# Agent input

/sop/input/Sus_scrofa.Sscrofa11.1.116.gtf.gz：该文件为Ensembl猪Sscrofa11.1基因组注释，用于提取1–18号常染色体的基因信息。
/sop/input/pig_10K_500.vcf:标准VCF 4.2格式，包括SNP染色体、位置、ID、REF和ALT、二倍体GT基因型、基因型使用0/0、0/1、1/1编码、允许.、./.和.|.表示缺失基因型。
/sop/input/phenotype.tsv：字段包括：FID家系编号、IID个体编号，与VCF样本名对应、SEX性别，F或M、POP亚群体，POP1、POP2或POP3、TRAIT连续型定量表型。


Only annotator-supplied inputs are present here. Solved outputs are excluded from the agent-visible data and Docker image.