DynaCLR-data / infection_transitions_analysis.csv
srivarra's picture
Add files using upload-large-folder tool
cec8ac8 verified
track_id,fov_name,transition_type,n_timepoints,n_uninfected,n_infected,n_unknown,first_timepoint,last_timepoint,first_uninfected_t,first_infected_t,status_sequence
15,A/2/001001,uninfected→infected,6,1,5,0,38,43,38,39,uni→inf→inf→inf→inf→inf
42,A/2/001000,uninfected→infected,26,3,23,0,37,62,37,40,uni→uni→uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf
93,A/2/000000,uninfected→infected,14,12,2,0,14,41,14,40,uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf
104,A/2/000001,uninfected→infected,27,19,8,0,20,46,20,39,uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf
107,A/2/000001,uninfected→infected,46,19,27,0,20,65,20,39,uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf
114,A/2/001000,uninfected→infected,49,29,20,0,11,59,11,40,uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf
116,A/2/001000,uninfected→infected,30,10,20,0,19,59,19,40,uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf
117,A/2/001000,uninfected→infected,47,21,26,0,19,65,19,40,uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf
119,A/2/000001,uninfected→infected,27,17,10,0,23,49,23,40,uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf
121,A/2/000001,uninfected→infected,28,1,27,0,38,65,38,39,uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf
122,A/2/000001,uninfected→infected,28,1,27,0,38,65,38,39,uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf
122,A/2/001000,uninfected→infected,26,7,19,0,25,65,25,47,uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf
127,A/2/001001,uninfected→infected,29,17,12,0,22,50,22,39,uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf
128,A/2/000000,uninfected→infected,36,26,10,0,14,49,14,40,uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf
131,A/2/000001,uninfected→infected,2,1,1,0,38,39,38,39,uni→inf
135,A/2/000000,uninfected→infected,46,36,10,0,4,49,4,40,uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf
137,A/2/000001,uninfected→infected,45,39,6,0,0,44,0,39,uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf
152,A/2/000001,uninfected→infected,64,38,26,0,0,65,0,40,uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf
168,A/2/000001,uninfected→infected,38,11,27,0,28,65,28,39,uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf
182,A/2/000000,uninfected→infected,55,33,22,0,7,61,7,40,uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf
198,A/2/002001,uninfected→infected,23,22,1,0,17,39,17,39,uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf
205,A/2/000000,uninfected→infected,32,6,26,0,34,65,34,40,uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf
209,A/2/000000,uninfected→infected,31,5,26,0,35,65,35,40,uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf
210,A/2/002001,uninfected→infected,29,27,2,0,12,40,12,39,uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf
225,A/2/001000,uninfected→infected,40,24,16,0,16,55,16,40,uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf
240,A/2/001000,uninfected→infected,48,34,14,0,6,53,6,40,uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→uni→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf→inf