Datasets:
File size: 4,681 Bytes
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configs:
- config_name: document_metadata
data_files:
- split: train
path: data/document_metadata/document_metadata.parquet
- config_name: spans
data_files:
- split: train
path: data/spans/spans.parquet
- config_name: relations
data_files:
- split: train
path: data/relations/relations.parquet
task_categories:
- token-classification
language:
- fr
tags:
- inception
- uima
- annotation
---
# Dataset Card for pseudo
## Dataset Description
- **Homepage:** - **Point of Contact:**
### Dataset Summary
ce truc decrit un truc
pseudo is a subpart of the PARHAF corpus, an open French corpus of human-authored clinical reports of fictional patients.
It was created to support the development and evaluation of clinical NLP systems for {use_case_short_description}.
Each patient record was:
- written by a senior medical resident
- reviewed by another senior medical resident, from the same specialty
- annotated by a specialist of the use case
- curated by another specialist of the use case
#### Data statistics
### Indicateurs globaux
| Indicateur | Valeur |
| --- | --- |
| Nombre de fichiers JSON | 846 |
| Total annotations | 11610 |
| Longueur moyenne des documents | 4009 caractères |
| Seuil 60% (annotations) | 6966 |
### Répartition par type du dataset complet
| Type | Annotations | % du total |
| --- | --- | --- |
| EntiteAnonymisation | 11610 | 100.00% |
### Répartition par champ renseigné du dataset complet
| Type.Champ | Occurrences | % du total annot. |
| --- | --- | --- |
| EntiteAnonymisation.Categorie | 11610 | 100.00% |
| EntiteAnonymisation.CodeType | 2 | 0.02% |
| EntiteAnonymisation.RoleLOC | 148 | 1.27% |
| EntiteAnonymisation.RoleNUM | 19 | 0.16% |
| EntiteAnonymisation.RolePER | 4145 | 35.70% |
### Résultats de la division Train / Test
| Indicateur | TRAIN | TOTAL |
| --- | --- | --- |
| Nombre de fichiers | 509 | 509 |
| Nombre d'annotations | 6976 | 6976 |
| Pourcentage du dataset | 60.09% | 100.00% |
| Longueur moy. documents (chars) | 4021 | |
### Répartition par type Train
| Type | TRAIN | % train du type |
| --- | --- | --- |
| EntiteAnonymisation | 6976 | 60.09% |
### Répartition par champ renseigné Train
| Type.Champ | TRAIN | % train du champ |
| --- | --- | --- |
| EntiteAnonymisation.Categorie | 6976 | 60.09% |
| EntiteAnonymisation.CodeType | 0 | 0.00% |
| EntiteAnonymisation.RoleLOC | 87 | 58.78% |
| EntiteAnonymisation.RoleNUM | 8 | 42.11% |
| EntiteAnonymisation.RolePER | 2466 | 59.49% |
### Répartition par valeur Train
| Type.Champ.Valeur | TRAIN | % train |
| --- | --- | --- |
| EntiteAnonymisation.Categorie.DateIdentifiante | 2880 | 60.67% |
| EntiteAnonymisation.Categorie.Nom | 1398 | 59.19% |
| EntiteAnonymisation.RolePER.Patient | 1235 | 58.59% |
| EntiteAnonymisation.RolePER.PersonnelSante | 1205 | 60.49% |
| EntiteAnonymisation.Categorie.Prenom | 1068 | 59.90% |
| EntiteAnonymisation.Categorie.SituationFamiliale | 970 | 59.51% |
| EntiteAnonymisation.Categorie.IdentiteSocialePatient | 523 | 61.82% |
| EntiteAnonymisation.Categorie.Ville | 54 | 58.70% |
| EntiteAnonymisation.RoleLOC.Patient | 46 | 66.67% |
| EntiteAnonymisation.RolePER.Autre | 26 | 57.78% |
| EntiteAnonymisation.RoleLOC.Hopital | 22 | 50.00% |
| EntiteAnonymisation.Categorie.Pays | 28 | 65.12% |
| EntiteAnonymisation.RoleLOC.Autre | 19 | 54.29% |
| EntiteAnonymisation.Categorie.DateNaissancePatient | 17 | 51.52% |
| EntiteAnonymisation.Categorie.DateNonIdentifiante | 19 | 59.38% |
| EntiteAnonymisation.Categorie.NumeroTelephone | 8 | 42.11% |
| EntiteAnonymisation.RoleNUM.PersonnelSante | 5 | 50.00% |
| EntiteAnonymisation.Categorie.Adresse | 3 | 30.00% |
| EntiteAnonymisation.Categorie.NationalitePatient | 6 | 85.71% |
| EntiteAnonymisation.RoleNUM.Hopital | 2 | 33.33% |
| EntiteAnonymisation.Categorie.Url | 2 | 50.00% |
| EntiteAnonymisation.RoleNUM.Autre | 1 | 33.33% |
| EntiteAnonymisation.Categorie.CodeIdentifiant | 0 | 0.00% |
| EntiteAnonymisation.CodeType.NIPouIPP | 0 | 0.00% |
| EntiteAnonymisation.CodeType.INS | 0 | 0.00% |
#### Data Origin
The clinical reports are extracted from
## Structure des fichiers
| Config | Contenu |
|---|---|
| `document_metadata` | Titre, texte brut, annotation document-level |
| `spans` | Annotations Span avec leurs attributs |
| `relations` | Relations entre spans |
## Chargement
```python
from datasets import load_dataset
metadata = load_dataset("abdellaouic/test", name="document_metadata", split="train")
spans = load_dataset("abdellaouic/test", name="spans", split="train")
relations = load_dataset("abdellaouic/test", name="relations", split="train")
```
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