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PDBbind_test / 6d3y /6d3y_rdkit_ligand.pdb
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b57a5d2 verified
COMPND 6d3y_ligand
HETATM 1 N1 UNL 1 -6.056 1.229 -0.532 1.00 0.00 N
HETATM 2 C1 UNL 1 -6.469 2.507 -0.029 1.00 0.00 C
HETATM 3 C2 UNL 1 -6.059 3.626 -0.898 1.00 0.00 C
HETATM 4 O1 UNL 1 -6.908 3.847 -1.852 1.00 0.00 O
HETATM 5 N2 UNL 1 -4.934 4.438 -0.838 1.00 0.00 N
HETATM 6 C3 UNL 1 -4.443 5.310 0.205 1.00 0.00 C
HETATM 7 C4 UNL 1 -3.008 5.647 -0.028 1.00 0.00 C
HETATM 8 O2 UNL 1 -2.746 6.857 -0.271 1.00 0.00 O
HETATM 9 C5 UNL 1 -4.740 4.895 1.595 1.00 0.00 C
HETATM 10 C6 UNL 1 -4.188 5.893 2.565 1.00 0.00 C
HETATM 11 C7 UNL 1 -4.757 7.269 2.464 1.00 0.00 C
HETATM 12 N3 UNL 1 -6.186 7.185 2.712 1.00 0.00 N
HETATM 13 C8 UNL 1 -6.665 6.847 3.999 1.00 0.00 C
HETATM 14 N4 UNL 1 -8.060 6.513 4.134 1.00 0.00 N
HETATM 15 N5 UNL 1 -5.906 6.830 5.034 1.00 0.00 N
HETATM 16 N6 UNL 1 -1.913 4.773 -0.013 1.00 0.00 N
HETATM 17 C9 UNL 1 -1.402 3.955 1.060 1.00 0.00 C
HETATM 18 C10 UNL 1 -0.285 4.613 1.786 1.00 0.00 C
HETATM 19 O3 UNL 1 -0.608 5.092 2.941 1.00 0.00 O
HETATM 20 C11 UNL 1 -0.982 2.594 0.473 1.00 0.00 C
HETATM 21 S1 UNL 1 -2.270 1.358 0.702 1.00 0.00 S
HETATM 22 N7 UNL 1 1.038 4.776 1.390 1.00 0.00 N
HETATM 23 C12 UNL 1 1.592 5.399 0.226 1.00 0.00 C
HETATM 24 C13 UNL 1 3.077 5.520 0.371 1.00 0.00 C
HETATM 25 O4 UNL 1 3.464 6.132 1.402 1.00 0.00 O
HETATM 26 C14 UNL 1 1.053 6.745 -0.123 1.00 0.00 C
HETATM 27 O5 UNL 1 1.724 7.217 -1.277 1.00 0.00 O
HETATM 28 C15 UNL 1 1.144 7.786 0.935 1.00 0.00 C
HETATM 29 N8 UNL 1 4.038 5.028 -0.505 1.00 0.00 N
HETATM 30 C16 UNL 1 3.826 4.000 -1.498 1.00 0.00 C
HETATM 31 C17 UNL 1 3.674 2.638 -0.914 1.00 0.00 C
HETATM 32 O6 UNL 1 2.740 1.905 -1.427 1.00 0.00 O
HETATM 33 C18 UNL 1 4.798 3.983 -2.622 1.00 0.00 C
HETATM 34 C19 UNL 1 4.834 5.208 -3.476 1.00 0.00 C
HETATM 35 C20 UNL 1 5.169 6.490 -2.771 1.00 0.00 C
HETATM 36 C21 UNL 1 5.218 7.653 -3.780 1.00 0.00 C
HETATM 37 N9 UNL 1 3.940 7.820 -4.432 1.00 0.00 N1+
HETATM 38 N10 UNL 1 4.410 2.064 0.111 1.00 0.00 N
HETATM 39 C22 UNL 1 5.829 1.818 0.212 1.00 0.00 C
HETATM 40 C23 UNL 1 6.076 0.642 1.087 1.00 0.00 C
HETATM 41 O7 UNL 1 5.447 0.671 2.206 1.00 0.00 O
HETATM 42 C24 UNL 1 6.569 2.974 0.904 1.00 0.00 C
HETATM 43 O8 UNL 1 6.089 3.180 2.173 1.00 0.00 O
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HETATM 47 O9 UNL 1 8.460 -2.576 -1.590 1.00 0.00 O
HETATM 48 C27 UNL 1 8.808 -0.094 -0.518 1.00 0.00 C
HETATM 49 C28 UNL 1 9.815 -0.323 0.531 1.00 0.00 C
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HETATM 179 H70 UNL 1 0.001 -4.736 0.548 1.00 0.00 H
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HETATM 184 H75 UNL 1 2.190 -5.026 3.613 1.00 0.00 H
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HETATM 186 H77 UNL 1 -1.326 -5.991 3.863 1.00 0.00 H
HETATM 187 H78 UNL 1 -1.732 -7.679 3.608 1.00 0.00 H
HETATM 188 H79 UNL 1 -2.255 -6.485 2.431 1.00 0.00 H
HETATM 189 H80 UNL 1 -2.584 -4.163 2.925 1.00 0.00 H
HETATM 190 H81 UNL 1 -3.317 -2.358 1.710 1.00 0.00 H
HETATM 191 H82 UNL 1 -0.560 -2.190 0.583 1.00 0.00 H
HETATM 192 H83 UNL 1 -1.877 -1.457 -0.341 1.00 0.00 H
HETATM 193 H84 UNL 1 -3.090 -3.554 -2.035 1.00 0.00 H
HETATM 194 H85 UNL 1 -4.771 -1.950 -1.988 1.00 0.00 H
HETATM 195 H86 UNL 1 -4.684 -3.552 -3.522 1.00 0.00 H
HETATM 196 H87 UNL 1 -6.390 -3.305 -3.203 1.00 0.00 H
HETATM 197 H88 UNL 1 -7.677 -5.199 -2.212 1.00 0.00 H
HETATM 198 H89 UNL 1 -3.475 -5.606 -3.081 1.00 0.00 H
HETATM 199 H90 UNL 1 -7.858 -7.615 -2.049 1.00 0.00 H
HETATM 200 H91 UNL 1 -3.733 -7.998 -2.912 1.00 0.00 H
HETATM 201 H92 UNL 1 -5.933 -9.071 -2.390 1.00 0.00 H
HETATM 202 H93 UNL 1 -8.303 -2.696 -1.948 1.00 0.00 H
HETATM 203 H94 UNL 1 -9.756 -4.450 -1.447 1.00 0.00 H
HETATM 204 H95 UNL 1 -10.427 -3.383 -0.142 1.00 0.00 H
HETATM 205 H96 UNL 1 -8.369 -5.577 0.043 1.00 0.00 H
HETATM 206 H97 UNL 1 -9.481 -5.022 1.320 1.00 0.00 H
HETATM 207 H98 UNL 1 -8.161 -3.052 1.815 1.00 0.00 H
HETATM 208 H99 UNL 1 -7.037 -4.393 1.598 1.00 0.00 H
HETATM 209 HA0 UNL 1 -8.432 0.445 0.223 1.00 0.00 H
HETATM 210 HA1 UNL 1 -8.033 -0.593 -2.613 1.00 0.00 H
HETATM 211 HA2 UNL 1 -8.448 1.820 -3.245 1.00 0.00 H
HETATM 212 HA3 UNL 1 -8.942 2.060 -1.519 1.00 0.00 H
HETATM 213 HA4 UNL 1 -11.531 0.104 -4.039 1.00 0.00 H
CONECT 1 2 103 109
CONECT 2 3 109 110
CONECT 3 4 4 5
CONECT 5 6 111
CONECT 6 7 9 112
CONECT 7 8 8 16
CONECT 9 10 113 114
CONECT 10 11 115 116
CONECT 11 12 117 118
CONECT 12 13 119
CONECT 13 14 15 15
CONECT 14 120 121
CONECT 15 122
CONECT 16 17 123
CONECT 17 18 20 124
CONECT 18 19 19 22
CONECT 20 21 125 126
CONECT 21 82
CONECT 22 23 127
CONECT 23 24 26 128
CONECT 24 25 25 29
CONECT 26 27 28 129
CONECT 27 130
CONECT 28 131 132 133
CONECT 29 30 134
CONECT 30 31 33 135
CONECT 31 32 32 38
CONECT 33 34 136 137
CONECT 34 35 138 139
CONECT 35 36 140 141
CONECT 36 37 142 143
CONECT 37 144 145 146
CONECT 38 39 147
CONECT 39 40 42 148
CONECT 40 41 41 44
CONECT 42 43 149 150
CONECT 43 151
CONECT 44 45 152
CONECT 45 46 48 153
CONECT 46 47 47 55
CONECT 48 49 154 155
CONECT 49 50 156 157
CONECT 50 51 158 159
CONECT 51 52 160
CONECT 52 53 54 54
CONECT 53 161 162
CONECT 54 163
CONECT 55 56 61
CONECT 56 57 59 164
CONECT 57 58 58 62
CONECT 59 60 165 166
CONECT 60 61 167 168
CONECT 61 169 170
CONECT 62 63 68
CONECT 63 64 66 171
CONECT 64 65 65 69
CONECT 66 67 172 173
CONECT 67 68 174 175
CONECT 68 176 177
CONECT 69 70 178
CONECT 70 71 73 179
CONECT 71 72 72 77
CONECT 73 74 75 180
CONECT 74 76 181 182
CONECT 75 183 184 185
CONECT 76 186 187 188
CONECT 77 78 189
CONECT 78 79 81 190
CONECT 79 80 80 83
CONECT 81 82 191 192
CONECT 83 84 193
CONECT 84 85 87 194
CONECT 85 86 86 94
CONECT 87 88 195 196
CONECT 88 89 89 90
CONECT 89 91 197
CONECT 90 92 92 198
CONECT 91 93 93 199
CONECT 92 93 200
CONECT 93 201
CONECT 94 95 100
CONECT 95 96 98 202
CONECT 96 97 97 101
CONECT 98 99 203 204
CONECT 99 100 205 206
CONECT 100 207 208
CONECT 101 102 209
CONECT 102 103 105 210
CONECT 103 104 104
CONECT 105 106 211 212
CONECT 106 107 108 108
CONECT 107 213
END