoxicity assay were then subjected to further analysis.
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PMC8193046
For interpretation of the references to colour in this figure legend, the reader is referred to the web version of this article.)
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PMC11782508
Lane M: 1 kb Gene Ruler (Fermentas, UK), Lane 1: PCR amplicon of the azurin gene (azu) from isolate 105 with the expected size of 442 bp. (
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PMC10734950
Subsequently, the cells were then treated with a gradient of concentrations (0.01 μM to 5 μM) with compound F8 for a 48 h time point.
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PMC11754784
The type II leakage mainly occurs when input proteins are separately expressed in different by-standing cells.
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PMC11545868
These glucosides exist in a glycosylated form, which means they are attached to a sugar molecule (glucose) via a glycosidic bond.
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PMC11721064
However, this percentage decreased to 25.3% ± 1.8% after Stattic treatment (Fig. 7A, B).
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PMC11206502
Increased expression of both genes has been related with the poor prognosis in patients with cancer disease .
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PMC8041314
Compounds 15, 20, and 33 were analyzed in our laboratory by using a Bruker Avance 500 MHz (500 MHz).
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PMC9429973
Aims: To assess the impact of comorbidities and response to treatment on the symptomatology of patients with MPN assessed by MPN SAF.
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PMC11699178
This is consistent with our findings regarding the specific regulation of FGFR1 by FGF-2.
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PMC4005030
Thus PCA which is a rich polyphenolic constituent of H. sabdariffa may serve as a good hyperlipidemic agent.
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PMC11754432
Immunocytochemistry staining (C) of endoplasmic reticulum marker Calnexin (magenta) in combination with plasma membrane marker MemGlow 488 (yellow) and cholesterol staining by filipin (Cyan).
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PMC10047551
PD-L1 expression can be induced by oncogenic driver mutations, e.g., epidermal growth factor receptor (EGFR) and Kirsten rat sarcoma virus (KRAS) mutations and anaplastic lymphoma kinase (ALK) chromosomal rearrangements .
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PMC10999934
The t-SNE plot demonstrated cell types. (
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PMC11544122
The pEC50 for receptor BRET was 10.03 for WT, 9.726 for 4A variant receptor (in an inverse manner), and not detectable (n.d.)
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PMC5941560
DNA library preparation was performed with the iGenomX RLP according to manufacturer’s specifications (http://www.igenomx.com/technology.html).
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PMC8658661
According to the results of transcriptome profiling in HepG2 cells, the cytochrome P450 superfamily genes are weakly expressed, as expected—at the proteomic level, the corresponding proteins are either absent or found at very low concentrations .
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PMC11680982
Tumor photographs in animals treated with normal saline (control group), CDK4/6 inhibitor (palbociclib, 150 mg/kg, i.g.)
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PMC6160470
After 48 hours of incubation, all cells were collected (attached and floating), washed thoroughly with PBS, and re-suspended in the Annexin binding buffer (10 mM HEPES, 140 mM NaCl, 2.5 mM CaCl2, pH = 7.4) containing Annexin V FITC conjugate (BD Pharmigen) and 4 mg/mL 7-actinomycin D (7-AAD, Molecular Bioprobes, Invitrogen).
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PMC10547921
Initially, ADCs were limited to oncology.
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PMC11772449
After treating normal PLC/PRF/5 (ATG5) cells and PLC/PRF/5 (ATG5) cells with different concentrations of Sora, it was found that knockout of ATG5 significantly enhanced the inhibitory effect of Sora on the proliferation of PLC/PRF/5 cells (Fig. 4 J, K).
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PMC6600253
Importantly, Li et al. indicated that CXCR2 drives senescence but acts as a barrier to apoptosis .
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PMC10994876
Therapeutic protein drugs have become an essential element within the healthcare industry and have brought about a significant transformation in the range of treatment choices available for various diseases (Lagassé et al. 2017).
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PMC11087301
While EMT is necessary for metastasis, MET is required for CTCs to establish a secondary site.
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PMC11760643
Related to the potential of the anti‐P2X7 mAb mediating CDC in vivo, a phase 1 clinical trial using topical treatment of a polyclonal antibody to non‐functional P2X7 (BIL010t) can reduce the size of primary basal cell carcinoma lesions in 65% of patients .
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PMC11476106
Horseradish peroxidase (20 U/mL) was also added to the mix.
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This study also found that MCM proteins were upregulated in HCC cells and tissues and that overexpression of MCM proteins was crucial for the overall survival of HCC patients.
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PMC11365427
Furthermore, phenylalanine deprivation demonstrated a negligible effect on normal BM cells while exhibiting selectivity on MM cells (Fig. S4E).
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PMC9581083
QFPDT formula is used in the treatment of NCP.
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The slices were rehydrated and treated with 3% hydrogen peroxide before being blocked with 10% bovine serum albumin (BSA, SRE0096, Sigma, USA) for 1 h. Following that, the sections were incubated at 4 °C overnight with primary antibody against ROBO1 (ab7279, Abcam, Cambridge, UK).
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PMC11737091
The current study revealed that DBF4 overexpression is a significant factor associated with malignant features and poor prognosis in patients with ccRCC.
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PMC9429973
Despite improved patient survival driven by a plethora of treatment options, the disease remains incurable.
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PMC11732523
No well-established therapeutic approach exists for GS patients with COVID-19.
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PMC9822769
The SLC22 superfamily is divided into three subfamilies based on the nature of the substrate: organic cation (OCT), organic anion (OAT), and organic zwitterion (OCTN) transporters.
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PMC4839679
We performed proliferation analysis with PBRM1 knockdown in Caki1 cells and A498 cells and were surprised to find no significant effect on proliferation under standard cell culture conditions (Fig 2A and 2B).
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PMC10006224
As control, we monitored the behavior of the replicative helicase component MCM3, which increases on chromatin during G1 and decreases as S phase progresses while total levels are maintained (Supplementary Fig. 1a, first column).
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PMC11727062
Extracts from Ginkgo biloba leaves have demonstrated the ability to induce apoptotic cell death in melanoma cells, characterized by DNA fragmentation, thereby exerting an anti-melanoma effect (Park and Kim 2015).
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PMC11593031
The presence of near-tetraploid karyotypes in all three cell lines studied here indicates that karyotype evolution occurred in Neuro-2a.
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PMC11476004
Reimann-Berg et al. reported a high degree of homology of human and canine chromosomes.
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PMC11594074
Using methylation array technology, the methylation status of 96% of CpG islands of the human genome may be investigated and therefore plays a role in many diagnostic processes, such as identifying the primary tumor of metastasis, as well as being important for the choice of further treatment of the tumor .
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PMC11515150
In other words, T cell aplasia caused by CD5 CARs targeting T cell malignancies can be considered as a novel conditioning regimen.
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PMC3681794
Thus, although it may contribute to hypoxia-induced drug resistance in U2OS cells, p53 inactivation cannot be the only cause of hypoxia-induced resistance in osteosarcoma cells.
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PMC8041314
Especially, the results for compound 27 must be put into perspective as it possessed an equal inhibitory power against ABCG2 as the “golden standard”, compound 34.
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PMC9545474
Cells were washed with PBS (1 mL) once and treated with either cisplatin (6.5 μM) or complexes 6 and 8 at IC50 concentrations and incubated for 24 h. Supernatants were removed by suction, and each well was washed with PBS before detaching the cells using trypsin.
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PMC5034105
Total nucleic acid (TNA) was extracted from culture supernatants of the 33 cell lines infected by ZIKV or DENV-2 at 1, 3 and 5 d.p.i.
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PMC10047551
Altogether, the results indicate that PD-L1 CpG island south shore methylation levels do not mirror the PD-L1 mRNA expression induced upon IFN-γ stimulation.
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PMC10114490
HLC generated through direct reprogramming or PSC differentiation from the same donor displayed similar functionality and equally improved their phenotype after in vivo repopulation .
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PMC11590870
They were first soaked in gentle commercial detergent for 15 min.
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PMC11343332
Aberrant activation of VEGF and FGF signaling can contribute to tumor growth and metastasis in breast cancer.
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Results: DIS3 silenced HMCLs show a significant decrease of cellular growth right after 4 days from LNA gapmeR delivery.
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Our groups have developed a series of 2-oxoamides as inhibitors of cPLA2α and studied their in vitro and in vivo activities.
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PMC11687167
The authors identified CAP1 as a new binding partner of PCSK9 and a key mediator of the caveolae-dependent endocytosis and lysosomal degradation of LDLR .
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PMC11240448
The resulting model parameters are available in the SBML files in the Supplementary Materials.
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Figure 2—figure supplement 1.Fixation can diminish liquid–liquid phase separation (LLPS) appearance.
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PMC11001582
Two-sided Welch’s t-test with 5% FDR multiple-correction was performed to identify differentially regulated proteins.
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Interestingly, at day nine the 500nM population recovered having a cell viability of 82% (Sup Fig. 2b).
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PMC11350568
We found that the fluorescence intensity of AptG-1 was 6 times that of AptG-2 at an extremely low concentration (0.1 nM), and at a high concentration (50 nM), it was still twice that of AptG-2.
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PMC11759751
58.6%, P < 0.001), but there was no difference in 2-year OS between the two groups (combination therapy 35.2%, monotherapy 36.5%) .
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PMC9031474
During apoptosis, PARP1 is cleaved by caspases 3 and 7, leading to the inactivation of PARP1-mediated DNA repair.
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VPA promotes caspase-3 activity in A549 cells Caspase-3 activity, an early marker of apoptosis, was determined in A549 cells exposed to VPA.
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D Normalized expression of KCNA2 transcripts (FPKM) in A673/TR/shEF cell line at day 0 and after 7 day of doxycycline treatment (1 µg/mL).
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In the GS-based system, CHO cells are cultured with MSX to select for cells that have increased copies of the GS gene and gene of interest.
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However, if the expression level of CD47 is lower than PTK7, the concentration of the Nb-S strand difussed into the surrounding solution will increase sharply, leading to the cross between target cells and by-standing cells.
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Turn on the temperature control module and CO2 in advance before use to provide suitable growth conditions for living cells.
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We also found significant overlaps with Nrf2-dependent genes and predicted targets of the transcription factors MafG, Nrf1 and Hes2 (Fig. 7b).
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PMC9429973
Then, we co-cultured control (wt) or CD44-silenced HS-5 cells with leukemic K562 cells.
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PMC11754784
As shown in Fig. 1c and Supplementary Fig. 2, NH2-PEG-N3 was specifically labeled at N terminal of Nb as a linker by glutamate transaminase, then DBCO-modified DNA strand was reacted with N3 through click chemistry.
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PMC11055443
Real time PCR analysis.
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PMC6684588
As anticipated, mdx mice displayed markedly increased concentrations of creatine phosphokinase compared to wild-type mice (Fig. 5b).
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PMC11352311
The intersecting targets of esculin and RCC were entered into STRING to obtain a protein-protein interaction (PPI) network diagram.
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PMC9895440
PT.58.704850), NR4A3 (Hs.
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PMC11756514
Unpaired two-sided t-tests analyzed data to compare two groups.
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PMC10932641
NC, negative control; SI, silent; OE, overexpressive; lncRNA, long noncoding RNA.
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PMC11543853
Some of the virus-containing endosomes were partially or fully covered with protein coats; however, we could not identify the type of vesicle coating (Fig. 2ab, Supplementary Fig. 1a, 2ab, 3a).
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PMC7342409
Caspase-7 expression in tumor tissue detected by immunohistochemistry.
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p < 0.01 and ***p < 0.001 versus NOR group; p < 0.01 and p < 0.001 versus High Ca group; p < 0.01 and p < 0.001 versus High Ca+HC group.
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PMC11546117
Culture conditions were optimized to obtain a tight monolayer of cells cultured on semipermeable transwell inserts.
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PMC8922418
In addition, compared with BE, which would cause bystander edits if the active window had multiple cytosine or adenine, PE has almost no byproduct.
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One-way ANOVA. (
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PMC9429973
Surrogate markers of host immunity and more sensitive techniques to identify extranodal involvement could potentially be added to the IPI model to further improve it.
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PMC10890307
After incubation, the cells were washed and fixed with paraformaldehyde (1% w/v) for further analysis on a FACS Canto II Flow Cytometer (Becton Dickinson, Lincoln Park, NJ, USA).
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PMC11650848
We have highlighted here that an inverse effect which does not directly increase the cognitive abilities of individuals with a particular mQTL variant but instead it may help in maintaining normal development.
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PMC9429973
Three pts who experienced the same intolerance events (pain in extremity, diarrhea, and atrial fibrillation) on ibrutinib and acalabrutinib did not have a recurrence of those on zanubrutinib.
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PMC11670407
Briefly, the human OTULIN genome sequence was first analyzed, two optimal sgRNA sequences were designed, and these sgRNA sequences were chemically synthesized.
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PMC11502066
In general, GPCRs couple to heterotrimeric G proteins and are classified based on their ability to preferentially activate an α subunit of four subfamilies: Gαs, Gαi/0, Gαq/11, and Gα12/13 [10–12].
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PMC11746948
Mice-bearing tumors derived from A375-GPX4-KO cells were randomly assigned to receive treatment with IKE (20 mg/kg), IKE plus 2-BP (20 mg/kg), or IKE plus ML349 (5 mg/kg), respectively, via intraperitoneal injection once every two days for four weeks.
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PMC11740207
Moreover, such studies may enhance our understanding of metabolic pathways applicable to therapy.
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PMC11194678
All statistical data in this figure are expressed as mean ± SD of three or four independent experiments.
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PMC10823017
Finally, electrophoresis was carried out according to the method described in the previously published protocol (23).
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PMC9429973
When the 2 cohorts were combined, treatment with 4+ drugs [Est -6.27; 95% CI (-11.8, -0.69); p = 0.02] and treatment with HCTZ and ACEi/ARB combination [Est -5.05; 95% CI (-9.61, -0.48); p = 0.03] or HCTZ and BB [Est -5.05; 95% CI(-9.61,-0.48); p= 0.03] were associated with MAP reduction.
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PMC10729469
6Adoptive transfer of TCRAβ-Tregs reduces reactive microglia in APP/PS1 mice.
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PMC11806818
Table 5Dual-mode nanozyme-based aptamer biosensors for tumor biomarker detectionBiomarkerAptamerNanozymeSubstrateDetection MethodElectrodeLinear RangeLODRecovery(RSD)Assay TimeRef.
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PMC11463018
Metal bonds and hydrogen bonds were labelled in baby blue and dark blue, respectively.
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FACIT-Fatigue scores increased for PEG-treated patients to near the general population norm [43.6], supporting the gains shown in the EORTC QLQ-C30-Fatigue scale.
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PMC11477621
Unless otherwise noted, all reagents were commercially available (Sinopharm (Beijing, China), Energy, Bide, Adamas-beta (Shanghai, China), TCI (Qingdao, China), J&K (Beijing, China), etc.)
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PMC11763111
Tumor burden of mice was measured every week.
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