diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000005772_ENSDART00000025214_GN:tsr2_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000005772_ENSDART00000025214_GN:tsr2_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..671bab553a50ad3045f3c8254891d47aa39644e5 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000005772_ENSDART00000025214_GN:tsr2_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,183 @@ +>ENSDARG00000005772|ENSDART00000025214|GN:tsr2|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.334 +2 A 0.311 +3 P 0.274 +4 L 0.229 +5 S 0.176 +6 S 0.122 +7 S 0.079 +8 T 0.050 +9 R 0.034 +10 E 0.027 +11 V 0.024 +12 F 0.025 +13 S 0.030 +14 E 0.037 +15 A 0.042 +16 V 0.044 +17 R 0.046 +18 A 0.048 +19 V 0.049 +20 L 0.049 +21 E 0.050 +22 T 0.050 +23 W 0.048 +24 P 0.044 +25 V 0.040 +26 L 0.041 +27 Q 0.044 +28 I 0.047 +29 A 0.051 +30 V 0.059 +31 D 0.072 +32 N 0.089 +33 G 0.106 +34 F 0.118 +35 G 0.124 +36 G 0.122 +37 A 0.114 +38 F 0.104 +39 S 0.094 +40 Q 0.081 +41 Q 0.069 +42 K 0.064 +43 A 0.063 +44 E 0.057 +45 W 0.047 +46 M 0.040 +47 V 0.035 +48 D 0.034 +49 A 0.036 +50 L 0.036 +51 Q 0.034 +52 Q 0.030 +53 Y 0.030 +54 F 0.036 +55 T 0.046 +56 D 0.057 +57 N 0.066 +58 G 0.071 +59 D 0.071 +60 L 0.066 +61 Q 0.058 +62 Q 0.049 +63 D 0.042 +64 E 0.039 +65 V 0.039 +66 E 0.038 +67 D 0.037 +68 F 0.037 +69 I 0.038 +70 S 0.041 +71 E 0.045 +72 L 0.049 +73 M 0.056 +74 N 0.065 +75 N 0.074 +76 E 0.079 +77 F 0.080 +78 N 0.081 +79 T 0.086 +80 V 0.097 +81 V 0.111 +82 D 0.126 +83 D 0.133 +84 G 0.123 +85 S 0.101 +86 L 0.077 +87 P 0.061 +88 Q 0.054 +89 V 0.051 +90 A 0.047 +91 Q 0.044 +92 Q 0.042 +93 V 0.041 +94 C 0.039 +95 G 0.037 +96 M 0.035 +97 F 0.034 +98 Q 0.034 +99 Q 0.038 +100 C 0.046 +101 E 0.056 +102 Q 0.066 +103 G 0.072 +104 R 0.072 +105 L 0.065 +106 A 0.055 +107 E 0.052 +108 V 0.057 +109 R 0.068 +110 E 0.077 +111 Q 0.074 +112 I 0.065 +113 L 0.061 +114 K 0.071 +115 L 0.093 +116 K 0.127 +117 Q 0.171 +118 K 0.232 +119 K 0.318 +120 T 0.420 +121 S 0.514 +122 S 0.584 +123 G 0.631 +124 R 0.659 +125 A 0.671 +126 K 0.673 +127 A 0.672 +128 T 0.676 +129 P 0.689 +130 A 0.703 +131 Q 0.714 +132 T 0.722 +133 P 0.733 +134 Q 0.749 +135 D 0.762 +136 D 0.768 +137 D 0.768 +138 D 0.767 +139 D 0.768 +140 D 0.769 +141 D 0.769 +142 E 0.761 +143 E 0.730 +144 E 0.680 +145 A 0.653 +146 M 0.681 +147 D 0.735 +148 C 0.772 +149 E 0.789 +150 G 0.800 +151 G 0.808 +152 S 0.811 +153 A 0.798 +154 V 0.756 +155 A 0.694 +156 S 0.661 +157 V 0.697 +158 S 0.765 +159 S 0.811 +160 T 0.825 +161 A 0.826 +162 V 0.822 +163 N 0.815 +164 D 0.804 +165 L 0.793 +166 H 0.786 +167 H 0.784 +168 E 0.782 +169 E 0.771 +170 E 0.748 +171 E 0.720 +172 D 0.694 +173 D 0.675 +174 G 0.669 +175 W 0.679 +176 T 0.695 +177 V 0.698 +178 V 0.669 +179 R 0.610 +180 R 0.535 +181 K 0.461 +182 K 0.413 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000005772_ENSDART00000025214_GN:tsr2_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000005772_ENSDART00000025214_GN:tsr2_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:5.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..cf9ce8f289d3a617eeac48bee6b901be46e8aa5c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000005772_ENSDART00000025214_GN:tsr2_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:5.caid @@ -0,0 +1,188 @@ +>ENSDARG00000005772|ENSDART00000025214|GN:tsr2|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:5 +1 M 0.351 +2 L 0.366 +3 V 0.391 +4 F 0.413 +5 K 0.416 +6 M 0.391 +7 A 0.348 +8 P 0.297 +9 L 0.239 +10 S 0.176 +11 S 0.119 +12 S 0.074 +13 T 0.046 +14 R 0.031 +15 E 0.025 +16 V 0.023 +17 F 0.024 +18 S 0.029 +19 E 0.037 +20 A 0.042 +21 V 0.044 +22 R 0.047 +23 A 0.049 +24 V 0.050 +25 L 0.049 +26 E 0.050 +27 T 0.051 +28 W 0.049 +29 P 0.044 +30 V 0.041 +31 L 0.042 +32 Q 0.044 +33 I 0.047 +34 A 0.050 +35 V 0.058 +36 D 0.072 +37 N 0.091 +38 G 0.109 +39 F 0.122 +40 G 0.128 +41 G 0.126 +42 A 0.118 +43 F 0.108 +44 S 0.097 +45 Q 0.084 +46 Q 0.072 +47 K 0.066 +48 A 0.064 +49 E 0.058 +50 W 0.048 +51 M 0.040 +52 V 0.036 +53 D 0.035 +54 A 0.037 +55 L 0.037 +56 Q 0.034 +57 Q 0.031 +58 Y 0.031 +59 F 0.036 +60 T 0.046 +61 D 0.056 +62 N 0.065 +63 G 0.070 +64 D 0.071 +65 L 0.066 +66 Q 0.058 +67 Q 0.050 +68 D 0.043 +69 E 0.040 +70 V 0.039 +71 E 0.039 +72 D 0.038 +73 F 0.037 +74 I 0.038 +75 S 0.041 +76 E 0.045 +77 L 0.049 +78 M 0.056 +79 N 0.065 +80 N 0.074 +81 E 0.079 +82 F 0.080 +83 N 0.081 +84 T 0.087 +85 V 0.098 +86 V 0.112 +87 D 0.127 +88 D 0.135 +89 G 0.126 +90 S 0.103 +91 L 0.079 +92 P 0.063 +93 Q 0.056 +94 V 0.053 +95 A 0.049 +96 Q 0.045 +97 Q 0.043 +98 V 0.041 +99 C 0.039 +100 G 0.037 +101 M 0.035 +102 F 0.034 +103 Q 0.035 +104 Q 0.038 +105 C 0.046 +106 E 0.056 +107 Q 0.066 +108 G 0.072 +109 R 0.072 +110 L 0.065 +111 A 0.056 +112 E 0.052 +113 V 0.057 +114 R 0.068 +115 E 0.077 +116 Q 0.075 +117 I 0.066 +118 L 0.062 +119 K 0.072 +120 L 0.095 +121 K 0.129 +122 Q 0.174 +123 K 0.237 +124 K 0.324 +125 T 0.426 +126 S 0.518 +127 S 0.588 +128 G 0.635 +129 R 0.663 +130 A 0.675 +131 K 0.676 +132 A 0.674 +133 T 0.677 +134 P 0.689 +135 A 0.703 +136 Q 0.713 +137 T 0.720 +138 P 0.732 +139 Q 0.747 +140 D 0.760 +141 D 0.766 +142 D 0.766 +143 D 0.765 +144 D 0.765 +145 D 0.767 +146 D 0.767 +147 E 0.758 +148 E 0.727 +149 E 0.676 +150 A 0.649 +151 M 0.678 +152 D 0.734 +153 C 0.772 +154 E 0.788 +155 G 0.798 +156 G 0.805 +157 S 0.808 +158 A 0.796 +159 V 0.754 +160 A 0.692 +161 S 0.660 +162 V 0.696 +163 S 0.763 +164 S 0.809 +165 T 0.824 +166 A 0.824 +167 V 0.820 +168 N 0.813 +169 D 0.802 +170 L 0.791 +171 H 0.785 +172 H 0.784 +173 E 0.782 +174 E 0.771 +175 E 0.748 +176 E 0.720 +177 D 0.694 +178 D 0.674 +179 G 0.668 +180 W 0.678 +181 T 0.695 +182 V 0.697 +183 V 0.667 +184 R 0.607 +185 R 0.531 +186 K 0.458 +187 K 0.410 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000007678_ENSDART00000033361_GN:ttyh3b_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000007678_ENSDART00000033361_GN:ttyh3b_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d9618524cbb8b36f5cdfffe891015e783d36d96a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000007678_ENSDART00000033361_GN:ttyh3b_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,561 @@ +>ENSDARG00000007678|ENSDART00000033361|GN:ttyh3b|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.281 +2 A 0.280 +3 A 0.270 +4 V 0.249 +5 V 0.221 +6 N 0.198 +7 Y 0.185 +8 S 0.175 +9 P 0.152 +10 P 0.119 +11 W 0.091 +12 W 0.082 +13 V 0.084 +14 N 0.085 +15 L 0.090 +16 F 0.107 +17 H 0.137 +18 R 0.171 +19 L 0.201 +20 P 0.215 +21 H 0.210 +22 F 0.199 +23 N 0.192 +24 L 0.193 +25 Q 0.198 +26 F 0.209 +27 Q 0.226 +28 Q 0.243 +29 T 0.247 +30 S 0.235 +31 S 0.217 +32 D 0.201 +33 F 0.191 +34 R 0.186 +35 P 0.177 +36 D 0.160 +37 D 0.138 +38 S 0.123 +39 D 0.119 +40 Y 0.122 +41 Q 0.128 +42 K 0.134 +43 A 0.135 +44 V 0.136 +45 L 0.148 +46 L 0.161 +47 L 0.154 +48 G 0.126 +49 A 0.097 +50 A 0.081 +51 A 0.077 +52 L 0.076 +53 V 0.075 +54 C 0.075 +55 L 0.074 +56 A 0.074 +57 L 0.074 +58 D 0.073 +59 L 0.066 +60 L 0.056 +61 F 0.050 +62 L 0.046 +63 L 0.043 +64 F 0.040 +65 Y 0.040 +66 S 0.038 +67 F 0.036 +68 W 0.035 +69 L 0.039 +70 C 0.053 +71 C 0.082 +72 C 0.127 +73 R 0.182 +74 R 0.234 +75 K 0.274 +76 N 0.304 +77 H 0.327 +78 D 0.346 +79 S 0.358 +80 P 0.355 +81 N 0.330 +82 A 0.279 +83 D 0.207 +84 C 0.134 +85 C 0.084 +86 C 0.064 +87 T 0.060 +88 A 0.056 +89 W 0.051 +90 C 0.047 +91 V 0.048 +92 I 0.053 +93 I 0.059 +94 A 0.061 +95 T 0.058 +96 L 0.055 +97 V 0.059 +98 C 0.070 +99 S 0.082 +100 A 0.088 +101 G 0.089 +102 I 0.090 +103 A 0.091 +104 V 0.087 +105 G 0.082 +106 F 0.086 +107 Y 0.099 +108 G 0.110 +109 N 0.115 +110 G 0.118 +111 E 0.121 +112 T 0.128 +113 C 0.139 +114 D 0.151 +115 G 0.155 +116 V 0.150 +117 T 0.141 +118 R 0.129 +119 L 0.116 +120 T 0.108 +121 Y 0.107 +122 S 0.106 +123 L 0.108 +124 R 0.113 +125 H 0.113 +126 A 0.106 +127 N 0.100 +128 Q 0.099 +129 T 0.107 +130 V 0.125 +131 A 0.148 +132 G 0.157 +133 I 0.144 +134 D 0.121 +135 K 0.101 +136 L 0.084 +137 V 0.075 +138 S 0.074 +139 E 0.073 +140 S 0.069 +141 T 0.065 +142 S 0.069 +143 S 0.076 +144 L 0.087 +145 N 0.101 +146 E 0.112 +147 T 0.109 +148 L 0.092 +149 M 0.073 +150 E 0.062 +151 G 0.056 +152 L 0.055 +153 V 0.056 +154 Q 0.056 +155 L 0.051 +156 E 0.046 +157 T 0.044 +158 V 0.045 +159 Y 0.047 +160 S 0.051 +161 K 0.059 +162 Q 0.068 +163 T 0.075 +164 D 0.076 +165 Y 0.076 +166 L 0.080 +167 S 0.084 +168 I 0.084 +169 V 0.085 +170 Q 0.094 +171 K 0.103 +172 L 0.105 +173 Q 0.103 +174 G 0.100 +175 Q 0.099 +176 L 0.106 +177 D 0.121 +178 E 0.127 +179 L 0.117 +180 I 0.105 +181 N 0.099 +182 L 0.103 +183 M 0.125 +184 L 0.163 +185 G 0.199 +186 V 0.214 +187 P 0.214 +188 F 0.221 +189 W 0.246 +190 S 0.282 +191 S 0.308 +192 N 0.310 +193 D 0.291 +194 L 0.259 +195 S 0.220 +196 L 0.183 +197 D 0.161 +198 H 0.154 +199 L 0.153 +200 A 0.155 +201 S 0.163 +202 I 0.175 +203 T 0.180 +204 E 0.168 +205 Q 0.143 +206 Y 0.119 +207 D 0.100 +208 W 0.083 +209 Y 0.071 +210 R 0.068 +211 W 0.068 +212 L 0.064 +213 G 0.059 +214 Y 0.058 +215 L 0.058 +216 G 0.056 +217 L 0.053 +218 L 0.048 +219 L 0.041 +220 F 0.036 +221 D 0.034 +222 V 0.033 +223 I 0.031 +224 I 0.029 +225 C 0.028 +226 L 0.026 +227 L 0.026 +228 V 0.029 +229 L 0.033 +230 V 0.038 +231 G 0.045 +232 L 0.053 +233 I 0.059 +234 R 0.064 +235 N 0.068 +236 S 0.067 +237 R 0.058 +238 S 0.049 +239 I 0.044 +240 L 0.042 +241 I 0.040 +242 G 0.039 +243 V 0.039 +244 C 0.038 +245 F 0.038 +246 L 0.042 +247 G 0.044 +248 V 0.042 +249 L 0.038 +250 T 0.037 +251 L 0.037 +252 V 0.036 +253 I 0.038 +254 S 0.043 +255 W 0.052 +256 A 0.059 +257 S 0.062 +258 L 0.062 +259 G 0.061 +260 L 0.062 +261 E 0.062 +262 F 0.059 +263 S 0.054 +264 F 0.051 +265 A 0.055 +266 V 0.065 +267 G 0.077 +268 A 0.086 +269 S 0.087 +270 D 0.082 +271 F 0.079 +272 C 0.079 +273 V 0.077 +274 S 0.072 +275 P 0.070 +276 D 0.071 +277 S 0.073 +278 Y 0.072 +279 I 0.070 +280 T 0.069 +281 K 0.072 +282 V 0.076 +283 T 0.084 +284 R 0.098 +285 E 0.115 +286 N 0.124 +287 A 0.119 +288 V 0.105 +289 I 0.090 +290 N 0.079 +291 Q 0.077 +292 D 0.081 +293 I 0.084 +294 L 0.079 +295 Q 0.069 +296 Y 0.062 +297 Y 0.063 +298 L 0.069 +299 K 0.081 +300 C 0.104 +301 S 0.133 +302 M 0.160 +303 G 0.180 +304 Q 0.193 +305 T 0.198 +306 N 0.188 +307 P 0.161 +308 F 0.124 +309 Q 0.092 +310 Q 0.076 +311 K 0.076 +312 L 0.085 +313 S 0.099 +314 G 0.109 +315 S 0.108 +316 H 0.102 +317 K 0.096 +318 A 0.088 +319 L 0.082 +320 V 0.077 +321 E 0.076 +322 M 0.078 +323 Q 0.083 +324 D 0.083 +325 D 0.074 +326 V 0.062 +327 S 0.054 +328 E 0.050 +329 L 0.047 +330 L 0.044 +331 R 0.042 +332 S 0.044 +333 A 0.047 +334 I 0.051 +335 R 0.056 +336 D 0.063 +337 F 0.069 +338 P 0.071 +339 K 0.072 +340 T 0.077 +341 K 0.083 +342 S 0.085 +343 N 0.081 +344 L 0.077 +345 E 0.080 +346 E 0.088 +347 M 0.098 +348 Q 0.110 +349 G 0.119 +350 V 0.123 +351 L 0.127 +352 N 0.132 +353 S 0.128 +354 T 0.116 +355 E 0.102 +356 V 0.087 +357 S 0.074 +358 L 0.068 +359 H 0.074 +360 H 0.091 +361 L 0.110 +362 T 0.124 +363 A 0.126 +364 L 0.118 +365 V 0.104 +366 D 0.094 +367 C 0.098 +368 R 0.114 +369 S 0.125 +370 L 0.118 +371 H 0.104 +372 M 0.093 +373 D 0.088 +374 Y 0.082 +375 V 0.078 +376 Q 0.078 +377 A 0.081 +378 L 0.082 +379 T 0.077 +380 G 0.071 +381 L 0.068 +382 C 0.073 +383 Y 0.083 +384 D 0.093 +385 G 0.099 +386 V 0.101 +387 E 0.099 +388 G 0.092 +389 L 0.082 +390 I 0.071 +391 Y 0.063 +392 L 0.061 +393 V 0.057 +394 L 0.049 +395 F 0.042 +396 S 0.039 +397 F 0.037 +398 V 0.038 +399 T 0.039 +400 A 0.038 +401 L 0.034 +402 M 0.031 +403 F 0.029 +404 S 0.029 +405 S 0.028 +406 I 0.028 +407 V 0.032 +408 C 0.039 +409 S 0.050 +410 V 0.059 +411 P 0.064 +412 H 0.068 +413 T 0.079 +414 W 0.101 +415 Q 0.140 +416 S 0.193 +417 K 0.252 +418 R 0.308 +419 S 0.364 +420 E 0.426 +421 E 0.492 +422 E 0.551 +423 D 0.601 +424 G 0.642 +425 D 0.670 +426 E 0.682 +427 T 0.684 +428 S 0.686 +429 A 0.692 +430 T 0.703 +431 L 0.712 +432 G 0.716 +433 S 0.711 +434 R 0.699 +435 A 0.692 +436 P 0.696 +437 H 0.710 +438 D 0.722 +439 N 0.721 +440 L 0.711 +441 Y 0.704 +442 R 0.705 +443 V 0.705 +444 H 0.702 +445 M 0.706 +446 P 0.722 +447 S 0.742 +448 L 0.757 +449 Y 0.769 +450 S 0.784 +451 C 0.800 +452 G 0.813 +453 S 0.819 +454 S 0.821 +455 T 0.824 +456 Y 0.831 +457 G 0.838 +458 S 0.839 +459 E 0.832 +460 A 0.820 +461 S 0.808 +462 L 0.804 +463 P 0.811 +464 A 0.821 +465 A 0.817 +466 A 0.777 +467 H 0.711 +468 T 0.673 +469 V 0.704 +470 S 0.763 +471 N 0.798 +472 A 0.806 +473 P 0.807 +474 V 0.809 +475 T 0.804 +476 E 0.780 +477 Y 0.726 +478 M 0.660 +479 S 0.633 +480 Q 0.673 +481 N 0.741 +482 A 0.787 +483 N 0.800 +484 F 0.798 +485 Q 0.797 +486 T 0.803 +487 P 0.815 +488 R 0.827 +489 C 0.831 +490 E 0.827 +491 N 0.819 +492 T 0.815 +493 P 0.821 +494 L 0.832 +495 I 0.841 +496 G 0.838 +497 R 0.819 +498 E 0.793 +499 S 0.774 +500 P 0.768 +501 P 0.770 +502 P 0.768 +503 S 0.751 +504 Y 0.723 +505 T 0.695 +506 S 0.672 +507 S 0.644 +508 M 0.595 +509 R 0.540 +510 A 0.520 +511 K 0.558 +512 Y 0.624 +513 L 0.679 +514 A 0.708 +515 T 0.713 +516 S 0.705 +517 R 0.699 +518 P 0.707 +519 D 0.721 +520 Q 0.733 +521 P 0.746 +522 R 0.765 +523 P 0.788 +524 T 0.806 +525 E 0.815 +526 S 0.819 +527 Q 0.820 +528 N 0.816 +529 G 0.805 +530 L 0.793 +531 E 0.784 +532 P 0.781 +533 N 0.778 +534 M 0.776 +535 R 0.777 +536 P 0.780 +537 D 0.784 +538 L 0.785 +539 T 0.782 +540 S 0.775 +541 R 0.765 +542 S 0.758 +543 A 0.759 +544 P 0.764 +545 N 0.767 +546 S 0.770 +547 R 0.775 +548 P 0.788 +549 N 0.805 +550 S 0.812 +551 A 0.802 +552 I 0.783 +553 H 0.771 +554 R 0.777 +555 P 0.792 +556 H 0.804 +557 S 0.806 +558 A 0.789 +559 I 0.755 +560 H 0.726 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000007678_ENSDART00000033361_GN:ttyh3b_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000007678_ENSDART00000033361_GN:ttyh3b_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:3.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b6a5fd43e3b2ed5cee11b30d5ae322bd1e50cf10 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000007678_ENSDART00000033361_GN:ttyh3b_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:3.caid @@ -0,0 +1,564 @@ +>ENSDARG00000007678|ENSDART00000033361|GN:ttyh3b|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:3 +1 M 0.329 +2 N 0.335 +3 A 0.343 +4 M 0.342 +5 A 0.325 +6 A 0.291 +7 V 0.251 +8 V 0.214 +9 N 0.190 +10 Y 0.179 +11 S 0.170 +12 P 0.148 +13 P 0.114 +14 W 0.088 +15 W 0.080 +16 V 0.083 +17 N 0.085 +18 L 0.090 +19 F 0.108 +20 H 0.137 +21 R 0.170 +22 L 0.198 +23 P 0.210 +24 H 0.205 +25 F 0.193 +26 N 0.187 +27 L 0.188 +28 Q 0.194 +29 F 0.207 +30 Q 0.225 +31 Q 0.242 +32 T 0.246 +33 S 0.234 +34 S 0.215 +35 D 0.200 +36 F 0.190 +37 R 0.185 +38 P 0.177 +39 D 0.160 +40 D 0.138 +41 S 0.122 +42 D 0.118 +43 Y 0.122 +44 Q 0.129 +45 K 0.134 +46 A 0.135 +47 V 0.138 +48 L 0.151 +49 L 0.164 +50 L 0.156 +51 G 0.126 +52 A 0.096 +53 A 0.080 +54 A 0.076 +55 L 0.074 +56 V 0.073 +57 C 0.073 +58 L 0.072 +59 A 0.072 +60 L 0.073 +61 D 0.072 +62 L 0.065 +63 L 0.056 +64 F 0.049 +65 L 0.046 +66 L 0.042 +67 F 0.040 +68 Y 0.039 +69 S 0.038 +70 F 0.035 +71 W 0.035 +72 L 0.039 +73 C 0.053 +74 C 0.081 +75 C 0.126 +76 R 0.180 +77 R 0.231 +78 K 0.272 +79 N 0.301 +80 H 0.324 +81 D 0.343 +82 S 0.355 +83 P 0.352 +84 N 0.328 +85 A 0.278 +86 D 0.206 +87 C 0.133 +88 C 0.084 +89 C 0.064 +90 T 0.060 +91 A 0.056 +92 W 0.051 +93 C 0.047 +94 V 0.048 +95 I 0.053 +96 I 0.059 +97 A 0.061 +98 T 0.058 +99 L 0.055 +100 V 0.059 +101 C 0.070 +102 S 0.082 +103 A 0.088 +104 G 0.089 +105 I 0.090 +106 A 0.091 +107 V 0.087 +108 G 0.082 +109 F 0.085 +110 Y 0.098 +111 G 0.109 +112 N 0.114 +113 G 0.117 +114 E 0.121 +115 T 0.127 +116 C 0.139 +117 D 0.152 +118 G 0.156 +119 V 0.150 +120 T 0.141 +121 R 0.129 +122 L 0.116 +123 T 0.109 +124 Y 0.107 +125 S 0.106 +126 L 0.108 +127 R 0.113 +128 H 0.113 +129 A 0.106 +130 N 0.099 +131 Q 0.100 +132 T 0.107 +133 V 0.126 +134 A 0.148 +135 G 0.157 +136 I 0.143 +137 D 0.119 +138 K 0.098 +139 L 0.082 +140 V 0.074 +141 S 0.074 +142 E 0.073 +143 S 0.069 +144 T 0.065 +145 S 0.069 +146 S 0.076 +147 L 0.087 +148 N 0.101 +149 E 0.111 +150 T 0.108 +151 L 0.091 +152 M 0.073 +153 E 0.061 +154 G 0.056 +155 L 0.054 +156 V 0.055 +157 Q 0.055 +158 L 0.051 +159 E 0.046 +160 T 0.044 +161 V 0.045 +162 Y 0.047 +163 S 0.051 +164 K 0.058 +165 Q 0.067 +166 T 0.074 +167 D 0.075 +168 Y 0.076 +169 L 0.080 +170 S 0.084 +171 I 0.083 +172 V 0.085 +173 Q 0.094 +174 K 0.103 +175 L 0.105 +176 Q 0.102 +177 G 0.099 +178 Q 0.098 +179 L 0.106 +180 D 0.121 +181 E 0.127 +182 L 0.119 +183 I 0.106 +184 N 0.100 +185 L 0.104 +186 M 0.126 +187 L 0.164 +188 G 0.199 +189 V 0.214 +190 P 0.215 +191 F 0.221 +192 W 0.246 +193 S 0.282 +194 S 0.307 +195 N 0.309 +196 D 0.289 +197 L 0.257 +198 S 0.218 +199 L 0.181 +200 D 0.159 +201 H 0.153 +202 L 0.156 +203 A 0.162 +204 S 0.172 +205 I 0.182 +206 T 0.183 +207 E 0.168 +208 Q 0.142 +209 Y 0.118 +210 D 0.099 +211 W 0.082 +212 Y 0.070 +213 R 0.068 +214 W 0.068 +215 L 0.064 +216 G 0.059 +217 Y 0.058 +218 L 0.058 +219 G 0.056 +220 L 0.053 +221 L 0.048 +222 L 0.041 +223 F 0.036 +224 D 0.034 +225 V 0.032 +226 I 0.031 +227 I 0.029 +228 C 0.027 +229 L 0.026 +230 L 0.026 +231 V 0.029 +232 L 0.033 +233 V 0.038 +234 G 0.045 +235 L 0.052 +236 I 0.058 +237 R 0.063 +238 N 0.068 +239 S 0.066 +240 R 0.058 +241 S 0.049 +242 I 0.044 +243 L 0.042 +244 I 0.040 +245 G 0.039 +246 V 0.039 +247 C 0.038 +248 F 0.039 +249 L 0.042 +250 G 0.044 +251 V 0.042 +252 L 0.038 +253 T 0.037 +254 L 0.037 +255 V 0.037 +256 I 0.038 +257 S 0.043 +258 W 0.052 +259 A 0.059 +260 S 0.062 +261 L 0.061 +262 G 0.061 +263 L 0.062 +264 E 0.062 +265 F 0.059 +266 S 0.054 +267 F 0.052 +268 A 0.056 +269 V 0.066 +270 G 0.078 +271 A 0.086 +272 S 0.087 +273 D 0.082 +274 F 0.080 +275 C 0.080 +276 V 0.077 +277 S 0.072 +278 P 0.069 +279 D 0.071 +280 S 0.073 +281 Y 0.072 +282 I 0.070 +283 T 0.069 +284 K 0.071 +285 V 0.076 +286 T 0.084 +287 R 0.098 +288 E 0.114 +289 N 0.124 +290 A 0.119 +291 V 0.106 +292 I 0.090 +293 N 0.079 +294 Q 0.077 +295 D 0.081 +296 I 0.084 +297 L 0.079 +298 Q 0.070 +299 Y 0.063 +300 Y 0.063 +301 L 0.069 +302 K 0.082 +303 C 0.104 +304 S 0.134 +305 M 0.161 +306 G 0.181 +307 Q 0.194 +308 T 0.199 +309 N 0.189 +310 P 0.162 +311 F 0.125 +312 Q 0.093 +313 Q 0.077 +314 K 0.076 +315 L 0.085 +316 S 0.099 +317 G 0.109 +318 S 0.108 +319 H 0.102 +320 K 0.096 +321 A 0.089 +322 L 0.082 +323 V 0.078 +324 E 0.076 +325 M 0.078 +326 Q 0.083 +327 D 0.084 +328 D 0.074 +329 V 0.062 +330 S 0.054 +331 E 0.051 +332 L 0.047 +333 L 0.044 +334 R 0.042 +335 S 0.044 +336 A 0.047 +337 I 0.051 +338 R 0.056 +339 D 0.063 +340 F 0.068 +341 P 0.070 +342 K 0.072 +343 T 0.077 +344 K 0.083 +345 S 0.085 +346 N 0.081 +347 L 0.077 +348 E 0.080 +349 E 0.087 +350 M 0.098 +351 Q 0.110 +352 G 0.119 +353 V 0.123 +354 L 0.127 +355 N 0.131 +356 S 0.128 +357 T 0.115 +358 E 0.101 +359 V 0.087 +360 S 0.073 +361 L 0.067 +362 H 0.074 +363 H 0.091 +364 L 0.110 +365 T 0.123 +366 A 0.126 +367 L 0.118 +368 V 0.103 +369 D 0.093 +370 C 0.098 +371 R 0.114 +372 S 0.124 +373 L 0.118 +374 H 0.104 +375 M 0.094 +376 D 0.088 +377 Y 0.083 +378 V 0.079 +379 Q 0.079 +380 A 0.081 +381 L 0.082 +382 T 0.077 +383 G 0.071 +384 L 0.069 +385 C 0.073 +386 Y 0.083 +387 D 0.093 +388 G 0.099 +389 V 0.101 +390 E 0.099 +391 G 0.092 +392 L 0.082 +393 I 0.071 +394 Y 0.063 +395 L 0.061 +396 V 0.057 +397 L 0.050 +398 F 0.043 +399 S 0.039 +400 F 0.037 +401 V 0.038 +402 T 0.039 +403 A 0.038 +404 L 0.035 +405 M 0.031 +406 F 0.029 +407 S 0.029 +408 S 0.028 +409 I 0.028 +410 V 0.032 +411 C 0.039 +412 S 0.049 +413 V 0.059 +414 P 0.064 +415 H 0.068 +416 T 0.078 +417 W 0.100 +418 Q 0.139 +419 S 0.192 +420 K 0.251 +421 R 0.307 +422 S 0.364 +423 E 0.426 +424 E 0.492 +425 E 0.552 +426 D 0.602 +427 G 0.642 +428 D 0.670 +429 E 0.683 +430 T 0.685 +431 S 0.687 +432 A 0.693 +433 T 0.703 +434 L 0.712 +435 G 0.716 +436 S 0.710 +437 R 0.699 +438 A 0.691 +439 P 0.695 +440 H 0.710 +441 D 0.722 +442 N 0.721 +443 L 0.710 +444 Y 0.704 +445 R 0.705 +446 V 0.705 +447 H 0.702 +448 M 0.706 +449 P 0.722 +450 S 0.742 +451 L 0.757 +452 Y 0.770 +453 S 0.784 +454 C 0.801 +455 G 0.814 +456 S 0.820 +457 S 0.822 +458 T 0.825 +459 Y 0.832 +460 G 0.839 +461 S 0.840 +462 E 0.833 +463 A 0.821 +464 S 0.808 +465 L 0.803 +466 P 0.808 +467 A 0.818 +468 A 0.814 +469 A 0.776 +470 H 0.711 +471 T 0.674 +472 V 0.704 +473 S 0.764 +474 N 0.799 +475 A 0.808 +476 P 0.809 +477 V 0.810 +478 T 0.805 +479 E 0.781 +480 Y 0.727 +481 M 0.661 +482 S 0.633 +483 Q 0.673 +484 N 0.742 +485 A 0.788 +486 N 0.801 +487 F 0.799 +488 Q 0.798 +489 T 0.804 +490 P 0.816 +491 R 0.828 +492 C 0.832 +493 E 0.827 +494 N 0.820 +495 T 0.816 +496 P 0.821 +497 L 0.833 +498 I 0.842 +499 G 0.838 +500 R 0.819 +501 E 0.794 +502 S 0.775 +503 P 0.768 +504 P 0.770 +505 P 0.768 +506 S 0.751 +507 Y 0.723 +508 T 0.695 +509 S 0.673 +510 S 0.644 +511 M 0.595 +512 R 0.539 +513 A 0.519 +514 K 0.557 +515 Y 0.623 +516 L 0.677 +517 A 0.706 +518 T 0.711 +519 S 0.703 +520 R 0.698 +521 P 0.706 +522 D 0.721 +523 Q 0.733 +524 P 0.746 +525 R 0.765 +526 P 0.787 +527 T 0.805 +528 E 0.815 +529 S 0.819 +530 Q 0.820 +531 N 0.816 +532 G 0.805 +533 L 0.792 +534 E 0.784 +535 P 0.781 +536 N 0.778 +537 M 0.776 +538 R 0.777 +539 P 0.780 +540 D 0.784 +541 L 0.785 +542 T 0.782 +543 S 0.775 +544 R 0.764 +545 S 0.758 +546 A 0.758 +547 P 0.763 +548 N 0.767 +549 S 0.769 +550 R 0.775 +551 P 0.788 +552 N 0.804 +553 S 0.811 +554 A 0.801 +555 I 0.782 +556 H 0.771 +557 R 0.776 +558 P 0.791 +559 H 0.804 +560 S 0.805 +561 A 0.789 +562 I 0.755 +563 H 0.725 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000007760_ENSDART00000130967_GN:spg21_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000007760_ENSDART00000130967_GN:spg21_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6fe887b7d2959f137619ca01074a8c106ae6b491 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000007760_ENSDART00000130967_GN:spg21_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,312 @@ +>ENSDARG00000007760|ENSDART00000130967|GN:spg21|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.286 +2 E 0.273 +3 E 0.254 +4 I 0.226 +5 S 0.190 +6 V 0.152 +7 S 0.120 +8 P 0.098 +9 D 0.085 +10 Y 0.076 +11 N 0.069 +12 W 0.067 +13 F 0.066 +14 R 0.063 +15 S 0.059 +16 T 0.059 +17 V 0.058 +18 P 0.051 +19 L 0.041 +20 K 0.034 +21 R 0.033 +22 I 0.038 +23 I 0.048 +24 V 0.065 +25 D 0.084 +26 D 0.098 +27 D 0.102 +28 D 0.094 +29 S 0.082 +30 K 0.070 +31 V 0.059 +32 W 0.048 +33 S 0.038 +34 L 0.035 +35 Y 0.043 +36 D 0.061 +37 A 0.080 +38 G 0.092 +39 P 0.092 +40 K 0.083 +41 S 0.075 +42 I 0.071 +43 R 0.069 +44 C 0.070 +45 P 0.074 +46 I 0.080 +47 I 0.087 +48 F 0.098 +49 L 0.110 +50 P 0.115 +51 P 0.106 +52 V 0.092 +53 S 0.087 +54 G 0.087 +55 T 0.084 +56 A 0.079 +57 E 0.076 +58 V 0.074 +59 F 0.070 +60 F 0.061 +61 Q 0.051 +62 Q 0.042 +63 V 0.037 +64 L 0.034 +65 A 0.034 +66 L 0.038 +67 S 0.046 +68 G 0.057 +69 W 0.070 +70 G 0.077 +71 Y 0.072 +72 R 0.059 +73 V 0.047 +74 I 0.041 +75 S 0.042 +76 L 0.051 +77 Q 0.069 +78 Y 0.086 +79 P 0.094 +80 V 0.090 +81 Y 0.080 +82 W 0.069 +83 D 0.058 +84 L 0.048 +85 L 0.040 +86 E 0.034 +87 F 0.031 +88 C 0.028 +89 D 0.025 +90 G 0.024 +91 F 0.022 +92 R 0.021 +93 K 0.019 +94 L 0.019 +95 L 0.020 +96 D 0.022 +97 H 0.025 +98 L 0.028 +99 Q 0.031 +100 L 0.032 +101 D 0.032 +102 K 0.032 +103 V 0.032 +104 H 0.034 +105 L 0.035 +106 F 0.033 +107 G 0.029 +108 A 0.029 +109 S 0.035 +110 L 0.044 +111 G 0.051 +112 G 0.054 +113 F 0.052 +114 L 0.049 +115 A 0.045 +116 Q 0.041 +117 K 0.040 +118 F 0.042 +119 A 0.045 +120 E 0.046 +121 V 0.049 +122 T 0.059 +123 Y 0.075 +124 K 0.093 +125 S 0.103 +126 P 0.096 +127 R 0.081 +128 V 0.070 +129 H 0.065 +130 S 0.066 +131 L 0.071 +132 V 0.076 +133 L 0.078 +134 C 0.081 +135 N 0.091 +136 S 0.104 +137 F 0.114 +138 S 0.122 +139 D 0.128 +140 T 0.132 +141 S 0.139 +142 I 0.152 +143 F 0.176 +144 N 0.206 +145 Q 0.229 +146 T 0.236 +147 W 0.230 +148 T 0.220 +149 A 0.207 +150 N 0.188 +151 S 0.163 +152 F 0.140 +153 W 0.126 +154 L 0.119 +155 M 0.112 +156 P 0.097 +157 S 0.077 +158 F 0.061 +159 M 0.052 +160 L 0.049 +161 K 0.050 +162 K 0.054 +163 I 0.060 +164 V 0.069 +165 L 0.086 +166 G 0.106 +167 N 0.124 +168 F 0.136 +169 A 0.151 +170 K 0.174 +171 G 0.195 +172 P 0.197 +173 V 0.176 +174 D 0.144 +175 P 0.121 +176 K 0.111 +177 M 0.104 +178 A 0.092 +179 D 0.077 +180 A 0.065 +181 I 0.056 +182 D 0.050 +183 F 0.049 +184 M 0.055 +185 V 0.066 +186 D 0.072 +187 R 0.068 +188 L 0.058 +189 E 0.050 +190 S 0.045 +191 L 0.044 +192 N 0.044 +193 Q 0.043 +194 S 0.044 +195 E 0.045 +196 L 0.046 +197 A 0.046 +198 S 0.048 +199 R 0.055 +200 L 0.063 +201 T 0.068 +202 L 0.071 +203 N 0.071 +204 C 0.067 +205 Q 0.062 +206 N 0.060 +207 S 0.063 +208 Y 0.070 +209 V 0.074 +210 E 0.072 +211 P 0.065 +212 H 0.061 +213 K 0.060 +214 I 0.063 +215 K 0.071 +216 D 0.085 +217 I 0.097 +218 A 0.098 +219 V 0.091 +220 T 0.086 +221 I 0.082 +222 M 0.079 +223 D 0.077 +224 V 0.078 +225 F 0.082 +226 D 0.091 +227 Q 0.097 +228 S 0.096 +229 A 0.092 +230 L 0.088 +231 S 0.082 +232 Q 0.072 +233 E 0.061 +234 A 0.055 +235 K 0.053 +236 E 0.054 +237 E 0.057 +238 M 0.063 +239 Y 0.070 +240 K 0.071 +241 L 0.063 +242 Y 0.054 +243 P 0.052 +244 N 0.058 +245 A 0.064 +246 R 0.065 +247 R 0.065 +248 A 0.068 +249 H 0.072 +250 L 0.075 +251 K 0.076 +252 T 0.074 +253 G 0.073 +254 G 0.076 +255 N 0.084 +256 F 0.089 +257 P 0.087 +258 Y 0.080 +259 L 0.071 +260 C 0.062 +261 R 0.052 +262 S 0.046 +263 A 0.043 +264 E 0.040 +265 V 0.037 +266 N 0.037 +267 L 0.037 +268 Y 0.037 +269 I 0.037 +270 Q 0.036 +271 I 0.033 +272 H 0.030 +273 L 0.030 +274 R 0.034 +275 Q 0.046 +276 F 0.070 +277 H 0.102 +278 G 0.138 +279 T 0.172 +280 R 0.202 +281 Y 0.231 +282 A 0.260 +283 A 0.286 +284 I 0.301 +285 S 0.310 +286 P 0.315 +287 E 0.311 +288 M 0.291 +289 V 0.262 +290 S 0.236 +291 A 0.221 +292 E 0.208 +293 E 0.193 +294 L 0.181 +295 E 0.179 +296 V 0.185 +297 Q 0.192 +298 R 0.208 +299 T 0.248 +300 H 0.309 +301 L 0.371 +302 S 0.421 +303 N 0.460 +304 N 0.481 +305 S 0.483 +306 E 0.492 +307 S 0.531 +308 E 0.570 +309 D 0.566 +310 E 0.521 +311 S 0.477 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000007760_ENSDART00000130967_GN:spg21_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000007760_ENSDART00000130967_GN:spg21_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:3.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5093225e94de70e4edd1c30df2b36df186299b57 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000007760_ENSDART00000130967_GN:spg21_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:3.caid @@ -0,0 +1,315 @@ +>ENSDARG00000007760|ENSDART00000130967|GN:spg21|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:3 +1 M 0.328 +2 S 0.329 +3 A 0.330 +4 M 0.323 +5 E 0.299 +6 E 0.263 +7 I 0.222 +8 S 0.182 +9 V 0.145 +10 S 0.115 +11 P 0.094 +12 D 0.081 +13 Y 0.072 +14 N 0.066 +15 W 0.065 +16 F 0.064 +17 R 0.060 +18 S 0.057 +19 T 0.056 +20 V 0.055 +21 P 0.049 +22 L 0.040 +23 K 0.033 +24 R 0.032 +25 I 0.036 +26 I 0.046 +27 V 0.062 +28 D 0.080 +29 D 0.094 +30 D 0.098 +31 D 0.091 +32 S 0.079 +33 K 0.068 +34 V 0.057 +35 W 0.046 +36 S 0.037 +37 L 0.034 +38 Y 0.042 +39 D 0.060 +40 A 0.080 +41 G 0.092 +42 P 0.092 +43 K 0.083 +44 S 0.075 +45 I 0.071 +46 R 0.069 +47 C 0.070 +48 P 0.074 +49 I 0.080 +50 I 0.087 +51 F 0.097 +52 L 0.110 +53 P 0.114 +54 P 0.105 +55 V 0.091 +56 S 0.086 +57 G 0.086 +58 T 0.083 +59 A 0.077 +60 E 0.074 +61 V 0.073 +62 F 0.069 +63 F 0.061 +64 Q 0.051 +65 Q 0.042 +66 V 0.036 +67 L 0.033 +68 A 0.034 +69 L 0.038 +70 S 0.046 +71 G 0.057 +72 W 0.069 +73 G 0.076 +74 Y 0.071 +75 R 0.059 +76 V 0.047 +77 I 0.040 +78 S 0.042 +79 L 0.051 +80 Q 0.069 +81 Y 0.086 +82 P 0.094 +83 V 0.090 +84 Y 0.080 +85 W 0.068 +86 D 0.058 +87 L 0.048 +88 L 0.040 +89 E 0.034 +90 F 0.031 +91 C 0.028 +92 D 0.026 +93 G 0.024 +94 F 0.022 +95 R 0.021 +96 K 0.019 +97 L 0.019 +98 L 0.019 +99 D 0.021 +100 H 0.024 +101 L 0.028 +102 Q 0.031 +103 L 0.032 +104 D 0.032 +105 K 0.031 +106 V 0.032 +107 H 0.034 +108 L 0.035 +109 F 0.033 +110 G 0.030 +111 A 0.029 +112 S 0.035 +113 L 0.044 +114 G 0.051 +115 G 0.054 +116 F 0.052 +117 L 0.049 +118 A 0.045 +119 Q 0.041 +120 K 0.040 +121 F 0.042 +122 A 0.045 +123 E 0.046 +124 V 0.049 +125 T 0.059 +126 Y 0.075 +127 K 0.094 +128 S 0.103 +129 P 0.096 +130 R 0.082 +131 V 0.070 +132 H 0.065 +133 S 0.066 +134 L 0.072 +135 V 0.076 +136 L 0.078 +137 C 0.081 +138 N 0.091 +139 S 0.104 +140 F 0.115 +141 S 0.123 +142 D 0.129 +143 T 0.133 +144 S 0.139 +145 I 0.153 +146 F 0.177 +147 N 0.207 +148 Q 0.230 +149 T 0.236 +150 W 0.230 +151 T 0.220 +152 A 0.207 +153 N 0.188 +154 S 0.162 +155 F 0.140 +156 W 0.126 +157 L 0.119 +158 M 0.112 +159 P 0.097 +160 S 0.077 +161 F 0.061 +162 M 0.051 +163 L 0.049 +164 K 0.051 +165 K 0.055 +166 I 0.060 +167 V 0.070 +168 L 0.086 +169 G 0.107 +170 N 0.124 +171 F 0.136 +172 A 0.151 +173 K 0.173 +174 G 0.194 +175 P 0.196 +176 V 0.174 +177 D 0.143 +178 P 0.120 +179 K 0.111 +180 M 0.104 +181 A 0.092 +182 D 0.077 +183 A 0.064 +184 I 0.056 +185 D 0.050 +186 F 0.048 +187 M 0.055 +188 V 0.066 +189 D 0.072 +190 R 0.068 +191 L 0.058 +192 E 0.050 +193 S 0.045 +194 L 0.044 +195 N 0.044 +196 Q 0.043 +197 S 0.043 +198 E 0.045 +199 L 0.046 +200 A 0.046 +201 S 0.049 +202 R 0.055 +203 L 0.063 +204 T 0.069 +205 L 0.072 +206 N 0.071 +207 C 0.067 +208 Q 0.062 +209 N 0.060 +210 S 0.063 +211 Y 0.069 +212 V 0.074 +213 E 0.072 +214 P 0.065 +215 H 0.060 +216 K 0.060 +217 I 0.063 +218 K 0.070 +219 D 0.085 +220 I 0.097 +221 A 0.098 +222 V 0.091 +223 T 0.086 +224 I 0.082 +225 M 0.079 +226 D 0.078 +227 V 0.078 +228 F 0.082 +229 D 0.091 +230 Q 0.097 +231 S 0.097 +232 A 0.093 +233 L 0.089 +234 S 0.082 +235 Q 0.072 +236 E 0.062 +237 A 0.055 +238 K 0.053 +239 E 0.054 +240 E 0.057 +241 M 0.063 +242 Y 0.071 +243 K 0.071 +244 L 0.063 +245 Y 0.053 +246 P 0.052 +247 N 0.058 +248 A 0.063 +249 R 0.065 +250 R 0.065 +251 A 0.067 +252 H 0.071 +253 L 0.075 +254 K 0.076 +255 T 0.074 +256 G 0.073 +257 G 0.076 +258 N 0.084 +259 F 0.090 +260 P 0.087 +261 Y 0.080 +262 L 0.072 +263 C 0.062 +264 R 0.052 +265 S 0.046 +266 A 0.043 +267 E 0.040 +268 V 0.038 +269 N 0.037 +270 L 0.038 +271 Y 0.037 +272 I 0.037 +273 Q 0.036 +274 I 0.033 +275 H 0.030 +276 L 0.030 +277 R 0.034 +278 Q 0.046 +279 F 0.069 +280 H 0.101 +281 G 0.137 +282 T 0.172 +283 R 0.202 +284 Y 0.230 +285 A 0.259 +286 A 0.284 +287 I 0.299 +288 S 0.308 +289 P 0.313 +290 E 0.309 +291 M 0.289 +292 V 0.260 +293 S 0.235 +294 A 0.220 +295 E 0.207 +296 E 0.192 +297 L 0.181 +298 E 0.180 +299 V 0.185 +300 Q 0.192 +301 R 0.208 +302 T 0.249 +303 H 0.310 +304 L 0.373 +305 S 0.425 +306 N 0.464 +307 N 0.485 +308 S 0.486 +309 E 0.495 +310 S 0.534 +311 E 0.573 +312 D 0.570 +313 E 0.526 +314 S 0.481 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000008105_ENSDART00000007857_GN:mettl2a_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000008105_ENSDART00000007857_GN:mettl2a_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d58cc3d6db94841c331fee10c9f31be89a4d44c4 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000008105_ENSDART00000007857_GN:mettl2a_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,354 @@ +>ENSDARG00000008105|ENSDART00000007857|GN:mettl2a|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.312 +2 A 0.322 +3 A 0.359 +4 P 0.413 +5 A 0.445 +6 V 0.438 +7 A 0.428 +8 A 0.445 +9 D 0.471 +10 S 0.480 +11 P 0.469 +12 V 0.441 +13 I 0.407 +14 E 0.394 +15 N 0.414 +16 M 0.443 +17 P 0.469 +18 E 0.516 +19 T 0.600 +20 A 0.684 +21 G 0.728 +22 G 0.736 +23 A 0.727 +24 T 0.714 +25 E 0.700 +26 N 0.681 +27 S 0.653 +28 A 0.615 +29 E 0.573 +30 A 0.529 +31 Q 0.482 +32 K 0.432 +33 R 0.379 +34 P 0.322 +35 Q 0.263 +36 F 0.209 +37 G 0.169 +38 T 0.142 +39 R 0.128 +40 F 0.128 +41 L 0.137 +42 T 0.148 +43 D 0.154 +44 P 0.154 +45 R 0.156 +46 Q 0.160 +47 V 0.163 +48 F 0.163 +49 Q 0.160 +50 H 0.153 +51 N 0.146 +52 A 0.140 +53 W 0.139 +54 D 0.140 +55 N 0.140 +56 V 0.138 +57 E 0.132 +58 W 0.123 +59 S 0.113 +60 A 0.101 +61 E 0.094 +62 Q 0.095 +63 E 0.102 +64 E 0.111 +65 A 0.117 +66 A 0.120 +67 L 0.123 +68 K 0.124 +69 K 0.126 +70 V 0.133 +71 Q 0.152 +72 E 0.174 +73 N 0.188 +74 S 0.194 +75 Q 0.199 +76 P 0.210 +77 L 0.222 +78 P 0.225 +79 A 0.215 +80 E 0.195 +81 K 0.174 +82 Q 0.160 +83 E 0.155 +84 E 0.153 +85 F 0.147 +86 D 0.136 +87 D 0.116 +88 R 0.093 +89 A 0.075 +90 N 0.065 +91 E 0.057 +92 Y 0.050 +93 W 0.047 +94 N 0.048 +95 D 0.051 +96 F 0.052 +97 Y 0.052 +98 T 0.054 +99 I 0.056 +100 H 0.057 +101 E 0.059 +102 N 0.067 +103 R 0.076 +104 F 0.081 +105 F 0.083 +106 K 0.083 +107 D 0.078 +108 R 0.068 +109 H 0.054 +110 W 0.041 +111 L 0.034 +112 F 0.031 +113 T 0.033 +114 E 0.036 +115 F 0.036 +116 P 0.036 +117 E 0.040 +118 L 0.054 +119 A 0.079 +120 P 0.111 +121 Q 0.149 +122 Q 0.191 +123 K 0.233 +124 H 0.275 +125 L 0.325 +126 R 0.382 +127 G 0.430 +128 A 0.447 +129 E 0.433 +130 E 0.403 +131 K 0.376 +132 E 0.350 +133 S 0.315 +134 L 0.282 +135 E 0.270 +136 H 0.284 +137 M 0.316 +138 L 0.368 +139 N 0.431 +140 G 0.486 +141 E 0.526 +142 D 0.553 +143 V 0.567 +144 S 0.567 +145 S 0.556 +146 N 0.536 +147 H 0.512 +148 T 0.484 +149 H 0.450 +150 D 0.416 +151 E 0.390 +152 F 0.376 +153 P 0.371 +154 G 0.368 +155 A 0.350 +156 S 0.305 +157 A 0.235 +158 S 0.160 +159 Y 0.100 +160 R 0.066 +161 I 0.052 +162 L 0.048 +163 E 0.048 +164 V 0.050 +165 G 0.056 +166 C 0.071 +167 G 0.092 +168 V 0.115 +169 G 0.127 +170 N 0.120 +171 T 0.098 +172 V 0.075 +173 F 0.063 +174 P 0.061 +175 I 0.066 +176 L 0.070 +177 K 0.071 +178 T 0.073 +179 N 0.078 +180 N 0.089 +181 D 0.099 +182 P 0.100 +183 G 0.089 +184 L 0.072 +185 F 0.055 +186 V 0.041 +187 Y 0.033 +188 C 0.030 +189 C 0.034 +190 D 0.042 +191 F 0.050 +192 S 0.052 +193 S 0.048 +194 T 0.043 +195 A 0.047 +196 V 0.060 +197 D 0.074 +198 L 0.081 +199 V 0.079 +200 K 0.071 +201 S 0.063 +202 N 0.057 +203 P 0.057 +204 E 0.057 +205 Y 0.055 +206 D 0.045 +207 P 0.033 +208 S 0.025 +209 R 0.022 +210 C 0.025 +211 H 0.030 +212 A 0.036 +213 F 0.042 +214 V 0.045 +215 H 0.047 +216 D 0.049 +217 M 0.054 +218 S 0.064 +219 D 0.076 +220 E 0.085 +221 S 0.088 +222 G 0.082 +223 E 0.071 +224 Y 0.062 +225 P 0.059 +226 M 0.063 +227 P 0.071 +228 D 0.075 +229 H 0.073 +230 S 0.063 +231 L 0.053 +232 D 0.046 +233 V 0.043 +234 I 0.044 +235 V 0.047 +236 L 0.051 +237 I 0.059 +238 F 0.071 +239 V 0.082 +240 L 0.085 +241 S 0.080 +242 A 0.074 +243 L 0.067 +244 H 0.057 +245 P 0.048 +246 E 0.041 +247 K 0.039 +248 M 0.039 +249 Q 0.038 +250 K 0.034 +251 S 0.032 +252 I 0.034 +253 N 0.039 +254 R 0.043 +255 L 0.045 +256 G 0.046 +257 R 0.048 +258 L 0.053 +259 L 0.064 +260 K 0.078 +261 P 0.085 +262 G 0.082 +263 G 0.073 +264 V 0.067 +265 L 0.066 +266 L 0.069 +267 L 0.079 +268 R 0.096 +269 D 0.111 +270 Y 0.115 +271 G 0.112 +272 R 0.106 +273 Y 0.095 +274 D 0.083 +275 M 0.075 +276 A 0.072 +277 Q 0.075 +278 L 0.083 +279 R 0.101 +280 F 0.128 +281 K 0.159 +282 K 0.178 +283 G 0.178 +284 R 0.167 +285 C 0.156 +286 L 0.151 +287 S 0.151 +288 E 0.151 +289 N 0.144 +290 F 0.132 +291 Y 0.120 +292 V 0.111 +293 R 0.107 +294 G 0.110 +295 D 0.114 +296 G 0.113 +297 T 0.106 +298 R 0.099 +299 V 0.092 +300 Y 0.086 +301 F 0.082 +302 F 0.079 +303 T 0.074 +304 Q 0.067 +305 D 0.064 +306 E 0.066 +307 L 0.071 +308 H 0.079 +309 D 0.083 +310 L 0.077 +311 F 0.068 +312 S 0.064 +313 S 0.070 +314 A 0.082 +315 G 0.088 +316 L 0.082 +317 E 0.071 +318 K 0.060 +319 L 0.054 +320 Q 0.051 +321 N 0.051 +322 L 0.053 +323 V 0.055 +324 D 0.057 +325 R 0.057 +326 R 0.057 +327 L 0.057 +328 Q 0.058 +329 V 0.059 +330 N 0.067 +331 R 0.083 +332 G 0.101 +333 K 0.113 +334 Q 0.115 +335 L 0.111 +336 T 0.104 +337 M 0.095 +338 Y 0.085 +339 R 0.073 +340 V 0.059 +341 W 0.046 +342 V 0.035 +343 Q 0.029 +344 C 0.026 +345 K 0.027 +346 Y 0.034 +347 R 0.050 +348 K 0.082 +349 V 0.134 +350 L 0.202 +351 A 0.268 +352 P 0.309 +353 T 0.323 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000008105_ENSDART00000007857_GN:mettl2a_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:13.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000008105_ENSDART00000007857_GN:mettl2a_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:13.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d6eee107253fd362894b13eafc72e927e3edd5ed --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000008105_ENSDART00000007857_GN:mettl2a_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:13.caid @@ -0,0 +1,367 @@ +>ENSDARG00000008105|ENSDART00000007857|GN:mettl2a|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:13 +1 M 0.356 +2 Q 0.357 +3 N 0.362 +4 S 0.373 +5 H 0.386 +6 V 0.402 +7 H 0.418 +8 P 0.418 +9 V 0.394 +10 R 0.373 +11 V 0.384 +12 S 0.411 +13 I 0.426 +14 M 0.439 +15 A 0.475 +16 A 0.529 +17 P 0.578 +18 A 0.609 +19 V 0.628 +20 A 0.640 +21 A 0.639 +22 D 0.628 +23 S 0.609 +24 P 0.579 +25 V 0.527 +26 I 0.468 +27 E 0.438 +28 N 0.450 +29 M 0.473 +30 P 0.492 +31 E 0.536 +32 T 0.619 +33 A 0.701 +34 G 0.744 +35 G 0.750 +36 A 0.740 +37 T 0.726 +38 E 0.712 +39 N 0.694 +40 S 0.666 +41 A 0.631 +42 E 0.591 +43 A 0.549 +44 Q 0.501 +45 K 0.447 +46 R 0.391 +47 P 0.333 +48 Q 0.274 +49 F 0.220 +50 G 0.178 +51 T 0.149 +52 R 0.133 +53 F 0.131 +54 L 0.139 +55 T 0.151 +56 D 0.158 +57 P 0.159 +58 R 0.161 +59 Q 0.165 +60 V 0.167 +61 F 0.164 +62 Q 0.158 +63 H 0.151 +64 N 0.143 +65 A 0.138 +66 W 0.137 +67 D 0.137 +68 N 0.136 +69 V 0.134 +70 E 0.129 +71 W 0.121 +72 S 0.111 +73 A 0.100 +74 E 0.093 +75 Q 0.094 +76 E 0.100 +77 E 0.109 +78 A 0.116 +79 A 0.119 +80 L 0.121 +81 K 0.123 +82 K 0.124 +83 V 0.131 +84 Q 0.149 +85 E 0.171 +86 N 0.185 +87 S 0.191 +88 Q 0.197 +89 P 0.207 +90 L 0.218 +91 P 0.221 +92 A 0.212 +93 E 0.192 +94 K 0.171 +95 Q 0.156 +96 E 0.151 +97 E 0.147 +98 F 0.142 +99 D 0.131 +100 D 0.112 +101 R 0.089 +102 A 0.072 +103 N 0.063 +104 E 0.055 +105 Y 0.048 +106 W 0.044 +107 N 0.046 +108 D 0.048 +109 F 0.049 +110 Y 0.049 +111 T 0.052 +112 I 0.055 +113 H 0.056 +114 E 0.059 +115 N 0.067 +116 R 0.076 +117 F 0.081 +118 F 0.083 +119 K 0.084 +120 D 0.080 +121 R 0.070 +122 H 0.055 +123 W 0.042 +124 L 0.035 +125 F 0.032 +126 T 0.034 +127 E 0.037 +128 F 0.037 +129 P 0.037 +130 E 0.042 +131 L 0.057 +132 A 0.084 +133 P 0.120 +134 Q 0.162 +135 Q 0.207 +136 K 0.252 +137 H 0.295 +138 L 0.347 +139 R 0.405 +140 G 0.451 +141 A 0.468 +142 E 0.452 +143 E 0.421 +144 K 0.392 +145 E 0.364 +146 S 0.328 +147 L 0.294 +148 E 0.282 +149 H 0.296 +150 M 0.330 +151 L 0.385 +152 N 0.452 +153 G 0.511 +154 E 0.553 +155 D 0.582 +156 V 0.596 +157 S 0.594 +158 S 0.580 +159 N 0.557 +160 H 0.530 +161 T 0.498 +162 H 0.461 +163 D 0.425 +164 E 0.398 +165 F 0.385 +166 P 0.383 +167 G 0.382 +168 A 0.365 +169 S 0.317 +170 A 0.243 +171 S 0.163 +172 Y 0.101 +173 R 0.066 +174 I 0.052 +175 L 0.048 +176 E 0.047 +177 V 0.049 +178 G 0.055 +179 C 0.070 +180 G 0.091 +181 V 0.113 +182 G 0.125 +183 N 0.119 +184 T 0.096 +185 V 0.074 +186 F 0.061 +187 P 0.060 +188 I 0.064 +189 L 0.068 +190 K 0.070 +191 T 0.073 +192 N 0.079 +193 N 0.088 +194 D 0.096 +195 P 0.096 +196 G 0.086 +197 L 0.069 +198 F 0.052 +199 V 0.039 +200 Y 0.031 +201 C 0.028 +202 C 0.032 +203 D 0.041 +204 F 0.049 +205 S 0.051 +206 S 0.046 +207 T 0.042 +208 A 0.046 +209 V 0.059 +210 D 0.073 +211 L 0.079 +212 V 0.077 +213 K 0.069 +214 S 0.060 +215 N 0.055 +216 P 0.054 +217 E 0.054 +218 Y 0.051 +219 D 0.042 +220 P 0.031 +221 S 0.023 +222 R 0.021 +223 C 0.024 +224 H 0.029 +225 A 0.035 +226 F 0.040 +227 V 0.044 +228 H 0.046 +229 D 0.048 +230 M 0.053 +231 S 0.063 +232 D 0.075 +233 E 0.083 +234 S 0.086 +235 G 0.080 +236 E 0.069 +237 Y 0.060 +238 P 0.057 +239 M 0.062 +240 P 0.070 +241 D 0.075 +242 H 0.072 +243 S 0.063 +244 L 0.053 +245 D 0.046 +246 V 0.043 +247 I 0.043 +248 V 0.047 +249 L 0.051 +250 I 0.059 +251 F 0.071 +252 V 0.082 +253 L 0.084 +254 S 0.080 +255 A 0.074 +256 L 0.066 +257 H 0.057 +258 P 0.048 +259 E 0.042 +260 K 0.039 +261 M 0.039 +262 Q 0.037 +263 K 0.034 +264 S 0.032 +265 I 0.033 +266 N 0.038 +267 R 0.043 +268 L 0.045 +269 G 0.047 +270 R 0.049 +271 L 0.054 +272 L 0.065 +273 K 0.079 +274 P 0.087 +275 G 0.083 +276 G 0.073 +277 V 0.067 +278 L 0.066 +279 L 0.070 +280 L 0.079 +281 R 0.096 +282 D 0.111 +283 Y 0.116 +284 G 0.113 +285 R 0.107 +286 Y 0.096 +287 D 0.084 +288 M 0.075 +289 A 0.073 +290 Q 0.076 +291 L 0.085 +292 R 0.102 +293 F 0.130 +294 K 0.161 +295 K 0.181 +296 G 0.181 +297 R 0.170 +298 C 0.160 +299 L 0.155 +300 S 0.155 +301 E 0.155 +302 N 0.147 +303 F 0.135 +304 Y 0.123 +305 V 0.114 +306 R 0.110 +307 G 0.113 +308 D 0.118 +309 G 0.116 +310 T 0.109 +311 R 0.101 +312 V 0.094 +313 Y 0.088 +314 F 0.083 +315 F 0.080 +316 T 0.074 +317 Q 0.068 +318 D 0.065 +319 E 0.066 +320 L 0.072 +321 H 0.080 +322 D 0.084 +323 L 0.079 +324 F 0.069 +325 S 0.065 +326 S 0.071 +327 A 0.083 +328 G 0.089 +329 L 0.083 +330 E 0.071 +331 K 0.060 +332 L 0.054 +333 Q 0.051 +334 N 0.051 +335 L 0.053 +336 V 0.055 +337 D 0.057 +338 R 0.058 +339 R 0.058 +340 L 0.058 +341 Q 0.057 +342 V 0.059 +343 N 0.066 +344 R 0.081 +345 G 0.099 +346 K 0.110 +347 Q 0.113 +348 L 0.109 +349 T 0.102 +350 M 0.094 +351 Y 0.084 +352 R 0.072 +353 V 0.059 +354 W 0.046 +355 V 0.035 +356 Q 0.029 +357 C 0.027 +358 K 0.028 +359 Y 0.034 +360 R 0.051 +361 K 0.083 +362 V 0.136 +363 L 0.205 +364 A 0.271 +365 P 0.312 +366 T 0.326 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000017657_ENSDART00000004295_GN:zgc:112163_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000017657_ENSDART00000004295_GN:zgc:112163_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e00fdc5ebc259f833241764f7949e2465e797584 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000017657_ENSDART00000004295_GN:zgc:112163_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,260 @@ +>ENSDARG00000017657|ENSDART00000004295|GN:zgc:112163|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.351 +2 V 0.349 +3 A 0.338 +4 S 0.309 +5 S 0.257 +6 P 0.195 +7 E 0.140 +8 T 0.105 +9 L 0.088 +10 I 0.082 +11 S 0.078 +12 A 0.070 +13 A 0.066 +14 Q 0.073 +15 K 0.086 +16 C 0.093 +17 L 0.095 +18 C 0.100 +19 S 0.110 +20 R 0.123 +21 K 0.137 +22 K 0.148 +23 R 0.159 +24 L 0.168 +25 S 0.171 +26 P 0.161 +27 S 0.138 +28 S 0.113 +29 C 0.088 +30 L 0.065 +31 E 0.046 +32 V 0.037 +33 T 0.033 +34 I 0.029 +35 H 0.028 +36 I 0.029 +37 I 0.034 +38 A 0.044 +39 V 0.058 +40 D 0.075 +41 L 0.090 +42 G 0.097 +43 V 0.086 +44 K 0.064 +45 P 0.044 +46 A 0.033 +47 L 0.033 +48 L 0.043 +49 Y 0.063 +50 D 0.089 +51 S 0.110 +52 N 0.117 +53 G 0.111 +54 A 0.097 +55 S 0.081 +56 P 0.064 +57 D 0.050 +58 Q 0.040 +59 L 0.034 +60 Q 0.032 +61 L 0.033 +62 Y 0.038 +63 L 0.044 +64 H 0.051 +65 S 0.059 +66 L 0.071 +67 Q 0.085 +68 E 0.099 +69 S 0.110 +70 S 0.113 +71 V 0.107 +72 V 0.097 +73 S 0.088 +74 N 0.079 +75 S 0.067 +76 L 0.053 +77 R 0.042 +78 I 0.036 +79 M 0.038 +80 S 0.048 +81 I 0.061 +82 N 0.070 +83 D 0.070 +84 N 0.063 +85 T 0.051 +86 F 0.043 +87 I 0.043 +88 I 0.047 +89 N 0.051 +90 P 0.050 +91 D 0.045 +92 I 0.041 +93 M 0.042 +94 K 0.048 +95 S 0.053 +96 H 0.057 +97 L 0.059 +98 G 0.062 +99 E 0.066 +100 L 0.071 +101 L 0.073 +102 K 0.076 +103 S 0.084 +104 K 0.097 +105 S 0.113 +106 L 0.125 +107 P 0.122 +108 L 0.105 +109 I 0.087 +110 D 0.076 +111 V 0.071 +112 C 0.073 +113 S 0.079 +114 S 0.088 +115 R 0.095 +116 K 0.096 +117 R 0.093 +118 P 0.084 +119 V 0.068 +120 L 0.049 +121 C 0.036 +122 A 0.033 +123 F 0.037 +124 E 0.045 +125 R 0.049 +126 S 0.047 +127 A 0.045 +128 E 0.044 +129 E 0.045 +130 M 0.043 +131 V 0.041 +132 R 0.039 +133 S 0.037 +134 F 0.036 +135 L 0.036 +136 E 0.040 +137 V 0.049 +138 F 0.063 +139 M 0.078 +140 N 0.093 +141 G 0.101 +142 L 0.099 +143 D 0.090 +144 L 0.084 +145 V 0.085 +146 V 0.091 +147 L 0.091 +148 E 0.084 +149 E 0.073 +150 E 0.063 +151 L 0.054 +152 Y 0.048 +153 K 0.048 +154 D 0.050 +155 W 0.048 +156 N 0.040 +157 L 0.033 +158 C 0.032 +159 T 0.036 +160 F 0.040 +161 F 0.044 +162 G 0.048 +163 I 0.051 +164 L 0.049 +165 L 0.047 +166 G 0.049 +167 Y 0.052 +168 P 0.052 +169 A 0.048 +170 S 0.042 +171 Y 0.039 +172 W 0.039 +173 F 0.042 +174 E 0.051 +175 Q 0.069 +176 T 0.093 +177 Q 0.114 +178 G 0.123 +179 F 0.118 +180 E 0.109 +181 N 0.105 +182 C 0.103 +183 L 0.100 +184 S 0.096 +185 M 0.091 +186 T 0.084 +187 P 0.074 +188 L 0.066 +189 V 0.060 +190 V 0.055 +191 C 0.048 +192 T 0.044 +193 V 0.042 +194 W 0.041 +195 V 0.039 +196 R 0.036 +197 W 0.034 +198 Q 0.035 +199 I 0.038 +200 H 0.042 +201 E 0.047 +202 I 0.052 +203 K 0.057 +204 Q 0.064 +205 R 0.071 +206 C 0.076 +207 C 0.075 +208 L 0.069 +209 Y 0.061 +210 S 0.054 +211 F 0.053 +212 S 0.056 +213 V 0.060 +214 P 0.059 +215 E 0.053 +216 E 0.045 +217 L 0.040 +218 W 0.037 +219 S 0.034 +220 D 0.034 +221 V 0.040 +222 Q 0.051 +223 S 0.056 +224 H 0.049 +225 I 0.036 +226 Q 0.028 +227 R 0.029 +228 W 0.038 +229 T 0.053 +230 D 0.062 +231 H 0.059 +232 L 0.056 +233 R 0.062 +234 E 0.074 +235 R 0.082 +236 F 0.089 +237 S 0.098 +238 K 0.111 +239 Q 0.130 +240 T 0.152 +241 V 0.169 +242 L 0.176 +243 T 0.174 +244 D 0.175 +245 I 0.182 +246 C 0.194 +247 F 0.208 +248 S 0.225 +249 R 0.245 +250 D 0.272 +251 T 0.302 +252 V 0.333 +253 T 0.366 +254 L 0.406 +255 P 0.447 +256 S 0.476 +257 V 0.474 +258 T 0.440 +259 L 0.404 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000017657_ENSDART00000004295_GN:zgc:112163_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:8.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000017657_ENSDART00000004295_GN:zgc:112163_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:8.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..8e82017ce8ae1294a3ef59c3c8620a3fcc10db4b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000017657_ENSDART00000004295_GN:zgc:112163_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:8.caid @@ -0,0 +1,268 @@ +>ENSDARG00000017657|ENSDART00000004295|GN:zgc:112163|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:8 +1 M 0.332 +2 T 0.342 +3 H 0.369 +4 L 0.410 +5 E 0.455 +6 R 0.498 +7 G 0.529 +8 A 0.536 +9 M 0.514 +10 V 0.468 +11 A 0.404 +12 S 0.327 +13 S 0.248 +14 P 0.179 +15 E 0.130 +16 T 0.103 +17 L 0.089 +18 I 0.083 +19 S 0.078 +20 A 0.069 +21 A 0.059 +22 Q 0.059 +23 K 0.068 +24 C 0.080 +25 L 0.093 +26 C 0.106 +27 S 0.119 +28 R 0.131 +29 K 0.144 +30 K 0.157 +31 R 0.169 +32 L 0.181 +33 S 0.187 +34 P 0.176 +35 S 0.150 +36 S 0.120 +37 C 0.091 +38 L 0.065 +39 E 0.046 +40 V 0.036 +41 T 0.032 +42 I 0.029 +43 H 0.028 +44 I 0.031 +45 I 0.036 +46 A 0.046 +47 V 0.061 +48 D 0.077 +49 L 0.094 +50 G 0.101 +51 V 0.090 +52 K 0.068 +53 P 0.046 +54 A 0.035 +55 L 0.035 +56 L 0.045 +57 Y 0.066 +58 D 0.092 +59 S 0.113 +60 N 0.120 +61 G 0.113 +62 A 0.098 +63 S 0.081 +64 P 0.063 +65 D 0.048 +66 Q 0.038 +67 L 0.032 +68 Q 0.030 +69 L 0.030 +70 Y 0.034 +71 L 0.039 +72 H 0.045 +73 S 0.054 +74 L 0.067 +75 Q 0.082 +76 E 0.097 +77 S 0.108 +78 S 0.110 +79 V 0.102 +80 V 0.092 +81 S 0.084 +82 N 0.075 +83 S 0.063 +84 L 0.051 +85 R 0.041 +86 I 0.035 +87 M 0.038 +88 S 0.047 +89 I 0.059 +90 N 0.068 +91 D 0.068 +92 N 0.060 +93 T 0.049 +94 F 0.041 +95 I 0.041 +96 I 0.045 +97 N 0.049 +98 P 0.048 +99 D 0.043 +100 I 0.039 +101 M 0.040 +102 K 0.045 +103 S 0.049 +104 H 0.052 +105 L 0.055 +106 G 0.058 +107 E 0.063 +108 L 0.067 +109 L 0.070 +110 K 0.074 +111 S 0.082 +112 K 0.097 +113 S 0.115 +114 L 0.127 +115 P 0.123 +116 L 0.106 +117 I 0.087 +118 D 0.077 +119 V 0.073 +120 C 0.074 +121 S 0.081 +122 S 0.090 +123 R 0.096 +124 K 0.098 +125 R 0.095 +126 P 0.086 +127 V 0.070 +128 L 0.051 +129 C 0.038 +130 A 0.034 +131 F 0.039 +132 E 0.047 +133 R 0.050 +134 S 0.048 +135 A 0.045 +136 E 0.044 +137 E 0.044 +138 M 0.042 +139 V 0.040 +140 R 0.038 +141 S 0.036 +142 F 0.035 +143 L 0.036 +144 E 0.040 +145 V 0.049 +146 F 0.061 +147 M 0.076 +148 N 0.091 +149 G 0.100 +150 L 0.098 +151 D 0.090 +152 L 0.084 +153 V 0.085 +154 V 0.090 +155 L 0.090 +156 E 0.083 +157 E 0.073 +158 E 0.064 +159 L 0.055 +160 Y 0.048 +161 K 0.048 +162 D 0.050 +163 W 0.047 +164 N 0.039 +165 L 0.032 +166 C 0.031 +167 T 0.035 +168 F 0.040 +169 F 0.044 +170 G 0.048 +171 I 0.050 +172 L 0.048 +173 L 0.046 +174 G 0.048 +175 Y 0.051 +176 P 0.051 +177 A 0.046 +178 S 0.040 +179 Y 0.037 +180 W 0.037 +181 F 0.040 +182 E 0.049 +183 Q 0.066 +184 T 0.090 +185 Q 0.110 +186 G 0.119 +187 F 0.114 +188 E 0.104 +189 N 0.099 +190 C 0.097 +191 L 0.094 +192 S 0.091 +193 M 0.087 +194 T 0.080 +195 P 0.070 +196 L 0.062 +197 V 0.056 +198 V 0.051 +199 C 0.045 +200 T 0.041 +201 V 0.039 +202 W 0.039 +203 V 0.037 +204 R 0.034 +205 W 0.033 +206 Q 0.034 +207 I 0.037 +208 H 0.041 +209 E 0.047 +210 I 0.053 +211 K 0.057 +212 Q 0.063 +213 R 0.069 +214 C 0.074 +215 C 0.073 +216 L 0.068 +217 Y 0.060 +218 S 0.055 +219 F 0.053 +220 S 0.057 +221 V 0.061 +222 P 0.060 +223 E 0.053 +224 E 0.045 +225 L 0.041 +226 W 0.038 +227 S 0.035 +228 D 0.035 +229 V 0.041 +230 Q 0.052 +231 S 0.057 +232 H 0.050 +233 I 0.037 +234 Q 0.029 +235 R 0.030 +236 W 0.040 +237 T 0.054 +238 D 0.062 +239 H 0.060 +240 L 0.057 +241 R 0.063 +242 E 0.075 +243 R 0.084 +244 F 0.091 +245 S 0.100 +246 K 0.113 +247 Q 0.131 +248 T 0.152 +249 V 0.169 +250 L 0.175 +251 T 0.174 +252 D 0.175 +253 I 0.183 +254 C 0.195 +255 F 0.209 +256 S 0.225 +257 R 0.245 +258 D 0.273 +259 T 0.305 +260 V 0.337 +261 T 0.371 +262 L 0.410 +263 P 0.451 +264 S 0.479 +265 V 0.478 +266 T 0.444 +267 L 0.407 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000023712_ENSDART00000028225_GN:mao_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000023712_ENSDART00000028225_GN:mao_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ff88f18039b49b526d2857f880b12f37018e28dd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000023712_ENSDART00000028225_GN:mao_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,523 @@ +>ENSDARG00000023712|ENSDART00000028225|GN:mao|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.381 +2 T 0.359 +3 A 0.311 +4 N 0.239 +5 A 0.162 +6 Y 0.103 +7 D 0.069 +8 V 0.055 +9 I 0.052 +10 V 0.051 +11 I 0.047 +12 G 0.042 +13 G 0.040 +14 G 0.045 +15 I 0.055 +16 S 0.061 +17 G 0.061 +18 L 0.061 +19 S 0.066 +20 A 0.073 +21 A 0.073 +22 K 0.066 +23 L 0.059 +24 L 0.055 +25 V 0.056 +26 D 0.066 +27 S 0.082 +28 G 0.096 +29 L 0.102 +30 N 0.103 +31 P 0.104 +32 V 0.109 +33 V 0.122 +34 L 0.138 +35 E 0.145 +36 A 0.141 +37 R 0.139 +38 S 0.150 +39 R 0.171 +40 V 0.186 +41 G 0.186 +42 G 0.177 +43 R 0.163 +44 T 0.146 +45 Y 0.130 +46 T 0.120 +47 V 0.120 +48 Q 0.126 +49 N 0.129 +50 K 0.125 +51 E 0.114 +52 T 0.102 +53 K 0.092 +54 W 0.091 +55 V 0.099 +56 D 0.108 +57 L 0.111 +58 G 0.111 +59 G 0.123 +60 A 0.149 +61 Y 0.174 +62 I 0.181 +63 G 0.169 +64 P 0.148 +65 T 0.127 +66 Q 0.107 +67 N 0.090 +68 R 0.082 +69 I 0.083 +70 L 0.086 +71 R 0.085 +72 I 0.077 +73 A 0.063 +74 K 0.051 +75 Q 0.051 +76 Y 0.064 +77 G 0.086 +78 V 0.107 +79 K 0.121 +80 T 0.129 +81 Y 0.141 +82 K 0.160 +83 V 0.182 +84 N 0.198 +85 E 0.202 +86 E 0.193 +87 E 0.170 +88 S 0.137 +89 L 0.104 +90 V 0.082 +91 H 0.075 +92 Y 0.080 +93 V 0.090 +94 K 0.099 +95 G 0.104 +96 K 0.110 +97 S 0.121 +98 Y 0.135 +99 P 0.143 +100 F 0.143 +101 K 0.140 +102 G 0.140 +103 P 0.143 +104 F 0.143 +105 P 0.138 +106 P 0.126 +107 M 0.111 +108 W 0.097 +109 N 0.085 +110 P 0.074 +111 F 0.066 +112 A 0.059 +113 Y 0.056 +114 M 0.056 +115 D 0.061 +116 Y 0.063 +117 N 0.064 +118 N 0.067 +119 L 0.073 +120 W 0.078 +121 R 0.076 +122 T 0.071 +123 M 0.071 +124 D 0.077 +125 K 0.082 +126 M 0.080 +127 G 0.079 +128 M 0.086 +129 E 0.100 +130 I 0.108 +131 P 0.105 +132 K 0.098 +133 E 0.094 +134 A 0.088 +135 P 0.080 +136 W 0.077 +137 R 0.080 +138 A 0.084 +139 P 0.079 +140 H 0.068 +141 A 0.058 +142 E 0.051 +143 E 0.051 +144 W 0.054 +145 D 0.054 +146 K 0.049 +147 M 0.042 +148 T 0.035 +149 M 0.030 +150 Q 0.027 +151 Q 0.025 +152 L 0.025 +153 F 0.027 +154 D 0.034 +155 K 0.046 +156 I 0.062 +157 C 0.080 +158 W 0.094 +159 T 0.096 +160 R 0.085 +161 S 0.069 +162 A 0.059 +163 R 0.056 +164 R 0.059 +165 F 0.061 +166 A 0.061 +167 T 0.060 +168 L 0.061 +169 F 0.063 +170 V 0.065 +171 N 0.067 +172 V 0.075 +173 N 0.085 +174 V 0.088 +175 T 0.087 +176 S 0.083 +177 E 0.079 +178 P 0.076 +179 H 0.076 +180 E 0.076 +181 V 0.070 +182 S 0.060 +183 A 0.051 +184 L 0.050 +185 W 0.053 +186 F 0.055 +187 L 0.054 +188 W 0.053 +189 Y 0.055 +190 V 0.062 +191 K 0.075 +192 Q 0.093 +193 C 0.110 +194 G 0.120 +195 G 0.120 +196 T 0.117 +197 M 0.122 +198 R 0.137 +199 I 0.153 +200 F 0.171 +201 S 0.199 +202 T 0.234 +203 T 0.257 +204 N 0.257 +205 G 0.243 +206 G 0.223 +207 Q 0.201 +208 E 0.170 +209 R 0.135 +210 K 0.103 +211 F 0.084 +212 A 0.078 +213 G 0.082 +214 G 0.092 +215 A 0.098 +216 N 0.097 +217 Q 0.094 +218 I 0.094 +219 S 0.093 +220 E 0.092 +221 G 0.096 +222 M 0.103 +223 A 0.107 +224 R 0.100 +225 E 0.085 +226 L 0.072 +227 G 0.069 +228 D 0.070 +229 R 0.076 +230 V 0.085 +231 K 0.090 +232 L 0.086 +233 S 0.073 +234 R 0.058 +235 A 0.050 +236 V 0.050 +237 C 0.056 +238 S 0.060 +239 I 0.061 +240 D 0.061 +241 Q 0.061 +242 T 0.064 +243 G 0.064 +244 D 0.057 +245 L 0.046 +246 V 0.035 +247 E 0.029 +248 V 0.028 +249 R 0.030 +250 T 0.035 +251 V 0.045 +252 N 0.059 +253 E 0.071 +254 E 0.073 +255 V 0.066 +256 Y 0.058 +257 K 0.054 +258 A 0.055 +259 K 0.061 +260 Y 0.073 +261 V 0.092 +262 I 0.110 +263 L 0.115 +264 A 0.107 +265 I 0.100 +266 P 0.100 +267 P 0.103 +268 G 0.103 +269 L 0.101 +270 N 0.099 +271 L 0.094 +272 K 0.087 +273 I 0.080 +274 H 0.072 +275 F 0.065 +276 N 0.064 +277 P 0.074 +278 E 0.089 +279 L 0.096 +280 P 0.090 +281 P 0.080 +282 L 0.074 +283 R 0.072 +284 N 0.074 +285 Q 0.080 +286 L 0.084 +287 I 0.085 +288 H 0.084 +289 R 0.087 +290 V 0.093 +291 P 0.096 +292 M 0.092 +293 G 0.084 +294 S 0.073 +295 V 0.057 +296 I 0.043 +297 K 0.033 +298 C 0.027 +299 M 0.024 +300 V 0.026 +301 Y 0.032 +302 Y 0.041 +303 K 0.048 +304 E 0.052 +305 N 0.054 +306 F 0.057 +307 W 0.064 +308 R 0.076 +309 K 0.090 +310 K 0.100 +311 G 0.110 +312 Y 0.118 +313 C 0.120 +314 G 0.112 +315 S 0.100 +316 M 0.089 +317 V 0.079 +318 I 0.074 +319 E 0.077 +320 E 0.089 +321 E 0.107 +322 D 0.123 +323 A 0.128 +324 P 0.119 +325 I 0.100 +326 G 0.083 +327 L 0.076 +328 T 0.078 +329 L 0.085 +330 D 0.094 +331 D 0.102 +332 T 0.108 +333 K 0.119 +334 P 0.135 +335 D 0.153 +336 G 0.158 +337 S 0.142 +338 V 0.112 +339 P 0.084 +340 A 0.063 +341 I 0.050 +342 M 0.044 +343 G 0.044 +344 F 0.050 +345 I 0.057 +346 L 0.062 +347 A 0.068 +348 R 0.075 +349 K 0.081 +350 S 0.084 +351 R 0.086 +352 K 0.087 +353 L 0.085 +354 A 0.079 +355 N 0.072 +356 L 0.066 +357 T 0.061 +358 R 0.056 +359 D 0.050 +360 E 0.046 +361 R 0.043 +362 K 0.045 +363 R 0.049 +364 R 0.051 +365 I 0.051 +366 C 0.050 +367 E 0.050 +368 I 0.051 +369 Y 0.051 +370 A 0.049 +371 R 0.046 +372 V 0.046 +373 L 0.053 +374 G 0.065 +375 S 0.074 +376 E 0.078 +377 E 0.079 +378 A 0.083 +379 L 0.090 +380 Y 0.093 +381 P 0.087 +382 V 0.069 +383 H 0.049 +384 Y 0.035 +385 E 0.030 +386 E 0.035 +387 K 0.044 +388 N 0.056 +389 W 0.066 +390 C 0.069 +391 E 0.064 +392 E 0.056 +393 E 0.054 +394 Y 0.063 +395 S 0.084 +396 G 0.110 +397 G 0.132 +398 C 0.147 +399 Y 0.155 +400 T 0.157 +401 A 0.154 +402 Y 0.150 +403 F 0.150 +404 P 0.155 +405 P 0.158 +406 G 0.152 +407 I 0.134 +408 M 0.109 +409 T 0.092 +410 Q 0.087 +411 F 0.089 +412 G 0.093 +413 R 0.099 +414 V 0.109 +415 L 0.122 +416 R 0.132 +417 E 0.137 +418 P 0.132 +419 V 0.115 +420 G 0.096 +421 R 0.087 +422 L 0.087 +423 Y 0.091 +424 F 0.093 +425 A 0.100 +426 G 0.123 +427 T 0.166 +428 E 0.213 +429 T 0.233 +430 A 0.216 +431 T 0.181 +432 E 0.152 +433 W 0.142 +434 S 0.147 +435 G 0.164 +436 Y 0.187 +437 M 0.208 +438 E 0.219 +439 G 0.220 +440 A 0.211 +441 V 0.195 +442 Q 0.174 +443 A 0.155 +444 G 0.140 +445 E 0.128 +446 R 0.120 +447 A 0.111 +448 S 0.103 +449 R 0.098 +450 E 0.098 +451 V 0.101 +452 M 0.101 +453 C 0.098 +454 A 0.099 +455 M 0.107 +456 G 0.115 +457 K 0.118 +458 L 0.116 +459 H 0.116 +460 A 0.123 +461 S 0.134 +462 Q 0.141 +463 I 0.138 +464 W 0.134 +465 Q 0.148 +466 S 0.187 +467 E 0.236 +468 P 0.268 +469 E 0.278 +470 S 0.281 +471 M 0.290 +472 D 0.303 +473 V 0.309 +474 P 0.305 +475 A 0.295 +476 R 0.289 +477 P 0.288 +478 F 0.285 +479 V 0.272 +480 T 0.250 +481 T 0.224 +482 F 0.202 +483 W 0.194 +484 E 0.209 +485 R 0.246 +486 N 0.293 +487 L 0.332 +488 P 0.354 +489 S 0.352 +490 V 0.330 +491 G 0.303 +492 G 0.286 +493 F 0.284 +494 L 0.291 +495 K 0.308 +496 F 0.344 +497 M 0.385 +498 G 0.413 +499 V 0.422 +500 S 0.413 +501 S 0.385 +502 F 0.348 +503 L 0.318 +504 A 0.292 +505 A 0.271 +506 A 0.260 +507 T 0.247 +508 A 0.225 +509 A 0.204 +510 G 0.194 +511 L 0.190 +512 V 0.191 +513 A 0.196 +514 C 0.206 +515 K 0.226 +516 K 0.262 +517 G 0.302 +518 L 0.320 +519 L 0.313 +520 P 0.290 +521 R 0.265 +522 C 0.249 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000023712_ENSDART00000028225_GN:mao_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:20.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000023712_ENSDART00000028225_GN:mao_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:20.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..41c4c0a36f37688d67f94c0573a09edc16ebafc8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000023712_ENSDART00000028225_GN:mao_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:20.caid @@ -0,0 +1,543 @@ +>ENSDARG00000023712|ENSDART00000028225|GN:mao|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:20 +1 M 0.339 +2 R 0.343 +3 S 0.364 +4 G 0.388 +5 S 0.381 +6 S 0.356 +7 S 0.368 +8 A 0.421 +9 L 0.469 +10 S 0.489 +11 A 0.488 +12 T 0.466 +13 E 0.428 +14 Q 0.410 +15 T 0.436 +16 R 0.483 +17 T 0.521 +18 D 0.536 +19 S 0.528 +20 T 0.499 +21 M 0.456 +22 T 0.398 +23 A 0.326 +24 N 0.242 +25 A 0.162 +26 Y 0.103 +27 D 0.070 +28 V 0.055 +29 I 0.051 +30 V 0.049 +31 I 0.045 +32 G 0.040 +33 G 0.039 +34 G 0.045 +35 I 0.055 +36 S 0.061 +37 G 0.061 +38 L 0.061 +39 S 0.067 +40 A 0.073 +41 A 0.073 +42 K 0.067 +43 L 0.061 +44 L 0.057 +45 V 0.058 +46 D 0.068 +47 S 0.084 +48 G 0.096 +49 L 0.102 +50 N 0.102 +51 P 0.102 +52 V 0.107 +53 V 0.119 +54 L 0.135 +55 E 0.143 +56 A 0.141 +57 R 0.139 +58 S 0.150 +59 R 0.171 +60 V 0.186 +61 G 0.186 +62 G 0.176 +63 R 0.162 +64 T 0.144 +65 Y 0.128 +66 T 0.118 +67 V 0.117 +68 Q 0.123 +69 N 0.126 +70 K 0.121 +71 E 0.110 +72 T 0.098 +73 K 0.088 +74 W 0.087 +75 V 0.095 +76 D 0.106 +77 L 0.109 +78 G 0.109 +79 G 0.121 +80 A 0.146 +81 Y 0.169 +82 I 0.174 +83 G 0.162 +84 P 0.143 +85 T 0.123 +86 Q 0.104 +87 N 0.088 +88 R 0.078 +89 I 0.072 +90 L 0.065 +91 R 0.058 +92 I 0.054 +93 A 0.050 +94 K 0.047 +95 Q 0.049 +96 Y 0.063 +97 G 0.085 +98 V 0.106 +99 K 0.119 +100 T 0.127 +101 Y 0.139 +102 K 0.159 +103 V 0.181 +104 N 0.195 +105 E 0.199 +106 E 0.189 +107 E 0.167 +108 S 0.136 +109 L 0.105 +110 V 0.083 +111 H 0.076 +112 Y 0.081 +113 V 0.091 +114 K 0.099 +115 G 0.104 +116 K 0.111 +117 S 0.123 +118 Y 0.137 +119 P 0.146 +120 F 0.148 +121 K 0.146 +122 G 0.147 +123 P 0.151 +124 F 0.151 +125 P 0.145 +126 P 0.132 +127 M 0.116 +128 W 0.102 +129 N 0.089 +130 P 0.077 +131 F 0.068 +132 A 0.061 +133 Y 0.056 +134 M 0.056 +135 D 0.060 +136 Y 0.063 +137 N 0.062 +138 N 0.063 +139 L 0.063 +140 W 0.059 +141 R 0.053 +142 T 0.052 +143 M 0.060 +144 D 0.072 +145 K 0.080 +146 M 0.079 +147 G 0.077 +148 M 0.085 +149 E 0.099 +150 I 0.107 +151 P 0.104 +152 K 0.098 +153 E 0.093 +154 A 0.087 +155 P 0.080 +156 W 0.077 +157 R 0.081 +158 A 0.084 +159 P 0.080 +160 H 0.069 +161 A 0.058 +162 E 0.052 +163 E 0.051 +164 W 0.054 +165 D 0.054 +166 K 0.049 +167 M 0.042 +168 T 0.036 +169 M 0.030 +170 Q 0.027 +171 Q 0.025 +172 L 0.025 +173 F 0.027 +174 D 0.034 +175 K 0.046 +176 I 0.062 +177 C 0.080 +178 W 0.094 +179 T 0.096 +180 R 0.085 +181 S 0.069 +182 A 0.059 +183 R 0.057 +184 R 0.059 +185 F 0.062 +186 A 0.062 +187 T 0.061 +188 L 0.063 +189 F 0.065 +190 V 0.066 +191 N 0.069 +192 V 0.076 +193 N 0.085 +194 V 0.088 +195 T 0.086 +196 S 0.081 +197 E 0.077 +198 P 0.074 +199 H 0.075 +200 E 0.075 +201 V 0.070 +202 S 0.059 +203 A 0.051 +204 L 0.050 +205 W 0.053 +206 F 0.054 +207 L 0.053 +208 W 0.053 +209 Y 0.055 +210 V 0.061 +211 K 0.074 +212 Q 0.091 +213 C 0.108 +214 G 0.117 +215 G 0.118 +216 T 0.116 +217 M 0.122 +218 R 0.137 +219 I 0.154 +220 F 0.172 +221 S 0.200 +222 T 0.235 +223 T 0.257 +224 N 0.257 +225 G 0.243 +226 G 0.223 +227 Q 0.200 +228 E 0.169 +229 R 0.133 +230 K 0.102 +231 F 0.082 +232 A 0.077 +233 G 0.082 +234 G 0.093 +235 A 0.099 +236 N 0.097 +237 Q 0.094 +238 I 0.093 +239 S 0.093 +240 E 0.092 +241 G 0.095 +242 M 0.103 +243 A 0.107 +244 R 0.100 +245 E 0.085 +246 L 0.073 +247 G 0.069 +248 D 0.071 +249 R 0.076 +250 V 0.085 +251 K 0.090 +252 L 0.086 +253 S 0.073 +254 R 0.058 +255 A 0.050 +256 V 0.050 +257 C 0.056 +258 S 0.060 +259 I 0.062 +260 D 0.061 +261 Q 0.062 +262 T 0.064 +263 G 0.064 +264 D 0.057 +265 L 0.046 +266 V 0.035 +267 E 0.029 +268 V 0.028 +269 R 0.030 +270 T 0.035 +271 V 0.045 +272 N 0.060 +273 E 0.073 +274 E 0.075 +275 V 0.067 +276 Y 0.058 +277 K 0.054 +278 A 0.055 +279 K 0.062 +280 Y 0.075 +281 V 0.094 +282 I 0.111 +283 L 0.116 +284 A 0.109 +285 I 0.100 +286 P 0.100 +287 P 0.103 +288 G 0.103 +289 L 0.102 +290 N 0.100 +291 L 0.096 +292 K 0.089 +293 I 0.082 +294 H 0.074 +295 F 0.066 +296 N 0.065 +297 P 0.076 +298 E 0.090 +299 L 0.097 +300 P 0.091 +301 P 0.081 +302 L 0.074 +303 R 0.073 +304 N 0.075 +305 Q 0.080 +306 L 0.085 +307 I 0.086 +308 H 0.086 +309 R 0.089 +310 V 0.095 +311 P 0.098 +312 M 0.094 +313 G 0.086 +314 S 0.074 +315 V 0.058 +316 I 0.044 +317 K 0.034 +318 C 0.028 +319 M 0.025 +320 V 0.027 +321 Y 0.033 +322 Y 0.042 +323 K 0.049 +324 E 0.052 +325 N 0.054 +326 F 0.058 +327 W 0.065 +328 R 0.077 +329 K 0.090 +330 K 0.101 +331 G 0.111 +332 Y 0.119 +333 C 0.120 +334 G 0.112 +335 S 0.101 +336 M 0.090 +337 V 0.081 +338 I 0.075 +339 E 0.079 +340 E 0.091 +341 E 0.108 +342 D 0.124 +343 A 0.129 +344 P 0.120 +345 I 0.101 +346 G 0.084 +347 L 0.077 +348 T 0.080 +349 L 0.087 +350 D 0.096 +351 D 0.103 +352 T 0.109 +353 K 0.119 +354 P 0.136 +355 D 0.154 +356 G 0.158 +357 S 0.142 +358 V 0.113 +359 P 0.084 +360 A 0.064 +361 I 0.051 +362 M 0.045 +363 G 0.045 +364 F 0.051 +365 I 0.058 +366 L 0.063 +367 A 0.068 +368 R 0.075 +369 K 0.081 +370 S 0.084 +371 R 0.086 +372 K 0.086 +373 L 0.085 +374 A 0.079 +375 N 0.072 +376 L 0.066 +377 T 0.061 +378 R 0.056 +379 D 0.051 +380 E 0.046 +381 R 0.044 +382 K 0.045 +383 R 0.049 +384 R 0.051 +385 I 0.051 +386 C 0.050 +387 E 0.050 +388 I 0.051 +389 Y 0.051 +390 A 0.049 +391 R 0.046 +392 V 0.047 +393 L 0.054 +394 G 0.065 +395 S 0.074 +396 E 0.078 +397 E 0.079 +398 A 0.084 +399 L 0.091 +400 Y 0.094 +401 P 0.088 +402 V 0.070 +403 H 0.050 +404 Y 0.036 +405 E 0.031 +406 E 0.036 +407 K 0.045 +408 N 0.057 +409 W 0.067 +410 C 0.070 +411 E 0.065 +412 E 0.057 +413 E 0.055 +414 Y 0.064 +415 S 0.086 +416 G 0.112 +417 G 0.135 +418 C 0.149 +419 Y 0.157 +420 T 0.160 +421 A 0.158 +422 Y 0.153 +423 F 0.152 +424 P 0.156 +425 P 0.159 +426 G 0.153 +427 I 0.135 +428 M 0.110 +429 T 0.093 +430 Q 0.088 +431 F 0.090 +432 G 0.093 +433 R 0.099 +434 V 0.111 +435 L 0.123 +436 R 0.135 +437 E 0.140 +438 P 0.135 +439 V 0.118 +440 G 0.099 +441 R 0.088 +442 L 0.089 +443 Y 0.092 +444 F 0.095 +445 A 0.102 +446 G 0.124 +447 T 0.168 +448 E 0.215 +449 T 0.235 +450 A 0.219 +451 T 0.183 +452 E 0.154 +453 W 0.143 +454 S 0.149 +455 G 0.165 +456 Y 0.188 +457 M 0.208 +458 E 0.218 +459 G 0.218 +460 A 0.210 +461 V 0.194 +462 Q 0.173 +463 A 0.154 +464 G 0.139 +465 E 0.128 +466 R 0.119 +467 A 0.111 +468 S 0.102 +469 R 0.097 +470 E 0.098 +471 V 0.101 +472 M 0.100 +473 C 0.097 +474 A 0.099 +475 M 0.107 +476 G 0.115 +477 K 0.116 +478 L 0.114 +479 H 0.114 +480 A 0.121 +481 S 0.132 +482 Q 0.140 +483 I 0.138 +484 W 0.134 +485 Q 0.149 +486 S 0.190 +487 E 0.240 +488 P 0.274 +489 E 0.285 +490 S 0.289 +491 M 0.298 +492 D 0.309 +493 V 0.314 +494 P 0.309 +495 A 0.299 +496 R 0.294 +497 P 0.294 +498 F 0.293 +499 V 0.282 +500 T 0.258 +501 T 0.229 +502 F 0.205 +503 W 0.196 +504 E 0.212 +505 R 0.249 +506 N 0.295 +507 L 0.336 +508 P 0.357 +509 S 0.355 +510 V 0.332 +511 G 0.305 +512 G 0.289 +513 F 0.287 +514 L 0.294 +515 K 0.311 +516 F 0.346 +517 M 0.388 +518 G 0.415 +519 V 0.422 +520 S 0.412 +521 S 0.384 +522 F 0.346 +523 L 0.313 +524 A 0.285 +525 A 0.263 +526 A 0.250 +527 T 0.237 +528 A 0.215 +529 A 0.192 +530 G 0.176 +531 L 0.167 +532 V 0.166 +533 A 0.174 +534 C 0.187 +535 K 0.208 +536 K 0.244 +537 G 0.279 +538 L 0.293 +539 L 0.282 +540 P 0.257 +541 R 0.231 +542 C 0.216 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000024771_ENSDART00000033574_GN:slc24a5_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000024771_ENSDART00000033574_GN:slc24a5_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..91d3d365c3c349a17930b5e1b585a809d08b8d7d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000024771_ENSDART00000033574_GN:slc24a5_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,514 @@ +>ENSDARG00000024771|ENSDART00000033574|GN:slc24a5|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.251 +2 R 0.248 +3 T 0.243 +4 D 0.230 +5 V 0.204 +6 F 0.176 +7 L 0.161 +8 Q 0.164 +9 R 0.171 +10 R 0.171 +11 K 0.163 +12 R 0.152 +13 R 0.137 +14 D 0.116 +15 V 0.093 +16 L 0.076 +17 L 0.069 +18 S 0.068 +19 I 0.065 +20 I 0.063 +21 A 0.065 +22 L 0.066 +23 L 0.058 +24 L 0.046 +25 L 0.038 +26 I 0.034 +27 F 0.032 +28 A 0.030 +29 I 0.031 +30 V 0.035 +31 H 0.039 +32 L 0.044 +33 V 0.056 +34 F 0.083 +35 C 0.125 +36 A 0.175 +37 G 0.223 +38 L 0.262 +39 S 0.295 +40 F 0.325 +41 Q 0.350 +42 G 0.370 +43 S 0.380 +44 S 0.372 +45 S 0.347 +46 A 0.321 +47 R 0.306 +48 V 0.294 +49 R 0.281 +50 R 0.291 +51 D 0.334 +52 L 0.389 +53 E 0.429 +54 N 0.449 +55 A 0.451 +56 S 0.434 +57 E 0.407 +58 C 0.386 +59 V 0.377 +60 Q 0.371 +61 P 0.363 +62 Q 0.353 +63 S 0.345 +64 S 0.333 +65 E 0.318 +66 F 0.307 +67 P 0.294 +68 E 0.268 +69 G 0.225 +70 F 0.179 +71 F 0.145 +72 T 0.130 +73 V 0.127 +74 Q 0.122 +75 E 0.111 +76 R 0.101 +77 K 0.102 +78 D 0.105 +79 G 0.101 +80 G 0.088 +81 I 0.071 +82 L 0.054 +83 I 0.044 +84 Y 0.043 +85 F 0.050 +86 M 0.059 +87 I 0.065 +88 I 0.063 +89 F 0.057 +90 Y 0.050 +91 M 0.045 +92 L 0.046 +93 L 0.052 +94 S 0.059 +95 V 0.060 +96 S 0.055 +97 I 0.053 +98 V 0.055 +99 C 0.057 +100 D 0.059 +101 E 0.062 +102 Y 0.063 +103 F 0.059 +104 L 0.053 +105 P 0.047 +106 S 0.043 +107 L 0.037 +108 E 0.032 +109 V 0.030 +110 I 0.030 +111 S 0.033 +112 E 0.042 +113 R 0.061 +114 L 0.086 +115 G 0.102 +116 L 0.100 +117 S 0.084 +118 Q 0.070 +119 D 0.064 +120 V 0.063 +121 A 0.061 +122 G 0.060 +123 A 0.059 +124 T 0.058 +125 F 0.055 +126 M 0.055 +127 A 0.057 +128 A 0.061 +129 G 0.064 +130 S 0.070 +131 S 0.079 +132 A 0.085 +133 P 0.084 +134 E 0.080 +135 L 0.074 +136 V 0.067 +137 T 0.067 +138 A 0.069 +139 F 0.069 +140 L 0.069 +141 G 0.074 +142 V 0.086 +143 F 0.104 +144 V 0.124 +145 T 0.141 +146 K 0.148 +147 G 0.146 +148 D 0.135 +149 I 0.116 +150 G 0.095 +151 V 0.081 +152 S 0.079 +153 T 0.087 +154 I 0.094 +155 M 0.098 +156 G 0.104 +157 S 0.109 +158 A 0.107 +159 V 0.098 +160 Y 0.087 +161 N 0.077 +162 L 0.066 +163 L 0.056 +164 C 0.050 +165 I 0.046 +166 C 0.043 +167 A 0.044 +168 A 0.051 +169 C 0.059 +170 G 0.066 +171 L 0.073 +172 L 0.079 +173 S 0.083 +174 S 0.087 +175 A 0.094 +176 V 0.105 +177 G 0.114 +178 R 0.114 +179 L 0.102 +180 S 0.083 +181 C 0.065 +182 W 0.052 +183 P 0.047 +184 L 0.044 +185 F 0.043 +186 R 0.046 +187 D 0.053 +188 C 0.061 +189 V 0.067 +190 A 0.071 +191 Y 0.073 +192 S 0.072 +193 I 0.069 +194 S 0.065 +195 V 0.060 +196 A 0.054 +197 A 0.051 +198 V 0.050 +199 I 0.056 +200 A 0.072 +201 I 0.092 +202 I 0.107 +203 S 0.112 +204 D 0.118 +205 N 0.130 +206 R 0.136 +207 V 0.122 +208 Y 0.093 +209 W 0.070 +210 Y 0.069 +211 D 0.082 +212 G 0.093 +213 A 0.097 +214 C 0.102 +215 L 0.108 +216 L 0.109 +217 L 0.098 +218 V 0.080 +219 Y 0.061 +220 G 0.049 +221 V 0.046 +222 Y 0.052 +223 V 0.062 +224 A 0.066 +225 V 0.062 +226 L 0.055 +227 C 0.050 +228 F 0.050 +229 D 0.054 +230 L 0.059 +231 K 0.062 +232 I 0.066 +233 S 0.074 +234 E 0.085 +235 Y 0.092 +236 V 0.095 +237 M 0.101 +238 Q 0.117 +239 R 0.144 +240 F 0.180 +241 S 0.212 +242 P 0.229 +243 C 0.225 +244 C 0.214 +245 W 0.219 +246 C 0.255 +247 L 0.318 +248 K 0.397 +249 P 0.477 +250 R 0.544 +251 D 0.587 +252 R 0.608 +253 D 0.617 +254 S 0.621 +255 G 0.617 +256 E 0.605 +257 Q 0.592 +258 Q 0.590 +259 P 0.604 +260 L 0.625 +261 V 0.637 +262 G 0.633 +263 W 0.618 +264 S 0.603 +265 D 0.589 +266 D 0.566 +267 S 0.538 +268 S 0.524 +269 L 0.527 +270 R 0.522 +271 V 0.494 +272 Q 0.473 +273 R 0.494 +274 R 0.537 +275 S 0.566 +276 R 0.585 +277 N 0.613 +278 D 0.644 +279 S 0.668 +280 G 0.682 +281 I 0.685 +282 F 0.677 +283 Q 0.662 +284 D 0.642 +285 D 0.614 +286 S 0.579 +287 G 0.541 +288 Y 0.510 +289 S 0.493 +290 H 0.482 +291 L 0.457 +292 S 0.420 +293 L 0.390 +294 S 0.380 +295 L 0.394 +296 H 0.429 +297 G 0.470 +298 L 0.508 +299 N 0.538 +300 E 0.555 +301 I 0.552 +302 S 0.535 +303 D 0.517 +304 E 0.500 +305 H 0.476 +306 K 0.443 +307 S 0.404 +308 V 0.366 +309 F 0.338 +310 S 0.309 +311 M 0.272 +312 P 0.232 +313 D 0.198 +314 H 0.164 +315 D 0.127 +316 L 0.095 +317 K 0.081 +318 R 0.082 +319 I 0.092 +320 L 0.107 +321 W 0.118 +322 V 0.122 +323 L 0.126 +324 S 0.135 +325 L 0.137 +326 P 0.122 +327 V 0.104 +328 S 0.093 +329 T 0.092 +330 L 0.100 +331 L 0.115 +332 F 0.125 +333 V 0.129 +334 S 0.139 +335 V 0.158 +336 P 0.175 +337 D 0.180 +338 C 0.172 +339 R 0.157 +340 R 0.141 +341 P 0.130 +342 F 0.124 +343 W 0.115 +344 K 0.100 +345 N 0.082 +346 F 0.068 +347 Y 0.057 +348 M 0.053 +349 L 0.055 +350 T 0.061 +351 F 0.066 +352 L 0.070 +353 M 0.076 +354 S 0.082 +355 A 0.087 +356 V 0.092 +357 W 0.098 +358 I 0.094 +359 S 0.078 +360 A 0.063 +361 F 0.058 +362 T 0.060 +363 Y 0.061 +364 V 0.060 +365 L 0.059 +366 V 0.057 +367 W 0.052 +368 M 0.047 +369 V 0.045 +370 T 0.046 +371 I 0.052 +372 V 0.060 +373 G 0.069 +374 E 0.077 +375 T 0.093 +376 L 0.122 +377 G 0.151 +378 I 0.157 +379 P 0.136 +380 D 0.109 +381 T 0.092 +382 V 0.082 +383 M 0.070 +384 G 0.058 +385 M 0.051 +386 T 0.054 +387 L 0.063 +388 L 0.072 +389 A 0.080 +390 A 0.084 +391 G 0.084 +392 T 0.087 +393 S 0.095 +394 I 0.101 +395 P 0.099 +396 D 0.092 +397 T 0.079 +398 V 0.065 +399 A 0.056 +400 S 0.052 +401 V 0.050 +402 M 0.051 +403 V 0.057 +404 A 0.067 +405 R 0.078 +406 E 0.090 +407 G 0.099 +408 K 0.098 +409 S 0.090 +410 D 0.085 +411 M 0.086 +412 A 0.089 +413 M 0.090 +414 S 0.095 +415 N 0.106 +416 I 0.117 +417 V 0.122 +418 G 0.130 +419 S 0.139 +420 N 0.138 +421 V 0.121 +422 F 0.096 +423 D 0.075 +424 M 0.061 +425 L 0.053 +426 C 0.046 +427 L 0.041 +428 G 0.038 +429 L 0.036 +430 P 0.033 +431 W 0.030 +432 F 0.028 +433 I 0.028 +434 Q 0.030 +435 T 0.036 +436 V 0.049 +437 F 0.072 +438 V 0.102 +439 D 0.135 +440 V 0.169 +441 G 0.199 +442 S 0.219 +443 P 0.220 +444 V 0.206 +445 D 0.193 +446 V 0.189 +447 N 0.191 +448 S 0.188 +449 S 0.171 +450 G 0.136 +451 L 0.097 +452 V 0.069 +453 F 0.059 +454 M 0.060 +455 S 0.067 +456 C 0.073 +457 T 0.078 +458 L 0.081 +459 L 0.078 +460 L 0.072 +461 S 0.067 +462 I 0.062 +463 I 0.055 +464 F 0.049 +465 L 0.046 +466 F 0.042 +467 L 0.040 +468 A 0.043 +469 V 0.047 +470 H 0.054 +471 I 0.063 +472 N 0.075 +473 G 0.087 +474 W 0.096 +475 K 0.100 +476 L 0.093 +477 D 0.076 +478 W 0.058 +479 K 0.050 +480 L 0.052 +481 G 0.059 +482 L 0.068 +483 V 0.081 +484 C 0.095 +485 L 0.104 +486 A 0.102 +487 C 0.090 +488 Y 0.073 +489 I 0.059 +490 L 0.054 +491 F 0.060 +492 A 0.071 +493 T 0.078 +494 L 0.076 +495 S 0.070 +496 I 0.068 +497 L 0.072 +498 Y 0.085 +499 E 0.104 +500 L 0.128 +501 G 0.152 +502 I 0.172 +503 I 0.192 +504 G 0.219 +505 N 0.254 +506 N 0.280 +507 P 0.281 +508 I 0.263 +509 R 0.252 +510 S 0.267 +511 C 0.306 +512 S 0.349 +513 D 0.377 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000024771_ENSDART00000033574_GN:slc24a5_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000024771_ENSDART00000033574_GN:slc24a5_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:1.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..76861bd38c1bbbc97b43e724a8b52e17e774f4d9 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000024771_ENSDART00000033574_GN:slc24a5_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:1.caid @@ -0,0 +1,515 @@ +>ENSDARG00000024771|ENSDART00000033574|GN:slc24a5|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:1 +1 M 0.266 +2 M 0.265 +3 R 0.262 +4 T 0.254 +5 D 0.233 +6 V 0.198 +7 F 0.168 +8 L 0.157 +9 Q 0.163 +10 R 0.172 +11 R 0.173 +12 K 0.167 +13 R 0.154 +14 R 0.137 +15 D 0.116 +16 V 0.093 +17 L 0.076 +18 L 0.069 +19 S 0.067 +20 I 0.062 +21 I 0.053 +22 A 0.047 +23 L 0.042 +24 L 0.039 +25 L 0.036 +26 L 0.035 +27 I 0.033 +28 F 0.032 +29 A 0.030 +30 I 0.031 +31 V 0.035 +32 H 0.039 +33 L 0.044 +34 V 0.056 +35 F 0.083 +36 C 0.126 +37 A 0.176 +38 G 0.224 +39 L 0.263 +40 S 0.297 +41 F 0.327 +42 Q 0.353 +43 G 0.375 +44 S 0.386 +45 S 0.378 +46 S 0.352 +47 A 0.326 +48 R 0.313 +49 V 0.305 +50 R 0.300 +51 R 0.314 +52 D 0.355 +53 L 0.406 +54 E 0.441 +55 N 0.458 +56 A 0.457 +57 S 0.437 +58 E 0.409 +59 C 0.386 +60 V 0.376 +61 Q 0.370 +62 P 0.362 +63 Q 0.352 +64 S 0.343 +65 S 0.331 +66 E 0.317 +67 F 0.306 +68 P 0.293 +69 E 0.267 +70 G 0.225 +71 F 0.178 +72 F 0.145 +73 T 0.130 +74 V 0.127 +75 Q 0.122 +76 E 0.110 +77 R 0.101 +78 K 0.101 +79 D 0.105 +80 G 0.101 +81 G 0.088 +82 I 0.071 +83 L 0.054 +84 I 0.044 +85 Y 0.043 +86 F 0.049 +87 M 0.059 +88 I 0.065 +89 I 0.063 +90 F 0.057 +91 Y 0.050 +92 M 0.045 +93 L 0.046 +94 L 0.052 +95 S 0.059 +96 V 0.059 +97 S 0.055 +98 I 0.053 +99 V 0.055 +100 C 0.057 +101 D 0.059 +102 E 0.062 +103 Y 0.063 +104 F 0.059 +105 L 0.053 +106 P 0.047 +107 S 0.043 +108 L 0.037 +109 E 0.032 +110 V 0.030 +111 I 0.030 +112 S 0.033 +113 E 0.042 +114 R 0.061 +115 L 0.086 +116 G 0.102 +117 L 0.100 +118 S 0.084 +119 Q 0.070 +120 D 0.064 +121 V 0.063 +122 A 0.061 +123 G 0.060 +124 A 0.059 +125 T 0.058 +126 F 0.055 +127 M 0.055 +128 A 0.057 +129 A 0.061 +130 G 0.064 +131 S 0.070 +132 S 0.079 +133 A 0.085 +134 P 0.084 +135 E 0.081 +136 L 0.074 +137 V 0.068 +138 T 0.067 +139 A 0.069 +140 F 0.069 +141 L 0.069 +142 G 0.074 +143 V 0.087 +144 F 0.105 +145 V 0.125 +146 T 0.141 +147 K 0.149 +148 G 0.147 +149 D 0.135 +150 I 0.117 +151 G 0.095 +152 V 0.081 +153 S 0.079 +154 T 0.087 +155 I 0.094 +156 M 0.098 +157 G 0.104 +158 S 0.109 +159 A 0.107 +160 V 0.098 +161 Y 0.088 +162 N 0.077 +163 L 0.066 +164 L 0.056 +165 C 0.050 +166 I 0.046 +167 C 0.043 +168 A 0.044 +169 A 0.051 +170 C 0.059 +171 G 0.066 +172 L 0.073 +173 L 0.079 +174 S 0.083 +175 S 0.087 +176 A 0.094 +177 V 0.105 +178 G 0.114 +179 R 0.114 +180 L 0.102 +181 S 0.084 +182 C 0.065 +183 W 0.052 +184 P 0.047 +185 L 0.044 +186 F 0.043 +187 R 0.046 +188 D 0.053 +189 C 0.061 +190 V 0.068 +191 A 0.072 +192 Y 0.074 +193 S 0.073 +194 I 0.070 +195 S 0.065 +196 V 0.060 +197 A 0.055 +198 A 0.051 +199 V 0.050 +200 I 0.056 +201 A 0.072 +202 I 0.092 +203 I 0.107 +204 S 0.112 +205 D 0.118 +206 N 0.130 +207 R 0.136 +208 V 0.122 +209 Y 0.093 +210 W 0.070 +211 Y 0.069 +212 D 0.082 +213 G 0.093 +214 A 0.097 +215 C 0.102 +216 L 0.108 +217 L 0.109 +218 L 0.098 +219 V 0.080 +220 Y 0.061 +221 G 0.049 +222 V 0.046 +223 Y 0.052 +224 V 0.062 +225 A 0.066 +226 V 0.062 +227 L 0.055 +228 C 0.050 +229 F 0.051 +230 D 0.055 +231 L 0.059 +232 K 0.062 +233 I 0.066 +234 S 0.075 +235 E 0.086 +236 Y 0.092 +237 V 0.095 +238 M 0.101 +239 Q 0.117 +240 R 0.145 +241 F 0.180 +242 S 0.213 +243 P 0.229 +244 C 0.225 +245 C 0.214 +246 W 0.219 +247 C 0.255 +248 L 0.319 +249 K 0.398 +250 P 0.478 +251 R 0.545 +252 D 0.588 +253 R 0.609 +254 D 0.619 +255 S 0.622 +256 G 0.618 +257 E 0.606 +258 Q 0.593 +259 Q 0.590 +260 P 0.605 +261 L 0.625 +262 V 0.638 +263 G 0.634 +264 W 0.618 +265 S 0.603 +266 D 0.590 +267 D 0.566 +268 S 0.538 +269 S 0.525 +270 L 0.528 +271 R 0.523 +272 V 0.494 +273 Q 0.473 +274 R 0.494 +275 R 0.538 +276 S 0.569 +277 R 0.589 +278 N 0.616 +279 D 0.646 +280 S 0.669 +281 G 0.683 +282 I 0.686 +283 F 0.678 +284 Q 0.664 +285 D 0.643 +286 D 0.615 +287 S 0.581 +288 G 0.543 +289 Y 0.512 +290 S 0.495 +291 H 0.483 +292 L 0.458 +293 S 0.421 +294 L 0.391 +295 S 0.381 +296 L 0.396 +297 H 0.430 +298 G 0.472 +299 L 0.510 +300 N 0.541 +301 E 0.557 +302 I 0.554 +303 S 0.537 +304 D 0.519 +305 E 0.501 +306 H 0.477 +307 K 0.444 +308 S 0.404 +309 V 0.367 +310 F 0.338 +311 S 0.309 +312 M 0.272 +313 P 0.232 +314 D 0.198 +315 H 0.164 +316 D 0.126 +317 L 0.095 +318 K 0.080 +319 R 0.082 +320 I 0.092 +321 L 0.107 +322 W 0.118 +323 V 0.122 +324 L 0.126 +325 S 0.135 +326 L 0.136 +327 P 0.122 +328 V 0.104 +329 S 0.094 +330 T 0.092 +331 L 0.100 +332 L 0.115 +333 F 0.126 +334 V 0.129 +335 S 0.139 +336 V 0.158 +337 P 0.175 +338 D 0.180 +339 C 0.172 +340 R 0.157 +341 R 0.141 +342 P 0.130 +343 F 0.124 +344 W 0.115 +345 K 0.100 +346 N 0.082 +347 F 0.068 +348 Y 0.057 +349 M 0.053 +350 L 0.055 +351 T 0.061 +352 F 0.066 +353 L 0.070 +354 M 0.076 +355 S 0.082 +356 A 0.087 +357 V 0.092 +358 W 0.098 +359 I 0.094 +360 S 0.078 +361 A 0.063 +362 F 0.058 +363 T 0.060 +364 Y 0.061 +365 V 0.060 +366 L 0.059 +367 V 0.057 +368 W 0.052 +369 M 0.047 +370 V 0.045 +371 T 0.046 +372 I 0.052 +373 V 0.060 +374 G 0.069 +375 E 0.077 +376 T 0.093 +377 L 0.122 +378 G 0.151 +379 I 0.157 +380 P 0.136 +381 D 0.108 +382 T 0.092 +383 V 0.082 +384 M 0.070 +385 G 0.058 +386 M 0.051 +387 T 0.054 +388 L 0.063 +389 L 0.072 +390 A 0.080 +391 A 0.084 +392 G 0.084 +393 T 0.087 +394 S 0.095 +395 I 0.101 +396 P 0.100 +397 D 0.092 +398 T 0.079 +399 V 0.065 +400 A 0.056 +401 S 0.052 +402 V 0.050 +403 M 0.051 +404 V 0.057 +405 A 0.068 +406 R 0.079 +407 E 0.090 +408 G 0.099 +409 K 0.098 +410 S 0.091 +411 D 0.085 +412 M 0.086 +413 A 0.089 +414 M 0.090 +415 S 0.095 +416 N 0.106 +417 I 0.117 +418 V 0.122 +419 G 0.130 +420 S 0.139 +421 N 0.138 +422 V 0.121 +423 F 0.096 +424 D 0.075 +425 M 0.061 +426 L 0.053 +427 C 0.046 +428 L 0.041 +429 G 0.038 +430 L 0.036 +431 P 0.033 +432 W 0.030 +433 F 0.028 +434 I 0.028 +435 Q 0.030 +436 T 0.036 +437 V 0.049 +438 F 0.072 +439 V 0.102 +440 D 0.136 +441 V 0.169 +442 G 0.200 +443 S 0.219 +444 P 0.220 +445 V 0.206 +446 D 0.193 +447 V 0.189 +448 N 0.191 +449 S 0.188 +450 S 0.171 +451 G 0.136 +452 L 0.097 +453 V 0.069 +454 F 0.059 +455 M 0.060 +456 S 0.067 +457 C 0.073 +458 T 0.078 +459 L 0.081 +460 L 0.078 +461 L 0.072 +462 S 0.067 +463 I 0.062 +464 I 0.055 +465 F 0.049 +466 L 0.046 +467 F 0.042 +468 L 0.041 +469 A 0.043 +470 V 0.047 +471 H 0.054 +472 I 0.063 +473 N 0.075 +474 G 0.087 +475 W 0.096 +476 K 0.100 +477 L 0.094 +478 D 0.076 +479 W 0.058 +480 K 0.050 +481 L 0.052 +482 G 0.059 +483 L 0.068 +484 V 0.081 +485 C 0.095 +486 L 0.104 +487 A 0.102 +488 C 0.090 +489 Y 0.073 +490 I 0.059 +491 L 0.054 +492 F 0.060 +493 A 0.071 +494 T 0.078 +495 L 0.076 +496 S 0.070 +497 I 0.068 +498 L 0.072 +499 Y 0.085 +500 E 0.104 +501 L 0.128 +502 G 0.152 +503 I 0.172 +504 I 0.192 +505 G 0.219 +506 N 0.254 +507 N 0.280 +508 P 0.281 +509 I 0.263 +510 R 0.252 +511 S 0.267 +512 C 0.305 +513 S 0.349 +514 D 0.377 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000037318_ENSDART00000124539_GN:ddost_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000037318_ENSDART00000124539_GN:ddost_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..11246419b2b190df4d464fed7711d9976a444955 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000037318_ENSDART00000124539_GN:ddost_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,442 @@ +>ENSDARG00000037318|ENSDART00000124539|GN:ddost|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.355 +2 A 0.360 +3 T 0.386 +4 A 0.433 +5 L 0.473 +6 S 0.488 +7 G 0.482 +8 G 0.455 +9 F 0.400 +10 S 0.334 +11 K 0.283 +12 N 0.253 +13 A 0.230 +14 L 0.206 +15 F 0.192 +16 I 0.194 +17 L 0.206 +18 S 0.228 +19 A 0.254 +20 A 0.272 +21 L 0.279 +22 M 0.284 +23 L 0.298 +24 Q 0.315 +25 A 0.324 +26 V 0.317 +27 L 0.290 +28 G 0.245 +29 D 0.188 +30 G 0.135 +31 K 0.098 +32 T 0.082 +33 L 0.079 +34 V 0.083 +35 L 0.087 +36 L 0.086 +37 D 0.085 +38 N 0.084 +39 P 0.082 +40 N 0.080 +41 I 0.075 +42 R 0.071 +43 D 0.071 +44 T 0.071 +45 H 0.065 +46 S 0.053 +47 I 0.045 +48 F 0.046 +49 F 0.055 +50 R 0.058 +51 S 0.052 +52 L 0.042 +53 A 0.040 +54 D 0.050 +55 R 0.070 +56 G 0.087 +57 F 0.087 +58 D 0.073 +59 L 0.055 +60 T 0.045 +61 F 0.046 +62 K 0.054 +63 T 0.067 +64 A 0.087 +65 D 0.112 +66 D 0.133 +67 P 0.139 +68 G 0.125 +69 L 0.102 +70 S 0.081 +71 L 0.069 +72 L 0.068 +73 K 0.076 +74 Y 0.086 +75 G 0.092 +76 Q 0.090 +77 F 0.081 +78 L 0.071 +79 Y 0.068 +80 D 0.069 +81 H 0.070 +82 L 0.070 +83 I 0.075 +84 L 0.085 +85 F 0.096 +86 S 0.103 +87 P 0.107 +88 S 0.109 +89 V 0.110 +90 E 0.111 +91 D 0.112 +92 F 0.118 +93 G 0.127 +94 G 0.131 +95 N 0.126 +96 I 0.111 +97 N 0.091 +98 V 0.070 +99 E 0.054 +100 T 0.046 +101 I 0.046 +102 T 0.047 +103 A 0.047 +104 F 0.048 +105 I 0.054 +106 D 0.063 +107 G 0.073 +108 G 0.081 +109 G 0.087 +110 N 0.099 +111 V 0.119 +112 L 0.139 +113 V 0.151 +114 A 0.156 +115 A 0.153 +116 S 0.145 +117 S 0.136 +118 D 0.128 +119 I 0.122 +120 G 0.116 +121 D 0.109 +122 P 0.098 +123 L 0.083 +124 R 0.070 +125 E 0.065 +126 L 0.066 +127 G 0.070 +128 S 0.076 +129 E 0.083 +130 C 0.094 +131 G 0.109 +132 I 0.124 +133 E 0.131 +134 F 0.130 +135 D 0.128 +136 E 0.126 +137 E 0.119 +138 K 0.112 +139 T 0.112 +140 A 0.117 +141 V 0.118 +142 I 0.112 +143 D 0.102 +144 H 0.092 +145 H 0.082 +146 N 0.076 +147 Y 0.076 +148 D 0.083 +149 I 0.095 +150 S 0.115 +151 D 0.143 +152 P 0.168 +153 G 0.177 +154 E 0.169 +155 H 0.149 +156 T 0.125 +157 L 0.103 +158 I 0.091 +159 V 0.093 +160 A 0.105 +161 D 0.115 +162 P 0.114 +163 E 0.105 +164 N 0.096 +165 L 0.094 +166 L 0.100 +167 K 0.109 +168 A 0.114 +169 P 0.111 +170 T 0.105 +171 I 0.102 +172 V 0.106 +173 G 0.118 +174 K 0.129 +175 P 0.135 +176 T 0.137 +177 D 0.141 +178 K 0.142 +179 P 0.135 +180 V 0.119 +181 L 0.103 +182 F 0.098 +183 K 0.106 +184 G 0.120 +185 V 0.131 +186 G 0.136 +187 M 0.138 +188 V 0.141 +189 A 0.145 +190 D 0.152 +191 P 0.165 +192 D 0.179 +193 N 0.180 +194 P 0.161 +195 L 0.137 +196 V 0.124 +197 L 0.122 +198 D 0.121 +199 I 0.117 +200 L 0.122 +201 T 0.143 +202 G 0.173 +203 S 0.188 +204 S 0.183 +205 T 0.166 +206 S 0.149 +207 Y 0.131 +208 S 0.112 +209 Y 0.102 +210 F 0.109 +211 P 0.127 +212 D 0.143 +213 R 0.149 +214 P 0.147 +215 I 0.140 +216 T 0.134 +217 Q 0.132 +218 Y 0.133 +219 P 0.132 +220 H 0.131 +221 A 0.134 +222 V 0.138 +223 G 0.140 +224 K 0.134 +225 N 0.119 +226 T 0.107 +227 L 0.106 +228 L 0.115 +229 I 0.125 +230 A 0.133 +231 G 0.143 +232 L 0.158 +233 Q 0.174 +234 A 0.186 +235 R 0.186 +236 N 0.175 +237 N 0.161 +238 A 0.155 +239 R 0.162 +240 V 0.177 +241 V 0.193 +242 F 0.206 +243 S 0.214 +244 G 0.209 +245 S 0.193 +246 L 0.174 +247 H 0.155 +248 F 0.132 +249 F 0.108 +250 S 0.093 +251 D 0.090 +252 A 0.096 +253 F 0.104 +254 F 0.113 +255 N 0.127 +256 S 0.142 +257 A 0.149 +258 V 0.149 +259 Q 0.148 +260 K 0.155 +261 A 0.170 +262 A 0.184 +263 T 0.195 +264 G 0.203 +265 S 0.207 +266 K 0.202 +267 R 0.190 +268 Y 0.176 +269 E 0.162 +270 Q 0.145 +271 T 0.124 +272 G 0.108 +273 N 0.100 +274 Q 0.096 +275 D 0.093 +276 L 0.090 +277 A 0.087 +278 E 0.083 +279 A 0.081 +280 L 0.081 +281 S 0.075 +282 R 0.062 +283 W 0.050 +284 V 0.045 +285 F 0.048 +286 K 0.060 +287 E 0.073 +288 A 0.082 +289 G 0.086 +290 V 0.086 +291 L 0.084 +292 R 0.082 +293 V 0.083 +294 G 0.083 +295 D 0.077 +296 V 0.066 +297 T 0.061 +298 H 0.068 +299 H 0.086 +300 P 0.108 +301 V 0.123 +302 G 0.124 +303 E 0.120 +304 S 0.122 +305 T 0.132 +306 P 0.140 +307 P 0.141 +308 A 0.132 +309 A 0.118 +310 Y 0.102 +311 T 0.090 +312 V 0.087 +313 T 0.091 +314 D 0.090 +315 L 0.079 +316 V 0.062 +317 E 0.049 +318 Y 0.044 +319 G 0.046 +320 I 0.051 +321 V 0.056 +322 I 0.061 +323 E 0.065 +324 M 0.071 +325 L 0.082 +326 S 0.102 +327 G 0.121 +328 G 0.128 +329 K 0.120 +330 W 0.103 +331 V 0.089 +332 P 0.081 +333 F 0.081 +334 D 0.091 +335 G 0.109 +336 D 0.123 +337 D 0.119 +338 I 0.101 +339 Q 0.085 +340 L 0.081 +341 E 0.087 +342 F 0.093 +343 V 0.096 +344 R 0.099 +345 I 0.107 +346 D 0.115 +347 P 0.117 +348 F 0.111 +349 V 0.103 +350 R 0.098 +351 T 0.095 +352 Y 0.092 +353 L 0.090 +354 K 0.087 +355 K 0.086 +356 N 0.087 +357 G 0.086 +358 G 0.077 +359 K 0.061 +360 Y 0.045 +361 S 0.037 +362 V 0.040 +363 Q 0.053 +364 F 0.076 +365 K 0.107 +366 L 0.135 +367 P 0.152 +368 D 0.157 +369 V 0.159 +370 Y 0.158 +371 G 0.152 +372 V 0.137 +373 F 0.118 +374 Q 0.101 +375 F 0.092 +376 K 0.093 +377 V 0.098 +378 D 0.100 +379 Y 0.102 +380 N 0.104 +381 R 0.108 +382 L 0.112 +383 G 0.114 +384 Y 0.116 +385 T 0.116 +386 H 0.117 +387 L 0.117 +388 Y 0.115 +389 S 0.114 +390 S 0.113 +391 T 0.112 +392 Q 0.108 +393 V 0.108 +394 S 0.118 +395 V 0.140 +396 R 0.170 +397 P 0.202 +398 L 0.229 +399 Q 0.249 +400 H 0.262 +401 T 0.268 +402 Q 0.278 +403 Y 0.297 +404 E 0.321 +405 R 0.337 +406 F 0.340 +407 I 0.331 +408 P 0.305 +409 S 0.267 +410 A 0.233 +411 F 0.209 +412 P 0.197 +413 Y 0.199 +414 Y 0.213 +415 A 0.233 +416 S 0.247 +417 A 0.256 +418 F 0.270 +419 S 0.282 +420 M 0.285 +421 M 0.281 +422 A 0.269 +423 G 0.243 +424 L 0.208 +425 F 0.179 +426 V 0.159 +427 F 0.141 +428 S 0.127 +429 V 0.127 +430 V 0.142 +431 F 0.161 +432 L 0.183 +433 H 0.217 +434 M 0.266 +435 R 0.326 +436 E 0.391 +437 K 0.451 +438 E 0.493 +439 K 0.508 +440 S 0.497 +441 D 0.480 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000037318_ENSDART00000124539_GN:ddost_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:25.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000037318_ENSDART00000124539_GN:ddost_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:25.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..61fea63e832710268544ca004fb01cfc58b875f6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000037318_ENSDART00000124539_GN:ddost_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:25.caid @@ -0,0 +1,467 @@ +>ENSDARG00000037318|ENSDART00000124539|GN:ddost|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:25 +1 M 0.354 +2 A 0.378 +3 T 0.419 +4 D 0.446 +5 C 0.427 +6 L 0.384 +7 S 0.373 +8 V 0.394 +9 R 0.401 +10 E 0.398 +11 T 0.416 +12 A 0.455 +13 T 0.499 +14 P 0.542 +15 A 0.573 +16 T 0.582 +17 L 0.572 +18 T 0.545 +19 C 0.496 +20 K 0.433 +21 R 0.391 +22 R 0.387 +23 R 0.404 +24 T 0.441 +25 T 0.497 +26 M 0.533 +27 A 0.525 +28 T 0.505 +29 A 0.514 +30 L 0.542 +31 S 0.560 +32 G 0.552 +33 G 0.514 +34 F 0.447 +35 S 0.368 +36 K 0.304 +37 N 0.262 +38 A 0.233 +39 L 0.210 +40 F 0.200 +41 I 0.205 +42 L 0.222 +43 S 0.246 +44 A 0.272 +45 A 0.287 +46 L 0.290 +47 M 0.291 +48 L 0.298 +49 Q 0.308 +50 A 0.313 +51 V 0.305 +52 L 0.281 +53 G 0.239 +54 D 0.185 +55 G 0.133 +56 K 0.097 +57 T 0.081 +58 L 0.078 +59 V 0.082 +60 L 0.086 +61 L 0.084 +62 D 0.081 +63 N 0.079 +64 P 0.077 +65 N 0.075 +66 I 0.071 +67 R 0.068 +68 D 0.068 +69 T 0.069 +70 H 0.063 +71 S 0.051 +72 I 0.043 +73 F 0.042 +74 F 0.047 +75 R 0.049 +76 S 0.044 +77 L 0.037 +78 A 0.036 +79 D 0.046 +80 R 0.066 +81 G 0.082 +82 F 0.083 +83 D 0.069 +84 L 0.052 +85 T 0.042 +86 F 0.043 +87 K 0.050 +88 T 0.063 +89 A 0.082 +90 D 0.106 +91 D 0.127 +92 P 0.132 +93 G 0.119 +94 L 0.096 +95 S 0.077 +96 L 0.066 +97 L 0.065 +98 K 0.073 +99 Y 0.082 +100 G 0.088 +101 Q 0.086 +102 F 0.078 +103 L 0.068 +104 Y 0.066 +105 D 0.068 +106 H 0.069 +107 L 0.070 +108 I 0.075 +109 L 0.085 +110 F 0.095 +111 S 0.102 +112 P 0.105 +113 S 0.107 +114 V 0.110 +115 E 0.111 +116 D 0.113 +117 F 0.118 +118 G 0.127 +119 G 0.131 +120 N 0.127 +121 I 0.113 +122 N 0.093 +123 V 0.072 +124 E 0.056 +125 T 0.047 +126 I 0.046 +127 T 0.046 +128 A 0.045 +129 F 0.047 +130 I 0.053 +131 D 0.064 +132 G 0.074 +133 G 0.082 +134 G 0.088 +135 N 0.101 +136 V 0.121 +137 L 0.140 +138 V 0.153 +139 A 0.156 +140 A 0.153 +141 S 0.146 +142 S 0.138 +143 D 0.133 +144 I 0.129 +145 G 0.123 +146 D 0.115 +147 P 0.103 +148 L 0.086 +149 R 0.072 +150 E 0.066 +151 L 0.067 +152 G 0.071 +153 S 0.076 +154 E 0.083 +155 C 0.094 +156 G 0.109 +157 I 0.124 +158 E 0.131 +159 F 0.131 +160 D 0.130 +161 E 0.128 +162 E 0.121 +163 K 0.113 +164 T 0.112 +165 A 0.117 +166 V 0.118 +167 I 0.112 +168 D 0.102 +169 H 0.091 +170 H 0.082 +171 N 0.075 +172 Y 0.075 +173 D 0.082 +174 I 0.095 +175 S 0.115 +176 D 0.143 +177 P 0.168 +178 G 0.177 +179 E 0.168 +180 H 0.148 +181 T 0.124 +182 L 0.102 +183 I 0.090 +184 V 0.093 +185 A 0.105 +186 D 0.114 +187 P 0.114 +188 E 0.105 +189 N 0.096 +190 L 0.093 +191 L 0.099 +192 K 0.109 +193 A 0.114 +194 P 0.112 +195 T 0.106 +196 I 0.103 +197 V 0.106 +198 G 0.117 +199 K 0.128 +200 P 0.133 +201 T 0.135 +202 D 0.139 +203 K 0.142 +204 P 0.134 +205 V 0.119 +206 L 0.104 +207 F 0.099 +208 K 0.107 +209 G 0.121 +210 V 0.133 +211 G 0.139 +212 M 0.140 +213 V 0.143 +214 A 0.147 +215 D 0.153 +216 P 0.165 +217 D 0.179 +218 N 0.181 +219 P 0.162 +220 L 0.138 +221 V 0.124 +222 L 0.122 +223 D 0.120 +224 I 0.116 +225 L 0.121 +226 T 0.143 +227 G 0.173 +228 S 0.188 +229 S 0.182 +230 T 0.166 +231 S 0.149 +232 Y 0.130 +233 S 0.111 +234 Y 0.101 +235 F 0.107 +236 P 0.125 +237 D 0.141 +238 R 0.147 +239 P 0.146 +240 I 0.140 +241 T 0.135 +242 Q 0.134 +243 Y 0.135 +244 P 0.135 +245 H 0.133 +246 A 0.136 +247 V 0.140 +248 G 0.142 +249 K 0.135 +250 N 0.121 +251 T 0.108 +252 L 0.107 +253 L 0.117 +254 I 0.127 +255 A 0.134 +256 G 0.144 +257 L 0.159 +258 Q 0.176 +259 A 0.188 +260 R 0.188 +261 N 0.177 +262 N 0.163 +263 A 0.157 +264 R 0.164 +265 V 0.179 +266 V 0.195 +267 F 0.208 +268 S 0.216 +269 G 0.211 +270 S 0.195 +271 L 0.176 +272 H 0.157 +273 F 0.133 +274 F 0.110 +275 S 0.094 +276 D 0.090 +277 A 0.096 +278 F 0.105 +279 F 0.114 +280 N 0.129 +281 S 0.144 +282 A 0.152 +283 V 0.151 +284 Q 0.150 +285 K 0.156 +286 A 0.170 +287 A 0.185 +288 T 0.196 +289 G 0.204 +290 S 0.209 +291 K 0.204 +292 R 0.192 +293 Y 0.179 +294 E 0.166 +295 Q 0.148 +296 T 0.127 +297 G 0.111 +298 N 0.102 +299 Q 0.098 +300 D 0.094 +301 L 0.091 +302 A 0.088 +303 E 0.084 +304 A 0.082 +305 L 0.082 +306 S 0.076 +307 R 0.063 +308 W 0.051 +309 V 0.045 +310 F 0.049 +311 K 0.061 +312 E 0.075 +313 A 0.084 +314 G 0.088 +315 V 0.088 +316 L 0.086 +317 R 0.084 +318 V 0.085 +319 G 0.085 +320 D 0.079 +321 V 0.068 +322 T 0.062 +323 H 0.069 +324 H 0.087 +325 P 0.110 +326 V 0.124 +327 G 0.125 +328 E 0.121 +329 S 0.123 +330 T 0.133 +331 P 0.143 +332 P 0.143 +333 A 0.135 +334 A 0.120 +335 Y 0.104 +336 T 0.091 +337 V 0.089 +338 T 0.093 +339 D 0.092 +340 L 0.081 +341 V 0.064 +342 E 0.050 +343 Y 0.045 +344 G 0.047 +345 I 0.052 +346 V 0.057 +347 I 0.062 +348 E 0.066 +349 M 0.072 +350 L 0.083 +351 S 0.103 +352 G 0.121 +353 G 0.126 +354 K 0.118 +355 W 0.102 +356 V 0.088 +357 P 0.081 +358 F 0.082 +359 D 0.092 +360 G 0.110 +361 D 0.123 +362 D 0.119 +363 I 0.101 +364 Q 0.086 +365 L 0.082 +366 E 0.087 +367 F 0.093 +368 V 0.097 +369 R 0.100 +370 I 0.108 +371 D 0.116 +372 P 0.118 +373 F 0.111 +374 V 0.103 +375 R 0.099 +376 T 0.096 +377 Y 0.093 +378 L 0.090 +379 K 0.088 +380 K 0.086 +381 N 0.087 +382 G 0.087 +383 G 0.078 +384 K 0.061 +385 Y 0.045 +386 S 0.037 +387 V 0.040 +388 Q 0.053 +389 F 0.077 +390 K 0.108 +391 L 0.137 +392 P 0.155 +393 D 0.160 +394 V 0.162 +395 Y 0.161 +396 G 0.154 +397 V 0.139 +398 F 0.120 +399 Q 0.102 +400 F 0.093 +401 K 0.094 +402 V 0.098 +403 D 0.101 +404 Y 0.102 +405 N 0.105 +406 R 0.109 +407 L 0.114 +408 G 0.117 +409 Y 0.118 +410 T 0.119 +411 H 0.120 +412 L 0.119 +413 Y 0.117 +414 S 0.115 +415 S 0.115 +416 T 0.113 +417 Q 0.109 +418 V 0.110 +419 S 0.121 +420 V 0.143 +421 R 0.173 +422 P 0.205 +423 L 0.232 +424 Q 0.252 +425 H 0.264 +426 T 0.271 +427 Q 0.281 +428 Y 0.301 +429 E 0.325 +430 R 0.340 +431 F 0.342 +432 I 0.332 +433 P 0.306 +434 S 0.269 +435 A 0.234 +436 F 0.210 +437 P 0.199 +438 Y 0.200 +439 Y 0.216 +440 A 0.237 +441 S 0.251 +442 A 0.261 +443 F 0.275 +444 S 0.288 +445 M 0.292 +446 M 0.288 +447 A 0.276 +448 G 0.248 +449 L 0.212 +450 F 0.183 +451 V 0.163 +452 F 0.144 +453 S 0.129 +454 V 0.129 +455 V 0.142 +456 F 0.160 +457 L 0.182 +458 H 0.216 +459 M 0.266 +460 R 0.327 +461 E 0.395 +462 K 0.458 +463 E 0.503 +464 K 0.520 +465 S 0.511 +466 D 0.495 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000040008_ENSDART00000058530_GN:neurod6a_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000040008_ENSDART00000058530_GN:neurod6a_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..3fd48cddfaf998621425deb5b9c1cd77518ac14c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000040008_ENSDART00000058530_GN:neurod6a_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,328 @@ +>ENSDARG00000040008|ENSDART00000058530|GN:neurod6a|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.475 +2 L 0.512 +3 T 0.563 +4 L 0.605 +5 P 0.628 +6 F 0.637 +7 E 0.649 +8 D 0.672 +9 P 0.700 +10 V 0.723 +11 I 0.739 +12 M 0.750 +13 D 0.754 +14 T 0.753 +15 Q 0.748 +16 F 0.747 +17 G 0.744 +18 A 0.733 +19 N 0.717 +20 F 0.709 +21 P 0.721 +22 R 0.746 +23 D 0.771 +24 C 0.787 +25 V 0.799 +26 G 0.810 +27 D 0.818 +28 L 0.820 +29 K 0.819 +30 G 0.816 +31 N 0.808 +32 K 0.794 +33 Q 0.782 +34 E 0.777 +35 P 0.778 +36 F 0.782 +37 E 0.790 +38 K 0.797 +39 E 0.800 +40 E 0.796 +41 T 0.786 +42 L 0.772 +43 S 0.759 +44 H 0.755 +45 V 0.760 +46 M 0.771 +47 D 0.779 +48 D 0.781 +49 D 0.776 +50 D 0.769 +51 S 0.767 +52 E 0.773 +53 K 0.781 +54 D 0.785 +55 E 0.783 +56 D 0.781 +57 E 0.783 +58 R 0.793 +59 E 0.806 +60 D 0.816 +61 G 0.816 +62 Q 0.809 +63 D 0.800 +64 E 0.790 +65 N 0.780 +66 G 0.771 +67 L 0.766 +68 P 0.766 +69 R 0.768 +70 R 0.763 +71 R 0.751 +72 G 0.738 +73 P 0.728 +74 R 0.718 +75 K 0.703 +76 K 0.672 +77 K 0.617 +78 M 0.545 +79 T 0.475 +80 K 0.417 +81 A 0.368 +82 R 0.326 +83 V 0.295 +84 D 0.282 +85 R 0.276 +86 V 0.262 +87 K 0.242 +88 V 0.232 +89 R 0.242 +90 R 0.256 +91 M 0.260 +92 E 0.251 +93 A 0.243 +94 N 0.244 +95 A 0.254 +96 R 0.265 +97 E 0.273 +98 R 0.277 +99 N 0.279 +100 R 0.279 +101 M 0.279 +102 H 0.284 +103 G 0.290 +104 L 0.276 +105 N 0.241 +106 N 0.201 +107 A 0.171 +108 L 0.148 +109 D 0.134 +110 S 0.129 +111 L 0.126 +112 R 0.122 +113 K 0.119 +114 V 0.116 +115 V 0.109 +116 P 0.107 +117 C 0.120 +118 Y 0.141 +119 S 0.159 +120 K 0.167 +121 T 0.171 +122 Q 0.177 +123 K 0.177 +124 L 0.162 +125 S 0.132 +126 K 0.103 +127 I 0.091 +128 E 0.096 +129 T 0.106 +130 L 0.113 +131 R 0.121 +132 L 0.133 +133 A 0.132 +134 K 0.107 +135 N 0.074 +136 Y 0.053 +137 I 0.044 +138 W 0.039 +139 A 0.039 +140 L 0.041 +141 S 0.044 +142 E 0.046 +143 I 0.049 +144 L 0.058 +145 S 0.074 +146 T 0.091 +147 G 0.102 +148 K 0.107 +149 R 0.103 +150 P 0.090 +151 D 0.074 +152 L 0.062 +153 L 0.053 +154 T 0.045 +155 F 0.039 +156 V 0.036 +157 Q 0.036 +158 T 0.039 +159 L 0.048 +160 C 0.065 +161 K 0.089 +162 G 0.112 +163 L 0.121 +164 S 0.116 +165 Q 0.104 +166 P 0.091 +167 T 0.079 +168 T 0.071 +169 N 0.073 +170 L 0.082 +171 V 0.093 +172 A 0.103 +173 G 0.114 +174 C 0.123 +175 L 0.129 +176 Q 0.132 +177 L 0.138 +178 N 0.152 +179 A 0.178 +180 R 0.212 +181 N 0.254 +182 F 0.319 +183 I 0.414 +184 P 0.526 +185 D 0.623 +186 Q 0.685 +187 I 0.718 +188 S 0.739 +189 G 0.758 +190 E 0.768 +191 A 0.767 +192 S 0.756 +193 F 0.745 +194 S 0.731 +195 G 0.707 +196 R 0.673 +197 S 0.642 +198 P 0.631 +199 Y 0.647 +200 E 0.674 +201 S 0.677 +202 V 0.634 +203 Y 0.572 +204 S 0.552 +205 T 0.597 +206 Y 0.663 +207 H 0.712 +208 S 0.747 +209 P 0.782 +210 S 0.813 +211 V 0.830 +212 V 0.831 +213 T 0.826 +214 P 0.822 +215 S 0.823 +216 G 0.828 +217 P 0.836 +218 S 0.843 +219 V 0.846 +220 D 0.842 +221 A 0.830 +222 V 0.816 +223 K 0.808 +224 P 0.813 +225 F 0.824 +226 R 0.829 +227 S 0.822 +228 F 0.810 +229 N 0.799 +230 Y 0.792 +231 C 0.791 +232 S 0.792 +233 S 0.792 +234 Y 0.789 +235 E 0.784 +236 S 0.777 +237 F 0.772 +238 Y 0.774 +239 E 0.782 +240 S 0.783 +241 V 0.776 +242 S 0.775 +243 P 0.788 +244 E 0.808 +245 C 0.819 +246 G 0.819 +247 S 0.814 +248 P 0.812 +249 Q 0.812 +250 F 0.809 +251 E 0.803 +252 G 0.796 +253 P 0.787 +254 L 0.771 +255 S 0.755 +256 P 0.748 +257 P 0.750 +258 I 0.749 +259 N 0.746 +260 F 0.753 +261 N 0.770 +262 G 0.785 +263 I 0.792 +264 F 0.797 +265 S 0.802 +266 L 0.801 +267 K 0.793 +268 H 0.782 +269 E 0.775 +270 E 0.778 +271 P 0.790 +272 V 0.805 +273 E 0.817 +274 Y 0.824 +275 G 0.827 +276 K 0.822 +277 S 0.808 +278 C 0.793 +279 H 0.788 +280 Y 0.795 +281 G 0.809 +282 T 0.819 +283 R 0.820 +284 Y 0.813 +285 C 0.801 +286 A 0.788 +287 V 0.780 +288 P 0.787 +289 P 0.811 +290 R 0.839 +291 A 0.861 +292 S 0.870 +293 I 0.869 +294 G 0.864 +295 Q 0.862 +296 S 0.861 +297 A 0.860 +298 R 0.859 +299 G 0.855 +300 S 0.846 +301 S 0.828 +302 D 0.802 +303 L 0.773 +304 H 0.750 +305 F 0.742 +306 P 0.751 +307 Y 0.769 +308 D 0.780 +309 I 0.777 +310 H 0.770 +311 L 0.769 +312 R 0.771 +313 G 0.763 +314 Q 0.745 +315 F 0.728 +316 Y 0.730 +317 P 0.752 +318 V 0.779 +319 Q 0.794 +320 D 0.797 +321 E 0.790 +322 L 0.780 +323 N 0.766 +324 T 0.743 +325 F 0.693 +326 H 0.617 +327 N 0.552 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000040008_ENSDART00000058530_GN:neurod6a_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:64.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000040008_ENSDART00000058530_GN:neurod6a_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:64.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6c5023f2c5cc88d7f35e7b9cd1ccdd727dc4b70a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000040008_ENSDART00000058530_GN:neurod6a_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:64.caid @@ -0,0 +1,392 @@ +>ENSDARG00000040008|ENSDART00000058530|GN:neurod6a|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:64 +1 M 0.442 +2 A 0.481 +3 W 0.544 +4 V 0.613 +5 P 0.666 +6 A 0.694 +7 L 0.709 +8 A 0.725 +9 V 0.741 +10 G 0.750 +11 I 0.757 +12 S 0.763 +13 V 0.760 +14 I 0.747 +15 S 0.737 +16 L 0.741 +17 S 0.753 +18 A 0.760 +19 R 0.763 +20 Q 0.769 +21 G 0.777 +22 E 0.781 +23 Q 0.780 +24 W 0.779 +25 G 0.779 +26 G 0.775 +27 E 0.762 +28 K 0.741 +29 T 0.721 +30 A 0.704 +31 R 0.684 +32 A 0.645 +33 V 0.591 +34 H 0.568 +35 L 0.601 +36 L 0.656 +37 K 0.693 +38 H 0.712 +39 H 0.728 +40 A 0.746 +41 G 0.764 +42 K 0.778 +43 K 0.789 +44 K 0.796 +45 V 0.801 +46 Q 0.801 +47 N 0.796 +48 R 0.788 +49 K 0.782 +50 Y 0.784 +51 E 0.792 +52 N 0.798 +53 C 0.799 +54 H 0.799 +55 L 0.802 +56 T 0.811 +57 P 0.825 +58 S 0.839 +59 Y 0.849 +60 S 0.855 +61 S 0.862 +62 K 0.869 +63 S 0.874 +64 T 0.875 +65 M 0.869 +66 L 0.859 +67 T 0.846 +68 L 0.833 +69 P 0.822 +70 F 0.817 +71 E 0.818 +72 D 0.829 +73 P 0.844 +74 V 0.858 +75 I 0.864 +76 M 0.864 +77 D 0.860 +78 T 0.856 +79 Q 0.851 +80 F 0.849 +81 G 0.845 +82 A 0.835 +83 N 0.820 +84 F 0.811 +85 P 0.818 +86 R 0.836 +87 D 0.855 +88 C 0.866 +89 V 0.869 +90 G 0.870 +91 D 0.870 +92 L 0.867 +93 K 0.863 +94 G 0.858 +95 N 0.849 +96 K 0.836 +97 Q 0.824 +98 E 0.817 +99 P 0.814 +100 F 0.816 +101 E 0.822 +102 K 0.825 +103 E 0.823 +104 E 0.817 +105 T 0.808 +106 L 0.798 +107 S 0.792 +108 H 0.792 +109 V 0.794 +110 M 0.797 +111 D 0.798 +112 D 0.793 +113 D 0.783 +114 D 0.772 +115 S 0.767 +116 E 0.770 +117 K 0.776 +118 D 0.779 +119 E 0.776 +120 D 0.772 +121 E 0.772 +122 R 0.781 +123 E 0.796 +124 D 0.807 +125 G 0.809 +126 Q 0.801 +127 D 0.790 +128 E 0.777 +129 N 0.765 +130 G 0.757 +131 L 0.753 +132 P 0.755 +133 R 0.758 +134 R 0.753 +135 R 0.742 +136 G 0.729 +137 P 0.720 +138 R 0.713 +139 K 0.701 +140 K 0.674 +141 K 0.626 +142 M 0.559 +143 T 0.485 +144 K 0.415 +145 A 0.354 +146 R 0.304 +147 V 0.266 +148 D 0.246 +149 R 0.237 +150 V 0.226 +151 K 0.210 +152 V 0.200 +153 R 0.205 +154 R 0.216 +155 M 0.220 +156 E 0.214 +157 A 0.209 +158 N 0.213 +159 A 0.225 +160 R 0.239 +161 E 0.249 +162 R 0.252 +163 N 0.255 +164 R 0.257 +165 M 0.260 +166 H 0.268 +167 G 0.276 +168 L 0.265 +169 N 0.233 +170 N 0.198 +171 A 0.169 +172 L 0.148 +173 D 0.135 +174 S 0.129 +175 L 0.124 +176 R 0.119 +177 K 0.119 +178 V 0.117 +179 V 0.110 +180 P 0.108 +181 C 0.119 +182 Y 0.138 +183 S 0.154 +184 K 0.162 +185 T 0.169 +186 Q 0.180 +187 K 0.185 +188 L 0.169 +189 S 0.136 +190 K 0.103 +191 I 0.088 +192 E 0.093 +193 T 0.103 +194 L 0.110 +195 R 0.118 +196 L 0.129 +197 A 0.127 +198 K 0.102 +199 N 0.070 +200 Y 0.049 +201 I 0.040 +202 W 0.036 +203 A 0.035 +204 L 0.038 +205 S 0.039 +206 E 0.040 +207 I 0.042 +208 L 0.049 +209 S 0.062 +210 T 0.077 +211 G 0.087 +212 K 0.091 +213 R 0.087 +214 P 0.076 +215 D 0.063 +216 L 0.053 +217 L 0.047 +218 T 0.041 +219 F 0.036 +220 V 0.034 +221 Q 0.034 +222 T 0.035 +223 L 0.041 +224 C 0.056 +225 K 0.078 +226 G 0.099 +227 L 0.108 +228 S 0.102 +229 Q 0.091 +230 P 0.080 +231 T 0.069 +232 T 0.063 +233 N 0.065 +234 L 0.073 +235 V 0.082 +236 A 0.091 +237 G 0.099 +238 C 0.105 +239 L 0.108 +240 Q 0.109 +241 L 0.114 +242 N 0.129 +243 A 0.155 +244 R 0.190 +245 N 0.234 +246 F 0.301 +247 I 0.397 +248 P 0.505 +249 D 0.598 +250 Q 0.661 +251 I 0.697 +252 S 0.724 +253 G 0.746 +254 E 0.759 +255 A 0.758 +256 S 0.749 +257 F 0.738 +258 S 0.723 +259 G 0.699 +260 R 0.665 +261 S 0.637 +262 P 0.627 +263 Y 0.642 +264 E 0.668 +265 S 0.671 +266 V 0.629 +267 Y 0.568 +268 S 0.549 +269 T 0.594 +270 Y 0.660 +271 H 0.709 +272 S 0.747 +273 P 0.783 +274 S 0.814 +275 V 0.832 +276 V 0.834 +277 T 0.830 +278 P 0.827 +279 S 0.828 +280 G 0.834 +281 P 0.843 +282 S 0.850 +283 V 0.852 +284 D 0.847 +285 A 0.835 +286 V 0.820 +287 K 0.812 +288 P 0.816 +289 F 0.827 +290 R 0.834 +291 S 0.829 +292 F 0.818 +293 N 0.809 +294 Y 0.805 +295 C 0.806 +296 S 0.808 +297 S 0.807 +298 Y 0.804 +299 E 0.800 +300 S 0.796 +301 F 0.792 +302 Y 0.796 +303 E 0.804 +304 S 0.808 +305 V 0.802 +306 S 0.800 +307 P 0.812 +308 E 0.830 +309 C 0.841 +310 G 0.840 +311 S 0.834 +312 P 0.831 +313 Q 0.830 +314 F 0.827 +315 E 0.822 +316 G 0.815 +317 P 0.805 +318 L 0.789 +319 S 0.773 +320 P 0.766 +321 P 0.768 +322 I 0.768 +323 N 0.766 +324 F 0.772 +325 N 0.789 +326 G 0.803 +327 I 0.810 +328 F 0.815 +329 S 0.820 +330 L 0.821 +331 K 0.814 +332 H 0.804 +333 E 0.799 +334 E 0.802 +335 P 0.813 +336 V 0.826 +337 E 0.836 +338 Y 0.843 +339 G 0.847 +340 K 0.843 +341 S 0.831 +342 C 0.817 +343 H 0.811 +344 Y 0.816 +345 G 0.828 +346 T 0.837 +347 R 0.837 +348 Y 0.828 +349 C 0.816 +350 A 0.805 +351 V 0.799 +352 P 0.805 +353 P 0.826 +354 R 0.853 +355 A 0.873 +356 S 0.882 +357 I 0.881 +358 G 0.877 +359 Q 0.874 +360 S 0.871 +361 A 0.869 +362 R 0.866 +363 G 0.863 +364 S 0.854 +365 S 0.837 +366 D 0.812 +367 L 0.784 +368 H 0.764 +369 F 0.757 +370 P 0.767 +371 Y 0.783 +372 D 0.793 +373 I 0.790 +374 H 0.783 +375 L 0.781 +376 R 0.782 +377 G 0.773 +378 Q 0.752 +379 F 0.734 +380 Y 0.735 +381 P 0.757 +382 V 0.783 +383 Q 0.799 +384 D 0.801 +385 E 0.796 +386 L 0.787 +387 N 0.773 +388 T 0.749 +389 F 0.699 +390 H 0.621 +391 N 0.555 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000041503_ENSDART00000060840_GN:med4_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000041503_ENSDART00000060840_GN:med4_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a27fa9b51e6a8b1857f2200291439d2068652883 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000041503_ENSDART00000060840_GN:med4_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,255 @@ +>ENSDARG00000041503|ENSDART00000060840|GN:med4|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.479 +2 A 0.517 +3 A 0.564 +4 A 0.591 +5 A 0.586 +6 A 0.543 +7 D 0.456 +8 K 0.338 +9 S 0.225 +10 T 0.149 +11 K 0.115 +12 E 0.105 +13 R 0.096 +14 L 0.083 +15 L 0.073 +16 S 0.067 +17 T 0.064 +18 L 0.067 +19 D 0.075 +20 D 0.077 +21 L 0.070 +22 E 0.062 +23 V 0.059 +24 L 0.057 +25 S 0.056 +26 R 0.055 +27 E 0.052 +28 L 0.050 +29 I 0.052 +30 E 0.057 +31 M 0.062 +32 L 0.068 +33 A 0.081 +34 L 0.103 +35 S 0.132 +36 R 0.162 +37 S 0.187 +38 Q 0.209 +39 K 0.235 +40 L 0.260 +41 P 0.272 +42 P 0.264 +43 P 0.241 +44 G 0.209 +45 E 0.173 +46 D 0.140 +47 T 0.112 +48 L 0.094 +49 I 0.086 +50 L 0.087 +51 E 0.088 +52 L 0.085 +53 L 0.081 +54 I 0.077 +55 Q 0.076 +56 R 0.080 +57 D 0.090 +58 K 0.096 +59 E 0.096 +60 F 0.097 +61 Q 0.103 +62 E 0.102 +63 L 0.097 +64 M 0.096 +65 Q 0.099 +66 T 0.104 +67 A 0.116 +68 L 0.135 +69 E 0.150 +70 Q 0.153 +71 G 0.146 +72 R 0.134 +73 V 0.126 +74 H 0.134 +75 Q 0.154 +76 E 0.169 +77 M 0.170 +78 Q 0.167 +79 S 0.172 +80 L 0.188 +81 E 0.211 +82 K 0.238 +83 E 0.259 +84 V 0.267 +85 E 0.263 +86 K 0.252 +87 R 0.244 +88 D 0.251 +89 S 0.270 +90 D 0.286 +91 I 0.286 +92 Q 0.277 +93 Q 0.266 +94 L 0.253 +95 Q 0.247 +96 K 0.254 +97 Q 0.263 +98 L 0.264 +99 K 0.262 +100 E 0.256 +101 A 0.240 +102 E 0.223 +103 H 0.216 +104 I 0.211 +105 L 0.202 +106 A 0.197 +107 T 0.194 +108 A 0.186 +109 V 0.175 +110 Y 0.170 +111 Q 0.173 +112 A 0.173 +113 K 0.168 +114 E 0.159 +115 K 0.151 +116 L 0.148 +117 K 0.152 +118 S 0.156 +119 I 0.157 +120 D 0.167 +121 K 0.190 +122 A 0.218 +123 R 0.245 +124 K 0.276 +125 G 0.307 +126 S 0.324 +127 I 0.311 +128 S 0.271 +129 S 0.223 +130 E 0.188 +131 E 0.170 +132 I 0.160 +133 I 0.153 +134 K 0.155 +135 Y 0.164 +136 A 0.167 +137 H 0.162 +138 R 0.165 +139 I 0.190 +140 S 0.228 +141 A 0.263 +142 S 0.289 +143 N 0.318 +144 A 0.359 +145 V 0.408 +146 C 0.460 +147 A 0.511 +148 P 0.548 +149 L 0.554 +150 N 0.518 +151 W 0.466 +152 V 0.435 +153 P 0.428 +154 G 0.420 +155 D 0.399 +156 P 0.371 +157 R 0.352 +158 R 0.362 +159 P 0.403 +160 Y 0.449 +161 P 0.467 +162 T 0.453 +163 D 0.428 +164 L 0.411 +165 E 0.399 +166 M 0.386 +167 R 0.378 +168 S 0.386 +169 G 0.414 +170 M 0.454 +171 L 0.500 +172 G 0.556 +173 N 0.617 +174 M 0.667 +175 S 0.696 +176 N 0.713 +177 M 0.728 +178 S 0.743 +179 T 0.758 +180 N 0.770 +181 G 0.781 +182 V 0.786 +183 N 0.781 +184 G 0.766 +185 H 0.751 +186 L 0.750 +187 P 0.768 +188 G 0.793 +189 D 0.813 +190 A 0.818 +191 L 0.813 +192 A 0.807 +193 A 0.806 +194 G 0.805 +195 R 0.801 +196 L 0.797 +197 P 0.797 +198 D 0.796 +199 V 0.784 +200 L 0.758 +201 T 0.726 +202 P 0.702 +203 Q 0.693 +204 Y 0.697 +205 P 0.713 +206 W 0.739 +207 Q 0.772 +208 S 0.799 +209 T 0.815 +210 D 0.821 +211 V 0.821 +212 S 0.817 +213 M 0.810 +214 G 0.798 +215 I 0.781 +216 L 0.765 +217 P 0.762 +218 P 0.773 +219 H 0.791 +220 H 0.805 +221 G 0.811 +222 N 0.810 +223 D 0.804 +224 F 0.796 +225 G 0.782 +226 L 0.759 +227 E 0.736 +228 P 0.728 +229 P 0.740 +230 G 0.761 +231 H 0.776 +232 N 0.781 +233 K 0.780 +234 E 0.778 +235 N 0.775 +236 E 0.771 +237 D 0.764 +238 D 0.745 +239 V 0.701 +240 E 0.637 +241 A 0.593 +242 M 0.584 +243 S 0.583 +244 T 0.589 +245 D 0.618 +246 S 0.641 +247 S 0.626 +248 S 0.612 +249 S 0.643 +250 S 0.689 +251 S 0.700 +252 D 0.666 +253 S 0.609 +254 D 0.564 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000041503_ENSDART00000060840_GN:med4_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:8.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000041503_ENSDART00000060840_GN:med4_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:8.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..beb9a7a421ebedcd6f62a6705c203de75b172f04 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000041503_ENSDART00000060840_GN:med4_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:8.caid @@ -0,0 +1,263 @@ +>ENSDARG00000041503|ENSDART00000060840|GN:med4|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:8 +1 M 0.316 +2 R 0.310 +3 T 0.300 +4 E 0.288 +5 R 0.275 +6 E 0.270 +7 T 0.276 +8 I 0.285 +9 M 0.299 +10 A 0.322 +11 A 0.351 +12 A 0.378 +13 A 0.398 +14 A 0.394 +15 D 0.347 +16 K 0.265 +17 S 0.181 +18 T 0.126 +19 K 0.106 +20 E 0.103 +21 R 0.098 +22 L 0.084 +23 L 0.074 +24 S 0.069 +25 T 0.065 +26 L 0.067 +27 D 0.074 +28 D 0.075 +29 L 0.067 +30 E 0.059 +31 V 0.055 +32 L 0.054 +33 S 0.054 +34 R 0.054 +35 E 0.052 +36 L 0.051 +37 I 0.055 +38 E 0.061 +39 M 0.067 +40 L 0.073 +41 A 0.087 +42 L 0.109 +43 S 0.136 +44 R 0.162 +45 S 0.180 +46 Q 0.196 +47 K 0.218 +48 L 0.243 +49 P 0.257 +50 P 0.250 +51 P 0.227 +52 G 0.194 +53 E 0.159 +54 D 0.126 +55 T 0.100 +56 L 0.083 +57 I 0.078 +58 L 0.080 +59 E 0.082 +60 L 0.080 +61 L 0.077 +62 I 0.075 +63 Q 0.074 +64 R 0.078 +65 D 0.087 +66 K 0.094 +67 E 0.094 +68 F 0.096 +69 Q 0.102 +70 E 0.101 +71 L 0.095 +72 M 0.093 +73 Q 0.097 +74 T 0.101 +75 A 0.113 +76 L 0.133 +77 E 0.147 +78 Q 0.148 +79 G 0.140 +80 R 0.129 +81 V 0.125 +82 H 0.135 +83 Q 0.156 +84 E 0.170 +85 M 0.170 +86 Q 0.165 +87 S 0.169 +88 L 0.183 +89 E 0.205 +90 K 0.230 +91 E 0.250 +92 V 0.258 +93 E 0.253 +94 K 0.242 +95 R 0.233 +96 D 0.238 +97 S 0.256 +98 D 0.270 +99 I 0.268 +100 Q 0.258 +101 Q 0.247 +102 L 0.236 +103 Q 0.232 +104 K 0.237 +105 Q 0.244 +106 L 0.244 +107 K 0.242 +108 E 0.236 +109 A 0.223 +110 E 0.210 +111 H 0.206 +112 I 0.202 +113 L 0.195 +114 A 0.191 +115 T 0.190 +116 A 0.184 +117 V 0.174 +118 Y 0.169 +119 Q 0.171 +120 A 0.172 +121 K 0.167 +122 E 0.159 +123 K 0.150 +124 L 0.147 +125 K 0.152 +126 S 0.157 +127 I 0.158 +128 D 0.169 +129 K 0.194 +130 A 0.223 +131 R 0.251 +132 K 0.282 +133 G 0.314 +134 S 0.332 +135 I 0.320 +136 S 0.280 +137 S 0.229 +138 E 0.192 +139 E 0.173 +140 I 0.162 +141 I 0.154 +142 K 0.156 +143 Y 0.165 +144 A 0.169 +145 H 0.165 +146 R 0.168 +147 I 0.191 +148 S 0.228 +149 A 0.261 +150 S 0.287 +151 N 0.316 +152 A 0.358 +153 V 0.410 +154 C 0.463 +155 A 0.515 +156 P 0.553 +157 L 0.558 +158 N 0.521 +159 W 0.467 +160 V 0.435 +161 P 0.428 +162 G 0.419 +163 D 0.395 +164 P 0.363 +165 R 0.341 +166 R 0.348 +167 P 0.387 +168 Y 0.434 +169 P 0.457 +170 T 0.447 +171 D 0.426 +172 L 0.408 +173 E 0.392 +174 M 0.375 +175 R 0.364 +176 S 0.372 +177 G 0.401 +178 M 0.441 +179 L 0.485 +180 G 0.537 +181 N 0.598 +182 M 0.650 +183 S 0.681 +184 N 0.700 +185 M 0.716 +186 S 0.733 +187 T 0.749 +188 N 0.763 +189 G 0.775 +190 V 0.781 +191 N 0.776 +192 G 0.761 +193 H 0.747 +194 L 0.746 +195 P 0.763 +196 G 0.789 +197 D 0.809 +198 A 0.815 +199 L 0.810 +200 A 0.804 +201 A 0.803 +202 G 0.802 +203 R 0.798 +204 L 0.795 +205 P 0.796 +206 D 0.794 +207 V 0.782 +208 L 0.755 +209 T 0.723 +210 P 0.699 +211 Q 0.691 +212 Y 0.696 +213 P 0.712 +214 W 0.738 +215 Q 0.770 +216 S 0.797 +217 T 0.813 +218 D 0.819 +219 V 0.819 +220 S 0.816 +221 M 0.808 +222 G 0.796 +223 I 0.779 +224 L 0.764 +225 P 0.761 +226 P 0.772 +227 H 0.790 +228 H 0.805 +229 G 0.811 +230 N 0.809 +231 D 0.803 +232 F 0.795 +233 G 0.780 +234 L 0.756 +235 E 0.732 +236 P 0.724 +237 P 0.736 +238 G 0.757 +239 H 0.772 +240 N 0.777 +241 K 0.777 +242 E 0.775 +243 N 0.773 +244 E 0.770 +245 D 0.763 +246 D 0.744 +247 V 0.700 +248 E 0.636 +249 A 0.591 +250 M 0.583 +251 S 0.582 +252 T 0.588 +253 D 0.618 +254 S 0.640 +255 S 0.624 +256 S 0.610 +257 S 0.641 +258 S 0.687 +259 S 0.698 +260 D 0.663 +261 S 0.604 +262 D 0.558 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000042874_ENSDART00000062930_GN:phlda2_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000042874_ENSDART00000062930_GN:phlda2_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..91c661db7974f70c53aaf2409cdee39d7b7e3cb5 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000042874_ENSDART00000062930_GN:phlda2_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,137 @@ +>ENSDARG00000042874|ENSDART00000062930|GN:phlda2|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.523 +2 T 0.535 +3 G 0.550 +4 S 0.547 +5 D 0.507 +6 I 0.427 +7 S 0.326 +8 H 0.231 +9 I 0.156 +10 L 0.104 +11 K 0.072 +12 E 0.056 +13 G 0.049 +14 E 0.045 +15 L 0.045 +16 E 0.052 +17 K 0.072 +18 R 0.103 +19 S 0.140 +20 D 0.172 +21 N 0.189 +22 L 0.188 +23 L 0.177 +24 Q 0.161 +25 F 0.137 +26 W 0.107 +27 K 0.077 +28 R 0.052 +29 K 0.035 +30 T 0.025 +31 C 0.023 +32 V 0.028 +33 L 0.034 +34 T 0.036 +35 T 0.032 +36 D 0.027 +37 S 0.025 +38 L 0.026 +39 N 0.032 +40 I 0.042 +41 Y 0.059 +42 T 0.078 +43 D 0.095 +44 Q 0.108 +45 Q 0.118 +46 K 0.128 +47 K 0.145 +48 N 0.163 +49 K 0.169 +50 S 0.158 +51 K 0.135 +52 E 0.110 +53 L 0.085 +54 K 0.061 +55 L 0.040 +56 Q 0.029 +57 S 0.024 +58 I 0.023 +59 K 0.023 +60 K 0.025 +61 V 0.028 +62 D 0.033 +63 C 0.041 +64 V 0.054 +65 E 0.068 +66 H 0.078 +67 T 0.081 +68 G 0.075 +69 K 0.061 +70 F 0.044 +71 V 0.030 +72 Y 0.020 +73 F 0.016 +74 T 0.015 +75 I 0.017 +76 V 0.022 +77 T 0.031 +78 T 0.041 +79 D 0.049 +80 N 0.054 +81 K 0.052 +82 E 0.046 +83 I 0.037 +84 D 0.029 +85 F 0.025 +86 R 0.028 +87 C 0.038 +88 S 0.050 +89 D 0.059 +90 E 0.061 +91 K 0.062 +92 N 0.062 +93 C 0.060 +94 W 0.056 +95 N 0.051 +96 A 0.044 +97 V 0.038 +98 I 0.032 +99 A 0.029 +100 I 0.027 +101 A 0.030 +102 L 0.038 +103 V 0.052 +104 N 0.068 +105 F 0.086 +106 Q 0.108 +107 N 0.134 +108 R 0.164 +109 K 0.200 +110 A 0.243 +111 I 0.292 +112 Q 0.351 +113 G 0.419 +114 F 0.485 +115 K 0.535 +116 T 0.563 +117 Q 0.574 +118 K 0.576 +119 E 0.574 +120 S 0.571 +121 E 0.568 +122 N 0.566 +123 T 0.568 +124 S 0.571 +125 L 0.558 +126 G 0.520 +127 Q 0.483 +128 Q 0.465 +129 E 0.454 +130 R 0.449 +131 C 0.474 +132 M 0.517 +133 A 0.538 +134 R 0.524 +135 A 0.493 +136 P 0.468 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000042874_ENSDART00000062930_GN:phlda2_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:38.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000042874_ENSDART00000062930_GN:phlda2_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:38.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..18f60a7477201dba5fee59e894cc1052a07afc4c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000042874_ENSDART00000062930_GN:phlda2_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:38.caid @@ -0,0 +1,175 @@ +>ENSDARG00000042874|ENSDART00000062930|GN:phlda2|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:38 +1 M 0.444 +2 K 0.445 +3 K 0.453 +4 H 0.473 +5 S 0.500 +6 V 0.513 +7 G 0.487 +8 R 0.422 +9 R 0.346 +10 L 0.286 +11 Q 0.246 +12 Q 0.226 +13 R 0.222 +14 L 0.229 +15 Y 0.248 +16 E 0.281 +17 A 0.320 +18 L 0.356 +19 G 0.384 +20 H 0.404 +21 S 0.411 +22 Y 0.402 +23 S 0.383 +24 C 0.367 +25 L 0.361 +26 F 0.370 +27 I 0.402 +28 H 0.449 +29 S 0.486 +30 P 0.500 +31 A 0.504 +32 I 0.518 +33 A 0.546 +34 R 0.578 +35 N 0.610 +36 V 0.633 +37 G 0.641 +38 K 0.636 +39 M 0.630 +40 T 0.625 +41 G 0.608 +42 S 0.565 +43 D 0.491 +44 I 0.392 +45 S 0.290 +46 H 0.202 +47 I 0.136 +48 L 0.091 +49 K 0.063 +50 E 0.050 +51 G 0.045 +52 E 0.041 +53 L 0.041 +54 E 0.048 +55 K 0.065 +56 R 0.094 +57 S 0.130 +58 D 0.161 +59 N 0.177 +60 L 0.175 +61 L 0.161 +62 Q 0.144 +63 F 0.121 +64 W 0.094 +65 K 0.068 +66 R 0.046 +67 K 0.031 +68 T 0.022 +69 C 0.021 +70 V 0.025 +71 L 0.031 +72 T 0.033 +73 T 0.029 +74 D 0.024 +75 S 0.021 +76 L 0.022 +77 N 0.026 +78 I 0.035 +79 Y 0.048 +80 T 0.064 +81 D 0.078 +82 Q 0.089 +83 Q 0.097 +84 K 0.106 +85 K 0.121 +86 N 0.139 +87 K 0.148 +88 S 0.140 +89 K 0.121 +90 E 0.099 +91 L 0.077 +92 K 0.055 +93 L 0.037 +94 Q 0.026 +95 S 0.022 +96 I 0.022 +97 K 0.022 +98 K 0.024 +99 V 0.028 +100 D 0.034 +101 C 0.042 +102 V 0.053 +103 E 0.064 +104 H 0.072 +105 T 0.073 +106 G 0.068 +107 K 0.056 +108 F 0.042 +109 V 0.029 +110 Y 0.020 +111 F 0.015 +112 T 0.014 +113 I 0.016 +114 V 0.021 +115 T 0.029 +116 T 0.039 +117 D 0.047 +118 N 0.052 +119 K 0.051 +120 E 0.045 +121 I 0.036 +122 D 0.028 +123 F 0.024 +124 R 0.025 +125 C 0.033 +126 S 0.044 +127 D 0.051 +128 E 0.051 +129 K 0.048 +130 N 0.046 +131 C 0.046 +132 W 0.043 +133 N 0.039 +134 A 0.034 +135 V 0.030 +136 I 0.027 +137 A 0.025 +138 I 0.024 +139 A 0.027 +140 L 0.035 +141 V 0.047 +142 N 0.061 +143 F 0.079 +144 Q 0.103 +145 N 0.131 +146 R 0.160 +147 K 0.194 +148 A 0.233 +149 I 0.278 +150 Q 0.335 +151 G 0.407 +152 F 0.478 +153 K 0.531 +154 T 0.559 +155 Q 0.567 +156 K 0.565 +157 E 0.563 +158 S 0.564 +159 E 0.567 +160 N 0.573 +161 T 0.580 +162 S 0.585 +163 L 0.571 +164 G 0.532 +165 Q 0.493 +166 Q 0.474 +167 E 0.461 +168 R 0.456 +169 C 0.481 +170 M 0.523 +171 A 0.544 +172 R 0.531 +173 A 0.499 +174 P 0.473 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000053194_ENSDART00000075187_GN:pdzd11_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000053194_ENSDART00000075187_GN:pdzd11_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c1972897bb3cf8860700541a278c787e59ae02d5 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000053194_ENSDART00000075187_GN:pdzd11_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,143 @@ +>ENSDARG00000053194|ENSDART00000075187|GN:pdzd11|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.478 +2 D 0.497 +3 Q 0.531 +4 K 0.567 +5 I 0.590 +6 P 0.600 +7 Y 0.605 +8 D 0.601 +9 D 0.586 +10 Y 0.572 +11 Q 0.583 +12 L 0.620 +13 P 0.661 +14 V 0.681 +15 V 0.678 +16 F 0.666 +17 L 0.658 +18 P 0.653 +19 S 0.642 +20 Y 0.614 +21 E 0.578 +22 N 0.560 +23 P 0.572 +24 P 0.595 +25 A 0.593 +26 W 0.561 +27 I 0.531 +28 P 0.534 +29 P 0.570 +30 Q 0.610 +31 E 0.629 +32 R 0.621 +33 I 0.596 +34 H 0.566 +35 H 0.545 +36 P 0.541 +37 D 0.544 +38 Y 0.539 +39 N 0.517 +40 N 0.467 +41 E 0.395 +42 L 0.328 +43 A 0.283 +44 Q 0.256 +45 F 0.228 +46 L 0.187 +47 P 0.141 +48 R 0.106 +49 T 0.087 +50 I 0.076 +51 V 0.067 +52 L 0.064 +53 K 0.074 +54 K 0.093 +55 P 0.114 +56 P 0.130 +57 G 0.142 +58 A 0.145 +59 Q 0.134 +60 L 0.111 +61 G 0.088 +62 F 0.079 +63 N 0.083 +64 I 0.087 +65 R 0.087 +66 G 0.088 +67 G 0.098 +68 K 0.118 +69 A 0.139 +70 S 0.150 +71 Q 0.143 +72 L 0.121 +73 G 0.091 +74 I 0.063 +75 F 0.047 +76 I 0.045 +77 S 0.053 +78 K 0.066 +79 V 0.079 +80 V 0.084 +81 P 0.076 +82 D 0.061 +83 S 0.046 +84 D 0.038 +85 A 0.036 +86 H 0.039 +87 R 0.046 +88 A 0.053 +89 G 0.060 +90 L 0.063 +91 Q 0.064 +92 E 0.063 +93 G 0.059 +94 D 0.052 +95 Q 0.044 +96 V 0.038 +97 L 0.036 +98 S 0.037 +99 V 0.041 +100 N 0.047 +101 E 0.054 +102 V 0.060 +103 D 0.061 +104 F 0.057 +105 Q 0.051 +106 D 0.047 +107 I 0.047 +108 E 0.047 +109 H 0.044 +110 S 0.040 +111 R 0.039 +112 A 0.045 +113 V 0.057 +114 E 0.064 +115 I 0.062 +116 L 0.054 +117 K 0.052 +118 T 0.054 +119 A 0.056 +120 R 0.053 +121 E 0.047 +122 I 0.041 +123 L 0.037 +124 M 0.035 +125 K 0.036 +126 V 0.039 +127 R 0.049 +128 Y 0.065 +129 F 0.083 +130 P 0.098 +131 Y 0.112 +132 N 0.126 +133 Y 0.145 +134 Q 0.167 +135 R 0.190 +136 Q 0.212 +137 K 0.235 +138 E 0.267 +139 R 0.318 +140 T 0.376 +141 V 0.410 +142 H 0.416 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000053194_ENSDART00000075187_GN:pdzd11_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000053194_ENSDART00000075187_GN:pdzd11_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:14.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..299d14b64f1edb9ebb3de80b15dbb56543e88fbb --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000053194_ENSDART00000075187_GN:pdzd11_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:14.caid @@ -0,0 +1,157 @@ +>ENSDARG00000053194|ENSDART00000075187|GN:pdzd11|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:14 +1 M 0.374 +2 T 0.384 +3 L 0.405 +4 L 0.430 +5 I 0.449 +6 F 0.459 +7 F 0.465 +8 L 0.470 +9 T 0.476 +10 S 0.504 +11 S 0.567 +12 S 0.635 +13 T 0.671 +14 N 0.676 +15 M 0.671 +16 D 0.668 +17 Q 0.671 +18 K 0.675 +19 I 0.676 +20 P 0.672 +21 Y 0.665 +22 D 0.652 +23 D 0.634 +24 Y 0.621 +25 Q 0.632 +26 L 0.668 +27 P 0.706 +28 V 0.725 +29 V 0.720 +30 F 0.703 +31 L 0.686 +32 P 0.674 +33 S 0.658 +34 Y 0.629 +35 E 0.594 +36 N 0.574 +37 P 0.582 +38 P 0.599 +39 A 0.594 +40 W 0.561 +41 I 0.531 +42 P 0.538 +43 P 0.580 +44 Q 0.626 +45 E 0.647 +46 R 0.639 +47 I 0.614 +48 H 0.586 +49 H 0.567 +50 P 0.565 +51 D 0.571 +52 Y 0.569 +53 N 0.548 +54 N 0.496 +55 E 0.420 +56 L 0.346 +57 A 0.295 +58 Q 0.262 +59 F 0.229 +60 L 0.185 +61 P 0.139 +62 R 0.106 +63 T 0.089 +64 I 0.078 +65 V 0.067 +66 L 0.063 +67 K 0.072 +68 K 0.090 +69 P 0.110 +70 P 0.127 +71 G 0.138 +72 A 0.139 +73 Q 0.127 +74 L 0.104 +75 G 0.081 +76 F 0.072 +77 N 0.076 +78 I 0.082 +79 R 0.083 +80 G 0.086 +81 G 0.096 +82 K 0.115 +83 A 0.136 +84 S 0.146 +85 Q 0.140 +86 L 0.118 +87 G 0.089 +88 I 0.061 +89 F 0.046 +90 I 0.044 +91 S 0.051 +92 K 0.064 +93 V 0.077 +94 V 0.082 +95 P 0.075 +96 D 0.060 +97 S 0.045 +98 D 0.037 +99 A 0.035 +100 H 0.038 +101 R 0.044 +102 A 0.052 +103 G 0.058 +104 L 0.061 +105 Q 0.062 +106 E 0.061 +107 G 0.058 +108 D 0.051 +109 Q 0.043 +110 V 0.037 +111 L 0.035 +112 S 0.036 +113 V 0.041 +114 N 0.047 +115 E 0.054 +116 V 0.060 +117 D 0.062 +118 F 0.057 +119 Q 0.051 +120 D 0.047 +121 I 0.047 +122 E 0.047 +123 H 0.044 +124 S 0.039 +125 R 0.038 +126 A 0.044 +127 V 0.056 +128 E 0.064 +129 I 0.061 +130 L 0.054 +131 K 0.051 +132 T 0.054 +133 A 0.055 +134 R 0.053 +135 E 0.047 +136 I 0.041 +137 L 0.037 +138 M 0.035 +139 K 0.036 +140 V 0.039 +141 R 0.049 +142 Y 0.064 +143 F 0.083 +144 P 0.098 +145 Y 0.110 +146 N 0.124 +147 Y 0.141 +148 Q 0.162 +149 R 0.183 +150 Q 0.203 +151 K 0.225 +152 E 0.258 +153 R 0.311 +154 T 0.369 +155 V 0.404 +156 H 0.410 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000058202_ENSDART00000081025_GN:pex16_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000058202_ENSDART00000081025_GN:pex16_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e8e3cd1a3e4043145c8fc792e0e4fdd3ef1efa6c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000058202_ENSDART00000081025_GN:pex16_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,336 @@ +>ENSDARG00000058202|ENSDART00000081025|GN:pex16|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.184 +2 E 0.161 +3 K 0.135 +4 L 0.122 +5 S 0.119 +6 R 0.111 +7 V 0.096 +8 F 0.085 +9 E 0.081 +10 R 0.080 +11 Y 0.085 +12 Q 0.092 +13 E 0.092 +14 Y 0.086 +15 V 0.083 +16 R 0.091 +17 T 0.101 +18 S 0.100 +19 P 0.083 +20 A 0.063 +21 A 0.051 +22 A 0.047 +23 S 0.048 +24 H 0.053 +25 L 0.059 +26 E 0.061 +27 S 0.058 +28 T 0.054 +29 V 0.055 +30 R 0.062 +31 A 0.063 +32 L 0.055 +33 S 0.046 +34 Y 0.043 +35 L 0.049 +36 I 0.064 +37 A 0.086 +38 G 0.112 +39 R 0.135 +40 F 0.150 +41 S 0.154 +42 D 0.147 +43 S 0.130 +44 H 0.107 +45 E 0.089 +46 I 0.081 +47 S 0.079 +48 E 0.079 +49 L 0.075 +50 V 0.069 +51 Y 0.066 +52 S 0.067 +53 A 0.069 +54 S 0.067 +55 N 0.062 +56 L 0.056 +57 L 0.053 +58 V 0.054 +59 L 0.056 +60 L 0.058 +61 N 0.063 +62 D 0.071 +63 G 0.076 +64 I 0.078 +65 L 0.078 +66 R 0.080 +67 K 0.091 +68 N 0.110 +69 L 0.129 +70 S 0.145 +71 R 0.161 +72 T 0.179 +73 L 0.188 +74 P 0.177 +75 M 0.147 +76 S 0.109 +77 I 0.075 +78 S 0.053 +79 Q 0.045 +80 Q 0.045 +81 K 0.051 +82 L 0.062 +83 L 0.073 +84 T 0.079 +85 W 0.082 +86 L 0.088 +87 S 0.099 +88 V 0.104 +89 L 0.099 +90 E 0.090 +91 Y 0.085 +92 V 0.079 +93 E 0.068 +94 V 0.055 +95 F 0.048 +96 V 0.048 +97 E 0.049 +98 M 0.049 +99 A 0.051 +100 A 0.055 +101 A 0.062 +102 K 0.069 +103 M 0.079 +104 W 0.088 +105 G 0.090 +106 D 0.081 +107 A 0.068 +108 G 0.056 +109 R 0.049 +110 W 0.047 +111 L 0.052 +112 V 0.059 +113 I 0.062 +114 V 0.062 +115 L 0.066 +116 I 0.074 +117 Q 0.082 +118 I 0.086 +119 A 0.080 +120 K 0.068 +121 A 0.056 +122 V 0.049 +123 L 0.044 +124 R 0.041 +125 C 0.037 +126 L 0.035 +127 L 0.035 +128 L 0.036 +129 F 0.036 +130 W 0.039 +131 Y 0.050 +132 K 0.068 +133 S 0.090 +134 G 0.105 +135 I 0.111 +136 Q 0.110 +137 T 0.109 +138 S 0.117 +139 P 0.142 +140 P 0.181 +141 I 0.230 +142 I 0.286 +143 P 0.344 +144 L 0.399 +145 D 0.443 +146 R 0.470 +147 D 0.480 +148 S 0.484 +149 Q 0.503 +150 L 0.545 +151 C 0.596 +152 S 0.640 +153 Q 0.671 +154 D 0.680 +155 N 0.654 +156 N 0.600 +157 E 0.562 +158 E 0.574 +159 E 0.609 +160 D 0.623 +161 D 0.606 +162 E 0.565 +163 D 0.508 +164 S 0.447 +165 S 0.399 +166 F 0.375 +167 V 0.375 +168 G 0.401 +169 Q 0.438 +170 R 0.463 +171 S 0.472 +172 G 0.476 +173 R 0.480 +174 V 0.480 +175 V 0.483 +176 R 0.505 +177 P 0.554 +178 L 0.613 +179 G 0.653 +180 S 0.664 +181 A 0.651 +182 P 0.621 +183 S 0.581 +184 L 0.539 +185 Q 0.502 +186 S 0.488 +187 R 0.512 +188 L 0.570 +189 W 0.630 +190 G 0.667 +191 L 0.679 +192 P 0.678 +193 R 0.675 +194 K 0.674 +195 K 0.670 +196 K 0.659 +197 V 0.645 +198 S 0.633 +199 R 0.618 +200 N 0.582 +201 Q 0.523 +202 E 0.461 +203 E 0.418 +204 E 0.394 +205 L 0.379 +206 Y 0.366 +207 S 0.350 +208 S 0.329 +209 P 0.299 +210 T 0.260 +211 P 0.217 +212 L 0.174 +213 G 0.135 +214 L 0.106 +215 Q 0.095 +216 E 0.095 +217 T 0.100 +218 I 0.111 +219 A 0.134 +220 E 0.154 +221 S 0.155 +222 L 0.140 +223 Y 0.131 +224 I 0.128 +225 A 0.119 +226 R 0.103 +227 P 0.087 +228 L 0.077 +229 L 0.073 +230 H 0.071 +231 L 0.065 +232 A 0.057 +233 S 0.054 +234 L 0.057 +235 G 0.065 +236 I 0.075 +237 C 0.088 +238 G 0.098 +239 K 0.098 +240 R 0.086 +241 S 0.070 +242 W 0.058 +243 K 0.054 +244 P 0.055 +245 W 0.056 +246 I 0.057 +247 L 0.061 +248 S 0.067 +249 G 0.071 +250 L 0.070 +251 L 0.069 +252 E 0.067 +253 I 0.062 +254 T 0.055 +255 S 0.052 +256 F 0.052 +257 S 0.057 +258 L 0.069 +259 L 0.087 +260 S 0.105 +261 D 0.121 +262 M 0.134 +263 K 0.142 +264 A 0.141 +265 L 0.129 +266 N 0.108 +267 R 0.085 +268 R 0.068 +269 E 0.061 +270 R 0.061 +271 A 0.066 +272 E 0.071 +273 M 0.074 +274 R 0.072 +275 R 0.069 +276 R 0.070 +277 A 0.079 +278 F 0.093 +279 L 0.104 +280 L 0.103 +281 L 0.093 +282 Y 0.080 +283 Y 0.069 +284 L 0.063 +285 L 0.062 +286 R 0.062 +287 S 0.060 +288 P 0.055 +289 F 0.050 +290 Y 0.048 +291 D 0.052 +292 R 0.059 +293 Y 0.065 +294 S 0.067 +295 E 0.064 +296 T 0.061 +297 K 0.060 +298 I 0.064 +299 L 0.071 +300 F 0.075 +301 L 0.069 +302 L 0.060 +303 R 0.054 +304 F 0.055 +305 L 0.069 +306 A 0.097 +307 D 0.138 +308 Y 0.179 +309 V 0.201 +310 P 0.193 +311 G 0.162 +312 V 0.124 +313 G 0.094 +314 L 0.079 +315 V 0.076 +316 A 0.080 +317 R 0.086 +318 P 0.091 +319 L 0.096 +320 M 0.096 +321 E 0.093 +322 Y 0.091 +323 L 0.096 +324 P 0.100 +325 I 0.101 +326 W 0.106 +327 Q 0.123 +328 K 0.148 +329 I 0.178 +330 Y 0.212 +331 F 0.244 +332 Y 0.267 +333 N 0.275 +334 W 0.276 +335 G 0.275 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000058202_ENSDART00000081025_GN:pex16_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000058202_ENSDART00000081025_GN:pex16_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:5.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..02bd2f1212f63565bdd8388f2dd9630545b7e00c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000058202_ENSDART00000081025_GN:pex16_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:5.caid @@ -0,0 +1,341 @@ +>ENSDARG00000058202|ENSDART00000081025|GN:pex16|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:5 +1 M 0.242 +2 S 0.226 +3 V 0.199 +4 L 0.170 +5 Y 0.146 +6 M 0.127 +7 E 0.111 +8 K 0.101 +9 L 0.101 +10 S 0.105 +11 R 0.102 +12 V 0.090 +13 F 0.080 +14 E 0.075 +15 R 0.073 +16 Y 0.073 +17 Q 0.074 +18 E 0.072 +19 Y 0.071 +20 V 0.076 +21 R 0.090 +22 T 0.103 +23 S 0.102 +24 P 0.086 +25 A 0.065 +26 A 0.052 +27 A 0.048 +28 S 0.049 +29 H 0.053 +30 L 0.058 +31 E 0.061 +32 S 0.058 +33 T 0.053 +34 V 0.055 +35 R 0.060 +36 A 0.062 +37 L 0.054 +38 S 0.046 +39 Y 0.043 +40 L 0.050 +41 I 0.065 +42 A 0.087 +43 G 0.114 +44 R 0.138 +45 F 0.153 +46 S 0.156 +47 D 0.148 +48 S 0.129 +49 H 0.107 +50 E 0.090 +51 I 0.082 +52 S 0.080 +53 E 0.080 +54 L 0.075 +55 V 0.069 +56 Y 0.065 +57 S 0.066 +58 A 0.068 +59 S 0.067 +60 N 0.061 +61 L 0.055 +62 L 0.052 +63 V 0.053 +64 L 0.055 +65 L 0.057 +66 N 0.062 +67 D 0.069 +68 G 0.074 +69 I 0.076 +70 L 0.075 +71 R 0.078 +72 K 0.089 +73 N 0.107 +74 L 0.127 +75 S 0.143 +76 R 0.159 +77 T 0.177 +78 L 0.187 +79 P 0.176 +80 M 0.146 +81 S 0.108 +82 I 0.074 +83 S 0.053 +84 Q 0.044 +85 Q 0.045 +86 K 0.051 +87 L 0.061 +88 L 0.072 +89 T 0.078 +90 W 0.081 +91 L 0.087 +92 S 0.097 +93 V 0.103 +94 L 0.097 +95 E 0.088 +96 Y 0.082 +97 V 0.077 +98 E 0.067 +99 V 0.054 +100 F 0.048 +101 V 0.047 +102 E 0.049 +103 M 0.049 +104 A 0.050 +105 A 0.055 +106 A 0.061 +107 K 0.069 +108 M 0.078 +109 W 0.088 +110 G 0.090 +111 D 0.081 +112 A 0.068 +113 G 0.057 +114 R 0.049 +115 W 0.048 +116 L 0.054 +117 V 0.060 +118 I 0.063 +119 V 0.063 +120 L 0.067 +121 I 0.074 +122 Q 0.083 +123 I 0.086 +124 A 0.081 +125 K 0.068 +126 A 0.056 +127 V 0.049 +128 L 0.045 +129 R 0.041 +130 C 0.038 +131 L 0.036 +132 L 0.036 +133 L 0.036 +134 F 0.036 +135 W 0.039 +136 Y 0.049 +137 K 0.068 +138 S 0.089 +139 G 0.105 +140 I 0.111 +141 Q 0.110 +142 T 0.109 +143 S 0.117 +144 P 0.140 +145 P 0.179 +146 I 0.227 +147 I 0.282 +148 P 0.341 +149 L 0.396 +150 D 0.440 +151 R 0.466 +152 D 0.475 +153 S 0.479 +154 Q 0.498 +155 L 0.541 +156 C 0.593 +157 S 0.639 +158 Q 0.672 +159 D 0.685 +160 N 0.671 +161 N 0.634 +162 E 0.605 +163 E 0.608 +164 E 0.626 +165 D 0.630 +166 D 0.608 +167 E 0.567 +168 D 0.511 +169 S 0.450 +170 S 0.403 +171 F 0.378 +172 V 0.378 +173 G 0.405 +174 Q 0.442 +175 R 0.468 +176 S 0.476 +177 G 0.479 +178 R 0.482 +179 V 0.483 +180 V 0.486 +181 R 0.508 +182 P 0.557 +183 L 0.615 +184 G 0.654 +185 S 0.663 +186 A 0.650 +187 P 0.621 +188 S 0.581 +189 L 0.539 +190 Q 0.502 +191 S 0.486 +192 R 0.510 +193 L 0.568 +194 W 0.629 +195 G 0.666 +196 L 0.679 +197 P 0.678 +198 R 0.675 +199 K 0.673 +200 K 0.669 +201 K 0.658 +202 V 0.643 +203 S 0.631 +204 R 0.617 +205 N 0.583 +206 Q 0.525 +207 E 0.465 +208 E 0.422 +209 E 0.398 +210 L 0.382 +211 Y 0.369 +212 S 0.352 +213 S 0.330 +214 P 0.299 +215 T 0.260 +216 P 0.217 +217 L 0.175 +218 G 0.136 +219 L 0.107 +220 Q 0.095 +221 E 0.096 +222 T 0.101 +223 I 0.112 +224 A 0.134 +225 E 0.155 +226 S 0.155 +227 L 0.141 +228 Y 0.132 +229 I 0.128 +230 A 0.119 +231 R 0.103 +232 P 0.088 +233 L 0.077 +234 L 0.073 +235 H 0.071 +236 L 0.066 +237 A 0.057 +238 S 0.054 +239 L 0.057 +240 G 0.065 +241 I 0.075 +242 C 0.088 +243 G 0.098 +244 K 0.098 +245 R 0.087 +246 S 0.070 +247 W 0.058 +248 K 0.054 +249 P 0.055 +250 W 0.057 +251 I 0.057 +252 L 0.061 +253 S 0.067 +254 G 0.071 +255 L 0.071 +256 L 0.070 +257 E 0.068 +258 I 0.062 +259 T 0.056 +260 S 0.052 +261 F 0.053 +262 S 0.057 +263 L 0.069 +264 L 0.087 +265 S 0.106 +266 D 0.122 +267 M 0.135 +268 K 0.143 +269 A 0.143 +270 L 0.131 +271 N 0.109 +272 R 0.087 +273 R 0.070 +274 E 0.062 +275 R 0.062 +276 A 0.066 +277 E 0.072 +278 M 0.075 +279 R 0.073 +280 R 0.070 +281 R 0.071 +282 A 0.080 +283 F 0.095 +284 L 0.106 +285 L 0.105 +286 L 0.094 +287 Y 0.082 +288 Y 0.071 +289 L 0.064 +290 L 0.063 +291 R 0.063 +292 S 0.061 +293 P 0.056 +294 F 0.051 +295 Y 0.049 +296 D 0.053 +297 R 0.060 +298 Y 0.066 +299 S 0.068 +300 E 0.065 +301 T 0.061 +302 K 0.060 +303 I 0.065 +304 L 0.072 +305 F 0.075 +306 L 0.070 +307 L 0.060 +308 R 0.054 +309 F 0.056 +310 L 0.069 +311 A 0.098 +312 D 0.138 +313 Y 0.179 +314 V 0.201 +315 P 0.192 +316 G 0.161 +317 V 0.123 +318 G 0.093 +319 L 0.078 +320 V 0.075 +321 A 0.079 +322 R 0.085 +323 P 0.091 +324 L 0.095 +325 M 0.096 +326 E 0.093 +327 Y 0.092 +328 L 0.096 +329 P 0.101 +330 I 0.101 +331 W 0.107 +332 Q 0.124 +333 K 0.150 +334 I 0.180 +335 Y 0.215 +336 F 0.248 +337 Y 0.269 +338 N 0.277 +339 W 0.276 +340 G 0.275 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000058730_ENSDART00000066703_GN:rdh10a_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000058730_ENSDART00000066703_GN:rdh10a_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..811e14e3fc329d835535ee94d89d2061568b5fae --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000058730_ENSDART00000066703_GN:rdh10a_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,340 @@ +>ENSDARG00000058730|ENSDART00000066703|GN:rdh10a|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.205 +2 N 0.180 +3 I 0.144 +4 F 0.115 +5 V 0.100 +6 E 0.091 +7 F 0.081 +8 F 0.076 +9 L 0.080 +10 V 0.087 +11 M 0.089 +12 L 0.090 +13 K 0.094 +14 V 0.097 +15 C 0.093 +16 W 0.087 +17 A 0.084 +18 I 0.081 +19 V 0.077 +20 M 0.076 +21 A 0.079 +22 G 0.081 +23 F 0.080 +24 K 0.079 +25 W 0.081 +26 L 0.091 +27 I 0.109 +28 R 0.131 +29 P 0.143 +30 K 0.138 +31 E 0.123 +32 K 0.111 +33 S 0.107 +34 V 0.104 +35 A 0.096 +36 G 0.079 +37 Q 0.059 +38 V 0.043 +39 C 0.034 +40 V 0.031 +41 I 0.030 +42 T 0.032 +43 G 0.039 +44 A 0.048 +45 G 0.055 +46 G 0.058 +47 G 0.057 +48 L 0.053 +49 G 0.046 +50 R 0.040 +51 L 0.038 +52 F 0.041 +53 A 0.041 +54 K 0.037 +55 E 0.031 +56 F 0.029 +57 A 0.035 +58 R 0.046 +59 R 0.062 +60 R 0.078 +61 A 0.087 +62 T 0.081 +63 L 0.066 +64 V 0.051 +65 L 0.043 +66 W 0.040 +67 D 0.041 +68 I 0.044 +69 N 0.048 +70 S 0.050 +71 H 0.047 +72 S 0.041 +73 N 0.037 +74 E 0.038 +75 E 0.045 +76 T 0.059 +77 A 0.074 +78 E 0.081 +79 M 0.077 +80 V 0.073 +81 R 0.080 +82 Q 0.088 +83 I 0.091 +84 Y 0.091 +85 R 0.102 +86 E 0.136 +87 Q 0.199 +88 D 0.283 +89 N 0.366 +90 P 0.431 +91 M 0.481 +92 S 0.529 +93 K 0.573 +94 E 0.603 +95 G 0.619 +96 A 0.628 +97 V 0.636 +98 G 0.641 +99 G 0.632 +100 V 0.599 +101 E 0.543 +102 E 0.477 +103 V 0.410 +104 P 0.343 +105 P 0.278 +106 F 0.219 +107 Q 0.171 +108 P 0.135 +109 Q 0.107 +110 V 0.085 +111 Y 0.070 +112 T 0.059 +113 Y 0.050 +114 V 0.044 +115 L 0.039 +116 D 0.038 +117 V 0.040 +118 G 0.040 +119 K 0.037 +120 R 0.034 +121 E 0.032 +122 S 0.032 +123 V 0.038 +124 Y 0.049 +125 S 0.058 +126 T 0.059 +127 A 0.058 +128 E 0.056 +129 K 0.050 +130 V 0.047 +131 R 0.054 +132 K 0.061 +133 E 0.060 +134 V 0.054 +135 G 0.049 +136 E 0.047 +137 V 0.044 +138 D 0.044 +139 L 0.047 +140 L 0.051 +141 I 0.056 +142 N 0.060 +143 N 0.065 +144 A 0.069 +145 G 0.070 +146 V 0.070 +147 V 0.070 +148 S 0.071 +149 G 0.076 +150 H 0.085 +151 H 0.096 +152 L 0.102 +153 L 0.105 +154 E 0.109 +155 C 0.110 +156 P 0.100 +157 D 0.084 +158 E 0.070 +159 L 0.063 +160 I 0.062 +161 E 0.063 +162 R 0.062 +163 T 0.060 +164 M 0.059 +165 V 0.061 +166 V 0.064 +167 N 0.065 +168 C 0.066 +169 H 0.072 +170 A 0.079 +171 H 0.075 +172 F 0.062 +173 W 0.051 +174 T 0.048 +175 T 0.048 +176 K 0.048 +177 A 0.045 +178 F 0.042 +179 L 0.038 +180 P 0.035 +181 K 0.034 +182 M 0.036 +183 L 0.040 +184 E 0.045 +185 M 0.048 +186 N 0.050 +187 H 0.051 +188 G 0.055 +189 H 0.060 +190 I 0.062 +191 V 0.061 +192 T 0.062 +193 V 0.071 +194 A 0.084 +195 S 0.096 +196 S 0.108 +197 L 0.120 +198 G 0.126 +199 L 0.124 +200 F 0.119 +201 S 0.120 +202 T 0.123 +203 A 0.124 +204 G 0.121 +205 V 0.115 +206 E 0.107 +207 D 0.100 +208 Y 0.099 +209 C 0.108 +210 A 0.117 +211 S 0.116 +212 K 0.107 +213 F 0.095 +214 G 0.083 +215 A 0.073 +216 I 0.071 +217 G 0.076 +218 F 0.079 +219 H 0.073 +220 E 0.061 +221 S 0.056 +222 L 0.060 +223 S 0.066 +224 H 0.067 +225 E 0.065 +226 I 0.064 +227 Q 0.069 +228 A 0.079 +229 S 0.086 +230 E 0.088 +231 K 0.087 +232 D 0.085 +233 G 0.082 +234 I 0.072 +235 K 0.058 +236 M 0.046 +237 T 0.043 +238 L 0.048 +239 V 0.056 +240 C 0.061 +241 P 0.064 +242 Y 0.067 +243 L 0.072 +244 V 0.076 +245 D 0.076 +246 T 0.075 +247 G 0.076 +248 M 0.081 +249 F 0.092 +250 R 0.109 +251 G 0.131 +252 C 0.152 +253 R 0.162 +254 I 0.158 +255 R 0.145 +256 K 0.133 +257 E 0.126 +258 I 0.118 +259 E 0.107 +260 P 0.101 +261 F 0.107 +262 L 0.122 +263 P 0.137 +264 P 0.136 +265 L 0.121 +266 R 0.104 +267 P 0.088 +268 E 0.074 +269 F 0.063 +270 C 0.057 +271 V 0.052 +272 K 0.050 +273 Q 0.054 +274 A 0.058 +275 M 0.058 +276 R 0.057 +277 A 0.061 +278 I 0.070 +279 L 0.082 +280 T 0.095 +281 D 0.105 +282 Q 0.110 +283 P 0.111 +284 M 0.109 +285 I 0.101 +286 C 0.088 +287 T 0.072 +288 P 0.060 +289 R 0.054 +290 I 0.049 +291 V 0.044 +292 Y 0.039 +293 M 0.039 +294 V 0.043 +295 N 0.046 +296 F 0.048 +297 M 0.051 +298 K 0.056 +299 S 0.061 +300 I 0.064 +301 L 0.067 +302 P 0.071 +303 F 0.071 +304 E 0.068 +305 A 0.067 +306 I 0.074 +307 V 0.086 +308 C 0.093 +309 M 0.090 +310 Y 0.085 +311 R 0.086 +312 F 0.093 +313 L 0.102 +314 G 0.110 +315 A 0.116 +316 D 0.119 +317 K 0.118 +318 C 0.113 +319 M 0.108 +320 Y 0.106 +321 P 0.105 +322 F 0.102 +323 L 0.100 +324 A 0.105 +325 Q 0.117 +326 R 0.132 +327 K 0.150 +328 E 0.176 +329 A 0.208 +330 M 0.242 +331 N 0.273 +332 N 0.302 +333 N 0.325 +334 E 0.341 +335 A 0.362 +336 K 0.394 +337 N 0.423 +338 G 0.430 +339 I 0.421 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000058730_ENSDART00000066703_GN:rdh10a_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000058730_ENSDART00000066703_GN:rdh10a_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:2.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..932a19c20a39267e341f192c9ada54b42ce5b1fd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000058730_ENSDART00000066703_GN:rdh10a_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:2.caid @@ -0,0 +1,342 @@ +>ENSDARG00000058730|ENSDART00000066703|GN:rdh10a|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:2 +1 M 0.218 +2 V 0.199 +3 M 0.178 +4 N 0.159 +5 I 0.136 +6 F 0.112 +7 V 0.094 +8 E 0.084 +9 F 0.076 +10 F 0.072 +11 L 0.077 +12 V 0.085 +13 M 0.087 +14 L 0.088 +15 K 0.092 +16 V 0.096 +17 C 0.093 +18 W 0.087 +19 A 0.083 +20 I 0.079 +21 V 0.075 +22 M 0.073 +23 A 0.076 +24 G 0.077 +25 F 0.076 +26 K 0.075 +27 W 0.078 +28 L 0.088 +29 I 0.108 +30 R 0.130 +31 P 0.143 +32 K 0.138 +33 E 0.123 +34 K 0.112 +35 S 0.108 +36 V 0.105 +37 A 0.097 +38 G 0.080 +39 Q 0.059 +40 V 0.043 +41 C 0.034 +42 V 0.031 +43 I 0.030 +44 T 0.032 +45 G 0.038 +46 A 0.047 +47 G 0.054 +48 G 0.057 +49 G 0.057 +50 L 0.053 +51 G 0.046 +52 R 0.040 +53 L 0.038 +54 F 0.040 +55 A 0.041 +56 K 0.037 +57 E 0.030 +58 F 0.029 +59 A 0.035 +60 R 0.046 +61 R 0.061 +62 R 0.077 +63 A 0.086 +64 T 0.080 +65 L 0.065 +66 V 0.051 +67 L 0.042 +68 W 0.040 +69 D 0.041 +70 I 0.044 +71 N 0.048 +72 S 0.050 +73 H 0.047 +74 S 0.041 +75 N 0.037 +76 E 0.038 +77 E 0.045 +78 T 0.059 +79 A 0.075 +80 E 0.081 +81 M 0.077 +82 V 0.074 +83 R 0.080 +84 Q 0.089 +85 I 0.091 +86 Y 0.091 +87 R 0.102 +88 E 0.137 +89 Q 0.200 +90 D 0.283 +91 N 0.366 +92 P 0.431 +93 M 0.481 +94 S 0.528 +95 K 0.572 +96 E 0.602 +97 G 0.618 +98 A 0.627 +99 V 0.635 +100 G 0.640 +101 G 0.630 +102 V 0.597 +103 E 0.541 +104 E 0.476 +105 V 0.409 +106 P 0.343 +107 P 0.278 +108 F 0.219 +109 Q 0.172 +110 P 0.135 +111 Q 0.107 +112 V 0.086 +113 Y 0.070 +114 T 0.059 +115 Y 0.050 +116 V 0.044 +117 L 0.039 +118 D 0.038 +119 V 0.040 +120 G 0.040 +121 K 0.038 +122 R 0.034 +123 E 0.032 +124 S 0.032 +125 V 0.038 +126 Y 0.050 +127 S 0.058 +128 T 0.059 +129 A 0.059 +130 E 0.057 +131 K 0.050 +132 V 0.047 +133 R 0.054 +134 K 0.061 +135 E 0.060 +136 V 0.054 +137 G 0.050 +138 E 0.047 +139 V 0.045 +140 D 0.045 +141 L 0.047 +142 L 0.051 +143 I 0.056 +144 N 0.060 +145 N 0.065 +146 A 0.069 +147 G 0.070 +148 V 0.071 +149 V 0.071 +150 S 0.072 +151 G 0.076 +152 H 0.086 +153 H 0.096 +154 L 0.103 +155 L 0.106 +156 E 0.109 +157 C 0.110 +158 P 0.101 +159 D 0.084 +160 E 0.070 +161 L 0.063 +162 I 0.062 +163 E 0.063 +164 R 0.062 +165 T 0.060 +166 M 0.059 +167 V 0.061 +168 V 0.064 +169 N 0.065 +170 C 0.066 +171 H 0.073 +172 A 0.080 +173 H 0.076 +174 F 0.062 +175 W 0.051 +176 T 0.048 +177 T 0.049 +178 K 0.048 +179 A 0.046 +180 F 0.042 +181 L 0.038 +182 P 0.035 +183 K 0.034 +184 M 0.036 +185 L 0.040 +186 E 0.045 +187 M 0.049 +188 N 0.050 +189 H 0.051 +190 G 0.055 +191 H 0.060 +192 I 0.062 +193 V 0.061 +194 T 0.062 +195 V 0.071 +196 A 0.083 +197 S 0.096 +198 S 0.108 +199 L 0.120 +200 G 0.126 +201 L 0.124 +202 F 0.119 +203 S 0.120 +204 T 0.123 +205 A 0.123 +206 G 0.120 +207 V 0.115 +208 E 0.107 +209 D 0.099 +210 Y 0.099 +211 C 0.108 +212 A 0.116 +213 S 0.115 +214 K 0.107 +215 F 0.095 +216 G 0.082 +217 A 0.073 +218 I 0.071 +219 G 0.076 +220 F 0.079 +221 H 0.073 +222 E 0.062 +223 S 0.057 +224 L 0.063 +225 S 0.072 +226 H 0.075 +227 E 0.071 +228 I 0.067 +229 Q 0.071 +230 A 0.079 +231 S 0.086 +232 E 0.088 +233 K 0.086 +234 D 0.085 +235 G 0.082 +236 I 0.072 +237 K 0.058 +238 M 0.046 +239 T 0.043 +240 L 0.048 +241 V 0.056 +242 C 0.061 +243 P 0.064 +244 Y 0.067 +245 L 0.072 +246 V 0.076 +247 D 0.076 +248 T 0.075 +249 G 0.076 +250 M 0.082 +251 F 0.092 +252 R 0.109 +253 G 0.131 +254 C 0.152 +255 R 0.162 +256 I 0.158 +257 R 0.145 +258 K 0.134 +259 E 0.126 +260 I 0.118 +261 E 0.107 +262 P 0.101 +263 F 0.106 +264 L 0.122 +265 P 0.136 +266 P 0.136 +267 L 0.121 +268 R 0.104 +269 P 0.088 +270 E 0.074 +271 F 0.063 +272 C 0.057 +273 V 0.052 +274 K 0.050 +275 Q 0.054 +276 A 0.058 +277 M 0.058 +278 R 0.057 +279 A 0.061 +280 I 0.070 +281 L 0.082 +282 T 0.095 +283 D 0.104 +284 Q 0.109 +285 P 0.111 +286 M 0.109 +287 I 0.102 +288 C 0.088 +289 T 0.072 +290 P 0.060 +291 R 0.054 +292 I 0.049 +293 V 0.044 +294 Y 0.039 +295 M 0.039 +296 V 0.042 +297 N 0.046 +298 F 0.048 +299 M 0.051 +300 K 0.056 +301 S 0.061 +302 I 0.064 +303 L 0.067 +304 P 0.071 +305 F 0.071 +306 E 0.068 +307 A 0.067 +308 I 0.074 +309 V 0.087 +310 C 0.093 +311 M 0.090 +312 Y 0.085 +313 R 0.085 +314 F 0.092 +315 L 0.102 +316 G 0.110 +317 A 0.116 +318 D 0.119 +319 K 0.118 +320 C 0.114 +321 M 0.109 +322 Y 0.107 +323 P 0.106 +324 F 0.102 +325 L 0.101 +326 A 0.105 +327 Q 0.117 +328 R 0.132 +329 K 0.150 +330 E 0.176 +331 A 0.208 +332 M 0.241 +333 N 0.272 +334 N 0.301 +335 N 0.323 +336 E 0.340 +337 A 0.360 +338 K 0.392 +339 N 0.422 +340 G 0.429 +341 I 0.420 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000070579_ENSDART00000103785_GN:ggact.3_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000070579_ENSDART00000103785_GN:ggact.3_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..258c7a4788a5a57224f55f3e1fac8fd9ddc13e0c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000070579_ENSDART00000103785_GN:ggact.3_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,153 @@ +>ENSDARG00000070579|ENSDART00000103785|GN:ggact.3|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.259 +2 S 0.214 +3 T 0.150 +4 H 0.095 +5 H 0.059 +6 V 0.042 +7 F 0.036 +8 V 0.034 +9 Y 0.036 +10 G 0.043 +11 S 0.058 +12 L 0.072 +13 K 0.080 +14 K 0.083 +15 G 0.082 +16 Q 0.079 +17 P 0.076 +18 N 0.073 +19 H 0.073 +20 H 0.080 +21 E 0.092 +22 L 0.109 +23 L 0.127 +24 N 0.144 +25 S 0.156 +26 N 0.164 +27 N 0.166 +28 G 0.154 +29 Q 0.129 +30 A 0.099 +31 E 0.075 +32 F 0.060 +33 I 0.051 +34 T 0.047 +35 C 0.047 +36 A 0.050 +37 Q 0.055 +38 T 0.064 +39 K 0.075 +40 E 0.081 +41 P 0.080 +42 Y 0.078 +43 P 0.079 +44 L 0.082 +45 V 0.084 +46 I 0.085 +47 A 0.086 +48 T 0.091 +49 K 0.097 +50 H 0.099 +51 N 0.094 +52 I 0.088 +53 P 0.086 +54 F 0.088 +55 L 0.094 +56 L 0.102 +57 N 0.108 +58 V 0.114 +59 P 0.121 +60 G 0.128 +61 S 0.130 +62 G 0.128 +63 K 0.129 +64 Q 0.132 +65 V 0.127 +66 S 0.107 +67 G 0.082 +68 E 0.063 +69 I 0.051 +70 Y 0.046 +71 S 0.046 +72 V 0.049 +73 D 0.051 +74 Q 0.051 +75 K 0.052 +76 M 0.056 +77 L 0.065 +78 E 0.072 +79 F 0.070 +80 L 0.062 +81 D 0.055 +82 W 0.050 +83 F 0.046 +84 E 0.042 +85 K 0.038 +86 C 0.038 +87 P 0.039 +88 D 0.040 +89 W 0.042 +90 Y 0.045 +91 Q 0.044 +92 R 0.042 +93 T 0.040 +94 S 0.040 +95 I 0.040 +96 Q 0.037 +97 L 0.038 +98 E 0.046 +99 I 0.066 +100 L 0.097 +101 K 0.130 +102 G 0.157 +103 N 0.171 +104 G 0.175 +105 E 0.173 +106 S 0.169 +107 G 0.160 +108 R 0.143 +109 I 0.121 +110 E 0.094 +111 E 0.071 +112 A 0.057 +113 S 0.052 +114 V 0.051 +115 Y 0.051 +116 S 0.052 +117 K 0.058 +118 I 0.068 +119 N 0.080 +120 F 0.088 +121 E 0.092 +122 P 0.094 +123 D 0.095 +124 W 0.094 +125 L 0.091 +126 N 0.087 +127 K 0.083 +128 P 0.081 +129 T 0.084 +130 H 0.096 +131 E 0.115 +132 S 0.137 +133 Y 0.155 +134 D 0.177 +135 T 0.216 +136 N 0.270 +137 G 0.321 +138 D 0.348 +139 H 0.355 +140 G 0.350 +141 L 0.339 +142 K 0.327 +143 F 0.324 +144 V 0.342 +145 C 0.385 +146 R 0.446 +147 E 0.506 +148 D 0.548 +149 R 0.565 +150 K 0.558 +151 D 0.528 +152 D 0.499 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000070579_ENSDART00000103785_GN:ggact.3_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:35.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000070579_ENSDART00000103785_GN:ggact.3_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:35.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..8606bc2607ef8c996b96c30627846a37a4581913 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000070579_ENSDART00000103785_GN:ggact.3_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:35.caid @@ -0,0 +1,188 @@ +>ENSDARG00000070579|ENSDART00000103785|GN:ggact.3|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:35 +1 M 0.393 +2 K 0.416 +3 L 0.450 +4 L 0.464 +5 I 0.439 +6 K 0.405 +7 H 0.415 +8 S 0.470 +9 V 0.524 +10 R 0.557 +11 P 0.581 +12 S 0.600 +13 R 0.613 +14 K 0.623 +15 K 0.632 +16 G 0.636 +17 F 0.631 +18 F 0.625 +19 S 0.621 +20 I 0.612 +21 L 0.604 +22 S 0.606 +23 V 0.617 +24 L 0.627 +25 V 0.636 +26 M 0.644 +27 N 0.652 +28 S 0.661 +29 T 0.668 +30 M 0.673 +31 N 0.675 +32 T 0.673 +33 T 0.656 +34 V 0.617 +35 S 0.542 +36 M 0.429 +37 S 0.297 +38 T 0.180 +39 H 0.101 +40 H 0.059 +41 V 0.041 +42 F 0.036 +43 V 0.035 +44 Y 0.035 +45 G 0.040 +46 S 0.053 +47 L 0.066 +48 K 0.074 +49 K 0.077 +50 G 0.077 +51 Q 0.076 +52 P 0.074 +53 N 0.072 +54 H 0.072 +55 H 0.078 +56 E 0.089 +57 L 0.104 +58 L 0.122 +59 N 0.139 +60 S 0.152 +61 N 0.159 +62 N 0.159 +63 G 0.146 +64 Q 0.120 +65 A 0.092 +66 E 0.071 +67 F 0.057 +68 I 0.049 +69 T 0.045 +70 C 0.045 +71 A 0.048 +72 Q 0.052 +73 T 0.061 +74 K 0.071 +75 E 0.078 +76 P 0.077 +77 Y 0.076 +78 P 0.077 +79 L 0.078 +80 V 0.079 +81 I 0.080 +82 A 0.081 +83 T 0.085 +84 K 0.091 +85 H 0.093 +86 N 0.088 +87 I 0.082 +88 P 0.081 +89 F 0.083 +90 L 0.089 +91 L 0.096 +92 N 0.102 +93 V 0.107 +94 P 0.113 +95 G 0.119 +96 S 0.123 +97 G 0.122 +98 K 0.123 +99 Q 0.126 +100 V 0.121 +101 S 0.101 +102 G 0.077 +103 E 0.059 +104 I 0.048 +105 Y 0.042 +106 S 0.041 +107 V 0.042 +108 D 0.044 +109 Q 0.045 +110 K 0.048 +111 M 0.054 +112 L 0.063 +113 E 0.071 +114 F 0.069 +115 L 0.060 +116 D 0.053 +117 W 0.049 +118 F 0.045 +119 E 0.041 +120 K 0.038 +121 C 0.037 +122 P 0.038 +123 D 0.039 +124 W 0.041 +125 Y 0.043 +126 Q 0.042 +127 R 0.040 +128 T 0.039 +129 S 0.039 +130 I 0.038 +131 Q 0.036 +132 L 0.037 +133 E 0.045 +134 I 0.064 +135 L 0.093 +136 K 0.124 +137 G 0.150 +138 N 0.166 +139 G 0.172 +140 E 0.174 +141 S 0.173 +142 G 0.165 +143 R 0.149 +144 I 0.125 +145 E 0.097 +146 E 0.072 +147 A 0.057 +148 S 0.052 +149 V 0.051 +150 Y 0.052 +151 S 0.055 +152 K 0.061 +153 I 0.073 +154 N 0.083 +155 F 0.090 +156 E 0.094 +157 P 0.096 +158 D 0.096 +159 W 0.094 +160 L 0.090 +161 N 0.085 +162 K 0.082 +163 P 0.080 +164 T 0.085 +165 H 0.098 +166 E 0.120 +167 S 0.142 +168 Y 0.159 +169 D 0.179 +170 T 0.216 +171 N 0.271 +172 G 0.323 +173 D 0.352 +174 H 0.360 +175 G 0.356 +176 L 0.345 +177 K 0.332 +178 F 0.330 +179 V 0.349 +180 C 0.393 +181 R 0.454 +182 E 0.514 +183 D 0.554 +184 R 0.568 +185 K 0.557 +186 D 0.526 +187 D 0.496 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000071669_ENSDART00000021657_GN:smyd5_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000071669_ENSDART00000021657_GN:smyd5_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f987b2f63a7d1ea47511dedea12c9bf40514e655 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000071669_ENSDART00000021657_GN:smyd5_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,416 @@ +>ENSDARG00000071669|ENSDART00000021657|GN:smyd5|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.367 +2 A 0.359 +3 A 0.338 +4 P 0.299 +5 V 0.247 +6 D 0.195 +7 D 0.152 +8 M 0.116 +9 F 0.091 +10 S 0.080 +11 R 0.082 +12 C 0.088 +13 V 0.092 +14 D 0.096 +15 S 0.105 +16 A 0.117 +17 K 0.124 +18 A 0.122 +19 S 0.105 +20 N 0.077 +21 C 0.050 +22 V 0.035 +23 D 0.032 +24 V 0.036 +25 R 0.045 +26 F 0.057 +27 I 0.066 +28 N 0.071 +29 N 0.074 +30 V 0.077 +31 K 0.077 +32 G 0.074 +33 K 0.072 +34 G 0.074 +35 L 0.077 +36 F 0.082 +37 A 0.089 +38 K 0.097 +39 K 0.104 +40 P 0.110 +41 F 0.115 +42 K 0.118 +43 K 0.124 +44 G 0.135 +45 D 0.149 +46 T 0.158 +47 I 0.161 +48 F 0.159 +49 I 0.156 +50 E 0.153 +51 R 0.146 +52 P 0.139 +53 L 0.133 +54 V 0.128 +55 S 0.122 +56 S 0.112 +57 Q 0.101 +58 F 0.095 +59 L 0.095 +60 W 0.097 +61 N 0.097 +62 A 0.098 +63 L 0.104 +64 Y 0.114 +65 K 0.121 +66 Y 0.118 +67 R 0.105 +68 A 0.088 +69 C 0.071 +70 E 0.058 +71 Y 0.051 +72 C 0.051 +73 L 0.057 +74 R 0.068 +75 A 0.079 +76 L 0.086 +77 E 0.084 +78 T 0.078 +79 A 0.073 +80 E 0.068 +81 E 0.064 +82 N 0.062 +83 A 0.064 +84 R 0.071 +85 R 0.083 +86 L 0.097 +87 S 0.108 +88 G 0.113 +89 L 0.112 +90 P 0.106 +91 A 0.098 +92 L 0.097 +93 I 0.100 +94 L 0.103 +95 P 0.101 +96 H 0.095 +97 P 0.090 +98 E 0.089 +99 L 0.095 +100 C 0.108 +101 K 0.128 +102 V 0.149 +103 R 0.163 +104 P 0.164 +105 D 0.151 +106 R 0.130 +107 H 0.110 +108 Q 0.097 +109 A 0.092 +110 C 0.092 +111 P 0.097 +112 Q 0.103 +113 C 0.104 +114 Q 0.100 +115 V 0.097 +116 M 0.101 +117 Y 0.109 +118 C 0.110 +119 S 0.095 +120 S 0.077 +121 E 0.068 +122 C 0.070 +123 R 0.076 +124 Q 0.077 +125 A 0.070 +126 A 0.059 +127 M 0.053 +128 D 0.051 +129 Q 0.049 +130 Y 0.047 +131 H 0.045 +132 K 0.047 +133 I 0.051 +134 L 0.054 +135 C 0.056 +136 L 0.062 +137 G 0.072 +138 P 0.084 +139 S 0.095 +140 N 0.107 +141 D 0.119 +142 D 0.128 +143 P 0.130 +144 D 0.126 +145 H 0.116 +146 P 0.100 +147 V 0.082 +148 N 0.068 +149 K 0.061 +150 L 0.059 +151 Q 0.057 +152 D 0.057 +153 A 0.056 +154 W 0.055 +155 R 0.057 +156 S 0.062 +157 V 0.067 +158 H 0.069 +159 F 0.070 +160 P 0.075 +161 P 0.084 +162 E 0.095 +163 T 0.100 +164 S 0.098 +165 S 0.088 +166 V 0.076 +167 M 0.066 +168 I 0.059 +169 L 0.055 +170 A 0.049 +171 K 0.044 +172 M 0.038 +173 V 0.034 +174 A 0.034 +175 T 0.035 +176 I 0.035 +177 K 0.033 +178 Q 0.033 +179 T 0.035 +180 Q 0.039 +181 D 0.041 +182 K 0.038 +183 E 0.031 +184 R 0.025 +185 W 0.022 +186 Q 0.026 +187 R 0.034 +188 L 0.042 +189 F 0.046 +190 T 0.046 +191 N 0.046 +192 F 0.047 +193 C 0.051 +194 S 0.064 +195 R 0.083 +196 T 0.099 +197 A 0.102 +198 N 0.094 +199 E 0.085 +200 E 0.082 +201 E 0.082 +202 E 0.080 +203 I 0.072 +204 V 0.062 +205 H 0.055 +206 K 0.055 +207 L 0.058 +208 L 0.061 +209 G 0.061 +210 E 0.058 +211 K 0.053 +212 F 0.048 +213 Q 0.045 +214 G 0.044 +215 Q 0.043 +216 L 0.042 +217 G 0.041 +218 L 0.042 +219 L 0.047 +220 R 0.057 +221 N 0.064 +222 L 0.058 +223 F 0.046 +224 T 0.037 +225 T 0.034 +226 A 0.032 +227 L 0.028 +228 Y 0.026 +229 E 0.027 +230 D 0.030 +231 R 0.032 +232 L 0.035 +233 S 0.037 +234 Q 0.035 +235 W 0.032 +236 F 0.031 +237 T 0.032 +238 P 0.034 +239 E 0.036 +240 G 0.039 +241 F 0.044 +242 R 0.052 +243 S 0.067 +244 L 0.080 +245 F 0.085 +246 S 0.084 +247 L 0.088 +248 V 0.093 +249 G 0.096 +250 T 0.095 +251 N 0.098 +252 G 0.107 +253 Q 0.123 +254 G 0.140 +255 I 0.154 +256 G 0.161 +257 T 0.155 +258 S 0.138 +259 S 0.114 +260 L 0.093 +261 S 0.079 +262 Q 0.071 +263 W 0.069 +264 V 0.073 +265 H 0.080 +266 A 0.082 +267 C 0.081 +268 D 0.081 +269 A 0.084 +270 L 0.091 +271 E 0.100 +272 L 0.106 +273 P 0.102 +274 R 0.089 +275 Q 0.074 +276 Q 0.066 +277 R 0.066 +278 E 0.069 +279 Q 0.074 +280 L 0.082 +281 D 0.092 +282 A 0.099 +283 F 0.098 +284 I 0.089 +285 D 0.078 +286 Q 0.072 +287 L 0.072 +288 Y 0.078 +289 K 0.088 +290 D 0.096 +291 I 0.097 +292 D 0.096 +293 K 0.100 +294 E 0.116 +295 T 0.140 +296 G 0.167 +297 D 0.190 +298 F 0.198 +299 L 0.186 +300 N 0.166 +301 C 0.147 +302 E 0.133 +303 G 0.121 +304 S 0.112 +305 G 0.108 +306 L 0.105 +307 F 0.094 +308 L 0.083 +309 L 0.083 +310 Q 0.092 +311 S 0.097 +312 S 0.093 +313 C 0.084 +314 N 0.078 +315 H 0.077 +316 S 0.080 +317 C 0.087 +318 V 0.091 +319 P 0.089 +320 N 0.084 +321 A 0.082 +322 E 0.087 +323 A 0.095 +324 S 0.103 +325 F 0.109 +326 P 0.109 +327 E 0.102 +328 N 0.089 +329 N 0.077 +330 F 0.068 +331 L 0.065 +332 L 0.066 +333 H 0.071 +334 L 0.082 +335 T 0.103 +336 A 0.127 +337 L 0.144 +338 G 0.149 +339 D 0.149 +340 I 0.153 +341 G 0.161 +342 P 0.171 +343 G 0.178 +344 E 0.181 +345 E 0.181 +346 I 0.173 +347 C 0.158 +348 I 0.147 +349 S 0.141 +350 Y 0.139 +351 L 0.144 +352 D 0.158 +353 C 0.168 +354 C 0.164 +355 Q 0.154 +356 R 0.151 +357 D 0.154 +358 R 0.153 +359 S 0.143 +360 R 0.121 +361 H 0.098 +362 S 0.087 +363 R 0.090 +364 H 0.098 +365 K 0.102 +366 I 0.098 +367 L 0.088 +368 R 0.073 +369 E 0.060 +370 N 0.051 +371 Y 0.048 +372 L 0.049 +373 F 0.053 +374 I 0.054 +375 C 0.050 +376 S 0.046 +377 C 0.049 +378 Q 0.059 +379 K 0.070 +380 C 0.077 +381 L 0.084 +382 S 0.104 +383 Q 0.142 +384 M 0.193 +385 D 0.249 +386 D 0.304 +387 A 0.351 +388 D 0.382 +389 M 0.404 +390 T 0.432 +391 S 0.463 +392 E 0.482 +393 D 0.487 +394 E 0.491 +395 E 0.507 +396 E 0.538 +397 V 0.576 +398 E 0.611 +399 G 0.634 +400 E 0.632 +401 G 0.593 +402 E 0.533 +403 T 0.492 +404 E 0.487 +405 G 0.491 +406 E 0.496 +407 D 0.518 +408 M 0.536 +409 E 0.524 +410 D 0.511 +411 E 0.531 +412 M 0.558 +413 T 0.554 +414 D 0.515 +415 V 0.477 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000071669_ENSDART00000021657_GN:smyd5_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:28.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000071669_ENSDART00000021657_GN:smyd5_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:28.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..3a8ed6e8a8e0fb7836f3a7f6987bd9e60f886d8d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000071669_ENSDART00000021657_GN:smyd5_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:28.caid @@ -0,0 +1,444 @@ +>ENSDARG00000071669|ENSDART00000021657|GN:smyd5|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:28 +1 M 0.232 +2 L 0.219 +3 K 0.208 +4 K 0.214 +5 E 0.228 +6 R 0.231 +7 R 0.227 +8 S 0.236 +9 L 0.255 +10 S 0.262 +11 R 0.251 +12 T 0.240 +13 L 0.238 +14 I 0.242 +15 G 0.245 +16 Q 0.246 +17 V 0.242 +18 E 0.230 +19 R 0.216 +20 L 0.211 +21 E 0.216 +22 V 0.222 +23 K 0.227 +24 M 0.242 +25 L 0.267 +26 I 0.293 +27 S 0.317 +28 N 0.342 +29 M 0.360 +30 A 0.358 +31 A 0.331 +32 P 0.287 +33 V 0.237 +34 D 0.193 +35 D 0.159 +36 M 0.130 +37 F 0.108 +38 S 0.097 +39 R 0.096 +40 C 0.099 +41 V 0.101 +42 D 0.102 +43 S 0.108 +44 A 0.117 +45 K 0.122 +46 A 0.119 +47 S 0.102 +48 N 0.075 +49 C 0.049 +50 V 0.035 +51 D 0.032 +52 V 0.037 +53 R 0.047 +54 F 0.059 +55 I 0.068 +56 N 0.073 +57 N 0.076 +58 V 0.077 +59 K 0.075 +60 G 0.071 +61 K 0.069 +62 G 0.071 +63 L 0.074 +64 F 0.080 +65 A 0.088 +66 K 0.096 +67 K 0.105 +68 P 0.112 +69 F 0.116 +70 K 0.118 +71 K 0.121 +72 G 0.129 +73 D 0.142 +74 T 0.151 +75 I 0.155 +76 F 0.155 +77 I 0.154 +78 E 0.151 +79 R 0.145 +80 P 0.138 +81 L 0.133 +82 V 0.129 +83 S 0.122 +84 S 0.111 +85 Q 0.099 +86 F 0.093 +87 L 0.092 +88 W 0.094 +89 N 0.094 +90 A 0.096 +91 L 0.102 +92 Y 0.111 +93 K 0.115 +94 Y 0.111 +95 R 0.100 +96 A 0.084 +97 C 0.068 +98 E 0.056 +99 Y 0.049 +100 C 0.049 +101 L 0.055 +102 R 0.065 +103 A 0.078 +104 L 0.085 +105 E 0.085 +106 T 0.079 +107 A 0.073 +108 E 0.067 +109 E 0.063 +110 N 0.061 +111 A 0.062 +112 R 0.069 +113 R 0.080 +114 L 0.094 +115 S 0.105 +116 G 0.111 +117 L 0.110 +118 P 0.105 +119 A 0.101 +120 L 0.102 +121 I 0.106 +122 L 0.108 +123 P 0.105 +124 H 0.099 +125 P 0.093 +126 E 0.092 +127 L 0.099 +128 C 0.114 +129 K 0.136 +130 V 0.158 +131 R 0.173 +132 P 0.174 +133 D 0.161 +134 R 0.137 +135 H 0.115 +136 Q 0.099 +137 A 0.093 +138 C 0.092 +139 P 0.096 +140 Q 0.103 +141 C 0.105 +142 Q 0.103 +143 V 0.102 +144 M 0.106 +145 Y 0.114 +146 C 0.113 +147 S 0.097 +148 S 0.077 +149 E 0.068 +150 C 0.070 +151 R 0.075 +152 Q 0.076 +153 A 0.069 +154 A 0.058 +155 M 0.052 +156 D 0.050 +157 Q 0.049 +158 Y 0.046 +159 H 0.044 +160 K 0.046 +161 I 0.050 +162 L 0.053 +163 C 0.055 +164 L 0.062 +165 G 0.073 +166 P 0.085 +167 S 0.096 +168 N 0.107 +169 D 0.119 +170 D 0.127 +171 P 0.128 +172 D 0.123 +173 H 0.113 +174 P 0.098 +175 V 0.080 +176 N 0.067 +177 K 0.060 +178 L 0.057 +179 Q 0.057 +180 D 0.056 +181 A 0.055 +182 W 0.055 +183 R 0.057 +184 S 0.062 +185 V 0.066 +186 H 0.067 +187 F 0.067 +188 P 0.071 +189 P 0.081 +190 E 0.091 +191 T 0.097 +192 S 0.094 +193 S 0.085 +194 V 0.074 +195 M 0.064 +196 I 0.058 +197 L 0.054 +198 A 0.048 +199 K 0.042 +200 M 0.037 +201 V 0.033 +202 A 0.032 +203 T 0.032 +204 I 0.032 +205 K 0.030 +206 Q 0.030 +207 T 0.033 +208 Q 0.036 +209 D 0.038 +210 K 0.035 +211 E 0.028 +212 R 0.022 +213 W 0.020 +214 Q 0.023 +215 R 0.030 +216 L 0.038 +217 F 0.042 +218 T 0.042 +219 N 0.041 +220 F 0.042 +221 C 0.046 +222 S 0.057 +223 R 0.075 +224 T 0.091 +225 A 0.095 +226 N 0.087 +227 E 0.079 +228 E 0.077 +229 E 0.077 +230 E 0.074 +231 I 0.066 +232 V 0.056 +233 H 0.049 +234 K 0.048 +235 L 0.052 +236 L 0.055 +237 G 0.056 +238 E 0.053 +239 K 0.049 +240 F 0.044 +241 Q 0.041 +242 G 0.040 +243 Q 0.039 +244 L 0.039 +245 G 0.038 +246 L 0.039 +247 L 0.045 +248 R 0.056 +249 N 0.062 +250 L 0.057 +251 F 0.044 +252 T 0.035 +253 T 0.031 +254 A 0.029 +255 L 0.026 +256 Y 0.025 +257 E 0.026 +258 D 0.029 +259 R 0.032 +260 L 0.035 +261 S 0.038 +262 Q 0.036 +263 W 0.033 +264 F 0.032 +265 T 0.033 +266 P 0.034 +267 E 0.036 +268 G 0.039 +269 F 0.044 +270 R 0.052 +271 S 0.067 +272 L 0.080 +273 F 0.084 +274 S 0.084 +275 L 0.087 +276 V 0.092 +277 G 0.095 +278 T 0.095 +279 N 0.098 +280 G 0.107 +281 Q 0.123 +282 G 0.139 +283 I 0.153 +284 G 0.159 +285 T 0.154 +286 S 0.138 +287 S 0.115 +288 L 0.094 +289 S 0.079 +290 Q 0.067 +291 W 0.058 +292 V 0.053 +293 H 0.055 +294 A 0.063 +295 C 0.073 +296 D 0.081 +297 A 0.087 +298 L 0.094 +299 E 0.104 +300 L 0.110 +301 P 0.107 +302 R 0.093 +303 Q 0.077 +304 Q 0.065 +305 R 0.060 +306 E 0.060 +307 Q 0.066 +308 L 0.078 +309 D 0.090 +310 A 0.098 +311 F 0.096 +312 I 0.089 +313 D 0.080 +314 Q 0.076 +315 L 0.077 +316 Y 0.084 +317 K 0.095 +318 D 0.103 +319 I 0.104 +320 D 0.101 +321 K 0.104 +322 E 0.118 +323 T 0.142 +324 G 0.171 +325 D 0.195 +326 F 0.203 +327 L 0.191 +328 N 0.170 +329 C 0.151 +330 E 0.136 +331 G 0.124 +332 S 0.115 +333 G 0.111 +334 L 0.107 +335 F 0.096 +336 L 0.085 +337 L 0.085 +338 Q 0.094 +339 S 0.099 +340 S 0.095 +341 C 0.086 +342 N 0.080 +343 H 0.079 +344 S 0.083 +345 C 0.090 +346 V 0.094 +347 P 0.092 +348 N 0.087 +349 A 0.085 +350 E 0.089 +351 A 0.097 +352 S 0.104 +353 F 0.110 +354 P 0.109 +355 E 0.100 +356 N 0.087 +357 N 0.075 +358 F 0.066 +359 L 0.064 +360 L 0.066 +361 H 0.071 +362 L 0.083 +363 T 0.103 +364 A 0.127 +365 L 0.144 +366 G 0.150 +367 D 0.150 +368 I 0.154 +369 G 0.162 +370 P 0.172 +371 G 0.178 +372 E 0.181 +373 E 0.180 +374 I 0.172 +375 C 0.158 +376 I 0.148 +377 S 0.143 +378 Y 0.141 +379 L 0.145 +380 D 0.157 +381 C 0.167 +382 C 0.163 +383 Q 0.153 +384 R 0.150 +385 D 0.153 +386 R 0.154 +387 S 0.144 +388 R 0.123 +389 H 0.100 +390 S 0.089 +391 R 0.091 +392 H 0.098 +393 K 0.102 +394 I 0.099 +395 L 0.088 +396 R 0.074 +397 E 0.060 +398 N 0.051 +399 Y 0.048 +400 L 0.049 +401 F 0.054 +402 I 0.055 +403 C 0.051 +404 S 0.047 +405 C 0.051 +406 Q 0.060 +407 K 0.071 +408 C 0.078 +409 L 0.085 +410 S 0.105 +411 Q 0.143 +412 M 0.194 +413 D 0.249 +414 D 0.306 +415 A 0.354 +416 D 0.387 +417 M 0.412 +418 T 0.442 +419 S 0.473 +420 E 0.491 +421 D 0.496 +422 E 0.500 +423 E 0.516 +424 E 0.546 +425 V 0.584 +426 E 0.619 +427 G 0.642 +428 E 0.640 +429 G 0.602 +430 E 0.541 +431 T 0.499 +432 E 0.494 +433 G 0.497 +434 E 0.502 +435 D 0.525 +436 M 0.543 +437 E 0.530 +438 D 0.519 +439 E 0.541 +440 M 0.572 +441 T 0.569 +442 D 0.528 +443 V 0.487 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000086458_ENSDART00000127600_GN:hdac10_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000086458_ENSDART00000127600_GN:hdac10_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..192f11bb2e897aaf426ce2ca620116f3ee4ae511 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000086458_ENSDART00000127600_GN:hdac10_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,676 @@ +>ENSDARG00000086458|ENSDART00000127600|GN:hdac10|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.320 +2 A 0.289 +3 S 0.230 +4 G 0.160 +5 S 0.104 +6 A 0.076 +7 L 0.072 +8 I 0.079 +9 F 0.087 +10 D 0.094 +11 E 0.103 +12 E 0.109 +13 M 0.110 +14 S 0.107 +15 R 0.107 +16 Y 0.112 +17 K 0.124 +18 L 0.143 +19 L 0.168 +20 W 0.196 +21 T 0.218 +22 D 0.230 +23 P 0.235 +24 A 0.240 +25 C 0.239 +26 E 0.230 +27 I 0.220 +28 E 0.215 +29 V 0.208 +30 P 0.189 +31 E 0.163 +32 R 0.139 +33 L 0.121 +34 T 0.109 +35 V 0.107 +36 S 0.115 +37 Y 0.122 +38 E 0.121 +39 A 0.115 +40 L 0.107 +41 R 0.098 +42 T 0.090 +43 H 0.087 +44 G 0.091 +45 L 0.098 +46 A 0.102 +47 Q 0.103 +48 R 0.104 +49 C 0.110 +50 K 0.119 +51 A 0.128 +52 V 0.128 +53 P 0.117 +54 V 0.104 +55 R 0.097 +56 Q 0.092 +57 A 0.085 +58 T 0.079 +59 E 0.081 +60 Q 0.087 +61 E 0.088 +62 I 0.083 +63 L 0.080 +64 L 0.084 +65 A 0.088 +66 H 0.082 +67 S 0.068 +68 E 0.056 +69 E 0.051 +70 Y 0.048 +71 L 0.045 +72 E 0.043 +73 A 0.046 +74 V 0.054 +75 K 0.062 +76 Q 0.071 +77 T 0.081 +78 P 0.088 +79 G 0.089 +80 M 0.084 +81 N 0.075 +82 V 0.064 +83 E 0.058 +84 E 0.060 +85 L 0.070 +86 M 0.086 +87 A 0.101 +88 F 0.110 +89 S 0.109 +90 K 0.103 +91 K 0.098 +92 Y 0.099 +93 N 0.106 +94 D 0.117 +95 V 0.125 +96 Y 0.124 +97 F 0.115 +98 H 0.105 +99 Q 0.105 +100 N 0.114 +101 I 0.122 +102 Y 0.126 +103 H 0.135 +104 C 0.148 +105 A 0.151 +106 K 0.138 +107 L 0.127 +108 A 0.124 +109 A 0.118 +110 G 0.107 +111 A 0.098 +112 T 0.088 +113 L 0.073 +114 Q 0.059 +115 L 0.050 +116 V 0.047 +117 D 0.044 +118 S 0.044 +119 V 0.046 +120 M 0.049 +121 K 0.052 +122 R 0.057 +123 E 0.060 +124 V 0.062 +125 R 0.069 +126 N 0.086 +127 G 0.113 +128 M 0.144 +129 A 0.170 +130 L 0.187 +131 V 0.198 +132 R 0.204 +133 P 0.201 +134 P 0.186 +135 G 0.167 +136 H 0.155 +137 H 0.151 +138 S 0.147 +139 Q 0.142 +140 R 0.146 +141 S 0.168 +142 A 0.199 +143 A 0.213 +144 N 0.204 +145 G 0.189 +146 F 0.183 +147 C 0.178 +148 V 0.167 +149 F 0.153 +150 N 0.143 +151 N 0.132 +152 V 0.118 +153 A 0.106 +154 I 0.098 +155 A 0.087 +156 A 0.074 +157 L 0.064 +158 Y 0.056 +159 A 0.049 +160 K 0.043 +161 K 0.041 +162 N 0.042 +163 Y 0.044 +164 N 0.046 +165 L 0.046 +166 N 0.048 +167 R 0.058 +168 I 0.079 +169 L 0.108 +170 I 0.140 +171 V 0.161 +172 D 0.156 +173 W 0.127 +174 D 0.093 +175 V 0.072 +176 H 0.068 +177 H 0.076 +178 G 0.090 +179 Q 0.107 +180 G 0.121 +181 I 0.122 +182 Q 0.112 +183 Y 0.101 +184 C 0.093 +185 F 0.085 +186 E 0.077 +187 E 0.072 +188 D 0.071 +189 P 0.070 +190 S 0.072 +191 V 0.077 +192 L 0.083 +193 Y 0.086 +194 F 0.087 +195 S 0.087 +196 W 0.084 +197 H 0.078 +198 R 0.074 +199 Y 0.076 +200 E 0.086 +201 H 0.098 +202 Q 0.102 +203 S 0.097 +204 F 0.088 +205 W 0.086 +206 P 0.095 +207 N 0.112 +208 L 0.127 +209 P 0.137 +210 E 0.142 +211 S 0.141 +212 D 0.135 +213 Y 0.130 +214 S 0.134 +215 S 0.145 +216 V 0.154 +217 G 0.156 +218 K 0.157 +219 G 0.168 +220 K 0.194 +221 G 0.222 +222 S 0.233 +223 G 0.228 +224 F 0.219 +225 N 0.219 +226 I 0.221 +227 N 0.217 +228 L 0.201 +229 P 0.180 +230 W 0.161 +231 N 0.146 +232 K 0.141 +233 V 0.146 +234 G 0.152 +235 M 0.146 +236 T 0.132 +237 N 0.123 +238 S 0.124 +239 D 0.121 +240 Y 0.109 +241 L 0.098 +242 A 0.095 +243 A 0.096 +244 F 0.089 +245 F 0.077 +246 H 0.067 +247 V 0.059 +248 L 0.048 +249 L 0.037 +250 P 0.031 +251 V 0.028 +252 A 0.026 +253 Y 0.028 +254 E 0.033 +255 F 0.042 +256 D 0.051 +257 P 0.061 +258 E 0.075 +259 L 0.098 +260 V 0.131 +261 I 0.166 +262 V 0.191 +263 S 0.199 +264 A 0.187 +265 G 0.169 +266 F 0.162 +267 D 0.165 +268 S 0.164 +269 A 0.151 +270 I 0.137 +271 G 0.131 +272 D 0.131 +273 P 0.129 +274 E 0.127 +275 G 0.129 +276 E 0.131 +277 M 0.129 +278 C 0.125 +279 A 0.120 +280 L 0.113 +281 P 0.103 +282 E 0.093 +283 I 0.087 +284 F 0.084 +285 A 0.082 +286 H 0.080 +287 L 0.078 +288 T 0.078 +289 H 0.076 +290 L 0.073 +291 L 0.066 +292 M 0.053 +293 P 0.041 +294 L 0.036 +295 A 0.042 +296 A 0.055 +297 G 0.069 +298 K 0.083 +299 M 0.099 +300 C 0.118 +301 V 0.133 +302 V 0.140 +303 L 0.138 +304 E 0.131 +305 G 0.126 +306 G 0.125 +307 Y 0.121 +308 N 0.111 +309 L 0.102 +310 T 0.100 +311 S 0.102 +312 L 0.099 +313 G 0.095 +314 Q 0.097 +315 S 0.102 +316 V 0.101 +317 C 0.098 +318 Q 0.096 +319 T 0.092 +320 V 0.086 +321 H 0.085 +322 S 0.090 +323 L 0.098 +324 L 0.117 +325 G 0.149 +326 D 0.185 +327 P 0.209 +328 T 0.219 +329 P 0.226 +330 R 0.242 +331 I 0.263 +332 S 0.277 +333 G 0.272 +334 L 0.252 +335 G 0.228 +336 T 0.209 +337 A 0.190 +338 C 0.164 +339 D 0.135 +340 S 0.116 +341 A 0.107 +342 L 0.104 +343 E 0.104 +344 S 0.106 +345 I 0.107 +346 Q 0.109 +347 N 0.113 +348 V 0.116 +349 R 0.114 +350 N 0.114 +351 V 0.117 +352 Q 0.114 +353 S 0.102 +354 S 0.085 +355 Y 0.070 +356 W 0.062 +357 S 0.061 +358 S 0.069 +359 F 0.084 +360 K 0.108 +361 H 0.149 +362 L 0.215 +363 A 0.294 +364 Q 0.370 +365 S 0.433 +366 E 0.482 +367 T 0.519 +368 N 0.542 +369 P 0.554 +370 K 0.563 +371 R 0.582 +372 P 0.616 +373 R 0.657 +374 L 0.693 +375 D 0.713 +376 A 0.715 +377 T 0.707 +378 N 0.694 +379 G 0.667 +380 G 0.608 +381 P 0.512 +382 K 0.425 +383 E 0.413 +384 S 0.479 +385 S 0.564 +386 E 0.624 +387 P 0.658 +388 A 0.674 +389 S 0.673 +390 E 0.660 +391 S 0.648 +392 N 0.642 +393 P 0.642 +394 K 0.646 +395 K 0.653 +396 T 0.660 +397 A 0.657 +398 Q 0.629 +399 D 0.569 +400 I 0.488 +401 V 0.415 +402 W 0.374 +403 P 0.369 +404 E 0.373 +405 P 0.357 +406 L 0.323 +407 K 0.290 +408 R 0.267 +409 M 0.252 +410 P 0.242 +411 A 0.239 +412 S 0.243 +413 V 0.249 +414 R 0.250 +415 T 0.241 +416 V 0.228 +417 V 0.220 +418 V 0.222 +419 P 0.235 +420 P 0.251 +421 P 0.258 +422 G 0.253 +423 V 0.238 +424 E 0.225 +425 L 0.222 +426 T 0.234 +427 L 0.258 +428 P 0.279 +429 K 0.285 +430 N 0.281 +431 C 0.282 +432 Q 0.302 +433 H 0.348 +434 S 0.399 +435 G 0.423 +436 D 0.405 +437 I 0.353 +438 S 0.280 +439 E 0.204 +440 S 0.146 +441 T 0.116 +442 A 0.106 +443 K 0.103 +444 E 0.095 +445 V 0.084 +446 Q 0.079 +447 R 0.081 +448 I 0.083 +449 R 0.082 +450 D 0.082 +451 K 0.087 +452 H 0.094 +453 F 0.099 +454 H 0.102 +455 D 0.108 +456 L 0.118 +457 T 0.130 +458 D 0.139 +459 Q 0.141 +460 N 0.137 +461 I 0.130 +462 L 0.122 +463 R 0.118 +464 S 0.118 +465 L 0.117 +466 G 0.109 +467 N 0.095 +468 I 0.080 +469 I 0.067 +470 S 0.060 +471 V 0.056 +472 L 0.055 +473 D 0.058 +474 R 0.066 +475 M 0.076 +476 M 0.084 +477 R 0.087 +478 S 0.087 +479 D 0.083 +480 E 0.078 +481 V 0.075 +482 C 0.077 +483 N 0.084 +484 G 0.098 +485 C 0.120 +486 V 0.143 +487 V 0.161 +488 V 0.164 +489 S 0.151 +490 D 0.133 +491 L 0.121 +492 S 0.112 +493 V 0.101 +494 S 0.091 +495 V 0.083 +496 Q 0.079 +497 C 0.077 +498 A 0.081 +499 L 0.087 +500 Q 0.086 +501 H 0.082 +502 A 0.078 +503 L 0.074 +504 T 0.069 +505 E 0.065 +506 P 0.066 +507 A 0.070 +508 E 0.080 +509 R 0.103 +510 V 0.137 +511 L 0.172 +512 V 0.196 +513 V 0.203 +514 Y 0.191 +515 V 0.168 +516 G 0.148 +517 D 0.140 +518 G 0.145 +519 E 0.156 +520 L 0.170 +521 P 0.178 +522 V 0.176 +523 K 0.171 +524 T 0.174 +525 N 0.185 +526 D 0.191 +527 G 0.180 +528 K 0.157 +529 V 0.141 +530 F 0.146 +531 L 0.165 +532 V 0.181 +533 Q 0.179 +534 I 0.162 +535 C 0.145 +536 T 0.141 +537 K 0.150 +538 E 0.167 +539 T 0.190 +540 E 0.217 +541 D 0.242 +542 K 0.255 +543 C 0.248 +544 V 0.218 +545 N 0.183 +546 R 0.158 +547 L 0.148 +548 S 0.147 +549 L 0.151 +550 C 0.157 +551 L 0.157 +552 R 0.154 +553 E 0.155 +554 G 0.161 +555 E 0.159 +556 S 0.145 +557 L 0.128 +558 T 0.118 +559 A 0.119 +560 G 0.122 +561 F 0.120 +562 M 0.116 +563 Q 0.118 +564 A 0.121 +565 L 0.120 +566 L 0.113 +567 G 0.104 +568 L 0.089 +569 I 0.069 +570 L 0.051 +571 P 0.039 +572 V 0.033 +573 A 0.033 +574 Y 0.037 +575 E 0.045 +576 F 0.055 +577 N 0.063 +578 P 0.069 +579 A 0.076 +580 L 0.088 +581 V 0.107 +582 L 0.130 +583 G 0.152 +584 I 0.161 +585 V 0.153 +586 G 0.140 +587 E 0.136 +588 T 0.142 +589 A 0.151 +590 A 0.159 +591 K 0.167 +592 T 0.173 +593 G 0.171 +594 L 0.161 +595 M 0.148 +596 T 0.131 +597 V 0.112 +598 W 0.097 +599 G 0.090 +600 H 0.089 +601 M 0.088 +602 T 0.083 +603 C 0.078 +604 L 0.075 +605 I 0.072 +606 Q 0.064 +607 G 0.056 +608 L 0.055 +609 A 0.063 +610 R 0.077 +611 G 0.092 +612 R 0.109 +613 T 0.125 +614 L 0.135 +615 T 0.132 +616 L 0.117 +617 L 0.099 +618 Q 0.088 +619 G 0.086 +620 Y 0.090 +621 D 0.098 +622 K 0.109 +623 D 0.117 +624 L 0.119 +625 L 0.117 +626 E 0.116 +627 L 0.116 +628 T 0.117 +629 V 0.118 +630 S 0.122 +631 A 0.127 +632 L 0.137 +633 S 0.156 +634 G 0.186 +635 A 0.216 +636 S 0.234 +637 I 0.240 +638 S 0.242 +639 P 0.246 +640 L 0.251 +641 G 0.254 +642 P 0.248 +643 L 0.234 +644 R 0.214 +645 A 0.187 +646 L 0.156 +647 K 0.130 +648 P 0.115 +649 E 0.110 +650 D 0.108 +651 V 0.110 +652 E 0.114 +653 M 0.116 +654 M 0.115 +655 E 0.113 +656 K 0.112 +657 Q 0.112 +658 R 0.112 +659 Q 0.113 +660 R 0.115 +661 L 0.113 +662 Q 0.108 +663 E 0.101 +664 R 0.096 +665 W 0.096 +666 G 0.102 +667 L 0.110 +668 L 0.119 +669 R 0.135 +670 C 0.162 +671 T 0.199 +672 V 0.238 +673 S 0.274 +674 E 0.306 +675 S 0.326 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000086458_ENSDART00000127600_GN:hdac10_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:48.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000086458_ENSDART00000127600_GN:hdac10_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:48.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..97bbb54e4d8fd81422ac3cfbdb622c27d02278ff --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000086458_ENSDART00000127600_GN:hdac10_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:48.caid @@ -0,0 +1,724 @@ +>ENSDARG00000086458|ENSDART00000127600|GN:hdac10|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:48 +1 M 0.276 +2 F 0.298 +3 V 0.326 +4 I 0.334 +5 K 0.309 +6 R 0.272 +7 R 0.250 +8 K 0.246 +9 R 0.250 +10 T 0.269 +11 K 0.294 +12 K 0.299 +13 K 0.288 +14 K 0.299 +15 H 0.341 +16 D 0.380 +17 T 0.409 +18 F 0.446 +19 E 0.490 +20 P 0.518 +21 A 0.518 +22 S 0.488 +23 F 0.429 +24 A 0.362 +25 S 0.308 +26 V 0.265 +27 T 0.226 +28 K 0.196 +29 Y 0.178 +30 I 0.165 +31 L 0.154 +32 Q 0.146 +33 V 0.137 +34 L 0.123 +35 L 0.116 +36 C 0.127 +37 C 0.149 +38 L 0.175 +39 F 0.200 +40 H 0.226 +41 R 0.252 +42 R 0.272 +43 Q 0.293 +44 T 0.320 +45 K 0.354 +46 S 0.387 +47 V 0.409 +48 K 0.409 +49 M 0.379 +50 A 0.318 +51 S 0.237 +52 G 0.159 +53 S 0.103 +54 A 0.076 +55 L 0.072 +56 I 0.079 +57 F 0.087 +58 D 0.094 +59 E 0.103 +60 E 0.111 +61 M 0.113 +62 S 0.112 +63 R 0.113 +64 Y 0.119 +65 K 0.130 +66 L 0.146 +67 L 0.167 +68 W 0.190 +69 T 0.209 +70 D 0.220 +71 P 0.226 +72 A 0.232 +73 C 0.234 +74 E 0.225 +75 I 0.213 +76 E 0.207 +77 V 0.197 +78 P 0.177 +79 E 0.152 +80 R 0.131 +81 L 0.115 +82 T 0.104 +83 V 0.103 +84 S 0.111 +85 Y 0.116 +86 E 0.114 +87 A 0.106 +88 L 0.098 +89 R 0.089 +90 T 0.081 +91 H 0.078 +92 G 0.082 +93 L 0.088 +94 A 0.091 +95 Q 0.091 +96 R 0.093 +97 C 0.098 +98 K 0.108 +99 A 0.118 +100 V 0.119 +101 P 0.109 +102 V 0.097 +103 R 0.091 +104 Q 0.087 +105 A 0.081 +106 T 0.075 +107 E 0.077 +108 Q 0.083 +109 E 0.083 +110 I 0.078 +111 L 0.075 +112 L 0.079 +113 A 0.083 +114 H 0.077 +115 S 0.064 +116 E 0.051 +117 E 0.046 +118 Y 0.043 +119 L 0.039 +120 E 0.038 +121 A 0.041 +122 V 0.049 +123 K 0.058 +124 Q 0.068 +125 T 0.077 +126 P 0.083 +127 G 0.083 +128 M 0.078 +129 N 0.069 +130 V 0.059 +131 E 0.053 +132 E 0.054 +133 L 0.062 +134 M 0.073 +135 A 0.086 +136 F 0.098 +137 S 0.101 +138 K 0.096 +139 K 0.092 +140 Y 0.095 +141 N 0.104 +142 D 0.118 +143 V 0.129 +144 Y 0.129 +145 F 0.119 +146 H 0.107 +147 Q 0.106 +148 N 0.114 +149 I 0.122 +150 Y 0.126 +151 H 0.135 +152 C 0.148 +153 A 0.150 +154 K 0.137 +155 L 0.126 +156 A 0.122 +157 A 0.116 +158 G 0.106 +159 A 0.097 +160 T 0.087 +161 L 0.072 +162 Q 0.057 +163 L 0.048 +164 V 0.044 +165 D 0.041 +166 S 0.042 +167 V 0.044 +168 M 0.046 +169 K 0.049 +170 R 0.053 +171 E 0.058 +172 V 0.061 +173 R 0.068 +174 N 0.086 +175 G 0.114 +176 M 0.146 +177 A 0.172 +178 L 0.188 +179 V 0.197 +180 R 0.202 +181 P 0.198 +182 P 0.183 +183 G 0.163 +184 H 0.152 +185 H 0.149 +186 S 0.147 +187 Q 0.142 +188 R 0.147 +189 S 0.171 +190 A 0.202 +191 A 0.216 +192 N 0.206 +193 G 0.190 +194 F 0.183 +195 C 0.178 +196 V 0.166 +197 F 0.153 +198 N 0.143 +199 N 0.133 +200 V 0.119 +201 A 0.107 +202 I 0.099 +203 A 0.089 +204 A 0.075 +205 L 0.064 +206 Y 0.056 +207 A 0.048 +208 K 0.042 +209 K 0.039 +210 N 0.040 +211 Y 0.042 +212 N 0.044 +213 L 0.045 +214 N 0.048 +215 R 0.059 +216 I 0.081 +217 L 0.112 +218 I 0.143 +219 V 0.164 +220 D 0.158 +221 W 0.127 +222 D 0.092 +223 V 0.070 +224 H 0.065 +225 H 0.073 +226 G 0.086 +227 Q 0.103 +228 G 0.116 +229 I 0.118 +230 Q 0.108 +231 Y 0.097 +232 C 0.090 +233 F 0.082 +234 E 0.074 +235 E 0.069 +236 D 0.067 +237 P 0.067 +238 S 0.069 +239 V 0.074 +240 L 0.080 +241 Y 0.083 +242 F 0.085 +243 S 0.085 +244 W 0.082 +245 H 0.076 +246 R 0.071 +247 Y 0.073 +248 E 0.083 +249 H 0.095 +250 Q 0.099 +251 S 0.093 +252 F 0.084 +253 W 0.082 +254 P 0.092 +255 N 0.108 +256 L 0.124 +257 P 0.134 +258 E 0.140 +259 S 0.140 +260 D 0.134 +261 Y 0.128 +262 S 0.131 +263 S 0.141 +264 V 0.150 +265 G 0.152 +266 K 0.153 +267 G 0.163 +268 K 0.188 +269 G 0.216 +270 S 0.228 +271 G 0.224 +272 F 0.217 +273 N 0.217 +274 I 0.220 +275 N 0.216 +276 L 0.201 +277 P 0.180 +278 W 0.160 +279 N 0.147 +280 K 0.142 +281 V 0.148 +282 G 0.154 +283 M 0.148 +284 T 0.134 +285 N 0.125 +286 S 0.126 +287 D 0.124 +288 Y 0.112 +289 L 0.101 +290 A 0.099 +291 A 0.099 +292 F 0.092 +293 F 0.079 +294 H 0.069 +295 V 0.060 +296 L 0.049 +297 L 0.039 +298 P 0.032 +299 V 0.029 +300 A 0.027 +301 Y 0.029 +302 E 0.035 +303 F 0.043 +304 D 0.053 +305 P 0.063 +306 E 0.077 +307 L 0.100 +308 V 0.134 +309 I 0.170 +310 V 0.196 +311 S 0.203 +312 A 0.191 +313 G 0.173 +314 F 0.166 +315 D 0.169 +316 S 0.167 +317 A 0.154 +318 I 0.139 +319 G 0.133 +320 D 0.133 +321 P 0.131 +322 E 0.129 +323 G 0.131 +324 E 0.134 +325 M 0.133 +326 C 0.129 +327 A 0.124 +328 L 0.117 +329 P 0.106 +330 E 0.096 +331 I 0.089 +332 F 0.086 +333 A 0.084 +334 H 0.082 +335 L 0.081 +336 T 0.080 +337 H 0.079 +338 L 0.076 +339 L 0.068 +340 M 0.055 +341 P 0.042 +342 L 0.037 +343 A 0.044 +344 A 0.057 +345 G 0.071 +346 K 0.085 +347 M 0.102 +348 C 0.120 +349 V 0.135 +350 V 0.143 +351 L 0.142 +352 E 0.135 +353 G 0.129 +354 G 0.127 +355 Y 0.123 +356 N 0.113 +357 L 0.104 +358 T 0.103 +359 S 0.104 +360 L 0.101 +361 G 0.097 +362 Q 0.099 +363 S 0.103 +364 V 0.103 +365 C 0.100 +366 Q 0.098 +367 T 0.094 +368 V 0.089 +369 H 0.087 +370 S 0.091 +371 L 0.099 +372 L 0.117 +373 G 0.150 +374 D 0.187 +375 P 0.211 +376 T 0.221 +377 P 0.229 +378 R 0.244 +379 I 0.264 +380 S 0.277 +381 G 0.273 +382 L 0.253 +383 G 0.229 +384 T 0.210 +385 A 0.191 +386 C 0.164 +387 D 0.136 +388 S 0.118 +389 A 0.109 +390 L 0.104 +391 E 0.104 +392 S 0.107 +393 I 0.108 +394 Q 0.110 +395 N 0.114 +396 V 0.116 +397 R 0.115 +398 N 0.115 +399 V 0.117 +400 Q 0.114 +401 S 0.101 +402 S 0.083 +403 Y 0.068 +404 W 0.060 +405 S 0.061 +406 S 0.069 +407 F 0.084 +408 K 0.109 +409 H 0.151 +410 L 0.217 +411 A 0.298 +412 Q 0.375 +413 S 0.439 +414 E 0.488 +415 T 0.523 +416 N 0.544 +417 P 0.554 +418 K 0.562 +419 R 0.581 +420 P 0.614 +421 R 0.654 +422 L 0.689 +423 D 0.708 +424 A 0.711 +425 T 0.704 +426 N 0.692 +427 G 0.666 +428 G 0.608 +429 P 0.516 +430 K 0.433 +431 E 0.421 +432 S 0.482 +433 S 0.562 +434 E 0.620 +435 P 0.655 +436 A 0.671 +437 S 0.671 +438 E 0.660 +439 S 0.648 +440 N 0.644 +441 P 0.646 +442 K 0.651 +443 K 0.658 +444 T 0.665 +445 A 0.659 +446 Q 0.627 +447 D 0.564 +448 I 0.482 +449 V 0.410 +450 W 0.373 +451 P 0.372 +452 E 0.376 +453 P 0.358 +454 L 0.324 +455 K 0.293 +456 R 0.272 +457 M 0.258 +458 P 0.251 +459 A 0.251 +460 S 0.258 +461 V 0.265 +462 R 0.263 +463 T 0.251 +464 V 0.238 +465 V 0.229 +466 V 0.231 +467 P 0.242 +468 P 0.256 +469 P 0.262 +470 G 0.255 +471 V 0.239 +472 E 0.224 +473 L 0.220 +474 T 0.233 +475 L 0.258 +476 P 0.281 +477 K 0.289 +478 N 0.287 +479 C 0.289 +480 Q 0.308 +481 H 0.351 +482 S 0.401 +483 G 0.427 +484 D 0.412 +485 I 0.361 +486 S 0.287 +487 E 0.209 +488 S 0.149 +489 T 0.118 +490 A 0.109 +491 K 0.106 +492 E 0.099 +493 V 0.088 +494 Q 0.082 +495 R 0.083 +496 I 0.085 +497 R 0.083 +498 D 0.083 +499 K 0.089 +500 H 0.096 +501 F 0.100 +502 H 0.102 +503 D 0.106 +504 L 0.115 +505 T 0.127 +506 D 0.137 +507 Q 0.140 +508 N 0.137 +509 I 0.131 +510 L 0.124 +511 R 0.120 +512 S 0.121 +513 L 0.121 +514 G 0.113 +515 N 0.099 +516 I 0.083 +517 I 0.069 +518 S 0.059 +519 V 0.054 +520 L 0.052 +521 D 0.056 +522 R 0.066 +523 M 0.076 +524 M 0.083 +525 R 0.086 +526 S 0.085 +527 D 0.082 +528 E 0.079 +529 V 0.078 +530 C 0.079 +531 N 0.086 +532 G 0.100 +533 C 0.121 +534 V 0.145 +535 V 0.165 +536 V 0.168 +537 S 0.156 +538 D 0.140 +539 L 0.128 +540 S 0.118 +541 V 0.106 +542 S 0.094 +543 V 0.085 +544 Q 0.080 +545 C 0.078 +546 A 0.083 +547 L 0.089 +548 Q 0.089 +549 H 0.084 +550 A 0.080 +551 L 0.077 +552 T 0.072 +553 E 0.068 +554 P 0.068 +555 A 0.071 +556 E 0.081 +557 R 0.102 +558 V 0.134 +559 L 0.167 +560 V 0.190 +561 V 0.198 +562 Y 0.190 +563 V 0.170 +564 G 0.150 +565 D 0.142 +566 G 0.145 +567 E 0.155 +568 L 0.167 +569 P 0.172 +570 V 0.167 +571 K 0.161 +572 T 0.165 +573 N 0.177 +574 D 0.185 +575 G 0.176 +576 K 0.157 +577 V 0.144 +578 F 0.150 +579 L 0.167 +580 V 0.182 +581 Q 0.180 +582 I 0.164 +583 C 0.148 +584 T 0.144 +585 K 0.152 +586 E 0.168 +587 T 0.192 +588 E 0.218 +589 D 0.243 +590 K 0.257 +591 C 0.250 +592 V 0.221 +593 N 0.186 +594 R 0.160 +595 L 0.147 +596 S 0.145 +597 L 0.149 +598 C 0.154 +599 L 0.154 +600 R 0.151 +601 E 0.153 +602 G 0.159 +603 E 0.159 +604 S 0.146 +605 L 0.130 +606 T 0.120 +607 A 0.121 +608 G 0.123 +609 F 0.120 +610 M 0.117 +611 Q 0.119 +612 A 0.122 +613 L 0.119 +614 L 0.112 +615 G 0.103 +616 L 0.089 +617 I 0.069 +618 L 0.051 +619 P 0.039 +620 V 0.033 +621 A 0.032 +622 Y 0.036 +623 E 0.045 +624 F 0.055 +625 N 0.063 +626 P 0.069 +627 A 0.075 +628 L 0.086 +629 V 0.105 +630 L 0.129 +631 G 0.152 +632 I 0.161 +633 V 0.153 +634 G 0.140 +635 E 0.136 +636 T 0.142 +637 A 0.151 +638 A 0.159 +639 K 0.167 +640 T 0.174 +641 G 0.173 +642 L 0.163 +643 M 0.149 +644 T 0.133 +645 V 0.113 +646 W 0.098 +647 G 0.090 +648 H 0.089 +649 M 0.088 +650 T 0.083 +651 C 0.078 +652 L 0.076 +653 I 0.073 +654 Q 0.065 +655 G 0.057 +656 L 0.057 +657 A 0.065 +658 R 0.078 +659 G 0.094 +660 R 0.110 +661 T 0.127 +662 L 0.138 +663 T 0.135 +664 L 0.119 +665 L 0.101 +666 Q 0.090 +667 G 0.088 +668 Y 0.091 +669 D 0.099 +670 K 0.109 +671 D 0.116 +672 L 0.117 +673 L 0.116 +674 E 0.116 +675 L 0.117 +676 T 0.118 +677 V 0.119 +678 S 0.123 +679 A 0.128 +680 L 0.139 +681 S 0.159 +682 G 0.188 +683 A 0.217 +684 S 0.234 +685 I 0.238 +686 S 0.239 +687 P 0.242 +688 L 0.248 +689 G 0.252 +690 P 0.246 +691 L 0.231 +692 R 0.210 +693 A 0.183 +694 L 0.152 +695 K 0.126 +696 P 0.112 +697 E 0.106 +698 D 0.098 +699 V 0.090 +700 E 0.089 +701 M 0.094 +702 M 0.098 +703 E 0.100 +704 K 0.101 +705 Q 0.104 +706 R 0.108 +707 Q 0.112 +708 R 0.114 +709 L 0.111 +710 Q 0.106 +711 E 0.099 +712 R 0.096 +713 W 0.097 +714 G 0.103 +715 L 0.112 +716 L 0.120 +717 R 0.134 +718 C 0.158 +719 T 0.191 +720 V 0.227 +721 S 0.262 +722 E 0.294 +723 S 0.316 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000099640_ENSDART00000162928_GN:eed_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000099640_ENSDART00000162928_GN:eed_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2e43b9e2edad5b7a417e4162267d2c9ee8dee3fc --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000099640_ENSDART00000162928_GN:eed_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,444 @@ +>ENSDARG00000099640|ENSDART00000162928|GN:eed|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.322 +2 K 0.331 +3 M 0.348 +4 R 0.356 +5 R 0.347 +6 K 0.339 +7 M 0.362 +8 S 0.419 +9 E 0.484 +10 P 0.530 +11 H 0.539 +12 G 0.518 +13 E 0.500 +14 A 0.497 +15 G 0.488 +16 N 0.467 +17 E 0.459 +18 M 0.455 +19 P 0.430 +20 N 0.397 +21 K 0.374 +22 K 0.349 +23 Q 0.323 +24 K 0.327 +25 L 0.368 +26 S 0.416 +27 S 0.468 +28 D 0.535 +29 E 0.593 +30 N 0.619 +31 S 0.628 +32 N 0.641 +33 P 0.660 +34 D 0.678 +35 L 0.691 +36 S 0.700 +37 G 0.701 +38 D 0.693 +39 D 0.681 +40 N 0.670 +41 D 0.663 +42 D 0.650 +43 A 0.613 +44 V 0.560 +45 S 0.539 +46 V 0.576 +47 E 0.640 +48 S 0.681 +49 G 0.688 +50 T 0.669 +51 H 0.640 +52 P 0.616 +53 E 0.603 +54 R 0.600 +55 P 0.601 +56 D 0.608 +57 T 0.628 +58 P 0.659 +59 T 0.692 +60 N 0.713 +61 T 0.714 +62 A 0.698 +63 S 0.684 +64 A 0.689 +65 P 0.704 +66 G 0.708 +67 R 0.697 +68 K 0.679 +69 S 0.661 +70 W 0.645 +71 G 0.629 +72 K 0.603 +73 G 0.560 +74 K 0.510 +75 W 0.468 +76 K 0.439 +77 S 0.415 +78 K 0.381 +79 K 0.325 +80 C 0.253 +81 K 0.178 +82 Y 0.114 +83 S 0.070 +84 F 0.048 +85 K 0.041 +86 C 0.041 +87 V 0.043 +88 N 0.044 +89 S 0.043 +90 L 0.044 +91 K 0.049 +92 E 0.060 +93 D 0.078 +94 H 0.097 +95 G 0.111 +96 Q 0.113 +97 P 0.101 +98 L 0.083 +99 F 0.068 +100 G 0.061 +101 V 0.061 +102 Q 0.065 +103 F 0.074 +104 N 0.084 +105 W 0.094 +106 H 0.102 +107 S 0.106 +108 K 0.111 +109 E 0.119 +110 G 0.126 +111 D 0.122 +112 P 0.102 +113 L 0.074 +114 V 0.052 +115 F 0.042 +116 A 0.038 +117 T 0.040 +118 V 0.052 +119 G 0.070 +120 S 0.083 +121 N 0.080 +122 R 0.065 +123 V 0.051 +124 T 0.044 +125 L 0.040 +126 Y 0.038 +127 E 0.039 +128 C 0.045 +129 H 0.057 +130 S 0.070 +131 Q 0.079 +132 G 0.078 +133 E 0.069 +134 I 0.057 +135 R 0.047 +136 L 0.042 +137 L 0.039 +138 Q 0.036 +139 S 0.035 +140 Y 0.037 +141 V 0.046 +142 D 0.060 +143 A 0.076 +144 D 0.090 +145 A 0.095 +146 D 0.088 +147 E 0.073 +148 N 0.056 +149 F 0.040 +150 Y 0.030 +151 T 0.024 +152 C 0.021 +153 A 0.022 +154 W 0.028 +155 T 0.041 +156 F 0.065 +157 D 0.096 +158 C 0.123 +159 S 0.137 +160 S 0.138 +161 S 0.129 +162 H 0.108 +163 P 0.080 +164 L 0.054 +165 L 0.037 +166 A 0.030 +167 V 0.032 +168 A 0.048 +169 G 0.074 +170 S 0.098 +171 R 0.106 +172 G 0.094 +173 I 0.072 +174 I 0.053 +175 R 0.043 +176 I 0.038 +177 I 0.034 +178 N 0.029 +179 H 0.027 +180 I 0.029 +181 T 0.036 +182 M 0.046 +183 Q 0.055 +184 C 0.056 +185 V 0.048 +186 K 0.037 +187 H 0.032 +188 Y 0.030 +189 V 0.031 +190 G 0.037 +191 H 0.049 +192 G 0.064 +193 N 0.078 +194 A 0.084 +195 I 0.078 +196 N 0.065 +197 E 0.056 +198 L 0.054 +199 K 0.058 +200 F 0.065 +201 H 0.072 +202 P 0.072 +203 R 0.065 +204 D 0.054 +205 P 0.042 +206 N 0.032 +207 L 0.027 +208 L 0.025 +209 L 0.028 +210 S 0.038 +211 V 0.061 +212 S 0.090 +213 K 0.110 +214 D 0.110 +215 H 0.091 +216 A 0.068 +217 L 0.052 +218 R 0.045 +219 L 0.042 +220 W 0.039 +221 N 0.035 +222 I 0.034 +223 Q 0.035 +224 T 0.035 +225 D 0.034 +226 T 0.034 +227 L 0.036 +228 V 0.039 +229 A 0.046 +230 I 0.055 +231 F 0.067 +232 G 0.082 +233 G 0.097 +234 V 0.105 +235 E 0.102 +236 G 0.092 +237 H 0.081 +238 R 0.077 +239 D 0.082 +240 E 0.088 +241 V 0.088 +242 L 0.079 +243 S 0.068 +244 A 0.060 +245 D 0.060 +246 F 0.067 +247 D 0.080 +248 L 0.094 +249 L 0.097 +250 G 0.085 +251 E 0.067 +252 K 0.053 +253 I 0.047 +254 M 0.046 +255 S 0.053 +256 C 0.073 +257 G 0.107 +258 M 0.142 +259 D 0.151 +260 H 0.126 +261 S 0.090 +262 L 0.069 +263 K 0.066 +264 L 0.067 +265 W 0.065 +266 R 0.060 +267 L 0.055 +268 D 0.050 +269 S 0.046 +270 E 0.042 +271 R 0.039 +272 L 0.040 +273 Q 0.042 +274 R 0.047 +275 A 0.058 +276 I 0.079 +277 R 0.110 +278 G 0.143 +279 S 0.170 +280 Y 0.195 +281 E 0.229 +282 Y 0.271 +283 N 0.306 +284 P 0.321 +285 S 0.323 +286 K 0.321 +287 T 0.325 +288 N 0.331 +289 R 0.330 +290 P 0.316 +291 F 0.287 +292 V 0.251 +293 S 0.218 +294 Q 0.194 +295 K 0.178 +296 I 0.159 +297 H 0.136 +298 F 0.118 +299 P 0.112 +300 D 0.104 +301 F 0.090 +302 S 0.077 +303 T 0.076 +304 R 0.085 +305 D 0.089 +306 I 0.088 +307 H 0.091 +308 R 0.100 +309 N 0.107 +310 Y 0.105 +311 V 0.093 +312 D 0.079 +313 C 0.067 +314 V 0.063 +315 R 0.067 +316 W 0.073 +317 L 0.074 +318 G 0.068 +319 D 0.061 +320 L 0.057 +321 I 0.053 +322 L 0.052 +323 S 0.057 +324 K 0.075 +325 S 0.098 +326 C 0.115 +327 E 0.116 +328 N 0.101 +329 A 0.078 +330 I 0.059 +331 V 0.053 +332 C 0.058 +333 W 0.076 +334 K 0.110 +335 P 0.159 +336 G 0.217 +337 R 0.269 +338 M 0.306 +339 E 0.323 +340 D 0.326 +341 D 0.323 +342 I 0.320 +343 D 0.318 +344 R 0.318 +345 I 0.312 +346 K 0.300 +347 P 0.285 +348 N 0.269 +349 E 0.246 +350 S 0.213 +351 N 0.173 +352 V 0.133 +353 T 0.104 +354 I 0.088 +355 L 0.077 +356 G 0.067 +357 R 0.058 +358 F 0.055 +359 D 0.061 +360 Y 0.076 +361 S 0.097 +362 Q 0.122 +363 C 0.158 +364 D 0.204 +365 I 0.245 +366 W 0.261 +367 Y 0.245 +368 M 0.202 +369 R 0.147 +370 F 0.102 +371 S 0.075 +372 M 0.063 +373 D 0.060 +374 F 0.058 +375 W 0.054 +376 Q 0.048 +377 K 0.048 +378 M 0.053 +379 L 0.059 +380 A 0.062 +381 L 0.071 +382 G 0.093 +383 N 0.125 +384 Q 0.150 +385 V 0.154 +386 G 0.135 +387 K 0.103 +388 L 0.075 +389 Y 0.064 +390 V 0.072 +391 W 0.088 +392 D 0.104 +393 L 0.115 +394 E 0.119 +395 V 0.118 +396 E 0.114 +397 D 0.106 +398 P 0.100 +399 H 0.099 +400 K 0.102 +401 A 0.106 +402 K 0.106 +403 C 0.103 +404 T 0.094 +405 T 0.082 +406 L 0.073 +407 T 0.075 +408 L 0.084 +409 P 0.094 +410 R 0.101 +411 C 0.105 +412 T 0.108 +413 S 0.110 +414 A 0.105 +415 I 0.096 +416 R 0.086 +417 Q 0.077 +418 T 0.067 +419 S 0.058 +420 F 0.056 +421 S 0.063 +422 R 0.075 +423 D 0.080 +424 S 0.075 +425 S 0.066 +426 I 0.058 +427 L 0.050 +428 I 0.042 +429 A 0.039 +430 V 0.047 +431 C 0.068 +432 D 0.089 +433 D 0.095 +434 A 0.083 +435 S 0.064 +436 I 0.051 +437 W 0.046 +438 R 0.047 +439 W 0.054 +440 D 0.072 +441 R 0.104 +442 L 0.142 +443 R 0.169 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000099640_ENSDART00000162928_GN:eed_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:11.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000099640_ENSDART00000162928_GN:eed_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:11.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b83020aedf5d881087f14b7081086851f7990d4e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000099640_ENSDART00000162928_GN:eed_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:11.caid @@ -0,0 +1,455 @@ +>ENSDARG00000099640|ENSDART00000162928|GN:eed|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:11 +1 M 0.268 +2 F 0.269 +3 C 0.271 +4 F 0.267 +5 P 0.248 +6 T 0.215 +7 V 0.172 +8 W 0.131 +9 H 0.103 +10 R 0.089 +11 W 0.088 +12 M 0.096 +13 K 0.111 +14 M 0.128 +15 R 0.149 +16 R 0.181 +17 K 0.228 +18 M 0.288 +19 S 0.360 +20 E 0.440 +21 P 0.520 +22 H 0.591 +23 G 0.640 +24 E 0.654 +25 A 0.629 +26 G 0.573 +27 N 0.521 +28 E 0.498 +29 M 0.483 +30 P 0.449 +31 N 0.414 +32 K 0.393 +33 K 0.368 +34 Q 0.339 +35 K 0.344 +36 L 0.388 +37 S 0.438 +38 S 0.490 +39 D 0.555 +40 E 0.607 +41 N 0.625 +42 S 0.628 +43 N 0.643 +44 P 0.665 +45 D 0.682 +46 L 0.693 +47 S 0.702 +48 G 0.704 +49 D 0.698 +50 D 0.688 +51 N 0.680 +52 D 0.676 +53 D 0.665 +54 A 0.630 +55 V 0.578 +56 S 0.558 +57 V 0.598 +58 E 0.662 +59 S 0.702 +60 G 0.709 +61 T 0.693 +62 H 0.669 +63 P 0.648 +64 E 0.637 +65 R 0.634 +66 P 0.634 +67 D 0.639 +68 T 0.657 +69 P 0.686 +70 T 0.715 +71 N 0.732 +72 T 0.731 +73 A 0.714 +74 S 0.701 +75 A 0.705 +76 P 0.720 +77 G 0.724 +78 R 0.713 +79 K 0.695 +80 S 0.676 +81 W 0.659 +82 G 0.641 +83 K 0.615 +84 G 0.574 +85 K 0.524 +86 W 0.482 +87 K 0.453 +88 S 0.428 +89 K 0.391 +90 K 0.333 +91 C 0.259 +92 K 0.182 +93 Y 0.117 +94 S 0.072 +95 F 0.049 +96 K 0.041 +97 C 0.041 +98 V 0.044 +99 N 0.044 +100 S 0.043 +101 L 0.044 +102 K 0.048 +103 E 0.058 +104 D 0.075 +105 H 0.094 +106 G 0.108 +107 Q 0.110 +108 P 0.099 +109 L 0.082 +110 F 0.067 +111 G 0.060 +112 V 0.060 +113 Q 0.065 +114 F 0.074 +115 N 0.084 +116 W 0.094 +117 H 0.101 +118 S 0.106 +119 K 0.110 +120 E 0.118 +121 G 0.126 +122 D 0.124 +123 P 0.104 +124 L 0.076 +125 V 0.054 +126 F 0.043 +127 A 0.039 +128 T 0.042 +129 V 0.053 +130 G 0.072 +131 S 0.086 +132 N 0.083 +133 R 0.068 +134 V 0.053 +135 T 0.046 +136 L 0.042 +137 Y 0.040 +138 E 0.041 +139 C 0.048 +140 H 0.060 +141 S 0.074 +142 Q 0.082 +143 G 0.082 +144 E 0.072 +145 I 0.059 +146 R 0.048 +147 L 0.041 +148 L 0.037 +149 Q 0.034 +150 S 0.033 +151 Y 0.036 +152 V 0.045 +153 D 0.059 +154 A 0.074 +155 D 0.087 +156 A 0.091 +157 D 0.085 +158 E 0.072 +159 N 0.055 +160 F 0.040 +161 Y 0.030 +162 T 0.023 +163 C 0.020 +164 A 0.021 +165 W 0.026 +166 T 0.038 +167 F 0.060 +168 D 0.088 +169 C 0.112 +170 S 0.126 +171 S 0.127 +172 S 0.119 +173 H 0.100 +174 P 0.074 +175 L 0.051 +176 L 0.035 +177 A 0.028 +178 V 0.031 +179 A 0.046 +180 G 0.071 +181 S 0.096 +182 R 0.103 +183 G 0.091 +184 I 0.069 +185 I 0.051 +186 R 0.041 +187 I 0.036 +188 I 0.032 +189 N 0.028 +190 H 0.026 +191 I 0.027 +192 T 0.033 +193 M 0.043 +194 Q 0.052 +195 C 0.053 +196 V 0.045 +197 K 0.035 +198 H 0.029 +199 Y 0.027 +200 V 0.029 +201 G 0.035 +202 H 0.045 +203 G 0.059 +204 N 0.072 +205 A 0.077 +206 I 0.072 +207 N 0.061 +208 E 0.054 +209 L 0.052 +210 K 0.056 +211 F 0.064 +212 H 0.069 +213 P 0.068 +214 R 0.060 +215 D 0.049 +216 P 0.038 +217 N 0.029 +218 L 0.025 +219 L 0.024 +220 L 0.026 +221 S 0.036 +222 V 0.057 +223 S 0.085 +224 K 0.105 +225 D 0.105 +226 H 0.087 +227 A 0.065 +228 L 0.050 +229 R 0.044 +230 L 0.041 +231 W 0.039 +232 N 0.035 +233 I 0.034 +234 Q 0.034 +235 T 0.034 +236 D 0.033 +237 T 0.033 +238 L 0.034 +239 V 0.039 +240 A 0.046 +241 I 0.056 +242 F 0.068 +243 G 0.084 +244 G 0.100 +245 V 0.108 +246 E 0.105 +247 G 0.094 +248 H 0.082 +249 R 0.077 +250 D 0.080 +251 E 0.086 +252 V 0.086 +253 L 0.077 +254 S 0.066 +255 A 0.058 +256 D 0.057 +257 F 0.063 +258 D 0.074 +259 L 0.087 +260 L 0.090 +261 G 0.081 +262 E 0.065 +263 K 0.052 +264 I 0.046 +265 M 0.046 +266 S 0.053 +267 C 0.075 +268 G 0.111 +269 M 0.148 +270 D 0.157 +271 H 0.130 +272 S 0.092 +273 L 0.070 +274 K 0.066 +275 L 0.068 +276 W 0.067 +277 R 0.062 +278 L 0.056 +279 D 0.052 +280 S 0.047 +281 E 0.043 +282 R 0.040 +283 L 0.041 +284 Q 0.044 +285 R 0.048 +286 A 0.059 +287 I 0.080 +288 R 0.112 +289 G 0.147 +290 S 0.175 +291 Y 0.202 +292 E 0.236 +293 Y 0.278 +294 N 0.313 +295 P 0.329 +296 S 0.331 +297 K 0.331 +298 T 0.334 +299 N 0.340 +300 R 0.340 +301 P 0.325 +302 F 0.296 +303 V 0.260 +304 S 0.226 +305 Q 0.202 +306 K 0.186 +307 I 0.167 +308 H 0.143 +309 F 0.124 +310 P 0.115 +311 D 0.105 +312 F 0.090 +313 S 0.076 +314 T 0.076 +315 R 0.085 +316 D 0.090 +317 I 0.090 +318 H 0.093 +319 R 0.105 +320 N 0.113 +321 Y 0.111 +322 V 0.099 +323 D 0.083 +324 C 0.071 +325 V 0.067 +326 R 0.070 +327 W 0.075 +328 L 0.075 +329 G 0.069 +330 D 0.063 +331 L 0.059 +332 I 0.057 +333 L 0.054 +334 S 0.059 +335 K 0.076 +336 S 0.099 +337 C 0.114 +338 E 0.114 +339 N 0.099 +340 A 0.077 +341 I 0.059 +342 V 0.054 +343 C 0.060 +344 W 0.080 +345 K 0.116 +346 P 0.167 +347 G 0.225 +348 R 0.278 +349 M 0.313 +350 E 0.327 +351 D 0.328 +352 D 0.324 +353 I 0.320 +354 D 0.317 +355 R 0.315 +356 I 0.309 +357 K 0.297 +358 P 0.283 +359 N 0.265 +360 E 0.240 +361 S 0.206 +362 N 0.166 +363 V 0.127 +364 T 0.099 +365 I 0.083 +366 L 0.074 +367 G 0.064 +368 R 0.056 +369 F 0.053 +370 D 0.058 +371 Y 0.071 +372 S 0.089 +373 Q 0.113 +374 C 0.148 +375 D 0.195 +376 I 0.237 +377 W 0.256 +378 Y 0.242 +379 M 0.200 +380 R 0.146 +381 F 0.101 +382 S 0.075 +383 M 0.063 +384 D 0.059 +385 F 0.057 +386 W 0.052 +387 Q 0.046 +388 K 0.045 +389 M 0.051 +390 L 0.057 +391 A 0.061 +392 L 0.069 +393 G 0.090 +394 N 0.121 +395 Q 0.145 +396 V 0.150 +397 G 0.132 +398 K 0.101 +399 L 0.073 +400 Y 0.063 +401 V 0.069 +402 W 0.084 +403 D 0.097 +404 L 0.106 +405 E 0.111 +406 V 0.111 +407 E 0.108 +408 D 0.102 +409 P 0.097 +410 H 0.098 +411 K 0.103 +412 A 0.108 +413 K 0.110 +414 C 0.106 +415 T 0.097 +416 T 0.084 +417 L 0.075 +418 T 0.077 +419 L 0.086 +420 P 0.097 +421 R 0.105 +422 C 0.109 +423 T 0.112 +424 S 0.114 +425 A 0.109 +426 I 0.099 +427 R 0.089 +428 Q 0.079 +429 T 0.069 +430 S 0.060 +431 F 0.058 +432 S 0.066 +433 R 0.078 +434 D 0.084 +435 S 0.079 +436 S 0.069 +437 I 0.060 +438 L 0.051 +439 I 0.043 +440 A 0.040 +441 V 0.050 +442 C 0.072 +443 D 0.093 +444 D 0.099 +445 A 0.086 +446 S 0.067 +447 I 0.052 +448 W 0.047 +449 R 0.048 +450 W 0.055 +451 D 0.074 +452 R 0.106 +453 L 0.145 +454 R 0.173 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000100588_ENSDART00000161212_GN:rpl36_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000100588_ENSDART00000161212_GN:rpl36_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..dbb4dca9a52ecb1193bb35e0dfbaccad39d2ab0e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000100588_ENSDART00000161212_GN:rpl36_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,106 @@ +>ENSDARG00000100588|ENSDART00000161212|GN:rpl36|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.427 +2 V 0.453 +3 V 0.506 +4 R 0.573 +5 Y 0.630 +6 P 0.663 +7 M 0.660 +8 A 0.622 +9 V 0.574 +10 G 0.562 +11 L 0.587 +12 N 0.602 +13 K 0.589 +14 G 0.585 +15 H 0.611 +16 K 0.651 +17 V 0.681 +18 T 0.701 +19 K 0.717 +20 N 0.726 +21 V 0.717 +22 S 0.686 +23 K 0.640 +24 P 0.592 +25 K 0.552 +26 H 0.516 +27 S 0.473 +28 R 0.437 +29 R 0.432 +30 R 0.454 +31 G 0.465 +32 R 0.439 +33 L 0.383 +34 T 0.320 +35 K 0.277 +36 H 0.258 +37 A 0.252 +38 K 0.255 +39 F 0.273 +40 A 0.298 +41 R 0.324 +42 D 0.358 +43 L 0.392 +44 I 0.390 +45 R 0.345 +46 E 0.286 +47 V 0.245 +48 C 0.232 +49 G 0.229 +50 F 0.213 +51 A 0.177 +52 P 0.132 +53 Y 0.094 +54 E 0.072 +55 R 0.061 +56 R 0.054 +57 A 0.051 +58 M 0.054 +59 E 0.060 +60 L 0.065 +61 L 0.067 +62 K 0.067 +63 V 0.067 +64 S 0.064 +65 K 0.059 +66 D 0.051 +67 K 0.045 +68 R 0.045 +69 A 0.048 +70 L 0.050 +71 K 0.052 +72 F 0.055 +73 I 0.055 +74 K 0.049 +75 K 0.043 +76 R 0.044 +77 V 0.049 +78 G 0.055 +79 T 0.059 +80 H 0.062 +81 I 0.063 +82 R 0.063 +83 A 0.062 +84 K 0.061 +85 R 0.062 +86 K 0.066 +87 R 0.074 +88 E 0.078 +89 E 0.075 +90 L 0.070 +91 S 0.070 +92 N 0.070 +93 T 0.062 +94 L 0.053 +95 A 0.052 +96 A 0.057 +97 M 0.068 +98 R 0.089 +99 K 0.126 +100 A 0.174 +101 A 0.223 +102 A 0.266 +103 K 0.296 +104 K 0.310 +105 E 0.312 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000100588_ENSDART00000161212_GN:rpl36_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:11.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000100588_ENSDART00000161212_GN:rpl36_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:11.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..06009264d779f28f456063dcac6f6e8baf9546b4 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000100588_ENSDART00000161212_GN:rpl36_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:11.caid @@ -0,0 +1,117 @@ +>ENSDARG00000100588|ENSDART00000161212|GN:rpl36|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:11 +1 M 0.415 +2 T 0.425 +3 I 0.440 +4 E 0.449 +5 L 0.454 +6 F 0.473 +7 C 0.517 +8 V 0.575 +9 S 0.617 +10 A 0.622 +11 E 0.594 +12 M 0.560 +13 V 0.551 +14 V 0.580 +15 R 0.631 +16 Y 0.675 +17 P 0.694 +18 M 0.679 +19 A 0.636 +20 V 0.588 +21 G 0.575 +22 L 0.600 +23 N 0.618 +24 K 0.611 +25 G 0.610 +26 H 0.635 +27 K 0.673 +28 V 0.703 +29 T 0.723 +30 K 0.737 +31 N 0.742 +32 V 0.730 +33 S 0.698 +34 K 0.650 +35 P 0.600 +36 K 0.556 +37 H 0.514 +38 S 0.467 +39 R 0.431 +40 R 0.431 +41 R 0.459 +42 G 0.473 +43 R 0.447 +44 L 0.389 +45 T 0.325 +46 K 0.281 +47 H 0.263 +48 A 0.258 +49 K 0.265 +50 F 0.289 +51 A 0.321 +52 R 0.350 +53 D 0.385 +54 L 0.420 +55 I 0.420 +56 R 0.375 +57 E 0.312 +58 V 0.265 +59 C 0.247 +60 G 0.240 +61 F 0.221 +62 A 0.183 +63 P 0.138 +64 Y 0.099 +65 E 0.077 +66 R 0.065 +67 R 0.057 +68 A 0.054 +69 M 0.057 +70 E 0.063 +71 L 0.068 +72 L 0.071 +73 K 0.071 +74 V 0.070 +75 S 0.067 +76 K 0.061 +77 D 0.052 +78 K 0.046 +79 R 0.046 +80 A 0.049 +81 L 0.052 +82 K 0.054 +83 F 0.056 +84 I 0.056 +85 K 0.050 +86 K 0.044 +87 R 0.045 +88 V 0.051 +89 G 0.056 +90 T 0.061 +91 H 0.063 +92 I 0.064 +93 R 0.064 +94 A 0.064 +95 K 0.064 +96 R 0.064 +97 K 0.069 +98 R 0.076 +99 E 0.080 +100 E 0.077 +101 L 0.072 +102 S 0.072 +103 N 0.071 +104 T 0.063 +105 L 0.054 +106 A 0.053 +107 A 0.059 +108 M 0.070 +109 R 0.093 +110 K 0.132 +111 A 0.181 +112 A 0.231 +113 A 0.274 +114 K 0.304 +115 K 0.319 +116 E 0.322 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000104413_ENSDART00000162875_GN:rogdi_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000104413_ENSDART00000162875_GN:rogdi_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7e87e100cb3d6e9b8681ed69a8203708c83e73fc --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000104413_ENSDART00000162875_GN:rogdi_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,285 @@ +>ENSDARG00000104413|ENSDART00000162875|GN:rogdi|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.322 +2 T 0.323 +3 A 0.327 +4 A 0.328 +5 S 0.318 +6 Q 0.305 +7 A 0.296 +8 E 0.277 +9 R 0.237 +10 T 0.188 +11 V 0.147 +12 L 0.119 +13 E 0.100 +14 E 0.088 +15 E 0.079 +16 F 0.069 +17 N 0.057 +18 W 0.047 +19 L 0.043 +20 L 0.044 +21 K 0.046 +22 E 0.051 +23 E 0.056 +24 V 0.064 +25 H 0.073 +26 A 0.076 +27 V 0.070 +28 L 0.061 +29 K 0.055 +30 Q 0.056 +31 L 0.061 +32 Q 0.070 +33 D 0.076 +34 I 0.073 +35 L 0.066 +36 K 0.060 +37 E 0.056 +38 A 0.054 +39 S 0.059 +40 R 0.074 +41 R 0.095 +42 F 0.124 +43 S 0.165 +44 M 0.221 +45 P 0.282 +46 S 0.334 +47 P 0.365 +48 G 0.369 +49 L 0.341 +50 E 0.298 +51 G 0.264 +52 Q 0.245 +53 L 0.233 +54 K 0.218 +55 Q 0.200 +56 E 0.188 +57 N 0.193 +58 F 0.224 +59 I 0.268 +60 L 0.297 +61 G 0.290 +62 S 0.253 +63 S 0.212 +64 T 0.185 +65 M 0.166 +66 D 0.148 +67 Q 0.132 +68 V 0.122 +69 K 0.116 +70 G 0.110 +71 V 0.103 +72 L 0.100 +73 T 0.113 +74 L 0.139 +75 Q 0.159 +76 G 0.159 +77 E 0.146 +78 A 0.130 +79 L 0.113 +80 T 0.103 +81 Q 0.106 +82 A 0.119 +83 D 0.130 +84 I 0.136 +85 N 0.143 +86 I 0.151 +87 K 0.156 +88 V 0.156 +89 A 0.154 +90 K 0.147 +91 S 0.136 +92 S 0.125 +93 Q 0.116 +94 V 0.109 +95 M 0.100 +96 H 0.089 +97 F 0.082 +98 A 0.084 +99 F 0.088 +100 R 0.089 +101 D 0.087 +102 D 0.085 +103 K 0.078 +104 Q 0.065 +105 W 0.053 +106 K 0.045 +107 L 0.040 +108 Q 0.038 +109 Q 0.039 +110 I 0.046 +111 Q 0.053 +112 D 0.060 +113 A 0.066 +114 R 0.071 +115 N 0.071 +116 H 0.066 +117 V 0.064 +118 N 0.067 +119 Q 0.069 +120 A 0.067 +121 L 0.069 +122 Q 0.080 +123 L 0.098 +124 L 0.120 +125 S 0.138 +126 S 0.144 +127 R 0.136 +128 D 0.124 +129 D 0.114 +130 S 0.104 +131 Y 0.093 +132 H 0.088 +133 F 0.088 +134 K 0.091 +135 T 0.093 +136 G 0.091 +137 A 0.086 +138 E 0.083 +139 V 0.084 +140 N 0.086 +141 K 0.081 +142 L 0.068 +143 M 0.052 +144 D 0.043 +145 A 0.041 +146 I 0.048 +147 M 0.058 +148 L 0.063 +149 Q 0.057 +150 L 0.045 +151 T 0.041 +152 R 0.044 +153 A 0.050 +154 R 0.057 +155 N 0.068 +156 R 0.086 +157 L 0.112 +158 T 0.142 +159 T 0.167 +160 P 0.177 +161 A 0.169 +162 S 0.151 +163 M 0.136 +164 T 0.133 +165 L 0.138 +166 P 0.140 +167 E 0.137 +168 L 0.135 +169 A 0.144 +170 A 0.163 +171 S 0.180 +172 G 0.175 +173 L 0.150 +174 M 0.122 +175 K 0.102 +176 M 0.090 +177 F 0.085 +178 T 0.091 +179 P 0.105 +180 P 0.119 +181 M 0.128 +182 P 0.128 +183 G 0.118 +184 D 0.104 +185 V 0.092 +186 M 0.081 +187 V 0.070 +188 N 0.059 +189 F 0.051 +190 Y 0.049 +191 I 0.051 +192 N 0.054 +193 L 0.058 +194 S 0.060 +195 K 0.061 +196 L 0.059 +197 C 0.054 +198 L 0.047 +199 T 0.044 +200 V 0.043 +201 Y 0.044 +202 Q 0.048 +203 L 0.057 +204 H 0.072 +205 V 0.097 +206 L 0.134 +207 Q 0.183 +208 P 0.232 +209 N 0.265 +210 T 0.282 +211 T 0.291 +212 K 0.304 +213 N 0.321 +214 F 0.344 +215 K 0.379 +216 P 0.426 +217 A 0.465 +218 G 0.467 +219 S 0.431 +220 S 0.387 +221 V 0.363 +222 L 0.364 +223 H 0.375 +224 N 0.376 +225 P 0.353 +226 G 0.318 +227 A 0.288 +228 M 0.275 +229 F 0.279 +230 E 0.293 +231 H 0.302 +232 N 0.302 +233 N 0.293 +234 T 0.273 +235 K 0.241 +236 F 0.205 +237 E 0.173 +238 V 0.150 +239 S 0.139 +240 H 0.136 +241 V 0.142 +242 H 0.154 +243 K 0.161 +244 V 0.155 +245 E 0.142 +246 C 0.135 +247 V 0.137 +248 V 0.142 +249 P 0.147 +250 W 0.154 +251 L 0.158 +252 N 0.160 +253 D 0.162 +254 T 0.160 +255 L 0.147 +256 V 0.127 +257 F 0.110 +258 F 0.100 +259 T 0.096 +260 I 0.097 +261 S 0.100 +262 L 0.105 +263 Q 0.106 +264 L 0.104 +265 C 0.100 +266 Q 0.104 +267 Q 0.115 +268 L 0.128 +269 K 0.139 +270 D 0.149 +271 K 0.166 +272 I 0.189 +273 S 0.215 +274 V 0.234 +275 F 0.243 +276 S 0.245 +277 S 0.246 +278 F 0.252 +279 W 0.268 +280 N 0.293 +281 Y 0.320 +282 R 0.338 +283 P 0.344 +284 F 0.341 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSDARG00000104413_ENSDART00000162875_GN:rogdi_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000104413_ENSDART00000162875_GN:rogdi_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:14.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..325f4b7d2866f4099890f235ff3bbddb761ae547 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSDARG00000104413_ENSDART00000162875_GN:rogdi_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:14.caid @@ -0,0 +1,299 @@ +>ENSDARG00000104413|ENSDART00000162875|GN:rogdi|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:14 +1 M 0.383 +2 L 0.402 +3 G 0.423 +4 A 0.423 +5 E 0.386 +6 R 0.326 +7 S 0.268 +8 T 0.226 +9 L 0.196 +10 S 0.171 +11 E 0.151 +12 V 0.140 +13 A 0.141 +14 K 0.153 +15 M 0.166 +16 T 0.176 +17 A 0.188 +18 A 0.203 +19 S 0.217 +20 Q 0.231 +21 A 0.241 +22 E 0.232 +23 R 0.196 +24 T 0.153 +25 V 0.121 +26 L 0.103 +27 E 0.091 +28 E 0.084 +29 E 0.077 +30 F 0.068 +31 N 0.057 +32 W 0.048 +33 L 0.044 +34 L 0.046 +35 K 0.048 +36 E 0.050 +37 E 0.054 +38 V 0.056 +39 H 0.056 +40 A 0.055 +41 V 0.054 +42 L 0.054 +43 K 0.057 +44 Q 0.063 +45 L 0.070 +46 Q 0.077 +47 D 0.081 +48 I 0.076 +49 L 0.068 +50 K 0.063 +51 E 0.059 +52 A 0.057 +53 S 0.062 +54 R 0.077 +55 R 0.099 +56 F 0.126 +57 S 0.165 +58 M 0.218 +59 P 0.276 +60 S 0.323 +61 P 0.352 +62 G 0.355 +63 L 0.330 +64 E 0.289 +65 G 0.255 +66 Q 0.234 +67 L 0.217 +68 K 0.198 +69 Q 0.179 +70 E 0.165 +71 N 0.167 +72 F 0.190 +73 I 0.225 +74 L 0.249 +75 G 0.242 +76 S 0.210 +77 S 0.177 +78 T 0.158 +79 M 0.148 +80 D 0.138 +81 Q 0.128 +82 V 0.121 +83 K 0.114 +84 G 0.104 +85 V 0.094 +86 L 0.090 +87 T 0.100 +88 L 0.123 +89 Q 0.141 +90 G 0.142 +91 E 0.132 +92 A 0.119 +93 L 0.105 +94 T 0.095 +95 Q 0.098 +96 A 0.112 +97 D 0.125 +98 I 0.133 +99 N 0.138 +100 I 0.142 +101 K 0.142 +102 V 0.140 +103 A 0.137 +104 K 0.135 +105 S 0.132 +106 S 0.126 +107 Q 0.119 +108 V 0.111 +109 M 0.099 +110 H 0.085 +111 F 0.078 +112 A 0.082 +113 F 0.088 +114 R 0.091 +115 D 0.090 +116 D 0.088 +117 K 0.081 +118 Q 0.068 +119 W 0.056 +120 K 0.047 +121 L 0.041 +122 Q 0.038 +123 Q 0.039 +124 I 0.046 +125 Q 0.055 +126 D 0.061 +127 A 0.066 +128 R 0.070 +129 N 0.071 +130 H 0.066 +131 V 0.064 +132 N 0.069 +133 Q 0.071 +134 A 0.069 +135 L 0.070 +136 Q 0.081 +137 L 0.100 +138 L 0.124 +139 S 0.144 +140 S 0.150 +141 R 0.140 +142 D 0.127 +143 D 0.115 +144 S 0.105 +145 Y 0.096 +146 H 0.092 +147 F 0.093 +148 K 0.094 +149 T 0.094 +150 G 0.091 +151 A 0.086 +152 E 0.082 +153 V 0.083 +154 N 0.084 +155 K 0.080 +156 L 0.066 +157 M 0.051 +158 D 0.042 +159 A 0.041 +160 I 0.048 +161 M 0.058 +162 L 0.063 +163 Q 0.056 +164 L 0.045 +165 T 0.041 +166 R 0.045 +167 A 0.052 +168 R 0.060 +169 N 0.070 +170 R 0.086 +171 L 0.110 +172 T 0.136 +173 T 0.158 +174 P 0.168 +175 A 0.162 +176 S 0.146 +177 M 0.132 +178 T 0.128 +179 L 0.133 +180 P 0.136 +181 E 0.134 +182 L 0.134 +183 A 0.145 +184 A 0.166 +185 S 0.184 +186 G 0.181 +187 L 0.156 +188 M 0.129 +189 K 0.108 +190 M 0.094 +191 F 0.088 +192 T 0.092 +193 P 0.104 +194 P 0.117 +195 M 0.125 +196 P 0.126 +197 G 0.119 +198 D 0.107 +199 V 0.096 +200 M 0.085 +201 V 0.073 +202 N 0.060 +203 F 0.053 +204 Y 0.052 +205 I 0.057 +206 N 0.062 +207 L 0.064 +208 S 0.064 +209 K 0.063 +210 L 0.061 +211 C 0.056 +212 L 0.050 +213 T 0.046 +214 V 0.045 +215 Y 0.046 +216 Q 0.049 +217 L 0.057 +218 H 0.073 +219 V 0.098 +220 L 0.136 +221 Q 0.184 +222 P 0.231 +223 N 0.263 +224 T 0.276 +225 T 0.281 +226 K 0.288 +227 N 0.303 +228 F 0.329 +229 K 0.368 +230 P 0.420 +231 A 0.459 +232 G 0.456 +233 S 0.415 +234 S 0.368 +235 V 0.343 +236 L 0.345 +237 H 0.359 +238 N 0.365 +239 P 0.348 +240 G 0.317 +241 A 0.290 +242 M 0.276 +243 F 0.278 +244 E 0.292 +245 H 0.307 +246 N 0.312 +247 N 0.304 +248 T 0.280 +249 K 0.247 +250 F 0.210 +251 E 0.175 +252 V 0.149 +253 S 0.137 +254 H 0.137 +255 V 0.147 +256 H 0.159 +257 K 0.162 +258 V 0.153 +259 E 0.141 +260 C 0.136 +261 V 0.140 +262 V 0.144 +263 P 0.147 +264 W 0.150 +265 L 0.152 +266 N 0.153 +267 D 0.156 +268 T 0.156 +269 L 0.147 +270 V 0.133 +271 F 0.120 +272 F 0.111 +273 T 0.106 +274 I 0.105 +275 S 0.107 +276 L 0.110 +277 Q 0.112 +278 L 0.110 +279 C 0.108 +280 Q 0.113 +281 Q 0.125 +282 L 0.139 +283 K 0.148 +284 D 0.157 +285 K 0.170 +286 I 0.192 +287 S 0.218 +288 V 0.238 +289 F 0.248 +290 S 0.250 +291 S 0.251 +292 F 0.256 +293 W 0.271 +294 N 0.295 +295 Y 0.320 +296 R 0.336 +297 P 0.339 +298 F 0.336 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000018869.19_ENST00000586929.6_GN:ZNF582_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000018869.19_ENST00000586929.6_GN:ZNF582_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c17e14b34d6eba9772792f55ea547d726019d6bd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000018869.19_ENST00000586929.6_GN:ZNF582_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,518 @@ +>ENSG00000018869.19|ENST00000586929.6|GN:ZNF582|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.369 +2 S 0.361 +3 L 0.341 +4 G 0.303 +5 S 0.247 +6 E 0.192 +7 L 0.155 +8 F 0.140 +9 R 0.139 +10 D 0.143 +11 V 0.145 +12 A 0.136 +13 I 0.118 +14 V 0.102 +15 F 0.093 +16 S 0.089 +17 Q 0.089 +18 E 0.093 +19 E 0.095 +20 W 0.096 +21 Q 0.110 +22 W 0.138 +23 L 0.160 +24 A 0.158 +25 P 0.140 +26 A 0.120 +27 Q 0.103 +28 R 0.091 +29 D 0.092 +30 L 0.104 +31 Y 0.118 +32 R 0.126 +33 D 0.130 +34 V 0.128 +35 M 0.114 +36 L 0.092 +37 E 0.074 +38 T 0.065 +39 Y 0.061 +40 S 0.060 +41 N 0.066 +42 L 0.078 +43 V 0.097 +44 S 0.116 +45 L 0.131 +46 G 0.136 +47 L 0.132 +48 A 0.123 +49 V 0.114 +50 S 0.109 +51 K 0.108 +52 P 0.105 +53 D 0.097 +54 V 0.088 +55 I 0.084 +56 S 0.090 +57 F 0.101 +58 L 0.113 +59 E 0.127 +60 Q 0.144 +61 G 0.160 +62 K 0.170 +63 E 0.175 +64 P 0.191 +65 W 0.234 +66 M 0.312 +67 V 0.411 +68 E 0.511 +69 R 0.590 +70 V 0.632 +71 V 0.635 +72 S 0.625 +73 G 0.628 +74 G 0.645 +75 L 0.666 +76 C 0.687 +77 P 0.707 +78 V 0.712 +79 L 0.703 +80 E 0.692 +81 S 0.682 +82 R 0.670 +83 Y 0.658 +84 D 0.652 +85 T 0.652 +86 K 0.650 +87 E 0.632 +88 L 0.596 +89 F 0.547 +90 P 0.510 +91 K 0.519 +92 Q 0.580 +93 H 0.645 +94 V 0.672 +95 Y 0.666 +96 E 0.646 +97 V 0.621 +98 E 0.595 +99 S 0.579 +100 P 0.566 +101 Q 0.537 +102 W 0.496 +103 E 0.475 +104 I 0.480 +105 M 0.480 +106 E 0.466 +107 S 0.456 +108 L 0.440 +109 T 0.416 +110 S 0.424 +111 Y 0.484 +112 G 0.558 +113 L 0.598 +114 E 0.592 +115 C 0.563 +116 S 0.539 +117 S 0.526 +118 F 0.514 +119 Q 0.499 +120 D 0.478 +121 D 0.442 +122 W 0.392 +123 E 0.351 +124 C 0.336 +125 R 0.347 +126 N 0.375 +127 Q 0.410 +128 F 0.431 +129 D 0.427 +130 R 0.415 +131 Q 0.419 +132 Q 0.441 +133 G 0.461 +134 N 0.462 +135 P 0.451 +136 D 0.447 +137 R 0.456 +138 H 0.456 +139 F 0.431 +140 H 0.397 +141 Q 0.389 +142 M 0.403 +143 I 0.401 +144 I 0.367 +145 R 0.323 +146 H 0.298 +147 E 0.301 +148 E 0.326 +149 M 0.374 +150 P 0.440 +151 T 0.505 +152 F 0.546 +153 D 0.553 +154 Q 0.539 +155 H 0.511 +156 A 0.473 +157 S 0.431 +158 L 0.399 +159 T 0.379 +160 F 0.359 +161 Y 0.339 +162 Q 0.330 +163 K 0.334 +164 I 0.337 +165 H 0.327 +166 T 0.313 +167 R 0.309 +168 E 0.314 +169 K 0.314 +170 P 0.301 +171 F 0.281 +172 G 0.260 +173 Y 0.239 +174 N 0.217 +175 K 0.198 +176 C 0.189 +177 R 0.189 +178 K 0.187 +179 D 0.178 +180 F 0.162 +181 W 0.150 +182 Q 0.148 +183 K 0.159 +184 E 0.177 +185 L 0.193 +186 L 0.205 +187 I 0.209 +188 N 0.201 +189 H 0.194 +190 Q 0.206 +191 G 0.230 +192 I 0.241 +193 Y 0.228 +194 T 0.208 +195 N 0.197 +196 E 0.190 +197 K 0.172 +198 P 0.139 +199 Y 0.105 +200 K 0.081 +201 C 0.067 +202 K 0.062 +203 E 0.063 +204 C 0.068 +205 G 0.074 +206 K 0.082 +207 A 0.089 +208 F 0.094 +209 K 0.101 +210 Y 0.117 +211 G 0.138 +212 S 0.153 +213 R 0.159 +214 L 0.164 +215 I 0.167 +216 Q 0.166 +217 H 0.166 +218 E 0.176 +219 N 0.190 +220 I 0.196 +221 H 0.200 +222 S 0.210 +223 G 0.217 +224 K 0.203 +225 K 0.163 +226 P 0.112 +227 Y 0.074 +228 E 0.054 +229 C 0.048 +230 K 0.050 +231 E 0.057 +232 C 0.067 +233 G 0.077 +234 K 0.088 +235 A 0.098 +236 F 0.109 +237 N 0.119 +238 S 0.126 +239 G 0.128 +240 S 0.127 +241 N 0.127 +242 F 0.128 +243 I 0.131 +244 Q 0.135 +245 H 0.138 +246 Q 0.148 +247 R 0.160 +248 V 0.169 +249 H 0.180 +250 T 0.195 +251 G 0.205 +252 E 0.195 +253 K 0.165 +254 P 0.127 +255 Y 0.098 +256 E 0.084 +257 C 0.079 +258 K 0.080 +259 D 0.085 +260 C 0.092 +261 E 0.099 +262 K 0.105 +263 A 0.114 +264 F 0.121 +265 S 0.127 +266 R 0.136 +267 S 0.158 +268 S 0.191 +269 Q 0.215 +270 L 0.212 +271 I 0.191 +272 E 0.172 +273 H 0.171 +274 Q 0.185 +275 R 0.201 +276 T 0.211 +277 H 0.219 +278 T 0.232 +279 G 0.240 +280 E 0.225 +281 K 0.186 +282 P 0.139 +283 Y 0.104 +284 Q 0.084 +285 C 0.073 +286 K 0.070 +287 E 0.077 +288 C 0.088 +289 G 0.099 +290 K 0.106 +291 A 0.110 +292 F 0.111 +293 N 0.105 +294 R 0.099 +295 I 0.102 +296 S 0.118 +297 H 0.133 +298 L 0.137 +299 K 0.136 +300 V 0.136 +301 H 0.141 +302 Y 0.159 +303 R 0.183 +304 I 0.203 +305 H 0.218 +306 T 0.232 +307 G 0.239 +308 E 0.224 +309 K 0.186 +310 P 0.142 +311 Y 0.111 +312 A 0.094 +313 C 0.083 +314 K 0.079 +315 E 0.084 +316 C 0.096 +317 G 0.108 +318 K 0.119 +319 T 0.127 +320 F 0.132 +321 S 0.132 +322 H 0.135 +323 R 0.147 +324 S 0.165 +325 Q 0.178 +326 L 0.178 +327 I 0.170 +328 Q 0.159 +329 H 0.148 +330 Q 0.145 +331 T 0.155 +332 V 0.172 +333 H 0.195 +334 T 0.225 +335 G 0.252 +336 R 0.258 +337 K 0.233 +338 L 0.189 +339 Y 0.146 +340 E 0.115 +341 C 0.096 +342 K 0.088 +343 E 0.091 +344 C 0.100 +345 G 0.109 +346 K 0.118 +347 A 0.129 +348 F 0.142 +349 N 0.157 +350 Q 0.174 +351 G 0.185 +352 S 0.185 +353 T 0.182 +354 L 0.184 +355 I 0.191 +356 R 0.197 +357 H 0.203 +358 Q 0.217 +359 R 0.239 +360 I 0.260 +361 H 0.278 +362 T 0.291 +363 G 0.292 +364 E 0.272 +365 K 0.235 +366 P 0.199 +367 Y 0.178 +368 E 0.159 +369 C 0.130 +370 K 0.105 +371 V 0.097 +372 C 0.104 +373 G 0.113 +374 K 0.117 +375 A 0.119 +376 F 0.122 +377 R 0.125 +378 V 0.130 +379 S 0.140 +380 S 0.155 +381 Q 0.167 +382 L 0.169 +383 K 0.167 +384 Q 0.168 +385 H 0.176 +386 Q 0.191 +387 R 0.205 +388 I 0.213 +389 H 0.223 +390 T 0.238 +391 G 0.247 +392 E 0.236 +393 K 0.202 +394 P 0.161 +395 Y 0.132 +396 Q 0.114 +397 C 0.096 +398 K 0.082 +399 V 0.080 +400 C 0.089 +401 G 0.099 +402 R 0.108 +403 A 0.115 +404 F 0.123 +405 K 0.127 +406 R 0.130 +407 V 0.139 +408 S 0.161 +409 H 0.180 +410 L 0.184 +411 T 0.178 +412 V 0.177 +413 H 0.184 +414 Y 0.210 +415 R 0.247 +416 I 0.272 +417 H 0.281 +418 T 0.291 +419 G 0.299 +420 E 0.285 +421 K 0.242 +422 P 0.192 +423 Y 0.156 +424 E 0.133 +425 C 0.116 +426 K 0.106 +427 E 0.110 +428 C 0.123 +429 G 0.136 +430 K 0.144 +431 A 0.150 +432 F 0.155 +433 S 0.159 +434 H 0.162 +435 C 0.165 +436 S 0.173 +437 Q 0.188 +438 L 0.209 +439 I 0.225 +440 H 0.224 +441 H 0.219 +442 Q 0.234 +443 V 0.265 +444 I 0.289 +445 H 0.311 +446 T 0.350 +447 E 0.403 +448 K 0.448 +449 K 0.468 +450 P 0.473 +451 Y 0.476 +452 E 0.473 +453 Y 0.459 +454 K 0.446 +455 E 0.454 +456 C 0.483 +457 E 0.516 +458 K 0.544 +459 T 0.570 +460 L 0.596 +461 S 0.619 +462 H 0.632 +463 D 0.627 +464 S 0.607 +465 T 0.581 +466 T 0.551 +467 V 0.518 +468 Q 0.509 +469 P 0.539 +470 Q 0.567 +471 R 0.553 +472 M 0.528 +473 H 0.535 +474 N 0.558 +475 R 0.571 +476 E 0.584 +477 T 0.608 +478 H 0.634 +479 V 0.644 +480 N 0.634 +481 I 0.603 +482 I 0.555 +483 N 0.502 +484 V 0.458 +485 E 0.433 +486 K 0.420 +487 P 0.409 +488 S 0.397 +489 I 0.386 +490 S 0.371 +491 S 0.349 +492 Y 0.313 +493 P 0.261 +494 L 0.211 +495 L 0.183 +496 I 0.180 +497 I 0.188 +498 R 0.199 +499 E 0.210 +500 F 0.217 +501 M 0.225 +502 L 0.248 +503 A 0.302 +504 S 0.376 +505 N 0.443 +506 H 0.492 +507 M 0.542 +508 N 0.590 +509 G 0.623 +510 S 0.641 +511 N 0.648 +512 G 0.640 +513 E 0.610 +514 S 0.565 +515 P 0.503 +516 L 0.429 +517 A 0.372 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000018869.19_ENST00000586929.6_GN:ZNF582_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:31.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000018869.19_ENST00000586929.6_GN:ZNF582_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:31.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..02af5fabe7207f14d0cafbe64a205739255d2f3a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000018869.19_ENST00000586929.6_GN:ZNF582_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:31.caid @@ -0,0 +1,549 @@ +>ENSG00000018869.19|ENST00000586929.6|GN:ZNF582|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:31 +1 M 0.393 +2 D 0.424 +3 P 0.464 +4 L 0.493 +5 A 0.508 +6 L 0.514 +7 P 0.504 +8 S 0.479 +9 Q 0.457 +10 D 0.449 +11 S 0.436 +12 A 0.415 +13 L 0.396 +14 P 0.382 +15 Q 0.384 +16 E 0.421 +17 R 0.475 +18 N 0.507 +19 Q 0.515 +20 K 0.516 +21 E 0.507 +22 D 0.462 +23 L 0.380 +24 S 0.290 +25 A 0.217 +26 L 0.171 +27 E 0.146 +28 I 0.133 +29 L 0.127 +30 K 0.132 +31 V 0.152 +32 M 0.179 +33 S 0.204 +34 L 0.215 +35 G 0.205 +36 S 0.176 +37 E 0.144 +38 L 0.125 +39 F 0.122 +40 R 0.129 +41 D 0.142 +42 V 0.149 +43 A 0.142 +44 I 0.124 +45 V 0.106 +46 F 0.094 +47 S 0.089 +48 Q 0.089 +49 E 0.093 +50 E 0.095 +51 W 0.096 +52 Q 0.109 +53 W 0.137 +54 L 0.160 +55 A 0.158 +56 P 0.139 +57 A 0.117 +58 Q 0.098 +59 R 0.087 +60 D 0.087 +61 L 0.101 +62 Y 0.116 +63 R 0.127 +64 D 0.133 +65 V 0.131 +66 M 0.117 +67 L 0.094 +68 E 0.074 +69 T 0.065 +70 Y 0.060 +71 S 0.057 +72 N 0.060 +73 L 0.067 +74 V 0.078 +75 S 0.093 +76 L 0.107 +77 G 0.113 +78 L 0.109 +79 A 0.100 +80 V 0.093 +81 S 0.089 +82 K 0.088 +83 P 0.085 +84 D 0.080 +85 V 0.073 +86 I 0.070 +87 S 0.075 +88 F 0.085 +89 L 0.096 +90 E 0.110 +91 Q 0.126 +92 G 0.142 +93 K 0.150 +94 E 0.153 +95 P 0.166 +96 W 0.204 +97 M 0.274 +98 V 0.369 +99 E 0.468 +100 R 0.546 +101 V 0.580 +102 V 0.575 +103 S 0.564 +104 G 0.576 +105 G 0.608 +106 L 0.641 +107 C 0.669 +108 P 0.689 +109 V 0.692 +110 L 0.681 +111 E 0.669 +112 S 0.659 +113 R 0.647 +114 Y 0.634 +115 D 0.626 +116 T 0.621 +117 K 0.615 +118 E 0.596 +119 L 0.559 +120 F 0.514 +121 P 0.484 +122 K 0.500 +123 Q 0.563 +124 H 0.628 +125 V 0.657 +126 Y 0.651 +127 E 0.631 +128 V 0.602 +129 E 0.574 +130 S 0.556 +131 P 0.541 +132 Q 0.512 +133 W 0.473 +134 E 0.451 +135 I 0.453 +136 M 0.449 +137 E 0.433 +138 S 0.421 +139 L 0.403 +140 T 0.383 +141 S 0.398 +142 Y 0.463 +143 G 0.544 +144 L 0.593 +145 E 0.596 +146 C 0.571 +147 S 0.545 +148 S 0.528 +149 F 0.512 +150 Q 0.497 +151 D 0.479 +152 D 0.449 +153 W 0.402 +154 E 0.362 +155 C 0.348 +156 R 0.361 +157 N 0.393 +158 Q 0.428 +159 F 0.446 +160 D 0.440 +161 R 0.427 +162 Q 0.429 +163 Q 0.448 +164 G 0.466 +165 N 0.466 +166 P 0.452 +167 D 0.445 +168 R 0.452 +169 H 0.452 +170 F 0.428 +171 H 0.399 +172 Q 0.396 +173 M 0.415 +174 I 0.416 +175 I 0.378 +176 R 0.329 +177 H 0.301 +178 E 0.303 +179 E 0.327 +180 M 0.371 +181 P 0.435 +182 T 0.501 +183 F 0.540 +184 D 0.541 +185 Q 0.515 +186 H 0.476 +187 A 0.430 +188 S 0.389 +189 L 0.364 +190 T 0.354 +191 F 0.343 +192 Y 0.327 +193 Q 0.322 +194 K 0.332 +195 I 0.342 +196 H 0.335 +197 T 0.319 +198 R 0.311 +199 E 0.316 +200 K 0.318 +201 P 0.306 +202 F 0.285 +203 G 0.261 +204 Y 0.236 +205 N 0.210 +206 K 0.186 +207 C 0.172 +208 R 0.170 +209 K 0.169 +210 D 0.161 +211 F 0.147 +212 W 0.137 +213 Q 0.138 +214 K 0.150 +215 E 0.167 +216 L 0.182 +217 L 0.193 +218 I 0.198 +219 N 0.194 +220 H 0.190 +221 Q 0.201 +222 G 0.220 +223 I 0.224 +224 Y 0.209 +225 T 0.189 +226 N 0.179 +227 E 0.172 +228 K 0.156 +229 P 0.126 +230 Y 0.096 +231 K 0.075 +232 C 0.063 +233 K 0.058 +234 E 0.060 +235 C 0.064 +236 G 0.070 +237 K 0.077 +238 A 0.083 +239 F 0.087 +240 K 0.093 +241 Y 0.109 +242 G 0.131 +243 S 0.149 +244 R 0.159 +245 L 0.167 +246 I 0.173 +247 Q 0.171 +248 H 0.168 +249 E 0.176 +250 N 0.187 +251 I 0.190 +252 H 0.191 +253 S 0.200 +254 G 0.208 +255 K 0.197 +256 K 0.160 +257 P 0.111 +258 Y 0.074 +259 E 0.055 +260 C 0.049 +261 K 0.051 +262 E 0.059 +263 C 0.070 +264 G 0.079 +265 K 0.089 +266 A 0.100 +267 F 0.112 +268 N 0.122 +269 S 0.129 +270 G 0.131 +271 S 0.132 +272 N 0.134 +273 F 0.138 +274 I 0.142 +275 Q 0.143 +276 H 0.144 +277 Q 0.154 +278 R 0.169 +279 V 0.181 +280 H 0.194 +281 T 0.213 +282 G 0.225 +283 E 0.216 +284 K 0.182 +285 P 0.141 +286 Y 0.109 +287 E 0.092 +288 C 0.087 +289 K 0.089 +290 D 0.097 +291 C 0.106 +292 E 0.113 +293 K 0.122 +294 A 0.131 +295 F 0.139 +296 S 0.144 +297 R 0.151 +298 S 0.175 +299 S 0.214 +300 Q 0.241 +301 L 0.235 +302 I 0.209 +303 E 0.185 +304 H 0.180 +305 Q 0.194 +306 R 0.214 +307 T 0.227 +308 H 0.239 +309 T 0.253 +310 G 0.259 +311 E 0.243 +312 K 0.201 +313 P 0.151 +314 Y 0.113 +315 Q 0.090 +316 C 0.078 +317 K 0.075 +318 E 0.083 +319 C 0.096 +320 G 0.106 +321 K 0.114 +322 A 0.120 +323 F 0.122 +324 N 0.117 +325 R 0.110 +326 I 0.114 +327 S 0.131 +328 H 0.146 +329 L 0.149 +330 K 0.146 +331 V 0.145 +332 H 0.152 +333 Y 0.172 +334 R 0.199 +335 I 0.220 +336 H 0.234 +337 T 0.245 +338 G 0.248 +339 E 0.230 +340 K 0.191 +341 P 0.147 +342 Y 0.117 +343 A 0.100 +344 C 0.088 +345 K 0.082 +346 E 0.086 +347 C 0.098 +348 G 0.111 +349 K 0.123 +350 T 0.131 +351 F 0.136 +352 S 0.137 +353 H 0.141 +354 R 0.152 +355 S 0.169 +356 Q 0.181 +357 L 0.181 +358 I 0.173 +359 Q 0.162 +360 H 0.152 +361 Q 0.149 +362 T 0.158 +363 V 0.174 +364 H 0.196 +365 T 0.226 +366 G 0.251 +367 R 0.256 +368 K 0.232 +369 L 0.189 +370 Y 0.148 +371 E 0.118 +372 C 0.098 +373 K 0.088 +374 E 0.088 +375 C 0.095 +376 G 0.103 +377 K 0.113 +378 A 0.125 +379 F 0.140 +380 N 0.158 +381 Q 0.177 +382 G 0.188 +383 S 0.189 +384 T 0.187 +385 L 0.192 +386 I 0.201 +387 R 0.208 +388 H 0.213 +389 Q 0.225 +390 R 0.243 +391 I 0.257 +392 H 0.267 +393 T 0.275 +394 G 0.274 +395 E 0.256 +396 K 0.222 +397 P 0.188 +398 Y 0.166 +399 E 0.148 +400 C 0.122 +401 K 0.098 +402 V 0.091 +403 C 0.098 +404 G 0.107 +405 K 0.113 +406 A 0.117 +407 F 0.121 +408 R 0.124 +409 V 0.129 +410 S 0.140 +411 S 0.156 +412 Q 0.168 +413 L 0.172 +414 K 0.169 +415 Q 0.168 +416 H 0.175 +417 Q 0.189 +418 R 0.202 +419 I 0.209 +420 H 0.216 +421 T 0.230 +422 G 0.240 +423 E 0.231 +424 K 0.199 +425 P 0.158 +426 Y 0.127 +427 Q 0.109 +428 C 0.093 +429 K 0.081 +430 V 0.079 +431 C 0.087 +432 G 0.097 +433 R 0.105 +434 A 0.114 +435 F 0.123 +436 K 0.130 +437 R 0.134 +438 V 0.145 +439 S 0.169 +440 H 0.191 +441 L 0.197 +442 T 0.195 +443 V 0.195 +444 H 0.200 +445 Y 0.224 +446 R 0.259 +447 I 0.282 +448 H 0.291 +449 T 0.301 +450 G 0.310 +451 E 0.296 +452 K 0.253 +453 P 0.201 +454 Y 0.161 +455 E 0.135 +456 C 0.116 +457 K 0.107 +458 E 0.111 +459 C 0.127 +460 G 0.144 +461 K 0.154 +462 A 0.160 +463 F 0.165 +464 S 0.169 +465 H 0.172 +466 C 0.177 +467 S 0.187 +468 Q 0.204 +469 L 0.226 +470 I 0.242 +471 H 0.239 +472 H 0.230 +473 Q 0.243 +474 V 0.273 +475 I 0.295 +476 H 0.313 +477 T 0.349 +478 E 0.401 +479 K 0.448 +480 K 0.473 +481 P 0.480 +482 Y 0.482 +483 E 0.475 +484 Y 0.451 +485 K 0.428 +486 E 0.431 +487 C 0.461 +488 E 0.499 +489 K 0.534 +490 T 0.567 +491 L 0.599 +492 S 0.622 +493 H 0.632 +494 D 0.625 +495 S 0.601 +496 T 0.570 +497 T 0.533 +498 V 0.499 +499 Q 0.490 +500 P 0.519 +501 Q 0.542 +502 R 0.525 +503 M 0.498 +504 H 0.499 +505 N 0.505 +506 R 0.495 +507 E 0.496 +508 T 0.526 +509 H 0.562 +510 V 0.579 +511 N 0.567 +512 I 0.527 +513 I 0.469 +514 N 0.413 +515 V 0.375 +516 E 0.358 +517 K 0.348 +518 P 0.335 +519 S 0.321 +520 I 0.312 +521 S 0.302 +522 S 0.284 +523 Y 0.248 +524 P 0.196 +525 L 0.145 +526 L 0.115 +527 I 0.108 +528 I 0.113 +529 R 0.126 +530 E 0.145 +531 F 0.162 +532 M 0.178 +533 L 0.210 +534 A 0.274 +535 S 0.357 +536 N 0.431 +537 H 0.485 +538 M 0.532 +539 N 0.573 +540 G 0.596 +541 S 0.605 +542 N 0.608 +543 G 0.591 +544 E 0.546 +545 S 0.482 +546 P 0.409 +547 L 0.337 +548 A 0.287 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000041880.16_ENST00000398755.8_GN:PARP3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000041880.16_ENST00000398755.8_GN:PARP3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e64b5dfe950137df668873205ace01fcaf98a1bd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000041880.16_ENST00000398755.8_GN:PARP3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,534 @@ +>ENSG00000041880.16|ENST00000398755.8|GN:PARP3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.367 +2 A 0.377 +3 P 0.393 +4 K 0.406 +5 P 0.409 +6 K 0.403 +7 P 0.389 +8 W 0.372 +9 V 0.354 +10 Q 0.351 +11 T 0.378 +12 E 0.426 +13 G 0.465 +14 P 0.482 +15 E 0.477 +16 K 0.457 +17 K 0.454 +18 K 0.493 +19 G 0.553 +20 R 0.594 +21 Q 0.606 +22 A 0.597 +23 G 0.568 +24 R 0.523 +25 E 0.469 +26 E 0.414 +27 D 0.357 +28 P 0.297 +29 F 0.243 +30 R 0.207 +31 S 0.191 +32 T 0.185 +33 A 0.185 +34 E 0.190 +35 A 0.196 +36 L 0.204 +37 K 0.222 +38 A 0.252 +39 I 0.284 +40 P 0.309 +41 A 0.323 +42 E 0.316 +43 K 0.284 +44 R 0.244 +45 I 0.210 +46 I 0.184 +47 R 0.161 +48 V 0.144 +49 D 0.136 +50 P 0.128 +51 T 0.117 +52 C 0.107 +53 P 0.104 +54 L 0.107 +55 S 0.115 +56 S 0.127 +57 N 0.140 +58 P 0.146 +59 G 0.142 +60 T 0.126 +61 Q 0.104 +62 V 0.084 +63 Y 0.073 +64 E 0.069 +65 D 0.067 +66 Y 0.061 +67 N 0.054 +68 C 0.051 +69 T 0.054 +70 L 0.060 +71 N 0.068 +72 Q 0.074 +73 T 0.076 +74 N 0.079 +75 I 0.089 +76 E 0.100 +77 N 0.105 +78 N 0.099 +79 N 0.091 +80 N 0.083 +81 K 0.074 +82 F 0.062 +83 Y 0.050 +84 I 0.042 +85 I 0.040 +86 Q 0.042 +87 L 0.045 +88 L 0.046 +89 Q 0.047 +90 D 0.048 +91 S 0.050 +92 N 0.048 +93 R 0.041 +94 F 0.033 +95 F 0.029 +96 T 0.028 +97 C 0.029 +98 W 0.035 +99 N 0.047 +100 R 0.062 +101 W 0.076 +102 G 0.088 +103 R 0.096 +104 V 0.103 +105 G 0.114 +106 E 0.130 +107 V 0.150 +108 G 0.165 +109 Q 0.168 +110 S 0.156 +111 K 0.138 +112 I 0.123 +113 N 0.113 +114 H 0.106 +115 F 0.097 +116 T 0.082 +117 R 0.064 +118 L 0.048 +119 E 0.035 +120 D 0.023 +121 A 0.013 +122 K 0.009 +123 K 0.012 +124 D 0.024 +125 F 0.044 +126 E 0.063 +127 K 0.071 +128 K 0.067 +129 F 0.064 +130 R 0.070 +131 E 0.080 +132 K 0.085 +133 T 0.083 +134 K 0.079 +135 N 0.075 +136 N 0.071 +137 W 0.065 +138 A 0.059 +139 E 0.055 +140 R 0.057 +141 D 0.064 +142 H 0.075 +143 F 0.083 +144 V 0.090 +145 S 0.100 +146 H 0.114 +147 P 0.130 +148 G 0.138 +149 K 0.135 +150 Y 0.126 +151 T 0.120 +152 L 0.124 +153 I 0.140 +154 E 0.168 +155 V 0.216 +156 Q 0.285 +157 A 0.368 +158 E 0.446 +159 D 0.508 +160 E 0.556 +161 A 0.592 +162 Q 0.619 +163 E 0.640 +164 A 0.654 +165 V 0.654 +166 V 0.644 +167 K 0.628 +168 V 0.607 +169 D 0.581 +170 R 0.560 +171 G 0.556 +172 P 0.571 +173 V 0.592 +174 R 0.604 +175 T 0.595 +176 V 0.560 +177 T 0.503 +178 K 0.435 +179 R 0.372 +180 V 0.325 +181 Q 0.290 +182 P 0.254 +183 C 0.212 +184 S 0.174 +185 L 0.143 +186 D 0.116 +187 P 0.093 +188 A 0.081 +189 T 0.082 +190 Q 0.092 +191 K 0.103 +192 L 0.103 +193 I 0.090 +194 T 0.075 +195 N 0.068 +196 I 0.067 +197 F 0.068 +198 S 0.068 +199 K 0.063 +200 E 0.058 +201 M 0.058 +202 F 0.065 +203 K 0.077 +204 N 0.090 +205 T 0.097 +206 M 0.102 +207 A 0.107 +208 L 0.111 +209 M 0.112 +210 D 0.107 +211 L 0.097 +212 D 0.085 +213 V 0.076 +214 K 0.075 +215 K 0.079 +216 M 0.089 +217 P 0.104 +218 L 0.122 +219 G 0.138 +220 K 0.143 +221 L 0.130 +222 S 0.102 +223 K 0.072 +224 Q 0.052 +225 Q 0.044 +226 I 0.045 +227 A 0.050 +228 R 0.054 +229 G 0.055 +230 F 0.054 +231 E 0.051 +232 A 0.049 +233 L 0.051 +234 E 0.057 +235 A 0.062 +236 L 0.063 +237 E 0.061 +238 E 0.062 +239 A 0.070 +240 L 0.086 +241 K 0.115 +242 G 0.156 +243 P 0.199 +244 T 0.235 +245 D 0.257 +246 G 0.259 +247 G 0.235 +248 Q 0.189 +249 S 0.138 +250 L 0.103 +251 E 0.089 +252 E 0.087 +253 L 0.089 +254 S 0.090 +255 S 0.089 +256 H 0.083 +257 F 0.075 +258 Y 0.068 +259 T 0.063 +260 V 0.062 +261 I 0.066 +262 P 0.081 +263 H 0.104 +264 N 0.128 +265 F 0.150 +266 G 0.173 +267 H 0.193 +268 S 0.205 +269 Q 0.207 +270 P 0.198 +271 P 0.179 +272 P 0.147 +273 I 0.111 +274 N 0.083 +275 S 0.069 +276 P 0.063 +277 E 0.060 +278 L 0.056 +279 L 0.054 +280 Q 0.054 +281 A 0.055 +282 K 0.055 +283 K 0.056 +284 D 0.061 +285 M 0.067 +286 L 0.068 +287 L 0.065 +288 V 0.064 +289 L 0.063 +290 A 0.063 +291 D 0.064 +292 I 0.065 +293 E 0.067 +294 L 0.070 +295 A 0.078 +296 Q 0.091 +297 A 0.104 +298 L 0.115 +299 Q 0.131 +300 A 0.157 +301 V 0.192 +302 S 0.227 +303 E 0.258 +304 Q 0.285 +305 E 0.306 +306 K 0.317 +307 T 0.312 +308 V 0.292 +309 E 0.265 +310 E 0.238 +311 V 0.208 +312 P 0.173 +313 H 0.140 +314 P 0.120 +315 L 0.112 +316 D 0.114 +317 R 0.117 +318 D 0.117 +319 Y 0.113 +320 Q 0.108 +321 L 0.099 +322 L 0.082 +323 K 0.062 +324 C 0.047 +325 Q 0.041 +326 L 0.043 +327 Q 0.049 +328 L 0.056 +329 L 0.061 +330 D 0.063 +331 S 0.064 +332 G 0.063 +333 A 0.059 +334 P 0.056 +335 E 0.058 +336 Y 0.064 +337 K 0.066 +338 V 0.058 +339 I 0.046 +340 Q 0.039 +341 T 0.037 +342 Y 0.038 +343 L 0.040 +344 E 0.046 +345 Q 0.057 +346 T 0.075 +347 G 0.096 +348 S 0.113 +349 N 0.123 +350 H 0.125 +351 R 0.124 +352 C 0.118 +353 P 0.107 +354 T 0.092 +355 L 0.079 +356 Q 0.070 +357 H 0.065 +358 I 0.063 +359 W 0.061 +360 K 0.061 +361 V 0.066 +362 N 0.081 +363 Q 0.101 +364 E 0.113 +365 G 0.110 +366 E 0.102 +367 E 0.098 +368 D 0.097 +369 R 0.094 +370 F 0.090 +371 Q 0.090 +372 A 0.094 +373 H 0.100 +374 S 0.108 +375 K 0.118 +376 L 0.124 +377 G 0.121 +378 N 0.113 +379 R 0.106 +380 K 0.102 +381 L 0.094 +382 L 0.082 +383 W 0.072 +384 H 0.067 +385 G 0.063 +386 T 0.062 +387 N 0.066 +388 M 0.071 +389 A 0.075 +390 V 0.076 +391 V 0.076 +392 A 0.078 +393 A 0.081 +394 I 0.090 +395 L 0.103 +396 T 0.114 +397 S 0.121 +398 G 0.128 +399 L 0.136 +400 R 0.148 +401 I 0.163 +402 M 0.187 +403 P 0.217 +404 H 0.246 +405 S 0.265 +406 G 0.270 +407 G 0.255 +408 R 0.228 +409 V 0.201 +410 G 0.185 +411 K 0.172 +412 G 0.154 +413 I 0.129 +414 Y 0.106 +415 F 0.091 +416 A 0.084 +417 S 0.082 +418 E 0.082 +419 N 0.082 +420 S 0.080 +421 K 0.078 +422 S 0.076 +423 A 0.070 +424 G 0.062 +425 Y 0.057 +426 V 0.056 +427 I 0.062 +428 G 0.080 +429 M 0.107 +430 K 0.139 +431 C 0.165 +432 G 0.175 +433 A 0.162 +434 H 0.133 +435 H 0.103 +436 V 0.084 +437 G 0.078 +438 Y 0.081 +439 M 0.088 +440 F 0.096 +441 L 0.103 +442 G 0.107 +443 E 0.107 +444 V 0.108 +445 A 0.110 +446 L 0.116 +447 G 0.123 +448 R 0.128 +449 E 0.132 +450 H 0.136 +451 H 0.139 +452 I 0.137 +453 N 0.133 +454 T 0.135 +455 D 0.141 +456 N 0.144 +457 P 0.137 +458 S 0.124 +459 L 0.114 +460 K 0.113 +461 S 0.119 +462 P 0.128 +463 P 0.130 +464 P 0.126 +465 G 0.119 +466 F 0.114 +467 D 0.116 +468 S 0.126 +469 V 0.140 +470 I 0.154 +471 A 0.166 +472 R 0.180 +473 G 0.202 +474 H 0.231 +475 T 0.254 +476 E 0.266 +477 P 0.267 +478 D 0.265 +479 P 0.262 +480 T 0.258 +481 Q 0.249 +482 D 0.237 +483 T 0.228 +484 E 0.221 +485 L 0.210 +486 E 0.195 +487 L 0.181 +488 D 0.173 +489 G 0.171 +490 Q 0.169 +491 Q 0.165 +492 V 0.162 +493 V 0.164 +494 V 0.172 +495 P 0.185 +496 Q 0.201 +497 G 0.222 +498 Q 0.244 +499 P 0.261 +500 V 0.271 +501 P 0.273 +502 C 0.269 +503 P 0.258 +504 E 0.248 +505 F 0.247 +506 S 0.249 +507 S 0.248 +508 S 0.244 +509 T 0.241 +510 F 0.236 +511 S 0.222 +512 Q 0.198 +513 S 0.169 +514 E 0.142 +515 Y 0.122 +516 L 0.109 +517 I 0.099 +518 Y 0.092 +519 Q 0.091 +520 E 0.092 +521 S 0.089 +522 Q 0.080 +523 C 0.072 +524 R 0.065 +525 L 0.057 +526 R 0.048 +527 Y 0.041 +528 L 0.039 +529 L 0.044 +530 E 0.055 +531 V 0.073 +532 H 0.097 +533 L 0.116 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000041880.16_ENST00000398755.8_GN:PARP3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000041880.16_ENST00000398755.8_GN:PARP3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0e4cd10cd58f3053a2cbeb6b922c591f25d28fb8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000041880.16_ENST00000398755.8_GN:PARP3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid @@ -0,0 +1,541 @@ +>ENSG00000041880.16|ENST00000398755.8|GN:PARP3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:7 +1 M 0.266 +2 S 0.259 +3 L 0.258 +4 L 0.262 +5 F 0.257 +6 L 0.249 +7 A 0.259 +8 M 0.294 +9 A 0.333 +10 P 0.360 +11 K 0.379 +12 P 0.394 +13 K 0.400 +14 P 0.395 +15 W 0.382 +16 V 0.370 +17 Q 0.373 +18 T 0.405 +19 E 0.457 +20 G 0.504 +21 P 0.536 +22 E 0.554 +23 K 0.561 +24 K 0.566 +25 K 0.578 +26 G 0.595 +27 R 0.606 +28 Q 0.607 +29 A 0.595 +30 G 0.566 +31 R 0.523 +32 E 0.473 +33 E 0.421 +34 D 0.364 +35 P 0.302 +36 F 0.247 +37 R 0.212 +38 S 0.196 +39 T 0.191 +40 A 0.193 +41 E 0.199 +42 A 0.205 +43 L 0.212 +44 K 0.228 +45 A 0.256 +46 I 0.287 +47 P 0.312 +48 A 0.326 +49 E 0.318 +50 K 0.286 +51 R 0.245 +52 I 0.211 +53 I 0.185 +54 R 0.162 +55 V 0.146 +56 D 0.137 +57 P 0.129 +58 T 0.117 +59 C 0.107 +60 P 0.103 +61 L 0.106 +62 S 0.114 +63 S 0.125 +64 N 0.136 +65 P 0.142 +66 G 0.137 +67 T 0.122 +68 Q 0.102 +69 V 0.083 +70 Y 0.072 +71 E 0.069 +72 D 0.067 +73 Y 0.061 +74 N 0.054 +75 C 0.051 +76 T 0.053 +77 L 0.059 +78 N 0.067 +79 Q 0.073 +80 T 0.075 +81 N 0.078 +82 I 0.087 +83 E 0.099 +84 N 0.103 +85 N 0.097 +86 N 0.089 +87 N 0.081 +88 K 0.073 +89 F 0.062 +90 Y 0.050 +91 I 0.042 +92 I 0.039 +93 Q 0.041 +94 L 0.044 +95 L 0.046 +96 Q 0.046 +97 D 0.047 +98 S 0.049 +99 N 0.047 +100 R 0.040 +101 F 0.033 +102 F 0.029 +103 T 0.028 +104 C 0.029 +105 W 0.035 +106 N 0.047 +107 R 0.062 +108 W 0.076 +109 G 0.087 +110 R 0.096 +111 V 0.103 +112 G 0.114 +113 E 0.131 +114 V 0.151 +115 G 0.166 +116 Q 0.169 +117 S 0.158 +118 K 0.140 +119 I 0.125 +120 N 0.115 +121 H 0.108 +122 F 0.099 +123 T 0.083 +124 R 0.065 +125 L 0.049 +126 E 0.036 +127 D 0.023 +128 A 0.013 +129 K 0.009 +130 K 0.013 +131 D 0.025 +132 F 0.044 +133 E 0.063 +134 K 0.072 +135 K 0.067 +136 F 0.063 +137 R 0.069 +138 E 0.079 +139 K 0.084 +140 T 0.083 +141 K 0.079 +142 N 0.075 +143 N 0.071 +144 W 0.066 +145 A 0.059 +146 E 0.055 +147 R 0.057 +148 D 0.064 +149 H 0.074 +150 F 0.083 +151 V 0.090 +152 S 0.099 +153 H 0.114 +154 P 0.129 +155 G 0.137 +156 K 0.135 +157 Y 0.126 +158 T 0.120 +159 L 0.124 +160 I 0.140 +161 E 0.169 +162 V 0.217 +163 Q 0.288 +164 A 0.372 +165 E 0.451 +166 D 0.513 +167 E 0.561 +168 A 0.597 +169 Q 0.624 +170 E 0.646 +171 A 0.659 +172 V 0.659 +173 V 0.648 +174 K 0.632 +175 V 0.611 +176 D 0.585 +177 R 0.563 +178 G 0.559 +179 P 0.573 +180 V 0.593 +181 R 0.605 +182 T 0.596 +183 V 0.561 +184 T 0.503 +185 K 0.436 +186 R 0.373 +187 V 0.326 +188 Q 0.290 +189 P 0.253 +190 C 0.212 +191 S 0.173 +192 L 0.143 +193 D 0.116 +194 P 0.093 +195 A 0.081 +196 T 0.081 +197 Q 0.091 +198 K 0.102 +199 L 0.102 +200 I 0.090 +201 T 0.075 +202 N 0.067 +203 I 0.067 +204 F 0.068 +205 S 0.068 +206 K 0.063 +207 E 0.058 +208 M 0.057 +209 F 0.064 +210 K 0.077 +211 N 0.089 +212 T 0.096 +213 M 0.101 +214 A 0.106 +215 L 0.111 +216 M 0.112 +217 D 0.107 +218 L 0.097 +219 D 0.085 +220 V 0.076 +221 K 0.075 +222 K 0.079 +223 M 0.089 +224 P 0.104 +225 L 0.123 +226 G 0.138 +227 K 0.143 +228 L 0.130 +229 S 0.102 +230 K 0.072 +231 Q 0.052 +232 Q 0.044 +233 I 0.045 +234 A 0.050 +235 R 0.054 +236 G 0.055 +237 F 0.054 +238 E 0.051 +239 A 0.050 +240 L 0.051 +241 E 0.057 +242 A 0.063 +243 L 0.064 +244 E 0.062 +245 E 0.063 +246 A 0.070 +247 L 0.087 +248 K 0.116 +249 G 0.157 +250 P 0.201 +251 T 0.237 +252 D 0.258 +253 G 0.260 +254 G 0.236 +255 Q 0.190 +256 S 0.138 +257 L 0.104 +258 E 0.090 +259 E 0.088 +260 L 0.089 +261 S 0.091 +262 S 0.089 +263 H 0.083 +264 F 0.075 +265 Y 0.068 +266 T 0.063 +267 V 0.062 +268 I 0.066 +269 P 0.081 +270 H 0.104 +271 N 0.128 +272 F 0.150 +273 G 0.173 +274 H 0.193 +275 S 0.206 +276 Q 0.207 +277 P 0.199 +278 P 0.179 +279 P 0.147 +280 I 0.112 +281 N 0.084 +282 S 0.069 +283 P 0.064 +284 E 0.060 +285 L 0.057 +286 L 0.054 +287 Q 0.054 +288 A 0.055 +289 K 0.055 +290 K 0.057 +291 D 0.062 +292 M 0.067 +293 L 0.068 +294 L 0.066 +295 V 0.064 +296 L 0.064 +297 A 0.063 +298 D 0.064 +299 I 0.065 +300 E 0.067 +301 L 0.070 +302 A 0.078 +303 Q 0.091 +304 A 0.104 +305 L 0.115 +306 Q 0.131 +307 A 0.157 +308 V 0.191 +309 S 0.226 +310 E 0.257 +311 Q 0.284 +312 E 0.305 +313 K 0.316 +314 T 0.311 +315 V 0.290 +316 E 0.264 +317 E 0.238 +318 V 0.208 +319 P 0.173 +320 H 0.140 +321 P 0.120 +322 L 0.112 +323 D 0.114 +324 R 0.118 +325 D 0.117 +326 Y 0.113 +327 Q 0.108 +328 L 0.099 +329 L 0.082 +330 K 0.062 +331 C 0.048 +332 Q 0.042 +333 L 0.043 +334 Q 0.049 +335 L 0.056 +336 L 0.061 +337 D 0.063 +338 S 0.064 +339 G 0.063 +340 A 0.060 +341 P 0.057 +342 E 0.059 +343 Y 0.065 +344 K 0.067 +345 V 0.059 +346 I 0.047 +347 Q 0.039 +348 T 0.038 +349 Y 0.038 +350 L 0.040 +351 E 0.046 +352 Q 0.058 +353 T 0.076 +354 G 0.097 +355 S 0.114 +356 N 0.124 +357 H 0.127 +358 R 0.125 +359 C 0.120 +360 P 0.108 +361 T 0.093 +362 L 0.080 +363 Q 0.070 +364 H 0.065 +365 I 0.063 +366 W 0.062 +367 K 0.062 +368 V 0.067 +369 N 0.082 +370 Q 0.102 +371 E 0.114 +372 G 0.111 +373 E 0.103 +374 E 0.098 +375 D 0.097 +376 R 0.094 +377 F 0.090 +378 Q 0.090 +379 A 0.094 +380 H 0.100 +381 S 0.108 +382 K 0.118 +383 L 0.124 +384 G 0.122 +385 N 0.114 +386 R 0.107 +387 K 0.103 +388 L 0.095 +389 L 0.083 +390 W 0.073 +391 H 0.067 +392 G 0.064 +393 T 0.063 +394 N 0.067 +395 M 0.072 +396 A 0.075 +397 V 0.076 +398 V 0.077 +399 A 0.078 +400 A 0.082 +401 I 0.090 +402 L 0.103 +403 T 0.114 +404 S 0.121 +405 G 0.128 +406 L 0.137 +407 R 0.148 +408 I 0.164 +409 M 0.187 +410 P 0.217 +411 H 0.245 +412 S 0.265 +413 G 0.269 +414 G 0.256 +415 R 0.228 +416 V 0.202 +417 G 0.186 +418 K 0.174 +419 G 0.155 +420 I 0.130 +421 Y 0.107 +422 F 0.092 +423 A 0.084 +424 S 0.082 +425 E 0.083 +426 N 0.083 +427 S 0.081 +428 K 0.079 +429 S 0.077 +430 A 0.071 +431 G 0.063 +432 Y 0.058 +433 V 0.057 +434 I 0.063 +435 G 0.080 +436 M 0.108 +437 K 0.140 +438 C 0.166 +439 G 0.176 +440 A 0.163 +441 H 0.134 +442 H 0.104 +443 V 0.085 +444 G 0.079 +445 Y 0.082 +446 M 0.089 +447 F 0.097 +448 L 0.104 +449 G 0.108 +450 E 0.109 +451 V 0.109 +452 A 0.111 +453 L 0.117 +454 G 0.124 +455 R 0.129 +456 E 0.133 +457 H 0.137 +458 H 0.140 +459 I 0.138 +460 N 0.135 +461 T 0.136 +462 D 0.142 +463 N 0.144 +464 P 0.138 +465 S 0.125 +466 L 0.115 +467 K 0.114 +468 S 0.120 +469 P 0.129 +470 P 0.132 +471 P 0.128 +472 G 0.120 +473 F 0.116 +474 D 0.118 +475 S 0.128 +476 V 0.142 +477 I 0.157 +478 A 0.169 +479 R 0.183 +480 G 0.206 +481 H 0.234 +482 T 0.257 +483 E 0.268 +484 P 0.270 +485 D 0.267 +486 P 0.265 +487 T 0.261 +488 Q 0.252 +489 D 0.240 +490 T 0.229 +491 E 0.222 +492 L 0.211 +493 E 0.196 +494 L 0.182 +495 D 0.175 +496 G 0.173 +497 Q 0.171 +498 Q 0.166 +499 V 0.163 +500 V 0.165 +501 V 0.174 +502 P 0.187 +503 Q 0.204 +504 G 0.225 +505 Q 0.246 +506 P 0.263 +507 V 0.272 +508 P 0.275 +509 C 0.271 +510 P 0.261 +511 E 0.252 +512 F 0.250 +513 S 0.253 +514 S 0.251 +515 S 0.247 +516 T 0.244 +517 F 0.238 +518 S 0.223 +519 Q 0.198 +520 S 0.169 +521 E 0.142 +522 Y 0.123 +523 L 0.110 +524 I 0.099 +525 Y 0.092 +526 Q 0.092 +527 E 0.093 +528 S 0.090 +529 Q 0.081 +530 C 0.073 +531 R 0.066 +532 L 0.057 +533 R 0.048 +534 Y 0.041 +535 L 0.040 +536 L 0.045 +537 E 0.055 +538 V 0.073 +539 H 0.097 +540 L 0.115 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000051596.11_ENST00000265097.9_GN:THOC3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000051596.11_ENST00000265097.9_GN:THOC3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c0489ead55f6e7e1704cf12490c498f52d1ad8a4 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000051596.11_ENST00000265097.9_GN:THOC3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,352 @@ +>ENSG00000051596.11|ENST00000265097.9|GN:THOC3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.326 +2 A 0.356 +3 V 0.404 +4 P 0.434 +5 A 0.415 +6 A 0.370 +7 A 0.364 +8 M 0.413 +9 G 0.461 +10 P 0.479 +11 S 0.500 +12 A 0.544 +13 L 0.567 +14 G 0.538 +15 Q 0.504 +16 S 0.522 +17 G 0.580 +18 P 0.633 +19 G 0.653 +20 S 0.641 +21 M 0.614 +22 A 0.597 +23 P 0.594 +24 W 0.591 +25 C 0.581 +26 S 0.567 +27 V 0.546 +28 S 0.520 +29 S 0.503 +30 G 0.502 +31 P 0.502 +32 S 0.486 +33 R 0.462 +34 Y 0.444 +35 V 0.424 +36 L 0.383 +37 G 0.322 +38 M 0.263 +39 Q 0.230 +40 E 0.221 +41 L 0.216 +42 F 0.202 +43 R 0.182 +44 G 0.166 +45 H 0.148 +46 S 0.122 +47 K 0.094 +48 T 0.072 +49 R 0.058 +50 E 0.050 +51 F 0.046 +52 L 0.044 +53 A 0.044 +54 H 0.044 +55 S 0.048 +56 A 0.055 +57 K 0.065 +58 V 0.071 +59 H 0.067 +60 S 0.057 +61 V 0.047 +62 A 0.040 +63 W 0.039 +64 S 0.044 +65 C 0.051 +66 D 0.054 +67 G 0.051 +68 R 0.046 +69 R 0.044 +70 L 0.044 +71 A 0.046 +72 S 0.051 +73 G 0.065 +74 S 0.085 +75 F 0.104 +76 D 0.107 +77 K 0.089 +78 T 0.060 +79 A 0.039 +80 S 0.031 +81 V 0.029 +82 F 0.031 +83 L 0.036 +84 L 0.042 +85 E 0.048 +86 K 0.049 +87 D 0.050 +88 R 0.052 +89 L 0.053 +90 V 0.053 +91 K 0.053 +92 E 0.053 +93 N 0.050 +94 N 0.045 +95 Y 0.043 +96 R 0.045 +97 G 0.052 +98 H 0.062 +99 G 0.071 +100 D 0.076 +101 S 0.074 +102 V 0.066 +103 D 0.058 +104 Q 0.052 +105 L 0.049 +106 C 0.049 +107 W 0.054 +108 H 0.061 +109 P 0.062 +110 S 0.057 +111 N 0.049 +112 P 0.040 +113 D 0.030 +114 L 0.022 +115 F 0.020 +116 V 0.024 +117 T 0.037 +118 A 0.064 +119 S 0.098 +120 G 0.121 +121 D 0.120 +122 K 0.097 +123 T 0.073 +124 I 0.063 +125 R 0.062 +126 I 0.061 +127 W 0.053 +128 D 0.042 +129 V 0.035 +130 R 0.037 +131 T 0.047 +132 T 0.060 +133 K 0.071 +134 C 0.072 +135 I 0.066 +136 A 0.060 +137 T 0.059 +138 V 0.060 +139 N 0.064 +140 T 0.072 +141 K 0.081 +142 G 0.083 +143 E 0.074 +144 N 0.058 +145 I 0.042 +146 N 0.032 +147 I 0.028 +148 C 0.029 +149 W 0.036 +150 S 0.049 +151 P 0.062 +152 D 0.068 +153 G 0.063 +154 Q 0.052 +155 T 0.042 +156 I 0.035 +157 A 0.034 +158 V 0.038 +159 G 0.051 +160 N 0.066 +161 K 0.075 +162 D 0.071 +163 D 0.059 +164 V 0.046 +165 V 0.039 +166 T 0.037 +167 F 0.039 +168 I 0.043 +169 D 0.046 +170 A 0.047 +171 K 0.046 +172 T 0.048 +173 H 0.056 +174 R 0.068 +175 S 0.075 +176 K 0.075 +177 A 0.070 +178 E 0.065 +179 E 0.061 +180 Q 0.056 +181 F 0.049 +182 K 0.044 +183 F 0.040 +184 E 0.040 +185 V 0.039 +186 N 0.037 +187 E 0.034 +188 I 0.030 +189 S 0.028 +190 W 0.032 +191 N 0.043 +192 N 0.055 +193 D 0.058 +194 N 0.049 +195 N 0.036 +196 M 0.027 +197 F 0.022 +198 F 0.021 +199 L 0.026 +200 T 0.040 +201 N 0.064 +202 G 0.089 +203 N 0.103 +204 G 0.099 +205 C 0.080 +206 I 0.062 +207 N 0.053 +208 I 0.051 +209 L 0.048 +210 S 0.041 +211 Y 0.036 +212 P 0.038 +213 E 0.046 +214 L 0.051 +215 K 0.053 +216 P 0.054 +217 V 0.054 +218 Q 0.055 +219 S 0.055 +220 I 0.054 +221 N 0.052 +222 A 0.049 +223 H 0.047 +224 P 0.048 +225 S 0.050 +226 N 0.050 +227 C 0.048 +228 I 0.045 +229 C 0.044 +230 I 0.049 +231 K 0.056 +232 F 0.066 +233 D 0.076 +234 P 0.081 +235 M 0.078 +236 G 0.065 +237 K 0.047 +238 Y 0.035 +239 F 0.031 +240 A 0.034 +241 T 0.045 +242 G 0.068 +243 S 0.097 +244 A 0.119 +245 D 0.119 +246 A 0.097 +247 L 0.070 +248 V 0.050 +249 S 0.043 +250 L 0.042 +251 W 0.042 +252 D 0.041 +253 V 0.039 +254 D 0.041 +255 E 0.043 +256 L 0.044 +257 V 0.044 +258 C 0.042 +259 V 0.039 +260 R 0.039 +261 C 0.044 +262 F 0.051 +263 S 0.058 +264 R 0.061 +265 L 0.063 +266 D 0.067 +267 W 0.070 +268 P 0.067 +269 V 0.058 +270 R 0.050 +271 T 0.045 +272 L 0.043 +273 S 0.041 +274 F 0.041 +275 S 0.047 +276 H 0.064 +277 D 0.082 +278 G 0.086 +279 K 0.076 +280 M 0.060 +281 L 0.048 +282 A 0.042 +283 S 0.042 +284 A 0.054 +285 S 0.075 +286 E 0.092 +287 D 0.094 +288 H 0.079 +289 F 0.059 +290 I 0.048 +291 D 0.045 +292 I 0.045 +293 A 0.043 +294 E 0.040 +295 V 0.040 +296 E 0.046 +297 T 0.058 +298 G 0.068 +299 D 0.071 +300 K 0.067 +301 L 0.058 +302 W 0.050 +303 E 0.046 +304 V 0.050 +305 Q 0.061 +306 C 0.072 +307 E 0.076 +308 S 0.073 +309 P 0.064 +310 T 0.057 +311 F 0.056 +312 T 0.060 +313 V 0.062 +314 A 0.062 +315 W 0.066 +316 H 0.076 +317 P 0.085 +318 K 0.086 +319 R 0.080 +320 P 0.074 +321 L 0.072 +322 L 0.069 +323 A 0.064 +324 F 0.063 +325 A 0.080 +326 C 0.125 +327 D 0.202 +328 D 0.297 +329 K 0.378 +330 D 0.420 +331 G 0.419 +332 K 0.393 +333 Y 0.367 +334 D 0.353 +335 S 0.347 +336 S 0.339 +337 R 0.324 +338 E 0.295 +339 A 0.248 +340 G 0.188 +341 T 0.131 +342 V 0.091 +343 K 0.072 +344 L 0.071 +345 F 0.090 +346 G 0.140 +347 L 0.223 +348 P 0.323 +349 N 0.399 +350 D 0.425 +351 S 0.418 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000051596.11_ENST00000265097.9_GN:THOC3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000051596.11_ENST00000265097.9_GN:THOC3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..cd3c3a120049334715dee2e716dced415b7643ad --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000051596.11_ENST00000265097.9_GN:THOC3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid @@ -0,0 +1,379 @@ +>ENSG00000051596.11|ENST00000265097.9|GN:THOC3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:27 +1 M 0.341 +2 R 0.346 +3 A 0.368 +4 A 0.401 +5 A 0.422 +6 A 0.441 +7 P 0.482 +8 G 0.527 +9 L 0.539 +10 T 0.517 +11 A 0.480 +12 P 0.428 +13 W 0.367 +14 R 0.320 +15 L 0.305 +16 L 0.307 +17 Q 0.318 +18 C 0.344 +19 C 0.379 +20 E 0.412 +21 L 0.448 +22 E 0.494 +23 A 0.543 +24 G 0.584 +25 E 0.614 +26 L 0.634 +27 G 0.641 +28 M 0.636 +29 A 0.621 +30 V 0.587 +31 P 0.540 +32 A 0.513 +33 A 0.521 +34 A 0.539 +35 M 0.550 +36 G 0.552 +37 P 0.534 +38 S 0.505 +39 A 0.504 +40 L 0.531 +41 G 0.539 +42 Q 0.531 +43 S 0.557 +44 G 0.619 +45 P 0.673 +46 G 0.693 +47 S 0.681 +48 M 0.660 +49 A 0.652 +50 P 0.657 +51 W 0.659 +52 C 0.650 +53 S 0.632 +54 V 0.607 +55 S 0.581 +56 S 0.566 +57 G 0.568 +58 P 0.572 +59 S 0.566 +60 R 0.553 +61 Y 0.537 +62 V 0.507 +63 L 0.447 +64 G 0.365 +65 M 0.291 +66 Q 0.251 +67 E 0.238 +68 L 0.228 +69 F 0.206 +70 R 0.181 +71 G 0.159 +72 H 0.138 +73 S 0.111 +74 K 0.084 +75 T 0.064 +76 R 0.052 +77 E 0.045 +78 F 0.041 +79 L 0.039 +80 A 0.038 +81 H 0.040 +82 S 0.043 +83 A 0.050 +84 K 0.059 +85 V 0.065 +86 H 0.063 +87 S 0.054 +88 V 0.046 +89 A 0.040 +90 W 0.039 +91 S 0.043 +92 C 0.050 +93 D 0.053 +94 G 0.050 +95 R 0.045 +96 R 0.043 +97 L 0.043 +98 A 0.045 +99 S 0.050 +100 G 0.062 +101 S 0.082 +102 F 0.100 +103 D 0.103 +104 K 0.085 +105 T 0.058 +106 A 0.039 +107 S 0.030 +108 V 0.028 +109 F 0.029 +110 L 0.033 +111 L 0.038 +112 E 0.044 +113 K 0.046 +114 D 0.048 +115 R 0.051 +116 L 0.053 +117 V 0.054 +118 K 0.055 +119 E 0.055 +120 N 0.052 +121 N 0.048 +122 Y 0.045 +123 R 0.048 +124 G 0.055 +125 H 0.066 +126 G 0.075 +127 D 0.081 +128 S 0.079 +129 V 0.072 +130 D 0.063 +131 Q 0.057 +132 L 0.054 +133 C 0.053 +134 W 0.057 +135 H 0.064 +136 P 0.065 +137 S 0.061 +138 N 0.056 +139 P 0.047 +140 D 0.036 +141 L 0.027 +142 F 0.024 +143 V 0.027 +144 T 0.042 +145 A 0.071 +146 S 0.107 +147 G 0.133 +148 D 0.131 +149 K 0.105 +150 T 0.078 +151 I 0.066 +152 R 0.066 +153 I 0.066 +154 W 0.059 +155 D 0.047 +156 V 0.039 +157 R 0.040 +158 T 0.050 +159 T 0.064 +160 K 0.074 +161 C 0.073 +162 I 0.065 +163 A 0.057 +164 T 0.055 +165 V 0.056 +166 N 0.061 +167 T 0.070 +168 K 0.082 +169 G 0.086 +170 E 0.078 +171 N 0.060 +172 I 0.043 +173 N 0.032 +174 I 0.028 +175 C 0.030 +176 W 0.037 +177 S 0.049 +178 P 0.063 +179 D 0.068 +180 G 0.063 +181 Q 0.052 +182 T 0.042 +183 I 0.035 +184 A 0.033 +185 V 0.036 +186 G 0.048 +187 N 0.064 +188 K 0.073 +189 D 0.070 +190 D 0.058 +191 V 0.045 +192 V 0.037 +193 T 0.035 +194 F 0.037 +195 I 0.041 +196 D 0.044 +197 A 0.045 +198 K 0.045 +199 T 0.046 +200 H 0.053 +201 R 0.064 +202 S 0.071 +203 K 0.071 +204 A 0.067 +205 E 0.064 +206 E 0.061 +207 Q 0.055 +208 F 0.049 +209 K 0.043 +210 F 0.039 +211 E 0.038 +212 V 0.037 +213 N 0.035 +214 E 0.032 +215 I 0.028 +216 S 0.027 +217 W 0.030 +218 N 0.040 +219 N 0.051 +220 D 0.053 +221 N 0.044 +222 N 0.032 +223 M 0.023 +224 F 0.019 +225 F 0.018 +226 L 0.023 +227 T 0.037 +228 N 0.059 +229 G 0.083 +230 N 0.097 +231 G 0.093 +232 C 0.075 +233 I 0.058 +234 N 0.050 +235 I 0.048 +236 L 0.045 +237 S 0.039 +238 Y 0.034 +239 P 0.036 +240 E 0.043 +241 L 0.049 +242 K 0.052 +243 P 0.054 +244 V 0.054 +245 Q 0.055 +246 S 0.055 +247 I 0.054 +248 N 0.052 +249 A 0.049 +250 H 0.047 +251 P 0.046 +252 S 0.046 +253 N 0.046 +254 C 0.044 +255 I 0.043 +256 C 0.043 +257 I 0.047 +258 K 0.054 +259 F 0.063 +260 D 0.072 +261 P 0.079 +262 M 0.077 +263 G 0.065 +264 K 0.048 +265 Y 0.035 +266 F 0.031 +267 A 0.035 +268 T 0.047 +269 G 0.070 +270 S 0.100 +271 A 0.122 +272 D 0.120 +273 A 0.098 +274 L 0.070 +275 V 0.050 +276 S 0.043 +277 L 0.042 +278 W 0.042 +279 D 0.041 +280 V 0.039 +281 D 0.041 +282 E 0.045 +283 L 0.047 +284 V 0.048 +285 C 0.045 +286 V 0.041 +287 R 0.040 +288 C 0.045 +289 F 0.053 +290 S 0.062 +291 R 0.066 +292 L 0.070 +293 D 0.076 +294 W 0.080 +295 P 0.076 +296 V 0.065 +297 R 0.055 +298 T 0.050 +299 L 0.047 +300 S 0.045 +301 F 0.044 +302 S 0.051 +303 H 0.069 +304 D 0.089 +305 G 0.095 +306 K 0.084 +307 M 0.067 +308 L 0.053 +309 A 0.045 +310 S 0.046 +311 A 0.059 +312 S 0.082 +313 E 0.100 +314 D 0.101 +315 H 0.085 +316 F 0.064 +317 I 0.051 +318 D 0.049 +319 I 0.049 +320 A 0.047 +321 E 0.044 +322 V 0.044 +323 E 0.050 +324 T 0.060 +325 G 0.070 +326 D 0.072 +327 K 0.068 +328 L 0.058 +329 W 0.050 +330 E 0.047 +331 V 0.052 +332 Q 0.064 +333 C 0.075 +334 E 0.080 +335 S 0.076 +336 P 0.067 +337 T 0.059 +338 F 0.058 +339 T 0.061 +340 V 0.063 +341 A 0.063 +342 W 0.067 +343 H 0.077 +344 P 0.087 +345 K 0.087 +346 R 0.081 +347 P 0.075 +348 L 0.074 +349 L 0.073 +350 A 0.067 +351 F 0.064 +352 A 0.078 +353 C 0.121 +354 D 0.196 +355 D 0.290 +356 K 0.371 +357 D 0.413 +358 G 0.411 +359 K 0.385 +360 Y 0.359 +361 D 0.347 +362 S 0.343 +363 S 0.337 +364 R 0.324 +365 E 0.295 +366 A 0.248 +367 G 0.187 +368 T 0.130 +369 V 0.090 +370 K 0.071 +371 L 0.069 +372 F 0.087 +373 G 0.135 +374 L 0.217 +375 P 0.316 +376 N 0.393 +377 D 0.421 +378 S 0.417 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000064547.15_ENST00000407877.8_GN:LPAR2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000064547.15_ENST00000407877.8_GN:LPAR2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d9b60c5e4cf7864dae084a2153adea2a60334de5 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000064547.15_ENST00000407877.8_GN:LPAR2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,349 @@ +>ENSG00000064547.15|ENST00000407877.8|GN:LPAR2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.268 +2 G 0.240 +3 Q 0.200 +4 C 0.162 +5 Y 0.130 +6 Y 0.107 +7 N 0.097 +8 E 0.100 +9 T 0.109 +10 I 0.121 +11 G 0.133 +12 F 0.145 +13 F 0.158 +14 Y 0.179 +15 N 0.206 +16 N 0.232 +17 S 0.252 +18 G 0.259 +19 K 0.253 +20 E 0.243 +21 L 0.236 +22 S 0.226 +23 S 0.208 +24 H 0.179 +25 W 0.147 +26 R 0.117 +27 P 0.093 +28 K 0.073 +29 D 0.055 +30 V 0.041 +31 V 0.034 +32 V 0.033 +33 V 0.036 +34 A 0.037 +35 L 0.039 +36 G 0.041 +37 L 0.045 +38 T 0.050 +39 V 0.055 +40 S 0.057 +41 V 0.056 +42 L 0.055 +43 V 0.054 +44 L 0.051 +45 L 0.048 +46 T 0.048 +47 N 0.049 +48 L 0.050 +49 L 0.050 +50 V 0.050 +51 I 0.049 +52 A 0.049 +53 A 0.050 +54 I 0.052 +55 A 0.057 +56 S 0.062 +57 N 0.063 +58 R 0.060 +59 R 0.056 +60 F 0.053 +61 H 0.050 +62 Q 0.046 +63 P 0.040 +64 I 0.033 +65 Y 0.028 +66 Y 0.027 +67 L 0.028 +68 L 0.033 +69 G 0.040 +70 N 0.045 +71 L 0.049 +72 A 0.052 +73 A 0.051 +74 A 0.045 +75 D 0.037 +76 L 0.030 +77 F 0.026 +78 A 0.024 +79 G 0.023 +80 V 0.022 +81 A 0.020 +82 Y 0.019 +83 L 0.019 +84 F 0.020 +85 L 0.021 +86 M 0.025 +87 F 0.033 +88 H 0.048 +89 T 0.067 +90 G 0.082 +91 P 0.089 +92 R 0.089 +93 T 0.086 +94 A 0.084 +95 R 0.082 +96 L 0.082 +97 S 0.080 +98 L 0.072 +99 E 0.059 +100 G 0.044 +101 W 0.033 +102 F 0.026 +103 L 0.024 +104 R 0.026 +105 Q 0.031 +106 G 0.034 +107 L 0.034 +108 L 0.032 +109 D 0.034 +110 T 0.036 +111 S 0.038 +112 L 0.038 +113 T 0.037 +114 A 0.036 +115 S 0.035 +116 V 0.034 +117 A 0.036 +118 T 0.039 +119 L 0.040 +120 L 0.039 +121 A 0.037 +122 I 0.035 +123 A 0.037 +124 V 0.042 +125 E 0.046 +126 R 0.049 +127 H 0.048 +128 R 0.049 +129 S 0.055 +130 V 0.064 +131 M 0.079 +132 A 0.099 +133 V 0.122 +134 Q 0.152 +135 L 0.185 +136 H 0.207 +137 S 0.209 +138 R 0.188 +139 L 0.150 +140 P 0.108 +141 R 0.073 +142 G 0.052 +143 R 0.045 +144 V 0.048 +145 V 0.058 +146 M 0.064 +147 L 0.061 +148 I 0.053 +149 V 0.049 +150 G 0.050 +151 V 0.052 +152 W 0.053 +153 V 0.053 +154 A 0.055 +155 A 0.058 +156 L 0.060 +157 G 0.062 +158 L 0.065 +159 G 0.067 +160 L 0.070 +161 L 0.075 +162 P 0.081 +163 A 0.085 +164 H 0.086 +165 S 0.087 +166 W 0.089 +167 H 0.087 +168 C 0.082 +169 L 0.079 +170 C 0.079 +171 A 0.086 +172 L 0.097 +173 D 0.110 +174 R 0.125 +175 C 0.140 +176 S 0.148 +177 R 0.146 +178 M 0.139 +179 A 0.125 +180 P 0.108 +181 L 0.097 +182 L 0.094 +183 S 0.092 +184 R 0.081 +185 S 0.067 +186 Y 0.056 +187 L 0.050 +188 A 0.046 +189 V 0.042 +190 W 0.039 +191 A 0.042 +192 L 0.049 +193 S 0.056 +194 S 0.058 +195 L 0.056 +196 L 0.053 +197 V 0.051 +198 F 0.049 +199 L 0.046 +200 L 0.047 +201 M 0.052 +202 V 0.060 +203 A 0.063 +204 V 0.054 +205 Y 0.041 +206 T 0.035 +207 R 0.037 +208 I 0.045 +209 F 0.054 +210 F 0.059 +211 Y 0.056 +212 V 0.053 +213 R 0.059 +214 R 0.069 +215 R 0.077 +216 V 0.086 +217 Q 0.104 +218 R 0.126 +219 M 0.149 +220 A 0.171 +221 E 0.193 +222 H 0.216 +223 V 0.234 +224 S 0.247 +225 C 0.254 +226 H 0.250 +227 P 0.229 +228 R 0.197 +229 Y 0.165 +230 R 0.139 +231 E 0.115 +232 T 0.094 +233 T 0.080 +234 L 0.072 +235 S 0.067 +236 L 0.061 +237 V 0.055 +238 K 0.051 +239 T 0.046 +240 V 0.040 +241 V 0.036 +242 I 0.036 +243 I 0.041 +244 L 0.045 +245 G 0.046 +246 A 0.043 +247 F 0.036 +248 V 0.029 +249 V 0.027 +250 C 0.031 +251 W 0.039 +252 T 0.044 +253 P 0.042 +254 G 0.036 +255 Q 0.031 +256 V 0.031 +257 V 0.032 +258 L 0.032 +259 L 0.032 +260 L 0.036 +261 D 0.044 +262 G 0.057 +263 L 0.076 +264 G 0.098 +265 C 0.121 +266 E 0.136 +267 S 0.140 +268 C 0.132 +269 N 0.116 +270 V 0.093 +271 L 0.071 +272 A 0.055 +273 V 0.046 +274 E 0.038 +275 K 0.033 +276 Y 0.033 +277 F 0.036 +278 L 0.041 +279 L 0.045 +280 L 0.050 +281 A 0.055 +282 E 0.062 +283 A 0.067 +284 N 0.067 +285 S 0.061 +286 L 0.052 +287 V 0.047 +288 N 0.044 +289 A 0.042 +290 A 0.041 +291 V 0.041 +292 Y 0.041 +293 S 0.046 +294 C 0.056 +295 R 0.065 +296 D 0.063 +297 A 0.053 +298 E 0.042 +299 M 0.035 +300 R 0.036 +301 R 0.041 +302 T 0.048 +303 F 0.052 +304 R 0.055 +305 R 0.058 +306 L 0.061 +307 L 0.068 +308 C 0.089 +309 C 0.127 +310 A 0.180 +311 C 0.239 +312 L 0.299 +313 R 0.363 +314 Q 0.429 +315 S 0.483 +316 T 0.516 +317 R 0.542 +318 E 0.575 +319 S 0.604 +320 V 0.616 +321 H 0.624 +322 Y 0.646 +323 T 0.673 +324 S 0.682 +325 S 0.674 +326 A 0.667 +327 Q 0.673 +328 G 0.694 +329 G 0.717 +330 A 0.732 +331 S 0.733 +332 T 0.726 +333 R 0.717 +334 I 0.708 +335 M 0.697 +336 L 0.689 +337 P 0.689 +338 E 0.695 +339 N 0.699 +340 G 0.701 +341 H 0.710 +342 P 0.728 +343 L 0.747 +344 M 0.750 +345 D 0.727 +346 S 0.673 +347 T 0.591 +348 L 0.524 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000064547.15_ENST00000407877.8_GN:LPAR2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000064547.15_ENST00000407877.8_GN:LPAR2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ef4599ce0277ce91115b2fdc631e2412804cdb81 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000064547.15_ENST00000407877.8_GN:LPAR2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid @@ -0,0 +1,352 @@ +>ENSG00000064547.15|ENST00000407877.8|GN:LPAR2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 +1 M 0.189 +2 V 0.191 +3 I 0.196 +4 M 0.196 +5 G 0.184 +6 Q 0.158 +7 C 0.129 +8 Y 0.106 +9 Y 0.093 +10 N 0.089 +11 E 0.094 +12 T 0.102 +13 I 0.113 +14 G 0.127 +15 F 0.141 +16 F 0.159 +17 Y 0.184 +18 N 0.212 +19 N 0.234 +20 S 0.250 +21 G 0.256 +22 K 0.250 +23 E 0.239 +24 L 0.230 +25 S 0.219 +26 S 0.200 +27 H 0.173 +28 W 0.143 +29 R 0.114 +30 P 0.092 +31 K 0.073 +32 D 0.055 +33 V 0.041 +34 V 0.034 +35 V 0.033 +36 V 0.036 +37 A 0.037 +38 L 0.039 +39 G 0.041 +40 L 0.045 +41 T 0.050 +42 V 0.055 +43 S 0.057 +44 V 0.055 +45 L 0.055 +46 V 0.054 +47 L 0.051 +48 L 0.048 +49 T 0.048 +50 N 0.049 +51 L 0.050 +52 L 0.051 +53 V 0.050 +54 I 0.049 +55 A 0.049 +56 A 0.050 +57 I 0.051 +58 A 0.056 +59 S 0.060 +60 N 0.062 +61 R 0.059 +62 R 0.055 +63 F 0.052 +64 H 0.049 +65 Q 0.045 +66 P 0.039 +67 I 0.033 +68 Y 0.028 +69 Y 0.026 +70 L 0.028 +71 L 0.033 +72 G 0.039 +73 N 0.045 +74 L 0.049 +75 A 0.052 +76 A 0.051 +77 A 0.044 +78 D 0.036 +79 L 0.030 +80 F 0.026 +81 A 0.024 +82 G 0.023 +83 V 0.021 +84 A 0.019 +85 Y 0.018 +86 L 0.018 +87 F 0.019 +88 L 0.020 +89 M 0.024 +90 F 0.032 +91 H 0.047 +92 T 0.065 +93 G 0.081 +94 P 0.087 +95 R 0.087 +96 T 0.084 +97 A 0.082 +98 R 0.080 +99 L 0.080 +100 S 0.079 +101 L 0.071 +102 E 0.058 +103 G 0.043 +104 W 0.032 +105 F 0.026 +106 L 0.024 +107 R 0.026 +108 Q 0.030 +109 G 0.034 +110 L 0.033 +111 L 0.032 +112 D 0.034 +113 T 0.036 +114 S 0.038 +115 L 0.038 +116 T 0.037 +117 A 0.036 +118 S 0.035 +119 V 0.034 +120 A 0.036 +121 T 0.038 +122 L 0.040 +123 L 0.039 +124 A 0.036 +125 I 0.035 +126 A 0.037 +127 V 0.042 +128 E 0.046 +129 R 0.049 +130 H 0.048 +131 R 0.049 +132 S 0.055 +133 V 0.064 +134 M 0.079 +135 A 0.098 +136 V 0.122 +137 Q 0.151 +138 L 0.184 +139 H 0.207 +140 S 0.209 +141 R 0.188 +142 L 0.150 +143 P 0.108 +144 R 0.073 +145 G 0.052 +146 R 0.045 +147 V 0.048 +148 V 0.058 +149 M 0.064 +150 L 0.061 +151 I 0.053 +152 V 0.049 +153 G 0.050 +154 V 0.053 +155 W 0.053 +156 V 0.053 +157 A 0.056 +158 A 0.059 +159 L 0.060 +160 G 0.063 +161 L 0.066 +162 G 0.068 +163 L 0.070 +164 L 0.076 +165 P 0.082 +166 A 0.086 +167 H 0.087 +168 S 0.089 +169 W 0.090 +170 H 0.088 +171 C 0.083 +172 L 0.079 +173 C 0.079 +174 A 0.085 +175 L 0.096 +176 D 0.108 +177 R 0.122 +178 C 0.136 +179 S 0.144 +180 R 0.142 +181 M 0.134 +182 A 0.122 +183 P 0.106 +184 L 0.095 +185 L 0.093 +186 S 0.090 +187 R 0.080 +188 S 0.066 +189 Y 0.056 +190 L 0.050 +191 A 0.047 +192 V 0.042 +193 W 0.039 +194 A 0.042 +195 L 0.049 +196 S 0.056 +197 S 0.058 +198 L 0.056 +199 L 0.053 +200 V 0.051 +201 F 0.049 +202 L 0.047 +203 L 0.047 +204 M 0.052 +205 V 0.061 +206 A 0.063 +207 V 0.054 +208 Y 0.042 +209 T 0.035 +210 R 0.037 +211 I 0.045 +212 F 0.055 +213 F 0.060 +214 Y 0.056 +215 V 0.053 +216 R 0.059 +217 R 0.069 +218 R 0.077 +219 V 0.086 +220 Q 0.104 +221 R 0.126 +222 M 0.149 +223 A 0.171 +224 E 0.193 +225 H 0.215 +226 V 0.234 +227 S 0.247 +228 C 0.254 +229 H 0.250 +230 P 0.230 +231 R 0.197 +232 Y 0.165 +233 R 0.140 +234 E 0.116 +235 T 0.094 +236 T 0.080 +237 L 0.073 +238 S 0.067 +239 L 0.061 +240 V 0.056 +241 K 0.052 +242 T 0.047 +243 V 0.041 +244 V 0.036 +245 I 0.037 +246 I 0.041 +247 L 0.045 +248 G 0.046 +249 A 0.043 +250 F 0.037 +251 V 0.030 +252 V 0.027 +253 C 0.031 +254 W 0.039 +255 T 0.045 +256 P 0.043 +257 G 0.036 +258 Q 0.031 +259 V 0.031 +260 V 0.031 +261 L 0.031 +262 L 0.031 +263 L 0.035 +264 D 0.043 +265 G 0.056 +266 L 0.075 +267 G 0.098 +268 C 0.120 +269 E 0.136 +270 S 0.140 +271 C 0.132 +272 N 0.116 +273 V 0.093 +274 L 0.070 +275 A 0.055 +276 V 0.046 +277 E 0.039 +278 K 0.033 +279 Y 0.033 +280 F 0.036 +281 L 0.041 +282 L 0.046 +283 L 0.051 +284 A 0.056 +285 E 0.063 +286 A 0.068 +287 N 0.068 +288 S 0.061 +289 L 0.053 +290 V 0.047 +291 N 0.044 +292 A 0.042 +293 A 0.042 +294 V 0.042 +295 Y 0.042 +296 S 0.046 +297 C 0.057 +298 R 0.065 +299 D 0.064 +300 A 0.054 +301 E 0.043 +302 M 0.036 +303 R 0.036 +304 R 0.041 +305 T 0.048 +306 F 0.052 +307 R 0.055 +308 R 0.058 +309 L 0.061 +310 L 0.069 +311 C 0.089 +312 C 0.128 +313 A 0.181 +314 C 0.240 +315 L 0.300 +316 R 0.364 +317 Q 0.430 +318 S 0.485 +319 T 0.517 +320 R 0.543 +321 E 0.577 +322 S 0.607 +323 V 0.619 +324 H 0.628 +325 Y 0.650 +326 T 0.674 +327 S 0.682 +328 S 0.674 +329 A 0.666 +330 Q 0.673 +331 G 0.693 +332 G 0.717 +333 A 0.731 +334 S 0.733 +335 T 0.726 +336 R 0.718 +337 I 0.709 +338 M 0.698 +339 L 0.689 +340 P 0.689 +341 E 0.694 +342 N 0.698 +343 G 0.701 +344 H 0.710 +345 P 0.729 +346 L 0.748 +347 M 0.751 +348 D 0.728 +349 S 0.674 +350 T 0.592 +351 L 0.525 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000077984.7_ENST00000480798.2_GN:CST7_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000077984.7_ENST00000480798.2_GN:CST7_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a82653cc4dae0372186d91f85abe353edc5ded35 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000077984.7_ENST00000480798.2_GN:CST7_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,146 @@ +>ENSG00000077984.7|ENST00000480798.2|GN:CST7|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.439 +2 R 0.472 +3 A 0.515 +4 A 0.529 +5 G 0.496 +6 T 0.443 +7 L 0.401 +8 L 0.357 +9 A 0.305 +10 F 0.273 +11 C 0.275 +12 C 0.300 +13 L 0.341 +14 V 0.392 +15 L 0.437 +16 S 0.475 +17 T 0.517 +18 T 0.561 +19 G 0.594 +20 G 0.609 +21 P 0.605 +22 S 0.591 +23 P 0.575 +24 D 0.559 +25 T 0.537 +26 C 0.521 +27 S 0.525 +28 Q 0.539 +29 D 0.541 +30 L 0.520 +31 N 0.486 +32 S 0.449 +33 R 0.411 +34 V 0.364 +35 K 0.309 +36 P 0.259 +37 G 0.222 +38 F 0.195 +39 P 0.167 +40 K 0.136 +41 T 0.103 +42 I 0.077 +43 K 0.062 +44 T 0.057 +45 N 0.057 +46 D 0.056 +47 P 0.052 +48 G 0.044 +49 V 0.035 +50 L 0.028 +51 Q 0.024 +52 A 0.022 +53 A 0.021 +54 R 0.021 +55 Y 0.019 +56 S 0.020 +57 V 0.022 +58 E 0.027 +59 K 0.036 +60 F 0.047 +61 N 0.060 +62 N 0.073 +63 C 0.084 +64 T 0.086 +65 N 0.079 +66 D 0.068 +67 M 0.061 +68 F 0.059 +69 L 0.059 +70 F 0.054 +71 K 0.044 +72 E 0.033 +73 S 0.026 +74 R 0.024 +75 I 0.023 +76 T 0.023 +77 R 0.023 +78 A 0.024 +79 L 0.027 +80 V 0.031 +81 Q 0.037 +82 I 0.042 +83 V 0.046 +84 K 0.046 +85 G 0.046 +86 L 0.046 +87 K 0.046 +88 Y 0.050 +89 M 0.057 +90 L 0.065 +91 E 0.070 +92 V 0.068 +93 E 0.060 +94 I 0.054 +95 G 0.056 +96 R 0.065 +97 T 0.074 +98 T 0.078 +99 C 0.076 +100 K 0.072 +101 K 0.071 +102 N 0.075 +103 Q 0.084 +104 H 0.090 +105 L 0.090 +106 R 0.086 +107 L 0.080 +108 D 0.074 +109 D 0.071 +110 C 0.073 +111 D 0.080 +112 F 0.092 +113 Q 0.111 +114 T 0.133 +115 N 0.150 +116 H 0.156 +117 T 0.150 +118 L 0.140 +119 K 0.127 +120 Q 0.115 +121 T 0.101 +122 L 0.085 +123 S 0.069 +124 C 0.056 +125 Y 0.047 +126 S 0.041 +127 E 0.039 +128 V 0.039 +129 W 0.041 +130 V 0.046 +131 V 0.054 +132 P 0.060 +133 W 0.063 +134 L 0.064 +135 Q 0.064 +136 H 0.062 +137 F 0.062 +138 E 0.065 +139 V 0.069 +140 P 0.068 +141 V 0.061 +142 L 0.054 +143 R 0.054 +144 C 0.063 +145 H 0.073 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000077984.7_ENST00000480798.2_GN:CST7_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000077984.7_ENST00000480798.2_GN:CST7_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d33a81f5c04b0ca6308938ee5595ebf6341b1cb0 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000077984.7_ENST00000480798.2_GN:CST7_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid @@ -0,0 +1,168 @@ +>ENSG00000077984.7|ENST00000480798.2|GN:CST7|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:22 +1 M 0.400 +2 L 0.434 +3 P 0.479 +4 E 0.503 +5 K 0.494 +6 A 0.480 +7 L 0.498 +8 H 0.537 +9 G 0.557 +10 H 0.535 +11 P 0.490 +12 Q 0.474 +13 L 0.515 +14 P 0.581 +15 R 0.629 +16 T 0.648 +17 V 0.647 +18 P 0.623 +19 T 0.583 +20 R 0.567 +21 A 0.602 +22 A 0.660 +23 M 0.703 +24 R 0.728 +25 A 0.741 +26 A 0.741 +27 G 0.723 +28 T 0.680 +29 L 0.607 +30 L 0.519 +31 A 0.451 +32 F 0.415 +33 C 0.400 +34 C 0.403 +35 L 0.431 +36 V 0.472 +37 L 0.507 +38 S 0.539 +39 T 0.577 +40 T 0.615 +41 G 0.641 +42 G 0.651 +43 P 0.644 +44 S 0.627 +45 P 0.607 +46 D 0.589 +47 T 0.569 +48 C 0.559 +49 S 0.574 +50 Q 0.598 +51 D 0.603 +52 L 0.582 +53 N 0.540 +54 S 0.491 +55 R 0.437 +56 V 0.375 +57 K 0.311 +58 P 0.257 +59 G 0.219 +60 F 0.192 +61 P 0.165 +62 K 0.134 +63 T 0.102 +64 I 0.075 +65 K 0.059 +66 T 0.054 +67 N 0.054 +68 D 0.054 +69 P 0.049 +70 G 0.042 +71 V 0.034 +72 L 0.027 +73 Q 0.022 +74 A 0.021 +75 A 0.020 +76 R 0.019 +77 Y 0.018 +78 S 0.019 +79 V 0.021 +80 E 0.026 +81 K 0.034 +82 F 0.044 +83 N 0.057 +84 N 0.069 +85 C 0.079 +86 T 0.080 +87 N 0.074 +88 D 0.063 +89 M 0.057 +90 F 0.055 +91 L 0.054 +92 F 0.050 +93 K 0.040 +94 E 0.031 +95 S 0.025 +96 R 0.023 +97 I 0.022 +98 T 0.022 +99 R 0.022 +100 A 0.023 +101 L 0.026 +102 V 0.030 +103 Q 0.035 +104 I 0.041 +105 V 0.044 +106 K 0.045 +107 G 0.046 +108 L 0.046 +109 K 0.047 +110 Y 0.050 +111 M 0.058 +112 L 0.066 +113 E 0.071 +114 V 0.068 +115 E 0.060 +116 I 0.054 +117 G 0.055 +118 R 0.064 +119 T 0.073 +120 T 0.077 +121 C 0.075 +122 K 0.071 +123 K 0.070 +124 N 0.074 +125 Q 0.083 +126 H 0.090 +127 L 0.090 +128 R 0.086 +129 L 0.080 +130 D 0.074 +131 D 0.071 +132 C 0.074 +133 D 0.080 +134 F 0.092 +135 Q 0.109 +136 T 0.129 +137 N 0.146 +138 H 0.152 +139 T 0.149 +140 L 0.139 +141 K 0.127 +142 Q 0.115 +143 T 0.101 +144 L 0.085 +145 S 0.070 +146 C 0.057 +147 Y 0.047 +148 S 0.042 +149 E 0.040 +150 V 0.040 +151 W 0.042 +152 V 0.047 +153 V 0.055 +154 P 0.061 +155 W 0.064 +156 L 0.065 +157 Q 0.064 +158 H 0.062 +159 F 0.062 +160 E 0.065 +161 V 0.068 +162 P 0.066 +163 V 0.060 +164 L 0.053 +165 R 0.054 +166 C 0.064 +167 H 0.074 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000080644.17_ENST00000326828.6_GN:CHRNA3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000080644.17_ENST00000326828.6_GN:CHRNA3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e44872da398de1bc385e7dace521908c366caf95 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000080644.17_ENST00000326828.6_GN:CHRNA3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,506 @@ +>ENSG00000080644.17|ENST00000326828.6|GN:CHRNA3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.369 +2 G 0.372 +3 S 0.391 +4 G 0.415 +5 P 0.407 +6 L 0.379 +7 S 0.392 +8 L 0.458 +9 P 0.517 +10 L 0.520 +11 A 0.475 +12 L 0.413 +13 S 0.359 +14 P 0.318 +15 P 0.283 +16 R 0.245 +17 L 0.210 +18 L 0.183 +19 L 0.171 +20 L 0.174 +21 L 0.184 +22 L 0.199 +23 L 0.220 +24 S 0.255 +25 L 0.300 +26 L 0.354 +27 P 0.413 +28 V 0.468 +29 A 0.497 +30 R 0.486 +31 A 0.432 +32 S 0.344 +33 E 0.247 +34 A 0.167 +35 E 0.114 +36 H 0.081 +37 R 0.062 +38 L 0.053 +39 F 0.051 +40 E 0.052 +41 R 0.053 +42 L 0.055 +43 F 0.061 +44 E 0.072 +45 D 0.082 +46 Y 0.087 +47 N 0.091 +48 E 0.099 +49 I 0.112 +50 I 0.122 +51 R 0.125 +52 P 0.125 +53 V 0.133 +54 A 0.150 +55 N 0.164 +56 V 0.168 +57 S 0.165 +58 D 0.161 +59 P 0.147 +60 V 0.121 +61 I 0.092 +62 I 0.069 +63 H 0.053 +64 F 0.043 +65 E 0.041 +66 V 0.044 +67 S 0.047 +68 M 0.049 +69 S 0.052 +70 Q 0.053 +71 L 0.053 +72 V 0.056 +73 K 0.060 +74 V 0.059 +75 D 0.053 +76 E 0.046 +77 V 0.043 +78 N 0.041 +79 Q 0.038 +80 I 0.034 +81 M 0.029 +82 E 0.025 +83 T 0.023 +84 N 0.025 +85 L 0.028 +86 W 0.033 +87 L 0.037 +88 K 0.039 +89 Q 0.041 +90 I 0.045 +91 W 0.051 +92 N 0.060 +93 D 0.068 +94 Y 0.074 +95 K 0.075 +96 L 0.070 +97 K 0.065 +98 W 0.063 +99 N 0.064 +100 P 0.064 +101 S 0.068 +102 D 0.079 +103 Y 0.098 +104 G 0.115 +105 G 0.119 +106 A 0.107 +107 E 0.089 +108 F 0.079 +109 M 0.081 +110 R 0.085 +111 V 0.084 +112 P 0.078 +113 A 0.072 +114 Q 0.067 +115 K 0.062 +116 I 0.059 +117 W 0.060 +118 K 0.066 +119 P 0.075 +120 D 0.083 +121 I 0.085 +122 V 0.083 +123 L 0.081 +124 Y 0.085 +125 N 0.097 +126 N 0.119 +127 A 0.146 +128 V 0.173 +129 G 0.195 +130 D 0.213 +131 F 0.229 +132 Q 0.247 +133 V 0.263 +134 D 0.268 +135 D 0.249 +136 K 0.209 +137 T 0.157 +138 K 0.107 +139 A 0.070 +140 L 0.052 +141 L 0.051 +142 K 0.065 +143 Y 0.088 +144 T 0.114 +145 G 0.130 +146 E 0.129 +147 V 0.121 +148 T 0.115 +149 W 0.120 +150 I 0.132 +151 P 0.140 +152 P 0.133 +153 A 0.114 +154 I 0.091 +155 F 0.074 +156 K 0.068 +157 S 0.072 +158 S 0.080 +159 C 0.086 +160 K 0.087 +161 I 0.082 +162 D 0.073 +163 V 0.062 +164 T 0.052 +165 Y 0.044 +166 F 0.041 +167 P 0.042 +168 F 0.046 +169 D 0.051 +170 Y 0.054 +171 Q 0.053 +172 N 0.050 +173 C 0.047 +174 T 0.043 +175 M 0.040 +176 K 0.038 +177 F 0.039 +178 G 0.043 +179 S 0.050 +180 W 0.057 +181 S 0.060 +182 Y 0.057 +183 D 0.053 +184 K 0.052 +185 A 0.054 +186 K 0.054 +187 I 0.051 +188 D 0.052 +189 L 0.061 +190 V 0.077 +191 L 0.094 +192 I 0.107 +193 G 0.114 +194 S 0.112 +195 S 0.101 +196 M 0.089 +197 N 0.083 +198 L 0.083 +199 K 0.085 +200 D 0.084 +201 Y 0.083 +202 W 0.087 +203 E 0.095 +204 S 0.098 +205 G 0.090 +206 E 0.081 +207 W 0.081 +208 A 0.086 +209 I 0.085 +210 I 0.080 +211 K 0.081 +212 A 0.088 +213 P 0.091 +214 G 0.086 +215 Y 0.079 +216 K 0.077 +217 H 0.081 +218 D 0.087 +219 I 0.093 +220 K 0.094 +221 Y 0.089 +222 N 0.081 +223 C 0.076 +224 C 0.079 +225 E 0.088 +226 E 0.098 +227 I 0.104 +228 Y 0.104 +229 P 0.097 +230 D 0.083 +231 I 0.065 +232 T 0.050 +233 Y 0.040 +234 S 0.033 +235 L 0.030 +236 Y 0.031 +237 I 0.038 +238 R 0.050 +239 R 0.065 +240 L 0.074 +241 P 0.071 +242 L 0.058 +243 F 0.046 +244 Y 0.041 +245 T 0.041 +246 I 0.046 +247 N 0.057 +248 L 0.074 +249 I 0.090 +250 I 0.100 +251 P 0.104 +252 C 0.107 +253 L 0.106 +254 L 0.103 +255 I 0.100 +256 S 0.098 +257 F 0.095 +258 L 0.093 +259 T 0.090 +260 V 0.084 +261 L 0.080 +262 V 0.078 +263 F 0.077 +264 Y 0.076 +265 L 0.078 +266 P 0.083 +267 S 0.091 +268 D 0.100 +269 C 0.103 +270 G 0.096 +271 E 0.082 +272 K 0.065 +273 V 0.053 +274 T 0.052 +275 L 0.063 +276 C 0.079 +277 I 0.091 +278 S 0.098 +279 V 0.101 +280 L 0.098 +281 L 0.095 +282 S 0.096 +283 L 0.102 +284 T 0.109 +285 V 0.115 +286 F 0.114 +287 L 0.111 +288 L 0.116 +289 V 0.133 +290 I 0.158 +291 T 0.180 +292 E 0.190 +293 T 0.193 +294 I 0.198 +295 P 0.207 +296 S 0.214 +297 T 0.211 +298 S 0.200 +299 L 0.182 +300 V 0.157 +301 I 0.128 +302 P 0.100 +303 L 0.081 +304 I 0.072 +305 G 0.071 +306 E 0.070 +307 Y 0.066 +308 L 0.059 +309 L 0.057 +310 F 0.062 +311 T 0.074 +312 M 0.085 +313 I 0.087 +314 F 0.080 +315 V 0.070 +316 T 0.064 +317 L 0.067 +318 S 0.077 +319 I 0.090 +320 V 0.098 +321 I 0.101 +322 T 0.098 +323 V 0.097 +324 F 0.102 +325 V 0.111 +326 L 0.119 +327 N 0.123 +328 V 0.125 +329 H 0.123 +330 Y 0.123 +331 R 0.128 +332 T 0.135 +333 P 0.140 +334 T 0.145 +335 T 0.156 +336 H 0.172 +337 T 0.182 +338 M 0.175 +339 P 0.147 +340 S 0.111 +341 W 0.082 +342 V 0.067 +343 K 0.062 +344 T 0.062 +345 V 0.071 +346 F 0.093 +347 L 0.118 +348 N 0.128 +349 L 0.120 +350 L 0.110 +351 P 0.109 +352 R 0.118 +353 V 0.135 +354 M 0.163 +355 F 0.206 +356 M 0.265 +357 T 0.336 +358 R 0.419 +359 P 0.510 +360 T 0.594 +361 S 0.654 +362 N 0.689 +363 E 0.705 +364 G 0.709 +365 N 0.699 +366 A 0.677 +367 Q 0.655 +368 K 0.643 +369 P 0.646 +370 R 0.660 +371 P 0.682 +372 L 0.706 +373 Y 0.724 +374 G 0.729 +375 A 0.719 +376 E 0.696 +377 L 0.670 +378 S 0.652 +379 N 0.639 +380 L 0.623 +381 N 0.606 +382 C 0.603 +383 F 0.623 +384 S 0.652 +385 R 0.672 +386 A 0.673 +387 E 0.661 +388 S 0.648 +389 K 0.635 +390 G 0.614 +391 C 0.590 +392 K 0.580 +393 E 0.582 +394 G 0.588 +395 Y 0.594 +396 P 0.595 +397 C 0.604 +398 Q 0.633 +399 D 0.668 +400 G 0.675 +401 M 0.651 +402 C 0.622 +403 G 0.596 +404 Y 0.556 +405 C 0.503 +406 H 0.468 +407 H 0.484 +408 R 0.553 +409 R 0.636 +410 I 0.693 +411 K 0.715 +412 I 0.715 +413 S 0.704 +414 N 0.692 +415 F 0.689 +416 S 0.699 +417 A 0.712 +418 N 0.714 +419 L 0.708 +420 T 0.701 +421 R 0.697 +422 S 0.694 +423 S 0.690 +424 S 0.685 +425 S 0.681 +426 E 0.675 +427 S 0.663 +428 V 0.651 +429 D 0.643 +430 A 0.627 +431 V 0.588 +432 L 0.532 +433 S 0.479 +434 L 0.442 +435 S 0.416 +436 A 0.387 +437 L 0.346 +438 S 0.305 +439 P 0.277 +440 E 0.259 +441 I 0.243 +442 K 0.235 +443 E 0.236 +444 A 0.237 +445 I 0.236 +446 Q 0.243 +447 S 0.258 +448 V 0.267 +449 K 0.269 +450 Y 0.274 +451 I 0.283 +452 A 0.295 +453 E 0.312 +454 N 0.325 +455 M 0.328 +456 K 0.330 +457 A 0.335 +458 Q 0.337 +459 N 0.331 +460 E 0.319 +461 A 0.303 +462 K 0.284 +463 E 0.260 +464 I 0.231 +465 Q 0.203 +466 D 0.182 +467 D 0.168 +468 W 0.162 +469 K 0.170 +470 Y 0.192 +471 V 0.212 +472 A 0.220 +473 M 0.221 +474 V 0.225 +475 I 0.220 +476 D 0.192 +477 R 0.154 +478 I 0.127 +479 F 0.112 +480 L 0.101 +481 W 0.092 +482 V 0.090 +483 F 0.096 +484 T 0.101 +485 L 0.101 +486 V 0.094 +487 C 0.085 +488 I 0.078 +489 L 0.076 +490 G 0.078 +491 T 0.079 +492 A 0.083 +493 G 0.091 +494 L 0.095 +495 F 0.092 +496 L 0.094 +497 Q 0.108 +498 P 0.132 +499 L 0.166 +500 M 0.212 +501 A 0.271 +502 R 0.339 +503 E 0.408 +504 D 0.468 +505 A 0.506 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000080644.17_ENST00000326828.6_GN:CHRNA3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:65.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000080644.17_ENST00000326828.6_GN:CHRNA3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:65.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f4097b5c352d0a92fa85c23de1a15941a74f1a97 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000080644.17_ENST00000326828.6_GN:CHRNA3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:65.caid @@ -0,0 +1,571 @@ +>ENSG00000080644.17|ENST00000326828.6|GN:CHRNA3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:65 +1 M 0.349 +2 V 0.362 +3 P 0.381 +4 V 0.399 +5 L 0.408 +6 P 0.404 +7 R 0.405 +8 V 0.431 +9 R 0.464 +10 G 0.476 +11 R 0.467 +12 W 0.465 +13 K 0.489 +14 P 0.539 +15 S 0.599 +16 G 0.644 +17 G 0.659 +18 E 0.645 +19 A 0.605 +20 E 0.550 +21 R 0.514 +22 S 0.524 +23 P 0.541 +24 A 0.523 +25 R 0.499 +26 L 0.512 +27 R 0.554 +28 P 0.594 +29 H 0.625 +30 G 0.648 +31 S 0.661 +32 R 0.669 +33 S 0.681 +34 G 0.691 +35 V 0.689 +36 C 0.672 +37 A 0.632 +38 G 0.577 +39 A 0.536 +40 A 0.525 +41 R 0.525 +42 G 0.531 +43 E 0.554 +44 A 0.564 +45 V 0.542 +46 S 0.529 +47 A 0.556 +48 T 0.594 +49 A 0.612 +50 A 0.620 +51 P 0.637 +52 A 0.662 +53 P 0.682 +54 D 0.690 +55 R 0.687 +56 P 0.683 +57 G 0.682 +58 P 0.674 +59 R 0.642 +60 P 0.593 +61 A 0.567 +62 R 0.587 +63 P 0.613 +64 P 0.605 +65 A 0.597 +66 M 0.627 +67 G 0.674 +68 S 0.701 +69 G 0.710 +70 P 0.707 +71 L 0.697 +72 S 0.692 +73 L 0.696 +74 P 0.694 +75 L 0.663 +76 A 0.589 +77 L 0.499 +78 S 0.428 +79 P 0.384 +80 P 0.343 +81 R 0.298 +82 L 0.255 +83 L 0.222 +84 L 0.207 +85 L 0.208 +86 L 0.218 +87 L 0.228 +88 L 0.243 +89 S 0.268 +90 L 0.305 +91 L 0.353 +92 P 0.413 +93 V 0.470 +94 A 0.496 +95 R 0.478 +96 A 0.419 +97 S 0.332 +98 E 0.238 +99 A 0.161 +100 E 0.111 +101 H 0.079 +102 R 0.059 +103 L 0.050 +104 F 0.048 +105 E 0.049 +106 R 0.050 +107 L 0.052 +108 F 0.058 +109 E 0.068 +110 D 0.078 +111 Y 0.084 +112 N 0.088 +113 E 0.096 +114 I 0.108 +115 I 0.119 +116 R 0.121 +117 P 0.121 +118 V 0.127 +119 A 0.143 +120 N 0.157 +121 V 0.161 +122 S 0.158 +123 D 0.154 +124 P 0.141 +125 V 0.116 +126 I 0.088 +127 I 0.066 +128 H 0.049 +129 F 0.040 +130 E 0.038 +131 V 0.040 +132 S 0.043 +133 M 0.046 +134 S 0.049 +135 Q 0.050 +136 L 0.051 +137 V 0.054 +138 K 0.058 +139 V 0.057 +140 D 0.050 +141 E 0.043 +142 V 0.040 +143 N 0.038 +144 Q 0.036 +145 I 0.032 +146 M 0.028 +147 E 0.024 +148 T 0.022 +149 N 0.023 +150 L 0.027 +151 W 0.031 +152 L 0.035 +153 K 0.037 +154 Q 0.039 +155 I 0.043 +156 W 0.050 +157 N 0.058 +158 D 0.066 +159 Y 0.072 +160 K 0.073 +161 L 0.068 +162 K 0.062 +163 W 0.059 +164 N 0.059 +165 P 0.060 +166 S 0.065 +167 D 0.077 +168 Y 0.097 +169 G 0.114 +170 G 0.118 +171 A 0.106 +172 E 0.088 +173 F 0.079 +174 M 0.081 +175 R 0.085 +176 V 0.083 +177 P 0.076 +178 A 0.069 +179 Q 0.065 +180 K 0.061 +181 I 0.058 +182 W 0.058 +183 K 0.063 +184 P 0.071 +185 D 0.078 +186 I 0.080 +187 V 0.078 +188 L 0.076 +189 Y 0.079 +190 N 0.092 +191 N 0.114 +192 A 0.142 +193 V 0.169 +194 G 0.190 +195 D 0.205 +196 F 0.218 +197 Q 0.233 +198 V 0.248 +199 D 0.251 +200 D 0.233 +201 K 0.195 +202 T 0.147 +203 K 0.100 +204 A 0.065 +205 L 0.048 +206 L 0.047 +207 K 0.059 +208 Y 0.082 +209 T 0.108 +210 G 0.124 +211 E 0.125 +212 V 0.117 +213 T 0.111 +214 W 0.115 +215 I 0.127 +216 P 0.136 +217 P 0.130 +218 A 0.112 +219 I 0.090 +220 F 0.073 +221 K 0.065 +222 S 0.067 +223 S 0.073 +224 C 0.077 +225 K 0.078 +226 I 0.073 +227 D 0.066 +228 V 0.057 +229 T 0.047 +230 Y 0.041 +231 F 0.037 +232 P 0.038 +233 F 0.042 +234 D 0.047 +235 Y 0.050 +236 Q 0.049 +237 N 0.047 +238 C 0.044 +239 T 0.042 +240 M 0.039 +241 K 0.038 +242 F 0.038 +243 G 0.041 +244 S 0.047 +245 W 0.053 +246 S 0.056 +247 Y 0.053 +248 D 0.049 +249 K 0.048 +250 A 0.050 +251 K 0.049 +252 I 0.047 +253 D 0.049 +254 L 0.058 +255 V 0.073 +256 L 0.089 +257 I 0.102 +258 G 0.110 +259 S 0.108 +260 S 0.097 +261 M 0.085 +262 N 0.079 +263 L 0.079 +264 K 0.081 +265 D 0.081 +266 Y 0.080 +267 W 0.084 +268 E 0.092 +269 S 0.094 +270 G 0.086 +271 E 0.077 +272 W 0.077 +273 A 0.081 +274 I 0.080 +275 I 0.075 +276 K 0.077 +277 A 0.083 +278 P 0.086 +279 G 0.081 +280 Y 0.074 +281 K 0.073 +282 H 0.078 +283 D 0.085 +284 I 0.092 +285 K 0.094 +286 Y 0.089 +287 N 0.081 +288 C 0.076 +289 C 0.079 +290 E 0.088 +291 E 0.098 +292 I 0.104 +293 Y 0.104 +294 P 0.097 +295 D 0.082 +296 I 0.065 +297 T 0.050 +298 Y 0.040 +299 S 0.033 +300 L 0.030 +301 Y 0.031 +302 I 0.038 +303 R 0.050 +304 R 0.065 +305 L 0.076 +306 P 0.074 +307 L 0.061 +308 F 0.049 +309 Y 0.045 +310 T 0.045 +311 I 0.051 +312 N 0.063 +313 L 0.080 +314 I 0.095 +315 I 0.105 +316 P 0.109 +317 C 0.110 +318 L 0.109 +319 L 0.106 +320 I 0.102 +321 S 0.098 +322 F 0.096 +323 L 0.093 +324 T 0.090 +325 V 0.084 +326 L 0.080 +327 V 0.080 +328 F 0.079 +329 Y 0.079 +330 L 0.082 +331 P 0.087 +332 S 0.096 +333 D 0.106 +334 C 0.110 +335 G 0.103 +336 E 0.087 +337 K 0.068 +338 V 0.055 +339 T 0.054 +340 L 0.065 +341 C 0.081 +342 I 0.094 +343 S 0.101 +344 V 0.103 +345 L 0.099 +346 L 0.096 +347 S 0.096 +348 L 0.098 +349 T 0.100 +350 V 0.103 +351 F 0.105 +352 L 0.107 +353 L 0.117 +354 V 0.138 +355 I 0.165 +356 T 0.186 +357 E 0.195 +358 T 0.197 +359 I 0.202 +360 P 0.210 +361 S 0.216 +362 T 0.212 +363 S 0.200 +364 L 0.180 +365 V 0.155 +366 I 0.126 +367 P 0.100 +368 L 0.081 +369 I 0.071 +370 G 0.069 +371 E 0.068 +372 Y 0.064 +373 L 0.057 +374 L 0.054 +375 F 0.056 +376 T 0.060 +377 M 0.060 +378 I 0.058 +379 F 0.056 +380 V 0.056 +381 T 0.058 +382 L 0.062 +383 S 0.067 +384 I 0.071 +385 V 0.075 +386 I 0.082 +387 T 0.089 +388 V 0.094 +389 F 0.102 +390 V 0.113 +391 L 0.121 +392 N 0.125 +393 V 0.126 +394 H 0.124 +395 Y 0.124 +396 R 0.128 +397 T 0.134 +398 P 0.138 +399 T 0.141 +400 T 0.151 +401 H 0.166 +402 T 0.176 +403 M 0.169 +404 P 0.142 +405 S 0.107 +406 W 0.079 +407 V 0.066 +408 K 0.060 +409 T 0.060 +410 V 0.068 +411 F 0.090 +412 L 0.113 +413 N 0.123 +414 L 0.116 +415 L 0.107 +416 P 0.106 +417 R 0.115 +418 V 0.132 +419 M 0.158 +420 F 0.199 +421 M 0.256 +422 T 0.328 +423 R 0.413 +424 P 0.506 +425 T 0.591 +426 S 0.652 +427 N 0.687 +428 E 0.705 +429 G 0.709 +430 N 0.700 +431 A 0.678 +432 Q 0.655 +433 K 0.642 +434 P 0.643 +435 R 0.655 +436 P 0.676 +437 L 0.700 +438 Y 0.720 +439 G 0.725 +440 A 0.714 +441 E 0.691 +442 L 0.666 +443 S 0.650 +444 N 0.641 +445 L 0.628 +446 N 0.613 +447 C 0.612 +448 F 0.633 +449 S 0.664 +450 R 0.685 +451 A 0.686 +452 E 0.675 +453 S 0.665 +454 K 0.654 +455 G 0.635 +456 C 0.614 +457 K 0.606 +458 E 0.610 +459 G 0.617 +460 Y 0.621 +461 P 0.619 +462 C 0.625 +463 Q 0.652 +464 D 0.685 +465 G 0.691 +466 M 0.667 +467 C 0.638 +468 G 0.615 +469 Y 0.589 +470 C 0.571 +471 H 0.584 +472 H 0.623 +473 R 0.666 +474 R 0.699 +475 I 0.721 +476 K 0.731 +477 I 0.731 +478 S 0.723 +479 N 0.711 +480 F 0.705 +481 S 0.713 +482 A 0.727 +483 N 0.731 +484 L 0.727 +485 T 0.724 +486 R 0.723 +487 S 0.721 +488 S 0.718 +489 S 0.713 +490 S 0.709 +491 E 0.702 +492 S 0.688 +493 V 0.675 +494 D 0.666 +495 A 0.649 +496 V 0.610 +497 L 0.556 +498 S 0.503 +499 L 0.464 +500 S 0.437 +501 A 0.407 +502 L 0.365 +503 S 0.324 +504 P 0.296 +505 E 0.277 +506 I 0.261 +507 K 0.254 +508 E 0.256 +509 A 0.253 +510 I 0.246 +511 Q 0.249 +512 S 0.264 +513 V 0.277 +514 K 0.284 +515 Y 0.291 +516 I 0.299 +517 A 0.311 +518 E 0.327 +519 N 0.339 +520 M 0.344 +521 K 0.348 +522 A 0.356 +523 Q 0.359 +524 N 0.350 +525 E 0.332 +526 A 0.312 +527 K 0.291 +528 E 0.266 +529 I 0.235 +530 Q 0.206 +531 D 0.184 +532 D 0.170 +533 W 0.165 +534 K 0.176 +535 Y 0.201 +536 V 0.223 +537 A 0.231 +538 M 0.232 +539 V 0.235 +540 I 0.228 +541 D 0.199 +542 R 0.159 +543 I 0.130 +544 F 0.114 +545 L 0.102 +546 W 0.092 +547 V 0.088 +548 F 0.088 +549 T 0.086 +550 L 0.081 +551 V 0.079 +552 C 0.077 +553 I 0.075 +554 L 0.074 +555 G 0.075 +556 T 0.076 +557 A 0.081 +558 G 0.089 +559 L 0.092 +560 F 0.089 +561 L 0.090 +562 Q 0.103 +563 P 0.127 +564 L 0.163 +565 M 0.210 +566 A 0.269 +567 R 0.333 +568 E 0.395 +569 D 0.445 +570 A 0.475 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000081842.18_ENST00000529310.6_GN:PCDHA6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000081842.18_ENST00000529310.6_GN:PCDHA6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ca67274ce4fa53214bfae17b45bbc32fbf5cdb8b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000081842.18_ENST00000529310.6_GN:PCDHA6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,951 @@ +>ENSG00000081842.18|ENST00000529310.6|GN:PCDHA6|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.337 +2 V 0.345 +3 F 0.362 +4 T 0.388 +5 P 0.413 +6 E 0.424 +7 D 0.430 +8 R 0.438 +9 L 0.441 +10 G 0.425 +11 K 0.397 +12 Q 0.376 +13 C 0.350 +14 L 0.307 +15 L 0.267 +16 L 0.245 +17 P 0.228 +18 L 0.210 +19 L 0.198 +20 L 0.194 +21 L 0.194 +22 A 0.202 +23 A 0.226 +24 W 0.262 +25 K 0.303 +26 V 0.343 +27 G 0.365 +28 S 0.347 +29 G 0.287 +30 Q 0.206 +31 L 0.131 +32 H 0.079 +33 Y 0.052 +34 S 0.043 +35 V 0.044 +36 P 0.051 +37 E 0.062 +38 E 0.074 +39 A 0.081 +40 K 0.080 +41 H 0.074 +42 G 0.069 +43 T 0.064 +44 F 0.058 +45 V 0.054 +46 G 0.051 +47 R 0.052 +48 I 0.056 +49 A 0.064 +50 Q 0.075 +51 D 0.091 +52 L 0.109 +53 G 0.121 +54 L 0.123 +55 E 0.117 +56 L 0.114 +57 A 0.112 +58 E 0.115 +59 L 0.124 +60 V 0.137 +61 P 0.135 +62 R 0.114 +63 L 0.088 +64 F 0.075 +65 R 0.080 +66 M 0.093 +67 A 0.105 +68 S 0.114 +69 K 0.125 +70 D 0.137 +71 R 0.147 +72 E 0.142 +73 D 0.119 +74 L 0.089 +75 L 0.067 +76 E 0.057 +77 V 0.054 +78 N 0.052 +79 L 0.053 +80 Q 0.059 +81 N 0.068 +82 G 0.072 +83 I 0.068 +84 L 0.063 +85 F 0.065 +86 V 0.075 +87 N 0.084 +88 S 0.085 +89 R 0.078 +90 I 0.069 +91 D 0.064 +92 R 0.067 +93 E 0.079 +94 E 0.092 +95 L 0.103 +96 C 0.113 +97 G 0.125 +98 R 0.135 +99 S 0.139 +100 A 0.133 +101 E 0.119 +102 C 0.102 +103 S 0.087 +104 I 0.077 +105 H 0.068 +106 L 0.058 +107 E 0.049 +108 V 0.043 +109 I 0.041 +110 V 0.041 +111 D 0.041 +112 R 0.043 +113 P 0.048 +114 L 0.059 +115 Q 0.074 +116 V 0.087 +117 F 0.095 +118 H 0.097 +119 V 0.094 +120 D 0.094 +121 V 0.106 +122 E 0.131 +123 V 0.158 +124 R 0.176 +125 D 0.181 +126 I 0.175 +127 N 0.166 +128 D 0.158 +129 N 0.150 +130 P 0.141 +131 P 0.138 +132 L 0.144 +133 F 0.154 +134 P 0.158 +135 V 0.153 +136 E 0.140 +137 E 0.120 +138 Q 0.098 +139 R 0.079 +140 V 0.065 +141 L 0.054 +142 I 0.046 +143 Y 0.046 +144 E 0.055 +145 S 0.069 +146 R 0.082 +147 L 0.090 +148 P 0.093 +149 D 0.093 +150 S 0.094 +151 V 0.094 +152 F 0.094 +153 P 0.098 +154 L 0.108 +155 E 0.120 +156 G 0.127 +157 A 0.127 +158 S 0.127 +159 D 0.131 +160 A 0.142 +161 D 0.153 +162 V 0.160 +163 G 0.162 +164 S 0.158 +165 N 0.148 +166 S 0.128 +167 I 0.102 +168 L 0.082 +169 T 0.073 +170 Y 0.073 +171 K 0.076 +172 L 0.076 +173 S 0.073 +174 S 0.068 +175 S 0.061 +176 E 0.054 +177 Y 0.049 +178 F 0.049 +179 G 0.054 +180 L 0.064 +181 D 0.078 +182 V 0.097 +183 K 0.124 +184 I 0.154 +185 N 0.175 +186 S 0.181 +187 D 0.173 +188 D 0.159 +189 N 0.141 +190 K 0.117 +191 Q 0.090 +192 I 0.069 +193 G 0.059 +194 L 0.061 +195 L 0.069 +196 L 0.078 +197 K 0.081 +198 K 0.079 +199 S 0.073 +200 L 0.066 +201 D 0.061 +202 R 0.062 +203 E 0.071 +204 E 0.082 +205 A 0.087 +206 P 0.089 +207 A 0.090 +208 H 0.088 +209 N 0.079 +210 L 0.065 +211 F 0.051 +212 L 0.042 +213 T 0.040 +214 A 0.043 +215 T 0.050 +216 D 0.060 +217 G 0.067 +218 G 0.064 +219 K 0.055 +220 P 0.050 +221 E 0.050 +222 L 0.054 +223 T 0.058 +224 G 0.068 +225 T 0.081 +226 V 0.088 +227 Q 0.084 +228 L 0.074 +229 L 0.068 +230 V 0.075 +231 T 0.096 +232 V 0.124 +233 L 0.148 +234 D 0.157 +235 V 0.150 +236 N 0.137 +237 D 0.124 +238 N 0.114 +239 A 0.108 +240 P 0.103 +241 T 0.099 +242 F 0.090 +243 E 0.078 +244 Q 0.070 +245 S 0.067 +246 E 0.063 +247 Y 0.055 +248 E 0.046 +249 V 0.036 +250 R 0.029 +251 I 0.026 +252 F 0.031 +253 E 0.046 +254 N 0.065 +255 A 0.080 +256 D 0.083 +257 N 0.078 +258 G 0.074 +259 T 0.072 +260 T 0.070 +261 V 0.070 +262 I 0.073 +263 R 0.081 +264 L 0.087 +265 N 0.092 +266 A 0.094 +267 S 0.098 +268 D 0.105 +269 R 0.118 +270 D 0.133 +271 E 0.140 +272 G 0.141 +273 A 0.139 +274 N 0.134 +275 G 0.123 +276 A 0.105 +277 I 0.082 +278 S 0.061 +279 Y 0.053 +280 S 0.056 +281 F 0.066 +282 N 0.076 +283 S 0.082 +284 L 0.081 +285 V 0.075 +286 A 0.064 +287 A 0.053 +288 M 0.046 +289 V 0.045 +290 I 0.045 +291 D 0.041 +292 H 0.035 +293 F 0.033 +294 S 0.036 +295 I 0.041 +296 D 0.045 +297 R 0.048 +298 N 0.051 +299 T 0.054 +300 G 0.055 +301 E 0.055 +302 I 0.057 +303 V 0.064 +304 I 0.076 +305 R 0.091 +306 G 0.100 +307 N 0.097 +308 L 0.083 +309 D 0.066 +310 F 0.058 +311 E 0.060 +312 Q 0.066 +313 E 0.065 +314 N 0.061 +315 L 0.059 +316 Y 0.061 +317 K 0.058 +318 I 0.049 +319 L 0.039 +320 I 0.033 +321 D 0.032 +322 A 0.034 +323 T 0.039 +324 D 0.044 +325 K 0.048 +326 G 0.049 +327 H 0.048 +328 P 0.052 +329 P 0.059 +330 M 0.063 +331 A 0.063 +332 G 0.061 +333 H 0.062 +334 C 0.064 +335 T 0.067 +336 V 0.070 +337 L 0.074 +338 V 0.085 +339 R 0.108 +340 I 0.139 +341 L 0.165 +342 D 0.175 +343 K 0.170 +344 N 0.162 +345 D 0.157 +346 N 0.153 +347 V 0.146 +348 P 0.135 +349 E 0.124 +350 I 0.117 +351 A 0.117 +352 L 0.123 +353 T 0.132 +354 S 0.139 +355 L 0.136 +356 S 0.118 +357 L 0.090 +358 P 0.067 +359 V 0.055 +360 R 0.058 +361 E 0.076 +362 D 0.103 +363 A 0.123 +364 Q 0.127 +365 F 0.125 +366 G 0.124 +367 T 0.121 +368 V 0.109 +369 I 0.092 +370 A 0.077 +371 L 0.067 +372 I 0.062 +373 S 0.067 +374 V 0.078 +375 N 0.092 +376 D 0.108 +377 L 0.128 +378 D 0.147 +379 S 0.158 +380 G 0.162 +381 A 0.161 +382 N 0.157 +383 G 0.150 +384 Q 0.137 +385 V 0.119 +386 N 0.100 +387 C 0.090 +388 S 0.092 +389 L 0.103 +390 T 0.117 +391 P 0.127 +392 H 0.122 +393 V 0.098 +394 P 0.074 +395 F 0.065 +396 K 0.069 +397 L 0.073 +398 V 0.073 +399 S 0.070 +400 T 0.066 +401 F 0.059 +402 K 0.050 +403 N 0.041 +404 Y 0.036 +405 Y 0.038 +406 S 0.047 +407 L 0.061 +408 V 0.078 +409 L 0.093 +410 D 0.101 +411 S 0.100 +412 A 0.090 +413 L 0.077 +414 D 0.066 +415 R 0.062 +416 E 0.066 +417 S 0.072 +418 V 0.075 +419 S 0.080 +420 A 0.086 +421 Y 0.085 +422 E 0.074 +423 L 0.058 +424 V 0.044 +425 V 0.038 +426 T 0.037 +427 A 0.043 +428 R 0.053 +429 D 0.064 +430 G 0.070 +431 G 0.067 +432 S 0.060 +433 P 0.057 +434 S 0.058 +435 L 0.057 +436 W 0.057 +437 A 0.063 +438 T 0.075 +439 A 0.085 +440 S 0.092 +441 L 0.095 +442 S 0.099 +443 V 0.111 +444 E 0.136 +445 V 0.168 +446 A 0.192 +447 D 0.195 +448 M 0.182 +449 N 0.164 +450 D 0.152 +451 N 0.144 +452 A 0.134 +453 P 0.126 +454 A 0.121 +455 F 0.117 +456 A 0.114 +457 Q 0.115 +458 P 0.117 +459 E 0.111 +460 Y 0.094 +461 T 0.074 +462 V 0.059 +463 F 0.050 +464 V 0.047 +465 K 0.052 +466 E 0.066 +467 N 0.090 +468 N 0.119 +469 P 0.140 +470 P 0.142 +471 G 0.127 +472 C 0.106 +473 H 0.088 +474 I 0.076 +475 F 0.075 +476 T 0.083 +477 V 0.098 +478 S 0.114 +479 A 0.126 +480 R 0.134 +481 D 0.141 +482 A 0.153 +483 D 0.167 +484 A 0.174 +485 Q 0.177 +486 E 0.179 +487 N 0.178 +488 A 0.166 +489 L 0.141 +490 V 0.111 +491 S 0.088 +492 Y 0.079 +493 S 0.082 +494 L 0.087 +495 V 0.093 +496 E 0.101 +497 R 0.114 +498 R 0.130 +499 V 0.150 +500 G 0.171 +501 E 0.183 +502 R 0.177 +503 A 0.157 +504 L 0.134 +505 S 0.109 +506 S 0.086 +507 Y 0.069 +508 I 0.062 +509 S 0.062 +510 V 0.067 +511 H 0.070 +512 A 0.072 +513 E 0.077 +514 S 0.083 +515 G 0.085 +516 K 0.083 +517 V 0.082 +518 Y 0.092 +519 A 0.112 +520 L 0.133 +521 Q 0.145 +522 P 0.142 +523 L 0.126 +524 D 0.106 +525 H 0.093 +526 E 0.093 +527 E 0.098 +528 L 0.094 +529 E 0.081 +530 L 0.069 +531 L 0.061 +532 Q 0.056 +533 F 0.052 +534 Q 0.048 +535 V 0.046 +536 S 0.047 +537 A 0.052 +538 R 0.059 +539 D 0.069 +540 A 0.076 +541 G 0.076 +542 V 0.071 +543 P 0.069 +544 P 0.076 +545 L 0.084 +546 G 0.089 +547 S 0.095 +548 N 0.104 +549 V 0.109 +550 T 0.104 +551 L 0.096 +552 Q 0.097 +553 V 0.112 +554 F 0.141 +555 V 0.174 +556 L 0.198 +557 D 0.207 +558 E 0.203 +559 N 0.197 +560 D 0.191 +561 N 0.185 +562 A 0.171 +563 P 0.151 +564 A 0.135 +565 L 0.133 +566 L 0.151 +567 A 0.200 +568 P 0.295 +569 R 0.428 +570 V 0.554 +571 G 0.630 +572 G 0.655 +573 T 0.649 +574 G 0.618 +575 G 0.553 +576 A 0.453 +577 V 0.341 +578 S 0.241 +579 E 0.166 +580 L 0.121 +581 V 0.101 +582 P 0.101 +583 R 0.110 +584 S 0.124 +585 L 0.141 +586 G 0.160 +587 A 0.169 +588 G 0.157 +589 Q 0.132 +590 V 0.110 +591 V 0.099 +592 A 0.096 +593 K 0.095 +594 V 0.096 +595 R 0.105 +596 A 0.123 +597 V 0.144 +598 D 0.163 +599 A 0.183 +600 D 0.198 +601 S 0.201 +602 G 0.194 +603 Y 0.181 +604 N 0.164 +605 A 0.141 +606 W 0.115 +607 L 0.095 +608 S 0.088 +609 Y 0.096 +610 E 0.117 +611 L 0.147 +612 Q 0.190 +613 P 0.242 +614 P 0.286 +615 A 0.307 +616 S 0.305 +617 S 0.288 +618 A 0.253 +619 R 0.200 +620 F 0.142 +621 P 0.100 +622 F 0.086 +623 R 0.094 +624 V 0.112 +625 G 0.124 +626 L 0.120 +627 Y 0.107 +628 T 0.095 +629 G 0.084 +630 E 0.075 +631 I 0.073 +632 S 0.081 +633 T 0.098 +634 T 0.114 +635 R 0.123 +636 V 0.126 +637 L 0.129 +638 D 0.138 +639 E 0.155 +640 A 0.169 +641 D 0.170 +642 S 0.157 +643 P 0.136 +644 R 0.119 +645 H 0.104 +646 R 0.089 +647 L 0.075 +648 L 0.064 +649 V 0.061 +650 L 0.064 +651 V 0.071 +652 K 0.077 +653 D 0.081 +654 H 0.084 +655 G 0.081 +656 E 0.075 +657 P 0.073 +658 A 0.076 +659 L 0.079 +660 T 0.081 +661 A 0.085 +662 T 0.091 +663 A 0.094 +664 T 0.094 +665 V 0.090 +666 L 0.084 +667 V 0.084 +668 S 0.096 +669 L 0.129 +670 V 0.191 +671 E 0.286 +672 S 0.404 +673 G 0.513 +674 Q 0.588 +675 A 0.636 +676 P 0.677 +677 K 0.713 +678 A 0.737 +679 S 0.747 +680 S 0.751 +681 R 0.756 +682 A 0.766 +683 S 0.779 +684 V 0.785 +685 G 0.780 +686 A 0.767 +687 A 0.757 +688 G 0.756 +689 P 0.762 +690 E 0.768 +691 A 0.770 +692 A 0.761 +693 L 0.737 +694 V 0.698 +695 D 0.641 +696 V 0.564 +697 N 0.471 +698 V 0.385 +699 Y 0.333 +700 L 0.324 +701 I 0.346 +702 I 0.388 +703 A 0.439 +704 I 0.484 +705 C 0.512 +706 A 0.527 +707 V 0.538 +708 S 0.547 +709 S 0.548 +710 L 0.527 +711 L 0.485 +712 V 0.433 +713 L 0.373 +714 T 0.317 +715 L 0.279 +716 L 0.262 +717 L 0.253 +718 Y 0.248 +719 T 0.258 +720 A 0.286 +721 L 0.326 +722 R 0.373 +723 C 0.421 +724 S 0.463 +725 A 0.504 +726 P 0.559 +727 P 0.628 +728 T 0.693 +729 E 0.738 +730 G 0.763 +731 A 0.771 +732 C 0.769 +733 T 0.763 +734 A 0.755 +735 D 0.751 +736 K 0.754 +737 P 0.764 +738 T 0.778 +739 L 0.790 +740 V 0.795 +741 C 0.792 +742 S 0.787 +743 S 0.787 +744 A 0.793 +745 V 0.799 +746 G 0.798 +747 S 0.790 +748 W 0.778 +749 S 0.762 +750 Y 0.734 +751 S 0.687 +752 Q 0.629 +753 Q 0.606 +754 R 0.649 +755 R 0.723 +756 Q 0.779 +757 R 0.805 +758 V 0.812 +759 C 0.809 +760 S 0.802 +761 G 0.794 +762 E 0.789 +763 G 0.786 +764 P 0.790 +765 P 0.803 +766 K 0.817 +767 M 0.824 +768 D 0.820 +769 L 0.811 +770 M 0.797 +771 A 0.781 +772 F 0.766 +773 S 0.758 +774 P 0.757 +775 S 0.752 +776 L 0.744 +777 S 0.738 +778 P 0.745 +779 C 0.767 +780 P 0.796 +781 I 0.821 +782 M 0.835 +783 M 0.840 +784 G 0.838 +785 K 0.831 +786 A 0.813 +787 E 0.766 +788 N 0.698 +789 Q 0.660 +790 D 0.689 +791 L 0.750 +792 N 0.790 +793 E 0.801 +794 D 0.797 +795 H 0.788 +796 D 0.779 +797 A 0.772 +798 K 0.767 +799 P 0.765 +800 R 0.762 +801 Q 0.755 +802 P 0.745 +803 N 0.737 +804 P 0.733 +805 D 0.730 +806 W 0.733 +807 R 0.741 +808 Y 0.753 +809 S 0.763 +810 A 0.770 +811 S 0.775 +812 L 0.779 +813 R 0.785 +814 A 0.792 +815 G 0.797 +816 M 0.802 +817 H 0.810 +818 S 0.818 +819 S 0.824 +820 V 0.827 +821 H 0.829 +822 L 0.832 +823 E 0.834 +824 E 0.833 +825 A 0.832 +826 G 0.832 +827 I 0.832 +828 L 0.826 +829 R 0.814 +830 A 0.801 +831 G 0.791 +832 P 0.788 +833 G 0.791 +834 G 0.795 +835 P 0.796 +836 D 0.788 +837 Q 0.771 +838 Q 0.755 +839 W 0.752 +840 P 0.765 +841 T 0.772 +842 V 0.743 +843 S 0.681 +844 S 0.636 +845 A 0.645 +846 T 0.676 +847 P 0.689 +848 E 0.703 +849 P 0.742 +850 E 0.791 +851 A 0.822 +852 G 0.829 +853 E 0.821 +854 V 0.804 +855 S 0.789 +856 P 0.790 +857 P 0.808 +858 V 0.829 +859 G 0.843 +860 A 0.845 +861 G 0.840 +862 V 0.832 +863 N 0.823 +864 S 0.816 +865 N 0.806 +866 S 0.794 +867 W 0.782 +868 T 0.773 +869 F 0.765 +870 K 0.757 +871 Y 0.754 +872 G 0.758 +873 P 0.767 +874 G 0.780 +875 N 0.794 +876 P 0.803 +877 K 0.805 +878 Q 0.800 +879 S 0.795 +880 G 0.796 +881 P 0.800 +882 G 0.802 +883 E 0.799 +884 L 0.796 +885 P 0.801 +886 D 0.809 +887 K 0.809 +888 F 0.799 +889 I 0.790 +890 I 0.790 +891 P 0.796 +892 G 0.804 +893 S 0.813 +894 P 0.826 +895 A 0.838 +896 I 0.844 +897 I 0.841 +898 S 0.832 +899 I 0.818 +900 R 0.801 +901 Q 0.786 +902 E 0.777 +903 P 0.775 +904 T 0.782 +905 N 0.793 +906 S 0.801 +907 Q 0.800 +908 I 0.793 +909 D 0.787 +910 K 0.783 +911 S 0.783 +912 D 0.785 +913 F 0.787 +914 I 0.788 +915 T 0.790 +916 F 0.790 +917 G 0.783 +918 K 0.765 +919 K 0.735 +920 E 0.685 +921 E 0.619 +922 T 0.582 +923 K 0.605 +924 K 0.658 +925 K 0.697 +926 K 0.717 +927 K 0.729 +928 K 0.735 +929 K 0.737 +930 K 0.740 +931 G 0.742 +932 N 0.728 +933 K 0.674 +934 T 0.572 +935 Q 0.475 +936 E 0.454 +937 K 0.498 +938 K 0.540 +939 E 0.571 +940 K 0.629 +941 G 0.703 +942 N 0.753 +943 S 0.774 +944 T 0.783 +945 T 0.791 +946 D 0.797 +947 N 0.795 +948 S 0.784 +949 D 0.767 +950 Q 0.755 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000081842.18_ENST00000529310.6_GN:PCDHA6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:9.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000081842.18_ENST00000529310.6_GN:PCDHA6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:9.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4dfe793f3f87e741dfeba9d2e1a0953188e0c042 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000081842.18_ENST00000529310.6_GN:PCDHA6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:9.caid @@ -0,0 +1,960 @@ +>ENSG00000081842.18|ENST00000529310.6|GN:PCDHA6|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:9 +1 M 0.342 +2 E 0.357 +3 I 0.376 +4 K 0.386 +5 P 0.385 +6 E 0.389 +7 V 0.409 +8 F 0.426 +9 D 0.423 +10 M 0.407 +11 V 0.388 +12 F 0.378 +13 T 0.390 +14 P 0.426 +15 E 0.457 +16 D 0.458 +17 R 0.438 +18 L 0.415 +19 G 0.380 +20 K 0.333 +21 Q 0.306 +22 C 0.304 +23 L 0.297 +24 L 0.276 +25 L 0.253 +26 P 0.230 +27 L 0.209 +28 L 0.199 +29 L 0.199 +30 L 0.202 +31 A 0.210 +32 A 0.229 +33 W 0.257 +34 K 0.293 +35 V 0.331 +36 G 0.353 +37 S 0.337 +38 G 0.281 +39 Q 0.203 +40 L 0.130 +41 H 0.079 +42 Y 0.052 +43 S 0.043 +44 V 0.044 +45 P 0.052 +46 E 0.063 +47 E 0.075 +48 A 0.083 +49 K 0.082 +50 H 0.076 +51 G 0.071 +52 T 0.065 +53 F 0.059 +54 V 0.053 +55 G 0.051 +56 R 0.052 +57 I 0.056 +58 A 0.064 +59 Q 0.075 +60 D 0.090 +61 L 0.108 +62 G 0.120 +63 L 0.121 +64 E 0.116 +65 L 0.113 +66 A 0.112 +67 E 0.114 +68 L 0.123 +69 V 0.135 +70 P 0.133 +71 R 0.111 +72 L 0.086 +73 F 0.073 +74 R 0.077 +75 M 0.090 +76 A 0.102 +77 S 0.110 +78 K 0.121 +79 D 0.134 +80 R 0.144 +81 E 0.140 +82 D 0.117 +83 L 0.087 +84 L 0.066 +85 E 0.056 +86 V 0.053 +87 N 0.051 +88 L 0.052 +89 Q 0.058 +90 N 0.067 +91 G 0.070 +92 I 0.066 +93 L 0.061 +94 F 0.063 +95 V 0.073 +96 N 0.082 +97 S 0.084 +98 R 0.077 +99 I 0.068 +100 D 0.062 +101 R 0.065 +102 E 0.076 +103 E 0.090 +104 L 0.101 +105 C 0.110 +106 G 0.122 +107 R 0.132 +108 S 0.136 +109 A 0.132 +110 E 0.119 +111 C 0.102 +112 S 0.088 +113 I 0.078 +114 H 0.068 +115 L 0.058 +116 E 0.049 +117 V 0.043 +118 I 0.041 +119 V 0.041 +120 D 0.042 +121 R 0.043 +122 P 0.049 +123 L 0.060 +124 Q 0.075 +125 V 0.088 +126 F 0.096 +127 H 0.097 +128 V 0.094 +129 D 0.094 +130 V 0.107 +131 E 0.132 +132 V 0.160 +133 R 0.178 +134 D 0.182 +135 I 0.176 +136 N 0.167 +137 D 0.158 +138 N 0.150 +139 P 0.141 +140 P 0.138 +141 L 0.145 +142 F 0.156 +143 P 0.160 +144 V 0.155 +145 E 0.142 +146 E 0.121 +147 Q 0.098 +148 R 0.078 +149 V 0.064 +150 L 0.053 +151 I 0.046 +152 Y 0.045 +153 E 0.054 +154 S 0.069 +155 R 0.081 +156 L 0.089 +157 P 0.092 +158 D 0.093 +159 S 0.093 +160 V 0.093 +161 F 0.092 +162 P 0.096 +163 L 0.105 +164 E 0.117 +165 G 0.124 +166 A 0.125 +167 S 0.126 +168 D 0.130 +169 A 0.141 +170 D 0.153 +171 V 0.160 +172 G 0.161 +173 S 0.158 +174 N 0.147 +175 S 0.127 +176 I 0.102 +177 L 0.081 +178 T 0.071 +179 Y 0.072 +180 K 0.076 +181 L 0.076 +182 S 0.072 +183 S 0.067 +184 S 0.060 +185 E 0.053 +186 Y 0.048 +187 F 0.048 +188 G 0.053 +189 L 0.063 +190 D 0.076 +191 V 0.095 +192 K 0.121 +193 I 0.149 +194 N 0.171 +195 S 0.177 +196 D 0.170 +197 D 0.156 +198 N 0.138 +199 K 0.115 +200 Q 0.089 +201 I 0.068 +202 G 0.058 +203 L 0.059 +204 L 0.068 +205 L 0.076 +206 K 0.080 +207 K 0.078 +208 S 0.072 +209 L 0.065 +210 D 0.059 +211 R 0.061 +212 E 0.070 +213 E 0.080 +214 A 0.086 +215 P 0.087 +216 A 0.088 +217 H 0.086 +218 N 0.077 +219 L 0.063 +220 F 0.050 +221 L 0.041 +222 T 0.039 +223 A 0.042 +224 T 0.049 +225 D 0.059 +226 G 0.065 +227 G 0.063 +228 K 0.054 +229 P 0.049 +230 E 0.050 +231 L 0.053 +232 T 0.057 +233 G 0.067 +234 T 0.079 +235 V 0.087 +236 Q 0.083 +237 L 0.073 +238 L 0.067 +239 V 0.074 +240 T 0.094 +241 V 0.122 +242 L 0.146 +243 D 0.155 +244 V 0.149 +245 N 0.136 +246 D 0.123 +247 N 0.114 +248 A 0.107 +249 P 0.103 +250 T 0.098 +251 F 0.089 +252 E 0.078 +253 Q 0.070 +254 S 0.067 +255 E 0.063 +256 Y 0.056 +257 E 0.046 +258 V 0.036 +259 R 0.029 +260 I 0.026 +261 F 0.032 +262 E 0.046 +263 N 0.066 +264 A 0.081 +265 D 0.084 +266 N 0.079 +267 G 0.075 +268 T 0.073 +269 T 0.071 +270 V 0.070 +271 I 0.074 +272 R 0.081 +273 L 0.088 +274 N 0.093 +275 A 0.096 +276 S 0.099 +277 D 0.107 +278 R 0.121 +279 D 0.135 +280 E 0.142 +281 G 0.143 +282 A 0.140 +283 N 0.135 +284 G 0.124 +285 A 0.106 +286 I 0.082 +287 S 0.062 +288 Y 0.054 +289 S 0.057 +290 F 0.067 +291 N 0.077 +292 S 0.083 +293 L 0.083 +294 V 0.076 +295 A 0.065 +296 A 0.054 +297 M 0.048 +298 V 0.047 +299 I 0.046 +300 D 0.042 +301 H 0.036 +302 F 0.034 +303 S 0.036 +304 I 0.042 +305 D 0.046 +306 R 0.049 +307 N 0.052 +308 T 0.056 +309 G 0.057 +310 E 0.057 +311 I 0.059 +312 V 0.066 +313 I 0.079 +314 R 0.094 +315 G 0.103 +316 N 0.100 +317 L 0.085 +318 D 0.068 +319 F 0.060 +320 E 0.062 +321 Q 0.068 +322 E 0.067 +323 N 0.062 +324 L 0.061 +325 Y 0.062 +326 K 0.059 +327 I 0.050 +328 L 0.040 +329 I 0.033 +330 D 0.032 +331 A 0.035 +332 T 0.040 +333 D 0.045 +334 K 0.049 +335 G 0.049 +336 H 0.049 +337 P 0.053 +338 P 0.060 +339 M 0.065 +340 A 0.064 +341 G 0.063 +342 H 0.063 +343 C 0.066 +344 T 0.069 +345 V 0.071 +346 L 0.075 +347 V 0.087 +348 R 0.110 +349 I 0.141 +350 L 0.166 +351 D 0.175 +352 K 0.170 +353 N 0.162 +354 D 0.158 +355 N 0.154 +356 V 0.147 +357 P 0.136 +358 E 0.124 +359 I 0.117 +360 A 0.117 +361 L 0.123 +362 T 0.131 +363 S 0.138 +364 L 0.135 +365 S 0.117 +366 L 0.089 +367 P 0.066 +368 V 0.055 +369 R 0.058 +370 E 0.076 +371 D 0.103 +372 A 0.122 +373 Q 0.126 +374 F 0.123 +375 G 0.122 +376 T 0.119 +377 V 0.107 +378 I 0.091 +379 A 0.077 +380 L 0.066 +381 I 0.062 +382 S 0.067 +383 V 0.078 +384 N 0.091 +385 D 0.106 +386 L 0.126 +387 D 0.144 +388 S 0.156 +389 G 0.159 +390 A 0.157 +391 N 0.154 +392 G 0.146 +393 Q 0.134 +394 V 0.116 +395 N 0.098 +396 C 0.088 +397 S 0.090 +398 L 0.100 +399 T 0.114 +400 P 0.125 +401 H 0.119 +402 V 0.096 +403 P 0.072 +404 F 0.064 +405 K 0.067 +406 L 0.072 +407 V 0.072 +408 S 0.069 +409 T 0.065 +410 F 0.058 +411 K 0.049 +412 N 0.040 +413 Y 0.036 +414 Y 0.038 +415 S 0.047 +416 L 0.061 +417 V 0.078 +418 L 0.093 +419 D 0.100 +420 S 0.098 +421 A 0.089 +422 L 0.076 +423 D 0.065 +424 R 0.061 +425 E 0.065 +426 S 0.071 +427 V 0.075 +428 S 0.079 +429 A 0.085 +430 Y 0.085 +431 E 0.074 +432 L 0.058 +433 V 0.044 +434 V 0.038 +435 T 0.038 +436 A 0.043 +437 R 0.053 +438 D 0.064 +439 G 0.070 +440 G 0.067 +441 S 0.060 +442 P 0.057 +443 S 0.058 +444 L 0.057 +445 W 0.057 +446 A 0.063 +447 T 0.075 +448 A 0.085 +449 S 0.091 +450 L 0.094 +451 S 0.097 +452 V 0.109 +453 E 0.135 +454 V 0.168 +455 A 0.192 +456 D 0.196 +457 M 0.183 +458 N 0.166 +459 D 0.154 +460 N 0.145 +461 A 0.136 +462 P 0.127 +463 A 0.122 +464 F 0.118 +465 A 0.115 +466 Q 0.116 +467 P 0.118 +468 E 0.112 +469 Y 0.095 +470 T 0.075 +471 V 0.059 +472 F 0.050 +473 V 0.047 +474 K 0.052 +475 E 0.066 +476 N 0.090 +477 N 0.120 +478 P 0.142 +479 P 0.144 +480 G 0.130 +481 C 0.109 +482 H 0.091 +483 I 0.079 +484 F 0.077 +485 T 0.085 +486 V 0.100 +487 S 0.115 +488 A 0.128 +489 R 0.136 +490 D 0.144 +491 A 0.157 +492 D 0.171 +493 A 0.178 +494 Q 0.181 +495 E 0.183 +496 N 0.182 +497 A 0.169 +498 L 0.143 +499 V 0.113 +500 S 0.089 +501 Y 0.080 +502 S 0.083 +503 L 0.088 +504 V 0.094 +505 E 0.102 +506 R 0.114 +507 R 0.130 +508 V 0.149 +509 G 0.171 +510 E 0.184 +511 R 0.178 +512 A 0.157 +513 L 0.133 +514 S 0.109 +515 S 0.086 +516 Y 0.069 +517 I 0.062 +518 S 0.062 +519 V 0.067 +520 H 0.070 +521 A 0.072 +522 E 0.077 +523 S 0.083 +524 G 0.086 +525 K 0.084 +526 V 0.083 +527 Y 0.092 +528 A 0.112 +529 L 0.134 +530 Q 0.145 +531 P 0.142 +532 L 0.126 +533 D 0.105 +534 H 0.092 +535 E 0.093 +536 E 0.097 +537 L 0.093 +538 E 0.081 +539 L 0.068 +540 L 0.061 +541 Q 0.056 +542 F 0.051 +543 Q 0.048 +544 V 0.047 +545 S 0.048 +546 A 0.052 +547 R 0.060 +548 D 0.069 +549 A 0.076 +550 G 0.076 +551 V 0.070 +552 P 0.069 +553 P 0.076 +554 L 0.084 +555 G 0.089 +556 S 0.095 +557 N 0.104 +558 V 0.109 +559 T 0.104 +560 L 0.097 +561 Q 0.097 +562 V 0.112 +563 F 0.141 +564 V 0.174 +565 L 0.198 +566 D 0.207 +567 E 0.204 +568 N 0.197 +569 D 0.192 +570 N 0.185 +571 A 0.171 +572 P 0.152 +573 A 0.136 +574 L 0.133 +575 L 0.151 +576 A 0.200 +577 P 0.294 +578 R 0.426 +579 V 0.552 +580 G 0.628 +581 G 0.652 +582 T 0.646 +583 G 0.617 +584 G 0.552 +585 A 0.453 +586 V 0.341 +587 S 0.241 +588 E 0.166 +589 L 0.120 +590 V 0.101 +591 P 0.101 +592 R 0.110 +593 S 0.124 +594 L 0.141 +595 G 0.160 +596 A 0.169 +597 G 0.157 +598 Q 0.132 +599 V 0.110 +600 V 0.099 +601 A 0.096 +602 K 0.095 +603 V 0.096 +604 R 0.105 +605 A 0.123 +606 V 0.144 +607 D 0.164 +608 A 0.184 +609 D 0.199 +610 S 0.202 +611 G 0.195 +612 Y 0.182 +613 N 0.165 +614 A 0.142 +615 W 0.117 +616 L 0.096 +617 S 0.088 +618 Y 0.097 +619 E 0.118 +620 L 0.148 +621 Q 0.190 +622 P 0.243 +623 P 0.288 +624 A 0.309 +625 S 0.307 +626 S 0.290 +627 A 0.255 +628 R 0.202 +629 F 0.143 +630 P 0.101 +631 F 0.086 +632 R 0.094 +633 V 0.113 +634 G 0.124 +635 L 0.121 +636 Y 0.108 +637 T 0.096 +638 G 0.085 +639 E 0.076 +640 I 0.073 +641 S 0.081 +642 T 0.098 +643 T 0.115 +644 R 0.124 +645 V 0.127 +646 L 0.130 +647 D 0.139 +648 E 0.155 +649 A 0.169 +650 D 0.171 +651 S 0.157 +652 P 0.137 +653 R 0.119 +654 H 0.104 +655 R 0.089 +656 L 0.075 +657 L 0.064 +658 V 0.061 +659 L 0.064 +660 V 0.071 +661 K 0.077 +662 D 0.082 +663 H 0.084 +664 G 0.081 +665 E 0.075 +666 P 0.073 +667 A 0.076 +668 L 0.079 +669 T 0.081 +670 A 0.085 +671 T 0.091 +672 A 0.094 +673 T 0.094 +674 V 0.090 +675 L 0.085 +676 V 0.084 +677 S 0.096 +678 L 0.130 +679 V 0.192 +680 E 0.288 +681 S 0.406 +682 G 0.514 +683 Q 0.589 +684 A 0.637 +685 P 0.678 +686 K 0.714 +687 A 0.737 +688 S 0.748 +689 S 0.752 +690 R 0.757 +691 A 0.766 +692 S 0.779 +693 V 0.786 +694 G 0.781 +695 A 0.767 +696 A 0.757 +697 G 0.756 +698 P 0.762 +699 E 0.769 +700 A 0.771 +701 A 0.762 +702 L 0.738 +703 V 0.699 +704 D 0.643 +705 V 0.566 +706 N 0.473 +707 V 0.387 +708 Y 0.334 +709 L 0.325 +710 I 0.348 +711 I 0.390 +712 A 0.441 +713 I 0.486 +714 C 0.515 +715 A 0.529 +716 V 0.538 +717 S 0.547 +718 S 0.549 +719 L 0.528 +720 L 0.486 +721 V 0.433 +722 L 0.374 +723 T 0.317 +724 L 0.279 +725 L 0.263 +726 L 0.255 +727 Y 0.250 +728 T 0.260 +729 A 0.288 +730 L 0.327 +731 R 0.374 +732 C 0.422 +733 S 0.463 +734 A 0.503 +735 P 0.558 +736 P 0.627 +737 T 0.692 +738 E 0.738 +739 G 0.762 +740 A 0.770 +741 C 0.769 +742 T 0.763 +743 A 0.755 +744 D 0.751 +745 K 0.753 +746 P 0.764 +747 T 0.778 +748 L 0.790 +749 V 0.795 +750 C 0.792 +751 S 0.787 +752 S 0.786 +753 A 0.792 +754 V 0.798 +755 G 0.798 +756 S 0.790 +757 W 0.778 +758 S 0.761 +759 Y 0.733 +760 S 0.685 +761 Q 0.627 +762 Q 0.605 +763 R 0.648 +764 R 0.722 +765 Q 0.778 +766 R 0.804 +767 V 0.812 +768 C 0.809 +769 S 0.802 +770 G 0.794 +771 E 0.789 +772 G 0.786 +773 P 0.790 +774 P 0.803 +775 K 0.817 +776 M 0.824 +777 D 0.821 +778 L 0.811 +779 M 0.798 +780 A 0.781 +781 F 0.766 +782 S 0.759 +783 P 0.757 +784 S 0.752 +785 L 0.744 +786 S 0.739 +787 P 0.746 +788 C 0.768 +789 P 0.797 +790 I 0.822 +791 M 0.836 +792 M 0.840 +793 G 0.838 +794 K 0.832 +795 A 0.813 +796 E 0.766 +797 N 0.698 +798 Q 0.660 +799 D 0.689 +800 L 0.750 +801 N 0.790 +802 E 0.801 +803 D 0.796 +804 H 0.788 +805 D 0.779 +806 A 0.772 +807 K 0.767 +808 P 0.765 +809 R 0.762 +810 Q 0.755 +811 P 0.745 +812 N 0.737 +813 P 0.732 +814 D 0.730 +815 W 0.733 +816 R 0.741 +817 Y 0.753 +818 S 0.763 +819 A 0.770 +820 S 0.775 +821 L 0.780 +822 R 0.786 +823 A 0.793 +824 G 0.798 +825 M 0.803 +826 H 0.810 +827 S 0.819 +828 S 0.825 +829 V 0.827 +830 H 0.829 +831 L 0.832 +832 E 0.834 +833 E 0.834 +834 A 0.832 +835 G 0.832 +836 I 0.832 +837 L 0.826 +838 R 0.815 +839 A 0.801 +840 G 0.792 +841 P 0.789 +842 G 0.792 +843 G 0.796 +844 P 0.796 +845 D 0.788 +846 Q 0.772 +847 Q 0.755 +848 W 0.753 +849 P 0.765 +850 T 0.772 +851 V 0.743 +852 S 0.681 +853 S 0.638 +854 A 0.653 +855 T 0.697 +856 P 0.730 +857 E 0.754 +858 P 0.783 +859 E 0.812 +860 A 0.829 +861 G 0.831 +862 E 0.821 +863 V 0.804 +864 S 0.789 +865 P 0.791 +866 P 0.808 +867 V 0.829 +868 G 0.842 +869 A 0.845 +870 G 0.840 +871 V 0.831 +872 N 0.823 +873 S 0.815 +874 N 0.806 +875 S 0.793 +876 W 0.782 +877 T 0.773 +878 F 0.764 +879 K 0.756 +880 Y 0.753 +881 G 0.757 +882 P 0.767 +883 G 0.780 +884 N 0.793 +885 P 0.803 +886 K 0.804 +887 Q 0.799 +888 S 0.794 +889 G 0.795 +890 P 0.799 +891 G 0.801 +892 E 0.798 +893 L 0.796 +894 P 0.801 +895 D 0.808 +896 K 0.808 +897 F 0.798 +898 I 0.790 +899 I 0.789 +900 P 0.796 +901 G 0.804 +902 S 0.813 +903 P 0.825 +904 A 0.838 +905 I 0.844 +906 I 0.841 +907 S 0.831 +908 I 0.817 +909 R 0.799 +910 Q 0.784 +911 E 0.775 +912 P 0.773 +913 T 0.780 +914 N 0.791 +915 S 0.799 +916 Q 0.799 +917 I 0.792 +918 D 0.786 +919 K 0.783 +920 S 0.783 +921 D 0.784 +922 F 0.786 +923 I 0.788 +924 T 0.790 +925 F 0.790 +926 G 0.782 +927 K 0.764 +928 K 0.734 +929 E 0.683 +930 E 0.618 +931 T 0.581 +932 K 0.603 +933 K 0.654 +934 K 0.693 +935 K 0.714 +936 K 0.727 +937 K 0.734 +938 K 0.737 +939 K 0.740 +940 G 0.741 +941 N 0.726 +942 K 0.672 +943 T 0.572 +944 Q 0.475 +945 E 0.453 +946 K 0.498 +947 K 0.540 +948 E 0.571 +949 K 0.629 +950 G 0.702 +951 N 0.753 +952 S 0.774 +953 T 0.783 +954 T 0.790 +955 D 0.796 +956 N 0.794 +957 S 0.783 +958 D 0.766 +959 Q 0.753 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000094661.3_ENST00000641398.1_GN:OR1I1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000094661.3_ENST00000641398.1_GN:OR1I1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ebb5c2827ded74ce62f05a94ca019d06d5c69675 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000094661.3_ENST00000641398.1_GN:OR1I1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,356 @@ +>ENSG00000094661.3|ENST00000641398.1|GN:OR1I1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.429 +2 E 0.455 +3 P 0.493 +4 E 0.524 +5 K 0.530 +6 Q 0.501 +7 T 0.437 +8 E 0.352 +9 I 0.266 +10 S 0.195 +11 E 0.149 +12 F 0.127 +13 F 0.120 +14 L 0.123 +15 Q 0.135 +16 G 0.153 +17 L 0.172 +18 S 0.192 +19 E 0.201 +20 K 0.192 +21 P 0.164 +22 E 0.129 +23 H 0.097 +24 Q 0.073 +25 T 0.057 +26 L 0.048 +27 L 0.047 +28 F 0.048 +29 T 0.046 +30 M 0.043 +31 F 0.041 +32 L 0.045 +33 S 0.050 +34 T 0.054 +35 Y 0.053 +36 L 0.052 +37 V 0.054 +38 T 0.058 +39 I 0.059 +40 I 0.062 +41 G 0.067 +42 N 0.071 +43 A 0.073 +44 L 0.071 +45 I 0.067 +46 I 0.061 +47 L 0.058 +48 A 0.058 +49 I 0.060 +50 I 0.063 +51 T 0.069 +52 D 0.075 +53 S 0.077 +54 H 0.073 +55 L 0.067 +56 H 0.059 +57 T 0.051 +58 P 0.042 +59 M 0.035 +60 Y 0.030 +61 F 0.026 +62 F 0.025 +63 L 0.029 +64 F 0.037 +65 N 0.047 +66 L 0.053 +67 S 0.055 +68 L 0.055 +69 V 0.060 +70 D 0.070 +71 T 0.077 +72 L 0.076 +73 L 0.070 +74 S 0.066 +75 S 0.065 +76 T 0.066 +77 T 0.069 +78 V 0.070 +79 P 0.068 +80 K 0.067 +81 M 0.067 +82 L 0.068 +83 A 0.071 +84 N 0.076 +85 I 0.082 +86 Q 0.090 +87 A 0.099 +88 Q 0.101 +89 S 0.092 +90 R 0.079 +91 A 0.070 +92 I 0.063 +93 P 0.054 +94 F 0.044 +95 V 0.039 +96 G 0.038 +97 C 0.037 +98 L 0.037 +99 T 0.037 +100 Q 0.038 +101 M 0.039 +102 Y 0.038 +103 A 0.035 +104 F 0.030 +105 H 0.027 +106 L 0.027 +107 F 0.030 +108 G 0.036 +109 T 0.043 +110 M 0.047 +111 D 0.047 +112 S 0.043 +113 F 0.038 +114 L 0.035 +115 L 0.034 +116 A 0.032 +117 V 0.031 +118 M 0.032 +119 A 0.037 +120 I 0.042 +121 D 0.046 +122 R 0.046 +123 F 0.044 +124 V 0.041 +125 A 0.040 +126 I 0.043 +127 V 0.048 +128 H 0.052 +129 P 0.052 +130 Q 0.047 +131 R 0.041 +132 Y 0.038 +133 L 0.039 +134 V 0.045 +135 L 0.053 +136 M 0.059 +137 C 0.059 +138 S 0.054 +139 P 0.048 +140 V 0.046 +141 C 0.052 +142 G 0.063 +143 L 0.071 +144 L 0.070 +145 L 0.065 +146 G 0.066 +147 A 0.071 +148 S 0.075 +149 W 0.073 +150 M 0.069 +151 I 0.070 +152 T 0.078 +153 N 0.089 +154 L 0.097 +155 Q 0.097 +156 S 0.087 +157 L 0.076 +158 I 0.071 +159 H 0.072 +160 T 0.072 +161 C 0.073 +162 L 0.080 +163 M 0.091 +164 A 0.101 +165 Q 0.108 +166 L 0.113 +167 T 0.117 +168 F 0.127 +169 C 0.142 +170 A 0.155 +171 G 0.163 +172 S 0.172 +173 E 0.179 +174 I 0.172 +175 S 0.145 +176 H 0.110 +177 F 0.084 +178 F 0.071 +179 C 0.072 +180 D 0.085 +181 L 0.105 +182 M 0.126 +183 P 0.142 +184 L 0.152 +185 L 0.159 +186 K 0.168 +187 L 0.176 +188 S 0.181 +189 G 0.187 +190 S 0.194 +191 D 0.194 +192 T 0.181 +193 H 0.160 +194 T 0.144 +195 N 0.134 +196 E 0.127 +197 L 0.123 +198 V 0.124 +199 I 0.125 +200 F 0.118 +201 A 0.106 +202 F 0.092 +203 G 0.080 +204 I 0.070 +205 V 0.067 +206 V 0.074 +207 G 0.087 +208 T 0.099 +209 S 0.105 +210 P 0.098 +211 F 0.083 +212 S 0.072 +213 C 0.069 +214 I 0.068 +215 L 0.059 +216 L 0.046 +217 S 0.038 +218 Y 0.035 +219 I 0.036 +220 R 0.039 +221 I 0.039 +222 F 0.037 +223 W 0.037 +224 T 0.043 +225 V 0.054 +226 F 0.073 +227 K 0.099 +228 I 0.124 +229 P 0.137 +230 S 0.135 +231 T 0.122 +232 R 0.103 +233 G 0.084 +234 K 0.069 +235 W 0.063 +236 K 0.066 +237 A 0.068 +238 F 0.066 +239 S 0.062 +240 T 0.062 +241 C 0.063 +242 G 0.064 +243 L 0.062 +244 H 0.057 +245 L 0.053 +246 T 0.053 +247 V 0.055 +248 V 0.052 +249 S 0.042 +250 L 0.033 +251 S 0.029 +252 Y 0.030 +253 G 0.033 +254 T 0.035 +255 I 0.034 +256 F 0.034 +257 A 0.040 +258 V 0.056 +259 Y 0.082 +260 L 0.119 +261 Q 0.166 +262 P 0.218 +263 T 0.269 +264 S 0.304 +265 P 0.314 +266 S 0.297 +267 S 0.261 +268 S 0.215 +269 Q 0.175 +270 K 0.151 +271 D 0.137 +272 K 0.125 +273 A 0.109 +274 A 0.091 +275 A 0.077 +276 L 0.074 +277 M 0.082 +278 C 0.096 +279 G 0.109 +280 V 0.117 +281 F 0.122 +282 I 0.121 +283 P 0.111 +284 M 0.095 +285 L 0.085 +286 N 0.078 +287 P 0.069 +288 F 0.062 +289 I 0.058 +290 Y 0.058 +291 S 0.063 +292 I 0.075 +293 R 0.085 +294 N 0.082 +295 K 0.070 +296 D 0.059 +297 M 0.053 +298 K 0.052 +299 A 0.056 +300 A 0.066 +301 L 0.077 +302 G 0.086 +303 K 0.094 +304 L 0.110 +305 I 0.147 +306 G 0.210 +307 K 0.287 +308 V 0.362 +309 A 0.421 +310 V 0.464 +311 P 0.492 +312 C 0.508 +313 P 0.511 +314 R 0.512 +315 P 0.518 +316 E 0.528 +317 Q 0.529 +318 L 0.515 +319 L 0.496 +320 D 0.485 +321 V 0.478 +322 Y 0.477 +323 H 0.491 +324 V 0.526 +325 P 0.572 +326 G 0.613 +327 S 0.636 +328 L 0.635 +329 L 0.607 +330 A 0.563 +331 A 0.540 +332 R 0.565 +333 D 0.610 +334 T 0.632 +335 E 0.626 +336 M 0.614 +337 H 0.614 +338 P 0.629 +339 I 0.645 +340 P 0.652 +341 Y 0.660 +342 P 0.679 +343 G 0.698 +344 G 0.684 +345 V 0.634 +346 Q 0.597 +347 S 0.617 +348 L 0.670 +349 A 0.705 +350 G 0.709 +351 N 0.695 +352 R 0.673 +353 D 0.637 +354 M 0.583 +355 E 0.538 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000094661.3_ENST00000641398.1_GN:OR1I1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000094661.3_ENST00000641398.1_GN:OR1I1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..24f890758490d7f5964e312726965cc70d2e80cc --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000094661.3_ENST00000641398.1_GN:OR1I1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid @@ -0,0 +1,375 @@ +>ENSG00000094661.3|ENST00000641398.1|GN:OR1I1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:19 +1 M 0.365 +2 N 0.390 +3 P 0.414 +4 S 0.406 +5 H 0.357 +6 R 0.295 +7 H 0.272 +8 Q 0.315 +9 A 0.393 +10 N 0.448 +11 P 0.459 +12 S 0.460 +13 D 0.480 +14 H 0.508 +15 S 0.525 +16 H 0.535 +17 R 0.544 +18 P 0.548 +19 Y 0.546 +20 M 0.546 +21 E 0.555 +22 P 0.571 +23 E 0.582 +24 K 0.575 +25 Q 0.538 +26 T 0.467 +27 E 0.374 +28 I 0.281 +29 S 0.204 +30 E 0.153 +31 F 0.127 +32 F 0.118 +33 L 0.120 +34 Q 0.131 +35 G 0.148 +36 L 0.169 +37 S 0.189 +38 E 0.199 +39 K 0.189 +40 P 0.161 +41 E 0.126 +42 H 0.095 +43 Q 0.072 +44 T 0.055 +45 L 0.047 +46 L 0.046 +47 F 0.047 +48 T 0.045 +49 M 0.042 +50 F 0.042 +51 L 0.046 +52 S 0.052 +53 T 0.055 +54 Y 0.054 +55 L 0.052 +56 V 0.055 +57 T 0.059 +58 I 0.060 +59 I 0.063 +60 G 0.068 +61 N 0.073 +62 A 0.074 +63 L 0.073 +64 I 0.069 +65 I 0.063 +66 L 0.059 +67 A 0.059 +68 I 0.059 +69 I 0.062 +70 T 0.068 +71 D 0.075 +72 S 0.076 +73 H 0.072 +74 L 0.065 +75 H 0.057 +76 T 0.049 +77 P 0.041 +78 M 0.034 +79 Y 0.028 +80 F 0.025 +81 F 0.024 +82 L 0.028 +83 F 0.037 +84 N 0.047 +85 L 0.054 +86 S 0.055 +87 L 0.055 +88 V 0.060 +89 D 0.070 +90 T 0.077 +91 L 0.076 +92 L 0.070 +93 S 0.066 +94 S 0.065 +95 T 0.066 +96 T 0.067 +97 V 0.067 +98 P 0.064 +99 K 0.062 +100 M 0.062 +101 L 0.062 +102 A 0.064 +103 N 0.068 +104 I 0.073 +105 Q 0.082 +106 A 0.091 +107 Q 0.094 +108 S 0.087 +109 R 0.076 +110 A 0.068 +111 I 0.061 +112 P 0.052 +113 F 0.042 +114 V 0.038 +115 G 0.037 +116 C 0.036 +117 L 0.035 +118 T 0.035 +119 Q 0.036 +120 M 0.037 +121 Y 0.037 +122 A 0.034 +123 F 0.029 +124 H 0.027 +125 L 0.027 +126 F 0.030 +127 G 0.036 +128 T 0.043 +129 M 0.047 +130 D 0.047 +131 S 0.043 +132 F 0.038 +133 L 0.035 +134 L 0.034 +135 A 0.033 +136 V 0.031 +137 M 0.033 +138 A 0.038 +139 I 0.043 +140 D 0.047 +141 R 0.048 +142 F 0.045 +143 V 0.042 +144 A 0.041 +145 I 0.044 +146 V 0.049 +147 H 0.054 +148 P 0.054 +149 Q 0.049 +150 R 0.043 +151 Y 0.040 +152 L 0.041 +153 V 0.047 +154 L 0.056 +155 M 0.062 +156 C 0.062 +157 S 0.056 +158 P 0.050 +159 V 0.048 +160 C 0.053 +161 G 0.063 +162 L 0.070 +163 L 0.069 +164 L 0.065 +165 G 0.066 +166 A 0.071 +167 S 0.073 +168 W 0.068 +169 M 0.063 +170 I 0.064 +171 T 0.069 +172 N 0.074 +173 L 0.079 +174 Q 0.082 +175 S 0.080 +176 L 0.074 +177 I 0.072 +178 H 0.073 +179 T 0.072 +180 C 0.074 +181 L 0.081 +182 M 0.092 +183 A 0.102 +184 Q 0.110 +185 L 0.114 +186 T 0.118 +187 F 0.126 +188 C 0.140 +189 A 0.152 +190 G 0.161 +191 S 0.170 +192 E 0.177 +193 I 0.171 +194 S 0.144 +195 H 0.109 +196 F 0.083 +197 F 0.071 +198 C 0.073 +199 D 0.086 +200 L 0.106 +201 M 0.127 +202 P 0.142 +203 L 0.152 +204 L 0.159 +205 K 0.168 +206 L 0.174 +207 S 0.179 +208 G 0.184 +209 S 0.191 +210 D 0.191 +211 T 0.178 +212 H 0.158 +213 T 0.142 +214 N 0.132 +215 E 0.125 +216 L 0.122 +217 V 0.124 +218 I 0.125 +219 F 0.119 +220 A 0.107 +221 F 0.093 +222 G 0.081 +223 I 0.071 +224 V 0.068 +225 V 0.075 +226 G 0.088 +227 T 0.100 +228 S 0.106 +229 P 0.100 +230 F 0.085 +231 S 0.074 +232 C 0.072 +233 I 0.070 +234 L 0.061 +235 L 0.048 +236 S 0.040 +237 Y 0.037 +238 I 0.037 +239 R 0.040 +240 I 0.040 +241 F 0.038 +242 W 0.038 +243 T 0.044 +244 V 0.056 +245 F 0.074 +246 K 0.101 +247 I 0.125 +248 P 0.139 +249 S 0.137 +250 T 0.124 +251 R 0.105 +252 G 0.086 +253 K 0.072 +254 W 0.067 +255 K 0.069 +256 A 0.072 +257 F 0.069 +258 S 0.066 +259 T 0.066 +260 C 0.068 +261 G 0.069 +262 L 0.066 +263 H 0.061 +264 L 0.056 +265 T 0.055 +266 V 0.056 +267 V 0.053 +268 S 0.043 +269 L 0.033 +270 S 0.029 +271 Y 0.030 +272 G 0.033 +273 T 0.034 +274 I 0.033 +275 F 0.034 +276 A 0.040 +277 V 0.057 +278 Y 0.083 +279 L 0.121 +280 Q 0.170 +281 P 0.224 +282 T 0.276 +283 S 0.313 +284 P 0.323 +285 S 0.306 +286 S 0.268 +287 S 0.222 +288 Q 0.181 +289 K 0.156 +290 D 0.142 +291 K 0.130 +292 A 0.113 +293 A 0.095 +294 A 0.081 +295 L 0.077 +296 M 0.085 +297 C 0.100 +298 G 0.112 +299 V 0.120 +300 F 0.125 +301 I 0.124 +302 P 0.113 +303 M 0.098 +304 L 0.087 +305 N 0.080 +306 P 0.071 +307 F 0.064 +308 I 0.060 +309 Y 0.060 +310 S 0.065 +311 I 0.077 +312 R 0.087 +313 N 0.085 +314 K 0.072 +315 D 0.060 +316 M 0.053 +317 K 0.051 +318 A 0.055 +319 A 0.065 +320 L 0.076 +321 G 0.086 +322 K 0.093 +323 L 0.110 +324 I 0.147 +325 G 0.209 +326 K 0.286 +327 V 0.362 +328 A 0.422 +329 V 0.466 +330 P 0.496 +331 C 0.513 +332 P 0.519 +333 R 0.522 +334 P 0.532 +335 E 0.546 +336 Q 0.549 +337 L 0.534 +338 L 0.514 +339 D 0.501 +340 V 0.494 +341 Y 0.491 +342 H 0.504 +343 V 0.539 +344 P 0.588 +345 G 0.634 +346 S 0.659 +347 L 0.656 +348 L 0.623 +349 A 0.574 +350 A 0.550 +351 R 0.577 +352 D 0.624 +353 T 0.648 +354 E 0.642 +355 M 0.628 +356 H 0.625 +357 P 0.639 +358 I 0.654 +359 P 0.661 +360 Y 0.669 +361 P 0.688 +362 G 0.705 +363 G 0.690 +364 V 0.639 +365 Q 0.603 +366 S 0.624 +367 L 0.677 +368 A 0.713 +369 G 0.718 +370 N 0.704 +371 R 0.682 +372 D 0.647 +373 M 0.596 +374 E 0.552 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000100121.14_ENST00000448514.3_GN:GGTLC2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000100121.14_ENST00000448514.3_GN:GGTLC2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..319de3e1ad71d0a1dfe559e5d6860217e2d2ff54 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000100121.14_ENST00000448514.3_GN:GGTLC2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,219 @@ +>ENSG00000100121.14|ENST00000448514.3|GN:GGTLC2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.291 +2 T 0.267 +3 S 0.227 +4 E 0.185 +5 F 0.157 +6 F 0.147 +7 A 0.150 +8 A 0.158 +9 Q 0.167 +10 L 0.175 +11 R 0.178 +12 A 0.178 +13 Q 0.187 +14 I 0.203 +15 S 0.207 +16 D 0.198 +17 D 0.189 +18 T 0.184 +19 T 0.179 +20 H 0.169 +21 P 0.155 +22 I 0.143 +23 S 0.136 +24 Y 0.136 +25 Y 0.147 +26 K 0.169 +27 P 0.198 +28 E 0.219 +29 F 0.231 +30 Y 0.239 +31 T 0.246 +32 P 0.252 +33 V 0.255 +34 D 0.256 +35 G 0.253 +36 G 0.247 +37 T 0.242 +38 A 0.234 +39 H 0.219 +40 L 0.199 +41 S 0.181 +42 V 0.169 +43 V 0.160 +44 A 0.150 +45 E 0.147 +46 D 0.164 +47 G 0.199 +48 S 0.234 +49 A 0.254 +50 V 0.264 +51 S 0.271 +52 A 0.276 +53 T 0.283 +54 S 0.293 +55 T 0.298 +56 I 0.284 +57 N 0.252 +58 L 0.223 +59 Y 0.213 +60 F 0.218 +61 G 0.224 +62 S 0.223 +63 K 0.219 +64 V 0.216 +65 R 0.211 +66 S 0.199 +67 P 0.182 +68 V 0.173 +69 S 0.182 +70 E 0.211 +71 I 0.253 +72 L 0.294 +73 F 0.330 +74 N 0.363 +75 D 0.384 +76 E 0.374 +77 M 0.332 +78 D 0.282 +79 D 0.249 +80 F 0.239 +81 S 0.241 +82 S 0.246 +83 P 0.252 +84 N 0.258 +85 I 0.262 +86 T 0.270 +87 N 0.284 +88 E 0.299 +89 F 0.308 +90 G 0.314 +91 V 0.323 +92 P 0.335 +93 P 0.341 +94 S 0.346 +95 P 0.355 +96 A 0.369 +97 N 0.370 +98 F 0.346 +99 I 0.316 +100 Q 0.312 +101 P 0.348 +102 G 0.410 +103 K 0.476 +104 Q 0.524 +105 P 0.541 +106 L 0.538 +107 S 0.525 +108 S 0.493 +109 M 0.439 +110 C 0.383 +111 P 0.346 +112 T 0.322 +113 I 0.290 +114 M 0.248 +115 V 0.211 +116 G 0.195 +117 Q 0.203 +118 D 0.222 +119 G 0.237 +120 Q 0.236 +121 P 0.218 +122 P 0.192 +123 S 0.169 +124 H 0.157 +125 A 0.156 +126 D 0.163 +127 H 0.177 +128 T 0.191 +129 P 0.198 +130 M 0.188 +131 P 0.163 +132 Q 0.139 +133 A 0.126 +134 I 0.116 +135 I 0.101 +136 Y 0.087 +137 N 0.083 +138 L 0.086 +139 W 0.089 +140 F 0.092 +141 G 0.094 +142 Y 0.091 +143 D 0.089 +144 V 0.092 +145 K 0.099 +146 R 0.110 +147 A 0.120 +148 V 0.126 +149 E 0.129 +150 E 0.134 +151 P 0.137 +152 R 0.133 +153 L 0.121 +154 H 0.105 +155 N 0.086 +156 Q 0.069 +157 L 0.059 +158 L 0.055 +159 P 0.058 +160 N 0.065 +161 V 0.071 +162 T 0.072 +163 T 0.067 +164 V 0.064 +165 E 0.071 +166 R 0.089 +167 N 0.112 +168 I 0.125 +169 D 0.120 +170 Q 0.107 +171 A 0.100 +172 V 0.099 +173 T 0.100 +174 A 0.097 +175 A 0.088 +176 L 0.075 +177 E 0.068 +178 T 0.069 +179 R 0.076 +180 H 0.087 +181 H 0.099 +182 H 0.105 +183 T 0.106 +184 Q 0.106 +185 I 0.108 +186 A 0.110 +187 S 0.116 +188 T 0.123 +189 F 0.122 +190 I 0.109 +191 A 0.094 +192 V 0.089 +193 V 0.091 +194 Q 0.089 +195 A 0.078 +196 I 0.062 +197 V 0.052 +198 R 0.055 +199 T 0.070 +200 A 0.090 +201 G 0.107 +202 G 0.118 +203 W 0.129 +204 A 0.141 +205 A 0.147 +206 A 0.141 +207 S 0.130 +208 D 0.126 +209 S 0.138 +210 R 0.168 +211 K 0.217 +212 G 0.283 +213 G 0.357 +214 E 0.418 +215 P 0.443 +216 A 0.427 +217 G 0.389 +218 Y 0.359 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000100121.14_ENST00000448514.3_GN:GGTLC2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000100121.14_ENST00000448514.3_GN:GGTLC2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2b92e103e91a27f6430cc0f321703ac39f13da97 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000100121.14_ENST00000448514.3_GN:GGTLC2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid @@ -0,0 +1,242 @@ +>ENSG00000100121.14|ENST00000448514.3|GN:GGTLC2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:23 +1 M 0.540 +2 A 0.539 +3 G 0.541 +4 G 0.552 +5 G 0.564 +6 R 0.570 +7 G 0.570 +8 G 0.566 +9 S 0.552 +10 C 0.532 +11 N 0.515 +12 R 0.508 +13 P 0.504 +14 A 0.497 +15 L 0.480 +16 G 0.447 +17 S 0.389 +18 R 0.317 +19 Q 0.258 +20 V 0.231 +21 V 0.223 +22 H 0.214 +23 N 0.205 +24 M 0.202 +25 T 0.193 +26 S 0.168 +27 E 0.134 +28 F 0.112 +29 F 0.109 +30 A 0.123 +31 A 0.142 +32 Q 0.160 +33 L 0.175 +34 R 0.180 +35 A 0.178 +36 Q 0.180 +37 I 0.186 +38 S 0.184 +39 D 0.174 +40 D 0.169 +41 T 0.170 +42 T 0.168 +43 H 0.159 +44 P 0.144 +45 I 0.130 +46 S 0.122 +47 Y 0.123 +48 Y 0.136 +49 K 0.161 +50 P 0.190 +51 E 0.214 +52 F 0.231 +53 Y 0.243 +54 T 0.250 +55 P 0.254 +56 V 0.255 +57 D 0.255 +58 G 0.253 +59 G 0.248 +60 T 0.243 +61 A 0.236 +62 H 0.220 +63 L 0.200 +64 S 0.181 +65 V 0.170 +66 V 0.161 +67 A 0.151 +68 E 0.148 +69 D 0.166 +70 G 0.201 +71 S 0.234 +72 A 0.253 +73 V 0.262 +74 S 0.268 +75 A 0.273 +76 T 0.277 +77 S 0.283 +78 T 0.285 +79 I 0.270 +80 N 0.239 +81 L 0.210 +82 Y 0.200 +83 F 0.206 +84 G 0.212 +85 S 0.211 +86 K 0.208 +87 V 0.205 +88 R 0.202 +89 S 0.192 +90 P 0.177 +91 V 0.169 +92 S 0.179 +93 E 0.209 +94 I 0.252 +95 L 0.294 +96 F 0.330 +97 N 0.362 +98 D 0.381 +99 E 0.368 +100 M 0.323 +101 D 0.274 +102 D 0.243 +103 F 0.233 +104 S 0.235 +105 S 0.240 +106 P 0.245 +107 N 0.249 +108 I 0.252 +109 T 0.258 +110 N 0.270 +111 E 0.284 +112 F 0.294 +113 G 0.302 +114 V 0.312 +115 P 0.319 +116 P 0.312 +117 S 0.293 +118 P 0.279 +119 A 0.286 +120 N 0.305 +121 F 0.309 +122 I 0.300 +123 Q 0.302 +124 P 0.330 +125 G 0.375 +126 K 0.432 +127 Q 0.485 +128 P 0.516 +129 L 0.524 +130 S 0.520 +131 S 0.499 +132 M 0.454 +133 C 0.403 +134 P 0.367 +135 T 0.342 +136 I 0.311 +137 M 0.269 +138 V 0.233 +139 G 0.216 +140 Q 0.223 +141 D 0.240 +142 G 0.253 +143 Q 0.250 +144 P 0.230 +145 P 0.201 +146 S 0.177 +147 H 0.164 +148 A 0.161 +149 D 0.167 +150 H 0.180 +151 T 0.196 +152 P 0.204 +153 M 0.194 +154 P 0.169 +155 Q 0.145 +156 A 0.132 +157 I 0.123 +158 I 0.107 +159 Y 0.092 +160 N 0.088 +161 L 0.090 +162 W 0.094 +163 F 0.097 +164 G 0.097 +165 Y 0.093 +166 D 0.091 +167 V 0.094 +168 K 0.101 +169 R 0.112 +170 A 0.123 +171 V 0.129 +172 E 0.132 +173 E 0.138 +174 P 0.142 +175 R 0.137 +176 L 0.126 +177 H 0.109 +178 N 0.090 +179 Q 0.074 +180 L 0.064 +181 L 0.059 +182 P 0.061 +183 N 0.068 +184 V 0.075 +185 T 0.075 +186 T 0.069 +187 V 0.065 +188 E 0.070 +189 R 0.088 +190 N 0.110 +191 I 0.123 +192 D 0.120 +193 Q 0.109 +194 A 0.103 +195 V 0.102 +196 T 0.102 +197 A 0.097 +198 A 0.087 +199 L 0.074 +200 E 0.067 +201 T 0.067 +202 R 0.074 +203 H 0.084 +204 H 0.095 +205 H 0.101 +206 T 0.103 +207 Q 0.104 +208 I 0.107 +209 A 0.111 +210 S 0.118 +211 T 0.127 +212 F 0.126 +213 I 0.113 +214 A 0.099 +215 V 0.093 +216 V 0.095 +217 Q 0.092 +218 A 0.081 +219 I 0.065 +220 V 0.054 +221 R 0.057 +222 T 0.071 +223 A 0.091 +224 G 0.109 +225 G 0.121 +226 W 0.132 +227 A 0.144 +228 A 0.150 +229 A 0.144 +230 S 0.133 +231 D 0.129 +232 S 0.141 +233 R 0.170 +234 K 0.219 +235 G 0.287 +236 G 0.362 +237 E 0.425 +238 P 0.451 +239 A 0.436 +240 G 0.399 +241 Y 0.370 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000101440.11_ENST00000374954.4_GN:ASIP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000101440.11_ENST00000374954.4_GN:ASIP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5c2f1c4c269eb02723c98c727cbcebd78b6c4771 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000101440.11_ENST00000374954.4_GN:ASIP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,133 @@ +>ENSG00000101440.11|ENST00000374954.4|GN:ASIP|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.270 +2 D 0.238 +3 V 0.191 +4 T 0.149 +5 R 0.124 +6 L 0.116 +7 L 0.119 +8 L 0.131 +9 A 0.142 +10 T 0.145 +11 L 0.140 +12 L 0.132 +13 V 0.122 +14 F 0.111 +15 L 0.105 +16 C 0.116 +17 F 0.154 +18 F 0.226 +19 T 0.328 +20 A 0.437 +21 N 0.525 +22 S 0.578 +23 H 0.602 +24 L 0.618 +25 P 0.641 +26 P 0.673 +27 E 0.709 +28 E 0.737 +29 K 0.750 +30 L 0.754 +31 R 0.755 +32 D 0.752 +33 D 0.740 +34 R 0.732 +35 S 0.741 +36 L 0.765 +37 R 0.788 +38 S 0.806 +39 N 0.819 +40 S 0.827 +41 S 0.830 +42 V 0.826 +43 N 0.820 +44 L 0.816 +45 L 0.810 +46 D 0.801 +47 V 0.796 +48 P 0.802 +49 S 0.816 +50 V 0.829 +51 S 0.836 +52 I 0.840 +53 V 0.837 +54 A 0.818 +55 L 0.771 +56 N 0.709 +57 K 0.677 +58 K 0.708 +59 S 0.768 +60 K 0.809 +61 Q 0.823 +62 I 0.823 +63 G 0.817 +64 R 0.813 +65 K 0.812 +66 A 0.811 +67 A 0.805 +68 E 0.798 +69 K 0.794 +70 K 0.793 +71 R 0.794 +72 S 0.797 +73 S 0.801 +74 K 0.803 +75 K 0.802 +76 E 0.802 +77 A 0.802 +78 S 0.797 +79 M 0.789 +80 K 0.782 +81 K 0.775 +82 V 0.762 +83 V 0.740 +84 R 0.716 +85 P 0.701 +86 R 0.692 +87 T 0.685 +88 P 0.671 +89 L 0.635 +90 S 0.569 +91 A 0.477 +92 P 0.382 +93 C 0.308 +94 V 0.265 +95 A 0.236 +96 T 0.200 +97 R 0.160 +98 N 0.128 +99 S 0.106 +100 C 0.093 +101 K 0.093 +102 P 0.104 +103 P 0.121 +104 A 0.135 +105 P 0.136 +106 A 0.124 +107 C 0.112 +108 C 0.107 +109 D 0.108 +110 P 0.105 +111 C 0.099 +112 A 0.097 +113 S 0.098 +114 C 0.095 +115 Q 0.082 +116 C 0.068 +117 R 0.061 +118 F 0.061 +119 F 0.064 +120 R 0.065 +121 S 0.064 +122 A 0.059 +123 C 0.056 +124 S 0.060 +125 C 0.074 +126 R 0.101 +127 V 0.135 +128 L 0.166 +129 S 0.187 +130 L 0.199 +131 N 0.205 +132 C 0.205 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000101440.11_ENST00000374954.4_GN:ASIP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:4.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000101440.11_ENST00000374954.4_GN:ASIP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:4.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..01ba29a5b00f0fe2fc17b37c789ddf8b6be26277 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000101440.11_ENST00000374954.4_GN:ASIP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:4.caid @@ -0,0 +1,137 @@ +>ENSG00000101440.11|ENST00000374954.4|GN:ASIP|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:4 +1 M 0.443 +2 P 0.470 +3 P 0.495 +4 G 0.482 +5 M 0.419 +6 D 0.328 +7 V 0.239 +8 T 0.175 +9 R 0.142 +10 L 0.132 +11 L 0.136 +12 L 0.149 +13 A 0.163 +14 T 0.166 +15 L 0.155 +16 L 0.139 +17 V 0.124 +18 F 0.110 +19 L 0.104 +20 C 0.117 +21 F 0.159 +22 F 0.236 +23 T 0.339 +24 A 0.447 +25 N 0.534 +26 S 0.587 +27 H 0.613 +28 L 0.627 +29 P 0.647 +30 P 0.680 +31 E 0.717 +32 E 0.746 +33 K 0.761 +34 L 0.765 +35 R 0.765 +36 D 0.762 +37 D 0.751 +38 R 0.742 +39 S 0.750 +40 L 0.770 +41 R 0.791 +42 S 0.808 +43 N 0.820 +44 S 0.829 +45 S 0.833 +46 V 0.829 +47 N 0.824 +48 L 0.820 +49 L 0.815 +50 D 0.806 +51 V 0.801 +52 P 0.808 +53 S 0.822 +54 V 0.835 +55 S 0.842 +56 I 0.846 +57 V 0.843 +58 A 0.823 +59 L 0.774 +60 N 0.708 +61 K 0.675 +62 K 0.707 +63 S 0.770 +64 K 0.812 +65 Q 0.827 +66 I 0.827 +67 G 0.822 +68 R 0.817 +69 K 0.816 +70 A 0.815 +71 A 0.809 +72 E 0.801 +73 K 0.796 +74 K 0.794 +75 R 0.795 +76 S 0.797 +77 S 0.801 +78 K 0.803 +79 K 0.804 +80 E 0.804 +81 A 0.803 +82 S 0.798 +83 M 0.790 +84 K 0.782 +85 K 0.776 +86 V 0.763 +87 V 0.741 +88 R 0.718 +89 P 0.703 +90 R 0.694 +91 T 0.687 +92 P 0.673 +93 L 0.638 +94 S 0.571 +95 A 0.479 +96 P 0.382 +97 C 0.308 +98 V 0.265 +99 A 0.237 +100 T 0.202 +101 R 0.162 +102 N 0.129 +103 S 0.107 +104 C 0.094 +105 K 0.094 +106 P 0.105 +107 P 0.123 +108 A 0.137 +109 P 0.138 +110 A 0.126 +111 C 0.113 +112 C 0.109 +113 D 0.110 +114 P 0.106 +115 C 0.100 +116 A 0.097 +117 S 0.098 +118 C 0.095 +119 Q 0.083 +120 C 0.070 +121 R 0.062 +122 F 0.062 +123 F 0.064 +124 R 0.065 +125 S 0.064 +126 A 0.060 +127 C 0.057 +128 S 0.060 +129 C 0.074 +130 R 0.101 +131 V 0.136 +132 L 0.166 +133 S 0.187 +134 L 0.201 +135 N 0.206 +136 C 0.207 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000104974.12_ENST00000251372.8_GN:LILRA1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000104974.12_ENST00000251372.8_GN:LILRA1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..123d2fe1eb3c7284287cb3cdad7e92556b231cba --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000104974.12_ENST00000251372.8_GN:LILRA1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,490 @@ +>ENSG00000104974.12|ENST00000251372.8|GN:LILRA1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.349 +2 T 0.354 +3 P 0.349 +4 I 0.321 +5 V 0.275 +6 T 0.234 +7 V 0.219 +8 L 0.228 +9 I 0.246 +10 C 0.261 +11 L 0.271 +12 R 0.279 +13 L 0.291 +14 S 0.318 +15 L 0.366 +16 G 0.427 +17 P 0.481 +18 R 0.522 +19 T 0.554 +20 H 0.581 +21 V 0.601 +22 Q 0.604 +23 A 0.581 +24 G 0.520 +25 T 0.421 +26 L 0.307 +27 P 0.207 +28 K 0.138 +29 P 0.098 +30 T 0.078 +31 L 0.068 +32 W 0.061 +33 A 0.053 +34 E 0.047 +35 P 0.044 +36 G 0.046 +37 S 0.050 +38 V 0.052 +39 I 0.052 +40 T 0.057 +41 Q 0.067 +42 G 0.079 +43 S 0.081 +44 P 0.069 +45 V 0.053 +46 T 0.040 +47 L 0.033 +48 W 0.031 +49 C 0.036 +50 Q 0.046 +51 G 0.057 +52 I 0.066 +53 L 0.069 +54 E 0.069 +55 T 0.064 +56 Q 0.055 +57 E 0.043 +58 Y 0.034 +59 R 0.032 +60 L 0.034 +61 Y 0.041 +62 R 0.055 +63 E 0.078 +64 K 0.109 +65 K 0.137 +66 T 0.154 +67 A 0.158 +68 P 0.146 +69 W 0.125 +70 I 0.108 +71 T 0.107 +72 R 0.120 +73 I 0.134 +74 P 0.134 +75 Q 0.119 +76 E 0.100 +77 I 0.080 +78 V 0.066 +79 K 0.058 +80 K 0.056 +81 G 0.053 +82 Q 0.047 +83 F 0.041 +84 P 0.039 +85 I 0.040 +86 P 0.043 +87 S 0.047 +88 I 0.051 +89 T 0.053 +90 W 0.053 +91 E 0.054 +92 H 0.058 +93 T 0.064 +94 G 0.063 +95 R 0.052 +96 Y 0.040 +97 R 0.032 +98 C 0.033 +99 F 0.039 +100 Y 0.051 +101 G 0.068 +102 S 0.084 +103 H 0.095 +104 T 0.101 +105 A 0.104 +106 G 0.099 +107 W 0.094 +108 S 0.095 +109 E 0.097 +110 P 0.096 +111 S 0.093 +112 D 0.090 +113 P 0.086 +114 L 0.081 +115 E 0.079 +116 L 0.082 +117 V 0.093 +118 V 0.109 +119 T 0.124 +120 G 0.134 +121 A 0.139 +122 Y 0.135 +123 I 0.122 +124 K 0.104 +125 P 0.089 +126 T 0.079 +127 L 0.073 +128 S 0.069 +129 A 0.064 +130 L 0.059 +131 P 0.058 +132 S 0.061 +133 P 0.064 +134 V 0.068 +135 V 0.074 +136 T 0.081 +137 S 0.087 +138 G 0.090 +139 G 0.086 +140 N 0.073 +141 V 0.059 +142 T 0.046 +143 L 0.037 +144 H 0.032 +145 C 0.033 +146 V 0.038 +147 S 0.045 +148 Q 0.051 +149 V 0.055 +150 A 0.058 +151 F 0.058 +152 G 0.054 +153 S 0.046 +154 F 0.038 +155 I 0.037 +156 L 0.046 +157 C 0.061 +158 K 0.080 +159 E 0.100 +160 G 0.121 +161 E 0.143 +162 D 0.159 +163 E 0.163 +164 H 0.153 +165 P 0.133 +166 Q 0.113 +167 C 0.096 +168 L 0.089 +169 N 0.093 +170 S 0.113 +171 Q 0.138 +172 P 0.154 +173 R 0.150 +174 T 0.133 +175 H 0.111 +176 G 0.089 +177 W 0.070 +178 S 0.055 +179 R 0.044 +180 A 0.037 +181 I 0.032 +182 F 0.031 +183 S 0.031 +184 V 0.033 +185 G 0.039 +186 P 0.052 +187 V 0.070 +188 S 0.087 +189 P 0.098 +190 S 0.105 +191 R 0.107 +192 R 0.097 +193 W 0.076 +194 S 0.054 +195 Y 0.039 +196 R 0.036 +197 C 0.041 +198 Y 0.053 +199 A 0.065 +200 Y 0.075 +201 D 0.081 +202 S 0.085 +203 N 0.088 +204 S 0.087 +205 P 0.086 +206 H 0.086 +207 V 0.086 +208 W 0.088 +209 S 0.094 +210 L 0.100 +211 P 0.100 +212 S 0.100 +213 D 0.101 +214 L 0.099 +215 L 0.093 +216 E 0.087 +217 L 0.086 +218 L 0.095 +219 V 0.111 +220 L 0.126 +221 G 0.136 +222 V 0.140 +223 S 0.138 +224 K 0.128 +225 K 0.110 +226 P 0.093 +227 S 0.079 +228 L 0.068 +229 S 0.061 +230 V 0.054 +231 Q 0.049 +232 P 0.047 +233 G 0.050 +234 P 0.055 +235 I 0.060 +236 V 0.069 +237 A 0.081 +238 P 0.093 +239 G 0.097 +240 E 0.089 +241 S 0.074 +242 L 0.058 +243 T 0.047 +244 L 0.043 +245 Q 0.043 +246 C 0.046 +247 V 0.050 +248 S 0.055 +249 D 0.059 +250 V 0.062 +251 S 0.064 +252 Y 0.060 +253 D 0.050 +254 R 0.038 +255 F 0.031 +256 V 0.031 +257 L 0.036 +258 Y 0.045 +259 K 0.058 +260 E 0.071 +261 G 0.080 +262 E 0.085 +263 R 0.087 +264 D 0.086 +265 F 0.083 +266 L 0.083 +267 Q 0.091 +268 L 0.110 +269 P 0.138 +270 G 0.168 +271 P 0.193 +272 Q 0.207 +273 P 0.201 +274 Q 0.179 +275 A 0.151 +276 G 0.122 +277 L 0.096 +278 S 0.074 +279 Q 0.058 +280 A 0.047 +281 N 0.043 +282 F 0.044 +283 T 0.045 +284 L 0.043 +285 G 0.041 +286 P 0.040 +287 V 0.042 +288 S 0.047 +289 R 0.055 +290 S 0.067 +291 Y 0.082 +292 G 0.096 +293 G 0.099 +294 Q 0.084 +295 Y 0.062 +296 R 0.050 +297 C 0.051 +298 S 0.059 +299 G 0.070 +300 A 0.079 +301 Y 0.087 +302 N 0.092 +303 L 0.094 +304 S 0.098 +305 S 0.101 +306 E 0.103 +307 W 0.106 +308 S 0.114 +309 A 0.121 +310 P 0.124 +311 S 0.126 +312 D 0.131 +313 P 0.128 +314 L 0.116 +315 D 0.104 +316 I 0.101 +317 L 0.113 +318 I 0.138 +319 A 0.166 +320 G 0.184 +321 Q 0.187 +322 F 0.182 +323 R 0.175 +324 G 0.163 +325 R 0.144 +326 P 0.122 +327 F 0.102 +328 I 0.087 +329 S 0.077 +330 V 0.070 +331 H 0.070 +332 P 0.079 +333 G 0.097 +334 P 0.116 +335 T 0.131 +336 V 0.145 +337 A 0.154 +338 S 0.154 +339 G 0.144 +340 E 0.129 +341 N 0.110 +342 V 0.090 +343 T 0.070 +344 L 0.054 +345 L 0.049 +346 C 0.052 +347 Q 0.062 +348 S 0.074 +349 W 0.087 +350 G 0.097 +351 P 0.097 +352 F 0.086 +353 H 0.070 +354 T 0.057 +355 F 0.052 +356 L 0.054 +357 L 0.062 +358 T 0.082 +359 K 0.114 +360 A 0.151 +361 G 0.181 +362 A 0.200 +363 A 0.209 +364 D 0.207 +365 A 0.189 +366 P 0.158 +367 L 0.127 +368 R 0.108 +369 L 0.100 +370 R 0.101 +371 S 0.110 +372 I 0.122 +373 H 0.124 +374 E 0.110 +375 Y 0.087 +376 P 0.068 +377 K 0.060 +378 Y 0.058 +379 Q 0.055 +380 A 0.051 +381 E 0.050 +382 F 0.052 +383 P 0.053 +384 M 0.050 +385 S 0.046 +386 P 0.049 +387 V 0.059 +388 T 0.072 +389 S 0.085 +390 A 0.099 +391 H 0.119 +392 S 0.141 +393 G 0.147 +394 T 0.125 +395 Y 0.092 +396 R 0.072 +397 C 0.070 +398 Y 0.078 +399 G 0.087 +400 S 0.096 +401 L 0.104 +402 S 0.113 +403 S 0.119 +404 N 0.120 +405 P 0.119 +406 Y 0.117 +407 L 0.117 +408 L 0.118 +409 S 0.122 +410 H 0.126 +411 P 0.126 +412 S 0.126 +413 D 0.131 +414 S 0.139 +415 L 0.147 +416 E 0.149 +417 L 0.149 +418 M 0.173 +419 V 0.242 +420 S 0.359 +421 G 0.496 +422 A 0.611 +423 A 0.680 +424 E 0.700 +425 T 0.685 +426 L 0.651 +427 S 0.625 +428 P 0.623 +429 P 0.644 +430 Q 0.670 +431 N 0.683 +432 K 0.674 +433 S 0.637 +434 D 0.583 +435 S 0.553 +436 K 0.565 +437 A 0.578 +438 G 0.557 +439 A 0.534 +440 A 0.532 +441 N 0.531 +442 T 0.526 +443 L 0.541 +444 S 0.561 +445 P 0.557 +446 S 0.548 +447 Q 0.553 +448 N 0.556 +449 K 0.563 +450 T 0.595 +451 A 0.636 +452 S 0.659 +453 H 0.665 +454 P 0.667 +455 Q 0.659 +456 D 0.634 +457 Y 0.595 +458 T 0.555 +459 V 0.523 +460 E 0.507 +461 N 0.501 +462 L 0.500 +463 I 0.506 +464 R 0.525 +465 M 0.546 +466 G 0.551 +467 I 0.534 +468 A 0.492 +469 G 0.428 +470 L 0.361 +471 V 0.313 +472 L 0.281 +473 V 0.256 +474 V 0.240 +475 L 0.232 +476 G 0.219 +477 I 0.202 +478 L 0.186 +479 L 0.179 +480 F 0.184 +481 E 0.201 +482 A 0.221 +483 Q 0.242 +484 H 0.269 +485 S 0.306 +486 Q 0.345 +487 R 0.390 +488 S 0.441 +489 L 0.480 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000104974.12_ENST00000251372.8_GN:LILRA1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000104974.12_ENST00000251372.8_GN:LILRA1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ca46a6c0ac54fb369225642c255b03ec9a490aa8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000104974.12_ENST00000251372.8_GN:LILRA1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid @@ -0,0 +1,507 @@ +>ENSG00000104974.12|ENST00000251372.8|GN:LILRA1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:17 +1 M 0.341 +2 H 0.347 +3 R 0.374 +4 G 0.414 +5 L 0.430 +6 I 0.421 +7 H 0.421 +8 P 0.428 +9 Q 0.408 +10 S 0.385 +11 R 0.420 +12 A 0.511 +13 V 0.596 +14 G 0.644 +15 G 0.670 +16 D 0.672 +17 A 0.636 +18 M 0.583 +19 T 0.540 +20 P 0.498 +21 I 0.428 +22 V 0.344 +23 T 0.286 +24 V 0.262 +25 L 0.254 +26 I 0.252 +27 C 0.262 +28 L 0.280 +29 R 0.296 +30 L 0.311 +31 S 0.335 +32 L 0.374 +33 G 0.425 +34 P 0.480 +35 R 0.526 +36 T 0.563 +37 H 0.589 +38 V 0.606 +39 Q 0.608 +40 A 0.583 +41 G 0.521 +42 T 0.421 +43 L 0.306 +44 P 0.207 +45 K 0.138 +46 P 0.099 +47 T 0.080 +48 L 0.069 +49 W 0.062 +50 A 0.054 +51 E 0.047 +52 P 0.043 +53 G 0.045 +54 S 0.049 +55 V 0.051 +56 I 0.052 +57 T 0.056 +58 Q 0.066 +59 G 0.077 +60 S 0.078 +61 P 0.067 +62 V 0.052 +63 T 0.039 +64 L 0.032 +65 W 0.030 +66 C 0.035 +67 Q 0.045 +68 G 0.056 +69 I 0.064 +70 L 0.067 +71 E 0.066 +72 T 0.061 +73 Q 0.052 +74 E 0.040 +75 Y 0.032 +76 R 0.029 +77 L 0.032 +78 Y 0.039 +79 R 0.052 +80 E 0.075 +81 K 0.104 +82 K 0.131 +83 T 0.149 +84 A 0.154 +85 P 0.144 +86 W 0.123 +87 I 0.106 +88 T 0.104 +89 R 0.118 +90 I 0.132 +91 P 0.132 +92 Q 0.118 +93 E 0.097 +94 I 0.078 +95 V 0.064 +96 K 0.056 +97 K 0.055 +98 G 0.052 +99 Q 0.046 +100 F 0.040 +101 P 0.038 +102 I 0.039 +103 P 0.042 +104 S 0.046 +105 I 0.051 +106 T 0.053 +107 W 0.053 +108 E 0.054 +109 H 0.058 +110 T 0.063 +111 G 0.062 +112 R 0.052 +113 Y 0.040 +114 R 0.033 +115 C 0.033 +116 F 0.039 +117 Y 0.050 +118 G 0.067 +119 S 0.082 +120 H 0.092 +121 T 0.099 +122 A 0.102 +123 G 0.099 +124 W 0.095 +125 S 0.095 +126 E 0.098 +127 P 0.096 +128 S 0.093 +129 D 0.090 +130 P 0.086 +131 L 0.082 +132 E 0.080 +133 L 0.083 +134 V 0.093 +135 V 0.108 +136 T 0.123 +137 G 0.134 +138 A 0.139 +139 Y 0.135 +140 I 0.122 +141 K 0.104 +142 P 0.088 +143 T 0.079 +144 L 0.073 +145 S 0.068 +146 A 0.064 +147 L 0.059 +148 P 0.059 +149 S 0.061 +150 P 0.064 +151 V 0.069 +152 V 0.075 +153 T 0.081 +154 S 0.087 +155 G 0.090 +156 G 0.085 +157 N 0.072 +158 V 0.058 +159 T 0.046 +160 L 0.037 +161 H 0.032 +162 C 0.033 +163 V 0.038 +164 S 0.045 +165 Q 0.051 +166 V 0.055 +167 A 0.057 +168 F 0.057 +169 G 0.053 +170 S 0.045 +171 F 0.037 +172 I 0.036 +173 L 0.044 +174 C 0.060 +175 K 0.078 +176 E 0.099 +177 G 0.120 +178 E 0.142 +179 D 0.157 +180 E 0.160 +181 H 0.150 +182 P 0.130 +183 Q 0.110 +184 C 0.095 +185 L 0.087 +186 N 0.092 +187 S 0.112 +188 Q 0.137 +189 P 0.152 +190 R 0.147 +191 T 0.129 +192 H 0.107 +193 G 0.086 +194 W 0.068 +195 S 0.054 +196 R 0.043 +197 A 0.036 +198 I 0.032 +199 F 0.030 +200 S 0.031 +201 V 0.032 +202 G 0.038 +203 P 0.051 +204 V 0.069 +205 S 0.085 +206 P 0.096 +207 S 0.103 +208 R 0.103 +209 R 0.093 +210 W 0.073 +211 S 0.052 +212 Y 0.038 +213 R 0.034 +214 C 0.040 +215 Y 0.051 +216 A 0.063 +217 Y 0.072 +218 D 0.077 +219 S 0.082 +220 N 0.084 +221 S 0.084 +222 P 0.082 +223 H 0.082 +224 V 0.082 +225 W 0.085 +226 S 0.091 +227 L 0.096 +228 P 0.097 +229 S 0.097 +230 D 0.098 +231 L 0.097 +232 L 0.092 +233 E 0.086 +234 L 0.086 +235 L 0.096 +236 V 0.113 +237 L 0.128 +238 G 0.139 +239 V 0.143 +240 S 0.141 +241 K 0.129 +242 K 0.111 +243 P 0.093 +244 S 0.079 +245 L 0.069 +246 S 0.061 +247 V 0.055 +248 Q 0.050 +249 P 0.048 +250 G 0.051 +251 P 0.056 +252 I 0.062 +253 V 0.070 +254 A 0.082 +255 P 0.095 +256 G 0.099 +257 E 0.091 +258 S 0.075 +259 L 0.059 +260 T 0.048 +261 L 0.044 +262 Q 0.044 +263 C 0.046 +264 V 0.051 +265 S 0.056 +266 D 0.060 +267 V 0.063 +268 S 0.065 +269 Y 0.061 +270 D 0.051 +271 R 0.039 +272 F 0.032 +273 V 0.031 +274 L 0.037 +275 Y 0.047 +276 K 0.060 +277 E 0.072 +278 G 0.082 +279 E 0.087 +280 R 0.090 +281 D 0.089 +282 F 0.087 +283 L 0.086 +284 Q 0.094 +285 L 0.113 +286 P 0.141 +287 G 0.171 +288 P 0.197 +289 Q 0.210 +290 P 0.204 +291 Q 0.182 +292 A 0.152 +293 G 0.123 +294 L 0.097 +295 S 0.075 +296 Q 0.058 +297 A 0.047 +298 N 0.043 +299 F 0.044 +300 T 0.046 +301 L 0.045 +302 G 0.043 +303 P 0.042 +304 V 0.044 +305 S 0.049 +306 R 0.058 +307 S 0.070 +308 Y 0.085 +309 G 0.099 +310 G 0.102 +311 Q 0.086 +312 Y 0.063 +313 R 0.051 +314 C 0.052 +315 S 0.061 +316 G 0.072 +317 A 0.082 +318 Y 0.090 +319 N 0.094 +320 L 0.097 +321 S 0.100 +322 S 0.103 +323 E 0.106 +324 W 0.108 +325 S 0.116 +326 A 0.124 +327 P 0.127 +328 S 0.129 +329 D 0.134 +330 P 0.131 +331 L 0.119 +332 D 0.107 +333 I 0.104 +334 L 0.115 +335 I 0.139 +336 A 0.166 +337 G 0.182 +338 Q 0.184 +339 F 0.181 +340 R 0.175 +341 G 0.163 +342 R 0.145 +343 P 0.122 +344 F 0.102 +345 I 0.087 +346 S 0.077 +347 V 0.070 +348 H 0.069 +349 P 0.078 +350 G 0.095 +351 P 0.114 +352 T 0.130 +353 V 0.145 +354 A 0.155 +355 S 0.155 +356 G 0.146 +357 E 0.130 +358 N 0.111 +359 V 0.091 +360 T 0.070 +361 L 0.055 +362 L 0.049 +363 C 0.053 +364 Q 0.062 +365 S 0.075 +366 W 0.087 +367 G 0.096 +368 P 0.096 +369 F 0.085 +370 H 0.069 +371 T 0.056 +372 F 0.052 +373 L 0.054 +374 L 0.063 +375 T 0.082 +376 K 0.114 +377 A 0.150 +378 G 0.179 +379 A 0.197 +380 A 0.205 +381 D 0.203 +382 A 0.186 +383 P 0.155 +384 L 0.125 +385 R 0.107 +386 L 0.100 +387 R 0.101 +388 S 0.110 +389 I 0.122 +390 H 0.124 +391 E 0.110 +392 Y 0.086 +393 P 0.068 +394 K 0.060 +395 Y 0.058 +396 Q 0.055 +397 A 0.051 +398 E 0.050 +399 F 0.052 +400 P 0.053 +401 M 0.050 +402 S 0.046 +403 P 0.049 +404 V 0.059 +405 T 0.073 +406 S 0.085 +407 A 0.099 +408 H 0.119 +409 S 0.142 +410 G 0.148 +411 T 0.126 +412 Y 0.093 +413 R 0.073 +414 C 0.071 +415 Y 0.078 +416 G 0.087 +417 S 0.095 +418 L 0.104 +419 S 0.112 +420 S 0.119 +421 N 0.121 +422 P 0.120 +423 Y 0.119 +424 L 0.118 +425 L 0.119 +426 S 0.122 +427 H 0.126 +428 P 0.126 +429 S 0.126 +430 D 0.132 +431 S 0.141 +432 L 0.149 +433 E 0.151 +434 L 0.152 +435 M 0.175 +436 V 0.244 +437 S 0.359 +438 G 0.495 +439 A 0.610 +440 A 0.678 +441 E 0.699 +442 T 0.683 +443 L 0.649 +444 S 0.620 +445 P 0.617 +446 P 0.637 +447 Q 0.663 +448 N 0.676 +449 K 0.668 +450 S 0.632 +451 D 0.579 +452 S 0.547 +453 K 0.555 +454 A 0.564 +455 G 0.541 +456 A 0.520 +457 A 0.524 +458 N 0.526 +459 T 0.522 +460 L 0.538 +461 S 0.558 +462 P 0.556 +463 S 0.554 +464 Q 0.575 +465 N 0.601 +466 K 0.619 +467 T 0.640 +468 A 0.660 +469 S 0.668 +470 H 0.670 +471 P 0.673 +472 Q 0.668 +473 D 0.648 +474 Y 0.614 +475 T 0.576 +476 V 0.545 +477 E 0.527 +478 N 0.519 +479 L 0.515 +480 I 0.517 +481 R 0.532 +482 M 0.550 +483 G 0.553 +484 I 0.535 +485 A 0.495 +486 G 0.431 +487 L 0.363 +488 V 0.313 +489 L 0.280 +490 V 0.256 +491 V 0.242 +492 L 0.235 +493 G 0.226 +494 I 0.214 +495 L 0.204 +496 L 0.204 +497 F 0.217 +498 E 0.241 +499 A 0.264 +500 Q 0.285 +501 H 0.310 +502 S 0.340 +503 Q 0.374 +504 R 0.417 +505 S 0.467 +506 L 0.504 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000105668.8_ENST00000222275.3_GN:UPK1A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000105668.8_ENST00000222275.3_GN:UPK1A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5e4fbf8648618ed16d069cd06cc32a116711dad6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000105668.8_ENST00000222275.3_GN:UPK1A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,259 @@ +>ENSG00000105668.8|ENST00000222275.3|GN:UPK1A|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.330 +2 A 0.336 +3 S 0.351 +4 A 0.374 +5 A 0.398 +6 A 0.418 +7 A 0.430 +8 E 0.428 +9 A 0.405 +10 E 0.361 +11 K 0.306 +12 G 0.244 +13 S 0.178 +14 P 0.119 +15 V 0.079 +16 V 0.060 +17 V 0.050 +18 G 0.042 +19 L 0.034 +20 L 0.030 +21 V 0.030 +22 V 0.033 +23 G 0.039 +24 N 0.040 +25 I 0.035 +26 I 0.029 +27 I 0.024 +28 L 0.022 +29 L 0.024 +30 S 0.028 +31 G 0.032 +32 L 0.033 +33 S 0.033 +34 L 0.033 +35 F 0.033 +36 A 0.034 +37 E 0.036 +38 T 0.035 +39 I 0.032 +40 W 0.033 +41 V 0.038 +42 T 0.045 +43 A 0.055 +44 D 0.068 +45 Q 0.084 +46 Y 0.106 +47 R 0.135 +48 V 0.166 +49 Y 0.200 +50 P 0.235 +51 L 0.270 +52 M 0.304 +53 G 0.334 +54 V 0.350 +55 S 0.348 +56 G 0.330 +57 K 0.303 +58 D 0.272 +59 D 0.239 +60 V 0.206 +61 F 0.173 +62 A 0.140 +63 G 0.108 +64 A 0.080 +65 W 0.063 +66 I 0.055 +67 A 0.049 +68 I 0.044 +69 F 0.042 +70 C 0.043 +71 G 0.043 +72 F 0.039 +73 S 0.032 +74 F 0.026 +75 F 0.024 +76 M 0.026 +77 V 0.032 +78 A 0.034 +79 S 0.034 +80 F 0.033 +81 G 0.038 +82 V 0.046 +83 G 0.055 +84 A 0.062 +85 A 0.064 +86 L 0.061 +87 C 0.057 +88 R 0.054 +89 R 0.049 +90 R 0.042 +91 S 0.037 +92 M 0.035 +93 V 0.034 +94 L 0.032 +95 T 0.033 +96 Y 0.043 +97 L 0.056 +98 V 0.063 +99 L 0.058 +100 M 0.044 +101 L 0.032 +102 I 0.028 +103 V 0.033 +104 Y 0.044 +105 I 0.051 +106 F 0.047 +107 E 0.036 +108 C 0.027 +109 A 0.021 +110 S 0.020 +111 C 0.020 +112 I 0.022 +113 T 0.028 +114 S 0.033 +115 Y 0.035 +116 T 0.035 +117 H 0.036 +118 R 0.039 +119 D 0.043 +120 Y 0.048 +121 M 0.060 +122 V 0.080 +123 S 0.100 +124 N 0.111 +125 P 0.106 +126 S 0.089 +127 L 0.073 +128 I 0.070 +129 T 0.072 +130 K 0.069 +131 Q 0.057 +132 M 0.047 +133 L 0.048 +134 T 0.057 +135 F 0.070 +136 Y 0.084 +137 S 0.100 +138 A 0.114 +139 D 0.122 +140 T 0.122 +141 D 0.115 +142 Q 0.106 +143 G 0.094 +144 Q 0.082 +145 E 0.071 +146 L 0.062 +147 T 0.055 +148 R 0.050 +149 L 0.046 +150 W 0.042 +151 D 0.036 +152 R 0.031 +153 V 0.028 +154 M 0.029 +155 I 0.032 +156 E 0.035 +157 Q 0.034 +158 E 0.029 +159 C 0.025 +160 C 0.028 +161 G 0.043 +162 T 0.068 +163 S 0.094 +164 G 0.111 +165 P 0.115 +166 M 0.109 +167 D 0.097 +168 W 0.084 +169 V 0.077 +170 N 0.081 +171 F 0.091 +172 T 0.101 +173 S 0.110 +174 A 0.118 +175 F 0.121 +176 R 0.125 +177 A 0.133 +178 A 0.141 +179 T 0.145 +180 P 0.143 +181 E 0.137 +182 V 0.130 +183 V 0.122 +184 F 0.119 +185 P 0.121 +186 W 0.118 +187 P 0.106 +188 P 0.091 +189 L 0.081 +190 C 0.077 +191 C 0.081 +192 R 0.097 +193 R 0.124 +194 T 0.156 +195 G 0.182 +196 N 0.199 +197 F 0.212 +198 I 0.227 +199 P 0.236 +200 L 0.229 +201 N 0.203 +202 E 0.175 +203 E 0.159 +204 G 0.147 +205 C 0.129 +206 R 0.109 +207 L 0.101 +208 G 0.103 +209 H 0.109 +210 M 0.112 +211 D 0.115 +212 Y 0.115 +213 L 0.112 +214 F 0.105 +215 T 0.098 +216 K 0.093 +217 G 0.087 +218 C 0.077 +219 F 0.068 +220 E 0.067 +221 H 0.075 +222 I 0.086 +223 G 0.099 +224 H 0.109 +225 A 0.110 +226 I 0.100 +227 D 0.087 +228 S 0.078 +229 Y 0.074 +230 T 0.068 +231 W 0.061 +232 G 0.060 +233 I 0.062 +234 S 0.062 +235 W 0.062 +236 F 0.066 +237 G 0.069 +238 F 0.067 +239 A 0.063 +240 I 0.058 +241 L 0.050 +242 M 0.040 +243 W 0.033 +244 T 0.030 +245 L 0.028 +246 P 0.030 +247 V 0.038 +248 M 0.049 +249 L 0.054 +250 I 0.045 +251 A 0.032 +252 M 0.023 +253 Y 0.023 +254 F 0.028 +255 Y 0.038 +256 T 0.054 +257 M 0.078 +258 L 0.098 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000105668.8_ENST00000222275.3_GN:UPK1A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000105668.8_ENST00000222275.3_GN:UPK1A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..bb9eb7da29a0e4ffb0a01047859b03faf3a38839 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000105668.8_ENST00000222275.3_GN:UPK1A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid @@ -0,0 +1,260 @@ +>ENSG00000105668.8|ENST00000222275.3|GN:UPK1A|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:1 +1 M 0.318 +2 M 0.319 +3 A 0.327 +4 S 0.343 +5 A 0.362 +6 A 0.384 +7 A 0.410 +8 A 0.433 +9 E 0.433 +10 A 0.404 +11 E 0.357 +12 K 0.301 +13 G 0.239 +14 S 0.173 +15 P 0.116 +16 V 0.078 +17 V 0.060 +18 V 0.051 +19 G 0.042 +20 L 0.034 +21 L 0.030 +22 V 0.030 +23 V 0.033 +24 G 0.039 +25 N 0.040 +26 I 0.036 +27 I 0.029 +28 I 0.024 +29 L 0.022 +30 L 0.024 +31 S 0.028 +32 G 0.032 +33 L 0.033 +34 S 0.033 +35 L 0.033 +36 F 0.033 +37 A 0.034 +38 E 0.036 +39 T 0.035 +40 I 0.032 +41 W 0.033 +42 V 0.038 +43 T 0.046 +44 A 0.056 +45 D 0.069 +46 Q 0.085 +47 Y 0.108 +48 R 0.136 +49 V 0.168 +50 Y 0.202 +51 P 0.238 +52 L 0.272 +53 M 0.306 +54 G 0.336 +55 V 0.352 +56 S 0.348 +57 G 0.330 +58 K 0.303 +59 D 0.272 +60 D 0.239 +61 V 0.206 +62 F 0.172 +63 A 0.139 +64 G 0.107 +65 A 0.080 +66 W 0.063 +67 I 0.054 +68 A 0.049 +69 I 0.044 +70 F 0.042 +71 C 0.043 +72 G 0.043 +73 F 0.039 +74 S 0.032 +75 F 0.026 +76 F 0.024 +77 M 0.026 +78 V 0.032 +79 A 0.035 +80 S 0.034 +81 F 0.033 +82 G 0.037 +83 V 0.046 +84 G 0.055 +85 A 0.062 +86 A 0.064 +87 L 0.061 +88 C 0.057 +89 R 0.054 +90 R 0.049 +91 R 0.042 +92 S 0.037 +93 M 0.035 +94 V 0.034 +95 L 0.032 +96 T 0.034 +97 Y 0.043 +98 L 0.056 +99 V 0.064 +100 L 0.058 +101 M 0.044 +102 L 0.032 +103 I 0.028 +104 V 0.034 +105 Y 0.045 +106 I 0.051 +107 F 0.047 +108 E 0.036 +109 C 0.027 +110 A 0.021 +111 S 0.020 +112 C 0.020 +113 I 0.022 +114 T 0.028 +115 S 0.033 +116 Y 0.036 +117 T 0.035 +118 H 0.036 +119 R 0.039 +120 D 0.043 +121 Y 0.049 +122 M 0.061 +123 V 0.080 +124 S 0.101 +125 N 0.112 +126 P 0.107 +127 S 0.089 +128 L 0.074 +129 I 0.070 +130 T 0.073 +131 K 0.069 +132 Q 0.057 +133 M 0.047 +134 L 0.048 +135 T 0.058 +136 F 0.070 +137 Y 0.084 +138 S 0.100 +139 A 0.114 +140 D 0.122 +141 T 0.122 +142 D 0.116 +143 Q 0.106 +144 G 0.094 +145 Q 0.082 +146 E 0.071 +147 L 0.062 +148 T 0.055 +149 R 0.050 +150 L 0.047 +151 W 0.042 +152 D 0.036 +153 R 0.031 +154 V 0.028 +155 M 0.029 +156 I 0.032 +157 E 0.035 +158 Q 0.034 +159 E 0.029 +160 C 0.025 +161 C 0.028 +162 G 0.043 +163 T 0.068 +164 S 0.094 +165 G 0.111 +166 P 0.115 +167 M 0.109 +168 D 0.097 +169 W 0.084 +170 V 0.077 +171 N 0.081 +172 F 0.091 +173 T 0.101 +174 S 0.111 +175 A 0.118 +176 F 0.122 +177 R 0.126 +178 A 0.134 +179 A 0.142 +180 T 0.146 +181 P 0.144 +182 E 0.138 +183 V 0.130 +184 V 0.123 +185 F 0.120 +186 P 0.121 +187 W 0.118 +188 P 0.106 +189 P 0.091 +190 L 0.081 +191 C 0.077 +192 C 0.081 +193 R 0.097 +194 R 0.124 +195 T 0.156 +196 G 0.181 +197 N 0.198 +198 F 0.212 +199 I 0.227 +200 P 0.236 +201 L 0.229 +202 N 0.203 +203 E 0.176 +204 E 0.159 +205 G 0.148 +206 C 0.129 +207 R 0.109 +208 L 0.101 +209 G 0.104 +210 H 0.109 +211 M 0.113 +212 D 0.115 +213 Y 0.116 +214 L 0.113 +215 F 0.106 +216 T 0.098 +217 K 0.093 +218 G 0.087 +219 C 0.077 +220 F 0.068 +221 E 0.067 +222 H 0.075 +223 I 0.087 +224 G 0.099 +225 H 0.109 +226 A 0.110 +227 I 0.100 +228 D 0.087 +229 S 0.078 +230 Y 0.074 +231 T 0.068 +232 W 0.061 +233 G 0.060 +234 I 0.062 +235 S 0.062 +236 W 0.062 +237 F 0.066 +238 G 0.070 +239 F 0.068 +240 A 0.063 +241 I 0.058 +242 L 0.050 +243 M 0.040 +244 W 0.034 +245 T 0.030 +246 L 0.029 +247 P 0.030 +248 V 0.038 +249 M 0.049 +250 L 0.054 +251 I 0.045 +252 A 0.032 +253 M 0.023 +254 Y 0.023 +255 F 0.029 +256 Y 0.038 +257 T 0.054 +258 M 0.078 +259 L 0.098 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000106392.12_ENST00000436587.7_GN:C1GALT1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000106392.12_ENST00000436587.7_GN:C1GALT1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..64c8846320ba0819cb618f7cd4b77ae0148d8c03 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000106392.12_ENST00000436587.7_GN:C1GALT1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,364 @@ +>ENSG00000106392.12|ENST00000436587.7|GN:C1GALT1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.373 +2 A 0.368 +3 S 0.356 +4 K 0.335 +5 S 0.305 +6 W 0.266 +7 L 0.232 +8 N 0.214 +9 F 0.205 +10 L 0.202 +11 T 0.209 +12 F 0.229 +13 L 0.261 +14 C 0.300 +15 G 0.334 +16 S 0.349 +17 A 0.348 +18 I 0.343 +19 G 0.328 +20 F 0.294 +21 L 0.255 +22 L 0.229 +23 C 0.220 +24 S 0.217 +25 Q 0.213 +26 L 0.217 +27 F 0.238 +28 S 0.267 +29 I 0.295 +30 L 0.329 +31 L 0.375 +32 G 0.426 +33 E 0.467 +34 K 0.489 +35 V 0.493 +36 D 0.488 +37 T 0.485 +38 Q 0.492 +39 P 0.501 +40 N 0.500 +41 V 0.484 +42 L 0.462 +43 H 0.452 +44 N 0.458 +45 D 0.466 +46 P 0.474 +47 H 0.503 +48 A 0.558 +49 R 0.611 +50 H 0.645 +51 S 0.669 +52 D 0.696 +53 D 0.715 +54 N 0.715 +55 G 0.699 +56 Q 0.675 +57 N 0.639 +58 H 0.582 +59 L 0.523 +60 E 0.506 +61 G 0.536 +62 Q 0.572 +63 M 0.585 +64 N 0.592 +65 F 0.610 +66 N 0.631 +67 A 0.640 +68 D 0.634 +69 S 0.618 +70 S 0.598 +71 Q 0.567 +72 H 0.518 +73 K 0.452 +74 D 0.389 +75 E 0.343 +76 N 0.311 +77 T 0.281 +78 D 0.253 +79 I 0.226 +80 A 0.200 +81 E 0.179 +82 N 0.160 +83 L 0.140 +84 Y 0.117 +85 Q 0.098 +86 K 0.083 +87 V 0.069 +88 R 0.051 +89 I 0.035 +90 L 0.024 +91 C 0.020 +92 W 0.021 +93 V 0.028 +94 M 0.038 +95 T 0.050 +96 G 0.056 +97 P 0.056 +98 Q 0.052 +99 N 0.045 +100 L 0.041 +101 E 0.041 +102 K 0.044 +103 K 0.046 +104 A 0.046 +105 K 0.048 +106 H 0.051 +107 V 0.049 +108 K 0.041 +109 A 0.033 +110 T 0.028 +111 W 0.029 +112 A 0.032 +113 Q 0.038 +114 R 0.044 +115 C 0.046 +116 N 0.041 +117 K 0.032 +118 V 0.025 +119 L 0.024 +120 F 0.029 +121 M 0.040 +122 S 0.054 +123 S 0.068 +124 E 0.079 +125 E 0.084 +126 N 0.081 +127 K 0.074 +128 D 0.069 +129 F 0.071 +130 P 0.076 +131 A 0.082 +132 V 0.088 +133 G 0.097 +134 L 0.109 +135 K 0.125 +136 T 0.139 +137 K 0.145 +138 E 0.144 +139 G 0.141 +140 R 0.136 +141 D 0.123 +142 Q 0.105 +143 L 0.088 +144 Y 0.078 +145 W 0.070 +146 K 0.061 +147 T 0.054 +148 I 0.048 +149 K 0.043 +150 A 0.037 +151 F 0.031 +152 Q 0.028 +153 Y 0.027 +154 V 0.026 +155 H 0.026 +156 E 0.027 +157 H 0.028 +158 Y 0.029 +159 L 0.032 +160 E 0.037 +161 D 0.041 +162 A 0.043 +163 D 0.039 +164 W 0.033 +165 F 0.028 +166 L 0.029 +167 K 0.036 +168 A 0.046 +169 D 0.057 +170 D 0.068 +171 D 0.076 +172 T 0.080 +173 Y 0.077 +174 V 0.068 +175 I 0.056 +176 L 0.046 +177 D 0.043 +178 N 0.043 +179 L 0.045 +180 R 0.044 +181 W 0.042 +182 L 0.040 +183 L 0.039 +184 S 0.039 +185 K 0.043 +186 Y 0.050 +187 D 0.056 +188 P 0.059 +189 E 0.063 +190 E 0.069 +191 P 0.075 +192 I 0.080 +193 Y 0.082 +194 F 0.080 +195 G 0.079 +196 R 0.080 +197 R 0.079 +198 F 0.071 +199 K 0.062 +200 P 0.062 +201 Y 0.075 +202 V 0.094 +203 K 0.115 +204 Q 0.133 +205 G 0.150 +206 Y 0.165 +207 M 0.176 +208 S 0.186 +209 G 0.200 +210 G 0.212 +211 A 0.203 +212 G 0.167 +213 Y 0.126 +214 V 0.103 +215 L 0.092 +216 S 0.082 +217 K 0.072 +218 E 0.065 +219 A 0.062 +220 L 0.058 +221 K 0.053 +222 R 0.050 +223 F 0.052 +224 V 0.056 +225 D 0.061 +226 A 0.067 +227 F 0.074 +228 K 0.082 +229 T 0.090 +230 D 0.095 +231 K 0.095 +232 C 0.094 +233 T 0.094 +234 H 0.093 +235 S 0.087 +236 S 0.079 +237 S 0.074 +238 I 0.075 +239 E 0.079 +240 D 0.083 +241 L 0.088 +242 A 0.092 +243 L 0.091 +244 G 0.085 +245 R 0.081 +246 C 0.079 +247 M 0.080 +248 E 0.084 +249 I 0.092 +250 M 0.104 +251 N 0.122 +252 V 0.139 +253 E 0.149 +254 A 0.153 +255 G 0.162 +256 D 0.173 +257 S 0.177 +258 R 0.170 +259 D 0.162 +260 T 0.166 +261 I 0.179 +262 G 0.186 +263 K 0.178 +264 E 0.161 +265 T 0.144 +266 F 0.135 +267 H 0.135 +268 P 0.135 +269 F 0.130 +270 V 0.120 +271 P 0.110 +272 E 0.101 +273 H 0.096 +274 H 0.094 +275 L 0.099 +276 I 0.110 +277 K 0.127 +278 G 0.140 +279 Y 0.142 +280 L 0.136 +281 P 0.129 +282 R 0.124 +283 T 0.123 +284 F 0.123 +285 W 0.123 +286 Y 0.123 +287 W 0.119 +288 N 0.110 +289 Y 0.104 +290 N 0.111 +291 Y 0.136 +292 Y 0.174 +293 P 0.212 +294 P 0.232 +295 V 0.231 +296 E 0.226 +297 G 0.234 +298 P 0.247 +299 G 0.248 +300 C 0.236 +301 C 0.224 +302 S 0.219 +303 D 0.219 +304 L 0.222 +305 A 0.221 +306 V 0.212 +307 S 0.199 +308 F 0.190 +309 H 0.189 +310 Y 0.194 +311 V 0.199 +312 D 0.192 +313 S 0.171 +314 T 0.147 +315 T 0.132 +316 M 0.128 +317 Y 0.132 +318 E 0.136 +319 L 0.134 +320 E 0.128 +321 Y 0.124 +322 L 0.125 +323 V 0.130 +324 Y 0.135 +325 H 0.144 +326 L 0.159 +327 R 0.178 +328 P 0.192 +329 Y 0.197 +330 G 0.196 +331 Y 0.197 +332 L 0.203 +333 Y 0.220 +334 R 0.248 +335 Y 0.278 +336 Q 0.298 +337 P 0.299 +338 T 0.281 +339 L 0.250 +340 P 0.212 +341 E 0.174 +342 R 0.145 +343 I 0.129 +344 L 0.123 +345 K 0.126 +346 E 0.133 +347 I 0.144 +348 S 0.163 +349 Q 0.198 +350 A 0.243 +351 N 0.281 +352 K 0.301 +353 N 0.316 +354 E 0.346 +355 D 0.391 +356 T 0.438 +357 K 0.478 +358 V 0.504 +359 K 0.517 +360 L 0.512 +361 G 0.485 +362 N 0.443 +363 P 0.410 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000106392.12_ENST00000436587.7_GN:C1GALT1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:8.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000106392.12_ENST00000436587.7_GN:C1GALT1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:8.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1e600a700a73985847a6278284a50d4d1e746519 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000106392.12_ENST00000436587.7_GN:C1GALT1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:8.caid @@ -0,0 +1,372 @@ +>ENSG00000106392.12|ENST00000436587.7|GN:C1GALT1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:8 +1 M 0.337 +2 S 0.342 +3 E 0.344 +4 I 0.335 +5 H 0.311 +6 F 0.285 +7 R 0.278 +8 E 0.302 +9 M 0.340 +10 A 0.363 +11 S 0.354 +12 K 0.324 +13 S 0.289 +14 W 0.259 +15 L 0.240 +16 N 0.229 +17 F 0.218 +18 L 0.207 +19 T 0.206 +20 F 0.219 +21 L 0.250 +22 C 0.291 +23 G 0.327 +24 S 0.344 +25 A 0.347 +26 I 0.349 +27 G 0.338 +28 F 0.306 +29 L 0.267 +30 L 0.241 +31 C 0.233 +32 S 0.229 +33 Q 0.224 +34 L 0.229 +35 F 0.252 +36 S 0.283 +37 I 0.310 +38 L 0.340 +39 L 0.382 +40 G 0.432 +41 E 0.475 +42 K 0.502 +43 V 0.512 +44 D 0.509 +45 T 0.508 +46 Q 0.515 +47 P 0.525 +48 N 0.524 +49 V 0.506 +50 L 0.483 +51 H 0.472 +52 N 0.480 +53 D 0.492 +54 P 0.501 +55 H 0.528 +56 A 0.580 +57 R 0.630 +58 H 0.660 +59 S 0.683 +60 D 0.707 +61 D 0.724 +62 N 0.723 +63 G 0.707 +64 Q 0.684 +65 N 0.648 +66 H 0.592 +67 L 0.533 +68 E 0.514 +69 G 0.543 +70 Q 0.578 +71 M 0.590 +72 N 0.596 +73 F 0.613 +74 N 0.634 +75 A 0.643 +76 D 0.636 +77 S 0.619 +78 S 0.597 +79 Q 0.565 +80 H 0.515 +81 K 0.449 +82 D 0.385 +83 E 0.339 +84 N 0.308 +85 T 0.279 +86 D 0.252 +87 I 0.225 +88 A 0.199 +89 E 0.177 +90 N 0.158 +91 L 0.138 +92 Y 0.116 +93 Q 0.097 +94 K 0.083 +95 V 0.069 +96 R 0.052 +97 I 0.035 +98 L 0.024 +99 C 0.020 +100 W 0.021 +101 V 0.028 +102 M 0.039 +103 T 0.050 +104 G 0.056 +105 P 0.056 +106 Q 0.052 +107 N 0.046 +108 L 0.041 +109 E 0.041 +110 K 0.044 +111 K 0.046 +112 A 0.046 +113 K 0.048 +114 H 0.051 +115 V 0.049 +116 K 0.041 +117 A 0.033 +118 T 0.029 +119 W 0.029 +120 A 0.033 +121 Q 0.038 +122 R 0.045 +123 C 0.047 +124 N 0.042 +125 K 0.033 +126 V 0.026 +127 L 0.025 +128 F 0.030 +129 M 0.040 +130 S 0.055 +131 S 0.069 +132 E 0.081 +133 E 0.086 +134 N 0.083 +135 K 0.076 +136 D 0.071 +137 F 0.072 +138 P 0.078 +139 A 0.083 +140 V 0.089 +141 G 0.098 +142 L 0.111 +143 K 0.126 +144 T 0.141 +145 K 0.147 +146 E 0.146 +147 G 0.143 +148 R 0.137 +149 D 0.124 +150 Q 0.106 +151 L 0.089 +152 Y 0.078 +153 W 0.070 +154 K 0.062 +155 T 0.054 +156 I 0.048 +157 K 0.043 +158 A 0.037 +159 F 0.031 +160 Q 0.028 +161 Y 0.027 +162 V 0.026 +163 H 0.026 +164 E 0.026 +165 H 0.028 +166 Y 0.029 +167 L 0.032 +168 E 0.037 +169 D 0.042 +170 A 0.043 +171 D 0.039 +172 W 0.033 +173 F 0.028 +174 L 0.029 +175 K 0.036 +176 A 0.046 +177 D 0.057 +178 D 0.068 +179 D 0.076 +180 T 0.079 +181 Y 0.076 +182 V 0.067 +183 I 0.055 +184 L 0.046 +185 D 0.043 +186 N 0.044 +187 L 0.045 +188 R 0.044 +189 W 0.042 +190 L 0.041 +191 L 0.039 +192 S 0.039 +193 K 0.043 +194 Y 0.049 +195 D 0.054 +196 P 0.057 +197 E 0.062 +198 E 0.068 +199 P 0.074 +200 I 0.080 +201 Y 0.082 +202 F 0.081 +203 G 0.079 +204 R 0.080 +205 R 0.079 +206 F 0.071 +207 K 0.062 +208 P 0.061 +209 Y 0.073 +210 V 0.092 +211 K 0.113 +212 Q 0.131 +213 G 0.148 +214 Y 0.163 +215 M 0.175 +216 S 0.185 +217 G 0.199 +218 G 0.211 +219 A 0.202 +220 G 0.166 +221 Y 0.126 +222 V 0.103 +223 L 0.092 +224 S 0.082 +225 K 0.072 +226 E 0.064 +227 A 0.061 +228 L 0.057 +229 K 0.052 +230 R 0.049 +231 F 0.051 +232 V 0.055 +233 D 0.060 +234 A 0.066 +235 F 0.073 +236 K 0.081 +237 T 0.089 +238 D 0.094 +239 K 0.094 +240 C 0.093 +241 T 0.093 +242 H 0.092 +243 S 0.086 +244 S 0.078 +245 S 0.073 +246 I 0.075 +247 E 0.079 +248 D 0.083 +249 L 0.088 +250 A 0.092 +251 L 0.090 +252 G 0.085 +253 R 0.081 +254 C 0.079 +255 M 0.080 +256 E 0.084 +257 I 0.091 +258 M 0.104 +259 N 0.122 +260 V 0.140 +261 E 0.150 +262 A 0.154 +263 G 0.163 +264 D 0.174 +265 S 0.178 +266 R 0.171 +267 D 0.164 +268 T 0.168 +269 I 0.181 +270 G 0.188 +271 K 0.180 +272 E 0.163 +273 T 0.146 +274 F 0.137 +275 H 0.136 +276 P 0.136 +277 F 0.130 +278 V 0.120 +279 P 0.109 +280 E 0.101 +281 H 0.096 +282 H 0.095 +283 L 0.100 +284 I 0.113 +285 K 0.130 +286 G 0.144 +287 Y 0.146 +288 L 0.140 +289 P 0.132 +290 R 0.127 +291 T 0.126 +292 F 0.125 +293 W 0.125 +294 Y 0.124 +295 W 0.121 +296 N 0.112 +297 Y 0.106 +298 N 0.112 +299 Y 0.138 +300 Y 0.177 +301 P 0.215 +302 P 0.236 +303 V 0.235 +304 E 0.231 +305 G 0.239 +306 P 0.252 +307 G 0.253 +308 C 0.240 +309 C 0.227 +310 S 0.221 +311 D 0.221 +312 L 0.223 +313 A 0.222 +314 V 0.213 +315 S 0.201 +316 F 0.192 +317 H 0.190 +318 Y 0.196 +319 V 0.201 +320 D 0.194 +321 S 0.173 +322 T 0.149 +323 T 0.134 +324 M 0.130 +325 Y 0.133 +326 E 0.137 +327 L 0.135 +328 E 0.128 +329 Y 0.124 +330 L 0.125 +331 V 0.129 +332 Y 0.134 +333 H 0.143 +334 L 0.158 +335 R 0.177 +336 P 0.191 +337 Y 0.196 +338 G 0.196 +339 Y 0.196 +340 L 0.202 +341 Y 0.219 +342 R 0.247 +343 Y 0.278 +344 Q 0.299 +345 P 0.300 +346 T 0.282 +347 L 0.251 +348 P 0.213 +349 E 0.174 +350 R 0.146 +351 I 0.130 +352 L 0.124 +353 K 0.126 +354 E 0.134 +355 I 0.144 +356 S 0.163 +357 Q 0.198 +358 A 0.244 +359 N 0.282 +360 K 0.301 +361 N 0.317 +362 E 0.347 +363 D 0.391 +364 T 0.437 +365 K 0.477 +366 V 0.505 +367 K 0.518 +368 L 0.514 +369 G 0.487 +370 N 0.445 +371 P 0.412 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000106483.13_ENST00000436072.7_GN:SFRP4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000106483.13_ENST00000436072.7_GN:SFRP4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c02a036ac50ca903eaa82c62f0d93388e3c6fbf2 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000106483.13_ENST00000436072.7_GN:SFRP4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,347 @@ +>ENSG00000106483.13|ENST00000436072.7|GN:SFRP4|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.215 +2 F 0.196 +3 L 0.173 +4 S 0.159 +5 I 0.153 +6 L 0.149 +7 V 0.147 +8 A 0.145 +9 L 0.144 +10 C 0.145 +11 L 0.150 +12 W 0.156 +13 L 0.166 +14 H 0.186 +15 L 0.224 +16 A 0.274 +17 L 0.328 +18 G 0.377 +19 V 0.409 +20 R 0.403 +21 G 0.352 +22 A 0.270 +23 P 0.185 +24 C 0.119 +25 E 0.080 +26 A 0.061 +27 V 0.052 +28 R 0.048 +29 I 0.045 +30 P 0.043 +31 M 0.044 +32 C 0.046 +33 R 0.052 +34 H 0.057 +35 M 0.058 +36 P 0.057 +37 W 0.059 +38 N 0.068 +39 I 0.082 +40 T 0.090 +41 R 0.086 +42 M 0.075 +43 P 0.071 +44 N 0.079 +45 H 0.095 +46 L 0.113 +47 H 0.126 +48 H 0.133 +49 S 0.139 +50 T 0.144 +51 Q 0.145 +52 E 0.139 +53 N 0.133 +54 A 0.128 +55 I 0.123 +56 L 0.115 +57 A 0.105 +58 I 0.095 +59 E 0.087 +60 Q 0.084 +61 Y 0.084 +62 E 0.083 +63 E 0.081 +64 L 0.084 +65 V 0.092 +66 D 0.100 +67 V 0.104 +68 N 0.104 +69 C 0.103 +70 S 0.097 +71 A 0.086 +72 V 0.074 +73 L 0.062 +74 R 0.050 +75 F 0.043 +76 F 0.044 +77 L 0.050 +78 C 0.055 +79 A 0.058 +80 M 0.058 +81 Y 0.056 +82 A 0.051 +83 P 0.048 +84 I 0.047 +85 C 0.045 +86 T 0.046 +87 L 0.050 +88 E 0.058 +89 F 0.069 +90 L 0.084 +91 H 0.102 +92 D 0.124 +93 P 0.138 +94 I 0.139 +95 K 0.125 +96 P 0.102 +97 C 0.078 +98 K 0.063 +99 S 0.058 +100 V 0.055 +101 C 0.051 +102 Q 0.049 +103 R 0.054 +104 A 0.059 +105 R 0.062 +106 D 0.061 +107 D 0.058 +108 C 0.054 +109 E 0.051 +110 P 0.052 +111 L 0.057 +112 M 0.063 +113 K 0.066 +114 M 0.070 +115 Y 0.082 +116 N 0.101 +117 H 0.121 +118 S 0.130 +119 W 0.124 +120 P 0.109 +121 E 0.093 +122 S 0.078 +123 L 0.066 +124 A 0.058 +125 C 0.054 +126 D 0.055 +127 E 0.060 +128 L 0.068 +129 P 0.078 +130 V 0.091 +131 Y 0.105 +132 D 0.110 +133 R 0.103 +134 G 0.091 +135 V 0.087 +136 C 0.096 +137 I 0.112 +138 S 0.136 +139 P 0.172 +140 E 0.218 +141 A 0.270 +142 I 0.328 +143 V 0.390 +144 T 0.442 +145 D 0.469 +146 L 0.474 +147 P 0.477 +148 E 0.491 +149 D 0.508 +150 V 0.517 +151 K 0.519 +152 W 0.524 +153 I 0.528 +154 D 0.515 +155 I 0.483 +156 T 0.457 +157 P 0.457 +158 D 0.478 +159 M 0.504 +160 M 0.527 +161 V 0.542 +162 Q 0.543 +163 E 0.535 +164 R 0.525 +165 P 0.521 +166 L 0.515 +167 D 0.495 +168 V 0.455 +169 D 0.412 +170 C 0.385 +171 K 0.384 +172 R 0.396 +173 L 0.402 +174 S 0.399 +175 P 0.385 +176 D 0.352 +177 R 0.297 +178 C 0.233 +179 K 0.184 +180 C 0.163 +181 K 0.166 +182 K 0.173 +183 V 0.171 +184 K 0.152 +185 P 0.121 +186 T 0.088 +187 L 0.061 +188 A 0.045 +189 T 0.037 +190 Y 0.034 +191 L 0.037 +192 S 0.044 +193 K 0.051 +194 N 0.053 +195 Y 0.047 +196 S 0.038 +197 Y 0.031 +198 V 0.029 +199 I 0.030 +200 H 0.032 +201 A 0.034 +202 K 0.034 +203 I 0.037 +204 K 0.044 +205 A 0.056 +206 V 0.071 +207 Q 0.085 +208 R 0.097 +209 S 0.105 +210 G 0.106 +211 C 0.099 +212 N 0.086 +213 E 0.070 +214 V 0.055 +215 T 0.042 +216 T 0.032 +217 V 0.026 +218 V 0.024 +219 D 0.024 +220 V 0.026 +221 K 0.030 +222 E 0.036 +223 I 0.041 +224 F 0.046 +225 K 0.053 +226 S 0.065 +227 S 0.078 +228 S 0.089 +229 P 0.100 +230 I 0.109 +231 P 0.107 +232 R 0.093 +233 T 0.078 +234 Q 0.070 +235 V 0.067 +236 P 0.064 +237 L 0.067 +238 I 0.078 +239 T 0.091 +240 N 0.097 +241 S 0.093 +242 S 0.083 +243 C 0.072 +244 Q 0.066 +245 C 0.067 +246 P 0.076 +247 H 0.088 +248 I 0.094 +249 L 0.091 +250 P 0.085 +251 H 0.080 +252 Q 0.075 +253 D 0.066 +254 V 0.056 +255 L 0.046 +256 I 0.040 +257 M 0.034 +258 C 0.031 +259 Y 0.032 +260 E 0.041 +261 W 0.055 +262 R 0.069 +263 S 0.080 +264 R 0.087 +265 M 0.087 +266 M 0.084 +267 L 0.085 +268 L 0.089 +269 E 0.087 +270 N 0.073 +271 C 0.057 +272 L 0.048 +273 V 0.048 +274 E 0.053 +275 K 0.059 +276 W 0.062 +277 R 0.066 +278 D 0.077 +279 Q 0.094 +280 L 0.106 +281 S 0.107 +282 K 0.099 +283 R 0.090 +284 S 0.088 +285 I 0.087 +286 Q 0.082 +287 W 0.074 +288 E 0.068 +289 E 0.065 +290 R 0.065 +291 L 0.069 +292 Q 0.077 +293 E 0.089 +294 Q 0.103 +295 R 0.122 +296 R 0.148 +297 T 0.181 +298 V 0.216 +299 Q 0.249 +300 D 0.276 +301 K 0.297 +302 K 0.320 +303 K 0.354 +304 T 0.412 +305 A 0.487 +306 G 0.561 +307 R 0.614 +308 T 0.641 +309 S 0.642 +310 R 0.624 +311 S 0.600 +312 N 0.585 +313 P 0.585 +314 P 0.600 +315 K 0.623 +316 P 0.643 +317 K 0.653 +318 G 0.651 +319 K 0.646 +320 P 0.642 +321 P 0.638 +322 A 0.638 +323 P 0.645 +324 K 0.652 +325 P 0.654 +326 A 0.653 +327 S 0.649 +328 P 0.625 +329 K 0.582 +330 K 0.556 +331 N 0.561 +332 I 0.569 +333 K 0.579 +334 T 0.609 +335 R 0.630 +336 S 0.610 +337 A 0.588 +338 Q 0.607 +339 K 0.646 +340 R 0.666 +341 T 0.667 +342 N 0.664 +343 P 0.654 +344 K 0.626 +345 R 0.578 +346 V 0.536 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000106483.13_ENST00000436072.7_GN:SFRP4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000106483.13_ENST00000436072.7_GN:SFRP4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..91003071b00594f3e6da07645802c5b40475f203 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000106483.13_ENST00000436072.7_GN:SFRP4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid @@ -0,0 +1,369 @@ +>ENSG00000106483.13|ENST00000436072.7|GN:SFRP4|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:22 +1 M 0.391 +2 R 0.416 +3 V 0.450 +4 A 0.462 +5 G 0.433 +6 R 0.398 +7 E 0.419 +8 G 0.496 +9 R 0.571 +10 F 0.612 +11 L 0.637 +12 S 0.660 +13 A 0.678 +14 G 0.689 +15 V 0.691 +16 A 0.677 +17 A 0.645 +18 R 0.611 +19 E 0.589 +20 G 0.567 +21 S 0.515 +22 A 0.431 +23 M 0.341 +24 F 0.268 +25 L 0.221 +26 S 0.197 +27 I 0.190 +28 L 0.187 +29 V 0.181 +30 A 0.173 +31 L 0.167 +32 C 0.159 +33 L 0.150 +34 W 0.143 +35 L 0.143 +36 H 0.157 +37 L 0.188 +38 A 0.236 +39 L 0.296 +40 G 0.352 +41 V 0.386 +42 R 0.383 +43 G 0.336 +44 A 0.259 +45 P 0.177 +46 C 0.113 +47 E 0.075 +48 A 0.057 +49 V 0.049 +50 R 0.045 +51 I 0.043 +52 P 0.043 +53 M 0.043 +54 C 0.046 +55 R 0.051 +56 H 0.057 +57 M 0.058 +58 P 0.057 +59 W 0.058 +60 N 0.067 +61 I 0.081 +62 T 0.090 +63 R 0.086 +64 M 0.075 +65 P 0.070 +66 N 0.077 +67 H 0.094 +68 L 0.110 +69 H 0.122 +70 H 0.128 +71 S 0.133 +72 T 0.139 +73 Q 0.140 +74 E 0.136 +75 N 0.130 +76 A 0.126 +77 I 0.121 +78 L 0.114 +79 A 0.104 +80 I 0.093 +81 E 0.085 +82 Q 0.082 +83 Y 0.082 +84 E 0.080 +85 E 0.078 +86 L 0.081 +87 V 0.089 +88 D 0.097 +89 V 0.101 +90 N 0.101 +91 C 0.100 +92 S 0.094 +93 A 0.083 +94 V 0.072 +95 L 0.060 +96 R 0.049 +97 F 0.042 +98 F 0.044 +99 L 0.050 +100 C 0.055 +101 A 0.058 +102 M 0.057 +103 Y 0.054 +104 A 0.050 +105 P 0.047 +106 I 0.045 +107 C 0.044 +108 T 0.045 +109 L 0.049 +110 E 0.059 +111 F 0.071 +112 L 0.086 +113 H 0.105 +114 D 0.127 +115 P 0.141 +116 I 0.141 +117 K 0.126 +118 P 0.102 +119 C 0.077 +120 K 0.062 +121 S 0.058 +122 V 0.055 +123 C 0.051 +124 Q 0.050 +125 R 0.055 +126 A 0.061 +127 R 0.063 +128 D 0.062 +129 D 0.060 +130 C 0.056 +131 E 0.053 +132 P 0.053 +133 L 0.058 +134 M 0.063 +135 K 0.066 +136 M 0.071 +137 Y 0.083 +138 N 0.103 +139 H 0.124 +140 S 0.133 +141 W 0.127 +142 P 0.111 +143 E 0.094 +144 S 0.079 +145 L 0.067 +146 A 0.058 +147 C 0.055 +148 D 0.056 +149 E 0.061 +150 L 0.070 +151 P 0.081 +152 V 0.094 +153 Y 0.107 +154 D 0.112 +155 R 0.105 +156 G 0.092 +157 V 0.088 +158 C 0.097 +159 I 0.113 +160 S 0.138 +161 P 0.174 +162 E 0.222 +163 A 0.278 +164 I 0.340 +165 V 0.403 +166 T 0.455 +167 D 0.480 +168 L 0.483 +169 P 0.485 +170 E 0.499 +171 D 0.515 +172 V 0.522 +173 K 0.524 +174 W 0.529 +175 I 0.533 +176 D 0.520 +177 I 0.488 +178 T 0.462 +179 P 0.461 +180 D 0.482 +181 M 0.509 +182 M 0.534 +183 V 0.551 +184 Q 0.555 +185 E 0.546 +186 R 0.534 +187 P 0.527 +188 L 0.520 +189 D 0.498 +190 V 0.458 +191 D 0.413 +192 C 0.385 +193 K 0.385 +194 R 0.397 +195 L 0.403 +196 S 0.399 +197 P 0.384 +198 D 0.351 +199 R 0.296 +200 C 0.231 +201 K 0.182 +202 C 0.162 +203 K 0.164 +204 K 0.171 +205 V 0.170 +206 K 0.151 +207 P 0.120 +208 T 0.087 +209 L 0.061 +210 A 0.045 +211 T 0.037 +212 Y 0.035 +213 L 0.037 +214 S 0.044 +215 K 0.052 +216 N 0.053 +217 Y 0.048 +218 S 0.039 +219 Y 0.032 +220 V 0.029 +221 I 0.031 +222 H 0.033 +223 A 0.035 +224 K 0.035 +225 I 0.037 +226 K 0.045 +227 A 0.057 +228 V 0.071 +229 Q 0.085 +230 R 0.097 +231 S 0.104 +232 G 0.105 +233 C 0.098 +234 N 0.085 +235 E 0.070 +236 V 0.055 +237 T 0.041 +238 T 0.032 +239 V 0.026 +240 V 0.024 +241 D 0.024 +242 V 0.026 +243 K 0.030 +244 E 0.036 +245 I 0.041 +246 F 0.046 +247 K 0.053 +248 S 0.064 +249 S 0.077 +250 S 0.087 +251 P 0.099 +252 I 0.108 +253 P 0.106 +254 R 0.092 +255 T 0.078 +256 Q 0.070 +257 V 0.067 +258 P 0.064 +259 L 0.067 +260 I 0.079 +261 T 0.092 +262 N 0.098 +263 S 0.093 +264 S 0.083 +265 C 0.072 +266 Q 0.066 +267 C 0.067 +268 P 0.077 +269 H 0.089 +270 I 0.095 +271 L 0.092 +272 P 0.086 +273 H 0.081 +274 Q 0.076 +275 D 0.067 +276 V 0.056 +277 L 0.047 +278 I 0.040 +279 M 0.035 +280 C 0.031 +281 Y 0.033 +282 E 0.041 +283 W 0.055 +284 R 0.069 +285 S 0.081 +286 R 0.088 +287 M 0.089 +288 M 0.086 +289 L 0.086 +290 L 0.091 +291 E 0.089 +292 N 0.075 +293 C 0.059 +294 L 0.049 +295 V 0.049 +296 E 0.054 +297 K 0.060 +298 W 0.063 +299 R 0.068 +300 D 0.079 +301 Q 0.095 +302 L 0.107 +303 S 0.108 +304 K 0.100 +305 R 0.091 +306 S 0.089 +307 I 0.089 +308 Q 0.084 +309 W 0.075 +310 E 0.068 +311 E 0.065 +312 R 0.065 +313 L 0.069 +314 Q 0.078 +315 E 0.089 +316 Q 0.104 +317 R 0.123 +318 R 0.149 +319 T 0.182 +320 V 0.218 +321 Q 0.251 +322 D 0.278 +323 K 0.300 +324 K 0.322 +325 K 0.355 +326 T 0.411 +327 A 0.486 +328 G 0.560 +329 R 0.614 +330 T 0.641 +331 S 0.644 +332 R 0.627 +333 S 0.603 +334 N 0.587 +335 P 0.588 +336 P 0.604 +337 K 0.628 +338 P 0.649 +339 K 0.659 +340 G 0.659 +341 K 0.654 +342 P 0.650 +343 P 0.647 +344 A 0.648 +345 P 0.656 +346 K 0.665 +347 P 0.669 +348 A 0.670 +349 S 0.667 +350 P 0.644 +351 K 0.601 +352 K 0.572 +353 N 0.572 +354 I 0.576 +355 K 0.584 +356 T 0.615 +357 R 0.635 +358 S 0.615 +359 A 0.593 +360 Q 0.614 +361 K 0.655 +362 R 0.677 +363 T 0.678 +364 N 0.673 +365 P 0.662 +366 K 0.635 +367 R 0.589 +368 V 0.550 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000108576.11_ENST00000650711.1_GN:SLC6A4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000108576.11_ENST00000650711.1_GN:SLC6A4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1a11d35806f3f7963b4c1e0c03b2134922619fab --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000108576.11_ENST00000650711.1_GN:SLC6A4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,631 @@ +>ENSG00000108576.11|ENST00000650711.1|GN:SLC6A4|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.357 +2 E 0.373 +3 T 0.403 +4 T 0.444 +5 P 0.479 +6 L 0.496 +7 N 0.495 +8 S 0.473 +9 Q 0.441 +10 K 0.433 +11 Q 0.463 +12 L 0.499 +13 S 0.517 +14 A 0.525 +15 C 0.543 +16 E 0.571 +17 D 0.601 +18 G 0.629 +19 E 0.649 +20 D 0.656 +21 C 0.650 +22 Q 0.646 +23 E 0.654 +24 N 0.665 +25 G 0.654 +26 V 0.600 +27 L 0.505 +28 Q 0.421 +29 K 0.407 +30 V 0.450 +31 V 0.494 +32 P 0.525 +33 T 0.566 +34 P 0.621 +35 G 0.673 +36 D 0.706 +37 K 0.717 +38 V 0.712 +39 E 0.702 +40 S 0.694 +41 G 0.682 +42 Q 0.646 +43 I 0.591 +44 S 0.563 +45 N 0.583 +46 G 0.602 +47 Y 0.583 +48 S 0.564 +49 A 0.584 +50 V 0.621 +51 P 0.654 +52 S 0.685 +53 P 0.719 +54 G 0.742 +55 A 0.751 +56 G 0.747 +57 D 0.735 +58 D 0.714 +59 T 0.683 +60 R 0.650 +61 H 0.628 +62 S 0.631 +63 I 0.652 +64 P 0.677 +65 A 0.695 +66 T 0.688 +67 T 0.649 +68 T 0.593 +69 T 0.552 +70 L 0.541 +71 V 0.545 +72 A 0.546 +73 E 0.535 +74 L 0.514 +75 H 0.484 +76 Q 0.446 +77 G 0.395 +78 E 0.333 +79 R 0.269 +80 E 0.213 +81 T 0.172 +82 W 0.140 +83 G 0.113 +84 K 0.093 +85 K 0.082 +86 V 0.079 +87 D 0.077 +88 F 0.070 +89 L 0.063 +90 L 0.065 +91 S 0.075 +92 V 0.085 +93 I 0.096 +94 G 0.112 +95 Y 0.127 +96 A 0.128 +97 V 0.115 +98 D 0.105 +99 L 0.110 +100 G 0.122 +101 N 0.127 +102 V 0.119 +103 W 0.110 +104 R 0.109 +105 F 0.111 +106 P 0.109 +107 Y 0.099 +108 I 0.089 +109 C 0.081 +110 Y 0.080 +111 Q 0.088 +112 N 0.100 +113 G 0.104 +114 G 0.095 +115 G 0.079 +116 A 0.064 +117 F 0.054 +118 L 0.048 +119 L 0.049 +120 P 0.054 +121 Y 0.056 +122 T 0.052 +123 I 0.049 +124 M 0.048 +125 A 0.046 +126 I 0.044 +127 F 0.047 +128 G 0.056 +129 G 0.063 +130 I 0.064 +131 P 0.061 +132 L 0.058 +133 F 0.055 +134 Y 0.053 +135 M 0.057 +136 E 0.065 +137 L 0.072 +138 A 0.077 +139 L 0.078 +140 G 0.076 +141 Q 0.076 +142 Y 0.080 +143 H 0.087 +144 R 0.092 +145 N 0.095 +146 G 0.098 +147 C 0.097 +148 I 0.089 +149 S 0.076 +150 I 0.064 +151 W 0.056 +152 R 0.052 +153 K 0.049 +154 I 0.049 +155 C 0.050 +156 P 0.054 +157 I 0.061 +158 F 0.070 +159 K 0.081 +160 G 0.095 +161 I 0.105 +162 G 0.104 +163 Y 0.094 +164 A 0.088 +165 I 0.088 +166 C 0.088 +167 I 0.083 +168 I 0.077 +169 A 0.073 +170 F 0.071 +171 Y 0.071 +172 I 0.071 +173 A 0.069 +174 S 0.064 +175 Y 0.061 +176 Y 0.062 +177 N 0.062 +178 T 0.061 +179 I 0.060 +180 M 0.059 +181 A 0.058 +182 W 0.060 +183 A 0.066 +184 L 0.072 +185 Y 0.076 +186 Y 0.081 +187 L 0.085 +188 I 0.089 +189 S 0.094 +190 S 0.098 +191 F 0.097 +192 T 0.094 +193 D 0.095 +194 Q 0.098 +195 L 0.101 +196 P 0.101 +197 W 0.100 +198 T 0.103 +199 S 0.113 +200 C 0.126 +201 K 0.136 +202 N 0.142 +203 S 0.145 +204 W 0.145 +205 N 0.148 +206 T 0.162 +207 G 0.183 +208 N 0.205 +209 C 0.217 +210 T 0.216 +211 N 0.210 +212 Y 0.205 +213 F 0.210 +214 S 0.228 +215 E 0.252 +216 D 0.270 +217 N 0.274 +218 I 0.269 +219 T 0.262 +220 W 0.255 +221 T 0.246 +222 L 0.237 +223 H 0.227 +224 S 0.215 +225 T 0.196 +226 S 0.174 +227 P 0.154 +228 A 0.139 +229 E 0.133 +230 E 0.131 +231 F 0.130 +232 Y 0.130 +233 T 0.141 +234 R 0.161 +235 H 0.177 +236 V 0.178 +237 L 0.169 +238 Q 0.166 +239 I 0.177 +240 H 0.202 +241 R 0.228 +242 S 0.240 +243 K 0.237 +244 G 0.223 +245 L 0.204 +246 Q 0.188 +247 D 0.182 +248 L 0.188 +249 G 0.200 +250 G 0.202 +251 I 0.182 +252 S 0.142 +253 W 0.105 +254 Q 0.090 +255 L 0.094 +256 A 0.106 +257 L 0.124 +258 C 0.148 +259 I 0.164 +260 M 0.164 +261 L 0.157 +262 I 0.150 +263 F 0.137 +264 T 0.115 +265 V 0.095 +266 I 0.083 +267 Y 0.075 +268 F 0.070 +269 S 0.069 +270 I 0.070 +271 W 0.074 +272 K 0.079 +273 G 0.081 +274 V 0.081 +275 K 0.085 +276 T 0.094 +277 S 0.105 +278 G 0.113 +279 K 0.125 +280 V 0.136 +281 V 0.130 +282 W 0.104 +283 V 0.081 +284 T 0.072 +285 A 0.069 +286 T 0.066 +287 F 0.066 +288 P 0.072 +289 Y 0.081 +290 I 0.088 +291 I 0.084 +292 L 0.071 +293 S 0.055 +294 V 0.046 +295 L 0.046 +296 L 0.049 +297 V 0.054 +298 R 0.059 +299 G 0.066 +300 A 0.075 +301 T 0.088 +302 L 0.105 +303 P 0.116 +304 G 0.112 +305 A 0.095 +306 W 0.075 +307 R 0.060 +308 G 0.050 +309 V 0.044 +310 L 0.041 +311 F 0.038 +312 Y 0.036 +313 L 0.036 +314 K 0.038 +315 P 0.041 +316 N 0.043 +317 W 0.042 +318 Q 0.043 +319 K 0.046 +320 L 0.050 +321 L 0.053 +322 E 0.055 +323 T 0.057 +324 G 0.061 +325 V 0.063 +326 W 0.063 +327 I 0.066 +328 D 0.075 +329 A 0.084 +330 A 0.089 +331 A 0.095 +332 Q 0.102 +333 I 0.102 +334 F 0.097 +335 F 0.100 +336 S 0.114 +337 L 0.130 +338 G 0.142 +339 P 0.151 +340 G 0.164 +341 F 0.182 +342 G 0.194 +343 V 0.190 +344 L 0.172 +345 L 0.157 +346 A 0.149 +347 F 0.145 +348 A 0.135 +349 S 0.118 +350 Y 0.100 +351 N 0.085 +352 K 0.075 +353 F 0.073 +354 N 0.078 +355 N 0.082 +356 N 0.077 +357 C 0.067 +358 Y 0.060 +359 Q 0.065 +360 D 0.076 +361 A 0.083 +362 L 0.086 +363 V 0.096 +364 T 0.112 +365 S 0.117 +366 V 0.110 +367 V 0.105 +368 N 0.107 +369 C 0.108 +370 M 0.109 +371 T 0.116 +372 S 0.124 +373 F 0.129 +374 V 0.131 +375 S 0.129 +376 G 0.124 +377 F 0.121 +378 V 0.120 +379 I 0.117 +380 F 0.109 +381 T 0.100 +382 V 0.096 +383 L 0.098 +384 G 0.100 +385 Y 0.095 +386 M 0.084 +387 A 0.078 +388 E 0.080 +389 M 0.088 +390 R 0.101 +391 N 0.118 +392 E 0.130 +393 D 0.133 +394 V 0.128 +395 S 0.123 +396 E 0.125 +397 V 0.134 +398 A 0.144 +399 K 0.149 +400 D 0.151 +401 A 0.148 +402 G 0.135 +403 P 0.118 +404 S 0.105 +405 L 0.094 +406 L 0.082 +407 F 0.070 +408 I 0.065 +409 T 0.065 +410 Y 0.063 +411 A 0.062 +412 E 0.063 +413 A 0.066 +414 I 0.068 +415 A 0.071 +416 N 0.075 +417 M 0.077 +418 P 0.072 +419 A 0.062 +420 S 0.051 +421 T 0.043 +422 F 0.039 +423 F 0.041 +424 A 0.045 +425 I 0.050 +426 I 0.055 +427 F 0.063 +428 F 0.071 +429 L 0.080 +430 M 0.086 +431 L 0.089 +432 I 0.090 +433 T 0.092 +434 L 0.099 +435 G 0.110 +436 L 0.124 +437 D 0.141 +438 S 0.155 +439 T 0.155 +440 F 0.139 +441 A 0.119 +442 G 0.108 +443 L 0.104 +444 E 0.100 +445 G 0.092 +446 V 0.081 +447 I 0.073 +448 T 0.068 +449 A 0.065 +450 V 0.060 +451 L 0.054 +452 D 0.049 +453 E 0.046 +454 F 0.044 +455 P 0.039 +456 H 0.033 +457 V 0.032 +458 W 0.036 +459 A 0.042 +460 K 0.043 +461 R 0.039 +462 R 0.035 +463 E 0.033 +464 R 0.035 +465 F 0.041 +466 V 0.048 +467 L 0.053 +468 A 0.058 +469 V 0.065 +470 V 0.065 +471 I 0.060 +472 T 0.056 +473 C 0.056 +474 F 0.059 +475 F 0.064 +476 G 0.070 +477 S 0.074 +478 L 0.075 +479 V 0.077 +480 T 0.082 +481 L 0.089 +482 T 0.099 +483 F 0.106 +484 G 0.106 +485 G 0.097 +486 A 0.084 +487 Y 0.077 +488 V 0.077 +489 V 0.084 +490 K 0.098 +491 L 0.116 +492 L 0.129 +493 E 0.132 +494 E 0.126 +495 Y 0.113 +496 A 0.098 +497 T 0.086 +498 G 0.078 +499 P 0.073 +500 A 0.070 +501 V 0.071 +502 L 0.074 +503 T 0.078 +504 V 0.080 +505 A 0.076 +506 L 0.068 +507 I 0.062 +508 E 0.059 +509 A 0.054 +510 V 0.045 +511 A 0.040 +512 V 0.040 +513 S 0.043 +514 W 0.045 +515 F 0.046 +516 Y 0.047 +517 G 0.048 +518 I 0.045 +519 T 0.040 +520 Q 0.038 +521 F 0.039 +522 C 0.041 +523 R 0.045 +524 D 0.052 +525 V 0.058 +526 K 0.060 +527 E 0.061 +528 M 0.064 +529 L 0.070 +530 G 0.081 +531 F 0.097 +532 S 0.107 +533 P 0.100 +534 G 0.078 +535 W 0.055 +536 F 0.041 +537 W 0.037 +538 R 0.038 +539 I 0.038 +540 C 0.041 +541 W 0.048 +542 V 0.055 +543 A 0.057 +544 I 0.058 +545 S 0.057 +546 P 0.053 +547 L 0.048 +548 F 0.046 +549 L 0.045 +550 L 0.047 +551 F 0.054 +552 I 0.063 +553 I 0.068 +554 C 0.072 +555 S 0.079 +556 F 0.090 +557 L 0.102 +558 M 0.119 +559 S 0.141 +560 P 0.160 +561 P 0.170 +562 Q 0.174 +563 L 0.178 +564 R 0.179 +565 L 0.174 +566 F 0.166 +567 Q 0.163 +568 Y 0.164 +569 N 0.156 +570 Y 0.132 +571 P 0.102 +572 Y 0.081 +573 W 0.077 +574 S 0.085 +575 I 0.094 +576 I 0.100 +577 L 0.112 +578 G 0.129 +579 Y 0.145 +580 C 0.165 +581 I 0.200 +582 G 0.240 +583 T 0.262 +584 S 0.249 +585 S 0.212 +586 F 0.166 +587 I 0.126 +588 C 0.101 +589 I 0.089 +590 P 0.078 +591 T 0.065 +592 Y 0.057 +593 I 0.055 +594 A 0.054 +595 Y 0.053 +596 R 0.058 +597 L 0.068 +598 I 0.085 +599 I 0.106 +600 T 0.126 +601 P 0.132 +602 G 0.125 +603 T 0.114 +604 F 0.107 +605 K 0.105 +606 E 0.108 +607 R 0.115 +608 I 0.126 +609 I 0.139 +610 K 0.150 +611 S 0.157 +612 I 0.159 +613 T 0.161 +614 P 0.173 +615 E 0.200 +616 T 0.237 +617 P 0.279 +618 T 0.321 +619 E 0.358 +620 I 0.381 +621 P 0.386 +622 C 0.376 +623 G 0.362 +624 D 0.345 +625 I 0.324 +626 R 0.303 +627 L 0.294 +628 N 0.303 +629 A 0.326 +630 V 0.346 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000108576.11_ENST00000650711.1_GN:SLC6A4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:42.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000108576.11_ENST00000650711.1_GN:SLC6A4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:42.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..588144cf5c5d45134ce5a6183daf94615580057e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000108576.11_ENST00000650711.1_GN:SLC6A4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:42.caid @@ -0,0 +1,673 @@ +>ENSG00000108576.11|ENST00000650711.1|GN:SLC6A4|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:42 +1 M 0.332 +2 S 0.348 +3 Q 0.374 +4 S 0.395 +5 R 0.397 +6 R 0.395 +7 V 0.408 +8 N 0.425 +9 P 0.431 +10 D 0.448 +11 D 0.493 +12 R 0.545 +13 E 0.577 +14 L 0.594 +15 G 0.613 +16 G 0.629 +17 D 0.630 +18 P 0.613 +19 Q 0.575 +20 I 0.531 +21 Q 0.520 +22 A 0.564 +23 P 0.632 +24 R 0.681 +25 D 0.706 +26 Q 0.719 +27 L 0.726 +28 G 0.725 +29 S 0.719 +30 L 0.712 +31 A 0.703 +32 D 0.690 +33 G 0.670 +34 H 0.635 +35 Q 0.575 +36 C 0.501 +37 H 0.450 +38 L 0.436 +39 L 0.434 +40 T 0.426 +41 S 0.435 +42 R 0.475 +43 M 0.527 +44 E 0.567 +45 T 0.596 +46 T 0.622 +47 P 0.645 +48 L 0.661 +49 N 0.658 +50 S 0.623 +51 Q 0.571 +52 K 0.554 +53 Q 0.592 +54 L 0.648 +55 S 0.686 +56 A 0.707 +57 C 0.724 +58 E 0.737 +59 D 0.749 +60 G 0.758 +61 E 0.763 +62 D 0.758 +63 C 0.750 +64 Q 0.747 +65 E 0.751 +66 N 0.753 +67 G 0.737 +68 V 0.690 +69 L 0.624 +70 Q 0.584 +71 K 0.599 +72 V 0.630 +73 V 0.638 +74 P 0.640 +75 T 0.664 +76 P 0.703 +77 G 0.742 +78 D 0.767 +79 K 0.777 +80 V 0.776 +81 E 0.772 +82 S 0.767 +83 G 0.749 +84 Q 0.702 +85 I 0.637 +86 S 0.604 +87 N 0.623 +88 G 0.643 +89 Y 0.623 +90 S 0.603 +91 A 0.629 +92 V 0.678 +93 P 0.716 +94 S 0.742 +95 P 0.763 +96 G 0.774 +97 A 0.776 +98 G 0.769 +99 D 0.756 +100 D 0.733 +101 T 0.697 +102 R 0.657 +103 H 0.630 +104 S 0.629 +105 I 0.646 +106 P 0.667 +107 A 0.679 +108 T 0.666 +109 T 0.618 +110 T 0.552 +111 T 0.501 +112 L 0.479 +113 V 0.475 +114 A 0.472 +115 E 0.463 +116 L 0.449 +117 H 0.434 +118 Q 0.414 +119 G 0.381 +120 E 0.331 +121 R 0.273 +122 E 0.220 +123 T 0.178 +124 W 0.144 +125 G 0.115 +126 K 0.093 +127 K 0.081 +128 V 0.077 +129 D 0.075 +130 F 0.068 +131 L 0.061 +132 L 0.062 +133 S 0.071 +134 V 0.080 +135 I 0.091 +136 G 0.108 +137 Y 0.124 +138 A 0.125 +139 V 0.112 +140 D 0.101 +141 L 0.104 +142 G 0.116 +143 N 0.122 +144 V 0.116 +145 W 0.108 +146 R 0.108 +147 F 0.111 +148 P 0.107 +149 Y 0.097 +150 I 0.087 +151 C 0.081 +152 Y 0.081 +153 Q 0.089 +154 N 0.102 +155 G 0.107 +156 G 0.099 +157 G 0.083 +158 A 0.067 +159 F 0.056 +160 L 0.049 +161 L 0.049 +162 P 0.053 +163 Y 0.055 +164 T 0.052 +165 I 0.048 +166 M 0.047 +167 A 0.045 +168 I 0.044 +169 F 0.048 +170 G 0.056 +171 G 0.063 +172 I 0.065 +173 P 0.063 +174 L 0.060 +175 F 0.057 +176 Y 0.056 +177 M 0.060 +178 E 0.068 +179 L 0.074 +180 A 0.078 +181 L 0.079 +182 G 0.078 +183 Q 0.080 +184 Y 0.085 +185 H 0.092 +186 R 0.096 +187 N 0.098 +188 G 0.098 +189 C 0.096 +190 I 0.087 +191 S 0.073 +192 I 0.061 +193 W 0.053 +194 R 0.049 +195 K 0.048 +196 I 0.047 +197 C 0.048 +198 P 0.051 +199 I 0.057 +200 F 0.066 +201 K 0.077 +202 G 0.092 +203 I 0.102 +204 G 0.101 +205 Y 0.093 +206 A 0.089 +207 I 0.091 +208 C 0.092 +209 I 0.087 +210 I 0.080 +211 A 0.075 +212 F 0.073 +213 Y 0.071 +214 I 0.072 +215 A 0.070 +216 S 0.065 +217 Y 0.061 +218 Y 0.062 +219 N 0.062 +220 T 0.061 +221 I 0.060 +222 M 0.059 +223 A 0.059 +224 W 0.061 +225 A 0.067 +226 L 0.072 +227 Y 0.077 +228 Y 0.081 +229 L 0.085 +230 I 0.087 +231 S 0.091 +232 S 0.095 +233 F 0.094 +234 T 0.090 +235 D 0.090 +236 Q 0.094 +237 L 0.097 +238 P 0.097 +239 W 0.096 +240 T 0.098 +241 S 0.107 +242 C 0.120 +243 K 0.130 +244 N 0.136 +245 S 0.139 +246 W 0.138 +247 N 0.141 +248 T 0.155 +249 G 0.177 +250 N 0.200 +251 C 0.212 +252 T 0.212 +253 N 0.205 +254 Y 0.201 +255 F 0.206 +256 S 0.224 +257 E 0.248 +258 D 0.266 +259 N 0.271 +260 I 0.267 +261 T 0.260 +262 W 0.252 +263 T 0.244 +264 L 0.236 +265 H 0.228 +266 S 0.218 +267 T 0.199 +268 S 0.176 +269 P 0.155 +270 A 0.140 +271 E 0.134 +272 E 0.133 +273 F 0.131 +274 Y 0.131 +275 T 0.141 +276 R 0.161 +277 H 0.177 +278 V 0.180 +279 L 0.174 +280 Q 0.172 +281 I 0.184 +282 H 0.209 +283 R 0.235 +284 S 0.248 +285 K 0.246 +286 G 0.232 +287 L 0.214 +288 Q 0.197 +289 D 0.189 +290 L 0.194 +291 G 0.205 +292 G 0.207 +293 I 0.185 +294 S 0.144 +295 W 0.106 +296 Q 0.091 +297 L 0.095 +298 A 0.106 +299 L 0.123 +300 C 0.147 +301 I 0.164 +302 M 0.165 +303 L 0.158 +304 I 0.151 +305 F 0.138 +306 T 0.117 +307 V 0.097 +308 I 0.085 +309 Y 0.078 +310 F 0.074 +311 S 0.074 +312 I 0.076 +313 W 0.080 +314 K 0.084 +315 G 0.086 +316 V 0.086 +317 K 0.090 +318 T 0.100 +319 S 0.110 +320 G 0.117 +321 K 0.129 +322 V 0.140 +323 V 0.133 +324 W 0.107 +325 V 0.082 +326 T 0.073 +327 A 0.071 +328 T 0.068 +329 F 0.068 +330 P 0.073 +331 Y 0.083 +332 I 0.089 +333 I 0.086 +334 L 0.072 +335 S 0.056 +336 V 0.047 +337 L 0.046 +338 L 0.050 +339 V 0.055 +340 R 0.061 +341 G 0.068 +342 A 0.078 +343 T 0.092 +344 L 0.110 +345 P 0.121 +346 G 0.117 +347 A 0.100 +348 W 0.079 +349 R 0.064 +350 G 0.053 +351 V 0.047 +352 L 0.043 +353 F 0.039 +354 Y 0.037 +355 L 0.037 +356 K 0.040 +357 P 0.043 +358 N 0.044 +359 W 0.043 +360 Q 0.043 +361 K 0.046 +362 L 0.050 +363 L 0.053 +364 E 0.054 +365 T 0.056 +366 G 0.059 +367 V 0.061 +368 W 0.061 +369 I 0.064 +370 D 0.074 +371 A 0.083 +372 A 0.088 +373 A 0.094 +374 Q 0.101 +375 I 0.101 +376 F 0.096 +377 F 0.099 +378 S 0.111 +379 L 0.126 +380 G 0.138 +381 P 0.148 +382 G 0.161 +383 F 0.179 +384 G 0.192 +385 V 0.187 +386 L 0.170 +387 L 0.155 +388 A 0.148 +389 F 0.144 +390 A 0.134 +391 S 0.117 +392 Y 0.100 +393 N 0.085 +394 K 0.075 +395 F 0.073 +396 N 0.078 +397 N 0.081 +398 N 0.076 +399 C 0.066 +400 Y 0.059 +401 Q 0.063 +402 D 0.074 +403 A 0.081 +404 L 0.084 +405 V 0.095 +406 T 0.111 +407 S 0.116 +408 V 0.109 +409 V 0.104 +410 N 0.106 +411 C 0.106 +412 M 0.107 +413 T 0.113 +414 S 0.121 +415 F 0.125 +416 V 0.128 +417 S 0.126 +418 G 0.122 +419 F 0.119 +420 V 0.119 +421 I 0.116 +422 F 0.108 +423 T 0.099 +424 V 0.095 +425 L 0.097 +426 G 0.099 +427 Y 0.094 +428 M 0.084 +429 A 0.078 +430 E 0.080 +431 M 0.088 +432 R 0.102 +433 N 0.119 +434 E 0.132 +435 D 0.135 +436 V 0.130 +437 S 0.125 +438 E 0.127 +439 V 0.137 +440 A 0.146 +441 K 0.152 +442 D 0.154 +443 A 0.151 +444 G 0.138 +445 P 0.120 +446 S 0.107 +447 L 0.097 +448 L 0.084 +449 F 0.072 +450 I 0.067 +451 T 0.067 +452 Y 0.066 +453 A 0.064 +454 E 0.065 +455 A 0.069 +456 I 0.070 +457 A 0.073 +458 N 0.077 +459 M 0.079 +460 P 0.074 +461 A 0.064 +462 S 0.053 +463 T 0.045 +464 F 0.041 +465 F 0.042 +466 A 0.047 +467 I 0.051 +468 I 0.057 +469 F 0.065 +470 F 0.074 +471 L 0.082 +472 M 0.089 +473 L 0.092 +474 I 0.093 +475 T 0.094 +476 L 0.102 +477 G 0.114 +478 L 0.128 +479 D 0.145 +480 S 0.160 +481 T 0.159 +482 F 0.143 +483 A 0.123 +484 G 0.111 +485 L 0.108 +486 E 0.103 +487 G 0.095 +488 V 0.083 +489 I 0.074 +490 T 0.070 +491 A 0.067 +492 V 0.062 +493 L 0.056 +494 D 0.050 +495 E 0.048 +496 F 0.046 +497 P 0.041 +498 H 0.035 +499 V 0.033 +500 W 0.038 +501 A 0.044 +502 K 0.045 +503 R 0.041 +504 R 0.037 +505 E 0.034 +506 R 0.036 +507 F 0.043 +508 V 0.050 +509 L 0.054 +510 A 0.060 +511 V 0.066 +512 V 0.065 +513 I 0.059 +514 T 0.055 +515 C 0.056 +516 F 0.060 +517 F 0.066 +518 G 0.073 +519 S 0.077 +520 L 0.078 +521 V 0.080 +522 T 0.085 +523 L 0.092 +524 T 0.102 +525 F 0.109 +526 G 0.109 +527 G 0.099 +528 A 0.086 +529 Y 0.079 +530 V 0.079 +531 V 0.087 +532 K 0.101 +533 L 0.119 +534 L 0.131 +535 E 0.134 +536 E 0.128 +537 Y 0.114 +538 A 0.099 +539 T 0.086 +540 G 0.079 +541 P 0.074 +542 A 0.072 +543 V 0.073 +544 L 0.077 +545 T 0.081 +546 V 0.082 +547 A 0.078 +548 L 0.070 +549 I 0.063 +550 E 0.060 +551 A 0.055 +552 V 0.046 +553 A 0.041 +554 V 0.041 +555 S 0.044 +556 W 0.045 +557 F 0.046 +558 Y 0.048 +559 G 0.048 +560 I 0.045 +561 T 0.040 +562 Q 0.038 +563 F 0.039 +564 C 0.042 +565 R 0.046 +566 D 0.054 +567 V 0.060 +568 K 0.062 +569 E 0.062 +570 M 0.065 +571 L 0.071 +572 G 0.082 +573 F 0.098 +574 S 0.108 +575 P 0.100 +576 G 0.078 +577 W 0.055 +578 F 0.041 +579 W 0.038 +580 R 0.038 +581 I 0.039 +582 C 0.042 +583 W 0.049 +584 V 0.056 +585 A 0.058 +586 I 0.058 +587 S 0.058 +588 P 0.054 +589 L 0.049 +590 F 0.046 +591 L 0.046 +592 L 0.048 +593 F 0.054 +594 I 0.063 +595 I 0.069 +596 C 0.072 +597 S 0.080 +598 F 0.090 +599 L 0.102 +600 M 0.119 +601 S 0.142 +602 P 0.161 +603 P 0.170 +604 Q 0.174 +605 L 0.177 +606 R 0.179 +607 L 0.174 +608 F 0.166 +609 Q 0.164 +610 Y 0.165 +611 N 0.157 +612 Y 0.133 +613 P 0.103 +614 Y 0.082 +615 W 0.078 +616 S 0.086 +617 I 0.095 +618 I 0.101 +619 L 0.114 +620 G 0.131 +621 Y 0.148 +622 C 0.169 +623 I 0.204 +624 G 0.245 +625 T 0.267 +626 S 0.253 +627 S 0.214 +628 F 0.168 +629 I 0.126 +630 C 0.100 +631 I 0.088 +632 P 0.078 +633 T 0.065 +634 Y 0.056 +635 I 0.054 +636 A 0.053 +637 Y 0.053 +638 R 0.058 +639 L 0.068 +640 I 0.084 +641 I 0.106 +642 T 0.126 +643 P 0.132 +644 G 0.125 +645 T 0.114 +646 F 0.107 +647 K 0.106 +648 E 0.108 +649 R 0.116 +650 I 0.127 +651 I 0.139 +652 K 0.149 +653 S 0.155 +654 I 0.156 +655 T 0.157 +656 P 0.166 +657 E 0.190 +658 T 0.225 +659 P 0.266 +660 T 0.308 +661 E 0.345 +662 I 0.369 +663 P 0.375 +664 C 0.366 +665 G 0.352 +666 D 0.336 +667 I 0.317 +668 R 0.297 +669 L 0.288 +670 N 0.297 +671 A 0.320 +672 V 0.339 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000108688.11_ENST00000378569.2_GN:CCL7_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000108688.11_ENST00000378569.2_GN:CCL7_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e50906b752811da7dfa505c3f882541fa7031727 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000108688.11_ENST00000378569.2_GN:CCL7_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,100 @@ +>ENSG00000108688.11|ENST00000378569.2|GN:CCL7|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.381 +2 K 0.386 +3 A 0.389 +4 S 0.373 +5 A 0.327 +6 A 0.273 +7 L 0.241 +8 L 0.239 +9 C 0.253 +10 L 0.285 +11 L 0.345 +12 L 0.425 +13 T 0.500 +14 A 0.550 +15 A 0.570 +16 A 0.568 +17 F 0.567 +18 S 0.590 +19 P 0.639 +20 Q 0.690 +21 G 0.723 +22 L 0.730 +23 A 0.721 +24 Q 0.715 +25 P 0.721 +26 V 0.732 +27 G 0.732 +28 I 0.711 +29 N 0.663 +30 T 0.586 +31 S 0.477 +32 T 0.350 +33 T 0.229 +34 C 0.138 +35 C 0.088 +36 Y 0.071 +37 R 0.073 +38 F 0.078 +39 I 0.080 +40 N 0.084 +41 K 0.092 +42 K 0.099 +43 I 0.095 +44 P 0.082 +45 K 0.066 +46 Q 0.056 +47 R 0.050 +48 L 0.044 +49 E 0.040 +50 S 0.041 +51 Y 0.050 +52 R 0.068 +53 R 0.090 +54 T 0.109 +55 T 0.123 +56 S 0.129 +57 S 0.123 +58 H 0.108 +59 C 0.094 +60 P 0.086 +61 R 0.083 +62 E 0.075 +63 A 0.058 +64 V 0.038 +65 I 0.026 +66 F 0.024 +67 K 0.031 +68 T 0.043 +69 K 0.058 +70 L 0.074 +71 D 0.085 +72 K 0.086 +73 E 0.077 +74 I 0.066 +75 C 0.064 +76 A 0.070 +77 D 0.075 +78 P 0.070 +79 T 0.057 +80 Q 0.043 +81 K 0.034 +82 W 0.030 +83 V 0.029 +84 Q 0.031 +85 D 0.037 +86 F 0.047 +87 M 0.063 +88 K 0.078 +89 H 0.089 +90 L 0.103 +91 D 0.129 +92 K 0.170 +93 K 0.230 +94 T 0.305 +95 Q 0.383 +96 T 0.443 +97 P 0.463 +98 K 0.444 +99 L 0.415 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000108688.11_ENST00000378569.2_GN:CCL7_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000108688.11_ENST00000378569.2_GN:CCL7_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1e87f55534982a7e964038c5401f750568d5624a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000108688.11_ENST00000378569.2_GN:CCL7_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid @@ -0,0 +1,110 @@ +>ENSG00000108688.11|ENST00000378569.2|GN:CCL7|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:10 +1 M 0.417 +2 W 0.451 +3 K 0.500 +4 P 0.546 +5 M 0.578 +6 P 0.600 +7 S 0.618 +8 P 0.632 +9 S 0.634 +10 N 0.621 +11 M 0.602 +12 K 0.591 +13 A 0.578 +14 S 0.537 +15 A 0.461 +16 A 0.376 +17 L 0.309 +18 L 0.274 +19 C 0.264 +20 L 0.283 +21 L 0.335 +22 L 0.411 +23 T 0.486 +24 A 0.540 +25 A 0.565 +26 A 0.567 +27 F 0.568 +28 S 0.592 +29 P 0.640 +30 Q 0.691 +31 G 0.725 +32 L 0.734 +33 A 0.726 +34 Q 0.719 +35 P 0.725 +36 V 0.737 +37 G 0.736 +38 I 0.714 +39 N 0.664 +40 T 0.582 +41 S 0.471 +42 T 0.344 +43 T 0.224 +44 C 0.135 +45 C 0.085 +46 Y 0.070 +47 R 0.072 +48 F 0.077 +49 I 0.080 +50 N 0.083 +51 K 0.091 +52 K 0.098 +53 I 0.094 +54 P 0.080 +55 K 0.065 +56 Q 0.055 +57 R 0.049 +58 L 0.045 +59 E 0.041 +60 S 0.041 +61 Y 0.050 +62 R 0.067 +63 R 0.088 +64 T 0.107 +65 T 0.120 +66 S 0.126 +67 S 0.119 +68 H 0.105 +69 C 0.091 +70 P 0.084 +71 R 0.081 +72 E 0.073 +73 A 0.057 +74 V 0.038 +75 I 0.026 +76 F 0.024 +77 K 0.031 +78 T 0.043 +79 K 0.058 +80 L 0.074 +81 D 0.085 +82 K 0.086 +83 E 0.077 +84 I 0.067 +85 C 0.065 +86 A 0.071 +87 D 0.076 +88 P 0.071 +89 T 0.058 +90 Q 0.044 +91 K 0.034 +92 W 0.030 +93 V 0.030 +94 Q 0.032 +95 D 0.037 +96 F 0.048 +97 M 0.064 +98 K 0.078 +99 H 0.089 +100 L 0.101 +101 D 0.125 +102 K 0.166 +103 K 0.227 +104 T 0.304 +105 Q 0.383 +106 T 0.443 +107 P 0.465 +108 K 0.448 +109 L 0.421 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000108700.5_ENST00000394620.2_GN:CCL8_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000108700.5_ENST00000394620.2_GN:CCL8_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d91fa8e9ab2ff1aced0d5da34969103a52f54cc7 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000108700.5_ENST00000394620.2_GN:CCL8_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,100 @@ +>ENSG00000108700.5|ENST00000394620.2|GN:CCL8|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.327 +2 K 0.310 +3 V 0.288 +4 S 0.267 +5 A 0.242 +6 A 0.216 +7 L 0.200 +8 L 0.197 +9 C 0.205 +10 L 0.224 +11 L 0.262 +12 L 0.317 +13 M 0.373 +14 A 0.419 +15 A 0.451 +16 T 0.474 +17 F 0.503 +18 S 0.554 +19 P 0.620 +20 Q 0.678 +21 G 0.712 +22 L 0.720 +23 A 0.711 +24 Q 0.703 +25 P 0.707 +26 D 0.711 +27 S 0.695 +28 V 0.650 +29 S 0.580 +30 I 0.493 +31 P 0.391 +32 I 0.283 +33 T 0.185 +34 C 0.114 +35 C 0.078 +36 F 0.071 +37 N 0.077 +38 V 0.082 +39 I 0.085 +40 N 0.090 +41 R 0.101 +42 K 0.108 +43 I 0.103 +44 P 0.086 +45 I 0.066 +46 Q 0.052 +47 R 0.045 +48 L 0.039 +49 E 0.035 +50 S 0.032 +51 Y 0.035 +52 T 0.044 +53 R 0.055 +54 I 0.064 +55 T 0.071 +56 N 0.076 +57 I 0.078 +58 Q 0.074 +59 C 0.069 +60 P 0.067 +61 K 0.066 +62 E 0.060 +63 A 0.046 +64 V 0.031 +65 I 0.022 +66 F 0.022 +67 K 0.030 +68 T 0.043 +69 K 0.061 +70 R 0.079 +71 G 0.093 +72 K 0.096 +73 E 0.088 +74 V 0.077 +75 C 0.074 +76 A 0.080 +77 D 0.085 +78 P 0.079 +79 K 0.064 +80 E 0.050 +81 R 0.042 +82 W 0.038 +83 V 0.037 +84 R 0.039 +85 D 0.045 +86 S 0.054 +87 M 0.064 +88 K 0.069 +89 H 0.065 +90 L 0.063 +91 D 0.072 +92 Q 0.088 +93 I 0.103 +94 F 0.118 +95 Q 0.143 +96 N 0.179 +97 L 0.217 +98 K 0.246 +99 P 0.259 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000108700.5_ENST00000394620.2_GN:CCL8_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000108700.5_ENST00000394620.2_GN:CCL8_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..8380d7d5954e8531091261039811826b9340caf3 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000108700.5_ENST00000394620.2_GN:CCL8_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid @@ -0,0 +1,110 @@ +>ENSG00000108700.5|ENST00000394620.2|GN:CCL8|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:10 +1 M 0.431 +2 L 0.457 +3 K 0.497 +4 L 0.534 +5 T 0.555 +6 P 0.560 +7 L 0.561 +8 P 0.567 +9 S 0.573 +10 K 0.567 +11 M 0.544 +12 K 0.510 +13 V 0.468 +14 S 0.413 +15 A 0.347 +16 A 0.284 +17 L 0.239 +18 L 0.221 +19 C 0.225 +20 L 0.240 +21 L 0.267 +22 L 0.309 +23 M 0.359 +24 A 0.403 +25 A 0.435 +26 T 0.459 +27 F 0.493 +28 S 0.547 +29 P 0.615 +30 Q 0.675 +31 G 0.712 +32 L 0.722 +33 A 0.715 +34 Q 0.709 +35 P 0.713 +36 D 0.717 +37 S 0.700 +38 V 0.652 +39 S 0.579 +40 I 0.488 +41 P 0.385 +42 I 0.278 +43 T 0.182 +44 C 0.112 +45 C 0.076 +46 F 0.069 +47 N 0.075 +48 V 0.080 +49 I 0.083 +50 N 0.089 +51 R 0.100 +52 K 0.107 +53 I 0.102 +54 P 0.085 +55 I 0.065 +56 Q 0.052 +57 R 0.044 +58 L 0.040 +59 E 0.035 +60 S 0.033 +61 Y 0.035 +62 T 0.043 +63 R 0.053 +64 I 0.061 +65 T 0.067 +66 N 0.072 +67 I 0.074 +68 Q 0.071 +69 C 0.067 +70 P 0.066 +71 K 0.065 +72 E 0.059 +73 A 0.046 +74 V 0.031 +75 I 0.022 +76 F 0.022 +77 K 0.029 +78 T 0.043 +79 K 0.060 +80 R 0.078 +81 G 0.092 +82 K 0.096 +83 E 0.089 +84 V 0.079 +85 C 0.076 +86 A 0.081 +87 D 0.085 +88 P 0.079 +89 K 0.064 +90 E 0.050 +91 R 0.042 +92 W 0.038 +93 V 0.037 +94 R 0.040 +95 D 0.046 +96 S 0.055 +97 M 0.066 +98 K 0.070 +99 H 0.066 +100 L 0.063 +101 D 0.072 +102 Q 0.087 +103 I 0.102 +104 F 0.119 +105 Q 0.145 +106 N 0.183 +107 L 0.222 +108 K 0.251 +109 P 0.264 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000111701.7_ENST00000229304.5_GN:APOBEC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000111701.7_ENST00000229304.5_GN:APOBEC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9489db0d9f979f43f593e7db7f464bdab845c73b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000111701.7_ENST00000229304.5_GN:APOBEC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,237 @@ +>ENSG00000111701.7|ENST00000229304.5|GN:APOBEC1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.428 +2 T 0.443 +3 S 0.478 +4 E 0.522 +5 K 0.559 +6 G 0.581 +7 P 0.590 +8 S 0.582 +9 T 0.544 +10 G 0.469 +11 D 0.374 +12 P 0.286 +13 T 0.219 +14 L 0.171 +15 R 0.140 +16 R 0.124 +17 R 0.118 +18 I 0.111 +19 E 0.099 +20 P 0.086 +21 W 0.079 +22 E 0.076 +23 F 0.077 +24 D 0.079 +25 V 0.078 +26 F 0.075 +27 Y 0.072 +28 D 0.073 +29 P 0.078 +30 R 0.084 +31 E 0.090 +32 L 0.092 +33 R 0.087 +34 K 0.075 +35 E 0.059 +36 A 0.042 +37 C 0.030 +38 L 0.023 +39 L 0.020 +40 Y 0.019 +41 E 0.021 +42 I 0.025 +43 K 0.033 +44 W 0.045 +45 G 0.058 +46 M 0.071 +47 S 0.080 +48 R 0.087 +49 K 0.090 +50 I 0.087 +51 W 0.077 +52 R 0.066 +53 S 0.061 +54 S 0.062 +55 G 0.067 +56 K 0.076 +57 N 0.087 +58 T 0.094 +59 T 0.090 +60 N 0.079 +61 H 0.070 +62 V 0.065 +63 E 0.061 +64 V 0.055 +65 N 0.048 +66 F 0.043 +67 I 0.039 +68 K 0.038 +69 K 0.039 +70 F 0.042 +71 T 0.051 +72 S 0.069 +73 E 0.093 +74 R 0.115 +75 D 0.134 +76 F 0.147 +77 H 0.154 +78 P 0.154 +79 S 0.148 +80 M 0.134 +81 S 0.115 +82 C 0.096 +83 S 0.085 +84 I 0.078 +85 T 0.071 +86 W 0.061 +87 F 0.053 +88 L 0.052 +89 S 0.057 +90 W 0.067 +91 S 0.073 +92 P 0.070 +93 C 0.059 +94 W 0.048 +95 E 0.044 +96 C 0.050 +97 S 0.062 +98 Q 0.071 +99 A 0.071 +100 I 0.070 +101 R 0.073 +102 E 0.072 +103 F 0.062 +104 L 0.053 +105 S 0.050 +106 R 0.051 +107 H 0.056 +108 P 0.063 +109 G 0.066 +110 V 0.063 +111 T 0.058 +112 L 0.054 +113 V 0.053 +114 I 0.051 +115 Y 0.047 +116 V 0.040 +117 A 0.034 +118 R 0.033 +119 L 0.036 +120 F 0.040 +121 W 0.044 +122 H 0.049 +123 M 0.053 +124 D 0.056 +125 Q 0.057 +126 Q 0.055 +127 N 0.052 +128 R 0.049 +129 Q 0.048 +130 G 0.048 +131 L 0.048 +132 R 0.048 +133 D 0.050 +134 L 0.055 +135 V 0.061 +136 N 0.067 +137 S 0.077 +138 G 0.087 +139 V 0.092 +140 T 0.088 +141 I 0.081 +142 Q 0.078 +143 I 0.076 +144 M 0.070 +145 R 0.059 +146 A 0.049 +147 S 0.042 +148 E 0.038 +149 Y 0.037 +150 Y 0.037 +151 H 0.039 +152 C 0.042 +153 W 0.047 +154 R 0.055 +155 N 0.065 +156 F 0.074 +157 V 0.086 +158 N 0.109 +159 Y 0.147 +160 P 0.192 +161 P 0.229 +162 G 0.252 +163 D 0.260 +164 E 0.254 +165 A 0.236 +166 H 0.212 +167 W 0.188 +168 P 0.169 +169 Q 0.156 +170 Y 0.147 +171 P 0.135 +172 P 0.111 +173 L 0.086 +174 W 0.070 +175 M 0.064 +176 M 0.059 +177 L 0.056 +178 Y 0.055 +179 A 0.055 +180 L 0.054 +181 E 0.055 +182 L 0.058 +183 H 0.059 +184 C 0.059 +185 I 0.062 +186 I 0.073 +187 L 0.096 +188 S 0.137 +189 L 0.189 +190 P 0.236 +191 P 0.268 +192 C 0.284 +193 L 0.283 +194 K 0.261 +195 I 0.227 +196 S 0.199 +197 R 0.186 +198 R 0.181 +199 W 0.174 +200 Q 0.161 +201 N 0.147 +202 H 0.131 +203 L 0.112 +204 T 0.097 +205 F 0.091 +206 F 0.095 +207 R 0.106 +208 L 0.119 +209 H 0.131 +210 L 0.146 +211 Q 0.173 +212 N 0.208 +213 C 0.238 +214 H 0.256 +215 Y 0.272 +216 Q 0.294 +217 T 0.314 +218 I 0.322 +219 P 0.323 +220 P 0.331 +221 H 0.353 +222 I 0.384 +223 L 0.406 +224 L 0.411 +225 A 0.409 +226 T 0.407 +227 G 0.405 +228 L 0.401 +229 I 0.401 +230 H 0.407 +231 P 0.420 +232 S 0.435 +233 V 0.441 +234 A 0.426 +235 W 0.391 +236 R 0.361 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000111701.7_ENST00000229304.5_GN:APOBEC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000111701.7_ENST00000229304.5_GN:APOBEC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e9b9379072743108311611bd3701d9b6609e0875 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000111701.7_ENST00000229304.5_GN:APOBEC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid @@ -0,0 +1,249 @@ +>ENSG00000111701.7|ENST00000229304.5|GN:APOBEC1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:12 +1 M 0.288 +2 T 0.307 +3 P 0.340 +4 E 0.367 +5 E 0.372 +6 E 0.354 +7 V 0.332 +8 Q 0.333 +9 R 0.374 +10 Q 0.440 +11 S 0.504 +12 T 0.549 +13 M 0.573 +14 T 0.582 +15 S 0.587 +16 E 0.592 +17 K 0.595 +18 G 0.596 +19 P 0.597 +20 S 0.589 +21 T 0.554 +22 G 0.482 +23 D 0.390 +24 P 0.304 +25 T 0.237 +26 L 0.187 +27 R 0.152 +28 R 0.132 +29 R 0.123 +30 I 0.115 +31 E 0.101 +32 P 0.085 +33 W 0.076 +34 E 0.073 +35 F 0.074 +36 D 0.077 +37 V 0.077 +38 F 0.074 +39 Y 0.071 +40 D 0.073 +41 P 0.078 +42 R 0.083 +43 E 0.088 +44 L 0.090 +45 R 0.086 +46 K 0.074 +47 E 0.057 +48 A 0.041 +49 C 0.029 +50 L 0.022 +51 L 0.019 +52 Y 0.019 +53 E 0.020 +54 I 0.024 +55 K 0.031 +56 W 0.042 +57 G 0.056 +58 M 0.068 +59 S 0.077 +60 R 0.084 +61 K 0.088 +62 I 0.085 +63 W 0.074 +64 R 0.064 +65 S 0.058 +66 S 0.059 +67 G 0.064 +68 K 0.073 +69 N 0.084 +70 T 0.090 +71 T 0.087 +72 N 0.076 +73 H 0.067 +74 V 0.063 +75 E 0.059 +76 V 0.053 +77 N 0.046 +78 F 0.041 +79 I 0.038 +80 K 0.037 +81 K 0.037 +82 F 0.040 +83 T 0.049 +84 S 0.066 +85 E 0.088 +86 R 0.110 +87 D 0.128 +88 F 0.141 +89 H 0.148 +90 P 0.149 +91 S 0.143 +92 M 0.131 +93 S 0.112 +94 C 0.095 +95 S 0.084 +96 I 0.078 +97 T 0.071 +98 W 0.061 +99 F 0.053 +100 L 0.051 +101 S 0.056 +102 W 0.065 +103 S 0.072 +104 P 0.068 +105 C 0.057 +106 W 0.047 +107 E 0.043 +108 C 0.049 +109 S 0.062 +110 Q 0.070 +111 A 0.070 +112 I 0.069 +113 R 0.072 +114 E 0.071 +115 F 0.062 +116 L 0.052 +117 S 0.049 +118 R 0.051 +119 H 0.056 +120 P 0.063 +121 G 0.066 +122 V 0.063 +123 T 0.058 +124 L 0.054 +125 V 0.053 +126 I 0.051 +127 Y 0.047 +128 V 0.040 +129 A 0.034 +130 R 0.033 +131 L 0.036 +132 F 0.040 +133 W 0.044 +134 H 0.049 +135 M 0.053 +136 D 0.057 +137 Q 0.058 +138 Q 0.056 +139 N 0.053 +140 R 0.050 +141 Q 0.049 +142 G 0.049 +143 L 0.049 +144 R 0.048 +145 D 0.050 +146 L 0.054 +147 V 0.059 +148 N 0.064 +149 S 0.074 +150 G 0.086 +151 V 0.092 +152 T 0.088 +153 I 0.081 +154 Q 0.078 +155 I 0.076 +156 M 0.070 +157 R 0.059 +158 A 0.048 +159 S 0.041 +160 E 0.038 +161 Y 0.037 +162 Y 0.038 +163 H 0.040 +164 C 0.042 +165 W 0.047 +166 R 0.055 +167 N 0.065 +168 F 0.073 +169 V 0.084 +170 N 0.107 +171 Y 0.145 +172 P 0.189 +173 P 0.227 +174 G 0.249 +175 D 0.256 +176 E 0.250 +177 A 0.232 +178 H 0.207 +179 W 0.184 +180 P 0.165 +181 Q 0.153 +182 Y 0.144 +183 P 0.132 +184 P 0.109 +185 L 0.084 +186 W 0.069 +187 M 0.063 +188 M 0.059 +189 L 0.055 +190 Y 0.055 +191 A 0.054 +192 L 0.053 +193 E 0.054 +194 L 0.057 +195 H 0.057 +196 C 0.056 +197 I 0.060 +198 I 0.071 +199 L 0.095 +200 S 0.137 +201 L 0.189 +202 P 0.236 +203 P 0.267 +204 C 0.282 +205 L 0.280 +206 K 0.258 +207 I 0.225 +208 S 0.197 +209 R 0.185 +210 R 0.181 +211 W 0.174 +212 Q 0.164 +213 N 0.151 +214 H 0.134 +215 L 0.114 +216 T 0.098 +217 F 0.092 +218 F 0.091 +219 R 0.096 +220 L 0.107 +221 H 0.121 +222 L 0.142 +223 Q 0.173 +224 N 0.210 +225 C 0.241 +226 H 0.260 +227 Y 0.277 +228 Q 0.300 +229 T 0.320 +230 I 0.329 +231 P 0.331 +232 P 0.340 +233 H 0.366 +234 I 0.399 +235 L 0.422 +236 L 0.429 +237 A 0.426 +238 T 0.423 +239 G 0.419 +240 L 0.413 +241 I 0.413 +242 H 0.419 +243 P 0.433 +244 S 0.449 +245 V 0.457 +246 A 0.441 +247 W 0.405 +248 R 0.373 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000112599.9_ENST00000230361.4_GN:GUCA1B_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000112599.9_ENST00000230361.4_GN:GUCA1B_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2bf1b656b051fcd5a5826d23d56c0e878e394471 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000112599.9_ENST00000230361.4_GN:GUCA1B_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,201 @@ +>ENSG00000112599.9|ENST00000230361.4|GN:GUCA1B|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.402 +2 G 0.384 +3 Q 0.344 +4 E 0.280 +5 F 0.206 +6 S 0.142 +7 W 0.105 +8 E 0.095 +9 E 0.098 +10 A 0.102 +11 E 0.104 +12 A 0.107 +13 A 0.109 +14 G 0.105 +15 E 0.096 +16 I 0.086 +17 D 0.078 +18 V 0.073 +19 A 0.067 +20 E 0.053 +21 L 0.037 +22 Q 0.025 +23 E 0.022 +24 W 0.029 +25 Y 0.043 +26 K 0.050 +27 K 0.043 +28 F 0.032 +29 V 0.029 +30 M 0.036 +31 E 0.048 +32 C 0.060 +33 P 0.068 +34 S 0.072 +35 G 0.074 +36 T 0.073 +37 L 0.065 +38 F 0.051 +39 M 0.038 +40 H 0.032 +41 E 0.032 +42 F 0.035 +43 K 0.042 +44 R 0.053 +45 F 0.065 +46 F 0.077 +47 K 0.094 +48 V 0.119 +49 T 0.144 +50 D 0.160 +51 D 0.165 +52 E 0.168 +53 E 0.166 +54 A 0.151 +55 S 0.125 +56 Q 0.097 +57 Y 0.076 +58 V 0.062 +59 E 0.058 +60 G 0.060 +61 M 0.063 +62 F 0.063 +63 R 0.060 +64 A 0.058 +65 F 0.061 +66 D 0.075 +67 K 0.099 +68 N 0.120 +69 G 0.124 +70 D 0.110 +71 N 0.095 +72 T 0.089 +73 I 0.083 +74 D 0.069 +75 F 0.055 +76 L 0.050 +77 E 0.052 +78 Y 0.051 +79 V 0.047 +80 A 0.046 +81 A 0.047 +82 L 0.045 +83 N 0.044 +84 L 0.049 +85 V 0.060 +86 L 0.072 +87 R 0.079 +88 G 0.078 +89 T 0.071 +90 L 0.062 +91 E 0.058 +92 H 0.056 +93 K 0.053 +94 L 0.050 +95 K 0.051 +96 W 0.057 +97 T 0.065 +98 F 0.071 +99 K 0.073 +100 I 0.070 +101 Y 0.066 +102 D 0.072 +103 K 0.091 +104 D 0.112 +105 G 0.121 +106 N 0.118 +107 G 0.111 +108 C 0.103 +109 I 0.091 +110 D 0.076 +111 R 0.067 +112 L 0.067 +113 E 0.067 +114 L 0.059 +115 L 0.049 +116 N 0.042 +117 I 0.039 +118 V 0.038 +119 E 0.039 +120 G 0.041 +121 I 0.043 +122 Y 0.047 +123 Q 0.052 +124 L 0.057 +125 K 0.064 +126 K 0.080 +127 A 0.103 +128 C 0.127 +129 R 0.151 +130 R 0.180 +131 E 0.214 +132 L 0.248 +133 Q 0.277 +134 T 0.299 +135 E 0.314 +136 Q 0.324 +137 G 0.325 +138 Q 0.303 +139 L 0.251 +140 L 0.180 +141 T 0.115 +142 P 0.075 +143 E 0.059 +144 E 0.057 +145 V 0.057 +146 V 0.053 +147 D 0.047 +148 R 0.043 +149 I 0.044 +150 F 0.045 +151 L 0.045 +152 L 0.049 +153 V 0.061 +154 D 0.083 +155 E 0.115 +156 N 0.146 +157 G 0.159 +158 D 0.155 +159 G 0.150 +160 Q 0.144 +161 L 0.127 +162 S 0.098 +163 L 0.070 +164 N 0.052 +165 E 0.043 +166 F 0.038 +167 V 0.036 +168 E 0.039 +169 G 0.047 +170 A 0.052 +171 R 0.054 +172 R 0.053 +173 D 0.051 +174 K 0.048 +175 W 0.045 +176 V 0.045 +177 M 0.050 +178 K 0.057 +179 M 0.065 +180 L 0.077 +181 Q 0.098 +182 M 0.125 +183 D 0.145 +184 M 0.146 +185 N 0.134 +186 P 0.126 +187 S 0.127 +188 S 0.131 +189 W 0.126 +190 L 0.118 +191 A 0.117 +192 Q 0.121 +193 Q 0.128 +194 R 0.146 +195 R 0.184 +196 K 0.240 +197 S 0.298 +198 A 0.339 +199 M 0.351 +200 F 0.347 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000112599.9_ENST00000230361.4_GN:GUCA1B_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000112599.9_ENST00000230361.4_GN:GUCA1B_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..269bf0351adf2fe8e1afc3f966fe8aa3f5045d59 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000112599.9_ENST00000230361.4_GN:GUCA1B_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid @@ -0,0 +1,207 @@ +>ENSG00000112599.9|ENST00000230361.4|GN:GUCA1B|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:6 +1 M 0.281 +2 L 0.298 +3 L 0.336 +4 R 0.392 +5 A 0.439 +6 S 0.456 +7 M 0.443 +8 G 0.407 +9 Q 0.345 +10 E 0.265 +11 F 0.185 +12 S 0.125 +13 W 0.094 +14 E 0.088 +15 E 0.093 +16 A 0.097 +17 E 0.098 +18 A 0.100 +19 A 0.102 +20 G 0.099 +21 E 0.093 +22 I 0.084 +23 D 0.077 +24 V 0.073 +25 A 0.067 +26 E 0.053 +27 L 0.037 +28 Q 0.025 +29 E 0.022 +30 W 0.029 +31 Y 0.042 +32 K 0.049 +33 K 0.042 +34 F 0.032 +35 V 0.028 +36 M 0.035 +37 E 0.047 +38 C 0.059 +39 P 0.066 +40 S 0.069 +41 G 0.071 +42 T 0.070 +43 L 0.063 +44 F 0.050 +45 M 0.037 +46 H 0.032 +47 E 0.032 +48 F 0.035 +49 K 0.041 +50 R 0.052 +51 F 0.064 +52 F 0.075 +53 K 0.091 +54 V 0.115 +55 T 0.139 +56 D 0.155 +57 D 0.161 +58 E 0.165 +59 E 0.164 +60 A 0.150 +61 S 0.123 +62 Q 0.096 +63 Y 0.074 +64 V 0.061 +65 E 0.056 +66 G 0.058 +67 M 0.061 +68 F 0.061 +69 R 0.058 +70 A 0.056 +71 F 0.059 +72 D 0.073 +73 K 0.095 +74 N 0.116 +75 G 0.119 +76 D 0.106 +77 N 0.092 +78 T 0.087 +79 I 0.081 +80 D 0.067 +81 F 0.053 +82 L 0.048 +83 E 0.049 +84 Y 0.048 +85 V 0.045 +86 A 0.044 +87 A 0.046 +88 L 0.045 +89 N 0.043 +90 L 0.049 +91 V 0.060 +92 L 0.071 +93 R 0.078 +94 G 0.078 +95 T 0.070 +96 L 0.061 +97 E 0.057 +98 H 0.055 +99 K 0.052 +100 L 0.049 +101 K 0.050 +102 W 0.056 +103 T 0.064 +104 F 0.070 +105 K 0.072 +106 I 0.069 +107 Y 0.066 +108 D 0.072 +109 K 0.090 +110 D 0.112 +111 G 0.121 +112 N 0.117 +113 G 0.110 +114 C 0.103 +115 I 0.091 +116 D 0.076 +117 R 0.067 +118 L 0.067 +119 E 0.067 +120 L 0.060 +121 L 0.049 +122 N 0.042 +123 I 0.039 +124 V 0.039 +125 E 0.039 +126 G 0.041 +127 I 0.043 +128 Y 0.048 +129 Q 0.053 +130 L 0.057 +131 K 0.065 +132 K 0.082 +133 A 0.105 +134 C 0.129 +135 R 0.154 +136 R 0.183 +137 E 0.218 +138 L 0.253 +139 Q 0.281 +140 T 0.301 +141 E 0.315 +142 Q 0.326 +143 G 0.326 +144 Q 0.304 +145 L 0.251 +146 L 0.180 +147 T 0.115 +148 P 0.075 +149 E 0.059 +150 E 0.057 +151 V 0.057 +152 V 0.053 +153 D 0.047 +154 R 0.044 +155 I 0.044 +156 F 0.045 +157 L 0.046 +158 L 0.049 +159 V 0.060 +160 D 0.082 +161 E 0.115 +162 N 0.146 +163 G 0.159 +164 D 0.155 +165 G 0.150 +166 Q 0.144 +167 L 0.127 +168 S 0.098 +169 L 0.070 +170 N 0.053 +171 E 0.044 +172 F 0.038 +173 V 0.036 +174 E 0.039 +175 G 0.046 +176 A 0.052 +177 R 0.054 +178 R 0.053 +179 D 0.050 +180 K 0.047 +181 W 0.044 +182 V 0.044 +183 M 0.049 +184 K 0.056 +185 M 0.064 +186 L 0.076 +187 Q 0.097 +188 M 0.125 +189 D 0.144 +190 M 0.145 +191 N 0.134 +192 P 0.125 +193 S 0.126 +194 S 0.130 +195 W 0.127 +196 L 0.123 +197 A 0.123 +198 Q 0.126 +199 Q 0.130 +200 R 0.145 +201 R 0.182 +202 K 0.238 +203 S 0.297 +204 A 0.337 +205 M 0.349 +206 F 0.346 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000123171.8_ENST00000242819.7_GN:CCDC70_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000123171.8_ENST00000242819.7_GN:CCDC70_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..014cd0aaf6b164f73368f735b7bd2c6fda1f3643 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000123171.8_ENST00000242819.7_GN:CCDC70_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,223 @@ +>ENSG00000123171.8|ENST00000242819.7|GN:CCDC70|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.352 +2 F 0.363 +3 S 0.387 +4 F 0.419 +5 K 0.448 +6 V 0.461 +7 S 0.453 +8 R 0.435 +9 W 0.424 +10 M 0.425 +11 G 0.416 +12 L 0.390 +13 A 0.369 +14 C 0.366 +15 F 0.378 +16 R 0.406 +17 S 0.450 +18 L 0.493 +19 A 0.518 +20 A 0.520 +21 S 0.500 +22 S 0.462 +23 P 0.405 +24 S 0.339 +25 I 0.284 +26 R 0.255 +27 Q 0.242 +28 K 0.234 +29 K 0.227 +30 L 0.225 +31 M 0.224 +32 H 0.222 +33 K 0.218 +34 L 0.222 +35 Q 0.242 +36 E 0.271 +37 E 0.296 +38 K 0.313 +39 A 0.317 +40 F 0.302 +41 R 0.276 +42 E 0.258 +43 E 0.255 +44 M 0.255 +45 K 0.252 +46 I 0.245 +47 F 0.239 +48 R 0.242 +49 E 0.252 +50 K 0.263 +51 I 0.275 +52 E 0.289 +53 D 0.297 +54 F 0.296 +55 R 0.295 +56 E 0.290 +57 E 0.269 +58 M 0.245 +59 W 0.237 +60 T 0.253 +61 F 0.288 +62 R 0.333 +63 G 0.368 +64 K 0.373 +65 I 0.352 +66 H 0.328 +67 A 0.309 +68 F 0.293 +69 R 0.291 +70 G 0.306 +71 Q 0.323 +72 I 0.339 +73 L 0.361 +74 G 0.368 +75 F 0.341 +76 W 0.305 +77 E 0.295 +78 E 0.306 +79 E 0.313 +80 R 0.314 +81 P 0.318 +82 F 0.328 +83 W 0.352 +84 E 0.387 +85 E 0.406 +86 E 0.386 +87 K 0.342 +88 T 0.308 +89 F 0.296 +90 W 0.302 +91 K 0.324 +92 E 0.355 +93 E 0.376 +94 K 0.372 +95 S 0.342 +96 F 0.295 +97 W 0.262 +98 E 0.259 +99 M 0.276 +100 E 0.298 +101 K 0.320 +102 S 0.328 +103 F 0.316 +104 R 0.305 +105 E 0.312 +106 E 0.326 +107 E 0.323 +108 K 0.298 +109 T 0.264 +110 F 0.234 +111 W 0.218 +112 K 0.216 +113 K 0.217 +114 Y 0.215 +115 R 0.217 +116 T 0.228 +117 F 0.245 +118 W 0.271 +119 K 0.307 +120 E 0.341 +121 D 0.366 +122 K 0.379 +123 A 0.386 +124 F 0.392 +125 W 0.404 +126 K 0.427 +127 E 0.446 +128 D 0.441 +129 N 0.399 +130 A 0.337 +131 L 0.285 +132 W 0.258 +133 E 0.246 +134 R 0.244 +135 D 0.252 +136 R 0.262 +137 N 0.263 +138 L 0.253 +139 L 0.255 +140 Q 0.280 +141 E 0.317 +142 D 0.344 +143 K 0.354 +144 A 0.346 +145 L 0.325 +146 W 0.310 +147 E 0.317 +148 E 0.334 +149 E 0.337 +150 K 0.319 +151 A 0.297 +152 L 0.284 +153 W 0.279 +154 V 0.279 +155 E 0.284 +156 E 0.289 +157 R 0.289 +158 A 0.280 +159 L 0.267 +160 L 0.269 +161 E 0.299 +162 G 0.340 +163 E 0.369 +164 K 0.378 +165 A 0.364 +166 L 0.335 +167 W 0.317 +168 E 0.327 +169 D 0.343 +170 K 0.344 +171 T 0.339 +172 S 0.339 +173 L 0.341 +174 W 0.343 +175 E 0.351 +176 E 0.359 +177 E 0.350 +178 N 0.325 +179 A 0.300 +180 L 0.283 +181 W 0.264 +182 E 0.239 +183 E 0.217 +184 E 0.201 +185 R 0.191 +186 A 0.188 +187 F 0.187 +188 W 0.189 +189 M 0.198 +190 E 0.220 +191 N 0.260 +192 N 0.316 +193 G 0.383 +194 H 0.444 +195 I 0.491 +196 A 0.532 +197 G 0.569 +198 E 0.590 +199 Q 0.588 +200 M 0.569 +201 L 0.543 +202 E 0.515 +203 D 0.496 +204 G 0.501 +205 P 0.537 +206 H 0.586 +207 N 0.620 +208 A 0.621 +209 N 0.590 +210 R 0.541 +211 G 0.495 +212 Q 0.485 +213 R 0.524 +214 L 0.575 +215 L 0.594 +216 A 0.586 +217 F 0.574 +218 S 0.569 +219 R 0.571 +220 G 0.568 +221 R 0.548 +222 A 0.523 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000123171.8_ENST00000242819.7_GN:CCDC70_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:11.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000123171.8_ENST00000242819.7_GN:CCDC70_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:11.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f900724a136a4609561849528f99385f1605cacd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000123171.8_ENST00000242819.7_GN:CCDC70_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:11.caid @@ -0,0 +1,234 @@ +>ENSG00000123171.8|ENST00000242819.7|GN:CCDC70|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:11 +1 M 0.391 +2 A 0.412 +3 T 0.443 +4 P 0.467 +5 P 0.463 +6 F 0.430 +7 R 0.389 +8 L 0.360 +9 I 0.351 +10 R 0.352 +11 K 0.354 +12 M 0.356 +13 F 0.368 +14 S 0.390 +15 F 0.417 +16 K 0.444 +17 V 0.461 +18 S 0.462 +19 R 0.450 +20 W 0.445 +21 M 0.451 +22 G 0.449 +23 L 0.435 +24 A 0.433 +25 C 0.449 +26 F 0.467 +27 R 0.484 +28 S 0.504 +29 L 0.523 +30 A 0.527 +31 A 0.515 +32 S 0.490 +33 S 0.452 +34 P 0.400 +35 S 0.339 +36 I 0.288 +37 R 0.260 +38 Q 0.251 +39 K 0.250 +40 K 0.255 +41 L 0.264 +42 M 0.271 +43 H 0.272 +44 K 0.266 +45 L 0.268 +46 Q 0.289 +47 E 0.323 +48 E 0.350 +49 K 0.364 +50 A 0.362 +51 F 0.338 +52 R 0.305 +53 E 0.283 +54 E 0.280 +55 M 0.284 +56 K 0.283 +57 I 0.273 +58 F 0.262 +59 R 0.259 +60 E 0.267 +61 K 0.276 +62 I 0.284 +63 E 0.294 +64 D 0.298 +65 F 0.292 +66 R 0.285 +67 E 0.277 +68 E 0.258 +69 M 0.235 +70 W 0.227 +71 T 0.242 +72 F 0.275 +73 R 0.316 +74 G 0.349 +75 K 0.356 +76 I 0.339 +77 H 0.319 +78 A 0.302 +79 F 0.288 +80 R 0.287 +81 G 0.300 +82 Q 0.315 +83 I 0.332 +84 L 0.355 +85 G 0.364 +86 F 0.337 +87 W 0.301 +88 E 0.290 +89 E 0.300 +90 E 0.309 +91 R 0.312 +92 P 0.316 +93 F 0.325 +94 W 0.346 +95 E 0.375 +96 E 0.391 +97 E 0.371 +98 K 0.331 +99 T 0.299 +100 F 0.285 +101 W 0.285 +102 K 0.304 +103 E 0.338 +104 E 0.362 +105 K 0.361 +106 S 0.333 +107 F 0.290 +108 W 0.256 +109 E 0.249 +110 M 0.262 +111 E 0.283 +112 K 0.305 +113 S 0.315 +114 F 0.307 +115 R 0.301 +116 E 0.315 +117 E 0.335 +118 E 0.336 +119 K 0.313 +120 T 0.279 +121 F 0.247 +122 W 0.229 +123 K 0.225 +124 K 0.224 +125 Y 0.222 +126 R 0.225 +127 T 0.237 +128 F 0.254 +129 W 0.279 +130 K 0.313 +131 E 0.347 +132 D 0.371 +133 K 0.386 +134 A 0.394 +135 F 0.401 +136 W 0.414 +137 K 0.435 +138 E 0.454 +139 D 0.448 +140 N 0.406 +141 A 0.343 +142 L 0.290 +143 W 0.261 +144 E 0.247 +145 R 0.243 +146 D 0.248 +147 R 0.257 +148 N 0.258 +149 L 0.250 +150 L 0.254 +151 Q 0.280 +152 E 0.316 +153 D 0.344 +154 K 0.355 +155 A 0.347 +156 L 0.326 +157 W 0.310 +158 E 0.316 +159 E 0.332 +160 E 0.335 +161 K 0.318 +162 A 0.298 +163 L 0.287 +164 W 0.282 +165 V 0.282 +166 E 0.287 +167 E 0.293 +168 R 0.294 +169 A 0.286 +170 L 0.273 +171 L 0.275 +172 E 0.306 +173 G 0.349 +174 E 0.379 +175 K 0.386 +176 A 0.369 +177 L 0.339 +178 W 0.321 +179 E 0.331 +180 D 0.346 +181 K 0.345 +182 T 0.336 +183 S 0.337 +184 L 0.341 +185 W 0.344 +186 E 0.350 +187 E 0.356 +188 E 0.348 +189 N 0.324 +190 A 0.301 +191 L 0.286 +192 W 0.267 +193 E 0.243 +194 E 0.221 +195 E 0.205 +196 R 0.195 +197 A 0.191 +198 F 0.190 +199 W 0.191 +200 M 0.198 +201 E 0.219 +202 N 0.257 +203 N 0.311 +204 G 0.375 +205 H 0.432 +206 I 0.479 +207 A 0.521 +208 G 0.560 +209 E 0.582 +210 Q 0.581 +211 M 0.565 +212 L 0.543 +213 E 0.518 +214 D 0.500 +215 G 0.505 +216 P 0.541 +217 H 0.589 +218 N 0.623 +219 A 0.623 +220 N 0.592 +221 R 0.544 +222 G 0.499 +223 Q 0.489 +224 R 0.528 +225 L 0.578 +226 L 0.598 +227 A 0.590 +228 F 0.579 +229 S 0.574 +230 R 0.575 +231 G 0.574 +232 R 0.556 +233 A 0.532 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000123569.10_ENST00000217926.7_GN:H2BW1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000123569.10_ENST00000217926.7_GN:H2BW1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..062ed488d8b2d83de933011b1f122987972a3143 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000123569.10_ENST00000217926.7_GN:H2BW1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,148 @@ +>ENSG00000123569.10|ENST00000217926.7|GN:H2BW1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.465 +2 A 0.499 +3 G 0.540 +4 P 0.558 +5 S 0.545 +6 S 0.541 +7 E 0.580 +8 T 0.636 +9 T 0.665 +10 S 0.654 +11 E 0.610 +12 E 0.555 +13 Q 0.527 +14 L 0.548 +15 I 0.591 +16 T 0.621 +17 Q 0.640 +18 E 0.664 +19 P 0.696 +20 K 0.725 +21 E 0.747 +22 A 0.760 +23 N 0.763 +24 S 0.755 +25 T 0.731 +26 T 0.681 +27 S 0.615 +28 Q 0.575 +29 K 0.593 +30 Q 0.638 +31 S 0.667 +32 K 0.675 +33 Q 0.679 +34 R 0.687 +35 K 0.696 +36 R 0.705 +37 G 0.705 +38 R 0.694 +39 H 0.680 +40 G 0.674 +41 P 0.680 +42 R 0.689 +43 R 0.694 +44 C 0.691 +45 H 0.684 +46 S 0.669 +47 N 0.640 +48 C 0.591 +49 R 0.521 +50 G 0.434 +51 D 0.334 +52 S 0.235 +53 F 0.151 +54 A 0.092 +55 T 0.056 +56 Y 0.039 +57 F 0.035 +58 R 0.041 +59 R 0.058 +60 V 0.078 +61 L 0.091 +62 K 0.097 +63 Q 0.106 +64 V 0.120 +65 H 0.133 +66 Q 0.143 +67 G 0.154 +68 L 0.161 +69 S 0.155 +70 L 0.139 +71 S 0.123 +72 R 0.114 +73 E 0.115 +74 A 0.117 +75 V 0.111 +76 S 0.104 +77 V 0.099 +78 M 0.098 +79 D 0.107 +80 S 0.127 +81 L 0.148 +82 V 0.158 +83 H 0.154 +84 D 0.143 +85 I 0.134 +86 L 0.123 +87 D 0.105 +88 R 0.087 +89 I 0.077 +90 A 0.073 +91 T 0.066 +92 E 0.056 +93 A 0.049 +94 G 0.047 +95 H 0.049 +96 L 0.052 +97 A 0.058 +98 R 0.069 +99 S 0.083 +100 T 0.095 +101 K 0.100 +102 R 0.104 +103 Q 0.115 +104 T 0.128 +105 I 0.125 +106 T 0.102 +107 A 0.075 +108 W 0.058 +109 E 0.052 +110 T 0.051 +111 R 0.051 +112 M 0.051 +113 A 0.052 +114 V 0.057 +115 R 0.068 +116 L 0.083 +117 L 0.100 +118 L 0.112 +119 P 0.115 +120 G 0.113 +121 Q 0.110 +122 M 0.103 +123 G 0.094 +124 K 0.088 +125 L 0.090 +126 A 0.099 +127 E 0.113 +128 S 0.129 +129 E 0.139 +130 G 0.138 +131 T 0.129 +132 K 0.121 +133 A 0.119 +134 V 0.115 +135 L 0.103 +136 R 0.084 +137 T 0.070 +138 S 0.066 +139 L 0.073 +140 Y 0.088 +141 A 0.107 +142 I 0.129 +143 Q 0.158 +144 Q 0.194 +145 Q 0.229 +146 R 0.254 +147 K 0.265 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000123569.10_ENST00000217926.7_GN:H2BW1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000123569.10_ENST00000217926.7_GN:H2BW1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0a1e0d5d7dca24d3f2bd4b13a12ce52c1cd58b33 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000123569.10_ENST00000217926.7_GN:H2BW1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid @@ -0,0 +1,154 @@ +>ENSG00000123569.10|ENST00000217926.7|GN:H2BW1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:6 +1 M 0.470 +2 A 0.518 +3 T 0.574 +4 A 0.593 +5 S 0.569 +6 A 0.551 +7 M 0.580 +8 A 0.639 +9 G 0.686 +10 P 0.712 +11 S 0.724 +12 S 0.729 +13 E 0.726 +14 T 0.719 +15 T 0.707 +16 S 0.684 +17 E 0.638 +18 E 0.582 +19 Q 0.558 +20 L 0.587 +21 I 0.638 +22 T 0.670 +23 Q 0.683 +24 E 0.696 +25 P 0.717 +26 K 0.740 +27 E 0.758 +28 A 0.767 +29 N 0.767 +30 S 0.757 +31 T 0.731 +32 T 0.681 +33 S 0.613 +34 Q 0.574 +35 K 0.594 +36 Q 0.642 +37 S 0.672 +38 K 0.682 +39 Q 0.687 +40 R 0.695 +41 K 0.704 +42 R 0.712 +43 G 0.712 +44 R 0.700 +45 H 0.685 +46 G 0.679 +47 P 0.685 +48 R 0.695 +49 R 0.700 +50 C 0.698 +51 H 0.690 +52 S 0.675 +53 N 0.646 +54 C 0.595 +55 R 0.524 +56 G 0.435 +57 D 0.334 +58 S 0.234 +59 F 0.151 +60 A 0.092 +61 T 0.056 +62 Y 0.039 +63 F 0.035 +64 R 0.043 +65 R 0.061 +66 V 0.082 +67 L 0.095 +68 K 0.099 +69 Q 0.107 +70 V 0.120 +71 H 0.132 +72 Q 0.141 +73 G 0.152 +74 L 0.159 +75 S 0.153 +76 L 0.137 +77 S 0.121 +78 R 0.113 +79 E 0.115 +80 A 0.116 +81 V 0.111 +82 S 0.104 +83 V 0.099 +84 M 0.098 +85 D 0.107 +86 S 0.127 +87 L 0.148 +88 V 0.158 +89 H 0.154 +90 D 0.143 +91 I 0.135 +92 L 0.124 +93 D 0.107 +94 R 0.088 +95 I 0.078 +96 A 0.074 +97 T 0.067 +98 E 0.056 +99 A 0.049 +100 G 0.047 +101 H 0.049 +102 L 0.052 +103 A 0.058 +104 R 0.068 +105 S 0.082 +106 T 0.094 +107 K 0.099 +108 R 0.103 +109 Q 0.115 +110 T 0.128 +111 I 0.125 +112 T 0.102 +113 A 0.075 +114 W 0.058 +115 E 0.052 +116 T 0.051 +117 R 0.051 +118 M 0.051 +119 A 0.052 +120 V 0.057 +121 R 0.068 +122 L 0.084 +123 L 0.101 +124 L 0.113 +125 P 0.117 +126 G 0.115 +127 Q 0.111 +128 M 0.104 +129 G 0.094 +130 K 0.089 +131 L 0.091 +132 A 0.100 +133 E 0.113 +134 S 0.129 +135 E 0.140 +136 G 0.139 +137 T 0.129 +138 K 0.121 +139 A 0.120 +140 V 0.116 +141 L 0.103 +142 R 0.084 +143 T 0.069 +144 S 0.065 +145 L 0.072 +146 Y 0.087 +147 A 0.106 +148 I 0.128 +149 Q 0.158 +150 Q 0.194 +151 Q 0.229 +152 R 0.254 +153 K 0.265 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000124089.4_ENST00000243911.2_GN:MC3R_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000124089.4_ENST00000243911.2_GN:MC3R_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..619f64e0863f737fea66dbb29f688e3eaa6ba20f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000124089.4_ENST00000243911.2_GN:MC3R_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,324 @@ +>ENSG00000124089.4|ENST00000243911.2|GN:MC3R|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.349 +2 N 0.355 +3 A 0.367 +4 S 0.378 +5 C 0.388 +6 C 0.408 +7 L 0.449 +8 P 0.496 +9 S 0.526 +10 V 0.533 +11 Q 0.536 +12 P 0.546 +13 T 0.566 +14 L 0.595 +15 P 0.631 +16 N 0.665 +17 G 0.679 +18 S 0.668 +19 E 0.644 +20 H 0.621 +21 L 0.606 +22 Q 0.601 +23 A 0.607 +24 P 0.619 +25 F 0.627 +26 F 0.627 +27 S 0.615 +28 N 0.595 +29 Q 0.577 +30 S 0.563 +31 S 0.538 +32 S 0.485 +33 A 0.406 +34 F 0.321 +35 C 0.255 +36 E 0.213 +37 Q 0.183 +38 V 0.154 +39 F 0.128 +40 I 0.106 +41 K 0.085 +42 P 0.064 +43 E 0.043 +44 V 0.029 +45 F 0.024 +46 L 0.026 +47 S 0.030 +48 L 0.036 +49 G 0.040 +50 I 0.045 +51 V 0.051 +52 S 0.055 +53 L 0.054 +54 L 0.052 +55 E 0.054 +56 N 0.055 +57 I 0.054 +58 L 0.051 +59 V 0.048 +60 I 0.045 +61 L 0.045 +62 A 0.047 +63 V 0.051 +64 V 0.058 +65 R 0.069 +66 N 0.079 +67 G 0.085 +68 N 0.085 +69 L 0.080 +70 H 0.073 +71 S 0.062 +72 P 0.048 +73 M 0.034 +74 Y 0.024 +75 F 0.019 +76 F 0.019 +77 L 0.023 +78 C 0.031 +79 S 0.039 +80 L 0.043 +81 A 0.044 +82 V 0.044 +83 A 0.043 +84 D 0.040 +85 M 0.035 +86 L 0.027 +87 V 0.022 +88 S 0.021 +89 V 0.021 +90 S 0.020 +91 N 0.019 +92 A 0.018 +93 L 0.019 +94 E 0.022 +95 T 0.026 +96 I 0.028 +97 M 0.028 +98 I 0.029 +99 A 0.032 +100 I 0.043 +101 V 0.065 +102 H 0.097 +103 S 0.129 +104 D 0.146 +105 Y 0.145 +106 L 0.135 +107 T 0.125 +108 F 0.123 +109 E 0.122 +110 D 0.114 +111 Q 0.096 +112 F 0.082 +113 I 0.078 +114 Q 0.079 +115 H 0.077 +116 M 0.071 +117 D 0.061 +118 N 0.051 +119 I 0.044 +120 F 0.040 +121 D 0.040 +122 S 0.040 +123 M 0.038 +124 I 0.034 +125 C 0.032 +126 I 0.032 +127 S 0.033 +128 L 0.034 +129 V 0.035 +130 A 0.036 +131 S 0.036 +132 I 0.034 +133 C 0.033 +134 N 0.035 +135 L 0.037 +136 L 0.037 +137 A 0.035 +138 I 0.036 +139 A 0.040 +140 V 0.046 +141 D 0.050 +142 R 0.050 +143 Y 0.046 +144 V 0.041 +145 T 0.039 +146 I 0.040 +147 F 0.044 +148 Y 0.046 +149 A 0.047 +150 L 0.048 +151 R 0.050 +152 Y 0.052 +153 H 0.052 +154 S 0.049 +155 I 0.048 +156 M 0.049 +157 T 0.051 +158 V 0.054 +159 R 0.055 +160 K 0.052 +161 A 0.051 +162 L 0.059 +163 T 0.066 +164 L 0.063 +165 I 0.053 +166 V 0.045 +167 A 0.042 +168 I 0.041 +169 W 0.037 +170 V 0.032 +171 C 0.031 +172 C 0.034 +173 G 0.038 +174 V 0.040 +175 C 0.043 +176 G 0.046 +177 V 0.045 +178 V 0.041 +179 F 0.043 +180 I 0.048 +181 V 0.053 +182 Y 0.057 +183 S 0.066 +184 E 0.077 +185 S 0.081 +186 K 0.072 +187 M 0.057 +188 V 0.045 +189 I 0.038 +190 V 0.034 +191 C 0.032 +192 L 0.033 +193 I 0.036 +194 T 0.042 +195 M 0.048 +196 F 0.050 +197 F 0.049 +198 A 0.047 +199 M 0.047 +200 M 0.047 +201 L 0.049 +202 L 0.054 +203 M 0.059 +204 G 0.056 +205 T 0.046 +206 L 0.034 +207 Y 0.027 +208 V 0.024 +209 H 0.026 +210 M 0.033 +211 F 0.044 +212 L 0.052 +213 F 0.055 +214 A 0.059 +215 R 0.071 +216 L 0.086 +217 H 0.099 +218 V 0.116 +219 K 0.143 +220 R 0.182 +221 I 0.225 +222 A 0.263 +223 A 0.296 +224 L 0.330 +225 P 0.368 +226 P 0.416 +227 A 0.469 +228 D 0.517 +229 G 0.539 +230 V 0.529 +231 A 0.501 +232 P 0.469 +233 Q 0.431 +234 Q 0.378 +235 H 0.313 +236 S 0.249 +237 C 0.200 +238 M 0.167 +239 K 0.133 +240 G 0.098 +241 A 0.073 +242 V 0.065 +243 T 0.064 +244 I 0.061 +245 T 0.057 +246 I 0.055 +247 L 0.056 +248 L 0.055 +249 G 0.051 +250 V 0.044 +251 F 0.036 +252 I 0.028 +253 F 0.024 +254 C 0.025 +255 W 0.031 +256 A 0.035 +257 P 0.034 +258 F 0.028 +259 F 0.024 +260 L 0.023 +261 H 0.024 +262 L 0.024 +263 V 0.023 +264 L 0.023 +265 I 0.026 +266 I 0.034 +267 T 0.048 +268 C 0.066 +269 P 0.082 +270 T 0.090 +271 N 0.091 +272 P 0.086 +273 Y 0.082 +274 C 0.081 +275 I 0.083 +276 C 0.087 +277 Y 0.091 +278 T 0.092 +279 A 0.089 +280 H 0.079 +281 F 0.063 +282 N 0.050 +283 T 0.043 +284 Y 0.042 +285 L 0.043 +286 V 0.047 +287 L 0.053 +288 I 0.061 +289 M 0.068 +290 C 0.076 +291 N 0.080 +292 S 0.078 +293 V 0.072 +294 I 0.067 +295 D 0.062 +296 P 0.056 +297 L 0.050 +298 I 0.045 +299 Y 0.041 +300 A 0.042 +301 F 0.048 +302 R 0.057 +303 S 0.061 +304 L 0.058 +305 E 0.051 +306 L 0.047 +307 R 0.048 +308 N 0.054 +309 T 0.062 +310 F 0.070 +311 R 0.078 +312 E 0.086 +313 I 0.102 +314 L 0.141 +315 C 0.210 +316 G 0.301 +317 C 0.396 +318 N 0.484 +319 G 0.551 +320 M 0.583 +321 N 0.571 +322 L 0.524 +323 G 0.479 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000124089.4_ENST00000243911.2_GN:MC3R_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:37.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000124089.4_ENST00000243911.2_GN:MC3R_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:37.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d563cdcd7ad998e00401dbf86267fe078b955da8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000124089.4_ENST00000243911.2_GN:MC3R_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:37.caid @@ -0,0 +1,361 @@ +>ENSG00000124089.4|ENST00000243911.2|GN:MC3R|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:37 +1 M 0.298 +2 S 0.303 +3 I 0.317 +4 Q 0.339 +5 K 0.362 +6 T 0.378 +7 Y 0.390 +8 L 0.409 +9 E 0.432 +10 G 0.441 +11 D 0.426 +12 F 0.405 +13 V 0.400 +14 F 0.412 +15 P 0.420 +16 V 0.409 +17 S 0.379 +18 S 0.343 +19 S 0.305 +20 S 0.264 +21 F 0.229 +22 L 0.212 +23 R 0.215 +24 T 0.224 +25 L 0.231 +26 L 0.238 +27 E 0.244 +28 P 0.248 +29 Q 0.252 +30 L 0.257 +31 G 0.257 +32 S 0.247 +33 A 0.227 +34 L 0.208 +35 L 0.197 +36 T 0.196 +37 A 0.202 +38 M 0.218 +39 N 0.240 +40 A 0.259 +41 S 0.270 +42 C 0.285 +43 C 0.326 +44 L 0.398 +45 P 0.483 +46 S 0.552 +47 V 0.591 +48 Q 0.614 +49 P 0.634 +50 T 0.651 +51 L 0.666 +52 P 0.686 +53 N 0.708 +54 G 0.720 +55 S 0.715 +56 E 0.700 +57 H 0.685 +58 L 0.675 +59 Q 0.673 +60 A 0.681 +61 P 0.695 +62 F 0.707 +63 F 0.715 +64 S 0.716 +65 N 0.709 +66 Q 0.696 +67 S 0.677 +68 S 0.642 +69 S 0.578 +70 A 0.482 +71 F 0.373 +72 C 0.285 +73 E 0.230 +74 Q 0.191 +75 V 0.154 +76 F 0.121 +77 I 0.095 +78 K 0.074 +79 P 0.055 +80 E 0.038 +81 V 0.027 +82 F 0.023 +83 L 0.025 +84 S 0.030 +85 L 0.036 +86 G 0.040 +87 I 0.044 +88 V 0.049 +89 S 0.052 +90 L 0.051 +91 L 0.050 +92 E 0.052 +93 N 0.054 +94 I 0.052 +95 L 0.049 +96 V 0.045 +97 I 0.042 +98 L 0.041 +99 A 0.042 +100 V 0.044 +101 V 0.049 +102 R 0.059 +103 N 0.069 +104 G 0.075 +105 N 0.075 +106 L 0.071 +107 H 0.064 +108 S 0.054 +109 P 0.043 +110 M 0.031 +111 Y 0.022 +112 F 0.018 +113 F 0.018 +114 L 0.023 +115 C 0.031 +116 S 0.039 +117 L 0.043 +118 A 0.044 +119 V 0.044 +120 A 0.043 +121 D 0.040 +122 M 0.035 +123 L 0.028 +124 V 0.022 +125 S 0.021 +126 V 0.021 +127 S 0.020 +128 N 0.019 +129 A 0.018 +130 L 0.018 +131 E 0.021 +132 T 0.025 +133 I 0.028 +134 M 0.029 +135 I 0.030 +136 A 0.033 +137 I 0.043 +138 V 0.064 +139 H 0.096 +140 S 0.130 +141 D 0.151 +142 Y 0.156 +143 L 0.148 +144 T 0.139 +145 F 0.134 +146 E 0.131 +147 D 0.120 +148 Q 0.101 +149 F 0.086 +150 I 0.081 +151 Q 0.081 +152 H 0.080 +153 M 0.073 +154 D 0.062 +155 N 0.051 +156 I 0.044 +157 F 0.040 +158 D 0.039 +159 S 0.040 +160 M 0.037 +161 I 0.034 +162 C 0.031 +163 I 0.031 +164 S 0.031 +165 L 0.033 +166 V 0.034 +167 A 0.035 +168 S 0.035 +169 I 0.033 +170 C 0.032 +171 N 0.034 +172 L 0.036 +173 L 0.035 +174 A 0.034 +175 I 0.035 +176 A 0.040 +177 V 0.047 +178 D 0.051 +179 R 0.050 +180 Y 0.045 +181 V 0.039 +182 T 0.037 +183 I 0.038 +184 F 0.041 +185 Y 0.043 +186 A 0.044 +187 L 0.045 +188 R 0.047 +189 Y 0.048 +190 H 0.048 +191 S 0.047 +192 I 0.047 +193 M 0.048 +194 T 0.050 +195 V 0.052 +196 R 0.052 +197 K 0.049 +198 A 0.049 +199 L 0.057 +200 T 0.064 +201 L 0.060 +202 I 0.050 +203 V 0.042 +204 A 0.039 +205 I 0.037 +206 W 0.034 +207 V 0.029 +208 C 0.027 +209 C 0.030 +210 G 0.033 +211 V 0.036 +212 C 0.039 +213 G 0.041 +214 V 0.039 +215 V 0.035 +216 F 0.037 +217 I 0.042 +218 V 0.046 +219 Y 0.050 +220 S 0.057 +221 E 0.066 +222 S 0.068 +223 K 0.060 +224 M 0.047 +225 V 0.037 +226 I 0.032 +227 V 0.030 +228 C 0.029 +229 L 0.030 +230 I 0.034 +231 T 0.041 +232 M 0.046 +233 F 0.048 +234 F 0.047 +235 A 0.045 +236 M 0.045 +237 M 0.046 +238 L 0.048 +239 L 0.054 +240 M 0.060 +241 G 0.057 +242 T 0.046 +243 L 0.034 +244 Y 0.026 +245 V 0.023 +246 H 0.023 +247 M 0.025 +248 F 0.028 +249 L 0.031 +250 F 0.038 +251 A 0.049 +252 R 0.066 +253 L 0.084 +254 H 0.097 +255 V 0.114 +256 K 0.141 +257 R 0.180 +258 I 0.222 +259 A 0.261 +260 A 0.296 +261 L 0.332 +262 P 0.372 +263 P 0.419 +264 A 0.472 +265 D 0.518 +266 G 0.539 +267 V 0.528 +268 A 0.499 +269 P 0.466 +270 Q 0.426 +271 Q 0.374 +272 H 0.310 +273 S 0.246 +274 C 0.198 +275 M 0.166 +276 K 0.133 +277 G 0.097 +278 A 0.072 +279 V 0.064 +280 T 0.064 +281 I 0.062 +282 T 0.058 +283 I 0.057 +284 L 0.058 +285 L 0.057 +286 G 0.053 +287 V 0.047 +288 F 0.038 +289 I 0.030 +290 F 0.025 +291 C 0.027 +292 W 0.033 +293 A 0.038 +294 P 0.037 +295 F 0.031 +296 F 0.026 +297 L 0.026 +298 H 0.027 +299 L 0.026 +300 V 0.024 +301 L 0.024 +302 I 0.028 +303 I 0.037 +304 T 0.052 +305 C 0.071 +306 P 0.088 +307 T 0.097 +308 N 0.099 +309 P 0.096 +310 Y 0.093 +311 C 0.094 +312 I 0.096 +313 C 0.099 +314 Y 0.101 +315 T 0.100 +316 A 0.095 +317 H 0.084 +318 F 0.067 +319 N 0.053 +320 T 0.046 +321 Y 0.045 +322 L 0.047 +323 V 0.051 +324 L 0.058 +325 I 0.066 +326 M 0.073 +327 C 0.080 +328 N 0.085 +329 S 0.083 +330 V 0.077 +331 I 0.071 +332 D 0.065 +333 P 0.059 +334 L 0.053 +335 I 0.047 +336 Y 0.043 +337 A 0.043 +338 F 0.049 +339 R 0.058 +340 S 0.061 +341 L 0.057 +342 E 0.051 +343 L 0.046 +344 R 0.046 +345 N 0.053 +346 T 0.061 +347 F 0.068 +348 R 0.076 +349 E 0.084 +350 I 0.099 +351 L 0.137 +352 C 0.206 +353 G 0.297 +354 C 0.393 +355 N 0.483 +356 G 0.552 +357 M 0.584 +358 N 0.574 +359 L 0.528 +360 G 0.483 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000124143.12_ENST00000373345.9_GN:ARHGAP40_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000124143.12_ENST00000373345.9_GN:ARHGAP40_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f692e603da30e4b12a275a170d39b231eb3c5369 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000124143.12_ENST00000373345.9_GN:ARHGAP40_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,676 @@ +>ENSG00000124143.12|ENST00000373345.9|GN:ARHGAP40|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.370 +2 A 0.406 +3 E 0.465 +4 P 0.522 +5 A 0.559 +6 L 0.574 +7 L 0.574 +8 P 0.556 +9 A 0.520 +10 A 0.494 +11 Q 0.508 +12 M 0.540 +13 E 0.550 +14 R 0.538 +15 L 0.532 +16 A 0.553 +17 P 0.592 +18 G 0.635 +19 P 0.662 +20 L 0.664 +21 A 0.650 +22 S 0.635 +23 P 0.632 +24 C 0.642 +25 P 0.653 +26 R 0.652 +27 I 0.633 +28 P 0.601 +29 R 0.564 +30 A 0.517 +31 R 0.455 +32 I 0.387 +33 A 0.327 +34 R 0.287 +35 R 0.275 +36 C 0.286 +37 A 0.297 +38 Q 0.310 +39 R 0.349 +40 W 0.420 +41 A 0.505 +42 D 0.581 +43 L 0.636 +44 G 0.669 +45 C 0.687 +46 S 0.693 +47 S 0.695 +48 G 0.699 +49 P 0.711 +50 S 0.729 +51 S 0.747 +52 G 0.758 +53 R 0.759 +54 M 0.750 +55 D 0.730 +56 Q 0.699 +57 L 0.662 +58 P 0.620 +59 Q 0.576 +60 K 0.557 +61 N 0.577 +62 L 0.612 +63 L 0.637 +64 R 0.654 +65 L 0.671 +66 H 0.693 +67 P 0.724 +68 A 0.757 +69 G 0.781 +70 S 0.789 +71 A 0.789 +72 G 0.788 +73 C 0.787 +74 S 0.786 +75 T 0.787 +76 G 0.785 +77 V 0.772 +78 E 0.738 +79 S 0.683 +80 S 0.607 +81 S 0.520 +82 M 0.449 +83 D 0.406 +84 G 0.356 +85 F 0.277 +86 W 0.194 +87 M 0.145 +88 E 0.129 +89 V 0.131 +90 E 0.140 +91 Q 0.152 +92 I 0.166 +93 Q 0.182 +94 Q 0.204 +95 R 0.230 +96 D 0.265 +97 E 0.311 +98 L 0.363 +99 R 0.415 +100 E 0.472 +101 E 0.536 +102 D 0.596 +103 S 0.641 +104 G 0.671 +105 G 0.686 +106 N 0.682 +107 E 0.659 +108 G 0.616 +109 Q 0.561 +110 L 0.510 +111 P 0.471 +112 E 0.436 +113 E 0.396 +114 G 0.338 +115 E 0.260 +116 A 0.188 +117 E 0.142 +118 S 0.116 +119 Q 0.100 +120 W 0.091 +121 L 0.090 +122 Q 0.099 +123 D 0.120 +124 T 0.142 +125 G 0.155 +126 L 0.160 +127 S 0.165 +128 G 0.167 +129 L 0.169 +130 L 0.182 +131 G 0.208 +132 G 0.233 +133 L 0.245 +134 G 0.242 +135 L 0.231 +136 D 0.220 +137 G 0.204 +138 D 0.174 +139 H 0.135 +140 Q 0.104 +141 E 0.090 +142 L 0.091 +143 L 0.105 +144 S 0.131 +145 T 0.161 +146 L 0.174 +147 T 0.155 +148 Q 0.118 +149 T 0.090 +150 Q 0.076 +151 V 0.068 +152 A 0.063 +153 A 0.062 +154 V 0.063 +155 C 0.060 +156 R 0.054 +157 R 0.052 +158 L 0.052 +159 D 0.050 +160 I 0.044 +161 Y 0.037 +162 A 0.035 +163 R 0.042 +164 S 0.056 +165 V 0.076 +166 R 0.099 +167 R 0.127 +168 Q 0.167 +169 H 0.220 +170 K 0.282 +171 T 0.339 +172 P 0.368 +173 V 0.354 +174 R 0.308 +175 D 0.262 +176 V 0.248 +177 R 0.267 +178 D 0.291 +179 V 0.306 +180 F 0.335 +181 G 0.387 +182 V 0.443 +183 F 0.497 +184 N 0.558 +185 S 0.621 +186 G 0.668 +187 K 0.693 +188 M 0.706 +189 S 0.716 +190 S 0.729 +191 E 0.742 +192 N 0.752 +193 G 0.752 +194 D 0.733 +195 S 0.686 +196 G 0.619 +197 M 0.569 +198 K 0.544 +199 G 0.503 +200 A 0.447 +201 Q 0.438 +202 L 0.484 +203 S 0.524 +204 S 0.544 +205 G 0.564 +206 A 0.565 +207 S 0.530 +208 K 0.504 +209 F 0.539 +210 P 0.624 +211 P 0.704 +212 A 0.752 +213 A 0.772 +214 E 0.780 +215 P 0.786 +216 G 0.794 +217 G 0.797 +218 L 0.792 +219 Q 0.782 +220 E 0.772 +221 Q 0.764 +222 A 0.751 +223 G 0.722 +224 R 0.671 +225 E 0.603 +226 E 0.528 +227 A 0.452 +228 F 0.385 +229 N 0.333 +230 M 0.296 +231 D 0.263 +232 S 0.230 +233 A 0.201 +234 Y 0.185 +235 S 0.182 +236 E 0.177 +237 Q 0.162 +238 A 0.147 +239 A 0.146 +240 V 0.160 +241 L 0.179 +242 L 0.204 +243 Q 0.242 +244 R 0.296 +245 S 0.369 +246 R 0.459 +247 P 0.556 +248 S 0.641 +249 R 0.700 +250 G 0.731 +251 G 0.737 +252 T 0.723 +253 S 0.693 +254 A 0.654 +255 W 0.620 +256 G 0.597 +257 K 0.573 +258 C 0.530 +259 S 0.469 +260 L 0.405 +261 P 0.355 +262 K 0.329 +263 F 0.328 +264 T 0.328 +265 V 0.310 +266 P 0.282 +267 K 0.260 +268 G 0.247 +269 R 0.234 +270 L 0.215 +271 G 0.193 +272 V 0.169 +273 T 0.146 +274 R 0.128 +275 I 0.117 +276 G 0.115 +277 D 0.116 +278 L 0.114 +279 S 0.103 +280 L 0.088 +281 Q 0.077 +282 D 0.070 +283 M 0.067 +284 R 0.065 +285 K 0.067 +286 V 0.072 +287 P 0.076 +288 S 0.080 +289 L 0.087 +290 A 0.094 +291 L 0.097 +292 I 0.096 +293 E 0.094 +294 L 0.093 +295 T 0.092 +296 A 0.088 +297 L 0.085 +298 C 0.084 +299 D 0.089 +300 I 0.100 +301 L 0.116 +302 G 0.134 +303 L 0.149 +304 D 0.156 +305 L 0.156 +306 K 0.159 +307 R 0.180 +308 S 0.222 +309 K 0.272 +310 A 0.314 +311 G 0.335 +312 K 0.337 +313 W 0.335 +314 K 0.332 +315 A 0.319 +316 A 0.283 +317 E 0.228 +318 T 0.173 +319 R 0.137 +320 L 0.123 +321 F 0.123 +322 G 0.129 +323 V 0.132 +324 P 0.128 +325 L 0.117 +326 D 0.103 +327 S 0.095 +328 L 0.098 +329 L 0.104 +330 E 0.105 +331 A 0.104 +332 D 0.104 +333 H 0.104 +334 K 0.108 +335 V 0.116 +336 L 0.123 +337 P 0.121 +338 S 0.112 +339 T 0.106 +340 Q 0.106 +341 V 0.103 +342 P 0.092 +343 L 0.076 +344 V 0.064 +345 L 0.057 +346 Q 0.053 +347 A 0.053 +348 L 0.059 +349 L 0.067 +350 S 0.068 +351 C 0.061 +352 L 0.052 +353 E 0.046 +354 K 0.048 +355 R 0.055 +356 G 0.065 +357 L 0.074 +358 D 0.083 +359 M 0.093 +360 E 0.105 +361 G 0.114 +362 I 0.116 +363 L 0.115 +364 R 0.120 +365 V 0.132 +366 P 0.141 +367 G 0.138 +368 S 0.118 +369 Q 0.090 +370 A 0.067 +371 R 0.054 +372 V 0.050 +373 K 0.051 +374 G 0.055 +375 L 0.058 +376 E 0.059 +377 Q 0.056 +378 K 0.051 +379 L 0.048 +380 E 0.048 +381 R 0.047 +382 D 0.046 +383 F 0.049 +384 Y 0.059 +385 A 0.072 +386 G 0.082 +387 L 0.083 +388 F 0.074 +389 S 0.062 +390 W 0.056 +391 D 0.059 +392 E 0.068 +393 V 0.079 +394 H 0.092 +395 H 0.109 +396 N 0.127 +397 D 0.136 +398 A 0.134 +399 S 0.131 +400 D 0.131 +401 L 0.125 +402 L 0.107 +403 K 0.085 +404 R 0.068 +405 F 0.058 +406 I 0.055 +407 R 0.056 +408 K 0.062 +409 L 0.066 +410 P 0.064 +411 T 0.062 +412 P 0.064 +413 L 0.066 +414 L 0.064 +415 T 0.062 +416 A 0.064 +417 E 0.066 +418 Y 0.062 +419 L 0.054 +420 P 0.048 +421 A 0.046 +422 F 0.046 +423 A 0.052 +424 V 0.060 +425 V 0.067 +426 P 0.072 +427 N 0.076 +428 I 0.077 +429 P 0.072 +430 N 0.061 +431 L 0.051 +432 K 0.045 +433 Q 0.041 +434 R 0.042 +435 L 0.047 +436 Q 0.053 +437 V 0.059 +438 L 0.062 +439 H 0.065 +440 L 0.067 +441 L 0.067 +442 I 0.062 +443 L 0.058 +444 I 0.059 +445 L 0.061 +446 P 0.060 +447 E 0.057 +448 P 0.055 +449 N 0.056 +450 R 0.057 +451 N 0.061 +452 A 0.068 +453 L 0.073 +454 K 0.077 +455 A 0.080 +456 L 0.079 +457 L 0.071 +458 E 0.060 +459 F 0.049 +460 L 0.042 +461 R 0.040 +462 K 0.043 +463 V 0.052 +464 V 0.059 +465 A 0.060 +466 R 0.060 +467 E 0.063 +468 Q 0.073 +469 H 0.084 +470 N 0.090 +471 K 0.090 +472 M 0.084 +473 T 0.074 +474 L 0.066 +475 R 0.066 +476 N 0.072 +477 V 0.077 +478 S 0.076 +479 T 0.075 +480 V 0.075 +481 M 0.073 +482 A 0.066 +483 P 0.059 +484 N 0.058 +485 L 0.066 +486 F 0.090 +487 L 0.139 +488 H 0.203 +489 Q 0.263 +490 G 0.307 +491 R 0.337 +492 P 0.352 +493 P 0.353 +494 K 0.344 +495 L 0.332 +496 P 0.317 +497 K 0.294 +498 G 0.258 +499 K 0.219 +500 E 0.187 +501 K 0.164 +502 Q 0.148 +503 L 0.136 +504 A 0.122 +505 E 0.104 +506 G 0.086 +507 A 0.073 +508 A 0.068 +509 E 0.070 +510 V 0.073 +511 V 0.071 +512 Q 0.062 +513 I 0.052 +514 M 0.046 +515 V 0.042 +516 H 0.039 +517 Y 0.040 +518 Q 0.045 +519 D 0.049 +520 L 0.049 +521 L 0.046 +522 W 0.046 +523 T 0.050 +524 V 0.054 +525 A 0.053 +526 S 0.050 +527 F 0.048 +528 L 0.054 +529 V 0.066 +530 A 0.077 +531 Q 0.080 +532 V 0.085 +533 R 0.103 +534 K 0.137 +535 L 0.183 +536 N 0.227 +537 D 0.255 +538 S 0.266 +539 S 0.273 +540 S 0.287 +541 R 0.312 +542 R 0.338 +543 P 0.350 +544 Q 0.343 +545 L 0.327 +546 C 0.309 +547 D 0.287 +548 A 0.261 +549 G 0.229 +550 L 0.195 +551 K 0.166 +552 T 0.147 +553 W 0.139 +554 L 0.138 +555 R 0.147 +556 R 0.163 +557 M 0.188 +558 H 0.224 +559 A 0.273 +560 D 0.334 +561 R 0.400 +562 D 0.466 +563 K 0.529 +564 A 0.588 +565 G 0.641 +566 D 0.673 +567 G 0.675 +568 L 0.645 +569 E 0.590 +570 A 0.518 +571 T 0.437 +572 P 0.350 +573 K 0.263 +574 V 0.185 +575 A 0.128 +576 K 0.095 +577 I 0.083 +578 Q 0.083 +579 V 0.084 +580 V 0.082 +581 W 0.082 +582 P 0.089 +583 I 0.103 +584 K 0.116 +585 D 0.120 +586 P 0.115 +587 L 0.108 +588 K 0.105 +589 V 0.104 +590 P 0.104 +591 L 0.104 +592 T 0.106 +593 P 0.110 +594 S 0.107 +595 T 0.097 +596 K 0.084 +597 V 0.077 +598 A 0.077 +599 H 0.077 +600 V 0.075 +601 L 0.074 +602 R 0.075 +603 Q 0.084 +604 F 0.107 +605 T 0.146 +606 E 0.195 +607 H 0.250 +608 L 0.320 +609 S 0.409 +610 P 0.504 +611 G 0.582 +612 S 0.632 +613 K 0.657 +614 G 0.665 +615 Q 0.665 +616 E 0.662 +617 D 0.651 +618 S 0.628 +619 E 0.597 +620 D 0.560 +621 M 0.519 +622 D 0.473 +623 S 0.426 +624 L 0.389 +625 L 0.380 +626 L 0.411 +627 H 0.457 +628 H 0.487 +629 R 0.492 +630 S 0.479 +631 M 0.445 +632 E 0.384 +633 S 0.305 +634 A 0.228 +635 N 0.165 +636 I 0.120 +637 L 0.091 +638 L 0.080 +639 Y 0.088 +640 E 0.110 +641 V 0.133 +642 G 0.142 +643 G 0.137 +644 N 0.123 +645 I 0.109 +646 N 0.095 +647 E 0.085 +648 H 0.083 +649 R 0.093 +650 L 0.105 +651 D 0.103 +652 P 0.086 +653 D 0.064 +654 A 0.046 +655 Y 0.034 +656 L 0.029 +657 L 0.030 +658 D 0.034 +659 L 0.041 +660 Y 0.049 +661 R 0.062 +662 A 0.082 +663 N 0.106 +664 P 0.128 +665 H 0.139 +666 G 0.134 +667 E 0.117 +668 W 0.098 +669 V 0.085 +670 L 0.080 +671 K 0.088 +672 Q 0.109 +673 N 0.134 +674 P 0.151 +675 T 0.157 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000124143.12_ENST00000373345.9_GN:ARHGAP40_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:42.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000124143.12_ENST00000373345.9_GN:ARHGAP40_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:42.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1a783d1b3e853474cc4056d90670cb5a26bf1228 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000124143.12_ENST00000373345.9_GN:ARHGAP40_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:42.caid @@ -0,0 +1,718 @@ +>ENSG00000124143.12|ENST00000373345.9|GN:ARHGAP40|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:42 +1 M 0.364 +2 R 0.387 +3 V 0.427 +4 S 0.473 +5 G 0.507 +6 N 0.519 +7 W 0.518 +8 V 0.516 +9 R 0.512 +10 H 0.517 +11 G 0.545 +12 G 0.588 +13 P 0.623 +14 T 0.634 +15 S 0.617 +16 L 0.587 +17 L 0.573 +18 P 0.584 +19 L 0.603 +20 T 0.617 +21 L 0.631 +22 P 0.644 +23 I 0.650 +24 E 0.648 +25 S 0.643 +26 A 0.648 +27 P 0.663 +28 R 0.682 +29 R 0.700 +30 Q 0.708 +31 H 0.708 +32 H 0.708 +33 D 0.711 +34 R 0.718 +35 P 0.724 +36 G 0.728 +37 S 0.730 +38 S 0.730 +39 R 0.726 +40 C 0.723 +41 Q 0.727 +42 P 0.737 +43 M 0.745 +44 A 0.749 +45 E 0.751 +46 P 0.747 +47 A 0.734 +48 L 0.716 +49 L 0.696 +50 P 0.664 +51 A 0.618 +52 A 0.595 +53 Q 0.627 +54 M 0.685 +55 E 0.721 +56 R 0.726 +57 L 0.720 +58 A 0.718 +59 P 0.728 +60 G 0.748 +61 P 0.765 +62 L 0.768 +63 A 0.756 +64 S 0.739 +65 P 0.729 +66 C 0.730 +67 P 0.736 +68 R 0.738 +69 I 0.732 +70 P 0.725 +71 R 0.715 +72 A 0.685 +73 R 0.620 +74 I 0.533 +75 A 0.447 +76 R 0.385 +77 R 0.361 +78 C 0.366 +79 A 0.379 +80 Q 0.400 +81 R 0.451 +82 W 0.528 +83 A 0.609 +84 D 0.673 +85 L 0.712 +86 G 0.734 +87 C 0.745 +88 S 0.749 +89 S 0.749 +90 G 0.751 +91 P 0.759 +92 S 0.771 +93 S 0.782 +94 G 0.786 +95 R 0.783 +96 M 0.771 +97 D 0.748 +98 Q 0.717 +99 L 0.682 +100 P 0.639 +101 Q 0.590 +102 K 0.566 +103 N 0.584 +104 L 0.616 +105 L 0.637 +106 R 0.649 +107 L 0.665 +108 H 0.691 +109 P 0.726 +110 A 0.759 +111 G 0.780 +112 S 0.787 +113 A 0.787 +114 G 0.785 +115 C 0.783 +116 S 0.780 +117 T 0.777 +118 G 0.772 +119 V 0.755 +120 E 0.718 +121 S 0.661 +122 S 0.583 +123 S 0.490 +124 M 0.408 +125 D 0.354 +126 G 0.308 +127 F 0.242 +128 W 0.172 +129 M 0.128 +130 E 0.113 +131 V 0.115 +132 E 0.125 +133 Q 0.137 +134 I 0.148 +135 Q 0.159 +136 Q 0.174 +137 R 0.197 +138 D 0.231 +139 E 0.275 +140 L 0.321 +141 R 0.362 +142 E 0.412 +143 E 0.478 +144 D 0.550 +145 S 0.611 +146 G 0.653 +147 G 0.674 +148 N 0.673 +149 E 0.653 +150 G 0.614 +151 Q 0.562 +152 L 0.509 +153 P 0.467 +154 E 0.431 +155 E 0.391 +156 G 0.334 +157 E 0.257 +158 A 0.185 +159 E 0.139 +160 S 0.112 +161 Q 0.095 +162 W 0.087 +163 L 0.086 +164 Q 0.098 +165 D 0.122 +166 T 0.148 +167 G 0.162 +168 L 0.169 +169 S 0.175 +170 G 0.178 +171 L 0.179 +172 L 0.191 +173 G 0.216 +174 G 0.240 +175 L 0.248 +176 G 0.241 +177 L 0.229 +178 D 0.218 +179 G 0.200 +180 D 0.168 +181 H 0.128 +182 Q 0.097 +183 E 0.083 +184 L 0.085 +185 L 0.099 +186 S 0.126 +187 T 0.158 +188 L 0.175 +189 T 0.157 +190 Q 0.119 +191 T 0.089 +192 Q 0.074 +193 V 0.066 +194 A 0.063 +195 A 0.063 +196 V 0.064 +197 C 0.061 +198 R 0.055 +199 R 0.051 +200 L 0.050 +201 D 0.049 +202 I 0.043 +203 Y 0.036 +204 A 0.034 +205 R 0.042 +206 S 0.057 +207 V 0.079 +208 R 0.102 +209 R 0.129 +210 Q 0.163 +211 H 0.208 +212 K 0.261 +213 T 0.311 +214 P 0.337 +215 V 0.326 +216 R 0.287 +217 D 0.249 +218 V 0.239 +219 R 0.259 +220 D 0.285 +221 V 0.307 +222 F 0.343 +223 G 0.399 +224 V 0.458 +225 F 0.514 +226 N 0.576 +227 S 0.638 +228 G 0.686 +229 K 0.713 +230 M 0.728 +231 S 0.740 +232 S 0.753 +233 E 0.764 +234 N 0.770 +235 G 0.767 +236 D 0.747 +237 S 0.697 +238 G 0.630 +239 M 0.580 +240 K 0.554 +241 G 0.510 +242 A 0.453 +243 Q 0.446 +244 L 0.495 +245 S 0.539 +246 S 0.567 +247 G 0.606 +248 A 0.644 +249 S 0.653 +250 K 0.644 +251 F 0.648 +252 P 0.682 +253 P 0.728 +254 A 0.762 +255 A 0.778 +256 E 0.785 +257 P 0.792 +258 G 0.799 +259 G 0.801 +260 L 0.794 +261 Q 0.782 +262 E 0.770 +263 Q 0.761 +264 A 0.751 +265 G 0.727 +266 R 0.682 +267 E 0.621 +268 E 0.551 +269 A 0.478 +270 F 0.414 +271 N 0.365 +272 M 0.331 +273 D 0.300 +274 S 0.265 +275 A 0.232 +276 Y 0.212 +277 S 0.205 +278 E 0.197 +279 Q 0.179 +280 A 0.159 +281 A 0.155 +282 V 0.168 +283 L 0.187 +284 L 0.211 +285 Q 0.249 +286 R 0.305 +287 S 0.379 +288 R 0.470 +289 P 0.568 +290 S 0.654 +291 R 0.714 +292 G 0.742 +293 G 0.747 +294 T 0.732 +295 S 0.704 +296 A 0.668 +297 W 0.636 +298 G 0.614 +299 K 0.588 +300 C 0.543 +301 S 0.480 +302 L 0.413 +303 P 0.360 +304 K 0.334 +305 F 0.334 +306 T 0.337 +307 V 0.319 +308 P 0.289 +309 K 0.265 +310 G 0.250 +311 R 0.240 +312 L 0.226 +313 G 0.205 +314 V 0.181 +315 T 0.157 +316 R 0.137 +317 I 0.125 +318 G 0.123 +319 D 0.125 +320 L 0.124 +321 S 0.113 +322 L 0.098 +323 Q 0.085 +324 D 0.077 +325 M 0.072 +326 R 0.070 +327 K 0.072 +328 V 0.076 +329 P 0.080 +330 S 0.085 +331 L 0.092 +332 A 0.101 +333 L 0.106 +334 I 0.105 +335 E 0.102 +336 L 0.102 +337 T 0.100 +338 A 0.096 +339 L 0.092 +340 C 0.092 +341 D 0.097 +342 I 0.108 +343 L 0.125 +344 G 0.143 +345 L 0.158 +346 D 0.165 +347 L 0.164 +348 K 0.166 +349 R 0.186 +350 S 0.226 +351 K 0.278 +352 A 0.321 +353 G 0.340 +354 K 0.338 +355 W 0.331 +356 K 0.326 +357 A 0.312 +358 A 0.277 +359 E 0.222 +360 T 0.167 +361 R 0.130 +362 L 0.117 +363 F 0.120 +364 G 0.127 +365 V 0.132 +366 P 0.129 +367 L 0.117 +368 D 0.103 +369 S 0.097 +370 L 0.100 +371 L 0.106 +372 E 0.107 +373 A 0.104 +374 D 0.102 +375 H 0.101 +376 K 0.104 +377 V 0.113 +378 L 0.121 +379 P 0.118 +380 S 0.109 +381 T 0.102 +382 Q 0.102 +383 V 0.099 +384 P 0.089 +385 L 0.075 +386 V 0.064 +387 L 0.057 +388 Q 0.053 +389 A 0.054 +390 L 0.061 +391 L 0.068 +392 S 0.070 +393 C 0.062 +394 L 0.052 +395 E 0.046 +396 K 0.048 +397 R 0.055 +398 G 0.064 +399 L 0.074 +400 D 0.082 +401 M 0.092 +402 E 0.103 +403 G 0.113 +404 I 0.115 +405 L 0.114 +406 R 0.118 +407 V 0.129 +408 P 0.138 +409 G 0.135 +410 S 0.116 +411 Q 0.090 +412 A 0.067 +413 R 0.054 +414 V 0.050 +415 K 0.052 +416 G 0.055 +417 L 0.058 +418 E 0.059 +419 Q 0.056 +420 K 0.051 +421 L 0.048 +422 E 0.047 +423 R 0.046 +424 D 0.045 +425 F 0.048 +426 Y 0.058 +427 A 0.072 +428 G 0.083 +429 L 0.084 +430 F 0.075 +431 S 0.063 +432 W 0.057 +433 D 0.061 +434 E 0.070 +435 V 0.081 +436 H 0.095 +437 H 0.112 +438 N 0.130 +439 D 0.139 +440 A 0.137 +441 S 0.133 +442 D 0.133 +443 L 0.127 +444 L 0.110 +445 K 0.087 +446 R 0.069 +447 F 0.059 +448 I 0.056 +449 R 0.058 +450 K 0.064 +451 L 0.068 +452 P 0.066 +453 T 0.064 +454 P 0.066 +455 L 0.068 +456 L 0.066 +457 T 0.064 +458 A 0.065 +459 E 0.067 +460 Y 0.063 +461 L 0.056 +462 P 0.049 +463 A 0.047 +464 F 0.047 +465 A 0.053 +466 V 0.061 +467 V 0.069 +468 P 0.073 +469 N 0.078 +470 I 0.080 +471 P 0.074 +472 N 0.063 +473 L 0.053 +474 K 0.046 +475 Q 0.043 +476 R 0.044 +477 L 0.049 +478 Q 0.056 +479 V 0.061 +480 L 0.064 +481 H 0.066 +482 L 0.069 +483 L 0.068 +484 I 0.064 +485 L 0.061 +486 I 0.061 +487 L 0.063 +488 P 0.062 +489 E 0.059 +490 P 0.058 +491 N 0.058 +492 R 0.059 +493 N 0.064 +494 A 0.070 +495 L 0.076 +496 K 0.080 +497 A 0.082 +498 L 0.081 +499 L 0.074 +500 E 0.062 +501 F 0.051 +502 L 0.044 +503 R 0.041 +504 K 0.045 +505 V 0.054 +506 V 0.061 +507 A 0.063 +508 R 0.061 +509 E 0.065 +510 Q 0.075 +511 H 0.086 +512 N 0.092 +513 K 0.092 +514 M 0.086 +515 T 0.076 +516 L 0.068 +517 R 0.069 +518 N 0.076 +519 V 0.080 +520 S 0.079 +521 T 0.077 +522 V 0.078 +523 M 0.075 +524 A 0.068 +525 P 0.061 +526 N 0.060 +527 L 0.067 +528 F 0.091 +529 L 0.140 +530 H 0.204 +531 Q 0.263 +532 G 0.308 +533 R 0.337 +534 P 0.352 +535 P 0.352 +536 K 0.342 +537 L 0.330 +538 P 0.317 +539 K 0.293 +540 G 0.257 +541 K 0.218 +542 E 0.187 +543 K 0.164 +544 Q 0.149 +545 L 0.136 +546 A 0.123 +547 E 0.105 +548 G 0.087 +549 A 0.074 +550 A 0.069 +551 E 0.071 +552 V 0.075 +553 V 0.072 +554 Q 0.063 +555 I 0.053 +556 M 0.047 +557 V 0.043 +558 H 0.040 +559 Y 0.040 +560 Q 0.045 +561 D 0.049 +562 L 0.049 +563 L 0.046 +564 W 0.045 +565 T 0.049 +566 V 0.053 +567 A 0.053 +568 S 0.050 +569 F 0.048 +570 L 0.054 +571 V 0.066 +572 A 0.076 +573 Q 0.079 +574 V 0.084 +575 R 0.101 +576 K 0.135 +577 L 0.179 +578 N 0.220 +579 D 0.247 +580 S 0.258 +581 S 0.265 +582 S 0.279 +583 R 0.304 +584 R 0.330 +585 P 0.342 +586 Q 0.337 +587 L 0.321 +588 C 0.302 +589 D 0.281 +590 A 0.254 +591 G 0.222 +592 L 0.188 +593 K 0.160 +594 T 0.143 +595 W 0.136 +596 L 0.136 +597 R 0.145 +598 R 0.161 +599 M 0.185 +600 H 0.221 +601 A 0.270 +602 D 0.328 +603 R 0.392 +604 D 0.458 +605 K 0.523 +606 A 0.586 +607 G 0.640 +608 D 0.674 +609 G 0.674 +610 L 0.644 +611 E 0.588 +612 A 0.516 +613 T 0.434 +614 P 0.348 +615 K 0.262 +616 V 0.185 +617 A 0.128 +618 K 0.095 +619 I 0.083 +620 Q 0.083 +621 V 0.083 +622 V 0.082 +623 W 0.081 +624 P 0.089 +625 I 0.103 +626 K 0.116 +627 D 0.120 +628 P 0.115 +629 L 0.109 +630 K 0.106 +631 V 0.106 +632 P 0.105 +633 L 0.105 +634 T 0.108 +635 P 0.112 +636 S 0.110 +637 T 0.099 +638 K 0.086 +639 V 0.078 +640 A 0.077 +641 H 0.078 +642 V 0.075 +643 L 0.074 +644 R 0.076 +645 Q 0.084 +646 F 0.106 +647 T 0.144 +648 E 0.191 +649 H 0.246 +650 L 0.317 +651 S 0.408 +652 P 0.504 +653 G 0.583 +654 S 0.633 +655 K 0.659 +656 G 0.667 +657 Q 0.668 +658 E 0.664 +659 D 0.653 +660 S 0.631 +661 E 0.599 +662 D 0.562 +663 M 0.520 +664 D 0.474 +665 S 0.426 +666 L 0.387 +667 L 0.378 +668 L 0.409 +669 H 0.456 +670 H 0.488 +671 R 0.494 +672 S 0.479 +673 M 0.442 +674 E 0.380 +675 S 0.302 +676 A 0.226 +677 N 0.165 +678 I 0.121 +679 L 0.092 +680 L 0.080 +681 Y 0.087 +682 E 0.109 +683 V 0.131 +684 G 0.140 +685 G 0.135 +686 N 0.123 +687 I 0.109 +688 N 0.095 +689 E 0.084 +690 H 0.082 +691 R 0.092 +692 L 0.105 +693 D 0.104 +694 P 0.087 +695 D 0.064 +696 A 0.046 +697 Y 0.035 +698 L 0.030 +699 L 0.030 +700 D 0.034 +701 L 0.039 +702 Y 0.047 +703 R 0.059 +704 A 0.079 +705 N 0.103 +706 P 0.123 +707 H 0.134 +708 G 0.131 +709 E 0.116 +710 W 0.097 +711 V 0.084 +712 L 0.079 +713 K 0.086 +714 Q 0.107 +715 N 0.132 +716 P 0.149 +717 T 0.155 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000127530.4_ENST00000641666.2_GN:OR7C1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000127530.4_ENST00000641666.2_GN:OR7C1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..dba05f2e9e00885bdc3cfacd354662f1d117fe8a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000127530.4_ENST00000641666.2_GN:OR7C1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,321 @@ +>ENSG00000127530.4|ENST00000641666.2|GN:OR7C1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.445 +2 E 0.461 +3 T 0.489 +4 G 0.513 +5 N 0.514 +6 Q 0.486 +7 T 0.433 +8 H 0.368 +9 A 0.299 +10 Q 0.235 +11 E 0.187 +12 F 0.161 +13 L 0.152 +14 L 0.152 +15 L 0.162 +16 G 0.176 +17 F 0.187 +18 S 0.190 +19 A 0.180 +20 T 0.157 +21 S 0.128 +22 E 0.101 +23 I 0.081 +24 Q 0.068 +25 F 0.061 +26 I 0.057 +27 L 0.055 +28 F 0.053 +29 G 0.049 +30 L 0.044 +31 F 0.043 +32 L 0.044 +33 S 0.047 +34 M 0.048 +35 Y 0.047 +36 L 0.048 +37 V 0.055 +38 T 0.061 +39 F 0.064 +40 T 0.065 +41 G 0.070 +42 N 0.076 +43 L 0.080 +44 L 0.081 +45 I 0.079 +46 I 0.073 +47 L 0.068 +48 A 0.068 +49 I 0.073 +50 C 0.083 +51 S 0.095 +52 D 0.100 +53 S 0.097 +54 H 0.090 +55 L 0.083 +56 H 0.073 +57 T 0.061 +58 P 0.048 +59 M 0.038 +60 Y 0.032 +61 F 0.028 +62 F 0.030 +63 L 0.037 +64 S 0.046 +65 N 0.055 +66 L 0.060 +67 S 0.062 +68 F 0.062 +69 A 0.065 +70 D 0.073 +71 L 0.079 +72 C 0.078 +73 F 0.072 +74 T 0.069 +75 S 0.068 +76 T 0.069 +77 T 0.070 +78 V 0.071 +79 P 0.071 +80 K 0.070 +81 M 0.069 +82 L 0.068 +83 L 0.068 +84 N 0.068 +85 I 0.069 +86 L 0.074 +87 T 0.084 +88 Q 0.092 +89 N 0.088 +90 K 0.075 +91 F 0.060 +92 I 0.050 +93 T 0.044 +94 Y 0.040 +95 A 0.039 +96 G 0.040 +97 C 0.039 +98 L 0.038 +99 S 0.037 +100 Q 0.037 +101 I 0.037 +102 F 0.034 +103 F 0.031 +104 F 0.028 +105 T 0.027 +106 S 0.027 +107 F 0.028 +108 G 0.032 +109 C 0.040 +110 L 0.048 +111 D 0.053 +112 N 0.053 +113 L 0.049 +114 L 0.045 +115 L 0.042 +116 T 0.039 +117 V 0.036 +118 M 0.035 +119 A 0.036 +120 Y 0.040 +121 D 0.044 +122 R 0.045 +123 F 0.044 +124 V 0.042 +125 A 0.043 +126 V 0.047 +127 C 0.052 +128 H 0.058 +129 P 0.059 +130 L 0.056 +131 H 0.052 +132 Y 0.049 +133 T 0.050 +134 V 0.055 +135 I 0.064 +136 M 0.073 +137 N 0.076 +138 P 0.076 +139 Q 0.072 +140 L 0.063 +141 C 0.059 +142 G 0.065 +143 L 0.073 +144 L 0.077 +145 V 0.080 +146 L 0.085 +147 G 0.087 +148 S 0.081 +149 W 0.072 +150 C 0.065 +151 I 0.067 +152 S 0.072 +153 V 0.076 +154 M 0.081 +155 G 0.088 +156 S 0.090 +157 L 0.087 +158 L 0.087 +159 E 0.090 +160 T 0.088 +161 L 0.086 +162 T 0.085 +163 V 0.086 +164 L 0.089 +165 R 0.097 +166 L 0.105 +167 S 0.106 +168 F 0.106 +169 C 0.116 +170 T 0.131 +171 E 0.148 +172 M 0.161 +173 E 0.171 +174 I 0.169 +175 P 0.149 +176 H 0.119 +177 F 0.093 +178 F 0.079 +179 C 0.076 +180 D 0.083 +181 L 0.096 +182 L 0.110 +183 E 0.122 +184 V 0.130 +185 L 0.136 +186 K 0.139 +187 L 0.134 +188 A 0.124 +189 C 0.117 +190 S 0.121 +191 D 0.129 +192 T 0.131 +193 F 0.122 +194 I 0.112 +195 N 0.105 +196 N 0.102 +197 V 0.100 +198 V 0.099 +199 I 0.095 +200 Y 0.088 +201 F 0.084 +202 A 0.083 +203 T 0.082 +204 G 0.079 +205 V 0.077 +206 L 0.077 +207 G 0.076 +208 V 0.071 +209 I 0.068 +210 S 0.070 +211 F 0.072 +212 T 0.076 +213 G 0.080 +214 I 0.077 +215 F 0.064 +216 F 0.051 +217 S 0.044 +218 Y 0.041 +219 Y 0.041 +220 K 0.047 +221 I 0.058 +222 V 0.071 +223 F 0.082 +224 S 0.085 +225 I 0.084 +226 L 0.087 +227 R 0.101 +228 I 0.123 +229 S 0.144 +230 S 0.156 +231 A 0.157 +232 G 0.145 +233 R 0.123 +234 K 0.103 +235 H 0.092 +236 K 0.092 +237 A 0.093 +238 F 0.092 +239 S 0.091 +240 T 0.091 +241 C 0.091 +242 G 0.091 +243 S 0.088 +244 H 0.080 +245 L 0.071 +246 S 0.065 +247 V 0.061 +248 V 0.054 +249 T 0.042 +250 L 0.032 +251 F 0.027 +252 Y 0.028 +253 G 0.032 +254 T 0.036 +255 G 0.040 +256 F 0.043 +257 G 0.042 +258 V 0.040 +259 Y 0.040 +260 L 0.048 +261 S 0.066 +262 S 0.095 +263 A 0.133 +264 A 0.172 +265 T 0.202 +266 P 0.213 +267 S 0.204 +268 S 0.180 +269 R 0.150 +270 T 0.127 +271 S 0.114 +272 L 0.107 +273 V 0.100 +274 A 0.094 +275 S 0.087 +276 V 0.084 +277 M 0.090 +278 Y 0.103 +279 T 0.115 +280 M 0.124 +281 V 0.130 +282 T 0.131 +283 P 0.122 +284 M 0.108 +285 L 0.098 +286 N 0.090 +287 P 0.083 +288 F 0.080 +289 I 0.082 +290 Y 0.085 +291 S 0.092 +292 L 0.106 +293 R 0.117 +294 N 0.109 +295 T 0.089 +296 D 0.074 +297 M 0.071 +298 K 0.077 +299 R 0.085 +300 A 0.089 +301 L 0.091 +302 G 0.098 +303 R 0.105 +304 L 0.111 +305 L 0.121 +306 S 0.143 +307 R 0.179 +308 A 0.223 +309 T 0.273 +310 F 0.324 +311 F 0.380 +312 N 0.444 +313 G 0.505 +314 D 0.536 +315 I 0.517 +316 T 0.471 +317 A 0.448 +318 G 0.454 +319 L 0.452 +320 S 0.434 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000127530.4_ENST00000641666.2_GN:OR7C1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:25.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000127530.4_ENST00000641666.2_GN:OR7C1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:25.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..bb70ababf6e49b1ca843d6e14341e0b3b5f2c2f9 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000127530.4_ENST00000641666.2_GN:OR7C1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:25.caid @@ -0,0 +1,346 @@ +>ENSG00000127530.4|ENST00000641666.2|GN:OR7C1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:25 +1 M 0.240 +2 V 0.231 +3 A 0.228 +4 K 0.241 +5 K 0.259 +6 R 0.273 +7 M 0.283 +8 E 0.299 +9 E 0.322 +10 F 0.345 +11 Q 0.368 +12 M 0.396 +13 P 0.423 +14 Q 0.437 +15 K 0.435 +16 K 0.433 +17 T 0.443 +18 A 0.457 +19 R 0.456 +20 K 0.437 +21 S 0.418 +22 Y 0.419 +23 F 0.441 +24 I 0.476 +25 P 0.510 +26 M 0.540 +27 E 0.564 +28 T 0.578 +29 G 0.577 +30 N 0.555 +31 Q 0.512 +32 T 0.452 +33 H 0.383 +34 A 0.311 +35 Q 0.243 +36 E 0.192 +37 F 0.163 +38 L 0.152 +39 L 0.152 +40 L 0.161 +41 G 0.176 +42 F 0.187 +43 S 0.190 +44 A 0.180 +45 T 0.157 +46 S 0.128 +47 E 0.101 +48 I 0.080 +49 Q 0.065 +50 F 0.056 +51 I 0.051 +52 L 0.050 +53 F 0.052 +54 G 0.050 +55 L 0.047 +56 F 0.046 +57 L 0.048 +58 S 0.050 +59 M 0.050 +60 Y 0.048 +61 L 0.048 +62 V 0.054 +63 T 0.060 +64 F 0.063 +65 T 0.065 +66 G 0.071 +67 N 0.077 +68 L 0.082 +69 L 0.084 +70 I 0.082 +71 I 0.075 +72 L 0.069 +73 A 0.067 +74 I 0.071 +75 C 0.079 +76 S 0.090 +77 D 0.095 +78 S 0.093 +79 H 0.087 +80 L 0.078 +81 H 0.069 +82 T 0.057 +83 P 0.046 +84 M 0.036 +85 Y 0.030 +86 F 0.027 +87 F 0.029 +88 L 0.037 +89 S 0.047 +90 N 0.056 +91 L 0.061 +92 S 0.062 +93 F 0.062 +94 A 0.065 +95 D 0.073 +96 L 0.079 +97 C 0.078 +98 F 0.073 +99 T 0.069 +100 S 0.068 +101 T 0.067 +102 T 0.067 +103 V 0.067 +104 P 0.065 +105 K 0.063 +106 M 0.062 +107 L 0.060 +108 L 0.059 +109 N 0.058 +110 I 0.059 +111 L 0.065 +112 T 0.075 +113 Q 0.084 +114 N 0.082 +115 K 0.070 +116 F 0.057 +117 I 0.047 +118 T 0.041 +119 Y 0.038 +120 A 0.037 +121 G 0.039 +122 C 0.038 +123 L 0.036 +124 S 0.035 +125 Q 0.035 +126 I 0.035 +127 F 0.033 +128 F 0.030 +129 F 0.027 +130 T 0.026 +131 S 0.026 +132 F 0.028 +133 G 0.032 +134 C 0.039 +135 L 0.047 +136 D 0.052 +137 N 0.052 +138 L 0.048 +139 L 0.044 +140 L 0.041 +141 T 0.038 +142 V 0.036 +143 M 0.035 +144 A 0.036 +145 Y 0.040 +146 D 0.043 +147 R 0.045 +148 F 0.044 +149 V 0.042 +150 A 0.043 +151 V 0.047 +152 C 0.053 +153 H 0.058 +154 P 0.060 +155 L 0.056 +156 H 0.052 +157 Y 0.050 +158 T 0.051 +159 V 0.057 +160 I 0.066 +161 M 0.075 +162 N 0.078 +163 P 0.077 +164 Q 0.071 +165 L 0.063 +166 C 0.059 +167 G 0.065 +168 L 0.072 +169 L 0.075 +170 V 0.076 +171 L 0.079 +172 G 0.081 +173 S 0.077 +174 W 0.068 +175 C 0.063 +176 I 0.066 +177 S 0.072 +178 V 0.077 +179 M 0.082 +180 G 0.089 +181 S 0.092 +182 L 0.089 +183 L 0.089 +184 E 0.091 +185 T 0.089 +186 L 0.086 +187 T 0.086 +188 V 0.086 +189 L 0.090 +190 R 0.098 +191 L 0.106 +192 S 0.107 +193 F 0.107 +194 C 0.114 +195 T 0.129 +196 E 0.145 +197 M 0.159 +198 E 0.168 +199 I 0.166 +200 P 0.146 +201 H 0.116 +202 F 0.091 +203 F 0.077 +204 C 0.076 +205 D 0.084 +206 L 0.097 +207 L 0.110 +208 E 0.120 +209 V 0.128 +210 L 0.133 +211 K 0.135 +212 L 0.130 +213 A 0.119 +214 C 0.112 +215 S 0.115 +216 D 0.123 +217 T 0.125 +218 F 0.117 +219 I 0.108 +220 N 0.101 +221 N 0.098 +222 V 0.097 +223 V 0.097 +224 I 0.093 +225 Y 0.087 +226 F 0.082 +227 A 0.082 +228 T 0.081 +229 G 0.079 +230 V 0.077 +231 L 0.078 +232 G 0.076 +233 V 0.072 +234 I 0.069 +235 S 0.070 +236 F 0.073 +237 T 0.076 +238 G 0.080 +239 I 0.077 +240 F 0.065 +241 F 0.052 +242 S 0.044 +243 Y 0.041 +244 Y 0.042 +245 K 0.047 +246 I 0.058 +247 V 0.071 +248 F 0.082 +249 S 0.085 +250 I 0.084 +251 L 0.086 +252 R 0.100 +253 I 0.122 +254 S 0.143 +255 S 0.157 +256 A 0.159 +257 G 0.148 +258 R 0.126 +259 K 0.105 +260 H 0.094 +261 K 0.093 +262 A 0.094 +263 F 0.093 +264 S 0.092 +265 T 0.092 +266 C 0.092 +267 G 0.092 +268 S 0.088 +269 H 0.081 +270 L 0.071 +271 S 0.066 +272 V 0.062 +273 V 0.055 +274 T 0.043 +275 L 0.032 +276 F 0.027 +277 Y 0.028 +278 G 0.031 +279 T 0.035 +280 G 0.039 +281 F 0.042 +282 G 0.042 +283 V 0.039 +284 Y 0.039 +285 L 0.047 +286 S 0.066 +287 S 0.095 +288 A 0.135 +289 A 0.176 +290 T 0.209 +291 P 0.223 +292 S 0.215 +293 S 0.190 +294 R 0.159 +295 T 0.135 +296 S 0.121 +297 L 0.113 +298 V 0.106 +299 A 0.099 +300 S 0.091 +301 V 0.089 +302 M 0.095 +303 Y 0.108 +304 T 0.120 +305 M 0.128 +306 V 0.134 +307 T 0.134 +308 P 0.124 +309 M 0.111 +310 L 0.100 +311 N 0.092 +312 P 0.085 +313 F 0.082 +314 I 0.084 +315 Y 0.087 +316 S 0.094 +317 L 0.109 +318 R 0.119 +319 N 0.111 +320 T 0.091 +321 D 0.074 +322 M 0.070 +323 K 0.077 +324 R 0.085 +325 A 0.088 +326 L 0.091 +327 G 0.097 +328 R 0.105 +329 L 0.111 +330 L 0.121 +331 S 0.143 +332 R 0.179 +333 A 0.224 +334 T 0.274 +335 F 0.328 +336 F 0.387 +337 N 0.455 +338 G 0.519 +339 D 0.551 +340 I 0.530 +341 T 0.483 +342 A 0.458 +343 G 0.463 +344 L 0.461 +345 S 0.442 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000128016.9_ENST00000597629.3_GN:ZFP36_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000128016.9_ENST00000597629.3_GN:ZFP36_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0d761de2e737b86c929630eafebdb64db7872dc9 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000128016.9_ENST00000597629.3_GN:ZFP36_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,327 @@ +>ENSG00000128016.9|ENST00000597629.3|GN:ZFP36|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.361 +2 D 0.361 +3 L 0.371 +4 T 0.395 +5 A 0.416 +6 I 0.422 +7 Y 0.425 +8 E 0.448 +9 S 0.487 +10 L 0.531 +11 L 0.577 +12 S 0.624 +13 L 0.659 +14 S 0.680 +15 P 0.697 +16 D 0.711 +17 V 0.718 +18 P 0.724 +19 V 0.737 +20 P 0.760 +21 S 0.786 +22 D 0.806 +23 H 0.815 +24 G 0.806 +25 G 0.763 +26 T 0.696 +27 E 0.651 +28 S 0.667 +29 S 0.715 +30 P 0.750 +31 G 0.753 +32 W 0.719 +33 G 0.662 +34 S 0.630 +35 S 0.659 +36 G 0.720 +37 P 0.767 +38 W 0.791 +39 S 0.803 +40 L 0.808 +41 S 0.813 +42 P 0.822 +43 S 0.830 +44 D 0.832 +45 S 0.828 +46 S 0.826 +47 P 0.834 +48 S 0.851 +49 G 0.868 +50 V 0.876 +51 T 0.875 +52 S 0.866 +53 R 0.858 +54 L 0.855 +55 P 0.861 +56 G 0.872 +57 R 0.882 +58 S 0.888 +59 T 0.890 +60 S 0.892 +61 L 0.893 +62 V 0.891 +63 E 0.886 +64 G 0.878 +65 R 0.871 +66 S 0.861 +67 C 0.844 +68 G 0.816 +69 W 0.782 +70 V 0.751 +71 P 0.736 +72 P 0.742 +73 P 0.765 +74 P 0.792 +75 G 0.810 +76 F 0.818 +77 A 0.824 +78 P 0.834 +79 L 0.845 +80 A 0.851 +81 P 0.854 +82 R 0.858 +83 L 0.862 +84 G 0.865 +85 P 0.869 +86 E 0.869 +87 L 0.862 +88 S 0.851 +89 P 0.843 +90 S 0.842 +91 P 0.845 +92 T 0.847 +93 S 0.848 +94 P 0.851 +95 T 0.853 +96 A 0.845 +97 T 0.821 +98 S 0.778 +99 T 0.717 +100 T 0.638 +101 P 0.541 +102 S 0.435 +103 R 0.341 +104 Y 0.269 +105 K 0.215 +106 T 0.178 +107 E 0.156 +108 L 0.138 +109 C 0.110 +110 R 0.080 +111 T 0.059 +112 F 0.051 +113 S 0.052 +114 E 0.058 +115 S 0.068 +116 G 0.078 +117 R 0.085 +118 C 0.088 +119 R 0.095 +120 Y 0.113 +121 G 0.136 +122 A 0.154 +123 K 0.164 +124 C 0.173 +125 Q 0.192 +126 F 0.219 +127 A 0.230 +128 H 0.210 +129 G 0.180 +130 L 0.172 +131 G 0.188 +132 E 0.220 +133 L 0.270 +134 R 0.344 +135 Q 0.432 +136 A 0.497 +137 N 0.504 +138 R 0.454 +139 H 0.375 +140 P 0.303 +141 K 0.256 +142 Y 0.230 +143 K 0.209 +144 T 0.188 +145 E 0.169 +146 L 0.145 +147 C 0.111 +148 H 0.077 +149 K 0.054 +150 F 0.048 +151 Y 0.052 +152 L 0.059 +153 Q 0.067 +154 G 0.077 +155 R 0.084 +156 C 0.088 +157 P 0.096 +158 Y 0.112 +159 G 0.130 +160 S 0.142 +161 R 0.145 +162 C 0.141 +163 H 0.132 +164 F 0.124 +165 I 0.127 +166 H 0.151 +167 N 0.200 +168 P 0.264 +169 S 0.341 +170 E 0.436 +171 D 0.536 +172 L 0.614 +173 A 0.659 +174 A 0.679 +175 P 0.687 +176 G 0.685 +177 H 0.682 +178 P 0.694 +179 P 0.723 +180 V 0.756 +181 L 0.780 +182 R 0.794 +183 Q 0.800 +184 S 0.797 +185 I 0.787 +186 S 0.779 +187 F 0.781 +188 S 0.787 +189 G 0.793 +190 L 0.798 +191 P 0.806 +192 S 0.817 +193 G 0.826 +194 R 0.827 +195 R 0.816 +196 T 0.792 +197 S 0.760 +198 P 0.739 +199 P 0.745 +200 P 0.773 +201 P 0.809 +202 G 0.836 +203 L 0.849 +204 A 0.846 +205 G 0.822 +206 P 0.754 +207 S 0.635 +208 L 0.526 +209 S 0.509 +210 S 0.566 +211 S 0.613 +212 S 0.639 +213 F 0.694 +214 S 0.767 +215 P 0.817 +216 S 0.831 +217 S 0.820 +218 S 0.800 +219 P 0.784 +220 P 0.785 +221 P 0.802 +222 P 0.826 +223 G 0.842 +224 D 0.847 +225 L 0.843 +226 P 0.836 +227 L 0.829 +228 S 0.827 +229 P 0.832 +230 S 0.841 +231 A 0.849 +232 F 0.850 +233 S 0.846 +234 A 0.837 +235 A 0.830 +236 P 0.829 +237 G 0.831 +238 T 0.836 +239 P 0.844 +240 L 0.849 +241 A 0.839 +242 R 0.811 +243 R 0.776 +244 D 0.747 +245 P 0.734 +246 T 0.728 +247 P 0.710 +248 V 0.657 +249 C 0.573 +250 C 0.491 +251 P 0.444 +252 S 0.444 +253 C 0.477 +254 R 0.521 +255 R 0.565 +256 A 0.612 +257 T 0.668 +258 P 0.725 +259 I 0.769 +260 S 0.790 +261 V 0.789 +262 W 0.777 +263 G 0.778 +264 P 0.798 +265 L 0.825 +266 G 0.843 +267 G 0.849 +268 L 0.844 +269 V 0.829 +270 R 0.811 +271 T 0.803 +272 P 0.811 +273 S 0.831 +274 V 0.849 +275 Q 0.859 +276 S 0.859 +277 L 0.851 +278 G 0.837 +279 S 0.821 +280 D 0.810 +281 P 0.810 +282 D 0.813 +283 E 0.802 +284 Y 0.760 +285 A 0.698 +286 S 0.670 +287 S 0.712 +288 G 0.785 +289 S 0.834 +290 S 0.850 +291 L 0.848 +292 G 0.842 +293 G 0.834 +294 S 0.825 +295 D 0.816 +296 S 0.812 +297 P 0.816 +298 V 0.825 +299 F 0.835 +300 E 0.842 +301 A 0.848 +302 G 0.847 +303 V 0.833 +304 F 0.808 +305 A 0.782 +306 P 0.768 +307 P 0.776 +308 Q 0.800 +309 P 0.828 +310 V 0.845 +311 A 0.847 +312 A 0.839 +313 P 0.827 +314 R 0.816 +315 R 0.807 +316 L 0.802 +317 P 0.803 +318 I 0.812 +319 F 0.826 +320 N 0.837 +321 R 0.839 +322 I 0.830 +323 S 0.803 +324 V 0.752 +325 S 0.682 +326 E 0.627 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000128016.9_ENST00000597629.3_GN:ZFP36_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000128016.9_ENST00000597629.3_GN:ZFP36_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5a758b34c4d3134c71cb5aafaf260a97ee481855 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000128016.9_ENST00000597629.3_GN:ZFP36_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid @@ -0,0 +1,333 @@ +>ENSG00000128016.9|ENST00000597629.3|GN:ZFP36|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:6 +1 M 0.516 +2 A 0.548 +3 N 0.591 +4 R 0.629 +5 Y 0.652 +6 T 0.643 +7 M 0.589 +8 D 0.500 +9 L 0.411 +10 T 0.359 +11 A 0.339 +12 I 0.323 +13 Y 0.305 +14 E 0.319 +15 S 0.379 +16 L 0.461 +17 L 0.541 +18 S 0.609 +19 L 0.659 +20 S 0.691 +21 P 0.714 +22 D 0.731 +23 V 0.739 +24 P 0.744 +25 V 0.756 +26 P 0.777 +27 S 0.799 +28 D 0.816 +29 H 0.823 +30 G 0.813 +31 G 0.774 +32 T 0.710 +33 E 0.668 +34 S 0.683 +35 S 0.728 +36 P 0.761 +37 G 0.763 +38 W 0.728 +39 G 0.669 +40 S 0.634 +41 S 0.662 +42 G 0.724 +43 P 0.773 +44 W 0.799 +45 S 0.810 +46 L 0.815 +47 S 0.820 +48 P 0.828 +49 S 0.837 +50 D 0.839 +51 S 0.834 +52 S 0.832 +53 P 0.841 +54 S 0.858 +55 G 0.875 +56 V 0.884 +57 T 0.882 +58 S 0.874 +59 R 0.866 +60 L 0.863 +61 P 0.868 +62 G 0.879 +63 R 0.888 +64 S 0.892 +65 T 0.894 +66 S 0.895 +67 L 0.895 +68 V 0.892 +69 E 0.886 +70 G 0.879 +71 R 0.871 +72 S 0.861 +73 C 0.845 +74 G 0.817 +75 W 0.782 +76 V 0.751 +77 P 0.735 +78 P 0.741 +79 P 0.765 +80 P 0.792 +81 G 0.809 +82 F 0.815 +83 A 0.821 +84 P 0.831 +85 L 0.842 +86 A 0.848 +87 P 0.852 +88 R 0.856 +89 L 0.860 +90 G 0.863 +91 P 0.866 +92 E 0.865 +93 L 0.858 +94 S 0.847 +95 P 0.839 +96 S 0.837 +97 P 0.839 +98 T 0.841 +99 S 0.841 +100 P 0.844 +101 T 0.846 +102 A 0.839 +103 T 0.815 +104 S 0.772 +105 T 0.711 +106 T 0.632 +107 P 0.536 +108 S 0.432 +109 R 0.340 +110 Y 0.269 +111 K 0.215 +112 T 0.178 +113 E 0.157 +114 L 0.139 +115 C 0.112 +116 R 0.082 +117 T 0.061 +118 F 0.053 +119 S 0.054 +120 E 0.061 +121 S 0.070 +122 G 0.081 +123 R 0.087 +124 C 0.090 +125 R 0.097 +126 Y 0.115 +127 G 0.140 +128 A 0.158 +129 K 0.168 +130 C 0.177 +131 Q 0.197 +132 F 0.224 +133 A 0.235 +134 H 0.214 +135 G 0.185 +136 L 0.176 +137 G 0.193 +138 E 0.226 +139 L 0.277 +140 R 0.352 +141 Q 0.442 +142 A 0.507 +143 N 0.515 +144 R 0.463 +145 H 0.383 +146 P 0.308 +147 K 0.259 +148 Y 0.232 +149 K 0.210 +150 T 0.189 +151 E 0.170 +152 L 0.146 +153 C 0.112 +154 H 0.077 +155 K 0.055 +156 F 0.048 +157 Y 0.052 +158 L 0.059 +159 Q 0.068 +160 G 0.077 +161 R 0.084 +162 C 0.088 +163 P 0.096 +164 Y 0.111 +165 G 0.129 +166 S 0.141 +167 R 0.145 +168 C 0.140 +169 H 0.130 +170 F 0.122 +171 I 0.125 +172 H 0.150 +173 N 0.198 +174 P 0.262 +175 S 0.339 +176 E 0.435 +177 D 0.535 +178 L 0.614 +179 A 0.658 +180 A 0.678 +181 P 0.685 +182 G 0.684 +183 H 0.680 +184 P 0.692 +185 P 0.721 +186 V 0.755 +187 L 0.780 +188 R 0.794 +189 Q 0.800 +190 S 0.797 +191 I 0.787 +192 S 0.779 +193 F 0.780 +194 S 0.786 +195 G 0.791 +196 L 0.796 +197 P 0.804 +198 S 0.814 +199 G 0.823 +200 R 0.824 +201 R 0.813 +202 T 0.788 +203 S 0.756 +204 P 0.735 +205 P 0.740 +206 P 0.769 +207 P 0.804 +208 G 0.832 +209 L 0.845 +210 A 0.843 +211 G 0.818 +212 P 0.751 +213 S 0.633 +214 L 0.525 +215 S 0.508 +216 S 0.564 +217 S 0.611 +218 S 0.638 +219 F 0.691 +220 S 0.765 +221 P 0.815 +222 S 0.829 +223 S 0.818 +224 S 0.798 +225 P 0.783 +226 P 0.784 +227 P 0.802 +228 P 0.825 +229 G 0.841 +230 D 0.845 +231 L 0.841 +232 P 0.834 +233 L 0.828 +234 S 0.826 +235 P 0.831 +236 S 0.840 +237 A 0.847 +238 F 0.849 +239 S 0.844 +240 A 0.835 +241 A 0.829 +242 P 0.828 +243 G 0.830 +244 T 0.835 +245 P 0.843 +246 L 0.847 +247 A 0.838 +248 R 0.810 +249 R 0.774 +250 D 0.746 +251 P 0.733 +252 T 0.727 +253 P 0.709 +254 V 0.657 +255 C 0.572 +256 C 0.489 +257 P 0.443 +258 S 0.445 +259 C 0.480 +260 R 0.528 +261 R 0.573 +262 A 0.619 +263 T 0.672 +264 P 0.727 +265 I 0.769 +266 S 0.789 +267 V 0.786 +268 W 0.775 +269 G 0.777 +270 P 0.798 +271 L 0.825 +272 G 0.844 +273 G 0.851 +274 L 0.846 +275 V 0.832 +276 R 0.815 +277 T 0.807 +278 P 0.815 +279 S 0.834 +280 V 0.852 +281 Q 0.861 +282 S 0.862 +283 L 0.854 +284 G 0.839 +285 S 0.824 +286 D 0.815 +287 P 0.814 +288 D 0.817 +289 E 0.806 +290 Y 0.763 +291 A 0.700 +292 S 0.673 +293 S 0.715 +294 G 0.789 +295 S 0.838 +296 S 0.854 +297 L 0.852 +298 G 0.846 +299 G 0.839 +300 S 0.830 +301 D 0.821 +302 S 0.817 +303 P 0.820 +304 V 0.829 +305 F 0.838 +306 E 0.845 +307 A 0.850 +308 G 0.849 +309 V 0.836 +310 F 0.811 +311 A 0.785 +312 P 0.772 +313 P 0.780 +314 Q 0.805 +315 P 0.832 +316 V 0.849 +317 A 0.851 +318 A 0.842 +319 P 0.830 +320 R 0.818 +321 R 0.809 +322 L 0.804 +323 P 0.806 +324 I 0.815 +325 F 0.828 +326 N 0.839 +327 R 0.842 +328 I 0.832 +329 S 0.805 +330 V 0.754 +331 S 0.683 +332 E 0.628 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000128617.3_ENST00000249389.3_GN:OPN1SW_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000128617.3_ENST00000249389.3_GN:OPN1SW_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2bcb9e19f3e65631a6962f325009c26c60f616b1 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000128617.3_ENST00000249389.3_GN:OPN1SW_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,346 @@ +>ENSG00000128617.3|ENST00000249389.3|GN:OPN1SW|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.292 +2 S 0.286 +3 E 0.273 +4 E 0.246 +5 E 0.205 +6 F 0.162 +7 Y 0.131 +8 L 0.120 +9 F 0.126 +10 K 0.142 +11 N 0.159 +12 I 0.170 +13 S 0.179 +14 S 0.194 +15 V 0.218 +16 G 0.231 +17 P 0.222 +18 W 0.204 +19 D 0.190 +20 G 0.176 +21 P 0.160 +22 Q 0.147 +23 Y 0.144 +24 H 0.147 +25 I 0.143 +26 A 0.127 +27 P 0.102 +28 V 0.076 +29 W 0.054 +30 A 0.043 +31 F 0.038 +32 Y 0.038 +33 L 0.040 +34 Q 0.044 +35 A 0.049 +36 A 0.054 +37 F 0.063 +38 M 0.072 +39 G 0.072 +40 T 0.062 +41 V 0.048 +42 F 0.041 +43 L 0.043 +44 I 0.050 +45 G 0.054 +46 F 0.053 +47 P 0.049 +48 L 0.050 +49 N 0.054 +50 A 0.057 +51 M 0.057 +52 V 0.053 +53 L 0.047 +54 V 0.045 +55 A 0.045 +56 T 0.046 +57 L 0.044 +58 R 0.043 +59 Y 0.043 +60 K 0.045 +61 K 0.047 +62 L 0.049 +63 R 0.051 +64 Q 0.052 +65 P 0.050 +66 L 0.046 +67 N 0.043 +68 Y 0.044 +69 I 0.044 +70 L 0.044 +71 V 0.043 +72 N 0.044 +73 V 0.046 +74 S 0.048 +75 F 0.048 +76 G 0.049 +77 G 0.048 +78 F 0.045 +79 L 0.041 +80 L 0.036 +81 C 0.032 +82 I 0.030 +83 F 0.030 +84 S 0.033 +85 V 0.037 +86 F 0.041 +87 P 0.044 +88 V 0.047 +89 F 0.052 +90 V 0.061 +91 A 0.070 +92 S 0.076 +93 C 0.082 +94 N 0.088 +95 G 0.088 +96 Y 0.081 +97 F 0.072 +98 V 0.065 +99 F 0.061 +100 G 0.057 +101 R 0.051 +102 H 0.043 +103 V 0.038 +104 C 0.036 +105 A 0.036 +106 L 0.038 +107 E 0.041 +108 G 0.042 +109 F 0.041 +110 L 0.039 +111 G 0.036 +112 T 0.035 +113 V 0.035 +114 A 0.035 +115 G 0.036 +116 L 0.038 +117 V 0.037 +118 T 0.035 +119 G 0.032 +120 W 0.032 +121 S 0.033 +122 L 0.032 +123 A 0.029 +124 F 0.028 +125 L 0.031 +126 A 0.036 +127 F 0.041 +128 E 0.043 +129 R 0.042 +130 Y 0.040 +131 I 0.041 +132 V 0.050 +133 I 0.070 +134 C 0.099 +135 K 0.128 +136 P 0.145 +137 F 0.146 +138 G 0.140 +139 N 0.132 +140 F 0.120 +141 R 0.100 +142 F 0.076 +143 S 0.055 +144 S 0.040 +145 K 0.035 +146 H 0.037 +147 A 0.046 +148 L 0.060 +149 T 0.070 +150 V 0.069 +151 V 0.061 +152 L 0.057 +153 A 0.059 +154 T 0.063 +155 W 0.065 +156 T 0.067 +157 I 0.072 +158 G 0.077 +159 I 0.082 +160 G 0.087 +161 V 0.096 +162 S 0.104 +163 I 0.106 +164 P 0.105 +165 P 0.103 +166 F 0.102 +167 F 0.102 +168 G 0.102 +169 W 0.100 +170 S 0.099 +171 R 0.104 +172 F 0.117 +173 I 0.131 +174 P 0.136 +175 E 0.132 +176 G 0.124 +177 L 0.117 +178 Q 0.110 +179 C 0.102 +180 S 0.098 +181 C 0.106 +182 G 0.125 +183 P 0.140 +184 D 0.141 +185 W 0.131 +186 Y 0.128 +187 T 0.144 +188 V 0.172 +189 G 0.194 +190 T 0.202 +191 K 0.195 +192 Y 0.177 +193 R 0.150 +194 S 0.119 +195 E 0.095 +196 S 0.082 +197 Y 0.077 +198 T 0.072 +199 W 0.069 +200 F 0.069 +201 L 0.067 +202 F 0.060 +203 I 0.053 +204 F 0.050 +205 C 0.051 +206 F 0.053 +207 I 0.060 +208 V 0.069 +209 P 0.072 +210 L 0.065 +211 S 0.058 +212 L 0.056 +213 I 0.054 +214 C 0.047 +215 F 0.039 +216 S 0.033 +217 Y 0.031 +218 T 0.036 +219 Q 0.046 +220 L 0.057 +221 L 0.069 +222 R 0.076 +223 A 0.074 +224 L 0.071 +225 K 0.078 +226 A 0.093 +227 V 0.108 +228 A 0.126 +229 A 0.148 +230 Q 0.173 +231 Q 0.196 +232 Q 0.214 +233 E 0.223 +234 S 0.219 +235 A 0.204 +236 T 0.187 +237 T 0.167 +238 Q 0.146 +239 K 0.130 +240 A 0.117 +241 E 0.105 +242 R 0.095 +243 E 0.088 +244 V 0.080 +245 S 0.069 +246 R 0.060 +247 M 0.055 +248 V 0.051 +249 V 0.047 +250 V 0.048 +251 M 0.054 +252 V 0.060 +253 G 0.060 +254 S 0.054 +255 F 0.044 +256 C 0.035 +257 V 0.030 +258 C 0.031 +259 Y 0.035 +260 V 0.039 +261 P 0.040 +262 Y 0.039 +263 A 0.035 +264 A 0.033 +265 F 0.033 +266 A 0.035 +267 M 0.037 +268 Y 0.039 +269 M 0.043 +270 V 0.050 +271 N 0.059 +272 N 0.071 +273 R 0.088 +274 N 0.112 +275 H 0.138 +276 G 0.151 +277 L 0.144 +278 D 0.119 +279 L 0.089 +280 R 0.067 +281 L 0.055 +282 V 0.051 +283 T 0.053 +284 I 0.057 +285 P 0.059 +286 S 0.059 +287 F 0.060 +288 F 0.064 +289 S 0.069 +290 K 0.076 +291 S 0.081 +292 A 0.079 +293 C 0.070 +294 I 0.060 +295 Y 0.056 +296 N 0.056 +297 P 0.058 +298 I 0.059 +299 I 0.056 +300 Y 0.049 +301 C 0.043 +302 F 0.046 +303 M 0.053 +304 N 0.051 +305 K 0.042 +306 Q 0.032 +307 F 0.027 +308 Q 0.027 +309 A 0.031 +310 C 0.036 +311 I 0.039 +312 M 0.041 +313 K 0.043 +314 M 0.053 +315 V 0.079 +316 C 0.129 +317 G 0.198 +318 K 0.270 +319 A 0.326 +320 M 0.365 +321 T 0.395 +322 D 0.420 +323 E 0.435 +324 S 0.442 +325 D 0.448 +326 T 0.456 +327 C 0.469 +328 S 0.492 +329 S 0.520 +330 Q 0.525 +331 K 0.490 +332 T 0.443 +333 E 0.434 +334 V 0.465 +335 S 0.493 +336 T 0.519 +337 V 0.566 +338 S 0.618 +339 S 0.644 +340 T 0.646 +341 Q 0.640 +342 V 0.626 +343 G 0.593 +344 P 0.544 +345 N 0.503 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000128617.3_ENST00000249389.3_GN:OPN1SW_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000128617.3_ENST00000249389.3_GN:OPN1SW_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1712376ac7777780420beb6fc0c9c710d5da4475 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000128617.3_ENST00000249389.3_GN:OPN1SW_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid @@ -0,0 +1,349 @@ +>ENSG00000128617.3|ENST00000249389.3|GN:OPN1SW|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 +1 M 0.298 +2 R 0.295 +3 K 0.279 +4 M 0.248 +5 S 0.214 +6 E 0.188 +7 E 0.167 +8 E 0.143 +9 F 0.118 +10 Y 0.102 +11 L 0.099 +12 F 0.109 +13 K 0.127 +14 N 0.145 +15 I 0.158 +16 S 0.169 +17 S 0.188 +18 V 0.215 +19 G 0.232 +20 P 0.225 +21 W 0.207 +22 D 0.193 +23 G 0.179 +24 P 0.161 +25 Q 0.145 +26 Y 0.139 +27 H 0.140 +28 I 0.136 +29 A 0.122 +30 P 0.099 +31 V 0.074 +32 W 0.053 +33 A 0.042 +34 F 0.038 +35 Y 0.037 +36 L 0.039 +37 Q 0.044 +38 A 0.049 +39 A 0.054 +40 F 0.062 +41 M 0.072 +42 G 0.072 +43 T 0.062 +44 V 0.049 +45 F 0.041 +46 L 0.043 +47 I 0.049 +48 G 0.054 +49 F 0.052 +50 P 0.049 +51 L 0.050 +52 N 0.054 +53 A 0.057 +54 M 0.057 +55 V 0.053 +56 L 0.047 +57 V 0.045 +58 A 0.045 +59 T 0.045 +60 L 0.043 +61 R 0.042 +62 Y 0.043 +63 K 0.045 +64 K 0.046 +65 L 0.048 +66 R 0.050 +67 Q 0.051 +68 P 0.050 +69 L 0.046 +70 N 0.043 +71 Y 0.043 +72 I 0.044 +73 L 0.043 +74 V 0.042 +75 N 0.044 +76 V 0.046 +77 S 0.047 +78 F 0.048 +79 G 0.048 +80 G 0.048 +81 F 0.045 +82 L 0.040 +83 L 0.036 +84 C 0.032 +85 I 0.029 +86 F 0.030 +87 S 0.032 +88 V 0.037 +89 F 0.041 +90 P 0.044 +91 V 0.046 +92 F 0.051 +93 V 0.060 +94 A 0.069 +95 S 0.074 +96 C 0.080 +97 N 0.085 +98 G 0.085 +99 Y 0.078 +100 F 0.069 +101 V 0.063 +102 F 0.060 +103 G 0.056 +104 R 0.050 +105 H 0.043 +106 V 0.037 +107 C 0.035 +108 A 0.035 +109 L 0.038 +110 E 0.040 +111 G 0.042 +112 F 0.041 +113 L 0.039 +114 G 0.036 +115 T 0.035 +116 V 0.035 +117 A 0.035 +118 G 0.036 +119 L 0.038 +120 V 0.038 +121 T 0.035 +122 G 0.032 +123 W 0.032 +124 S 0.033 +125 L 0.032 +126 A 0.029 +127 F 0.028 +128 L 0.031 +129 A 0.036 +130 F 0.041 +131 E 0.044 +132 R 0.043 +133 Y 0.040 +134 I 0.041 +135 V 0.050 +136 I 0.070 +137 C 0.099 +138 K 0.128 +139 P 0.146 +140 F 0.147 +141 G 0.141 +142 N 0.133 +143 F 0.121 +144 R 0.101 +145 F 0.077 +146 S 0.055 +147 S 0.040 +148 K 0.035 +149 H 0.038 +150 A 0.047 +151 L 0.060 +152 T 0.070 +153 V 0.069 +154 V 0.061 +155 L 0.057 +156 A 0.059 +157 T 0.063 +158 W 0.065 +159 T 0.067 +160 I 0.072 +161 G 0.077 +162 I 0.082 +163 G 0.088 +164 V 0.097 +165 S 0.104 +166 I 0.107 +167 P 0.106 +168 P 0.104 +169 F 0.103 +170 F 0.103 +171 G 0.102 +172 W 0.100 +173 S 0.098 +174 R 0.102 +175 F 0.115 +176 I 0.129 +177 P 0.134 +178 E 0.130 +179 G 0.122 +180 L 0.116 +181 Q 0.109 +182 C 0.101 +183 S 0.098 +184 C 0.106 +185 G 0.125 +186 P 0.140 +187 D 0.141 +188 W 0.131 +189 Y 0.128 +190 T 0.144 +191 V 0.172 +192 G 0.195 +193 T 0.202 +194 K 0.195 +195 Y 0.177 +196 R 0.150 +197 S 0.119 +198 E 0.095 +199 S 0.082 +200 Y 0.077 +201 T 0.072 +202 W 0.069 +203 F 0.069 +204 L 0.067 +205 F 0.060 +206 I 0.053 +207 F 0.051 +208 C 0.051 +209 F 0.053 +210 I 0.060 +211 V 0.069 +212 P 0.072 +213 L 0.065 +214 S 0.058 +215 L 0.056 +216 I 0.054 +217 C 0.047 +218 F 0.039 +219 S 0.033 +220 Y 0.031 +221 T 0.036 +222 Q 0.046 +223 L 0.058 +224 L 0.069 +225 R 0.076 +226 A 0.074 +227 L 0.071 +228 K 0.078 +229 A 0.093 +230 V 0.109 +231 A 0.126 +232 A 0.148 +233 Q 0.173 +234 Q 0.196 +235 Q 0.214 +236 E 0.223 +237 S 0.219 +238 A 0.205 +239 T 0.187 +240 T 0.167 +241 Q 0.147 +242 K 0.130 +243 A 0.117 +244 E 0.105 +245 R 0.095 +246 E 0.088 +247 V 0.080 +248 S 0.069 +249 R 0.061 +250 M 0.056 +251 V 0.051 +252 V 0.047 +253 V 0.048 +254 M 0.054 +255 V 0.060 +256 G 0.060 +257 S 0.054 +258 F 0.044 +259 C 0.035 +260 V 0.031 +261 C 0.031 +262 Y 0.035 +263 V 0.039 +264 P 0.040 +265 Y 0.039 +266 A 0.035 +267 A 0.033 +268 F 0.033 +269 A 0.035 +270 M 0.037 +271 Y 0.039 +272 M 0.043 +273 V 0.050 +274 N 0.059 +275 N 0.071 +276 R 0.088 +277 N 0.112 +278 H 0.137 +279 G 0.150 +280 L 0.143 +281 D 0.118 +282 L 0.089 +283 R 0.067 +284 L 0.055 +285 V 0.051 +286 T 0.053 +287 I 0.057 +288 P 0.060 +289 S 0.060 +290 F 0.061 +291 F 0.064 +292 S 0.070 +293 K 0.077 +294 S 0.082 +295 A 0.080 +296 C 0.071 +297 I 0.061 +298 Y 0.056 +299 N 0.056 +300 P 0.058 +301 I 0.059 +302 I 0.057 +303 Y 0.049 +304 C 0.044 +305 F 0.047 +306 M 0.053 +307 N 0.052 +308 K 0.042 +309 Q 0.032 +310 F 0.027 +311 Q 0.027 +312 A 0.031 +313 C 0.036 +314 I 0.039 +315 M 0.041 +316 K 0.043 +317 M 0.053 +318 V 0.080 +319 C 0.129 +320 G 0.198 +321 K 0.270 +322 A 0.328 +323 M 0.368 +324 T 0.399 +325 D 0.424 +326 E 0.439 +327 S 0.445 +328 D 0.451 +329 T 0.459 +330 C 0.470 +331 S 0.493 +332 S 0.519 +333 Q 0.521 +334 K 0.482 +335 T 0.433 +336 E 0.427 +337 V 0.462 +338 S 0.492 +339 T 0.519 +340 V 0.566 +341 S 0.618 +342 S 0.644 +343 T 0.647 +344 Q 0.641 +345 V 0.626 +346 G 0.594 +347 P 0.545 +348 N 0.504 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000130024.16_ENST00000339209.9_GN:PHF10_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000130024.16_ENST00000339209.9_GN:PHF10_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d4ce76b1aeff788692af6ae9b61e459b80fc02aa --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000130024.16_ENST00000339209.9_GN:PHF10_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,499 @@ +>ENSG00000130024.16|ENST00000339209.9|GN:PHF10|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.400 +2 A 0.422 +3 A 0.456 +4 A 0.497 +5 A 0.539 +6 G 0.578 +7 P 0.604 +8 G 0.596 +9 A 0.545 +10 A 0.489 +11 L 0.472 +12 S 0.491 +13 P 0.525 +14 R 0.565 +15 P 0.597 +16 C 0.597 +17 D 0.565 +18 S 0.547 +19 D 0.574 +20 P 0.625 +21 A 0.664 +22 T 0.692 +23 P 0.716 +24 G 0.729 +25 A 0.722 +26 Q 0.691 +27 S 0.640 +28 P 0.587 +29 K 0.570 +30 D 0.598 +31 D 0.618 +32 N 0.597 +33 E 0.580 +34 D 0.602 +35 N 0.638 +36 S 0.664 +37 N 0.688 +38 D 0.707 +39 G 0.707 +40 T 0.692 +41 Q 0.678 +42 P 0.673 +43 S 0.673 +44 K 0.674 +45 R 0.678 +46 R 0.686 +47 R 0.701 +48 M 0.720 +49 G 0.735 +50 S 0.741 +51 G 0.739 +52 D 0.733 +53 S 0.723 +54 S 0.715 +55 R 0.715 +56 S 0.723 +57 C 0.730 +58 E 0.732 +59 T 0.726 +60 S 0.714 +61 S 0.697 +62 Q 0.676 +63 D 0.648 +64 L 0.598 +65 G 0.521 +66 F 0.433 +67 S 0.356 +68 Y 0.298 +69 Y 0.259 +70 P 0.231 +71 A 0.207 +72 E 0.178 +73 N 0.142 +74 L 0.108 +75 I 0.082 +76 E 0.064 +77 Y 0.055 +78 K 0.055 +79 W 0.064 +80 P 0.086 +81 P 0.117 +82 D 0.144 +83 E 0.156 +84 T 0.149 +85 G 0.127 +86 E 0.095 +87 Y 0.062 +88 Y 0.036 +89 M 0.022 +90 L 0.017 +91 Q 0.018 +92 E 0.024 +93 Q 0.029 +94 V 0.033 +95 S 0.038 +96 E 0.041 +97 Y 0.042 +98 L 0.040 +99 G 0.038 +100 V 0.038 +101 T 0.039 +102 S 0.038 +103 F 0.038 +104 K 0.039 +105 R 0.045 +106 K 0.056 +107 Y 0.071 +108 P 0.084 +109 D 0.090 +110 L 0.088 +111 E 0.078 +112 R 0.064 +113 R 0.054 +114 D 0.052 +115 L 0.052 +116 S 0.047 +117 H 0.036 +118 K 0.025 +119 E 0.019 +120 K 0.019 +121 L 0.023 +122 Y 0.029 +123 L 0.037 +124 R 0.045 +125 E 0.055 +126 L 0.064 +127 N 0.070 +128 V 0.072 +129 I 0.073 +130 T 0.075 +131 E 0.078 +132 T 0.084 +133 Q 0.098 +134 C 0.117 +135 T 0.130 +136 L 0.126 +137 G 0.102 +138 L 0.071 +139 T 0.044 +140 A 0.027 +141 L 0.020 +142 R 0.019 +143 S 0.020 +144 D 0.023 +145 E 0.025 +146 V 0.024 +147 I 0.024 +148 D 0.026 +149 L 0.028 +150 M 0.029 +151 I 0.028 +152 K 0.029 +153 E 0.032 +154 Y 0.036 +155 P 0.036 +156 A 0.032 +157 K 0.028 +158 H 0.025 +159 A 0.024 +160 E 0.025 +161 Y 0.029 +162 S 0.034 +163 V 0.038 +164 I 0.042 +165 L 0.049 +166 Q 0.060 +167 E 0.069 +168 K 0.078 +169 E 0.089 +170 R 0.106 +171 Q 0.123 +172 R 0.135 +173 I 0.142 +174 T 0.151 +175 D 0.169 +176 H 0.190 +177 Y 0.206 +178 K 0.219 +179 E 0.228 +180 Y 0.232 +181 S 0.232 +182 Q 0.242 +183 M 0.269 +184 Q 0.308 +185 Q 0.351 +186 Q 0.396 +187 N 0.446 +188 T 0.494 +189 Q 0.521 +190 K 0.511 +191 V 0.470 +192 E 0.411 +193 A 0.346 +194 S 0.286 +195 K 0.241 +196 V 0.213 +197 P 0.199 +198 E 0.197 +199 Y 0.207 +200 I 0.216 +201 K 0.219 +202 K 0.226 +203 A 0.241 +204 A 0.248 +205 K 0.245 +206 K 0.247 +207 A 0.257 +208 A 0.260 +209 E 0.248 +210 F 0.229 +211 N 0.212 +212 S 0.198 +213 N 0.187 +214 L 0.178 +215 N 0.166 +216 R 0.154 +217 E 0.146 +218 R 0.143 +219 M 0.144 +220 E 0.148 +221 E 0.156 +222 R 0.169 +223 R 0.190 +224 A 0.216 +225 Y 0.240 +226 F 0.259 +227 D 0.270 +228 L 0.267 +229 Q 0.258 +230 T 0.261 +231 H 0.281 +232 V 0.309 +233 I 0.340 +234 Q 0.386 +235 V 0.443 +236 P 0.484 +237 Q 0.496 +238 G 0.482 +239 K 0.452 +240 Y 0.423 +241 K 0.406 +242 V 0.406 +243 L 0.417 +244 P 0.428 +245 T 0.434 +246 E 0.435 +247 R 0.423 +248 T 0.406 +249 K 0.406 +250 V 0.426 +251 S 0.451 +252 S 0.472 +253 Y 0.500 +254 P 0.533 +255 V 0.559 +256 A 0.579 +257 L 0.597 +258 I 0.599 +259 P 0.581 +260 G 0.561 +261 Q 0.549 +262 F 0.530 +263 Q 0.491 +264 E 0.453 +265 Y 0.438 +266 Y 0.430 +267 K 0.398 +268 R 0.344 +269 Y 0.289 +270 S 0.249 +271 P 0.231 +272 D 0.230 +273 E 0.231 +274 L 0.222 +275 R 0.215 +276 Y 0.230 +277 L 0.273 +278 P 0.334 +279 L 0.395 +280 N 0.446 +281 T 0.482 +282 A 0.504 +283 L 0.513 +284 Y 0.519 +285 E 0.537 +286 P 0.574 +287 P 0.615 +288 L 0.643 +289 D 0.653 +290 P 0.652 +291 E 0.656 +292 L 0.672 +293 P 0.701 +294 A 0.732 +295 L 0.753 +296 D 0.763 +297 S 0.763 +298 D 0.760 +299 G 0.757 +300 D 0.755 +301 S 0.754 +302 D 0.753 +303 D 0.751 +304 G 0.749 +305 E 0.749 +306 D 0.749 +307 G 0.746 +308 R 0.737 +309 G 0.713 +310 D 0.663 +311 E 0.599 +312 K 0.564 +313 R 0.581 +314 K 0.606 +315 N 0.598 +316 K 0.582 +317 G 0.585 +318 T 0.593 +319 S 0.612 +320 D 0.664 +321 S 0.727 +322 S 0.765 +323 S 0.784 +324 G 0.797 +325 N 0.804 +326 V 0.802 +327 S 0.796 +328 E 0.789 +329 G 0.776 +330 E 0.759 +331 S 0.747 +332 P 0.749 +333 P 0.764 +334 D 0.780 +335 S 0.788 +336 Q 0.786 +337 E 0.778 +338 D 0.763 +339 S 0.747 +340 F 0.738 +341 Q 0.739 +342 G 0.740 +343 R 0.725 +344 Q 0.684 +345 K 0.628 +346 S 0.601 +347 K 0.628 +348 D 0.676 +349 K 0.700 +350 A 0.692 +351 A 0.672 +352 T 0.658 +353 P 0.662 +354 R 0.679 +355 K 0.690 +356 D 0.685 +357 G 0.676 +358 P 0.677 +359 K 0.690 +360 R 0.704 +361 S 0.707 +362 V 0.699 +363 L 0.690 +364 S 0.681 +365 K 0.661 +366 S 0.628 +367 V 0.592 +368 P 0.563 +369 G 0.533 +370 Y 0.492 +371 K 0.452 +372 P 0.424 +373 K 0.403 +374 V 0.375 +375 I 0.330 +376 P 0.272 +377 N 0.210 +378 A 0.154 +379 I 0.108 +380 C 0.074 +381 G 0.054 +382 I 0.051 +383 C 0.061 +384 L 0.083 +385 K 0.117 +386 G 0.154 +387 K 0.188 +388 E 0.221 +389 S 0.252 +390 N 0.271 +391 K 0.277 +392 K 0.277 +393 G 0.280 +394 K 0.282 +395 A 0.268 +396 E 0.236 +397 S 0.191 +398 L 0.146 +399 I 0.109 +400 H 0.087 +401 C 0.077 +402 S 0.075 +403 Q 0.079 +404 C 0.090 +405 E 0.104 +406 N 0.115 +407 S 0.117 +408 G 0.112 +409 H 0.105 +410 P 0.103 +411 S 0.110 +412 C 0.121 +413 L 0.132 +414 D 0.141 +415 M 0.142 +416 T 0.131 +417 M 0.111 +418 E 0.094 +419 L 0.082 +420 V 0.075 +421 S 0.075 +422 M 0.079 +423 I 0.085 +424 K 0.090 +425 T 0.091 +426 Y 0.090 +427 P 0.082 +428 W 0.070 +429 Q 0.060 +430 C 0.059 +431 M 0.067 +432 E 0.078 +433 C 0.081 +434 K 0.074 +435 T 0.063 +436 C 0.056 +437 I 0.056 +438 I 0.064 +439 C 0.080 +440 G 0.098 +441 Q 0.114 +442 P 0.123 +443 H 0.125 +444 H 0.125 +445 E 0.129 +446 E 0.130 +447 E 0.128 +448 M 0.126 +449 M 0.126 +450 F 0.123 +451 C 0.114 +452 D 0.104 +453 M 0.099 +454 C 0.103 +455 D 0.113 +456 R 0.121 +457 G 0.122 +458 Y 0.112 +459 H 0.097 +460 T 0.090 +461 F 0.096 +462 C 0.110 +463 V 0.119 +464 G 0.122 +465 L 0.126 +466 G 0.133 +467 A 0.142 +468 I 0.149 +469 P 0.154 +470 S 0.156 +471 G 0.150 +472 R 0.131 +473 W 0.103 +474 I 0.079 +475 C 0.063 +476 D 0.062 +477 C 0.075 +478 C 0.108 +479 Q 0.160 +480 R 0.230 +481 A 0.309 +482 P 0.388 +483 P 0.462 +484 T 0.527 +485 P 0.577 +486 R 0.616 +487 K 0.650 +488 V 0.678 +489 G 0.694 +490 R 0.702 +491 R 0.710 +492 G 0.721 +493 K 0.733 +494 N 0.739 +495 S 0.740 +496 K 0.735 +497 E 0.723 +498 G 0.712 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000130024.16_ENST00000339209.9_GN:PHF10_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:66.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000130024.16_ENST00000339209.9_GN:PHF10_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:66.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a7798c9f48567958ea6596b20038695bdd568bb9 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000130024.16_ENST00000339209.9_GN:PHF10_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:66.caid @@ -0,0 +1,565 @@ +>ENSG00000130024.16|ENST00000339209.9|GN:PHF10|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:66 +1 M 0.325 +2 A 0.354 +3 V 0.397 +4 A 0.428 +5 A 0.424 +6 A 0.407 +7 L 0.413 +8 A 0.439 +9 G 0.457 +10 R 0.469 +11 G 0.487 +12 A 0.500 +13 R 0.517 +14 G 0.561 +15 G 0.610 +16 R 0.631 +17 G 0.626 +18 R 0.623 +19 P 0.640 +20 P 0.675 +21 G 0.712 +22 G 0.734 +23 R 0.740 +24 A 0.737 +25 E 0.730 +26 G 0.715 +27 A 0.694 +28 G 0.683 +29 P 0.687 +30 G 0.696 +31 R 0.696 +32 R 0.689 +33 G 0.671 +34 A 0.625 +35 R 0.552 +36 A 0.486 +37 A 0.445 +38 A 0.408 +39 A 0.368 +40 A 0.340 +41 A 0.323 +42 A 0.309 +43 A 0.310 +44 A 0.336 +45 A 0.373 +46 A 0.410 +47 A 0.445 +48 A 0.483 +49 A 0.524 +50 G 0.555 +51 T 0.561 +52 R 0.538 +53 R 0.510 +54 R 0.498 +55 R 0.501 +56 R 0.510 +57 R 0.526 +58 R 0.557 +59 R 0.595 +60 R 0.627 +61 R 0.658 +62 G 0.694 +63 A 0.727 +64 L 0.749 +65 G 0.764 +66 L 0.774 +67 M 0.781 +68 A 0.783 +69 A 0.777 +70 A 0.763 +71 A 0.751 +72 G 0.749 +73 P 0.760 +74 G 0.774 +75 A 0.779 +76 A 0.771 +77 L 0.754 +78 S 0.738 +79 P 0.736 +80 R 0.749 +81 P 0.770 +82 C 0.787 +83 D 0.792 +84 S 0.788 +85 D 0.783 +86 P 0.779 +87 A 0.781 +88 T 0.789 +89 P 0.801 +90 G 0.809 +91 A 0.802 +92 Q 0.773 +93 S 0.717 +94 P 0.651 +95 K 0.625 +96 D 0.665 +97 D 0.727 +98 N 0.764 +99 E 0.776 +100 D 0.778 +101 N 0.775 +102 S 0.769 +103 N 0.763 +104 D 0.754 +105 G 0.738 +106 T 0.719 +107 Q 0.707 +108 P 0.705 +109 S 0.707 +110 K 0.711 +111 R 0.719 +112 R 0.733 +113 R 0.750 +114 M 0.766 +115 G 0.776 +116 S 0.778 +117 G 0.773 +118 D 0.764 +119 S 0.751 +120 S 0.739 +121 R 0.733 +122 S 0.733 +123 C 0.733 +124 E 0.726 +125 T 0.711 +126 S 0.691 +127 S 0.669 +128 Q 0.646 +129 D 0.615 +130 L 0.564 +131 G 0.489 +132 F 0.403 +133 S 0.324 +134 Y 0.262 +135 Y 0.220 +136 P 0.192 +137 A 0.172 +138 E 0.152 +139 N 0.126 +140 L 0.098 +141 I 0.076 +142 E 0.061 +143 Y 0.053 +144 K 0.054 +145 W 0.063 +146 P 0.084 +147 P 0.115 +148 D 0.142 +149 E 0.154 +150 T 0.149 +151 G 0.128 +152 E 0.096 +153 Y 0.063 +154 Y 0.036 +155 M 0.021 +156 L 0.016 +157 Q 0.017 +158 E 0.023 +159 Q 0.028 +160 V 0.032 +161 S 0.035 +162 E 0.038 +163 Y 0.039 +164 L 0.038 +165 G 0.037 +166 V 0.038 +167 T 0.039 +168 S 0.038 +169 F 0.037 +170 K 0.038 +171 R 0.043 +172 K 0.053 +173 Y 0.067 +174 P 0.079 +175 D 0.086 +176 L 0.085 +177 E 0.075 +178 R 0.061 +179 R 0.052 +180 D 0.050 +181 L 0.050 +182 S 0.045 +183 H 0.034 +184 K 0.023 +185 E 0.017 +186 K 0.016 +187 L 0.019 +188 Y 0.024 +189 L 0.031 +190 R 0.038 +191 E 0.047 +192 L 0.056 +193 N 0.062 +194 V 0.064 +195 I 0.065 +196 T 0.066 +197 E 0.067 +198 T 0.070 +199 Q 0.080 +200 C 0.095 +201 T 0.106 +202 L 0.103 +203 G 0.084 +204 L 0.059 +205 T 0.037 +206 A 0.024 +207 L 0.018 +208 R 0.017 +209 S 0.018 +210 D 0.020 +211 E 0.021 +212 V 0.020 +213 I 0.021 +214 D 0.023 +215 L 0.025 +216 M 0.025 +217 I 0.024 +218 K 0.025 +219 E 0.027 +220 Y 0.030 +221 P 0.029 +222 A 0.026 +223 K 0.022 +224 H 0.019 +225 A 0.018 +226 E 0.018 +227 Y 0.020 +228 S 0.024 +229 V 0.026 +230 I 0.030 +231 L 0.037 +232 Q 0.047 +233 E 0.056 +234 K 0.064 +235 E 0.071 +236 R 0.080 +237 Q 0.090 +238 R 0.101 +239 I 0.111 +240 T 0.123 +241 D 0.139 +242 H 0.158 +243 Y 0.176 +244 K 0.193 +245 E 0.207 +246 Y 0.215 +247 S 0.219 +248 Q 0.227 +249 M 0.248 +250 Q 0.281 +251 Q 0.319 +252 Q 0.361 +253 N 0.409 +254 T 0.455 +255 Q 0.481 +256 K 0.472 +257 V 0.433 +258 E 0.379 +259 A 0.321 +260 S 0.267 +261 K 0.227 +262 V 0.202 +263 P 0.187 +264 E 0.185 +265 Y 0.193 +266 I 0.203 +267 K 0.207 +268 K 0.217 +269 A 0.235 +270 A 0.245 +271 K 0.243 +272 K 0.246 +273 A 0.256 +274 A 0.258 +275 E 0.246 +276 F 0.226 +277 N 0.207 +278 S 0.191 +279 N 0.179 +280 L 0.171 +281 N 0.163 +282 R 0.155 +283 E 0.150 +284 R 0.148 +285 M 0.148 +286 E 0.152 +287 E 0.160 +288 R 0.174 +289 R 0.196 +290 A 0.224 +291 Y 0.249 +292 F 0.268 +293 D 0.279 +294 L 0.279 +295 Q 0.274 +296 T 0.283 +297 H 0.309 +298 V 0.340 +299 I 0.373 +300 Q 0.421 +301 V 0.480 +302 P 0.524 +303 Q 0.536 +304 G 0.521 +305 K 0.492 +306 Y 0.463 +307 K 0.444 +308 V 0.440 +309 L 0.446 +310 P 0.455 +311 T 0.465 +312 E 0.472 +313 R 0.466 +314 T 0.450 +315 K 0.443 +316 V 0.456 +317 S 0.477 +318 S 0.496 +319 Y 0.521 +320 P 0.547 +321 V 0.566 +322 A 0.581 +323 L 0.596 +324 I 0.599 +325 P 0.586 +326 G 0.572 +327 Q 0.566 +328 F 0.552 +329 Q 0.519 +330 E 0.487 +331 Y 0.476 +332 Y 0.470 +333 K 0.438 +334 R 0.382 +335 Y 0.322 +336 S 0.276 +337 P 0.254 +338 D 0.252 +339 E 0.251 +340 L 0.237 +341 R 0.224 +342 Y 0.236 +343 L 0.284 +344 P 0.350 +345 L 0.414 +346 N 0.460 +347 T 0.488 +348 A 0.504 +349 L 0.512 +350 Y 0.516 +351 E 0.533 +352 P 0.570 +353 P 0.614 +354 L 0.645 +355 D 0.654 +356 P 0.652 +357 E 0.654 +358 L 0.672 +359 P 0.702 +360 A 0.733 +361 L 0.754 +362 D 0.762 +363 S 0.763 +364 D 0.760 +365 G 0.757 +366 D 0.754 +367 S 0.753 +368 D 0.751 +369 D 0.749 +370 G 0.748 +371 E 0.748 +372 D 0.748 +373 G 0.744 +374 R 0.734 +375 G 0.709 +376 D 0.660 +377 E 0.596 +378 K 0.559 +379 R 0.575 +380 K 0.600 +381 N 0.592 +382 K 0.575 +383 G 0.578 +384 T 0.587 +385 S 0.606 +386 D 0.656 +387 S 0.715 +388 S 0.752 +389 S 0.771 +390 G 0.785 +391 N 0.792 +392 V 0.788 +393 S 0.781 +394 E 0.773 +395 G 0.759 +396 E 0.741 +397 S 0.729 +398 P 0.732 +399 P 0.749 +400 D 0.766 +401 S 0.774 +402 Q 0.773 +403 E 0.763 +404 D 0.747 +405 S 0.730 +406 F 0.720 +407 Q 0.724 +408 G 0.729 +409 R 0.716 +410 Q 0.675 +411 K 0.619 +412 S 0.593 +413 K 0.621 +414 D 0.669 +415 K 0.693 +416 A 0.684 +417 A 0.662 +418 T 0.646 +419 P 0.649 +420 R 0.665 +421 K 0.676 +422 D 0.672 +423 G 0.663 +424 P 0.665 +425 K 0.678 +426 R 0.690 +427 S 0.689 +428 V 0.675 +429 L 0.662 +430 S 0.653 +431 K 0.634 +432 S 0.599 +433 V 0.562 +434 P 0.538 +435 G 0.514 +436 Y 0.479 +437 K 0.440 +438 P 0.413 +439 K 0.392 +440 V 0.365 +441 I 0.324 +442 P 0.269 +443 N 0.210 +444 A 0.156 +445 I 0.111 +446 C 0.075 +447 G 0.056 +448 I 0.053 +449 C 0.064 +450 L 0.088 +451 K 0.124 +452 G 0.164 +453 K 0.202 +454 E 0.236 +455 S 0.266 +456 N 0.283 +457 K 0.288 +458 K 0.289 +459 G 0.292 +460 K 0.293 +461 A 0.279 +462 E 0.245 +463 S 0.199 +464 L 0.152 +465 I 0.115 +466 H 0.093 +467 C 0.083 +468 S 0.082 +469 Q 0.087 +470 C 0.098 +471 E 0.113 +472 N 0.124 +473 S 0.126 +474 G 0.119 +475 H 0.111 +476 P 0.109 +477 S 0.116 +478 C 0.128 +479 L 0.139 +480 D 0.147 +481 M 0.146 +482 T 0.133 +483 M 0.112 +484 E 0.095 +485 L 0.084 +486 V 0.078 +487 S 0.078 +488 M 0.083 +489 I 0.090 +490 K 0.095 +491 T 0.097 +492 Y 0.095 +493 P 0.087 +494 W 0.075 +495 Q 0.065 +496 C 0.063 +497 M 0.071 +498 E 0.082 +499 C 0.085 +500 K 0.077 +501 T 0.066 +502 C 0.058 +503 I 0.058 +504 I 0.066 +505 C 0.083 +506 G 0.102 +507 Q 0.119 +508 P 0.128 +509 H 0.131 +510 H 0.132 +511 E 0.135 +512 E 0.137 +513 E 0.135 +514 M 0.133 +515 M 0.134 +516 F 0.132 +517 C 0.122 +518 D 0.111 +519 M 0.105 +520 C 0.109 +521 D 0.119 +522 R 0.128 +523 G 0.128 +524 Y 0.117 +525 H 0.101 +526 T 0.091 +527 F 0.096 +528 C 0.109 +529 V 0.118 +530 G 0.122 +531 L 0.126 +532 G 0.134 +533 A 0.143 +534 I 0.149 +535 P 0.154 +536 S 0.157 +537 G 0.151 +538 R 0.132 +539 W 0.104 +540 I 0.079 +541 C 0.063 +542 D 0.061 +543 C 0.074 +544 C 0.105 +545 Q 0.156 +546 R 0.224 +547 A 0.302 +548 P 0.382 +549 P 0.458 +550 T 0.523 +551 P 0.572 +552 R 0.609 +553 K 0.644 +554 V 0.674 +555 G 0.693 +556 R 0.703 +557 R 0.712 +558 G 0.725 +559 K 0.736 +560 N 0.742 +561 S 0.740 +562 K 0.730 +563 E 0.710 +564 G 0.692 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000131042.16_ENST00000314446.10_GN:LILRB2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000131042.16_ENST00000314446.10_GN:LILRB2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9d3c1faf24d009407a11f4d330ef9d6ee0a6872e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000131042.16_ENST00000314446.10_GN:LILRB2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,598 @@ +>ENSG00000131042.16|ENST00000314446.10|GN:LILRB2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.310 +2 T 0.309 +3 P 0.298 +4 I 0.273 +5 V 0.238 +6 T 0.210 +7 V 0.199 +8 L 0.201 +9 I 0.210 +10 C 0.232 +11 L 0.267 +12 G 0.297 +13 L 0.310 +14 S 0.324 +15 L 0.363 +16 G 0.417 +17 P 0.467 +18 R 0.508 +19 T 0.544 +20 R 0.571 +21 V 0.580 +22 Q 0.566 +23 T 0.528 +24 G 0.466 +25 T 0.381 +26 I 0.288 +27 P 0.202 +28 K 0.137 +29 P 0.096 +30 T 0.073 +31 L 0.062 +32 W 0.056 +33 A 0.052 +34 E 0.048 +35 P 0.047 +36 D 0.050 +37 S 0.053 +38 V 0.052 +39 I 0.051 +40 T 0.054 +41 Q 0.065 +42 G 0.077 +43 S 0.080 +44 P 0.070 +45 V 0.055 +46 T 0.044 +47 L 0.040 +48 S 0.042 +49 C 0.049 +50 Q 0.060 +51 G 0.072 +52 S 0.079 +53 L 0.082 +54 E 0.081 +55 A 0.074 +56 Q 0.061 +57 E 0.047 +58 Y 0.037 +59 R 0.034 +60 L 0.038 +61 Y 0.050 +62 R 0.075 +63 E 0.113 +64 K 0.154 +65 K 0.182 +66 S 0.185 +67 A 0.169 +68 S 0.145 +69 W 0.125 +70 I 0.111 +71 T 0.106 +72 R 0.109 +73 I 0.111 +74 R 0.108 +75 P 0.098 +76 E 0.085 +77 L 0.075 +78 V 0.067 +79 K 0.064 +80 N 0.061 +81 G 0.054 +82 Q 0.044 +83 F 0.037 +84 H 0.037 +85 I 0.039 +86 P 0.043 +87 S 0.046 +88 I 0.048 +89 T 0.048 +90 W 0.047 +91 E 0.049 +92 H 0.054 +93 T 0.060 +94 G 0.060 +95 R 0.050 +96 Y 0.038 +97 G 0.032 +98 C 0.031 +99 Q 0.035 +100 Y 0.039 +101 Y 0.044 +102 S 0.047 +103 R 0.051 +104 A 0.055 +105 R 0.060 +106 W 0.066 +107 S 0.075 +108 E 0.081 +109 L 0.083 +110 S 0.083 +111 D 0.082 +112 P 0.075 +113 L 0.067 +114 V 0.066 +115 L 0.075 +116 V 0.090 +117 M 0.107 +118 T 0.124 +119 G 0.139 +120 A 0.147 +121 Y 0.143 +122 P 0.127 +123 K 0.105 +124 P 0.087 +125 T 0.075 +126 L 0.068 +127 S 0.062 +128 A 0.056 +129 Q 0.053 +130 P 0.054 +131 S 0.060 +132 P 0.067 +133 V 0.073 +134 V 0.080 +135 T 0.088 +136 S 0.095 +137 G 0.097 +138 G 0.089 +139 R 0.074 +140 V 0.059 +141 T 0.048 +142 L 0.043 +143 Q 0.042 +144 C 0.045 +145 E 0.050 +146 S 0.056 +147 Q 0.061 +148 V 0.065 +149 A 0.070 +150 F 0.073 +151 G 0.070 +152 G 0.059 +153 F 0.047 +154 I 0.041 +155 L 0.048 +156 C 0.064 +157 K 0.086 +158 E 0.111 +159 G 0.138 +160 E 0.161 +161 D 0.173 +162 E 0.171 +163 H 0.154 +164 P 0.133 +165 Q 0.114 +166 C 0.103 +167 L 0.101 +168 N 0.108 +169 S 0.126 +170 Q 0.151 +171 P 0.168 +172 H 0.167 +173 A 0.153 +174 R 0.132 +175 G 0.111 +176 S 0.091 +177 S 0.074 +178 R 0.059 +179 A 0.047 +180 I 0.038 +181 F 0.033 +182 S 0.033 +183 V 0.038 +184 G 0.053 +185 P 0.080 +186 V 0.112 +187 S 0.136 +188 P 0.146 +189 N 0.149 +190 R 0.146 +191 R 0.132 +192 W 0.108 +193 S 0.082 +194 H 0.060 +195 R 0.048 +196 C 0.047 +197 Y 0.056 +198 G 0.067 +199 Y 0.076 +200 D 0.081 +201 L 0.082 +202 N 0.082 +203 S 0.081 +204 P 0.082 +205 Y 0.085 +206 V 0.089 +207 W 0.094 +208 S 0.104 +209 S 0.112 +210 P 0.113 +211 S 0.111 +212 D 0.111 +213 L 0.108 +214 L 0.100 +215 E 0.091 +216 L 0.091 +217 L 0.106 +218 V 0.129 +219 P 0.145 +220 G 0.149 +221 V 0.145 +222 S 0.136 +223 K 0.121 +224 K 0.102 +225 P 0.083 +226 S 0.070 +227 L 0.062 +228 S 0.057 +229 V 0.052 +230 Q 0.048 +231 P 0.048 +232 G 0.051 +233 P 0.055 +234 V 0.059 +235 M 0.066 +236 A 0.078 +237 P 0.089 +238 G 0.091 +239 E 0.082 +240 S 0.066 +241 L 0.052 +242 T 0.043 +243 L 0.040 +244 Q 0.039 +245 C 0.040 +246 V 0.042 +247 S 0.047 +248 D 0.056 +249 V 0.066 +250 G 0.071 +251 Y 0.067 +252 D 0.052 +253 R 0.037 +254 F 0.028 +255 V 0.028 +256 L 0.033 +257 Y 0.043 +258 K 0.055 +259 E 0.068 +260 G 0.077 +261 E 0.082 +262 R 0.084 +263 D 0.086 +264 L 0.086 +265 R 0.087 +266 Q 0.092 +267 L 0.105 +268 P 0.123 +269 G 0.141 +270 R 0.161 +271 Q 0.176 +272 P 0.177 +273 Q 0.164 +274 A 0.141 +275 G 0.116 +276 L 0.094 +277 S 0.075 +278 Q 0.059 +279 A 0.048 +280 N 0.042 +281 F 0.042 +282 T 0.042 +283 L 0.041 +284 G 0.039 +285 P 0.038 +286 V 0.041 +287 S 0.045 +288 R 0.053 +289 S 0.064 +290 Y 0.076 +291 G 0.089 +292 G 0.091 +293 Q 0.076 +294 Y 0.056 +295 R 0.045 +296 C 0.045 +297 Y 0.054 +298 G 0.066 +299 A 0.079 +300 H 0.090 +301 N 0.098 +302 L 0.102 +303 S 0.103 +304 S 0.104 +305 E 0.106 +306 C 0.110 +307 S 0.117 +308 A 0.122 +309 P 0.122 +310 S 0.121 +311 D 0.123 +312 P 0.118 +313 L 0.106 +314 D 0.093 +315 I 0.086 +316 L 0.092 +317 I 0.110 +318 T 0.132 +319 G 0.148 +320 Q 0.152 +321 I 0.150 +322 R 0.148 +323 G 0.142 +324 T 0.127 +325 P 0.107 +326 F 0.088 +327 I 0.076 +328 S 0.069 +329 V 0.065 +330 Q 0.066 +331 P 0.075 +332 G 0.093 +333 P 0.113 +334 T 0.130 +335 V 0.141 +336 A 0.146 +337 S 0.143 +338 G 0.132 +339 E 0.117 +340 N 0.101 +341 V 0.084 +342 T 0.065 +343 L 0.052 +344 L 0.047 +345 C 0.049 +346 Q 0.054 +347 S 0.057 +348 W 0.058 +349 R 0.062 +350 Q 0.066 +351 F 0.066 +352 H 0.058 +353 T 0.049 +354 F 0.044 +355 L 0.045 +356 L 0.052 +357 T 0.070 +358 K 0.100 +359 A 0.135 +360 G 0.165 +361 A 0.188 +362 A 0.203 +363 D 0.205 +364 A 0.190 +365 P 0.159 +366 L 0.128 +367 R 0.109 +368 L 0.100 +369 R 0.101 +370 S 0.108 +371 I 0.117 +372 H 0.117 +373 E 0.102 +374 Y 0.081 +375 P 0.065 +376 K 0.061 +377 Y 0.060 +378 Q 0.056 +379 A 0.052 +380 E 0.052 +381 F 0.055 +382 P 0.056 +383 M 0.051 +384 S 0.046 +385 P 0.046 +386 V 0.053 +387 T 0.064 +388 S 0.075 +389 A 0.088 +390 H 0.106 +391 A 0.123 +392 G 0.125 +393 T 0.105 +394 Y 0.078 +395 R 0.063 +396 C 0.064 +397 Y 0.073 +398 G 0.083 +399 S 0.093 +400 L 0.102 +401 N 0.110 +402 S 0.113 +403 D 0.111 +404 P 0.107 +405 Y 0.107 +406 L 0.109 +407 L 0.110 +408 S 0.113 +409 H 0.117 +410 P 0.120 +411 S 0.123 +412 E 0.129 +413 P 0.133 +414 L 0.130 +415 E 0.125 +416 L 0.128 +417 V 0.155 +418 V 0.222 +419 S 0.333 +420 G 0.467 +421 P 0.590 +422 S 0.671 +423 M 0.707 +424 G 0.705 +425 S 0.677 +426 S 0.643 +427 P 0.627 +428 P 0.639 +429 P 0.666 +430 T 0.688 +431 G 0.686 +432 P 0.648 +433 I 0.585 +434 S 0.543 +435 T 0.553 +436 P 0.577 +437 G 0.573 +438 P 0.558 +439 E 0.555 +440 D 0.552 +441 Q 0.557 +442 P 0.595 +443 L 0.652 +444 T 0.698 +445 P 0.721 +446 T 0.712 +447 G 0.677 +448 S 0.652 +449 D 0.667 +450 P 0.704 +451 Q 0.733 +452 S 0.745 +453 G 0.744 +454 L 0.729 +455 G 0.701 +456 R 0.666 +457 H 0.636 +458 L 0.620 +459 G 0.609 +460 V 0.585 +461 V 0.549 +462 I 0.515 +463 G 0.491 +464 I 0.468 +465 L 0.438 +466 V 0.405 +467 A 0.379 +468 V 0.364 +469 V 0.353 +470 L 0.339 +471 L 0.322 +472 L 0.302 +473 L 0.280 +474 L 0.253 +475 L 0.228 +476 L 0.210 +477 L 0.195 +478 L 0.181 +479 F 0.170 +480 L 0.165 +481 I 0.166 +482 L 0.179 +483 R 0.205 +484 H 0.240 +485 R 0.282 +486 R 0.334 +487 Q 0.400 +488 G 0.464 +489 K 0.513 +490 H 0.547 +491 W 0.579 +492 T 0.609 +493 S 0.628 +494 T 0.637 +495 Q 0.642 +496 R 0.646 +497 K 0.648 +498 A 0.637 +499 D 0.599 +500 F 0.544 +501 Q 0.524 +502 H 0.572 +503 P 0.656 +504 A 0.726 +505 G 0.764 +506 A 0.777 +507 V 0.777 +508 G 0.773 +509 P 0.773 +510 E 0.780 +511 P 0.789 +512 T 0.799 +513 D 0.807 +514 R 0.811 +515 G 0.810 +516 L 0.803 +517 Q 0.796 +518 W 0.792 +519 R 0.792 +520 S 0.795 +521 S 0.803 +522 P 0.816 +523 A 0.832 +524 A 0.845 +525 D 0.848 +526 A 0.841 +527 Q 0.829 +528 E 0.820 +529 E 0.814 +530 N 0.807 +531 L 0.802 +532 Y 0.802 +533 A 0.805 +534 A 0.809 +535 V 0.811 +536 K 0.810 +537 D 0.804 +538 T 0.796 +539 Q 0.794 +540 P 0.804 +541 E 0.824 +542 D 0.843 +543 G 0.852 +544 V 0.853 +545 E 0.849 +546 M 0.843 +547 D 0.837 +548 T 0.834 +549 R 0.835 +550 A 0.837 +551 A 0.836 +552 A 0.826 +553 S 0.812 +554 E 0.798 +555 A 0.791 +556 P 0.793 +557 Q 0.800 +558 D 0.806 +559 V 0.807 +560 T 0.806 +561 Y 0.805 +562 A 0.801 +563 Q 0.788 +564 L 0.773 +565 H 0.761 +566 S 0.753 +567 L 0.733 +568 T 0.689 +569 L 0.634 +570 R 0.610 +571 R 0.641 +572 K 0.689 +573 A 0.707 +574 T 0.693 +575 E 0.677 +576 P 0.680 +577 P 0.708 +578 P 0.749 +579 S 0.780 +580 Q 0.786 +581 E 0.769 +582 R 0.741 +583 E 0.721 +584 P 0.717 +585 P 0.726 +586 A 0.740 +587 E 0.756 +588 P 0.771 +589 S 0.782 +590 I 0.789 +591 Y 0.796 +592 A 0.803 +593 T 0.801 +594 L 0.783 +595 A 0.753 +596 I 0.718 +597 H 0.693 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000131042.16_ENST00000314446.10_GN:LILRB2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000131042.16_ENST00000314446.10_GN:LILRB2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f337fc878900075488caf401388e5749fcccd7d7 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000131042.16_ENST00000314446.10_GN:LILRB2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid @@ -0,0 +1,615 @@ +>ENSG00000131042.16|ENST00000314446.10|GN:LILRB2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:17 +1 M 0.331 +2 H 0.339 +3 R 0.368 +4 G 0.402 +5 L 0.403 +6 I 0.382 +7 H 0.386 +8 P 0.410 +9 Q 0.407 +10 S 0.389 +11 R 0.424 +12 A 0.517 +13 V 0.602 +14 G 0.649 +15 G 0.673 +16 D 0.675 +17 A 0.642 +18 M 0.591 +19 T 0.548 +20 P 0.504 +21 I 0.437 +22 V 0.358 +23 T 0.309 +24 V 0.294 +25 L 0.291 +26 I 0.288 +27 C 0.299 +28 L 0.324 +29 G 0.346 +30 L 0.357 +31 S 0.370 +32 L 0.398 +33 G 0.440 +34 P 0.486 +35 R 0.529 +36 T 0.566 +37 R 0.589 +38 V 0.593 +39 Q 0.575 +40 T 0.535 +41 G 0.470 +42 T 0.383 +43 I 0.288 +44 P 0.202 +45 K 0.137 +46 P 0.097 +47 T 0.076 +48 L 0.065 +49 W 0.058 +50 A 0.053 +51 E 0.048 +52 P 0.047 +53 D 0.050 +54 S 0.053 +55 V 0.053 +56 I 0.051 +57 T 0.054 +58 Q 0.065 +59 G 0.077 +60 S 0.080 +61 P 0.069 +62 V 0.054 +63 T 0.043 +64 L 0.039 +65 S 0.041 +66 C 0.047 +67 Q 0.058 +68 G 0.069 +69 S 0.076 +70 L 0.079 +71 E 0.077 +72 A 0.070 +73 Q 0.058 +74 E 0.044 +75 Y 0.035 +76 R 0.032 +77 L 0.036 +78 Y 0.049 +79 R 0.073 +80 E 0.110 +81 K 0.150 +82 K 0.175 +83 S 0.177 +84 A 0.160 +85 S 0.138 +86 W 0.119 +87 I 0.107 +88 T 0.102 +89 R 0.106 +90 I 0.110 +91 R 0.107 +92 P 0.097 +93 E 0.083 +94 L 0.072 +95 V 0.065 +96 K 0.062 +97 N 0.059 +98 G 0.053 +99 Q 0.044 +100 F 0.037 +101 H 0.036 +102 I 0.039 +103 P 0.042 +104 S 0.045 +105 I 0.047 +106 T 0.047 +107 W 0.046 +108 E 0.048 +109 H 0.053 +110 T 0.059 +111 G 0.058 +112 R 0.049 +113 Y 0.038 +114 G 0.032 +115 C 0.031 +116 Q 0.034 +117 Y 0.039 +118 Y 0.043 +119 S 0.046 +120 R 0.050 +121 A 0.054 +122 R 0.059 +123 W 0.066 +124 S 0.074 +125 E 0.081 +126 L 0.083 +127 S 0.084 +128 D 0.083 +129 P 0.076 +130 L 0.068 +131 V 0.068 +132 L 0.077 +133 V 0.092 +134 M 0.109 +135 T 0.126 +136 G 0.141 +137 A 0.149 +138 Y 0.145 +139 P 0.129 +140 K 0.106 +141 P 0.086 +142 T 0.075 +143 L 0.068 +144 S 0.062 +145 A 0.056 +146 Q 0.053 +147 P 0.055 +148 S 0.061 +149 P 0.067 +150 V 0.073 +151 V 0.080 +152 T 0.087 +153 S 0.093 +154 G 0.094 +155 G 0.087 +156 R 0.073 +157 V 0.058 +158 T 0.048 +159 L 0.043 +160 Q 0.042 +161 C 0.045 +162 E 0.050 +163 S 0.056 +164 Q 0.061 +165 V 0.065 +166 A 0.070 +167 F 0.073 +168 G 0.070 +169 G 0.059 +170 F 0.046 +171 I 0.040 +172 L 0.046 +173 C 0.062 +174 K 0.083 +175 E 0.109 +176 G 0.136 +177 E 0.159 +178 D 0.170 +179 E 0.167 +180 H 0.150 +181 P 0.129 +182 Q 0.111 +183 C 0.101 +184 L 0.099 +185 N 0.106 +186 S 0.125 +187 Q 0.149 +188 P 0.165 +189 H 0.164 +190 A 0.149 +191 R 0.129 +192 G 0.108 +193 S 0.089 +194 S 0.072 +195 R 0.058 +196 A 0.046 +197 I 0.038 +198 F 0.033 +199 S 0.032 +200 V 0.037 +201 G 0.052 +202 P 0.078 +203 V 0.110 +204 S 0.133 +205 P 0.142 +206 N 0.145 +207 R 0.141 +208 R 0.127 +209 W 0.104 +210 S 0.078 +211 H 0.057 +212 R 0.046 +213 C 0.046 +214 Y 0.054 +215 G 0.065 +216 Y 0.074 +217 D 0.078 +218 L 0.080 +219 N 0.079 +220 S 0.078 +221 P 0.079 +222 Y 0.082 +223 V 0.086 +224 W 0.091 +225 S 0.101 +226 S 0.109 +227 P 0.110 +228 S 0.108 +229 D 0.109 +230 L 0.106 +231 L 0.097 +232 E 0.089 +233 L 0.089 +234 L 0.105 +235 V 0.129 +236 P 0.146 +237 G 0.152 +238 V 0.148 +239 S 0.139 +240 K 0.123 +241 K 0.103 +242 P 0.084 +243 S 0.071 +244 L 0.063 +245 S 0.057 +246 V 0.053 +247 Q 0.049 +248 P 0.049 +249 G 0.053 +250 P 0.057 +251 V 0.061 +252 M 0.067 +253 A 0.079 +254 P 0.091 +255 G 0.093 +256 E 0.083 +257 S 0.068 +258 L 0.054 +259 T 0.044 +260 L 0.041 +261 Q 0.040 +262 C 0.041 +263 V 0.043 +264 S 0.048 +265 D 0.057 +266 V 0.066 +267 G 0.072 +268 Y 0.067 +269 D 0.053 +270 R 0.037 +271 F 0.029 +272 V 0.028 +273 L 0.034 +274 Y 0.044 +275 K 0.057 +276 E 0.069 +277 G 0.079 +278 E 0.084 +279 R 0.087 +280 D 0.089 +281 L 0.089 +282 R 0.089 +283 Q 0.094 +284 L 0.107 +285 P 0.124 +286 G 0.144 +287 R 0.164 +288 Q 0.179 +289 P 0.180 +290 Q 0.166 +291 A 0.143 +292 G 0.117 +293 L 0.095 +294 S 0.075 +295 Q 0.059 +296 A 0.048 +297 N 0.043 +298 F 0.042 +299 T 0.043 +300 L 0.042 +301 G 0.040 +302 P 0.040 +303 V 0.042 +304 S 0.047 +305 R 0.055 +306 S 0.066 +307 Y 0.079 +308 G 0.092 +309 G 0.094 +310 Q 0.079 +311 Y 0.058 +312 R 0.046 +313 C 0.046 +314 Y 0.055 +315 G 0.068 +316 A 0.082 +317 H 0.093 +318 N 0.101 +319 L 0.105 +320 S 0.106 +321 S 0.107 +322 E 0.109 +323 C 0.114 +324 S 0.120 +325 A 0.125 +326 P 0.124 +327 S 0.124 +328 D 0.126 +329 P 0.122 +330 L 0.110 +331 D 0.097 +332 I 0.090 +333 L 0.096 +334 I 0.113 +335 T 0.135 +336 G 0.150 +337 Q 0.154 +338 I 0.152 +339 R 0.150 +340 G 0.144 +341 T 0.129 +342 P 0.108 +343 F 0.089 +344 I 0.077 +345 S 0.070 +346 V 0.066 +347 Q 0.067 +348 P 0.076 +349 G 0.094 +350 P 0.114 +351 T 0.130 +352 V 0.142 +353 A 0.148 +354 S 0.144 +355 G 0.133 +356 E 0.119 +357 N 0.103 +358 V 0.085 +359 T 0.066 +360 L 0.053 +361 L 0.048 +362 C 0.050 +363 Q 0.055 +364 S 0.058 +365 W 0.059 +366 R 0.063 +367 Q 0.067 +368 F 0.067 +369 H 0.059 +370 T 0.049 +371 F 0.045 +372 L 0.046 +373 L 0.053 +374 T 0.070 +375 K 0.099 +376 A 0.133 +377 G 0.163 +378 A 0.185 +379 A 0.199 +380 D 0.202 +381 A 0.187 +382 P 0.157 +383 L 0.126 +384 R 0.107 +385 L 0.099 +386 R 0.099 +387 S 0.107 +388 I 0.116 +389 H 0.116 +390 E 0.102 +391 Y 0.080 +392 P 0.065 +393 K 0.060 +394 Y 0.059 +395 Q 0.056 +396 A 0.052 +397 E 0.052 +398 F 0.055 +399 P 0.055 +400 M 0.051 +401 S 0.045 +402 P 0.046 +403 V 0.053 +404 T 0.063 +405 S 0.074 +406 A 0.088 +407 H 0.105 +408 A 0.123 +409 G 0.126 +410 T 0.106 +411 Y 0.079 +412 R 0.064 +413 C 0.065 +414 Y 0.074 +415 G 0.084 +416 S 0.093 +417 L 0.102 +418 N 0.110 +419 S 0.113 +420 D 0.111 +421 P 0.108 +422 Y 0.108 +423 L 0.109 +424 L 0.110 +425 S 0.113 +426 H 0.118 +427 P 0.120 +428 S 0.124 +429 E 0.130 +430 P 0.133 +431 L 0.130 +432 E 0.125 +433 L 0.128 +434 V 0.156 +435 V 0.224 +436 S 0.334 +437 G 0.469 +438 P 0.591 +439 S 0.672 +440 M 0.708 +441 G 0.705 +442 S 0.678 +443 S 0.644 +444 P 0.629 +445 P 0.641 +446 P 0.669 +447 T 0.692 +448 G 0.689 +449 P 0.651 +450 I 0.588 +451 S 0.547 +452 T 0.557 +453 P 0.581 +454 G 0.578 +455 P 0.563 +456 E 0.558 +457 D 0.553 +458 Q 0.557 +459 P 0.595 +460 L 0.653 +461 T 0.702 +462 P 0.734 +463 T 0.748 +464 G 0.747 +465 S 0.740 +466 D 0.737 +467 P 0.741 +468 Q 0.746 +469 S 0.750 +470 G 0.747 +471 L 0.733 +472 G 0.706 +473 R 0.673 +474 H 0.644 +475 L 0.628 +476 G 0.616 +477 V 0.592 +478 V 0.556 +479 I 0.522 +480 G 0.498 +481 I 0.476 +482 L 0.448 +483 V 0.416 +484 A 0.392 +485 V 0.379 +486 V 0.367 +487 L 0.352 +488 L 0.332 +489 L 0.311 +490 L 0.287 +491 L 0.260 +492 L 0.234 +493 L 0.215 +494 L 0.200 +495 L 0.185 +496 F 0.173 +497 L 0.168 +498 I 0.170 +499 L 0.183 +500 R 0.209 +501 H 0.243 +502 R 0.285 +503 R 0.339 +504 Q 0.405 +505 G 0.471 +506 K 0.521 +507 H 0.556 +508 W 0.587 +509 T 0.615 +510 S 0.633 +511 T 0.643 +512 Q 0.650 +513 R 0.657 +514 K 0.660 +515 A 0.648 +516 D 0.606 +517 F 0.549 +518 Q 0.528 +519 H 0.574 +520 P 0.658 +521 A 0.729 +522 G 0.767 +523 A 0.780 +524 V 0.780 +525 G 0.776 +526 P 0.776 +527 E 0.782 +528 P 0.791 +529 T 0.800 +530 D 0.808 +531 R 0.813 +532 G 0.812 +533 L 0.805 +534 Q 0.798 +535 W 0.794 +536 R 0.795 +537 S 0.798 +538 S 0.805 +539 P 0.818 +540 A 0.834 +541 A 0.846 +542 D 0.848 +543 A 0.841 +544 Q 0.830 +545 E 0.821 +546 E 0.815 +547 N 0.809 +548 L 0.804 +549 Y 0.803 +550 A 0.806 +551 A 0.810 +552 V 0.811 +553 K 0.809 +554 D 0.804 +555 T 0.797 +556 Q 0.794 +557 P 0.805 +558 E 0.825 +559 D 0.843 +560 G 0.852 +561 V 0.853 +562 E 0.849 +563 M 0.843 +564 D 0.837 +565 T 0.834 +566 R 0.834 +567 A 0.837 +568 A 0.835 +569 A 0.826 +570 S 0.811 +571 E 0.797 +572 A 0.790 +573 P 0.792 +574 Q 0.799 +575 D 0.805 +576 V 0.806 +577 T 0.805 +578 Y 0.803 +579 A 0.799 +580 Q 0.786 +581 L 0.771 +582 H 0.759 +583 S 0.751 +584 L 0.732 +585 T 0.690 +586 L 0.639 +587 R 0.617 +588 R 0.647 +589 K 0.693 +590 A 0.710 +591 T 0.696 +592 E 0.680 +593 P 0.682 +594 P 0.709 +595 P 0.749 +596 S 0.780 +597 Q 0.786 +598 E 0.769 +599 R 0.742 +600 E 0.722 +601 P 0.718 +602 P 0.727 +603 A 0.741 +604 E 0.757 +605 P 0.771 +606 S 0.782 +607 I 0.789 +608 Y 0.796 +609 A 0.803 +610 T 0.801 +611 L 0.783 +612 A 0.753 +613 I 0.717 +614 H 0.691 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000131482.11_ENST00000253801.7_GN:G6PC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000131482.11_ENST00000253801.7_GN:G6PC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..caf9065ce81a4cf87228eb900fee397c2041f487 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000131482.11_ENST00000253801.7_GN:G6PC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,358 @@ +>ENSG00000131482.11|ENST00000253801.7|GN:G6PC1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.205 +2 E 0.199 +3 E 0.184 +4 G 0.159 +5 M 0.129 +6 N 0.102 +7 V 0.086 +8 L 0.082 +9 H 0.083 +10 D 0.080 +11 F 0.073 +12 G 0.068 +13 I 0.068 +14 Q 0.069 +15 S 0.072 +16 T 0.078 +17 H 0.084 +18 Y 0.087 +19 L 0.086 +20 Q 0.084 +21 V 0.081 +22 N 0.075 +23 Y 0.070 +24 Q 0.067 +25 D 0.062 +26 S 0.054 +27 Q 0.045 +28 D 0.040 +29 W 0.042 +30 F 0.052 +31 I 0.064 +32 L 0.076 +33 V 0.087 +34 S 0.095 +35 V 0.096 +36 I 0.093 +37 A 0.092 +38 D 0.093 +39 L 0.088 +40 R 0.076 +41 N 0.060 +42 A 0.048 +43 F 0.042 +44 Y 0.042 +45 V 0.044 +46 L 0.043 +47 F 0.037 +48 P 0.028 +49 I 0.022 +50 W 0.022 +51 F 0.025 +52 H 0.032 +53 L 0.037 +54 Q 0.035 +55 E 0.031 +56 A 0.030 +57 V 0.032 +58 G 0.033 +59 I 0.032 +60 K 0.031 +61 L 0.031 +62 L 0.031 +63 W 0.031 +64 V 0.033 +65 A 0.036 +66 V 0.040 +67 I 0.045 +68 G 0.049 +69 D 0.048 +70 W 0.043 +71 L 0.037 +72 N 0.034 +73 L 0.032 +74 V 0.032 +75 F 0.035 +76 K 0.042 +77 W 0.051 +78 I 0.059 +79 L 0.067 +80 F 0.075 +81 G 0.081 +82 Q 0.084 +83 R 0.080 +84 P 0.071 +85 Y 0.062 +86 W 0.057 +87 W 0.057 +88 V 0.058 +89 L 0.062 +90 D 0.072 +91 T 0.086 +92 D 0.097 +93 Y 0.108 +94 Y 0.122 +95 S 0.139 +96 N 0.154 +97 T 0.162 +98 S 0.169 +99 V 0.177 +100 P 0.183 +101 L 0.187 +102 I 0.195 +103 K 0.206 +104 Q 0.216 +105 F 0.221 +106 P 0.219 +107 V 0.212 +108 T 0.201 +109 C 0.191 +110 E 0.183 +111 T 0.176 +112 G 0.170 +113 P 0.159 +114 G 0.148 +115 S 0.152 +116 P 0.172 +117 S 0.188 +118 G 0.179 +119 H 0.157 +120 A 0.140 +121 M 0.132 +122 G 0.125 +123 T 0.118 +124 A 0.107 +125 G 0.089 +126 V 0.066 +127 Y 0.046 +128 Y 0.035 +129 V 0.029 +130 M 0.025 +131 V 0.025 +132 T 0.027 +133 S 0.028 +134 T 0.028 +135 L 0.029 +136 S 0.035 +137 I 0.048 +138 F 0.073 +139 Q 0.107 +140 G 0.142 +141 K 0.169 +142 I 0.183 +143 K 0.182 +144 P 0.165 +145 T 0.143 +146 Y 0.123 +147 R 0.107 +148 F 0.090 +149 R 0.070 +150 C 0.059 +151 L 0.063 +152 N 0.074 +153 V 0.078 +154 I 0.071 +155 L 0.066 +156 W 0.072 +157 L 0.081 +158 G 0.081 +159 F 0.068 +160 W 0.055 +161 A 0.049 +162 V 0.050 +163 Q 0.050 +164 L 0.049 +165 N 0.049 +166 V 0.052 +167 C 0.053 +168 L 0.055 +169 S 0.060 +170 R 0.072 +171 I 0.088 +172 Y 0.103 +173 L 0.111 +174 A 0.110 +175 A 0.103 +176 H 0.095 +177 F 0.089 +178 P 0.085 +179 H 0.083 +180 Q 0.085 +181 V 0.084 +182 V 0.075 +183 A 0.065 +184 G 0.059 +185 V 0.059 +186 L 0.061 +187 S 0.060 +188 G 0.056 +189 I 0.050 +190 A 0.048 +191 V 0.050 +192 A 0.048 +193 E 0.041 +194 T 0.034 +195 F 0.033 +196 S 0.037 +197 H 0.046 +198 I 0.059 +199 H 0.072 +200 S 0.078 +201 I 0.074 +202 Y 0.067 +203 N 0.063 +204 A 0.059 +205 S 0.053 +206 L 0.043 +207 K 0.034 +208 K 0.029 +209 Y 0.033 +210 F 0.045 +211 L 0.054 +212 I 0.051 +213 T 0.041 +214 F 0.034 +215 F 0.033 +216 L 0.035 +217 F 0.035 +218 S 0.032 +219 F 0.030 +220 A 0.029 +221 I 0.031 +222 G 0.037 +223 F 0.047 +224 Y 0.060 +225 L 0.068 +226 L 0.067 +227 L 0.064 +228 K 0.064 +229 G 0.070 +230 L 0.082 +231 G 0.094 +232 V 0.098 +233 D 0.092 +234 L 0.082 +235 L 0.072 +236 W 0.062 +237 T 0.056 +238 L 0.054 +239 E 0.052 +240 K 0.049 +241 A 0.048 +242 Q 0.049 +243 R 0.051 +244 W 0.055 +245 C 0.061 +246 E 0.073 +247 Q 0.089 +248 P 0.107 +249 E 0.123 +250 W 0.136 +251 V 0.147 +252 H 0.156 +253 I 0.160 +254 D 0.154 +255 T 0.136 +256 T 0.118 +257 P 0.105 +258 F 0.098 +259 A 0.090 +260 S 0.081 +261 L 0.073 +262 L 0.068 +263 K 0.066 +264 N 0.062 +265 L 0.055 +266 G 0.045 +267 T 0.036 +268 L 0.031 +269 F 0.030 +270 G 0.032 +271 L 0.037 +272 G 0.044 +273 L 0.053 +274 A 0.060 +275 L 0.066 +276 N 0.079 +277 S 0.098 +278 S 0.117 +279 M 0.127 +280 Y 0.131 +281 R 0.143 +282 E 0.169 +283 S 0.202 +284 C 0.226 +285 K 0.235 +286 G 0.229 +287 K 0.202 +288 L 0.160 +289 S 0.119 +290 K 0.087 +291 W 0.065 +292 L 0.050 +293 P 0.043 +294 F 0.041 +295 R 0.041 +296 L 0.042 +297 S 0.046 +298 S 0.048 +299 I 0.048 +300 V 0.047 +301 A 0.049 +302 S 0.050 +303 L 0.048 +304 V 0.044 +305 L 0.043 +306 L 0.043 +307 H 0.045 +308 V 0.053 +309 F 0.070 +310 D 0.095 +311 S 0.128 +312 L 0.171 +313 K 0.211 +314 P 0.229 +315 P 0.216 +316 S 0.186 +317 Q 0.157 +318 V 0.129 +319 E 0.097 +320 L 0.070 +321 V 0.055 +322 F 0.050 +323 Y 0.049 +324 V 0.051 +325 L 0.055 +326 S 0.058 +327 F 0.057 +328 C 0.052 +329 K 0.048 +330 S 0.045 +331 A 0.043 +332 V 0.042 +333 V 0.041 +334 P 0.039 +335 L 0.036 +336 A 0.035 +337 S 0.037 +338 V 0.040 +339 S 0.045 +340 V 0.050 +341 I 0.050 +342 P 0.045 +343 Y 0.041 +344 C 0.044 +345 L 0.058 +346 A 0.081 +347 Q 0.112 +348 V 0.153 +349 L 0.213 +350 G 0.286 +351 Q 0.360 +352 P 0.419 +353 H 0.460 +354 K 0.479 +355 K 0.469 +356 S 0.430 +357 L 0.392 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000131482.11_ENST00000253801.7_GN:G6PC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000131482.11_ENST00000253801.7_GN:G6PC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9874ec0f9cdcf0034e4602bcf338637fbe933d4e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000131482.11_ENST00000253801.7_GN:G6PC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid @@ -0,0 +1,360 @@ +>ENSG00000131482.11|ENST00000253801.7|GN:G6PC1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:2 +1 M 0.218 +2 R 0.201 +3 M 0.186 +4 E 0.180 +5 E 0.172 +6 G 0.154 +7 M 0.127 +8 N 0.102 +9 V 0.086 +10 L 0.081 +11 H 0.081 +12 D 0.077 +13 F 0.071 +14 G 0.067 +15 I 0.068 +16 Q 0.069 +17 S 0.072 +18 T 0.078 +19 H 0.084 +20 Y 0.087 +21 L 0.086 +22 Q 0.084 +23 V 0.081 +24 N 0.075 +25 Y 0.070 +26 Q 0.067 +27 D 0.062 +28 S 0.054 +29 Q 0.045 +30 D 0.040 +31 W 0.042 +32 F 0.051 +33 I 0.064 +34 L 0.076 +35 V 0.088 +36 S 0.096 +37 V 0.096 +38 I 0.093 +39 A 0.092 +40 D 0.092 +41 L 0.089 +42 R 0.077 +43 N 0.061 +44 A 0.048 +45 F 0.043 +46 Y 0.042 +47 V 0.044 +48 L 0.043 +49 F 0.037 +50 P 0.028 +51 I 0.023 +52 W 0.022 +53 F 0.026 +54 H 0.032 +55 L 0.037 +56 Q 0.035 +57 E 0.031 +58 A 0.030 +59 V 0.031 +60 G 0.032 +61 I 0.032 +62 K 0.031 +63 L 0.031 +64 L 0.031 +65 W 0.031 +66 V 0.033 +67 A 0.036 +68 V 0.040 +69 I 0.045 +70 G 0.049 +71 D 0.048 +72 W 0.043 +73 L 0.037 +74 N 0.034 +75 L 0.032 +76 V 0.031 +77 F 0.035 +78 K 0.042 +79 W 0.051 +80 I 0.060 +81 L 0.068 +82 F 0.075 +83 G 0.080 +84 Q 0.083 +85 R 0.080 +86 P 0.071 +87 Y 0.062 +88 W 0.057 +89 W 0.056 +90 V 0.058 +91 L 0.062 +92 D 0.072 +93 T 0.086 +94 D 0.097 +95 Y 0.107 +96 Y 0.121 +97 S 0.138 +98 N 0.153 +99 T 0.162 +100 S 0.170 +101 V 0.177 +102 P 0.183 +103 L 0.188 +104 I 0.195 +105 K 0.206 +106 Q 0.216 +107 F 0.221 +108 P 0.219 +109 V 0.211 +110 T 0.201 +111 C 0.190 +112 E 0.182 +113 T 0.175 +114 G 0.169 +115 P 0.158 +116 G 0.147 +117 S 0.151 +118 P 0.171 +119 S 0.186 +120 G 0.178 +121 H 0.156 +122 A 0.139 +123 M 0.131 +124 G 0.125 +125 T 0.117 +126 A 0.106 +127 G 0.089 +128 V 0.066 +129 Y 0.046 +130 Y 0.035 +131 V 0.029 +132 M 0.025 +133 V 0.025 +134 T 0.026 +135 S 0.028 +136 T 0.028 +137 L 0.029 +138 S 0.035 +139 I 0.048 +140 F 0.074 +141 Q 0.108 +142 G 0.143 +143 K 0.170 +144 I 0.184 +145 K 0.183 +146 P 0.167 +147 T 0.144 +148 Y 0.124 +149 R 0.108 +150 F 0.090 +151 R 0.070 +152 C 0.059 +153 L 0.063 +154 N 0.075 +155 V 0.078 +156 I 0.071 +157 L 0.066 +158 W 0.072 +159 L 0.082 +160 G 0.081 +161 F 0.068 +162 W 0.055 +163 A 0.049 +164 V 0.050 +165 Q 0.050 +166 L 0.049 +167 N 0.049 +168 V 0.052 +169 C 0.053 +170 L 0.055 +171 S 0.060 +172 R 0.072 +173 I 0.087 +174 Y 0.102 +175 L 0.110 +176 A 0.110 +177 A 0.103 +178 H 0.095 +179 F 0.089 +180 P 0.084 +181 H 0.083 +182 Q 0.085 +183 V 0.083 +184 V 0.075 +185 A 0.065 +186 G 0.060 +187 V 0.060 +188 L 0.062 +189 S 0.062 +190 G 0.057 +191 I 0.050 +192 A 0.048 +193 V 0.050 +194 A 0.048 +195 E 0.041 +196 T 0.034 +197 F 0.033 +198 S 0.037 +199 H 0.046 +200 I 0.059 +201 H 0.072 +202 S 0.077 +203 I 0.074 +204 Y 0.067 +205 N 0.063 +206 A 0.059 +207 S 0.053 +208 L 0.043 +209 K 0.034 +210 K 0.029 +211 Y 0.033 +212 F 0.045 +213 L 0.054 +214 I 0.051 +215 T 0.041 +216 F 0.034 +217 F 0.033 +218 L 0.035 +219 F 0.035 +220 S 0.032 +221 F 0.030 +222 A 0.029 +223 I 0.031 +224 G 0.036 +225 F 0.047 +226 Y 0.060 +227 L 0.067 +228 L 0.067 +229 L 0.063 +230 K 0.064 +231 G 0.070 +232 L 0.082 +233 G 0.094 +234 V 0.097 +235 D 0.092 +236 L 0.082 +237 L 0.072 +238 W 0.062 +239 T 0.056 +240 L 0.054 +241 E 0.051 +242 K 0.048 +243 A 0.047 +244 Q 0.049 +245 R 0.051 +246 W 0.055 +247 C 0.061 +248 E 0.073 +249 Q 0.089 +250 P 0.106 +251 E 0.122 +252 W 0.136 +253 V 0.147 +254 H 0.156 +255 I 0.160 +256 D 0.154 +257 T 0.136 +258 T 0.117 +259 P 0.105 +260 F 0.098 +261 A 0.090 +262 S 0.081 +263 L 0.073 +264 L 0.068 +265 K 0.066 +266 N 0.062 +267 L 0.055 +268 G 0.045 +269 T 0.036 +270 L 0.031 +271 F 0.030 +272 G 0.032 +273 L 0.037 +274 G 0.044 +275 L 0.052 +276 A 0.059 +277 L 0.066 +278 N 0.079 +279 S 0.098 +280 S 0.117 +281 M 0.127 +282 Y 0.132 +283 R 0.144 +284 E 0.170 +285 S 0.203 +286 C 0.227 +287 K 0.237 +288 G 0.231 +289 K 0.204 +290 L 0.162 +291 S 0.120 +292 K 0.088 +293 W 0.066 +294 L 0.050 +295 P 0.043 +296 F 0.041 +297 R 0.041 +298 L 0.042 +299 S 0.046 +300 S 0.049 +301 I 0.048 +302 V 0.048 +303 A 0.049 +304 S 0.050 +305 L 0.048 +306 V 0.044 +307 L 0.043 +308 L 0.043 +309 H 0.045 +310 V 0.053 +311 F 0.070 +312 D 0.095 +313 S 0.129 +314 L 0.171 +315 K 0.211 +316 P 0.229 +317 P 0.216 +318 S 0.187 +319 Q 0.158 +320 V 0.129 +321 E 0.097 +322 L 0.070 +323 V 0.055 +324 F 0.050 +325 Y 0.049 +326 V 0.051 +327 L 0.055 +328 S 0.059 +329 F 0.057 +330 C 0.052 +331 K 0.048 +332 S 0.045 +333 A 0.043 +334 V 0.042 +335 V 0.041 +336 P 0.039 +337 L 0.036 +338 A 0.035 +339 S 0.037 +340 V 0.040 +341 S 0.045 +342 V 0.050 +343 I 0.050 +344 P 0.045 +345 Y 0.041 +346 C 0.044 +347 L 0.058 +348 A 0.081 +349 Q 0.112 +350 V 0.153 +351 L 0.213 +352 G 0.287 +353 Q 0.361 +354 P 0.421 +355 H 0.462 +356 K 0.481 +357 K 0.470 +358 S 0.431 +359 L 0.393 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000133063.17_ENST00000367229.6_GN:CHIT1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000133063.17_ENST00000367229.6_GN:CHIT1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a094dcbe240aa328039dca8d157ece041d27a668 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000133063.17_ENST00000367229.6_GN:CHIT1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,467 @@ +>ENSG00000133063.17|ENST00000367229.6|GN:CHIT1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.369 +2 V 0.362 +3 R 0.367 +4 S 0.385 +5 V 0.381 +6 A 0.352 +7 W 0.344 +8 A 0.364 +9 G 0.367 +10 F 0.351 +11 M 0.365 +12 V 0.412 +13 L 0.443 +14 L 0.440 +15 M 0.428 +16 I 0.428 +17 P 0.438 +18 W 0.443 +19 G 0.422 +20 S 0.362 +21 A 0.274 +22 A 0.185 +23 K 0.116 +24 L 0.073 +25 V 0.051 +26 C 0.043 +27 Y 0.041 +28 F 0.041 +29 T 0.039 +30 N 0.039 +31 W 0.044 +32 A 0.053 +33 Q 0.061 +34 Y 0.071 +35 R 0.086 +36 Q 0.104 +37 G 0.117 +38 E 0.124 +39 A 0.124 +40 R 0.115 +41 F 0.096 +42 L 0.077 +43 P 0.068 +44 K 0.069 +45 D 0.071 +46 L 0.070 +47 D 0.063 +48 P 0.056 +49 S 0.055 +50 L 0.061 +51 C 0.065 +52 T 0.062 +53 H 0.056 +54 L 0.053 +55 I 0.052 +56 Y 0.051 +57 A 0.052 +58 F 0.054 +59 A 0.058 +60 G 0.063 +61 M 0.065 +62 T 0.067 +63 N 0.071 +64 H 0.076 +65 Q 0.081 +66 L 0.086 +67 S 0.089 +68 T 0.090 +69 T 0.087 +70 E 0.080 +71 W 0.073 +72 N 0.064 +73 D 0.054 +74 E 0.045 +75 T 0.040 +76 L 0.038 +77 Y 0.038 +78 Q 0.041 +79 E 0.044 +80 F 0.046 +81 N 0.048 +82 G 0.054 +83 L 0.059 +84 K 0.062 +85 K 0.059 +86 M 0.058 +87 N 0.061 +88 P 0.067 +89 K 0.071 +90 L 0.071 +91 K 0.071 +92 T 0.070 +93 L 0.068 +94 L 0.069 +95 A 0.078 +96 I 0.094 +97 G 0.107 +98 G 0.108 +99 W 0.099 +100 N 0.088 +101 F 0.081 +102 G 0.075 +103 T 0.068 +104 Q 0.062 +105 K 0.056 +106 F 0.054 +107 T 0.057 +108 D 0.065 +109 M 0.074 +110 V 0.080 +111 A 0.081 +112 T 0.078 +113 A 0.072 +114 N 0.065 +115 N 0.056 +116 R 0.047 +117 Q 0.040 +118 T 0.038 +119 F 0.043 +120 V 0.052 +121 N 0.059 +122 S 0.062 +123 A 0.064 +124 I 0.067 +125 R 0.066 +126 F 0.056 +127 L 0.043 +128 R 0.034 +129 K 0.031 +130 Y 0.034 +131 S 0.040 +132 F 0.046 +133 D 0.047 +134 G 0.044 +135 L 0.042 +136 D 0.043 +137 L 0.046 +138 D 0.051 +139 W 0.057 +140 E 0.066 +141 Y 0.077 +142 P 0.087 +143 G 0.091 +144 S 0.092 +145 Q 0.097 +146 G 0.105 +147 S 0.112 +148 P 0.111 +149 A 0.104 +150 V 0.095 +151 D 0.090 +152 K 0.086 +153 E 0.080 +154 R 0.076 +155 F 0.075 +156 T 0.071 +157 T 0.065 +158 L 0.059 +159 V 0.056 +160 Q 0.055 +161 D 0.063 +162 L 0.077 +163 A 0.090 +164 N 0.092 +165 A 0.083 +166 F 0.074 +167 Q 0.075 +168 Q 0.079 +169 E 0.077 +170 A 0.072 +171 Q 0.070 +172 T 0.078 +173 S 0.093 +174 G 0.108 +175 K 0.116 +176 E 0.116 +177 R 0.106 +178 L 0.089 +179 L 0.073 +180 L 0.060 +181 S 0.053 +182 A 0.056 +183 A 0.066 +184 V 0.077 +185 P 0.083 +186 A 0.082 +187 G 0.080 +188 Q 0.075 +189 T 0.067 +190 Y 0.059 +191 V 0.053 +192 D 0.051 +193 A 0.052 +194 G 0.053 +195 Y 0.052 +196 E 0.049 +197 V 0.048 +198 D 0.049 +199 K 0.050 +200 I 0.051 +201 A 0.054 +202 Q 0.062 +203 N 0.070 +204 L 0.069 +205 D 0.057 +206 F 0.043 +207 V 0.037 +208 N 0.039 +209 L 0.048 +210 M 0.057 +211 A 0.063 +212 Y 0.063 +213 D 0.064 +214 F 0.064 +215 H 0.060 +216 G 0.055 +217 S 0.052 +218 W 0.053 +219 E 0.058 +220 K 0.067 +221 V 0.080 +222 T 0.093 +223 G 0.105 +224 H 0.115 +225 N 0.128 +226 S 0.144 +227 P 0.157 +228 L 0.160 +229 Y 0.155 +230 K 0.146 +231 R 0.136 +232 Q 0.130 +233 E 0.136 +234 E 0.151 +235 S 0.162 +236 G 0.163 +237 A 0.158 +238 A 0.152 +239 A 0.146 +240 S 0.137 +241 L 0.127 +242 N 0.118 +243 V 0.108 +244 D 0.098 +245 A 0.091 +246 A 0.082 +247 V 0.071 +248 Q 0.060 +249 Q 0.056 +250 W 0.063 +251 L 0.077 +252 Q 0.090 +253 K 0.095 +254 G 0.095 +255 T 0.093 +256 P 0.090 +257 A 0.089 +258 S 0.091 +259 K 0.091 +260 L 0.091 +261 I 0.090 +262 L 0.093 +263 G 0.099 +264 M 0.102 +265 P 0.095 +266 T 0.083 +267 Y 0.075 +268 G 0.074 +269 R 0.078 +270 S 0.082 +271 F 0.087 +272 T 0.095 +273 L 0.103 +274 A 0.109 +275 S 0.112 +276 S 0.115 +277 S 0.115 +278 D 0.110 +279 T 0.106 +280 R 0.108 +281 V 0.120 +282 G 0.137 +283 A 0.151 +284 P 0.157 +285 A 0.160 +286 T 0.170 +287 G 0.191 +288 S 0.213 +289 G 0.230 +290 T 0.242 +291 P 0.242 +292 G 0.221 +293 P 0.181 +294 F 0.144 +295 T 0.127 +296 K 0.135 +297 E 0.151 +298 G 0.158 +299 G 0.145 +300 M 0.117 +301 L 0.087 +302 A 0.064 +303 Y 0.051 +304 Y 0.049 +305 E 0.050 +306 V 0.049 +307 C 0.049 +308 S 0.055 +309 W 0.070 +310 K 0.086 +311 G 0.096 +312 A 0.094 +313 T 0.083 +314 K 0.072 +315 Q 0.068 +316 R 0.069 +317 I 0.072 +318 Q 0.076 +319 D 0.080 +320 Q 0.086 +321 K 0.089 +322 V 0.086 +323 P 0.076 +324 Y 0.066 +325 I 0.061 +326 F 0.061 +327 R 0.064 +328 D 0.069 +329 N 0.071 +330 Q 0.067 +331 W 0.059 +332 V 0.051 +333 G 0.050 +334 F 0.059 +335 D 0.075 +336 D 0.086 +337 V 0.088 +338 E 0.083 +339 S 0.074 +340 F 0.063 +341 K 0.053 +342 T 0.046 +343 K 0.042 +344 V 0.041 +345 S 0.042 +346 Y 0.048 +347 L 0.059 +348 K 0.077 +349 Q 0.097 +350 K 0.113 +351 G 0.120 +352 L 0.110 +353 G 0.089 +354 G 0.068 +355 A 0.059 +356 M 0.060 +357 V 0.065 +358 W 0.070 +359 A 0.074 +360 L 0.076 +361 D 0.076 +362 L 0.076 +363 D 0.078 +364 D 0.084 +365 F 0.094 +366 A 0.107 +367 G 0.112 +368 F 0.107 +369 S 0.095 +370 C 0.086 +371 N 0.087 +372 Q 0.094 +373 G 0.099 +374 R 0.097 +375 Y 0.086 +376 P 0.073 +377 L 0.062 +378 I 0.058 +379 Q 0.059 +380 T 0.061 +381 L 0.060 +382 R 0.059 +383 Q 0.064 +384 E 0.076 +385 L 0.093 +386 S 0.122 +387 L 0.165 +388 P 0.223 +389 Y 0.300 +390 L 0.398 +391 P 0.496 +392 S 0.568 +393 G 0.601 +394 T 0.611 +395 P 0.612 +396 E 0.610 +397 L 0.598 +398 E 0.576 +399 V 0.557 +400 P 0.553 +401 K 0.566 +402 P 0.588 +403 G 0.608 +404 Q 0.620 +405 P 0.625 +406 S 0.626 +407 E 0.628 +408 P 0.635 +409 E 0.635 +410 H 0.624 +411 G 0.608 +412 P 0.601 +413 S 0.601 +414 P 0.595 +415 G 0.561 +416 Q 0.482 +417 D 0.368 +418 T 0.252 +419 F 0.169 +420 C 0.129 +421 Q 0.119 +422 G 0.122 +423 K 0.132 +424 A 0.142 +425 D 0.146 +426 G 0.141 +427 L 0.135 +428 Y 0.135 +429 P 0.140 +430 N 0.137 +431 P 0.124 +432 R 0.111 +433 E 0.106 +434 R 0.101 +435 S 0.088 +436 S 0.067 +437 F 0.053 +438 Y 0.053 +439 S 0.065 +440 C 0.082 +441 A 0.103 +442 A 0.124 +443 G 0.140 +444 R 0.147 +445 L 0.145 +446 F 0.138 +447 Q 0.129 +448 Q 0.118 +449 S 0.113 +450 C 0.123 +451 P 0.142 +452 T 0.156 +453 G 0.159 +454 L 0.152 +455 V 0.139 +456 F 0.125 +457 S 0.112 +458 N 0.101 +459 S 0.091 +460 C 0.087 +461 K 0.092 +462 C 0.109 +463 C 0.135 +464 T 0.165 +465 W 0.196 +466 N 0.217 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000133063.17_ENST00000367229.6_GN:CHIT1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000133063.17_ENST00000367229.6_GN:CHIT1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1aa9c6e32efaa77e87a03fec53e4025eb202e385 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000133063.17_ENST00000367229.6_GN:CHIT1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid @@ -0,0 +1,477 @@ +>ENSG00000133063.17|ENST00000367229.6|GN:CHIT1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:10 +1 M 0.402 +2 G 0.412 +3 C 0.426 +4 S 0.433 +5 L 0.421 +6 P 0.398 +7 L 0.393 +8 S 0.407 +9 C 0.402 +10 I 0.378 +11 M 0.381 +12 V 0.414 +13 R 0.438 +14 S 0.452 +15 V 0.478 +16 A 0.495 +17 W 0.481 +18 A 0.459 +19 G 0.443 +20 F 0.411 +21 M 0.366 +22 V 0.355 +23 L 0.389 +24 L 0.422 +25 M 0.431 +26 I 0.432 +27 P 0.439 +28 W 0.442 +29 G 0.418 +30 S 0.357 +31 A 0.270 +32 A 0.183 +33 K 0.115 +34 L 0.072 +35 V 0.050 +36 C 0.042 +37 Y 0.040 +38 F 0.039 +39 T 0.038 +40 N 0.038 +41 W 0.043 +42 A 0.052 +43 Q 0.060 +44 Y 0.070 +45 R 0.084 +46 Q 0.101 +47 G 0.115 +48 E 0.121 +49 A 0.122 +50 R 0.113 +51 F 0.094 +52 L 0.076 +53 P 0.067 +54 K 0.068 +55 D 0.071 +56 L 0.070 +57 D 0.063 +58 P 0.056 +59 S 0.055 +60 L 0.060 +61 C 0.064 +62 T 0.061 +63 H 0.054 +64 L 0.051 +65 I 0.050 +66 Y 0.049 +67 A 0.049 +68 F 0.051 +69 A 0.055 +70 G 0.059 +71 M 0.062 +72 T 0.065 +73 N 0.069 +74 H 0.074 +75 Q 0.080 +76 L 0.084 +77 S 0.087 +78 T 0.088 +79 T 0.085 +80 E 0.079 +81 W 0.071 +82 N 0.062 +83 D 0.052 +84 E 0.043 +85 T 0.039 +86 L 0.037 +87 Y 0.037 +88 Q 0.040 +89 E 0.044 +90 F 0.045 +91 N 0.047 +92 G 0.052 +93 L 0.058 +94 K 0.060 +95 K 0.058 +96 M 0.056 +97 N 0.059 +98 P 0.065 +99 K 0.069 +100 L 0.071 +101 K 0.071 +102 T 0.070 +103 L 0.068 +104 L 0.069 +105 A 0.078 +106 I 0.094 +107 G 0.108 +108 G 0.109 +109 W 0.099 +110 N 0.087 +111 F 0.080 +112 G 0.075 +113 T 0.069 +114 Q 0.062 +115 K 0.056 +116 F 0.054 +117 T 0.058 +118 D 0.066 +119 M 0.075 +120 V 0.081 +121 A 0.081 +122 T 0.078 +123 A 0.073 +124 N 0.065 +125 N 0.057 +126 R 0.048 +127 Q 0.040 +128 T 0.037 +129 F 0.037 +130 V 0.040 +131 N 0.044 +132 S 0.050 +133 A 0.058 +134 I 0.063 +135 R 0.063 +136 F 0.054 +137 L 0.042 +138 R 0.034 +139 K 0.032 +140 Y 0.034 +141 S 0.041 +142 F 0.047 +143 D 0.048 +144 G 0.045 +145 L 0.042 +146 D 0.043 +147 L 0.046 +148 D 0.051 +149 W 0.057 +150 E 0.066 +151 Y 0.077 +152 P 0.086 +153 G 0.091 +154 S 0.092 +155 Q 0.097 +156 G 0.106 +157 S 0.112 +158 P 0.111 +159 A 0.104 +160 V 0.095 +161 D 0.090 +162 K 0.086 +163 E 0.080 +164 R 0.076 +165 F 0.075 +166 T 0.071 +167 T 0.065 +168 L 0.059 +169 V 0.056 +170 Q 0.056 +171 D 0.063 +172 L 0.077 +173 A 0.091 +174 N 0.092 +175 A 0.083 +176 F 0.075 +177 Q 0.076 +178 Q 0.079 +179 E 0.077 +180 A 0.071 +181 Q 0.070 +182 T 0.077 +183 S 0.092 +184 G 0.107 +185 K 0.116 +186 E 0.114 +187 R 0.104 +188 L 0.088 +189 L 0.071 +190 L 0.059 +191 S 0.052 +192 A 0.055 +193 A 0.065 +194 V 0.077 +195 P 0.083 +196 A 0.083 +197 G 0.081 +198 Q 0.076 +199 T 0.068 +200 Y 0.059 +201 V 0.052 +202 D 0.051 +203 A 0.052 +204 G 0.053 +205 Y 0.051 +206 E 0.049 +207 V 0.048 +208 D 0.049 +209 K 0.050 +210 I 0.050 +211 A 0.053 +212 Q 0.061 +213 N 0.068 +214 L 0.067 +215 D 0.056 +216 F 0.042 +217 V 0.036 +218 N 0.039 +219 L 0.047 +220 M 0.057 +221 A 0.062 +222 Y 0.063 +223 D 0.063 +224 F 0.063 +225 H 0.060 +226 G 0.054 +227 S 0.051 +228 W 0.053 +229 E 0.057 +230 K 0.067 +231 V 0.079 +232 T 0.092 +233 G 0.104 +234 H 0.115 +235 N 0.128 +236 S 0.144 +237 P 0.157 +238 L 0.160 +239 Y 0.155 +240 K 0.146 +241 R 0.136 +242 Q 0.130 +243 E 0.137 +244 E 0.152 +245 S 0.163 +246 G 0.164 +247 A 0.159 +248 A 0.153 +249 A 0.146 +250 S 0.138 +251 L 0.128 +252 N 0.118 +253 V 0.108 +254 D 0.099 +255 A 0.091 +256 A 0.083 +257 V 0.071 +258 Q 0.060 +259 Q 0.056 +260 W 0.063 +261 L 0.077 +262 Q 0.089 +263 K 0.095 +264 G 0.096 +265 T 0.093 +266 P 0.091 +267 A 0.090 +268 S 0.091 +269 K 0.092 +270 L 0.091 +271 I 0.091 +272 L 0.094 +273 G 0.101 +274 M 0.103 +275 P 0.096 +276 T 0.083 +277 Y 0.074 +278 G 0.074 +279 R 0.078 +280 S 0.082 +281 F 0.087 +282 T 0.095 +283 L 0.104 +284 A 0.109 +285 S 0.112 +286 S 0.115 +287 S 0.115 +288 D 0.111 +289 T 0.106 +290 R 0.109 +291 V 0.121 +292 G 0.138 +293 A 0.153 +294 P 0.159 +295 A 0.161 +296 T 0.172 +297 G 0.193 +298 S 0.215 +299 G 0.232 +300 T 0.244 +301 P 0.243 +302 G 0.222 +303 P 0.182 +304 F 0.144 +305 T 0.128 +306 K 0.136 +307 E 0.153 +308 G 0.160 +309 G 0.146 +310 M 0.118 +311 L 0.088 +312 A 0.065 +313 Y 0.052 +314 Y 0.050 +315 E 0.051 +316 V 0.050 +317 C 0.049 +318 S 0.056 +319 W 0.071 +320 K 0.088 +321 G 0.097 +322 A 0.095 +323 T 0.085 +324 K 0.074 +325 Q 0.069 +326 R 0.070 +327 I 0.073 +328 Q 0.077 +329 D 0.082 +330 Q 0.088 +331 K 0.091 +332 V 0.087 +333 P 0.076 +334 Y 0.066 +335 I 0.061 +336 F 0.061 +337 R 0.065 +338 D 0.070 +339 N 0.072 +340 Q 0.068 +341 W 0.060 +342 V 0.052 +343 G 0.050 +344 F 0.059 +345 D 0.075 +346 D 0.087 +347 V 0.088 +348 E 0.083 +349 S 0.075 +350 F 0.064 +351 K 0.054 +352 T 0.046 +353 K 0.043 +354 V 0.041 +355 S 0.042 +356 Y 0.047 +357 L 0.057 +358 K 0.071 +359 Q 0.090 +360 K 0.108 +361 G 0.117 +362 L 0.110 +363 G 0.089 +364 G 0.068 +365 A 0.059 +366 M 0.060 +367 V 0.065 +368 W 0.070 +369 A 0.074 +370 L 0.076 +371 D 0.076 +372 L 0.076 +373 D 0.078 +374 D 0.084 +375 F 0.094 +376 A 0.107 +377 G 0.112 +378 F 0.106 +379 S 0.094 +380 C 0.086 +381 N 0.087 +382 Q 0.093 +383 G 0.099 +384 R 0.097 +385 Y 0.087 +386 P 0.073 +387 L 0.063 +388 I 0.059 +389 Q 0.060 +390 T 0.061 +391 L 0.060 +392 R 0.060 +393 Q 0.065 +394 E 0.077 +395 L 0.095 +396 S 0.124 +397 L 0.168 +398 P 0.227 +399 Y 0.305 +400 L 0.403 +401 P 0.501 +402 S 0.571 +403 G 0.604 +404 T 0.612 +405 P 0.613 +406 E 0.610 +407 L 0.598 +408 E 0.577 +409 V 0.558 +410 P 0.554 +411 K 0.567 +412 P 0.589 +413 G 0.608 +414 Q 0.621 +415 P 0.626 +416 S 0.628 +417 E 0.632 +418 P 0.638 +419 E 0.639 +420 H 0.627 +421 G 0.612 +422 P 0.604 +423 S 0.604 +424 P 0.597 +425 G 0.562 +426 Q 0.483 +427 D 0.369 +428 T 0.253 +429 F 0.170 +430 C 0.130 +431 Q 0.119 +432 G 0.123 +433 K 0.133 +434 A 0.143 +435 D 0.147 +436 G 0.142 +437 L 0.137 +438 Y 0.137 +439 P 0.141 +440 N 0.138 +441 P 0.125 +442 R 0.113 +443 E 0.108 +444 R 0.103 +445 S 0.089 +446 S 0.068 +447 F 0.054 +448 Y 0.054 +449 S 0.065 +450 C 0.083 +451 A 0.104 +452 A 0.125 +453 G 0.142 +454 R 0.148 +455 L 0.146 +456 F 0.139 +457 Q 0.130 +458 Q 0.119 +459 S 0.114 +460 C 0.125 +461 P 0.144 +462 T 0.158 +463 G 0.161 +464 L 0.153 +465 V 0.140 +466 F 0.126 +467 S 0.113 +468 N 0.102 +469 S 0.092 +470 C 0.087 +471 K 0.093 +472 C 0.110 +473 C 0.137 +474 T 0.169 +475 W 0.202 +476 N 0.224 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000133101.11_ENST00000255465.8_GN:CCNA1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000133101.11_ENST00000255465.8_GN:CCNA1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..15bee5fb347cf157c5206fe6a412653820e1009e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000133101.11_ENST00000255465.8_GN:CCNA1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,422 @@ +>ENSG00000133101.11|ENST00000255465.8|GN:CCNA1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.382 +2 H 0.402 +3 C 0.432 +4 S 0.460 +5 N 0.481 +6 P 0.503 +7 K 0.542 +8 S 0.602 +9 G 0.654 +10 V 0.678 +11 V 0.684 +12 L 0.689 +13 A 0.680 +14 T 0.636 +15 V 0.569 +16 A 0.517 +17 R 0.504 +18 G 0.521 +19 P 0.553 +20 D 0.578 +21 A 0.576 +22 C 0.553 +23 Q 0.552 +24 I 0.598 +25 L 0.658 +26 T 0.681 +27 R 0.671 +28 A 0.656 +29 P 0.652 +30 L 0.655 +31 G 0.651 +32 Q 0.629 +33 D 0.604 +34 P 0.601 +35 P 0.626 +36 Q 0.651 +37 R 0.649 +38 T 0.619 +39 V 0.594 +40 L 0.606 +41 G 0.641 +42 L 0.653 +43 L 0.639 +44 T 0.635 +45 A 0.661 +46 N 0.697 +47 G 0.717 +48 Q 0.720 +49 Y 0.721 +50 R 0.726 +51 R 0.725 +52 T 0.705 +53 C 0.660 +54 G 0.605 +55 Q 0.578 +56 G 0.603 +57 I 0.652 +58 T 0.683 +59 R 0.687 +60 I 0.678 +61 R 0.672 +62 C 0.681 +63 Y 0.705 +64 S 0.740 +65 G 0.770 +66 S 0.785 +67 E 0.779 +68 N 0.752 +69 A 0.713 +70 F 0.687 +71 P 0.697 +72 P 0.738 +73 A 0.781 +74 G 0.803 +75 K 0.801 +76 K 0.786 +77 A 0.771 +78 L 0.765 +79 P 0.770 +80 D 0.783 +81 C 0.793 +82 G 0.792 +83 V 0.776 +84 Q 0.748 +85 E 0.718 +86 P 0.700 +87 P 0.703 +88 K 0.719 +89 Q 0.722 +90 G 0.698 +91 F 0.667 +92 D 0.645 +93 I 0.624 +94 Y 0.600 +95 M 0.592 +96 D 0.607 +97 E 0.622 +98 L 0.632 +99 E 0.651 +100 Q 0.686 +101 G 0.725 +102 D 0.751 +103 R 0.759 +104 D 0.753 +105 S 0.737 +106 C 0.723 +107 S 0.718 +108 V 0.724 +109 R 0.733 +110 E 0.735 +111 G 0.722 +112 M 0.697 +113 A 0.674 +114 F 0.666 +115 E 0.675 +116 D 0.681 +117 V 0.679 +118 Y 0.679 +119 E 0.684 +120 V 0.687 +121 D 0.682 +122 T 0.675 +123 G 0.666 +124 T 0.654 +125 L 0.641 +126 K 0.623 +127 S 0.589 +128 D 0.532 +129 L 0.468 +130 H 0.426 +131 F 0.417 +132 L 0.427 +133 L 0.439 +134 D 0.451 +135 F 0.474 +136 N 0.515 +137 T 0.562 +138 V 0.605 +139 S 0.639 +140 P 0.660 +141 M 0.666 +142 L 0.653 +143 V 0.623 +144 D 0.588 +145 S 0.559 +146 S 0.543 +147 L 0.543 +148 L 0.561 +149 S 0.584 +150 Q 0.591 +151 S 0.571 +152 E 0.537 +153 D 0.515 +154 I 0.527 +155 S 0.566 +156 S 0.607 +157 L 0.636 +158 G 0.648 +159 T 0.639 +160 D 0.603 +161 V 0.548 +162 I 0.483 +163 N 0.411 +164 V 0.336 +165 T 0.270 +166 E 0.220 +167 Y 0.181 +168 A 0.147 +169 E 0.120 +170 E 0.106 +171 I 0.104 +172 Y 0.105 +173 Q 0.101 +174 Y 0.094 +175 L 0.089 +176 R 0.091 +177 E 0.093 +178 A 0.093 +179 E 0.090 +180 I 0.087 +181 R 0.086 +182 H 0.086 +183 R 0.092 +184 P 0.097 +185 K 0.096 +186 A 0.086 +187 H 0.076 +188 Y 0.068 +189 M 0.063 +190 K 0.060 +191 K 0.063 +192 Q 0.068 +193 P 0.074 +194 D 0.078 +195 I 0.077 +196 T 0.071 +197 E 0.061 +198 G 0.054 +199 M 0.051 +200 R 0.052 +201 T 0.056 +202 I 0.062 +203 L 0.064 +204 V 0.061 +205 D 0.053 +206 W 0.044 +207 L 0.037 +208 V 0.033 +209 E 0.032 +210 V 0.030 +211 G 0.031 +212 E 0.036 +213 E 0.042 +214 Y 0.049 +215 K 0.055 +216 L 0.057 +217 R 0.055 +218 A 0.050 +219 E 0.046 +220 T 0.044 +221 L 0.041 +222 Y 0.037 +223 L 0.033 +224 A 0.030 +225 V 0.028 +226 N 0.026 +227 F 0.026 +228 L 0.028 +229 D 0.030 +230 R 0.032 +231 F 0.035 +232 L 0.040 +233 S 0.044 +234 C 0.047 +235 M 0.052 +236 S 0.059 +237 V 0.061 +238 L 0.057 +239 R 0.052 +240 G 0.050 +241 K 0.050 +242 L 0.054 +243 Q 0.061 +244 L 0.072 +245 V 0.079 +246 G 0.079 +247 T 0.076 +248 A 0.077 +249 A 0.079 +250 M 0.076 +251 L 0.074 +252 L 0.077 +253 A 0.081 +254 S 0.079 +255 K 0.071 +256 Y 0.066 +257 E 0.068 +258 E 0.074 +259 I 0.083 +260 Y 0.092 +261 P 0.095 +262 P 0.089 +263 E 0.077 +264 V 0.064 +265 D 0.055 +266 E 0.052 +267 F 0.053 +268 V 0.053 +269 Y 0.049 +270 I 0.046 +271 T 0.050 +272 D 0.061 +273 D 0.068 +274 T 0.065 +275 Y 0.058 +276 T 0.055 +277 K 0.061 +278 R 0.066 +279 Q 0.064 +280 L 0.060 +281 L 0.063 +282 K 0.067 +283 M 0.064 +284 E 0.054 +285 H 0.044 +286 L 0.038 +287 L 0.036 +288 L 0.036 +289 K 0.038 +290 V 0.042 +291 L 0.048 +292 A 0.054 +293 F 0.062 +294 D 0.074 +295 L 0.085 +296 T 0.091 +297 V 0.088 +298 P 0.076 +299 T 0.059 +300 T 0.046 +301 N 0.036 +302 Q 0.029 +303 F 0.024 +304 L 0.021 +305 L 0.021 +306 Q 0.022 +307 Y 0.026 +308 L 0.031 +309 R 0.039 +310 R 0.050 +311 Q 0.064 +312 G 0.074 +313 V 0.075 +314 C 0.067 +315 V 0.057 +316 R 0.050 +317 T 0.046 +318 E 0.048 +319 N 0.051 +320 L 0.051 +321 A 0.048 +322 K 0.045 +323 Y 0.044 +324 V 0.047 +325 A 0.052 +326 E 0.057 +327 L 0.060 +328 S 0.061 +329 L 0.059 +330 L 0.056 +331 E 0.055 +332 A 0.056 +333 D 0.057 +334 P 0.058 +335 F 0.063 +336 L 0.072 +337 K 0.079 +338 Y 0.082 +339 L 0.085 +340 P 0.091 +341 S 0.106 +342 L 0.128 +343 I 0.140 +344 A 0.128 +345 A 0.103 +346 A 0.086 +347 A 0.078 +348 F 0.074 +349 C 0.077 +350 L 0.083 +351 A 0.088 +352 N 0.087 +353 Y 0.084 +354 T 0.081 +355 V 0.076 +356 N 0.069 +357 K 0.064 +358 H 0.061 +359 F 0.061 +360 W 0.063 +361 P 0.064 +362 E 0.062 +363 T 0.060 +364 L 0.058 +365 A 0.056 +366 A 0.056 +367 F 0.055 +368 T 0.055 +369 G 0.058 +370 Y 0.062 +371 S 0.067 +372 L 0.070 +373 S 0.074 +374 E 0.077 +375 I 0.075 +376 V 0.064 +377 P 0.053 +378 C 0.049 +379 L 0.050 +380 S 0.050 +381 E 0.050 +382 L 0.053 +383 H 0.056 +384 K 0.059 +385 A 0.063 +386 Y 0.071 +387 L 0.085 +388 D 0.108 +389 I 0.134 +390 P 0.153 +391 H 0.164 +392 R 0.170 +393 P 0.169 +394 Q 0.159 +395 Q 0.143 +396 A 0.125 +397 I 0.111 +398 R 0.105 +399 E 0.107 +400 K 0.113 +401 Y 0.118 +402 K 0.118 +403 A 0.115 +404 S 0.116 +405 K 0.127 +406 Y 0.147 +407 L 0.171 +408 C 0.188 +409 V 0.192 +410 S 0.186 +411 L 0.178 +412 M 0.174 +413 E 0.173 +414 P 0.174 +415 P 0.175 +416 A 0.181 +417 V 0.190 +418 L 0.196 +419 L 0.197 +420 L 0.199 +421 Q 0.202 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000133101.11_ENST00000255465.8_GN:CCNA1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:44.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000133101.11_ENST00000255465.8_GN:CCNA1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:44.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7fb004e0542ccf81e3cf45da037e7de429157f1f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000133101.11_ENST00000255465.8_GN:CCNA1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:44.caid @@ -0,0 +1,466 @@ +>ENSG00000133101.11|ENST00000255465.8|GN:CCNA1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:44 +1 M 0.399 +2 E 0.422 +3 T 0.458 +4 G 0.500 +5 F 0.544 +6 P 0.575 +7 A 0.575 +8 I 0.547 +9 M 0.527 +10 Y 0.548 +11 P 0.599 +12 G 0.646 +13 S 0.663 +14 F 0.657 +15 I 0.652 +16 G 0.651 +17 G 0.633 +18 W 0.589 +19 G 0.542 +20 E 0.529 +21 E 0.558 +22 Y 0.592 +23 L 0.595 +24 S 0.569 +25 W 0.548 +26 E 0.551 +27 G 0.578 +28 P 0.611 +29 G 0.637 +30 L 0.650 +31 P 0.652 +32 D 0.639 +33 F 0.600 +34 V 0.538 +35 F 0.480 +36 Q 0.469 +37 Q 0.522 +38 Q 0.607 +39 P 0.681 +40 V 0.729 +41 E 0.757 +42 S 0.774 +43 E 0.783 +44 A 0.784 +45 M 0.779 +46 H 0.767 +47 C 0.748 +48 S 0.725 +49 N 0.706 +50 P 0.705 +51 K 0.727 +52 S 0.758 +53 G 0.779 +54 V 0.786 +55 V 0.789 +56 L 0.792 +57 A 0.790 +58 T 0.773 +59 V 0.741 +60 A 0.705 +61 R 0.678 +62 G 0.667 +63 P 0.677 +64 D 0.705 +65 A 0.740 +66 C 0.772 +67 Q 0.793 +68 I 0.800 +69 L 0.795 +70 T 0.778 +71 R 0.755 +72 A 0.735 +73 P 0.726 +74 L 0.723 +75 G 0.708 +76 Q 0.675 +77 D 0.642 +78 P 0.641 +79 P 0.675 +80 Q 0.718 +81 R 0.743 +82 T 0.744 +83 V 0.737 +84 L 0.740 +85 G 0.754 +86 L 0.755 +87 L 0.736 +88 T 0.718 +89 A 0.725 +90 N 0.746 +91 G 0.756 +92 Q 0.747 +93 Y 0.739 +94 R 0.745 +95 R 0.755 +96 T 0.754 +97 C 0.748 +98 G 0.746 +99 Q 0.748 +100 G 0.747 +101 I 0.747 +102 T 0.747 +103 R 0.742 +104 I 0.731 +105 R 0.722 +106 C 0.723 +107 Y 0.734 +108 S 0.754 +109 G 0.772 +110 S 0.779 +111 E 0.772 +112 N 0.747 +113 A 0.710 +114 F 0.684 +115 P 0.692 +116 P 0.730 +117 A 0.772 +118 G 0.795 +119 K 0.794 +120 K 0.778 +121 A 0.760 +122 L 0.752 +123 P 0.758 +124 D 0.774 +125 C 0.788 +126 G 0.790 +127 V 0.773 +128 Q 0.741 +129 E 0.705 +130 P 0.682 +131 P 0.684 +132 K 0.702 +133 Q 0.710 +134 G 0.694 +135 F 0.665 +136 D 0.639 +137 I 0.613 +138 Y 0.589 +139 M 0.586 +140 D 0.606 +141 E 0.624 +142 L 0.635 +143 E 0.655 +144 Q 0.690 +145 G 0.727 +146 D 0.753 +147 R 0.764 +148 D 0.764 +149 S 0.757 +150 C 0.749 +151 S 0.745 +152 V 0.748 +153 R 0.755 +154 E 0.757 +155 G 0.748 +156 M 0.729 +157 A 0.710 +158 F 0.703 +159 E 0.712 +160 D 0.723 +161 V 0.727 +162 Y 0.731 +163 E 0.737 +164 V 0.737 +165 D 0.728 +166 T 0.718 +167 G 0.709 +168 T 0.699 +169 L 0.687 +170 K 0.667 +171 S 0.627 +172 D 0.566 +173 L 0.505 +174 H 0.472 +175 F 0.475 +176 L 0.491 +177 L 0.500 +178 D 0.505 +179 F 0.523 +180 N 0.559 +181 T 0.600 +182 V 0.636 +183 S 0.664 +184 P 0.683 +185 M 0.686 +186 L 0.668 +187 V 0.632 +188 D 0.592 +189 S 0.566 +190 S 0.559 +191 L 0.568 +192 L 0.589 +193 S 0.608 +194 Q 0.608 +195 S 0.582 +196 E 0.543 +197 D 0.517 +198 I 0.527 +199 S 0.567 +200 S 0.610 +201 L 0.639 +202 G 0.653 +203 T 0.645 +204 D 0.610 +205 V 0.554 +206 I 0.486 +207 N 0.408 +208 V 0.328 +209 T 0.261 +210 E 0.212 +211 Y 0.176 +212 A 0.144 +213 E 0.118 +214 E 0.104 +215 I 0.101 +216 Y 0.102 +217 Q 0.099 +218 Y 0.092 +219 L 0.088 +220 R 0.089 +221 E 0.092 +222 A 0.091 +223 E 0.088 +224 I 0.086 +225 R 0.084 +226 H 0.083 +227 R 0.087 +228 P 0.093 +229 K 0.091 +230 A 0.082 +231 H 0.072 +232 Y 0.065 +233 M 0.059 +234 K 0.057 +235 K 0.060 +236 Q 0.065 +237 P 0.070 +238 D 0.074 +239 I 0.073 +240 T 0.067 +241 E 0.059 +242 G 0.053 +243 M 0.050 +244 R 0.051 +245 T 0.055 +246 I 0.060 +247 L 0.062 +248 V 0.059 +249 D 0.052 +250 W 0.043 +251 L 0.036 +252 V 0.033 +253 E 0.031 +254 V 0.030 +255 G 0.031 +256 E 0.036 +257 E 0.042 +258 Y 0.048 +259 K 0.054 +260 L 0.056 +261 R 0.054 +262 A 0.049 +263 E 0.045 +264 T 0.044 +265 L 0.041 +266 Y 0.037 +267 L 0.033 +268 A 0.030 +269 V 0.028 +270 N 0.026 +271 F 0.026 +272 L 0.028 +273 D 0.030 +274 R 0.032 +275 F 0.035 +276 L 0.041 +277 S 0.044 +278 C 0.048 +279 M 0.054 +280 S 0.060 +281 V 0.063 +282 L 0.059 +283 R 0.054 +284 G 0.052 +285 K 0.052 +286 L 0.055 +287 Q 0.062 +288 L 0.073 +289 V 0.080 +290 G 0.080 +291 T 0.078 +292 A 0.079 +293 A 0.081 +294 M 0.078 +295 L 0.076 +296 L 0.079 +297 A 0.083 +298 S 0.081 +299 K 0.074 +300 Y 0.069 +301 E 0.071 +302 E 0.077 +303 I 0.086 +304 Y 0.095 +305 P 0.098 +306 P 0.092 +307 E 0.080 +308 V 0.067 +309 D 0.057 +310 E 0.054 +311 F 0.056 +312 V 0.057 +313 Y 0.053 +314 I 0.050 +315 T 0.055 +316 D 0.066 +317 D 0.074 +318 T 0.071 +319 Y 0.062 +320 T 0.058 +321 K 0.063 +322 R 0.067 +323 Q 0.065 +324 L 0.061 +325 L 0.063 +326 K 0.067 +327 M 0.064 +328 E 0.054 +329 H 0.044 +330 L 0.038 +331 L 0.036 +332 L 0.036 +333 K 0.038 +334 V 0.042 +335 L 0.047 +336 A 0.053 +337 F 0.061 +338 D 0.072 +339 L 0.084 +340 T 0.090 +341 V 0.088 +342 P 0.075 +343 T 0.060 +344 T 0.046 +345 N 0.037 +346 Q 0.030 +347 F 0.025 +348 L 0.022 +349 L 0.022 +350 Q 0.024 +351 Y 0.027 +352 L 0.031 +353 R 0.039 +354 R 0.050 +355 Q 0.063 +356 G 0.072 +357 V 0.073 +358 C 0.066 +359 V 0.057 +360 R 0.050 +361 T 0.047 +362 E 0.049 +363 N 0.053 +364 L 0.054 +365 A 0.051 +366 K 0.048 +367 Y 0.047 +368 V 0.049 +369 A 0.053 +370 E 0.058 +371 L 0.060 +372 S 0.061 +373 L 0.059 +374 L 0.056 +375 E 0.054 +376 A 0.055 +377 D 0.056 +378 P 0.057 +379 F 0.063 +380 L 0.072 +381 K 0.080 +382 Y 0.083 +383 L 0.085 +384 P 0.092 +385 S 0.107 +386 L 0.129 +387 I 0.140 +388 A 0.128 +389 A 0.103 +390 A 0.086 +391 A 0.077 +392 F 0.074 +393 C 0.077 +394 L 0.084 +395 A 0.088 +396 N 0.088 +397 Y 0.086 +398 T 0.083 +399 V 0.078 +400 N 0.071 +401 K 0.065 +402 H 0.062 +403 F 0.063 +404 W 0.065 +405 P 0.066 +406 E 0.064 +407 T 0.062 +408 L 0.059 +409 A 0.057 +410 A 0.057 +411 F 0.056 +412 T 0.057 +413 G 0.060 +414 Y 0.064 +415 S 0.068 +416 L 0.072 +417 S 0.076 +418 E 0.079 +419 I 0.077 +420 V 0.066 +421 P 0.054 +422 C 0.049 +423 L 0.050 +424 S 0.050 +425 E 0.051 +426 L 0.053 +427 H 0.057 +428 K 0.060 +429 A 0.064 +430 Y 0.073 +431 L 0.088 +432 D 0.111 +433 I 0.139 +434 P 0.159 +435 H 0.170 +436 R 0.176 +437 P 0.176 +438 Q 0.166 +439 Q 0.149 +440 A 0.131 +441 I 0.116 +442 R 0.109 +443 E 0.110 +444 K 0.116 +445 Y 0.122 +446 K 0.122 +447 A 0.120 +448 S 0.122 +449 K 0.135 +450 Y 0.157 +451 L 0.182 +452 C 0.201 +453 V 0.205 +454 S 0.198 +455 L 0.188 +456 M 0.182 +457 E 0.180 +458 P 0.179 +459 P 0.178 +460 A 0.181 +461 V 0.189 +462 L 0.197 +463 L 0.201 +464 L 0.208 +465 Q 0.216 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000134389.12_ENST00000256785.5_GN:CFHR5_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000134389.12_ENST00000256785.5_GN:CFHR5_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e58b855f16b0e8585fe0382669237a6d56ccf5bc --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000134389.12_ENST00000256785.5_GN:CFHR5_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,570 @@ +>ENSG00000134389.12|ENST00000256785.5|GN:CFHR5|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.254 +2 L 0.248 +3 L 0.246 +4 L 0.249 +5 F 0.245 +6 S 0.234 +7 V 0.234 +8 I 0.243 +9 L 0.242 +10 I 0.234 +11 S 0.239 +12 W 0.259 +13 V 0.284 +14 S 0.324 +15 T 0.390 +16 V 0.463 +17 G 0.514 +18 G 0.529 +19 E 0.498 +20 G 0.415 +21 T 0.304 +22 L 0.210 +23 C 0.157 +24 D 0.133 +25 F 0.121 +26 P 0.111 +27 K 0.102 +28 I 0.095 +29 H 0.090 +30 H 0.084 +31 G 0.081 +32 F 0.085 +33 L 0.101 +34 Y 0.127 +35 D 0.159 +36 E 0.193 +37 E 0.222 +38 D 0.237 +39 Y 0.228 +40 N 0.198 +41 P 0.158 +42 F 0.126 +43 S 0.106 +44 Q 0.094 +45 V 0.087 +46 P 0.084 +47 T 0.087 +48 G 0.093 +49 E 0.091 +50 V 0.078 +51 F 0.063 +52 Y 0.054 +53 Y 0.055 +54 S 0.066 +55 C 0.080 +56 E 0.091 +57 Y 0.095 +58 N 0.097 +59 F 0.102 +60 V 0.112 +61 S 0.122 +62 P 0.128 +63 S 0.127 +64 K 0.116 +65 S 0.102 +66 F 0.090 +67 W 0.080 +68 T 0.071 +69 R 0.063 +70 I 0.058 +71 T 0.056 +72 C 0.061 +73 T 0.072 +74 E 0.084 +75 E 0.090 +76 G 0.083 +77 W 0.068 +78 S 0.056 +79 P 0.053 +80 T 0.057 +81 P 0.064 +82 K 0.073 +83 C 0.084 +84 L 0.087 +85 R 0.080 +86 M 0.074 +87 C 0.082 +88 S 0.100 +89 F 0.115 +90 P 0.120 +91 F 0.116 +92 V 0.108 +93 K 0.098 +94 N 0.088 +95 G 0.085 +96 H 0.095 +97 S 0.117 +98 E 0.146 +99 S 0.173 +100 S 0.179 +101 G 0.157 +102 L 0.116 +103 I 0.080 +104 H 0.061 +105 L 0.058 +106 E 0.064 +107 G 0.073 +108 D 0.082 +109 T 0.087 +110 V 0.085 +111 Q 0.077 +112 I 0.070 +113 I 0.071 +114 C 0.080 +115 N 0.090 +116 T 0.093 +117 G 0.090 +118 Y 0.086 +119 S 0.085 +120 L 0.089 +121 Q 0.099 +122 N 0.110 +123 N 0.118 +124 E 0.114 +125 K 0.098 +126 N 0.080 +127 I 0.067 +128 S 0.063 +129 C 0.066 +130 V 0.073 +131 E 0.079 +132 R 0.083 +133 G 0.082 +134 W 0.080 +135 S 0.085 +136 T 0.096 +137 P 0.100 +138 P 0.097 +139 I 0.094 +140 C 0.101 +141 S 0.114 +142 F 0.127 +143 T 0.134 +144 K 0.129 +145 G 0.118 +146 E 0.113 +147 C 0.121 +148 H 0.136 +149 V 0.153 +150 P 0.170 +151 I 0.182 +152 L 0.179 +153 E 0.160 +154 A 0.132 +155 N 0.108 +156 V 0.095 +157 D 0.087 +158 A 0.081 +159 Q 0.081 +160 P 0.088 +161 K 0.093 +162 K 0.084 +163 E 0.067 +164 S 0.052 +165 Y 0.044 +166 K 0.043 +167 V 0.045 +168 G 0.050 +169 D 0.054 +170 V 0.056 +171 L 0.054 +172 K 0.051 +173 F 0.050 +174 S 0.057 +175 C 0.071 +176 R 0.089 +177 K 0.101 +178 N 0.104 +179 L 0.104 +180 I 0.108 +181 R 0.117 +182 V 0.123 +183 G 0.118 +184 S 0.103 +185 D 0.084 +186 S 0.066 +187 V 0.052 +188 Q 0.043 +189 C 0.042 +190 Y 0.049 +191 Q 0.062 +192 F 0.073 +193 G 0.074 +194 W 0.067 +195 S 0.065 +196 P 0.077 +197 N 0.090 +198 F 0.089 +199 P 0.083 +200 T 0.094 +201 C 0.133 +202 K 0.193 +203 G 0.245 +204 Q 0.262 +205 V 0.233 +206 R 0.182 +207 S 0.144 +208 C 0.138 +209 G 0.155 +210 P 0.168 +211 P 0.165 +212 P 0.154 +213 Q 0.141 +214 L 0.127 +215 S 0.110 +216 N 0.095 +217 G 0.087 +218 E 0.087 +219 V 0.094 +220 K 0.109 +221 E 0.126 +222 I 0.132 +223 R 0.119 +224 K 0.095 +225 E 0.075 +226 E 0.065 +227 Y 0.063 +228 G 0.062 +229 H 0.059 +230 N 0.056 +231 E 0.054 +232 V 0.055 +233 V 0.056 +234 E 0.055 +235 Y 0.054 +236 D 0.057 +237 C 0.070 +238 N 0.083 +239 P 0.088 +240 N 0.079 +241 F 0.067 +242 I 0.060 +243 I 0.063 +244 N 0.073 +245 G 0.079 +246 P 0.074 +247 K 0.063 +248 K 0.052 +249 I 0.047 +250 Q 0.047 +251 C 0.052 +252 V 0.061 +253 D 0.068 +254 G 0.069 +255 E 0.064 +256 W 0.059 +257 T 0.061 +258 T 0.067 +259 L 0.069 +260 P 0.070 +261 T 0.081 +262 C 0.111 +263 V 0.156 +264 E 0.200 +265 Q 0.220 +266 V 0.205 +267 K 0.167 +268 T 0.139 +269 C 0.141 +270 G 0.162 +271 Y 0.178 +272 I 0.178 +273 P 0.169 +274 E 0.157 +275 L 0.138 +276 E 0.113 +277 Y 0.093 +278 G 0.086 +279 Y 0.089 +280 V 0.091 +281 Q 0.093 +282 P 0.104 +283 S 0.115 +284 V 0.107 +285 P 0.083 +286 P 0.060 +287 Y 0.051 +288 Q 0.052 +289 H 0.059 +290 G 0.070 +291 V 0.082 +292 S 0.089 +293 V 0.090 +294 E 0.085 +295 V 0.079 +296 N 0.081 +297 C 0.093 +298 R 0.110 +299 N 0.118 +300 E 0.113 +301 Y 0.103 +302 A 0.099 +303 M 0.103 +304 I 0.107 +305 G 0.103 +306 N 0.090 +307 N 0.075 +308 M 0.062 +309 I 0.055 +310 T 0.054 +311 C 0.060 +312 I 0.070 +313 N 0.079 +314 G 0.083 +315 I 0.081 +316 W 0.079 +317 T 0.085 +318 E 0.093 +319 L 0.093 +320 P 0.088 +321 M 0.090 +322 C 0.110 +323 V 0.141 +324 A 0.176 +325 T 0.212 +326 H 0.242 +327 Q 0.250 +328 L 0.232 +329 K 0.196 +330 R 0.163 +331 C 0.152 +332 K 0.167 +333 I 0.199 +334 A 0.228 +335 G 0.236 +336 V 0.223 +337 N 0.204 +338 I 0.187 +339 K 0.175 +340 T 0.169 +341 L 0.174 +342 L 0.183 +343 K 0.190 +344 L 0.192 +345 S 0.187 +346 G 0.167 +347 K 0.136 +348 E 0.109 +349 F 0.095 +350 N 0.093 +351 H 0.096 +352 N 0.101 +353 S 0.108 +354 R 0.110 +355 I 0.103 +356 R 0.090 +357 Y 0.081 +358 R 0.083 +359 C 0.091 +360 S 0.097 +361 D 0.094 +362 I 0.091 +363 F 0.093 +364 R 0.102 +365 Y 0.113 +366 R 0.115 +367 H 0.106 +368 S 0.095 +369 V 0.093 +370 C 0.102 +371 I 0.117 +372 N 0.126 +373 G 0.127 +374 K 0.117 +375 W 0.103 +376 N 0.101 +377 P 0.120 +378 E 0.145 +379 V 0.157 +380 D 0.166 +381 C 0.193 +382 T 0.251 +383 E 0.319 +384 K 0.364 +385 R 0.360 +386 E 0.309 +387 Q 0.239 +388 F 0.190 +389 C 0.179 +390 P 0.195 +391 P 0.210 +392 P 0.216 +393 P 0.218 +394 Q 0.219 +395 I 0.213 +396 P 0.194 +397 N 0.172 +398 A 0.169 +399 Q 0.189 +400 N 0.213 +401 M 0.227 +402 T 0.227 +403 T 0.209 +404 T 0.177 +405 V 0.141 +406 N 0.113 +407 Y 0.102 +408 Q 0.103 +409 D 0.107 +410 G 0.113 +411 E 0.119 +412 K 0.121 +413 V 0.116 +414 A 0.103 +415 V 0.093 +416 L 0.094 +417 C 0.109 +418 K 0.127 +419 E 0.136 +420 N 0.129 +421 Y 0.117 +422 L 0.112 +423 L 0.121 +424 P 0.135 +425 E 0.143 +426 A 0.138 +427 K 0.120 +428 E 0.098 +429 I 0.082 +430 V 0.079 +431 C 0.087 +432 K 0.101 +433 D 0.110 +434 G 0.108 +435 R 0.098 +436 W 0.091 +437 Q 0.096 +438 S 0.109 +439 L 0.118 +440 P 0.123 +441 R 0.134 +442 C 0.163 +443 V 0.206 +444 E 0.242 +445 S 0.255 +446 T 0.239 +447 A 0.206 +448 Y 0.179 +449 C 0.180 +450 G 0.202 +451 P 0.222 +452 P 0.227 +453 P 0.222 +454 S 0.211 +455 I 0.194 +456 N 0.174 +457 N 0.156 +458 G 0.152 +459 D 0.161 +460 T 0.177 +461 T 0.199 +462 S 0.224 +463 F 0.234 +464 P 0.216 +465 L 0.175 +466 S 0.134 +467 V 0.111 +468 Y 0.112 +469 P 0.128 +470 P 0.144 +471 G 0.153 +472 S 0.153 +473 T 0.146 +474 V 0.136 +475 T 0.125 +476 Y 0.117 +477 R 0.119 +478 C 0.131 +479 Q 0.148 +480 S 0.158 +481 F 0.162 +482 Y 0.169 +483 K 0.179 +484 L 0.185 +485 Q 0.180 +486 G 0.165 +487 S 0.144 +488 V 0.123 +489 T 0.104 +490 V 0.092 +491 T 0.087 +492 C 0.091 +493 R 0.099 +494 N 0.105 +495 K 0.107 +496 Q 0.107 +497 W 0.115 +498 S 0.136 +499 E 0.162 +500 P 0.176 +501 P 0.172 +502 R 0.161 +503 C 0.153 +504 L 0.144 +505 D 0.126 +506 P 0.107 +507 C 0.102 +508 V 0.109 +509 V 0.114 +510 S 0.112 +511 E 0.113 +512 E 0.122 +513 N 0.135 +514 M 0.147 +515 N 0.161 +516 K 0.173 +517 N 0.179 +518 N 0.174 +519 I 0.161 +520 Q 0.145 +521 L 0.136 +522 K 0.145 +523 W 0.169 +524 R 0.198 +525 N 0.221 +526 D 0.224 +527 G 0.199 +528 K 0.158 +529 L 0.122 +530 Y 0.105 +531 A 0.105 +532 K 0.114 +533 T 0.126 +534 G 0.138 +535 D 0.145 +536 A 0.145 +537 V 0.139 +538 E 0.129 +539 F 0.120 +540 Q 0.114 +541 C 0.109 +542 K 0.101 +543 F 0.095 +544 P 0.094 +545 H 0.106 +546 K 0.128 +547 A 0.152 +548 M 0.169 +549 I 0.177 +550 S 0.180 +551 S 0.177 +552 P 0.164 +553 P 0.141 +554 F 0.117 +555 R 0.104 +556 A 0.100 +557 I 0.100 +558 C 0.104 +559 Q 0.112 +560 E 0.123 +561 G 0.131 +562 K 0.135 +563 F 0.135 +564 E 0.135 +565 Y 0.136 +566 P 0.137 +567 I 0.139 +568 C 0.146 +569 E 0.154 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000134389.12_ENST00000256785.5_GN:CFHR5_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000134389.12_ENST00000256785.5_GN:CFHR5_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4a170001b6be3622fc8ae9230abccb9788b3a809 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000134389.12_ENST00000256785.5_GN:CFHR5_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid @@ -0,0 +1,594 @@ +>ENSG00000134389.12|ENST00000256785.5|GN:CFHR5|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:24 +1 M 0.328 +2 K 0.324 +3 A 0.332 +4 D 0.343 +5 L 0.328 +6 K 0.288 +7 Q 0.257 +8 H 0.245 +9 H 0.247 +10 H 0.269 +11 H 0.310 +12 W 0.350 +13 S 0.367 +14 I 0.358 +15 F 0.329 +16 S 0.303 +17 Y 0.304 +18 I 0.328 +19 R 0.349 +20 L 0.356 +21 R 0.363 +22 L 0.369 +23 P 0.367 +24 S 0.362 +25 M 0.354 +26 L 0.328 +27 L 0.294 +28 L 0.289 +29 F 0.310 +30 S 0.319 +31 V 0.309 +32 I 0.303 +33 L 0.309 +34 I 0.313 +35 S 0.314 +36 W 0.317 +37 V 0.331 +38 S 0.366 +39 T 0.422 +40 V 0.486 +41 G 0.535 +42 G 0.547 +43 E 0.507 +44 G 0.415 +45 T 0.300 +46 L 0.206 +47 C 0.155 +48 D 0.134 +49 F 0.124 +50 P 0.115 +51 K 0.106 +52 I 0.099 +53 H 0.092 +54 H 0.084 +55 G 0.079 +56 F 0.084 +57 L 0.099 +58 Y 0.125 +59 D 0.157 +60 E 0.192 +61 E 0.221 +62 D 0.234 +63 Y 0.223 +64 N 0.191 +65 P 0.151 +66 F 0.118 +67 S 0.097 +68 Q 0.084 +69 V 0.076 +70 P 0.073 +71 T 0.076 +72 G 0.081 +73 E 0.079 +74 V 0.068 +75 F 0.055 +76 Y 0.048 +77 Y 0.051 +78 S 0.061 +79 C 0.074 +80 E 0.084 +81 Y 0.086 +82 N 0.087 +83 F 0.092 +84 V 0.101 +85 S 0.110 +86 P 0.117 +87 S 0.117 +88 K 0.109 +89 S 0.097 +90 F 0.086 +91 W 0.076 +92 T 0.067 +93 R 0.059 +94 I 0.053 +95 T 0.051 +96 C 0.056 +97 T 0.067 +98 E 0.079 +99 E 0.084 +100 G 0.079 +101 W 0.064 +102 S 0.053 +103 P 0.051 +104 T 0.056 +105 P 0.062 +106 K 0.071 +107 C 0.080 +108 L 0.083 +109 R 0.077 +110 M 0.073 +111 C 0.083 +112 S 0.102 +113 F 0.118 +114 P 0.123 +115 F 0.120 +116 V 0.111 +117 K 0.099 +118 N 0.090 +119 G 0.090 +120 H 0.102 +121 S 0.125 +122 E 0.157 +123 S 0.186 +124 S 0.194 +125 G 0.171 +126 L 0.128 +127 I 0.090 +128 H 0.070 +129 L 0.067 +130 E 0.073 +131 G 0.081 +132 D 0.090 +133 T 0.094 +134 V 0.092 +135 Q 0.083 +136 I 0.076 +137 I 0.077 +138 C 0.087 +139 N 0.098 +140 T 0.101 +141 G 0.097 +142 Y 0.092 +143 S 0.091 +144 L 0.095 +145 Q 0.104 +146 N 0.115 +147 N 0.122 +148 E 0.118 +149 K 0.103 +150 N 0.084 +151 I 0.071 +152 S 0.068 +153 C 0.071 +154 V 0.077 +155 E 0.083 +156 R 0.088 +157 G 0.086 +158 W 0.083 +159 S 0.088 +160 T 0.098 +161 P 0.102 +162 P 0.097 +163 I 0.094 +164 C 0.101 +165 S 0.114 +166 F 0.126 +167 T 0.131 +168 K 0.125 +169 G 0.113 +170 E 0.108 +171 C 0.116 +172 H 0.131 +173 V 0.150 +174 P 0.168 +175 I 0.181 +176 L 0.179 +177 E 0.161 +178 A 0.133 +179 N 0.109 +180 V 0.095 +181 D 0.086 +182 A 0.079 +183 Q 0.078 +184 P 0.085 +185 K 0.090 +186 K 0.081 +187 E 0.064 +188 S 0.050 +189 Y 0.043 +190 K 0.042 +191 V 0.044 +192 G 0.049 +193 D 0.053 +194 V 0.055 +195 L 0.053 +196 K 0.049 +197 F 0.048 +198 S 0.055 +199 C 0.069 +200 R 0.086 +201 K 0.097 +202 N 0.098 +203 L 0.095 +204 I 0.097 +205 R 0.104 +206 V 0.110 +207 G 0.106 +208 S 0.093 +209 D 0.076 +210 S 0.060 +211 V 0.048 +212 Q 0.040 +213 C 0.038 +214 Y 0.044 +215 Q 0.056 +216 F 0.066 +217 G 0.067 +218 W 0.060 +219 S 0.058 +220 P 0.069 +221 N 0.080 +222 F 0.079 +223 P 0.076 +224 T 0.087 +225 C 0.125 +226 K 0.183 +227 G 0.236 +228 Q 0.254 +229 V 0.229 +230 R 0.180 +231 S 0.142 +232 C 0.136 +233 G 0.152 +234 P 0.164 +235 P 0.160 +236 P 0.148 +237 Q 0.136 +238 L 0.122 +239 S 0.108 +240 N 0.094 +241 G 0.086 +242 E 0.086 +243 V 0.093 +244 K 0.108 +245 E 0.125 +246 I 0.131 +247 R 0.118 +248 K 0.095 +249 E 0.075 +250 E 0.064 +251 Y 0.061 +252 G 0.060 +253 H 0.058 +254 N 0.054 +255 E 0.053 +256 V 0.054 +257 V 0.055 +258 E 0.054 +259 Y 0.054 +260 D 0.058 +261 C 0.071 +262 N 0.085 +263 P 0.088 +264 N 0.080 +265 F 0.067 +266 I 0.060 +267 I 0.065 +268 N 0.075 +269 G 0.081 +270 P 0.077 +271 K 0.065 +272 K 0.053 +273 I 0.047 +274 Q 0.046 +275 C 0.052 +276 V 0.059 +277 D 0.066 +278 G 0.068 +279 E 0.063 +280 W 0.059 +281 T 0.062 +282 T 0.068 +283 L 0.071 +284 P 0.073 +285 T 0.084 +286 C 0.115 +287 V 0.162 +288 E 0.208 +289 Q 0.229 +290 V 0.213 +291 K 0.174 +292 T 0.145 +293 C 0.146 +294 G 0.167 +295 Y 0.183 +296 I 0.184 +297 P 0.176 +298 E 0.165 +299 L 0.145 +300 E 0.120 +301 Y 0.099 +302 G 0.092 +303 Y 0.095 +304 V 0.096 +305 Q 0.098 +306 P 0.110 +307 S 0.123 +308 V 0.116 +309 P 0.090 +310 P 0.066 +311 Y 0.056 +312 Q 0.058 +313 H 0.065 +314 G 0.077 +315 V 0.088 +316 S 0.095 +317 V 0.095 +318 E 0.090 +319 V 0.083 +320 N 0.085 +321 C 0.099 +322 R 0.118 +323 N 0.127 +324 E 0.121 +325 Y 0.109 +326 A 0.105 +327 M 0.110 +328 I 0.114 +329 G 0.110 +330 N 0.097 +331 N 0.080 +332 M 0.067 +333 I 0.059 +334 T 0.058 +335 C 0.064 +336 I 0.076 +337 N 0.086 +338 G 0.091 +339 I 0.088 +340 W 0.086 +341 T 0.091 +342 E 0.099 +343 L 0.099 +344 P 0.093 +345 M 0.095 +346 C 0.114 +347 V 0.145 +348 A 0.180 +349 T 0.215 +350 H 0.243 +351 Q 0.251 +352 L 0.233 +353 K 0.197 +354 R 0.165 +355 C 0.155 +356 K 0.171 +357 I 0.205 +358 A 0.236 +359 G 0.243 +360 V 0.228 +361 N 0.207 +362 I 0.190 +363 K 0.177 +364 T 0.171 +365 L 0.175 +366 L 0.183 +367 K 0.189 +368 L 0.191 +369 S 0.186 +370 G 0.167 +371 K 0.137 +372 E 0.111 +373 F 0.098 +374 N 0.095 +375 H 0.097 +376 N 0.103 +377 S 0.108 +378 R 0.109 +379 I 0.101 +380 R 0.088 +381 Y 0.078 +382 R 0.080 +383 C 0.088 +384 S 0.092 +385 D 0.089 +386 I 0.085 +387 F 0.087 +388 R 0.097 +389 Y 0.109 +390 R 0.111 +391 H 0.103 +392 S 0.093 +393 V 0.091 +394 C 0.102 +395 I 0.116 +396 N 0.125 +397 G 0.125 +398 K 0.115 +399 W 0.101 +400 N 0.098 +401 P 0.117 +402 E 0.140 +403 V 0.153 +404 D 0.161 +405 C 0.189 +406 T 0.247 +407 E 0.316 +408 K 0.361 +409 R 0.359 +410 E 0.309 +411 Q 0.239 +412 F 0.190 +413 C 0.180 +414 P 0.196 +415 P 0.211 +416 P 0.218 +417 P 0.220 +418 Q 0.221 +419 I 0.214 +420 P 0.195 +421 N 0.173 +422 A 0.171 +423 Q 0.190 +424 N 0.214 +425 M 0.229 +426 T 0.229 +427 T 0.212 +428 T 0.180 +429 V 0.142 +430 N 0.115 +431 Y 0.104 +432 Q 0.105 +433 D 0.110 +434 G 0.116 +435 E 0.121 +436 K 0.122 +437 V 0.116 +438 A 0.104 +439 V 0.094 +440 L 0.096 +441 C 0.111 +442 K 0.130 +443 E 0.139 +444 N 0.132 +445 Y 0.120 +446 L 0.116 +447 L 0.125 +448 P 0.138 +449 E 0.145 +450 A 0.139 +451 K 0.120 +452 E 0.097 +453 I 0.082 +454 V 0.078 +455 C 0.088 +456 K 0.102 +457 D 0.112 +458 G 0.109 +459 R 0.099 +460 W 0.092 +461 Q 0.097 +462 S 0.111 +463 L 0.121 +464 P 0.127 +465 R 0.138 +466 C 0.167 +467 V 0.210 +468 E 0.248 +469 S 0.261 +470 T 0.245 +471 A 0.211 +472 Y 0.184 +473 C 0.184 +474 G 0.206 +475 P 0.226 +476 P 0.231 +477 P 0.226 +478 S 0.214 +479 I 0.197 +480 N 0.177 +481 N 0.160 +482 G 0.156 +483 D 0.165 +484 T 0.181 +485 T 0.203 +486 S 0.229 +487 F 0.240 +488 P 0.221 +489 L 0.180 +490 S 0.138 +491 V 0.115 +492 Y 0.116 +493 P 0.132 +494 P 0.149 +495 G 0.158 +496 S 0.158 +497 T 0.151 +498 V 0.140 +499 T 0.128 +500 Y 0.120 +501 R 0.121 +502 C 0.133 +503 Q 0.150 +504 S 0.160 +505 F 0.164 +506 Y 0.170 +507 K 0.181 +508 L 0.187 +509 Q 0.182 +510 G 0.167 +511 S 0.147 +512 V 0.125 +513 T 0.106 +514 V 0.094 +515 T 0.088 +516 C 0.092 +517 R 0.100 +518 N 0.106 +519 K 0.108 +520 Q 0.108 +521 W 0.115 +522 S 0.136 +523 E 0.161 +524 P 0.176 +525 P 0.172 +526 R 0.161 +527 C 0.153 +528 L 0.145 +529 D 0.126 +530 P 0.107 +531 C 0.102 +532 V 0.109 +533 V 0.115 +534 S 0.114 +535 E 0.116 +536 E 0.126 +537 N 0.138 +538 M 0.149 +539 N 0.161 +540 K 0.174 +541 N 0.179 +542 N 0.174 +543 I 0.161 +544 Q 0.144 +545 L 0.135 +546 K 0.144 +547 W 0.168 +548 R 0.196 +549 N 0.218 +550 D 0.222 +551 G 0.198 +552 K 0.157 +553 L 0.121 +554 Y 0.105 +555 A 0.105 +556 K 0.114 +557 T 0.127 +558 G 0.139 +559 D 0.146 +560 A 0.146 +561 V 0.139 +562 E 0.129 +563 F 0.120 +564 Q 0.114 +565 C 0.108 +566 K 0.101 +567 F 0.094 +568 P 0.094 +569 H 0.106 +570 K 0.128 +571 A 0.151 +572 M 0.167 +573 I 0.176 +574 S 0.179 +575 S 0.176 +576 P 0.164 +577 P 0.142 +578 F 0.118 +579 R 0.104 +580 A 0.101 +581 I 0.101 +582 C 0.105 +583 Q 0.114 +584 E 0.125 +585 G 0.133 +586 K 0.137 +587 F 0.137 +588 E 0.138 +589 Y 0.140 +590 P 0.141 +591 I 0.143 +592 C 0.148 +593 E 0.155 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000135744.9_ENST00000366667.6_GN:AGT_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000135744.9_ENST00000366667.6_GN:AGT_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a8854fd4e63e97d51bfb345d50eb7c82fb79253e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000135744.9_ENST00000366667.6_GN:AGT_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,477 @@ +>ENSG00000135744.9|ENST00000366667.6|GN:AGT|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.356 +2 A 0.383 +3 P 0.426 +4 A 0.465 +5 G 0.471 +6 V 0.429 +7 S 0.353 +8 L 0.278 +9 R 0.229 +10 A 0.207 +11 T 0.197 +12 I 0.186 +13 L 0.175 +14 C 0.170 +15 L 0.174 +16 L 0.183 +17 A 0.206 +18 W 0.250 +19 A 0.309 +20 G 0.368 +21 L 0.415 +22 A 0.442 +23 A 0.433 +24 G 0.385 +25 D 0.321 +26 R 0.264 +27 V 0.222 +28 Y 0.189 +29 I 0.165 +30 H 0.148 +31 P 0.135 +32 F 0.126 +33 H 0.128 +34 L 0.142 +35 V 0.159 +36 I 0.165 +37 H 0.156 +38 N 0.136 +39 E 0.115 +40 S 0.100 +41 T 0.093 +42 C 0.089 +43 E 0.090 +44 Q 0.098 +45 L 0.114 +46 A 0.140 +47 K 0.177 +48 A 0.221 +49 N 0.260 +50 A 0.285 +51 G 0.296 +52 K 0.294 +53 P 0.281 +54 K 0.263 +55 D 0.247 +56 P 0.233 +57 T 0.220 +58 F 0.215 +59 I 0.228 +60 P 0.254 +61 A 0.283 +62 P 0.301 +63 I 0.304 +64 Q 0.295 +65 A 0.288 +66 K 0.284 +67 T 0.284 +68 S 0.285 +69 P 0.279 +70 V 0.252 +71 D 0.203 +72 E 0.154 +73 K 0.126 +74 A 0.117 +75 L 0.115 +76 Q 0.114 +77 D 0.115 +78 Q 0.118 +79 L 0.119 +80 V 0.121 +81 L 0.123 +82 V 0.126 +83 A 0.128 +84 A 0.127 +85 K 0.123 +86 L 0.122 +87 D 0.125 +88 T 0.125 +89 E 0.113 +90 D 0.089 +91 K 0.070 +92 L 0.059 +93 R 0.052 +94 A 0.047 +95 A 0.047 +96 M 0.050 +97 V 0.051 +98 G 0.048 +99 M 0.044 +100 L 0.042 +101 A 0.042 +102 N 0.040 +103 F 0.039 +104 L 0.037 +105 G 0.036 +106 F 0.036 +107 R 0.036 +108 I 0.038 +109 Y 0.044 +110 G 0.053 +111 M 0.066 +112 H 0.077 +113 S 0.079 +114 E 0.077 +115 L 0.078 +116 W 0.088 +117 G 0.106 +118 V 0.123 +119 V 0.134 +120 H 0.134 +121 G 0.125 +122 A 0.116 +123 T 0.110 +124 V 0.103 +125 L 0.094 +126 S 0.083 +127 P 0.073 +128 T 0.065 +129 A 0.059 +130 V 0.054 +131 F 0.050 +132 G 0.050 +133 T 0.051 +134 L 0.053 +135 A 0.058 +136 S 0.062 +137 L 0.063 +138 Y 0.062 +139 L 0.064 +140 G 0.070 +141 A 0.075 +142 L 0.076 +143 D 0.074 +144 H 0.075 +145 T 0.080 +146 A 0.087 +147 D 0.090 +148 R 0.083 +149 L 0.071 +150 Q 0.057 +151 A 0.046 +152 I 0.043 +153 L 0.055 +154 G 0.083 +155 V 0.117 +156 P 0.142 +157 W 0.151 +158 K 0.149 +159 D 0.147 +160 K 0.150 +161 N 0.155 +162 C 0.163 +163 T 0.173 +164 S 0.182 +165 R 0.177 +166 L 0.151 +167 D 0.115 +168 A 0.083 +169 H 0.063 +170 K 0.053 +171 V 0.051 +172 L 0.051 +173 S 0.046 +174 A 0.038 +175 L 0.031 +176 Q 0.028 +177 A 0.029 +178 V 0.032 +179 Q 0.037 +180 G 0.043 +181 L 0.049 +182 L 0.060 +183 V 0.084 +184 A 0.116 +185 Q 0.152 +186 G 0.188 +187 R 0.219 +188 A 0.236 +189 D 0.237 +190 S 0.225 +191 Q 0.208 +192 A 0.187 +193 Q 0.158 +194 L 0.122 +195 L 0.086 +196 L 0.057 +197 S 0.038 +198 T 0.029 +199 V 0.025 +200 V 0.023 +201 G 0.024 +202 V 0.026 +203 F 0.035 +204 T 0.052 +205 A 0.073 +206 P 0.088 +207 G 0.094 +208 L 0.093 +209 H 0.087 +210 L 0.077 +211 K 0.062 +212 Q 0.048 +213 P 0.038 +214 F 0.034 +215 V 0.034 +216 Q 0.034 +217 G 0.034 +218 L 0.033 +219 A 0.031 +220 L 0.029 +221 Y 0.028 +222 T 0.030 +223 P 0.036 +224 V 0.044 +225 V 0.052 +226 L 0.057 +227 P 0.056 +228 R 0.050 +229 S 0.044 +230 L 0.040 +231 D 0.040 +232 F 0.043 +233 T 0.045 +234 E 0.044 +235 L 0.043 +236 D 0.041 +237 V 0.040 +238 A 0.041 +239 A 0.043 +240 E 0.044 +241 K 0.046 +242 I 0.052 +243 D 0.062 +244 R 0.066 +245 F 0.057 +246 M 0.043 +247 Q 0.035 +248 A 0.036 +249 V 0.043 +250 T 0.055 +251 G 0.074 +252 W 0.105 +253 K 0.144 +254 T 0.182 +255 G 0.204 +256 C 0.212 +257 S 0.212 +258 L 0.210 +259 M 0.212 +260 G 0.218 +261 A 0.216 +262 S 0.200 +263 V 0.172 +264 D 0.141 +265 S 0.114 +266 T 0.093 +267 L 0.079 +268 A 0.070 +269 F 0.066 +270 N 0.069 +271 T 0.078 +272 Y 0.089 +273 V 0.096 +274 H 0.096 +275 F 0.090 +276 Q 0.085 +277 G 0.084 +278 K 0.088 +279 M 0.096 +280 K 0.111 +281 G 0.136 +282 F 0.163 +283 S 0.178 +284 L 0.170 +285 L 0.149 +286 A 0.127 +287 E 0.105 +288 P 0.083 +289 Q 0.068 +290 E 0.060 +291 F 0.058 +292 W 0.058 +293 V 0.060 +294 D 0.064 +295 N 0.067 +296 S 0.072 +297 T 0.079 +298 S 0.089 +299 V 0.095 +300 S 0.095 +301 V 0.088 +302 P 0.079 +303 M 0.073 +304 L 0.073 +305 S 0.076 +306 G 0.078 +307 M 0.077 +308 G 0.069 +309 T 0.055 +310 F 0.039 +311 Q 0.028 +312 H 0.023 +313 W 0.023 +314 S 0.029 +315 D 0.036 +316 I 0.042 +317 Q 0.044 +318 D 0.043 +319 N 0.037 +320 F 0.030 +321 S 0.025 +322 V 0.025 +323 T 0.028 +324 Q 0.032 +325 V 0.032 +326 P 0.030 +327 F 0.028 +328 T 0.030 +329 E 0.033 +330 S 0.034 +331 A 0.034 +332 C 0.034 +333 L 0.038 +334 L 0.045 +335 L 0.052 +336 I 0.060 +337 Q 0.067 +338 P 0.072 +339 H 0.070 +340 Y 0.064 +341 A 0.059 +342 S 0.057 +343 D 0.056 +344 L 0.056 +345 D 0.057 +346 K 0.056 +347 V 0.054 +348 E 0.055 +349 G 0.060 +350 L 0.068 +351 T 0.074 +352 F 0.077 +353 Q 0.075 +354 Q 0.070 +355 N 0.062 +356 S 0.055 +357 L 0.053 +358 N 0.055 +359 W 0.057 +360 M 0.057 +361 K 0.056 +362 K 0.060 +363 L 0.068 +364 S 0.075 +365 P 0.075 +366 R 0.072 +367 T 0.072 +368 I 0.073 +369 H 0.072 +370 L 0.073 +371 T 0.078 +372 M 0.089 +373 P 0.101 +374 Q 0.108 +375 L 0.111 +376 V 0.115 +377 L 0.121 +378 Q 0.126 +379 G 0.120 +380 S 0.103 +381 Y 0.083 +382 D 0.073 +383 L 0.074 +384 Q 0.078 +385 D 0.078 +386 L 0.069 +387 L 0.058 +388 A 0.052 +389 Q 0.051 +390 A 0.054 +391 E 0.065 +392 L 0.081 +393 P 0.097 +394 A 0.110 +395 I 0.119 +396 L 0.127 +397 H 0.135 +398 T 0.139 +399 E 0.129 +400 L 0.107 +401 N 0.087 +402 L 0.074 +403 Q 0.068 +404 K 0.063 +405 L 0.063 +406 S 0.072 +407 N 0.093 +408 D 0.116 +409 R 0.128 +410 I 0.123 +411 R 0.110 +412 V 0.102 +413 G 0.103 +414 E 0.108 +415 V 0.114 +416 L 0.121 +417 N 0.130 +418 S 0.139 +419 I 0.145 +420 F 0.148 +421 F 0.155 +422 E 0.176 +423 L 0.210 +424 E 0.254 +425 A 0.298 +426 D 0.337 +427 E 0.371 +428 R 0.408 +429 E 0.456 +430 P 0.511 +431 T 0.558 +432 E 0.588 +433 S 0.596 +434 T 0.586 +435 Q 0.567 +436 Q 0.549 +437 L 0.526 +438 N 0.493 +439 K 0.449 +440 P 0.393 +441 E 0.328 +442 V 0.265 +443 L 0.214 +444 E 0.180 +445 V 0.155 +446 T 0.132 +447 L 0.108 +448 N 0.087 +449 R 0.069 +450 P 0.057 +451 F 0.050 +452 L 0.048 +453 F 0.049 +454 A 0.050 +455 V 0.050 +456 Y 0.050 +457 D 0.051 +458 Q 0.058 +459 S 0.066 +460 A 0.071 +461 T 0.069 +462 A 0.065 +463 L 0.063 +464 H 0.062 +465 F 0.063 +466 L 0.062 +467 G 0.061 +468 R 0.064 +469 V 0.074 +470 A 0.090 +471 N 0.109 +472 P 0.134 +473 L 0.165 +474 S 0.206 +475 T 0.248 +476 A 0.276 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000135744.9_ENST00000366667.6_GN:AGT_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:9.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000135744.9_ENST00000366667.6_GN:AGT_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:9.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..44cb1727ab11a1de93e1eb7a35082d370e14a600 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000135744.9_ENST00000366667.6_GN:AGT_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:9.caid @@ -0,0 +1,486 @@ +>ENSG00000135744.9|ENST00000366667.6|GN:AGT|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:9 +1 M 0.334 +2 R 0.328 +3 K 0.337 +4 R 0.370 +5 A 0.401 +6 P 0.410 +7 Q 0.424 +8 S 0.463 +9 E 0.502 +10 M 0.524 +11 A 0.549 +12 P 0.584 +13 A 0.606 +14 G 0.585 +15 V 0.515 +16 S 0.413 +17 L 0.312 +18 R 0.246 +19 A 0.221 +20 T 0.214 +21 I 0.201 +22 L 0.188 +23 C 0.183 +24 L 0.185 +25 L 0.192 +26 A 0.212 +27 W 0.251 +28 A 0.303 +29 G 0.356 +30 L 0.404 +31 A 0.433 +32 A 0.421 +33 G 0.369 +34 D 0.305 +35 R 0.251 +36 V 0.212 +37 Y 0.181 +38 I 0.158 +39 H 0.143 +40 P 0.132 +41 F 0.125 +42 H 0.129 +43 L 0.144 +44 V 0.162 +45 I 0.170 +46 H 0.163 +47 N 0.144 +48 E 0.124 +49 S 0.109 +50 T 0.099 +51 C 0.095 +52 E 0.095 +53 Q 0.102 +54 L 0.116 +55 A 0.138 +56 K 0.173 +57 A 0.220 +58 N 0.263 +59 A 0.291 +60 G 0.302 +61 K 0.298 +62 P 0.284 +63 K 0.265 +64 D 0.247 +65 P 0.232 +66 T 0.218 +67 F 0.213 +68 I 0.226 +69 P 0.253 +70 A 0.283 +71 P 0.302 +72 I 0.304 +73 Q 0.294 +74 A 0.285 +75 K 0.281 +76 T 0.282 +77 S 0.284 +78 P 0.278 +79 V 0.251 +80 D 0.201 +81 E 0.152 +82 K 0.123 +83 A 0.114 +84 L 0.112 +85 Q 0.111 +86 D 0.112 +87 Q 0.115 +88 L 0.116 +89 V 0.117 +90 L 0.120 +91 V 0.123 +92 A 0.125 +93 A 0.124 +94 K 0.120 +95 L 0.118 +96 D 0.119 +97 T 0.119 +98 E 0.106 +99 D 0.084 +100 K 0.066 +101 L 0.056 +102 R 0.050 +103 A 0.046 +104 A 0.046 +105 M 0.048 +106 V 0.049 +107 G 0.047 +108 M 0.043 +109 L 0.041 +110 A 0.041 +111 N 0.039 +112 F 0.037 +113 L 0.036 +114 G 0.035 +115 F 0.035 +116 R 0.035 +117 I 0.037 +118 Y 0.043 +119 G 0.053 +120 M 0.065 +121 H 0.076 +122 S 0.080 +123 E 0.078 +124 L 0.081 +125 W 0.092 +126 G 0.111 +127 V 0.128 +128 V 0.139 +129 H 0.138 +130 G 0.128 +131 A 0.118 +132 T 0.112 +133 V 0.105 +134 L 0.096 +135 S 0.084 +136 P 0.074 +137 T 0.065 +138 A 0.059 +139 V 0.053 +140 F 0.050 +141 G 0.049 +142 T 0.049 +143 L 0.052 +144 A 0.056 +145 S 0.061 +146 L 0.062 +147 Y 0.061 +148 L 0.063 +149 G 0.070 +150 A 0.076 +151 L 0.077 +152 D 0.075 +153 H 0.076 +154 T 0.081 +155 A 0.087 +156 D 0.090 +157 R 0.083 +158 L 0.071 +159 Q 0.057 +160 A 0.046 +161 I 0.043 +162 L 0.054 +163 G 0.082 +164 V 0.116 +165 P 0.140 +166 W 0.148 +167 K 0.146 +168 D 0.144 +169 K 0.147 +170 N 0.153 +171 C 0.160 +172 T 0.170 +173 S 0.179 +174 R 0.174 +175 L 0.148 +176 D 0.113 +177 A 0.081 +178 H 0.061 +179 K 0.052 +180 V 0.050 +181 L 0.049 +182 S 0.045 +183 A 0.038 +184 L 0.030 +185 Q 0.028 +186 A 0.029 +187 V 0.032 +188 Q 0.037 +189 G 0.042 +190 L 0.047 +191 L 0.058 +192 V 0.080 +193 A 0.111 +194 Q 0.145 +195 G 0.180 +196 R 0.210 +197 A 0.227 +198 D 0.228 +199 S 0.218 +200 Q 0.202 +201 A 0.182 +202 Q 0.152 +203 L 0.116 +204 L 0.081 +205 L 0.054 +206 S 0.036 +207 T 0.028 +208 V 0.024 +209 V 0.022 +210 G 0.023 +211 V 0.026 +212 F 0.034 +213 T 0.050 +214 A 0.071 +215 P 0.085 +216 G 0.091 +217 L 0.090 +218 H 0.085 +219 L 0.075 +220 K 0.060 +221 Q 0.046 +222 P 0.037 +223 F 0.033 +224 V 0.032 +225 Q 0.032 +226 G 0.032 +227 L 0.031 +228 A 0.029 +229 L 0.027 +230 Y 0.026 +231 T 0.028 +232 P 0.033 +233 V 0.042 +234 V 0.050 +235 L 0.056 +236 P 0.055 +237 R 0.050 +238 S 0.043 +239 L 0.039 +240 D 0.039 +241 F 0.042 +242 T 0.044 +243 E 0.043 +244 L 0.042 +245 D 0.040 +246 V 0.038 +247 A 0.038 +248 A 0.038 +249 E 0.038 +250 K 0.041 +251 I 0.049 +252 D 0.060 +253 R 0.064 +254 F 0.055 +255 M 0.042 +256 Q 0.034 +257 A 0.034 +258 V 0.041 +259 T 0.054 +260 G 0.073 +261 W 0.104 +262 K 0.144 +263 T 0.181 +264 G 0.204 +265 C 0.212 +266 S 0.212 +267 L 0.210 +268 M 0.213 +269 G 0.217 +270 A 0.214 +271 S 0.198 +272 V 0.171 +273 D 0.141 +274 S 0.115 +275 T 0.094 +276 L 0.080 +277 A 0.071 +278 F 0.066 +279 N 0.069 +280 T 0.079 +281 Y 0.089 +282 V 0.096 +283 H 0.096 +284 F 0.090 +285 Q 0.085 +286 G 0.085 +287 K 0.089 +288 M 0.097 +289 K 0.113 +290 G 0.139 +291 F 0.168 +292 S 0.183 +293 L 0.175 +294 L 0.154 +295 A 0.131 +296 E 0.108 +297 P 0.086 +298 Q 0.070 +299 E 0.062 +300 F 0.059 +301 W 0.060 +302 V 0.062 +303 D 0.066 +304 N 0.070 +305 S 0.074 +306 T 0.082 +307 S 0.091 +308 V 0.098 +309 S 0.098 +310 V 0.090 +311 P 0.081 +312 M 0.075 +313 L 0.074 +314 S 0.077 +315 G 0.079 +316 M 0.078 +317 G 0.070 +318 T 0.055 +319 F 0.039 +320 Q 0.028 +321 H 0.023 +322 W 0.023 +323 S 0.029 +324 D 0.036 +325 I 0.042 +326 Q 0.044 +327 D 0.042 +328 N 0.036 +329 F 0.029 +330 S 0.024 +331 V 0.024 +332 T 0.028 +333 Q 0.031 +334 V 0.032 +335 P 0.030 +336 F 0.028 +337 T 0.029 +338 E 0.031 +339 S 0.033 +340 A 0.033 +341 C 0.034 +342 L 0.038 +343 L 0.044 +344 L 0.052 +345 I 0.059 +346 Q 0.066 +347 P 0.070 +348 H 0.069 +349 Y 0.063 +350 A 0.058 +351 S 0.056 +352 D 0.055 +353 L 0.055 +354 D 0.056 +355 K 0.055 +356 V 0.054 +357 E 0.054 +358 G 0.059 +359 L 0.066 +360 T 0.072 +361 F 0.075 +362 Q 0.073 +363 Q 0.068 +364 N 0.060 +365 S 0.054 +366 L 0.051 +367 N 0.053 +368 W 0.056 +369 M 0.056 +370 K 0.055 +371 K 0.060 +372 L 0.068 +373 S 0.074 +374 P 0.074 +375 R 0.072 +376 T 0.072 +377 I 0.072 +378 H 0.072 +379 L 0.072 +380 T 0.077 +381 M 0.089 +382 P 0.101 +383 Q 0.108 +384 L 0.111 +385 V 0.115 +386 L 0.121 +387 Q 0.126 +388 G 0.120 +389 S 0.102 +390 Y 0.082 +391 D 0.070 +392 L 0.064 +393 Q 0.060 +394 D 0.055 +395 L 0.050 +396 L 0.048 +397 A 0.048 +398 Q 0.049 +399 A 0.053 +400 E 0.064 +401 L 0.080 +402 P 0.095 +403 A 0.108 +404 I 0.117 +405 L 0.124 +406 H 0.132 +407 T 0.136 +408 E 0.127 +409 L 0.106 +410 N 0.086 +411 L 0.073 +412 Q 0.066 +413 K 0.062 +414 L 0.061 +415 S 0.071 +416 N 0.092 +417 D 0.116 +418 R 0.128 +419 I 0.123 +420 R 0.110 +421 V 0.102 +422 G 0.103 +423 E 0.108 +424 V 0.114 +425 L 0.121 +426 N 0.130 +427 S 0.139 +428 I 0.145 +429 F 0.148 +430 F 0.156 +431 E 0.177 +432 L 0.211 +433 E 0.254 +434 A 0.298 +435 D 0.336 +436 E 0.370 +437 R 0.407 +438 E 0.455 +439 P 0.509 +440 T 0.557 +441 E 0.587 +442 S 0.595 +443 T 0.584 +444 Q 0.565 +445 Q 0.547 +446 L 0.524 +447 N 0.492 +448 K 0.449 +449 P 0.394 +450 E 0.329 +451 V 0.266 +452 L 0.215 +453 E 0.181 +454 V 0.156 +455 T 0.133 +456 L 0.109 +457 N 0.088 +458 R 0.070 +459 P 0.058 +460 F 0.051 +461 L 0.048 +462 F 0.049 +463 A 0.050 +464 V 0.050 +465 Y 0.050 +466 D 0.051 +467 Q 0.057 +468 S 0.065 +469 A 0.069 +470 T 0.068 +471 A 0.065 +472 L 0.063 +473 H 0.062 +474 F 0.062 +475 L 0.062 +476 G 0.061 +477 R 0.064 +478 V 0.074 +479 A 0.090 +480 N 0.110 +481 P 0.134 +482 L 0.167 +483 S 0.208 +484 T 0.252 +485 A 0.282 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000138085.19_ENST00000380171.9_GN:ATRAID_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000138085.19_ENST00000380171.9_GN:ATRAID_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0a4ddaa838a3acfc2089130c6fb6fc0effda0b4c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000138085.19_ENST00000380171.9_GN:ATRAID_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,230 @@ +>ENSG00000138085.19|ENST00000380171.9|GN:ATRAID|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.407 +2 A 0.438 +3 P 0.486 +4 H 0.540 +5 D 0.593 +6 P 0.635 +7 G 0.662 +8 S 0.667 +9 L 0.645 +10 T 0.604 +11 T 0.572 +12 L 0.561 +13 V 0.549 +14 P 0.519 +15 W 0.484 +16 A 0.452 +17 A 0.414 +18 A 0.380 +19 L 0.370 +20 L 0.376 +21 L 0.385 +22 A 0.401 +23 L 0.436 +24 G 0.477 +25 V 0.506 +26 E 0.515 +27 R 0.503 +28 A 0.468 +29 L 0.410 +30 A 0.333 +31 L 0.249 +32 P 0.170 +33 E 0.106 +34 I 0.067 +35 C 0.048 +36 T 0.043 +37 Q 0.049 +38 C 0.062 +39 P 0.076 +40 G 0.086 +41 S 0.091 +42 V 0.091 +43 Q 0.086 +44 N 0.081 +45 L 0.077 +46 S 0.074 +47 K 0.074 +48 V 0.074 +49 A 0.070 +50 F 0.066 +51 Y 0.064 +52 C 0.065 +53 K 0.071 +54 T 0.082 +55 T 0.097 +56 R 0.113 +57 E 0.132 +58 L 0.149 +59 M 0.151 +60 L 0.134 +61 H 0.107 +62 A 0.081 +63 R 0.063 +64 C 0.054 +65 C 0.055 +66 L 0.061 +67 N 0.071 +68 Q 0.084 +69 K 0.098 +70 G 0.105 +71 T 0.102 +72 I 0.093 +73 L 0.084 +74 G 0.081 +75 L 0.087 +76 D 0.105 +77 L 0.126 +78 Q 0.137 +79 N 0.129 +80 C 0.107 +81 S 0.087 +82 L 0.081 +83 E 0.090 +84 D 0.106 +85 P 0.120 +86 G 0.127 +87 P 0.123 +88 N 0.108 +89 F 0.088 +90 H 0.070 +91 Q 0.059 +92 A 0.056 +93 H 0.061 +94 T 0.072 +95 T 0.087 +96 V 0.103 +97 I 0.116 +98 I 0.126 +99 D 0.132 +100 L 0.132 +101 Q 0.128 +102 A 0.121 +103 N 0.110 +104 P 0.098 +105 L 0.093 +106 K 0.100 +107 G 0.110 +108 D 0.114 +109 L 0.110 +110 A 0.101 +111 N 0.085 +112 T 0.070 +113 F 0.061 +114 R 0.060 +115 G 0.063 +116 F 0.070 +117 T 0.077 +118 Q 0.080 +119 L 0.081 +120 Q 0.086 +121 T 0.095 +122 L 0.099 +123 I 0.093 +124 L 0.079 +125 P 0.066 +126 Q 0.061 +127 H 0.062 +128 V 0.067 +129 N 0.074 +130 C 0.084 +131 P 0.099 +132 G 0.113 +133 G 0.117 +134 I 0.107 +135 N 0.094 +136 A 0.088 +137 W 0.089 +138 N 0.091 +139 T 0.091 +140 I 0.090 +141 T 0.089 +142 S 0.088 +143 Y 0.090 +144 I 0.093 +145 D 0.096 +146 N 0.094 +147 Q 0.089 +148 I 0.086 +149 C 0.095 +150 Q 0.115 +151 G 0.136 +152 Q 0.148 +153 K 0.146 +154 N 0.141 +155 L 0.151 +156 C 0.183 +157 N 0.224 +158 N 0.258 +159 T 0.276 +160 G 0.285 +161 D 0.286 +162 P 0.274 +163 E 0.248 +164 M 0.215 +165 C 0.189 +166 P 0.170 +167 E 0.156 +168 N 0.146 +169 G 0.147 +170 S 0.164 +171 C 0.187 +172 V 0.198 +173 P 0.189 +174 D 0.170 +175 G 0.158 +176 P 0.160 +177 G 0.168 +178 L 0.164 +179 L 0.145 +180 Q 0.126 +181 C 0.121 +182 V 0.133 +183 C 0.156 +184 A 0.176 +185 D 0.182 +186 G 0.177 +187 F 0.165 +188 H 0.153 +189 G 0.148 +190 Y 0.152 +191 K 0.164 +192 C 0.190 +193 M 0.252 +194 R 0.356 +195 Q 0.463 +196 G 0.513 +197 S 0.481 +198 F 0.395 +199 S 0.297 +200 L 0.215 +201 L 0.163 +202 M 0.142 +203 F 0.137 +204 F 0.142 +205 G 0.157 +206 I 0.179 +207 L 0.195 +208 G 0.195 +209 A 0.184 +210 T 0.172 +211 T 0.162 +212 L 0.156 +213 S 0.152 +214 V 0.146 +215 S 0.134 +216 I 0.117 +217 L 0.099 +218 L 0.085 +219 W 0.079 +220 A 0.080 +221 T 0.091 +222 Q 0.115 +223 R 0.152 +224 R 0.201 +225 K 0.259 +226 A 0.318 +227 K 0.363 +228 T 0.384 +229 S 0.386 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000138085.19_ENST00000380171.9_GN:ATRAID_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:55.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000138085.19_ENST00000380171.9_GN:ATRAID_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:55.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b3104431879032fea95d0de754eb03877831d746 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000138085.19_ENST00000380171.9_GN:ATRAID_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:55.caid @@ -0,0 +1,285 @@ +>ENSG00000138085.19|ENST00000380171.9|GN:ATRAID|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:55 +1 M 0.391 +2 K 0.411 +3 T 0.450 +4 S 0.493 +5 A 0.518 +6 E 0.526 +7 L 0.529 +8 H 0.521 +9 E 0.491 +10 Q 0.460 +11 E 0.460 +12 K 0.491 +13 P 0.534 +14 P 0.582 +15 S 0.628 +16 S 0.666 +17 P 0.695 +18 R 0.712 +19 A 0.718 +20 T 0.719 +21 G 0.722 +22 P 0.731 +23 G 0.738 +24 R 0.728 +25 L 0.687 +26 G 0.629 +27 H 0.600 +28 A 0.632 +29 R 0.691 +30 G 0.731 +31 R 0.747 +32 G 0.750 +33 P 0.748 +34 D 0.735 +35 A 0.697 +36 L 0.639 +37 R 0.610 +38 G 0.632 +39 G 0.654 +40 A 0.632 +41 A 0.604 +42 G 0.617 +43 P 0.638 +44 G 0.624 +45 R 0.596 +46 A 0.585 +47 S 0.578 +48 S 0.579 +49 G 0.604 +50 A 0.621 +51 P 0.605 +52 R 0.595 +53 E 0.630 +54 R 0.682 +55 K 0.715 +56 M 0.730 +57 A 0.739 +58 P 0.744 +59 H 0.749 +60 D 0.759 +61 P 0.774 +62 G 0.787 +63 S 0.792 +64 L 0.789 +65 T 0.776 +66 T 0.755 +67 L 0.724 +68 V 0.683 +69 P 0.639 +70 W 0.599 +71 A 0.561 +72 A 0.516 +73 A 0.481 +74 L 0.483 +75 L 0.507 +76 L 0.525 +77 A 0.537 +78 L 0.553 +79 G 0.575 +80 V 0.590 +81 E 0.583 +82 R 0.553 +83 A 0.501 +84 L 0.427 +85 A 0.340 +86 L 0.253 +87 P 0.174 +88 E 0.111 +89 I 0.069 +90 C 0.048 +91 T 0.041 +92 Q 0.045 +93 C 0.056 +94 P 0.067 +95 G 0.076 +96 S 0.080 +97 V 0.079 +98 Q 0.074 +99 N 0.068 +100 L 0.064 +101 S 0.061 +102 K 0.060 +103 V 0.061 +104 A 0.057 +105 F 0.051 +106 Y 0.048 +107 C 0.047 +108 K 0.051 +109 T 0.061 +110 T 0.075 +111 R 0.092 +112 E 0.111 +113 L 0.127 +114 M 0.130 +115 L 0.117 +116 H 0.096 +117 A 0.074 +118 R 0.058 +119 C 0.050 +120 C 0.049 +121 L 0.052 +122 N 0.059 +123 Q 0.072 +124 K 0.086 +125 G 0.096 +126 T 0.097 +127 I 0.092 +128 L 0.086 +129 G 0.083 +130 L 0.089 +131 D 0.105 +132 L 0.125 +133 Q 0.134 +134 N 0.127 +135 C 0.109 +136 S 0.091 +137 L 0.086 +138 E 0.096 +139 D 0.111 +140 P 0.123 +141 G 0.128 +142 P 0.123 +143 N 0.107 +144 F 0.088 +145 H 0.071 +146 Q 0.061 +147 A 0.059 +148 H 0.065 +149 T 0.076 +150 T 0.090 +151 V 0.106 +152 I 0.121 +153 I 0.134 +154 D 0.141 +155 L 0.141 +156 Q 0.135 +157 A 0.127 +158 N 0.119 +159 P 0.113 +160 L 0.113 +161 K 0.123 +162 G 0.133 +163 D 0.132 +164 L 0.122 +165 A 0.108 +166 N 0.092 +167 T 0.077 +168 F 0.067 +169 R 0.066 +170 G 0.069 +171 F 0.076 +172 T 0.083 +173 Q 0.085 +174 L 0.084 +175 Q 0.087 +176 T 0.096 +177 L 0.102 +178 I 0.096 +179 L 0.081 +180 P 0.068 +181 Q 0.062 +182 H 0.064 +183 V 0.069 +184 N 0.074 +185 C 0.082 +186 P 0.096 +187 G 0.109 +188 G 0.111 +189 I 0.100 +190 N 0.085 +191 A 0.078 +192 W 0.079 +193 N 0.084 +194 T 0.086 +195 I 0.086 +196 T 0.084 +197 S 0.082 +198 Y 0.083 +199 I 0.087 +200 D 0.090 +201 N 0.089 +202 Q 0.083 +203 I 0.080 +204 C 0.088 +205 Q 0.107 +206 G 0.127 +207 Q 0.139 +208 K 0.137 +209 N 0.133 +210 L 0.142 +211 C 0.171 +212 N 0.210 +213 N 0.242 +214 T 0.261 +215 G 0.270 +216 D 0.271 +217 P 0.257 +218 E 0.229 +219 M 0.195 +220 C 0.170 +221 P 0.154 +222 E 0.144 +223 N 0.137 +224 G 0.140 +225 S 0.160 +226 C 0.185 +227 V 0.196 +228 P 0.186 +229 D 0.166 +230 G 0.155 +231 P 0.158 +232 G 0.166 +233 L 0.161 +234 L 0.141 +235 Q 0.121 +236 C 0.116 +237 V 0.129 +238 C 0.152 +239 A 0.173 +240 D 0.180 +241 G 0.174 +242 F 0.162 +243 H 0.151 +244 G 0.147 +245 Y 0.152 +246 K 0.165 +247 C 0.191 +248 M 0.251 +249 R 0.353 +250 Q 0.462 +251 G 0.516 +252 S 0.487 +253 F 0.402 +254 S 0.302 +255 L 0.219 +256 L 0.167 +257 M 0.146 +258 F 0.142 +259 F 0.147 +260 G 0.162 +261 I 0.186 +262 L 0.208 +263 G 0.215 +264 A 0.209 +265 T 0.195 +266 T 0.181 +267 L 0.171 +268 S 0.164 +269 V 0.156 +270 S 0.143 +271 I 0.126 +272 L 0.108 +273 L 0.095 +274 W 0.087 +275 A 0.087 +276 T 0.097 +277 Q 0.121 +278 R 0.159 +279 R 0.208 +280 K 0.267 +281 A 0.331 +282 K 0.382 +283 T 0.407 +284 S 0.412 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000139132.16_ENST00000534526.7_GN:FGD4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000139132.16_ENST00000534526.7_GN:FGD4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0010c4846577b05d600cc49b6f05cc88ac951224 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000139132.16_ENST00000534526.7_GN:FGD4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,904 @@ +>ENSG00000139132.16|ENST00000534526.7|GN:FGD4|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.399 +2 S 0.432 +3 D 0.486 +4 E 0.543 +5 G 0.588 +6 G 0.607 +7 S 0.602 +8 N 0.576 +9 F 0.542 +10 R 0.525 +11 R 0.538 +12 V 0.562 +13 A 0.570 +14 I 0.560 +15 R 0.548 +16 R 0.538 +17 K 0.536 +18 S 0.554 +19 N 0.595 +20 P 0.627 +21 S 0.629 +22 Y 0.613 +23 L 0.607 +24 P 0.624 +25 P 0.655 +26 G 0.679 +27 V 0.685 +28 P 0.678 +29 R 0.667 +30 P 0.657 +31 W 0.654 +32 S 0.661 +33 R 0.681 +34 P 0.707 +35 A 0.730 +36 S 0.742 +37 H 0.751 +38 L 0.767 +39 G 0.784 +40 R 0.791 +41 V 0.776 +42 G 0.727 +43 T 0.656 +44 A 0.614 +45 A 0.635 +46 F 0.692 +47 K 0.740 +48 G 0.761 +49 Q 0.761 +50 V 0.754 +51 P 0.755 +52 S 0.770 +53 G 0.788 +54 A 0.798 +55 T 0.798 +56 G 0.795 +57 S 0.787 +58 S 0.776 +59 T 0.767 +60 C 0.767 +61 P 0.774 +62 K 0.783 +63 I 0.787 +64 A 0.779 +65 L 0.762 +66 V 0.748 +67 P 0.749 +68 P 0.765 +69 C 0.785 +70 S 0.801 +71 T 0.809 +72 S 0.813 +73 S 0.814 +74 T 0.815 +75 T 0.816 +76 T 0.817 +77 L 0.819 +78 V 0.821 +79 G 0.823 +80 E 0.825 +81 N 0.826 +82 V 0.824 +83 S 0.820 +84 E 0.815 +85 E 0.813 +86 E 0.808 +87 A 0.803 +88 Q 0.801 +89 G 0.805 +90 I 0.810 +91 N 0.810 +92 G 0.800 +93 N 0.784 +94 R 0.773 +95 P 0.770 +96 A 0.775 +97 K 0.780 +98 H 0.781 +99 S 0.777 +100 A 0.769 +101 A 0.758 +102 S 0.747 +103 P 0.741 +104 K 0.743 +105 P 0.744 +106 Q 0.737 +107 V 0.725 +108 P 0.717 +109 P 0.719 +110 K 0.718 +111 P 0.691 +112 L 0.643 +113 H 0.622 +114 L 0.661 +115 Q 0.723 +116 N 0.761 +117 S 0.774 +118 P 0.781 +119 S 0.789 +120 S 0.794 +121 N 0.791 +122 I 0.780 +123 H 0.762 +124 Q 0.744 +125 T 0.736 +126 P 0.740 +127 R 0.753 +128 H 0.766 +129 K 0.772 +130 A 0.770 +131 L 0.766 +132 P 0.768 +133 S 0.774 +134 A 0.778 +135 K 0.782 +136 P 0.785 +137 R 0.775 +138 M 0.731 +139 E 0.660 +140 E 0.615 +141 I 0.635 +142 K 0.697 +143 P 0.752 +144 A 0.785 +145 S 0.799 +146 A 0.799 +147 S 0.794 +148 C 0.786 +149 V 0.774 +150 S 0.759 +151 K 0.745 +152 E 0.734 +153 K 0.728 +154 P 0.722 +155 S 0.710 +156 K 0.685 +157 V 0.656 +158 S 0.634 +159 D 0.607 +160 L 0.563 +161 I 0.522 +162 S 0.516 +163 R 0.552 +164 F 0.614 +165 E 0.678 +166 G 0.728 +167 G 0.754 +168 S 0.758 +169 S 0.747 +170 L 0.734 +171 S 0.726 +172 N 0.721 +173 Y 0.715 +174 S 0.715 +175 D 0.724 +176 L 0.737 +177 K 0.751 +178 K 0.768 +179 E 0.785 +180 S 0.796 +181 A 0.798 +182 V 0.795 +183 N 0.789 +184 L 0.778 +185 N 0.765 +186 A 0.757 +187 P 0.756 +188 R 0.759 +189 T 0.768 +190 P 0.784 +191 G 0.800 +192 R 0.809 +193 H 0.808 +194 G 0.799 +195 L 0.783 +196 T 0.760 +197 T 0.736 +198 T 0.719 +199 P 0.708 +200 Q 0.681 +201 Q 0.635 +202 K 0.607 +203 L 0.623 +204 L 0.639 +205 S 0.614 +206 Q 0.588 +207 H 0.617 +208 L 0.686 +209 P 0.749 +210 Q 0.789 +211 R 0.810 +212 Q 0.819 +213 G 0.822 +214 N 0.821 +215 D 0.816 +216 T 0.809 +217 D 0.806 +218 K 0.805 +219 T 0.806 +220 Q 0.802 +221 G 0.783 +222 A 0.734 +223 Q 0.665 +224 T 0.627 +225 C 0.652 +226 V 0.707 +227 A 0.743 +228 N 0.751 +229 G 0.740 +230 V 0.721 +231 M 0.707 +232 A 0.704 +233 A 0.709 +234 Q 0.718 +235 N 0.729 +236 Q 0.738 +237 M 0.746 +238 E 0.752 +239 C 0.753 +240 E 0.749 +241 E 0.744 +242 E 0.743 +243 K 0.742 +244 A 0.740 +245 A 0.736 +246 T 0.734 +247 L 0.737 +248 S 0.745 +249 S 0.751 +250 D 0.755 +251 T 0.758 +252 S 0.760 +253 I 0.758 +254 Q 0.750 +255 A 0.738 +256 S 0.723 +257 E 0.702 +258 P 0.665 +259 L 0.617 +260 L 0.595 +261 D 0.624 +262 T 0.672 +263 H 0.703 +264 I 0.721 +265 V 0.741 +266 N 0.759 +267 G 0.773 +268 E 0.782 +269 R 0.789 +270 D 0.792 +271 E 0.792 +272 T 0.788 +273 A 0.781 +274 T 0.774 +275 A 0.770 +276 P 0.768 +277 A 0.768 +278 S 0.772 +279 P 0.783 +280 T 0.798 +281 T 0.810 +282 D 0.816 +283 S 0.819 +284 C 0.823 +285 D 0.827 +286 G 0.828 +287 N 0.824 +288 A 0.815 +289 S 0.801 +290 D 0.785 +291 S 0.767 +292 S 0.745 +293 Y 0.727 +294 R 0.720 +295 T 0.726 +296 P 0.734 +297 G 0.739 +298 I 0.742 +299 G 0.746 +300 P 0.750 +301 V 0.755 +302 L 0.766 +303 P 0.778 +304 L 0.789 +305 E 0.797 +306 E 0.804 +307 R 0.806 +308 G 0.803 +309 A 0.793 +310 E 0.778 +311 T 0.762 +312 E 0.749 +313 T 0.742 +314 K 0.739 +315 V 0.737 +316 Q 0.733 +317 E 0.730 +318 R 0.727 +319 E 0.722 +320 N 0.707 +321 G 0.683 +322 E 0.662 +323 S 0.657 +324 P 0.669 +325 L 0.687 +326 E 0.699 +327 L 0.702 +328 E 0.700 +329 Q 0.698 +330 L 0.695 +331 D 0.684 +332 Q 0.661 +333 H 0.633 +334 H 0.607 +335 E 0.573 +336 M 0.506 +337 K 0.396 +338 E 0.271 +339 T 0.170 +340 N 0.112 +341 E 0.088 +342 Q 0.080 +343 K 0.073 +344 L 0.062 +345 H 0.051 +346 K 0.046 +347 I 0.047 +348 A 0.052 +349 N 0.061 +350 E 0.068 +351 L 0.068 +352 L 0.066 +353 L 0.077 +354 T 0.099 +355 E 0.117 +356 R 0.117 +357 A 0.103 +358 Y 0.086 +359 V 0.071 +360 N 0.063 +361 R 0.061 +362 L 0.060 +363 D 0.055 +364 L 0.049 +365 L 0.044 +366 D 0.043 +367 Q 0.040 +368 V 0.034 +369 F 0.026 +370 Y 0.020 +371 C 0.018 +372 K 0.020 +373 L 0.023 +374 L 0.026 +375 E 0.031 +376 E 0.038 +377 A 0.050 +378 N 0.064 +379 R 0.077 +380 G 0.084 +381 S 0.085 +382 F 0.083 +383 P 0.078 +384 A 0.067 +385 E 0.055 +386 M 0.047 +387 V 0.046 +388 N 0.048 +389 K 0.051 +390 I 0.053 +391 F 0.051 +392 S 0.049 +393 N 0.051 +394 I 0.059 +395 S 0.063 +396 S 0.062 +397 I 0.057 +398 N 0.052 +399 A 0.048 +400 F 0.048 +401 H 0.054 +402 S 0.060 +403 K 0.059 +404 F 0.053 +405 L 0.046 +406 L 0.039 +407 P 0.034 +408 E 0.031 +409 L 0.032 +410 E 0.032 +411 K 0.032 +412 R 0.031 +413 M 0.032 +414 Q 0.034 +415 E 0.035 +416 W 0.034 +417 E 0.033 +418 T 0.033 +419 T 0.033 +420 P 0.037 +421 R 0.043 +422 I 0.052 +423 G 0.059 +424 D 0.063 +425 I 0.063 +426 L 0.060 +427 Q 0.056 +428 K 0.056 +429 L 0.059 +430 A 0.063 +431 P 0.064 +432 F 0.061 +433 L 0.056 +434 K 0.050 +435 M 0.046 +436 Y 0.041 +437 G 0.039 +438 E 0.044 +439 Y 0.053 +440 V 0.061 +441 K 0.068 +442 G 0.071 +443 F 0.067 +444 D 0.059 +445 N 0.055 +446 A 0.050 +447 M 0.043 +448 E 0.037 +449 L 0.035 +450 V 0.037 +451 K 0.040 +452 N 0.044 +453 M 0.047 +454 T 0.046 +455 E 0.043 +456 R 0.041 +457 I 0.039 +458 P 0.036 +459 Q 0.032 +460 F 0.028 +461 K 0.027 +462 S 0.030 +463 V 0.035 +464 V 0.039 +465 E 0.042 +466 E 0.046 +467 I 0.052 +468 Q 0.057 +469 K 0.058 +470 Q 0.059 +471 K 0.065 +472 I 0.074 +473 C 0.080 +474 G 0.081 +475 S 0.078 +476 L 0.072 +477 T 0.067 +478 L 0.065 +479 Q 0.065 +480 H 0.073 +481 H 0.091 +482 M 0.110 +483 L 0.120 +484 E 0.122 +485 P 0.117 +486 V 0.107 +487 Q 0.099 +488 R 0.097 +489 I 0.094 +490 P 0.084 +491 R 0.069 +492 Y 0.055 +493 E 0.043 +494 M 0.035 +495 L 0.034 +496 L 0.036 +497 K 0.040 +498 D 0.042 +499 Y 0.043 +500 L 0.046 +501 R 0.052 +502 K 0.060 +503 L 0.069 +504 P 0.076 +505 P 0.081 +506 D 0.085 +507 S 0.090 +508 L 0.093 +509 D 0.089 +510 W 0.077 +511 N 0.062 +512 D 0.053 +513 A 0.051 +514 K 0.055 +515 K 0.065 +516 S 0.074 +517 L 0.083 +518 E 0.086 +519 I 0.080 +520 I 0.069 +521 S 0.058 +522 T 0.053 +523 A 0.051 +524 A 0.053 +525 S 0.058 +526 H 0.065 +527 S 0.073 +528 N 0.086 +529 S 0.105 +530 A 0.126 +531 I 0.148 +532 R 0.169 +533 K 0.180 +534 M 0.173 +535 E 0.155 +536 N 0.136 +537 L 0.117 +538 K 0.096 +539 K 0.075 +540 L 0.060 +541 L 0.053 +542 E 0.053 +543 I 0.055 +544 Y 0.059 +545 E 0.062 +546 M 0.068 +547 L 0.078 +548 G 0.090 +549 E 0.100 +550 E 0.105 +551 E 0.104 +552 D 0.099 +553 I 0.097 +554 V 0.101 +555 N 0.105 +556 P 0.101 +557 S 0.087 +558 N 0.069 +559 E 0.053 +560 L 0.041 +561 I 0.033 +562 K 0.029 +563 E 0.029 +564 G 0.029 +565 Q 0.028 +566 I 0.028 +567 L 0.034 +568 K 0.047 +569 L 0.069 +570 A 0.097 +571 A 0.125 +572 R 0.144 +573 N 0.152 +574 T 0.150 +575 S 0.139 +576 A 0.119 +577 Q 0.093 +578 E 0.067 +579 R 0.045 +580 Y 0.030 +581 L 0.023 +582 F 0.024 +583 L 0.026 +584 F 0.026 +585 N 0.023 +586 N 0.019 +587 M 0.017 +588 L 0.019 +589 L 0.026 +590 Y 0.040 +591 C 0.061 +592 V 0.081 +593 P 0.100 +594 K 0.119 +595 F 0.138 +596 S 0.153 +597 L 0.163 +598 V 0.167 +599 G 0.160 +600 S 0.136 +601 K 0.103 +602 F 0.075 +603 T 0.059 +604 V 0.054 +605 R 0.050 +606 T 0.046 +607 R 0.043 +608 V 0.039 +609 G 0.033 +610 I 0.027 +611 D 0.024 +612 G 0.025 +613 M 0.029 +614 K 0.037 +615 I 0.050 +616 V 0.067 +617 E 0.085 +618 T 0.103 +619 Q 0.116 +620 N 0.119 +621 E 0.109 +622 E 0.095 +623 Y 0.084 +624 P 0.071 +625 H 0.055 +626 T 0.038 +627 F 0.030 +628 Q 0.031 +629 V 0.041 +630 S 0.056 +631 G 0.069 +632 K 0.075 +633 E 0.074 +634 R 0.065 +635 T 0.055 +636 L 0.048 +637 E 0.047 +638 L 0.051 +639 Q 0.059 +640 A 0.072 +641 S 0.088 +642 S 0.098 +643 A 0.096 +644 Q 0.082 +645 D 0.067 +646 K 0.055 +647 E 0.048 +648 E 0.047 +649 W 0.053 +650 I 0.063 +651 K 0.068 +652 A 0.063 +653 L 0.053 +654 Q 0.046 +655 E 0.043 +656 T 0.043 +657 I 0.050 +658 D 0.061 +659 A 0.074 +660 F 0.088 +661 H 0.106 +662 Q 0.127 +663 R 0.148 +664 H 0.165 +665 E 0.183 +666 T 0.204 +667 F 0.224 +668 R 0.240 +669 N 0.258 +670 A 0.285 +671 I 0.321 +672 A 0.359 +673 K 0.397 +674 D 0.431 +675 N 0.459 +676 D 0.479 +677 I 0.492 +678 H 0.499 +679 S 0.497 +680 E 0.477 +681 V 0.445 +682 S 0.416 +683 T 0.392 +684 A 0.364 +685 E 0.323 +686 L 0.278 +687 G 0.247 +688 K 0.231 +689 R 0.216 +690 A 0.199 +691 P 0.187 +692 R 0.183 +693 W 0.180 +694 I 0.167 +695 R 0.143 +696 D 0.119 +697 N 0.105 +698 E 0.100 +699 V 0.095 +700 T 0.088 +701 M 0.079 +702 C 0.068 +703 M 0.061 +704 K 0.063 +705 C 0.074 +706 K 0.092 +707 E 0.115 +708 P 0.136 +709 F 0.148 +710 N 0.143 +711 A 0.129 +712 L 0.124 +713 T 0.136 +714 R 0.164 +715 R 0.196 +716 R 0.216 +717 H 0.210 +718 H 0.182 +719 C 0.157 +720 R 0.153 +721 A 0.162 +722 C 0.166 +723 G 0.159 +724 Y 0.142 +725 V 0.120 +726 V 0.100 +727 C 0.089 +728 W 0.087 +729 K 0.091 +730 C 0.092 +731 S 0.091 +732 D 0.089 +733 Y 0.091 +734 K 0.093 +735 A 0.092 +736 Q 0.087 +737 L 0.083 +738 E 0.083 +739 Y 0.096 +740 D 0.125 +741 G 0.161 +742 G 0.188 +743 K 0.192 +744 L 0.172 +745 S 0.138 +746 K 0.106 +747 V 0.087 +748 C 0.077 +749 K 0.068 +750 D 0.062 +751 C 0.065 +752 Y 0.078 +753 Q 0.101 +754 I 0.134 +755 I 0.182 +756 S 0.245 +757 G 0.317 +758 F 0.389 +759 T 0.452 +760 D 0.490 +761 S 0.493 +762 E 0.476 +763 E 0.457 +764 K 0.445 +765 K 0.437 +766 R 0.429 +767 K 0.415 +768 G 0.397 +769 I 0.377 +770 L 0.355 +771 E 0.331 +772 I 0.310 +773 E 0.295 +774 S 0.286 +775 A 0.276 +776 E 0.259 +777 V 0.237 +778 S 0.217 +779 G 0.197 +780 N 0.172 +781 S 0.141 +782 V 0.110 +783 V 0.085 +784 C 0.067 +785 S 0.052 +786 F 0.041 +787 L 0.035 +788 Q 0.036 +789 Y 0.044 +790 M 0.058 +791 E 0.074 +792 K 0.085 +793 S 0.090 +794 K 0.092 +795 P 0.094 +796 W 0.093 +797 Q 0.087 +798 K 0.072 +799 A 0.053 +800 W 0.039 +801 C 0.039 +802 V 0.052 +803 I 0.069 +804 P 0.079 +805 K 0.079 +806 Q 0.072 +807 D 0.068 +808 P 0.065 +809 L 0.062 +810 V 0.059 +811 L 0.060 +812 Y 0.069 +813 M 0.086 +814 Y 0.108 +815 G 0.123 +816 A 0.123 +817 P 0.114 +818 Q 0.110 +819 D 0.115 +820 V 0.126 +821 R 0.128 +822 A 0.117 +823 Q 0.098 +824 A 0.084 +825 T 0.080 +826 I 0.079 +827 P 0.075 +828 L 0.068 +829 L 0.063 +830 G 0.061 +831 Y 0.058 +832 V 0.057 +833 V 0.063 +834 D 0.080 +835 E 0.108 +836 M 0.141 +837 P 0.162 +838 R 0.162 +839 S 0.151 +840 A 0.143 +841 D 0.139 +842 L 0.134 +843 P 0.119 +844 H 0.094 +845 S 0.070 +846 F 0.054 +847 K 0.047 +848 L 0.048 +849 T 0.054 +850 Q 0.063 +851 S 0.071 +852 K 0.075 +853 S 0.075 +854 V 0.072 +855 H 0.067 +856 S 0.061 +857 F 0.059 +858 A 0.064 +859 A 0.078 +860 D 0.097 +861 S 0.110 +862 E 0.105 +863 E 0.089 +864 L 0.072 +865 K 0.060 +866 Q 0.053 +867 K 0.048 +868 W 0.046 +869 L 0.047 +870 K 0.047 +871 V 0.046 +872 I 0.050 +873 L 0.060 +874 L 0.072 +875 A 0.090 +876 V 0.129 +877 T 0.195 +878 G 0.283 +879 E 0.377 +880 T 0.463 +881 P 0.531 +882 G 0.578 +883 G 0.605 +884 P 0.617 +885 N 0.621 +886 E 0.625 +887 H 0.633 +888 P 0.645 +889 A 0.657 +890 T 0.664 +891 L 0.660 +892 D 0.637 +893 D 0.604 +894 H 0.585 +895 P 0.594 +896 E 0.624 +897 P 0.657 +898 K 0.676 +899 K 0.667 +900 K 0.624 +901 S 0.561 +902 E 0.499 +903 C 0.460 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000139132.16_ENST00000534526.7_GN:FGD4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000139132.16_ENST00000534526.7_GN:FGD4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..396a90bce8883048d75e95442ee427dd3a61f301 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000139132.16_ENST00000534526.7_GN:FGD4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid @@ -0,0 +1,931 @@ +>ENSG00000139132.16|ENST00000534526.7|GN:FGD4|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:27 +1 M 0.367 +2 Q 0.380 +3 A 0.400 +4 T 0.420 +5 P 0.433 +6 P 0.441 +7 R 0.465 +8 G 0.504 +9 R 0.517 +10 S 0.496 +11 R 0.493 +12 L 0.534 +13 D 0.571 +14 G 0.563 +15 S 0.537 +16 G 0.514 +17 R 0.475 +18 S 0.439 +19 R 0.468 +20 G 0.564 +21 A 0.653 +22 A 0.692 +23 V 0.703 +24 E 0.716 +25 P 0.737 +26 G 0.755 +27 R 0.760 +28 M 0.755 +29 S 0.749 +30 D 0.747 +31 E 0.751 +32 G 0.755 +33 G 0.754 +34 S 0.744 +35 N 0.729 +36 F 0.717 +37 R 0.716 +38 R 0.722 +39 V 0.727 +40 A 0.725 +41 I 0.715 +42 R 0.703 +43 R 0.687 +44 K 0.671 +45 S 0.666 +46 N 0.681 +47 P 0.698 +48 S 0.699 +49 Y 0.683 +50 L 0.670 +51 P 0.677 +52 P 0.700 +53 G 0.722 +54 V 0.729 +55 P 0.727 +56 R 0.724 +57 P 0.723 +58 W 0.725 +59 S 0.731 +60 R 0.744 +61 P 0.763 +62 A 0.781 +63 S 0.791 +64 H 0.799 +65 L 0.809 +66 G 0.821 +67 R 0.829 +68 V 0.829 +69 G 0.823 +70 T 0.814 +71 A 0.805 +72 A 0.799 +73 F 0.799 +74 K 0.803 +75 G 0.805 +76 Q 0.800 +77 V 0.793 +78 P 0.794 +79 S 0.804 +80 G 0.818 +81 A 0.825 +82 T 0.824 +83 G 0.820 +84 S 0.812 +85 S 0.801 +86 T 0.791 +87 C 0.787 +88 P 0.790 +89 K 0.794 +90 I 0.793 +91 A 0.782 +92 L 0.765 +93 V 0.752 +94 P 0.754 +95 P 0.769 +96 C 0.788 +97 S 0.802 +98 T 0.810 +99 S 0.813 +100 S 0.814 +101 T 0.814 +102 T 0.813 +103 T 0.812 +104 L 0.812 +105 V 0.813 +106 G 0.812 +107 E 0.812 +108 N 0.811 +109 V 0.808 +110 S 0.804 +111 E 0.800 +112 E 0.798 +113 E 0.794 +114 A 0.789 +115 Q 0.788 +116 G 0.793 +117 I 0.799 +118 N 0.799 +119 G 0.790 +120 N 0.775 +121 R 0.763 +122 P 0.760 +123 A 0.764 +124 K 0.770 +125 H 0.771 +126 S 0.767 +127 A 0.760 +128 A 0.750 +129 S 0.740 +130 P 0.737 +131 K 0.740 +132 P 0.743 +133 Q 0.738 +134 V 0.729 +135 P 0.724 +136 P 0.729 +137 K 0.730 +138 P 0.704 +139 L 0.656 +140 H 0.635 +141 L 0.675 +142 Q 0.739 +143 N 0.778 +144 S 0.791 +145 P 0.798 +146 S 0.805 +147 S 0.811 +148 N 0.809 +149 I 0.799 +150 H 0.782 +151 Q 0.765 +152 T 0.757 +153 P 0.762 +154 R 0.775 +155 H 0.788 +156 K 0.793 +157 A 0.789 +158 L 0.783 +159 P 0.783 +160 S 0.788 +161 A 0.792 +162 K 0.796 +163 P 0.803 +164 R 0.809 +165 M 0.806 +166 E 0.791 +167 E 0.774 +168 I 0.765 +169 K 0.769 +170 P 0.785 +171 A 0.802 +172 S 0.812 +173 A 0.813 +174 S 0.810 +175 C 0.802 +176 V 0.790 +177 S 0.775 +178 K 0.760 +179 E 0.747 +180 K 0.738 +181 P 0.730 +182 S 0.714 +183 K 0.686 +184 V 0.652 +185 S 0.627 +186 D 0.599 +187 L 0.557 +188 I 0.517 +189 S 0.514 +190 R 0.555 +191 F 0.621 +192 E 0.687 +193 G 0.736 +194 G 0.762 +195 S 0.766 +196 S 0.756 +197 L 0.744 +198 S 0.737 +199 N 0.729 +200 Y 0.720 +201 S 0.718 +202 D 0.726 +203 L 0.739 +204 K 0.752 +205 K 0.768 +206 E 0.783 +207 S 0.793 +208 A 0.794 +209 V 0.791 +210 N 0.786 +211 L 0.775 +212 N 0.763 +213 A 0.755 +214 P 0.754 +215 R 0.758 +216 T 0.768 +217 P 0.783 +218 G 0.800 +219 R 0.809 +220 H 0.809 +221 G 0.800 +222 L 0.784 +223 T 0.761 +224 T 0.735 +225 T 0.716 +226 P 0.703 +227 Q 0.675 +228 Q 0.628 +229 K 0.600 +230 L 0.616 +231 L 0.631 +232 S 0.606 +233 Q 0.581 +234 H 0.610 +235 L 0.679 +236 P 0.744 +237 Q 0.785 +238 R 0.807 +239 Q 0.818 +240 G 0.822 +241 N 0.821 +242 D 0.815 +243 T 0.808 +244 D 0.804 +245 K 0.803 +246 T 0.803 +247 Q 0.799 +248 G 0.779 +249 A 0.730 +250 Q 0.662 +251 T 0.624 +252 C 0.650 +253 V 0.705 +254 A 0.743 +255 N 0.752 +256 G 0.740 +257 V 0.721 +258 M 0.706 +259 A 0.702 +260 A 0.706 +261 Q 0.717 +262 N 0.729 +263 Q 0.739 +264 M 0.748 +265 E 0.754 +266 C 0.755 +267 E 0.750 +268 E 0.744 +269 E 0.742 +270 K 0.742 +271 A 0.739 +272 A 0.735 +273 T 0.733 +274 L 0.738 +275 S 0.747 +276 S 0.755 +277 D 0.760 +278 T 0.764 +279 S 0.767 +280 I 0.765 +281 Q 0.758 +282 A 0.747 +283 S 0.734 +284 E 0.727 +285 P 0.727 +286 L 0.731 +287 L 0.738 +288 D 0.740 +289 T 0.737 +290 H 0.732 +291 I 0.736 +292 V 0.749 +293 N 0.765 +294 G 0.776 +295 E 0.784 +296 R 0.790 +297 D 0.794 +298 E 0.795 +299 T 0.792 +300 A 0.785 +301 T 0.778 +302 A 0.773 +303 P 0.772 +304 A 0.773 +305 S 0.779 +306 P 0.792 +307 T 0.809 +308 T 0.822 +309 D 0.829 +310 S 0.833 +311 C 0.835 +312 D 0.837 +313 G 0.838 +314 N 0.834 +315 A 0.825 +316 S 0.812 +317 D 0.797 +318 S 0.780 +319 S 0.760 +320 Y 0.744 +321 R 0.739 +322 T 0.744 +323 P 0.752 +324 G 0.756 +325 I 0.758 +326 G 0.761 +327 P 0.764 +328 V 0.769 +329 L 0.778 +330 P 0.789 +331 L 0.800 +332 E 0.809 +333 E 0.815 +334 R 0.816 +335 G 0.811 +336 A 0.801 +337 E 0.786 +338 T 0.770 +339 E 0.757 +340 T 0.749 +341 K 0.747 +342 V 0.746 +343 Q 0.744 +344 E 0.741 +345 R 0.739 +346 E 0.734 +347 N 0.718 +348 G 0.693 +349 E 0.671 +350 S 0.664 +351 P 0.676 +352 L 0.695 +353 E 0.707 +354 L 0.708 +355 E 0.706 +356 Q 0.704 +357 L 0.701 +358 D 0.691 +359 Q 0.669 +360 H 0.641 +361 H 0.614 +362 E 0.577 +363 M 0.506 +364 K 0.394 +365 E 0.268 +366 T 0.168 +367 N 0.112 +368 E 0.090 +369 Q 0.082 +370 K 0.075 +371 L 0.064 +372 H 0.053 +373 K 0.047 +374 I 0.048 +375 A 0.055 +376 N 0.064 +377 E 0.070 +378 L 0.069 +379 L 0.067 +380 L 0.078 +381 T 0.101 +382 E 0.119 +383 R 0.119 +384 A 0.105 +385 Y 0.087 +386 V 0.072 +387 N 0.063 +388 R 0.062 +389 L 0.061 +390 D 0.056 +391 L 0.049 +392 L 0.044 +393 D 0.043 +394 Q 0.040 +395 V 0.033 +396 F 0.025 +397 Y 0.019 +398 C 0.017 +399 K 0.019 +400 L 0.022 +401 L 0.026 +402 E 0.030 +403 E 0.037 +404 A 0.048 +405 N 0.062 +406 R 0.074 +407 G 0.081 +408 S 0.082 +409 F 0.082 +410 P 0.077 +411 A 0.067 +412 E 0.055 +413 M 0.047 +414 V 0.045 +415 N 0.047 +416 K 0.051 +417 I 0.053 +418 F 0.051 +419 S 0.048 +420 N 0.051 +421 I 0.058 +422 S 0.063 +423 S 0.062 +424 I 0.057 +425 N 0.053 +426 A 0.048 +427 F 0.048 +428 H 0.054 +429 S 0.060 +430 K 0.059 +431 F 0.053 +432 L 0.046 +433 L 0.039 +434 P 0.034 +435 E 0.031 +436 L 0.032 +437 E 0.033 +438 K 0.032 +439 R 0.032 +440 M 0.033 +441 Q 0.036 +442 E 0.037 +443 W 0.036 +444 E 0.034 +445 T 0.034 +446 T 0.035 +447 P 0.038 +448 R 0.045 +449 I 0.053 +450 G 0.061 +451 D 0.065 +452 I 0.065 +453 L 0.061 +454 Q 0.057 +455 K 0.056 +456 L 0.060 +457 A 0.064 +458 P 0.065 +459 F 0.062 +460 L 0.057 +461 K 0.051 +462 M 0.046 +463 Y 0.042 +464 G 0.040 +465 E 0.046 +466 Y 0.054 +467 V 0.063 +468 K 0.070 +469 G 0.073 +470 F 0.068 +471 D 0.061 +472 N 0.056 +473 A 0.051 +474 M 0.044 +475 E 0.038 +476 L 0.036 +477 V 0.038 +478 K 0.041 +479 N 0.045 +480 M 0.049 +481 T 0.048 +482 E 0.045 +483 R 0.043 +484 I 0.041 +485 P 0.038 +486 Q 0.033 +487 F 0.029 +488 K 0.028 +489 S 0.031 +490 V 0.036 +491 V 0.040 +492 E 0.043 +493 E 0.047 +494 I 0.054 +495 Q 0.058 +496 K 0.059 +497 Q 0.061 +498 K 0.067 +499 I 0.075 +500 C 0.082 +501 G 0.083 +502 S 0.079 +503 L 0.073 +504 T 0.068 +505 L 0.066 +506 Q 0.067 +507 H 0.075 +508 H 0.093 +509 M 0.112 +510 L 0.123 +511 E 0.125 +512 P 0.120 +513 V 0.111 +514 Q 0.102 +515 R 0.100 +516 I 0.096 +517 P 0.086 +518 R 0.071 +519 Y 0.056 +520 E 0.044 +521 M 0.036 +522 L 0.035 +523 L 0.037 +524 K 0.040 +525 D 0.042 +526 Y 0.044 +527 L 0.047 +528 R 0.052 +529 K 0.061 +530 L 0.070 +531 P 0.077 +532 P 0.082 +533 D 0.086 +534 S 0.090 +535 L 0.093 +536 D 0.089 +537 W 0.076 +538 N 0.062 +539 D 0.053 +540 A 0.051 +541 K 0.056 +542 K 0.066 +543 S 0.076 +544 L 0.084 +545 E 0.087 +546 I 0.082 +547 I 0.070 +548 S 0.060 +549 T 0.055 +550 A 0.053 +551 A 0.054 +552 S 0.058 +553 H 0.065 +554 S 0.074 +555 N 0.087 +556 S 0.106 +557 A 0.129 +558 I 0.151 +559 R 0.172 +560 K 0.183 +561 M 0.176 +562 E 0.158 +563 N 0.139 +564 L 0.119 +565 K 0.097 +566 K 0.076 +567 L 0.061 +568 L 0.053 +569 E 0.053 +570 I 0.056 +571 Y 0.059 +572 E 0.062 +573 M 0.068 +574 L 0.079 +575 G 0.090 +576 E 0.101 +577 E 0.106 +578 E 0.105 +579 D 0.100 +580 I 0.098 +581 V 0.102 +582 N 0.106 +583 P 0.102 +584 S 0.089 +585 N 0.071 +586 E 0.054 +587 L 0.041 +588 I 0.033 +589 K 0.030 +590 E 0.029 +591 G 0.029 +592 Q 0.028 +593 I 0.029 +594 L 0.034 +595 K 0.048 +596 L 0.070 +597 A 0.099 +598 A 0.127 +599 R 0.146 +600 N 0.154 +601 T 0.151 +602 S 0.140 +603 A 0.120 +604 Q 0.094 +605 E 0.068 +606 R 0.046 +607 Y 0.030 +608 L 0.023 +609 F 0.024 +610 L 0.027 +611 F 0.027 +612 N 0.023 +613 N 0.019 +614 M 0.017 +615 L 0.019 +616 L 0.026 +617 Y 0.041 +618 C 0.062 +619 V 0.083 +620 P 0.102 +621 K 0.121 +622 F 0.140 +623 S 0.156 +624 L 0.166 +625 V 0.170 +626 G 0.162 +627 S 0.138 +628 K 0.104 +629 F 0.075 +630 T 0.060 +631 V 0.054 +632 R 0.050 +633 T 0.046 +634 R 0.043 +635 V 0.039 +636 G 0.033 +637 I 0.027 +638 D 0.024 +639 G 0.025 +640 M 0.030 +641 K 0.038 +642 I 0.050 +643 V 0.067 +644 E 0.086 +645 T 0.104 +646 Q 0.117 +647 N 0.119 +648 E 0.110 +649 E 0.096 +650 Y 0.084 +651 P 0.071 +652 H 0.055 +653 T 0.039 +654 F 0.030 +655 Q 0.031 +656 V 0.041 +657 S 0.056 +658 G 0.069 +659 K 0.075 +660 E 0.074 +661 R 0.065 +662 T 0.055 +663 L 0.049 +664 E 0.048 +665 L 0.052 +666 Q 0.060 +667 A 0.073 +668 S 0.088 +669 S 0.099 +670 A 0.096 +671 Q 0.083 +672 D 0.067 +673 K 0.055 +674 E 0.049 +675 E 0.048 +676 W 0.053 +677 I 0.063 +678 K 0.069 +679 A 0.063 +680 L 0.053 +681 Q 0.047 +682 E 0.043 +683 T 0.044 +684 I 0.050 +685 D 0.062 +686 A 0.075 +687 F 0.090 +688 H 0.108 +689 Q 0.129 +690 R 0.150 +691 H 0.167 +692 E 0.186 +693 T 0.207 +694 F 0.229 +695 R 0.247 +696 N 0.266 +697 A 0.292 +698 I 0.326 +699 A 0.363 +700 K 0.400 +701 D 0.434 +702 N 0.462 +703 D 0.482 +704 I 0.494 +705 H 0.501 +706 S 0.499 +707 E 0.480 +708 V 0.448 +709 S 0.419 +710 T 0.396 +711 A 0.367 +712 E 0.325 +713 L 0.280 +714 G 0.249 +715 K 0.232 +716 R 0.218 +717 A 0.201 +718 P 0.188 +719 R 0.184 +720 W 0.181 +721 I 0.169 +722 R 0.145 +723 D 0.120 +724 N 0.107 +725 E 0.101 +726 V 0.096 +727 T 0.089 +728 M 0.079 +729 C 0.069 +730 M 0.062 +731 K 0.064 +732 C 0.076 +733 K 0.094 +734 E 0.116 +735 P 0.138 +736 F 0.149 +737 N 0.144 +738 A 0.130 +739 L 0.124 +740 T 0.137 +741 R 0.166 +742 R 0.198 +743 R 0.219 +744 H 0.213 +745 H 0.185 +746 C 0.159 +747 R 0.155 +748 A 0.164 +749 C 0.168 +750 G 0.161 +751 Y 0.143 +752 V 0.121 +753 V 0.101 +754 C 0.089 +755 W 0.088 +756 K 0.092 +757 C 0.093 +758 S 0.091 +759 D 0.090 +760 Y 0.091 +761 K 0.094 +762 A 0.093 +763 Q 0.089 +764 L 0.084 +765 E 0.084 +766 Y 0.097 +767 D 0.127 +768 G 0.164 +769 G 0.191 +770 K 0.195 +771 L 0.175 +772 S 0.139 +773 K 0.107 +774 V 0.088 +775 C 0.077 +776 K 0.069 +777 D 0.063 +778 C 0.065 +779 Y 0.079 +780 Q 0.102 +781 I 0.135 +782 I 0.183 +783 S 0.246 +784 G 0.317 +785 F 0.389 +786 T 0.451 +787 D 0.488 +788 S 0.491 +789 E 0.474 +790 E 0.455 +791 K 0.443 +792 K 0.436 +793 R 0.428 +794 K 0.414 +795 G 0.395 +796 I 0.376 +797 L 0.355 +798 E 0.333 +799 I 0.313 +800 E 0.300 +801 S 0.292 +802 A 0.283 +803 E 0.266 +804 V 0.244 +805 S 0.222 +806 G 0.200 +807 N 0.174 +808 S 0.143 +809 V 0.111 +810 V 0.085 +811 C 0.067 +812 S 0.052 +813 F 0.041 +814 L 0.035 +815 Q 0.036 +816 Y 0.044 +817 M 0.058 +818 E 0.074 +819 K 0.085 +820 S 0.090 +821 K 0.092 +822 P 0.094 +823 W 0.094 +824 Q 0.088 +825 K 0.073 +826 A 0.053 +827 W 0.040 +828 C 0.039 +829 V 0.052 +830 I 0.069 +831 P 0.080 +832 K 0.079 +833 Q 0.072 +834 D 0.068 +835 P 0.065 +836 L 0.062 +837 V 0.059 +838 L 0.060 +839 Y 0.069 +840 M 0.086 +841 Y 0.108 +842 G 0.123 +843 A 0.123 +844 P 0.115 +845 Q 0.111 +846 D 0.116 +847 V 0.127 +848 R 0.129 +849 A 0.117 +850 Q 0.099 +851 A 0.085 +852 T 0.080 +853 I 0.079 +854 P 0.075 +855 L 0.068 +856 L 0.063 +857 G 0.061 +858 Y 0.058 +859 V 0.058 +860 V 0.063 +861 D 0.080 +862 E 0.109 +863 M 0.142 +864 P 0.163 +865 R 0.163 +866 S 0.153 +867 A 0.144 +868 D 0.140 +869 L 0.134 +870 P 0.119 +871 H 0.095 +872 S 0.070 +873 F 0.054 +874 K 0.047 +875 L 0.048 +876 T 0.054 +877 Q 0.063 +878 S 0.071 +879 K 0.075 +880 S 0.075 +881 V 0.072 +882 H 0.067 +883 S 0.061 +884 F 0.059 +885 A 0.064 +886 A 0.078 +887 D 0.097 +888 S 0.109 +889 E 0.105 +890 E 0.089 +891 L 0.071 +892 K 0.060 +893 Q 0.053 +894 K 0.047 +895 W 0.046 +896 L 0.047 +897 K 0.047 +898 V 0.046 +899 I 0.050 +900 L 0.060 +901 L 0.072 +902 A 0.090 +903 V 0.129 +904 T 0.195 +905 G 0.282 +906 E 0.376 +907 T 0.463 +908 P 0.531 +909 G 0.577 +910 G 0.604 +911 P 0.616 +912 N 0.620 +913 E 0.624 +914 H 0.631 +915 P 0.641 +916 A 0.652 +917 T 0.659 +918 L 0.654 +919 D 0.631 +920 D 0.599 +921 H 0.580 +922 P 0.590 +923 E 0.621 +924 P 0.653 +925 K 0.672 +926 K 0.661 +927 K 0.616 +928 S 0.552 +929 E 0.489 +930 C 0.450 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000139800.9_ENST00000267294.5_GN:ZIC5_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000139800.9_ENST00000267294.5_GN:ZIC5_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..14120b6214d783bce8990fce7f422cef6a39c3df --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000139800.9_ENST00000267294.5_GN:ZIC5_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,640 @@ +>ENSG00000139800.9|ENST00000267294.5|GN:ZIC5|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.419 +2 E 0.453 +3 P 0.508 +4 P 0.566 +5 L 0.608 +6 S 0.629 +7 K 0.635 +8 R 0.637 +9 N 0.645 +10 P 0.664 +11 P 0.691 +12 A 0.709 +13 L 0.708 +14 R 0.702 +15 L 0.706 +16 A 0.719 +17 D 0.729 +18 L 0.736 +19 A 0.742 +20 T 0.743 +21 A 0.740 +22 Q 0.739 +23 V 0.742 +24 Q 0.750 +25 P 0.762 +26 L 0.777 +27 Q 0.788 +28 N 0.789 +29 M 0.782 +30 T 0.772 +31 G 0.765 +32 F 0.766 +33 P 0.778 +34 A 0.788 +35 L 0.782 +36 A 0.759 +37 G 0.736 +38 P 0.732 +39 P 0.749 +40 A 0.771 +41 H 0.780 +42 S 0.774 +43 Q 0.752 +44 L 0.703 +45 R 0.637 +46 A 0.597 +47 A 0.615 +48 V 0.662 +49 A 0.697 +50 H 0.714 +51 L 0.724 +52 R 0.740 +53 L 0.760 +54 R 0.778 +55 D 0.788 +56 L 0.791 +57 G 0.790 +58 A 0.791 +59 D 0.796 +60 P 0.806 +61 G 0.822 +62 V 0.835 +63 A 0.835 +64 T 0.820 +65 T 0.802 +66 P 0.793 +67 L 0.789 +68 G 0.786 +69 P 0.783 +70 E 0.771 +71 H 0.734 +72 M 0.675 +73 A 0.645 +74 Q 0.668 +75 A 0.690 +76 S 0.666 +77 T 0.643 +78 L 0.674 +79 G 0.731 +80 L 0.766 +81 S 0.776 +82 P 0.784 +83 P 0.800 +84 S 0.817 +85 Q 0.824 +86 A 0.818 +87 F 0.808 +88 P 0.799 +89 A 0.793 +90 H 0.788 +91 P 0.787 +92 E 0.790 +93 A 0.796 +94 P 0.801 +95 A 0.801 +96 A 0.783 +97 A 0.733 +98 A 0.665 +99 R 0.631 +100 A 0.666 +101 A 0.731 +102 A 0.773 +103 L 0.781 +104 V 0.769 +105 A 0.753 +106 H 0.748 +107 P 0.762 +108 G 0.787 +109 A 0.807 +110 G 0.810 +111 S 0.802 +112 Y 0.799 +113 P 0.807 +114 C 0.820 +115 G 0.830 +116 G 0.835 +117 G 0.837 +118 S 0.835 +119 S 0.832 +120 G 0.825 +121 A 0.814 +122 Q 0.800 +123 P 0.786 +124 S 0.765 +125 A 0.728 +126 P 0.668 +127 P 0.602 +128 P 0.578 +129 P 0.614 +130 A 0.672 +131 P 0.705 +132 P 0.712 +133 L 0.712 +134 P 0.714 +135 P 0.717 +136 T 0.718 +137 P 0.713 +138 S 0.703 +139 P 0.692 +140 P 0.685 +141 P 0.683 +142 P 0.685 +143 P 0.690 +144 P 0.692 +145 P 0.691 +146 P 0.698 +147 P 0.720 +148 P 0.756 +149 P 0.792 +150 A 0.818 +151 L 0.832 +152 S 0.837 +153 G 0.839 +154 Y 0.840 +155 T 0.841 +156 T 0.840 +157 T 0.838 +158 N 0.836 +159 S 0.835 +160 G 0.837 +161 G 0.840 +162 G 0.842 +163 G 0.841 +164 S 0.836 +165 S 0.831 +166 G 0.827 +167 K 0.823 +168 G 0.815 +169 H 0.805 +170 S 0.797 +171 R 0.792 +172 D 0.789 +173 F 0.787 +174 V 0.787 +175 L 0.792 +176 R 0.798 +177 R 0.803 +178 D 0.803 +179 L 0.799 +180 S 0.797 +181 A 0.795 +182 T 0.793 +183 A 0.795 +184 P 0.807 +185 A 0.825 +186 A 0.838 +187 A 0.840 +188 M 0.835 +189 H 0.828 +190 G 0.822 +191 A 0.822 +192 P 0.829 +193 L 0.836 +194 G 0.825 +195 G 0.779 +196 E 0.707 +197 Q 0.667 +198 R 0.699 +199 S 0.764 +200 G 0.808 +201 T 0.821 +202 G 0.816 +203 S 0.804 +204 P 0.791 +205 Q 0.778 +206 H 0.766 +207 P 0.753 +208 A 0.740 +209 P 0.733 +210 P 0.739 +211 P 0.758 +212 H 0.780 +213 S 0.798 +214 A 0.810 +215 G 0.820 +216 M 0.827 +217 F 0.830 +218 I 0.830 +219 S 0.828 +220 A 0.827 +221 S 0.827 +222 G 0.829 +223 T 0.829 +224 Y 0.823 +225 A 0.813 +226 G 0.805 +227 P 0.805 +228 D 0.812 +229 G 0.818 +230 S 0.817 +231 G 0.810 +232 G 0.804 +233 P 0.800 +234 A 0.792 +235 L 0.783 +236 F 0.781 +237 P 0.792 +238 A 0.803 +239 L 0.805 +240 H 0.799 +241 D 0.792 +242 T 0.788 +243 P 0.790 +244 G 0.795 +245 A 0.800 +246 P 0.802 +247 G 0.797 +248 G 0.781 +249 H 0.757 +250 P 0.738 +251 H 0.736 +252 P 0.750 +253 L 0.767 +254 N 0.776 +255 G 0.776 +256 Q 0.772 +257 M 0.765 +258 R 0.756 +259 L 0.739 +260 G 0.701 +261 L 0.631 +262 A 0.532 +263 A 0.433 +264 A 0.369 +265 A 0.347 +266 A 0.358 +267 A 0.385 +268 A 0.413 +269 A 0.436 +270 A 0.452 +271 E 0.469 +272 L 0.498 +273 Y 0.542 +274 G 0.592 +275 R 0.628 +276 A 0.642 +277 E 0.644 +278 P 0.652 +279 P 0.675 +280 F 0.705 +281 A 0.728 +282 P 0.746 +283 R 0.761 +284 S 0.769 +285 G 0.764 +286 D 0.749 +287 A 0.727 +288 H 0.693 +289 Y 0.637 +290 G 0.569 +291 A 0.495 +292 V 0.410 +293 A 0.325 +294 A 0.269 +295 A 0.253 +296 A 0.257 +297 A 0.268 +298 A 0.289 +299 A 0.328 +300 L 0.384 +301 H 0.453 +302 G 0.528 +303 Y 0.593 +304 G 0.644 +305 A 0.681 +306 V 0.703 +307 N 0.710 +308 L 0.709 +309 N 0.706 +310 L 0.697 +311 N 0.664 +312 L 0.606 +313 A 0.554 +314 A 0.533 +315 A 0.536 +316 A 0.552 +317 A 0.582 +318 A 0.618 +319 A 0.638 +320 A 0.636 +321 A 0.628 +322 G 0.637 +323 P 0.670 +324 G 0.714 +325 P 0.748 +326 H 0.767 +327 L 0.767 +328 Q 0.751 +329 H 0.720 +330 H 0.675 +331 A 0.612 +332 P 0.550 +333 P 0.525 +334 P 0.548 +335 A 0.580 +336 P 0.593 +337 P 0.600 +338 P 0.620 +339 P 0.654 +340 P 0.696 +341 A 0.738 +342 P 0.767 +343 A 0.776 +344 Q 0.773 +345 H 0.770 +346 P 0.773 +347 H 0.775 +348 Q 0.771 +349 H 0.764 +350 H 0.763 +351 P 0.770 +352 H 0.780 +353 L 0.790 +354 P 0.798 +355 G 0.798 +356 A 0.787 +357 A 0.762 +358 G 0.727 +359 A 0.684 +360 F 0.627 +361 L 0.564 +362 R 0.518 +363 Y 0.507 +364 M 0.521 +365 R 0.540 +366 Q 0.551 +367 P 0.540 +368 I 0.490 +369 K 0.403 +370 Q 0.300 +371 E 0.205 +372 L 0.132 +373 I 0.089 +374 C 0.073 +375 K 0.083 +376 W 0.117 +377 I 0.169 +378 D 0.237 +379 P 0.330 +380 D 0.439 +381 E 0.529 +382 L 0.571 +383 A 0.565 +384 G 0.528 +385 L 0.484 +386 P 0.455 +387 P 0.448 +388 P 0.449 +389 P 0.446 +390 P 0.437 +391 P 0.426 +392 P 0.411 +393 P 0.391 +394 P 0.376 +395 P 0.376 +396 P 0.393 +397 P 0.428 +398 P 0.481 +399 P 0.549 +400 P 0.609 +401 A 0.633 +402 G 0.597 +403 G 0.507 +404 A 0.387 +405 K 0.274 +406 P 0.187 +407 C 0.129 +408 S 0.098 +409 K 0.090 +410 T 0.097 +411 F 0.105 +412 G 0.103 +413 T 0.097 +414 M 0.096 +415 H 0.100 +416 E 0.105 +417 L 0.108 +418 V 0.102 +419 N 0.087 +420 H 0.070 +421 V 0.058 +422 T 0.053 +423 V 0.052 +424 E 0.057 +425 H 0.074 +426 V 0.108 +427 G 0.154 +428 G 0.198 +429 P 0.219 +430 E 0.210 +431 Q 0.177 +432 S 0.135 +433 S 0.100 +434 H 0.077 +435 V 0.063 +436 C 0.055 +437 F 0.053 +438 W 0.055 +439 E 0.060 +440 D 0.064 +441 C 0.067 +442 P 0.072 +443 R 0.083 +444 E 0.097 +445 G 0.112 +446 K 0.125 +447 P 0.130 +448 F 0.123 +449 K 0.105 +450 A 0.091 +451 K 0.092 +452 Y 0.108 +453 K 0.128 +454 L 0.138 +455 I 0.129 +456 N 0.113 +457 H 0.102 +458 I 0.104 +459 R 0.111 +460 V 0.116 +461 H 0.125 +462 T 0.145 +463 G 0.168 +464 E 0.176 +465 K 0.165 +466 P 0.149 +467 F 0.144 +468 P 0.148 +469 C 0.153 +470 P 0.161 +471 F 0.166 +472 P 0.160 +473 G 0.146 +474 C 0.136 +475 G 0.136 +476 K 0.145 +477 V 0.158 +478 F 0.167 +479 A 0.167 +480 R 0.167 +481 S 0.182 +482 E 0.215 +483 N 0.240 +484 L 0.231 +485 K 0.194 +486 I 0.156 +487 H 0.140 +488 K 0.150 +489 R 0.172 +490 T 0.194 +491 H 0.217 +492 T 0.243 +493 G 0.260 +494 E 0.252 +495 K 0.217 +496 P 0.175 +497 F 0.144 +498 K 0.128 +499 C 0.127 +500 E 0.138 +501 F 0.148 +502 D 0.144 +503 G 0.124 +504 C 0.103 +505 D 0.100 +506 R 0.121 +507 K 0.160 +508 F 0.193 +509 A 0.204 +510 N 0.202 +511 S 0.205 +512 S 0.217 +513 D 0.227 +514 R 0.229 +515 K 0.227 +516 K 0.224 +517 H 0.222 +518 S 0.225 +519 H 0.226 +520 V 0.227 +521 H 0.233 +522 T 0.244 +523 S 0.254 +524 D 0.253 +525 K 0.234 +526 P 0.198 +527 Y 0.157 +528 Y 0.131 +529 C 0.126 +530 K 0.140 +531 I 0.157 +532 R 0.159 +533 G 0.144 +534 C 0.126 +535 D 0.120 +536 K 0.128 +537 S 0.140 +538 Y 0.150 +539 T 0.156 +540 H 0.156 +541 P 0.145 +542 S 0.128 +543 S 0.114 +544 L 0.108 +545 R 0.107 +546 K 0.103 +547 H 0.093 +548 M 0.084 +549 K 0.089 +550 I 0.120 +551 H 0.188 +552 C 0.287 +553 K 0.387 +554 S 0.467 +555 P 0.531 +556 P 0.586 +557 P 0.633 +558 S 0.668 +559 P 0.691 +560 G 0.707 +561 P 0.721 +562 L 0.732 +563 G 0.737 +564 Y 0.738 +565 S 0.741 +566 S 0.744 +567 V 0.739 +568 G 0.728 +569 T 0.722 +570 P 0.728 +571 V 0.737 +572 G 0.738 +573 A 0.731 +574 P 0.724 +575 L 0.721 +576 S 0.728 +577 P 0.740 +578 V 0.747 +579 L 0.744 +580 D 0.737 +581 P 0.731 +582 A 0.734 +583 R 0.750 +584 S 0.772 +585 H 0.789 +586 S 0.796 +587 S 0.792 +588 T 0.777 +589 L 0.758 +590 S 0.745 +591 P 0.739 +592 Q 0.731 +593 V 0.709 +594 T 0.671 +595 N 0.619 +596 L 0.560 +597 N 0.503 +598 E 0.461 +599 W 0.460 +600 Y 0.511 +601 V 0.584 +602 C 0.643 +603 Q 0.679 +604 A 0.699 +605 S 0.708 +606 G 0.707 +607 A 0.705 +608 P 0.710 +609 S 0.715 +610 H 0.712 +611 L 0.700 +612 H 0.685 +613 T 0.674 +614 P 0.655 +615 S 0.624 +616 S 0.615 +617 N 0.657 +618 G 0.718 +619 T 0.754 +620 T 0.760 +621 S 0.751 +622 E 0.734 +623 T 0.705 +624 E 0.657 +625 D 0.593 +626 E 0.527 +627 E 0.467 +628 I 0.417 +629 Y 0.379 +630 G 0.353 +631 N 0.330 +632 P 0.304 +633 E 0.270 +634 V 0.232 +635 V 0.205 +636 R 0.198 +637 T 0.199 +638 I 0.196 +639 H 0.192 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000139800.9_ENST00000267294.5_GN:ZIC5_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000139800.9_ENST00000267294.5_GN:ZIC5_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6ec460ca5cea9a7f9716ce872ff2efbca159de63 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000139800.9_ENST00000267294.5_GN:ZIC5_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid @@ -0,0 +1,664 @@ +>ENSG00000139800.9|ENST00000267294.5|GN:ZIC5|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:24 +1 M 0.422 +2 F 0.485 +3 L 0.569 +4 K 0.634 +5 A 0.666 +6 G 0.670 +7 R 0.664 +8 G 0.663 +9 N 0.663 +10 K 0.662 +11 V 0.671 +12 P 0.699 +13 P 0.731 +14 V 0.748 +15 R 0.742 +16 V 0.720 +17 Y 0.689 +18 G 0.665 +19 P 0.660 +20 D 0.674 +21 C 0.697 +22 V 0.723 +23 V 0.739 +24 L 0.732 +25 M 0.699 +26 E 0.667 +27 P 0.662 +28 P 0.684 +29 L 0.709 +30 S 0.717 +31 K 0.703 +32 R 0.678 +33 N 0.668 +34 P 0.692 +35 P 0.736 +36 A 0.766 +37 L 0.768 +38 R 0.757 +39 L 0.750 +40 A 0.750 +41 D 0.756 +42 L 0.762 +43 A 0.760 +44 T 0.745 +45 A 0.731 +46 Q 0.730 +47 V 0.741 +48 Q 0.760 +49 P 0.779 +50 L 0.796 +51 Q 0.805 +52 N 0.806 +53 M 0.799 +54 T 0.790 +55 G 0.784 +56 F 0.789 +57 P 0.801 +58 A 0.808 +59 L 0.799 +60 A 0.774 +61 G 0.749 +62 P 0.745 +63 P 0.763 +64 A 0.785 +65 H 0.796 +66 S 0.798 +67 Q 0.797 +68 L 0.795 +69 R 0.789 +70 A 0.776 +71 A 0.756 +72 V 0.739 +73 A 0.734 +74 H 0.738 +75 L 0.746 +76 R 0.757 +77 L 0.772 +78 R 0.785 +79 D 0.790 +80 L 0.790 +81 G 0.786 +82 A 0.785 +83 D 0.787 +84 P 0.795 +85 G 0.810 +86 V 0.825 +87 A 0.826 +88 T 0.811 +89 T 0.793 +90 P 0.782 +91 L 0.775 +92 G 0.770 +93 P 0.765 +94 E 0.753 +95 H 0.716 +96 M 0.660 +97 A 0.631 +98 Q 0.653 +99 A 0.674 +100 S 0.651 +101 T 0.628 +102 L 0.657 +103 G 0.711 +104 L 0.742 +105 S 0.749 +106 P 0.755 +107 P 0.772 +108 S 0.789 +109 Q 0.796 +110 A 0.791 +111 F 0.779 +112 P 0.769 +113 A 0.762 +114 H 0.758 +115 P 0.759 +116 E 0.766 +117 A 0.774 +118 P 0.780 +119 A 0.780 +120 A 0.761 +121 A 0.712 +122 A 0.645 +123 R 0.612 +124 A 0.646 +125 A 0.711 +126 A 0.755 +127 L 0.765 +128 V 0.756 +129 A 0.744 +130 H 0.742 +131 P 0.758 +132 G 0.785 +133 A 0.805 +134 G 0.809 +135 S 0.804 +136 Y 0.803 +137 P 0.812 +138 C 0.826 +139 G 0.837 +140 G 0.843 +141 G 0.845 +142 S 0.844 +143 S 0.842 +144 G 0.835 +145 A 0.824 +146 Q 0.810 +147 P 0.795 +148 S 0.773 +149 A 0.734 +150 P 0.673 +151 P 0.605 +152 P 0.570 +153 P 0.584 +154 A 0.608 +155 P 0.624 +156 P 0.650 +157 L 0.685 +158 P 0.712 +159 P 0.723 +160 T 0.724 +161 P 0.717 +162 S 0.705 +163 P 0.691 +164 P 0.681 +165 P 0.676 +166 P 0.674 +167 P 0.675 +168 P 0.676 +169 P 0.677 +170 P 0.687 +171 P 0.715 +172 P 0.756 +173 P 0.795 +174 A 0.824 +175 L 0.838 +176 S 0.843 +177 G 0.843 +178 Y 0.843 +179 T 0.843 +180 T 0.842 +181 T 0.839 +182 N 0.837 +183 S 0.836 +184 G 0.837 +185 G 0.840 +186 G 0.842 +187 G 0.841 +188 S 0.836 +189 S 0.831 +190 G 0.827 +191 K 0.822 +192 G 0.815 +193 H 0.805 +194 S 0.798 +195 R 0.795 +196 D 0.793 +197 F 0.792 +198 V 0.792 +199 L 0.795 +200 R 0.799 +201 R 0.802 +202 D 0.801 +203 L 0.797 +204 S 0.793 +205 A 0.792 +206 T 0.791 +207 A 0.794 +208 P 0.807 +209 A 0.826 +210 A 0.839 +211 A 0.840 +212 M 0.835 +213 H 0.827 +214 G 0.820 +215 A 0.819 +216 P 0.824 +217 L 0.829 +218 G 0.818 +219 G 0.771 +220 E 0.699 +221 Q 0.659 +222 R 0.688 +223 S 0.751 +224 G 0.794 +225 T 0.806 +226 G 0.803 +227 S 0.793 +228 P 0.780 +229 Q 0.767 +230 H 0.755 +231 P 0.742 +232 A 0.730 +233 P 0.723 +234 P 0.729 +235 P 0.747 +236 H 0.767 +237 S 0.784 +238 A 0.797 +239 G 0.807 +240 M 0.815 +241 F 0.819 +242 I 0.819 +243 S 0.815 +244 A 0.812 +245 S 0.812 +246 G 0.816 +247 T 0.818 +248 Y 0.814 +249 A 0.804 +250 G 0.797 +251 P 0.798 +252 D 0.806 +253 G 0.812 +254 S 0.810 +255 G 0.803 +256 G 0.797 +257 P 0.792 +258 A 0.784 +259 L 0.773 +260 F 0.772 +261 P 0.783 +262 A 0.796 +263 L 0.799 +264 H 0.794 +265 D 0.788 +266 T 0.785 +267 P 0.786 +268 G 0.791 +269 A 0.795 +270 P 0.796 +271 G 0.791 +272 G 0.774 +273 H 0.749 +274 P 0.729 +275 H 0.727 +276 P 0.741 +277 L 0.758 +278 N 0.768 +279 G 0.771 +280 Q 0.769 +281 M 0.765 +282 R 0.756 +283 L 0.735 +284 G 0.690 +285 L 0.613 +286 A 0.510 +287 A 0.410 +288 A 0.347 +289 A 0.329 +290 A 0.347 +291 A 0.379 +292 A 0.408 +293 A 0.433 +294 A 0.458 +295 E 0.486 +296 L 0.521 +297 Y 0.564 +298 G 0.609 +299 R 0.642 +300 A 0.657 +301 E 0.661 +302 P 0.670 +303 P 0.694 +304 F 0.722 +305 A 0.744 +306 P 0.759 +307 R 0.772 +308 S 0.780 +309 G 0.776 +310 D 0.764 +311 A 0.746 +312 H 0.711 +313 Y 0.654 +314 G 0.584 +315 A 0.506 +316 V 0.418 +317 A 0.329 +318 A 0.270 +319 A 0.252 +320 A 0.258 +321 A 0.274 +322 A 0.305 +323 A 0.353 +324 L 0.415 +325 H 0.485 +326 G 0.555 +327 Y 0.616 +328 G 0.663 +329 A 0.698 +330 V 0.720 +331 N 0.727 +332 L 0.725 +333 N 0.721 +334 L 0.708 +335 N 0.669 +336 L 0.604 +337 A 0.547 +338 A 0.523 +339 A 0.525 +340 A 0.543 +341 A 0.577 +342 A 0.617 +343 A 0.641 +344 A 0.641 +345 A 0.633 +346 G 0.642 +347 P 0.675 +348 G 0.718 +349 P 0.752 +350 H 0.770 +351 L 0.771 +352 Q 0.756 +353 H 0.727 +354 H 0.682 +355 A 0.619 +356 P 0.556 +357 P 0.530 +358 P 0.553 +359 A 0.585 +360 P 0.598 +361 P 0.606 +362 P 0.627 +363 P 0.660 +364 P 0.699 +365 A 0.738 +366 P 0.764 +367 A 0.773 +368 Q 0.771 +369 H 0.769 +370 P 0.772 +371 H 0.774 +372 Q 0.770 +373 H 0.762 +374 H 0.760 +375 P 0.767 +376 H 0.777 +377 L 0.787 +378 P 0.795 +379 G 0.796 +380 A 0.784 +381 A 0.759 +382 G 0.721 +383 A 0.672 +384 F 0.612 +385 L 0.551 +386 R 0.508 +387 Y 0.500 +388 M 0.518 +389 R 0.539 +390 Q 0.549 +391 P 0.536 +392 I 0.483 +393 K 0.395 +394 Q 0.292 +395 E 0.200 +396 L 0.131 +397 I 0.091 +398 C 0.076 +399 K 0.087 +400 W 0.122 +401 I 0.174 +402 D 0.240 +403 P 0.330 +404 D 0.437 +405 E 0.525 +406 L 0.565 +407 A 0.559 +408 G 0.526 +409 L 0.487 +410 P 0.462 +411 P 0.457 +412 P 0.460 +413 P 0.458 +414 P 0.450 +415 P 0.439 +416 P 0.423 +417 P 0.404 +418 P 0.390 +419 P 0.390 +420 P 0.409 +421 P 0.446 +422 P 0.498 +423 P 0.562 +424 P 0.616 +425 A 0.635 +426 G 0.600 +427 G 0.511 +428 A 0.393 +429 K 0.281 +430 P 0.194 +431 C 0.136 +432 S 0.103 +433 K 0.094 +434 T 0.099 +435 F 0.105 +436 G 0.103 +437 T 0.096 +438 M 0.094 +439 H 0.098 +440 E 0.104 +441 L 0.107 +442 V 0.101 +443 N 0.086 +444 H 0.069 +445 V 0.057 +446 T 0.053 +447 V 0.053 +448 E 0.059 +449 H 0.078 +450 V 0.115 +451 G 0.164 +452 G 0.209 +453 P 0.231 +454 E 0.221 +455 Q 0.185 +456 S 0.141 +457 S 0.105 +458 H 0.081 +459 V 0.067 +460 C 0.059 +461 F 0.057 +462 W 0.059 +463 E 0.065 +464 D 0.070 +465 C 0.074 +466 P 0.079 +467 R 0.089 +468 E 0.103 +469 G 0.118 +470 K 0.131 +471 P 0.137 +472 F 0.129 +473 K 0.109 +474 A 0.095 +475 K 0.097 +476 Y 0.116 +477 K 0.138 +478 L 0.148 +479 I 0.138 +480 N 0.119 +481 H 0.108 +482 I 0.111 +483 R 0.118 +484 V 0.124 +485 H 0.136 +486 T 0.159 +487 G 0.183 +488 E 0.191 +489 K 0.177 +490 P 0.159 +491 F 0.152 +492 P 0.153 +493 C 0.155 +494 P 0.161 +495 F 0.166 +496 P 0.161 +497 G 0.148 +498 C 0.138 +499 G 0.138 +500 K 0.147 +501 V 0.159 +502 F 0.168 +503 A 0.168 +504 R 0.169 +505 S 0.186 +506 E 0.222 +507 N 0.249 +508 L 0.240 +509 K 0.202 +510 I 0.163 +511 H 0.146 +512 K 0.155 +513 R 0.177 +514 T 0.197 +515 H 0.218 +516 T 0.244 +517 G 0.259 +518 E 0.248 +519 K 0.212 +520 P 0.170 +521 F 0.139 +522 K 0.123 +523 C 0.121 +524 E 0.129 +525 F 0.138 +526 D 0.132 +527 G 0.113 +528 C 0.093 +529 D 0.090 +530 R 0.112 +531 K 0.150 +532 F 0.182 +533 A 0.194 +534 N 0.193 +535 S 0.196 +536 S 0.207 +537 D 0.216 +538 R 0.221 +539 K 0.224 +540 K 0.225 +541 H 0.224 +542 S 0.225 +543 H 0.223 +544 V 0.218 +545 H 0.219 +546 T 0.228 +547 S 0.237 +548 D 0.238 +549 K 0.221 +550 P 0.187 +551 Y 0.150 +552 Y 0.126 +553 C 0.122 +554 K 0.136 +555 I 0.152 +556 R 0.154 +557 G 0.139 +558 C 0.123 +559 D 0.118 +560 K 0.126 +561 S 0.138 +562 Y 0.148 +563 T 0.154 +564 H 0.153 +565 P 0.143 +566 S 0.125 +567 S 0.112 +568 L 0.106 +569 R 0.106 +570 K 0.102 +571 H 0.091 +572 M 0.082 +573 K 0.086 +574 I 0.116 +575 H 0.182 +576 C 0.278 +577 K 0.377 +578 S 0.459 +579 P 0.526 +580 P 0.583 +581 P 0.629 +582 S 0.663 +583 P 0.685 +584 G 0.701 +585 P 0.715 +586 L 0.726 +587 G 0.731 +588 Y 0.731 +589 S 0.734 +590 S 0.737 +591 V 0.733 +592 G 0.722 +593 T 0.716 +594 P 0.723 +595 V 0.733 +596 G 0.733 +597 A 0.727 +598 P 0.720 +599 L 0.718 +600 S 0.724 +601 P 0.736 +602 V 0.742 +603 L 0.740 +604 D 0.733 +605 P 0.728 +606 A 0.731 +607 R 0.747 +608 S 0.769 +609 H 0.787 +610 S 0.794 +611 S 0.790 +612 T 0.775 +613 L 0.757 +614 S 0.744 +615 P 0.739 +616 Q 0.731 +617 V 0.711 +618 T 0.674 +619 N 0.621 +620 L 0.562 +621 N 0.505 +622 E 0.464 +623 W 0.464 +624 Y 0.512 +625 V 0.583 +626 C 0.642 +627 Q 0.678 +628 A 0.699 +629 S 0.707 +630 G 0.706 +631 A 0.704 +632 P 0.709 +633 S 0.713 +634 H 0.711 +635 L 0.699 +636 H 0.685 +637 T 0.675 +638 P 0.656 +639 S 0.625 +640 S 0.616 +641 N 0.658 +642 G 0.720 +643 T 0.755 +644 T 0.760 +645 S 0.750 +646 E 0.732 +647 T 0.702 +648 E 0.654 +649 D 0.591 +650 E 0.526 +651 E 0.468 +652 I 0.419 +653 Y 0.382 +654 G 0.356 +655 N 0.332 +656 P 0.304 +657 E 0.268 +658 V 0.229 +659 V 0.201 +660 R 0.194 +661 T 0.196 +662 I 0.196 +663 H 0.194 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000142224.18_ENST00000659997.3_GN:IL19_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000142224.18_ENST00000659997.3_GN:IL19_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..689cac7ebdff86752c4f8df82d633d16c12ad0ba --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000142224.18_ENST00000659997.3_GN:IL19_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,178 @@ +>ENSG00000142224.18|ENST00000659997.3|GN:IL19|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.373 +2 K 0.376 +3 L 0.379 +4 Q 0.371 +5 C 0.348 +6 V 0.323 +7 S 0.316 +8 L 0.321 +9 W 0.330 +10 L 0.343 +11 L 0.355 +12 G 0.348 +13 T 0.330 +14 I 0.323 +15 L 0.336 +16 I 0.349 +17 L 0.355 +18 C 0.362 +19 S 0.386 +20 V 0.423 +21 D 0.459 +22 N 0.475 +23 H 0.464 +24 G 0.428 +25 L 0.372 +26 R 0.302 +27 R 0.237 +28 C 0.189 +29 L 0.158 +30 I 0.140 +31 S 0.131 +32 T 0.123 +33 D 0.108 +34 M 0.089 +35 H 0.077 +36 H 0.072 +37 I 0.065 +38 E 0.055 +39 E 0.046 +40 S 0.040 +41 F 0.035 +42 Q 0.034 +43 E 0.036 +44 I 0.041 +45 K 0.048 +46 R 0.057 +47 A 0.065 +48 I 0.072 +49 Q 0.083 +50 A 0.103 +51 K 0.131 +52 D 0.162 +53 T 0.192 +54 F 0.208 +55 P 0.202 +56 N 0.177 +57 V 0.147 +58 T 0.122 +59 I 0.105 +60 L 0.098 +61 S 0.096 +62 T 0.096 +63 L 0.094 +64 E 0.090 +65 T 0.085 +66 L 0.083 +67 Q 0.086 +68 I 0.089 +69 I 0.085 +70 K 0.078 +71 P 0.072 +72 L 0.067 +73 D 0.056 +74 V 0.041 +75 C 0.033 +76 C 0.032 +77 V 0.035 +78 T 0.039 +79 K 0.041 +80 N 0.042 +81 L 0.041 +82 L 0.037 +83 A 0.032 +84 F 0.027 +85 Y 0.028 +86 V 0.036 +87 D 0.048 +88 R 0.056 +89 V 0.058 +90 F 0.063 +91 K 0.077 +92 D 0.094 +93 H 0.103 +94 Q 0.101 +95 E 0.094 +96 P 0.087 +97 N 0.078 +98 P 0.069 +99 K 0.063 +100 I 0.060 +101 L 0.056 +102 R 0.050 +103 K 0.045 +104 I 0.045 +105 S 0.047 +106 S 0.052 +107 I 0.062 +108 A 0.071 +109 N 0.071 +110 S 0.058 +111 F 0.042 +112 L 0.033 +113 Y 0.030 +114 M 0.036 +115 Q 0.048 +116 K 0.053 +117 T 0.047 +118 L 0.035 +119 R 0.028 +120 Q 0.027 +121 C 0.030 +122 Q 0.038 +123 E 0.050 +124 Q 0.065 +125 R 0.078 +126 Q 0.082 +127 C 0.077 +128 H 0.067 +129 C 0.056 +130 R 0.051 +131 Q 0.051 +132 E 0.053 +133 A 0.055 +134 T 0.059 +135 N 0.060 +136 A 0.057 +137 T 0.053 +138 R 0.051 +139 V 0.054 +140 I 0.058 +141 H 0.065 +142 D 0.074 +143 N 0.082 +144 Y 0.087 +145 D 0.090 +146 Q 0.092 +147 L 0.091 +148 E 0.086 +149 V 0.077 +150 H 0.071 +151 A 0.069 +152 A 0.071 +153 A 0.080 +154 I 0.089 +155 K 0.095 +156 S 0.098 +157 L 0.098 +158 G 0.094 +159 E 0.084 +160 L 0.069 +161 D 0.053 +162 V 0.042 +163 F 0.037 +164 L 0.035 +165 A 0.032 +166 W 0.031 +167 I 0.031 +168 N 0.033 +169 K 0.035 +170 N 0.038 +171 H 0.042 +172 E 0.046 +173 V 0.052 +174 M 0.067 +175 F 0.096 +176 S 0.132 +177 A 0.157 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000142224.18_ENST00000659997.3_GN:IL19_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:38.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000142224.18_ENST00000659997.3_GN:IL19_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:38.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..025db8a5650660ae48ad14578bbf2e76df613eab --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000142224.18_ENST00000659997.3_GN:IL19_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:38.caid @@ -0,0 +1,216 @@ +>ENSG00000142224.18|ENST00000659997.3|GN:IL19|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:38 +1 M 0.356 +2 C 0.394 +3 T 0.464 +4 E 0.545 +5 G 0.606 +6 A 0.632 +7 F 0.644 +8 P 0.665 +9 H 0.694 +10 R 0.715 +11 S 0.714 +12 A 0.690 +13 C 0.658 +14 S 0.639 +15 L 0.630 +16 P 0.605 +17 L 0.560 +18 T 0.529 +19 H 0.535 +20 V 0.542 +21 H 0.523 +22 T 0.511 +23 H 0.543 +24 I 0.599 +25 H 0.640 +26 V 0.657 +27 C 0.666 +28 V 0.681 +29 P 0.699 +30 V 0.708 +31 L 0.708 +32 W 0.702 +33 G 0.688 +34 S 0.661 +35 V 0.638 +36 P 0.644 +37 R 0.677 +38 G 0.711 +39 M 0.720 +40 K 0.709 +41 L 0.697 +42 Q 0.689 +43 C 0.674 +44 V 0.644 +45 S 0.605 +46 L 0.579 +47 W 0.578 +48 L 0.595 +49 L 0.616 +50 G 0.622 +51 T 0.602 +52 I 0.564 +53 L 0.529 +54 I 0.503 +55 L 0.476 +56 C 0.458 +57 S 0.462 +58 V 0.485 +59 D 0.504 +60 N 0.508 +61 H 0.492 +62 G 0.456 +63 L 0.394 +64 R 0.315 +65 R 0.242 +66 C 0.190 +67 L 0.157 +68 I 0.137 +69 S 0.126 +70 T 0.117 +71 D 0.103 +72 M 0.085 +73 H 0.074 +74 H 0.069 +75 I 0.063 +76 E 0.053 +77 E 0.045 +78 S 0.040 +79 F 0.035 +80 Q 0.033 +81 E 0.034 +82 I 0.038 +83 K 0.042 +84 R 0.049 +85 A 0.057 +86 I 0.064 +87 Q 0.073 +88 A 0.090 +89 K 0.115 +90 D 0.145 +91 T 0.172 +92 F 0.188 +93 P 0.182 +94 N 0.159 +95 V 0.130 +96 T 0.106 +97 I 0.090 +98 L 0.084 +99 S 0.084 +100 T 0.085 +101 L 0.084 +102 E 0.080 +103 T 0.076 +104 L 0.075 +105 Q 0.080 +106 I 0.083 +107 I 0.081 +108 K 0.075 +109 P 0.071 +110 L 0.066 +111 D 0.055 +112 V 0.041 +113 C 0.032 +114 C 0.031 +115 V 0.033 +116 T 0.036 +117 K 0.039 +118 N 0.040 +119 L 0.039 +120 L 0.035 +121 A 0.030 +122 F 0.026 +123 Y 0.026 +124 V 0.033 +125 D 0.044 +126 R 0.051 +127 V 0.052 +128 F 0.056 +129 K 0.069 +130 D 0.086 +131 H 0.096 +132 Q 0.097 +133 E 0.093 +134 P 0.088 +135 N 0.080 +136 P 0.071 +137 K 0.065 +138 I 0.062 +139 L 0.058 +140 R 0.051 +141 K 0.047 +142 I 0.046 +143 S 0.049 +144 S 0.054 +145 I 0.064 +146 A 0.074 +147 N 0.073 +148 S 0.060 +149 F 0.044 +150 L 0.033 +151 Y 0.031 +152 M 0.037 +153 Q 0.048 +154 K 0.053 +155 T 0.047 +156 L 0.035 +157 R 0.028 +158 Q 0.027 +159 C 0.031 +160 Q 0.039 +161 E 0.052 +162 Q 0.068 +163 R 0.079 +164 Q 0.083 +165 C 0.077 +166 H 0.067 +167 C 0.058 +168 R 0.053 +169 Q 0.054 +170 E 0.058 +171 A 0.061 +172 T 0.064 +173 N 0.064 +174 A 0.060 +175 T 0.054 +176 R 0.051 +177 V 0.054 +178 I 0.059 +179 H 0.066 +180 D 0.075 +181 N 0.083 +182 Y 0.087 +183 D 0.089 +184 Q 0.091 +185 L 0.090 +186 E 0.085 +187 V 0.078 +188 H 0.073 +189 A 0.072 +190 A 0.076 +191 A 0.086 +192 I 0.098 +193 K 0.104 +194 S 0.106 +195 L 0.106 +196 G 0.102 +197 E 0.092 +198 L 0.076 +199 D 0.058 +200 V 0.046 +201 F 0.041 +202 L 0.037 +203 A 0.034 +204 W 0.031 +205 I 0.031 +206 N 0.033 +207 K 0.035 +208 N 0.039 +209 H 0.043 +210 E 0.046 +211 V 0.053 +212 M 0.069 +213 F 0.099 +214 S 0.137 +215 A 0.164 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000142538.3_ENST00000270631.2_GN:PTH2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000142538.3_ENST00000270631.2_GN:PTH2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..31e5bcc9fff5946d3de31c207814040977d12133 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000142538.3_ENST00000270631.2_GN:PTH2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,101 @@ +>ENSG00000142538.3|ENST00000270631.2|GN:PTH2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.475 +2 E 0.497 +3 T 0.529 +4 R 0.558 +5 Q 0.571 +6 V 0.559 +7 S 0.515 +8 R 0.447 +9 S 0.365 +10 P 0.282 +11 R 0.217 +12 V 0.178 +13 R 0.160 +14 L 0.156 +15 L 0.157 +16 L 0.160 +17 L 0.162 +18 L 0.159 +19 L 0.156 +20 L 0.161 +21 L 0.177 +22 L 0.201 +23 V 0.236 +24 V 0.282 +25 P 0.344 +26 W 0.431 +27 G 0.525 +28 V 0.594 +29 R 0.637 +30 T 0.671 +31 A 0.697 +32 S 0.709 +33 G 0.708 +34 V 0.696 +35 A 0.675 +36 L 0.660 +37 P 0.670 +38 P 0.703 +39 V 0.738 +40 G 0.749 +41 V 0.720 +42 L 0.662 +43 S 0.606 +44 L 0.582 +45 R 0.589 +46 P 0.616 +47 P 0.657 +48 G 0.696 +49 R 0.715 +50 A 0.712 +51 W 0.693 +52 A 0.663 +53 D 0.626 +54 P 0.590 +55 A 0.569 +56 T 0.569 +57 P 0.591 +58 R 0.629 +59 P 0.667 +60 R 0.690 +61 R 0.695 +62 S 0.687 +63 L 0.666 +64 A 0.631 +65 L 0.575 +66 A 0.494 +67 D 0.395 +68 D 0.304 +69 A 0.238 +70 A 0.197 +71 F 0.165 +72 R 0.140 +73 E 0.124 +74 R 0.119 +75 A 0.121 +76 R 0.128 +77 L 0.134 +78 L 0.136 +79 A 0.133 +80 A 0.127 +81 L 0.118 +82 E 0.108 +83 R 0.103 +84 R 0.105 +85 H 0.113 +86 W 0.126 +87 L 0.144 +88 N 0.162 +89 S 0.176 +90 Y 0.188 +91 M 0.206 +92 H 0.235 +93 K 0.270 +94 L 0.304 +95 L 0.336 +96 V 0.368 +97 L 0.392 +98 D 0.402 +99 A 0.401 +100 P 0.398 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000142538.3_ENST00000270631.2_GN:PTH2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000142538.3_ENST00000270631.2_GN:PTH2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7fcaea438a6a37c04139c3aad5bd16d84d7140f6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000142538.3_ENST00000270631.2_GN:PTH2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid @@ -0,0 +1,125 @@ +>ENSG00000142538.3|ENST00000270631.2|GN:PTH2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:24 +1 M 0.492 +2 H 0.536 +3 G 0.588 +4 G 0.606 +5 A 0.586 +6 R 0.575 +7 G 0.610 +8 S 0.668 +9 G 0.712 +10 P 0.735 +11 G 0.745 +12 C 0.744 +13 S 0.741 +14 P 0.744 +15 T 0.753 +16 E 0.765 +17 P 0.778 +18 L 0.788 +19 S 0.796 +20 G 0.799 +21 S 0.803 +22 P 0.812 +23 Q 0.825 +24 V 0.834 +25 M 0.833 +26 E 0.821 +27 T 0.804 +28 R 0.784 +29 Q 0.755 +30 V 0.707 +31 S 0.630 +32 R 0.528 +33 S 0.418 +34 P 0.321 +35 R 0.252 +36 V 0.211 +37 R 0.190 +38 L 0.182 +39 L 0.184 +40 L 0.194 +41 L 0.198 +42 L 0.191 +43 L 0.181 +44 L 0.181 +45 L 0.191 +46 L 0.210 +47 V 0.241 +48 V 0.282 +49 P 0.339 +50 W 0.425 +51 G 0.525 +52 V 0.602 +53 R 0.652 +54 T 0.693 +55 A 0.724 +56 S 0.740 +57 G 0.742 +58 V 0.733 +59 A 0.716 +60 L 0.701 +61 P 0.708 +62 P 0.737 +63 V 0.770 +64 G 0.783 +65 V 0.761 +66 L 0.709 +67 S 0.657 +68 L 0.632 +69 R 0.634 +70 P 0.654 +71 P 0.687 +72 G 0.720 +73 R 0.736 +74 A 0.730 +75 W 0.709 +76 A 0.680 +77 D 0.645 +78 P 0.613 +79 A 0.593 +80 T 0.593 +81 P 0.613 +82 R 0.649 +83 P 0.685 +84 R 0.706 +85 R 0.707 +86 S 0.691 +87 L 0.664 +88 A 0.625 +89 L 0.569 +90 A 0.491 +91 D 0.396 +92 D 0.306 +93 A 0.240 +94 A 0.198 +95 F 0.168 +96 R 0.143 +97 E 0.128 +98 R 0.122 +99 A 0.124 +100 R 0.128 +101 L 0.131 +102 L 0.129 +103 A 0.124 +104 A 0.117 +105 L 0.108 +106 E 0.099 +107 R 0.095 +108 R 0.099 +109 H 0.108 +110 W 0.122 +111 L 0.139 +112 N 0.158 +113 S 0.173 +114 Y 0.187 +115 M 0.204 +116 H 0.231 +117 K 0.267 +118 L 0.306 +119 L 0.344 +120 V 0.383 +121 L 0.413 +122 D 0.423 +123 A 0.419 +124 P 0.413 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000143067.6_ENST00000421812.3_GN:ZNF697_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000143067.6_ENST00000421812.3_GN:ZNF697_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1fd3c9ddf9ebc1b3a1932625916dd873f8c07054 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000143067.6_ENST00000421812.3_GN:ZNF697_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,546 @@ +>ENSG00000143067.6|ENST00000421812.3|GN:ZNF697|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.393 +2 K 0.417 +3 Q 0.457 +4 E 0.502 +5 D 0.527 +6 N 0.524 +7 Q 0.524 +8 G 0.549 +9 V 0.560 +10 C 0.530 +11 A 0.499 +12 H 0.508 +13 Q 0.529 +14 D 0.525 +15 S 0.514 +16 E 0.522 +17 D 0.535 +18 K 0.551 +19 G 0.584 +20 M 0.604 +21 G 0.585 +22 S 0.566 +23 D 0.592 +24 F 0.646 +25 E 0.690 +26 D 0.712 +27 S 0.719 +28 E 0.718 +29 D 0.716 +30 R 0.714 +31 E 0.710 +32 G 0.706 +33 D 0.700 +34 P 0.687 +35 E 0.657 +36 E 0.612 +37 R 0.594 +38 E 0.622 +39 M 0.644 +40 G 0.619 +41 S 0.577 +42 N 0.560 +43 P 0.561 +44 H 0.582 +45 D 0.643 +46 T 0.714 +47 N 0.756 +48 K 0.765 +49 R 0.762 +50 E 0.753 +51 G 0.739 +52 H 0.727 +53 P 0.728 +54 E 0.745 +55 P 0.770 +56 E 0.793 +57 M 0.804 +58 G 0.797 +59 S 0.770 +60 N 0.718 +61 P 0.655 +62 Q 0.628 +63 D 0.665 +64 S 0.722 +65 R 0.754 +66 H 0.765 +67 R 0.777 +68 E 0.785 +69 A 0.782 +70 V 0.776 +71 P 0.780 +72 D 0.789 +73 I 0.794 +74 C 0.796 +75 T 0.800 +76 E 0.805 +77 G 0.807 +78 Q 0.804 +79 L 0.794 +80 S 0.771 +81 E 0.728 +82 E 0.675 +83 E 0.652 +84 G 0.683 +85 V 0.736 +86 S 0.773 +87 V 0.793 +88 R 0.804 +89 G 0.807 +90 E 0.805 +91 E 0.801 +92 D 0.797 +93 D 0.792 +94 Q 0.788 +95 S 0.790 +96 G 0.795 +97 V 0.799 +98 A 0.797 +99 D 0.790 +100 M 0.774 +101 A 0.753 +102 M 0.734 +103 F 0.730 +104 P 0.738 +105 G 0.748 +106 L 0.750 +107 S 0.746 +108 E 0.742 +109 S 0.735 +110 D 0.718 +111 S 0.682 +112 I 0.624 +113 S 0.563 +114 R 0.542 +115 S 0.582 +116 L 0.649 +117 R 0.702 +118 E 0.732 +119 D 0.745 +120 D 0.752 +121 D 0.757 +122 E 0.764 +123 S 0.772 +124 A 0.777 +125 G 0.777 +126 E 0.765 +127 N 0.730 +128 R 0.679 +129 L 0.648 +130 E 0.663 +131 E 0.697 +132 E 0.706 +133 E 0.681 +134 E 0.637 +135 Q 0.595 +136 P 0.572 +137 A 0.576 +138 P 0.599 +139 P 0.629 +140 V 0.651 +141 L 0.660 +142 P 0.659 +143 W 0.660 +144 R 0.673 +145 R 0.694 +146 H 0.709 +147 L 0.717 +148 S 0.725 +149 L 0.735 +150 G 0.742 +151 S 0.746 +152 R 0.749 +153 H 0.750 +154 R 0.748 +155 G 0.742 +156 D 0.733 +157 K 0.725 +158 P 0.724 +159 A 0.729 +160 H 0.734 +161 R 0.735 +162 R 0.731 +163 F 0.726 +164 H 0.716 +165 R 0.698 +166 L 0.673 +167 H 0.659 +168 H 0.672 +169 P 0.705 +170 M 0.730 +171 A 0.722 +172 V 0.680 +173 D 0.631 +174 L 0.595 +175 G 0.564 +176 E 0.522 +177 L 0.470 +178 D 0.427 +179 S 0.419 +180 L 0.434 +181 V 0.447 +182 A 0.455 +183 S 0.470 +184 I 0.478 +185 M 0.462 +186 D 0.426 +187 A 0.368 +188 P 0.285 +189 T 0.197 +190 I 0.133 +191 C 0.101 +192 P 0.091 +193 D 0.097 +194 C 0.112 +195 G 0.124 +196 E 0.126 +197 S 0.122 +198 F 0.117 +199 S 0.108 +200 P 0.096 +201 G 0.090 +202 A 0.091 +203 A 0.090 +204 F 0.086 +205 L 0.083 +206 Q 0.080 +207 H 0.078 +208 Q 0.080 +209 R 0.089 +210 I 0.105 +211 H 0.132 +212 R 0.168 +213 L 0.207 +214 A 0.245 +215 E 0.284 +216 A 0.321 +217 A 0.359 +218 A 0.403 +219 A 0.452 +220 A 0.495 +221 S 0.533 +222 L 0.573 +223 E 0.617 +224 P 0.655 +225 F 0.680 +226 G 0.690 +227 L 0.691 +228 A 0.688 +229 G 0.681 +230 E 0.658 +231 C 0.612 +232 D 0.560 +233 A 0.543 +234 M 0.578 +235 V 0.632 +236 G 0.663 +237 M 0.673 +238 M 0.684 +239 G 0.705 +240 V 0.732 +241 G 0.754 +242 V 0.768 +243 A 0.772 +244 G 0.771 +245 G 0.770 +246 F 0.768 +247 G 0.760 +248 A 0.744 +249 G 0.727 +250 P 0.717 +251 P 0.715 +252 L 0.705 +253 A 0.676 +254 R 0.632 +255 P 0.581 +256 P 0.521 +257 R 0.439 +258 E 0.342 +259 K 0.246 +260 P 0.169 +261 F 0.119 +262 R 0.094 +263 C 0.086 +264 G 0.087 +265 E 0.092 +266 C 0.097 +267 G 0.101 +268 K 0.106 +269 G 0.113 +270 F 0.115 +271 S 0.108 +272 R 0.100 +273 N 0.101 +274 T 0.113 +275 Y 0.131 +276 L 0.144 +277 T 0.148 +278 N 0.141 +279 H 0.133 +280 L 0.136 +281 R 0.151 +282 L 0.168 +283 H 0.185 +284 T 0.203 +285 G 0.217 +286 E 0.211 +287 R 0.182 +288 P 0.141 +289 N 0.105 +290 L 0.081 +291 C 0.070 +292 A 0.069 +293 D 0.074 +294 C 0.082 +295 G 0.090 +296 K 0.101 +297 S 0.114 +298 F 0.123 +299 S 0.124 +300 W 0.123 +301 R 0.126 +302 A 0.129 +303 D 0.132 +304 L 0.136 +305 L 0.141 +306 K 0.144 +307 H 0.152 +308 R 0.176 +309 R 0.210 +310 L 0.234 +311 H 0.243 +312 T 0.248 +313 G 0.254 +314 E 0.242 +315 K 0.208 +316 P 0.166 +317 Y 0.137 +318 P 0.121 +319 C 0.112 +320 P 0.107 +321 E 0.110 +322 C 0.119 +323 G 0.128 +324 E 0.132 +325 A 0.129 +326 F 0.123 +327 S 0.115 +328 L 0.110 +329 S 0.110 +330 S 0.109 +331 H 0.102 +332 L 0.092 +333 L 0.084 +334 S 0.079 +335 H 0.080 +336 R 0.090 +337 R 0.111 +338 A 0.138 +339 H 0.175 +340 A 0.227 +341 A 0.283 +342 A 0.330 +343 S 0.371 +344 G 0.415 +345 A 0.459 +346 G 0.483 +347 A 0.475 +348 A 0.440 +349 A 0.384 +350 L 0.313 +351 R 0.238 +352 P 0.176 +353 F 0.134 +354 A 0.110 +355 C 0.098 +356 G 0.096 +357 E 0.100 +358 C 0.108 +359 G 0.117 +360 K 0.127 +361 G 0.138 +362 F 0.144 +363 V 0.145 +364 R 0.148 +365 R 0.162 +366 S 0.188 +367 H 0.212 +368 L 0.223 +369 A 0.223 +370 N 0.215 +371 H 0.205 +372 Q 0.202 +373 R 0.207 +374 I 0.213 +375 H 0.219 +376 T 0.227 +377 G 0.227 +378 E 0.208 +379 K 0.173 +380 P 0.141 +381 H 0.125 +382 G 0.120 +383 C 0.115 +384 G 0.108 +385 E 0.104 +386 C 0.102 +387 G 0.103 +388 K 0.109 +389 R 0.118 +390 F 0.125 +391 S 0.126 +392 W 0.125 +393 R 0.126 +394 S 0.131 +395 D 0.141 +396 L 0.155 +397 V 0.167 +398 K 0.174 +399 H 0.179 +400 Q 0.189 +401 R 0.201 +402 V 0.210 +403 H 0.220 +404 T 0.233 +405 G 0.238 +406 E 0.222 +407 K 0.186 +408 P 0.143 +409 Y 0.111 +410 M 0.091 +411 C 0.081 +412 S 0.080 +413 E 0.085 +414 C 0.094 +415 G 0.102 +416 E 0.109 +417 T 0.112 +418 F 0.112 +419 S 0.110 +420 V 0.110 +421 S 0.116 +422 S 0.128 +423 H 0.138 +424 L 0.141 +425 F 0.138 +426 T 0.137 +427 H 0.144 +428 K 0.167 +429 R 0.197 +430 T 0.223 +431 H 0.245 +432 S 0.261 +433 G 0.259 +434 E 0.233 +435 R 0.189 +436 P 0.142 +437 Y 0.106 +438 V 0.085 +439 C 0.077 +440 R 0.079 +441 E 0.090 +442 C 0.103 +443 G 0.115 +444 K 0.126 +445 G 0.138 +446 F 0.150 +447 G 0.156 +448 R 0.159 +449 N 0.170 +450 S 0.193 +451 H 0.216 +452 L 0.226 +453 V 0.225 +454 N 0.214 +455 H 0.199 +456 L 0.197 +457 R 0.215 +458 V 0.237 +459 H 0.253 +460 T 0.266 +461 G 0.270 +462 E 0.250 +463 K 0.206 +464 P 0.159 +465 F 0.127 +466 R 0.112 +467 C 0.108 +468 G 0.108 +469 Q 0.108 +470 C 0.107 +471 E 0.114 +472 K 0.130 +473 R 0.152 +474 F 0.171 +475 S 0.182 +476 D 0.180 +477 F 0.166 +478 S 0.152 +479 T 0.148 +480 L 0.151 +481 T 0.160 +482 Q 0.173 +483 H 0.190 +484 Q 0.216 +485 R 0.246 +486 T 0.274 +487 H 0.297 +488 T 0.314 +489 G 0.319 +490 E 0.300 +491 K 0.256 +492 P 0.202 +493 Y 0.156 +494 T 0.124 +495 C 0.107 +496 I 0.104 +497 E 0.113 +498 C 0.130 +499 G 0.144 +500 K 0.148 +501 S 0.147 +502 F 0.145 +503 I 0.148 +504 Q 0.159 +505 S 0.174 +506 S 0.185 +507 H 0.188 +508 L 0.182 +509 I 0.174 +510 R 0.167 +511 H 0.163 +512 R 0.168 +513 R 0.182 +514 I 0.200 +515 H 0.220 +516 T 0.242 +517 G 0.261 +518 N 0.263 +519 K 0.244 +520 P 0.215 +521 H 0.191 +522 K 0.175 +523 C 0.165 +524 A 0.162 +525 G 0.164 +526 C 0.164 +527 G 0.160 +528 K 0.152 +529 G 0.144 +530 F 0.140 +531 R 0.139 +532 Y 0.140 +533 K 0.142 +534 T 0.141 +535 H 0.137 +536 L 0.135 +537 A 0.136 +538 Q 0.135 +539 H 0.128 +540 Q 0.118 +541 K 0.109 +542 L 0.100 +543 H 0.094 +544 L 0.092 +545 C 0.093 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000143067.6_ENST00000421812.3_GN:ZNF697_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:63.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000143067.6_ENST00000421812.3_GN:ZNF697_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:63.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4c399ed5d5aa61575d1cf34134ff2861f5588e21 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000143067.6_ENST00000421812.3_GN:ZNF697_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:63.caid @@ -0,0 +1,609 @@ +>ENSG00000143067.6|ENST00000421812.3|GN:ZNF697|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:63 +1 M 0.379 +2 W 0.412 +3 R 0.463 +4 G 0.507 +5 A 0.515 +6 G 0.490 +7 R 0.478 +8 R 0.507 +9 R 0.547 +10 L 0.564 +11 R 0.573 +12 L 0.598 +13 E 0.642 +14 G 0.687 +15 G 0.715 +16 D 0.713 +17 S 0.674 +18 D 0.614 +19 A 0.580 +20 R 0.595 +21 G 0.617 +22 N 0.603 +23 R 0.583 +24 T 0.598 +25 V 0.636 +26 P 0.669 +27 P 0.697 +28 T 0.719 +29 T 0.730 +30 E 0.737 +31 G 0.746 +32 G 0.748 +33 I 0.735 +34 R 0.718 +35 D 0.710 +36 P 0.715 +37 R 0.726 +38 R 0.730 +39 N 0.703 +40 Q 0.649 +41 A 0.617 +42 Q 0.645 +43 G 0.702 +44 G 0.738 +45 A 0.746 +46 W 0.743 +47 K 0.740 +48 A 0.736 +49 R 0.729 +50 R 0.724 +51 R 0.721 +52 D 0.709 +53 S 0.680 +54 W 0.650 +55 S 0.640 +56 P 0.657 +57 P 0.689 +58 L 0.716 +59 L 0.728 +60 F 0.725 +61 S 0.712 +62 S 0.693 +63 W 0.670 +64 M 0.640 +65 K 0.607 +66 Q 0.607 +67 E 0.660 +68 D 0.733 +69 N 0.780 +70 Q 0.802 +71 G 0.813 +72 V 0.820 +73 C 0.821 +74 A 0.818 +75 H 0.817 +76 Q 0.816 +77 D 0.815 +78 S 0.811 +79 E 0.809 +80 D 0.811 +81 K 0.811 +82 G 0.794 +83 M 0.746 +84 G 0.675 +85 S 0.633 +86 D 0.656 +87 F 0.713 +88 E 0.757 +89 D 0.774 +90 S 0.777 +91 E 0.775 +92 D 0.771 +93 R 0.768 +94 E 0.763 +95 G 0.758 +96 D 0.750 +97 P 0.732 +98 E 0.694 +99 E 0.640 +100 R 0.614 +101 E 0.636 +102 M 0.656 +103 G 0.628 +104 S 0.585 +105 N 0.568 +106 P 0.567 +107 H 0.586 +108 D 0.645 +109 T 0.718 +110 N 0.761 +111 K 0.772 +112 R 0.768 +113 E 0.758 +114 G 0.745 +115 H 0.733 +116 P 0.732 +117 E 0.745 +118 P 0.767 +119 E 0.784 +120 M 0.790 +121 G 0.780 +122 S 0.751 +123 N 0.697 +124 P 0.634 +125 Q 0.607 +126 D 0.644 +127 S 0.703 +128 R 0.740 +129 H 0.754 +130 R 0.764 +131 E 0.771 +132 A 0.768 +133 V 0.763 +134 P 0.764 +135 D 0.771 +136 I 0.775 +137 C 0.778 +138 T 0.782 +139 E 0.788 +140 G 0.793 +141 Q 0.794 +142 L 0.793 +143 S 0.789 +144 E 0.785 +145 E 0.785 +146 E 0.789 +147 G 0.794 +148 V 0.796 +149 S 0.796 +150 V 0.800 +151 R 0.806 +152 G 0.808 +153 E 0.806 +154 E 0.803 +155 D 0.799 +156 D 0.794 +157 Q 0.791 +158 S 0.792 +159 G 0.797 +160 V 0.800 +161 A 0.801 +162 D 0.797 +163 M 0.783 +164 A 0.762 +165 M 0.744 +166 F 0.738 +167 P 0.747 +168 G 0.760 +169 L 0.767 +170 S 0.766 +171 E 0.760 +172 S 0.751 +173 D 0.730 +174 S 0.688 +175 I 0.622 +176 S 0.558 +177 R 0.542 +178 S 0.589 +179 L 0.663 +180 R 0.720 +181 E 0.753 +182 D 0.769 +183 D 0.778 +184 D 0.785 +185 E 0.792 +186 S 0.798 +187 A 0.801 +188 G 0.802 +189 E 0.802 +190 N 0.800 +191 R 0.795 +192 L 0.789 +193 E 0.783 +194 E 0.774 +195 E 0.753 +196 E 0.719 +197 E 0.676 +198 Q 0.636 +199 P 0.615 +200 A 0.618 +201 P 0.640 +202 P 0.666 +203 V 0.684 +204 L 0.691 +205 P 0.692 +206 W 0.695 +207 R 0.707 +208 R 0.724 +209 H 0.738 +210 L 0.748 +211 S 0.758 +212 L 0.769 +213 G 0.776 +214 S 0.780 +215 R 0.781 +216 H 0.781 +217 R 0.776 +218 G 0.768 +219 D 0.759 +220 K 0.751 +221 P 0.749 +222 A 0.753 +223 H 0.758 +224 R 0.759 +225 R 0.757 +226 F 0.752 +227 H 0.744 +228 R 0.731 +229 L 0.713 +230 H 0.702 +231 H 0.711 +232 P 0.737 +233 M 0.756 +234 A 0.748 +235 V 0.710 +236 D 0.665 +237 L 0.631 +238 G 0.602 +239 E 0.568 +240 L 0.528 +241 D 0.495 +242 S 0.486 +243 L 0.493 +244 V 0.492 +245 A 0.482 +246 S 0.474 +247 I 0.461 +248 M 0.432 +249 D 0.390 +250 A 0.335 +251 P 0.259 +252 T 0.178 +253 I 0.119 +254 C 0.091 +255 P 0.084 +256 D 0.090 +257 C 0.104 +258 G 0.114 +259 E 0.113 +260 S 0.107 +261 F 0.101 +262 S 0.092 +263 P 0.083 +264 G 0.081 +265 A 0.086 +266 A 0.088 +267 F 0.085 +268 L 0.082 +269 Q 0.079 +270 H 0.079 +271 Q 0.083 +272 R 0.095 +273 I 0.114 +274 H 0.141 +275 R 0.175 +276 L 0.210 +277 A 0.246 +278 E 0.285 +279 A 0.323 +280 A 0.360 +281 A 0.400 +282 A 0.443 +283 A 0.482 +284 S 0.519 +285 L 0.563 +286 E 0.612 +287 P 0.654 +288 F 0.681 +289 G 0.692 +290 L 0.692 +291 A 0.690 +292 G 0.685 +293 E 0.662 +294 C 0.615 +295 D 0.561 +296 A 0.539 +297 M 0.571 +298 V 0.623 +299 G 0.654 +300 M 0.665 +301 M 0.679 +302 G 0.704 +303 V 0.732 +304 G 0.752 +305 V 0.763 +306 A 0.765 +307 G 0.764 +308 G 0.763 +309 F 0.762 +310 G 0.756 +311 A 0.742 +312 G 0.725 +313 P 0.717 +314 P 0.715 +315 L 0.708 +316 A 0.684 +317 R 0.648 +318 P 0.609 +319 P 0.562 +320 R 0.489 +321 E 0.391 +322 K 0.285 +323 P 0.197 +324 F 0.141 +325 R 0.113 +326 C 0.106 +327 G 0.110 +328 E 0.118 +329 C 0.125 +330 G 0.132 +331 K 0.141 +332 G 0.154 +333 F 0.159 +334 S 0.150 +335 R 0.136 +336 N 0.132 +337 T 0.143 +338 Y 0.160 +339 L 0.175 +340 T 0.179 +341 N 0.170 +342 H 0.158 +343 L 0.163 +344 R 0.185 +345 L 0.209 +346 H 0.229 +347 T 0.248 +348 G 0.257 +349 E 0.244 +350 R 0.208 +351 P 0.163 +352 N 0.123 +353 L 0.095 +354 C 0.079 +355 A 0.073 +356 D 0.076 +357 C 0.082 +358 G 0.089 +359 K 0.100 +360 S 0.115 +361 F 0.127 +362 S 0.130 +363 W 0.132 +364 R 0.136 +365 A 0.140 +366 D 0.142 +367 L 0.146 +368 L 0.153 +369 K 0.160 +370 H 0.167 +371 R 0.185 +372 R 0.212 +373 L 0.230 +374 H 0.236 +375 T 0.241 +376 G 0.243 +377 E 0.228 +378 K 0.196 +379 P 0.160 +380 Y 0.137 +381 P 0.125 +382 C 0.114 +383 P 0.103 +384 E 0.099 +385 C 0.102 +386 G 0.109 +387 E 0.113 +388 A 0.113 +389 F 0.110 +390 S 0.105 +391 L 0.102 +392 S 0.103 +393 S 0.101 +394 H 0.095 +395 L 0.088 +396 L 0.084 +397 S 0.082 +398 H 0.086 +399 R 0.098 +400 R 0.118 +401 A 0.139 +402 H 0.170 +403 A 0.216 +404 A 0.266 +405 A 0.308 +406 S 0.346 +407 G 0.388 +408 A 0.430 +409 G 0.454 +410 A 0.449 +411 A 0.417 +412 A 0.366 +413 L 0.301 +414 R 0.232 +415 P 0.174 +416 F 0.135 +417 A 0.113 +418 C 0.102 +419 G 0.099 +420 E 0.104 +421 C 0.110 +422 G 0.116 +423 K 0.120 +424 G 0.125 +425 F 0.129 +426 V 0.132 +427 R 0.140 +428 R 0.160 +429 S 0.188 +430 H 0.213 +431 L 0.224 +432 A 0.221 +433 N 0.212 +434 H 0.207 +435 Q 0.212 +436 R 0.219 +437 I 0.221 +438 H 0.223 +439 T 0.229 +440 G 0.229 +441 E 0.211 +442 K 0.176 +443 P 0.143 +444 H 0.127 +445 G 0.124 +446 C 0.123 +447 G 0.120 +448 E 0.117 +449 C 0.115 +450 G 0.115 +451 K 0.120 +452 R 0.128 +453 F 0.133 +454 S 0.131 +455 W 0.128 +456 R 0.131 +457 S 0.141 +458 D 0.155 +459 L 0.170 +460 V 0.181 +461 K 0.186 +462 H 0.189 +463 Q 0.201 +464 R 0.218 +465 V 0.232 +466 H 0.247 +467 T 0.266 +468 G 0.276 +469 E 0.262 +470 K 0.221 +471 P 0.171 +472 Y 0.131 +473 M 0.106 +474 C 0.095 +475 S 0.098 +476 E 0.109 +477 C 0.120 +478 G 0.128 +479 E 0.134 +480 T 0.137 +481 F 0.136 +482 S 0.133 +483 V 0.134 +484 S 0.142 +485 S 0.155 +486 H 0.164 +487 L 0.164 +488 F 0.156 +489 T 0.149 +490 H 0.155 +491 K 0.181 +492 R 0.219 +493 T 0.258 +494 H 0.290 +495 S 0.311 +496 G 0.306 +497 E 0.272 +498 R 0.218 +499 P 0.163 +500 Y 0.120 +501 V 0.092 +502 C 0.079 +503 R 0.080 +504 E 0.092 +505 C 0.110 +506 G 0.127 +507 K 0.144 +508 G 0.161 +509 F 0.175 +510 G 0.179 +511 R 0.180 +512 N 0.192 +513 S 0.220 +514 H 0.247 +515 L 0.254 +516 V 0.245 +517 N 0.228 +518 H 0.207 +519 L 0.202 +520 R 0.219 +521 V 0.246 +522 H 0.273 +523 T 0.295 +524 G 0.301 +525 E 0.277 +526 K 0.229 +527 P 0.178 +528 F 0.141 +529 R 0.121 +530 C 0.110 +531 G 0.104 +532 Q 0.100 +533 C 0.097 +534 E 0.103 +535 K 0.120 +536 R 0.141 +537 F 0.160 +538 S 0.169 +539 D 0.167 +540 F 0.156 +541 S 0.146 +542 T 0.144 +543 L 0.150 +544 T 0.164 +545 Q 0.185 +546 H 0.213 +547 Q 0.246 +548 R 0.276 +549 T 0.296 +550 H 0.311 +551 T 0.323 +552 G 0.321 +553 E 0.296 +554 K 0.249 +555 P 0.195 +556 Y 0.150 +557 T 0.119 +558 C 0.103 +559 I 0.101 +560 E 0.111 +561 C 0.128 +562 G 0.141 +563 K 0.143 +564 S 0.138 +565 F 0.134 +566 I 0.139 +567 Q 0.154 +568 S 0.173 +569 S 0.185 +570 H 0.187 +571 L 0.182 +572 I 0.179 +573 R 0.177 +574 H 0.178 +575 R 0.186 +576 R 0.198 +577 I 0.209 +578 H 0.224 +579 T 0.243 +580 G 0.259 +581 N 0.261 +582 K 0.245 +583 P 0.220 +584 H 0.199 +585 K 0.184 +586 C 0.172 +587 A 0.169 +588 G 0.171 +589 C 0.174 +590 G 0.172 +591 K 0.166 +592 G 0.158 +593 F 0.152 +594 R 0.147 +595 Y 0.146 +596 K 0.148 +597 T 0.149 +598 H 0.147 +599 L 0.144 +600 A 0.141 +601 Q 0.136 +602 H 0.129 +603 Q 0.122 +604 K 0.114 +605 L 0.103 +606 H 0.092 +607 L 0.086 +608 C 0.085 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000143107.11_ENST00000370017.9_GN:FNDC7_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000143107.11_ENST00000370017.9_GN:FNDC7_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7bd5e29bd8c484a71ef74bfd81dde503a671ca46 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000143107.11_ENST00000370017.9_GN:FNDC7_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,734 @@ +>ENSG00000143107.11|ENST00000370017.9|GN:FNDC7|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.369 +2 A 0.381 +3 G 0.396 +4 G 0.394 +5 R 0.359 +6 E 0.318 +7 T 0.312 +8 C 0.341 +9 L 0.368 +10 P 0.371 +11 L 0.347 +12 I 0.303 +13 G 0.256 +14 F 0.227 +15 I 0.215 +16 L 0.209 +17 I 0.210 +18 C 0.217 +19 L 0.231 +20 K 0.263 +21 M 0.321 +22 V 0.386 +23 A 0.437 +24 S 0.468 +25 A 0.473 +26 K 0.438 +27 S 0.368 +28 A 0.286 +29 P 0.210 +30 E 0.149 +31 I 0.106 +32 P 0.080 +33 T 0.063 +34 I 0.053 +35 D 0.048 +36 Q 0.048 +37 A 0.049 +38 Y 0.050 +39 S 0.050 +40 K 0.047 +41 L 0.042 +42 S 0.036 +43 N 0.031 +44 S 0.028 +45 I 0.028 +46 T 0.030 +47 V 0.032 +48 E 0.035 +49 W 0.038 +50 A 0.046 +51 T 0.059 +52 V 0.075 +53 P 0.084 +54 G 0.082 +55 A 0.069 +56 T 0.052 +57 S 0.038 +58 Y 0.032 +59 L 0.033 +60 L 0.037 +61 T 0.044 +62 A 0.054 +63 E 0.066 +64 D 0.074 +65 G 0.079 +66 D 0.081 +67 T 0.083 +68 V 0.083 +69 I 0.080 +70 E 0.073 +71 T 0.064 +72 T 0.057 +73 V 0.054 +74 A 0.051 +75 N 0.045 +76 S 0.039 +77 P 0.040 +78 G 0.044 +79 T 0.046 +80 V 0.047 +81 T 0.052 +82 G 0.063 +83 L 0.079 +84 K 0.094 +85 A 0.102 +86 A 0.097 +87 T 0.082 +88 W 0.063 +89 Y 0.049 +90 E 0.040 +91 I 0.033 +92 T 0.029 +93 I 0.030 +94 R 0.034 +95 S 0.040 +96 I 0.047 +97 S 0.058 +98 A 0.072 +99 A 0.083 +100 G 0.084 +101 R 0.077 +102 S 0.071 +103 Q 0.071 +104 A 0.075 +105 S 0.080 +106 P 0.080 +107 P 0.073 +108 K 0.064 +109 Q 0.058 +110 A 0.058 +111 K 0.066 +112 T 0.083 +113 V 0.104 +114 L 0.125 +115 A 0.134 +116 A 0.124 +117 P 0.101 +118 I 0.078 +119 L 0.063 +120 E 0.056 +121 V 0.052 +122 S 0.051 +123 S 0.054 +124 P 0.058 +125 S 0.059 +126 S 0.053 +127 D 0.042 +128 S 0.033 +129 I 0.028 +130 L 0.029 +131 V 0.032 +132 Q 0.037 +133 W 0.042 +134 E 0.047 +135 A 0.054 +136 V 0.060 +137 Y 0.063 +138 M 0.063 +139 A 0.057 +140 I 0.045 +141 A 0.031 +142 F 0.022 +143 S 0.021 +144 V 0.024 +145 S 0.032 +146 I 0.044 +147 M 0.062 +148 R 0.089 +149 A 0.121 +150 N 0.153 +151 G 0.179 +152 L 0.191 +153 G 0.186 +154 S 0.165 +155 I 0.134 +156 W 0.106 +157 K 0.085 +158 E 0.071 +159 N 0.063 +160 T 0.060 +161 T 0.056 +162 N 0.050 +163 T 0.043 +164 S 0.039 +165 L 0.038 +166 T 0.041 +167 F 0.049 +168 T 0.062 +169 S 0.077 +170 L 0.093 +171 E 0.108 +172 A 0.116 +173 G 0.113 +174 T 0.097 +175 L 0.073 +176 Y 0.051 +177 T 0.037 +178 I 0.029 +179 K 0.026 +180 A 0.027 +181 Y 0.030 +182 A 0.036 +183 W 0.044 +184 N 0.059 +185 A 0.077 +186 N 0.095 +187 R 0.110 +188 I 0.125 +189 P 0.135 +190 G 0.137 +191 D 0.126 +192 D 0.106 +193 S 0.087 +194 T 0.073 +195 C 0.066 +196 N 0.063 +197 Q 0.069 +198 R 0.082 +199 T 0.102 +200 S 0.124 +201 P 0.141 +202 R 0.140 +203 A 0.121 +204 P 0.096 +205 A 0.077 +206 N 0.064 +207 I 0.050 +208 Q 0.038 +209 V 0.030 +210 S 0.029 +211 F 0.036 +212 D 0.050 +213 S 0.066 +214 G 0.075 +215 A 0.068 +216 L 0.051 +217 K 0.035 +218 A 0.025 +219 S 0.020 +220 F 0.019 +221 S 0.021 +222 W 0.027 +223 A 0.035 +224 R 0.047 +225 A 0.064 +226 E 0.078 +227 G 0.081 +228 A 0.069 +229 F 0.048 +230 N 0.030 +231 Y 0.021 +232 T 0.020 +233 V 0.022 +234 M 0.028 +235 A 0.037 +236 L 0.049 +237 S 0.064 +238 D 0.078 +239 S 0.087 +240 S 0.086 +241 E 0.079 +242 L 0.069 +243 T 0.059 +244 C 0.052 +245 S 0.047 +246 T 0.043 +247 T 0.039 +248 F 0.035 +249 S 0.034 +250 S 0.034 +251 C 0.036 +252 T 0.036 +253 I 0.036 +254 S 0.038 +255 S 0.045 +256 L 0.057 +257 Q 0.071 +258 C 0.084 +259 G 0.089 +260 T 0.084 +261 E 0.068 +262 Y 0.051 +263 L 0.039 +264 I 0.033 +265 S 0.031 +266 V 0.032 +267 L 0.035 +268 A 0.039 +269 S 0.046 +270 N 0.057 +271 D 0.069 +272 A 0.078 +273 G 0.078 +274 S 0.075 +275 S 0.074 +276 K 0.076 +277 S 0.079 +278 S 0.085 +279 S 0.086 +280 A 0.079 +281 M 0.067 +282 T 0.058 +283 L 0.059 +284 K 0.069 +285 T 0.088 +286 V 0.109 +287 A 0.121 +288 C 0.122 +289 A 0.115 +290 P 0.104 +291 G 0.092 +292 R 0.077 +293 V 0.062 +294 T 0.052 +295 I 0.049 +296 Q 0.050 +297 E 0.054 +298 D 0.061 +299 P 0.066 +300 P 0.064 +301 G 0.056 +302 H 0.045 +303 L 0.036 +304 S 0.031 +305 V 0.031 +306 A 0.033 +307 W 0.037 +308 S 0.043 +309 S 0.050 +310 V 0.059 +311 D 0.067 +312 L 0.072 +313 G 0.070 +314 D 0.056 +315 Y 0.039 +316 Y 0.027 +317 V 0.024 +318 V 0.026 +319 F 0.033 +320 V 0.042 +321 K 0.055 +322 S 0.074 +323 D 0.099 +324 D 0.122 +325 G 0.131 +326 L 0.121 +327 E 0.100 +328 V 0.080 +329 H 0.067 +330 C 0.062 +331 N 0.063 +332 T 0.064 +333 S 0.062 +334 L 0.057 +335 T 0.052 +336 Q 0.050 +337 C 0.050 +338 N 0.053 +339 F 0.058 +340 L 0.065 +341 S 0.071 +342 E 0.078 +343 C 0.090 +344 G 0.101 +345 F 0.098 +346 T 0.080 +347 Y 0.057 +348 F 0.041 +349 I 0.034 +350 S 0.032 +351 V 0.035 +352 F 0.043 +353 V 0.056 +354 Y 0.068 +355 N 0.079 +356 K 0.089 +357 A 0.098 +358 G 0.100 +359 Q 0.098 +360 S 0.099 +361 P 0.103 +362 L 0.106 +363 G 0.109 +364 D 0.111 +365 I 0.107 +366 F 0.098 +367 N 0.087 +368 Y 0.081 +369 T 0.085 +370 T 0.105 +371 A 0.131 +372 P 0.147 +373 C 0.147 +374 C 0.135 +375 P 0.121 +376 S 0.112 +377 D 0.106 +378 I 0.099 +379 N 0.089 +380 P 0.078 +381 V 0.068 +382 L 0.064 +383 V 0.062 +384 S 0.057 +385 S 0.047 +386 D 0.036 +387 R 0.029 +388 V 0.028 +389 E 0.031 +390 I 0.036 +391 V 0.042 +392 W 0.051 +393 S 0.068 +394 P 0.091 +395 V 0.116 +396 R 0.132 +397 G 0.129 +398 A 0.106 +399 E 0.075 +400 L 0.051 +401 Y 0.039 +402 E 0.037 +403 T 0.040 +404 K 0.045 +405 A 0.053 +406 V 0.065 +407 D 0.081 +408 G 0.100 +409 Y 0.117 +410 N 0.128 +411 M 0.131 +412 V 0.125 +413 E 0.111 +414 C 0.094 +415 N 0.079 +416 D 0.071 +417 T 0.067 +418 T 0.064 +419 P 0.060 +420 A 0.058 +421 C 0.059 +422 T 0.060 +423 L 0.062 +424 S 0.068 +425 A 0.077 +426 L 0.087 +427 E 0.099 +428 C 0.109 +429 D 0.116 +430 T 0.115 +431 K 0.104 +432 Y 0.088 +433 N 0.075 +434 I 0.066 +435 T 0.060 +436 V 0.059 +437 Y 0.062 +438 S 0.067 +439 F 0.071 +440 N 0.075 +441 E 0.084 +442 V 0.098 +443 R 0.113 +444 G 0.123 +445 S 0.129 +446 N 0.133 +447 M 0.136 +448 S 0.133 +449 C 0.126 +450 T 0.119 +451 P 0.111 +452 Q 0.101 +453 F 0.090 +454 I 0.085 +455 T 0.097 +456 T 0.124 +457 A 0.154 +458 P 0.170 +459 C 0.166 +460 S 0.147 +461 P 0.126 +462 E 0.111 +463 I 0.105 +464 K 0.102 +465 N 0.095 +466 V 0.083 +467 S 0.073 +468 R 0.070 +469 D 0.072 +470 A 0.069 +471 F 0.059 +472 S 0.046 +473 M 0.036 +474 I 0.032 +475 N 0.033 +476 V 0.039 +477 H 0.046 +478 W 0.056 +479 R 0.073 +480 S 0.098 +481 T 0.127 +482 N 0.150 +483 D 0.160 +484 D 0.152 +485 A 0.126 +486 T 0.092 +487 Y 0.064 +488 T 0.052 +489 V 0.054 +490 T 0.066 +491 A 0.086 +492 Q 0.110 +493 G 0.134 +494 E 0.149 +495 K 0.148 +496 G 0.136 +497 L 0.122 +498 Y 0.113 +499 Q 0.103 +500 C 0.092 +501 S 0.085 +502 S 0.086 +503 T 0.092 +504 G 0.096 +505 E 0.092 +506 S 0.083 +507 C 0.076 +508 T 0.077 +509 M 0.085 +510 R 0.100 +511 G 0.120 +512 L 0.137 +513 P 0.145 +514 C 0.145 +515 G 0.141 +516 S 0.132 +517 V 0.114 +518 F 0.093 +519 S 0.077 +520 V 0.068 +521 T 0.063 +522 A 0.063 +523 V 0.068 +524 A 0.077 +525 E 0.087 +526 T 0.099 +527 Q 0.114 +528 A 0.129 +529 G 0.138 +530 R 0.141 +531 S 0.144 +532 L 0.154 +533 P 0.163 +534 S 0.163 +535 Y 0.155 +536 S 0.144 +537 V 0.140 +538 P 0.143 +539 L 0.153 +540 E 0.166 +541 T 0.177 +542 V 0.186 +543 P 0.189 +544 C 0.182 +545 C 0.165 +546 P 0.147 +547 T 0.132 +548 G 0.119 +549 L 0.101 +550 T 0.082 +551 V 0.068 +552 T 0.059 +553 Q 0.055 +554 I 0.053 +555 T 0.049 +556 Q 0.043 +557 S 0.038 +558 V 0.039 +559 I 0.043 +560 N 0.048 +561 V 0.052 +562 S 0.054 +563 W 0.054 +564 T 0.061 +565 I 0.081 +566 G 0.105 +567 R 0.120 +568 V 0.117 +569 A 0.099 +570 Q 0.076 +571 T 0.054 +572 H 0.041 +573 V 0.037 +574 A 0.042 +575 V 0.051 +576 L 0.063 +577 E 0.077 +578 S 0.099 +579 H 0.126 +580 T 0.149 +581 G 0.158 +582 Q 0.152 +583 S 0.137 +584 K 0.118 +585 C 0.101 +586 H 0.090 +587 T 0.085 +588 H 0.080 +589 Q 0.075 +590 N 0.073 +591 H 0.076 +592 C 0.079 +593 L 0.079 +594 L 0.077 +595 G 0.077 +596 C 0.077 +597 I 0.081 +598 T 0.094 +599 C 0.117 +600 G 0.140 +601 I 0.146 +602 N 0.128 +603 Y 0.099 +604 T 0.075 +605 V 0.061 +606 T 0.054 +607 L 0.054 +608 K 0.060 +609 A 0.071 +610 I 0.083 +611 S 0.097 +612 A 0.115 +613 T 0.131 +614 G 0.137 +615 L 0.129 +616 T 0.120 +617 A 0.120 +618 D 0.122 +619 C 0.117 +620 S 0.109 +621 Y 0.105 +622 Q 0.102 +623 S 0.099 +624 Y 0.098 +625 F 0.107 +626 S 0.133 +627 G 0.170 +628 A 0.198 +629 C 0.198 +630 C 0.177 +631 P 0.152 +632 L 0.133 +633 G 0.113 +634 V 0.090 +635 K 0.070 +636 L 0.060 +637 Y 0.064 +638 R 0.077 +639 L 0.088 +640 G 0.085 +641 P 0.072 +642 N 0.059 +643 G 0.050 +644 I 0.046 +645 R 0.045 +646 I 0.049 +647 Y 0.058 +648 W 0.073 +649 Q 0.097 +650 A 0.126 +651 S 0.151 +652 R 0.165 +653 G 0.162 +654 S 0.140 +655 A 0.108 +656 N 0.078 +657 Y 0.062 +658 S 0.060 +659 T 0.066 +660 D 0.077 +661 L 0.092 +662 Y 0.111 +663 G 0.130 +664 S 0.141 +665 K 0.141 +666 G 0.134 +667 I 0.126 +668 F 0.119 +669 T 0.114 +670 C 0.118 +671 T 0.134 +672 P 0.156 +673 S 0.169 +674 A 0.168 +675 G 0.152 +676 L 0.129 +677 S 0.105 +678 F 0.091 +679 C 0.089 +680 D 0.091 +681 V 0.095 +682 T 0.102 +683 E 0.113 +684 I 0.119 +685 P 0.120 +686 C 0.124 +687 G 0.132 +688 D 0.133 +689 V 0.118 +690 Y 0.096 +691 T 0.081 +692 V 0.074 +693 M 0.075 +694 V 0.082 +695 S 0.092 +696 P 0.100 +697 V 0.108 +698 A 0.124 +699 K 0.152 +700 T 0.185 +701 G 0.207 +702 L 0.207 +703 K 0.187 +704 L 0.161 +705 T 0.144 +706 F 0.141 +707 C 0.147 +708 P 0.150 +709 K 0.140 +710 K 0.117 +711 I 0.091 +712 Y 0.071 +713 S 0.064 +714 V 0.069 +715 T 0.080 +716 C 0.091 +717 S 0.099 +718 G 0.101 +719 S 0.099 +720 T 0.094 +721 L 0.091 +722 G 0.092 +723 M 0.096 +724 V 0.097 +725 I 0.096 +726 Y 0.098 +727 R 0.106 +728 G 0.118 +729 K 0.130 +730 R 0.141 +731 N 0.154 +732 E 0.169 +733 E 0.179 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000143107.11_ENST00000370017.9_GN:FNDC7_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:4.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000143107.11_ENST00000370017.9_GN:FNDC7_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:4.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e96fc05686f5644795a98e33bf72aebd36116f25 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000143107.11_ENST00000370017.9_GN:FNDC7_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:4.caid @@ -0,0 +1,738 @@ +>ENSG00000143107.11|ENST00000370017.9|GN:FNDC7|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:4 +1 M 0.327 +2 S 0.322 +3 N 0.327 +4 R 0.344 +5 M 0.359 +6 A 0.377 +7 G 0.411 +8 G 0.437 +9 R 0.429 +10 E 0.412 +11 T 0.414 +12 C 0.422 +13 L 0.418 +14 P 0.407 +15 L 0.384 +16 I 0.340 +17 G 0.289 +18 F 0.254 +19 I 0.235 +20 L 0.222 +21 I 0.218 +22 C 0.224 +23 L 0.237 +24 K 0.267 +25 M 0.323 +26 V 0.386 +27 A 0.436 +28 S 0.466 +29 A 0.471 +30 K 0.437 +31 S 0.369 +32 A 0.287 +33 P 0.211 +34 E 0.150 +35 I 0.107 +36 P 0.080 +37 T 0.063 +38 I 0.053 +39 D 0.049 +40 Q 0.048 +41 A 0.049 +42 Y 0.051 +43 S 0.051 +44 K 0.048 +45 L 0.043 +46 S 0.036 +47 N 0.031 +48 S 0.028 +49 I 0.028 +50 T 0.030 +51 V 0.032 +52 E 0.035 +53 W 0.038 +54 A 0.045 +55 T 0.059 +56 V 0.074 +57 P 0.083 +58 G 0.082 +59 A 0.069 +60 T 0.051 +61 S 0.037 +62 Y 0.032 +63 L 0.032 +64 L 0.036 +65 T 0.043 +66 A 0.053 +67 E 0.065 +68 D 0.074 +69 G 0.078 +70 D 0.080 +71 T 0.081 +72 V 0.082 +73 I 0.079 +74 E 0.071 +75 T 0.063 +76 T 0.056 +77 V 0.053 +78 A 0.050 +79 N 0.044 +80 S 0.039 +81 P 0.039 +82 G 0.043 +83 T 0.045 +84 V 0.046 +85 T 0.051 +86 G 0.062 +87 L 0.078 +88 K 0.093 +89 A 0.101 +90 A 0.096 +91 T 0.081 +92 W 0.063 +93 Y 0.050 +94 E 0.040 +95 I 0.033 +96 T 0.029 +97 I 0.030 +98 R 0.034 +99 S 0.040 +100 I 0.047 +101 S 0.058 +102 A 0.072 +103 A 0.083 +104 G 0.084 +105 R 0.077 +106 S 0.071 +107 Q 0.071 +108 A 0.075 +109 S 0.079 +110 P 0.079 +111 P 0.073 +112 K 0.064 +113 Q 0.058 +114 A 0.058 +115 K 0.067 +116 T 0.084 +117 V 0.106 +118 L 0.126 +119 A 0.135 +120 A 0.125 +121 P 0.101 +122 I 0.078 +123 L 0.063 +124 E 0.056 +125 V 0.052 +126 S 0.052 +127 S 0.054 +128 P 0.058 +129 S 0.059 +130 S 0.053 +131 D 0.042 +132 S 0.033 +133 I 0.028 +134 L 0.028 +135 V 0.032 +136 Q 0.037 +137 W 0.042 +138 E 0.048 +139 A 0.054 +140 V 0.061 +141 Y 0.065 +142 M 0.065 +143 A 0.058 +144 I 0.045 +145 A 0.031 +146 F 0.022 +147 S 0.021 +148 V 0.024 +149 S 0.032 +150 I 0.044 +151 M 0.062 +152 R 0.089 +153 A 0.121 +154 N 0.153 +155 G 0.179 +156 L 0.192 +157 G 0.187 +158 S 0.165 +159 I 0.134 +160 W 0.105 +161 K 0.084 +162 E 0.071 +163 N 0.063 +164 T 0.059 +165 T 0.055 +166 N 0.049 +167 T 0.043 +168 S 0.039 +169 L 0.038 +170 T 0.041 +171 F 0.049 +172 T 0.062 +173 S 0.077 +174 L 0.093 +175 E 0.108 +176 A 0.117 +177 G 0.113 +178 T 0.097 +179 L 0.073 +180 Y 0.051 +181 T 0.037 +182 I 0.029 +183 K 0.026 +184 A 0.027 +185 Y 0.031 +186 A 0.036 +187 W 0.044 +188 N 0.058 +189 A 0.076 +190 N 0.094 +191 R 0.109 +192 I 0.124 +193 P 0.134 +194 G 0.136 +195 D 0.125 +196 D 0.105 +197 S 0.086 +198 T 0.072 +199 C 0.065 +200 N 0.063 +201 Q 0.068 +202 R 0.082 +203 T 0.101 +204 S 0.124 +205 P 0.141 +206 R 0.140 +207 A 0.121 +208 P 0.096 +209 A 0.077 +210 N 0.063 +211 I 0.049 +212 Q 0.037 +213 V 0.030 +214 S 0.029 +215 F 0.035 +216 D 0.049 +217 S 0.066 +218 G 0.074 +219 A 0.067 +220 L 0.050 +221 K 0.034 +222 A 0.024 +223 S 0.020 +224 F 0.019 +225 S 0.021 +226 W 0.026 +227 A 0.035 +228 R 0.047 +229 A 0.063 +230 E 0.077 +231 G 0.080 +232 A 0.068 +233 F 0.048 +234 N 0.030 +235 Y 0.021 +236 T 0.020 +237 V 0.022 +238 M 0.028 +239 A 0.037 +240 L 0.049 +241 S 0.064 +242 D 0.078 +243 S 0.087 +244 S 0.086 +245 E 0.079 +246 L 0.069 +247 T 0.059 +248 C 0.051 +249 S 0.047 +250 T 0.043 +251 T 0.039 +252 F 0.035 +253 S 0.033 +254 S 0.034 +255 C 0.036 +256 T 0.036 +257 I 0.036 +258 S 0.038 +259 S 0.045 +260 L 0.057 +261 Q 0.071 +262 C 0.083 +263 G 0.089 +264 T 0.084 +265 E 0.068 +266 Y 0.051 +267 L 0.039 +268 I 0.033 +269 S 0.031 +270 V 0.032 +271 L 0.035 +272 A 0.039 +273 S 0.046 +274 N 0.056 +275 D 0.069 +276 A 0.078 +277 G 0.078 +278 S 0.075 +279 S 0.074 +280 K 0.075 +281 S 0.078 +282 S 0.082 +283 S 0.083 +284 A 0.076 +285 M 0.065 +286 T 0.058 +287 L 0.059 +288 K 0.070 +289 T 0.089 +290 V 0.110 +291 A 0.122 +292 C 0.123 +293 A 0.116 +294 P 0.105 +295 G 0.093 +296 R 0.078 +297 V 0.063 +298 T 0.053 +299 I 0.049 +300 Q 0.050 +301 E 0.055 +302 D 0.062 +303 P 0.066 +304 P 0.065 +305 G 0.057 +306 H 0.045 +307 L 0.036 +308 S 0.031 +309 V 0.031 +310 A 0.034 +311 W 0.038 +312 S 0.044 +313 S 0.051 +314 V 0.059 +315 D 0.068 +316 L 0.073 +317 G 0.071 +318 D 0.057 +319 Y 0.039 +320 Y 0.027 +321 V 0.024 +322 V 0.027 +323 F 0.033 +324 V 0.042 +325 K 0.055 +326 S 0.074 +327 D 0.100 +328 D 0.123 +329 G 0.132 +330 L 0.122 +331 E 0.101 +332 V 0.081 +333 H 0.068 +334 C 0.063 +335 N 0.063 +336 T 0.065 +337 S 0.063 +338 L 0.058 +339 T 0.053 +340 Q 0.050 +341 C 0.051 +342 N 0.053 +343 F 0.059 +344 L 0.066 +345 S 0.071 +346 E 0.079 +347 C 0.091 +348 G 0.102 +349 F 0.099 +350 T 0.080 +351 Y 0.058 +352 F 0.042 +353 I 0.034 +354 S 0.032 +355 V 0.035 +356 F 0.043 +357 V 0.056 +358 Y 0.068 +359 N 0.079 +360 K 0.090 +361 A 0.098 +362 G 0.100 +363 Q 0.099 +364 S 0.100 +365 P 0.103 +366 L 0.107 +367 G 0.110 +368 D 0.112 +369 I 0.108 +370 F 0.099 +371 N 0.088 +372 Y 0.081 +373 T 0.086 +374 T 0.105 +375 A 0.131 +376 P 0.148 +377 C 0.148 +378 C 0.136 +379 P 0.121 +380 S 0.112 +381 D 0.106 +382 I 0.099 +383 N 0.089 +384 P 0.077 +385 V 0.068 +386 L 0.064 +387 V 0.062 +388 S 0.057 +389 S 0.047 +390 D 0.036 +391 R 0.029 +392 V 0.028 +393 E 0.031 +394 I 0.036 +395 V 0.042 +396 W 0.051 +397 S 0.067 +398 P 0.091 +399 V 0.116 +400 R 0.132 +401 G 0.128 +402 A 0.106 +403 E 0.075 +404 L 0.051 +405 Y 0.039 +406 E 0.037 +407 T 0.040 +408 K 0.045 +409 A 0.053 +410 V 0.064 +411 D 0.080 +412 G 0.099 +413 Y 0.116 +414 N 0.128 +415 M 0.131 +416 V 0.124 +417 E 0.111 +418 C 0.094 +419 N 0.079 +420 D 0.071 +421 T 0.067 +422 T 0.064 +423 P 0.060 +424 A 0.058 +425 C 0.059 +426 T 0.060 +427 L 0.062 +428 S 0.068 +429 A 0.077 +430 L 0.087 +431 E 0.099 +432 C 0.109 +433 D 0.116 +434 T 0.115 +435 K 0.104 +436 Y 0.089 +437 N 0.075 +438 I 0.066 +439 T 0.060 +440 V 0.059 +441 Y 0.062 +442 S 0.067 +443 F 0.071 +444 N 0.076 +445 E 0.084 +446 V 0.098 +447 R 0.113 +448 G 0.124 +449 S 0.129 +450 N 0.134 +451 M 0.137 +452 S 0.134 +453 C 0.127 +454 T 0.119 +455 P 0.112 +456 Q 0.101 +457 F 0.090 +458 I 0.085 +459 T 0.097 +460 T 0.125 +461 A 0.155 +462 P 0.171 +463 C 0.167 +464 S 0.148 +465 P 0.126 +466 E 0.111 +467 I 0.105 +468 K 0.103 +469 N 0.096 +470 V 0.083 +471 S 0.073 +472 R 0.071 +473 D 0.072 +474 A 0.069 +475 F 0.059 +476 S 0.046 +477 M 0.037 +478 I 0.033 +479 N 0.034 +480 V 0.039 +481 H 0.047 +482 W 0.057 +483 R 0.073 +484 S 0.099 +485 T 0.128 +486 N 0.151 +487 D 0.161 +488 D 0.153 +489 A 0.127 +490 T 0.092 +491 Y 0.064 +492 T 0.052 +493 V 0.055 +494 T 0.067 +495 A 0.086 +496 Q 0.111 +497 G 0.135 +498 E 0.150 +499 K 0.149 +500 G 0.136 +501 L 0.123 +502 Y 0.113 +503 Q 0.104 +504 C 0.093 +505 S 0.085 +506 S 0.086 +507 T 0.093 +508 G 0.097 +509 E 0.092 +510 S 0.083 +511 C 0.077 +512 T 0.078 +513 M 0.086 +514 R 0.101 +515 G 0.120 +516 L 0.138 +517 P 0.146 +518 C 0.146 +519 G 0.142 +520 S 0.132 +521 V 0.114 +522 F 0.093 +523 S 0.077 +524 V 0.068 +525 T 0.063 +526 A 0.063 +527 V 0.068 +528 A 0.077 +529 E 0.087 +530 T 0.099 +531 Q 0.114 +532 A 0.129 +533 G 0.138 +534 R 0.141 +535 S 0.145 +536 L 0.154 +537 P 0.163 +538 S 0.163 +539 Y 0.155 +540 S 0.145 +541 V 0.140 +542 P 0.143 +543 L 0.153 +544 E 0.167 +545 T 0.178 +546 V 0.186 +547 P 0.189 +548 C 0.182 +549 C 0.165 +550 P 0.147 +551 T 0.133 +552 G 0.119 +553 L 0.101 +554 T 0.082 +555 V 0.068 +556 T 0.059 +557 Q 0.055 +558 I 0.053 +559 T 0.049 +560 Q 0.042 +561 S 0.038 +562 V 0.039 +563 I 0.043 +564 N 0.048 +565 V 0.052 +566 S 0.053 +567 W 0.054 +568 T 0.061 +569 I 0.080 +570 G 0.105 +571 R 0.120 +572 V 0.116 +573 A 0.099 +574 Q 0.075 +575 T 0.054 +576 H 0.041 +577 V 0.037 +578 A 0.041 +579 V 0.051 +580 L 0.062 +581 E 0.077 +582 S 0.099 +583 H 0.126 +584 T 0.149 +585 G 0.158 +586 Q 0.152 +587 S 0.137 +588 K 0.118 +589 C 0.101 +590 H 0.090 +591 T 0.085 +592 H 0.080 +593 Q 0.075 +594 N 0.073 +595 H 0.076 +596 C 0.079 +597 L 0.079 +598 L 0.077 +599 G 0.076 +600 C 0.077 +601 I 0.081 +602 T 0.094 +603 C 0.117 +604 G 0.140 +605 I 0.146 +606 N 0.128 +607 Y 0.098 +608 T 0.075 +609 V 0.061 +610 T 0.054 +611 L 0.054 +612 K 0.060 +613 A 0.070 +614 I 0.083 +615 S 0.097 +616 A 0.115 +617 T 0.131 +618 G 0.137 +619 L 0.129 +620 T 0.121 +621 A 0.121 +622 D 0.122 +623 C 0.117 +624 S 0.109 +625 Y 0.105 +626 Q 0.102 +627 S 0.099 +628 Y 0.098 +629 F 0.107 +630 S 0.133 +631 G 0.170 +632 A 0.198 +633 C 0.199 +634 C 0.177 +635 P 0.152 +636 L 0.132 +637 G 0.112 +638 V 0.090 +639 K 0.070 +640 L 0.060 +641 Y 0.064 +642 R 0.077 +643 L 0.088 +644 G 0.085 +645 P 0.072 +646 N 0.059 +647 G 0.050 +648 I 0.045 +649 R 0.045 +650 I 0.049 +651 Y 0.058 +652 W 0.073 +653 Q 0.097 +654 A 0.126 +655 S 0.151 +656 R 0.165 +657 G 0.161 +658 S 0.140 +659 A 0.107 +660 N 0.078 +661 Y 0.061 +662 S 0.059 +663 T 0.066 +664 D 0.077 +665 L 0.092 +666 Y 0.111 +667 G 0.130 +668 S 0.141 +669 K 0.141 +670 G 0.134 +671 I 0.125 +672 F 0.118 +673 T 0.114 +674 C 0.118 +675 T 0.134 +676 P 0.155 +677 S 0.169 +678 A 0.167 +679 G 0.152 +680 L 0.128 +681 S 0.105 +682 F 0.091 +683 C 0.089 +684 D 0.091 +685 V 0.095 +686 T 0.102 +687 E 0.112 +688 I 0.119 +689 P 0.120 +690 C 0.123 +691 G 0.132 +692 D 0.133 +693 V 0.118 +694 Y 0.096 +695 T 0.081 +696 V 0.074 +697 M 0.075 +698 V 0.082 +699 S 0.092 +700 P 0.100 +701 V 0.108 +702 A 0.124 +703 K 0.152 +704 T 0.185 +705 G 0.207 +706 L 0.207 +707 K 0.187 +708 L 0.161 +709 T 0.144 +710 F 0.141 +711 C 0.147 +712 P 0.150 +713 K 0.140 +714 K 0.117 +715 I 0.091 +716 Y 0.071 +717 S 0.065 +718 V 0.069 +719 T 0.080 +720 C 0.091 +721 S 0.098 +722 G 0.101 +723 S 0.098 +724 T 0.093 +725 L 0.090 +726 G 0.091 +727 M 0.095 +728 V 0.096 +729 I 0.095 +730 Y 0.097 +731 R 0.105 +732 G 0.117 +733 K 0.129 +734 R 0.140 +735 N 0.153 +736 E 0.167 +737 E 0.177 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000143627.19_ENST00000342741.6_GN:PKLR_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000143627.19_ENST00000342741.6_GN:PKLR_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..3bc0a76327ccb5a022f7fcfc7ff8591508ef29ac --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000143627.19_ENST00000342741.6_GN:PKLR_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,575 @@ +>ENSG00000143627.19|ENST00000342741.6|GN:PKLR|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.278 +2 S 0.283 +3 I 0.290 +4 Q 0.293 +5 E 0.292 +6 N 0.280 +7 I 0.256 +8 S 0.226 +9 S 0.197 +10 L 0.177 +11 Q 0.170 +12 L 0.168 +13 R 0.160 +14 S 0.148 +15 W 0.138 +16 V 0.128 +17 S 0.113 +18 K 0.105 +19 S 0.109 +20 Q 0.119 +21 R 0.130 +22 D 0.147 +23 L 0.169 +24 A 0.191 +25 K 0.215 +26 S 0.251 +27 I 0.300 +28 L 0.349 +29 I 0.384 +30 G 0.402 +31 A 0.404 +32 P 0.401 +33 G 0.413 +34 G 0.446 +35 P 0.480 +36 A 0.487 +37 G 0.465 +38 Y 0.437 +39 L 0.412 +40 R 0.379 +41 R 0.333 +42 A 0.291 +43 S 0.265 +44 V 0.243 +45 A 0.216 +46 Q 0.193 +47 L 0.185 +48 T 0.193 +49 Q 0.223 +50 E 0.270 +51 L 0.311 +52 G 0.329 +53 T 0.329 +54 A 0.322 +55 F 0.313 +56 F 0.305 +57 Q 0.299 +58 Q 0.297 +59 Q 0.300 +60 Q 0.304 +61 L 0.303 +62 P 0.294 +63 A 0.277 +64 A 0.256 +65 M 0.240 +66 A 0.236 +67 D 0.240 +68 T 0.244 +69 F 0.247 +70 L 0.258 +71 E 0.290 +72 H 0.348 +73 L 0.410 +74 C 0.452 +75 L 0.483 +76 L 0.512 +77 D 0.513 +78 I 0.466 +79 D 0.396 +80 S 0.342 +81 E 0.306 +82 P 0.268 +83 V 0.225 +84 A 0.184 +85 A 0.150 +86 R 0.119 +87 S 0.088 +88 T 0.065 +89 S 0.052 +90 I 0.047 +91 I 0.045 +92 A 0.046 +93 T 0.050 +94 I 0.056 +95 G 0.061 +96 P 0.065 +97 A 0.068 +98 S 0.067 +99 R 0.064 +100 S 0.062 +101 V 0.063 +102 E 0.062 +103 R 0.058 +104 L 0.053 +105 K 0.051 +106 E 0.052 +107 M 0.054 +108 I 0.056 +109 K 0.057 +110 A 0.059 +111 G 0.058 +112 M 0.054 +113 N 0.054 +114 I 0.061 +115 A 0.072 +116 R 0.081 +117 L 0.083 +118 N 0.081 +119 F 0.080 +120 S 0.085 +121 H 0.094 +122 G 0.097 +123 S 0.095 +124 H 0.092 +125 E 0.087 +126 Y 0.077 +127 H 0.063 +128 A 0.055 +129 E 0.055 +130 S 0.062 +131 I 0.074 +132 A 0.081 +133 N 0.077 +134 V 0.064 +135 R 0.054 +136 E 0.052 +137 A 0.056 +138 V 0.060 +139 E 0.065 +140 S 0.080 +141 F 0.103 +142 A 0.127 +143 G 0.139 +144 S 0.133 +145 P 0.115 +146 L 0.098 +147 S 0.087 +148 Y 0.079 +149 R 0.073 +150 P 0.068 +151 V 0.064 +152 A 0.063 +153 I 0.067 +154 A 0.080 +155 L 0.101 +156 D 0.127 +157 T 0.150 +158 K 0.168 +159 G 0.178 +160 P 0.181 +161 E 0.176 +162 I 0.162 +163 R 0.140 +164 T 0.120 +165 G 0.114 +166 I 0.123 +167 L 0.138 +168 Q 0.148 +169 G 0.151 +170 G 0.153 +171 P 0.150 +172 E 0.141 +173 S 0.128 +174 E 0.114 +175 V 0.101 +176 E 0.088 +177 L 0.074 +178 V 0.063 +179 K 0.059 +180 G 0.060 +181 S 0.059 +182 Q 0.055 +183 V 0.051 +184 L 0.053 +185 V 0.059 +186 T 0.066 +187 V 0.073 +188 D 0.077 +189 P 0.077 +190 A 0.073 +191 F 0.070 +192 R 0.070 +193 T 0.073 +194 R 0.080 +195 G 0.088 +196 N 0.093 +197 A 0.091 +198 N 0.081 +199 T 0.066 +200 V 0.049 +201 W 0.037 +202 V 0.032 +203 D 0.033 +204 Y 0.037 +205 P 0.040 +206 N 0.039 +207 I 0.036 +208 V 0.037 +209 R 0.045 +210 V 0.055 +211 V 0.059 +212 P 0.058 +213 V 0.055 +214 G 0.053 +215 G 0.051 +216 R 0.047 +217 I 0.042 +218 Y 0.040 +219 I 0.040 +220 D 0.043 +221 D 0.048 +222 G 0.051 +223 L 0.051 +224 I 0.047 +225 S 0.041 +226 L 0.038 +227 V 0.038 +228 V 0.038 +229 Q 0.040 +230 K 0.045 +231 I 0.049 +232 G 0.052 +233 P 0.049 +234 E 0.043 +235 G 0.034 +236 L 0.026 +237 V 0.024 +238 T 0.031 +239 Q 0.045 +240 V 0.062 +241 E 0.078 +242 N 0.090 +243 G 0.098 +244 G 0.099 +245 V 0.095 +246 L 0.090 +247 G 0.086 +248 S 0.084 +249 R 0.086 +250 K 0.094 +251 G 0.108 +252 V 0.122 +253 N 0.137 +254 L 0.152 +255 P 0.165 +256 G 0.174 +257 A 0.178 +258 Q 0.178 +259 V 0.178 +260 D 0.182 +261 L 0.186 +262 P 0.179 +263 G 0.160 +264 L 0.131 +265 S 0.100 +266 E 0.076 +267 Q 0.069 +268 D 0.075 +269 V 0.084 +270 R 0.086 +271 D 0.080 +272 L 0.068 +273 R 0.056 +274 F 0.050 +275 G 0.050 +276 V 0.052 +277 E 0.054 +278 H 0.056 +279 G 0.053 +280 V 0.048 +281 D 0.044 +282 I 0.043 +283 V 0.043 +284 F 0.044 +285 A 0.046 +286 S 0.052 +287 F 0.060 +288 V 0.065 +289 R 0.064 +290 K 0.059 +291 A 0.055 +292 S 0.051 +293 D 0.048 +294 V 0.047 +295 A 0.050 +296 A 0.056 +297 V 0.066 +298 R 0.077 +299 A 0.083 +300 A 0.079 +301 L 0.072 +302 G 0.066 +303 P 0.062 +304 E 0.059 +305 G 0.055 +306 H 0.053 +307 G 0.052 +308 I 0.052 +309 K 0.048 +310 I 0.042 +311 I 0.037 +312 S 0.037 +313 K 0.043 +314 I 0.048 +315 E 0.045 +316 N 0.040 +317 H 0.042 +318 E 0.048 +319 G 0.050 +320 V 0.047 +321 K 0.039 +322 R 0.032 +323 F 0.029 +324 D 0.031 +325 E 0.037 +326 I 0.041 +327 L 0.044 +328 E 0.047 +329 V 0.050 +330 S 0.050 +331 D 0.045 +332 G 0.039 +333 I 0.038 +334 M 0.042 +335 V 0.046 +336 A 0.047 +337 R 0.051 +338 G 0.062 +339 D 0.078 +340 L 0.086 +341 G 0.083 +342 I 0.078 +343 E 0.078 +344 I 0.081 +345 P 0.077 +346 A 0.066 +347 E 0.055 +348 K 0.050 +349 V 0.046 +350 F 0.043 +351 L 0.043 +352 A 0.047 +353 Q 0.049 +354 K 0.045 +355 M 0.041 +356 M 0.039 +357 I 0.038 +358 G 0.038 +359 R 0.039 +360 C 0.041 +361 N 0.047 +362 L 0.053 +363 A 0.059 +364 G 0.066 +365 K 0.077 +366 P 0.089 +367 V 0.099 +368 V 0.107 +369 C 0.113 +370 A 0.118 +371 T 0.125 +372 Q 0.133 +373 M 0.135 +374 L 0.125 +375 E 0.108 +376 S 0.094 +377 M 0.085 +378 I 0.076 +379 T 0.069 +380 K 0.071 +381 P 0.085 +382 R 0.103 +383 P 0.111 +384 T 0.103 +385 R 0.090 +386 A 0.083 +387 E 0.083 +388 T 0.086 +389 S 0.096 +390 D 0.111 +391 V 0.121 +392 A 0.125 +393 N 0.130 +394 A 0.133 +395 V 0.131 +396 L 0.131 +397 D 0.137 +398 G 0.145 +399 A 0.140 +400 D 0.124 +401 C 0.111 +402 I 0.110 +403 M 0.118 +404 L 0.127 +405 S 0.134 +406 G 0.136 +407 E 0.130 +408 T 0.119 +409 A 0.108 +410 K 0.102 +411 G 0.100 +412 N 0.101 +413 F 0.101 +414 P 0.098 +415 V 0.097 +416 E 0.099 +417 A 0.104 +418 V 0.108 +419 K 0.112 +420 M 0.115 +421 Q 0.113 +422 H 0.108 +423 A 0.108 +424 I 0.112 +425 A 0.114 +426 R 0.118 +427 E 0.129 +428 A 0.142 +429 E 0.147 +430 A 0.142 +431 A 0.127 +432 V 0.103 +433 Y 0.077 +434 H 0.059 +435 R 0.053 +436 Q 0.055 +437 L 0.063 +438 F 0.074 +439 E 0.079 +440 E 0.075 +441 L 0.066 +442 R 0.065 +443 R 0.077 +444 A 0.100 +445 A 0.125 +446 P 0.139 +447 L 0.141 +448 S 0.136 +449 R 0.129 +450 D 0.119 +451 P 0.108 +452 T 0.102 +453 E 0.102 +454 V 0.106 +455 T 0.107 +456 A 0.108 +457 I 0.109 +458 G 0.108 +459 A 0.104 +460 V 0.098 +461 E 0.093 +462 A 0.088 +463 A 0.083 +464 F 0.081 +465 K 0.084 +466 C 0.088 +467 C 0.086 +468 A 0.076 +469 A 0.064 +470 A 0.056 +471 I 0.056 +472 I 0.065 +473 V 0.075 +474 L 0.081 +475 T 0.086 +476 T 0.098 +477 T 0.117 +478 G 0.133 +479 R 0.133 +480 S 0.121 +481 A 0.110 +482 Q 0.110 +483 L 0.121 +484 L 0.128 +485 S 0.114 +486 R 0.092 +487 Y 0.081 +488 R 0.083 +489 P 0.092 +490 R 0.099 +491 A 0.099 +492 A 0.090 +493 V 0.074 +494 I 0.060 +495 A 0.055 +496 V 0.057 +497 T 0.064 +498 R 0.071 +499 S 0.071 +500 A 0.064 +501 Q 0.056 +502 A 0.051 +503 A 0.051 +504 R 0.057 +505 Q 0.067 +506 V 0.072 +507 H 0.068 +508 L 0.062 +509 C 0.061 +510 R 0.062 +511 G 0.064 +512 V 0.066 +513 F 0.069 +514 P 0.070 +515 L 0.070 +516 L 0.070 +517 Y 0.074 +518 R 0.085 +519 E 0.107 +520 P 0.134 +521 P 0.151 +522 E 0.149 +523 A 0.135 +524 I 0.114 +525 W 0.094 +526 A 0.080 +527 D 0.076 +528 D 0.079 +529 V 0.079 +530 D 0.071 +531 R 0.061 +532 R 0.054 +533 V 0.050 +534 Q 0.047 +535 F 0.045 +536 G 0.048 +537 I 0.056 +538 E 0.065 +539 S 0.069 +540 G 0.068 +541 K 0.069 +542 L 0.076 +543 R 0.088 +544 G 0.095 +545 F 0.095 +546 L 0.093 +547 R 0.096 +548 V 0.106 +549 G 0.118 +550 D 0.123 +551 L 0.118 +552 V 0.110 +553 I 0.107 +554 V 0.109 +555 V 0.108 +556 T 0.106 +557 G 0.108 +558 W 0.116 +559 R 0.128 +560 P 0.143 +561 G 0.167 +562 S 0.203 +563 G 0.240 +564 Y 0.256 +565 T 0.249 +566 N 0.231 +567 I 0.210 +568 M 0.181 +569 R 0.151 +570 V 0.128 +571 L 0.117 +572 S 0.121 +573 I 0.139 +574 S 0.158 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000143627.19_ENST00000342741.6_GN:PKLR_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:11.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000143627.19_ENST00000342741.6_GN:PKLR_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:11.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..72d0bbedc5e8930ebd0187980fdaee6ddbc0d1d2 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000143627.19_ENST00000342741.6_GN:PKLR_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:11.caid @@ -0,0 +1,586 @@ +>ENSG00000143627.19|ENST00000342741.6|GN:PKLR|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:11 +1 M 0.350 +2 V 0.363 +3 P 0.380 +4 Q 0.382 +5 P 0.356 +6 Q 0.318 +7 A 0.307 +8 H 0.330 +9 T 0.356 +10 E 0.373 +11 S 0.382 +12 M 0.377 +13 S 0.362 +14 I 0.354 +15 Q 0.356 +16 E 0.360 +17 N 0.351 +18 I 0.319 +19 S 0.277 +20 S 0.245 +21 L 0.224 +22 Q 0.212 +23 L 0.201 +24 R 0.187 +25 S 0.172 +26 W 0.163 +27 V 0.151 +28 S 0.134 +29 K 0.124 +30 S 0.128 +31 Q 0.138 +32 R 0.149 +33 D 0.164 +34 L 0.185 +35 A 0.205 +36 K 0.230 +37 S 0.274 +38 I 0.334 +39 L 0.389 +40 I 0.421 +41 G 0.429 +42 A 0.422 +43 P 0.415 +44 G 0.426 +45 G 0.460 +46 P 0.495 +47 A 0.505 +48 G 0.486 +49 Y 0.457 +50 L 0.431 +51 R 0.395 +52 R 0.345 +53 A 0.298 +54 S 0.267 +55 V 0.243 +56 A 0.217 +57 Q 0.195 +58 L 0.187 +59 T 0.193 +60 Q 0.222 +61 E 0.269 +62 L 0.307 +63 G 0.319 +64 T 0.315 +65 A 0.307 +66 F 0.300 +67 F 0.294 +68 Q 0.291 +69 Q 0.290 +70 Q 0.294 +71 Q 0.298 +72 L 0.295 +73 P 0.284 +74 A 0.265 +75 A 0.244 +76 M 0.230 +77 A 0.228 +78 D 0.233 +79 T 0.238 +80 F 0.241 +81 L 0.251 +82 E 0.283 +83 H 0.341 +84 L 0.402 +85 C 0.445 +86 L 0.476 +87 L 0.505 +88 D 0.505 +89 I 0.457 +90 D 0.387 +91 S 0.333 +92 E 0.298 +93 P 0.261 +94 V 0.220 +95 A 0.182 +96 A 0.149 +97 R 0.118 +98 S 0.088 +99 T 0.065 +100 S 0.052 +101 I 0.047 +102 I 0.045 +103 A 0.046 +104 T 0.050 +105 I 0.056 +106 G 0.061 +107 P 0.065 +108 A 0.068 +109 S 0.068 +110 R 0.064 +111 S 0.059 +112 V 0.056 +113 E 0.054 +114 R 0.051 +115 L 0.050 +116 K 0.051 +117 E 0.053 +118 M 0.055 +119 I 0.056 +120 K 0.058 +121 A 0.059 +122 G 0.058 +123 M 0.055 +124 N 0.055 +125 I 0.062 +126 A 0.073 +127 R 0.082 +128 L 0.084 +129 N 0.082 +130 F 0.081 +131 S 0.087 +132 H 0.096 +133 G 0.100 +134 S 0.097 +135 H 0.093 +136 E 0.088 +137 Y 0.078 +138 H 0.064 +139 A 0.056 +140 E 0.055 +141 S 0.062 +142 I 0.072 +143 A 0.078 +144 N 0.075 +145 V 0.063 +146 R 0.054 +147 E 0.053 +148 A 0.057 +149 V 0.061 +150 E 0.066 +151 S 0.081 +152 F 0.105 +153 A 0.128 +154 G 0.140 +155 S 0.133 +156 P 0.114 +157 L 0.096 +158 S 0.085 +159 Y 0.078 +160 R 0.072 +161 P 0.067 +162 V 0.063 +163 A 0.062 +164 I 0.067 +165 A 0.080 +166 L 0.101 +167 D 0.126 +168 T 0.150 +169 K 0.168 +170 G 0.178 +171 P 0.180 +172 E 0.175 +173 I 0.160 +174 R 0.138 +175 T 0.118 +176 G 0.111 +177 I 0.121 +178 L 0.136 +179 Q 0.146 +180 G 0.150 +181 G 0.151 +182 P 0.148 +183 E 0.139 +184 S 0.125 +185 E 0.112 +186 V 0.099 +187 E 0.086 +188 L 0.073 +189 V 0.063 +190 K 0.059 +191 G 0.059 +192 S 0.059 +193 Q 0.055 +194 V 0.051 +195 L 0.053 +196 V 0.059 +197 T 0.066 +198 V 0.073 +199 D 0.077 +200 P 0.076 +201 A 0.072 +202 F 0.069 +203 R 0.068 +204 T 0.071 +205 R 0.078 +206 G 0.086 +207 N 0.091 +208 A 0.089 +209 N 0.080 +210 T 0.064 +211 V 0.049 +212 W 0.037 +213 V 0.032 +214 D 0.033 +215 Y 0.037 +216 P 0.040 +217 N 0.038 +218 I 0.035 +219 V 0.036 +220 R 0.044 +221 V 0.054 +222 V 0.058 +223 P 0.056 +224 V 0.054 +225 G 0.052 +226 G 0.050 +227 R 0.046 +228 I 0.042 +229 Y 0.039 +230 I 0.039 +231 D 0.042 +232 D 0.047 +233 G 0.050 +234 L 0.050 +235 I 0.046 +236 S 0.041 +237 L 0.037 +238 V 0.037 +239 V 0.037 +240 Q 0.040 +241 K 0.044 +242 I 0.049 +243 G 0.052 +244 P 0.049 +245 E 0.043 +246 G 0.033 +247 L 0.025 +248 V 0.023 +249 T 0.030 +250 Q 0.044 +251 V 0.062 +252 E 0.078 +253 N 0.090 +254 G 0.098 +255 G 0.099 +256 V 0.095 +257 L 0.090 +258 G 0.086 +259 S 0.084 +260 R 0.086 +261 K 0.094 +262 G 0.108 +263 V 0.123 +264 N 0.138 +265 L 0.152 +266 P 0.165 +267 G 0.175 +268 A 0.180 +269 Q 0.180 +270 V 0.181 +271 D 0.186 +272 L 0.191 +273 P 0.186 +274 G 0.166 +275 L 0.136 +276 S 0.103 +277 E 0.079 +278 Q 0.071 +279 D 0.077 +280 V 0.085 +281 R 0.087 +282 D 0.081 +283 L 0.069 +284 R 0.057 +285 F 0.052 +286 G 0.051 +287 V 0.054 +288 E 0.056 +289 H 0.058 +290 G 0.055 +291 V 0.050 +292 D 0.046 +293 I 0.045 +294 V 0.045 +295 F 0.045 +296 A 0.048 +297 S 0.055 +298 F 0.064 +299 V 0.070 +300 R 0.068 +301 K 0.062 +302 A 0.058 +303 S 0.054 +304 D 0.050 +305 V 0.049 +306 A 0.052 +307 A 0.059 +308 V 0.069 +309 R 0.079 +310 A 0.085 +311 A 0.082 +312 L 0.075 +313 G 0.069 +314 P 0.066 +315 E 0.063 +316 G 0.060 +317 H 0.057 +318 G 0.056 +319 I 0.055 +320 K 0.051 +321 I 0.044 +322 I 0.039 +323 S 0.039 +324 K 0.045 +325 I 0.050 +326 E 0.047 +327 N 0.042 +328 H 0.044 +329 E 0.050 +330 G 0.052 +331 V 0.048 +332 K 0.040 +333 R 0.033 +334 F 0.030 +335 D 0.032 +336 E 0.038 +337 I 0.043 +338 L 0.046 +339 E 0.049 +340 V 0.053 +341 S 0.053 +342 D 0.047 +343 G 0.041 +344 I 0.040 +345 M 0.044 +346 V 0.048 +347 A 0.049 +348 R 0.053 +349 G 0.064 +350 D 0.079 +351 L 0.087 +352 G 0.083 +353 I 0.078 +354 E 0.078 +355 I 0.081 +356 P 0.076 +357 A 0.065 +358 E 0.055 +359 K 0.049 +360 V 0.046 +361 F 0.042 +362 L 0.043 +363 A 0.048 +364 Q 0.050 +365 K 0.047 +366 M 0.042 +367 M 0.039 +368 I 0.039 +369 G 0.039 +370 R 0.039 +371 C 0.042 +372 N 0.047 +373 L 0.053 +374 A 0.059 +375 G 0.066 +376 K 0.077 +377 P 0.089 +378 V 0.100 +379 V 0.108 +380 C 0.114 +381 A 0.119 +382 T 0.126 +383 Q 0.133 +384 M 0.135 +385 L 0.125 +386 E 0.108 +387 S 0.094 +388 M 0.085 +389 I 0.077 +390 T 0.070 +391 K 0.072 +392 P 0.086 +393 R 0.104 +394 P 0.112 +395 T 0.104 +396 R 0.090 +397 A 0.084 +398 E 0.084 +399 T 0.087 +400 S 0.096 +401 D 0.111 +402 V 0.121 +403 A 0.125 +404 N 0.129 +405 A 0.132 +406 V 0.130 +407 L 0.130 +408 D 0.136 +409 G 0.143 +410 A 0.139 +411 D 0.123 +412 C 0.111 +413 I 0.110 +414 M 0.118 +415 L 0.128 +416 S 0.135 +417 G 0.137 +418 E 0.131 +419 T 0.120 +420 A 0.109 +421 K 0.103 +422 G 0.101 +423 N 0.102 +424 F 0.101 +425 P 0.099 +426 V 0.097 +427 E 0.099 +428 A 0.104 +429 V 0.108 +430 K 0.112 +431 M 0.115 +432 Q 0.112 +433 H 0.107 +434 A 0.106 +435 I 0.110 +436 A 0.113 +437 R 0.118 +438 E 0.129 +439 A 0.142 +440 E 0.147 +441 A 0.143 +442 A 0.128 +443 V 0.103 +444 Y 0.076 +445 H 0.057 +446 R 0.049 +447 Q 0.049 +448 L 0.059 +449 F 0.071 +450 E 0.078 +451 E 0.074 +452 L 0.066 +453 R 0.065 +454 R 0.077 +455 A 0.100 +456 A 0.125 +457 P 0.140 +458 L 0.142 +459 S 0.137 +460 R 0.130 +461 D 0.120 +462 P 0.109 +463 T 0.103 +464 E 0.103 +465 V 0.106 +466 T 0.108 +467 A 0.109 +468 I 0.111 +469 G 0.109 +470 A 0.105 +471 V 0.099 +472 E 0.094 +473 A 0.089 +474 A 0.083 +475 F 0.081 +476 K 0.084 +477 C 0.088 +478 C 0.086 +479 A 0.077 +480 A 0.065 +481 A 0.056 +482 I 0.056 +483 I 0.065 +484 V 0.076 +485 L 0.082 +486 T 0.087 +487 T 0.098 +488 T 0.118 +489 G 0.134 +490 R 0.134 +491 S 0.122 +492 A 0.111 +493 Q 0.111 +494 L 0.122 +495 L 0.129 +496 S 0.115 +497 R 0.093 +498 Y 0.081 +499 R 0.084 +500 P 0.092 +501 R 0.100 +502 A 0.100 +503 A 0.090 +504 V 0.074 +505 I 0.061 +506 A 0.055 +507 V 0.057 +508 T 0.064 +509 R 0.071 +510 S 0.071 +511 A 0.064 +512 Q 0.056 +513 A 0.051 +514 A 0.051 +515 R 0.057 +516 Q 0.067 +517 V 0.072 +518 H 0.068 +519 L 0.062 +520 C 0.061 +521 R 0.063 +522 G 0.064 +523 V 0.066 +524 F 0.069 +525 P 0.070 +526 L 0.070 +527 L 0.070 +528 Y 0.074 +529 R 0.084 +530 E 0.107 +531 P 0.133 +532 P 0.150 +533 E 0.148 +534 A 0.134 +535 I 0.114 +536 W 0.093 +537 A 0.079 +538 D 0.076 +539 D 0.079 +540 V 0.079 +541 D 0.071 +542 R 0.061 +543 R 0.055 +544 V 0.050 +545 Q 0.047 +546 F 0.042 +547 G 0.039 +548 I 0.038 +549 E 0.042 +550 S 0.051 +551 G 0.059 +552 K 0.066 +553 L 0.076 +554 R 0.088 +555 G 0.095 +556 F 0.095 +557 L 0.093 +558 R 0.095 +559 V 0.106 +560 G 0.118 +561 D 0.123 +562 L 0.118 +563 V 0.110 +564 I 0.107 +565 V 0.109 +566 V 0.109 +567 T 0.106 +568 G 0.108 +569 W 0.116 +570 R 0.128 +571 P 0.143 +572 G 0.167 +573 S 0.204 +574 G 0.241 +575 Y 0.257 +576 T 0.250 +577 N 0.232 +578 I 0.210 +579 M 0.181 +580 R 0.151 +581 V 0.128 +582 L 0.117 +583 S 0.121 +584 I 0.139 +585 S 0.158 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000144182.18_ENST00000651691.1_GN:LIPT1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000144182.18_ENST00000651691.1_GN:LIPT1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..846e98cee0f508ecdd96662ee0d778509cea61bb --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000144182.18_ENST00000651691.1_GN:LIPT1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,374 @@ +>ENSG00000144182.18|ENST00000651691.1|GN:LIPT1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.318 +2 L 0.333 +3 I 0.354 +4 P 0.365 +5 F 0.361 +6 S 0.347 +7 M 0.331 +8 K 0.318 +9 N 0.310 +10 C 0.300 +11 F 0.282 +12 Q 0.272 +13 L 0.281 +14 L 0.297 +15 C 0.307 +16 N 0.316 +17 C 0.334 +18 Q 0.367 +19 V 0.410 +20 P 0.456 +21 A 0.490 +22 A 0.499 +23 G 0.479 +24 F 0.438 +25 K 0.390 +26 K 0.341 +27 T 0.288 +28 V 0.227 +29 K 0.164 +30 N 0.114 +31 G 0.082 +32 L 0.064 +33 I 0.057 +34 L 0.058 +35 Q 0.063 +36 S 0.067 +37 I 0.067 +38 S 0.066 +39 N 0.068 +40 D 0.070 +41 V 0.071 +42 Y 0.070 +43 Q 0.067 +44 N 0.061 +45 L 0.054 +46 A 0.049 +47 V 0.043 +48 E 0.038 +49 D 0.035 +50 W 0.032 +51 I 0.029 +52 H 0.029 +53 D 0.031 +54 H 0.033 +55 M 0.035 +56 N 0.038 +57 L 0.045 +58 E 0.058 +59 G 0.073 +60 K 0.082 +61 P 0.077 +62 I 0.064 +63 L 0.050 +64 F 0.041 +65 F 0.040 +66 W 0.048 +67 Q 0.064 +68 N 0.083 +69 S 0.096 +70 P 0.100 +71 S 0.104 +72 V 0.112 +73 V 0.116 +74 I 0.110 +75 G 0.101 +76 R 0.094 +77 H 0.094 +78 Q 0.094 +79 N 0.088 +80 P 0.079 +81 W 0.073 +82 Q 0.072 +83 E 0.074 +84 C 0.073 +85 N 0.066 +86 L 0.059 +87 N 0.056 +88 L 0.059 +89 M 0.066 +90 R 0.078 +91 E 0.096 +92 E 0.120 +93 G 0.148 +94 I 0.167 +95 K 0.169 +96 L 0.163 +97 A 0.164 +98 R 0.176 +99 R 0.199 +100 R 0.231 +101 S 0.265 +102 G 0.289 +103 G 0.297 +104 G 0.293 +105 T 0.279 +106 V 0.245 +107 Y 0.195 +108 H 0.151 +109 D 0.127 +110 M 0.121 +111 G 0.119 +112 N 0.109 +113 I 0.091 +114 N 0.070 +115 L 0.052 +116 T 0.040 +117 F 0.033 +118 F 0.031 +119 T 0.035 +120 T 0.043 +121 K 0.052 +122 K 0.061 +123 K 0.068 +124 Y 0.070 +125 D 0.068 +126 R 0.063 +127 M 0.058 +128 E 0.052 +129 N 0.047 +130 L 0.044 +131 K 0.043 +132 L 0.044 +133 I 0.042 +134 V 0.039 +135 R 0.040 +136 A 0.046 +137 L 0.053 +138 N 0.057 +139 A 0.058 +140 V 0.059 +141 Q 0.064 +142 P 0.070 +143 Q 0.074 +144 L 0.073 +145 D 0.067 +146 V 0.060 +147 Q 0.056 +148 A 0.057 +149 T 0.062 +150 K 0.068 +151 R 0.074 +152 F 0.080 +153 D 0.082 +154 L 0.075 +155 L 0.063 +156 L 0.053 +157 D 0.050 +158 G 0.053 +159 Q 0.060 +160 F 0.070 +161 K 0.082 +162 I 0.096 +163 S 0.114 +164 G 0.140 +165 T 0.173 +166 A 0.196 +167 S 0.192 +168 K 0.166 +169 I 0.138 +170 G 0.115 +171 R 0.095 +172 T 0.076 +173 T 0.060 +174 A 0.049 +175 Y 0.042 +176 H 0.040 +177 H 0.042 +178 C 0.047 +179 T 0.057 +180 L 0.069 +181 L 0.078 +182 C 0.085 +183 S 0.094 +184 T 0.103 +185 D 0.107 +186 G 0.108 +187 T 0.112 +188 F 0.126 +189 L 0.145 +190 S 0.154 +191 S 0.149 +192 L 0.142 +193 L 0.148 +194 K 0.172 +195 S 0.204 +196 P 0.227 +197 Y 0.238 +198 Q 0.248 +199 G 0.265 +200 I 0.286 +201 R 0.301 +202 S 0.301 +203 N 0.294 +204 A 0.288 +205 T 0.286 +206 A 0.287 +207 S 0.285 +208 I 0.268 +209 P 0.234 +210 S 0.186 +211 L 0.137 +212 V 0.102 +213 K 0.086 +214 N 0.082 +215 L 0.081 +216 L 0.082 +217 E 0.085 +218 K 0.088 +219 D 0.087 +220 P 0.081 +221 T 0.075 +222 L 0.070 +223 T 0.065 +224 C 0.058 +225 E 0.053 +226 V 0.053 +227 L 0.053 +228 M 0.051 +229 N 0.046 +230 A 0.043 +231 V 0.042 +232 A 0.042 +233 T 0.043 +234 E 0.044 +235 Y 0.044 +236 A 0.043 +237 A 0.043 +238 Y 0.042 +239 H 0.040 +240 Q 0.042 +241 I 0.049 +242 D 0.055 +243 N 0.057 +244 H 0.054 +245 I 0.050 +246 H 0.046 +247 L 0.045 +248 I 0.045 +249 N 0.047 +250 P 0.051 +251 T 0.053 +252 D 0.052 +253 E 0.050 +254 T 0.049 +255 L 0.050 +256 F 0.052 +257 P 0.056 +258 G 0.059 +259 I 0.062 +260 N 0.067 +261 S 0.073 +262 K 0.078 +263 A 0.084 +264 K 0.085 +265 E 0.078 +266 L 0.066 +267 Q 0.057 +268 T 0.055 +269 W 0.060 +270 E 0.067 +271 W 0.069 +272 I 0.067 +273 Y 0.070 +274 G 0.081 +275 K 0.095 +276 T 0.103 +277 P 0.103 +278 K 0.101 +279 F 0.099 +280 S 0.093 +281 I 0.079 +282 N 0.060 +283 T 0.043 +284 S 0.033 +285 F 0.031 +286 H 0.035 +287 V 0.046 +288 L 0.058 +289 Y 0.068 +290 E 0.074 +291 Q 0.078 +292 S 0.083 +293 H 0.082 +294 L 0.074 +295 E 0.061 +296 I 0.049 +297 K 0.040 +298 V 0.036 +299 F 0.035 +300 I 0.038 +301 D 0.043 +302 I 0.051 +303 K 0.061 +304 N 0.073 +305 G 0.083 +306 R 0.086 +307 I 0.077 +308 E 0.062 +309 I 0.049 +310 C 0.043 +311 N 0.044 +312 I 0.054 +313 E 0.069 +314 A 0.081 +315 P 0.082 +316 D 0.078 +317 H 0.076 +318 W 0.078 +319 L 0.079 +320 P 0.076 +321 L 0.070 +322 E 0.063 +323 I 0.056 +324 R 0.050 +325 D 0.048 +326 K 0.049 +327 L 0.055 +328 N 0.062 +329 S 0.069 +330 S 0.070 +331 L 0.069 +332 I 0.070 +333 G 0.074 +334 S 0.078 +335 K 0.078 +336 F 0.075 +337 C 0.072 +338 P 0.071 +339 T 0.072 +340 E 0.074 +341 T 0.072 +342 T 0.068 +343 M 0.065 +344 L 0.068 +345 T 0.077 +346 N 0.085 +347 I 0.082 +348 L 0.070 +349 L 0.064 +350 R 0.076 +351 T 0.107 +352 C 0.143 +353 P 0.165 +354 Q 0.171 +355 D 0.168 +356 H 0.159 +357 K 0.140 +358 L 0.117 +359 N 0.097 +360 S 0.077 +361 K 0.057 +362 W 0.044 +363 N 0.038 +364 I 0.039 +365 L 0.046 +366 C 0.059 +367 E 0.071 +368 K 0.076 +369 I 0.079 +370 K 0.088 +371 G 0.104 +372 I 0.121 +373 M 0.133 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000144182.18_ENST00000651691.1_GN:LIPT1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000144182.18_ENST00000651691.1_GN:LIPT1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e65ef868005d196668e5fbf07589b414814fad84 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000144182.18_ENST00000651691.1_GN:LIPT1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid @@ -0,0 +1,394 @@ +>ENSG00000144182.18|ENST00000651691.1|GN:LIPT1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:20 +1 M 0.313 +2 T 0.308 +3 H 0.313 +4 F 0.323 +5 S 0.320 +6 S 0.312 +7 S 0.335 +8 S 0.378 +9 P 0.393 +10 H 0.388 +11 E 0.426 +12 A 0.517 +13 V 0.596 +14 G 0.627 +15 T 0.627 +16 T 0.618 +17 G 0.604 +18 S 0.586 +19 R 0.569 +20 S 0.555 +21 M 0.541 +22 L 0.522 +23 I 0.494 +24 P 0.454 +25 F 0.412 +26 S 0.373 +27 M 0.345 +28 K 0.329 +29 N 0.323 +30 C 0.313 +31 F 0.291 +32 Q 0.274 +33 L 0.276 +34 L 0.288 +35 C 0.298 +36 N 0.307 +37 C 0.325 +38 Q 0.357 +39 V 0.398 +40 P 0.442 +41 A 0.477 +42 A 0.492 +43 G 0.479 +44 F 0.444 +45 K 0.397 +46 K 0.349 +47 T 0.297 +48 V 0.235 +49 K 0.169 +50 N 0.116 +51 G 0.082 +52 L 0.064 +53 I 0.056 +54 L 0.058 +55 Q 0.063 +56 S 0.065 +57 I 0.065 +58 S 0.064 +59 N 0.066 +60 D 0.068 +61 V 0.069 +62 Y 0.068 +63 Q 0.065 +64 N 0.059 +65 L 0.053 +66 A 0.048 +67 V 0.042 +68 E 0.037 +69 D 0.034 +70 W 0.031 +71 I 0.028 +72 H 0.028 +73 D 0.029 +74 H 0.031 +75 M 0.032 +76 N 0.035 +77 L 0.043 +78 E 0.055 +79 G 0.070 +80 K 0.078 +81 P 0.074 +82 I 0.061 +83 L 0.048 +84 F 0.040 +85 F 0.039 +86 W 0.046 +87 Q 0.061 +88 N 0.079 +89 S 0.092 +90 P 0.097 +91 S 0.101 +92 V 0.110 +93 V 0.114 +94 I 0.109 +95 G 0.099 +96 R 0.093 +97 H 0.093 +98 Q 0.093 +99 N 0.088 +100 P 0.078 +101 W 0.072 +102 Q 0.071 +103 E 0.073 +104 C 0.072 +105 N 0.065 +106 L 0.057 +107 N 0.054 +108 L 0.057 +109 M 0.064 +110 R 0.076 +111 E 0.093 +112 E 0.118 +113 G 0.147 +114 I 0.166 +115 K 0.168 +116 L 0.161 +117 A 0.161 +118 R 0.173 +119 R 0.197 +120 R 0.230 +121 S 0.266 +122 G 0.290 +123 G 0.296 +124 G 0.291 +125 T 0.275 +126 V 0.242 +127 Y 0.193 +128 H 0.149 +129 D 0.126 +130 M 0.120 +131 G 0.117 +132 N 0.108 +133 I 0.090 +134 N 0.070 +135 L 0.053 +136 T 0.041 +137 F 0.034 +138 F 0.032 +139 T 0.036 +140 T 0.044 +141 K 0.053 +142 K 0.063 +143 K 0.070 +144 Y 0.072 +145 D 0.069 +146 R 0.064 +147 M 0.059 +148 E 0.053 +149 N 0.047 +150 L 0.044 +151 K 0.044 +152 L 0.044 +153 I 0.042 +154 V 0.039 +155 R 0.040 +156 A 0.046 +157 L 0.053 +158 N 0.057 +159 A 0.058 +160 V 0.060 +161 Q 0.064 +162 P 0.071 +163 Q 0.075 +164 L 0.073 +165 D 0.067 +166 V 0.059 +167 Q 0.055 +168 A 0.057 +169 T 0.062 +170 K 0.068 +171 R 0.074 +172 F 0.080 +173 D 0.082 +174 L 0.075 +175 L 0.063 +176 L 0.052 +177 D 0.049 +178 G 0.053 +179 Q 0.060 +180 F 0.070 +181 K 0.083 +182 I 0.098 +183 S 0.117 +184 G 0.143 +185 T 0.178 +186 A 0.202 +187 S 0.198 +188 K 0.170 +189 I 0.140 +190 G 0.116 +191 R 0.095 +192 T 0.077 +193 T 0.061 +194 A 0.049 +195 Y 0.043 +196 H 0.041 +197 H 0.043 +198 C 0.049 +199 T 0.058 +200 L 0.069 +201 L 0.077 +202 C 0.084 +203 S 0.093 +204 T 0.101 +205 D 0.106 +206 G 0.107 +207 T 0.111 +208 F 0.126 +209 L 0.145 +210 S 0.154 +211 S 0.149 +212 L 0.142 +213 L 0.148 +214 K 0.171 +215 S 0.201 +216 P 0.224 +217 Y 0.235 +218 Q 0.244 +219 G 0.260 +220 I 0.280 +221 R 0.293 +222 S 0.293 +223 N 0.285 +224 A 0.278 +225 T 0.275 +226 A 0.276 +227 S 0.274 +228 I 0.259 +229 P 0.226 +230 S 0.180 +231 L 0.133 +232 V 0.100 +233 K 0.084 +234 N 0.080 +235 L 0.080 +236 L 0.080 +237 E 0.083 +238 K 0.087 +239 D 0.086 +240 P 0.081 +241 T 0.075 +242 L 0.070 +243 T 0.065 +244 C 0.058 +245 E 0.054 +246 V 0.053 +247 L 0.054 +248 M 0.051 +249 N 0.046 +250 A 0.043 +251 V 0.042 +252 A 0.041 +253 T 0.042 +254 E 0.044 +255 Y 0.044 +256 A 0.043 +257 A 0.042 +258 Y 0.041 +259 H 0.040 +260 Q 0.042 +261 I 0.049 +262 D 0.056 +263 N 0.058 +264 H 0.055 +265 I 0.050 +266 H 0.047 +267 L 0.045 +268 I 0.045 +269 N 0.047 +270 P 0.050 +271 T 0.053 +272 D 0.053 +273 E 0.051 +274 T 0.050 +275 L 0.051 +276 F 0.054 +277 P 0.057 +278 G 0.058 +279 I 0.055 +280 N 0.051 +281 S 0.053 +282 K 0.062 +283 A 0.075 +284 K 0.082 +285 E 0.078 +286 L 0.067 +287 Q 0.059 +288 T 0.056 +289 W 0.061 +290 E 0.069 +291 W 0.071 +292 I 0.069 +293 Y 0.071 +294 G 0.083 +295 K 0.097 +296 T 0.104 +297 P 0.104 +298 K 0.103 +299 F 0.101 +300 S 0.094 +301 I 0.079 +302 N 0.060 +303 T 0.043 +304 S 0.034 +305 F 0.032 +306 H 0.037 +307 V 0.048 +308 L 0.062 +309 Y 0.071 +310 E 0.077 +311 Q 0.081 +312 S 0.086 +313 H 0.085 +314 L 0.076 +315 E 0.063 +316 I 0.050 +317 K 0.042 +318 V 0.037 +319 F 0.037 +320 I 0.040 +321 D 0.045 +322 I 0.053 +323 K 0.063 +324 N 0.075 +325 G 0.085 +326 R 0.087 +327 I 0.078 +328 E 0.062 +329 I 0.049 +330 C 0.043 +331 N 0.045 +332 I 0.054 +333 E 0.070 +334 A 0.081 +335 P 0.083 +336 D 0.079 +337 H 0.078 +338 W 0.080 +339 L 0.080 +340 P 0.076 +341 L 0.069 +342 E 0.062 +343 I 0.055 +344 R 0.050 +345 D 0.048 +346 K 0.049 +347 L 0.053 +348 N 0.059 +349 S 0.064 +350 S 0.066 +351 L 0.067 +352 I 0.069 +353 G 0.074 +354 S 0.079 +355 K 0.079 +356 F 0.075 +357 C 0.072 +358 P 0.071 +359 T 0.072 +360 E 0.074 +361 T 0.073 +362 T 0.068 +363 M 0.062 +364 L 0.058 +365 T 0.058 +366 N 0.060 +367 I 0.061 +368 L 0.059 +369 L 0.059 +370 R 0.074 +371 T 0.105 +372 C 0.141 +373 P 0.163 +374 Q 0.169 +375 D 0.166 +376 H 0.157 +377 K 0.138 +378 L 0.116 +379 N 0.096 +380 S 0.076 +381 K 0.057 +382 W 0.043 +383 N 0.038 +384 I 0.039 +385 L 0.045 +386 C 0.058 +387 E 0.070 +388 K 0.075 +389 I 0.077 +390 K 0.086 +391 G 0.102 +392 I 0.120 +393 M 0.133 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000145050.19_ENST00000528157.7_GN:MANF_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000145050.19_ENST00000528157.7_GN:MANF_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..482b9f9d3b1bedb129466ba7f4bf2644bd295085 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000145050.19_ENST00000528157.7_GN:MANF_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,183 @@ +>ENSG00000145050.19|ENST00000528157.7|GN:MANF|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.426 +2 R 0.442 +3 R 0.465 +4 M 0.478 +5 W 0.477 +6 A 0.486 +7 T 0.521 +8 Q 0.549 +9 G 0.534 +10 L 0.498 +11 A 0.465 +12 V 0.421 +13 A 0.374 +14 L 0.375 +15 A 0.427 +16 L 0.478 +17 S 0.496 +18 V 0.496 +19 L 0.507 +20 P 0.536 +21 G 0.562 +22 S 0.555 +23 R 0.503 +24 A 0.419 +25 L 0.337 +26 R 0.287 +27 P 0.269 +28 G 0.257 +29 D 0.226 +30 C 0.173 +31 E 0.112 +32 V 0.062 +33 C 0.035 +34 I 0.025 +35 S 0.026 +36 Y 0.029 +37 L 0.031 +38 G 0.030 +39 R 0.030 +40 F 0.037 +41 Y 0.050 +42 Q 0.059 +43 D 0.061 +44 L 0.060 +45 K 0.063 +46 D 0.073 +47 R 0.086 +48 D 0.099 +49 V 0.105 +50 T 0.099 +51 F 0.088 +52 S 0.078 +53 P 0.070 +54 A 0.063 +55 T 0.058 +56 I 0.058 +57 E 0.064 +58 N 0.068 +59 E 0.063 +60 L 0.052 +61 I 0.041 +62 K 0.035 +63 F 0.032 +64 C 0.033 +65 R 0.041 +66 E 0.053 +67 A 0.064 +68 R 0.069 +69 G 0.067 +70 K 0.062 +71 E 0.057 +72 N 0.052 +73 R 0.046 +74 L 0.039 +75 C 0.037 +76 Y 0.043 +77 Y 0.056 +78 I 0.071 +79 G 0.085 +80 A 0.100 +81 T 0.120 +82 D 0.143 +83 D 0.162 +84 A 0.170 +85 A 0.164 +86 T 0.146 +87 K 0.122 +88 I 0.098 +89 I 0.081 +90 N 0.071 +91 E 0.067 +92 V 0.065 +93 S 0.062 +94 K 0.057 +95 P 0.054 +96 L 0.055 +97 A 0.059 +98 H 0.064 +99 H 0.066 +100 I 0.062 +101 P 0.052 +102 V 0.040 +103 E 0.031 +104 K 0.028 +105 I 0.028 +106 C 0.030 +107 E 0.034 +108 K 0.040 +109 L 0.047 +110 K 0.053 +111 K 0.056 +112 K 0.057 +113 D 0.057 +114 S 0.059 +115 Q 0.064 +116 I 0.073 +117 C 0.086 +118 E 0.110 +119 L 0.146 +120 K 0.194 +121 Y 0.251 +122 D 0.303 +123 K 0.331 +124 Q 0.330 +125 I 0.304 +126 D 0.265 +127 L 0.232 +128 S 0.216 +129 T 0.208 +130 V 0.191 +131 D 0.159 +132 L 0.123 +133 K 0.096 +134 K 0.083 +135 L 0.073 +136 R 0.062 +137 V 0.053 +138 K 0.052 +139 E 0.055 +140 L 0.060 +141 K 0.069 +142 K 0.079 +143 I 0.083 +144 L 0.080 +145 D 0.072 +146 D 0.064 +147 W 0.063 +148 G 0.073 +149 E 0.090 +150 T 0.105 +151 C 0.114 +152 K 0.121 +153 G 0.124 +154 C 0.118 +155 A 0.103 +156 E 0.084 +157 K 0.067 +158 S 0.057 +159 D 0.052 +160 Y 0.054 +161 I 0.061 +162 R 0.065 +163 K 0.061 +164 I 0.054 +165 N 0.050 +166 E 0.049 +167 L 0.051 +168 M 0.056 +169 P 0.064 +170 K 0.083 +171 Y 0.120 +172 A 0.175 +173 P 0.235 +174 K 0.283 +175 A 0.321 +176 A 0.353 +177 S 0.379 +178 A 0.400 +179 R 0.419 +180 T 0.429 +181 D 0.421 +182 L 0.404 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000145050.19_ENST00000528157.7_GN:MANF_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000145050.19_ENST00000528157.7_GN:MANF_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..af4120be48b6c77d95065c6866a135913b6b8bd8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000145050.19_ENST00000528157.7_GN:MANF_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid @@ -0,0 +1,186 @@ +>ENSG00000145050.19|ENST00000528157.7|GN:MANF|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 +1 M 0.396 +2 R 0.414 +3 R 0.445 +4 M 0.465 +5 R 0.462 +6 R 0.462 +7 M 0.495 +8 W 0.548 +9 A 0.584 +10 T 0.593 +11 Q 0.579 +12 G 0.544 +13 L 0.518 +14 A 0.524 +15 V 0.538 +16 A 0.530 +17 L 0.516 +18 A 0.517 +19 L 0.524 +20 S 0.521 +21 V 0.513 +22 L 0.519 +23 P 0.543 +24 G 0.566 +25 S 0.558 +26 R 0.505 +27 A 0.421 +28 L 0.341 +29 R 0.291 +30 P 0.272 +31 G 0.260 +32 D 0.229 +33 C 0.175 +34 E 0.113 +35 V 0.063 +36 C 0.035 +37 I 0.025 +38 S 0.026 +39 Y 0.029 +40 L 0.031 +41 G 0.030 +42 R 0.031 +43 F 0.038 +44 Y 0.050 +45 Q 0.060 +46 D 0.062 +47 L 0.060 +48 K 0.063 +49 D 0.073 +50 R 0.087 +51 D 0.100 +52 V 0.105 +53 T 0.099 +54 F 0.088 +55 S 0.078 +56 P 0.070 +57 A 0.063 +58 T 0.058 +59 I 0.061 +60 E 0.070 +61 N 0.076 +62 E 0.070 +63 L 0.056 +64 I 0.043 +65 K 0.035 +66 F 0.032 +67 C 0.033 +68 R 0.041 +69 E 0.053 +70 A 0.065 +71 R 0.069 +72 G 0.067 +73 K 0.062 +74 E 0.057 +75 N 0.052 +76 R 0.046 +77 L 0.039 +78 C 0.037 +79 Y 0.043 +80 Y 0.056 +81 I 0.071 +82 G 0.085 +83 A 0.100 +84 T 0.120 +85 D 0.143 +86 D 0.162 +87 A 0.170 +88 A 0.164 +89 T 0.146 +90 K 0.123 +91 I 0.099 +92 I 0.081 +93 N 0.071 +94 E 0.068 +95 V 0.065 +96 S 0.062 +97 K 0.057 +98 P 0.054 +99 L 0.055 +100 A 0.059 +101 H 0.064 +102 H 0.066 +103 I 0.062 +104 P 0.052 +105 V 0.040 +106 E 0.031 +107 K 0.028 +108 I 0.028 +109 C 0.031 +110 E 0.034 +111 K 0.040 +112 L 0.047 +113 K 0.053 +114 K 0.057 +115 K 0.057 +116 D 0.057 +117 S 0.059 +118 Q 0.064 +119 I 0.073 +120 C 0.086 +121 E 0.110 +122 L 0.145 +123 K 0.194 +124 Y 0.251 +125 D 0.303 +126 K 0.332 +127 Q 0.331 +128 I 0.305 +129 D 0.266 +130 L 0.234 +131 S 0.218 +132 T 0.210 +133 V 0.192 +134 D 0.160 +135 L 0.124 +136 K 0.097 +137 K 0.084 +138 L 0.074 +139 R 0.063 +140 V 0.054 +141 K 0.052 +142 E 0.055 +143 L 0.061 +144 K 0.070 +145 K 0.080 +146 I 0.084 +147 L 0.081 +148 D 0.073 +149 D 0.065 +150 W 0.064 +151 G 0.074 +152 E 0.091 +153 T 0.106 +154 C 0.116 +155 K 0.122 +156 G 0.125 +157 C 0.119 +158 A 0.104 +159 E 0.084 +160 K 0.068 +161 S 0.057 +162 D 0.052 +163 Y 0.054 +164 I 0.061 +165 R 0.066 +166 K 0.062 +167 I 0.055 +168 N 0.050 +169 E 0.050 +170 L 0.051 +171 M 0.056 +172 P 0.064 +173 K 0.083 +174 Y 0.120 +175 A 0.176 +176 P 0.236 +177 K 0.285 +178 A 0.324 +179 A 0.356 +180 S 0.383 +181 A 0.406 +182 R 0.425 +183 T 0.435 +184 D 0.426 +185 L 0.408 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000146910.14_ENST00000636446.2_GN:CNPY1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000146910.14_ENST00000636446.2_GN:CNPY1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..be42a18a815816a30df03d30aa359c0de9883bdd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000146910.14_ENST00000636446.2_GN:CNPY1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,146 @@ +>ENSG00000146910.14|ENST00000636446.2|GN:CNPY1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.112 +2 D 0.109 +3 E 0.100 +4 I 0.090 +5 E 0.086 +6 H 0.082 +7 D 0.072 +8 I 0.059 +9 T 0.056 +10 K 0.064 +11 A 0.074 +12 R 0.079 +13 Q 0.087 +14 K 0.107 +15 K 0.148 +16 T 0.207 +17 K 0.278 +18 V 0.349 +19 G 0.413 +20 S 0.461 +21 F 0.485 +22 R 0.479 +23 I 0.454 +24 N 0.437 +25 P 0.434 +26 D 0.438 +27 G 0.434 +28 T 0.411 +29 Q 0.375 +30 E 0.344 +31 R 0.328 +32 R 0.327 +33 K 0.327 +34 I 0.301 +35 P 0.239 +36 L 0.166 +37 A 0.112 +38 Q 0.088 +39 S 0.084 +40 E 0.088 +41 A 0.086 +42 F 0.076 +43 L 0.062 +44 T 0.054 +45 D 0.053 +46 L 0.053 +47 L 0.050 +48 E 0.046 +49 K 0.043 +50 V 0.043 +51 C 0.043 +52 E 0.044 +53 R 0.048 +54 M 0.051 +55 N 0.055 +56 D 0.058 +57 Y 0.057 +58 K 0.055 +59 L 0.058 +60 E 0.070 +61 E 0.089 +62 D 0.106 +63 P 0.113 +64 V 0.109 +65 T 0.103 +66 K 0.096 +67 E 0.086 +68 R 0.073 +69 T 0.062 +70 F 0.058 +71 K 0.062 +72 R 0.078 +73 F 0.105 +74 A 0.136 +75 P 0.163 +76 R 0.183 +77 K 0.196 +78 G 0.192 +79 D 0.171 +80 K 0.145 +81 I 0.127 +82 Y 0.123 +83 Q 0.128 +84 E 0.134 +85 F 0.132 +86 K 0.124 +87 K 0.117 +88 L 0.115 +89 Y 0.115 +90 F 0.114 +91 Y 0.111 +92 S 0.106 +93 D 0.095 +94 A 0.080 +95 Y 0.067 +96 R 0.059 +97 P 0.055 +98 L 0.055 +99 K 0.056 +100 F 0.058 +101 A 0.059 +102 C 0.057 +103 E 0.056 +104 T 0.058 +105 I 0.059 +106 I 0.056 +107 E 0.052 +108 E 0.049 +109 Y 0.046 +110 E 0.043 +111 D 0.040 +112 E 0.040 +113 I 0.044 +114 S 0.054 +115 S 0.061 +116 L 0.058 +117 I 0.048 +118 A 0.040 +119 Q 0.039 +120 E 0.043 +121 T 0.049 +122 H 0.051 +123 Y 0.048 +124 L 0.042 +125 A 0.036 +126 D 0.033 +127 K 0.035 +128 L 0.042 +129 C 0.055 +130 S 0.071 +131 E 0.087 +132 K 0.098 +133 S 0.109 +134 D 0.131 +135 L 0.172 +136 C 0.241 +137 E 0.334 +138 T 0.427 +139 S 0.497 +140 A 0.540 +141 N 0.568 +142 H 0.583 +143 T 0.574 +144 E 0.534 +145 L 0.493 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000146910.14_ENST00000636446.2_GN:CNPY1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000146910.14_ENST00000636446.2_GN:CNPY1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..dfd06fa4cec364229d39ab8e9f7b415cdcfde941 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000146910.14_ENST00000636446.2_GN:CNPY1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid @@ -0,0 +1,165 @@ +>ENSG00000146910.14|ENST00000636446.2|GN:CNPY1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:19 +1 M 0.427 +2 V 0.435 +3 A 0.446 +4 D 0.450 +5 T 0.439 +6 C 0.418 +7 N 0.397 +8 P 0.374 +9 S 0.343 +10 N 0.301 +11 S 0.248 +12 G 0.186 +13 G 0.124 +14 Q 0.076 +15 A 0.047 +16 C 0.034 +17 R 0.033 +18 A 0.039 +19 L 0.043 +20 M 0.043 +21 D 0.040 +22 E 0.041 +23 I 0.047 +24 E 0.058 +25 H 0.064 +26 D 0.058 +27 I 0.047 +28 T 0.045 +29 K 0.055 +30 A 0.067 +31 R 0.073 +32 Q 0.083 +33 K 0.109 +34 K 0.159 +35 T 0.229 +36 K 0.307 +37 V 0.381 +38 G 0.443 +39 S 0.483 +40 F 0.490 +41 R 0.464 +42 I 0.428 +43 N 0.408 +44 P 0.407 +45 D 0.411 +46 G 0.404 +47 T 0.380 +48 Q 0.349 +49 E 0.328 +50 R 0.320 +51 R 0.324 +52 K 0.327 +53 I 0.304 +54 P 0.243 +55 L 0.168 +56 A 0.111 +57 Q 0.083 +58 S 0.078 +59 E 0.080 +60 A 0.079 +61 F 0.070 +62 L 0.058 +63 T 0.052 +64 D 0.052 +65 L 0.052 +66 L 0.049 +67 E 0.044 +68 K 0.042 +69 V 0.041 +70 C 0.040 +71 E 0.040 +72 R 0.042 +73 M 0.045 +74 N 0.047 +75 D 0.048 +76 Y 0.045 +77 K 0.041 +78 L 0.043 +79 E 0.054 +80 E 0.072 +81 D 0.086 +82 P 0.092 +83 V 0.090 +84 T 0.086 +85 K 0.082 +86 E 0.074 +87 R 0.062 +88 T 0.051 +89 F 0.046 +90 K 0.050 +91 R 0.068 +92 F 0.096 +93 A 0.128 +94 P 0.154 +95 R 0.170 +96 K 0.180 +97 G 0.176 +98 D 0.159 +99 K 0.137 +100 I 0.125 +101 Y 0.125 +102 Q 0.132 +103 E 0.138 +104 F 0.137 +105 K 0.128 +106 K 0.119 +107 L 0.117 +108 Y 0.121 +109 F 0.122 +110 Y 0.118 +111 S 0.107 +112 D 0.091 +113 A 0.075 +114 Y 0.061 +115 R 0.049 +116 P 0.041 +117 L 0.039 +118 K 0.037 +119 F 0.035 +120 A 0.033 +121 C 0.036 +122 E 0.043 +123 T 0.051 +124 I 0.055 +125 I 0.054 +126 E 0.050 +127 E 0.047 +128 Y 0.044 +129 E 0.042 +130 D 0.039 +131 E 0.039 +132 I 0.044 +133 S 0.054 +134 S 0.062 +135 L 0.059 +136 I 0.049 +137 A 0.043 +138 Q 0.044 +139 E 0.050 +140 T 0.056 +141 H 0.056 +142 Y 0.050 +143 L 0.039 +144 A 0.030 +145 D 0.027 +146 K 0.028 +147 L 0.035 +148 C 0.048 +149 S 0.065 +150 E 0.080 +151 K 0.089 +152 S 0.092 +153 D 0.100 +154 L 0.129 +155 C 0.197 +156 E 0.301 +157 T 0.411 +158 S 0.493 +159 A 0.542 +160 N 0.572 +161 H 0.589 +162 T 0.580 +163 E 0.540 +164 L 0.499 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000149243.18_ENST00000539798.3_GN:KLHL35_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000149243.18_ENST00000539798.3_GN:KLHL35_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ea475e3bc4f1ecf525bcdb12e91095c885db4793 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000149243.18_ENST00000539798.3_GN:KLHL35_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,584 @@ +>ENSG00000149243.18|ENST00000539798.3|GN:KLHL35|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.366 +2 R 0.363 +3 Q 0.374 +4 G 0.398 +5 H 0.416 +6 A 0.438 +7 P 0.481 +8 E 0.525 +9 E 0.545 +10 S 0.552 +11 E 0.569 +12 P 0.592 +13 G 0.600 +14 C 0.589 +15 E 0.574 +16 A 0.568 +17 P 0.562 +18 C 0.540 +19 A 0.502 +20 G 0.449 +21 P 0.382 +22 C 0.309 +23 H 0.243 +24 A 0.191 +25 Q 0.150 +26 R 0.120 +27 V 0.098 +28 L 0.082 +29 Q 0.073 +30 A 0.069 +31 L 0.073 +32 N 0.080 +33 A 0.083 +34 Y 0.079 +35 R 0.074 +36 R 0.080 +37 S 0.097 +38 G 0.116 +39 T 0.122 +40 L 0.109 +41 T 0.084 +42 D 0.061 +43 V 0.044 +44 V 0.035 +45 L 0.034 +46 R 0.041 +47 A 0.053 +48 G 0.063 +49 G 0.066 +50 R 0.065 +51 D 0.065 +52 F 0.069 +53 P 0.074 +54 C 0.078 +55 H 0.076 +56 R 0.066 +57 A 0.055 +58 A 0.053 +59 L 0.060 +60 S 0.073 +61 A 0.085 +62 G 0.085 +63 S 0.073 +64 A 0.057 +65 Y 0.047 +66 F 0.050 +67 R 0.065 +68 S 0.081 +69 L 0.094 +70 F 0.115 +71 A 0.151 +72 A 0.198 +73 G 0.245 +74 R 0.288 +75 P 0.316 +76 E 0.323 +77 R 0.306 +78 G 0.275 +79 P 0.243 +80 A 0.217 +81 V 0.201 +82 V 0.191 +83 P 0.184 +84 V 0.188 +85 V 0.209 +86 P 0.240 +87 V 0.269 +88 A 0.300 +89 P 0.331 +90 E 0.355 +91 A 0.371 +92 P 0.378 +93 G 0.364 +94 T 0.326 +95 S 0.274 +96 P 0.235 +97 A 0.218 +98 G 0.204 +99 A 0.172 +100 A 0.126 +101 A 0.086 +102 A 0.062 +103 L 0.052 +104 A 0.049 +105 V 0.049 +106 V 0.050 +107 L 0.050 +108 D 0.049 +109 Y 0.048 +110 V 0.048 +111 Y 0.054 +112 G 0.066 +113 A 0.081 +114 G 0.090 +115 V 0.090 +116 R 0.085 +117 L 0.080 +118 R 0.075 +119 A 0.070 +120 E 0.065 +121 D 0.059 +122 E 0.051 +123 A 0.044 +124 A 0.038 +125 A 0.035 +126 V 0.035 +127 L 0.035 +128 A 0.037 +129 L 0.039 +130 A 0.040 +131 E 0.041 +132 R 0.046 +133 L 0.055 +134 G 0.064 +135 V 0.065 +136 A 0.058 +137 G 0.050 +138 L 0.043 +139 R 0.039 +140 E 0.037 +141 A 0.040 +142 C 0.049 +143 V 0.061 +144 R 0.067 +145 F 0.063 +146 L 0.057 +147 E 0.056 +148 G 0.057 +149 R 0.059 +150 L 0.062 +151 R 0.063 +152 A 0.060 +153 A 0.052 +154 N 0.045 +155 S 0.039 +156 L 0.036 +157 A 0.035 +158 L 0.035 +159 R 0.034 +160 R 0.036 +161 V 0.041 +162 A 0.047 +163 A 0.051 +164 A 0.051 +165 F 0.052 +166 S 0.052 +167 L 0.050 +168 A 0.044 +169 P 0.040 +170 L 0.044 +171 A 0.055 +172 E 0.065 +173 R 0.070 +174 C 0.076 +175 G 0.088 +176 R 0.095 +177 V 0.088 +178 L 0.074 +179 R 0.059 +180 Q 0.047 +181 A 0.037 +182 F 0.030 +183 A 0.029 +184 E 0.031 +185 V 0.030 +186 A 0.026 +187 R 0.023 +188 H 0.024 +189 A 0.027 +190 D 0.030 +191 F 0.031 +192 L 0.031 +193 E 0.031 +194 L 0.033 +195 A 0.034 +196 P 0.032 +197 D 0.028 +198 E 0.025 +199 V 0.025 +200 V 0.030 +201 A 0.038 +202 L 0.051 +203 L 0.068 +204 A 0.087 +205 D 0.098 +206 P 0.096 +207 A 0.081 +208 L 0.062 +209 G 0.046 +210 V 0.035 +211 A 0.030 +212 R 0.033 +213 E 0.040 +214 E 0.047 +215 A 0.051 +216 V 0.052 +217 F 0.051 +218 E 0.049 +219 A 0.047 +220 A 0.045 +221 M 0.045 +222 R 0.050 +223 W 0.054 +224 V 0.056 +225 R 0.055 +226 H 0.052 +227 D 0.049 +228 A 0.047 +229 P 0.047 +230 A 0.047 +231 R 0.047 +232 R 0.049 +233 G 0.051 +234 Q 0.051 +235 L 0.047 +236 R 0.042 +237 R 0.038 +238 L 0.038 +239 L 0.041 +240 E 0.043 +241 H 0.044 +242 V 0.045 +243 R 0.046 +244 L 0.047 +245 P 0.047 +246 L 0.045 +247 L 0.043 +248 A 0.046 +249 P 0.053 +250 A 0.057 +251 Y 0.050 +252 F 0.040 +253 L 0.034 +254 E 0.036 +255 K 0.042 +256 V 0.049 +257 E 0.052 +258 A 0.053 +259 D 0.050 +260 E 0.048 +261 L 0.046 +262 L 0.047 +263 Q 0.050 +264 A 0.055 +265 C 0.060 +266 G 0.061 +267 E 0.058 +268 C 0.052 +269 R 0.047 +270 P 0.048 +271 L 0.055 +272 L 0.066 +273 L 0.073 +274 E 0.069 +275 A 0.057 +276 R 0.046 +277 A 0.040 +278 C 0.042 +279 F 0.055 +280 I 0.082 +281 L 0.126 +282 G 0.178 +283 R 0.226 +284 E 0.257 +285 A 0.268 +286 G 0.263 +287 A 0.248 +288 L 0.231 +289 R 0.218 +290 T 0.212 +291 R 0.207 +292 P 0.197 +293 R 0.188 +294 R 0.186 +295 F 0.193 +296 M 0.196 +297 D 0.185 +298 L 0.155 +299 A 0.113 +300 E 0.072 +301 V 0.042 +302 I 0.025 +303 V 0.023 +304 V 0.032 +305 I 0.050 +306 G 0.074 +307 G 0.099 +308 C 0.124 +309 D 0.144 +310 R 0.154 +311 K 0.151 +312 G 0.145 +313 L 0.148 +314 L 0.159 +315 K 0.168 +316 L 0.163 +317 P 0.141 +318 F 0.106 +319 A 0.073 +320 D 0.051 +321 A 0.043 +322 Y 0.043 +323 H 0.045 +324 P 0.049 +325 E 0.053 +326 S 0.059 +327 Q 0.065 +328 R 0.070 +329 W 0.075 +330 T 0.080 +331 P 0.080 +332 L 0.078 +333 P 0.077 +334 S 0.078 +335 L 0.076 +336 P 0.071 +337 G 0.065 +338 Y 0.065 +339 T 0.075 +340 R 0.093 +341 S 0.108 +342 E 0.114 +343 F 0.111 +344 A 0.101 +345 A 0.086 +346 C 0.073 +347 A 0.066 +348 L 0.061 +349 R 0.054 +350 N 0.044 +351 D 0.034 +352 V 0.026 +353 Y 0.023 +354 V 0.031 +355 S 0.045 +356 G 0.061 +357 G 0.072 +358 H 0.080 +359 I 0.089 +360 N 0.103 +361 S 0.116 +362 H 0.116 +363 D 0.101 +364 V 0.079 +365 W 0.058 +366 M 0.042 +367 F 0.033 +368 S 0.029 +369 S 0.030 +370 H 0.033 +371 L 0.040 +372 H 0.046 +373 T 0.049 +374 W 0.050 +375 I 0.052 +376 K 0.057 +377 V 0.064 +378 A 0.068 +379 S 0.067 +380 L 0.063 +381 H 0.060 +382 K 0.061 +383 G 0.068 +384 R 0.079 +385 W 0.090 +386 R 0.097 +387 H 0.096 +388 K 0.089 +389 M 0.080 +390 A 0.077 +391 V 0.081 +392 V 0.085 +393 Q 0.080 +394 G 0.065 +395 Q 0.046 +396 L 0.030 +397 F 0.023 +398 A 0.028 +399 V 0.038 +400 G 0.052 +401 G 0.066 +402 F 0.076 +403 D 0.080 +404 G 0.083 +405 L 0.092 +406 R 0.107 +407 R 0.117 +408 L 0.118 +409 H 0.111 +410 S 0.100 +411 V 0.086 +412 E 0.070 +413 R 0.057 +414 Y 0.048 +415 D 0.044 +416 P 0.045 +417 F 0.049 +418 S 0.056 +419 N 0.064 +420 T 0.072 +421 W 0.081 +422 A 0.091 +423 A 0.098 +424 A 0.100 +425 A 0.099 +426 P 0.097 +427 L 0.092 +428 P 0.084 +429 E 0.080 +430 A 0.084 +431 V 0.093 +432 S 0.101 +433 S 0.106 +434 A 0.106 +435 A 0.100 +436 V 0.094 +437 A 0.091 +438 S 0.094 +439 C 0.098 +440 A 0.097 +441 G 0.083 +442 K 0.060 +443 L 0.040 +444 F 0.034 +445 V 0.044 +446 I 0.063 +447 G 0.083 +448 G 0.099 +449 A 0.110 +450 R 0.119 +451 Q 0.130 +452 G 0.147 +453 G 0.160 +454 V 0.160 +455 N 0.149 +456 T 0.137 +457 D 0.126 +458 K 0.112 +459 V 0.094 +460 Q 0.077 +461 C 0.066 +462 F 0.061 +463 D 0.062 +464 P 0.065 +465 K 0.069 +466 E 0.074 +467 D 0.079 +468 R 0.082 +469 W 0.083 +470 S 0.087 +471 L 0.095 +472 R 0.101 +473 S 0.105 +474 P 0.107 +475 A 0.104 +476 P 0.097 +477 F 0.094 +478 S 0.101 +479 Q 0.117 +480 R 0.132 +481 C 0.139 +482 L 0.136 +483 E 0.123 +484 A 0.110 +485 V 0.105 +486 S 0.110 +487 L 0.117 +488 E 0.115 +489 D 0.101 +490 T 0.078 +491 I 0.056 +492 Y 0.048 +493 V 0.059 +494 M 0.085 +495 G 0.113 +496 G 0.133 +497 L 0.143 +498 M 0.144 +499 S 0.141 +500 K 0.128 +501 I 0.107 +502 F 0.088 +503 T 0.080 +504 Y 0.084 +505 D 0.094 +506 P 0.103 +507 G 0.108 +508 T 0.110 +509 D 0.110 +510 V 0.110 +511 W 0.111 +512 G 0.115 +513 E 0.116 +514 A 0.114 +515 A 0.110 +516 V 0.105 +517 L 0.102 +518 P 0.102 +519 S 0.112 +520 P 0.133 +521 V 0.158 +522 E 0.174 +523 S 0.176 +524 C 0.163 +525 G 0.138 +526 V 0.109 +527 T 0.091 +528 V 0.091 +529 C 0.101 +530 D 0.108 +531 G 0.101 +532 K 0.079 +533 V 0.057 +534 H 0.048 +535 I 0.058 +536 L 0.081 +537 G 0.111 +538 G 0.142 +539 R 0.165 +540 D 0.173 +541 D 0.169 +542 R 0.164 +543 G 0.165 +544 E 0.164 +545 S 0.155 +546 T 0.145 +547 D 0.135 +548 K 0.120 +549 V 0.097 +550 F 0.077 +551 T 0.068 +552 F 0.069 +553 D 0.073 +554 P 0.079 +555 S 0.088 +556 S 0.099 +557 G 0.108 +558 Q 0.109 +559 V 0.103 +560 E 0.097 +561 V 0.092 +562 Q 0.087 +563 P 0.086 +564 S 0.087 +565 L 0.089 +566 Q 0.093 +567 R 0.104 +568 C 0.123 +569 T 0.147 +570 S 0.165 +571 S 0.162 +572 H 0.137 +573 G 0.101 +574 C 0.074 +575 V 0.065 +576 T 0.074 +577 I 0.087 +578 I 0.096 +579 Q 0.102 +580 S 0.114 +581 L 0.134 +582 G 0.157 +583 R 0.173 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000149243.18_ENST00000539798.3_GN:KLHL35_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000149243.18_ENST00000539798.3_GN:KLHL35_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2fd6ee32213e4102e0132cdc30b204268091c965 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000149243.18_ENST00000539798.3_GN:KLHL35_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid @@ -0,0 +1,587 @@ +>ENSG00000149243.18|ENST00000539798.3|GN:KLHL35|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 +1 M 0.314 +2 A 0.317 +3 R 0.334 +4 M 0.359 +5 R 0.379 +6 Q 0.401 +7 G 0.443 +8 H 0.492 +9 A 0.526 +10 P 0.539 +11 E 0.542 +12 E 0.540 +13 S 0.544 +14 E 0.561 +15 P 0.587 +16 G 0.604 +17 C 0.599 +18 E 0.584 +19 A 0.576 +20 P 0.570 +21 C 0.551 +22 A 0.514 +23 G 0.460 +24 P 0.393 +25 C 0.321 +26 H 0.253 +27 A 0.196 +28 Q 0.153 +29 R 0.121 +30 V 0.099 +31 L 0.083 +32 Q 0.073 +33 A 0.070 +34 L 0.073 +35 N 0.080 +36 A 0.083 +37 Y 0.078 +38 R 0.074 +39 R 0.080 +40 S 0.097 +41 G 0.115 +42 T 0.121 +43 L 0.108 +44 T 0.084 +45 D 0.060 +46 V 0.044 +47 V 0.035 +48 L 0.034 +49 R 0.041 +50 A 0.052 +51 G 0.062 +52 G 0.065 +53 R 0.064 +54 D 0.065 +55 F 0.068 +56 P 0.073 +57 C 0.077 +58 H 0.075 +59 R 0.065 +60 A 0.055 +61 A 0.052 +62 L 0.059 +63 S 0.071 +64 A 0.082 +65 G 0.082 +66 S 0.071 +67 A 0.055 +68 Y 0.046 +69 F 0.050 +70 R 0.064 +71 S 0.080 +72 L 0.093 +73 F 0.113 +74 A 0.148 +75 A 0.194 +76 G 0.242 +77 R 0.285 +78 P 0.315 +79 E 0.322 +80 R 0.305 +81 G 0.275 +82 P 0.243 +83 A 0.217 +84 V 0.201 +85 V 0.191 +86 P 0.183 +87 V 0.187 +88 V 0.208 +89 P 0.238 +90 V 0.267 +91 A 0.298 +92 P 0.328 +93 E 0.352 +94 A 0.369 +95 P 0.375 +96 G 0.363 +97 T 0.325 +98 S 0.273 +99 P 0.234 +100 A 0.217 +101 G 0.203 +102 A 0.171 +103 A 0.126 +104 A 0.086 +105 A 0.062 +106 L 0.052 +107 A 0.049 +108 V 0.049 +109 V 0.050 +110 L 0.050 +111 D 0.049 +112 Y 0.048 +113 V 0.048 +114 Y 0.054 +115 G 0.066 +116 A 0.081 +117 G 0.090 +118 V 0.090 +119 R 0.085 +120 L 0.080 +121 R 0.075 +122 A 0.071 +123 E 0.066 +124 D 0.059 +125 E 0.052 +126 A 0.044 +127 A 0.038 +128 A 0.035 +129 V 0.035 +130 L 0.035 +131 A 0.037 +132 L 0.039 +133 A 0.040 +134 E 0.041 +135 R 0.046 +136 L 0.055 +137 G 0.064 +138 V 0.065 +139 A 0.058 +140 G 0.050 +141 L 0.043 +142 R 0.039 +143 E 0.037 +144 A 0.040 +145 C 0.049 +146 V 0.061 +147 R 0.067 +148 F 0.063 +149 L 0.057 +150 E 0.055 +151 G 0.056 +152 R 0.058 +153 L 0.061 +154 R 0.063 +155 A 0.059 +156 A 0.052 +157 N 0.044 +158 S 0.039 +159 L 0.036 +160 A 0.035 +161 L 0.035 +162 R 0.034 +163 R 0.036 +164 V 0.041 +165 A 0.047 +166 A 0.050 +167 A 0.051 +168 F 0.051 +169 S 0.052 +170 L 0.049 +171 A 0.044 +172 P 0.040 +173 L 0.043 +174 A 0.053 +175 E 0.063 +176 R 0.068 +177 C 0.075 +178 G 0.087 +179 R 0.094 +180 V 0.087 +181 L 0.073 +182 R 0.059 +183 Q 0.047 +184 A 0.036 +185 F 0.030 +186 A 0.029 +187 E 0.031 +188 V 0.030 +189 A 0.026 +190 R 0.023 +191 H 0.023 +192 A 0.026 +193 D 0.029 +194 F 0.030 +195 L 0.030 +196 E 0.031 +197 L 0.033 +198 A 0.033 +199 P 0.032 +200 D 0.028 +201 E 0.025 +202 V 0.025 +203 V 0.030 +204 A 0.038 +205 L 0.051 +206 L 0.068 +207 A 0.086 +208 D 0.098 +209 P 0.095 +210 A 0.081 +211 L 0.062 +212 G 0.046 +213 V 0.034 +214 A 0.029 +215 R 0.032 +216 E 0.040 +217 E 0.047 +218 A 0.051 +219 V 0.052 +220 F 0.051 +221 E 0.049 +222 A 0.047 +223 A 0.045 +224 M 0.045 +225 R 0.049 +226 W 0.054 +227 V 0.056 +228 R 0.054 +229 H 0.052 +230 D 0.049 +231 A 0.047 +232 P 0.047 +233 A 0.047 +234 R 0.047 +235 R 0.049 +236 G 0.051 +237 Q 0.051 +238 L 0.047 +239 R 0.042 +240 R 0.038 +241 L 0.038 +242 L 0.041 +243 E 0.043 +244 H 0.044 +245 V 0.045 +246 R 0.046 +247 L 0.047 +248 P 0.047 +249 L 0.045 +250 L 0.043 +251 A 0.046 +252 P 0.053 +253 A 0.057 +254 Y 0.050 +255 F 0.040 +256 L 0.034 +257 E 0.036 +258 K 0.042 +259 V 0.049 +260 E 0.053 +261 A 0.053 +262 D 0.051 +263 E 0.048 +264 L 0.047 +265 L 0.047 +266 Q 0.050 +267 A 0.055 +268 C 0.060 +269 G 0.061 +270 E 0.058 +271 C 0.052 +272 R 0.047 +273 P 0.048 +274 L 0.055 +275 L 0.067 +276 L 0.073 +277 E 0.069 +278 A 0.057 +279 R 0.046 +280 A 0.040 +281 C 0.042 +282 F 0.055 +283 I 0.082 +284 L 0.126 +285 G 0.179 +286 R 0.227 +287 E 0.257 +288 A 0.268 +289 G 0.264 +290 A 0.249 +291 L 0.231 +292 R 0.219 +293 T 0.213 +294 R 0.207 +295 P 0.197 +296 R 0.188 +297 R 0.186 +298 F 0.192 +299 M 0.195 +300 D 0.184 +301 L 0.155 +302 A 0.113 +303 E 0.072 +304 V 0.042 +305 I 0.025 +306 V 0.023 +307 V 0.032 +308 I 0.050 +309 G 0.074 +310 G 0.099 +311 C 0.124 +312 D 0.144 +313 R 0.153 +314 K 0.150 +315 G 0.145 +316 L 0.147 +317 L 0.159 +318 K 0.168 +319 L 0.164 +320 P 0.141 +321 F 0.106 +322 A 0.073 +323 D 0.051 +324 A 0.043 +325 Y 0.043 +326 H 0.045 +327 P 0.049 +328 E 0.053 +329 S 0.059 +330 Q 0.065 +331 R 0.070 +332 W 0.075 +333 T 0.079 +334 P 0.080 +335 L 0.078 +336 P 0.077 +337 S 0.078 +338 L 0.076 +339 P 0.070 +340 G 0.065 +341 Y 0.065 +342 T 0.075 +343 R 0.093 +344 S 0.109 +345 E 0.115 +346 F 0.112 +347 A 0.102 +348 A 0.087 +349 C 0.073 +350 A 0.066 +351 L 0.061 +352 R 0.054 +353 N 0.044 +354 D 0.034 +355 V 0.025 +356 Y 0.023 +357 V 0.031 +358 S 0.045 +359 G 0.060 +360 G 0.072 +361 H 0.079 +362 I 0.089 +363 N 0.103 +364 S 0.115 +365 H 0.116 +366 D 0.101 +367 V 0.079 +368 W 0.057 +369 M 0.041 +370 F 0.033 +371 S 0.029 +372 S 0.029 +373 H 0.033 +374 L 0.039 +375 H 0.046 +376 T 0.049 +377 W 0.050 +378 I 0.052 +379 K 0.057 +380 V 0.064 +381 A 0.068 +382 S 0.067 +383 L 0.063 +384 H 0.060 +385 K 0.061 +386 G 0.068 +387 R 0.079 +388 W 0.090 +389 R 0.096 +390 H 0.097 +391 K 0.090 +392 M 0.080 +393 A 0.077 +394 V 0.081 +395 V 0.085 +396 Q 0.080 +397 G 0.065 +398 Q 0.046 +399 L 0.030 +400 F 0.024 +401 A 0.028 +402 V 0.039 +403 G 0.052 +404 G 0.066 +405 F 0.076 +406 D 0.080 +407 G 0.083 +408 L 0.092 +409 R 0.106 +410 R 0.117 +411 L 0.118 +412 H 0.111 +413 S 0.100 +414 V 0.086 +415 E 0.070 +416 R 0.057 +417 Y 0.048 +418 D 0.044 +419 P 0.045 +420 F 0.049 +421 S 0.056 +422 N 0.064 +423 T 0.072 +424 W 0.081 +425 A 0.090 +426 A 0.097 +427 A 0.100 +428 A 0.099 +429 P 0.097 +430 L 0.092 +431 P 0.084 +432 E 0.080 +433 A 0.083 +434 V 0.092 +435 S 0.101 +436 S 0.106 +437 A 0.105 +438 A 0.100 +439 V 0.094 +440 A 0.091 +441 S 0.094 +442 C 0.098 +443 A 0.097 +444 G 0.083 +445 K 0.060 +446 L 0.040 +447 F 0.034 +448 V 0.045 +449 I 0.063 +450 G 0.083 +451 G 0.100 +452 A 0.112 +453 R 0.120 +454 Q 0.131 +455 G 0.148 +456 G 0.161 +457 V 0.161 +458 N 0.150 +459 T 0.139 +460 D 0.128 +461 K 0.113 +462 V 0.094 +463 Q 0.078 +464 C 0.067 +465 F 0.062 +466 D 0.062 +467 P 0.064 +468 K 0.068 +469 E 0.073 +470 D 0.080 +471 R 0.083 +472 W 0.084 +473 S 0.088 +474 L 0.095 +475 R 0.101 +476 S 0.105 +477 P 0.107 +478 A 0.104 +479 P 0.098 +480 F 0.095 +481 S 0.102 +482 Q 0.117 +483 R 0.132 +484 C 0.139 +485 L 0.136 +486 E 0.124 +487 A 0.110 +488 V 0.105 +489 S 0.111 +490 L 0.117 +491 E 0.115 +492 D 0.101 +493 T 0.079 +494 I 0.057 +495 Y 0.048 +496 V 0.060 +497 M 0.085 +498 G 0.113 +499 G 0.134 +500 L 0.143 +501 M 0.144 +502 S 0.141 +503 K 0.128 +504 I 0.107 +505 F 0.088 +506 T 0.080 +507 Y 0.084 +508 D 0.094 +509 P 0.103 +510 G 0.108 +511 T 0.110 +512 D 0.110 +513 V 0.110 +514 W 0.111 +515 G 0.114 +516 E 0.116 +517 A 0.114 +518 A 0.109 +519 V 0.105 +520 L 0.101 +521 P 0.101 +522 S 0.112 +523 P 0.133 +524 V 0.157 +525 E 0.174 +526 S 0.176 +527 C 0.163 +528 G 0.138 +529 V 0.109 +530 T 0.091 +531 V 0.091 +532 C 0.100 +533 D 0.107 +534 G 0.101 +535 K 0.079 +536 V 0.057 +537 H 0.048 +538 I 0.059 +539 L 0.082 +540 G 0.112 +541 G 0.142 +542 R 0.165 +543 D 0.172 +544 D 0.168 +545 R 0.164 +546 G 0.165 +547 E 0.163 +548 S 0.155 +549 T 0.145 +550 D 0.135 +551 K 0.120 +552 V 0.097 +553 F 0.077 +554 T 0.068 +555 F 0.069 +556 D 0.073 +557 P 0.078 +558 S 0.087 +559 S 0.099 +560 G 0.108 +561 Q 0.109 +562 V 0.103 +563 E 0.097 +564 V 0.092 +565 Q 0.087 +566 P 0.086 +567 S 0.087 +568 L 0.089 +569 Q 0.093 +570 R 0.103 +571 C 0.122 +572 T 0.146 +573 S 0.164 +574 S 0.162 +575 H 0.136 +576 G 0.101 +577 C 0.073 +578 V 0.065 +579 T 0.073 +580 I 0.086 +581 I 0.094 +582 Q 0.100 +583 S 0.112 +584 L 0.132 +585 G 0.156 +586 R 0.172 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000152133.18_ENST00000674370.2_GN:GPATCH11_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000152133.18_ENST00000674370.2_GN:GPATCH11_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b076397fe55eb947a51390e4f115aa229962ca60 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000152133.18_ENST00000674370.2_GN:GPATCH11_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,264 @@ +>ENSG00000152133.18|ENST00000674370.2|GN:GPATCH11|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.457 +2 K 0.490 +3 L 0.542 +4 N 0.594 +5 M 0.627 +6 A 0.636 +7 E 0.627 +8 E 0.611 +9 E 0.600 +10 D 0.598 +11 Y 0.597 +12 M 0.586 +13 S 0.573 +14 D 0.572 +15 S 0.588 +16 F 0.611 +17 I 0.631 +18 N 0.646 +19 V 0.660 +20 Q 0.664 +21 E 0.653 +22 D 0.636 +23 I 0.632 +24 R 0.638 +25 P 0.645 +26 G 0.645 +27 L 0.634 +28 P 0.598 +29 M 0.520 +30 L 0.409 +31 R 0.306 +32 Q 0.242 +33 I 0.216 +34 R 0.206 +35 E 0.196 +36 A 0.188 +37 R 0.181 +38 R 0.178 +39 K 0.181 +40 E 0.191 +41 E 0.201 +42 K 0.209 +43 Q 0.220 +44 Q 0.239 +45 E 0.268 +46 A 0.309 +47 N 0.364 +48 L 0.426 +49 K 0.477 +50 N 0.500 +51 R 0.497 +52 Q 0.482 +53 K 0.460 +54 S 0.425 +55 L 0.372 +56 K 0.315 +57 E 0.274 +58 E 0.254 +59 E 0.248 +60 Q 0.250 +61 E 0.255 +62 R 0.270 +63 R 0.294 +64 D 0.316 +65 I 0.329 +66 G 0.331 +67 L 0.325 +68 K 0.321 +69 N 0.321 +70 A 0.311 +71 L 0.283 +72 G 0.251 +73 C 0.236 +74 E 0.235 +75 N 0.225 +76 K 0.200 +77 G 0.175 +78 F 0.163 +79 A 0.163 +80 L 0.166 +81 L 0.169 +82 Q 0.176 +83 K 0.192 +84 M 0.210 +85 G 0.219 +86 Y 0.216 +87 K 0.217 +88 S 0.234 +89 G 0.269 +90 Q 0.315 +91 A 0.357 +92 L 0.378 +93 G 0.385 +94 K 0.406 +95 S 0.451 +96 G 0.494 +97 G 0.509 +98 G 0.492 +99 I 0.465 +100 V 0.468 +101 E 0.517 +102 P 0.582 +103 I 0.628 +104 P 0.647 +105 L 0.649 +106 N 0.633 +107 I 0.597 +108 K 0.552 +109 T 0.521 +110 G 0.518 +111 K 0.542 +112 S 0.577 +113 G 0.584 +114 I 0.531 +115 G 0.435 +116 H 0.352 +117 E 0.304 +118 A 0.278 +119 S 0.262 +120 L 0.253 +121 K 0.247 +122 R 0.240 +123 K 0.236 +124 A 0.235 +125 E 0.230 +126 E 0.215 +127 K 0.196 +128 L 0.177 +129 E 0.159 +130 S 0.148 +131 Y 0.144 +132 R 0.148 +133 K 0.160 +134 K 0.179 +135 I 0.200 +136 H 0.215 +137 M 0.224 +138 K 0.230 +139 N 0.231 +140 Q 0.229 +141 A 0.225 +142 E 0.218 +143 E 0.205 +144 K 0.193 +145 A 0.182 +146 A 0.167 +147 E 0.152 +148 Q 0.143 +149 F 0.144 +150 R 0.154 +151 M 0.172 +152 R 0.195 +153 L 0.213 +154 K 0.220 +155 N 0.219 +156 K 0.209 +157 Q 0.189 +158 D 0.168 +159 E 0.156 +160 M 0.144 +161 K 0.123 +162 L 0.099 +163 E 0.083 +164 G 0.076 +165 D 0.071 +166 L 0.067 +167 R 0.063 +168 R 0.057 +169 S 0.053 +170 Q 0.050 +171 R 0.047 +172 A 0.043 +173 C 0.042 +174 Q 0.043 +175 Q 0.045 +176 L 0.049 +177 D 0.054 +178 V 0.060 +179 Q 0.067 +180 K 0.078 +181 N 0.094 +182 I 0.113 +183 Q 0.133 +184 V 0.148 +185 P 0.152 +186 R 0.146 +187 E 0.134 +188 A 0.118 +189 W 0.102 +190 Y 0.103 +191 W 0.135 +192 L 0.199 +193 R 0.288 +194 L 0.379 +195 E 0.449 +196 E 0.483 +197 E 0.493 +198 T 0.503 +199 E 0.528 +200 E 0.554 +201 D 0.568 +202 E 0.575 +203 E 0.585 +204 E 0.601 +205 K 0.617 +206 E 0.628 +207 Q 0.630 +208 D 0.624 +209 E 0.604 +210 D 0.570 +211 E 0.528 +212 Y 0.490 +213 K 0.454 +214 S 0.402 +215 E 0.325 +216 D 0.238 +217 L 0.163 +218 S 0.113 +219 V 0.088 +220 L 0.077 +221 E 0.073 +222 K 0.073 +223 L 0.076 +224 Q 0.078 +225 I 0.080 +226 L 0.083 +227 T 0.083 +228 S 0.075 +229 Y 0.061 +230 L 0.051 +231 R 0.051 +232 E 0.061 +233 E 0.071 +234 H 0.071 +235 L 0.059 +236 Y 0.045 +237 C 0.039 +238 I 0.042 +239 W 0.055 +240 C 0.074 +241 G 0.094 +242 T 0.106 +243 A 0.111 +244 Y 0.108 +245 E 0.099 +246 D 0.088 +247 K 0.079 +248 E 0.073 +249 D 0.072 +250 L 0.076 +251 S 0.083 +252 S 0.090 +253 N 0.100 +254 C 0.115 +255 P 0.132 +256 G 0.148 +257 P 0.164 +258 T 0.182 +259 S 0.206 +260 A 0.228 +261 D 0.238 +262 H 0.235 +263 D 0.229 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000152133.18_ENST00000674370.2_GN:GPATCH11_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000152133.18_ENST00000674370.2_GN:GPATCH11_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b76d7987e346a2ac9dfbf6b140ebaec7a63ddc4c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000152133.18_ENST00000674370.2_GN:GPATCH11_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid @@ -0,0 +1,286 @@ +>ENSG00000152133.18|ENST00000674370.2|GN:GPATCH11|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:22 +1 M 0.405 +2 R 0.425 +3 S 0.467 +4 A 0.517 +5 R 0.555 +6 S 0.571 +7 T 0.572 +8 A 0.553 +9 L 0.511 +10 N 0.466 +11 R 0.436 +12 G 0.412 +13 E 0.378 +14 Q 0.337 +15 R 0.306 +16 A 0.283 +17 V 0.259 +18 R 0.238 +19 Y 0.234 +20 Y 0.253 +21 S 0.294 +22 H 0.351 +23 M 0.422 +24 K 0.504 +25 L 0.581 +26 N 0.634 +27 M 0.657 +28 A 0.657 +29 E 0.642 +30 E 0.622 +31 E 0.611 +32 D 0.613 +33 Y 0.611 +34 M 0.591 +35 S 0.564 +36 D 0.554 +37 S 0.566 +38 F 0.591 +39 I 0.616 +40 N 0.639 +41 V 0.657 +42 Q 0.663 +43 E 0.648 +44 D 0.627 +45 I 0.621 +46 R 0.632 +47 P 0.644 +48 G 0.649 +49 L 0.642 +50 P 0.607 +51 M 0.532 +52 L 0.427 +53 R 0.330 +54 Q 0.270 +55 I 0.242 +56 R 0.226 +57 E 0.213 +58 A 0.205 +59 R 0.201 +60 R 0.200 +61 K 0.202 +62 E 0.209 +63 E 0.216 +64 K 0.219 +65 Q 0.227 +66 Q 0.244 +67 E 0.271 +68 A 0.310 +69 N 0.363 +70 L 0.423 +71 K 0.471 +72 N 0.492 +73 R 0.485 +74 Q 0.466 +75 K 0.443 +76 S 0.407 +77 L 0.352 +78 K 0.293 +79 E 0.252 +80 E 0.233 +81 E 0.229 +82 Q 0.233 +83 E 0.239 +84 R 0.252 +85 R 0.274 +86 D 0.294 +87 I 0.308 +88 G 0.315 +89 L 0.314 +90 K 0.311 +91 N 0.310 +92 A 0.300 +93 L 0.274 +94 G 0.243 +95 C 0.228 +96 E 0.225 +97 N 0.214 +98 K 0.191 +99 G 0.168 +100 F 0.160 +101 A 0.163 +102 L 0.167 +103 L 0.169 +104 Q 0.173 +105 K 0.186 +106 M 0.205 +107 G 0.216 +108 Y 0.216 +109 K 0.217 +110 S 0.234 +111 G 0.270 +112 Q 0.316 +113 A 0.357 +114 L 0.374 +115 G 0.377 +116 K 0.396 +117 S 0.442 +118 G 0.490 +119 G 0.508 +120 G 0.492 +121 I 0.463 +122 V 0.463 +123 E 0.509 +124 P 0.572 +125 I 0.616 +126 P 0.637 +127 L 0.640 +128 N 0.626 +129 I 0.591 +130 K 0.548 +131 T 0.521 +132 G 0.519 +133 K 0.544 +134 S 0.579 +135 G 0.587 +136 I 0.535 +137 G 0.441 +138 H 0.358 +139 E 0.309 +140 A 0.282 +141 S 0.264 +142 L 0.253 +143 K 0.245 +144 R 0.238 +145 K 0.234 +146 A 0.234 +147 E 0.230 +148 E 0.216 +149 K 0.197 +150 L 0.176 +151 E 0.157 +152 S 0.144 +153 Y 0.139 +154 R 0.143 +155 K 0.154 +156 K 0.173 +157 I 0.194 +158 H 0.210 +159 M 0.220 +160 K 0.227 +161 N 0.230 +162 Q 0.230 +163 A 0.227 +164 E 0.220 +165 E 0.208 +166 K 0.196 +167 A 0.184 +168 A 0.169 +169 E 0.154 +170 Q 0.146 +171 F 0.147 +172 R 0.156 +173 M 0.173 +174 R 0.196 +175 L 0.214 +176 K 0.222 +177 N 0.223 +178 K 0.214 +179 Q 0.193 +180 D 0.172 +181 E 0.160 +182 M 0.149 +183 K 0.128 +184 L 0.102 +185 E 0.085 +186 G 0.078 +187 D 0.072 +188 L 0.068 +189 R 0.064 +190 R 0.059 +191 S 0.054 +192 Q 0.051 +193 R 0.049 +194 A 0.045 +195 C 0.043 +196 Q 0.043 +197 Q 0.046 +198 L 0.049 +199 D 0.054 +200 V 0.059 +201 Q 0.065 +202 K 0.075 +203 N 0.088 +204 I 0.105 +205 Q 0.123 +206 V 0.138 +207 P 0.144 +208 R 0.140 +209 E 0.130 +210 A 0.114 +211 W 0.098 +212 Y 0.098 +213 W 0.129 +214 L 0.191 +215 R 0.278 +216 L 0.368 +217 E 0.438 +218 E 0.473 +219 E 0.484 +220 T 0.496 +221 E 0.522 +222 E 0.549 +223 D 0.564 +224 E 0.571 +225 E 0.582 +226 E 0.598 +227 K 0.614 +228 E 0.626 +229 Q 0.630 +230 D 0.624 +231 E 0.605 +232 D 0.572 +233 E 0.531 +234 Y 0.494 +235 K 0.460 +236 S 0.408 +237 E 0.330 +238 D 0.241 +239 L 0.164 +240 S 0.114 +241 V 0.089 +242 L 0.078 +243 E 0.074 +244 K 0.074 +245 L 0.077 +246 Q 0.079 +247 I 0.081 +248 L 0.084 +249 T 0.085 +250 S 0.077 +251 Y 0.063 +252 L 0.052 +253 R 0.052 +254 E 0.062 +255 E 0.072 +256 H 0.072 +257 L 0.060 +258 Y 0.047 +259 C 0.040 +260 I 0.044 +261 W 0.057 +262 C 0.077 +263 G 0.097 +264 T 0.110 +265 A 0.114 +266 Y 0.112 +267 E 0.102 +268 D 0.091 +269 K 0.081 +270 E 0.075 +271 D 0.074 +272 L 0.078 +273 S 0.085 +274 S 0.092 +275 N 0.102 +276 C 0.117 +277 P 0.135 +278 G 0.152 +279 P 0.167 +280 T 0.186 +281 S 0.209 +282 A 0.231 +283 D 0.241 +284 H 0.238 +285 D 0.231 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000153485.7_ENST00000415050.3_GN:LYSET_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000153485.7_ENST00000415050.3_GN:LYSET_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..03d9e24c8e1ace76b009f23100991705c19d0870 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000153485.7_ENST00000415050.3_GN:LYSET_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,164 @@ +>ENSG00000153485.7|ENST00000415050.3|GN:LYSET|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.400 +2 P 0.413 +3 K 0.426 +4 P 0.422 +5 P 0.387 +6 D 0.332 +7 Y 0.284 +8 S 0.258 +9 E 0.254 +10 L 0.263 +11 S 0.275 +12 D 0.282 +13 S 0.283 +14 L 0.282 +15 T 0.289 +16 L 0.312 +17 A 0.347 +18 V 0.379 +19 G 0.392 +20 T 0.384 +21 G 0.362 +22 R 0.339 +23 F 0.313 +24 S 0.275 +25 G 0.223 +26 P 0.171 +27 L 0.132 +28 H 0.111 +29 R 0.100 +30 A 0.093 +31 W 0.091 +32 R 0.092 +33 M 0.093 +34 M 0.086 +35 N 0.068 +36 F 0.050 +37 R 0.037 +38 Q 0.033 +39 R 0.032 +40 M 0.032 +41 G 0.034 +42 W 0.034 +43 I 0.034 +44 G 0.033 +45 V 0.034 +46 G 0.035 +47 L 0.032 +48 Y 0.029 +49 L 0.027 +50 L 0.025 +51 A 0.023 +52 S 0.021 +53 A 0.020 +54 A 0.019 +55 A 0.018 +56 F 0.018 +57 Y 0.019 +58 Y 0.023 +59 V 0.028 +60 F 0.037 +61 E 0.050 +62 I 0.062 +63 S 0.069 +64 E 0.070 +65 T 0.071 +66 Y 0.075 +67 N 0.082 +68 R 0.085 +69 L 0.081 +70 A 0.078 +71 L 0.088 +72 E 0.105 +73 H 0.119 +74 I 0.127 +75 Q 0.144 +76 Q 0.179 +77 H 0.229 +78 P 0.276 +79 E 0.310 +80 E 0.335 +81 P 0.362 +82 L 0.388 +83 E 0.401 +84 G 0.386 +85 T 0.342 +86 T 0.282 +87 W 0.230 +88 T 0.203 +89 H 0.198 +90 S 0.194 +91 L 0.179 +92 K 0.157 +93 A 0.144 +94 Q 0.143 +95 L 0.153 +96 L 0.163 +97 S 0.161 +98 L 0.139 +99 P 0.105 +100 F 0.075 +101 W 0.057 +102 V 0.047 +103 W 0.040 +104 T 0.036 +105 V 0.035 +106 I 0.035 +107 F 0.033 +108 L 0.030 +109 V 0.027 +110 P 0.023 +111 Y 0.020 +112 L 0.018 +113 Q 0.017 +114 M 0.016 +115 F 0.016 +116 L 0.016 +117 F 0.019 +118 L 0.021 +119 Y 0.025 +120 S 0.032 +121 C 0.047 +122 T 0.068 +123 R 0.092 +124 A 0.107 +125 D 0.111 +126 P 0.110 +127 K 0.111 +128 T 0.112 +129 V 0.107 +130 G 0.094 +131 Y 0.083 +132 C 0.080 +133 I 0.080 +134 I 0.072 +135 P 0.058 +136 I 0.045 +137 C 0.037 +138 L 0.031 +139 A 0.029 +140 V 0.032 +141 I 0.042 +142 C 0.057 +143 N 0.075 +144 R 0.090 +145 H 0.092 +146 Q 0.082 +147 A 0.074 +148 F 0.076 +149 V 0.088 +150 K 0.101 +151 A 0.114 +152 S 0.128 +153 N 0.146 +154 Q 0.160 +155 I 0.170 +156 S 0.184 +157 R 0.211 +158 L 0.250 +159 Q 0.293 +160 L 0.330 +161 I 0.353 +162 D 0.358 +163 T 0.355 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000153485.7_ENST00000415050.3_GN:LYSET_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000153485.7_ENST00000415050.3_GN:LYSET_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..530f58d00a0d63b6cdb40c84c4ed072b41e7e2ba --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000153485.7_ENST00000415050.3_GN:LYSET_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid @@ -0,0 +1,170 @@ +>ENSG00000153485.7|ENST00000415050.3|GN:LYSET|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:6 +1 M 0.406 +2 L 0.431 +3 A 0.468 +4 F 0.492 +5 S 0.483 +6 E 0.449 +7 M 0.415 +8 P 0.398 +9 K 0.391 +10 P 0.378 +11 P 0.348 +12 D 0.305 +13 Y 0.265 +14 S 0.245 +15 E 0.250 +16 L 0.271 +17 S 0.293 +18 D 0.304 +19 S 0.308 +20 L 0.315 +21 T 0.329 +22 L 0.357 +23 A 0.392 +24 V 0.417 +25 G 0.420 +26 T 0.404 +27 G 0.379 +28 R 0.356 +29 F 0.332 +30 S 0.292 +31 G 0.238 +32 P 0.185 +33 L 0.146 +34 H 0.125 +35 R 0.114 +36 A 0.105 +37 W 0.101 +38 R 0.101 +39 M 0.101 +40 M 0.092 +41 N 0.074 +42 F 0.054 +43 R 0.041 +44 Q 0.035 +45 R 0.033 +46 M 0.034 +47 G 0.036 +48 W 0.037 +49 I 0.036 +50 G 0.036 +51 V 0.036 +52 G 0.036 +53 L 0.033 +54 Y 0.030 +55 L 0.028 +56 L 0.026 +57 A 0.023 +58 S 0.022 +59 A 0.021 +60 A 0.019 +61 A 0.018 +62 F 0.018 +63 Y 0.019 +64 Y 0.022 +65 V 0.027 +66 F 0.035 +67 E 0.048 +68 I 0.059 +69 S 0.067 +70 E 0.070 +71 T 0.072 +72 Y 0.077 +73 N 0.084 +74 R 0.087 +75 L 0.081 +76 A 0.076 +77 L 0.081 +78 E 0.097 +79 H 0.112 +80 I 0.122 +81 Q 0.140 +82 Q 0.176 +83 H 0.227 +84 P 0.274 +85 E 0.309 +86 E 0.335 +87 P 0.363 +88 L 0.390 +89 E 0.402 +90 G 0.385 +91 T 0.339 +92 T 0.278 +93 W 0.226 +94 T 0.199 +95 H 0.192 +96 S 0.188 +97 L 0.173 +98 K 0.154 +99 A 0.140 +100 Q 0.138 +101 L 0.147 +102 L 0.158 +103 S 0.157 +104 L 0.137 +105 P 0.104 +106 F 0.074 +107 W 0.056 +108 V 0.046 +109 W 0.040 +110 T 0.036 +111 V 0.035 +112 I 0.035 +113 F 0.033 +114 L 0.031 +115 V 0.029 +116 P 0.025 +117 Y 0.021 +118 L 0.019 +119 Q 0.018 +120 M 0.017 +121 F 0.017 +122 L 0.018 +123 F 0.020 +124 L 0.022 +125 Y 0.025 +126 S 0.032 +127 C 0.047 +128 T 0.068 +129 R 0.091 +130 A 0.107 +131 D 0.111 +132 P 0.111 +133 K 0.113 +134 T 0.114 +135 V 0.108 +136 G 0.095 +137 Y 0.084 +138 C 0.082 +139 I 0.084 +140 I 0.078 +141 P 0.065 +142 I 0.051 +143 C 0.041 +144 L 0.034 +145 A 0.031 +146 V 0.034 +147 I 0.042 +148 C 0.056 +149 N 0.072 +150 R 0.086 +151 H 0.089 +152 Q 0.083 +153 A 0.078 +154 F 0.085 +155 V 0.100 +156 K 0.114 +157 A 0.124 +158 S 0.135 +159 N 0.151 +160 Q 0.165 +161 I 0.175 +162 S 0.188 +163 R 0.214 +164 L 0.252 +165 Q 0.292 +166 L 0.328 +167 I 0.352 +168 D 0.358 +169 T 0.356 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000153684.16_ENST00000526619.7_GN:GOLGA8F_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000153684.16_ENST00000526619.7_GN:GOLGA8F_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..637c0649a8f42426f698558cd35ff20c1865c915 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000153684.16_ENST00000526619.7_GN:GOLGA8F_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,637 @@ +>ENSG00000153684.16|ENST00000526619.7|GN:GOLGA8F|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.332 +2 A 0.334 +3 E 0.328 +4 E 0.309 +5 T 0.283 +6 R 0.258 +7 Q 0.245 +8 S 0.243 +9 K 0.245 +10 L 0.245 +11 A 0.247 +12 A 0.250 +13 A 0.245 +14 K 0.229 +15 R 0.216 +16 K 0.211 +17 L 0.210 +18 K 0.210 +19 E 0.214 +20 Y 0.223 +21 W 0.240 +22 Q 0.274 +23 R 0.332 +24 N 0.412 +25 S 0.502 +26 P 0.586 +27 G 0.650 +28 V 0.693 +29 P 0.720 +30 A 0.739 +31 G 0.750 +32 A 0.752 +33 K 0.749 +34 R 0.748 +35 N 0.746 +36 R 0.740 +37 K 0.737 +38 T 0.732 +39 N 0.704 +40 G 0.652 +41 S 0.617 +42 I 0.629 +43 H 0.647 +44 E 0.636 +45 T 0.631 +46 A 0.675 +47 T 0.744 +48 S 0.794 +49 G 0.814 +50 G 0.815 +51 C 0.804 +52 H 0.794 +53 S 0.796 +54 P 0.810 +55 G 0.828 +56 D 0.841 +57 S 0.846 +58 A 0.846 +59 T 0.847 +60 G 0.848 +61 I 0.847 +62 H 0.841 +63 G 0.830 +64 E 0.816 +65 S 0.806 +66 P 0.807 +67 T 0.816 +68 S 0.823 +69 S 0.826 +70 A 0.827 +71 T 0.829 +72 L 0.829 +73 K 0.826 +74 D 0.817 +75 L 0.799 +76 E 0.784 +77 S 0.779 +78 P 0.785 +79 C 0.792 +80 Q 0.796 +81 E 0.795 +82 L 0.788 +83 A 0.775 +84 V 0.755 +85 V 0.736 +86 P 0.718 +87 D 0.694 +88 S 0.657 +89 R 0.620 +90 S 0.603 +91 V 0.591 +92 K 0.551 +93 V 0.493 +94 S 0.446 +95 Q 0.404 +96 L 0.355 +97 K 0.321 +98 N 0.318 +99 T 0.329 +100 I 0.335 +101 K 0.343 +102 S 0.356 +103 L 0.368 +104 K 0.385 +105 Q 0.407 +106 Q 0.419 +107 N 0.420 +108 K 0.420 +109 Q 0.416 +110 V 0.406 +111 E 0.399 +112 H 0.383 +113 Q 0.346 +114 L 0.307 +115 E 0.290 +116 E 0.288 +117 E 0.288 +118 K 0.293 +119 K 0.304 +120 A 0.311 +121 N 0.311 +122 N 0.311 +123 E 0.313 +124 K 0.319 +125 Q 0.337 +126 K 0.363 +127 A 0.373 +128 E 0.359 +129 R 0.331 +130 E 0.300 +131 L 0.270 +132 E 0.246 +133 V 0.227 +134 Q 0.209 +135 I 0.192 +136 Q 0.179 +137 R 0.169 +138 L 0.165 +139 N 0.172 +140 I 0.193 +141 Q 0.221 +142 K 0.253 +143 G 0.284 +144 K 0.305 +145 L 0.313 +146 N 0.315 +147 T 0.311 +148 D 0.286 +149 L 0.240 +150 Y 0.198 +151 H 0.180 +152 T 0.186 +153 K 0.210 +154 R 0.239 +155 S 0.251 +156 L 0.239 +157 R 0.214 +158 Y 0.194 +159 F 0.195 +160 E 0.223 +161 E 0.262 +162 E 0.288 +163 S 0.296 +164 K 0.294 +165 D 0.282 +166 L 0.267 +167 A 0.259 +168 V 0.254 +169 R 0.241 +170 L 0.228 +171 Q 0.222 +172 H 0.223 +173 S 0.232 +174 L 0.258 +175 Q 0.295 +176 R 0.321 +177 K 0.332 +178 G 0.334 +179 E 0.326 +180 L 0.315 +181 E 0.313 +182 R 0.321 +183 A 0.327 +184 L 0.331 +185 S 0.338 +186 A 0.339 +187 V 0.324 +188 T 0.305 +189 A 0.293 +190 T 0.292 +191 Q 0.300 +192 K 0.308 +193 K 0.312 +194 K 0.316 +195 A 0.329 +196 E 0.347 +197 R 0.368 +198 Q 0.397 +199 F 0.429 +200 S 0.440 +201 S 0.426 +202 R 0.400 +203 S 0.372 +204 K 0.346 +205 A 0.330 +206 R 0.331 +207 M 0.341 +208 E 0.343 +209 W 0.326 +210 K 0.295 +211 L 0.268 +212 E 0.254 +213 Q 0.248 +214 S 0.244 +215 M 0.250 +216 R 0.263 +217 E 0.268 +218 Q 0.260 +219 A 0.251 +220 L 0.250 +221 L 0.258 +222 K 0.280 +223 A 0.302 +224 Q 0.306 +225 L 0.297 +226 T 0.293 +227 Q 0.296 +228 L 0.308 +229 K 0.335 +230 E 0.358 +231 S 0.349 +232 L 0.315 +233 K 0.276 +234 E 0.238 +235 V 0.204 +236 Q 0.186 +237 L 0.180 +238 E 0.172 +239 R 0.162 +240 D 0.159 +241 E 0.159 +242 Y 0.157 +243 A 0.158 +244 E 0.163 +245 H 0.166 +246 L 0.168 +247 K 0.178 +248 G 0.195 +249 E 0.203 +250 R 0.198 +251 A 0.188 +252 R 0.180 +253 W 0.177 +254 Q 0.181 +255 Q 0.189 +256 R 0.199 +257 M 0.207 +258 R 0.214 +259 K 0.218 +260 M 0.218 +261 S 0.217 +262 Q 0.212 +263 E 0.201 +264 V 0.190 +265 C 0.191 +266 S 0.203 +267 L 0.215 +268 K 0.227 +269 K 0.239 +270 E 0.250 +271 K 0.262 +272 K 0.276 +273 H 0.288 +274 D 0.294 +275 K 0.297 +276 Y 0.301 +277 R 0.302 +278 V 0.291 +279 E 0.268 +280 K 0.243 +281 L 0.228 +282 E 0.227 +283 R 0.231 +284 S 0.235 +285 L 0.239 +286 S 0.247 +287 K 0.261 +288 L 0.284 +289 K 0.319 +290 H 0.364 +291 Q 0.406 +292 M 0.436 +293 A 0.459 +294 E 0.488 +295 P 0.526 +296 L 0.564 +297 P 0.598 +298 P 0.630 +299 E 0.659 +300 P 0.684 +301 P 0.702 +302 A 0.712 +303 V 0.706 +304 P 0.674 +305 S 0.617 +306 E 0.554 +307 V 0.498 +308 E 0.447 +309 L 0.394 +310 Q 0.355 +311 H 0.338 +312 L 0.336 +313 R 0.339 +314 K 0.341 +315 E 0.336 +316 L 0.320 +317 E 0.304 +318 R 0.307 +319 V 0.343 +320 A 0.400 +321 G 0.432 +322 E 0.410 +323 L 0.358 +324 Q 0.314 +325 A 0.288 +326 Q 0.273 +327 V 0.267 +328 E 0.260 +329 Y 0.254 +330 N 0.262 +331 Q 0.285 +332 R 0.310 +333 I 0.338 +334 S 0.376 +335 L 0.409 +336 L 0.413 +337 N 0.402 +338 E 0.399 +339 G 0.402 +340 Q 0.397 +341 K 0.389 +342 E 0.377 +343 R 0.350 +344 L 0.312 +345 R 0.284 +346 E 0.271 +347 Q 0.264 +348 E 0.260 +349 E 0.260 +350 R 0.267 +351 L 0.287 +352 Q 0.320 +353 E 0.358 +354 Q 0.389 +355 Q 0.409 +356 E 0.419 +357 R 0.424 +358 L 0.437 +359 P 0.470 +360 E 0.514 +361 Q 0.549 +362 E 0.569 +363 E 0.574 +364 R 0.562 +365 L 0.546 +366 Q 0.547 +367 Q 0.567 +368 L 0.578 +369 A 0.563 +370 E 0.535 +371 P 0.523 +372 Q 0.539 +373 N 0.571 +374 S 0.597 +375 F 0.615 +376 K 0.637 +377 E 0.660 +378 L 0.670 +379 N 0.669 +380 N 0.664 +381 E 0.655 +382 N 0.641 +383 K 0.622 +384 S 0.589 +385 V 0.527 +386 L 0.439 +387 Q 0.364 +388 L 0.330 +389 E 0.323 +390 Q 0.314 +391 Q 0.297 +392 V 0.274 +393 K 0.252 +394 E 0.237 +395 L 0.236 +396 Q 0.245 +397 E 0.251 +398 K 0.254 +399 L 0.267 +400 G 0.298 +401 K 0.334 +402 E 0.354 +403 R 0.351 +404 L 0.340 +405 E 0.341 +406 A 0.364 +407 A 0.408 +408 S 0.470 +409 Q 0.525 +410 Q 0.552 +411 K 0.548 +412 Q 0.532 +413 Q 0.516 +414 L 0.507 +415 T 0.510 +416 A 0.529 +417 Q 0.559 +418 L 0.591 +419 S 0.616 +420 L 0.631 +421 M 0.633 +422 A 0.633 +423 L 0.645 +424 P 0.676 +425 G 0.716 +426 E 0.749 +427 G 0.768 +428 D 0.777 +429 G 0.781 +430 G 0.784 +431 G 0.788 +432 H 0.791 +433 L 0.793 +434 D 0.795 +435 S 0.795 +436 E 0.793 +437 G 0.788 +438 E 0.780 +439 E 0.769 +440 A 0.758 +441 P 0.748 +442 R 0.741 +443 P 0.741 +444 I 0.748 +445 P 0.760 +446 S 0.768 +447 I 0.771 +448 P 0.774 +449 Q 0.778 +450 D 0.780 +451 L 0.777 +452 E 0.774 +453 S 0.767 +454 R 0.750 +455 E 0.723 +456 A 0.696 +457 M 0.683 +458 S 0.678 +459 G 0.656 +460 F 0.612 +461 M 0.570 +462 D 0.550 +463 H 0.534 +464 L 0.513 +465 E 0.502 +466 E 0.515 +467 K 0.527 +468 A 0.506 +469 D 0.458 +470 L 0.421 +471 S 0.419 +472 E 0.429 +473 L 0.415 +474 V 0.375 +475 E 0.340 +476 K 0.329 +477 E 0.339 +478 E 0.356 +479 L 0.357 +480 G 0.324 +481 F 0.265 +482 F 0.209 +483 Q 0.174 +484 Y 0.159 +485 Y 0.156 +486 R 0.163 +487 E 0.180 +488 R 0.209 +489 C 0.252 +490 H 0.311 +491 Q 0.384 +492 K 0.459 +493 V 0.520 +494 Y 0.569 +495 H 0.621 +496 P 0.675 +497 I 0.718 +498 T 0.743 +499 K 0.760 +500 P 0.780 +501 G 0.805 +502 G 0.826 +503 S 0.837 +504 A 0.841 +505 K 0.839 +506 D 0.830 +507 A 0.816 +508 A 0.805 +509 P 0.800 +510 G 0.788 +511 G 0.734 +512 G 0.627 +513 H 0.528 +514 H 0.526 +515 Q 0.624 +516 A 0.734 +517 G 0.796 +518 P 0.821 +519 G 0.834 +520 Q 0.843 +521 G 0.849 +522 G 0.851 +523 D 0.849 +524 E 0.844 +525 G 0.826 +526 E 0.779 +527 A 0.714 +528 A 0.682 +529 G 0.720 +530 A 0.790 +531 A 0.838 +532 G 0.858 +533 D 0.864 +534 G 0.865 +535 V 0.864 +536 A 0.862 +537 A 0.858 +538 G 0.851 +539 G 0.840 +540 D 0.828 +541 Y 0.819 +542 K 0.814 +543 G 0.809 +544 H 0.805 +545 S 0.803 +546 K 0.806 +547 F 0.812 +548 L 0.819 +549 V 0.821 +550 T 0.814 +551 A 0.800 +552 Q 0.788 +553 N 0.786 +554 P 0.789 +555 A 0.790 +556 H 0.785 +557 E 0.781 +558 P 0.782 +559 S 0.789 +560 P 0.799 +561 G 0.805 +562 A 0.806 +563 P 0.807 +564 A 0.813 +565 P 0.824 +566 Q 0.838 +567 E 0.850 +568 L 0.856 +569 G 0.856 +570 A 0.849 +571 A 0.838 +572 H 0.828 +573 K 0.824 +574 H 0.827 +575 G 0.832 +576 D 0.833 +577 L 0.831 +578 C 0.828 +579 E 0.827 +580 V 0.827 +581 S 0.827 +582 L 0.826 +583 T 0.824 +584 D 0.817 +585 S 0.804 +586 V 0.794 +587 E 0.796 +588 P 0.810 +589 V 0.825 +590 Q 0.834 +591 G 0.836 +592 E 0.834 +593 A 0.830 +594 R 0.822 +595 E 0.811 +596 G 0.798 +597 S 0.788 +598 P 0.783 +599 H 0.783 +600 D 0.784 +601 N 0.784 +602 P 0.782 +603 T 0.780 +604 A 0.778 +605 Q 0.778 +606 P 0.773 +607 I 0.740 +608 V 0.682 +609 Q 0.646 +610 D 0.664 +611 H 0.706 +612 Q 0.729 +613 E 0.734 +614 H 0.740 +615 P 0.758 +616 G 0.781 +617 L 0.798 +618 G 0.794 +619 S 0.763 +620 N 0.708 +621 C 0.649 +622 C 0.600 +623 V 0.551 +624 P 0.485 +625 F 0.409 +626 F 0.342 +627 C 0.286 +628 W 0.243 +629 A 0.225 +630 W 0.239 +631 L 0.278 +632 P 0.328 +633 R 0.375 +634 R 0.396 +635 R 0.386 +636 R 0.366 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000153684.16_ENST00000526619.7_GN:GOLGA8F_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000153684.16_ENST00000526619.7_GN:GOLGA8F_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d76f2b3238a3ec15973168224efd3821c26b90bd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000153684.16_ENST00000526619.7_GN:GOLGA8F_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid @@ -0,0 +1,649 @@ +>ENSG00000153684.16|ENST00000526619.7|GN:GOLGA8F|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:12 +1 M 0.417 +2 W 0.452 +3 P 0.504 +4 Q 0.545 +5 A 0.562 +6 R 0.561 +7 L 0.563 +8 P 0.579 +9 P 0.603 +10 H 0.624 +11 P 0.634 +12 A 0.622 +13 M 0.584 +14 A 0.531 +15 E 0.478 +16 E 0.428 +17 T 0.380 +18 R 0.343 +19 Q 0.323 +20 S 0.311 +21 K 0.297 +22 L 0.283 +23 A 0.277 +24 A 0.279 +25 A 0.273 +26 K 0.256 +27 R 0.239 +28 K 0.233 +29 L 0.236 +30 K 0.239 +31 E 0.246 +32 Y 0.256 +33 W 0.273 +34 Q 0.306 +35 R 0.362 +36 N 0.436 +37 S 0.518 +38 P 0.597 +39 G 0.661 +40 V 0.704 +41 P 0.732 +42 A 0.753 +43 G 0.766 +44 A 0.769 +45 K 0.766 +46 R 0.755 +47 N 0.727 +48 R 0.684 +49 K 0.662 +50 T 0.674 +51 N 0.681 +52 G 0.652 +53 S 0.626 +54 I 0.644 +55 H 0.670 +56 E 0.668 +57 T 0.667 +58 A 0.707 +59 T 0.767 +60 S 0.811 +61 G 0.829 +62 G 0.829 +63 C 0.819 +64 H 0.808 +65 S 0.808 +66 P 0.820 +67 G 0.836 +68 D 0.847 +69 S 0.852 +70 A 0.851 +71 T 0.851 +72 G 0.853 +73 I 0.852 +74 H 0.846 +75 G 0.836 +76 E 0.822 +77 S 0.813 +78 P 0.814 +79 T 0.822 +80 S 0.828 +81 S 0.830 +82 A 0.830 +83 T 0.830 +84 L 0.830 +85 K 0.827 +86 D 0.818 +87 L 0.800 +88 E 0.785 +89 S 0.780 +90 P 0.784 +91 C 0.789 +92 Q 0.790 +93 E 0.787 +94 L 0.778 +95 A 0.762 +96 V 0.741 +97 V 0.720 +98 P 0.703 +99 D 0.679 +100 S 0.638 +101 R 0.596 +102 S 0.576 +103 V 0.565 +104 K 0.529 +105 V 0.473 +106 S 0.426 +107 Q 0.387 +108 L 0.344 +109 K 0.315 +110 N 0.313 +111 T 0.323 +112 I 0.325 +113 K 0.329 +114 S 0.340 +115 L 0.349 +116 K 0.363 +117 Q 0.382 +118 Q 0.397 +119 N 0.407 +120 K 0.414 +121 Q 0.412 +122 V 0.401 +123 E 0.392 +124 H 0.377 +125 Q 0.343 +126 L 0.308 +127 E 0.294 +128 E 0.294 +129 E 0.294 +130 K 0.300 +131 K 0.313 +132 A 0.321 +133 N 0.322 +134 N 0.324 +135 E 0.325 +136 K 0.328 +137 Q 0.344 +138 K 0.368 +139 A 0.376 +140 E 0.358 +141 R 0.327 +142 E 0.295 +143 L 0.266 +144 E 0.243 +145 V 0.224 +146 Q 0.205 +147 I 0.187 +148 Q 0.172 +149 R 0.163 +150 L 0.160 +151 N 0.168 +152 I 0.188 +153 Q 0.215 +154 K 0.247 +155 G 0.279 +156 K 0.301 +157 L 0.311 +158 N 0.315 +159 T 0.311 +160 D 0.285 +161 L 0.239 +162 Y 0.199 +163 H 0.182 +164 T 0.189 +165 K 0.214 +166 R 0.243 +167 S 0.257 +168 L 0.245 +169 R 0.219 +170 Y 0.200 +171 F 0.202 +172 E 0.232 +173 E 0.273 +174 E 0.299 +175 S 0.306 +176 K 0.304 +177 D 0.292 +178 L 0.276 +179 A 0.268 +180 V 0.261 +181 R 0.248 +182 L 0.236 +183 Q 0.233 +184 H 0.235 +185 S 0.247 +186 L 0.276 +187 Q 0.316 +188 R 0.345 +189 K 0.357 +190 G 0.359 +191 E 0.350 +192 L 0.337 +193 E 0.337 +194 R 0.343 +195 A 0.344 +196 L 0.342 +197 S 0.343 +198 A 0.339 +199 V 0.320 +200 T 0.298 +201 A 0.284 +202 T 0.281 +203 Q 0.288 +204 K 0.296 +205 K 0.299 +206 K 0.303 +207 A 0.316 +208 E 0.332 +209 R 0.350 +210 Q 0.377 +211 F 0.406 +212 S 0.418 +213 S 0.406 +214 R 0.385 +215 S 0.362 +216 K 0.338 +217 A 0.323 +218 R 0.325 +219 M 0.337 +220 E 0.340 +221 W 0.324 +222 K 0.295 +223 L 0.270 +224 E 0.258 +225 Q 0.251 +226 S 0.247 +227 M 0.252 +228 R 0.264 +229 E 0.267 +230 Q 0.258 +231 A 0.249 +232 L 0.247 +233 L 0.256 +234 K 0.278 +235 A 0.300 +236 Q 0.304 +237 L 0.296 +238 T 0.293 +239 Q 0.297 +240 L 0.312 +241 K 0.342 +242 E 0.365 +243 S 0.354 +244 L 0.317 +245 K 0.277 +246 E 0.238 +247 V 0.204 +248 Q 0.185 +249 L 0.179 +250 E 0.171 +251 R 0.160 +252 D 0.157 +253 E 0.156 +254 Y 0.154 +255 A 0.155 +256 E 0.160 +257 H 0.163 +258 L 0.166 +259 K 0.178 +260 G 0.195 +261 E 0.204 +262 R 0.200 +263 A 0.192 +264 R 0.185 +265 W 0.182 +266 Q 0.184 +267 Q 0.192 +268 R 0.202 +269 M 0.212 +270 R 0.219 +271 K 0.223 +272 M 0.224 +273 S 0.222 +274 Q 0.216 +275 E 0.205 +276 V 0.195 +277 C 0.197 +278 S 0.209 +279 L 0.222 +280 K 0.236 +281 K 0.249 +282 E 0.261 +283 K 0.276 +284 K 0.292 +285 H 0.305 +286 D 0.310 +287 K 0.313 +288 Y 0.319 +289 R 0.320 +290 V 0.310 +291 E 0.287 +292 K 0.260 +293 L 0.243 +294 E 0.240 +295 R 0.243 +296 S 0.245 +297 L 0.248 +298 S 0.257 +299 K 0.271 +300 L 0.293 +301 K 0.328 +302 H 0.374 +303 Q 0.418 +304 M 0.448 +305 A 0.470 +306 E 0.498 +307 P 0.534 +308 L 0.570 +309 P 0.603 +310 P 0.635 +311 E 0.665 +312 P 0.690 +313 P 0.709 +314 A 0.719 +315 V 0.713 +316 P 0.683 +317 S 0.629 +318 E 0.567 +319 V 0.511 +320 E 0.457 +321 L 0.402 +322 Q 0.362 +323 H 0.345 +324 L 0.343 +325 R 0.345 +326 K 0.346 +327 E 0.341 +328 L 0.326 +329 E 0.312 +330 R 0.316 +331 V 0.354 +332 A 0.413 +333 G 0.446 +334 E 0.424 +335 L 0.370 +336 Q 0.324 +337 A 0.297 +338 Q 0.282 +339 V 0.275 +340 E 0.268 +341 Y 0.262 +342 N 0.270 +343 Q 0.295 +344 R 0.322 +345 I 0.352 +346 S 0.391 +347 L 0.424 +348 L 0.429 +349 N 0.418 +350 E 0.416 +351 G 0.420 +352 Q 0.415 +353 K 0.406 +354 E 0.391 +355 R 0.361 +356 L 0.321 +357 R 0.291 +358 E 0.276 +359 Q 0.269 +360 E 0.265 +361 E 0.265 +362 R 0.272 +363 L 0.292 +364 Q 0.326 +365 E 0.364 +366 Q 0.395 +367 Q 0.414 +368 E 0.422 +369 R 0.424 +370 L 0.436 +371 P 0.469 +372 E 0.513 +373 Q 0.548 +374 E 0.569 +375 E 0.574 +376 R 0.560 +377 L 0.543 +378 Q 0.543 +379 Q 0.561 +380 L 0.572 +381 A 0.556 +382 E 0.527 +383 P 0.513 +384 Q 0.529 +385 N 0.561 +386 S 0.587 +387 F 0.606 +388 K 0.630 +389 E 0.655 +390 L 0.667 +391 N 0.667 +392 N 0.663 +393 E 0.654 +394 N 0.641 +395 K 0.623 +396 S 0.591 +397 V 0.528 +398 L 0.440 +399 Q 0.366 +400 L 0.333 +401 E 0.327 +402 Q 0.320 +403 Q 0.304 +404 V 0.282 +405 K 0.259 +406 E 0.243 +407 L 0.241 +408 Q 0.250 +409 E 0.257 +410 K 0.260 +411 L 0.272 +412 G 0.303 +413 K 0.340 +414 E 0.360 +415 R 0.356 +416 L 0.345 +417 E 0.345 +418 A 0.366 +419 A 0.410 +420 S 0.471 +421 Q 0.527 +422 Q 0.554 +423 K 0.553 +424 Q 0.538 +425 Q 0.521 +426 L 0.511 +427 T 0.514 +428 A 0.533 +429 Q 0.563 +430 L 0.595 +431 S 0.620 +432 L 0.635 +433 M 0.637 +434 A 0.635 +435 L 0.647 +436 P 0.676 +437 G 0.716 +438 E 0.749 +439 G 0.768 +440 D 0.777 +441 G 0.781 +442 G 0.785 +443 G 0.788 +444 H 0.792 +445 L 0.794 +446 D 0.796 +447 S 0.796 +448 E 0.795 +449 G 0.790 +450 E 0.782 +451 E 0.772 +452 A 0.761 +453 P 0.752 +454 R 0.746 +455 P 0.745 +456 I 0.753 +457 P 0.765 +458 S 0.772 +459 I 0.775 +460 P 0.778 +461 Q 0.782 +462 D 0.784 +463 L 0.782 +464 E 0.778 +465 S 0.772 +466 R 0.756 +467 E 0.731 +468 A 0.705 +469 M 0.693 +470 S 0.687 +471 G 0.666 +472 F 0.623 +473 M 0.582 +474 D 0.563 +475 H 0.548 +476 L 0.526 +477 E 0.515 +478 E 0.527 +479 K 0.538 +480 A 0.516 +481 D 0.467 +482 L 0.431 +483 S 0.430 +484 E 0.440 +485 L 0.427 +486 V 0.387 +487 E 0.352 +488 K 0.341 +489 E 0.351 +490 E 0.367 +491 L 0.367 +492 G 0.333 +493 F 0.273 +494 F 0.216 +495 Q 0.181 +496 Y 0.165 +497 Y 0.163 +498 R 0.170 +499 E 0.188 +500 R 0.218 +501 C 0.262 +502 H 0.322 +503 Q 0.396 +504 K 0.469 +505 V 0.527 +506 Y 0.575 +507 H 0.625 +508 P 0.678 +509 I 0.720 +510 T 0.745 +511 K 0.762 +512 P 0.782 +513 G 0.807 +514 G 0.828 +515 S 0.840 +516 A 0.843 +517 K 0.840 +518 D 0.832 +519 A 0.818 +520 A 0.807 +521 P 0.802 +522 G 0.789 +523 G 0.735 +524 G 0.628 +525 H 0.529 +526 H 0.527 +527 Q 0.624 +528 A 0.734 +529 G 0.796 +530 P 0.821 +531 G 0.834 +532 Q 0.843 +533 G 0.849 +534 G 0.851 +535 D 0.850 +536 E 0.844 +537 G 0.826 +538 E 0.779 +539 A 0.713 +540 A 0.681 +541 G 0.719 +542 A 0.789 +543 A 0.838 +544 G 0.857 +545 D 0.863 +546 G 0.864 +547 V 0.863 +548 A 0.861 +549 A 0.857 +550 G 0.851 +551 G 0.840 +552 D 0.827 +553 Y 0.818 +554 K 0.813 +555 G 0.809 +556 H 0.804 +557 S 0.803 +558 K 0.805 +559 F 0.811 +560 L 0.818 +561 V 0.820 +562 T 0.814 +563 A 0.800 +564 Q 0.788 +565 N 0.786 +566 P 0.789 +567 A 0.789 +568 H 0.784 +569 E 0.780 +570 P 0.781 +571 S 0.788 +572 P 0.797 +573 G 0.804 +574 A 0.805 +575 P 0.805 +576 A 0.811 +577 P 0.822 +578 Q 0.836 +579 E 0.848 +580 L 0.855 +581 G 0.855 +582 A 0.848 +583 A 0.837 +584 H 0.827 +585 K 0.823 +586 H 0.826 +587 G 0.831 +588 D 0.832 +589 L 0.830 +590 C 0.827 +591 E 0.826 +592 V 0.826 +593 S 0.827 +594 L 0.826 +595 T 0.824 +596 D 0.817 +597 S 0.804 +598 V 0.794 +599 E 0.796 +600 P 0.810 +601 V 0.825 +602 Q 0.834 +603 G 0.836 +604 E 0.834 +605 A 0.830 +606 R 0.822 +607 E 0.811 +608 G 0.799 +609 S 0.788 +610 P 0.784 +611 H 0.784 +612 D 0.785 +613 N 0.785 +614 P 0.783 +615 T 0.781 +616 A 0.779 +617 Q 0.779 +618 P 0.773 +619 I 0.740 +620 V 0.681 +621 Q 0.645 +622 D 0.663 +623 H 0.705 +624 Q 0.729 +625 E 0.734 +626 H 0.740 +627 P 0.758 +628 G 0.781 +629 L 0.797 +630 G 0.793 +631 S 0.760 +632 N 0.703 +633 C 0.641 +634 C 0.592 +635 V 0.542 +636 P 0.476 +637 F 0.401 +638 F 0.335 +639 C 0.281 +640 W 0.239 +641 A 0.221 +642 W 0.236 +643 L 0.276 +644 P 0.328 +645 R 0.375 +646 R 0.397 +647 R 0.387 +648 R 0.368 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000156206.14_ENST00000286732.5_GN:CFAP161_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000156206.14_ENST00000286732.5_GN:CFAP161_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c708c76df55d914cc6db3926bf1ca59d7b6bded7 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000156206.14_ENST00000286732.5_GN:CFAP161_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,302 @@ +>ENSG00000156206.14|ENST00000286732.5|GN:CFAP161|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.391 +2 A 0.404 +3 Q 0.426 +4 N 0.446 +5 V 0.460 +6 Y 0.483 +7 G 0.531 +8 P 0.591 +9 G 0.621 +10 V 0.603 +11 R 0.563 +12 I 0.543 +13 G 0.548 +14 N 0.538 +15 W 0.492 +16 N 0.432 +17 E 0.384 +18 D 0.351 +19 V 0.325 +20 Y 0.305 +21 L 0.292 +22 E 0.274 +23 E 0.247 +24 E 0.218 +25 L 0.195 +26 M 0.177 +27 K 0.162 +28 D 0.147 +29 F 0.138 +30 L 0.134 +31 E 0.139 +32 K 0.152 +33 R 0.175 +34 D 0.203 +35 K 0.228 +36 G 0.238 +37 K 0.230 +38 L 0.215 +39 L 0.200 +40 I 0.184 +41 Q 0.169 +42 R 0.161 +43 S 0.163 +44 R 0.170 +45 R 0.178 +46 L 0.182 +47 K 0.178 +48 Q 0.164 +49 N 0.147 +50 L 0.132 +51 L 0.119 +52 R 0.110 +53 P 0.106 +54 M 0.109 +55 Q 0.116 +56 L 0.124 +57 S 0.130 +58 V 0.133 +59 T 0.131 +60 E 0.125 +61 D 0.114 +62 G 0.103 +63 Y 0.089 +64 I 0.072 +65 H 0.058 +66 Y 0.052 +67 G 0.057 +68 D 0.066 +69 K 0.069 +70 V 0.068 +71 M 0.073 +72 L 0.094 +73 V 0.129 +74 N 0.163 +75 P 0.178 +76 D 0.181 +77 D 0.192 +78 P 0.212 +79 D 0.222 +80 T 0.210 +81 E 0.185 +82 A 0.159 +83 D 0.137 +84 V 0.126 +85 F 0.124 +86 L 0.127 +87 R 0.128 +88 G 0.126 +89 D 0.126 +90 L 0.124 +91 S 0.117 +92 L 0.110 +93 C 0.110 +94 M 0.117 +95 T 0.128 +96 P 0.139 +97 D 0.145 +98 E 0.145 +99 I 0.146 +100 Q 0.157 +101 S 0.177 +102 H 0.201 +103 L 0.222 +104 K 0.237 +105 D 0.242 +106 E 0.235 +107 L 0.218 +108 E 0.200 +109 V 0.186 +110 P 0.179 +111 C 0.171 +112 G 0.155 +113 L 0.134 +114 S 0.110 +115 A 0.091 +116 V 0.078 +117 Q 0.071 +118 A 0.071 +119 K 0.083 +120 T 0.104 +121 P 0.121 +122 I 0.124 +123 G 0.112 +124 R 0.095 +125 N 0.078 +126 T 0.062 +127 F 0.052 +128 I 0.053 +129 I 0.061 +130 L 0.074 +131 S 0.086 +132 V 0.094 +133 H 0.100 +134 R 0.110 +135 D 0.121 +136 A 0.124 +137 T 0.114 +138 G 0.099 +139 Q 0.087 +140 V 0.077 +141 L 0.065 +142 R 0.054 +143 Y 0.048 +144 G 0.050 +145 Q 0.054 +146 D 0.056 +147 F 0.058 +148 C 0.065 +149 L 0.081 +150 G 0.104 +151 I 0.123 +152 T 0.133 +153 G 0.142 +154 G 0.153 +155 F 0.158 +156 D 0.153 +157 N 0.143 +158 K 0.127 +159 M 0.107 +160 L 0.088 +161 Y 0.075 +162 L 0.071 +163 S 0.081 +164 S 0.103 +165 D 0.129 +166 H 0.148 +167 R 0.157 +168 T 0.163 +169 L 0.169 +170 L 0.175 +171 K 0.179 +172 S 0.178 +173 S 0.173 +174 K 0.160 +175 R 0.144 +176 S 0.131 +177 W 0.125 +178 L 0.124 +179 Q 0.123 +180 E 0.121 +181 V 0.112 +182 Y 0.096 +183 L 0.083 +184 T 0.081 +185 D 0.088 +186 E 0.097 +187 V 0.102 +188 S 0.101 +189 H 0.094 +190 V 0.083 +191 N 0.069 +192 C 0.056 +193 W 0.047 +194 Q 0.046 +195 A 0.052 +196 A 0.064 +197 F 0.079 +198 P 0.092 +199 D 0.098 +200 P 0.097 +201 Q 0.087 +202 L 0.076 +203 R 0.072 +204 L 0.076 +205 E 0.078 +206 Y 0.076 +207 E 0.074 +208 G 0.077 +209 F 0.085 +210 P 0.090 +211 V 0.088 +212 P 0.080 +213 A 0.075 +214 N 0.076 +215 A 0.081 +216 K 0.087 +217 I 0.095 +218 L 0.107 +219 I 0.123 +220 N 0.139 +221 H 0.142 +222 C 0.126 +223 H 0.104 +224 T 0.092 +225 N 0.091 +226 R 0.094 +227 G 0.093 +228 L 0.089 +229 A 0.086 +230 A 0.087 +231 H 0.091 +232 R 0.094 +233 H 0.094 +234 L 0.091 +235 F 0.089 +236 L 0.094 +237 S 0.102 +238 T 0.105 +239 Y 0.101 +240 F 0.100 +241 G 0.105 +242 K 0.112 +243 E 0.111 +244 A 0.104 +245 E 0.099 +246 V 0.096 +247 V 0.090 +248 A 0.085 +249 H 0.089 +250 T 0.104 +251 Y 0.128 +252 L 0.151 +253 D 0.161 +254 S 0.151 +255 H 0.133 +256 R 0.122 +257 V 0.122 +258 E 0.125 +259 K 0.120 +260 P 0.106 +261 R 0.088 +262 N 0.071 +263 H 0.056 +264 W 0.046 +265 M 0.042 +266 L 0.048 +267 V 0.069 +268 T 0.103 +269 G 0.145 +270 N 0.186 +271 P 0.217 +272 R 0.245 +273 D 0.283 +274 A 0.334 +275 S 0.381 +276 S 0.410 +277 S 0.419 +278 M 0.416 +279 L 0.408 +280 D 0.403 +281 L 0.406 +282 P 0.418 +283 K 0.433 +284 P 0.438 +285 P 0.418 +286 T 0.376 +287 E 0.339 +288 D 0.320 +289 T 0.303 +290 R 0.283 +291 A 0.281 +292 M 0.300 +293 E 0.319 +294 Q 0.342 +295 A 0.391 +296 M 0.465 +297 G 0.535 +298 L 0.575 +299 D 0.573 +300 T 0.532 +301 Q 0.488 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000156206.14_ENST00000286732.5_GN:CFAP161_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000156206.14_ENST00000286732.5_GN:CFAP161_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..bf164e11dfc75f984a3509e5f22133d5453e5d49 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000156206.14_ENST00000286732.5_GN:CFAP161_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid @@ -0,0 +1,316 @@ +>ENSG00000156206.14|ENST00000286732.5|GN:CFAP161|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:14 +1 M 0.430 +2 V 0.453 +3 S 0.492 +4 E 0.540 +5 G 0.585 +6 G 0.617 +7 P 0.627 +8 L 0.604 +9 A 0.555 +10 E 0.522 +11 Q 0.547 +12 Q 0.608 +13 G 0.655 +14 A 0.669 +15 M 0.665 +16 A 0.657 +17 Q 0.644 +18 N 0.616 +19 V 0.579 +20 Y 0.560 +21 G 0.585 +22 P 0.638 +23 G 0.669 +24 V 0.655 +25 R 0.619 +26 I 0.599 +27 G 0.601 +28 N 0.589 +29 W 0.538 +30 N 0.471 +31 E 0.416 +32 D 0.380 +33 V 0.351 +34 Y 0.326 +35 L 0.306 +36 E 0.285 +37 E 0.258 +38 E 0.228 +39 L 0.202 +40 M 0.180 +41 K 0.161 +42 D 0.146 +43 F 0.137 +44 L 0.136 +45 E 0.141 +46 K 0.155 +47 R 0.178 +48 D 0.208 +49 K 0.235 +50 G 0.246 +51 K 0.239 +52 L 0.224 +53 L 0.209 +54 I 0.191 +55 Q 0.173 +56 R 0.164 +57 S 0.165 +58 R 0.173 +59 R 0.182 +60 L 0.188 +61 K 0.181 +62 Q 0.165 +63 N 0.146 +64 L 0.129 +65 L 0.115 +66 R 0.105 +67 P 0.102 +68 M 0.105 +69 Q 0.112 +70 L 0.119 +71 S 0.124 +72 V 0.126 +73 T 0.125 +74 E 0.119 +75 D 0.110 +76 G 0.100 +77 Y 0.086 +78 I 0.070 +79 H 0.056 +80 Y 0.051 +81 G 0.056 +82 D 0.063 +83 K 0.066 +84 V 0.065 +85 M 0.071 +86 L 0.092 +87 V 0.128 +88 N 0.163 +89 P 0.177 +90 D 0.178 +91 D 0.188 +92 P 0.209 +93 D 0.220 +94 T 0.209 +95 E 0.185 +96 A 0.158 +97 D 0.136 +98 V 0.123 +99 F 0.119 +100 L 0.120 +101 R 0.120 +102 G 0.120 +103 D 0.123 +104 L 0.122 +105 S 0.116 +106 L 0.111 +107 C 0.113 +108 M 0.120 +109 T 0.130 +110 P 0.140 +111 D 0.145 +112 E 0.143 +113 I 0.143 +114 Q 0.153 +115 S 0.172 +116 H 0.195 +117 L 0.216 +118 K 0.231 +119 D 0.237 +120 E 0.233 +121 L 0.219 +122 E 0.202 +123 V 0.189 +124 P 0.182 +125 C 0.174 +126 G 0.159 +127 L 0.138 +128 S 0.114 +129 A 0.095 +130 V 0.083 +131 Q 0.075 +132 A 0.075 +133 K 0.087 +134 T 0.108 +135 P 0.127 +136 I 0.129 +137 G 0.117 +138 R 0.099 +139 N 0.080 +140 T 0.063 +141 F 0.053 +142 I 0.053 +143 I 0.061 +144 L 0.073 +145 S 0.085 +146 V 0.094 +147 H 0.101 +148 R 0.112 +149 D 0.125 +150 A 0.129 +151 T 0.118 +152 G 0.102 +153 Q 0.089 +154 V 0.079 +155 L 0.067 +156 R 0.055 +157 Y 0.049 +158 G 0.051 +159 Q 0.055 +160 D 0.056 +161 F 0.058 +162 C 0.066 +163 L 0.082 +164 G 0.105 +165 I 0.124 +166 T 0.135 +167 G 0.146 +168 G 0.157 +169 F 0.160 +170 D 0.155 +171 N 0.143 +172 K 0.127 +173 M 0.106 +174 L 0.088 +175 Y 0.075 +176 L 0.071 +177 S 0.081 +178 S 0.105 +179 D 0.131 +180 H 0.150 +181 R 0.160 +182 T 0.165 +183 L 0.172 +184 L 0.179 +185 K 0.183 +186 S 0.182 +187 S 0.175 +188 K 0.162 +189 R 0.144 +190 S 0.131 +191 W 0.125 +192 L 0.124 +193 Q 0.124 +194 E 0.121 +195 V 0.112 +196 Y 0.095 +197 L 0.082 +198 T 0.079 +199 D 0.086 +200 E 0.095 +201 V 0.099 +202 S 0.098 +203 H 0.091 +204 V 0.081 +205 N 0.067 +206 C 0.055 +207 W 0.046 +208 Q 0.045 +209 A 0.051 +210 A 0.063 +211 F 0.078 +212 P 0.091 +213 D 0.097 +214 P 0.096 +215 Q 0.085 +216 L 0.074 +217 R 0.070 +218 L 0.073 +219 E 0.075 +220 Y 0.074 +221 E 0.072 +222 G 0.075 +223 F 0.083 +224 P 0.089 +225 V 0.087 +226 P 0.080 +227 A 0.076 +228 N 0.077 +229 A 0.082 +230 K 0.087 +231 I 0.095 +232 L 0.106 +233 I 0.123 +234 N 0.139 +235 H 0.141 +236 C 0.125 +237 H 0.104 +238 T 0.092 +239 N 0.092 +240 R 0.095 +241 G 0.094 +242 L 0.090 +243 A 0.087 +244 A 0.088 +245 H 0.091 +246 R 0.094 +247 H 0.094 +248 L 0.090 +249 F 0.089 +250 L 0.094 +251 S 0.102 +252 T 0.105 +253 Y 0.101 +254 F 0.099 +255 G 0.104 +256 K 0.111 +257 E 0.110 +258 A 0.103 +259 E 0.099 +260 V 0.096 +261 V 0.090 +262 A 0.086 +263 H 0.090 +264 T 0.106 +265 Y 0.130 +266 L 0.153 +267 D 0.162 +268 S 0.152 +269 H 0.134 +270 R 0.124 +271 V 0.124 +272 E 0.127 +273 K 0.121 +274 P 0.107 +275 R 0.090 +276 N 0.072 +277 H 0.058 +278 W 0.047 +279 M 0.043 +280 L 0.050 +281 V 0.069 +282 T 0.103 +283 G 0.144 +284 N 0.182 +285 P 0.210 +286 R 0.235 +287 D 0.269 +288 A 0.316 +289 S 0.362 +290 S 0.391 +291 S 0.401 +292 M 0.399 +293 L 0.394 +294 D 0.393 +295 L 0.400 +296 P 0.415 +297 K 0.433 +298 P 0.441 +299 P 0.425 +300 T 0.387 +301 E 0.351 +302 D 0.331 +303 T 0.311 +304 R 0.289 +305 A 0.286 +306 M 0.306 +307 E 0.326 +308 Q 0.348 +309 A 0.398 +310 M 0.471 +311 G 0.540 +312 L 0.579 +313 D 0.576 +314 T 0.533 +315 Q 0.489 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000160991.18_ENST00000495936.7_GN:ORAI2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000160991.18_ENST00000495936.7_GN:ORAI2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5ef93785186d9acedd4c7da0ac1fa61cac9f1787 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000160991.18_ENST00000495936.7_GN:ORAI2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,255 @@ +>ENSG00000160991.18|ENST00000495936.7|GN:ORAI2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.436 +2 S 0.456 +3 A 0.484 +4 E 0.508 +5 L 0.524 +6 N 0.538 +7 V 0.553 +8 P 0.561 +9 I 0.554 +10 D 0.536 +11 P 0.518 +12 S 0.511 +13 A 0.518 +14 P 0.538 +15 A 0.559 +16 C 0.570 +17 P 0.578 +18 E 0.598 +19 P 0.624 +20 G 0.643 +21 H 0.651 +22 K 0.640 +23 G 0.596 +24 M 0.514 +25 D 0.415 +26 Y 0.322 +27 R 0.253 +28 D 0.217 +29 W 0.209 +30 V 0.210 +31 R 0.213 +32 R 0.223 +33 S 0.236 +34 Y 0.240 +35 L 0.238 +36 E 0.250 +37 L 0.284 +38 V 0.333 +39 T 0.385 +40 S 0.425 +41 N 0.429 +42 H 0.396 +43 H 0.356 +44 S 0.332 +45 V 0.316 +46 Q 0.300 +47 A 0.280 +48 L 0.256 +49 S 0.231 +50 W 0.212 +51 R 0.198 +52 K 0.177 +53 L 0.147 +54 Y 0.118 +55 L 0.101 +56 S 0.094 +57 R 0.089 +58 A 0.084 +59 K 0.083 +60 L 0.085 +61 K 0.089 +62 A 0.096 +63 S 0.102 +64 S 0.099 +65 R 0.087 +66 T 0.075 +67 S 0.070 +68 A 0.071 +69 L 0.076 +70 L 0.081 +71 S 0.084 +72 G 0.087 +73 F 0.094 +74 A 0.107 +75 M 0.126 +76 V 0.155 +77 A 0.188 +78 M 0.215 +79 V 0.227 +80 E 0.228 +81 V 0.222 +82 Q 0.213 +83 L 0.209 +84 E 0.212 +85 T 0.215 +86 Q 0.210 +87 Y 0.193 +88 Q 0.166 +89 Y 0.138 +90 P 0.109 +91 R 0.081 +92 P 0.060 +93 L 0.048 +94 L 0.044 +95 I 0.047 +96 A 0.051 +97 F 0.057 +98 S 0.059 +99 A 0.058 +100 C 0.058 +101 T 0.062 +102 T 0.064 +103 V 0.060 +104 L 0.051 +105 V 0.045 +106 A 0.041 +107 V 0.040 +108 H 0.041 +109 L 0.043 +110 F 0.045 +111 A 0.048 +112 L 0.049 +113 L 0.046 +114 I 0.043 +115 S 0.044 +116 T 0.051 +117 C 0.066 +118 I 0.087 +119 L 0.101 +120 P 0.101 +121 N 0.092 +122 V 0.088 +123 E 0.098 +124 A 0.124 +125 V 0.170 +126 S 0.231 +127 N 0.289 +128 I 0.332 +129 H 0.366 +130 N 0.391 +131 L 0.400 +132 N 0.396 +133 S 0.401 +134 I 0.417 +135 S 0.423 +136 E 0.411 +137 S 0.389 +138 P 0.365 +139 H 0.331 +140 E 0.285 +141 R 0.241 +142 M 0.209 +143 H 0.180 +144 P 0.144 +145 Y 0.113 +146 I 0.096 +147 E 0.089 +148 L 0.083 +149 A 0.073 +150 W 0.061 +151 G 0.051 +152 F 0.047 +153 S 0.046 +154 T 0.048 +155 V 0.050 +156 L 0.053 +157 G 0.056 +158 I 0.056 +159 L 0.053 +160 L 0.049 +161 F 0.049 +162 L 0.049 +163 A 0.050 +164 E 0.053 +165 V 0.055 +166 V 0.054 +167 L 0.050 +168 L 0.046 +169 C 0.044 +170 W 0.047 +171 I 0.059 +172 K 0.082 +173 F 0.122 +174 L 0.189 +175 P 0.278 +176 V 0.368 +177 D 0.432 +178 A 0.460 +179 R 0.464 +180 R 0.461 +181 Q 0.460 +182 P 0.460 +183 G 0.461 +184 P 0.471 +185 P 0.495 +186 P 0.529 +187 G 0.559 +188 P 0.571 +189 G 0.556 +190 S 0.503 +191 H 0.417 +192 T 0.318 +193 G 0.232 +194 W 0.171 +195 Q 0.133 +196 A 0.110 +197 A 0.097 +198 L 0.090 +199 V 0.086 +200 S 0.085 +201 T 0.083 +202 I 0.078 +203 I 0.073 +204 M 0.073 +205 V 0.073 +206 P 0.071 +207 V 0.067 +208 G 0.063 +209 L 0.058 +210 I 0.052 +211 F 0.048 +212 V 0.044 +213 V 0.043 +214 F 0.043 +215 T 0.045 +216 I 0.047 +217 H 0.051 +218 F 0.055 +219 Y 0.058 +220 R 0.063 +221 S 0.070 +222 L 0.079 +223 V 0.090 +224 R 0.107 +225 H 0.124 +226 K 0.130 +227 T 0.130 +228 E 0.135 +229 R 0.146 +230 H 0.156 +231 N 0.163 +232 R 0.168 +233 E 0.172 +234 I 0.171 +235 E 0.166 +236 E 0.159 +237 L 0.152 +238 H 0.147 +239 K 0.146 +240 L 0.145 +241 K 0.140 +242 V 0.137 +243 Q 0.148 +244 L 0.174 +245 D 0.210 +246 G 0.245 +247 H 0.268 +248 E 0.275 +249 R 0.280 +250 S 0.302 +251 L 0.336 +252 Q 0.358 +253 V 0.356 +254 L 0.343 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000160991.18_ENST00000495936.7_GN:ORAI2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000160991.18_ENST00000495936.7_GN:ORAI2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..835181d9a96b4fa21040493b73c335c6bb7e8521 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000160991.18_ENST00000495936.7_GN:ORAI2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid @@ -0,0 +1,262 @@ +>ENSG00000160991.18|ENST00000495936.7|GN:ORAI2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:7 +1 M 0.438 +2 T 0.477 +3 C 0.531 +4 L 0.577 +5 A 0.611 +6 P 0.635 +7 T 0.652 +8 M 0.657 +9 S 0.647 +10 A 0.628 +11 E 0.608 +12 L 0.596 +13 N 0.596 +14 V 0.601 +15 P 0.599 +16 I 0.586 +17 D 0.565 +18 P 0.548 +19 S 0.544 +20 A 0.558 +21 P 0.585 +22 A 0.612 +23 C 0.625 +24 P 0.628 +25 E 0.636 +26 P 0.651 +27 G 0.663 +28 H 0.667 +29 K 0.653 +30 G 0.605 +31 M 0.523 +32 D 0.427 +33 Y 0.334 +34 R 0.262 +35 D 0.222 +36 W 0.212 +37 V 0.214 +38 R 0.219 +39 R 0.234 +40 S 0.251 +41 Y 0.255 +42 L 0.251 +43 E 0.264 +44 L 0.304 +45 V 0.358 +46 T 0.417 +47 S 0.461 +48 N 0.468 +49 H 0.435 +50 H 0.392 +51 S 0.363 +52 V 0.340 +53 Q 0.316 +54 A 0.290 +55 L 0.263 +56 S 0.235 +57 W 0.215 +58 R 0.200 +59 K 0.179 +60 L 0.149 +61 Y 0.119 +62 L 0.102 +63 S 0.095 +64 R 0.090 +65 A 0.084 +66 K 0.083 +67 L 0.084 +68 K 0.087 +69 A 0.094 +70 S 0.100 +71 S 0.096 +72 R 0.084 +73 T 0.073 +74 S 0.068 +75 A 0.070 +76 L 0.075 +77 L 0.080 +78 S 0.083 +79 G 0.087 +80 F 0.094 +81 A 0.107 +82 M 0.127 +83 V 0.155 +84 A 0.189 +85 M 0.216 +86 V 0.229 +87 E 0.229 +88 V 0.222 +89 Q 0.213 +90 L 0.209 +91 E 0.211 +92 T 0.214 +93 Q 0.209 +94 Y 0.192 +95 Q 0.166 +96 Y 0.138 +97 P 0.109 +98 R 0.081 +99 P 0.060 +100 L 0.048 +101 L 0.044 +102 I 0.047 +103 A 0.052 +104 F 0.057 +105 S 0.060 +106 A 0.058 +107 C 0.057 +108 T 0.060 +109 T 0.062 +110 V 0.058 +111 L 0.050 +112 V 0.045 +113 A 0.041 +114 V 0.041 +115 H 0.042 +116 L 0.043 +117 F 0.045 +118 A 0.048 +119 L 0.048 +120 L 0.045 +121 I 0.043 +122 S 0.044 +123 T 0.051 +124 C 0.067 +125 I 0.088 +126 L 0.103 +127 P 0.103 +128 N 0.094 +129 V 0.091 +130 E 0.101 +131 A 0.128 +132 V 0.175 +133 S 0.236 +134 N 0.294 +135 I 0.337 +136 H 0.371 +137 N 0.396 +138 L 0.405 +139 N 0.402 +140 S 0.407 +141 I 0.422 +142 S 0.429 +143 E 0.416 +144 S 0.393 +145 P 0.367 +146 H 0.332 +147 E 0.285 +148 R 0.241 +149 M 0.209 +150 H 0.179 +151 P 0.143 +152 Y 0.112 +153 I 0.095 +154 E 0.088 +155 L 0.081 +156 A 0.071 +157 W 0.060 +158 G 0.051 +159 F 0.046 +160 S 0.046 +161 T 0.048 +162 V 0.050 +163 L 0.053 +164 G 0.056 +165 I 0.056 +166 L 0.053 +167 L 0.049 +168 F 0.048 +169 L 0.049 +170 A 0.050 +171 E 0.053 +172 V 0.055 +173 V 0.054 +174 L 0.050 +175 L 0.046 +176 C 0.044 +177 W 0.047 +178 I 0.059 +179 K 0.082 +180 F 0.122 +181 L 0.189 +182 P 0.278 +183 V 0.368 +184 D 0.431 +185 A 0.459 +186 R 0.462 +187 R 0.460 +188 Q 0.460 +189 P 0.460 +190 G 0.462 +191 P 0.472 +192 P 0.496 +193 P 0.531 +194 G 0.561 +195 P 0.574 +196 G 0.558 +197 S 0.505 +198 H 0.417 +199 T 0.318 +200 G 0.232 +201 W 0.171 +202 Q 0.133 +203 A 0.111 +204 A 0.097 +205 L 0.089 +206 V 0.086 +207 S 0.085 +208 T 0.083 +209 I 0.078 +210 I 0.073 +211 M 0.072 +212 V 0.073 +213 P 0.071 +214 V 0.067 +215 G 0.063 +216 L 0.057 +217 I 0.051 +218 F 0.047 +219 V 0.044 +220 V 0.042 +221 F 0.042 +222 T 0.044 +223 I 0.047 +224 H 0.051 +225 F 0.055 +226 Y 0.058 +227 R 0.063 +228 S 0.070 +229 L 0.078 +230 V 0.090 +231 R 0.106 +232 H 0.122 +233 K 0.129 +234 T 0.129 +235 E 0.133 +236 R 0.144 +237 H 0.154 +238 N 0.161 +239 R 0.166 +240 E 0.170 +241 I 0.169 +242 E 0.164 +243 E 0.158 +244 L 0.150 +245 H 0.145 +246 K 0.144 +247 L 0.144 +248 K 0.139 +249 V 0.137 +250 Q 0.147 +251 L 0.173 +252 D 0.209 +253 G 0.245 +254 H 0.269 +255 E 0.276 +256 R 0.282 +257 S 0.304 +258 L 0.338 +259 Q 0.359 +260 V 0.357 +261 L 0.344 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000161921.18_ENST00000293778.12_GN:CXCL16_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000161921.18_ENST00000293778.12_GN:CXCL16_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1ba2fef685e28654745648b8b49b3db7d9b59530 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000161921.18_ENST00000293778.12_GN:CXCL16_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,255 @@ +>ENSG00000161921.18|ENST00000293778.12|GN:CXCL16|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.470 +2 G 0.490 +3 R 0.508 +4 D 0.503 +5 L 0.473 +6 R 0.434 +7 P 0.393 +8 G 0.338 +9 S 0.262 +10 R 0.182 +11 V 0.123 +12 L 0.096 +13 L 0.093 +14 L 0.094 +15 L 0.089 +16 L 0.079 +17 L 0.072 +18 L 0.072 +19 L 0.078 +20 L 0.092 +21 V 0.115 +22 Y 0.154 +23 L 0.215 +24 T 0.298 +25 Q 0.396 +26 P 0.504 +27 G 0.604 +28 N 0.677 +29 G 0.716 +30 N 0.731 +31 E 0.729 +32 G 0.711 +33 S 0.671 +34 V 0.604 +35 T 0.506 +36 G 0.383 +37 S 0.258 +38 C 0.161 +39 Y 0.108 +40 C 0.096 +41 G 0.108 +42 K 0.127 +43 R 0.145 +44 I 0.154 +45 S 0.153 +46 S 0.147 +47 D 0.141 +48 S 0.138 +49 P 0.130 +50 P 0.114 +51 S 0.093 +52 V 0.072 +53 Q 0.057 +54 F 0.049 +55 M 0.045 +56 N 0.042 +57 R 0.037 +58 L 0.036 +59 R 0.042 +60 K 0.054 +61 H 0.067 +62 L 0.076 +63 R 0.081 +64 A 0.082 +65 Y 0.080 +66 H 0.074 +67 R 0.067 +68 C 0.061 +69 L 0.055 +70 Y 0.047 +71 Y 0.036 +72 T 0.027 +73 R 0.024 +74 F 0.029 +75 Q 0.037 +76 L 0.045 +77 L 0.050 +78 S 0.054 +79 W 0.055 +80 S 0.052 +81 V 0.048 +82 C 0.053 +83 G 0.071 +84 G 0.090 +85 N 0.094 +86 K 0.080 +87 D 0.060 +88 P 0.044 +89 W 0.033 +90 V 0.026 +91 Q 0.022 +92 E 0.023 +93 L 0.025 +94 M 0.027 +95 S 0.028 +96 C 0.026 +97 L 0.026 +98 D 0.030 +99 L 0.040 +100 K 0.053 +101 E 0.074 +102 C 0.109 +103 G 0.157 +104 H 0.210 +105 A 0.257 +106 Y 0.294 +107 S 0.324 +108 G 0.353 +109 I 0.383 +110 V 0.418 +111 A 0.454 +112 H 0.482 +113 Q 0.503 +114 K 0.527 +115 H 0.555 +116 L 0.586 +117 L 0.618 +118 P 0.649 +119 T 0.672 +120 S 0.686 +121 P 0.704 +122 P 0.723 +123 I 0.717 +124 S 0.680 +125 Q 0.661 +126 A 0.701 +127 S 0.770 +128 E 0.820 +129 G 0.840 +130 A 0.844 +131 S 0.838 +132 S 0.826 +133 D 0.808 +134 I 0.785 +135 H 0.760 +136 T 0.728 +137 P 0.679 +138 A 0.619 +139 Q 0.593 +140 M 0.617 +141 L 0.640 +142 L 0.625 +143 S 0.616 +144 T 0.653 +145 L 0.713 +146 Q 0.757 +147 S 0.780 +148 T 0.786 +149 Q 0.786 +150 R 0.789 +151 P 0.800 +152 T 0.815 +153 L 0.829 +154 P 0.845 +155 V 0.861 +156 G 0.872 +157 S 0.876 +158 L 0.874 +159 S 0.870 +160 S 0.865 +161 D 0.859 +162 K 0.851 +163 E 0.839 +164 L 0.822 +165 T 0.806 +166 R 0.800 +167 P 0.806 +168 N 0.820 +169 E 0.829 +170 T 0.817 +171 T 0.770 +172 I 0.703 +173 H 0.670 +174 T 0.706 +175 A 0.770 +176 G 0.810 +177 H 0.822 +178 S 0.827 +179 L 0.830 +180 A 0.824 +181 A 0.813 +182 G 0.804 +183 P 0.807 +184 E 0.819 +185 A 0.830 +186 G 0.835 +187 E 0.833 +188 N 0.825 +189 Q 0.813 +190 K 0.803 +191 Q 0.805 +192 P 0.817 +193 E 0.831 +194 K 0.838 +195 N 0.835 +196 A 0.827 +197 G 0.822 +198 P 0.823 +199 T 0.824 +200 A 0.815 +201 R 0.792 +202 T 0.754 +203 S 0.698 +204 A 0.626 +205 T 0.546 +206 V 0.474 +207 P 0.412 +208 V 0.361 +209 L 0.331 +210 C 0.327 +211 L 0.329 +212 L 0.312 +213 A 0.278 +214 I 0.248 +215 I 0.223 +216 F 0.200 +217 I 0.182 +218 L 0.174 +219 T 0.168 +220 A 0.157 +221 A 0.144 +222 L 0.132 +223 S 0.119 +224 Y 0.105 +225 V 0.102 +226 L 0.119 +227 C 0.150 +228 K 0.185 +229 R 0.228 +230 R 0.288 +231 R 0.368 +232 G 0.456 +233 Q 0.533 +234 S 0.596 +235 P 0.647 +236 Q 0.683 +237 S 0.701 +238 S 0.702 +239 P 0.696 +240 D 0.691 +241 L 0.692 +242 P 0.697 +243 V 0.696 +244 H 0.688 +245 Y 0.683 +246 I 0.692 +247 P 0.711 +248 V 0.729 +249 A 0.737 +250 P 0.737 +251 D 0.726 +252 S 0.688 +253 N 0.618 +254 T 0.556 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000161921.18_ENST00000293778.12_GN:CXCL16_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000161921.18_ENST00000293778.12_GN:CXCL16_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4a9d8c9c4f787edc0ff717c4050f5e0cab48cb82 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000161921.18_ENST00000293778.12_GN:CXCL16_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid @@ -0,0 +1,274 @@ +>ENSG00000161921.18|ENST00000293778.12|GN:CXCL16|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:19 +1 M 0.485 +2 S 0.523 +3 G 0.560 +4 S 0.553 +5 Q 0.492 +6 S 0.431 +7 E 0.441 +8 V 0.521 +9 A 0.603 +10 P 0.651 +11 S 0.676 +12 P 0.691 +13 Q 0.698 +14 S 0.703 +15 P 0.710 +16 R 0.718 +17 S 0.727 +18 P 0.738 +19 E 0.749 +20 M 0.753 +21 G 0.741 +22 R 0.709 +23 D 0.660 +24 L 0.602 +25 R 0.548 +26 P 0.497 +27 G 0.430 +28 S 0.336 +29 R 0.235 +30 V 0.159 +31 L 0.121 +32 L 0.112 +33 L 0.111 +34 L 0.105 +35 L 0.094 +36 L 0.085 +37 L 0.083 +38 L 0.088 +39 L 0.101 +40 V 0.123 +41 Y 0.159 +42 L 0.215 +43 T 0.293 +44 Q 0.391 +45 P 0.501 +46 G 0.606 +47 N 0.683 +48 G 0.724 +49 N 0.740 +50 E 0.739 +51 G 0.722 +52 S 0.684 +53 V 0.617 +54 T 0.516 +55 G 0.389 +56 S 0.260 +57 C 0.162 +58 Y 0.109 +59 C 0.097 +60 G 0.109 +61 K 0.129 +62 R 0.146 +63 I 0.156 +64 S 0.155 +65 S 0.148 +66 D 0.142 +67 S 0.138 +68 P 0.130 +69 P 0.114 +70 S 0.093 +71 V 0.072 +72 Q 0.056 +73 F 0.046 +74 M 0.042 +75 N 0.039 +76 R 0.035 +77 L 0.034 +78 R 0.040 +79 K 0.051 +80 H 0.063 +81 L 0.072 +82 R 0.077 +83 A 0.077 +84 Y 0.075 +85 H 0.069 +86 R 0.063 +87 C 0.057 +88 L 0.052 +89 Y 0.045 +90 Y 0.035 +91 T 0.027 +92 R 0.023 +93 F 0.027 +94 Q 0.035 +95 L 0.043 +96 L 0.049 +97 S 0.054 +98 W 0.056 +99 S 0.053 +100 V 0.049 +101 C 0.053 +102 G 0.069 +103 G 0.087 +104 N 0.090 +105 K 0.077 +106 D 0.059 +107 P 0.043 +108 W 0.032 +109 V 0.025 +110 Q 0.022 +111 E 0.023 +112 L 0.025 +113 M 0.028 +114 S 0.028 +115 C 0.026 +116 L 0.026 +117 D 0.030 +118 L 0.040 +119 K 0.054 +120 E 0.075 +121 C 0.110 +122 G 0.157 +123 H 0.207 +124 A 0.251 +125 Y 0.286 +126 S 0.315 +127 G 0.343 +128 I 0.370 +129 V 0.402 +130 A 0.437 +131 H 0.466 +132 Q 0.489 +133 K 0.515 +134 H 0.547 +135 L 0.581 +136 L 0.617 +137 P 0.652 +138 T 0.676 +139 S 0.693 +140 P 0.716 +141 P 0.751 +142 I 0.785 +143 S 0.805 +144 Q 0.815 +145 A 0.826 +146 S 0.838 +147 E 0.847 +148 G 0.852 +149 A 0.851 +150 S 0.845 +151 S 0.833 +152 D 0.815 +153 I 0.791 +154 H 0.765 +155 T 0.733 +156 P 0.683 +157 A 0.623 +158 Q 0.600 +159 M 0.637 +160 L 0.693 +161 L 0.725 +162 S 0.740 +163 T 0.753 +164 L 0.764 +165 Q 0.775 +166 S 0.786 +167 T 0.791 +168 Q 0.791 +169 R 0.795 +170 P 0.807 +171 T 0.822 +172 L 0.836 +173 P 0.850 +174 V 0.865 +175 G 0.876 +176 S 0.879 +177 L 0.876 +178 S 0.872 +179 S 0.867 +180 D 0.861 +181 K 0.853 +182 E 0.842 +183 L 0.826 +184 T 0.811 +185 R 0.805 +186 P 0.811 +187 N 0.824 +188 E 0.833 +189 T 0.822 +190 T 0.776 +191 I 0.708 +192 H 0.674 +193 T 0.711 +194 A 0.776 +195 G 0.818 +196 H 0.832 +197 S 0.836 +198 L 0.835 +199 A 0.828 +200 A 0.817 +201 G 0.808 +202 P 0.811 +203 E 0.823 +204 A 0.834 +205 G 0.837 +206 E 0.835 +207 N 0.827 +208 Q 0.816 +209 K 0.807 +210 Q 0.808 +211 P 0.819 +212 E 0.831 +213 K 0.837 +214 N 0.833 +215 A 0.824 +216 G 0.819 +217 P 0.821 +218 T 0.821 +219 A 0.812 +220 R 0.787 +221 T 0.748 +222 S 0.693 +223 A 0.620 +224 T 0.541 +225 V 0.470 +226 P 0.411 +227 V 0.362 +228 L 0.332 +229 C 0.327 +230 L 0.329 +231 L 0.311 +232 A 0.275 +233 I 0.241 +234 I 0.214 +235 F 0.191 +236 I 0.175 +237 L 0.167 +238 T 0.163 +239 A 0.153 +240 A 0.140 +241 L 0.129 +242 S 0.116 +243 Y 0.103 +244 V 0.102 +245 L 0.120 +246 C 0.152 +247 K 0.189 +248 R 0.233 +249 R 0.294 +250 R 0.374 +251 G 0.462 +252 Q 0.539 +253 S 0.602 +254 P 0.653 +255 Q 0.689 +256 S 0.707 +257 S 0.709 +258 P 0.702 +259 D 0.697 +260 L 0.699 +261 P 0.704 +262 V 0.704 +263 H 0.699 +264 Y 0.694 +265 I 0.701 +266 P 0.719 +267 V 0.735 +268 A 0.743 +269 P 0.742 +270 D 0.730 +271 S 0.692 +272 N 0.623 +273 T 0.562 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000162040.7_ENST00000454677.3_GN:HS3ST6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000162040.7_ENST00000454677.3_GN:HS3ST6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..50829210dc94ffccfd9fd7c85a44dc2974f2981b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000162040.7_ENST00000454677.3_GN:HS3ST6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,343 @@ +>ENSG00000162040.7|ENST00000454677.3|GN:HS3ST6|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.401 +2 A 0.422 +3 G 0.450 +4 S 0.457 +5 G 0.427 +6 G 0.389 +7 L 0.395 +8 G 0.432 +9 G 0.435 +10 G 0.410 +11 A 0.427 +12 G 0.497 +13 G 0.552 +14 G 0.557 +15 Q 0.557 +16 G 0.598 +17 A 0.660 +18 G 0.705 +19 A 0.728 +20 G 0.741 +21 Q 0.748 +22 G 0.751 +23 A 0.752 +24 A 0.751 +25 L 0.745 +26 R 0.731 +27 A 0.710 +28 S 0.689 +29 R 0.674 +30 A 0.663 +31 P 0.638 +32 M 0.586 +33 L 0.522 +34 L 0.487 +35 V 0.496 +36 A 0.520 +37 L 0.533 +38 V 0.545 +39 L 0.564 +40 G 0.562 +41 A 0.514 +42 Y 0.441 +43 C 0.384 +44 L 0.359 +45 C 0.358 +46 A 0.376 +47 L 0.417 +48 P 0.482 +49 G 0.548 +50 R 0.582 +51 C 0.586 +52 P 0.594 +53 P 0.618 +54 A 0.641 +55 A 0.642 +56 R 0.626 +57 A 0.612 +58 P 0.608 +59 A 0.612 +60 P 0.619 +61 A 0.629 +62 P 0.641 +63 A 0.649 +64 P 0.656 +65 S 0.672 +66 E 0.697 +67 P 0.723 +68 S 0.744 +69 S 0.759 +70 S 0.761 +71 V 0.749 +72 H 0.736 +73 R 0.735 +74 P 0.743 +75 G 0.749 +76 A 0.753 +77 P 0.756 +78 G 0.759 +79 L 0.757 +80 P 0.749 +81 L 0.726 +82 A 0.678 +83 S 0.613 +84 G 0.559 +85 P 0.528 +86 G 0.498 +87 R 0.441 +88 R 0.352 +89 R 0.257 +90 F 0.182 +91 P 0.130 +92 Q 0.094 +93 A 0.069 +94 L 0.057 +95 I 0.056 +96 V 0.063 +97 G 0.071 +98 V 0.075 +99 K 0.074 +100 K 0.074 +101 G 0.079 +102 G 0.086 +103 T 0.087 +104 R 0.082 +105 A 0.081 +106 L 0.083 +107 L 0.085 +108 E 0.083 +109 F 0.080 +110 L 0.074 +111 R 0.067 +112 L 0.062 +113 H 0.060 +114 P 0.058 +115 D 0.059 +116 V 0.065 +117 R 0.077 +118 A 0.092 +119 L 0.104 +120 G 0.110 +121 S 0.110 +122 E 0.105 +123 P 0.097 +124 H 0.082 +125 F 0.067 +126 F 0.055 +127 D 0.049 +128 R 0.049 +129 C 0.054 +130 Y 0.061 +131 E 0.064 +132 R 0.063 +133 G 0.060 +134 L 0.058 +135 A 0.059 +136 W 0.056 +137 Y 0.050 +138 R 0.048 +139 S 0.055 +140 L 0.072 +141 M 0.091 +142 P 0.105 +143 R 0.113 +144 T 0.119 +145 L 0.129 +146 D 0.144 +147 G 0.158 +148 Q 0.160 +149 I 0.145 +150 T 0.122 +151 M 0.105 +152 E 0.102 +153 K 0.115 +154 T 0.133 +155 P 0.146 +156 S 0.147 +157 Y 0.135 +158 F 0.115 +159 V 0.100 +160 T 0.092 +161 R 0.085 +162 E 0.075 +163 A 0.064 +164 P 0.056 +165 R 0.055 +166 R 0.055 +167 I 0.054 +168 H 0.052 +169 A 0.055 +170 M 0.060 +171 S 0.067 +172 P 0.076 +173 D 0.082 +174 T 0.081 +175 K 0.075 +176 L 0.071 +177 I 0.070 +178 V 0.077 +179 V 0.093 +180 V 0.112 +181 R 0.116 +182 N 0.101 +183 P 0.077 +184 V 0.057 +185 T 0.045 +186 R 0.039 +187 A 0.035 +188 I 0.032 +189 S 0.034 +190 D 0.040 +191 Y 0.047 +192 A 0.050 +193 Q 0.051 +194 T 0.055 +195 L 0.064 +196 S 0.079 +197 K 0.102 +198 T 0.128 +199 P 0.149 +200 G 0.155 +201 L 0.148 +202 P 0.131 +203 S 0.107 +204 F 0.085 +205 R 0.074 +206 A 0.076 +207 L 0.088 +208 A 0.102 +209 F 0.120 +210 R 0.142 +211 H 0.164 +212 G 0.176 +213 L 0.177 +214 G 0.175 +215 P 0.169 +216 V 0.154 +217 D 0.128 +218 T 0.104 +219 A 0.090 +220 W 0.085 +221 S 0.086 +222 A 0.094 +223 V 0.106 +224 R 0.115 +225 I 0.118 +226 G 0.114 +227 L 0.101 +228 Y 0.083 +229 A 0.067 +230 Q 0.057 +231 H 0.052 +232 L 0.051 +233 D 0.049 +234 H 0.046 +235 W 0.040 +236 L 0.037 +237 R 0.039 +238 Y 0.044 +239 F 0.046 +240 P 0.045 +241 L 0.042 +242 S 0.038 +243 H 0.035 +244 F 0.038 +245 L 0.048 +246 F 0.065 +247 V 0.083 +248 S 0.089 +249 G 0.080 +250 E 0.065 +251 R 0.054 +252 L 0.048 +253 V 0.046 +254 S 0.047 +255 D 0.049 +256 P 0.052 +257 A 0.053 +258 G 0.052 +259 E 0.049 +260 V 0.046 +261 G 0.046 +262 R 0.047 +263 V 0.052 +264 Q 0.060 +265 D 0.064 +266 F 0.059 +267 L 0.055 +268 G 0.059 +269 L 0.070 +270 K 0.080 +271 R 0.084 +272 V 0.086 +273 V 0.086 +274 T 0.083 +275 D 0.074 +276 K 0.062 +277 H 0.055 +278 F 0.057 +279 Y 0.065 +280 F 0.071 +281 N 0.073 +282 A 0.075 +283 T 0.080 +284 K 0.087 +285 G 0.097 +286 F 0.111 +287 P 0.124 +288 C 0.133 +289 L 0.146 +290 K 0.177 +291 K 0.226 +292 A 0.278 +293 Q 0.315 +294 G 0.329 +295 G 0.325 +296 S 0.313 +297 R 0.300 +298 P 0.295 +299 R 0.307 +300 C 0.334 +301 L 0.359 +302 G 0.369 +303 K 0.364 +304 S 0.352 +305 K 0.338 +306 G 0.321 +307 R 0.301 +308 P 0.275 +309 H 0.248 +310 P 0.226 +311 R 0.209 +312 V 0.189 +313 P 0.163 +314 Q 0.138 +315 A 0.120 +316 L 0.113 +317 V 0.113 +318 R 0.118 +319 R 0.126 +320 L 0.134 +321 Q 0.137 +322 E 0.134 +323 F 0.127 +324 Y 0.118 +325 R 0.102 +326 P 0.086 +327 F 0.079 +328 N 0.080 +329 R 0.081 +330 R 0.083 +331 F 0.088 +332 Y 0.096 +333 Q 0.099 +334 M 0.098 +335 T 0.094 +336 G 0.092 +337 Q 0.096 +338 D 0.100 +339 F 0.101 +340 G 0.104 +341 W 0.118 +342 G 0.136 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000162040.7_ENST00000454677.3_GN:HS3ST6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000162040.7_ENST00000454677.3_GN:HS3ST6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..381d57f6062ea3c1f4b24c78cf8dec6d3dc29e4f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000162040.7_ENST00000454677.3_GN:HS3ST6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid @@ -0,0 +1,360 @@ +>ENSG00000162040.7|ENST00000454677.3|GN:HS3ST6|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:17 +1 M 0.391 +2 R 0.402 +3 A 0.417 +4 R 0.426 +5 L 0.428 +6 L 0.431 +7 P 0.447 +8 P 0.479 +9 L 0.519 +10 P 0.548 +11 G 0.547 +12 L 0.509 +13 E 0.450 +14 R 0.413 +15 R 0.425 +16 D 0.460 +17 P 0.479 +18 M 0.498 +19 A 0.542 +20 G 0.577 +21 S 0.573 +22 G 0.564 +23 G 0.584 +24 L 0.601 +25 G 0.585 +26 G 0.566 +27 G 0.567 +28 A 0.571 +29 G 0.584 +30 G 0.619 +31 G 0.643 +32 Q 0.625 +33 G 0.609 +34 A 0.645 +35 G 0.706 +36 A 0.746 +37 G 0.749 +38 Q 0.712 +39 G 0.652 +40 A 0.619 +41 A 0.646 +42 L 0.697 +43 R 0.724 +44 A 0.718 +45 S 0.698 +46 R 0.685 +47 A 0.678 +48 P 0.659 +49 M 0.610 +50 L 0.545 +51 L 0.507 +52 V 0.516 +53 A 0.544 +54 L 0.561 +55 V 0.576 +56 L 0.594 +57 G 0.593 +58 A 0.551 +59 Y 0.486 +60 C 0.431 +61 L 0.401 +62 C 0.394 +63 A 0.410 +64 L 0.450 +65 P 0.513 +66 G 0.575 +67 R 0.605 +68 C 0.606 +69 P 0.613 +70 P 0.639 +71 A 0.665 +72 A 0.669 +73 R 0.654 +74 A 0.638 +75 P 0.635 +76 A 0.640 +77 P 0.648 +78 A 0.658 +79 P 0.666 +80 A 0.670 +81 P 0.673 +82 S 0.686 +83 E 0.708 +84 P 0.731 +85 S 0.751 +86 S 0.765 +87 S 0.767 +88 V 0.755 +89 H 0.742 +90 R 0.739 +91 P 0.746 +92 G 0.750 +93 A 0.752 +94 P 0.754 +95 G 0.755 +96 L 0.751 +97 P 0.743 +98 L 0.721 +99 A 0.673 +100 S 0.609 +101 G 0.555 +102 P 0.522 +103 G 0.489 +104 R 0.429 +105 R 0.341 +106 R 0.249 +107 F 0.177 +108 P 0.128 +109 Q 0.092 +110 A 0.068 +111 L 0.056 +112 I 0.056 +113 V 0.062 +114 G 0.071 +115 V 0.075 +116 K 0.074 +117 K 0.073 +118 G 0.079 +119 G 0.086 +120 T 0.087 +121 R 0.082 +122 A 0.081 +123 L 0.083 +124 L 0.085 +125 E 0.084 +126 F 0.081 +127 L 0.076 +128 R 0.070 +129 L 0.064 +130 H 0.061 +131 P 0.060 +132 D 0.061 +133 V 0.068 +134 R 0.081 +135 A 0.096 +136 L 0.108 +137 G 0.113 +138 S 0.111 +139 E 0.105 +140 P 0.097 +141 H 0.083 +142 F 0.068 +143 F 0.055 +144 D 0.049 +145 R 0.048 +146 C 0.053 +147 Y 0.060 +148 E 0.063 +149 R 0.063 +150 G 0.059 +151 L 0.057 +152 A 0.057 +153 W 0.055 +154 Y 0.050 +155 R 0.047 +156 S 0.055 +157 L 0.072 +158 M 0.092 +159 P 0.107 +160 R 0.115 +161 T 0.121 +162 L 0.129 +163 D 0.142 +164 G 0.156 +165 Q 0.157 +166 I 0.142 +167 T 0.119 +168 M 0.102 +169 E 0.100 +170 K 0.112 +171 T 0.130 +172 P 0.142 +173 S 0.144 +174 Y 0.132 +175 F 0.114 +176 V 0.099 +177 T 0.091 +178 R 0.085 +179 E 0.074 +180 A 0.063 +181 P 0.056 +182 R 0.055 +183 R 0.055 +184 I 0.053 +185 H 0.052 +186 A 0.054 +187 M 0.059 +188 S 0.065 +189 P 0.074 +190 D 0.080 +191 T 0.080 +192 K 0.075 +193 L 0.070 +194 I 0.070 +195 V 0.076 +196 V 0.092 +197 V 0.111 +198 R 0.116 +199 N 0.101 +200 P 0.078 +201 V 0.058 +202 T 0.045 +203 R 0.039 +204 A 0.035 +205 I 0.032 +206 S 0.034 +207 D 0.040 +208 Y 0.046 +209 A 0.049 +210 Q 0.050 +211 T 0.053 +212 L 0.062 +213 S 0.077 +214 K 0.099 +215 T 0.124 +216 P 0.144 +217 G 0.150 +218 L 0.143 +219 P 0.126 +220 S 0.103 +221 F 0.082 +222 R 0.071 +223 A 0.073 +224 L 0.084 +225 A 0.099 +226 F 0.115 +227 R 0.137 +228 H 0.159 +229 G 0.171 +230 L 0.174 +231 G 0.172 +232 P 0.167 +233 V 0.152 +234 D 0.128 +235 T 0.103 +236 A 0.089 +237 W 0.083 +238 S 0.084 +239 A 0.092 +240 V 0.105 +241 R 0.114 +242 I 0.118 +243 G 0.114 +244 L 0.101 +245 Y 0.083 +246 A 0.067 +247 Q 0.057 +248 H 0.052 +249 L 0.050 +250 D 0.049 +251 H 0.046 +252 W 0.040 +253 L 0.037 +254 R 0.039 +255 Y 0.044 +256 F 0.047 +257 P 0.046 +258 L 0.043 +259 S 0.039 +260 H 0.036 +261 F 0.038 +262 L 0.048 +263 F 0.066 +264 V 0.084 +265 S 0.090 +266 G 0.080 +267 E 0.066 +268 R 0.055 +269 L 0.049 +270 V 0.047 +271 S 0.047 +272 D 0.050 +273 P 0.053 +274 A 0.054 +275 G 0.053 +276 E 0.050 +277 V 0.047 +278 G 0.046 +279 R 0.047 +280 V 0.051 +281 Q 0.059 +282 D 0.063 +283 F 0.059 +284 L 0.055 +285 G 0.060 +286 L 0.071 +287 K 0.083 +288 R 0.089 +289 V 0.090 +290 V 0.090 +291 T 0.087 +292 D 0.077 +293 K 0.064 +294 H 0.057 +295 F 0.059 +296 Y 0.068 +297 F 0.074 +298 N 0.076 +299 A 0.077 +300 T 0.081 +301 K 0.088 +302 G 0.099 +303 F 0.113 +304 P 0.127 +305 C 0.136 +306 L 0.149 +307 K 0.181 +308 K 0.231 +309 A 0.284 +310 Q 0.320 +311 G 0.332 +312 G 0.328 +313 S 0.316 +314 R 0.303 +315 P 0.298 +316 R 0.312 +317 C 0.339 +318 L 0.365 +319 G 0.375 +320 K 0.369 +321 S 0.354 +322 K 0.338 +323 G 0.321 +324 R 0.300 +325 P 0.275 +326 H 0.248 +327 P 0.226 +328 R 0.209 +329 V 0.189 +330 P 0.165 +331 Q 0.140 +332 A 0.123 +333 L 0.116 +334 V 0.116 +335 R 0.120 +336 R 0.127 +337 L 0.134 +338 Q 0.137 +339 E 0.132 +340 F 0.126 +341 Y 0.118 +342 R 0.102 +343 P 0.086 +344 F 0.079 +345 N 0.080 +346 R 0.081 +347 R 0.084 +348 F 0.089 +349 Y 0.096 +350 Q 0.099 +351 M 0.098 +352 T 0.094 +353 G 0.092 +354 Q 0.094 +355 D 0.098 +356 F 0.099 +357 G 0.102 +358 W 0.116 +359 G 0.134 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000162078.13_ENST00000382280.8_GN:ZG16B_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000162078.13_ENST00000382280.8_GN:ZG16B_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9a617716a115c96e29d510c0d8f8ab0f73456493 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000162078.13_ENST00000382280.8_GN:ZG16B_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,173 @@ +>ENSG00000162078.13|ENST00000382280.8|GN:ZG16B|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.292 +2 L 0.294 +3 L 0.307 +4 L 0.322 +5 L 0.318 +6 T 0.308 +7 L 0.331 +8 A 0.387 +9 L 0.432 +10 L 0.439 +11 G 0.418 +12 G 0.386 +13 P 0.349 +14 T 0.307 +15 W 0.261 +16 A 0.217 +17 G 0.183 +18 K 0.162 +19 M 0.151 +20 Y 0.144 +21 G 0.140 +22 P 0.144 +23 G 0.151 +24 G 0.154 +25 G 0.147 +26 K 0.133 +27 Y 0.112 +28 F 0.094 +29 S 0.087 +30 T 0.096 +31 T 0.112 +32 E 0.124 +33 D 0.123 +34 Y 0.110 +35 D 0.094 +36 H 0.078 +37 E 0.062 +38 I 0.046 +39 T 0.034 +40 G 0.028 +41 L 0.028 +42 R 0.031 +43 V 0.036 +44 S 0.044 +45 V 0.053 +46 G 0.060 +47 L 0.062 +48 L 0.061 +49 L 0.056 +50 V 0.051 +51 K 0.044 +52 S 0.040 +53 V 0.039 +54 Q 0.040 +55 V 0.040 +56 K 0.042 +57 L 0.048 +58 G 0.055 +59 D 0.058 +60 S 0.056 +61 W 0.054 +62 D 0.058 +63 V 0.066 +64 K 0.072 +65 L 0.081 +66 G 0.099 +67 A 0.123 +68 L 0.140 +69 G 0.139 +70 G 0.126 +71 N 0.107 +72 T 0.088 +73 Q 0.072 +74 E 0.061 +75 V 0.053 +76 T 0.048 +77 L 0.050 +78 Q 0.057 +79 P 0.060 +80 G 0.054 +81 E 0.043 +82 Y 0.035 +83 I 0.031 +84 T 0.028 +85 K 0.025 +86 V 0.023 +87 F 0.022 +88 V 0.023 +89 A 0.025 +90 F 0.028 +91 Q 0.029 +92 A 0.030 +93 F 0.033 +94 L 0.036 +95 R 0.037 +96 G 0.035 +97 M 0.030 +98 V 0.024 +99 M 0.020 +100 Y 0.022 +101 T 0.027 +102 S 0.034 +103 K 0.040 +104 D 0.042 +105 R 0.042 +106 Y 0.042 +107 F 0.042 +108 Y 0.043 +109 F 0.046 +110 G 0.054 +111 K 0.064 +112 L 0.072 +113 D 0.073 +114 G 0.070 +115 Q 0.066 +116 I 0.063 +117 S 0.058 +118 S 0.054 +119 A 0.053 +120 Y 0.054 +121 P 0.057 +122 S 0.067 +123 Q 0.083 +124 E 0.098 +125 G 0.100 +126 Q 0.090 +127 V 0.076 +128 L 0.066 +129 V 0.063 +130 G 0.067 +131 I 0.071 +132 Y 0.070 +133 G 0.068 +134 Q 0.066 +135 Y 0.067 +136 Q 0.072 +137 L 0.079 +138 L 0.082 +139 G 0.079 +140 I 0.072 +141 K 0.066 +142 S 0.061 +143 I 0.056 +144 G 0.051 +145 F 0.046 +146 E 0.048 +147 W 0.064 +148 N 0.108 +149 Y 0.184 +150 P 0.282 +151 L 0.381 +152 E 0.466 +153 E 0.530 +154 P 0.568 +155 T 0.583 +156 T 0.582 +157 E 0.579 +158 P 0.587 +159 P 0.607 +160 V 0.627 +161 N 0.632 +162 L 0.622 +163 T 0.604 +164 Y 0.592 +165 S 0.590 +166 A 0.585 +167 N 0.578 +168 S 0.585 +169 P 0.601 +170 V 0.595 +171 G 0.553 +172 R 0.508 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000162078.13_ENST00000382280.8_GN:ZG16B_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000162078.13_ENST00000382280.8_GN:ZG16B_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b1f4e91f975a9350c3159ef929a48c709fdecb8d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000162078.13_ENST00000382280.8_GN:ZG16B_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid @@ -0,0 +1,179 @@ +>ENSG00000162078.13|ENST00000382280.8|GN:ZG16B|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:6 +1 M 0.418 +2 H 0.444 +3 R 0.481 +4 P 0.489 +5 E 0.441 +6 A 0.364 +7 M 0.317 +8 L 0.312 +9 L 0.319 +10 L 0.337 +11 L 0.382 +12 T 0.435 +13 L 0.463 +14 A 0.467 +15 L 0.465 +16 L 0.460 +17 G 0.442 +18 G 0.413 +19 P 0.376 +20 T 0.334 +21 W 0.285 +22 A 0.234 +23 G 0.190 +24 K 0.162 +25 M 0.147 +26 Y 0.137 +27 G 0.131 +28 P 0.132 +29 G 0.138 +30 G 0.142 +31 G 0.138 +32 K 0.127 +33 Y 0.108 +34 F 0.090 +35 S 0.083 +36 T 0.091 +37 T 0.107 +38 E 0.120 +39 D 0.120 +40 Y 0.108 +41 D 0.092 +42 H 0.077 +43 E 0.061 +44 I 0.045 +45 T 0.033 +46 G 0.027 +47 L 0.027 +48 R 0.030 +49 V 0.036 +50 S 0.044 +51 V 0.053 +52 G 0.060 +53 L 0.062 +54 L 0.060 +55 L 0.055 +56 V 0.050 +57 K 0.044 +58 S 0.040 +59 V 0.039 +60 Q 0.039 +61 V 0.039 +62 K 0.042 +63 L 0.047 +64 G 0.053 +65 D 0.056 +66 S 0.054 +67 W 0.052 +68 D 0.056 +69 V 0.064 +70 K 0.070 +71 L 0.079 +72 G 0.096 +73 A 0.120 +74 L 0.137 +75 G 0.137 +76 G 0.124 +77 N 0.106 +78 T 0.088 +79 Q 0.072 +80 E 0.060 +81 V 0.052 +82 T 0.047 +83 L 0.049 +84 Q 0.057 +85 P 0.060 +86 G 0.054 +87 E 0.043 +88 Y 0.035 +89 I 0.031 +90 T 0.028 +91 K 0.025 +92 V 0.023 +93 F 0.022 +94 V 0.023 +95 A 0.025 +96 F 0.028 +97 Q 0.029 +98 A 0.030 +99 F 0.033 +100 L 0.036 +101 R 0.037 +102 G 0.035 +103 M 0.030 +104 V 0.024 +105 M 0.020 +106 Y 0.022 +107 T 0.027 +108 S 0.034 +109 K 0.040 +110 D 0.042 +111 R 0.042 +112 Y 0.042 +113 F 0.042 +114 Y 0.043 +115 F 0.046 +116 G 0.055 +117 K 0.066 +118 L 0.073 +119 D 0.074 +120 G 0.071 +121 Q 0.067 +122 I 0.064 +123 S 0.059 +124 S 0.055 +125 A 0.054 +126 Y 0.055 +127 P 0.058 +128 S 0.068 +129 Q 0.084 +130 E 0.099 +131 G 0.101 +132 Q 0.091 +133 V 0.077 +134 L 0.066 +135 V 0.063 +136 G 0.067 +137 I 0.071 +138 Y 0.070 +139 G 0.068 +140 Q 0.066 +141 Y 0.067 +142 Q 0.072 +143 L 0.079 +144 L 0.082 +145 G 0.079 +146 I 0.072 +147 K 0.066 +148 S 0.060 +149 I 0.055 +150 G 0.050 +151 F 0.045 +152 E 0.047 +153 W 0.063 +154 N 0.108 +155 Y 0.186 +156 P 0.286 +157 L 0.387 +158 E 0.473 +159 E 0.537 +160 P 0.578 +161 T 0.593 +162 T 0.592 +163 E 0.586 +164 P 0.592 +165 P 0.612 +166 V 0.633 +167 N 0.640 +168 L 0.631 +169 T 0.613 +170 Y 0.602 +171 S 0.599 +172 A 0.594 +173 N 0.586 +174 S 0.591 +175 P 0.605 +176 V 0.598 +177 G 0.555 +178 R 0.509 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000163283.7_ENST00000392027.3_GN:ALPP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000163283.7_ENST00000392027.3_GN:ALPP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d26a28cfbd7325fb84360186ed7140d2c17a5529 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000163283.7_ENST00000392027.3_GN:ALPP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,536 @@ +>ENSG00000163283.7|ENST00000392027.3|GN:ALPP|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.290 +2 L 0.286 +3 G 0.275 +4 P 0.253 +5 C 0.221 +6 M 0.186 +7 L 0.158 +8 L 0.142 +9 L 0.140 +10 L 0.147 +11 L 0.162 +12 L 0.185 +13 L 0.215 +14 G 0.243 +15 L 0.261 +16 R 0.270 +17 L 0.281 +18 Q 0.301 +19 L 0.328 +20 S 0.352 +21 L 0.365 +22 G 0.361 +23 I 0.344 +24 I 0.316 +25 P 0.280 +26 V 0.239 +27 E 0.200 +28 E 0.171 +29 E 0.153 +30 N 0.145 +31 P 0.144 +32 D 0.148 +33 F 0.153 +34 W 0.159 +35 N 0.164 +36 R 0.176 +37 E 0.194 +38 A 0.205 +39 A 0.204 +40 E 0.202 +41 A 0.203 +42 L 0.201 +43 G 0.195 +44 A 0.190 +45 A 0.185 +46 K 0.184 +47 K 0.194 +48 L 0.210 +49 Q 0.217 +50 P 0.209 +51 A 0.196 +52 Q 0.187 +53 T 0.182 +54 A 0.173 +55 A 0.158 +56 K 0.146 +57 N 0.148 +58 L 0.160 +59 I 0.166 +60 I 0.156 +61 F 0.136 +62 L 0.124 +63 G 0.126 +64 D 0.138 +65 G 0.144 +66 M 0.138 +67 G 0.124 +68 V 0.115 +69 S 0.118 +70 T 0.125 +71 V 0.128 +72 T 0.128 +73 A 0.131 +74 A 0.131 +75 R 0.124 +76 I 0.113 +77 L 0.111 +78 K 0.118 +79 G 0.128 +80 Q 0.135 +81 K 0.143 +82 K 0.153 +83 D 0.164 +84 K 0.171 +85 L 0.173 +86 G 0.174 +87 P 0.181 +88 E 0.194 +89 I 0.204 +90 P 0.200 +91 L 0.182 +92 A 0.165 +93 M 0.154 +94 D 0.147 +95 R 0.139 +96 F 0.134 +97 P 0.132 +98 Y 0.131 +99 V 0.132 +100 A 0.143 +101 L 0.167 +102 S 0.194 +103 K 0.216 +104 T 0.229 +105 Y 0.230 +106 N 0.219 +107 V 0.197 +108 D 0.174 +109 K 0.165 +110 H 0.188 +111 V 0.247 +112 P 0.320 +113 D 0.371 +114 S 0.390 +115 G 0.389 +116 A 0.376 +117 T 0.344 +118 A 0.300 +119 T 0.258 +120 A 0.225 +121 Y 0.206 +122 L 0.201 +123 C 0.214 +124 G 0.247 +125 V 0.285 +126 K 0.308 +127 G 0.309 +128 N 0.299 +129 F 0.296 +130 Q 0.305 +131 T 0.317 +132 I 0.327 +133 G 0.344 +134 L 0.360 +135 S 0.358 +136 A 0.329 +137 A 0.283 +138 A 0.235 +139 R 0.195 +140 F 0.168 +141 N 0.154 +142 Q 0.151 +143 C 0.162 +144 N 0.184 +145 T 0.206 +146 T 0.219 +147 R 0.226 +148 G 0.232 +149 N 0.231 +150 E 0.216 +151 V 0.189 +152 I 0.159 +153 S 0.132 +154 V 0.112 +155 M 0.097 +156 N 0.087 +157 R 0.080 +158 A 0.078 +159 K 0.084 +160 K 0.097 +161 A 0.114 +162 G 0.132 +163 K 0.151 +164 S 0.176 +165 V 0.211 +166 G 0.249 +167 V 0.275 +168 V 0.269 +169 T 0.229 +170 T 0.176 +171 T 0.133 +172 R 0.113 +173 V 0.107 +174 Q 0.110 +175 H 0.118 +176 A 0.131 +177 S 0.145 +178 P 0.154 +179 A 0.159 +180 G 0.158 +181 T 0.152 +182 Y 0.142 +183 A 0.132 +184 H 0.123 +185 T 0.115 +186 V 0.112 +187 N 0.115 +188 R 0.125 +189 N 0.138 +190 W 0.146 +191 Y 0.145 +192 S 0.139 +193 D 0.136 +194 A 0.134 +195 D 0.131 +196 V 0.126 +197 P 0.121 +198 A 0.112 +199 S 0.102 +200 A 0.091 +201 R 0.081 +202 Q 0.076 +203 E 0.083 +204 G 0.099 +205 C 0.117 +206 Q 0.126 +207 D 0.124 +208 I 0.116 +209 A 0.110 +210 T 0.105 +211 Q 0.101 +212 L 0.096 +213 I 0.091 +214 S 0.085 +215 N 0.082 +216 M 0.081 +217 D 0.086 +218 I 0.096 +219 D 0.107 +220 V 0.109 +221 I 0.101 +222 L 0.089 +223 G 0.085 +224 G 0.094 +225 G 0.113 +226 R 0.132 +227 K 0.145 +228 Y 0.150 +229 M 0.155 +230 F 0.168 +231 R 0.190 +232 M 0.210 +233 G 0.220 +234 T 0.224 +235 P 0.221 +236 D 0.214 +237 P 0.204 +238 E 0.201 +239 Y 0.204 +240 P 0.210 +241 D 0.212 +242 D 0.212 +243 Y 0.220 +244 S 0.238 +245 Q 0.259 +246 G 0.266 +247 G 0.252 +248 T 0.219 +249 R 0.185 +250 L 0.168 +251 D 0.169 +252 G 0.172 +253 K 0.162 +254 N 0.141 +255 L 0.117 +256 V 0.096 +257 Q 0.079 +258 E 0.069 +259 W 0.069 +260 L 0.074 +261 A 0.077 +262 K 0.076 +263 R 0.078 +264 Q 0.086 +265 G 0.093 +266 A 0.097 +267 R 0.101 +268 Y 0.109 +269 V 0.116 +270 W 0.116 +271 N 0.108 +272 R 0.097 +273 T 0.085 +274 E 0.073 +275 L 0.064 +276 M 0.059 +277 Q 0.060 +278 A 0.065 +279 S 0.068 +280 L 0.067 +281 D 0.066 +282 P 0.068 +283 S 0.073 +284 V 0.080 +285 T 0.092 +286 H 0.114 +287 L 0.144 +288 M 0.170 +289 G 0.181 +290 L 0.180 +291 F 0.171 +292 E 0.161 +293 P 0.154 +294 G 0.152 +295 D 0.153 +296 M 0.155 +297 K 0.153 +298 Y 0.148 +299 E 0.146 +300 I 0.146 +301 H 0.146 +302 R 0.143 +303 D 0.135 +304 S 0.128 +305 T 0.121 +306 L 0.121 +307 D 0.127 +308 P 0.137 +309 S 0.144 +310 L 0.140 +311 M 0.126 +312 E 0.111 +313 M 0.107 +314 T 0.104 +315 E 0.092 +316 A 0.075 +317 A 0.064 +318 L 0.061 +319 R 0.065 +320 L 0.072 +321 L 0.079 +322 S 0.086 +323 R 0.099 +324 N 0.119 +325 P 0.140 +326 R 0.151 +327 G 0.153 +328 F 0.160 +329 F 0.175 +330 L 0.192 +331 F 0.205 +332 V 0.212 +333 E 0.207 +334 G 0.192 +335 G 0.178 +336 R 0.169 +337 I 0.159 +338 D 0.146 +339 H 0.133 +340 G 0.125 +341 H 0.130 +342 H 0.146 +343 E 0.166 +344 S 0.180 +345 R 0.181 +346 A 0.175 +347 Y 0.171 +348 R 0.178 +349 A 0.192 +350 L 0.205 +351 T 0.210 +352 E 0.206 +353 T 0.195 +354 I 0.181 +355 M 0.168 +356 F 0.152 +357 D 0.131 +358 D 0.110 +359 A 0.094 +360 I 0.082 +361 E 0.075 +362 R 0.076 +363 A 0.085 +364 G 0.098 +365 Q 0.109 +366 L 0.112 +367 T 0.104 +368 S 0.093 +369 E 0.087 +370 E 0.086 +371 D 0.088 +372 T 0.098 +373 L 0.120 +374 S 0.149 +375 L 0.178 +376 V 0.200 +377 T 0.205 +378 A 0.194 +379 D 0.174 +380 H 0.157 +381 S 0.152 +382 H 0.165 +383 V 0.196 +384 F 0.234 +385 S 0.269 +386 F 0.288 +387 G 0.284 +388 G 0.261 +389 Y 0.237 +390 P 0.224 +391 L 0.218 +392 R 0.213 +393 G 0.216 +394 S 0.225 +395 S 0.230 +396 I 0.231 +397 F 0.244 +398 G 0.266 +399 L 0.273 +400 A 0.254 +401 P 0.221 +402 G 0.194 +403 K 0.180 +404 A 0.176 +405 R 0.177 +406 D 0.184 +407 R 0.201 +408 K 0.219 +409 A 0.228 +410 Y 0.230 +411 T 0.231 +412 V 0.236 +413 L 0.248 +414 L 0.267 +415 Y 0.286 +416 G 0.295 +417 N 0.299 +418 G 0.312 +419 P 0.331 +420 G 0.331 +421 Y 0.300 +422 V 0.255 +423 L 0.224 +424 K 0.220 +425 D 0.236 +426 G 0.255 +427 A 0.258 +428 R 0.247 +429 P 0.231 +430 D 0.213 +431 V 0.192 +432 T 0.177 +433 E 0.175 +434 S 0.182 +435 E 0.192 +436 S 0.206 +437 G 0.224 +438 S 0.236 +439 P 0.238 +440 E 0.236 +441 Y 0.243 +442 R 0.258 +443 Q 0.276 +444 Q 0.287 +445 S 0.294 +446 A 0.302 +447 V 0.308 +448 P 0.304 +449 L 0.289 +450 D 0.271 +451 E 0.265 +452 E 0.280 +453 T 0.309 +454 H 0.342 +455 A 0.371 +456 G 0.399 +457 E 0.424 +458 D 0.430 +459 V 0.400 +460 A 0.337 +461 V 0.265 +462 F 0.204 +463 A 0.163 +464 R 0.141 +465 G 0.137 +466 P 0.137 +467 Q 0.134 +468 A 0.133 +469 H 0.143 +470 L 0.170 +471 V 0.210 +472 H 0.251 +473 G 0.276 +474 V 0.273 +475 Q 0.252 +476 E 0.226 +477 Q 0.202 +478 T 0.186 +479 F 0.176 +480 I 0.163 +481 A 0.144 +482 H 0.127 +483 V 0.115 +484 M 0.103 +485 A 0.093 +486 F 0.090 +487 A 0.090 +488 A 0.088 +489 C 0.085 +490 L 0.084 +491 E 0.087 +492 P 0.099 +493 Y 0.124 +494 T 0.163 +495 A 0.213 +496 C 0.273 +497 D 0.344 +498 L 0.414 +499 A 0.473 +500 P 0.523 +501 P 0.576 +502 A 0.629 +503 G 0.666 +504 T 0.683 +505 T 0.687 +506 D 0.678 +507 A 0.658 +508 A 0.634 +509 H 0.625 +510 P 0.632 +511 G 0.641 +512 R 0.641 +513 S 0.639 +514 V 0.640 +515 V 0.640 +516 P 0.632 +517 A 0.608 +518 L 0.571 +519 L 0.534 +520 P 0.511 +521 L 0.492 +522 L 0.468 +523 A 0.460 +524 G 0.477 +525 T 0.486 +526 L 0.466 +527 L 0.456 +528 L 0.481 +529 L 0.512 +530 E 0.518 +531 T 0.505 +532 A 0.489 +533 T 0.478 +534 A 0.476 +535 P 0.479 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000163283.7_ENST00000392027.3_GN:ALPP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000163283.7_ENST00000392027.3_GN:ALPP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..fc2b8708948b703f474bf2b3d880c2ef38c99e1a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000163283.7_ENST00000392027.3_GN:ALPP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid @@ -0,0 +1,551 @@ +>ENSG00000163283.7|ENST00000392027.3|GN:ALPP|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:15 +1 M 0.341 +2 P 0.343 +3 R 0.356 +4 I 0.378 +5 P 0.388 +6 A 0.393 +7 S 0.410 +8 P 0.420 +9 L 0.397 +10 S 0.363 +11 C 0.353 +12 C 0.370 +13 P 0.393 +14 P 0.410 +15 D 0.410 +16 M 0.396 +17 L 0.374 +18 G 0.347 +19 P 0.313 +20 C 0.271 +21 M 0.225 +22 L 0.188 +23 L 0.168 +24 L 0.161 +25 L 0.161 +26 L 0.166 +27 L 0.180 +28 L 0.202 +29 G 0.222 +30 L 0.231 +31 R 0.235 +32 L 0.246 +33 Q 0.270 +34 L 0.302 +35 S 0.333 +36 L 0.353 +37 G 0.354 +38 I 0.340 +39 I 0.311 +40 P 0.274 +41 V 0.234 +42 E 0.198 +43 E 0.170 +44 E 0.154 +45 N 0.147 +46 P 0.147 +47 D 0.152 +48 F 0.160 +49 W 0.168 +50 N 0.175 +51 R 0.190 +52 E 0.211 +53 A 0.223 +54 A 0.220 +55 E 0.214 +56 A 0.213 +57 L 0.210 +58 G 0.204 +59 A 0.197 +60 A 0.190 +61 K 0.187 +62 K 0.196 +63 L 0.210 +64 Q 0.215 +65 P 0.206 +66 A 0.194 +67 Q 0.186 +68 T 0.181 +69 A 0.172 +70 A 0.157 +71 K 0.145 +72 N 0.147 +73 L 0.158 +74 I 0.163 +75 I 0.152 +76 F 0.133 +77 L 0.122 +78 G 0.126 +79 D 0.138 +80 G 0.144 +81 M 0.138 +82 G 0.125 +83 V 0.115 +84 S 0.117 +85 T 0.124 +86 V 0.126 +87 T 0.126 +88 A 0.129 +89 A 0.130 +90 R 0.123 +91 I 0.112 +92 L 0.110 +93 K 0.117 +94 G 0.127 +95 Q 0.133 +96 K 0.139 +97 K 0.149 +98 D 0.160 +99 K 0.167 +100 L 0.168 +101 G 0.170 +102 P 0.177 +103 E 0.191 +104 I 0.203 +105 P 0.199 +106 L 0.182 +107 A 0.165 +108 M 0.154 +109 D 0.146 +110 R 0.139 +111 F 0.133 +112 P 0.130 +113 Y 0.129 +114 V 0.131 +115 A 0.143 +116 L 0.167 +117 S 0.195 +118 K 0.218 +119 T 0.232 +120 Y 0.234 +121 N 0.222 +122 V 0.200 +123 D 0.177 +124 K 0.168 +125 H 0.192 +126 V 0.251 +127 P 0.322 +128 D 0.371 +129 S 0.387 +130 G 0.385 +131 A 0.372 +132 T 0.342 +133 A 0.300 +134 T 0.258 +135 A 0.226 +136 Y 0.207 +137 L 0.202 +138 C 0.215 +139 G 0.249 +140 V 0.288 +141 K 0.312 +142 G 0.312 +143 N 0.302 +144 F 0.298 +145 Q 0.307 +146 T 0.319 +147 I 0.331 +148 G 0.349 +149 L 0.366 +150 S 0.363 +151 A 0.334 +152 A 0.286 +153 A 0.236 +154 R 0.194 +155 F 0.166 +156 N 0.151 +157 Q 0.149 +158 C 0.159 +159 N 0.181 +160 T 0.204 +161 T 0.217 +162 R 0.224 +163 G 0.231 +164 N 0.232 +165 E 0.219 +166 V 0.192 +167 I 0.161 +168 S 0.134 +169 V 0.113 +170 M 0.099 +171 N 0.088 +172 R 0.081 +173 A 0.079 +174 K 0.084 +175 K 0.097 +176 A 0.114 +177 G 0.133 +178 K 0.152 +179 S 0.178 +180 V 0.213 +181 G 0.251 +182 V 0.276 +183 V 0.269 +184 T 0.229 +185 T 0.176 +186 T 0.134 +187 R 0.114 +188 V 0.108 +189 Q 0.110 +190 H 0.118 +191 A 0.131 +192 S 0.144 +193 P 0.152 +194 A 0.156 +195 G 0.155 +196 T 0.148 +197 Y 0.139 +198 A 0.129 +199 H 0.120 +200 T 0.113 +201 V 0.110 +202 N 0.113 +203 R 0.123 +204 N 0.136 +205 W 0.143 +206 Y 0.142 +207 S 0.137 +208 D 0.134 +209 A 0.132 +210 D 0.129 +211 V 0.124 +212 P 0.118 +213 A 0.110 +214 S 0.101 +215 A 0.090 +216 R 0.079 +217 Q 0.075 +218 E 0.081 +219 G 0.097 +220 C 0.115 +221 Q 0.124 +222 D 0.121 +223 I 0.115 +224 A 0.109 +225 T 0.104 +226 Q 0.099 +227 L 0.095 +228 I 0.089 +229 S 0.083 +230 N 0.079 +231 M 0.078 +232 D 0.083 +233 I 0.095 +234 D 0.106 +235 V 0.109 +236 I 0.102 +237 L 0.091 +238 G 0.086 +239 G 0.096 +240 G 0.114 +241 R 0.132 +242 K 0.144 +243 Y 0.149 +244 M 0.153 +245 F 0.166 +246 R 0.188 +247 M 0.208 +248 G 0.220 +249 T 0.224 +250 P 0.223 +251 D 0.215 +252 P 0.206 +253 E 0.201 +254 Y 0.205 +255 P 0.211 +256 D 0.212 +257 D 0.212 +258 Y 0.220 +259 S 0.239 +260 Q 0.259 +261 G 0.266 +262 G 0.251 +263 T 0.218 +264 R 0.184 +265 L 0.168 +266 D 0.169 +267 G 0.173 +268 K 0.163 +269 N 0.142 +270 L 0.118 +271 V 0.096 +272 Q 0.079 +273 E 0.070 +274 W 0.069 +275 L 0.075 +276 A 0.078 +277 K 0.077 +278 R 0.079 +279 Q 0.088 +280 G 0.095 +281 A 0.099 +282 R 0.102 +283 Y 0.110 +284 V 0.118 +285 W 0.117 +286 N 0.108 +287 R 0.096 +288 T 0.084 +289 E 0.073 +290 L 0.064 +291 M 0.060 +292 Q 0.061 +293 A 0.066 +294 S 0.070 +295 L 0.069 +296 D 0.068 +297 P 0.070 +298 S 0.076 +299 V 0.083 +300 T 0.094 +301 H 0.116 +302 L 0.145 +303 M 0.171 +304 G 0.182 +305 L 0.181 +306 F 0.173 +307 E 0.163 +308 P 0.156 +309 G 0.154 +310 D 0.156 +311 M 0.158 +312 K 0.155 +313 Y 0.150 +314 E 0.148 +315 I 0.148 +316 H 0.148 +317 R 0.145 +318 D 0.138 +319 S 0.130 +320 T 0.124 +321 L 0.123 +322 D 0.130 +323 P 0.140 +324 S 0.146 +325 L 0.142 +326 M 0.128 +327 E 0.113 +328 M 0.108 +329 T 0.106 +330 E 0.094 +331 A 0.077 +332 A 0.065 +333 L 0.062 +334 R 0.066 +335 L 0.074 +336 L 0.080 +337 S 0.087 +338 R 0.100 +339 N 0.121 +340 P 0.142 +341 R 0.152 +342 G 0.155 +343 F 0.162 +344 F 0.177 +345 L 0.195 +346 F 0.208 +347 V 0.215 +348 E 0.210 +349 G 0.195 +350 G 0.181 +351 R 0.171 +352 I 0.161 +353 D 0.148 +354 H 0.134 +355 G 0.126 +356 H 0.131 +357 H 0.147 +358 E 0.167 +359 S 0.181 +360 R 0.183 +361 A 0.176 +362 Y 0.172 +363 R 0.179 +364 A 0.193 +365 L 0.207 +366 T 0.212 +367 E 0.207 +368 T 0.195 +369 I 0.182 +370 M 0.169 +371 F 0.153 +372 D 0.131 +373 D 0.110 +374 A 0.094 +375 I 0.082 +376 E 0.075 +377 R 0.077 +378 A 0.086 +379 G 0.098 +380 Q 0.109 +381 L 0.111 +382 T 0.103 +383 S 0.093 +384 E 0.087 +385 E 0.086 +386 D 0.088 +387 T 0.099 +388 L 0.121 +389 S 0.151 +390 L 0.180 +391 V 0.202 +392 T 0.207 +393 A 0.195 +394 D 0.174 +395 H 0.157 +396 S 0.152 +397 H 0.165 +398 V 0.196 +399 F 0.235 +400 S 0.269 +401 F 0.289 +402 G 0.285 +403 G 0.263 +404 Y 0.239 +405 P 0.227 +406 L 0.221 +407 R 0.216 +408 G 0.219 +409 S 0.227 +410 S 0.232 +411 I 0.232 +412 F 0.244 +413 G 0.266 +414 L 0.274 +415 A 0.254 +416 P 0.222 +417 G 0.195 +418 K 0.181 +419 A 0.177 +420 R 0.177 +421 D 0.185 +422 R 0.202 +423 K 0.220 +424 A 0.229 +425 Y 0.230 +426 T 0.230 +427 V 0.235 +428 L 0.247 +429 L 0.267 +430 Y 0.287 +431 G 0.298 +432 N 0.302 +433 G 0.314 +434 P 0.333 +435 G 0.333 +436 Y 0.302 +437 V 0.257 +438 L 0.226 +439 K 0.221 +440 D 0.238 +441 G 0.257 +442 A 0.260 +443 R 0.248 +444 P 0.232 +445 D 0.214 +446 V 0.194 +447 T 0.178 +448 E 0.176 +449 S 0.182 +450 E 0.192 +451 S 0.206 +452 G 0.224 +453 S 0.237 +454 P 0.239 +455 E 0.238 +456 Y 0.245 +457 R 0.261 +458 Q 0.279 +459 Q 0.292 +460 S 0.299 +461 A 0.306 +462 V 0.311 +463 P 0.307 +464 L 0.291 +465 D 0.273 +466 E 0.267 +467 E 0.282 +468 T 0.311 +469 H 0.342 +470 A 0.371 +471 G 0.399 +472 E 0.425 +473 D 0.432 +474 V 0.402 +475 A 0.339 +476 V 0.267 +477 F 0.206 +478 A 0.165 +479 R 0.144 +480 G 0.139 +481 P 0.140 +482 Q 0.136 +483 A 0.134 +484 H 0.144 +485 L 0.172 +486 V 0.213 +487 H 0.256 +488 G 0.280 +489 V 0.277 +490 Q 0.256 +491 E 0.229 +492 Q 0.205 +493 T 0.188 +494 F 0.178 +495 I 0.164 +496 A 0.145 +497 H 0.128 +498 V 0.116 +499 M 0.104 +500 A 0.094 +501 F 0.090 +502 A 0.090 +503 A 0.089 +504 C 0.085 +505 L 0.083 +506 E 0.086 +507 P 0.098 +508 Y 0.123 +509 T 0.162 +510 A 0.212 +511 C 0.272 +512 D 0.343 +513 L 0.413 +514 A 0.472 +515 P 0.523 +516 P 0.575 +517 A 0.627 +518 G 0.663 +519 T 0.680 +520 T 0.683 +521 D 0.674 +522 A 0.653 +523 A 0.630 +524 H 0.621 +525 P 0.628 +526 G 0.635 +527 R 0.634 +528 S 0.631 +529 V 0.631 +530 V 0.629 +531 P 0.618 +532 A 0.592 +533 L 0.551 +534 L 0.511 +535 P 0.483 +536 L 0.463 +537 L 0.443 +538 A 0.440 +539 G 0.461 +540 T 0.470 +541 L 0.450 +542 L 0.441 +543 L 0.464 +544 L 0.490 +545 E 0.492 +546 T 0.478 +547 A 0.465 +548 T 0.456 +549 A 0.453 +550 P 0.455 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000163463.14_ENST00000295682.6_GN:KRTCAP2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000163463.14_ENST00000295682.6_GN:KRTCAP2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d1df83bdf3894682cf78c3de0cd502ab7cfe16ee --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000163463.14_ENST00000295682.6_GN:KRTCAP2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,137 @@ +>ENSG00000163463.14|ENST00000295682.6|GN:KRTCAP2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.425 +2 V 0.397 +3 V 0.341 +4 G 0.266 +5 T 0.195 +6 G 0.140 +7 T 0.102 +8 S 0.081 +9 L 0.074 +10 A 0.073 +11 L 0.072 +12 S 0.075 +13 S 0.083 +14 L 0.085 +15 L 0.076 +16 S 0.064 +17 L 0.060 +18 L 0.065 +19 L 0.076 +20 F 0.086 +21 A 0.091 +22 G 0.093 +23 M 0.093 +24 Q 0.091 +25 M 0.086 +26 Y 0.082 +27 S 0.084 +28 R 0.093 +29 Q 0.108 +30 L 0.124 +31 A 0.136 +32 S 0.137 +33 T 0.122 +34 E 0.094 +35 W 0.069 +36 L 0.056 +37 T 0.051 +38 I 0.050 +39 Q 0.052 +40 G 0.056 +41 G 0.058 +42 L 0.058 +43 L 0.060 +44 G 0.062 +45 S 0.058 +46 G 0.049 +47 L 0.041 +48 F 0.035 +49 V 0.034 +50 F 0.038 +51 S 0.047 +52 L 0.055 +53 T 0.060 +54 A 0.064 +55 F 0.073 +56 N 0.084 +57 N 0.094 +58 L 0.099 +59 E 0.098 +60 N 0.093 +61 L 0.093 +62 V 0.114 +63 F 0.157 +64 G 0.209 +65 K 0.243 +66 G 0.248 +67 F 0.231 +68 Q 0.203 +69 A 0.173 +70 K 0.140 +71 I 0.106 +72 F 0.077 +73 P 0.059 +74 E 0.051 +75 I 0.049 +76 L 0.048 +77 L 0.051 +78 C 0.055 +79 L 0.057 +80 L 0.059 +81 L 0.060 +82 A 0.062 +83 L 0.063 +84 F 0.064 +85 A 0.070 +86 S 0.079 +87 G 0.087 +88 L 0.094 +89 I 0.095 +90 H 0.091 +91 R 0.083 +92 V 0.077 +93 C 0.073 +94 V 0.065 +95 T 0.056 +96 T 0.048 +97 C 0.044 +98 F 0.041 +99 I 0.038 +100 F 0.037 +101 S 0.038 +102 M 0.039 +103 V 0.039 +104 G 0.037 +105 L 0.035 +106 Y 0.034 +107 Y 0.036 +108 I 0.045 +109 N 0.056 +110 K 0.071 +111 I 0.090 +112 S 0.114 +113 S 0.133 +114 T 0.148 +115 L 0.167 +116 Y 0.201 +117 Q 0.258 +118 A 0.328 +119 A 0.397 +120 A 0.455 +121 P 0.500 +122 V 0.530 +123 L 0.550 +124 T 0.573 +125 P 0.605 +126 A 0.636 +127 K 0.652 +128 V 0.650 +129 T 0.631 +130 G 0.605 +131 K 0.586 +132 S 0.582 +133 K 0.576 +134 K 0.545 +135 R 0.490 +136 N 0.446 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000163463.14_ENST00000295682.6_GN:KRTCAP2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000163463.14_ENST00000295682.6_GN:KRTCAP2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e300e99ef2159aeb052944c7b8d3538f5637bf19 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000163463.14_ENST00000295682.6_GN:KRTCAP2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid @@ -0,0 +1,163 @@ +>ENSG00000163463.14|ENST00000295682.6|GN:KRTCAP2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:26 +1 M 0.431 +2 R 0.460 +3 I 0.503 +4 A 0.539 +5 N 0.555 +6 R 0.556 +7 T 0.555 +8 R 0.563 +9 F 0.574 +10 S 0.582 +11 S 0.579 +12 P 0.567 +13 F 0.559 +14 L 0.570 +15 A 0.604 +16 R 0.648 +17 G 0.684 +18 A 0.698 +19 G 0.691 +20 W 0.683 +21 T 0.688 +22 H 0.702 +23 G 0.714 +24 R 0.721 +25 G 0.722 +26 M 0.711 +27 M 0.680 +28 V 0.615 +29 V 0.508 +30 G 0.381 +31 T 0.267 +32 G 0.185 +33 T 0.129 +34 S 0.092 +35 L 0.070 +36 A 0.061 +37 L 0.060 +38 S 0.067 +39 S 0.076 +40 L 0.077 +41 L 0.071 +42 S 0.063 +43 L 0.062 +44 L 0.067 +45 L 0.078 +46 F 0.088 +47 A 0.094 +48 G 0.097 +49 M 0.098 +50 Q 0.097 +51 M 0.093 +52 Y 0.090 +53 S 0.091 +54 R 0.098 +55 Q 0.111 +56 L 0.124 +57 A 0.135 +58 S 0.136 +59 T 0.122 +60 E 0.095 +61 W 0.070 +62 L 0.057 +63 T 0.053 +64 I 0.052 +65 Q 0.054 +66 G 0.057 +67 G 0.058 +68 L 0.058 +69 L 0.059 +70 G 0.061 +71 S 0.057 +72 G 0.049 +73 L 0.041 +74 F 0.036 +75 V 0.034 +76 F 0.038 +77 S 0.047 +78 L 0.054 +79 T 0.059 +80 A 0.063 +81 F 0.071 +82 N 0.081 +83 N 0.091 +84 L 0.097 +85 E 0.096 +86 N 0.090 +87 L 0.090 +88 V 0.110 +89 F 0.153 +90 G 0.206 +91 K 0.244 +92 G 0.252 +93 F 0.237 +94 Q 0.212 +95 A 0.182 +96 K 0.148 +97 I 0.110 +98 F 0.079 +99 P 0.061 +100 E 0.053 +101 I 0.051 +102 L 0.050 +103 L 0.052 +104 C 0.057 +105 L 0.060 +106 L 0.061 +107 L 0.062 +108 A 0.063 +109 L 0.062 +110 F 0.063 +111 A 0.069 +112 S 0.078 +113 G 0.086 +114 L 0.092 +115 I 0.094 +116 H 0.090 +117 R 0.083 +118 V 0.078 +119 C 0.074 +120 V 0.066 +121 T 0.056 +122 T 0.049 +123 C 0.044 +124 F 0.041 +125 I 0.038 +126 F 0.038 +127 S 0.040 +128 M 0.041 +129 V 0.040 +130 G 0.039 +131 L 0.037 +132 Y 0.036 +133 Y 0.040 +134 I 0.052 +135 N 0.069 +136 K 0.087 +137 I 0.106 +138 S 0.125 +139 S 0.141 +140 T 0.155 +141 L 0.174 +142 Y 0.211 +143 Q 0.270 +144 A 0.343 +145 A 0.414 +146 A 0.473 +147 P 0.518 +148 V 0.549 +149 L 0.568 +150 T 0.591 +151 P 0.623 +152 A 0.655 +153 K 0.673 +154 V 0.673 +155 T 0.660 +156 G 0.640 +157 K 0.625 +158 S 0.617 +159 K 0.602 +160 K 0.563 +161 R 0.505 +162 N 0.460 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000164022.19_ENST00000672341.1_GN:AIMP1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000164022.19_ENST00000672341.1_GN:AIMP1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..bce878ed1db4e4e9637bf26b6636d08435e3eeac --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000164022.19_ENST00000672341.1_GN:AIMP1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,313 @@ +>ENSG00000164022.19|ENST00000672341.1|GN:AIMP1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.330 +2 A 0.319 +3 N 0.299 +4 N 0.268 +5 D 0.229 +6 A 0.194 +7 V 0.173 +8 L 0.164 +9 K 0.163 +10 R 0.167 +11 L 0.177 +12 E 0.188 +13 Q 0.197 +14 K 0.208 +15 G 0.224 +16 A 0.239 +17 E 0.250 +18 A 0.248 +19 D 0.231 +20 Q 0.208 +21 I 0.188 +22 I 0.169 +23 E 0.151 +24 Y 0.137 +25 L 0.133 +26 K 0.139 +27 Q 0.149 +28 Q 0.148 +29 V 0.134 +30 S 0.120 +31 L 0.116 +32 L 0.121 +33 K 0.131 +34 E 0.141 +35 K 0.154 +36 A 0.169 +37 I 0.183 +38 L 0.190 +39 Q 0.193 +40 A 0.196 +41 T 0.196 +42 L 0.196 +43 R 0.198 +44 E 0.199 +45 E 0.190 +46 K 0.176 +47 K 0.165 +48 L 0.161 +49 R 0.166 +50 V 0.182 +51 E 0.201 +52 N 0.208 +53 A 0.207 +54 K 0.215 +55 L 0.234 +56 K 0.250 +57 K 0.260 +58 E 0.266 +59 I 0.264 +60 E 0.250 +61 E 0.234 +62 L 0.223 +63 K 0.214 +64 Q 0.208 +65 E 0.204 +66 L 0.199 +67 I 0.194 +68 Q 0.193 +69 A 0.195 +70 E 0.192 +71 I 0.195 +72 Q 0.223 +73 N 0.274 +74 G 0.330 +75 V 0.371 +76 K 0.401 +77 Q 0.440 +78 I 0.496 +79 P 0.557 +80 F 0.611 +81 P 0.654 +82 S 0.682 +83 G 0.696 +84 T 0.705 +85 P 0.717 +86 L 0.734 +87 H 0.753 +88 A 0.767 +89 N 0.770 +90 S 0.765 +91 M 0.758 +92 V 0.756 +93 S 0.757 +94 E 0.757 +95 N 0.753 +96 V 0.743 +97 I 0.737 +98 Q 0.738 +99 S 0.742 +100 T 0.747 +101 A 0.754 +102 V 0.761 +103 T 0.769 +104 T 0.772 +105 V 0.770 +106 S 0.766 +107 S 0.765 +108 G 0.766 +109 T 0.768 +110 K 0.770 +111 E 0.771 +112 Q 0.770 +113 I 0.766 +114 K 0.761 +115 G 0.754 +116 G 0.744 +117 T 0.731 +118 G 0.716 +119 D 0.693 +120 E 0.645 +121 K 0.576 +122 K 0.517 +123 A 0.494 +124 K 0.488 +125 E 0.488 +126 K 0.508 +127 I 0.527 +128 E 0.521 +129 K 0.513 +130 K 0.544 +131 G 0.597 +132 E 0.637 +133 K 0.657 +134 K 0.673 +135 E 0.690 +136 K 0.703 +137 K 0.710 +138 Q 0.716 +139 Q 0.723 +140 S 0.733 +141 I 0.744 +142 A 0.748 +143 G 0.742 +144 S 0.722 +145 A 0.686 +146 D 0.625 +147 S 0.539 +148 K 0.431 +149 P 0.318 +150 I 0.217 +151 D 0.143 +152 V 0.100 +153 S 0.082 +154 R 0.074 +155 L 0.063 +156 D 0.050 +157 L 0.039 +158 R 0.033 +159 I 0.031 +160 G 0.031 +161 C 0.030 +162 I 0.030 +163 I 0.032 +164 T 0.037 +165 A 0.044 +166 R 0.053 +167 K 0.064 +168 H 0.073 +169 P 0.077 +170 D 0.076 +171 A 0.071 +172 D 0.063 +173 S 0.053 +174 L 0.042 +175 Y 0.032 +176 V 0.026 +177 E 0.024 +178 E 0.025 +179 V 0.029 +180 D 0.034 +181 V 0.038 +182 G 0.041 +183 E 0.042 +184 I 0.041 +185 A 0.040 +186 P 0.039 +187 R 0.038 +188 T 0.035 +189 V 0.033 +190 V 0.034 +191 S 0.038 +192 G 0.044 +193 L 0.047 +194 V 0.047 +195 N 0.045 +196 H 0.044 +197 V 0.043 +198 P 0.040 +199 L 0.037 +200 E 0.037 +201 Q 0.040 +202 M 0.046 +203 Q 0.054 +204 N 0.062 +205 R 0.066 +206 M 0.066 +207 V 0.064 +208 I 0.066 +209 L 0.072 +210 L 0.081 +211 C 0.087 +212 N 0.089 +213 L 0.092 +214 K 0.100 +215 P 0.110 +216 A 0.115 +217 K 0.114 +218 M 0.108 +219 R 0.104 +220 G 0.109 +221 V 0.118 +222 L 0.122 +223 S 0.112 +224 Q 0.095 +225 A 0.080 +226 M 0.071 +227 V 0.066 +228 M 0.064 +229 C 0.065 +230 A 0.071 +231 S 0.079 +232 S 0.086 +233 P 0.091 +234 E 0.094 +235 K 0.094 +236 I 0.092 +237 E 0.091 +238 I 0.095 +239 L 0.108 +240 A 0.125 +241 P 0.139 +242 P 0.141 +243 N 0.135 +244 G 0.126 +245 S 0.117 +246 V 0.106 +247 P 0.096 +248 G 0.094 +249 D 0.100 +250 R 0.105 +251 I 0.104 +252 T 0.098 +253 F 0.097 +254 D 0.105 +255 A 0.120 +256 F 0.135 +257 P 0.147 +258 G 0.153 +259 E 0.154 +260 P 0.149 +261 D 0.143 +262 K 0.143 +263 E 0.147 +264 L 0.145 +265 N 0.133 +266 P 0.118 +267 K 0.107 +268 K 0.103 +269 K 0.101 +270 I 0.095 +271 W 0.084 +272 E 0.076 +273 Q 0.078 +274 I 0.086 +275 Q 0.088 +276 P 0.086 +277 D 0.083 +278 L 0.085 +279 H 0.092 +280 T 0.102 +281 N 0.117 +282 D 0.134 +283 E 0.149 +284 C 0.151 +285 V 0.138 +286 A 0.116 +287 T 0.096 +288 Y 0.087 +289 K 0.092 +290 G 0.107 +291 V 0.114 +292 P 0.103 +293 F 0.084 +294 E 0.072 +295 V 0.076 +296 K 0.091 +297 G 0.108 +298 K 0.117 +299 G 0.117 +300 V 0.111 +301 C 0.106 +302 R 0.103 +303 A 0.106 +304 Q 0.116 +305 T 0.132 +306 M 0.152 +307 S 0.172 +308 N 0.190 +309 S 0.201 +310 G 0.199 +311 I 0.186 +312 K 0.174 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000164022.19_ENST00000672341.1_GN:AIMP1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:9.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000164022.19_ENST00000672341.1_GN:AIMP1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:9.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6c3bb274cc6a10ef5a8c54b81e46f68c3ecb1c16 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000164022.19_ENST00000672341.1_GN:AIMP1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:9.caid @@ -0,0 +1,322 @@ +>ENSG00000164022.19|ENST00000672341.1|GN:AIMP1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:9 +1 M 0.201 +2 I 0.190 +3 F 0.177 +4 C 0.163 +5 R 0.152 +6 L 0.152 +7 L 0.170 +8 A 0.205 +9 K 0.244 +10 M 0.284 +11 A 0.320 +12 N 0.330 +13 N 0.302 +14 D 0.253 +15 A 0.216 +16 V 0.198 +17 L 0.188 +18 K 0.180 +19 R 0.179 +20 L 0.186 +21 E 0.195 +22 Q 0.203 +23 K 0.215 +24 G 0.231 +25 A 0.247 +26 E 0.260 +27 A 0.260 +28 D 0.242 +29 Q 0.219 +30 I 0.200 +31 I 0.182 +32 E 0.164 +33 Y 0.150 +34 L 0.145 +35 K 0.151 +36 Q 0.158 +37 Q 0.157 +38 V 0.143 +39 S 0.129 +40 L 0.125 +41 L 0.131 +42 K 0.140 +43 E 0.151 +44 K 0.164 +45 A 0.181 +46 I 0.196 +47 L 0.205 +48 Q 0.209 +49 A 0.212 +50 T 0.213 +51 L 0.215 +52 R 0.220 +53 E 0.221 +54 E 0.212 +55 K 0.198 +56 K 0.185 +57 L 0.176 +58 R 0.176 +59 V 0.189 +60 E 0.206 +61 N 0.212 +62 A 0.211 +63 K 0.219 +64 L 0.238 +65 K 0.254 +66 K 0.262 +67 E 0.266 +68 I 0.262 +69 E 0.247 +70 E 0.231 +71 L 0.221 +72 K 0.215 +73 Q 0.210 +74 E 0.207 +75 L 0.201 +76 I 0.193 +77 Q 0.191 +78 A 0.192 +79 E 0.188 +80 I 0.193 +81 Q 0.221 +82 N 0.272 +83 G 0.328 +84 V 0.370 +85 K 0.401 +86 Q 0.441 +87 I 0.497 +88 P 0.557 +89 F 0.611 +90 P 0.656 +91 S 0.685 +92 G 0.698 +93 T 0.706 +94 P 0.717 +95 L 0.733 +96 H 0.751 +97 A 0.764 +98 N 0.767 +99 S 0.759 +100 M 0.751 +101 V 0.749 +102 S 0.749 +103 E 0.749 +104 N 0.742 +105 V 0.731 +106 I 0.724 +107 Q 0.725 +108 S 0.730 +109 T 0.736 +110 A 0.743 +111 V 0.752 +112 T 0.760 +113 T 0.764 +114 V 0.763 +115 S 0.760 +116 S 0.760 +117 G 0.763 +118 T 0.765 +119 K 0.768 +120 E 0.770 +121 Q 0.770 +122 I 0.766 +123 K 0.761 +124 G 0.755 +125 G 0.745 +126 T 0.734 +127 G 0.720 +128 D 0.698 +129 E 0.650 +130 K 0.580 +131 K 0.521 +132 A 0.498 +133 K 0.492 +134 E 0.493 +135 K 0.512 +136 I 0.532 +137 E 0.524 +138 K 0.515 +139 K 0.545 +140 G 0.597 +141 E 0.636 +142 K 0.656 +143 K 0.673 +144 E 0.690 +145 K 0.703 +146 K 0.710 +147 Q 0.716 +148 Q 0.723 +149 S 0.734 +150 I 0.745 +151 A 0.750 +152 G 0.744 +153 S 0.724 +154 A 0.687 +155 D 0.626 +156 S 0.540 +157 K 0.432 +158 P 0.319 +159 I 0.218 +160 D 0.144 +161 V 0.101 +162 S 0.083 +163 R 0.075 +164 L 0.064 +165 D 0.051 +166 L 0.039 +167 R 0.033 +168 I 0.031 +169 G 0.031 +170 C 0.030 +171 I 0.030 +172 I 0.032 +173 T 0.037 +174 A 0.044 +175 R 0.053 +176 K 0.064 +177 H 0.073 +178 P 0.077 +179 D 0.076 +180 A 0.071 +181 D 0.064 +182 S 0.054 +183 L 0.043 +184 Y 0.033 +185 V 0.026 +186 E 0.024 +187 E 0.025 +188 V 0.029 +189 D 0.034 +190 V 0.038 +191 G 0.041 +192 E 0.042 +193 I 0.041 +194 A 0.040 +195 P 0.039 +196 R 0.037 +197 T 0.035 +198 V 0.033 +199 V 0.034 +200 S 0.038 +201 G 0.043 +202 L 0.046 +203 V 0.046 +204 N 0.045 +205 H 0.044 +206 V 0.042 +207 P 0.040 +208 L 0.037 +209 E 0.037 +210 Q 0.040 +211 M 0.046 +212 Q 0.054 +213 N 0.062 +214 R 0.066 +215 M 0.066 +216 V 0.064 +217 I 0.066 +218 L 0.073 +219 L 0.082 +220 C 0.088 +221 N 0.090 +222 L 0.093 +223 K 0.101 +224 P 0.110 +225 A 0.115 +226 K 0.114 +227 M 0.108 +228 R 0.104 +229 G 0.108 +230 V 0.118 +231 L 0.121 +232 S 0.112 +233 Q 0.095 +234 A 0.080 +235 M 0.071 +236 V 0.066 +237 M 0.064 +238 C 0.066 +239 A 0.072 +240 S 0.079 +241 S 0.086 +242 P 0.091 +243 E 0.094 +244 K 0.094 +245 I 0.092 +246 E 0.091 +247 I 0.095 +248 L 0.107 +249 A 0.125 +250 P 0.139 +251 P 0.142 +252 N 0.135 +253 G 0.126 +254 S 0.117 +255 V 0.106 +256 P 0.096 +257 G 0.094 +258 D 0.100 +259 R 0.105 +260 I 0.104 +261 T 0.098 +262 F 0.098 +263 D 0.106 +264 A 0.122 +265 F 0.138 +266 P 0.149 +267 G 0.155 +268 E 0.155 +269 P 0.150 +270 D 0.144 +271 K 0.145 +272 E 0.149 +273 L 0.146 +274 N 0.134 +275 P 0.119 +276 K 0.108 +277 K 0.104 +278 K 0.102 +279 I 0.095 +280 W 0.084 +281 E 0.077 +282 Q 0.079 +283 I 0.086 +284 Q 0.089 +285 P 0.086 +286 D 0.084 +287 L 0.086 +288 H 0.092 +289 T 0.103 +290 N 0.118 +291 D 0.135 +292 E 0.149 +293 C 0.152 +294 V 0.139 +295 A 0.117 +296 T 0.097 +297 Y 0.088 +298 K 0.093 +299 G 0.107 +300 V 0.114 +301 P 0.104 +302 F 0.084 +303 E 0.073 +304 V 0.077 +305 K 0.092 +306 G 0.109 +307 K 0.118 +308 G 0.117 +309 V 0.111 +310 C 0.106 +311 R 0.104 +312 A 0.107 +313 Q 0.117 +314 T 0.133 +315 M 0.153 +316 S 0.173 +317 N 0.191 +318 S 0.203 +319 G 0.201 +320 I 0.187 +321 K 0.176 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000164690.8_ENST00000297261.7_GN:SHH_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000164690.8_ENST00000297261.7_GN:SHH_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7e08609e3ebb44d470e8f90eb614c112add39ed5 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000164690.8_ENST00000297261.7_GN:SHH_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,463 @@ +>ENSG00000164690.8|ENST00000297261.7|GN:SHH|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.176 +2 L 0.164 +3 L 0.151 +4 L 0.144 +5 A 0.144 +6 R 0.145 +7 C 0.143 +8 L 0.139 +9 L 0.139 +10 L 0.142 +11 V 0.148 +12 L 0.161 +13 V 0.181 +14 S 0.202 +15 S 0.221 +16 L 0.240 +17 L 0.265 +18 V 0.298 +19 C 0.333 +20 S 0.366 +21 G 0.396 +22 L 0.426 +23 A 0.459 +24 C 0.496 +25 G 0.535 +26 P 0.570 +27 G 0.594 +28 R 0.605 +29 G 0.608 +30 F 0.606 +31 G 0.599 +32 K 0.585 +33 R 0.568 +34 R 0.551 +35 H 0.532 +36 P 0.503 +37 K 0.460 +38 K 0.407 +39 L 0.353 +40 T 0.305 +41 P 0.268 +42 L 0.239 +43 A 0.210 +44 Y 0.182 +45 K 0.160 +46 Q 0.148 +47 F 0.144 +48 I 0.143 +49 P 0.142 +50 N 0.138 +51 V 0.130 +52 A 0.123 +53 E 0.121 +54 K 0.129 +55 T 0.141 +56 L 0.153 +57 G 0.165 +58 A 0.175 +59 S 0.176 +60 G 0.168 +61 R 0.157 +62 Y 0.152 +63 E 0.156 +64 G 0.164 +65 K 0.164 +66 I 0.155 +67 S 0.145 +68 R 0.138 +69 N 0.135 +70 S 0.134 +71 E 0.133 +72 R 0.136 +73 F 0.142 +74 K 0.149 +75 E 0.156 +76 L 0.167 +77 T 0.180 +78 P 0.195 +79 N 0.205 +80 Y 0.205 +81 N 0.193 +82 P 0.176 +83 D 0.163 +84 I 0.160 +85 I 0.165 +86 F 0.175 +87 K 0.189 +88 D 0.205 +89 E 0.221 +90 E 0.236 +91 N 0.250 +92 T 0.263 +93 G 0.264 +94 A 0.243 +95 D 0.203 +96 R 0.163 +97 L 0.137 +98 M 0.120 +99 T 0.103 +100 Q 0.083 +101 R 0.070 +102 C 0.068 +103 K 0.074 +104 D 0.080 +105 K 0.079 +106 L 0.074 +107 N 0.071 +108 A 0.071 +109 L 0.075 +110 A 0.078 +111 I 0.076 +112 S 0.069 +113 V 0.062 +114 M 0.057 +115 N 0.055 +116 Q 0.057 +117 W 0.066 +118 P 0.079 +119 G 0.092 +120 V 0.102 +121 K 0.113 +122 L 0.128 +123 R 0.148 +124 V 0.171 +125 T 0.193 +126 E 0.209 +127 G 0.218 +128 W 0.218 +129 D 0.210 +130 E 0.201 +131 D 0.199 +132 G 0.204 +133 H 0.209 +134 H 0.213 +135 S 0.220 +136 E 0.237 +137 E 0.256 +138 S 0.260 +139 L 0.243 +140 H 0.221 +141 Y 0.208 +142 E 0.195 +143 G 0.170 +144 R 0.135 +145 A 0.103 +146 V 0.083 +147 D 0.073 +148 I 0.070 +149 T 0.069 +150 T 0.073 +151 S 0.080 +152 D 0.088 +153 R 0.098 +154 D 0.105 +155 R 0.103 +156 S 0.093 +157 K 0.080 +158 Y 0.072 +159 G 0.072 +160 M 0.076 +161 L 0.077 +162 A 0.074 +163 R 0.071 +164 L 0.069 +165 A 0.069 +166 V 0.074 +167 E 0.083 +168 A 0.095 +169 G 0.105 +170 F 0.108 +171 D 0.100 +172 W 0.085 +173 V 0.072 +174 Y 0.067 +175 Y 0.069 +176 E 0.076 +177 S 0.079 +178 K 0.076 +179 A 0.068 +180 H 0.059 +181 I 0.054 +182 H 0.053 +183 C 0.058 +184 S 0.073 +185 V 0.106 +186 K 0.161 +187 A 0.226 +188 E 0.288 +189 N 0.340 +190 S 0.376 +191 V 0.389 +192 A 0.376 +193 A 0.346 +194 K 0.300 +195 S 0.240 +196 G 0.176 +197 G 0.125 +198 C 0.092 +199 F 0.077 +200 P 0.072 +201 G 0.068 +202 S 0.062 +203 A 0.053 +204 T 0.047 +205 V 0.046 +206 H 0.050 +207 L 0.057 +208 E 0.065 +209 Q 0.076 +210 G 0.083 +211 G 0.082 +212 T 0.075 +213 K 0.067 +214 L 0.065 +215 V 0.073 +216 K 0.090 +217 D 0.105 +218 L 0.108 +219 S 0.098 +220 P 0.087 +221 G 0.083 +222 D 0.088 +223 R 0.093 +224 V 0.095 +225 L 0.097 +226 A 0.100 +227 A 0.102 +228 D 0.100 +229 D 0.095 +230 Q 0.091 +231 G 0.090 +232 R 0.087 +233 L 0.079 +234 L 0.066 +235 Y 0.050 +236 S 0.038 +237 D 0.031 +238 F 0.028 +239 L 0.030 +240 T 0.035 +241 F 0.042 +242 L 0.051 +243 D 0.057 +244 R 0.061 +245 D 0.065 +246 D 0.069 +247 G 0.074 +248 A 0.073 +249 K 0.065 +250 K 0.052 +251 V 0.040 +252 F 0.030 +253 Y 0.027 +254 V 0.030 +255 I 0.036 +256 E 0.043 +257 T 0.046 +258 R 0.046 +259 E 0.046 +260 P 0.053 +261 R 0.063 +262 E 0.068 +263 R 0.064 +264 L 0.058 +265 L 0.055 +266 L 0.057 +267 T 0.060 +268 A 0.060 +269 A 0.055 +270 H 0.048 +271 L 0.043 +272 L 0.045 +273 F 0.059 +274 V 0.092 +275 A 0.146 +276 P 0.221 +277 H 0.309 +278 N 0.395 +279 D 0.463 +280 S 0.508 +281 A 0.537 +282 T 0.557 +283 G 0.574 +284 E 0.592 +285 P 0.613 +286 E 0.634 +287 A 0.649 +288 S 0.655 +289 S 0.650 +290 G 0.633 +291 S 0.605 +292 G 0.579 +293 P 0.569 +294 P 0.575 +295 S 0.577 +296 G 0.553 +297 G 0.498 +298 A 0.418 +299 L 0.330 +300 G 0.254 +301 P 0.197 +302 R 0.151 +303 A 0.107 +304 L 0.074 +305 F 0.059 +306 A 0.061 +307 S 0.072 +308 R 0.084 +309 V 0.088 +310 R 0.083 +311 P 0.076 +312 G 0.071 +313 Q 0.069 +314 R 0.064 +315 V 0.057 +316 Y 0.055 +317 V 0.060 +318 V 0.073 +319 A 0.090 +320 E 0.108 +321 R 0.123 +322 D 0.135 +323 G 0.141 +324 D 0.141 +325 R 0.135 +326 R 0.121 +327 L 0.105 +328 L 0.089 +329 P 0.072 +330 A 0.057 +331 A 0.045 +332 V 0.039 +333 H 0.038 +334 S 0.041 +335 V 0.045 +336 T 0.050 +337 L 0.054 +338 S 0.059 +339 E 0.064 +340 E 0.070 +341 A 0.075 +342 A 0.075 +343 G 0.074 +344 A 0.073 +345 Y 0.076 +346 A 0.081 +347 P 0.084 +348 L 0.086 +349 T 0.095 +350 A 0.112 +351 Q 0.125 +352 G 0.126 +353 T 0.119 +354 I 0.118 +355 L 0.123 +356 I 0.122 +357 N 0.111 +358 R 0.096 +359 V 0.081 +360 L 0.070 +361 A 0.066 +362 S 0.070 +363 C 0.080 +364 Y 0.092 +365 A 0.104 +366 V 0.111 +367 I 0.110 +368 E 0.103 +369 E 0.095 +370 H 0.091 +371 S 0.090 +372 W 0.093 +373 A 0.102 +374 H 0.115 +375 R 0.129 +376 A 0.142 +377 F 0.154 +378 A 0.156 +379 P 0.146 +380 F 0.131 +381 R 0.117 +382 L 0.108 +383 A 0.105 +384 H 0.107 +385 A 0.111 +386 L 0.116 +387 L 0.128 +388 A 0.154 +389 A 0.201 +390 L 0.272 +391 A 0.365 +392 P 0.458 +393 A 0.528 +394 R 0.574 +395 T 0.605 +396 D 0.628 +397 R 0.649 +398 G 0.666 +399 G 0.680 +400 D 0.691 +401 S 0.697 +402 G 0.701 +403 G 0.704 +404 G 0.707 +405 D 0.703 +406 R 0.695 +407 G 0.689 +408 G 0.690 +409 G 0.696 +410 G 0.698 +411 G 0.691 +412 R 0.676 +413 V 0.656 +414 A 0.637 +415 L 0.621 +416 T 0.619 +417 A 0.639 +418 P 0.673 +419 G 0.698 +420 A 0.700 +421 A 0.683 +422 D 0.667 +423 A 0.665 +424 P 0.678 +425 G 0.688 +426 A 0.674 +427 G 0.628 +428 A 0.553 +429 T 0.470 +430 A 0.397 +431 G 0.338 +432 I 0.287 +433 H 0.237 +434 W 0.186 +435 Y 0.143 +436 S 0.117 +437 Q 0.107 +438 L 0.106 +439 L 0.108 +440 Y 0.111 +441 Q 0.115 +442 I 0.119 +443 G 0.127 +444 T 0.139 +445 W 0.154 +446 L 0.175 +447 L 0.209 +448 D 0.255 +449 S 0.299 +450 E 0.327 +451 A 0.343 +452 L 0.358 +453 H 0.374 +454 P 0.383 +455 L 0.383 +456 G 0.385 +457 M 0.404 +458 A 0.437 +459 V 0.459 +460 K 0.455 +461 S 0.433 +462 S 0.413 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000164690.8_ENST00000297261.7_GN:SHH_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000164690.8_ENST00000297261.7_GN:SHH_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c09d233c216819e9827e1bd38e600d5de9c6acf4 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000164690.8_ENST00000297261.7_GN:SHH_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid @@ -0,0 +1,466 @@ +>ENSG00000164690.8|ENST00000297261.7|GN:SHH|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 +1 M 0.281 +2 G 0.265 +3 E 0.229 +4 M 0.185 +5 L 0.149 +6 L 0.129 +7 L 0.119 +8 A 0.116 +9 R 0.118 +10 C 0.123 +11 L 0.129 +12 L 0.136 +13 L 0.144 +14 V 0.152 +15 L 0.162 +16 V 0.174 +17 S 0.187 +18 S 0.200 +19 L 0.217 +20 L 0.245 +21 V 0.283 +22 C 0.323 +23 S 0.359 +24 G 0.390 +25 L 0.418 +26 A 0.450 +27 C 0.489 +28 G 0.530 +29 P 0.567 +30 G 0.593 +31 R 0.605 +32 G 0.608 +33 F 0.607 +34 G 0.602 +35 K 0.590 +36 R 0.574 +37 R 0.557 +38 H 0.537 +39 P 0.508 +40 K 0.465 +41 K 0.411 +42 L 0.356 +43 T 0.307 +44 P 0.269 +45 L 0.239 +46 A 0.210 +47 Y 0.182 +48 K 0.160 +49 Q 0.148 +50 F 0.144 +51 I 0.143 +52 P 0.141 +53 N 0.137 +54 V 0.130 +55 A 0.122 +56 E 0.120 +57 K 0.128 +58 T 0.139 +59 L 0.151 +60 G 0.163 +61 A 0.173 +62 S 0.174 +63 G 0.166 +64 R 0.155 +65 Y 0.151 +66 E 0.155 +67 G 0.162 +68 K 0.163 +69 I 0.154 +70 S 0.143 +71 R 0.137 +72 N 0.134 +73 S 0.133 +74 E 0.132 +75 R 0.135 +76 F 0.141 +77 K 0.148 +78 E 0.156 +79 L 0.167 +80 T 0.180 +81 P 0.194 +82 N 0.205 +83 Y 0.205 +84 N 0.193 +85 P 0.175 +86 D 0.163 +87 I 0.160 +88 I 0.165 +89 F 0.176 +90 K 0.190 +91 D 0.206 +92 E 0.222 +93 E 0.236 +94 N 0.250 +95 T 0.263 +96 G 0.265 +97 A 0.243 +98 D 0.203 +99 R 0.163 +100 L 0.137 +101 M 0.120 +102 T 0.103 +103 Q 0.083 +104 R 0.070 +105 C 0.068 +106 K 0.074 +107 D 0.080 +108 K 0.079 +109 L 0.074 +110 N 0.071 +111 A 0.071 +112 L 0.075 +113 A 0.078 +114 I 0.076 +115 S 0.069 +116 V 0.062 +117 M 0.057 +118 N 0.055 +119 Q 0.057 +120 W 0.066 +121 P 0.080 +122 G 0.092 +123 V 0.103 +124 K 0.114 +125 L 0.129 +126 R 0.148 +127 V 0.172 +128 T 0.194 +129 E 0.210 +130 G 0.219 +131 W 0.220 +132 D 0.211 +133 E 0.202 +134 D 0.201 +135 G 0.205 +136 H 0.210 +137 H 0.214 +138 S 0.221 +139 E 0.238 +140 E 0.257 +141 S 0.261 +142 L 0.244 +143 H 0.222 +144 Y 0.209 +145 E 0.196 +146 G 0.171 +147 R 0.136 +148 A 0.103 +149 V 0.083 +150 D 0.074 +151 I 0.070 +152 T 0.070 +153 T 0.073 +154 S 0.080 +155 D 0.089 +156 R 0.098 +157 D 0.105 +158 R 0.103 +159 S 0.093 +160 K 0.080 +161 Y 0.072 +162 G 0.072 +163 M 0.076 +164 L 0.077 +165 A 0.074 +166 R 0.071 +167 L 0.069 +168 A 0.069 +169 V 0.074 +170 E 0.084 +171 A 0.095 +172 G 0.105 +173 F 0.108 +174 D 0.100 +175 W 0.085 +176 V 0.072 +177 Y 0.067 +178 Y 0.069 +179 E 0.075 +180 S 0.079 +181 K 0.075 +182 A 0.067 +183 H 0.059 +184 I 0.053 +185 H 0.053 +186 C 0.058 +187 S 0.073 +188 V 0.107 +189 K 0.162 +190 A 0.228 +191 E 0.291 +192 N 0.342 +193 S 0.378 +194 V 0.391 +195 A 0.378 +196 A 0.347 +197 K 0.301 +198 S 0.240 +199 G 0.176 +200 G 0.125 +201 C 0.092 +202 F 0.077 +203 P 0.072 +204 G 0.068 +205 S 0.062 +206 A 0.053 +207 T 0.046 +208 V 0.046 +209 H 0.050 +210 L 0.057 +211 E 0.065 +212 Q 0.076 +213 G 0.083 +214 G 0.082 +215 T 0.075 +216 K 0.067 +217 L 0.065 +218 V 0.073 +219 K 0.090 +220 D 0.105 +221 L 0.108 +222 S 0.098 +223 P 0.087 +224 G 0.084 +225 D 0.088 +226 R 0.093 +227 V 0.095 +228 L 0.097 +229 A 0.100 +230 A 0.102 +231 D 0.100 +232 D 0.095 +233 Q 0.091 +234 G 0.090 +235 R 0.087 +236 L 0.079 +237 L 0.066 +238 Y 0.050 +239 S 0.038 +240 D 0.031 +241 F 0.028 +242 L 0.030 +243 T 0.035 +244 F 0.042 +245 L 0.051 +246 D 0.057 +247 R 0.061 +248 D 0.065 +249 D 0.069 +250 G 0.074 +251 A 0.073 +252 K 0.065 +253 K 0.052 +254 V 0.040 +255 F 0.030 +256 Y 0.027 +257 V 0.030 +258 I 0.036 +259 E 0.043 +260 T 0.046 +261 R 0.046 +262 E 0.046 +263 P 0.053 +264 R 0.063 +265 E 0.068 +266 R 0.064 +267 L 0.058 +268 L 0.055 +269 L 0.057 +270 T 0.060 +271 A 0.060 +272 A 0.055 +273 H 0.048 +274 L 0.043 +275 L 0.045 +276 F 0.060 +277 V 0.092 +278 A 0.146 +279 P 0.221 +280 H 0.309 +281 N 0.395 +282 D 0.463 +283 S 0.508 +284 A 0.537 +285 T 0.557 +286 G 0.574 +287 E 0.592 +288 P 0.613 +289 E 0.634 +290 A 0.649 +291 S 0.655 +292 S 0.651 +293 G 0.634 +294 S 0.606 +295 G 0.580 +296 P 0.570 +297 P 0.576 +298 S 0.578 +299 G 0.554 +300 G 0.499 +301 A 0.419 +302 L 0.330 +303 G 0.254 +304 P 0.198 +305 R 0.151 +306 A 0.108 +307 L 0.074 +308 F 0.059 +309 A 0.061 +310 S 0.072 +311 R 0.084 +312 V 0.088 +313 R 0.083 +314 P 0.076 +315 G 0.072 +316 Q 0.069 +317 R 0.064 +318 V 0.058 +319 Y 0.055 +320 V 0.060 +321 V 0.074 +322 A 0.091 +323 E 0.108 +324 R 0.124 +325 D 0.136 +326 G 0.141 +327 D 0.142 +328 R 0.135 +329 R 0.122 +330 L 0.106 +331 L 0.089 +332 P 0.073 +333 A 0.057 +334 A 0.045 +335 V 0.039 +336 H 0.038 +337 S 0.041 +338 V 0.045 +339 T 0.050 +340 L 0.055 +341 S 0.059 +342 E 0.065 +343 E 0.071 +344 A 0.075 +345 A 0.076 +346 G 0.074 +347 A 0.073 +348 Y 0.076 +349 A 0.081 +350 P 0.085 +351 L 0.087 +352 T 0.095 +353 A 0.112 +354 Q 0.126 +355 G 0.126 +356 T 0.120 +357 I 0.119 +358 L 0.124 +359 I 0.123 +360 N 0.112 +361 R 0.096 +362 V 0.081 +363 L 0.070 +364 A 0.066 +365 S 0.070 +366 C 0.080 +367 Y 0.093 +368 A 0.104 +369 V 0.111 +370 I 0.110 +371 E 0.103 +372 E 0.095 +373 H 0.091 +374 S 0.090 +375 W 0.093 +376 A 0.101 +377 H 0.115 +378 R 0.129 +379 A 0.142 +380 F 0.154 +381 A 0.157 +382 P 0.147 +383 F 0.130 +384 R 0.117 +385 L 0.108 +386 A 0.105 +387 H 0.107 +388 A 0.111 +389 L 0.116 +390 L 0.128 +391 A 0.154 +392 A 0.200 +393 L 0.271 +394 A 0.365 +395 P 0.458 +396 A 0.528 +397 R 0.574 +398 T 0.605 +399 D 0.628 +400 R 0.648 +401 G 0.666 +402 G 0.680 +403 D 0.690 +404 S 0.696 +405 G 0.700 +406 G 0.704 +407 G 0.706 +408 D 0.703 +409 R 0.695 +410 G 0.689 +411 G 0.690 +412 G 0.696 +413 G 0.699 +414 G 0.692 +415 R 0.677 +416 V 0.659 +417 A 0.640 +418 L 0.624 +419 T 0.622 +420 A 0.642 +421 P 0.675 +422 G 0.700 +423 A 0.702 +424 A 0.685 +425 D 0.668 +426 A 0.667 +427 P 0.679 +428 G 0.689 +429 A 0.675 +430 G 0.628 +431 A 0.554 +432 T 0.471 +433 A 0.398 +434 G 0.338 +435 I 0.287 +436 H 0.238 +437 W 0.187 +438 Y 0.143 +439 S 0.118 +440 Q 0.108 +441 L 0.106 +442 L 0.108 +443 Y 0.112 +444 Q 0.115 +445 I 0.119 +446 G 0.128 +447 T 0.140 +448 W 0.154 +449 L 0.175 +450 L 0.210 +451 D 0.257 +452 S 0.302 +453 E 0.330 +454 A 0.345 +455 L 0.360 +456 H 0.376 +457 P 0.385 +458 L 0.384 +459 G 0.386 +460 M 0.406 +461 A 0.439 +462 V 0.461 +463 K 0.458 +464 S 0.436 +465 S 0.415 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000164749.13_ENST00000396423.4_GN:HNF4G_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000164749.13_ENST00000396423.4_GN:HNF4G_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d18a0298ed47a91035e35725a60558d994a2c742 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000164749.13_ENST00000396423.4_GN:HNF4G_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,456 @@ +>ENSG00000164749.13|ENST00000396423.4|GN:HNF4G|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.375 +2 M 0.391 +3 R 0.417 +4 V 0.446 +5 S 0.477 +6 E 0.508 +7 P 0.533 +8 I 0.542 +9 L 0.538 +10 D 0.529 +11 M 0.513 +12 D 0.489 +13 M 0.467 +14 A 0.460 +15 N 0.466 +16 Y 0.477 +17 S 0.488 +18 E 0.487 +19 V 0.470 +20 L 0.451 +21 D 0.446 +22 P 0.445 +23 T 0.430 +24 Y 0.400 +25 T 0.370 +26 T 0.341 +27 L 0.311 +28 E 0.278 +29 F 0.245 +30 E 0.214 +31 T 0.197 +32 M 0.197 +33 Q 0.213 +34 I 0.244 +35 L 0.297 +36 Y 0.372 +37 N 0.454 +38 S 0.523 +39 S 0.570 +40 D 0.599 +41 S 0.615 +42 S 0.621 +43 A 0.627 +44 P 0.643 +45 E 0.668 +46 T 0.691 +47 S 0.703 +48 M 0.706 +49 N 0.702 +50 T 0.693 +51 T 0.686 +52 D 0.681 +53 N 0.666 +54 G 0.616 +55 V 0.514 +56 N 0.373 +57 C 0.232 +58 L 0.129 +59 C 0.071 +60 A 0.047 +61 I 0.045 +62 C 0.061 +63 G 0.089 +64 D 0.120 +65 R 0.148 +66 A 0.174 +67 T 0.198 +68 G 0.210 +69 K 0.199 +70 H 0.181 +71 Y 0.179 +72 G 0.187 +73 A 0.182 +74 S 0.165 +75 S 0.148 +76 C 0.131 +77 D 0.111 +78 G 0.097 +79 C 0.089 +80 K 0.081 +81 G 0.072 +82 F 0.069 +83 F 0.068 +84 R 0.067 +85 R 0.067 +86 S 0.073 +87 I 0.080 +88 R 0.087 +89 K 0.091 +90 S 0.091 +91 H 0.089 +92 V 0.083 +93 Y 0.076 +94 S 0.069 +95 C 0.065 +96 R 0.063 +97 F 0.059 +98 S 0.054 +99 R 0.050 +100 Q 0.052 +101 C 0.060 +102 V 0.072 +103 V 0.082 +104 D 0.085 +105 K 0.084 +106 D 0.087 +107 K 0.094 +108 R 0.102 +109 N 0.107 +110 Q 0.111 +111 C 0.106 +112 R 0.093 +113 Y 0.080 +114 C 0.074 +115 R 0.073 +116 L 0.072 +117 R 0.068 +118 K 0.063 +119 C 0.061 +120 F 0.062 +121 R 0.067 +122 A 0.073 +123 G 0.081 +124 M 0.091 +125 K 0.107 +126 K 0.132 +127 E 0.162 +128 A 0.187 +129 V 0.203 +130 Q 0.226 +131 N 0.273 +132 E 0.346 +133 R 0.427 +134 D 0.494 +135 R 0.536 +136 I 0.554 +137 S 0.558 +138 T 0.557 +139 R 0.556 +140 R 0.557 +141 S 0.557 +142 T 0.557 +143 F 0.553 +144 D 0.532 +145 G 0.477 +146 S 0.397 +147 N 0.309 +148 I 0.230 +149 P 0.165 +150 S 0.122 +151 I 0.095 +152 N 0.076 +153 T 0.065 +154 L 0.066 +155 A 0.075 +156 Q 0.082 +157 A 0.082 +158 E 0.080 +159 V 0.079 +160 R 0.084 +161 S 0.099 +162 R 0.128 +163 Q 0.169 +164 I 0.217 +165 S 0.273 +166 V 0.338 +167 S 0.414 +168 S 0.492 +169 P 0.563 +170 G 0.615 +171 S 0.641 +172 S 0.640 +173 T 0.617 +174 D 0.578 +175 I 0.525 +176 N 0.462 +177 V 0.393 +178 K 0.326 +179 K 0.278 +180 I 0.250 +181 A 0.222 +182 S 0.182 +183 I 0.143 +184 G 0.124 +185 D 0.119 +186 V 0.112 +187 C 0.103 +188 E 0.096 +189 S 0.093 +190 M 0.092 +191 K 0.093 +192 Q 0.092 +193 Q 0.086 +194 L 0.074 +195 L 0.064 +196 V 0.060 +197 L 0.062 +198 V 0.067 +199 E 0.069 +200 W 0.062 +201 A 0.055 +202 K 0.053 +203 Y 0.057 +204 I 0.060 +205 P 0.060 +206 A 0.058 +207 F 0.057 +208 C 0.059 +209 E 0.066 +210 L 0.073 +211 P 0.077 +212 L 0.074 +213 D 0.066 +214 D 0.056 +215 Q 0.048 +216 V 0.047 +217 A 0.052 +218 L 0.060 +219 L 0.064 +220 R 0.060 +221 A 0.050 +222 H 0.042 +223 A 0.037 +224 G 0.037 +225 E 0.037 +226 H 0.037 +227 L 0.038 +228 L 0.040 +229 L 0.040 +230 G 0.040 +231 A 0.042 +232 T 0.045 +233 K 0.046 +234 R 0.045 +235 S 0.045 +236 M 0.048 +237 M 0.056 +238 Y 0.065 +239 K 0.068 +240 D 0.066 +241 I 0.061 +242 L 0.057 +243 L 0.057 +244 L 0.067 +245 G 0.086 +246 N 0.104 +247 N 0.110 +248 Y 0.102 +249 V 0.089 +250 I 0.085 +251 H 0.097 +252 R 0.122 +253 N 0.145 +254 S 0.157 +255 C 0.155 +256 E 0.142 +257 V 0.122 +258 E 0.099 +259 I 0.079 +260 S 0.065 +261 R 0.060 +262 V 0.062 +263 A 0.067 +264 N 0.076 +265 R 0.088 +266 V 0.099 +267 L 0.107 +268 D 0.105 +269 E 0.093 +270 L 0.075 +271 V 0.062 +272 R 0.055 +273 P 0.053 +274 F 0.055 +275 Q 0.062 +276 E 0.072 +277 I 0.076 +278 Q 0.073 +279 I 0.066 +280 D 0.058 +281 D 0.053 +282 N 0.049 +283 E 0.048 +284 Y 0.048 +285 A 0.047 +286 C 0.049 +287 L 0.052 +288 K 0.055 +289 A 0.054 +290 I 0.051 +291 V 0.046 +292 F 0.043 +293 F 0.047 +294 D 0.062 +295 P 0.084 +296 D 0.103 +297 A 0.111 +298 K 0.107 +299 G 0.097 +300 L 0.089 +301 S 0.086 +302 D 0.086 +303 P 0.083 +304 V 0.077 +305 K 0.073 +306 I 0.077 +307 K 0.089 +308 N 0.100 +309 M 0.097 +310 R 0.082 +311 F 0.066 +312 Q 0.061 +313 V 0.064 +314 Q 0.067 +315 I 0.066 +316 G 0.063 +317 L 0.061 +318 E 0.061 +319 D 0.059 +320 Y 0.057 +321 I 0.058 +322 N 0.062 +323 D 0.068 +324 R 0.077 +325 Q 0.091 +326 Y 0.106 +327 D 0.120 +328 S 0.130 +329 R 0.128 +330 G 0.110 +331 R 0.086 +332 F 0.069 +333 G 0.065 +334 E 0.069 +335 L 0.076 +336 L 0.083 +337 L 0.091 +338 L 0.100 +339 L 0.104 +340 P 0.103 +341 T 0.103 +342 L 0.109 +343 Q 0.116 +344 S 0.120 +345 I 0.116 +346 T 0.104 +347 W 0.091 +348 Q 0.086 +349 M 0.091 +350 I 0.098 +351 E 0.096 +352 Q 0.085 +353 I 0.072 +354 Q 0.062 +355 F 0.057 +356 V 0.056 +357 K 0.056 +358 L 0.062 +359 F 0.077 +360 G 0.096 +361 M 0.106 +362 V 0.105 +363 K 0.099 +364 I 0.090 +365 D 0.078 +366 N 0.064 +367 L 0.054 +368 L 0.052 +369 Q 0.058 +370 E 0.070 +371 M 0.092 +372 L 0.141 +373 L 0.228 +374 G 0.348 +375 G 0.473 +376 A 0.570 +377 S 0.625 +378 N 0.646 +379 D 0.648 +380 G 0.643 +381 S 0.633 +382 H 0.621 +383 L 0.608 +384 H 0.599 +385 H 0.600 +386 P 0.614 +387 M 0.636 +388 H 0.668 +389 P 0.702 +390 H 0.721 +391 L 0.713 +392 S 0.685 +393 Q 0.657 +394 D 0.642 +395 P 0.638 +396 L 0.650 +397 T 0.678 +398 G 0.710 +399 Q 0.727 +400 T 0.727 +401 I 0.716 +402 L 0.702 +403 L 0.692 +404 G 0.694 +405 P 0.707 +406 M 0.723 +407 S 0.734 +408 T 0.741 +409 L 0.747 +410 V 0.753 +411 H 0.758 +412 A 0.763 +413 D 0.762 +414 Q 0.749 +415 I 0.728 +416 S 0.712 +417 T 0.708 +418 P 0.708 +419 E 0.704 +420 T 0.694 +421 P 0.683 +422 L 0.674 +423 P 0.668 +424 S 0.666 +425 P 0.672 +426 P 0.687 +427 Q 0.703 +428 G 0.705 +429 S 0.674 +430 G 0.604 +431 Q 0.512 +432 E 0.430 +433 Q 0.371 +434 Y 0.337 +435 K 0.331 +436 I 0.339 +437 A 0.330 +438 A 0.310 +439 N 0.310 +440 Q 0.335 +441 A 0.365 +442 S 0.391 +443 V 0.404 +444 I 0.386 +445 S 0.341 +446 H 0.304 +447 Q 0.315 +448 H 0.363 +449 L 0.409 +450 S 0.435 +451 K 0.455 +452 Q 0.472 +453 K 0.472 +454 Q 0.449 +455 L 0.421 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000164749.13_ENST00000396423.4_GN:HNF4G_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000164749.13_ENST00000396423.4_GN:HNF4G_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9e1cde7509f656d9af4bcb2e9fd883ec900a5d53 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000164749.13_ENST00000396423.4_GN:HNF4G_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid @@ -0,0 +1,462 @@ +>ENSG00000164749.13|ENST00000396423.4|GN:HNF4G|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:6 +1 M 0.304 +2 C 0.322 +3 V 0.354 +4 S 0.385 +5 K 0.404 +6 S 0.423 +7 M 0.464 +8 M 0.511 +9 R 0.537 +10 V 0.538 +11 S 0.537 +12 E 0.550 +13 P 0.566 +14 I 0.571 +15 L 0.565 +16 D 0.556 +17 M 0.542 +18 D 0.524 +19 M 0.512 +20 A 0.514 +21 N 0.520 +22 Y 0.526 +23 S 0.534 +24 E 0.529 +25 V 0.503 +26 L 0.473 +27 D 0.461 +28 P 0.460 +29 T 0.449 +30 Y 0.424 +31 T 0.394 +32 T 0.363 +33 L 0.329 +34 E 0.293 +35 F 0.256 +36 E 0.225 +37 T 0.209 +38 M 0.211 +39 Q 0.227 +40 I 0.258 +41 L 0.311 +42 Y 0.386 +43 N 0.468 +44 S 0.535 +45 S 0.579 +46 D 0.606 +47 S 0.621 +48 S 0.627 +49 A 0.635 +50 P 0.654 +51 E 0.680 +52 T 0.702 +53 S 0.713 +54 M 0.714 +55 N 0.710 +56 T 0.701 +57 T 0.694 +58 D 0.689 +59 N 0.673 +60 G 0.622 +61 V 0.520 +62 N 0.378 +63 C 0.236 +64 L 0.131 +65 C 0.072 +66 A 0.047 +67 I 0.045 +68 C 0.061 +69 G 0.088 +70 D 0.118 +71 R 0.145 +72 A 0.169 +73 T 0.190 +74 G 0.202 +75 K 0.193 +76 H 0.178 +77 Y 0.178 +78 G 0.186 +79 A 0.182 +80 S 0.165 +81 S 0.148 +82 C 0.131 +83 D 0.111 +84 G 0.096 +85 C 0.088 +86 K 0.080 +87 G 0.072 +88 F 0.069 +89 F 0.068 +90 R 0.066 +91 R 0.067 +92 S 0.072 +93 I 0.079 +94 R 0.085 +95 K 0.089 +96 S 0.090 +97 H 0.089 +98 V 0.083 +99 Y 0.076 +100 S 0.069 +101 C 0.065 +102 R 0.062 +103 F 0.059 +104 S 0.054 +105 R 0.050 +106 Q 0.052 +107 C 0.061 +108 V 0.073 +109 V 0.082 +110 D 0.085 +111 K 0.084 +112 D 0.087 +113 K 0.094 +114 R 0.102 +115 N 0.107 +116 Q 0.111 +117 C 0.107 +118 R 0.094 +119 Y 0.080 +120 C 0.074 +121 R 0.074 +122 L 0.072 +123 R 0.068 +124 K 0.063 +125 C 0.061 +126 F 0.062 +127 R 0.067 +128 A 0.073 +129 G 0.081 +130 M 0.091 +131 K 0.107 +132 K 0.132 +133 E 0.162 +134 A 0.187 +135 V 0.203 +136 Q 0.226 +137 N 0.273 +138 E 0.345 +139 R 0.426 +140 D 0.493 +141 R 0.536 +142 I 0.556 +143 S 0.560 +144 T 0.559 +145 R 0.558 +146 R 0.558 +147 S 0.557 +148 T 0.557 +149 F 0.553 +150 D 0.532 +151 G 0.477 +152 S 0.396 +153 N 0.309 +154 I 0.229 +155 P 0.165 +156 S 0.121 +157 I 0.094 +158 N 0.075 +159 T 0.065 +160 L 0.066 +161 A 0.074 +162 Q 0.082 +163 A 0.082 +164 E 0.079 +165 V 0.079 +166 R 0.083 +167 S 0.098 +168 R 0.127 +169 Q 0.168 +170 I 0.217 +171 S 0.272 +172 V 0.338 +173 S 0.414 +174 S 0.492 +175 P 0.563 +176 G 0.615 +177 S 0.640 +178 S 0.639 +179 T 0.616 +180 D 0.576 +181 I 0.523 +182 N 0.460 +183 V 0.392 +184 K 0.325 +185 K 0.277 +186 I 0.250 +187 A 0.222 +188 S 0.182 +189 I 0.143 +190 G 0.124 +191 D 0.119 +192 V 0.112 +193 C 0.103 +194 E 0.096 +195 S 0.093 +196 M 0.093 +197 K 0.093 +198 Q 0.093 +199 Q 0.086 +200 L 0.075 +201 L 0.064 +202 V 0.060 +203 L 0.063 +204 V 0.067 +205 E 0.069 +206 W 0.062 +207 A 0.054 +208 K 0.053 +209 Y 0.057 +210 I 0.060 +211 P 0.060 +212 A 0.058 +213 F 0.057 +214 C 0.059 +215 E 0.065 +216 L 0.072 +217 P 0.076 +218 L 0.074 +219 D 0.066 +220 D 0.056 +221 Q 0.048 +222 V 0.047 +223 A 0.052 +224 L 0.060 +225 L 0.064 +226 R 0.060 +227 A 0.050 +228 H 0.042 +229 A 0.037 +230 G 0.037 +231 E 0.037 +232 H 0.037 +233 L 0.038 +234 L 0.040 +235 L 0.040 +236 G 0.040 +237 A 0.042 +238 T 0.045 +239 K 0.046 +240 R 0.045 +241 S 0.045 +242 M 0.048 +243 M 0.056 +244 Y 0.065 +245 K 0.069 +246 D 0.066 +247 I 0.061 +248 L 0.057 +249 L 0.057 +250 L 0.067 +251 G 0.086 +252 N 0.104 +253 N 0.110 +254 Y 0.102 +255 V 0.090 +256 I 0.086 +257 H 0.098 +258 R 0.123 +259 N 0.146 +260 S 0.158 +261 C 0.156 +262 E 0.143 +263 V 0.122 +264 E 0.099 +265 I 0.079 +266 S 0.065 +267 R 0.060 +268 V 0.062 +269 A 0.067 +270 N 0.076 +271 R 0.088 +272 V 0.100 +273 L 0.107 +274 D 0.105 +275 E 0.092 +276 L 0.075 +277 V 0.061 +278 R 0.055 +279 P 0.053 +280 F 0.055 +281 Q 0.062 +282 E 0.072 +283 I 0.076 +284 Q 0.073 +285 I 0.066 +286 D 0.059 +287 D 0.053 +288 N 0.050 +289 E 0.049 +290 Y 0.048 +291 A 0.047 +292 C 0.049 +293 L 0.052 +294 K 0.055 +295 A 0.054 +296 I 0.051 +297 V 0.046 +298 F 0.043 +299 F 0.048 +300 D 0.063 +301 P 0.085 +302 D 0.105 +303 A 0.113 +304 K 0.108 +305 G 0.098 +306 L 0.090 +307 S 0.087 +308 D 0.087 +309 P 0.084 +310 V 0.077 +311 K 0.073 +312 I 0.078 +313 K 0.090 +314 N 0.100 +315 M 0.098 +316 R 0.083 +317 F 0.067 +318 Q 0.061 +319 V 0.064 +320 Q 0.068 +321 I 0.066 +322 G 0.063 +323 L 0.062 +324 E 0.061 +325 D 0.059 +326 Y 0.057 +327 I 0.058 +328 N 0.063 +329 D 0.069 +330 R 0.078 +331 Q 0.091 +332 Y 0.106 +333 D 0.120 +334 S 0.130 +335 R 0.128 +336 G 0.110 +337 R 0.086 +338 F 0.070 +339 G 0.066 +340 E 0.070 +341 L 0.076 +342 L 0.083 +343 L 0.092 +344 L 0.101 +345 L 0.105 +346 P 0.104 +347 T 0.105 +348 L 0.110 +349 Q 0.117 +350 S 0.121 +351 I 0.117 +352 T 0.105 +353 W 0.092 +354 Q 0.087 +355 M 0.092 +356 I 0.098 +357 E 0.096 +358 Q 0.085 +359 I 0.072 +360 Q 0.062 +361 F 0.057 +362 V 0.055 +363 K 0.056 +364 L 0.061 +365 F 0.077 +366 G 0.095 +367 M 0.104 +368 V 0.104 +369 K 0.097 +370 I 0.088 +371 D 0.076 +372 N 0.063 +373 L 0.053 +374 L 0.051 +375 Q 0.057 +376 E 0.069 +377 M 0.092 +378 L 0.140 +379 L 0.227 +380 G 0.346 +381 G 0.472 +382 A 0.569 +383 S 0.624 +384 N 0.645 +385 D 0.648 +386 G 0.642 +387 S 0.633 +388 H 0.621 +389 L 0.608 +390 H 0.599 +391 H 0.601 +392 P 0.614 +393 M 0.637 +394 H 0.669 +395 P 0.703 +396 H 0.722 +397 L 0.714 +398 S 0.687 +399 Q 0.660 +400 D 0.644 +401 P 0.641 +402 L 0.652 +403 T 0.681 +404 G 0.712 +405 Q 0.729 +406 T 0.728 +407 I 0.717 +408 L 0.703 +409 L 0.693 +410 G 0.695 +411 P 0.708 +412 M 0.723 +413 S 0.734 +414 T 0.741 +415 L 0.746 +416 V 0.750 +417 H 0.754 +418 A 0.757 +419 D 0.758 +420 Q 0.747 +421 I 0.728 +422 S 0.713 +423 T 0.709 +424 P 0.710 +425 E 0.706 +426 T 0.697 +427 P 0.686 +428 L 0.677 +429 P 0.670 +430 S 0.668 +431 P 0.675 +432 P 0.690 +433 Q 0.705 +434 G 0.707 +435 S 0.678 +436 G 0.611 +437 Q 0.522 +438 E 0.441 +439 Q 0.381 +440 Y 0.345 +441 K 0.339 +442 I 0.347 +443 A 0.339 +444 A 0.320 +445 N 0.321 +446 Q 0.346 +447 A 0.376 +448 S 0.402 +449 V 0.414 +450 I 0.394 +451 S 0.346 +452 H 0.308 +453 Q 0.318 +454 H 0.367 +455 L 0.414 +456 S 0.441 +457 K 0.460 +458 Q 0.477 +459 K 0.477 +460 Q 0.453 +461 L 0.425 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000165131.8_ENST00000409607.5_GN:LLCFC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000165131.8_ENST00000409607.5_GN:LLCFC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d90437e7b78b5ec6e5ee89cf0064df8d9d224ed3 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000165131.8_ENST00000409607.5_GN:LLCFC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,123 @@ +>ENSG00000165131.8|ENST00000409607.5|GN:LLCFC1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.437 +2 P 0.463 +3 P 0.497 +4 L 0.518 +5 A 0.504 +6 P 0.454 +7 Q 0.389 +8 L 0.334 +9 C 0.301 +10 R 0.285 +11 A 0.275 +12 V 0.260 +13 F 0.240 +14 L 0.224 +15 V 0.219 +16 P 0.217 +17 I 0.210 +18 L 0.203 +19 L 0.209 +20 L 0.236 +21 L 0.288 +22 Q 0.362 +23 V 0.452 +24 K 0.546 +25 P 0.632 +26 L 0.697 +27 N 0.733 +28 G 0.745 +29 S 0.743 +30 P 0.741 +31 G 0.750 +32 P 0.768 +33 K 0.790 +34 D 0.805 +35 G 0.809 +36 S 0.803 +37 Q 0.793 +38 T 0.783 +39 E 0.772 +40 K 0.759 +41 T 0.749 +42 P 0.749 +43 S 0.757 +44 A 0.766 +45 D 0.769 +46 Q 0.767 +47 N 0.762 +48 Q 0.758 +49 E 0.756 +50 Q 0.749 +51 F 0.733 +52 E 0.701 +53 E 0.655 +54 H 0.614 +55 F 0.590 +56 V 0.575 +57 A 0.568 +58 S 0.578 +59 S 0.588 +60 V 0.574 +61 G 0.546 +62 E 0.514 +63 M 0.466 +64 W 0.404 +65 Q 0.371 +66 V 0.393 +67 V 0.449 +68 D 0.496 +69 M 0.516 +70 A 0.515 +71 Q 0.517 +72 Q 0.534 +73 E 0.563 +74 E 0.585 +75 D 0.592 +76 Q 0.597 +77 S 0.614 +78 S 0.642 +79 K 0.667 +80 T 0.676 +81 A 0.668 +82 A 0.645 +83 V 0.608 +84 H 0.560 +85 K 0.508 +86 H 0.465 +87 S 0.433 +88 F 0.404 +89 H 0.365 +90 L 0.322 +91 S 0.292 +92 F 0.284 +93 C 0.306 +94 F 0.357 +95 S 0.408 +96 L 0.435 +97 A 0.443 +98 S 0.443 +99 V 0.429 +100 M 0.407 +101 V 0.398 +102 F 0.412 +103 S 0.440 +104 G 0.468 +105 G 0.491 +106 P 0.497 +107 L 0.469 +108 R 0.425 +109 R 0.400 +110 T 0.399 +111 F 0.405 +112 P 0.409 +113 N 0.396 +114 I 0.359 +115 Q 0.311 +116 L 0.280 +117 C 0.275 +118 F 0.284 +119 M 0.290 +120 L 0.288 +121 T 0.283 +122 H 0.279 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000165131.8_ENST00000409607.5_GN:LLCFC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:25.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000165131.8_ENST00000409607.5_GN:LLCFC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:25.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5a8acf13f94881314b3d7f5e536d9c37e05ec7d7 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000165131.8_ENST00000409607.5_GN:LLCFC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:25.caid @@ -0,0 +1,148 @@ +>ENSG00000165131.8|ENST00000409607.5|GN:LLCFC1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:25 +1 M 0.466 +2 G 0.509 +3 Q 0.572 +4 E 0.628 +5 V 0.664 +6 H 0.686 +7 G 0.702 +8 S 0.714 +9 C 0.728 +10 W 0.748 +11 A 0.772 +12 L 0.786 +13 G 0.789 +14 A 0.789 +15 G 0.792 +16 G 0.798 +17 G 0.802 +18 Q 0.799 +19 R 0.795 +20 Q 0.796 +21 W 0.801 +22 V 0.807 +23 G 0.806 +24 R 0.789 +25 S 0.760 +26 M 0.730 +27 P 0.712 +28 P 0.704 +29 L 0.691 +30 A 0.665 +31 P 0.634 +32 Q 0.613 +33 L 0.599 +34 C 0.574 +35 R 0.534 +36 A 0.483 +37 V 0.424 +38 F 0.367 +39 L 0.325 +40 V 0.304 +41 P 0.291 +42 I 0.274 +43 L 0.260 +44 L 0.260 +45 L 0.280 +46 L 0.324 +47 Q 0.392 +48 V 0.481 +49 K 0.577 +50 P 0.663 +51 L 0.726 +52 N 0.760 +53 G 0.769 +54 S 0.766 +55 P 0.765 +56 G 0.774 +57 P 0.793 +58 K 0.812 +59 D 0.826 +60 G 0.830 +61 S 0.825 +62 Q 0.816 +63 T 0.807 +64 E 0.796 +65 K 0.782 +66 T 0.771 +67 P 0.769 +68 S 0.775 +69 A 0.781 +70 D 0.783 +71 Q 0.779 +72 N 0.772 +73 Q 0.767 +74 E 0.762 +75 Q 0.752 +76 F 0.731 +77 E 0.691 +78 E 0.635 +79 H 0.584 +80 F 0.554 +81 V 0.535 +82 A 0.527 +83 S 0.538 +84 S 0.548 +85 V 0.533 +86 G 0.503 +87 E 0.474 +88 M 0.442 +89 W 0.410 +90 Q 0.398 +91 V 0.409 +92 V 0.432 +93 D 0.453 +94 M 0.464 +95 A 0.464 +96 Q 0.467 +97 Q 0.484 +98 E 0.512 +99 E 0.530 +100 D 0.530 +101 Q 0.531 +102 S 0.550 +103 S 0.584 +104 K 0.618 +105 T 0.635 +106 A 0.629 +107 A 0.604 +108 V 0.560 +109 H 0.505 +110 K 0.451 +111 H 0.409 +112 S 0.378 +113 F 0.349 +114 H 0.315 +115 L 0.282 +116 S 0.261 +117 F 0.259 +118 C 0.276 +119 F 0.315 +120 S 0.359 +121 L 0.391 +122 A 0.412 +123 S 0.427 +124 V 0.427 +125 M 0.420 +126 V 0.424 +127 F 0.447 +128 S 0.475 +129 G 0.501 +130 G 0.522 +131 P 0.524 +132 L 0.493 +133 R 0.447 +134 R 0.422 +135 T 0.420 +136 F 0.424 +137 P 0.427 +138 N 0.416 +139 I 0.383 +140 Q 0.342 +141 L 0.317 +142 C 0.319 +143 F 0.336 +144 M 0.350 +145 L 0.348 +146 T 0.334 +147 H 0.321 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000166148.4_ENST00000299178.4_GN:AVPR1A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000166148.4_ENST00000299178.4_GN:AVPR1A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9dbeec9dcc98f7f2d3063d40b321fcba6517c8e9 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000166148.4_ENST00000299178.4_GN:AVPR1A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,419 @@ +>ENSG00000166148.4|ENST00000299178.4|GN:AVPR1A|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.265 +2 R 0.279 +3 L 0.309 +4 S 0.357 +5 A 0.419 +6 G 0.485 +7 P 0.543 +8 D 0.581 +9 A 0.595 +10 G 0.596 +11 P 0.600 +12 S 0.606 +13 G 0.596 +14 N 0.559 +15 S 0.505 +16 S 0.453 +17 P 0.410 +18 W 0.380 +19 W 0.370 +20 P 0.375 +21 L 0.395 +22 A 0.440 +23 T 0.510 +24 G 0.580 +25 A 0.625 +26 G 0.639 +27 N 0.619 +28 T 0.564 +29 S 0.486 +30 R 0.431 +31 E 0.429 +32 A 0.471 +33 E 0.529 +34 A 0.589 +35 L 0.637 +36 G 0.663 +37 E 0.664 +38 G 0.639 +39 N 0.592 +40 G 0.542 +41 P 0.503 +42 P 0.476 +43 R 0.447 +44 D 0.404 +45 V 0.345 +46 R 0.277 +47 N 0.216 +48 E 0.175 +49 E 0.153 +50 L 0.135 +51 A 0.111 +52 K 0.084 +53 L 0.064 +54 E 0.053 +55 I 0.047 +56 A 0.042 +57 V 0.039 +58 L 0.038 +59 A 0.039 +60 V 0.041 +61 T 0.041 +62 F 0.039 +63 A 0.035 +64 V 0.033 +65 A 0.031 +66 V 0.031 +67 L 0.034 +68 G 0.039 +69 N 0.044 +70 S 0.049 +71 S 0.052 +72 V 0.050 +73 L 0.044 +74 L 0.041 +75 A 0.044 +76 L 0.052 +77 H 0.064 +78 R 0.082 +79 T 0.106 +80 P 0.128 +81 R 0.138 +82 K 0.132 +83 T 0.115 +84 S 0.093 +85 R 0.073 +86 M 0.055 +87 H 0.041 +88 L 0.032 +89 F 0.029 +90 I 0.030 +91 R 0.033 +92 H 0.037 +93 L 0.040 +94 S 0.043 +95 L 0.044 +96 A 0.044 +97 D 0.044 +98 L 0.041 +99 A 0.035 +100 V 0.029 +101 A 0.027 +102 F 0.028 +103 F 0.030 +104 Q 0.033 +105 V 0.035 +106 L 0.035 +107 P 0.033 +108 Q 0.030 +109 M 0.029 +110 C 0.028 +111 W 0.030 +112 D 0.032 +113 I 0.037 +114 T 0.043 +115 Y 0.049 +116 R 0.056 +117 F 0.062 +118 R 0.069 +119 G 0.073 +120 P 0.068 +121 D 0.055 +122 W 0.040 +123 L 0.029 +124 C 0.024 +125 R 0.023 +126 V 0.026 +127 V 0.029 +128 K 0.031 +129 H 0.030 +130 L 0.027 +131 Q 0.027 +132 V 0.031 +133 F 0.034 +134 G 0.036 +135 M 0.036 +136 F 0.036 +137 A 0.035 +138 S 0.034 +139 A 0.033 +140 Y 0.031 +141 M 0.029 +142 L 0.028 +143 V 0.028 +144 V 0.028 +145 M 0.030 +146 T 0.033 +147 A 0.037 +148 D 0.039 +149 R 0.039 +150 Y 0.038 +151 I 0.039 +152 A 0.045 +153 V 0.057 +154 C 0.074 +155 H 0.094 +156 P 0.110 +157 L 0.124 +158 K 0.143 +159 T 0.166 +160 L 0.182 +161 Q 0.184 +162 Q 0.167 +163 P 0.135 +164 A 0.099 +165 R 0.071 +166 R 0.057 +167 S 0.057 +168 R 0.065 +169 L 0.070 +170 M 0.065 +171 I 0.055 +172 A 0.049 +173 A 0.048 +174 A 0.051 +175 W 0.051 +176 V 0.051 +177 L 0.053 +178 S 0.056 +179 F 0.060 +180 V 0.065 +181 L 0.074 +182 S 0.079 +183 T 0.076 +184 P 0.066 +185 Q 0.057 +186 Y 0.051 +187 F 0.048 +188 V 0.047 +189 F 0.045 +190 S 0.047 +191 M 0.054 +192 I 0.067 +193 E 0.085 +194 V 0.107 +195 N 0.130 +196 N 0.144 +197 V 0.142 +198 T 0.130 +199 K 0.118 +200 A 0.107 +201 R 0.090 +202 D 0.073 +203 C 0.064 +204 W 0.067 +205 A 0.077 +206 T 0.088 +207 F 0.095 +208 I 0.095 +209 Q 0.086 +210 P 0.075 +211 W 0.069 +212 G 0.067 +213 S 0.065 +214 R 0.060 +215 A 0.055 +216 Y 0.053 +217 V 0.055 +218 T 0.058 +219 W 0.060 +220 M 0.061 +221 T 0.058 +222 G 0.055 +223 G 0.052 +224 I 0.048 +225 F 0.045 +226 V 0.048 +227 A 0.054 +228 P 0.055 +229 V 0.049 +230 V 0.045 +231 I 0.047 +232 L 0.051 +233 G 0.051 +234 T 0.045 +235 C 0.038 +236 Y 0.033 +237 G 0.032 +238 F 0.034 +239 I 0.035 +240 C 0.036 +241 Y 0.038 +242 N 0.042 +243 I 0.047 +244 W 0.056 +245 C 0.078 +246 N 0.110 +247 V 0.147 +248 R 0.193 +249 G 0.253 +250 K 0.316 +251 T 0.366 +252 A 0.398 +253 S 0.419 +254 R 0.438 +255 Q 0.452 +256 S 0.462 +257 K 0.480 +258 G 0.502 +259 A 0.498 +260 E 0.470 +261 Q 0.458 +262 A 0.491 +263 G 0.538 +264 V 0.559 +265 A 0.555 +266 F 0.551 +267 Q 0.564 +268 K 0.589 +269 G 0.610 +270 F 0.620 +271 L 0.628 +272 L 0.636 +273 A 0.645 +274 P 0.650 +275 C 0.649 +276 V 0.642 +277 S 0.626 +278 S 0.598 +279 V 0.555 +280 K 0.499 +281 S 0.426 +282 I 0.339 +283 S 0.256 +284 R 0.191 +285 A 0.147 +286 K 0.121 +287 I 0.105 +288 R 0.089 +289 T 0.075 +290 V 0.066 +291 K 0.061 +292 M 0.057 +293 T 0.050 +294 F 0.045 +295 V 0.044 +296 I 0.048 +297 V 0.051 +298 T 0.051 +299 A 0.048 +300 Y 0.041 +301 I 0.034 +302 V 0.029 +303 C 0.027 +304 W 0.029 +305 A 0.031 +306 P 0.031 +307 F 0.029 +308 F 0.027 +309 I 0.028 +310 I 0.031 +311 Q 0.033 +312 M 0.035 +313 W 0.035 +314 S 0.037 +315 V 0.047 +316 W 0.065 +317 D 0.084 +318 P 0.095 +319 M 0.103 +320 S 0.117 +321 V 0.133 +322 W 0.149 +323 T 0.170 +324 E 0.196 +325 S 0.209 +326 E 0.194 +327 N 0.155 +328 P 0.114 +329 T 0.083 +330 I 0.064 +331 T 0.056 +332 I 0.055 +333 T 0.056 +334 A 0.057 +335 L 0.061 +336 L 0.067 +337 G 0.073 +338 S 0.080 +339 L 0.086 +340 N 0.088 +341 S 0.083 +342 C 0.074 +343 C 0.068 +344 N 0.063 +345 P 0.058 +346 W 0.052 +347 I 0.047 +348 Y 0.042 +349 M 0.041 +350 F 0.047 +351 F 0.062 +352 S 0.080 +353 G 0.094 +354 H 0.103 +355 L 0.107 +356 L 0.111 +357 Q 0.122 +358 D 0.140 +359 C 0.155 +360 V 0.162 +361 Q 0.165 +362 S 0.172 +363 F 0.177 +364 P 0.176 +365 C 0.175 +366 C 0.185 +367 Q 0.210 +368 N 0.239 +369 M 0.253 +370 K 0.250 +371 E 0.248 +372 K 0.260 +373 F 0.277 +374 N 0.289 +375 K 0.301 +376 E 0.320 +377 D 0.336 +378 T 0.341 +379 D 0.337 +380 S 0.320 +381 M 0.290 +382 S 0.265 +383 R 0.265 +384 R 0.286 +385 Q 0.308 +386 T 0.337 +387 F 0.381 +388 Y 0.433 +389 S 0.482 +390 N 0.525 +391 N 0.554 +392 R 0.575 +393 S 0.604 +394 P 0.647 +395 T 0.691 +396 N 0.719 +397 S 0.728 +398 T 0.728 +399 G 0.726 +400 M 0.722 +401 W 0.717 +402 K 0.711 +403 D 0.705 +404 S 0.702 +405 P 0.706 +406 K 0.719 +407 S 0.729 +408 S 0.728 +409 K 0.713 +410 S 0.691 +411 I 0.666 +412 K 0.644 +413 F 0.634 +414 I 0.639 +415 P 0.643 +416 V 0.620 +417 S 0.563 +418 T 0.511 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000166148.4_ENST00000299178.4_GN:AVPR1A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000166148.4_ENST00000299178.4_GN:AVPR1A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4d9555fc0321d103c7ef83ec31c43404db7261b1 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000166148.4_ENST00000299178.4_GN:AVPR1A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid @@ -0,0 +1,422 @@ +>ENSG00000166148.4|ENST00000299178.4|GN:AVPR1A|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 +1 M 0.316 +2 D 0.328 +3 S 0.347 +4 M 0.364 +5 R 0.367 +6 L 0.359 +7 S 0.373 +8 A 0.432 +9 G 0.510 +10 P 0.573 +11 D 0.608 +12 A 0.621 +13 G 0.623 +14 P 0.625 +15 S 0.628 +16 G 0.615 +17 N 0.572 +18 S 0.513 +19 S 0.458 +20 P 0.416 +21 W 0.388 +22 W 0.379 +23 P 0.383 +24 L 0.397 +25 A 0.436 +26 T 0.506 +27 G 0.582 +28 A 0.635 +29 G 0.654 +30 N 0.638 +31 T 0.585 +32 S 0.510 +33 R 0.456 +34 E 0.461 +35 A 0.508 +36 E 0.566 +37 A 0.618 +38 L 0.656 +39 G 0.675 +40 E 0.671 +41 G 0.643 +42 N 0.595 +43 G 0.544 +44 P 0.507 +45 P 0.482 +46 R 0.456 +47 D 0.415 +48 V 0.356 +49 R 0.286 +50 N 0.222 +51 E 0.179 +52 E 0.154 +53 L 0.135 +54 A 0.111 +55 K 0.083 +56 L 0.063 +57 E 0.052 +58 I 0.046 +59 A 0.041 +60 V 0.038 +61 L 0.038 +62 A 0.039 +63 V 0.041 +64 T 0.041 +65 F 0.038 +66 A 0.034 +67 V 0.032 +68 A 0.031 +69 V 0.031 +70 L 0.034 +71 G 0.038 +72 N 0.043 +73 S 0.048 +74 S 0.051 +75 V 0.049 +76 L 0.044 +77 L 0.041 +78 A 0.043 +79 L 0.051 +80 H 0.063 +81 R 0.081 +82 T 0.105 +83 P 0.127 +84 R 0.136 +85 K 0.131 +86 T 0.114 +87 S 0.092 +88 R 0.072 +89 M 0.054 +90 H 0.040 +91 L 0.032 +92 F 0.029 +93 I 0.030 +94 R 0.033 +95 H 0.037 +96 L 0.040 +97 S 0.043 +98 L 0.044 +99 A 0.044 +100 D 0.044 +101 L 0.040 +102 A 0.034 +103 V 0.029 +104 A 0.027 +105 F 0.028 +106 F 0.030 +107 Q 0.033 +108 V 0.035 +109 L 0.035 +110 P 0.033 +111 Q 0.030 +112 M 0.029 +113 C 0.029 +114 W 0.030 +115 D 0.032 +116 I 0.036 +117 T 0.043 +118 Y 0.050 +119 R 0.056 +120 F 0.062 +121 R 0.069 +122 G 0.073 +123 P 0.069 +124 D 0.056 +125 W 0.040 +126 L 0.029 +127 C 0.024 +128 R 0.023 +129 V 0.026 +130 V 0.030 +131 K 0.031 +132 H 0.030 +133 L 0.027 +134 Q 0.027 +135 V 0.031 +136 F 0.034 +137 G 0.036 +138 M 0.036 +139 F 0.036 +140 A 0.035 +141 S 0.034 +142 A 0.032 +143 Y 0.030 +144 M 0.029 +145 L 0.028 +146 V 0.027 +147 V 0.027 +148 M 0.029 +149 T 0.033 +150 A 0.037 +151 D 0.039 +152 R 0.039 +153 Y 0.038 +154 I 0.039 +155 A 0.045 +156 V 0.057 +157 C 0.074 +158 H 0.094 +159 P 0.110 +160 L 0.124 +161 K 0.143 +162 T 0.165 +163 L 0.182 +164 Q 0.184 +165 Q 0.167 +166 P 0.135 +167 A 0.098 +168 R 0.070 +169 R 0.057 +170 S 0.057 +171 R 0.065 +172 L 0.070 +173 M 0.065 +174 I 0.055 +175 A 0.048 +176 A 0.048 +177 A 0.051 +178 W 0.051 +179 V 0.051 +180 L 0.052 +181 S 0.056 +182 F 0.060 +183 V 0.065 +184 L 0.074 +185 S 0.079 +186 T 0.076 +187 P 0.066 +188 Q 0.057 +189 Y 0.051 +190 F 0.048 +191 V 0.046 +192 F 0.045 +193 S 0.047 +194 M 0.054 +195 I 0.067 +196 E 0.085 +197 V 0.107 +198 N 0.129 +199 N 0.143 +200 V 0.141 +201 T 0.129 +202 K 0.118 +203 A 0.107 +204 R 0.090 +205 D 0.073 +206 C 0.064 +207 W 0.067 +208 A 0.076 +209 T 0.087 +210 F 0.095 +211 I 0.095 +212 Q 0.086 +213 P 0.075 +214 W 0.068 +215 G 0.067 +216 S 0.064 +217 R 0.059 +218 A 0.054 +219 Y 0.053 +220 V 0.055 +221 T 0.057 +222 W 0.060 +223 M 0.061 +224 T 0.058 +225 G 0.055 +226 G 0.051 +227 I 0.048 +228 F 0.045 +229 V 0.048 +230 A 0.053 +231 P 0.054 +232 V 0.049 +233 V 0.045 +234 I 0.047 +235 L 0.051 +236 G 0.050 +237 T 0.045 +238 C 0.038 +239 Y 0.033 +240 G 0.032 +241 F 0.034 +242 I 0.035 +243 C 0.035 +244 Y 0.037 +245 N 0.041 +246 I 0.046 +247 W 0.056 +248 C 0.078 +249 N 0.109 +250 V 0.146 +251 R 0.193 +252 G 0.252 +253 K 0.316 +254 T 0.367 +255 A 0.398 +256 S 0.419 +257 R 0.438 +258 Q 0.452 +259 S 0.462 +260 K 0.481 +261 G 0.502 +262 A 0.498 +263 E 0.469 +264 Q 0.458 +265 A 0.490 +266 G 0.538 +267 V 0.559 +268 A 0.554 +269 F 0.550 +270 Q 0.563 +271 K 0.588 +272 G 0.609 +273 F 0.619 +274 L 0.627 +275 L 0.636 +276 A 0.645 +277 P 0.650 +278 C 0.649 +279 V 0.642 +280 S 0.626 +281 S 0.599 +282 V 0.556 +283 K 0.500 +284 S 0.426 +285 I 0.340 +286 S 0.256 +287 R 0.191 +288 A 0.147 +289 K 0.121 +290 I 0.105 +291 R 0.090 +292 T 0.075 +293 V 0.066 +294 K 0.061 +295 M 0.056 +296 T 0.050 +297 F 0.045 +298 V 0.044 +299 I 0.048 +300 V 0.051 +301 T 0.051 +302 A 0.048 +303 Y 0.041 +304 I 0.034 +305 V 0.029 +306 C 0.027 +307 W 0.029 +308 A 0.031 +309 P 0.031 +310 F 0.029 +311 F 0.027 +312 I 0.028 +313 I 0.031 +314 Q 0.034 +315 M 0.035 +316 W 0.035 +317 S 0.037 +318 V 0.047 +319 W 0.066 +320 D 0.085 +321 P 0.096 +322 M 0.104 +323 S 0.118 +324 V 0.134 +325 W 0.150 +326 T 0.170 +327 E 0.196 +328 S 0.209 +329 E 0.194 +330 N 0.156 +331 P 0.114 +332 T 0.083 +333 I 0.064 +334 T 0.056 +335 I 0.055 +336 T 0.056 +337 A 0.058 +338 L 0.061 +339 L 0.067 +340 G 0.073 +341 S 0.080 +342 L 0.086 +343 N 0.088 +344 S 0.083 +345 C 0.074 +346 C 0.068 +347 N 0.063 +348 P 0.058 +349 W 0.052 +350 I 0.047 +351 Y 0.042 +352 M 0.041 +353 F 0.047 +354 F 0.062 +355 S 0.079 +356 G 0.093 +357 H 0.103 +358 L 0.106 +359 L 0.110 +360 Q 0.121 +361 D 0.139 +362 C 0.154 +363 V 0.161 +364 Q 0.165 +365 S 0.171 +366 F 0.176 +367 P 0.175 +368 C 0.174 +369 C 0.184 +370 Q 0.209 +371 N 0.238 +372 M 0.252 +373 K 0.250 +374 E 0.248 +375 K 0.259 +376 F 0.277 +377 N 0.289 +378 K 0.300 +379 E 0.319 +380 D 0.336 +381 T 0.341 +382 D 0.337 +383 S 0.322 +384 M 0.297 +385 S 0.278 +386 R 0.281 +387 R 0.298 +388 Q 0.314 +389 T 0.338 +390 F 0.381 +391 Y 0.432 +392 S 0.482 +393 N 0.524 +394 N 0.553 +395 R 0.575 +396 S 0.604 +397 P 0.647 +398 T 0.691 +399 N 0.719 +400 S 0.729 +401 T 0.729 +402 G 0.726 +403 M 0.722 +404 W 0.717 +405 K 0.712 +406 D 0.706 +407 S 0.703 +408 P 0.707 +409 K 0.720 +410 S 0.730 +411 S 0.729 +412 K 0.715 +413 S 0.694 +414 I 0.669 +415 K 0.647 +416 F 0.636 +417 I 0.641 +418 P 0.645 +419 V 0.621 +420 S 0.564 +421 T 0.512 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000168124.4_ENST00000304646.3_GN:OR1F1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000168124.4_ENST00000304646.3_GN:OR1F1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a38c7747950604a222c566ffe9640e646d441c18 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000168124.4_ENST00000304646.3_GN:OR1F1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,313 @@ +>ENSG00000168124.4|ENST00000304646.3|GN:OR1F1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.456 +2 S 0.472 +3 G 0.498 +4 T 0.521 +5 N 0.526 +6 Q 0.499 +7 S 0.437 +8 S 0.354 +9 V 0.270 +10 S 0.202 +11 E 0.158 +12 F 0.136 +13 L 0.128 +14 L 0.128 +15 L 0.136 +16 G 0.151 +17 L 0.168 +18 S 0.185 +19 R 0.196 +20 Q 0.191 +21 P 0.170 +22 Q 0.140 +23 Q 0.108 +24 Q 0.081 +25 H 0.061 +26 L 0.053 +27 L 0.057 +28 F 0.067 +29 V 0.068 +30 F 0.057 +31 F 0.045 +32 L 0.041 +33 S 0.044 +34 M 0.048 +35 Y 0.050 +36 L 0.051 +37 A 0.054 +38 T 0.057 +39 V 0.057 +40 L 0.059 +41 G 0.064 +42 N 0.070 +43 L 0.072 +44 L 0.073 +45 I 0.071 +46 I 0.064 +47 L 0.058 +48 S 0.059 +49 V 0.067 +50 S 0.076 +51 I 0.083 +52 D 0.084 +53 S 0.079 +54 C 0.074 +55 L 0.070 +56 H 0.065 +57 T 0.056 +58 P 0.045 +59 M 0.035 +60 Y 0.029 +61 F 0.026 +62 F 0.029 +63 L 0.038 +64 S 0.050 +65 N 0.061 +66 L 0.065 +67 S 0.063 +68 F 0.058 +69 V 0.056 +70 D 0.060 +71 I 0.065 +72 C 0.065 +73 F 0.060 +74 S 0.056 +75 F 0.056 +76 T 0.060 +77 T 0.065 +78 V 0.069 +79 P 0.069 +80 K 0.067 +81 M 0.065 +82 L 0.064 +83 A 0.062 +84 N 0.060 +85 H 0.062 +86 I 0.071 +87 L 0.083 +88 E 0.089 +89 T 0.083 +90 Q 0.072 +91 T 0.060 +92 I 0.051 +93 S 0.044 +94 F 0.037 +95 C 0.035 +96 G 0.035 +97 C 0.036 +98 L 0.036 +99 T 0.038 +100 Q 0.040 +101 M 0.041 +102 Y 0.041 +103 F 0.038 +104 V 0.035 +105 F 0.032 +106 M 0.032 +107 F 0.034 +108 V 0.040 +109 D 0.048 +110 M 0.053 +111 D 0.054 +112 N 0.050 +113 F 0.044 +114 L 0.039 +115 L 0.035 +116 A 0.033 +117 V 0.032 +118 M 0.032 +119 A 0.034 +120 Y 0.037 +121 D 0.039 +122 H 0.040 +123 F 0.038 +124 V 0.038 +125 A 0.040 +126 V 0.045 +127 C 0.052 +128 H 0.059 +129 P 0.063 +130 L 0.063 +131 H 0.062 +132 Y 0.062 +133 T 0.064 +134 A 0.067 +135 K 0.072 +136 M 0.076 +137 T 0.077 +138 H 0.075 +139 Q 0.070 +140 L 0.061 +141 C 0.058 +142 A 0.065 +143 L 0.075 +144 L 0.080 +145 V 0.081 +146 A 0.081 +147 G 0.075 +148 L 0.066 +149 W 0.058 +150 V 0.058 +151 V 0.066 +152 A 0.076 +153 N 0.080 +154 L 0.081 +155 N 0.082 +156 V 0.082 +157 L 0.079 +158 L 0.079 +159 H 0.081 +160 T 0.083 +161 L 0.086 +162 L 0.097 +163 M 0.111 +164 A 0.119 +165 P 0.119 +166 L 0.115 +167 S 0.109 +168 F 0.108 +169 C 0.116 +170 A 0.129 +171 D 0.143 +172 N 0.154 +173 A 0.163 +174 I 0.162 +175 T 0.145 +176 H 0.117 +177 F 0.091 +178 F 0.074 +179 C 0.070 +180 D 0.079 +181 V 0.099 +182 T 0.122 +183 P 0.137 +184 L 0.143 +185 L 0.143 +186 K 0.141 +187 L 0.135 +188 S 0.126 +189 C 0.123 +190 S 0.132 +191 D 0.145 +192 T 0.148 +193 H 0.141 +194 L 0.137 +195 N 0.141 +196 E 0.147 +197 V 0.147 +198 I 0.143 +199 I 0.136 +200 L 0.127 +201 S 0.120 +202 E 0.115 +203 G 0.106 +204 A 0.088 +205 L 0.072 +206 V 0.065 +207 M 0.065 +208 I 0.070 +209 T 0.077 +210 P 0.077 +211 F 0.070 +212 L 0.066 +213 C 0.071 +214 I 0.074 +215 L 0.070 +216 A 0.061 +217 S 0.053 +218 Y 0.049 +219 M 0.049 +220 H 0.055 +221 I 0.067 +222 T 0.079 +223 C 0.089 +224 T 0.092 +225 V 0.093 +226 L 0.102 +227 K 0.124 +228 V 0.149 +229 P 0.164 +230 S 0.162 +231 T 0.147 +232 K 0.126 +233 G 0.104 +234 R 0.085 +235 W 0.075 +236 K 0.076 +237 A 0.079 +238 F 0.081 +239 S 0.084 +240 T 0.087 +241 C 0.090 +242 G 0.090 +243 S 0.086 +244 H 0.078 +245 L 0.070 +246 A 0.065 +247 V 0.063 +248 V 0.055 +249 L 0.043 +250 L 0.032 +251 F 0.027 +252 Y 0.028 +253 S 0.031 +254 T 0.034 +255 I 0.035 +256 I 0.035 +257 A 0.039 +258 V 0.052 +259 Y 0.077 +260 F 0.117 +261 N 0.167 +262 P 0.215 +263 L 0.253 +264 S 0.278 +265 S 0.286 +266 H 0.273 +267 S 0.244 +268 A 0.209 +269 E 0.183 +270 K 0.168 +271 D 0.156 +272 T 0.141 +273 M 0.125 +274 A 0.111 +275 T 0.098 +276 V 0.089 +277 L 0.093 +278 Y 0.105 +279 T 0.118 +280 V 0.126 +281 V 0.131 +282 T 0.130 +283 P 0.120 +284 M 0.104 +285 L 0.093 +286 N 0.084 +287 P 0.075 +288 F 0.070 +289 I 0.070 +290 Y 0.074 +291 S 0.083 +292 L 0.100 +293 R 0.113 +294 N 0.109 +295 R 0.091 +296 Y 0.073 +297 L 0.064 +298 K 0.062 +299 G 0.066 +300 A 0.072 +301 L 0.082 +302 K 0.093 +303 K 0.102 +304 V 0.110 +305 V 0.123 +306 G 0.147 +307 R 0.178 +308 V 0.212 +309 V 0.244 +310 F 0.267 +311 S 0.278 +312 V 0.281 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000168124.4_ENST00000304646.3_GN:OR1F1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000168124.4_ENST00000304646.3_GN:OR1F1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7850bf60f241438248a2e6f2a49b417d92385a54 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000168124.4_ENST00000304646.3_GN:OR1F1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid @@ -0,0 +1,323 @@ +>ENSG00000168124.4|ENST00000304646.3|GN:OR1F1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:10 +1 M 0.409 +2 G 0.426 +3 D 0.447 +4 R 0.452 +5 R 0.437 +6 A 0.429 +7 D 0.456 +8 P 0.501 +9 R 0.535 +10 P 0.554 +11 M 0.570 +12 S 0.584 +13 G 0.591 +14 T 0.584 +15 N 0.563 +16 Q 0.520 +17 S 0.452 +18 S 0.366 +19 V 0.281 +20 S 0.211 +21 E 0.165 +22 F 0.141 +23 L 0.131 +24 L 0.129 +25 L 0.136 +26 G 0.151 +27 L 0.170 +28 S 0.188 +29 R 0.198 +30 Q 0.193 +31 P 0.172 +32 Q 0.142 +33 Q 0.110 +34 Q 0.082 +35 H 0.061 +36 L 0.050 +37 L 0.048 +38 F 0.049 +39 V 0.045 +40 F 0.039 +41 F 0.036 +42 L 0.039 +43 S 0.044 +44 M 0.049 +45 Y 0.050 +46 L 0.051 +47 A 0.055 +48 T 0.058 +49 V 0.058 +50 L 0.060 +51 G 0.066 +52 N 0.072 +53 L 0.075 +54 L 0.076 +55 I 0.074 +56 I 0.067 +57 L 0.060 +58 S 0.060 +59 V 0.067 +60 S 0.077 +61 I 0.084 +62 D 0.085 +63 S 0.081 +64 C 0.076 +65 L 0.071 +66 H 0.066 +67 T 0.057 +68 P 0.046 +69 M 0.035 +70 Y 0.029 +71 F 0.026 +72 F 0.029 +73 L 0.038 +74 S 0.051 +75 N 0.062 +76 L 0.066 +77 S 0.064 +78 F 0.059 +79 V 0.056 +80 D 0.059 +81 I 0.064 +82 C 0.064 +83 F 0.060 +84 S 0.056 +85 F 0.056 +86 T 0.060 +87 T 0.064 +88 V 0.068 +89 P 0.068 +90 K 0.066 +91 M 0.064 +92 L 0.063 +93 A 0.060 +94 N 0.058 +95 H 0.060 +96 I 0.069 +97 L 0.082 +98 E 0.088 +99 T 0.083 +100 Q 0.071 +101 T 0.059 +102 I 0.051 +103 S 0.043 +104 F 0.037 +105 C 0.035 +106 G 0.036 +107 C 0.036 +108 L 0.036 +109 T 0.037 +110 Q 0.039 +111 M 0.040 +112 Y 0.040 +113 F 0.038 +114 V 0.035 +115 F 0.033 +116 M 0.032 +117 F 0.035 +118 V 0.041 +119 D 0.048 +120 M 0.054 +121 D 0.054 +122 N 0.051 +123 F 0.045 +124 L 0.040 +125 L 0.036 +126 A 0.034 +127 V 0.033 +128 M 0.033 +129 A 0.035 +130 Y 0.038 +131 D 0.041 +132 H 0.041 +133 F 0.040 +134 V 0.039 +135 A 0.042 +136 V 0.046 +137 C 0.054 +138 H 0.061 +139 P 0.065 +140 L 0.065 +141 H 0.064 +142 Y 0.065 +143 T 0.066 +144 A 0.070 +145 K 0.075 +146 M 0.080 +147 T 0.080 +148 H 0.078 +149 Q 0.071 +150 L 0.062 +151 C 0.058 +152 A 0.065 +153 L 0.075 +154 L 0.080 +155 V 0.081 +156 A 0.081 +157 G 0.075 +158 L 0.066 +159 W 0.058 +160 V 0.057 +161 V 0.066 +162 A 0.077 +163 N 0.082 +164 L 0.083 +165 N 0.084 +166 V 0.083 +167 L 0.080 +168 L 0.080 +169 H 0.082 +170 T 0.084 +171 L 0.087 +172 L 0.098 +173 M 0.112 +174 A 0.120 +175 P 0.121 +176 L 0.116 +177 S 0.111 +178 F 0.110 +179 C 0.117 +180 A 0.130 +181 D 0.143 +182 N 0.154 +183 A 0.164 +184 I 0.163 +185 T 0.146 +186 H 0.117 +187 F 0.091 +188 F 0.075 +189 C 0.071 +190 D 0.080 +191 V 0.100 +192 T 0.123 +193 P 0.138 +194 L 0.144 +195 L 0.144 +196 K 0.142 +197 L 0.136 +198 S 0.126 +199 C 0.122 +200 S 0.131 +201 D 0.144 +202 T 0.148 +203 H 0.141 +204 L 0.137 +205 N 0.141 +206 E 0.145 +207 V 0.146 +208 I 0.142 +209 I 0.136 +210 L 0.128 +211 S 0.121 +212 E 0.117 +213 G 0.107 +214 A 0.089 +215 L 0.073 +216 V 0.065 +217 M 0.065 +218 I 0.071 +219 T 0.077 +220 P 0.078 +221 F 0.071 +222 L 0.067 +223 C 0.072 +224 I 0.076 +225 L 0.071 +226 A 0.062 +227 S 0.055 +228 Y 0.050 +229 M 0.050 +230 H 0.056 +231 I 0.068 +232 T 0.080 +233 C 0.089 +234 T 0.092 +235 V 0.094 +236 L 0.103 +237 K 0.125 +238 V 0.151 +239 P 0.166 +240 S 0.164 +241 T 0.150 +242 K 0.128 +243 G 0.106 +244 R 0.087 +245 W 0.078 +246 K 0.079 +247 A 0.082 +248 F 0.084 +249 S 0.087 +250 T 0.091 +251 C 0.094 +252 G 0.095 +253 S 0.091 +254 H 0.082 +255 L 0.072 +256 A 0.067 +257 V 0.065 +258 V 0.057 +259 L 0.044 +260 L 0.033 +261 F 0.028 +262 Y 0.028 +263 S 0.031 +264 T 0.034 +265 I 0.035 +266 I 0.035 +267 A 0.040 +268 V 0.053 +269 Y 0.078 +270 F 0.119 +271 N 0.170 +272 P 0.219 +273 L 0.258 +274 S 0.284 +275 S 0.292 +276 H 0.279 +277 S 0.249 +278 A 0.214 +279 E 0.188 +280 K 0.173 +281 D 0.161 +282 T 0.145 +283 M 0.129 +284 A 0.115 +285 T 0.101 +286 V 0.092 +287 L 0.095 +288 Y 0.108 +289 T 0.121 +290 V 0.129 +291 V 0.134 +292 T 0.133 +293 P 0.122 +294 M 0.107 +295 L 0.095 +296 N 0.086 +297 P 0.077 +298 F 0.071 +299 I 0.072 +300 Y 0.076 +301 S 0.086 +302 L 0.104 +303 R 0.117 +304 N 0.112 +305 R 0.093 +306 Y 0.075 +307 L 0.066 +308 K 0.064 +309 G 0.067 +310 A 0.074 +311 L 0.083 +312 K 0.094 +313 K 0.103 +314 V 0.111 +315 V 0.124 +316 G 0.148 +317 R 0.179 +318 V 0.213 +319 V 0.245 +320 F 0.269 +321 S 0.281 +322 V 0.283 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000169550.14_ENST00000529533.6_GN:MUC15_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000169550.14_ENST00000529533.6_GN:MUC15_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ec4d2e6a237f1c818ec55fe358047e1bede1bbb6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000169550.14_ENST00000529533.6_GN:MUC15_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,362 @@ +>ENSG00000169550.14|ENST00000529533.6|GN:MUC15|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.357 +2 G 0.382 +3 I 0.397 +4 I 0.381 +5 Q 0.349 +6 S 0.326 +7 I 0.324 +8 L 0.350 +9 A 0.415 +10 T 0.507 +11 S 0.583 +12 R 0.615 +13 D 0.606 +14 C 0.578 +15 Y 0.558 +16 S 0.558 +17 F 0.573 +18 K 0.589 +19 K 0.601 +20 K 0.615 +21 P 0.636 +22 I 0.661 +23 P 0.681 +24 K 0.690 +25 K 0.685 +26 P 0.655 +27 T 0.585 +28 M 0.480 +29 L 0.377 +30 A 0.310 +31 L 0.277 +32 A 0.260 +33 K 0.248 +34 I 0.232 +35 L 0.213 +36 L 0.202 +37 I 0.203 +38 S 0.208 +39 T 0.209 +40 L 0.211 +41 F 0.218 +42 Y 0.232 +43 S 0.260 +44 L 0.312 +45 L 0.400 +46 S 0.511 +47 G 0.613 +48 S 0.688 +49 H 0.740 +50 G 0.777 +51 K 0.803 +52 E 0.820 +53 N 0.829 +54 Q 0.834 +55 D 0.836 +56 I 0.837 +57 N 0.834 +58 T 0.825 +59 T 0.809 +60 Q 0.790 +61 N 0.768 +62 I 0.736 +63 A 0.701 +64 E 0.680 +65 V 0.679 +66 F 0.690 +67 K 0.709 +68 T 0.732 +69 M 0.747 +70 E 0.748 +71 N 0.747 +72 K 0.762 +73 P 0.796 +74 I 0.833 +75 S 0.860 +76 L 0.875 +77 E 0.882 +78 S 0.885 +79 E 0.882 +80 A 0.875 +81 N 0.864 +82 L 0.852 +83 N 0.845 +84 S 0.844 +85 D 0.846 +86 K 0.850 +87 E 0.854 +88 N 0.851 +89 I 0.831 +90 T 0.781 +91 T 0.711 +92 S 0.677 +93 N 0.714 +94 L 0.783 +95 K 0.830 +96 A 0.841 +97 S 0.827 +98 H 0.802 +99 S 0.786 +100 P 0.789 +101 P 0.809 +102 L 0.826 +103 N 0.832 +104 L 0.831 +105 P 0.834 +106 N 0.842 +107 N 0.852 +108 S 0.860 +109 H 0.867 +110 G 0.870 +111 I 0.869 +112 T 0.863 +113 D 0.857 +114 F 0.853 +115 S 0.853 +116 S 0.857 +117 N 0.860 +118 S 0.860 +119 S 0.859 +120 A 0.855 +121 E 0.852 +122 H 0.851 +123 S 0.855 +124 L 0.857 +125 G 0.856 +126 S 0.848 +127 L 0.837 +128 K 0.832 +129 P 0.838 +130 T 0.850 +131 S 0.860 +132 T 0.859 +133 I 0.847 +134 S 0.826 +135 T 0.801 +136 S 0.782 +137 P 0.784 +138 P 0.804 +139 L 0.825 +140 I 0.835 +141 H 0.832 +142 S 0.822 +143 F 0.805 +144 V 0.782 +145 S 0.759 +146 K 0.740 +147 V 0.724 +148 P 0.718 +149 W 0.729 +150 N 0.752 +151 A 0.780 +152 P 0.804 +153 I 0.819 +154 A 0.826 +155 D 0.826 +156 E 0.822 +157 D 0.816 +158 L 0.815 +159 L 0.822 +160 P 0.835 +161 I 0.846 +162 S 0.843 +163 A 0.822 +164 H 0.799 +165 P 0.793 +166 N 0.805 +167 A 0.821 +168 T 0.835 +169 P 0.848 +170 A 0.858 +171 L 0.857 +172 S 0.847 +173 S 0.833 +174 E 0.819 +175 N 0.801 +176 F 0.783 +177 T 0.775 +178 W 0.781 +179 S 0.789 +180 L 0.778 +181 V 0.748 +182 N 0.726 +183 D 0.729 +184 T 0.740 +185 V 0.736 +186 K 0.724 +187 T 0.724 +188 P 0.740 +189 D 0.760 +190 N 0.775 +191 S 0.786 +192 S 0.798 +193 I 0.809 +194 T 0.823 +195 V 0.840 +196 S 0.855 +197 I 0.863 +198 L 0.862 +199 S 0.852 +200 S 0.838 +201 E 0.825 +202 P 0.816 +203 T 0.815 +204 S 0.819 +205 P 0.825 +206 S 0.828 +207 V 0.828 +208 T 0.831 +209 P 0.840 +210 L 0.847 +211 I 0.843 +212 V 0.829 +213 E 0.818 +214 P 0.817 +215 S 0.826 +216 G 0.840 +217 W 0.855 +218 L 0.869 +219 T 0.876 +220 T 0.873 +221 N 0.864 +222 S 0.854 +223 D 0.846 +224 S 0.841 +225 F 0.838 +226 T 0.833 +227 G 0.823 +228 F 0.810 +229 T 0.806 +230 P 0.813 +231 Y 0.827 +232 Q 0.839 +233 E 0.847 +234 K 0.849 +235 T 0.846 +236 T 0.838 +237 L 0.829 +238 Q 0.827 +239 P 0.834 +240 T 0.841 +241 L 0.844 +242 K 0.843 +243 F 0.842 +244 T 0.840 +245 N 0.836 +246 N 0.828 +247 S 0.821 +248 K 0.816 +249 L 0.815 +250 F 0.820 +251 P 0.830 +252 N 0.837 +253 T 0.837 +254 S 0.828 +255 D 0.819 +256 P 0.814 +257 Q 0.812 +258 K 0.807 +259 E 0.791 +260 N 0.755 +261 R 0.699 +262 N 0.636 +263 T 0.587 +264 G 0.559 +265 I 0.542 +266 V 0.524 +267 F 0.506 +268 G 0.498 +269 A 0.497 +270 I 0.481 +271 L 0.449 +272 G 0.425 +273 A 0.405 +274 I 0.366 +275 L 0.320 +276 G 0.294 +277 V 0.282 +278 S 0.261 +279 L 0.230 +280 L 0.203 +281 T 0.187 +282 L 0.182 +283 V 0.180 +284 G 0.171 +285 Y 0.160 +286 L 0.168 +287 L 0.211 +288 C 0.284 +289 G 0.368 +290 K 0.456 +291 R 0.543 +292 K 0.616 +293 T 0.662 +294 D 0.680 +295 S 0.681 +296 F 0.678 +297 S 0.680 +298 H 0.691 +299 R 0.711 +300 R 0.736 +301 L 0.754 +302 Y 0.759 +303 D 0.758 +304 D 0.754 +305 R 0.751 +306 N 0.754 +307 E 0.770 +308 P 0.795 +309 V 0.818 +310 L 0.829 +311 R 0.831 +312 L 0.828 +313 D 0.820 +314 N 0.809 +315 A 0.801 +316 P 0.804 +317 E 0.817 +318 P 0.833 +319 Y 0.842 +320 D 0.845 +321 V 0.844 +322 S 0.846 +323 F 0.849 +324 G 0.853 +325 N 0.853 +326 S 0.848 +327 S 0.837 +328 Y 0.821 +329 Y 0.808 +330 N 0.806 +331 P 0.817 +332 T 0.836 +333 L 0.853 +334 N 0.860 +335 D 0.857 +336 S 0.848 +337 A 0.837 +338 M 0.830 +339 P 0.831 +340 E 0.840 +341 S 0.848 +342 E 0.851 +343 E 0.850 +344 N 0.847 +345 A 0.843 +346 R 0.840 +347 D 0.834 +348 G 0.822 +349 I 0.804 +350 P 0.789 +351 M 0.778 +352 D 0.764 +353 D 0.745 +354 I 0.728 +355 P 0.732 +356 P 0.757 +357 L 0.783 +358 R 0.786 +359 T 0.750 +360 S 0.684 +361 V 0.628 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000169550.14_ENST00000529533.6_GN:MUC15_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:89.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000169550.14_ENST00000529533.6_GN:MUC15_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:89.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..dc18f65cf817490b44fdd788f7f095b4abc336fa --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000169550.14_ENST00000529533.6_GN:MUC15_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:89.caid @@ -0,0 +1,451 @@ +>ENSG00000169550.14|ENST00000529533.6|GN:MUC15|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:89 +1 M 0.469 +2 L 0.518 +3 T 0.575 +4 A 0.585 +5 E 0.531 +6 K 0.468 +7 Q 0.473 +8 V 0.535 +9 S 0.578 +10 Q 0.601 +11 V 0.651 +12 P 0.724 +13 G 0.780 +14 R 0.808 +15 S 0.821 +16 V 0.826 +17 T 0.825 +18 Q 0.819 +19 A 0.809 +20 R 0.797 +21 Y 0.785 +22 S 0.782 +23 Q 0.789 +24 P 0.802 +25 H 0.812 +26 L 0.812 +27 I 0.800 +28 L 0.776 +29 F 0.744 +30 P 0.708 +31 W 0.683 +32 H 0.685 +33 P 0.719 +34 P 0.770 +35 A 0.816 +36 Q 0.841 +37 C 0.849 +38 D 0.849 +39 I 0.845 +40 V 0.835 +41 T 0.812 +42 L 0.778 +43 N 0.747 +44 P 0.736 +45 S 0.746 +46 V 0.766 +47 F 0.785 +48 S 0.800 +49 N 0.812 +50 A 0.820 +51 R 0.825 +52 Q 0.827 +53 I 0.831 +54 P 0.834 +55 F 0.834 +56 R 0.832 +57 Q 0.828 +58 D 0.822 +59 N 0.813 +60 C 0.805 +61 D 0.799 +62 I 0.795 +63 S 0.786 +64 V 0.766 +65 P 0.731 +66 D 0.675 +67 C 0.604 +68 K 0.535 +69 Y 0.478 +70 L 0.433 +71 L 0.399 +72 S 0.377 +73 L 0.360 +74 K 0.335 +75 L 0.298 +76 L 0.259 +77 L 0.229 +78 L 0.207 +79 A 0.187 +80 I 0.170 +81 V 0.159 +82 S 0.161 +83 F 0.171 +84 S 0.181 +85 F 0.185 +86 F 0.195 +87 I 0.224 +88 C 0.275 +89 K 0.344 +90 M 0.426 +91 G 0.500 +92 I 0.531 +93 I 0.518 +94 Q 0.496 +95 S 0.482 +96 I 0.464 +97 L 0.447 +98 A 0.453 +99 T 0.473 +100 S 0.479 +101 R 0.476 +102 D 0.474 +103 C 0.466 +104 Y 0.457 +105 S 0.468 +106 F 0.502 +107 K 0.535 +108 K 0.552 +109 K 0.563 +110 P 0.583 +111 I 0.612 +112 P 0.638 +113 K 0.653 +114 K 0.656 +115 P 0.638 +116 T 0.585 +117 M 0.502 +118 L 0.424 +119 A 0.380 +120 L 0.361 +121 A 0.340 +122 K 0.309 +123 I 0.271 +124 L 0.234 +125 L 0.210 +126 I 0.198 +127 S 0.190 +128 T 0.182 +129 L 0.178 +130 F 0.177 +131 Y 0.179 +132 S 0.193 +133 L 0.228 +134 L 0.297 +135 S 0.397 +136 G 0.506 +137 S 0.600 +138 H 0.676 +139 G 0.734 +140 K 0.773 +141 E 0.795 +142 N 0.805 +143 Q 0.809 +144 D 0.809 +145 I 0.805 +146 N 0.787 +147 T 0.738 +148 T 0.666 +149 Q 0.614 +150 N 0.599 +151 I 0.578 +152 A 0.528 +153 E 0.491 +154 V 0.505 +155 F 0.553 +156 K 0.608 +157 T 0.660 +158 M 0.700 +159 E 0.719 +160 N 0.726 +161 K 0.743 +162 P 0.778 +163 I 0.814 +164 S 0.841 +165 L 0.856 +166 E 0.863 +167 S 0.866 +168 E 0.865 +169 A 0.859 +170 N 0.849 +171 L 0.839 +172 N 0.833 +173 S 0.832 +174 D 0.833 +175 K 0.836 +176 E 0.841 +177 N 0.840 +178 I 0.822 +179 T 0.772 +180 T 0.704 +181 S 0.671 +182 N 0.708 +183 L 0.777 +184 K 0.824 +185 A 0.838 +186 S 0.827 +187 H 0.806 +188 S 0.792 +189 P 0.797 +190 P 0.819 +191 L 0.838 +192 N 0.846 +193 L 0.847 +194 P 0.850 +195 N 0.857 +196 N 0.865 +197 S 0.873 +198 H 0.878 +199 G 0.880 +200 I 0.879 +201 T 0.872 +202 D 0.865 +203 F 0.860 +204 S 0.860 +205 S 0.862 +206 N 0.863 +207 S 0.863 +208 S 0.861 +209 A 0.857 +210 E 0.854 +211 H 0.854 +212 S 0.856 +213 L 0.860 +214 G 0.859 +215 S 0.853 +216 L 0.843 +217 K 0.839 +218 P 0.844 +219 T 0.856 +220 S 0.866 +221 T 0.866 +222 I 0.855 +223 S 0.834 +224 T 0.808 +225 S 0.789 +226 P 0.791 +227 P 0.811 +228 L 0.831 +229 I 0.839 +230 H 0.837 +231 S 0.830 +232 F 0.817 +233 V 0.800 +234 S 0.781 +235 K 0.762 +236 V 0.745 +237 P 0.737 +238 W 0.744 +239 N 0.763 +240 A 0.788 +241 P 0.811 +242 I 0.826 +243 A 0.832 +244 D 0.830 +245 E 0.823 +246 D 0.815 +247 L 0.810 +248 L 0.816 +249 P 0.830 +250 I 0.842 +251 S 0.839 +252 A 0.820 +253 H 0.800 +254 P 0.795 +255 N 0.803 +256 A 0.814 +257 T 0.824 +258 P 0.836 +259 A 0.846 +260 L 0.845 +261 S 0.835 +262 S 0.821 +263 E 0.805 +264 N 0.785 +265 F 0.766 +266 T 0.759 +267 W 0.769 +268 S 0.780 +269 L 0.774 +270 V 0.751 +271 N 0.733 +272 D 0.734 +273 T 0.737 +274 V 0.726 +275 K 0.713 +276 T 0.715 +277 P 0.734 +278 D 0.757 +279 N 0.772 +280 S 0.782 +281 S 0.792 +282 I 0.803 +283 T 0.817 +284 V 0.834 +285 S 0.848 +286 I 0.854 +287 L 0.853 +288 S 0.844 +289 S 0.831 +290 E 0.819 +291 P 0.814 +292 T 0.816 +293 S 0.823 +294 P 0.831 +295 S 0.835 +296 V 0.834 +297 T 0.837 +298 P 0.846 +299 L 0.852 +300 I 0.848 +301 V 0.836 +302 E 0.827 +303 P 0.829 +304 S 0.839 +305 G 0.854 +306 W 0.867 +307 L 0.880 +308 T 0.887 +309 T 0.886 +310 N 0.879 +311 S 0.869 +312 D 0.862 +313 S 0.858 +314 F 0.856 +315 T 0.852 +316 G 0.843 +317 F 0.831 +318 T 0.827 +319 P 0.834 +320 Y 0.847 +321 Q 0.858 +322 E 0.863 +323 K 0.864 +324 T 0.859 +325 T 0.849 +326 L 0.838 +327 Q 0.835 +328 P 0.841 +329 T 0.850 +330 L 0.855 +331 K 0.856 +332 F 0.857 +333 T 0.857 +334 N 0.856 +335 N 0.851 +336 S 0.846 +337 K 0.842 +338 L 0.841 +339 F 0.844 +340 P 0.850 +341 N 0.854 +342 T 0.850 +343 S 0.841 +344 D 0.832 +345 P 0.828 +346 Q 0.827 +347 K 0.826 +348 E 0.818 +349 N 0.794 +350 R 0.753 +351 N 0.707 +352 T 0.669 +353 G 0.648 +354 I 0.632 +355 V 0.605 +356 F 0.570 +357 G 0.549 +358 A 0.543 +359 I 0.526 +360 L 0.490 +361 G 0.464 +362 A 0.449 +363 I 0.414 +364 L 0.363 +365 G 0.327 +366 V 0.306 +367 S 0.277 +368 L 0.241 +369 L 0.209 +370 T 0.191 +371 L 0.184 +372 V 0.182 +373 G 0.174 +374 Y 0.163 +375 L 0.171 +376 L 0.215 +377 C 0.290 +378 G 0.375 +379 K 0.460 +380 R 0.542 +381 K 0.612 +382 T 0.657 +383 D 0.675 +384 S 0.676 +385 F 0.673 +386 S 0.676 +387 H 0.687 +388 R 0.709 +389 R 0.736 +390 L 0.756 +391 Y 0.762 +392 D 0.762 +393 D 0.758 +394 R 0.754 +395 N 0.756 +396 E 0.771 +397 P 0.795 +398 V 0.817 +399 L 0.828 +400 R 0.830 +401 L 0.826 +402 D 0.818 +403 N 0.806 +404 A 0.798 +405 P 0.803 +406 E 0.818 +407 P 0.835 +408 Y 0.845 +409 D 0.847 +410 V 0.846 +411 S 0.847 +412 F 0.851 +413 G 0.853 +414 N 0.853 +415 S 0.846 +416 S 0.835 +417 Y 0.819 +418 Y 0.807 +419 N 0.805 +420 P 0.817 +421 T 0.836 +422 L 0.852 +423 N 0.857 +424 D 0.853 +425 S 0.843 +426 A 0.832 +427 M 0.825 +428 P 0.826 +429 E 0.835 +430 S 0.845 +431 E 0.848 +432 E 0.848 +433 N 0.845 +434 A 0.841 +435 R 0.838 +436 D 0.833 +437 G 0.821 +438 I 0.804 +439 P 0.790 +440 M 0.781 +441 D 0.770 +442 D 0.750 +443 I 0.732 +444 P 0.734 +445 P 0.757 +446 L 0.783 +447 R 0.788 +448 T 0.756 +449 S 0.697 +450 V 0.645 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000169814.19_ENST00000643237.3_GN:BTD_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000169814.19_ENST00000643237.3_GN:BTD_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..19af48955114c1c8f000cdead03927e91c231a2f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000169814.19_ENST00000643237.3_GN:BTD_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,524 @@ +>ENSG00000169814.19|ENST00000643237.3|GN:BTD|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.363 +2 S 0.381 +3 G 0.404 +4 A 0.404 +5 R 0.364 +6 S 0.309 +7 K 0.283 +8 L 0.291 +9 A 0.299 +10 L 0.299 +11 F 0.303 +12 L 0.313 +13 C 0.323 +14 G 0.327 +15 C 0.317 +16 Y 0.294 +17 V 0.278 +18 V 0.303 +19 A 0.373 +20 L 0.454 +21 G 0.518 +22 A 0.559 +23 H 0.589 +24 T 0.617 +25 G 0.638 +26 E 0.648 +27 E 0.649 +28 S 0.644 +29 V 0.628 +30 A 0.600 +31 D 0.560 +32 H 0.506 +33 H 0.437 +34 E 0.352 +35 A 0.255 +36 E 0.160 +37 Y 0.090 +38 Y 0.053 +39 V 0.041 +40 A 0.041 +41 A 0.047 +42 V 0.055 +43 Y 0.064 +44 E 0.073 +45 H 0.083 +46 P 0.098 +47 S 0.118 +48 I 0.141 +49 L 0.162 +50 S 0.181 +51 L 0.200 +52 N 0.215 +53 P 0.221 +54 L 0.221 +55 A 0.216 +56 L 0.200 +57 I 0.173 +58 S 0.143 +59 R 0.118 +60 Q 0.103 +61 E 0.099 +62 A 0.103 +63 L 0.111 +64 E 0.119 +65 L 0.121 +66 M 0.113 +67 N 0.101 +68 Q 0.095 +69 N 0.096 +70 L 0.098 +71 D 0.095 +72 I 0.087 +73 Y 0.082 +74 E 0.080 +75 Q 0.077 +76 Q 0.067 +77 V 0.055 +78 M 0.047 +79 T 0.047 +80 A 0.054 +81 A 0.064 +82 Q 0.074 +83 K 0.082 +84 D 0.085 +85 V 0.082 +86 Q 0.079 +87 I 0.079 +88 I 0.078 +89 V 0.073 +90 F 0.067 +91 P 0.067 +92 E 0.072 +93 D 0.077 +94 G 0.077 +95 I 0.073 +96 H 0.073 +97 G 0.084 +98 F 0.097 +99 N 0.106 +100 F 0.107 +101 T 0.103 +102 R 0.091 +103 T 0.075 +104 S 0.063 +105 I 0.059 +106 Y 0.063 +107 P 0.071 +108 F 0.079 +109 L 0.085 +110 D 0.091 +111 F 0.098 +112 M 0.103 +113 P 0.099 +114 S 0.086 +115 P 0.074 +116 Q 0.069 +117 V 0.070 +118 V 0.074 +119 R 0.078 +120 W 0.083 +121 N 0.084 +122 P 0.082 +123 C 0.079 +124 L 0.080 +125 E 0.084 +126 P 0.090 +127 H 0.096 +128 R 0.103 +129 F 0.116 +130 N 0.130 +131 D 0.132 +132 T 0.117 +133 E 0.098 +134 V 0.090 +135 L 0.089 +136 Q 0.085 +137 R 0.074 +138 L 0.065 +139 S 0.060 +140 C 0.058 +141 M 0.055 +142 A 0.054 +143 I 0.053 +144 R 0.052 +145 G 0.052 +146 D 0.054 +147 M 0.057 +148 F 0.060 +149 L 0.062 +150 V 0.065 +151 A 0.070 +152 N 0.078 +153 L 0.085 +154 G 0.091 +155 T 0.097 +156 K 0.103 +157 E 0.108 +158 P 0.114 +159 C 0.116 +160 H 0.114 +161 S 0.110 +162 S 0.111 +163 D 0.118 +164 P 0.132 +165 R 0.151 +166 C 0.162 +167 P 0.155 +168 K 0.139 +169 D 0.126 +170 G 0.121 +171 R 0.126 +172 Y 0.132 +173 Q 0.132 +174 F 0.125 +175 N 0.115 +176 T 0.102 +177 N 0.087 +178 V 0.074 +179 V 0.067 +180 F 0.066 +181 S 0.073 +182 N 0.088 +183 N 0.102 +184 G 0.106 +185 T 0.102 +186 L 0.097 +187 V 0.096 +188 D 0.096 +189 R 0.092 +190 Y 0.087 +191 R 0.084 +192 K 0.085 +193 H 0.086 +194 N 0.087 +195 L 0.088 +196 Y 0.092 +197 F 0.099 +198 E 0.104 +199 A 0.104 +200 A 0.105 +201 F 0.112 +202 D 0.125 +203 V 0.137 +204 P 0.142 +205 L 0.144 +206 K 0.146 +207 V 0.150 +208 D 0.149 +209 L 0.137 +210 I 0.117 +211 T 0.093 +212 F 0.075 +213 D 0.065 +214 T 0.063 +215 P 0.062 +216 F 0.062 +217 A 0.062 +218 G 0.065 +219 R 0.070 +220 F 0.075 +221 G 0.081 +222 I 0.090 +223 F 0.101 +224 T 0.118 +225 C 0.137 +226 F 0.149 +227 D 0.146 +228 I 0.123 +229 L 0.092 +230 F 0.065 +231 F 0.048 +232 D 0.036 +233 P 0.028 +234 A 0.023 +235 I 0.023 +236 R 0.026 +237 V 0.028 +238 L 0.031 +239 R 0.037 +240 D 0.047 +241 Y 0.055 +242 K 0.060 +243 V 0.065 +244 K 0.078 +245 H 0.099 +246 V 0.118 +247 V 0.126 +248 Y 0.125 +249 P 0.123 +250 T 0.127 +251 A 0.132 +252 W 0.131 +253 M 0.117 +254 N 0.095 +255 Q 0.076 +256 L 0.067 +257 P 0.070 +258 L 0.079 +259 L 0.083 +260 A 0.076 +261 A 0.062 +262 I 0.050 +263 E 0.042 +264 I 0.040 +265 Q 0.042 +266 K 0.045 +267 A 0.046 +268 F 0.047 +269 A 0.048 +270 V 0.048 +271 A 0.049 +272 F 0.053 +273 G 0.060 +274 I 0.068 +275 N 0.077 +276 V 0.085 +277 L 0.090 +278 A 0.091 +279 A 0.089 +280 N 0.086 +281 V 0.083 +282 H 0.081 +283 H 0.080 +284 P 0.083 +285 V 0.091 +286 L 0.103 +287 G 0.115 +288 M 0.123 +289 T 0.128 +290 G 0.134 +291 S 0.142 +292 G 0.147 +293 I 0.141 +294 H 0.123 +295 T 0.103 +296 P 0.093 +297 L 0.096 +298 E 0.110 +299 S 0.127 +300 F 0.137 +301 W 0.136 +302 Y 0.133 +303 H 0.133 +304 D 0.137 +305 M 0.138 +306 E 0.134 +307 N 0.128 +308 P 0.125 +309 K 0.128 +310 S 0.137 +311 H 0.143 +312 L 0.142 +313 I 0.132 +314 I 0.115 +315 A 0.100 +316 Q 0.087 +317 V 0.081 +318 A 0.091 +319 K 0.131 +320 N 0.202 +321 P 0.288 +322 V 0.376 +323 G 0.465 +324 L 0.550 +325 I 0.613 +326 G 0.646 +327 A 0.658 +328 E 0.660 +329 N 0.655 +330 A 0.646 +331 T 0.635 +332 G 0.614 +333 E 0.569 +334 T 0.503 +335 D 0.435 +336 P 0.381 +337 S 0.344 +338 H 0.317 +339 S 0.294 +340 K 0.272 +341 F 0.254 +342 L 0.245 +343 K 0.244 +344 I 0.251 +345 L 0.264 +346 S 0.288 +347 G 0.320 +348 D 0.354 +349 P 0.378 +350 Y 0.388 +351 C 0.388 +352 E 0.387 +353 K 0.390 +354 D 0.397 +355 A 0.406 +356 Q 0.419 +357 E 0.436 +358 V 0.443 +359 H 0.423 +360 C 0.388 +361 D 0.354 +362 E 0.322 +363 A 0.285 +364 T 0.244 +365 K 0.210 +366 W 0.195 +367 N 0.193 +368 V 0.192 +369 N 0.187 +370 A 0.181 +371 P 0.171 +372 P 0.155 +373 T 0.138 +374 F 0.126 +375 H 0.118 +376 S 0.112 +377 E 0.108 +378 M 0.107 +379 M 0.108 +380 Y 0.108 +381 D 0.108 +382 N 0.106 +383 F 0.102 +384 T 0.098 +385 L 0.096 +386 V 0.096 +387 P 0.093 +388 V 0.088 +389 W 0.084 +390 G 0.082 +391 K 0.079 +392 E 0.078 +393 G 0.079 +394 Y 0.081 +395 L 0.084 +396 H 0.084 +397 V 0.085 +398 C 0.089 +399 S 0.093 +400 N 0.092 +401 G 0.084 +402 L 0.078 +403 C 0.079 +404 C 0.089 +405 Y 0.102 +406 L 0.110 +407 L 0.109 +408 Y 0.101 +409 E 0.095 +410 R 0.095 +411 P 0.100 +412 T 0.110 +413 L 0.120 +414 S 0.121 +415 K 0.114 +416 E 0.107 +417 L 0.105 +418 Y 0.108 +419 A 0.114 +420 L 0.123 +421 G 0.134 +422 V 0.143 +423 F 0.141 +424 D 0.127 +425 G 0.111 +426 L 0.099 +427 H 0.094 +428 T 0.089 +429 V 0.079 +430 H 0.067 +431 G 0.063 +432 T 0.072 +433 Y 0.090 +434 Y 0.105 +435 I 0.110 +436 Q 0.104 +437 V 0.094 +438 C 0.088 +439 A 0.090 +440 L 0.097 +441 V 0.104 +442 R 0.110 +443 C 0.122 +444 G 0.135 +445 G 0.139 +446 L 0.129 +447 G 0.114 +448 F 0.103 +449 D 0.098 +450 T 0.096 +451 C 0.098 +452 G 0.104 +453 Q 0.112 +454 E 0.117 +455 I 0.116 +456 T 0.113 +457 E 0.112 +458 A 0.110 +459 T 0.104 +460 G 0.097 +461 I 0.091 +462 F 0.087 +463 E 0.087 +464 F 0.087 +465 H 0.086 +466 L 0.085 +467 W 0.082 +468 G 0.076 +469 N 0.066 +470 F 0.056 +471 S 0.052 +472 T 0.053 +473 S 0.060 +474 Y 0.070 +475 I 0.081 +476 F 0.090 +477 P 0.096 +478 L 0.101 +479 F 0.114 +480 L 0.135 +481 T 0.154 +482 S 0.160 +483 G 0.151 +484 M 0.140 +485 T 0.141 +486 L 0.155 +487 E 0.179 +488 V 0.200 +489 P 0.208 +490 D 0.201 +491 Q 0.186 +492 L 0.174 +493 G 0.163 +494 W 0.151 +495 E 0.134 +496 N 0.113 +497 D 0.094 +498 H 0.081 +499 Y 0.075 +500 F 0.074 +501 L 0.077 +502 R 0.086 +503 K 0.096 +504 S 0.106 +505 R 0.114 +506 L 0.125 +507 S 0.140 +508 S 0.151 +509 G 0.155 +510 L 0.145 +511 V 0.125 +512 T 0.106 +513 A 0.096 +514 A 0.093 +515 L 0.096 +516 Y 0.101 +517 G 0.106 +518 R 0.109 +519 L 0.114 +520 Y 0.133 +521 E 0.171 +522 R 0.219 +523 D 0.254 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000169814.19_ENST00000643237.3_GN:BTD_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000169814.19_ENST00000643237.3_GN:BTD_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2767e7a8d07f80563f8a79e00cfb7a8df2ca1996 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000169814.19_ENST00000643237.3_GN:BTD_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid @@ -0,0 +1,544 @@ +>ENSG00000169814.19|ENST00000643237.3|GN:BTD|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:20 +1 M 0.273 +2 A 0.280 +3 H 0.302 +4 A 0.333 +5 H 0.352 +6 I 0.358 +7 Q 0.373 +8 G 0.397 +9 G 0.395 +10 R 0.369 +11 R 0.367 +12 A 0.387 +13 K 0.382 +14 S 0.357 +15 R 0.373 +16 F 0.437 +17 V 0.492 +18 V 0.506 +19 C 0.497 +20 I 0.483 +21 M 0.472 +22 S 0.480 +23 G 0.516 +24 A 0.556 +25 R 0.574 +26 S 0.570 +27 K 0.551 +28 L 0.514 +29 A 0.468 +30 L 0.443 +31 F 0.450 +32 L 0.466 +33 C 0.474 +34 G 0.482 +35 C 0.491 +36 Y 0.497 +37 V 0.502 +38 V 0.505 +39 A 0.511 +40 L 0.524 +41 G 0.546 +42 A 0.568 +43 H 0.591 +44 T 0.618 +45 G 0.644 +46 E 0.660 +47 E 0.666 +48 S 0.662 +49 V 0.648 +50 A 0.622 +51 D 0.583 +52 H 0.527 +53 H 0.454 +54 E 0.364 +55 A 0.261 +56 E 0.163 +57 Y 0.090 +58 Y 0.053 +59 V 0.041 +60 A 0.042 +61 A 0.047 +62 V 0.055 +63 Y 0.064 +64 E 0.073 +65 H 0.083 +66 P 0.097 +67 S 0.118 +68 I 0.140 +69 L 0.159 +70 S 0.177 +71 L 0.196 +72 N 0.211 +73 P 0.217 +74 L 0.216 +75 A 0.209 +76 L 0.192 +77 I 0.165 +78 S 0.136 +79 R 0.111 +80 Q 0.097 +81 E 0.094 +82 A 0.099 +83 L 0.108 +84 E 0.116 +85 L 0.118 +86 M 0.110 +87 N 0.098 +88 Q 0.092 +89 N 0.092 +90 L 0.093 +91 D 0.089 +92 I 0.082 +93 Y 0.078 +94 E 0.078 +95 Q 0.075 +96 Q 0.065 +97 V 0.053 +98 M 0.045 +99 T 0.045 +100 A 0.051 +101 A 0.060 +102 Q 0.069 +103 K 0.077 +104 D 0.082 +105 V 0.080 +106 Q 0.078 +107 I 0.079 +108 I 0.078 +109 V 0.073 +110 F 0.067 +111 P 0.066 +112 E 0.071 +113 D 0.076 +114 G 0.076 +115 I 0.071 +116 H 0.071 +117 G 0.081 +118 F 0.094 +119 N 0.102 +120 F 0.104 +121 T 0.100 +122 R 0.089 +123 T 0.073 +124 S 0.062 +125 I 0.059 +126 Y 0.063 +127 P 0.071 +128 F 0.079 +129 L 0.086 +130 D 0.092 +131 F 0.101 +132 M 0.106 +133 P 0.101 +134 S 0.087 +135 P 0.075 +136 Q 0.070 +137 V 0.071 +138 V 0.075 +139 R 0.078 +140 W 0.083 +141 N 0.084 +142 P 0.082 +143 C 0.079 +144 L 0.079 +145 E 0.084 +146 P 0.090 +147 H 0.096 +148 R 0.104 +149 F 0.118 +150 N 0.132 +151 D 0.134 +152 T 0.118 +153 E 0.098 +154 V 0.089 +155 L 0.087 +156 Q 0.083 +157 R 0.072 +158 L 0.063 +159 S 0.059 +160 C 0.056 +161 M 0.054 +162 A 0.053 +163 I 0.052 +164 R 0.052 +165 G 0.052 +166 D 0.053 +167 M 0.055 +168 F 0.059 +169 L 0.061 +170 V 0.063 +171 A 0.069 +172 N 0.077 +173 L 0.084 +174 G 0.090 +175 T 0.096 +176 K 0.102 +177 E 0.107 +178 P 0.111 +179 C 0.113 +180 H 0.111 +181 S 0.107 +182 S 0.108 +183 D 0.115 +184 P 0.129 +185 R 0.149 +186 C 0.159 +187 P 0.153 +188 K 0.136 +189 D 0.123 +190 G 0.119 +191 R 0.124 +192 Y 0.131 +193 Q 0.131 +194 F 0.124 +195 N 0.115 +196 T 0.102 +197 N 0.087 +198 V 0.074 +199 V 0.067 +200 F 0.066 +201 S 0.073 +202 N 0.087 +203 N 0.100 +204 G 0.105 +205 T 0.100 +206 L 0.096 +207 V 0.095 +208 D 0.095 +209 R 0.091 +210 Y 0.086 +211 R 0.083 +212 K 0.084 +213 H 0.086 +214 N 0.086 +215 L 0.087 +216 Y 0.091 +217 F 0.098 +218 E 0.103 +219 A 0.103 +220 A 0.103 +221 F 0.110 +222 D 0.122 +223 V 0.133 +224 P 0.140 +225 L 0.141 +226 K 0.144 +227 V 0.147 +228 D 0.146 +229 L 0.135 +230 I 0.115 +231 T 0.091 +232 F 0.073 +233 D 0.063 +234 T 0.061 +235 P 0.061 +236 F 0.061 +237 A 0.061 +238 G 0.064 +239 R 0.069 +240 F 0.074 +241 G 0.081 +242 I 0.089 +243 F 0.101 +244 T 0.117 +245 C 0.136 +246 F 0.148 +247 D 0.145 +248 I 0.123 +249 L 0.091 +250 F 0.065 +251 F 0.047 +252 D 0.035 +253 P 0.027 +254 A 0.023 +255 I 0.023 +256 R 0.026 +257 V 0.028 +258 L 0.031 +259 R 0.037 +260 D 0.046 +261 Y 0.054 +262 K 0.059 +263 V 0.065 +264 K 0.078 +265 H 0.099 +266 V 0.119 +267 V 0.127 +268 Y 0.125 +269 P 0.124 +270 T 0.128 +271 A 0.133 +272 W 0.132 +273 M 0.118 +274 N 0.096 +275 Q 0.076 +276 L 0.067 +277 P 0.070 +278 L 0.080 +279 L 0.084 +280 A 0.077 +281 A 0.063 +282 I 0.050 +283 E 0.042 +284 I 0.041 +285 Q 0.043 +286 K 0.045 +287 A 0.046 +288 F 0.047 +289 A 0.048 +290 V 0.048 +291 A 0.049 +292 F 0.053 +293 G 0.060 +294 I 0.068 +295 N 0.077 +296 V 0.085 +297 L 0.090 +298 A 0.091 +299 A 0.089 +300 N 0.086 +301 V 0.083 +302 H 0.081 +303 H 0.080 +304 P 0.083 +305 V 0.091 +306 L 0.104 +307 G 0.116 +308 M 0.124 +309 T 0.129 +310 G 0.135 +311 S 0.143 +312 G 0.148 +313 I 0.142 +314 H 0.124 +315 T 0.104 +316 P 0.093 +317 L 0.095 +318 E 0.110 +319 S 0.126 +320 F 0.136 +321 W 0.136 +322 Y 0.133 +323 H 0.133 +324 D 0.136 +325 M 0.137 +326 E 0.133 +327 N 0.128 +328 P 0.124 +329 K 0.128 +330 S 0.137 +331 H 0.144 +332 L 0.144 +333 I 0.133 +334 I 0.117 +335 A 0.101 +336 Q 0.088 +337 V 0.081 +338 A 0.091 +339 K 0.130 +340 N 0.201 +341 P 0.286 +342 V 0.374 +343 G 0.464 +344 L 0.549 +345 I 0.613 +346 G 0.646 +347 A 0.658 +348 E 0.660 +349 N 0.655 +350 A 0.645 +351 T 0.634 +352 G 0.613 +353 E 0.569 +354 T 0.503 +355 D 0.434 +356 P 0.380 +357 S 0.343 +358 H 0.316 +359 S 0.293 +360 K 0.272 +361 F 0.253 +362 L 0.244 +363 K 0.244 +364 I 0.250 +365 L 0.263 +366 S 0.286 +367 G 0.318 +368 D 0.352 +369 P 0.376 +370 Y 0.387 +371 C 0.389 +372 E 0.388 +373 K 0.390 +374 D 0.396 +375 A 0.405 +376 Q 0.417 +377 E 0.434 +378 V 0.439 +379 H 0.419 +380 C 0.383 +381 D 0.349 +382 E 0.317 +383 A 0.281 +384 T 0.239 +385 K 0.205 +386 W 0.190 +387 N 0.189 +388 V 0.187 +389 N 0.183 +390 A 0.177 +391 P 0.168 +392 P 0.153 +393 T 0.136 +394 F 0.124 +395 H 0.116 +396 S 0.110 +397 E 0.107 +398 M 0.107 +399 M 0.109 +400 Y 0.109 +401 D 0.108 +402 N 0.105 +403 F 0.102 +404 T 0.097 +405 L 0.095 +406 V 0.095 +407 P 0.092 +408 V 0.087 +409 W 0.083 +410 G 0.081 +411 K 0.079 +412 E 0.077 +413 G 0.078 +414 Y 0.080 +415 L 0.084 +416 H 0.085 +417 V 0.085 +418 C 0.090 +419 S 0.094 +420 N 0.092 +421 G 0.084 +422 L 0.078 +423 C 0.080 +424 C 0.089 +425 Y 0.102 +426 L 0.110 +427 L 0.108 +428 Y 0.100 +429 E 0.094 +430 R 0.094 +431 P 0.100 +432 T 0.111 +433 L 0.121 +434 S 0.123 +435 K 0.116 +436 E 0.109 +437 L 0.107 +438 Y 0.110 +439 A 0.116 +440 L 0.125 +441 G 0.137 +442 V 0.146 +443 F 0.143 +444 D 0.129 +445 G 0.112 +446 L 0.101 +447 H 0.096 +448 T 0.091 +449 V 0.080 +450 H 0.068 +451 G 0.064 +452 T 0.073 +453 Y 0.090 +454 Y 0.105 +455 I 0.110 +456 Q 0.105 +457 V 0.095 +458 C 0.090 +459 A 0.091 +460 L 0.098 +461 V 0.105 +462 R 0.110 +463 C 0.122 +464 G 0.135 +465 G 0.139 +466 L 0.129 +467 G 0.114 +468 F 0.103 +469 D 0.098 +470 T 0.097 +471 C 0.099 +472 G 0.105 +473 Q 0.113 +474 E 0.118 +475 I 0.118 +476 T 0.115 +477 E 0.113 +478 A 0.111 +479 T 0.105 +480 G 0.098 +481 I 0.092 +482 F 0.089 +483 E 0.088 +484 F 0.088 +485 H 0.087 +486 L 0.085 +487 W 0.083 +488 G 0.076 +489 N 0.066 +490 F 0.057 +491 S 0.053 +492 T 0.055 +493 S 0.062 +494 Y 0.073 +495 I 0.085 +496 F 0.093 +497 P 0.098 +498 L 0.103 +499 F 0.115 +500 L 0.135 +501 T 0.154 +502 S 0.161 +503 G 0.153 +504 M 0.142 +505 T 0.142 +506 L 0.158 +507 E 0.182 +508 V 0.206 +509 P 0.218 +510 D 0.212 +511 Q 0.198 +512 L 0.184 +513 G 0.171 +514 W 0.156 +515 E 0.137 +516 N 0.115 +517 D 0.096 +518 H 0.083 +519 Y 0.077 +520 F 0.076 +521 L 0.080 +522 R 0.089 +523 K 0.101 +524 S 0.110 +525 R 0.117 +526 L 0.128 +527 S 0.141 +528 S 0.152 +529 G 0.154 +530 L 0.144 +531 V 0.126 +532 T 0.108 +533 A 0.100 +534 A 0.099 +535 L 0.103 +536 Y 0.107 +537 G 0.110 +538 R 0.109 +539 L 0.111 +540 Y 0.128 +541 E 0.164 +542 R 0.213 +543 D 0.250 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000170634.13_ENST00000394666.9_GN:ACYP2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000170634.13_ENST00000394666.9_GN:ACYP2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6746668c5943810c4672db68919ab88869749cce --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000170634.13_ENST00000394666.9_GN:ACYP2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,100 @@ +>ENSG00000170634.13|ENST00000394666.9|GN:ACYP2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.451 +2 S 0.455 +3 T 0.457 +4 A 0.434 +5 Q 0.368 +6 S 0.270 +7 L 0.172 +8 K 0.100 +9 S 0.058 +10 V 0.040 +11 D 0.033 +12 Y 0.032 +13 E 0.037 +14 V 0.049 +15 F 0.065 +16 G 0.080 +17 R 0.094 +18 V 0.109 +19 Q 0.121 +20 G 0.123 +21 V 0.112 +22 C 0.094 +23 F 0.073 +24 R 0.057 +25 M 0.048 +26 Y 0.046 +27 T 0.050 +28 E 0.059 +29 D 0.063 +30 E 0.058 +31 A 0.049 +32 R 0.044 +33 K 0.045 +34 I 0.046 +35 G 0.047 +36 V 0.047 +37 V 0.044 +38 G 0.041 +39 W 0.040 +40 V 0.046 +41 K 0.058 +42 N 0.073 +43 T 0.084 +44 S 0.090 +45 K 0.090 +46 G 0.084 +47 T 0.070 +48 V 0.056 +49 T 0.045 +50 G 0.041 +51 Q 0.043 +52 V 0.049 +53 Q 0.055 +54 G 0.057 +55 P 0.053 +56 E 0.043 +57 D 0.034 +58 K 0.029 +59 V 0.027 +60 N 0.029 +61 S 0.036 +62 M 0.048 +63 K 0.063 +64 S 0.071 +65 W 0.069 +66 L 0.066 +67 S 0.067 +68 K 0.071 +69 V 0.078 +70 G 0.091 +71 S 0.102 +72 P 0.105 +73 S 0.101 +74 S 0.094 +75 R 0.084 +76 I 0.074 +77 D 0.065 +78 R 0.058 +79 T 0.055 +80 N 0.053 +81 F 0.051 +82 S 0.050 +83 N 0.050 +84 E 0.050 +85 K 0.049 +86 T 0.051 +87 I 0.057 +88 S 0.064 +89 K 0.070 +90 L 0.075 +91 E 0.078 +92 Y 0.078 +93 S 0.075 +94 N 0.075 +95 F 0.082 +96 S 0.092 +97 I 0.105 +98 R 0.118 +99 Y 0.127 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000170634.13_ENST00000394666.9_GN:ACYP2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:28.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000170634.13_ENST00000394666.9_GN:ACYP2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:28.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..88dc69df6dc82bdedb157a32038a249f8b734f32 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000170634.13_ENST00000394666.9_GN:ACYP2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:28.caid @@ -0,0 +1,128 @@ +>ENSG00000170634.13|ENST00000394666.9|GN:ACYP2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:28 +1 M 0.418 +2 C 0.448 +3 P 0.497 +4 L 0.542 +5 P 0.558 +6 L 0.545 +7 A 0.545 +8 A 0.587 +9 A 0.644 +10 A 0.675 +11 V 0.676 +12 A 0.660 +13 A 0.644 +14 P 0.634 +15 R 0.629 +16 A 0.619 +17 P 0.588 +18 L 0.543 +19 R 0.524 +20 L 0.558 +21 L 0.617 +22 N 0.660 +23 R 0.684 +24 G 0.703 +25 L 0.718 +26 A 0.726 +27 A 0.724 +28 A 0.712 +29 M 0.692 +30 S 0.666 +31 T 0.624 +32 A 0.548 +33 Q 0.431 +34 S 0.298 +35 L 0.184 +36 K 0.105 +37 S 0.059 +38 V 0.039 +39 D 0.031 +40 Y 0.030 +41 E 0.036 +42 V 0.049 +43 F 0.064 +44 G 0.079 +45 R 0.095 +46 V 0.112 +47 Q 0.126 +48 G 0.129 +49 V 0.119 +50 C 0.099 +51 F 0.078 +52 R 0.061 +53 M 0.051 +54 Y 0.047 +55 T 0.048 +56 E 0.053 +57 D 0.054 +58 E 0.050 +59 A 0.043 +60 R 0.040 +61 K 0.040 +62 I 0.042 +63 G 0.045 +64 V 0.046 +65 V 0.044 +66 G 0.041 +67 W 0.040 +68 V 0.045 +69 K 0.055 +70 N 0.068 +71 T 0.079 +72 S 0.085 +73 K 0.086 +74 G 0.079 +75 T 0.067 +76 V 0.054 +77 T 0.045 +78 G 0.042 +79 Q 0.045 +80 V 0.051 +81 Q 0.057 +82 G 0.058 +83 P 0.053 +84 E 0.043 +85 D 0.034 +86 K 0.028 +87 V 0.026 +88 N 0.028 +89 S 0.032 +90 M 0.038 +91 K 0.043 +92 S 0.045 +93 W 0.049 +94 L 0.055 +95 S 0.063 +96 K 0.069 +97 V 0.075 +98 G 0.086 +99 S 0.097 +100 P 0.100 +101 S 0.097 +102 S 0.091 +103 R 0.083 +104 I 0.074 +105 D 0.065 +106 R 0.058 +107 T 0.054 +108 N 0.050 +109 F 0.046 +110 S 0.044 +111 N 0.043 +112 E 0.042 +113 K 0.041 +114 T 0.043 +115 I 0.047 +116 S 0.054 +117 K 0.061 +118 L 0.066 +119 E 0.070 +120 Y 0.071 +121 S 0.071 +122 N 0.073 +123 F 0.079 +124 S 0.089 +125 I 0.100 +126 R 0.112 +127 Y 0.121 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000170835.17_ENST00000372080.8_GN:CEL_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000170835.17_ENST00000372080.8_GN:CEL_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c337b94e9652328ab7d74204ef78423daac0585e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000170835.17_ENST00000372080.8_GN:CEL_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,754 @@ +>ENSG00000170835.17|ENST00000372080.8|GN:CEL|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.277 +2 G 0.263 +3 R 0.240 +4 L 0.220 +5 Q 0.207 +6 L 0.204 +7 V 0.214 +8 V 0.235 +9 L 0.255 +10 G 0.267 +11 L 0.266 +12 T 0.248 +13 C 0.228 +14 C 0.230 +15 W 0.264 +16 A 0.317 +17 V 0.368 +18 A 0.408 +19 S 0.428 +20 A 0.419 +21 A 0.374 +22 K 0.308 +23 L 0.239 +24 G 0.177 +25 A 0.128 +26 V 0.099 +27 Y 0.089 +28 T 0.096 +29 E 0.111 +30 G 0.123 +31 G 0.126 +32 F 0.120 +33 V 0.110 +34 E 0.100 +35 G 0.093 +36 V 0.093 +37 N 0.102 +38 K 0.120 +39 K 0.148 +40 L 0.179 +41 G 0.201 +42 L 0.210 +43 L 0.204 +44 G 0.182 +45 D 0.148 +46 S 0.113 +47 V 0.087 +48 D 0.072 +49 I 0.071 +50 F 0.085 +51 K 0.109 +52 G 0.137 +53 I 0.159 +54 P 0.170 +55 F 0.177 +56 A 0.187 +57 A 0.192 +58 P 0.184 +59 T 0.167 +60 K 0.148 +61 A 0.135 +62 L 0.130 +63 E 0.135 +64 N 0.147 +65 P 0.164 +66 Q 0.181 +67 P 0.193 +68 H 0.195 +69 P 0.191 +70 G 0.183 +71 W 0.177 +72 Q 0.180 +73 G 0.188 +74 T 0.193 +75 L 0.191 +76 K 0.183 +77 A 0.171 +78 K 0.158 +79 N 0.146 +80 F 0.135 +81 K 0.129 +82 K 0.128 +83 R 0.131 +84 C 0.139 +85 L 0.153 +86 Q 0.169 +87 A 0.179 +88 T 0.176 +89 I 0.165 +90 T 0.154 +91 Q 0.149 +92 D 0.150 +93 S 0.150 +94 T 0.147 +95 Y 0.140 +96 G 0.132 +97 D 0.129 +98 E 0.134 +99 D 0.138 +100 C 0.127 +101 L 0.104 +102 Y 0.080 +103 L 0.065 +104 N 0.056 +105 I 0.052 +106 W 0.053 +107 V 0.066 +108 P 0.092 +109 Q 0.124 +110 G 0.148 +111 R 0.156 +112 K 0.152 +113 Q 0.147 +114 V 0.148 +115 S 0.152 +116 R 0.154 +117 D 0.148 +118 L 0.136 +119 P 0.126 +120 V 0.123 +121 M 0.122 +122 I 0.117 +123 W 0.109 +124 I 0.102 +125 Y 0.096 +126 G 0.091 +127 G 0.087 +128 A 0.086 +129 F 0.091 +130 L 0.099 +131 M 0.107 +132 G 0.119 +133 S 0.144 +134 G 0.190 +135 H 0.252 +136 G 0.306 +137 A 0.324 +138 N 0.303 +139 F 0.260 +140 L 0.224 +141 N 0.213 +142 N 0.215 +143 Y 0.209 +144 L 0.191 +145 Y 0.166 +146 D 0.138 +147 G 0.109 +148 E 0.083 +149 E 0.066 +150 I 0.057 +151 A 0.051 +152 T 0.050 +153 R 0.054 +154 G 0.057 +155 N 0.059 +156 V 0.061 +157 I 0.063 +158 V 0.064 +159 V 0.062 +160 T 0.056 +161 F 0.052 +162 N 0.052 +163 Y 0.057 +164 R 0.063 +165 V 0.071 +166 G 0.080 +167 P 0.088 +168 L 0.094 +169 G 0.095 +170 F 0.093 +171 L 0.092 +172 S 0.096 +173 T 0.100 +174 G 0.102 +175 D 0.104 +176 A 0.107 +177 N 0.108 +178 L 0.101 +179 P 0.091 +180 G 0.083 +181 N 0.080 +182 Y 0.077 +183 G 0.075 +184 L 0.075 +185 R 0.078 +186 D 0.079 +187 Q 0.074 +188 H 0.066 +189 M 0.061 +190 A 0.057 +191 I 0.053 +192 A 0.048 +193 W 0.045 +194 V 0.044 +195 K 0.044 +196 R 0.045 +197 N 0.045 +198 I 0.044 +199 A 0.045 +200 A 0.046 +201 F 0.047 +202 G 0.050 +203 G 0.059 +204 D 0.069 +205 P 0.072 +206 N 0.066 +207 N 0.056 +208 I 0.049 +209 T 0.046 +210 L 0.046 +211 F 0.048 +212 G 0.049 +213 E 0.051 +214 S 0.057 +215 A 0.066 +216 G 0.076 +217 G 0.083 +218 A 0.087 +219 S 0.086 +220 V 0.084 +221 S 0.084 +222 L 0.087 +223 Q 0.091 +224 T 0.088 +225 L 0.079 +226 S 0.069 +227 P 0.065 +228 Y 0.066 +229 N 0.069 +230 K 0.066 +231 G 0.058 +232 L 0.047 +233 I 0.042 +234 R 0.045 +235 R 0.058 +236 A 0.074 +237 I 0.086 +238 S 0.089 +239 Q 0.084 +240 S 0.079 +241 G 0.080 +242 V 0.087 +243 A 0.093 +244 L 0.095 +245 S 0.093 +246 P 0.092 +247 W 0.093 +248 V 0.093 +249 I 0.095 +250 Q 0.100 +251 K 0.107 +252 N 0.105 +253 P 0.088 +254 L 0.066 +255 F 0.049 +256 W 0.040 +257 A 0.037 +258 K 0.035 +259 K 0.034 +260 V 0.035 +261 A 0.036 +262 E 0.038 +263 K 0.043 +264 V 0.053 +265 G 0.067 +266 C 0.085 +267 P 0.100 +268 V 0.110 +269 G 0.109 +270 D 0.099 +271 A 0.083 +272 A 0.067 +273 R 0.055 +274 M 0.048 +275 A 0.045 +276 Q 0.046 +277 C 0.050 +278 L 0.052 +279 K 0.052 +280 V 0.055 +281 T 0.063 +282 D 0.068 +283 P 0.064 +284 R 0.058 +285 A 0.055 +286 L 0.056 +287 T 0.060 +288 L 0.069 +289 A 0.084 +290 Y 0.106 +291 K 0.135 +292 V 0.169 +293 P 0.198 +294 L 0.218 +295 A 0.231 +296 G 0.236 +297 L 0.230 +298 E 0.211 +299 Y 0.181 +300 P 0.149 +301 M 0.125 +302 L 0.111 +303 H 0.103 +304 Y 0.096 +305 V 0.091 +306 G 0.091 +307 F 0.096 +308 V 0.105 +309 P 0.115 +310 V 0.122 +311 I 0.124 +312 D 0.121 +313 G 0.115 +314 D 0.111 +315 F 0.111 +316 I 0.117 +317 P 0.124 +318 A 0.130 +319 D 0.129 +320 P 0.119 +321 I 0.106 +322 N 0.096 +323 L 0.090 +324 Y 0.085 +325 A 0.082 +326 N 0.083 +327 A 0.091 +328 A 0.110 +329 D 0.140 +330 I 0.171 +331 D 0.192 +332 Y 0.202 +333 I 0.205 +334 A 0.203 +335 G 0.197 +336 T 0.188 +337 N 0.182 +338 N 0.178 +339 M 0.170 +340 D 0.151 +341 G 0.123 +342 H 0.097 +343 I 0.081 +344 F 0.074 +345 A 0.072 +346 S 0.074 +347 I 0.081 +348 D 0.090 +349 M 0.102 +350 P 0.117 +351 A 0.131 +352 I 0.137 +353 N 0.137 +354 K 0.143 +355 G 0.157 +356 N 0.170 +357 K 0.174 +358 K 0.163 +359 V 0.137 +360 T 0.106 +361 E 0.083 +362 E 0.074 +363 D 0.068 +364 F 0.059 +365 Y 0.051 +366 K 0.047 +367 L 0.042 +368 V 0.038 +369 S 0.036 +370 E 0.039 +371 F 0.044 +372 T 0.048 +373 I 0.058 +374 T 0.077 +375 K 0.100 +376 G 0.116 +377 L 0.116 +378 R 0.107 +379 G 0.094 +380 A 0.083 +381 K 0.076 +382 T 0.074 +383 T 0.073 +384 F 0.069 +385 D 0.059 +386 V 0.047 +387 Y 0.039 +388 T 0.036 +389 E 0.043 +390 S 0.060 +391 W 0.084 +392 A 0.109 +393 Q 0.130 +394 D 0.143 +395 P 0.143 +396 S 0.128 +397 Q 0.106 +398 E 0.089 +399 N 0.080 +400 K 0.079 +401 K 0.086 +402 K 0.101 +403 T 0.115 +404 V 0.123 +405 V 0.129 +406 D 0.136 +407 F 0.138 +408 E 0.131 +409 T 0.118 +410 D 0.104 +411 V 0.088 +412 L 0.074 +413 F 0.066 +414 L 0.065 +415 V 0.065 +416 P 0.064 +417 T 0.062 +418 E 0.058 +419 I 0.053 +420 A 0.052 +421 L 0.054 +422 A 0.055 +423 Q 0.053 +424 H 0.051 +425 R 0.051 +426 A 0.054 +427 N 0.058 +428 A 0.063 +429 K 0.073 +430 S 0.089 +431 A 0.107 +432 K 0.120 +433 T 0.122 +434 Y 0.118 +435 A 0.114 +436 Y 0.111 +437 L 0.112 +438 F 0.118 +439 S 0.132 +440 H 0.149 +441 P 0.162 +442 S 0.166 +443 R 0.164 +444 M 0.159 +445 P 0.146 +446 V 0.128 +447 Y 0.112 +448 P 0.103 +449 K 0.101 +450 W 0.109 +451 V 0.126 +452 G 0.145 +453 A 0.163 +454 D 0.182 +455 H 0.202 +456 A 0.221 +457 D 0.232 +458 D 0.223 +459 I 0.191 +460 Q 0.155 +461 Y 0.131 +462 V 0.119 +463 F 0.116 +464 G 0.124 +465 K 0.136 +466 P 0.141 +467 F 0.136 +468 A 0.131 +469 T 0.130 +470 P 0.131 +471 T 0.131 +472 G 0.127 +473 Y 0.115 +474 R 0.103 +475 P 0.101 +476 Q 0.112 +477 D 0.123 +478 R 0.127 +479 T 0.127 +480 V 0.128 +481 S 0.131 +482 K 0.133 +483 A 0.134 +484 M 0.131 +485 I 0.123 +486 A 0.107 +487 Y 0.091 +488 W 0.077 +489 T 0.066 +490 N 0.060 +491 F 0.057 +492 A 0.060 +493 K 0.073 +494 T 0.097 +495 G 0.129 +496 D 0.154 +497 P 0.163 +498 N 0.163 +499 M 0.175 +500 G 0.201 +501 D 0.222 +502 S 0.227 +503 A 0.214 +504 V 0.190 +505 P 0.164 +506 T 0.140 +507 H 0.120 +508 W 0.103 +509 E 0.090 +510 P 0.082 +511 Y 0.076 +512 T 0.075 +513 T 0.082 +514 E 0.098 +515 N 0.118 +516 S 0.135 +517 G 0.142 +518 Y 0.141 +519 L 0.134 +520 E 0.129 +521 I 0.129 +522 T 0.145 +523 K 0.182 +524 K 0.242 +525 M 0.314 +526 G 0.372 +527 S 0.387 +528 S 0.350 +529 S 0.282 +530 M 0.214 +531 K 0.167 +532 R 0.144 +533 S 0.137 +534 L 0.129 +535 R 0.117 +536 T 0.104 +537 N 0.095 +538 F 0.086 +539 L 0.076 +540 R 0.066 +541 Y 0.061 +542 W 0.059 +543 T 0.064 +544 L 0.081 +545 T 0.110 +546 Y 0.148 +547 L 0.198 +548 A 0.262 +549 L 0.332 +550 P 0.398 +551 T 0.453 +552 V 0.495 +553 T 0.527 +554 D 0.554 +555 Q 0.565 +556 E 0.550 +557 A 0.521 +558 T 0.506 +559 P 0.522 +560 V 0.558 +561 P 0.586 +562 P 0.594 +563 T 0.591 +564 G 0.574 +565 D 0.517 +566 S 0.441 +567 E 0.412 +568 A 0.435 +569 T 0.465 +570 P 0.500 +571 V 0.560 +572 P 0.611 +573 P 0.617 +574 T 0.618 +575 G 0.661 +576 D 0.721 +577 S 0.757 +578 E 0.766 +579 T 0.765 +580 A 0.761 +581 P 0.757 +582 V 0.755 +583 P 0.756 +584 P 0.754 +585 T 0.756 +586 G 0.768 +587 D 0.781 +588 S 0.786 +589 G 0.779 +590 A 0.767 +591 P 0.757 +592 P 0.754 +593 V 0.760 +594 P 0.767 +595 P 0.767 +596 T 0.764 +597 G 0.766 +598 D 0.772 +599 S 0.774 +600 G 0.767 +601 A 0.756 +602 P 0.741 +603 P 0.728 +604 V 0.722 +605 P 0.720 +606 P 0.715 +607 T 0.715 +608 G 0.729 +609 D 0.749 +610 S 0.762 +611 G 0.762 +612 A 0.756 +613 P 0.750 +614 P 0.747 +615 V 0.750 +616 P 0.755 +617 P 0.755 +618 T 0.752 +619 G 0.753 +620 D 0.758 +621 S 0.757 +622 G 0.750 +623 A 0.740 +624 P 0.729 +625 P 0.721 +626 V 0.718 +627 P 0.721 +628 P 0.721 +629 T 0.720 +630 G 0.726 +631 D 0.736 +632 S 0.743 +633 G 0.741 +634 A 0.734 +635 P 0.727 +636 P 0.724 +637 V 0.728 +638 P 0.738 +639 P 0.746 +640 T 0.752 +641 G 0.759 +642 D 0.765 +643 S 0.767 +644 G 0.762 +645 A 0.754 +646 P 0.747 +647 P 0.741 +648 V 0.739 +649 P 0.739 +650 P 0.735 +651 T 0.729 +652 G 0.729 +653 D 0.731 +654 S 0.730 +655 G 0.725 +656 A 0.721 +657 P 0.720 +658 P 0.722 +659 V 0.728 +660 P 0.738 +661 P 0.747 +662 T 0.753 +663 G 0.756 +664 D 0.756 +665 S 0.752 +666 G 0.746 +667 A 0.742 +668 P 0.739 +669 P 0.738 +670 V 0.737 +671 P 0.733 +672 P 0.724 +673 T 0.715 +674 G 0.716 +675 D 0.723 +676 A 0.726 +677 G 0.724 +678 P 0.724 +679 P 0.730 +680 P 0.741 +681 V 0.750 +682 P 0.755 +683 P 0.754 +684 T 0.753 +685 G 0.755 +686 D 0.755 +687 S 0.746 +688 G 0.732 +689 A 0.723 +690 P 0.722 +691 P 0.727 +692 V 0.734 +693 P 0.739 +694 P 0.739 +695 T 0.741 +696 G 0.753 +697 D 0.769 +698 S 0.780 +699 G 0.784 +700 A 0.786 +701 P 0.789 +702 P 0.790 +703 V 0.785 +704 T 0.775 +705 P 0.762 +706 T 0.757 +707 G 0.767 +708 D 0.773 +709 S 0.766 +710 E 0.758 +711 T 0.763 +712 A 0.776 +713 P 0.784 +714 V 0.775 +715 P 0.736 +716 P 0.674 +717 T 0.634 +718 G 0.649 +719 D 0.684 +720 S 0.692 +721 G 0.667 +722 A 0.618 +723 P 0.562 +724 P 0.538 +725 V 0.573 +726 P 0.630 +727 P 0.664 +728 T 0.678 +729 G 0.695 +730 D 0.703 +731 S 0.689 +732 E 0.663 +733 A 0.637 +734 A 0.614 +735 P 0.605 +736 V 0.610 +737 P 0.622 +738 P 0.628 +739 T 0.623 +740 D 0.602 +741 D 0.566 +742 S 0.527 +743 K 0.503 +744 E 0.491 +745 A 0.469 +746 Q 0.413 +747 M 0.333 +748 P 0.264 +749 A 0.221 +750 V 0.194 +751 I 0.169 +752 R 0.149 +753 F 0.137 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000170835.17_ENST00000372080.8_GN:CEL_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000170835.17_ENST00000372080.8_GN:CEL_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..8ecd9e21a4a65a99c85ae9f503a214bf5340846f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000170835.17_ENST00000372080.8_GN:CEL_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid @@ -0,0 +1,757 @@ +>ENSG00000170835.17|ENST00000372080.8|GN:CEL|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 +1 M 0.242 +2 L 0.240 +3 T 0.247 +4 M 0.262 +5 G 0.259 +6 R 0.233 +7 L 0.204 +8 Q 0.189 +9 L 0.185 +10 V 0.190 +11 V 0.209 +12 L 0.235 +13 G 0.253 +14 L 0.260 +15 T 0.264 +16 C 0.265 +17 C 0.267 +18 W 0.288 +19 A 0.329 +20 V 0.374 +21 A 0.405 +22 S 0.420 +23 A 0.412 +24 A 0.372 +25 K 0.308 +26 L 0.238 +27 G 0.175 +28 A 0.127 +29 V 0.098 +30 Y 0.088 +31 T 0.095 +32 E 0.110 +33 G 0.122 +34 G 0.125 +35 F 0.119 +36 V 0.111 +37 E 0.101 +38 G 0.094 +39 V 0.094 +40 N 0.103 +41 K 0.121 +42 K 0.149 +43 L 0.180 +44 G 0.203 +45 L 0.212 +46 L 0.205 +47 G 0.182 +48 D 0.148 +49 S 0.113 +50 V 0.087 +51 D 0.072 +52 I 0.072 +53 F 0.085 +54 K 0.109 +55 G 0.137 +56 I 0.159 +57 P 0.170 +58 F 0.177 +59 A 0.186 +60 A 0.191 +61 P 0.183 +62 T 0.166 +63 K 0.148 +64 A 0.135 +65 L 0.129 +66 E 0.134 +67 N 0.147 +68 P 0.164 +69 Q 0.181 +70 P 0.192 +71 H 0.195 +72 P 0.190 +73 G 0.181 +74 W 0.176 +75 Q 0.180 +76 G 0.188 +77 T 0.192 +78 L 0.191 +79 K 0.183 +80 A 0.171 +81 K 0.158 +82 N 0.145 +83 F 0.135 +84 K 0.128 +85 K 0.127 +86 R 0.130 +87 C 0.138 +88 L 0.152 +89 Q 0.168 +90 A 0.178 +91 T 0.175 +92 I 0.164 +93 T 0.153 +94 Q 0.149 +95 D 0.149 +96 S 0.150 +97 T 0.147 +98 Y 0.140 +99 G 0.132 +100 D 0.130 +101 E 0.134 +102 D 0.138 +103 C 0.127 +104 L 0.104 +105 Y 0.080 +106 L 0.065 +107 N 0.056 +108 I 0.052 +109 W 0.053 +110 V 0.066 +111 P 0.092 +112 Q 0.124 +113 G 0.148 +114 R 0.156 +115 K 0.152 +116 Q 0.148 +117 V 0.149 +118 S 0.153 +119 R 0.154 +120 D 0.148 +121 L 0.136 +122 P 0.126 +123 V 0.123 +124 M 0.122 +125 I 0.117 +126 W 0.109 +127 I 0.102 +128 Y 0.096 +129 G 0.092 +130 G 0.088 +131 A 0.087 +132 F 0.091 +133 L 0.099 +134 M 0.108 +135 G 0.119 +136 S 0.144 +137 G 0.191 +138 H 0.254 +139 G 0.307 +140 A 0.326 +141 N 0.304 +142 F 0.261 +143 L 0.224 +144 N 0.212 +145 N 0.214 +146 Y 0.209 +147 L 0.191 +148 Y 0.166 +149 D 0.138 +150 G 0.108 +151 E 0.082 +152 E 0.066 +153 I 0.057 +154 A 0.051 +155 T 0.050 +156 R 0.054 +157 G 0.057 +158 N 0.059 +159 V 0.060 +160 I 0.063 +161 V 0.064 +162 V 0.062 +163 T 0.056 +164 F 0.052 +165 N 0.052 +166 Y 0.057 +167 R 0.063 +168 V 0.071 +169 G 0.080 +170 P 0.089 +171 L 0.095 +172 G 0.096 +173 F 0.093 +174 L 0.092 +175 S 0.096 +176 T 0.100 +177 G 0.102 +178 D 0.104 +179 A 0.107 +180 N 0.108 +181 L 0.101 +182 P 0.091 +183 G 0.083 +184 N 0.080 +185 Y 0.077 +186 G 0.075 +187 L 0.075 +188 R 0.078 +189 D 0.079 +190 Q 0.074 +191 H 0.066 +192 M 0.061 +193 A 0.057 +194 I 0.053 +195 A 0.048 +196 W 0.045 +197 V 0.044 +198 K 0.044 +199 R 0.045 +200 N 0.044 +201 I 0.044 +202 A 0.045 +203 A 0.046 +204 F 0.046 +205 G 0.050 +206 G 0.059 +207 D 0.069 +208 P 0.072 +209 N 0.066 +210 N 0.056 +211 I 0.049 +212 T 0.046 +213 L 0.046 +214 F 0.047 +215 G 0.049 +216 E 0.051 +217 S 0.056 +218 A 0.066 +219 G 0.075 +220 G 0.083 +221 A 0.086 +222 S 0.086 +223 V 0.084 +224 S 0.083 +225 L 0.087 +226 Q 0.091 +227 T 0.088 +228 L 0.078 +229 S 0.068 +230 P 0.064 +231 Y 0.066 +232 N 0.068 +233 K 0.066 +234 G 0.057 +235 L 0.047 +236 I 0.042 +237 R 0.045 +238 R 0.058 +239 A 0.074 +240 I 0.086 +241 S 0.088 +242 Q 0.084 +243 S 0.079 +244 G 0.080 +245 V 0.086 +246 A 0.093 +247 L 0.095 +248 S 0.093 +249 P 0.092 +250 W 0.093 +251 V 0.093 +252 I 0.095 +253 Q 0.100 +254 K 0.107 +255 N 0.105 +256 P 0.088 +257 L 0.066 +258 F 0.049 +259 W 0.040 +260 A 0.037 +261 K 0.035 +262 K 0.034 +263 V 0.035 +264 A 0.036 +265 E 0.038 +266 K 0.043 +267 V 0.053 +268 G 0.068 +269 C 0.085 +270 P 0.101 +271 V 0.110 +272 G 0.109 +273 D 0.099 +274 A 0.083 +275 A 0.067 +276 R 0.055 +277 M 0.048 +278 A 0.045 +279 Q 0.046 +280 C 0.050 +281 L 0.053 +282 K 0.052 +283 V 0.056 +284 T 0.064 +285 D 0.068 +286 P 0.065 +287 R 0.058 +288 A 0.055 +289 L 0.056 +290 T 0.060 +291 L 0.069 +292 A 0.085 +293 Y 0.107 +294 K 0.136 +295 V 0.169 +296 P 0.199 +297 L 0.219 +298 A 0.231 +299 G 0.236 +300 L 0.231 +301 E 0.211 +302 Y 0.181 +303 P 0.150 +304 M 0.125 +305 L 0.111 +306 H 0.103 +307 Y 0.097 +308 V 0.092 +309 G 0.091 +310 F 0.096 +311 V 0.105 +312 P 0.116 +313 V 0.123 +314 I 0.124 +315 D 0.121 +316 G 0.115 +317 D 0.111 +318 F 0.111 +319 I 0.117 +320 P 0.124 +321 A 0.130 +322 D 0.129 +323 P 0.119 +324 I 0.106 +325 N 0.096 +326 L 0.090 +327 Y 0.085 +328 A 0.082 +329 N 0.083 +330 A 0.091 +331 A 0.111 +332 D 0.140 +333 I 0.171 +334 D 0.193 +335 Y 0.203 +336 I 0.206 +337 A 0.203 +338 G 0.196 +339 T 0.188 +340 N 0.182 +341 N 0.178 +342 M 0.170 +343 D 0.151 +344 G 0.123 +345 H 0.096 +346 I 0.081 +347 F 0.074 +348 A 0.072 +349 S 0.074 +350 I 0.081 +351 D 0.090 +352 M 0.102 +353 P 0.117 +354 A 0.131 +355 I 0.137 +356 N 0.137 +357 K 0.143 +358 G 0.157 +359 N 0.170 +360 K 0.174 +361 K 0.163 +362 V 0.137 +363 T 0.105 +364 E 0.083 +365 E 0.073 +366 D 0.067 +367 F 0.058 +368 Y 0.051 +369 K 0.047 +370 L 0.042 +371 V 0.038 +372 S 0.036 +373 E 0.039 +374 F 0.044 +375 T 0.048 +376 I 0.057 +377 T 0.076 +378 K 0.099 +379 G 0.115 +380 L 0.116 +381 R 0.106 +382 G 0.094 +383 A 0.083 +384 K 0.076 +385 T 0.074 +386 T 0.073 +387 F 0.068 +388 D 0.059 +389 V 0.047 +390 Y 0.038 +391 T 0.036 +392 E 0.043 +393 S 0.060 +394 W 0.084 +395 A 0.108 +396 Q 0.129 +397 D 0.143 +398 P 0.143 +399 S 0.128 +400 Q 0.106 +401 E 0.089 +402 N 0.080 +403 K 0.079 +404 K 0.086 +405 K 0.101 +406 T 0.115 +407 V 0.123 +408 V 0.129 +409 D 0.136 +410 F 0.138 +411 E 0.131 +412 T 0.118 +413 D 0.104 +414 V 0.088 +415 L 0.074 +416 F 0.066 +417 L 0.064 +418 V 0.064 +419 P 0.064 +420 T 0.062 +421 E 0.058 +422 I 0.053 +423 A 0.052 +424 L 0.054 +425 A 0.055 +426 Q 0.053 +427 H 0.050 +428 R 0.051 +429 A 0.053 +430 N 0.058 +431 A 0.063 +432 K 0.073 +433 S 0.089 +434 A 0.108 +435 K 0.120 +436 T 0.122 +437 Y 0.118 +438 A 0.114 +439 Y 0.111 +440 L 0.112 +441 F 0.118 +442 S 0.132 +443 H 0.148 +444 P 0.161 +445 S 0.165 +446 R 0.164 +447 M 0.159 +448 P 0.146 +449 V 0.128 +450 Y 0.112 +451 P 0.103 +452 K 0.101 +453 W 0.109 +454 V 0.126 +455 G 0.145 +456 A 0.163 +457 D 0.182 +458 H 0.202 +459 A 0.221 +460 D 0.232 +461 D 0.222 +462 I 0.190 +463 Q 0.155 +464 Y 0.131 +465 V 0.119 +466 F 0.116 +467 G 0.123 +468 K 0.136 +469 P 0.141 +470 F 0.136 +471 A 0.131 +472 T 0.130 +473 P 0.131 +474 T 0.131 +475 G 0.127 +476 Y 0.115 +477 R 0.103 +478 P 0.101 +479 Q 0.112 +480 D 0.123 +481 R 0.127 +482 T 0.127 +483 V 0.129 +484 S 0.131 +485 K 0.133 +486 A 0.134 +487 M 0.131 +488 I 0.123 +489 A 0.107 +490 Y 0.090 +491 W 0.076 +492 T 0.066 +493 N 0.060 +494 F 0.057 +495 A 0.060 +496 K 0.073 +497 T 0.097 +498 G 0.129 +499 D 0.154 +500 P 0.163 +501 N 0.163 +502 M 0.175 +503 G 0.201 +504 D 0.222 +505 S 0.227 +506 A 0.214 +507 V 0.190 +508 P 0.164 +509 T 0.140 +510 H 0.120 +511 W 0.103 +512 E 0.090 +513 P 0.082 +514 Y 0.076 +515 T 0.075 +516 T 0.082 +517 E 0.098 +518 N 0.118 +519 S 0.135 +520 G 0.142 +521 Y 0.141 +522 L 0.135 +523 E 0.129 +524 I 0.129 +525 T 0.145 +526 K 0.182 +527 K 0.243 +528 M 0.314 +529 G 0.373 +530 S 0.388 +531 S 0.350 +532 S 0.282 +533 M 0.215 +534 K 0.167 +535 R 0.144 +536 S 0.136 +537 L 0.129 +538 R 0.116 +539 T 0.104 +540 N 0.094 +541 F 0.086 +542 L 0.075 +543 R 0.066 +544 Y 0.060 +545 W 0.059 +546 T 0.064 +547 L 0.081 +548 T 0.110 +549 Y 0.148 +550 L 0.198 +551 A 0.262 +552 L 0.332 +553 P 0.398 +554 T 0.454 +555 V 0.496 +556 T 0.529 +557 D 0.555 +558 Q 0.566 +559 E 0.551 +560 A 0.522 +561 T 0.507 +562 P 0.524 +563 V 0.567 +564 P 0.613 +565 P 0.646 +566 T 0.656 +567 G 0.625 +568 D 0.543 +569 S 0.450 +570 E 0.414 +571 A 0.436 +572 T 0.465 +573 P 0.500 +574 V 0.561 +575 P 0.611 +576 P 0.618 +577 T 0.618 +578 G 0.661 +579 D 0.722 +580 S 0.758 +581 E 0.767 +582 T 0.766 +583 A 0.762 +584 P 0.757 +585 V 0.756 +586 P 0.756 +587 P 0.755 +588 T 0.756 +589 G 0.768 +590 D 0.782 +591 S 0.786 +592 G 0.780 +593 A 0.769 +594 P 0.760 +595 P 0.757 +596 V 0.763 +597 P 0.770 +598 P 0.770 +599 T 0.767 +600 G 0.769 +601 D 0.774 +602 S 0.774 +603 G 0.768 +604 A 0.756 +605 P 0.741 +606 P 0.729 +607 V 0.723 +608 P 0.721 +609 P 0.716 +610 T 0.716 +611 G 0.730 +612 D 0.750 +613 S 0.762 +614 G 0.763 +615 A 0.757 +616 P 0.750 +617 P 0.748 +618 V 0.751 +619 P 0.756 +620 P 0.756 +621 T 0.753 +622 G 0.754 +623 D 0.758 +624 S 0.758 +625 G 0.751 +626 A 0.741 +627 P 0.730 +628 P 0.722 +629 V 0.719 +630 P 0.722 +631 P 0.722 +632 T 0.722 +633 G 0.728 +634 D 0.738 +635 S 0.743 +636 G 0.742 +637 A 0.735 +638 P 0.728 +639 P 0.724 +640 V 0.729 +641 P 0.739 +642 P 0.747 +643 T 0.753 +644 G 0.760 +645 D 0.766 +646 S 0.768 +647 G 0.763 +648 A 0.755 +649 P 0.747 +650 P 0.742 +651 V 0.740 +652 P 0.740 +653 P 0.736 +654 T 0.730 +655 G 0.730 +656 D 0.732 +657 S 0.731 +658 G 0.726 +659 A 0.721 +660 P 0.721 +661 P 0.723 +662 V 0.729 +663 P 0.739 +664 P 0.748 +665 T 0.754 +666 G 0.756 +667 D 0.756 +668 S 0.752 +669 G 0.747 +670 A 0.742 +671 P 0.740 +672 P 0.739 +673 V 0.738 +674 P 0.734 +675 P 0.725 +676 T 0.716 +677 G 0.717 +678 D 0.724 +679 A 0.727 +680 G 0.725 +681 P 0.725 +682 P 0.731 +683 P 0.742 +684 V 0.751 +685 P 0.756 +686 P 0.755 +687 T 0.754 +688 G 0.756 +689 D 0.756 +690 S 0.746 +691 G 0.733 +692 A 0.723 +693 P 0.722 +694 P 0.727 +695 V 0.734 +696 P 0.740 +697 P 0.741 +698 T 0.744 +699 G 0.755 +700 D 0.770 +701 S 0.780 +702 G 0.784 +703 A 0.786 +704 P 0.789 +705 P 0.790 +706 V 0.785 +707 T 0.775 +708 P 0.762 +709 T 0.758 +710 G 0.767 +711 D 0.774 +712 S 0.767 +713 E 0.759 +714 T 0.764 +715 A 0.777 +716 P 0.785 +717 V 0.778 +718 P 0.745 +719 P 0.691 +720 T 0.656 +721 G 0.667 +722 D 0.693 +723 S 0.696 +724 G 0.669 +725 A 0.620 +726 P 0.563 +727 P 0.539 +728 V 0.574 +729 P 0.633 +730 P 0.667 +731 T 0.682 +732 G 0.698 +733 D 0.704 +734 S 0.690 +735 E 0.664 +736 A 0.637 +737 A 0.614 +738 P 0.605 +739 V 0.610 +740 P 0.621 +741 P 0.628 +742 T 0.623 +743 D 0.601 +744 D 0.565 +745 S 0.527 +746 K 0.502 +747 E 0.490 +748 A 0.467 +749 Q 0.411 +750 M 0.331 +751 P 0.262 +752 A 0.219 +753 V 0.191 +754 I 0.167 +755 R 0.147 +756 F 0.135 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000170915.10_ENST00000442253.3_GN:PAQR8_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000170915.10_ENST00000442253.3_GN:PAQR8_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b0289d7e6a2f6176f743872feb3b4e1ffdb0a4a4 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000170915.10_ENST00000442253.3_GN:PAQR8_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,355 @@ +>ENSG00000170915.10|ENST00000442253.3|GN:PAQR8|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.249 +2 T 0.233 +3 T 0.214 +4 A 0.199 +5 I 0.185 +6 L 0.177 +7 E 0.180 +8 R 0.195 +9 L 0.212 +10 S 0.234 +11 T 0.262 +12 L 0.290 +13 S 0.313 +14 V 0.332 +15 S 0.347 +16 G 0.348 +17 Q 0.336 +18 Q 0.330 +19 L 0.340 +20 R 0.367 +21 R 0.402 +22 L 0.422 +23 P 0.406 +24 K 0.364 +25 I 0.324 +26 L 0.301 +27 E 0.297 +28 D 0.311 +29 G 0.330 +30 L 0.333 +31 P 0.309 +32 K 0.268 +33 M 0.227 +34 P 0.193 +35 C 0.167 +36 T 0.148 +37 V 0.128 +38 P 0.105 +39 E 0.084 +40 T 0.072 +41 D 0.071 +42 V 0.075 +43 P 0.080 +44 Q 0.088 +45 L 0.097 +46 F 0.103 +47 R 0.107 +48 E 0.117 +49 P 0.133 +50 Y 0.145 +51 I 0.141 +52 R 0.129 +53 T 0.122 +54 G 0.122 +55 Y 0.120 +56 R 0.115 +57 P 0.109 +58 T 0.103 +59 G 0.099 +60 H 0.094 +61 E 0.087 +62 W 0.080 +63 R 0.074 +64 Y 0.072 +65 Y 0.073 +66 F 0.080 +67 F 0.090 +68 S 0.095 +69 L 0.086 +70 F 0.068 +71 Q 0.054 +72 K 0.047 +73 H 0.047 +74 N 0.053 +75 E 0.064 +76 V 0.083 +77 V 0.103 +78 N 0.111 +79 V 0.104 +80 W 0.104 +81 T 0.124 +82 H 0.138 +83 L 0.126 +84 L 0.104 +85 A 0.094 +86 A 0.090 +87 L 0.081 +88 A 0.066 +89 V 0.055 +90 L 0.054 +91 L 0.054 +92 R 0.048 +93 F 0.040 +94 W 0.039 +95 A 0.049 +96 F 0.067 +97 A 0.091 +98 E 0.118 +99 A 0.141 +100 E 0.149 +101 A 0.145 +102 L 0.136 +103 P 0.126 +104 W 0.116 +105 A 0.107 +106 S 0.096 +107 T 0.080 +108 H 0.063 +109 S 0.049 +110 L 0.042 +111 P 0.038 +112 L 0.036 +113 L 0.034 +114 L 0.032 +115 F 0.033 +116 I 0.038 +117 L 0.046 +118 S 0.053 +119 S 0.055 +120 I 0.052 +121 T 0.046 +122 Y 0.040 +123 L 0.039 +124 T 0.043 +125 C 0.050 +126 S 0.056 +127 L 0.056 +128 L 0.056 +129 A 0.059 +130 H 0.061 +131 L 0.060 +132 L 0.057 +133 Q 0.058 +134 S 0.065 +135 K 0.074 +136 S 0.077 +137 E 0.073 +138 L 0.063 +139 S 0.054 +140 H 0.048 +141 Y 0.047 +142 T 0.047 +143 F 0.045 +144 Y 0.042 +145 F 0.039 +146 V 0.038 +147 D 0.040 +148 Y 0.049 +149 V 0.062 +150 G 0.076 +151 V 0.082 +152 S 0.077 +153 V 0.065 +154 Y 0.056 +155 Q 0.052 +156 Y 0.052 +157 G 0.051 +158 S 0.048 +159 A 0.044 +160 L 0.038 +161 A 0.034 +162 H 0.032 +163 F 0.032 +164 F 0.035 +165 Y 0.039 +166 S 0.041 +167 S 0.040 +168 D 0.035 +169 Q 0.030 +170 A 0.027 +171 W 0.026 +172 Y 0.025 +173 D 0.024 +174 R 0.021 +175 F 0.019 +176 W 0.019 +177 L 0.020 +178 F 0.023 +179 F 0.028 +180 L 0.030 +181 P 0.030 +182 A 0.030 +183 A 0.031 +184 A 0.032 +185 F 0.034 +186 C 0.037 +187 G 0.040 +188 W 0.040 +189 L 0.040 +190 S 0.041 +191 C 0.040 +192 A 0.037 +193 G 0.034 +194 C 0.033 +195 C 0.033 +196 Y 0.031 +197 A 0.030 +198 K 0.031 +199 Y 0.036 +200 R 0.044 +201 Y 0.052 +202 R 0.058 +203 R 0.065 +204 P 0.074 +205 Y 0.077 +206 P 0.069 +207 V 0.056 +208 M 0.044 +209 R 0.037 +210 K 0.033 +211 I 0.031 +212 C 0.031 +213 Q 0.033 +214 V 0.038 +215 V 0.044 +216 P 0.049 +217 A 0.053 +218 G 0.054 +219 L 0.054 +220 A 0.052 +221 F 0.049 +222 I 0.045 +223 L 0.042 +224 D 0.041 +225 I 0.041 +226 S 0.040 +227 P 0.038 +228 V 0.035 +229 A 0.029 +230 H 0.025 +231 R 0.022 +232 V 0.024 +233 A 0.031 +234 L 0.045 +235 C 0.062 +236 H 0.075 +237 L 0.083 +238 A 0.091 +239 G 0.097 +240 C 0.099 +241 Q 0.098 +242 E 0.095 +243 Q 0.086 +244 A 0.069 +245 A 0.048 +246 W 0.033 +247 Y 0.029 +248 H 0.032 +249 T 0.035 +250 L 0.040 +251 Q 0.049 +252 I 0.061 +253 L 0.063 +254 F 0.053 +255 F 0.040 +256 L 0.031 +257 V 0.028 +258 S 0.026 +259 A 0.026 +260 Y 0.027 +261 F 0.033 +262 F 0.041 +263 S 0.047 +264 C 0.052 +265 P 0.053 +266 V 0.050 +267 P 0.045 +268 E 0.042 +269 K 0.045 +270 Y 0.055 +271 F 0.074 +272 P 0.094 +273 G 0.107 +274 S 0.107 +275 C 0.099 +276 D 0.088 +277 I 0.078 +278 V 0.073 +279 G 0.081 +280 H 0.106 +281 G 0.139 +282 H 0.160 +283 Q 0.154 +284 I 0.134 +285 F 0.113 +286 H 0.095 +287 A 0.080 +288 F 0.072 +289 L 0.067 +290 S 0.061 +291 I 0.054 +292 C 0.051 +293 T 0.052 +294 L 0.052 +295 S 0.051 +296 Q 0.050 +297 L 0.052 +298 E 0.053 +299 A 0.053 +300 I 0.049 +301 L 0.043 +302 L 0.040 +303 D 0.040 +304 Y 0.045 +305 Q 0.053 +306 G 0.056 +307 R 0.052 +308 Q 0.046 +309 E 0.045 +310 I 0.045 +311 F 0.045 +312 L 0.046 +313 Q 0.053 +314 R 0.064 +315 H 0.073 +316 G 0.078 +317 P 0.075 +318 L 0.063 +319 S 0.051 +320 V 0.042 +321 H 0.036 +322 M 0.034 +323 A 0.036 +324 C 0.043 +325 L 0.050 +326 S 0.055 +327 F 0.056 +328 F 0.057 +329 F 0.060 +330 L 0.061 +331 A 0.059 +332 A 0.059 +333 C 0.064 +334 S 0.066 +335 A 0.063 +336 A 0.062 +337 T 0.068 +338 A 0.077 +339 A 0.081 +340 L 0.075 +341 L 0.066 +342 R 0.058 +343 H 0.057 +344 K 0.067 +345 V 0.088 +346 K 0.113 +347 A 0.131 +348 R 0.142 +349 L 0.157 +350 T 0.185 +351 K 0.225 +352 K 0.267 +353 D 0.294 +354 S 0.303 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000170915.10_ENST00000442253.3_GN:PAQR8_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000170915.10_ENST00000442253.3_GN:PAQR8_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..cd3f7416a3da98b594a48cf1ea7ffae4c8562303 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000170915.10_ENST00000442253.3_GN:PAQR8_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid @@ -0,0 +1,360 @@ +>ENSG00000170915.10|ENST00000442253.3|GN:PAQR8|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:5 +1 M 0.247 +2 R 0.236 +3 A 0.227 +4 A 0.223 +5 A 0.214 +6 M 0.194 +7 T 0.168 +8 T 0.146 +9 A 0.135 +10 I 0.132 +11 L 0.135 +12 E 0.145 +13 R 0.157 +14 L 0.171 +15 S 0.193 +16 T 0.223 +17 L 0.255 +18 S 0.285 +19 V 0.317 +20 S 0.348 +21 G 0.365 +22 Q 0.361 +23 Q 0.350 +24 L 0.347 +25 R 0.364 +26 R 0.395 +27 L 0.415 +28 P 0.399 +29 K 0.357 +30 I 0.320 +31 L 0.300 +32 E 0.298 +33 D 0.312 +34 G 0.329 +35 L 0.331 +36 P 0.307 +37 K 0.268 +38 M 0.227 +39 P 0.194 +40 C 0.168 +41 T 0.149 +42 V 0.129 +43 P 0.106 +44 E 0.085 +45 T 0.074 +46 D 0.073 +47 V 0.078 +48 P 0.083 +49 Q 0.090 +50 L 0.098 +51 F 0.104 +52 R 0.107 +53 E 0.116 +54 P 0.133 +55 Y 0.144 +56 I 0.141 +57 R 0.129 +58 T 0.122 +59 G 0.121 +60 Y 0.119 +61 R 0.114 +62 P 0.107 +63 T 0.102 +64 G 0.098 +65 H 0.093 +66 E 0.086 +67 W 0.078 +68 R 0.073 +69 Y 0.071 +70 Y 0.072 +71 F 0.079 +72 F 0.089 +73 S 0.094 +74 L 0.085 +75 F 0.068 +76 Q 0.054 +77 K 0.047 +78 H 0.047 +79 N 0.052 +80 E 0.064 +81 V 0.083 +82 V 0.103 +83 N 0.111 +84 V 0.104 +85 W 0.105 +86 T 0.126 +87 H 0.140 +88 L 0.127 +89 L 0.105 +90 A 0.094 +91 A 0.090 +92 L 0.080 +93 A 0.065 +94 V 0.054 +95 L 0.053 +96 L 0.053 +97 R 0.047 +98 F 0.039 +99 W 0.038 +100 A 0.048 +101 F 0.067 +102 A 0.090 +103 E 0.118 +104 A 0.141 +105 E 0.150 +106 A 0.146 +107 L 0.137 +108 P 0.127 +109 W 0.117 +110 A 0.107 +111 S 0.096 +112 T 0.080 +113 H 0.063 +114 S 0.049 +115 L 0.042 +116 P 0.038 +117 L 0.036 +118 L 0.034 +119 L 0.032 +120 F 0.033 +121 I 0.038 +122 L 0.046 +123 S 0.054 +124 S 0.056 +125 I 0.053 +126 T 0.046 +127 Y 0.040 +128 L 0.039 +129 T 0.043 +130 C 0.051 +131 S 0.056 +132 L 0.056 +133 L 0.056 +134 A 0.059 +135 H 0.062 +136 L 0.060 +137 L 0.058 +138 Q 0.059 +139 S 0.066 +140 K 0.074 +141 S 0.078 +142 E 0.073 +143 L 0.064 +144 S 0.054 +145 H 0.048 +146 Y 0.047 +147 T 0.047 +148 F 0.045 +149 Y 0.042 +150 F 0.040 +151 V 0.038 +152 D 0.041 +153 Y 0.049 +154 V 0.062 +155 G 0.076 +156 V 0.083 +157 S 0.077 +158 V 0.065 +159 Y 0.056 +160 Q 0.052 +161 Y 0.052 +162 G 0.051 +163 S 0.048 +164 A 0.044 +165 L 0.038 +166 A 0.034 +167 H 0.032 +168 F 0.032 +169 F 0.035 +170 Y 0.038 +171 S 0.041 +172 S 0.040 +173 D 0.035 +174 Q 0.030 +175 A 0.027 +176 W 0.026 +177 Y 0.025 +178 D 0.024 +179 R 0.021 +180 F 0.019 +181 W 0.019 +182 L 0.020 +183 F 0.023 +184 F 0.028 +185 L 0.030 +186 P 0.030 +187 A 0.030 +188 A 0.031 +189 A 0.032 +190 F 0.034 +191 C 0.038 +192 G 0.040 +193 W 0.040 +194 L 0.040 +195 S 0.041 +196 C 0.041 +197 A 0.038 +198 G 0.035 +199 C 0.034 +200 C 0.033 +201 Y 0.032 +202 A 0.030 +203 K 0.031 +204 Y 0.036 +205 R 0.044 +206 Y 0.052 +207 R 0.058 +208 R 0.065 +209 P 0.074 +210 Y 0.077 +211 P 0.069 +212 V 0.056 +213 M 0.044 +214 R 0.037 +215 K 0.033 +216 I 0.031 +217 C 0.031 +218 Q 0.033 +219 V 0.038 +220 V 0.044 +221 P 0.049 +222 A 0.053 +223 G 0.055 +224 L 0.054 +225 A 0.053 +226 F 0.049 +227 I 0.045 +228 L 0.042 +229 D 0.041 +230 I 0.041 +231 S 0.040 +232 P 0.039 +233 V 0.035 +234 A 0.029 +235 H 0.025 +236 R 0.022 +237 V 0.024 +238 A 0.031 +239 L 0.046 +240 C 0.062 +241 H 0.075 +242 L 0.084 +243 A 0.092 +244 G 0.097 +245 C 0.099 +246 Q 0.098 +247 E 0.095 +248 Q 0.086 +249 A 0.069 +250 A 0.048 +251 W 0.033 +252 Y 0.029 +253 H 0.032 +254 T 0.036 +255 L 0.040 +256 Q 0.050 +257 I 0.061 +258 L 0.063 +259 F 0.053 +260 F 0.040 +261 L 0.031 +262 V 0.028 +263 S 0.026 +264 A 0.026 +265 Y 0.027 +266 F 0.033 +267 F 0.041 +268 S 0.048 +269 C 0.052 +270 P 0.054 +271 V 0.051 +272 P 0.045 +273 E 0.042 +274 K 0.045 +275 Y 0.056 +276 F 0.075 +277 P 0.095 +278 G 0.107 +279 S 0.108 +280 C 0.100 +281 D 0.089 +282 I 0.078 +283 V 0.074 +284 G 0.082 +285 H 0.107 +286 G 0.140 +287 H 0.161 +288 Q 0.155 +289 I 0.135 +290 F 0.114 +291 H 0.095 +292 A 0.081 +293 F 0.072 +294 L 0.068 +295 S 0.062 +296 I 0.055 +297 C 0.052 +298 T 0.053 +299 L 0.053 +300 S 0.051 +301 Q 0.051 +302 L 0.052 +303 E 0.054 +304 A 0.053 +305 I 0.049 +306 L 0.043 +307 L 0.040 +308 D 0.041 +309 Y 0.046 +310 Q 0.053 +311 G 0.057 +312 R 0.052 +313 Q 0.047 +314 E 0.046 +315 I 0.046 +316 F 0.045 +317 L 0.047 +318 Q 0.054 +319 R 0.064 +320 H 0.074 +321 G 0.079 +322 P 0.075 +323 L 0.064 +324 S 0.051 +325 V 0.042 +326 H 0.036 +327 M 0.034 +328 A 0.036 +329 C 0.043 +330 L 0.050 +331 S 0.055 +332 F 0.056 +333 F 0.057 +334 F 0.060 +335 L 0.061 +336 A 0.059 +337 A 0.059 +338 C 0.064 +339 S 0.066 +340 A 0.063 +341 A 0.062 +342 T 0.068 +343 A 0.078 +344 A 0.081 +345 L 0.075 +346 L 0.066 +347 R 0.058 +348 H 0.057 +349 K 0.067 +350 V 0.088 +351 K 0.113 +352 A 0.130 +353 R 0.141 +354 L 0.156 +355 T 0.184 +356 K 0.225 +357 K 0.267 +358 D 0.294 +359 S 0.303 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000170929.6_ENST00000641627.1_GN:OR1M1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000170929.6_ENST00000641627.1_GN:OR1M1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..41d9b82ec9604bb5da6b3144a4404998074bfbcf --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000170929.6_ENST00000641627.1_GN:OR1M1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,314 @@ +>ENSG00000170929.6|ENST00000641627.1|GN:OR1M1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.429 +2 E 0.449 +3 P 0.481 +4 R 0.509 +5 N 0.518 +6 Q 0.499 +7 T 0.452 +8 S 0.385 +9 A 0.307 +10 S 0.232 +11 Q 0.176 +12 F 0.145 +13 I 0.134 +14 L 0.137 +15 L 0.151 +16 G 0.174 +17 L 0.198 +18 S 0.217 +19 E 0.226 +20 K 0.218 +21 P 0.194 +22 E 0.160 +23 Q 0.127 +24 E 0.097 +25 T 0.072 +26 L 0.054 +27 L 0.046 +28 F 0.042 +29 S 0.039 +30 L 0.036 +31 F 0.037 +32 F 0.041 +33 C 0.046 +34 M 0.050 +35 Y 0.050 +36 L 0.050 +37 V 0.050 +38 M 0.052 +39 V 0.053 +40 V 0.058 +41 G 0.065 +42 N 0.070 +43 L 0.071 +44 L 0.071 +45 I 0.069 +46 I 0.064 +47 L 0.061 +48 A 0.064 +49 I 0.072 +50 S 0.082 +51 I 0.088 +52 D 0.088 +53 S 0.084 +54 H 0.077 +55 L 0.070 +56 H 0.063 +57 T 0.055 +58 P 0.045 +59 M 0.036 +60 Y 0.030 +61 F 0.027 +62 F 0.029 +63 L 0.036 +64 A 0.047 +65 N 0.057 +66 L 0.060 +67 S 0.058 +68 L 0.053 +69 V 0.052 +70 D 0.055 +71 F 0.058 +72 C 0.058 +73 L 0.057 +74 A 0.058 +75 T 0.061 +76 N 0.064 +77 T 0.067 +78 I 0.067 +79 P 0.066 +80 K 0.064 +81 M 0.064 +82 L 0.065 +83 V 0.067 +84 S 0.073 +85 L 0.082 +86 Q 0.095 +87 T 0.112 +88 G 0.124 +89 S 0.123 +90 K 0.106 +91 A 0.084 +92 I 0.065 +93 S 0.050 +94 Y 0.041 +95 P 0.035 +96 C 0.033 +97 C 0.031 +98 L 0.030 +99 I 0.031 +100 Q 0.031 +101 M 0.031 +102 Y 0.029 +103 F 0.025 +104 F 0.023 +105 H 0.024 +106 F 0.026 +107 F 0.030 +108 G 0.035 +109 I 0.040 +110 V 0.044 +111 D 0.044 +112 S 0.043 +113 V 0.041 +114 I 0.039 +115 I 0.036 +116 A 0.034 +117 M 0.032 +118 M 0.032 +119 A 0.034 +120 Y 0.038 +121 D 0.041 +122 R 0.043 +123 F 0.041 +124 V 0.040 +125 A 0.041 +126 I 0.045 +127 C 0.050 +128 H 0.056 +129 P 0.058 +130 L 0.056 +131 H 0.053 +132 Y 0.051 +133 A 0.050 +134 K 0.052 +135 I 0.059 +136 M 0.066 +137 S 0.070 +138 L 0.070 +139 R 0.066 +140 L 0.058 +141 C 0.053 +142 R 0.060 +143 L 0.068 +144 L 0.067 +145 V 0.059 +146 G 0.053 +147 A 0.054 +148 L 0.063 +149 W 0.073 +150 A 0.077 +151 F 0.074 +152 S 0.068 +153 C 0.064 +154 F 0.064 +155 I 0.069 +156 S 0.070 +157 L 0.068 +158 T 0.066 +159 H 0.067 +160 I 0.066 +161 L 0.067 +162 L 0.073 +163 M 0.081 +164 A 0.091 +165 R 0.099 +166 L 0.104 +167 V 0.104 +168 F 0.107 +169 C 0.118 +170 G 0.134 +171 S 0.148 +172 H 0.159 +173 E 0.166 +174 V 0.162 +175 P 0.140 +176 H 0.107 +177 Y 0.081 +178 F 0.068 +179 C 0.070 +180 D 0.084 +181 L 0.106 +182 T 0.128 +183 P 0.142 +184 I 0.146 +185 L 0.146 +186 R 0.146 +187 L 0.142 +188 S 0.134 +189 C 0.130 +190 T 0.135 +191 D 0.143 +192 T 0.140 +193 S 0.127 +194 V 0.115 +195 N 0.112 +196 R 0.113 +197 I 0.113 +198 F 0.106 +199 I 0.093 +200 L 0.084 +201 I 0.082 +202 V 0.085 +203 A 0.086 +204 G 0.079 +205 M 0.069 +206 V 0.063 +207 I 0.066 +208 A 0.075 +209 T 0.083 +210 P 0.081 +211 F 0.070 +212 V 0.061 +213 C 0.062 +214 I 0.064 +215 L 0.059 +216 A 0.051 +217 S 0.046 +218 Y 0.044 +219 A 0.045 +220 R 0.052 +221 I 0.064 +222 L 0.079 +223 V 0.091 +224 A 0.096 +225 I 0.097 +226 M 0.104 +227 K 0.125 +228 V 0.153 +229 P 0.177 +230 S 0.188 +231 A 0.186 +232 G 0.171 +233 G 0.143 +234 R 0.113 +235 K 0.095 +236 K 0.091 +237 A 0.090 +238 F 0.087 +239 S 0.086 +240 T 0.088 +241 C 0.091 +242 S 0.092 +243 S 0.091 +244 H 0.086 +245 L 0.078 +246 S 0.073 +247 V 0.070 +248 V 0.061 +249 A 0.047 +250 L 0.035 +251 F 0.030 +252 Y 0.032 +253 G 0.037 +254 T 0.040 +255 T 0.041 +256 I 0.042 +257 G 0.045 +258 V 0.053 +259 Y 0.070 +260 L 0.097 +261 C 0.126 +262 P 0.151 +263 S 0.167 +264 S 0.174 +265 V 0.169 +266 L 0.157 +267 T 0.143 +268 T 0.130 +269 V 0.119 +270 K 0.115 +271 E 0.114 +272 K 0.115 +273 A 0.112 +274 S 0.103 +275 A 0.090 +276 V 0.082 +277 M 0.088 +278 Y 0.103 +279 T 0.118 +280 A 0.128 +281 V 0.134 +282 T 0.135 +283 P 0.126 +284 M 0.111 +285 L 0.100 +286 N 0.091 +287 P 0.083 +288 F 0.079 +289 I 0.082 +290 Y 0.087 +291 S 0.097 +292 L 0.117 +293 R 0.133 +294 N 0.130 +295 R 0.113 +296 D 0.095 +297 L 0.083 +298 K 0.078 +299 G 0.079 +300 A 0.083 +301 L 0.088 +302 R 0.096 +303 K 0.105 +304 L 0.113 +305 V 0.127 +306 N 0.156 +307 R 0.199 +308 K 0.252 +309 I 0.303 +310 T 0.347 +311 S 0.374 +312 S 0.377 +313 S 0.367 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000170929.6_ENST00000641627.1_GN:OR1M1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000170929.6_ENST00000641627.1_GN:OR1M1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..aef9f2a84f2587658e40729980ad282d82dcc1d0 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000170929.6_ENST00000641627.1_GN:OR1M1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid @@ -0,0 +1,328 @@ +>ENSG00000170929.6|ENST00000641627.1|GN:OR1M1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:14 +1 M 0.348 +2 V 0.362 +3 S 0.387 +4 R 0.414 +5 R 0.427 +6 G 0.419 +7 K 0.407 +8 I 0.409 +9 A 0.417 +10 Q 0.427 +11 G 0.446 +12 I 0.467 +13 T 0.479 +14 P 0.488 +15 M 0.501 +16 E 0.520 +17 P 0.542 +18 R 0.556 +19 N 0.556 +20 Q 0.532 +21 T 0.480 +22 S 0.407 +23 A 0.324 +24 S 0.244 +25 Q 0.183 +26 F 0.149 +27 I 0.136 +28 L 0.138 +29 L 0.152 +30 G 0.174 +31 L 0.199 +32 S 0.219 +33 E 0.228 +34 K 0.219 +35 P 0.194 +36 E 0.161 +37 Q 0.127 +38 E 0.097 +39 T 0.071 +40 L 0.054 +41 L 0.045 +42 F 0.042 +43 S 0.038 +44 L 0.036 +45 F 0.037 +46 F 0.042 +47 C 0.047 +48 M 0.050 +49 Y 0.051 +50 L 0.050 +51 V 0.051 +52 M 0.052 +53 V 0.054 +54 V 0.059 +55 G 0.066 +56 N 0.071 +57 L 0.074 +58 L 0.074 +59 I 0.072 +60 I 0.067 +61 L 0.063 +62 A 0.065 +63 I 0.072 +64 S 0.081 +65 I 0.087 +66 D 0.087 +67 S 0.083 +68 H 0.076 +69 L 0.069 +70 H 0.061 +71 T 0.053 +72 P 0.044 +73 M 0.035 +74 Y 0.029 +75 F 0.027 +76 F 0.028 +77 L 0.036 +78 A 0.048 +79 N 0.058 +80 L 0.061 +81 S 0.058 +82 L 0.053 +83 V 0.051 +84 D 0.054 +85 F 0.057 +86 C 0.057 +87 L 0.057 +88 A 0.057 +89 T 0.060 +90 N 0.064 +91 T 0.066 +92 I 0.065 +93 P 0.063 +94 K 0.061 +95 M 0.061 +96 L 0.061 +97 V 0.063 +98 S 0.068 +99 L 0.076 +100 Q 0.089 +101 T 0.107 +102 G 0.120 +103 S 0.119 +104 K 0.103 +105 A 0.082 +106 I 0.063 +107 S 0.049 +108 Y 0.039 +109 P 0.035 +110 C 0.032 +111 C 0.031 +112 L 0.029 +113 I 0.029 +114 Q 0.030 +115 M 0.030 +116 Y 0.028 +117 F 0.024 +118 F 0.023 +119 H 0.024 +120 F 0.026 +121 F 0.030 +122 G 0.035 +123 I 0.040 +124 V 0.043 +125 D 0.044 +126 S 0.043 +127 V 0.042 +128 I 0.039 +129 I 0.037 +130 A 0.034 +131 M 0.032 +132 M 0.032 +133 A 0.034 +134 Y 0.038 +135 D 0.042 +136 R 0.044 +137 F 0.042 +138 V 0.041 +139 A 0.041 +140 I 0.045 +141 C 0.051 +142 H 0.057 +143 P 0.059 +144 L 0.057 +145 H 0.054 +146 Y 0.052 +147 A 0.051 +148 K 0.054 +149 I 0.061 +150 M 0.069 +151 S 0.072 +152 L 0.071 +153 R 0.065 +154 L 0.057 +155 C 0.053 +156 R 0.059 +157 L 0.068 +158 L 0.067 +159 V 0.059 +160 G 0.053 +161 A 0.052 +162 L 0.054 +163 W 0.055 +164 A 0.056 +165 F 0.057 +166 S 0.060 +167 C 0.062 +168 F 0.065 +169 I 0.069 +170 S 0.071 +171 L 0.069 +172 T 0.067 +173 H 0.067 +174 I 0.066 +175 L 0.067 +176 L 0.073 +177 M 0.082 +178 A 0.091 +179 R 0.100 +180 L 0.105 +181 V 0.106 +182 F 0.108 +183 C 0.118 +184 G 0.133 +185 S 0.147 +186 H 0.158 +187 E 0.166 +188 V 0.162 +189 P 0.140 +190 H 0.107 +191 Y 0.081 +192 F 0.068 +193 C 0.070 +194 D 0.085 +195 L 0.107 +196 T 0.129 +197 P 0.142 +198 I 0.146 +199 L 0.146 +200 R 0.145 +201 L 0.141 +202 S 0.132 +203 C 0.128 +204 T 0.133 +205 D 0.141 +206 T 0.139 +207 S 0.127 +208 V 0.116 +209 N 0.112 +210 R 0.113 +211 I 0.112 +212 F 0.105 +213 I 0.093 +214 L 0.084 +215 I 0.082 +216 V 0.086 +217 A 0.087 +218 G 0.080 +219 M 0.069 +220 V 0.064 +221 I 0.067 +222 A 0.076 +223 T 0.084 +224 P 0.082 +225 F 0.070 +226 V 0.062 +227 C 0.062 +228 I 0.064 +229 L 0.059 +230 A 0.052 +231 S 0.046 +232 Y 0.044 +233 A 0.046 +234 R 0.053 +235 I 0.064 +236 L 0.079 +237 V 0.092 +238 A 0.097 +239 I 0.097 +240 M 0.104 +241 K 0.125 +242 V 0.153 +243 P 0.177 +244 S 0.189 +245 A 0.188 +246 G 0.173 +247 G 0.145 +248 R 0.115 +249 K 0.097 +250 K 0.092 +251 A 0.091 +252 F 0.089 +253 S 0.088 +254 T 0.091 +255 C 0.093 +256 S 0.095 +257 S 0.093 +258 H 0.087 +259 L 0.079 +260 S 0.074 +261 V 0.071 +262 V 0.062 +263 A 0.048 +264 L 0.036 +265 F 0.031 +266 Y 0.033 +267 G 0.037 +268 T 0.040 +269 T 0.041 +270 I 0.042 +271 G 0.045 +272 V 0.054 +273 Y 0.071 +274 L 0.098 +275 C 0.129 +276 P 0.155 +277 S 0.173 +278 S 0.180 +279 V 0.176 +280 L 0.164 +281 T 0.150 +282 T 0.135 +283 V 0.124 +284 K 0.119 +285 E 0.118 +286 K 0.118 +287 A 0.115 +288 S 0.106 +289 A 0.093 +290 V 0.085 +291 M 0.090 +292 Y 0.105 +293 T 0.120 +294 A 0.130 +295 V 0.136 +296 T 0.137 +297 P 0.128 +298 M 0.114 +299 L 0.102 +300 N 0.093 +301 P 0.085 +302 F 0.081 +303 I 0.083 +304 Y 0.088 +305 S 0.099 +306 L 0.119 +307 R 0.135 +308 N 0.133 +309 R 0.115 +310 D 0.097 +311 L 0.084 +312 K 0.079 +313 G 0.080 +314 A 0.084 +315 L 0.089 +316 R 0.097 +317 K 0.105 +318 L 0.113 +319 V 0.127 +320 N 0.155 +321 R 0.199 +322 K 0.253 +323 I 0.306 +324 T 0.351 +325 S 0.380 +326 S 0.383 +327 S 0.372 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000171130.20_ENST00000425642.3_GN:ATP6V0E2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000171130.20_ENST00000425642.3_GN:ATP6V0E2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d8e8a8ba788a74beb9573e8468978f6ee5137faf --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000171130.20_ENST00000425642.3_GN:ATP6V0E2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,82 @@ +>ENSG00000171130.20|ENST00000425642.3|GN:ATP6V0E2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.371 +2 T 0.355 +3 A 0.324 +4 H 0.280 +5 S 0.224 +6 F 0.163 +7 A 0.109 +8 L 0.072 +9 P 0.050 +10 V 0.039 +11 I 0.035 +12 I 0.033 +13 F 0.035 +14 T 0.040 +15 T 0.046 +16 F 0.051 +17 W 0.056 +18 G 0.058 +19 L 0.061 +20 V 0.068 +21 G 0.078 +22 I 0.085 +23 A 0.091 +24 G 0.099 +25 P 0.108 +26 W 0.124 +27 F 0.150 +28 V 0.181 +29 P 0.197 +30 K 0.192 +31 G 0.171 +32 P 0.144 +33 N 0.118 +34 R 0.095 +35 G 0.082 +36 V 0.082 +37 I 0.088 +38 I 0.093 +39 T 0.097 +40 M 0.113 +41 L 0.142 +42 V 0.163 +43 A 0.164 +44 T 0.153 +45 A 0.142 +46 V 0.127 +47 C 0.114 +48 C 0.115 +49 Y 0.124 +50 L 0.130 +51 F 0.130 +52 W 0.137 +53 L 0.152 +54 I 0.170 +55 A 0.193 +56 I 0.223 +57 L 0.248 +58 A 0.256 +59 Q 0.251 +60 L 0.250 +61 N 0.264 +62 P 0.297 +63 L 0.343 +64 F 0.390 +65 G 0.422 +66 P 0.424 +67 Q 0.398 +68 L 0.349 +69 K 0.287 +70 N 0.234 +71 E 0.200 +72 T 0.178 +73 I 0.161 +74 W 0.155 +75 Y 0.164 +76 V 0.181 +77 R 0.198 +78 F 0.214 +79 L 0.233 +80 W 0.251 +81 E 0.262 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000171130.20_ENST00000425642.3_GN:ATP6V0E2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000171130.20_ENST00000425642.3_GN:ATP6V0E2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a60a5fa574c4f8880251f4e7790e2729dc176044 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000171130.20_ENST00000425642.3_GN:ATP6V0E2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid @@ -0,0 +1,112 @@ +>ENSG00000171130.20|ENST00000425642.3|GN:ATP6V0E2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:30 +1 M 0.432 +2 L 0.465 +3 S 0.510 +4 A 0.547 +5 L 0.569 +6 P 0.575 +7 G 0.565 +8 W 0.542 +9 G 0.507 +10 P 0.466 +11 A 0.451 +12 H 0.482 +13 L 0.530 +14 Q 0.565 +15 R 0.587 +16 P 0.605 +17 L 0.617 +18 L 0.624 +19 G 0.623 +20 P 0.611 +21 A 0.590 +22 S 0.563 +23 C 0.537 +24 L 0.534 +25 G 0.559 +26 I 0.590 +27 L 0.605 +28 R 0.605 +29 P 0.596 +30 A 0.571 +31 M 0.525 +32 T 0.468 +33 A 0.405 +34 H 0.335 +35 S 0.261 +36 F 0.188 +37 A 0.127 +38 L 0.085 +39 P 0.061 +40 V 0.048 +41 I 0.043 +42 I 0.041 +43 F 0.043 +44 T 0.048 +45 T 0.056 +46 F 0.062 +47 W 0.067 +48 G 0.070 +49 L 0.071 +50 V 0.078 +51 G 0.088 +52 I 0.095 +53 A 0.100 +54 G 0.107 +55 P 0.116 +56 W 0.132 +57 F 0.159 +58 V 0.190 +59 P 0.207 +60 K 0.202 +61 G 0.181 +62 P 0.153 +63 N 0.123 +64 R 0.099 +65 G 0.084 +66 V 0.082 +67 I 0.086 +68 I 0.089 +69 T 0.092 +70 M 0.104 +71 L 0.127 +72 V 0.145 +73 A 0.149 +74 T 0.144 +75 A 0.137 +76 V 0.126 +77 C 0.116 +78 C 0.117 +79 Y 0.128 +80 L 0.135 +81 F 0.137 +82 W 0.145 +83 L 0.162 +84 I 0.182 +85 A 0.208 +86 I 0.241 +87 L 0.267 +88 A 0.275 +89 Q 0.266 +90 L 0.259 +91 N 0.271 +92 P 0.308 +93 L 0.360 +94 F 0.412 +95 G 0.444 +96 P 0.445 +97 Q 0.414 +98 L 0.359 +99 K 0.292 +100 N 0.236 +101 E 0.202 +102 T 0.179 +103 I 0.162 +104 W 0.154 +105 Y 0.160 +106 V 0.176 +107 R 0.195 +108 F 0.214 +109 L 0.235 +110 W 0.254 +111 E 0.265 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000171501.11_ENST00000373688.3_GN:OR1N2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000171501.11_ENST00000373688.3_GN:OR1N2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d97b2e42afa5798574615eb720ee383dc1293268 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000171501.11_ENST00000373688.3_GN:OR1N2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,317 @@ +>ENSG00000171501.11|ENST00000373688.3|GN:OR1N2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.423 +2 G 0.453 +3 K 0.500 +4 P 0.542 +5 G 0.566 +6 R 0.570 +7 V 0.562 +8 N 0.542 +9 Q 0.503 +10 T 0.438 +11 T 0.358 +12 V 0.278 +13 S 0.214 +14 D 0.173 +15 F 0.152 +16 L 0.141 +17 L 0.138 +18 L 0.148 +19 G 0.166 +20 L 0.186 +21 S 0.202 +22 E 0.209 +23 W 0.206 +24 P 0.191 +25 E 0.165 +26 E 0.134 +27 Q 0.103 +28 P 0.076 +29 L 0.058 +30 L 0.051 +31 F 0.049 +32 G 0.047 +33 I 0.042 +34 F 0.040 +35 L 0.043 +36 G 0.048 +37 M 0.052 +38 Y 0.052 +39 L 0.052 +40 V 0.055 +41 T 0.059 +42 M 0.061 +43 V 0.063 +44 G 0.068 +45 N 0.073 +46 L 0.075 +47 L 0.076 +48 I 0.074 +49 I 0.069 +50 L 0.065 +51 A 0.068 +52 I 0.078 +53 S 0.091 +54 S 0.100 +55 D 0.102 +56 P 0.095 +57 H 0.084 +58 L 0.073 +59 H 0.063 +60 T 0.053 +61 P 0.043 +62 M 0.034 +63 Y 0.029 +64 F 0.026 +65 F 0.027 +66 L 0.033 +67 A 0.044 +68 N 0.053 +69 L 0.058 +70 S 0.059 +71 L 0.058 +72 T 0.061 +73 D 0.070 +74 A 0.077 +75 C 0.075 +76 F 0.069 +77 T 0.065 +78 S 0.065 +79 A 0.067 +80 S 0.069 +81 I 0.070 +82 P 0.070 +83 K 0.069 +84 M 0.069 +85 L 0.070 +86 A 0.070 +87 N 0.072 +88 I 0.077 +89 H 0.086 +90 T 0.099 +91 Q 0.106 +92 S 0.099 +93 Q 0.084 +94 I 0.068 +95 I 0.057 +96 S 0.048 +97 Y 0.042 +98 S 0.039 +99 G 0.039 +100 C 0.038 +101 L 0.036 +102 A 0.035 +103 Q 0.035 +104 L 0.036 +105 Y 0.034 +106 F 0.030 +107 L 0.027 +108 L 0.026 +109 M 0.028 +110 F 0.033 +111 G 0.040 +112 G 0.049 +113 L 0.055 +114 D 0.056 +115 N 0.052 +116 C 0.046 +117 L 0.041 +118 L 0.039 +119 A 0.037 +120 V 0.035 +121 M 0.034 +122 A 0.035 +123 Y 0.038 +124 D 0.041 +125 R 0.043 +126 Y 0.042 +127 V 0.041 +128 A 0.043 +129 I 0.049 +130 C 0.058 +131 Q 0.067 +132 P 0.073 +133 L 0.075 +134 H 0.075 +135 Y 0.075 +136 S 0.076 +137 T 0.080 +138 S 0.085 +139 M 0.087 +140 S 0.085 +141 P 0.080 +142 Q 0.073 +143 L 0.063 +144 C 0.059 +145 A 0.064 +146 L 0.070 +147 M 0.066 +148 L 0.057 +149 G 0.049 +150 V 0.046 +151 C 0.046 +152 W 0.044 +153 V 0.045 +154 L 0.049 +155 T 0.055 +156 N 0.059 +157 C 0.061 +158 P 0.064 +159 A 0.065 +160 L 0.066 +161 M 0.068 +162 H 0.070 +163 T 0.069 +164 L 0.070 +165 L 0.075 +166 L 0.082 +167 T 0.090 +168 R 0.100 +169 V 0.105 +170 A 0.099 +171 F 0.092 +172 C 0.095 +173 A 0.107 +174 Q 0.124 +175 K 0.141 +176 A 0.156 +177 I 0.159 +178 P 0.141 +179 H 0.110 +180 F 0.084 +181 Y 0.070 +182 C 0.071 +183 D 0.082 +184 P 0.097 +185 S 0.109 +186 A 0.116 +187 L 0.121 +188 L 0.124 +189 K 0.124 +190 L 0.119 +191 A 0.114 +192 C 0.114 +193 S 0.125 +194 D 0.139 +195 T 0.144 +196 H 0.140 +197 V 0.135 +198 N 0.134 +199 E 0.135 +200 L 0.132 +201 M 0.126 +202 I 0.115 +203 I 0.101 +204 T 0.089 +205 M 0.080 +206 G 0.070 +207 L 0.058 +208 L 0.048 +209 F 0.046 +210 L 0.050 +211 T 0.058 +212 V 0.067 +213 P 0.071 +214 L 0.069 +215 L 0.067 +216 L 0.070 +217 I 0.071 +218 V 0.062 +219 F 0.050 +220 S 0.042 +221 Y 0.039 +222 V 0.041 +223 R 0.045 +224 I 0.046 +225 F 0.045 +226 W 0.047 +227 A 0.054 +228 V 0.061 +229 F 0.071 +230 V 0.090 +231 I 0.116 +232 S 0.144 +233 S 0.167 +234 P 0.178 +235 G 0.167 +236 G 0.136 +237 R 0.102 +238 W 0.083 +239 K 0.079 +240 A 0.080 +241 F 0.078 +242 S 0.078 +243 T 0.079 +244 C 0.081 +245 G 0.083 +246 S 0.083 +247 H 0.077 +248 L 0.069 +249 T 0.064 +250 V 0.063 +251 V 0.057 +252 L 0.045 +253 L 0.035 +254 F 0.030 +255 Y 0.032 +256 G 0.037 +257 S 0.042 +258 L 0.046 +259 M 0.048 +260 G 0.053 +261 V 0.064 +262 Y 0.082 +263 L 0.107 +264 L 0.136 +265 P 0.166 +266 P 0.194 +267 S 0.217 +268 T 0.229 +269 Y 0.228 +270 S 0.212 +271 T 0.188 +272 E 0.166 +273 R 0.151 +274 E 0.140 +275 S 0.126 +276 R 0.113 +277 A 0.102 +278 A 0.091 +279 V 0.086 +280 L 0.091 +281 Y 0.107 +282 M 0.120 +283 V 0.126 +284 I 0.128 +285 I 0.126 +286 P 0.117 +287 T 0.104 +288 L 0.094 +289 N 0.087 +290 P 0.081 +291 F 0.079 +292 I 0.080 +293 Y 0.083 +294 S 0.090 +295 L 0.106 +296 R 0.120 +297 N 0.116 +298 R 0.098 +299 D 0.082 +300 M 0.077 +301 K 0.083 +302 E 0.090 +303 A 0.091 +304 L 0.086 +305 G 0.083 +306 K 0.087 +307 L 0.100 +308 F 0.128 +309 V 0.179 +310 S 0.252 +311 G 0.323 +312 K 0.371 +313 T 0.390 +314 F 0.379 +315 F 0.344 +316 L 0.310 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000171501.11_ENST00000373688.3_GN:OR1N2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000171501.11_ENST00000373688.3_GN:OR1N2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f0880057293ab9cf6147d0c9f671acc293a5b47c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000171501.11_ENST00000373688.3_GN:OR1N2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid @@ -0,0 +1,331 @@ +>ENSG00000171501.11|ENST00000373688.3|GN:OR1N2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:14 +1 M 0.280 +2 E 0.278 +3 G 0.265 +4 F 0.239 +5 Y 0.209 +6 L 0.190 +7 R 0.186 +8 R 0.192 +9 S 0.200 +10 H 0.217 +11 E 0.242 +12 L 0.277 +13 Q 0.328 +14 G 0.391 +15 M 0.448 +16 G 0.490 +17 K 0.526 +18 P 0.560 +19 G 0.584 +20 R 0.591 +21 V 0.584 +22 N 0.563 +23 Q 0.523 +24 T 0.456 +25 T 0.371 +26 V 0.286 +27 S 0.218 +28 D 0.174 +29 F 0.151 +30 L 0.141 +31 L 0.140 +32 L 0.151 +33 G 0.170 +34 L 0.191 +35 S 0.206 +36 E 0.214 +37 W 0.210 +38 P 0.193 +39 E 0.166 +40 E 0.133 +41 Q 0.102 +42 P 0.075 +43 L 0.057 +44 L 0.050 +45 F 0.049 +46 G 0.047 +47 I 0.043 +48 F 0.041 +49 L 0.045 +50 G 0.050 +51 M 0.053 +52 Y 0.052 +53 L 0.052 +54 V 0.055 +55 T 0.059 +56 M 0.061 +57 V 0.063 +58 G 0.068 +59 N 0.074 +60 L 0.077 +61 L 0.078 +62 I 0.076 +63 I 0.071 +64 L 0.066 +65 A 0.068 +66 I 0.077 +67 S 0.089 +68 S 0.098 +69 D 0.100 +70 P 0.094 +71 H 0.084 +72 L 0.072 +73 H 0.062 +74 T 0.052 +75 P 0.042 +76 M 0.034 +77 Y 0.028 +78 F 0.026 +79 F 0.027 +80 L 0.033 +81 A 0.044 +82 N 0.053 +83 L 0.058 +84 S 0.059 +85 L 0.058 +86 T 0.061 +87 D 0.070 +88 A 0.077 +89 C 0.075 +90 F 0.069 +91 T 0.066 +92 S 0.066 +93 A 0.067 +94 S 0.067 +95 I 0.067 +96 P 0.066 +97 K 0.065 +98 M 0.066 +99 L 0.066 +100 A 0.066 +101 N 0.067 +102 I 0.071 +103 H 0.081 +104 T 0.095 +105 Q 0.103 +106 S 0.097 +107 Q 0.082 +108 I 0.067 +109 I 0.055 +110 S 0.047 +111 Y 0.040 +112 S 0.038 +113 G 0.038 +114 C 0.037 +115 L 0.035 +116 A 0.033 +117 Q 0.034 +118 L 0.035 +119 Y 0.033 +120 F 0.029 +121 L 0.026 +122 L 0.025 +123 M 0.028 +124 F 0.033 +125 G 0.040 +126 G 0.049 +127 L 0.055 +128 D 0.056 +129 N 0.051 +130 C 0.045 +131 L 0.040 +132 L 0.038 +133 A 0.037 +134 V 0.035 +135 M 0.034 +136 A 0.035 +137 Y 0.037 +138 D 0.041 +139 R 0.043 +140 Y 0.042 +141 V 0.041 +142 A 0.043 +143 I 0.049 +144 C 0.058 +145 Q 0.067 +146 P 0.073 +147 L 0.076 +148 H 0.076 +149 Y 0.077 +150 S 0.078 +151 T 0.082 +152 S 0.088 +153 M 0.090 +154 S 0.087 +155 P 0.081 +156 Q 0.073 +157 L 0.063 +158 C 0.058 +159 A 0.064 +160 L 0.070 +161 M 0.067 +162 L 0.058 +163 G 0.050 +164 V 0.047 +165 C 0.046 +166 W 0.045 +167 V 0.045 +168 L 0.050 +169 T 0.056 +170 N 0.059 +171 C 0.062 +172 P 0.064 +173 A 0.066 +174 L 0.066 +175 M 0.069 +176 H 0.070 +177 T 0.069 +178 L 0.069 +179 L 0.075 +180 L 0.082 +181 T 0.090 +182 R 0.100 +183 V 0.105 +184 A 0.100 +185 F 0.093 +186 C 0.095 +187 A 0.106 +188 Q 0.122 +189 K 0.139 +190 A 0.154 +191 I 0.157 +192 P 0.139 +193 H 0.109 +194 F 0.083 +195 Y 0.070 +196 C 0.071 +197 D 0.082 +198 P 0.097 +199 S 0.109 +200 A 0.115 +201 L 0.120 +202 L 0.123 +203 K 0.123 +204 L 0.118 +205 A 0.112 +206 C 0.112 +207 S 0.122 +208 D 0.137 +209 T 0.143 +210 H 0.140 +211 V 0.135 +212 N 0.133 +213 E 0.133 +214 L 0.130 +215 M 0.124 +216 I 0.115 +217 I 0.102 +218 T 0.090 +219 M 0.081 +220 G 0.072 +221 L 0.059 +222 L 0.049 +223 F 0.046 +224 L 0.051 +225 T 0.058 +226 V 0.067 +227 P 0.070 +228 L 0.066 +229 L 0.063 +230 L 0.067 +231 I 0.069 +232 V 0.062 +233 F 0.050 +234 S 0.042 +235 Y 0.040 +236 V 0.042 +237 R 0.046 +238 I 0.047 +239 F 0.045 +240 W 0.047 +241 A 0.054 +242 V 0.061 +243 F 0.071 +244 V 0.090 +245 I 0.116 +246 S 0.144 +247 S 0.168 +248 P 0.180 +249 G 0.170 +250 G 0.138 +251 R 0.104 +252 W 0.084 +253 K 0.080 +254 A 0.081 +255 F 0.080 +256 S 0.079 +257 T 0.080 +258 C 0.083 +259 G 0.085 +260 S 0.084 +261 H 0.078 +262 L 0.069 +263 T 0.065 +264 V 0.063 +265 V 0.057 +266 L 0.046 +267 L 0.035 +268 F 0.031 +269 Y 0.032 +270 G 0.037 +271 S 0.042 +272 L 0.046 +273 M 0.048 +274 G 0.051 +275 V 0.061 +276 Y 0.078 +277 L 0.104 +278 L 0.135 +279 P 0.167 +280 P 0.197 +281 S 0.222 +282 T 0.236 +283 Y 0.235 +284 S 0.219 +285 T 0.194 +286 E 0.171 +287 R 0.156 +288 E 0.144 +289 S 0.130 +290 R 0.117 +291 A 0.105 +292 A 0.095 +293 V 0.089 +294 L 0.094 +295 Y 0.110 +296 M 0.123 +297 V 0.128 +298 I 0.130 +299 I 0.127 +300 P 0.118 +301 T 0.105 +302 L 0.095 +303 N 0.088 +304 P 0.082 +305 F 0.080 +306 I 0.082 +307 Y 0.084 +308 S 0.091 +309 L 0.108 +310 R 0.123 +311 N 0.119 +312 R 0.100 +313 D 0.084 +314 M 0.078 +315 K 0.083 +316 E 0.091 +317 A 0.092 +318 L 0.087 +319 G 0.084 +320 K 0.089 +321 L 0.102 +322 F 0.131 +323 V 0.183 +324 S 0.256 +325 G 0.327 +326 K 0.375 +327 T 0.395 +328 F 0.385 +329 F 0.349 +330 L 0.315 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000171936.3_ENST00000641646.1_GN:OR10H3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000171936.3_ENST00000641646.1_GN:OR10H3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..53a12d61d70ffc3d34935bd16b38ffee8ea75893 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000171936.3_ENST00000641646.1_GN:OR10H3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,317 @@ +>ENSG00000171936.3|ENST00000641646.1|GN:OR10H3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.447 +2 P 0.457 +3 G 0.468 +4 Q 0.468 +5 N 0.452 +6 Y 0.416 +7 R 0.360 +8 T 0.291 +9 I 0.223 +10 S 0.168 +11 E 0.134 +12 F 0.122 +13 I 0.122 +14 L 0.126 +15 S 0.138 +16 G 0.158 +17 F 0.178 +18 S 0.190 +19 A 0.188 +20 F 0.173 +21 P 0.150 +22 Q 0.125 +23 Q 0.101 +24 L 0.082 +25 L 0.067 +26 P 0.055 +27 V 0.048 +28 L 0.051 +29 F 0.061 +30 L 0.065 +31 L 0.058 +32 Y 0.046 +33 L 0.038 +34 L 0.037 +35 M 0.039 +36 F 0.041 +37 L 0.043 +38 F 0.047 +39 T 0.052 +40 L 0.055 +41 L 0.057 +42 G 0.061 +43 N 0.066 +44 L 0.071 +45 L 0.073 +46 I 0.069 +47 M 0.059 +48 A 0.051 +49 T 0.047 +50 V 0.045 +51 W 0.046 +52 I 0.051 +53 E 0.058 +54 R 0.064 +55 R 0.068 +56 L 0.069 +57 H 0.065 +58 T 0.058 +59 P 0.047 +60 M 0.036 +61 Y 0.027 +62 L 0.023 +63 F 0.022 +64 L 0.029 +65 C 0.040 +66 A 0.049 +67 L 0.052 +68 S 0.051 +69 I 0.051 +70 S 0.054 +71 E 0.059 +72 I 0.061 +73 L 0.059 +74 F 0.054 +75 T 0.051 +76 V 0.051 +77 A 0.053 +78 I 0.057 +79 T 0.060 +80 P 0.059 +81 R 0.058 +82 M 0.056 +83 L 0.053 +84 A 0.047 +85 D 0.041 +86 L 0.040 +87 L 0.046 +88 F 0.056 +89 T 0.064 +90 H 0.064 +91 R 0.058 +92 S 0.052 +93 I 0.045 +94 T 0.039 +95 F 0.033 +96 V 0.032 +97 A 0.032 +98 C 0.033 +99 A 0.031 +100 I 0.031 +101 Q 0.030 +102 M 0.030 +103 F 0.029 +104 F 0.027 +105 S 0.025 +106 F 0.024 +107 M 0.024 +108 F 0.024 +109 G 0.026 +110 F 0.031 +111 T 0.035 +112 H 0.038 +113 S 0.038 +114 F 0.037 +115 L 0.035 +116 L 0.034 +117 M 0.032 +118 V 0.031 +119 M 0.030 +120 G 0.032 +121 Y 0.036 +122 D 0.039 +123 H 0.040 +124 Y 0.039 +125 V 0.037 +126 T 0.038 +127 I 0.043 +128 C 0.049 +129 H 0.054 +130 P 0.055 +131 L 0.053 +132 H 0.052 +133 Y 0.052 +134 N 0.055 +135 M 0.061 +136 L 0.070 +137 M 0.078 +138 S 0.081 +139 P 0.081 +140 R 0.077 +141 G 0.070 +142 C 0.066 +143 A 0.071 +144 H 0.079 +145 L 0.084 +146 V 0.084 +147 A 0.080 +148 W 0.073 +149 T 0.067 +150 W 0.066 +151 A 0.072 +152 G 0.079 +153 G 0.079 +154 S 0.074 +155 V 0.071 +156 M 0.072 +157 G 0.072 +158 M 0.072 +159 M 0.073 +160 V 0.075 +161 T 0.074 +162 M 0.070 +163 M 0.067 +164 V 0.068 +165 F 0.073 +166 H 0.083 +167 L 0.090 +168 T 0.092 +169 F 0.097 +170 C 0.107 +171 G 0.118 +172 S 0.127 +173 N 0.137 +174 V 0.144 +175 I 0.139 +176 H 0.117 +177 H 0.088 +178 F 0.065 +179 L 0.053 +180 C 0.051 +181 H 0.055 +182 V 0.065 +183 L 0.078 +184 S 0.091 +185 L 0.102 +186 L 0.110 +187 K 0.117 +188 L 0.124 +189 A 0.131 +190 C 0.143 +191 G 0.164 +192 S 0.185 +193 K 0.192 +194 T 0.180 +195 S 0.158 +196 S 0.140 +197 V 0.130 +198 I 0.128 +199 M 0.128 +200 G 0.126 +201 V 0.118 +202 M 0.104 +203 L 0.087 +204 V 0.073 +205 C 0.068 +206 V 0.068 +207 T 0.071 +208 A 0.074 +209 L 0.075 +210 I 0.072 +211 G 0.072 +212 C 0.071 +213 L 0.068 +214 F 0.066 +215 L 0.069 +216 I 0.070 +217 I 0.065 +218 L 0.056 +219 S 0.050 +220 F 0.045 +221 V 0.042 +222 F 0.046 +223 I 0.058 +224 V 0.073 +225 A 0.084 +226 A 0.085 +227 I 0.081 +228 L 0.085 +229 R 0.101 +230 I 0.124 +231 P 0.144 +232 S 0.150 +233 A 0.142 +234 E 0.125 +235 G 0.107 +236 R 0.093 +237 H 0.086 +238 K 0.082 +239 T 0.078 +240 F 0.075 +241 S 0.073 +242 T 0.070 +243 C 0.066 +244 V 0.062 +245 S 0.060 +246 H 0.056 +247 L 0.051 +248 T 0.049 +249 V 0.049 +250 V 0.045 +251 V 0.037 +252 M 0.029 +253 H 0.023 +254 Y 0.022 +255 S 0.023 +256 F 0.027 +257 A 0.032 +258 S 0.037 +259 L 0.042 +260 I 0.053 +261 Y 0.075 +262 L 0.109 +263 K 0.148 +264 P 0.185 +265 K 0.210 +266 G 0.221 +267 L 0.217 +268 H 0.195 +269 S 0.163 +270 M 0.131 +271 Y 0.112 +272 S 0.102 +273 D 0.096 +274 A 0.089 +275 L 0.084 +276 M 0.080 +277 A 0.076 +278 T 0.071 +279 T 0.072 +280 Y 0.078 +281 T 0.086 +282 V 0.093 +283 F 0.097 +284 T 0.097 +285 P 0.090 +286 F 0.082 +287 L 0.078 +288 S 0.076 +289 P 0.074 +290 I 0.073 +291 I 0.077 +292 F 0.081 +293 S 0.087 +294 L 0.100 +295 R 0.111 +296 N 0.106 +297 K 0.088 +298 E 0.073 +299 L 0.069 +300 K 0.076 +301 N 0.083 +302 A 0.083 +303 I 0.080 +304 N 0.078 +305 K 0.077 +306 N 0.076 +307 F 0.086 +308 C 0.113 +309 R 0.158 +310 R 0.221 +311 F 0.296 +312 C 0.371 +313 P 0.430 +314 L 0.455 +315 S 0.442 +316 S 0.415 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000171936.3_ENST00000641646.1_GN:OR10H3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:11.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000171936.3_ENST00000641646.1_GN:OR10H3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:11.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0a424e33ac0d067b55ade8abd2a636afd7c15176 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000171936.3_ENST00000641646.1_GN:OR10H3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:11.caid @@ -0,0 +1,328 @@ +>ENSG00000171936.3|ENST00000641646.1|GN:OR10H3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:11 +1 M 0.352 +2 L 0.371 +3 K 0.405 +4 N 0.447 +5 S 0.485 +6 G 0.511 +7 I 0.527 +8 N 0.536 +9 T 0.531 +10 V 0.511 +11 S 0.495 +12 M 0.499 +13 P 0.514 +14 G 0.522 +15 Q 0.515 +16 N 0.491 +17 Y 0.447 +18 R 0.381 +19 T 0.304 +20 I 0.229 +21 S 0.170 +22 E 0.133 +23 F 0.120 +24 I 0.120 +25 L 0.125 +26 S 0.138 +27 G 0.157 +28 F 0.177 +29 S 0.189 +30 A 0.188 +31 F 0.174 +32 P 0.150 +33 Q 0.124 +34 Q 0.100 +35 L 0.081 +36 L 0.066 +37 P 0.054 +38 V 0.048 +39 L 0.051 +40 F 0.060 +41 L 0.064 +42 L 0.057 +43 Y 0.045 +44 L 0.038 +45 L 0.037 +46 M 0.039 +47 F 0.041 +48 L 0.043 +49 F 0.048 +50 T 0.054 +51 L 0.056 +52 L 0.058 +53 G 0.063 +54 N 0.068 +55 L 0.073 +56 L 0.075 +57 I 0.070 +58 M 0.060 +59 A 0.052 +60 T 0.047 +61 V 0.045 +62 W 0.045 +63 I 0.050 +64 E 0.057 +65 R 0.063 +66 R 0.067 +67 L 0.068 +68 H 0.064 +69 T 0.057 +70 P 0.047 +71 M 0.036 +72 Y 0.027 +73 L 0.022 +74 F 0.022 +75 L 0.029 +76 C 0.040 +77 A 0.049 +78 L 0.052 +79 S 0.051 +80 I 0.051 +81 S 0.053 +82 E 0.058 +83 I 0.060 +84 L 0.058 +85 F 0.054 +86 T 0.051 +87 V 0.050 +88 A 0.053 +89 I 0.056 +90 T 0.059 +91 P 0.058 +92 R 0.056 +93 M 0.055 +94 L 0.051 +95 A 0.045 +96 D 0.039 +97 L 0.038 +98 L 0.043 +99 F 0.054 +100 T 0.062 +101 H 0.062 +102 R 0.057 +103 S 0.051 +104 I 0.045 +105 T 0.038 +106 F 0.033 +107 V 0.031 +108 A 0.032 +109 C 0.032 +110 A 0.031 +111 I 0.030 +112 Q 0.030 +113 M 0.029 +114 F 0.028 +115 F 0.026 +116 S 0.025 +117 F 0.024 +118 M 0.024 +119 F 0.024 +120 G 0.026 +121 F 0.030 +122 T 0.035 +123 H 0.038 +124 S 0.038 +125 F 0.037 +126 L 0.035 +127 L 0.034 +128 M 0.032 +129 V 0.031 +130 M 0.030 +131 G 0.032 +132 Y 0.036 +133 D 0.040 +134 H 0.041 +135 Y 0.039 +136 V 0.038 +137 T 0.039 +138 I 0.044 +139 C 0.050 +140 H 0.055 +141 P 0.057 +142 L 0.055 +143 H 0.054 +144 Y 0.054 +145 N 0.057 +146 M 0.064 +147 L 0.073 +148 M 0.080 +149 S 0.082 +150 P 0.081 +151 R 0.076 +152 G 0.069 +153 C 0.065 +154 A 0.071 +155 H 0.079 +156 L 0.084 +157 V 0.084 +158 A 0.080 +159 W 0.073 +160 T 0.067 +161 W 0.066 +162 A 0.073 +163 G 0.080 +164 G 0.080 +165 S 0.075 +166 V 0.072 +167 M 0.072 +168 G 0.073 +169 M 0.072 +170 M 0.073 +171 V 0.075 +172 T 0.074 +173 M 0.070 +174 M 0.068 +175 V 0.069 +176 F 0.074 +177 H 0.084 +178 L 0.091 +179 T 0.094 +180 F 0.098 +181 C 0.107 +182 G 0.118 +183 S 0.128 +184 N 0.137 +185 V 0.144 +186 I 0.139 +187 H 0.117 +188 H 0.087 +189 F 0.065 +190 L 0.053 +191 C 0.051 +192 H 0.056 +193 V 0.065 +194 L 0.078 +195 S 0.091 +196 L 0.102 +197 L 0.109 +198 K 0.117 +199 L 0.123 +200 A 0.130 +201 C 0.142 +202 G 0.164 +203 S 0.186 +204 K 0.193 +205 T 0.180 +206 S 0.158 +207 S 0.139 +208 V 0.129 +209 I 0.127 +210 M 0.127 +211 G 0.125 +212 V 0.118 +213 M 0.104 +214 L 0.087 +215 V 0.073 +216 C 0.068 +217 V 0.068 +218 T 0.071 +219 A 0.074 +220 L 0.074 +221 I 0.072 +222 G 0.072 +223 C 0.071 +224 L 0.068 +225 F 0.066 +226 L 0.069 +227 I 0.071 +228 I 0.065 +229 L 0.056 +230 S 0.050 +231 F 0.045 +232 V 0.042 +233 F 0.046 +234 I 0.058 +235 V 0.074 +236 A 0.085 +237 A 0.086 +238 I 0.082 +239 L 0.085 +240 R 0.101 +241 I 0.125 +242 P 0.145 +243 S 0.151 +244 A 0.143 +245 E 0.127 +246 G 0.109 +247 R 0.095 +248 H 0.088 +249 K 0.084 +250 T 0.079 +251 F 0.076 +252 S 0.074 +253 T 0.072 +254 C 0.067 +255 V 0.064 +256 S 0.061 +257 H 0.057 +258 L 0.052 +259 T 0.050 +260 V 0.049 +261 V 0.045 +262 V 0.037 +263 M 0.029 +264 H 0.024 +265 Y 0.022 +266 S 0.023 +267 F 0.027 +268 A 0.032 +269 S 0.037 +270 L 0.042 +271 I 0.054 +272 Y 0.075 +273 L 0.109 +274 K 0.150 +275 P 0.187 +276 K 0.213 +277 G 0.225 +278 L 0.222 +279 H 0.200 +280 S 0.167 +281 M 0.134 +282 Y 0.114 +283 S 0.104 +284 D 0.098 +285 A 0.092 +286 L 0.087 +287 M 0.083 +288 A 0.078 +289 T 0.073 +290 T 0.073 +291 Y 0.079 +292 T 0.087 +293 V 0.095 +294 F 0.099 +295 T 0.098 +296 P 0.091 +297 F 0.083 +298 L 0.079 +299 S 0.077 +300 P 0.074 +301 I 0.074 +302 I 0.078 +303 F 0.082 +304 S 0.088 +305 L 0.101 +306 R 0.112 +307 N 0.108 +308 K 0.090 +309 E 0.074 +310 L 0.070 +311 K 0.076 +312 N 0.083 +313 A 0.084 +314 I 0.080 +315 N 0.079 +316 K 0.077 +317 N 0.076 +318 F 0.086 +319 C 0.114 +320 R 0.160 +321 R 0.223 +322 F 0.299 +323 C 0.375 +324 P 0.435 +325 L 0.461 +326 S 0.446 +327 S 0.419 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000172936.19_ENST00000650905.2_GN:MYD88_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000172936.19_ENST00000650905.2_GN:MYD88_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5f4545941d23667760b14ebb4c051493972e43ac --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000172936.19_ENST00000650905.2_GN:MYD88_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,297 @@ +>ENSG00000172936.19|ENST00000650905.2|GN:MYD88|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.413 +2 A 0.406 +3 A 0.422 +4 G 0.479 +5 G 0.552 +6 P 0.609 +7 G 0.643 +8 A 0.656 +9 G 0.651 +10 S 0.633 +11 A 0.615 +12 A 0.608 +13 P 0.607 +14 V 0.595 +15 S 0.551 +16 S 0.469 +17 T 0.364 +18 S 0.259 +19 S 0.177 +20 L 0.124 +21 P 0.089 +22 L 0.066 +23 A 0.053 +24 A 0.047 +25 L 0.044 +26 N 0.037 +27 M 0.029 +28 R 0.024 +29 V 0.023 +30 R 0.024 +31 R 0.027 +32 R 0.032 +33 L 0.038 +34 S 0.044 +35 L 0.053 +36 F 0.064 +37 L 0.077 +38 N 0.091 +39 V 0.110 +40 R 0.132 +41 T 0.150 +42 Q 0.158 +43 V 0.153 +44 A 0.137 +45 A 0.111 +46 D 0.082 +47 W 0.058 +48 T 0.047 +49 A 0.045 +50 L 0.046 +51 A 0.047 +52 E 0.045 +53 E 0.040 +54 M 0.037 +55 D 0.036 +56 F 0.037 +57 E 0.038 +58 Y 0.039 +59 L 0.040 +60 E 0.042 +61 I 0.046 +62 R 0.049 +63 Q 0.052 +64 L 0.057 +65 E 0.063 +66 T 0.068 +67 Q 0.070 +68 A 0.071 +69 D 0.067 +70 P 0.056 +71 T 0.044 +72 G 0.038 +73 R 0.039 +74 L 0.040 +75 L 0.039 +76 D 0.038 +77 A 0.038 +78 W 0.038 +79 Q 0.037 +80 G 0.037 +81 R 0.042 +82 P 0.049 +83 G 0.052 +84 A 0.050 +85 S 0.048 +86 V 0.047 +87 G 0.047 +88 R 0.046 +89 L 0.045 +90 L 0.045 +91 E 0.048 +92 L 0.054 +93 L 0.057 +94 T 0.060 +95 K 0.067 +96 L 0.077 +97 G 0.079 +98 R 0.069 +99 D 0.055 +100 D 0.045 +101 V 0.041 +102 L 0.039 +103 L 0.038 +104 E 0.040 +105 L 0.045 +106 G 0.048 +107 P 0.045 +108 S 0.042 +109 I 0.046 +110 E 0.056 +111 E 0.063 +112 D 0.067 +113 C 0.076 +114 Q 0.090 +115 K 0.096 +116 Y 0.092 +117 I 0.092 +118 L 0.100 +119 K 0.113 +120 Q 0.133 +121 Q 0.162 +122 Q 0.199 +123 E 0.247 +124 E 0.302 +125 A 0.353 +126 E 0.397 +127 K 0.442 +128 P 0.488 +129 L 0.536 +130 Q 0.581 +131 V 0.617 +132 A 0.631 +133 A 0.623 +134 V 0.600 +135 D 0.569 +136 S 0.538 +137 S 0.514 +138 V 0.499 +139 P 0.490 +140 R 0.486 +141 T 0.473 +142 A 0.439 +143 E 0.384 +144 L 0.329 +145 A 0.284 +146 G 0.247 +147 I 0.213 +148 T 0.193 +149 T 0.198 +150 L 0.222 +151 D 0.254 +152 D 0.280 +153 P 0.294 +154 L 0.299 +155 G 0.301 +156 H 0.291 +157 M 0.260 +158 P 0.211 +159 E 0.154 +160 R 0.105 +161 F 0.071 +162 D 0.048 +163 A 0.034 +164 F 0.028 +165 I 0.029 +166 C 0.032 +167 Y 0.032 +168 C 0.031 +169 P 0.029 +170 S 0.028 +171 D 0.027 +172 I 0.024 +173 Q 0.020 +174 F 0.017 +175 V 0.017 +176 Q 0.020 +177 E 0.027 +178 M 0.040 +179 I 0.057 +180 R 0.068 +181 Q 0.070 +182 L 0.068 +183 E 0.068 +184 Q 0.070 +185 T 0.074 +186 N 0.078 +187 Y 0.081 +188 R 0.077 +189 L 0.065 +190 K 0.051 +191 L 0.041 +192 C 0.037 +193 V 0.039 +194 S 0.046 +195 D 0.056 +196 R 0.068 +197 D 0.083 +198 V 0.104 +199 L 0.124 +200 P 0.133 +201 G 0.129 +202 T 0.114 +203 C 0.094 +204 V 0.076 +205 W 0.068 +206 S 0.067 +207 I 0.067 +208 A 0.065 +209 S 0.061 +210 E 0.056 +211 L 0.053 +212 I 0.058 +213 E 0.068 +214 K 0.074 +215 R 0.070 +216 C 0.060 +217 R 0.050 +218 R 0.041 +219 M 0.039 +220 V 0.044 +221 V 0.052 +222 V 0.057 +223 V 0.054 +224 S 0.049 +225 D 0.046 +226 D 0.048 +227 Y 0.050 +228 L 0.049 +229 Q 0.046 +230 S 0.044 +231 K 0.042 +232 E 0.040 +233 C 0.039 +234 D 0.038 +235 F 0.036 +236 Q 0.035 +237 T 0.037 +238 K 0.040 +239 F 0.043 +240 A 0.047 +241 L 0.059 +242 S 0.081 +243 L 0.112 +244 S 0.141 +245 P 0.161 +246 G 0.171 +247 A 0.169 +248 H 0.153 +249 Q 0.125 +250 K 0.093 +251 R 0.067 +252 L 0.055 +253 I 0.057 +254 P 0.069 +255 I 0.083 +256 K 0.090 +257 Y 0.088 +258 K 0.083 +259 A 0.083 +260 M 0.092 +261 K 0.102 +262 K 0.104 +263 E 0.098 +264 F 0.089 +265 P 0.080 +266 S 0.070 +267 I 0.063 +268 L 0.059 +269 R 0.061 +270 F 0.064 +271 I 0.065 +272 T 0.063 +273 V 0.063 +274 C 0.070 +275 D 0.081 +276 Y 0.093 +277 T 0.100 +278 N 0.103 +279 P 0.103 +280 C 0.100 +281 T 0.095 +282 K 0.084 +283 S 0.071 +284 W 0.058 +285 F 0.046 +286 W 0.038 +287 T 0.037 +288 R 0.041 +289 L 0.049 +290 A 0.055 +291 K 0.058 +292 A 0.063 +293 L 0.084 +294 S 0.130 +295 L 0.188 +296 P 0.231 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000172936.19_ENST00000650905.2_GN:MYD88_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000172936.19_ENST00000650905.2_GN:MYD88_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..59509c19cdcf81a462e9b150cd0ab065ff263da1 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000172936.19_ENST00000650905.2_GN:MYD88_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid @@ -0,0 +1,310 @@ +>ENSG00000172936.19|ENST00000650905.2|GN:MYD88|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:13 +1 M 0.441 +2 R 0.462 +3 P 0.489 +4 D 0.496 +5 R 0.471 +6 A 0.442 +7 E 0.447 +8 A 0.481 +9 P 0.511 +10 G 0.518 +11 P 0.495 +12 P 0.445 +13 A 0.402 +14 M 0.423 +15 A 0.508 +16 A 0.594 +17 G 0.640 +18 G 0.650 +19 P 0.630 +20 G 0.588 +21 A 0.561 +22 G 0.575 +23 S 0.607 +24 A 0.622 +25 A 0.625 +26 P 0.626 +27 V 0.613 +28 S 0.562 +29 S 0.472 +30 T 0.362 +31 S 0.256 +32 S 0.174 +33 L 0.120 +34 P 0.086 +35 L 0.063 +36 A 0.050 +37 A 0.046 +38 L 0.043 +39 N 0.037 +40 M 0.029 +41 R 0.024 +42 V 0.023 +43 R 0.024 +44 R 0.027 +45 R 0.033 +46 L 0.039 +47 S 0.045 +48 L 0.053 +49 F 0.065 +50 L 0.076 +51 N 0.090 +52 V 0.109 +53 R 0.131 +54 T 0.149 +55 Q 0.157 +56 V 0.152 +57 A 0.135 +58 A 0.109 +59 D 0.080 +60 W 0.057 +61 T 0.046 +62 A 0.044 +63 L 0.046 +64 A 0.046 +65 E 0.044 +66 E 0.039 +67 M 0.035 +68 D 0.034 +69 F 0.035 +70 E 0.036 +71 Y 0.037 +72 L 0.037 +73 E 0.040 +74 I 0.044 +75 R 0.046 +76 Q 0.049 +77 L 0.054 +78 E 0.061 +79 T 0.065 +80 Q 0.068 +81 A 0.068 +82 D 0.064 +83 P 0.054 +84 T 0.042 +85 G 0.037 +86 R 0.037 +87 L 0.039 +88 L 0.038 +89 D 0.036 +90 A 0.036 +91 W 0.037 +92 Q 0.036 +93 G 0.036 +94 R 0.041 +95 P 0.048 +96 G 0.051 +97 A 0.050 +98 S 0.047 +99 V 0.046 +100 G 0.045 +101 R 0.045 +102 L 0.044 +103 L 0.044 +104 E 0.047 +105 L 0.052 +106 L 0.056 +107 T 0.058 +108 K 0.065 +109 L 0.074 +110 G 0.077 +111 R 0.068 +112 D 0.054 +113 D 0.045 +114 V 0.041 +115 L 0.040 +116 L 0.039 +117 E 0.041 +118 L 0.046 +119 G 0.048 +120 P 0.045 +121 S 0.042 +122 I 0.045 +123 E 0.052 +124 E 0.055 +125 D 0.049 +126 C 0.041 +127 Q 0.039 +128 K 0.044 +129 Y 0.057 +130 I 0.075 +131 L 0.093 +132 K 0.109 +133 Q 0.129 +134 Q 0.158 +135 Q 0.195 +136 E 0.243 +137 E 0.299 +138 A 0.351 +139 E 0.397 +140 K 0.443 +141 P 0.493 +142 L 0.543 +143 Q 0.589 +144 V 0.622 +145 A 0.635 +146 A 0.627 +147 V 0.605 +148 D 0.574 +149 S 0.542 +150 S 0.518 +151 V 0.503 +152 P 0.495 +153 R 0.490 +154 T 0.477 +155 A 0.441 +156 E 0.385 +157 L 0.329 +158 A 0.284 +159 G 0.246 +160 I 0.212 +161 T 0.191 +162 T 0.195 +163 L 0.218 +164 D 0.249 +165 D 0.276 +166 P 0.290 +167 L 0.296 +168 G 0.298 +169 H 0.289 +170 M 0.260 +171 P 0.210 +172 E 0.154 +173 R 0.105 +174 F 0.070 +175 D 0.048 +176 A 0.033 +177 F 0.027 +178 I 0.028 +179 C 0.031 +180 Y 0.032 +181 C 0.030 +182 P 0.029 +183 S 0.028 +184 D 0.027 +185 I 0.023 +186 Q 0.019 +187 F 0.017 +188 V 0.017 +189 Q 0.020 +190 E 0.027 +191 M 0.040 +192 I 0.055 +193 R 0.065 +194 Q 0.067 +195 L 0.066 +196 E 0.067 +197 Q 0.069 +198 T 0.073 +199 N 0.077 +200 Y 0.080 +201 R 0.075 +202 L 0.063 +203 K 0.049 +204 L 0.040 +205 C 0.036 +206 V 0.038 +207 S 0.045 +208 D 0.055 +209 R 0.066 +210 D 0.082 +211 V 0.102 +212 L 0.122 +213 P 0.130 +214 G 0.125 +215 T 0.110 +216 C 0.091 +217 V 0.074 +218 W 0.067 +219 S 0.066 +220 I 0.067 +221 A 0.065 +222 S 0.062 +223 E 0.056 +224 L 0.053 +225 I 0.059 +226 E 0.068 +227 K 0.074 +228 R 0.070 +229 C 0.060 +230 R 0.049 +231 R 0.041 +232 M 0.040 +233 V 0.045 +234 V 0.052 +235 V 0.057 +236 V 0.055 +237 S 0.049 +238 D 0.046 +239 D 0.048 +240 Y 0.050 +241 L 0.049 +242 Q 0.046 +243 S 0.044 +244 K 0.041 +245 E 0.039 +246 C 0.038 +247 D 0.037 +248 F 0.035 +249 Q 0.035 +250 T 0.037 +251 K 0.039 +252 F 0.042 +253 A 0.047 +254 L 0.059 +255 S 0.082 +256 L 0.113 +257 S 0.142 +258 P 0.163 +259 G 0.173 +260 A 0.171 +261 H 0.154 +262 Q 0.126 +263 K 0.094 +264 R 0.067 +265 L 0.055 +266 I 0.058 +267 P 0.070 +268 I 0.083 +269 K 0.091 +270 Y 0.089 +271 K 0.083 +272 A 0.084 +273 M 0.093 +274 K 0.104 +275 K 0.106 +276 E 0.100 +277 F 0.091 +278 P 0.081 +279 S 0.071 +280 I 0.064 +281 L 0.060 +282 R 0.061 +283 F 0.064 +284 I 0.066 +285 T 0.064 +286 V 0.064 +287 C 0.070 +288 D 0.082 +289 Y 0.093 +290 T 0.100 +291 N 0.103 +292 P 0.104 +293 C 0.102 +294 T 0.096 +295 K 0.086 +296 S 0.072 +297 W 0.058 +298 F 0.046 +299 W 0.038 +300 T 0.037 +301 R 0.042 +302 L 0.049 +303 A 0.055 +304 K 0.058 +305 A 0.063 +306 L 0.084 +307 S 0.129 +308 L 0.188 +309 P 0.231 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000173535.16_ENST00000356864.4_GN:TNFRSF10C_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000173535.16_ENST00000356864.4_GN:TNFRSF10C_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d9ce730d54b9549b3ae35a062cd574155fffe4b5 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000173535.16_ENST00000356864.4_GN:TNFRSF10C_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,260 @@ +>ENSG00000173535.16|ENST00000356864.4|GN:TNFRSF10C|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.394 +2 A 0.390 +3 R 0.369 +4 I 0.325 +5 P 0.264 +6 K 0.210 +7 T 0.177 +8 L 0.158 +9 K 0.144 +10 F 0.133 +11 V 0.128 +12 V 0.133 +13 V 0.145 +14 I 0.160 +15 V 0.177 +16 A 0.192 +17 V 0.206 +18 L 0.229 +19 L 0.268 +20 P 0.314 +21 V 0.353 +22 L 0.386 +23 A 0.417 +24 Y 0.459 +25 S 0.519 +26 A 0.582 +27 T 0.630 +28 T 0.655 +29 A 0.659 +30 R 0.652 +31 Q 0.645 +32 E 0.646 +33 E 0.652 +34 V 0.657 +35 P 0.667 +36 Q 0.682 +37 Q 0.693 +38 T 0.692 +39 V 0.679 +40 A 0.665 +41 P 0.656 +42 Q 0.651 +43 Q 0.645 +44 Q 0.632 +45 R 0.605 +46 H 0.565 +47 S 0.519 +48 F 0.473 +49 K 0.424 +50 G 0.364 +51 E 0.296 +52 E 0.228 +53 C 0.176 +54 P 0.140 +55 A 0.113 +56 G 0.090 +57 S 0.078 +58 H 0.081 +59 R 0.094 +60 S 0.106 +61 E 0.112 +62 H 0.117 +63 T 0.128 +64 G 0.142 +65 A 0.153 +66 C 0.156 +67 N 0.146 +68 P 0.125 +69 C 0.103 +70 T 0.091 +71 E 0.093 +72 G 0.104 +73 V 0.115 +74 D 0.125 +75 Y 0.136 +76 T 0.152 +77 N 0.177 +78 A 0.198 +79 S 0.198 +80 N 0.180 +81 N 0.160 +82 E 0.147 +83 P 0.144 +84 S 0.149 +85 C 0.155 +86 F 0.158 +87 P 0.154 +88 C 0.140 +89 T 0.119 +90 V 0.098 +91 C 0.082 +92 K 0.074 +93 S 0.070 +94 D 0.068 +95 Q 0.073 +96 K 0.085 +97 H 0.101 +98 K 0.113 +99 S 0.120 +100 S 0.119 +101 C 0.109 +102 T 0.096 +103 M 0.090 +104 T 0.096 +105 R 0.110 +106 D 0.119 +107 T 0.114 +108 V 0.099 +109 C 0.082 +110 Q 0.074 +111 C 0.076 +112 K 0.084 +113 E 0.091 +114 G 0.091 +115 T 0.090 +116 F 0.092 +117 R 0.098 +118 N 0.107 +119 E 0.118 +120 N 0.125 +121 S 0.126 +122 P 0.123 +123 E 0.125 +124 M 0.133 +125 C 0.142 +126 R 0.143 +127 K 0.138 +128 C 0.132 +129 S 0.126 +130 R 0.127 +131 C 0.137 +132 P 0.150 +133 S 0.155 +134 G 0.149 +135 E 0.141 +136 V 0.138 +137 Q 0.145 +138 V 0.165 +139 S 0.193 +140 N 0.209 +141 C 0.198 +142 T 0.169 +143 S 0.144 +144 W 0.140 +145 D 0.153 +146 D 0.174 +147 I 0.193 +148 Q 0.206 +149 C 0.219 +150 V 0.264 +151 E 0.360 +152 E 0.482 +153 F 0.584 +154 G 0.651 +155 A 0.695 +156 N 0.724 +157 A 0.741 +158 T 0.746 +159 V 0.740 +160 E 0.730 +161 T 0.728 +162 P 0.737 +163 A 0.740 +164 A 0.713 +165 E 0.659 +166 E 0.628 +167 T 0.655 +168 M 0.705 +169 N 0.730 +170 T 0.730 +171 S 0.725 +172 P 0.723 +173 G 0.716 +174 T 0.708 +175 P 0.708 +176 A 0.717 +177 P 0.728 +178 A 0.724 +179 A 0.689 +180 E 0.634 +181 E 0.605 +182 T 0.633 +183 M 0.686 +184 N 0.721 +185 T 0.735 +186 S 0.744 +187 P 0.751 +188 G 0.753 +189 T 0.751 +190 P 0.754 +191 A 0.765 +192 P 0.782 +193 A 0.796 +194 A 0.802 +195 E 0.803 +196 E 0.798 +197 T 0.786 +198 M 0.771 +199 T 0.758 +200 T 0.754 +201 S 0.755 +202 P 0.757 +203 G 0.756 +204 T 0.752 +205 P 0.751 +206 A 0.757 +207 P 0.769 +208 A 0.782 +209 A 0.789 +210 E 0.790 +211 E 0.785 +212 T 0.775 +213 M 0.760 +214 T 0.744 +215 T 0.732 +216 S 0.725 +217 P 0.721 +218 G 0.717 +219 T 0.716 +220 P 0.720 +221 A 0.733 +222 P 0.748 +223 A 0.748 +224 A 0.714 +225 E 0.656 +226 E 0.627 +227 T 0.660 +228 M 0.719 +229 I 0.756 +230 T 0.768 +231 S 0.771 +232 P 0.770 +233 G 0.764 +234 T 0.755 +235 P 0.747 +236 A 0.730 +237 S 0.701 +238 S 0.662 +239 H 0.616 +240 Y 0.561 +241 L 0.505 +242 S 0.462 +243 C 0.427 +244 T 0.387 +245 I 0.347 +246 V 0.321 +247 G 0.310 +248 I 0.298 +249 I 0.283 +250 V 0.271 +251 L 0.258 +252 I 0.237 +253 V 0.211 +254 L 0.188 +255 L 0.175 +256 I 0.173 +257 V 0.179 +258 F 0.188 +259 V 0.194 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000173535.16_ENST00000356864.4_GN:TNFRSF10C_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:40.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000173535.16_ENST00000356864.4_GN:TNFRSF10C_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:40.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f44687c8f589f45562caa97ebf0e3f58a60236ca --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000173535.16_ENST00000356864.4_GN:TNFRSF10C_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:40.caid @@ -0,0 +1,300 @@ +>ENSG00000173535.16|ENST00000356864.4|GN:TNFRSF10C|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:40 +1 M 0.481 +2 Q 0.508 +3 G 0.536 +4 V 0.532 +5 K 0.496 +6 E 0.471 +7 R 0.493 +8 F 0.550 +9 L 0.609 +10 P 0.660 +11 L 0.702 +12 G 0.731 +13 N 0.743 +14 S 0.745 +15 G 0.738 +16 D 0.719 +17 R 0.689 +18 A 0.659 +19 P 0.636 +20 R 0.629 +21 P 0.639 +22 P 0.660 +23 D 0.679 +24 G 0.678 +25 R 0.644 +26 G 0.588 +27 R 0.553 +28 V 0.564 +29 R 0.583 +30 P 0.581 +31 R 0.590 +32 T 0.646 +33 Q 0.721 +34 D 0.770 +35 G 0.789 +36 V 0.789 +37 G 0.781 +38 N 0.773 +39 H 0.766 +40 T 0.757 +41 M 0.738 +42 A 0.696 +43 R 0.622 +44 I 0.515 +45 P 0.402 +46 K 0.321 +47 T 0.282 +48 L 0.256 +49 K 0.221 +50 F 0.191 +51 V 0.176 +52 V 0.174 +53 V 0.177 +54 I 0.187 +55 V 0.204 +56 A 0.221 +57 V 0.236 +58 L 0.260 +59 L 0.304 +60 P 0.362 +61 V 0.419 +62 L 0.466 +63 A 0.504 +64 Y 0.546 +65 S 0.601 +66 A 0.659 +67 T 0.703 +68 T 0.725 +69 A 0.730 +70 R 0.726 +71 Q 0.723 +72 E 0.725 +73 E 0.729 +74 V 0.730 +75 P 0.734 +76 Q 0.744 +77 Q 0.752 +78 T 0.751 +79 V 0.739 +80 A 0.724 +81 P 0.713 +82 Q 0.704 +83 Q 0.693 +84 Q 0.675 +85 R 0.645 +86 H 0.603 +87 S 0.555 +88 F 0.504 +89 K 0.446 +90 G 0.376 +91 E 0.297 +92 E 0.226 +93 C 0.174 +94 P 0.141 +95 A 0.114 +96 G 0.090 +97 S 0.076 +98 H 0.077 +99 R 0.088 +100 S 0.099 +101 E 0.103 +102 H 0.108 +103 T 0.117 +104 G 0.130 +105 A 0.141 +106 C 0.145 +107 N 0.137 +108 P 0.118 +109 C 0.098 +110 T 0.087 +111 E 0.090 +112 G 0.101 +113 V 0.112 +114 D 0.121 +115 Y 0.130 +116 T 0.144 +117 N 0.163 +118 A 0.179 +119 S 0.180 +120 N 0.166 +121 N 0.150 +122 E 0.142 +123 P 0.143 +124 S 0.150 +125 C 0.158 +126 F 0.161 +127 P 0.157 +128 C 0.145 +129 T 0.126 +130 V 0.106 +131 C 0.090 +132 K 0.081 +133 S 0.076 +134 D 0.074 +135 Q 0.079 +136 K 0.091 +137 H 0.107 +138 K 0.120 +139 S 0.129 +140 S 0.129 +141 C 0.119 +142 T 0.106 +143 M 0.101 +144 T 0.110 +145 R 0.127 +146 D 0.138 +147 T 0.131 +148 V 0.111 +149 C 0.091 +150 Q 0.080 +151 C 0.081 +152 K 0.090 +153 E 0.096 +154 G 0.096 +155 T 0.094 +156 F 0.097 +157 R 0.103 +158 N 0.113 +159 E 0.124 +160 N 0.130 +161 S 0.129 +162 P 0.126 +163 E 0.130 +164 M 0.140 +165 C 0.150 +166 R 0.151 +167 K 0.145 +168 C 0.139 +169 S 0.133 +170 R 0.134 +171 C 0.145 +172 P 0.158 +173 S 0.161 +174 G 0.153 +175 E 0.143 +176 V 0.137 +177 Q 0.143 +178 V 0.163 +179 S 0.191 +180 N 0.209 +181 C 0.200 +182 T 0.172 +183 S 0.146 +184 W 0.138 +185 D 0.148 +186 D 0.164 +187 I 0.181 +188 Q 0.193 +189 C 0.211 +190 V 0.264 +191 E 0.369 +192 E 0.496 +193 F 0.599 +194 G 0.664 +195 A 0.706 +196 N 0.733 +197 A 0.749 +198 T 0.755 +199 V 0.750 +200 E 0.739 +201 T 0.735 +202 P 0.742 +203 A 0.743 +204 A 0.715 +205 E 0.660 +206 E 0.630 +207 T 0.659 +208 M 0.710 +209 N 0.735 +210 T 0.734 +211 S 0.726 +212 P 0.720 +213 G 0.711 +214 T 0.701 +215 P 0.700 +216 A 0.709 +217 P 0.722 +218 A 0.720 +219 A 0.686 +220 E 0.631 +221 E 0.603 +222 T 0.631 +223 M 0.684 +224 N 0.719 +225 T 0.732 +226 S 0.740 +227 P 0.746 +228 G 0.746 +229 T 0.744 +230 P 0.747 +231 A 0.759 +232 P 0.777 +233 A 0.793 +234 A 0.801 +235 E 0.802 +236 E 0.797 +237 T 0.785 +238 M 0.770 +239 T 0.758 +240 T 0.754 +241 S 0.755 +242 P 0.756 +243 G 0.755 +244 T 0.750 +245 P 0.749 +246 A 0.754 +247 P 0.764 +248 A 0.762 +249 A 0.729 +250 E 0.673 +251 E 0.639 +252 T 0.660 +253 M 0.703 +254 T 0.728 +255 T 0.731 +256 S 0.726 +257 P 0.722 +258 G 0.720 +259 T 0.718 +260 P 0.723 +261 A 0.735 +262 P 0.749 +263 A 0.749 +264 A 0.714 +265 E 0.656 +266 E 0.627 +267 T 0.661 +268 M 0.721 +269 I 0.759 +270 T 0.772 +271 S 0.776 +272 P 0.775 +273 G 0.768 +274 T 0.761 +275 P 0.754 +276 A 0.742 +277 S 0.717 +278 S 0.682 +279 H 0.639 +280 Y 0.585 +281 L 0.527 +282 S 0.481 +283 C 0.441 +284 T 0.397 +285 I 0.351 +286 V 0.321 +287 G 0.307 +288 I 0.292 +289 I 0.273 +290 V 0.257 +291 L 0.244 +292 I 0.226 +293 V 0.203 +294 L 0.184 +295 L 0.173 +296 I 0.174 +297 V 0.181 +298 F 0.192 +299 V 0.200 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000173908.9_ENST00000306658.8_GN:KRT28_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000173908.9_ENST00000306658.8_GN:KRT28_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..de74ff1c2ecb1a01cd810cbbe502c8d533853260 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000173908.9_ENST00000306658.8_GN:KRT28_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,465 @@ +>ENSG00000173908.9|ENST00000306658.8|GN:KRT28|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.453 +2 S 0.510 +3 L 0.583 +4 Q 0.633 +5 F 0.654 +6 S 0.664 +7 N 0.675 +8 G 0.690 +9 S 0.708 +10 R 0.727 +11 H 0.748 +12 V 0.763 +13 C 0.766 +14 L 0.760 +15 R 0.758 +16 S 0.765 +17 G 0.777 +18 A 0.787 +19 G 0.793 +20 S 0.792 +21 V 0.785 +22 R 0.783 +23 P 0.794 +24 L 0.814 +25 N 0.831 +26 G 0.841 +27 G 0.845 +28 A 0.846 +29 G 0.847 +30 F 0.849 +31 A 0.852 +32 G 0.854 +33 S 0.854 +34 S 0.853 +35 A 0.851 +36 C 0.849 +37 G 0.843 +38 G 0.837 +39 S 0.833 +40 V 0.831 +41 A 0.832 +42 G 0.833 +43 S 0.831 +44 E 0.827 +45 F 0.824 +46 S 0.827 +47 C 0.829 +48 A 0.829 +49 L 0.829 +50 G 0.832 +51 G 0.838 +52 G 0.841 +53 L 0.839 +54 G 0.834 +55 S 0.828 +56 V 0.824 +57 P 0.828 +58 G 0.838 +59 G 0.846 +60 S 0.847 +61 H 0.845 +62 A 0.843 +63 G 0.843 +64 G 0.842 +65 A 0.839 +66 L 0.837 +67 G 0.836 +68 N 0.835 +69 A 0.832 +70 A 0.828 +71 C 0.823 +72 I 0.815 +73 G 0.807 +74 F 0.804 +75 A 0.805 +76 G 0.807 +77 S 0.810 +78 E 0.811 +79 G 0.810 +80 G 0.804 +81 L 0.795 +82 L 0.788 +83 S 0.781 +84 G 0.769 +85 N 0.751 +86 E 0.731 +87 K 0.713 +88 V 0.693 +89 T 0.669 +90 M 0.657 +91 Q 0.664 +92 N 0.668 +93 L 0.659 +94 N 0.643 +95 D 0.621 +96 R 0.584 +97 L 0.543 +98 A 0.507 +99 S 0.459 +100 Y 0.403 +101 L 0.375 +102 D 0.382 +103 N 0.389 +104 V 0.392 +105 R 0.408 +106 A 0.422 +107 L 0.412 +108 E 0.396 +109 E 0.391 +110 A 0.381 +111 N 0.354 +112 A 0.321 +113 E 0.292 +114 L 0.261 +115 E 0.228 +116 R 0.204 +117 K 0.196 +118 I 0.196 +119 K 0.191 +120 G 0.173 +121 W 0.153 +122 Y 0.146 +123 E 0.160 +124 K 0.199 +125 Y 0.262 +126 G 0.346 +127 P 0.442 +128 G 0.528 +129 S 0.585 +130 C 0.614 +131 R 0.630 +132 G 0.640 +133 L 0.629 +134 D 0.583 +135 H 0.503 +136 D 0.405 +137 Y 0.319 +138 S 0.268 +139 R 0.252 +140 Y 0.257 +141 H 0.264 +142 L 0.272 +143 T 0.286 +144 I 0.306 +145 E 0.319 +146 D 0.311 +147 L 0.288 +148 K 0.268 +149 N 0.261 +150 K 0.267 +151 I 0.281 +152 I 0.302 +153 S 0.323 +154 S 0.338 +155 T 0.363 +156 T 0.400 +157 T 0.433 +158 N 0.455 +159 A 0.467 +160 N 0.458 +161 V 0.437 +162 I 0.434 +163 L 0.446 +164 Q 0.454 +165 I 0.456 +166 D 0.458 +167 N 0.439 +168 A 0.391 +169 R 0.346 +170 L 0.330 +171 A 0.329 +172 A 0.323 +173 D 0.310 +174 D 0.286 +175 F 0.254 +176 R 0.230 +177 L 0.218 +178 K 0.209 +179 Y 0.207 +180 E 0.217 +181 N 0.227 +182 E 0.233 +183 L 0.248 +184 T 0.269 +185 L 0.285 +186 H 0.298 +187 Q 0.309 +188 N 0.307 +189 V 0.303 +190 E 0.325 +191 A 0.361 +192 D 0.370 +193 I 0.345 +194 N 0.314 +195 G 0.290 +196 L 0.265 +197 R 0.238 +198 R 0.218 +199 V 0.210 +200 L 0.216 +201 D 0.228 +202 E 0.234 +203 L 0.234 +204 T 0.247 +205 L 0.272 +206 C 0.293 +207 R 0.308 +208 T 0.329 +209 D 0.351 +210 Q 0.372 +211 E 0.400 +212 L 0.416 +213 Q 0.394 +214 Y 0.352 +215 E 0.325 +216 S 0.306 +217 L 0.280 +218 S 0.263 +219 E 0.266 +220 E 0.268 +221 M 0.257 +222 T 0.244 +223 Y 0.242 +224 L 0.248 +225 K 0.253 +226 K 0.248 +227 N 0.236 +228 H 0.230 +229 E 0.242 +230 E 0.267 +231 E 0.293 +232 M 0.319 +233 K 0.346 +234 A 0.369 +235 L 0.392 +236 Q 0.428 +237 C 0.477 +238 A 0.527 +239 A 0.566 +240 G 0.595 +241 G 0.620 +242 N 0.639 +243 V 0.652 +244 N 0.659 +245 V 0.663 +246 E 0.669 +247 M 0.677 +248 N 0.682 +249 A 0.680 +250 A 0.674 +251 P 0.660 +252 G 0.624 +253 V 0.552 +254 D 0.456 +255 L 0.374 +256 A 0.343 +257 V 0.357 +258 L 0.384 +259 L 0.411 +260 N 0.440 +261 N 0.456 +262 M 0.432 +263 R 0.375 +264 A 0.326 +265 E 0.301 +266 Y 0.290 +267 E 0.285 +268 A 0.279 +269 L 0.271 +270 A 0.268 +271 E 0.273 +272 Q 0.280 +273 N 0.289 +274 R 0.303 +275 K 0.321 +276 D 0.329 +277 A 0.323 +278 E 0.304 +279 A 0.278 +280 W 0.255 +281 F 0.245 +282 N 0.248 +283 E 0.250 +284 K 0.244 +285 S 0.234 +286 A 0.229 +287 S 0.233 +288 L 0.237 +289 Q 0.237 +290 Q 0.236 +291 Q 0.240 +292 I 0.253 +293 S 0.273 +294 H 0.294 +295 D 0.311 +296 S 0.331 +297 G 0.348 +298 A 0.350 +299 A 0.343 +300 T 0.339 +301 F 0.335 +302 A 0.322 +303 R 0.310 +304 S 0.313 +305 Q 0.325 +306 L 0.333 +307 T 0.338 +308 E 0.334 +309 M 0.314 +310 R 0.286 +311 R 0.269 +312 T 0.269 +313 L 0.277 +314 Q 0.281 +315 T 0.271 +316 L 0.259 +317 E 0.263 +318 I 0.280 +319 Q 0.293 +320 L 0.308 +321 Q 0.333 +322 S 0.350 +323 L 0.360 +324 M 0.381 +325 A 0.407 +326 T 0.412 +327 K 0.404 +328 H 0.403 +329 S 0.399 +330 L 0.389 +331 E 0.390 +332 C 0.396 +333 S 0.376 +334 L 0.331 +335 T 0.292 +336 E 0.273 +337 T 0.264 +338 E 0.262 +339 S 0.258 +340 N 0.240 +341 Y 0.222 +342 C 0.226 +343 T 0.244 +344 Q 0.257 +345 L 0.270 +346 A 0.294 +347 Q 0.314 +348 I 0.315 +349 Q 0.307 +350 A 0.313 +351 Q 0.338 +352 I 0.370 +353 G 0.392 +354 A 0.383 +355 L 0.345 +356 E 0.302 +357 E 0.270 +358 Q 0.254 +359 L 0.255 +360 H 0.268 +361 Q 0.276 +362 V 0.279 +363 R 0.287 +364 T 0.301 +365 E 0.315 +366 T 0.339 +367 E 0.368 +368 G 0.372 +369 Q 0.344 +370 K 0.317 +371 L 0.299 +372 E 0.281 +373 Y 0.269 +374 E 0.269 +375 H 0.267 +376 L 0.263 +377 L 0.286 +378 D 0.328 +379 V 0.352 +380 K 0.346 +381 V 0.336 +382 H 0.341 +383 L 0.360 +384 E 0.379 +385 K 0.375 +386 E 0.340 +387 I 0.299 +388 E 0.268 +389 T 0.245 +390 Y 0.234 +391 C 0.242 +392 R 0.264 +393 L 0.295 +394 I 0.345 +395 D 0.421 +396 G 0.509 +397 D 0.587 +398 G 0.637 +399 N 0.658 +400 S 0.667 +401 C 0.677 +402 S 0.691 +403 K 0.708 +404 S 0.724 +405 K 0.739 +406 G 0.752 +407 F 0.762 +408 G 0.766 +409 S 0.760 +410 G 0.751 +411 S 0.750 +412 P 0.759 +413 G 0.770 +414 N 0.775 +415 S 0.774 +416 S 0.765 +417 K 0.751 +418 D 0.736 +419 L 0.724 +420 S 0.708 +421 K 0.681 +422 T 0.654 +423 T 0.638 +424 L 0.621 +425 V 0.587 +426 K 0.543 +427 T 0.507 +428 V 0.476 +429 V 0.442 +430 E 0.409 +431 E 0.386 +432 L 0.386 +433 D 0.424 +434 Q 0.479 +435 R 0.511 +436 G 0.497 +437 K 0.445 +438 V 0.393 +439 L 0.388 +440 S 0.441 +441 S 0.505 +442 R 0.538 +443 I 0.540 +444 H 0.535 +445 S 0.530 +446 I 0.521 +447 E 0.502 +448 E 0.479 +449 K 0.465 +450 T 0.473 +451 S 0.496 +452 K 0.507 +453 M 0.513 +454 T 0.542 +455 N 0.599 +456 G 0.659 +457 K 0.696 +458 T 0.709 +459 E 0.706 +460 Q 0.691 +461 R 0.665 +462 V 0.620 +463 P 0.558 +464 F 0.508 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000173908.9_ENST00000306658.8_GN:KRT28_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000173908.9_ENST00000306658.8_GN:KRT28_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2762501fe3c1e37f04f96293c00a76ee4003a825 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000173908.9_ENST00000306658.8_GN:KRT28_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid @@ -0,0 +1,487 @@ +>ENSG00000173908.9|ENST00000306658.8|GN:KRT28|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:22 +1 M 0.333 +2 I 0.364 +3 F 0.414 +4 C 0.466 +5 S 0.507 +6 L 0.528 +7 G 0.524 +8 T 0.493 +9 L 0.445 +10 Q 0.409 +11 F 0.392 +12 C 0.366 +13 I 0.326 +14 D 0.306 +15 K 0.333 +16 V 0.393 +17 N 0.454 +18 I 0.499 +19 S 0.527 +20 Q 0.538 +21 N 0.532 +22 T 0.525 +23 M 0.526 +24 S 0.534 +25 L 0.543 +26 Q 0.554 +27 F 0.578 +28 S 0.625 +29 N 0.678 +30 G 0.715 +31 S 0.729 +32 R 0.735 +33 H 0.746 +34 V 0.764 +35 C 0.778 +36 L 0.781 +37 R 0.781 +38 S 0.787 +39 G 0.798 +40 A 0.808 +41 G 0.811 +42 S 0.803 +43 V 0.788 +44 R 0.781 +45 P 0.791 +46 L 0.811 +47 N 0.830 +48 G 0.843 +49 G 0.849 +50 A 0.853 +51 G 0.856 +52 F 0.860 +53 A 0.865 +54 G 0.867 +55 S 0.867 +56 S 0.866 +57 A 0.866 +58 C 0.866 +59 G 0.863 +60 G 0.859 +61 S 0.856 +62 V 0.855 +63 A 0.855 +64 G 0.855 +65 S 0.853 +66 E 0.849 +67 F 0.846 +68 S 0.847 +69 C 0.849 +70 A 0.850 +71 L 0.850 +72 G 0.854 +73 G 0.859 +74 G 0.861 +75 L 0.858 +76 G 0.853 +77 S 0.847 +78 V 0.843 +79 P 0.846 +80 G 0.854 +81 G 0.861 +82 S 0.862 +83 H 0.859 +84 A 0.856 +85 G 0.853 +86 G 0.850 +87 A 0.845 +88 L 0.840 +89 G 0.836 +90 N 0.831 +91 A 0.826 +92 A 0.822 +93 C 0.818 +94 I 0.811 +95 G 0.805 +96 F 0.803 +97 A 0.802 +98 G 0.803 +99 S 0.803 +100 E 0.804 +101 G 0.801 +102 G 0.794 +103 L 0.785 +104 L 0.776 +105 S 0.767 +106 G 0.754 +107 N 0.732 +108 E 0.706 +109 K 0.682 +110 V 0.658 +111 T 0.631 +112 M 0.615 +113 Q 0.618 +114 N 0.621 +115 L 0.609 +116 N 0.594 +117 D 0.573 +118 R 0.538 +119 L 0.496 +120 A 0.459 +121 S 0.415 +122 Y 0.364 +123 L 0.340 +124 D 0.348 +125 N 0.356 +126 V 0.360 +127 R 0.378 +128 A 0.398 +129 L 0.397 +130 E 0.393 +131 E 0.397 +132 A 0.393 +133 N 0.365 +134 A 0.329 +135 E 0.295 +136 L 0.260 +137 E 0.227 +138 R 0.202 +139 K 0.193 +140 I 0.193 +141 K 0.186 +142 G 0.169 +143 W 0.150 +144 Y 0.144 +145 E 0.160 +146 K 0.199 +147 Y 0.261 +148 G 0.346 +149 P 0.444 +150 G 0.533 +151 S 0.593 +152 C 0.623 +153 R 0.640 +154 G 0.647 +155 L 0.634 +156 D 0.588 +157 H 0.507 +158 D 0.408 +159 Y 0.320 +160 S 0.267 +161 R 0.251 +162 Y 0.254 +163 H 0.260 +164 L 0.266 +165 T 0.276 +166 I 0.292 +167 E 0.302 +168 D 0.295 +169 L 0.273 +170 K 0.253 +171 N 0.246 +172 K 0.250 +173 I 0.264 +174 I 0.289 +175 S 0.313 +176 S 0.332 +177 T 0.360 +178 T 0.400 +179 T 0.433 +180 N 0.455 +181 A 0.466 +182 N 0.456 +183 V 0.434 +184 I 0.429 +185 L 0.440 +186 Q 0.447 +187 I 0.450 +188 D 0.455 +189 N 0.440 +190 A 0.397 +191 R 0.355 +192 L 0.340 +193 A 0.341 +194 A 0.337 +195 D 0.325 +196 D 0.299 +197 F 0.263 +198 R 0.237 +199 L 0.226 +200 K 0.216 +201 Y 0.212 +202 E 0.220 +203 N 0.227 +204 E 0.229 +205 L 0.240 +206 T 0.259 +207 L 0.274 +208 H 0.286 +209 Q 0.298 +210 N 0.297 +211 V 0.294 +212 E 0.316 +213 A 0.350 +214 D 0.358 +215 I 0.332 +216 N 0.302 +217 G 0.281 +218 L 0.259 +219 R 0.235 +220 R 0.217 +221 V 0.211 +222 L 0.217 +223 D 0.230 +224 E 0.238 +225 L 0.238 +226 T 0.249 +227 L 0.272 +228 C 0.289 +229 R 0.303 +230 T 0.324 +231 D 0.347 +232 Q 0.368 +233 E 0.395 +234 L 0.410 +235 Q 0.387 +236 Y 0.346 +237 E 0.320 +238 S 0.301 +239 L 0.275 +240 S 0.258 +241 E 0.261 +242 E 0.264 +243 M 0.254 +244 T 0.241 +245 Y 0.239 +246 L 0.246 +247 K 0.252 +248 K 0.248 +249 N 0.235 +250 H 0.229 +251 E 0.242 +252 E 0.266 +253 E 0.291 +254 M 0.316 +255 K 0.342 +256 A 0.364 +257 L 0.386 +258 Q 0.420 +259 C 0.470 +260 A 0.521 +261 A 0.562 +262 G 0.595 +263 G 0.622 +264 N 0.644 +265 V 0.657 +266 N 0.662 +267 V 0.663 +268 E 0.667 +269 M 0.674 +270 N 0.677 +271 A 0.674 +272 A 0.669 +273 P 0.657 +274 G 0.625 +275 V 0.557 +276 D 0.463 +277 L 0.381 +278 A 0.348 +279 V 0.359 +280 L 0.384 +281 L 0.409 +282 N 0.438 +283 N 0.452 +284 M 0.426 +285 R 0.371 +286 A 0.325 +287 E 0.304 +288 Y 0.297 +289 E 0.295 +290 A 0.292 +291 L 0.285 +292 A 0.283 +293 E 0.288 +294 Q 0.297 +295 N 0.307 +296 R 0.323 +297 K 0.340 +298 D 0.348 +299 A 0.340 +300 E 0.319 +301 A 0.292 +302 W 0.269 +303 F 0.259 +304 N 0.260 +305 E 0.261 +306 K 0.254 +307 S 0.243 +308 A 0.239 +309 S 0.243 +310 L 0.247 +311 Q 0.246 +312 Q 0.243 +313 Q 0.246 +314 I 0.260 +315 S 0.283 +316 H 0.307 +317 D 0.328 +318 S 0.350 +319 G 0.369 +320 A 0.371 +321 A 0.361 +322 T 0.356 +323 F 0.351 +324 A 0.336 +325 R 0.322 +326 S 0.326 +327 Q 0.340 +328 L 0.351 +329 T 0.357 +330 E 0.353 +331 M 0.330 +332 R 0.299 +333 R 0.281 +334 T 0.283 +335 L 0.295 +336 Q 0.302 +337 T 0.292 +338 L 0.278 +339 E 0.282 +340 I 0.299 +341 Q 0.310 +342 L 0.324 +343 Q 0.348 +344 S 0.365 +345 L 0.374 +346 M 0.394 +347 A 0.418 +348 T 0.422 +349 K 0.415 +350 H 0.414 +351 S 0.410 +352 L 0.397 +353 E 0.396 +354 C 0.400 +355 S 0.380 +356 L 0.337 +357 T 0.300 +358 E 0.283 +359 T 0.277 +360 E 0.276 +361 S 0.273 +362 N 0.255 +363 Y 0.236 +364 C 0.239 +365 T 0.258 +366 Q 0.270 +367 L 0.282 +368 A 0.305 +369 Q 0.324 +370 I 0.325 +371 Q 0.316 +372 A 0.320 +373 Q 0.344 +374 I 0.379 +375 G 0.402 +376 A 0.394 +377 L 0.355 +378 E 0.310 +379 E 0.277 +380 Q 0.260 +381 L 0.262 +382 H 0.277 +383 Q 0.287 +384 V 0.289 +385 R 0.296 +386 T 0.308 +387 E 0.321 +388 T 0.345 +389 E 0.374 +390 G 0.377 +391 Q 0.350 +392 K 0.324 +393 L 0.309 +394 E 0.293 +395 Y 0.284 +396 E 0.286 +397 H 0.284 +398 L 0.280 +399 L 0.304 +400 D 0.348 +401 V 0.371 +402 K 0.366 +403 V 0.358 +404 H 0.364 +405 L 0.382 +406 E 0.400 +407 K 0.393 +408 E 0.355 +409 I 0.309 +410 E 0.275 +411 T 0.251 +412 Y 0.239 +413 C 0.248 +414 R 0.270 +415 L 0.302 +416 I 0.353 +417 D 0.428 +418 G 0.514 +419 D 0.590 +420 G 0.639 +421 N 0.662 +422 S 0.672 +423 C 0.681 +424 S 0.695 +425 K 0.710 +426 S 0.726 +427 K 0.740 +428 G 0.752 +429 F 0.762 +430 G 0.765 +431 S 0.761 +432 G 0.753 +433 S 0.752 +434 P 0.761 +435 G 0.772 +436 N 0.778 +437 S 0.777 +438 S 0.769 +439 K 0.756 +440 D 0.742 +441 L 0.731 +442 S 0.716 +443 K 0.691 +444 T 0.667 +445 T 0.654 +446 L 0.641 +447 V 0.609 +448 K 0.566 +449 T 0.526 +450 V 0.489 +451 V 0.453 +452 E 0.422 +453 E 0.399 +454 L 0.395 +455 D 0.429 +456 Q 0.483 +457 R 0.516 +458 G 0.505 +459 K 0.455 +460 V 0.403 +461 L 0.400 +462 S 0.456 +463 S 0.523 +464 R 0.558 +465 I 0.564 +466 H 0.564 +467 S 0.564 +468 I 0.558 +469 E 0.543 +470 E 0.522 +471 K 0.506 +472 T 0.512 +473 S 0.528 +474 K 0.534 +475 M 0.533 +476 T 0.557 +477 N 0.609 +478 G 0.664 +479 K 0.698 +480 T 0.709 +481 E 0.705 +482 Q 0.691 +483 R 0.664 +484 V 0.617 +485 P 0.553 +486 F 0.502 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000173976.16_ENST00000555633.3_GN:RAX2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000173976.16_ENST00000555633.3_GN:RAX2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..cd63a547947a0b8e4ceda0996738934412a23770 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000173976.16_ENST00000555633.3_GN:RAX2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,185 @@ +>ENSG00000173976.16|ENST00000555633.3|GN:RAX2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.525 +2 F 0.556 +3 L 0.598 +4 S 0.639 +5 P 0.677 +6 G 0.711 +7 E 0.741 +8 G 0.767 +9 P 0.788 +10 A 0.802 +11 T 0.811 +12 E 0.816 +13 G 0.818 +14 G 0.815 +15 G 0.808 +16 L 0.799 +17 G 0.790 +18 P 0.782 +19 G 0.771 +20 E 0.757 +21 E 0.741 +22 A 0.730 +23 P 0.726 +24 K 0.725 +25 K 0.720 +26 K 0.706 +27 H 0.683 +28 R 0.648 +29 R 0.595 +30 N 0.511 +31 R 0.404 +32 T 0.304 +33 T 0.237 +34 F 0.193 +35 T 0.151 +36 T 0.107 +37 Y 0.071 +38 Q 0.053 +39 L 0.051 +40 H 0.060 +41 Q 0.070 +42 L 0.076 +43 E 0.074 +44 R 0.067 +45 A 0.060 +46 F 0.058 +47 E 0.059 +48 A 0.059 +49 S 0.057 +50 H 0.058 +51 Y 0.066 +52 P 0.075 +53 D 0.076 +54 V 0.067 +55 Y 0.054 +56 S 0.044 +57 R 0.041 +58 E 0.049 +59 E 0.067 +60 L 0.088 +61 A 0.101 +62 A 0.098 +63 K 0.083 +64 V 0.068 +65 H 0.060 +66 L 0.057 +67 P 0.055 +68 E 0.055 +69 V 0.058 +70 R 0.060 +71 V 0.057 +72 Q 0.050 +73 V 0.042 +74 W 0.035 +75 F 0.030 +76 Q 0.028 +77 N 0.028 +78 R 0.029 +79 R 0.032 +80 A 0.036 +81 K 0.042 +82 W 0.055 +83 R 0.079 +84 R 0.115 +85 Q 0.161 +86 E 0.215 +87 R 0.276 +88 L 0.348 +89 E 0.440 +90 S 0.545 +91 G 0.637 +92 S 0.695 +93 G 0.727 +94 A 0.742 +95 V 0.746 +96 A 0.737 +97 A 0.723 +98 P 0.712 +99 R 0.711 +100 L 0.716 +101 P 0.724 +102 E 0.731 +103 A 0.736 +104 P 0.738 +105 A 0.739 +106 L 0.741 +107 P 0.743 +108 F 0.746 +109 A 0.748 +110 R 0.751 +111 P 0.763 +112 P 0.785 +113 A 0.806 +114 M 0.815 +115 S 0.810 +116 L 0.798 +117 P 0.784 +118 L 0.774 +119 E 0.766 +120 P 0.755 +121 W 0.742 +122 L 0.731 +123 G 0.728 +124 P 0.733 +125 G 0.745 +126 P 0.758 +127 P 0.769 +128 A 0.776 +129 V 0.781 +130 P 0.785 +131 G 0.787 +132 L 0.791 +133 P 0.799 +134 R 0.807 +135 L 0.803 +136 L 0.788 +137 G 0.772 +138 P 0.769 +139 G 0.781 +140 P 0.804 +141 G 0.828 +142 L 0.842 +143 Q 0.843 +144 A 0.833 +145 S 0.813 +146 F 0.789 +147 G 0.776 +148 P 0.778 +149 H 0.790 +150 A 0.797 +151 F 0.792 +152 A 0.783 +153 P 0.782 +154 T 0.790 +155 F 0.798 +156 A 0.801 +157 D 0.799 +158 G 0.795 +159 F 0.788 +160 A 0.769 +161 L 0.727 +162 E 0.648 +163 E 0.537 +164 A 0.428 +165 S 0.351 +166 L 0.307 +167 R 0.287 +168 L 0.285 +169 L 0.289 +170 A 0.287 +171 K 0.288 +172 E 0.300 +173 H 0.316 +174 A 0.324 +175 Q 0.337 +176 A 0.370 +177 L 0.402 +178 D 0.412 +179 R 0.404 +180 A 0.397 +181 W 0.396 +182 P 0.400 +183 P 0.406 +184 A 0.408 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000173976.16_ENST00000555633.3_GN:RAX2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:46.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000173976.16_ENST00000555633.3_GN:RAX2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:46.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ad2444e4f170e5cb69b334c23dada038ec9979c9 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000173976.16_ENST00000555633.3_GN:RAX2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:46.caid @@ -0,0 +1,231 @@ +>ENSG00000173976.16|ENST00000555633.3|GN:RAX2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:46 +1 M 0.535 +2 P 0.578 +3 A 0.642 +4 P 0.705 +5 V 0.752 +6 E 0.779 +7 G 0.789 +8 T 0.786 +9 D 0.776 +10 F 0.770 +11 P 0.778 +12 G 0.796 +13 A 0.813 +14 G 0.820 +15 R 0.816 +16 Q 0.802 +17 A 0.781 +18 W 0.763 +19 G 0.761 +20 S 0.773 +21 P 0.790 +22 A 0.803 +23 L 0.808 +24 S 0.808 +25 L 0.809 +26 P 0.811 +27 V 0.812 +28 A 0.813 +29 P 0.818 +30 P 0.828 +31 A 0.835 +32 V 0.829 +33 S 0.814 +34 P 0.803 +35 P 0.804 +36 S 0.809 +37 V 0.808 +38 P 0.801 +39 L 0.795 +40 P 0.795 +41 S 0.799 +42 H 0.803 +43 Q 0.807 +44 V 0.812 +45 G 0.813 +46 A 0.806 +47 M 0.795 +48 F 0.786 +49 L 0.785 +50 S 0.792 +51 P 0.802 +52 G 0.813 +53 E 0.823 +54 G 0.832 +55 P 0.841 +56 A 0.849 +57 T 0.855 +58 E 0.857 +59 G 0.857 +60 G 0.856 +61 G 0.852 +62 L 0.847 +63 G 0.843 +64 P 0.841 +65 G 0.838 +66 E 0.830 +67 E 0.820 +68 A 0.810 +69 P 0.803 +70 K 0.795 +71 K 0.783 +72 K 0.764 +73 H 0.736 +74 R 0.698 +75 R 0.642 +76 N 0.554 +77 R 0.439 +78 T 0.330 +79 T 0.256 +80 F 0.209 +81 T 0.165 +82 T 0.119 +83 Y 0.080 +84 Q 0.058 +85 L 0.055 +86 H 0.062 +87 Q 0.072 +88 L 0.078 +89 E 0.076 +90 R 0.069 +91 A 0.062 +92 F 0.059 +93 E 0.059 +94 A 0.058 +95 S 0.054 +96 H 0.054 +97 Y 0.061 +98 P 0.070 +99 D 0.072 +100 V 0.064 +101 Y 0.052 +102 S 0.043 +103 R 0.041 +104 E 0.048 +105 E 0.065 +106 L 0.085 +107 A 0.097 +108 A 0.094 +109 K 0.078 +110 V 0.063 +111 H 0.054 +112 L 0.051 +113 P 0.050 +114 E 0.051 +115 V 0.054 +116 R 0.056 +117 V 0.054 +118 Q 0.048 +119 V 0.040 +120 W 0.033 +121 F 0.029 +122 Q 0.028 +123 N 0.027 +124 R 0.028 +125 R 0.031 +126 A 0.035 +127 K 0.040 +128 W 0.052 +129 R 0.074 +130 R 0.105 +131 Q 0.145 +132 E 0.193 +133 R 0.251 +134 L 0.322 +135 E 0.415 +136 S 0.523 +137 G 0.619 +138 S 0.684 +139 G 0.719 +140 A 0.737 +141 V 0.740 +142 A 0.730 +143 A 0.713 +144 P 0.701 +145 R 0.698 +146 L 0.703 +147 P 0.712 +148 E 0.722 +149 A 0.728 +150 P 0.731 +151 A 0.732 +152 L 0.734 +153 P 0.739 +154 F 0.745 +155 A 0.751 +156 R 0.757 +157 P 0.771 +158 P 0.795 +159 A 0.817 +160 M 0.827 +161 S 0.823 +162 L 0.811 +163 P 0.799 +164 L 0.792 +165 E 0.787 +166 P 0.781 +167 W 0.772 +168 L 0.764 +169 G 0.761 +170 P 0.764 +171 G 0.773 +172 P 0.783 +173 P 0.793 +174 A 0.799 +175 V 0.803 +176 P 0.805 +177 G 0.807 +178 L 0.811 +179 P 0.818 +180 R 0.823 +181 L 0.817 +182 L 0.802 +183 G 0.786 +184 P 0.783 +185 G 0.794 +186 P 0.816 +187 G 0.840 +188 L 0.854 +189 Q 0.856 +190 A 0.846 +191 S 0.826 +192 F 0.803 +193 G 0.790 +194 P 0.792 +195 H 0.802 +196 A 0.807 +197 F 0.801 +198 A 0.793 +199 P 0.793 +200 T 0.800 +201 F 0.807 +202 A 0.808 +203 D 0.805 +204 G 0.800 +205 F 0.793 +206 A 0.773 +207 L 0.729 +208 E 0.648 +209 E 0.539 +210 A 0.437 +211 S 0.367 +212 L 0.324 +213 R 0.301 +214 L 0.295 +215 L 0.296 +216 A 0.292 +217 K 0.291 +218 E 0.305 +219 H 0.325 +220 A 0.336 +221 Q 0.352 +222 A 0.384 +223 L 0.416 +224 D 0.425 +225 R 0.416 +226 A 0.406 +227 W 0.403 +228 P 0.407 +229 P 0.413 +230 A 0.415 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000174007.10_ENST00000409690.5_GN:CEP19_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000174007.10_ENST00000409690.5_GN:CEP19_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..626ebb903489f97bf9ed6bce5ac94df3bf1de792 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000174007.10_ENST00000409690.5_GN:CEP19_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,164 @@ +>ENSG00000174007.10|ENST00000409690.5|GN:CEP19|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.322 +2 M 0.278 +3 C 0.212 +4 T 0.148 +5 A 0.100 +6 K 0.067 +7 K 0.046 +8 C 0.036 +9 G 0.033 +10 I 0.035 +11 R 0.040 +12 F 0.043 +13 Q 0.042 +14 P 0.036 +15 P 0.029 +16 A 0.023 +17 I 0.019 +18 I 0.017 +19 L 0.017 +20 I 0.022 +21 Y 0.033 +22 E 0.047 +23 S 0.063 +24 E 0.080 +25 I 0.100 +26 K 0.125 +27 G 0.146 +28 K 0.154 +29 I 0.145 +30 R 0.123 +31 Q 0.101 +32 R 0.083 +33 I 0.067 +34 M 0.058 +35 P 0.057 +36 V 0.063 +37 R 0.068 +38 N 0.066 +39 F 0.062 +40 S 0.062 +41 K 0.071 +42 F 0.080 +43 S 0.080 +44 D 0.070 +45 C 0.057 +46 T 0.048 +47 R 0.045 +48 A 0.043 +49 A 0.042 +50 E 0.045 +51 Q 0.051 +52 L 0.060 +53 K 0.066 +54 N 0.072 +55 N 0.076 +56 P 0.072 +57 R 0.061 +58 H 0.050 +59 K 0.044 +60 S 0.043 +61 Y 0.046 +62 L 0.053 +63 E 0.061 +64 Q 0.066 +65 V 0.065 +66 S 0.059 +67 L 0.049 +68 R 0.040 +69 Q 0.032 +70 L 0.028 +71 E 0.025 +72 K 0.023 +73 L 0.022 +74 F 0.021 +75 S 0.022 +76 F 0.024 +77 L 0.028 +78 R 0.034 +79 G 0.044 +80 Y 0.059 +81 L 0.081 +82 S 0.107 +83 G 0.122 +84 Q 0.118 +85 S 0.103 +86 L 0.090 +87 A 0.090 +88 E 0.097 +89 T 0.102 +90 M 0.107 +91 E 0.116 +92 Q 0.132 +93 I 0.153 +94 Q 0.180 +95 R 0.211 +96 E 0.244 +97 T 0.276 +98 T 0.304 +99 I 0.329 +100 D 0.352 +101 P 0.368 +102 E 0.369 +103 E 0.356 +104 D 0.343 +105 L 0.338 +106 N 0.333 +107 K 0.323 +108 L 0.310 +109 D 0.294 +110 D 0.268 +111 K 0.233 +112 E 0.202 +113 L 0.185 +114 A 0.179 +115 K 0.181 +116 R 0.187 +117 K 0.192 +118 S 0.196 +119 I 0.201 +120 M 0.204 +121 D 0.200 +122 E 0.189 +123 L 0.181 +124 F 0.181 +125 E 0.187 +126 K 0.196 +127 N 0.206 +128 Q 0.216 +129 K 0.238 +130 K 0.280 +131 K 0.325 +132 D 0.352 +133 D 0.364 +134 P 0.377 +135 N 0.394 +136 F 0.415 +137 V 0.445 +138 Y 0.480 +139 D 0.509 +140 I 0.518 +141 E 0.505 +142 V 0.490 +143 E 0.497 +144 F 0.534 +145 P 0.589 +146 Q 0.643 +147 D 0.676 +148 D 0.684 +149 Q 0.680 +150 L 0.681 +151 Q 0.688 +152 S 0.699 +153 C 0.712 +154 G 0.722 +155 W 0.730 +156 D 0.738 +157 T 0.745 +158 E 0.748 +159 S 0.740 +160 A 0.712 +161 D 0.659 +162 E 0.591 +163 F 0.538 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000174007.10_ENST00000409690.5_GN:CEP19_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000174007.10_ENST00000409690.5_GN:CEP19_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..00ede0e81e40a1b553cd969c13e5c04efbc8a696 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000174007.10_ENST00000409690.5_GN:CEP19_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid @@ -0,0 +1,166 @@ +>ENSG00000174007.10|ENST00000409690.5|GN:CEP19|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:2 +1 M 0.504 +2 G 0.488 +3 M 0.441 +4 M 0.354 +5 C 0.248 +6 T 0.158 +7 A 0.098 +8 K 0.062 +9 K 0.042 +10 C 0.033 +11 G 0.030 +12 I 0.032 +13 R 0.037 +14 F 0.040 +15 Q 0.039 +16 P 0.034 +17 P 0.028 +18 A 0.023 +19 I 0.019 +20 I 0.017 +21 L 0.017 +22 I 0.022 +23 Y 0.031 +24 E 0.044 +25 S 0.057 +26 E 0.073 +27 I 0.093 +28 K 0.117 +29 G 0.139 +30 K 0.149 +31 I 0.141 +32 R 0.121 +33 Q 0.101 +34 R 0.083 +35 I 0.068 +36 M 0.058 +37 P 0.057 +38 V 0.063 +39 R 0.067 +40 N 0.065 +41 F 0.061 +42 S 0.062 +43 K 0.071 +44 F 0.080 +45 S 0.080 +46 D 0.070 +47 C 0.057 +48 T 0.048 +49 R 0.045 +50 A 0.043 +51 A 0.042 +52 E 0.045 +53 Q 0.051 +54 L 0.059 +55 K 0.066 +56 N 0.071 +57 N 0.075 +58 P 0.072 +59 R 0.061 +60 H 0.049 +61 K 0.043 +62 S 0.042 +63 Y 0.045 +64 L 0.052 +65 E 0.060 +66 Q 0.065 +67 V 0.064 +68 S 0.058 +69 L 0.049 +70 R 0.039 +71 Q 0.032 +72 L 0.027 +73 E 0.025 +74 K 0.023 +75 L 0.022 +76 F 0.021 +77 S 0.022 +78 F 0.024 +79 L 0.027 +80 R 0.033 +81 G 0.043 +82 Y 0.058 +83 L 0.080 +84 S 0.105 +85 G 0.121 +86 Q 0.118 +87 S 0.102 +88 L 0.089 +89 A 0.088 +90 E 0.095 +91 T 0.100 +92 M 0.105 +93 E 0.113 +94 Q 0.128 +95 I 0.150 +96 Q 0.177 +97 R 0.207 +98 E 0.241 +99 T 0.274 +100 T 0.302 +101 I 0.327 +102 D 0.349 +103 P 0.365 +104 E 0.365 +105 E 0.352 +106 D 0.339 +107 L 0.334 +108 N 0.330 +109 K 0.320 +110 L 0.308 +111 D 0.291 +112 D 0.265 +113 K 0.231 +114 E 0.200 +115 L 0.183 +116 A 0.179 +117 K 0.181 +118 R 0.186 +119 K 0.192 +120 S 0.197 +121 I 0.201 +122 M 0.204 +123 D 0.199 +124 E 0.188 +125 L 0.180 +126 F 0.181 +127 E 0.186 +128 K 0.194 +129 N 0.203 +130 Q 0.212 +131 K 0.234 +132 K 0.276 +133 K 0.322 +134 D 0.348 +135 D 0.360 +136 P 0.373 +137 N 0.390 +138 F 0.411 +139 V 0.440 +140 Y 0.475 +141 D 0.504 +142 I 0.513 +143 E 0.500 +144 V 0.485 +145 E 0.493 +146 F 0.532 +147 P 0.588 +148 Q 0.642 +149 D 0.675 +150 D 0.681 +151 Q 0.677 +152 L 0.678 +153 Q 0.686 +154 S 0.699 +155 C 0.712 +156 G 0.723 +157 W 0.731 +158 D 0.738 +159 T 0.746 +160 E 0.748 +161 S 0.740 +162 A 0.711 +163 D 0.659 +164 E 0.590 +165 F 0.537 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000174804.4_ENST00000531380.2_GN:FZD4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000174804.4_ENST00000531380.2_GN:FZD4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ccfb7e3beeac7f28c04b617ef719b7dda63da521 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000174804.4_ENST00000531380.2_GN:FZD4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,538 @@ +>ENSG00000174804.4|ENST00000531380.2|GN:FZD4|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.308 +2 A 0.325 +3 W 0.350 +4 R 0.373 +5 G 0.388 +6 A 0.409 +7 G 0.450 +8 P 0.490 +9 S 0.509 +10 V 0.517 +11 P 0.527 +12 G 0.537 +13 A 0.541 +14 P 0.546 +15 G 0.551 +16 G 0.540 +17 V 0.490 +18 G 0.409 +19 L 0.322 +20 S 0.248 +21 L 0.190 +22 G 0.148 +23 L 0.123 +24 L 0.113 +25 L 0.112 +26 Q 0.112 +27 L 0.109 +28 L 0.107 +29 L 0.120 +30 L 0.160 +31 L 0.225 +32 G 0.300 +33 P 0.375 +34 A 0.442 +35 R 0.498 +36 G 0.541 +37 F 0.569 +38 G 0.582 +39 D 0.579 +40 E 0.549 +41 E 0.483 +42 E 0.386 +43 R 0.280 +44 R 0.192 +45 C 0.133 +46 D 0.099 +47 P 0.081 +48 I 0.072 +49 R 0.064 +50 I 0.058 +51 S 0.053 +52 M 0.054 +53 C 0.060 +54 Q 0.073 +55 N 0.087 +56 L 0.095 +57 G 0.095 +58 Y 0.089 +59 N 0.087 +60 V 0.090 +61 T 0.092 +62 K 0.085 +63 M 0.075 +64 P 0.077 +65 N 0.092 +66 L 0.113 +67 V 0.130 +68 G 0.137 +69 H 0.131 +70 E 0.121 +71 L 0.119 +72 Q 0.121 +73 T 0.123 +74 D 0.126 +75 A 0.129 +76 E 0.128 +77 L 0.120 +78 Q 0.108 +79 L 0.095 +80 T 0.084 +81 T 0.076 +82 F 0.071 +83 T 0.065 +84 P 0.059 +85 L 0.059 +86 I 0.064 +87 Q 0.075 +88 Y 0.084 +89 G 0.090 +90 C 0.090 +91 S 0.083 +92 S 0.074 +93 Q 0.065 +94 L 0.056 +95 Q 0.050 +96 F 0.048 +97 F 0.053 +98 L 0.060 +99 C 0.064 +100 S 0.064 +101 V 0.061 +102 Y 0.058 +103 V 0.056 +104 P 0.055 +105 M 0.057 +106 C 0.061 +107 T 0.067 +108 E 0.075 +109 K 0.086 +110 I 0.100 +111 N 0.119 +112 I 0.138 +113 P 0.150 +114 I 0.146 +115 G 0.128 +116 P 0.101 +117 C 0.076 +118 G 0.061 +119 G 0.054 +120 M 0.048 +121 C 0.043 +122 L 0.041 +123 S 0.043 +124 V 0.046 +125 K 0.045 +126 R 0.043 +127 R 0.040 +128 C 0.037 +129 E 0.037 +130 P 0.040 +131 V 0.046 +132 L 0.052 +133 K 0.055 +134 E 0.060 +135 F 0.075 +136 G 0.100 +137 F 0.124 +138 A 0.134 +139 W 0.127 +140 P 0.109 +141 E 0.091 +142 S 0.074 +143 L 0.061 +144 N 0.051 +145 C 0.046 +146 S 0.045 +147 K 0.051 +148 F 0.064 +149 P 0.083 +150 P 0.100 +151 Q 0.114 +152 N 0.128 +153 D 0.141 +154 H 0.144 +155 N 0.135 +156 H 0.121 +157 M 0.117 +158 C 0.132 +159 M 0.168 +160 E 0.228 +161 G 0.313 +162 P 0.417 +163 G 0.515 +164 D 0.582 +165 E 0.608 +166 E 0.605 +167 V 0.593 +168 P 0.585 +169 L 0.583 +170 P 0.579 +171 H 0.570 +172 K 0.558 +173 T 0.543 +174 P 0.524 +175 I 0.510 +176 Q 0.501 +177 P 0.477 +178 G 0.419 +179 E 0.338 +180 E 0.261 +181 C 0.208 +182 H 0.181 +183 S 0.179 +184 V 0.191 +185 G 0.204 +186 T 0.207 +187 N 0.195 +188 S 0.171 +189 D 0.145 +190 Q 0.123 +191 Y 0.105 +192 I 0.088 +193 W 0.075 +194 V 0.068 +195 K 0.071 +196 R 0.079 +197 S 0.089 +198 L 0.102 +199 N 0.120 +200 C 0.130 +201 V 0.124 +202 L 0.109 +203 K 0.104 +204 C 0.122 +205 G 0.162 +206 Y 0.209 +207 D 0.241 +208 A 0.245 +209 G 0.230 +210 L 0.214 +211 Y 0.201 +212 S 0.180 +213 R 0.153 +214 S 0.133 +215 A 0.123 +216 K 0.117 +217 E 0.110 +218 F 0.100 +219 T 0.091 +220 D 0.081 +221 I 0.070 +222 W 0.062 +223 M 0.059 +224 A 0.057 +225 V 0.053 +226 W 0.053 +227 A 0.058 +228 S 0.065 +229 L 0.069 +230 C 0.070 +231 F 0.069 +232 I 0.071 +233 S 0.077 +234 T 0.078 +235 A 0.072 +236 F 0.064 +237 T 0.057 +238 V 0.052 +239 L 0.048 +240 T 0.044 +241 F 0.043 +242 L 0.044 +243 I 0.047 +244 D 0.048 +245 S 0.046 +246 S 0.044 +247 R 0.042 +248 F 0.038 +249 S 0.033 +250 Y 0.028 +251 P 0.027 +252 E 0.029 +253 R 0.032 +254 P 0.034 +255 I 0.036 +256 I 0.041 +257 F 0.049 +258 L 0.058 +259 S 0.066 +260 M 0.071 +261 C 0.072 +262 Y 0.073 +263 N 0.072 +264 I 0.069 +265 Y 0.066 +266 S 0.064 +267 I 0.062 +268 A 0.064 +269 Y 0.070 +270 I 0.075 +271 V 0.079 +272 R 0.084 +273 L 0.089 +274 T 0.096 +275 V 0.110 +276 G 0.125 +277 R 0.134 +278 E 0.136 +279 R 0.134 +280 I 0.131 +281 S 0.127 +282 C 0.125 +283 D 0.132 +284 F 0.150 +285 E 0.175 +286 E 0.193 +287 A 0.197 +288 A 0.191 +289 E 0.184 +290 P 0.173 +291 V 0.157 +292 L 0.144 +293 I 0.140 +294 Q 0.147 +295 E 0.160 +296 G 0.175 +297 L 0.180 +298 K 0.173 +299 N 0.152 +300 T 0.125 +301 G 0.106 +302 C 0.099 +303 A 0.095 +304 I 0.092 +305 I 0.087 +306 F 0.077 +307 L 0.062 +308 L 0.047 +309 M 0.036 +310 Y 0.033 +311 F 0.036 +312 F 0.044 +313 G 0.058 +314 M 0.074 +315 A 0.083 +316 S 0.079 +317 S 0.066 +318 I 0.052 +319 W 0.042 +320 W 0.037 +321 V 0.037 +322 I 0.042 +323 L 0.048 +324 T 0.052 +325 L 0.053 +326 T 0.053 +327 W 0.052 +328 F 0.054 +329 L 0.060 +330 A 0.073 +331 A 0.089 +332 G 0.098 +333 L 0.098 +334 K 0.092 +335 W 0.090 +336 G 0.096 +337 H 0.107 +338 E 0.115 +339 A 0.114 +340 I 0.103 +341 E 0.087 +342 M 0.073 +343 H 0.061 +344 S 0.049 +345 S 0.039 +346 Y 0.033 +347 F 0.034 +348 H 0.038 +349 I 0.048 +350 A 0.059 +351 A 0.064 +352 W 0.060 +353 A 0.057 +354 I 0.059 +355 P 0.064 +356 A 0.067 +357 V 0.070 +358 K 0.074 +359 T 0.075 +360 I 0.073 +361 V 0.071 +362 I 0.073 +363 L 0.077 +364 I 0.085 +365 M 0.095 +366 R 0.106 +367 L 0.116 +368 V 0.122 +369 D 0.123 +370 A 0.128 +371 D 0.134 +372 E 0.137 +373 L 0.134 +374 T 0.126 +375 G 0.115 +376 L 0.106 +377 C 0.112 +378 Y 0.136 +379 V 0.166 +380 G 0.185 +381 N 0.188 +382 Q 0.177 +383 N 0.158 +384 L 0.140 +385 D 0.128 +386 A 0.119 +387 L 0.107 +388 T 0.096 +389 G 0.092 +390 F 0.090 +391 V 0.086 +392 V 0.082 +393 A 0.087 +394 P 0.095 +395 L 0.095 +396 F 0.083 +397 T 0.071 +398 Y 0.066 +399 L 0.070 +400 V 0.083 +401 I 0.104 +402 G 0.124 +403 T 0.132 +404 L 0.124 +405 F 0.110 +406 I 0.100 +407 A 0.093 +408 A 0.090 +409 G 0.094 +410 L 0.101 +411 V 0.102 +412 A 0.090 +413 L 0.074 +414 F 0.066 +415 K 0.071 +416 I 0.087 +417 R 0.110 +418 S 0.141 +419 N 0.179 +420 L 0.223 +421 Q 0.263 +422 K 0.296 +423 D 0.318 +424 G 0.327 +425 T 0.318 +426 K 0.291 +427 T 0.253 +428 D 0.210 +429 K 0.175 +430 L 0.149 +431 E 0.127 +432 R 0.103 +433 L 0.079 +434 M 0.063 +435 V 0.056 +436 K 0.056 +437 I 0.061 +438 G 0.063 +439 V 0.059 +440 F 0.056 +441 S 0.055 +442 V 0.054 +443 L 0.049 +444 Y 0.045 +445 T 0.043 +446 V 0.041 +447 P 0.044 +448 A 0.053 +449 T 0.060 +450 C 0.056 +451 V 0.047 +452 I 0.039 +453 A 0.038 +454 C 0.038 +455 Y 0.038 +456 F 0.040 +457 Y 0.043 +458 E 0.048 +459 I 0.052 +460 S 0.054 +461 N 0.057 +462 W 0.064 +463 A 0.076 +464 L 0.093 +465 F 0.117 +466 R 0.148 +467 Y 0.183 +468 S 0.217 +469 A 0.245 +470 D 0.267 +471 D 0.274 +472 S 0.254 +473 N 0.205 +474 M 0.147 +475 A 0.105 +476 V 0.088 +477 E 0.082 +478 M 0.078 +479 L 0.074 +480 K 0.072 +481 I 0.073 +482 F 0.076 +483 M 0.077 +484 S 0.078 +485 L 0.080 +486 L 0.082 +487 V 0.083 +488 G 0.081 +489 I 0.083 +490 T 0.090 +491 S 0.093 +492 G 0.089 +493 M 0.081 +494 W 0.075 +495 I 0.069 +496 W 0.064 +497 S 0.062 +498 A 0.064 +499 K 0.066 +500 T 0.067 +501 L 0.071 +502 H 0.072 +503 T 0.065 +504 W 0.057 +505 Q 0.057 +506 K 0.070 +507 C 0.093 +508 S 0.117 +509 N 0.137 +510 R 0.159 +511 L 0.194 +512 V 0.243 +513 N 0.304 +514 S 0.374 +515 G 0.445 +516 K 0.501 +517 V 0.528 +518 K 0.521 +519 R 0.492 +520 E 0.478 +521 K 0.507 +522 R 0.559 +523 G 0.598 +524 N 0.615 +525 G 0.615 +526 W 0.608 +527 V 0.607 +528 K 0.619 +529 P 0.648 +530 G 0.687 +531 K 0.725 +532 G 0.751 +533 S 0.765 +534 E 0.772 +535 T 0.774 +536 V 0.770 +537 V 0.765 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000174804.4_ENST00000531380.2_GN:FZD4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000174804.4_ENST00000531380.2_GN:FZD4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..91bef5b7c837d94034c23921d98a71fcf716fa84 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000174804.4_ENST00000531380.2_GN:FZD4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid @@ -0,0 +1,541 @@ +>ENSG00000174804.4|ENST00000531380.2|GN:FZD4|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 +1 M 0.200 +2 L 0.202 +3 A 0.217 +4 M 0.245 +5 A 0.271 +6 W 0.292 +7 R 0.325 +8 G 0.377 +9 A 0.427 +10 G 0.457 +11 P 0.470 +12 S 0.479 +13 V 0.491 +14 P 0.505 +15 G 0.520 +16 A 0.539 +17 P 0.558 +18 G 0.569 +19 G 0.556 +20 V 0.507 +21 G 0.428 +22 L 0.342 +23 S 0.265 +24 L 0.203 +25 G 0.158 +26 L 0.129 +27 L 0.115 +28 L 0.112 +29 Q 0.112 +30 L 0.108 +31 L 0.107 +32 L 0.122 +33 L 0.162 +34 L 0.227 +35 G 0.302 +36 P 0.377 +37 A 0.445 +38 R 0.502 +39 G 0.545 +40 F 0.573 +41 G 0.586 +42 D 0.581 +43 E 0.551 +44 E 0.484 +45 E 0.386 +46 R 0.280 +47 R 0.192 +48 C 0.133 +49 D 0.099 +50 P 0.081 +51 I 0.071 +52 R 0.064 +53 I 0.057 +54 S 0.053 +55 M 0.053 +56 C 0.060 +57 Q 0.072 +58 N 0.086 +59 L 0.095 +60 G 0.095 +61 Y 0.088 +62 N 0.085 +63 V 0.089 +64 T 0.091 +65 K 0.084 +66 M 0.075 +67 P 0.076 +68 N 0.091 +69 L 0.112 +70 V 0.130 +71 G 0.136 +72 H 0.130 +73 E 0.120 +74 L 0.117 +75 Q 0.119 +76 T 0.121 +77 D 0.124 +78 A 0.127 +79 E 0.126 +80 L 0.119 +81 Q 0.107 +82 L 0.094 +83 T 0.083 +84 T 0.075 +85 F 0.070 +86 T 0.064 +87 P 0.059 +88 L 0.058 +89 I 0.064 +90 Q 0.074 +91 Y 0.084 +92 G 0.090 +93 C 0.089 +94 S 0.082 +95 S 0.073 +96 Q 0.064 +97 L 0.055 +98 Q 0.049 +99 F 0.048 +100 F 0.053 +101 L 0.060 +102 C 0.064 +103 S 0.063 +104 V 0.061 +105 Y 0.058 +106 V 0.055 +107 P 0.055 +108 M 0.057 +109 C 0.061 +110 T 0.067 +111 E 0.075 +112 K 0.086 +113 I 0.100 +114 N 0.119 +115 I 0.138 +116 P 0.150 +117 I 0.146 +118 G 0.128 +119 P 0.101 +120 C 0.076 +121 G 0.061 +122 G 0.054 +123 M 0.048 +124 C 0.043 +125 L 0.041 +126 S 0.043 +127 V 0.045 +128 K 0.045 +129 R 0.042 +130 R 0.039 +131 C 0.037 +132 E 0.037 +133 P 0.040 +134 V 0.046 +135 L 0.051 +136 K 0.054 +137 E 0.059 +138 F 0.074 +139 G 0.099 +140 F 0.123 +141 A 0.133 +142 W 0.126 +143 P 0.108 +144 E 0.090 +145 S 0.074 +146 L 0.060 +147 N 0.051 +148 C 0.046 +149 S 0.045 +150 K 0.051 +151 F 0.064 +152 P 0.083 +153 P 0.100 +154 Q 0.114 +155 N 0.128 +156 D 0.141 +157 H 0.143 +158 N 0.134 +159 H 0.121 +160 M 0.117 +161 C 0.131 +162 M 0.167 +163 E 0.227 +164 G 0.312 +165 P 0.415 +166 G 0.514 +167 D 0.581 +168 E 0.607 +169 E 0.605 +170 V 0.593 +171 P 0.585 +172 L 0.582 +173 P 0.579 +174 H 0.569 +175 K 0.557 +176 T 0.541 +177 P 0.523 +178 I 0.508 +179 Q 0.498 +180 P 0.474 +181 G 0.416 +182 E 0.335 +183 E 0.259 +184 C 0.206 +185 H 0.180 +186 S 0.178 +187 V 0.191 +188 G 0.203 +189 T 0.206 +190 N 0.194 +191 S 0.170 +192 D 0.144 +193 Q 0.123 +194 Y 0.105 +195 I 0.088 +196 W 0.074 +197 V 0.068 +198 K 0.070 +199 R 0.078 +200 S 0.088 +201 L 0.102 +202 N 0.119 +203 C 0.130 +204 V 0.124 +205 L 0.109 +206 K 0.104 +207 C 0.121 +208 G 0.161 +209 Y 0.207 +210 D 0.239 +211 A 0.243 +212 G 0.229 +213 L 0.213 +214 Y 0.199 +215 S 0.179 +216 R 0.152 +217 S 0.132 +218 A 0.123 +219 K 0.117 +220 E 0.109 +221 F 0.100 +222 T 0.090 +223 D 0.080 +224 I 0.068 +225 W 0.061 +226 M 0.059 +227 A 0.056 +228 V 0.053 +229 W 0.053 +230 A 0.058 +231 S 0.065 +232 L 0.069 +233 C 0.069 +234 F 0.068 +235 I 0.071 +236 S 0.076 +237 T 0.077 +238 A 0.072 +239 F 0.064 +240 T 0.057 +241 V 0.051 +242 L 0.047 +243 T 0.044 +244 F 0.042 +245 L 0.043 +246 I 0.046 +247 D 0.047 +248 S 0.046 +249 S 0.044 +250 R 0.041 +251 F 0.038 +252 S 0.032 +253 Y 0.027 +254 P 0.027 +255 E 0.029 +256 R 0.032 +257 P 0.034 +258 I 0.036 +259 I 0.041 +260 F 0.048 +261 L 0.058 +262 S 0.066 +263 M 0.070 +264 C 0.072 +265 Y 0.073 +266 N 0.071 +267 I 0.069 +268 Y 0.066 +269 S 0.063 +270 I 0.062 +271 A 0.064 +272 Y 0.069 +273 I 0.074 +274 V 0.079 +275 R 0.084 +276 L 0.088 +277 T 0.096 +278 V 0.110 +279 G 0.125 +280 R 0.134 +281 E 0.136 +282 R 0.134 +283 I 0.131 +284 S 0.127 +285 C 0.125 +286 D 0.131 +287 F 0.149 +288 E 0.174 +289 E 0.192 +290 A 0.196 +291 A 0.191 +292 E 0.184 +293 P 0.173 +294 V 0.157 +295 L 0.143 +296 I 0.140 +297 Q 0.146 +298 E 0.160 +299 G 0.174 +300 L 0.180 +301 K 0.173 +302 N 0.152 +303 T 0.125 +304 G 0.106 +305 C 0.099 +306 A 0.095 +307 I 0.092 +308 I 0.087 +309 F 0.077 +310 L 0.062 +311 L 0.047 +312 M 0.036 +313 Y 0.033 +314 F 0.036 +315 F 0.044 +316 G 0.058 +317 M 0.074 +318 A 0.083 +319 S 0.079 +320 S 0.066 +321 I 0.052 +322 W 0.042 +323 W 0.037 +324 V 0.037 +325 I 0.043 +326 L 0.049 +327 T 0.052 +328 L 0.053 +329 T 0.053 +330 W 0.052 +331 F 0.053 +332 L 0.060 +333 A 0.073 +334 A 0.089 +335 G 0.098 +336 L 0.097 +337 K 0.092 +338 W 0.090 +339 G 0.096 +340 H 0.107 +341 E 0.115 +342 A 0.114 +343 I 0.103 +344 E 0.087 +345 M 0.073 +346 H 0.060 +347 S 0.049 +348 S 0.038 +349 Y 0.033 +350 F 0.033 +351 H 0.038 +352 I 0.048 +353 A 0.059 +354 A 0.063 +355 W 0.060 +356 A 0.057 +357 I 0.059 +358 P 0.064 +359 A 0.067 +360 V 0.070 +361 K 0.073 +362 T 0.075 +363 I 0.073 +364 V 0.071 +365 I 0.072 +366 L 0.077 +367 I 0.084 +368 M 0.095 +369 R 0.106 +370 L 0.116 +371 V 0.121 +372 D 0.123 +373 A 0.128 +374 D 0.134 +375 E 0.137 +376 L 0.134 +377 T 0.126 +378 G 0.115 +379 L 0.106 +380 C 0.112 +381 Y 0.136 +382 V 0.166 +383 G 0.185 +384 N 0.188 +385 Q 0.176 +386 N 0.158 +387 L 0.140 +388 D 0.128 +389 A 0.118 +390 L 0.107 +391 T 0.096 +392 G 0.091 +393 F 0.090 +394 V 0.086 +395 V 0.082 +396 A 0.086 +397 P 0.095 +398 L 0.095 +399 F 0.083 +400 T 0.071 +401 Y 0.066 +402 L 0.070 +403 V 0.083 +404 I 0.104 +405 G 0.124 +406 T 0.132 +407 L 0.124 +408 F 0.110 +409 I 0.100 +410 A 0.092 +411 A 0.089 +412 G 0.093 +413 L 0.101 +414 V 0.101 +415 A 0.090 +416 L 0.074 +417 F 0.066 +418 K 0.071 +419 I 0.087 +420 R 0.110 +421 S 0.141 +422 N 0.179 +423 L 0.223 +424 Q 0.264 +425 K 0.296 +426 D 0.318 +427 G 0.327 +428 T 0.318 +429 K 0.292 +430 T 0.253 +431 D 0.210 +432 K 0.175 +433 L 0.149 +434 E 0.127 +435 R 0.103 +436 L 0.079 +437 M 0.063 +438 V 0.055 +439 K 0.056 +440 I 0.061 +441 G 0.062 +442 V 0.059 +443 F 0.056 +444 S 0.055 +445 V 0.054 +446 L 0.049 +447 Y 0.045 +448 T 0.043 +449 V 0.041 +450 P 0.044 +451 A 0.053 +452 T 0.060 +453 C 0.056 +454 V 0.046 +455 I 0.039 +456 A 0.037 +457 C 0.038 +458 Y 0.038 +459 F 0.040 +460 Y 0.043 +461 E 0.048 +462 I 0.052 +463 S 0.054 +464 N 0.057 +465 W 0.064 +466 A 0.076 +467 L 0.093 +468 F 0.117 +469 R 0.149 +470 Y 0.183 +471 S 0.217 +472 A 0.245 +473 D 0.267 +474 D 0.274 +475 S 0.254 +476 N 0.205 +477 M 0.147 +478 A 0.105 +479 V 0.087 +480 E 0.082 +481 M 0.078 +482 L 0.073 +483 K 0.071 +484 I 0.073 +485 F 0.076 +486 M 0.077 +487 S 0.078 +488 L 0.080 +489 L 0.082 +490 V 0.082 +491 G 0.081 +492 I 0.083 +493 T 0.090 +494 S 0.093 +495 G 0.089 +496 M 0.081 +497 W 0.075 +498 I 0.069 +499 W 0.064 +500 S 0.062 +501 A 0.064 +502 K 0.066 +503 T 0.067 +504 L 0.070 +505 H 0.071 +506 T 0.065 +507 W 0.056 +508 Q 0.057 +509 K 0.070 +510 C 0.093 +511 S 0.118 +512 N 0.138 +513 R 0.160 +514 L 0.195 +515 V 0.244 +516 N 0.305 +517 S 0.375 +518 G 0.446 +519 K 0.502 +520 V 0.529 +521 K 0.522 +522 R 0.494 +523 E 0.480 +524 K 0.509 +525 R 0.560 +526 G 0.599 +527 N 0.615 +528 G 0.615 +529 W 0.609 +530 V 0.608 +531 K 0.620 +532 P 0.649 +533 G 0.688 +534 K 0.726 +535 G 0.752 +536 S 0.766 +537 E 0.773 +538 T 0.775 +539 V 0.771 +540 V 0.765 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000175336.11_ENST00000398189.4_GN:APOF_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000175336.11_ENST00000398189.4_GN:APOF_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2d49611788a30282621d546635a865dac7ef0985 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000175336.11_ENST00000398189.4_GN:APOF_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,327 @@ +>ENSG00000175336.11|ENST00000398189.4|GN:APOF|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.434 +2 T 0.465 +3 G 0.505 +4 L 0.521 +5 C 0.497 +6 G 0.469 +7 Y 0.483 +8 S 0.533 +9 A 0.573 +10 P 0.574 +11 D 0.544 +12 M 0.510 +13 R 0.506 +14 G 0.535 +15 L 0.549 +16 R 0.520 +17 L 0.479 +18 I 0.459 +19 M 0.437 +20 I 0.383 +21 P 0.311 +22 V 0.250 +23 E 0.210 +24 L 0.184 +25 L 0.171 +26 L 0.168 +27 C 0.166 +28 Y 0.161 +29 L 0.162 +30 L 0.185 +31 L 0.240 +32 H 0.319 +33 P 0.406 +34 V 0.488 +35 D 0.555 +36 A 0.600 +37 T 0.626 +38 S 0.642 +39 Y 0.660 +40 G 0.677 +41 K 0.689 +42 Q 0.696 +43 T 0.697 +44 N 0.687 +45 V 0.655 +46 L 0.600 +47 M 0.539 +48 H 0.505 +49 F 0.520 +50 P 0.568 +51 L 0.618 +52 S 0.654 +53 L 0.678 +54 E 0.687 +55 S 0.673 +56 Q 0.643 +57 T 0.611 +58 P 0.585 +59 S 0.559 +60 S 0.523 +61 D 0.474 +62 P 0.420 +63 L 0.376 +64 S 0.351 +65 C 0.342 +66 Q 0.336 +67 F 0.326 +68 L 0.314 +69 H 0.304 +70 P 0.292 +71 K 0.283 +72 S 0.285 +73 L 0.295 +74 P 0.296 +75 G 0.278 +76 F 0.249 +77 S 0.219 +78 H 0.193 +79 M 0.171 +80 A 0.152 +81 P 0.131 +82 L 0.105 +83 P 0.076 +84 K 0.055 +85 F 0.044 +86 L 0.039 +87 V 0.034 +88 S 0.031 +89 L 0.031 +90 A 0.033 +91 L 0.034 +92 R 0.035 +93 N 0.037 +94 A 0.040 +95 L 0.046 +96 E 0.057 +97 E 0.071 +98 A 0.082 +99 G 0.082 +100 C 0.073 +101 Q 0.060 +102 A 0.045 +103 D 0.033 +104 V 0.022 +105 W 0.016 +106 A 0.012 +107 L 0.011 +108 Q 0.012 +109 L 0.015 +110 Q 0.020 +111 L 0.025 +112 Y 0.031 +113 R 0.045 +114 Q 0.067 +115 G 0.086 +116 G 0.089 +117 V 0.075 +118 N 0.056 +119 A 0.041 +120 T 0.032 +121 Q 0.027 +122 V 0.025 +123 L 0.025 +124 I 0.027 +125 Q 0.031 +126 H 0.041 +127 L 0.058 +128 R 0.081 +129 G 0.105 +130 L 0.124 +131 Q 0.146 +132 K 0.176 +133 G 0.210 +134 R 0.236 +135 S 0.247 +136 T 0.240 +137 E 0.217 +138 R 0.191 +139 N 0.168 +140 V 0.140 +141 S 0.105 +142 V 0.071 +143 E 0.048 +144 A 0.040 +145 L 0.044 +146 A 0.054 +147 S 0.059 +148 A 0.053 +149 L 0.043 +150 Q 0.039 +151 L 0.043 +152 L 0.053 +153 A 0.069 +154 R 0.094 +155 E 0.124 +156 Q 0.162 +157 Q 0.211 +158 S 0.272 +159 T 0.331 +160 G 0.375 +161 R 0.403 +162 V 0.422 +163 G 0.429 +164 R 0.422 +165 S 0.405 +166 L 0.379 +167 P 0.343 +168 T 0.300 +169 E 0.258 +170 D 0.216 +171 C 0.178 +172 E 0.155 +173 N 0.150 +174 E 0.153 +175 K 0.154 +176 E 0.156 +177 Q 0.158 +178 A 0.153 +179 V 0.146 +180 H 0.145 +181 N 0.143 +182 V 0.132 +183 V 0.119 +184 Q 0.110 +185 L 0.103 +186 L 0.097 +187 P 0.097 +188 G 0.100 +189 V 0.104 +190 G 0.105 +191 T 0.098 +192 F 0.082 +193 Y 0.069 +194 N 0.062 +195 L 0.058 +196 G 0.051 +197 T 0.044 +198 A 0.038 +199 L 0.031 +200 Y 0.025 +201 Y 0.024 +202 A 0.031 +203 T 0.045 +204 Q 0.066 +205 N 0.087 +206 C 0.095 +207 L 0.088 +208 G 0.078 +209 K 0.070 +210 A 0.066 +211 R 0.068 +212 E 0.079 +213 R 0.101 +214 G 0.121 +215 R 0.125 +216 D 0.110 +217 G 0.085 +218 A 0.065 +219 I 0.055 +220 D 0.052 +221 L 0.050 +222 G 0.049 +223 Y 0.049 +224 D 0.048 +225 L 0.045 +226 L 0.043 +227 M 0.044 +228 T 0.048 +229 M 0.055 +230 A 0.064 +231 G 0.075 +232 M 0.089 +233 S 0.106 +234 G 0.128 +235 G 0.144 +236 P 0.143 +237 M 0.126 +238 G 0.105 +239 L 0.092 +240 A 0.088 +241 I 0.085 +242 S 0.080 +243 A 0.077 +244 A 0.079 +245 L 0.080 +246 K 0.075 +247 P 0.068 +248 A 0.062 +249 L 0.058 +250 R 0.056 +251 S 0.055 +252 G 0.051 +253 V 0.044 +254 Q 0.039 +255 Q 0.040 +256 L 0.048 +257 I 0.060 +258 Q 0.069 +259 Y 0.066 +260 Y 0.061 +261 Q 0.066 +262 D 0.086 +263 Q 0.120 +264 K 0.167 +265 D 0.225 +266 A 0.279 +267 N 0.317 +268 I 0.339 +269 S 0.352 +270 Q 0.355 +271 P 0.345 +272 E 0.329 +273 T 0.315 +274 T 0.297 +275 K 0.267 +276 E 0.232 +277 G 0.208 +278 L 0.204 +279 R 0.216 +280 A 0.237 +281 I 0.259 +282 S 0.285 +283 D 0.317 +284 V 0.347 +285 S 0.367 +286 D 0.370 +287 L 0.353 +288 E 0.323 +289 E 0.288 +290 T 0.244 +291 T 0.193 +292 T 0.145 +293 L 0.111 +294 A 0.093 +295 S 0.089 +296 F 0.088 +297 I 0.087 +298 S 0.086 +299 E 0.092 +300 V 0.102 +301 V 0.114 +302 S 0.128 +303 S 0.142 +304 A 0.144 +305 P 0.132 +306 Y 0.118 +307 W 0.109 +308 G 0.105 +309 W 0.106 +310 A 0.118 +311 I 0.136 +312 I 0.146 +313 K 0.149 +314 S 0.163 +315 Y 0.198 +316 D 0.247 +317 L 0.309 +318 D 0.380 +319 P 0.452 +320 G 0.515 +321 A 0.564 +322 G 0.592 +323 S 0.595 +324 L 0.571 +325 E 0.519 +326 I 0.470 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000175336.11_ENST00000398189.4_GN:APOF_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000175336.11_ENST00000398189.4_GN:APOF_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..262fbaf281693a55c4c0ff8d07044fdbacacd2fc --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000175336.11_ENST00000398189.4_GN:APOF_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid @@ -0,0 +1,350 @@ +>ENSG00000175336.11|ENST00000398189.4|GN:APOF|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:23 +1 M 0.393 +2 G 0.408 +3 H 0.430 +4 R 0.440 +5 T 0.416 +6 R 0.385 +7 Q 0.400 +8 N 0.454 +9 R 0.483 +10 I 0.466 +11 R 0.448 +12 K 0.452 +13 R 0.453 +14 S 0.448 +15 N 0.458 +16 L 0.464 +17 P 0.436 +18 R 0.405 +19 Q 0.433 +20 S 0.519 +21 H 0.602 +22 F 0.650 +23 S 0.678 +24 M 0.705 +25 T 0.728 +26 G 0.738 +27 L 0.733 +28 C 0.718 +29 G 0.700 +30 Y 0.684 +31 S 0.674 +32 A 0.671 +33 P 0.671 +34 D 0.672 +35 M 0.677 +36 R 0.687 +37 G 0.700 +38 L 0.706 +39 R 0.700 +40 L 0.677 +41 I 0.632 +42 M 0.564 +43 I 0.473 +44 P 0.382 +45 V 0.312 +46 E 0.269 +47 L 0.241 +48 L 0.227 +49 L 0.223 +50 C 0.217 +51 Y 0.205 +52 L 0.200 +53 L 0.219 +54 L 0.275 +55 H 0.362 +56 P 0.462 +57 V 0.553 +58 D 0.622 +59 A 0.666 +60 T 0.689 +61 S 0.703 +62 Y 0.719 +63 G 0.735 +64 K 0.746 +65 Q 0.749 +66 T 0.745 +67 N 0.730 +68 V 0.697 +69 L 0.643 +70 M 0.580 +71 H 0.543 +72 F 0.554 +73 P 0.600 +74 L 0.649 +75 S 0.686 +76 L 0.711 +77 E 0.719 +78 S 0.707 +79 Q 0.677 +80 T 0.643 +81 P 0.612 +82 S 0.580 +83 S 0.540 +84 D 0.490 +85 P 0.436 +86 L 0.393 +87 S 0.365 +88 C 0.349 +89 Q 0.336 +90 F 0.322 +91 L 0.307 +92 H 0.293 +93 P 0.280 +94 K 0.273 +95 S 0.277 +96 L 0.287 +97 P 0.285 +98 G 0.265 +99 F 0.236 +100 S 0.206 +101 H 0.182 +102 M 0.164 +103 A 0.149 +104 P 0.130 +105 L 0.104 +106 P 0.074 +107 K 0.052 +108 F 0.041 +109 L 0.037 +110 V 0.033 +111 S 0.029 +112 L 0.028 +113 A 0.029 +114 L 0.031 +115 R 0.032 +116 N 0.033 +117 A 0.036 +118 L 0.042 +119 E 0.052 +120 E 0.065 +121 A 0.076 +122 G 0.079 +123 C 0.073 +124 Q 0.062 +125 A 0.048 +126 D 0.035 +127 V 0.025 +128 W 0.017 +129 A 0.013 +130 L 0.011 +131 Q 0.012 +132 L 0.015 +133 Q 0.020 +134 L 0.025 +135 Y 0.031 +136 R 0.046 +137 Q 0.070 +138 G 0.092 +139 G 0.097 +140 V 0.082 +141 N 0.061 +142 A 0.044 +143 T 0.034 +144 Q 0.028 +145 V 0.024 +146 L 0.024 +147 I 0.025 +148 Q 0.029 +149 H 0.038 +150 L 0.057 +151 R 0.081 +152 G 0.105 +153 L 0.125 +154 Q 0.147 +155 K 0.180 +156 G 0.216 +157 R 0.245 +158 S 0.258 +159 T 0.248 +160 E 0.222 +161 R 0.193 +162 N 0.169 +163 V 0.142 +164 S 0.107 +165 V 0.072 +166 E 0.048 +167 A 0.036 +168 L 0.031 +169 A 0.028 +170 S 0.027 +171 A 0.027 +172 L 0.029 +173 Q 0.034 +174 L 0.041 +175 L 0.052 +176 A 0.067 +177 R 0.090 +178 E 0.118 +179 Q 0.152 +180 Q 0.200 +181 S 0.258 +182 T 0.315 +183 G 0.358 +184 R 0.386 +185 V 0.405 +186 G 0.413 +187 R 0.408 +188 S 0.394 +189 L 0.372 +190 P 0.337 +191 T 0.295 +192 E 0.253 +193 D 0.212 +194 C 0.175 +195 E 0.153 +196 N 0.150 +197 E 0.153 +198 K 0.154 +199 E 0.155 +200 Q 0.157 +201 A 0.153 +202 V 0.147 +203 H 0.146 +204 N 0.144 +205 V 0.132 +206 V 0.119 +207 Q 0.110 +208 L 0.103 +209 L 0.097 +210 P 0.095 +211 G 0.098 +212 V 0.102 +213 G 0.105 +214 T 0.098 +215 F 0.082 +216 Y 0.068 +217 N 0.062 +218 L 0.057 +219 G 0.051 +220 T 0.044 +221 A 0.038 +222 L 0.032 +223 Y 0.026 +224 Y 0.025 +225 A 0.031 +226 T 0.045 +227 Q 0.066 +228 N 0.086 +229 C 0.094 +230 L 0.088 +231 G 0.078 +232 K 0.072 +233 A 0.069 +234 R 0.070 +235 E 0.082 +236 R 0.104 +237 G 0.124 +238 R 0.127 +239 D 0.112 +240 G 0.087 +241 A 0.066 +242 I 0.056 +243 D 0.053 +244 L 0.051 +245 G 0.050 +246 Y 0.049 +247 D 0.048 +248 L 0.045 +249 L 0.043 +250 M 0.044 +251 T 0.048 +252 M 0.054 +253 A 0.063 +254 G 0.074 +255 M 0.088 +256 S 0.106 +257 G 0.129 +258 G 0.145 +259 P 0.144 +260 M 0.128 +261 G 0.106 +262 L 0.093 +263 A 0.089 +264 I 0.087 +265 S 0.081 +266 A 0.079 +267 A 0.081 +268 L 0.082 +269 K 0.077 +270 P 0.070 +271 A 0.064 +272 L 0.060 +273 R 0.059 +274 S 0.058 +275 G 0.054 +276 V 0.047 +277 Q 0.040 +278 Q 0.037 +279 L 0.036 +280 I 0.035 +281 Q 0.038 +282 Y 0.043 +283 Y 0.052 +284 Q 0.068 +285 D 0.094 +286 Q 0.131 +287 K 0.181 +288 D 0.242 +289 A 0.299 +290 N 0.338 +291 I 0.360 +292 S 0.373 +293 Q 0.377 +294 P 0.367 +295 E 0.351 +296 T 0.335 +297 T 0.315 +298 K 0.282 +299 E 0.244 +300 G 0.220 +301 L 0.215 +302 R 0.229 +303 A 0.251 +304 I 0.275 +305 S 0.303 +306 D 0.336 +307 V 0.366 +308 S 0.385 +309 D 0.385 +310 L 0.367 +311 E 0.335 +312 E 0.299 +313 T 0.254 +314 T 0.201 +315 T 0.152 +316 L 0.117 +317 A 0.100 +318 S 0.096 +319 F 0.096 +320 I 0.093 +321 S 0.092 +322 E 0.097 +323 V 0.107 +324 V 0.120 +325 S 0.135 +326 S 0.148 +327 A 0.149 +328 P 0.137 +329 Y 0.122 +330 W 0.113 +331 G 0.109 +332 W 0.111 +333 A 0.124 +334 I 0.144 +335 I 0.154 +336 K 0.157 +337 S 0.171 +338 Y 0.205 +339 D 0.254 +340 L 0.316 +341 D 0.388 +342 P 0.461 +343 G 0.526 +344 A 0.575 +345 G 0.603 +346 S 0.608 +347 L 0.582 +348 E 0.528 +349 I 0.478 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000176547.11_ENST00000319856.5_GN:OR4C3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000176547.11_ENST00000319856.5_GN:OR4C3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..eb5131121cf557c2547b976a923e2fe7e34bf087 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000176547.11_ENST00000319856.5_GN:OR4C3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,303 @@ +>ENSG00000176547.11|ENST00000319856.5|GN:OR4C3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.428 +2 D 0.435 +3 I 0.437 +4 P 0.418 +5 Q 0.369 +6 N 0.300 +7 I 0.228 +8 T 0.172 +9 E 0.141 +10 F 0.131 +11 F 0.131 +12 M 0.135 +13 L 0.141 +14 G 0.151 +15 L 0.161 +16 S 0.169 +17 Q 0.168 +18 N 0.151 +19 S 0.120 +20 E 0.089 +21 V 0.068 +22 Q 0.059 +23 R 0.058 +24 V 0.061 +25 L 0.065 +26 F 0.071 +27 V 0.070 +28 V 0.059 +29 F 0.045 +30 L 0.039 +31 L 0.042 +32 I 0.047 +33 Y 0.048 +34 V 0.047 +35 V 0.048 +36 T 0.050 +37 V 0.051 +38 C 0.054 +39 G 0.061 +40 N 0.068 +41 M 0.072 +42 L 0.070 +43 I 0.065 +44 V 0.058 +45 V 0.056 +46 T 0.061 +47 I 0.072 +48 T 0.084 +49 S 0.093 +50 S 0.094 +51 P 0.091 +52 T 0.087 +53 L 0.084 +54 A 0.079 +55 S 0.067 +56 P 0.050 +57 V 0.035 +58 Y 0.026 +59 F 0.022 +60 F 0.022 +61 L 0.028 +62 A 0.037 +63 N 0.047 +64 L 0.053 +65 S 0.054 +66 F 0.053 +67 I 0.053 +68 D 0.056 +69 T 0.057 +70 F 0.055 +71 Y 0.052 +72 S 0.051 +73 S 0.054 +74 S 0.058 +75 M 0.063 +76 A 0.065 +77 P 0.063 +78 K 0.061 +79 L 0.060 +80 I 0.058 +81 A 0.053 +82 D 0.051 +83 S 0.055 +84 L 0.067 +85 Y 0.082 +86 E 0.093 +87 G 0.092 +88 R 0.080 +89 T 0.067 +90 I 0.056 +91 S 0.045 +92 Y 0.035 +93 E 0.030 +94 C 0.028 +95 C 0.027 +96 M 0.027 +97 A 0.029 +98 Q 0.032 +99 L 0.035 +100 F 0.038 +101 G 0.038 +102 A 0.034 +103 H 0.030 +104 F 0.028 +105 L 0.030 +106 G 0.033 +107 G 0.038 +108 V 0.045 +109 E 0.050 +110 I 0.051 +111 I 0.046 +112 L 0.040 +113 L 0.035 +114 T 0.033 +115 V 0.031 +116 M 0.030 +117 A 0.032 +118 Y 0.035 +119 D 0.039 +120 R 0.041 +121 Y 0.043 +122 V 0.046 +123 A 0.050 +124 I 0.056 +125 C 0.063 +126 K 0.072 +127 P 0.078 +128 L 0.079 +129 H 0.077 +130 N 0.074 +131 T 0.069 +132 T 0.066 +133 I 0.067 +134 M 0.069 +135 T 0.070 +136 R 0.070 +137 H 0.068 +138 L 0.061 +139 C 0.058 +140 A 0.064 +141 M 0.069 +142 L 0.065 +143 V 0.053 +144 G 0.046 +145 V 0.046 +146 A 0.051 +147 W 0.056 +148 L 0.065 +149 G 0.075 +150 G 0.080 +151 F 0.078 +152 L 0.076 +153 H 0.079 +154 S 0.082 +155 L 0.082 +156 V 0.083 +157 Q 0.085 +158 L 0.083 +159 L 0.078 +160 L 0.075 +161 V 0.072 +162 L 0.073 +163 W 0.083 +164 L 0.096 +165 P 0.102 +166 F 0.104 +167 C 0.108 +168 G 0.117 +169 P 0.125 +170 N 0.134 +171 V 0.141 +172 I 0.139 +173 N 0.120 +174 H 0.095 +175 F 0.076 +176 A 0.066 +177 C 0.066 +178 D 0.077 +179 L 0.097 +180 Y 0.118 +181 P 0.131 +182 L 0.136 +183 L 0.139 +184 E 0.141 +185 V 0.133 +186 A 0.117 +187 C 0.103 +188 T 0.100 +189 N 0.104 +190 T 0.107 +191 Y 0.104 +192 V 0.100 +193 I 0.099 +194 G 0.100 +195 L 0.099 +196 L 0.094 +197 V 0.087 +198 V 0.079 +199 A 0.075 +200 N 0.073 +201 S 0.070 +202 G 0.065 +203 L 0.060 +204 I 0.060 +205 C 0.060 +206 L 0.061 +207 L 0.068 +208 N 0.075 +209 F 0.075 +210 L 0.069 +211 M 0.068 +212 L 0.072 +213 A 0.072 +214 A 0.064 +215 S 0.051 +216 Y 0.041 +217 I 0.037 +218 V 0.040 +219 I 0.049 +220 L 0.063 +221 Y 0.075 +222 S 0.081 +223 L 0.085 +224 R 0.094 +225 S 0.111 +226 H 0.131 +227 S 0.147 +228 A 0.153 +229 D 0.145 +230 G 0.125 +231 R 0.103 +232 C 0.087 +233 K 0.079 +234 A 0.075 +235 L 0.075 +236 S 0.077 +237 T 0.077 +238 C 0.077 +239 G 0.078 +240 A 0.078 +241 H 0.072 +242 F 0.063 +243 I 0.056 +244 V 0.052 +245 V 0.046 +246 A 0.037 +247 L 0.029 +248 F 0.025 +249 F 0.025 +250 V 0.028 +251 P 0.031 +252 C 0.034 +253 I 0.034 +254 F 0.035 +255 T 0.041 +256 Y 0.059 +257 V 0.090 +258 H 0.124 +259 P 0.154 +260 F 0.176 +261 S 0.191 +262 T 0.197 +263 L 0.192 +264 P 0.178 +265 I 0.157 +266 D 0.134 +267 K 0.112 +268 N 0.092 +269 M 0.077 +270 A 0.068 +271 L 0.066 +272 F 0.076 +273 Y 0.094 +274 G 0.109 +275 I 0.118 +276 L 0.121 +277 T 0.118 +278 P 0.108 +279 M 0.093 +280 L 0.082 +281 N 0.075 +282 P 0.069 +283 L 0.066 +284 I 0.067 +285 Y 0.068 +286 T 0.075 +287 L 0.091 +288 R 0.102 +289 N 0.094 +290 E 0.076 +291 E 0.063 +292 V 0.061 +293 K 0.070 +294 N 0.078 +295 A 0.078 +296 M 0.073 +297 R 0.073 +298 K 0.085 +299 L 0.109 +300 F 0.139 +301 T 0.168 +302 W 0.188 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000176547.11_ENST00000319856.5_GN:OR4C3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000176547.11_ENST00000319856.5_GN:OR4C3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9b5e3752e9416538bc6bd5f9e829486a1683b6c9 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000176547.11_ENST00000319856.5_GN:OR4C3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid @@ -0,0 +1,330 @@ +>ENSG00000176547.11|ENST00000319856.5|GN:OR4C3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:27 +1 M 0.097 +2 Q 0.082 +3 L 0.062 +4 V 0.048 +5 L 0.040 +6 L 0.035 +7 L 0.034 +8 M 0.035 +9 F 0.036 +10 L 0.038 +11 L 0.048 +12 V 0.072 +13 F 0.110 +14 I 0.161 +15 G 0.220 +16 N 0.279 +17 T 0.328 +18 A 0.359 +19 P 0.372 +20 A 0.377 +21 F 0.380 +22 S 0.382 +23 V 0.389 +24 T 0.405 +25 L 0.429 +26 E 0.450 +27 S 0.457 +28 M 0.450 +29 D 0.437 +30 I 0.420 +31 P 0.389 +32 Q 0.342 +33 N 0.284 +34 I 0.224 +35 T 0.176 +36 E 0.147 +37 F 0.136 +38 F 0.133 +39 M 0.131 +40 L 0.132 +41 G 0.139 +42 L 0.151 +43 S 0.162 +44 Q 0.164 +45 N 0.147 +46 S 0.117 +47 E 0.087 +48 V 0.065 +49 Q 0.051 +50 R 0.044 +51 V 0.043 +52 L 0.051 +53 F 0.064 +54 V 0.069 +55 V 0.060 +56 F 0.046 +57 L 0.040 +58 L 0.041 +59 I 0.045 +60 Y 0.046 +61 V 0.045 +62 V 0.044 +63 T 0.045 +64 V 0.045 +65 C 0.048 +66 G 0.055 +67 N 0.063 +68 M 0.067 +69 L 0.066 +70 I 0.061 +71 V 0.055 +72 V 0.051 +73 T 0.055 +74 I 0.063 +75 T 0.073 +76 S 0.080 +77 S 0.083 +78 P 0.080 +79 T 0.076 +80 L 0.074 +81 A 0.069 +82 S 0.059 +83 P 0.044 +84 V 0.031 +85 Y 0.023 +86 F 0.020 +87 F 0.020 +88 L 0.025 +89 A 0.034 +90 N 0.043 +91 L 0.051 +92 S 0.054 +93 F 0.053 +94 I 0.052 +95 D 0.054 +96 T 0.055 +97 F 0.051 +98 Y 0.048 +99 S 0.047 +100 S 0.049 +101 S 0.052 +102 M 0.055 +103 A 0.057 +104 P 0.055 +105 K 0.052 +106 L 0.051 +107 I 0.048 +108 A 0.044 +109 D 0.041 +110 S 0.045 +111 L 0.056 +112 Y 0.071 +113 E 0.083 +114 G 0.083 +115 R 0.073 +116 T 0.062 +117 I 0.053 +118 S 0.042 +119 Y 0.033 +120 E 0.027 +121 C 0.025 +122 C 0.025 +123 M 0.026 +124 A 0.028 +125 Q 0.031 +126 L 0.033 +127 F 0.036 +128 G 0.035 +129 A 0.031 +130 H 0.028 +131 F 0.027 +132 L 0.029 +133 G 0.032 +134 G 0.036 +135 V 0.042 +136 E 0.046 +137 I 0.045 +138 I 0.041 +139 L 0.036 +140 L 0.032 +141 T 0.030 +142 V 0.028 +143 M 0.028 +144 A 0.030 +145 Y 0.033 +146 D 0.037 +147 R 0.040 +148 Y 0.042 +149 V 0.045 +150 A 0.050 +151 I 0.055 +152 C 0.063 +153 K 0.072 +154 P 0.077 +155 L 0.078 +156 H 0.076 +157 N 0.072 +158 T 0.067 +159 T 0.064 +160 I 0.065 +161 M 0.067 +162 T 0.068 +163 R 0.068 +164 H 0.065 +165 L 0.058 +166 C 0.054 +167 A 0.061 +168 M 0.067 +169 L 0.062 +170 V 0.050 +171 G 0.042 +172 V 0.042 +173 A 0.046 +174 W 0.050 +175 L 0.056 +176 G 0.065 +177 G 0.073 +178 F 0.074 +179 L 0.074 +180 H 0.077 +181 S 0.079 +182 L 0.079 +183 V 0.078 +184 Q 0.080 +185 L 0.079 +186 L 0.075 +187 L 0.073 +188 V 0.071 +189 L 0.073 +190 W 0.082 +191 L 0.094 +192 P 0.100 +193 F 0.100 +194 C 0.103 +195 G 0.110 +196 P 0.118 +197 N 0.127 +198 V 0.134 +199 I 0.132 +200 N 0.113 +201 H 0.089 +202 F 0.071 +203 A 0.063 +204 C 0.064 +205 D 0.076 +206 L 0.095 +207 Y 0.114 +208 P 0.126 +209 L 0.132 +210 L 0.135 +211 E 0.137 +212 V 0.130 +213 A 0.112 +214 C 0.097 +215 T 0.092 +216 N 0.096 +217 T 0.099 +218 Y 0.097 +219 V 0.092 +220 I 0.091 +221 G 0.092 +222 L 0.090 +223 L 0.086 +224 V 0.080 +225 V 0.074 +226 A 0.069 +227 N 0.067 +228 S 0.065 +229 G 0.060 +230 L 0.055 +231 I 0.055 +232 C 0.055 +233 L 0.056 +234 L 0.062 +235 N 0.069 +236 F 0.070 +237 L 0.065 +238 M 0.065 +239 L 0.069 +240 A 0.069 +241 A 0.060 +242 S 0.049 +243 Y 0.039 +244 I 0.036 +245 V 0.038 +246 I 0.047 +247 L 0.060 +248 Y 0.072 +249 S 0.078 +250 L 0.082 +251 R 0.091 +252 S 0.108 +253 H 0.127 +254 S 0.144 +255 A 0.150 +256 D 0.143 +257 G 0.124 +258 R 0.102 +259 C 0.086 +260 K 0.078 +261 A 0.074 +262 L 0.074 +263 S 0.075 +264 T 0.076 +265 C 0.076 +266 G 0.077 +267 A 0.077 +268 H 0.072 +269 F 0.063 +270 I 0.057 +271 V 0.052 +272 V 0.045 +273 A 0.036 +274 L 0.028 +275 F 0.024 +276 F 0.024 +277 V 0.027 +278 P 0.030 +279 C 0.032 +280 I 0.033 +281 F 0.033 +282 T 0.039 +283 Y 0.057 +284 V 0.087 +285 H 0.122 +286 P 0.153 +287 F 0.177 +288 S 0.194 +289 T 0.201 +290 L 0.197 +291 P 0.184 +292 I 0.163 +293 D 0.138 +294 K 0.114 +295 N 0.093 +296 M 0.078 +297 A 0.069 +298 L 0.068 +299 F 0.079 +300 Y 0.096 +301 G 0.112 +302 I 0.119 +303 L 0.121 +304 T 0.118 +305 P 0.107 +306 M 0.092 +307 L 0.080 +308 N 0.073 +309 P 0.068 +310 L 0.066 +311 I 0.066 +312 Y 0.068 +313 T 0.075 +314 L 0.090 +315 R 0.101 +316 N 0.095 +317 E 0.076 +318 E 0.062 +319 V 0.060 +320 K 0.068 +321 N 0.076 +322 A 0.076 +323 M 0.070 +324 R 0.069 +325 K 0.081 +326 L 0.103 +327 F 0.133 +328 T 0.163 +329 W 0.183 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000178726.7_ENST00000377103.3_GN:THBD_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000178726.7_ENST00000377103.3_GN:THBD_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..8d523f1f2bd18a22188c8f40825c6e52d6605f4c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000178726.7_ENST00000377103.3_GN:THBD_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,576 @@ +>ENSG00000178726.7|ENST00000377103.3|GN:THBD|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.287 +2 L 0.285 +3 G 0.281 +4 V 0.270 +5 L 0.253 +6 V 0.245 +7 L 0.263 +8 G 0.290 +9 A 0.300 +10 L 0.301 +11 A 0.322 +12 L 0.363 +13 A 0.400 +14 G 0.425 +15 L 0.441 +16 G 0.454 +17 F 0.473 +18 P 0.498 +19 A 0.523 +20 P 0.534 +21 A 0.528 +22 E 0.512 +23 P 0.496 +24 Q 0.474 +25 P 0.435 +26 G 0.370 +27 G 0.280 +28 S 0.184 +29 Q 0.114 +30 C 0.080 +31 V 0.065 +32 E 0.053 +33 H 0.041 +34 D 0.035 +35 C 0.033 +36 F 0.037 +37 A 0.048 +38 L 0.068 +39 Y 0.090 +40 P 0.103 +41 G 0.097 +42 P 0.078 +43 A 0.060 +44 T 0.046 +45 F 0.037 +46 L 0.034 +47 N 0.039 +48 A 0.050 +49 S 0.063 +50 Q 0.071 +51 I 0.069 +52 C 0.067 +53 D 0.074 +54 G 0.084 +55 L 0.089 +56 R 0.085 +57 G 0.077 +58 H 0.070 +59 L 0.070 +60 M 0.077 +61 T 0.090 +62 V 0.100 +63 R 0.100 +64 S 0.085 +65 S 0.063 +66 V 0.042 +67 A 0.030 +68 A 0.028 +69 D 0.030 +70 V 0.032 +71 I 0.032 +72 S 0.035 +73 L 0.046 +74 L 0.069 +75 L 0.107 +76 N 0.158 +77 G 0.208 +78 D 0.244 +79 G 0.257 +80 G 0.243 +81 V 0.207 +82 G 0.158 +83 R 0.110 +84 R 0.075 +85 R 0.051 +86 L 0.035 +87 W 0.026 +88 I 0.026 +89 G 0.034 +90 L 0.046 +91 Q 0.062 +92 L 0.080 +93 P 0.098 +94 P 0.114 +95 G 0.134 +96 C 0.158 +97 G 0.177 +98 D 0.182 +99 P 0.179 +100 K 0.178 +101 R 0.178 +102 L 0.178 +103 G 0.177 +104 P 0.172 +105 L 0.157 +106 R 0.132 +107 G 0.102 +108 F 0.075 +109 Q 0.055 +110 W 0.045 +111 V 0.046 +112 T 0.057 +113 G 0.073 +114 D 0.090 +115 N 0.104 +116 N 0.113 +117 T 0.111 +118 S 0.099 +119 Y 0.089 +120 S 0.086 +121 R 0.091 +122 W 0.103 +123 A 0.128 +124 R 0.166 +125 L 0.210 +126 D 0.245 +127 L 0.264 +128 N 0.272 +129 G 0.269 +130 A 0.248 +131 P 0.207 +132 L 0.157 +133 C 0.116 +134 G 0.091 +135 P 0.077 +136 L 0.068 +137 C 0.060 +138 V 0.053 +139 A 0.051 +140 V 0.059 +141 S 0.082 +142 A 0.121 +143 A 0.169 +144 E 0.219 +145 A 0.263 +146 T 0.293 +147 V 0.305 +148 P 0.296 +149 S 0.270 +150 E 0.230 +151 P 0.184 +152 I 0.141 +153 W 0.109 +154 E 0.089 +155 E 0.076 +156 Q 0.068 +157 Q 0.062 +158 C 0.061 +159 E 0.064 +160 V 0.069 +161 K 0.073 +162 A 0.072 +163 D 0.070 +164 G 0.064 +165 F 0.058 +166 L 0.052 +167 C 0.051 +168 E 0.056 +169 F 0.064 +170 H 0.074 +171 F 0.082 +172 P 0.082 +173 A 0.076 +174 T 0.071 +175 C 0.080 +176 R 0.107 +177 P 0.147 +178 L 0.191 +179 A 0.232 +180 V 0.263 +181 E 0.279 +182 P 0.276 +183 G 0.261 +184 A 0.244 +185 A 0.225 +186 A 0.198 +187 A 0.162 +188 A 0.128 +189 V 0.105 +190 S 0.092 +191 I 0.086 +192 T 0.088 +193 Y 0.098 +194 G 0.118 +195 T 0.140 +196 P 0.160 +197 F 0.184 +198 A 0.213 +199 A 0.242 +200 R 0.261 +201 G 0.260 +202 A 0.231 +203 D 0.184 +204 F 0.138 +205 Q 0.104 +206 A 0.084 +207 L 0.074 +208 P 0.070 +209 V 0.070 +210 G 0.072 +211 S 0.075 +212 S 0.077 +213 A 0.079 +214 A 0.085 +215 V 0.094 +216 A 0.106 +217 P 0.122 +218 L 0.138 +219 G 0.150 +220 L 0.151 +221 Q 0.140 +222 L 0.121 +223 M 0.109 +224 C 0.110 +225 T 0.126 +226 A 0.153 +227 P 0.178 +228 P 0.186 +229 G 0.173 +230 A 0.147 +231 V 0.127 +232 Q 0.122 +233 G 0.125 +234 H 0.127 +235 W 0.132 +236 A 0.153 +237 R 0.198 +238 E 0.253 +239 A 0.291 +240 P 0.298 +241 G 0.279 +242 A 0.242 +243 W 0.195 +244 D 0.154 +245 C 0.135 +246 S 0.135 +247 V 0.137 +248 E 0.134 +249 N 0.135 +250 G 0.143 +251 G 0.147 +252 C 0.140 +253 E 0.133 +254 H 0.142 +255 A 0.166 +256 C 0.186 +257 N 0.193 +258 A 0.196 +259 I 0.194 +260 P 0.182 +261 G 0.166 +262 A 0.149 +263 P 0.128 +264 R 0.109 +265 C 0.101 +266 Q 0.109 +267 C 0.129 +268 P 0.149 +269 A 0.156 +270 G 0.148 +271 A 0.136 +272 A 0.131 +273 L 0.133 +274 Q 0.134 +275 A 0.130 +276 D 0.122 +277 G 0.117 +278 R 0.121 +279 S 0.139 +280 C 0.179 +281 T 0.244 +282 A 0.314 +283 S 0.361 +284 A 0.369 +285 T 0.344 +286 Q 0.298 +287 S 0.248 +288 C 0.209 +289 N 0.187 +290 D 0.172 +291 L 0.150 +292 C 0.126 +293 E 0.111 +294 H 0.112 +295 F 0.132 +296 C 0.162 +297 V 0.190 +298 P 0.207 +299 N 0.207 +300 P 0.192 +301 D 0.179 +302 Q 0.180 +303 P 0.183 +304 G 0.170 +305 S 0.143 +306 Y 0.115 +307 S 0.099 +308 C 0.096 +309 M 0.103 +310 C 0.115 +311 E 0.126 +312 T 0.130 +313 G 0.127 +314 Y 0.128 +315 R 0.135 +316 L 0.139 +317 A 0.135 +318 A 0.125 +319 D 0.115 +320 Q 0.116 +321 H 0.128 +322 R 0.142 +323 C 0.149 +324 E 0.149 +325 D 0.149 +326 V 0.152 +327 D 0.157 +328 D 0.158 +329 C 0.151 +330 I 0.140 +331 L 0.131 +332 E 0.128 +333 P 0.132 +334 S 0.140 +335 P 0.145 +336 C 0.140 +337 P 0.125 +338 Q 0.112 +339 R 0.111 +340 C 0.122 +341 V 0.140 +342 N 0.163 +343 T 0.189 +344 Q 0.206 +345 G 0.202 +346 G 0.177 +347 F 0.145 +348 E 0.118 +349 C 0.101 +350 H 0.098 +351 C 0.112 +352 Y 0.141 +353 P 0.169 +354 N 0.183 +355 Y 0.187 +356 D 0.189 +357 L 0.191 +358 V 0.189 +359 D 0.187 +360 G 0.186 +361 E 0.188 +362 C 0.202 +363 V 0.240 +364 E 0.293 +365 P 0.324 +366 V 0.305 +367 D 0.243 +368 P 0.176 +369 C 0.135 +370 F 0.123 +371 R 0.125 +372 A 0.125 +373 N 0.119 +374 C 0.113 +375 E 0.110 +376 Y 0.114 +377 Q 0.129 +378 C 0.149 +379 Q 0.161 +380 P 0.159 +381 L 0.148 +382 N 0.137 +383 Q 0.132 +384 T 0.128 +385 S 0.121 +386 Y 0.109 +387 L 0.095 +388 C 0.089 +389 V 0.097 +390 C 0.118 +391 A 0.141 +392 E 0.150 +393 G 0.145 +394 F 0.138 +395 A 0.138 +396 P 0.143 +397 I 0.148 +398 P 0.147 +399 H 0.137 +400 E 0.123 +401 P 0.113 +402 H 0.112 +403 R 0.117 +404 C 0.126 +405 Q 0.138 +406 M 0.153 +407 F 0.163 +408 C 0.171 +409 N 0.185 +410 Q 0.205 +411 T 0.228 +412 A 0.247 +413 C 0.258 +414 P 0.265 +415 A 0.274 +416 D 0.280 +417 C 0.272 +418 D 0.250 +419 P 0.230 +420 N 0.221 +421 T 0.216 +422 Q 0.205 +423 A 0.188 +424 S 0.174 +425 C 0.173 +426 E 0.189 +427 C 0.215 +428 P 0.241 +429 E 0.251 +430 G 0.243 +431 Y 0.239 +432 I 0.250 +433 L 0.265 +434 D 0.261 +435 D 0.234 +436 G 0.200 +437 F 0.179 +438 I 0.171 +439 C 0.166 +440 T 0.157 +441 D 0.147 +442 I 0.140 +443 D 0.139 +444 E 0.146 +445 C 0.161 +446 E 0.185 +447 N 0.218 +448 G 0.244 +449 G 0.246 +450 F 0.224 +451 C 0.198 +452 S 0.186 +453 G 0.185 +454 V 0.189 +455 C 0.195 +456 H 0.207 +457 N 0.229 +458 L 0.257 +459 P 0.267 +460 G 0.248 +461 T 0.210 +462 F 0.174 +463 E 0.154 +464 C 0.155 +465 I 0.188 +466 C 0.253 +467 G 0.322 +468 P 0.364 +469 D 0.369 +470 S 0.357 +471 A 0.349 +472 L 0.355 +473 A 0.365 +474 R 0.371 +475 H 0.373 +476 I 0.380 +477 G 0.399 +478 T 0.438 +479 D 0.496 +480 C 0.562 +481 D 0.624 +482 S 0.672 +483 G 0.703 +484 K 0.721 +485 V 0.735 +486 D 0.747 +487 G 0.753 +488 G 0.754 +489 D 0.753 +490 S 0.747 +491 G 0.734 +492 S 0.711 +493 G 0.680 +494 E 0.648 +495 P 0.622 +496 P 0.610 +497 P 0.612 +498 S 0.628 +499 P 0.653 +500 T 0.687 +501 P 0.722 +502 G 0.745 +503 S 0.747 +504 T 0.733 +505 L 0.717 +506 T 0.715 +507 P 0.733 +508 P 0.761 +509 A 0.786 +510 V 0.800 +511 G 0.804 +512 L 0.802 +513 V 0.795 +514 H 0.787 +515 S 0.780 +516 G 0.775 +517 L 0.772 +518 L 0.768 +519 I 0.757 +520 G 0.731 +521 I 0.690 +522 S 0.641 +523 I 0.595 +524 A 0.563 +525 S 0.529 +526 L 0.479 +527 C 0.437 +528 L 0.424 +529 V 0.412 +530 V 0.373 +531 A 0.318 +532 L 0.273 +533 L 0.238 +534 A 0.206 +535 L 0.181 +536 L 0.167 +537 C 0.168 +538 H 0.182 +539 L 0.209 +540 R 0.243 +541 K 0.282 +542 K 0.335 +543 Q 0.399 +544 G 0.463 +545 A 0.509 +546 A 0.534 +547 R 0.547 +548 A 0.553 +549 K 0.554 +550 M 0.543 +551 E 0.522 +552 Y 0.503 +553 K 0.504 +554 C 0.528 +555 A 0.564 +556 A 0.598 +557 P 0.624 +558 S 0.639 +559 K 0.643 +560 E 0.632 +561 V 0.605 +562 V 0.563 +563 L 0.527 +564 Q 0.520 +565 H 0.535 +566 V 0.537 +567 R 0.522 +568 T 0.517 +569 E 0.526 +570 R 0.523 +571 T 0.493 +572 P 0.446 +573 Q 0.401 +574 R 0.368 +575 L 0.352 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000178726.7_ENST00000377103.3_GN:THBD_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:56.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000178726.7_ENST00000377103.3_GN:THBD_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:56.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1d3f7b70cbb129407802f87d7804a1e704f4e62e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000178726.7_ENST00000377103.3_GN:THBD_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:56.caid @@ -0,0 +1,632 @@ +>ENSG00000178726.7|ENST00000377103.3|GN:THBD|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:56 +1 M 0.316 +2 S 0.322 +3 E 0.332 +4 A 0.340 +5 A 0.342 +6 S 0.343 +7 Q 0.355 +8 G 0.364 +9 L 0.342 +10 R 0.310 +11 A 0.309 +12 A 0.332 +13 A 0.347 +14 R 0.362 +15 S 0.401 +16 V 0.458 +17 W 0.516 +18 A 0.572 +19 G 0.614 +20 T 0.625 +21 D 0.605 +22 R 0.581 +23 R 0.581 +24 G 0.599 +25 C 0.606 +26 R 0.592 +27 H 0.569 +28 R 0.553 +29 R 0.557 +30 P 0.584 +31 V 0.625 +32 P 0.666 +33 L 0.695 +34 C 0.710 +35 S 0.711 +36 G 0.705 +37 T 0.694 +38 A 0.664 +39 L 0.606 +40 S 0.555 +41 Q 0.547 +42 C 0.567 +43 P 0.582 +44 R 0.587 +45 F 0.590 +46 P 0.577 +47 R 0.547 +48 R 0.535 +49 L 0.567 +50 H 0.615 +51 A 0.647 +52 A 0.665 +53 R 0.686 +54 L 0.706 +55 G 0.717 +56 N 0.714 +57 M 0.696 +58 L 0.669 +59 G 0.637 +60 V 0.591 +61 L 0.525 +62 V 0.461 +63 L 0.436 +64 G 0.450 +65 A 0.461 +66 L 0.454 +67 A 0.456 +68 L 0.479 +69 A 0.506 +70 G 0.522 +71 L 0.528 +72 G 0.529 +73 F 0.532 +74 P 0.543 +75 A 0.556 +76 P 0.559 +77 A 0.547 +78 E 0.529 +79 P 0.513 +80 Q 0.492 +81 P 0.452 +82 G 0.382 +83 G 0.285 +84 S 0.183 +85 Q 0.111 +86 C 0.076 +87 V 0.062 +88 E 0.050 +89 H 0.039 +90 D 0.034 +91 C 0.033 +92 F 0.037 +93 A 0.048 +94 L 0.067 +95 Y 0.089 +96 P 0.101 +97 G 0.094 +98 P 0.075 +99 A 0.056 +100 T 0.043 +101 F 0.034 +102 L 0.032 +103 N 0.037 +104 A 0.047 +105 S 0.060 +106 Q 0.067 +107 I 0.064 +108 C 0.060 +109 D 0.062 +110 G 0.069 +111 L 0.075 +112 R 0.075 +113 G 0.070 +114 H 0.066 +115 L 0.066 +116 M 0.073 +117 T 0.085 +118 V 0.093 +119 R 0.092 +120 S 0.078 +121 S 0.057 +122 V 0.037 +123 A 0.026 +124 A 0.024 +125 D 0.025 +126 V 0.026 +127 I 0.027 +128 S 0.030 +129 L 0.040 +130 L 0.062 +131 L 0.097 +132 N 0.144 +133 G 0.193 +134 D 0.231 +135 G 0.245 +136 G 0.232 +137 V 0.197 +138 G 0.151 +139 R 0.108 +140 R 0.075 +141 R 0.052 +142 L 0.036 +143 W 0.026 +144 I 0.026 +145 G 0.034 +146 L 0.045 +147 Q 0.060 +148 L 0.077 +149 P 0.094 +150 P 0.112 +151 G 0.136 +152 C 0.166 +153 G 0.190 +154 D 0.199 +155 P 0.198 +156 K 0.195 +157 R 0.193 +158 L 0.190 +159 G 0.186 +160 P 0.180 +161 L 0.166 +162 R 0.142 +163 G 0.112 +164 F 0.083 +165 Q 0.060 +166 W 0.050 +167 V 0.052 +168 T 0.065 +169 G 0.085 +170 D 0.106 +171 N 0.122 +172 N 0.131 +173 T 0.128 +174 S 0.114 +175 Y 0.101 +176 S 0.096 +177 R 0.098 +178 W 0.109 +179 A 0.132 +180 R 0.169 +181 L 0.211 +182 D 0.243 +183 L 0.262 +184 N 0.272 +185 G 0.273 +186 A 0.255 +187 P 0.213 +188 L 0.160 +189 C 0.114 +190 G 0.086 +191 P 0.071 +192 L 0.063 +193 C 0.057 +194 V 0.053 +195 A 0.052 +196 V 0.061 +197 S 0.085 +198 A 0.123 +199 A 0.170 +200 E 0.219 +201 A 0.262 +202 T 0.293 +203 V 0.305 +204 P 0.294 +205 S 0.265 +206 E 0.223 +207 P 0.175 +208 I 0.133 +209 W 0.104 +210 E 0.086 +211 E 0.073 +212 Q 0.064 +213 Q 0.057 +214 C 0.054 +215 E 0.057 +216 V 0.062 +217 K 0.066 +218 A 0.067 +219 D 0.066 +220 G 0.062 +221 F 0.056 +222 L 0.052 +223 C 0.051 +224 E 0.055 +225 F 0.062 +226 H 0.072 +227 F 0.079 +228 P 0.081 +229 A 0.076 +230 T 0.071 +231 C 0.079 +232 R 0.101 +233 P 0.135 +234 L 0.172 +235 A 0.207 +236 V 0.235 +237 E 0.249 +238 P 0.244 +239 G 0.225 +240 A 0.205 +241 A 0.189 +242 A 0.168 +243 A 0.140 +244 A 0.114 +245 V 0.095 +246 S 0.085 +247 I 0.081 +248 T 0.082 +249 Y 0.091 +250 G 0.106 +251 T 0.122 +252 P 0.138 +253 F 0.158 +254 A 0.182 +255 A 0.205 +256 R 0.222 +257 G 0.224 +258 A 0.203 +259 D 0.164 +260 F 0.124 +261 Q 0.094 +262 A 0.076 +263 L 0.068 +264 P 0.066 +265 V 0.068 +266 G 0.071 +267 S 0.074 +268 S 0.076 +269 A 0.076 +270 A 0.079 +271 V 0.086 +272 A 0.097 +273 P 0.114 +274 L 0.132 +275 G 0.146 +276 L 0.149 +277 Q 0.137 +278 L 0.118 +279 M 0.106 +280 C 0.109 +281 T 0.128 +282 A 0.156 +283 P 0.181 +284 P 0.188 +285 G 0.173 +286 A 0.147 +287 V 0.127 +288 Q 0.122 +289 G 0.126 +290 H 0.130 +291 W 0.138 +292 A 0.163 +293 R 0.211 +294 E 0.271 +295 A 0.316 +296 P 0.332 +297 G 0.321 +298 A 0.288 +299 W 0.238 +300 D 0.191 +301 C 0.164 +302 S 0.158 +303 V 0.158 +304 E 0.155 +305 N 0.156 +306 G 0.164 +307 G 0.167 +308 C 0.160 +309 E 0.154 +310 H 0.167 +311 A 0.193 +312 C 0.214 +313 N 0.224 +314 A 0.231 +315 I 0.233 +316 P 0.221 +317 G 0.201 +318 A 0.179 +319 P 0.153 +320 R 0.130 +321 C 0.121 +322 Q 0.132 +323 C 0.157 +324 P 0.183 +325 A 0.193 +326 G 0.184 +327 A 0.170 +328 A 0.164 +329 L 0.166 +330 Q 0.166 +331 A 0.159 +332 D 0.148 +333 G 0.140 +334 R 0.145 +335 S 0.166 +336 C 0.210 +337 T 0.278 +338 A 0.352 +339 S 0.401 +340 A 0.408 +341 T 0.379 +342 Q 0.332 +343 S 0.280 +344 C 0.240 +345 N 0.218 +346 D 0.200 +347 L 0.173 +348 C 0.143 +349 E 0.124 +350 H 0.126 +351 F 0.148 +352 C 0.181 +353 V 0.212 +354 P 0.231 +355 N 0.231 +356 P 0.214 +357 D 0.200 +358 Q 0.200 +359 P 0.200 +360 G 0.185 +361 S 0.156 +362 Y 0.128 +363 S 0.109 +364 C 0.104 +365 M 0.109 +366 C 0.124 +367 E 0.139 +368 T 0.144 +369 G 0.141 +370 Y 0.142 +371 R 0.149 +372 L 0.153 +373 A 0.148 +374 A 0.134 +375 D 0.123 +376 Q 0.124 +377 H 0.139 +378 R 0.155 +379 C 0.163 +380 E 0.162 +381 D 0.159 +382 V 0.159 +383 D 0.162 +384 D 0.160 +385 C 0.151 +386 I 0.138 +387 L 0.128 +388 E 0.122 +389 P 0.124 +390 S 0.130 +391 P 0.134 +392 C 0.131 +393 P 0.119 +394 Q 0.108 +395 R 0.110 +396 C 0.123 +397 V 0.141 +398 N 0.164 +399 T 0.190 +400 Q 0.207 +401 G 0.202 +402 G 0.176 +403 F 0.141 +404 E 0.110 +405 C 0.091 +406 H 0.086 +407 C 0.100 +408 Y 0.128 +409 P 0.155 +410 N 0.168 +411 Y 0.171 +412 D 0.172 +413 L 0.174 +414 V 0.173 +415 D 0.172 +416 G 0.172 +417 E 0.175 +418 C 0.191 +419 V 0.233 +420 E 0.289 +421 P 0.323 +422 V 0.305 +423 D 0.244 +424 P 0.178 +425 C 0.136 +426 F 0.123 +427 R 0.124 +428 A 0.124 +429 N 0.119 +430 C 0.112 +431 E 0.107 +432 Y 0.109 +433 Q 0.123 +434 C 0.144 +435 Q 0.159 +436 P 0.159 +437 L 0.150 +438 N 0.139 +439 Q 0.133 +440 T 0.130 +441 S 0.123 +442 Y 0.112 +443 L 0.100 +444 C 0.094 +445 V 0.102 +446 C 0.122 +447 A 0.145 +448 E 0.154 +449 G 0.149 +450 F 0.141 +451 A 0.139 +452 P 0.144 +453 I 0.148 +454 P 0.147 +455 H 0.138 +456 E 0.126 +457 P 0.118 +458 H 0.119 +459 R 0.125 +460 C 0.132 +461 Q 0.143 +462 M 0.156 +463 F 0.168 +464 C 0.177 +465 N 0.192 +466 Q 0.214 +467 T 0.237 +468 A 0.255 +469 C 0.268 +470 P 0.277 +471 A 0.287 +472 D 0.291 +473 C 0.280 +474 D 0.256 +475 P 0.236 +476 N 0.227 +477 T 0.222 +478 Q 0.212 +479 A 0.196 +480 S 0.186 +481 C 0.190 +482 E 0.208 +483 C 0.232 +484 P 0.253 +485 E 0.259 +486 G 0.251 +487 Y 0.253 +488 I 0.275 +489 L 0.297 +490 D 0.295 +491 D 0.266 +492 G 0.230 +493 F 0.205 +494 I 0.192 +495 C 0.183 +496 T 0.170 +497 D 0.156 +498 I 0.148 +499 D 0.146 +500 E 0.153 +501 C 0.168 +502 E 0.193 +503 N 0.228 +504 G 0.255 +505 G 0.256 +506 F 0.234 +507 C 0.209 +508 S 0.198 +509 G 0.197 +510 V 0.201 +511 C 0.209 +512 H 0.222 +513 N 0.248 +514 L 0.279 +515 P 0.291 +516 G 0.270 +517 T 0.227 +518 F 0.186 +519 E 0.161 +520 C 0.160 +521 I 0.191 +522 C 0.254 +523 G 0.323 +524 P 0.363 +525 D 0.365 +526 S 0.349 +527 A 0.340 +528 L 0.345 +529 A 0.355 +530 R 0.358 +531 H 0.355 +532 I 0.359 +533 G 0.380 +534 T 0.425 +535 D 0.488 +536 C 0.557 +537 D 0.620 +538 S 0.671 +539 G 0.702 +540 K 0.720 +541 V 0.734 +542 D 0.746 +543 G 0.752 +544 G 0.754 +545 D 0.753 +546 S 0.748 +547 G 0.735 +548 S 0.713 +549 G 0.685 +550 E 0.657 +551 P 0.636 +552 P 0.626 +553 P 0.628 +554 S 0.642 +555 P 0.666 +556 T 0.697 +557 P 0.730 +558 G 0.751 +559 S 0.752 +560 T 0.738 +561 L 0.722 +562 T 0.719 +563 P 0.735 +564 P 0.761 +565 A 0.784 +566 V 0.796 +567 G 0.799 +568 L 0.794 +569 V 0.785 +570 H 0.776 +571 S 0.768 +572 G 0.762 +573 L 0.758 +574 L 0.754 +575 I 0.743 +576 G 0.719 +577 I 0.681 +578 S 0.635 +579 I 0.593 +580 A 0.564 +581 S 0.531 +582 L 0.481 +583 C 0.436 +584 L 0.417 +585 V 0.403 +586 V 0.362 +587 A 0.308 +588 L 0.264 +589 L 0.231 +590 A 0.200 +591 L 0.176 +592 L 0.164 +593 C 0.164 +594 H 0.178 +595 L 0.204 +596 R 0.237 +597 K 0.279 +598 K 0.331 +599 Q 0.394 +600 G 0.455 +601 A 0.498 +602 A 0.519 +603 R 0.524 +604 A 0.517 +605 K 0.505 +606 M 0.489 +607 E 0.467 +608 Y 0.449 +609 K 0.453 +610 C 0.485 +611 A 0.531 +612 A 0.569 +613 P 0.591 +614 S 0.599 +615 K 0.595 +616 E 0.576 +617 V 0.539 +618 V 0.487 +619 L 0.446 +620 Q 0.436 +621 H 0.446 +622 V 0.439 +623 R 0.412 +624 T 0.396 +625 E 0.400 +626 R 0.403 +627 T 0.385 +628 P 0.351 +629 Q 0.315 +630 R 0.284 +631 L 0.267 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000179639.11_ENST00000693622.1_GN:FCER1A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000179639.11_ENST00000693622.1_GN:FCER1A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0feec6480c6785a1b99ddcba8d07f02c070177e2 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000179639.11_ENST00000693622.1_GN:FCER1A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,258 @@ +>ENSG00000179639.11|ENST00000693622.1|GN:FCER1A|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.448 +2 A 0.489 +3 P 0.547 +4 A 0.592 +5 M 0.615 +6 E 0.621 +7 S 0.613 +8 P 0.575 +9 T 0.500 +10 L 0.423 +11 L 0.382 +12 C 0.367 +13 V 0.345 +14 A 0.321 +15 L 0.324 +16 L 0.353 +17 F 0.396 +18 F 0.451 +19 A 0.521 +20 P 0.594 +21 D 0.651 +22 G 0.681 +23 V 0.684 +24 L 0.659 +25 A 0.605 +26 V 0.522 +27 P 0.417 +28 Q 0.310 +29 K 0.217 +30 P 0.147 +31 K 0.102 +32 V 0.078 +33 S 0.067 +34 L 0.060 +35 N 0.055 +36 P 0.055 +37 P 0.057 +38 W 0.055 +39 N 0.049 +40 R 0.043 +41 I 0.043 +42 F 0.049 +43 K 0.057 +44 G 0.059 +45 E 0.055 +46 N 0.049 +47 V 0.046 +48 T 0.043 +49 L 0.042 +50 T 0.045 +51 C 0.056 +52 N 0.078 +53 G 0.106 +54 N 0.133 +55 N 0.150 +56 F 0.156 +57 F 0.154 +58 E 0.148 +59 V 0.136 +60 S 0.114 +61 S 0.084 +62 T 0.058 +63 K 0.042 +64 W 0.038 +65 F 0.043 +66 H 0.054 +67 N 0.068 +68 G 0.081 +69 S 0.089 +70 L 0.089 +71 S 0.082 +72 E 0.072 +73 E 0.065 +74 T 0.060 +75 N 0.056 +76 S 0.053 +77 S 0.053 +78 L 0.058 +79 N 0.063 +80 I 0.068 +81 V 0.071 +82 N 0.071 +83 A 0.067 +84 K 0.063 +85 F 0.062 +86 E 0.067 +87 D 0.075 +88 S 0.082 +89 G 0.080 +90 E 0.065 +91 Y 0.045 +92 K 0.033 +93 C 0.033 +94 Q 0.039 +95 H 0.046 +96 Q 0.056 +97 Q 0.067 +98 V 0.075 +99 N 0.073 +100 E 0.066 +101 S 0.062 +102 E 0.062 +103 P 0.062 +104 V 0.059 +105 Y 0.058 +106 L 0.061 +107 E 0.067 +108 V 0.069 +109 F 0.065 +110 S 0.060 +111 D 0.055 +112 W 0.051 +113 L 0.050 +114 L 0.053 +115 L 0.059 +116 Q 0.064 +117 A 0.066 +118 S 0.071 +119 A 0.078 +120 E 0.081 +121 V 0.077 +122 V 0.070 +123 M 0.071 +124 E 0.080 +125 G 0.088 +126 Q 0.083 +127 P 0.067 +128 L 0.050 +129 F 0.039 +130 L 0.036 +131 R 0.039 +132 C 0.045 +133 H 0.053 +134 G 0.058 +135 W 0.060 +136 R 0.063 +137 N 0.072 +138 W 0.084 +139 D 0.092 +140 V 0.084 +141 Y 0.064 +142 K 0.042 +143 V 0.028 +144 I 0.023 +145 Y 0.026 +146 Y 0.036 +147 K 0.049 +148 D 0.062 +149 G 0.073 +150 E 0.077 +151 A 0.070 +152 L 0.056 +153 K 0.043 +154 Y 0.036 +155 W 0.036 +156 Y 0.038 +157 E 0.040 +158 N 0.041 +159 H 0.040 +160 N 0.037 +161 I 0.037 +162 S 0.041 +163 I 0.046 +164 T 0.051 +165 N 0.059 +166 A 0.067 +167 T 0.074 +168 V 0.077 +169 E 0.080 +170 D 0.086 +171 S 0.093 +172 G 0.090 +173 T 0.070 +174 Y 0.045 +175 Y 0.029 +176 C 0.024 +177 T 0.026 +178 G 0.030 +179 K 0.033 +180 V 0.037 +181 W 0.042 +182 Q 0.050 +183 L 0.061 +184 D 0.070 +185 Y 0.074 +186 E 0.072 +187 S 0.072 +188 E 0.074 +189 P 0.075 +190 L 0.074 +191 N 0.071 +192 I 0.071 +193 T 0.080 +194 V 0.106 +195 I 0.157 +196 K 0.234 +197 A 0.319 +198 P 0.382 +199 R 0.404 +200 E 0.388 +201 K 0.349 +202 Y 0.305 +203 W 0.271 +204 L 0.259 +205 Q 0.269 +206 F 0.286 +207 F 0.294 +208 I 0.282 +209 P 0.260 +210 L 0.244 +211 L 0.238 +212 V 0.231 +213 V 0.222 +214 I 0.224 +215 L 0.240 +216 F 0.258 +217 A 0.276 +218 V 0.294 +219 D 0.309 +220 T 0.313 +221 G 0.303 +222 L 0.276 +223 F 0.248 +224 I 0.233 +225 S 0.232 +226 T 0.231 +227 Q 0.226 +228 Q 0.226 +229 Q 0.232 +230 V 0.234 +231 T 0.224 +232 F 0.210 +233 L 0.207 +234 L 0.221 +235 K 0.246 +236 I 0.268 +237 K 0.282 +238 R 0.297 +239 T 0.327 +240 R 0.372 +241 K 0.433 +242 G 0.499 +243 F 0.546 +244 R 0.565 +245 L 0.561 +246 L 0.541 +247 N 0.520 +248 P 0.511 +249 H 0.518 +250 P 0.532 +251 K 0.550 +252 P 0.573 +253 N 0.603 +254 P 0.622 +255 K 0.611 +256 N 0.565 +257 N 0.520 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000179639.11_ENST00000693622.1_GN:FCER1A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000179639.11_ENST00000693622.1_GN:FCER1A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..3b7198961b216c1b459d89d1d1b0b8c4808eff23 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000179639.11_ENST00000693622.1_GN:FCER1A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid @@ -0,0 +1,261 @@ +>ENSG00000179639.11|ENST00000693622.1|GN:FCER1A|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 +1 M 0.393 +2 K 0.395 +3 K 0.423 +4 M 0.489 +5 A 0.568 +6 P 0.626 +7 A 0.655 +8 M 0.662 +9 E 0.656 +10 S 0.635 +11 P 0.579 +12 T 0.484 +13 L 0.386 +14 L 0.342 +15 C 0.345 +16 V 0.345 +17 A 0.330 +18 L 0.330 +19 L 0.357 +20 F 0.400 +21 F 0.456 +22 A 0.526 +23 P 0.598 +24 D 0.655 +25 G 0.685 +26 V 0.687 +27 L 0.660 +28 A 0.604 +29 V 0.520 +30 P 0.415 +31 Q 0.308 +32 K 0.215 +33 P 0.146 +34 K 0.101 +35 V 0.078 +36 S 0.067 +37 L 0.060 +38 N 0.055 +39 P 0.055 +40 P 0.057 +41 W 0.055 +42 N 0.049 +43 R 0.043 +44 I 0.042 +45 F 0.049 +46 K 0.057 +47 G 0.059 +48 E 0.054 +49 N 0.049 +50 V 0.046 +51 T 0.043 +52 L 0.042 +53 T 0.045 +54 C 0.056 +55 N 0.077 +56 G 0.106 +57 N 0.133 +58 N 0.150 +59 F 0.156 +60 F 0.154 +61 E 0.147 +62 V 0.135 +63 S 0.114 +64 S 0.084 +65 T 0.057 +66 K 0.041 +67 W 0.037 +68 F 0.043 +69 H 0.053 +70 N 0.067 +71 G 0.080 +72 S 0.088 +73 L 0.089 +74 S 0.082 +75 E 0.072 +76 E 0.065 +77 T 0.060 +78 N 0.056 +79 S 0.052 +80 S 0.053 +81 L 0.057 +82 N 0.063 +83 I 0.067 +84 V 0.070 +85 N 0.070 +86 A 0.067 +87 K 0.063 +88 F 0.063 +89 E 0.067 +90 D 0.075 +91 S 0.082 +92 G 0.080 +93 E 0.065 +94 Y 0.045 +95 K 0.033 +96 C 0.033 +97 Q 0.039 +98 H 0.046 +99 Q 0.056 +100 Q 0.068 +101 V 0.075 +102 N 0.073 +103 E 0.066 +104 S 0.062 +105 E 0.062 +106 P 0.061 +107 V 0.059 +108 Y 0.057 +109 L 0.060 +110 E 0.066 +111 V 0.068 +112 F 0.065 +113 S 0.061 +114 D 0.056 +115 W 0.051 +116 L 0.051 +117 L 0.054 +118 L 0.059 +119 Q 0.064 +120 A 0.067 +121 S 0.071 +122 A 0.078 +123 E 0.082 +124 V 0.077 +125 V 0.070 +126 M 0.071 +127 E 0.081 +128 G 0.088 +129 Q 0.084 +130 P 0.068 +131 L 0.050 +132 F 0.039 +133 L 0.037 +134 R 0.040 +135 C 0.046 +136 H 0.053 +137 G 0.058 +138 W 0.061 +139 R 0.064 +140 N 0.072 +141 W 0.085 +142 D 0.092 +143 V 0.085 +144 Y 0.064 +145 K 0.042 +146 V 0.028 +147 I 0.023 +148 Y 0.026 +149 Y 0.036 +150 K 0.049 +151 D 0.063 +152 G 0.073 +153 E 0.077 +154 A 0.070 +155 L 0.056 +156 K 0.043 +157 Y 0.036 +158 W 0.036 +159 Y 0.038 +160 E 0.041 +161 N 0.042 +162 H 0.040 +163 N 0.037 +164 I 0.037 +165 S 0.041 +166 I 0.046 +167 T 0.051 +168 N 0.059 +169 A 0.067 +170 T 0.074 +171 V 0.077 +172 E 0.080 +173 D 0.086 +174 S 0.093 +175 G 0.090 +176 T 0.070 +177 Y 0.045 +178 Y 0.029 +179 C 0.024 +180 T 0.026 +181 G 0.030 +182 K 0.033 +183 V 0.036 +184 W 0.041 +185 Q 0.049 +186 L 0.060 +187 D 0.069 +188 Y 0.073 +189 E 0.072 +190 S 0.071 +191 E 0.074 +192 P 0.075 +193 L 0.073 +194 N 0.071 +195 I 0.071 +196 T 0.080 +197 V 0.106 +198 I 0.157 +199 K 0.234 +200 A 0.318 +201 P 0.382 +202 R 0.405 +203 E 0.389 +204 K 0.349 +205 Y 0.305 +206 W 0.271 +207 L 0.259 +208 Q 0.269 +209 F 0.286 +210 F 0.294 +211 I 0.283 +212 P 0.261 +213 L 0.245 +214 L 0.240 +215 V 0.233 +216 V 0.223 +217 I 0.225 +218 L 0.241 +219 F 0.262 +220 A 0.282 +221 V 0.302 +222 D 0.317 +223 T 0.322 +224 G 0.311 +225 L 0.284 +226 F 0.255 +227 I 0.240 +228 S 0.237 +229 T 0.236 +230 Q 0.231 +231 Q 0.231 +232 Q 0.238 +233 V 0.240 +234 T 0.229 +235 F 0.216 +236 L 0.213 +237 L 0.226 +238 K 0.250 +239 I 0.272 +240 K 0.284 +241 R 0.299 +242 T 0.328 +243 R 0.373 +244 K 0.433 +245 G 0.498 +246 F 0.545 +247 R 0.564 +248 L 0.560 +249 L 0.540 +250 N 0.518 +251 P 0.509 +252 H 0.516 +253 P 0.531 +254 K 0.549 +255 P 0.574 +256 N 0.603 +257 P 0.622 +258 K 0.611 +259 N 0.566 +260 N 0.520 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000180383.4_ENST00000317676.3_GN:DEFB124_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000180383.4_ENST00000317676.3_GN:DEFB124_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ba9b083ded721060be87f2c2147b14cff8c4d87f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000180383.4_ENST00000317676.3_GN:DEFB124_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,72 @@ +>ENSG00000180383.4|ENST00000317676.3|GN:DEFB124|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.225 +2 T 0.198 +3 Q 0.161 +4 L 0.134 +5 L 0.127 +6 L 0.134 +7 F 0.142 +8 L 0.144 +9 V 0.141 +10 A 0.139 +11 L 0.146 +12 L 0.172 +13 V 0.219 +14 L 0.281 +15 G 0.346 +16 H 0.406 +17 V 0.461 +18 P 0.511 +19 S 0.547 +20 G 0.553 +21 R 0.521 +22 S 0.455 +23 E 0.367 +24 F 0.270 +25 K 0.179 +26 R 0.112 +27 C 0.076 +28 W 0.071 +29 K 0.088 +30 G 0.108 +31 Q 0.118 +32 G 0.114 +33 A 0.102 +34 C 0.091 +35 Q 0.086 +36 T 0.089 +37 Y 0.098 +38 C 0.103 +39 T 0.101 +40 R 0.095 +41 Q 0.089 +42 E 0.086 +43 T 0.082 +44 Y 0.077 +45 M 0.070 +46 H 0.062 +47 L 0.060 +48 C 0.067 +49 P 0.078 +50 D 0.085 +51 A 0.086 +52 S 0.079 +53 L 0.071 +54 C 0.069 +55 C 0.083 +56 L 0.121 +57 S 0.191 +58 Y 0.286 +59 A 0.383 +60 L 0.454 +61 K 0.493 +62 P 0.519 +63 P 0.550 +64 P 0.585 +65 V 0.615 +66 P 0.634 +67 K 0.640 +68 H 0.633 +69 E 0.604 +70 Y 0.552 +71 E 0.506 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000180383.4_ENST00000317676.3_GN:DEFB124_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000180383.4_ENST00000317676.3_GN:DEFB124_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..09cbface61bb5356e2f391b62a788296ee26701e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000180383.4_ENST00000317676.3_GN:DEFB124_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid @@ -0,0 +1,89 @@ +>ENSG00000180383.4|ENST00000317676.3|GN:DEFB124|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:17 +1 M 0.461 +2 A 0.492 +3 E 0.545 +4 K 0.605 +5 K 0.653 +6 N 0.680 +7 A 0.694 +8 P 0.700 +9 S 0.695 +10 S 0.671 +11 L 0.632 +12 P 0.588 +13 R 0.540 +14 S 0.477 +15 P 0.394 +16 V 0.310 +17 A 0.248 +18 M 0.208 +19 T 0.180 +20 Q 0.156 +21 L 0.138 +22 L 0.129 +23 L 0.131 +24 F 0.137 +25 L 0.141 +26 V 0.142 +27 A 0.138 +28 L 0.133 +29 L 0.144 +30 V 0.181 +31 L 0.241 +32 G 0.313 +33 H 0.386 +34 V 0.452 +35 P 0.505 +36 S 0.536 +37 G 0.534 +38 R 0.495 +39 S 0.428 +40 E 0.347 +41 F 0.258 +42 K 0.174 +43 R 0.108 +44 C 0.073 +45 W 0.068 +46 K 0.084 +47 G 0.104 +48 Q 0.113 +49 G 0.109 +50 A 0.099 +51 C 0.088 +52 Q 0.084 +53 T 0.088 +54 Y 0.097 +55 C 0.102 +56 T 0.101 +57 R 0.096 +58 Q 0.090 +59 E 0.086 +60 T 0.083 +61 Y 0.078 +62 M 0.070 +63 H 0.062 +64 L 0.058 +65 C 0.064 +66 P 0.075 +67 D 0.082 +68 A 0.083 +69 S 0.077 +70 L 0.069 +71 C 0.067 +72 C 0.081 +73 L 0.120 +74 S 0.193 +75 Y 0.293 +76 A 0.396 +77 L 0.469 +78 K 0.508 +79 P 0.533 +80 P 0.564 +81 P 0.598 +82 V 0.627 +83 P 0.643 +84 K 0.647 +85 H 0.638 +86 E 0.608 +87 Y 0.556 +88 E 0.510 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000180433.6_ENST00000641861.1_GN:OR6K6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000180433.6_ENST00000641861.1_GN:OR6K6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4de259c43b4950f23e91f66363c5dcf55aefb6bf --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000180433.6_ENST00000641861.1_GN:OR6K6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,320 @@ +>ENSG00000180433.6|ENST00000641861.1|GN:OR6K6|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.338 +2 T 0.347 +3 Q 0.383 +4 L 0.450 +5 T 0.516 +6 A 0.555 +7 S 0.571 +8 G 0.574 +9 N 0.557 +10 Q 0.510 +11 T 0.436 +12 M 0.347 +13 V 0.259 +14 T 0.188 +15 E 0.140 +16 F 0.113 +17 L 0.103 +18 F 0.109 +19 S 0.134 +20 M 0.175 +21 F 0.222 +22 P 0.260 +23 H 0.285 +24 A 0.297 +25 H 0.290 +26 R 0.263 +27 G 0.218 +28 G 0.163 +29 L 0.112 +30 L 0.076 +31 F 0.058 +32 F 0.050 +33 I 0.046 +34 P 0.044 +35 L 0.042 +36 L 0.042 +37 L 0.045 +38 I 0.051 +39 Y 0.054 +40 G 0.055 +41 F 0.058 +42 I 0.060 +43 L 0.060 +44 T 0.058 +45 G 0.059 +46 N 0.062 +47 L 0.065 +48 I 0.065 +49 M 0.059 +50 F 0.050 +51 I 0.048 +52 V 0.051 +53 I 0.056 +54 Q 0.064 +55 V 0.074 +56 G 0.085 +57 M 0.092 +58 A 0.093 +59 L 0.086 +60 H 0.073 +61 T 0.058 +62 P 0.045 +63 L 0.033 +64 Y 0.025 +65 F 0.021 +66 F 0.021 +67 I 0.026 +68 S 0.035 +69 V 0.042 +70 L 0.046 +71 S 0.046 +72 F 0.046 +73 L 0.048 +74 E 0.053 +75 I 0.058 +76 C 0.060 +77 Y 0.057 +78 T 0.053 +79 T 0.050 +80 T 0.050 +81 T 0.051 +82 I 0.053 +83 P 0.053 +84 K 0.052 +85 M 0.052 +86 L 0.052 +87 S 0.050 +88 C 0.051 +89 L 0.057 +90 I 0.069 +91 S 0.083 +92 E 0.093 +93 Q 0.092 +94 K 0.081 +95 S 0.068 +96 I 0.057 +97 S 0.049 +98 V 0.044 +99 A 0.043 +100 G 0.042 +101 C 0.039 +102 L 0.034 +103 L 0.032 +104 Q 0.033 +105 M 0.034 +106 Y 0.033 +107 F 0.030 +108 F 0.028 +109 H 0.029 +110 S 0.032 +111 L 0.036 +112 G 0.040 +113 I 0.045 +114 T 0.047 +115 E 0.045 +116 S 0.039 +117 C 0.033 +118 V 0.031 +119 L 0.032 +120 T 0.033 +121 A 0.032 +122 M 0.032 +123 A 0.036 +124 I 0.041 +125 D 0.045 +126 R 0.046 +127 Y 0.044 +128 I 0.042 +129 A 0.042 +130 I 0.045 +131 C 0.051 +132 N 0.057 +133 P 0.059 +134 L 0.056 +135 R 0.052 +136 Y 0.051 +137 P 0.054 +138 T 0.058 +139 I 0.064 +140 M 0.069 +141 I 0.071 +142 P 0.069 +143 K 0.064 +144 L 0.054 +145 C 0.049 +146 I 0.054 +147 Q 0.061 +148 L 0.062 +149 T 0.058 +150 V 0.058 +151 G 0.061 +152 S 0.065 +153 C 0.069 +154 F 0.073 +155 C 0.077 +156 G 0.077 +157 F 0.074 +158 L 0.074 +159 L 0.078 +160 V 0.082 +161 L 0.082 +162 P 0.080 +163 E 0.078 +164 I 0.072 +165 A 0.067 +166 W 0.066 +167 I 0.072 +168 S 0.081 +169 T 0.095 +170 L 0.107 +171 P 0.112 +172 F 0.114 +173 C 0.119 +174 G 0.128 +175 S 0.135 +176 N 0.139 +177 Q 0.141 +178 I 0.135 +179 H 0.115 +180 Q 0.091 +181 I 0.071 +182 F 0.061 +183 C 0.061 +184 D 0.072 +185 F 0.092 +186 T 0.113 +187 P 0.125 +188 V 0.129 +189 L 0.130 +190 S 0.131 +191 L 0.125 +192 A 0.112 +193 C 0.101 +194 T 0.101 +195 D 0.106 +196 T 0.102 +197 F 0.090 +198 L 0.079 +199 V 0.078 +200 V 0.084 +201 I 0.091 +202 V 0.092 +203 D 0.085 +204 A 0.077 +205 I 0.074 +206 H 0.073 +207 A 0.070 +208 A 0.065 +209 E 0.062 +210 I 0.060 +211 V 0.060 +212 A 0.064 +213 S 0.067 +214 F 0.065 +215 L 0.060 +216 V 0.062 +217 I 0.063 +218 A 0.058 +219 L 0.048 +220 S 0.041 +221 Y 0.037 +222 I 0.037 +223 R 0.043 +224 I 0.053 +225 I 0.067 +226 I 0.078 +227 V 0.082 +228 I 0.084 +229 L 0.093 +230 G 0.112 +231 M 0.134 +232 H 0.154 +233 S 0.164 +234 A 0.162 +235 E 0.151 +236 G 0.135 +237 H 0.117 +238 H 0.100 +239 K 0.089 +240 A 0.082 +241 F 0.077 +242 S 0.073 +243 T 0.070 +244 C 0.067 +245 A 0.067 +246 A 0.068 +247 H 0.066 +248 L 0.061 +249 A 0.057 +250 V 0.051 +251 F 0.042 +252 L 0.031 +253 L 0.024 +254 F 0.022 +255 F 0.025 +256 G 0.028 +257 S 0.030 +258 V 0.030 +259 A 0.029 +260 V 0.027 +261 M 0.027 +262 Y 0.029 +263 L 0.039 +264 R 0.055 +265 F 0.078 +266 S 0.102 +267 A 0.122 +268 T 0.131 +269 Y 0.128 +270 S 0.113 +271 V 0.093 +272 F 0.076 +273 W 0.068 +274 D 0.066 +275 T 0.068 +276 A 0.070 +277 I 0.071 +278 A 0.068 +279 V 0.065 +280 T 0.067 +281 F 0.075 +282 V 0.083 +283 I 0.089 +284 L 0.093 +285 A 0.093 +286 P 0.086 +287 F 0.076 +288 F 0.069 +289 N 0.066 +290 P 0.065 +291 I 0.066 +292 I 0.070 +293 Y 0.072 +294 S 0.078 +295 L 0.092 +296 K 0.103 +297 N 0.096 +298 K 0.078 +299 D 0.063 +300 M 0.061 +301 K 0.069 +302 E 0.076 +303 A 0.074 +304 I 0.066 +305 G 0.061 +306 R 0.061 +307 L 0.069 +308 F 0.086 +309 H 0.114 +310 Y 0.150 +311 Q 0.188 +312 K 0.223 +313 R 0.265 +314 A 0.325 +315 G 0.393 +316 W 0.448 +317 A 0.472 +318 G 0.457 +319 K 0.431 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000180433.6_ENST00000641861.1_GN:OR6K6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000180433.6_ENST00000641861.1_GN:OR6K6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c35a6b82a130de3fcd1642b42781eca3adea676a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000180433.6_ENST00000641861.1_GN:OR6K6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid @@ -0,0 +1,344 @@ +>ENSG00000180433.6|ENST00000641861.1|GN:OR6K6|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:24 +1 M 0.341 +2 K 0.347 +3 Q 0.364 +4 Y 0.394 +5 S 0.427 +6 V 0.452 +7 G 0.464 +8 N 0.466 +9 Q 0.453 +10 H 0.425 +11 S 0.394 +12 N 0.367 +13 Y 0.338 +14 R 0.302 +15 S 0.266 +16 L 0.236 +17 L 0.213 +18 F 0.190 +19 P 0.158 +20 F 0.125 +21 L 0.109 +22 C 0.119 +23 S 0.146 +24 Q 0.178 +25 M 0.208 +26 T 0.242 +27 Q 0.301 +28 L 0.385 +29 T 0.467 +30 A 0.523 +31 S 0.552 +32 G 0.560 +33 N 0.544 +34 Q 0.500 +35 T 0.430 +36 M 0.343 +37 V 0.257 +38 T 0.186 +39 E 0.139 +40 F 0.112 +41 L 0.102 +42 F 0.108 +43 S 0.133 +44 M 0.176 +45 F 0.225 +46 P 0.263 +47 H 0.287 +48 A 0.297 +49 H 0.292 +50 R 0.265 +51 G 0.218 +52 G 0.162 +53 L 0.112 +54 L 0.077 +55 F 0.059 +56 F 0.051 +57 I 0.047 +58 P 0.043 +59 L 0.042 +60 L 0.043 +61 L 0.047 +62 I 0.052 +63 Y 0.056 +64 G 0.057 +65 F 0.058 +66 I 0.060 +67 L 0.059 +68 T 0.057 +69 G 0.058 +70 N 0.061 +71 L 0.065 +72 I 0.065 +73 M 0.058 +74 F 0.049 +75 I 0.046 +76 V 0.048 +77 I 0.051 +78 Q 0.056 +79 V 0.066 +80 G 0.076 +81 M 0.084 +82 A 0.085 +83 L 0.078 +84 H 0.066 +85 T 0.053 +86 P 0.041 +87 L 0.031 +88 Y 0.024 +89 F 0.020 +90 F 0.021 +91 I 0.026 +92 S 0.035 +93 V 0.043 +94 L 0.047 +95 S 0.047 +96 F 0.046 +97 L 0.048 +98 E 0.053 +99 I 0.058 +100 C 0.060 +101 Y 0.057 +102 T 0.053 +103 T 0.049 +104 T 0.048 +105 T 0.049 +106 I 0.050 +107 P 0.048 +108 K 0.047 +109 M 0.046 +110 L 0.045 +111 S 0.044 +112 C 0.044 +113 L 0.050 +114 I 0.062 +115 S 0.077 +116 E 0.088 +117 Q 0.088 +118 K 0.078 +119 S 0.066 +120 I 0.055 +121 S 0.047 +122 V 0.042 +123 A 0.041 +124 G 0.041 +125 C 0.038 +126 L 0.034 +127 L 0.031 +128 Q 0.031 +129 M 0.033 +130 Y 0.032 +131 F 0.029 +132 F 0.027 +133 H 0.028 +134 S 0.031 +135 L 0.035 +136 G 0.040 +137 I 0.044 +138 T 0.046 +139 E 0.044 +140 S 0.038 +141 C 0.033 +142 V 0.031 +143 L 0.031 +144 T 0.031 +145 A 0.031 +146 M 0.031 +147 A 0.035 +148 I 0.041 +149 D 0.045 +150 R 0.046 +151 Y 0.044 +152 I 0.042 +153 A 0.041 +154 I 0.044 +155 C 0.050 +156 N 0.056 +157 P 0.058 +158 L 0.056 +159 R 0.052 +160 Y 0.052 +161 P 0.054 +162 T 0.059 +163 I 0.065 +164 M 0.070 +165 I 0.071 +166 P 0.069 +167 K 0.063 +168 L 0.053 +169 C 0.048 +170 I 0.053 +171 Q 0.060 +172 L 0.061 +173 T 0.057 +174 V 0.056 +175 G 0.059 +176 S 0.063 +177 C 0.066 +178 F 0.070 +179 C 0.075 +180 G 0.076 +181 F 0.074 +182 L 0.074 +183 L 0.078 +184 V 0.082 +185 L 0.082 +186 P 0.080 +187 E 0.077 +188 I 0.072 +189 A 0.066 +190 W 0.066 +191 I 0.071 +192 S 0.081 +193 T 0.095 +194 L 0.106 +195 P 0.111 +196 F 0.113 +197 C 0.118 +198 G 0.127 +199 S 0.134 +200 N 0.139 +201 Q 0.140 +202 I 0.132 +203 H 0.112 +204 Q 0.088 +205 I 0.069 +206 F 0.060 +207 C 0.061 +208 D 0.072 +209 F 0.091 +210 T 0.110 +211 P 0.122 +212 V 0.126 +213 L 0.127 +214 S 0.127 +215 L 0.121 +216 A 0.108 +217 C 0.096 +218 T 0.096 +219 D 0.100 +220 T 0.096 +221 F 0.085 +222 L 0.074 +223 V 0.070 +224 V 0.073 +225 I 0.078 +226 V 0.080 +227 D 0.078 +228 A 0.074 +229 I 0.073 +230 H 0.073 +231 A 0.069 +232 A 0.064 +233 E 0.061 +234 I 0.059 +235 V 0.060 +236 A 0.064 +237 S 0.067 +238 F 0.064 +239 L 0.059 +240 V 0.060 +241 I 0.062 +242 A 0.057 +243 L 0.047 +244 S 0.040 +245 Y 0.036 +246 I 0.037 +247 R 0.042 +248 I 0.052 +249 I 0.066 +250 I 0.076 +251 V 0.080 +252 I 0.082 +253 L 0.091 +254 G 0.109 +255 M 0.131 +256 H 0.151 +257 S 0.161 +258 A 0.160 +259 E 0.150 +260 G 0.135 +261 H 0.118 +262 H 0.101 +263 K 0.089 +264 A 0.082 +265 F 0.076 +266 S 0.073 +267 T 0.070 +268 C 0.067 +269 A 0.067 +270 A 0.068 +271 H 0.066 +272 L 0.061 +273 A 0.057 +274 V 0.051 +275 F 0.042 +276 L 0.032 +277 L 0.024 +278 F 0.022 +279 F 0.025 +280 G 0.028 +281 S 0.030 +282 V 0.030 +283 A 0.029 +284 V 0.027 +285 M 0.026 +286 Y 0.029 +287 L 0.038 +288 R 0.055 +289 F 0.078 +290 S 0.104 +291 A 0.124 +292 T 0.134 +293 Y 0.132 +294 S 0.118 +295 V 0.097 +296 F 0.080 +297 W 0.072 +298 D 0.070 +299 T 0.071 +300 A 0.074 +301 I 0.074 +302 A 0.071 +303 V 0.068 +304 T 0.071 +305 F 0.078 +306 V 0.087 +307 I 0.093 +308 L 0.096 +309 A 0.097 +310 P 0.090 +311 F 0.079 +312 F 0.071 +313 N 0.068 +314 P 0.067 +315 I 0.069 +316 I 0.072 +317 Y 0.075 +318 S 0.080 +319 L 0.094 +320 K 0.104 +321 N 0.097 +322 K 0.079 +323 D 0.063 +324 M 0.061 +325 K 0.068 +326 E 0.075 +327 A 0.074 +328 I 0.066 +329 G 0.060 +330 R 0.061 +331 L 0.069 +332 F 0.087 +333 H 0.115 +334 Y 0.151 +335 Q 0.189 +336 K 0.224 +337 R 0.267 +338 A 0.328 +339 G 0.398 +340 W 0.454 +341 A 0.479 +342 G 0.464 +343 K 0.437 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000180872.7_ENST00000651554.2_GN:DEFB112_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000180872.7_ENST00000651554.2_GN:DEFB112_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5b869505acb42699cbddc3f286934c39bc937298 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000180872.7_ENST00000651554.2_GN:DEFB112_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,95 @@ +>ENSG00000180872.7|ENST00000651554.2|GN:DEFB112|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.198 +2 K 0.172 +3 I 0.141 +4 L 0.123 +5 L 0.125 +6 F 0.138 +7 F 0.147 +8 C 0.143 +9 I 0.130 +10 L 0.119 +11 L 0.128 +12 F 0.163 +13 F 0.219 +14 G 0.279 +15 V 0.327 +16 L 0.368 +17 I 0.421 +18 P 0.494 +19 P 0.574 +20 A 0.633 +21 R 0.660 +22 S 0.664 +23 E 0.654 +24 G 0.627 +25 H 0.581 +26 H 0.521 +27 I 0.457 +28 T 0.396 +29 F 0.342 +30 S 0.287 +31 R 0.221 +32 W 0.156 +33 K 0.108 +34 S 0.078 +35 C 0.063 +36 T 0.062 +37 A 0.073 +38 I 0.087 +39 G 0.092 +40 G 0.086 +41 R 0.077 +42 C 0.071 +43 K 0.068 +44 N 0.070 +45 Q 0.080 +46 C 0.095 +47 D 0.105 +48 D 0.103 +49 S 0.092 +50 E 0.084 +51 F 0.082 +52 R 0.081 +53 I 0.074 +54 S 0.063 +55 Y 0.053 +56 C 0.050 +57 A 0.054 +58 R 0.061 +59 P 0.065 +60 T 0.062 +61 T 0.056 +62 H 0.051 +63 C 0.051 +64 C 0.061 +65 V 0.092 +66 T 0.148 +67 E 0.213 +68 C 0.260 +69 D 0.281 +70 P 0.290 +71 T 0.302 +72 D 0.323 +73 P 0.350 +74 N 0.374 +75 N 0.402 +76 W 0.441 +77 I 0.486 +78 P 0.531 +79 K 0.576 +80 D 0.622 +81 S 0.658 +82 V 0.679 +83 G 0.681 +84 T 0.663 +85 Q 0.620 +86 E 0.557 +87 W 0.497 +88 Y 0.467 +89 P 0.475 +90 K 0.509 +91 D 0.538 +92 S 0.533 +93 R 0.493 +94 H 0.453 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000180872.7_ENST00000651554.2_GN:DEFB112_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000180872.7_ENST00000651554.2_GN:DEFB112_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..91c114a099ece799c3f28f24d692ad789b937185 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000180872.7_ENST00000651554.2_GN:DEFB112_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid @@ -0,0 +1,108 @@ +>ENSG00000180872.7|ENST00000651554.2|GN:DEFB112|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:13 +1 M 0.295 +2 I 0.285 +3 C 0.275 +4 T 0.270 +5 L 0.268 +6 F 0.280 +7 Y 0.319 +8 T 0.373 +9 K 0.406 +10 K 0.401 +11 S 0.371 +12 F 0.331 +13 T 0.285 +14 M 0.232 +15 K 0.185 +16 I 0.156 +17 L 0.142 +18 L 0.136 +19 F 0.137 +20 F 0.140 +21 C 0.138 +22 I 0.126 +23 L 0.115 +24 L 0.118 +25 F 0.144 +26 F 0.192 +27 G 0.253 +28 V 0.310 +29 L 0.361 +30 I 0.419 +31 P 0.492 +32 P 0.569 +33 A 0.626 +34 R 0.654 +35 S 0.661 +36 E 0.657 +37 G 0.636 +38 H 0.596 +39 H 0.539 +40 I 0.474 +41 T 0.409 +42 F 0.351 +43 S 0.291 +44 R 0.224 +45 W 0.159 +46 K 0.109 +47 S 0.079 +48 C 0.064 +49 T 0.063 +50 A 0.075 +51 I 0.088 +52 G 0.091 +53 G 0.085 +54 R 0.076 +55 C 0.070 +56 K 0.067 +57 N 0.069 +58 Q 0.078 +59 C 0.091 +60 D 0.101 +61 D 0.100 +62 S 0.090 +63 E 0.082 +64 F 0.079 +65 R 0.077 +66 I 0.071 +67 S 0.060 +68 Y 0.050 +69 C 0.047 +70 A 0.051 +71 R 0.057 +72 P 0.061 +73 T 0.058 +74 T 0.053 +75 H 0.048 +76 C 0.048 +77 C 0.058 +78 V 0.088 +79 T 0.143 +80 E 0.207 +81 C 0.254 +82 D 0.275 +83 P 0.283 +84 T 0.296 +85 D 0.319 +86 P 0.347 +87 N 0.372 +88 N 0.400 +89 W 0.438 +90 I 0.482 +91 P 0.526 +92 K 0.572 +93 D 0.619 +94 S 0.657 +95 V 0.677 +96 G 0.680 +97 T 0.662 +98 Q 0.618 +99 E 0.555 +100 W 0.496 +101 Y 0.466 +102 P 0.476 +103 K 0.510 +104 D 0.539 +105 S 0.535 +106 R 0.495 +107 H 0.455 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000180934.7_ENST00000641900.1_GN:OR56A1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000180934.7_ENST00000641900.1_GN:OR56A1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1a552e59d43b4b4ca7061a32a5e6a0a4893c6ef9 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000180934.7_ENST00000641900.1_GN:OR56A1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,315 @@ +>ENSG00000180934.7|ENST00000641900.1|GN:OR56A1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.381 +2 A 0.408 +3 S 0.453 +4 P 0.501 +5 S 0.535 +6 N 0.551 +7 S 0.553 +8 S 0.538 +9 T 0.495 +10 V 0.425 +11 P 0.342 +12 V 0.263 +13 S 0.199 +14 E 0.151 +15 F 0.120 +16 L 0.101 +17 L 0.095 +18 I 0.106 +19 C 0.133 +20 F 0.164 +21 P 0.180 +22 N 0.172 +23 F 0.149 +24 Q 0.121 +25 S 0.095 +26 W 0.072 +27 Q 0.056 +28 H 0.047 +29 W 0.044 +30 L 0.043 +31 S 0.043 +32 L 0.043 +33 P 0.046 +34 L 0.051 +35 S 0.053 +36 L 0.051 +37 L 0.047 +38 F 0.043 +39 L 0.042 +40 L 0.045 +41 A 0.050 +42 M 0.055 +43 G 0.060 +44 A 0.067 +45 N 0.072 +46 T 0.072 +47 T 0.068 +48 L 0.061 +49 L 0.056 +50 I 0.057 +51 T 0.059 +52 I 0.059 +53 Q 0.058 +54 L 0.060 +55 E 0.063 +56 A 0.066 +57 S 0.065 +58 L 0.062 +59 H 0.056 +60 Q 0.049 +61 P 0.041 +62 L 0.033 +63 Y 0.027 +64 Y 0.024 +65 L 0.024 +66 L 0.027 +67 S 0.033 +68 L 0.038 +69 L 0.041 +70 S 0.042 +71 L 0.043 +72 L 0.047 +73 D 0.052 +74 I 0.054 +75 V 0.050 +76 L 0.043 +77 C 0.038 +78 L 0.037 +79 T 0.039 +80 V 0.042 +81 I 0.043 +82 P 0.040 +83 K 0.036 +84 V 0.032 +85 L 0.029 +86 A 0.026 +87 I 0.025 +88 F 0.029 +89 W 0.038 +90 Y 0.048 +91 D 0.052 +92 L 0.050 +93 R 0.046 +94 S 0.044 +95 I 0.043 +96 S 0.040 +97 F 0.035 +98 P 0.031 +99 A 0.029 +100 C 0.027 +101 F 0.025 +102 L 0.026 +103 Q 0.030 +104 M 0.036 +105 F 0.040 +106 I 0.041 +107 M 0.038 +108 N 0.034 +109 S 0.031 +110 F 0.028 +111 L 0.029 +112 P 0.031 +113 M 0.034 +114 E 0.035 +115 S 0.035 +116 C 0.033 +117 T 0.029 +118 F 0.027 +119 M 0.027 +120 V 0.028 +121 M 0.029 +122 A 0.031 +123 Y 0.034 +124 D 0.037 +125 R 0.038 +126 Y 0.037 +127 V 0.036 +128 A 0.038 +129 I 0.042 +130 C 0.048 +131 H 0.053 +132 P 0.056 +133 L 0.054 +134 R 0.053 +135 Y 0.054 +136 P 0.056 +137 S 0.061 +138 I 0.069 +139 I 0.074 +140 T 0.074 +141 N 0.070 +142 Q 0.064 +143 F 0.052 +144 V 0.041 +145 A 0.039 +146 K 0.046 +147 A 0.061 +148 S 0.073 +149 V 0.076 +150 F 0.069 +151 I 0.059 +152 V 0.054 +153 V 0.054 +154 R 0.057 +155 N 0.058 +156 A 0.056 +157 L 0.058 +158 L 0.066 +159 T 0.076 +160 A 0.082 +161 P 0.086 +162 I 0.086 +163 P 0.083 +164 I 0.081 +165 L 0.083 +166 T 0.085 +167 S 0.089 +168 L 0.096 +169 L 0.101 +170 H 0.102 +171 Y 0.103 +172 C 0.109 +173 G 0.116 +174 E 0.123 +175 N 0.134 +176 V 0.146 +177 I 0.144 +178 E 0.121 +179 N 0.088 +180 C 0.063 +181 I 0.054 +182 C 0.058 +183 A 0.070 +184 N 0.086 +185 L 0.104 +186 S 0.119 +187 V 0.129 +188 S 0.133 +189 R 0.132 +190 L 0.123 +191 S 0.109 +192 C 0.099 +193 D 0.099 +194 N 0.103 +195 F 0.101 +196 T 0.091 +197 L 0.081 +198 N 0.078 +199 R 0.081 +200 I 0.083 +201 Y 0.077 +202 Q 0.066 +203 F 0.058 +204 V 0.054 +205 A 0.050 +206 G 0.044 +207 W 0.039 +208 T 0.039 +209 L 0.044 +210 L 0.051 +211 G 0.057 +212 S 0.061 +213 D 0.061 +214 L 0.057 +215 F 0.056 +216 L 0.059 +217 I 0.060 +218 F 0.053 +219 L 0.042 +220 S 0.035 +221 Y 0.030 +222 T 0.030 +223 F 0.035 +224 I 0.047 +225 L 0.063 +226 R 0.076 +227 A 0.077 +228 V 0.071 +229 L 0.070 +230 R 0.087 +231 F 0.119 +232 K 0.159 +233 A 0.189 +234 E 0.196 +235 G 0.180 +236 A 0.153 +237 A 0.124 +238 V 0.103 +239 K 0.092 +240 A 0.087 +241 L 0.086 +242 S 0.086 +243 T 0.086 +244 C 0.087 +245 G 0.086 +246 S 0.080 +247 H 0.068 +248 F 0.055 +249 I 0.047 +250 L 0.042 +251 I 0.035 +252 L 0.029 +253 F 0.025 +254 F 0.026 +255 S 0.028 +256 T 0.029 +257 I 0.030 +258 L 0.029 +259 L 0.026 +260 V 0.022 +261 V 0.019 +262 V 0.017 +263 L 0.019 +264 T 0.024 +265 N 0.033 +266 V 0.046 +267 A 0.064 +268 R 0.087 +269 K 0.113 +270 K 0.131 +271 V 0.131 +272 P 0.112 +273 M 0.085 +274 D 0.066 +275 I 0.055 +276 L 0.049 +277 I 0.046 +278 L 0.045 +279 L 0.044 +280 N 0.041 +281 V 0.040 +282 L 0.043 +283 H 0.051 +284 H 0.063 +285 L 0.075 +286 I 0.083 +287 P 0.082 +288 P 0.075 +289 A 0.067 +290 L 0.062 +291 N 0.058 +292 P 0.054 +293 I 0.053 +294 V 0.057 +295 Y 0.063 +296 G 0.072 +297 V 0.085 +298 R 0.091 +299 T 0.084 +300 K 0.068 +301 E 0.058 +302 I 0.060 +303 K 0.073 +304 Q 0.087 +305 G 0.095 +306 I 0.098 +307 Q 0.100 +308 K 0.103 +309 L 0.107 +310 L 0.120 +311 Q 0.152 +312 R 0.204 +313 G 0.253 +314 R 0.279 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000180934.7_ENST00000641900.1_GN:OR56A1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000180934.7_ENST00000641900.1_GN:OR56A1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a06a977e6e8eda1d3ad393b668e06447dc5d62f4 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000180934.7_ENST00000641900.1_GN:OR56A1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid @@ -0,0 +1,330 @@ +>ENSG00000180934.7|ENST00000641900.1|GN:OR56A1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:15 +1 M 0.366 +2 R 0.369 +3 R 0.374 +4 N 0.377 +5 H 0.376 +6 Q 0.392 +7 K 0.428 +8 P 0.449 +9 T 0.424 +10 Q 0.380 +11 L 0.360 +12 M 0.371 +13 I 0.395 +14 Q 0.420 +15 P 0.444 +16 M 0.463 +17 A 0.486 +18 S 0.519 +19 P 0.559 +20 S 0.589 +21 N 0.602 +22 S 0.598 +23 S 0.576 +24 T 0.528 +25 V 0.454 +26 P 0.366 +27 V 0.282 +28 S 0.210 +29 E 0.158 +30 F 0.124 +31 L 0.104 +32 L 0.097 +33 I 0.106 +34 C 0.133 +35 F 0.165 +36 P 0.181 +37 N 0.173 +38 F 0.148 +39 Q 0.119 +40 S 0.093 +41 W 0.071 +42 Q 0.055 +43 H 0.047 +44 W 0.043 +45 L 0.043 +46 S 0.043 +47 L 0.043 +48 P 0.046 +49 L 0.051 +50 S 0.054 +51 L 0.052 +52 L 0.048 +53 F 0.045 +54 L 0.043 +55 L 0.046 +56 A 0.052 +57 M 0.057 +58 G 0.062 +59 A 0.069 +60 N 0.074 +61 T 0.074 +62 T 0.070 +63 L 0.063 +64 L 0.057 +65 I 0.057 +66 T 0.059 +67 I 0.058 +68 Q 0.057 +69 L 0.058 +70 E 0.062 +71 A 0.064 +72 S 0.063 +73 L 0.059 +74 H 0.054 +75 Q 0.047 +76 P 0.040 +77 L 0.032 +78 Y 0.026 +79 Y 0.023 +80 L 0.023 +81 L 0.027 +82 S 0.033 +83 L 0.039 +84 L 0.042 +85 S 0.042 +86 L 0.043 +87 L 0.046 +88 D 0.051 +89 I 0.054 +90 V 0.050 +91 L 0.043 +92 C 0.038 +93 L 0.037 +94 T 0.038 +95 V 0.040 +96 I 0.040 +97 P 0.038 +98 K 0.034 +99 V 0.030 +100 L 0.027 +101 A 0.024 +102 I 0.023 +103 F 0.027 +104 W 0.036 +105 Y 0.045 +106 D 0.050 +107 L 0.048 +108 R 0.044 +109 S 0.043 +110 I 0.042 +111 S 0.039 +112 F 0.034 +113 P 0.030 +114 A 0.028 +115 C 0.026 +116 F 0.024 +117 L 0.025 +118 Q 0.029 +119 M 0.034 +120 F 0.038 +121 I 0.039 +122 M 0.037 +123 N 0.033 +124 S 0.030 +125 F 0.028 +126 L 0.029 +127 P 0.031 +128 M 0.033 +129 E 0.035 +130 S 0.035 +131 C 0.033 +132 T 0.029 +133 F 0.027 +134 M 0.027 +135 V 0.028 +136 M 0.030 +137 A 0.032 +138 Y 0.035 +139 D 0.038 +140 R 0.039 +141 Y 0.038 +142 V 0.037 +143 A 0.039 +144 I 0.043 +145 C 0.049 +146 H 0.054 +147 P 0.056 +148 L 0.055 +149 R 0.054 +150 Y 0.055 +151 P 0.057 +152 S 0.062 +153 I 0.070 +154 I 0.073 +155 T 0.065 +156 N 0.052 +157 Q 0.040 +158 F 0.033 +159 V 0.031 +160 A 0.034 +161 K 0.045 +162 A 0.060 +163 S 0.073 +164 V 0.075 +165 F 0.068 +166 I 0.058 +167 V 0.054 +168 V 0.054 +169 R 0.057 +170 N 0.057 +171 A 0.057 +172 L 0.059 +173 L 0.067 +174 T 0.076 +175 A 0.083 +176 P 0.085 +177 I 0.085 +178 P 0.083 +179 I 0.082 +180 L 0.083 +181 T 0.086 +182 S 0.089 +183 L 0.096 +184 L 0.101 +185 H 0.102 +186 Y 0.102 +187 C 0.107 +188 G 0.113 +189 E 0.121 +190 N 0.132 +191 V 0.144 +192 I 0.143 +193 E 0.120 +194 N 0.087 +195 C 0.063 +196 I 0.055 +197 C 0.058 +198 A 0.070 +199 N 0.086 +200 L 0.103 +201 S 0.118 +202 V 0.126 +203 S 0.131 +204 R 0.130 +205 L 0.121 +206 S 0.107 +207 C 0.097 +208 D 0.097 +209 N 0.101 +210 F 0.100 +211 T 0.090 +212 L 0.079 +213 N 0.074 +214 R 0.073 +215 I 0.072 +216 Y 0.068 +217 Q 0.062 +218 F 0.058 +219 V 0.054 +220 A 0.050 +221 G 0.043 +222 W 0.039 +223 T 0.039 +224 L 0.044 +225 L 0.051 +226 G 0.057 +227 S 0.061 +228 D 0.061 +229 L 0.057 +230 F 0.056 +231 L 0.059 +232 I 0.060 +233 F 0.053 +234 L 0.043 +235 S 0.036 +236 Y 0.031 +237 T 0.030 +238 F 0.035 +239 I 0.047 +240 L 0.063 +241 R 0.075 +242 A 0.077 +243 V 0.071 +244 L 0.070 +245 R 0.087 +246 F 0.120 +247 K 0.160 +248 A 0.190 +249 E 0.198 +250 G 0.183 +251 A 0.156 +252 A 0.127 +253 V 0.105 +254 K 0.093 +255 A 0.089 +256 L 0.087 +257 S 0.087 +258 T 0.087 +259 C 0.088 +260 G 0.087 +261 S 0.081 +262 H 0.069 +263 F 0.056 +264 I 0.048 +265 L 0.043 +266 I 0.036 +267 L 0.029 +268 F 0.026 +269 F 0.026 +270 S 0.028 +271 T 0.029 +272 I 0.030 +273 L 0.029 +274 L 0.026 +275 V 0.022 +276 V 0.019 +277 V 0.017 +278 L 0.019 +279 T 0.024 +280 N 0.033 +281 V 0.046 +282 A 0.065 +283 R 0.089 +284 K 0.116 +285 K 0.135 +286 V 0.135 +287 P 0.115 +288 M 0.088 +289 D 0.068 +290 I 0.057 +291 L 0.051 +292 I 0.048 +293 L 0.047 +294 L 0.045 +295 N 0.043 +296 V 0.041 +297 L 0.044 +298 H 0.052 +299 H 0.065 +300 L 0.077 +301 I 0.085 +302 P 0.084 +303 P 0.077 +304 A 0.069 +305 L 0.063 +306 N 0.059 +307 P 0.055 +308 I 0.055 +309 V 0.058 +310 Y 0.064 +311 G 0.074 +312 V 0.087 +313 R 0.094 +314 T 0.086 +315 K 0.070 +316 E 0.059 +317 I 0.061 +318 K 0.073 +319 Q 0.086 +320 G 0.090 +321 I 0.084 +322 Q 0.077 +323 K 0.079 +324 L 0.091 +325 L 0.113 +326 Q 0.151 +327 R 0.204 +328 G 0.254 +329 R 0.281 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000181616.10_ENST00000322653.7_GN:OR52H1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000181616.10_ENST00000322653.7_GN:OR52H1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..fcdd390fd4bb62188e312aa523928c4c835852ff --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000181616.10_ENST00000322653.7_GN:OR52H1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,315 @@ +>ENSG00000181616.10|ENST00000322653.7|GN:OR52H1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.259 +2 I 0.278 +3 I 0.311 +4 F 0.345 +5 N 0.372 +6 L 0.386 +7 S 0.388 +8 S 0.376 +9 Y 0.347 +10 N 0.303 +11 P 0.252 +12 G 0.202 +13 P 0.161 +14 F 0.137 +15 I 0.129 +16 L 0.134 +17 V 0.154 +18 G 0.191 +19 I 0.226 +20 P 0.238 +21 G 0.220 +22 L 0.186 +23 E 0.150 +24 Q 0.117 +25 F 0.088 +26 H 0.067 +27 V 0.056 +28 W 0.051 +29 I 0.051 +30 G 0.051 +31 I 0.048 +32 P 0.046 +33 F 0.050 +34 C 0.063 +35 I 0.078 +36 I 0.086 +37 Y 0.088 +38 I 0.083 +39 V 0.073 +40 A 0.060 +41 V 0.051 +42 V 0.049 +43 G 0.052 +44 N 0.056 +45 C 0.058 +46 I 0.057 +47 L 0.051 +48 L 0.045 +49 Y 0.042 +50 L 0.045 +51 I 0.051 +52 V 0.056 +53 V 0.058 +54 E 0.059 +55 H 0.060 +56 S 0.061 +57 L 0.060 +58 H 0.057 +59 E 0.050 +60 P 0.041 +61 M 0.031 +62 F 0.024 +63 F 0.021 +64 F 0.021 +65 L 0.026 +66 S 0.033 +67 M 0.040 +68 L 0.044 +69 A 0.047 +70 M 0.049 +71 T 0.052 +72 D 0.055 +73 L 0.055 +74 I 0.050 +75 L 0.045 +76 S 0.043 +77 T 0.045 +78 A 0.048 +79 G 0.050 +80 V 0.051 +81 P 0.050 +82 K 0.050 +83 A 0.048 +84 L 0.043 +85 S 0.036 +86 I 0.032 +87 F 0.034 +88 W 0.042 +89 L 0.053 +90 G 0.061 +91 A 0.061 +92 R 0.055 +93 E 0.048 +94 I 0.044 +95 T 0.040 +96 F 0.037 +97 P 0.035 +98 G 0.035 +99 C 0.034 +100 L 0.032 +101 T 0.033 +102 Q 0.035 +103 M 0.037 +104 F 0.037 +105 F 0.035 +106 L 0.033 +107 H 0.032 +108 Y 0.032 +109 N 0.031 +110 F 0.032 +111 V 0.036 +112 L 0.041 +113 D 0.044 +114 S 0.045 +115 A 0.043 +116 I 0.041 +117 L 0.038 +118 M 0.035 +119 A 0.033 +120 M 0.033 +121 A 0.035 +122 F 0.038 +123 D 0.041 +124 H 0.041 +125 Y 0.041 +126 V 0.042 +127 A 0.045 +128 I 0.049 +129 C 0.054 +130 S 0.058 +131 P 0.061 +132 L 0.061 +133 R 0.060 +134 Y 0.059 +135 T 0.061 +136 T 0.066 +137 I 0.075 +138 L 0.081 +139 T 0.082 +140 P 0.080 +141 K 0.074 +142 T 0.065 +143 I 0.059 +144 I 0.064 +145 K 0.073 +146 S 0.076 +147 A 0.071 +148 M 0.065 +149 G 0.064 +150 I 0.068 +151 S 0.074 +152 F 0.079 +153 R 0.080 +154 S 0.073 +155 F 0.064 +156 C 0.061 +157 I 0.068 +158 I 0.077 +159 L 0.080 +160 P 0.078 +161 D 0.074 +162 V 0.070 +163 F 0.069 +164 L 0.071 +165 L 0.075 +166 T 0.079 +167 C 0.086 +168 L 0.091 +169 P 0.089 +170 F 0.081 +171 C 0.077 +172 R 0.080 +173 T 0.089 +174 R 0.107 +175 I 0.129 +176 I 0.138 +177 P 0.124 +178 H 0.097 +179 T 0.075 +180 Y 0.061 +181 C 0.057 +182 E 0.063 +183 H 0.079 +184 I 0.100 +185 G 0.117 +186 V 0.125 +187 A 0.129 +188 Q 0.128 +189 L 0.122 +190 A 0.110 +191 C 0.101 +192 A 0.104 +193 D 0.111 +194 I 0.111 +195 S 0.099 +196 I 0.083 +197 N 0.068 +198 F 0.060 +199 W 0.060 +200 Y 0.066 +201 G 0.070 +202 F 0.068 +203 C 0.065 +204 V 0.062 +205 P 0.057 +206 I 0.050 +207 M 0.046 +208 T 0.047 +209 V 0.048 +210 I 0.051 +211 S 0.061 +212 D 0.076 +213 V 0.088 +214 I 0.094 +215 L 0.091 +216 I 0.081 +217 A 0.065 +218 V 0.050 +219 S 0.041 +220 Y 0.038 +221 A 0.041 +222 H 0.047 +223 I 0.048 +224 L 0.047 +225 C 0.051 +226 A 0.063 +227 V 0.078 +228 F 0.096 +229 G 0.118 +230 L 0.136 +231 P 0.144 +232 S 0.137 +233 Q 0.120 +234 D 0.100 +235 A 0.082 +236 C 0.069 +237 Q 0.064 +238 K 0.066 +239 A 0.070 +240 L 0.073 +241 G 0.076 +242 T 0.076 +243 C 0.075 +244 G 0.075 +245 S 0.073 +246 H 0.069 +247 V 0.063 +248 C 0.059 +249 V 0.056 +250 I 0.049 +251 L 0.037 +252 M 0.027 +253 F 0.021 +254 Y 0.022 +255 T 0.024 +256 P 0.025 +257 A 0.023 +258 F 0.020 +259 F 0.019 +260 S 0.018 +261 I 0.019 +262 L 0.022 +263 A 0.029 +264 H 0.041 +265 R 0.060 +266 F 0.084 +267 G 0.112 +268 H 0.135 +269 N 0.145 +270 V 0.135 +271 S 0.109 +272 R 0.081 +273 T 0.061 +274 F 0.051 +275 H 0.050 +276 I 0.050 +277 M 0.050 +278 F 0.050 +279 A 0.048 +280 N 0.049 +281 L 0.055 +282 Y 0.068 +283 I 0.081 +284 V 0.092 +285 I 0.098 +286 P 0.098 +287 P 0.091 +288 A 0.081 +289 L 0.075 +290 N 0.071 +291 P 0.068 +292 M 0.065 +293 V 0.064 +294 Y 0.069 +295 G 0.080 +296 V 0.097 +297 K 0.108 +298 T 0.100 +299 K 0.079 +300 Q 0.062 +301 I 0.058 +302 R 0.065 +303 D 0.073 +304 K 0.074 +305 V 0.071 +306 I 0.072 +307 L 0.081 +308 L 0.102 +309 F 0.144 +310 S 0.212 +311 K 0.295 +312 G 0.365 +313 T 0.393 +314 G 0.392 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000181616.10_ENST00000322653.7_GN:OR52H1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000181616.10_ENST00000322653.7_GN:OR52H1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6a781f525b87f3ba81be3a579fe3b3b6a8740658 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000181616.10_ENST00000322653.7_GN:OR52H1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid @@ -0,0 +1,321 @@ +>ENSG00000181616.10|ENST00000322653.7|GN:OR52H1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:6 +1 M 0.375 +2 P 0.388 +3 S 0.405 +4 A 0.414 +5 S 0.404 +6 A 0.379 +7 M 0.357 +8 I 0.352 +9 I 0.360 +10 F 0.372 +11 N 0.385 +12 L 0.391 +13 S 0.384 +14 S 0.363 +15 Y 0.329 +16 N 0.288 +17 P 0.242 +18 G 0.196 +19 P 0.157 +20 F 0.134 +21 I 0.126 +22 L 0.130 +23 V 0.150 +24 G 0.188 +25 I 0.225 +26 P 0.238 +27 G 0.222 +28 L 0.188 +29 E 0.150 +30 Q 0.116 +31 F 0.087 +32 H 0.067 +33 V 0.055 +34 W 0.050 +35 I 0.050 +36 G 0.050 +37 I 0.048 +38 P 0.046 +39 F 0.051 +40 C 0.063 +41 I 0.078 +42 I 0.086 +43 Y 0.088 +44 I 0.084 +45 V 0.073 +46 A 0.060 +47 V 0.051 +48 V 0.049 +49 G 0.052 +50 N 0.056 +51 C 0.058 +52 I 0.057 +53 L 0.052 +54 L 0.045 +55 Y 0.042 +56 L 0.045 +57 I 0.051 +58 V 0.055 +59 V 0.056 +60 E 0.057 +61 H 0.059 +62 S 0.059 +63 L 0.058 +64 H 0.055 +65 E 0.049 +66 P 0.040 +67 M 0.031 +68 F 0.024 +69 F 0.020 +70 F 0.021 +71 L 0.026 +72 S 0.033 +73 M 0.040 +74 L 0.044 +75 A 0.047 +76 M 0.049 +77 T 0.051 +78 D 0.054 +79 L 0.053 +80 I 0.049 +81 L 0.044 +82 S 0.042 +83 T 0.044 +84 A 0.047 +85 G 0.049 +86 V 0.050 +87 P 0.049 +88 K 0.049 +89 A 0.046 +90 L 0.041 +91 S 0.035 +92 I 0.031 +93 F 0.033 +94 W 0.041 +95 L 0.052 +96 G 0.059 +97 A 0.059 +98 R 0.054 +99 E 0.048 +100 I 0.044 +101 T 0.040 +102 F 0.037 +103 P 0.035 +104 G 0.035 +105 C 0.033 +106 L 0.032 +107 T 0.032 +108 Q 0.034 +109 M 0.036 +110 F 0.036 +111 F 0.034 +112 L 0.032 +113 H 0.032 +114 Y 0.031 +115 N 0.031 +116 F 0.032 +117 V 0.036 +118 L 0.041 +119 D 0.044 +120 S 0.045 +121 A 0.043 +122 I 0.041 +123 L 0.038 +124 M 0.035 +125 A 0.033 +126 M 0.033 +127 A 0.036 +128 F 0.039 +129 D 0.041 +130 H 0.042 +131 Y 0.041 +132 V 0.042 +133 A 0.045 +134 I 0.050 +135 C 0.054 +136 S 0.059 +137 P 0.062 +138 L 0.061 +139 R 0.060 +140 Y 0.060 +141 T 0.061 +142 T 0.066 +143 I 0.075 +144 L 0.082 +145 T 0.083 +146 P 0.080 +147 K 0.075 +148 T 0.066 +149 I 0.060 +150 I 0.064 +151 K 0.073 +152 S 0.076 +153 A 0.071 +154 M 0.065 +155 G 0.063 +156 I 0.068 +157 S 0.074 +158 F 0.079 +159 R 0.079 +160 S 0.073 +161 F 0.064 +162 C 0.062 +163 I 0.068 +164 I 0.077 +165 L 0.080 +166 P 0.079 +167 D 0.075 +168 V 0.070 +169 F 0.069 +170 L 0.071 +171 L 0.075 +172 T 0.079 +173 C 0.086 +174 L 0.092 +175 P 0.089 +176 F 0.082 +177 C 0.078 +178 R 0.080 +179 T 0.089 +180 R 0.107 +181 I 0.128 +182 I 0.136 +183 P 0.122 +184 H 0.096 +185 T 0.074 +186 Y 0.061 +187 C 0.057 +188 E 0.063 +189 H 0.079 +190 I 0.099 +191 G 0.116 +192 V 0.125 +193 A 0.128 +194 Q 0.128 +195 L 0.121 +196 A 0.109 +197 C 0.101 +198 A 0.103 +199 D 0.110 +200 I 0.110 +201 S 0.099 +202 I 0.082 +203 N 0.068 +204 F 0.060 +205 W 0.060 +206 Y 0.066 +207 G 0.070 +208 F 0.069 +209 C 0.065 +210 V 0.062 +211 P 0.057 +212 I 0.050 +213 M 0.046 +214 T 0.047 +215 V 0.048 +216 I 0.051 +217 S 0.061 +218 D 0.076 +219 V 0.089 +220 I 0.094 +221 L 0.091 +222 I 0.081 +223 A 0.066 +224 V 0.051 +225 S 0.041 +226 Y 0.038 +227 A 0.042 +228 H 0.047 +229 I 0.049 +230 L 0.047 +231 C 0.051 +232 A 0.063 +233 V 0.078 +234 F 0.096 +235 G 0.118 +236 L 0.137 +237 P 0.144 +238 S 0.137 +239 Q 0.120 +240 D 0.100 +241 A 0.083 +242 C 0.070 +243 Q 0.065 +244 K 0.066 +245 A 0.071 +246 L 0.074 +247 G 0.077 +248 T 0.077 +249 C 0.077 +250 G 0.076 +251 S 0.074 +252 H 0.069 +253 V 0.063 +254 C 0.059 +255 V 0.056 +256 I 0.049 +257 L 0.037 +258 M 0.027 +259 F 0.022 +260 Y 0.022 +261 T 0.024 +262 P 0.025 +263 A 0.023 +264 F 0.020 +265 F 0.019 +266 S 0.018 +267 I 0.019 +268 L 0.022 +269 A 0.029 +270 H 0.041 +271 R 0.060 +272 F 0.085 +273 G 0.113 +274 H 0.137 +275 N 0.147 +276 V 0.137 +277 S 0.111 +278 R 0.082 +279 T 0.061 +280 F 0.052 +281 H 0.050 +282 I 0.051 +283 M 0.051 +284 F 0.050 +285 A 0.049 +286 N 0.050 +287 L 0.056 +288 Y 0.069 +289 I 0.082 +290 V 0.093 +291 I 0.099 +292 P 0.099 +293 P 0.091 +294 A 0.081 +295 L 0.075 +296 N 0.071 +297 P 0.068 +298 M 0.065 +299 V 0.065 +300 Y 0.069 +301 G 0.080 +302 V 0.097 +303 K 0.108 +304 T 0.100 +305 K 0.079 +306 Q 0.062 +307 I 0.058 +308 R 0.065 +309 D 0.073 +310 K 0.074 +311 V 0.071 +312 I 0.071 +313 L 0.080 +314 L 0.101 +315 F 0.144 +316 S 0.212 +317 K 0.296 +318 G 0.366 +319 T 0.394 +320 G 0.393 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000181638.21_ENST00000330701.7_GN:ZFP41_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000181638.21_ENST00000330701.7_GN:ZFP41_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..11620c89768903419ea3d8d2d24864d030af371e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000181638.21_ENST00000330701.7_GN:ZFP41_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,199 @@ +>ENSG00000181638.21|ENST00000330701.7|GN:ZFP41|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.420 +2 E 0.447 +3 K 0.498 +4 P 0.558 +5 A 0.609 +6 G 0.639 +7 R 0.651 +8 K 0.645 +9 K 0.618 +10 K 0.580 +11 T 0.544 +12 P 0.522 +13 T 0.524 +14 P 0.554 +15 R 0.591 +16 E 0.609 +17 E 0.603 +18 A 0.583 +19 D 0.551 +20 V 0.500 +21 Q 0.432 +22 K 0.384 +23 S 0.399 +24 A 0.456 +25 L 0.499 +26 R 0.526 +27 E 0.574 +28 E 0.639 +29 K 0.684 +30 V 0.700 +31 S 0.695 +32 G 0.680 +33 D 0.658 +34 R 0.639 +35 K 0.627 +36 P 0.624 +37 P 0.629 +38 E 0.639 +39 R 0.644 +40 P 0.645 +41 T 0.653 +42 V 0.662 +43 P 0.667 +44 R 0.669 +45 K 0.670 +46 P 0.670 +47 R 0.671 +48 T 0.675 +49 E 0.679 +50 P 0.669 +51 C 0.640 +52 L 0.604 +53 S 0.585 +54 P 0.598 +55 E 0.628 +56 D 0.655 +57 E 0.673 +58 E 0.685 +59 H 0.695 +60 V 0.704 +61 F 0.712 +62 D 0.716 +63 A 0.712 +64 F 0.696 +65 D 0.676 +66 A 0.659 +67 S 0.651 +68 F 0.655 +69 K 0.672 +70 D 0.695 +71 D 0.713 +72 F 0.724 +73 E 0.732 +74 G 0.737 +75 V 0.740 +76 P 0.740 +77 V 0.736 +78 F 0.725 +79 I 0.710 +80 P 0.685 +81 F 0.638 +82 Q 0.564 +83 R 0.466 +84 K 0.354 +85 K 0.246 +86 P 0.160 +87 Y 0.104 +88 E 0.075 +89 C 0.065 +90 S 0.066 +91 E 0.074 +92 C 0.085 +93 G 0.095 +94 R 0.098 +95 I 0.096 +96 F 0.092 +97 K 0.088 +98 H 0.090 +99 K 0.103 +100 T 0.123 +101 D 0.141 +102 H 0.152 +103 I 0.153 +104 R 0.143 +105 H 0.132 +106 Q 0.133 +107 R 0.143 +108 V 0.160 +109 H 0.184 +110 T 0.209 +111 G 0.219 +112 E 0.203 +113 K 0.166 +114 P 0.124 +115 F 0.092 +116 K 0.075 +117 C 0.068 +118 A 0.067 +119 Q 0.070 +120 C 0.075 +121 G 0.080 +122 K 0.087 +123 A 0.095 +124 F 0.105 +125 R 0.110 +126 H 0.110 +127 S 0.106 +128 S 0.102 +129 D 0.099 +130 V 0.104 +131 T 0.117 +132 K 0.132 +133 H 0.144 +134 Q 0.159 +135 R 0.179 +136 T 0.202 +137 H 0.226 +138 T 0.250 +139 G 0.259 +140 E 0.243 +141 K 0.201 +142 P 0.151 +143 F 0.111 +144 K 0.087 +145 C 0.077 +146 G 0.077 +147 E 0.082 +148 C 0.087 +149 G 0.091 +150 K 0.093 +151 A 0.097 +152 F 0.104 +153 N 0.113 +154 C 0.118 +155 G 0.118 +156 S 0.115 +157 N 0.116 +158 L 0.122 +159 L 0.127 +160 K 0.129 +161 H 0.134 +162 Q 0.147 +163 K 0.163 +164 T 0.178 +165 H 0.197 +166 T 0.225 +167 G 0.246 +168 E 0.244 +169 K 0.213 +170 P 0.168 +171 Y 0.129 +172 E 0.101 +173 C 0.081 +174 T 0.071 +175 H 0.071 +176 C 0.076 +177 G 0.082 +178 K 0.083 +179 A 0.083 +180 F 0.080 +181 A 0.077 +182 Y 0.073 +183 S 0.069 +184 S 0.066 +185 C 0.067 +186 L 0.076 +187 I 0.086 +188 R 0.090 +189 H 0.087 +190 Q 0.089 +191 K 0.103 +192 R 0.139 +193 H 0.209 +194 P 0.308 +195 R 0.397 +196 K 0.438 +197 K 0.426 +198 P 0.399 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000181638.21_ENST00000330701.7_GN:ZFP41_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000181638.21_ENST00000330701.7_GN:ZFP41_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f15ab855acd3435f7d0e46795f8393b4ebe11092 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000181638.21_ENST00000330701.7_GN:ZFP41_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid @@ -0,0 +1,200 @@ +>ENSG00000181638.21|ENST00000330701.7|GN:ZFP41|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:1 +1 M 0.409 +2 M 0.429 +3 E 0.464 +4 K 0.502 +5 P 0.532 +6 A 0.561 +7 G 0.602 +8 R 0.638 +9 K 0.646 +10 K 0.623 +11 K 0.587 +12 T 0.550 +13 P 0.521 +14 T 0.520 +15 P 0.554 +16 R 0.595 +17 E 0.612 +18 E 0.605 +19 A 0.587 +20 D 0.562 +21 V 0.525 +22 Q 0.479 +23 K 0.442 +24 S 0.443 +25 A 0.475 +26 L 0.501 +27 R 0.522 +28 E 0.569 +29 E 0.634 +30 K 0.682 +31 V 0.700 +32 S 0.696 +33 G 0.681 +34 D 0.659 +35 R 0.640 +36 K 0.628 +37 P 0.625 +38 P 0.631 +39 E 0.640 +40 R 0.644 +41 P 0.646 +42 T 0.653 +43 V 0.663 +44 P 0.668 +45 R 0.670 +46 K 0.672 +47 P 0.671 +48 R 0.672 +49 T 0.677 +50 E 0.680 +51 P 0.671 +52 C 0.642 +53 L 0.606 +54 S 0.587 +55 P 0.599 +56 E 0.630 +57 D 0.656 +58 E 0.674 +59 E 0.686 +60 H 0.696 +61 V 0.705 +62 F 0.713 +63 D 0.717 +64 A 0.712 +65 F 0.696 +66 D 0.676 +67 A 0.659 +68 S 0.651 +69 F 0.655 +70 K 0.672 +71 D 0.694 +72 D 0.712 +73 F 0.724 +74 E 0.732 +75 G 0.738 +76 V 0.741 +77 P 0.741 +78 V 0.736 +79 F 0.726 +80 I 0.711 +81 P 0.685 +82 F 0.638 +83 Q 0.564 +84 R 0.466 +85 K 0.354 +86 K 0.246 +87 P 0.160 +88 Y 0.104 +89 E 0.075 +90 C 0.065 +91 S 0.066 +92 E 0.074 +93 C 0.086 +94 G 0.095 +95 R 0.098 +96 I 0.096 +97 F 0.092 +98 K 0.088 +99 H 0.090 +100 K 0.102 +101 T 0.123 +102 D 0.141 +103 H 0.152 +104 I 0.152 +105 R 0.143 +106 H 0.132 +107 Q 0.132 +108 R 0.142 +109 V 0.159 +110 H 0.183 +111 T 0.207 +112 G 0.217 +113 E 0.203 +114 K 0.166 +115 P 0.124 +116 F 0.092 +117 K 0.076 +118 C 0.069 +119 A 0.067 +120 Q 0.070 +121 C 0.075 +122 G 0.081 +123 K 0.087 +124 A 0.096 +125 F 0.105 +126 R 0.110 +127 H 0.110 +128 S 0.106 +129 S 0.102 +130 D 0.099 +131 V 0.104 +132 T 0.117 +133 K 0.131 +134 H 0.143 +135 Q 0.158 +136 R 0.179 +137 T 0.202 +138 H 0.226 +139 T 0.250 +140 G 0.260 +141 E 0.243 +142 K 0.201 +143 P 0.151 +144 F 0.111 +145 K 0.087 +146 C 0.076 +147 G 0.076 +148 E 0.081 +149 C 0.087 +150 G 0.090 +151 K 0.092 +152 A 0.097 +153 F 0.104 +154 N 0.112 +155 C 0.118 +156 G 0.118 +157 S 0.115 +158 N 0.116 +159 L 0.122 +160 L 0.127 +161 K 0.129 +162 H 0.133 +163 Q 0.147 +164 K 0.163 +165 T 0.177 +166 H 0.197 +167 T 0.224 +168 G 0.246 +169 E 0.243 +170 K 0.212 +171 P 0.167 +172 Y 0.128 +173 E 0.100 +174 C 0.081 +175 T 0.071 +176 H 0.070 +177 C 0.076 +178 G 0.081 +179 K 0.083 +180 A 0.082 +181 F 0.080 +182 A 0.076 +183 Y 0.072 +184 S 0.068 +185 S 0.065 +186 C 0.067 +187 L 0.076 +188 I 0.086 +189 R 0.090 +190 H 0.087 +191 Q 0.088 +192 K 0.103 +193 R 0.139 +194 H 0.209 +195 P 0.307 +196 R 0.397 +197 K 0.438 +198 K 0.426 +199 P 0.400 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000181718.7_ENST00000641661.1_GN:OR5T2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000181718.7_ENST00000641661.1_GN:OR5T2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..dceaf8f402d5c2cffc546805add81eed5e01c930 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000181718.7_ENST00000641661.1_GN:OR5T2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,319 @@ +>ENSG00000181718.7|ENST00000641661.1|GN:OR5T2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.418 +2 K 0.425 +3 N 0.436 +4 V 0.436 +5 T 0.403 +6 E 0.335 +7 V 0.250 +8 T 0.177 +9 L 0.133 +10 F 0.118 +11 V 0.118 +12 L 0.120 +13 K 0.123 +14 G 0.128 +15 F 0.139 +16 T 0.156 +17 D 0.169 +18 N 0.161 +19 L 0.131 +20 E 0.095 +21 L 0.070 +22 Q 0.063 +23 T 0.067 +24 I 0.072 +25 F 0.073 +26 F 0.073 +27 F 0.068 +28 L 0.057 +29 F 0.044 +30 L 0.039 +31 A 0.042 +32 I 0.047 +33 Y 0.049 +34 L 0.047 +35 F 0.047 +36 T 0.050 +37 L 0.050 +38 M 0.051 +39 G 0.059 +40 N 0.074 +41 L 0.089 +42 G 0.096 +43 L 0.088 +44 I 0.073 +45 L 0.062 +46 V 0.058 +47 V 0.059 +48 I 0.062 +49 R 0.066 +50 D 0.070 +51 S 0.070 +52 Q 0.068 +53 L 0.063 +54 H 0.056 +55 K 0.047 +56 P 0.038 +57 M 0.031 +58 Y 0.028 +59 Y 0.027 +60 F 0.027 +61 L 0.032 +62 S 0.043 +63 M 0.054 +64 L 0.063 +65 S 0.068 +66 S 0.067 +67 V 0.066 +68 D 0.069 +69 A 0.074 +70 C 0.075 +71 Y 0.070 +72 S 0.066 +73 S 0.066 +74 V 0.073 +75 I 0.081 +76 T 0.086 +77 P 0.083 +78 N 0.077 +79 M 0.071 +80 L 0.065 +81 V 0.060 +82 D 0.057 +83 F 0.060 +84 T 0.070 +85 T 0.085 +86 K 0.095 +87 N 0.090 +88 K 0.075 +89 V 0.059 +90 I 0.047 +91 S 0.039 +92 F 0.034 +93 L 0.033 +94 G 0.034 +95 C 0.034 +96 V 0.033 +97 A 0.032 +98 Q 0.033 +99 V 0.033 +100 F 0.031 +101 L 0.028 +102 A 0.026 +103 C 0.026 +104 S 0.027 +105 F 0.031 +106 G 0.037 +107 T 0.044 +108 T 0.049 +109 E 0.048 +110 C 0.043 +111 F 0.036 +112 L 0.033 +113 L 0.033 +114 A 0.033 +115 A 0.032 +116 M 0.031 +117 A 0.032 +118 Y 0.035 +119 D 0.039 +120 R 0.041 +121 Y 0.041 +122 V 0.042 +123 A 0.045 +124 I 0.051 +125 Y 0.057 +126 N 0.059 +127 P 0.056 +128 L 0.051 +129 L 0.049 +130 Y 0.051 +131 S 0.055 +132 V 0.062 +133 S 0.071 +134 M 0.078 +135 S 0.074 +136 P 0.061 +137 R 0.048 +138 V 0.039 +139 Y 0.035 +140 M 0.035 +141 P 0.041 +142 L 0.053 +143 I 0.068 +144 N 0.080 +145 A 0.083 +146 S 0.084 +147 Y 0.088 +148 V 0.094 +149 A 0.095 +150 G 0.089 +151 I 0.081 +152 L 0.080 +153 H 0.087 +154 A 0.093 +155 T 0.091 +156 I 0.088 +157 H 0.088 +158 T 0.088 +159 V 0.087 +160 A 0.087 +161 T 0.087 +162 F 0.089 +163 S 0.097 +164 L 0.104 +165 S 0.105 +166 F 0.105 +167 C 0.109 +168 G 0.116 +169 A 0.126 +170 N 0.138 +171 E 0.149 +172 I 0.147 +173 R 0.125 +174 R 0.097 +175 V 0.075 +176 F 0.064 +177 C 0.065 +178 D 0.081 +179 I 0.110 +180 P 0.140 +181 P 0.158 +182 L 0.164 +183 L 0.168 +184 A 0.172 +185 I 0.170 +186 S 0.162 +187 Y 0.158 +188 S 0.162 +189 D 0.169 +190 T 0.165 +191 H 0.147 +192 T 0.127 +193 N 0.113 +194 Q 0.106 +195 L 0.104 +196 L 0.104 +197 L 0.100 +198 F 0.090 +199 Y 0.081 +200 F 0.075 +201 V 0.074 +202 G 0.073 +203 S 0.072 +204 I 0.071 +205 E 0.068 +206 L 0.067 +207 V 0.074 +208 T 0.087 +209 I 0.097 +210 L 0.098 +211 I 0.090 +212 V 0.077 +213 L 0.061 +214 I 0.050 +215 S 0.044 +216 Y 0.042 +217 G 0.043 +218 L 0.048 +219 I 0.057 +220 L 0.067 +221 L 0.074 +222 A 0.072 +223 I 0.064 +224 L 0.060 +225 K 0.065 +226 M 0.082 +227 Y 0.103 +228 S 0.119 +229 A 0.121 +230 E 0.111 +231 G 0.096 +232 R 0.082 +233 R 0.073 +234 K 0.068 +235 V 0.065 +236 F 0.065 +237 S 0.067 +238 T 0.069 +239 C 0.071 +240 G 0.074 +241 A 0.077 +242 H 0.075 +243 L 0.071 +244 T 0.072 +245 G 0.074 +246 V 0.067 +247 S 0.051 +248 I 0.037 +249 Y 0.029 +250 Y 0.030 +251 G 0.034 +252 T 0.039 +253 I 0.041 +254 L 0.041 +255 F 0.043 +256 M 0.055 +257 Y 0.077 +258 V 0.113 +259 R 0.161 +260 P 0.212 +261 S 0.253 +262 S 0.274 +263 S 0.276 +264 Y 0.262 +265 A 0.234 +266 S 0.200 +267 D 0.168 +268 H 0.145 +269 D 0.127 +270 M 0.112 +271 I 0.098 +272 V 0.087 +273 S 0.076 +274 I 0.069 +275 F 0.071 +276 Y 0.083 +277 T 0.098 +278 I 0.109 +279 V 0.115 +280 I 0.115 +281 P 0.104 +282 L 0.090 +283 L 0.078 +284 N 0.071 +285 P 0.067 +286 V 0.065 +287 I 0.066 +288 Y 0.068 +289 S 0.074 +290 L 0.087 +291 R 0.100 +292 N 0.099 +293 K 0.086 +294 D 0.074 +295 V 0.072 +296 K 0.078 +297 D 0.086 +298 S 0.088 +299 M 0.087 +300 K 0.087 +301 K 0.096 +302 M 0.123 +303 F 0.173 +304 G 0.240 +305 K 0.304 +306 N 0.348 +307 Q 0.367 +308 V 0.368 +309 I 0.353 +310 N 0.327 +311 K 0.306 +312 V 0.304 +313 Y 0.315 +314 F 0.332 +315 H 0.357 +316 T 0.377 +317 K 0.376 +318 K 0.362 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000181718.7_ENST00000641661.1_GN:OR5T2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:41.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000181718.7_ENST00000641661.1_GN:OR5T2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:41.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7adeb6d7095af2b64b8c773e9e77af37b2a31864 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000181718.7_ENST00000641661.1_GN:OR5T2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:41.caid @@ -0,0 +1,360 @@ +>ENSG00000181718.7|ENST00000641661.1|GN:OR5T2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:41 +1 M 0.258 +2 S 0.253 +3 Y 0.252 +4 S 0.258 +5 I 0.261 +6 Y 0.254 +7 K 0.253 +8 S 0.272 +9 T 0.305 +10 V 0.339 +11 N 0.369 +12 I 0.385 +13 P 0.374 +14 L 0.343 +15 S 0.306 +16 H 0.271 +17 G 0.238 +18 V 0.212 +19 V 0.199 +20 H 0.200 +21 S 0.205 +22 F 0.209 +23 C 0.215 +24 H 0.228 +25 N 0.248 +26 M 0.266 +27 N 0.277 +28 C 0.268 +29 N 0.230 +30 F 0.177 +31 M 0.135 +32 H 0.112 +33 I 0.101 +34 F 0.095 +35 K 0.094 +36 F 0.095 +37 V 0.100 +38 L 0.118 +39 D 0.153 +40 F 0.197 +41 N 0.241 +42 M 0.282 +43 K 0.323 +44 N 0.360 +45 V 0.377 +46 T 0.357 +47 E 0.300 +48 V 0.226 +49 T 0.161 +50 L 0.124 +51 F 0.113 +52 V 0.114 +53 L 0.114 +54 K 0.114 +55 G 0.117 +56 F 0.129 +57 T 0.147 +58 D 0.162 +59 N 0.155 +60 L 0.127 +61 E 0.092 +62 L 0.065 +63 Q 0.051 +64 T 0.043 +65 I 0.040 +66 F 0.040 +67 F 0.041 +68 F 0.038 +69 L 0.034 +70 F 0.032 +71 L 0.033 +72 A 0.038 +73 I 0.043 +74 Y 0.045 +75 L 0.044 +76 F 0.045 +77 T 0.047 +78 L 0.048 +79 M 0.049 +80 G 0.056 +81 N 0.071 +82 L 0.087 +83 G 0.093 +84 L 0.086 +85 I 0.071 +86 L 0.058 +87 V 0.053 +88 V 0.052 +89 I 0.054 +90 R 0.058 +91 D 0.061 +92 S 0.061 +93 Q 0.057 +94 L 0.052 +95 H 0.046 +96 K 0.038 +97 P 0.031 +98 M 0.026 +99 Y 0.024 +100 Y 0.023 +101 F 0.024 +102 L 0.030 +103 S 0.041 +104 M 0.052 +105 L 0.061 +106 S 0.065 +107 S 0.064 +108 V 0.063 +109 D 0.066 +110 A 0.071 +111 C 0.071 +112 Y 0.066 +113 S 0.061 +114 S 0.062 +115 V 0.067 +116 I 0.074 +117 T 0.076 +118 P 0.073 +119 N 0.067 +120 M 0.062 +121 L 0.056 +122 V 0.051 +123 D 0.047 +124 F 0.050 +125 T 0.060 +126 T 0.075 +127 K 0.085 +128 N 0.082 +129 K 0.069 +130 V 0.055 +131 I 0.044 +132 S 0.036 +133 F 0.031 +134 L 0.030 +135 G 0.031 +136 C 0.032 +137 V 0.031 +138 A 0.031 +139 Q 0.031 +140 V 0.031 +141 F 0.029 +142 L 0.027 +143 A 0.025 +144 C 0.025 +145 S 0.027 +146 F 0.030 +147 G 0.036 +148 T 0.043 +149 T 0.047 +150 E 0.046 +151 C 0.041 +152 F 0.035 +153 L 0.032 +154 L 0.032 +155 A 0.032 +156 A 0.031 +157 M 0.030 +158 A 0.031 +159 Y 0.034 +160 D 0.038 +161 R 0.040 +162 Y 0.041 +163 V 0.042 +164 A 0.046 +165 I 0.051 +166 Y 0.057 +167 N 0.059 +168 P 0.056 +169 L 0.051 +170 L 0.048 +171 Y 0.051 +172 S 0.056 +173 V 0.064 +174 S 0.074 +175 M 0.081 +176 S 0.077 +177 P 0.064 +178 R 0.049 +179 V 0.039 +180 Y 0.034 +181 M 0.033 +182 P 0.036 +183 L 0.041 +184 I 0.046 +185 N 0.052 +186 A 0.060 +187 S 0.070 +188 Y 0.081 +189 V 0.089 +190 A 0.092 +191 G 0.087 +192 I 0.079 +193 L 0.078 +194 H 0.086 +195 A 0.092 +196 T 0.090 +197 I 0.086 +198 H 0.086 +199 T 0.085 +200 V 0.083 +201 A 0.083 +202 T 0.084 +203 F 0.087 +204 S 0.095 +205 L 0.101 +206 S 0.101 +207 F 0.098 +208 C 0.100 +209 G 0.107 +210 A 0.117 +211 N 0.131 +212 E 0.142 +213 I 0.139 +214 R 0.118 +215 R 0.092 +216 V 0.072 +217 F 0.063 +218 C 0.065 +219 D 0.080 +220 I 0.106 +221 P 0.134 +222 P 0.150 +223 L 0.157 +224 L 0.161 +225 A 0.164 +226 I 0.162 +227 S 0.153 +228 Y 0.148 +229 S 0.151 +230 D 0.156 +231 T 0.151 +232 H 0.134 +233 T 0.115 +234 N 0.102 +235 Q 0.096 +236 L 0.095 +237 L 0.095 +238 L 0.092 +239 F 0.085 +240 Y 0.076 +241 F 0.071 +242 V 0.070 +243 G 0.070 +244 S 0.069 +245 I 0.069 +246 E 0.067 +247 L 0.066 +248 V 0.070 +249 T 0.074 +250 I 0.072 +251 L 0.067 +252 I 0.065 +253 V 0.064 +254 L 0.057 +255 I 0.048 +256 S 0.043 +257 Y 0.040 +258 G 0.041 +259 L 0.045 +260 I 0.054 +261 L 0.066 +262 L 0.073 +263 A 0.070 +264 I 0.062 +265 L 0.056 +266 K 0.061 +267 M 0.077 +268 Y 0.098 +269 S 0.113 +270 A 0.116 +271 E 0.108 +272 G 0.094 +273 R 0.081 +274 R 0.072 +275 K 0.066 +276 V 0.063 +277 F 0.062 +278 S 0.064 +279 T 0.067 +280 C 0.069 +281 G 0.073 +282 A 0.076 +283 H 0.074 +284 L 0.071 +285 T 0.073 +286 G 0.075 +287 V 0.067 +288 S 0.051 +289 I 0.037 +290 Y 0.029 +291 Y 0.029 +292 G 0.033 +293 T 0.038 +294 I 0.039 +295 L 0.039 +296 F 0.041 +297 M 0.050 +298 Y 0.071 +299 V 0.107 +300 R 0.158 +301 P 0.212 +302 S 0.256 +303 S 0.281 +304 S 0.285 +305 Y 0.273 +306 A 0.245 +307 S 0.209 +308 D 0.176 +309 H 0.152 +310 D 0.134 +311 M 0.118 +312 I 0.104 +313 V 0.093 +314 S 0.081 +315 I 0.074 +316 F 0.077 +317 Y 0.088 +318 T 0.102 +319 I 0.112 +320 V 0.118 +321 I 0.117 +322 P 0.107 +323 L 0.092 +324 L 0.081 +325 N 0.074 +326 P 0.069 +327 V 0.067 +328 I 0.068 +329 Y 0.070 +330 S 0.075 +331 L 0.088 +332 R 0.101 +333 N 0.101 +334 K 0.087 +335 D 0.074 +336 V 0.071 +337 K 0.077 +338 D 0.085 +339 S 0.088 +340 M 0.088 +341 K 0.089 +342 K 0.097 +343 M 0.123 +344 F 0.174 +345 G 0.243 +346 K 0.311 +347 N 0.359 +348 Q 0.383 +349 V 0.389 +350 I 0.376 +351 N 0.347 +352 K 0.323 +353 V 0.319 +354 Y 0.329 +355 F 0.346 +356 H 0.370 +357 T 0.390 +358 K 0.387 +359 K 0.371 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000181785.3_ENST00000641320.1_GN:OR5AS1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000181785.3_ENST00000641320.1_GN:OR5AS1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..191cc448620e1d7967781f8f68c8b7c6de7a54db --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000181785.3_ENST00000641320.1_GN:OR5AS1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,325 @@ +>ENSG00000181785.3|ENST00000641320.1|GN:OR5AS1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.417 +2 L 0.429 +3 E 0.443 +4 S 0.450 +5 N 0.444 +6 Y 0.418 +7 T 0.369 +8 M 0.305 +9 P 0.244 +10 T 0.192 +11 E 0.153 +12 F 0.127 +13 L 0.114 +14 F 0.112 +15 V 0.116 +16 G 0.124 +17 F 0.133 +18 T 0.142 +19 D 0.145 +20 Y 0.134 +21 L 0.110 +22 P 0.084 +23 L 0.065 +24 R 0.053 +25 V 0.047 +26 T 0.046 +27 L 0.055 +28 F 0.067 +29 L 0.072 +30 V 0.062 +31 F 0.048 +32 L 0.040 +33 L 0.042 +34 V 0.048 +35 Y 0.051 +36 T 0.052 +37 L 0.053 +38 T 0.057 +39 M 0.058 +40 V 0.060 +41 G 0.065 +42 N 0.071 +43 I 0.073 +44 L 0.071 +45 L 0.064 +46 I 0.056 +47 I 0.051 +48 L 0.052 +49 V 0.057 +50 N 0.065 +51 I 0.074 +52 N 0.080 +53 S 0.080 +54 S 0.076 +55 L 0.071 +56 Q 0.065 +57 I 0.054 +58 P 0.042 +59 M 0.032 +60 Y 0.026 +61 Y 0.024 +62 F 0.027 +63 L 0.035 +64 S 0.047 +65 N 0.056 +66 L 0.061 +67 S 0.061 +68 F 0.060 +69 L 0.062 +70 D 0.069 +71 I 0.075 +72 S 0.074 +73 C 0.068 +74 S 0.064 +75 T 0.066 +76 A 0.069 +77 I 0.070 +78 T 0.068 +79 P 0.066 +80 K 0.064 +81 M 0.063 +82 L 0.061 +83 A 0.057 +84 N 0.056 +85 F 0.062 +86 L 0.075 +87 A 0.089 +88 S 0.096 +89 R 0.091 +90 K 0.081 +91 S 0.071 +92 I 0.064 +93 S 0.059 +94 P 0.055 +95 Y 0.051 +96 G 0.047 +97 C 0.043 +98 A 0.039 +99 L 0.036 +100 Q 0.037 +101 M 0.037 +102 F 0.034 +103 F 0.030 +104 F 0.028 +105 A 0.029 +106 S 0.032 +107 F 0.037 +108 A 0.045 +109 D 0.054 +110 A 0.059 +111 E 0.059 +112 C 0.054 +113 L 0.049 +114 I 0.044 +115 L 0.041 +116 A 0.038 +117 A 0.034 +118 M 0.033 +119 A 0.034 +120 Y 0.038 +121 D 0.043 +122 R 0.047 +123 Y 0.048 +124 A 0.048 +125 A 0.049 +126 I 0.052 +127 C 0.058 +128 N 0.064 +129 P 0.064 +130 L 0.059 +131 L 0.055 +132 Y 0.053 +133 T 0.054 +134 T 0.060 +135 L 0.067 +136 M 0.073 +137 S 0.075 +138 R 0.074 +139 R 0.069 +140 V 0.061 +141 C 0.055 +142 V 0.057 +143 C 0.065 +144 F 0.070 +145 I 0.073 +146 V 0.074 +147 L 0.068 +148 A 0.061 +149 Y 0.058 +150 F 0.064 +151 S 0.077 +152 G 0.086 +153 S 0.086 +154 T 0.081 +155 T 0.079 +156 S 0.079 +157 L 0.078 +158 V 0.076 +159 H 0.075 +160 V 0.070 +161 C 0.066 +162 L 0.068 +163 T 0.073 +164 F 0.080 +165 R 0.091 +166 L 0.099 +167 S 0.101 +168 F 0.101 +169 C 0.108 +170 G 0.117 +171 S 0.127 +172 N 0.135 +173 I 0.141 +174 V 0.136 +175 N 0.116 +176 H 0.092 +177 F 0.074 +178 F 0.065 +179 C 0.066 +180 D 0.080 +181 I 0.105 +182 P 0.129 +183 P 0.142 +184 L 0.145 +185 L 0.147 +186 A 0.147 +187 L 0.138 +188 S 0.122 +189 C 0.112 +190 T 0.117 +191 D 0.131 +192 T 0.137 +193 Q 0.131 +194 I 0.118 +195 N 0.106 +196 Q 0.098 +197 L 0.096 +198 L 0.098 +199 L 0.099 +200 F 0.095 +201 A 0.089 +202 L 0.085 +203 C 0.082 +204 S 0.076 +205 F 0.068 +206 I 0.065 +207 Q 0.067 +208 T 0.072 +209 S 0.082 +210 T 0.087 +211 F 0.083 +212 V 0.077 +213 V 0.075 +214 I 0.073 +215 F 0.065 +216 I 0.056 +217 S 0.049 +218 Y 0.046 +219 F 0.046 +220 C 0.049 +221 I 0.053 +222 L 0.057 +223 I 0.060 +224 T 0.062 +225 V 0.065 +226 L 0.076 +227 S 0.100 +228 I 0.133 +229 K 0.168 +230 S 0.195 +231 S 0.208 +232 G 0.201 +233 G 0.175 +234 R 0.141 +235 S 0.116 +236 K 0.103 +237 T 0.094 +238 F 0.086 +239 S 0.080 +240 T 0.076 +241 C 0.072 +242 A 0.071 +243 S 0.071 +244 H 0.069 +245 L 0.064 +246 I 0.063 +247 A 0.063 +248 V 0.056 +249 T 0.044 +250 L 0.032 +251 F 0.027 +252 Y 0.029 +253 G 0.035 +254 A 0.041 +255 L 0.043 +256 L 0.042 +257 F 0.044 +258 M 0.053 +259 Y 0.073 +260 L 0.106 +261 Q 0.148 +262 P 0.190 +263 T 0.223 +264 T 0.239 +265 S 0.240 +266 Y 0.226 +267 S 0.204 +268 L 0.176 +269 D 0.147 +270 T 0.125 +271 D 0.114 +272 K 0.109 +273 V 0.105 +274 V 0.098 +275 A 0.085 +276 V 0.074 +277 F 0.073 +278 Y 0.084 +279 T 0.098 +280 V 0.106 +281 V 0.108 +282 F 0.106 +283 P 0.100 +284 M 0.091 +285 F 0.085 +286 N 0.080 +287 P 0.075 +288 I 0.073 +289 I 0.073 +290 Y 0.072 +291 S 0.076 +292 F 0.087 +293 R 0.097 +294 N 0.093 +295 K 0.077 +296 D 0.063 +297 V 0.061 +298 K 0.068 +299 N 0.077 +300 A 0.080 +301 L 0.081 +302 K 0.086 +303 K 0.090 +304 L 0.091 +305 L 0.093 +306 E 0.102 +307 R 0.122 +308 I 0.153 +309 G 0.190 +310 Y 0.222 +311 S 0.242 +312 N 0.244 +313 E 0.225 +314 W 0.199 +315 Y 0.181 +316 L 0.180 +317 N 0.196 +318 R 0.224 +319 L 0.256 +320 R 0.289 +321 I 0.315 +322 V 0.323 +323 N 0.312 +324 I 0.296 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000181785.3_ENST00000641320.1_GN:OR5AS1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000181785.3_ENST00000641320.1_GN:OR5AS1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7bc96e96b643de29ecc9244f336f36c1eba9f71f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000181785.3_ENST00000641320.1_GN:OR5AS1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid @@ -0,0 +1,338 @@ +>ENSG00000181785.3|ENST00000641320.1|GN:OR5AS1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:13 +1 M 0.320 +2 V 0.337 +3 L 0.363 +4 R 0.384 +5 S 0.394 +6 S 0.409 +7 G 0.436 +8 K 0.449 +9 N 0.428 +10 K 0.399 +11 K 0.387 +12 T 0.388 +13 K 0.401 +14 M 0.438 +15 L 0.483 +16 E 0.504 +17 S 0.492 +18 N 0.463 +19 Y 0.425 +20 T 0.374 +21 M 0.314 +22 P 0.255 +23 T 0.202 +24 E 0.159 +25 F 0.129 +26 L 0.114 +27 F 0.111 +28 V 0.115 +29 G 0.124 +30 F 0.134 +31 T 0.145 +32 D 0.150 +33 Y 0.139 +34 L 0.114 +35 P 0.086 +36 L 0.065 +37 R 0.053 +38 V 0.046 +39 T 0.045 +40 L 0.052 +41 F 0.062 +42 L 0.065 +43 V 0.057 +44 F 0.045 +45 L 0.039 +46 L 0.042 +47 V 0.048 +48 Y 0.052 +49 T 0.052 +50 L 0.054 +51 T 0.057 +52 M 0.059 +53 V 0.061 +54 G 0.066 +55 N 0.071 +56 I 0.074 +57 L 0.072 +58 L 0.066 +59 I 0.058 +60 I 0.053 +61 L 0.053 +62 V 0.058 +63 N 0.066 +64 I 0.075 +65 N 0.080 +66 S 0.080 +67 S 0.076 +68 L 0.071 +69 Q 0.064 +70 I 0.054 +71 P 0.042 +72 M 0.031 +73 Y 0.025 +74 Y 0.023 +75 F 0.026 +76 L 0.035 +77 S 0.048 +78 N 0.057 +79 L 0.062 +80 S 0.062 +81 F 0.060 +82 L 0.061 +83 D 0.068 +84 I 0.073 +85 S 0.073 +86 C 0.068 +87 S 0.065 +88 T 0.066 +89 A 0.069 +90 I 0.068 +91 T 0.066 +92 P 0.063 +93 K 0.062 +94 M 0.060 +95 L 0.058 +96 A 0.054 +97 N 0.053 +98 F 0.058 +99 L 0.070 +100 A 0.084 +101 S 0.091 +102 R 0.088 +103 K 0.079 +104 S 0.070 +105 I 0.063 +106 S 0.058 +107 P 0.054 +108 Y 0.050 +109 G 0.047 +110 C 0.043 +111 A 0.038 +112 L 0.035 +113 Q 0.036 +114 M 0.036 +115 F 0.034 +116 F 0.030 +117 F 0.028 +118 A 0.029 +119 S 0.032 +120 F 0.037 +121 A 0.045 +122 D 0.053 +123 A 0.058 +124 E 0.058 +125 C 0.054 +126 L 0.049 +127 I 0.044 +128 L 0.041 +129 A 0.038 +130 A 0.034 +131 M 0.033 +132 A 0.034 +133 Y 0.038 +134 D 0.043 +135 R 0.047 +136 Y 0.049 +137 A 0.049 +138 A 0.050 +139 I 0.053 +140 C 0.059 +141 N 0.065 +142 P 0.065 +143 L 0.061 +144 L 0.056 +145 Y 0.054 +146 T 0.056 +147 T 0.061 +148 L 0.070 +149 M 0.076 +150 S 0.076 +151 R 0.074 +152 R 0.069 +153 V 0.060 +154 C 0.054 +155 V 0.057 +156 C 0.064 +157 F 0.069 +158 I 0.071 +159 V 0.071 +160 L 0.067 +161 A 0.060 +162 Y 0.058 +163 F 0.065 +164 S 0.078 +165 G 0.088 +166 S 0.088 +167 T 0.082 +168 T 0.080 +169 S 0.080 +170 L 0.078 +171 V 0.076 +172 H 0.075 +173 V 0.070 +174 C 0.066 +175 L 0.067 +176 T 0.072 +177 F 0.081 +178 R 0.092 +179 L 0.101 +180 S 0.102 +181 F 0.102 +182 C 0.108 +183 G 0.118 +184 S 0.128 +185 N 0.137 +186 I 0.144 +187 V 0.138 +188 N 0.118 +189 H 0.093 +190 F 0.075 +191 F 0.066 +192 C 0.067 +193 D 0.081 +194 I 0.105 +195 P 0.129 +196 P 0.142 +197 L 0.145 +198 L 0.147 +199 A 0.147 +200 L 0.138 +201 S 0.122 +202 C 0.111 +203 T 0.116 +204 D 0.129 +205 T 0.135 +206 Q 0.129 +207 I 0.117 +208 N 0.106 +209 Q 0.098 +210 L 0.096 +211 L 0.098 +212 L 0.099 +213 F 0.095 +214 A 0.090 +215 L 0.086 +216 C 0.083 +217 S 0.077 +218 F 0.069 +219 I 0.066 +220 Q 0.068 +221 T 0.074 +222 S 0.083 +223 T 0.088 +224 F 0.084 +225 V 0.077 +226 V 0.075 +227 I 0.074 +228 F 0.066 +229 I 0.057 +230 S 0.050 +231 Y 0.047 +232 F 0.046 +233 C 0.047 +234 I 0.046 +235 L 0.043 +236 I 0.043 +237 T 0.048 +238 V 0.058 +239 L 0.074 +240 S 0.100 +241 I 0.133 +242 K 0.169 +243 S 0.196 +244 S 0.209 +245 G 0.203 +246 G 0.177 +247 R 0.143 +248 S 0.118 +249 K 0.104 +250 T 0.095 +251 F 0.087 +252 S 0.081 +253 T 0.077 +254 C 0.073 +255 A 0.072 +256 S 0.073 +257 H 0.070 +258 L 0.065 +259 I 0.064 +260 A 0.064 +261 V 0.057 +262 T 0.044 +263 L 0.033 +264 F 0.028 +265 Y 0.029 +266 G 0.035 +267 A 0.041 +268 L 0.043 +269 L 0.042 +270 F 0.043 +271 M 0.053 +272 Y 0.073 +273 L 0.106 +274 Q 0.149 +275 P 0.192 +276 T 0.225 +277 T 0.243 +278 S 0.244 +279 Y 0.231 +280 S 0.209 +281 L 0.181 +282 D 0.152 +283 T 0.129 +284 D 0.117 +285 K 0.112 +286 V 0.108 +287 V 0.101 +288 A 0.087 +289 V 0.076 +290 F 0.075 +291 Y 0.086 +292 T 0.100 +293 V 0.108 +294 V 0.110 +295 F 0.108 +296 P 0.101 +297 M 0.093 +298 F 0.086 +299 N 0.081 +300 P 0.076 +301 I 0.073 +302 I 0.074 +303 Y 0.074 +304 S 0.077 +305 F 0.089 +306 R 0.099 +307 N 0.095 +308 K 0.078 +309 D 0.064 +310 V 0.061 +311 K 0.068 +312 N 0.077 +313 A 0.080 +314 L 0.082 +315 K 0.086 +316 K 0.091 +317 L 0.092 +318 L 0.094 +319 E 0.103 +320 R 0.123 +321 I 0.155 +322 G 0.193 +323 Y 0.226 +324 S 0.247 +325 N 0.248 +326 E 0.229 +327 W 0.203 +328 Y 0.184 +329 L 0.182 +330 N 0.197 +331 R 0.225 +332 L 0.258 +333 R 0.292 +334 I 0.320 +335 V 0.329 +336 N 0.317 +337 I 0.300 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000181982.21_ENST00000635206.3_GN:CCDC149_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000181982.21_ENST00000635206.3_GN:CCDC149_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c63282e57945010b936125cf04aabad37d03ccfa --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000181982.21_ENST00000635206.3_GN:CCDC149_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,536 @@ +>ENSG00000181982.21|ENST00000635206.3|GN:CCDC149|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.430 +2 N 0.464 +3 G 0.505 +4 D 0.517 +5 R 0.488 +6 T 0.443 +7 E 0.410 +8 S 0.385 +9 D 0.348 +10 W 0.300 +11 Q 0.257 +12 G 0.224 +13 L 0.194 +14 V 0.171 +15 S 0.158 +16 E 0.144 +17 Y 0.121 +18 L 0.103 +19 V 0.101 +20 C 0.112 +21 K 0.129 +22 R 0.144 +23 K 0.157 +24 L 0.177 +25 E 0.205 +26 S 0.228 +27 K 0.247 +28 K 0.275 +29 E 0.305 +30 A 0.308 +31 L 0.280 +32 L 0.249 +33 I 0.232 +34 L 0.226 +35 S 0.227 +36 K 0.231 +37 E 0.234 +38 L 0.237 +39 D 0.243 +40 T 0.243 +41 C 0.241 +42 Q 0.254 +43 Q 0.277 +44 E 0.280 +45 R 0.259 +46 D 0.239 +47 Q 0.225 +48 Y 0.212 +49 K 0.206 +50 L 0.206 +51 M 0.205 +52 A 0.206 +53 N 0.215 +54 Q 0.222 +55 L 0.224 +56 R 0.230 +57 E 0.238 +58 R 0.236 +59 H 0.223 +60 Q 0.215 +61 S 0.215 +62 L 0.216 +63 K 0.218 +64 K 0.222 +65 K 0.218 +66 Y 0.208 +67 R 0.205 +68 E 0.221 +69 L 0.253 +70 I 0.295 +71 D 0.341 +72 G 0.386 +73 D 0.415 +74 P 0.422 +75 S 0.415 +76 L 0.406 +77 P 0.399 +78 P 0.391 +79 E 0.385 +80 K 0.389 +81 R 0.414 +82 K 0.452 +83 Q 0.482 +84 A 0.485 +85 N 0.453 +86 L 0.398 +87 A 0.350 +88 Q 0.324 +89 L 0.302 +90 L 0.285 +91 R 0.286 +92 D 0.302 +93 S 0.322 +94 Q 0.353 +95 D 0.388 +96 R 0.401 +97 N 0.390 +98 K 0.381 +99 H 0.383 +100 L 0.393 +101 G 0.409 +102 E 0.410 +103 E 0.380 +104 I 0.331 +105 K 0.288 +106 E 0.259 +107 L 0.246 +108 Q 0.251 +109 Q 0.270 +110 R 0.294 +111 L 0.323 +112 G 0.350 +113 E 0.358 +114 V 0.350 +115 Q 0.352 +116 G 0.362 +117 D 0.350 +118 N 0.309 +119 K 0.262 +120 L 0.228 +121 L 0.210 +122 R 0.204 +123 M 0.204 +124 T 0.206 +125 I 0.212 +126 A 0.224 +127 K 0.241 +128 Q 0.272 +129 R 0.327 +130 L 0.396 +131 G 0.461 +132 D 0.513 +133 E 0.547 +134 A 0.566 +135 I 0.585 +136 G 0.607 +137 V 0.616 +138 R 0.600 +139 H 0.564 +140 F 0.512 +141 A 0.453 +142 A 0.416 +143 H 0.412 +144 E 0.417 +145 R 0.413 +146 E 0.405 +147 D 0.389 +148 L 0.360 +149 V 0.326 +150 Q 0.300 +151 Q 0.283 +152 L 0.268 +153 E 0.256 +154 R 0.250 +155 A 0.248 +156 K 0.247 +157 E 0.249 +158 Q 0.256 +159 I 0.269 +160 E 0.290 +161 S 0.319 +162 L 0.362 +163 E 0.411 +164 H 0.441 +165 D 0.441 +166 L 0.434 +167 Q 0.433 +168 A 0.419 +169 S 0.393 +170 V 0.388 +171 D 0.395 +172 E 0.378 +173 L 0.342 +174 Q 0.320 +175 D 0.307 +176 V 0.289 +177 K 0.284 +178 E 0.299 +179 E 0.310 +180 R 0.304 +181 S 0.288 +182 S 0.271 +183 Y 0.263 +184 Q 0.274 +185 D 0.289 +186 K 0.288 +187 V 0.276 +188 E 0.265 +189 R 0.259 +190 L 0.255 +191 N 0.258 +192 Q 0.267 +193 E 0.270 +194 L 0.267 +195 N 0.267 +196 H 0.276 +197 I 0.293 +198 L 0.319 +199 S 0.352 +200 G 0.385 +201 H 0.414 +202 E 0.439 +203 N 0.463 +204 R 0.485 +205 I 0.498 +206 I 0.480 +207 D 0.427 +208 V 0.368 +209 D 0.324 +210 A 0.293 +211 L 0.274 +212 C 0.282 +213 M 0.308 +214 E 0.317 +215 N 0.287 +216 R 0.241 +217 Y 0.209 +218 L 0.199 +219 Q 0.202 +220 E 0.203 +221 R 0.197 +222 L 0.188 +223 K 0.182 +224 Q 0.180 +225 L 0.183 +226 H 0.196 +227 E 0.213 +228 E 0.218 +229 V 0.213 +230 N 0.209 +231 L 0.208 +232 L 0.213 +233 K 0.224 +234 S 0.238 +235 N 0.241 +236 I 0.233 +237 A 0.217 +238 K 0.198 +239 Y 0.185 +240 K 0.184 +241 N 0.192 +242 A 0.205 +243 L 0.219 +244 E 0.238 +245 R 0.264 +246 R 0.304 +247 K 0.363 +248 N 0.429 +249 S 0.490 +250 K 0.543 +251 G 0.592 +252 Q 0.635 +253 G 0.666 +254 K 0.684 +255 S 0.694 +256 S 0.701 +257 S 0.703 +258 S 0.700 +259 A 0.696 +260 L 0.696 +261 T 0.698 +262 G 0.689 +263 V 0.652 +264 L 0.582 +265 S 0.504 +266 A 0.452 +267 K 0.439 +268 Q 0.454 +269 V 0.488 +270 Q 0.536 +271 D 0.583 +272 L 0.617 +273 L 0.643 +274 S 0.663 +275 E 0.679 +276 D 0.690 +277 H 0.696 +278 G 0.693 +279 C 0.684 +280 S 0.677 +281 L 0.675 +282 P 0.667 +283 A 0.644 +284 T 0.601 +285 P 0.543 +286 Q 0.476 +287 S 0.417 +288 I 0.385 +289 S 0.378 +290 D 0.375 +291 L 0.361 +292 K 0.344 +293 S 0.329 +294 L 0.315 +295 A 0.300 +296 T 0.281 +297 A 0.257 +298 L 0.236 +299 L 0.223 +300 E 0.210 +301 T 0.187 +302 I 0.166 +303 H 0.157 +304 E 0.158 +305 K 0.162 +306 N 0.170 +307 M 0.181 +308 V 0.187 +309 I 0.188 +310 Q 0.190 +311 H 0.198 +312 Q 0.216 +313 R 0.250 +314 Q 0.291 +315 T 0.319 +316 N 0.326 +317 K 0.319 +318 I 0.308 +319 L 0.308 +320 G 0.326 +321 N 0.343 +322 R 0.333 +323 V 0.296 +324 A 0.254 +325 E 0.225 +326 L 0.212 +327 E 0.210 +328 K 0.211 +329 K 0.215 +330 L 0.227 +331 R 0.252 +332 T 0.293 +333 L 0.346 +334 E 0.404 +335 V 0.463 +336 S 0.525 +337 G 0.586 +338 L 0.633 +339 W 0.659 +340 S 0.673 +341 L 0.688 +342 P 0.713 +343 G 0.740 +344 L 0.762 +345 S 0.779 +346 Y 0.796 +347 N 0.812 +348 V 0.823 +349 S 0.827 +350 V 0.825 +351 G 0.821 +352 F 0.819 +353 G 0.821 +354 R 0.827 +355 G 0.835 +356 K 0.842 +357 D 0.846 +358 T 0.848 +359 I 0.849 +360 L 0.846 +361 F 0.836 +362 S 0.820 +363 D 0.804 +364 P 0.792 +365 T 0.786 +366 L 0.793 +367 P 0.811 +368 S 0.833 +369 G 0.848 +370 Q 0.850 +371 R 0.839 +372 S 0.824 +373 R 0.815 +374 S 0.818 +375 P 0.831 +376 L 0.844 +377 L 0.851 +378 K 0.852 +379 F 0.847 +380 V 0.835 +381 E 0.821 +382 Q 0.813 +383 P 0.816 +384 T 0.825 +385 E 0.833 +386 N 0.832 +387 K 0.822 +388 A 0.809 +389 D 0.801 +390 P 0.803 +391 K 0.809 +392 D 0.814 +393 G 0.811 +394 E 0.788 +395 A 0.735 +396 Q 0.665 +397 K 0.631 +398 Q 0.666 +399 E 0.731 +400 E 0.778 +401 D 0.799 +402 E 0.805 +403 S 0.807 +404 C 0.811 +405 A 0.817 +406 A 0.821 +407 A 0.822 +408 E 0.820 +409 A 0.815 +410 L 0.806 +411 T 0.795 +412 A 0.790 +413 P 0.797 +414 E 0.812 +415 D 0.823 +416 A 0.822 +417 G 0.813 +418 R 0.806 +419 P 0.809 +420 A 0.814 +421 V 0.810 +422 N 0.797 +423 S 0.785 +424 P 0.773 +425 A 0.740 +426 N 0.683 +427 Q 0.650 +428 S 0.681 +429 R 0.747 +430 G 0.796 +431 N 0.813 +432 Q 0.808 +433 C 0.797 +434 K 0.785 +435 L 0.767 +436 F 0.744 +437 H 0.730 +438 P 0.731 +439 S 0.742 +440 L 0.750 +441 P 0.754 +442 Q 0.755 +443 L 0.749 +444 P 0.721 +445 S 0.667 +446 E 0.603 +447 E 0.558 +448 E 0.535 +449 V 0.516 +450 N 0.501 +451 S 0.494 +452 L 0.485 +453 G 0.467 +454 R 0.452 +455 E 0.435 +456 I 0.400 +457 I 0.363 +458 K 0.361 +459 L 0.393 +460 T 0.416 +461 K 0.414 +462 E 0.411 +463 Q 0.427 +464 A 0.469 +465 A 0.531 +466 A 0.584 +467 E 0.606 +468 L 0.602 +469 E 0.590 +470 E 0.580 +471 V 0.569 +472 R 0.556 +473 R 0.552 +474 E 0.567 +475 S 0.602 +476 P 0.655 +477 I 0.715 +478 E 0.767 +479 G 0.796 +480 Q 0.806 +481 R 0.806 +482 S 0.802 +483 E 0.793 +484 T 0.780 +485 G 0.766 +486 P 0.755 +487 A 0.756 +488 P 0.773 +489 P 0.802 +490 G 0.830 +491 L 0.847 +492 A 0.852 +493 I 0.850 +494 Q 0.845 +495 G 0.834 +496 E 0.820 +497 L 0.809 +498 P 0.807 +499 K 0.811 +500 S 0.814 +501 H 0.814 +502 L 0.815 +503 D 0.817 +504 S 0.814 +505 F 0.807 +506 E 0.796 +507 A 0.779 +508 S 0.764 +509 R 0.761 +510 P 0.777 +511 A 0.803 +512 A 0.822 +513 K 0.825 +514 A 0.815 +515 S 0.801 +516 T 0.794 +517 P 0.800 +518 E 0.813 +519 D 0.822 +520 G 0.822 +521 K 0.812 +522 G 0.800 +523 I 0.792 +524 P 0.793 +525 E 0.799 +526 G 0.805 +527 G 0.810 +528 G 0.814 +529 M 0.818 +530 R 0.819 +531 S 0.814 +532 T 0.797 +533 V 0.761 +534 K 0.712 +535 T 0.673 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000181982.21_ENST00000635206.3_GN:CCDC149_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000181982.21_ENST00000635206.3_GN:CCDC149_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..83f497f009cba643020ca6f92142547048807bd8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000181982.21_ENST00000635206.3_GN:CCDC149_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid @@ -0,0 +1,541 @@ +>ENSG00000181982.21|ENST00000635206.3|GN:CCDC149|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:5 +1 M 0.451 +2 E 0.489 +3 E 0.538 +4 E 0.575 +5 A 0.591 +6 M 0.594 +7 N 0.598 +8 G 0.601 +9 D 0.582 +10 R 0.538 +11 T 0.497 +12 E 0.474 +13 S 0.447 +14 D 0.396 +15 W 0.333 +16 Q 0.282 +17 G 0.243 +18 L 0.207 +19 V 0.180 +20 S 0.163 +21 E 0.146 +22 Y 0.124 +23 L 0.107 +24 V 0.105 +25 C 0.115 +26 K 0.130 +27 R 0.144 +28 K 0.157 +29 L 0.178 +30 E 0.207 +31 S 0.232 +32 K 0.253 +33 K 0.285 +34 E 0.318 +35 A 0.321 +36 L 0.293 +37 L 0.261 +38 I 0.242 +39 L 0.234 +40 S 0.234 +41 K 0.237 +42 E 0.241 +43 L 0.247 +44 D 0.256 +45 T 0.257 +46 C 0.254 +47 Q 0.268 +48 Q 0.292 +49 E 0.295 +50 R 0.271 +51 D 0.246 +52 Q 0.230 +53 Y 0.216 +54 K 0.208 +55 L 0.207 +56 M 0.205 +57 A 0.205 +58 N 0.213 +59 Q 0.218 +60 L 0.216 +61 R 0.217 +62 E 0.223 +63 R 0.222 +64 H 0.212 +65 Q 0.207 +66 S 0.208 +67 L 0.210 +68 K 0.212 +69 K 0.215 +70 K 0.211 +71 Y 0.202 +72 R 0.200 +73 E 0.216 +74 L 0.248 +75 I 0.289 +76 D 0.335 +77 G 0.380 +78 D 0.410 +79 P 0.417 +80 S 0.410 +81 L 0.401 +82 P 0.393 +83 P 0.383 +84 E 0.375 +85 K 0.379 +86 R 0.403 +87 K 0.440 +88 Q 0.468 +89 A 0.472 +90 N 0.441 +91 L 0.387 +92 A 0.341 +93 Q 0.317 +94 L 0.296 +95 L 0.276 +96 R 0.276 +97 D 0.291 +98 S 0.311 +99 Q 0.339 +100 D 0.371 +101 R 0.382 +102 N 0.372 +103 K 0.363 +104 H 0.366 +105 L 0.377 +106 G 0.393 +107 E 0.393 +108 E 0.365 +109 I 0.320 +110 K 0.281 +111 E 0.254 +112 L 0.243 +113 Q 0.249 +114 Q 0.266 +115 R 0.288 +116 L 0.316 +117 G 0.344 +118 E 0.354 +119 V 0.347 +120 Q 0.349 +121 G 0.359 +122 D 0.347 +123 N 0.307 +124 K 0.260 +125 L 0.227 +126 L 0.209 +127 R 0.203 +128 M 0.203 +129 T 0.205 +130 I 0.212 +131 A 0.224 +132 K 0.242 +133 Q 0.276 +134 R 0.333 +135 L 0.404 +136 G 0.472 +137 D 0.524 +138 E 0.557 +139 A 0.576 +140 I 0.594 +141 G 0.614 +142 V 0.622 +143 R 0.606 +144 H 0.570 +145 F 0.516 +146 A 0.455 +147 A 0.416 +148 H 0.410 +149 E 0.412 +150 R 0.406 +151 E 0.397 +152 D 0.382 +153 L 0.355 +154 V 0.322 +155 Q 0.298 +156 Q 0.281 +157 L 0.265 +158 E 0.253 +159 R 0.247 +160 A 0.245 +161 K 0.245 +162 E 0.249 +163 Q 0.256 +164 I 0.270 +165 E 0.291 +166 S 0.322 +167 L 0.364 +168 E 0.413 +169 H 0.443 +170 D 0.443 +171 L 0.435 +172 Q 0.434 +173 A 0.419 +174 S 0.393 +175 V 0.387 +176 D 0.394 +177 E 0.377 +178 L 0.340 +179 Q 0.317 +180 D 0.303 +181 V 0.285 +182 K 0.280 +183 E 0.296 +184 E 0.307 +185 R 0.302 +186 S 0.286 +187 S 0.270 +188 Y 0.262 +189 Q 0.272 +190 D 0.287 +191 K 0.286 +192 V 0.273 +193 E 0.263 +194 R 0.257 +195 L 0.252 +196 N 0.253 +197 Q 0.260 +198 E 0.262 +199 L 0.258 +200 N 0.258 +201 H 0.267 +202 I 0.285 +203 L 0.310 +204 S 0.342 +205 G 0.375 +206 H 0.404 +207 E 0.430 +208 N 0.453 +209 R 0.475 +210 I 0.488 +211 I 0.470 +212 D 0.418 +213 V 0.360 +214 D 0.318 +215 A 0.288 +216 L 0.270 +217 C 0.279 +218 M 0.306 +219 E 0.315 +220 N 0.286 +221 R 0.241 +222 Y 0.209 +223 L 0.200 +224 Q 0.203 +225 E 0.205 +226 R 0.198 +227 L 0.189 +228 K 0.183 +229 Q 0.180 +230 L 0.183 +231 H 0.196 +232 E 0.213 +233 E 0.218 +234 V 0.212 +235 N 0.208 +236 L 0.208 +237 L 0.212 +238 K 0.224 +239 S 0.238 +240 N 0.241 +241 I 0.233 +242 A 0.217 +243 K 0.198 +244 Y 0.184 +245 K 0.183 +246 N 0.191 +247 A 0.203 +248 L 0.218 +249 E 0.236 +250 R 0.262 +251 R 0.302 +252 K 0.360 +253 N 0.426 +254 S 0.487 +255 K 0.540 +256 G 0.589 +257 Q 0.633 +258 G 0.664 +259 K 0.683 +260 S 0.694 +261 S 0.700 +262 S 0.703 +263 S 0.700 +264 A 0.695 +265 L 0.695 +266 T 0.698 +267 G 0.690 +268 V 0.652 +269 L 0.583 +270 S 0.506 +271 A 0.454 +272 K 0.442 +273 Q 0.458 +274 V 0.492 +275 Q 0.540 +276 D 0.588 +277 L 0.622 +278 L 0.646 +279 S 0.665 +280 E 0.680 +281 D 0.691 +282 H 0.698 +283 G 0.696 +284 C 0.687 +285 S 0.681 +286 L 0.678 +287 P 0.671 +288 A 0.649 +289 T 0.607 +290 P 0.549 +291 Q 0.481 +292 S 0.422 +293 I 0.389 +294 S 0.382 +295 D 0.379 +296 L 0.366 +297 K 0.349 +298 S 0.334 +299 L 0.319 +300 A 0.303 +301 T 0.283 +302 A 0.259 +303 L 0.238 +304 L 0.224 +305 E 0.211 +306 T 0.188 +307 I 0.167 +308 H 0.158 +309 E 0.160 +310 K 0.163 +311 N 0.172 +312 M 0.183 +313 V 0.189 +314 I 0.190 +315 Q 0.193 +316 H 0.200 +317 Q 0.218 +318 R 0.252 +319 Q 0.293 +320 T 0.322 +321 N 0.330 +322 K 0.324 +323 I 0.313 +324 L 0.313 +325 G 0.331 +326 N 0.348 +327 R 0.337 +328 V 0.299 +329 A 0.258 +330 E 0.229 +331 L 0.216 +332 E 0.213 +333 K 0.213 +334 K 0.216 +335 L 0.228 +336 R 0.254 +337 T 0.295 +338 L 0.348 +339 E 0.407 +340 V 0.466 +341 S 0.527 +342 G 0.586 +343 L 0.632 +344 W 0.658 +345 S 0.671 +346 L 0.687 +347 P 0.712 +348 G 0.740 +349 L 0.762 +350 S 0.778 +351 Y 0.795 +352 N 0.811 +353 V 0.822 +354 S 0.826 +355 V 0.825 +356 G 0.821 +357 F 0.818 +358 G 0.820 +359 R 0.827 +360 G 0.835 +361 K 0.842 +362 D 0.846 +363 T 0.847 +364 I 0.849 +365 L 0.846 +366 F 0.836 +367 S 0.820 +368 D 0.804 +369 P 0.791 +370 T 0.785 +371 L 0.792 +372 P 0.810 +373 S 0.832 +374 G 0.848 +375 Q 0.849 +376 R 0.838 +377 S 0.823 +378 R 0.814 +379 S 0.818 +380 P 0.830 +381 L 0.843 +382 L 0.851 +383 K 0.851 +384 F 0.846 +385 V 0.834 +386 E 0.820 +387 Q 0.813 +388 P 0.815 +389 T 0.824 +390 E 0.832 +391 N 0.832 +392 K 0.822 +393 A 0.809 +394 D 0.801 +395 P 0.802 +396 K 0.809 +397 D 0.814 +398 G 0.810 +399 E 0.785 +400 A 0.730 +401 Q 0.658 +402 K 0.625 +403 Q 0.659 +404 E 0.722 +405 E 0.767 +406 D 0.790 +407 E 0.801 +408 S 0.805 +409 C 0.810 +410 A 0.816 +411 A 0.821 +412 A 0.821 +413 E 0.819 +414 A 0.814 +415 L 0.805 +416 T 0.793 +417 A 0.789 +418 P 0.796 +419 E 0.810 +420 D 0.821 +421 A 0.821 +422 G 0.811 +423 R 0.804 +424 P 0.807 +425 A 0.812 +426 V 0.808 +427 N 0.794 +428 S 0.782 +429 P 0.770 +430 A 0.738 +431 N 0.681 +432 Q 0.648 +433 S 0.679 +434 R 0.746 +435 G 0.795 +436 N 0.812 +437 Q 0.808 +438 C 0.798 +439 K 0.785 +440 L 0.767 +441 F 0.745 +442 H 0.730 +443 P 0.731 +444 S 0.742 +445 L 0.750 +446 P 0.753 +447 Q 0.755 +448 L 0.749 +449 P 0.722 +450 S 0.669 +451 E 0.606 +452 E 0.561 +453 E 0.538 +454 V 0.520 +455 N 0.504 +456 S 0.497 +457 L 0.488 +458 G 0.470 +459 R 0.455 +460 E 0.439 +461 I 0.404 +462 I 0.367 +463 K 0.365 +464 L 0.397 +465 T 0.420 +466 K 0.418 +467 E 0.415 +468 Q 0.430 +469 A 0.472 +470 A 0.532 +471 A 0.585 +472 E 0.607 +473 L 0.602 +474 E 0.590 +475 E 0.580 +476 V 0.569 +477 R 0.557 +478 R 0.553 +479 E 0.567 +480 S 0.602 +481 P 0.655 +482 I 0.715 +483 E 0.767 +484 G 0.796 +485 Q 0.805 +486 R 0.805 +487 S 0.801 +488 E 0.792 +489 T 0.779 +490 G 0.765 +491 P 0.754 +492 A 0.755 +493 P 0.772 +494 P 0.802 +495 G 0.830 +496 L 0.847 +497 A 0.852 +498 I 0.851 +499 Q 0.845 +500 G 0.834 +501 E 0.820 +502 L 0.809 +503 P 0.807 +504 K 0.811 +505 S 0.814 +506 H 0.814 +507 L 0.815 +508 D 0.817 +509 S 0.814 +510 F 0.807 +511 E 0.796 +512 A 0.779 +513 S 0.764 +514 R 0.761 +515 P 0.777 +516 A 0.803 +517 A 0.822 +518 K 0.825 +519 A 0.814 +520 S 0.800 +521 T 0.794 +522 P 0.800 +523 E 0.813 +524 D 0.822 +525 G 0.822 +526 K 0.812 +527 G 0.800 +528 I 0.792 +529 P 0.792 +530 E 0.798 +531 G 0.804 +532 G 0.809 +533 G 0.814 +534 M 0.818 +535 R 0.819 +536 S 0.814 +537 T 0.795 +538 V 0.758 +539 K 0.707 +540 T 0.666 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000182287.16_ENST00000672987.1_GN:AP1S2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000182287.16_ENST00000672987.1_GN:AP1S2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b363b0c95503f8d396d0af766ec9a2d5db86ec49 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000182287.16_ENST00000672987.1_GN:AP1S2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,161 @@ +>ENSG00000182287.16|ENST00000672987.1|GN:AP1S2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.070 +2 Q 0.055 +3 F 0.035 +4 M 0.021 +5 L 0.014 +6 L 0.013 +7 F 0.015 +8 S 0.020 +9 R 0.030 +10 Q 0.043 +11 G 0.053 +12 K 0.057 +13 L 0.056 +14 R 0.052 +15 L 0.047 +16 Q 0.045 +17 K 0.047 +18 W 0.053 +19 Y 0.060 +20 V 0.065 +21 P 0.069 +22 L 0.070 +23 S 0.071 +24 D 0.072 +25 K 0.070 +26 E 0.064 +27 K 0.060 +28 K 0.062 +29 K 0.067 +30 I 0.066 +31 T 0.058 +32 R 0.048 +33 E 0.041 +34 L 0.039 +35 V 0.042 +36 Q 0.046 +37 T 0.050 +38 V 0.056 +39 L 0.064 +40 A 0.075 +41 R 0.090 +42 K 0.108 +43 P 0.126 +44 K 0.137 +45 M 0.136 +46 C 0.120 +47 S 0.093 +48 F 0.069 +49 L 0.056 +50 E 0.052 +51 W 0.050 +52 R 0.049 +53 D 0.050 +54 L 0.048 +55 K 0.042 +56 I 0.034 +57 V 0.026 +58 Y 0.023 +59 K 0.025 +60 R 0.032 +61 Y 0.038 +62 A 0.040 +63 S 0.037 +64 L 0.030 +65 Y 0.022 +66 F 0.016 +67 C 0.016 +68 C 0.024 +69 A 0.039 +70 I 0.058 +71 E 0.075 +72 D 0.090 +73 Q 0.100 +74 D 0.102 +75 N 0.098 +76 E 0.092 +77 L 0.089 +78 I 0.088 +79 T 0.088 +80 L 0.086 +81 E 0.085 +82 I 0.084 +83 I 0.082 +84 H 0.080 +85 R 0.078 +86 Y 0.078 +87 V 0.081 +88 E 0.083 +89 L 0.079 +90 L 0.071 +91 D 0.065 +92 K 0.064 +93 Y 0.066 +94 F 0.069 +95 G 0.067 +96 S 0.060 +97 V 0.053 +98 C 0.051 +99 E 0.057 +100 L 0.067 +101 D 0.074 +102 I 0.071 +103 I 0.060 +104 F 0.049 +105 N 0.043 +106 F 0.041 +107 E 0.044 +108 K 0.049 +109 A 0.052 +110 Y 0.055 +111 F 0.062 +112 I 0.068 +113 L 0.071 +114 D 0.071 +115 E 0.071 +116 F 0.072 +117 L 0.077 +118 L 0.086 +119 G 0.100 +120 G 0.115 +121 E 0.122 +122 V 0.119 +123 Q 0.114 +124 E 0.113 +125 T 0.115 +126 S 0.112 +127 K 0.099 +128 K 0.085 +129 N 0.080 +130 V 0.083 +131 L 0.089 +132 K 0.092 +133 A 0.089 +134 I 0.081 +135 E 0.077 +136 Q 0.083 +137 A 0.106 +138 D 0.142 +139 L 0.181 +140 L 0.216 +141 Q 0.249 +142 E 0.282 +143 D 0.310 +144 A 0.334 +145 K 0.361 +146 E 0.394 +147 A 0.426 +148 E 0.448 +149 T 0.456 +150 P 0.451 +151 R 0.442 +152 S 0.433 +153 V 0.412 +154 L 0.372 +155 E 0.337 +156 E 0.339 +157 I 0.372 +158 G 0.400 +159 L 0.402 +160 T 0.391 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000182287.16_ENST00000672987.1_GN:AP1S2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:42.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000182287.16_ENST00000672987.1_GN:AP1S2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:42.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2e30e26c2d08784ccd4255df13ce1861b9e51a0d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000182287.16_ENST00000672987.1_GN:AP1S2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:42.caid @@ -0,0 +1,203 @@ +>ENSG00000182287.16|ENST00000672987.1|GN:AP1S2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:42 +1 M 0.408 +2 P 0.440 +3 A 0.483 +4 G 0.513 +5 C 0.523 +6 P 0.521 +7 P 0.504 +8 H 0.468 +9 S 0.436 +10 T 0.427 +11 T 0.430 +12 A 0.440 +13 S 0.464 +14 L 0.480 +15 P 0.473 +16 Q 0.473 +17 H 0.512 +18 G 0.563 +19 D 0.589 +20 R 0.591 +21 G 0.586 +22 F 0.584 +23 P 0.586 +24 F 0.596 +25 A 0.618 +26 A 0.646 +27 A 0.671 +28 A 0.687 +29 A 0.694 +30 A 0.687 +31 G 0.663 +32 Q 0.627 +33 A 0.589 +34 P 0.560 +35 P 0.542 +36 R 0.529 +37 P 0.516 +38 R 0.491 +39 P 0.442 +40 A 0.360 +41 A 0.260 +42 A 0.166 +43 M 0.098 +44 Q 0.056 +45 F 0.032 +46 M 0.019 +47 L 0.013 +48 L 0.012 +49 F 0.014 +50 S 0.019 +51 R 0.028 +52 Q 0.041 +53 G 0.051 +54 K 0.055 +55 L 0.053 +56 R 0.048 +57 L 0.044 +58 Q 0.041 +59 K 0.043 +60 W 0.049 +61 Y 0.058 +62 V 0.065 +63 P 0.070 +64 L 0.071 +65 S 0.066 +66 D 0.060 +67 K 0.054 +68 E 0.049 +69 K 0.046 +70 K 0.047 +71 K 0.051 +72 I 0.054 +73 T 0.052 +74 R 0.047 +75 E 0.042 +76 L 0.041 +77 V 0.044 +78 Q 0.048 +79 T 0.053 +80 V 0.058 +81 L 0.066 +82 A 0.076 +83 R 0.090 +84 K 0.109 +85 P 0.126 +86 K 0.135 +87 M 0.131 +88 C 0.113 +89 S 0.087 +90 F 0.065 +91 L 0.054 +92 E 0.050 +93 W 0.048 +94 R 0.047 +95 D 0.047 +96 L 0.045 +97 K 0.039 +98 I 0.031 +99 V 0.024 +100 Y 0.021 +101 K 0.023 +102 R 0.029 +103 Y 0.036 +104 A 0.038 +105 S 0.035 +106 L 0.028 +107 Y 0.020 +108 F 0.015 +109 C 0.014 +110 C 0.019 +111 A 0.031 +112 I 0.047 +113 E 0.066 +114 D 0.086 +115 Q 0.099 +116 D 0.102 +117 N 0.096 +118 E 0.089 +119 L 0.085 +120 I 0.083 +121 T 0.082 +122 L 0.082 +123 E 0.081 +124 I 0.081 +125 I 0.079 +126 H 0.077 +127 R 0.075 +128 Y 0.076 +129 V 0.079 +130 E 0.081 +131 L 0.076 +132 L 0.069 +133 D 0.064 +134 K 0.063 +135 Y 0.067 +136 F 0.069 +137 G 0.068 +138 S 0.063 +139 V 0.056 +140 C 0.054 +141 E 0.060 +142 L 0.069 +143 D 0.075 +144 I 0.071 +145 I 0.060 +146 F 0.048 +147 N 0.042 +148 F 0.040 +149 E 0.043 +150 K 0.048 +151 A 0.051 +152 Y 0.054 +153 F 0.061 +154 I 0.068 +155 L 0.071 +156 D 0.071 +157 E 0.071 +158 F 0.072 +159 L 0.077 +160 L 0.086 +161 G 0.101 +162 G 0.116 +163 E 0.124 +164 V 0.122 +165 Q 0.116 +166 E 0.115 +167 T 0.117 +168 S 0.114 +169 K 0.102 +170 K 0.088 +171 N 0.083 +172 V 0.085 +173 L 0.090 +174 K 0.093 +175 A 0.091 +176 I 0.084 +177 E 0.082 +178 Q 0.090 +179 A 0.115 +180 D 0.154 +181 L 0.195 +182 L 0.232 +183 Q 0.267 +184 E 0.303 +185 D 0.331 +186 A 0.352 +187 K 0.377 +188 E 0.409 +189 A 0.440 +190 E 0.464 +191 T 0.477 +192 P 0.482 +193 R 0.483 +194 S 0.484 +195 V 0.478 +196 L 0.455 +197 E 0.425 +198 E 0.414 +199 I 0.426 +200 G 0.438 +201 L 0.431 +202 T 0.417 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000182521.6_ENST00000247219.6_GN:TBPL2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000182521.6_ENST00000247219.6_GN:TBPL2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ba37714b926cdfb75e4720a54f64088a3f8b5357 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000182521.6_ENST00000247219.6_GN:TBPL2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,344 @@ +>ENSG00000182521.6|ENST00000247219.6|GN:TBPL2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.388 +2 E 0.395 +3 Q 0.401 +4 E 0.397 +5 E 0.375 +6 T 0.335 +7 Y 0.290 +8 L 0.253 +9 E 0.227 +10 L 0.214 +11 Y 0.219 +12 L 0.241 +13 D 0.273 +14 Q 0.316 +15 C 0.379 +16 A 0.450 +17 A 0.503 +18 Q 0.543 +19 D 0.587 +20 G 0.621 +21 L 0.628 +22 A 0.615 +23 P 0.601 +24 P 0.599 +25 R 0.605 +26 S 0.605 +27 P 0.591 +28 L 0.563 +29 F 0.535 +30 S 0.516 +31 P 0.507 +32 V 0.503 +33 V 0.498 +34 P 0.494 +35 Y 0.498 +36 D 0.511 +37 M 0.524 +38 Y 0.533 +39 I 0.548 +40 L 0.584 +41 N 0.622 +42 A 0.638 +43 S 0.637 +44 N 0.645 +45 P 0.674 +46 D 0.712 +47 T 0.741 +48 A 0.750 +49 F 0.744 +50 N 0.736 +51 S 0.732 +52 N 0.736 +53 P 0.747 +54 E 0.762 +55 V 0.776 +56 K 0.782 +57 E 0.781 +58 T 0.775 +59 S 0.764 +60 G 0.747 +61 D 0.728 +62 F 0.717 +63 S 0.711 +64 S 0.690 +65 V 0.640 +66 D 0.571 +67 L 0.507 +68 S 0.470 +69 F 0.475 +70 L 0.522 +71 P 0.591 +72 D 0.653 +73 E 0.691 +74 V 0.705 +75 T 0.709 +76 Q 0.715 +77 E 0.727 +78 N 0.737 +79 K 0.736 +80 D 0.730 +81 Q 0.726 +82 P 0.726 +83 V 0.715 +84 I 0.676 +85 S 0.616 +86 K 0.580 +87 H 0.597 +88 E 0.624 +89 T 0.618 +90 E 0.614 +91 E 0.656 +92 N 0.719 +93 S 0.754 +94 E 0.758 +95 S 0.749 +96 Q 0.740 +97 S 0.734 +98 P 0.732 +99 Q 0.731 +100 S 0.724 +101 R 0.707 +102 L 0.692 +103 P 0.687 +104 S 0.685 +105 P 0.661 +106 S 0.619 +107 E 0.603 +108 Q 0.642 +109 D 0.703 +110 V 0.738 +111 G 0.735 +112 L 0.694 +113 G 0.634 +114 L 0.598 +115 N 0.608 +116 S 0.620 +117 S 0.595 +118 S 0.572 +119 L 0.602 +120 S 0.667 +121 N 0.715 +122 S 0.731 +123 H 0.729 +124 S 0.720 +125 Q 0.712 +126 L 0.712 +127 H 0.727 +128 P 0.749 +129 G 0.768 +130 D 0.778 +131 T 0.777 +132 D 0.767 +133 S 0.751 +134 V 0.734 +135 Q 0.724 +136 P 0.722 +137 S 0.723 +138 P 0.724 +139 E 0.721 +140 K 0.709 +141 P 0.672 +142 N 0.621 +143 S 0.597 +144 D 0.629 +145 S 0.682 +146 L 0.716 +147 S 0.730 +148 L 0.736 +149 A 0.734 +150 S 0.722 +151 I 0.706 +152 T 0.695 +153 P 0.691 +154 M 0.689 +155 T 0.684 +156 P 0.676 +157 M 0.669 +158 T 0.667 +159 P 0.662 +160 I 0.644 +161 S 0.600 +162 E 0.528 +163 C 0.441 +164 C 0.356 +165 G 0.287 +166 I 0.229 +167 V 0.178 +168 P 0.133 +169 Q 0.098 +170 L 0.072 +171 Q 0.055 +172 N 0.043 +173 I 0.035 +174 V 0.029 +175 S 0.026 +176 T 0.028 +177 V 0.034 +178 N 0.042 +179 L 0.049 +180 A 0.053 +181 C 0.054 +182 K 0.051 +183 L 0.046 +184 D 0.041 +185 L 0.038 +186 K 0.038 +187 K 0.040 +188 I 0.046 +189 A 0.053 +190 L 0.056 +191 H 0.058 +192 A 0.060 +193 K 0.063 +194 N 0.066 +195 A 0.067 +196 E 0.066 +197 Y 0.063 +198 N 0.059 +199 P 0.056 +200 K 0.056 +201 R 0.057 +202 F 0.060 +203 A 0.064 +204 A 0.065 +205 V 0.063 +206 I 0.059 +207 M 0.057 +208 R 0.057 +209 I 0.056 +210 R 0.052 +211 E 0.049 +212 P 0.053 +213 R 0.059 +214 T 0.062 +215 T 0.058 +216 A 0.051 +217 L 0.046 +218 I 0.045 +219 F 0.051 +220 S 0.066 +221 S 0.082 +222 G 0.087 +223 K 0.079 +224 M 0.069 +225 V 0.064 +226 C 0.068 +227 T 0.081 +228 G 0.101 +229 A 0.110 +230 K 0.100 +231 S 0.083 +232 E 0.072 +233 E 0.073 +234 Q 0.075 +235 S 0.071 +236 R 0.064 +237 L 0.062 +238 A 0.063 +239 A 0.060 +240 R 0.053 +241 K 0.049 +242 Y 0.055 +243 A 0.068 +244 R 0.077 +245 V 0.074 +246 V 0.064 +247 Q 0.059 +248 K 0.062 +249 L 0.071 +250 G 0.081 +251 F 0.089 +252 P 0.087 +253 A 0.078 +254 R 0.066 +255 F 0.058 +256 L 0.052 +257 D 0.047 +258 F 0.041 +259 K 0.038 +260 I 0.039 +261 Q 0.040 +262 N 0.041 +263 M 0.039 +264 V 0.033 +265 G 0.028 +266 S 0.027 +267 C 0.032 +268 D 0.039 +269 V 0.043 +270 R 0.043 +271 F 0.043 +272 P 0.042 +273 I 0.042 +274 R 0.041 +275 L 0.042 +276 E 0.045 +277 G 0.050 +278 L 0.055 +279 V 0.061 +280 L 0.063 +281 T 0.059 +282 H 0.052 +283 Q 0.047 +284 Q 0.046 +285 F 0.049 +286 S 0.055 +287 S 0.062 +288 Y 0.066 +289 E 0.064 +290 P 0.063 +291 E 0.063 +292 L 0.064 +293 F 0.068 +294 P 0.076 +295 G 0.081 +296 L 0.077 +297 I 0.068 +298 Y 0.061 +299 R 0.059 +300 M 0.059 +301 V 0.056 +302 K 0.055 +303 P 0.061 +304 R 0.073 +305 I 0.081 +306 V 0.077 +307 L 0.067 +308 L 0.056 +309 I 0.051 +310 F 0.053 +311 V 0.066 +312 S 0.083 +313 G 0.091 +314 K 0.089 +315 V 0.084 +316 V 0.085 +317 L 0.091 +318 T 0.100 +319 G 0.109 +320 A 0.110 +321 K 0.100 +322 E 0.086 +323 R 0.076 +324 S 0.073 +325 E 0.072 +326 I 0.067 +327 Y 0.061 +328 E 0.057 +329 A 0.053 +330 F 0.049 +331 E 0.045 +332 N 0.043 +333 I 0.041 +334 Y 0.039 +335 P 0.039 +336 I 0.040 +337 L 0.044 +338 K 0.049 +339 G 0.056 +340 F 0.065 +341 K 0.080 +342 K 0.106 +343 A 0.129 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000182521.6_ENST00000247219.6_GN:TBPL2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:32.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000182521.6_ENST00000247219.6_GN:TBPL2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:32.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..477e368ff37a4cab501ccbb374e88c86d46d41d3 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000182521.6_ENST00000247219.6_GN:TBPL2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:32.caid @@ -0,0 +1,376 @@ +>ENSG00000182521.6|ENST00000247219.6|GN:TBPL2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:32 +1 M 0.418 +2 A 0.442 +3 S 0.484 +4 A 0.528 +5 P 0.558 +6 W 0.579 +7 P 0.602 +8 E 0.624 +9 R 0.637 +10 V 0.643 +11 P 0.651 +12 R 0.662 +13 L 0.670 +14 L 0.671 +15 A 0.665 +16 P 0.652 +17 R 0.637 +18 L 0.619 +19 P 0.590 +20 S 0.546 +21 Y 0.499 +22 P 0.467 +23 P 0.467 +24 P 0.505 +25 P 0.574 +26 P 0.647 +27 T 0.699 +28 V 0.718 +29 G 0.703 +30 L 0.659 +31 R 0.603 +32 S 0.563 +33 M 0.555 +34 E 0.565 +35 Q 0.568 +36 E 0.556 +37 E 0.533 +38 T 0.493 +39 Y 0.431 +40 L 0.370 +41 E 0.332 +42 L 0.320 +43 Y 0.327 +44 L 0.348 +45 D 0.382 +46 Q 0.432 +47 C 0.507 +48 A 0.591 +49 A 0.651 +50 Q 0.686 +51 D 0.709 +52 G 0.720 +53 L 0.714 +54 A 0.694 +55 P 0.678 +56 P 0.676 +57 R 0.686 +58 S 0.696 +59 P 0.696 +60 L 0.685 +61 F 0.671 +62 S 0.660 +63 P 0.654 +64 V 0.648 +65 V 0.640 +66 P 0.636 +67 Y 0.641 +68 D 0.652 +69 M 0.659 +70 Y 0.661 +71 I 0.669 +72 L 0.692 +73 N 0.717 +74 A 0.725 +75 S 0.717 +76 N 0.716 +77 P 0.730 +78 D 0.755 +79 T 0.775 +80 A 0.780 +81 F 0.775 +82 N 0.769 +83 S 0.766 +84 N 0.769 +85 P 0.776 +86 E 0.788 +87 V 0.797 +88 K 0.801 +89 E 0.799 +90 T 0.793 +91 S 0.781 +92 G 0.763 +93 D 0.742 +94 F 0.728 +95 S 0.721 +96 S 0.701 +97 V 0.655 +98 D 0.593 +99 L 0.536 +100 S 0.504 +101 F 0.510 +102 L 0.557 +103 P 0.623 +104 D 0.680 +105 E 0.711 +106 V 0.719 +107 T 0.719 +108 Q 0.721 +109 E 0.725 +110 N 0.726 +111 K 0.717 +112 D 0.704 +113 Q 0.700 +114 P 0.704 +115 V 0.698 +116 I 0.662 +117 S 0.605 +118 K 0.571 +119 H 0.588 +120 E 0.612 +121 T 0.604 +122 E 0.595 +123 E 0.622 +124 N 0.662 +125 S 0.688 +126 E 0.707 +127 S 0.724 +128 Q 0.732 +129 S 0.731 +130 P 0.731 +131 Q 0.733 +132 S 0.729 +133 R 0.717 +134 L 0.702 +135 P 0.695 +136 S 0.690 +137 P 0.666 +138 S 0.624 +139 E 0.608 +140 Q 0.649 +141 D 0.712 +142 V 0.751 +143 G 0.749 +144 L 0.710 +145 G 0.649 +146 L 0.613 +147 N 0.624 +148 S 0.637 +149 S 0.610 +150 S 0.585 +151 L 0.616 +152 S 0.684 +153 N 0.736 +154 S 0.756 +155 H 0.757 +156 S 0.750 +157 Q 0.743 +158 L 0.741 +159 H 0.752 +160 P 0.770 +161 G 0.787 +162 D 0.795 +163 T 0.794 +164 D 0.784 +165 S 0.769 +166 V 0.753 +167 Q 0.742 +168 P 0.740 +169 S 0.740 +170 P 0.740 +171 E 0.737 +172 K 0.723 +173 P 0.686 +174 N 0.633 +175 S 0.608 +176 D 0.639 +177 S 0.693 +178 L 0.728 +179 S 0.744 +180 L 0.752 +181 A 0.752 +182 S 0.740 +183 I 0.723 +184 T 0.711 +185 P 0.707 +186 M 0.705 +187 T 0.700 +188 P 0.692 +189 M 0.686 +190 T 0.683 +191 P 0.679 +192 I 0.661 +193 S 0.618 +194 E 0.545 +195 C 0.454 +196 C 0.366 +197 G 0.292 +198 I 0.231 +199 V 0.177 +200 P 0.132 +201 Q 0.098 +202 L 0.073 +203 Q 0.056 +204 N 0.044 +205 I 0.036 +206 V 0.030 +207 S 0.027 +208 T 0.028 +209 V 0.034 +210 N 0.041 +211 L 0.048 +212 A 0.051 +213 C 0.052 +214 K 0.049 +215 L 0.045 +216 D 0.040 +217 L 0.037 +218 K 0.036 +219 K 0.039 +220 I 0.045 +221 A 0.051 +222 L 0.054 +223 H 0.055 +224 A 0.058 +225 K 0.061 +226 N 0.064 +227 A 0.066 +228 E 0.065 +229 Y 0.061 +230 N 0.057 +231 P 0.053 +232 K 0.053 +233 R 0.054 +234 F 0.057 +235 A 0.060 +236 A 0.062 +237 V 0.060 +238 I 0.057 +239 M 0.056 +240 R 0.056 +241 I 0.055 +242 R 0.051 +243 E 0.048 +244 P 0.051 +245 R 0.059 +246 T 0.062 +247 T 0.059 +248 A 0.052 +249 L 0.046 +250 I 0.045 +251 F 0.051 +252 S 0.065 +253 S 0.081 +254 G 0.087 +255 K 0.079 +256 M 0.069 +257 V 0.065 +258 C 0.069 +259 T 0.083 +260 G 0.102 +261 A 0.111 +262 K 0.101 +263 S 0.084 +264 E 0.074 +265 E 0.074 +266 Q 0.076 +267 S 0.072 +268 R 0.065 +269 L 0.063 +270 A 0.063 +271 A 0.061 +272 R 0.054 +273 K 0.050 +274 Y 0.056 +275 A 0.069 +276 R 0.078 +277 V 0.074 +278 V 0.064 +279 Q 0.059 +280 K 0.062 +281 L 0.071 +282 G 0.082 +283 F 0.091 +284 P 0.090 +285 A 0.081 +286 R 0.069 +287 F 0.060 +288 L 0.053 +289 D 0.047 +290 F 0.041 +291 K 0.039 +292 I 0.039 +293 Q 0.040 +294 N 0.041 +295 M 0.039 +296 V 0.033 +297 G 0.028 +298 S 0.028 +299 C 0.033 +300 D 0.041 +301 V 0.044 +302 R 0.044 +303 F 0.044 +304 P 0.043 +305 I 0.043 +306 R 0.043 +307 L 0.044 +308 E 0.047 +309 G 0.051 +310 L 0.057 +311 V 0.063 +312 L 0.065 +313 T 0.062 +314 H 0.055 +315 Q 0.049 +316 Q 0.048 +317 F 0.051 +318 S 0.057 +319 S 0.065 +320 Y 0.068 +321 E 0.067 +322 P 0.066 +323 E 0.066 +324 L 0.067 +325 F 0.071 +326 P 0.078 +327 G 0.084 +328 L 0.080 +329 I 0.070 +330 Y 0.063 +331 R 0.061 +332 M 0.060 +333 V 0.057 +334 K 0.056 +335 P 0.062 +336 R 0.075 +337 I 0.083 +338 V 0.081 +339 L 0.070 +340 L 0.059 +341 I 0.053 +342 F 0.055 +343 V 0.068 +344 S 0.085 +345 G 0.094 +346 K 0.091 +347 V 0.086 +348 V 0.086 +349 L 0.092 +350 T 0.101 +351 G 0.110 +352 A 0.111 +353 K 0.101 +354 E 0.087 +355 R 0.078 +356 S 0.075 +357 E 0.073 +358 I 0.068 +359 Y 0.062 +360 E 0.057 +361 A 0.053 +362 F 0.049 +363 E 0.045 +364 N 0.043 +365 I 0.042 +366 Y 0.040 +367 P 0.039 +368 I 0.041 +369 L 0.045 +370 K 0.050 +371 G 0.057 +372 F 0.066 +373 K 0.082 +374 K 0.108 +375 A 0.131 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000182545.7_ENST00000430083.2_GN:RNASE10_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000182545.7_ENST00000430083.2_GN:RNASE10_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..492c23222cfe97c4dd6dd5fba7eb8e3de83f4cd5 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000182545.7_ENST00000430083.2_GN:RNASE10_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,217 @@ +>ENSG00000182545.7|ENST00000430083.2|GN:RNASE10|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.341 +2 K 0.307 +3 L 0.249 +4 N 0.187 +5 L 0.137 +6 V 0.108 +7 Q 0.099 +8 I 0.107 +9 F 0.126 +10 F 0.148 +11 M 0.167 +12 L 0.180 +13 L 0.194 +14 M 0.219 +15 L 0.262 +16 L 0.320 +17 L 0.395 +18 G 0.483 +19 L 0.566 +20 G 0.624 +21 M 0.656 +22 G 0.669 +23 L 0.672 +24 G 0.670 +25 L 0.665 +26 G 0.656 +27 L 0.644 +28 H 0.640 +29 M 0.652 +30 A 0.672 +31 T 0.687 +32 A 0.694 +33 V 0.694 +34 L 0.687 +35 E 0.679 +36 E 0.664 +37 S 0.638 +38 D 0.611 +39 Q 0.602 +40 P 0.611 +41 L 0.627 +42 N 0.630 +43 E 0.609 +44 F 0.578 +45 W 0.573 +46 S 0.602 +47 S 0.630 +48 D 0.620 +49 S 0.581 +50 Q 0.568 +51 D 0.603 +52 K 0.635 +53 A 0.625 +54 E 0.612 +55 A 0.644 +56 T 0.700 +57 E 0.740 +58 E 0.760 +59 G 0.773 +60 D 0.782 +61 G 0.788 +62 T 0.793 +63 Q 0.797 +64 T 0.796 +65 T 0.792 +66 E 0.786 +67 T 0.776 +68 L 0.762 +69 V 0.752 +70 L 0.746 +71 S 0.736 +72 N 0.720 +73 K 0.701 +74 E 0.678 +75 V 0.649 +76 V 0.621 +77 Q 0.605 +78 P 0.592 +79 G 0.565 +80 W 0.530 +81 P 0.511 +82 E 0.525 +83 D 0.567 +84 P 0.622 +85 I 0.676 +86 L 0.714 +87 G 0.728 +88 E 0.723 +89 D 0.709 +90 E 0.695 +91 V 0.688 +92 G 0.684 +93 G 0.667 +94 N 0.622 +95 K 0.559 +96 M 0.497 +97 L 0.445 +98 R 0.398 +99 A 0.353 +100 S 0.312 +101 A 0.276 +102 L 0.243 +103 F 0.213 +104 Q 0.191 +105 S 0.174 +106 N 0.151 +107 K 0.120 +108 D 0.088 +109 Y 0.064 +110 L 0.050 +111 R 0.047 +112 L 0.051 +113 D 0.056 +114 Q 0.057 +115 T 0.051 +116 D 0.045 +117 R 0.039 +118 E 0.034 +119 C 0.029 +120 N 0.027 +121 D 0.028 +122 M 0.033 +123 M 0.042 +124 A 0.058 +125 H 0.081 +126 K 0.103 +127 M 0.122 +128 K 0.132 +129 E 0.135 +130 P 0.130 +131 S 0.117 +132 Q 0.101 +133 S 0.087 +134 C 0.074 +135 I 0.063 +136 A 0.055 +137 Q 0.049 +138 Y 0.043 +139 A 0.038 +140 F 0.038 +141 I 0.045 +142 H 0.057 +143 E 0.069 +144 D 0.072 +145 L 0.065 +146 N 0.055 +147 T 0.045 +148 V 0.038 +149 K 0.036 +150 A 0.036 +151 V 0.035 +152 C 0.038 +153 N 0.048 +154 S 0.060 +155 P 0.066 +156 V 0.064 +157 I 0.059 +158 A 0.055 +159 C 0.055 +160 E 0.062 +161 L 0.074 +162 K 0.085 +163 G 0.090 +164 G 0.084 +165 K 0.072 +166 C 0.062 +167 H 0.060 +168 K 0.067 +169 S 0.079 +170 S 0.090 +171 R 0.095 +172 P 0.092 +173 F 0.083 +174 D 0.076 +175 L 0.077 +176 T 0.081 +177 L 0.081 +178 C 0.082 +179 E 0.088 +180 L 0.102 +181 S 0.120 +182 Q 0.134 +183 P 0.139 +184 D 0.132 +185 Q 0.115 +186 V 0.098 +187 T 0.089 +188 P 0.088 +189 N 0.091 +190 C 0.094 +191 N 0.097 +192 Y 0.104 +193 L 0.112 +194 T 0.114 +195 S 0.112 +196 V 0.108 +197 I 0.104 +198 K 0.098 +199 K 0.095 +200 H 0.101 +201 I 0.111 +202 I 0.113 +203 I 0.101 +204 T 0.083 +205 C 0.073 +206 N 0.080 +207 D 0.098 +208 M 0.123 +209 K 0.154 +210 R 0.186 +211 Q 0.214 +212 L 0.239 +213 P 0.261 +214 T 0.274 +215 G 0.277 +216 Q 0.275 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000182545.7_ENST00000430083.2_GN:RNASE10_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:28.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000182545.7_ENST00000430083.2_GN:RNASE10_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:28.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4f73b78302c32b15c700112b12aa5167a88c3c9a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000182545.7_ENST00000430083.2_GN:RNASE10_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:28.caid @@ -0,0 +1,245 @@ +>ENSG00000182545.7|ENST00000430083.2|GN:RNASE10|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:28 +1 M 0.405 +2 W 0.429 +3 G 0.465 +4 A 0.495 +5 P 0.512 +6 L 0.525 +7 P 0.546 +8 R 0.569 +9 R 0.581 +10 P 0.578 +11 V 0.572 +12 W 0.575 +13 D 0.577 +14 V 0.568 +15 R 0.575 +16 S 0.624 +17 A 0.683 +18 S 0.715 +19 A 0.724 +20 G 0.729 +21 P 0.732 +22 Q 0.731 +23 P 0.728 +24 C 0.729 +25 L 0.742 +26 G 0.758 +27 G 0.763 +28 K 0.742 +29 M 0.686 +30 K 0.592 +31 L 0.475 +32 N 0.359 +33 L 0.264 +34 V 0.203 +35 Q 0.176 +36 I 0.171 +37 F 0.181 +38 F 0.202 +39 M 0.228 +40 L 0.251 +41 L 0.281 +42 M 0.330 +43 L 0.387 +44 L 0.439 +45 L 0.491 +46 G 0.553 +47 L 0.615 +48 G 0.660 +49 M 0.682 +50 G 0.690 +51 L 0.693 +52 G 0.696 +53 L 0.700 +54 G 0.699 +55 L 0.692 +56 H 0.688 +57 M 0.692 +58 A 0.699 +59 T 0.705 +60 A 0.712 +61 V 0.715 +62 L 0.714 +63 E 0.712 +64 E 0.703 +65 S 0.683 +66 D 0.660 +67 Q 0.650 +68 P 0.656 +69 L 0.670 +70 N 0.674 +71 E 0.657 +72 F 0.629 +73 W 0.622 +74 S 0.645 +75 S 0.666 +76 D 0.649 +77 S 0.603 +78 Q 0.584 +79 D 0.614 +80 K 0.645 +81 A 0.634 +82 E 0.623 +83 A 0.658 +84 T 0.714 +85 E 0.754 +86 E 0.774 +87 G 0.786 +88 D 0.794 +89 G 0.799 +90 T 0.805 +91 Q 0.810 +92 T 0.810 +93 T 0.806 +94 E 0.801 +95 T 0.793 +96 L 0.780 +97 V 0.769 +98 L 0.761 +99 S 0.751 +100 N 0.736 +101 K 0.720 +102 E 0.701 +103 V 0.676 +104 V 0.650 +105 Q 0.634 +106 P 0.623 +107 G 0.603 +108 W 0.576 +109 P 0.562 +110 E 0.572 +111 D 0.604 +112 P 0.646 +113 I 0.687 +114 L 0.717 +115 G 0.727 +116 E 0.719 +117 D 0.702 +118 E 0.686 +119 V 0.677 +120 G 0.669 +121 G 0.646 +122 N 0.594 +123 K 0.525 +124 M 0.457 +125 L 0.403 +126 R 0.359 +127 A 0.323 +128 S 0.293 +129 A 0.267 +130 L 0.240 +131 F 0.212 +132 Q 0.187 +133 S 0.165 +134 N 0.139 +135 K 0.109 +136 D 0.080 +137 Y 0.060 +138 L 0.048 +139 R 0.047 +140 L 0.052 +141 D 0.058 +142 Q 0.059 +143 T 0.053 +144 D 0.046 +145 R 0.040 +146 E 0.036 +147 C 0.030 +148 N 0.028 +149 D 0.030 +150 M 0.034 +151 M 0.042 +152 A 0.057 +153 H 0.078 +154 K 0.100 +155 M 0.118 +156 K 0.129 +157 E 0.133 +158 P 0.128 +159 S 0.116 +160 Q 0.099 +161 S 0.084 +162 C 0.072 +163 I 0.062 +164 A 0.056 +165 Q 0.051 +166 Y 0.045 +167 A 0.040 +168 F 0.039 +169 I 0.045 +170 H 0.057 +171 E 0.069 +172 D 0.072 +173 L 0.067 +174 N 0.057 +175 T 0.047 +176 V 0.040 +177 K 0.037 +178 A 0.037 +179 V 0.036 +180 C 0.039 +181 N 0.048 +182 S 0.060 +183 P 0.065 +184 V 0.064 +185 I 0.059 +186 A 0.055 +187 C 0.054 +188 E 0.061 +189 L 0.072 +190 K 0.083 +191 G 0.087 +192 G 0.081 +193 K 0.070 +194 C 0.061 +195 H 0.059 +196 K 0.067 +197 S 0.078 +198 S 0.090 +199 R 0.095 +200 P 0.091 +201 F 0.083 +202 D 0.076 +203 L 0.077 +204 T 0.081 +205 L 0.081 +206 C 0.081 +207 E 0.088 +208 L 0.101 +209 S 0.118 +210 Q 0.131 +211 P 0.136 +212 D 0.128 +213 Q 0.112 +214 V 0.095 +215 T 0.085 +216 P 0.085 +217 N 0.089 +218 C 0.091 +219 N 0.095 +220 Y 0.101 +221 L 0.108 +222 T 0.111 +223 S 0.109 +224 V 0.107 +225 I 0.103 +226 K 0.098 +227 K 0.095 +228 H 0.101 +229 I 0.111 +230 I 0.111 +231 I 0.098 +232 T 0.080 +233 C 0.070 +234 N 0.077 +235 D 0.094 +236 M 0.118 +237 K 0.146 +238 R 0.173 +239 Q 0.198 +240 L 0.223 +241 P 0.245 +242 T 0.260 +243 G 0.267 +244 Q 0.267 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000182612.12_ENST00000611590.2_GN:TSPAN10_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000182612.12_ENST00000611590.2_GN:TSPAN10_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..15b35135b2d424ed125ac4212317cf5dbe490292 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000182612.12_ENST00000611590.2_GN:TSPAN10_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,356 @@ +>ENSG00000182612.12|ENST00000611590.2|GN:TSPAN10|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.447 +2 E 0.475 +3 E 0.507 +4 G 0.513 +5 E 0.486 +6 R 0.461 +7 S 0.467 +8 P 0.480 +9 L 0.476 +10 L 0.484 +11 S 0.521 +12 Q 0.550 +13 E 0.536 +14 T 0.508 +15 A 0.496 +16 G 0.490 +17 Q 0.493 +18 K 0.519 +19 P 0.545 +20 L 0.541 +21 S 0.533 +22 V 0.556 +23 H 0.596 +24 R 0.630 +25 P 0.662 +26 P 0.696 +27 T 0.720 +28 S 0.719 +29 G 0.695 +30 C 0.668 +31 L 0.661 +32 G 0.675 +33 P 0.691 +34 V 0.698 +35 P 0.701 +36 R 0.709 +37 E 0.722 +38 D 0.730 +39 Q 0.725 +40 A 0.715 +41 E 0.707 +42 A 0.693 +43 W 0.666 +44 G 0.620 +45 C 0.560 +46 S 0.496 +47 C 0.448 +48 C 0.445 +49 P 0.496 +50 P 0.577 +51 E 0.649 +52 T 0.679 +53 K 0.655 +54 H 0.601 +55 Q 0.575 +56 A 0.607 +57 L 0.665 +58 S 0.702 +59 G 0.712 +60 T 0.708 +61 P 0.702 +62 K 0.697 +63 K 0.690 +64 G 0.678 +65 P 0.665 +66 A 0.654 +67 P 0.637 +68 S 0.602 +69 L 0.551 +70 S 0.495 +71 P 0.434 +72 G 0.359 +73 S 0.271 +74 S 0.190 +75 C 0.132 +76 V 0.097 +77 K 0.075 +78 Y 0.062 +79 L 0.054 +80 I 0.048 +81 F 0.044 +82 L 0.044 +83 S 0.047 +84 N 0.048 +85 F 0.042 +86 P 0.032 +87 F 0.024 +88 S 0.023 +89 L 0.029 +90 L 0.038 +91 G 0.046 +92 L 0.047 +93 L 0.045 +94 A 0.043 +95 L 0.044 +96 A 0.048 +97 I 0.052 +98 G 0.051 +99 L 0.048 +100 W 0.046 +101 G 0.048 +102 L 0.051 +103 A 0.060 +104 V 0.082 +105 K 0.122 +106 G 0.179 +107 S 0.247 +108 L 0.319 +109 G 0.384 +110 S 0.431 +111 D 0.456 +112 L 0.466 +113 G 0.460 +114 G 0.440 +115 P 0.409 +116 L 0.376 +117 P 0.341 +118 A 0.299 +119 D 0.245 +120 P 0.185 +121 M 0.133 +122 L 0.098 +123 G 0.078 +124 L 0.072 +125 A 0.079 +126 L 0.092 +127 G 0.101 +128 G 0.097 +129 L 0.083 +130 V 0.068 +131 V 0.057 +132 S 0.054 +133 A 0.056 +134 V 0.062 +135 S 0.063 +136 L 0.059 +137 A 0.054 +138 G 0.054 +139 Y 0.058 +140 L 0.067 +141 G 0.079 +142 A 0.089 +143 L 0.096 +144 C 0.101 +145 E 0.101 +146 N 0.093 +147 T 0.079 +148 C 0.067 +149 L 0.061 +150 L 0.057 +151 R 0.053 +152 G 0.052 +153 F 0.054 +154 S 0.055 +155 G 0.054 +156 G 0.053 +157 I 0.049 +158 L 0.044 +159 A 0.040 +160 F 0.044 +161 L 0.055 +162 V 0.063 +163 L 0.061 +164 E 0.054 +165 A 0.048 +166 V 0.046 +167 A 0.048 +168 G 0.049 +169 A 0.046 +170 L 0.041 +171 V 0.040 +172 V 0.043 +173 A 0.047 +174 L 0.051 +175 W 0.057 +176 G 0.067 +177 P 0.075 +178 L 0.079 +179 Q 0.083 +180 D 0.092 +181 S 0.103 +182 L 0.110 +183 E 0.113 +184 H 0.110 +185 T 0.103 +186 L 0.096 +187 R 0.090 +188 V 0.081 +189 A 0.069 +190 I 0.061 +191 A 0.061 +192 H 0.066 +193 Y 0.076 +194 Q 0.090 +195 D 0.107 +196 D 0.117 +197 P 0.111 +198 D 0.095 +199 L 0.079 +200 R 0.072 +201 F 0.074 +202 L 0.074 +203 L 0.069 +204 D 0.061 +205 Q 0.056 +206 V 0.053 +207 Q 0.056 +208 L 0.065 +209 G 0.070 +210 L 0.063 +211 R 0.049 +212 C 0.038 +213 C 0.041 +214 G 0.058 +215 A 0.078 +216 A 0.092 +217 S 0.102 +218 Y 0.114 +219 Q 0.129 +220 D 0.137 +221 W 0.132 +222 Q 0.119 +223 Q 0.107 +224 N 0.103 +225 L 0.105 +226 Y 0.109 +227 F 0.115 +228 N 0.124 +229 C 0.138 +230 S 0.158 +231 S 0.180 +232 P 0.197 +233 G 0.207 +234 V 0.212 +235 Q 0.218 +236 A 0.228 +237 C 0.236 +238 S 0.238 +239 L 0.227 +240 P 0.200 +241 A 0.167 +242 S 0.141 +243 C 0.135 +244 C 0.159 +245 I 0.219 +246 D 0.298 +247 P 0.362 +248 R 0.395 +249 E 0.405 +250 D 0.410 +251 G 0.414 +252 A 0.405 +253 S 0.370 +254 V 0.318 +255 N 0.271 +256 D 0.238 +257 Q 0.212 +258 C 0.185 +259 G 0.164 +260 F 0.158 +261 G 0.158 +262 V 0.154 +263 L 0.144 +264 R 0.134 +265 L 0.130 +266 D 0.131 +267 A 0.137 +268 D 0.142 +269 A 0.145 +270 A 0.147 +271 Q 0.153 +272 R 0.160 +273 V 0.161 +274 V 0.151 +275 Y 0.131 +276 L 0.113 +277 E 0.105 +278 G 0.103 +279 C 0.100 +280 G 0.094 +281 P 0.092 +282 P 0.099 +283 L 0.107 +284 R 0.112 +285 R 0.113 +286 W 0.107 +287 L 0.094 +288 R 0.078 +289 A 0.063 +290 N 0.053 +291 L 0.051 +292 A 0.063 +293 A 0.085 +294 S 0.102 +295 G 0.106 +296 G 0.103 +297 Y 0.100 +298 A 0.095 +299 I 0.085 +300 A 0.076 +301 V 0.072 +302 V 0.068 +303 L 0.062 +304 L 0.056 +305 Q 0.054 +306 G 0.052 +307 A 0.051 +308 E 0.054 +309 L 0.062 +310 L 0.064 +311 L 0.053 +312 A 0.038 +313 A 0.029 +314 R 0.028 +315 L 0.033 +316 L 0.040 +317 G 0.048 +318 A 0.061 +319 L 0.080 +320 A 0.105 +321 A 0.134 +322 R 0.171 +323 R 0.225 +324 G 0.288 +325 A 0.350 +326 A 0.407 +327 Y 0.465 +328 G 0.526 +329 P 0.587 +330 G 0.638 +331 A 0.667 +332 R 0.675 +333 G 0.670 +334 E 0.652 +335 D 0.616 +336 R 0.580 +337 A 0.563 +338 G 0.550 +339 P 0.526 +340 Q 0.515 +341 S 0.543 +342 P 0.592 +343 S 0.631 +344 P 0.651 +345 G 0.656 +346 A 0.655 +347 P 0.663 +348 P 0.683 +349 A 0.700 +350 A 0.701 +351 K 0.693 +352 P 0.683 +353 A 0.657 +354 R 0.603 +355 G 0.550 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000182612.12_ENST00000611590.2_GN:TSPAN10_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:38.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000182612.12_ENST00000611590.2_GN:TSPAN10_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:38.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ef29cadd1829035561a794adead16c0cc51714dd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000182612.12_ENST00000611590.2_GN:TSPAN10_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:38.caid @@ -0,0 +1,394 @@ +>ENSG00000182612.12|ENST00000611590.2|GN:TSPAN10|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:38 +1 M 0.391 +2 H 0.422 +3 R 0.460 +4 L 0.480 +5 A 0.481 +6 Q 0.499 +7 G 0.547 +8 R 0.578 +9 S 0.561 +10 Q 0.540 +11 D 0.560 +12 Q 0.599 +13 P 0.621 +14 S 0.635 +15 S 0.658 +16 P 0.681 +17 A 0.683 +18 T 0.665 +19 E 0.649 +20 E 0.648 +21 P 0.650 +22 A 0.631 +23 N 0.576 +24 L 0.489 +25 S 0.407 +26 R 0.358 +27 R 0.340 +28 L 0.335 +29 C 0.344 +30 W 0.380 +31 G 0.431 +32 L 0.482 +33 S 0.532 +34 V 0.588 +35 P 0.647 +36 A 0.699 +37 S 0.731 +38 R 0.745 +39 M 0.752 +40 E 0.757 +41 E 0.760 +42 G 0.755 +43 E 0.739 +44 R 0.717 +45 S 0.698 +46 P 0.693 +47 L 0.704 +48 L 0.724 +49 S 0.730 +50 Q 0.699 +51 E 0.641 +52 T 0.602 +53 A 0.611 +54 G 0.639 +55 Q 0.659 +56 K 0.679 +57 P 0.698 +58 L 0.703 +59 S 0.699 +60 V 0.702 +61 H 0.711 +62 R 0.723 +63 P 0.743 +64 P 0.770 +65 T 0.791 +66 S 0.796 +67 G 0.783 +68 C 0.763 +69 L 0.755 +70 G 0.760 +71 P 0.769 +72 V 0.773 +73 P 0.773 +74 R 0.777 +75 E 0.785 +76 D 0.788 +77 Q 0.781 +78 A 0.771 +79 E 0.762 +80 A 0.747 +81 W 0.719 +82 G 0.673 +83 C 0.611 +84 S 0.540 +85 C 0.488 +86 C 0.487 +87 P 0.542 +88 P 0.623 +89 E 0.687 +90 T 0.709 +91 K 0.679 +92 H 0.622 +93 Q 0.595 +94 A 0.628 +95 L 0.684 +96 S 0.719 +97 G 0.727 +98 T 0.722 +99 P 0.716 +100 K 0.707 +101 K 0.695 +102 G 0.678 +103 P 0.660 +104 A 0.645 +105 P 0.625 +106 S 0.588 +107 L 0.535 +108 S 0.478 +109 P 0.416 +110 G 0.342 +111 S 0.257 +112 S 0.178 +113 C 0.122 +114 V 0.090 +115 K 0.070 +116 Y 0.058 +117 L 0.050 +118 I 0.045 +119 F 0.042 +120 L 0.042 +121 S 0.045 +122 N 0.046 +123 F 0.040 +124 P 0.031 +125 F 0.024 +126 S 0.023 +127 L 0.028 +128 L 0.038 +129 G 0.046 +130 L 0.047 +131 L 0.045 +132 A 0.043 +133 L 0.043 +134 A 0.047 +135 I 0.050 +136 G 0.049 +137 L 0.046 +138 W 0.045 +139 G 0.048 +140 L 0.052 +141 A 0.063 +142 V 0.086 +143 K 0.129 +144 G 0.190 +145 S 0.260 +146 L 0.334 +147 G 0.400 +148 S 0.448 +149 D 0.474 +150 L 0.487 +151 G 0.486 +152 G 0.465 +153 P 0.430 +154 L 0.390 +155 P 0.352 +156 A 0.309 +157 D 0.254 +158 P 0.194 +159 M 0.139 +160 L 0.101 +161 G 0.080 +162 L 0.074 +163 A 0.079 +164 L 0.092 +165 G 0.101 +166 G 0.096 +167 L 0.082 +168 V 0.066 +169 V 0.056 +170 S 0.052 +171 A 0.055 +172 V 0.060 +173 S 0.062 +174 L 0.057 +175 A 0.052 +176 G 0.051 +177 Y 0.056 +178 L 0.064 +179 G 0.076 +180 A 0.086 +181 L 0.092 +182 C 0.096 +183 E 0.096 +184 N 0.089 +185 T 0.075 +186 C 0.062 +187 L 0.056 +188 L 0.052 +189 R 0.049 +190 G 0.048 +191 F 0.049 +192 S 0.051 +193 G 0.051 +194 G 0.051 +195 I 0.048 +196 L 0.044 +197 A 0.040 +198 F 0.044 +199 L 0.053 +200 V 0.060 +201 L 0.057 +202 E 0.051 +203 A 0.045 +204 V 0.044 +205 A 0.046 +206 G 0.047 +207 A 0.043 +208 L 0.039 +209 V 0.038 +210 V 0.040 +211 A 0.043 +212 L 0.047 +213 W 0.053 +214 G 0.062 +215 P 0.071 +216 L 0.075 +217 Q 0.079 +218 D 0.089 +219 S 0.101 +220 L 0.109 +221 E 0.112 +222 H 0.110 +223 T 0.103 +224 L 0.097 +225 R 0.091 +226 V 0.081 +227 A 0.069 +228 I 0.060 +229 A 0.059 +230 H 0.063 +231 Y 0.070 +232 Q 0.081 +233 D 0.095 +234 D 0.103 +235 P 0.100 +236 D 0.086 +237 L 0.072 +238 R 0.066 +239 F 0.068 +240 L 0.069 +241 L 0.064 +242 D 0.058 +243 Q 0.053 +244 V 0.051 +245 Q 0.054 +246 L 0.061 +247 G 0.066 +248 L 0.060 +249 R 0.046 +250 C 0.037 +251 C 0.040 +252 G 0.057 +253 A 0.076 +254 A 0.091 +255 S 0.101 +256 Y 0.113 +257 Q 0.127 +258 D 0.136 +259 W 0.130 +260 Q 0.116 +261 Q 0.104 +262 N 0.100 +263 L 0.103 +264 Y 0.110 +265 F 0.116 +266 N 0.126 +267 C 0.139 +268 S 0.158 +269 S 0.180 +270 P 0.198 +271 G 0.209 +272 V 0.214 +273 Q 0.220 +274 A 0.229 +275 C 0.236 +276 S 0.235 +277 L 0.222 +278 P 0.194 +279 A 0.161 +280 S 0.137 +281 C 0.132 +282 C 0.159 +283 I 0.223 +284 D 0.306 +285 P 0.372 +286 R 0.407 +287 E 0.417 +288 D 0.421 +289 G 0.424 +290 A 0.415 +291 S 0.379 +292 V 0.326 +293 N 0.277 +294 D 0.244 +295 Q 0.217 +296 C 0.190 +297 G 0.170 +298 F 0.164 +299 G 0.166 +300 V 0.162 +301 L 0.151 +302 R 0.140 +303 L 0.135 +304 D 0.136 +305 A 0.141 +306 D 0.147 +307 A 0.148 +308 A 0.149 +309 Q 0.154 +310 R 0.161 +311 V 0.162 +312 V 0.152 +313 Y 0.132 +314 L 0.115 +315 E 0.106 +316 G 0.105 +317 C 0.103 +318 G 0.096 +319 P 0.094 +320 P 0.101 +321 L 0.109 +322 R 0.114 +323 R 0.114 +324 W 0.109 +325 L 0.095 +326 R 0.079 +327 A 0.064 +328 N 0.053 +329 L 0.051 +330 A 0.062 +331 A 0.084 +332 S 0.102 +333 G 0.106 +334 G 0.102 +335 Y 0.098 +336 A 0.091 +337 I 0.080 +338 A 0.072 +339 V 0.070 +340 V 0.067 +341 L 0.061 +342 L 0.056 +343 Q 0.054 +344 G 0.052 +345 A 0.050 +346 E 0.054 +347 L 0.061 +348 L 0.063 +349 L 0.053 +350 A 0.038 +351 A 0.028 +352 R 0.027 +353 L 0.031 +354 L 0.038 +355 G 0.046 +356 A 0.058 +357 L 0.077 +358 A 0.102 +359 A 0.131 +360 R 0.169 +361 R 0.223 +362 G 0.288 +363 A 0.350 +364 A 0.407 +365 Y 0.465 +366 G 0.527 +367 P 0.588 +368 G 0.639 +369 A 0.667 +370 R 0.676 +371 G 0.676 +372 E 0.668 +373 D 0.648 +374 R 0.622 +375 A 0.600 +376 G 0.574 +377 P 0.541 +378 Q 0.526 +379 S 0.552 +380 P 0.600 +381 S 0.639 +382 P 0.659 +383 G 0.664 +384 A 0.664 +385 P 0.672 +386 P 0.691 +387 A 0.709 +388 A 0.711 +389 K 0.704 +390 P 0.695 +391 A 0.669 +392 R 0.616 +393 G 0.564 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000183560.10_ENST00000687084.1_GN:IZUMO1R_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000183560.10_ENST00000687084.1_GN:IZUMO1R_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..275309f0b798f42bface303026503ec063d66179 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000183560.10_ENST00000687084.1_GN:IZUMO1R_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,251 @@ +>ENSG00000183560.10|ENST00000687084.1|GN:IZUMO1R|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.340 +2 A 0.346 +3 C 0.354 +4 W 0.356 +5 W 0.344 +6 P 0.322 +7 L 0.303 +8 L 0.294 +9 L 0.286 +10 E 0.276 +11 L 0.272 +12 W 0.278 +13 T 0.295 +14 V 0.325 +15 M 0.358 +16 P 0.384 +17 T 0.403 +18 W 0.413 +19 A 0.406 +20 G 0.374 +21 D 0.321 +22 E 0.256 +23 L 0.190 +24 L 0.136 +25 N 0.101 +26 I 0.083 +27 C 0.075 +28 M 0.073 +29 N 0.077 +30 A 0.087 +31 K 0.100 +32 H 0.114 +33 H 0.124 +34 K 0.128 +35 R 0.137 +36 V 0.158 +37 P 0.187 +38 S 0.214 +39 P 0.231 +40 E 0.233 +41 D 0.221 +42 K 0.202 +43 L 0.177 +44 Y 0.151 +45 E 0.130 +46 E 0.124 +47 C 0.133 +48 I 0.145 +49 P 0.147 +50 W 0.141 +51 K 0.131 +52 D 0.116 +53 N 0.099 +54 A 0.084 +55 C 0.084 +56 C 0.109 +57 T 0.146 +58 L 0.173 +59 T 0.176 +60 T 0.166 +61 S 0.160 +62 W 0.162 +63 E 0.167 +64 A 0.170 +65 H 0.172 +66 L 0.171 +67 D 0.170 +68 V 0.172 +69 S 0.177 +70 P 0.179 +71 L 0.178 +72 Y 0.179 +73 N 0.184 +74 F 0.188 +75 S 0.185 +76 L 0.170 +77 F 0.156 +78 H 0.153 +79 C 0.157 +80 G 0.159 +81 L 0.155 +82 L 0.140 +83 M 0.120 +84 P 0.101 +85 G 0.089 +86 C 0.083 +87 R 0.086 +88 K 0.095 +89 H 0.106 +90 F 0.111 +91 I 0.109 +92 Q 0.099 +93 A 0.086 +94 I 0.073 +95 C 0.060 +96 F 0.052 +97 Y 0.051 +98 E 0.056 +99 C 0.068 +100 S 0.088 +101 P 0.108 +102 N 0.120 +103 L 0.123 +104 G 0.120 +105 P 0.117 +106 W 0.123 +107 I 0.144 +108 Q 0.180 +109 P 0.225 +110 V 0.271 +111 G 0.302 +112 S 0.311 +113 L 0.300 +114 G 0.279 +115 W 0.257 +116 E 0.242 +117 V 0.240 +118 A 0.251 +119 P 0.268 +120 S 0.283 +121 G 0.287 +122 Q 0.275 +123 G 0.248 +124 E 0.217 +125 R 0.203 +126 V 0.209 +127 V 0.219 +128 N 0.217 +129 V 0.196 +130 P 0.162 +131 L 0.122 +132 C 0.090 +133 Q 0.076 +134 E 0.074 +135 D 0.075 +136 C 0.078 +137 E 0.085 +138 E 0.091 +139 W 0.090 +140 W 0.086 +141 E 0.085 +142 D 0.085 +143 C 0.084 +144 R 0.088 +145 M 0.102 +146 S 0.118 +147 Y 0.122 +148 T 0.111 +149 C 0.095 +150 K 0.086 +151 S 0.085 +152 N 0.085 +153 W 0.087 +154 R 0.100 +155 G 0.120 +156 G 0.134 +157 W 0.134 +158 D 0.128 +159 W 0.126 +160 S 0.133 +161 Q 0.147 +162 G 0.158 +163 K 0.161 +164 N 0.157 +165 R 0.153 +166 C 0.153 +167 P 0.156 +168 K 0.161 +169 G 0.163 +170 A 0.160 +171 Q 0.147 +172 C 0.126 +173 L 0.104 +174 P 0.086 +175 F 0.075 +176 S 0.074 +177 H 0.080 +178 Y 0.086 +179 F 0.086 +180 P 0.080 +181 T 0.078 +182 P 0.083 +183 A 0.090 +184 D 0.088 +185 L 0.075 +186 C 0.062 +187 E 0.057 +188 K 0.058 +189 T 0.065 +190 W 0.077 +191 S 0.091 +192 N 0.099 +193 S 0.097 +194 F 0.096 +195 K 0.105 +196 A 0.125 +197 S 0.144 +198 P 0.152 +199 E 0.152 +200 R 0.160 +201 R 0.183 +202 N 0.209 +203 S 0.219 +204 G 0.207 +205 R 0.182 +206 C 0.160 +207 L 0.144 +208 Q 0.132 +209 K 0.130 +210 W 0.138 +211 F 0.154 +212 E 0.178 +213 P 0.207 +214 A 0.234 +215 Q 0.246 +216 G 0.234 +217 N 0.202 +218 P 0.166 +219 N 0.144 +220 V 0.142 +221 A 0.148 +222 V 0.148 +223 A 0.147 +224 R 0.155 +225 L 0.175 +226 F 0.205 +227 A 0.250 +228 S 0.312 +229 S 0.378 +230 A 0.435 +231 P 0.471 +232 S 0.488 +233 W 0.491 +234 E 0.476 +235 L 0.439 +236 S 0.396 +237 Y 0.356 +238 T 0.320 +239 I 0.298 +240 M 0.308 +241 V 0.332 +242 C 0.336 +243 S 0.330 +244 L 0.340 +245 F 0.367 +246 L 0.394 +247 P 0.416 +248 F 0.422 +249 L 0.399 +250 S 0.371 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000183560.10_ENST00000687084.1_GN:IZUMO1R_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000183560.10_ENST00000687084.1_GN:IZUMO1R_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6a1177b19ee9a19dbd885bda34dd876dcf43398e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000183560.10_ENST00000687084.1_GN:IZUMO1R_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid @@ -0,0 +1,281 @@ +>ENSG00000183560.10|ENST00000687084.1|GN:IZUMO1R|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:30 +1 M 0.391 +2 G 0.404 +3 G 0.420 +4 T 0.432 +5 W 0.437 +6 N 0.446 +7 S 0.467 +8 P 0.492 +9 Q 0.507 +10 P 0.506 +11 H 0.492 +12 S 0.468 +13 L 0.443 +14 R 0.435 +15 G 0.435 +16 R 0.404 +17 R 0.356 +18 E 0.345 +19 Q 0.377 +20 E 0.409 +21 H 0.433 +22 L 0.472 +23 K 0.522 +24 A 0.559 +25 P 0.574 +26 A 0.565 +27 L 0.523 +28 K 0.468 +29 Q 0.442 +30 A 0.446 +31 M 0.440 +32 A 0.406 +33 C 0.370 +34 W 0.350 +35 W 0.346 +36 P 0.350 +37 L 0.353 +38 L 0.346 +39 L 0.329 +40 E 0.308 +41 L 0.292 +42 W 0.291 +43 T 0.305 +44 V 0.326 +45 M 0.347 +46 P 0.367 +47 T 0.387 +48 W 0.402 +49 A 0.400 +50 G 0.369 +51 D 0.316 +52 E 0.251 +53 L 0.186 +54 L 0.132 +55 N 0.099 +56 I 0.083 +57 C 0.076 +58 M 0.075 +59 N 0.079 +60 A 0.088 +61 K 0.101 +62 H 0.114 +63 H 0.121 +64 K 0.124 +65 R 0.132 +66 V 0.153 +67 P 0.183 +68 S 0.211 +69 P 0.228 +70 E 0.229 +71 D 0.216 +72 K 0.195 +73 L 0.172 +74 Y 0.147 +75 E 0.128 +76 E 0.122 +77 C 0.131 +78 I 0.142 +79 P 0.142 +80 W 0.135 +81 K 0.123 +82 D 0.108 +83 N 0.091 +84 A 0.078 +85 C 0.080 +86 C 0.104 +87 T 0.141 +88 L 0.166 +89 T 0.169 +90 T 0.160 +91 S 0.153 +92 W 0.155 +93 E 0.161 +94 A 0.166 +95 H 0.168 +96 L 0.167 +97 D 0.165 +98 V 0.166 +99 S 0.169 +100 P 0.169 +101 L 0.168 +102 Y 0.170 +103 N 0.176 +104 F 0.182 +105 S 0.180 +106 L 0.165 +107 F 0.151 +108 H 0.148 +109 C 0.153 +110 G 0.158 +111 L 0.155 +112 L 0.142 +113 M 0.122 +114 P 0.103 +115 G 0.089 +116 C 0.082 +117 R 0.084 +118 K 0.092 +119 H 0.102 +120 F 0.107 +121 I 0.104 +122 Q 0.094 +123 A 0.081 +124 I 0.068 +125 C 0.056 +126 F 0.049 +127 Y 0.049 +128 E 0.054 +129 C 0.067 +130 S 0.087 +131 P 0.108 +132 N 0.120 +133 L 0.123 +134 G 0.120 +135 P 0.118 +136 W 0.125 +137 I 0.147 +138 Q 0.184 +139 P 0.231 +140 V 0.278 +141 G 0.310 +142 S 0.320 +143 L 0.310 +144 G 0.290 +145 W 0.268 +146 E 0.254 +147 V 0.250 +148 A 0.259 +149 P 0.275 +150 S 0.288 +151 G 0.292 +152 Q 0.281 +153 G 0.254 +154 E 0.223 +155 R 0.207 +156 V 0.212 +157 V 0.221 +158 N 0.216 +159 V 0.195 +160 P 0.160 +161 L 0.120 +162 C 0.089 +163 Q 0.076 +164 E 0.075 +165 D 0.076 +166 C 0.079 +167 E 0.086 +168 E 0.092 +169 W 0.091 +170 W 0.087 +171 E 0.086 +172 D 0.087 +173 C 0.086 +174 R 0.090 +175 M 0.104 +176 S 0.120 +177 Y 0.124 +178 T 0.112 +179 C 0.095 +180 K 0.086 +181 S 0.085 +182 N 0.085 +183 W 0.087 +184 R 0.100 +185 G 0.120 +186 G 0.134 +187 W 0.134 +188 D 0.128 +189 W 0.126 +190 S 0.134 +191 Q 0.148 +192 G 0.159 +193 K 0.161 +194 N 0.157 +195 R 0.152 +196 C 0.151 +197 P 0.154 +198 K 0.158 +199 G 0.161 +200 A 0.157 +201 Q 0.143 +202 C 0.123 +203 L 0.101 +204 P 0.084 +205 F 0.073 +206 S 0.072 +207 H 0.078 +208 Y 0.084 +209 F 0.084 +210 P 0.079 +211 T 0.077 +212 P 0.081 +213 A 0.088 +214 D 0.087 +215 L 0.074 +216 C 0.061 +217 E 0.056 +218 K 0.057 +219 T 0.064 +220 W 0.075 +221 S 0.089 +222 N 0.096 +223 S 0.095 +224 F 0.094 +225 K 0.103 +226 A 0.123 +227 S 0.142 +228 P 0.149 +229 E 0.147 +230 R 0.154 +231 R 0.176 +232 N 0.203 +233 S 0.215 +234 G 0.204 +235 R 0.181 +236 C 0.160 +237 L 0.143 +238 Q 0.132 +239 K 0.129 +240 W 0.137 +241 F 0.153 +242 E 0.177 +243 P 0.206 +244 A 0.234 +245 Q 0.247 +246 G 0.236 +247 N 0.204 +248 P 0.166 +249 N 0.142 +250 V 0.138 +251 A 0.143 +252 V 0.142 +253 A 0.139 +254 R 0.146 +255 L 0.164 +256 F 0.193 +257 A 0.240 +258 S 0.304 +259 S 0.374 +260 A 0.434 +261 P 0.473 +262 S 0.490 +263 W 0.493 +264 E 0.476 +265 L 0.439 +266 S 0.396 +267 Y 0.369 +268 T 0.359 +269 I 0.363 +270 M 0.371 +271 V 0.364 +272 C 0.338 +273 S 0.319 +274 L 0.331 +275 F 0.360 +276 L 0.387 +277 P 0.409 +278 F 0.415 +279 L 0.395 +280 S 0.368 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000185245.9_ENST00000329125.6_GN:GP1BA_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000185245.9_ENST00000329125.6_GN:GP1BA_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..843fbfe1b53b05edfb50199790e5546f2ae75656 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000185245.9_ENST00000329125.6_GN:GP1BA_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,653 @@ +>ENSG00000185245.9|ENST00000329125.6|GN:GP1BA|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.274 +2 P 0.257 +3 L 0.230 +4 L 0.204 +5 L 0.189 +6 L 0.188 +7 L 0.206 +8 L 0.238 +9 L 0.280 +10 L 0.333 +11 P 0.397 +12 S 0.458 +13 P 0.492 +14 L 0.493 +15 H 0.475 +16 P 0.437 +17 H 0.367 +18 P 0.267 +19 I 0.167 +20 C 0.098 +21 E 0.069 +22 V 0.069 +23 S 0.079 +24 K 0.088 +25 V 0.090 +26 A 0.087 +27 S 0.084 +28 H 0.082 +29 L 0.081 +30 E 0.083 +31 V 0.088 +32 N 0.095 +33 C 0.102 +34 D 0.109 +35 K 0.112 +36 R 0.113 +37 N 0.112 +38 L 0.110 +39 T 0.109 +40 A 0.113 +41 L 0.118 +42 P 0.114 +43 P 0.100 +44 D 0.083 +45 L 0.070 +46 P 0.063 +47 K 0.066 +48 D 0.076 +49 T 0.092 +50 T 0.114 +51 I 0.137 +52 L 0.152 +53 H 0.159 +54 L 0.160 +55 S 0.153 +56 E 0.135 +57 N 0.109 +58 L 0.086 +59 L 0.073 +60 Y 0.069 +61 T 0.072 +62 F 0.074 +63 S 0.072 +64 L 0.065 +65 A 0.058 +66 T 0.050 +67 L 0.045 +68 M 0.040 +69 P 0.035 +70 Y 0.035 +71 T 0.041 +72 R 0.051 +73 L 0.060 +74 T 0.072 +75 Q 0.085 +76 L 0.099 +77 N 0.111 +78 L 0.123 +79 D 0.125 +80 R 0.112 +81 C 0.092 +82 E 0.078 +83 L 0.074 +84 T 0.075 +85 K 0.079 +86 L 0.083 +87 Q 0.082 +88 V 0.080 +89 D 0.079 +90 G 0.079 +91 T 0.083 +92 L 0.088 +93 P 0.090 +94 V 0.089 +95 L 0.092 +96 G 0.106 +97 T 0.125 +98 L 0.140 +99 D 0.147 +100 L 0.147 +101 S 0.139 +102 H 0.124 +103 N 0.111 +104 Q 0.106 +105 L 0.109 +106 Q 0.115 +107 S 0.127 +108 L 0.142 +109 P 0.146 +110 L 0.135 +111 L 0.117 +112 G 0.100 +113 Q 0.086 +114 T 0.076 +115 L 0.074 +116 P 0.080 +117 A 0.087 +118 L 0.096 +119 T 0.110 +120 V 0.125 +121 L 0.133 +122 D 0.132 +123 V 0.130 +124 S 0.131 +125 F 0.129 +126 N 0.122 +127 R 0.117 +128 L 0.117 +129 T 0.126 +130 S 0.147 +131 L 0.173 +132 P 0.189 +133 L 0.186 +134 G 0.164 +135 A 0.137 +136 L 0.120 +137 R 0.116 +138 G 0.119 +139 L 0.124 +140 G 0.130 +141 E 0.133 +142 L 0.136 +143 Q 0.146 +144 E 0.158 +145 L 0.165 +146 Y 0.164 +147 L 0.159 +148 K 0.147 +149 G 0.126 +150 N 0.106 +151 E 0.100 +152 L 0.107 +153 K 0.123 +154 T 0.147 +155 L 0.171 +156 P 0.183 +157 P 0.179 +158 G 0.162 +159 L 0.138 +160 L 0.113 +161 T 0.091 +162 P 0.079 +163 T 0.081 +164 P 0.094 +165 K 0.109 +166 L 0.119 +167 E 0.124 +168 K 0.124 +169 L 0.124 +170 S 0.130 +171 L 0.141 +172 A 0.148 +173 N 0.141 +174 N 0.124 +175 N 0.111 +176 L 0.110 +177 T 0.124 +178 E 0.152 +179 L 0.179 +180 P 0.184 +181 A 0.172 +182 G 0.154 +183 L 0.132 +184 L 0.111 +185 N 0.099 +186 G 0.102 +187 L 0.119 +188 E 0.140 +189 N 0.154 +190 L 0.150 +191 D 0.140 +192 T 0.138 +193 L 0.140 +194 L 0.141 +195 L 0.143 +196 Q 0.143 +197 E 0.128 +198 N 0.099 +199 S 0.072 +200 L 0.062 +201 Y 0.070 +202 T 0.091 +203 I 0.113 +204 P 0.123 +205 K 0.119 +206 G 0.105 +207 F 0.090 +208 F 0.086 +209 G 0.095 +210 S 0.106 +211 H 0.111 +212 L 0.115 +213 L 0.125 +214 P 0.134 +215 F 0.138 +216 A 0.136 +217 F 0.133 +218 L 0.131 +219 H 0.129 +220 G 0.119 +221 N 0.099 +222 P 0.077 +223 W 0.061 +224 L 0.048 +225 C 0.038 +226 N 0.034 +227 C 0.035 +228 E 0.036 +229 I 0.035 +230 L 0.032 +231 Y 0.029 +232 F 0.027 +233 R 0.027 +234 R 0.029 +235 W 0.032 +236 L 0.035 +237 Q 0.036 +238 D 0.037 +239 N 0.037 +240 A 0.039 +241 E 0.042 +242 N 0.048 +243 V 0.060 +244 Y 0.082 +245 V 0.115 +246 W 0.153 +247 K 0.186 +248 Q 0.206 +249 G 0.210 +250 V 0.207 +251 D 0.205 +252 V 0.202 +253 K 0.195 +254 A 0.187 +255 M 0.184 +256 T 0.185 +257 S 0.188 +258 N 0.189 +259 V 0.184 +260 A 0.164 +261 S 0.134 +262 V 0.105 +263 Q 0.088 +264 C 0.085 +265 D 0.088 +266 N 0.094 +267 S 0.100 +268 D 0.107 +269 K 0.109 +270 F 0.105 +271 P 0.099 +272 V 0.094 +273 Y 0.096 +274 K 0.107 +275 Y 0.123 +276 P 0.136 +277 G 0.148 +278 K 0.168 +279 G 0.206 +280 C 0.276 +281 P 0.383 +282 T 0.507 +283 L 0.616 +284 G 0.683 +285 D 0.709 +286 E 0.712 +287 G 0.708 +288 D 0.701 +289 T 0.691 +290 D 0.676 +291 L 0.654 +292 Y 0.623 +293 D 0.584 +294 Y 0.558 +295 Y 0.569 +296 P 0.614 +297 E 0.667 +298 E 0.705 +299 D 0.720 +300 T 0.721 +301 E 0.723 +302 G 0.735 +303 D 0.750 +304 K 0.758 +305 V 0.758 +306 R 0.754 +307 A 0.748 +308 T 0.741 +309 R 0.736 +310 T 0.730 +311 V 0.718 +312 V 0.704 +313 K 0.703 +314 F 0.720 +315 P 0.746 +316 T 0.767 +317 K 0.774 +318 A 0.764 +319 H 0.740 +320 T 0.715 +321 T 0.694 +322 P 0.683 +323 W 0.686 +324 G 0.701 +325 L 0.716 +326 F 0.722 +327 Y 0.723 +328 S 0.722 +329 W 0.720 +330 S 0.724 +331 T 0.738 +332 A 0.755 +333 S 0.766 +334 L 0.771 +335 D 0.767 +336 S 0.751 +337 Q 0.728 +338 M 0.716 +339 P 0.727 +340 S 0.748 +341 S 0.761 +342 L 0.763 +343 H 0.763 +344 P 0.754 +345 T 0.717 +346 Q 0.655 +347 E 0.609 +348 S 0.599 +349 T 0.600 +350 K 0.607 +351 E 0.643 +352 Q 0.681 +353 T 0.681 +354 T 0.653 +355 F 0.634 +356 P 0.640 +357 P 0.654 +358 R 0.650 +359 W 0.637 +360 T 0.645 +361 P 0.673 +362 N 0.699 +363 F 0.711 +364 T 0.719 +365 L 0.730 +366 H 0.744 +367 M 0.756 +368 E 0.758 +369 S 0.746 +370 I 0.728 +371 T 0.715 +372 F 0.710 +373 S 0.711 +374 K 0.715 +375 T 0.727 +376 P 0.750 +377 K 0.775 +378 S 0.788 +379 T 0.781 +380 T 0.763 +381 E 0.745 +382 P 0.733 +383 T 0.728 +384 P 0.730 +385 S 0.734 +386 P 0.727 +387 T 0.679 +388 T 0.578 +389 S 0.475 +390 E 0.440 +391 P 0.460 +392 V 0.464 +393 P 0.448 +394 E 0.468 +395 P 0.523 +396 A 0.566 +397 P 0.598 +398 N 0.642 +399 M 0.669 +400 T 0.650 +401 T 0.631 +402 L 0.660 +403 E 0.715 +404 P 0.754 +405 T 0.769 +406 P 0.777 +407 S 0.786 +408 P 0.793 +409 T 0.795 +410 T 0.795 +411 P 0.796 +412 E 0.801 +413 P 0.804 +414 T 0.799 +415 S 0.788 +416 E 0.777 +417 P 0.771 +418 A 0.768 +419 P 0.767 +420 S 0.768 +421 P 0.767 +422 T 0.763 +423 T 0.760 +424 P 0.766 +425 E 0.777 +426 P 0.783 +427 T 0.780 +428 S 0.771 +429 E 0.762 +430 P 0.755 +431 A 0.751 +432 P 0.750 +433 S 0.751 +434 P 0.752 +435 T 0.750 +436 T 0.749 +437 P 0.754 +438 E 0.766 +439 P 0.776 +440 T 0.779 +441 S 0.778 +442 E 0.778 +443 P 0.780 +444 A 0.783 +445 P 0.786 +446 S 0.787 +447 P 0.782 +448 T 0.768 +449 T 0.753 +450 P 0.745 +451 E 0.741 +452 P 0.739 +453 T 0.738 +454 P 0.744 +455 I 0.760 +456 P 0.779 +457 T 0.793 +458 I 0.795 +459 A 0.787 +460 T 0.776 +461 S 0.773 +462 P 0.779 +463 T 0.786 +464 I 0.774 +465 L 0.730 +466 V 0.667 +467 S 0.637 +468 A 0.672 +469 T 0.733 +470 S 0.769 +471 L 0.772 +472 I 0.765 +473 T 0.768 +474 P 0.784 +475 K 0.803 +476 S 0.818 +477 T 0.824 +478 F 0.824 +479 L 0.821 +480 T 0.816 +481 T 0.808 +482 T 0.802 +483 K 0.806 +484 P 0.818 +485 V 0.832 +486 S 0.840 +487 L 0.840 +488 L 0.836 +489 E 0.831 +490 S 0.826 +491 T 0.821 +492 K 0.814 +493 K 0.806 +494 T 0.798 +495 I 0.794 +496 P 0.796 +497 E 0.797 +498 L 0.786 +499 D 0.762 +500 Q 0.741 +501 P 0.741 +502 P 0.762 +503 K 0.788 +504 L 0.805 +505 R 0.812 +506 G 0.811 +507 V 0.807 +508 L 0.802 +509 Q 0.800 +510 G 0.797 +511 H 0.793 +512 L 0.789 +513 E 0.787 +514 S 0.782 +515 S 0.772 +516 R 0.756 +517 N 0.736 +518 D 0.715 +519 P 0.692 +520 F 0.669 +521 L 0.658 +522 H 0.656 +523 P 0.642 +524 D 0.590 +525 F 0.508 +526 C 0.438 +527 C 0.417 +528 L 0.430 +529 L 0.434 +530 P 0.409 +531 L 0.368 +532 G 0.327 +533 F 0.296 +534 Y 0.280 +535 V 0.284 +536 L 0.308 +537 G 0.340 +538 L 0.359 +539 F 0.352 +540 W 0.323 +541 L 0.284 +542 L 0.247 +543 F 0.223 +544 A 0.212 +545 S 0.204 +546 V 0.192 +547 V 0.177 +548 L 0.159 +549 I 0.144 +550 L 0.140 +551 L 0.144 +552 L 0.157 +553 S 0.180 +554 W 0.217 +555 V 0.262 +556 G 0.305 +557 H 0.346 +558 V 0.397 +559 K 0.464 +560 P 0.539 +561 Q 0.609 +562 A 0.664 +563 L 0.700 +564 D 0.720 +565 S 0.735 +566 G 0.751 +567 Q 0.764 +568 G 0.773 +569 A 0.777 +570 A 0.779 +571 L 0.776 +572 T 0.767 +573 T 0.745 +574 A 0.700 +575 T 0.620 +576 Q 0.501 +577 T 0.368 +578 T 0.258 +579 H 0.193 +580 L 0.170 +581 E 0.181 +582 L 0.223 +583 Q 0.277 +584 R 0.311 +585 G 0.304 +586 R 0.271 +587 Q 0.236 +588 V 0.217 +589 T 0.220 +590 V 0.227 +591 P 0.215 +592 R 0.180 +593 A 0.144 +594 W 0.122 +595 L 0.113 +596 L 0.118 +597 F 0.135 +598 L 0.156 +599 R 0.175 +600 G 0.188 +601 S 0.195 +602 L 0.193 +603 P 0.183 +604 T 0.168 +605 F 0.149 +606 R 0.130 +607 S 0.111 +608 S 0.093 +609 L 0.076 +610 F 0.068 +611 L 0.071 +612 W 0.085 +613 V 0.109 +614 R 0.138 +615 P 0.165 +616 N 0.185 +617 G 0.197 +618 R 0.197 +619 V 0.190 +620 G 0.186 +621 P 0.190 +622 L 0.207 +623 V 0.245 +624 A 0.307 +625 G 0.382 +626 R 0.451 +627 R 0.506 +628 P 0.550 +629 S 0.586 +630 A 0.608 +631 L 0.616 +632 S 0.614 +633 Q 0.612 +634 G 0.612 +635 R 0.598 +636 G 0.553 +637 Q 0.485 +638 D 0.417 +639 L 0.362 +640 L 0.316 +641 S 0.267 +642 T 0.214 +643 V 0.163 +644 S 0.130 +645 I 0.119 +646 R 0.121 +647 Y 0.125 +648 S 0.131 +649 G 0.135 +650 H 0.135 +651 S 0.127 +652 L 0.118 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000185245.9_ENST00000329125.6_GN:GP1BA_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:29.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000185245.9_ENST00000329125.6_GN:GP1BA_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:29.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..74765d69b02c0da66184fc75c9f6dd7b18e59885 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000185245.9_ENST00000329125.6_GN:GP1BA_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:29.caid @@ -0,0 +1,682 @@ +>ENSG00000185245.9|ENST00000329125.6|GN:GP1BA|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:29 +1 M 0.398 +2 G 0.412 +3 L 0.429 +4 E 0.428 +5 E 0.395 +6 R 0.357 +7 R 0.364 +8 T 0.411 +9 E 0.453 +10 S 0.489 +11 S 0.548 +12 G 0.615 +13 T 0.648 +14 L 0.643 +15 E 0.620 +16 D 0.578 +17 A 0.507 +18 L 0.436 +19 C 0.409 +20 L 0.430 +21 R 0.460 +22 R 0.471 +23 S 0.465 +24 F 0.454 +25 C 0.438 +26 L 0.410 +27 P 0.365 +28 V 0.314 +29 L 0.274 +30 M 0.247 +31 P 0.223 +32 L 0.197 +33 L 0.177 +34 L 0.171 +35 L 0.176 +36 L 0.187 +37 L 0.206 +38 L 0.241 +39 L 0.299 +40 P 0.374 +41 S 0.448 +42 P 0.497 +43 L 0.508 +44 H 0.490 +45 P 0.446 +46 H 0.374 +47 P 0.275 +48 I 0.174 +49 C 0.102 +50 E 0.071 +51 V 0.070 +52 S 0.080 +53 K 0.089 +54 V 0.090 +55 A 0.085 +56 S 0.079 +57 H 0.076 +58 L 0.077 +59 E 0.080 +60 V 0.086 +61 N 0.092 +62 C 0.099 +63 D 0.105 +64 K 0.107 +65 R 0.108 +66 N 0.107 +67 L 0.105 +68 T 0.103 +69 A 0.106 +70 L 0.109 +71 P 0.105 +72 P 0.092 +73 D 0.076 +74 L 0.063 +75 P 0.059 +76 K 0.062 +77 D 0.071 +78 T 0.085 +79 T 0.106 +80 I 0.127 +81 L 0.141 +82 H 0.145 +83 L 0.144 +84 S 0.137 +85 E 0.121 +86 N 0.097 +87 L 0.075 +88 L 0.062 +89 Y 0.059 +90 T 0.062 +91 F 0.064 +92 S 0.063 +93 L 0.058 +94 A 0.052 +95 T 0.045 +96 L 0.040 +97 M 0.036 +98 P 0.031 +99 Y 0.031 +100 T 0.037 +101 R 0.046 +102 L 0.056 +103 T 0.067 +104 Q 0.080 +105 L 0.093 +106 N 0.105 +107 L 0.117 +108 D 0.120 +109 R 0.108 +110 C 0.088 +111 E 0.073 +112 L 0.068 +113 T 0.070 +114 K 0.076 +115 L 0.080 +116 Q 0.080 +117 V 0.079 +118 D 0.079 +119 G 0.081 +120 T 0.086 +121 L 0.092 +122 P 0.095 +123 V 0.095 +124 L 0.100 +125 G 0.116 +126 T 0.138 +127 L 0.156 +128 D 0.166 +129 L 0.167 +130 S 0.159 +131 H 0.143 +132 N 0.126 +133 Q 0.120 +134 L 0.123 +135 Q 0.131 +136 S 0.145 +137 L 0.162 +138 P 0.166 +139 L 0.153 +140 L 0.132 +141 G 0.114 +142 Q 0.099 +143 T 0.087 +144 L 0.084 +145 P 0.089 +146 A 0.097 +147 L 0.105 +148 T 0.117 +149 V 0.131 +150 L 0.138 +151 D 0.136 +152 V 0.134 +153 S 0.134 +154 F 0.133 +155 N 0.127 +156 R 0.123 +157 L 0.124 +158 T 0.133 +159 S 0.154 +160 L 0.180 +161 P 0.194 +162 L 0.190 +163 G 0.168 +164 A 0.140 +165 L 0.121 +166 R 0.116 +167 G 0.118 +168 L 0.122 +169 G 0.126 +170 E 0.129 +171 L 0.133 +172 Q 0.144 +173 E 0.157 +174 L 0.163 +175 Y 0.161 +176 L 0.154 +177 K 0.141 +178 G 0.121 +179 N 0.104 +180 E 0.100 +181 L 0.107 +182 K 0.122 +183 T 0.146 +184 L 0.169 +185 P 0.179 +186 P 0.171 +187 G 0.152 +188 L 0.127 +189 L 0.103 +190 T 0.085 +191 P 0.074 +192 T 0.077 +193 P 0.090 +194 K 0.106 +195 L 0.118 +196 E 0.125 +197 K 0.126 +198 L 0.123 +199 S 0.125 +200 L 0.133 +201 A 0.139 +202 N 0.133 +203 N 0.118 +204 N 0.106 +205 L 0.105 +206 T 0.117 +207 E 0.142 +208 L 0.168 +209 P 0.174 +210 A 0.163 +211 G 0.145 +212 L 0.123 +213 L 0.102 +214 N 0.091 +215 G 0.093 +216 L 0.109 +217 E 0.131 +218 N 0.145 +219 L 0.142 +220 D 0.132 +221 T 0.131 +222 L 0.135 +223 L 0.138 +224 L 0.142 +225 Q 0.142 +226 E 0.128 +227 N 0.098 +228 S 0.071 +229 L 0.060 +230 Y 0.067 +231 T 0.087 +232 I 0.109 +233 P 0.120 +234 K 0.117 +235 G 0.103 +236 F 0.088 +237 F 0.084 +238 G 0.094 +239 S 0.105 +240 H 0.110 +241 L 0.115 +242 L 0.125 +243 P 0.133 +244 F 0.137 +245 A 0.136 +246 F 0.133 +247 L 0.132 +248 H 0.130 +249 G 0.120 +250 N 0.100 +251 P 0.079 +252 W 0.062 +253 L 0.050 +254 C 0.040 +255 N 0.035 +256 C 0.036 +257 E 0.037 +258 I 0.036 +259 L 0.032 +260 Y 0.030 +261 F 0.028 +262 R 0.028 +263 R 0.030 +264 W 0.033 +265 L 0.036 +266 Q 0.038 +267 D 0.038 +268 N 0.039 +269 A 0.041 +270 E 0.045 +271 N 0.052 +272 V 0.065 +273 Y 0.089 +274 V 0.125 +275 W 0.166 +276 K 0.203 +277 Q 0.226 +278 G 0.231 +279 V 0.226 +280 D 0.221 +281 V 0.216 +282 K 0.206 +283 A 0.196 +284 M 0.192 +285 T 0.193 +286 S 0.197 +287 N 0.199 +288 V 0.194 +289 A 0.173 +290 S 0.141 +291 V 0.111 +292 Q 0.093 +293 C 0.090 +294 D 0.094 +295 N 0.099 +296 S 0.106 +297 D 0.112 +298 K 0.115 +299 F 0.112 +300 P 0.105 +301 V 0.100 +302 Y 0.101 +303 K 0.112 +304 Y 0.128 +305 P 0.142 +306 G 0.157 +307 K 0.179 +308 G 0.219 +309 C 0.292 +310 P 0.401 +311 T 0.526 +312 L 0.632 +313 G 0.696 +314 D 0.719 +315 E 0.722 +316 G 0.718 +317 D 0.712 +318 T 0.703 +319 D 0.688 +320 L 0.666 +321 Y 0.634 +322 D 0.594 +323 Y 0.565 +324 Y 0.575 +325 P 0.621 +326 E 0.675 +327 E 0.713 +328 D 0.727 +329 T 0.728 +330 E 0.731 +331 G 0.744 +332 D 0.760 +333 K 0.769 +334 V 0.769 +335 R 0.765 +336 A 0.760 +337 T 0.754 +338 R 0.750 +339 T 0.744 +340 V 0.732 +341 V 0.719 +342 K 0.716 +343 F 0.729 +344 P 0.751 +345 T 0.770 +346 K 0.777 +347 A 0.768 +348 H 0.744 +349 T 0.718 +350 T 0.696 +351 P 0.685 +352 W 0.688 +353 G 0.704 +354 L 0.718 +355 F 0.724 +356 Y 0.725 +357 S 0.723 +358 W 0.717 +359 S 0.718 +360 T 0.730 +361 A 0.747 +362 S 0.761 +363 L 0.768 +364 D 0.766 +365 S 0.752 +366 Q 0.730 +367 M 0.720 +368 P 0.730 +369 S 0.750 +370 S 0.761 +371 L 0.763 +372 H 0.762 +373 P 0.754 +374 T 0.719 +375 Q 0.661 +376 E 0.631 +377 S 0.662 +378 T 0.721 +379 K 0.758 +380 E 0.762 +381 Q 0.739 +382 T 0.698 +383 T 0.655 +384 F 0.633 +385 P 0.640 +386 P 0.655 +387 R 0.653 +388 W 0.641 +389 T 0.648 +390 P 0.675 +391 N 0.699 +392 F 0.710 +393 T 0.717 +394 L 0.727 +395 H 0.741 +396 M 0.752 +397 E 0.753 +398 S 0.739 +399 I 0.718 +400 T 0.703 +401 F 0.699 +402 S 0.703 +403 K 0.710 +404 T 0.724 +405 P 0.747 +406 K 0.772 +407 S 0.785 +408 T 0.779 +409 T 0.762 +410 E 0.745 +411 P 0.734 +412 T 0.729 +413 P 0.731 +414 S 0.739 +415 P 0.747 +416 T 0.736 +417 T 0.689 +418 S 0.616 +419 E 0.565 +420 P 0.559 +421 V 0.560 +422 P 0.541 +423 E 0.534 +424 P 0.557 +425 A 0.588 +426 P 0.618 +427 N 0.658 +428 M 0.677 +429 T 0.654 +430 T 0.633 +431 L 0.660 +432 E 0.714 +433 P 0.752 +434 T 0.767 +435 P 0.774 +436 S 0.783 +437 P 0.790 +438 T 0.793 +439 T 0.793 +440 P 0.793 +441 E 0.797 +442 P 0.800 +443 T 0.796 +444 S 0.785 +445 E 0.774 +446 P 0.768 +447 A 0.765 +448 P 0.764 +449 S 0.767 +450 P 0.768 +451 T 0.766 +452 T 0.765 +453 P 0.771 +454 E 0.782 +455 P 0.788 +456 T 0.786 +457 S 0.778 +458 E 0.769 +459 P 0.762 +460 A 0.758 +461 P 0.757 +462 S 0.759 +463 P 0.760 +464 T 0.759 +465 T 0.758 +466 P 0.762 +467 E 0.773 +468 P 0.784 +469 T 0.788 +470 S 0.787 +471 E 0.787 +472 P 0.789 +473 A 0.792 +474 P 0.795 +475 S 0.796 +476 P 0.790 +477 T 0.777 +478 T 0.762 +479 P 0.753 +480 E 0.750 +481 P 0.747 +482 T 0.746 +483 P 0.752 +484 I 0.768 +485 P 0.788 +486 T 0.801 +487 I 0.803 +488 A 0.795 +489 T 0.785 +490 S 0.781 +491 P 0.787 +492 T 0.793 +493 I 0.781 +494 L 0.736 +495 V 0.672 +496 S 0.641 +497 A 0.676 +498 T 0.738 +499 S 0.773 +500 L 0.777 +501 I 0.771 +502 T 0.775 +503 P 0.791 +504 K 0.810 +505 S 0.823 +506 T 0.828 +507 F 0.827 +508 L 0.824 +509 T 0.819 +510 T 0.812 +511 T 0.806 +512 K 0.810 +513 P 0.822 +514 V 0.835 +515 S 0.841 +516 L 0.841 +517 L 0.837 +518 E 0.832 +519 S 0.828 +520 T 0.823 +521 K 0.816 +522 K 0.809 +523 T 0.802 +524 I 0.799 +525 P 0.801 +526 E 0.802 +527 L 0.789 +528 D 0.764 +529 Q 0.743 +530 P 0.743 +531 P 0.764 +532 K 0.790 +533 L 0.806 +534 R 0.812 +535 G 0.811 +536 V 0.805 +537 L 0.799 +538 Q 0.796 +539 G 0.794 +540 H 0.790 +541 L 0.786 +542 E 0.784 +543 S 0.778 +544 S 0.765 +545 R 0.745 +546 N 0.721 +547 D 0.697 +548 P 0.671 +549 F 0.645 +550 L 0.633 +551 H 0.633 +552 P 0.621 +553 D 0.570 +554 F 0.489 +555 C 0.422 +556 C 0.399 +557 L 0.404 +558 L 0.400 +559 P 0.373 +560 L 0.334 +561 G 0.296 +562 F 0.267 +563 Y 0.251 +564 V 0.256 +565 L 0.282 +566 G 0.316 +567 L 0.339 +568 F 0.337 +569 W 0.312 +570 L 0.274 +571 L 0.238 +572 F 0.214 +573 A 0.201 +574 S 0.190 +575 V 0.177 +576 V 0.163 +577 L 0.148 +578 I 0.136 +579 L 0.132 +580 L 0.137 +581 L 0.148 +582 S 0.172 +583 W 0.209 +584 V 0.255 +585 G 0.299 +586 H 0.340 +587 V 0.389 +588 K 0.455 +589 P 0.529 +590 Q 0.598 +591 A 0.654 +592 L 0.691 +593 D 0.714 +594 S 0.731 +595 G 0.749 +596 Q 0.764 +597 G 0.774 +598 A 0.779 +599 A 0.778 +600 L 0.774 +601 T 0.764 +602 T 0.743 +603 A 0.703 +604 T 0.627 +605 Q 0.511 +606 T 0.375 +607 T 0.262 +608 H 0.194 +609 L 0.169 +610 E 0.179 +611 L 0.220 +612 Q 0.276 +613 R 0.313 +614 G 0.311 +615 R 0.280 +616 Q 0.243 +617 V 0.223 +618 T 0.224 +619 V 0.231 +620 P 0.219 +621 R 0.182 +622 A 0.146 +623 W 0.123 +624 L 0.114 +625 L 0.118 +626 F 0.136 +627 L 0.157 +628 R 0.175 +629 G 0.190 +630 S 0.197 +631 L 0.195 +632 P 0.185 +633 T 0.170 +634 F 0.152 +635 R 0.133 +636 S 0.115 +637 S 0.095 +638 L 0.078 +639 F 0.068 +640 L 0.071 +641 W 0.085 +642 V 0.111 +643 R 0.141 +644 P 0.168 +645 N 0.189 +646 G 0.201 +647 R 0.201 +648 V 0.193 +649 G 0.189 +650 P 0.192 +651 L 0.208 +652 V 0.246 +653 A 0.311 +654 G 0.388 +655 R 0.458 +656 R 0.512 +657 P 0.552 +658 S 0.585 +659 A 0.606 +660 L 0.614 +661 S 0.612 +662 Q 0.610 +663 G 0.610 +664 R 0.596 +665 G 0.553 +666 Q 0.486 +667 D 0.419 +668 L 0.364 +669 L 0.317 +670 S 0.268 +671 T 0.213 +672 V 0.162 +673 S 0.130 +674 I 0.119 +675 R 0.121 +676 Y 0.126 +677 S 0.131 +678 G 0.136 +679 H 0.135 +680 S 0.128 +681 L 0.120 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000185614.8_ENST00000333323.6_GN:INKA1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000185614.8_ENST00000333323.6_GN:INKA1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5e8e2838673481ac51ac43b8af4f7c907525d04e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000185614.8_ENST00000333323.6_GN:INKA1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,286 @@ +>ENSG00000185614.8|ENST00000333323.6|GN:INKA1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.402 +2 H 0.424 +3 S 0.452 +4 A 0.460 +5 R 0.425 +6 L 0.359 +7 D 0.297 +8 S 0.255 +9 F 0.225 +10 L 0.200 +11 S 0.187 +12 Q 0.189 +13 L 0.193 +14 R 0.194 +15 W 0.198 +16 E 0.214 +17 L 0.251 +18 L 0.327 +19 C 0.447 +20 G 0.580 +21 R 0.686 +22 D 0.746 +23 T 0.767 +24 G 0.768 +25 S 0.765 +26 P 0.762 +27 S 0.759 +28 M 0.757 +29 P 0.765 +30 G 0.782 +31 P 0.799 +32 L 0.809 +33 Q 0.814 +34 P 0.809 +35 T 0.774 +36 S 0.711 +37 Q 0.670 +38 T 0.696 +39 G 0.760 +40 P 0.811 +41 D 0.833 +42 V 0.838 +43 Q 0.839 +44 P 0.845 +45 S 0.856 +46 H 0.869 +47 Q 0.880 +48 L 0.889 +49 R 0.897 +50 A 0.902 +51 S 0.904 +52 G 0.904 +53 A 0.905 +54 L 0.905 +55 E 0.904 +56 E 0.901 +57 D 0.899 +58 S 0.898 +59 V 0.899 +60 C 0.899 +61 C 0.891 +62 V 0.866 +63 E 0.809 +64 E 0.735 +65 E 0.696 +66 E 0.725 +67 E 0.788 +68 E 0.835 +69 E 0.859 +70 E 0.873 +71 E 0.884 +72 A 0.890 +73 V 0.891 +74 V 0.886 +75 T 0.879 +76 E 0.873 +77 D 0.870 +78 R 0.869 +79 D 0.870 +80 A 0.868 +81 A 0.861 +82 L 0.846 +83 G 0.830 +84 G 0.824 +85 P 0.831 +86 R 0.842 +87 E 0.851 +88 H 0.851 +89 A 0.843 +90 L 0.828 +91 D 0.809 +92 W 0.794 +93 D 0.792 +94 S 0.801 +95 G 0.818 +96 F 0.836 +97 S 0.850 +98 E 0.858 +99 V 0.860 +100 S 0.860 +101 G 0.857 +102 S 0.854 +103 T 0.851 +104 W 0.850 +105 R 0.848 +106 E 0.844 +107 E 0.832 +108 E 0.816 +109 L 0.801 +110 P 0.800 +111 V 0.811 +112 S 0.818 +113 Q 0.813 +114 R 0.805 +115 P 0.808 +116 A 0.822 +117 P 0.837 +118 S 0.842 +119 A 0.836 +120 Q 0.830 +121 P 0.834 +122 L 0.847 +123 R 0.860 +124 R 0.869 +125 Q 0.876 +126 C 0.880 +127 L 0.879 +128 S 0.872 +129 V 0.863 +130 S 0.853 +131 G 0.841 +132 L 0.828 +133 P 0.821 +134 M 0.825 +135 P 0.837 +136 S 0.848 +137 R 0.854 +138 A 0.860 +139 P 0.869 +140 V 0.875 +141 A 0.870 +142 S 0.850 +143 V 0.829 +144 P 0.821 +145 P 0.826 +146 V 0.829 +147 H 0.820 +148 H 0.807 +149 P 0.803 +150 R 0.810 +151 P 0.822 +152 K 0.828 +153 S 0.823 +154 T 0.814 +155 P 0.809 +156 D 0.807 +157 A 0.800 +158 C 0.785 +159 L 0.766 +160 E 0.746 +161 H 0.733 +162 W 0.736 +163 Q 0.754 +164 G 0.773 +165 L 0.777 +166 E 0.759 +167 A 0.716 +168 E 0.648 +169 D 0.562 +170 W 0.479 +171 T 0.427 +172 A 0.422 +173 A 0.461 +174 L 0.514 +175 L 0.549 +176 N 0.571 +177 R 0.604 +178 G 0.643 +179 R 0.674 +180 S 0.699 +181 R 0.723 +182 Q 0.747 +183 P 0.763 +184 L 0.764 +185 V 0.750 +186 L 0.729 +187 G 0.709 +188 D 0.699 +189 N 0.685 +190 C 0.643 +191 F 0.573 +192 A 0.520 +193 D 0.514 +194 L 0.528 +195 V 0.528 +196 H 0.524 +197 N 0.537 +198 W 0.561 +199 M 0.585 +200 E 0.613 +201 L 0.656 +202 P 0.711 +203 E 0.764 +204 T 0.802 +205 G 0.820 +206 S 0.825 +207 E 0.824 +208 G 0.822 +209 G 0.821 +210 D 0.820 +211 G 0.820 +212 G 0.821 +213 G 0.822 +214 H 0.821 +215 R 0.816 +216 A 0.801 +217 R 0.774 +218 A 0.736 +219 R 0.697 +220 P 0.668 +221 P 0.656 +222 Q 0.654 +223 F 0.650 +224 L 0.640 +225 L 0.620 +226 G 0.583 +227 L 0.514 +228 S 0.410 +229 E 0.302 +230 Q 0.226 +231 L 0.190 +232 R 0.181 +233 R 0.190 +234 R 0.209 +235 L 0.231 +236 A 0.254 +237 R 0.281 +238 A 0.310 +239 R 0.344 +240 R 0.384 +241 T 0.431 +242 A 0.478 +243 M 0.526 +244 A 0.579 +245 G 0.639 +246 K 0.690 +247 R 0.717 +248 L 0.717 +249 S 0.696 +250 C 0.667 +251 P 0.651 +252 P 0.653 +253 R 0.666 +254 P 0.680 +255 E 0.691 +256 P 0.697 +257 E 0.696 +258 L 0.685 +259 P 0.664 +260 A 0.633 +261 D 0.591 +262 V 0.546 +263 S 0.509 +264 R 0.479 +265 F 0.448 +266 A 0.425 +267 A 0.439 +268 L 0.489 +269 M 0.545 +270 S 0.587 +271 C 0.621 +272 R 0.656 +273 S 0.687 +274 R 0.709 +275 Q 0.727 +276 P 0.743 +277 I 0.745 +278 I 0.729 +279 C 0.704 +280 N 0.683 +281 D 0.673 +282 V 0.670 +283 S 0.651 +284 Y 0.598 +285 L 0.541 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000185614.8_ENST00000333323.6_GN:INKA1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000185614.8_ENST00000333323.6_GN:INKA1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5eb2295d6cb7b2167c9683c5867b86a3a8f1af2a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000185614.8_ENST00000333323.6_GN:INKA1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid @@ -0,0 +1,288 @@ +>ENSG00000185614.8|ENST00000333323.6|GN:INKA1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:2 +1 M 0.420 +2 D 0.425 +3 M 0.429 +4 H 0.428 +5 S 0.421 +6 A 0.402 +7 R 0.365 +8 L 0.319 +9 D 0.281 +10 S 0.251 +11 F 0.221 +12 L 0.195 +13 S 0.185 +14 Q 0.189 +15 L 0.193 +16 R 0.191 +17 W 0.193 +18 E 0.208 +19 L 0.247 +20 L 0.325 +21 C 0.446 +22 G 0.580 +23 R 0.685 +24 D 0.745 +25 T 0.766 +26 G 0.767 +27 S 0.763 +28 P 0.760 +29 S 0.757 +30 M 0.756 +31 P 0.764 +32 G 0.781 +33 P 0.798 +34 L 0.809 +35 Q 0.813 +36 P 0.808 +37 T 0.774 +38 S 0.711 +39 Q 0.671 +40 T 0.697 +41 G 0.760 +42 P 0.811 +43 D 0.834 +44 V 0.839 +45 Q 0.840 +46 P 0.846 +47 S 0.857 +48 H 0.870 +49 Q 0.881 +50 L 0.890 +51 R 0.898 +52 A 0.904 +53 S 0.906 +54 G 0.906 +55 A 0.907 +56 L 0.908 +57 E 0.906 +58 E 0.903 +59 D 0.900 +60 S 0.900 +61 V 0.900 +62 C 0.900 +63 C 0.893 +64 V 0.868 +65 E 0.813 +66 E 0.741 +67 E 0.704 +68 E 0.732 +69 E 0.791 +70 E 0.836 +71 E 0.859 +72 E 0.872 +73 E 0.883 +74 A 0.889 +75 V 0.890 +76 V 0.885 +77 T 0.878 +78 E 0.873 +79 D 0.870 +80 R 0.869 +81 D 0.869 +82 A 0.868 +83 A 0.860 +84 L 0.845 +85 G 0.830 +86 G 0.824 +87 P 0.831 +88 R 0.843 +89 E 0.851 +90 H 0.851 +91 A 0.843 +92 L 0.828 +93 D 0.808 +94 W 0.793 +95 D 0.791 +96 S 0.800 +97 G 0.816 +98 F 0.834 +99 S 0.848 +100 E 0.856 +101 V 0.858 +102 S 0.857 +103 G 0.855 +104 S 0.852 +105 T 0.849 +106 W 0.848 +107 R 0.847 +108 E 0.843 +109 E 0.832 +110 E 0.815 +111 L 0.800 +112 P 0.799 +113 V 0.810 +114 S 0.818 +115 Q 0.812 +116 R 0.804 +117 P 0.808 +118 A 0.822 +119 P 0.837 +120 S 0.842 +121 A 0.836 +122 Q 0.830 +123 P 0.835 +124 L 0.848 +125 R 0.861 +126 R 0.870 +127 Q 0.877 +128 C 0.881 +129 L 0.880 +130 S 0.874 +131 V 0.864 +132 S 0.854 +133 G 0.842 +134 L 0.829 +135 P 0.821 +136 M 0.825 +137 P 0.837 +138 S 0.848 +139 R 0.855 +140 A 0.860 +141 P 0.869 +142 V 0.875 +143 A 0.869 +144 S 0.850 +145 V 0.829 +146 P 0.820 +147 P 0.826 +148 V 0.829 +149 H 0.820 +150 H 0.807 +151 P 0.802 +152 R 0.809 +153 P 0.821 +154 K 0.828 +155 S 0.823 +156 T 0.813 +157 P 0.809 +158 D 0.807 +159 A 0.800 +160 C 0.786 +161 L 0.767 +162 E 0.747 +163 H 0.733 +164 W 0.736 +165 Q 0.755 +166 G 0.774 +167 L 0.778 +168 E 0.760 +169 A 0.717 +170 E 0.648 +171 D 0.562 +172 W 0.479 +173 T 0.428 +174 A 0.423 +175 A 0.462 +176 L 0.516 +177 L 0.551 +178 N 0.574 +179 R 0.608 +180 G 0.648 +181 R 0.680 +182 S 0.704 +183 R 0.727 +184 Q 0.749 +185 P 0.764 +186 L 0.765 +187 V 0.751 +188 L 0.729 +189 G 0.709 +190 D 0.698 +191 N 0.684 +192 C 0.642 +193 F 0.572 +194 A 0.519 +195 D 0.514 +196 L 0.528 +197 V 0.528 +198 H 0.524 +199 N 0.537 +200 W 0.561 +201 M 0.584 +202 E 0.612 +203 L 0.655 +204 P 0.710 +205 E 0.763 +206 T 0.801 +207 G 0.820 +208 S 0.824 +209 E 0.824 +210 G 0.822 +211 G 0.821 +212 D 0.820 +213 G 0.820 +214 G 0.821 +215 G 0.822 +216 H 0.821 +217 R 0.816 +218 A 0.801 +219 R 0.773 +220 A 0.735 +221 R 0.696 +222 P 0.667 +223 P 0.655 +224 Q 0.653 +225 F 0.650 +226 L 0.638 +227 L 0.619 +228 G 0.582 +229 L 0.514 +230 S 0.410 +231 E 0.302 +232 Q 0.226 +233 L 0.190 +234 R 0.182 +235 R 0.191 +236 R 0.209 +237 L 0.231 +238 A 0.254 +239 R 0.281 +240 A 0.310 +241 R 0.344 +242 R 0.384 +243 T 0.431 +244 A 0.479 +245 M 0.525 +246 A 0.579 +247 G 0.640 +248 K 0.690 +249 R 0.717 +250 L 0.718 +251 S 0.696 +252 C 0.668 +253 P 0.652 +254 P 0.655 +255 R 0.668 +256 P 0.682 +257 E 0.693 +258 P 0.699 +259 E 0.699 +260 L 0.690 +261 P 0.670 +262 A 0.639 +263 D 0.598 +264 V 0.554 +265 S 0.518 +266 R 0.488 +267 F 0.456 +268 A 0.432 +269 A 0.445 +270 L 0.495 +271 M 0.550 +272 S 0.591 +273 C 0.625 +274 R 0.660 +275 S 0.692 +276 R 0.715 +277 Q 0.733 +278 P 0.748 +279 I 0.751 +280 I 0.736 +281 C 0.712 +282 N 0.692 +283 D 0.681 +284 V 0.676 +285 S 0.656 +286 Y 0.601 +287 L 0.543 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000185674.11_ENST00000333017.7_GN:LYG2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000185674.11_ENST00000333017.7_GN:LYG2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e47253a14642492f55380e73cb9cfb9f382ca9d0 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000185674.11_ENST00000333017.7_GN:LYG2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,213 @@ +>ENSG00000185674.11|ENST00000333017.7|GN:LYG2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.363 +2 L 0.376 +3 S 0.394 +4 S 0.391 +5 V 0.354 +6 V 0.304 +7 F 0.285 +8 W 0.299 +9 G 0.309 +10 L 0.310 +11 I 0.339 +12 A 0.406 +13 L 0.472 +14 I 0.513 +15 G 0.539 +16 T 0.559 +17 S 0.570 +18 R 0.566 +19 G 0.546 +20 S 0.519 +21 Y 0.502 +22 P 0.499 +23 F 0.507 +24 S 0.514 +25 H 0.509 +26 S 0.493 +27 M 0.467 +28 K 0.435 +29 P 0.402 +30 H 0.374 +31 L 0.355 +32 H 0.336 +33 P 0.310 +34 R 0.273 +35 L 0.231 +36 Y 0.189 +37 H 0.153 +38 G 0.128 +39 C 0.112 +40 Y 0.103 +41 G 0.098 +42 D 0.093 +43 I 0.090 +44 M 0.091 +45 T 0.098 +46 M 0.114 +47 K 0.136 +48 T 0.162 +49 S 0.193 +50 G 0.220 +51 A 0.233 +52 T 0.228 +53 C 0.217 +54 D 0.216 +55 A 0.225 +56 N 0.230 +57 S 0.223 +58 V 0.208 +59 M 0.194 +60 N 0.186 +61 C 0.183 +62 G 0.178 +63 I 0.172 +64 R 0.164 +65 G 0.149 +66 S 0.133 +67 E 0.125 +68 M 0.120 +69 F 0.110 +70 A 0.096 +71 E 0.087 +72 M 0.084 +73 D 0.079 +74 L 0.071 +75 R 0.063 +76 A 0.060 +77 I 0.058 +78 K 0.055 +79 P 0.054 +80 Y 0.058 +81 Q 0.065 +82 T 0.065 +83 L 0.055 +84 I 0.045 +85 K 0.044 +86 E 0.050 +87 V 0.054 +88 G 0.055 +89 Q 0.054 +90 R 0.056 +91 H 0.060 +92 C 0.065 +93 V 0.066 +94 D 0.062 +95 P 0.057 +96 A 0.055 +97 V 0.058 +98 I 0.064 +99 A 0.067 +100 A 0.066 +101 I 0.062 +102 I 0.060 +103 S 0.056 +104 R 0.051 +105 E 0.055 +106 S 0.076 +107 H 0.108 +108 G 0.140 +109 G 0.156 +110 S 0.156 +111 V 0.149 +112 L 0.148 +113 Q 0.155 +114 D 0.161 +115 G 0.156 +116 W 0.141 +117 D 0.126 +118 H 0.118 +119 R 0.111 +120 G 0.100 +121 L 0.089 +122 K 0.080 +123 F 0.071 +124 G 0.061 +125 L 0.055 +126 M 0.054 +127 Q 0.053 +128 L 0.050 +129 D 0.047 +130 K 0.049 +131 Q 0.058 +132 T 0.075 +133 Y 0.092 +134 H 0.108 +135 P 0.126 +136 V 0.140 +137 G 0.143 +138 A 0.136 +139 W 0.127 +140 D 0.120 +141 S 0.112 +142 K 0.103 +143 E 0.098 +144 H 0.096 +145 L 0.095 +146 S 0.097 +147 Q 0.102 +148 A 0.101 +149 T 0.089 +150 G 0.072 +151 I 0.059 +152 L 0.049 +153 T 0.041 +154 E 0.036 +155 R 0.035 +156 I 0.036 +157 K 0.039 +158 A 0.042 +159 I 0.048 +160 Q 0.057 +161 K 0.064 +162 K 0.067 +163 F 0.065 +164 P 0.062 +165 T 0.056 +166 W 0.048 +167 S 0.042 +168 V 0.038 +169 A 0.035 +170 Q 0.036 +171 H 0.038 +172 L 0.043 +173 K 0.051 +174 G 0.062 +175 G 0.070 +176 L 0.072 +177 S 0.068 +178 A 0.061 +179 F 0.054 +180 K 0.053 +181 S 0.061 +182 G 0.076 +183 I 0.097 +184 E 0.119 +185 A 0.140 +186 I 0.151 +187 A 0.148 +188 T 0.140 +189 P 0.144 +190 S 0.163 +191 D 0.182 +192 I 0.180 +193 D 0.154 +194 N 0.118 +195 D 0.087 +196 F 0.068 +197 V 0.058 +198 N 0.053 +199 D 0.052 +200 I 0.051 +201 I 0.046 +202 A 0.039 +203 R 0.035 +204 A 0.035 +205 K 0.038 +206 F 0.042 +207 Y 0.048 +208 K 0.055 +209 R 0.067 +210 Q 0.089 +211 S 0.114 +212 F 0.132 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000185674.11_ENST00000333017.7_GN:LYG2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:59.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000185674.11_ENST00000333017.7_GN:LYG2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:59.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9846c1cfd5e7a99bb67319ba7f71020df60853c6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000185674.11_ENST00000333017.7_GN:LYG2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:59.caid @@ -0,0 +1,272 @@ +>ENSG00000185674.11|ENST00000333017.7|GN:LYG2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:59 +1 M 0.383 +2 G 0.391 +3 T 0.401 +4 K 0.402 +5 S 0.391 +6 R 0.392 +7 R 0.422 +8 P 0.462 +9 N 0.481 +10 I 0.484 +11 S 0.488 +12 A 0.490 +13 Y 0.484 +14 V 0.490 +15 T 0.517 +16 G 0.555 +17 Q 0.591 +18 R 0.615 +19 P 0.619 +20 S 0.594 +21 L 0.545 +22 C 0.491 +23 K 0.465 +24 S 0.481 +25 L 0.517 +26 K 0.541 +27 C 0.546 +28 S 0.542 +29 L 0.531 +30 L 0.512 +31 L 0.491 +32 S 0.485 +33 T 0.500 +34 E 0.515 +35 D 0.495 +36 L 0.435 +37 C 0.382 +38 K 0.391 +39 Q 0.467 +40 R 0.561 +41 G 0.629 +42 E 0.651 +43 I 0.624 +44 F 0.573 +45 S 0.552 +46 V 0.578 +47 R 0.602 +48 L 0.588 +49 Q 0.572 +50 T 0.598 +51 R 0.647 +52 S 0.686 +53 W 0.706 +54 K 0.711 +55 I 0.710 +56 R 0.713 +57 F 0.726 +58 P 0.749 +59 A 0.768 +60 M 0.765 +61 L 0.723 +62 S 0.656 +63 S 0.617 +64 V 0.634 +65 V 0.667 +66 F 0.675 +67 W 0.673 +68 G 0.686 +69 L 0.705 +70 I 0.712 +71 A 0.709 +72 L 0.705 +73 I 0.704 +74 G 0.709 +75 T 0.715 +76 S 0.715 +77 R 0.702 +78 G 0.671 +79 S 0.637 +80 Y 0.620 +81 P 0.626 +82 F 0.644 +83 S 0.657 +84 H 0.654 +85 S 0.634 +86 M 0.601 +87 K 0.561 +88 P 0.523 +89 H 0.491 +90 L 0.467 +91 H 0.444 +92 P 0.412 +93 R 0.363 +94 L 0.300 +95 Y 0.235 +96 H 0.182 +97 G 0.147 +98 C 0.126 +99 Y 0.112 +100 G 0.101 +101 D 0.092 +102 I 0.084 +103 M 0.081 +104 T 0.085 +105 M 0.096 +106 K 0.113 +107 T 0.134 +108 S 0.157 +109 G 0.178 +110 A 0.188 +111 T 0.184 +112 C 0.176 +113 D 0.175 +114 A 0.183 +115 N 0.191 +116 S 0.193 +117 V 0.187 +118 M 0.181 +119 N 0.180 +120 C 0.181 +121 G 0.181 +122 I 0.177 +123 R 0.170 +124 G 0.155 +125 S 0.137 +126 E 0.125 +127 M 0.118 +128 F 0.107 +129 A 0.092 +130 E 0.083 +131 M 0.080 +132 D 0.077 +133 L 0.069 +134 R 0.062 +135 A 0.060 +136 I 0.060 +137 K 0.057 +138 P 0.055 +139 Y 0.058 +140 Q 0.062 +141 T 0.060 +142 L 0.048 +143 I 0.035 +144 K 0.029 +145 E 0.031 +146 V 0.038 +147 G 0.044 +148 Q 0.048 +149 R 0.051 +150 H 0.056 +151 C 0.062 +152 V 0.064 +153 D 0.062 +154 P 0.058 +155 A 0.055 +156 V 0.058 +157 I 0.063 +158 A 0.067 +159 A 0.066 +160 I 0.063 +161 I 0.062 +162 S 0.058 +163 R 0.054 +164 E 0.059 +165 S 0.081 +166 H 0.115 +167 G 0.148 +168 G 0.165 +169 S 0.163 +170 V 0.156 +171 L 0.157 +172 Q 0.165 +173 D 0.173 +174 G 0.169 +175 W 0.152 +176 D 0.137 +177 H 0.128 +178 R 0.119 +179 G 0.106 +180 L 0.093 +181 K 0.083 +182 F 0.073 +183 G 0.063 +184 L 0.057 +185 M 0.056 +186 Q 0.055 +187 L 0.051 +188 D 0.048 +189 K 0.050 +190 Q 0.059 +191 T 0.075 +192 Y 0.092 +193 H 0.107 +194 P 0.123 +195 V 0.135 +196 G 0.138 +197 A 0.132 +198 W 0.123 +199 D 0.117 +200 S 0.111 +201 K 0.104 +202 E 0.099 +203 H 0.099 +204 L 0.099 +205 S 0.100 +206 Q 0.104 +207 A 0.102 +208 T 0.088 +209 G 0.071 +210 I 0.057 +211 L 0.047 +212 T 0.040 +213 E 0.035 +214 R 0.035 +215 I 0.036 +216 K 0.038 +217 A 0.039 +218 I 0.038 +219 Q 0.036 +220 K 0.038 +221 K 0.045 +222 F 0.052 +223 P 0.055 +224 T 0.051 +225 W 0.045 +226 S 0.040 +227 V 0.036 +228 A 0.035 +229 Q 0.035 +230 H 0.038 +231 L 0.042 +232 K 0.050 +233 G 0.059 +234 G 0.067 +235 L 0.069 +236 S 0.064 +237 A 0.056 +238 F 0.048 +239 K 0.046 +240 S 0.053 +241 G 0.069 +242 I 0.090 +243 E 0.114 +244 A 0.135 +245 I 0.146 +246 A 0.144 +247 T 0.138 +248 P 0.143 +249 S 0.162 +250 D 0.180 +251 I 0.179 +252 D 0.155 +253 N 0.120 +254 D 0.090 +255 F 0.071 +256 V 0.059 +257 N 0.053 +258 D 0.052 +259 I 0.050 +260 I 0.045 +261 A 0.039 +262 R 0.034 +263 A 0.034 +264 K 0.037 +265 F 0.042 +266 Y 0.047 +267 K 0.055 +268 R 0.067 +269 Q 0.089 +270 S 0.115 +271 F 0.132 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000185860.15_ENST00000367912.7_GN:CCDC190_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000185860.15_ENST00000367912.7_GN:CCDC190_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..51f8f4d635b0c69f9bad081fd7ba4126f28f2f90 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000185860.15_ENST00000367912.7_GN:CCDC190_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,302 @@ +>ENSG00000185860.15|ENST00000367912.7|GN:CCDC190|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.404 +2 E 0.403 +3 R 0.392 +4 H 0.376 +5 M 0.363 +6 V 0.349 +7 R 0.336 +8 G 0.326 +9 Q 0.311 +10 L 0.283 +11 Y 0.250 +12 K 0.226 +13 H 0.210 +14 F 0.191 +15 D 0.174 +16 L 0.167 +17 E 0.173 +18 R 0.187 +19 K 0.205 +20 N 0.224 +21 A 0.234 +22 K 0.235 +23 Q 0.238 +24 A 0.249 +25 E 0.254 +26 A 0.244 +27 R 0.227 +28 L 0.217 +29 D 0.213 +30 Q 0.208 +31 R 0.200 +32 L 0.195 +33 Q 0.193 +34 R 0.187 +35 L 0.172 +36 K 0.154 +37 V 0.142 +38 I 0.135 +39 C 0.129 +40 L 0.126 +41 Y 0.130 +42 H 0.140 +43 V 0.155 +44 K 0.175 +45 L 0.197 +46 L 0.211 +47 T 0.213 +48 W 0.213 +49 E 0.213 +50 Q 0.209 +51 R 0.204 +52 Q 0.203 +53 L 0.204 +54 Q 0.202 +55 K 0.196 +56 E 0.189 +57 L 0.189 +58 Q 0.195 +59 R 0.203 +60 L 0.215 +61 Q 0.230 +62 Q 0.243 +63 E 0.255 +64 T 0.273 +65 M 0.298 +66 K 0.329 +67 K 0.367 +68 K 0.413 +69 F 0.465 +70 S 0.514 +71 S 0.557 +72 Y 0.597 +73 L 0.635 +74 G 0.673 +75 N 0.704 +76 G 0.722 +77 F 0.721 +78 Q 0.711 +79 K 0.708 +80 R 0.718 +81 P 0.737 +82 E 0.761 +83 D 0.786 +84 V 0.806 +85 L 0.815 +86 V 0.810 +87 F 0.797 +88 S 0.789 +89 P 0.794 +90 Q 0.807 +91 G 0.819 +92 R 0.823 +93 Q 0.821 +94 K 0.814 +95 H 0.805 +96 R 0.794 +97 A 0.787 +98 P 0.786 +99 Q 0.788 +100 A 0.790 +101 K 0.789 +102 K 0.777 +103 M 0.736 +104 R 0.668 +105 A 0.622 +106 L 0.636 +107 A 0.688 +108 T 0.735 +109 R 0.761 +110 M 0.771 +111 A 0.771 +112 Q 0.770 +113 D 0.776 +114 T 0.786 +115 C 0.794 +116 K 0.800 +117 S 0.805 +118 K 0.803 +119 S 0.791 +120 Q 0.772 +121 V 0.757 +122 P 0.760 +123 P 0.782 +124 S 0.810 +125 H 0.830 +126 D 0.840 +127 A 0.840 +128 G 0.833 +129 L 0.821 +130 K 0.809 +131 D 0.795 +132 P 0.765 +133 M 0.720 +134 K 0.698 +135 S 0.724 +136 K 0.770 +137 K 0.799 +138 Q 0.810 +139 P 0.820 +140 L 0.832 +141 S 0.841 +142 Q 0.842 +143 N 0.839 +144 N 0.837 +145 R 0.841 +146 T 0.849 +147 A 0.855 +148 C 0.858 +149 F 0.858 +150 I 0.854 +151 K 0.847 +152 E 0.841 +153 Q 0.843 +154 P 0.852 +155 Q 0.865 +156 A 0.874 +157 Q 0.876 +158 E 0.875 +159 K 0.872 +160 D 0.866 +161 S 0.855 +162 V 0.843 +163 N 0.838 +164 P 0.841 +165 S 0.847 +166 K 0.848 +167 D 0.837 +168 V 0.817 +169 D 0.800 +170 P 0.798 +171 S 0.811 +172 K 0.829 +173 G 0.840 +174 I 0.840 +175 S 0.829 +176 V 0.806 +177 P 0.760 +178 C 0.695 +179 Q 0.653 +180 N 0.655 +181 Q 0.670 +182 E 0.691 +183 V 0.742 +184 S 0.806 +185 T 0.849 +186 N 0.866 +187 T 0.870 +188 I 0.869 +189 E 0.865 +190 Q 0.859 +191 G 0.855 +192 P 0.855 +193 S 0.859 +194 S 0.861 +195 S 0.861 +196 P 0.862 +197 A 0.866 +198 S 0.869 +199 D 0.871 +200 S 0.869 +201 G 0.865 +202 M 0.847 +203 A 0.798 +204 C 0.725 +205 A 0.680 +206 D 0.704 +207 E 0.763 +208 T 0.805 +209 R 0.822 +210 S 0.828 +211 K 0.833 +212 D 0.837 +213 V 0.835 +214 A 0.826 +215 L 0.813 +216 K 0.805 +217 P 0.810 +218 D 0.825 +219 G 0.840 +220 N 0.847 +221 T 0.846 +222 G 0.838 +223 K 0.823 +224 Q 0.805 +225 I 0.791 +226 P 0.793 +227 P 0.811 +228 K 0.833 +229 H 0.848 +230 M 0.855 +231 E 0.858 +232 C 0.857 +233 A 0.850 +234 G 0.837 +235 S 0.821 +236 F 0.809 +237 E 0.797 +238 G 0.778 +239 E 0.747 +240 F 0.701 +241 T 0.640 +242 K 0.570 +243 P 0.496 +244 T 0.419 +245 F 0.345 +246 L 0.294 +247 E 0.278 +248 L 0.288 +249 L 0.295 +250 S 0.289 +251 K 0.291 +252 A 0.318 +253 R 0.359 +254 N 0.385 +255 A 0.377 +256 H 0.342 +257 Y 0.312 +258 L 0.311 +259 R 0.341 +260 H 0.387 +261 R 0.440 +262 V 0.504 +263 P 0.575 +264 P 0.639 +265 E 0.683 +266 S 0.702 +267 E 0.707 +268 R 0.706 +269 L 0.695 +270 L 0.667 +271 S 0.629 +272 I 0.607 +273 G 0.619 +274 E 0.648 +275 I 0.674 +276 F 0.695 +277 G 0.722 +278 H 0.754 +279 G 0.783 +280 E 0.802 +281 S 0.812 +282 S 0.815 +283 S 0.814 +284 S 0.813 +285 R 0.816 +286 A 0.823 +287 G 0.828 +288 K 0.828 +289 E 0.825 +290 C 0.818 +291 E 0.807 +292 N 0.790 +293 R 0.771 +294 V 0.755 +295 P 0.747 +296 S 0.743 +297 K 0.735 +298 F 0.714 +299 L 0.672 +300 P 0.609 +301 L 0.558 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000185860.15_ENST00000367912.7_GN:CCDC190_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000185860.15_ENST00000367912.7_GN:CCDC190_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a015165b78e7db6907a773423696de0939953427 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000185860.15_ENST00000367912.7_GN:CCDC190_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid @@ -0,0 +1,314 @@ +>ENSG00000185860.15|ENST00000367912.7|GN:CCDC190|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:12 +1 M 0.518 +2 V 0.540 +3 K 0.550 +4 T 0.512 +5 L 0.422 +6 D 0.311 +7 L 0.222 +8 E 0.177 +9 T 0.165 +10 I 0.171 +11 K 0.187 +12 K 0.214 +13 M 0.250 +14 E 0.276 +15 R 0.279 +16 H 0.278 +17 M 0.297 +18 V 0.324 +19 R 0.335 +20 G 0.329 +21 Q 0.313 +22 L 0.285 +23 Y 0.248 +24 K 0.218 +25 H 0.199 +26 F 0.186 +27 D 0.180 +28 L 0.187 +29 E 0.199 +30 R 0.208 +31 K 0.215 +32 N 0.223 +33 A 0.228 +34 K 0.227 +35 Q 0.228 +36 A 0.236 +37 E 0.239 +38 A 0.229 +39 R 0.217 +40 L 0.212 +41 D 0.212 +42 Q 0.208 +43 R 0.203 +44 L 0.204 +45 Q 0.213 +46 R 0.220 +47 L 0.215 +48 K 0.201 +49 V 0.185 +50 I 0.171 +51 C 0.158 +52 L 0.151 +53 Y 0.153 +54 H 0.161 +55 V 0.174 +56 K 0.195 +57 L 0.218 +58 L 0.228 +59 T 0.220 +60 W 0.210 +61 E 0.203 +62 Q 0.196 +63 R 0.189 +64 Q 0.190 +65 L 0.193 +66 Q 0.193 +67 K 0.186 +68 E 0.179 +69 L 0.180 +70 Q 0.187 +71 R 0.197 +72 L 0.207 +73 Q 0.218 +74 Q 0.228 +75 E 0.241 +76 T 0.262 +77 M 0.290 +78 K 0.318 +79 K 0.350 +80 K 0.392 +81 F 0.440 +82 S 0.485 +83 S 0.526 +84 Y 0.566 +85 L 0.609 +86 G 0.650 +87 N 0.684 +88 G 0.704 +89 F 0.705 +90 Q 0.696 +91 K 0.693 +92 R 0.702 +93 P 0.721 +94 E 0.745 +95 D 0.769 +96 V 0.790 +97 L 0.800 +98 V 0.796 +99 F 0.784 +100 S 0.775 +101 P 0.779 +102 Q 0.792 +103 G 0.803 +104 R 0.807 +105 Q 0.803 +106 K 0.795 +107 H 0.783 +108 R 0.772 +109 A 0.764 +110 P 0.764 +111 Q 0.766 +112 A 0.767 +113 K 0.766 +114 K 0.753 +115 M 0.712 +116 R 0.646 +117 A 0.598 +118 L 0.607 +119 A 0.655 +120 T 0.704 +121 R 0.735 +122 M 0.750 +123 A 0.754 +124 Q 0.756 +125 D 0.765 +126 T 0.778 +127 C 0.788 +128 K 0.796 +129 S 0.801 +130 K 0.801 +131 S 0.791 +132 Q 0.773 +133 V 0.759 +134 P 0.762 +135 P 0.783 +136 S 0.812 +137 H 0.832 +138 D 0.842 +139 A 0.843 +140 G 0.836 +141 L 0.824 +142 K 0.811 +143 D 0.792 +144 P 0.751 +145 M 0.692 +146 K 0.662 +147 S 0.695 +148 K 0.756 +149 K 0.794 +150 Q 0.809 +151 P 0.820 +152 L 0.832 +153 S 0.840 +154 Q 0.841 +155 N 0.838 +156 N 0.837 +157 R 0.841 +158 T 0.849 +159 A 0.856 +160 C 0.858 +161 F 0.858 +162 I 0.854 +163 K 0.847 +164 E 0.841 +165 Q 0.842 +166 P 0.852 +167 Q 0.865 +168 A 0.873 +169 Q 0.875 +170 E 0.873 +171 K 0.870 +172 D 0.863 +173 S 0.852 +174 V 0.840 +175 N 0.834 +176 P 0.837 +177 S 0.844 +178 K 0.845 +179 D 0.834 +180 V 0.814 +181 D 0.797 +182 P 0.795 +183 S 0.808 +184 K 0.825 +185 G 0.836 +186 I 0.836 +187 S 0.826 +188 V 0.803 +189 P 0.757 +190 C 0.692 +191 Q 0.648 +192 N 0.644 +193 Q 0.650 +194 E 0.667 +195 V 0.721 +196 S 0.792 +197 T 0.840 +198 N 0.859 +199 T 0.864 +200 I 0.864 +201 E 0.860 +202 Q 0.854 +203 G 0.850 +204 P 0.850 +205 S 0.853 +206 S 0.855 +207 S 0.855 +208 P 0.857 +209 A 0.860 +210 S 0.864 +211 D 0.865 +212 S 0.864 +213 G 0.860 +214 M 0.842 +215 A 0.793 +216 C 0.720 +217 A 0.675 +218 D 0.699 +219 E 0.757 +220 T 0.798 +221 R 0.815 +222 S 0.822 +223 K 0.828 +224 D 0.831 +225 V 0.830 +226 A 0.821 +227 L 0.808 +228 K 0.801 +229 P 0.806 +230 D 0.822 +231 G 0.837 +232 N 0.844 +233 T 0.844 +234 G 0.836 +235 K 0.822 +236 Q 0.804 +237 I 0.790 +238 P 0.792 +239 P 0.810 +240 K 0.832 +241 H 0.847 +242 M 0.854 +243 E 0.857 +244 C 0.856 +245 A 0.849 +246 G 0.836 +247 S 0.820 +248 F 0.807 +249 E 0.795 +250 G 0.776 +251 E 0.745 +252 F 0.699 +253 T 0.638 +254 K 0.567 +255 P 0.491 +256 T 0.411 +257 F 0.335 +258 L 0.283 +259 E 0.264 +260 L 0.269 +261 L 0.273 +262 S 0.267 +263 K 0.271 +264 A 0.301 +265 R 0.347 +266 N 0.380 +267 A 0.379 +268 H 0.350 +269 Y 0.320 +270 L 0.320 +271 R 0.350 +272 H 0.397 +273 R 0.452 +274 V 0.515 +275 P 0.583 +276 P 0.644 +277 E 0.687 +278 S 0.707 +279 E 0.713 +280 R 0.713 +281 L 0.702 +282 L 0.673 +283 S 0.635 +284 I 0.615 +285 G 0.626 +286 E 0.655 +287 I 0.680 +288 F 0.702 +289 G 0.728 +290 H 0.759 +291 G 0.787 +292 E 0.805 +293 S 0.814 +294 S 0.816 +295 S 0.815 +296 S 0.814 +297 R 0.817 +298 A 0.824 +299 G 0.830 +300 K 0.830 +301 E 0.826 +302 C 0.819 +303 E 0.808 +304 N 0.792 +305 R 0.772 +306 V 0.755 +307 P 0.747 +308 S 0.742 +309 K 0.734 +310 F 0.714 +311 L 0.671 +312 P 0.608 +313 L 0.557 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000186190.8_ENST00000375494.4_GN:BPIFB3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000186190.8_ENST00000375494.4_GN:BPIFB3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..3499904e29f2e6de47a9f3cb4b2e233f8ce7bb78 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000186190.8_ENST00000375494.4_GN:BPIFB3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,473 @@ +>ENSG00000186190.8|ENST00000375494.4|GN:BPIFB3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.155 +2 L 0.142 +3 A 0.125 +4 L 0.114 +5 W 0.115 +6 S 0.121 +7 L 0.120 +8 L 0.115 +9 L 0.122 +10 L 0.146 +11 W 0.181 +12 G 0.213 +13 L 0.236 +14 A 0.256 +15 T 0.279 +16 P 0.297 +17 C 0.298 +18 Q 0.289 +19 E 0.284 +20 L 0.282 +21 L 0.274 +22 E 0.254 +23 T 0.222 +24 V 0.181 +25 G 0.137 +26 T 0.101 +27 L 0.079 +28 A 0.067 +29 R 0.058 +30 I 0.049 +31 D 0.039 +32 K 0.030 +33 D 0.027 +34 E 0.031 +35 L 0.041 +36 G 0.055 +37 K 0.064 +38 A 0.064 +39 I 0.059 +40 Q 0.057 +41 N 0.059 +42 S 0.066 +43 L 0.079 +44 V 0.098 +45 G 0.118 +46 E 0.127 +47 P 0.119 +48 I 0.099 +49 L 0.083 +50 Q 0.082 +51 N 0.096 +52 V 0.119 +53 L 0.145 +54 G 0.170 +55 S 0.187 +56 V 0.192 +57 T 0.195 +58 A 0.203 +59 V 0.220 +60 N 0.249 +61 R 0.291 +62 G 0.346 +63 L 0.411 +64 L 0.488 +65 G 0.566 +66 S 0.618 +67 G 0.633 +68 G 0.628 +69 L 0.624 +70 L 0.636 +71 G 0.657 +72 G 0.668 +73 G 0.660 +74 G 0.642 +75 L 0.629 +76 L 0.626 +77 G 0.623 +78 H 0.606 +79 G 0.571 +80 G 0.529 +81 V 0.494 +82 F 0.471 +83 G 0.440 +84 V 0.383 +85 V 0.307 +86 E 0.242 +87 E 0.205 +88 L 0.191 +89 S 0.188 +90 G 0.180 +91 L 0.158 +92 K 0.128 +93 I 0.102 +94 E 0.082 +95 E 0.069 +96 L 0.061 +97 T 0.057 +98 L 0.052 +99 P 0.045 +100 K 0.035 +101 V 0.026 +102 L 0.021 +103 L 0.023 +104 K 0.032 +105 L 0.046 +106 L 0.060 +107 P 0.071 +108 G 0.075 +109 F 0.072 +110 G 0.063 +111 V 0.054 +112 Q 0.048 +113 L 0.046 +114 S 0.046 +115 L 0.046 +116 H 0.045 +117 T 0.043 +118 K 0.040 +119 V 0.039 +120 G 0.040 +121 M 0.043 +122 H 0.047 +123 C 0.053 +124 S 0.065 +125 G 0.082 +126 P 0.101 +127 L 0.123 +128 G 0.143 +129 G 0.150 +130 L 0.144 +131 L 0.136 +132 Q 0.129 +133 L 0.119 +134 A 0.104 +135 A 0.089 +136 E 0.076 +137 V 0.065 +138 N 0.057 +139 V 0.051 +140 T 0.048 +141 S 0.045 +142 R 0.043 +143 V 0.045 +144 A 0.053 +145 L 0.065 +146 A 0.078 +147 V 0.090 +148 S 0.105 +149 S 0.122 +150 R 0.138 +151 G 0.143 +152 T 0.132 +153 P 0.110 +154 I 0.084 +155 L 0.062 +156 I 0.048 +157 L 0.039 +158 K 0.035 +159 R 0.035 +160 C 0.038 +161 S 0.040 +162 T 0.042 +163 L 0.045 +164 L 0.050 +165 G 0.055 +166 H 0.055 +167 I 0.053 +168 S 0.053 +169 L 0.061 +170 F 0.079 +171 S 0.106 +172 G 0.133 +173 L 0.156 +174 L 0.173 +175 P 0.184 +176 T 0.177 +177 P 0.147 +178 L 0.112 +179 F 0.088 +180 G 0.078 +181 V 0.074 +182 V 0.076 +183 E 0.083 +184 Q 0.090 +185 M 0.091 +186 L 0.089 +187 F 0.089 +188 K 0.091 +189 V 0.091 +190 L 0.084 +191 P 0.075 +192 G 0.068 +193 L 0.068 +194 L 0.070 +195 C 0.074 +196 P 0.081 +197 V 0.089 +198 V 0.092 +199 D 0.092 +200 S 0.092 +201 V 0.092 +202 L 0.090 +203 G 0.089 +204 V 0.088 +205 V 0.086 +206 N 0.084 +207 E 0.082 +208 L 0.073 +209 L 0.061 +210 G 0.053 +211 A 0.054 +212 V 0.057 +213 L 0.059 +214 G 0.060 +215 L 0.062 +216 V 0.067 +217 S 0.074 +218 L 0.083 +219 G 0.091 +220 A 0.093 +221 L 0.087 +222 G 0.078 +223 S 0.074 +224 V 0.074 +225 E 0.071 +226 F 0.069 +227 S 0.071 +228 L 0.078 +229 A 0.082 +230 T 0.081 +231 L 0.074 +232 P 0.067 +233 L 0.062 +234 I 0.061 +235 S 0.065 +236 N 0.068 +237 Q 0.065 +238 Y 0.054 +239 I 0.043 +240 E 0.035 +241 L 0.032 +242 D 0.033 +243 I 0.037 +244 N 0.044 +245 P 0.052 +246 I 0.056 +247 V 0.060 +248 K 0.069 +249 S 0.092 +250 V 0.120 +251 A 0.143 +252 G 0.153 +253 D 0.152 +254 I 0.149 +255 I 0.150 +256 D 0.156 +257 F 0.166 +258 P 0.176 +259 K 0.181 +260 S 0.182 +261 R 0.178 +262 A 0.169 +263 P 0.155 +264 A 0.143 +265 K 0.137 +266 V 0.133 +267 P 0.130 +268 P 0.124 +269 K 0.119 +270 K 0.119 +271 D 0.120 +272 H 0.116 +273 T 0.110 +274 S 0.104 +275 Q 0.100 +276 V 0.092 +277 M 0.079 +278 V 0.061 +279 P 0.046 +280 L 0.039 +281 Y 0.035 +282 L 0.032 +283 F 0.032 +284 N 0.037 +285 T 0.046 +286 T 0.054 +287 F 0.060 +288 G 0.066 +289 L 0.072 +290 L 0.080 +291 Q 0.088 +292 T 0.097 +293 N 0.102 +294 G 0.101 +295 A 0.095 +296 L 0.085 +297 D 0.076 +298 M 0.072 +299 D 0.071 +300 I 0.070 +301 T 0.071 +302 P 0.074 +303 E 0.082 +304 L 0.091 +305 V 0.102 +306 P 0.114 +307 S 0.125 +308 D 0.132 +309 V 0.128 +310 P 0.113 +311 L 0.094 +312 T 0.080 +313 T 0.074 +314 T 0.070 +315 D 0.066 +316 L 0.063 +317 A 0.070 +318 A 0.086 +319 L 0.105 +320 L 0.121 +321 P 0.130 +322 E 0.134 +323 A 0.137 +324 L 0.141 +325 G 0.146 +326 K 0.149 +327 L 0.147 +328 P 0.140 +329 L 0.134 +330 H 0.130 +331 Q 0.125 +332 Q 0.114 +333 L 0.097 +334 L 0.078 +335 L 0.064 +336 F 0.057 +337 L 0.061 +338 R 0.074 +339 V 0.096 +340 R 0.118 +341 E 0.126 +342 A 0.113 +343 P 0.088 +344 T 0.064 +345 V 0.051 +346 T 0.051 +347 L 0.062 +348 H 0.080 +349 N 0.093 +350 K 0.095 +351 K 0.087 +352 A 0.077 +353 L 0.069 +354 V 0.067 +355 S 0.068 +356 L 0.070 +357 P 0.065 +358 A 0.057 +359 N 0.048 +360 I 0.043 +361 H 0.040 +362 V 0.040 +363 L 0.044 +364 F 0.052 +365 Y 0.067 +366 V 0.087 +367 P 0.109 +368 K 0.128 +369 G 0.138 +370 T 0.136 +371 P 0.125 +372 E 0.114 +373 S 0.110 +374 L 0.112 +375 F 0.117 +376 E 0.122 +377 L 0.127 +378 N 0.126 +379 S 0.119 +380 V 0.111 +381 M 0.106 +382 T 0.103 +383 V 0.098 +384 R 0.088 +385 A 0.081 +386 Q 0.083 +387 L 0.094 +388 A 0.109 +389 P 0.116 +390 S 0.112 +391 A 0.100 +392 T 0.092 +393 K 0.090 +394 L 0.091 +395 H 0.089 +396 I 0.084 +397 S 0.075 +398 L 0.065 +399 S 0.058 +400 L 0.054 +401 E 0.049 +402 R 0.043 +403 L 0.039 +404 S 0.039 +405 V 0.045 +406 K 0.055 +407 V 0.066 +408 A 0.076 +409 S 0.083 +410 S 0.090 +411 F 0.104 +412 T 0.125 +413 H 0.146 +414 A 0.158 +415 F 0.162 +416 D 0.157 +417 G 0.143 +418 S 0.119 +419 R 0.094 +420 L 0.079 +421 E 0.077 +422 E 0.077 +423 W 0.070 +424 L 0.060 +425 S 0.054 +426 H 0.054 +427 V 0.060 +428 V 0.072 +429 G 0.083 +430 A 0.087 +431 V 0.083 +432 Y 0.080 +433 A 0.081 +434 P 0.084 +435 K 0.085 +436 L 0.089 +437 N 0.095 +438 V 0.099 +439 A 0.097 +440 L 0.095 +441 D 0.099 +442 V 0.103 +443 G 0.105 +444 I 0.106 +445 P 0.113 +446 L 0.124 +447 P 0.133 +448 K 0.134 +449 V 0.131 +450 L 0.128 +451 N 0.127 +452 I 0.125 +453 N 0.126 +454 F 0.135 +455 S 0.150 +456 N 0.155 +457 S 0.140 +458 V 0.114 +459 L 0.090 +460 E 0.076 +461 I 0.072 +462 V 0.070 +463 E 0.065 +464 N 0.060 +465 A 0.058 +466 V 0.058 +467 V 0.059 +468 L 0.062 +469 T 0.071 +470 V 0.092 +471 A 0.122 +472 S 0.145 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000186190.8_ENST00000375494.4_GN:BPIFB3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:4.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000186190.8_ENST00000375494.4_GN:BPIFB3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:4.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1a412a08eef657617a6c616a98bde25dee2261c7 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000186190.8_ENST00000375494.4_GN:BPIFB3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:4.caid @@ -0,0 +1,477 @@ +>ENSG00000186190.8|ENST00000375494.4|GN:BPIFB3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:4 +1 M 0.227 +2 Q 0.210 +3 P 0.181 +4 V 0.151 +5 M 0.132 +6 L 0.124 +7 A 0.114 +8 L 0.104 +9 W 0.104 +10 S 0.109 +11 L 0.107 +12 L 0.097 +13 L 0.094 +14 L 0.114 +15 W 0.155 +16 G 0.201 +17 L 0.236 +18 A 0.262 +19 T 0.287 +20 P 0.304 +21 C 0.305 +22 Q 0.293 +23 E 0.283 +24 L 0.276 +25 L 0.264 +26 E 0.243 +27 T 0.214 +28 V 0.176 +29 G 0.134 +30 T 0.101 +31 L 0.079 +32 A 0.068 +33 R 0.059 +34 I 0.050 +35 D 0.040 +36 K 0.031 +37 D 0.027 +38 E 0.031 +39 L 0.042 +40 G 0.055 +41 K 0.064 +42 A 0.063 +43 I 0.059 +44 Q 0.057 +45 N 0.059 +46 S 0.066 +47 L 0.079 +48 V 0.098 +49 G 0.118 +50 E 0.127 +51 P 0.119 +52 I 0.098 +53 L 0.083 +54 Q 0.082 +55 N 0.096 +56 V 0.119 +57 L 0.146 +58 G 0.170 +59 S 0.186 +60 V 0.191 +61 T 0.193 +62 A 0.201 +63 V 0.218 +64 N 0.246 +65 R 0.288 +66 G 0.343 +67 L 0.408 +68 L 0.484 +69 G 0.562 +70 S 0.615 +71 G 0.631 +72 G 0.627 +73 L 0.623 +74 L 0.634 +75 G 0.655 +76 G 0.666 +77 G 0.658 +78 G 0.641 +79 L 0.627 +80 L 0.623 +81 G 0.620 +82 H 0.603 +83 G 0.568 +84 G 0.526 +85 V 0.491 +86 F 0.467 +87 G 0.437 +88 V 0.379 +89 V 0.304 +90 E 0.241 +91 E 0.204 +92 L 0.190 +93 S 0.187 +94 G 0.179 +95 L 0.157 +96 K 0.127 +97 I 0.101 +98 E 0.082 +99 E 0.068 +100 L 0.060 +101 T 0.056 +102 L 0.052 +103 P 0.045 +104 K 0.035 +105 V 0.026 +106 L 0.021 +107 L 0.023 +108 K 0.032 +109 L 0.045 +110 L 0.060 +111 P 0.070 +112 G 0.075 +113 F 0.072 +114 G 0.064 +115 V 0.054 +116 Q 0.048 +117 L 0.046 +118 S 0.046 +119 L 0.046 +120 H 0.045 +121 T 0.043 +122 K 0.040 +123 V 0.039 +124 G 0.040 +125 M 0.043 +126 H 0.047 +127 C 0.053 +128 S 0.065 +129 G 0.082 +130 P 0.102 +131 L 0.124 +132 G 0.143 +133 G 0.150 +134 L 0.144 +135 L 0.136 +136 Q 0.129 +137 L 0.119 +138 A 0.104 +139 A 0.089 +140 E 0.076 +141 V 0.065 +142 N 0.057 +143 V 0.051 +144 T 0.048 +145 S 0.045 +146 R 0.043 +147 V 0.045 +148 A 0.053 +149 L 0.065 +150 A 0.078 +151 V 0.090 +152 S 0.105 +153 S 0.122 +154 R 0.138 +155 G 0.144 +156 T 0.133 +157 P 0.110 +158 I 0.084 +159 L 0.062 +160 I 0.048 +161 L 0.039 +162 K 0.035 +163 R 0.035 +164 C 0.038 +165 S 0.040 +166 T 0.042 +167 L 0.045 +168 L 0.050 +169 G 0.055 +170 H 0.055 +171 I 0.053 +172 S 0.053 +173 L 0.061 +174 F 0.079 +175 S 0.105 +176 G 0.132 +177 L 0.154 +178 L 0.172 +179 P 0.182 +180 T 0.175 +181 P 0.146 +182 L 0.111 +183 F 0.087 +184 G 0.077 +185 V 0.073 +186 V 0.075 +187 E 0.083 +188 Q 0.090 +189 M 0.090 +190 L 0.088 +191 F 0.088 +192 K 0.091 +193 V 0.091 +194 L 0.084 +195 P 0.074 +196 G 0.068 +197 L 0.068 +198 L 0.070 +199 C 0.074 +200 P 0.081 +201 V 0.088 +202 V 0.091 +203 D 0.091 +204 S 0.090 +205 V 0.089 +206 L 0.088 +207 G 0.087 +208 V 0.086 +209 V 0.084 +210 N 0.083 +211 E 0.081 +212 L 0.072 +213 L 0.060 +214 G 0.053 +215 A 0.054 +216 V 0.057 +217 L 0.059 +218 G 0.059 +219 L 0.062 +220 V 0.067 +221 S 0.074 +222 L 0.083 +223 G 0.091 +224 A 0.093 +225 L 0.086 +226 G 0.078 +227 S 0.074 +228 V 0.073 +229 E 0.071 +230 F 0.069 +231 S 0.071 +232 L 0.078 +233 A 0.083 +234 T 0.081 +235 L 0.074 +236 P 0.067 +237 L 0.062 +238 I 0.061 +239 S 0.065 +240 N 0.068 +241 Q 0.065 +242 Y 0.054 +243 I 0.043 +244 E 0.035 +245 L 0.032 +246 D 0.033 +247 I 0.037 +248 N 0.045 +249 P 0.053 +250 I 0.057 +251 V 0.060 +252 K 0.069 +253 S 0.091 +254 V 0.120 +255 A 0.143 +256 G 0.153 +257 D 0.153 +258 I 0.150 +259 I 0.150 +260 D 0.156 +261 F 0.166 +262 P 0.176 +263 K 0.182 +264 S 0.183 +265 R 0.179 +266 A 0.169 +267 P 0.156 +268 A 0.144 +269 K 0.137 +270 V 0.134 +271 P 0.130 +272 P 0.124 +273 K 0.120 +274 K 0.120 +275 D 0.121 +276 H 0.117 +277 T 0.110 +278 S 0.104 +279 Q 0.099 +280 V 0.092 +281 M 0.079 +282 V 0.061 +283 P 0.047 +284 L 0.039 +285 Y 0.035 +286 L 0.032 +287 F 0.032 +288 N 0.037 +289 T 0.046 +290 T 0.053 +291 F 0.060 +292 G 0.066 +293 L 0.072 +294 L 0.080 +295 Q 0.088 +296 T 0.097 +297 N 0.102 +298 G 0.101 +299 A 0.095 +300 L 0.085 +301 D 0.077 +302 M 0.072 +303 D 0.071 +304 I 0.071 +305 T 0.071 +306 P 0.075 +307 E 0.082 +308 L 0.092 +309 V 0.102 +310 P 0.114 +311 S 0.125 +312 D 0.132 +313 V 0.128 +314 P 0.113 +315 L 0.094 +316 T 0.080 +317 T 0.074 +318 T 0.070 +319 D 0.066 +320 L 0.063 +321 A 0.070 +322 A 0.086 +323 L 0.105 +324 L 0.121 +325 P 0.130 +326 E 0.134 +327 A 0.137 +328 L 0.141 +329 G 0.146 +330 K 0.149 +331 L 0.147 +332 P 0.141 +333 L 0.134 +334 H 0.130 +335 Q 0.126 +336 Q 0.115 +337 L 0.097 +338 L 0.078 +339 L 0.064 +340 F 0.058 +341 L 0.061 +342 R 0.074 +343 V 0.096 +344 R 0.118 +345 E 0.126 +346 A 0.114 +347 P 0.088 +348 T 0.064 +349 V 0.051 +350 T 0.051 +351 L 0.063 +352 H 0.080 +353 N 0.093 +354 K 0.095 +355 K 0.087 +356 A 0.077 +357 L 0.069 +358 V 0.066 +359 S 0.068 +360 L 0.069 +361 P 0.065 +362 A 0.057 +363 N 0.048 +364 I 0.043 +365 H 0.040 +366 V 0.040 +367 L 0.043 +368 F 0.052 +369 Y 0.067 +370 V 0.087 +371 P 0.109 +372 K 0.127 +373 G 0.138 +374 T 0.136 +375 P 0.124 +376 E 0.114 +377 S 0.110 +378 L 0.112 +379 F 0.117 +380 E 0.122 +381 L 0.127 +382 N 0.126 +383 S 0.119 +384 V 0.111 +385 M 0.106 +386 T 0.104 +387 V 0.098 +388 R 0.088 +389 A 0.081 +390 Q 0.083 +391 L 0.094 +392 A 0.109 +393 P 0.116 +394 S 0.112 +395 A 0.100 +396 T 0.092 +397 K 0.090 +398 L 0.091 +399 H 0.089 +400 I 0.084 +401 S 0.075 +402 L 0.065 +403 S 0.058 +404 L 0.054 +405 E 0.050 +406 R 0.044 +407 L 0.039 +408 S 0.039 +409 V 0.046 +410 K 0.055 +411 V 0.066 +412 A 0.076 +413 S 0.083 +414 S 0.090 +415 F 0.104 +416 T 0.125 +417 H 0.146 +418 A 0.158 +419 F 0.162 +420 D 0.158 +421 G 0.143 +422 S 0.119 +423 R 0.094 +424 L 0.079 +425 E 0.077 +426 E 0.077 +427 W 0.070 +428 L 0.060 +429 S 0.054 +430 H 0.054 +431 V 0.060 +432 V 0.072 +433 G 0.083 +434 A 0.087 +435 V 0.083 +436 Y 0.079 +437 A 0.081 +438 P 0.084 +439 K 0.085 +440 L 0.089 +441 N 0.095 +442 V 0.099 +443 A 0.097 +444 L 0.096 +445 D 0.099 +446 V 0.104 +447 G 0.105 +448 I 0.106 +449 P 0.113 +450 L 0.124 +451 P 0.133 +452 K 0.134 +453 V 0.131 +454 L 0.128 +455 N 0.127 +456 I 0.125 +457 N 0.126 +458 F 0.135 +459 S 0.150 +460 N 0.156 +461 S 0.141 +462 V 0.114 +463 L 0.090 +464 E 0.076 +465 I 0.072 +466 V 0.070 +467 E 0.065 +468 N 0.060 +469 A 0.058 +470 V 0.059 +471 V 0.059 +472 L 0.062 +473 T 0.071 +474 V 0.092 +475 A 0.122 +476 S 0.145 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000186191.9_ENST00000375483.4_GN:BPIFB4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000186191.9_ENST00000375483.4_GN:BPIFB4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b481d02cf4a4e4dfce590c010587edbd3ab9017f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000186191.9_ENST00000375483.4_GN:BPIFB4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,615 @@ +>ENSG00000186191.9|ENST00000375483.4|GN:BPIFB4|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.154 +2 W 0.142 +3 M 0.123 +4 A 0.109 +5 W 0.108 +6 C 0.118 +7 V 0.124 +8 A 0.125 +9 A 0.130 +10 L 0.140 +11 S 0.151 +12 V 0.159 +13 V 0.170 +14 A 0.196 +15 V 0.235 +16 C 0.269 +17 G 0.287 +18 T 0.284 +19 S 0.264 +20 H 0.230 +21 E 0.183 +22 T 0.134 +23 N 0.095 +24 T 0.074 +25 V 0.065 +26 L 0.060 +27 R 0.053 +28 V 0.045 +29 T 0.037 +30 K 0.032 +31 D 0.031 +32 V 0.032 +33 L 0.034 +34 S 0.037 +35 N 0.044 +36 A 0.055 +37 I 0.064 +38 S 0.071 +39 G 0.077 +40 M 0.081 +41 L 0.088 +42 Q 0.103 +43 Q 0.125 +44 S 0.139 +45 D 0.135 +46 A 0.122 +47 L 0.115 +48 H 0.119 +49 S 0.130 +50 A 0.138 +51 L 0.140 +52 R 0.141 +53 E 0.151 +54 V 0.168 +55 P 0.193 +56 L 0.241 +57 G 0.320 +58 V 0.408 +59 G 0.468 +60 D 0.487 +61 I 0.491 +62 P 0.507 +63 Y 0.545 +64 N 0.586 +65 D 0.609 +66 F 0.609 +67 H 0.594 +68 V 0.558 +69 R 0.502 +70 G 0.457 +71 P 0.463 +72 P 0.527 +73 P 0.612 +74 V 0.674 +75 Y 0.702 +76 T 0.708 +77 N 0.713 +78 G 0.725 +79 K 0.742 +80 K 0.756 +81 L 0.761 +82 D 0.757 +83 G 0.745 +84 I 0.729 +85 Y 0.717 +86 Q 0.713 +87 Y 0.722 +88 G 0.740 +89 H 0.758 +90 I 0.762 +91 E 0.749 +92 T 0.734 +93 N 0.728 +94 D 0.727 +95 N 0.719 +96 T 0.707 +97 A 0.703 +98 Q 0.713 +99 L 0.727 +100 G 0.729 +101 G 0.719 +102 K 0.699 +103 Y 0.674 +104 R 0.656 +105 Y 0.664 +106 G 0.694 +107 E 0.711 +108 I 0.698 +109 L 0.666 +110 E 0.640 +111 S 0.634 +112 E 0.643 +113 G 0.653 +114 S 0.650 +115 I 0.640 +116 R 0.629 +117 D 0.615 +118 L 0.601 +119 R 0.597 +120 N 0.605 +121 S 0.614 +122 G 0.602 +123 Y 0.569 +124 R 0.550 +125 S 0.570 +126 A 0.607 +127 E 0.635 +128 N 0.649 +129 A 0.654 +130 Y 0.662 +131 G 0.674 +132 G 0.684 +133 H 0.686 +134 R 0.679 +135 G 0.655 +136 L 0.607 +137 G 0.546 +138 R 0.509 +139 Y 0.523 +140 R 0.558 +141 A 0.578 +142 A 0.586 +143 P 0.602 +144 V 0.624 +145 G 0.631 +146 R 0.614 +147 L 0.590 +148 H 0.576 +149 R 0.580 +150 R 0.596 +151 E 0.611 +152 L 0.615 +153 Q 0.620 +154 P 0.639 +155 G 0.664 +156 E 0.678 +157 I 0.681 +158 P 0.695 +159 P 0.729 +160 G 0.766 +161 V 0.788 +162 A 0.799 +163 T 0.809 +164 G 0.815 +165 A 0.807 +166 V 0.781 +167 G 0.752 +168 P 0.735 +169 G 0.736 +170 G 0.742 +171 L 0.734 +172 L 0.703 +173 G 0.659 +174 T 0.640 +175 G 0.670 +176 G 0.721 +177 M 0.754 +178 L 0.762 +179 A 0.760 +180 A 0.756 +181 D 0.755 +182 G 0.758 +183 I 0.762 +184 L 0.770 +185 A 0.778 +186 G 0.778 +187 Q 0.768 +188 G 0.755 +189 G 0.746 +190 L 0.749 +191 L 0.762 +192 G 0.776 +193 G 0.779 +194 G 0.767 +195 G 0.744 +196 L 0.724 +197 L 0.721 +198 G 0.735 +199 D 0.745 +200 G 0.740 +201 G 0.729 +202 L 0.723 +203 L 0.724 +204 G 0.726 +205 G 0.717 +206 G 0.686 +207 G 0.637 +208 V 0.592 +209 L 0.571 +210 G 0.566 +211 V 0.554 +212 L 0.541 +213 G 0.553 +214 E 0.576 +215 G 0.566 +216 G 0.505 +217 I 0.416 +218 L 0.337 +219 S 0.287 +220 T 0.268 +221 V 0.269 +222 Q 0.273 +223 G 0.267 +224 I 0.252 +225 T 0.232 +226 G 0.206 +227 L 0.169 +228 R 0.129 +229 I 0.096 +230 V 0.076 +231 E 0.066 +232 L 0.062 +233 T 0.057 +234 L 0.051 +235 P 0.043 +236 R 0.034 +237 V 0.026 +238 S 0.023 +239 V 0.028 +240 R 0.039 +241 L 0.056 +242 L 0.071 +243 P 0.082 +244 G 0.085 +245 V 0.079 +246 G 0.065 +247 V 0.051 +248 Y 0.044 +249 L 0.041 +250 S 0.039 +251 L 0.037 +252 Y 0.034 +253 T 0.031 +254 R 0.029 +255 V 0.029 +256 A 0.032 +257 I 0.036 +258 N 0.040 +259 G 0.043 +260 K 0.047 +261 S 0.052 +262 L 0.060 +263 I 0.069 +264 G 0.079 +265 F 0.087 +266 L 0.093 +267 D 0.097 +268 I 0.098 +269 A 0.097 +270 V 0.094 +271 E 0.088 +272 V 0.078 +273 N 0.065 +274 I 0.052 +275 T 0.044 +276 A 0.039 +277 K 0.039 +278 V 0.044 +279 R 0.054 +280 L 0.067 +281 T 0.081 +282 M 0.095 +283 D 0.113 +284 R 0.132 +285 T 0.145 +286 G 0.140 +287 Y 0.120 +288 P 0.094 +289 R 0.073 +290 L 0.058 +291 V 0.047 +292 I 0.041 +293 E 0.039 +294 R 0.041 +295 C 0.046 +296 D 0.051 +297 T 0.056 +298 L 0.066 +299 L 0.080 +300 G 0.092 +301 G 0.092 +302 I 0.082 +303 K 0.073 +304 V 0.069 +305 K 0.072 +306 L 0.080 +307 L 0.100 +308 R 0.128 +309 G 0.150 +310 L 0.157 +311 L 0.154 +312 P 0.145 +313 N 0.129 +314 L 0.110 +315 V 0.097 +316 D 0.090 +317 N 0.085 +318 L 0.082 +319 V 0.082 +320 N 0.084 +321 R 0.087 +322 V 0.093 +323 L 0.105 +324 A 0.119 +325 D 0.125 +326 V 0.118 +327 L 0.102 +328 P 0.084 +329 D 0.074 +330 L 0.073 +331 L 0.077 +332 C 0.083 +333 P 0.090 +334 I 0.095 +335 V 0.093 +336 D 0.089 +337 V 0.088 +338 V 0.089 +339 L 0.091 +340 G 0.096 +341 L 0.100 +342 V 0.096 +343 N 0.085 +344 D 0.074 +345 Q 0.069 +346 L 0.070 +347 G 0.075 +348 L 0.080 +349 V 0.079 +350 D 0.072 +351 S 0.066 +352 L 0.069 +353 I 0.079 +354 P 0.086 +355 L 0.087 +356 G 0.086 +357 I 0.084 +358 L 0.081 +359 G 0.077 +360 S 0.073 +361 V 0.069 +362 Q 0.065 +363 Y 0.062 +364 T 0.065 +365 F 0.072 +366 S 0.079 +367 S 0.079 +368 L 0.074 +369 P 0.069 +370 L 0.065 +371 V 0.065 +372 T 0.067 +373 G 0.070 +374 E 0.068 +375 F 0.060 +376 L 0.051 +377 E 0.043 +378 L 0.038 +379 D 0.033 +380 L 0.031 +381 N 0.034 +382 T 0.046 +383 L 0.068 +384 V 0.105 +385 G 0.162 +386 E 0.238 +387 A 0.314 +388 G 0.363 +389 G 0.372 +390 G 0.346 +391 L 0.307 +392 I 0.276 +393 D 0.264 +394 Y 0.264 +395 P 0.264 +396 L 0.255 +397 G 0.247 +398 W 0.247 +399 P 0.247 +400 A 0.238 +401 V 0.223 +402 S 0.209 +403 P 0.197 +404 K 0.183 +405 P 0.169 +406 M 0.158 +407 P 0.153 +408 E 0.156 +409 L 0.165 +410 P 0.179 +411 P 0.191 +412 M 0.194 +413 G 0.188 +414 D 0.170 +415 N 0.145 +416 T 0.121 +417 K 0.104 +418 S 0.095 +419 Q 0.091 +420 L 0.085 +421 A 0.074 +422 M 0.061 +423 S 0.050 +424 A 0.044 +425 N 0.041 +426 F 0.040 +427 L 0.042 +428 G 0.047 +429 S 0.053 +430 V 0.057 +431 L 0.060 +432 T 0.062 +433 L 0.066 +434 L 0.070 +435 Q 0.076 +436 K 0.081 +437 Q 0.084 +438 H 0.085 +439 A 0.084 +440 L 0.082 +441 D 0.078 +442 L 0.072 +443 D 0.068 +444 I 0.072 +445 T 0.086 +446 N 0.107 +447 G 0.121 +448 M 0.120 +449 F 0.111 +450 E 0.106 +451 E 0.108 +452 L 0.117 +453 P 0.125 +454 P 0.127 +455 L 0.120 +456 T 0.111 +457 T 0.103 +458 A 0.093 +459 T 0.081 +460 L 0.073 +461 G 0.078 +462 A 0.091 +463 L 0.101 +464 I 0.104 +465 P 0.103 +466 K 0.100 +467 V 0.099 +468 F 0.105 +469 Q 0.119 +470 Q 0.138 +471 Y 0.154 +472 P 0.160 +473 E 0.154 +474 S 0.143 +475 C 0.136 +476 P 0.132 +477 L 0.123 +478 I 0.108 +479 I 0.091 +480 R 0.079 +481 I 0.076 +482 Q 0.083 +483 V 0.099 +484 L 0.115 +485 N 0.120 +486 P 0.106 +487 P 0.083 +488 S 0.064 +489 V 0.060 +490 M 0.068 +491 L 0.086 +492 Q 0.105 +493 K 0.118 +494 D 0.117 +495 K 0.106 +496 A 0.091 +497 L 0.078 +498 V 0.070 +499 K 0.068 +500 V 0.067 +501 L 0.063 +502 A 0.055 +503 T 0.046 +504 A 0.041 +505 E 0.043 +506 V 0.051 +507 M 0.064 +508 V 0.082 +509 S 0.103 +510 Q 0.126 +511 P 0.145 +512 K 0.161 +513 D 0.170 +514 L 0.167 +515 E 0.151 +516 T 0.131 +517 T 0.118 +518 I 0.114 +519 C 0.117 +520 L 0.127 +521 I 0.137 +522 D 0.139 +523 V 0.132 +524 D 0.120 +525 T 0.105 +526 E 0.090 +527 F 0.078 +528 L 0.070 +529 A 0.066 +530 S 0.066 +531 F 0.072 +532 S 0.083 +533 T 0.096 +534 E 0.108 +535 G 0.118 +536 D 0.125 +537 K 0.127 +538 L 0.123 +539 M 0.114 +540 I 0.102 +541 D 0.087 +542 A 0.074 +543 K 0.066 +544 L 0.061 +545 E 0.058 +546 K 0.055 +547 T 0.053 +548 S 0.056 +549 L 0.063 +550 N 0.073 +551 L 0.082 +552 R 0.092 +553 T 0.105 +554 S 0.118 +555 N 0.132 +556 V 0.146 +557 G 0.159 +558 N 0.166 +559 F 0.158 +560 D 0.137 +561 I 0.113 +562 G 0.093 +563 L 0.080 +564 M 0.076 +565 E 0.079 +566 V 0.080 +567 L 0.072 +568 V 0.063 +569 E 0.059 +570 K 0.061 +571 I 0.069 +572 F 0.080 +573 D 0.088 +574 L 0.088 +575 A 0.086 +576 F 0.089 +577 M 0.099 +578 P 0.108 +579 A 0.110 +580 M 0.104 +581 N 0.099 +582 A 0.102 +583 V 0.111 +584 L 0.122 +585 G 0.134 +586 S 0.138 +587 G 0.134 +588 V 0.127 +589 P 0.128 +590 L 0.136 +591 P 0.142 +592 K 0.140 +593 I 0.130 +594 L 0.120 +595 N 0.115 +596 I 0.113 +597 D 0.113 +598 F 0.121 +599 S 0.141 +600 N 0.161 +601 A 0.165 +602 D 0.152 +603 I 0.132 +604 D 0.116 +605 V 0.111 +606 L 0.112 +607 E 0.108 +608 D 0.092 +609 L 0.074 +610 L 0.064 +611 V 0.068 +612 L 0.087 +613 S 0.115 +614 A 0.137 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000186191.9_ENST00000375483.4_GN:BPIFB4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000186191.9_ENST00000375483.4_GN:BPIFB4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..526c16c8b4e55b80ea7bb90cd95335f23d081749 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000186191.9_ENST00000375483.4_GN:BPIFB4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid @@ -0,0 +1,635 @@ +>ENSG00000186191.9|ENST00000375483.4|GN:BPIFB4|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:20 +1 M 0.219 +2 R 0.204 +3 Y 0.187 +4 N 0.175 +5 L 0.163 +6 F 0.153 +7 V 0.151 +8 I 0.157 +9 W 0.164 +10 E 0.170 +11 Q 0.179 +12 K 0.197 +13 F 0.225 +14 K 0.268 +15 K 0.327 +16 G 0.383 +17 S 0.406 +18 S 0.383 +19 A 0.325 +20 S 0.256 +21 M 0.194 +22 W 0.148 +23 M 0.121 +24 A 0.112 +25 W 0.114 +26 C 0.117 +27 V 0.116 +28 A 0.113 +29 A 0.113 +30 L 0.118 +31 S 0.128 +32 V 0.138 +33 V 0.153 +34 A 0.181 +35 V 0.220 +36 C 0.257 +37 G 0.280 +38 T 0.283 +39 S 0.267 +40 H 0.231 +41 E 0.181 +42 T 0.130 +43 N 0.092 +44 T 0.072 +45 V 0.065 +46 L 0.061 +47 R 0.055 +48 V 0.046 +49 T 0.037 +50 K 0.033 +51 D 0.032 +52 V 0.032 +53 L 0.033 +54 S 0.036 +55 N 0.043 +56 A 0.054 +57 I 0.066 +58 S 0.077 +59 G 0.085 +60 M 0.089 +61 L 0.094 +62 Q 0.107 +63 Q 0.128 +64 S 0.141 +65 D 0.136 +66 A 0.122 +67 L 0.115 +68 H 0.118 +69 S 0.130 +70 A 0.141 +71 L 0.146 +72 R 0.150 +73 E 0.162 +74 V 0.183 +75 P 0.214 +76 L 0.270 +77 G 0.357 +78 V 0.450 +79 G 0.512 +80 D 0.531 +81 I 0.530 +82 P 0.541 +83 Y 0.573 +84 N 0.611 +85 D 0.632 +86 F 0.633 +87 H 0.620 +88 V 0.587 +89 R 0.534 +90 G 0.487 +91 P 0.487 +92 P 0.543 +93 P 0.621 +94 V 0.679 +95 Y 0.704 +96 T 0.711 +97 N 0.716 +98 G 0.727 +99 K 0.742 +100 K 0.753 +101 L 0.757 +102 D 0.751 +103 G 0.736 +104 I 0.716 +105 Y 0.699 +106 Q 0.693 +107 Y 0.703 +108 G 0.723 +109 H 0.743 +110 I 0.747 +111 E 0.737 +112 T 0.725 +113 N 0.725 +114 D 0.731 +115 N 0.730 +116 T 0.719 +117 A 0.710 +118 Q 0.713 +119 L 0.721 +120 G 0.724 +121 G 0.716 +122 K 0.699 +123 Y 0.679 +124 R 0.669 +125 Y 0.683 +126 G 0.714 +127 E 0.734 +128 I 0.723 +129 L 0.694 +130 E 0.669 +131 S 0.662 +132 E 0.669 +133 G 0.677 +134 S 0.673 +135 I 0.664 +136 R 0.654 +137 D 0.641 +138 L 0.625 +139 R 0.620 +140 N 0.627 +141 S 0.634 +142 G 0.620 +143 Y 0.585 +144 R 0.565 +145 S 0.588 +146 A 0.630 +147 E 0.659 +148 N 0.672 +149 A 0.676 +150 Y 0.682 +151 G 0.692 +152 G 0.698 +153 H 0.695 +154 R 0.685 +155 G 0.661 +156 L 0.614 +157 G 0.552 +158 R 0.516 +159 Y 0.531 +160 R 0.570 +161 A 0.594 +162 A 0.604 +163 P 0.620 +164 V 0.641 +165 G 0.647 +166 R 0.632 +167 L 0.609 +168 H 0.594 +169 R 0.596 +170 R 0.612 +171 E 0.627 +172 L 0.634 +173 Q 0.640 +174 P 0.658 +175 G 0.681 +176 E 0.692 +177 I 0.693 +178 P 0.708 +179 P 0.742 +180 G 0.779 +181 V 0.801 +182 A 0.811 +183 T 0.819 +184 G 0.824 +185 A 0.814 +186 V 0.790 +187 G 0.763 +188 P 0.749 +189 G 0.752 +190 G 0.756 +191 L 0.745 +192 L 0.707 +193 G 0.653 +194 T 0.628 +195 G 0.662 +196 G 0.723 +197 M 0.761 +198 L 0.772 +199 A 0.770 +200 A 0.768 +201 D 0.769 +202 G 0.772 +203 I 0.775 +204 L 0.781 +205 A 0.787 +206 G 0.786 +207 Q 0.776 +208 G 0.765 +209 G 0.761 +210 L 0.767 +211 L 0.779 +212 G 0.791 +213 G 0.794 +214 G 0.784 +215 G 0.765 +216 L 0.746 +217 L 0.741 +218 G 0.750 +219 D 0.757 +220 G 0.752 +221 G 0.741 +222 L 0.733 +223 L 0.732 +224 G 0.733 +225 G 0.721 +226 G 0.690 +227 G 0.642 +228 V 0.597 +229 L 0.575 +230 G 0.568 +231 V 0.553 +232 L 0.537 +233 G 0.546 +234 E 0.566 +235 G 0.556 +236 G 0.495 +237 I 0.406 +238 L 0.326 +239 S 0.277 +240 T 0.258 +241 V 0.258 +242 Q 0.260 +243 G 0.252 +244 I 0.237 +245 T 0.218 +246 G 0.193 +247 L 0.158 +248 R 0.121 +249 I 0.091 +250 V 0.073 +251 E 0.064 +252 L 0.060 +253 T 0.056 +254 L 0.050 +255 P 0.042 +256 R 0.033 +257 V 0.025 +258 S 0.022 +259 V 0.026 +260 R 0.038 +261 L 0.054 +262 L 0.070 +263 P 0.081 +264 G 0.085 +265 V 0.079 +266 G 0.064 +267 V 0.051 +268 Y 0.043 +269 L 0.040 +270 S 0.038 +271 L 0.036 +272 Y 0.034 +273 T 0.031 +274 R 0.029 +275 V 0.028 +276 A 0.030 +277 I 0.034 +278 N 0.038 +279 G 0.041 +280 K 0.045 +281 S 0.051 +282 L 0.059 +283 I 0.069 +284 G 0.079 +285 F 0.087 +286 L 0.093 +287 D 0.097 +288 I 0.097 +289 A 0.095 +290 V 0.092 +291 E 0.087 +292 V 0.077 +293 N 0.064 +294 I 0.052 +295 T 0.044 +296 A 0.039 +297 K 0.039 +298 V 0.044 +299 R 0.054 +300 L 0.067 +301 T 0.081 +302 M 0.096 +303 D 0.114 +304 R 0.134 +305 T 0.146 +306 G 0.141 +307 Y 0.121 +308 P 0.095 +309 R 0.073 +310 L 0.058 +311 V 0.048 +312 I 0.041 +313 E 0.039 +314 R 0.041 +315 C 0.046 +316 D 0.051 +317 T 0.057 +318 L 0.067 +319 L 0.082 +320 G 0.094 +321 G 0.094 +322 I 0.084 +323 K 0.074 +324 V 0.071 +325 K 0.073 +326 L 0.082 +327 L 0.103 +328 R 0.132 +329 G 0.154 +330 L 0.159 +331 L 0.156 +332 P 0.146 +333 N 0.130 +334 L 0.111 +335 V 0.098 +336 D 0.092 +337 N 0.087 +338 L 0.083 +339 V 0.083 +340 N 0.085 +341 R 0.088 +342 V 0.095 +343 L 0.108 +344 A 0.123 +345 D 0.129 +346 V 0.122 +347 L 0.105 +348 P 0.087 +349 D 0.076 +350 L 0.075 +351 L 0.078 +352 C 0.084 +353 P 0.090 +354 I 0.094 +355 V 0.093 +356 D 0.089 +357 V 0.087 +358 V 0.087 +359 L 0.088 +360 G 0.093 +361 L 0.097 +362 V 0.093 +363 N 0.083 +364 D 0.073 +365 Q 0.068 +366 L 0.070 +367 G 0.076 +368 L 0.080 +369 V 0.079 +370 D 0.072 +371 S 0.064 +372 L 0.067 +373 I 0.076 +374 P 0.084 +375 L 0.086 +376 G 0.085 +377 I 0.083 +378 L 0.080 +379 G 0.076 +380 S 0.073 +381 V 0.069 +382 Q 0.065 +383 Y 0.062 +384 T 0.065 +385 F 0.073 +386 S 0.079 +387 S 0.079 +388 L 0.075 +389 P 0.069 +390 L 0.065 +391 V 0.064 +392 T 0.066 +393 G 0.068 +394 E 0.066 +395 F 0.058 +396 L 0.049 +397 E 0.042 +398 L 0.037 +399 D 0.033 +400 L 0.031 +401 N 0.034 +402 T 0.047 +403 L 0.069 +404 V 0.107 +405 G 0.164 +406 E 0.240 +407 A 0.318 +408 G 0.369 +409 G 0.378 +410 G 0.352 +411 L 0.312 +412 I 0.280 +413 D 0.266 +414 Y 0.266 +415 P 0.265 +416 L 0.257 +417 G 0.249 +418 W 0.250 +419 P 0.251 +420 A 0.244 +421 V 0.229 +422 S 0.215 +423 P 0.202 +424 K 0.187 +425 P 0.171 +426 M 0.158 +427 P 0.152 +428 E 0.155 +429 L 0.165 +430 P 0.180 +431 P 0.192 +432 M 0.197 +433 G 0.191 +434 D 0.173 +435 N 0.147 +436 T 0.122 +437 K 0.105 +438 S 0.096 +439 Q 0.091 +440 L 0.085 +441 A 0.075 +442 M 0.061 +443 S 0.050 +444 A 0.044 +445 N 0.042 +446 F 0.041 +447 L 0.042 +448 G 0.047 +449 S 0.053 +450 V 0.057 +451 L 0.060 +452 T 0.063 +453 L 0.067 +454 L 0.071 +455 Q 0.076 +456 K 0.082 +457 Q 0.085 +458 H 0.085 +459 A 0.084 +460 L 0.083 +461 D 0.079 +462 L 0.073 +463 D 0.069 +464 I 0.073 +465 T 0.087 +466 N 0.109 +467 G 0.123 +468 M 0.122 +469 F 0.113 +470 E 0.107 +471 E 0.109 +472 L 0.118 +473 P 0.127 +474 P 0.128 +475 L 0.121 +476 T 0.112 +477 T 0.105 +478 A 0.095 +479 T 0.082 +480 L 0.074 +481 G 0.080 +482 A 0.093 +483 L 0.102 +484 I 0.105 +485 P 0.104 +486 K 0.101 +487 V 0.101 +488 F 0.107 +489 Q 0.121 +490 Q 0.140 +491 Y 0.157 +492 P 0.162 +493 E 0.157 +494 S 0.147 +495 C 0.140 +496 P 0.136 +497 L 0.127 +498 I 0.111 +499 I 0.093 +500 R 0.081 +501 I 0.077 +502 Q 0.084 +503 V 0.100 +504 L 0.117 +505 N 0.122 +506 P 0.109 +507 P 0.085 +508 S 0.066 +509 V 0.061 +510 M 0.070 +511 L 0.088 +512 Q 0.107 +513 K 0.119 +514 D 0.118 +515 K 0.106 +516 A 0.091 +517 L 0.078 +518 V 0.071 +519 K 0.068 +520 V 0.067 +521 L 0.064 +522 A 0.056 +523 T 0.047 +524 A 0.042 +525 E 0.044 +526 V 0.052 +527 M 0.065 +528 V 0.083 +529 S 0.106 +530 Q 0.128 +531 P 0.148 +532 K 0.164 +533 D 0.173 +534 L 0.170 +535 E 0.153 +536 T 0.134 +537 T 0.120 +538 I 0.116 +539 C 0.120 +540 L 0.130 +541 I 0.140 +542 D 0.142 +543 V 0.134 +544 D 0.121 +545 T 0.106 +546 E 0.091 +547 F 0.078 +548 L 0.070 +549 A 0.067 +550 S 0.067 +551 F 0.072 +552 S 0.083 +553 T 0.096 +554 E 0.109 +555 G 0.118 +556 D 0.125 +557 K 0.127 +558 L 0.123 +559 M 0.114 +560 I 0.102 +561 D 0.088 +562 A 0.075 +563 K 0.066 +564 L 0.062 +565 E 0.059 +566 K 0.056 +567 T 0.054 +568 S 0.057 +569 L 0.064 +570 N 0.073 +571 L 0.083 +572 R 0.094 +573 T 0.106 +574 S 0.120 +575 N 0.135 +576 V 0.149 +577 G 0.162 +578 N 0.169 +579 F 0.161 +580 D 0.140 +581 I 0.116 +582 G 0.095 +583 L 0.082 +584 M 0.078 +585 E 0.081 +586 V 0.081 +587 L 0.073 +588 V 0.064 +589 E 0.060 +590 K 0.062 +591 I 0.070 +592 F 0.082 +593 D 0.091 +594 L 0.091 +595 A 0.088 +596 F 0.091 +597 M 0.101 +598 P 0.110 +599 A 0.111 +600 M 0.105 +601 N 0.101 +602 A 0.103 +603 V 0.112 +604 L 0.124 +605 G 0.136 +606 S 0.141 +607 G 0.135 +608 V 0.129 +609 P 0.129 +610 L 0.137 +611 P 0.143 +612 K 0.140 +613 I 0.129 +614 L 0.119 +615 N 0.113 +616 I 0.111 +617 D 0.112 +618 F 0.120 +619 S 0.140 +620 N 0.160 +621 A 0.165 +622 D 0.153 +623 I 0.133 +624 D 0.118 +625 V 0.114 +626 L 0.115 +627 E 0.110 +628 D 0.094 +629 L 0.075 +630 L 0.064 +631 V 0.068 +632 L 0.086 +633 S 0.114 +634 A 0.135 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000186407.9_ENST00000392619.2_GN:CD300E_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000186407.9_ENST00000392619.2_GN:CD300E_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6b1c76218765cb2862cb783f4fe9506875ff12cf --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000186407.9_ENST00000392619.2_GN:CD300E_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,206 @@ +>ENSG00000186407.9|ENST00000392619.2|GN:CD300E|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.300 +2 W 0.281 +3 L 0.257 +4 L 0.237 +5 P 0.219 +6 A 0.201 +7 L 0.190 +8 L 0.194 +9 L 0.211 +10 L 0.240 +11 C 0.276 +12 L 0.314 +13 S 0.342 +14 G 0.345 +15 C 0.308 +16 L 0.237 +17 S 0.165 +18 L 0.121 +19 K 0.107 +20 G 0.108 +21 P 0.111 +22 G 0.105 +23 S 0.093 +24 V 0.081 +25 T 0.074 +26 G 0.073 +27 T 0.078 +28 A 0.082 +29 G 0.078 +30 D 0.068 +31 S 0.056 +32 L 0.044 +33 T 0.034 +34 V 0.026 +35 W 0.023 +36 C 0.025 +37 Q 0.032 +38 Y 0.038 +39 E 0.042 +40 S 0.046 +41 M 0.051 +42 Y 0.056 +43 K 0.058 +44 G 0.057 +45 Y 0.052 +46 N 0.044 +47 K 0.033 +48 Y 0.028 +49 W 0.031 +50 C 0.042 +51 R 0.056 +52 G 0.070 +53 Q 0.081 +54 Y 0.089 +55 D 0.093 +56 T 0.095 +57 S 0.093 +58 C 0.084 +59 E 0.074 +60 S 0.069 +61 I 0.069 +62 V 0.069 +63 E 0.072 +64 T 0.085 +65 K 0.100 +66 G 0.105 +67 E 0.097 +68 E 0.082 +69 K 0.071 +70 V 0.068 +71 E 0.072 +72 R 0.079 +73 N 0.079 +74 G 0.066 +75 R 0.051 +76 V 0.044 +77 S 0.045 +78 I 0.047 +79 R 0.048 +80 D 0.049 +81 H 0.052 +82 P 0.055 +83 E 0.057 +84 A 0.053 +85 L 0.044 +86 A 0.032 +87 F 0.023 +88 T 0.020 +89 V 0.022 +90 T 0.029 +91 M 0.041 +92 Q 0.055 +93 N 0.064 +94 L 0.066 +95 N 0.065 +96 E 0.065 +97 D 0.071 +98 D 0.082 +99 A 0.089 +100 G 0.081 +101 S 0.058 +102 Y 0.034 +103 W 0.022 +104 C 0.024 +105 K 0.034 +106 I 0.050 +107 Q 0.070 +108 T 0.092 +109 V 0.114 +110 W 0.134 +111 V 0.152 +112 L 0.170 +113 D 0.187 +114 S 0.201 +115 W 0.212 +116 S 0.218 +117 R 0.212 +118 D 0.190 +119 P 0.158 +120 S 0.124 +121 D 0.094 +122 L 0.070 +123 V 0.051 +124 R 0.043 +125 V 0.048 +126 Y 0.071 +127 V 0.125 +128 S 0.217 +129 P 0.344 +130 A 0.472 +131 I 0.564 +132 T 0.610 +133 T 0.637 +134 P 0.664 +135 R 0.692 +136 R 0.709 +137 T 0.706 +138 T 0.689 +139 H 0.670 +140 P 0.656 +141 A 0.641 +142 T 0.628 +143 P 0.629 +144 P 0.649 +145 I 0.677 +146 F 0.701 +147 L 0.712 +148 V 0.710 +149 V 0.702 +150 N 0.701 +151 P 0.711 +152 G 0.725 +153 R 0.736 +154 N 0.743 +155 L 0.750 +156 S 0.760 +157 T 0.769 +158 G 0.774 +159 E 0.775 +160 V 0.776 +161 L 0.778 +162 T 0.779 +163 Q 0.777 +164 N 0.768 +165 S 0.752 +166 G 0.726 +167 F 0.694 +168 R 0.659 +169 L 0.621 +170 S 0.566 +171 S 0.489 +172 P 0.402 +173 H 0.323 +174 F 0.270 +175 L 0.245 +176 L 0.243 +177 V 0.254 +178 V 0.267 +179 L 0.278 +180 L 0.290 +181 K 0.298 +182 L 0.300 +183 P 0.296 +184 L 0.292 +185 L 0.288 +186 L 0.284 +187 S 0.276 +188 M 0.258 +189 L 0.232 +190 G 0.207 +191 A 0.189 +192 V 0.176 +193 F 0.175 +194 W 0.199 +195 V 0.250 +196 N 0.309 +197 R 0.363 +198 P 0.411 +199 Q 0.453 +200 W 0.483 +201 A 0.503 +202 P 0.523 +203 P 0.534 +204 G 0.521 +205 R 0.496 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000186407.9_ENST00000392619.2_GN:CD300E_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000186407.9_ENST00000392619.2_GN:CD300E_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9c565c1d6e0ae06e504852f2da36e414c1b4232c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000186407.9_ENST00000392619.2_GN:CD300E_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid @@ -0,0 +1,233 @@ +>ENSG00000186407.9|ENST00000392619.2|GN:CD300E|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:27 +1 M 0.422 +2 T 0.443 +3 Q 0.480 +4 A 0.513 +5 P 0.514 +6 L 0.487 +7 H 0.474 +8 I 0.504 +9 L 0.546 +10 G 0.566 +11 F 0.571 +12 Q 0.584 +13 L 0.610 +14 G 0.641 +15 P 0.663 +16 R 0.664 +17 F 0.636 +18 A 0.592 +19 E 0.577 +20 D 0.613 +21 G 0.666 +22 S 0.699 +23 Q 0.711 +24 G 0.709 +25 D 0.684 +26 R 0.631 +27 N 0.552 +28 M 0.458 +29 W 0.368 +30 L 0.304 +31 L 0.270 +32 P 0.249 +33 A 0.231 +34 L 0.222 +35 L 0.227 +36 L 0.242 +37 L 0.267 +38 C 0.300 +39 L 0.338 +40 S 0.369 +41 G 0.373 +42 C 0.330 +43 L 0.249 +44 S 0.166 +45 L 0.116 +46 K 0.101 +47 G 0.103 +48 P 0.107 +49 G 0.103 +50 S 0.092 +51 V 0.080 +52 T 0.072 +53 G 0.071 +54 T 0.076 +55 A 0.081 +56 G 0.077 +57 D 0.067 +58 S 0.054 +59 L 0.042 +60 T 0.032 +61 V 0.025 +62 W 0.023 +63 C 0.026 +64 Q 0.033 +65 Y 0.039 +66 E 0.042 +67 S 0.045 +68 M 0.050 +69 Y 0.055 +70 K 0.056 +71 G 0.055 +72 Y 0.051 +73 N 0.043 +74 K 0.032 +75 Y 0.027 +76 W 0.031 +77 C 0.041 +78 R 0.055 +79 G 0.068 +80 Q 0.078 +81 Y 0.085 +82 D 0.089 +83 T 0.091 +84 S 0.088 +85 C 0.079 +86 E 0.070 +87 S 0.065 +88 I 0.065 +89 V 0.066 +90 E 0.071 +91 T 0.084 +92 K 0.100 +93 G 0.105 +94 E 0.096 +95 E 0.082 +96 K 0.071 +97 V 0.068 +98 E 0.072 +99 R 0.078 +100 N 0.077 +101 G 0.064 +102 R 0.050 +103 V 0.044 +104 S 0.044 +105 I 0.046 +106 R 0.046 +107 D 0.047 +108 H 0.049 +109 P 0.053 +110 E 0.054 +111 A 0.051 +112 L 0.042 +113 A 0.031 +114 F 0.023 +115 T 0.019 +116 V 0.021 +117 T 0.029 +118 M 0.041 +119 Q 0.055 +120 N 0.064 +121 L 0.066 +122 N 0.065 +123 E 0.067 +124 D 0.073 +125 D 0.084 +126 A 0.092 +127 G 0.084 +128 S 0.060 +129 Y 0.035 +130 W 0.023 +131 C 0.024 +132 K 0.034 +133 I 0.050 +134 Q 0.071 +135 T 0.093 +136 V 0.116 +137 W 0.136 +138 V 0.154 +139 L 0.171 +140 D 0.186 +141 S 0.199 +142 W 0.209 +143 S 0.215 +144 R 0.210 +145 D 0.189 +146 P 0.156 +147 S 0.123 +148 D 0.093 +149 L 0.068 +150 V 0.051 +151 R 0.043 +152 V 0.048 +153 Y 0.072 +154 V 0.125 +155 S 0.218 +156 P 0.347 +157 A 0.479 +158 I 0.575 +159 T 0.623 +160 T 0.649 +161 P 0.675 +162 R 0.702 +163 R 0.719 +164 T 0.717 +165 T 0.700 +166 H 0.681 +167 P 0.665 +168 A 0.650 +169 T 0.636 +170 P 0.637 +171 P 0.658 +172 I 0.687 +173 F 0.711 +174 L 0.723 +175 V 0.719 +176 V 0.710 +177 N 0.709 +178 P 0.719 +179 G 0.734 +180 R 0.745 +181 N 0.753 +182 L 0.761 +183 S 0.771 +184 T 0.781 +185 G 0.786 +186 E 0.786 +187 V 0.786 +188 L 0.787 +189 T 0.787 +190 Q 0.783 +191 N 0.774 +192 S 0.756 +193 G 0.730 +194 F 0.696 +195 R 0.661 +196 L 0.623 +197 S 0.569 +198 S 0.492 +199 P 0.401 +200 H 0.320 +201 F 0.265 +202 L 0.241 +203 L 0.242 +204 V 0.256 +205 V 0.269 +206 L 0.279 +207 L 0.289 +208 K 0.297 +209 L 0.298 +210 P 0.295 +211 L 0.293 +212 L 0.292 +213 L 0.292 +214 S 0.285 +215 M 0.267 +216 L 0.239 +217 G 0.215 +218 A 0.198 +219 V 0.185 +220 F 0.183 +221 W 0.205 +222 V 0.253 +223 N 0.311 +224 R 0.363 +225 P 0.410 +226 Q 0.452 +227 W 0.482 +228 A 0.504 +229 P 0.525 +230 P 0.538 +231 G 0.526 +232 R 0.502 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000186684.15_ENST00000664447.2_GN:CYP27C1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000186684.15_ENST00000664447.2_GN:CYP27C1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..dce0ac3022612657caa122f3b69a92fe773cd12e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000186684.15_ENST00000664447.2_GN:CYP27C1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,538 @@ +>ENSG00000186684.15|ENST00000664447.2|GN:CYP27C1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.111 +2 A 0.100 +3 L 0.090 +4 L 0.092 +5 A 0.107 +6 R 0.130 +7 I 0.154 +8 L 0.180 +9 R 0.214 +10 A 0.253 +11 G 0.293 +12 L 0.328 +13 R 0.362 +14 P 0.395 +15 A 0.419 +16 P 0.433 +17 E 0.464 +18 R 0.532 +19 G 0.606 +20 G 0.645 +21 L 0.651 +22 L 0.654 +23 G 0.666 +24 G 0.667 +25 G 0.636 +26 A 0.573 +27 P 0.499 +28 R 0.455 +29 R 0.459 +30 P 0.492 +31 Q 0.534 +32 P 0.574 +33 A 0.587 +34 G 0.555 +35 A 0.504 +36 R 0.473 +37 L 0.462 +38 P 0.457 +39 A 0.466 +40 G 0.477 +41 A 0.451 +42 R 0.406 +43 A 0.409 +44 E 0.462 +45 D 0.508 +46 K 0.537 +47 G 0.579 +48 A 0.627 +49 G 0.655 +50 R 0.664 +51 P 0.662 +52 G 0.649 +53 S 0.637 +54 P 0.646 +55 P 0.678 +56 G 0.709 +57 G 0.717 +58 G 0.695 +59 R 0.648 +60 A 0.583 +61 E 0.509 +62 G 0.434 +63 P 0.364 +64 R 0.307 +65 S 0.268 +66 L 0.247 +67 A 0.231 +68 A 0.211 +69 M 0.184 +70 P 0.156 +71 G 0.136 +72 P 0.125 +73 R 0.114 +74 T 0.091 +75 L 0.065 +76 A 0.050 +77 N 0.044 +78 L 0.042 +79 A 0.047 +80 E 0.062 +81 F 0.084 +82 F 0.107 +83 C 0.125 +84 R 0.132 +85 D 0.128 +86 G 0.121 +87 F 0.114 +88 S 0.103 +89 R 0.087 +90 I 0.073 +91 H 0.066 +92 E 0.061 +93 I 0.053 +94 Q 0.044 +95 Q 0.038 +96 K 0.033 +97 H 0.030 +98 T 0.027 +99 R 0.029 +100 E 0.033 +101 Y 0.036 +102 G 0.034 +103 K 0.028 +104 I 0.024 +105 F 0.024 +106 K 0.026 +107 S 0.029 +108 H 0.033 +109 F 0.039 +110 G 0.049 +111 P 0.058 +112 Q 0.060 +113 F 0.055 +114 V 0.048 +115 V 0.046 +116 S 0.054 +117 I 0.067 +118 A 0.078 +119 D 0.078 +120 R 0.068 +121 D 0.058 +122 M 0.052 +123 V 0.052 +124 A 0.058 +125 Q 0.069 +126 V 0.083 +127 L 0.097 +128 R 0.110 +129 A 0.122 +130 E 0.129 +131 G 0.130 +132 A 0.124 +133 A 0.114 +134 P 0.107 +135 Q 0.105 +136 R 0.107 +137 A 0.109 +138 N 0.106 +139 M 0.096 +140 E 0.084 +141 S 0.073 +142 W 0.064 +143 R 0.058 +144 E 0.055 +145 Y 0.056 +146 R 0.062 +147 D 0.075 +148 L 0.096 +149 R 0.127 +150 G 0.164 +151 R 0.186 +152 A 0.180 +153 T 0.158 +154 G 0.141 +155 L 0.136 +156 I 0.135 +157 S 0.132 +158 A 0.127 +159 E 0.118 +160 G 0.107 +161 E 0.100 +162 Q 0.097 +163 W 0.092 +164 L 0.083 +165 K 0.077 +166 M 0.081 +167 R 0.089 +168 S 0.091 +169 V 0.084 +170 L 0.073 +171 R 0.067 +172 Q 0.066 +173 R 0.066 +174 I 0.066 +175 L 0.070 +176 K 0.080 +177 P 0.092 +178 K 0.098 +179 D 0.093 +180 V 0.084 +181 A 0.078 +182 I 0.077 +183 Y 0.076 +184 S 0.072 +185 G 0.067 +186 E 0.063 +187 V 0.064 +188 N 0.071 +189 Q 0.075 +190 V 0.070 +191 I 0.057 +192 A 0.044 +193 D 0.035 +194 L 0.033 +195 I 0.035 +196 K 0.038 +197 R 0.039 +198 I 0.037 +199 Y 0.037 +200 L 0.042 +201 L 0.056 +202 R 0.074 +203 S 0.095 +204 Q 0.113 +205 A 0.127 +206 E 0.134 +207 D 0.133 +208 G 0.120 +209 E 0.098 +210 T 0.079 +211 V 0.070 +212 T 0.067 +213 N 0.061 +214 V 0.055 +215 N 0.050 +216 D 0.048 +217 L 0.047 +218 F 0.047 +219 F 0.050 +220 K 0.061 +221 Y 0.072 +222 S 0.078 +223 M 0.083 +224 E 0.090 +225 G 0.091 +226 V 0.078 +227 A 0.059 +228 T 0.044 +229 I 0.036 +230 L 0.032 +231 Y 0.034 +232 E 0.045 +233 S 0.068 +234 R 0.098 +235 L 0.125 +236 G 0.135 +237 C 0.124 +238 L 0.104 +239 E 0.090 +240 N 0.084 +241 S 0.081 +242 I 0.073 +243 P 0.058 +244 Q 0.043 +245 L 0.033 +246 T 0.031 +247 V 0.032 +248 E 0.034 +249 Y 0.036 +250 I 0.035 +251 E 0.032 +252 A 0.028 +253 L 0.024 +254 E 0.022 +255 L 0.021 +256 M 0.021 +257 F 0.024 +258 S 0.028 +259 M 0.031 +260 F 0.031 +261 K 0.029 +262 T 0.026 +263 S 0.027 +264 M 0.029 +265 Y 0.033 +266 A 0.040 +267 G 0.049 +268 A 0.057 +269 I 0.061 +270 P 0.058 +271 R 0.049 +272 W 0.040 +273 L 0.039 +274 R 0.043 +275 P 0.052 +276 F 0.062 +277 I 0.069 +278 P 0.065 +279 K 0.053 +280 P 0.044 +281 W 0.042 +282 R 0.045 +283 E 0.050 +284 F 0.051 +285 C 0.050 +286 R 0.051 +287 S 0.054 +288 W 0.055 +289 D 0.055 +290 G 0.057 +291 L 0.057 +292 F 0.052 +293 K 0.043 +294 F 0.033 +295 S 0.025 +296 Q 0.020 +297 I 0.019 +298 H 0.021 +299 V 0.023 +300 D 0.025 +301 N 0.030 +302 K 0.040 +303 L 0.055 +304 R 0.068 +305 D 0.069 +306 I 0.060 +307 Q 0.052 +308 Y 0.052 +309 Q 0.062 +310 M 0.077 +311 D 0.097 +312 R 0.123 +313 G 0.149 +314 R 0.165 +315 R 0.164 +316 V 0.147 +317 S 0.120 +318 G 0.088 +319 G 0.061 +320 L 0.045 +321 L 0.040 +322 T 0.040 +323 Y 0.043 +324 L 0.047 +325 F 0.057 +326 L 0.070 +327 S 0.080 +328 Q 0.083 +329 A 0.077 +330 L 0.066 +331 T 0.056 +332 L 0.053 +333 Q 0.055 +334 E 0.057 +335 I 0.056 +336 Y 0.055 +337 A 0.063 +338 N 0.083 +339 V 0.101 +340 T 0.107 +341 E 0.109 +342 M 0.112 +343 L 0.115 +344 L 0.114 +345 A 0.117 +346 G 0.120 +347 V 0.119 +348 D 0.116 +349 T 0.113 +350 T 0.103 +351 S 0.086 +352 F 0.071 +353 T 0.061 +354 L 0.052 +355 S 0.042 +356 W 0.035 +357 T 0.032 +358 V 0.031 +359 Y 0.032 +360 L 0.034 +361 L 0.038 +362 A 0.042 +363 R 0.045 +364 H 0.043 +365 P 0.037 +366 E 0.029 +367 V 0.023 +368 Q 0.021 +369 Q 0.024 +370 T 0.033 +371 V 0.047 +372 Y 0.061 +373 R 0.066 +374 E 0.059 +375 I 0.047 +376 V 0.045 +377 K 0.055 +378 N 0.071 +379 L 0.084 +380 G 0.087 +381 E 0.079 +382 R 0.070 +383 H 0.069 +384 V 0.072 +385 P 0.071 +386 T 0.064 +387 A 0.060 +388 A 0.064 +389 D 0.071 +390 V 0.074 +391 P 0.073 +392 K 0.070 +393 V 0.065 +394 P 0.057 +395 L 0.049 +396 V 0.047 +397 R 0.054 +398 A 0.070 +399 L 0.087 +400 L 0.095 +401 K 0.096 +402 E 0.095 +403 T 0.093 +404 L 0.087 +405 R 0.077 +406 L 0.063 +407 F 0.050 +408 P 0.046 +409 V 0.052 +410 L 0.062 +411 P 0.065 +412 G 0.059 +413 N 0.050 +414 G 0.045 +415 R 0.047 +416 V 0.055 +417 T 0.065 +418 Q 0.071 +419 E 0.069 +420 D 0.063 +421 L 0.057 +422 V 0.053 +423 I 0.057 +424 G 0.067 +425 G 0.076 +426 Y 0.077 +427 L 0.072 +428 I 0.067 +429 P 0.069 +430 K 0.071 +431 G 0.067 +432 T 0.060 +433 Q 0.052 +434 L 0.044 +435 A 0.041 +436 L 0.045 +437 C 0.055 +438 H 0.066 +439 Y 0.070 +440 A 0.069 +441 T 0.067 +442 S 0.065 +443 Y 0.066 +444 Q 0.071 +445 D 0.081 +446 E 0.091 +447 N 0.098 +448 F 0.100 +449 P 0.098 +450 R 0.091 +451 A 0.085 +452 K 0.080 +453 E 0.075 +454 F 0.070 +455 R 0.063 +456 P 0.058 +457 E 0.058 +458 R 0.063 +459 W 0.072 +460 L 0.086 +461 R 0.113 +462 K 0.154 +463 G 0.197 +464 D 0.229 +465 L 0.244 +466 D 0.248 +467 R 0.248 +468 V 0.239 +469 D 0.214 +470 N 0.175 +471 F 0.140 +472 G 0.126 +473 S 0.132 +474 I 0.146 +475 P 0.154 +476 F 0.152 +477 G 0.142 +478 H 0.131 +479 G 0.123 +480 V 0.123 +481 R 0.137 +482 S 0.161 +483 C 0.179 +484 I 0.183 +485 G 0.174 +486 R 0.161 +487 R 0.162 +488 I 0.183 +489 A 0.196 +490 E 0.180 +491 L 0.153 +492 E 0.137 +493 I 0.121 +494 H 0.099 +495 L 0.078 +496 V 0.068 +497 V 0.064 +498 I 0.061 +499 Q 0.058 +500 L 0.057 +501 L 0.054 +502 Q 0.048 +503 H 0.042 +504 F 0.039 +505 E 0.042 +506 I 0.053 +507 K 0.071 +508 T 0.098 +509 S 0.132 +510 S 0.163 +511 Q 0.186 +512 T 0.196 +513 N 0.193 +514 A 0.178 +515 V 0.152 +516 H 0.125 +517 A 0.103 +518 K 0.085 +519 T 0.071 +520 H 0.065 +521 G 0.072 +522 L 0.087 +523 L 0.104 +524 T 0.119 +525 P 0.135 +526 G 0.147 +527 G 0.146 +528 P 0.128 +529 I 0.102 +530 H 0.082 +531 V 0.071 +532 R 0.069 +533 F 0.075 +534 V 0.096 +535 N 0.135 +536 R 0.180 +537 K 0.211 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000186684.15_ENST00000664447.2_GN:CYP27C1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000186684.15_ENST00000664447.2_GN:CYP27C1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..65c8afac75b4a42bf321d123cda7417e85ddc750 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000186684.15_ENST00000664447.2_GN:CYP27C1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid @@ -0,0 +1,543 @@ +>ENSG00000186684.15|ENST00000664447.2|GN:CYP27C1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:5 +1 M 0.218 +2 Q 0.209 +3 T 0.199 +4 S 0.186 +5 A 0.165 +6 M 0.140 +7 A 0.119 +8 L 0.103 +9 L 0.091 +10 A 0.088 +11 R 0.094 +12 I 0.108 +13 L 0.131 +14 R 0.167 +15 A 0.214 +16 G 0.262 +17 L 0.306 +18 R 0.352 +19 P 0.403 +20 A 0.459 +21 P 0.512 +22 E 0.564 +23 R 0.615 +24 G 0.653 +25 G 0.665 +26 L 0.660 +27 L 0.660 +28 G 0.670 +29 G 0.669 +30 G 0.637 +31 A 0.572 +32 P 0.498 +33 R 0.452 +34 R 0.454 +35 P 0.484 +36 Q 0.525 +37 P 0.567 +38 A 0.584 +39 G 0.554 +40 A 0.503 +41 R 0.473 +42 L 0.464 +43 P 0.460 +44 A 0.470 +45 G 0.481 +46 A 0.455 +47 R 0.410 +48 A 0.413 +49 E 0.468 +50 D 0.516 +51 K 0.548 +52 G 0.596 +53 A 0.649 +54 G 0.679 +55 R 0.686 +56 P 0.682 +57 G 0.667 +58 S 0.652 +59 P 0.659 +60 P 0.689 +61 G 0.718 +62 G 0.725 +63 G 0.701 +64 R 0.653 +65 A 0.586 +66 E 0.510 +67 G 0.433 +68 P 0.362 +69 R 0.303 +70 S 0.263 +71 L 0.242 +72 A 0.226 +73 A 0.206 +74 M 0.181 +75 P 0.153 +76 G 0.133 +77 P 0.123 +78 R 0.111 +79 T 0.088 +80 L 0.063 +81 A 0.048 +82 N 0.042 +83 L 0.040 +84 A 0.045 +85 E 0.059 +86 F 0.081 +87 F 0.103 +88 C 0.121 +89 R 0.128 +90 D 0.124 +91 G 0.117 +92 F 0.110 +93 S 0.100 +94 R 0.085 +95 I 0.072 +96 H 0.064 +97 E 0.059 +98 I 0.052 +99 Q 0.044 +100 Q 0.037 +101 K 0.033 +102 H 0.029 +103 T 0.027 +104 R 0.028 +105 E 0.032 +106 Y 0.035 +107 G 0.033 +108 K 0.028 +109 I 0.024 +110 F 0.023 +111 K 0.025 +112 S 0.028 +113 H 0.032 +114 F 0.038 +115 G 0.048 +116 P 0.057 +117 Q 0.060 +118 F 0.055 +119 V 0.048 +120 V 0.046 +121 S 0.054 +122 I 0.068 +123 A 0.079 +124 D 0.078 +125 R 0.069 +126 D 0.058 +127 M 0.052 +128 V 0.052 +129 A 0.058 +130 Q 0.068 +131 V 0.082 +132 L 0.097 +133 R 0.110 +134 A 0.122 +135 E 0.129 +136 G 0.130 +137 A 0.124 +138 A 0.115 +139 P 0.108 +140 Q 0.105 +141 R 0.107 +142 A 0.110 +143 N 0.106 +144 M 0.096 +145 E 0.084 +146 S 0.073 +147 W 0.064 +148 R 0.058 +149 E 0.055 +150 Y 0.056 +151 R 0.062 +152 D 0.074 +153 L 0.095 +154 R 0.127 +155 G 0.163 +156 R 0.185 +157 A 0.180 +158 T 0.157 +159 G 0.140 +160 L 0.135 +161 I 0.133 +162 S 0.131 +163 A 0.126 +164 E 0.117 +165 G 0.107 +166 E 0.100 +167 Q 0.097 +168 W 0.092 +169 L 0.083 +170 K 0.076 +171 M 0.079 +172 R 0.085 +173 S 0.087 +174 V 0.081 +175 L 0.072 +176 R 0.066 +177 Q 0.066 +178 R 0.066 +179 I 0.066 +180 L 0.070 +181 K 0.080 +182 P 0.092 +183 K 0.098 +184 D 0.093 +185 V 0.084 +186 A 0.078 +187 I 0.077 +188 Y 0.076 +189 S 0.072 +190 G 0.067 +191 E 0.063 +192 V 0.064 +193 N 0.071 +194 Q 0.075 +195 V 0.070 +196 I 0.057 +197 A 0.044 +198 D 0.034 +199 L 0.029 +200 I 0.028 +201 K 0.029 +202 R 0.031 +203 I 0.033 +204 Y 0.035 +205 L 0.042 +206 L 0.055 +207 R 0.073 +208 S 0.093 +209 Q 0.111 +210 A 0.125 +211 E 0.132 +212 D 0.131 +213 G 0.118 +214 E 0.096 +215 T 0.078 +216 V 0.069 +217 T 0.066 +218 N 0.061 +219 V 0.054 +220 N 0.049 +221 D 0.048 +222 L 0.047 +223 F 0.046 +224 F 0.050 +225 K 0.061 +226 Y 0.072 +227 S 0.077 +228 M 0.082 +229 E 0.089 +230 G 0.090 +231 V 0.077 +232 A 0.058 +233 T 0.043 +234 I 0.035 +235 L 0.031 +236 Y 0.033 +237 E 0.045 +238 S 0.067 +239 R 0.096 +240 L 0.123 +241 G 0.133 +242 C 0.123 +243 L 0.103 +244 E 0.088 +245 N 0.083 +246 S 0.080 +247 I 0.072 +248 P 0.057 +249 Q 0.042 +250 L 0.032 +251 T 0.030 +252 V 0.030 +253 E 0.032 +254 Y 0.034 +255 I 0.033 +256 E 0.030 +257 A 0.026 +258 L 0.023 +259 E 0.021 +260 L 0.020 +261 M 0.020 +262 F 0.023 +263 S 0.027 +264 M 0.031 +265 F 0.031 +266 K 0.029 +267 T 0.026 +268 S 0.027 +269 M 0.029 +270 Y 0.033 +271 A 0.040 +272 G 0.049 +273 A 0.057 +274 I 0.061 +275 P 0.058 +276 R 0.049 +277 W 0.040 +278 L 0.039 +279 R 0.043 +280 P 0.052 +281 F 0.062 +282 I 0.068 +283 P 0.064 +284 K 0.053 +285 P 0.044 +286 W 0.041 +287 R 0.045 +288 E 0.050 +289 F 0.051 +290 C 0.050 +291 R 0.051 +292 S 0.053 +293 W 0.055 +294 D 0.055 +295 G 0.056 +296 L 0.056 +297 F 0.050 +298 K 0.041 +299 F 0.032 +300 S 0.024 +301 Q 0.020 +302 I 0.019 +303 H 0.021 +304 V 0.023 +305 D 0.025 +306 N 0.030 +307 K 0.040 +308 L 0.055 +309 R 0.068 +310 D 0.069 +311 I 0.060 +312 Q 0.052 +313 Y 0.053 +314 Q 0.062 +315 M 0.077 +316 D 0.097 +317 R 0.123 +318 G 0.149 +319 R 0.165 +320 R 0.164 +321 V 0.148 +322 S 0.120 +323 G 0.089 +324 G 0.061 +325 L 0.045 +326 L 0.040 +327 T 0.040 +328 Y 0.042 +329 L 0.047 +330 F 0.057 +331 L 0.070 +332 S 0.080 +333 Q 0.083 +334 A 0.077 +335 L 0.066 +336 T 0.056 +337 L 0.053 +338 Q 0.055 +339 E 0.057 +340 I 0.056 +341 Y 0.055 +342 A 0.063 +343 N 0.083 +344 V 0.101 +345 T 0.108 +346 E 0.109 +347 M 0.112 +348 L 0.114 +349 L 0.114 +350 A 0.116 +351 G 0.119 +352 V 0.118 +353 D 0.115 +354 T 0.112 +355 T 0.102 +356 S 0.086 +357 F 0.071 +358 T 0.061 +359 L 0.052 +360 S 0.042 +361 W 0.035 +362 T 0.032 +363 V 0.031 +364 Y 0.032 +365 L 0.034 +366 L 0.038 +367 A 0.042 +368 R 0.045 +369 H 0.043 +370 P 0.036 +371 E 0.029 +372 V 0.023 +373 Q 0.021 +374 Q 0.024 +375 T 0.033 +376 V 0.046 +377 Y 0.060 +378 R 0.066 +379 E 0.058 +380 I 0.047 +381 V 0.045 +382 K 0.054 +383 N 0.071 +384 L 0.084 +385 G 0.087 +386 E 0.078 +387 R 0.069 +388 H 0.068 +389 V 0.072 +390 P 0.071 +391 T 0.064 +392 A 0.060 +393 A 0.064 +394 D 0.071 +395 V 0.074 +396 P 0.073 +397 K 0.070 +398 V 0.065 +399 P 0.057 +400 L 0.049 +401 V 0.047 +402 R 0.054 +403 A 0.070 +404 L 0.087 +405 L 0.096 +406 K 0.097 +407 E 0.095 +408 T 0.093 +409 L 0.088 +410 R 0.077 +411 L 0.063 +412 F 0.050 +413 P 0.046 +414 V 0.053 +415 L 0.062 +416 P 0.065 +417 G 0.059 +418 N 0.050 +419 G 0.045 +420 R 0.047 +421 V 0.055 +422 T 0.065 +423 Q 0.071 +424 E 0.070 +425 D 0.064 +426 L 0.057 +427 V 0.054 +428 I 0.057 +429 G 0.067 +430 G 0.076 +431 Y 0.077 +432 L 0.072 +433 I 0.067 +434 P 0.069 +435 K 0.071 +436 G 0.068 +437 T 0.060 +438 Q 0.052 +439 L 0.044 +440 A 0.041 +441 L 0.045 +442 C 0.056 +443 H 0.066 +444 Y 0.070 +445 A 0.070 +446 T 0.067 +447 S 0.065 +448 Y 0.066 +449 Q 0.072 +450 D 0.082 +451 E 0.092 +452 N 0.098 +453 F 0.101 +454 P 0.098 +455 R 0.091 +456 A 0.085 +457 K 0.080 +458 E 0.075 +459 F 0.070 +460 R 0.063 +461 P 0.058 +462 E 0.058 +463 R 0.063 +464 W 0.072 +465 L 0.086 +466 R 0.113 +467 K 0.154 +468 G 0.196 +469 D 0.228 +470 L 0.244 +471 D 0.248 +472 R 0.248 +473 V 0.239 +474 D 0.214 +475 N 0.175 +476 F 0.140 +477 G 0.126 +478 S 0.132 +479 I 0.146 +480 P 0.154 +481 F 0.152 +482 G 0.142 +483 H 0.131 +484 G 0.123 +485 V 0.123 +486 R 0.137 +487 S 0.162 +488 C 0.180 +489 I 0.184 +490 G 0.175 +491 R 0.162 +492 R 0.163 +493 I 0.184 +494 A 0.197 +495 E 0.181 +496 L 0.154 +497 E 0.137 +498 I 0.122 +499 H 0.099 +500 L 0.079 +501 V 0.069 +502 V 0.064 +503 I 0.061 +504 Q 0.059 +505 L 0.057 +506 L 0.054 +507 Q 0.048 +508 H 0.042 +509 F 0.039 +510 E 0.042 +511 I 0.053 +512 K 0.071 +513 T 0.098 +514 S 0.132 +515 S 0.164 +516 Q 0.186 +517 T 0.196 +518 N 0.193 +519 A 0.178 +520 V 0.152 +521 H 0.125 +522 A 0.103 +523 K 0.085 +524 T 0.071 +525 H 0.065 +526 G 0.072 +527 L 0.088 +528 L 0.104 +529 T 0.120 +530 P 0.135 +531 G 0.148 +532 G 0.147 +533 P 0.129 +534 I 0.103 +535 H 0.082 +536 V 0.072 +537 R 0.069 +538 F 0.075 +539 V 0.095 +540 N 0.133 +541 R 0.178 +542 K 0.209 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000187080.10_ENST00000366480.5_GN:OR2AK2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000187080.10_ENST00000366480.5_GN:OR2AK2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1ddc3275b4744d7623e3146be7a0df7fb5478bba --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000187080.10_ENST00000366480.5_GN:OR2AK2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,321 @@ +>ENSG00000187080.10|ENST00000366480.5|GN:OR2AK2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.415 +2 K 0.430 +3 T 0.459 +4 G 0.492 +5 N 0.507 +6 Q 0.496 +7 S 0.461 +8 F 0.408 +9 G 0.340 +10 T 0.269 +11 D 0.210 +12 F 0.168 +13 L 0.142 +14 L 0.128 +15 V 0.125 +16 G 0.128 +17 L 0.133 +18 F 0.138 +19 Q 0.143 +20 Y 0.142 +21 G 0.127 +22 W 0.103 +23 I 0.078 +24 N 0.061 +25 S 0.051 +26 L 0.047 +27 L 0.049 +28 F 0.055 +29 V 0.058 +30 V 0.056 +31 I 0.053 +32 A 0.051 +33 T 0.049 +34 L 0.047 +35 F 0.044 +36 T 0.043 +37 V 0.044 +38 A 0.045 +39 L 0.046 +40 T 0.047 +41 G 0.052 +42 N 0.058 +43 I 0.061 +44 M 0.061 +45 L 0.057 +46 I 0.051 +47 H 0.046 +48 L 0.046 +49 I 0.048 +50 R 0.052 +51 L 0.058 +52 N 0.064 +53 T 0.066 +54 R 0.064 +55 L 0.061 +56 H 0.059 +57 T 0.055 +58 P 0.047 +59 M 0.038 +60 Y 0.032 +61 F 0.028 +62 L 0.029 +63 L 0.036 +64 S 0.045 +65 Q 0.053 +66 L 0.057 +67 S 0.058 +68 I 0.057 +69 V 0.056 +70 D 0.057 +71 L 0.058 +72 M 0.058 +73 Y 0.056 +74 I 0.054 +75 S 0.053 +76 T 0.057 +77 T 0.063 +78 V 0.066 +79 P 0.065 +80 K 0.061 +81 M 0.059 +82 A 0.056 +83 V 0.052 +84 S 0.051 +85 F 0.058 +86 L 0.072 +87 S 0.086 +88 Q 0.093 +89 S 0.091 +90 K 0.081 +91 T 0.067 +92 I 0.055 +93 R 0.044 +94 F 0.038 +95 L 0.038 +96 G 0.040 +97 C 0.042 +98 E 0.041 +99 I 0.040 +100 Q 0.040 +101 T 0.042 +102 Y 0.042 +103 V 0.040 +104 F 0.036 +105 L 0.034 +106 A 0.037 +107 L 0.040 +108 G 0.044 +109 G 0.048 +110 T 0.051 +111 E 0.050 +112 A 0.046 +113 L 0.040 +114 L 0.035 +115 L 0.032 +116 G 0.029 +117 F 0.028 +118 M 0.031 +119 S 0.035 +120 Y 0.040 +121 D 0.044 +122 R 0.045 +123 Y 0.042 +124 V 0.040 +125 A 0.040 +126 I 0.043 +127 C 0.049 +128 H 0.055 +129 P 0.056 +130 L 0.054 +131 H 0.052 +132 Y 0.051 +133 P 0.054 +134 M 0.059 +135 L 0.066 +136 M 0.070 +137 S 0.071 +138 K 0.071 +139 K 0.068 +140 I 0.060 +141 C 0.054 +142 C 0.060 +143 L 0.070 +144 M 0.076 +145 V 0.077 +146 A 0.076 +147 C 0.070 +148 A 0.061 +149 W 0.055 +150 A 0.057 +151 S 0.065 +152 G 0.072 +153 S 0.077 +154 I 0.081 +155 N 0.085 +156 A 0.087 +157 F 0.082 +158 I 0.078 +159 H 0.075 +160 T 0.069 +161 L 0.062 +162 Y 0.060 +163 V 0.063 +164 F 0.070 +165 Q 0.083 +166 L 0.092 +167 P 0.093 +168 F 0.089 +169 C 0.090 +170 R 0.097 +171 S 0.109 +172 R 0.124 +173 L 0.137 +174 I 0.137 +175 N 0.121 +176 H 0.098 +177 F 0.081 +178 F 0.071 +179 C 0.069 +180 E 0.077 +181 V 0.095 +182 P 0.112 +183 A 0.122 +184 L 0.125 +185 L 0.125 +186 S 0.122 +187 L 0.111 +188 V 0.097 +189 C 0.093 +190 Q 0.103 +191 D 0.118 +192 T 0.125 +193 S 0.123 +194 Q 0.118 +195 Y 0.112 +196 E 0.105 +197 Y 0.098 +198 T 0.095 +199 V 0.094 +200 L 0.094 +201 L 0.092 +202 S 0.088 +203 G 0.079 +204 L 0.065 +205 I 0.055 +206 I 0.052 +207 L 0.054 +208 L 0.059 +209 L 0.066 +210 P 0.068 +211 F 0.065 +212 L 0.064 +213 A 0.067 +214 I 0.068 +215 L 0.060 +216 A 0.049 +217 S 0.043 +218 Y 0.040 +219 A 0.041 +220 R 0.046 +221 V 0.054 +222 L 0.065 +223 I 0.073 +224 V 0.072 +225 V 0.066 +226 F 0.070 +227 Q 0.092 +228 M 0.131 +229 S 0.173 +230 S 0.201 +231 G 0.203 +232 K 0.181 +233 G 0.149 +234 Q 0.120 +235 A 0.101 +236 K 0.092 +237 A 0.088 +238 V 0.088 +239 S 0.089 +240 T 0.089 +241 C 0.085 +242 S 0.080 +243 S 0.075 +244 H 0.068 +245 L 0.062 +246 I 0.060 +247 V 0.063 +248 A 0.060 +249 S 0.049 +250 L 0.036 +251 F 0.027 +252 Y 0.025 +253 A 0.027 +254 T 0.032 +255 T 0.035 +256 L 0.038 +257 F 0.043 +258 T 0.055 +259 Y 0.077 +260 T 0.110 +261 R 0.146 +262 P 0.173 +263 H 0.185 +264 S 0.184 +265 L 0.176 +266 R 0.162 +267 S 0.145 +268 P 0.127 +269 S 0.115 +270 R 0.110 +271 D 0.107 +272 K 0.102 +273 A 0.097 +274 V 0.089 +275 A 0.079 +276 V 0.071 +277 F 0.071 +278 Y 0.079 +279 T 0.090 +280 I 0.099 +281 V 0.106 +282 T 0.108 +283 P 0.101 +284 L 0.089 +285 L 0.080 +286 N 0.074 +287 P 0.068 +288 F 0.063 +289 I 0.064 +290 Y 0.068 +291 S 0.078 +292 L 0.095 +293 R 0.106 +294 N 0.101 +295 K 0.084 +296 E 0.069 +297 V 0.061 +298 T 0.060 +299 G 0.064 +300 A 0.066 +301 V 0.065 +302 R 0.061 +303 R 0.062 +304 L 0.072 +305 L 0.090 +306 G 0.109 +307 Y 0.122 +308 W 0.133 +309 I 0.155 +310 C 0.197 +311 C 0.248 +312 R 0.293 +313 K 0.324 +314 Y 0.347 +315 D 0.360 +316 F 0.356 +317 R 0.343 +318 S 0.337 +319 L 0.331 +320 Y 0.323 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000187080.10_ENST00000366480.5_GN:OR2AK2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000187080.10_ENST00000366480.5_GN:OR2AK2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5a2f1be8c3e1212879fd51a8842e3f72d6d3b171 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000187080.10_ENST00000366480.5_GN:OR2AK2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid @@ -0,0 +1,336 @@ +>ENSG00000187080.10|ENST00000366480.5|GN:OR2AK2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:15 +1 M 0.250 +2 N 0.244 +3 I 0.245 +4 S 0.251 +5 D 0.251 +6 V 0.233 +7 I 0.204 +8 S 0.174 +9 F 0.149 +10 D 0.125 +11 I 0.107 +12 L 0.102 +13 V 0.119 +14 S 0.155 +15 A 0.201 +16 M 0.252 +17 K 0.307 +18 T 0.365 +19 G 0.413 +20 N 0.441 +21 Q 0.442 +22 S 0.413 +23 F 0.359 +24 G 0.294 +25 T 0.233 +26 D 0.185 +27 F 0.152 +28 L 0.130 +29 L 0.119 +30 V 0.115 +31 G 0.116 +32 L 0.120 +33 F 0.125 +34 Q 0.132 +35 Y 0.131 +36 G 0.118 +37 W 0.095 +38 I 0.072 +39 N 0.056 +40 S 0.047 +41 L 0.043 +42 L 0.042 +43 F 0.041 +44 V 0.041 +45 V 0.043 +46 I 0.046 +47 A 0.048 +48 T 0.047 +49 L 0.046 +50 F 0.044 +51 T 0.042 +52 V 0.043 +53 A 0.046 +54 L 0.046 +55 T 0.047 +56 G 0.052 +57 N 0.057 +58 I 0.061 +59 M 0.061 +60 L 0.057 +61 I 0.051 +62 H 0.045 +63 L 0.044 +64 I 0.046 +65 R 0.049 +66 L 0.055 +67 N 0.060 +68 T 0.062 +69 R 0.059 +70 L 0.057 +71 H 0.054 +72 T 0.051 +73 P 0.044 +74 M 0.036 +75 Y 0.030 +76 F 0.027 +77 L 0.029 +78 L 0.036 +79 S 0.046 +80 Q 0.054 +81 L 0.058 +82 S 0.059 +83 I 0.057 +84 V 0.055 +85 D 0.056 +86 L 0.058 +87 M 0.058 +88 Y 0.056 +89 I 0.053 +90 S 0.052 +91 T 0.054 +92 T 0.060 +93 V 0.063 +94 P 0.060 +95 K 0.056 +96 M 0.053 +97 A 0.050 +98 V 0.047 +99 S 0.045 +100 F 0.051 +101 L 0.064 +102 S 0.078 +103 Q 0.087 +104 S 0.086 +105 K 0.076 +106 T 0.064 +107 I 0.052 +108 R 0.042 +109 F 0.037 +110 L 0.036 +111 G 0.039 +112 C 0.040 +113 E 0.040 +114 I 0.039 +115 Q 0.039 +116 T 0.040 +117 Y 0.041 +118 V 0.039 +119 F 0.035 +120 L 0.034 +121 A 0.036 +122 L 0.040 +123 G 0.044 +124 G 0.048 +125 T 0.050 +126 E 0.049 +127 A 0.045 +128 L 0.040 +129 L 0.035 +130 L 0.032 +131 G 0.029 +132 F 0.028 +133 M 0.030 +134 S 0.035 +135 Y 0.040 +136 D 0.044 +137 R 0.045 +138 Y 0.042 +139 V 0.039 +140 A 0.040 +141 I 0.043 +142 C 0.049 +143 H 0.055 +144 P 0.056 +145 L 0.054 +146 H 0.052 +147 Y 0.052 +148 P 0.054 +149 M 0.060 +150 L 0.067 +151 M 0.071 +152 S 0.072 +153 K 0.071 +154 K 0.068 +155 I 0.060 +156 C 0.055 +157 C 0.061 +158 L 0.071 +159 M 0.076 +160 V 0.078 +161 A 0.076 +162 C 0.070 +163 A 0.061 +164 W 0.055 +165 A 0.057 +166 S 0.065 +167 G 0.073 +168 S 0.077 +169 I 0.081 +170 N 0.085 +171 A 0.087 +172 F 0.082 +173 I 0.077 +174 H 0.074 +175 T 0.068 +176 L 0.062 +177 Y 0.060 +178 V 0.063 +179 F 0.071 +180 Q 0.083 +181 L 0.092 +182 P 0.092 +183 F 0.087 +184 C 0.088 +185 R 0.095 +186 S 0.107 +187 R 0.121 +188 L 0.133 +189 I 0.133 +190 N 0.117 +191 H 0.095 +192 F 0.079 +193 F 0.069 +194 C 0.068 +195 E 0.076 +196 V 0.093 +197 P 0.110 +198 A 0.119 +199 L 0.122 +200 L 0.123 +201 S 0.120 +202 L 0.109 +203 V 0.096 +204 C 0.091 +205 Q 0.101 +206 D 0.116 +207 T 0.123 +208 S 0.121 +209 Q 0.116 +210 Y 0.110 +211 E 0.102 +212 Y 0.095 +213 T 0.092 +214 V 0.092 +215 L 0.091 +216 L 0.090 +217 S 0.087 +218 G 0.078 +219 L 0.065 +220 I 0.055 +221 I 0.052 +222 L 0.054 +223 L 0.059 +224 L 0.065 +225 P 0.068 +226 F 0.065 +227 L 0.063 +228 A 0.067 +229 I 0.068 +230 L 0.060 +231 A 0.049 +232 S 0.042 +233 Y 0.040 +234 A 0.041 +235 R 0.045 +236 V 0.054 +237 L 0.065 +238 I 0.073 +239 V 0.071 +240 V 0.066 +241 F 0.069 +242 Q 0.091 +243 M 0.128 +244 S 0.170 +245 S 0.197 +246 G 0.199 +247 K 0.178 +248 G 0.147 +249 Q 0.119 +250 A 0.101 +251 K 0.092 +252 A 0.088 +253 V 0.087 +254 S 0.088 +255 T 0.088 +256 C 0.084 +257 S 0.079 +258 S 0.075 +259 H 0.068 +260 L 0.062 +261 I 0.061 +262 V 0.063 +263 A 0.060 +264 S 0.049 +265 L 0.036 +266 F 0.027 +267 Y 0.025 +268 A 0.027 +269 T 0.031 +270 T 0.034 +271 L 0.037 +272 F 0.042 +273 T 0.053 +274 Y 0.075 +275 T 0.107 +276 R 0.144 +277 P 0.171 +278 H 0.184 +279 S 0.184 +280 L 0.177 +281 R 0.164 +282 S 0.146 +283 P 0.128 +284 S 0.116 +285 R 0.110 +286 D 0.107 +287 K 0.103 +288 A 0.098 +289 V 0.090 +290 A 0.080 +291 V 0.072 +292 F 0.073 +293 Y 0.081 +294 T 0.092 +295 I 0.101 +296 V 0.108 +297 T 0.109 +298 P 0.102 +299 L 0.091 +300 L 0.082 +301 N 0.076 +302 P 0.069 +303 F 0.065 +304 I 0.065 +305 Y 0.069 +306 S 0.079 +307 L 0.095 +308 R 0.107 +309 N 0.101 +310 K 0.084 +311 E 0.068 +312 V 0.060 +313 T 0.059 +314 G 0.063 +315 A 0.065 +316 V 0.064 +317 R 0.061 +318 R 0.062 +319 L 0.071 +320 L 0.089 +321 G 0.108 +322 Y 0.121 +323 W 0.133 +324 I 0.156 +325 C 0.199 +326 C 0.252 +327 R 0.297 +328 K 0.329 +329 Y 0.352 +330 D 0.364 +331 F 0.359 +332 R 0.346 +333 S 0.339 +334 L 0.334 +335 Y 0.325 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000187170.6_ENST00000368777.2_GN:LCE4A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000187170.6_ENST00000368777.2_GN:LCE4A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a662261b3cd6c5b0324f655020e007e93cd07be5 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000187170.6_ENST00000368777.2_GN:LCE4A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,100 @@ +>ENSG00000187170.6|ENST00000368777.2|GN:LCE4A|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.530 +2 S 0.556 +3 C 0.607 +4 Q 0.672 +5 Q 0.729 +6 N 0.759 +7 Q 0.763 +8 Q 0.744 +9 Q 0.701 +10 C 0.646 +11 Q 0.611 +12 P 0.617 +13 P 0.653 +14 P 0.684 +15 K 0.691 +16 C 0.680 +17 P 0.674 +18 I 0.673 +19 P 0.666 +20 K 0.651 +21 Y 0.649 +22 P 0.669 +23 P 0.694 +24 K 0.707 +25 C 0.713 +26 P 0.725 +27 S 0.737 +28 K 0.740 +29 C 0.744 +30 A 0.754 +31 S 0.753 +32 S 0.728 +33 C 0.698 +34 P 0.695 +35 P 0.726 +36 P 0.767 +37 I 0.791 +38 S 0.791 +39 S 0.777 +40 C 0.765 +41 C 0.770 +42 G 0.790 +43 S 0.808 +44 S 0.814 +45 S 0.809 +46 G 0.796 +47 G 0.782 +48 C 0.773 +49 G 0.774 +50 C 0.779 +51 C 0.785 +52 S 0.792 +53 S 0.800 +54 E 0.806 +55 G 0.809 +56 G 0.809 +57 G 0.804 +58 C 0.796 +59 C 0.795 +60 L 0.807 +61 S 0.819 +62 H 0.824 +63 H 0.824 +64 R 0.823 +65 H 0.819 +66 H 0.811 +67 R 0.794 +68 S 0.763 +69 H 0.722 +70 C 0.694 +71 H 0.700 +72 R 0.731 +73 P 0.767 +74 K 0.796 +75 S 0.810 +76 S 0.808 +77 N 0.798 +78 C 0.795 +79 Y 0.807 +80 G 0.829 +81 S 0.848 +82 G 0.859 +83 S 0.864 +84 G 0.863 +85 Q 0.859 +86 Q 0.850 +87 S 0.837 +88 G 0.826 +89 G 0.814 +90 S 0.795 +91 G 0.765 +92 C 0.732 +93 C 0.714 +94 S 0.711 +95 G 0.706 +96 G 0.674 +97 G 0.604 +98 C 0.511 +99 C 0.444 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000187170.6_ENST00000368777.2_GN:LCE4A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:70.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000187170.6_ENST00000368777.2_GN:LCE4A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:70.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5435131021bdd4a6eceaf0d78b616de092324a75 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000187170.6_ENST00000368777.2_GN:LCE4A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:70.caid @@ -0,0 +1,170 @@ +>ENSG00000187170.6|ENST00000368777.2|GN:LCE4A|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:70 +1 M 0.482 +2 K 0.533 +3 P 0.597 +4 G 0.627 +5 G 0.618 +6 R 0.616 +7 R 0.665 +8 M 0.738 +9 S 0.786 +10 G 0.795 +11 M 0.783 +12 T 0.770 +13 P 0.767 +14 H 0.768 +15 L 0.766 +16 C 0.758 +17 N 0.743 +18 S 0.717 +19 H 0.678 +20 V 0.631 +21 L 0.588 +22 L 0.554 +23 L 0.518 +24 P 0.460 +25 L 0.392 +26 A 0.350 +27 W 0.352 +28 L 0.386 +29 I 0.432 +30 R 0.483 +31 G 0.542 +32 P 0.609 +33 A 0.671 +34 P 0.709 +35 G 0.709 +36 S 0.662 +37 I 0.588 +38 Q 0.525 +39 S 0.488 +40 V 0.460 +41 F 0.428 +42 L 0.404 +43 L 0.398 +44 L 0.400 +45 A 0.388 +46 S 0.359 +47 H 0.325 +48 L 0.293 +49 L 0.282 +50 C 0.313 +51 F 0.383 +52 L 0.474 +53 R 0.574 +54 D 0.669 +55 V 0.744 +56 S 0.794 +57 V 0.823 +58 A 0.832 +59 A 0.823 +60 S 0.809 +61 E 0.806 +62 P 0.817 +63 T 0.835 +64 V 0.843 +65 Y 0.837 +66 R 0.825 +67 N 0.818 +68 P 0.824 +69 T 0.834 +70 K 0.837 +71 M 0.829 +72 S 0.818 +73 C 0.815 +74 Q 0.830 +75 Q 0.850 +76 N 0.858 +77 Q 0.848 +78 Q 0.824 +79 Q 0.787 +80 C 0.746 +81 Q 0.719 +82 P 0.720 +83 P 0.742 +84 P 0.765 +85 K 0.774 +86 C 0.769 +87 P 0.761 +88 I 0.752 +89 P 0.743 +90 K 0.736 +91 Y 0.740 +92 P 0.752 +93 P 0.761 +94 K 0.761 +95 C 0.763 +96 P 0.778 +97 S 0.796 +98 K 0.803 +99 C 0.806 +100 A 0.810 +101 S 0.801 +102 S 0.772 +103 C 0.741 +104 P 0.738 +105 P 0.764 +106 P 0.800 +107 I 0.820 +108 S 0.820 +109 S 0.808 +110 C 0.797 +111 C 0.800 +112 G 0.814 +113 S 0.827 +114 S 0.831 +115 S 0.825 +116 G 0.815 +117 G 0.805 +118 C 0.801 +119 G 0.805 +120 C 0.809 +121 C 0.812 +122 S 0.815 +123 S 0.820 +124 E 0.824 +125 G 0.827 +126 G 0.829 +127 G 0.830 +128 C 0.827 +129 C 0.824 +130 L 0.825 +131 S 0.826 +132 H 0.824 +133 H 0.821 +134 R 0.820 +135 H 0.818 +136 H 0.813 +137 R 0.801 +138 S 0.779 +139 H 0.749 +140 C 0.728 +141 H 0.727 +142 R 0.745 +143 P 0.772 +144 K 0.799 +145 S 0.815 +146 S 0.816 +147 N 0.810 +148 C 0.809 +149 Y 0.821 +150 G 0.842 +151 S 0.860 +152 G 0.870 +153 S 0.874 +154 G 0.873 +155 Q 0.868 +156 Q 0.860 +157 S 0.850 +158 G 0.841 +159 G 0.833 +160 S 0.821 +161 G 0.799 +162 C 0.776 +163 C 0.761 +164 S 0.755 +165 G 0.744 +166 G 0.714 +167 G 0.658 +168 C 0.590 +169 C 0.543 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000187475.6_ENST00000338379.6_GN:H1-6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000187475.6_ENST00000338379.6_GN:H1-6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1e51a3ade30e3568b1c8352f4de25f63ce42d307 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000187475.6_ENST00000338379.6_GN:H1-6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,208 @@ +>ENSG00000187475.6|ENST00000338379.6|GN:H1-6|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.628 +2 S 0.642 +3 E 0.661 +4 T 0.666 +5 V 0.645 +6 P 0.610 +7 A 0.604 +8 A 0.643 +9 S 0.676 +10 A 0.662 +11 S 0.648 +12 A 0.673 +13 G 0.694 +14 V 0.670 +15 A 0.646 +16 A 0.671 +17 M 0.723 +18 E 0.756 +19 K 0.762 +20 L 0.758 +21 P 0.758 +22 T 0.764 +23 K 0.767 +24 K 0.765 +25 R 0.756 +26 G 0.746 +27 R 0.743 +28 K 0.751 +29 P 0.769 +30 A 0.789 +31 G 0.801 +32 L 0.801 +33 I 0.788 +34 S 0.765 +35 A 0.733 +36 S 0.691 +37 R 0.632 +38 K 0.551 +39 V 0.459 +40 P 0.369 +41 N 0.288 +42 L 0.213 +43 S 0.146 +44 V 0.093 +45 S 0.059 +46 K 0.044 +47 L 0.037 +48 I 0.033 +49 T 0.033 +50 E 0.037 +51 A 0.044 +52 L 0.054 +53 S 0.065 +54 V 0.073 +55 S 0.078 +56 Q 0.081 +57 E 0.084 +58 R 0.089 +59 V 0.093 +60 G 0.089 +61 M 0.076 +62 S 0.059 +63 L 0.045 +64 V 0.039 +65 A 0.041 +66 L 0.051 +67 K 0.062 +68 K 0.067 +69 A 0.062 +70 L 0.057 +71 A 0.060 +72 A 0.072 +73 A 0.086 +74 G 0.094 +75 Y 0.090 +76 D 0.075 +77 V 0.059 +78 E 0.045 +79 K 0.038 +80 N 0.036 +81 N 0.036 +82 S 0.036 +83 R 0.036 +84 I 0.038 +85 K 0.040 +86 L 0.040 +87 S 0.041 +88 L 0.042 +89 K 0.043 +90 S 0.045 +91 L 0.048 +92 V 0.053 +93 N 0.057 +94 K 0.061 +95 G 0.061 +96 I 0.062 +97 L 0.069 +98 V 0.085 +99 Q 0.107 +100 T 0.129 +101 R 0.145 +102 G 0.155 +103 T 0.159 +104 G 0.159 +105 A 0.158 +106 S 0.157 +107 G 0.148 +108 S 0.127 +109 F 0.113 +110 K 0.135 +111 L 0.211 +112 S 0.330 +113 K 0.450 +114 K 0.533 +115 V 0.579 +116 I 0.620 +117 P 0.676 +118 K 0.734 +119 S 0.774 +120 T 0.790 +121 R 0.793 +122 S 0.794 +123 K 0.797 +124 A 0.802 +125 K 0.806 +126 K 0.803 +127 S 0.785 +128 V 0.738 +129 S 0.669 +130 A 0.625 +131 K 0.643 +132 T 0.692 +133 K 0.729 +134 K 0.749 +135 L 0.764 +136 V 0.779 +137 L 0.791 +138 S 0.796 +139 R 0.796 +140 D 0.792 +141 S 0.783 +142 K 0.774 +143 S 0.773 +144 P 0.783 +145 K 0.803 +146 T 0.822 +147 A 0.833 +148 K 0.839 +149 T 0.843 +150 N 0.841 +151 K 0.836 +152 R 0.828 +153 A 0.819 +154 K 0.811 +155 K 0.813 +156 P 0.824 +157 R 0.837 +158 A 0.843 +159 T 0.841 +160 T 0.837 +161 P 0.840 +162 K 0.850 +163 T 0.861 +164 V 0.865 +165 R 0.865 +166 S 0.863 +167 G 0.860 +168 R 0.856 +169 K 0.853 +170 A 0.850 +171 K 0.846 +172 G 0.843 +173 A 0.842 +174 K 0.844 +175 G 0.848 +176 K 0.852 +177 Q 0.853 +178 Q 0.847 +179 Q 0.835 +180 K 0.820 +181 S 0.811 +182 P 0.814 +183 V 0.826 +184 K 0.836 +185 A 0.840 +186 R 0.839 +187 A 0.837 +188 S 0.835 +189 K 0.832 +190 S 0.829 +191 K 0.828 +192 L 0.826 +193 T 0.819 +194 Q 0.809 +195 H 0.797 +196 H 0.787 +197 E 0.781 +198 V 0.778 +199 N 0.773 +200 V 0.763 +201 R 0.750 +202 K 0.734 +203 A 0.709 +204 T 0.671 +205 S 0.625 +206 K 0.578 +207 K 0.544 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000187475.6_ENST00000338379.6_GN:H1-6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000187475.6_ENST00000338379.6_GN:H1-6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..302bc47bbbb379cc19d95a18e350619404876907 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000187475.6_ENST00000338379.6_GN:H1-6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid @@ -0,0 +1,222 @@ +>ENSG00000187475.6|ENST00000338379.6|GN:H1-6|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:14 +1 M 0.498 +2 L 0.530 +3 F 0.569 +4 A 0.583 +5 G 0.558 +6 Y 0.510 +7 Y 0.471 +8 I 0.443 +9 L 0.427 +10 R 0.450 +11 F 0.531 +12 S 0.637 +13 V 0.718 +14 V 0.762 +15 M 0.780 +16 S 0.787 +17 E 0.791 +18 T 0.793 +19 V 0.799 +20 P 0.811 +21 A 0.826 +22 A 0.839 +23 S 0.844 +24 A 0.844 +25 S 0.841 +26 A 0.825 +27 G 0.777 +28 V 0.706 +29 A 0.665 +30 A 0.691 +31 M 0.746 +32 E 0.779 +33 K 0.782 +34 L 0.776 +35 P 0.776 +36 T 0.782 +37 K 0.786 +38 K 0.782 +39 R 0.771 +40 G 0.759 +41 R 0.754 +42 K 0.762 +43 P 0.783 +44 A 0.805 +45 G 0.819 +46 L 0.819 +47 I 0.806 +48 S 0.780 +49 A 0.746 +50 S 0.702 +51 R 0.639 +52 K 0.553 +53 V 0.455 +54 P 0.363 +55 N 0.283 +56 L 0.211 +57 S 0.146 +58 V 0.093 +59 S 0.060 +60 K 0.044 +61 L 0.037 +62 I 0.033 +63 T 0.033 +64 E 0.037 +65 A 0.044 +66 L 0.054 +67 S 0.064 +68 V 0.072 +69 S 0.077 +70 Q 0.079 +71 E 0.081 +72 R 0.086 +73 V 0.090 +74 G 0.087 +75 M 0.074 +76 S 0.058 +77 L 0.044 +78 V 0.038 +79 A 0.041 +80 L 0.050 +81 K 0.062 +82 K 0.067 +83 A 0.062 +84 L 0.056 +85 A 0.059 +86 A 0.070 +87 A 0.084 +88 G 0.092 +89 Y 0.088 +90 D 0.074 +91 V 0.058 +92 E 0.045 +93 K 0.037 +94 N 0.035 +95 N 0.035 +96 S 0.035 +97 R 0.035 +98 I 0.037 +99 K 0.039 +100 L 0.039 +101 S 0.040 +102 L 0.042 +103 K 0.043 +104 S 0.044 +105 L 0.047 +106 V 0.051 +107 N 0.056 +108 K 0.060 +109 G 0.061 +110 I 0.062 +111 L 0.068 +112 V 0.084 +113 Q 0.106 +114 T 0.127 +115 R 0.144 +116 G 0.156 +117 T 0.161 +118 G 0.161 +119 A 0.160 +120 S 0.158 +121 G 0.148 +122 S 0.127 +123 F 0.113 +124 K 0.136 +125 L 0.213 +126 S 0.333 +127 K 0.456 +128 K 0.540 +129 V 0.587 +130 I 0.627 +131 P 0.681 +132 K 0.738 +133 S 0.777 +134 T 0.793 +135 R 0.796 +136 S 0.796 +137 K 0.800 +138 A 0.805 +139 K 0.808 +140 K 0.805 +141 S 0.787 +142 V 0.740 +143 S 0.669 +144 A 0.625 +145 K 0.642 +146 T 0.691 +147 K 0.729 +148 K 0.750 +149 L 0.766 +150 V 0.782 +151 L 0.794 +152 S 0.799 +153 R 0.799 +154 D 0.795 +155 S 0.787 +156 K 0.779 +157 S 0.778 +158 P 0.789 +159 K 0.808 +160 T 0.826 +161 A 0.837 +162 K 0.842 +163 T 0.845 +164 N 0.843 +165 K 0.838 +166 R 0.830 +167 A 0.821 +168 K 0.813 +169 K 0.815 +170 P 0.826 +171 R 0.839 +172 A 0.845 +173 T 0.843 +174 T 0.840 +175 P 0.843 +176 K 0.853 +177 T 0.863 +178 V 0.867 +179 R 0.866 +180 S 0.864 +181 G 0.861 +182 R 0.857 +183 K 0.854 +184 A 0.851 +185 K 0.847 +186 G 0.844 +187 A 0.843 +188 K 0.845 +189 G 0.849 +190 K 0.853 +191 Q 0.854 +192 Q 0.848 +193 Q 0.836 +194 K 0.822 +195 S 0.813 +196 P 0.816 +197 V 0.824 +198 K 0.822 +199 A 0.797 +200 R 0.754 +201 A 0.731 +202 S 0.751 +203 K 0.790 +204 S 0.818 +205 K 0.829 +206 L 0.830 +207 T 0.824 +208 Q 0.814 +209 H 0.802 +210 H 0.792 +211 E 0.787 +212 V 0.784 +213 N 0.779 +214 V 0.770 +215 R 0.759 +216 K 0.744 +217 A 0.719 +218 T 0.680 +219 S 0.632 +220 K 0.582 +221 K 0.546 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000187855.6_ENST00000342331.5_GN:ASCL4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000187855.6_ENST00000342331.5_GN:ASCL4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6763f27d594c31a2cab1e1a3f28d87ec1748afa8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000187855.6_ENST00000342331.5_GN:ASCL4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,173 @@ +>ENSG00000187855.6|ENST00000342331.5|GN:ASCL4|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.480 +2 E 0.508 +3 T 0.550 +4 R 0.592 +5 K 0.632 +6 P 0.667 +7 A 0.693 +8 E 0.707 +9 R 0.708 +10 L 0.700 +11 A 0.682 +12 L 0.659 +13 P 0.644 +14 Y 0.654 +15 S 0.685 +16 L 0.715 +17 R 0.731 +18 T 0.736 +19 A 0.745 +20 P 0.759 +21 L 0.775 +22 G 0.786 +23 V 0.791 +24 P 0.795 +25 G 0.793 +26 T 0.784 +27 L 0.772 +28 P 0.763 +29 G 0.754 +30 L 0.740 +31 P 0.721 +32 R 0.694 +33 R 0.654 +34 D 0.612 +35 P 0.591 +36 L 0.609 +37 R 0.659 +38 V 0.709 +39 A 0.726 +40 L 0.705 +41 R 0.657 +42 L 0.585 +43 D 0.492 +44 A 0.402 +45 A 0.343 +46 C 0.313 +47 W 0.296 +48 E 0.285 +49 W 0.289 +50 A 0.312 +51 R 0.358 +52 S 0.423 +53 G 0.491 +54 C 0.547 +55 A 0.587 +56 R 0.611 +57 G 0.624 +58 W 0.628 +59 Q 0.627 +60 Y 0.627 +61 L 0.637 +62 P 0.658 +63 V 0.683 +64 P 0.695 +65 L 0.683 +66 D 0.650 +67 S 0.602 +68 A 0.537 +69 F 0.450 +70 E 0.348 +71 P 0.260 +72 A 0.207 +73 F 0.187 +74 L 0.185 +75 R 0.187 +76 K 0.194 +77 R 0.201 +78 N 0.211 +79 E 0.225 +80 R 0.239 +81 E 0.243 +82 R 0.236 +83 Q 0.231 +84 R 0.231 +85 V 0.230 +86 R 0.225 +87 C 0.217 +88 V 0.199 +89 N 0.174 +90 E 0.152 +91 G 0.136 +92 Y 0.124 +93 A 0.113 +94 R 0.105 +95 L 0.101 +96 R 0.102 +97 D 0.110 +98 H 0.113 +99 L 0.103 +100 P 0.086 +101 R 0.074 +102 E 0.075 +103 L 0.087 +104 A 0.101 +105 D 0.112 +106 K 0.118 +107 R 0.116 +108 L 0.106 +109 S 0.088 +110 K 0.074 +111 V 0.069 +112 E 0.073 +113 T 0.081 +114 L 0.085 +115 R 0.089 +116 A 0.096 +117 A 0.098 +118 I 0.086 +119 D 0.072 +120 Y 0.069 +121 I 0.077 +122 K 0.085 +123 H 0.087 +124 L 0.089 +125 Q 0.096 +126 E 0.105 +127 L 0.111 +128 L 0.114 +129 E 0.122 +130 R 0.143 +131 Q 0.187 +132 A 0.258 +133 W 0.346 +134 G 0.436 +135 L 0.514 +136 E 0.576 +137 G 0.619 +138 A 0.645 +139 A 0.656 +140 G 0.654 +141 A 0.646 +142 V 0.639 +143 P 0.642 +144 Q 0.659 +145 R 0.682 +146 R 0.694 +147 A 0.689 +148 E 0.675 +149 C 0.667 +150 N 0.671 +151 S 0.679 +152 D 0.677 +153 G 0.651 +154 E 0.610 +155 S 0.593 +156 K 0.618 +157 A 0.636 +158 S 0.608 +159 S 0.576 +160 A 0.591 +161 P 0.643 +162 S 0.693 +163 P 0.725 +164 S 0.739 +165 S 0.740 +166 E 0.737 +167 P 0.740 +168 E 0.744 +169 E 0.737 +170 G 0.703 +171 G 0.646 +172 S 0.597 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000187855.6_ENST00000342331.5_GN:ASCL4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000187855.6_ENST00000342331.5_GN:ASCL4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..610a664125badd7cf7d43a1069c4b80ddf803555 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000187855.6_ENST00000342331.5_GN:ASCL4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid @@ -0,0 +1,174 @@ +>ENSG00000187855.6|ENST00000342331.5|GN:ASCL4|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:1 +1 M 0.466 +2 M 0.494 +3 E 0.537 +4 T 0.580 +5 R 0.617 +6 K 0.648 +7 P 0.678 +8 A 0.702 +9 E 0.715 +10 R 0.715 +11 L 0.705 +12 A 0.687 +13 L 0.662 +14 P 0.645 +15 Y 0.652 +16 S 0.681 +17 L 0.710 +18 R 0.724 +19 T 0.731 +20 A 0.741 +21 P 0.758 +22 L 0.775 +23 G 0.786 +24 V 0.792 +25 P 0.794 +26 G 0.791 +27 T 0.782 +28 L 0.770 +29 P 0.761 +30 G 0.752 +31 L 0.739 +32 P 0.721 +33 R 0.694 +34 R 0.653 +35 D 0.609 +36 P 0.587 +37 L 0.604 +38 R 0.655 +39 V 0.706 +40 A 0.725 +41 L 0.704 +42 R 0.656 +43 L 0.584 +44 D 0.490 +45 A 0.399 +46 A 0.340 +47 C 0.311 +48 W 0.294 +49 E 0.285 +50 W 0.289 +51 A 0.312 +52 R 0.357 +53 S 0.420 +54 G 0.487 +55 C 0.543 +56 A 0.582 +57 R 0.606 +58 G 0.618 +59 W 0.622 +60 Q 0.621 +61 Y 0.621 +62 L 0.631 +63 P 0.653 +64 V 0.679 +65 P 0.691 +66 L 0.679 +67 D 0.644 +68 S 0.595 +69 A 0.531 +70 F 0.444 +71 E 0.344 +72 P 0.258 +73 A 0.205 +74 F 0.186 +75 L 0.183 +76 R 0.186 +77 K 0.192 +78 R 0.199 +79 N 0.209 +80 E 0.222 +81 R 0.236 +82 E 0.240 +83 R 0.235 +84 Q 0.230 +85 R 0.230 +86 V 0.228 +87 R 0.224 +88 C 0.215 +89 V 0.199 +90 N 0.174 +91 E 0.152 +92 G 0.136 +93 Y 0.124 +94 A 0.113 +95 R 0.106 +96 L 0.101 +97 R 0.102 +98 D 0.110 +99 H 0.113 +100 L 0.103 +101 P 0.086 +102 R 0.074 +103 E 0.075 +104 L 0.087 +105 A 0.102 +106 D 0.112 +107 K 0.118 +108 R 0.116 +109 L 0.106 +110 S 0.088 +111 K 0.074 +112 V 0.069 +113 E 0.073 +114 T 0.081 +115 L 0.085 +116 R 0.089 +117 A 0.096 +118 A 0.098 +119 I 0.086 +120 D 0.071 +121 Y 0.069 +122 I 0.077 +123 K 0.085 +124 H 0.087 +125 L 0.089 +126 Q 0.096 +127 E 0.105 +128 L 0.111 +129 L 0.114 +130 E 0.122 +131 R 0.143 +132 Q 0.188 +133 A 0.258 +134 W 0.346 +135 G 0.436 +136 L 0.514 +137 E 0.576 +138 G 0.619 +139 A 0.645 +140 A 0.655 +141 G 0.654 +142 A 0.645 +143 V 0.638 +144 P 0.641 +145 Q 0.658 +146 R 0.681 +147 R 0.694 +148 A 0.689 +149 E 0.675 +150 C 0.667 +151 N 0.671 +152 S 0.680 +153 D 0.677 +154 G 0.651 +155 E 0.609 +156 S 0.593 +157 K 0.618 +158 A 0.635 +159 S 0.608 +160 S 0.575 +161 A 0.590 +162 P 0.642 +163 S 0.692 +164 P 0.724 +165 S 0.738 +166 S 0.739 +167 E 0.736 +168 P 0.739 +169 E 0.744 +170 E 0.737 +171 G 0.703 +172 G 0.645 +173 S 0.596 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000188124.4_ENST00000641124.1_GN:OR2AG2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000188124.4_ENST00000641124.1_GN:OR2AG2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..260e61aa4f9220acc52df4e8e0c5e70f8ee6decd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000188124.4_ENST00000641124.1_GN:OR2AG2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,317 @@ +>ENSG00000188124.4|ENST00000641124.1|GN:OR2AG2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.392 +2 E 0.411 +3 L 0.441 +4 R 0.472 +5 N 0.492 +6 S 0.495 +7 T 0.481 +8 L 0.447 +9 G 0.390 +10 S 0.316 +11 G 0.244 +12 F 0.188 +13 I 0.155 +14 L 0.144 +15 V 0.150 +16 G 0.170 +17 I 0.200 +18 L 0.242 +19 N 0.291 +20 D 0.324 +21 S 0.322 +22 G 0.282 +23 S 0.218 +24 P 0.148 +25 E 0.092 +26 L 0.063 +27 L 0.059 +28 Y 0.066 +29 A 0.070 +30 T 0.062 +31 F 0.051 +32 T 0.045 +33 I 0.046 +34 L 0.048 +35 Y 0.049 +36 M 0.047 +37 L 0.047 +38 A 0.047 +39 L 0.047 +40 T 0.048 +41 S 0.054 +42 N 0.061 +43 G 0.064 +44 L 0.063 +45 L 0.058 +46 L 0.053 +47 L 0.052 +48 A 0.054 +49 I 0.057 +50 T 0.059 +51 I 0.062 +52 E 0.065 +53 A 0.066 +54 R 0.068 +55 L 0.068 +56 H 0.065 +57 M 0.059 +58 P 0.049 +59 M 0.038 +60 Y 0.029 +61 L 0.025 +62 L 0.027 +63 L 0.034 +64 G 0.044 +65 Q 0.050 +66 L 0.052 +67 S 0.051 +68 L 0.052 +69 M 0.056 +70 D 0.062 +71 L 0.066 +72 L 0.066 +73 F 0.064 +74 T 0.062 +75 S 0.060 +76 V 0.062 +77 V 0.069 +78 T 0.074 +79 P 0.072 +80 K 0.065 +81 A 0.059 +82 L 0.055 +83 A 0.051 +84 D 0.050 +85 F 0.053 +86 L 0.062 +87 R 0.075 +88 R 0.086 +89 E 0.089 +90 N 0.084 +91 T 0.074 +92 I 0.063 +93 S 0.053 +94 F 0.047 +95 G 0.046 +96 G 0.045 +97 C 0.042 +98 A 0.038 +99 L 0.036 +100 Q 0.037 +101 M 0.040 +102 F 0.041 +103 L 0.038 +104 A 0.033 +105 L 0.031 +106 T 0.031 +107 M 0.034 +108 G 0.039 +109 S 0.045 +110 A 0.049 +111 E 0.051 +112 D 0.051 +113 L 0.048 +114 L 0.042 +115 L 0.037 +116 A 0.032 +117 F 0.030 +118 M 0.031 +119 A 0.034 +120 Y 0.037 +121 D 0.039 +122 R 0.039 +123 Y 0.037 +124 V 0.036 +125 A 0.037 +126 I 0.040 +127 C 0.044 +128 H 0.048 +129 P 0.048 +130 L 0.046 +131 K 0.043 +132 Y 0.043 +133 M 0.047 +134 T 0.054 +135 L 0.064 +136 M 0.071 +137 S 0.072 +138 P 0.066 +139 R 0.059 +140 V 0.051 +141 C 0.049 +142 W 0.057 +143 I 0.067 +144 M 0.072 +145 V 0.073 +146 A 0.074 +147 T 0.073 +148 S 0.075 +149 W 0.080 +150 I 0.086 +151 L 0.090 +152 A 0.089 +153 S 0.082 +154 L 0.076 +155 I 0.077 +156 A 0.081 +157 I 0.084 +158 G 0.086 +159 H 0.088 +160 T 0.082 +161 M 0.072 +162 Y 0.067 +163 T 0.070 +164 M 0.082 +165 H 0.098 +166 L 0.109 +167 P 0.108 +168 F 0.100 +169 C 0.094 +170 V 0.095 +171 S 0.099 +172 W 0.110 +173 E 0.126 +174 I 0.134 +175 R 0.122 +176 H 0.098 +177 L 0.075 +178 L 0.062 +179 C 0.060 +180 E 0.072 +181 I 0.094 +182 P 0.116 +183 P 0.127 +184 L 0.129 +185 L 0.129 +186 K 0.128 +187 L 0.125 +188 A 0.118 +189 C 0.115 +190 A 0.121 +191 D 0.128 +192 T 0.126 +193 S 0.116 +194 R 0.107 +195 Y 0.103 +196 E 0.103 +197 L 0.103 +198 I 0.098 +199 I 0.089 +200 Y 0.079 +201 V 0.073 +202 T 0.069 +203 G 0.063 +204 V 0.056 +205 T 0.052 +206 F 0.054 +207 L 0.057 +208 L 0.063 +209 L 0.072 +210 P 0.078 +211 I 0.079 +212 S 0.080 +213 A 0.086 +214 I 0.087 +215 V 0.077 +216 A 0.063 +217 S 0.054 +218 Y 0.050 +219 T 0.049 +220 L 0.052 +221 V 0.059 +222 L 0.069 +223 F 0.077 +224 T 0.078 +225 V 0.079 +226 L 0.088 +227 R 0.107 +228 M 0.130 +229 P 0.146 +230 S 0.144 +231 N 0.130 +232 E 0.111 +233 G 0.092 +234 R 0.075 +235 K 0.066 +236 K 0.064 +237 A 0.065 +238 L 0.067 +239 V 0.073 +240 T 0.080 +241 C 0.085 +242 S 0.087 +243 S 0.084 +244 H 0.075 +245 L 0.066 +246 I 0.063 +247 V 0.064 +248 V 0.061 +249 G 0.050 +250 M 0.037 +251 F 0.030 +252 Y 0.030 +253 G 0.034 +254 A 0.038 +255 A 0.040 +256 T 0.040 +257 F 0.041 +258 M 0.048 +259 Y 0.062 +260 V 0.083 +261 L 0.106 +262 P 0.127 +263 S 0.142 +264 S 0.152 +265 F 0.159 +266 H 0.160 +267 S 0.152 +268 P 0.139 +269 K 0.129 +270 Q 0.123 +271 D 0.116 +272 N 0.107 +273 I 0.099 +274 I 0.090 +275 S 0.079 +276 V 0.070 +277 F 0.071 +278 Y 0.080 +279 T 0.090 +280 I 0.098 +281 V 0.105 +282 T 0.107 +283 P 0.100 +284 A 0.087 +285 L 0.077 +286 N 0.070 +287 P 0.063 +288 L 0.058 +289 I 0.058 +290 Y 0.061 +291 S 0.069 +292 L 0.081 +293 R 0.091 +294 N 0.086 +295 K 0.071 +296 E 0.059 +297 V 0.057 +298 M 0.065 +299 R 0.073 +300 A 0.072 +301 L 0.064 +302 R 0.056 +303 R 0.055 +304 V 0.063 +305 L 0.080 +306 G 0.104 +307 K 0.126 +308 Y 0.144 +309 I 0.163 +310 L 0.190 +311 L 0.225 +312 A 0.266 +313 H 0.305 +314 S 0.332 +315 T 0.341 +316 L 0.338 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000188124.4_ENST00000641124.1_GN:OR2AG2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:33.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000188124.4_ENST00000641124.1_GN:OR2AG2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:33.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6979a2a761b561df70b433ae73cd4f345683dba8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000188124.4_ENST00000641124.1_GN:OR2AG2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:33.caid @@ -0,0 +1,350 @@ +>ENSG00000188124.4|ENST00000641124.1|GN:OR2AG2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:33 +1 M 0.249 +2 H 0.237 +3 S 0.222 +4 D 0.205 +5 L 0.184 +6 E 0.164 +7 Q 0.150 +8 S 0.140 +9 K 0.136 +10 A 0.141 +11 R 0.147 +12 V 0.151 +13 N 0.154 +14 T 0.160 +15 F 0.170 +16 R 0.176 +17 K 0.178 +18 A 0.183 +19 S 0.192 +20 T 0.203 +21 D 0.220 +22 N 0.239 +23 I 0.252 +24 F 0.254 +25 G 0.243 +26 S 0.211 +27 R 0.166 +28 Q 0.129 +29 L 0.114 +30 K 0.117 +31 K 0.125 +32 H 0.130 +33 I 0.132 +34 M 0.142 +35 E 0.168 +36 L 0.208 +37 R 0.256 +38 N 0.305 +39 S 0.345 +40 T 0.367 +41 L 0.362 +42 G 0.330 +43 S 0.277 +44 G 0.220 +45 F 0.174 +46 I 0.148 +47 L 0.140 +48 V 0.149 +49 G 0.172 +50 I 0.205 +51 L 0.246 +52 N 0.290 +53 D 0.320 +54 S 0.317 +55 G 0.278 +56 S 0.215 +57 P 0.145 +58 E 0.089 +59 L 0.058 +60 L 0.046 +61 Y 0.043 +62 A 0.041 +63 T 0.039 +64 F 0.039 +65 T 0.040 +66 I 0.043 +67 L 0.046 +68 Y 0.047 +69 M 0.046 +70 L 0.047 +71 A 0.047 +72 L 0.046 +73 T 0.048 +74 S 0.054 +75 N 0.061 +76 G 0.065 +77 L 0.064 +78 L 0.059 +79 L 0.054 +80 L 0.052 +81 A 0.053 +82 I 0.053 +83 T 0.054 +84 I 0.055 +85 E 0.058 +86 A 0.060 +87 R 0.061 +88 L 0.062 +89 H 0.060 +90 M 0.055 +91 P 0.047 +92 M 0.036 +93 Y 0.027 +94 L 0.024 +95 L 0.026 +96 L 0.034 +97 G 0.043 +98 Q 0.050 +99 L 0.052 +100 S 0.051 +101 L 0.051 +102 M 0.055 +103 D 0.061 +104 L 0.065 +105 L 0.065 +106 F 0.062 +107 T 0.059 +108 S 0.056 +109 V 0.057 +110 V 0.061 +111 T 0.064 +112 P 0.062 +113 K 0.057 +114 A 0.051 +115 L 0.047 +116 A 0.043 +117 D 0.041 +118 F 0.045 +119 L 0.054 +120 R 0.067 +121 R 0.078 +122 E 0.083 +123 N 0.080 +124 T 0.071 +125 I 0.061 +126 S 0.051 +127 F 0.045 +128 G 0.043 +129 G 0.043 +130 C 0.040 +131 A 0.036 +132 L 0.034 +133 Q 0.035 +134 M 0.038 +135 F 0.039 +136 L 0.036 +137 A 0.031 +138 L 0.029 +139 T 0.029 +140 M 0.032 +141 G 0.038 +142 S 0.043 +143 A 0.047 +144 E 0.049 +145 D 0.049 +146 L 0.046 +147 L 0.041 +148 L 0.036 +149 A 0.031 +150 F 0.029 +151 M 0.030 +152 A 0.034 +153 Y 0.037 +154 D 0.039 +155 R 0.039 +156 Y 0.037 +157 V 0.036 +158 A 0.037 +159 I 0.040 +160 C 0.044 +161 H 0.047 +162 P 0.048 +163 L 0.045 +164 K 0.043 +165 Y 0.043 +166 M 0.046 +167 T 0.054 +168 L 0.064 +169 M 0.070 +170 S 0.065 +171 P 0.053 +172 R 0.041 +173 V 0.036 +174 C 0.041 +175 W 0.053 +176 I 0.062 +177 M 0.060 +178 V 0.051 +179 A 0.046 +180 T 0.048 +181 S 0.053 +182 W 0.056 +183 I 0.061 +184 L 0.070 +185 A 0.078 +186 S 0.077 +187 L 0.073 +188 I 0.075 +189 A 0.080 +190 I 0.084 +191 G 0.086 +192 H 0.087 +193 T 0.082 +194 M 0.071 +195 Y 0.066 +196 T 0.070 +197 M 0.082 +198 H 0.097 +199 L 0.108 +200 P 0.106 +201 F 0.096 +202 C 0.089 +203 V 0.089 +204 S 0.095 +205 W 0.107 +206 E 0.123 +207 I 0.130 +208 R 0.119 +209 H 0.095 +210 L 0.073 +211 L 0.060 +212 C 0.059 +213 E 0.072 +214 I 0.095 +215 P 0.116 +216 P 0.125 +217 L 0.125 +218 L 0.124 +219 K 0.123 +220 L 0.119 +221 A 0.111 +222 C 0.107 +223 A 0.113 +224 D 0.120 +225 T 0.120 +226 S 0.111 +227 R 0.101 +228 Y 0.093 +229 E 0.085 +230 L 0.080 +231 I 0.080 +232 I 0.079 +233 Y 0.075 +234 V 0.071 +235 T 0.067 +236 G 0.061 +237 V 0.055 +238 T 0.052 +239 F 0.054 +240 L 0.057 +241 L 0.063 +242 L 0.072 +243 P 0.078 +244 I 0.079 +245 S 0.080 +246 A 0.086 +247 I 0.088 +248 V 0.077 +249 A 0.063 +250 S 0.053 +251 Y 0.048 +252 T 0.046 +253 L 0.045 +254 V 0.044 +255 L 0.042 +256 F 0.043 +257 T 0.051 +258 V 0.065 +259 L 0.082 +260 R 0.104 +261 M 0.128 +262 P 0.143 +263 S 0.142 +264 N 0.128 +265 E 0.110 +266 G 0.091 +267 R 0.076 +268 K 0.066 +269 K 0.065 +270 A 0.066 +271 L 0.068 +272 V 0.074 +273 T 0.081 +274 C 0.087 +275 S 0.088 +276 S 0.084 +277 H 0.076 +278 L 0.067 +279 I 0.063 +280 V 0.065 +281 V 0.062 +282 G 0.051 +283 M 0.038 +284 F 0.031 +285 Y 0.030 +286 G 0.033 +287 A 0.037 +288 A 0.039 +289 T 0.039 +290 F 0.040 +291 M 0.046 +292 Y 0.060 +293 V 0.082 +294 L 0.108 +295 P 0.132 +296 S 0.149 +297 S 0.161 +298 F 0.169 +299 H 0.169 +300 S 0.160 +301 P 0.147 +302 K 0.137 +303 Q 0.131 +304 D 0.124 +305 N 0.113 +306 I 0.104 +307 I 0.095 +308 S 0.084 +309 V 0.074 +310 F 0.075 +311 Y 0.084 +312 T 0.094 +313 I 0.101 +314 V 0.108 +315 T 0.110 +316 P 0.103 +317 A 0.090 +318 L 0.080 +319 N 0.073 +320 P 0.066 +321 L 0.061 +322 I 0.060 +323 Y 0.063 +324 S 0.071 +325 L 0.084 +326 R 0.094 +327 N 0.089 +328 K 0.074 +329 E 0.061 +330 V 0.058 +331 M 0.066 +332 R 0.074 +333 A 0.074 +334 L 0.065 +335 R 0.057 +336 R 0.055 +337 V 0.063 +338 L 0.080 +339 G 0.103 +340 K 0.124 +341 Y 0.141 +342 I 0.159 +343 L 0.184 +344 L 0.220 +345 A 0.262 +346 H 0.303 +347 S 0.330 +348 T 0.338 +349 L 0.333 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000188386.8_ENST00000374806.2_GN:PPP3R2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000188386.8_ENST00000374806.2_GN:PPP3R2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..387cfc03f96bb5786a35c5fc8bf8469184d31af8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000188386.8_ENST00000374806.2_GN:PPP3R2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,171 @@ +>ENSG00000188386.8|ENST00000374806.2|GN:PPP3R2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.442 +2 G 0.454 +3 N 0.475 +4 E 0.485 +5 A 0.460 +6 S 0.401 +7 Y 0.334 +8 P 0.285 +9 A 0.258 +10 E 0.233 +11 M 0.200 +12 C 0.164 +13 S 0.136 +14 H 0.117 +15 F 0.100 +16 D 0.082 +17 N 0.067 +18 D 0.058 +19 E 0.053 +20 I 0.047 +21 K 0.041 +22 R 0.041 +23 L 0.051 +24 G 0.066 +25 R 0.073 +26 R 0.068 +27 F 0.059 +28 K 0.053 +29 K 0.054 +30 L 0.064 +31 D 0.086 +32 L 0.114 +33 D 0.134 +34 K 0.138 +35 S 0.135 +36 G 0.134 +37 S 0.131 +38 L 0.117 +39 S 0.095 +40 V 0.077 +41 E 0.073 +42 E 0.078 +43 F 0.083 +44 M 0.085 +45 S 0.088 +46 L 0.093 +47 P 0.098 +48 E 0.099 +49 L 0.101 +50 R 0.110 +51 H 0.123 +52 N 0.125 +53 P 0.110 +54 L 0.086 +55 V 0.069 +56 R 0.063 +57 R 0.062 +58 V 0.062 +59 I 0.062 +60 D 0.064 +61 V 0.069 +62 F 0.078 +63 D 0.101 +64 T 0.135 +65 D 0.168 +66 G 0.181 +67 D 0.174 +68 G 0.161 +69 E 0.145 +70 V 0.120 +71 D 0.091 +72 F 0.069 +73 K 0.063 +74 E 0.068 +75 F 0.071 +76 I 0.072 +77 L 0.076 +78 G 0.083 +79 T 0.083 +80 S 0.079 +81 Q 0.081 +82 F 0.098 +83 S 0.123 +84 V 0.143 +85 K 0.149 +86 G 0.140 +87 D 0.120 +88 E 0.097 +89 E 0.083 +90 Q 0.077 +91 K 0.072 +92 L 0.064 +93 R 0.060 +94 F 0.062 +95 A 0.068 +96 F 0.075 +97 S 0.082 +98 I 0.082 +99 Y 0.077 +100 D 0.077 +101 M 0.087 +102 D 0.099 +103 K 0.104 +104 D 0.107 +105 G 0.110 +106 Y 0.109 +107 I 0.098 +108 S 0.084 +109 N 0.078 +110 G 0.083 +111 E 0.088 +112 L 0.084 +113 F 0.076 +114 Q 0.071 +115 V 0.069 +116 L 0.067 +117 K 0.064 +118 M 0.069 +119 M 0.084 +120 V 0.106 +121 G 0.126 +122 N 0.134 +123 N 0.126 +124 L 0.111 +125 T 0.102 +126 D 0.102 +127 W 0.103 +128 Q 0.101 +129 L 0.097 +130 Q 0.095 +131 Q 0.092 +132 L 0.087 +133 V 0.078 +134 D 0.067 +135 K 0.059 +136 T 0.056 +137 I 0.056 +138 I 0.057 +139 I 0.061 +140 L 0.070 +141 D 0.087 +142 K 0.113 +143 D 0.141 +144 G 0.159 +145 D 0.164 +146 G 0.162 +147 K 0.152 +148 I 0.131 +149 S 0.107 +150 F 0.093 +151 E 0.087 +152 E 0.077 +153 F 0.061 +154 S 0.048 +155 A 0.045 +156 V 0.050 +157 V 0.066 +158 R 0.095 +159 D 0.131 +160 L 0.163 +161 E 0.182 +162 I 0.185 +163 H 0.181 +164 K 0.179 +165 K 0.177 +166 L 0.170 +167 V 0.168 +168 L 0.183 +169 I 0.206 +170 V 0.221 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000188386.8_ENST00000374806.2_GN:PPP3R2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000188386.8_ENST00000374806.2_GN:PPP3R2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..59362c6f08baab830d789b8bd911d8e0396b47fd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000188386.8_ENST00000374806.2_GN:PPP3R2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid @@ -0,0 +1,174 @@ +>ENSG00000188386.8|ENST00000374806.2|GN:PPP3R2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 +1 M 0.426 +2 S 0.455 +3 T 0.506 +4 M 0.559 +5 G 0.592 +6 N 0.594 +7 E 0.564 +8 A 0.502 +9 S 0.421 +10 Y 0.344 +11 P 0.294 +12 A 0.265 +13 E 0.239 +14 M 0.203 +15 C 0.165 +16 S 0.137 +17 H 0.118 +18 F 0.101 +19 D 0.083 +20 N 0.069 +21 D 0.060 +22 E 0.055 +23 I 0.048 +24 K 0.041 +25 R 0.041 +26 L 0.051 +27 G 0.065 +28 R 0.072 +29 R 0.067 +30 F 0.058 +31 K 0.053 +32 K 0.053 +33 L 0.064 +34 D 0.085 +35 L 0.113 +36 D 0.132 +37 K 0.136 +38 S 0.133 +39 G 0.133 +40 S 0.130 +41 L 0.117 +42 S 0.095 +43 V 0.077 +44 E 0.073 +45 E 0.078 +46 F 0.083 +47 M 0.084 +48 S 0.087 +49 L 0.092 +50 P 0.097 +51 E 0.098 +52 L 0.100 +53 R 0.108 +54 H 0.121 +55 N 0.124 +56 P 0.109 +57 L 0.086 +58 V 0.069 +59 R 0.062 +60 R 0.061 +61 V 0.062 +62 I 0.062 +63 D 0.065 +64 V 0.069 +65 F 0.078 +66 D 0.100 +67 T 0.134 +68 D 0.166 +69 G 0.179 +70 D 0.173 +71 G 0.160 +72 E 0.144 +73 V 0.119 +74 D 0.090 +75 F 0.068 +76 K 0.063 +77 E 0.068 +78 F 0.071 +79 I 0.072 +80 L 0.076 +81 G 0.083 +82 T 0.083 +83 S 0.079 +84 Q 0.082 +85 F 0.098 +86 S 0.123 +87 V 0.142 +88 K 0.148 +89 G 0.140 +90 D 0.119 +91 E 0.097 +92 E 0.082 +93 Q 0.076 +94 K 0.071 +95 L 0.064 +96 R 0.060 +97 F 0.062 +98 A 0.068 +99 F 0.075 +100 S 0.082 +101 I 0.082 +102 Y 0.077 +103 D 0.077 +104 M 0.087 +105 D 0.099 +106 K 0.104 +107 D 0.107 +108 G 0.110 +109 Y 0.109 +110 I 0.098 +111 S 0.084 +112 N 0.078 +113 G 0.083 +114 E 0.089 +115 L 0.085 +116 F 0.076 +117 Q 0.071 +118 V 0.070 +119 L 0.067 +120 K 0.064 +121 M 0.069 +122 M 0.084 +123 V 0.106 +124 G 0.127 +125 N 0.135 +126 N 0.127 +127 L 0.112 +128 T 0.103 +129 D 0.102 +130 W 0.104 +131 Q 0.102 +132 L 0.097 +133 Q 0.095 +134 Q 0.092 +135 L 0.087 +136 V 0.078 +137 D 0.068 +138 K 0.059 +139 T 0.056 +140 I 0.056 +141 I 0.057 +142 I 0.062 +143 L 0.070 +144 D 0.087 +145 K 0.113 +146 D 0.142 +147 G 0.159 +148 D 0.164 +149 G 0.163 +150 K 0.153 +151 I 0.131 +152 S 0.107 +153 F 0.093 +154 E 0.087 +155 E 0.077 +156 F 0.061 +157 S 0.048 +158 A 0.045 +159 V 0.051 +160 V 0.067 +161 R 0.095 +162 D 0.132 +163 L 0.164 +164 E 0.182 +165 I 0.186 +166 H 0.181 +167 K 0.179 +168 K 0.177 +169 L 0.169 +170 V 0.167 +171 L 0.181 +172 I 0.204 +173 V 0.219 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000188676.16_ENST00000502986.4_GN:IDO2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000188676.16_ENST00000502986.4_GN:IDO2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9756bb05d0f7309a2cb1faf2f5a0146b37c556a5 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000188676.16_ENST00000502986.4_GN:IDO2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,408 @@ +>ENSG00000188676.16|ENST00000502986.4|GN:IDO2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.421 +2 E 0.438 +3 P 0.460 +4 H 0.476 +5 R 0.482 +6 P 0.482 +7 N 0.478 +8 V 0.467 +9 K 0.440 +10 T 0.399 +11 A 0.346 +12 V 0.278 +13 P 0.204 +14 L 0.145 +15 S 0.115 +16 L 0.107 +17 E 0.104 +18 S 0.103 +19 Y 0.106 +20 H 0.109 +21 I 0.110 +22 S 0.105 +23 E 0.093 +24 E 0.081 +25 Y 0.077 +26 G 0.085 +27 F 0.102 +28 L 0.118 +29 L 0.124 +30 P 0.118 +31 D 0.107 +32 S 0.096 +33 L 0.084 +34 K 0.075 +35 E 0.070 +36 L 0.065 +37 P 0.059 +38 D 0.053 +39 H 0.046 +40 Y 0.040 +41 R 0.037 +42 P 0.039 +43 W 0.046 +44 M 0.058 +45 E 0.065 +46 I 0.063 +47 A 0.056 +48 N 0.052 +49 K 0.051 +50 L 0.055 +51 P 0.062 +52 Q 0.068 +53 L 0.071 +54 I 0.078 +55 D 0.090 +56 A 0.096 +57 H 0.090 +58 Q 0.084 +59 L 0.084 +60 Q 0.090 +61 A 0.099 +62 H 0.106 +63 V 0.111 +64 D 0.115 +65 K 0.121 +66 M 0.123 +67 P 0.113 +68 L 0.093 +69 L 0.075 +70 S 0.064 +71 C 0.059 +72 Q 0.060 +73 F 0.065 +74 L 0.071 +75 K 0.071 +76 G 0.066 +77 H 0.057 +78 R 0.049 +79 E 0.044 +80 Q 0.042 +81 R 0.043 +82 L 0.048 +83 A 0.053 +84 H 0.056 +85 L 0.060 +86 V 0.065 +87 L 0.067 +88 S 0.066 +89 F 0.068 +90 L 0.073 +91 T 0.075 +92 M 0.075 +93 G 0.078 +94 Y 0.082 +95 V 0.081 +96 W 0.078 +97 Q 0.086 +98 E 0.109 +99 G 0.136 +100 E 0.158 +101 A 0.169 +102 Q 0.166 +103 P 0.154 +104 A 0.141 +105 E 0.133 +106 V 0.130 +107 L 0.126 +108 P 0.116 +109 R 0.101 +110 N 0.083 +111 L 0.069 +112 A 0.063 +113 L 0.065 +114 P 0.068 +115 F 0.070 +116 V 0.072 +117 E 0.076 +118 V 0.086 +119 S 0.103 +120 R 0.129 +121 N 0.157 +122 L 0.177 +123 G 0.179 +124 L 0.161 +125 P 0.128 +126 P 0.100 +127 I 0.090 +128 L 0.102 +129 V 0.127 +130 H 0.150 +131 S 0.161 +132 D 0.160 +133 L 0.148 +134 V 0.129 +135 L 0.111 +136 T 0.100 +137 N 0.094 +138 W 0.089 +139 T 0.091 +140 K 0.107 +141 K 0.129 +142 D 0.150 +143 P 0.173 +144 D 0.194 +145 G 0.205 +146 F 0.197 +147 L 0.180 +148 E 0.168 +149 I 0.166 +150 G 0.164 +151 N 0.151 +152 L 0.131 +153 E 0.118 +154 T 0.112 +155 I 0.109 +156 I 0.110 +157 S 0.120 +158 F 0.140 +159 P 0.160 +160 G 0.173 +161 G 0.176 +162 E 0.170 +163 S 0.158 +164 L 0.146 +165 H 0.144 +166 G 0.147 +167 F 0.148 +168 I 0.146 +169 L 0.146 +170 V 0.153 +171 T 0.167 +172 A 0.187 +173 L 0.199 +174 V 0.191 +175 E 0.167 +176 K 0.143 +177 E 0.127 +178 A 0.115 +179 V 0.102 +180 P 0.086 +181 G 0.073 +182 I 0.062 +183 K 0.054 +184 A 0.049 +185 L 0.047 +186 V 0.047 +187 Q 0.048 +188 A 0.051 +189 T 0.057 +190 N 0.060 +191 A 0.057 +192 I 0.054 +193 L 0.053 +194 Q 0.056 +195 P 0.060 +196 N 0.060 +197 Q 0.056 +198 E 0.052 +199 A 0.054 +200 L 0.062 +201 L 0.071 +202 Q 0.075 +203 A 0.069 +204 L 0.059 +205 Q 0.057 +206 R 0.064 +207 L 0.075 +208 R 0.087 +209 L 0.097 +210 S 0.102 +211 I 0.100 +212 Q 0.097 +213 D 0.098 +214 I 0.099 +215 T 0.100 +216 K 0.099 +217 T 0.095 +218 L 0.090 +219 G 0.085 +220 Q 0.082 +221 M 0.079 +222 H 0.074 +223 D 0.074 +224 Y 0.078 +225 V 0.083 +226 D 0.083 +227 P 0.076 +228 D 0.065 +229 I 0.050 +230 F 0.040 +231 Y 0.037 +232 A 0.039 +233 G 0.040 +234 I 0.041 +235 R 0.044 +236 I 0.052 +237 F 0.067 +238 L 0.086 +239 S 0.109 +240 G 0.139 +241 W 0.172 +242 K 0.197 +243 D 0.206 +244 N 0.201 +245 P 0.192 +246 A 0.189 +247 M 0.195 +248 P 0.204 +249 A 0.202 +250 G 0.182 +251 L 0.152 +252 M 0.129 +253 Y 0.123 +254 E 0.128 +255 G 0.134 +256 V 0.136 +257 S 0.141 +258 Q 0.162 +259 E 0.198 +260 P 0.238 +261 L 0.269 +262 K 0.288 +263 Y 0.299 +264 S 0.314 +265 G 0.337 +266 G 0.360 +267 S 0.367 +268 A 0.349 +269 A 0.306 +270 Q 0.263 +271 S 0.244 +272 T 0.242 +273 V 0.244 +274 L 0.253 +275 H 0.262 +276 A 0.251 +277 F 0.216 +278 D 0.180 +279 E 0.158 +280 F 0.146 +281 L 0.141 +282 G 0.142 +283 I 0.146 +284 R 0.149 +285 H 0.148 +286 S 0.141 +287 K 0.130 +288 E 0.122 +289 S 0.118 +290 G 0.116 +291 D 0.113 +292 F 0.110 +293 L 0.107 +294 Y 0.109 +295 R 0.111 +296 M 0.106 +297 R 0.095 +298 D 0.082 +299 Y 0.073 +300 M 0.074 +301 P 0.082 +302 P 0.095 +303 S 0.105 +304 H 0.108 +305 K 0.105 +306 A 0.101 +307 F 0.095 +308 I 0.090 +309 E 0.089 +310 D 0.093 +311 I 0.101 +312 H 0.109 +313 S 0.111 +314 A 0.101 +315 P 0.078 +316 S 0.056 +317 L 0.044 +318 R 0.042 +319 D 0.044 +320 Y 0.049 +321 I 0.057 +322 L 0.068 +323 S 0.081 +324 S 0.091 +325 G 0.093 +326 Q 0.087 +327 D 0.078 +328 H 0.072 +329 L 0.073 +330 L 0.079 +331 T 0.080 +332 A 0.075 +333 Y 0.069 +334 N 0.065 +335 Q 0.064 +336 C 0.066 +337 V 0.073 +338 Q 0.080 +339 A 0.085 +340 L 0.085 +341 A 0.085 +342 E 0.086 +343 L 0.085 +344 R 0.081 +345 S 0.078 +346 Y 0.076 +347 H 0.071 +348 I 0.061 +349 T 0.050 +350 M 0.044 +351 V 0.041 +352 T 0.041 +353 K 0.042 +354 Y 0.048 +355 L 0.061 +356 I 0.078 +357 T 0.103 +358 A 0.140 +359 A 0.184 +360 A 0.228 +361 K 0.270 +362 A 0.317 +363 K 0.373 +364 H 0.427 +365 G 0.467 +366 K 0.482 +367 P 0.476 +368 N 0.455 +369 H 0.429 +370 L 0.403 +371 P 0.379 +372 G 0.361 +373 P 0.353 +374 P 0.347 +375 Q 0.332 +376 A 0.308 +377 L 0.284 +378 K 0.264 +379 D 0.250 +380 R 0.235 +381 G 0.212 +382 T 0.189 +383 G 0.178 +384 G 0.178 +385 T 0.172 +386 A 0.155 +387 V 0.133 +388 M 0.112 +389 S 0.098 +390 F 0.093 +391 L 0.093 +392 K 0.093 +393 S 0.092 +394 V 0.093 +395 R 0.099 +396 D 0.106 +397 K 0.110 +398 T 0.115 +399 L 0.122 +400 E 0.127 +401 S 0.136 +402 I 0.160 +403 L 0.209 +404 H 0.268 +405 P 0.309 +406 R 0.323 +407 G 0.320 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000188676.16_ENST00000502986.4_GN:IDO2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000188676.16_ENST00000502986.4_GN:IDO2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..cf351117b479d70de612ac1ad9e166f636fc8711 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000188676.16_ENST00000502986.4_GN:IDO2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid @@ -0,0 +1,421 @@ +>ENSG00000188676.16|ENST00000502986.4|GN:IDO2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:13 +1 M 0.279 +2 L 0.283 +3 H 0.296 +4 F 0.316 +5 H 0.336 +6 Y 0.350 +7 Y 0.358 +8 D 0.363 +9 T 0.364 +10 S 0.357 +11 N 0.347 +12 K 0.351 +13 I 0.378 +14 M 0.412 +15 E 0.437 +16 P 0.454 +17 H 0.461 +18 R 0.461 +19 P 0.460 +20 N 0.457 +21 V 0.442 +22 K 0.408 +23 T 0.362 +24 A 0.311 +25 V 0.250 +26 P 0.186 +27 L 0.137 +28 S 0.115 +29 L 0.108 +30 E 0.105 +31 S 0.102 +32 Y 0.104 +33 H 0.108 +34 I 0.110 +35 S 0.104 +36 E 0.092 +37 E 0.080 +38 Y 0.075 +39 G 0.083 +40 F 0.099 +41 L 0.116 +42 L 0.121 +43 P 0.115 +44 D 0.104 +45 S 0.093 +46 L 0.083 +47 K 0.074 +48 E 0.069 +49 L 0.065 +50 P 0.059 +51 D 0.053 +52 H 0.046 +53 Y 0.040 +54 R 0.037 +55 P 0.039 +56 W 0.046 +57 M 0.058 +58 E 0.065 +59 I 0.063 +60 A 0.056 +61 N 0.052 +62 K 0.051 +63 L 0.054 +64 P 0.061 +65 Q 0.067 +66 L 0.070 +67 I 0.077 +68 D 0.088 +69 A 0.093 +70 H 0.088 +71 Q 0.081 +72 L 0.082 +73 Q 0.088 +74 A 0.097 +75 H 0.104 +76 V 0.107 +77 D 0.111 +78 K 0.117 +79 M 0.118 +80 P 0.109 +81 L 0.091 +82 L 0.074 +83 S 0.063 +84 C 0.058 +85 Q 0.059 +86 F 0.065 +87 L 0.070 +88 K 0.071 +89 G 0.066 +90 H 0.057 +91 R 0.049 +92 E 0.044 +93 Q 0.041 +94 R 0.043 +95 L 0.047 +96 A 0.052 +97 H 0.055 +98 L 0.059 +99 V 0.063 +100 L 0.065 +101 S 0.064 +102 F 0.066 +103 L 0.072 +104 T 0.074 +105 M 0.073 +106 G 0.076 +107 Y 0.080 +108 V 0.079 +109 W 0.076 +110 Q 0.084 +111 E 0.106 +112 G 0.133 +113 E 0.156 +114 A 0.168 +115 Q 0.167 +116 P 0.156 +117 A 0.142 +118 E 0.134 +119 V 0.131 +120 L 0.127 +121 P 0.116 +122 R 0.101 +123 N 0.084 +124 L 0.069 +125 A 0.064 +126 L 0.066 +127 P 0.070 +128 F 0.071 +129 V 0.073 +130 E 0.077 +131 V 0.085 +132 S 0.102 +133 R 0.127 +134 N 0.154 +135 L 0.174 +136 G 0.177 +137 L 0.160 +138 P 0.129 +139 P 0.101 +140 I 0.091 +141 L 0.103 +142 V 0.127 +143 H 0.148 +144 S 0.159 +145 D 0.157 +146 L 0.146 +147 V 0.129 +148 L 0.112 +149 T 0.102 +150 N 0.095 +151 W 0.090 +152 T 0.092 +153 K 0.107 +154 K 0.129 +155 D 0.150 +156 P 0.172 +157 D 0.193 +158 G 0.203 +159 F 0.196 +160 L 0.180 +161 E 0.169 +162 I 0.168 +163 G 0.165 +164 N 0.151 +165 L 0.131 +166 E 0.118 +167 T 0.112 +168 I 0.109 +169 I 0.109 +170 S 0.119 +171 F 0.139 +172 P 0.160 +173 G 0.173 +174 G 0.177 +175 E 0.171 +176 S 0.158 +177 L 0.147 +178 H 0.144 +179 G 0.148 +180 F 0.149 +181 I 0.147 +182 L 0.146 +183 V 0.152 +184 T 0.166 +185 A 0.185 +186 L 0.197 +187 V 0.189 +188 E 0.165 +189 K 0.141 +190 E 0.125 +191 A 0.114 +192 V 0.101 +193 P 0.086 +194 G 0.072 +195 I 0.062 +196 K 0.054 +197 A 0.048 +198 L 0.047 +199 V 0.047 +200 Q 0.047 +201 A 0.051 +202 T 0.057 +203 N 0.059 +204 A 0.057 +205 I 0.053 +206 L 0.052 +207 Q 0.055 +208 P 0.058 +209 N 0.059 +210 Q 0.055 +211 E 0.051 +212 A 0.053 +213 L 0.061 +214 L 0.071 +215 Q 0.074 +216 A 0.068 +217 L 0.059 +218 Q 0.057 +219 R 0.063 +220 L 0.075 +221 R 0.087 +222 L 0.097 +223 S 0.101 +224 I 0.099 +225 Q 0.096 +226 D 0.096 +227 I 0.098 +228 T 0.099 +229 K 0.099 +230 T 0.095 +231 L 0.089 +232 G 0.084 +233 Q 0.081 +234 M 0.077 +235 H 0.073 +236 D 0.072 +237 Y 0.077 +238 V 0.082 +239 D 0.082 +240 P 0.076 +241 D 0.064 +242 I 0.050 +243 F 0.040 +244 Y 0.037 +245 A 0.038 +246 G 0.040 +247 I 0.040 +248 R 0.043 +249 I 0.052 +250 F 0.067 +251 L 0.086 +252 S 0.110 +253 G 0.140 +254 W 0.172 +255 K 0.198 +256 D 0.206 +257 N 0.201 +258 P 0.192 +259 A 0.189 +260 M 0.195 +261 P 0.204 +262 A 0.202 +263 G 0.182 +264 L 0.152 +265 M 0.128 +266 Y 0.121 +267 E 0.127 +268 G 0.134 +269 V 0.136 +270 S 0.142 +271 Q 0.162 +272 E 0.198 +273 P 0.236 +274 L 0.267 +275 K 0.285 +276 Y 0.297 +277 S 0.311 +278 G 0.335 +279 G 0.358 +280 S 0.366 +281 A 0.349 +282 A 0.307 +283 Q 0.265 +284 S 0.246 +285 T 0.244 +286 V 0.245 +287 L 0.252 +288 H 0.260 +289 A 0.249 +290 F 0.215 +291 D 0.180 +292 E 0.158 +293 F 0.146 +294 L 0.141 +295 G 0.142 +296 I 0.146 +297 R 0.150 +298 H 0.150 +299 S 0.144 +300 K 0.133 +301 E 0.124 +302 S 0.119 +303 G 0.115 +304 D 0.112 +305 F 0.109 +306 L 0.108 +307 Y 0.111 +308 R 0.113 +309 M 0.108 +310 R 0.097 +311 D 0.083 +312 Y 0.075 +313 M 0.075 +314 P 0.084 +315 P 0.097 +316 S 0.107 +317 H 0.110 +318 K 0.107 +319 A 0.102 +320 F 0.096 +321 I 0.091 +322 E 0.090 +323 D 0.095 +324 I 0.103 +325 H 0.111 +326 S 0.113 +327 A 0.102 +328 P 0.079 +329 S 0.057 +330 L 0.045 +331 R 0.043 +332 D 0.045 +333 Y 0.050 +334 I 0.058 +335 L 0.069 +336 S 0.082 +337 S 0.092 +338 G 0.094 +339 Q 0.087 +340 D 0.078 +341 H 0.072 +342 L 0.074 +343 L 0.079 +344 T 0.081 +345 A 0.076 +346 Y 0.070 +347 N 0.066 +348 Q 0.065 +349 C 0.067 +350 V 0.074 +351 Q 0.081 +352 A 0.086 +353 L 0.087 +354 A 0.087 +355 E 0.087 +356 L 0.086 +357 R 0.082 +358 S 0.079 +359 Y 0.077 +360 H 0.072 +361 I 0.061 +362 T 0.051 +363 M 0.045 +364 V 0.042 +365 T 0.041 +366 K 0.042 +367 Y 0.048 +368 L 0.060 +369 I 0.077 +370 T 0.102 +371 A 0.139 +372 A 0.183 +373 A 0.226 +374 K 0.267 +375 A 0.314 +376 K 0.370 +377 H 0.425 +378 G 0.465 +379 K 0.482 +380 P 0.476 +381 N 0.455 +382 H 0.430 +383 L 0.404 +384 P 0.380 +385 G 0.362 +386 P 0.355 +387 P 0.349 +388 Q 0.334 +389 A 0.310 +390 L 0.286 +391 K 0.266 +392 D 0.252 +393 R 0.237 +394 G 0.214 +395 T 0.190 +396 G 0.179 +397 G 0.179 +398 T 0.173 +399 A 0.156 +400 V 0.133 +401 M 0.112 +402 S 0.098 +403 F 0.093 +404 L 0.093 +405 K 0.094 +406 S 0.092 +407 V 0.094 +408 R 0.100 +409 D 0.106 +410 K 0.111 +411 T 0.116 +412 L 0.123 +413 E 0.128 +414 S 0.136 +415 I 0.161 +416 L 0.210 +417 H 0.268 +418 P 0.310 +419 R 0.323 +420 G 0.320 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000188710.3_ENST00000623824.2_GN:QRFP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000188710.3_ENST00000623824.2_GN:QRFP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ce10a05bb30a6addbf87d3df675ac342499c3611 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000188710.3_ENST00000623824.2_GN:QRFP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,137 @@ +>ENSG00000188710.3|ENST00000623824.2|GN:QRFP|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.401 +2 V 0.418 +3 R 0.441 +4 P 0.459 +5 Y 0.455 +6 P 0.423 +7 L 0.388 +8 I 0.373 +9 Y 0.370 +10 F 0.377 +11 L 0.418 +12 F 0.495 +13 L 0.578 +14 P 0.639 +15 L 0.671 +16 G 0.672 +17 A 0.646 +18 C 0.620 +19 F 0.626 +20 P 0.658 +21 L 0.686 +22 L 0.698 +23 D 0.702 +24 R 0.706 +25 R 0.713 +26 E 0.726 +27 P 0.746 +28 T 0.770 +29 D 0.792 +30 A 0.806 +31 M 0.811 +32 G 0.812 +33 G 0.808 +34 L 0.795 +35 G 0.774 +36 A 0.746 +37 G 0.704 +38 E 0.654 +39 R 0.619 +40 W 0.616 +41 A 0.638 +42 D 0.662 +43 L 0.666 +44 A 0.642 +45 M 0.603 +46 G 0.583 +47 P 0.599 +48 R 0.635 +49 P 0.668 +50 H 0.692 +51 S 0.708 +52 V 0.709 +53 W 0.696 +54 G 0.686 +55 S 0.687 +56 S 0.685 +57 R 0.675 +58 W 0.669 +59 L 0.668 +60 R 0.665 +61 A 0.658 +62 S 0.656 +63 Q 0.659 +64 P 0.658 +65 Q 0.635 +66 A 0.589 +67 L 0.546 +68 L 0.527 +69 V 0.523 +70 I 0.510 +71 A 0.487 +72 R 0.470 +73 G 0.477 +74 L 0.511 +75 Q 0.552 +76 T 0.579 +77 S 0.578 +78 G 0.551 +79 R 0.502 +80 E 0.452 +81 H 0.420 +82 A 0.419 +83 G 0.438 +84 C 0.456 +85 R 0.462 +86 F 0.464 +87 R 0.474 +88 F 0.506 +89 G 0.565 +90 R 0.632 +91 Q 0.682 +92 D 0.714 +93 E 0.740 +94 G 0.761 +95 S 0.769 +96 E 0.762 +97 A 0.744 +98 T 0.727 +99 G 0.719 +100 F 0.721 +101 L 0.729 +102 P 0.742 +103 A 0.754 +104 A 0.753 +105 G 0.735 +106 E 0.705 +107 K 0.660 +108 T 0.597 +109 S 0.534 +110 G 0.495 +111 P 0.484 +112 L 0.493 +113 G 0.517 +114 N 0.535 +115 L 0.521 +116 A 0.479 +117 E 0.443 +118 E 0.429 +119 L 0.427 +120 N 0.427 +121 G 0.428 +122 Y 0.428 +123 S 0.423 +124 R 0.417 +125 K 0.428 +126 K 0.464 +127 G 0.510 +128 G 0.543 +129 F 0.551 +130 S 0.546 +131 F 0.540 +132 R 0.539 +133 F 0.534 +134 G 0.509 +135 R 0.461 +136 R 0.419 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000188710.3_ENST00000623824.2_GN:QRFP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:33.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000188710.3_ENST00000623824.2_GN:QRFP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:33.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e1233e22bd53ada2404d85da34121266044380e6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000188710.3_ENST00000623824.2_GN:QRFP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:33.caid @@ -0,0 +1,170 @@ +>ENSG00000188710.3|ENST00000623824.2|GN:QRFP|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:33 +1 M 0.466 +2 P 0.521 +3 P 0.602 +4 G 0.674 +5 R 0.715 +6 G 0.719 +7 P 0.686 +8 R 0.635 +9 A 0.607 +10 A 0.621 +11 L 0.629 +12 P 0.602 +13 S 0.575 +14 P 0.582 +15 A 0.603 +16 P 0.631 +17 E 0.679 +18 P 0.732 +19 S 0.761 +20 D 0.772 +21 P 0.785 +22 P 0.809 +23 A 0.833 +24 S 0.845 +25 L 0.848 +26 P 0.851 +27 G 0.854 +28 S 0.852 +29 S 0.847 +30 P 0.847 +31 S 0.852 +32 H 0.854 +33 T 0.843 +34 M 0.813 +35 V 0.765 +36 R 0.709 +37 P 0.657 +38 Y 0.606 +39 P 0.545 +40 L 0.473 +41 I 0.415 +42 Y 0.390 +43 F 0.398 +44 L 0.432 +45 F 0.487 +46 L 0.550 +47 P 0.609 +48 L 0.659 +49 G 0.694 +50 A 0.705 +51 C 0.704 +52 F 0.718 +53 P 0.751 +54 L 0.784 +55 L 0.806 +56 D 0.814 +57 R 0.817 +58 R 0.820 +59 E 0.828 +60 P 0.843 +61 T 0.860 +62 D 0.875 +63 A 0.882 +64 M 0.883 +65 G 0.880 +66 G 0.878 +67 L 0.876 +68 G 0.870 +69 A 0.860 +70 G 0.846 +71 E 0.832 +72 R 0.823 +73 W 0.823 +74 A 0.830 +75 D 0.834 +76 L 0.829 +77 A 0.813 +78 M 0.793 +79 G 0.782 +80 P 0.788 +81 R 0.806 +82 P 0.824 +83 H 0.835 +84 S 0.837 +85 V 0.833 +86 W 0.826 +87 G 0.821 +88 S 0.814 +89 S 0.800 +90 R 0.789 +91 W 0.791 +92 L 0.804 +93 R 0.816 +94 A 0.810 +95 S 0.788 +96 Q 0.760 +97 P 0.734 +98 Q 0.705 +99 A 0.674 +100 L 0.658 +101 L 0.672 +102 V 0.705 +103 I 0.728 +104 A 0.729 +105 R 0.723 +106 G 0.727 +107 L 0.744 +108 Q 0.762 +109 T 0.773 +110 S 0.775 +111 G 0.765 +112 R 0.742 +113 E 0.714 +114 H 0.694 +115 A 0.694 +116 G 0.707 +117 C 0.719 +118 R 0.722 +119 F 0.722 +120 R 0.732 +121 F 0.751 +122 G 0.774 +123 R 0.795 +124 Q 0.809 +125 D 0.820 +126 E 0.828 +127 G 0.836 +128 S 0.842 +129 E 0.844 +130 A 0.841 +131 T 0.836 +132 G 0.832 +133 F 0.829 +134 L 0.832 +135 P 0.841 +136 A 0.853 +137 A 0.857 +138 G 0.848 +139 E 0.828 +140 K 0.795 +141 T 0.746 +142 S 0.698 +143 G 0.673 +144 P 0.673 +145 L 0.680 +146 G 0.685 +147 N 0.681 +148 L 0.655 +149 A 0.612 +150 E 0.578 +151 E 0.563 +152 L 0.563 +153 N 0.576 +154 G 0.602 +155 Y 0.631 +156 S 0.643 +157 R 0.633 +158 K 0.618 +159 K 0.620 +160 G 0.639 +161 G 0.663 +162 F 0.682 +163 S 0.693 +164 F 0.701 +165 R 0.705 +166 F 0.695 +167 G 0.650 +168 R 0.577 +169 R 0.517 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000188784.4_ENST00000375116.3_GN:PLA2G2E_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000188784.4_ENST00000375116.3_GN:PLA2G2E_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e33551554f4150c6fc3411b41a18a8d29a45b04e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000188784.4_ENST00000375116.3_GN:PLA2G2E_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,143 @@ +>ENSG00000188784.4|ENST00000375116.3|GN:PLA2G2E|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.375 +2 K 0.373 +3 S 0.368 +4 P 0.352 +5 H 0.320 +6 V 0.283 +7 L 0.257 +8 V 0.250 +9 F 0.249 +10 L 0.248 +11 C 0.251 +12 L 0.266 +13 L 0.287 +14 V 0.303 +15 A 0.310 +16 L 0.312 +17 V 0.306 +18 T 0.285 +19 G 0.243 +20 N 0.187 +21 L 0.132 +22 V 0.095 +23 Q 0.082 +24 F 0.087 +25 G 0.097 +26 V 0.099 +27 M 0.089 +28 I 0.076 +29 E 0.070 +30 K 0.073 +31 M 0.080 +32 T 0.086 +33 G 0.087 +34 K 0.090 +35 S 0.098 +36 A 0.108 +37 L 0.117 +38 Q 0.126 +39 Y 0.134 +40 N 0.136 +41 D 0.126 +42 Y 0.106 +43 G 0.084 +44 C 0.073 +45 Y 0.080 +46 C 0.107 +47 G 0.148 +48 I 0.194 +49 G 0.229 +50 G 0.239 +51 S 0.230 +52 H 0.220 +53 W 0.217 +54 P 0.214 +55 V 0.204 +56 D 0.191 +57 Q 0.178 +58 T 0.169 +59 D 0.155 +60 W 0.128 +61 C 0.103 +62 C 0.096 +63 H 0.102 +64 A 0.105 +65 H 0.098 +66 D 0.085 +67 C 0.071 +68 C 0.064 +69 Y 0.067 +70 G 0.077 +71 R 0.088 +72 L 0.094 +73 E 0.094 +74 K 0.095 +75 L 0.102 +76 G 0.112 +77 C 0.117 +78 E 0.115 +79 P 0.112 +80 K 0.112 +81 L 0.115 +82 E 0.112 +83 K 0.102 +84 Y 0.088 +85 L 0.073 +86 F 0.061 +87 S 0.053 +88 V 0.051 +89 S 0.055 +90 E 0.063 +91 R 0.069 +92 G 0.071 +93 I 0.071 +94 F 0.076 +95 C 0.089 +96 A 0.103 +97 G 0.111 +98 R 0.109 +99 T 0.100 +100 T 0.092 +101 C 0.091 +102 Q 0.095 +103 R 0.098 +104 L 0.095 +105 T 0.086 +106 C 0.075 +107 E 0.072 +108 C 0.077 +109 D 0.082 +110 K 0.080 +111 R 0.074 +112 A 0.070 +113 A 0.068 +114 L 0.064 +115 C 0.061 +116 F 0.058 +117 R 0.058 +118 R 0.059 +119 N 0.062 +120 L 0.068 +121 G 0.075 +122 T 0.077 +123 Y 0.072 +124 N 0.067 +125 R 0.066 +126 K 0.070 +127 Y 0.077 +128 A 0.085 +129 H 0.093 +130 Y 0.098 +131 P 0.100 +132 N 0.100 +133 K 0.101 +134 L 0.102 +135 C 0.108 +136 T 0.124 +137 G 0.147 +138 P 0.166 +139 T 0.169 +140 P 0.159 +141 P 0.146 +142 C 0.140 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000188784.4_ENST00000375116.3_GN:PLA2G2E_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000188784.4_ENST00000375116.3_GN:PLA2G2E_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..15344deddfbcd9c84c2806996e01650eaeecd217 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000188784.4_ENST00000375116.3_GN:PLA2G2E_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid @@ -0,0 +1,155 @@ +>ENSG00000188784.4|ENST00000375116.3|GN:PLA2G2E|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:12 +1 M 0.373 +2 L 0.395 +3 L 0.423 +4 V 0.444 +5 H 0.454 +6 L 0.464 +7 P 0.481 +8 S 0.507 +9 P 0.537 +10 Q 0.562 +11 P 0.573 +12 G 0.563 +13 M 0.531 +14 K 0.488 +15 S 0.443 +16 P 0.394 +17 H 0.341 +18 V 0.292 +19 L 0.255 +20 V 0.240 +21 F 0.244 +22 L 0.255 +23 C 0.264 +24 L 0.276 +25 L 0.291 +26 V 0.300 +27 A 0.303 +28 L 0.303 +29 V 0.297 +30 T 0.277 +31 G 0.238 +32 N 0.184 +33 L 0.130 +34 V 0.094 +35 Q 0.081 +36 F 0.085 +37 G 0.094 +38 V 0.096 +39 M 0.086 +40 I 0.074 +41 E 0.068 +42 K 0.071 +43 M 0.079 +44 T 0.085 +45 G 0.086 +46 K 0.089 +47 S 0.097 +48 A 0.107 +49 L 0.116 +50 Q 0.125 +51 Y 0.133 +52 N 0.135 +53 D 0.125 +54 Y 0.105 +55 G 0.084 +56 C 0.071 +57 Y 0.078 +58 C 0.104 +59 G 0.146 +60 I 0.191 +61 G 0.226 +62 G 0.236 +63 S 0.225 +64 H 0.214 +65 W 0.210 +66 P 0.207 +67 V 0.198 +68 D 0.186 +69 Q 0.174 +70 T 0.166 +71 D 0.152 +72 W 0.125 +73 C 0.100 +74 C 0.093 +75 H 0.100 +76 A 0.103 +77 H 0.096 +78 D 0.083 +79 C 0.070 +80 C 0.063 +81 Y 0.067 +82 G 0.077 +83 R 0.087 +84 L 0.093 +85 E 0.092 +86 K 0.093 +87 L 0.100 +88 G 0.110 +89 C 0.115 +90 E 0.113 +91 P 0.109 +92 K 0.110 +93 L 0.111 +94 E 0.109 +95 K 0.099 +96 Y 0.086 +97 L 0.072 +98 F 0.060 +99 S 0.052 +100 V 0.050 +101 S 0.054 +102 E 0.062 +103 R 0.069 +104 G 0.071 +105 I 0.071 +106 F 0.077 +107 C 0.089 +108 A 0.103 +109 G 0.111 +110 R 0.109 +111 T 0.100 +112 T 0.092 +113 C 0.092 +114 Q 0.096 +115 R 0.099 +116 L 0.097 +117 T 0.087 +118 C 0.076 +119 E 0.072 +120 C 0.077 +121 D 0.082 +122 K 0.080 +123 R 0.074 +124 A 0.070 +125 A 0.068 +126 L 0.065 +127 C 0.061 +128 F 0.059 +129 R 0.058 +130 R 0.059 +131 N 0.063 +132 L 0.069 +133 G 0.075 +134 T 0.077 +135 Y 0.072 +136 N 0.067 +137 R 0.066 +138 K 0.070 +139 Y 0.078 +140 A 0.086 +141 H 0.093 +142 Y 0.098 +143 P 0.099 +144 N 0.099 +145 K 0.100 +146 L 0.102 +147 C 0.108 +148 T 0.124 +149 G 0.149 +150 P 0.168 +151 T 0.172 +152 P 0.161 +153 P 0.148 +154 C 0.141 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000188937.8_ENST00000378220.3_GN:NYX_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000188937.8_ENST00000378220.3_GN:NYX_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f24e25915148a9a60e71822f7c2072441df43395 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000188937.8_ENST00000378220.3_GN:NYX_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,477 @@ +>ENSG00000188937.8|ENST00000378220.3|GN:NYX|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.250 +2 L 0.245 +3 V 0.245 +4 L 0.252 +5 L 0.253 +6 L 0.251 +7 H 0.268 +8 A 0.306 +9 V 0.339 +10 V 0.356 +11 L 0.374 +12 G 0.407 +13 L 0.457 +14 P 0.512 +15 S 0.554 +16 A 0.573 +17 W 0.580 +18 A 0.585 +19 V 0.575 +20 G 0.537 +21 A 0.471 +22 C 0.392 +23 A 0.315 +24 R 0.245 +25 A 0.181 +26 C 0.127 +27 P 0.087 +28 A 0.062 +29 A 0.049 +30 C 0.046 +31 A 0.055 +32 C 0.071 +33 S 0.090 +34 T 0.107 +35 V 0.116 +36 E 0.114 +37 R 0.104 +38 G 0.090 +39 C 0.077 +40 S 0.069 +41 V 0.070 +42 R 0.078 +43 C 0.091 +44 D 0.105 +45 R 0.112 +46 A 0.112 +47 G 0.109 +48 L 0.106 +49 L 0.103 +50 R 0.101 +51 V 0.100 +52 P 0.101 +53 A 0.104 +54 E 0.102 +55 L 0.094 +56 P 0.084 +57 C 0.081 +58 E 0.084 +59 A 0.089 +60 V 0.098 +61 S 0.115 +62 I 0.138 +63 D 0.161 +64 L 0.174 +65 D 0.169 +66 R 0.148 +67 N 0.125 +68 G 0.112 +69 L 0.113 +70 R 0.129 +71 F 0.161 +72 L 0.193 +73 G 0.204 +74 E 0.190 +75 R 0.157 +76 A 0.124 +77 F 0.102 +78 G 0.089 +79 T 0.081 +80 L 0.075 +81 P 0.071 +82 S 0.070 +83 L 0.073 +84 R 0.083 +85 R 0.097 +86 L 0.113 +87 S 0.132 +88 L 0.149 +89 R 0.154 +90 H 0.140 +91 N 0.115 +92 N 0.100 +93 L 0.102 +94 S 0.123 +95 F 0.151 +96 I 0.172 +97 T 0.178 +98 P 0.172 +99 G 0.153 +100 A 0.121 +101 F 0.092 +102 K 0.075 +103 G 0.072 +104 L 0.078 +105 P 0.087 +106 R 0.093 +107 L 0.096 +108 A 0.105 +109 E 0.117 +110 L 0.129 +111 R 0.140 +112 L 0.149 +113 A 0.151 +114 H 0.142 +115 N 0.126 +116 G 0.113 +117 D 0.104 +118 L 0.098 +119 R 0.099 +120 Y 0.108 +121 L 0.116 +122 H 0.115 +123 A 0.107 +124 R 0.093 +125 T 0.077 +126 F 0.064 +127 A 0.057 +128 A 0.054 +129 L 0.057 +130 S 0.066 +131 R 0.074 +132 L 0.079 +133 R 0.086 +134 R 0.095 +135 L 0.104 +136 D 0.113 +137 L 0.125 +138 A 0.135 +139 A 0.134 +140 C 0.118 +141 R 0.101 +142 L 0.092 +143 F 0.098 +144 S 0.117 +145 V 0.136 +146 P 0.140 +147 E 0.131 +148 R 0.117 +149 L 0.101 +150 L 0.088 +151 A 0.079 +152 E 0.075 +153 L 0.074 +154 P 0.075 +155 A 0.074 +156 L 0.076 +157 R 0.087 +158 E 0.106 +159 L 0.124 +160 A 0.138 +161 A 0.145 +162 F 0.145 +163 D 0.133 +164 N 0.112 +165 L 0.092 +166 F 0.085 +167 R 0.088 +168 R 0.096 +169 V 0.105 +170 P 0.115 +171 G 0.124 +172 A 0.128 +173 L 0.125 +174 R 0.116 +175 G 0.108 +176 L 0.108 +177 A 0.114 +178 N 0.113 +179 L 0.104 +180 T 0.102 +181 H 0.115 +182 A 0.132 +183 H 0.146 +184 L 0.155 +185 E 0.156 +186 R 0.143 +187 G 0.124 +188 R 0.112 +189 I 0.112 +190 E 0.125 +191 A 0.140 +192 V 0.147 +193 A 0.140 +194 S 0.124 +195 S 0.104 +196 S 0.085 +197 L 0.078 +198 Q 0.081 +199 G 0.086 +200 L 0.092 +201 R 0.096 +202 R 0.096 +203 L 0.092 +204 R 0.091 +205 S 0.099 +206 L 0.113 +207 S 0.133 +208 L 0.154 +209 Q 0.161 +210 A 0.144 +211 N 0.116 +212 R 0.096 +213 V 0.096 +214 R 0.114 +215 A 0.142 +216 V 0.161 +217 H 0.165 +218 A 0.157 +219 G 0.139 +220 A 0.113 +221 F 0.088 +222 G 0.069 +223 D 0.058 +224 C 0.054 +225 G 0.057 +226 V 0.066 +227 L 0.085 +228 E 0.112 +229 H 0.135 +230 L 0.145 +231 L 0.144 +232 L 0.143 +233 N 0.142 +234 D 0.137 +235 N 0.125 +236 L 0.119 +237 L 0.122 +238 A 0.133 +239 E 0.152 +240 L 0.168 +241 P 0.167 +242 A 0.148 +243 D 0.123 +244 A 0.100 +245 F 0.086 +246 R 0.082 +247 G 0.085 +248 L 0.095 +249 R 0.109 +250 R 0.118 +251 L 0.118 +252 R 0.117 +253 T 0.123 +254 L 0.132 +255 N 0.140 +256 L 0.143 +257 G 0.137 +258 G 0.122 +259 N 0.102 +260 A 0.084 +261 L 0.076 +262 D 0.075 +263 R 0.077 +264 V 0.078 +265 A 0.080 +266 R 0.078 +267 A 0.068 +268 W 0.056 +269 F 0.051 +270 A 0.055 +271 D 0.063 +272 L 0.074 +273 A 0.089 +274 E 0.101 +275 L 0.110 +276 E 0.118 +277 L 0.126 +278 L 0.132 +279 Y 0.137 +280 L 0.140 +281 D 0.139 +282 R 0.129 +283 N 0.117 +284 S 0.113 +285 I 0.125 +286 A 0.151 +287 F 0.181 +288 V 0.197 +289 E 0.197 +290 E 0.189 +291 G 0.173 +292 A 0.149 +293 F 0.130 +294 Q 0.124 +295 N 0.128 +296 L 0.138 +297 S 0.151 +298 G 0.162 +299 L 0.164 +300 L 0.161 +301 A 0.161 +302 L 0.164 +303 H 0.167 +304 L 0.168 +305 N 0.160 +306 G 0.142 +307 N 0.120 +308 R 0.104 +309 L 0.100 +310 T 0.110 +311 V 0.126 +312 L 0.131 +313 A 0.117 +314 W 0.097 +315 V 0.084 +316 A 0.081 +317 F 0.092 +318 Q 0.112 +319 P 0.127 +320 G 0.125 +321 F 0.119 +322 F 0.126 +323 L 0.148 +324 G 0.174 +325 R 0.191 +326 L 0.199 +327 F 0.207 +328 L 0.215 +329 F 0.210 +330 R 0.180 +331 N 0.135 +332 P 0.094 +333 W 0.067 +334 C 0.055 +335 C 0.055 +336 D 0.063 +337 C 0.075 +338 R 0.080 +339 L 0.072 +340 E 0.057 +341 W 0.047 +342 L 0.049 +343 R 0.058 +344 D 0.067 +345 W 0.070 +346 M 0.075 +347 E 0.087 +348 G 0.101 +349 S 0.110 +350 G 0.109 +351 R 0.102 +352 V 0.093 +353 T 0.089 +354 D 0.090 +355 V 0.091 +356 P 0.086 +357 C 0.075 +358 A 0.065 +359 S 0.065 +360 P 0.077 +361 G 0.091 +362 S 0.097 +363 V 0.096 +364 A 0.094 +365 G 0.094 +366 L 0.095 +367 D 0.095 +368 L 0.093 +369 S 0.097 +370 Q 0.111 +371 V 0.139 +372 T 0.177 +373 F 0.228 +374 G 0.282 +375 R 0.319 +376 S 0.327 +377 S 0.313 +378 D 0.288 +379 G 0.262 +380 L 0.244 +381 C 0.246 +382 V 0.276 +383 D 0.330 +384 P 0.393 +385 E 0.453 +386 E 0.507 +387 L 0.555 +388 N 0.599 +389 L 0.638 +390 T 0.665 +391 T 0.672 +392 S 0.665 +393 S 0.657 +394 P 0.654 +395 G 0.652 +396 P 0.650 +397 S 0.650 +398 P 0.659 +399 E 0.678 +400 P 0.697 +401 A 0.704 +402 A 0.692 +403 T 0.665 +404 T 0.630 +405 V 0.588 +406 S 0.532 +407 R 0.463 +408 F 0.393 +409 S 0.334 +410 S 0.302 +411 L 0.300 +412 L 0.318 +413 S 0.338 +414 K 0.361 +415 L 0.402 +416 L 0.467 +417 A 0.542 +418 P 0.609 +419 R 0.658 +420 V 0.691 +421 P 0.708 +422 V 0.707 +423 E 0.691 +424 E 0.683 +425 A 0.705 +426 A 0.739 +427 N 0.762 +428 T 0.773 +429 T 0.781 +430 G 0.786 +431 G 0.783 +432 L 0.761 +433 A 0.711 +434 N 0.639 +435 A 0.578 +436 S 0.538 +437 L 0.486 +438 S 0.431 +439 D 0.430 +440 S 0.477 +441 L 0.516 +442 S 0.544 +443 S 0.598 +444 R 0.668 +445 G 0.718 +446 V 0.740 +447 G 0.746 +448 G 0.741 +449 A 0.726 +450 G 0.700 +451 R 0.670 +452 Q 0.648 +453 P 0.641 +454 W 0.649 +455 F 0.660 +456 L 0.657 +457 L 0.628 +458 A 0.580 +459 S 0.535 +460 C 0.516 +461 L 0.529 +462 L 0.557 +463 P 0.584 +464 S 0.593 +465 V 0.559 +466 A 0.488 +467 Q 0.436 +468 H 0.444 +469 V 0.489 +470 V 0.530 +471 F 0.557 +472 G 0.574 +473 L 0.573 +474 Q 0.544 +475 M 0.496 +476 D 0.456 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000188937.8_ENST00000378220.3_GN:NYX_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000188937.8_ENST00000378220.3_GN:NYX_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ad818b0671dadcf52b4c1f3a6049349146602d8d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000188937.8_ENST00000378220.3_GN:NYX_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid @@ -0,0 +1,482 @@ +>ENSG00000188937.8|ENST00000378220.3|GN:NYX|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:5 +1 M 0.377 +2 K 0.397 +3 G 0.425 +4 R 0.432 +5 G 0.392 +6 M 0.325 +7 L 0.273 +8 V 0.247 +9 L 0.235 +10 L 0.239 +11 L 0.268 +12 H 0.301 +13 A 0.320 +14 V 0.337 +15 V 0.364 +16 L 0.397 +17 G 0.437 +18 L 0.490 +19 P 0.546 +20 S 0.583 +21 A 0.594 +22 W 0.595 +23 A 0.593 +24 V 0.574 +25 G 0.528 +26 A 0.462 +27 C 0.388 +28 A 0.315 +29 R 0.244 +30 A 0.179 +31 C 0.126 +32 P 0.087 +33 A 0.062 +34 A 0.048 +35 C 0.047 +36 A 0.055 +37 C 0.072 +38 S 0.090 +39 T 0.107 +40 V 0.117 +41 E 0.115 +42 R 0.103 +43 G 0.088 +44 C 0.075 +45 S 0.068 +46 V 0.069 +47 R 0.076 +48 C 0.089 +49 D 0.102 +50 R 0.109 +51 A 0.109 +52 G 0.107 +53 L 0.104 +54 L 0.101 +55 R 0.099 +56 V 0.098 +57 P 0.099 +58 A 0.101 +59 E 0.100 +60 L 0.092 +61 P 0.082 +62 C 0.079 +63 E 0.082 +64 A 0.088 +65 V 0.097 +66 S 0.113 +67 I 0.134 +68 D 0.156 +69 L 0.169 +70 D 0.165 +71 R 0.144 +72 N 0.122 +73 G 0.110 +74 L 0.111 +75 R 0.127 +76 F 0.158 +77 L 0.190 +78 G 0.202 +79 E 0.187 +80 R 0.154 +81 A 0.121 +82 F 0.098 +83 G 0.086 +84 T 0.078 +85 L 0.072 +86 P 0.069 +87 S 0.068 +88 L 0.071 +89 R 0.082 +90 R 0.096 +91 L 0.113 +92 S 0.131 +93 L 0.149 +94 R 0.154 +95 H 0.139 +96 N 0.115 +97 N 0.099 +98 L 0.101 +99 S 0.122 +100 F 0.150 +101 I 0.170 +102 T 0.176 +103 P 0.170 +104 G 0.151 +105 A 0.120 +106 F 0.091 +107 K 0.076 +108 G 0.073 +109 L 0.079 +110 P 0.088 +111 R 0.095 +112 L 0.099 +113 A 0.107 +114 E 0.120 +115 L 0.132 +116 R 0.143 +117 L 0.153 +118 A 0.156 +119 H 0.147 +120 N 0.130 +121 G 0.117 +122 D 0.108 +123 L 0.102 +124 R 0.104 +125 Y 0.113 +126 L 0.121 +127 H 0.119 +128 A 0.111 +129 R 0.097 +130 T 0.080 +131 F 0.067 +132 A 0.059 +133 A 0.056 +134 L 0.059 +135 S 0.068 +136 R 0.076 +137 L 0.081 +138 R 0.086 +139 R 0.095 +140 L 0.104 +141 D 0.113 +142 L 0.124 +143 A 0.135 +144 A 0.133 +145 C 0.118 +146 R 0.101 +147 L 0.092 +148 F 0.099 +149 S 0.118 +150 V 0.137 +151 P 0.141 +152 E 0.131 +153 R 0.116 +154 L 0.100 +155 L 0.087 +156 A 0.079 +157 E 0.074 +158 L 0.074 +159 P 0.074 +160 A 0.074 +161 L 0.076 +162 R 0.087 +163 E 0.105 +164 L 0.123 +165 A 0.136 +166 A 0.143 +167 F 0.143 +168 D 0.132 +169 N 0.111 +170 L 0.092 +171 F 0.084 +172 R 0.087 +173 R 0.095 +174 V 0.104 +175 P 0.114 +176 G 0.123 +177 A 0.126 +178 L 0.123 +179 R 0.115 +180 G 0.107 +181 L 0.107 +182 A 0.113 +183 N 0.111 +184 L 0.102 +185 T 0.101 +186 H 0.114 +187 A 0.132 +188 H 0.146 +189 L 0.155 +190 E 0.155 +191 R 0.143 +192 G 0.124 +193 R 0.111 +194 I 0.111 +195 E 0.124 +196 A 0.140 +197 V 0.146 +198 A 0.140 +199 S 0.124 +200 S 0.102 +201 S 0.084 +202 L 0.077 +203 Q 0.079 +204 G 0.085 +205 L 0.091 +206 R 0.095 +207 R 0.095 +208 L 0.091 +209 R 0.090 +210 S 0.098 +211 L 0.112 +212 S 0.131 +213 L 0.153 +214 Q 0.160 +215 A 0.145 +216 N 0.116 +217 R 0.096 +218 V 0.095 +219 R 0.113 +220 A 0.140 +221 V 0.160 +222 H 0.164 +223 A 0.157 +224 G 0.139 +225 A 0.113 +226 F 0.087 +227 G 0.069 +228 D 0.057 +229 C 0.053 +230 G 0.057 +231 V 0.066 +232 L 0.085 +233 E 0.111 +234 H 0.134 +235 L 0.144 +236 L 0.144 +237 L 0.142 +238 N 0.142 +239 D 0.136 +240 N 0.125 +241 L 0.118 +242 L 0.121 +243 A 0.132 +244 E 0.151 +245 L 0.168 +246 P 0.167 +247 A 0.148 +248 D 0.123 +249 A 0.100 +250 F 0.087 +251 R 0.083 +252 G 0.086 +253 L 0.096 +254 R 0.110 +255 R 0.119 +256 L 0.119 +257 R 0.119 +258 T 0.124 +259 L 0.134 +260 N 0.142 +261 L 0.144 +262 G 0.138 +263 G 0.123 +264 N 0.103 +265 A 0.085 +266 L 0.077 +267 D 0.077 +268 R 0.079 +269 V 0.081 +270 A 0.082 +271 R 0.080 +272 A 0.071 +273 W 0.058 +274 F 0.054 +275 A 0.057 +276 D 0.065 +277 L 0.077 +278 A 0.092 +279 E 0.104 +280 L 0.113 +281 E 0.120 +282 L 0.128 +283 L 0.134 +284 Y 0.139 +285 L 0.142 +286 D 0.141 +287 R 0.131 +288 N 0.119 +289 S 0.116 +290 I 0.128 +291 A 0.154 +292 F 0.184 +293 V 0.201 +294 E 0.200 +295 E 0.191 +296 G 0.174 +297 A 0.151 +298 F 0.132 +299 Q 0.127 +300 N 0.131 +301 L 0.140 +302 S 0.153 +303 G 0.163 +304 L 0.166 +305 L 0.163 +306 A 0.163 +307 L 0.166 +308 H 0.169 +309 L 0.169 +310 N 0.161 +311 G 0.143 +312 N 0.121 +313 R 0.105 +314 L 0.101 +315 T 0.111 +316 V 0.127 +317 L 0.132 +318 A 0.118 +319 W 0.097 +320 V 0.084 +321 A 0.081 +322 F 0.091 +323 Q 0.112 +324 P 0.126 +325 G 0.125 +326 F 0.119 +327 F 0.125 +328 L 0.148 +329 G 0.173 +330 R 0.190 +331 L 0.199 +332 F 0.206 +333 L 0.214 +334 F 0.209 +335 R 0.179 +336 N 0.133 +337 P 0.092 +338 W 0.066 +339 C 0.054 +340 C 0.054 +341 D 0.063 +342 C 0.074 +343 R 0.079 +344 L 0.071 +345 E 0.056 +346 W 0.045 +347 L 0.043 +348 R 0.047 +349 D 0.052 +350 W 0.058 +351 M 0.069 +352 E 0.084 +353 G 0.100 +354 S 0.109 +355 G 0.108 +356 R 0.101 +357 V 0.093 +358 T 0.088 +359 D 0.089 +360 V 0.091 +361 P 0.085 +362 C 0.074 +363 A 0.065 +364 S 0.065 +365 P 0.077 +366 G 0.091 +367 S 0.097 +368 V 0.096 +369 A 0.094 +370 G 0.094 +371 L 0.096 +372 D 0.095 +373 L 0.094 +374 S 0.097 +375 Q 0.111 +376 V 0.138 +377 T 0.177 +378 F 0.228 +379 G 0.282 +380 R 0.319 +381 S 0.328 +382 S 0.313 +383 D 0.289 +384 G 0.263 +385 L 0.245 +386 C 0.247 +387 V 0.276 +388 D 0.330 +389 P 0.393 +390 E 0.453 +391 E 0.507 +392 L 0.555 +393 N 0.600 +394 L 0.639 +395 T 0.665 +396 T 0.672 +397 S 0.664 +398 S 0.657 +399 P 0.653 +400 G 0.652 +401 P 0.650 +402 S 0.650 +403 P 0.658 +404 E 0.676 +405 P 0.695 +406 A 0.701 +407 A 0.688 +408 T 0.660 +409 T 0.624 +410 V 0.581 +411 S 0.524 +412 R 0.455 +413 F 0.385 +414 S 0.328 +415 S 0.297 +416 L 0.297 +417 L 0.315 +418 S 0.337 +419 K 0.361 +420 L 0.402 +421 L 0.467 +422 A 0.542 +423 P 0.608 +424 R 0.658 +425 V 0.692 +426 P 0.719 +427 V 0.741 +428 E 0.758 +429 E 0.767 +430 A 0.772 +431 A 0.774 +432 N 0.774 +433 T 0.776 +434 T 0.781 +435 G 0.786 +436 G 0.782 +437 L 0.760 +438 A 0.711 +439 N 0.640 +440 A 0.581 +441 S 0.545 +442 L 0.505 +443 S 0.465 +444 D 0.471 +445 S 0.510 +446 L 0.533 +447 S 0.550 +448 S 0.600 +449 R 0.669 +450 G 0.719 +451 V 0.741 +452 G 0.746 +453 G 0.741 +454 A 0.727 +455 G 0.701 +456 R 0.671 +457 Q 0.650 +458 P 0.643 +459 W 0.650 +460 F 0.662 +461 L 0.659 +462 L 0.632 +463 A 0.586 +464 S 0.541 +465 C 0.521 +466 L 0.533 +467 L 0.560 +468 P 0.587 +469 S 0.595 +470 V 0.560 +471 A 0.488 +472 Q 0.436 +473 H 0.444 +474 V 0.491 +475 V 0.533 +476 F 0.561 +477 G 0.579 +478 L 0.578 +479 Q 0.548 +480 M 0.499 +481 D 0.460 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000196240.6_ENST00000641925.2_GN:OR2T2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000196240.6_ENST00000641925.2_GN:OR2T2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..8c3a6d94de8d10ef9f5e50a8dbaa6faf4b8d9a3a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000196240.6_ENST00000641925.2_GN:OR2T2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,325 @@ +>ENSG00000196240.6|ENST00000641925.2|GN:OR2T2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.404 +2 G 0.419 +3 M 0.448 +4 E 0.482 +5 G 0.501 +6 L 0.498 +7 L 0.480 +8 Q 0.452 +9 N 0.405 +10 S 0.335 +11 T 0.255 +12 N 0.192 +13 F 0.158 +14 V 0.146 +15 L 0.144 +16 T 0.148 +17 G 0.157 +18 L 0.171 +19 I 0.191 +20 T 0.213 +21 H 0.221 +22 P 0.201 +23 A 0.161 +24 F 0.122 +25 P 0.092 +26 G 0.071 +27 L 0.056 +28 L 0.048 +29 F 0.044 +30 A 0.042 +31 I 0.042 +32 V 0.042 +33 F 0.042 +34 S 0.041 +35 I 0.041 +36 F 0.041 +37 V 0.043 +38 V 0.050 +39 A 0.055 +40 I 0.056 +41 T 0.056 +42 A 0.061 +43 N 0.067 +44 L 0.072 +45 V 0.073 +46 M 0.070 +47 I 0.063 +48 L 0.059 +49 L 0.059 +50 I 0.062 +51 H 0.066 +52 M 0.072 +53 D 0.078 +54 S 0.079 +55 R 0.074 +56 L 0.066 +57 H 0.059 +58 T 0.053 +59 P 0.045 +60 M 0.037 +61 Y 0.031 +62 F 0.028 +63 L 0.028 +64 L 0.032 +65 S 0.040 +66 Q 0.048 +67 L 0.053 +68 S 0.057 +69 I 0.060 +70 M 0.064 +71 D 0.072 +72 T 0.076 +73 I 0.071 +74 Y 0.060 +75 I 0.052 +76 C 0.048 +77 I 0.050 +78 T 0.055 +79 V 0.059 +80 P 0.058 +81 K 0.054 +82 M 0.052 +83 L 0.050 +84 Q 0.049 +85 D 0.050 +86 L 0.057 +87 L 0.071 +88 S 0.088 +89 K 0.099 +90 D 0.096 +91 K 0.082 +92 T 0.067 +93 I 0.055 +94 S 0.046 +95 F 0.041 +96 L 0.040 +97 G 0.041 +98 C 0.041 +99 A 0.038 +100 V 0.037 +101 Q 0.038 +102 I 0.040 +103 F 0.040 +104 L 0.038 +105 Y 0.034 +106 L 0.031 +107 T 0.031 +108 L 0.035 +109 I 0.039 +110 G 0.043 +111 G 0.045 +112 E 0.044 +113 F 0.040 +114 F 0.036 +115 L 0.034 +116 L 0.033 +117 G 0.033 +118 L 0.033 +119 M 0.033 +120 A 0.035 +121 Y 0.038 +122 D 0.043 +123 R 0.044 +124 Y 0.042 +125 V 0.040 +126 A 0.041 +127 V 0.046 +128 C 0.053 +129 N 0.059 +130 P 0.060 +131 L 0.057 +132 R 0.051 +133 Y 0.049 +134 P 0.050 +135 L 0.056 +136 L 0.063 +137 M 0.066 +138 N 0.066 +139 R 0.068 +140 R 0.067 +141 V 0.061 +142 C 0.057 +143 L 0.061 +144 F 0.068 +145 M 0.066 +146 V 0.058 +147 V 0.055 +148 G 0.059 +149 S 0.063 +150 W 0.065 +151 V 0.068 +152 G 0.074 +153 G 0.077 +154 S 0.078 +155 L 0.082 +156 D 0.086 +157 G 0.085 +158 F 0.082 +159 M 0.085 +160 L 0.094 +161 T 0.099 +162 P 0.098 +163 V 0.096 +164 T 0.094 +165 M 0.095 +166 S 0.101 +167 F 0.106 +168 P 0.106 +169 F 0.103 +170 C 0.105 +171 R 0.114 +172 S 0.127 +173 R 0.141 +174 E 0.151 +175 I 0.148 +176 N 0.129 +177 H 0.104 +178 F 0.082 +179 F 0.068 +180 C 0.064 +181 E 0.072 +182 I 0.090 +183 P 0.109 +184 A 0.121 +185 V 0.127 +186 L 0.132 +187 K 0.135 +188 L 0.132 +189 S 0.121 +190 C 0.113 +191 T 0.116 +192 D 0.121 +193 T 0.117 +194 S 0.105 +195 L 0.093 +196 Y 0.092 +197 E 0.098 +198 T 0.104 +199 L 0.104 +200 M 0.098 +201 Y 0.088 +202 A 0.078 +203 C 0.070 +204 C 0.062 +205 V 0.054 +206 L 0.050 +207 M 0.052 +208 L 0.058 +209 L 0.070 +210 I 0.080 +211 P 0.082 +212 L 0.077 +213 S 0.075 +214 V 0.081 +215 I 0.084 +216 S 0.077 +217 V 0.065 +218 S 0.055 +219 Y 0.050 +220 T 0.050 +221 H 0.055 +222 I 0.064 +223 L 0.073 +224 L 0.080 +225 T 0.080 +226 V 0.078 +227 H 0.081 +228 R 0.096 +229 M 0.119 +230 N 0.139 +231 S 0.144 +232 A 0.133 +233 E 0.113 +234 G 0.092 +235 R 0.076 +236 R 0.068 +237 K 0.069 +238 A 0.072 +239 F 0.074 +240 A 0.077 +241 T 0.081 +242 C 0.084 +243 S 0.086 +244 S 0.087 +245 H 0.084 +246 I 0.077 +247 M 0.070 +248 V 0.066 +249 V 0.059 +250 S 0.047 +251 V 0.035 +252 F 0.029 +253 Y 0.029 +254 G 0.032 +255 A 0.035 +256 A 0.037 +257 F 0.038 +258 Y 0.043 +259 T 0.054 +260 N 0.072 +261 V 0.095 +262 L 0.120 +263 P 0.141 +264 H 0.154 +265 S 0.159 +266 Y 0.160 +267 H 0.156 +268 T 0.142 +269 P 0.123 +270 E 0.109 +271 K 0.101 +272 D 0.096 +273 K 0.092 +274 V 0.088 +275 V 0.082 +276 S 0.074 +277 A 0.066 +278 F 0.066 +279 Y 0.074 +280 T 0.086 +281 I 0.096 +282 L 0.104 +283 T 0.107 +284 P 0.100 +285 M 0.089 +286 L 0.079 +287 N 0.072 +288 P 0.065 +289 L 0.061 +290 I 0.062 +291 Y 0.066 +292 S 0.075 +293 L 0.090 +294 R 0.102 +295 N 0.099 +296 K 0.084 +297 D 0.072 +298 V 0.071 +299 A 0.080 +300 A 0.090 +301 A 0.092 +302 L 0.086 +303 R 0.080 +304 K 0.085 +305 V 0.109 +306 L 0.160 +307 G 0.235 +308 R 0.325 +309 C 0.411 +310 G 0.473 +311 S 0.505 +312 S 0.519 +313 Q 0.523 +314 S 0.512 +315 I 0.487 +316 R 0.456 +317 V 0.421 +318 A 0.386 +319 T 0.376 +320 V 0.399 +321 I 0.421 +322 R 0.413 +323 K 0.389 +324 G 0.371 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000196240.6_ENST00000641925.2_GN:OR2T2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:31.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000196240.6_ENST00000641925.2_GN:OR2T2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:31.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..45f74cfeee7b73f5df9752dfb69edf7f82d64a5f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000196240.6_ENST00000641925.2_GN:OR2T2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:31.caid @@ -0,0 +1,356 @@ +>ENSG00000196240.6|ENST00000641925.2|GN:OR2T2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:31 +1 M 0.234 +2 N 0.217 +3 C 0.193 +4 S 0.175 +5 K 0.167 +6 L 0.169 +7 F 0.182 +8 S 0.213 +9 L 0.257 +10 V 0.299 +11 E 0.333 +12 E 0.353 +13 P 0.352 +14 V 0.329 +15 T 0.301 +16 S 0.282 +17 L 0.273 +18 G 0.268 +19 D 0.263 +20 L 0.259 +21 F 0.270 +22 N 0.300 +23 F 0.340 +24 R 0.370 +25 P 0.378 +26 R 0.369 +27 S 0.351 +28 L 0.333 +29 S 0.317 +30 W 0.311 +31 T 0.327 +32 M 0.364 +33 G 0.408 +34 M 0.446 +35 E 0.474 +36 G 0.489 +37 L 0.487 +38 L 0.471 +39 Q 0.442 +40 N 0.394 +41 S 0.324 +42 T 0.249 +43 N 0.189 +44 F 0.159 +45 V 0.149 +46 L 0.148 +47 T 0.152 +48 G 0.160 +49 L 0.174 +50 I 0.195 +51 T 0.218 +52 H 0.226 +53 P 0.205 +54 A 0.164 +55 F 0.123 +56 P 0.093 +57 G 0.071 +58 L 0.056 +59 L 0.047 +60 F 0.043 +61 A 0.041 +62 I 0.040 +63 V 0.041 +64 F 0.040 +65 S 0.040 +66 I 0.041 +67 F 0.041 +68 V 0.043 +69 V 0.050 +70 A 0.055 +71 I 0.055 +72 T 0.055 +73 A 0.059 +74 N 0.066 +75 L 0.070 +76 V 0.071 +77 M 0.068 +78 I 0.062 +79 L 0.057 +80 L 0.056 +81 I 0.058 +82 H 0.061 +83 M 0.067 +84 D 0.073 +85 S 0.073 +86 R 0.068 +87 L 0.060 +88 H 0.053 +89 T 0.048 +90 P 0.041 +91 M 0.034 +92 Y 0.029 +93 F 0.026 +94 L 0.026 +95 L 0.032 +96 S 0.041 +97 Q 0.049 +98 L 0.054 +99 S 0.058 +100 I 0.061 +101 M 0.064 +102 D 0.071 +103 T 0.076 +104 I 0.071 +105 Y 0.061 +106 I 0.051 +107 C 0.047 +108 I 0.047 +109 T 0.050 +110 V 0.053 +111 P 0.051 +112 K 0.047 +113 M 0.045 +114 L 0.043 +115 Q 0.041 +116 D 0.042 +117 L 0.048 +118 L 0.062 +119 S 0.079 +120 K 0.091 +121 D 0.090 +122 K 0.078 +123 T 0.064 +124 I 0.053 +125 S 0.044 +126 F 0.038 +127 L 0.038 +128 G 0.039 +129 C 0.040 +130 A 0.037 +131 V 0.035 +132 Q 0.036 +133 I 0.037 +134 F 0.038 +135 L 0.036 +136 Y 0.033 +137 L 0.030 +138 T 0.031 +139 L 0.034 +140 I 0.039 +141 G 0.042 +142 G 0.044 +143 E 0.043 +144 F 0.039 +145 F 0.035 +146 L 0.033 +147 L 0.032 +148 G 0.032 +149 L 0.031 +150 M 0.032 +151 A 0.033 +152 Y 0.037 +153 D 0.042 +154 R 0.044 +155 Y 0.042 +156 V 0.040 +157 A 0.041 +158 V 0.045 +159 C 0.052 +160 N 0.058 +161 P 0.060 +162 L 0.056 +163 R 0.051 +164 Y 0.049 +165 P 0.051 +166 L 0.057 +167 L 0.063 +168 M 0.067 +169 N 0.067 +170 R 0.068 +171 R 0.066 +172 V 0.060 +173 C 0.054 +174 L 0.058 +175 F 0.064 +176 M 0.063 +177 V 0.055 +178 V 0.052 +179 G 0.056 +180 S 0.060 +181 W 0.063 +182 V 0.066 +183 G 0.072 +184 G 0.076 +185 S 0.078 +186 L 0.082 +187 D 0.086 +188 G 0.085 +189 F 0.081 +190 M 0.083 +191 L 0.091 +192 T 0.097 +193 P 0.098 +194 V 0.095 +195 T 0.094 +196 M 0.095 +197 S 0.101 +198 F 0.107 +199 P 0.107 +200 F 0.103 +201 C 0.103 +202 R 0.111 +203 S 0.123 +204 R 0.137 +205 E 0.147 +206 I 0.144 +207 N 0.125 +208 H 0.100 +209 F 0.079 +210 F 0.066 +211 C 0.063 +212 E 0.072 +213 I 0.090 +214 P 0.108 +215 A 0.119 +216 V 0.124 +217 L 0.128 +218 K 0.131 +219 L 0.127 +220 S 0.116 +221 C 0.108 +222 T 0.110 +223 D 0.115 +224 T 0.112 +225 S 0.100 +226 L 0.088 +227 Y 0.086 +228 E 0.092 +229 T 0.099 +230 L 0.099 +231 M 0.091 +232 Y 0.081 +233 A 0.073 +234 C 0.066 +235 C 0.059 +236 V 0.052 +237 L 0.049 +238 M 0.051 +239 L 0.057 +240 L 0.067 +241 I 0.077 +242 P 0.079 +243 L 0.075 +244 S 0.073 +245 V 0.080 +246 I 0.084 +247 S 0.077 +248 V 0.064 +249 S 0.054 +250 Y 0.049 +251 T 0.049 +252 H 0.054 +253 I 0.062 +254 L 0.072 +255 L 0.079 +256 T 0.080 +257 V 0.077 +258 H 0.081 +259 R 0.095 +260 M 0.117 +261 N 0.137 +262 S 0.143 +263 A 0.132 +264 E 0.112 +265 G 0.092 +266 R 0.076 +267 R 0.069 +268 K 0.070 +269 A 0.072 +270 F 0.074 +271 A 0.077 +272 T 0.081 +273 C 0.083 +274 S 0.085 +275 S 0.086 +276 H 0.083 +277 I 0.077 +278 M 0.072 +279 V 0.067 +280 V 0.060 +281 S 0.047 +282 V 0.036 +283 F 0.029 +284 Y 0.029 +285 G 0.032 +286 A 0.035 +287 A 0.036 +288 F 0.037 +289 Y 0.041 +290 T 0.050 +291 N 0.066 +292 V 0.090 +293 L 0.119 +294 P 0.144 +295 H 0.160 +296 S 0.167 +297 Y 0.169 +298 H 0.163 +299 T 0.147 +300 P 0.128 +301 E 0.114 +302 K 0.107 +303 D 0.102 +304 K 0.097 +305 V 0.093 +306 V 0.088 +307 S 0.079 +308 A 0.071 +309 F 0.070 +310 Y 0.078 +311 T 0.089 +312 I 0.099 +313 L 0.107 +314 T 0.109 +315 P 0.103 +316 M 0.091 +317 L 0.081 +318 N 0.073 +319 P 0.066 +320 L 0.062 +321 I 0.064 +322 Y 0.067 +323 S 0.075 +324 L 0.089 +325 R 0.101 +326 N 0.099 +327 K 0.085 +328 D 0.072 +329 V 0.070 +330 A 0.079 +331 A 0.089 +332 A 0.091 +333 L 0.086 +334 R 0.081 +335 K 0.086 +336 V 0.110 +337 L 0.162 +338 G 0.238 +339 R 0.329 +340 C 0.417 +341 G 0.481 +342 S 0.516 +343 S 0.532 +344 Q 0.539 +345 S 0.532 +346 I 0.512 +347 R 0.484 +348 V 0.447 +349 A 0.409 +350 T 0.399 +351 V 0.423 +352 I 0.443 +353 R 0.430 +354 K 0.400 +355 G 0.378 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000196248.6_ENST00000641123.1_GN:OR10S1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000196248.6_ENST00000641123.1_GN:OR10S1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7ffd85e759ac8846108a970ee6757d7b912779d6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000196248.6_ENST00000641123.1_GN:OR10S1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,323 @@ +>ENSG00000196248.6|ENST00000641123.1|GN:OR10S1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.361 +2 T 0.374 +3 M 0.401 +4 T 0.436 +5 T 0.465 +6 E 0.484 +7 N 0.495 +8 P 0.495 +9 N 0.475 +10 Q 0.433 +11 T 0.375 +12 V 0.306 +13 V 0.233 +14 S 0.172 +15 H 0.134 +16 F 0.115 +17 F 0.111 +18 L 0.118 +19 E 0.136 +20 G 0.156 +21 L 0.165 +22 R 0.159 +23 Y 0.148 +24 T 0.144 +25 A 0.140 +26 K 0.128 +27 H 0.106 +28 S 0.082 +29 S 0.060 +30 L 0.049 +31 F 0.050 +32 F 0.060 +33 L 0.064 +34 L 0.057 +35 F 0.045 +36 L 0.039 +37 L 0.041 +38 I 0.046 +39 Y 0.050 +40 S 0.052 +41 I 0.054 +42 T 0.057 +43 V 0.057 +44 A 0.058 +45 G 0.062 +46 N 0.067 +47 L 0.069 +48 L 0.069 +49 I 0.065 +50 L 0.060 +51 L 0.061 +52 T 0.070 +53 V 0.085 +54 G 0.100 +55 S 0.108 +56 D 0.106 +57 S 0.098 +58 H 0.092 +59 L 0.087 +60 S 0.079 +61 L 0.067 +62 P 0.051 +63 M 0.038 +64 Y 0.029 +65 H 0.025 +66 F 0.024 +67 L 0.029 +68 G 0.037 +69 H 0.045 +70 L 0.051 +71 S 0.054 +72 F 0.055 +73 L 0.060 +74 D 0.069 +75 A 0.076 +76 C 0.073 +77 L 0.062 +78 S 0.053 +79 T 0.049 +80 V 0.049 +81 T 0.050 +82 V 0.051 +83 P 0.052 +84 K 0.052 +85 V 0.052 +86 M 0.052 +87 A 0.052 +88 G 0.055 +89 L 0.064 +90 L 0.079 +91 T 0.097 +92 L 0.115 +93 D 0.122 +94 G 0.115 +95 K 0.097 +96 V 0.076 +97 I 0.059 +98 S 0.048 +99 F 0.042 +100 E 0.040 +101 G 0.041 +102 C 0.039 +103 A 0.037 +104 V 0.035 +105 Q 0.035 +106 L 0.036 +107 Y 0.035 +108 C 0.033 +109 F 0.029 +110 H 0.026 +111 F 0.026 +112 L 0.029 +113 A 0.032 +114 S 0.036 +115 T 0.039 +116 E 0.039 +117 C 0.036 +118 F 0.031 +119 L 0.028 +120 Y 0.027 +121 T 0.028 +122 V 0.028 +123 M 0.029 +124 A 0.032 +125 Y 0.036 +126 D 0.041 +127 R 0.045 +128 Y 0.045 +129 L 0.045 +130 A 0.046 +131 I 0.051 +132 C 0.057 +133 Q 0.063 +134 P 0.065 +135 L 0.063 +136 H 0.061 +137 Y 0.060 +138 P 0.063 +139 V 0.069 +140 A 0.076 +141 M 0.078 +142 N 0.076 +143 R 0.074 +144 R 0.070 +145 M 0.062 +146 C 0.058 +147 A 0.064 +148 E 0.072 +149 M 0.071 +150 A 0.062 +151 G 0.055 +152 I 0.055 +153 T 0.061 +154 W 0.071 +155 A 0.078 +156 I 0.081 +157 G 0.080 +158 A 0.076 +159 T 0.075 +160 H 0.076 +161 A 0.077 +162 A 0.075 +163 I 0.073 +164 H 0.074 +165 T 0.074 +166 S 0.072 +167 L 0.072 +168 T 0.074 +169 F 0.080 +170 R 0.090 +171 L 0.097 +172 L 0.096 +173 Y 0.091 +174 C 0.091 +175 G 0.100 +176 P 0.114 +177 C 0.129 +178 H 0.140 +179 I 0.139 +180 A 0.121 +181 Y 0.095 +182 F 0.074 +183 F 0.064 +184 C 0.063 +185 D 0.075 +186 I 0.096 +187 P 0.117 +188 P 0.128 +189 V 0.128 +190 L 0.126 +191 K 0.125 +192 L 0.122 +193 A 0.114 +194 C 0.108 +195 T 0.112 +196 D 0.121 +197 T 0.123 +198 T 0.116 +199 I 0.107 +200 N 0.100 +201 E 0.094 +202 L 0.090 +203 V 0.088 +204 M 0.087 +205 L 0.086 +206 A 0.084 +207 S 0.081 +208 I 0.075 +209 G 0.069 +210 I 0.068 +211 V 0.071 +212 A 0.073 +213 A 0.075 +214 G 0.081 +215 C 0.091 +216 L 0.099 +217 I 0.099 +218 L 0.094 +219 I 0.083 +220 V 0.070 +221 I 0.057 +222 S 0.047 +223 Y 0.040 +224 I 0.038 +225 F 0.042 +226 I 0.053 +227 V 0.067 +228 A 0.077 +229 A 0.077 +230 V 0.070 +231 L 0.069 +232 R 0.078 +233 I 0.093 +234 R 0.107 +235 T 0.117 +236 A 0.124 +237 Q 0.125 +238 G 0.119 +239 R 0.109 +240 Q 0.105 +241 R 0.110 +242 A 0.119 +243 F 0.127 +244 S 0.127 +245 P 0.116 +246 C 0.099 +247 T 0.085 +248 A 0.076 +249 Q 0.070 +250 L 0.066 +251 T 0.067 +252 G 0.067 +253 V 0.057 +254 L 0.040 +255 L 0.027 +256 Y 0.023 +257 Y 0.028 +258 V 0.037 +259 P 0.042 +260 P 0.042 +261 V 0.040 +262 C 0.042 +263 I 0.054 +264 Y 0.078 +265 L 0.120 +266 Q 0.176 +267 P 0.233 +268 R 0.276 +269 S 0.300 +270 S 0.308 +271 E 0.301 +272 A 0.282 +273 G 0.255 +274 A 0.222 +275 G 0.186 +276 A 0.150 +277 P 0.117 +278 A 0.093 +279 V 0.080 +280 F 0.081 +281 Y 0.090 +282 T 0.102 +283 I 0.113 +284 V 0.120 +285 T 0.122 +286 P 0.114 +287 M 0.100 +288 L 0.090 +289 N 0.082 +290 P 0.074 +291 F 0.070 +292 I 0.069 +293 Y 0.069 +294 T 0.075 +295 L 0.090 +296 R 0.103 +297 N 0.099 +298 K 0.084 +299 E 0.070 +300 V 0.068 +301 K 0.076 +302 H 0.086 +303 A 0.088 +304 L 0.080 +305 Q 0.070 +306 R 0.064 +307 L 0.065 +308 L 0.080 +309 C 0.122 +310 S 0.190 +311 S 0.262 +312 F 0.317 +313 R 0.357 +314 E 0.390 +315 S 0.411 +316 T 0.412 +317 A 0.415 +318 G 0.434 +319 S 0.453 +320 P 0.446 +321 P 0.420 +322 P 0.398 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000196248.6_ENST00000641123.1_GN:OR10S1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000196248.6_ENST00000641123.1_GN:OR10S1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c8ce7c91d1e36e5e5439200466cc115abff66199 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000196248.6_ENST00000641123.1_GN:OR10S1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid @@ -0,0 +1,353 @@ +>ENSG00000196248.6|ENST00000641123.1|GN:OR10S1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:30 +1 M 0.251 +2 T 0.251 +3 S 0.261 +4 Q 0.280 +5 E 0.289 +6 R 0.282 +7 D 0.270 +8 T 0.262 +9 A 0.258 +10 I 0.252 +11 Y 0.245 +12 S 0.238 +13 I 0.228 +14 N 0.209 +15 V 0.187 +16 S 0.176 +17 F 0.183 +18 V 0.207 +19 A 0.246 +20 K 0.290 +21 G 0.322 +22 M 0.324 +23 T 0.302 +24 S 0.269 +25 R 0.239 +26 S 0.224 +27 V 0.222 +28 C 0.230 +29 E 0.246 +30 K 0.276 +31 M 0.312 +32 T 0.348 +33 M 0.385 +34 T 0.421 +35 T 0.449 +36 E 0.468 +37 N 0.480 +38 P 0.482 +39 N 0.469 +40 Q 0.436 +41 T 0.384 +42 V 0.313 +43 V 0.237 +44 S 0.175 +45 H 0.135 +46 F 0.117 +47 F 0.113 +48 L 0.120 +49 E 0.138 +50 G 0.158 +51 L 0.167 +52 R 0.161 +53 Y 0.151 +54 T 0.145 +55 A 0.142 +56 K 0.130 +57 H 0.107 +58 S 0.082 +59 S 0.060 +60 L 0.049 +61 F 0.051 +62 F 0.061 +63 L 0.065 +64 L 0.057 +65 F 0.045 +66 L 0.039 +67 L 0.040 +68 I 0.045 +69 Y 0.049 +70 S 0.050 +71 I 0.052 +72 T 0.055 +73 V 0.056 +74 A 0.057 +75 G 0.062 +76 N 0.067 +77 L 0.069 +78 L 0.068 +79 I 0.064 +80 L 0.059 +81 L 0.059 +82 T 0.066 +83 V 0.078 +84 G 0.091 +85 S 0.100 +86 D 0.099 +87 S 0.093 +88 H 0.086 +89 L 0.080 +90 S 0.072 +91 L 0.061 +92 P 0.047 +93 M 0.035 +94 Y 0.027 +95 H 0.023 +96 F 0.024 +97 L 0.029 +98 G 0.038 +99 H 0.047 +100 L 0.053 +101 S 0.055 +102 F 0.055 +103 L 0.060 +104 D 0.070 +105 A 0.078 +106 C 0.074 +107 L 0.063 +108 S 0.052 +109 T 0.048 +110 V 0.047 +111 T 0.047 +112 V 0.047 +113 P 0.046 +114 K 0.045 +115 V 0.045 +116 M 0.045 +117 A 0.045 +118 G 0.047 +119 L 0.055 +120 L 0.070 +121 T 0.090 +122 L 0.110 +123 D 0.120 +124 G 0.114 +125 K 0.096 +126 V 0.074 +127 I 0.058 +128 S 0.047 +129 F 0.040 +130 E 0.039 +131 G 0.039 +132 C 0.038 +133 A 0.036 +134 V 0.034 +135 Q 0.034 +136 L 0.035 +137 Y 0.035 +138 C 0.033 +139 F 0.028 +140 H 0.026 +141 F 0.026 +142 L 0.029 +143 A 0.032 +144 S 0.035 +145 T 0.038 +146 E 0.038 +147 C 0.035 +148 F 0.030 +149 L 0.027 +150 Y 0.027 +151 T 0.027 +152 V 0.028 +153 M 0.029 +154 A 0.031 +155 Y 0.036 +156 D 0.041 +157 R 0.045 +158 Y 0.045 +159 L 0.045 +160 A 0.046 +161 I 0.050 +162 C 0.057 +163 Q 0.063 +164 P 0.065 +165 L 0.063 +166 H 0.061 +167 Y 0.061 +168 P 0.064 +169 V 0.070 +170 A 0.077 +171 M 0.080 +172 N 0.078 +173 R 0.075 +174 R 0.070 +175 M 0.061 +176 C 0.057 +177 A 0.063 +178 E 0.071 +179 M 0.070 +180 A 0.061 +181 G 0.054 +182 I 0.051 +183 T 0.051 +184 W 0.053 +185 A 0.056 +186 I 0.063 +187 G 0.070 +188 A 0.073 +189 T 0.074 +190 H 0.076 +191 A 0.077 +192 A 0.075 +193 I 0.074 +194 H 0.075 +195 T 0.074 +196 S 0.073 +197 L 0.073 +198 T 0.074 +199 F 0.079 +200 R 0.088 +201 L 0.095 +202 L 0.092 +203 Y 0.085 +204 C 0.084 +205 G 0.092 +206 P 0.105 +207 C 0.119 +208 H 0.131 +209 I 0.131 +210 A 0.115 +211 Y 0.090 +212 F 0.071 +213 F 0.062 +214 C 0.063 +215 D 0.075 +216 I 0.095 +217 P 0.115 +218 P 0.125 +219 V 0.125 +220 L 0.123 +221 K 0.123 +222 L 0.119 +223 A 0.109 +224 C 0.101 +225 T 0.105 +226 D 0.114 +227 T 0.117 +228 T 0.111 +229 I 0.102 +230 N 0.094 +231 E 0.088 +232 L 0.084 +233 V 0.084 +234 M 0.084 +235 L 0.082 +236 A 0.081 +237 S 0.078 +238 I 0.073 +239 G 0.067 +240 I 0.067 +241 V 0.070 +242 A 0.072 +243 A 0.074 +244 G 0.080 +245 C 0.090 +246 L 0.097 +247 I 0.097 +248 L 0.092 +249 I 0.082 +250 V 0.070 +251 I 0.057 +252 S 0.047 +253 Y 0.040 +254 I 0.038 +255 F 0.042 +256 I 0.053 +257 V 0.067 +258 A 0.078 +259 A 0.077 +260 V 0.070 +261 L 0.069 +262 R 0.077 +263 I 0.091 +264 R 0.105 +265 T 0.116 +266 A 0.123 +267 Q 0.125 +268 G 0.119 +269 R 0.110 +270 Q 0.107 +271 R 0.112 +272 A 0.121 +273 F 0.128 +274 S 0.128 +275 P 0.117 +276 C 0.100 +277 T 0.085 +278 A 0.076 +279 Q 0.069 +280 L 0.065 +281 T 0.066 +282 G 0.066 +283 V 0.056 +284 L 0.040 +285 L 0.027 +286 Y 0.023 +287 Y 0.028 +288 V 0.036 +289 P 0.042 +290 P 0.042 +291 V 0.039 +292 C 0.041 +293 I 0.052 +294 Y 0.076 +295 L 0.119 +296 Q 0.177 +297 P 0.237 +298 R 0.282 +299 S 0.308 +300 S 0.316 +301 E 0.308 +302 A 0.289 +303 G 0.261 +304 A 0.228 +305 G 0.192 +306 A 0.155 +307 P 0.123 +308 A 0.098 +309 V 0.086 +310 F 0.086 +311 Y 0.095 +312 T 0.106 +313 I 0.116 +314 V 0.123 +315 T 0.125 +316 P 0.117 +317 M 0.103 +318 L 0.093 +319 N 0.085 +320 P 0.077 +321 F 0.073 +322 I 0.071 +323 Y 0.071 +324 T 0.077 +325 L 0.092 +326 R 0.105 +327 N 0.101 +328 K 0.085 +329 E 0.071 +330 V 0.069 +331 K 0.076 +332 H 0.086 +333 A 0.088 +334 L 0.080 +335 Q 0.070 +336 R 0.064 +337 L 0.065 +338 L 0.081 +339 C 0.123 +340 S 0.193 +341 S 0.268 +342 F 0.326 +343 R 0.368 +344 E 0.404 +345 S 0.425 +346 T 0.424 +347 A 0.425 +348 G 0.444 +349 S 0.462 +350 P 0.455 +351 P 0.427 +352 P 0.403 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000196666.7_ENST00000538490.3_GN:FAM180B_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000196666.7_ENST00000538490.3_GN:FAM180B_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c8852dcba8091c3e8baf5d5a18d58866d19fd189 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000196666.7_ENST00000538490.3_GN:FAM180B_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,184 @@ +>ENSG00000196666.7|ENST00000538490.3|GN:FAM180B|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.289 +2 A 0.283 +3 A 0.268 +4 T 0.241 +5 L 0.206 +6 Q 0.175 +7 F 0.151 +8 L 0.134 +9 V 0.124 +10 C 0.120 +11 L 0.119 +12 V 0.121 +13 V 0.125 +14 A 0.129 +15 I 0.133 +16 C 0.143 +17 L 0.175 +18 L 0.237 +19 S 0.323 +20 G 0.411 +21 V 0.489 +22 T 0.554 +23 T 0.598 +24 T 0.618 +25 Q 0.628 +26 P 0.646 +27 H 0.671 +28 A 0.689 +29 G 0.693 +30 Q 0.691 +31 P 0.697 +32 M 0.714 +33 D 0.732 +34 S 0.743 +35 T 0.751 +36 S 0.760 +37 V 0.770 +38 G 0.775 +39 G 0.769 +40 G 0.746 +41 L 0.702 +42 Q 0.643 +43 E 0.581 +44 P 0.523 +45 E 0.457 +46 A 0.372 +47 P 0.277 +48 E 0.196 +49 V 0.140 +50 M 0.105 +51 F 0.084 +52 E 0.070 +53 L 0.062 +54 L 0.056 +55 W 0.055 +56 A 0.059 +57 G 0.065 +58 L 0.069 +59 E 0.072 +60 L 0.078 +61 D 0.082 +62 V 0.082 +63 M 0.084 +64 G 0.091 +65 Q 0.098 +66 L 0.101 +67 H 0.102 +68 I 0.105 +69 Q 0.111 +70 D 0.116 +71 E 0.116 +72 E 0.113 +73 L 0.107 +74 A 0.098 +75 S 0.089 +76 T 0.083 +77 H 0.081 +78 P 0.080 +79 G 0.075 +80 R 0.066 +81 R 0.056 +82 L 0.051 +83 R 0.051 +84 L 0.053 +85 L 0.053 +86 L 0.052 +87 Q 0.055 +88 H 0.065 +89 H 0.079 +90 V 0.095 +91 P 0.105 +92 S 0.109 +93 D 0.111 +94 L 0.114 +95 E 0.112 +96 G 0.102 +97 T 0.086 +98 E 0.068 +99 Q 0.053 +100 W 0.046 +101 L 0.045 +102 Q 0.046 +103 Q 0.042 +104 L 0.039 +105 Q 0.042 +106 D 0.049 +107 L 0.055 +108 R 0.061 +109 K 0.071 +110 G 0.081 +111 P 0.087 +112 P 0.086 +113 L 0.078 +114 S 0.067 +115 T 0.057 +116 W 0.050 +117 D 0.046 +118 F 0.041 +119 E 0.036 +120 H 0.033 +121 L 0.033 +122 L 0.035 +123 L 0.035 +124 T 0.033 +125 G 0.029 +126 L 0.023 +127 S 0.018 +128 C 0.016 +129 V 0.018 +130 Y 0.023 +131 R 0.033 +132 L 0.045 +133 H 0.059 +134 A 0.076 +135 A 0.093 +136 S 0.104 +137 E 0.103 +138 A 0.094 +139 E 0.083 +140 E 0.076 +141 R 0.071 +142 G 0.065 +143 R 0.055 +144 W 0.045 +145 A 0.040 +146 Q 0.037 +147 V 0.032 +148 F 0.028 +149 A 0.028 +150 L 0.032 +151 L 0.038 +152 A 0.044 +153 Q 0.047 +154 E 0.047 +155 T 0.046 +156 L 0.044 +157 W 0.044 +158 D 0.045 +159 L 0.051 +160 C 0.063 +161 K 0.088 +162 G 0.127 +163 F 0.172 +164 C 0.211 +165 P 0.236 +166 Q 0.254 +167 D 0.272 +168 R 0.297 +169 P 0.326 +170 P 0.353 +171 S 0.370 +172 L 0.369 +173 G 0.350 +174 S 0.321 +175 W 0.296 +176 A 0.288 +177 S 0.292 +178 I 0.301 +179 L 0.313 +180 D 0.328 +181 P 0.337 +182 F 0.335 +183 P 0.328 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000196666.7_ENST00000538490.3_GN:FAM180B_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:18.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000196666.7_ENST00000538490.3_GN:FAM180B_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:18.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c10036c6b91a5854496abfdf84706f2738cb4478 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000196666.7_ENST00000538490.3_GN:FAM180B_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:18.caid @@ -0,0 +1,202 @@ +>ENSG00000196666.7|ENST00000538490.3|GN:FAM180B|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:18 +1 M 0.296 +2 R 0.296 +3 E 0.301 +4 Q 0.307 +5 R 0.303 +6 T 0.293 +7 A 0.295 +8 E 0.310 +9 Q 0.319 +10 S 0.311 +11 E 0.293 +12 T 0.275 +13 Q 0.258 +14 R 0.244 +15 T 0.237 +16 W 0.232 +17 L 0.231 +18 S 0.235 +19 M 0.235 +20 A 0.225 +21 A 0.212 +22 T 0.205 +23 L 0.204 +24 Q 0.199 +25 F 0.186 +26 L 0.169 +27 V 0.157 +28 C 0.154 +29 L 0.154 +30 V 0.149 +31 V 0.140 +32 A 0.131 +33 I 0.129 +34 C 0.140 +35 L 0.174 +36 L 0.240 +37 S 0.333 +38 G 0.431 +39 V 0.519 +40 T 0.590 +41 T 0.632 +42 T 0.645 +43 Q 0.649 +44 P 0.664 +45 H 0.689 +46 A 0.707 +47 G 0.710 +48 Q 0.708 +49 P 0.713 +50 M 0.728 +51 D 0.743 +52 S 0.754 +53 T 0.763 +54 S 0.774 +55 V 0.787 +56 G 0.793 +57 G 0.789 +58 G 0.768 +59 L 0.728 +60 Q 0.675 +61 E 0.620 +62 P 0.565 +63 E 0.497 +64 A 0.405 +65 P 0.302 +66 E 0.213 +67 V 0.153 +68 M 0.116 +69 F 0.091 +70 E 0.074 +71 L 0.063 +72 L 0.056 +73 W 0.054 +74 A 0.057 +75 G 0.062 +76 L 0.066 +77 E 0.070 +78 L 0.076 +79 D 0.080 +80 V 0.081 +81 M 0.082 +82 G 0.089 +83 Q 0.096 +84 L 0.100 +85 H 0.101 +86 I 0.103 +87 Q 0.108 +88 D 0.112 +89 E 0.112 +90 E 0.109 +91 L 0.105 +92 A 0.096 +93 S 0.086 +94 T 0.078 +95 H 0.074 +96 P 0.071 +97 G 0.066 +98 R 0.058 +99 R 0.050 +100 L 0.047 +101 R 0.048 +102 L 0.050 +103 L 0.049 +104 L 0.048 +105 Q 0.051 +106 H 0.061 +107 H 0.076 +108 V 0.092 +109 P 0.103 +110 S 0.107 +111 D 0.110 +112 L 0.114 +113 E 0.113 +114 G 0.104 +115 T 0.088 +116 E 0.069 +117 Q 0.055 +118 W 0.049 +119 L 0.051 +120 Q 0.052 +121 Q 0.046 +122 L 0.041 +123 Q 0.042 +124 D 0.049 +125 L 0.056 +126 R 0.062 +127 K 0.074 +128 G 0.086 +129 P 0.092 +130 P 0.091 +131 L 0.082 +132 S 0.070 +133 T 0.059 +134 W 0.053 +135 D 0.048 +136 F 0.042 +137 E 0.037 +138 H 0.034 +139 L 0.034 +140 L 0.035 +141 L 0.036 +142 T 0.033 +143 G 0.029 +144 L 0.022 +145 S 0.018 +146 C 0.016 +147 V 0.018 +148 Y 0.025 +149 R 0.036 +150 L 0.049 +151 H 0.065 +152 A 0.084 +153 A 0.103 +154 S 0.114 +155 E 0.112 +156 A 0.101 +157 E 0.090 +158 E 0.083 +159 R 0.077 +160 G 0.069 +161 R 0.058 +162 W 0.047 +163 A 0.041 +164 Q 0.037 +165 V 0.033 +166 F 0.029 +167 A 0.028 +168 L 0.032 +169 L 0.039 +170 A 0.046 +171 Q 0.050 +172 E 0.050 +173 T 0.049 +174 L 0.047 +175 W 0.047 +176 D 0.048 +177 L 0.054 +178 C 0.067 +179 K 0.093 +180 G 0.132 +181 F 0.176 +182 C 0.212 +183 P 0.234 +184 Q 0.249 +185 D 0.265 +186 R 0.287 +187 P 0.314 +188 P 0.339 +189 S 0.354 +190 L 0.353 +191 G 0.335 +192 S 0.309 +193 W 0.289 +194 A 0.285 +195 S 0.292 +196 I 0.300 +197 L 0.312 +198 D 0.327 +199 P 0.337 +200 F 0.336 +201 P 0.330 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000197125.3_ENST00000642064.1_GN:OR8B8_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000197125.3_ENST00000642064.1_GN:OR8B8_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..bbc476f1fe00f1762a7ea8ce8b9cff8f2ffb8c74 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000197125.3_ENST00000642064.1_GN:OR8B8_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,312 @@ +>ENSG00000197125.3|ENST00000642064.1|GN:OR8B8|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.437 +2 A 0.458 +3 A 0.491 +4 E 0.517 +5 N 0.516 +6 S 0.477 +7 S 0.407 +8 F 0.324 +9 V 0.243 +10 T 0.177 +11 Q 0.137 +12 F 0.123 +13 I 0.123 +14 L 0.129 +15 A 0.138 +16 G 0.148 +17 L 0.161 +18 T 0.181 +19 D 0.200 +20 Q 0.200 +21 P 0.175 +22 G 0.138 +23 V 0.104 +24 Q 0.077 +25 I 0.060 +26 P 0.052 +27 L 0.049 +28 F 0.047 +29 F 0.042 +30 L 0.037 +31 F 0.036 +32 L 0.041 +33 G 0.047 +34 F 0.051 +35 Y 0.051 +36 V 0.048 +37 V 0.047 +38 T 0.047 +39 V 0.048 +40 V 0.050 +41 G 0.056 +42 N 0.065 +43 L 0.073 +44 G 0.076 +45 L 0.070 +46 I 0.058 +47 T 0.050 +48 L 0.048 +49 I 0.049 +50 R 0.050 +51 L 0.055 +52 N 0.061 +53 S 0.067 +54 H 0.071 +55 L 0.071 +56 H 0.066 +57 T 0.057 +58 P 0.046 +59 M 0.036 +60 Y 0.028 +61 F 0.024 +62 F 0.024 +63 L 0.030 +64 Y 0.039 +65 N 0.049 +66 L 0.054 +67 S 0.053 +68 F 0.050 +69 I 0.050 +70 D 0.055 +71 F 0.061 +72 C 0.065 +73 Y 0.066 +74 S 0.065 +75 S 0.066 +76 V 0.069 +77 I 0.073 +78 T 0.073 +79 P 0.068 +80 K 0.062 +81 M 0.058 +82 L 0.053 +83 M 0.049 +84 S 0.047 +85 F 0.051 +86 V 0.061 +87 L 0.071 +88 K 0.075 +89 K 0.070 +90 N 0.061 +91 S 0.053 +92 I 0.047 +93 S 0.042 +94 Y 0.038 +95 A 0.038 +96 G 0.038 +97 C 0.036 +98 M 0.034 +99 T 0.032 +100 Q 0.032 +101 L 0.032 +102 F 0.031 +103 F 0.029 +104 F 0.027 +105 L 0.026 +106 F 0.026 +107 F 0.028 +108 V 0.034 +109 V 0.043 +110 S 0.051 +111 E 0.052 +112 S 0.048 +113 F 0.041 +114 I 0.036 +115 L 0.034 +116 S 0.033 +117 A 0.031 +118 M 0.031 +119 A 0.034 +120 Y 0.038 +121 D 0.043 +122 R 0.045 +123 Y 0.045 +124 V 0.043 +125 A 0.045 +126 I 0.049 +127 C 0.055 +128 N 0.058 +129 P 0.056 +130 L 0.050 +131 L 0.047 +132 Y 0.047 +133 M 0.049 +134 V 0.054 +135 T 0.064 +136 M 0.075 +137 S 0.081 +138 P 0.082 +139 Q 0.078 +140 V 0.068 +141 C 0.061 +142 F 0.063 +143 L 0.068 +144 L 0.066 +145 L 0.060 +146 L 0.060 +147 G 0.067 +148 V 0.072 +149 Y 0.072 +150 G 0.072 +151 M 0.076 +152 G 0.079 +153 F 0.081 +154 A 0.082 +155 G 0.084 +156 A 0.084 +157 M 0.082 +158 A 0.083 +159 H 0.086 +160 T 0.086 +161 A 0.086 +162 C 0.089 +163 M 0.097 +164 M 0.107 +165 G 0.115 +166 V 0.114 +167 T 0.100 +168 F 0.085 +169 C 0.082 +170 A 0.091 +171 N 0.105 +172 N 0.122 +173 L 0.136 +174 V 0.137 +175 N 0.120 +176 H 0.094 +177 Y 0.074 +178 M 0.063 +179 C 0.063 +180 D 0.072 +181 I 0.087 +182 L 0.104 +183 P 0.115 +184 L 0.119 +185 L 0.124 +186 E 0.128 +187 C 0.127 +188 A 0.120 +189 C 0.117 +190 T 0.125 +191 S 0.135 +192 T 0.136 +193 Y 0.125 +194 V 0.112 +195 N 0.101 +196 E 0.097 +197 L 0.098 +198 V 0.098 +199 V 0.094 +200 F 0.085 +201 V 0.078 +202 V 0.073 +203 V 0.067 +204 G 0.062 +205 I 0.061 +206 D 0.067 +207 I 0.076 +208 G 0.085 +209 V 0.092 +210 P 0.093 +211 T 0.087 +212 V 0.079 +213 T 0.076 +214 I 0.072 +215 F 0.063 +216 I 0.053 +217 S 0.047 +218 Y 0.045 +219 A 0.046 +220 L 0.052 +221 I 0.062 +222 L 0.073 +223 S 0.081 +224 S 0.083 +225 I 0.082 +226 F 0.087 +227 H 0.106 +228 I 0.132 +229 D 0.153 +230 S 0.159 +231 T 0.148 +232 E 0.130 +233 G 0.111 +234 R 0.095 +235 S 0.087 +236 K 0.087 +237 A 0.086 +238 F 0.084 +239 S 0.082 +240 T 0.080 +241 C 0.078 +242 S 0.077 +243 S 0.079 +244 H 0.078 +245 I 0.075 +246 I 0.073 +247 A 0.072 +248 V 0.064 +249 S 0.050 +250 L 0.037 +251 F 0.032 +252 F 0.033 +253 G 0.037 +254 S 0.041 +255 G 0.042 +256 A 0.040 +257 F 0.037 +258 M 0.040 +259 Y 0.054 +260 L 0.081 +261 K 0.111 +262 P 0.135 +263 F 0.152 +264 S 0.165 +265 L 0.174 +266 L 0.177 +267 A 0.175 +268 M 0.170 +269 N 0.162 +270 Q 0.156 +271 G 0.151 +272 K 0.141 +273 V 0.127 +274 S 0.111 +275 S 0.095 +276 L 0.085 +277 F 0.086 +278 Y 0.094 +279 T 0.103 +280 T 0.112 +281 V 0.121 +282 V 0.124 +283 P 0.115 +284 M 0.099 +285 L 0.087 +286 N 0.079 +287 P 0.075 +288 L 0.074 +289 I 0.077 +290 Y 0.079 +291 S 0.085 +292 L 0.099 +293 R 0.111 +294 N 0.104 +295 K 0.084 +296 D 0.067 +297 V 0.064 +298 K 0.074 +299 V 0.085 +300 A 0.091 +301 L 0.093 +302 K 0.097 +303 K 0.105 +304 I 0.118 +305 L 0.145 +306 N 0.191 +307 K 0.253 +308 N 0.316 +309 A 0.353 +310 F 0.354 +311 S 0.338 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000197125.3_ENST00000642064.1_GN:OR8B8_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000197125.3_ENST00000642064.1_GN:OR8B8_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ed4c50430385e3a1252565d12907e7a475f9d068 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000197125.3_ENST00000642064.1_GN:OR8B8_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid @@ -0,0 +1,314 @@ +>ENSG00000197125.3|ENST00000642064.1|GN:OR8B8|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:2 +1 M 0.406 +2 T 0.430 +3 M 0.473 +4 A 0.519 +5 A 0.552 +6 E 0.562 +7 N 0.544 +8 S 0.494 +9 S 0.419 +10 F 0.330 +11 V 0.245 +12 T 0.177 +13 Q 0.136 +14 F 0.121 +15 I 0.122 +16 L 0.128 +17 A 0.137 +18 G 0.147 +19 L 0.161 +20 T 0.182 +21 D 0.202 +22 Q 0.202 +23 P 0.176 +24 G 0.139 +25 V 0.104 +26 Q 0.078 +27 I 0.061 +28 P 0.052 +29 L 0.049 +30 F 0.047 +31 F 0.042 +32 L 0.037 +33 F 0.036 +34 L 0.041 +35 G 0.047 +36 F 0.051 +37 Y 0.051 +38 V 0.048 +39 V 0.047 +40 T 0.048 +41 V 0.048 +42 V 0.050 +43 G 0.056 +44 N 0.065 +45 L 0.074 +46 G 0.077 +47 L 0.070 +48 I 0.058 +49 T 0.050 +50 L 0.048 +51 I 0.049 +52 R 0.050 +53 L 0.055 +54 N 0.061 +55 S 0.067 +56 H 0.071 +57 L 0.071 +58 H 0.066 +59 T 0.057 +60 P 0.046 +61 M 0.036 +62 Y 0.028 +63 F 0.024 +64 F 0.024 +65 L 0.029 +66 Y 0.039 +67 N 0.049 +68 L 0.054 +69 S 0.053 +70 F 0.050 +71 I 0.050 +72 D 0.055 +73 F 0.060 +74 C 0.064 +75 Y 0.066 +76 S 0.066 +77 S 0.066 +78 V 0.069 +79 I 0.072 +80 T 0.073 +81 P 0.068 +82 K 0.062 +83 M 0.057 +84 L 0.053 +85 M 0.048 +86 S 0.047 +87 F 0.051 +88 V 0.060 +89 L 0.070 +90 K 0.074 +91 K 0.069 +92 N 0.060 +93 S 0.052 +94 I 0.047 +95 S 0.042 +96 Y 0.038 +97 A 0.038 +98 G 0.038 +99 C 0.036 +100 M 0.034 +101 T 0.032 +102 Q 0.032 +103 L 0.032 +104 F 0.031 +105 F 0.029 +106 F 0.027 +107 L 0.026 +108 F 0.026 +109 F 0.028 +110 V 0.034 +111 V 0.043 +112 S 0.050 +113 E 0.052 +114 S 0.047 +115 F 0.041 +116 I 0.036 +117 L 0.034 +118 S 0.033 +119 A 0.031 +120 M 0.031 +121 A 0.034 +122 Y 0.038 +123 D 0.043 +124 R 0.045 +125 Y 0.045 +126 V 0.043 +127 A 0.045 +128 I 0.049 +129 C 0.055 +130 N 0.058 +131 P 0.056 +132 L 0.050 +133 L 0.047 +134 Y 0.047 +135 M 0.049 +136 V 0.055 +137 T 0.064 +138 M 0.075 +139 S 0.081 +140 P 0.082 +141 Q 0.078 +142 V 0.068 +143 C 0.061 +144 F 0.063 +145 L 0.068 +146 L 0.066 +147 L 0.060 +148 L 0.060 +149 G 0.066 +150 V 0.072 +151 Y 0.072 +152 G 0.072 +153 M 0.076 +154 G 0.080 +155 F 0.081 +156 A 0.082 +157 G 0.085 +158 A 0.085 +159 M 0.082 +160 A 0.083 +161 H 0.086 +162 T 0.086 +163 A 0.086 +164 C 0.089 +165 M 0.097 +166 M 0.107 +167 G 0.115 +168 V 0.114 +169 T 0.100 +170 F 0.085 +171 C 0.082 +172 A 0.091 +173 N 0.105 +174 N 0.122 +175 L 0.136 +176 V 0.138 +177 N 0.120 +178 H 0.094 +179 Y 0.074 +180 M 0.063 +181 C 0.063 +182 D 0.072 +183 I 0.088 +184 L 0.104 +185 P 0.115 +186 L 0.119 +187 L 0.124 +188 E 0.128 +189 C 0.127 +190 A 0.119 +191 C 0.116 +192 T 0.125 +193 S 0.135 +194 T 0.136 +195 Y 0.125 +196 V 0.111 +197 N 0.101 +198 E 0.097 +199 L 0.098 +200 V 0.099 +201 V 0.094 +202 F 0.085 +203 V 0.078 +204 V 0.073 +205 V 0.067 +206 G 0.062 +207 I 0.061 +208 D 0.067 +209 I 0.076 +210 G 0.085 +211 V 0.092 +212 P 0.093 +213 T 0.087 +214 V 0.079 +215 T 0.076 +216 I 0.073 +217 F 0.064 +218 I 0.054 +219 S 0.047 +220 Y 0.045 +221 A 0.046 +222 L 0.052 +223 I 0.062 +224 L 0.073 +225 S 0.081 +226 S 0.083 +227 I 0.082 +228 F 0.087 +229 H 0.106 +230 I 0.132 +231 D 0.153 +232 S 0.159 +233 T 0.148 +234 E 0.130 +235 G 0.111 +236 R 0.095 +237 S 0.088 +238 K 0.087 +239 A 0.087 +240 F 0.084 +241 S 0.082 +242 T 0.081 +243 C 0.078 +244 S 0.078 +245 S 0.079 +246 H 0.079 +247 I 0.076 +248 I 0.074 +249 A 0.072 +250 V 0.065 +251 S 0.051 +252 L 0.038 +253 F 0.032 +254 F 0.033 +255 G 0.037 +256 S 0.041 +257 G 0.042 +258 A 0.040 +259 F 0.037 +260 M 0.040 +261 Y 0.054 +262 L 0.081 +263 K 0.111 +264 P 0.135 +265 F 0.152 +266 S 0.166 +267 L 0.174 +268 L 0.177 +269 A 0.176 +270 M 0.170 +271 N 0.162 +272 Q 0.157 +273 G 0.152 +274 K 0.142 +275 V 0.128 +276 S 0.111 +277 S 0.096 +278 L 0.086 +279 F 0.087 +280 Y 0.095 +281 T 0.104 +282 T 0.113 +283 V 0.121 +284 V 0.124 +285 P 0.115 +286 M 0.099 +287 L 0.087 +288 N 0.080 +289 P 0.075 +290 L 0.075 +291 I 0.078 +292 Y 0.080 +293 S 0.085 +294 L 0.100 +295 R 0.111 +296 N 0.104 +297 K 0.084 +298 D 0.068 +299 V 0.064 +300 K 0.074 +301 V 0.085 +302 A 0.091 +303 L 0.093 +304 K 0.097 +305 K 0.105 +306 I 0.118 +307 L 0.145 +308 N 0.191 +309 K 0.253 +310 N 0.316 +311 A 0.353 +312 F 0.354 +313 S 0.339 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000198680.6_ENST00000358022.6_GN:TUSC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000198680.6_ENST00000358022.6_GN:TUSC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..02b97fc7032797f7abe3c0e5438fb939ee5c3001 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000198680.6_ENST00000358022.6_GN:TUSC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,210 @@ +>ENSG00000198680.6|ENST00000358022.6|GN:TUSC1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.449 +2 W 0.505 +3 R 0.586 +4 M 0.660 +5 R 0.709 +6 G 0.734 +7 G 0.735 +8 A 0.705 +9 T 0.655 +10 R 0.633 +11 R 0.674 +12 G 0.741 +13 S 0.786 +14 C 0.804 +15 C 0.813 +16 G 0.821 +17 G 0.828 +18 D 0.832 +19 G 0.831 +20 A 0.826 +21 A 0.818 +22 D 0.807 +23 G 0.795 +24 R 0.782 +25 G 0.777 +26 P 0.784 +27 G 0.799 +28 R 0.813 +29 S 0.820 +30 G 0.822 +31 R 0.823 +32 A 0.827 +33 R 0.833 +34 G 0.835 +35 G 0.832 +36 G 0.827 +37 S 0.825 +38 P 0.828 +39 S 0.832 +40 G 0.833 +41 G 0.828 +42 G 0.819 +43 G 0.805 +44 G 0.781 +45 V 0.741 +46 G 0.685 +47 W 0.636 +48 R 0.614 +49 G 0.615 +50 R 0.612 +51 A 0.600 +52 D 0.587 +53 G 0.573 +54 A 0.546 +55 R 0.508 +56 Q 0.470 +57 Q 0.431 +58 L 0.388 +59 E 0.353 +60 E 0.339 +61 R 0.344 +62 F 0.360 +63 A 0.380 +64 D 0.383 +65 L 0.360 +66 A 0.325 +67 A 0.293 +68 S 0.263 +69 H 0.234 +70 L 0.217 +71 E 0.211 +72 A 0.211 +73 I 0.215 +74 R 0.220 +75 A 0.218 +76 R 0.209 +77 D 0.207 +78 E 0.213 +79 W 0.220 +80 D 0.228 +81 R 0.233 +82 Q 0.229 +83 N 0.214 +84 A 0.196 +85 R 0.181 +86 L 0.176 +87 R 0.186 +88 Q 0.202 +89 E 0.204 +90 N 0.188 +91 A 0.169 +92 R 0.160 +93 L 0.162 +94 R 0.176 +95 L 0.199 +96 E 0.221 +97 N 0.232 +98 R 0.233 +99 R 0.240 +100 L 0.258 +101 K 0.281 +102 R 0.295 +103 E 0.287 +104 N 0.262 +105 R 0.234 +106 S 0.216 +107 L 0.211 +108 F 0.220 +109 R 0.238 +110 Q 0.262 +111 A 0.297 +112 L 0.344 +113 R 0.405 +114 L 0.484 +115 P 0.576 +116 G 0.662 +117 E 0.720 +118 G 0.747 +119 G 0.754 +120 N 0.752 +121 G 0.747 +122 T 0.743 +123 P 0.746 +124 A 0.755 +125 E 0.765 +126 A 0.769 +127 R 0.767 +128 R 0.762 +129 V 0.758 +130 P 0.760 +131 E 0.768 +132 E 0.773 +133 A 0.772 +134 S 0.771 +135 T 0.769 +136 N 0.767 +137 R 0.763 +138 R 0.761 +139 A 0.762 +140 R 0.763 +141 D 0.765 +142 S 0.761 +143 G 0.748 +144 R 0.724 +145 E 0.689 +146 D 0.648 +147 E 0.604 +148 P 0.560 +149 G 0.501 +150 S 0.417 +151 P 0.325 +152 R 0.258 +153 A 0.226 +154 L 0.213 +155 R 0.204 +156 A 0.198 +157 R 0.193 +158 L 0.187 +159 E 0.180 +160 K 0.173 +161 L 0.166 +162 E 0.162 +163 A 0.157 +164 M 0.148 +165 Y 0.133 +166 R 0.123 +167 R 0.124 +168 A 0.135 +169 L 0.148 +170 L 0.158 +171 Q 0.167 +172 L 0.180 +173 H 0.207 +174 L 0.248 +175 E 0.294 +176 Q 0.335 +177 R 0.376 +178 G 0.436 +179 P 0.522 +180 R 0.617 +181 P 0.694 +182 S 0.741 +183 G 0.762 +184 D 0.769 +185 K 0.766 +186 E 0.754 +187 E 0.739 +188 Q 0.732 +189 P 0.734 +190 L 0.736 +191 Q 0.733 +192 E 0.730 +193 P 0.732 +194 D 0.741 +195 S 0.755 +196 G 0.771 +197 L 0.785 +198 R 0.795 +199 S 0.799 +200 R 0.796 +201 D 0.783 +202 S 0.767 +203 E 0.756 +204 P 0.752 +205 S 0.751 +206 G 0.736 +207 P 0.689 +208 W 0.612 +209 L 0.545 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000198680.6_ENST00000358022.6_GN:TUSC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000198680.6_ENST00000358022.6_GN:TUSC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7ac0823265a0279d267e1b35e6f8e4ba95c9b631 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000198680.6_ENST00000358022.6_GN:TUSC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid @@ -0,0 +1,213 @@ +>ENSG00000198680.6|ENST00000358022.6|GN:TUSC1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 +1 M 0.459 +2 G 0.508 +3 P 0.578 +4 M 0.638 +5 W 0.680 +6 R 0.713 +7 M 0.743 +8 R 0.771 +9 G 0.791 +10 G 0.803 +11 A 0.809 +12 T 0.812 +13 R 0.815 +14 R 0.819 +15 G 0.822 +16 S 0.823 +17 C 0.824 +18 C 0.827 +19 G 0.834 +20 G 0.840 +21 D 0.845 +22 G 0.846 +23 A 0.843 +24 A 0.836 +25 D 0.824 +26 G 0.808 +27 R 0.794 +28 G 0.787 +29 P 0.793 +30 G 0.808 +31 R 0.821 +32 S 0.828 +33 G 0.828 +34 R 0.829 +35 A 0.833 +36 R 0.838 +37 G 0.840 +38 G 0.836 +39 G 0.830 +40 S 0.827 +41 P 0.829 +42 S 0.834 +43 G 0.835 +44 G 0.831 +45 G 0.823 +46 G 0.810 +47 G 0.788 +48 V 0.750 +49 G 0.698 +50 W 0.653 +51 R 0.635 +52 G 0.635 +53 R 0.631 +54 A 0.617 +55 D 0.604 +56 G 0.588 +57 A 0.559 +58 R 0.519 +59 Q 0.480 +60 Q 0.440 +61 L 0.396 +62 E 0.361 +63 E 0.346 +64 R 0.352 +65 F 0.369 +66 A 0.386 +67 D 0.387 +68 L 0.360 +69 A 0.323 +70 A 0.290 +71 S 0.258 +72 H 0.229 +73 L 0.213 +74 E 0.207 +75 A 0.207 +76 I 0.210 +77 R 0.215 +78 A 0.213 +79 R 0.205 +80 D 0.202 +81 E 0.209 +82 W 0.216 +83 D 0.223 +84 R 0.228 +85 Q 0.224 +86 N 0.210 +87 A 0.192 +88 R 0.177 +89 L 0.173 +90 R 0.183 +91 Q 0.197 +92 E 0.200 +93 N 0.185 +94 A 0.167 +95 R 0.159 +96 L 0.161 +97 R 0.173 +98 L 0.194 +99 E 0.215 +100 N 0.225 +101 R 0.227 +102 R 0.234 +103 L 0.252 +104 K 0.273 +105 R 0.286 +106 E 0.277 +107 N 0.253 +108 R 0.228 +109 S 0.211 +110 L 0.208 +111 F 0.217 +112 R 0.235 +113 Q 0.261 +114 A 0.297 +115 L 0.345 +116 R 0.406 +117 L 0.485 +118 P 0.577 +119 G 0.662 +120 E 0.720 +121 G 0.748 +122 G 0.755 +123 N 0.754 +124 G 0.749 +125 T 0.745 +126 P 0.747 +127 A 0.757 +128 E 0.766 +129 A 0.770 +130 R 0.769 +131 R 0.764 +132 V 0.760 +133 P 0.761 +134 E 0.769 +135 E 0.774 +136 A 0.774 +137 S 0.772 +138 T 0.771 +139 N 0.768 +140 R 0.765 +141 R 0.762 +142 A 0.763 +143 R 0.765 +144 D 0.766 +145 S 0.763 +146 G 0.750 +147 R 0.726 +148 E 0.691 +149 D 0.649 +150 E 0.606 +151 P 0.561 +152 G 0.502 +153 S 0.417 +154 P 0.324 +155 R 0.257 +156 A 0.225 +157 L 0.212 +158 R 0.204 +159 A 0.198 +160 R 0.193 +161 L 0.187 +162 E 0.179 +163 K 0.172 +164 L 0.166 +165 E 0.162 +166 A 0.157 +167 M 0.148 +168 Y 0.136 +169 R 0.129 +170 R 0.131 +171 A 0.140 +172 L 0.150 +173 L 0.158 +174 Q 0.165 +175 L 0.178 +176 H 0.204 +177 L 0.246 +178 E 0.291 +179 Q 0.331 +180 R 0.373 +181 G 0.434 +182 P 0.521 +183 R 0.616 +184 P 0.694 +185 S 0.740 +186 G 0.762 +187 D 0.769 +188 K 0.766 +189 E 0.755 +190 E 0.741 +191 Q 0.734 +192 P 0.736 +193 L 0.738 +194 Q 0.735 +195 E 0.731 +196 P 0.733 +197 D 0.741 +198 S 0.754 +199 G 0.770 +200 L 0.784 +201 R 0.794 +202 S 0.798 +203 R 0.795 +204 D 0.784 +205 S 0.768 +206 E 0.757 +207 P 0.753 +208 S 0.752 +209 G 0.737 +210 P 0.690 +211 W 0.612 +212 L 0.546 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000203857.10_ENST00000369413.8_GN:HSD3B1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000203857.10_ENST00000369413.8_GN:HSD3B1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..53d937068ee2033072d3fea32975345fb507da7e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000203857.10_ENST00000369413.8_GN:HSD3B1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,374 @@ +>ENSG00000203857.10|ENST00000369413.8|GN:HSD3B1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.336 +2 T 0.290 +3 G 0.213 +4 W 0.132 +5 S 0.072 +6 C 0.040 +7 L 0.027 +8 V 0.027 +9 T 0.035 +10 G 0.049 +11 A 0.059 +12 G 0.058 +13 G 0.049 +14 F 0.043 +15 L 0.040 +16 G 0.036 +17 Q 0.034 +18 R 0.037 +19 I 0.041 +20 I 0.040 +21 R 0.036 +22 L 0.034 +23 L 0.036 +24 V 0.037 +25 K 0.038 +26 E 0.041 +27 K 0.046 +28 E 0.050 +29 L 0.051 +30 K 0.048 +31 E 0.042 +32 I 0.036 +33 R 0.034 +34 V 0.037 +35 L 0.042 +36 D 0.044 +37 K 0.043 +38 A 0.044 +39 F 0.049 +40 G 0.052 +41 P 0.048 +42 E 0.042 +43 L 0.044 +44 R 0.055 +45 E 0.064 +46 E 0.065 +47 F 0.063 +48 S 0.065 +49 K 0.072 +50 L 0.079 +51 Q 0.087 +52 N 0.092 +53 K 0.092 +54 T 0.083 +55 K 0.070 +56 L 0.060 +57 T 0.060 +58 V 0.066 +59 L 0.072 +60 E 0.072 +61 G 0.065 +62 D 0.057 +63 I 0.052 +64 L 0.050 +65 D 0.048 +66 E 0.041 +67 P 0.032 +68 F 0.025 +69 L 0.023 +70 K 0.026 +71 R 0.030 +72 A 0.038 +73 C 0.050 +74 Q 0.062 +75 D 0.065 +76 V 0.058 +77 S 0.050 +78 V 0.046 +79 I 0.047 +80 I 0.053 +81 H 0.064 +82 T 0.078 +83 A 0.090 +84 C 0.102 +85 I 0.115 +86 I 0.128 +87 D 0.135 +88 V 0.137 +89 F 0.137 +90 G 0.133 +91 V 0.124 +92 T 0.113 +93 H 0.102 +94 R 0.091 +95 E 0.078 +96 S 0.068 +97 I 0.063 +98 M 0.057 +99 N 0.053 +100 V 0.057 +101 N 0.063 +102 V 0.064 +103 K 0.062 +104 G 0.063 +105 T 0.064 +106 Q 0.059 +107 L 0.049 +108 L 0.042 +109 L 0.038 +110 E 0.034 +111 A 0.030 +112 C 0.031 +113 V 0.037 +114 Q 0.047 +115 A 0.054 +116 S 0.057 +117 V 0.056 +118 P 0.052 +119 V 0.048 +120 F 0.044 +121 I 0.044 +122 Y 0.048 +123 T 0.055 +124 S 0.063 +125 S 0.073 +126 I 0.094 +127 E 0.126 +128 V 0.158 +129 A 0.182 +130 G 0.200 +131 P 0.215 +132 N 0.220 +133 S 0.214 +134 Y 0.204 +135 K 0.193 +136 E 0.189 +137 I 0.195 +138 I 0.210 +139 Q 0.227 +140 N 0.234 +141 G 0.218 +142 H 0.180 +143 E 0.151 +144 E 0.149 +145 E 0.162 +146 P 0.167 +147 L 0.158 +148 E 0.151 +149 N 0.150 +150 T 0.150 +151 W 0.142 +152 P 0.125 +153 A 0.106 +154 P 0.098 +155 Y 0.099 +156 P 0.103 +157 H 0.110 +158 S 0.119 +159 K 0.121 +160 K 0.115 +161 L 0.112 +162 A 0.115 +163 E 0.117 +164 K 0.115 +165 A 0.112 +166 V 0.109 +167 L 0.105 +168 A 0.104 +169 A 0.105 +170 N 0.107 +171 G 0.107 +172 W 0.108 +173 N 0.110 +174 L 0.117 +175 K 0.133 +176 N 0.157 +177 G 0.173 +178 G 0.167 +179 T 0.138 +180 L 0.101 +181 Y 0.075 +182 T 0.063 +183 C 0.063 +184 A 0.077 +185 L 0.098 +186 R 0.112 +187 P 0.110 +188 M 0.101 +189 Y 0.095 +190 I 0.088 +191 Y 0.078 +192 G 0.073 +193 E 0.078 +194 G 0.087 +195 S 0.090 +196 R 0.087 +197 F 0.081 +198 L 0.078 +199 S 0.079 +200 A 0.084 +201 S 0.088 +202 I 0.085 +203 N 0.080 +204 E 0.076 +205 A 0.076 +206 L 0.084 +207 N 0.099 +208 N 0.118 +209 N 0.134 +210 G 0.147 +211 I 0.159 +212 L 0.166 +213 S 0.163 +214 S 0.156 +215 V 0.155 +216 G 0.156 +217 K 0.150 +218 F 0.138 +219 S 0.124 +220 T 0.109 +221 V 0.098 +222 N 0.092 +223 P 0.088 +224 V 0.082 +225 Y 0.079 +226 V 0.083 +227 G 0.090 +228 N 0.097 +229 V 0.101 +230 A 0.098 +231 W 0.091 +232 A 0.080 +233 H 0.067 +234 I 0.054 +235 L 0.047 +236 A 0.045 +237 L 0.047 +238 R 0.053 +239 A 0.061 +240 L 0.066 +241 Q 0.067 +242 D 0.067 +243 P 0.067 +244 K 0.066 +245 K 0.063 +246 A 0.064 +247 P 0.068 +248 S 0.075 +249 I 0.083 +250 R 0.090 +251 G 0.092 +252 Q 0.088 +253 F 0.080 +254 Y 0.072 +255 Y 0.068 +256 I 0.071 +257 S 0.080 +258 D 0.086 +259 D 0.088 +260 T 0.087 +261 P 0.086 +262 H 0.083 +263 Q 0.076 +264 S 0.069 +265 Y 0.062 +266 D 0.055 +267 N 0.048 +268 L 0.042 +269 N 0.038 +270 Y 0.036 +271 T 0.037 +272 L 0.038 +273 S 0.040 +274 K 0.045 +275 E 0.053 +276 F 0.066 +277 G 0.081 +278 L 0.095 +279 R 0.104 +280 L 0.111 +281 D 0.117 +282 S 0.123 +283 R 0.128 +284 W 0.128 +285 S 0.121 +286 F 0.109 +287 P 0.093 +288 L 0.076 +289 S 0.061 +290 L 0.055 +291 M 0.060 +292 Y 0.073 +293 W 0.085 +294 I 0.088 +295 G 0.084 +296 F 0.079 +297 L 0.075 +298 L 0.075 +299 E 0.076 +300 I 0.076 +301 V 0.076 +302 S 0.080 +303 F 0.086 +304 L 0.091 +305 L 0.101 +306 R 0.118 +307 P 0.139 +308 I 0.159 +309 Y 0.174 +310 T 0.183 +311 Y 0.188 +312 R 0.184 +313 P 0.168 +314 P 0.143 +315 F 0.118 +316 N 0.098 +317 R 0.086 +318 H 0.086 +319 I 0.094 +320 V 0.100 +321 T 0.099 +322 L 0.098 +323 S 0.103 +324 N 0.112 +325 S 0.123 +326 V 0.129 +327 F 0.127 +328 T 0.117 +329 F 0.105 +330 S 0.097 +331 Y 0.091 +332 K 0.082 +333 K 0.076 +334 A 0.077 +335 Q 0.085 +336 R 0.088 +337 D 0.082 +338 L 0.072 +339 A 0.067 +340 Y 0.069 +341 K 0.073 +342 P 0.075 +343 L 0.073 +344 Y 0.072 +345 S 0.070 +346 W 0.066 +347 E 0.061 +348 E 0.059 +349 A 0.058 +350 K 0.053 +351 Q 0.046 +352 K 0.045 +353 T 0.053 +354 V 0.065 +355 E 0.073 +356 W 0.070 +357 V 0.061 +358 G 0.053 +359 S 0.047 +360 L 0.045 +361 V 0.047 +362 D 0.052 +363 R 0.060 +364 H 0.074 +365 K 0.096 +366 E 0.127 +367 T 0.160 +368 L 0.194 +369 K 0.231 +370 S 0.271 +371 K 0.306 +372 T 0.325 +373 Q 0.328 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000203857.10_ENST00000369413.8_GN:HSD3B1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000203857.10_ENST00000369413.8_GN:HSD3B1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..8bcaf37b2a888416d924d7d1786257c2497a3806 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000203857.10_ENST00000369413.8_GN:HSD3B1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid @@ -0,0 +1,376 @@ +>ENSG00000203857.10|ENST00000369413.8|GN:HSD3B1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:2 +1 M 0.365 +2 A 0.361 +3 M 0.341 +4 T 0.289 +5 G 0.210 +6 W 0.130 +7 S 0.071 +8 C 0.040 +9 L 0.028 +10 V 0.027 +11 T 0.035 +12 G 0.049 +13 A 0.059 +14 G 0.058 +15 G 0.049 +16 F 0.043 +17 L 0.040 +18 G 0.036 +19 Q 0.034 +20 R 0.037 +21 I 0.041 +22 I 0.040 +23 R 0.035 +24 L 0.033 +25 L 0.035 +26 V 0.037 +27 K 0.038 +28 E 0.042 +29 K 0.047 +30 E 0.052 +31 L 0.053 +32 K 0.049 +33 E 0.042 +34 I 0.036 +35 R 0.034 +36 V 0.037 +37 L 0.042 +38 D 0.044 +39 K 0.043 +40 A 0.044 +41 F 0.049 +42 G 0.052 +43 P 0.048 +44 E 0.042 +45 L 0.044 +46 R 0.054 +47 E 0.064 +48 E 0.065 +49 F 0.063 +50 S 0.065 +51 K 0.071 +52 L 0.079 +53 Q 0.086 +54 N 0.091 +55 K 0.091 +56 T 0.082 +57 K 0.069 +58 L 0.059 +59 T 0.059 +60 V 0.066 +61 L 0.072 +62 E 0.072 +63 G 0.065 +64 D 0.056 +65 I 0.052 +66 L 0.050 +67 D 0.047 +68 E 0.041 +69 P 0.032 +70 F 0.025 +71 L 0.024 +72 K 0.026 +73 R 0.031 +74 A 0.038 +75 C 0.050 +76 Q 0.061 +77 D 0.064 +78 V 0.058 +79 S 0.050 +80 V 0.046 +81 I 0.047 +82 I 0.053 +83 H 0.064 +84 T 0.078 +85 A 0.090 +86 C 0.101 +87 I 0.115 +88 I 0.128 +89 D 0.135 +90 V 0.137 +91 F 0.137 +92 G 0.132 +93 V 0.123 +94 T 0.112 +95 H 0.102 +96 R 0.091 +97 E 0.078 +98 S 0.068 +99 I 0.063 +100 M 0.057 +101 N 0.053 +102 V 0.057 +103 N 0.063 +104 V 0.064 +105 K 0.062 +106 G 0.063 +107 T 0.065 +108 Q 0.059 +109 L 0.049 +110 L 0.042 +111 L 0.038 +112 E 0.034 +113 A 0.030 +114 C 0.031 +115 V 0.037 +116 Q 0.047 +117 A 0.054 +118 S 0.057 +119 V 0.056 +120 P 0.053 +121 V 0.048 +122 F 0.044 +123 I 0.044 +124 Y 0.048 +125 T 0.055 +126 S 0.063 +127 S 0.073 +128 I 0.094 +129 E 0.126 +130 V 0.158 +131 A 0.182 +132 G 0.201 +133 P 0.216 +134 N 0.221 +135 S 0.215 +136 Y 0.205 +137 K 0.194 +138 E 0.190 +139 I 0.196 +140 I 0.211 +141 Q 0.228 +142 N 0.235 +143 G 0.219 +144 H 0.181 +145 E 0.151 +146 E 0.150 +147 E 0.163 +148 P 0.167 +149 L 0.159 +150 E 0.151 +151 N 0.150 +152 T 0.150 +153 W 0.142 +154 P 0.124 +155 A 0.106 +156 P 0.098 +157 Y 0.099 +158 P 0.103 +159 H 0.110 +160 S 0.119 +161 K 0.121 +162 K 0.115 +163 L 0.112 +164 A 0.115 +165 E 0.118 +166 K 0.115 +167 A 0.112 +168 V 0.109 +169 L 0.106 +170 A 0.104 +171 A 0.106 +172 N 0.107 +173 G 0.107 +174 W 0.108 +175 N 0.110 +176 L 0.117 +177 K 0.133 +178 N 0.157 +179 G 0.173 +180 G 0.167 +181 T 0.137 +182 L 0.101 +183 Y 0.075 +184 T 0.063 +185 C 0.063 +186 A 0.077 +187 L 0.098 +188 R 0.112 +189 P 0.110 +190 M 0.101 +191 Y 0.095 +192 I 0.088 +193 Y 0.078 +194 G 0.073 +195 E 0.078 +196 G 0.087 +197 S 0.091 +198 R 0.087 +199 F 0.081 +200 L 0.078 +201 S 0.079 +202 A 0.084 +203 S 0.088 +204 I 0.086 +205 N 0.080 +206 E 0.076 +207 A 0.076 +208 L 0.084 +209 N 0.099 +210 N 0.117 +211 N 0.133 +212 G 0.147 +213 I 0.159 +214 L 0.166 +215 S 0.162 +216 S 0.156 +217 V 0.154 +218 G 0.155 +219 K 0.150 +220 F 0.138 +221 S 0.123 +222 T 0.109 +223 V 0.097 +224 N 0.092 +225 P 0.088 +226 V 0.082 +227 Y 0.079 +228 V 0.083 +229 G 0.090 +230 N 0.097 +231 V 0.101 +232 A 0.098 +233 W 0.091 +234 A 0.080 +235 H 0.067 +236 I 0.054 +237 L 0.046 +238 A 0.045 +239 L 0.048 +240 R 0.054 +241 A 0.062 +242 L 0.067 +243 Q 0.069 +244 D 0.068 +245 P 0.068 +246 K 0.065 +247 K 0.063 +248 A 0.063 +249 P 0.068 +250 S 0.075 +251 I 0.083 +252 R 0.090 +253 G 0.092 +254 Q 0.088 +255 F 0.080 +256 Y 0.072 +257 Y 0.068 +258 I 0.072 +259 S 0.080 +260 D 0.087 +261 D 0.088 +262 T 0.087 +263 P 0.086 +264 H 0.083 +265 Q 0.076 +266 S 0.069 +267 Y 0.062 +268 D 0.055 +269 N 0.048 +270 L 0.042 +271 N 0.038 +272 Y 0.036 +273 T 0.037 +274 L 0.038 +275 S 0.040 +276 K 0.045 +277 E 0.054 +278 F 0.066 +279 G 0.081 +280 L 0.095 +281 R 0.104 +282 L 0.111 +283 D 0.117 +284 S 0.123 +285 R 0.128 +286 W 0.128 +287 S 0.121 +288 F 0.109 +289 P 0.094 +290 L 0.076 +291 S 0.061 +292 L 0.055 +293 M 0.060 +294 Y 0.073 +295 W 0.085 +296 I 0.088 +297 G 0.085 +298 F 0.079 +299 L 0.075 +300 L 0.075 +301 E 0.076 +302 I 0.076 +303 V 0.076 +304 S 0.080 +305 F 0.086 +306 L 0.091 +307 L 0.101 +308 R 0.118 +309 P 0.140 +310 I 0.160 +311 Y 0.174 +312 T 0.184 +313 Y 0.188 +314 R 0.185 +315 P 0.168 +316 P 0.143 +317 F 0.119 +318 N 0.098 +319 R 0.086 +320 H 0.086 +321 I 0.095 +322 V 0.100 +323 T 0.099 +324 L 0.098 +325 S 0.103 +326 N 0.112 +327 S 0.123 +328 V 0.129 +329 F 0.128 +330 T 0.117 +331 F 0.105 +332 S 0.097 +333 Y 0.091 +334 K 0.083 +335 K 0.076 +336 A 0.077 +337 Q 0.085 +338 R 0.088 +339 D 0.082 +340 L 0.072 +341 A 0.067 +342 Y 0.069 +343 K 0.073 +344 P 0.075 +345 L 0.073 +346 Y 0.072 +347 S 0.070 +348 W 0.066 +349 E 0.061 +350 E 0.059 +351 A 0.058 +352 K 0.052 +353 Q 0.046 +354 K 0.045 +355 T 0.053 +356 V 0.065 +357 E 0.073 +358 W 0.070 +359 V 0.061 +360 G 0.053 +361 S 0.047 +362 L 0.045 +363 V 0.047 +364 D 0.052 +365 R 0.060 +366 H 0.074 +367 K 0.096 +368 E 0.127 +369 T 0.160 +370 L 0.194 +371 K 0.231 +372 S 0.271 +373 K 0.307 +374 T 0.326 +375 Q 0.329 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000204246.4_ENST00000641090.1_GN:OR13C3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000204246.4_ENST00000641090.1_GN:OR13C3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a5ca0c3aa74b50df05de0d2e5667afe0b9980fb7 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000204246.4_ENST00000641090.1_GN:OR13C3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,318 @@ +>ENSG00000204246.4|ENST00000641090.1|GN:OR13C3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.431 +2 G 0.446 +3 E 0.469 +4 I 0.484 +5 N 0.478 +6 Q 0.443 +7 T 0.382 +8 L 0.308 +9 V 0.237 +10 S 0.182 +11 E 0.149 +12 F 0.135 +13 L 0.130 +14 L 0.130 +15 L 0.139 +16 G 0.158 +17 L 0.180 +18 S 0.196 +19 G 0.197 +20 Y 0.180 +21 P 0.148 +22 K 0.112 +23 I 0.081 +24 E 0.059 +25 I 0.048 +26 V 0.047 +27 Y 0.055 +28 F 0.066 +29 A 0.070 +30 L 0.064 +31 I 0.054 +32 L 0.049 +33 V 0.051 +34 M 0.053 +35 Y 0.053 +36 L 0.050 +37 V 0.050 +38 I 0.052 +39 L 0.053 +40 I 0.056 +41 G 0.061 +42 N 0.065 +43 G 0.066 +44 V 0.064 +45 L 0.061 +46 I 0.058 +47 I 0.056 +48 A 0.056 +49 S 0.055 +50 I 0.057 +51 F 0.063 +52 D 0.070 +53 S 0.074 +54 H 0.074 +55 F 0.070 +56 H 0.065 +57 T 0.057 +58 P 0.044 +59 M 0.031 +60 Y 0.023 +61 F 0.020 +62 F 0.024 +63 L 0.033 +64 G 0.045 +65 N 0.054 +66 L 0.060 +67 S 0.061 +68 F 0.059 +69 L 0.057 +70 D 0.058 +71 I 0.060 +72 C 0.060 +73 Y 0.061 +74 T 0.061 +75 S 0.063 +76 S 0.064 +77 S 0.067 +78 V 0.070 +79 P 0.069 +80 S 0.063 +81 T 0.058 +82 L 0.054 +83 V 0.051 +84 S 0.051 +85 L 0.057 +86 I 0.066 +87 S 0.076 +88 K 0.081 +89 K 0.078 +90 R 0.070 +91 N 0.062 +92 I 0.054 +93 S 0.048 +94 F 0.043 +95 S 0.041 +96 G 0.041 +97 C 0.040 +98 A 0.037 +99 V 0.035 +100 Q 0.035 +101 M 0.036 +102 F 0.035 +103 F 0.031 +104 G 0.029 +105 F 0.029 +106 A 0.031 +107 M 0.035 +108 G 0.040 +109 S 0.046 +110 T 0.050 +111 E 0.050 +112 C 0.046 +113 L 0.041 +114 L 0.038 +115 L 0.035 +116 G 0.033 +117 M 0.032 +118 M 0.033 +119 A 0.035 +120 F 0.039 +121 D 0.043 +122 R 0.045 +123 Y 0.043 +124 V 0.041 +125 A 0.042 +126 I 0.046 +127 C 0.052 +128 N 0.058 +129 P 0.060 +130 L 0.057 +131 R 0.053 +132 Y 0.052 +133 P 0.053 +134 I 0.057 +135 I 0.061 +136 L 0.065 +137 S 0.066 +138 K 0.068 +139 V 0.068 +140 A 0.062 +141 Y 0.056 +142 V 0.060 +143 L 0.067 +144 M 0.067 +145 A 0.061 +146 S 0.055 +147 V 0.052 +148 S 0.052 +149 W 0.054 +150 L 0.060 +151 S 0.071 +152 G 0.082 +153 G 0.089 +154 I 0.095 +155 N 0.101 +156 S 0.101 +157 A 0.097 +158 V 0.095 +159 Q 0.094 +160 T 0.090 +161 L 0.084 +162 L 0.083 +163 A 0.088 +164 M 0.097 +165 R 0.110 +166 L 0.119 +167 P 0.119 +168 F 0.115 +169 C 0.116 +170 G 0.119 +171 N 0.124 +172 N 0.131 +173 I 0.140 +174 I 0.140 +175 N 0.124 +176 H 0.102 +177 F 0.085 +178 A 0.073 +179 C 0.069 +180 E 0.074 +181 I 0.085 +182 L 0.099 +183 A 0.112 +184 V 0.122 +185 L 0.127 +186 K 0.127 +187 L 0.121 +188 A 0.111 +189 C 0.106 +190 A 0.112 +191 D 0.121 +192 I 0.123 +193 S 0.118 +194 L 0.116 +195 N 0.122 +196 I 0.129 +197 I 0.132 +198 T 0.129 +199 M 0.121 +200 V 0.110 +201 I 0.098 +202 S 0.087 +203 N 0.077 +204 M 0.064 +205 A 0.055 +206 F 0.053 +207 L 0.056 +208 V 0.064 +209 L 0.073 +210 P 0.077 +211 L 0.072 +212 M 0.068 +213 V 0.069 +214 I 0.068 +215 F 0.059 +216 F 0.050 +217 S 0.044 +218 Y 0.040 +219 M 0.039 +220 F 0.043 +221 I 0.053 +222 L 0.067 +223 Y 0.077 +224 T 0.079 +225 I 0.077 +226 L 0.080 +227 Q 0.092 +228 M 0.113 +229 N 0.133 +230 S 0.141 +231 A 0.133 +232 T 0.113 +233 G 0.093 +234 R 0.079 +235 R 0.073 +236 K 0.075 +237 A 0.076 +238 F 0.076 +239 S 0.076 +240 T 0.078 +241 C 0.078 +242 S 0.078 +243 A 0.077 +244 H 0.073 +245 L 0.067 +246 T 0.064 +247 V 0.063 +248 V 0.057 +249 I 0.045 +250 I 0.034 +251 F 0.028 +252 Y 0.028 +253 G 0.031 +254 T 0.035 +255 I 0.036 +256 F 0.035 +257 F 0.039 +258 M 0.052 +259 Y 0.077 +260 A 0.114 +261 K 0.153 +262 P 0.186 +263 K 0.207 +264 S 0.220 +265 Q 0.229 +266 D 0.235 +267 L 0.235 +268 I 0.226 +269 G 0.207 +270 E 0.183 +271 E 0.165 +272 K 0.155 +273 L 0.145 +274 Q 0.128 +275 A 0.112 +276 L 0.104 +277 D 0.100 +278 K 0.094 +279 L 0.087 +280 I 0.079 +281 S 0.072 +282 L 0.071 +283 F 0.083 +284 Y 0.103 +285 G 0.117 +286 V 0.122 +287 V 0.123 +288 T 0.120 +289 P 0.109 +290 M 0.093 +291 L 0.081 +292 N 0.074 +293 P 0.068 +294 I 0.064 +295 L 0.065 +296 Y 0.069 +297 S 0.076 +298 L 0.087 +299 R 0.095 +300 N 0.091 +301 K 0.076 +302 D 0.064 +303 V 0.063 +304 K 0.073 +305 A 0.085 +306 A 0.088 +307 V 0.085 +308 K 0.083 +309 Y 0.090 +310 L 0.112 +311 L 0.151 +312 N 0.207 +313 K 0.275 +314 K 0.343 +315 P 0.386 +316 I 0.392 +317 H 0.380 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000204246.4_ENST00000641090.1_GN:OR13C3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000204246.4_ENST00000641090.1_GN:OR13C3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..237b53bbdd1f9d8ed9379235f65b19b4a0981e18 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000204246.4_ENST00000641090.1_GN:OR13C3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid @@ -0,0 +1,348 @@ +>ENSG00000204246.4|ENST00000641090.1|GN:OR13C3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:30 +1 M 0.097 +2 I 0.083 +3 V 0.065 +4 Q 0.053 +5 L 0.047 +6 I 0.043 +7 C 0.040 +8 T 0.038 +9 V 0.038 +10 C 0.039 +11 F 0.041 +12 L 0.045 +13 A 0.056 +14 V 0.074 +15 N 0.095 +16 T 0.118 +17 F 0.143 +18 H 0.165 +19 V 0.178 +20 R 0.188 +21 S 0.204 +22 S 0.225 +23 F 0.244 +24 D 0.257 +25 F 0.269 +26 L 0.287 +27 K 0.318 +28 A 0.363 +29 D 0.413 +30 D 0.456 +31 M 0.488 +32 G 0.512 +33 E 0.530 +34 I 0.539 +35 N 0.530 +36 Q 0.493 +37 T 0.426 +38 L 0.340 +39 V 0.258 +40 S 0.193 +41 E 0.152 +42 F 0.134 +43 L 0.126 +44 L 0.126 +45 L 0.134 +46 G 0.154 +47 L 0.179 +48 S 0.197 +49 G 0.199 +50 Y 0.180 +51 P 0.145 +52 K 0.108 +53 I 0.077 +54 E 0.058 +55 I 0.048 +56 V 0.047 +57 Y 0.055 +58 F 0.067 +59 A 0.071 +60 L 0.064 +61 I 0.053 +62 L 0.048 +63 V 0.049 +64 M 0.051 +65 Y 0.051 +66 L 0.047 +67 V 0.046 +68 I 0.047 +69 L 0.048 +70 I 0.051 +71 G 0.057 +72 N 0.061 +73 G 0.061 +74 V 0.059 +75 L 0.056 +76 I 0.054 +77 I 0.052 +78 A 0.050 +79 S 0.048 +80 I 0.048 +81 F 0.053 +82 D 0.060 +83 S 0.064 +84 H 0.064 +85 F 0.061 +86 H 0.056 +87 T 0.049 +88 P 0.038 +89 M 0.027 +90 Y 0.020 +91 F 0.017 +92 F 0.021 +93 L 0.029 +94 G 0.039 +95 N 0.048 +96 L 0.055 +97 S 0.057 +98 F 0.056 +99 L 0.054 +100 D 0.055 +101 I 0.057 +102 C 0.058 +103 Y 0.058 +104 T 0.059 +105 S 0.059 +106 S 0.059 +107 S 0.060 +108 V 0.060 +109 P 0.058 +110 S 0.053 +111 T 0.048 +112 L 0.044 +113 V 0.042 +114 S 0.042 +115 L 0.047 +116 I 0.056 +117 S 0.067 +118 K 0.074 +119 K 0.072 +120 R 0.066 +121 N 0.058 +122 I 0.051 +123 S 0.045 +124 F 0.039 +125 S 0.037 +126 G 0.037 +127 C 0.037 +128 A 0.035 +129 V 0.033 +130 Q 0.033 +131 M 0.034 +132 F 0.033 +133 F 0.030 +134 G 0.027 +135 F 0.027 +136 A 0.030 +137 M 0.033 +138 G 0.038 +139 S 0.044 +140 T 0.046 +141 E 0.046 +142 C 0.042 +143 L 0.037 +144 L 0.034 +145 L 0.032 +146 G 0.031 +147 M 0.030 +148 M 0.031 +149 A 0.033 +150 F 0.037 +151 D 0.042 +152 R 0.043 +153 Y 0.042 +154 V 0.040 +155 A 0.041 +156 I 0.045 +157 C 0.051 +158 N 0.057 +159 P 0.059 +160 L 0.056 +161 R 0.053 +162 Y 0.052 +163 P 0.053 +164 I 0.057 +165 I 0.063 +166 L 0.067 +167 S 0.068 +168 K 0.068 +169 V 0.065 +170 A 0.057 +171 Y 0.052 +172 V 0.057 +173 L 0.065 +174 M 0.065 +175 A 0.057 +176 S 0.050 +177 V 0.047 +178 S 0.048 +179 W 0.049 +180 L 0.053 +181 S 0.064 +182 G 0.076 +183 G 0.085 +184 I 0.090 +185 N 0.095 +186 S 0.096 +187 A 0.092 +188 V 0.089 +189 Q 0.089 +190 T 0.086 +191 L 0.081 +192 L 0.080 +193 A 0.085 +194 M 0.094 +195 R 0.107 +196 L 0.117 +197 P 0.118 +198 F 0.115 +199 C 0.115 +200 G 0.118 +201 N 0.120 +202 N 0.126 +203 I 0.134 +204 I 0.134 +205 N 0.119 +206 H 0.098 +207 F 0.082 +208 A 0.071 +209 C 0.069 +210 E 0.074 +211 I 0.084 +212 L 0.097 +213 A 0.108 +214 V 0.118 +215 L 0.123 +216 K 0.124 +217 L 0.117 +218 A 0.106 +219 C 0.100 +220 A 0.104 +221 D 0.113 +222 I 0.115 +223 S 0.111 +224 L 0.109 +225 N 0.114 +226 I 0.121 +227 I 0.124 +228 T 0.121 +229 M 0.113 +230 V 0.102 +231 I 0.091 +232 S 0.082 +233 N 0.072 +234 M 0.061 +235 A 0.053 +236 F 0.051 +237 L 0.055 +238 V 0.063 +239 L 0.072 +240 P 0.075 +241 L 0.069 +242 M 0.064 +243 V 0.066 +244 I 0.065 +245 F 0.058 +246 F 0.048 +247 S 0.041 +248 Y 0.038 +249 M 0.037 +250 F 0.041 +251 I 0.052 +252 L 0.065 +253 Y 0.075 +254 T 0.078 +255 I 0.075 +256 L 0.077 +257 Q 0.089 +258 M 0.109 +259 N 0.128 +260 S 0.137 +261 A 0.130 +262 T 0.112 +263 G 0.093 +264 R 0.080 +265 R 0.075 +266 K 0.076 +267 A 0.077 +268 F 0.075 +269 S 0.075 +270 T 0.076 +271 C 0.077 +272 S 0.076 +273 A 0.075 +274 H 0.072 +275 L 0.066 +276 T 0.063 +277 V 0.063 +278 V 0.057 +279 I 0.046 +280 I 0.034 +281 F 0.028 +282 Y 0.027 +283 G 0.030 +284 T 0.034 +285 I 0.035 +286 F 0.034 +287 F 0.036 +288 M 0.048 +289 Y 0.072 +290 A 0.109 +291 K 0.151 +292 P 0.187 +293 K 0.212 +294 S 0.227 +295 Q 0.239 +296 D 0.247 +297 L 0.249 +298 I 0.240 +299 G 0.219 +300 E 0.193 +301 E 0.172 +302 K 0.161 +303 L 0.150 +304 Q 0.133 +305 A 0.117 +306 L 0.109 +307 D 0.105 +308 K 0.099 +309 L 0.092 +310 I 0.084 +311 S 0.076 +312 L 0.075 +313 F 0.087 +314 Y 0.108 +315 G 0.122 +316 V 0.126 +317 V 0.125 +318 T 0.121 +319 P 0.109 +320 M 0.093 +321 L 0.081 +322 N 0.074 +323 P 0.068 +324 I 0.064 +325 L 0.065 +326 Y 0.069 +327 S 0.075 +328 L 0.086 +329 R 0.095 +330 N 0.090 +331 K 0.075 +332 D 0.063 +333 V 0.062 +334 K 0.071 +335 A 0.083 +336 A 0.086 +337 V 0.082 +338 K 0.080 +339 Y 0.086 +340 L 0.107 +341 L 0.145 +342 N 0.200 +343 K 0.267 +344 K 0.334 +345 P 0.377 +346 I 0.386 +347 H 0.375 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000204390.11_ENST00000375654.5_GN:HSPA1L_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000204390.11_ENST00000375654.5_GN:HSPA1L_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a7bec3e0a9e2bb92a1091acdfbbf598cad0aff7d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000204390.11_ENST00000375654.5_GN:HSPA1L_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,642 @@ +>ENSG00000204390.11|ENST00000375654.5|GN:HSPA1L|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.413 +2 A 0.404 +3 T 0.379 +4 A 0.330 +5 K 0.261 +6 G 0.186 +7 I 0.120 +8 A 0.071 +9 I 0.042 +10 G 0.028 +11 I 0.026 +12 D 0.031 +13 L 0.035 +14 G 0.038 +15 T 0.040 +16 T 0.040 +17 Y 0.038 +18 S 0.036 +19 C 0.035 +20 V 0.036 +21 G 0.037 +22 V 0.038 +23 F 0.043 +24 Q 0.049 +25 H 0.055 +26 G 0.061 +27 K 0.065 +28 V 0.069 +29 E 0.074 +30 I 0.084 +31 I 0.093 +32 A 0.100 +33 N 0.106 +34 D 0.116 +35 Q 0.126 +36 G 0.125 +37 N 0.109 +38 R 0.088 +39 T 0.077 +40 T 0.077 +41 P 0.080 +42 S 0.080 +43 Y 0.077 +44 V 0.077 +45 A 0.080 +46 F 0.081 +47 T 0.080 +48 D 0.079 +49 T 0.082 +50 E 0.089 +51 R 0.095 +52 L 0.095 +53 I 0.093 +54 G 0.093 +55 D 0.099 +56 A 0.105 +57 A 0.102 +58 K 0.089 +59 N 0.076 +60 Q 0.068 +61 V 0.066 +62 A 0.071 +63 M 0.083 +64 N 0.097 +65 P 0.108 +66 Q 0.114 +67 N 0.117 +68 T 0.120 +69 V 0.120 +70 F 0.119 +71 D 0.118 +72 A 0.116 +73 K 0.110 +74 R 0.102 +75 L 0.093 +76 I 0.082 +77 G 0.071 +78 R 0.064 +79 K 0.063 +80 F 0.061 +81 N 0.055 +82 D 0.048 +83 P 0.045 +84 V 0.045 +85 V 0.044 +86 Q 0.042 +87 A 0.042 +88 D 0.045 +89 M 0.045 +90 K 0.041 +91 L 0.035 +92 W 0.031 +93 P 0.031 +94 F 0.036 +95 Q 0.045 +96 V 0.055 +97 I 0.062 +98 N 0.070 +99 E 0.081 +100 G 0.093 +101 G 0.101 +102 K 0.100 +103 P 0.092 +104 K 0.080 +105 V 0.067 +106 L 0.057 +107 V 0.049 +108 S 0.046 +109 Y 0.053 +110 K 0.072 +111 G 0.093 +112 E 0.100 +113 N 0.090 +114 K 0.073 +115 A 0.059 +116 F 0.053 +117 Y 0.054 +118 P 0.062 +119 E 0.074 +120 E 0.085 +121 I 0.087 +122 S 0.079 +123 S 0.068 +124 M 0.064 +125 V 0.064 +126 L 0.062 +127 T 0.058 +128 K 0.056 +129 L 0.061 +130 K 0.070 +131 E 0.077 +132 T 0.076 +133 A 0.074 +134 E 0.079 +135 A 0.083 +136 F 0.081 +137 L 0.077 +138 G 0.082 +139 H 0.091 +140 P 0.092 +141 V 0.078 +142 T 0.058 +143 N 0.040 +144 A 0.026 +145 V 0.018 +146 I 0.017 +147 T 0.023 +148 V 0.033 +149 P 0.041 +150 A 0.045 +151 Y 0.044 +152 F 0.039 +153 N 0.033 +154 D 0.030 +155 S 0.031 +156 Q 0.034 +157 R 0.039 +158 Q 0.047 +159 A 0.054 +160 T 0.055 +161 K 0.055 +162 D 0.058 +163 A 0.059 +164 G 0.054 +165 V 0.050 +166 I 0.054 +167 A 0.062 +168 G 0.069 +169 L 0.072 +170 N 0.073 +171 V 0.067 +172 L 0.056 +173 R 0.045 +174 I 0.043 +175 I 0.049 +176 N 0.056 +177 E 0.060 +178 P 0.057 +179 T 0.051 +180 A 0.046 +181 A 0.041 +182 A 0.038 +183 I 0.037 +184 A 0.039 +185 Y 0.043 +186 G 0.051 +187 L 0.070 +188 D 0.103 +189 K 0.147 +190 G 0.187 +191 G 0.203 +192 Q 0.185 +193 G 0.143 +194 E 0.098 +195 R 0.066 +196 H 0.048 +197 V 0.038 +198 L 0.033 +199 I 0.031 +200 F 0.030 +201 D 0.029 +202 L 0.030 +203 G 0.032 +204 G 0.036 +205 G 0.040 +206 T 0.045 +207 F 0.049 +208 D 0.053 +209 V 0.053 +210 S 0.051 +211 I 0.048 +212 L 0.049 +213 T 0.056 +214 I 0.070 +215 D 0.091 +216 D 0.109 +217 G 0.112 +218 I 0.100 +219 F 0.084 +220 E 0.074 +221 V 0.071 +222 K 0.071 +223 A 0.072 +224 T 0.072 +225 A 0.069 +226 G 0.065 +227 D 0.065 +228 T 0.070 +229 H 0.079 +230 L 0.088 +231 G 0.096 +232 G 0.101 +233 E 0.103 +234 D 0.100 +235 F 0.091 +236 D 0.078 +237 N 0.067 +238 R 0.062 +239 L 0.063 +240 V 0.067 +241 S 0.066 +242 H 0.058 +243 F 0.053 +244 V 0.057 +245 E 0.061 +246 E 0.058 +247 F 0.056 +248 K 0.059 +249 R 0.063 +250 K 0.059 +251 H 0.053 +252 K 0.053 +253 K 0.059 +254 D 0.064 +255 I 0.063 +256 S 0.058 +257 Q 0.054 +258 N 0.051 +259 K 0.047 +260 R 0.042 +261 A 0.040 +262 V 0.040 +263 R 0.044 +264 R 0.052 +265 L 0.058 +266 R 0.059 +267 T 0.058 +268 A 0.058 +269 C 0.058 +270 E 0.056 +271 R 0.056 +272 A 0.057 +273 K 0.058 +274 R 0.059 +275 T 0.061 +276 L 0.063 +277 S 0.062 +278 S 0.060 +279 S 0.059 +280 T 0.058 +281 Q 0.055 +282 A 0.052 +283 N 0.050 +284 L 0.050 +285 E 0.049 +286 I 0.047 +287 D 0.045 +288 S 0.044 +289 L 0.043 +290 Y 0.043 +291 E 0.049 +292 G 0.056 +293 I 0.060 +294 D 0.058 +295 F 0.054 +296 Y 0.050 +297 T 0.048 +298 S 0.049 +299 I 0.054 +300 T 0.061 +301 R 0.069 +302 A 0.073 +303 R 0.072 +304 F 0.071 +305 E 0.076 +306 E 0.083 +307 L 0.081 +308 C 0.070 +309 A 0.062 +310 D 0.064 +311 L 0.071 +312 F 0.074 +313 R 0.072 +314 G 0.070 +315 T 0.065 +316 L 0.055 +317 E 0.047 +318 P 0.043 +319 V 0.043 +320 E 0.045 +321 K 0.050 +322 A 0.061 +323 L 0.073 +324 R 0.081 +325 D 0.080 +326 A 0.075 +327 K 0.071 +328 M 0.069 +329 D 0.068 +330 K 0.069 +331 A 0.077 +332 K 0.085 +333 I 0.083 +334 H 0.068 +335 D 0.048 +336 I 0.031 +337 V 0.023 +338 L 0.023 +339 V 0.029 +340 G 0.037 +341 G 0.045 +342 S 0.052 +343 T 0.056 +344 R 0.057 +345 I 0.059 +346 P 0.064 +347 K 0.072 +348 V 0.078 +349 Q 0.081 +350 R 0.079 +351 L 0.070 +352 L 0.058 +353 Q 0.052 +354 D 0.053 +355 Y 0.058 +356 F 0.068 +357 N 0.083 +358 G 0.102 +359 R 0.118 +360 D 0.125 +361 L 0.118 +362 N 0.103 +363 K 0.093 +364 S 0.092 +365 I 0.097 +366 N 0.098 +367 P 0.094 +368 D 0.089 +369 E 0.087 +370 A 0.088 +371 V 0.087 +372 A 0.081 +373 Y 0.074 +374 G 0.070 +375 A 0.070 +376 A 0.071 +377 V 0.077 +378 Q 0.088 +379 A 0.100 +380 A 0.109 +381 I 0.113 +382 L 0.116 +383 M 0.127 +384 G 0.152 +385 D 0.184 +386 K 0.209 +387 S 0.215 +388 E 0.205 +389 K 0.191 +390 V 0.184 +391 Q 0.184 +392 D 0.184 +393 L 0.178 +394 L 0.167 +395 L 0.154 +396 L 0.139 +397 D 0.124 +398 V 0.113 +399 A 0.104 +400 P 0.092 +401 L 0.081 +402 S 0.076 +403 L 0.073 +404 G 0.072 +405 L 0.081 +406 E 0.099 +407 T 0.120 +408 A 0.137 +409 G 0.147 +410 G 0.145 +411 V 0.130 +412 M 0.106 +413 T 0.088 +414 A 0.084 +415 L 0.092 +416 I 0.101 +417 K 0.101 +418 R 0.095 +419 N 0.090 +420 S 0.090 +421 T 0.092 +422 I 0.095 +423 P 0.100 +424 T 0.105 +425 K 0.105 +426 Q 0.100 +427 T 0.096 +428 Q 0.094 +429 I 0.091 +430 F 0.088 +431 T 0.087 +432 T 0.089 +433 Y 0.095 +434 S 0.105 +435 D 0.117 +436 N 0.128 +437 Q 0.136 +438 P 0.138 +439 G 0.135 +440 V 0.124 +441 L 0.110 +442 I 0.094 +443 Q 0.080 +444 V 0.069 +445 Y 0.061 +446 E 0.056 +447 G 0.052 +448 E 0.050 +449 R 0.051 +450 A 0.058 +451 M 0.071 +452 T 0.081 +453 K 0.086 +454 D 0.086 +455 N 0.085 +456 N 0.087 +457 L 0.092 +458 L 0.094 +459 G 0.093 +460 R 0.092 +461 F 0.096 +462 D 0.105 +463 L 0.119 +464 T 0.134 +465 G 0.153 +466 I 0.169 +467 P 0.174 +468 P 0.169 +469 A 0.165 +470 P 0.173 +471 R 0.186 +472 G 0.188 +473 V 0.173 +474 P 0.149 +475 Q 0.127 +476 I 0.108 +477 E 0.091 +478 V 0.077 +479 T 0.070 +480 F 0.071 +481 D 0.080 +482 I 0.095 +483 D 0.112 +484 A 0.126 +485 N 0.132 +486 G 0.128 +487 I 0.114 +488 L 0.095 +489 N 0.080 +490 V 0.071 +491 T 0.065 +492 A 0.061 +493 T 0.061 +494 D 0.065 +495 K 0.078 +496 S 0.098 +497 T 0.123 +498 G 0.141 +499 K 0.147 +500 V 0.145 +501 N 0.147 +502 K 0.158 +503 I 0.178 +504 T 0.203 +505 I 0.237 +506 T 0.282 +507 N 0.334 +508 D 0.379 +509 K 0.394 +510 G 0.371 +511 R 0.327 +512 L 0.287 +513 S 0.258 +514 K 0.235 +515 E 0.217 +516 E 0.204 +517 I 0.190 +518 E 0.181 +519 R 0.180 +520 M 0.184 +521 V 0.189 +522 L 0.195 +523 D 0.201 +524 A 0.198 +525 E 0.184 +526 K 0.171 +527 Y 0.171 +528 K 0.183 +529 A 0.198 +530 E 0.211 +531 D 0.221 +532 E 0.226 +533 V 0.221 +534 Q 0.210 +535 R 0.192 +536 E 0.172 +537 K 0.159 +538 I 0.155 +539 A 0.151 +540 A 0.143 +541 K 0.140 +542 N 0.143 +543 A 0.141 +544 L 0.130 +545 E 0.113 +546 S 0.096 +547 Y 0.082 +548 A 0.070 +549 F 0.064 +550 N 0.065 +551 M 0.068 +552 K 0.071 +553 S 0.078 +554 V 0.090 +555 V 0.109 +556 S 0.133 +557 D 0.154 +558 E 0.161 +559 G 0.154 +560 L 0.145 +561 K 0.139 +562 G 0.138 +563 K 0.133 +564 I 0.117 +565 S 0.092 +566 E 0.068 +567 S 0.054 +568 D 0.055 +569 K 0.066 +570 N 0.079 +571 K 0.087 +572 I 0.092 +573 L 0.096 +574 D 0.096 +575 K 0.089 +576 C 0.079 +577 N 0.073 +578 E 0.073 +579 L 0.082 +580 L 0.092 +581 S 0.091 +582 W 0.078 +583 L 0.067 +584 E 0.063 +585 V 0.064 +586 N 0.067 +587 Q 0.073 +588 L 0.081 +589 A 0.089 +590 E 0.093 +591 K 0.087 +592 D 0.075 +593 E 0.069 +594 F 0.072 +595 D 0.084 +596 H 0.096 +597 K 0.105 +598 R 0.111 +599 K 0.111 +600 E 0.106 +601 L 0.099 +602 E 0.094 +603 Q 0.090 +604 M 0.083 +605 C 0.073 +606 N 0.067 +607 P 0.071 +608 I 0.080 +609 I 0.087 +610 T 0.095 +611 K 0.116 +612 L 0.159 +613 Y 0.232 +614 Q 0.325 +615 G 0.416 +616 G 0.481 +617 C 0.518 +618 T 0.549 +619 G 0.586 +620 P 0.625 +621 A 0.654 +622 C 0.670 +623 G 0.670 +624 T 0.649 +625 G 0.609 +626 Y 0.578 +627 V 0.582 +628 P 0.611 +629 G 0.638 +630 R 0.654 +631 P 0.665 +632 A 0.674 +633 T 0.681 +634 G 0.688 +635 P 0.696 +636 T 0.699 +637 I 0.701 +638 E 0.702 +639 E 0.690 +640 V 0.658 +641 D 0.628 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000204390.11_ENST00000375654.5_GN:HSPA1L_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:64.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000204390.11_ENST00000375654.5_GN:HSPA1L_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:64.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..84bae074c2cf3c767886f4e8c7b3bced7f144295 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000204390.11_ENST00000375654.5_GN:HSPA1L_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:64.caid @@ -0,0 +1,706 @@ +>ENSG00000204390.11|ENST00000375654.5|GN:HSPA1L|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:64 +1 M 0.272 +2 G 0.273 +3 Q 0.277 +4 F 0.282 +5 G 0.281 +6 K 0.276 +7 R 0.275 +8 L 0.274 +9 L 0.267 +10 S 0.260 +11 W 0.262 +12 S 0.271 +13 R 0.282 +14 L 0.302 +15 K 0.341 +16 F 0.403 +17 A 0.474 +18 G 0.533 +19 R 0.576 +20 D 0.608 +21 G 0.630 +22 V 0.641 +23 G 0.646 +24 G 0.648 +25 G 0.640 +26 G 0.624 +27 T 0.606 +28 P 0.587 +29 V 0.566 +30 V 0.545 +31 Q 0.524 +32 F 0.502 +33 D 0.479 +34 I 0.466 +35 E 0.470 +36 G 0.493 +37 A 0.524 +38 P 0.553 +39 T 0.579 +40 Y 0.601 +41 S 0.615 +42 L 0.614 +43 G 0.601 +44 L 0.583 +45 R 0.562 +46 N 0.530 +47 L 0.481 +48 D 0.418 +49 V 0.358 +50 S 0.323 +51 K 0.321 +52 L 0.331 +53 K 0.336 +54 R 0.344 +55 R 0.370 +56 R 0.403 +57 R 0.430 +58 E 0.455 +59 T 0.480 +60 R 0.504 +61 P 0.534 +62 Q 0.572 +63 R 0.608 +64 T 0.626 +65 M 0.614 +66 A 0.569 +67 T 0.492 +68 A 0.397 +69 K 0.298 +70 G 0.208 +71 I 0.133 +72 A 0.080 +73 I 0.046 +74 G 0.030 +75 I 0.026 +76 D 0.029 +77 L 0.033 +78 G 0.036 +79 T 0.038 +80 T 0.040 +81 Y 0.038 +82 S 0.035 +83 C 0.034 +84 V 0.033 +85 G 0.032 +86 V 0.032 +87 F 0.036 +88 Q 0.042 +89 H 0.048 +90 G 0.053 +91 K 0.057 +92 V 0.060 +93 E 0.065 +94 I 0.073 +95 I 0.082 +96 A 0.089 +97 N 0.096 +98 D 0.106 +99 Q 0.116 +100 G 0.114 +101 N 0.098 +102 R 0.078 +103 T 0.069 +104 T 0.070 +105 P 0.074 +106 S 0.074 +107 Y 0.072 +108 V 0.070 +109 A 0.071 +110 F 0.072 +111 T 0.071 +112 D 0.071 +113 T 0.077 +114 E 0.084 +115 R 0.089 +116 L 0.089 +117 I 0.085 +118 G 0.085 +119 D 0.090 +120 A 0.096 +121 A 0.094 +122 K 0.082 +123 N 0.069 +124 Q 0.061 +125 V 0.058 +126 A 0.062 +127 M 0.073 +128 N 0.086 +129 P 0.098 +130 Q 0.105 +131 N 0.110 +132 T 0.113 +133 V 0.112 +134 F 0.109 +135 D 0.108 +136 A 0.106 +137 K 0.101 +138 R 0.094 +139 L 0.087 +140 I 0.075 +141 G 0.064 +142 R 0.058 +143 K 0.058 +144 F 0.056 +145 N 0.051 +146 D 0.046 +147 P 0.043 +148 V 0.043 +149 V 0.042 +150 Q 0.040 +151 A 0.040 +152 D 0.042 +153 M 0.042 +154 K 0.039 +155 L 0.033 +156 W 0.029 +157 P 0.029 +158 F 0.035 +159 Q 0.044 +160 V 0.053 +161 I 0.059 +162 N 0.065 +163 E 0.075 +164 G 0.087 +165 G 0.096 +166 K 0.096 +167 P 0.089 +168 K 0.077 +169 V 0.064 +170 L 0.054 +171 V 0.046 +172 S 0.044 +173 Y 0.050 +174 K 0.067 +175 G 0.086 +176 E 0.093 +177 N 0.085 +178 K 0.069 +179 A 0.056 +180 F 0.050 +181 Y 0.051 +182 P 0.059 +183 E 0.070 +184 E 0.081 +185 I 0.083 +186 S 0.076 +187 S 0.065 +188 M 0.061 +189 V 0.060 +190 L 0.058 +191 T 0.054 +192 K 0.052 +193 L 0.057 +194 K 0.066 +195 E 0.073 +196 T 0.072 +197 A 0.070 +198 E 0.074 +199 A 0.078 +200 F 0.074 +201 L 0.070 +202 G 0.074 +203 H 0.083 +204 P 0.084 +205 V 0.071 +206 T 0.052 +207 N 0.036 +208 A 0.023 +209 V 0.016 +210 I 0.015 +211 T 0.020 +212 V 0.028 +213 P 0.036 +214 A 0.039 +215 Y 0.038 +216 F 0.034 +217 N 0.028 +218 D 0.026 +219 S 0.027 +220 Q 0.030 +221 R 0.035 +222 Q 0.042 +223 A 0.048 +224 T 0.048 +225 K 0.048 +226 D 0.051 +227 A 0.052 +228 G 0.047 +229 V 0.043 +230 I 0.046 +231 A 0.053 +232 G 0.059 +233 L 0.063 +234 N 0.064 +235 V 0.060 +236 L 0.050 +237 R 0.041 +238 I 0.040 +239 I 0.045 +240 N 0.052 +241 E 0.056 +242 P 0.055 +243 T 0.049 +244 A 0.044 +245 A 0.040 +246 A 0.036 +247 I 0.036 +248 A 0.038 +249 Y 0.040 +250 G 0.048 +251 L 0.066 +252 D 0.098 +253 K 0.140 +254 G 0.179 +255 G 0.194 +256 Q 0.175 +257 G 0.135 +258 E 0.093 +259 R 0.063 +260 H 0.047 +261 V 0.038 +262 L 0.033 +263 I 0.031 +264 F 0.029 +265 D 0.029 +266 L 0.030 +267 G 0.032 +268 G 0.035 +269 G 0.039 +270 T 0.043 +271 F 0.048 +272 D 0.052 +273 V 0.052 +274 S 0.050 +275 I 0.048 +276 L 0.049 +277 T 0.055 +278 I 0.069 +279 D 0.090 +280 D 0.107 +281 G 0.110 +282 I 0.098 +283 F 0.082 +284 E 0.072 +285 V 0.069 +286 K 0.070 +287 A 0.072 +288 T 0.072 +289 A 0.069 +290 G 0.066 +291 D 0.065 +292 T 0.070 +293 H 0.080 +294 L 0.089 +295 G 0.097 +296 G 0.102 +297 E 0.103 +298 D 0.101 +299 F 0.092 +300 D 0.078 +301 N 0.066 +302 R 0.059 +303 L 0.055 +304 V 0.051 +305 S 0.046 +306 H 0.042 +307 F 0.045 +308 V 0.055 +309 E 0.061 +310 E 0.059 +311 F 0.056 +312 K 0.059 +313 R 0.063 +314 K 0.059 +315 H 0.054 +316 K 0.056 +317 K 0.062 +318 D 0.067 +319 I 0.066 +320 S 0.060 +321 Q 0.055 +322 N 0.052 +323 K 0.048 +324 R 0.043 +325 A 0.041 +326 V 0.041 +327 R 0.045 +328 R 0.053 +329 L 0.060 +330 R 0.061 +331 T 0.059 +332 A 0.059 +333 C 0.059 +334 E 0.057 +335 R 0.057 +336 A 0.058 +337 K 0.060 +338 R 0.061 +339 T 0.063 +340 L 0.064 +341 S 0.063 +342 S 0.061 +343 S 0.061 +344 T 0.060 +345 Q 0.057 +346 A 0.054 +347 N 0.052 +348 L 0.051 +349 E 0.050 +350 I 0.048 +351 D 0.046 +352 S 0.045 +353 L 0.043 +354 Y 0.044 +355 E 0.049 +356 G 0.057 +357 I 0.061 +358 D 0.060 +359 F 0.056 +360 Y 0.052 +361 T 0.050 +362 S 0.051 +363 I 0.056 +364 T 0.063 +365 R 0.070 +366 A 0.073 +367 R 0.072 +368 F 0.071 +369 E 0.076 +370 E 0.082 +371 L 0.080 +372 C 0.070 +373 A 0.063 +374 D 0.066 +375 L 0.073 +376 F 0.075 +377 R 0.073 +378 G 0.070 +379 T 0.065 +380 L 0.056 +381 E 0.048 +382 P 0.044 +383 V 0.044 +384 E 0.046 +385 K 0.051 +386 A 0.062 +387 L 0.073 +388 R 0.081 +389 D 0.080 +390 A 0.075 +391 K 0.071 +392 M 0.069 +393 D 0.067 +394 K 0.069 +395 A 0.076 +396 K 0.084 +397 I 0.081 +398 H 0.067 +399 D 0.048 +400 I 0.032 +401 V 0.023 +402 L 0.024 +403 V 0.029 +404 G 0.038 +405 G 0.046 +406 S 0.052 +407 T 0.056 +408 R 0.057 +409 I 0.058 +410 P 0.063 +411 K 0.071 +412 V 0.078 +413 Q 0.081 +414 R 0.079 +415 L 0.070 +416 L 0.058 +417 Q 0.051 +418 D 0.052 +419 Y 0.057 +420 F 0.065 +421 N 0.079 +422 G 0.097 +423 R 0.112 +424 D 0.120 +425 L 0.115 +426 N 0.101 +427 K 0.092 +428 S 0.092 +429 I 0.097 +430 N 0.099 +431 P 0.095 +432 D 0.091 +433 E 0.089 +434 A 0.090 +435 V 0.089 +436 A 0.082 +437 Y 0.075 +438 G 0.071 +439 A 0.070 +440 A 0.071 +441 V 0.077 +442 Q 0.088 +443 A 0.099 +444 A 0.107 +445 I 0.110 +446 L 0.113 +447 M 0.124 +448 G 0.150 +449 D 0.184 +450 K 0.211 +451 S 0.219 +452 E 0.211 +453 K 0.198 +454 V 0.191 +455 Q 0.191 +456 D 0.189 +457 L 0.182 +458 L 0.171 +459 L 0.159 +460 L 0.144 +461 D 0.130 +462 V 0.119 +463 A 0.110 +464 P 0.099 +465 L 0.088 +466 S 0.082 +467 L 0.079 +468 G 0.077 +469 L 0.085 +470 E 0.102 +471 T 0.123 +472 A 0.141 +473 G 0.151 +474 G 0.150 +475 V 0.134 +476 M 0.110 +477 T 0.092 +478 A 0.088 +479 L 0.096 +480 I 0.105 +481 K 0.106 +482 R 0.099 +483 N 0.093 +484 S 0.094 +485 T 0.096 +486 I 0.098 +487 P 0.103 +488 T 0.107 +489 K 0.106 +490 Q 0.101 +491 T 0.097 +492 Q 0.096 +493 I 0.094 +494 F 0.092 +495 T 0.091 +496 T 0.092 +497 Y 0.096 +498 S 0.106 +499 D 0.118 +500 N 0.130 +501 Q 0.138 +502 P 0.140 +503 G 0.137 +504 V 0.126 +505 L 0.111 +506 I 0.096 +507 Q 0.082 +508 V 0.071 +509 Y 0.063 +510 E 0.059 +511 G 0.055 +512 E 0.052 +513 R 0.053 +514 A 0.062 +515 M 0.074 +516 T 0.085 +517 K 0.089 +518 D 0.089 +519 N 0.088 +520 N 0.090 +521 L 0.094 +522 L 0.096 +523 G 0.095 +524 R 0.093 +525 F 0.097 +526 D 0.106 +527 L 0.119 +528 T 0.134 +529 G 0.152 +530 I 0.168 +531 P 0.174 +532 P 0.169 +533 A 0.168 +534 P 0.177 +535 R 0.191 +536 G 0.193 +537 V 0.176 +538 P 0.152 +539 Q 0.130 +540 I 0.111 +541 E 0.094 +542 V 0.080 +543 T 0.073 +544 F 0.074 +545 D 0.083 +546 I 0.098 +547 D 0.115 +548 A 0.129 +549 N 0.135 +550 G 0.130 +551 I 0.116 +552 L 0.098 +553 N 0.083 +554 V 0.074 +555 T 0.067 +556 A 0.063 +557 T 0.062 +558 D 0.067 +559 K 0.079 +560 S 0.099 +561 T 0.124 +562 G 0.142 +563 K 0.147 +564 V 0.146 +565 N 0.148 +566 K 0.160 +567 I 0.181 +568 T 0.207 +569 I 0.241 +570 T 0.285 +571 N 0.335 +572 D 0.378 +573 K 0.392 +574 G 0.368 +575 R 0.323 +576 L 0.283 +577 S 0.255 +578 K 0.233 +579 E 0.217 +580 E 0.205 +581 I 0.191 +582 E 0.181 +583 R 0.179 +584 M 0.183 +585 V 0.188 +586 L 0.195 +587 D 0.203 +588 A 0.201 +589 E 0.188 +590 K 0.174 +591 Y 0.175 +592 K 0.188 +593 A 0.204 +594 E 0.218 +595 D 0.229 +596 E 0.233 +597 V 0.229 +598 Q 0.217 +599 R 0.199 +600 E 0.179 +601 K 0.167 +602 I 0.162 +603 A 0.157 +604 A 0.149 +605 K 0.145 +606 N 0.146 +607 A 0.144 +608 L 0.131 +609 E 0.113 +610 S 0.096 +611 Y 0.082 +612 A 0.069 +613 F 0.063 +614 N 0.064 +615 M 0.067 +616 K 0.071 +617 S 0.077 +618 V 0.089 +619 V 0.108 +620 S 0.132 +621 D 0.152 +622 E 0.158 +623 G 0.152 +624 L 0.144 +625 K 0.139 +626 G 0.137 +627 K 0.132 +628 I 0.117 +629 S 0.093 +630 E 0.069 +631 S 0.056 +632 D 0.056 +633 K 0.066 +634 N 0.079 +635 K 0.086 +636 I 0.092 +637 L 0.097 +638 D 0.096 +639 K 0.089 +640 C 0.080 +641 N 0.074 +642 E 0.074 +643 L 0.081 +644 L 0.089 +645 S 0.087 +646 W 0.075 +647 L 0.065 +648 E 0.062 +649 V 0.064 +650 N 0.068 +651 Q 0.073 +652 L 0.082 +653 A 0.090 +654 E 0.093 +655 K 0.088 +656 D 0.077 +657 E 0.070 +658 F 0.074 +659 D 0.085 +660 H 0.097 +661 K 0.106 +662 R 0.112 +663 K 0.112 +664 E 0.106 +665 L 0.094 +666 E 0.083 +667 Q 0.075 +668 M 0.070 +669 C 0.066 +670 N 0.064 +671 P 0.070 +672 I 0.080 +673 I 0.087 +674 T 0.095 +675 K 0.116 +676 L 0.160 +677 Y 0.232 +678 Q 0.325 +679 G 0.417 +680 G 0.481 +681 C 0.516 +682 T 0.546 +683 G 0.583 +684 P 0.623 +685 A 0.652 +686 C 0.668 +687 G 0.666 +688 T 0.642 +689 G 0.598 +690 Y 0.563 +691 V 0.564 +692 P 0.592 +693 G 0.618 +694 R 0.630 +695 P 0.636 +696 A 0.636 +697 T 0.635 +698 G 0.636 +699 P 0.638 +700 T 0.638 +701 I 0.643 +702 E 0.648 +703 E 0.624 +704 V 0.565 +705 D 0.511 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000204710.3_ENST00000377185.3_GN:SPDYC_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000204710.3_ENST00000377185.3_GN:SPDYC_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ef8d19fe9fbf7e7a4775c4ddebc8dc0b543b2cc7 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000204710.3_ENST00000377185.3_GN:SPDYC_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,275 @@ +>ENSG00000204710.3|ENST00000377185.3|GN:SPDYC|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.449 +2 S 0.475 +3 D 0.509 +4 S 0.535 +5 Q 0.553 +6 D 0.567 +7 P 0.580 +8 T 0.589 +9 T 0.594 +10 S 0.603 +11 P 0.616 +12 V 0.632 +13 V 0.649 +14 T 0.663 +15 T 0.664 +16 Q 0.650 +17 V 0.639 +18 E 0.651 +19 L 0.680 +20 G 0.706 +21 G 0.721 +22 C 0.728 +23 S 0.731 +24 R 0.732 +25 Q 0.733 +26 G 0.733 +27 G 0.732 +28 G 0.719 +29 N 0.678 +30 G 0.598 +31 F 0.496 +32 L 0.402 +33 R 0.330 +34 F 0.272 +35 R 0.222 +36 Q 0.180 +37 H 0.140 +38 Q 0.105 +39 E 0.079 +40 V 0.065 +41 Q 0.058 +42 A 0.055 +43 F 0.055 +44 L 0.061 +45 S 0.068 +46 L 0.070 +47 L 0.068 +48 E 0.064 +49 D 0.059 +50 S 0.051 +51 F 0.044 +52 V 0.040 +53 Q 0.039 +54 E 0.041 +55 F 0.048 +56 L 0.060 +57 S 0.078 +58 K 0.094 +59 D 0.105 +60 P 0.110 +61 C 0.108 +62 F 0.100 +63 Q 0.092 +64 I 0.088 +65 S 0.086 +66 D 0.082 +67 K 0.076 +68 Y 0.069 +69 L 0.064 +70 L 0.062 +71 A 0.060 +72 M 0.057 +73 V 0.051 +74 L 0.044 +75 V 0.040 +76 Y 0.042 +77 F 0.047 +78 Q 0.055 +79 R 0.065 +80 A 0.074 +81 H 0.079 +82 L 0.081 +83 K 0.085 +84 L 0.092 +85 S 0.100 +86 E 0.109 +87 Y 0.113 +88 T 0.108 +89 H 0.093 +90 S 0.079 +91 S 0.071 +92 L 0.067 +93 F 0.066 +94 L 0.070 +95 A 0.072 +96 L 0.067 +97 Y 0.061 +98 L 0.058 +99 A 0.058 +100 N 0.057 +101 D 0.060 +102 M 0.067 +103 E 0.079 +104 E 0.094 +105 D 0.115 +106 L 0.140 +107 E 0.161 +108 G 0.165 +109 P 0.147 +110 K 0.123 +111 C 0.105 +112 E 0.095 +113 I 0.086 +114 F 0.077 +115 P 0.072 +116 W 0.073 +117 A 0.080 +118 L 0.088 +119 G 0.093 +120 K 0.094 +121 D 0.091 +122 W 0.084 +123 C 0.076 +124 L 0.072 +125 R 0.074 +126 V 0.078 +127 G 0.080 +128 K 0.076 +129 F 0.073 +130 L 0.073 +131 H 0.072 +132 Q 0.063 +133 R 0.050 +134 D 0.041 +135 K 0.040 +136 L 0.047 +137 W 0.058 +138 A 0.065 +139 R 0.064 +140 M 0.060 +141 G 0.061 +142 F 0.063 +143 R 0.066 +144 A 0.067 +145 V 0.069 +146 V 0.068 +147 S 0.064 +148 R 0.058 +149 Q 0.050 +150 C 0.040 +151 C 0.034 +152 E 0.032 +153 E 0.034 +154 V 0.037 +155 M 0.040 +156 A 0.045 +157 K 0.052 +158 E 0.061 +159 P 0.073 +160 F 0.085 +161 H 0.092 +162 W 0.094 +163 A 0.092 +164 W 0.091 +165 T 0.096 +166 R 0.112 +167 D 0.147 +168 R 0.209 +169 R 0.297 +170 P 0.398 +171 H 0.500 +172 H 0.586 +173 G 0.645 +174 G 0.672 +175 V 0.676 +176 Q 0.670 +177 R 0.659 +178 V 0.649 +179 C 0.649 +180 P 0.665 +181 Q 0.692 +182 V 0.720 +183 P 0.740 +184 V 0.748 +185 R 0.744 +186 L 0.734 +187 P 0.724 +188 R 0.722 +189 G 0.729 +190 P 0.740 +191 G 0.739 +192 L 0.719 +193 S 0.689 +194 P 0.670 +195 P 0.660 +196 H 0.639 +197 C 0.594 +198 S 0.540 +199 P 0.514 +200 C 0.542 +201 G 0.600 +202 L 0.648 +203 P 0.667 +204 Q 0.663 +205 H 0.643 +206 C 0.623 +207 S 0.621 +208 S 0.632 +209 H 0.652 +210 L 0.684 +211 L 0.717 +212 K 0.740 +213 P 0.752 +214 V 0.755 +215 S 0.749 +216 S 0.735 +217 K 0.720 +218 C 0.715 +219 P 0.730 +220 S 0.755 +221 L 0.772 +222 T 0.771 +223 S 0.752 +224 E 0.717 +225 C 0.673 +226 H 0.632 +227 R 0.607 +228 P 0.604 +229 P 0.617 +230 S 0.625 +231 Q 0.603 +232 N 0.550 +233 Y 0.498 +234 L 0.490 +235 S 0.529 +236 R 0.576 +237 V 0.605 +238 K 0.612 +239 N 0.604 +240 A 0.589 +241 W 0.581 +242 G 0.574 +243 G 0.551 +244 D 0.515 +245 F 0.494 +246 L 0.503 +247 I 0.522 +248 V 0.535 +249 L 0.548 +250 P 0.580 +251 P 0.624 +252 Q 0.649 +253 M 0.634 +254 Q 0.596 +255 L 0.562 +256 E 0.541 +257 P 0.525 +258 G 0.506 +259 T 0.491 +260 Y 0.487 +261 S 0.492 +262 L 0.497 +263 R 0.488 +264 I 0.461 +265 F 0.432 +266 P 0.425 +267 K 0.451 +268 P 0.502 +269 P 0.559 +270 A 0.607 +271 R 0.633 +272 P 0.625 +273 G 0.585 +274 H 0.542 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000204710.3_ENST00000377185.3_GN:SPDYC_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000204710.3_ENST00000377185.3_GN:SPDYC_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9ddde56a1ace0c6f77c5b6b76a350b65dcb4bae6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000204710.3_ENST00000377185.3_GN:SPDYC_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid @@ -0,0 +1,294 @@ +>ENSG00000204710.3|ENST00000377185.3|GN:SPDYC|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:19 +1 M 0.341 +2 L 0.369 +3 W 0.411 +4 A 0.451 +5 I 0.480 +6 P 0.503 +7 E 0.527 +8 L 0.548 +9 G 0.551 +10 S 0.540 +11 P 0.532 +12 C 0.538 +13 P 0.545 +14 I 0.539 +15 S 0.525 +16 I 0.515 +17 S 0.519 +18 Y 0.546 +19 E 0.597 +20 M 0.653 +21 S 0.687 +22 D 0.690 +23 S 0.672 +24 Q 0.653 +25 D 0.649 +26 P 0.655 +27 T 0.662 +28 T 0.668 +29 S 0.679 +30 P 0.696 +31 V 0.714 +32 V 0.725 +33 T 0.726 +34 T 0.714 +35 Q 0.695 +36 V 0.684 +37 E 0.695 +38 L 0.720 +39 G 0.744 +40 G 0.757 +41 C 0.762 +42 S 0.766 +43 R 0.767 +44 Q 0.767 +45 G 0.765 +46 G 0.761 +47 G 0.747 +48 N 0.706 +49 G 0.628 +50 F 0.531 +51 L 0.444 +52 R 0.371 +53 F 0.305 +54 R 0.245 +55 Q 0.191 +56 H 0.145 +57 Q 0.106 +58 E 0.080 +59 V 0.066 +60 Q 0.059 +61 A 0.056 +62 F 0.057 +63 L 0.062 +64 S 0.069 +65 L 0.072 +66 L 0.070 +67 E 0.065 +68 D 0.059 +69 S 0.052 +70 F 0.044 +71 V 0.039 +72 Q 0.038 +73 E 0.040 +74 F 0.046 +75 L 0.058 +76 S 0.075 +77 K 0.091 +78 D 0.102 +79 P 0.108 +80 C 0.106 +81 F 0.098 +82 Q 0.090 +83 I 0.086 +84 S 0.084 +85 D 0.080 +86 K 0.073 +87 Y 0.066 +88 L 0.062 +89 L 0.060 +90 A 0.058 +91 M 0.055 +92 V 0.049 +93 L 0.042 +94 V 0.039 +95 Y 0.041 +96 F 0.046 +97 Q 0.054 +98 R 0.064 +99 A 0.073 +100 H 0.078 +101 L 0.080 +102 K 0.084 +103 L 0.090 +104 S 0.098 +105 E 0.108 +106 Y 0.113 +107 T 0.107 +108 H 0.093 +109 S 0.079 +110 S 0.070 +111 L 0.066 +112 F 0.066 +113 L 0.070 +114 A 0.072 +115 L 0.067 +116 Y 0.060 +117 L 0.058 +118 A 0.057 +119 N 0.057 +120 D 0.060 +121 M 0.068 +122 E 0.082 +123 E 0.099 +124 D 0.121 +125 L 0.148 +126 E 0.170 +127 G 0.172 +128 P 0.154 +129 K 0.127 +130 C 0.108 +131 E 0.098 +132 I 0.090 +133 F 0.081 +134 P 0.076 +135 W 0.078 +136 A 0.085 +137 L 0.094 +138 G 0.099 +139 K 0.099 +140 D 0.094 +141 W 0.086 +142 C 0.078 +143 L 0.073 +144 R 0.073 +145 V 0.077 +146 G 0.078 +147 K 0.075 +148 F 0.072 +149 L 0.073 +150 H 0.071 +151 Q 0.062 +152 R 0.050 +153 D 0.041 +154 K 0.040 +155 L 0.047 +156 W 0.058 +157 A 0.066 +158 R 0.064 +159 M 0.060 +160 G 0.060 +161 F 0.062 +162 R 0.064 +163 A 0.066 +164 V 0.067 +165 V 0.065 +166 S 0.060 +167 R 0.052 +168 Q 0.042 +169 C 0.035 +170 C 0.031 +171 E 0.032 +172 E 0.034 +173 V 0.037 +174 M 0.041 +175 A 0.045 +176 K 0.051 +177 E 0.059 +178 P 0.070 +179 F 0.082 +180 H 0.088 +181 W 0.090 +182 A 0.088 +183 W 0.087 +184 T 0.091 +185 R 0.105 +186 D 0.138 +187 R 0.196 +188 R 0.278 +189 P 0.376 +190 H 0.478 +191 H 0.568 +192 G 0.632 +193 G 0.663 +194 V 0.668 +195 Q 0.661 +196 R 0.650 +197 V 0.642 +198 C 0.644 +199 P 0.660 +200 Q 0.687 +201 V 0.716 +202 P 0.736 +203 V 0.744 +204 R 0.741 +205 L 0.731 +206 P 0.723 +207 R 0.721 +208 G 0.728 +209 P 0.739 +210 G 0.737 +211 L 0.715 +212 S 0.684 +213 P 0.663 +214 P 0.654 +215 H 0.635 +216 C 0.593 +217 S 0.541 +218 P 0.516 +219 C 0.542 +220 G 0.597 +221 L 0.642 +222 P 0.661 +223 Q 0.659 +224 H 0.642 +225 C 0.626 +226 S 0.627 +227 S 0.642 +228 H 0.663 +229 L 0.693 +230 L 0.724 +231 K 0.746 +232 P 0.758 +233 V 0.762 +234 S 0.756 +235 S 0.742 +236 K 0.726 +237 C 0.720 +238 P 0.734 +239 S 0.759 +240 L 0.777 +241 T 0.778 +242 S 0.761 +243 E 0.727 +244 C 0.684 +245 H 0.643 +246 R 0.617 +247 P 0.613 +248 P 0.625 +249 S 0.632 +250 Q 0.610 +251 N 0.558 +252 Y 0.507 +253 L 0.500 +254 S 0.538 +255 R 0.582 +256 V 0.607 +257 K 0.611 +258 N 0.600 +259 A 0.584 +260 W 0.575 +261 G 0.570 +262 G 0.546 +263 D 0.507 +264 F 0.484 +265 L 0.492 +266 I 0.513 +267 V 0.528 +268 L 0.544 +269 P 0.578 +270 P 0.624 +271 Q 0.650 +272 M 0.636 +273 Q 0.597 +274 L 0.562 +275 E 0.539 +276 P 0.518 +277 G 0.492 +278 T 0.473 +279 Y 0.469 +280 S 0.478 +281 L 0.486 +282 R 0.477 +283 I 0.449 +284 F 0.419 +285 P 0.413 +286 K 0.440 +287 P 0.493 +288 P 0.553 +289 A 0.603 +290 R 0.631 +291 P 0.626 +292 G 0.587 +293 H 0.545 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000205045.13_ENST00000628453.4_GN:SLFN12L_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000205045.13_ENST00000628453.4_GN:SLFN12L_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..086be2d7876cf6dada4407d4ee8becc52b6fc389 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000205045.13_ENST00000628453.4_GN:SLFN12L_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,613 @@ +>ENSG00000205045.13|ENST00000628453.4|GN:SLFN12L|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.229 +2 E 0.234 +3 K 0.240 +4 I 0.240 +5 R 0.231 +6 N 0.225 +7 V 0.224 +8 F 0.215 +9 H 0.192 +10 C 0.166 +11 E 0.143 +12 A 0.129 +13 H 0.127 +14 R 0.142 +15 I 0.165 +16 L 0.179 +17 Y 0.179 +18 I 0.171 +19 C 0.164 +20 E 0.156 +21 S 0.142 +22 Q 0.123 +23 F 0.110 +24 L 0.107 +25 R 0.105 +26 N 0.101 +27 F 0.097 +28 I 0.097 +29 R 0.104 +30 K 0.112 +31 E 0.116 +32 F 0.121 +33 L 0.136 +34 R 0.171 +35 G 0.222 +36 N 0.266 +37 G 0.279 +38 L 0.258 +39 A 0.225 +40 A 0.194 +41 G 0.165 +42 K 0.135 +43 M 0.110 +44 N 0.096 +45 I 0.087 +46 S 0.077 +47 I 0.065 +48 D 0.053 +49 L 0.044 +50 D 0.041 +51 T 0.042 +52 N 0.043 +53 Y 0.047 +54 A 0.053 +55 E 0.061 +56 L 0.068 +57 V 0.076 +58 L 0.085 +59 N 0.088 +60 V 0.084 +61 G 0.081 +62 R 0.085 +63 V 0.094 +64 T 0.101 +65 L 0.111 +66 G 0.133 +67 E 0.166 +68 N 0.199 +69 N 0.217 +70 R 0.216 +71 K 0.206 +72 K 0.193 +73 M 0.181 +74 K 0.169 +75 D 0.154 +76 C 0.132 +77 Q 0.111 +78 L 0.096 +79 R 0.086 +80 K 0.077 +81 Q 0.072 +82 Q 0.073 +83 N 0.072 +84 E 0.067 +85 N 0.060 +86 V 0.056 +87 S 0.056 +88 R 0.055 +89 A 0.054 +90 V 0.053 +91 C 0.054 +92 A 0.059 +93 L 0.070 +94 L 0.079 +95 N 0.081 +96 S 0.077 +97 G 0.074 +98 G 0.073 +99 G 0.075 +100 V 0.075 +101 I 0.072 +102 K 0.067 +103 A 0.063 +104 E 0.063 +105 V 0.069 +106 E 0.080 +107 N 0.093 +108 K 0.101 +109 G 0.103 +110 Y 0.099 +111 S 0.094 +112 Y 0.096 +113 K 0.104 +114 K 0.114 +115 D 0.123 +116 G 0.126 +117 I 0.118 +118 G 0.101 +119 L 0.082 +120 D 0.069 +121 L 0.066 +122 E 0.070 +123 N 0.072 +124 S 0.069 +125 F 0.065 +126 S 0.065 +127 N 0.065 +128 M 0.062 +129 L 0.057 +130 P 0.058 +131 F 0.068 +132 V 0.080 +133 P 0.079 +134 N 0.062 +135 F 0.041 +136 L 0.027 +137 D 0.021 +138 F 0.022 +139 M 0.026 +140 Q 0.031 +141 N 0.033 +142 G 0.031 +143 N 0.026 +144 Y 0.021 +145 F 0.019 +146 H 0.021 +147 I 0.027 +148 F 0.034 +149 V 0.043 +150 K 0.055 +151 S 0.070 +152 W 0.090 +153 S 0.111 +154 L 0.129 +155 E 0.141 +156 T 0.147 +157 S 0.147 +158 G 0.143 +159 P 0.136 +160 Q 0.130 +161 I 0.129 +162 A 0.130 +163 T 0.130 +164 L 0.126 +165 S 0.117 +166 S 0.105 +167 S 0.093 +168 L 0.082 +169 Y 0.078 +170 K 0.082 +171 R 0.090 +172 D 0.096 +173 V 0.101 +174 T 0.113 +175 S 0.130 +176 A 0.146 +177 K 0.153 +178 V 0.146 +179 M 0.125 +180 N 0.099 +181 A 0.077 +182 S 0.064 +183 A 0.060 +184 A 0.065 +185 L 0.077 +186 E 0.090 +187 F 0.098 +188 L 0.103 +189 K 0.108 +190 D 0.110 +191 M 0.113 +192 E 0.128 +193 K 0.162 +194 T 0.212 +195 G 0.259 +196 G 0.286 +197 R 0.288 +198 A 0.282 +199 Y 0.284 +200 L 0.291 +201 R 0.297 +202 P 0.301 +203 E 0.307 +204 F 0.319 +205 P 0.340 +206 A 0.365 +207 K 0.388 +208 R 0.413 +209 A 0.446 +210 C 0.475 +211 V 0.490 +212 D 0.495 +213 V 0.487 +214 Q 0.459 +215 E 0.420 +216 E 0.379 +217 S 0.329 +218 N 0.265 +219 M 0.202 +220 E 0.152 +221 A 0.114 +222 L 0.082 +223 A 0.063 +224 A 0.056 +225 D 0.057 +226 F 0.057 +227 F 0.056 +228 N 0.056 +229 R 0.059 +230 T 0.069 +231 E 0.083 +232 L 0.096 +233 G 0.102 +234 Y 0.101 +235 K 0.096 +236 E 0.093 +237 K 0.089 +238 L 0.084 +239 T 0.077 +240 F 0.072 +241 T 0.069 +242 E 0.065 +243 S 0.058 +244 T 0.051 +245 H 0.046 +246 V 0.049 +247 E 0.058 +248 I 0.071 +249 K 0.080 +250 N 0.081 +251 F 0.075 +252 S 0.066 +253 T 0.056 +254 E 0.047 +255 K 0.041 +256 L 0.039 +257 L 0.037 +258 Q 0.037 +259 R 0.039 +260 I 0.043 +261 T 0.046 +262 E 0.047 +263 I 0.045 +264 L 0.041 +265 P 0.037 +266 Q 0.037 +267 Y 0.039 +268 V 0.041 +269 S 0.044 +270 A 0.052 +271 F 0.064 +272 A 0.071 +273 N 0.070 +274 T 0.070 +275 D 0.074 +276 G 0.079 +277 G 0.079 +278 Y 0.074 +279 L 0.068 +280 F 0.070 +281 V 0.081 +282 G 0.092 +283 L 0.094 +284 N 0.085 +285 E 0.078 +286 D 0.078 +287 K 0.086 +288 E 0.093 +289 V 0.094 +290 I 0.088 +291 G 0.081 +292 F 0.075 +293 K 0.071 +294 A 0.066 +295 E 0.057 +296 K 0.049 +297 S 0.047 +298 Y 0.053 +299 L 0.063 +300 T 0.068 +301 K 0.067 +302 L 0.067 +303 E 0.074 +304 E 0.080 +305 V 0.080 +306 T 0.078 +307 K 0.080 +308 N 0.086 +309 S 0.101 +310 I 0.122 +311 G 0.145 +312 K 0.165 +313 L 0.177 +314 P 0.176 +315 V 0.167 +316 H 0.160 +317 H 0.160 +318 F 0.167 +319 C 0.177 +320 V 0.184 +321 E 0.189 +322 K 0.189 +323 G 0.178 +324 T 0.161 +325 I 0.138 +326 N 0.110 +327 Y 0.078 +328 L 0.051 +329 C 0.035 +330 K 0.031 +331 F 0.032 +332 L 0.037 +333 G 0.045 +334 V 0.056 +335 Y 0.067 +336 D 0.073 +337 K 0.077 +338 G 0.081 +339 R 0.086 +340 L 0.087 +341 C 0.080 +342 G 0.065 +343 Y 0.049 +344 V 0.037 +345 Y 0.030 +346 A 0.030 +347 L 0.036 +348 R 0.047 +349 V 0.054 +350 E 0.054 +351 R 0.051 +352 F 0.050 +353 C 0.054 +354 C 0.064 +355 A 0.077 +356 V 0.090 +357 F 0.095 +358 A 0.093 +359 K 0.086 +360 K 0.081 +361 P 0.081 +362 D 0.085 +363 S 0.090 +364 W 0.090 +365 H 0.085 +366 V 0.081 +367 K 0.081 +368 D 0.086 +369 N 0.095 +370 R 0.105 +371 V 0.108 +372 K 0.107 +373 Q 0.100 +374 L 0.086 +375 T 0.068 +376 E 0.053 +377 K 0.045 +378 E 0.044 +379 W 0.047 +380 I 0.056 +381 Q 0.072 +382 F 0.097 +383 M 0.129 +384 V 0.164 +385 D 0.200 +386 S 0.254 +387 E 0.335 +388 P 0.430 +389 V 0.508 +390 C 0.547 +391 E 0.546 +392 E 0.524 +393 L 0.507 +394 P 0.517 +395 S 0.551 +396 P 0.586 +397 A 0.593 +398 S 0.565 +399 T 0.527 +400 S 0.508 +401 S 0.512 +402 P 0.515 +403 V 0.492 +404 S 0.439 +405 Q 0.374 +406 S 0.316 +407 Y 0.281 +408 P 0.274 +409 L 0.280 +410 R 0.277 +411 E 0.256 +412 Y 0.229 +413 I 0.210 +414 N 0.197 +415 F 0.186 +416 K 0.180 +417 I 0.177 +418 Q 0.175 +419 P 0.170 +420 L 0.159 +421 R 0.148 +422 Y 0.148 +423 H 0.166 +424 L 0.202 +425 P 0.242 +426 G 0.266 +427 L 0.261 +428 S 0.233 +429 E 0.202 +430 K 0.177 +431 I 0.161 +432 T 0.150 +433 C 0.143 +434 A 0.138 +435 P 0.132 +436 K 0.123 +437 T 0.112 +438 F 0.106 +439 C 0.104 +440 R 0.101 +441 N 0.095 +442 L 0.092 +443 F 0.098 +444 S 0.111 +445 Q 0.125 +446 H 0.129 +447 E 0.121 +448 G 0.109 +449 L 0.100 +450 K 0.099 +451 Q 0.100 +452 L 0.098 +453 I 0.095 +454 C 0.098 +455 E 0.110 +456 E 0.126 +457 M 0.139 +458 G 0.143 +459 S 0.142 +460 V 0.143 +461 N 0.149 +462 K 0.155 +463 G 0.151 +464 S 0.134 +465 L 0.111 +466 I 0.090 +467 F 0.075 +468 S 0.063 +469 R 0.055 +470 S 0.050 +471 W 0.053 +472 S 0.065 +473 L 0.085 +474 D 0.108 +475 L 0.127 +476 G 0.136 +477 L 0.137 +478 Q 0.136 +479 E 0.133 +480 N 0.126 +481 H 0.115 +482 K 0.101 +483 V 0.086 +484 L 0.076 +485 C 0.073 +486 D 0.069 +487 A 0.060 +488 L 0.052 +489 L 0.049 +490 I 0.054 +491 S 0.063 +492 Q 0.076 +493 D 0.093 +494 K 0.110 +495 P 0.118 +496 P 0.110 +497 V 0.092 +498 L 0.075 +499 Y 0.066 +500 T 0.067 +501 F 0.078 +502 H 0.092 +503 M 0.099 +504 V 0.094 +505 Q 0.085 +506 D 0.082 +507 E 0.087 +508 E 0.097 +509 F 0.107 +510 K 0.110 +511 D 0.106 +512 Y 0.102 +513 S 0.101 +514 T 0.094 +515 Q 0.077 +516 T 0.061 +517 A 0.054 +518 Q 0.052 +519 T 0.052 +520 L 0.058 +521 K 0.069 +522 Q 0.075 +523 K 0.073 +524 L 0.069 +525 A 0.073 +526 K 0.085 +527 I 0.105 +528 G 0.127 +529 G 0.140 +530 Y 0.139 +531 T 0.130 +532 K 0.121 +533 K 0.112 +534 V 0.098 +535 C 0.081 +536 V 0.068 +537 M 0.059 +538 T 0.054 +539 K 0.052 +540 I 0.053 +541 F 0.060 +542 Y 0.077 +543 L 0.106 +544 S 0.140 +545 P 0.173 +546 E 0.201 +547 G 0.217 +548 K 0.216 +549 T 0.202 +550 S 0.187 +551 C 0.178 +552 Q 0.173 +553 Y 0.168 +554 D 0.160 +555 L 0.149 +556 N 0.136 +557 S 0.127 +558 Q 0.124 +559 V 0.127 +560 I 0.133 +561 Y 0.135 +562 P 0.132 +563 E 0.128 +564 S 0.125 +565 Y 0.122 +566 Y 0.119 +567 W 0.116 +568 T 0.116 +569 T 0.118 +570 A 0.120 +571 Q 0.119 +572 T 0.114 +573 M 0.107 +574 K 0.099 +575 D 0.095 +576 L 0.100 +577 E 0.112 +578 K 0.120 +579 A 0.124 +580 L 0.132 +581 S 0.144 +582 N 0.160 +583 I 0.179 +584 L 0.201 +585 P 0.222 +586 K 0.232 +587 E 0.226 +588 N 0.202 +589 Q 0.167 +590 I 0.136 +591 F 0.116 +592 L 0.104 +593 F 0.098 +594 V 0.100 +595 C 0.109 +596 L 0.119 +597 F 0.127 +598 R 0.133 +599 F 0.134 +600 C 0.128 +601 L 0.119 +602 F 0.113 +603 V 0.109 +604 C 0.101 +605 W 0.091 +606 F 0.083 +607 V 0.075 +608 C 0.069 +609 F 0.070 +610 F 0.086 +611 L 0.111 +612 R 0.131 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000205045.13_ENST00000628453.4_GN:SLFN12L_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000205045.13_ENST00000628453.4_GN:SLFN12L_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..93104b7e3d534b5923b56bd7c85df58711e7779a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000205045.13_ENST00000628453.4_GN:SLFN12L_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid @@ -0,0 +1,616 @@ +>ENSG00000205045.13|ENST00000628453.4|GN:SLFN12L|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 +1 M 0.173 +2 K 0.157 +3 I 0.140 +4 M 0.131 +5 E 0.134 +6 K 0.144 +7 I 0.152 +8 R 0.160 +9 N 0.171 +10 V 0.179 +11 F 0.176 +12 H 0.163 +13 C 0.152 +14 E 0.144 +15 A 0.140 +16 H 0.141 +17 R 0.153 +18 I 0.171 +19 L 0.181 +20 Y 0.180 +21 I 0.171 +22 C 0.161 +23 E 0.151 +24 S 0.136 +25 Q 0.116 +26 F 0.101 +27 L 0.096 +28 R 0.093 +29 N 0.089 +30 F 0.086 +31 I 0.089 +32 R 0.096 +33 K 0.106 +34 E 0.111 +35 F 0.117 +36 L 0.133 +37 R 0.170 +38 G 0.221 +39 N 0.265 +40 G 0.279 +41 L 0.258 +42 A 0.224 +43 A 0.193 +44 G 0.165 +45 K 0.135 +46 M 0.110 +47 N 0.096 +48 I 0.086 +49 S 0.076 +50 I 0.065 +51 D 0.053 +52 L 0.044 +53 D 0.041 +54 T 0.041 +55 N 0.043 +56 Y 0.046 +57 A 0.053 +58 E 0.060 +59 L 0.067 +60 V 0.076 +61 L 0.084 +62 N 0.087 +63 V 0.083 +64 G 0.081 +65 R 0.085 +66 V 0.093 +67 T 0.100 +68 L 0.111 +69 G 0.133 +70 E 0.167 +71 N 0.200 +72 N 0.217 +73 R 0.216 +74 K 0.205 +75 K 0.192 +76 M 0.180 +77 K 0.168 +78 D 0.153 +79 C 0.131 +80 Q 0.110 +81 L 0.095 +82 R 0.085 +83 K 0.077 +84 Q 0.072 +85 Q 0.073 +86 N 0.072 +87 E 0.067 +88 N 0.060 +89 V 0.056 +90 S 0.055 +91 R 0.055 +92 A 0.054 +93 V 0.053 +94 C 0.053 +95 A 0.059 +96 L 0.070 +97 L 0.079 +98 N 0.080 +99 S 0.077 +100 G 0.073 +101 G 0.073 +102 G 0.074 +103 V 0.074 +104 I 0.072 +105 K 0.067 +106 A 0.063 +107 E 0.063 +108 V 0.069 +109 E 0.080 +110 N 0.093 +111 K 0.102 +112 G 0.104 +113 Y 0.100 +114 S 0.097 +115 Y 0.099 +116 K 0.107 +117 K 0.118 +118 D 0.126 +119 G 0.129 +120 I 0.121 +121 G 0.104 +122 L 0.084 +123 D 0.070 +124 L 0.066 +125 E 0.069 +126 N 0.072 +127 S 0.068 +128 F 0.065 +129 S 0.065 +130 N 0.065 +131 M 0.062 +132 L 0.057 +133 P 0.058 +134 F 0.069 +135 V 0.081 +136 P 0.080 +137 N 0.063 +138 F 0.041 +139 L 0.027 +140 D 0.021 +141 F 0.022 +142 M 0.026 +143 Q 0.031 +144 N 0.034 +145 G 0.031 +146 N 0.026 +147 Y 0.021 +148 F 0.019 +149 H 0.021 +150 I 0.026 +151 F 0.034 +152 V 0.043 +153 K 0.054 +154 S 0.070 +155 W 0.090 +156 S 0.111 +157 L 0.128 +158 E 0.140 +159 T 0.146 +160 S 0.146 +161 G 0.142 +162 P 0.135 +163 Q 0.130 +164 I 0.129 +165 A 0.130 +166 T 0.130 +167 L 0.125 +168 S 0.116 +169 S 0.105 +170 S 0.092 +171 L 0.082 +172 Y 0.078 +173 K 0.081 +174 R 0.088 +175 D 0.095 +176 V 0.101 +177 T 0.112 +178 S 0.129 +179 A 0.146 +180 K 0.153 +181 V 0.146 +182 M 0.125 +183 N 0.099 +184 A 0.077 +185 S 0.064 +186 A 0.060 +187 A 0.064 +188 L 0.077 +189 E 0.090 +190 F 0.098 +191 L 0.103 +192 K 0.108 +193 D 0.110 +194 M 0.113 +195 E 0.128 +196 K 0.163 +197 T 0.211 +198 G 0.259 +199 G 0.284 +200 R 0.286 +201 A 0.280 +202 Y 0.283 +203 L 0.291 +204 R 0.297 +205 P 0.301 +206 E 0.308 +207 F 0.321 +208 P 0.342 +209 A 0.367 +210 K 0.391 +211 R 0.416 +212 A 0.448 +213 C 0.476 +214 V 0.491 +215 D 0.496 +216 V 0.488 +217 Q 0.460 +218 E 0.421 +219 E 0.381 +220 S 0.330 +221 N 0.266 +222 M 0.201 +223 E 0.151 +224 A 0.113 +225 L 0.081 +226 A 0.061 +227 A 0.055 +228 D 0.055 +229 F 0.056 +230 F 0.055 +231 N 0.055 +232 R 0.059 +233 T 0.068 +234 E 0.082 +235 L 0.095 +236 G 0.102 +237 Y 0.101 +238 K 0.097 +239 E 0.093 +240 K 0.090 +241 L 0.084 +242 T 0.077 +243 F 0.072 +244 T 0.069 +245 E 0.064 +246 S 0.058 +247 T 0.050 +248 H 0.046 +249 V 0.048 +250 E 0.058 +251 I 0.070 +252 K 0.079 +253 N 0.080 +254 F 0.075 +255 S 0.066 +256 T 0.057 +257 E 0.048 +258 K 0.042 +259 L 0.039 +260 L 0.037 +261 Q 0.037 +262 R 0.039 +263 I 0.043 +264 T 0.046 +265 E 0.046 +266 I 0.045 +267 L 0.041 +268 P 0.037 +269 Q 0.037 +270 Y 0.039 +271 V 0.041 +272 S 0.044 +273 A 0.052 +274 F 0.064 +275 A 0.070 +276 N 0.070 +277 T 0.070 +278 D 0.074 +279 G 0.079 +280 G 0.078 +281 Y 0.073 +282 L 0.068 +283 F 0.070 +284 V 0.081 +285 G 0.092 +286 L 0.093 +287 N 0.085 +288 E 0.077 +289 D 0.078 +290 K 0.086 +291 E 0.093 +292 V 0.094 +293 I 0.089 +294 G 0.081 +295 F 0.076 +296 K 0.072 +297 A 0.066 +298 E 0.058 +299 K 0.049 +300 S 0.047 +301 Y 0.054 +302 L 0.064 +303 T 0.069 +304 K 0.067 +305 L 0.067 +306 E 0.074 +307 E 0.080 +308 V 0.080 +309 T 0.079 +310 K 0.081 +311 N 0.088 +312 S 0.102 +313 I 0.123 +314 G 0.146 +315 K 0.166 +316 L 0.177 +317 P 0.176 +318 V 0.167 +319 H 0.159 +320 H 0.159 +321 F 0.166 +322 C 0.174 +323 V 0.181 +324 E 0.186 +325 K 0.185 +326 G 0.176 +327 T 0.159 +328 I 0.138 +329 N 0.110 +330 Y 0.078 +331 L 0.051 +332 C 0.035 +333 K 0.031 +334 F 0.032 +335 L 0.037 +336 G 0.045 +337 V 0.056 +338 Y 0.067 +339 D 0.073 +340 K 0.076 +341 G 0.081 +342 R 0.086 +343 L 0.087 +344 C 0.079 +345 G 0.065 +346 Y 0.049 +347 V 0.037 +348 Y 0.030 +349 A 0.030 +350 L 0.036 +351 R 0.046 +352 V 0.054 +353 E 0.054 +354 R 0.051 +355 F 0.050 +356 C 0.054 +357 C 0.063 +358 A 0.077 +359 V 0.090 +360 F 0.095 +361 A 0.092 +362 K 0.086 +363 K 0.081 +364 P 0.080 +365 D 0.085 +366 S 0.089 +367 W 0.089 +368 H 0.084 +369 V 0.080 +370 K 0.080 +371 D 0.085 +372 N 0.094 +373 R 0.103 +374 V 0.107 +375 K 0.106 +376 Q 0.099 +377 L 0.085 +378 T 0.067 +379 E 0.053 +380 K 0.045 +381 E 0.044 +382 W 0.047 +383 I 0.056 +384 Q 0.071 +385 F 0.096 +386 M 0.128 +387 V 0.161 +388 D 0.198 +389 S 0.252 +390 E 0.332 +391 P 0.427 +392 V 0.506 +393 C 0.544 +394 E 0.543 +395 E 0.520 +396 L 0.503 +397 P 0.513 +398 S 0.548 +399 P 0.583 +400 A 0.590 +401 S 0.563 +402 T 0.524 +403 S 0.505 +404 S 0.508 +405 P 0.511 +406 V 0.487 +407 S 0.434 +408 Q 0.369 +409 S 0.312 +410 Y 0.277 +411 P 0.270 +412 L 0.276 +413 R 0.273 +414 E 0.252 +415 Y 0.225 +416 I 0.205 +417 N 0.192 +418 F 0.183 +419 K 0.178 +420 I 0.176 +421 Q 0.174 +422 P 0.169 +423 L 0.158 +424 R 0.147 +425 Y 0.146 +426 H 0.165 +427 L 0.201 +428 P 0.241 +429 G 0.265 +430 L 0.261 +431 S 0.234 +432 E 0.202 +433 K 0.177 +434 I 0.160 +435 T 0.150 +436 C 0.142 +437 A 0.138 +438 P 0.132 +439 K 0.123 +440 T 0.112 +441 F 0.106 +442 C 0.104 +443 R 0.101 +444 N 0.095 +445 L 0.092 +446 F 0.097 +447 S 0.111 +448 Q 0.125 +449 H 0.129 +450 E 0.120 +451 G 0.107 +452 L 0.095 +453 K 0.089 +454 Q 0.087 +455 L 0.088 +456 I 0.090 +457 C 0.097 +458 E 0.110 +459 E 0.126 +460 M 0.139 +461 G 0.143 +462 S 0.142 +463 V 0.143 +464 N 0.150 +465 K 0.155 +466 G 0.152 +467 S 0.135 +468 L 0.112 +469 I 0.091 +470 F 0.075 +471 S 0.064 +472 R 0.055 +473 S 0.050 +474 W 0.053 +475 S 0.065 +476 L 0.085 +477 D 0.109 +478 L 0.128 +479 G 0.137 +480 L 0.138 +481 Q 0.137 +482 E 0.133 +483 N 0.126 +484 H 0.115 +485 K 0.100 +486 V 0.085 +487 L 0.076 +488 C 0.073 +489 D 0.069 +490 A 0.060 +491 L 0.052 +492 L 0.050 +493 I 0.054 +494 S 0.063 +495 Q 0.076 +496 D 0.093 +497 K 0.110 +498 P 0.118 +499 P 0.110 +500 V 0.092 +501 L 0.075 +502 Y 0.066 +503 T 0.067 +504 F 0.078 +505 H 0.092 +506 M 0.099 +507 V 0.094 +508 Q 0.084 +509 D 0.082 +510 E 0.087 +511 E 0.097 +512 F 0.107 +513 K 0.110 +514 D 0.106 +515 Y 0.102 +516 S 0.101 +517 T 0.094 +518 Q 0.077 +519 T 0.061 +520 A 0.054 +521 Q 0.052 +522 T 0.052 +523 L 0.058 +524 K 0.068 +525 Q 0.075 +526 K 0.073 +527 L 0.069 +528 A 0.072 +529 K 0.084 +530 I 0.104 +531 G 0.126 +532 G 0.139 +533 Y 0.139 +534 T 0.130 +535 K 0.121 +536 K 0.112 +537 V 0.098 +538 C 0.081 +539 V 0.068 +540 M 0.059 +541 T 0.054 +542 K 0.052 +543 I 0.053 +544 F 0.060 +545 Y 0.077 +546 L 0.106 +547 S 0.141 +548 P 0.173 +549 E 0.200 +550 G 0.217 +551 K 0.216 +552 T 0.202 +553 S 0.187 +554 C 0.179 +555 Q 0.173 +556 Y 0.168 +557 D 0.160 +558 L 0.149 +559 N 0.137 +560 S 0.127 +561 Q 0.125 +562 V 0.128 +563 I 0.133 +564 Y 0.134 +565 P 0.131 +566 E 0.127 +567 S 0.125 +568 Y 0.123 +569 Y 0.120 +570 W 0.117 +571 T 0.116 +572 T 0.118 +573 A 0.120 +574 Q 0.119 +575 T 0.114 +576 M 0.107 +577 K 0.099 +578 D 0.095 +579 L 0.100 +580 E 0.111 +581 K 0.119 +582 A 0.123 +583 L 0.131 +584 S 0.143 +585 N 0.159 +586 I 0.178 +587 L 0.200 +588 P 0.220 +589 K 0.230 +590 E 0.224 +591 N 0.198 +592 Q 0.164 +593 I 0.133 +594 F 0.112 +595 L 0.100 +596 F 0.094 +597 V 0.096 +598 C 0.105 +599 L 0.116 +600 F 0.124 +601 R 0.130 +602 F 0.131 +603 C 0.125 +604 L 0.116 +605 F 0.110 +606 V 0.106 +607 C 0.099 +608 W 0.089 +609 F 0.081 +610 V 0.074 +611 C 0.068 +612 F 0.069 +613 F 0.084 +614 L 0.110 +615 R 0.130 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000205186.4_ENST00000379071.4_GN:FABP9_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000205186.4_ENST00000379071.4_GN:FABP9_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..41094b6589edb3a026d81b86ae0d8e4f0e996598 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000205186.4_ENST00000379071.4_GN:FABP9_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,133 @@ +>ENSG00000205186.4|ENST00000379071.4|GN:FABP9|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.215 +2 V 0.180 +3 E 0.130 +4 P 0.086 +5 F 0.057 +6 L 0.045 +7 G 0.045 +8 T 0.049 +9 W 0.050 +10 K 0.047 +11 L 0.043 +12 V 0.045 +13 S 0.055 +14 S 0.067 +15 E 0.074 +16 N 0.072 +17 F 0.065 +18 E 0.058 +19 D 0.052 +20 Y 0.048 +21 M 0.049 +22 K 0.058 +23 E 0.078 +24 L 0.109 +25 G 0.139 +26 V 0.151 +27 N 0.137 +28 F 0.114 +29 A 0.102 +30 A 0.104 +31 R 0.113 +32 N 0.121 +33 M 0.128 +34 A 0.136 +35 G 0.139 +36 L 0.131 +37 V 0.111 +38 K 0.083 +39 P 0.055 +40 T 0.037 +41 V 0.028 +42 T 0.025 +43 I 0.025 +44 S 0.028 +45 V 0.036 +46 D 0.047 +47 G 0.054 +48 K 0.054 +49 M 0.048 +50 M 0.041 +51 T 0.038 +52 I 0.038 +53 R 0.040 +54 T 0.045 +55 E 0.054 +56 S 0.065 +57 S 0.073 +58 F 0.078 +59 Q 0.080 +60 D 0.079 +61 T 0.077 +62 K 0.073 +63 I 0.065 +64 S 0.054 +65 F 0.043 +66 K 0.039 +67 L 0.043 +68 G 0.048 +69 E 0.050 +70 E 0.049 +71 F 0.051 +72 D 0.058 +73 E 0.067 +74 T 0.073 +75 T 0.073 +76 A 0.072 +77 D 0.075 +78 N 0.081 +79 R 0.089 +80 K 0.095 +81 V 0.094 +82 K 0.084 +83 S 0.069 +84 T 0.054 +85 I 0.042 +86 T 0.038 +87 L 0.042 +88 E 0.051 +89 N 0.055 +90 G 0.052 +91 S 0.044 +92 M 0.037 +93 I 0.033 +94 H 0.033 +95 V 0.033 +96 Q 0.034 +97 K 0.036 +98 W 0.041 +99 L 0.048 +100 G 0.052 +101 K 0.050 +102 E 0.045 +103 T 0.040 +104 T 0.037 +105 I 0.034 +106 K 0.030 +107 R 0.027 +108 K 0.028 +109 I 0.033 +110 V 0.037 +111 D 0.039 +112 E 0.039 +113 K 0.035 +114 M 0.031 +115 V 0.031 +116 V 0.032 +117 E 0.034 +118 C 0.035 +119 K 0.037 +120 M 0.042 +121 N 0.051 +122 N 0.061 +123 I 0.068 +124 V 0.069 +125 S 0.063 +126 T 0.055 +127 R 0.046 +128 I 0.040 +129 Y 0.038 +130 E 0.041 +131 K 0.048 +132 V 0.053 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000205186.4_ENST00000379071.4_GN:FABP9_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000205186.4_ENST00000379071.4_GN:FABP9_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b3f2c16cf02f7cface2b1bc74702d8bff5b35f94 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000205186.4_ENST00000379071.4_GN:FABP9_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid @@ -0,0 +1,134 @@ +>ENSG00000205186.4|ENST00000379071.4|GN:FABP9|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:1 +1 M 0.289 +2 M 0.251 +3 V 0.191 +4 E 0.132 +5 P 0.086 +6 F 0.057 +7 L 0.044 +8 G 0.044 +9 T 0.048 +10 W 0.049 +11 K 0.046 +12 L 0.043 +13 V 0.045 +14 S 0.054 +15 S 0.066 +16 E 0.073 +17 N 0.071 +18 F 0.064 +19 E 0.058 +20 D 0.052 +21 Y 0.048 +22 M 0.049 +23 K 0.058 +24 E 0.078 +25 L 0.109 +26 G 0.140 +27 V 0.151 +28 N 0.137 +29 F 0.114 +30 A 0.102 +31 A 0.104 +32 R 0.112 +33 N 0.121 +34 M 0.128 +35 A 0.136 +36 G 0.139 +37 L 0.131 +38 V 0.110 +39 K 0.082 +40 P 0.055 +41 T 0.037 +42 V 0.028 +43 T 0.025 +44 I 0.024 +45 S 0.028 +46 V 0.036 +47 D 0.046 +48 G 0.053 +49 K 0.053 +50 M 0.047 +51 M 0.040 +52 T 0.037 +53 I 0.038 +54 R 0.040 +55 T 0.045 +56 E 0.054 +57 S 0.065 +58 S 0.073 +59 F 0.078 +60 Q 0.080 +61 D 0.080 +62 T 0.077 +63 K 0.072 +64 I 0.065 +65 S 0.053 +66 F 0.042 +67 K 0.039 +68 L 0.043 +69 G 0.048 +70 E 0.049 +71 E 0.049 +72 F 0.051 +73 D 0.058 +74 E 0.067 +75 T 0.073 +76 T 0.073 +77 A 0.072 +78 D 0.074 +79 N 0.081 +80 R 0.089 +81 K 0.095 +82 V 0.094 +83 K 0.084 +84 S 0.069 +85 T 0.053 +86 I 0.041 +87 T 0.036 +88 L 0.040 +89 E 0.048 +90 N 0.053 +91 G 0.050 +92 S 0.042 +93 M 0.036 +94 I 0.033 +95 H 0.032 +96 V 0.033 +97 Q 0.033 +98 K 0.035 +99 W 0.041 +100 L 0.048 +101 G 0.052 +102 K 0.050 +103 E 0.045 +104 T 0.040 +105 T 0.037 +106 I 0.034 +107 K 0.030 +108 R 0.027 +109 K 0.028 +110 I 0.033 +111 V 0.037 +112 D 0.039 +113 E 0.038 +114 K 0.035 +115 M 0.031 +116 V 0.031 +117 V 0.032 +118 E 0.034 +119 C 0.035 +120 K 0.037 +121 M 0.042 +122 N 0.051 +123 N 0.061 +124 I 0.068 +125 V 0.069 +126 S 0.063 +127 T 0.055 +128 R 0.046 +129 I 0.040 +130 Y 0.037 +131 E 0.041 +132 K 0.048 +133 V 0.053 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000205209.8_ENST00000601241.6_GN:SCGB2B2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000205209.8_ENST00000601241.6_GN:SCGB2B2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2f88a0dc26604a1d29aa320f19b0026a778bd508 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000205209.8_ENST00000601241.6_GN:SCGB2B2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,97 @@ +>ENSG00000205209.8|ENST00000601241.6|GN:SCGB2B2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.347 +2 R 0.349 +3 V 0.351 +4 T 0.348 +5 S 0.329 +6 A 0.291 +7 T 0.246 +8 C 0.205 +9 A 0.174 +10 L 0.151 +11 L 0.134 +12 L 0.126 +13 A 0.125 +14 L 0.126 +15 I 0.133 +16 C 0.152 +17 S 0.186 +18 V 0.235 +19 Q 0.288 +20 L 0.328 +21 G 0.335 +22 D 0.303 +23 A 0.245 +24 C 0.180 +25 L 0.122 +26 D 0.080 +27 I 0.052 +28 D 0.037 +29 K 0.030 +30 L 0.030 +31 L 0.034 +32 A 0.040 +33 N 0.049 +34 V 0.056 +35 V 0.061 +36 F 0.067 +37 D 0.075 +38 V 0.079 +39 S 0.074 +40 Q 0.064 +41 D 0.054 +42 L 0.047 +43 L 0.044 +44 K 0.045 +45 E 0.050 +46 E 0.054 +47 L 0.059 +48 A 0.067 +49 R 0.078 +50 Y 0.092 +51 N 0.108 +52 P 0.127 +53 S 0.144 +54 P 0.154 +55 L 0.148 +56 T 0.131 +57 E 0.112 +58 E 0.102 +59 S 0.095 +60 F 0.087 +61 L 0.084 +62 N 0.086 +63 V 0.088 +64 Q 0.088 +65 Q 0.086 +66 C 0.079 +67 F 0.069 +68 A 0.065 +69 N 0.069 +70 V 0.070 +71 S 0.064 +72 V 0.059 +73 T 0.056 +74 E 0.052 +75 R 0.046 +76 F 0.043 +77 A 0.046 +78 H 0.053 +79 S 0.060 +80 V 0.065 +81 V 0.066 +82 I 0.062 +83 K 0.058 +84 K 0.057 +85 I 0.059 +86 L 0.063 +87 Q 0.071 +88 S 0.084 +89 N 0.095 +90 D 0.103 +91 C 0.117 +92 I 0.145 +93 E 0.182 +94 A 0.208 +95 A 0.209 +96 F 0.198 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000205209.8_ENST00000601241.6_GN:SCGB2B2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000205209.8_ENST00000601241.6_GN:SCGB2B2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d6bc2e81567d2b7091ca0c2fb9d0112f2bf18f35 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000205209.8_ENST00000601241.6_GN:SCGB2B2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid @@ -0,0 +1,124 @@ +>ENSG00000205209.8|ENST00000601241.6|GN:SCGB2B2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:27 +1 M 0.182 +2 C 0.187 +3 L 0.199 +4 V 0.216 +5 Q 0.233 +6 I 0.243 +7 Y 0.254 +8 I 0.266 +9 K 0.277 +10 L 0.288 +11 T 0.307 +12 H 0.340 +13 R 0.392 +14 Q 0.459 +15 I 0.521 +16 P 0.557 +17 C 0.567 +18 L 0.564 +19 C 0.562 +20 L 0.565 +21 L 0.581 +22 G 0.615 +23 P 0.657 +24 D 0.691 +25 S 0.710 +26 A 0.711 +27 V 0.696 +28 M 0.675 +29 R 0.659 +30 V 0.643 +31 T 0.608 +32 S 0.540 +33 A 0.455 +34 T 0.375 +35 C 0.307 +36 A 0.250 +37 L 0.212 +38 L 0.194 +39 L 0.186 +40 A 0.176 +41 L 0.167 +42 I 0.169 +43 C 0.188 +44 S 0.223 +45 V 0.274 +46 Q 0.330 +47 L 0.369 +48 G 0.368 +49 D 0.323 +50 A 0.252 +51 C 0.178 +52 L 0.118 +53 D 0.076 +54 I 0.050 +55 D 0.037 +56 K 0.032 +57 L 0.033 +58 L 0.038 +59 A 0.045 +60 N 0.053 +61 V 0.061 +62 V 0.067 +63 F 0.074 +64 D 0.082 +65 V 0.085 +66 S 0.079 +67 Q 0.068 +68 D 0.058 +69 L 0.051 +70 L 0.047 +71 K 0.047 +72 E 0.051 +73 E 0.054 +74 L 0.057 +75 A 0.065 +76 R 0.077 +77 Y 0.091 +78 N 0.106 +79 P 0.123 +80 S 0.139 +81 P 0.148 +82 L 0.143 +83 T 0.126 +84 E 0.109 +85 E 0.097 +86 S 0.090 +87 F 0.084 +88 L 0.085 +89 N 0.090 +90 V 0.093 +91 Q 0.093 +92 Q 0.091 +93 C 0.082 +94 F 0.071 +95 A 0.068 +96 N 0.072 +97 V 0.072 +98 S 0.066 +99 V 0.061 +100 T 0.059 +101 E 0.055 +102 R 0.049 +103 F 0.046 +104 A 0.049 +105 H 0.055 +106 S 0.061 +107 V 0.064 +108 V 0.062 +109 I 0.057 +110 K 0.053 +111 K 0.053 +112 I 0.055 +113 L 0.060 +114 Q 0.069 +115 S 0.081 +116 N 0.092 +117 D 0.102 +118 C 0.119 +119 I 0.150 +120 E 0.192 +121 A 0.221 +122 A 0.224 +123 F 0.214 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000205784.5_ENST00000650722.2_GN:ARRDC5_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000205784.5_ENST00000650722.2_GN:ARRDC5_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..547fc1837e3b7e187fcfcf51123b34680e08b377 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000205784.5_ENST00000650722.2_GN:ARRDC5_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,329 @@ +>ENSG00000205784.5|ENST00000650722.2|GN:ARRDC5|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.246 +2 S 0.202 +3 V 0.141 +4 V 0.092 +5 K 0.064 +6 S 0.050 +7 I 0.044 +8 E 0.043 +9 L 0.046 +10 V 0.056 +11 L 0.069 +12 P 0.077 +13 E 0.077 +14 D 0.069 +15 R 0.055 +16 I 0.043 +17 Y 0.034 +18 L 0.029 +19 A 0.027 +20 G 0.028 +21 S 0.031 +22 S 0.035 +23 I 0.040 +24 K 0.044 +25 G 0.048 +26 Q 0.048 +27 V 0.046 +28 I 0.046 +29 L 0.051 +30 T 0.062 +31 L 0.072 +32 N 0.078 +33 S 0.077 +34 T 0.071 +35 L 0.066 +36 V 0.065 +37 D 0.063 +38 P 0.055 +39 I 0.043 +40 V 0.034 +41 K 0.030 +42 V 0.032 +43 E 0.036 +44 L 0.040 +45 V 0.044 +46 G 0.049 +47 R 0.056 +48 G 0.062 +49 Y 0.070 +50 V 0.080 +51 E 0.096 +52 W 0.124 +53 S 0.173 +54 E 0.244 +55 E 0.322 +56 A 0.388 +57 G 0.432 +58 A 0.451 +59 S 0.447 +60 C 0.434 +61 D 0.428 +62 Y 0.429 +63 S 0.420 +64 R 0.391 +65 N 0.350 +66 V 0.308 +67 I 0.268 +68 C 0.230 +69 N 0.193 +70 N 0.155 +71 K 0.120 +72 A 0.094 +73 D 0.079 +74 Y 0.071 +75 V 0.065 +76 H 0.059 +77 K 0.053 +78 T 0.047 +79 K 0.043 +80 T 0.043 +81 F 0.051 +82 P 0.066 +83 V 0.083 +84 E 0.091 +85 D 0.088 +86 N 0.080 +87 W 0.076 +88 L 0.079 +89 S 0.086 +90 A 0.089 +91 G 0.085 +92 S 0.075 +93 H 0.064 +94 T 0.053 +95 F 0.043 +96 D 0.036 +97 F 0.031 +98 H 0.031 +99 F 0.036 +100 N 0.047 +101 L 0.060 +102 P 0.070 +103 P 0.076 +104 R 0.082 +105 L 0.087 +106 P 0.087 +107 S 0.081 +108 T 0.074 +109 F 0.073 +110 T 0.080 +111 S 0.091 +112 K 0.098 +113 F 0.095 +114 G 0.086 +115 H 0.076 +116 V 0.069 +117 F 0.065 +118 Y 0.059 +119 F 0.048 +120 V 0.037 +121 Q 0.030 +122 A 0.028 +123 S 0.031 +124 C 0.037 +125 M 0.048 +126 G 0.062 +127 R 0.076 +128 E 0.086 +129 H 0.090 +130 I 0.089 +131 L 0.083 +132 A 0.071 +133 K 0.059 +134 K 0.048 +135 R 0.040 +136 M 0.033 +137 Y 0.029 +138 L 0.032 +139 L 0.045 +140 V 0.068 +141 Q 0.099 +142 G 0.133 +143 T 0.167 +144 S 0.195 +145 T 0.209 +146 F 0.209 +147 H 0.198 +148 K 0.183 +149 E 0.179 +150 T 0.195 +151 P 0.217 +152 F 0.221 +153 Q 0.200 +154 N 0.163 +155 P 0.126 +156 L 0.103 +157 F 0.096 +158 V 0.095 +159 E 0.087 +160 A 0.077 +161 E 0.076 +162 E 0.085 +163 K 0.096 +164 V 0.103 +165 S 0.105 +166 Y 0.101 +167 N 0.097 +168 C 0.098 +169 C 0.107 +170 R 0.115 +171 Q 0.112 +172 G 0.102 +173 T 0.090 +174 V 0.077 +175 C 0.062 +176 L 0.049 +177 Q 0.042 +178 I 0.041 +179 Q 0.045 +180 M 0.049 +181 E 0.051 +182 R 0.052 +183 N 0.053 +184 T 0.054 +185 F 0.053 +186 T 0.053 +187 P 0.054 +188 G 0.054 +189 E 0.053 +190 K 0.051 +191 V 0.050 +192 V 0.050 +193 F 0.049 +194 T 0.048 +195 T 0.049 +196 E 0.051 +197 I 0.054 +198 N 0.059 +199 N 0.065 +200 Q 0.070 +201 T 0.070 +202 S 0.063 +203 K 0.056 +204 C 0.052 +205 I 0.047 +206 K 0.039 +207 T 0.031 +208 V 0.025 +209 V 0.022 +210 F 0.020 +211 A 0.021 +212 L 0.025 +213 Y 0.031 +214 A 0.041 +215 H 0.051 +216 I 0.062 +217 Q 0.076 +218 Y 0.096 +219 E 0.118 +220 G 0.138 +221 F 0.158 +222 T 0.182 +223 P 0.210 +224 S 0.233 +225 A 0.246 +226 E 0.251 +227 R 0.253 +228 R 0.250 +229 S 0.233 +230 R 0.201 +231 L 0.165 +232 D 0.133 +233 S 0.109 +234 S 0.093 +235 E 0.083 +236 L 0.075 +237 L 0.067 +238 R 0.065 +239 Q 0.070 +240 E 0.076 +241 A 0.083 +242 N 0.093 +243 T 0.098 +244 P 0.096 +245 V 0.092 +246 T 0.093 +247 R 0.095 +248 F 0.092 +249 N 0.085 +250 T 0.077 +251 T 0.069 +252 K 0.064 +253 V 0.058 +254 V 0.051 +255 S 0.043 +256 T 0.040 +257 F 0.044 +258 N 0.058 +259 L 0.074 +260 P 0.083 +261 L 0.086 +262 L 0.090 +263 L 0.103 +264 S 0.126 +265 V 0.155 +266 S 0.188 +267 S 0.221 +268 S 0.241 +269 T 0.237 +270 Q 0.221 +271 D 0.201 +272 G 0.175 +273 E 0.140 +274 I 0.106 +275 M 0.085 +276 H 0.076 +277 T 0.074 +278 R 0.075 +279 Y 0.073 +280 E 0.060 +281 L 0.044 +282 V 0.032 +283 T 0.028 +284 T 0.031 +285 V 0.042 +286 H 0.059 +287 L 0.079 +288 P 0.092 +289 W 0.096 +290 S 0.095 +291 L 0.093 +292 T 0.090 +293 S 0.082 +294 L 0.071 +295 K 0.059 +296 A 0.051 +297 K 0.045 +298 V 0.040 +299 P 0.034 +300 I 0.031 +301 I 0.036 +302 I 0.054 +303 T 0.086 +304 S 0.133 +305 A 0.186 +306 S 0.234 +307 V 0.277 +308 D 0.318 +309 S 0.354 +310 A 0.382 +311 I 0.395 +312 C 0.398 +313 Q 0.402 +314 L 0.410 +315 S 0.411 +316 E 0.422 +317 D 0.458 +318 G 0.498 +319 V 0.519 +320 L 0.532 +321 P 0.548 +322 V 0.560 +323 N 0.561 +324 P 0.560 +325 D 0.556 +326 H 0.538 +327 Q 0.497 +328 N 0.460 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000205784.5_ENST00000650722.2_GN:ARRDC5_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000205784.5_ENST00000650722.2_GN:ARRDC5_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c2f23e1dfde5bc700aacb3bec3ae99eee0ccb2da --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000205784.5_ENST00000650722.2_GN:ARRDC5_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid @@ -0,0 +1,343 @@ +>ENSG00000205784.5|ENST00000650722.2|GN:ARRDC5|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:14 +1 M 0.440 +2 G 0.465 +3 D 0.490 +4 R 0.487 +5 E 0.457 +6 E 0.438 +7 C 0.450 +8 L 0.469 +9 S 0.471 +10 T 0.461 +11 P 0.458 +12 Q 0.465 +13 P 0.468 +14 P 0.444 +15 M 0.374 +16 S 0.269 +17 V 0.167 +18 V 0.097 +19 K 0.062 +20 S 0.047 +21 I 0.042 +22 E 0.041 +23 L 0.045 +24 V 0.054 +25 L 0.065 +26 P 0.074 +27 E 0.077 +28 D 0.070 +29 R 0.058 +30 I 0.044 +31 Y 0.035 +32 L 0.029 +33 A 0.027 +34 G 0.028 +35 S 0.031 +36 S 0.034 +37 I 0.038 +38 K 0.043 +39 G 0.046 +40 Q 0.046 +41 V 0.044 +42 I 0.044 +43 L 0.050 +44 T 0.061 +45 L 0.071 +46 N 0.078 +47 S 0.077 +48 T 0.071 +49 L 0.066 +50 V 0.064 +51 D 0.061 +52 P 0.053 +53 I 0.041 +54 V 0.032 +55 K 0.029 +56 V 0.031 +57 E 0.035 +58 L 0.039 +59 V 0.044 +60 G 0.049 +61 R 0.056 +62 G 0.062 +63 Y 0.069 +64 V 0.079 +65 E 0.094 +66 W 0.122 +67 S 0.170 +68 E 0.241 +69 E 0.320 +70 A 0.388 +71 G 0.434 +72 A 0.454 +73 S 0.449 +74 C 0.437 +75 D 0.433 +76 Y 0.436 +77 S 0.429 +78 R 0.400 +79 N 0.358 +80 V 0.315 +81 I 0.273 +82 C 0.233 +83 N 0.195 +84 N 0.157 +85 K 0.121 +86 A 0.095 +87 D 0.080 +88 Y 0.072 +89 V 0.066 +90 H 0.060 +91 K 0.053 +92 T 0.047 +93 K 0.043 +94 T 0.044 +95 F 0.052 +96 P 0.067 +97 V 0.083 +98 E 0.091 +99 D 0.087 +100 N 0.078 +101 W 0.073 +102 L 0.076 +103 S 0.083 +104 A 0.087 +105 G 0.083 +106 S 0.074 +107 H 0.063 +108 T 0.052 +109 F 0.043 +110 D 0.036 +111 F 0.031 +112 H 0.031 +113 F 0.036 +114 N 0.048 +115 L 0.060 +116 P 0.070 +117 P 0.076 +118 R 0.082 +119 L 0.087 +120 P 0.086 +121 S 0.081 +122 T 0.074 +123 F 0.072 +124 T 0.080 +125 S 0.091 +126 K 0.098 +127 F 0.096 +128 G 0.087 +129 H 0.077 +130 V 0.069 +131 F 0.065 +132 Y 0.059 +133 F 0.048 +134 V 0.037 +135 Q 0.029 +136 A 0.027 +137 S 0.030 +138 C 0.037 +139 M 0.047 +140 G 0.061 +141 R 0.075 +142 E 0.085 +143 H 0.089 +144 I 0.088 +145 L 0.081 +146 A 0.069 +147 K 0.056 +148 K 0.046 +149 R 0.038 +150 M 0.032 +151 Y 0.029 +152 L 0.032 +153 L 0.045 +154 V 0.068 +155 Q 0.099 +156 G 0.134 +157 T 0.168 +158 S 0.196 +159 T 0.212 +160 F 0.213 +161 H 0.201 +162 K 0.186 +163 E 0.182 +164 T 0.198 +165 P 0.221 +166 F 0.225 +167 Q 0.204 +168 N 0.167 +169 P 0.129 +170 L 0.105 +171 F 0.097 +172 V 0.095 +173 E 0.087 +174 A 0.078 +175 E 0.077 +176 E 0.086 +177 K 0.097 +178 V 0.105 +179 S 0.106 +180 Y 0.102 +181 N 0.096 +182 C 0.097 +183 C 0.106 +184 R 0.113 +185 Q 0.111 +186 G 0.102 +187 T 0.090 +188 V 0.077 +189 C 0.062 +190 L 0.049 +191 Q 0.042 +192 I 0.041 +193 Q 0.045 +194 M 0.049 +195 E 0.050 +196 R 0.051 +197 N 0.053 +198 T 0.054 +199 F 0.053 +200 T 0.053 +201 P 0.054 +202 G 0.054 +203 E 0.053 +204 K 0.051 +205 V 0.050 +206 V 0.049 +207 F 0.049 +208 T 0.048 +209 T 0.049 +210 E 0.051 +211 I 0.055 +212 N 0.059 +213 N 0.065 +214 Q 0.070 +215 T 0.070 +216 S 0.063 +217 K 0.056 +218 C 0.053 +219 I 0.047 +220 K 0.039 +221 T 0.031 +222 V 0.025 +223 V 0.022 +224 F 0.021 +225 A 0.022 +226 L 0.025 +227 Y 0.032 +228 A 0.041 +229 H 0.052 +230 I 0.063 +231 Q 0.077 +232 Y 0.097 +233 E 0.118 +234 G 0.138 +235 F 0.159 +236 T 0.184 +237 P 0.212 +238 S 0.236 +239 A 0.250 +240 E 0.255 +241 R 0.258 +242 R 0.255 +243 S 0.237 +244 R 0.204 +245 L 0.167 +246 D 0.135 +247 S 0.110 +248 S 0.094 +249 E 0.084 +250 L 0.075 +251 L 0.068 +252 R 0.066 +253 Q 0.070 +254 E 0.077 +255 A 0.084 +256 N 0.094 +257 T 0.099 +258 P 0.097 +259 V 0.093 +260 T 0.094 +261 R 0.096 +262 F 0.094 +263 N 0.087 +264 T 0.078 +265 T 0.071 +266 K 0.065 +267 V 0.059 +268 V 0.051 +269 S 0.044 +270 T 0.041 +271 F 0.045 +272 N 0.059 +273 L 0.075 +274 P 0.085 +275 L 0.088 +276 L 0.093 +277 L 0.106 +278 S 0.130 +279 V 0.160 +280 S 0.194 +281 S 0.228 +282 S 0.248 +283 T 0.244 +284 Q 0.226 +285 D 0.205 +286 G 0.179 +287 E 0.143 +288 I 0.109 +289 M 0.087 +290 H 0.078 +291 T 0.076 +292 R 0.077 +293 Y 0.074 +294 E 0.061 +295 L 0.045 +296 V 0.032 +297 T 0.028 +298 T 0.032 +299 V 0.042 +300 H 0.060 +301 L 0.079 +302 P 0.093 +303 W 0.097 +304 S 0.095 +305 L 0.094 +306 T 0.090 +307 S 0.082 +308 L 0.071 +309 K 0.060 +310 A 0.051 +311 K 0.045 +312 V 0.040 +313 P 0.035 +314 I 0.032 +315 I 0.037 +316 I 0.055 +317 T 0.088 +318 S 0.135 +319 A 0.188 +320 S 0.237 +321 V 0.281 +322 D 0.322 +323 S 0.360 +324 A 0.388 +325 I 0.401 +326 C 0.404 +327 Q 0.408 +328 L 0.417 +329 S 0.419 +330 E 0.430 +331 D 0.467 +332 G 0.507 +333 V 0.527 +334 L 0.540 +335 P 0.556 +336 V 0.569 +337 N 0.573 +338 P 0.574 +339 D 0.573 +340 H 0.558 +341 Q 0.518 +342 N 0.480 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000212127.6_ENST00000537503.2_GN:TAS2R14_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000212127.6_ENST00000537503.2_GN:TAS2R14_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..08db07a933fc2314849e14e60231a81785cd733f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000212127.6_ENST00000537503.2_GN:TAS2R14_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,318 @@ +>ENSG00000212127.6|ENST00000537503.2|GN:TAS2R14|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.243 +2 G 0.225 +3 G 0.192 +4 V 0.158 +5 I 0.131 +6 K 0.112 +7 S 0.094 +8 I 0.079 +9 F 0.073 +10 T 0.073 +11 F 0.071 +12 V 0.059 +13 L 0.045 +14 I 0.034 +15 V 0.029 +16 E 0.027 +17 F 0.026 +18 I 0.029 +19 I 0.033 +20 G 0.036 +21 N 0.035 +22 L 0.034 +23 G 0.037 +24 N 0.041 +25 S 0.046 +26 F 0.049 +27 I 0.049 +28 A 0.046 +29 L 0.045 +30 V 0.046 +31 N 0.045 +32 C 0.045 +33 I 0.050 +34 D 0.059 +35 W 0.069 +36 V 0.080 +37 K 0.093 +38 G 0.108 +39 R 0.119 +40 K 0.117 +41 I 0.102 +42 S 0.079 +43 S 0.058 +44 V 0.043 +45 D 0.033 +46 R 0.028 +47 I 0.028 +48 L 0.033 +49 T 0.040 +50 A 0.043 +51 L 0.041 +52 A 0.041 +53 I 0.043 +54 S 0.044 +55 R 0.046 +56 I 0.046 +57 S 0.040 +58 L 0.031 +59 V 0.023 +60 W 0.019 +61 L 0.019 +62 I 0.023 +63 F 0.030 +64 G 0.034 +65 S 0.031 +66 W 0.025 +67 C 0.022 +68 V 0.024 +69 S 0.032 +70 V 0.045 +71 F 0.061 +72 F 0.075 +73 P 0.082 +74 A 0.085 +75 L 0.091 +76 F 0.102 +77 A 0.111 +78 T 0.109 +79 E 0.095 +80 K 0.077 +81 M 0.063 +82 F 0.056 +83 R 0.052 +84 M 0.048 +85 L 0.044 +86 T 0.043 +87 N 0.045 +88 I 0.043 +89 W 0.036 +90 T 0.029 +91 V 0.027 +92 I 0.027 +93 N 0.028 +94 H 0.030 +95 F 0.031 +96 S 0.030 +97 V 0.028 +98 W 0.025 +99 L 0.023 +100 A 0.023 +101 T 0.026 +102 G 0.029 +103 L 0.031 +104 G 0.034 +105 T 0.036 +106 F 0.037 +107 Y 0.038 +108 F 0.044 +109 L 0.054 +110 K 0.069 +111 I 0.089 +112 A 0.111 +113 N 0.129 +114 F 0.142 +115 S 0.148 +116 N 0.139 +117 S 0.116 +118 I 0.091 +119 F 0.074 +120 L 0.066 +121 Y 0.063 +122 L 0.062 +123 K 0.059 +124 W 0.053 +125 R 0.046 +126 V 0.042 +127 K 0.037 +128 K 0.034 +129 V 0.032 +130 V 0.030 +131 L 0.028 +132 V 0.028 +133 L 0.029 +134 L 0.029 +135 L 0.029 +136 V 0.031 +137 T 0.034 +138 S 0.033 +139 V 0.029 +140 F 0.025 +141 L 0.024 +142 F 0.027 +143 L 0.030 +144 N 0.034 +145 I 0.036 +146 A 0.038 +147 L 0.041 +148 I 0.046 +149 N 0.049 +150 I 0.051 +151 H 0.055 +152 I 0.060 +153 N 0.070 +154 A 0.088 +155 S 0.115 +156 I 0.156 +157 N 0.208 +158 G 0.261 +159 Y 0.301 +160 R 0.330 +161 R 0.357 +162 N 0.381 +163 K 0.394 +164 T 0.400 +165 C 0.413 +166 S 0.439 +167 S 0.462 +168 D 0.460 +169 S 0.427 +170 S 0.376 +171 N 0.326 +172 F 0.279 +173 T 0.235 +174 R 0.198 +175 F 0.167 +176 S 0.138 +177 S 0.114 +178 L 0.097 +179 I 0.085 +180 V 0.076 +181 L 0.070 +182 T 0.064 +183 S 0.057 +184 T 0.046 +185 V 0.036 +186 F 0.029 +187 I 0.028 +188 F 0.031 +189 I 0.034 +190 P 0.035 +191 F 0.034 +192 T 0.036 +193 L 0.041 +194 S 0.049 +195 L 0.059 +196 A 0.061 +197 M 0.052 +198 F 0.039 +199 L 0.030 +200 L 0.028 +201 L 0.028 +202 I 0.027 +203 F 0.028 +204 S 0.032 +205 M 0.037 +206 W 0.043 +207 K 0.052 +208 H 0.068 +209 R 0.091 +210 K 0.115 +211 K 0.138 +212 M 0.163 +213 Q 0.194 +214 H 0.231 +215 T 0.266 +216 V 0.292 +217 K 0.310 +218 I 0.323 +219 S 0.331 +220 G 0.333 +221 D 0.324 +222 A 0.303 +223 S 0.269 +224 T 0.231 +225 K 0.201 +226 A 0.180 +227 H 0.161 +228 R 0.136 +229 G 0.106 +230 V 0.082 +231 K 0.065 +232 S 0.051 +233 V 0.039 +234 I 0.030 +235 T 0.025 +236 F 0.022 +237 F 0.019 +238 L 0.017 +239 L 0.018 +240 Y 0.019 +241 A 0.019 +242 I 0.018 +243 F 0.017 +244 S 0.018 +245 L 0.020 +246 S 0.020 +247 F 0.020 +248 F 0.021 +249 I 0.024 +250 S 0.032 +251 V 0.047 +252 W 0.069 +253 T 0.095 +254 S 0.116 +255 E 0.126 +256 R 0.124 +257 L 0.111 +258 E 0.090 +259 E 0.069 +260 N 0.054 +261 L 0.046 +262 I 0.041 +263 I 0.037 +264 L 0.035 +265 S 0.035 +266 Q 0.036 +267 V 0.036 +268 M 0.037 +269 G 0.040 +270 M 0.045 +271 A 0.051 +272 Y 0.051 +273 P 0.046 +274 S 0.040 +275 C 0.039 +276 H 0.041 +277 S 0.043 +278 C 0.043 +279 V 0.041 +280 L 0.042 +281 I 0.046 +282 L 0.054 +283 G 0.061 +284 N 0.062 +285 K 0.056 +286 K 0.049 +287 L 0.043 +288 R 0.042 +289 Q 0.046 +290 A 0.052 +291 S 0.056 +292 L 0.058 +293 S 0.060 +294 V 0.063 +295 L 0.067 +296 L 0.077 +297 W 0.089 +298 L 0.100 +299 R 0.112 +300 Y 0.135 +301 M 0.174 +302 F 0.227 +303 K 0.297 +304 D 0.385 +305 G 0.471 +306 E 0.531 +307 P 0.562 +308 S 0.571 +309 G 0.550 +310 H 0.498 +311 K 0.452 +312 E 0.455 +313 F 0.488 +314 R 0.508 +315 E 0.495 +316 S 0.459 +317 S 0.427 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000212127.6_ENST00000537503.2_GN:TAS2R14_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000212127.6_ENST00000537503.2_GN:TAS2R14_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..06a64ee5778749b30f7d10635852338ecf6a91c2 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000212127.6_ENST00000537503.2_GN:TAS2R14_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid @@ -0,0 +1,323 @@ +>ENSG00000212127.6|ENST00000537503.2|GN:TAS2R14|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:5 +1 M 0.189 +2 L 0.175 +3 L 0.166 +4 Q 0.174 +5 A 0.190 +6 M 0.202 +7 G 0.197 +8 G 0.175 +9 V 0.147 +10 I 0.122 +11 K 0.101 +12 S 0.081 +13 I 0.068 +14 F 0.065 +15 T 0.068 +16 F 0.068 +17 V 0.058 +18 L 0.044 +19 I 0.035 +20 V 0.030 +21 E 0.028 +22 F 0.027 +23 I 0.029 +24 I 0.033 +25 G 0.035 +26 N 0.034 +27 L 0.034 +28 G 0.036 +29 N 0.041 +30 S 0.046 +31 F 0.049 +32 I 0.048 +33 A 0.045 +34 L 0.044 +35 V 0.045 +36 N 0.044 +37 C 0.045 +38 I 0.050 +39 D 0.059 +40 W 0.070 +41 V 0.081 +42 K 0.094 +43 G 0.109 +44 R 0.120 +45 K 0.119 +46 I 0.103 +47 S 0.080 +48 S 0.059 +49 V 0.044 +50 D 0.033 +51 R 0.028 +52 I 0.028 +53 L 0.033 +54 T 0.039 +55 A 0.042 +56 L 0.041 +57 A 0.040 +58 I 0.042 +59 S 0.044 +60 R 0.046 +61 I 0.045 +62 S 0.040 +63 L 0.031 +64 V 0.023 +65 W 0.018 +66 L 0.018 +67 I 0.022 +68 F 0.028 +69 G 0.032 +70 S 0.030 +71 W 0.024 +72 C 0.021 +73 V 0.023 +74 S 0.031 +75 V 0.044 +76 F 0.060 +77 F 0.073 +78 P 0.080 +79 A 0.082 +80 L 0.088 +81 F 0.100 +82 A 0.109 +83 T 0.107 +84 E 0.094 +85 K 0.076 +86 M 0.063 +87 F 0.056 +88 R 0.052 +89 M 0.047 +90 L 0.043 +91 T 0.043 +92 N 0.044 +93 I 0.043 +94 W 0.036 +95 T 0.029 +96 V 0.027 +97 I 0.027 +98 N 0.028 +99 H 0.030 +100 F 0.031 +101 S 0.030 +102 V 0.027 +103 W 0.025 +104 L 0.023 +105 A 0.023 +106 T 0.026 +107 G 0.029 +108 L 0.030 +109 G 0.033 +110 T 0.035 +111 F 0.036 +112 Y 0.037 +113 F 0.043 +114 L 0.054 +115 K 0.069 +116 I 0.089 +117 A 0.111 +118 N 0.129 +119 F 0.143 +120 S 0.149 +121 N 0.141 +122 S 0.118 +123 I 0.092 +124 F 0.075 +125 L 0.068 +126 Y 0.065 +127 L 0.063 +128 K 0.060 +129 W 0.054 +130 R 0.047 +131 V 0.042 +132 K 0.038 +133 K 0.035 +134 V 0.032 +135 V 0.030 +136 L 0.027 +137 V 0.027 +138 L 0.029 +139 L 0.029 +140 L 0.029 +141 V 0.031 +142 T 0.034 +143 S 0.033 +144 V 0.029 +145 F 0.025 +146 L 0.024 +147 F 0.027 +148 L 0.031 +149 N 0.034 +150 I 0.036 +151 A 0.038 +152 L 0.042 +153 I 0.046 +154 N 0.049 +155 I 0.051 +156 H 0.055 +157 I 0.060 +158 N 0.071 +159 A 0.088 +160 S 0.116 +161 I 0.157 +162 N 0.209 +163 G 0.261 +164 Y 0.301 +165 R 0.331 +166 R 0.358 +167 N 0.381 +168 K 0.394 +169 T 0.400 +170 C 0.414 +171 S 0.440 +172 S 0.464 +173 D 0.462 +174 S 0.428 +175 S 0.377 +176 N 0.326 +177 F 0.278 +178 T 0.234 +179 R 0.197 +180 F 0.165 +181 S 0.136 +182 S 0.113 +183 L 0.096 +184 I 0.085 +185 V 0.076 +186 L 0.070 +187 T 0.065 +188 S 0.057 +189 T 0.046 +190 V 0.036 +191 F 0.029 +192 I 0.028 +193 F 0.031 +194 I 0.034 +195 P 0.035 +196 F 0.035 +197 T 0.036 +198 L 0.041 +199 S 0.050 +200 L 0.059 +201 A 0.062 +202 M 0.053 +203 F 0.039 +204 L 0.030 +205 L 0.028 +206 L 0.028 +207 I 0.028 +208 F 0.028 +209 S 0.032 +210 M 0.037 +211 W 0.043 +212 K 0.052 +213 H 0.068 +214 R 0.091 +215 K 0.115 +216 K 0.137 +217 M 0.161 +218 Q 0.192 +219 H 0.229 +220 T 0.264 +221 V 0.290 +222 K 0.308 +223 I 0.321 +224 S 0.329 +225 G 0.331 +226 D 0.322 +227 A 0.301 +228 S 0.268 +229 T 0.230 +230 K 0.200 +231 A 0.179 +232 H 0.160 +233 R 0.135 +234 G 0.106 +235 V 0.081 +236 K 0.065 +237 S 0.051 +238 V 0.039 +239 I 0.030 +240 T 0.026 +241 F 0.022 +242 F 0.019 +243 L 0.017 +244 L 0.018 +245 Y 0.020 +246 A 0.020 +247 I 0.018 +248 F 0.017 +249 S 0.018 +250 L 0.020 +251 S 0.021 +252 F 0.020 +253 F 0.021 +254 I 0.024 +255 S 0.032 +256 V 0.047 +257 W 0.069 +258 T 0.095 +259 S 0.116 +260 E 0.125 +261 R 0.123 +262 L 0.110 +263 E 0.090 +264 E 0.069 +265 N 0.053 +266 L 0.045 +267 I 0.040 +268 I 0.037 +269 L 0.035 +270 S 0.035 +271 Q 0.036 +272 V 0.036 +273 M 0.037 +274 G 0.040 +275 M 0.046 +276 A 0.052 +277 Y 0.052 +278 P 0.047 +279 S 0.041 +280 C 0.039 +281 H 0.041 +282 S 0.043 +283 C 0.043 +284 V 0.042 +285 L 0.042 +286 I 0.046 +287 L 0.054 +288 G 0.061 +289 N 0.062 +290 K 0.056 +291 K 0.049 +292 L 0.043 +293 R 0.042 +294 Q 0.045 +295 A 0.051 +296 S 0.054 +297 L 0.057 +298 S 0.059 +299 V 0.062 +300 L 0.067 +301 L 0.077 +302 W 0.089 +303 L 0.101 +304 R 0.113 +305 Y 0.136 +306 M 0.174 +307 F 0.227 +308 K 0.298 +309 D 0.385 +310 G 0.471 +311 E 0.531 +312 P 0.563 +313 S 0.572 +314 G 0.549 +315 H 0.492 +316 K 0.441 +317 E 0.440 +318 F 0.478 +319 R 0.504 +320 E 0.496 +321 S 0.462 +322 S 0.430 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000212938.4_ENST00000391624.2_GN:KRTAP6-3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000212938.4_ENST00000391624.2_GN:KRTAP6-3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d933fc4f98bdc099656387606357e58afd1740cb --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000212938.4_ENST00000391624.2_GN:KRTAP6-3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,104 @@ +>ENSG00000212938.4|ENST00000391624.2|GN:KRTAP6-3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.378 +2 C 0.428 +3 G 0.490 +4 S 0.524 +5 Y 0.516 +6 Y 0.486 +7 R 0.459 +8 N 0.450 +9 Y 0.463 +10 N 0.489 +11 G 0.516 +12 G 0.533 +13 H 0.536 +14 G 0.541 +15 Y 0.553 +16 G 0.554 +17 C 0.531 +18 C 0.510 +19 G 0.532 +20 Y 0.589 +21 G 0.633 +22 G 0.626 +23 L 0.567 +24 G 0.485 +25 C 0.426 +26 G 0.413 +27 Y 0.429 +28 G 0.444 +29 G 0.449 +30 C 0.462 +31 G 0.493 +32 Y 0.522 +33 G 0.521 +34 C 0.491 +35 C 0.472 +36 G 0.500 +37 Y 0.558 +38 G 0.596 +39 G 0.581 +40 L 0.522 +41 G 0.463 +42 F 0.450 +43 G 0.496 +44 Y 0.574 +45 G 0.632 +46 G 0.635 +47 L 0.587 +48 D 0.524 +49 C 0.484 +50 G 0.492 +51 Y 0.540 +52 G 0.585 +53 G 0.586 +54 L 0.538 +55 G 0.478 +56 C 0.444 +57 G 0.437 +58 Y 0.424 +59 G 0.385 +60 S 0.332 +61 F 0.297 +62 C 0.300 +63 G 0.332 +64 C 0.373 +65 G 0.415 +66 Y 0.460 +67 R 0.501 +68 G 0.518 +69 L 0.497 +70 D 0.443 +71 C 0.382 +72 G 0.338 +73 Y 0.317 +74 G 0.309 +75 C 0.312 +76 G 0.326 +77 Y 0.343 +78 G 0.346 +79 Y 0.330 +80 V 0.307 +81 S 0.293 +82 H 0.295 +83 S 0.302 +84 F 0.308 +85 C 0.320 +86 G 0.349 +87 C 0.393 +88 G 0.430 +89 Y 0.447 +90 R 0.445 +91 C 0.437 +92 G 0.439 +93 S 0.466 +94 G 0.516 +95 Y 0.567 +96 G 0.600 +97 S 0.613 +98 S 0.612 +99 F 0.593 +100 G 0.549 +101 Y 0.479 +102 Y 0.397 +103 Y 0.340 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000212938.4_ENST00000391624.2_GN:KRTAP6-3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000212938.4_ENST00000391624.2_GN:KRTAP6-3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f30ccf845785df88e6ea7067911fae38a87a6915 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000212938.4_ENST00000391624.2_GN:KRTAP6-3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid @@ -0,0 +1,111 @@ +>ENSG00000212938.4|ENST00000391624.2|GN:KRTAP6-3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:7 +1 M 0.410 +2 T 0.439 +3 S 0.487 +4 T 0.529 +5 T 0.539 +6 N 0.506 +7 T 0.452 +8 M 0.416 +9 C 0.422 +10 G 0.453 +11 S 0.468 +12 Y 0.445 +13 Y 0.401 +14 R 0.363 +15 N 0.350 +16 Y 0.369 +17 N 0.415 +18 G 0.469 +19 G 0.509 +20 H 0.526 +21 G 0.531 +22 Y 0.533 +23 G 0.527 +24 C 0.509 +25 C 0.502 +26 G 0.533 +27 Y 0.591 +28 G 0.633 +29 G 0.625 +30 L 0.564 +31 G 0.481 +32 C 0.423 +33 G 0.411 +34 Y 0.426 +35 G 0.436 +36 G 0.437 +37 C 0.446 +38 G 0.473 +39 Y 0.499 +40 G 0.499 +41 C 0.474 +42 C 0.464 +43 G 0.498 +44 Y 0.558 +45 G 0.596 +46 G 0.584 +47 L 0.530 +48 G 0.477 +49 F 0.469 +50 G 0.517 +51 Y 0.593 +52 G 0.649 +53 G 0.651 +54 L 0.606 +55 D 0.545 +56 C 0.503 +57 G 0.506 +58 Y 0.547 +59 G 0.585 +60 G 0.579 +61 L 0.524 +62 G 0.459 +63 C 0.422 +64 G 0.412 +65 Y 0.398 +66 G 0.359 +67 S 0.308 +68 F 0.276 +69 C 0.281 +70 G 0.312 +71 C 0.350 +72 G 0.391 +73 Y 0.436 +74 R 0.478 +75 G 0.495 +76 L 0.476 +77 D 0.427 +78 C 0.373 +79 G 0.337 +80 Y 0.320 +81 G 0.311 +82 C 0.308 +83 G 0.313 +84 Y 0.318 +85 G 0.312 +86 Y 0.291 +87 V 0.271 +88 S 0.263 +89 H 0.266 +90 S 0.271 +91 F 0.279 +92 C 0.301 +93 G 0.342 +94 C 0.393 +95 G 0.432 +96 Y 0.448 +97 R 0.444 +98 C 0.432 +99 G 0.430 +100 S 0.454 +101 G 0.504 +102 Y 0.557 +103 G 0.593 +104 S 0.607 +105 S 0.606 +106 F 0.588 +107 G 0.547 +108 Y 0.482 +109 Y 0.404 +110 Y 0.347 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000214226.10_ENST00000397861.7_GN:C17orf67_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000214226.10_ENST00000397861.7_GN:C17orf67_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1cd8135fe6872d75035cc68719d434666fb2db29 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000214226.10_ENST00000397861.7_GN:C17orf67_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,91 @@ +>ENSG00000214226.10|ENST00000397861.7|GN:C17orf67|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.364 +2 K 0.358 +3 T 0.338 +4 L 0.304 +5 P 0.262 +6 V 0.226 +7 L 0.204 +8 V 0.204 +9 L 0.220 +10 S 0.241 +11 L 0.260 +12 T 0.271 +13 L 0.276 +14 L 0.295 +15 T 0.343 +16 V 0.407 +17 F 0.463 +18 S 0.510 +19 E 0.556 +20 T 0.595 +21 S 0.612 +22 P 0.594 +23 I 0.528 +24 L 0.421 +25 T 0.308 +26 E 0.225 +27 K 0.183 +28 Q 0.168 +29 A 0.166 +30 K 0.171 +31 Q 0.186 +32 L 0.207 +33 L 0.229 +34 R 0.253 +35 S 0.283 +36 R 0.321 +37 R 0.371 +38 Q 0.430 +39 D 0.484 +40 R 0.527 +41 P 0.561 +42 S 0.591 +43 K 0.617 +44 P 0.633 +45 G 0.630 +46 F 0.595 +47 P 0.533 +48 D 0.464 +49 E 0.407 +50 P 0.354 +51 M 0.291 +52 R 0.234 +53 E 0.203 +54 Y 0.195 +55 M 0.192 +56 H 0.198 +57 H 0.216 +58 L 0.237 +59 L 0.245 +60 A 0.250 +61 L 0.267 +62 E 0.287 +63 H 0.291 +64 R 0.288 +65 A 0.294 +66 E 0.307 +67 E 0.308 +68 Q 0.295 +69 F 0.274 +70 L 0.246 +71 E 0.220 +72 H 0.211 +73 W 0.226 +74 L 0.250 +75 N 0.269 +76 P 0.275 +77 H 0.263 +78 C 0.247 +79 K 0.249 +80 P 0.277 +81 H 0.317 +82 C 0.357 +83 D 0.404 +84 R 0.458 +85 N 0.502 +86 R 0.523 +87 I 0.528 +88 H 0.519 +89 P 0.492 +90 V 0.465 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000214226.10_ENST00000397861.7_GN:C17orf67_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000214226.10_ENST00000397861.7_GN:C17orf67_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c1010cbc7950ad7ae1873cd4723d11d4a01af987 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000214226.10_ENST00000397861.7_GN:C17orf67_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid @@ -0,0 +1,115 @@ +>ENSG00000214226.10|ENST00000397861.7|GN:C17orf67|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:24 +1 M 0.430 +2 A 0.456 +3 S 0.491 +4 F 0.524 +5 K 0.551 +6 L 0.570 +7 A 0.579 +8 D 0.575 +9 S 0.558 +10 V 0.535 +11 W 0.521 +12 E 0.511 +13 D 0.482 +14 S 0.433 +15 L 0.399 +16 S 0.414 +17 K 0.474 +18 R 0.554 +19 Q 0.624 +20 R 0.676 +21 N 0.709 +22 Q 0.727 +23 G 0.731 +24 R 0.715 +25 M 0.676 +26 K 0.611 +27 T 0.524 +28 L 0.431 +29 P 0.350 +30 V 0.294 +31 L 0.267 +32 V 0.270 +33 L 0.293 +34 S 0.316 +35 L 0.330 +36 T 0.332 +37 L 0.329 +38 L 0.332 +39 T 0.357 +40 V 0.400 +41 F 0.451 +42 S 0.507 +43 E 0.566 +44 T 0.614 +45 S 0.639 +46 P 0.632 +47 I 0.577 +48 L 0.475 +49 T 0.361 +50 E 0.275 +51 K 0.231 +52 Q 0.217 +53 A 0.218 +54 K 0.229 +55 Q 0.250 +56 L 0.274 +57 L 0.298 +58 R 0.326 +59 S 0.358 +60 R 0.396 +61 R 0.445 +62 Q 0.502 +63 D 0.551 +64 R 0.584 +65 P 0.608 +66 S 0.629 +67 K 0.650 +68 P 0.663 +69 G 0.656 +70 F 0.618 +71 P 0.553 +72 D 0.480 +73 E 0.418 +74 P 0.358 +75 M 0.290 +76 R 0.231 +77 E 0.201 +78 Y 0.192 +79 M 0.191 +80 H 0.199 +81 H 0.222 +82 L 0.243 +83 L 0.245 +84 A 0.244 +85 L 0.258 +86 E 0.278 +87 H 0.286 +88 R 0.287 +89 A 0.297 +90 E 0.311 +91 E 0.308 +92 Q 0.289 +93 F 0.264 +94 L 0.236 +95 E 0.210 +96 H 0.200 +97 W 0.210 +98 L 0.230 +99 N 0.245 +100 P 0.248 +101 H 0.235 +102 C 0.218 +103 K 0.219 +104 P 0.248 +105 H 0.292 +106 C 0.336 +107 D 0.385 +108 R 0.442 +109 N 0.493 +110 R 0.524 +111 I 0.538 +112 H 0.536 +113 P 0.511 +114 V 0.483 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000214336.5_ENST00000428390.3_GN:FOXI3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000214336.5_ENST00000428390.3_GN:FOXI3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..10e6c1f69aefe61735bc20617777eac053ecd154 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000214336.5_ENST00000428390.3_GN:FOXI3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,421 @@ +>ENSG00000214336.5|ENST00000428390.3|GN:FOXI3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.511 +2 A 0.563 +3 L 0.626 +4 Y 0.671 +5 C 0.696 +6 G 0.708 +7 D 0.712 +8 N 0.716 +9 F 0.726 +10 G 0.740 +11 V 0.750 +12 Y 0.751 +13 S 0.745 +14 Q 0.739 +15 P 0.732 +16 G 0.724 +17 L 0.711 +18 P 0.694 +19 P 0.668 +20 P 0.638 +21 A 0.643 +22 A 0.705 +23 T 0.782 +24 A 0.822 +25 A 0.823 +26 A 0.807 +27 P 0.791 +28 G 0.779 +29 A 0.773 +30 P 0.778 +31 P 0.793 +32 A 0.806 +33 A 0.806 +34 R 0.792 +35 A 0.777 +36 P 0.772 +37 Y 0.778 +38 G 0.787 +39 L 0.793 +40 A 0.794 +41 D 0.790 +42 Y 0.782 +43 A 0.772 +44 A 0.768 +45 P 0.777 +46 P 0.801 +47 A 0.826 +48 A 0.835 +49 A 0.822 +50 A 0.793 +51 N 0.763 +52 P 0.744 +53 Y 0.743 +54 L 0.754 +55 W 0.768 +56 L 0.779 +57 N 0.788 +58 G 0.801 +59 P 0.821 +60 G 0.839 +61 V 0.843 +62 G 0.833 +63 G 0.819 +64 P 0.814 +65 P 0.819 +66 S 0.824 +67 A 0.810 +68 A 0.760 +69 A 0.690 +70 A 0.656 +71 A 0.692 +72 A 0.756 +73 A 0.795 +74 A 0.801 +75 Y 0.793 +76 L 0.780 +77 G 0.763 +78 A 0.742 +79 P 0.721 +80 P 0.709 +81 P 0.711 +82 P 0.726 +83 P 0.750 +84 P 0.780 +85 P 0.810 +86 G 0.835 +87 A 0.847 +88 A 0.847 +89 A 0.839 +90 G 0.829 +91 P 0.822 +92 F 0.818 +93 L 0.809 +94 Q 0.797 +95 P 0.791 +96 P 0.801 +97 P 0.822 +98 A 0.844 +99 A 0.855 +100 G 0.854 +101 T 0.847 +102 F 0.840 +103 G 0.832 +104 C 0.820 +105 S 0.803 +106 Q 0.787 +107 R 0.778 +108 P 0.776 +109 F 0.779 +110 A 0.784 +111 Q 0.785 +112 P 0.786 +113 A 0.789 +114 P 0.795 +115 A 0.799 +116 A 0.799 +117 P 0.797 +118 A 0.795 +119 S 0.793 +120 P 0.787 +121 A 0.776 +122 A 0.760 +123 P 0.739 +124 A 0.716 +125 G 0.688 +126 P 0.652 +127 G 0.595 +128 E 0.512 +129 L 0.418 +130 G 0.330 +131 W 0.259 +132 L 0.214 +133 S 0.195 +134 M 0.186 +135 A 0.174 +136 S 0.158 +137 R 0.142 +138 E 0.131 +139 D 0.126 +140 L 0.123 +141 M 0.123 +142 K 0.126 +143 M 0.129 +144 V 0.124 +145 R 0.115 +146 P 0.107 +147 P 0.096 +148 Y 0.079 +149 S 0.057 +150 Y 0.038 +151 S 0.026 +152 A 0.022 +153 L 0.023 +154 I 0.026 +155 A 0.032 +156 M 0.038 +157 A 0.043 +158 I 0.045 +159 Q 0.046 +160 S 0.047 +161 A 0.050 +162 P 0.053 +163 E 0.055 +164 R 0.056 +165 K 0.054 +166 L 0.047 +167 T 0.038 +168 L 0.033 +169 S 0.035 +170 H 0.039 +171 I 0.041 +172 Y 0.042 +173 Q 0.041 +174 F 0.040 +175 V 0.039 +176 A 0.042 +177 D 0.047 +178 S 0.051 +179 F 0.051 +180 P 0.052 +181 F 0.051 +182 Y 0.050 +183 Q 0.050 +184 R 0.052 +185 S 0.057 +186 K 0.060 +187 A 0.056 +188 G 0.049 +189 W 0.041 +190 Q 0.036 +191 N 0.036 +192 S 0.041 +193 I 0.050 +194 R 0.054 +195 H 0.056 +196 N 0.057 +197 L 0.060 +198 S 0.064 +199 L 0.069 +200 N 0.071 +201 D 0.069 +202 C 0.063 +203 F 0.061 +204 K 0.074 +205 K 0.104 +206 V 0.142 +207 P 0.174 +208 R 0.189 +209 D 0.191 +210 E 0.190 +211 D 0.201 +212 D 0.218 +213 P 0.226 +214 G 0.213 +215 K 0.181 +216 G 0.140 +217 N 0.101 +218 Y 0.073 +219 W 0.061 +220 T 0.062 +221 L 0.070 +222 D 0.074 +223 P 0.071 +224 N 0.067 +225 C 0.069 +226 E 0.078 +227 K 0.093 +228 M 0.111 +229 F 0.130 +230 D 0.147 +231 N 0.160 +232 G 0.165 +233 N 0.165 +234 F 0.168 +235 R 0.182 +236 R 0.211 +237 K 0.262 +238 R 0.345 +239 K 0.457 +240 R 0.569 +241 R 0.655 +242 S 0.706 +243 E 0.727 +244 A 0.733 +245 S 0.739 +246 N 0.749 +247 G 0.761 +248 S 0.773 +249 T 0.783 +250 V 0.788 +251 A 0.789 +252 A 0.784 +253 G 0.763 +254 T 0.716 +255 S 0.650 +256 K 0.615 +257 S 0.646 +258 E 0.712 +259 E 0.765 +260 G 0.791 +261 L 0.803 +262 S 0.811 +263 S 0.820 +264 G 0.829 +265 L 0.836 +266 G 0.842 +267 S 0.846 +268 G 0.848 +269 V 0.847 +270 G 0.842 +271 G 0.833 +272 K 0.825 +273 P 0.819 +274 E 0.817 +275 E 0.812 +276 E 0.805 +277 S 0.799 +278 P 0.799 +279 S 0.803 +280 T 0.805 +281 L 0.800 +282 L 0.794 +283 R 0.796 +284 P 0.805 +285 S 0.811 +286 H 0.805 +287 S 0.793 +288 P 0.781 +289 E 0.776 +290 P 0.783 +291 P 0.803 +292 E 0.829 +293 G 0.852 +294 T 0.866 +295 K 0.873 +296 S 0.872 +297 T 0.865 +298 A 0.851 +299 S 0.836 +300 S 0.827 +301 P 0.828 +302 G 0.839 +303 G 0.852 +304 P 0.862 +305 M 0.866 +306 L 0.862 +307 T 0.850 +308 S 0.832 +309 T 0.815 +310 P 0.803 +311 C 0.797 +312 L 0.793 +313 N 0.786 +314 T 0.770 +315 F 0.750 +316 F 0.738 +317 S 0.743 +318 S 0.759 +319 L 0.777 +320 S 0.795 +321 S 0.812 +322 L 0.827 +323 S 0.841 +324 V 0.850 +325 S 0.854 +326 S 0.856 +327 S 0.859 +328 V 0.862 +329 S 0.862 +330 T 0.858 +331 Q 0.848 +332 R 0.834 +333 A 0.819 +334 L 0.809 +335 P 0.811 +336 G 0.822 +337 S 0.833 +338 R 0.840 +339 H 0.844 +340 L 0.850 +341 G 0.857 +342 I 0.862 +343 Q 0.863 +344 G 0.859 +345 A 0.847 +346 Q 0.833 +347 L 0.826 +348 P 0.829 +349 S 0.836 +350 S 0.843 +351 G 0.845 +352 V 0.841 +353 F 0.834 +354 S 0.832 +355 P 0.841 +356 T 0.858 +357 S 0.871 +358 I 0.877 +359 S 0.874 +360 E 0.854 +361 A 0.804 +362 S 0.731 +363 A 0.689 +364 D 0.705 +365 T 0.724 +366 L 0.699 +367 Q 0.679 +368 L 0.720 +369 S 0.792 +370 N 0.842 +371 S 0.858 +372 T 0.857 +373 S 0.853 +374 N 0.848 +375 S 0.844 +376 T 0.840 +377 G 0.839 +378 Q 0.840 +379 R 0.838 +380 S 0.830 +381 S 0.811 +382 Y 0.784 +383 Y 0.758 +384 S 0.746 +385 P 0.754 +386 F 0.779 +387 P 0.811 +388 A 0.837 +389 S 0.850 +390 T 0.852 +391 S 0.851 +392 G 0.849 +393 G 0.843 +394 Q 0.831 +395 S 0.814 +396 S 0.797 +397 P 0.784 +398 F 0.774 +399 S 0.763 +400 S 0.753 +401 P 0.752 +402 F 0.764 +403 H 0.780 +404 N 0.790 +405 F 0.794 +406 S 0.797 +407 M 0.800 +408 V 0.795 +409 N 0.779 +410 S 0.756 +411 L 0.725 +412 I 0.689 +413 Y 0.665 +414 P 0.673 +415 R 0.712 +416 E 0.752 +417 G 0.767 +418 S 0.751 +419 E 0.712 +420 V 0.678 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000214336.5_ENST00000428390.3_GN:FOXI3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000214336.5_ENST00000428390.3_GN:FOXI3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..3f5a1a586193806dd3a7cf67c384490014e91873 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000214336.5_ENST00000428390.3_GN:FOXI3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid @@ -0,0 +1,447 @@ +>ENSG00000214336.5|ENST00000428390.3|GN:FOXI3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:26 +1 M 0.451 +2 L 0.481 +3 S 0.527 +4 P 0.567 +5 E 0.577 +6 R 0.555 +7 R 0.544 +8 D 0.578 +9 Q 0.635 +10 P 0.680 +11 R 0.711 +12 S 0.737 +13 P 0.763 +14 L 0.787 +15 A 0.799 +16 A 0.793 +17 A 0.769 +18 A 0.736 +19 P 0.707 +20 Q 0.686 +21 P 0.673 +22 P 0.667 +23 T 0.674 +24 A 0.692 +25 A 0.705 +26 D 0.706 +27 M 0.702 +28 A 0.698 +29 L 0.696 +30 Y 0.701 +31 C 0.715 +32 G 0.728 +33 D 0.733 +34 N 0.736 +35 F 0.745 +36 G 0.760 +37 V 0.771 +38 Y 0.772 +39 S 0.766 +40 Q 0.760 +41 P 0.756 +42 G 0.750 +43 L 0.745 +44 P 0.750 +45 P 0.772 +46 P 0.809 +47 A 0.845 +48 A 0.867 +49 T 0.872 +50 A 0.862 +51 A 0.843 +52 A 0.823 +53 P 0.807 +54 G 0.797 +55 A 0.794 +56 P 0.800 +57 P 0.816 +58 A 0.830 +59 A 0.831 +60 R 0.819 +61 A 0.807 +62 P 0.804 +63 Y 0.810 +64 G 0.818 +65 L 0.822 +66 A 0.821 +67 D 0.816 +68 Y 0.807 +69 A 0.798 +70 A 0.793 +71 P 0.800 +72 P 0.821 +73 A 0.844 +74 A 0.852 +75 A 0.839 +76 A 0.811 +77 N 0.779 +78 P 0.757 +79 Y 0.752 +80 L 0.759 +81 W 0.770 +82 L 0.779 +83 N 0.787 +84 G 0.799 +85 P 0.817 +86 G 0.834 +87 V 0.837 +88 G 0.826 +89 G 0.811 +90 P 0.805 +91 P 0.809 +92 S 0.811 +93 A 0.793 +94 A 0.741 +95 A 0.671 +96 A 0.638 +97 A 0.672 +98 A 0.734 +99 A 0.770 +100 A 0.775 +101 Y 0.766 +102 L 0.753 +103 G 0.737 +104 A 0.715 +105 P 0.693 +106 P 0.680 +107 P 0.682 +108 P 0.698 +109 P 0.724 +110 P 0.755 +111 P 0.787 +112 G 0.812 +113 A 0.824 +114 A 0.823 +115 A 0.813 +116 G 0.803 +117 P 0.797 +118 F 0.793 +119 L 0.784 +120 Q 0.771 +121 P 0.765 +122 P 0.776 +123 P 0.799 +124 A 0.823 +125 A 0.836 +126 G 0.835 +127 T 0.827 +128 F 0.819 +129 G 0.812 +130 C 0.801 +131 S 0.786 +132 Q 0.771 +133 R 0.763 +134 P 0.762 +135 F 0.768 +136 A 0.774 +137 Q 0.777 +138 P 0.779 +139 A 0.785 +140 P 0.793 +141 A 0.799 +142 A 0.800 +143 P 0.798 +144 A 0.797 +145 S 0.794 +146 P 0.788 +147 A 0.777 +148 A 0.761 +149 P 0.741 +150 A 0.716 +151 G 0.685 +152 P 0.644 +153 G 0.582 +154 E 0.498 +155 L 0.405 +156 G 0.317 +157 W 0.246 +158 L 0.200 +159 S 0.181 +160 M 0.173 +161 A 0.162 +162 S 0.147 +163 R 0.132 +164 E 0.122 +165 D 0.117 +166 L 0.116 +167 M 0.116 +168 K 0.119 +169 M 0.122 +170 V 0.118 +171 R 0.111 +172 P 0.106 +173 P 0.097 +174 Y 0.081 +175 S 0.059 +176 Y 0.039 +177 S 0.027 +178 A 0.023 +179 L 0.023 +180 I 0.026 +181 A 0.032 +182 M 0.038 +183 A 0.042 +184 I 0.044 +185 Q 0.045 +186 S 0.046 +187 A 0.048 +188 P 0.051 +189 E 0.054 +190 R 0.055 +191 K 0.053 +192 L 0.047 +193 T 0.039 +194 L 0.034 +195 S 0.034 +196 H 0.038 +197 I 0.041 +198 Y 0.041 +199 Q 0.041 +200 F 0.039 +201 V 0.038 +202 A 0.041 +203 D 0.045 +204 S 0.048 +205 F 0.049 +206 P 0.049 +207 F 0.049 +208 Y 0.048 +209 Q 0.047 +210 R 0.050 +211 S 0.055 +212 K 0.057 +213 A 0.053 +214 G 0.047 +215 W 0.040 +216 Q 0.035 +217 N 0.035 +218 S 0.041 +219 I 0.049 +220 R 0.054 +221 H 0.055 +222 N 0.056 +223 L 0.059 +224 S 0.064 +225 L 0.069 +226 N 0.070 +227 D 0.068 +228 C 0.062 +229 F 0.061 +230 K 0.074 +231 K 0.104 +232 V 0.142 +233 P 0.173 +234 R 0.188 +235 D 0.189 +236 E 0.188 +237 D 0.198 +238 D 0.216 +239 P 0.225 +240 G 0.212 +241 K 0.181 +242 G 0.140 +243 N 0.100 +244 Y 0.073 +245 W 0.061 +246 T 0.061 +247 L 0.068 +248 D 0.072 +249 P 0.070 +250 N 0.066 +251 C 0.068 +252 E 0.078 +253 K 0.094 +254 M 0.112 +255 F 0.130 +256 D 0.147 +257 N 0.160 +258 G 0.166 +259 N 0.167 +260 F 0.171 +261 R 0.185 +262 R 0.215 +263 K 0.269 +264 R 0.356 +265 K 0.470 +266 R 0.582 +267 R 0.667 +268 S 0.714 +269 E 0.734 +270 A 0.740 +271 S 0.746 +272 N 0.755 +273 G 0.767 +274 S 0.780 +275 T 0.790 +276 V 0.796 +277 A 0.796 +278 A 0.790 +279 G 0.769 +280 T 0.722 +281 S 0.656 +282 K 0.621 +283 S 0.653 +284 E 0.720 +285 E 0.773 +286 G 0.800 +287 L 0.812 +288 S 0.821 +289 S 0.829 +290 G 0.837 +291 L 0.844 +292 G 0.850 +293 S 0.854 +294 G 0.855 +295 V 0.853 +296 G 0.848 +297 G 0.839 +298 K 0.831 +299 P 0.826 +300 E 0.824 +301 E 0.820 +302 E 0.812 +303 S 0.806 +304 P 0.806 +305 S 0.811 +306 T 0.813 +307 L 0.808 +308 L 0.802 +309 R 0.802 +310 P 0.810 +311 S 0.816 +312 H 0.811 +313 S 0.799 +314 P 0.788 +315 E 0.783 +316 P 0.790 +317 P 0.810 +318 E 0.836 +319 G 0.857 +320 T 0.871 +321 K 0.877 +322 S 0.876 +323 T 0.869 +324 A 0.855 +325 S 0.840 +326 S 0.832 +327 P 0.833 +328 G 0.843 +329 G 0.855 +330 P 0.865 +331 M 0.868 +332 L 0.865 +333 T 0.853 +334 S 0.836 +335 T 0.820 +336 P 0.809 +337 C 0.803 +338 L 0.800 +339 N 0.793 +340 T 0.778 +341 F 0.758 +342 F 0.746 +343 S 0.750 +344 S 0.764 +345 L 0.782 +346 S 0.799 +347 S 0.815 +348 L 0.829 +349 S 0.841 +350 V 0.849 +351 S 0.853 +352 S 0.855 +353 S 0.858 +354 V 0.860 +355 S 0.860 +356 T 0.856 +357 Q 0.847 +358 R 0.832 +359 A 0.817 +360 L 0.808 +361 P 0.809 +362 G 0.820 +363 S 0.832 +364 R 0.839 +365 H 0.843 +366 L 0.849 +367 G 0.856 +368 I 0.861 +369 Q 0.862 +370 G 0.858 +371 A 0.846 +372 Q 0.832 +373 L 0.825 +374 P 0.828 +375 S 0.836 +376 S 0.842 +377 G 0.844 +378 V 0.840 +379 F 0.833 +380 S 0.831 +381 P 0.840 +382 T 0.857 +383 S 0.871 +384 I 0.877 +385 S 0.874 +386 E 0.855 +387 A 0.805 +388 S 0.732 +389 A 0.690 +390 D 0.705 +391 T 0.724 +392 L 0.699 +393 Q 0.679 +394 L 0.719 +395 S 0.792 +396 N 0.841 +397 S 0.857 +398 T 0.856 +399 S 0.851 +400 N 0.847 +401 S 0.842 +402 T 0.838 +403 G 0.837 +404 Q 0.837 +405 R 0.835 +406 S 0.827 +407 S 0.808 +408 Y 0.781 +409 Y 0.756 +410 S 0.744 +411 P 0.752 +412 F 0.778 +413 P 0.810 +414 A 0.836 +415 S 0.849 +416 T 0.851 +417 S 0.850 +418 G 0.848 +419 G 0.843 +420 Q 0.830 +421 S 0.813 +422 S 0.797 +423 P 0.784 +424 F 0.774 +425 S 0.764 +426 S 0.754 +427 P 0.753 +428 F 0.765 +429 H 0.782 +430 N 0.793 +431 F 0.797 +432 S 0.801 +433 M 0.804 +434 V 0.799 +435 N 0.784 +436 S 0.760 +437 L 0.730 +438 I 0.695 +439 Y 0.670 +440 P 0.677 +441 R 0.716 +442 E 0.756 +443 G 0.771 +444 S 0.756 +445 E 0.719 +446 V 0.686 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000215595.3_ENST00000400633.3_GN:C20orf202_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000215595.3_ENST00000400633.3_GN:C20orf202_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..8941cb6cf2b2670dd3f2af6cd7371f490406cf27 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000215595.3_ENST00000400633.3_GN:C20orf202_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,100 @@ +>ENSG00000215595.3|ENST00000400633.3|GN:C20orf202|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.540 +2 K 0.572 +3 I 0.610 +4 A 0.624 +5 E 0.610 +6 E 0.583 +7 P 0.553 +8 S 0.513 +9 P 0.450 +10 S 0.365 +11 L 0.280 +12 G 0.216 +13 Q 0.176 +14 T 0.150 +15 L 0.130 +16 E 0.118 +17 W 0.116 +18 L 0.121 +19 R 0.132 +20 K 0.148 +21 E 0.165 +22 L 0.179 +23 S 0.199 +24 E 0.225 +25 M 0.247 +26 Q 0.263 +27 I 0.283 +28 Q 0.305 +29 D 0.309 +30 Q 0.284 +31 S 0.241 +32 L 0.196 +33 L 0.160 +34 L 0.139 +35 T 0.131 +36 L 0.128 +37 R 0.127 +38 H 0.130 +39 L 0.133 +40 H 0.133 +41 S 0.131 +42 V 0.128 +43 L 0.132 +44 E 0.144 +45 E 0.159 +46 L 0.174 +47 R 0.200 +48 A 0.247 +49 D 0.299 +50 S 0.338 +51 A 0.364 +52 H 0.386 +53 W 0.408 +54 E 0.440 +55 D 0.480 +56 A 0.521 +57 R 0.564 +58 S 0.615 +59 S 0.663 +60 G 0.696 +61 G 0.712 +62 T 0.718 +63 S 0.725 +64 P 0.742 +65 I 0.765 +66 R 0.784 +67 A 0.795 +68 R 0.801 +69 A 0.801 +70 G 0.797 +71 S 0.790 +72 E 0.781 +73 G 0.773 +74 R 0.765 +75 G 0.750 +76 C 0.731 +77 Q 0.714 +78 P 0.705 +79 V 0.699 +80 C 0.691 +81 S 0.683 +82 R 0.675 +83 G 0.653 +84 L 0.610 +85 A 0.573 +86 Q 0.573 +87 L 0.600 +88 L 0.626 +89 R 0.650 +90 G 0.678 +91 E 0.705 +92 D 0.721 +93 S 0.726 +94 R 0.724 +95 R 0.713 +96 S 0.683 +97 S 0.627 +98 L 0.556 +99 P 0.502 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000215595.3_ENST00000400633.3_GN:C20orf202_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000215595.3_ENST00000400633.3_GN:C20orf202_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7155cfb69c05a01307e96d8326253d0f60d52e4d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000215595.3_ENST00000400633.3_GN:C20orf202_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid @@ -0,0 +1,123 @@ +>ENSG00000215595.3|ENST00000400633.3|GN:C20orf202|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:23 +1 M 0.475 +2 Y 0.523 +3 K 0.587 +4 S 0.637 +5 K 0.667 +6 I 0.690 +7 P 0.719 +8 R 0.751 +9 A 0.773 +10 Q 0.783 +11 N 0.789 +12 Q 0.799 +13 V 0.807 +14 S 0.809 +15 V 0.802 +16 K 0.788 +17 V 0.770 +18 T 0.761 +19 P 0.771 +20 K 0.793 +21 N 0.811 +22 T 0.819 +23 E 0.817 +24 M 0.812 +25 K 0.806 +26 I 0.789 +27 A 0.756 +28 E 0.709 +29 E 0.661 +30 P 0.623 +31 S 0.589 +32 P 0.544 +33 S 0.472 +34 L 0.380 +35 G 0.297 +36 Q 0.240 +37 T 0.203 +38 L 0.176 +39 E 0.160 +40 W 0.155 +41 L 0.156 +42 R 0.164 +43 K 0.183 +44 E 0.209 +45 L 0.237 +46 S 0.267 +47 E 0.295 +48 M 0.315 +49 Q 0.332 +50 I 0.355 +51 Q 0.379 +52 D 0.379 +53 Q 0.345 +54 S 0.292 +55 L 0.238 +56 L 0.196 +57 L 0.173 +58 T 0.163 +59 L 0.158 +60 R 0.153 +61 H 0.150 +62 L 0.146 +63 H 0.143 +64 S 0.142 +65 V 0.141 +66 L 0.145 +67 E 0.156 +68 E 0.168 +69 L 0.181 +70 R 0.207 +71 A 0.255 +72 D 0.307 +73 S 0.343 +74 A 0.363 +75 H 0.379 +76 W 0.401 +77 E 0.432 +78 D 0.469 +79 A 0.505 +80 R 0.547 +81 S 0.598 +82 S 0.647 +83 G 0.679 +84 G 0.695 +85 T 0.702 +86 S 0.711 +87 P 0.730 +88 I 0.755 +89 R 0.775 +90 A 0.787 +91 R 0.796 +92 A 0.799 +93 G 0.797 +94 S 0.791 +95 E 0.782 +96 G 0.774 +97 R 0.765 +98 G 0.751 +99 C 0.731 +100 Q 0.714 +101 P 0.705 +102 V 0.699 +103 C 0.686 +104 S 0.671 +105 R 0.659 +106 G 0.637 +107 L 0.593 +108 A 0.554 +109 Q 0.551 +110 L 0.578 +111 L 0.609 +112 R 0.640 +113 G 0.677 +114 E 0.710 +115 D 0.728 +116 S 0.733 +117 R 0.732 +118 R 0.726 +119 S 0.700 +120 S 0.644 +121 L 0.571 +122 P 0.515 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000215845.12_ENST00000423014.3_GN:TSTD1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000215845.12_ENST00000423014.3_GN:TSTD1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1c8de78ab79b7a7a5f4c38b677c4feb6374119df --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000215845.12_ENST00000423014.3_GN:TSTD1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,116 @@ +>ENSG00000215845.12|ENST00000423014.3|GN:TSTD1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.513 +2 A 0.484 +3 G 0.428 +4 A 0.342 +5 P 0.237 +6 T 0.144 +7 V 0.083 +8 S 0.052 +9 L 0.038 +10 P 0.033 +11 E 0.034 +12 L 0.041 +13 R 0.052 +14 S 0.061 +15 L 0.062 +16 L 0.063 +17 A 0.071 +18 S 0.081 +19 G 0.082 +20 R 0.072 +21 A 0.057 +22 R 0.046 +23 L 0.044 +24 F 0.052 +25 D 0.061 +26 V 0.066 +27 R 0.067 +28 S 0.068 +29 R 0.071 +30 E 0.076 +31 E 0.086 +32 A 0.095 +33 A 0.102 +34 A 0.108 +35 G 0.118 +36 T 0.126 +37 I 0.125 +38 P 0.116 +39 G 0.107 +40 A 0.099 +41 L 0.090 +42 N 0.081 +43 I 0.074 +44 P 0.066 +45 V 0.055 +46 S 0.046 +47 E 0.040 +48 L 0.038 +49 E 0.039 +50 S 0.043 +51 A 0.047 +52 L 0.050 +53 Q 0.052 +54 M 0.056 +55 E 0.061 +56 P 0.065 +57 A 0.063 +58 A 0.058 +59 F 0.053 +60 Q 0.051 +61 A 0.050 +62 L 0.054 +63 Y 0.065 +64 S 0.084 +65 A 0.106 +66 E 0.119 +67 K 0.116 +68 P 0.100 +69 K 0.085 +70 L 0.080 +71 E 0.083 +72 D 0.083 +73 E 0.074 +74 H 0.060 +75 L 0.047 +76 V 0.037 +77 F 0.031 +78 F 0.030 +79 C 0.035 +80 Q 0.048 +81 M 0.065 +82 G 0.076 +83 K 0.074 +84 R 0.063 +85 G 0.053 +86 L 0.051 +87 Q 0.052 +88 A 0.057 +89 T 0.062 +90 Q 0.066 +91 L 0.068 +92 A 0.071 +93 R 0.080 +94 S 0.087 +95 L 0.083 +96 G 0.072 +97 Y 0.062 +98 T 0.057 +99 G 0.059 +100 A 0.062 +101 R 0.061 +102 N 0.054 +103 Y 0.046 +104 A 0.042 +105 G 0.038 +106 A 0.034 +107 Y 0.031 +108 R 0.029 +109 E 0.032 +110 W 0.041 +111 L 0.057 +112 E 0.082 +113 K 0.120 +114 E 0.165 +115 S 0.199 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000215845.12_ENST00000423014.3_GN:TSTD1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000215845.12_ENST00000423014.3_GN:TSTD1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..778f71ecd671fd3717b79ab351d64980491c5aba --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000215845.12_ENST00000423014.3_GN:TSTD1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid @@ -0,0 +1,138 @@ +>ENSG00000215845.12|ENST00000423014.3|GN:TSTD1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:22 +1 M 0.481 +2 L 0.490 +3 Q 0.511 +4 A 0.540 +5 P 0.572 +6 R 0.596 +7 G 0.598 +8 R 0.560 +9 A 0.479 +10 R 0.401 +11 A 0.383 +12 A 0.415 +13 L 0.442 +14 R 0.459 +15 R 0.496 +16 L 0.552 +17 A 0.599 +18 V 0.627 +19 A 0.639 +20 T 0.637 +21 R 0.627 +22 T 0.612 +23 M 0.584 +24 A 0.535 +25 G 0.462 +26 A 0.366 +27 P 0.255 +28 T 0.156 +29 V 0.090 +30 S 0.055 +31 L 0.038 +32 P 0.031 +33 E 0.031 +34 L 0.037 +35 R 0.048 +36 S 0.057 +37 L 0.059 +38 L 0.060 +39 A 0.067 +40 S 0.076 +41 G 0.075 +42 R 0.066 +43 A 0.053 +44 R 0.044 +45 L 0.043 +46 F 0.051 +47 D 0.060 +48 V 0.064 +49 R 0.064 +50 S 0.064 +51 R 0.066 +52 E 0.072 +53 E 0.083 +54 A 0.094 +55 A 0.101 +56 A 0.107 +57 G 0.115 +58 T 0.122 +59 I 0.122 +60 P 0.114 +61 G 0.105 +62 A 0.097 +63 L 0.088 +64 N 0.079 +65 I 0.071 +66 P 0.063 +67 V 0.052 +68 S 0.042 +69 E 0.037 +70 L 0.035 +71 E 0.037 +72 S 0.041 +73 A 0.045 +74 L 0.048 +75 Q 0.050 +76 M 0.053 +77 E 0.059 +78 P 0.062 +79 A 0.060 +80 A 0.055 +81 F 0.050 +82 Q 0.046 +83 A 0.045 +84 L 0.048 +85 Y 0.058 +86 S 0.076 +87 A 0.098 +88 E 0.112 +89 K 0.111 +90 P 0.098 +91 K 0.084 +92 L 0.079 +93 E 0.082 +94 D 0.082 +95 E 0.074 +96 H 0.060 +97 L 0.047 +98 V 0.038 +99 F 0.031 +100 F 0.030 +101 C 0.034 +102 Q 0.045 +103 M 0.059 +104 G 0.068 +105 K 0.066 +106 R 0.056 +107 G 0.048 +108 L 0.046 +109 Q 0.047 +110 A 0.046 +111 T 0.045 +112 Q 0.045 +113 L 0.047 +114 A 0.051 +115 R 0.056 +116 S 0.059 +117 L 0.061 +118 G 0.060 +119 Y 0.057 +120 T 0.056 +121 G 0.059 +122 A 0.062 +123 R 0.061 +124 N 0.053 +125 Y 0.046 +126 A 0.041 +127 G 0.038 +128 A 0.033 +129 Y 0.030 +130 R 0.028 +131 E 0.030 +132 W 0.038 +133 L 0.054 +134 E 0.080 +135 K 0.119 +136 E 0.165 +137 S 0.198 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000221813.4_ENST00000641698.1_GN:OR6B1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000221813.4_ENST00000641698.1_GN:OR6B1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b7347114a438c142958f6b070f715655861efefd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000221813.4_ENST00000641698.1_GN:OR6B1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,312 @@ +>ENSG00000221813.4|ENST00000641698.1|GN:OR6B1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.429 +2 E 0.448 +3 L 0.476 +4 E 0.496 +5 N 0.495 +6 Q 0.465 +7 T 0.405 +8 R 0.327 +9 V 0.247 +10 T 0.184 +11 K 0.147 +12 F 0.132 +13 I 0.132 +14 L 0.137 +15 V 0.150 +16 G 0.171 +17 F 0.191 +18 P 0.200 +19 G 0.193 +20 S 0.169 +21 L 0.134 +22 S 0.100 +23 M 0.078 +24 R 0.069 +25 A 0.070 +26 A 0.074 +27 M 0.076 +28 F 0.077 +29 L 0.073 +30 I 0.060 +31 F 0.046 +32 L 0.039 +33 V 0.040 +34 A 0.043 +35 Y 0.045 +36 I 0.043 +37 L 0.044 +38 T 0.045 +39 V 0.045 +40 A 0.046 +41 E 0.051 +42 N 0.058 +43 V 0.063 +44 I 0.066 +45 I 0.063 +46 I 0.056 +47 L 0.050 +48 L 0.048 +49 V 0.050 +50 L 0.053 +51 Q 0.059 +52 N 0.066 +53 R 0.071 +54 P 0.073 +55 L 0.071 +56 H 0.065 +57 K 0.055 +58 P 0.044 +59 M 0.034 +60 Y 0.028 +61 F 0.025 +62 F 0.025 +63 L 0.031 +64 A 0.041 +65 N 0.050 +66 L 0.054 +67 S 0.055 +68 F 0.054 +69 L 0.058 +70 E 0.067 +71 T 0.074 +72 W 0.073 +73 Y 0.066 +74 I 0.059 +75 S 0.056 +76 V 0.058 +77 T 0.061 +78 V 0.063 +79 P 0.061 +80 K 0.056 +81 L 0.052 +82 L 0.046 +83 F 0.041 +84 S 0.039 +85 F 0.044 +86 W 0.057 +87 S 0.078 +88 V 0.094 +89 N 0.094 +90 N 0.081 +91 S 0.065 +92 I 0.053 +93 S 0.043 +94 F 0.035 +95 T 0.030 +96 L 0.029 +97 C 0.028 +98 M 0.028 +99 I 0.028 +100 Q 0.029 +101 L 0.032 +102 Y 0.033 +103 F 0.032 +104 F 0.031 +105 I 0.032 +106 A 0.034 +107 L 0.035 +108 M 0.038 +109 C 0.043 +110 T 0.046 +111 E 0.049 +112 C 0.049 +113 V 0.046 +114 L 0.042 +115 L 0.038 +116 A 0.035 +117 A 0.033 +118 M 0.033 +119 A 0.034 +120 Y 0.037 +121 D 0.040 +122 R 0.041 +123 Y 0.038 +124 V 0.037 +125 A 0.038 +126 I 0.042 +127 C 0.047 +128 R 0.054 +129 P 0.058 +130 L 0.058 +131 H 0.057 +132 Y 0.055 +133 P 0.055 +134 T 0.058 +135 I 0.061 +136 M 0.063 +137 S 0.058 +138 H 0.049 +139 G 0.040 +140 L 0.036 +141 C 0.041 +142 F 0.052 +143 R 0.061 +144 L 0.060 +145 A 0.056 +146 L 0.056 +147 G 0.060 +148 S 0.061 +149 W 0.058 +150 A 0.055 +151 I 0.057 +152 G 0.062 +153 F 0.065 +154 G 0.066 +155 I 0.067 +156 S 0.067 +157 L 0.066 +158 A 0.066 +159 K 0.067 +160 I 0.065 +161 Y 0.062 +162 F 0.064 +163 I 0.068 +164 S 0.074 +165 C 0.081 +166 L 0.086 +167 S 0.089 +168 F 0.093 +169 C 0.102 +170 G 0.114 +171 P 0.124 +172 N 0.132 +173 V 0.137 +174 I 0.132 +175 N 0.114 +176 H 0.091 +177 F 0.074 +178 F 0.066 +179 C 0.067 +180 D 0.080 +181 I 0.102 +182 S 0.126 +183 P 0.144 +184 V 0.152 +185 L 0.155 +186 N 0.154 +187 L 0.145 +188 S 0.131 +189 C 0.123 +190 T 0.126 +191 D 0.132 +192 M 0.130 +193 S 0.119 +194 I 0.107 +195 T 0.100 +196 E 0.100 +197 L 0.102 +198 V 0.104 +199 D 0.104 +200 F 0.101 +201 I 0.091 +202 L 0.077 +203 A 0.064 +204 L 0.054 +205 V 0.047 +206 I 0.045 +207 F 0.049 +208 L 0.059 +209 F 0.070 +210 P 0.073 +211 L 0.068 +212 F 0.064 +213 I 0.063 +214 T 0.062 +215 V 0.057 +216 L 0.052 +217 S 0.051 +218 Y 0.051 +219 G 0.055 +220 C 0.060 +221 I 0.067 +222 L 0.074 +223 A 0.079 +224 T 0.078 +225 I 0.074 +226 L 0.073 +227 C 0.083 +228 M 0.100 +229 P 0.114 +230 T 0.116 +231 G 0.108 +232 K 0.097 +233 Q 0.089 +234 K 0.085 +235 A 0.081 +236 F 0.077 +237 S 0.076 +238 T 0.077 +239 C 0.077 +240 A 0.077 +241 S 0.077 +242 H 0.073 +243 L 0.067 +244 V 0.064 +245 V 0.064 +246 V 0.060 +247 T 0.050 +248 I 0.037 +249 F 0.029 +250 Y 0.027 +251 S 0.029 +252 A 0.032 +253 I 0.034 +254 I 0.035 +255 F 0.040 +256 M 0.055 +257 Y 0.081 +258 A 0.114 +259 R 0.146 +260 P 0.167 +261 R 0.175 +262 V 0.178 +263 I 0.183 +264 H 0.188 +265 A 0.187 +266 F 0.173 +267 N 0.150 +268 M 0.129 +269 N 0.114 +270 K 0.102 +271 I 0.093 +272 I 0.082 +273 S 0.070 +274 I 0.062 +275 F 0.065 +276 Y 0.078 +277 A 0.093 +278 I 0.107 +279 V 0.119 +280 T 0.124 +281 P 0.118 +282 S 0.104 +283 L 0.091 +284 N 0.080 +285 P 0.071 +286 F 0.065 +287 I 0.064 +288 Y 0.065 +289 C 0.073 +290 L 0.089 +291 R 0.102 +292 N 0.097 +293 R 0.078 +294 E 0.063 +295 V 0.062 +296 K 0.072 +297 E 0.083 +298 A 0.084 +299 L 0.074 +300 K 0.063 +301 K 0.058 +302 L 0.065 +303 A 0.087 +304 Y 0.129 +305 C 0.190 +306 Q 0.259 +307 A 0.318 +308 S 0.359 +309 R 0.379 +310 S 0.379 +311 D 0.370 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000221813.4_ENST00000641698.1_GN:OR6B1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:100.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000221813.4_ENST00000641698.1_GN:OR6B1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:100.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f97bc0ae65f7981fee64a84b7df2c9dbc38f93ee --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000221813.4_ENST00000641698.1_GN:OR6B1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:100.caid @@ -0,0 +1,412 @@ +>ENSG00000221813.4|ENST00000641698.1|GN:OR6B1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:100 +1 M 0.358 +2 G 0.377 +3 T 0.407 +4 L 0.445 +5 V 0.487 +6 P 0.518 +7 G 0.522 +8 C 0.493 +9 W 0.446 +10 T 0.416 +11 K 0.425 +12 Q 0.453 +13 P 0.472 +14 R 0.499 +15 A 0.552 +16 T 0.608 +17 S 0.637 +18 D 0.643 +19 A 0.637 +20 D 0.612 +21 V 0.572 +22 V 0.534 +23 L 0.510 +24 V 0.479 +25 P 0.423 +26 R 0.357 +27 A 0.316 +28 L 0.309 +29 L 0.319 +30 S 0.340 +31 S 0.382 +32 Y 0.447 +33 P 0.524 +34 G 0.598 +35 F 0.653 +36 Q 0.677 +37 L 0.672 +38 E 0.654 +39 S 0.634 +40 S 0.616 +41 G 0.594 +42 A 0.564 +43 I 0.523 +44 C 0.476 +45 T 0.436 +46 Q 0.417 +47 S 0.410 +48 L 0.399 +49 F 0.396 +50 L 0.414 +51 G 0.438 +52 L 0.445 +53 E 0.438 +54 S 0.419 +55 G 0.377 +56 F 0.312 +57 L 0.250 +58 T 0.210 +59 S 0.186 +60 I 0.164 +61 Q 0.147 +62 Y 0.135 +63 L 0.128 +64 N 0.124 +65 L 0.121 +66 F 0.122 +67 L 0.131 +68 L 0.148 +69 H 0.162 +70 L 0.159 +71 P 0.133 +72 I 0.099 +73 L 0.076 +74 E 0.066 +75 L 0.063 +76 V 0.061 +77 K 0.062 +78 A 0.064 +79 L 0.067 +80 F 0.072 +81 S 0.085 +82 H 0.103 +83 F 0.124 +84 I 0.148 +85 L 0.182 +86 S 0.228 +87 E 0.277 +88 A 0.319 +89 A 0.349 +90 V 0.369 +91 P 0.382 +92 R 0.390 +93 R 0.393 +94 A 0.389 +95 K 0.377 +96 P 0.366 +97 C 0.369 +98 V 0.388 +99 S 0.414 +100 N 0.445 +101 M 0.476 +102 E 0.505 +103 L 0.523 +104 E 0.528 +105 N 0.514 +106 Q 0.476 +107 T 0.411 +108 R 0.331 +109 V 0.251 +110 T 0.188 +111 K 0.150 +112 F 0.135 +113 I 0.133 +114 L 0.134 +115 V 0.141 +116 G 0.156 +117 F 0.171 +118 P 0.177 +119 G 0.171 +120 S 0.150 +121 L 0.119 +122 S 0.088 +123 M 0.067 +124 R 0.056 +125 A 0.049 +126 A 0.048 +127 M 0.052 +128 F 0.059 +129 L 0.059 +130 I 0.051 +131 F 0.042 +132 L 0.038 +133 V 0.040 +134 A 0.044 +135 Y 0.045 +136 I 0.043 +137 L 0.041 +138 T 0.041 +139 V 0.040 +140 A 0.041 +141 E 0.046 +142 N 0.053 +143 V 0.058 +144 I 0.059 +145 I 0.056 +146 I 0.050 +147 L 0.045 +148 L 0.043 +149 V 0.044 +150 L 0.046 +151 Q 0.050 +152 N 0.057 +153 R 0.063 +154 P 0.066 +155 L 0.064 +156 H 0.057 +157 K 0.046 +158 P 0.036 +159 M 0.029 +160 Y 0.025 +161 F 0.022 +162 F 0.022 +163 L 0.027 +164 A 0.035 +165 N 0.042 +166 L 0.047 +167 S 0.049 +168 F 0.051 +169 L 0.055 +170 E 0.064 +171 T 0.071 +172 W 0.070 +173 Y 0.062 +174 I 0.055 +175 S 0.053 +176 V 0.055 +177 T 0.058 +178 V 0.060 +179 P 0.056 +180 K 0.051 +181 L 0.047 +182 L 0.042 +183 F 0.037 +184 S 0.035 +185 F 0.039 +186 W 0.052 +187 S 0.072 +188 V 0.088 +189 N 0.090 +190 N 0.078 +191 S 0.063 +192 I 0.050 +193 S 0.041 +194 F 0.033 +195 T 0.028 +196 L 0.026 +197 C 0.027 +198 M 0.028 +199 I 0.029 +200 Q 0.030 +201 L 0.031 +202 Y 0.032 +203 F 0.031 +204 F 0.030 +205 I 0.031 +206 A 0.033 +207 L 0.034 +208 M 0.038 +209 C 0.042 +210 T 0.045 +211 E 0.047 +212 C 0.046 +213 V 0.043 +214 L 0.039 +215 L 0.036 +216 A 0.035 +217 A 0.033 +218 M 0.033 +219 A 0.035 +220 Y 0.038 +221 D 0.041 +222 R 0.041 +223 Y 0.038 +224 V 0.035 +225 A 0.035 +226 I 0.038 +227 C 0.044 +228 R 0.049 +229 P 0.053 +230 L 0.054 +231 H 0.053 +232 Y 0.051 +233 P 0.051 +234 T 0.052 +235 I 0.056 +236 M 0.058 +237 S 0.054 +238 H 0.045 +239 G 0.036 +240 L 0.032 +241 C 0.037 +242 F 0.050 +243 R 0.059 +244 L 0.058 +245 A 0.052 +246 L 0.050 +247 G 0.051 +248 S 0.052 +249 W 0.050 +250 A 0.047 +251 I 0.050 +252 G 0.056 +253 F 0.059 +254 G 0.059 +255 I 0.059 +256 S 0.057 +257 L 0.056 +258 A 0.056 +259 K 0.057 +260 I 0.055 +261 Y 0.053 +262 F 0.055 +263 I 0.060 +264 S 0.067 +265 C 0.074 +266 L 0.080 +267 S 0.082 +268 F 0.084 +269 C 0.093 +270 G 0.104 +271 P 0.114 +272 N 0.122 +273 V 0.127 +274 I 0.122 +275 N 0.104 +276 H 0.084 +277 F 0.070 +278 F 0.064 +279 C 0.066 +280 D 0.079 +281 I 0.100 +282 S 0.124 +283 P 0.141 +284 V 0.150 +285 L 0.157 +286 N 0.157 +287 L 0.146 +288 S 0.130 +289 C 0.120 +290 T 0.123 +291 D 0.130 +292 M 0.129 +293 S 0.119 +294 I 0.107 +295 T 0.098 +296 E 0.093 +297 L 0.092 +298 V 0.094 +299 D 0.099 +300 F 0.098 +301 I 0.089 +302 L 0.076 +303 A 0.062 +304 L 0.051 +305 V 0.045 +306 I 0.044 +307 F 0.048 +308 L 0.055 +309 F 0.064 +310 P 0.067 +311 L 0.062 +312 F 0.058 +313 I 0.059 +314 T 0.060 +315 V 0.057 +316 L 0.051 +317 S 0.048 +318 Y 0.048 +319 G 0.049 +320 C 0.051 +321 I 0.052 +322 L 0.051 +323 A 0.052 +324 T 0.057 +325 I 0.064 +326 L 0.073 +327 C 0.087 +328 M 0.106 +329 P 0.121 +330 T 0.123 +331 G 0.113 +332 K 0.102 +333 Q 0.095 +334 K 0.091 +335 A 0.084 +336 F 0.079 +337 S 0.077 +338 T 0.079 +339 C 0.079 +340 A 0.078 +341 S 0.078 +342 H 0.074 +343 L 0.067 +344 V 0.065 +345 V 0.065 +346 V 0.062 +347 T 0.051 +348 I 0.038 +349 F 0.030 +350 Y 0.028 +351 S 0.031 +352 A 0.035 +353 I 0.036 +354 I 0.037 +355 F 0.041 +356 M 0.055 +357 Y 0.080 +358 A 0.114 +359 R 0.151 +360 P 0.177 +361 R 0.189 +362 V 0.193 +363 I 0.197 +364 H 0.201 +365 A 0.197 +366 F 0.181 +367 N 0.156 +368 M 0.133 +369 N 0.117 +370 K 0.106 +371 I 0.097 +372 I 0.087 +373 S 0.074 +374 I 0.066 +375 F 0.068 +376 Y 0.080 +377 A 0.095 +378 I 0.107 +379 V 0.118 +380 T 0.123 +381 P 0.117 +382 S 0.102 +383 L 0.090 +384 N 0.080 +385 P 0.071 +386 F 0.064 +387 I 0.062 +388 Y 0.062 +389 C 0.069 +390 L 0.085 +391 R 0.098 +392 N 0.093 +393 R 0.075 +394 E 0.061 +395 V 0.060 +396 K 0.070 +397 E 0.080 +398 A 0.080 +399 L 0.071 +400 K 0.059 +401 K 0.054 +402 L 0.060 +403 A 0.082 +404 Y 0.125 +405 C 0.190 +406 Q 0.262 +407 A 0.324 +408 S 0.366 +409 R 0.387 +410 S 0.388 +411 D 0.380 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000221888.4_ENST00000641256.1_GN:OR1C1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000221888.4_ENST00000641256.1_GN:OR1C1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..cac6efb88bee9bbdc3e33d130e904a4bfadfc4de --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000221888.4_ENST00000641256.1_GN:OR1C1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,315 @@ +>ENSG00000221888.4|ENST00000641256.1|GN:OR1C1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.424 +2 E 0.441 +3 K 0.466 +4 R 0.483 +5 N 0.480 +6 L 0.450 +7 T 0.392 +8 V 0.319 +9 V 0.244 +10 R 0.182 +11 E 0.144 +12 F 0.129 +13 V 0.126 +14 L 0.132 +15 L 0.148 +16 G 0.171 +17 L 0.186 +18 P 0.187 +19 S 0.176 +20 S 0.159 +21 A 0.138 +22 E 0.115 +23 Q 0.093 +24 Q 0.076 +25 H 0.063 +26 L 0.060 +27 L 0.066 +28 S 0.076 +29 V 0.077 +30 L 0.066 +31 F 0.053 +32 L 0.048 +33 C 0.049 +34 M 0.052 +35 Y 0.053 +36 L 0.054 +37 A 0.058 +38 T 0.062 +39 T 0.063 +40 L 0.064 +41 G 0.068 +42 N 0.074 +43 M 0.075 +44 L 0.074 +45 I 0.071 +46 I 0.066 +47 A 0.063 +48 T 0.064 +49 I 0.070 +50 G 0.076 +51 F 0.081 +52 D 0.084 +53 S 0.084 +54 H 0.081 +55 L 0.077 +56 H 0.071 +57 S 0.061 +58 P 0.049 +59 M 0.038 +60 Y 0.030 +61 F 0.026 +62 F 0.027 +63 L 0.035 +64 S 0.046 +65 N 0.056 +66 L 0.060 +67 A 0.060 +68 F 0.057 +69 V 0.057 +70 D 0.061 +71 I 0.066 +72 C 0.068 +73 F 0.067 +74 T 0.065 +75 S 0.065 +76 T 0.066 +77 T 0.067 +78 V 0.068 +79 P 0.067 +80 Q 0.066 +81 M 0.065 +82 V 0.062 +83 V 0.059 +84 N 0.060 +85 I 0.066 +86 L 0.073 +87 T 0.078 +88 G 0.078 +89 T 0.071 +90 K 0.061 +91 T 0.054 +92 I 0.050 +93 S 0.046 +94 F 0.042 +95 A 0.041 +96 G 0.040 +97 C 0.038 +98 L 0.035 +99 T 0.033 +100 Q 0.032 +101 L 0.031 +102 F 0.029 +103 F 0.026 +104 F 0.024 +105 V 0.024 +106 S 0.027 +107 F 0.032 +108 V 0.039 +109 N 0.046 +110 M 0.051 +111 D 0.051 +112 S 0.049 +113 L 0.046 +114 L 0.041 +115 L 0.036 +116 C 0.034 +117 V 0.032 +118 M 0.032 +119 A 0.034 +120 Y 0.037 +121 D 0.040 +122 R 0.041 +123 Y 0.039 +124 V 0.037 +125 A 0.038 +126 I 0.042 +127 C 0.049 +128 H 0.056 +129 P 0.060 +130 L 0.060 +131 H 0.061 +132 Y 0.062 +133 T 0.065 +134 A 0.069 +135 R 0.072 +136 M 0.071 +137 N 0.062 +138 L 0.047 +139 C 0.035 +140 L 0.032 +141 C 0.040 +142 V 0.054 +143 Q 0.065 +144 L 0.067 +145 V 0.063 +146 A 0.062 +147 G 0.064 +148 L 0.066 +149 W 0.067 +150 L 0.069 +151 V 0.071 +152 T 0.073 +153 Y 0.071 +154 L 0.070 +155 H 0.071 +156 A 0.073 +157 L 0.074 +158 L 0.077 +159 H 0.081 +160 T 0.080 +161 V 0.078 +162 L 0.079 +163 I 0.083 +164 A 0.089 +165 Q 0.094 +166 L 0.095 +167 S 0.093 +168 F 0.092 +169 C 0.099 +170 A 0.110 +171 S 0.120 +172 N 0.130 +173 I 0.140 +174 I 0.139 +175 H 0.120 +176 H 0.094 +177 F 0.076 +178 F 0.068 +179 C 0.071 +180 D 0.084 +181 L 0.103 +182 N 0.123 +183 P 0.135 +184 L 0.138 +185 L 0.139 +186 Q 0.139 +187 L 0.133 +188 S 0.124 +189 C 0.121 +190 S 0.129 +191 D 0.141 +192 V 0.144 +193 S 0.137 +194 F 0.130 +195 N 0.126 +196 V 0.124 +197 M 0.121 +198 I 0.117 +199 I 0.113 +200 F 0.109 +201 A 0.110 +202 V 0.115 +203 G 0.114 +204 G 0.102 +205 L 0.085 +206 L 0.074 +207 A 0.072 +208 L 0.078 +209 T 0.086 +210 P 0.087 +211 L 0.082 +212 V 0.079 +213 C 0.083 +214 I 0.082 +215 L 0.071 +216 V 0.058 +217 S 0.051 +218 Y 0.049 +219 G 0.051 +220 L 0.057 +221 I 0.063 +222 F 0.070 +223 S 0.075 +224 T 0.075 +225 V 0.073 +226 L 0.079 +227 K 0.095 +228 I 0.114 +229 T 0.129 +230 S 0.136 +231 T 0.134 +232 Q 0.125 +233 G 0.112 +234 K 0.098 +235 Q 0.089 +236 R 0.088 +237 A 0.090 +238 V 0.092 +239 S 0.093 +240 T 0.092 +241 C 0.089 +242 S 0.085 +243 C 0.083 +244 H 0.079 +245 L 0.073 +246 S 0.068 +247 V 0.065 +248 V 0.056 +249 V 0.043 +250 L 0.031 +251 F 0.027 +252 Y 0.029 +253 G 0.033 +254 T 0.037 +255 A 0.039 +256 I 0.040 +257 A 0.045 +258 V 0.059 +259 Y 0.085 +260 F 0.128 +261 S 0.185 +262 P 0.248 +263 S 0.301 +264 S 0.331 +265 P 0.332 +266 H 0.315 +267 M 0.291 +268 P 0.264 +269 E 0.238 +270 S 0.212 +271 D 0.184 +272 T 0.154 +273 L 0.129 +274 S 0.112 +275 T 0.100 +276 I 0.094 +277 M 0.098 +278 Y 0.110 +279 S 0.121 +280 M 0.127 +281 V 0.131 +282 A 0.129 +283 P 0.120 +284 M 0.107 +285 L 0.099 +286 N 0.092 +287 P 0.084 +288 F 0.080 +289 I 0.080 +290 Y 0.080 +291 T 0.086 +292 L 0.103 +293 R 0.117 +294 N 0.110 +295 R 0.090 +296 D 0.074 +297 M 0.071 +298 K 0.080 +299 R 0.090 +300 G 0.093 +301 L 0.092 +302 Q 0.092 +303 K 0.091 +304 M 0.087 +305 L 0.087 +306 L 0.104 +307 K 0.141 +308 C 0.186 +309 T 0.228 +310 V 0.269 +311 F 0.309 +312 Q 0.335 +313 Q 0.341 +314 Q 0.335 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000221888.4_ENST00000641256.1_GN:OR1C1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:31.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000221888.4_ENST00000641256.1_GN:OR1C1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:31.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..296a006cc282f28fa2f14a4e8e0539ea490f122d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000221888.4_ENST00000641256.1_GN:OR1C1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:31.caid @@ -0,0 +1,346 @@ +>ENSG00000221888.4|ENST00000641256.1|GN:OR1C1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:31 +1 M 0.220 +2 H 0.217 +3 R 0.213 +4 S 0.206 +5 I 0.191 +6 Y 0.174 +7 A 0.170 +8 F 0.182 +9 V 0.208 +10 I 0.241 +11 G 0.272 +12 Y 0.299 +13 S 0.328 +14 G 0.361 +15 K 0.399 +16 R 0.439 +17 K 0.476 +18 V 0.508 +19 I 0.536 +20 G 0.560 +21 G 0.571 +22 K 0.568 +23 G 0.554 +24 L 0.522 +25 R 0.478 +26 K 0.452 +27 G 0.460 +28 F 0.486 +29 V 0.513 +30 G 0.533 +31 N 0.541 +32 M 0.541 +33 E 0.544 +34 K 0.550 +35 R 0.550 +36 N 0.536 +37 L 0.498 +38 T 0.431 +39 V 0.346 +40 V 0.261 +41 R 0.194 +42 E 0.151 +43 F 0.132 +44 V 0.126 +45 L 0.129 +46 L 0.142 +47 G 0.164 +48 L 0.181 +49 P 0.185 +50 S 0.178 +51 S 0.163 +52 A 0.143 +53 E 0.119 +54 Q 0.096 +55 Q 0.077 +56 H 0.064 +57 L 0.060 +58 L 0.066 +59 S 0.075 +60 V 0.075 +61 L 0.065 +62 F 0.054 +63 L 0.049 +64 C 0.050 +65 M 0.052 +66 Y 0.053 +67 L 0.053 +68 A 0.057 +69 T 0.062 +70 T 0.062 +71 L 0.063 +72 G 0.068 +73 N 0.074 +74 M 0.076 +75 L 0.075 +76 I 0.072 +77 I 0.067 +78 A 0.062 +79 T 0.061 +80 I 0.065 +81 G 0.069 +82 F 0.074 +83 D 0.077 +84 S 0.077 +85 H 0.074 +86 L 0.069 +87 H 0.063 +88 S 0.056 +89 P 0.045 +90 M 0.035 +91 Y 0.028 +92 F 0.024 +93 F 0.026 +94 L 0.035 +95 S 0.046 +96 N 0.056 +97 L 0.061 +98 A 0.060 +99 F 0.057 +100 V 0.056 +101 D 0.061 +102 I 0.066 +103 C 0.069 +104 F 0.068 +105 T 0.066 +106 S 0.065 +107 T 0.063 +108 T 0.062 +109 V 0.061 +110 P 0.060 +111 Q 0.059 +112 M 0.058 +113 V 0.055 +114 V 0.052 +115 N 0.052 +116 I 0.056 +117 L 0.063 +118 T 0.069 +119 G 0.070 +120 T 0.066 +121 K 0.058 +122 T 0.052 +123 I 0.047 +124 S 0.043 +125 F 0.039 +126 A 0.037 +127 G 0.037 +128 C 0.035 +129 L 0.033 +130 T 0.032 +131 Q 0.031 +132 L 0.030 +133 F 0.028 +134 F 0.025 +135 F 0.023 +136 V 0.023 +137 S 0.026 +138 F 0.031 +139 V 0.038 +140 N 0.045 +141 M 0.049 +142 D 0.050 +143 S 0.048 +144 L 0.045 +145 L 0.040 +146 L 0.035 +147 C 0.032 +148 V 0.031 +149 M 0.031 +150 A 0.033 +151 Y 0.037 +152 D 0.040 +153 R 0.041 +154 Y 0.039 +155 V 0.037 +156 A 0.038 +157 I 0.042 +158 C 0.049 +159 H 0.057 +160 P 0.060 +161 L 0.061 +162 H 0.061 +163 Y 0.063 +164 T 0.067 +165 A 0.071 +166 R 0.075 +167 M 0.075 +168 N 0.065 +169 L 0.049 +170 C 0.035 +171 L 0.032 +172 C 0.040 +173 V 0.054 +174 Q 0.065 +175 L 0.065 +176 V 0.059 +177 A 0.056 +178 G 0.057 +179 L 0.056 +180 W 0.053 +181 L 0.051 +182 V 0.057 +183 T 0.065 +184 Y 0.068 +185 L 0.069 +186 H 0.071 +187 A 0.073 +188 L 0.074 +189 L 0.077 +190 H 0.081 +191 T 0.080 +192 V 0.077 +193 L 0.078 +194 I 0.083 +195 A 0.088 +196 Q 0.094 +197 L 0.096 +198 S 0.094 +199 F 0.092 +200 C 0.097 +201 A 0.107 +202 S 0.116 +203 N 0.127 +204 I 0.137 +205 I 0.136 +206 H 0.118 +207 H 0.093 +208 F 0.074 +209 F 0.067 +210 C 0.071 +211 D 0.085 +212 L 0.105 +213 N 0.124 +214 P 0.134 +215 L 0.137 +216 L 0.138 +217 Q 0.137 +218 L 0.131 +219 S 0.120 +220 C 0.115 +221 S 0.122 +222 D 0.134 +223 V 0.138 +224 S 0.133 +225 F 0.126 +226 N 0.122 +227 V 0.120 +228 M 0.117 +229 I 0.114 +230 I 0.111 +231 F 0.108 +232 A 0.110 +233 V 0.114 +234 G 0.114 +235 G 0.102 +236 L 0.085 +237 L 0.074 +238 A 0.073 +239 L 0.080 +240 T 0.087 +241 P 0.088 +242 L 0.083 +243 V 0.080 +244 C 0.083 +245 I 0.084 +246 L 0.073 +247 V 0.060 +248 S 0.052 +249 Y 0.049 +250 G 0.051 +251 L 0.055 +252 I 0.062 +253 F 0.070 +254 S 0.076 +255 T 0.076 +256 V 0.074 +257 L 0.079 +258 K 0.094 +259 I 0.112 +260 T 0.127 +261 S 0.135 +262 T 0.133 +263 Q 0.126 +264 G 0.113 +265 K 0.100 +266 Q 0.091 +267 R 0.090 +268 A 0.092 +269 V 0.093 +270 S 0.094 +271 T 0.092 +272 C 0.089 +273 S 0.086 +274 C 0.084 +275 H 0.079 +276 L 0.074 +277 S 0.069 +278 V 0.066 +279 V 0.057 +280 V 0.044 +281 L 0.032 +282 F 0.027 +283 Y 0.029 +284 G 0.033 +285 T 0.037 +286 A 0.038 +287 I 0.039 +288 A 0.044 +289 V 0.057 +290 Y 0.083 +291 F 0.127 +292 S 0.187 +293 P 0.252 +294 S 0.308 +295 S 0.339 +296 P 0.341 +297 H 0.325 +298 M 0.301 +299 P 0.274 +300 E 0.248 +301 S 0.221 +302 D 0.192 +303 T 0.161 +304 L 0.135 +305 S 0.117 +306 T 0.105 +307 I 0.099 +308 M 0.104 +309 Y 0.116 +310 S 0.126 +311 M 0.132 +312 V 0.135 +313 A 0.133 +314 P 0.123 +315 M 0.111 +316 L 0.102 +317 N 0.094 +318 P 0.087 +319 F 0.083 +320 I 0.083 +321 Y 0.083 +322 T 0.089 +323 L 0.107 +324 R 0.120 +325 N 0.113 +326 R 0.092 +327 D 0.075 +328 M 0.072 +329 K 0.080 +330 R 0.090 +331 G 0.094 +332 L 0.094 +333 Q 0.094 +334 K 0.093 +335 M 0.088 +336 L 0.087 +337 L 0.104 +338 K 0.141 +339 C 0.188 +340 T 0.232 +341 V 0.274 +342 F 0.314 +343 Q 0.341 +344 Q 0.347 +345 Q 0.341 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000223611.7_ENST00000486479.3_GN:SUPT20HL2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000223611.7_ENST00000486479.3_GN:SUPT20HL2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7d3eb8b72ada6e818882f1e1624ad264ff17acac --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000223611.7_ENST00000486479.3_GN:SUPT20HL2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,818 @@ +>ENSG00000223611.7|ENST00000486479.3|GN:SUPT20HL2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.351 +2 D 0.347 +3 R 0.341 +4 D 0.335 +5 L 0.327 +6 E 0.313 +7 Q 0.307 +8 A 0.330 +9 L 0.377 +10 D 0.428 +11 R 0.472 +12 T 0.507 +13 E 0.525 +14 N 0.518 +15 I 0.481 +16 T 0.422 +17 E 0.373 +18 I 0.363 +19 A 0.379 +20 Q 0.399 +21 Q 0.419 +22 R 0.446 +23 R 0.478 +24 P 0.512 +25 R 0.548 +26 R 0.577 +27 R 0.589 +28 Y 0.584 +29 S 0.577 +30 P 0.577 +31 R 0.586 +32 A 0.585 +33 G 0.544 +34 K 0.461 +35 T 0.364 +36 L 0.284 +37 Q 0.231 +38 E 0.203 +39 K 0.187 +40 L 0.175 +41 Y 0.167 +42 D 0.165 +43 I 0.161 +44 Y 0.154 +45 V 0.159 +46 E 0.183 +47 E 0.226 +48 C 0.275 +49 G 0.314 +50 K 0.331 +51 E 0.332 +52 P 0.325 +53 E 0.309 +54 D 0.284 +55 P 0.250 +56 Q 0.217 +57 E 0.196 +58 L 0.189 +59 R 0.194 +60 S 0.208 +61 N 0.215 +62 V 0.201 +63 N 0.165 +64 L 0.123 +65 L 0.092 +66 E 0.078 +67 K 0.076 +68 L 0.080 +69 V 0.086 +70 R 0.095 +71 R 0.107 +72 E 0.119 +73 S 0.129 +74 L 0.129 +75 P 0.113 +76 C 0.087 +77 L 0.065 +78 L 0.054 +79 V 0.050 +80 N 0.051 +81 L 0.056 +82 Y 0.066 +83 P 0.081 +84 G 0.094 +85 N 0.101 +86 Q 0.099 +87 G 0.090 +88 Y 0.078 +89 S 0.070 +90 V 0.070 +91 M 0.080 +92 L 0.100 +93 Q 0.127 +94 R 0.152 +95 E 0.168 +96 D 0.176 +97 G 0.178 +98 S 0.179 +99 F 0.178 +100 A 0.176 +101 E 0.172 +102 T 0.161 +103 I 0.146 +104 R 0.132 +105 L 0.116 +106 P 0.102 +107 Y 0.090 +108 E 0.079 +109 E 0.067 +110 R 0.058 +111 A 0.057 +112 L 0.064 +113 L 0.073 +114 D 0.079 +115 Y 0.084 +116 L 0.091 +117 D 0.096 +118 A 0.094 +119 E 0.086 +120 E 0.077 +121 L 0.067 +122 P 0.057 +123 P 0.048 +124 A 0.042 +125 L 0.036 +126 G 0.032 +127 D 0.031 +128 V 0.031 +129 L 0.031 +130 D 0.029 +131 K 0.027 +132 A 0.027 +133 S 0.029 +134 V 0.033 +135 N 0.039 +136 I 0.045 +137 F 0.051 +138 H 0.061 +139 S 0.070 +140 G 0.074 +141 C 0.068 +142 V 0.058 +143 I 0.050 +144 V 0.045 +145 E 0.043 +146 V 0.044 +147 R 0.048 +148 D 0.056 +149 Y 0.074 +150 R 0.105 +151 Q 0.149 +152 S 0.191 +153 S 0.214 +154 N 0.213 +155 M 0.197 +156 Q 0.181 +157 P 0.172 +158 P 0.167 +159 G 0.157 +160 Y 0.136 +161 Q 0.107 +162 S 0.079 +163 R 0.059 +164 H 0.047 +165 I 0.042 +166 L 0.041 +167 L 0.046 +168 R 0.058 +169 P 0.073 +170 T 0.090 +171 M 0.111 +172 Q 0.138 +173 T 0.169 +174 L 0.199 +175 A 0.222 +176 P 0.240 +177 E 0.257 +178 V 0.277 +179 K 0.294 +180 T 0.298 +181 M 0.300 +182 T 0.308 +183 R 0.317 +184 D 0.322 +185 G 0.317 +186 E 0.295 +187 K 0.262 +188 W 0.238 +189 S 0.228 +190 Q 0.229 +191 E 0.239 +192 D 0.257 +193 K 0.273 +194 F 0.270 +195 P 0.244 +196 L 0.205 +197 E 0.170 +198 S 0.150 +199 Q 0.149 +200 L 0.156 +201 I 0.158 +202 L 0.156 +203 A 0.157 +204 T 0.158 +205 A 0.157 +206 E 0.160 +207 P 0.172 +208 L 0.189 +209 C 0.203 +210 L 0.211 +211 D 0.209 +212 P 0.202 +213 S 0.197 +214 V 0.201 +215 A 0.215 +216 V 0.221 +217 A 0.203 +218 C 0.173 +219 T 0.149 +220 A 0.131 +221 N 0.115 +222 R 0.108 +223 L 0.110 +224 L 0.117 +225 Y 0.129 +226 N 0.143 +227 K 0.152 +228 Q 0.161 +229 K 0.181 +230 M 0.209 +231 N 0.232 +232 T 0.246 +233 D 0.252 +234 P 0.253 +235 M 0.250 +236 E 0.245 +237 Q 0.240 +238 C 0.233 +239 L 0.219 +240 Q 0.202 +241 R 0.194 +242 Y 0.203 +243 S 0.240 +244 W 0.316 +245 P 0.418 +246 S 0.514 +247 V 0.586 +248 K 0.643 +249 P 0.694 +250 Q 0.736 +251 Q 0.758 +252 E 0.754 +253 Q 0.730 +254 S 0.694 +255 D 0.657 +256 C 0.624 +257 P 0.611 +258 P 0.631 +259 P 0.684 +260 P 0.747 +261 E 0.799 +262 L 0.827 +263 R 0.837 +264 V 0.838 +265 S 0.836 +266 T 0.833 +267 S 0.831 +268 G 0.829 +269 Q 0.827 +270 K 0.824 +271 E 0.820 +272 E 0.813 +273 R 0.807 +274 K 0.801 +275 V 0.796 +276 G 0.792 +277 Q 0.795 +278 P 0.806 +279 C 0.819 +280 E 0.829 +281 L 0.832 +282 N 0.825 +283 I 0.812 +284 T 0.805 +285 K 0.808 +286 A 0.815 +287 G 0.821 +288 S 0.820 +289 C 0.808 +290 V 0.773 +291 D 0.707 +292 T 0.630 +293 W 0.585 +294 K 0.596 +295 G 0.637 +296 R 0.671 +297 P 0.684 +298 C 0.687 +299 D 0.691 +300 L 0.699 +301 A 0.697 +302 V 0.685 +303 P 0.684 +304 S 0.696 +305 E 0.698 +306 V 0.658 +307 D 0.576 +308 V 0.475 +309 E 0.389 +310 K 0.345 +311 L 0.353 +312 A 0.399 +313 K 0.466 +314 G 0.546 +315 Y 0.628 +316 Q 0.689 +317 S 0.720 +318 V 0.723 +319 T 0.704 +320 A 0.669 +321 A 0.628 +322 D 0.594 +323 P 0.574 +324 Q 0.577 +325 L 0.607 +326 P 0.646 +327 V 0.673 +328 W 0.686 +329 P 0.707 +330 A 0.735 +331 Q 0.748 +332 E 0.727 +333 V 0.672 +334 E 0.597 +335 D 0.514 +336 P 0.444 +337 F 0.410 +338 R 0.412 +339 H 0.420 +340 A 0.415 +341 W 0.414 +342 E 0.442 +343 A 0.494 +344 G 0.543 +345 C 0.571 +346 Q 0.570 +347 A 0.540 +348 W 0.500 +349 D 0.478 +350 T 0.486 +351 K 0.523 +352 P 0.579 +353 N 0.632 +354 I 0.664 +355 M 0.676 +356 Q 0.680 +357 S 0.678 +358 F 0.668 +359 N 0.656 +360 D 0.644 +361 P 0.629 +362 L 0.621 +363 L 0.639 +364 C 0.679 +365 G 0.711 +366 K 0.716 +367 I 0.706 +368 R 0.704 +369 P 0.718 +370 R 0.740 +371 K 0.763 +372 K 0.782 +373 A 0.795 +374 R 0.799 +375 Q 0.795 +376 K 0.788 +377 S 0.777 +378 Q 0.764 +379 K 0.748 +380 S 0.731 +381 P 0.718 +382 W 0.717 +383 Q 0.731 +384 P 0.752 +385 F 0.775 +386 P 0.800 +387 D 0.819 +388 D 0.827 +389 H 0.826 +390 S 0.826 +391 A 0.829 +392 C 0.829 +393 L 0.828 +394 R 0.832 +395 P 0.843 +396 G 0.854 +397 S 0.859 +398 E 0.858 +399 T 0.852 +400 D 0.845 +401 A 0.841 +402 G 0.837 +403 R 0.834 +404 A 0.829 +405 V 0.819 +406 S 0.806 +407 Q 0.783 +408 A 0.735 +409 Q 0.672 +410 E 0.644 +411 S 0.681 +412 V 0.746 +413 Q 0.790 +414 S 0.808 +415 K 0.813 +416 V 0.810 +417 K 0.806 +418 G 0.810 +419 P 0.821 +420 G 0.835 +421 K 0.844 +422 M 0.845 +423 S 0.842 +424 H 0.837 +425 S 0.833 +426 S 0.832 +427 S 0.831 +428 G 0.831 +429 P 0.835 +430 A 0.838 +431 S 0.834 +432 V 0.824 +433 S 0.812 +434 Q 0.803 +435 L 0.794 +436 S 0.785 +437 S 0.776 +438 W 0.769 +439 K 0.768 +440 T 0.773 +441 P 0.778 +442 E 0.777 +443 Q 0.774 +444 P 0.776 +445 D 0.787 +446 P 0.799 +447 V 0.807 +448 W 0.813 +449 V 0.820 +450 Q 0.825 +451 S 0.826 +452 S 0.825 +453 V 0.826 +454 S 0.828 +455 G 0.832 +456 K 0.833 +457 G 0.827 +458 E 0.812 +459 K 0.789 +460 H 0.766 +461 P 0.755 +462 P 0.763 +463 P 0.781 +464 R 0.792 +465 T 0.784 +466 Q 0.754 +467 L 0.701 +468 P 0.641 +469 S 0.616 +470 S 0.644 +471 S 0.674 +472 G 0.661 +473 K 0.645 +474 I 0.678 +475 S 0.739 +476 S 0.782 +477 G 0.796 +478 N 0.788 +479 S 0.770 +480 F 0.757 +481 P 0.761 +482 P 0.778 +483 Q 0.796 +484 Q 0.806 +485 A 0.807 +486 G 0.801 +487 S 0.791 +488 P 0.783 +489 L 0.775 +490 K 0.767 +491 R 0.759 +492 P 0.760 +493 F 0.773 +494 P 0.793 +495 A 0.812 +496 A 0.822 +497 A 0.829 +498 P 0.837 +499 A 0.845 +500 V 0.850 +501 A 0.850 +502 A 0.843 +503 A 0.828 +504 A 0.813 +505 P 0.801 +506 A 0.796 +507 P 0.793 +508 A 0.789 +509 P 0.783 +510 A 0.767 +511 P 0.726 +512 A 0.661 +513 A 0.609 +514 A 0.593 +515 P 0.593 +516 A 0.605 +517 L 0.644 +518 A 0.672 +519 A 0.658 +520 A 0.647 +521 A 0.689 +522 V 0.759 +523 A 0.808 +524 A 0.826 +525 A 0.830 +526 A 0.829 +527 G 0.827 +528 G 0.822 +529 A 0.814 +530 A 0.809 +531 P 0.811 +532 S 0.818 +533 H 0.821 +534 S 0.816 +535 Q 0.812 +536 K 0.813 +537 P 0.820 +538 S 0.828 +539 V 0.839 +540 P 0.852 +541 L 0.864 +542 I 0.871 +543 K 0.871 +544 A 0.865 +545 S 0.855 +546 R 0.843 +547 R 0.833 +548 R 0.827 +549 P 0.827 +550 A 0.830 +551 A 0.829 +552 G 0.823 +553 R 0.819 +554 P 0.825 +555 T 0.837 +556 R 0.846 +557 F 0.845 +558 V 0.837 +559 K 0.825 +560 I 0.819 +561 A 0.824 +562 P 0.839 +563 A 0.857 +564 I 0.871 +565 Q 0.877 +566 V 0.879 +567 R 0.877 +568 T 0.873 +569 G 0.871 +570 S 0.873 +571 T 0.877 +572 G 0.882 +573 L 0.885 +574 K 0.885 +575 A 0.881 +576 T 0.875 +577 N 0.866 +578 V 0.855 +579 E 0.846 +580 G 0.841 +581 P 0.846 +582 V 0.858 +583 R 0.868 +584 G 0.869 +585 A 0.859 +586 Q 0.847 +587 V 0.839 +588 L 0.836 +589 G 0.830 +590 C 0.816 +591 S 0.800 +592 F 0.792 +593 K 0.797 +594 P 0.810 +595 V 0.820 +596 Q 0.823 +597 A 0.823 +598 P 0.828 +599 G 0.837 +600 S 0.843 +601 G 0.841 +602 A 0.833 +603 P 0.826 +604 A 0.828 +605 P 0.837 +606 A 0.845 +607 G 0.843 +608 I 0.821 +609 S 0.769 +610 G 0.702 +611 S 0.667 +612 G 0.698 +613 L 0.752 +614 Q 0.783 +615 S 0.791 +616 S 0.800 +617 G 0.811 +618 G 0.817 +619 P 0.815 +620 L 0.813 +621 P 0.813 +622 D 0.814 +623 A 0.814 +624 R 0.818 +625 P 0.830 +626 G 0.846 +627 A 0.855 +628 V 0.852 +629 Q 0.834 +630 A 0.802 +631 S 0.761 +632 S 0.719 +633 P 0.670 +634 A 0.603 +635 P 0.512 +636 L 0.415 +637 Q 0.335 +638 F 0.284 +639 F 0.268 +640 L 0.291 +641 N 0.334 +642 T 0.361 +643 P 0.357 +644 E 0.346 +645 G 0.345 +646 L 0.357 +647 R 0.374 +648 P 0.381 +649 L 0.376 +650 T 0.367 +651 L 0.358 +652 Q 0.356 +653 V 0.378 +654 P 0.425 +655 Q 0.464 +656 G 0.477 +657 W 0.492 +658 A 0.537 +659 V 0.594 +660 L 0.629 +661 T 0.642 +662 G 0.656 +663 P 0.678 +664 Q 0.691 +665 Q 0.681 +666 Q 0.648 +667 S 0.608 +668 H 0.568 +669 Q 0.524 +670 L 0.470 +671 V 0.426 +672 S 0.420 +673 L 0.452 +674 Q 0.495 +675 Q 0.530 +676 L 0.557 +677 Q 0.583 +678 Q 0.620 +679 P 0.670 +680 T 0.715 +681 A 0.736 +682 A 0.733 +683 H 0.724 +684 P 0.726 +685 P 0.739 +686 Q 0.756 +687 P 0.771 +688 G 0.786 +689 P 0.802 +690 Q 0.818 +691 G 0.832 +692 S 0.843 +693 T 0.852 +694 L 0.858 +695 G 0.855 +696 L 0.844 +697 S 0.830 +698 T 0.818 +699 Q 0.810 +700 G 0.802 +701 Q 0.790 +702 A 0.780 +703 F 0.779 +704 P 0.786 +705 A 0.798 +706 Q 0.809 +707 Q 0.817 +708 L 0.825 +709 L 0.830 +710 N 0.834 +711 V 0.835 +712 N 0.834 +713 L 0.834 +714 T 0.838 +715 G 0.844 +716 A 0.849 +717 G 0.849 +718 S 0.842 +719 G 0.827 +720 L 0.806 +721 Q 0.787 +722 P 0.780 +723 Q 0.787 +724 P 0.805 +725 Q 0.825 +726 A 0.838 +727 A 0.840 +728 V 0.830 +729 L 0.817 +730 S 0.809 +731 L 0.805 +732 L 0.805 +733 G 0.805 +734 S 0.804 +735 A 0.799 +736 Q 0.792 +737 V 0.787 +738 P 0.790 +739 Q 0.799 +740 Q 0.810 +741 G 0.817 +742 V 0.818 +743 Q 0.817 +744 L 0.819 +745 P 0.825 +746 F 0.830 +747 V 0.828 +748 L 0.817 +749 G 0.796 +750 Q 0.775 +751 Q 0.762 +752 P 0.765 +753 Q 0.785 +754 P 0.811 +755 L 0.827 +756 L 0.828 +757 L 0.814 +758 L 0.792 +759 Q 0.770 +760 P 0.755 +761 Q 0.752 +762 P 0.763 +763 Q 0.785 +764 P 0.809 +765 Q 0.828 +766 Q 0.838 +767 I 0.839 +768 Q 0.832 +769 L 0.821 +770 Q 0.809 +771 T 0.802 +772 Q 0.805 +773 P 0.814 +774 L 0.823 +775 R 0.825 +776 V 0.820 +777 L 0.813 +778 Q 0.809 +779 Q 0.812 +780 P 0.818 +781 V 0.820 +782 F 0.819 +783 L 0.820 +784 A 0.823 +785 T 0.825 +786 G 0.820 +787 A 0.811 +788 V 0.801 +789 Q 0.793 +790 I 0.782 +791 V 0.765 +792 Q 0.747 +793 P 0.738 +794 H 0.748 +795 P 0.775 +796 G 0.804 +797 V 0.824 +798 Q 0.835 +799 A 0.839 +800 G 0.840 +801 S 0.840 +802 Q 0.841 +803 L 0.842 +804 V 0.840 +805 G 0.830 +806 Q 0.816 +807 R 0.800 +808 K 0.788 +809 G 0.779 +810 G 0.770 +811 K 0.758 +812 P 0.745 +813 T 0.740 +814 P 0.748 +815 P 0.759 +816 A 0.762 +817 P 0.758 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000223611.7_ENST00000486479.3_GN:SUPT20HL2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000223611.7_ENST00000486479.3_GN:SUPT20HL2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..937cc9f6882149e9f45950458f44fa4bfcc7d386 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000223611.7_ENST00000486479.3_GN:SUPT20HL2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid @@ -0,0 +1,844 @@ +>ENSG00000223611.7|ENST00000486479.3|GN:SUPT20HL2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:26 +1 M 0.308 +2 T 0.319 +3 A 0.335 +4 V 0.342 +5 I 0.338 +6 P 0.337 +7 P 0.355 +8 C 0.384 +9 F 0.397 +10 T 0.379 +11 N 0.339 +12 A 0.293 +13 H 0.246 +14 A 0.206 +15 F 0.178 +16 S 0.166 +17 L 0.167 +18 L 0.173 +19 L 0.181 +20 G 0.191 +21 A 0.202 +22 L 0.219 +23 F 0.247 +24 S 0.281 +25 V 0.302 +26 T 0.300 +27 M 0.291 +28 D 0.288 +29 R 0.290 +30 D 0.290 +31 L 0.286 +32 E 0.276 +33 Q 0.275 +34 A 0.297 +35 L 0.345 +36 D 0.404 +37 R 0.457 +38 T 0.493 +39 E 0.506 +40 N 0.497 +41 I 0.462 +42 T 0.407 +43 E 0.361 +44 I 0.349 +45 A 0.361 +46 Q 0.378 +47 Q 0.399 +48 R 0.429 +49 R 0.468 +50 P 0.509 +51 R 0.550 +52 R 0.582 +53 R 0.594 +54 Y 0.591 +55 S 0.589 +56 P 0.594 +57 R 0.603 +58 A 0.599 +59 G 0.561 +60 K 0.487 +61 T 0.400 +62 L 0.321 +63 Q 0.262 +64 E 0.226 +65 K 0.203 +66 L 0.181 +67 Y 0.164 +68 D 0.156 +69 I 0.150 +70 Y 0.140 +71 V 0.138 +72 E 0.153 +73 E 0.185 +74 C 0.223 +75 G 0.256 +76 K 0.272 +77 E 0.275 +78 P 0.269 +79 E 0.256 +80 D 0.235 +81 P 0.207 +82 Q 0.180 +83 E 0.162 +84 L 0.155 +85 R 0.156 +86 S 0.162 +87 N 0.162 +88 V 0.149 +89 N 0.123 +90 L 0.093 +91 L 0.072 +92 E 0.063 +93 K 0.063 +94 L 0.067 +95 V 0.072 +96 R 0.081 +97 R 0.093 +98 E 0.106 +99 S 0.116 +100 L 0.115 +101 P 0.099 +102 C 0.075 +103 L 0.056 +104 L 0.048 +105 V 0.047 +106 N 0.048 +107 L 0.053 +108 Y 0.062 +109 P 0.072 +110 G 0.081 +111 N 0.087 +112 Q 0.086 +113 G 0.081 +114 Y 0.073 +115 S 0.066 +116 V 0.066 +117 M 0.074 +118 L 0.090 +119 Q 0.113 +120 R 0.134 +121 E 0.150 +122 D 0.160 +123 G 0.165 +124 S 0.167 +125 F 0.167 +126 A 0.168 +127 E 0.168 +128 T 0.161 +129 I 0.147 +130 R 0.132 +131 L 0.115 +132 P 0.099 +133 Y 0.084 +134 E 0.071 +135 E 0.060 +136 R 0.052 +137 A 0.053 +138 L 0.061 +139 L 0.070 +140 D 0.076 +141 Y 0.082 +142 L 0.090 +143 D 0.096 +144 A 0.094 +145 E 0.088 +146 E 0.080 +147 L 0.072 +148 P 0.061 +149 P 0.052 +150 A 0.045 +151 L 0.039 +152 G 0.034 +153 D 0.032 +154 V 0.032 +155 L 0.032 +156 D 0.030 +157 K 0.027 +158 A 0.027 +159 S 0.029 +160 V 0.033 +161 N 0.039 +162 I 0.044 +163 F 0.049 +164 H 0.057 +165 S 0.065 +166 G 0.070 +167 C 0.065 +168 V 0.055 +169 I 0.048 +170 V 0.044 +171 E 0.043 +172 V 0.045 +173 R 0.050 +174 D 0.060 +175 Y 0.078 +176 R 0.110 +177 Q 0.150 +178 S 0.186 +179 S 0.203 +180 N 0.200 +181 M 0.184 +182 Q 0.167 +183 P 0.156 +184 P 0.151 +185 G 0.143 +186 Y 0.125 +187 Q 0.100 +188 S 0.074 +189 R 0.056 +190 H 0.045 +191 I 0.040 +192 L 0.039 +193 L 0.044 +194 R 0.056 +195 P 0.070 +196 T 0.084 +197 M 0.103 +198 Q 0.132 +199 T 0.171 +200 L 0.212 +201 A 0.247 +202 P 0.271 +203 E 0.286 +204 V 0.300 +205 K 0.310 +206 T 0.311 +207 M 0.310 +208 T 0.312 +209 R 0.313 +210 D 0.308 +211 G 0.293 +212 E 0.264 +213 K 0.228 +214 W 0.203 +215 S 0.193 +216 Q 0.194 +217 E 0.201 +218 D 0.214 +219 K 0.224 +220 F 0.220 +221 P 0.199 +222 L 0.170 +223 E 0.141 +224 S 0.123 +225 Q 0.121 +226 L 0.127 +227 I 0.131 +228 L 0.131 +229 A 0.133 +230 T 0.134 +231 A 0.131 +232 E 0.128 +233 P 0.130 +234 L 0.138 +235 C 0.149 +236 L 0.158 +237 D 0.162 +238 P 0.161 +239 S 0.158 +240 V 0.163 +241 A 0.176 +242 V 0.179 +243 A 0.159 +244 C 0.130 +245 T 0.108 +246 A 0.091 +247 N 0.080 +248 R 0.076 +249 L 0.081 +250 L 0.091 +251 Y 0.105 +252 N 0.119 +253 K 0.127 +254 Q 0.135 +255 K 0.152 +256 M 0.179 +257 N 0.206 +258 T 0.222 +259 D 0.224 +260 P 0.216 +261 M 0.205 +262 E 0.196 +263 Q 0.191 +264 C 0.185 +265 L 0.174 +266 Q 0.161 +267 R 0.158 +268 Y 0.170 +269 S 0.209 +270 W 0.284 +271 P 0.382 +272 S 0.475 +273 V 0.548 +274 K 0.610 +275 P 0.669 +276 Q 0.717 +277 Q 0.742 +278 E 0.736 +279 Q 0.707 +280 S 0.667 +281 D 0.628 +282 C 0.595 +283 P 0.582 +284 P 0.604 +285 P 0.662 +286 P 0.732 +287 E 0.790 +288 L 0.822 +289 R 0.833 +290 V 0.834 +291 S 0.831 +292 T 0.828 +293 S 0.826 +294 G 0.825 +295 Q 0.823 +296 K 0.820 +297 E 0.815 +298 E 0.807 +299 R 0.798 +300 K 0.791 +301 V 0.785 +302 G 0.780 +303 Q 0.783 +304 P 0.796 +305 C 0.812 +306 E 0.825 +307 L 0.828 +308 N 0.819 +309 I 0.802 +310 T 0.790 +311 K 0.790 +312 A 0.798 +313 G 0.804 +314 S 0.802 +315 C 0.787 +316 V 0.747 +317 D 0.677 +318 T 0.597 +319 W 0.550 +320 K 0.559 +321 G 0.597 +322 R 0.626 +323 P 0.635 +324 C 0.633 +325 D 0.635 +326 L 0.641 +327 A 0.637 +328 V 0.621 +329 P 0.617 +330 S 0.630 +331 E 0.633 +332 V 0.592 +333 D 0.510 +334 V 0.415 +335 E 0.336 +336 K 0.297 +337 L 0.306 +338 A 0.350 +339 K 0.417 +340 G 0.501 +341 Y 0.589 +342 Q 0.658 +343 S 0.693 +344 V 0.693 +345 T 0.666 +346 A 0.621 +347 A 0.572 +348 D 0.529 +349 P 0.505 +350 Q 0.507 +351 L 0.541 +352 P 0.586 +353 V 0.616 +354 W 0.631 +355 P 0.653 +356 A 0.683 +357 Q 0.698 +358 E 0.675 +359 V 0.617 +360 E 0.539 +361 D 0.457 +362 P 0.388 +363 F 0.349 +364 R 0.343 +365 H 0.345 +366 A 0.340 +367 W 0.343 +368 E 0.373 +369 A 0.424 +370 G 0.467 +371 C 0.489 +372 Q 0.482 +373 A 0.451 +374 W 0.412 +375 D 0.394 +376 T 0.409 +377 K 0.455 +378 P 0.518 +379 N 0.573 +380 I 0.602 +381 M 0.615 +382 Q 0.624 +383 S 0.625 +384 F 0.616 +385 N 0.607 +386 D 0.598 +387 P 0.585 +388 L 0.575 +389 L 0.593 +390 C 0.639 +391 G 0.678 +392 K 0.688 +393 I 0.682 +394 R 0.684 +395 P 0.701 +396 R 0.726 +397 K 0.751 +398 K 0.772 +399 A 0.785 +400 R 0.788 +401 Q 0.785 +402 K 0.778 +403 S 0.768 +404 Q 0.755 +405 K 0.740 +406 S 0.723 +407 P 0.709 +408 W 0.707 +409 Q 0.720 +410 P 0.741 +411 F 0.765 +412 P 0.790 +413 D 0.811 +414 D 0.819 +415 H 0.818 +416 S 0.818 +417 A 0.820 +418 C 0.820 +419 L 0.820 +420 R 0.826 +421 P 0.839 +422 G 0.852 +423 S 0.858 +424 E 0.856 +425 T 0.850 +426 D 0.844 +427 A 0.839 +428 G 0.837 +429 R 0.834 +430 A 0.829 +431 V 0.821 +432 S 0.808 +433 Q 0.784 +434 A 0.736 +435 Q 0.672 +436 E 0.644 +437 S 0.682 +438 V 0.747 +439 Q 0.791 +440 S 0.809 +441 K 0.813 +442 V 0.810 +443 K 0.807 +444 G 0.810 +445 P 0.822 +446 G 0.836 +447 K 0.845 +448 M 0.846 +449 S 0.843 +450 H 0.839 +451 S 0.836 +452 S 0.834 +453 S 0.832 +454 G 0.832 +455 P 0.835 +456 A 0.838 +457 S 0.834 +458 V 0.823 +459 S 0.811 +460 Q 0.802 +461 L 0.793 +462 S 0.784 +463 S 0.774 +464 W 0.767 +465 K 0.766 +466 T 0.772 +467 P 0.777 +468 E 0.777 +469 Q 0.774 +470 P 0.776 +471 D 0.785 +472 P 0.796 +473 V 0.804 +474 W 0.810 +475 V 0.817 +476 Q 0.822 +477 S 0.823 +478 S 0.822 +479 V 0.823 +480 S 0.827 +481 G 0.832 +482 K 0.833 +483 G 0.828 +484 E 0.813 +485 K 0.790 +486 H 0.767 +487 P 0.757 +488 P 0.765 +489 P 0.782 +490 R 0.792 +491 T 0.784 +492 Q 0.754 +493 L 0.700 +494 P 0.640 +495 S 0.614 +496 S 0.642 +497 S 0.670 +498 G 0.652 +499 K 0.623 +500 I 0.622 +501 S 0.635 +502 S 0.655 +503 G 0.694 +504 N 0.735 +505 S 0.751 +506 F 0.752 +507 P 0.759 +508 P 0.777 +509 Q 0.796 +510 Q 0.806 +511 A 0.806 +512 G 0.799 +513 S 0.790 +514 P 0.781 +515 L 0.773 +516 K 0.764 +517 R 0.757 +518 P 0.757 +519 F 0.769 +520 P 0.789 +521 A 0.808 +522 A 0.818 +523 A 0.825 +524 P 0.833 +525 A 0.842 +526 V 0.847 +527 A 0.847 +528 A 0.840 +529 A 0.826 +530 A 0.810 +531 P 0.799 +532 A 0.793 +533 P 0.789 +534 A 0.785 +535 P 0.778 +536 A 0.763 +537 P 0.722 +538 A 0.658 +539 A 0.606 +540 A 0.590 +541 P 0.589 +542 A 0.602 +543 L 0.641 +544 A 0.669 +545 A 0.655 +546 A 0.645 +547 A 0.686 +548 V 0.755 +549 A 0.804 +550 A 0.822 +551 A 0.825 +552 A 0.824 +553 G 0.823 +554 G 0.818 +555 A 0.811 +556 A 0.805 +557 P 0.807 +558 S 0.814 +559 H 0.816 +560 S 0.813 +561 Q 0.808 +562 K 0.810 +563 P 0.817 +564 S 0.825 +565 V 0.835 +566 P 0.848 +567 L 0.860 +568 I 0.866 +569 K 0.867 +570 A 0.861 +571 S 0.851 +572 R 0.839 +573 R 0.830 +574 R 0.825 +575 P 0.825 +576 A 0.828 +577 A 0.827 +578 G 0.821 +579 R 0.818 +580 P 0.824 +581 T 0.836 +582 R 0.845 +583 F 0.844 +584 V 0.836 +585 K 0.824 +586 I 0.817 +587 A 0.822 +588 P 0.838 +589 A 0.856 +590 I 0.870 +591 Q 0.877 +592 V 0.878 +593 R 0.877 +594 T 0.874 +595 G 0.872 +596 S 0.874 +597 T 0.878 +598 G 0.883 +599 L 0.886 +600 K 0.886 +601 A 0.882 +602 T 0.875 +603 N 0.866 +604 V 0.855 +605 E 0.845 +606 G 0.841 +607 P 0.846 +608 V 0.858 +609 R 0.869 +610 G 0.870 +611 A 0.862 +612 Q 0.848 +613 V 0.839 +614 L 0.835 +615 G 0.829 +616 C 0.815 +617 S 0.800 +618 F 0.792 +619 K 0.798 +620 P 0.811 +621 V 0.822 +622 Q 0.825 +623 A 0.825 +624 P 0.830 +625 G 0.839 +626 S 0.845 +627 G 0.843 +628 A 0.835 +629 P 0.828 +630 A 0.829 +631 P 0.838 +632 A 0.845 +633 G 0.842 +634 I 0.820 +635 S 0.769 +636 G 0.702 +637 S 0.666 +638 G 0.691 +639 L 0.733 +640 Q 0.744 +641 S 0.742 +642 S 0.760 +643 G 0.790 +644 G 0.809 +645 P 0.813 +646 L 0.811 +647 P 0.811 +648 D 0.812 +649 A 0.812 +650 R 0.816 +651 P 0.828 +652 G 0.844 +653 A 0.854 +654 V 0.851 +655 Q 0.832 +656 A 0.801 +657 S 0.761 +658 S 0.719 +659 P 0.671 +660 A 0.604 +661 P 0.517 +662 L 0.423 +663 Q 0.345 +664 F 0.295 +665 F 0.280 +666 L 0.302 +667 N 0.344 +668 T 0.367 +669 P 0.362 +670 E 0.349 +671 G 0.348 +672 L 0.362 +673 R 0.382 +674 P 0.392 +675 L 0.389 +676 T 0.379 +677 L 0.369 +678 Q 0.365 +679 V 0.388 +680 P 0.435 +681 Q 0.474 +682 G 0.487 +683 W 0.501 +684 A 0.544 +685 V 0.598 +686 L 0.632 +687 T 0.645 +688 G 0.658 +689 P 0.680 +690 Q 0.694 +691 Q 0.684 +692 Q 0.654 +693 S 0.617 +694 H 0.580 +695 Q 0.537 +696 L 0.484 +697 V 0.440 +698 S 0.434 +699 L 0.464 +700 Q 0.505 +701 Q 0.539 +702 L 0.566 +703 Q 0.591 +704 Q 0.627 +705 P 0.675 +706 T 0.718 +707 A 0.738 +708 A 0.734 +709 H 0.725 +710 P 0.726 +711 P 0.739 +712 Q 0.755 +713 P 0.771 +714 G 0.786 +715 P 0.801 +716 Q 0.817 +717 G 0.832 +718 S 0.843 +719 T 0.852 +720 L 0.857 +721 G 0.855 +722 L 0.845 +723 S 0.831 +724 T 0.820 +725 Q 0.812 +726 G 0.803 +727 Q 0.792 +728 A 0.782 +729 F 0.781 +730 P 0.789 +731 A 0.800 +732 Q 0.811 +733 Q 0.820 +734 L 0.826 +735 L 0.831 +736 N 0.835 +737 V 0.836 +738 N 0.835 +739 L 0.835 +740 T 0.839 +741 G 0.845 +742 A 0.850 +743 G 0.850 +744 S 0.843 +745 G 0.829 +746 L 0.808 +747 Q 0.790 +748 P 0.782 +749 Q 0.789 +750 P 0.807 +751 Q 0.826 +752 A 0.840 +753 A 0.841 +754 V 0.831 +755 L 0.818 +756 S 0.809 +757 L 0.805 +758 L 0.805 +759 G 0.806 +760 S 0.807 +761 A 0.803 +762 Q 0.796 +763 V 0.792 +764 P 0.794 +765 Q 0.802 +766 Q 0.812 +767 G 0.819 +768 V 0.818 +769 Q 0.816 +770 L 0.819 +771 P 0.825 +772 F 0.830 +773 V 0.830 +774 L 0.819 +775 G 0.800 +776 Q 0.779 +777 Q 0.766 +778 P 0.769 +779 Q 0.787 +780 P 0.812 +781 L 0.828 +782 L 0.828 +783 L 0.815 +784 L 0.794 +785 Q 0.772 +786 P 0.757 +787 Q 0.754 +788 P 0.765 +789 Q 0.787 +790 P 0.812 +791 Q 0.830 +792 Q 0.841 +793 I 0.841 +794 Q 0.834 +795 L 0.822 +796 Q 0.810 +797 T 0.804 +798 Q 0.806 +799 P 0.816 +800 L 0.825 +801 R 0.828 +802 V 0.824 +803 L 0.817 +804 Q 0.814 +805 Q 0.816 +806 P 0.821 +807 V 0.823 +808 F 0.822 +809 L 0.823 +810 A 0.825 +811 T 0.826 +812 G 0.823 +813 A 0.816 +814 V 0.808 +815 Q 0.800 +816 I 0.788 +817 V 0.771 +818 Q 0.752 +819 P 0.743 +820 H 0.752 +821 P 0.778 +822 G 0.806 +823 V 0.826 +824 Q 0.835 +825 A 0.839 +826 G 0.839 +827 S 0.838 +828 Q 0.839 +829 L 0.840 +830 V 0.838 +831 G 0.830 +832 Q 0.816 +833 R 0.801 +834 K 0.789 +835 G 0.780 +836 G 0.772 +837 K 0.760 +838 P 0.747 +839 T 0.742 +840 P 0.750 +841 P 0.761 +842 A 0.763 +843 P 0.759 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000223731.4_ENST00000686983.1_GN:SUPT20HL1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000223731.4_ENST00000686983.1_GN:SUPT20HL1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..15637fb867a9c524fa58562add4a5f6442a15bcc --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000223731.4_ENST00000686983.1_GN:SUPT20HL1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,888 @@ +>ENSG00000223731.4|ENST00000686983.1|GN:SUPT20HL1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.322 +2 D 0.309 +3 R 0.290 +4 D 0.273 +5 L 0.259 +6 E 0.244 +7 Q 0.232 +8 A 0.235 +9 L 0.253 +10 D 0.271 +11 R 0.288 +12 A 0.308 +13 E 0.331 +14 N 0.346 +15 I 0.345 +16 I 0.328 +17 E 0.312 +18 I 0.309 +19 A 0.318 +20 Q 0.330 +21 Q 0.351 +22 R 0.386 +23 P 0.433 +24 P 0.480 +25 R 0.519 +26 R 0.546 +27 R 0.557 +28 Y 0.556 +29 S 0.551 +30 P 0.551 +31 R 0.561 +32 A 0.563 +33 G 0.531 +34 K 0.461 +35 T 0.378 +36 L 0.307 +37 Q 0.255 +38 E 0.225 +39 K 0.208 +40 L 0.193 +41 Y 0.180 +42 D 0.172 +43 I 0.164 +44 Y 0.156 +45 V 0.157 +46 E 0.180 +47 E 0.221 +48 C 0.269 +49 G 0.306 +50 K 0.320 +51 E 0.320 +52 P 0.313 +53 E 0.300 +54 D 0.275 +55 P 0.240 +56 Q 0.204 +57 E 0.181 +58 L 0.175 +59 R 0.181 +60 S 0.196 +61 N 0.204 +62 V 0.191 +63 N 0.156 +64 L 0.117 +65 L 0.089 +66 E 0.076 +67 K 0.074 +68 L 0.078 +69 V 0.084 +70 R 0.094 +71 R 0.106 +72 E 0.117 +73 S 0.125 +74 L 0.124 +75 P 0.109 +76 C 0.085 +77 L 0.065 +78 L 0.054 +79 V 0.051 +80 N 0.052 +81 L 0.058 +82 Y 0.070 +83 P 0.086 +84 G 0.100 +85 N 0.108 +86 Q 0.106 +87 G 0.096 +88 Y 0.084 +89 S 0.074 +90 V 0.074 +91 M 0.083 +92 L 0.103 +93 Q 0.129 +94 R 0.154 +95 E 0.169 +96 D 0.176 +97 G 0.182 +98 S 0.188 +99 F 0.191 +100 A 0.189 +101 E 0.180 +102 T 0.167 +103 I 0.153 +104 R 0.141 +105 L 0.127 +106 P 0.113 +107 Y 0.100 +108 E 0.087 +109 E 0.071 +110 R 0.059 +111 A 0.056 +112 L 0.061 +113 L 0.069 +114 D 0.074 +115 Y 0.079 +116 L 0.086 +117 D 0.091 +118 A 0.089 +119 E 0.082 +120 E 0.074 +121 L 0.066 +122 P 0.058 +123 P 0.050 +124 A 0.043 +125 L 0.036 +126 G 0.031 +127 D 0.029 +128 V 0.029 +129 L 0.029 +130 D 0.027 +131 K 0.026 +132 A 0.026 +133 S 0.028 +134 V 0.032 +135 N 0.039 +136 I 0.046 +137 F 0.053 +138 H 0.061 +139 S 0.068 +140 G 0.070 +141 C 0.064 +142 V 0.054 +143 I 0.047 +144 V 0.044 +145 E 0.043 +146 V 0.044 +147 R 0.048 +148 D 0.055 +149 Y 0.073 +150 R 0.106 +151 Q 0.155 +152 S 0.203 +153 S 0.228 +154 N 0.221 +155 M 0.198 +156 Q 0.179 +157 P 0.173 +158 P 0.169 +159 G 0.155 +160 Y 0.131 +161 Q 0.100 +162 S 0.072 +163 R 0.053 +164 H 0.043 +165 I 0.038 +166 L 0.038 +167 L 0.045 +168 R 0.059 +169 P 0.073 +170 T 0.080 +171 M 0.083 +172 Q 0.086 +173 T 0.085 +174 L 0.082 +175 A 0.081 +176 H 0.085 +177 D 0.093 +178 V 0.101 +179 K 0.110 +180 M 0.125 +181 M 0.143 +182 T 0.157 +183 R 0.164 +184 D 0.173 +185 G 0.183 +186 Q 0.182 +187 K 0.162 +188 W 0.135 +189 S 0.115 +190 Q 0.107 +191 E 0.107 +192 D 0.107 +193 K 0.104 +194 L 0.101 +195 Q 0.099 +196 L 0.096 +197 E 0.091 +198 S 0.087 +199 Q 0.090 +200 L 0.100 +201 I 0.110 +202 L 0.121 +203 A 0.137 +204 T 0.160 +205 A 0.183 +206 E 0.203 +207 P 0.218 +208 L 0.228 +209 C 0.232 +210 L 0.225 +211 D 0.202 +212 P 0.171 +213 S 0.151 +214 V 0.148 +215 A 0.154 +216 V 0.159 +217 A 0.164 +218 C 0.171 +219 T 0.168 +220 A 0.150 +221 N 0.131 +222 R 0.128 +223 L 0.139 +224 L 0.151 +225 Y 0.158 +226 N 0.167 +227 K 0.177 +228 Q 0.192 +229 K 0.215 +230 M 0.241 +231 N 0.261 +232 T 0.277 +233 D 0.288 +234 P 0.294 +235 M 0.296 +236 K 0.303 +237 R 0.324 +238 C 0.349 +239 L 0.353 +240 Q 0.328 +241 R 0.297 +242 Y 0.286 +243 S 0.312 +244 W 0.387 +245 P 0.492 +246 S 0.588 +247 V 0.653 +248 K 0.694 +249 P 0.728 +250 Q 0.758 +251 Q 0.776 +252 E 0.777 +253 Q 0.763 +254 S 0.737 +255 D 0.703 +256 C 0.670 +257 P 0.653 +258 P 0.667 +259 P 0.710 +260 P 0.765 +261 E 0.812 +262 L 0.840 +263 R 0.849 +264 V 0.848 +265 S 0.843 +266 T 0.838 +267 S 0.836 +268 G 0.835 +269 Q 0.835 +270 K 0.834 +271 E 0.831 +272 E 0.827 +273 R 0.821 +274 K 0.817 +275 V 0.814 +276 G 0.811 +277 Q 0.813 +278 P 0.821 +279 C 0.833 +280 E 0.843 +281 L 0.848 +282 N 0.845 +283 I 0.836 +284 A 0.829 +285 K 0.829 +286 A 0.832 +287 G 0.835 +288 S 0.836 +289 C 0.833 +290 V 0.813 +291 D 0.766 +292 T 0.704 +293 W 0.667 +294 K 0.676 +295 G 0.712 +296 R 0.745 +297 P 0.765 +298 C 0.777 +299 D 0.785 +300 L 0.788 +301 A 0.781 +302 V 0.771 +303 P 0.769 +304 S 0.778 +305 E 0.778 +306 V 0.748 +307 D 0.680 +308 V 0.588 +309 E 0.499 +310 K 0.449 +311 L 0.455 +312 A 0.499 +313 K 0.561 +314 G 0.628 +315 Y 0.690 +316 Q 0.736 +317 S 0.761 +318 V 0.767 +319 T 0.757 +320 A 0.736 +321 A 0.708 +322 D 0.680 +323 P 0.660 +324 Q 0.659 +325 L 0.679 +326 P 0.710 +327 V 0.734 +328 W 0.752 +329 P 0.773 +330 A 0.796 +331 Q 0.807 +332 E 0.797 +333 V 0.770 +334 E 0.735 +335 D 0.702 +336 P 0.685 +337 F 0.700 +338 G 0.742 +339 F 0.787 +340 A 0.813 +341 L 0.820 +342 E 0.820 +343 A 0.821 +344 G 0.821 +345 C 0.814 +346 Q 0.797 +347 A 0.770 +348 W 0.739 +349 D 0.715 +350 T 0.708 +351 K 0.721 +352 P 0.746 +353 S 0.771 +354 I 0.783 +355 M 0.787 +356 Q 0.787 +357 S 0.782 +358 F 0.770 +359 N 0.755 +360 D 0.739 +361 P 0.720 +362 L 0.711 +363 L 0.724 +364 C 0.754 +365 G 0.777 +366 K 0.780 +367 I 0.769 +368 R 0.763 +369 P 0.768 +370 R 0.778 +371 K 0.792 +372 K 0.806 +373 A 0.816 +374 R 0.819 +375 Q 0.815 +376 K 0.806 +377 S 0.795 +378 Q 0.781 +379 K 0.764 +380 S 0.747 +381 P 0.734 +382 W 0.731 +383 Q 0.741 +384 P 0.759 +385 F 0.780 +386 P 0.803 +387 D 0.822 +388 D 0.832 +389 H 0.833 +390 S 0.833 +391 A 0.836 +392 C 0.836 +393 L 0.836 +394 R 0.840 +395 P 0.850 +396 G 0.861 +397 S 0.866 +398 E 0.864 +399 T 0.859 +400 D 0.854 +401 A 0.850 +402 G 0.847 +403 R 0.844 +404 A 0.837 +405 V 0.828 +406 S 0.815 +407 Q 0.791 +408 A 0.742 +409 Q 0.677 +410 E 0.646 +411 S 0.682 +412 V 0.745 +413 Q 0.789 +414 S 0.807 +415 K 0.811 +416 V 0.810 +417 K 0.808 +418 G 0.810 +419 P 0.820 +420 G 0.832 +421 K 0.839 +422 M 0.840 +423 S 0.837 +424 H 0.833 +425 S 0.830 +426 S 0.828 +427 S 0.828 +428 G 0.829 +429 P 0.833 +430 A 0.836 +431 S 0.833 +432 V 0.824 +433 S 0.812 +434 Q 0.803 +435 L 0.795 +436 S 0.787 +437 S 0.777 +438 W 0.770 +439 K 0.770 +440 T 0.775 +441 P 0.780 +442 E 0.781 +443 Q 0.779 +444 P 0.782 +445 D 0.791 +446 P 0.801 +447 V 0.808 +448 W 0.814 +449 V 0.820 +450 Q 0.825 +451 S 0.827 +452 S 0.826 +453 V 0.828 +454 S 0.832 +455 G 0.837 +456 K 0.838 +457 G 0.832 +458 E 0.817 +459 K 0.793 +460 H 0.768 +461 P 0.755 +462 P 0.760 +463 P 0.777 +464 R 0.787 +465 T 0.778 +466 Q 0.746 +467 L 0.692 +468 P 0.631 +469 S 0.608 +470 S 0.648 +471 S 0.717 +472 G 0.762 +473 K 0.764 +474 I 0.728 +475 S 0.673 +476 S 0.647 +477 G 0.678 +478 N 0.729 +479 S 0.756 +480 F 0.762 +481 P 0.773 +482 P 0.794 +483 Q 0.814 +484 Q 0.825 +485 A 0.825 +486 G 0.818 +487 S 0.808 +488 P 0.800 +489 L 0.796 +490 K 0.796 +491 R 0.799 +492 P 0.807 +493 F 0.817 +494 S 0.825 +495 A 0.829 +496 A 0.827 +497 A 0.820 +498 A 0.808 +499 I 0.791 +500 A 0.770 +501 A 0.742 +502 A 0.708 +503 A 0.660 +504 A 0.604 +505 A 0.578 +506 A 0.608 +507 A 0.665 +508 A 0.706 +509 A 0.730 +510 A 0.748 +511 A 0.762 +512 A 0.774 +513 A 0.781 +514 A 0.782 +515 A 0.775 +516 A 0.762 +517 A 0.754 +518 P 0.761 +519 A 0.783 +520 P 0.809 +521 A 0.829 +522 L 0.837 +523 A 0.834 +524 A 0.824 +525 A 0.809 +526 A 0.794 +527 A 0.785 +528 P 0.781 +529 A 0.772 +530 L 0.733 +531 A 0.669 +532 A 0.631 +533 A 0.657 +534 A 0.717 +535 A 0.767 +536 P 0.797 +537 A 0.817 +538 L 0.831 +539 A 0.840 +540 A 0.843 +541 A 0.837 +542 A 0.824 +543 A 0.811 +544 P 0.807 +545 A 0.813 +546 P 0.823 +547 A 0.834 +548 P 0.843 +549 A 0.847 +550 A 0.846 +551 A 0.842 +552 P 0.838 +553 A 0.822 +554 V 0.774 +555 A 0.701 +556 A 0.656 +557 A 0.683 +558 P 0.749 +559 A 0.801 +560 A 0.822 +561 A 0.826 +562 A 0.822 +563 S 0.814 +564 A 0.805 +565 A 0.799 +566 P 0.802 +567 S 0.811 +568 H 0.819 +569 S 0.820 +570 Q 0.819 +571 K 0.819 +572 P 0.823 +573 S 0.829 +574 V 0.840 +575 P 0.854 +576 L 0.866 +577 I 0.870 +578 Q 0.868 +579 A 0.859 +580 S 0.847 +581 R 0.837 +582 P 0.835 +583 C 0.841 +584 P 0.849 +585 A 0.848 +586 A 0.835 +587 Q 0.818 +588 P 0.813 +589 P 0.826 +590 T 0.843 +591 K 0.851 +592 F 0.848 +593 I 0.836 +594 K 0.823 +595 I 0.814 +596 A 0.816 +597 P 0.827 +598 A 0.841 +599 I 0.853 +600 Q 0.861 +601 L 0.865 +602 R 0.864 +603 T 0.861 +604 G 0.858 +605 S 0.854 +606 T 0.851 +607 G 0.850 +608 L 0.852 +609 K 0.854 +610 A 0.854 +611 I 0.851 +612 N 0.847 +613 V 0.842 +614 E 0.837 +615 G 0.835 +616 P 0.838 +617 V 0.847 +618 Q 0.859 +619 G 0.867 +620 A 0.866 +621 Q 0.858 +622 A 0.849 +623 L 0.841 +624 G 0.831 +625 S 0.819 +626 S 0.807 +627 F 0.804 +628 K 0.811 +629 P 0.822 +630 V 0.827 +631 Q 0.823 +632 A 0.817 +633 P 0.816 +634 G 0.822 +635 S 0.828 +636 G 0.827 +637 A 0.821 +638 P 0.816 +639 A 0.816 +640 P 0.823 +641 A 0.829 +642 G 0.827 +643 I 0.807 +644 S 0.757 +645 G 0.690 +646 S 0.655 +647 D 0.685 +648 L 0.744 +649 Q 0.782 +650 S 0.797 +651 S 0.807 +652 G 0.815 +653 G 0.819 +654 P 0.818 +655 L 0.817 +656 P 0.819 +657 D 0.822 +658 A 0.824 +659 R 0.828 +660 P 0.840 +661 G 0.856 +662 A 0.868 +663 V 0.868 +664 Q 0.854 +665 A 0.829 +666 S 0.799 +667 S 0.770 +668 P 0.746 +669 A 0.717 +670 P 0.668 +671 L 0.596 +672 Q 0.517 +673 F 0.458 +674 F 0.438 +675 L 0.464 +676 N 0.507 +677 T 0.528 +678 P 0.522 +679 E 0.505 +680 G 0.493 +681 L 0.493 +682 R 0.514 +683 P 0.551 +684 L 0.594 +685 T 0.631 +686 L 0.662 +687 L 0.686 +688 Q 0.704 +689 V 0.727 +690 P 0.764 +691 Q 0.805 +692 G 0.834 +693 S 0.844 +694 A 0.842 +695 V 0.835 +696 L 0.824 +697 T 0.812 +698 G 0.803 +699 P 0.802 +700 Q 0.804 +701 Q 0.800 +702 Q 0.785 +703 S 0.765 +704 H 0.744 +705 Q 0.717 +706 L 0.679 +707 V 0.647 +708 S 0.642 +709 L 0.661 +710 Q 0.681 +711 Q 0.693 +712 L 0.700 +713 Q 0.705 +714 Q 0.718 +715 P 0.743 +716 T 0.771 +717 A 0.784 +718 A 0.780 +719 H 0.770 +720 P 0.769 +721 P 0.778 +722 Q 0.791 +723 P 0.804 +724 G 0.817 +725 P 0.831 +726 Q 0.844 +727 G 0.856 +728 S 0.865 +729 A 0.872 +730 L 0.874 +731 G 0.869 +732 L 0.858 +733 S 0.846 +734 T 0.835 +735 Q 0.827 +736 G 0.818 +737 Q 0.807 +738 A 0.797 +739 F 0.796 +740 P 0.804 +741 A 0.817 +742 Q 0.829 +743 Q 0.833 +744 L 0.833 +745 L 0.829 +746 K 0.825 +747 V 0.822 +748 N 0.823 +749 P 0.829 +750 T 0.838 +751 R 0.848 +752 A 0.853 +753 R 0.852 +754 S 0.846 +755 G 0.835 +756 L 0.818 +757 Q 0.799 +758 P 0.785 +759 Q 0.780 +760 P 0.786 +761 Q 0.802 +762 P 0.822 +763 A 0.838 +764 V 0.841 +765 L 0.837 +766 S 0.831 +767 L 0.826 +768 L 0.823 +769 G 0.824 +770 S 0.824 +771 A 0.820 +772 Q 0.816 +773 V 0.815 +774 P 0.822 +775 Q 0.832 +776 Q 0.840 +777 G 0.840 +778 V 0.833 +779 Q 0.822 +780 L 0.816 +781 P 0.819 +782 S 0.828 +783 V 0.835 +784 L 0.834 +785 R 0.825 +786 Q 0.811 +787 Q 0.795 +788 Q 0.780 +789 P 0.769 +790 Q 0.765 +791 P 0.766 +792 Q 0.773 +793 P 0.785 +794 P 0.786 +795 K 0.753 +796 L 0.689 +797 Q 0.646 +798 L 0.664 +799 Q 0.712 +800 P 0.735 +801 Q 0.725 +802 W 0.708 +803 Q 0.708 +804 P 0.723 +805 K 0.745 +806 P 0.765 +807 R 0.776 +808 Q 0.779 +809 E 0.778 +810 Q 0.779 +811 P 0.787 +812 Q 0.798 +813 S 0.805 +814 Q 0.805 +815 Q 0.799 +816 Q 0.795 +817 Q 0.801 +818 P 0.813 +819 Q 0.824 +820 H 0.827 +821 I 0.822 +822 Q 0.811 +823 L 0.788 +824 Q 0.740 +825 T 0.674 +826 Q 0.640 +827 Q 0.671 +828 L 0.731 +829 R 0.771 +830 V 0.778 +831 L 0.769 +832 Q 0.757 +833 Q 0.756 +834 P 0.768 +835 Q 0.787 +836 H 0.802 +837 I 0.805 +838 Q 0.801 +839 L 0.795 +840 Q 0.788 +841 T 0.783 +842 Q 0.781 +843 Q 0.782 +844 L 0.783 +845 R 0.779 +846 V 0.769 +847 L 0.755 +848 Q 0.748 +849 Q 0.758 +850 P 0.777 +851 V 0.792 +852 F 0.802 +853 L 0.811 +854 A 0.818 +855 T 0.819 +856 G 0.815 +857 A 0.809 +858 V 0.803 +859 Q 0.794 +860 I 0.778 +861 V 0.757 +862 Q 0.737 +863 P 0.730 +864 H 0.744 +865 P 0.774 +866 G 0.805 +867 V 0.823 +868 Q 0.830 +869 V 0.831 +870 G 0.832 +871 S 0.831 +872 Q 0.828 +873 L 0.822 +874 V 0.810 +875 D 0.794 +876 Q 0.777 +877 R 0.763 +878 K 0.750 +879 E 0.742 +880 G 0.739 +881 K 0.739 +882 P 0.741 +883 T 0.747 +884 P 0.757 +885 P 0.763 +886 A 0.759 +887 P 0.751 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000223731.4_ENST00000686983.1_GN:SUPT20HL1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000223731.4_ENST00000686983.1_GN:SUPT20HL1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..bb92ad63f42e06d0fa0e50c634d3fb296e900e6d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000223731.4_ENST00000686983.1_GN:SUPT20HL1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid @@ -0,0 +1,914 @@ +>ENSG00000223731.4|ENST00000686983.1|GN:SUPT20HL1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:26 +1 M 0.299 +2 T 0.306 +3 A 0.315 +4 V 0.318 +5 I 0.314 +6 P 0.315 +7 P 0.330 +8 C 0.352 +9 F 0.358 +10 T 0.334 +11 N 0.292 +12 A 0.242 +13 H 0.192 +14 A 0.149 +15 F 0.119 +16 S 0.104 +17 L 0.100 +18 L 0.103 +19 L 0.111 +20 G 0.121 +21 A 0.135 +22 L 0.152 +23 F 0.172 +24 S 0.196 +25 V 0.215 +26 T 0.220 +27 M 0.219 +28 D 0.214 +29 R 0.205 +30 D 0.196 +31 L 0.187 +32 E 0.172 +33 Q 0.158 +34 A 0.156 +35 L 0.167 +36 D 0.181 +37 R 0.190 +38 A 0.200 +39 E 0.216 +40 N 0.231 +41 I 0.235 +42 I 0.227 +43 E 0.216 +44 I 0.216 +45 A 0.227 +46 Q 0.249 +47 Q 0.284 +48 R 0.330 +49 P 0.378 +50 P 0.416 +51 R 0.444 +52 R 0.466 +53 R 0.482 +54 Y 0.493 +55 S 0.502 +56 P 0.510 +57 R 0.518 +58 A 0.517 +59 G 0.488 +60 K 0.426 +61 T 0.353 +62 L 0.289 +63 Q 0.241 +64 E 0.213 +65 K 0.196 +66 L 0.176 +67 Y 0.157 +68 D 0.144 +69 I 0.134 +70 Y 0.124 +71 V 0.124 +72 E 0.141 +73 E 0.172 +74 C 0.209 +75 G 0.239 +76 K 0.255 +77 E 0.257 +78 P 0.253 +79 E 0.241 +80 D 0.221 +81 P 0.192 +82 Q 0.162 +83 E 0.142 +84 L 0.135 +85 R 0.136 +86 S 0.143 +87 N 0.147 +88 V 0.137 +89 N 0.114 +90 L 0.088 +91 L 0.068 +92 E 0.061 +93 K 0.062 +94 L 0.067 +95 V 0.073 +96 R 0.082 +97 R 0.093 +98 E 0.105 +99 S 0.113 +100 L 0.111 +101 P 0.097 +102 C 0.074 +103 L 0.056 +104 L 0.048 +105 V 0.047 +106 N 0.049 +107 L 0.054 +108 Y 0.063 +109 P 0.073 +110 G 0.082 +111 N 0.087 +112 Q 0.087 +113 G 0.082 +114 Y 0.073 +115 S 0.067 +116 V 0.067 +117 M 0.076 +118 L 0.093 +119 Q 0.116 +120 R 0.137 +121 E 0.152 +122 D 0.162 +123 G 0.168 +124 S 0.170 +125 F 0.170 +126 A 0.169 +127 E 0.166 +128 T 0.158 +129 I 0.148 +130 R 0.136 +131 L 0.122 +132 P 0.106 +133 Y 0.091 +134 E 0.077 +135 E 0.063 +136 R 0.053 +137 A 0.052 +138 L 0.059 +139 L 0.067 +140 D 0.073 +141 Y 0.079 +142 L 0.086 +143 D 0.091 +144 A 0.089 +145 E 0.084 +146 E 0.078 +147 L 0.071 +148 P 0.062 +149 P 0.053 +150 A 0.046 +151 L 0.038 +152 G 0.033 +153 D 0.030 +154 V 0.030 +155 L 0.029 +156 D 0.027 +157 K 0.026 +158 A 0.026 +159 S 0.027 +160 V 0.031 +161 N 0.036 +162 I 0.043 +163 F 0.049 +164 H 0.055 +165 S 0.062 +166 G 0.065 +167 C 0.060 +168 V 0.051 +169 I 0.044 +170 V 0.041 +171 E 0.041 +172 V 0.043 +173 R 0.048 +174 D 0.056 +175 Y 0.074 +176 R 0.106 +177 Q 0.150 +178 S 0.193 +179 S 0.214 +180 N 0.208 +181 M 0.186 +182 Q 0.167 +183 P 0.159 +184 P 0.153 +185 G 0.141 +186 Y 0.118 +187 Q 0.090 +188 S 0.065 +189 R 0.048 +190 H 0.039 +191 I 0.036 +192 L 0.036 +193 L 0.042 +194 R 0.055 +195 P 0.066 +196 T 0.071 +197 M 0.072 +198 Q 0.075 +199 T 0.077 +200 L 0.074 +201 A 0.074 +202 H 0.078 +203 D 0.084 +204 V 0.091 +205 K 0.099 +206 M 0.111 +207 M 0.125 +208 T 0.134 +209 R 0.137 +210 D 0.141 +211 G 0.148 +212 Q 0.147 +213 K 0.131 +214 W 0.107 +215 S 0.090 +216 Q 0.083 +217 E 0.084 +218 D 0.084 +219 K 0.082 +220 L 0.081 +221 Q 0.080 +222 L 0.077 +223 E 0.071 +224 S 0.068 +225 Q 0.070 +226 L 0.077 +227 I 0.086 +228 L 0.095 +229 A 0.110 +230 T 0.133 +231 A 0.157 +232 E 0.177 +233 P 0.191 +234 L 0.198 +235 C 0.196 +236 L 0.189 +237 D 0.174 +238 P 0.154 +239 S 0.141 +240 V 0.139 +241 A 0.143 +242 V 0.144 +243 A 0.144 +244 C 0.147 +245 T 0.144 +246 A 0.130 +247 N 0.115 +248 R 0.113 +249 L 0.122 +250 L 0.132 +251 Y 0.142 +252 N 0.152 +253 K 0.163 +254 Q 0.175 +255 K 0.195 +256 M 0.221 +257 N 0.245 +258 T 0.264 +259 D 0.271 +260 P 0.265 +261 M 0.256 +262 K 0.259 +263 R 0.279 +264 C 0.304 +265 L 0.310 +266 Q 0.290 +267 R 0.265 +268 Y 0.258 +269 S 0.287 +270 W 0.363 +271 P 0.468 +272 S 0.565 +273 V 0.632 +274 K 0.678 +275 P 0.718 +276 Q 0.752 +277 Q 0.773 +278 E 0.773 +279 Q 0.756 +280 S 0.727 +281 D 0.692 +282 C 0.658 +283 P 0.641 +284 P 0.654 +285 P 0.699 +286 P 0.757 +287 E 0.808 +288 L 0.839 +289 R 0.850 +290 V 0.849 +291 S 0.844 +292 T 0.838 +293 S 0.836 +294 G 0.836 +295 Q 0.837 +296 K 0.836 +297 E 0.832 +298 E 0.826 +299 R 0.819 +300 K 0.814 +301 V 0.809 +302 G 0.806 +303 Q 0.808 +304 P 0.818 +305 C 0.831 +306 E 0.843 +307 L 0.847 +308 N 0.842 +309 I 0.831 +310 A 0.821 +311 K 0.819 +312 A 0.822 +313 G 0.824 +314 S 0.825 +315 C 0.820 +316 V 0.796 +317 D 0.741 +318 T 0.670 +319 W 0.627 +320 K 0.639 +321 G 0.681 +322 R 0.719 +323 P 0.740 +324 C 0.751 +325 D 0.759 +326 L 0.762 +327 A 0.753 +328 V 0.739 +329 P 0.735 +330 S 0.744 +331 E 0.745 +332 V 0.710 +333 D 0.633 +334 V 0.531 +335 E 0.440 +336 K 0.393 +337 L 0.401 +338 A 0.444 +339 K 0.503 +340 G 0.575 +341 Y 0.648 +342 Q 0.705 +343 S 0.737 +344 V 0.743 +345 T 0.729 +346 A 0.700 +347 A 0.663 +348 D 0.628 +349 P 0.604 +350 Q 0.602 +351 L 0.629 +352 P 0.668 +353 V 0.698 +354 W 0.717 +355 P 0.740 +356 A 0.767 +357 Q 0.781 +358 E 0.772 +359 V 0.743 +360 E 0.706 +361 D 0.672 +362 P 0.655 +363 F 0.671 +364 G 0.717 +365 F 0.767 +366 A 0.797 +367 L 0.804 +368 E 0.802 +369 A 0.799 +370 G 0.792 +371 C 0.778 +372 Q 0.757 +373 A 0.724 +374 W 0.685 +375 D 0.656 +376 T 0.651 +377 K 0.669 +378 P 0.702 +379 S 0.732 +380 I 0.747 +381 M 0.751 +382 Q 0.751 +383 S 0.746 +384 F 0.734 +385 N 0.721 +386 D 0.706 +387 P 0.685 +388 L 0.670 +389 L 0.680 +390 C 0.716 +391 G 0.747 +392 K 0.754 +393 I 0.745 +394 R 0.740 +395 P 0.747 +396 R 0.761 +397 K 0.778 +398 K 0.794 +399 A 0.805 +400 R 0.807 +401 Q 0.803 +402 K 0.794 +403 S 0.784 +404 Q 0.770 +405 K 0.755 +406 S 0.739 +407 P 0.725 +408 W 0.721 +409 Q 0.730 +410 P 0.748 +411 F 0.770 +412 P 0.794 +413 D 0.814 +414 D 0.824 +415 H 0.825 +416 S 0.826 +417 A 0.828 +418 C 0.828 +419 L 0.827 +420 R 0.833 +421 P 0.845 +422 G 0.858 +423 S 0.864 +424 E 0.862 +425 T 0.857 +426 D 0.852 +427 A 0.847 +428 G 0.841 +429 R 0.824 +430 A 0.786 +431 V 0.731 +432 S 0.695 +433 Q 0.695 +434 A 0.692 +435 Q 0.660 +436 E 0.643 +437 S 0.682 +438 V 0.747 +439 Q 0.790 +440 S 0.808 +441 K 0.813 +442 V 0.811 +443 K 0.809 +444 G 0.812 +445 P 0.822 +446 G 0.834 +447 K 0.842 +448 M 0.843 +449 S 0.840 +450 H 0.836 +451 S 0.833 +452 S 0.831 +453 S 0.830 +454 G 0.831 +455 P 0.834 +456 A 0.836 +457 S 0.832 +458 V 0.821 +459 S 0.809 +460 Q 0.800 +461 L 0.792 +462 S 0.784 +463 S 0.774 +464 W 0.768 +465 K 0.768 +466 T 0.774 +467 P 0.780 +468 E 0.782 +469 Q 0.781 +470 P 0.782 +471 D 0.789 +472 P 0.798 +473 V 0.804 +474 W 0.809 +475 V 0.817 +476 Q 0.823 +477 S 0.825 +478 S 0.825 +479 V 0.827 +480 S 0.832 +481 G 0.838 +482 K 0.840 +483 G 0.835 +484 E 0.819 +485 K 0.795 +486 H 0.770 +487 P 0.758 +488 P 0.763 +489 P 0.780 +490 R 0.789 +491 T 0.779 +492 Q 0.746 +493 L 0.691 +494 P 0.629 +495 S 0.605 +496 S 0.646 +497 S 0.715 +498 G 0.759 +499 K 0.761 +500 I 0.723 +501 S 0.666 +502 S 0.641 +503 G 0.674 +504 N 0.727 +505 S 0.755 +506 F 0.762 +507 P 0.774 +508 P 0.795 +509 Q 0.815 +510 Q 0.826 +511 A 0.825 +512 G 0.818 +513 S 0.807 +514 P 0.799 +515 L 0.794 +516 K 0.793 +517 R 0.797 +518 P 0.804 +519 F 0.814 +520 S 0.822 +521 A 0.825 +522 A 0.823 +523 A 0.815 +524 A 0.804 +525 I 0.790 +526 A 0.775 +527 A 0.757 +528 A 0.728 +529 A 0.676 +530 A 0.614 +531 A 0.583 +532 A 0.611 +533 A 0.667 +534 A 0.708 +535 A 0.731 +536 A 0.748 +537 A 0.761 +538 A 0.771 +539 A 0.777 +540 A 0.778 +541 A 0.771 +542 A 0.758 +543 A 0.750 +544 P 0.757 +545 A 0.779 +546 P 0.805 +547 A 0.825 +548 L 0.833 +549 A 0.831 +550 A 0.820 +551 A 0.805 +552 A 0.790 +553 A 0.779 +554 P 0.776 +555 A 0.767 +556 L 0.729 +557 A 0.666 +558 A 0.628 +559 A 0.654 +560 A 0.714 +561 A 0.763 +562 P 0.793 +563 A 0.813 +564 L 0.828 +565 A 0.837 +566 A 0.840 +567 A 0.835 +568 A 0.823 +569 A 0.809 +570 P 0.804 +571 A 0.810 +572 P 0.821 +573 A 0.832 +574 P 0.842 +575 A 0.847 +576 A 0.846 +577 A 0.843 +578 P 0.838 +579 A 0.823 +580 V 0.775 +581 A 0.702 +582 A 0.657 +583 A 0.683 +584 P 0.747 +585 A 0.796 +586 A 0.816 +587 A 0.821 +588 A 0.819 +589 S 0.812 +590 A 0.803 +591 A 0.797 +592 P 0.799 +593 S 0.808 +594 H 0.816 +595 S 0.818 +596 Q 0.817 +597 K 0.818 +598 P 0.821 +599 S 0.827 +600 V 0.838 +601 P 0.851 +602 L 0.863 +603 I 0.868 +604 Q 0.866 +605 A 0.857 +606 S 0.845 +607 R 0.835 +608 P 0.834 +609 C 0.840 +610 P 0.848 +611 A 0.847 +612 A 0.834 +613 Q 0.817 +614 P 0.813 +615 P 0.825 +616 T 0.842 +617 K 0.850 +618 F 0.846 +619 I 0.835 +620 K 0.821 +621 I 0.812 +622 A 0.813 +623 P 0.824 +624 A 0.839 +625 I 0.852 +626 Q 0.860 +627 L 0.863 +628 R 0.863 +629 T 0.860 +630 G 0.856 +631 S 0.852 +632 T 0.849 +633 G 0.848 +634 L 0.849 +635 K 0.852 +636 A 0.852 +637 I 0.849 +638 N 0.846 +639 V 0.841 +640 E 0.837 +641 G 0.834 +642 P 0.837 +643 V 0.846 +644 Q 0.858 +645 G 0.866 +646 A 0.864 +647 Q 0.856 +648 A 0.847 +649 L 0.839 +650 G 0.829 +651 S 0.817 +652 S 0.805 +653 F 0.800 +654 K 0.807 +655 P 0.818 +656 V 0.823 +657 Q 0.820 +658 A 0.814 +659 P 0.813 +660 G 0.820 +661 S 0.825 +662 G 0.825 +663 A 0.819 +664 P 0.813 +665 A 0.814 +666 P 0.821 +667 A 0.827 +668 G 0.825 +669 I 0.804 +670 S 0.754 +671 G 0.687 +672 S 0.653 +673 D 0.683 +674 L 0.741 +675 Q 0.779 +676 S 0.795 +677 S 0.804 +678 G 0.812 +679 G 0.816 +680 P 0.815 +681 L 0.813 +682 P 0.815 +683 D 0.819 +684 A 0.821 +685 R 0.825 +686 P 0.837 +687 G 0.853 +688 A 0.865 +689 V 0.865 +690 Q 0.852 +691 A 0.827 +692 S 0.797 +693 S 0.769 +694 P 0.746 +695 A 0.721 +696 P 0.676 +697 L 0.605 +698 Q 0.526 +699 F 0.465 +700 F 0.445 +701 L 0.469 +702 N 0.510 +703 T 0.530 +704 P 0.523 +705 E 0.506 +706 G 0.494 +707 L 0.495 +708 R 0.517 +709 P 0.555 +710 L 0.598 +711 T 0.636 +712 L 0.665 +713 L 0.687 +714 Q 0.705 +715 V 0.728 +716 P 0.766 +717 Q 0.807 +718 G 0.836 +719 S 0.847 +720 A 0.845 +721 V 0.837 +722 L 0.826 +723 T 0.814 +724 G 0.805 +725 P 0.803 +726 Q 0.806 +727 Q 0.802 +728 Q 0.788 +729 S 0.769 +730 H 0.748 +731 Q 0.722 +732 L 0.687 +733 V 0.657 +734 S 0.651 +735 L 0.668 +736 Q 0.687 +737 Q 0.697 +738 L 0.703 +739 Q 0.708 +740 Q 0.720 +741 P 0.745 +742 T 0.772 +743 A 0.784 +744 A 0.780 +745 H 0.771 +746 P 0.770 +747 P 0.779 +748 Q 0.792 +749 P 0.804 +750 G 0.817 +751 P 0.831 +752 Q 0.844 +753 G 0.856 +754 S 0.865 +755 A 0.871 +756 L 0.873 +757 G 0.868 +758 L 0.857 +759 S 0.845 +760 T 0.834 +761 Q 0.826 +762 G 0.816 +763 Q 0.805 +764 A 0.795 +765 F 0.794 +766 P 0.802 +767 A 0.816 +768 Q 0.827 +769 Q 0.832 +770 L 0.832 +771 L 0.828 +772 K 0.824 +773 V 0.821 +774 N 0.822 +775 P 0.828 +776 T 0.838 +777 R 0.847 +778 A 0.852 +779 R 0.852 +780 S 0.846 +781 G 0.835 +782 L 0.818 +783 Q 0.799 +784 P 0.785 +785 Q 0.781 +786 P 0.786 +787 Q 0.802 +788 P 0.822 +789 A 0.837 +790 V 0.840 +791 L 0.835 +792 S 0.829 +793 L 0.824 +794 L 0.821 +795 G 0.822 +796 S 0.822 +797 A 0.819 +798 Q 0.815 +799 V 0.814 +800 P 0.821 +801 Q 0.831 +802 Q 0.839 +803 G 0.839 +804 V 0.831 +805 Q 0.820 +806 L 0.814 +807 P 0.817 +808 S 0.825 +809 V 0.832 +810 L 0.831 +811 R 0.822 +812 Q 0.808 +813 Q 0.793 +814 Q 0.778 +815 P 0.768 +816 Q 0.764 +817 P 0.765 +818 Q 0.772 +819 P 0.784 +820 P 0.785 +821 K 0.751 +822 L 0.687 +823 Q 0.644 +824 L 0.661 +825 Q 0.707 +826 P 0.727 +827 Q 0.716 +828 W 0.700 +829 Q 0.701 +830 P 0.718 +831 K 0.742 +832 P 0.762 +833 R 0.773 +834 Q 0.776 +835 E 0.775 +836 Q 0.776 +837 P 0.784 +838 Q 0.796 +839 S 0.804 +840 Q 0.803 +841 Q 0.797 +842 Q 0.794 +843 Q 0.798 +844 P 0.810 +845 Q 0.822 +846 H 0.825 +847 I 0.820 +848 Q 0.809 +849 L 0.787 +850 Q 0.739 +851 T 0.673 +852 Q 0.639 +853 Q 0.670 +854 L 0.730 +855 R 0.770 +856 V 0.778 +857 L 0.768 +858 Q 0.757 +859 Q 0.756 +860 P 0.768 +861 Q 0.787 +862 H 0.800 +863 I 0.804 +864 Q 0.800 +865 L 0.794 +866 Q 0.787 +867 T 0.781 +868 Q 0.778 +869 Q 0.779 +870 L 0.780 +871 R 0.775 +872 V 0.764 +873 L 0.751 +874 Q 0.746 +875 Q 0.756 +876 P 0.775 +877 V 0.789 +878 F 0.799 +879 L 0.807 +880 A 0.814 +881 T 0.814 +882 G 0.810 +883 A 0.804 +884 V 0.798 +885 Q 0.788 +886 I 0.771 +887 V 0.750 +888 Q 0.730 +889 P 0.724 +890 H 0.738 +891 P 0.769 +892 G 0.801 +893 V 0.820 +894 Q 0.826 +895 V 0.827 +896 G 0.828 +897 S 0.828 +898 Q 0.827 +899 L 0.820 +900 V 0.808 +901 D 0.792 +902 Q 0.775 +903 R 0.759 +904 K 0.746 +905 E 0.738 +906 G 0.735 +907 K 0.736 +908 P 0.738 +909 T 0.744 +910 P 0.754 +911 P 0.761 +912 A 0.756 +913 P 0.747 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000226288.3_ENST00000641896.1_GN:OR52I2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000226288.3_ENST00000641896.1_GN:OR52I2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..66fcf5ac72317c00fa96933fac27f1637704b9a0 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000226288.3_ENST00000641896.1_GN:OR52I2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,325 @@ +>ENSG00000226288.3|ENST00000641896.1|GN:OR52I2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.393 +2 L 0.412 +3 G 0.445 +4 P 0.479 +5 A 0.501 +6 Y 0.508 +7 N 0.508 +8 H 0.505 +9 T 0.493 +10 M 0.458 +11 E 0.400 +12 T 0.329 +13 P 0.258 +14 A 0.196 +15 S 0.153 +16 F 0.130 +17 L 0.121 +18 L 0.121 +19 V 0.138 +20 G 0.169 +21 I 0.205 +22 P 0.228 +23 G 0.230 +24 L 0.212 +25 Q 0.182 +26 S 0.145 +27 S 0.107 +28 H 0.074 +29 L 0.053 +30 W 0.046 +31 L 0.047 +32 A 0.051 +33 I 0.053 +34 S 0.055 +35 L 0.059 +36 S 0.063 +37 A 0.065 +38 M 0.067 +39 Y 0.071 +40 I 0.072 +41 I 0.067 +42 A 0.058 +43 L 0.050 +44 L 0.048 +45 G 0.054 +46 N 0.062 +47 T 0.066 +48 I 0.064 +49 I 0.055 +50 V 0.045 +51 T 0.039 +52 A 0.038 +53 I 0.039 +54 W 0.044 +55 M 0.055 +56 D 0.072 +57 S 0.089 +58 T 0.100 +59 R 0.100 +60 H 0.090 +61 E 0.073 +62 P 0.054 +63 M 0.040 +64 Y 0.030 +65 C 0.025 +66 F 0.024 +67 L 0.027 +68 C 0.034 +69 V 0.042 +70 L 0.048 +71 A 0.051 +72 A 0.051 +73 V 0.050 +74 D 0.050 +75 I 0.049 +76 V 0.047 +77 M 0.046 +78 A 0.048 +79 S 0.049 +80 S 0.050 +81 V 0.052 +82 V 0.053 +83 P 0.051 +84 K 0.048 +85 M 0.047 +86 V 0.048 +87 S 0.050 +88 I 0.054 +89 F 0.065 +90 C 0.084 +91 S 0.106 +92 G 0.119 +93 D 0.116 +94 S 0.100 +95 S 0.079 +96 I 0.062 +97 S 0.048 +98 F 0.038 +99 S 0.034 +100 A 0.032 +101 C 0.030 +102 F 0.028 +103 T 0.028 +104 Q 0.030 +105 M 0.030 +106 F 0.030 +107 F 0.028 +108 V 0.028 +109 H 0.028 +110 L 0.028 +111 A 0.028 +112 T 0.030 +113 A 0.033 +114 V 0.038 +115 E 0.043 +116 T 0.046 +117 G 0.045 +118 L 0.040 +119 L 0.036 +120 L 0.033 +121 T 0.032 +122 M 0.031 +123 A 0.033 +124 F 0.036 +125 D 0.039 +126 R 0.040 +127 Y 0.039 +128 V 0.038 +129 A 0.039 +130 I 0.043 +131 C 0.048 +132 K 0.053 +133 P 0.056 +134 L 0.057 +135 H 0.057 +136 Y 0.057 +137 K 0.056 +138 R 0.060 +139 I 0.070 +140 L 0.081 +141 T 0.082 +142 P 0.075 +143 Q 0.066 +144 V 0.055 +145 M 0.046 +146 L 0.046 +147 G 0.054 +148 M 0.068 +149 S 0.080 +150 M 0.084 +151 A 0.080 +152 I 0.073 +153 T 0.068 +154 I 0.067 +155 R 0.068 +156 A 0.067 +157 I 0.066 +158 I 0.072 +159 A 0.085 +160 I 0.096 +161 T 0.099 +162 P 0.097 +163 L 0.092 +164 S 0.086 +165 W 0.080 +166 M 0.077 +167 V 0.079 +168 S 0.088 +169 H 0.104 +170 L 0.116 +171 P 0.118 +172 F 0.113 +173 C 0.113 +174 G 0.120 +175 S 0.127 +176 N 0.134 +177 V 0.139 +178 V 0.131 +179 V 0.109 +180 H 0.085 +181 S 0.067 +182 Y 0.057 +183 C 0.053 +184 E 0.057 +185 H 0.069 +186 I 0.083 +187 A 0.096 +188 L 0.105 +189 A 0.112 +190 R 0.117 +191 L 0.117 +192 A 0.111 +193 C 0.111 +194 A 0.122 +195 D 0.136 +196 P 0.140 +197 V 0.130 +198 P 0.112 +199 S 0.097 +200 S 0.087 +201 L 0.081 +202 Y 0.077 +203 S 0.075 +204 L 0.075 +205 I 0.075 +206 G 0.073 +207 S 0.067 +208 S 0.059 +209 L 0.055 +210 M 0.058 +211 V 0.062 +212 G 0.065 +213 S 0.067 +214 D 0.069 +215 V 0.066 +216 A 0.065 +217 F 0.071 +218 I 0.081 +219 A 0.086 +220 A 0.080 +221 S 0.064 +222 Y 0.047 +223 I 0.038 +224 L 0.039 +225 I 0.049 +226 L 0.063 +227 K 0.074 +228 A 0.077 +229 V 0.077 +230 F 0.084 +231 G 0.100 +232 L 0.119 +233 S 0.128 +234 S 0.123 +235 K 0.108 +236 T 0.090 +237 A 0.076 +238 Q 0.065 +239 L 0.059 +240 K 0.058 +241 A 0.060 +242 L 0.063 +243 S 0.067 +244 T 0.072 +245 C 0.077 +246 G 0.081 +247 S 0.081 +248 H 0.077 +249 V 0.071 +250 G 0.066 +251 V 0.061 +252 M 0.052 +253 A 0.039 +254 L 0.028 +255 Y 0.022 +256 Y 0.021 +257 L 0.024 +258 P 0.028 +259 G 0.030 +260 M 0.030 +261 A 0.029 +262 S 0.026 +263 I 0.025 +264 Y 0.027 +265 A 0.032 +266 A 0.039 +267 W 0.053 +268 L 0.075 +269 G 0.105 +270 Q 0.131 +271 D 0.146 +272 V 0.146 +273 V 0.132 +274 P 0.110 +275 L 0.088 +276 H 0.070 +277 T 0.058 +278 Q 0.053 +279 V 0.054 +280 L 0.059 +281 L 0.061 +282 A 0.058 +283 D 0.052 +284 L 0.050 +285 Y 0.054 +286 V 0.063 +287 I 0.073 +288 I 0.078 +289 P 0.077 +290 A 0.072 +291 T 0.068 +292 L 0.067 +293 N 0.067 +294 P 0.067 +295 I 0.067 +296 I 0.068 +297 Y 0.067 +298 G 0.069 +299 M 0.077 +300 R 0.084 +301 T 0.080 +302 K 0.066 +303 Q 0.055 +304 L 0.053 +305 R 0.061 +306 E 0.068 +307 R 0.068 +308 I 0.067 +309 W 0.071 +310 S 0.076 +311 Y 0.074 +312 L 0.069 +313 M 0.072 +314 H 0.087 +315 V 0.110 +316 L 0.140 +317 F 0.182 +318 D 0.238 +319 H 0.303 +320 S 0.366 +321 N 0.420 +322 L 0.452 +323 G 0.450 +324 S 0.431 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000226288.3_ENST00000641896.1_GN:OR52I2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000226288.3_ENST00000641896.1_GN:OR52I2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1d4f40c0247527b571784c8451e7a53176abb4be --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000226288.3_ENST00000641896.1_GN:OR52I2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid @@ -0,0 +1,332 @@ +>ENSG00000226288.3|ENST00000641896.1|GN:OR52I2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:7 +1 M 0.304 +2 K 0.313 +3 K 0.330 +4 V 0.348 +5 S 0.359 +6 L 0.365 +7 V 0.373 +8 M 0.383 +9 L 0.398 +10 G 0.419 +11 P 0.443 +12 A 0.464 +13 Y 0.474 +14 N 0.480 +15 H 0.483 +16 T 0.476 +17 M 0.447 +18 E 0.395 +19 T 0.331 +20 P 0.263 +21 A 0.201 +22 S 0.155 +23 F 0.129 +24 L 0.117 +25 L 0.116 +26 V 0.132 +27 G 0.165 +28 I 0.201 +29 P 0.224 +30 G 0.227 +31 L 0.209 +32 Q 0.180 +33 S 0.144 +34 S 0.105 +35 H 0.073 +36 L 0.052 +37 W 0.045 +38 L 0.047 +39 A 0.051 +40 I 0.053 +41 S 0.055 +42 L 0.059 +43 S 0.063 +44 A 0.065 +45 M 0.066 +46 Y 0.068 +47 I 0.069 +48 I 0.064 +49 A 0.057 +50 L 0.050 +51 L 0.049 +52 G 0.054 +53 N 0.062 +54 T 0.066 +55 I 0.064 +56 I 0.055 +57 V 0.045 +58 T 0.039 +59 A 0.037 +60 I 0.038 +61 W 0.043 +62 M 0.054 +63 D 0.070 +64 S 0.086 +65 T 0.097 +66 R 0.097 +67 H 0.087 +68 E 0.071 +69 P 0.053 +70 M 0.039 +71 Y 0.030 +72 C 0.025 +73 F 0.024 +74 L 0.026 +75 C 0.034 +76 V 0.042 +77 L 0.049 +78 A 0.051 +79 A 0.051 +80 V 0.050 +81 D 0.049 +82 I 0.048 +83 V 0.047 +84 M 0.046 +85 A 0.047 +86 S 0.049 +87 S 0.050 +88 V 0.051 +89 V 0.051 +90 P 0.049 +91 K 0.046 +92 M 0.045 +93 V 0.045 +94 S 0.047 +95 I 0.052 +96 F 0.062 +97 C 0.081 +98 S 0.103 +99 G 0.117 +100 D 0.114 +101 S 0.098 +102 S 0.078 +103 I 0.061 +104 S 0.047 +105 F 0.037 +106 S 0.033 +107 A 0.031 +108 C 0.030 +109 F 0.028 +110 T 0.028 +111 Q 0.030 +112 M 0.030 +113 F 0.030 +114 F 0.028 +115 V 0.028 +116 H 0.028 +117 L 0.028 +118 A 0.029 +119 T 0.030 +120 A 0.033 +121 V 0.038 +122 E 0.043 +123 T 0.046 +124 G 0.045 +125 L 0.040 +126 L 0.036 +127 L 0.033 +128 T 0.031 +129 M 0.031 +130 A 0.033 +131 F 0.036 +132 D 0.039 +133 R 0.040 +134 Y 0.039 +135 V 0.038 +136 A 0.039 +137 I 0.043 +138 C 0.048 +139 K 0.053 +140 P 0.057 +141 L 0.058 +142 H 0.058 +143 Y 0.057 +144 K 0.056 +145 R 0.060 +146 I 0.071 +147 L 0.082 +148 T 0.083 +149 P 0.077 +150 Q 0.068 +151 V 0.057 +152 M 0.047 +153 L 0.046 +154 G 0.055 +155 M 0.068 +156 S 0.080 +157 M 0.085 +158 A 0.080 +159 I 0.073 +160 T 0.068 +161 I 0.067 +162 R 0.068 +163 A 0.067 +164 I 0.067 +165 I 0.072 +166 A 0.085 +167 I 0.096 +168 T 0.099 +169 P 0.097 +170 L 0.093 +171 S 0.086 +172 W 0.080 +173 M 0.077 +174 V 0.079 +175 S 0.088 +176 H 0.103 +177 L 0.116 +178 P 0.118 +179 F 0.113 +180 C 0.113 +181 G 0.119 +182 S 0.126 +183 N 0.133 +184 V 0.137 +185 V 0.130 +186 V 0.109 +187 H 0.084 +188 S 0.067 +189 Y 0.057 +190 C 0.053 +191 E 0.058 +192 H 0.069 +193 I 0.083 +194 A 0.095 +195 L 0.104 +196 A 0.111 +197 R 0.116 +198 L 0.115 +199 A 0.110 +200 C 0.109 +201 A 0.120 +202 D 0.134 +203 P 0.138 +204 V 0.129 +205 P 0.111 +206 S 0.095 +207 S 0.083 +208 L 0.077 +209 Y 0.074 +210 S 0.073 +211 L 0.074 +212 I 0.075 +213 G 0.073 +214 S 0.068 +215 S 0.060 +216 L 0.056 +217 M 0.058 +218 V 0.062 +219 G 0.065 +220 S 0.068 +221 D 0.069 +222 V 0.067 +223 A 0.065 +224 F 0.072 +225 I 0.082 +226 A 0.086 +227 A 0.080 +228 S 0.064 +229 Y 0.047 +230 I 0.038 +231 L 0.039 +232 I 0.049 +233 L 0.063 +234 K 0.074 +235 A 0.078 +236 V 0.077 +237 F 0.083 +238 G 0.099 +239 L 0.117 +240 S 0.127 +241 S 0.122 +242 K 0.107 +243 T 0.090 +244 A 0.076 +245 Q 0.065 +246 L 0.059 +247 K 0.059 +248 A 0.061 +249 L 0.064 +250 S 0.067 +251 T 0.072 +252 C 0.077 +253 G 0.081 +254 S 0.081 +255 H 0.077 +256 V 0.071 +257 G 0.067 +258 V 0.062 +259 M 0.052 +260 A 0.040 +261 L 0.029 +262 Y 0.022 +263 Y 0.022 +264 L 0.024 +265 P 0.028 +266 G 0.030 +267 M 0.031 +268 A 0.029 +269 S 0.026 +270 I 0.025 +271 Y 0.027 +272 A 0.031 +273 A 0.038 +274 W 0.051 +275 L 0.075 +276 G 0.105 +277 Q 0.133 +278 D 0.148 +279 V 0.147 +280 V 0.133 +281 P 0.111 +282 L 0.089 +283 H 0.071 +284 T 0.059 +285 Q 0.053 +286 V 0.055 +287 L 0.060 +288 L 0.062 +289 A 0.059 +290 D 0.053 +291 L 0.051 +292 Y 0.055 +293 V 0.064 +294 I 0.074 +295 I 0.079 +296 P 0.078 +297 A 0.073 +298 T 0.069 +299 L 0.068 +300 N 0.068 +301 P 0.068 +302 I 0.068 +303 I 0.069 +304 Y 0.068 +305 G 0.069 +306 M 0.077 +307 R 0.084 +308 T 0.080 +309 K 0.067 +310 Q 0.055 +311 L 0.053 +312 R 0.060 +313 E 0.068 +314 R 0.068 +315 I 0.066 +316 W 0.071 +317 S 0.075 +318 Y 0.073 +319 L 0.069 +320 M 0.072 +321 H 0.087 +322 V 0.111 +323 L 0.142 +324 F 0.183 +325 D 0.240 +326 H 0.306 +327 S 0.370 +328 N 0.424 +329 L 0.456 +330 G 0.453 +331 S 0.434 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000228716.8_ENST00000439211.7_GN:DHFR_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000228716.8_ENST00000439211.7_GN:DHFR_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9b80374a8883dd895a955af4e1543183f4f184e0 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000228716.8_ENST00000439211.7_GN:DHFR_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,188 @@ +>ENSG00000228716.8|ENST00000439211.7|GN:DHFR|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.294 +2 V 0.261 +3 G 0.202 +4 S 0.137 +5 L 0.086 +6 N 0.059 +7 C 0.050 +8 I 0.049 +9 V 0.051 +10 A 0.053 +11 V 0.057 +12 S 0.067 +13 Q 0.090 +14 N 0.122 +15 M 0.157 +16 G 0.182 +17 I 0.188 +18 G 0.182 +19 K 0.179 +20 N 0.184 +21 G 0.190 +22 D 0.183 +23 L 0.162 +24 P 0.141 +25 W 0.132 +26 P 0.127 +27 P 0.112 +28 L 0.086 +29 R 0.060 +30 N 0.048 +31 E 0.052 +32 F 0.064 +33 R 0.073 +34 Y 0.071 +35 F 0.068 +36 Q 0.070 +37 R 0.076 +38 M 0.086 +39 T 0.098 +40 T 0.112 +41 T 0.128 +42 S 0.145 +43 S 0.161 +44 V 0.171 +45 E 0.176 +46 G 0.179 +47 K 0.175 +48 Q 0.160 +49 N 0.138 +50 L 0.120 +51 V 0.110 +52 I 0.104 +53 M 0.094 +54 G 0.085 +55 K 0.087 +56 K 0.099 +57 T 0.110 +58 W 0.110 +59 F 0.109 +60 S 0.117 +61 I 0.126 +62 P 0.124 +63 E 0.114 +64 K 0.104 +65 N 0.099 +66 R 0.101 +67 P 0.110 +68 L 0.122 +69 K 0.128 +70 G 0.126 +71 R 0.112 +72 I 0.092 +73 N 0.075 +74 L 0.068 +75 V 0.066 +76 L 0.063 +77 S 0.061 +78 R 0.062 +79 E 0.064 +80 L 0.070 +81 K 0.083 +82 E 0.099 +83 P 0.109 +84 P 0.105 +85 Q 0.094 +86 G 0.086 +87 A 0.081 +88 H 0.076 +89 F 0.069 +90 L 0.064 +91 S 0.059 +92 R 0.052 +93 S 0.044 +94 L 0.038 +95 D 0.036 +96 D 0.037 +97 A 0.045 +98 L 0.058 +99 K 0.068 +100 L 0.067 +101 T 0.061 +102 E 0.059 +103 Q 0.062 +104 P 0.065 +105 E 0.065 +106 L 0.062 +107 A 0.061 +108 N 0.064 +109 K 0.070 +110 V 0.073 +111 D 0.069 +112 M 0.061 +113 V 0.053 +114 W 0.046 +115 I 0.040 +116 V 0.037 +117 G 0.042 +118 G 0.056 +119 S 0.071 +120 S 0.078 +121 V 0.076 +122 Y 0.069 +123 K 0.064 +124 E 0.064 +125 A 0.067 +126 M 0.069 +127 N 0.074 +128 H 0.083 +129 P 0.091 +130 G 0.093 +131 H 0.084 +132 L 0.068 +133 K 0.051 +134 L 0.041 +135 F 0.037 +136 V 0.036 +137 T 0.036 +138 R 0.037 +139 I 0.040 +140 M 0.045 +141 Q 0.053 +142 D 0.059 +143 F 0.062 +144 E 0.061 +145 S 0.061 +146 D 0.065 +147 T 0.070 +148 F 0.075 +149 F 0.081 +150 P 0.087 +151 E 0.088 +152 I 0.082 +153 D 0.075 +154 L 0.072 +155 E 0.069 +156 K 0.062 +157 Y 0.055 +158 K 0.056 +159 L 0.065 +160 L 0.079 +161 P 0.093 +162 E 0.107 +163 Y 0.119 +164 P 0.132 +165 G 0.143 +166 V 0.145 +167 L 0.137 +168 S 0.121 +169 D 0.101 +170 V 0.084 +171 Q 0.072 +172 E 0.067 +173 E 0.070 +174 K 0.079 +175 G 0.090 +176 I 0.094 +177 K 0.085 +178 Y 0.069 +179 K 0.053 +180 F 0.044 +181 E 0.041 +182 V 0.042 +183 Y 0.049 +184 E 0.067 +185 K 0.098 +186 N 0.137 +187 D 0.164 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000228716.8_ENST00000439211.7_GN:DHFR_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:80.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000228716.8_ENST00000439211.7_GN:DHFR_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:80.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b96efc5e6aeb6e3b9887786c2e5ce4f6487032d2 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000228716.8_ENST00000439211.7_GN:DHFR_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:80.caid @@ -0,0 +1,268 @@ +>ENSG00000228716.8|ENST00000439211.7|GN:DHFR|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:80 +1 M 0.456 +2 A 0.484 +3 G 0.525 +4 Q 0.555 +5 G 0.555 +6 W 0.544 +7 Q 0.554 +8 P 0.585 +9 G 0.609 +10 G 0.604 +11 R 0.565 +12 A 0.506 +13 W 0.460 +14 R 0.463 +15 G 0.506 +16 A 0.530 +17 R 0.512 +18 A 0.499 +19 R 0.526 +20 G 0.556 +21 R 0.555 +22 S 0.556 +23 S 0.589 +24 Q 0.618 +25 A 0.607 +26 S 0.598 +27 A 0.634 +28 G 0.689 +29 A 0.714 +30 S 0.704 +31 T 0.683 +32 P 0.673 +33 R 0.676 +34 P 0.674 +35 C 0.648 +36 V 0.603 +37 R 0.586 +38 R 0.627 +39 G 0.695 +40 G 0.737 +41 G 0.741 +42 A 0.724 +43 G 0.705 +44 P 0.691 +45 R 0.683 +46 L 0.676 +47 H 0.673 +48 K 0.676 +49 W 0.687 +50 G 0.704 +51 R 0.720 +52 G 0.736 +53 G 0.748 +54 R 0.750 +55 G 0.743 +56 G 0.729 +57 H 0.707 +58 N 0.683 +59 F 0.668 +60 A 0.670 +61 P 0.684 +62 N 0.703 +63 L 0.726 +64 T 0.753 +65 A 0.777 +66 R 0.794 +67 S 0.807 +68 A 0.818 +69 V 0.821 +70 T 0.817 +71 S 0.808 +72 G 0.793 +73 L 0.766 +74 G 0.734 +75 G 0.712 +76 P 0.713 +77 P 0.727 +78 A 0.726 +79 A 0.683 +80 V 0.593 +81 M 0.469 +82 V 0.335 +83 G 0.216 +84 S 0.127 +85 L 0.074 +86 N 0.051 +87 C 0.045 +88 I 0.045 +89 V 0.047 +90 A 0.050 +91 V 0.054 +92 S 0.065 +93 Q 0.086 +94 N 0.120 +95 M 0.156 +96 G 0.181 +97 I 0.187 +98 G 0.180 +99 K 0.177 +100 N 0.182 +101 G 0.187 +102 D 0.177 +103 L 0.154 +104 P 0.131 +105 W 0.119 +106 P 0.114 +107 P 0.100 +108 L 0.076 +109 R 0.053 +110 N 0.041 +111 E 0.040 +112 F 0.044 +113 R 0.048 +114 Y 0.052 +115 F 0.057 +116 Q 0.066 +117 R 0.075 +118 M 0.085 +119 T 0.098 +120 T 0.114 +121 T 0.129 +122 S 0.141 +123 S 0.151 +124 V 0.157 +125 E 0.161 +126 G 0.165 +127 K 0.163 +128 Q 0.150 +129 N 0.130 +130 L 0.114 +131 V 0.107 +132 I 0.102 +133 M 0.094 +134 G 0.085 +135 K 0.085 +136 K 0.098 +137 T 0.111 +138 W 0.112 +139 F 0.109 +140 S 0.114 +141 I 0.122 +142 P 0.119 +143 E 0.110 +144 K 0.101 +145 N 0.099 +146 R 0.102 +147 P 0.109 +148 L 0.118 +149 K 0.125 +150 G 0.125 +151 R 0.114 +152 I 0.095 +153 N 0.077 +154 L 0.069 +155 V 0.067 +156 L 0.065 +157 S 0.063 +158 R 0.064 +159 E 0.068 +160 L 0.076 +161 K 0.090 +162 E 0.108 +163 P 0.118 +164 P 0.113 +165 Q 0.101 +166 G 0.094 +167 A 0.089 +168 H 0.082 +169 F 0.073 +170 L 0.067 +171 S 0.062 +172 R 0.054 +173 S 0.045 +174 L 0.038 +175 D 0.035 +176 D 0.037 +177 A 0.045 +178 L 0.057 +179 K 0.066 +180 L 0.064 +181 T 0.058 +182 E 0.056 +183 Q 0.059 +184 P 0.063 +185 E 0.064 +186 L 0.061 +187 A 0.060 +188 N 0.066 +189 K 0.076 +190 V 0.080 +191 D 0.074 +192 M 0.063 +193 V 0.054 +194 W 0.046 +195 I 0.039 +196 V 0.037 +197 G 0.042 +198 G 0.056 +199 S 0.072 +200 S 0.079 +201 V 0.077 +202 Y 0.069 +203 K 0.063 +204 E 0.061 +205 A 0.063 +206 M 0.065 +207 N 0.069 +208 H 0.075 +209 P 0.081 +210 G 0.081 +211 H 0.073 +212 L 0.059 +213 K 0.046 +214 L 0.039 +215 F 0.037 +216 V 0.036 +217 T 0.035 +218 R 0.035 +219 I 0.037 +220 M 0.041 +221 Q 0.046 +222 D 0.050 +223 F 0.052 +224 E 0.052 +225 S 0.053 +226 D 0.057 +227 T 0.063 +228 F 0.068 +229 F 0.074 +230 P 0.079 +231 E 0.079 +232 I 0.072 +233 D 0.062 +234 L 0.053 +235 E 0.048 +236 K 0.046 +237 Y 0.046 +238 K 0.051 +239 L 0.061 +240 L 0.073 +241 P 0.084 +242 E 0.094 +243 Y 0.105 +244 P 0.118 +245 G 0.129 +246 V 0.134 +247 L 0.128 +248 S 0.114 +249 D 0.097 +250 V 0.080 +251 Q 0.069 +252 E 0.064 +253 E 0.067 +254 K 0.077 +255 G 0.091 +256 I 0.097 +257 K 0.089 +258 Y 0.072 +259 K 0.056 +260 F 0.046 +261 E 0.042 +262 V 0.044 +263 Y 0.051 +264 E 0.068 +265 K 0.100 +266 N 0.140 +267 D 0.169 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000235387.6_ENST00000443779.3_GN:SPAAR_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000235387.6_ENST00000443779.3_GN:SPAAR_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a2393bab3b719a1fbef5a095c9ecf8d0b74e1411 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000235387.6_ENST00000443779.3_GN:SPAAR_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,76 @@ +>ENSG00000235387.6|ENST00000443779.3|GN:SPAAR|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.242 +2 E 0.218 +3 T 0.180 +4 A 0.143 +5 V 0.115 +6 I 0.097 +7 G 0.089 +8 V 0.091 +9 V 0.096 +10 V 0.100 +11 V 0.096 +12 L 0.088 +13 F 0.079 +14 V 0.073 +15 V 0.073 +16 T 0.080 +17 V 0.085 +18 A 0.085 +19 I 0.085 +20 T 0.084 +21 C 0.079 +22 V 0.075 +23 L 0.077 +24 C 0.090 +25 C 0.117 +26 F 0.166 +27 S 0.239 +28 C 0.327 +29 D 0.419 +30 S 0.505 +31 R 0.576 +32 A 0.627 +33 Q 0.657 +34 D 0.675 +35 P 0.690 +36 Q 0.701 +37 G 0.708 +38 G 0.715 +39 P 0.727 +40 G 0.738 +41 R 0.736 +42 S 0.721 +43 F 0.700 +44 T 0.673 +45 V 0.643 +46 A 0.626 +47 T 0.632 +48 F 0.648 +49 R 0.659 +50 Q 0.671 +51 E 0.683 +52 A 0.689 +53 S 0.688 +54 L 0.685 +55 F 0.682 +56 T 0.686 +57 G 0.701 +58 P 0.729 +59 V 0.758 +60 R 0.772 +61 H 0.765 +62 A 0.744 +63 Q 0.719 +64 P 0.703 +65 V 0.695 +66 P 0.681 +67 S 0.648 +68 A 0.601 +69 Q 0.550 +70 D 0.499 +71 F 0.447 +72 W 0.397 +73 T 0.356 +74 F 0.322 +75 M 0.300 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000235387.6_ENST00000443779.3_GN:SPAAR_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000235387.6_ENST00000443779.3_GN:SPAAR_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a760063826113d15ef72e35155038d466ac11508 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000235387.6_ENST00000443779.3_GN:SPAAR_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid @@ -0,0 +1,91 @@ +>ENSG00000235387.6|ENST00000443779.3|GN:SPAAR|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:15 +1 M 0.520 +2 G 0.547 +3 A 0.580 +4 K 0.600 +5 A 0.606 +6 P 0.606 +7 R 0.600 +8 G 0.576 +9 P 0.527 +10 K 0.460 +11 V 0.392 +12 A 0.336 +13 Q 0.292 +14 W 0.260 +15 A 0.241 +16 M 0.229 +17 E 0.209 +18 T 0.181 +19 A 0.154 +20 V 0.135 +21 I 0.125 +22 G 0.117 +23 V 0.105 +24 V 0.091 +25 V 0.083 +26 V 0.084 +27 L 0.088 +28 F 0.091 +29 V 0.091 +30 V 0.094 +31 T 0.098 +32 V 0.100 +33 A 0.099 +34 I 0.097 +35 T 0.092 +36 C 0.085 +37 V 0.079 +38 L 0.081 +39 C 0.093 +40 C 0.119 +41 F 0.168 +42 S 0.244 +43 C 0.336 +44 D 0.427 +45 S 0.508 +46 R 0.577 +47 A 0.627 +48 Q 0.658 +49 D 0.677 +50 P 0.692 +51 Q 0.703 +52 G 0.710 +53 G 0.717 +54 P 0.731 +55 G 0.744 +56 R 0.742 +57 S 0.727 +58 F 0.709 +59 T 0.688 +60 V 0.661 +61 A 0.641 +62 T 0.643 +63 F 0.653 +64 R 0.660 +65 Q 0.664 +66 E 0.669 +67 A 0.671 +68 S 0.670 +69 L 0.670 +70 F 0.673 +71 T 0.680 +72 G 0.697 +73 P 0.727 +74 V 0.757 +75 R 0.771 +76 H 0.765 +77 A 0.745 +78 Q 0.722 +79 P 0.706 +80 V 0.697 +81 P 0.679 +82 S 0.640 +83 A 0.584 +84 Q 0.527 +85 D 0.477 +86 F 0.431 +87 W 0.391 +88 T 0.359 +89 F 0.333 +90 M 0.315 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000237651.8_ENST00000432605.3_GN:C2orf74_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000237651.8_ENST00000432605.3_GN:C2orf74_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7dd31ab22bc057f38f3e73d950c1c6e528d3c137 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000237651.8_ENST00000432605.3_GN:C2orf74_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,188 @@ +>ENSG00000237651.8|ENST00000432605.3|GN:C2orf74|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.333 +2 S 0.311 +3 F 0.275 +4 E 0.232 +5 T 0.185 +6 T 0.144 +7 A 0.119 +8 I 0.112 +9 T 0.114 +10 F 0.118 +11 F 0.126 +12 I 0.133 +13 I 0.132 +14 L 0.120 +15 L 0.106 +16 I 0.100 +17 C 0.102 +18 L 0.111 +19 I 0.121 +20 C 0.130 +21 I 0.134 +22 L 0.133 +23 L 0.129 +24 L 0.121 +25 L 0.106 +26 V 0.087 +27 V 0.073 +28 F 0.068 +29 L 0.071 +30 Y 0.082 +31 K 0.101 +32 C 0.131 +33 F 0.177 +34 Q 0.240 +35 G 0.316 +36 R 0.401 +37 K 0.493 +38 G 0.578 +39 K 0.642 +40 E 0.680 +41 T 0.702 +42 K 0.716 +43 K 0.728 +44 V 0.742 +45 P 0.760 +46 C 0.778 +47 T 0.794 +48 D 0.804 +49 A 0.809 +50 N 0.812 +51 G 0.816 +52 G 0.818 +53 V 0.813 +54 D 0.803 +55 C 0.797 +56 A 0.802 +57 A 0.816 +58 A 0.831 +59 K 0.838 +60 V 0.831 +61 V 0.807 +62 T 0.761 +63 S 0.699 +64 N 0.635 +65 P 0.587 +66 E 0.572 +67 D 0.589 +68 H 0.618 +69 E 0.637 +70 R 0.649 +71 I 0.671 +72 L 0.691 +73 M 0.697 +74 Q 0.699 +75 V 0.704 +76 M 0.704 +77 N 0.697 +78 L 0.690 +79 N 0.692 +80 V 0.706 +81 P 0.730 +82 M 0.758 +83 R 0.787 +84 P 0.815 +85 G 0.839 +86 I 0.854 +87 L 0.857 +88 V 0.850 +89 Q 0.842 +90 R 0.836 +91 Q 0.835 +92 S 0.836 +93 K 0.841 +94 E 0.848 +95 V 0.850 +96 L 0.840 +97 A 0.820 +98 T 0.801 +99 P 0.794 +100 L 0.801 +101 E 0.810 +102 N 0.814 +103 R 0.810 +104 R 0.806 +105 D 0.803 +106 M 0.801 +107 E 0.792 +108 A 0.775 +109 E 0.764 +110 E 0.767 +111 E 0.775 +112 N 0.781 +113 Q 0.786 +114 I 0.793 +115 N 0.793 +116 E 0.782 +117 K 0.765 +118 Q 0.751 +119 E 0.751 +120 P 0.769 +121 E 0.797 +122 N 0.820 +123 A 0.832 +124 G 0.835 +125 E 0.838 +126 T 0.839 +127 G 0.837 +128 Q 0.830 +129 E 0.822 +130 E 0.814 +131 D 0.808 +132 D 0.805 +133 G 0.807 +134 L 0.814 +135 Q 0.824 +136 K 0.835 +137 I 0.842 +138 H 0.849 +139 T 0.857 +140 S 0.861 +141 V 0.856 +142 T 0.844 +143 R 0.830 +144 T 0.828 +145 P 0.841 +146 S 0.859 +147 V 0.871 +148 V 0.867 +149 E 0.850 +150 S 0.824 +151 Q 0.794 +152 K 0.768 +153 R 0.759 +154 P 0.773 +155 L 0.800 +156 K 0.823 +157 G 0.828 +158 V 0.822 +159 T 0.814 +160 F 0.802 +161 S 0.781 +162 R 0.761 +163 E 0.758 +164 V 0.770 +165 I 0.781 +166 V 0.778 +167 V 0.764 +168 D 0.748 +169 L 0.736 +170 G 0.729 +171 N 0.720 +172 E 0.706 +173 Y 0.686 +174 P 0.668 +175 T 0.671 +176 P 0.699 +177 R 0.736 +178 S 0.757 +179 Y 0.755 +180 T 0.741 +181 R 0.726 +182 E 0.713 +183 H 0.696 +184 K 0.665 +185 E 0.618 +186 R 0.560 +187 K 0.515 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000237651.8_ENST00000432605.3_GN:C2orf74_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000237651.8_ENST00000432605.3_GN:C2orf74_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f68f3d1686863e14e60e8ae001c9e9856b4507f0 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000237651.8_ENST00000432605.3_GN:C2orf74_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid @@ -0,0 +1,195 @@ +>ENSG00000237651.8|ENST00000432605.3|GN:C2orf74|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:7 +1 M 0.490 +2 S 0.518 +3 L 0.562 +4 L 0.600 +5 A 0.619 +6 K 0.616 +7 P 0.599 +8 M 0.563 +9 S 0.497 +10 F 0.407 +11 E 0.316 +12 T 0.241 +13 T 0.184 +14 A 0.144 +15 I 0.120 +16 T 0.111 +17 F 0.116 +18 F 0.127 +19 I 0.137 +20 I 0.134 +21 L 0.122 +22 L 0.109 +23 I 0.105 +24 C 0.109 +25 L 0.118 +26 I 0.129 +27 C 0.138 +28 I 0.141 +29 L 0.139 +30 L 0.133 +31 L 0.123 +32 L 0.106 +33 V 0.085 +34 V 0.070 +35 F 0.064 +36 L 0.067 +37 Y 0.079 +38 K 0.098 +39 C 0.128 +40 F 0.172 +41 Q 0.235 +42 G 0.311 +43 R 0.397 +44 K 0.490 +45 G 0.579 +46 K 0.645 +47 E 0.684 +48 T 0.706 +49 K 0.720 +50 K 0.732 +51 V 0.748 +52 P 0.767 +53 C 0.786 +54 T 0.803 +55 D 0.813 +56 A 0.818 +57 N 0.822 +58 G 0.826 +59 G 0.828 +60 V 0.823 +61 D 0.813 +62 C 0.807 +63 A 0.811 +64 A 0.825 +65 A 0.838 +66 K 0.845 +67 V 0.838 +68 V 0.813 +69 T 0.767 +70 S 0.707 +71 N 0.647 +72 P 0.603 +73 E 0.590 +74 D 0.606 +75 H 0.633 +76 E 0.649 +77 R 0.659 +78 I 0.679 +79 L 0.701 +80 M 0.710 +81 Q 0.714 +82 V 0.718 +83 M 0.716 +84 N 0.708 +85 L 0.702 +86 N 0.703 +87 V 0.717 +88 P 0.740 +89 M 0.767 +90 R 0.794 +91 P 0.822 +92 G 0.845 +93 I 0.858 +94 L 0.860 +95 V 0.854 +96 Q 0.845 +97 R 0.839 +98 Q 0.838 +99 S 0.839 +100 K 0.843 +101 E 0.849 +102 V 0.849 +103 L 0.838 +104 A 0.817 +105 T 0.797 +106 P 0.790 +107 L 0.797 +108 E 0.807 +109 N 0.811 +110 R 0.807 +111 R 0.802 +112 D 0.797 +113 M 0.781 +114 E 0.739 +115 A 0.676 +116 E 0.638 +117 E 0.649 +118 E 0.664 +119 N 0.647 +120 Q 0.637 +121 I 0.676 +122 N 0.734 +123 E 0.765 +124 K 0.764 +125 Q 0.755 +126 E 0.755 +127 P 0.773 +128 E 0.801 +129 N 0.824 +130 A 0.836 +131 G 0.839 +132 E 0.841 +133 T 0.843 +134 G 0.840 +135 Q 0.834 +136 E 0.827 +137 E 0.819 +138 D 0.813 +139 D 0.809 +140 G 0.811 +141 L 0.817 +142 Q 0.827 +143 K 0.838 +144 I 0.845 +145 H 0.852 +146 T 0.859 +147 S 0.862 +148 V 0.858 +149 T 0.845 +150 R 0.832 +151 T 0.829 +152 P 0.841 +153 S 0.860 +154 V 0.871 +155 V 0.868 +156 E 0.851 +157 S 0.825 +158 Q 0.795 +159 K 0.769 +160 R 0.760 +161 P 0.773 +162 L 0.800 +163 K 0.823 +164 G 0.828 +165 V 0.822 +166 T 0.814 +167 F 0.801 +168 S 0.779 +169 R 0.759 +170 E 0.756 +171 V 0.769 +172 I 0.779 +173 V 0.777 +174 V 0.763 +175 D 0.749 +176 L 0.739 +177 G 0.732 +178 N 0.724 +179 E 0.710 +180 Y 0.688 +181 P 0.669 +182 T 0.671 +183 P 0.700 +184 R 0.737 +185 S 0.758 +186 Y 0.757 +187 T 0.742 +188 R 0.727 +189 E 0.714 +190 H 0.698 +191 K 0.670 +192 E 0.626 +193 R 0.570 +194 K 0.526 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000241563.4_ENST00000377049.4_GN:CORT_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000241563.4_ENST00000377049.4_GN:CORT_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9afcd7faeff76a67fa74725bb1de246e7d97f399 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000241563.4_ENST00000377049.4_GN:CORT_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,106 @@ +>ENSG00000241563.4|ENST00000377049.4|GN:CORT|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.384 +2 P 0.368 +3 L 0.339 +4 S 0.304 +5 P 0.271 +6 G 0.237 +7 L 0.202 +8 L 0.178 +9 L 0.178 +10 L 0.211 +11 L 0.288 +12 L 0.407 +13 S 0.542 +14 G 0.655 +15 A 0.726 +16 T 0.759 +17 A 0.769 +18 T 0.770 +19 A 0.762 +20 A 0.748 +21 L 0.738 +22 P 0.744 +23 L 0.762 +24 E 0.773 +25 G 0.768 +26 G 0.760 +27 P 0.763 +28 T 0.775 +29 G 0.781 +30 R 0.775 +31 D 0.758 +32 S 0.739 +33 E 0.727 +34 H 0.728 +35 M 0.740 +36 Q 0.752 +37 E 0.757 +38 A 0.752 +39 A 0.740 +40 G 0.725 +41 I 0.704 +42 R 0.672 +43 K 0.624 +44 S 0.551 +45 S 0.450 +46 L 0.345 +47 L 0.279 +48 T 0.266 +49 F 0.273 +50 L 0.266 +51 A 0.245 +52 W 0.229 +53 W 0.223 +54 F 0.226 +55 E 0.247 +56 W 0.297 +57 T 0.378 +58 S 0.479 +59 Q 0.578 +60 A 0.653 +61 S 0.694 +62 A 0.706 +63 G 0.712 +64 P 0.725 +65 L 0.732 +66 I 0.718 +67 G 0.686 +68 E 0.646 +69 E 0.594 +70 A 0.541 +71 R 0.519 +72 E 0.536 +73 V 0.559 +74 A 0.564 +75 R 0.570 +76 R 0.601 +77 Q 0.649 +78 E 0.685 +79 G 0.694 +80 A 0.691 +81 P 0.695 +82 P 0.714 +83 Q 0.738 +84 Q 0.751 +85 S 0.738 +86 A 0.706 +87 R 0.676 +88 R 0.661 +89 D 0.652 +90 R 0.634 +91 M 0.605 +92 P 0.564 +93 C 0.511 +94 R 0.462 +95 N 0.439 +96 F 0.446 +97 F 0.451 +98 W 0.435 +99 K 0.420 +100 T 0.425 +101 F 0.437 +102 S 0.431 +103 S 0.395 +104 C 0.342 +105 K 0.303 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000241563.4_ENST00000377049.4_GN:CORT_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:50.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000241563.4_ENST00000377049.4_GN:CORT_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:50.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..03a2605b211f0c571d7b408584d47d4b3ed08e98 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000241563.4_ENST00000377049.4_GN:CORT_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:50.caid @@ -0,0 +1,156 @@ +>ENSG00000241563.4|ENST00000377049.4|GN:CORT|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:50 +1 M 0.455 +2 Y 0.493 +3 R 0.550 +4 H 0.607 +5 K 0.650 +6 N 0.672 +7 S 0.682 +8 W 0.698 +9 R 0.724 +10 L 0.747 +11 G 0.755 +12 L 0.746 +13 K 0.726 +14 Y 0.711 +15 P 0.720 +16 P 0.755 +17 S 0.796 +18 S 0.820 +19 K 0.826 +20 E 0.824 +21 E 0.820 +22 T 0.812 +23 Q 0.801 +24 V 0.798 +25 P 0.810 +26 K 0.832 +27 T 0.851 +28 L 0.861 +29 I 0.858 +30 S 0.846 +31 G 0.832 +32 L 0.823 +33 P 0.827 +34 G 0.841 +35 R 0.855 +36 K 0.861 +37 S 0.858 +38 S 0.852 +39 S 0.848 +40 R 0.850 +41 V 0.854 +42 G 0.855 +43 E 0.853 +44 K 0.853 +45 L 0.853 +46 Q 0.855 +47 S 0.852 +48 A 0.838 +49 H 0.809 +50 K 0.773 +51 M 0.738 +52 P 0.695 +53 L 0.639 +54 S 0.572 +55 P 0.513 +56 G 0.473 +57 L 0.451 +58 L 0.448 +59 L 0.470 +60 L 0.518 +61 L 0.586 +62 L 0.660 +63 S 0.725 +64 G 0.774 +65 A 0.806 +66 T 0.822 +67 A 0.827 +68 T 0.824 +69 A 0.812 +70 A 0.796 +71 L 0.787 +72 P 0.792 +73 L 0.808 +74 E 0.818 +75 G 0.815 +76 G 0.811 +77 P 0.815 +78 T 0.826 +79 G 0.832 +80 R 0.827 +81 D 0.812 +82 S 0.796 +83 E 0.788 +84 H 0.789 +85 M 0.797 +86 Q 0.803 +87 E 0.803 +88 A 0.794 +89 A 0.779 +90 G 0.760 +91 I 0.732 +92 R 0.691 +93 K 0.637 +94 S 0.563 +95 S 0.464 +96 L 0.359 +97 L 0.292 +98 T 0.284 +99 F 0.303 +100 L 0.303 +101 A 0.277 +102 W 0.247 +103 W 0.227 +104 F 0.221 +105 E 0.236 +106 W 0.278 +107 T 0.349 +108 S 0.439 +109 Q 0.533 +110 A 0.612 +111 S 0.663 +112 A 0.685 +113 G 0.696 +114 P 0.710 +115 L 0.716 +116 I 0.701 +117 G 0.671 +118 E 0.635 +119 E 0.589 +120 A 0.536 +121 R 0.509 +122 E 0.519 +123 V 0.538 +124 A 0.540 +125 R 0.544 +126 R 0.577 +127 Q 0.631 +128 E 0.675 +129 G 0.692 +130 A 0.694 +131 P 0.702 +132 P 0.725 +133 Q 0.752 +134 Q 0.767 +135 S 0.761 +136 A 0.738 +137 R 0.715 +138 R 0.702 +139 D 0.691 +140 R 0.671 +141 M 0.642 +142 P 0.606 +143 C 0.563 +144 R 0.523 +145 N 0.505 +146 F 0.510 +147 F 0.509 +148 W 0.489 +149 K 0.475 +150 T 0.485 +151 F 0.503 +152 S 0.499 +153 S 0.456 +154 C 0.389 +155 K 0.340 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000243130.8_ENST00000320078.12_GN:PSG11_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000243130.8_ENST00000320078.12_GN:PSG11_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..60e50705cf4115de095b9972109b56f3a64e46f6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000243130.8_ENST00000320078.12_GN:PSG11_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,336 @@ +>ENSG00000243130.8|ENST00000320078.12|GN:PSG11|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.416 +2 G 0.433 +3 P 0.451 +4 L 0.449 +5 S 0.433 +6 A 0.436 +7 P 0.472 +8 P 0.502 +9 C 0.492 +10 T 0.473 +11 E 0.478 +12 H 0.489 +13 I 0.476 +14 K 0.453 +15 W 0.449 +16 K 0.456 +17 G 0.449 +18 L 0.427 +19 L 0.402 +20 L 0.363 +21 T 0.314 +22 A 0.289 +23 L 0.296 +24 L 0.308 +25 L 0.319 +26 N 0.341 +27 F 0.371 +28 W 0.397 +29 N 0.422 +30 L 0.452 +31 P 0.476 +32 T 0.469 +33 T 0.418 +34 A 0.327 +35 Q 0.226 +36 V 0.143 +37 M 0.092 +38 I 0.070 +39 E 0.062 +40 A 0.056 +41 Q 0.048 +42 P 0.040 +43 P 0.036 +44 K 0.034 +45 V 0.037 +46 S 0.044 +47 E 0.053 +48 G 0.057 +49 K 0.055 +50 D 0.051 +51 V 0.050 +52 L 0.050 +53 L 0.051 +54 L 0.054 +55 V 0.058 +56 H 0.062 +57 N 0.063 +58 L 0.062 +59 P 0.060 +60 Q 0.058 +61 N 0.053 +62 L 0.047 +63 T 0.039 +64 G 0.032 +65 Y 0.027 +66 I 0.026 +67 W 0.029 +68 Y 0.034 +69 K 0.039 +70 G 0.043 +71 Q 0.048 +72 I 0.053 +73 R 0.058 +74 D 0.065 +75 L 0.075 +76 Y 0.085 +77 H 0.090 +78 Y 0.089 +79 I 0.083 +80 T 0.072 +81 S 0.060 +82 Y 0.054 +83 V 0.057 +84 V 0.066 +85 D 0.079 +86 G 0.090 +87 Q 0.099 +88 I 0.107 +89 I 0.113 +90 I 0.115 +91 Y 0.112 +92 G 0.109 +93 P 0.109 +94 A 0.110 +95 Y 0.105 +96 S 0.093 +97 G 0.079 +98 R 0.072 +99 E 0.078 +100 T 0.093 +101 V 0.102 +102 Y 0.096 +103 S 0.079 +104 N 0.063 +105 A 0.055 +106 S 0.053 +107 L 0.055 +108 L 0.058 +109 I 0.062 +110 Q 0.069 +111 N 0.072 +112 V 0.070 +113 T 0.066 +114 R 0.066 +115 E 0.075 +116 D 0.088 +117 A 0.097 +118 G 0.088 +119 S 0.066 +120 Y 0.042 +121 T 0.030 +122 L 0.030 +123 H 0.036 +124 I 0.045 +125 I 0.058 +126 K 0.081 +127 R 0.117 +128 G 0.161 +129 D 0.201 +130 G 0.226 +131 T 0.233 +132 R 0.226 +133 G 0.208 +134 V 0.181 +135 T 0.144 +136 G 0.107 +137 Y 0.078 +138 F 0.060 +139 T 0.049 +140 F 0.041 +141 T 0.037 +142 L 0.040 +143 Y 0.058 +144 L 0.090 +145 E 0.121 +146 T 0.137 +147 P 0.132 +148 K 0.116 +149 P 0.096 +150 S 0.081 +151 I 0.072 +152 S 0.069 +153 S 0.065 +154 S 0.060 +155 N 0.056 +156 L 0.053 +157 N 0.050 +158 P 0.049 +159 R 0.051 +160 E 0.057 +161 A 0.063 +162 M 0.066 +163 E 0.063 +164 T 0.057 +165 V 0.052 +166 I 0.048 +167 L 0.043 +168 T 0.037 +169 C 0.033 +170 N 0.036 +171 P 0.050 +172 E 0.072 +173 T 0.092 +174 P 0.101 +175 D 0.096 +176 A 0.080 +177 S 0.059 +178 Y 0.041 +179 L 0.033 +180 W 0.035 +181 W 0.045 +182 M 0.061 +183 N 0.075 +184 G 0.088 +185 Q 0.100 +186 S 0.111 +187 L 0.120 +188 P 0.129 +189 M 0.134 +190 T 0.126 +191 H 0.104 +192 R 0.084 +193 M 0.078 +194 Q 0.082 +195 L 0.084 +196 S 0.081 +197 E 0.075 +198 T 0.067 +199 N 0.057 +200 R 0.048 +201 T 0.045 +202 L 0.044 +203 F 0.045 +204 L 0.049 +205 F 0.057 +206 G 0.064 +207 V 0.066 +208 T 0.061 +209 K 0.059 +210 Y 0.064 +211 T 0.074 +212 A 0.080 +213 G 0.076 +214 P 0.061 +215 Y 0.043 +216 E 0.032 +217 C 0.033 +218 E 0.040 +219 I 0.047 +220 W 0.052 +221 N 0.056 +222 S 0.060 +223 G 0.064 +224 S 0.068 +225 A 0.070 +226 S 0.069 +227 R 0.065 +228 S 0.063 +229 D 0.064 +230 P 0.063 +231 V 0.060 +232 T 0.056 +233 L 0.057 +234 N 0.066 +235 L 0.079 +236 L 0.091 +237 H 0.097 +238 G 0.099 +239 P 0.105 +240 D 0.110 +241 L 0.108 +242 P 0.098 +243 R 0.085 +244 I 0.077 +245 F 0.075 +246 P 0.077 +247 S 0.079 +248 V 0.076 +249 T 0.069 +250 S 0.063 +251 Y 0.062 +252 Y 0.069 +253 S 0.078 +254 G 0.083 +255 E 0.079 +256 N 0.070 +257 L 0.060 +258 D 0.054 +259 L 0.057 +260 S 0.067 +261 C 0.080 +262 F 0.090 +263 A 0.097 +264 N 0.097 +265 S 0.090 +266 N 0.084 +267 P 0.086 +268 P 0.093 +269 A 0.088 +270 Q 0.069 +271 Y 0.047 +272 S 0.033 +273 W 0.029 +274 T 0.034 +275 I 0.046 +276 N 0.059 +277 G 0.067 +278 K 0.069 +279 F 0.069 +280 Q 0.069 +281 L 0.071 +282 S 0.073 +283 G 0.073 +284 Q 0.070 +285 K 0.067 +286 L 0.068 +287 F 0.070 +288 I 0.071 +289 P 0.070 +290 Q 0.070 +291 I 0.070 +292 T 0.070 +293 P 0.069 +294 K 0.069 +295 H 0.073 +296 N 0.081 +297 G 0.082 +298 L 0.069 +299 Y 0.052 +300 A 0.040 +301 C 0.038 +302 S 0.040 +303 A 0.043 +304 R 0.047 +305 N 0.054 +306 S 0.065 +307 A 0.075 +308 T 0.082 +309 G 0.085 +310 E 0.083 +311 E 0.073 +312 S 0.062 +313 S 0.053 +314 T 0.050 +315 S 0.048 +316 L 0.047 +317 T 0.048 +318 I 0.058 +319 R 0.084 +320 V 0.135 +321 I 0.212 +322 A 0.312 +323 P 0.424 +324 P 0.528 +325 G 0.607 +326 L 0.656 +327 G 0.675 +328 T 0.675 +329 F 0.664 +330 A 0.648 +331 F 0.625 +332 N 0.595 +333 N 0.566 +334 P 0.533 +335 T 0.505 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000243130.8_ENST00000320078.12_GN:PSG11_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000243130.8_ENST00000320078.12_GN:PSG11_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c4488205d6e275f74eb834e4ed14ab4523955f2c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000243130.8_ENST00000320078.12_GN:PSG11_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid @@ -0,0 +1,342 @@ +>ENSG00000243130.8|ENST00000320078.12|GN:PSG11|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:6 +1 M 0.356 +2 H 0.360 +3 A 0.385 +4 A 0.419 +5 E 0.426 +6 I 0.409 +7 M 0.415 +8 G 0.441 +9 P 0.439 +10 L 0.412 +11 S 0.411 +12 A 0.452 +13 P 0.498 +14 P 0.508 +15 C 0.483 +16 T 0.465 +17 E 0.482 +18 H 0.509 +19 I 0.513 +20 K 0.501 +21 W 0.495 +22 K 0.492 +23 G 0.477 +24 L 0.457 +25 L 0.436 +26 L 0.393 +27 T 0.335 +28 A 0.305 +29 L 0.311 +30 L 0.321 +31 L 0.328 +32 N 0.347 +33 F 0.376 +34 W 0.401 +35 N 0.425 +36 L 0.455 +37 P 0.477 +38 T 0.470 +39 T 0.418 +40 A 0.327 +41 Q 0.225 +42 V 0.142 +43 M 0.092 +44 I 0.071 +45 E 0.063 +46 A 0.057 +47 Q 0.048 +48 P 0.040 +49 P 0.036 +50 K 0.034 +51 V 0.037 +52 S 0.044 +53 E 0.053 +54 G 0.057 +55 K 0.055 +56 D 0.051 +57 V 0.050 +58 L 0.050 +59 L 0.051 +60 L 0.053 +61 V 0.058 +62 H 0.061 +63 N 0.062 +64 L 0.061 +65 P 0.059 +66 Q 0.056 +67 N 0.052 +68 L 0.046 +69 T 0.038 +70 G 0.031 +71 Y 0.026 +72 I 0.025 +73 W 0.028 +74 Y 0.033 +75 K 0.038 +76 G 0.043 +77 Q 0.048 +78 I 0.052 +79 R 0.057 +80 D 0.063 +81 L 0.074 +82 Y 0.083 +83 H 0.088 +84 Y 0.087 +85 I 0.081 +86 T 0.071 +87 S 0.060 +88 Y 0.054 +89 V 0.056 +90 V 0.065 +91 D 0.078 +92 G 0.090 +93 Q 0.099 +94 I 0.108 +95 I 0.114 +96 I 0.116 +97 Y 0.113 +98 G 0.109 +99 P 0.109 +100 A 0.109 +101 Y 0.104 +102 S 0.092 +103 G 0.079 +104 R 0.072 +105 E 0.077 +106 T 0.091 +107 V 0.100 +108 Y 0.094 +109 S 0.078 +110 N 0.062 +111 A 0.054 +112 S 0.053 +113 L 0.054 +114 L 0.057 +115 I 0.062 +116 Q 0.068 +117 N 0.072 +118 V 0.070 +119 T 0.065 +120 R 0.066 +121 E 0.075 +122 D 0.089 +123 A 0.097 +124 G 0.089 +125 S 0.066 +126 Y 0.042 +127 T 0.030 +128 L 0.030 +129 H 0.036 +130 I 0.045 +131 I 0.058 +132 K 0.081 +133 R 0.118 +134 G 0.162 +135 D 0.201 +136 G 0.226 +137 T 0.234 +138 R 0.227 +139 G 0.209 +140 V 0.182 +141 T 0.145 +142 G 0.106 +143 Y 0.077 +144 F 0.060 +145 T 0.049 +146 F 0.041 +147 T 0.036 +148 L 0.040 +149 Y 0.057 +150 L 0.089 +151 E 0.121 +152 T 0.136 +153 P 0.132 +154 K 0.116 +155 P 0.096 +156 S 0.081 +157 I 0.072 +158 S 0.069 +159 S 0.065 +160 S 0.061 +161 N 0.056 +162 L 0.053 +163 N 0.050 +164 P 0.048 +165 R 0.051 +166 E 0.057 +167 A 0.064 +168 M 0.066 +169 E 0.063 +170 T 0.057 +171 V 0.052 +172 I 0.048 +173 L 0.043 +174 T 0.037 +175 C 0.032 +176 N 0.036 +177 P 0.050 +178 E 0.072 +179 T 0.092 +180 P 0.100 +181 D 0.095 +182 A 0.079 +183 S 0.058 +184 Y 0.041 +185 L 0.032 +186 W 0.034 +187 W 0.045 +188 M 0.060 +189 N 0.074 +190 G 0.087 +191 Q 0.098 +192 S 0.109 +193 L 0.118 +194 P 0.127 +195 M 0.133 +196 T 0.125 +197 H 0.103 +198 R 0.083 +199 M 0.077 +200 Q 0.081 +201 L 0.083 +202 S 0.080 +203 E 0.074 +204 T 0.066 +205 N 0.056 +206 R 0.048 +207 T 0.044 +208 L 0.043 +209 F 0.044 +210 L 0.048 +211 F 0.056 +212 G 0.063 +213 V 0.065 +214 T 0.060 +215 K 0.058 +216 Y 0.063 +217 T 0.073 +218 A 0.079 +219 G 0.075 +220 P 0.060 +221 Y 0.043 +222 E 0.032 +223 C 0.032 +224 E 0.039 +225 I 0.046 +226 W 0.051 +227 N 0.055 +228 S 0.059 +229 G 0.063 +230 S 0.067 +231 A 0.070 +232 S 0.069 +233 R 0.064 +234 S 0.062 +235 D 0.063 +236 P 0.063 +237 V 0.059 +238 T 0.055 +239 L 0.057 +240 N 0.065 +241 L 0.079 +242 L 0.092 +243 H 0.097 +244 G 0.099 +245 P 0.105 +246 D 0.110 +247 L 0.108 +248 P 0.098 +249 R 0.086 +250 I 0.077 +251 F 0.075 +252 P 0.077 +253 S 0.080 +254 V 0.077 +255 T 0.070 +256 S 0.063 +257 Y 0.063 +258 Y 0.069 +259 S 0.078 +260 G 0.083 +261 E 0.079 +262 N 0.070 +263 L 0.060 +264 D 0.055 +265 L 0.058 +266 S 0.068 +267 C 0.080 +268 F 0.091 +269 A 0.098 +270 N 0.098 +271 S 0.091 +272 N 0.084 +273 P 0.087 +274 P 0.093 +275 A 0.088 +276 Q 0.069 +277 Y 0.048 +278 S 0.034 +279 W 0.030 +280 T 0.034 +281 I 0.046 +282 N 0.060 +283 G 0.068 +284 K 0.069 +285 F 0.069 +286 Q 0.070 +287 L 0.071 +288 S 0.074 +289 G 0.074 +290 Q 0.071 +291 K 0.068 +292 L 0.069 +293 F 0.071 +294 I 0.072 +295 P 0.072 +296 Q 0.071 +297 I 0.071 +298 T 0.071 +299 P 0.070 +300 K 0.070 +301 H 0.074 +302 N 0.082 +303 G 0.083 +304 L 0.070 +305 Y 0.052 +306 A 0.041 +307 C 0.038 +308 S 0.041 +309 A 0.044 +310 R 0.048 +311 N 0.055 +312 S 0.065 +313 A 0.076 +314 T 0.083 +315 G 0.086 +316 E 0.083 +317 E 0.074 +318 S 0.063 +319 S 0.054 +320 T 0.050 +321 S 0.049 +322 L 0.048 +323 T 0.049 +324 I 0.058 +325 R 0.086 +326 V 0.137 +327 I 0.215 +328 A 0.315 +329 P 0.427 +330 P 0.530 +331 G 0.609 +332 L 0.657 +333 G 0.677 +334 T 0.677 +335 F 0.667 +336 A 0.651 +337 F 0.628 +338 N 0.599 +339 N 0.568 +340 P 0.535 +341 T 0.507 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000250298.6_ENST00000638719.4_GN:GIMD1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000250298.6_ENST00000638719.4_GN:GIMD1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..695da01f66f9a89700f01b0b7d7dab8d3cf4d177 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000250298.6_ENST00000638719.4_GN:GIMD1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,218 @@ +>ENSG00000250298.6|ENST00000638719.4|GN:GIMD1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.378 +2 T 0.367 +3 D 0.350 +4 P 0.320 +5 N 0.269 +6 K 0.201 +7 M 0.132 +8 I 0.080 +9 I 0.049 +10 N 0.032 +11 L 0.024 +12 A 0.020 +13 L 0.020 +14 F 0.024 +15 G 0.035 +16 M 0.049 +17 T 0.058 +18 Q 0.059 +19 S 0.053 +20 G 0.050 +21 K 0.054 +22 S 0.061 +23 S 0.069 +24 A 0.080 +25 G 0.093 +26 N 0.104 +27 I 0.106 +28 L 0.103 +29 L 0.100 +30 G 0.104 +31 S 0.118 +32 T 0.141 +33 D 0.165 +34 F 0.187 +35 H 0.206 +36 S 0.226 +37 S 0.247 +38 F 0.265 +39 A 0.273 +40 P 0.267 +41 C 0.249 +42 S 0.223 +43 V 0.193 +44 T 0.162 +45 T 0.135 +46 C 0.119 +47 C 0.118 +48 S 0.123 +49 L 0.125 +50 G 0.115 +51 R 0.095 +52 S 0.075 +53 C 0.064 +54 H 0.064 +55 L 0.072 +56 H 0.089 +57 S 0.113 +58 F 0.141 +59 M 0.170 +60 R 0.196 +61 R 0.222 +62 G 0.247 +63 G 0.264 +64 L 0.266 +65 E 0.254 +66 V 0.226 +67 A 0.185 +68 L 0.140 +69 Q 0.098 +70 V 0.066 +71 Q 0.045 +72 V 0.034 +73 L 0.032 +74 D 0.038 +75 T 0.051 +76 P 0.066 +77 G 0.084 +78 Y 0.105 +79 P 0.133 +80 H 0.158 +81 S 0.168 +82 R 0.159 +83 L 0.137 +84 S 0.113 +85 K 0.099 +86 K 0.092 +87 Y 0.084 +88 V 0.072 +89 K 0.058 +90 Q 0.045 +91 E 0.037 +92 V 0.037 +93 K 0.043 +94 E 0.046 +95 A 0.041 +96 L 0.032 +97 A 0.029 +98 H 0.037 +99 H 0.054 +100 F 0.078 +101 G 0.106 +102 Q 0.130 +103 G 0.138 +104 G 0.125 +105 L 0.099 +106 H 0.072 +107 L 0.052 +108 A 0.041 +109 L 0.039 +110 L 0.043 +111 V 0.048 +112 Q 0.051 +113 R 0.057 +114 A 0.070 +115 D 0.090 +116 V 0.114 +117 P 0.138 +118 F 0.160 +119 C 0.176 +120 G 0.173 +121 Q 0.152 +122 E 0.131 +123 V 0.118 +124 T 0.106 +125 D 0.085 +126 P 0.066 +127 V 0.059 +128 Q 0.058 +129 M 0.049 +130 I 0.035 +131 Q 0.027 +132 E 0.027 +133 L 0.034 +134 L 0.040 +135 G 0.041 +136 H 0.039 +137 A 0.038 +138 W 0.041 +139 M 0.043 +140 N 0.039 +141 Y 0.031 +142 T 0.024 +143 A 0.020 +144 I 0.017 +145 L 0.016 +146 F 0.018 +147 T 0.024 +148 H 0.034 +149 A 0.047 +150 E 0.061 +151 K 0.074 +152 I 0.083 +153 E 0.090 +154 E 0.102 +155 A 0.116 +156 G 0.122 +157 L 0.115 +158 T 0.100 +159 E 0.083 +160 D 0.069 +161 K 0.064 +162 Y 0.068 +163 L 0.073 +164 H 0.073 +165 E 0.071 +166 A 0.069 +167 S 0.061 +168 D 0.050 +169 T 0.044 +170 L 0.047 +171 K 0.057 +172 T 0.063 +173 L 0.060 +174 L 0.051 +175 N 0.045 +176 S 0.040 +177 I 0.034 +178 Q 0.027 +179 H 0.022 +180 K 0.020 +181 Y 0.024 +182 V 0.034 +183 F 0.051 +184 Q 0.072 +185 Y 0.095 +186 K 0.117 +187 K 0.135 +188 G 0.145 +189 K 0.136 +190 S 0.109 +191 L 0.075 +192 N 0.051 +193 E 0.039 +194 Q 0.035 +195 R 0.034 +196 M 0.034 +197 K 0.035 +198 I 0.036 +199 L 0.036 +200 E 0.036 +201 R 0.039 +202 I 0.049 +203 M 0.061 +204 E 0.066 +205 F 0.061 +206 I 0.055 +207 K 0.055 +208 E 0.059 +209 N 0.068 +210 C 0.086 +211 Y 0.118 +212 Q 0.160 +213 V 0.196 +214 L 0.211 +215 T 0.209 +216 F 0.203 +217 K 0.201 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000250298.6_ENST00000638719.4_GN:GIMD1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000250298.6_ENST00000638719.4_GN:GIMD1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f206a3beb4b6eb6a78fb01413b907c24bb7257c6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000250298.6_ENST00000638719.4_GN:GIMD1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid @@ -0,0 +1,241 @@ +>ENSG00000250298.6|ENST00000638719.4|GN:GIMD1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:23 +1 M 0.341 +2 K 0.341 +3 E 0.348 +4 Q 0.362 +5 L 0.370 +6 C 0.372 +7 Q 0.385 +8 G 0.410 +9 E 0.421 +10 R 0.411 +11 R 0.411 +12 L 0.435 +13 C 0.458 +14 G 0.451 +15 E 0.421 +16 S 0.392 +17 I 0.376 +18 F 0.382 +19 K 0.409 +20 T 0.439 +21 G 0.446 +22 K 0.436 +23 A 0.422 +24 M 0.401 +25 T 0.369 +26 D 0.328 +27 P 0.283 +28 N 0.232 +29 K 0.176 +30 M 0.121 +31 I 0.077 +32 I 0.048 +33 N 0.032 +34 L 0.024 +35 A 0.020 +36 L 0.020 +37 F 0.024 +38 G 0.035 +39 M 0.049 +40 T 0.059 +41 Q 0.059 +42 S 0.054 +43 G 0.051 +44 K 0.054 +45 S 0.061 +46 S 0.070 +47 A 0.080 +48 G 0.093 +49 N 0.103 +50 I 0.105 +51 L 0.100 +52 L 0.097 +53 G 0.102 +54 S 0.116 +55 T 0.138 +56 D 0.163 +57 F 0.186 +58 H 0.206 +59 S 0.227 +60 S 0.248 +61 F 0.266 +62 A 0.274 +63 P 0.265 +64 C 0.244 +65 S 0.215 +66 V 0.185 +67 T 0.154 +68 T 0.129 +69 C 0.114 +70 C 0.114 +71 S 0.119 +72 L 0.120 +73 G 0.110 +74 R 0.091 +75 S 0.073 +76 C 0.064 +77 H 0.064 +78 L 0.070 +79 H 0.081 +80 S 0.097 +81 F 0.118 +82 M 0.142 +83 R 0.168 +84 R 0.196 +85 G 0.223 +86 G 0.242 +87 L 0.246 +88 E 0.238 +89 V 0.215 +90 A 0.176 +91 L 0.132 +92 Q 0.092 +93 V 0.062 +94 Q 0.043 +95 V 0.033 +96 L 0.031 +97 D 0.037 +98 T 0.050 +99 P 0.066 +100 G 0.083 +101 Y 0.104 +102 P 0.131 +103 H 0.155 +104 S 0.165 +105 R 0.156 +106 L 0.133 +107 S 0.111 +108 K 0.097 +109 K 0.091 +110 Y 0.084 +111 V 0.072 +112 K 0.056 +113 Q 0.042 +114 E 0.032 +115 V 0.026 +116 K 0.024 +117 E 0.023 +118 A 0.022 +119 L 0.022 +120 A 0.025 +121 H 0.034 +122 H 0.051 +123 F 0.075 +124 G 0.103 +125 Q 0.127 +126 G 0.137 +127 G 0.125 +128 L 0.100 +129 H 0.073 +130 L 0.053 +131 A 0.043 +132 L 0.041 +133 L 0.045 +134 V 0.049 +135 Q 0.053 +136 R 0.059 +137 A 0.072 +138 D 0.094 +139 V 0.119 +140 P 0.143 +141 F 0.165 +142 C 0.180 +143 G 0.178 +144 Q 0.159 +145 E 0.137 +146 V 0.125 +147 T 0.112 +148 D 0.089 +149 P 0.069 +150 V 0.061 +151 Q 0.059 +152 M 0.050 +153 I 0.036 +154 Q 0.028 +155 E 0.029 +156 L 0.036 +157 L 0.043 +158 G 0.044 +159 H 0.041 +160 A 0.040 +161 W 0.042 +162 M 0.044 +163 N 0.039 +164 Y 0.031 +165 T 0.024 +166 A 0.020 +167 I 0.018 +168 L 0.017 +169 F 0.018 +170 T 0.024 +171 H 0.035 +172 A 0.049 +173 E 0.064 +174 K 0.077 +175 I 0.087 +176 E 0.094 +177 E 0.105 +178 A 0.118 +179 G 0.124 +180 L 0.116 +181 T 0.100 +182 E 0.082 +183 D 0.069 +184 K 0.063 +185 Y 0.066 +186 L 0.071 +187 H 0.072 +188 E 0.071 +189 A 0.069 +190 S 0.061 +191 D 0.050 +192 T 0.043 +193 L 0.046 +194 K 0.055 +195 T 0.061 +196 L 0.057 +197 L 0.049 +198 N 0.043 +199 S 0.038 +200 I 0.033 +201 Q 0.026 +202 H 0.021 +203 K 0.020 +204 Y 0.024 +205 V 0.034 +206 F 0.050 +207 Q 0.071 +208 Y 0.093 +209 K 0.115 +210 K 0.134 +211 G 0.145 +212 K 0.137 +213 S 0.109 +214 L 0.075 +215 N 0.051 +216 E 0.039 +217 Q 0.035 +218 R 0.034 +219 M 0.034 +220 K 0.035 +221 I 0.036 +222 L 0.036 +223 E 0.036 +224 R 0.039 +225 I 0.049 +226 M 0.061 +227 E 0.066 +228 F 0.062 +229 I 0.056 +230 K 0.057 +231 E 0.062 +232 N 0.071 +233 C 0.089 +234 Y 0.121 +235 Q 0.162 +236 V 0.195 +237 L 0.208 +238 T 0.206 +239 F 0.201 +240 K 0.200 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000250506.10_ENST00000448471.3_GN:CDK3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000250506.10_ENST00000448471.3_GN:CDK3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..fcea5a975567a726f1e5a58bb1cd4a1a50b89b90 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000250506.10_ENST00000448471.3_GN:CDK3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,306 @@ +>ENSG00000250506.10|ENST00000448471.3|GN:CDK3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.147 +2 D 0.121 +3 M 0.086 +4 F 0.057 +5 Q 0.040 +6 K 0.033 +7 V 0.030 +8 E 0.032 +9 K 0.034 +10 I 0.036 +11 G 0.039 +12 E 0.047 +13 G 0.057 +14 T 0.061 +15 Y 0.057 +16 G 0.049 +17 V 0.041 +18 V 0.034 +19 Y 0.030 +20 K 0.028 +21 A 0.029 +22 K 0.030 +23 N 0.033 +24 R 0.039 +25 E 0.052 +26 T 0.070 +27 G 0.087 +28 Q 0.096 +29 L 0.092 +30 V 0.080 +31 A 0.067 +32 L 0.059 +33 K 0.065 +34 K 0.088 +35 I 0.125 +36 R 0.168 +37 L 0.207 +38 D 0.230 +39 L 0.235 +40 E 0.230 +41 M 0.230 +42 E 0.237 +43 G 0.243 +44 V 0.229 +45 P 0.187 +46 S 0.133 +47 T 0.093 +48 A 0.075 +49 I 0.074 +50 R 0.083 +51 E 0.093 +52 I 0.097 +53 S 0.093 +54 L 0.081 +55 L 0.069 +56 K 0.060 +57 E 0.058 +58 L 0.060 +59 K 0.061 +60 H 0.060 +61 P 0.056 +62 N 0.049 +63 I 0.041 +64 V 0.033 +65 R 0.029 +66 L 0.027 +67 L 0.025 +68 D 0.023 +69 V 0.023 +70 V 0.027 +71 H 0.035 +72 N 0.043 +73 E 0.047 +74 R 0.045 +75 K 0.037 +76 L 0.027 +77 Y 0.020 +78 L 0.019 +79 V 0.021 +80 F 0.025 +81 E 0.027 +82 F 0.026 +83 L 0.021 +84 S 0.016 +85 Q 0.015 +86 D 0.018 +87 L 0.022 +88 K 0.026 +89 K 0.030 +90 Y 0.035 +91 M 0.043 +92 D 0.055 +93 S 0.072 +94 T 0.094 +95 P 0.111 +96 G 0.113 +97 S 0.103 +98 E 0.085 +99 L 0.066 +100 P 0.051 +101 L 0.043 +102 H 0.039 +103 L 0.036 +104 I 0.035 +105 K 0.037 +106 S 0.040 +107 Y 0.039 +108 L 0.035 +109 F 0.031 +110 Q 0.029 +111 L 0.031 +112 L 0.034 +113 Q 0.034 +114 G 0.031 +115 V 0.028 +116 S 0.030 +117 F 0.035 +118 C 0.043 +119 H 0.055 +120 S 0.063 +121 H 0.059 +122 R 0.047 +123 V 0.040 +124 I 0.039 +125 H 0.043 +126 R 0.048 +127 D 0.052 +128 L 0.049 +129 K 0.041 +130 P 0.036 +131 Q 0.037 +132 N 0.039 +133 L 0.038 +134 L 0.031 +135 I 0.025 +136 N 0.028 +137 E 0.042 +138 L 0.058 +139 G 0.064 +140 A 0.060 +141 I 0.057 +142 K 0.061 +143 L 0.071 +144 A 0.085 +145 D 0.105 +146 F 0.130 +147 G 0.154 +148 L 0.173 +149 A 0.186 +150 R 0.197 +151 A 0.213 +152 F 0.236 +153 G 0.257 +154 V 0.270 +155 P 0.274 +156 L 0.278 +157 R 0.289 +158 T 0.309 +159 Y 0.332 +160 T 0.353 +161 H 0.369 +162 E 0.375 +163 V 0.358 +164 V 0.313 +165 T 0.255 +166 L 0.205 +167 W 0.167 +168 Y 0.137 +169 R 0.112 +170 A 0.094 +171 P 0.086 +172 E 0.089 +173 I 0.093 +174 L 0.094 +175 L 0.094 +176 G 0.100 +177 S 0.111 +178 K 0.121 +179 F 0.124 +180 Y 0.114 +181 T 0.097 +182 T 0.089 +183 A 0.105 +184 V 0.131 +185 D 0.146 +186 I 0.141 +187 W 0.130 +188 S 0.123 +189 I 0.114 +190 G 0.104 +191 C 0.099 +192 I 0.097 +193 F 0.092 +194 A 0.083 +195 E 0.074 +196 M 0.066 +197 V 0.060 +198 T 0.059 +199 R 0.065 +200 K 0.079 +201 A 0.095 +202 L 0.107 +203 F 0.113 +204 P 0.117 +205 G 0.120 +206 D 0.120 +207 S 0.113 +208 E 0.102 +209 I 0.095 +210 D 0.093 +211 Q 0.093 +212 L 0.090 +213 F 0.091 +214 R 0.093 +215 I 0.093 +216 F 0.094 +217 R 0.104 +218 M 0.119 +219 L 0.131 +220 G 0.136 +221 T 0.134 +222 P 0.126 +223 S 0.112 +224 E 0.093 +225 D 0.075 +226 T 0.064 +227 W 0.065 +228 P 0.076 +229 G 0.083 +230 V 0.082 +231 T 0.077 +232 Q 0.076 +233 L 0.082 +234 P 0.091 +235 D 0.095 +236 Y 0.098 +237 K 0.101 +238 G 0.106 +239 S 0.112 +240 F 0.115 +241 P 0.115 +242 K 0.108 +243 W 0.100 +244 T 0.097 +245 R 0.099 +246 K 0.104 +247 G 0.104 +248 L 0.099 +249 E 0.093 +250 E 0.092 +251 I 0.097 +252 V 0.108 +253 P 0.118 +254 N 0.119 +255 L 0.112 +256 E 0.104 +257 P 0.098 +258 E 0.093 +259 G 0.090 +260 R 0.093 +261 D 0.099 +262 L 0.103 +263 L 0.101 +264 M 0.093 +265 Q 0.078 +266 L 0.063 +267 L 0.054 +268 Q 0.049 +269 Y 0.050 +270 D 0.054 +271 P 0.059 +272 S 0.066 +273 Q 0.074 +274 R 0.077 +275 I 0.071 +276 T 0.063 +277 A 0.060 +278 K 0.062 +279 T 0.066 +280 A 0.072 +281 L 0.080 +282 A 0.090 +283 H 0.096 +284 P 0.094 +285 Y 0.085 +286 F 0.075 +287 S 0.073 +288 S 0.087 +289 P 0.118 +290 E 0.157 +291 P 0.191 +292 S 0.211 +293 P 0.214 +294 A 0.195 +295 A 0.162 +296 R 0.131 +297 Q 0.118 +298 Y 0.117 +299 V 0.121 +300 L 0.130 +301 Q 0.145 +302 R 0.167 +303 F 0.195 +304 R 0.225 +305 H 0.244 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000250506.10_ENST00000448471.3_GN:CDK3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000250506.10_ENST00000448471.3_GN:CDK3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..3550961c526e292c2942eb57aa013af94bdeafe0 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000250506.10_ENST00000448471.3_GN:CDK3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid @@ -0,0 +1,326 @@ +>ENSG00000250506.10|ENST00000448471.3|GN:CDK3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:20 +1 M 0.354 +2 C 0.361 +3 T 0.386 +4 Q 0.438 +5 S 0.504 +6 L 0.560 +7 G 0.597 +8 L 0.624 +9 A 0.645 +10 G 0.652 +11 L 0.637 +12 G 0.606 +13 S 0.580 +14 D 0.575 +15 P 0.582 +16 G 0.574 +17 S 0.526 +18 S 0.440 +19 V 0.338 +20 A 0.242 +21 M 0.164 +22 D 0.107 +23 M 0.069 +24 F 0.046 +25 Q 0.034 +26 K 0.029 +27 V 0.028 +28 E 0.029 +29 K 0.031 +30 I 0.033 +31 G 0.037 +32 E 0.045 +33 G 0.054 +34 T 0.058 +35 Y 0.055 +36 G 0.048 +37 V 0.040 +38 V 0.033 +39 Y 0.028 +40 K 0.026 +41 A 0.027 +42 K 0.029 +43 N 0.031 +44 R 0.037 +45 E 0.049 +46 T 0.065 +47 G 0.082 +48 Q 0.090 +49 L 0.087 +50 V 0.077 +51 A 0.065 +52 L 0.059 +53 K 0.066 +54 K 0.089 +55 I 0.126 +56 R 0.168 +57 L 0.205 +58 D 0.229 +59 L 0.234 +60 E 0.229 +61 M 0.226 +62 E 0.233 +63 G 0.239 +64 V 0.226 +65 P 0.185 +66 S 0.132 +67 T 0.092 +68 A 0.074 +69 I 0.072 +70 R 0.079 +71 E 0.086 +72 I 0.090 +73 S 0.087 +74 L 0.078 +75 L 0.066 +76 K 0.058 +77 E 0.055 +78 L 0.057 +79 K 0.059 +80 H 0.057 +81 P 0.053 +82 N 0.046 +83 I 0.038 +84 V 0.031 +85 R 0.027 +86 L 0.025 +87 L 0.023 +88 D 0.021 +89 V 0.021 +90 V 0.024 +91 H 0.030 +92 N 0.038 +93 E 0.043 +94 R 0.041 +95 K 0.034 +96 L 0.025 +97 Y 0.019 +98 L 0.017 +99 V 0.020 +100 F 0.024 +101 E 0.026 +102 F 0.024 +103 L 0.019 +104 S 0.015 +105 Q 0.014 +106 D 0.017 +107 L 0.021 +108 K 0.024 +109 K 0.027 +110 Y 0.033 +111 M 0.041 +112 D 0.053 +113 S 0.071 +114 T 0.093 +115 P 0.110 +116 G 0.114 +117 S 0.104 +118 E 0.086 +119 L 0.067 +120 P 0.052 +121 L 0.043 +122 H 0.039 +123 L 0.037 +124 I 0.035 +125 K 0.038 +126 S 0.041 +127 Y 0.040 +128 L 0.035 +129 F 0.031 +130 Q 0.029 +131 L 0.031 +132 L 0.033 +133 Q 0.034 +134 G 0.031 +135 V 0.028 +136 S 0.029 +137 F 0.034 +138 C 0.042 +139 H 0.054 +140 S 0.063 +141 H 0.059 +142 R 0.047 +143 V 0.040 +144 I 0.039 +145 H 0.043 +146 R 0.049 +147 D 0.052 +148 L 0.049 +149 K 0.042 +150 P 0.037 +151 Q 0.037 +152 N 0.039 +153 L 0.038 +154 L 0.032 +155 I 0.026 +156 N 0.029 +157 E 0.042 +158 L 0.058 +159 G 0.064 +160 A 0.061 +161 I 0.057 +162 K 0.061 +163 L 0.070 +164 A 0.084 +165 D 0.104 +166 F 0.128 +167 G 0.152 +168 L 0.171 +169 A 0.184 +170 R 0.196 +171 A 0.213 +172 F 0.237 +173 G 0.259 +174 V 0.272 +175 P 0.278 +176 L 0.283 +177 R 0.295 +178 T 0.315 +179 Y 0.336 +180 T 0.355 +181 H 0.370 +182 E 0.376 +183 V 0.361 +184 V 0.317 +185 T 0.259 +186 L 0.209 +187 W 0.172 +188 Y 0.141 +189 R 0.115 +190 A 0.096 +191 P 0.088 +192 E 0.091 +193 I 0.096 +194 L 0.097 +195 L 0.097 +196 G 0.102 +197 S 0.112 +198 K 0.121 +199 F 0.124 +200 Y 0.114 +201 T 0.096 +202 T 0.088 +203 A 0.103 +204 V 0.130 +205 D 0.145 +206 I 0.140 +207 W 0.129 +208 S 0.121 +209 I 0.113 +210 G 0.103 +211 C 0.098 +212 I 0.097 +213 F 0.092 +214 A 0.082 +215 E 0.073 +216 M 0.065 +217 V 0.059 +218 T 0.058 +219 R 0.064 +220 K 0.077 +221 A 0.093 +222 L 0.105 +223 F 0.111 +224 P 0.116 +225 G 0.119 +226 D 0.119 +227 S 0.112 +228 E 0.101 +229 I 0.094 +230 D 0.093 +231 Q 0.093 +232 L 0.091 +233 F 0.091 +234 R 0.094 +235 I 0.094 +236 F 0.095 +237 R 0.105 +238 M 0.121 +239 L 0.133 +240 G 0.137 +241 T 0.135 +242 P 0.127 +243 S 0.112 +244 E 0.093 +245 D 0.075 +246 T 0.064 +247 W 0.066 +248 P 0.076 +249 G 0.083 +250 V 0.082 +251 T 0.077 +252 Q 0.076 +253 L 0.082 +254 P 0.091 +255 D 0.096 +256 Y 0.098 +257 K 0.101 +258 G 0.106 +259 S 0.111 +260 F 0.115 +261 P 0.115 +262 K 0.109 +263 W 0.101 +264 T 0.097 +265 R 0.100 +266 K 0.105 +267 G 0.105 +268 L 0.100 +269 E 0.094 +270 E 0.093 +271 I 0.098 +272 V 0.110 +273 P 0.121 +274 N 0.122 +275 L 0.115 +276 E 0.107 +277 P 0.100 +278 E 0.094 +279 G 0.091 +280 R 0.094 +281 D 0.100 +282 L 0.104 +283 L 0.103 +284 M 0.094 +285 Q 0.079 +286 L 0.065 +287 L 0.055 +288 Q 0.051 +289 Y 0.051 +290 D 0.055 +291 P 0.061 +292 S 0.068 +293 Q 0.076 +294 R 0.079 +295 I 0.073 +296 T 0.065 +297 A 0.061 +298 K 0.063 +299 T 0.067 +300 A 0.073 +301 L 0.082 +302 A 0.092 +303 H 0.098 +304 P 0.096 +305 Y 0.086 +306 F 0.076 +307 S 0.074 +308 S 0.086 +309 P 0.115 +310 E 0.152 +311 P 0.184 +312 S 0.204 +313 P 0.207 +314 A 0.189 +315 A 0.155 +316 R 0.126 +317 Q 0.113 +318 Y 0.113 +319 V 0.119 +320 L 0.128 +321 Q 0.143 +322 R 0.166 +323 F 0.195 +324 R 0.225 +325 H 0.245 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000251664.5_ENST00000398631.3_GN:PCDHA12_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000251664.5_ENST00000398631.3_GN:PCDHA12_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6e9ec2074f0fdfbb1a2148d4e490396d79148949 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000251664.5_ENST00000398631.3_GN:PCDHA12_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,942 @@ +>ENSG00000251664.5|ENST00000398631.3|GN:PCDHA12|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.306 +2 V 0.325 +3 I 0.352 +4 I 0.377 +5 G 0.391 +6 P 0.398 +7 R 0.415 +8 G 0.455 +9 P 0.491 +10 G 0.489 +11 S 0.431 +12 Q 0.339 +13 R 0.253 +14 L 0.201 +15 L 0.179 +16 L 0.173 +17 S 0.173 +18 L 0.176 +19 L 0.178 +20 L 0.181 +21 L 0.194 +22 A 0.221 +23 A 0.253 +24 W 0.287 +25 E 0.324 +26 V 0.357 +27 G 0.368 +28 S 0.341 +29 G 0.281 +30 Q 0.204 +31 L 0.133 +32 H 0.082 +33 Y 0.054 +34 S 0.041 +35 V 0.039 +36 Y 0.043 +37 E 0.054 +38 E 0.069 +39 A 0.079 +40 K 0.080 +41 H 0.075 +42 G 0.070 +43 T 0.066 +44 F 0.060 +45 V 0.055 +46 G 0.052 +47 R 0.053 +48 I 0.057 +49 A 0.066 +50 Q 0.077 +51 D 0.093 +52 L 0.112 +53 G 0.125 +54 L 0.127 +55 E 0.122 +56 L 0.118 +57 A 0.116 +58 E 0.118 +59 L 0.127 +60 V 0.139 +61 P 0.137 +62 R 0.114 +63 L 0.085 +64 F 0.069 +65 R 0.072 +66 V 0.086 +67 A 0.100 +68 S 0.108 +69 K 0.110 +70 R 0.114 +71 H 0.123 +72 G 0.128 +73 D 0.115 +74 L 0.090 +75 L 0.069 +76 E 0.059 +77 V 0.056 +78 N 0.054 +79 L 0.055 +80 Q 0.061 +81 N 0.070 +82 G 0.074 +83 I 0.070 +84 L 0.065 +85 F 0.067 +86 V 0.076 +87 N 0.084 +88 S 0.085 +89 R 0.077 +90 I 0.067 +91 D 0.061 +92 R 0.064 +93 E 0.075 +94 K 0.089 +95 L 0.101 +96 C 0.111 +97 G 0.122 +98 R 0.132 +99 S 0.135 +100 A 0.129 +101 E 0.115 +102 C 0.098 +103 S 0.085 +104 I 0.076 +105 H 0.069 +106 L 0.061 +107 E 0.054 +108 V 0.048 +109 I 0.046 +110 V 0.045 +111 D 0.045 +112 R 0.046 +113 P 0.051 +114 L 0.061 +115 Q 0.075 +116 V 0.087 +117 F 0.095 +118 H 0.096 +119 V 0.094 +120 D 0.096 +121 V 0.109 +122 E 0.134 +123 V 0.159 +124 K 0.173 +125 D 0.174 +126 I 0.168 +127 N 0.162 +128 D 0.158 +129 N 0.153 +130 P 0.147 +131 P 0.142 +132 V 0.143 +133 F 0.149 +134 R 0.151 +135 E 0.145 +136 R 0.131 +137 E 0.114 +138 Q 0.099 +139 K 0.089 +140 V 0.081 +141 P 0.074 +142 V 0.066 +143 S 0.064 +144 E 0.074 +145 S 0.090 +146 A 0.101 +147 P 0.100 +148 L 0.092 +149 D 0.088 +150 S 0.090 +151 H 0.092 +152 F 0.096 +153 P 0.102 +154 L 0.111 +155 E 0.120 +156 G 0.123 +157 A 0.121 +158 S 0.122 +159 D 0.128 +160 A 0.140 +161 D 0.150 +162 I 0.153 +163 G 0.154 +164 V 0.155 +165 N 0.152 +166 S 0.138 +167 L 0.117 +168 L 0.099 +169 T 0.088 +170 Y 0.085 +171 A 0.084 +172 L 0.082 +173 S 0.079 +174 L 0.076 +175 N 0.071 +176 E 0.062 +177 N 0.054 +178 F 0.049 +179 E 0.051 +180 L 0.058 +181 K 0.069 +182 I 0.082 +183 K 0.095 +184 T 0.109 +185 K 0.121 +186 K 0.125 +187 D 0.127 +188 K 0.130 +189 S 0.129 +190 I 0.117 +191 L 0.098 +192 P 0.079 +193 E 0.069 +194 L 0.070 +195 V 0.078 +196 L 0.089 +197 R 0.096 +198 K 0.096 +199 L 0.090 +200 L 0.079 +201 D 0.067 +202 R 0.066 +203 E 0.076 +204 Q 0.088 +205 T 0.091 +206 P 0.085 +207 K 0.079 +208 L 0.077 +209 N 0.077 +210 L 0.072 +211 L 0.062 +212 L 0.051 +213 M 0.047 +214 V 0.049 +215 I 0.057 +216 D 0.066 +217 G 0.072 +218 G 0.068 +219 K 0.058 +220 P 0.052 +221 E 0.053 +222 L 0.058 +223 T 0.065 +224 G 0.074 +225 S 0.083 +226 V 0.087 +227 Q 0.084 +228 I 0.077 +229 Q 0.072 +230 I 0.077 +231 T 0.096 +232 V 0.126 +233 L 0.155 +234 D 0.169 +235 V 0.167 +236 N 0.157 +237 D 0.145 +238 N 0.134 +239 G 0.122 +240 P 0.114 +241 A 0.107 +242 F 0.097 +243 D 0.088 +244 K 0.085 +245 P 0.082 +246 S 0.072 +247 Y 0.058 +248 K 0.046 +249 V 0.038 +250 V 0.033 +251 L 0.031 +252 S 0.036 +253 E 0.047 +254 N 0.062 +255 V 0.072 +256 Q 0.073 +257 N 0.066 +258 D 0.061 +259 T 0.061 +260 R 0.063 +261 V 0.066 +262 I 0.072 +263 Q 0.082 +264 L 0.092 +265 N 0.100 +266 A 0.106 +267 S 0.110 +268 D 0.116 +269 P 0.128 +270 D 0.143 +271 E 0.153 +272 G 0.155 +273 L 0.154 +274 N 0.151 +275 G 0.141 +276 E 0.121 +277 I 0.099 +278 S 0.083 +279 Y 0.081 +280 G 0.088 +281 I 0.094 +282 K 0.097 +283 M 0.099 +284 I 0.096 +285 L 0.090 +286 P 0.091 +287 V 0.104 +288 S 0.124 +289 E 0.139 +290 K 0.141 +291 C 0.125 +292 M 0.096 +293 F 0.072 +294 S 0.062 +295 I 0.063 +296 N 0.066 +297 P 0.067 +298 D 0.068 +299 T 0.070 +300 G 0.069 +301 E 0.066 +302 I 0.064 +303 R 0.069 +304 I 0.081 +305 Y 0.098 +306 G 0.109 +307 E 0.107 +308 L 0.092 +309 D 0.073 +310 F 0.065 +311 E 0.070 +312 E 0.079 +313 N 0.081 +314 N 0.078 +315 A 0.077 +316 Y 0.076 +317 E 0.070 +318 I 0.059 +319 Q 0.047 +320 V 0.039 +321 N 0.035 +322 A 0.036 +323 I 0.041 +324 D 0.047 +325 K 0.051 +326 G 0.053 +327 I 0.053 +328 P 0.059 +329 S 0.066 +330 M 0.068 +331 A 0.066 +332 G 0.064 +333 H 0.065 +334 S 0.069 +335 M 0.071 +336 V 0.072 +337 L 0.077 +338 V 0.090 +339 E 0.116 +340 V 0.146 +341 L 0.168 +342 D 0.173 +343 V 0.166 +344 N 0.156 +345 D 0.151 +346 N 0.147 +347 V 0.141 +348 P 0.134 +349 E 0.127 +350 V 0.124 +351 M 0.125 +352 V 0.131 +353 T 0.138 +354 S 0.144 +355 L 0.140 +356 S 0.122 +357 L 0.096 +358 P 0.074 +359 V 0.063 +360 Q 0.066 +361 E 0.085 +362 D 0.114 +363 A 0.136 +364 Q 0.141 +365 V 0.136 +366 G 0.133 +367 T 0.128 +368 V 0.115 +369 I 0.098 +370 A 0.083 +371 L 0.070 +372 I 0.063 +373 S 0.066 +374 V 0.076 +375 S 0.090 +376 D 0.107 +377 R 0.127 +378 D 0.147 +379 S 0.160 +380 G 0.164 +381 A 0.163 +382 N 0.158 +383 G 0.148 +384 Q 0.132 +385 V 0.112 +386 I 0.092 +387 C 0.084 +388 S 0.088 +389 L 0.100 +390 T 0.115 +391 P 0.126 +392 H 0.120 +393 V 0.098 +394 P 0.074 +395 F 0.066 +396 K 0.071 +397 L 0.076 +398 V 0.075 +399 S 0.072 +400 T 0.067 +401 Y 0.060 +402 K 0.050 +403 N 0.041 +404 Y 0.036 +405 Y 0.038 +406 S 0.046 +407 L 0.060 +408 V 0.077 +409 L 0.092 +410 D 0.101 +411 S 0.101 +412 A 0.092 +413 L 0.078 +414 D 0.065 +415 R 0.061 +416 E 0.065 +417 S 0.071 +418 V 0.075 +419 S 0.077 +420 A 0.081 +421 Y 0.080 +422 E 0.069 +423 L 0.054 +424 V 0.042 +425 V 0.037 +426 T 0.037 +427 A 0.042 +428 R 0.052 +429 D 0.063 +430 G 0.069 +431 G 0.066 +432 S 0.060 +433 P 0.057 +434 S 0.057 +435 L 0.056 +436 W 0.056 +437 A 0.061 +438 T 0.071 +439 A 0.081 +440 R 0.088 +441 V 0.093 +442 S 0.098 +443 V 0.110 +444 E 0.134 +445 V 0.164 +446 A 0.187 +447 D 0.192 +448 V 0.181 +449 N 0.164 +450 D 0.152 +451 N 0.144 +452 A 0.136 +453 P 0.129 +454 A 0.124 +455 F 0.120 +456 A 0.116 +457 Q 0.117 +458 P 0.119 +459 E 0.112 +460 Y 0.094 +461 T 0.073 +462 V 0.058 +463 F 0.049 +464 V 0.047 +465 K 0.052 +466 E 0.066 +467 N 0.091 +468 N 0.121 +469 P 0.143 +470 P 0.145 +471 G 0.131 +472 C 0.110 +473 H 0.091 +474 I 0.078 +475 F 0.076 +476 T 0.085 +477 V 0.100 +478 S 0.114 +479 A 0.122 +480 W 0.126 +481 D 0.130 +482 A 0.141 +483 D 0.155 +484 A 0.163 +485 Q 0.167 +486 K 0.171 +487 N 0.172 +488 A 0.163 +489 L 0.140 +490 V 0.113 +491 S 0.091 +492 Y 0.084 +493 S 0.089 +494 L 0.096 +495 V 0.104 +496 E 0.113 +497 R 0.125 +498 R 0.138 +499 V 0.153 +500 G 0.172 +501 E 0.187 +502 H 0.185 +503 A 0.167 +504 L 0.142 +505 S 0.115 +506 S 0.090 +507 Y 0.072 +508 V 0.064 +509 S 0.066 +510 V 0.071 +511 H 0.075 +512 A 0.077 +513 E 0.082 +514 S 0.087 +515 G 0.089 +516 K 0.085 +517 V 0.083 +518 Y 0.092 +519 A 0.112 +520 L 0.136 +521 Q 0.150 +522 P 0.148 +523 L 0.131 +524 D 0.109 +525 H 0.096 +526 E 0.097 +527 E 0.102 +528 L 0.098 +529 E 0.086 +530 L 0.074 +531 L 0.066 +532 Q 0.060 +533 F 0.054 +534 Q 0.049 +535 V 0.047 +536 S 0.047 +537 A 0.051 +538 R 0.058 +539 D 0.068 +540 A 0.075 +541 G 0.076 +542 V 0.071 +543 P 0.071 +544 P 0.078 +545 L 0.086 +546 G 0.091 +547 S 0.098 +548 N 0.109 +549 V 0.115 +550 T 0.110 +551 L 0.101 +552 Q 0.100 +553 V 0.113 +554 F 0.141 +555 V 0.172 +556 L 0.195 +557 D 0.202 +558 E 0.199 +559 N 0.193 +560 D 0.189 +561 N 0.184 +562 A 0.173 +563 P 0.157 +564 A 0.143 +565 L 0.141 +566 L 0.159 +567 A 0.201 +568 T 0.280 +569 P 0.400 +570 A 0.530 +571 G 0.623 +572 S 0.661 +573 A 0.659 +574 G 0.627 +575 G 0.561 +576 A 0.465 +577 V 0.355 +578 S 0.251 +579 E 0.171 +580 L 0.120 +581 V 0.099 +582 P 0.098 +583 R 0.108 +584 S 0.123 +585 V 0.141 +586 G 0.161 +587 A 0.169 +588 G 0.157 +589 H 0.133 +590 V 0.109 +591 V 0.095 +592 A 0.088 +593 K 0.087 +594 V 0.089 +595 R 0.098 +596 A 0.115 +597 V 0.135 +598 D 0.156 +599 A 0.177 +600 D 0.193 +601 S 0.198 +602 G 0.191 +603 Y 0.179 +604 N 0.161 +605 A 0.137 +606 W 0.111 +607 L 0.091 +608 S 0.084 +609 Y 0.095 +610 E 0.118 +611 L 0.152 +612 Q 0.202 +613 P 0.263 +614 A 0.319 +615 A 0.344 +616 V 0.334 +617 G 0.301 +618 A 0.260 +619 H 0.210 +620 I 0.153 +621 P 0.107 +622 F 0.088 +623 H 0.094 +624 V 0.112 +625 G 0.123 +626 L 0.119 +627 Y 0.107 +628 T 0.095 +629 G 0.086 +630 E 0.077 +631 I 0.074 +632 S 0.081 +633 T 0.098 +634 T 0.114 +635 R 0.123 +636 I 0.125 +637 L 0.126 +638 D 0.132 +639 E 0.144 +640 A 0.157 +641 D 0.158 +642 A 0.145 +643 P 0.128 +644 R 0.113 +645 H 0.101 +646 R 0.089 +647 L 0.076 +648 L 0.066 +649 V 0.063 +650 L 0.066 +651 V 0.072 +652 K 0.077 +653 D 0.081 +654 H 0.084 +655 G 0.082 +656 E 0.076 +657 P 0.074 +658 A 0.076 +659 L 0.076 +660 T 0.074 +661 S 0.078 +662 T 0.087 +663 A 0.095 +664 T 0.097 +665 V 0.093 +666 L 0.087 +667 V 0.085 +668 S 0.095 +669 L 0.122 +670 V 0.172 +671 E 0.252 +672 N 0.359 +673 G 0.467 +674 Q 0.550 +675 A 0.611 +676 P 0.665 +677 K 0.717 +678 T 0.753 +679 S 0.770 +680 S 0.775 +681 R 0.780 +682 A 0.790 +683 S 0.803 +684 V 0.809 +685 G 0.798 +686 A 0.776 +687 V 0.754 +688 D 0.737 +689 P 0.726 +690 E 0.720 +691 A 0.715 +692 A 0.706 +693 L 0.682 +694 V 0.638 +695 D 0.573 +696 I 0.488 +697 N 0.398 +698 V 0.322 +699 Y 0.280 +700 L 0.273 +701 I 0.292 +702 I 0.331 +703 A 0.379 +704 I 0.419 +705 C 0.446 +706 A 0.471 +707 V 0.495 +708 S 0.510 +709 S 0.508 +710 L 0.487 +711 L 0.448 +712 V 0.399 +713 L 0.350 +714 T 0.310 +715 L 0.284 +716 L 0.265 +717 L 0.246 +718 Y 0.234 +719 T 0.240 +720 A 0.265 +721 L 0.302 +722 R 0.345 +723 C 0.390 +724 S 0.434 +725 A 0.483 +726 P 0.546 +727 P 0.619 +728 T 0.681 +729 V 0.719 +730 S 0.735 +731 R 0.736 +732 C 0.733 +733 A 0.733 +734 P 0.737 +735 G 0.748 +736 K 0.763 +737 P 0.778 +738 T 0.790 +739 L 0.800 +740 V 0.804 +741 C 0.800 +742 S 0.792 +743 S 0.790 +744 A 0.797 +745 V 0.805 +746 G 0.805 +747 S 0.796 +748 W 0.782 +749 S 0.763 +750 Y 0.733 +751 S 0.685 +752 Q 0.626 +753 Q 0.600 +754 R 0.639 +755 R 0.711 +756 Q 0.766 +757 R 0.792 +758 V 0.800 +759 C 0.796 +760 S 0.786 +761 A 0.773 +762 E 0.759 +763 S 0.751 +764 P 0.756 +765 P 0.778 +766 K 0.804 +767 T 0.820 +768 D 0.823 +769 L 0.815 +770 M 0.799 +771 A 0.777 +772 F 0.758 +773 S 0.754 +774 P 0.766 +775 S 0.780 +776 L 0.787 +777 Q 0.784 +778 L 0.768 +779 S 0.726 +780 R 0.666 +781 E 0.638 +782 D 0.667 +783 C 0.715 +784 L 0.733 +785 N 0.727 +786 P 0.726 +787 P 0.741 +788 S 0.761 +789 E 0.776 +790 P 0.781 +791 R 0.776 +792 Q 0.766 +793 P 0.757 +794 N 0.752 +795 P 0.750 +796 D 0.750 +797 W 0.755 +798 R 0.765 +799 Y 0.777 +800 S 0.786 +801 A 0.792 +802 S 0.794 +803 L 0.797 +804 R 0.801 +805 A 0.806 +806 G 0.808 +807 M 0.811 +808 H 0.816 +809 S 0.822 +810 S 0.826 +811 V 0.826 +812 H 0.827 +813 L 0.831 +814 E 0.833 +815 E 0.833 +816 A 0.831 +817 G 0.830 +818 I 0.829 +819 L 0.823 +820 R 0.811 +821 A 0.797 +822 G 0.786 +823 P 0.783 +824 G 0.786 +825 G 0.791 +826 P 0.791 +827 D 0.784 +828 Q 0.769 +829 Q 0.753 +830 W 0.751 +831 P 0.765 +832 T 0.772 +833 V 0.743 +834 S 0.681 +835 S 0.634 +836 A 0.636 +837 T 0.649 +838 P 0.637 +839 E 0.637 +840 P 0.690 +841 E 0.764 +842 A 0.813 +843 G 0.827 +844 E 0.820 +845 V 0.803 +846 S 0.788 +847 P 0.790 +848 P 0.808 +849 V 0.829 +850 G 0.843 +851 A 0.845 +852 G 0.841 +853 V 0.833 +854 N 0.825 +855 S 0.817 +856 N 0.806 +857 S 0.793 +858 W 0.782 +859 T 0.774 +860 F 0.766 +861 K 0.758 +862 Y 0.756 +863 G 0.760 +864 P 0.769 +865 G 0.781 +866 N 0.794 +867 P 0.803 +868 K 0.804 +869 Q 0.800 +870 S 0.796 +871 G 0.797 +872 P 0.801 +873 G 0.802 +874 E 0.799 +875 L 0.797 +876 P 0.802 +877 D 0.810 +878 K 0.810 +879 F 0.800 +880 I 0.791 +881 I 0.791 +882 P 0.797 +883 G 0.806 +884 S 0.814 +885 P 0.826 +886 A 0.839 +887 I 0.845 +888 I 0.842 +889 S 0.833 +890 I 0.818 +891 R 0.800 +892 Q 0.785 +893 E 0.777 +894 P 0.777 +895 T 0.784 +896 N 0.795 +897 S 0.802 +898 Q 0.801 +899 I 0.794 +900 D 0.787 +901 K 0.784 +902 S 0.784 +903 D 0.786 +904 F 0.788 +905 I 0.789 +906 T 0.790 +907 F 0.790 +908 G 0.782 +909 K 0.764 +910 K 0.734 +911 E 0.685 +912 E 0.621 +913 T 0.584 +914 K 0.608 +915 K 0.662 +916 K 0.703 +917 K 0.722 +918 K 0.731 +919 K 0.736 +920 K 0.739 +921 K 0.741 +922 G 0.742 +923 N 0.728 +924 K 0.674 +925 T 0.572 +926 Q 0.475 +927 E 0.454 +928 K 0.499 +929 K 0.541 +930 E 0.572 +931 K 0.630 +932 G 0.702 +933 N 0.752 +934 S 0.773 +935 T 0.781 +936 T 0.789 +937 D 0.795 +938 N 0.794 +939 S 0.783 +940 D 0.768 +941 Q 0.756 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000251664.5_ENST00000398631.3_GN:PCDHA12_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:32.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000251664.5_ENST00000398631.3_GN:PCDHA12_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:32.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..fc3d20c049ef21330287f47c3c2d9765643ddb80 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000251664.5_ENST00000398631.3_GN:PCDHA12_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:32.caid @@ -0,0 +1,974 @@ +>ENSG00000251664.5|ENST00000398631.3|GN:PCDHA12|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:32 +1 M 0.304 +2 Y 0.312 +3 L 0.323 +4 Q 0.330 +5 K 0.332 +6 R 0.342 +7 V 0.364 +8 T 0.379 +9 A 0.375 +10 H 0.371 +11 K 0.388 +12 I 0.407 +13 P 0.408 +14 Q 0.411 +15 A 0.444 +16 S 0.496 +17 D 0.540 +18 P 0.564 +19 L 0.570 +20 K 0.567 +21 L 0.561 +22 I 0.551 +23 V 0.532 +24 P 0.508 +25 T 0.492 +26 Q 0.497 +27 R 0.517 +28 P 0.532 +29 S 0.527 +30 F 0.514 +31 S 0.533 +32 A 0.597 +33 M 0.661 +34 V 0.675 +35 I 0.643 +36 I 0.592 +37 G 0.542 +38 P 0.504 +39 R 0.494 +40 G 0.523 +41 P 0.569 +42 G 0.592 +43 S 0.570 +44 Q 0.507 +45 R 0.429 +46 L 0.366 +47 L 0.324 +48 L 0.296 +49 S 0.280 +50 L 0.281 +51 L 0.286 +52 L 0.288 +53 L 0.292 +54 A 0.302 +55 A 0.314 +56 W 0.330 +57 E 0.354 +58 V 0.379 +59 G 0.386 +60 S 0.355 +61 G 0.289 +62 Q 0.208 +63 L 0.134 +64 H 0.083 +65 Y 0.055 +66 S 0.043 +67 V 0.040 +68 Y 0.044 +69 E 0.055 +70 E 0.070 +71 A 0.079 +72 K 0.080 +73 H 0.075 +74 G 0.070 +75 T 0.065 +76 F 0.059 +77 V 0.054 +78 G 0.051 +79 R 0.052 +80 I 0.056 +81 A 0.064 +82 Q 0.074 +83 D 0.087 +84 L 0.103 +85 G 0.115 +86 L 0.117 +87 E 0.113 +88 L 0.110 +89 A 0.110 +90 E 0.111 +91 L 0.119 +92 V 0.130 +93 P 0.128 +94 R 0.108 +95 L 0.082 +96 F 0.066 +97 R 0.067 +98 V 0.079 +99 A 0.091 +100 S 0.097 +101 K 0.100 +102 R 0.106 +103 H 0.118 +104 G 0.124 +105 D 0.112 +106 L 0.087 +107 L 0.066 +108 E 0.057 +109 V 0.053 +110 N 0.052 +111 L 0.053 +112 Q 0.060 +113 N 0.069 +114 G 0.073 +115 I 0.068 +116 L 0.062 +117 F 0.064 +118 V 0.073 +119 N 0.082 +120 S 0.084 +121 R 0.076 +122 I 0.066 +123 D 0.059 +124 R 0.061 +125 E 0.073 +126 K 0.087 +127 L 0.098 +128 C 0.107 +129 G 0.117 +130 R 0.127 +131 S 0.133 +132 A 0.131 +133 E 0.120 +134 C 0.104 +135 S 0.090 +136 I 0.080 +137 H 0.072 +138 L 0.063 +139 E 0.054 +140 V 0.049 +141 I 0.047 +142 V 0.047 +143 D 0.047 +144 R 0.047 +145 P 0.053 +146 L 0.064 +147 Q 0.078 +148 V 0.091 +149 F 0.098 +150 H 0.099 +151 V 0.096 +152 D 0.098 +153 V 0.112 +154 E 0.139 +155 V 0.165 +156 K 0.178 +157 D 0.179 +158 I 0.172 +159 N 0.165 +160 D 0.160 +161 N 0.154 +162 P 0.146 +163 P 0.141 +164 V 0.142 +165 F 0.149 +166 R 0.151 +167 E 0.145 +168 R 0.130 +169 E 0.113 +170 Q 0.098 +171 K 0.087 +172 V 0.079 +173 P 0.071 +174 V 0.063 +175 S 0.062 +176 E 0.071 +177 S 0.087 +178 A 0.098 +179 P 0.096 +180 L 0.088 +181 D 0.085 +182 S 0.087 +183 H 0.088 +184 F 0.090 +185 P 0.095 +186 L 0.104 +187 E 0.112 +188 G 0.116 +189 A 0.116 +190 S 0.116 +191 D 0.124 +192 A 0.136 +193 D 0.147 +194 I 0.151 +195 G 0.152 +196 V 0.152 +197 N 0.148 +198 S 0.133 +199 L 0.112 +200 L 0.093 +201 T 0.083 +202 Y 0.080 +203 A 0.080 +204 L 0.078 +205 S 0.074 +206 L 0.071 +207 N 0.066 +208 E 0.058 +209 N 0.050 +210 F 0.047 +211 E 0.048 +212 L 0.055 +213 K 0.065 +214 I 0.076 +215 K 0.088 +216 T 0.100 +217 K 0.111 +218 K 0.115 +219 D 0.118 +220 K 0.122 +221 S 0.122 +222 I 0.111 +223 L 0.092 +224 P 0.075 +225 E 0.066 +226 L 0.066 +227 V 0.074 +228 L 0.083 +229 R 0.089 +230 K 0.090 +231 L 0.084 +232 L 0.074 +233 D 0.064 +234 R 0.062 +235 E 0.072 +236 Q 0.083 +237 T 0.086 +238 P 0.080 +239 K 0.074 +240 L 0.072 +241 N 0.071 +242 L 0.067 +243 L 0.057 +244 L 0.048 +245 M 0.044 +246 V 0.046 +247 I 0.052 +248 D 0.061 +249 G 0.066 +250 G 0.063 +251 K 0.054 +252 P 0.049 +253 E 0.051 +254 L 0.056 +255 T 0.062 +256 G 0.070 +257 S 0.079 +258 V 0.083 +259 Q 0.080 +260 I 0.074 +261 Q 0.069 +262 I 0.074 +263 T 0.094 +264 V 0.124 +265 L 0.153 +266 D 0.167 +267 V 0.165 +268 N 0.155 +269 D 0.144 +270 N 0.132 +271 G 0.122 +272 P 0.114 +273 A 0.107 +274 F 0.097 +275 D 0.089 +276 K 0.086 +277 P 0.083 +278 S 0.074 +279 Y 0.059 +280 K 0.047 +281 V 0.039 +282 V 0.034 +283 L 0.032 +284 S 0.036 +285 E 0.048 +286 N 0.063 +287 V 0.075 +288 Q 0.076 +289 N 0.070 +290 D 0.065 +291 T 0.065 +292 R 0.066 +293 V 0.067 +294 I 0.073 +295 Q 0.084 +296 L 0.095 +297 N 0.104 +298 A 0.110 +299 S 0.115 +300 D 0.120 +301 P 0.132 +302 D 0.146 +303 E 0.156 +304 G 0.158 +305 L 0.157 +306 N 0.154 +307 G 0.144 +308 E 0.125 +309 I 0.102 +310 S 0.086 +311 Y 0.086 +312 G 0.094 +313 I 0.101 +314 K 0.104 +315 M 0.105 +316 I 0.102 +317 L 0.095 +318 P 0.096 +319 V 0.111 +320 S 0.132 +321 E 0.148 +322 K 0.149 +323 C 0.132 +324 M 0.102 +325 F 0.076 +326 S 0.065 +327 I 0.066 +328 N 0.069 +329 P 0.071 +330 D 0.072 +331 T 0.073 +332 G 0.072 +333 E 0.069 +334 I 0.067 +335 R 0.073 +336 I 0.086 +337 Y 0.104 +338 G 0.117 +339 E 0.115 +340 L 0.098 +341 D 0.078 +342 F 0.069 +343 E 0.075 +344 E 0.085 +345 N 0.087 +346 N 0.083 +347 A 0.081 +348 Y 0.079 +349 E 0.072 +350 I 0.060 +351 Q 0.048 +352 V 0.040 +353 N 0.036 +354 A 0.038 +355 I 0.043 +356 D 0.049 +357 K 0.054 +358 G 0.055 +359 I 0.056 +360 P 0.062 +361 S 0.069 +362 M 0.072 +363 A 0.069 +364 G 0.067 +365 H 0.069 +366 S 0.072 +367 M 0.075 +368 V 0.076 +369 L 0.081 +370 V 0.095 +371 E 0.120 +372 V 0.150 +373 L 0.171 +374 D 0.175 +375 V 0.168 +376 N 0.159 +377 D 0.155 +378 N 0.151 +379 V 0.145 +380 P 0.138 +381 E 0.130 +382 V 0.127 +383 M 0.128 +384 V 0.133 +385 T 0.138 +386 S 0.143 +387 L 0.139 +388 S 0.121 +389 L 0.095 +390 P 0.074 +391 V 0.064 +392 Q 0.068 +393 E 0.087 +394 D 0.115 +395 A 0.137 +396 Q 0.142 +397 V 0.137 +398 G 0.133 +399 T 0.127 +400 V 0.114 +401 I 0.098 +402 A 0.083 +403 L 0.071 +404 I 0.064 +405 S 0.067 +406 V 0.076 +407 S 0.089 +408 D 0.105 +409 R 0.125 +410 D 0.144 +411 S 0.155 +412 G 0.159 +413 A 0.157 +414 N 0.152 +415 G 0.143 +416 Q 0.129 +417 V 0.109 +418 I 0.091 +419 C 0.083 +420 S 0.087 +421 L 0.098 +422 T 0.113 +423 P 0.123 +424 H 0.118 +425 V 0.096 +426 P 0.073 +427 F 0.066 +428 K 0.071 +429 L 0.076 +430 V 0.075 +431 S 0.072 +432 T 0.067 +433 Y 0.059 +434 K 0.050 +435 N 0.041 +436 Y 0.036 +437 Y 0.038 +438 S 0.047 +439 L 0.061 +440 V 0.077 +441 L 0.092 +442 D 0.101 +443 S 0.100 +444 A 0.092 +445 L 0.078 +446 D 0.065 +447 R 0.060 +448 E 0.064 +449 S 0.071 +450 V 0.074 +451 S 0.078 +452 A 0.081 +453 Y 0.080 +454 E 0.069 +455 L 0.055 +456 V 0.044 +457 V 0.038 +458 T 0.038 +459 A 0.044 +460 R 0.053 +461 D 0.064 +462 G 0.069 +463 G 0.066 +464 S 0.060 +465 P 0.057 +466 S 0.058 +467 L 0.057 +468 W 0.057 +469 A 0.062 +470 T 0.072 +471 A 0.081 +472 R 0.087 +473 V 0.091 +474 S 0.096 +475 V 0.109 +476 E 0.133 +477 V 0.164 +478 A 0.189 +479 D 0.195 +480 V 0.184 +481 N 0.167 +482 D 0.155 +483 N 0.147 +484 A 0.140 +485 P 0.133 +486 A 0.129 +487 F 0.124 +488 A 0.121 +489 Q 0.121 +490 P 0.123 +491 E 0.115 +492 Y 0.096 +493 T 0.075 +494 V 0.059 +495 F 0.050 +496 V 0.048 +497 K 0.053 +498 E 0.067 +499 N 0.093 +500 N 0.125 +501 P 0.148 +502 P 0.152 +503 G 0.138 +504 C 0.118 +505 H 0.097 +506 I 0.083 +507 F 0.080 +508 T 0.089 +509 V 0.103 +510 S 0.117 +511 A 0.126 +512 W 0.130 +513 D 0.135 +514 A 0.147 +515 D 0.162 +516 A 0.171 +517 Q 0.175 +518 K 0.178 +519 N 0.179 +520 A 0.169 +521 L 0.146 +522 V 0.117 +523 S 0.094 +524 Y 0.086 +525 S 0.090 +526 L 0.098 +527 V 0.106 +528 E 0.115 +529 R 0.125 +530 R 0.137 +531 V 0.153 +532 G 0.173 +533 E 0.188 +534 H 0.185 +535 A 0.166 +536 L 0.140 +537 S 0.114 +538 S 0.089 +539 Y 0.071 +540 V 0.064 +541 S 0.065 +542 V 0.070 +543 H 0.074 +544 A 0.077 +545 E 0.082 +546 S 0.087 +547 G 0.089 +548 K 0.086 +549 V 0.084 +550 Y 0.092 +551 A 0.113 +552 L 0.136 +553 Q 0.150 +554 P 0.148 +555 L 0.131 +556 D 0.109 +557 H 0.095 +558 E 0.096 +559 E 0.100 +560 L 0.097 +561 E 0.084 +562 L 0.072 +563 L 0.065 +564 Q 0.059 +565 F 0.054 +566 Q 0.049 +567 V 0.047 +568 S 0.048 +569 A 0.052 +570 R 0.060 +571 D 0.068 +572 A 0.075 +573 G 0.075 +574 V 0.070 +575 P 0.070 +576 P 0.077 +577 L 0.085 +578 G 0.091 +579 S 0.098 +580 N 0.110 +581 V 0.117 +582 T 0.112 +583 L 0.102 +584 Q 0.101 +585 V 0.114 +586 F 0.142 +587 V 0.173 +588 L 0.196 +589 D 0.203 +590 E 0.199 +591 N 0.193 +592 D 0.189 +593 N 0.185 +594 A 0.176 +595 P 0.160 +596 A 0.146 +597 L 0.144 +598 L 0.162 +599 A 0.204 +600 T 0.283 +601 P 0.401 +602 A 0.529 +603 G 0.621 +604 S 0.658 +605 A 0.656 +606 G 0.626 +607 G 0.562 +608 A 0.468 +609 V 0.358 +610 S 0.254 +611 E 0.173 +612 L 0.121 +613 V 0.099 +614 P 0.098 +615 R 0.108 +616 S 0.124 +617 V 0.142 +618 G 0.162 +619 A 0.170 +620 G 0.159 +621 H 0.134 +622 V 0.111 +623 V 0.096 +624 A 0.090 +625 K 0.088 +626 V 0.090 +627 R 0.100 +628 A 0.117 +629 V 0.137 +630 D 0.157 +631 A 0.179 +632 D 0.196 +633 S 0.201 +634 G 0.194 +635 Y 0.182 +636 N 0.165 +637 A 0.141 +638 W 0.115 +639 L 0.094 +640 S 0.087 +641 Y 0.097 +642 E 0.120 +643 L 0.154 +644 Q 0.203 +645 P 0.265 +646 A 0.322 +647 A 0.349 +648 V 0.339 +649 G 0.306 +650 A 0.264 +651 H 0.213 +652 I 0.156 +653 P 0.109 +654 F 0.090 +655 H 0.096 +656 V 0.114 +657 G 0.125 +658 L 0.122 +659 Y 0.110 +660 T 0.098 +661 G 0.088 +662 E 0.079 +663 I 0.076 +664 S 0.083 +665 T 0.100 +666 T 0.117 +667 R 0.126 +668 I 0.128 +669 L 0.128 +670 D 0.134 +671 E 0.146 +672 A 0.158 +673 D 0.159 +674 A 0.147 +675 P 0.130 +676 R 0.115 +677 H 0.103 +678 R 0.090 +679 L 0.077 +680 L 0.068 +681 V 0.064 +682 L 0.067 +683 V 0.073 +684 K 0.078 +685 D 0.082 +686 H 0.085 +687 G 0.083 +688 E 0.077 +689 P 0.075 +690 A 0.077 +691 L 0.076 +692 T 0.075 +693 S 0.078 +694 T 0.087 +695 A 0.095 +696 T 0.098 +697 V 0.094 +698 L 0.088 +699 V 0.086 +700 S 0.096 +701 L 0.123 +702 V 0.173 +703 E 0.253 +704 N 0.360 +705 G 0.467 +706 Q 0.551 +707 A 0.611 +708 P 0.666 +709 K 0.718 +710 T 0.754 +711 S 0.772 +712 S 0.778 +713 R 0.783 +714 A 0.792 +715 S 0.805 +716 V 0.810 +717 G 0.800 +718 A 0.778 +719 V 0.756 +720 D 0.739 +721 P 0.729 +722 E 0.724 +723 A 0.720 +724 A 0.712 +725 L 0.689 +726 V 0.648 +727 D 0.584 +728 I 0.501 +729 N 0.409 +730 V 0.331 +731 Y 0.287 +732 L 0.279 +733 I 0.299 +734 I 0.339 +735 A 0.389 +736 I 0.431 +737 C 0.461 +738 A 0.488 +739 V 0.512 +740 S 0.525 +741 S 0.522 +742 L 0.498 +743 L 0.457 +744 V 0.406 +745 L 0.355 +746 T 0.314 +747 L 0.287 +748 L 0.269 +749 L 0.251 +750 Y 0.240 +751 T 0.247 +752 A 0.273 +753 L 0.309 +754 R 0.352 +755 C 0.395 +756 S 0.437 +757 A 0.485 +758 P 0.547 +759 P 0.619 +760 T 0.681 +761 V 0.720 +762 S 0.736 +763 R 0.738 +764 C 0.735 +765 A 0.734 +766 P 0.738 +767 G 0.749 +768 K 0.763 +769 P 0.778 +770 T 0.791 +771 L 0.800 +772 V 0.805 +773 C 0.802 +774 S 0.794 +775 S 0.791 +776 A 0.797 +777 V 0.803 +778 G 0.803 +779 S 0.794 +780 W 0.780 +781 S 0.761 +782 Y 0.731 +783 S 0.683 +784 Q 0.624 +785 Q 0.599 +786 R 0.638 +787 R 0.710 +788 Q 0.765 +789 R 0.791 +790 V 0.798 +791 C 0.794 +792 S 0.783 +793 A 0.770 +794 E 0.758 +795 S 0.750 +796 P 0.756 +797 P 0.777 +798 K 0.803 +799 T 0.819 +800 D 0.822 +801 L 0.814 +802 M 0.798 +803 A 0.776 +804 F 0.756 +805 S 0.752 +806 P 0.764 +807 S 0.779 +808 L 0.786 +809 Q 0.783 +810 L 0.767 +811 S 0.724 +812 R 0.665 +813 E 0.637 +814 D 0.667 +815 C 0.714 +816 L 0.733 +817 N 0.727 +818 P 0.726 +819 P 0.740 +820 S 0.761 +821 E 0.776 +822 P 0.781 +823 R 0.776 +824 Q 0.766 +825 P 0.758 +826 N 0.753 +827 P 0.751 +828 D 0.751 +829 W 0.756 +830 R 0.766 +831 Y 0.777 +832 S 0.786 +833 A 0.791 +834 S 0.794 +835 L 0.797 +836 R 0.801 +837 A 0.806 +838 G 0.809 +839 M 0.811 +840 H 0.817 +841 S 0.823 +842 S 0.826 +843 V 0.827 +844 H 0.828 +845 L 0.831 +846 E 0.834 +847 E 0.833 +848 A 0.831 +849 G 0.830 +850 I 0.830 +851 L 0.824 +852 R 0.811 +853 A 0.797 +854 G 0.787 +855 P 0.783 +856 G 0.787 +857 G 0.792 +858 P 0.793 +859 D 0.786 +860 Q 0.771 +861 Q 0.755 +862 W 0.753 +863 P 0.765 +864 T 0.772 +865 V 0.744 +866 S 0.681 +867 S 0.638 +868 A 0.655 +869 T 0.702 +870 P 0.740 +871 E 0.766 +872 P 0.793 +873 E 0.817 +874 A 0.830 +875 G 0.831 +876 E 0.821 +877 V 0.803 +878 S 0.788 +879 P 0.790 +880 P 0.808 +881 V 0.829 +882 G 0.842 +883 A 0.845 +884 G 0.840 +885 V 0.832 +886 N 0.824 +887 S 0.816 +888 N 0.805 +889 S 0.793 +890 W 0.782 +891 T 0.773 +892 F 0.764 +893 K 0.756 +894 Y 0.754 +895 G 0.758 +896 P 0.767 +897 G 0.779 +898 N 0.792 +899 P 0.801 +900 K 0.803 +901 Q 0.798 +902 S 0.794 +903 G 0.795 +904 P 0.799 +905 G 0.801 +906 E 0.798 +907 L 0.796 +908 P 0.801 +909 D 0.809 +910 K 0.809 +911 F 0.799 +912 I 0.790 +913 I 0.790 +914 P 0.797 +915 G 0.805 +916 S 0.814 +917 P 0.826 +918 A 0.838 +919 I 0.844 +920 I 0.841 +921 S 0.831 +922 I 0.816 +923 R 0.798 +924 Q 0.782 +925 E 0.774 +926 P 0.773 +927 T 0.780 +928 N 0.791 +929 S 0.799 +930 Q 0.798 +931 I 0.792 +932 D 0.786 +933 K 0.783 +934 S 0.782 +935 D 0.784 +936 F 0.786 +937 I 0.788 +938 T 0.789 +939 F 0.789 +940 G 0.780 +941 K 0.761 +942 K 0.731 +943 E 0.682 +944 E 0.618 +945 T 0.582 +946 K 0.606 +947 K 0.661 +948 K 0.701 +949 K 0.721 +950 K 0.731 +951 K 0.736 +952 K 0.738 +953 K 0.740 +954 G 0.741 +955 N 0.726 +956 K 0.672 +957 T 0.571 +958 Q 0.474 +959 E 0.453 +960 K 0.497 +961 K 0.539 +962 E 0.570 +963 K 0.628 +964 G 0.701 +965 N 0.750 +966 S 0.771 +967 T 0.779 +968 T 0.787 +969 D 0.793 +970 N 0.792 +971 S 0.782 +972 D 0.766 +973 Q 0.754 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000254997.4_ENST00000528743.4_GN:KRTAP5-9_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000254997.4_ENST00000528743.4_GN:KRTAP5-9_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..3a9ee41aaa7567ad5576159ead667dcc9c356359 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000254997.4_ENST00000528743.4_GN:KRTAP5-9_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,170 @@ +>ENSG00000254997.4|ENST00000528743.4|GN:KRTAP5-9|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.478 +2 G 0.495 +3 C 0.529 +4 C 0.568 +5 G 0.601 +6 C 0.624 +7 S 0.645 +8 G 0.655 +9 G 0.645 +10 C 0.611 +11 G 0.568 +12 S 0.548 +13 S 0.570 +14 C 0.619 +15 G 0.661 +16 G 0.673 +17 C 0.646 +18 D 0.598 +19 S 0.573 +20 S 0.596 +21 C 0.644 +22 G 0.683 +23 S 0.701 +24 C 0.701 +25 G 0.696 +26 S 0.688 +27 G 0.676 +28 C 0.668 +29 R 0.668 +30 G 0.662 +31 C 0.646 +32 G 0.636 +33 P 0.648 +34 S 0.678 +35 C 0.704 +36 C 0.719 +37 A 0.724 +38 P 0.721 +39 V 0.712 +40 Y 0.700 +41 C 0.695 +42 C 0.703 +43 K 0.715 +44 P 0.717 +45 V 0.703 +46 C 0.674 +47 C 0.644 +48 C 0.630 +49 V 0.637 +50 P 0.649 +51 A 0.642 +52 C 0.613 +53 S 0.577 +54 C 0.554 +55 S 0.550 +56 S 0.565 +57 C 0.593 +58 G 0.628 +59 K 0.664 +60 R 0.688 +61 G 0.700 +62 C 0.713 +63 G 0.732 +64 S 0.747 +65 C 0.749 +66 G 0.737 +67 G 0.715 +68 S 0.692 +69 K 0.681 +70 G 0.681 +71 G 0.689 +72 C 0.698 +73 G 0.702 +74 S 0.692 +75 C 0.659 +76 G 0.610 +77 C 0.561 +78 S 0.518 +79 Q 0.477 +80 C 0.448 +81 S 0.450 +82 C 0.488 +83 C 0.537 +84 K 0.565 +85 P 0.545 +86 C 0.483 +87 C 0.422 +88 C 0.408 +89 S 0.446 +90 S 0.512 +91 G 0.580 +92 C 0.636 +93 G 0.657 +94 S 0.619 +95 S 0.519 +96 C 0.395 +97 C 0.300 +98 Q 0.252 +99 C 0.239 +100 S 0.245 +101 C 0.271 +102 C 0.315 +103 K 0.352 +104 P 0.349 +105 Y 0.304 +106 C 0.247 +107 S 0.209 +108 Q 0.198 +109 C 0.213 +110 S 0.252 +111 C 0.311 +112 C 0.379 +113 K 0.434 +114 P 0.443 +115 C 0.400 +116 C 0.338 +117 S 0.294 +118 S 0.276 +119 S 0.287 +120 G 0.326 +121 R 0.390 +122 G 0.457 +123 S 0.491 +124 S 0.470 +125 C 0.418 +126 C 0.377 +127 Q 0.366 +128 S 0.378 +129 S 0.405 +130 C 0.446 +131 C 0.488 +132 K 0.508 +133 P 0.485 +134 C 0.423 +135 C 0.356 +136 S 0.312 +137 S 0.301 +138 S 0.324 +139 G 0.382 +140 C 0.461 +141 G 0.530 +142 S 0.547 +143 S 0.496 +144 C 0.414 +145 C 0.348 +146 Q 0.313 +147 S 0.295 +148 S 0.289 +149 C 0.313 +150 C 0.363 +151 K 0.400 +152 P 0.383 +153 C 0.318 +154 C 0.249 +155 S 0.211 +156 Q 0.200 +157 S 0.202 +158 R 0.214 +159 C 0.246 +160 C 0.297 +161 V 0.351 +162 P 0.382 +163 V 0.373 +164 C 0.341 +165 Y 0.319 +166 Q 0.317 +167 C 0.318 +168 K 0.309 +169 I 0.297 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000254997.4_ENST00000528743.4_GN:KRTAP5-9_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:32.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000254997.4_ENST00000528743.4_GN:KRTAP5-9_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:32.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d1742b6effb7d66ba0963fb875ac6a12af7f6d27 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000254997.4_ENST00000528743.4_GN:KRTAP5-9_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:32.caid @@ -0,0 +1,202 @@ +>ENSG00000254997.4|ENST00000528743.4|GN:KRTAP5-9|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:32 +1 M 0.387 +2 W 0.422 +3 D 0.470 +4 I 0.491 +5 K 0.460 +6 S 0.422 +7 R 0.457 +8 G 0.565 +9 S 0.670 +10 G 0.720 +11 G 0.724 +12 S 0.702 +13 T 0.669 +14 P 0.637 +15 A 0.619 +16 P 0.615 +17 P 0.616 +18 S 0.607 +19 H 0.576 +20 L 0.524 +21 L 0.467 +22 L 0.428 +23 Y 0.420 +24 L 0.437 +25 L 0.472 +26 H 0.529 +27 P 0.605 +28 Q 0.680 +29 S 0.732 +30 T 0.755 +31 R 0.761 +32 T 0.765 +33 M 0.766 +34 G 0.761 +35 C 0.751 +36 C 0.739 +37 G 0.729 +38 C 0.728 +39 S 0.740 +40 G 0.756 +41 G 0.764 +42 C 0.766 +43 G 0.769 +44 S 0.771 +45 S 0.770 +46 C 0.771 +47 G 0.775 +48 G 0.766 +49 C 0.726 +50 D 0.664 +51 S 0.630 +52 S 0.658 +53 C 0.718 +54 G 0.763 +55 S 0.781 +56 C 0.783 +57 G 0.780 +58 S 0.772 +59 G 0.758 +60 C 0.746 +61 R 0.745 +62 G 0.744 +63 C 0.737 +64 G 0.734 +65 P 0.743 +66 S 0.760 +67 C 0.773 +68 C 0.778 +69 A 0.779 +70 P 0.775 +71 V 0.762 +72 Y 0.744 +73 C 0.732 +74 C 0.735 +75 K 0.747 +76 P 0.755 +77 V 0.745 +78 C 0.717 +79 C 0.687 +80 C 0.672 +81 V 0.677 +82 P 0.685 +83 A 0.672 +84 C 0.639 +85 S 0.602 +86 C 0.575 +87 S 0.565 +88 S 0.572 +89 C 0.592 +90 G 0.625 +91 K 0.662 +92 R 0.689 +93 G 0.703 +94 C 0.716 +95 G 0.731 +96 S 0.740 +97 C 0.734 +98 G 0.716 +99 G 0.689 +100 S 0.664 +101 K 0.652 +102 G 0.653 +103 G 0.659 +104 C 0.666 +105 G 0.669 +106 S 0.655 +107 C 0.618 +108 G 0.567 +109 C 0.518 +110 S 0.480 +111 Q 0.452 +112 C 0.439 +113 S 0.459 +114 C 0.507 +115 C 0.558 +116 K 0.583 +117 P 0.558 +118 C 0.492 +119 C 0.427 +120 C 0.411 +121 S 0.451 +122 S 0.524 +123 G 0.600 +124 C 0.659 +125 G 0.677 +126 S 0.636 +127 S 0.540 +128 C 0.428 +129 C 0.345 +130 Q 0.306 +131 C 0.298 +132 S 0.314 +133 C 0.353 +134 C 0.406 +135 K 0.442 +136 P 0.430 +137 Y 0.373 +138 C 0.311 +139 S 0.272 +140 Q 0.262 +141 C 0.276 +142 S 0.315 +143 C 0.378 +144 C 0.449 +145 K 0.500 +146 P 0.501 +147 C 0.452 +148 C 0.390 +149 S 0.347 +150 S 0.329 +151 S 0.336 +152 G 0.372 +153 R 0.436 +154 G 0.506 +155 S 0.539 +156 S 0.512 +157 C 0.453 +158 C 0.407 +159 Q 0.392 +160 S 0.399 +161 S 0.421 +162 C 0.461 +163 C 0.511 +164 K 0.538 +165 P 0.515 +166 C 0.450 +167 C 0.380 +168 S 0.337 +169 S 0.326 +170 S 0.346 +171 G 0.398 +172 C 0.473 +173 G 0.544 +174 S 0.565 +175 S 0.518 +176 C 0.436 +177 C 0.369 +178 Q 0.330 +179 S 0.305 +180 S 0.291 +181 C 0.308 +182 C 0.357 +183 K 0.397 +184 P 0.385 +185 C 0.321 +186 C 0.250 +187 S 0.209 +188 Q 0.198 +189 S 0.201 +190 R 0.216 +191 C 0.253 +192 C 0.312 +193 V 0.378 +194 P 0.419 +195 V 0.415 +196 C 0.385 +197 Y 0.364 +198 Q 0.364 +199 C 0.360 +200 K 0.342 +201 I 0.322 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000257017.11_ENST00000355906.10_GN:HP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000257017.11_ENST00000355906.10_GN:HP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b95225c66227cd98ec3f0b3b91dde3b6a8d6b6a5 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000257017.11_ENST00000355906.10_GN:HP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,407 @@ +>ENSG00000257017.11|ENST00000355906.10|GN:HP|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.304 +2 S 0.299 +3 A 0.306 +4 L 0.323 +5 G 0.317 +6 A 0.279 +7 V 0.241 +8 I 0.225 +9 A 0.221 +10 L 0.222 +11 L 0.239 +12 L 0.272 +13 W 0.305 +14 G 0.328 +15 Q 0.348 +16 L 0.381 +17 F 0.434 +18 A 0.497 +19 V 0.553 +20 D 0.598 +21 S 0.630 +22 G 0.651 +23 N 0.668 +24 D 0.687 +25 V 0.704 +26 T 0.713 +27 D 0.708 +28 I 0.679 +29 A 0.619 +30 D 0.538 +31 D 0.459 +32 G 0.401 +33 C 0.376 +34 P 0.380 +35 K 0.394 +36 P 0.389 +37 P 0.350 +38 E 0.284 +39 I 0.215 +40 A 0.163 +41 H 0.135 +42 G 0.134 +43 Y 0.148 +44 V 0.157 +45 E 0.148 +46 H 0.139 +47 S 0.147 +48 V 0.165 +49 R 0.171 +50 Y 0.163 +51 Q 0.155 +52 C 0.163 +53 K 0.183 +54 N 0.196 +55 Y 0.190 +56 Y 0.179 +57 K 0.175 +58 L 0.175 +59 R 0.172 +60 T 0.167 +61 E 0.162 +62 G 0.151 +63 D 0.131 +64 G 0.109 +65 V 0.088 +66 Y 0.074 +67 T 0.067 +68 L 0.068 +69 N 0.074 +70 D 0.078 +71 K 0.076 +72 K 0.072 +73 Q 0.071 +74 W 0.073 +75 I 0.083 +76 N 0.106 +77 K 0.140 +78 A 0.174 +79 V 0.191 +80 G 0.192 +81 D 0.189 +82 K 0.185 +83 L 0.178 +84 P 0.171 +85 E 0.174 +86 C 0.187 +87 E 0.208 +88 A 0.234 +89 D 0.254 +90 D 0.262 +91 G 0.256 +92 C 0.241 +93 P 0.228 +94 K 0.221 +95 P 0.215 +96 P 0.199 +97 E 0.172 +98 I 0.140 +99 A 0.111 +100 H 0.092 +101 G 0.090 +102 Y 0.102 +103 V 0.110 +104 E 0.103 +105 H 0.093 +106 S 0.094 +107 V 0.104 +108 R 0.107 +109 Y 0.102 +110 Q 0.097 +111 C 0.099 +112 K 0.111 +113 N 0.120 +114 Y 0.118 +115 Y 0.108 +116 K 0.098 +117 L 0.091 +118 R 0.086 +119 T 0.086 +120 E 0.093 +121 G 0.098 +122 D 0.093 +123 G 0.079 +124 V 0.065 +125 Y 0.055 +126 T 0.050 +127 L 0.052 +128 N 0.056 +129 N 0.057 +130 E 0.055 +131 K 0.055 +132 Q 0.058 +133 W 0.065 +134 I 0.074 +135 N 0.089 +136 K 0.109 +137 A 0.130 +138 V 0.139 +139 G 0.133 +140 D 0.125 +141 K 0.122 +142 L 0.122 +143 P 0.121 +144 E 0.118 +145 C 0.115 +146 E 0.115 +147 A 0.113 +148 V 0.107 +149 C 0.100 +150 G 0.101 +151 K 0.114 +152 P 0.139 +153 K 0.179 +154 N 0.233 +155 P 0.289 +156 A 0.335 +157 N 0.363 +158 P 0.366 +159 V 0.343 +160 Q 0.308 +161 R 0.277 +162 I 0.255 +163 L 0.237 +164 G 0.216 +165 G 0.194 +166 H 0.182 +167 L 0.188 +168 D 0.201 +169 A 0.204 +170 K 0.187 +171 G 0.156 +172 S 0.118 +173 F 0.081 +174 P 0.052 +175 W 0.034 +176 Q 0.024 +177 A 0.020 +178 K 0.021 +179 M 0.026 +180 V 0.035 +181 S 0.046 +182 H 0.055 +183 H 0.059 +184 N 0.057 +185 L 0.049 +186 T 0.038 +187 T 0.026 +188 G 0.020 +189 A 0.021 +190 T 0.029 +191 L 0.039 +192 I 0.045 +193 N 0.045 +194 E 0.039 +195 Q 0.032 +196 W 0.026 +197 L 0.022 +198 L 0.020 +199 T 0.019 +200 T 0.023 +201 A 0.032 +202 K 0.046 +203 N 0.062 +204 L 0.078 +205 F 0.098 +206 L 0.120 +207 N 0.137 +208 H 0.141 +209 S 0.140 +210 E 0.142 +211 N 0.143 +212 A 0.134 +213 T 0.116 +214 A 0.103 +215 K 0.100 +216 D 0.102 +217 I 0.102 +218 A 0.092 +219 P 0.073 +220 T 0.050 +221 L 0.032 +222 T 0.021 +223 L 0.017 +224 Y 0.018 +225 V 0.022 +226 G 0.028 +227 K 0.033 +228 K 0.037 +229 Q 0.039 +230 L 0.039 +231 V 0.036 +232 E 0.031 +233 I 0.027 +234 E 0.024 +235 K 0.024 +236 V 0.029 +237 V 0.037 +238 L 0.045 +239 H 0.047 +240 P 0.044 +241 N 0.041 +242 Y 0.043 +243 S 0.049 +244 Q 0.054 +245 V 0.051 +246 D 0.039 +247 I 0.027 +248 G 0.019 +249 L 0.017 +250 I 0.019 +251 K 0.023 +252 L 0.029 +253 K 0.034 +254 Q 0.040 +255 K 0.050 +256 V 0.065 +257 S 0.082 +258 V 0.092 +259 N 0.089 +260 E 0.078 +261 R 0.065 +262 V 0.057 +263 M 0.053 +264 P 0.050 +265 I 0.049 +266 C 0.052 +267 L 0.061 +268 P 0.072 +269 S 0.080 +270 K 0.080 +271 D 0.074 +272 Y 0.064 +273 A 0.056 +274 E 0.053 +275 V 0.054 +276 G 0.054 +277 R 0.049 +278 V 0.039 +279 G 0.030 +280 Y 0.026 +281 V 0.027 +282 S 0.033 +283 G 0.043 +284 W 0.057 +285 G 0.071 +286 R 0.084 +287 N 0.098 +288 A 0.113 +289 N 0.127 +290 F 0.133 +291 K 0.128 +292 F 0.115 +293 T 0.100 +294 D 0.089 +295 H 0.084 +296 L 0.081 +297 K 0.077 +298 Y 0.073 +299 V 0.072 +300 M 0.073 +301 L 0.072 +302 P 0.069 +303 V 0.065 +304 A 0.060 +305 D 0.055 +306 Q 0.050 +307 D 0.045 +308 Q 0.042 +309 C 0.044 +310 I 0.054 +311 R 0.070 +312 H 0.093 +313 Y 0.125 +314 E 0.172 +315 G 0.238 +316 S 0.314 +317 T 0.384 +318 V 0.430 +319 P 0.450 +320 E 0.449 +321 K 0.438 +322 K 0.428 +323 T 0.426 +324 P 0.430 +325 K 0.440 +326 S 0.454 +327 P 0.469 +328 V 0.471 +329 G 0.451 +330 V 0.412 +331 Q 0.354 +332 P 0.283 +333 I 0.209 +334 L 0.148 +335 N 0.107 +336 E 0.081 +337 H 0.065 +338 T 0.052 +339 F 0.046 +340 C 0.049 +341 A 0.060 +342 G 0.077 +343 M 0.096 +344 S 0.112 +345 K 0.121 +346 Y 0.123 +347 Q 0.118 +348 E 0.110 +349 D 0.099 +350 T 0.088 +351 C 0.079 +352 Y 0.079 +353 G 0.084 +354 D 0.085 +355 A 0.079 +356 G 0.071 +357 S 0.067 +358 A 0.063 +359 F 0.057 +360 A 0.052 +361 V 0.053 +362 H 0.058 +363 D 0.063 +364 L 0.067 +365 E 0.072 +366 E 0.074 +367 D 0.069 +368 T 0.059 +369 W 0.047 +370 Y 0.038 +371 A 0.035 +372 T 0.038 +373 G 0.044 +374 I 0.050 +375 L 0.056 +376 S 0.060 +377 F 0.064 +378 D 0.067 +379 K 0.069 +380 S 0.071 +381 C 0.076 +382 A 0.082 +383 V 0.085 +384 A 0.078 +385 E 0.063 +386 Y 0.048 +387 G 0.041 +388 V 0.040 +389 Y 0.045 +390 V 0.053 +391 K 0.063 +392 V 0.071 +393 T 0.076 +394 S 0.077 +395 I 0.077 +396 Q 0.077 +397 D 0.075 +398 W 0.068 +399 V 0.068 +400 Q 0.077 +401 K 0.088 +402 T 0.094 +403 I 0.108 +404 A 0.133 +405 E 0.164 +406 N 0.185 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000257017.11_ENST00000355906.10_GN:HP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000257017.11_ENST00000355906.10_GN:HP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..cda2c5e6cd948d9d62b9f299f99dc846d7d83ba4 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000257017.11_ENST00000355906.10_GN:HP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid @@ -0,0 +1,421 @@ +>ENSG00000257017.11|ENST00000355906.10|GN:HP|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:14 +1 M 0.351 +2 P 0.347 +3 H 0.354 +4 S 0.373 +5 T 0.389 +6 A 0.406 +7 L 0.438 +8 P 0.465 +9 E 0.462 +10 A 0.448 +11 R 0.453 +12 P 0.462 +13 T 0.450 +14 K 0.433 +15 M 0.432 +16 S 0.429 +17 A 0.413 +18 L 0.401 +19 G 0.394 +20 A 0.362 +21 V 0.305 +22 I 0.266 +23 A 0.254 +24 L 0.253 +25 L 0.257 +26 L 0.280 +27 W 0.312 +28 G 0.340 +29 Q 0.364 +30 L 0.403 +31 F 0.464 +32 A 0.531 +33 V 0.588 +34 D 0.631 +35 S 0.658 +36 G 0.672 +37 N 0.684 +38 D 0.699 +39 V 0.713 +40 T 0.721 +41 D 0.716 +42 I 0.685 +43 A 0.623 +44 D 0.539 +45 D 0.456 +46 G 0.398 +47 C 0.377 +48 P 0.387 +49 K 0.402 +50 P 0.395 +51 P 0.353 +52 E 0.286 +53 I 0.217 +54 A 0.165 +55 H 0.136 +56 G 0.134 +57 Y 0.148 +58 V 0.155 +59 E 0.145 +60 H 0.134 +61 S 0.140 +62 V 0.155 +63 R 0.161 +64 Y 0.153 +65 Q 0.146 +66 C 0.153 +67 K 0.170 +68 N 0.181 +69 Y 0.177 +70 Y 0.167 +71 K 0.164 +72 L 0.165 +73 R 0.162 +74 T 0.157 +75 E 0.152 +76 G 0.141 +77 D 0.122 +78 G 0.100 +79 V 0.081 +80 Y 0.068 +81 T 0.061 +82 L 0.061 +83 N 0.065 +84 D 0.069 +85 K 0.069 +86 K 0.067 +87 Q 0.067 +88 W 0.071 +89 I 0.080 +90 N 0.101 +91 K 0.134 +92 A 0.167 +93 V 0.185 +94 G 0.188 +95 D 0.186 +96 K 0.182 +97 L 0.175 +98 P 0.170 +99 E 0.174 +100 C 0.186 +101 E 0.206 +102 A 0.230 +103 D 0.251 +104 D 0.262 +105 G 0.259 +106 C 0.247 +107 P 0.235 +108 K 0.231 +109 P 0.227 +110 P 0.213 +111 E 0.185 +112 I 0.151 +113 A 0.119 +114 H 0.097 +115 G 0.094 +116 Y 0.105 +117 V 0.112 +118 E 0.106 +119 H 0.095 +120 S 0.096 +121 V 0.106 +122 R 0.110 +123 Y 0.105 +124 Q 0.099 +125 C 0.101 +126 K 0.112 +127 N 0.121 +128 Y 0.120 +129 Y 0.110 +130 K 0.100 +131 L 0.093 +132 R 0.087 +133 T 0.087 +134 E 0.095 +135 G 0.102 +136 D 0.097 +137 G 0.084 +138 V 0.069 +139 Y 0.057 +140 T 0.052 +141 L 0.054 +142 N 0.057 +143 N 0.058 +144 E 0.055 +145 K 0.055 +146 Q 0.059 +147 W 0.067 +148 I 0.076 +149 N 0.090 +150 K 0.110 +151 A 0.131 +152 V 0.139 +153 G 0.133 +154 D 0.126 +155 K 0.123 +156 L 0.123 +157 P 0.121 +158 E 0.117 +159 C 0.114 +160 E 0.115 +161 A 0.114 +162 V 0.108 +163 C 0.101 +164 G 0.102 +165 K 0.114 +166 P 0.139 +167 K 0.179 +168 N 0.233 +169 P 0.289 +170 A 0.336 +171 N 0.364 +172 P 0.366 +173 V 0.342 +174 Q 0.306 +175 R 0.274 +176 I 0.253 +177 L 0.236 +178 G 0.216 +179 G 0.194 +180 H 0.183 +181 L 0.189 +182 D 0.202 +183 A 0.205 +184 K 0.188 +185 G 0.156 +186 S 0.118 +187 F 0.081 +188 P 0.052 +189 W 0.034 +190 Q 0.024 +191 A 0.020 +192 K 0.021 +193 M 0.026 +194 V 0.036 +195 S 0.047 +196 H 0.056 +197 H 0.059 +198 N 0.057 +199 L 0.049 +200 T 0.037 +201 T 0.026 +202 G 0.020 +203 A 0.021 +204 T 0.028 +205 L 0.038 +206 I 0.044 +207 N 0.044 +208 E 0.038 +209 Q 0.031 +210 W 0.025 +211 L 0.022 +212 L 0.020 +213 T 0.019 +214 T 0.023 +215 A 0.032 +216 K 0.046 +217 N 0.061 +218 L 0.076 +219 F 0.095 +220 L 0.117 +221 N 0.133 +222 H 0.137 +223 S 0.136 +224 E 0.138 +225 N 0.140 +226 A 0.131 +227 T 0.114 +228 A 0.101 +229 K 0.098 +230 D 0.101 +231 I 0.101 +232 A 0.092 +233 P 0.072 +234 T 0.050 +235 L 0.032 +236 T 0.021 +237 L 0.017 +238 Y 0.018 +239 V 0.022 +240 G 0.028 +241 K 0.033 +242 K 0.037 +243 Q 0.040 +244 L 0.040 +245 V 0.037 +246 E 0.032 +247 I 0.027 +248 E 0.024 +249 K 0.024 +250 V 0.029 +251 V 0.037 +252 L 0.045 +253 H 0.047 +254 P 0.044 +255 N 0.041 +256 Y 0.043 +257 S 0.049 +258 Q 0.054 +259 V 0.050 +260 D 0.039 +261 I 0.027 +262 G 0.019 +263 L 0.017 +264 I 0.019 +265 K 0.023 +266 L 0.029 +267 K 0.034 +268 Q 0.040 +269 K 0.051 +270 V 0.067 +271 S 0.084 +272 V 0.093 +273 N 0.091 +274 E 0.080 +275 R 0.066 +276 V 0.058 +277 M 0.054 +278 P 0.051 +279 I 0.050 +280 C 0.053 +281 L 0.063 +282 P 0.074 +283 S 0.082 +284 K 0.082 +285 D 0.076 +286 Y 0.066 +287 A 0.057 +288 E 0.054 +289 V 0.055 +290 G 0.055 +291 R 0.050 +292 V 0.041 +293 G 0.031 +294 Y 0.027 +295 V 0.028 +296 S 0.034 +297 G 0.044 +298 W 0.058 +299 G 0.072 +300 R 0.086 +301 N 0.100 +302 A 0.116 +303 N 0.129 +304 F 0.135 +305 K 0.131 +306 F 0.118 +307 T 0.102 +308 D 0.092 +309 H 0.087 +310 L 0.084 +311 K 0.079 +312 Y 0.075 +313 V 0.074 +314 M 0.075 +315 L 0.074 +316 P 0.071 +317 V 0.067 +318 A 0.062 +319 D 0.057 +320 Q 0.051 +321 D 0.046 +322 Q 0.043 +323 C 0.045 +324 I 0.055 +325 R 0.072 +326 H 0.095 +327 Y 0.128 +328 E 0.176 +329 G 0.241 +330 S 0.318 +331 T 0.387 +332 V 0.433 +333 P 0.452 +334 E 0.451 +335 K 0.440 +336 K 0.429 +337 T 0.426 +338 P 0.430 +339 K 0.440 +340 S 0.455 +341 P 0.471 +342 V 0.474 +343 G 0.454 +344 V 0.414 +345 Q 0.356 +346 P 0.284 +347 I 0.211 +348 L 0.150 +349 N 0.108 +350 E 0.083 +351 H 0.066 +352 T 0.053 +353 F 0.047 +354 C 0.050 +355 A 0.061 +356 G 0.078 +357 M 0.097 +358 S 0.114 +359 K 0.123 +360 Y 0.124 +361 Q 0.120 +362 E 0.110 +363 D 0.099 +364 T 0.087 +365 C 0.079 +366 Y 0.079 +367 G 0.084 +368 D 0.085 +369 A 0.079 +370 G 0.071 +371 S 0.067 +372 A 0.064 +373 F 0.057 +374 A 0.052 +375 V 0.054 +376 H 0.059 +377 D 0.063 +378 L 0.068 +379 E 0.072 +380 E 0.073 +381 D 0.069 +382 T 0.059 +383 W 0.047 +384 Y 0.038 +385 A 0.035 +386 T 0.038 +387 G 0.044 +388 I 0.051 +389 L 0.057 +390 S 0.061 +391 F 0.065 +392 D 0.068 +393 K 0.070 +394 S 0.072 +395 C 0.076 +396 A 0.083 +397 V 0.085 +398 A 0.078 +399 E 0.063 +400 Y 0.049 +401 G 0.041 +402 V 0.041 +403 Y 0.045 +404 V 0.053 +405 K 0.063 +406 V 0.072 +407 T 0.077 +408 S 0.078 +409 I 0.078 +410 Q 0.078 +411 D 0.075 +412 W 0.069 +413 V 0.068 +414 Q 0.078 +415 K 0.088 +416 T 0.095 +417 I 0.109 +418 A 0.134 +419 E 0.165 +420 N 0.186 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000258436.2_ENST00000696784.1_GN:RNASE12_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000258436.2_ENST00000696784.1_GN:RNASE12_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..87b022c2e280e8ee361a3cb51f2c22a101a05f63 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000258436.2_ENST00000696784.1_GN:RNASE12_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,148 @@ +>ENSG00000258436.2|ENST00000696784.1|GN:RNASE12|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.239 +2 I 0.216 +3 I 0.188 +4 M 0.170 +5 V 0.163 +6 I 0.159 +7 I 0.155 +8 F 0.151 +9 L 0.147 +10 V 0.150 +11 L 0.166 +12 L 0.195 +13 F 0.233 +14 W 0.277 +15 E 0.323 +16 N 0.366 +17 E 0.394 +18 V 0.398 +19 N 0.376 +20 D 0.348 +21 E 0.328 +22 A 0.312 +23 V 0.278 +24 M 0.225 +25 S 0.171 +26 T 0.129 +27 L 0.099 +28 E 0.079 +29 H 0.069 +30 L 0.065 +31 H 0.062 +32 V 0.064 +33 D 0.073 +34 Y 0.084 +35 P 0.095 +36 Q 0.109 +37 N 0.125 +38 D 0.139 +39 V 0.144 +40 P 0.136 +41 V 0.118 +42 P 0.097 +43 A 0.080 +44 R 0.065 +45 Y 0.050 +46 C 0.037 +47 N 0.032 +48 H 0.032 +49 M 0.034 +50 I 0.038 +51 I 0.046 +52 Q 0.059 +53 R 0.074 +54 V 0.090 +55 I 0.104 +56 R 0.115 +57 E 0.118 +58 P 0.113 +59 D 0.105 +60 H 0.096 +61 T 0.085 +62 C 0.071 +63 K 0.059 +64 K 0.052 +65 E 0.049 +66 H 0.045 +67 V 0.041 +68 F 0.039 +69 I 0.043 +70 H 0.051 +71 E 0.060 +72 R 0.066 +73 P 0.069 +74 R 0.068 +75 K 0.064 +76 I 0.062 +77 N 0.060 +78 G 0.057 +79 I 0.050 +80 C 0.043 +81 I 0.041 +82 S 0.045 +83 P 0.050 +84 K 0.053 +85 K 0.056 +86 V 0.061 +87 A 0.068 +88 C 0.075 +89 Q 0.083 +90 N 0.093 +91 L 0.099 +92 S 0.097 +93 A 0.083 +94 I 0.064 +95 F 0.049 +96 C 0.043 +97 F 0.048 +98 Q 0.063 +99 S 0.080 +100 E 0.091 +101 T 0.093 +102 K 0.087 +103 F 0.076 +104 K 0.067 +105 M 0.062 +106 T 0.061 +107 V 0.058 +108 C 0.057 +109 Q 0.060 +110 L 0.067 +111 I 0.075 +112 E 0.079 +113 G 0.077 +114 T 0.069 +115 R 0.058 +116 Y 0.053 +117 P 0.057 +118 A 0.065 +119 C 0.072 +120 R 0.076 +121 Y 0.082 +122 H 0.090 +123 Y 0.098 +124 S 0.108 +125 P 0.120 +126 T 0.134 +127 E 0.144 +128 G 0.146 +129 F 0.141 +130 V 0.132 +131 L 0.118 +132 V 0.096 +133 T 0.074 +134 C 0.061 +135 D 0.059 +136 D 0.067 +137 L 0.080 +138 R 0.092 +139 P 0.095 +140 D 0.090 +141 S 0.081 +142 F 0.078 +143 L 0.087 +144 G 0.107 +145 Y 0.134 +146 V 0.159 +147 K 0.174 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000258436.2_ENST00000696784.1_GN:RNASE12_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000258436.2_ENST00000696784.1_GN:RNASE12_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..548f74861d3efa1eb253a34084097166240e2845 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000258436.2_ENST00000696784.1_GN:RNASE12_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid @@ -0,0 +1,172 @@ +>ENSG00000258436.2|ENST00000696784.1|GN:RNASE12|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:24 +1 M 0.382 +2 L 0.409 +3 P 0.460 +4 V 0.515 +5 T 0.551 +6 V 0.566 +7 T 0.580 +8 R 0.606 +9 K 0.642 +10 M 0.677 +11 T 0.702 +12 A 0.713 +13 V 0.706 +14 K 0.684 +15 A 0.658 +16 K 0.631 +17 D 0.601 +18 A 0.558 +19 K 0.500 +20 S 0.428 +21 L 0.344 +22 L 0.265 +23 P 0.211 +24 L 0.187 +25 M 0.179 +26 I 0.172 +27 I 0.166 +28 M 0.160 +29 V 0.157 +30 I 0.154 +31 I 0.146 +32 F 0.133 +33 L 0.119 +34 V 0.113 +35 L 0.121 +36 L 0.144 +37 F 0.179 +38 W 0.225 +39 E 0.281 +40 N 0.339 +41 E 0.384 +42 V 0.399 +43 N 0.382 +44 D 0.352 +45 E 0.329 +46 A 0.309 +47 V 0.274 +48 M 0.221 +49 S 0.169 +50 T 0.129 +51 L 0.100 +52 E 0.081 +53 H 0.072 +54 L 0.068 +55 H 0.065 +56 V 0.066 +57 D 0.074 +58 Y 0.084 +59 P 0.095 +60 Q 0.109 +61 N 0.125 +62 D 0.137 +63 V 0.139 +64 P 0.129 +65 V 0.111 +66 P 0.091 +67 A 0.075 +68 R 0.061 +69 Y 0.046 +70 C 0.034 +71 N 0.030 +72 H 0.030 +73 M 0.033 +74 I 0.036 +75 I 0.044 +76 Q 0.055 +77 R 0.068 +78 V 0.081 +79 I 0.094 +80 R 0.103 +81 E 0.108 +82 P 0.106 +83 D 0.099 +84 H 0.092 +85 T 0.082 +86 C 0.069 +87 K 0.057 +88 K 0.051 +89 E 0.050 +90 H 0.047 +91 V 0.044 +92 F 0.042 +93 I 0.046 +94 H 0.054 +95 E 0.062 +96 R 0.068 +97 P 0.069 +98 R 0.067 +99 K 0.064 +100 I 0.062 +101 N 0.060 +102 G 0.057 +103 I 0.050 +104 C 0.042 +105 I 0.041 +106 S 0.045 +107 P 0.050 +108 K 0.054 +109 K 0.059 +110 V 0.066 +111 A 0.073 +112 C 0.081 +113 Q 0.089 +114 N 0.098 +115 L 0.105 +116 S 0.102 +117 A 0.088 +118 I 0.069 +119 F 0.053 +120 C 0.046 +121 F 0.052 +122 Q 0.067 +123 S 0.085 +124 E 0.096 +125 T 0.098 +126 K 0.090 +127 F 0.079 +128 K 0.068 +129 M 0.063 +130 T 0.061 +131 V 0.059 +132 C 0.058 +133 Q 0.061 +134 L 0.069 +135 I 0.076 +136 E 0.080 +137 G 0.079 +138 T 0.071 +139 R 0.060 +140 Y 0.056 +141 P 0.061 +142 A 0.071 +143 C 0.077 +144 R 0.081 +145 Y 0.086 +146 H 0.093 +147 Y 0.101 +148 S 0.111 +149 P 0.123 +150 T 0.135 +151 E 0.144 +152 G 0.146 +153 F 0.141 +154 V 0.132 +155 L 0.118 +156 V 0.096 +157 T 0.074 +158 C 0.062 +159 D 0.060 +160 D 0.066 +161 L 0.076 +162 R 0.086 +163 P 0.088 +164 D 0.083 +165 S 0.075 +166 F 0.073 +167 L 0.082 +168 G 0.102 +169 Y 0.128 +170 V 0.152 +171 K 0.166 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000263956.9_ENST00000682118.1_GN:NBPF11_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000263956.9_ENST00000682118.1_GN:NBPF11_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..8665c7013c36cff1f8c1946ab46d94a3f0c4ffe4 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000263956.9_ENST00000682118.1_GN:NBPF11_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,866 @@ +>ENSG00000263956.9|ENST00000682118.1|GN:NBPF11|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.377 +2 V 0.412 +3 V 0.459 +4 S 0.501 +5 A 0.535 +6 G 0.556 +7 P 0.564 +8 W 0.567 +9 S 0.562 +10 S 0.536 +11 E 0.492 +12 K 0.449 +13 A 0.410 +14 E 0.367 +15 M 0.321 +16 N 0.275 +17 I 0.228 +18 L 0.187 +19 E 0.162 +20 I 0.153 +21 N 0.147 +22 E 0.138 +23 K 0.127 +24 L 0.123 +25 R 0.125 +26 P 0.126 +27 Q 0.125 +28 L 0.124 +29 A 0.127 +30 E 0.126 +31 N 0.122 +32 K 0.127 +33 Q 0.141 +34 Q 0.152 +35 F 0.152 +36 R 0.151 +37 N 0.151 +38 L 0.150 +39 K 0.146 +40 E 0.138 +41 R 0.126 +42 C 0.113 +43 F 0.105 +44 L 0.101 +45 T 0.102 +46 Q 0.106 +47 L 0.106 +48 A 0.104 +49 G 0.109 +50 F 0.126 +51 L 0.143 +52 A 0.151 +53 N 0.148 +54 R 0.139 +55 Q 0.132 +56 K 0.134 +57 K 0.139 +58 Y 0.135 +59 K 0.121 +60 Y 0.106 +61 E 0.102 +62 E 0.105 +63 C 0.108 +64 K 0.107 +65 D 0.104 +66 L 0.095 +67 I 0.083 +68 K 0.071 +69 F 0.062 +70 M 0.056 +71 L 0.058 +72 R 0.065 +73 N 0.071 +74 E 0.074 +75 R 0.077 +76 Q 0.083 +77 F 0.091 +78 K 0.103 +79 E 0.118 +80 E 0.132 +81 K 0.146 +82 L 0.165 +83 A 0.183 +84 E 0.190 +85 Q 0.188 +86 L 0.188 +87 K 0.193 +88 Q 0.199 +89 A 0.200 +90 E 0.189 +91 E 0.166 +92 L 0.144 +93 R 0.130 +94 Q 0.121 +95 Y 0.115 +96 K 0.115 +97 V 0.120 +98 L 0.123 +99 V 0.124 +100 H 0.129 +101 S 0.141 +102 Q 0.154 +103 E 0.165 +104 R 0.168 +105 E 0.159 +106 L 0.142 +107 T 0.127 +108 Q 0.119 +109 L 0.118 +110 R 0.119 +111 E 0.118 +112 K 0.115 +113 L 0.120 +114 R 0.133 +115 E 0.145 +116 G 0.143 +117 R 0.130 +118 D 0.117 +119 A 0.117 +120 S 0.134 +121 R 0.152 +122 S 0.157 +123 L 0.153 +124 N 0.155 +125 E 0.167 +126 H 0.181 +127 L 0.196 +128 Q 0.219 +129 A 0.248 +130 L 0.276 +131 L 0.294 +132 T 0.308 +133 P 0.332 +134 D 0.374 +135 E 0.420 +136 P 0.444 +137 D 0.435 +138 K 0.407 +139 S 0.386 +140 Q 0.385 +141 G 0.394 +142 Q 0.386 +143 D 0.343 +144 L 0.275 +145 Q 0.210 +146 E 0.171 +147 Q 0.165 +148 L 0.185 +149 A 0.207 +150 E 0.205 +151 G 0.179 +152 C 0.151 +153 R 0.136 +154 L 0.133 +155 A 0.139 +156 Q 0.150 +157 H 0.157 +158 L 0.160 +159 V 0.173 +160 Q 0.208 +161 K 0.261 +162 L 0.323 +163 S 0.393 +164 P 0.477 +165 E 0.568 +166 N 0.639 +167 D 0.678 +168 E 0.692 +169 D 0.697 +170 E 0.701 +171 D 0.706 +172 E 0.711 +173 D 0.713 +174 V 0.709 +175 Q 0.692 +176 V 0.651 +177 E 0.596 +178 E 0.570 +179 D 0.604 +180 E 0.669 +181 K 0.718 +182 V 0.740 +183 L 0.742 +184 E 0.733 +185 S 0.720 +186 S 0.714 +187 A 0.724 +188 P 0.748 +189 R 0.776 +190 E 0.796 +191 V 0.805 +192 Q 0.808 +193 K 0.809 +194 A 0.807 +195 E 0.802 +196 E 0.797 +197 S 0.793 +198 K 0.789 +199 V 0.786 +200 P 0.788 +201 E 0.797 +202 D 0.805 +203 S 0.806 +204 L 0.805 +205 E 0.805 +206 E 0.811 +207 C 0.818 +208 A 0.821 +209 I 0.820 +210 T 0.815 +211 C 0.809 +212 S 0.804 +213 N 0.801 +214 S 0.797 +215 H 0.796 +216 G 0.800 +217 P 0.807 +218 C 0.809 +219 D 0.804 +220 S 0.789 +221 I 0.769 +222 Q 0.757 +223 P 0.762 +224 H 0.779 +225 K 0.798 +226 N 0.810 +227 I 0.812 +228 K 0.804 +229 I 0.793 +230 T 0.783 +231 F 0.781 +232 E 0.785 +233 E 0.789 +234 D 0.790 +235 K 0.788 +236 V 0.787 +237 N 0.788 +238 S 0.791 +239 S 0.794 +240 L 0.799 +241 V 0.804 +242 V 0.808 +243 D 0.806 +244 R 0.801 +245 E 0.795 +246 S 0.790 +247 S 0.787 +248 H 0.788 +249 D 0.796 +250 G 0.802 +251 C 0.803 +252 Q 0.800 +253 D 0.799 +254 A 0.796 +255 L 0.788 +256 N 0.774 +257 I 0.755 +258 L 0.735 +259 P 0.720 +260 V 0.720 +261 P 0.734 +262 G 0.756 +263 P 0.778 +264 T 0.794 +265 S 0.802 +266 S 0.805 +267 A 0.809 +268 T 0.815 +269 N 0.822 +270 V 0.826 +271 S 0.829 +272 M 0.828 +273 V 0.819 +274 V 0.800 +275 S 0.778 +276 A 0.763 +277 G 0.756 +278 P 0.754 +279 L 0.753 +280 S 0.746 +281 S 0.725 +282 E 0.697 +283 K 0.671 +284 A 0.637 +285 E 0.586 +286 M 0.534 +287 N 0.493 +288 I 0.447 +289 L 0.383 +290 E 0.309 +291 I 0.240 +292 N 0.185 +293 E 0.153 +294 K 0.143 +295 L 0.142 +296 C 0.140 +297 P 0.134 +298 Q 0.125 +299 L 0.115 +300 A 0.105 +301 E 0.097 +302 K 0.092 +303 K 0.098 +304 Q 0.115 +305 Q 0.130 +306 F 0.131 +307 R 0.122 +308 S 0.115 +309 L 0.115 +310 K 0.121 +311 E 0.129 +312 K 0.128 +313 C 0.119 +314 F 0.108 +315 V 0.098 +316 T 0.088 +317 Q 0.081 +318 V 0.079 +319 A 0.077 +320 C 0.079 +321 F 0.089 +322 L 0.103 +323 A 0.107 +324 K 0.099 +325 Q 0.088 +326 Q 0.085 +327 N 0.092 +328 K 0.102 +329 Y 0.104 +330 K 0.096 +331 Y 0.086 +332 E 0.084 +333 E 0.087 +334 C 0.084 +335 K 0.075 +336 D 0.067 +337 L 0.066 +338 I 0.066 +339 K 0.062 +340 S 0.057 +341 M 0.050 +342 L 0.045 +343 R 0.043 +344 N 0.042 +345 E 0.042 +346 R 0.046 +347 Q 0.050 +348 F 0.057 +349 K 0.067 +350 E 0.081 +351 E 0.095 +352 K 0.105 +353 L 0.118 +354 A 0.130 +355 E 0.137 +356 Q 0.142 +357 L 0.151 +358 K 0.161 +359 Q 0.169 +360 A 0.172 +361 E 0.163 +362 E 0.146 +363 L 0.131 +364 R 0.126 +365 Q 0.128 +366 Y 0.130 +367 K 0.132 +368 V 0.137 +369 L 0.142 +370 V 0.148 +371 H 0.158 +372 S 0.172 +373 Q 0.184 +374 E 0.187 +375 R 0.178 +376 E 0.157 +377 L 0.135 +378 T 0.121 +379 Q 0.117 +380 L 0.120 +381 R 0.123 +382 E 0.121 +383 K 0.116 +384 L 0.114 +385 R 0.119 +386 E 0.125 +387 G 0.123 +388 R 0.110 +389 D 0.099 +390 A 0.100 +391 S 0.112 +392 R 0.121 +393 S 0.120 +394 L 0.114 +395 N 0.113 +396 E 0.119 +397 H 0.129 +398 L 0.144 +399 Q 0.164 +400 A 0.185 +401 L 0.200 +402 L 0.201 +403 T 0.199 +404 P 0.208 +405 D 0.233 +406 E 0.258 +407 P 0.263 +408 D 0.250 +409 K 0.234 +410 S 0.230 +411 Q 0.238 +412 G 0.242 +413 Q 0.230 +414 D 0.204 +415 L 0.175 +416 Q 0.150 +417 E 0.133 +418 Q 0.132 +419 L 0.147 +420 A 0.166 +421 E 0.171 +422 G 0.161 +423 C 0.147 +424 R 0.139 +425 L 0.140 +426 A 0.151 +427 Q 0.162 +428 H 0.163 +429 L 0.159 +430 V 0.168 +431 Q 0.194 +432 K 0.233 +433 L 0.285 +434 S 0.358 +435 P 0.460 +436 E 0.572 +437 N 0.655 +438 D 0.694 +439 N 0.706 +440 D 0.711 +441 D 0.720 +442 D 0.732 +443 E 0.743 +444 D 0.750 +445 V 0.749 +446 Q 0.742 +447 V 0.732 +448 E 0.716 +449 V 0.690 +450 A 0.661 +451 E 0.641 +452 K 0.621 +453 V 0.593 +454 Q 0.581 +455 K 0.613 +456 S 0.663 +457 S 0.695 +458 S 0.717 +459 P 0.745 +460 R 0.778 +461 E 0.804 +462 M 0.818 +463 Q 0.825 +464 K 0.828 +465 A 0.826 +466 E 0.821 +467 E 0.815 +468 K 0.809 +469 E 0.804 +470 V 0.802 +471 P 0.808 +472 E 0.821 +473 D 0.832 +474 S 0.836 +475 L 0.838 +476 E 0.843 +477 E 0.853 +478 C 0.861 +479 A 0.866 +480 I 0.864 +481 T 0.858 +482 C 0.851 +483 S 0.846 +484 N 0.841 +485 S 0.835 +486 H 0.830 +487 G 0.830 +488 P 0.833 +489 Y 0.836 +490 D 0.836 +491 S 0.829 +492 N 0.819 +493 Q 0.816 +494 P 0.825 +495 H 0.844 +496 R 0.864 +497 K 0.877 +498 T 0.882 +499 K 0.880 +500 I 0.872 +501 T 0.863 +502 F 0.858 +503 E 0.857 +504 E 0.859 +505 D 0.861 +506 K 0.862 +507 V 0.863 +508 D 0.863 +509 S 0.863 +510 T 0.862 +511 L 0.862 +512 I 0.861 +513 G 0.859 +514 S 0.852 +515 S 0.842 +516 S 0.834 +517 H 0.829 +518 V 0.824 +519 E 0.818 +520 W 0.814 +521 E 0.817 +522 D 0.825 +523 A 0.828 +524 V 0.824 +525 H 0.817 +526 I 0.809 +527 I 0.806 +528 P 0.811 +529 E 0.821 +530 N 0.828 +531 E 0.828 +532 S 0.823 +533 D 0.819 +534 D 0.818 +535 E 0.820 +536 E 0.821 +537 E 0.821 +538 E 0.821 +539 E 0.821 +540 K 0.817 +541 G 0.811 +542 P 0.803 +543 V 0.793 +544 S 0.773 +545 P 0.730 +546 R 0.671 +547 N 0.640 +548 L 0.658 +549 Q 0.679 +550 E 0.658 +551 S 0.638 +552 E 0.670 +553 E 0.729 +554 E 0.768 +555 E 0.779 +556 V 0.782 +557 P 0.790 +558 Q 0.803 +559 E 0.812 +560 S 0.811 +561 W 0.808 +562 D 0.811 +563 E 0.818 +564 G 0.824 +565 Y 0.827 +566 S 0.828 +567 T 0.820 +568 L 0.800 +569 S 0.768 +570 I 0.740 +571 P 0.731 +572 P 0.746 +573 E 0.765 +574 R 0.771 +575 L 0.771 +576 A 0.776 +577 S 0.782 +578 Y 0.779 +579 Q 0.770 +580 S 0.756 +581 Y 0.745 +582 S 0.743 +583 S 0.748 +584 T 0.747 +585 F 0.738 +586 H 0.723 +587 S 0.697 +588 L 0.672 +589 E 0.666 +590 E 0.673 +591 Q 0.674 +592 Q 0.675 +593 V 0.688 +594 C 0.708 +595 M 0.722 +596 A 0.726 +597 V 0.715 +598 D 0.687 +599 I 0.651 +600 G 0.624 +601 R 0.604 +602 H 0.581 +603 R 0.545 +604 W 0.504 +605 D 0.484 +606 Q 0.490 +607 V 0.510 +608 K 0.539 +609 K 0.582 +610 E 0.626 +611 D 0.653 +612 Q 0.661 +613 E 0.662 +614 A 0.671 +615 T 0.693 +616 G 0.725 +617 P 0.757 +618 R 0.777 +619 L 0.782 +620 S 0.774 +621 R 0.761 +622 E 0.752 +623 L 0.750 +624 L 0.749 +625 D 0.740 +626 E 0.727 +627 K 0.721 +628 E 0.729 +629 P 0.747 +630 E 0.763 +631 V 0.769 +632 L 0.766 +633 Q 0.760 +634 D 0.756 +635 S 0.756 +636 L 0.760 +637 D 0.768 +638 R 0.774 +639 C 0.772 +640 Y 0.764 +641 S 0.762 +642 T 0.771 +643 P 0.785 +644 S 0.797 +645 V 0.806 +646 Y 0.815 +647 L 0.823 +648 G 0.824 +649 L 0.816 +650 T 0.802 +651 D 0.783 +652 S 0.760 +653 C 0.746 +654 Q 0.746 +655 P 0.751 +656 Y 0.750 +657 R 0.743 +658 S 0.729 +659 A 0.704 +660 F 0.667 +661 Y 0.622 +662 V 0.574 +663 L 0.544 +664 E 0.555 +665 Q 0.599 +666 Q 0.650 +667 R 0.690 +668 I 0.719 +669 G 0.738 +670 L 0.751 +671 A 0.755 +672 V 0.745 +673 D 0.720 +674 M 0.691 +675 D 0.665 +676 E 0.640 +677 I 0.612 +678 E 0.585 +679 K 0.561 +680 Y 0.548 +681 Q 0.556 +682 E 0.582 +683 V 0.617 +684 E 0.649 +685 E 0.665 +686 D 0.657 +687 Q 0.641 +688 D 0.638 +689 P 0.652 +690 S 0.679 +691 C 0.717 +692 P 0.755 +693 R 0.778 +694 L 0.771 +695 S 0.725 +696 R 0.656 +697 E 0.614 +698 L 0.633 +699 L 0.676 +700 A 0.696 +701 E 0.692 +702 K 0.690 +703 E 0.701 +704 P 0.720 +705 E 0.738 +706 V 0.747 +707 L 0.748 +708 Q 0.746 +709 D 0.747 +710 S 0.751 +711 L 0.756 +712 D 0.763 +713 R 0.768 +714 C 0.767 +715 Y 0.759 +716 S 0.756 +717 T 0.770 +718 P 0.793 +719 S 0.814 +720 G 0.824 +721 Y 0.822 +722 L 0.808 +723 E 0.789 +724 L 0.771 +725 P 0.751 +726 D 0.728 +727 L 0.705 +728 G 0.697 +729 Q 0.711 +730 P 0.733 +731 Y 0.749 +732 R 0.753 +733 S 0.747 +734 A 0.724 +735 V 0.687 +736 Y 0.642 +737 S 0.593 +738 L 0.554 +739 E 0.545 +740 E 0.560 +741 Q 0.579 +742 Y 0.593 +743 L 0.606 +744 G 0.618 +745 L 0.624 +746 A 0.621 +747 L 0.597 +748 D 0.548 +749 V 0.494 +750 D 0.461 +751 R 0.460 +752 I 0.482 +753 K 0.515 +754 K 0.549 +755 D 0.571 +756 Q 0.577 +757 E 0.575 +758 E 0.579 +759 E 0.594 +760 E 0.606 +761 D 0.600 +762 Q 0.584 +763 G 0.585 +764 P 0.617 +765 P 0.672 +766 C 0.729 +767 P 0.770 +768 R 0.790 +769 L 0.792 +770 S 0.786 +771 R 0.778 +772 E 0.766 +773 L 0.747 +774 L 0.714 +775 E 0.667 +776 V 0.618 +777 V 0.587 +778 E 0.590 +779 P 0.614 +780 E 0.634 +781 V 0.635 +782 L 0.623 +783 Q 0.614 +784 D 0.614 +785 S 0.605 +786 L 0.568 +787 D 0.503 +788 V 0.442 +789 I 0.407 +790 Q 0.399 +791 L 0.411 +792 L 0.440 +793 P 0.473 +794 V 0.490 +795 V 0.496 +796 L 0.513 +797 N 0.540 +798 S 0.551 +799 L 0.543 +800 T 0.535 +801 P 0.535 +802 A 0.534 +803 S 0.520 +804 P 0.496 +805 T 0.469 +806 E 0.439 +807 V 0.395 +808 P 0.330 +809 F 0.253 +810 M 0.187 +811 H 0.151 +812 W 0.137 +813 R 0.137 +814 K 0.143 +815 N 0.148 +816 M 0.145 +817 L 0.136 +818 A 0.123 +819 F 0.109 +820 L 0.098 +821 L 0.095 +822 T 0.099 +823 W 0.111 +824 E 0.133 +825 K 0.164 +826 L 0.203 +827 K 0.256 +828 R 0.330 +829 R 0.426 +830 G 0.527 +831 R 0.611 +832 G 0.664 +833 R 0.685 +834 K 0.683 +835 E 0.667 +836 G 0.644 +837 E 0.611 +838 E 0.551 +839 D 0.462 +840 Q 0.384 +841 R 0.373 +842 R 0.432 +843 K 0.508 +844 E 0.564 +845 E 0.601 +846 G 0.625 +847 E 0.635 +848 E 0.636 +849 K 0.637 +850 K 0.648 +851 G 0.667 +852 K 0.691 +853 K 0.708 +854 I 0.716 +855 K 0.714 +856 T 0.705 +857 H 0.697 +858 H 0.699 +859 A 0.715 +860 P 0.736 +861 G 0.741 +862 S 0.705 +863 A 0.615 +864 A 0.498 +865 C 0.415 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000263956.9_ENST00000682118.1_GN:NBPF11_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:54.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000263956.9_ENST00000682118.1_GN:NBPF11_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:54.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..8c3344d2cee42906942922d50ce1b3a5ce9a696e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000263956.9_ENST00000682118.1_GN:NBPF11_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:54.caid @@ -0,0 +1,920 @@ +>ENSG00000263956.9|ENST00000682118.1|GN:NBPF11|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:54 +1 M 0.389 +2 V 0.416 +3 K 0.459 +4 Q 0.509 +5 N 0.556 +6 N 0.593 +7 I 0.626 +8 I 0.661 +9 P 0.695 +10 G 0.714 +11 E 0.706 +12 T 0.674 +13 Q 0.636 +14 I 0.614 +15 L 0.608 +16 L 0.608 +17 R 0.604 +18 F 0.597 +19 T 0.588 +20 G 0.580 +21 W 0.584 +22 E 0.609 +23 S 0.644 +24 K 0.676 +25 V 0.699 +26 N 0.711 +27 A 0.710 +28 K 0.702 +29 K 0.698 +30 Q 0.708 +31 L 0.733 +32 P 0.767 +33 V 0.798 +34 G 0.810 +35 I 0.800 +36 K 0.779 +37 C 0.760 +38 E 0.752 +39 P 0.755 +40 M 0.760 +41 D 0.759 +42 Q 0.752 +43 V 0.749 +44 P 0.760 +45 D 0.781 +46 S 0.797 +47 T 0.801 +48 S 0.799 +49 S 0.799 +50 A 0.805 +51 T 0.815 +52 N 0.825 +53 V 0.833 +54 S 0.839 +55 M 0.840 +56 V 0.828 +57 V 0.800 +58 S 0.766 +59 A 0.740 +60 G 0.728 +61 P 0.728 +62 W 0.736 +63 S 0.748 +64 S 0.752 +65 E 0.745 +66 K 0.728 +67 A 0.701 +68 E 0.660 +69 M 0.615 +70 N 0.567 +71 I 0.511 +72 L 0.450 +73 E 0.391 +74 I 0.330 +75 N 0.266 +76 E 0.215 +77 K 0.187 +78 L 0.183 +79 R 0.189 +80 P 0.193 +81 Q 0.187 +82 L 0.176 +83 A 0.167 +84 E 0.161 +85 N 0.159 +86 K 0.169 +87 Q 0.188 +88 Q 0.198 +89 F 0.190 +90 R 0.175 +91 N 0.165 +92 L 0.162 +93 K 0.158 +94 E 0.150 +95 R 0.137 +96 C 0.122 +97 F 0.111 +98 L 0.103 +99 T 0.100 +100 Q 0.100 +101 L 0.098 +102 A 0.098 +103 G 0.107 +104 F 0.124 +105 L 0.140 +106 A 0.148 +107 N 0.145 +108 R 0.138 +109 Q 0.135 +110 K 0.140 +111 K 0.144 +112 Y 0.141 +113 K 0.128 +114 Y 0.116 +115 E 0.114 +116 E 0.117 +117 C 0.118 +118 K 0.112 +119 D 0.105 +120 L 0.099 +121 I 0.091 +122 K 0.080 +123 F 0.070 +124 M 0.069 +125 L 0.079 +126 R 0.091 +127 N 0.094 +128 E 0.091 +129 R 0.088 +130 Q 0.090 +131 F 0.096 +132 K 0.105 +133 E 0.117 +134 E 0.127 +135 K 0.139 +136 L 0.155 +137 A 0.171 +138 E 0.180 +139 Q 0.182 +140 L 0.187 +141 K 0.194 +142 Q 0.200 +143 A 0.200 +144 E 0.190 +145 E 0.172 +146 L 0.154 +147 R 0.143 +148 Q 0.139 +149 Y 0.136 +150 K 0.138 +151 V 0.143 +152 L 0.143 +153 V 0.140 +154 H 0.142 +155 S 0.150 +156 Q 0.162 +157 E 0.171 +158 R 0.172 +159 E 0.162 +160 L 0.145 +161 T 0.130 +162 Q 0.122 +163 L 0.121 +164 R 0.124 +165 E 0.126 +166 K 0.127 +167 L 0.133 +168 R 0.148 +169 E 0.164 +170 G 0.169 +171 R 0.161 +172 D 0.150 +173 A 0.149 +174 S 0.164 +175 R 0.182 +176 S 0.186 +177 L 0.178 +178 N 0.175 +179 E 0.183 +180 H 0.192 +181 L 0.205 +182 Q 0.233 +183 A 0.277 +184 L 0.317 +185 L 0.341 +186 T 0.357 +187 P 0.386 +188 D 0.435 +189 E 0.485 +190 P 0.511 +191 D 0.499 +192 K 0.459 +193 S 0.419 +194 Q 0.401 +195 G 0.406 +196 Q 0.407 +197 D 0.373 +198 L 0.301 +199 Q 0.227 +200 E 0.184 +201 Q 0.175 +202 L 0.193 +203 A 0.212 +204 E 0.210 +205 G 0.187 +206 C 0.162 +207 R 0.148 +208 L 0.145 +209 A 0.151 +210 Q 0.162 +211 H 0.173 +212 L 0.180 +213 V 0.195 +214 Q 0.233 +215 K 0.290 +216 L 0.352 +217 S 0.421 +218 P 0.505 +219 E 0.595 +220 N 0.664 +221 D 0.699 +222 E 0.709 +223 D 0.711 +224 E 0.714 +225 D 0.718 +226 E 0.722 +227 D 0.722 +228 V 0.717 +229 Q 0.700 +230 V 0.660 +231 E 0.603 +232 E 0.574 +233 D 0.605 +234 E 0.667 +235 K 0.715 +236 V 0.736 +237 L 0.740 +238 E 0.734 +239 S 0.724 +240 S 0.717 +241 A 0.724 +242 P 0.745 +243 R 0.770 +244 E 0.788 +245 V 0.797 +246 Q 0.801 +247 K 0.802 +248 A 0.800 +249 E 0.796 +250 E 0.792 +251 S 0.789 +252 K 0.785 +253 V 0.782 +254 P 0.785 +255 E 0.794 +256 D 0.802 +257 S 0.804 +258 L 0.803 +259 E 0.805 +260 E 0.810 +261 C 0.815 +262 A 0.818 +263 I 0.816 +264 T 0.809 +265 C 0.801 +266 S 0.796 +267 N 0.792 +268 S 0.788 +269 H 0.788 +270 G 0.794 +271 P 0.801 +272 C 0.805 +273 D 0.801 +274 S 0.785 +275 I 0.765 +276 Q 0.754 +277 P 0.760 +278 H 0.779 +279 K 0.800 +280 N 0.814 +281 I 0.818 +282 K 0.812 +283 I 0.801 +284 T 0.791 +285 F 0.787 +286 E 0.789 +287 E 0.793 +288 D 0.794 +289 K 0.792 +290 V 0.790 +291 N 0.788 +292 S 0.786 +293 S 0.786 +294 L 0.790 +295 V 0.796 +296 V 0.801 +297 D 0.802 +298 R 0.801 +299 E 0.800 +300 S 0.801 +301 S 0.803 +302 H 0.808 +303 D 0.817 +304 G 0.825 +305 C 0.826 +306 Q 0.824 +307 D 0.823 +308 A 0.820 +309 L 0.812 +310 N 0.797 +311 I 0.778 +312 L 0.759 +313 P 0.747 +314 V 0.750 +315 P 0.765 +316 G 0.785 +317 P 0.805 +318 T 0.821 +319 S 0.832 +320 S 0.838 +321 A 0.844 +322 T 0.850 +323 N 0.857 +324 V 0.862 +325 S 0.864 +326 M 0.860 +327 V 0.849 +328 V 0.828 +329 S 0.802 +330 A 0.786 +331 G 0.784 +332 P 0.789 +333 L 0.795 +334 S 0.795 +335 S 0.783 +336 E 0.761 +337 K 0.734 +338 A 0.696 +339 E 0.642 +340 M 0.586 +341 N 0.544 +342 I 0.506 +343 L 0.449 +344 E 0.372 +345 I 0.290 +346 N 0.225 +347 E 0.189 +348 K 0.175 +349 L 0.173 +350 C 0.171 +351 P 0.166 +352 Q 0.156 +353 L 0.143 +354 A 0.130 +355 E 0.117 +356 K 0.111 +357 K 0.116 +358 Q 0.130 +359 Q 0.141 +360 F 0.139 +361 R 0.130 +362 S 0.125 +363 L 0.128 +364 K 0.138 +365 E 0.146 +366 K 0.142 +367 C 0.126 +368 F 0.110 +369 V 0.098 +370 T 0.086 +371 Q 0.078 +372 V 0.073 +373 A 0.068 +374 C 0.066 +375 F 0.073 +376 L 0.085 +377 A 0.091 +378 K 0.086 +379 Q 0.079 +380 Q 0.078 +381 N 0.083 +382 K 0.089 +383 Y 0.089 +384 K 0.080 +385 Y 0.073 +386 E 0.072 +387 E 0.076 +388 C 0.075 +389 K 0.068 +390 D 0.063 +391 L 0.063 +392 I 0.064 +393 K 0.061 +394 S 0.054 +395 M 0.049 +396 L 0.046 +397 R 0.048 +398 N 0.051 +399 E 0.055 +400 R 0.059 +401 Q 0.064 +402 F 0.070 +403 K 0.082 +404 E 0.099 +405 E 0.116 +406 K 0.131 +407 L 0.145 +408 A 0.156 +409 E 0.160 +410 Q 0.158 +411 L 0.158 +412 K 0.161 +413 Q 0.165 +414 A 0.166 +415 E 0.159 +416 E 0.144 +417 L 0.133 +418 R 0.131 +419 Q 0.134 +420 Y 0.138 +421 K 0.141 +422 V 0.146 +423 L 0.151 +424 V 0.160 +425 H 0.173 +426 S 0.187 +427 Q 0.195 +428 E 0.196 +429 R 0.187 +430 E 0.165 +431 L 0.140 +432 T 0.122 +433 Q 0.117 +434 L 0.119 +435 R 0.125 +436 E 0.127 +437 K 0.125 +438 L 0.127 +439 R 0.139 +440 E 0.154 +441 G 0.156 +442 R 0.140 +443 D 0.121 +444 A 0.114 +445 S 0.121 +446 R 0.130 +447 S 0.132 +448 L 0.130 +449 N 0.132 +450 E 0.141 +451 H 0.152 +452 L 0.166 +453 Q 0.190 +454 A 0.219 +455 L 0.241 +456 L 0.248 +457 T 0.249 +458 P 0.264 +459 D 0.299 +460 E 0.331 +461 P 0.339 +462 D 0.320 +463 K 0.295 +464 S 0.283 +465 Q 0.292 +466 G 0.304 +467 Q 0.297 +468 D 0.267 +469 L 0.226 +470 Q 0.189 +471 E 0.166 +472 Q 0.164 +473 L 0.183 +474 A 0.205 +475 E 0.208 +476 G 0.190 +477 C 0.167 +478 R 0.154 +479 L 0.155 +480 A 0.169 +481 Q 0.185 +482 H 0.192 +483 L 0.194 +484 V 0.209 +485 Q 0.244 +486 K 0.289 +487 L 0.340 +488 S 0.408 +489 P 0.503 +490 E 0.608 +491 N 0.687 +492 D 0.725 +493 N 0.735 +494 D 0.739 +495 D 0.744 +496 D 0.753 +497 E 0.761 +498 D 0.766 +499 V 0.766 +500 Q 0.762 +501 V 0.756 +502 E 0.746 +503 V 0.732 +504 A 0.717 +505 E 0.701 +506 K 0.670 +507 V 0.622 +508 Q 0.597 +509 K 0.624 +510 S 0.673 +511 S 0.706 +512 S 0.727 +513 P 0.754 +514 R 0.786 +515 E 0.811 +516 M 0.825 +517 Q 0.831 +518 K 0.832 +519 A 0.830 +520 E 0.824 +521 E 0.819 +522 K 0.813 +523 E 0.807 +524 V 0.804 +525 P 0.808 +526 E 0.820 +527 D 0.831 +528 S 0.837 +529 L 0.839 +530 E 0.845 +531 E 0.853 +532 C 0.861 +533 A 0.864 +534 I 0.863 +535 T 0.857 +536 C 0.850 +537 S 0.844 +538 N 0.838 +539 S 0.832 +540 H 0.828 +541 G 0.827 +542 P 0.830 +543 Y 0.833 +544 D 0.833 +545 S 0.826 +546 N 0.816 +547 Q 0.812 +548 P 0.821 +549 H 0.840 +550 R 0.860 +551 K 0.874 +552 T 0.880 +553 K 0.876 +554 I 0.866 +555 T 0.856 +556 F 0.849 +557 E 0.849 +558 E 0.851 +559 D 0.853 +560 K 0.853 +561 V 0.853 +562 D 0.853 +563 S 0.852 +564 T 0.850 +565 L 0.850 +566 I 0.850 +567 G 0.849 +568 S 0.842 +569 S 0.833 +570 S 0.826 +571 H 0.821 +572 V 0.817 +573 E 0.811 +574 W 0.807 +575 E 0.811 +576 D 0.818 +577 A 0.819 +578 V 0.814 +579 H 0.806 +580 I 0.798 +581 I 0.795 +582 P 0.801 +583 E 0.813 +584 N 0.821 +585 E 0.822 +586 S 0.819 +587 D 0.816 +588 D 0.815 +589 E 0.817 +590 E 0.819 +591 E 0.820 +592 E 0.820 +593 E 0.819 +594 K 0.815 +595 G 0.808 +596 P 0.801 +597 V 0.791 +598 S 0.772 +599 P 0.730 +600 R 0.671 +601 N 0.639 +602 L 0.658 +603 Q 0.679 +604 E 0.659 +605 S 0.639 +606 E 0.670 +607 E 0.729 +608 E 0.768 +609 E 0.779 +610 V 0.781 +611 P 0.790 +612 Q 0.803 +613 E 0.813 +614 S 0.813 +615 W 0.811 +616 D 0.814 +617 E 0.822 +618 G 0.827 +619 Y 0.829 +620 S 0.829 +621 T 0.822 +622 L 0.803 +623 S 0.774 +624 I 0.748 +625 P 0.741 +626 P 0.755 +627 E 0.773 +628 R 0.782 +629 L 0.784 +630 A 0.788 +631 S 0.792 +632 Y 0.790 +633 Q 0.782 +634 S 0.768 +635 Y 0.756 +636 S 0.752 +637 S 0.753 +638 T 0.750 +639 F 0.742 +640 H 0.728 +641 S 0.706 +642 L 0.686 +643 E 0.685 +644 E 0.694 +645 Q 0.697 +646 Q 0.700 +647 V 0.711 +648 C 0.727 +649 M 0.740 +650 A 0.743 +651 V 0.731 +652 D 0.704 +653 I 0.673 +654 G 0.649 +655 R 0.631 +656 H 0.609 +657 R 0.575 +658 W 0.535 +659 D 0.514 +660 Q 0.518 +661 V 0.537 +662 K 0.565 +663 K 0.607 +664 E 0.650 +665 D 0.677 +666 Q 0.684 +667 E 0.684 +668 A 0.689 +669 T 0.705 +670 G 0.732 +671 P 0.759 +672 R 0.775 +673 L 0.772 +674 S 0.747 +675 R 0.709 +676 E 0.685 +677 L 0.695 +678 L 0.720 +679 D 0.730 +680 E 0.727 +681 K 0.724 +682 E 0.732 +683 P 0.749 +684 E 0.765 +685 V 0.772 +686 L 0.770 +687 Q 0.765 +688 D 0.762 +689 S 0.762 +690 L 0.765 +691 D 0.771 +692 R 0.776 +693 C 0.773 +694 Y 0.766 +695 S 0.764 +696 T 0.774 +697 P 0.790 +698 S 0.802 +699 V 0.811 +700 Y 0.819 +701 L 0.825 +702 G 0.825 +703 L 0.817 +704 T 0.803 +705 D 0.784 +706 S 0.763 +707 C 0.748 +708 Q 0.746 +709 P 0.750 +710 Y 0.750 +711 R 0.744 +712 S 0.732 +713 A 0.709 +714 F 0.676 +715 Y 0.635 +716 V 0.589 +717 L 0.559 +718 E 0.569 +719 Q 0.611 +720 Q 0.658 +721 R 0.695 +722 I 0.721 +723 G 0.738 +724 L 0.748 +725 A 0.752 +726 V 0.744 +727 D 0.722 +728 M 0.694 +729 D 0.668 +730 E 0.642 +731 I 0.615 +732 E 0.590 +733 K 0.569 +734 Y 0.557 +735 Q 0.564 +736 E 0.589 +737 V 0.623 +738 E 0.654 +739 E 0.670 +740 D 0.662 +741 Q 0.646 +742 D 0.643 +743 P 0.656 +744 S 0.682 +745 C 0.718 +746 P 0.754 +747 R 0.775 +748 L 0.768 +749 S 0.723 +750 R 0.655 +751 E 0.614 +752 L 0.633 +753 L 0.676 +754 A 0.697 +755 E 0.694 +756 K 0.692 +757 E 0.704 +758 P 0.724 +759 E 0.742 +760 V 0.752 +761 L 0.754 +762 Q 0.752 +763 D 0.752 +764 S 0.756 +765 L 0.761 +766 D 0.767 +767 R 0.773 +768 C 0.771 +769 Y 0.760 +770 S 0.756 +771 T 0.770 +772 P 0.794 +773 S 0.816 +774 G 0.825 +775 Y 0.822 +776 L 0.807 +777 E 0.787 +778 L 0.769 +779 P 0.751 +780 D 0.730 +781 L 0.710 +782 G 0.703 +783 Q 0.717 +784 P 0.741 +785 Y 0.758 +786 R 0.763 +787 S 0.758 +788 A 0.737 +789 V 0.702 +790 Y 0.659 +791 S 0.614 +792 L 0.576 +793 E 0.566 +794 E 0.577 +795 Q 0.591 +796 Y 0.602 +797 L 0.615 +798 G 0.628 +799 L 0.636 +800 A 0.634 +801 L 0.610 +802 D 0.561 +803 V 0.508 +804 D 0.478 +805 R 0.478 +806 I 0.501 +807 K 0.534 +808 K 0.566 +809 D 0.587 +810 Q 0.594 +811 E 0.594 +812 E 0.599 +813 E 0.612 +814 E 0.622 +815 D 0.614 +816 Q 0.597 +817 G 0.597 +818 P 0.627 +819 P 0.678 +820 C 0.731 +821 P 0.769 +822 R 0.787 +823 L 0.789 +824 S 0.783 +825 R 0.774 +826 E 0.761 +827 L 0.741 +828 L 0.709 +829 E 0.664 +830 V 0.616 +831 V 0.585 +832 E 0.585 +833 P 0.606 +834 E 0.623 +835 V 0.620 +836 L 0.606 +837 Q 0.595 +838 D 0.593 +839 S 0.585 +840 L 0.546 +841 D 0.478 +842 V 0.413 +843 I 0.378 +844 Q 0.374 +845 L 0.390 +846 L 0.419 +847 P 0.448 +848 V 0.461 +849 V 0.466 +850 L 0.484 +851 N 0.514 +852 S 0.529 +853 L 0.524 +854 T 0.519 +855 P 0.521 +856 A 0.521 +857 S 0.508 +858 P 0.485 +859 T 0.458 +860 E 0.428 +861 V 0.385 +862 P 0.321 +863 F 0.244 +864 M 0.179 +865 H 0.143 +866 W 0.131 +867 R 0.131 +868 K 0.137 +869 N 0.140 +870 M 0.137 +871 L 0.127 +872 A 0.114 +873 F 0.099 +874 L 0.089 +875 L 0.087 +876 T 0.091 +877 W 0.103 +878 E 0.126 +879 K 0.158 +880 L 0.198 +881 K 0.249 +882 R 0.321 +883 R 0.415 +884 G 0.515 +885 R 0.599 +886 G 0.653 +887 R 0.674 +888 K 0.669 +889 E 0.649 +890 G 0.624 +891 E 0.588 +892 E 0.528 +893 D 0.442 +894 Q 0.369 +895 R 0.361 +896 R 0.417 +897 K 0.489 +898 E 0.545 +899 E 0.585 +900 G 0.611 +901 E 0.623 +902 E 0.623 +903 K 0.623 +904 K 0.631 +905 G 0.648 +906 K 0.667 +907 K 0.678 +908 I 0.678 +909 K 0.669 +910 T 0.660 +911 H 0.655 +912 H 0.664 +913 A 0.685 +914 P 0.707 +915 G 0.706 +916 S 0.657 +917 A 0.551 +918 A 0.424 +919 C 0.339 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000267673.7_ENST00000393708.3_GN:FDX2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000267673.7_ENST00000393708.3_GN:FDX2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2aad6f3c1c400de9199d7496a0cf3647cf04dab3 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000267673.7_ENST00000393708.3_GN:FDX2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,184 @@ +>ENSG00000267673.7|ENST00000393708.3|GN:FDX2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.449 +2 A 0.443 +3 A 0.448 +4 S 0.461 +5 M 0.452 +6 A 0.429 +7 R 0.451 +8 G 0.525 +9 G 0.597 +10 V 0.625 +11 S 0.616 +12 A 0.596 +13 R 0.578 +14 V 0.561 +15 L 0.533 +16 L 0.497 +17 Q 0.487 +18 A 0.521 +19 A 0.572 +20 R 0.607 +21 G 0.615 +22 T 0.595 +23 W 0.562 +24 W 0.549 +25 N 0.571 +26 R 0.616 +27 P 0.667 +28 G 0.715 +29 G 0.752 +30 T 0.771 +31 S 0.774 +32 G 0.770 +33 S 0.766 +34 G 0.765 +35 E 0.762 +36 G 0.754 +37 V 0.744 +38 A 0.738 +39 L 0.733 +40 G 0.723 +41 T 0.697 +42 T 0.663 +43 R 0.641 +44 K 0.647 +45 F 0.676 +46 Q 0.712 +47 A 0.737 +48 T 0.744 +49 G 0.733 +50 S 0.713 +51 R 0.701 +52 P 0.707 +53 A 0.727 +54 G 0.745 +55 E 0.751 +56 E 0.749 +57 D 0.739 +58 A 0.716 +59 G 0.677 +60 G 0.629 +61 P 0.576 +62 E 0.515 +63 R 0.448 +64 P 0.376 +65 G 0.299 +66 D 0.219 +67 V 0.144 +68 V 0.085 +69 N 0.047 +70 V 0.029 +71 V 0.022 +72 F 0.023 +73 V 0.030 +74 D 0.041 +75 R 0.056 +76 S 0.071 +77 G 0.079 +78 Q 0.077 +79 R 0.069 +80 I 0.058 +81 P 0.047 +82 V 0.037 +83 S 0.031 +84 G 0.030 +85 R 0.035 +86 V 0.044 +87 G 0.052 +88 D 0.056 +89 N 0.059 +90 V 0.065 +91 L 0.070 +92 H 0.072 +93 L 0.071 +94 A 0.070 +95 Q 0.069 +96 R 0.068 +97 H 0.071 +98 G 0.080 +99 V 0.097 +100 D 0.122 +101 L 0.149 +102 E 0.165 +103 G 0.165 +104 A 0.152 +105 C 0.138 +106 E 0.132 +107 A 0.132 +108 S 0.133 +109 L 0.138 +110 A 0.148 +111 C 0.152 +112 S 0.144 +113 T 0.128 +114 C 0.109 +115 H 0.087 +116 V 0.069 +117 Y 0.064 +118 V 0.068 +119 S 0.073 +120 E 0.072 +121 D 0.066 +122 H 0.062 +123 L 0.063 +124 D 0.070 +125 L 0.082 +126 L 0.100 +127 P 0.120 +128 P 0.134 +129 P 0.132 +130 E 0.112 +131 E 0.090 +132 R 0.076 +133 E 0.072 +134 D 0.076 +135 D 0.084 +136 M 0.094 +137 L 0.102 +138 D 0.106 +139 M 0.110 +140 A 0.115 +141 P 0.119 +142 L 0.123 +143 L 0.123 +144 Q 0.112 +145 E 0.091 +146 N 0.072 +147 S 0.060 +148 R 0.053 +149 L 0.047 +150 G 0.042 +151 C 0.040 +152 Q 0.040 +153 I 0.041 +154 V 0.039 +155 L 0.037 +156 T 0.038 +157 P 0.044 +158 E 0.054 +159 L 0.063 +160 E 0.066 +161 G 0.063 +162 A 0.055 +163 E 0.049 +164 F 0.049 +165 T 0.061 +166 L 0.083 +167 P 0.110 +168 K 0.141 +169 I 0.174 +170 T 0.205 +171 R 0.242 +172 N 0.288 +173 F 0.339 +174 Y 0.384 +175 V 0.426 +176 D 0.468 +177 G 0.505 +178 H 0.525 +179 V 0.529 +180 P 0.522 +181 K 0.502 +182 P 0.468 +183 H 0.437 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000267673.7_ENST00000393708.3_GN:FDX2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000267673.7_ENST00000393708.3_GN:FDX2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e0d013328c6e5ba66f49f6244da9cdc0d26a721a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000267673.7_ENST00000393708.3_GN:FDX2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid @@ -0,0 +1,187 @@ +>ENSG00000267673.7|ENST00000393708.3|GN:FDX2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 +1 M 0.441 +2 H 0.476 +3 V 0.526 +4 M 0.556 +5 A 0.550 +6 A 0.542 +7 S 0.572 +8 M 0.622 +9 A 0.655 +10 R 0.666 +11 G 0.670 +12 G 0.669 +13 V 0.661 +14 S 0.646 +15 A 0.631 +16 R 0.619 +17 V 0.602 +18 L 0.568 +19 L 0.523 +20 Q 0.505 +21 A 0.536 +22 A 0.586 +23 R 0.620 +24 G 0.626 +25 T 0.604 +26 W 0.568 +27 W 0.551 +28 N 0.571 +29 R 0.616 +30 P 0.668 +31 G 0.717 +32 G 0.755 +33 T 0.775 +34 S 0.779 +35 G 0.774 +36 S 0.770 +37 G 0.768 +38 E 0.765 +39 G 0.758 +40 V 0.749 +41 A 0.744 +42 L 0.740 +43 G 0.730 +44 T 0.706 +45 T 0.674 +46 R 0.653 +47 K 0.657 +48 F 0.684 +49 Q 0.716 +50 A 0.740 +51 T 0.747 +52 G 0.736 +53 S 0.716 +54 R 0.703 +55 P 0.709 +56 A 0.730 +57 G 0.747 +58 E 0.754 +59 E 0.751 +60 D 0.741 +61 A 0.717 +62 G 0.678 +63 G 0.629 +64 P 0.573 +65 E 0.511 +66 R 0.443 +67 P 0.372 +68 G 0.296 +69 D 0.216 +70 V 0.142 +71 V 0.084 +72 N 0.047 +73 V 0.029 +74 V 0.022 +75 F 0.023 +76 V 0.029 +77 D 0.041 +78 R 0.056 +79 S 0.070 +80 G 0.078 +81 Q 0.077 +82 R 0.068 +83 I 0.057 +84 P 0.046 +85 V 0.037 +86 S 0.031 +87 G 0.030 +88 R 0.034 +89 V 0.043 +90 G 0.051 +91 D 0.055 +92 N 0.057 +93 V 0.063 +94 L 0.068 +95 H 0.070 +96 L 0.069 +97 A 0.069 +98 Q 0.067 +99 R 0.066 +100 H 0.070 +101 G 0.080 +102 V 0.097 +103 D 0.122 +104 L 0.148 +105 E 0.164 +106 G 0.164 +107 A 0.151 +108 C 0.137 +109 E 0.131 +110 A 0.131 +111 S 0.133 +112 L 0.138 +113 A 0.147 +114 C 0.151 +115 S 0.143 +116 T 0.128 +117 C 0.109 +118 H 0.086 +119 V 0.069 +120 Y 0.063 +121 V 0.067 +122 S 0.072 +123 E 0.071 +124 D 0.065 +125 H 0.061 +126 L 0.062 +127 D 0.070 +128 L 0.082 +129 L 0.099 +130 P 0.119 +131 P 0.134 +132 P 0.131 +133 E 0.112 +134 E 0.090 +135 R 0.076 +136 E 0.072 +137 D 0.076 +138 D 0.084 +139 M 0.094 +140 L 0.102 +141 D 0.106 +142 M 0.110 +143 A 0.115 +144 P 0.119 +145 L 0.123 +146 L 0.123 +147 Q 0.112 +148 E 0.091 +149 N 0.071 +150 S 0.060 +151 R 0.053 +152 L 0.047 +153 G 0.042 +154 C 0.039 +155 Q 0.040 +156 I 0.041 +157 V 0.039 +158 L 0.037 +159 T 0.038 +160 P 0.044 +161 E 0.054 +162 L 0.062 +163 E 0.066 +164 G 0.063 +165 A 0.055 +166 E 0.049 +167 F 0.049 +168 T 0.061 +169 L 0.083 +170 P 0.110 +171 K 0.141 +172 I 0.173 +173 T 0.204 +174 R 0.240 +175 N 0.286 +176 F 0.336 +177 Y 0.381 +178 V 0.422 +179 D 0.465 +180 G 0.502 +181 H 0.523 +182 V 0.527 +183 P 0.520 +184 K 0.500 +185 P 0.466 +186 H 0.436 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000280236.3_ENST00000642051.1_GN:OR12D2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000280236.3_ENST00000642051.1_GN:OR12D2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b4befc483dfec4501e616cb0f600bcea49f0bf78 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000280236.3_ENST00000642051.1_GN:OR12D2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,308 @@ +>ENSG00000280236.3|ENST00000642051.1|GN:OR12D2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.436 +2 L 0.446 +3 N 0.456 +4 T 0.448 +5 T 0.406 +6 S 0.336 +7 V 0.258 +8 T 0.194 +9 E 0.154 +10 F 0.136 +11 L 0.130 +12 L 0.129 +13 L 0.139 +14 G 0.157 +15 V 0.173 +16 T 0.181 +17 D 0.179 +18 I 0.167 +19 Q 0.147 +20 E 0.122 +21 L 0.097 +22 Q 0.076 +23 P 0.060 +24 F 0.055 +25 L 0.060 +26 F 0.071 +27 V 0.074 +28 V 0.063 +29 F 0.049 +30 L 0.042 +31 T 0.044 +32 I 0.049 +33 Y 0.050 +34 F 0.048 +35 I 0.047 +36 S 0.047 +37 V 0.049 +38 T 0.054 +39 G 0.064 +40 N 0.075 +41 G 0.083 +42 A 0.084 +43 V 0.076 +44 L 0.065 +45 M 0.059 +46 I 0.061 +47 V 0.068 +48 I 0.077 +49 S 0.087 +50 D 0.095 +51 P 0.094 +52 R 0.086 +53 L 0.078 +54 H 0.071 +55 S 0.061 +56 L 0.047 +57 M 0.034 +58 Y 0.026 +59 F 0.022 +60 F 0.024 +61 L 0.031 +62 G 0.043 +63 N 0.052 +64 L 0.056 +65 S 0.055 +66 Y 0.053 +67 L 0.054 +68 D 0.061 +69 I 0.068 +70 C 0.069 +71 Y 0.064 +72 S 0.058 +73 T 0.057 +74 V 0.060 +75 T 0.064 +76 L 0.067 +77 P 0.065 +78 K 0.061 +79 M 0.060 +80 L 0.058 +81 Q 0.055 +82 N 0.053 +83 F 0.058 +84 L 0.071 +85 S 0.088 +86 T 0.098 +87 H 0.094 +88 K 0.082 +89 A 0.069 +90 I 0.058 +91 S 0.048 +92 F 0.041 +93 L 0.038 +94 G 0.038 +95 C 0.038 +96 I 0.037 +97 S 0.038 +98 Q 0.039 +99 L 0.037 +100 H 0.034 +101 F 0.030 +102 F 0.027 +103 H 0.027 +104 S 0.029 +105 L 0.034 +106 G 0.040 +107 S 0.046 +108 T 0.052 +109 E 0.055 +110 S 0.053 +111 M 0.046 +112 L 0.038 +113 F 0.032 +114 A 0.030 +115 V 0.031 +116 M 0.037 +117 A 0.044 +118 F 0.049 +119 D 0.052 +120 L 0.050 +121 S 0.046 +122 V 0.042 +123 A 0.043 +124 I 0.047 +125 C 0.052 +126 K 0.057 +127 P 0.059 +128 L 0.056 +129 R 0.051 +130 Y 0.048 +131 T 0.049 +132 V 0.053 +133 I 0.061 +134 M 0.066 +135 N 0.068 +136 P 0.067 +137 Q 0.064 +138 L 0.057 +139 C 0.053 +140 T 0.060 +141 Q 0.070 +142 M 0.075 +143 A 0.077 +144 I 0.075 +145 T 0.067 +146 I 0.056 +147 W 0.048 +148 V 0.046 +149 I 0.051 +150 G 0.057 +151 F 0.062 +152 F 0.066 +153 H 0.072 +154 A 0.076 +155 L 0.076 +156 L 0.079 +157 H 0.084 +158 S 0.087 +159 V 0.087 +160 M 0.091 +161 T 0.098 +162 S 0.106 +163 R 0.115 +164 L 0.120 +165 N 0.119 +166 F 0.118 +167 C 0.122 +168 G 0.128 +169 S 0.133 +170 N 0.139 +171 R 0.143 +172 I 0.139 +173 H 0.119 +174 H 0.093 +175 F 0.073 +176 L 0.063 +177 C 0.065 +178 D 0.078 +179 I 0.100 +180 K 0.121 +181 P 0.132 +182 L 0.135 +183 L 0.136 +184 K 0.136 +185 L 0.133 +186 A 0.128 +187 C 0.127 +188 G 0.136 +189 N 0.146 +190 T 0.145 +191 E 0.130 +192 L 0.112 +193 N 0.099 +194 Q 0.094 +195 W 0.093 +196 L 0.095 +197 L 0.094 +198 S 0.092 +199 T 0.090 +200 V 0.090 +201 T 0.087 +202 G 0.079 +203 T 0.068 +204 I 0.060 +205 A 0.058 +206 M 0.064 +207 G 0.072 +208 P 0.075 +209 F 0.068 +210 F 0.058 +211 L 0.054 +212 T 0.052 +213 L 0.048 +214 L 0.042 +215 S 0.037 +216 Y 0.034 +217 F 0.032 +218 Y 0.035 +219 I 0.044 +220 I 0.055 +221 T 0.060 +222 Y 0.056 +223 L 0.049 +224 F 0.053 +225 F 0.069 +226 K 0.092 +227 T 0.116 +228 R 0.133 +229 S 0.137 +230 C 0.127 +231 S 0.109 +232 M 0.091 +233 L 0.075 +234 C 0.065 +235 K 0.062 +236 A 0.061 +237 L 0.061 +238 S 0.061 +239 T 0.059 +240 C 0.056 +241 A 0.056 +242 S 0.058 +243 H 0.056 +244 F 0.053 +245 M 0.052 +246 V 0.051 +247 V 0.045 +248 I 0.036 +249 L 0.028 +250 F 0.025 +251 Y 0.027 +252 A 0.033 +253 P 0.036 +254 V 0.034 +255 L 0.032 +256 F 0.033 +257 T 0.043 +258 Y 0.067 +259 I 0.104 +260 H 0.146 +261 P 0.176 +262 A 0.189 +263 L 0.190 +264 E 0.190 +265 S 0.192 +266 F 0.194 +267 M 0.188 +268 D 0.173 +269 Q 0.152 +270 D 0.132 +271 R 0.116 +272 I 0.105 +273 V 0.094 +274 A 0.084 +275 I 0.078 +276 M 0.084 +277 Y 0.099 +278 T 0.115 +279 V 0.124 +280 V 0.128 +281 T 0.124 +282 P 0.113 +283 V 0.099 +284 L 0.087 +285 N 0.078 +286 P 0.071 +287 L 0.068 +288 I 0.070 +289 Y 0.073 +290 T 0.081 +291 L 0.098 +292 R 0.112 +293 N 0.106 +294 K 0.088 +295 E 0.070 +296 V 0.060 +297 K 0.058 +298 G 0.061 +299 A 0.067 +300 L 0.074 +301 G 0.086 +302 R 0.097 +303 V 0.106 +304 I 0.118 +305 R 0.139 +306 R 0.164 +307 L 0.183 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000280236.3_ENST00000642051.1_GN:OR12D2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000280236.3_ENST00000642051.1_GN:OR12D2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e119ff1a341616733ed1e918b5c0f1a8ccbcd8b8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000280236.3_ENST00000642051.1_GN:OR12D2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid @@ -0,0 +1,309 @@ +>ENSG00000280236.3|ENST00000642051.1|GN:OR12D2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:1 +1 M 0.416 +2 M 0.434 +3 L 0.460 +4 N 0.474 +5 T 0.459 +6 T 0.409 +7 S 0.333 +8 V 0.255 +9 T 0.192 +10 E 0.153 +11 F 0.135 +12 L 0.129 +13 L 0.128 +14 L 0.138 +15 G 0.156 +16 V 0.172 +17 T 0.179 +18 D 0.178 +19 I 0.166 +20 Q 0.147 +21 E 0.122 +22 L 0.097 +23 Q 0.076 +24 P 0.060 +25 F 0.055 +26 L 0.060 +27 F 0.071 +28 V 0.074 +29 V 0.063 +30 F 0.049 +31 L 0.042 +32 T 0.044 +33 I 0.049 +34 Y 0.050 +35 F 0.048 +36 I 0.047 +37 S 0.047 +38 V 0.049 +39 T 0.054 +40 G 0.064 +41 N 0.075 +42 G 0.083 +43 A 0.084 +44 V 0.076 +45 L 0.065 +46 M 0.059 +47 I 0.061 +48 V 0.067 +49 I 0.076 +50 S 0.087 +51 D 0.094 +52 P 0.093 +53 R 0.086 +54 L 0.078 +55 H 0.070 +56 S 0.060 +57 L 0.047 +58 M 0.034 +59 Y 0.026 +60 F 0.022 +61 F 0.024 +62 L 0.031 +63 G 0.042 +64 N 0.052 +65 L 0.056 +66 S 0.055 +67 Y 0.053 +68 L 0.054 +69 D 0.061 +70 I 0.068 +71 C 0.069 +72 Y 0.064 +73 S 0.058 +74 T 0.056 +75 V 0.059 +76 T 0.064 +77 L 0.067 +78 P 0.064 +79 K 0.061 +80 M 0.060 +81 L 0.058 +82 Q 0.055 +83 N 0.053 +84 F 0.057 +85 L 0.071 +86 S 0.088 +87 T 0.097 +88 H 0.094 +89 K 0.081 +90 A 0.068 +91 I 0.057 +92 S 0.048 +93 F 0.041 +94 L 0.038 +95 G 0.038 +96 C 0.038 +97 I 0.037 +98 S 0.038 +99 Q 0.039 +100 L 0.037 +101 H 0.034 +102 F 0.030 +103 F 0.027 +104 H 0.027 +105 S 0.029 +106 L 0.034 +107 G 0.040 +108 S 0.046 +109 T 0.052 +110 E 0.054 +111 S 0.053 +112 M 0.046 +113 L 0.038 +114 F 0.032 +115 A 0.030 +116 V 0.031 +117 M 0.037 +118 A 0.044 +119 F 0.050 +120 D 0.052 +121 L 0.050 +122 S 0.046 +123 V 0.042 +124 A 0.042 +125 I 0.046 +126 C 0.052 +127 K 0.057 +128 P 0.059 +129 L 0.056 +130 R 0.051 +131 Y 0.048 +132 T 0.049 +133 V 0.053 +134 I 0.061 +135 M 0.066 +136 N 0.068 +137 P 0.067 +138 Q 0.064 +139 L 0.056 +140 C 0.053 +141 T 0.059 +142 Q 0.070 +143 M 0.075 +144 A 0.077 +145 I 0.075 +146 T 0.067 +147 I 0.056 +148 W 0.048 +149 V 0.046 +150 I 0.051 +151 G 0.057 +152 F 0.062 +153 F 0.066 +154 H 0.072 +155 A 0.076 +156 L 0.076 +157 L 0.079 +158 H 0.084 +159 S 0.087 +160 V 0.088 +161 M 0.091 +162 T 0.098 +163 S 0.106 +164 R 0.115 +165 L 0.119 +166 N 0.118 +167 F 0.117 +168 C 0.121 +169 G 0.127 +170 S 0.133 +171 N 0.138 +172 R 0.143 +173 I 0.139 +174 H 0.119 +175 H 0.093 +176 F 0.073 +177 L 0.063 +178 C 0.065 +179 D 0.078 +180 I 0.100 +181 K 0.121 +182 P 0.133 +183 L 0.135 +184 L 0.136 +185 K 0.136 +186 L 0.133 +187 A 0.127 +188 C 0.127 +189 G 0.136 +190 N 0.146 +191 T 0.145 +192 E 0.130 +193 L 0.112 +194 N 0.099 +195 Q 0.094 +196 W 0.093 +197 L 0.095 +198 L 0.094 +199 S 0.092 +200 T 0.090 +201 V 0.090 +202 T 0.087 +203 G 0.079 +204 T 0.068 +205 I 0.060 +206 A 0.058 +207 M 0.064 +208 G 0.073 +209 P 0.075 +210 F 0.068 +211 F 0.058 +212 L 0.054 +213 T 0.052 +214 L 0.048 +215 L 0.043 +216 S 0.038 +217 Y 0.034 +218 F 0.032 +219 Y 0.035 +220 I 0.044 +221 I 0.055 +222 T 0.060 +223 Y 0.055 +224 L 0.049 +225 F 0.053 +226 F 0.069 +227 K 0.092 +228 T 0.116 +229 R 0.133 +230 S 0.137 +231 C 0.127 +232 S 0.109 +233 M 0.091 +234 L 0.075 +235 C 0.065 +236 K 0.062 +237 A 0.061 +238 L 0.061 +239 S 0.061 +240 T 0.059 +241 C 0.056 +242 A 0.056 +243 S 0.058 +244 H 0.057 +245 F 0.053 +246 M 0.052 +247 V 0.051 +248 V 0.045 +249 I 0.036 +250 L 0.028 +251 F 0.025 +252 Y 0.027 +253 A 0.033 +254 P 0.036 +255 V 0.034 +256 L 0.032 +257 F 0.033 +258 T 0.043 +259 Y 0.067 +260 I 0.105 +261 H 0.146 +262 P 0.177 +263 A 0.189 +264 L 0.191 +265 E 0.190 +266 S 0.193 +267 F 0.194 +268 M 0.188 +269 D 0.173 +270 Q 0.152 +271 D 0.132 +272 R 0.116 +273 I 0.105 +274 V 0.095 +275 A 0.084 +276 I 0.078 +277 M 0.084 +278 Y 0.099 +279 T 0.115 +280 V 0.125 +281 V 0.128 +282 T 0.124 +283 P 0.113 +284 V 0.099 +285 L 0.087 +286 N 0.078 +287 P 0.071 +288 L 0.068 +289 I 0.070 +290 Y 0.073 +291 T 0.081 +292 L 0.099 +293 R 0.112 +294 N 0.106 +295 K 0.088 +296 E 0.070 +297 V 0.060 +298 K 0.058 +299 G 0.061 +300 A 0.067 +301 L 0.074 +302 G 0.086 +303 R 0.097 +304 V 0.106 +305 I 0.118 +306 R 0.139 +307 R 0.164 +308 L 0.183 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000283268.2_ENST00000636508.2_GN:TEX54_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000283268.2_ENST00000636508.2_GN:TEX54_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..eb8584e33bc565082a11fac688083487780cb830 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000283268.2_ENST00000636508.2_GN:TEX54_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,125 @@ +>ENSG00000283268.2|ENST00000636508.2|GN:TEX54|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.617 +2 G 0.645 +3 C 0.685 +4 C 0.720 +5 Q 0.741 +6 D 0.751 +7 K 0.758 +8 D 0.766 +9 F 0.774 +10 E 0.785 +11 M 0.794 +12 S 0.797 +13 D 0.790 +14 E 0.772 +15 Q 0.732 +16 S 0.677 +17 K 0.651 +18 E 0.688 +19 E 0.752 +20 E 0.795 +21 S 0.811 +22 E 0.815 +23 D 0.818 +24 G 0.821 +25 R 0.824 +26 E 0.827 +27 D 0.830 +28 E 0.835 +29 T 0.838 +30 T 0.838 +31 D 0.831 +32 T 0.819 +33 Q 0.804 +34 R 0.796 +35 G 0.798 +36 P 0.808 +37 R 0.815 +38 E 0.813 +39 C 0.809 +40 E 0.807 +41 R 0.805 +42 G 0.800 +43 L 0.795 +44 P 0.795 +45 E 0.801 +46 G 0.808 +47 R 0.810 +48 G 0.809 +49 E 0.814 +50 L 0.828 +51 R 0.844 +52 G 0.852 +53 L 0.846 +54 V 0.829 +55 V 0.812 +56 P 0.806 +57 S 0.807 +58 G 0.806 +59 A 0.801 +60 E 0.792 +61 D 0.779 +62 I 0.760 +63 D 0.733 +64 L 0.691 +65 N 0.639 +66 S 0.594 +67 P 0.573 +68 D 0.576 +69 H 0.599 +70 P 0.637 +71 N 0.675 +72 H 0.707 +73 K 0.732 +74 S 0.748 +75 N 0.745 +76 E 0.727 +77 S 0.705 +78 L 0.678 +79 L 0.638 +80 I 0.585 +81 T 0.535 +82 V 0.493 +83 L 0.457 +84 W 0.434 +85 R 0.440 +86 R 0.475 +87 L 0.518 +88 S 0.558 +89 T 0.606 +90 F 0.664 +91 G 0.716 +92 R 0.751 +93 R 0.771 +94 G 0.782 +95 S 0.784 +96 S 0.778 +97 R 0.774 +98 P 0.777 +99 S 0.781 +100 K 0.778 +101 R 0.769 +102 Q 0.764 +103 P 0.772 +104 D 0.787 +105 Q 0.800 +106 I 0.807 +107 R 0.807 +108 K 0.800 +109 Q 0.785 +110 E 0.767 +111 S 0.755 +112 P 0.751 +113 I 0.736 +114 R 0.701 +115 E 0.681 +116 G 0.705 +117 N 0.747 +118 Q 0.766 +119 E 0.760 +120 E 0.745 +121 P 0.729 +122 E 0.704 +123 K 0.665 +124 G 0.631 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000283268.2_ENST00000636508.2_GN:TEX54_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000283268.2_ENST00000636508.2_GN:TEX54_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d68f3ad4104d71425de047ce33271c213bf93a39 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000283268.2_ENST00000636508.2_GN:TEX54_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid @@ -0,0 +1,149 @@ +>ENSG00000283268.2|ENST00000636508.2|GN:TEX54|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:24 +1 M 0.520 +2 S 0.557 +3 Q 0.613 +4 K 0.673 +5 P 0.723 +6 G 0.754 +7 L 0.767 +8 E 0.774 +9 A 0.781 +10 G 0.789 +11 R 0.793 +12 L 0.791 +13 A 0.787 +14 W 0.787 +15 V 0.791 +16 A 0.789 +17 R 0.780 +18 S 0.773 +19 P 0.778 +20 G 0.797 +21 P 0.826 +22 R 0.853 +23 G 0.869 +24 A 0.872 +25 M 0.866 +26 G 0.855 +27 C 0.846 +28 C 0.841 +29 Q 0.838 +30 D 0.838 +31 K 0.839 +32 D 0.842 +33 F 0.846 +34 E 0.851 +35 M 0.854 +36 S 0.854 +37 D 0.847 +38 E 0.828 +39 Q 0.780 +40 S 0.713 +41 K 0.677 +42 E 0.711 +43 E 0.776 +44 E 0.820 +45 S 0.836 +46 E 0.840 +47 D 0.843 +48 G 0.846 +49 R 0.849 +50 E 0.853 +51 D 0.857 +52 E 0.862 +53 T 0.865 +54 T 0.865 +55 D 0.861 +56 T 0.853 +57 Q 0.843 +58 R 0.837 +59 G 0.839 +60 P 0.846 +61 R 0.852 +62 E 0.853 +63 C 0.851 +64 E 0.848 +65 R 0.844 +66 G 0.836 +67 L 0.828 +68 P 0.827 +69 E 0.832 +70 G 0.838 +71 R 0.839 +72 G 0.838 +73 E 0.841 +74 L 0.850 +75 R 0.860 +76 G 0.862 +77 L 0.853 +78 V 0.835 +79 V 0.818 +80 P 0.813 +81 S 0.815 +82 G 0.815 +83 A 0.810 +84 E 0.801 +85 D 0.785 +86 I 0.759 +87 D 0.724 +88 L 0.682 +89 N 0.639 +90 S 0.606 +91 P 0.593 +92 D 0.598 +93 H 0.620 +94 P 0.654 +95 N 0.689 +96 H 0.716 +97 K 0.735 +98 S 0.744 +99 N 0.738 +100 E 0.722 +101 S 0.702 +102 L 0.675 +103 L 0.633 +104 I 0.576 +105 T 0.515 +106 V 0.458 +107 L 0.408 +108 W 0.376 +109 R 0.377 +110 R 0.409 +111 L 0.456 +112 S 0.507 +113 T 0.569 +114 F 0.641 +115 G 0.702 +116 R 0.742 +117 R 0.763 +118 G 0.776 +119 S 0.780 +120 S 0.776 +121 R 0.772 +122 P 0.775 +123 S 0.781 +124 K 0.779 +125 R 0.771 +126 Q 0.768 +127 P 0.777 +128 D 0.794 +129 Q 0.809 +130 I 0.817 +131 R 0.818 +132 K 0.814 +133 Q 0.802 +134 E 0.785 +135 S 0.773 +136 P 0.763 +137 I 0.736 +138 R 0.687 +139 E 0.660 +140 G 0.691 +141 N 0.746 +142 Q 0.774 +143 E 0.771 +144 E 0.757 +145 P 0.742 +146 E 0.721 +147 K 0.688 +148 G 0.659 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000284188.3_ENST00000640271.3_GN:C1orf202_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000284188.3_ENST00000640271.3_GN:C1orf202_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..8591fc044345a14f66e6c70830bdd8b033a65bc3 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000284188.3_ENST00000640271.3_GN:C1orf202_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,183 @@ +>ENSG00000284188.3|ENST00000640271.3|GN:C1orf202|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.548 +2 A 0.577 +3 A 0.621 +4 P 0.668 +5 R 0.709 +6 F 0.734 +7 G 0.743 +8 G 0.745 +9 P 0.748 +10 R 0.753 +11 R 0.754 +12 G 0.747 +13 G 0.728 +14 A 0.692 +15 Q 0.635 +16 H 0.564 +17 E 0.496 +18 L 0.444 +19 L 0.412 +20 E 0.403 +21 K 0.416 +22 A 0.442 +23 A 0.474 +24 R 0.519 +25 L 0.561 +26 E 0.569 +27 R 0.549 +28 G 0.545 +29 P 0.586 +30 P 0.654 +31 P 0.718 +32 R 0.758 +33 G 0.770 +34 D 0.765 +35 P 0.760 +36 E 0.767 +37 A 0.785 +38 V 0.807 +39 G 0.823 +40 R 0.834 +41 R 0.846 +42 A 0.856 +43 V 0.861 +44 A 0.858 +45 G 0.853 +46 D 0.850 +47 G 0.846 +48 G 0.835 +49 S 0.815 +50 C 0.784 +51 S 0.739 +52 G 0.670 +53 C 0.580 +54 W 0.494 +55 C 0.440 +56 W 0.411 +57 R 0.391 +58 R 0.383 +59 L 0.401 +60 F 0.451 +61 R 0.522 +62 G 0.596 +63 P 0.663 +64 R 0.710 +65 R 0.736 +66 K 0.751 +67 K 0.752 +68 L 0.719 +69 R 0.659 +70 Q 0.627 +71 A 0.662 +72 H 0.729 +73 A 0.777 +74 R 0.798 +75 A 0.805 +76 G 0.803 +77 K 0.791 +78 E 0.774 +79 A 0.761 +80 P 0.759 +81 E 0.763 +82 R 0.758 +83 G 0.735 +84 L 0.696 +85 W 0.650 +86 G 0.603 +87 P 0.553 +88 S 0.486 +89 S 0.400 +90 L 0.317 +91 Q 0.264 +92 R 0.250 +93 L 0.252 +94 L 0.246 +95 Q 0.230 +96 R 0.211 +97 L 0.196 +98 A 0.189 +99 T 0.189 +100 W 0.186 +101 R 0.180 +102 R 0.175 +103 R 0.178 +104 Y 0.190 +105 L 0.215 +106 R 0.262 +107 R 0.337 +108 K 0.424 +109 E 0.500 +110 R 0.561 +111 P 0.618 +112 D 0.674 +113 R 0.717 +114 L 0.740 +115 E 0.744 +116 E 0.741 +117 I 0.738 +118 P 0.741 +119 L 0.757 +120 L 0.779 +121 V 0.791 +122 L 0.792 +123 D 0.786 +124 R 0.779 +125 A 0.778 +126 Q 0.785 +127 G 0.799 +128 G 0.819 +129 H 0.837 +130 E 0.848 +131 A 0.849 +132 A 0.839 +133 A 0.826 +134 G 0.820 +135 P 0.828 +136 Q 0.841 +137 S 0.847 +138 S 0.841 +139 V 0.830 +140 P 0.822 +141 G 0.816 +142 R 0.802 +143 P 0.764 +144 A 0.706 +145 Q 0.670 +146 A 0.679 +147 A 0.688 +148 P 0.661 +149 A 0.640 +150 R 0.671 +151 Q 0.733 +152 P 0.781 +153 R 0.810 +154 R 0.832 +155 R 0.849 +156 S 0.859 +157 A 0.862 +158 T 0.858 +159 R 0.847 +160 S 0.833 +161 R 0.820 +162 S 0.813 +163 P 0.811 +164 V 0.804 +165 A 0.792 +166 P 0.784 +167 P 0.790 +168 V 0.805 +169 H 0.813 +170 A 0.809 +171 Q 0.793 +172 D 0.771 +173 C 0.749 +174 F 0.737 +175 F 0.735 +176 L 0.737 +177 F 0.736 +178 G 0.730 +179 Q 0.714 +180 Q 0.676 +181 K 0.613 +182 Q 0.558 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000284188.3_ENST00000640271.3_GN:C1orf202_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000284188.3_ENST00000640271.3_GN:C1orf202_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f25d29611443fdec42f5d1c89ded4443a6f1c560 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000284188.3_ENST00000640271.3_GN:C1orf202_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid @@ -0,0 +1,196 @@ +>ENSG00000284188.3|ENST00000640271.3|GN:C1orf202|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:13 +1 M 0.483 +2 W 0.532 +3 A 0.602 +4 P 0.661 +5 R 0.697 +6 S 0.713 +7 E 0.718 +8 K 0.725 +9 R 0.743 +10 P 0.770 +11 A 0.801 +12 R 0.823 +13 A 0.830 +14 M 0.824 +15 A 0.812 +16 A 0.801 +17 P 0.796 +18 R 0.800 +19 F 0.803 +20 G 0.798 +21 G 0.789 +22 P 0.788 +23 R 0.793 +24 R 0.796 +25 G 0.789 +26 G 0.771 +27 A 0.741 +28 Q 0.698 +29 H 0.644 +30 E 0.590 +31 L 0.547 +32 L 0.514 +33 E 0.497 +34 K 0.500 +35 A 0.515 +36 A 0.536 +37 R 0.565 +38 L 0.594 +39 E 0.591 +40 R 0.562 +41 G 0.552 +42 P 0.592 +43 P 0.662 +44 P 0.727 +45 R 0.767 +46 G 0.778 +47 D 0.773 +48 P 0.770 +49 E 0.778 +50 A 0.798 +51 V 0.821 +52 G 0.839 +53 R 0.850 +54 R 0.861 +55 A 0.870 +56 V 0.872 +57 A 0.868 +58 G 0.862 +59 D 0.858 +60 G 0.854 +61 G 0.843 +62 S 0.822 +63 C 0.791 +64 S 0.745 +65 G 0.674 +66 C 0.582 +67 W 0.498 +68 C 0.444 +69 W 0.415 +70 R 0.392 +71 R 0.378 +72 L 0.392 +73 F 0.440 +74 R 0.509 +75 G 0.584 +76 P 0.651 +77 R 0.696 +78 R 0.719 +79 K 0.732 +80 K 0.733 +81 L 0.700 +82 R 0.641 +83 Q 0.609 +84 A 0.644 +85 H 0.712 +86 A 0.762 +87 R 0.786 +88 A 0.795 +89 G 0.793 +90 K 0.781 +91 E 0.763 +92 A 0.751 +93 P 0.751 +94 E 0.756 +95 R 0.753 +96 G 0.731 +97 L 0.691 +98 W 0.642 +99 G 0.592 +100 P 0.540 +101 S 0.473 +102 S 0.388 +103 L 0.304 +104 Q 0.248 +105 R 0.229 +106 L 0.226 +107 L 0.219 +108 Q 0.205 +109 R 0.190 +110 L 0.179 +111 A 0.175 +112 T 0.176 +113 W 0.176 +114 R 0.170 +115 R 0.166 +116 R 0.170 +117 Y 0.184 +118 L 0.210 +119 R 0.257 +120 R 0.330 +121 K 0.416 +122 E 0.493 +123 R 0.558 +124 P 0.618 +125 D 0.677 +126 R 0.724 +127 L 0.749 +128 E 0.755 +129 E 0.752 +130 I 0.749 +131 P 0.753 +132 L 0.769 +133 L 0.789 +134 V 0.800 +135 L 0.798 +136 D 0.790 +137 R 0.782 +138 A 0.779 +139 Q 0.786 +140 G 0.801 +141 G 0.821 +142 H 0.840 +143 E 0.851 +144 A 0.853 +145 A 0.845 +146 A 0.833 +147 G 0.827 +148 P 0.834 +149 Q 0.846 +150 S 0.852 +151 S 0.846 +152 V 0.834 +153 P 0.826 +154 G 0.819 +155 R 0.804 +156 P 0.763 +157 A 0.701 +158 Q 0.663 +159 A 0.674 +160 A 0.686 +161 P 0.660 +162 A 0.640 +163 R 0.673 +164 Q 0.736 +165 P 0.787 +166 R 0.817 +167 R 0.838 +168 R 0.853 +169 S 0.861 +170 A 0.864 +171 T 0.859 +172 R 0.848 +173 S 0.834 +174 R 0.820 +175 S 0.813 +176 P 0.811 +177 V 0.804 +178 A 0.791 +179 P 0.783 +180 P 0.789 +181 V 0.804 +182 H 0.813 +183 A 0.810 +184 Q 0.795 +185 D 0.774 +186 C 0.753 +187 F 0.741 +188 F 0.739 +189 L 0.740 +190 F 0.738 +191 G 0.730 +192 Q 0.714 +193 Q 0.676 +194 K 0.613 +195 Q 0.558 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000285480.2_ENST00000644661.2_GN:H2BK1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000285480.2_ENST00000644661.2_GN:H2BK1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..22a05b3c1dfdf2747f5b721f5d0a2988ed100f8b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000285480.2_ENST00000644661.2_GN:H2BK1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,123 @@ +>ENSG00000285480.2|ENST00000644661.2|GN:H2BK1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.482 +2 S 0.516 +3 A 0.559 +4 E 0.583 +5 Y 0.573 +6 G 0.540 +7 Q 0.526 +8 R 0.557 +9 Q 0.611 +10 Q 0.655 +11 P 0.686 +12 G 0.709 +13 G 0.721 +14 R 0.726 +15 G 0.728 +16 G 0.726 +17 R 0.718 +18 S 0.712 +19 S 0.707 +20 G 0.701 +21 N 0.688 +22 K 0.672 +23 K 0.660 +24 S 0.654 +25 K 0.648 +26 K 0.637 +27 R 0.620 +28 C 0.591 +29 R 0.544 +30 R 0.477 +31 K 0.393 +32 E 0.297 +33 S 0.206 +34 Y 0.133 +35 S 0.083 +36 M 0.054 +37 Y 0.042 +38 I 0.040 +39 Y 0.048 +40 K 0.065 +41 V 0.084 +42 L 0.095 +43 K 0.101 +44 Q 0.112 +45 V 0.128 +46 H 0.144 +47 P 0.162 +48 D 0.186 +49 I 0.202 +50 G 0.196 +51 I 0.171 +52 S 0.142 +53 A 0.124 +54 K 0.121 +55 A 0.121 +56 M 0.117 +57 S 0.114 +58 I 0.114 +59 M 0.118 +60 N 0.128 +61 S 0.149 +62 F 0.171 +63 V 0.184 +64 N 0.181 +65 D 0.166 +66 V 0.146 +67 F 0.126 +68 E 0.107 +69 Q 0.093 +70 L 0.086 +71 A 0.083 +72 C 0.074 +73 E 0.063 +74 A 0.061 +75 A 0.068 +76 R 0.073 +77 L 0.070 +78 A 0.067 +79 Q 0.074 +80 Y 0.089 +81 S 0.102 +82 G 0.108 +83 R 0.111 +84 T 0.120 +85 T 0.132 +86 L 0.129 +87 T 0.107 +88 S 0.080 +89 R 0.063 +90 E 0.056 +91 V 0.054 +92 Q 0.054 +93 T 0.051 +94 A 0.046 +95 V 0.045 +96 R 0.053 +97 L 0.069 +98 L 0.090 +99 L 0.105 +100 P 0.107 +101 G 0.104 +102 E 0.101 +103 L 0.097 +104 A 0.089 +105 K 0.081 +106 H 0.082 +107 A 0.092 +108 V 0.109 +109 S 0.126 +110 E 0.137 +111 G 0.140 +112 T 0.141 +113 K 0.142 +114 A 0.141 +115 V 0.135 +116 T 0.126 +117 K 0.125 +118 Y 0.139 +119 T 0.173 +120 S 0.218 +121 S 0.254 +122 K 0.272 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSG00000285480.2_ENST00000644661.2_GN:H2BK1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:29.caid b/havana_hard_negatives/ENSG00000285480.2_ENST00000644661.2_GN:H2BK1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:29.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e6f126c3254ccf9ae96b4985ca71302a420f09a8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSG00000285480.2_ENST00000644661.2_GN:H2BK1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:29.caid @@ -0,0 +1,152 @@ +>ENSG00000285480.2|ENST00000644661.2|GN:H2BK1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:29 +1 M 0.462 +2 S 0.496 +3 P 0.541 +4 A 0.579 +5 T 0.613 +6 P 0.643 +7 G 0.656 +8 G 0.640 +9 A 0.608 +10 A 0.590 +11 D 0.595 +12 L 0.612 +13 I 0.643 +14 K 0.686 +15 S 0.725 +16 S 0.744 +17 S 0.749 +18 K 0.750 +19 G 0.750 +20 V 0.749 +21 G 0.745 +22 E 0.735 +23 G 0.716 +24 Y 0.694 +25 S 0.674 +26 R 0.649 +27 S 0.605 +28 R 0.547 +29 R 0.519 +30 M 0.549 +31 S 0.611 +32 A 0.660 +33 E 0.687 +34 Y 0.707 +35 G 0.725 +36 Q 0.733 +37 R 0.731 +38 Q 0.727 +39 Q 0.728 +40 P 0.737 +41 G 0.751 +42 G 0.764 +43 R 0.772 +44 G 0.775 +45 G 0.774 +46 R 0.771 +47 S 0.769 +48 S 0.766 +49 G 0.758 +50 N 0.744 +51 K 0.726 +52 K 0.712 +53 S 0.704 +54 K 0.697 +55 K 0.685 +56 R 0.665 +57 C 0.630 +58 R 0.573 +59 R 0.494 +60 K 0.399 +61 E 0.298 +62 S 0.206 +63 Y 0.134 +64 S 0.084 +65 M 0.054 +66 Y 0.041 +67 I 0.039 +68 Y 0.048 +69 K 0.066 +70 V 0.087 +71 L 0.099 +72 K 0.105 +73 Q 0.115 +74 V 0.129 +75 H 0.142 +76 P 0.158 +77 D 0.180 +78 I 0.196 +79 G 0.191 +80 I 0.165 +81 S 0.137 +82 A 0.121 +83 K 0.120 +84 A 0.122 +85 M 0.118 +86 S 0.115 +87 I 0.116 +88 M 0.118 +89 N 0.127 +90 S 0.145 +91 F 0.166 +92 V 0.178 +93 N 0.176 +94 D 0.161 +95 V 0.142 +96 F 0.125 +97 E 0.107 +98 Q 0.092 +99 L 0.085 +100 A 0.082 +101 C 0.073 +102 E 0.062 +103 A 0.058 +104 A 0.063 +105 R 0.067 +106 L 0.065 +107 A 0.065 +108 Q 0.073 +109 Y 0.087 +110 S 0.100 +111 G 0.106 +112 R 0.109 +113 T 0.119 +114 T 0.131 +115 L 0.129 +116 T 0.106 +117 S 0.080 +118 R 0.063 +119 E 0.056 +120 V 0.054 +121 Q 0.053 +122 T 0.050 +123 A 0.046 +124 V 0.045 +125 R 0.052 +126 L 0.069 +127 L 0.090 +128 L 0.106 +129 P 0.109 +130 G 0.105 +131 E 0.101 +132 L 0.097 +133 A 0.089 +134 K 0.081 +135 H 0.082 +136 A 0.092 +137 V 0.109 +138 S 0.126 +139 E 0.137 +140 G 0.140 +141 T 0.140 +142 K 0.141 +143 A 0.137 +144 V 0.127 +145 T 0.116 +146 K 0.117 +147 Y 0.136 +148 T 0.174 +149 S 0.220 +150 S 0.256 +151 K 0.273 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000002033.15_ENSMUST00000002101.12_GN:Cd3g_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000002033.15_ENSMUST00000002101.12_GN:Cd3g_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b5332c544e7979fc0956c610736cf3b4732b3540 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000002033.15_ENSMUST00000002101.12_GN:Cd3g_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,183 @@ +>ENSMUSG00000002033.15|ENSMUST00000002101.12|GN:Cd3g|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.448 +2 E 0.462 +3 Q 0.484 +4 R 0.511 +5 K 0.538 +6 G 0.552 +7 L 0.543 +8 A 0.515 +9 G 0.461 +10 L 0.383 +11 F 0.312 +12 L 0.279 +13 V 0.282 +14 I 0.301 +15 S 0.329 +16 L 0.377 +17 L 0.442 +18 Q 0.510 +19 G 0.566 +20 T 0.608 +21 V 0.638 +22 A 0.650 +23 Q 0.642 +24 T 0.613 +25 N 0.559 +26 K 0.478 +27 A 0.379 +28 K 0.276 +29 N 0.184 +30 L 0.120 +31 V 0.089 +32 Q 0.085 +33 V 0.096 +34 D 0.108 +35 G 0.115 +36 S 0.122 +37 R 0.130 +38 G 0.136 +39 D 0.133 +40 G 0.116 +41 S 0.090 +42 V 0.064 +43 L 0.047 +44 L 0.039 +45 T 0.037 +46 C 0.040 +47 G 0.046 +48 L 0.053 +49 T 0.063 +50 D 0.069 +51 K 0.067 +52 T 0.058 +53 I 0.046 +54 K 0.040 +55 W 0.042 +56 L 0.051 +57 K 0.060 +58 D 0.066 +59 G 0.066 +60 S 0.062 +61 I 0.055 +62 I 0.050 +63 S 0.050 +64 P 0.060 +65 L 0.073 +66 N 0.081 +67 A 0.079 +68 T 0.068 +69 K 0.054 +70 N 0.044 +71 T 0.043 +72 W 0.050 +73 N 0.061 +74 L 0.072 +75 G 0.082 +76 N 0.086 +77 N 0.084 +78 A 0.079 +79 K 0.077 +80 D 0.078 +81 P 0.082 +82 R 0.085 +83 G 0.078 +84 T 0.061 +85 Y 0.043 +86 Q 0.038 +87 C 0.048 +88 Q 0.066 +89 G 0.079 +90 A 0.081 +91 K 0.078 +92 E 0.072 +93 T 0.067 +94 S 0.063 +95 N 0.063 +96 P 0.062 +97 L 0.060 +98 Q 0.055 +99 V 0.052 +100 Y 0.060 +101 Y 0.086 +102 R 0.127 +103 M 0.176 +104 C 0.224 +105 E 0.267 +106 N 0.304 +107 C 0.336 +108 I 0.357 +109 E 0.351 +110 L 0.315 +111 N 0.266 +112 I 0.226 +113 G 0.205 +114 T 0.199 +115 I 0.200 +116 S 0.205 +117 G 0.216 +118 F 0.230 +119 I 0.240 +120 F 0.239 +121 A 0.229 +122 E 0.214 +123 V 0.199 +124 I 0.190 +125 S 0.183 +126 I 0.172 +127 F 0.154 +128 F 0.134 +129 L 0.120 +130 A 0.112 +131 L 0.114 +132 G 0.121 +133 V 0.125 +134 Y 0.131 +135 L 0.154 +136 I 0.197 +137 A 0.250 +138 G 0.306 +139 Q 0.366 +140 D 0.425 +141 G 0.462 +142 V 0.456 +143 R 0.424 +144 Q 0.407 +145 S 0.419 +146 R 0.440 +147 A 0.458 +148 S 0.474 +149 D 0.469 +150 K 0.440 +151 Q 0.421 +152 T 0.436 +153 L 0.468 +154 L 0.497 +155 Q 0.530 +156 N 0.559 +157 E 0.573 +158 Q 0.573 +159 L 0.572 +160 Y 0.576 +161 Q 0.589 +162 P 0.615 +163 L 0.643 +164 K 0.653 +165 D 0.639 +166 R 0.618 +167 E 0.610 +168 Y 0.611 +169 D 0.608 +170 Q 0.596 +171 Y 0.589 +172 S 0.603 +173 H 0.639 +174 L 0.680 +175 Q 0.714 +176 G 0.731 +177 N 0.732 +178 Q 0.717 +179 L 0.686 +180 R 0.629 +181 K 0.552 +182 K 0.491 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000002033.15_ENSMUST00000002101.12_GN:Cd3g_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:37.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000002033.15_ENSMUST00000002101.12_GN:Cd3g_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:37.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ab14242f87a99718bcaa09f985e15961071c7db6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000002033.15_ENSMUST00000002101.12_GN:Cd3g_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:37.caid @@ -0,0 +1,220 @@ +>ENSMUSG00000002033.15|ENSMUST00000002101.12|GN:Cd3g|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:37 +1 M 0.428 +2 H 0.467 +3 A 0.522 +4 G 0.559 +5 W 0.568 +6 S 0.578 +7 Q 0.609 +8 A 0.643 +9 S 0.650 +10 C 0.638 +11 C 0.637 +12 T 0.656 +13 G 0.675 +14 C 0.685 +15 L 0.689 +16 G 0.691 +17 G 0.681 +18 W 0.657 +19 V 0.630 +20 A 0.612 +21 G 0.601 +22 W 0.588 +23 L 0.577 +24 R 0.575 +25 D 0.563 +26 S 0.522 +27 Q 0.464 +28 Y 0.418 +29 F 0.402 +30 Y 0.414 +31 W 0.445 +32 R 0.492 +33 S 0.547 +34 K 0.596 +35 E 0.629 +36 T 0.644 +37 D 0.643 +38 M 0.637 +39 E 0.635 +40 Q 0.640 +41 R 0.648 +42 K 0.657 +43 G 0.661 +44 L 0.650 +45 A 0.617 +46 G 0.553 +47 L 0.458 +48 F 0.361 +49 L 0.296 +50 V 0.276 +51 I 0.289 +52 S 0.326 +53 L 0.382 +54 L 0.455 +55 Q 0.530 +56 G 0.594 +57 T 0.638 +58 V 0.665 +59 A 0.675 +60 Q 0.664 +61 T 0.630 +62 N 0.565 +63 K 0.474 +64 A 0.369 +65 K 0.263 +66 N 0.173 +67 L 0.113 +68 V 0.086 +69 Q 0.082 +70 V 0.092 +71 D 0.104 +72 G 0.112 +73 S 0.118 +74 R 0.127 +75 G 0.133 +76 D 0.128 +77 G 0.110 +78 S 0.084 +79 V 0.060 +80 L 0.044 +81 L 0.037 +82 T 0.035 +83 C 0.037 +84 G 0.042 +85 L 0.049 +86 T 0.057 +87 D 0.062 +88 K 0.061 +89 T 0.052 +90 I 0.042 +91 K 0.037 +92 W 0.039 +93 L 0.048 +94 K 0.058 +95 D 0.063 +96 G 0.064 +97 S 0.060 +98 I 0.053 +99 I 0.048 +100 S 0.049 +101 P 0.059 +102 L 0.072 +103 N 0.082 +104 A 0.080 +105 T 0.069 +106 K 0.054 +107 N 0.043 +108 T 0.042 +109 W 0.048 +110 N 0.057 +111 L 0.068 +112 G 0.076 +113 N 0.080 +114 N 0.080 +115 A 0.077 +116 K 0.078 +117 D 0.081 +118 P 0.086 +119 R 0.088 +120 G 0.081 +121 T 0.062 +122 Y 0.043 +123 Q 0.037 +124 C 0.048 +125 Q 0.066 +126 G 0.079 +127 A 0.082 +128 K 0.078 +129 E 0.073 +130 T 0.067 +131 S 0.063 +132 N 0.062 +133 P 0.061 +134 L 0.058 +135 Q 0.054 +136 V 0.052 +137 Y 0.059 +138 Y 0.083 +139 R 0.123 +140 M 0.172 +141 C 0.223 +142 E 0.269 +143 N 0.310 +144 C 0.350 +145 I 0.376 +146 E 0.369 +147 L 0.326 +148 N 0.270 +149 I 0.226 +150 G 0.203 +151 T 0.196 +152 I 0.195 +153 S 0.201 +154 G 0.212 +155 F 0.226 +156 I 0.234 +157 F 0.232 +158 A 0.223 +159 E 0.210 +160 V 0.198 +161 I 0.190 +162 S 0.185 +163 I 0.174 +164 F 0.155 +165 F 0.133 +166 L 0.117 +167 A 0.110 +168 L 0.113 +169 G 0.121 +170 V 0.126 +171 Y 0.134 +172 L 0.160 +173 I 0.206 +174 A 0.262 +175 G 0.319 +176 Q 0.378 +177 D 0.437 +178 G 0.475 +179 V 0.469 +180 R 0.437 +181 Q 0.421 +182 S 0.435 +183 R 0.459 +184 A 0.480 +185 S 0.495 +186 D 0.488 +187 K 0.456 +188 Q 0.436 +189 T 0.454 +190 L 0.490 +191 L 0.523 +192 Q 0.554 +193 N 0.579 +194 E 0.587 +195 Q 0.584 +196 L 0.582 +197 Y 0.586 +198 Q 0.598 +199 P 0.622 +200 L 0.649 +201 K 0.660 +202 D 0.646 +203 R 0.625 +204 E 0.616 +205 Y 0.617 +206 D 0.616 +207 Q 0.605 +208 Y 0.597 +209 S 0.609 +210 H 0.642 +211 L 0.683 +212 Q 0.718 +213 G 0.735 +214 N 0.734 +215 Q 0.717 +216 L 0.685 +217 R 0.630 +218 K 0.555 +219 K 0.495 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000002064.11_ENSMUST00000002133.9_GN:Sdf2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000002064.11_ENSMUST00000002133.9_GN:Sdf2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f43fb9fb472a249fe6ccfd7552ba21190bb6467d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000002064.11_ENSMUST00000002133.9_GN:Sdf2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,212 @@ +>ENSMUSG00000002064.11|ENSMUST00000002133.9|GN:Sdf2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.329 +2 A 0.326 +3 V 0.334 +4 L 0.350 +5 S 0.347 +6 L 0.330 +7 L 0.348 +8 L 0.416 +9 L 0.496 +10 G 0.550 +11 G 0.568 +12 L 0.556 +13 W 0.536 +14 S 0.536 +15 A 0.557 +16 V 0.579 +17 G 0.585 +18 A 0.571 +19 S 0.530 +20 N 0.456 +21 M 0.357 +22 A 0.251 +23 V 0.158 +24 V 0.094 +25 T 0.058 +26 C 0.041 +27 G 0.037 +28 S 0.040 +29 V 0.042 +30 V 0.044 +31 K 0.047 +32 L 0.056 +33 L 0.071 +34 N 0.081 +35 T 0.081 +36 R 0.077 +37 H 0.076 +38 N 0.078 +39 V 0.080 +40 R 0.082 +41 L 0.089 +42 H 0.102 +43 S 0.117 +44 H 0.129 +45 D 0.138 +46 V 0.146 +47 R 0.151 +48 Y 0.151 +49 G 0.150 +50 S 0.148 +51 G 0.153 +52 S 0.166 +53 G 0.179 +54 Q 0.181 +55 Q 0.174 +56 S 0.165 +57 V 0.154 +58 T 0.137 +59 G 0.117 +60 V 0.102 +61 T 0.092 +62 S 0.087 +63 V 0.087 +64 D 0.090 +65 D 0.094 +66 S 0.096 +67 N 0.089 +68 S 0.071 +69 Y 0.051 +70 W 0.040 +71 R 0.043 +72 I 0.060 +73 R 0.088 +74 G 0.120 +75 K 0.143 +76 T 0.148 +77 A 0.140 +78 T 0.128 +79 V 0.116 +80 C 0.101 +81 E 0.086 +82 R 0.077 +83 G 0.078 +84 T 0.085 +85 P 0.086 +86 I 0.079 +87 K 0.067 +88 C 0.060 +89 G 0.060 +90 Q 0.062 +91 P 0.064 +92 I 0.066 +93 R 0.072 +94 L 0.084 +95 T 0.097 +96 H 0.103 +97 I 0.098 +98 N 0.096 +99 T 0.102 +100 G 0.107 +101 R 0.102 +102 N 0.093 +103 L 0.090 +104 H 0.098 +105 S 0.110 +106 H 0.117 +107 H 0.119 +108 F 0.120 +109 T 0.121 +110 S 0.117 +111 P 0.107 +112 L 0.100 +113 S 0.102 +114 G 0.110 +115 N 0.116 +116 Q 0.118 +117 E 0.120 +118 V 0.120 +119 S 0.115 +120 A 0.111 +121 F 0.115 +122 G 0.124 +123 E 0.134 +124 E 0.146 +125 G 0.159 +126 E 0.168 +127 G 0.164 +128 D 0.147 +129 Y 0.124 +130 L 0.100 +131 D 0.074 +132 D 0.050 +133 W 0.036 +134 T 0.034 +135 V 0.041 +136 L 0.053 +137 C 0.064 +138 N 0.068 +139 G 0.062 +140 P 0.054 +141 Y 0.050 +142 W 0.049 +143 V 0.050 +144 R 0.053 +145 D 0.059 +146 G 0.065 +147 E 0.069 +148 V 0.069 +149 R 0.069 +150 F 0.076 +151 K 0.091 +152 H 0.103 +153 S 0.100 +154 S 0.087 +155 T 0.077 +156 D 0.072 +157 V 0.069 +158 L 0.065 +159 L 0.063 +160 S 0.067 +161 V 0.082 +162 T 0.107 +163 G 0.134 +164 E 0.152 +165 Q 0.153 +166 Y 0.145 +167 G 0.137 +168 R 0.135 +169 P 0.133 +170 I 0.129 +171 S 0.127 +172 G 0.126 +173 Q 0.123 +174 K 0.119 +175 E 0.119 +176 V 0.119 +177 H 0.111 +178 G 0.097 +179 M 0.090 +180 A 0.095 +181 Q 0.106 +182 P 0.112 +183 S 0.106 +184 Q 0.090 +185 N 0.071 +186 N 0.054 +187 Y 0.041 +188 W 0.034 +189 K 0.034 +190 A 0.042 +191 M 0.058 +192 E 0.079 +193 G 0.097 +194 I 0.111 +195 F 0.125 +196 M 0.147 +197 K 0.174 +198 P 0.196 +199 S 0.208 +200 E 0.217 +201 L 0.236 +202 L 0.271 +203 R 0.324 +204 A 0.389 +205 E 0.443 +206 V 0.470 +207 H 0.478 +208 H 0.483 +209 A 0.473 +210 E 0.439 +211 L 0.403 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000002064.11_ENSMUST00000002133.9_GN:Sdf2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000002064.11_ENSMUST00000002133.9_GN:Sdf2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6b88945f9086ba475a7ef03fcbbd591add6a3554 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000002064.11_ENSMUST00000002133.9_GN:Sdf2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid @@ -0,0 +1,220 @@ +>ENSMUSG00000002064.11|ENSMUST00000002133.9|GN:Sdf2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:8 +1 M 0.420 +2 I 0.435 +3 S 0.466 +4 S 0.503 +5 L 0.519 +6 G 0.505 +7 S 0.485 +8 R 0.471 +9 M 0.434 +10 A 0.377 +11 V 0.355 +12 L 0.374 +13 S 0.387 +14 L 0.384 +15 L 0.407 +16 L 0.466 +17 L 0.532 +18 G 0.578 +19 G 0.596 +20 L 0.589 +21 W 0.576 +22 S 0.578 +23 A 0.594 +24 V 0.606 +25 G 0.603 +26 A 0.583 +27 S 0.539 +28 N 0.461 +29 M 0.358 +30 A 0.249 +31 V 0.155 +32 V 0.091 +33 T 0.056 +34 C 0.041 +35 G 0.037 +36 S 0.040 +37 V 0.042 +38 V 0.044 +39 K 0.047 +40 L 0.056 +41 L 0.071 +42 N 0.081 +43 T 0.081 +44 R 0.076 +45 H 0.075 +46 N 0.077 +47 V 0.078 +48 R 0.081 +49 L 0.088 +50 H 0.101 +51 S 0.116 +52 H 0.128 +53 D 0.138 +54 V 0.146 +55 R 0.150 +56 Y 0.151 +57 G 0.149 +58 S 0.147 +59 G 0.151 +60 S 0.163 +61 G 0.176 +62 Q 0.178 +63 Q 0.171 +64 S 0.163 +65 V 0.151 +66 T 0.133 +67 G 0.113 +68 V 0.098 +69 T 0.088 +70 S 0.084 +71 V 0.083 +72 D 0.086 +73 D 0.091 +74 S 0.094 +75 N 0.087 +76 S 0.069 +77 Y 0.050 +78 W 0.039 +79 R 0.043 +80 I 0.059 +81 R 0.087 +82 G 0.119 +83 K 0.142 +84 T 0.147 +85 A 0.139 +86 T 0.127 +87 V 0.115 +88 C 0.100 +89 E 0.086 +90 R 0.077 +91 G 0.078 +92 T 0.084 +93 P 0.085 +94 I 0.078 +95 K 0.067 +96 C 0.060 +97 G 0.059 +98 Q 0.062 +99 P 0.063 +100 I 0.065 +101 R 0.070 +102 L 0.082 +103 T 0.096 +104 H 0.101 +105 I 0.097 +106 N 0.094 +107 T 0.101 +108 G 0.106 +109 R 0.102 +110 N 0.093 +111 L 0.092 +112 H 0.101 +113 S 0.113 +114 H 0.120 +115 H 0.121 +116 F 0.122 +117 T 0.123 +118 S 0.120 +119 P 0.110 +120 L 0.102 +121 S 0.104 +122 G 0.112 +123 N 0.118 +124 Q 0.121 +125 E 0.123 +126 V 0.123 +127 S 0.119 +128 A 0.115 +129 F 0.119 +130 G 0.128 +131 E 0.138 +132 E 0.150 +133 G 0.164 +134 E 0.173 +135 G 0.169 +136 D 0.151 +137 Y 0.127 +138 L 0.102 +139 D 0.076 +140 D 0.051 +141 W 0.037 +142 T 0.034 +143 V 0.041 +144 L 0.053 +145 C 0.064 +146 N 0.068 +147 G 0.062 +148 P 0.054 +149 Y 0.051 +150 W 0.050 +151 V 0.050 +152 R 0.053 +153 D 0.059 +154 G 0.065 +155 E 0.069 +156 V 0.070 +157 R 0.069 +158 F 0.076 +159 K 0.091 +160 H 0.103 +161 S 0.100 +162 S 0.087 +163 T 0.076 +164 D 0.071 +165 V 0.068 +166 L 0.065 +167 L 0.063 +168 S 0.067 +169 V 0.082 +170 T 0.107 +171 G 0.134 +172 E 0.152 +173 Q 0.154 +174 Y 0.145 +175 G 0.137 +176 R 0.134 +177 P 0.132 +178 I 0.129 +179 S 0.128 +180 G 0.127 +181 Q 0.124 +182 K 0.120 +183 E 0.120 +184 V 0.120 +185 H 0.111 +186 G 0.097 +187 M 0.089 +188 A 0.094 +189 Q 0.104 +190 P 0.109 +191 S 0.103 +192 Q 0.088 +193 N 0.069 +194 N 0.052 +195 Y 0.040 +196 W 0.033 +197 K 0.033 +198 A 0.042 +199 M 0.058 +200 E 0.078 +201 G 0.096 +202 I 0.109 +203 F 0.123 +204 M 0.144 +205 K 0.172 +206 P 0.194 +207 S 0.205 +208 E 0.214 +209 L 0.234 +210 L 0.271 +211 R 0.326 +212 A 0.392 +213 E 0.447 +214 V 0.474 +215 H 0.483 +216 H 0.488 +217 A 0.477 +218 E 0.441 +219 L 0.404 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000002550.17_ENSMUST00000002625.15_GN:Uck1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000002550.17_ENSMUST00000002625.15_GN:Uck1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6a8582e5697dbaf827cb1ae07f4e4868da89d264 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000002550.17_ENSMUST00000002625.15_GN:Uck1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,284 @@ +>ENSMUSG00000002550.17|ENSMUST00000002625.15|GN:Uck1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.370 +2 S 0.396 +3 V 0.443 +4 A 0.500 +5 P 0.553 +6 D 0.587 +7 M 0.588 +8 A 0.551 +9 S 0.504 +10 A 0.504 +11 G 0.569 +12 G 0.649 +13 G 0.696 +14 G 0.705 +15 S 0.696 +16 E 0.683 +17 S 0.671 +18 A 0.658 +19 A 0.643 +20 P 0.630 +21 E 0.618 +22 A 0.596 +23 D 0.558 +24 R 0.510 +25 P 0.456 +26 Q 0.393 +27 P 0.315 +28 R 0.231 +29 P 0.157 +30 F 0.105 +31 L 0.081 +32 I 0.079 +33 G 0.087 +34 V 0.098 +35 S 0.109 +36 G 0.117 +37 G 0.116 +38 T 0.109 +39 A 0.101 +40 S 0.098 +41 G 0.094 +42 K 0.085 +43 S 0.075 +44 T 0.072 +45 V 0.078 +46 C 0.082 +47 E 0.082 +48 K 0.085 +49 I 0.092 +50 M 0.095 +51 E 0.092 +52 L 0.090 +53 L 0.095 +54 G 0.103 +55 Q 0.109 +56 N 0.113 +57 E 0.111 +58 V 0.102 +59 D 0.091 +60 R 0.084 +61 R 0.087 +62 Q 0.092 +63 R 0.088 +64 K 0.075 +65 L 0.063 +66 V 0.058 +67 I 0.058 +68 L 0.059 +69 S 0.061 +70 Q 0.064 +71 D 0.071 +72 C 0.078 +73 F 0.082 +74 Y 0.081 +75 K 0.082 +76 V 0.085 +77 L 0.085 +78 T 0.078 +79 A 0.068 +80 E 0.062 +81 Q 0.064 +82 K 0.076 +83 A 0.092 +84 K 0.107 +85 A 0.124 +86 L 0.140 +87 K 0.153 +88 G 0.161 +89 Q 0.165 +90 Y 0.161 +91 N 0.144 +92 F 0.119 +93 D 0.098 +94 H 0.091 +95 P 0.094 +96 D 0.099 +97 A 0.101 +98 F 0.094 +99 D 0.078 +100 N 0.060 +101 D 0.047 +102 L 0.043 +103 M 0.049 +104 H 0.061 +105 K 0.069 +106 T 0.066 +107 L 0.058 +108 K 0.053 +109 N 0.052 +110 I 0.055 +111 V 0.063 +112 E 0.077 +113 G 0.091 +114 K 0.096 +115 T 0.095 +116 V 0.095 +117 E 0.095 +118 V 0.093 +119 P 0.087 +120 T 0.072 +121 Y 0.054 +122 D 0.042 +123 F 0.040 +124 V 0.049 +125 T 0.061 +126 H 0.071 +127 S 0.080 +128 R 0.086 +129 L 0.093 +130 P 0.099 +131 E 0.105 +132 T 0.103 +133 T 0.093 +134 V 0.080 +135 V 0.070 +136 Y 0.065 +137 P 0.065 +138 A 0.070 +139 D 0.083 +140 V 0.096 +141 V 0.105 +142 L 0.111 +143 F 0.116 +144 E 0.116 +145 G 0.110 +146 I 0.103 +147 L 0.102 +148 V 0.098 +149 F 0.086 +150 Y 0.072 +151 T 0.062 +152 Q 0.056 +153 E 0.053 +154 I 0.051 +155 R 0.054 +156 D 0.063 +157 M 0.074 +158 F 0.078 +159 H 0.070 +160 L 0.059 +161 R 0.055 +162 L 0.060 +163 F 0.069 +164 V 0.078 +165 D 0.083 +166 T 0.084 +167 D 0.082 +168 S 0.078 +169 D 0.074 +170 V 0.071 +171 R 0.070 +172 L 0.072 +173 S 0.074 +174 R 0.074 +175 R 0.073 +176 V 0.070 +177 L 0.067 +178 R 0.063 +179 D 0.061 +180 V 0.063 +181 Q 0.073 +182 R 0.088 +183 G 0.099 +184 R 0.102 +185 D 0.098 +186 L 0.092 +187 E 0.089 +188 Q 0.089 +189 I 0.088 +190 L 0.085 +191 T 0.086 +192 Q 0.092 +193 Y 0.094 +194 T 0.089 +195 A 0.083 +196 F 0.083 +197 V 0.084 +198 K 0.078 +199 P 0.067 +200 A 0.059 +201 F 0.057 +202 E 0.057 +203 E 0.056 +204 F 0.054 +205 C 0.051 +206 L 0.051 +207 P 0.055 +208 T 0.063 +209 K 0.073 +210 K 0.085 +211 Y 0.097 +212 A 0.103 +213 D 0.105 +214 V 0.111 +215 I 0.120 +216 I 0.126 +217 P 0.120 +218 R 0.109 +219 G 0.103 +220 V 0.103 +221 D 0.103 +222 N 0.095 +223 M 0.081 +224 V 0.068 +225 A 0.061 +226 I 0.057 +227 N 0.054 +228 L 0.056 +229 I 0.062 +230 V 0.071 +231 Q 0.074 +232 H 0.066 +233 I 0.054 +234 Q 0.048 +235 D 0.052 +236 I 0.069 +237 L 0.107 +238 N 0.168 +239 G 0.236 +240 D 0.289 +241 L 0.322 +242 C 0.346 +243 K 0.374 +244 R 0.411 +245 H 0.452 +246 R 0.492 +247 G 0.526 +248 G 0.556 +249 P 0.585 +250 N 0.613 +251 G 0.631 +252 R 0.632 +253 N 0.620 +254 H 0.596 +255 K 0.565 +256 R 0.537 +257 T 0.522 +258 F 0.525 +259 P 0.543 +260 E 0.570 +261 P 0.594 +262 G 0.608 +263 D 0.617 +264 H 0.633 +265 P 0.660 +266 G 0.688 +267 V 0.706 +268 L 0.707 +269 A 0.694 +270 T 0.665 +271 G 0.607 +272 K 0.515 +273 R 0.435 +274 S 0.429 +275 H 0.481 +276 L 0.523 +277 E 0.540 +278 S 0.563 +279 S 0.581 +280 S 0.568 +281 R 0.532 +282 P 0.492 +283 H 0.465 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000002550.17_ENSMUST00000002625.15_GN:Uck1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:29.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000002550.17_ENSMUST00000002625.15_GN:Uck1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:29.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..77138a773fad1fbc34600b62c6c82fdacd3789ec --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000002550.17_ENSMUST00000002625.15_GN:Uck1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:29.caid @@ -0,0 +1,313 @@ +>ENSMUSG00000002550.17|ENSMUST00000002625.15|GN:Uck1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:29 +1 M 0.411 +2 R 0.442 +3 A 0.488 +4 C 0.520 +5 A 0.526 +6 H 0.522 +7 V 0.534 +8 P 0.554 +9 G 0.555 +10 S 0.523 +11 D 0.463 +12 A 0.397 +13 H 0.355 +14 S 0.349 +15 I 0.363 +16 R 0.373 +17 H 0.370 +18 Y 0.363 +19 V 0.368 +20 Q 0.408 +21 A 0.489 +22 G 0.576 +23 A 0.633 +24 G 0.658 +25 R 0.661 +26 V 0.648 +27 G 0.625 +28 E 0.600 +29 C 0.580 +30 M 0.567 +31 S 0.562 +32 V 0.569 +33 A 0.592 +34 P 0.626 +35 D 0.660 +36 M 0.682 +37 A 0.693 +38 S 0.699 +39 A 0.709 +40 G 0.725 +41 G 0.742 +42 G 0.754 +43 G 0.754 +44 S 0.745 +45 E 0.729 +46 S 0.711 +47 A 0.691 +48 A 0.672 +49 P 0.659 +50 E 0.649 +51 A 0.626 +52 D 0.582 +53 R 0.526 +54 P 0.466 +55 Q 0.400 +56 P 0.322 +57 R 0.237 +58 P 0.162 +59 F 0.109 +60 L 0.085 +61 I 0.082 +62 G 0.089 +63 V 0.098 +64 S 0.108 +65 G 0.114 +66 G 0.113 +67 T 0.106 +68 A 0.099 +69 S 0.096 +70 G 0.093 +71 K 0.084 +72 S 0.074 +73 T 0.071 +74 V 0.076 +75 C 0.080 +76 E 0.081 +77 K 0.083 +78 I 0.089 +79 M 0.092 +80 E 0.087 +81 L 0.084 +82 L 0.087 +83 G 0.093 +84 Q 0.099 +85 N 0.102 +86 E 0.101 +87 V 0.094 +88 D 0.083 +89 R 0.078 +90 R 0.082 +91 Q 0.087 +92 R 0.084 +93 K 0.072 +94 L 0.061 +95 V 0.056 +96 I 0.055 +97 L 0.056 +98 S 0.058 +99 Q 0.063 +100 D 0.069 +101 C 0.076 +102 F 0.079 +103 Y 0.078 +104 K 0.078 +105 V 0.080 +106 L 0.081 +107 T 0.074 +108 A 0.065 +109 E 0.059 +110 Q 0.062 +111 K 0.074 +112 A 0.090 +113 K 0.105 +114 A 0.120 +115 L 0.135 +116 K 0.147 +117 G 0.155 +118 Q 0.159 +119 Y 0.156 +120 N 0.140 +121 F 0.116 +122 D 0.096 +123 H 0.090 +124 P 0.094 +125 D 0.100 +126 A 0.103 +127 F 0.095 +128 D 0.079 +129 N 0.060 +130 D 0.046 +131 L 0.042 +132 M 0.048 +133 H 0.060 +134 K 0.068 +135 T 0.065 +136 L 0.057 +137 K 0.052 +138 N 0.052 +139 I 0.054 +140 V 0.063 +141 E 0.078 +142 G 0.094 +143 K 0.100 +144 T 0.098 +145 V 0.096 +146 E 0.095 +147 V 0.093 +148 P 0.086 +149 T 0.071 +150 Y 0.053 +151 D 0.041 +152 F 0.041 +153 V 0.049 +154 T 0.062 +155 H 0.073 +156 S 0.082 +157 R 0.088 +158 L 0.093 +159 P 0.099 +160 E 0.105 +161 T 0.104 +162 T 0.094 +163 V 0.082 +164 V 0.072 +165 Y 0.067 +166 P 0.067 +167 A 0.072 +168 D 0.084 +169 V 0.097 +170 V 0.106 +171 L 0.112 +172 F 0.116 +173 E 0.117 +174 G 0.111 +175 I 0.105 +176 L 0.103 +177 V 0.099 +178 F 0.087 +179 Y 0.073 +180 T 0.062 +181 Q 0.056 +182 E 0.053 +183 I 0.051 +184 R 0.054 +185 D 0.063 +186 M 0.074 +187 F 0.078 +188 H 0.070 +189 L 0.058 +190 R 0.054 +191 L 0.059 +192 F 0.069 +193 V 0.077 +194 D 0.083 +195 T 0.083 +196 D 0.081 +197 S 0.077 +198 D 0.073 +199 V 0.071 +200 R 0.071 +201 L 0.072 +202 S 0.074 +203 R 0.074 +204 R 0.073 +205 V 0.070 +206 L 0.067 +207 R 0.063 +208 D 0.060 +209 V 0.062 +210 Q 0.071 +211 R 0.086 +212 G 0.097 +213 R 0.099 +214 D 0.095 +215 L 0.089 +216 E 0.087 +217 Q 0.087 +218 I 0.086 +219 L 0.083 +220 T 0.084 +221 Q 0.090 +222 Y 0.092 +223 T 0.087 +224 A 0.080 +225 F 0.080 +226 V 0.081 +227 K 0.075 +228 P 0.065 +229 A 0.058 +230 F 0.056 +231 E 0.056 +232 E 0.055 +233 F 0.053 +234 C 0.050 +235 L 0.050 +236 P 0.054 +237 T 0.062 +238 K 0.072 +239 K 0.084 +240 Y 0.096 +241 A 0.103 +242 D 0.105 +243 V 0.111 +244 I 0.122 +245 I 0.128 +246 P 0.122 +247 R 0.109 +248 G 0.102 +249 V 0.102 +250 D 0.102 +251 N 0.095 +252 M 0.081 +253 V 0.068 +254 A 0.061 +255 I 0.057 +256 N 0.054 +257 L 0.055 +258 I 0.062 +259 V 0.071 +260 Q 0.074 +261 H 0.066 +262 I 0.054 +263 Q 0.049 +264 D 0.054 +265 I 0.071 +266 L 0.109 +267 N 0.171 +268 G 0.240 +269 D 0.294 +270 L 0.327 +271 C 0.352 +272 K 0.379 +273 R 0.415 +274 H 0.457 +275 R 0.496 +276 G 0.530 +277 G 0.560 +278 P 0.590 +279 N 0.619 +280 G 0.638 +281 R 0.641 +282 N 0.630 +283 H 0.608 +284 K 0.579 +285 R 0.553 +286 T 0.538 +287 F 0.541 +288 P 0.558 +289 E 0.583 +290 P 0.606 +291 G 0.618 +292 D 0.626 +293 H 0.642 +294 P 0.668 +295 G 0.696 +296 V 0.713 +297 L 0.715 +298 A 0.704 +299 T 0.676 +300 G 0.617 +301 K 0.523 +302 R 0.440 +303 S 0.433 +304 H 0.486 +305 L 0.527 +306 E 0.545 +307 S 0.570 +308 S 0.589 +309 S 0.576 +310 R 0.539 +311 P 0.499 +312 H 0.472 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000004127.13_ENSMUST00000162864.8_GN:Trmt10a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000004127.13_ENSMUST00000162864.8_GN:Trmt10a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..36ea07d51656e3720fc056f0b2b880a835d7c307 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000004127.13_ENSMUST00000162864.8_GN:Trmt10a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,329 @@ +>ENSMUSG00000004127.13|ENSMUST00000162864.8|GN:Trmt10a|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.428 +2 S 0.454 +3 S 0.496 +4 E 0.539 +5 M 0.571 +6 L 0.599 +7 P 0.633 +8 A 0.666 +9 S 0.684 +10 I 0.687 +11 E 0.685 +12 S 0.683 +13 T 0.681 +14 N 0.678 +15 V 0.677 +16 E 0.680 +17 E 0.685 +18 K 0.693 +19 L 0.700 +20 G 0.705 +21 T 0.710 +22 S 0.718 +23 D 0.728 +24 G 0.733 +25 E 0.730 +26 E 0.721 +27 E 0.710 +28 R 0.700 +29 Q 0.699 +30 E 0.709 +31 P 0.725 +32 R 0.741 +33 V 0.751 +34 D 0.748 +35 A 0.725 +36 G 0.689 +37 A 0.649 +38 E 0.599 +39 P 0.524 +40 I 0.431 +41 S 0.344 +42 K 0.284 +43 R 0.256 +44 Q 0.258 +45 L 0.269 +46 K 0.274 +47 K 0.280 +48 L 0.293 +49 M 0.302 +50 K 0.297 +51 Q 0.284 +52 K 0.272 +53 Q 0.258 +54 W 0.227 +55 E 0.190 +56 E 0.163 +57 Q 0.152 +58 R 0.149 +59 E 0.150 +60 Q 0.150 +61 R 0.148 +62 K 0.145 +63 E 0.143 +64 K 0.139 +65 R 0.130 +66 K 0.124 +67 E 0.123 +68 K 0.120 +69 R 0.113 +70 K 0.109 +71 R 0.108 +72 K 0.104 +73 K 0.099 +74 L 0.102 +75 E 0.111 +76 R 0.122 +77 R 0.140 +78 Q 0.174 +79 L 0.232 +80 E 0.308 +81 S 0.386 +82 N 0.457 +83 S 0.520 +84 D 0.573 +85 G 0.599 +86 N 0.591 +87 D 0.564 +88 R 0.533 +89 K 0.507 +90 R 0.487 +91 V 0.474 +92 R 0.455 +93 R 0.422 +94 D 0.373 +95 V 0.316 +96 A 0.255 +97 R 0.194 +98 S 0.138 +99 S 0.093 +100 L 0.061 +101 R 0.041 +102 L 0.036 +103 V 0.046 +104 I 0.067 +105 D 0.090 +106 C 0.102 +107 S 0.101 +108 F 0.094 +109 D 0.090 +110 D 0.092 +111 L 0.096 +112 M 0.094 +113 V 0.083 +114 L 0.071 +115 K 0.065 +116 D 0.064 +117 I 0.061 +118 K 0.058 +119 K 0.059 +120 L 0.065 +121 H 0.069 +122 K 0.069 +123 Q 0.065 +124 I 0.059 +125 Q 0.053 +126 R 0.050 +127 C 0.050 +128 Y 0.052 +129 A 0.056 +130 E 0.062 +131 N 0.068 +132 R 0.075 +133 R 0.082 +134 A 0.090 +135 S 0.096 +136 H 0.098 +137 P 0.089 +138 V 0.070 +139 Q 0.048 +140 F 0.032 +141 Y 0.026 +142 L 0.032 +143 T 0.049 +144 S 0.070 +145 H 0.084 +146 G 0.083 +147 G 0.073 +148 Q 0.064 +149 L 0.065 +150 K 0.072 +151 K 0.076 +152 N 0.074 +153 M 0.069 +154 D 0.066 +155 E 0.068 +156 N 0.073 +157 D 0.075 +158 Q 0.069 +159 G 0.056 +160 W 0.044 +161 V 0.037 +162 N 0.033 +163 W 0.032 +164 K 0.033 +165 D 0.036 +166 I 0.042 +167 H 0.049 +168 I 0.056 +169 K 0.060 +170 S 0.059 +171 E 0.051 +172 H 0.039 +173 Y 0.030 +174 S 0.028 +175 E 0.035 +176 L 0.047 +177 I 0.057 +178 K 0.057 +179 K 0.051 +180 E 0.045 +181 D 0.039 +182 L 0.036 +183 V 0.036 +184 Y 0.040 +185 L 0.050 +186 T 0.068 +187 S 0.090 +188 D 0.111 +189 S 0.125 +190 P 0.132 +191 N 0.134 +192 V 0.128 +193 L 0.110 +194 K 0.092 +195 D 0.081 +196 L 0.076 +197 D 0.072 +198 E 0.071 +199 S 0.072 +200 K 0.068 +201 A 0.057 +202 Y 0.041 +203 V 0.029 +204 I 0.033 +205 G 0.063 +206 G 0.120 +207 L 0.186 +208 V 0.235 +209 D 0.243 +210 H 0.221 +211 N 0.198 +212 H 0.198 +213 H 0.215 +214 K 0.230 +215 G 0.219 +216 L 0.179 +217 T 0.132 +218 F 0.098 +219 K 0.079 +220 Q 0.070 +221 A 0.067 +222 T 0.068 +223 S 0.075 +224 Y 0.092 +225 G 0.112 +226 I 0.122 +227 E 0.117 +228 H 0.107 +229 A 0.107 +230 Q 0.118 +231 L 0.129 +232 P 0.126 +233 L 0.111 +234 A 0.097 +235 D 0.091 +236 F 0.097 +237 V 0.110 +238 K 0.124 +239 M 0.135 +240 N 0.144 +241 S 0.151 +242 R 0.158 +243 K 0.166 +244 V 0.169 +245 L 0.159 +246 A 0.136 +247 V 0.109 +248 N 0.090 +249 H 0.081 +250 V 0.077 +251 F 0.073 +252 E 0.067 +253 I 0.060 +254 I 0.053 +255 L 0.048 +256 E 0.045 +257 F 0.044 +258 L 0.044 +259 E 0.043 +260 T 0.044 +261 R 0.049 +262 D 0.055 +263 W 0.062 +264 Q 0.070 +265 E 0.077 +266 A 0.077 +267 F 0.070 +268 F 0.065 +269 T 0.072 +270 I 0.087 +271 L 0.105 +272 P 0.125 +273 Q 0.154 +274 R 0.195 +275 K 0.244 +276 G 0.299 +277 A 0.355 +278 V 0.412 +279 P 0.469 +280 A 0.527 +281 H 0.578 +282 K 0.617 +283 A 0.642 +284 C 0.652 +285 E 0.651 +286 S 0.644 +287 S 0.641 +288 P 0.648 +289 Q 0.662 +290 D 0.672 +291 H 0.664 +292 Q 0.638 +293 S 0.610 +294 L 0.600 +295 P 0.615 +296 E 0.632 +297 G 0.630 +298 W 0.615 +299 D 0.606 +300 S 0.610 +301 A 0.621 +302 S 0.638 +303 E 0.658 +304 G 0.669 +305 E 0.661 +306 S 0.621 +307 C 0.563 +308 R 0.532 +309 D 0.560 +310 N 0.617 +311 P 0.661 +312 V 0.674 +313 S 0.651 +314 P 0.603 +315 Q 0.564 +316 K 0.543 +317 D 0.504 +318 E 0.451 +319 Q 0.448 +320 G 0.495 +321 Q 0.531 +322 Q 0.549 +323 S 0.588 +324 S 0.641 +325 P 0.667 +326 V 0.645 +327 L 0.584 +328 Q 0.526 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000004127.13_ENSMUST00000162864.8_GN:Trmt10a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000004127.13_ENSMUST00000162864.8_GN:Trmt10a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..86c654b0c58f8bfc870a6f06391a10900e47888e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000004127.13_ENSMUST00000162864.8_GN:Trmt10a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid @@ -0,0 +1,331 @@ +>ENSMUSG00000004127.13|ENSMUST00000162864.8|GN:Trmt10a|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:2 +1 M 0.438 +2 N 0.466 +3 M 0.509 +4 S 0.552 +5 S 0.581 +6 E 0.597 +7 M 0.611 +8 L 0.633 +9 P 0.662 +10 A 0.689 +11 S 0.703 +12 I 0.705 +13 E 0.702 +14 S 0.701 +15 T 0.701 +16 N 0.700 +17 V 0.698 +18 E 0.698 +19 E 0.704 +20 K 0.710 +21 L 0.714 +22 G 0.715 +23 T 0.717 +24 S 0.724 +25 D 0.731 +26 G 0.734 +27 E 0.730 +28 E 0.722 +29 E 0.711 +30 R 0.703 +31 Q 0.703 +32 E 0.714 +33 P 0.730 +34 R 0.745 +35 V 0.755 +36 D 0.752 +37 A 0.730 +38 G 0.694 +39 A 0.655 +40 E 0.604 +41 P 0.528 +42 I 0.435 +43 S 0.350 +44 K 0.290 +45 R 0.263 +46 Q 0.264 +47 L 0.275 +48 K 0.280 +49 K 0.286 +50 L 0.299 +51 M 0.308 +52 K 0.301 +53 Q 0.286 +54 K 0.274 +55 Q 0.258 +56 W 0.227 +57 E 0.189 +58 E 0.162 +59 Q 0.151 +60 R 0.148 +61 E 0.149 +62 Q 0.150 +63 R 0.147 +64 K 0.144 +65 E 0.142 +66 K 0.138 +67 R 0.129 +68 K 0.124 +69 E 0.123 +70 K 0.119 +71 R 0.112 +72 K 0.109 +73 R 0.107 +74 K 0.103 +75 K 0.099 +76 L 0.101 +77 E 0.110 +78 R 0.122 +79 R 0.139 +80 Q 0.173 +81 L 0.231 +82 E 0.307 +83 S 0.385 +84 N 0.456 +85 S 0.520 +86 D 0.572 +87 G 0.598 +88 N 0.591 +89 D 0.563 +90 R 0.532 +91 K 0.506 +92 R 0.487 +93 V 0.473 +94 R 0.455 +95 R 0.422 +96 D 0.373 +97 V 0.317 +98 A 0.255 +99 R 0.194 +100 S 0.138 +101 S 0.093 +102 L 0.061 +103 R 0.041 +104 L 0.036 +105 V 0.046 +106 I 0.067 +107 D 0.090 +108 C 0.102 +109 S 0.101 +110 F 0.094 +111 D 0.090 +112 D 0.092 +113 L 0.096 +114 M 0.094 +115 V 0.083 +116 L 0.071 +117 K 0.065 +118 D 0.064 +119 I 0.062 +120 K 0.058 +121 K 0.059 +122 L 0.065 +123 H 0.070 +124 K 0.069 +125 Q 0.065 +126 I 0.059 +127 Q 0.053 +128 R 0.050 +129 C 0.050 +130 Y 0.053 +131 A 0.057 +132 E 0.062 +133 N 0.068 +134 R 0.075 +135 R 0.083 +136 A 0.091 +137 S 0.097 +138 H 0.098 +139 P 0.090 +140 V 0.070 +141 Q 0.048 +142 F 0.032 +143 Y 0.026 +144 L 0.032 +145 T 0.049 +146 S 0.070 +147 H 0.084 +148 G 0.083 +149 G 0.073 +150 Q 0.065 +151 L 0.065 +152 K 0.072 +153 K 0.076 +154 N 0.074 +155 M 0.069 +156 D 0.066 +157 E 0.068 +158 N 0.073 +159 D 0.075 +160 Q 0.069 +161 G 0.056 +162 W 0.044 +163 V 0.037 +164 N 0.033 +165 W 0.032 +166 K 0.033 +167 D 0.036 +168 I 0.042 +169 H 0.049 +170 I 0.055 +171 K 0.059 +172 S 0.059 +173 E 0.051 +174 H 0.039 +175 Y 0.030 +176 S 0.028 +177 E 0.035 +178 L 0.047 +179 I 0.057 +180 K 0.057 +181 K 0.051 +182 E 0.045 +183 D 0.039 +184 L 0.036 +185 V 0.036 +186 Y 0.040 +187 L 0.050 +188 T 0.068 +189 S 0.090 +190 D 0.111 +191 S 0.124 +192 P 0.131 +193 N 0.134 +194 V 0.127 +195 L 0.110 +196 K 0.092 +197 D 0.081 +198 L 0.075 +199 D 0.072 +200 E 0.071 +201 S 0.071 +202 K 0.068 +203 A 0.057 +204 Y 0.041 +205 V 0.029 +206 I 0.033 +207 G 0.063 +208 G 0.119 +209 L 0.185 +210 V 0.233 +211 D 0.242 +212 H 0.219 +213 N 0.197 +214 H 0.197 +215 H 0.214 +216 K 0.229 +217 G 0.218 +218 L 0.178 +219 T 0.132 +220 F 0.098 +221 K 0.079 +222 Q 0.070 +223 A 0.067 +224 T 0.068 +225 S 0.075 +226 Y 0.092 +227 G 0.112 +228 I 0.122 +229 E 0.117 +230 H 0.107 +231 A 0.107 +232 Q 0.119 +233 L 0.129 +234 P 0.126 +235 L 0.111 +236 A 0.097 +237 D 0.092 +238 F 0.097 +239 V 0.110 +240 K 0.124 +241 M 0.135 +242 N 0.144 +243 S 0.151 +244 R 0.159 +245 K 0.166 +246 V 0.169 +247 L 0.160 +248 A 0.136 +249 V 0.109 +250 N 0.090 +251 H 0.081 +252 V 0.077 +253 F 0.073 +254 E 0.067 +255 I 0.060 +256 I 0.053 +257 L 0.048 +258 E 0.046 +259 F 0.045 +260 L 0.044 +261 E 0.043 +262 T 0.045 +263 R 0.049 +264 D 0.055 +265 W 0.062 +266 Q 0.070 +267 E 0.077 +268 A 0.077 +269 F 0.070 +270 F 0.066 +271 T 0.072 +272 I 0.088 +273 L 0.105 +274 P 0.125 +275 Q 0.154 +276 R 0.195 +277 K 0.244 +278 G 0.299 +279 A 0.355 +280 V 0.412 +281 P 0.469 +282 A 0.527 +283 H 0.578 +284 K 0.617 +285 A 0.642 +286 C 0.652 +287 E 0.651 +288 S 0.645 +289 S 0.641 +290 P 0.648 +291 Q 0.662 +292 D 0.672 +293 H 0.665 +294 Q 0.639 +295 S 0.611 +296 L 0.601 +297 P 0.615 +298 E 0.632 +299 G 0.630 +300 W 0.615 +301 D 0.607 +302 S 0.610 +303 A 0.622 +304 S 0.639 +305 E 0.658 +306 G 0.670 +307 E 0.661 +308 S 0.622 +309 C 0.564 +310 R 0.533 +311 D 0.560 +312 N 0.618 +313 P 0.662 +314 V 0.674 +315 S 0.651 +316 P 0.603 +317 Q 0.564 +318 K 0.544 +319 D 0.504 +320 E 0.452 +321 Q 0.449 +322 G 0.496 +323 Q 0.532 +324 Q 0.551 +325 S 0.590 +326 S 0.642 +327 P 0.668 +328 V 0.646 +329 L 0.584 +330 Q 0.527 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000005547.15_ENSMUST00000005685.15_GN:Cyp2a5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000005547.15_ENSMUST00000005685.15_GN:Cyp2a5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..fd2e9393c4e0a1fd792ac407682b267110eea9ed --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000005547.15_ENSMUST00000005685.15_GN:Cyp2a5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,495 @@ +>ENSMUSG00000005547.15|ENSMUST00000005685.15|GN:Cyp2a5|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.340 +2 L 0.333 +3 T 0.323 +4 S 0.306 +5 G 0.271 +6 L 0.219 +7 L 0.171 +8 L 0.144 +9 V 0.137 +10 A 0.141 +11 A 0.144 +12 V 0.142 +13 A 0.137 +14 F 0.134 +15 L 0.132 +16 S 0.129 +17 V 0.122 +18 L 0.115 +19 V 0.108 +20 L 0.104 +21 M 0.109 +22 S 0.119 +23 V 0.129 +24 W 0.146 +25 K 0.174 +26 Q 0.210 +27 R 0.248 +28 K 0.282 +29 L 0.300 +30 S 0.287 +31 G 0.247 +32 K 0.207 +33 L 0.186 +34 P 0.177 +35 P 0.166 +36 G 0.162 +37 P 0.172 +38 T 0.183 +39 P 0.173 +40 L 0.142 +41 P 0.104 +42 F 0.072 +43 I 0.054 +44 G 0.048 +45 N 0.048 +46 F 0.052 +47 L 0.061 +48 Q 0.076 +49 L 0.090 +50 N 0.099 +51 T 0.102 +52 E 0.096 +53 Q 0.084 +54 M 0.073 +55 Y 0.068 +56 N 0.062 +57 S 0.053 +58 L 0.045 +59 M 0.041 +60 K 0.040 +61 I 0.037 +62 S 0.034 +63 Q 0.035 +64 R 0.039 +65 Y 0.042 +66 G 0.039 +67 P 0.034 +68 V 0.030 +69 F 0.029 +70 T 0.032 +71 I 0.036 +72 Y 0.042 +73 L 0.049 +74 G 0.058 +75 P 0.066 +76 R 0.069 +77 R 0.064 +78 I 0.055 +79 V 0.052 +80 V 0.058 +81 L 0.070 +82 C 0.081 +83 G 0.083 +84 Q 0.074 +85 E 0.059 +86 A 0.047 +87 V 0.046 +88 K 0.050 +89 E 0.056 +90 A 0.067 +91 L 0.085 +92 V 0.099 +93 D 0.098 +94 Q 0.084 +95 A 0.068 +96 E 0.060 +97 E 0.060 +98 F 0.068 +99 S 0.084 +100 G 0.106 +101 R 0.129 +102 G 0.141 +103 E 0.138 +104 Q 0.122 +105 A 0.102 +106 T 0.084 +107 F 0.072 +108 D 0.071 +109 W 0.082 +110 L 0.104 +111 F 0.130 +112 K 0.151 +113 G 0.155 +114 Y 0.141 +115 G 0.119 +116 V 0.103 +117 A 0.103 +118 F 0.118 +119 S 0.134 +120 S 0.134 +121 G 0.119 +122 E 0.101 +123 R 0.089 +124 A 0.080 +125 K 0.074 +126 Q 0.077 +127 L 0.093 +128 R 0.108 +129 R 0.110 +130 F 0.102 +131 S 0.095 +132 I 0.094 +133 A 0.097 +134 T 0.098 +135 L 0.097 +136 R 0.093 +137 D 0.090 +138 F 0.092 +139 G 0.111 +140 V 0.144 +141 G 0.173 +142 K 0.181 +143 R 0.173 +144 G 0.154 +145 I 0.128 +146 E 0.101 +147 E 0.082 +148 R 0.073 +149 I 0.073 +150 Q 0.079 +151 E 0.083 +152 E 0.080 +153 A 0.074 +154 G 0.066 +155 F 0.057 +156 L 0.050 +157 I 0.046 +158 D 0.047 +159 S 0.049 +160 F 0.054 +161 R 0.059 +162 K 0.068 +163 T 0.080 +164 N 0.092 +165 G 0.100 +166 A 0.097 +167 F 0.091 +168 I 0.085 +169 D 0.079 +170 P 0.069 +171 T 0.060 +172 F 0.057 +173 Y 0.059 +174 L 0.060 +175 S 0.065 +176 R 0.082 +177 T 0.101 +178 V 0.113 +179 S 0.119 +180 N 0.125 +181 V 0.119 +182 I 0.096 +183 S 0.068 +184 S 0.051 +185 I 0.045 +186 V 0.047 +187 F 0.057 +188 G 0.075 +189 D 0.095 +190 R 0.103 +191 F 0.096 +192 D 0.080 +193 Y 0.067 +194 E 0.057 +195 D 0.049 +196 K 0.043 +197 E 0.040 +198 F 0.039 +199 L 0.040 +200 S 0.042 +201 L 0.043 +202 L 0.040 +203 R 0.037 +204 M 0.034 +205 M 0.035 +206 L 0.036 +207 G 0.037 +208 S 0.039 +209 F 0.043 +210 Q 0.048 +211 F 0.051 +212 T 0.054 +213 A 0.059 +214 T 0.064 +215 S 0.066 +216 M 0.064 +217 G 0.060 +218 Q 0.054 +219 L 0.049 +220 Y 0.045 +221 E 0.043 +222 M 0.043 +223 F 0.044 +224 S 0.045 +225 S 0.042 +226 V 0.038 +227 M 0.039 +228 K 0.051 +229 H 0.070 +230 L 0.088 +231 P 0.096 +232 G 0.098 +233 P 0.098 +234 Q 0.096 +235 Q 0.096 +236 Q 0.099 +237 A 0.103 +238 F 0.110 +239 K 0.118 +240 E 0.124 +241 L 0.122 +242 Q 0.114 +243 G 0.108 +244 L 0.105 +245 E 0.099 +246 D 0.087 +247 F 0.071 +248 I 0.061 +249 T 0.061 +250 K 0.063 +251 K 0.059 +252 V 0.051 +253 E 0.047 +254 H 0.048 +255 N 0.052 +256 Q 0.057 +257 R 0.066 +258 T 0.081 +259 L 0.098 +260 D 0.105 +261 P 0.103 +262 N 0.097 +263 S 0.091 +264 P 0.080 +265 R 0.062 +266 D 0.049 +267 F 0.047 +268 I 0.055 +269 D 0.060 +270 S 0.060 +271 F 0.060 +272 L 0.061 +273 I 0.057 +274 R 0.049 +275 M 0.042 +276 L 0.042 +277 E 0.048 +278 E 0.062 +279 K 0.085 +280 K 0.112 +281 N 0.135 +282 P 0.148 +283 N 0.147 +284 T 0.134 +285 E 0.114 +286 F 0.095 +287 Y 0.079 +288 M 0.069 +289 K 0.066 +290 N 0.068 +291 L 0.070 +292 V 0.070 +293 L 0.077 +294 T 0.091 +295 T 0.102 +296 L 0.101 +297 N 0.097 +298 L 0.098 +299 F 0.103 +300 F 0.115 +301 A 0.134 +302 G 0.145 +303 T 0.140 +304 E 0.128 +305 T 0.118 +306 V 0.105 +307 S 0.087 +308 T 0.072 +309 T 0.063 +310 L 0.053 +311 R 0.044 +312 Y 0.038 +313 G 0.036 +314 F 0.036 +315 L 0.039 +316 L 0.045 +317 L 0.049 +318 M 0.052 +319 K 0.053 +320 H 0.051 +321 P 0.048 +322 D 0.045 +323 I 0.048 +324 E 0.058 +325 A 0.067 +326 K 0.068 +327 V 0.068 +328 H 0.074 +329 E 0.080 +330 E 0.076 +331 I 0.065 +332 D 0.059 +333 R 0.064 +334 V 0.078 +335 I 0.091 +336 G 0.094 +337 R 0.089 +338 N 0.082 +339 R 0.082 +340 Q 0.084 +341 P 0.080 +342 K 0.070 +343 Y 0.062 +344 E 0.059 +345 D 0.058 +346 R 0.058 +347 M 0.061 +348 K 0.068 +349 M 0.072 +350 P 0.072 +351 Y 0.066 +352 T 0.059 +353 E 0.060 +354 A 0.069 +355 V 0.079 +356 I 0.082 +357 H 0.081 +358 E 0.080 +359 I 0.078 +360 Q 0.073 +361 R 0.066 +362 F 0.059 +363 A 0.055 +364 D 0.056 +365 M 0.062 +366 I 0.067 +367 P 0.070 +368 M 0.069 +369 G 0.065 +370 L 0.058 +371 A 0.050 +372 R 0.047 +373 R 0.049 +374 V 0.054 +375 T 0.056 +376 K 0.055 +377 D 0.052 +378 T 0.049 +379 K 0.045 +380 F 0.043 +381 R 0.045 +382 D 0.053 +383 F 0.063 +384 L 0.069 +385 L 0.072 +386 P 0.077 +387 K 0.079 +388 G 0.074 +389 T 0.064 +390 E 0.056 +391 V 0.053 +392 F 0.057 +393 P 0.068 +394 M 0.081 +395 L 0.087 +396 G 0.082 +397 S 0.075 +398 V 0.076 +399 L 0.083 +400 K 0.091 +401 D 0.093 +402 P 0.093 +403 K 0.092 +404 F 0.094 +405 F 0.099 +406 S 0.103 +407 N 0.104 +408 P 0.099 +409 K 0.093 +410 D 0.089 +411 F 0.087 +412 N 0.085 +413 P 0.085 +414 K 0.093 +415 H 0.109 +416 F 0.126 +417 L 0.135 +418 D 0.136 +419 D 0.136 +420 K 0.141 +421 G 0.154 +422 Q 0.171 +423 F 0.186 +424 K 0.189 +425 K 0.179 +426 N 0.162 +427 D 0.146 +428 A 0.140 +429 F 0.148 +430 V 0.163 +431 P 0.171 +432 F 0.163 +433 S 0.142 +434 I 0.124 +435 G 0.116 +436 K 0.116 +437 R 0.125 +438 Y 0.143 +439 C 0.162 +440 F 0.173 +441 G 0.174 +442 E 0.172 +443 G 0.184 +444 L 0.214 +445 A 0.227 +446 R 0.203 +447 M 0.171 +448 E 0.155 +449 L 0.141 +450 F 0.114 +451 L 0.087 +452 F 0.073 +453 L 0.069 +454 T 0.065 +455 N 0.062 +456 I 0.061 +457 M 0.062 +458 Q 0.062 +459 N 0.059 +460 F 0.054 +461 H 0.051 +462 F 0.053 +463 K 0.064 +464 S 0.084 +465 T 0.108 +466 Q 0.129 +467 A 0.141 +468 P 0.142 +469 Q 0.138 +470 D 0.135 +471 I 0.139 +472 D 0.151 +473 V 0.172 +474 S 0.190 +475 P 0.185 +476 R 0.155 +477 L 0.116 +478 V 0.089 +479 G 0.084 +480 F 0.098 +481 A 0.129 +482 T 0.173 +483 I 0.217 +484 P 0.239 +485 P 0.221 +486 T 0.174 +487 Y 0.128 +488 T 0.098 +489 M 0.082 +490 S 0.078 +491 F 0.087 +492 L 0.116 +493 S 0.162 +494 R 0.201 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000005547.15_ENSMUST00000005685.15_GN:Cyp2a5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000005547.15_ENSMUST00000005685.15_GN:Cyp2a5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a515d3db81096525d98c1940e67a379fff679bc0 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000005547.15_ENSMUST00000005685.15_GN:Cyp2a5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid @@ -0,0 +1,514 @@ +>ENSMUSG00000005547.15|ENSMUST00000005685.15|GN:Cyp2a5|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:19 +1 M 0.375 +2 Y 0.383 +3 K 0.397 +4 S 0.412 +5 K 0.428 +6 L 0.445 +7 I 0.471 +8 Q 0.501 +9 P 0.521 +10 S 0.520 +11 L 0.507 +12 S 0.494 +13 V 0.483 +14 Y 0.481 +15 H 0.499 +16 P 0.524 +17 T 0.520 +18 A 0.474 +19 T 0.423 +20 M 0.398 +21 L 0.385 +22 T 0.366 +23 S 0.335 +24 G 0.289 +25 L 0.233 +26 L 0.188 +27 L 0.165 +28 V 0.158 +29 A 0.155 +30 A 0.155 +31 V 0.157 +32 A 0.158 +33 F 0.154 +34 L 0.148 +35 S 0.141 +36 V 0.133 +37 L 0.123 +38 V 0.112 +39 L 0.105 +40 M 0.105 +41 S 0.112 +42 V 0.123 +43 W 0.142 +44 K 0.173 +45 Q 0.213 +46 R 0.253 +47 K 0.287 +48 L 0.302 +49 S 0.287 +50 G 0.247 +51 K 0.208 +52 L 0.188 +53 P 0.178 +54 P 0.166 +55 G 0.160 +56 P 0.169 +57 T 0.179 +58 P 0.169 +59 L 0.138 +60 P 0.101 +61 F 0.070 +62 I 0.053 +63 G 0.048 +64 N 0.049 +65 F 0.052 +66 L 0.061 +67 Q 0.074 +68 L 0.087 +69 N 0.096 +70 T 0.099 +71 E 0.094 +72 Q 0.082 +73 M 0.071 +74 Y 0.066 +75 N 0.061 +76 S 0.052 +77 L 0.043 +78 M 0.039 +79 K 0.037 +80 I 0.034 +81 S 0.032 +82 Q 0.032 +83 R 0.036 +84 Y 0.039 +85 G 0.037 +86 P 0.032 +87 V 0.028 +88 F 0.028 +89 T 0.030 +90 I 0.035 +91 Y 0.040 +92 L 0.047 +93 G 0.056 +94 P 0.064 +95 R 0.066 +96 R 0.062 +97 I 0.054 +98 V 0.052 +99 V 0.058 +100 L 0.070 +101 C 0.080 +102 G 0.082 +103 Q 0.073 +104 E 0.058 +105 A 0.046 +106 V 0.045 +107 K 0.049 +108 E 0.055 +109 A 0.066 +110 L 0.083 +111 V 0.096 +112 D 0.095 +113 Q 0.082 +114 A 0.067 +115 E 0.060 +116 E 0.060 +117 F 0.068 +118 S 0.083 +119 G 0.105 +120 R 0.126 +121 G 0.138 +122 E 0.135 +123 Q 0.119 +124 A 0.099 +125 T 0.082 +126 F 0.071 +127 D 0.070 +128 W 0.082 +129 L 0.104 +130 F 0.131 +131 K 0.153 +132 G 0.157 +133 Y 0.143 +134 G 0.121 +135 V 0.105 +136 A 0.106 +137 F 0.122 +138 S 0.138 +139 S 0.139 +140 G 0.123 +141 E 0.104 +142 R 0.091 +143 A 0.081 +144 K 0.074 +145 Q 0.078 +146 L 0.093 +147 R 0.108 +148 R 0.110 +149 F 0.102 +150 S 0.095 +151 I 0.093 +152 A 0.096 +153 T 0.098 +154 L 0.096 +155 R 0.093 +156 D 0.090 +157 F 0.092 +158 G 0.111 +159 V 0.145 +160 G 0.175 +161 K 0.184 +162 R 0.176 +163 G 0.157 +164 I 0.130 +165 E 0.102 +166 E 0.082 +167 R 0.073 +168 I 0.073 +169 Q 0.078 +170 E 0.082 +171 E 0.080 +172 A 0.073 +173 G 0.064 +174 F 0.056 +175 L 0.049 +176 I 0.045 +177 D 0.045 +178 S 0.048 +179 F 0.052 +180 R 0.058 +181 K 0.066 +182 T 0.078 +183 N 0.090 +184 G 0.097 +185 A 0.095 +186 F 0.089 +187 I 0.084 +188 D 0.078 +189 P 0.069 +190 T 0.060 +191 F 0.058 +192 Y 0.060 +193 L 0.061 +194 S 0.066 +195 R 0.082 +196 T 0.102 +197 V 0.113 +198 S 0.119 +199 N 0.124 +200 V 0.119 +201 I 0.096 +202 S 0.068 +203 S 0.050 +204 I 0.044 +205 V 0.046 +206 F 0.056 +207 G 0.074 +208 D 0.093 +209 R 0.101 +210 F 0.093 +211 D 0.078 +212 Y 0.065 +213 E 0.055 +214 D 0.047 +215 K 0.042 +216 E 0.039 +217 F 0.039 +218 L 0.039 +219 S 0.041 +220 L 0.042 +221 L 0.040 +222 R 0.036 +223 M 0.034 +224 M 0.034 +225 L 0.036 +226 G 0.037 +227 S 0.039 +228 F 0.042 +229 Q 0.047 +230 F 0.050 +231 T 0.052 +232 A 0.057 +233 T 0.061 +234 S 0.063 +235 M 0.062 +236 G 0.058 +237 Q 0.053 +238 L 0.048 +239 Y 0.044 +240 E 0.042 +241 M 0.042 +242 F 0.043 +243 S 0.044 +244 S 0.041 +245 V 0.037 +246 M 0.039 +247 K 0.050 +248 H 0.069 +249 L 0.087 +250 P 0.095 +251 G 0.097 +252 P 0.098 +253 Q 0.097 +254 Q 0.097 +255 Q 0.099 +256 A 0.104 +257 F 0.110 +258 K 0.118 +259 E 0.124 +260 L 0.121 +261 Q 0.114 +262 G 0.108 +263 L 0.104 +264 E 0.099 +265 D 0.087 +266 F 0.071 +267 I 0.061 +268 T 0.061 +269 K 0.062 +270 K 0.058 +271 V 0.051 +272 E 0.047 +273 H 0.048 +274 N 0.052 +275 Q 0.057 +276 R 0.067 +277 T 0.083 +278 L 0.100 +279 D 0.108 +280 P 0.105 +281 N 0.099 +282 S 0.093 +283 P 0.081 +284 R 0.064 +285 D 0.050 +286 F 0.048 +287 I 0.056 +288 D 0.061 +289 S 0.062 +290 F 0.062 +291 L 0.063 +292 I 0.059 +293 R 0.050 +294 M 0.043 +295 L 0.043 +296 E 0.049 +297 E 0.064 +298 K 0.088 +299 K 0.115 +300 N 0.139 +301 P 0.151 +302 N 0.149 +303 T 0.136 +304 E 0.116 +305 F 0.096 +306 Y 0.081 +307 M 0.071 +308 K 0.067 +309 N 0.070 +310 L 0.072 +311 V 0.072 +312 L 0.078 +313 T 0.092 +314 T 0.103 +315 L 0.102 +316 N 0.098 +317 L 0.098 +318 F 0.103 +319 F 0.116 +320 A 0.134 +321 G 0.145 +322 T 0.141 +323 E 0.129 +324 T 0.119 +325 V 0.106 +326 S 0.089 +327 T 0.074 +328 T 0.064 +329 L 0.055 +330 R 0.045 +331 Y 0.039 +332 G 0.037 +333 F 0.037 +334 L 0.040 +335 L 0.045 +336 L 0.050 +337 M 0.053 +338 K 0.053 +339 H 0.052 +340 P 0.049 +341 D 0.046 +342 I 0.049 +343 E 0.058 +344 A 0.067 +345 K 0.069 +346 V 0.069 +347 H 0.074 +348 E 0.081 +349 E 0.077 +350 I 0.065 +351 D 0.058 +352 R 0.063 +353 V 0.077 +354 I 0.089 +355 G 0.091 +356 R 0.085 +357 N 0.078 +358 R 0.078 +359 Q 0.082 +360 P 0.079 +361 K 0.069 +362 Y 0.061 +363 E 0.058 +364 D 0.057 +365 R 0.057 +366 M 0.061 +367 K 0.067 +368 M 0.072 +369 P 0.072 +370 Y 0.066 +371 T 0.060 +372 E 0.061 +373 A 0.070 +374 V 0.080 +375 I 0.083 +376 H 0.082 +377 E 0.081 +378 I 0.079 +379 Q 0.074 +380 R 0.067 +381 F 0.060 +382 A 0.056 +383 D 0.057 +384 M 0.062 +385 I 0.068 +386 P 0.071 +387 M 0.070 +388 G 0.066 +389 L 0.058 +390 A 0.051 +391 R 0.047 +392 R 0.050 +393 V 0.054 +394 T 0.057 +395 K 0.056 +396 D 0.052 +397 T 0.049 +398 K 0.046 +399 F 0.043 +400 R 0.045 +401 D 0.054 +402 F 0.064 +403 L 0.070 +404 L 0.073 +405 P 0.077 +406 K 0.080 +407 G 0.075 +408 T 0.064 +409 E 0.056 +410 V 0.053 +411 F 0.058 +412 P 0.069 +413 M 0.082 +414 L 0.088 +415 G 0.083 +416 S 0.076 +417 V 0.076 +418 L 0.084 +419 K 0.091 +420 D 0.093 +421 P 0.093 +422 K 0.093 +423 F 0.095 +424 F 0.100 +425 S 0.104 +426 N 0.105 +427 P 0.100 +428 K 0.093 +429 D 0.090 +430 F 0.088 +431 N 0.086 +432 P 0.086 +433 K 0.093 +434 H 0.110 +435 F 0.127 +436 L 0.135 +437 D 0.136 +438 D 0.136 +439 K 0.141 +440 G 0.153 +441 Q 0.171 +442 F 0.187 +443 K 0.189 +444 K 0.179 +445 N 0.162 +446 D 0.146 +447 A 0.141 +448 F 0.148 +449 V 0.163 +450 P 0.172 +451 F 0.164 +452 S 0.144 +453 I 0.126 +454 G 0.117 +455 K 0.117 +456 R 0.126 +457 Y 0.144 +458 C 0.163 +459 F 0.174 +460 G 0.175 +461 E 0.173 +462 G 0.185 +463 L 0.215 +464 A 0.228 +465 R 0.204 +466 M 0.172 +467 E 0.157 +468 L 0.143 +469 F 0.115 +470 L 0.088 +471 F 0.074 +472 L 0.070 +473 T 0.066 +474 N 0.062 +475 I 0.061 +476 M 0.062 +477 Q 0.061 +478 N 0.058 +479 F 0.053 +480 H 0.050 +481 F 0.053 +482 K 0.064 +483 S 0.084 +484 T 0.107 +485 Q 0.128 +486 A 0.140 +487 P 0.140 +488 Q 0.135 +489 D 0.132 +490 I 0.136 +491 D 0.149 +492 V 0.170 +493 S 0.188 +494 P 0.184 +495 R 0.153 +496 L 0.115 +497 V 0.089 +498 G 0.084 +499 F 0.098 +500 A 0.129 +501 T 0.172 +502 I 0.216 +503 P 0.238 +504 P 0.219 +505 T 0.173 +506 Y 0.127 +507 T 0.098 +508 M 0.083 +509 S 0.079 +510 F 0.088 +511 L 0.113 +512 S 0.153 +513 R 0.187 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000005846.13_ENSMUST00000119953.2_GN:Rsl1d1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000005846.13_ENSMUST00000119953.2_GN:Rsl1d1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..db5054d3ebf3bba93be57407a4293ecadd8e0fde --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000005846.13_ENSMUST00000119953.2_GN:Rsl1d1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,453 @@ +>ENSMUSG00000005846.13|ENSMUST00000119953.2|GN:Rsl1d1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.463 +2 K 0.482 +3 G 0.505 +4 S 0.500 +5 A 0.451 +6 S 0.398 +7 E 0.404 +8 S 0.471 +9 P 0.532 +10 S 0.548 +11 A 0.561 +12 S 0.607 +13 V 0.663 +14 A 0.695 +15 E 0.705 +16 A 0.705 +17 T 0.699 +18 T 0.691 +19 T 0.688 +20 D 0.685 +21 V 0.672 +22 Q 0.651 +23 V 0.633 +24 T 0.620 +25 P 0.601 +26 T 0.556 +27 A 0.476 +28 L 0.372 +29 L 0.267 +30 Q 0.179 +31 L 0.116 +32 D 0.075 +33 R 0.052 +34 E 0.041 +35 Q 0.039 +36 I 0.039 +37 R 0.038 +38 K 0.036 +39 A 0.035 +40 V 0.033 +41 E 0.033 +42 V 0.039 +43 I 0.047 +44 S 0.055 +45 N 0.065 +46 R 0.081 +47 S 0.110 +48 K 0.158 +49 S 0.221 +50 K 0.288 +51 K 0.357 +52 N 0.422 +53 N 0.468 +54 N 0.484 +55 E 0.479 +56 L 0.473 +57 L 0.475 +58 L 0.475 +59 S 0.449 +60 G 0.379 +61 S 0.275 +62 E 0.173 +63 N 0.099 +64 L 0.057 +65 F 0.038 +66 L 0.032 +67 M 0.035 +68 V 0.043 +69 I 0.054 +70 L 0.063 +71 W 0.072 +72 K 0.082 +73 I 0.097 +74 P 0.117 +75 E 0.136 +76 K 0.145 +77 E 0.139 +78 L 0.126 +79 R 0.120 +80 V 0.122 +81 K 0.127 +82 V 0.130 +83 P 0.128 +84 L 0.122 +85 P 0.119 +86 H 0.120 +87 S 0.123 +88 I 0.128 +89 L 0.137 +90 S 0.146 +91 E 0.148 +92 S 0.136 +93 S 0.109 +94 D 0.075 +95 V 0.046 +96 C 0.029 +97 L 0.026 +98 F 0.034 +99 T 0.051 +100 K 0.072 +101 D 0.092 +102 E 0.104 +103 F 0.106 +104 D 0.101 +105 S 0.097 +106 P 0.093 +107 E 0.087 +108 Q 0.078 +109 T 0.068 +110 E 0.060 +111 G 0.052 +112 F 0.048 +113 Y 0.050 +114 K 0.058 +115 K 0.062 +116 L 0.056 +117 L 0.044 +118 K 0.038 +119 K 0.038 +120 H 0.042 +121 G 0.047 +122 V 0.050 +123 N 0.049 +124 T 0.045 +125 I 0.041 +126 S 0.037 +127 Q 0.035 +128 I 0.034 +129 I 0.035 +130 P 0.034 +131 F 0.034 +132 K 0.034 +133 T 0.036 +134 L 0.038 +135 K 0.041 +136 T 0.046 +137 E 0.052 +138 Y 0.056 +139 K 0.058 +140 A 0.057 +141 Y 0.057 +142 E 0.056 +143 A 0.052 +144 K 0.045 +145 L 0.041 +146 R 0.044 +147 L 0.051 +148 L 0.057 +149 G 0.061 +150 S 0.062 +151 F 0.061 +152 E 0.055 +153 V 0.044 +154 F 0.033 +155 I 0.030 +156 T 0.037 +157 D 0.048 +158 A 0.056 +159 R 0.060 +160 I 0.062 +161 R 0.062 +162 R 0.060 +163 H 0.060 +164 L 0.061 +165 P 0.062 +166 S 0.064 +167 H 0.065 +168 I 0.061 +169 G 0.059 +170 R 0.060 +171 H 0.063 +172 F 0.066 +173 Y 0.071 +174 Q 0.080 +175 R 0.092 +176 K 0.103 +177 K 0.107 +178 V 0.102 +179 P 0.092 +180 V 0.081 +181 S 0.075 +182 V 0.070 +183 N 0.065 +184 L 0.063 +185 L 0.067 +186 A 0.074 +187 K 0.077 +188 N 0.071 +189 L 0.061 +190 S 0.054 +191 K 0.052 +192 E 0.053 +193 I 0.060 +194 N 0.073 +195 R 0.091 +196 C 0.104 +197 I 0.105 +198 T 0.092 +199 G 0.075 +200 T 0.063 +201 V 0.062 +202 L 0.065 +203 N 0.068 +204 I 0.068 +205 S 0.070 +206 K 0.080 +207 R 0.093 +208 G 0.096 +209 S 0.083 +210 C 0.061 +211 S 0.045 +212 T 0.038 +213 I 0.037 +214 R 0.037 +215 I 0.039 +216 G 0.044 +217 H 0.052 +218 T 0.063 +219 G 0.071 +220 M 0.072 +221 E 0.067 +222 T 0.061 +223 E 0.059 +224 H 0.060 +225 I 0.061 +226 V 0.065 +227 D 0.072 +228 N 0.076 +229 I 0.072 +230 L 0.065 +231 A 0.061 +232 V 0.057 +233 S 0.051 +234 E 0.045 +235 M 0.042 +236 L 0.041 +237 S 0.041 +238 E 0.043 +239 K 0.048 +240 L 0.054 +241 P 0.059 +242 E 0.058 +243 K 0.053 +244 W 0.047 +245 Q 0.043 +246 S 0.039 +247 V 0.036 +248 K 0.032 +249 L 0.029 +250 L 0.028 +251 F 0.029 +252 L 0.034 +253 K 0.042 +254 T 0.053 +255 E 0.064 +256 K 0.072 +257 S 0.073 +258 V 0.066 +259 S 0.059 +260 L 0.054 +261 P 0.055 +262 I 0.064 +263 F 0.090 +264 S 0.139 +265 S 0.206 +266 F 0.283 +267 V 0.371 +268 T 0.466 +269 S 0.542 +270 Q 0.571 +271 D 0.553 +272 E 0.511 +273 N 0.458 +274 A 0.396 +275 V 0.332 +276 S 0.280 +277 L 0.245 +278 R 0.226 +279 S 0.220 +280 L 0.218 +281 R 0.214 +282 K 0.210 +283 Q 0.207 +284 E 0.205 +285 L 0.202 +286 K 0.199 +287 K 0.198 +288 R 0.197 +289 K 0.199 +290 R 0.206 +291 E 0.218 +292 N 0.227 +293 A 0.228 +294 K 0.229 +295 L 0.235 +296 K 0.245 +297 K 0.256 +298 E 0.266 +299 S 0.275 +300 K 0.281 +301 M 0.286 +302 L 0.301 +303 R 0.328 +304 K 0.369 +305 K 0.423 +306 S 0.481 +307 K 0.532 +308 K 0.577 +309 A 0.617 +310 T 0.645 +311 S 0.661 +312 L 0.671 +313 L 0.674 +314 T 0.671 +315 Q 0.675 +316 S 0.696 +317 G 0.727 +318 L 0.752 +319 A 0.765 +320 S 0.763 +321 S 0.753 +322 A 0.745 +323 P 0.746 +324 A 0.749 +325 K 0.750 +326 S 0.750 +327 P 0.753 +328 G 0.761 +329 A 0.765 +330 Q 0.763 +331 K 0.758 +332 K 0.753 +333 K 0.750 +334 T 0.746 +335 N 0.728 +336 K 0.684 +337 A 0.622 +338 H 0.593 +339 K 0.631 +340 K 0.704 +341 Q 0.764 +342 K 0.798 +343 V 0.817 +344 T 0.827 +345 E 0.832 +346 E 0.832 +347 C 0.827 +348 E 0.819 +349 E 0.809 +350 A 0.798 +351 I 0.792 +352 P 0.793 +353 Q 0.799 +354 L 0.806 +355 V 0.811 +356 P 0.815 +357 I 0.818 +358 G 0.814 +359 E 0.803 +360 T 0.791 +361 P 0.789 +362 D 0.794 +363 K 0.798 +364 E 0.784 +365 N 0.739 +366 V 0.673 +367 K 0.638 +368 M 0.673 +369 Q 0.739 +370 E 0.785 +371 N 0.799 +372 I 0.797 +373 T 0.788 +374 G 0.781 +375 K 0.778 +376 T 0.782 +377 P 0.791 +378 K 0.800 +379 S 0.805 +380 K 0.802 +381 S 0.793 +382 D 0.783 +383 P 0.775 +384 S 0.770 +385 T 0.772 +386 P 0.781 +387 K 0.789 +388 G 0.787 +389 K 0.764 +390 K 0.715 +391 R 0.654 +392 K 0.632 +393 A 0.678 +394 L 0.749 +395 L 0.794 +396 A 0.803 +397 T 0.794 +398 E 0.783 +399 T 0.782 +400 P 0.792 +401 E 0.805 +402 A 0.809 +403 S 0.803 +404 A 0.796 +405 P 0.798 +406 G 0.806 +407 T 0.815 +408 S 0.817 +409 G 0.813 +410 K 0.803 +411 K 0.784 +412 Q 0.738 +413 K 0.675 +414 K 0.646 +415 D 0.682 +416 V 0.740 +417 Q 0.769 +418 E 0.766 +419 F 0.751 +420 R 0.743 +421 K 0.748 +422 P 0.768 +423 E 0.789 +424 A 0.799 +425 S 0.791 +426 S 0.772 +427 F 0.753 +428 S 0.741 +429 T 0.741 +430 P 0.749 +431 R 0.760 +432 K 0.774 +433 S 0.786 +434 G 0.795 +435 K 0.797 +436 K 0.795 +437 A 0.787 +438 S 0.770 +439 N 0.748 +440 T 0.731 +441 P 0.726 +442 R 0.724 +443 D 0.713 +444 K 0.690 +445 K 0.651 +446 T 0.601 +447 K 0.575 +448 A 0.595 +449 A 0.629 +450 H 0.629 +451 S 0.593 +452 N 0.558 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000005846.13_ENSMUST00000119953.2_GN:Rsl1d1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:13.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000005846.13_ENSMUST00000119953.2_GN:Rsl1d1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:13.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..05124b36e8655a74905b331befd90c4b225c5849 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000005846.13_ENSMUST00000119953.2_GN:Rsl1d1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:13.caid @@ -0,0 +1,466 @@ +>ENSMUSG00000005846.13|ENSMUST00000119953.2|GN:Rsl1d1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:13 +1 M 0.439 +2 S 0.456 +3 S 0.477 +4 D 0.487 +5 F 0.488 +6 Y 0.500 +7 R 0.538 +8 P 0.594 +9 S 0.649 +10 T 0.691 +11 R 0.715 +12 G 0.727 +13 D 0.729 +14 M 0.727 +15 K 0.727 +16 G 0.726 +17 S 0.717 +18 A 0.698 +19 S 0.673 +20 E 0.654 +21 S 0.643 +22 P 0.625 +23 S 0.596 +24 A 0.589 +25 S 0.631 +26 V 0.690 +27 A 0.727 +28 E 0.739 +29 A 0.739 +30 T 0.732 +31 T 0.723 +32 T 0.717 +33 D 0.708 +34 V 0.689 +35 Q 0.664 +36 V 0.642 +37 T 0.627 +38 P 0.607 +39 T 0.562 +40 A 0.483 +41 L 0.379 +42 L 0.271 +43 Q 0.181 +44 L 0.117 +45 D 0.075 +46 R 0.051 +47 E 0.040 +48 Q 0.038 +49 I 0.039 +50 R 0.038 +51 K 0.036 +52 A 0.035 +53 V 0.033 +54 E 0.034 +55 V 0.040 +56 I 0.050 +57 S 0.060 +58 N 0.070 +59 R 0.085 +60 S 0.114 +61 K 0.161 +62 S 0.223 +63 K 0.289 +64 K 0.358 +65 N 0.423 +66 N 0.467 +67 N 0.482 +68 E 0.478 +69 L 0.473 +70 L 0.475 +71 L 0.473 +72 S 0.445 +73 G 0.374 +74 S 0.270 +75 E 0.168 +76 N 0.095 +77 L 0.055 +78 F 0.036 +79 L 0.031 +80 M 0.034 +81 V 0.042 +82 I 0.052 +83 L 0.062 +84 W 0.070 +85 K 0.079 +86 I 0.094 +87 P 0.113 +88 E 0.131 +89 K 0.140 +90 E 0.134 +91 L 0.122 +92 R 0.116 +93 V 0.119 +94 K 0.125 +95 V 0.128 +96 P 0.125 +97 L 0.120 +98 P 0.117 +99 H 0.116 +100 S 0.118 +101 I 0.122 +102 L 0.129 +103 S 0.139 +104 E 0.142 +105 S 0.132 +106 S 0.106 +107 D 0.074 +108 V 0.046 +109 C 0.029 +110 L 0.025 +111 F 0.033 +112 T 0.049 +113 K 0.069 +114 D 0.089 +115 E 0.102 +116 F 0.104 +117 D 0.099 +118 S 0.095 +119 P 0.091 +120 E 0.085 +121 Q 0.076 +122 T 0.067 +123 E 0.059 +124 G 0.052 +125 F 0.047 +126 Y 0.050 +127 K 0.058 +128 K 0.062 +129 L 0.055 +130 L 0.044 +131 K 0.037 +132 K 0.037 +133 H 0.041 +134 G 0.046 +135 V 0.049 +136 N 0.048 +137 T 0.045 +138 I 0.041 +139 S 0.037 +140 Q 0.035 +141 I 0.034 +142 I 0.035 +143 P 0.034 +144 F 0.033 +145 K 0.034 +146 T 0.035 +147 L 0.037 +148 K 0.040 +149 T 0.045 +150 E 0.051 +151 Y 0.056 +152 K 0.057 +153 A 0.057 +154 Y 0.056 +155 E 0.055 +156 A 0.051 +157 K 0.045 +158 L 0.040 +159 R 0.043 +160 L 0.050 +161 L 0.056 +162 G 0.060 +163 S 0.061 +164 F 0.060 +165 E 0.054 +166 V 0.043 +167 F 0.032 +168 I 0.029 +169 T 0.036 +170 D 0.047 +171 A 0.055 +172 R 0.059 +173 I 0.060 +174 R 0.061 +175 R 0.060 +176 H 0.060 +177 L 0.060 +178 P 0.061 +179 S 0.064 +180 H 0.064 +181 I 0.061 +182 G 0.058 +183 R 0.059 +184 H 0.062 +185 F 0.065 +186 Y 0.069 +187 Q 0.078 +188 R 0.089 +189 K 0.100 +190 K 0.104 +191 V 0.099 +192 P 0.089 +193 V 0.079 +194 S 0.073 +195 V 0.069 +196 N 0.064 +197 L 0.062 +198 L 0.066 +199 A 0.073 +200 K 0.075 +201 N 0.069 +202 L 0.060 +203 S 0.052 +204 K 0.050 +205 E 0.052 +206 I 0.059 +207 N 0.072 +208 R 0.089 +209 C 0.103 +210 I 0.104 +211 T 0.092 +212 G 0.074 +213 T 0.063 +214 V 0.061 +215 L 0.064 +216 N 0.066 +217 I 0.067 +218 S 0.069 +219 K 0.078 +220 R 0.091 +221 G 0.094 +222 S 0.081 +223 C 0.060 +224 S 0.044 +225 T 0.038 +226 I 0.037 +227 R 0.037 +228 I 0.039 +229 G 0.043 +230 H 0.051 +231 T 0.061 +232 G 0.069 +233 M 0.071 +234 E 0.067 +235 T 0.061 +236 E 0.058 +237 H 0.059 +238 I 0.061 +239 V 0.065 +240 D 0.072 +241 N 0.076 +242 I 0.072 +243 L 0.065 +244 A 0.061 +245 V 0.057 +246 S 0.051 +247 E 0.045 +248 M 0.042 +249 L 0.041 +250 S 0.041 +251 E 0.042 +252 K 0.047 +253 L 0.054 +254 P 0.058 +255 E 0.058 +256 K 0.053 +257 W 0.047 +258 Q 0.043 +259 S 0.040 +260 V 0.036 +261 K 0.032 +262 L 0.029 +263 L 0.028 +264 F 0.029 +265 L 0.034 +266 K 0.042 +267 T 0.053 +268 E 0.065 +269 K 0.073 +270 S 0.073 +271 V 0.067 +272 S 0.059 +273 L 0.055 +274 P 0.056 +275 I 0.065 +276 F 0.091 +277 S 0.141 +278 S 0.209 +279 F 0.286 +280 V 0.374 +281 T 0.469 +282 S 0.543 +283 Q 0.570 +284 D 0.550 +285 E 0.507 +286 N 0.454 +287 A 0.393 +288 V 0.330 +289 S 0.279 +290 L 0.244 +291 R 0.225 +292 S 0.218 +293 L 0.216 +294 R 0.212 +295 K 0.208 +296 Q 0.205 +297 E 0.202 +298 L 0.199 +299 K 0.196 +300 K 0.194 +301 R 0.194 +302 K 0.196 +303 R 0.205 +304 E 0.217 +305 N 0.224 +306 A 0.225 +307 K 0.224 +308 L 0.230 +309 K 0.240 +310 K 0.252 +311 E 0.263 +312 S 0.273 +313 K 0.279 +314 M 0.285 +315 L 0.298 +316 R 0.324 +317 K 0.365 +318 K 0.420 +319 S 0.479 +320 K 0.529 +321 K 0.575 +322 A 0.617 +323 T 0.646 +324 S 0.663 +325 L 0.673 +326 L 0.676 +327 T 0.673 +328 Q 0.676 +329 S 0.698 +330 G 0.729 +331 L 0.755 +332 A 0.767 +333 S 0.766 +334 S 0.756 +335 A 0.748 +336 P 0.749 +337 A 0.752 +338 K 0.752 +339 S 0.752 +340 P 0.756 +341 G 0.763 +342 A 0.767 +343 Q 0.765 +344 K 0.760 +345 K 0.755 +346 K 0.752 +347 T 0.748 +348 N 0.730 +349 K 0.685 +350 A 0.624 +351 H 0.594 +352 K 0.632 +353 K 0.705 +354 Q 0.765 +355 K 0.799 +356 V 0.818 +357 T 0.828 +358 E 0.833 +359 E 0.833 +360 C 0.829 +361 E 0.821 +362 E 0.811 +363 A 0.800 +364 I 0.793 +365 P 0.794 +366 Q 0.801 +367 L 0.807 +368 V 0.812 +369 P 0.816 +370 I 0.819 +371 G 0.815 +372 E 0.803 +373 T 0.791 +374 P 0.788 +375 D 0.793 +376 K 0.796 +377 E 0.783 +378 N 0.738 +379 V 0.672 +380 K 0.638 +381 M 0.672 +382 Q 0.739 +383 E 0.784 +384 N 0.799 +385 I 0.796 +386 T 0.788 +387 G 0.780 +388 K 0.778 +389 T 0.782 +390 P 0.791 +391 K 0.801 +392 S 0.805 +393 K 0.802 +394 S 0.793 +395 D 0.783 +396 P 0.775 +397 S 0.770 +398 T 0.772 +399 P 0.780 +400 K 0.788 +401 G 0.786 +402 K 0.764 +403 K 0.715 +404 R 0.654 +405 K 0.632 +406 A 0.677 +407 L 0.749 +408 L 0.794 +409 A 0.803 +410 T 0.794 +411 E 0.784 +412 T 0.782 +413 P 0.792 +414 E 0.805 +415 A 0.809 +416 S 0.803 +417 A 0.796 +418 P 0.797 +419 G 0.805 +420 T 0.814 +421 S 0.817 +422 G 0.812 +423 K 0.803 +424 K 0.783 +425 Q 0.738 +426 K 0.675 +427 K 0.647 +428 D 0.682 +429 V 0.741 +430 Q 0.771 +431 E 0.768 +432 F 0.753 +433 R 0.744 +434 K 0.750 +435 P 0.769 +436 E 0.790 +437 A 0.800 +438 S 0.793 +439 S 0.774 +440 F 0.755 +441 S 0.743 +442 T 0.743 +443 P 0.750 +444 R 0.761 +445 K 0.774 +446 S 0.787 +447 G 0.796 +448 K 0.798 +449 K 0.795 +450 A 0.788 +451 S 0.771 +452 N 0.749 +453 T 0.732 +454 P 0.726 +455 R 0.723 +456 D 0.712 +457 K 0.689 +458 K 0.650 +459 T 0.601 +460 K 0.575 +461 A 0.595 +462 A 0.628 +463 H 0.629 +464 S 0.595 +465 N 0.559 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000006273.15_ENSMUST00000006435.8_GN:Atp6v1b2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000006273.15_ENSMUST00000006435.8_GN:Atp6v1b2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f3f50c03404094bd5426784c3db425aa38fa52ce --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000006273.15_ENSMUST00000006435.8_GN:Atp6v1b2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,512 @@ +>ENSMUSG00000006273.15|ENSMUST00000006435.8|GN:Atp6v1b2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.270 +2 A 0.262 +3 L 0.261 +4 R 0.283 +5 A 0.324 +6 M 0.365 +7 R 0.412 +8 G 0.472 +9 I 0.521 +10 V 0.541 +11 N 0.542 +12 G 0.540 +13 A 0.534 +14 A 0.522 +15 P 0.514 +16 E 0.519 +17 L 0.534 +18 P 0.549 +19 V 0.558 +20 P 0.563 +21 T 0.561 +22 G 0.557 +23 G 0.559 +24 P 0.569 +25 M 0.570 +26 A 0.542 +27 G 0.480 +28 A 0.393 +29 R 0.309 +30 E 0.257 +31 Q 0.243 +32 A 0.242 +33 L 0.233 +34 A 0.225 +35 V 0.229 +36 S 0.245 +37 R 0.264 +38 N 0.280 +39 Y 0.291 +40 L 0.299 +41 S 0.303 +42 Q 0.299 +43 P 0.280 +44 R 0.241 +45 L 0.188 +46 T 0.131 +47 Y 0.085 +48 K 0.056 +49 T 0.044 +50 V 0.044 +51 S 0.051 +52 G 0.060 +53 V 0.066 +54 N 0.067 +55 G 0.059 +56 P 0.047 +57 L 0.035 +58 V 0.031 +59 I 0.035 +60 L 0.047 +61 D 0.062 +62 H 0.075 +63 V 0.082 +64 K 0.082 +65 F 0.078 +66 P 0.071 +67 R 0.065 +68 Y 0.061 +69 A 0.059 +70 E 0.055 +71 I 0.046 +72 V 0.038 +73 H 0.035 +74 L 0.038 +75 T 0.045 +76 L 0.056 +77 P 0.068 +78 D 0.077 +79 G 0.079 +80 T 0.073 +81 K 0.063 +82 R 0.053 +83 S 0.047 +84 G 0.045 +85 Q 0.047 +86 V 0.049 +87 L 0.052 +88 E 0.057 +89 V 0.064 +90 S 0.067 +91 G 0.064 +92 S 0.054 +93 K 0.041 +94 A 0.032 +95 V 0.031 +96 V 0.037 +97 Q 0.045 +98 V 0.051 +99 F 0.059 +100 E 0.071 +101 G 0.083 +102 T 0.092 +103 S 0.098 +104 G 0.102 +105 I 0.102 +106 D 0.096 +107 A 0.088 +108 K 0.081 +109 K 0.072 +110 T 0.064 +111 S 0.060 +112 C 0.069 +113 E 0.089 +114 F 0.114 +115 T 0.137 +116 G 0.154 +117 D 0.165 +118 I 0.171 +119 L 0.176 +120 R 0.189 +121 T 0.214 +122 P 0.233 +123 V 0.226 +124 S 0.192 +125 E 0.157 +126 D 0.144 +127 M 0.148 +128 L 0.158 +129 G 0.170 +130 R 0.183 +131 V 0.186 +132 F 0.172 +133 N 0.155 +134 G 0.154 +135 S 0.165 +136 G 0.171 +137 K 0.164 +138 P 0.152 +139 I 0.141 +140 D 0.135 +141 R 0.141 +142 G 0.163 +143 P 0.189 +144 V 0.202 +145 V 0.193 +146 L 0.169 +147 A 0.149 +148 E 0.145 +149 D 0.148 +150 F 0.152 +151 L 0.155 +152 D 0.157 +153 I 0.161 +154 M 0.183 +155 G 0.230 +156 Q 0.286 +157 P 0.326 +158 I 0.331 +159 N 0.301 +160 P 0.254 +161 Q 0.212 +162 C 0.183 +163 R 0.167 +164 I 0.161 +165 Y 0.159 +166 P 0.151 +167 E 0.138 +168 E 0.126 +169 M 0.118 +170 I 0.110 +171 Q 0.097 +172 T 0.084 +173 G 0.073 +174 I 0.068 +175 S 0.070 +176 A 0.076 +177 I 0.079 +178 D 0.078 +179 G 0.076 +180 M 0.078 +181 N 0.084 +182 S 0.091 +183 I 0.093 +184 A 0.092 +185 R 0.096 +186 G 0.106 +187 Q 0.120 +188 K 0.137 +189 I 0.151 +190 P 0.159 +191 I 0.163 +192 F 0.171 +193 S 0.183 +194 A 0.190 +195 A 0.180 +196 G 0.155 +197 L 0.126 +198 P 0.104 +199 H 0.097 +200 N 0.102 +201 E 0.113 +202 I 0.120 +203 A 0.120 +204 A 0.114 +205 Q 0.111 +206 I 0.109 +207 C 0.101 +208 R 0.089 +209 Q 0.082 +210 A 0.088 +211 G 0.099 +212 L 0.111 +213 V 0.132 +214 K 0.168 +215 K 0.212 +216 S 0.251 +217 K 0.277 +218 D 0.288 +219 V 0.284 +220 V 0.274 +221 D 0.263 +222 Y 0.251 +223 S 0.229 +224 E 0.190 +225 E 0.141 +226 N 0.099 +227 F 0.074 +228 A 0.069 +229 I 0.077 +230 V 0.086 +231 F 0.087 +232 A 0.082 +233 A 0.079 +234 M 0.083 +235 G 0.088 +236 V 0.085 +237 N 0.073 +238 M 0.063 +239 E 0.063 +240 T 0.070 +241 A 0.075 +242 R 0.075 +243 F 0.069 +244 F 0.064 +245 K 0.065 +246 S 0.066 +247 D 0.061 +248 F 0.055 +249 E 0.056 +250 E 0.060 +251 N 0.060 +252 G 0.054 +253 S 0.049 +254 M 0.047 +255 D 0.046 +256 N 0.043 +257 V 0.040 +258 C 0.042 +259 L 0.051 +260 F 0.066 +261 L 0.085 +262 N 0.104 +263 L 0.120 +264 A 0.126 +265 N 0.124 +266 D 0.118 +267 P 0.108 +268 T 0.096 +269 I 0.088 +270 E 0.086 +271 R 0.086 +272 I 0.086 +273 I 0.087 +274 T 0.090 +275 P 0.089 +276 R 0.081 +277 L 0.069 +278 A 0.061 +279 L 0.056 +280 T 0.050 +281 T 0.043 +282 A 0.037 +283 E 0.032 +284 F 0.028 +285 L 0.028 +286 A 0.032 +287 Y 0.040 +288 Q 0.049 +289 C 0.055 +290 E 0.059 +291 K 0.062 +292 H 0.069 +293 V 0.079 +294 L 0.088 +295 V 0.091 +296 I 0.088 +297 L 0.080 +298 T 0.074 +299 D 0.075 +300 M 0.084 +301 S 0.097 +302 S 0.108 +303 Y 0.114 +304 A 0.118 +305 E 0.120 +306 A 0.118 +307 L 0.110 +308 R 0.102 +309 E 0.098 +310 V 0.099 +311 S 0.108 +312 A 0.121 +313 A 0.136 +314 R 0.151 +315 E 0.172 +316 E 0.199 +317 V 0.227 +318 P 0.243 +319 G 0.241 +320 R 0.232 +321 R 0.227 +322 G 0.221 +323 F 0.204 +324 P 0.173 +325 G 0.142 +326 Y 0.117 +327 M 0.099 +328 Y 0.087 +329 T 0.083 +330 D 0.084 +331 L 0.083 +332 A 0.079 +333 T 0.075 +334 I 0.070 +335 Y 0.068 +336 E 0.067 +337 R 0.068 +338 A 0.074 +339 G 0.087 +340 R 0.101 +341 V 0.111 +342 E 0.113 +343 G 0.112 +344 R 0.111 +345 N 0.112 +346 G 0.116 +347 S 0.122 +348 I 0.129 +349 T 0.135 +350 Q 0.140 +351 I 0.138 +352 P 0.131 +353 I 0.127 +354 L 0.134 +355 T 0.155 +356 M 0.176 +357 P 0.185 +358 N 0.181 +359 D 0.176 +360 D 0.169 +361 I 0.155 +362 T 0.141 +363 H 0.137 +364 P 0.143 +365 I 0.152 +366 P 0.155 +367 D 0.157 +368 L 0.164 +369 T 0.170 +370 G 0.167 +371 Y 0.155 +372 I 0.140 +373 T 0.124 +374 E 0.109 +375 G 0.096 +376 Q 0.086 +377 I 0.082 +378 Y 0.082 +379 V 0.083 +380 D 0.084 +381 R 0.085 +382 Q 0.091 +383 L 0.104 +384 H 0.122 +385 N 0.143 +386 R 0.164 +387 Q 0.176 +388 I 0.167 +389 Y 0.148 +390 P 0.138 +391 P 0.143 +392 I 0.155 +393 N 0.169 +394 V 0.175 +395 L 0.169 +396 P 0.158 +397 S 0.150 +398 L 0.148 +399 S 0.149 +400 R 0.148 +401 L 0.145 +402 M 0.146 +403 K 0.154 +404 S 0.164 +405 A 0.172 +406 I 0.182 +407 G 0.199 +408 E 0.214 +409 G 0.213 +410 M 0.191 +411 T 0.161 +412 R 0.142 +413 K 0.140 +414 D 0.146 +415 H 0.149 +416 A 0.144 +417 D 0.134 +418 V 0.123 +419 S 0.117 +420 N 0.116 +421 Q 0.116 +422 L 0.113 +423 Y 0.105 +424 A 0.098 +425 C 0.097 +426 Y 0.101 +427 A 0.105 +428 I 0.108 +429 G 0.110 +430 K 0.115 +431 D 0.119 +432 V 0.117 +433 Q 0.114 +434 A 0.114 +435 M 0.115 +436 K 0.122 +437 A 0.139 +438 V 0.162 +439 V 0.180 +440 G 0.184 +441 E 0.178 +442 E 0.172 +443 A 0.167 +444 L 0.154 +445 T 0.134 +446 S 0.119 +447 D 0.118 +448 D 0.119 +449 L 0.113 +450 L 0.107 +451 Y 0.104 +452 L 0.097 +453 E 0.085 +454 F 0.081 +455 L 0.082 +456 Q 0.079 +457 K 0.070 +458 F 0.067 +459 E 0.075 +460 K 0.087 +461 N 0.095 +462 F 0.098 +463 I 0.105 +464 T 0.127 +465 Q 0.164 +466 G 0.199 +467 P 0.210 +468 Y 0.194 +469 E 0.169 +470 N 0.145 +471 R 0.124 +472 T 0.105 +473 V 0.092 +474 Y 0.084 +475 E 0.080 +476 T 0.082 +477 L 0.087 +478 D 0.092 +479 I 0.091 +480 G 0.086 +481 W 0.082 +482 Q 0.083 +483 L 0.086 +484 L 0.085 +485 R 0.080 +486 I 0.075 +487 F 0.071 +488 P 0.070 +489 K 0.074 +490 E 0.080 +491 M 0.086 +492 L 0.092 +493 K 0.098 +494 R 0.100 +495 I 0.097 +496 P 0.090 +497 Q 0.080 +498 S 0.071 +499 T 0.063 +500 L 0.057 +501 S 0.057 +502 E 0.065 +503 F 0.085 +504 Y 0.124 +505 P 0.183 +506 R 0.254 +507 D 0.320 +508 S 0.371 +509 A 0.404 +510 K 0.422 +511 H 0.429 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000006273.15_ENSMUST00000006435.8_GN:Atp6v1b2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:29.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000006273.15_ENSMUST00000006435.8_GN:Atp6v1b2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:29.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..aac27a1988399a6946ec4578a260fb6764cd708a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000006273.15_ENSMUST00000006435.8_GN:Atp6v1b2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:29.caid @@ -0,0 +1,541 @@ +>ENSMUSG00000006273.15|ENSMUST00000006435.8|GN:Atp6v1b2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:29 +1 M 0.396 +2 G 0.408 +3 G 0.421 +4 A 0.414 +5 G 0.378 +6 R 0.344 +7 T 0.361 +8 G 0.419 +9 L 0.459 +10 P 0.448 +11 A 0.417 +12 I 0.401 +13 C 0.397 +14 A 0.406 +15 P 0.438 +16 A 0.473 +17 P 0.484 +18 R 0.494 +19 C 0.524 +20 C 0.545 +21 G 0.528 +22 A 0.507 +23 S 0.525 +24 R 0.570 +25 D 0.609 +26 G 0.622 +27 G 0.593 +28 D 0.511 +29 K 0.408 +30 M 0.333 +31 A 0.297 +32 L 0.285 +33 R 0.295 +34 A 0.337 +35 M 0.395 +36 R 0.456 +37 G 0.513 +38 I 0.555 +39 V 0.576 +40 N 0.583 +41 G 0.578 +42 A 0.558 +43 A 0.533 +44 P 0.518 +45 E 0.520 +46 L 0.531 +47 P 0.538 +48 V 0.541 +49 P 0.545 +50 T 0.552 +51 G 0.562 +52 G 0.577 +53 P 0.595 +54 M 0.603 +55 A 0.587 +56 G 0.542 +57 A 0.471 +58 R 0.390 +59 E 0.332 +60 Q 0.306 +61 A 0.293 +62 L 0.271 +63 A 0.249 +64 V 0.244 +65 S 0.254 +66 R 0.265 +67 N 0.274 +68 Y 0.284 +69 L 0.297 +70 S 0.308 +71 Q 0.307 +72 P 0.284 +73 R 0.240 +74 L 0.183 +75 T 0.126 +76 Y 0.082 +77 K 0.054 +78 T 0.041 +79 V 0.040 +80 S 0.046 +81 G 0.054 +82 V 0.061 +83 N 0.062 +84 G 0.056 +85 P 0.044 +86 L 0.033 +87 V 0.030 +88 I 0.034 +89 L 0.045 +90 D 0.059 +91 H 0.071 +92 V 0.078 +93 K 0.078 +94 F 0.073 +95 P 0.067 +96 R 0.060 +97 Y 0.056 +98 A 0.054 +99 E 0.050 +100 I 0.043 +101 V 0.036 +102 H 0.033 +103 L 0.036 +104 T 0.042 +105 L 0.052 +106 P 0.063 +107 D 0.072 +108 G 0.075 +109 T 0.071 +110 K 0.062 +111 R 0.052 +112 S 0.045 +113 G 0.042 +114 Q 0.043 +115 V 0.046 +116 L 0.049 +117 E 0.055 +118 V 0.062 +119 S 0.067 +120 G 0.064 +121 S 0.054 +122 K 0.041 +123 A 0.032 +124 V 0.031 +125 V 0.037 +126 Q 0.044 +127 V 0.051 +128 F 0.059 +129 E 0.071 +130 G 0.084 +131 T 0.093 +132 S 0.100 +133 G 0.104 +134 I 0.104 +135 D 0.098 +136 A 0.091 +137 K 0.084 +138 K 0.075 +139 T 0.066 +140 S 0.062 +141 C 0.071 +142 E 0.092 +143 F 0.119 +144 T 0.143 +145 G 0.160 +146 D 0.171 +147 I 0.177 +148 L 0.182 +149 R 0.194 +150 T 0.217 +151 P 0.235 +152 V 0.226 +153 S 0.191 +154 E 0.157 +155 D 0.144 +156 M 0.148 +157 L 0.158 +158 G 0.171 +159 R 0.183 +160 V 0.185 +161 F 0.170 +162 N 0.153 +163 G 0.153 +164 S 0.166 +165 G 0.172 +166 K 0.165 +167 P 0.152 +168 I 0.140 +169 D 0.134 +170 R 0.140 +171 G 0.162 +172 P 0.190 +173 V 0.204 +174 V 0.194 +175 L 0.169 +176 A 0.147 +177 E 0.142 +178 D 0.146 +179 F 0.151 +180 L 0.155 +181 D 0.157 +182 I 0.163 +183 M 0.186 +184 G 0.235 +185 Q 0.292 +186 P 0.331 +187 I 0.334 +188 N 0.303 +189 P 0.256 +190 Q 0.214 +191 C 0.185 +192 R 0.169 +193 I 0.163 +194 Y 0.161 +195 P 0.153 +196 E 0.139 +197 E 0.127 +198 M 0.119 +199 I 0.110 +200 Q 0.098 +201 T 0.084 +202 G 0.073 +203 I 0.068 +204 S 0.070 +205 A 0.075 +206 I 0.078 +207 D 0.077 +208 G 0.075 +209 M 0.078 +210 N 0.085 +211 S 0.092 +212 I 0.094 +213 A 0.094 +214 R 0.097 +215 G 0.107 +216 Q 0.121 +217 K 0.137 +218 I 0.151 +219 P 0.159 +220 I 0.163 +221 F 0.171 +222 S 0.184 +223 A 0.190 +224 A 0.180 +225 G 0.154 +226 L 0.125 +227 P 0.103 +228 H 0.095 +229 N 0.101 +230 E 0.111 +231 I 0.119 +232 A 0.119 +233 A 0.114 +234 Q 0.110 +235 I 0.108 +236 C 0.100 +237 R 0.088 +238 Q 0.082 +239 A 0.088 +240 G 0.099 +241 L 0.112 +242 V 0.133 +243 K 0.169 +244 K 0.212 +245 S 0.252 +246 K 0.278 +247 D 0.288 +248 V 0.285 +249 V 0.275 +250 D 0.265 +251 Y 0.253 +252 S 0.230 +253 E 0.190 +254 E 0.142 +255 N 0.099 +256 F 0.074 +257 A 0.069 +258 I 0.077 +259 V 0.086 +260 F 0.086 +261 A 0.081 +262 A 0.078 +263 M 0.082 +264 G 0.086 +265 V 0.083 +266 N 0.071 +267 M 0.060 +268 E 0.059 +269 T 0.065 +270 A 0.071 +271 R 0.071 +272 F 0.066 +273 F 0.062 +274 K 0.065 +275 S 0.066 +276 D 0.059 +277 F 0.049 +278 E 0.045 +279 E 0.046 +280 N 0.048 +281 G 0.048 +282 S 0.047 +283 M 0.047 +284 D 0.046 +285 N 0.043 +286 V 0.040 +287 C 0.042 +288 L 0.050 +289 F 0.065 +290 L 0.084 +291 N 0.104 +292 L 0.120 +293 A 0.126 +294 N 0.124 +295 D 0.118 +296 P 0.107 +297 T 0.096 +298 I 0.088 +299 E 0.086 +300 R 0.087 +301 I 0.086 +302 I 0.087 +303 T 0.090 +304 P 0.089 +305 R 0.081 +306 L 0.070 +307 A 0.062 +308 L 0.057 +309 T 0.051 +310 T 0.044 +311 A 0.038 +312 E 0.033 +313 F 0.029 +314 L 0.029 +315 A 0.033 +316 Y 0.040 +317 Q 0.049 +318 C 0.056 +319 E 0.060 +320 K 0.064 +321 H 0.071 +322 V 0.081 +323 L 0.090 +324 V 0.093 +325 I 0.090 +326 L 0.082 +327 T 0.076 +328 D 0.076 +329 M 0.086 +330 S 0.099 +331 S 0.111 +332 Y 0.117 +333 A 0.120 +334 E 0.122 +335 A 0.120 +336 L 0.112 +337 R 0.104 +338 E 0.100 +339 V 0.100 +340 S 0.106 +341 A 0.119 +342 A 0.135 +343 R 0.152 +344 E 0.173 +345 E 0.201 +346 V 0.229 +347 P 0.246 +348 G 0.245 +349 R 0.236 +350 R 0.230 +351 G 0.224 +352 F 0.206 +353 P 0.175 +354 G 0.143 +355 Y 0.119 +356 M 0.100 +357 Y 0.089 +358 T 0.084 +359 D 0.085 +360 L 0.085 +361 A 0.081 +362 T 0.076 +363 I 0.072 +364 Y 0.070 +365 E 0.069 +366 R 0.070 +367 A 0.076 +368 G 0.089 +369 R 0.104 +370 V 0.113 +371 E 0.115 +372 G 0.114 +373 R 0.113 +374 N 0.114 +375 G 0.118 +376 S 0.123 +377 I 0.130 +378 T 0.136 +379 Q 0.141 +380 I 0.140 +381 P 0.133 +382 I 0.128 +383 L 0.134 +384 T 0.155 +385 M 0.176 +386 P 0.184 +387 N 0.180 +388 D 0.175 +389 D 0.168 +390 I 0.155 +391 T 0.141 +392 H 0.137 +393 P 0.143 +394 I 0.152 +395 P 0.155 +396 D 0.157 +397 L 0.165 +398 T 0.171 +399 G 0.168 +400 Y 0.156 +401 I 0.141 +402 T 0.125 +403 E 0.110 +404 G 0.097 +405 Q 0.087 +406 I 0.083 +407 Y 0.083 +408 V 0.084 +409 D 0.084 +410 R 0.085 +411 Q 0.092 +412 L 0.105 +413 H 0.122 +414 N 0.143 +415 R 0.164 +416 Q 0.176 +417 I 0.168 +418 Y 0.150 +419 P 0.140 +420 P 0.144 +421 I 0.157 +422 N 0.170 +423 V 0.175 +424 L 0.170 +425 P 0.159 +426 S 0.151 +427 L 0.150 +428 S 0.151 +429 R 0.150 +430 L 0.147 +431 M 0.148 +432 K 0.157 +433 S 0.166 +434 A 0.174 +435 I 0.183 +436 G 0.200 +437 E 0.217 +438 G 0.216 +439 M 0.194 +440 T 0.164 +441 R 0.144 +442 K 0.142 +443 D 0.148 +444 H 0.151 +445 A 0.147 +446 D 0.137 +447 V 0.125 +448 S 0.118 +449 N 0.117 +450 Q 0.118 +451 L 0.114 +452 Y 0.106 +453 A 0.099 +454 C 0.097 +455 Y 0.101 +456 A 0.106 +457 I 0.108 +458 G 0.110 +459 K 0.115 +460 D 0.119 +461 V 0.117 +462 Q 0.114 +463 A 0.114 +464 M 0.116 +465 K 0.124 +466 A 0.142 +467 V 0.165 +468 V 0.183 +469 G 0.187 +470 E 0.180 +471 E 0.174 +472 A 0.168 +473 L 0.155 +474 T 0.134 +475 S 0.120 +476 D 0.118 +477 D 0.119 +478 L 0.113 +479 L 0.108 +480 Y 0.105 +481 L 0.098 +482 E 0.086 +483 F 0.081 +484 L 0.082 +485 Q 0.079 +486 K 0.070 +487 F 0.067 +488 E 0.075 +489 K 0.088 +490 N 0.096 +491 F 0.099 +492 I 0.107 +493 T 0.130 +494 Q 0.167 +495 G 0.202 +496 P 0.212 +497 Y 0.196 +498 E 0.170 +499 N 0.146 +500 R 0.125 +501 T 0.107 +502 V 0.093 +503 Y 0.085 +504 E 0.082 +505 T 0.084 +506 L 0.089 +507 D 0.094 +508 I 0.093 +509 G 0.087 +510 W 0.082 +511 Q 0.083 +512 L 0.086 +513 L 0.085 +514 R 0.081 +515 I 0.075 +516 F 0.071 +517 P 0.069 +518 K 0.072 +519 E 0.079 +520 M 0.085 +521 L 0.092 +522 K 0.097 +523 R 0.100 +524 I 0.097 +525 P 0.090 +526 Q 0.080 +527 S 0.071 +528 T 0.063 +529 L 0.057 +530 S 0.057 +531 E 0.065 +532 F 0.084 +533 Y 0.121 +534 P 0.176 +535 R 0.241 +536 D 0.301 +537 S 0.347 +538 A 0.377 +539 K 0.394 +540 H 0.401 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000006538.13_ENSMUST00000164097.4_GN:Ihh_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000006538.13_ENSMUST00000164097.4_GN:Ihh_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..545b92566e4cb1f74c52b0b31d7e0a153341f41b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000006538.13_ENSMUST00000164097.4_GN:Ihh_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,412 @@ +>ENSMUSG00000006538.13|ENSMUST00000164097.4|GN:Ihh|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.365 +2 S 0.373 +3 P 0.385 +4 A 0.394 +5 W 0.392 +6 L 0.378 +7 R 0.360 +8 P 0.335 +9 R 0.297 +10 L 0.256 +11 R 0.230 +12 F 0.222 +13 C 0.216 +14 L 0.205 +15 F 0.201 +16 L 0.207 +17 L 0.215 +18 L 0.222 +19 L 0.238 +20 L 0.267 +21 L 0.311 +22 V 0.365 +23 P 0.421 +24 A 0.463 +25 A 0.487 +26 R 0.508 +27 G 0.539 +28 C 0.573 +29 G 0.604 +30 P 0.630 +31 G 0.651 +32 R 0.666 +33 V 0.673 +34 V 0.669 +35 G 0.653 +36 S 0.626 +37 R 0.590 +38 R 0.555 +39 R 0.531 +40 P 0.515 +41 P 0.489 +42 R 0.441 +43 K 0.380 +44 L 0.320 +45 V 0.267 +46 P 0.226 +47 L 0.198 +48 A 0.175 +49 Y 0.151 +50 K 0.131 +51 Q 0.117 +52 F 0.110 +53 S 0.108 +54 P 0.111 +55 N 0.117 +56 V 0.121 +57 P 0.121 +58 E 0.122 +59 K 0.129 +60 T 0.141 +61 L 0.153 +62 G 0.164 +63 A 0.174 +64 S 0.177 +65 G 0.171 +66 R 0.163 +67 Y 0.159 +68 E 0.162 +69 G 0.170 +70 K 0.173 +71 I 0.168 +72 A 0.160 +73 R 0.154 +74 S 0.150 +75 S 0.147 +76 E 0.145 +77 R 0.149 +78 F 0.157 +79 K 0.165 +80 E 0.172 +81 L 0.180 +82 T 0.190 +83 P 0.202 +84 N 0.212 +85 Y 0.210 +86 N 0.196 +87 P 0.178 +88 D 0.165 +89 I 0.161 +90 I 0.166 +91 F 0.177 +92 K 0.192 +93 D 0.209 +94 E 0.225 +95 E 0.239 +96 N 0.252 +97 T 0.267 +98 G 0.269 +99 A 0.249 +100 D 0.209 +101 R 0.168 +102 L 0.140 +103 M 0.122 +104 T 0.104 +105 Q 0.085 +106 R 0.072 +107 C 0.070 +108 K 0.078 +109 D 0.084 +110 R 0.083 +111 L 0.077 +112 N 0.073 +113 S 0.073 +114 L 0.077 +115 A 0.081 +116 I 0.080 +117 S 0.073 +118 V 0.065 +119 M 0.060 +120 N 0.057 +121 Q 0.059 +122 W 0.068 +123 P 0.082 +124 G 0.094 +125 V 0.104 +126 K 0.115 +127 L 0.129 +128 R 0.149 +129 V 0.172 +130 T 0.193 +131 E 0.210 +132 G 0.220 +133 W 0.220 +134 D 0.212 +135 E 0.203 +136 D 0.202 +137 G 0.208 +138 H 0.214 +139 H 0.219 +140 S 0.229 +141 E 0.247 +142 E 0.266 +143 S 0.268 +144 L 0.248 +145 H 0.225 +146 Y 0.212 +147 E 0.200 +148 G 0.174 +149 R 0.138 +150 A 0.105 +151 V 0.084 +152 D 0.074 +153 I 0.070 +154 T 0.071 +155 T 0.076 +156 S 0.084 +157 D 0.092 +158 R 0.101 +159 D 0.108 +160 R 0.107 +161 N 0.097 +162 K 0.083 +163 Y 0.074 +164 G 0.073 +165 L 0.076 +166 L 0.076 +167 A 0.074 +168 R 0.070 +169 L 0.068 +170 A 0.069 +171 V 0.074 +172 E 0.084 +173 A 0.097 +174 G 0.109 +175 F 0.113 +176 D 0.104 +177 W 0.089 +178 V 0.075 +179 Y 0.068 +180 Y 0.070 +181 E 0.075 +182 S 0.078 +183 K 0.074 +184 A 0.066 +185 H 0.058 +186 V 0.052 +187 H 0.051 +188 C 0.056 +189 S 0.069 +190 V 0.101 +191 K 0.159 +192 S 0.235 +193 E 0.308 +194 H 0.361 +195 S 0.391 +196 A 0.400 +197 A 0.389 +198 A 0.359 +199 K 0.309 +200 T 0.244 +201 G 0.177 +202 G 0.125 +203 C 0.093 +204 F 0.076 +205 P 0.067 +206 A 0.059 +207 G 0.051 +208 A 0.044 +209 Q 0.039 +210 V 0.036 +211 R 0.037 +212 L 0.042 +213 E 0.052 +214 N 0.065 +215 G 0.076 +216 E 0.080 +217 R 0.077 +218 V 0.071 +219 A 0.068 +220 L 0.073 +221 S 0.084 +222 A 0.094 +223 V 0.094 +224 K 0.084 +225 P 0.075 +226 G 0.074 +227 D 0.080 +228 R 0.089 +229 V 0.097 +230 L 0.104 +231 A 0.109 +232 M 0.114 +233 G 0.117 +234 E 0.115 +235 D 0.112 +236 G 0.109 +237 T 0.105 +238 P 0.094 +239 T 0.075 +240 F 0.056 +241 S 0.044 +242 D 0.040 +243 V 0.041 +244 L 0.043 +245 I 0.047 +246 F 0.054 +247 L 0.059 +248 D 0.062 +249 R 0.063 +250 E 0.062 +251 P 0.060 +252 N 0.059 +253 R 0.058 +254 L 0.054 +255 R 0.048 +256 A 0.042 +257 F 0.038 +258 Q 0.035 +259 V 0.036 +260 I 0.040 +261 E 0.046 +262 T 0.051 +263 Q 0.052 +264 D 0.052 +265 P 0.054 +266 P 0.059 +267 R 0.062 +268 R 0.059 +269 L 0.054 +270 A 0.052 +271 L 0.057 +272 T 0.065 +273 P 0.070 +274 A 0.067 +275 H 0.059 +276 L 0.051 +277 L 0.048 +278 F 0.054 +279 I 0.067 +280 A 0.083 +281 D 0.096 +282 N 0.100 +283 H 0.099 +284 T 0.098 +285 E 0.097 +286 P 0.094 +287 A 0.091 +288 A 0.090 +289 H 0.091 +290 F 0.088 +291 R 0.079 +292 A 0.066 +293 T 0.055 +294 F 0.054 +295 A 0.062 +296 S 0.075 +297 H 0.084 +298 V 0.082 +299 Q 0.071 +300 P 0.060 +301 G 0.055 +302 Q 0.057 +303 Y 0.062 +304 V 0.070 +305 L 0.079 +306 V 0.087 +307 S 0.093 +308 G 0.099 +309 V 0.103 +310 P 0.106 +311 G 0.108 +312 L 0.108 +313 Q 0.102 +314 P 0.089 +315 A 0.073 +316 R 0.060 +317 V 0.055 +318 A 0.056 +319 A 0.059 +320 V 0.063 +321 S 0.068 +322 T 0.074 +323 H 0.079 +324 V 0.083 +325 A 0.084 +326 L 0.083 +327 G 0.080 +328 S 0.076 +329 Y 0.074 +330 A 0.075 +331 P 0.077 +332 L 0.081 +333 T 0.095 +334 R 0.118 +335 H 0.137 +336 G 0.137 +337 T 0.123 +338 L 0.114 +339 V 0.111 +340 V 0.108 +341 E 0.100 +342 D 0.090 +343 V 0.080 +344 V 0.073 +345 A 0.071 +346 S 0.078 +347 C 0.093 +348 F 0.109 +349 A 0.120 +350 A 0.124 +351 V 0.120 +352 A 0.114 +353 D 0.107 +354 H 0.101 +355 H 0.099 +356 L 0.103 +357 A 0.111 +358 Q 0.124 +359 L 0.136 +360 A 0.144 +361 F 0.145 +362 W 0.139 +363 P 0.132 +364 L 0.126 +365 R 0.125 +366 L 0.136 +367 F 0.161 +368 P 0.199 +369 S 0.236 +370 L 0.266 +371 A 0.290 +372 W 0.314 +373 G 0.340 +374 S 0.363 +375 W 0.373 +376 T 0.369 +377 P 0.351 +378 S 0.328 +379 E 0.306 +380 G 0.289 +381 V 0.273 +382 H 0.249 +383 W 0.211 +384 Y 0.172 +385 P 0.146 +386 Q 0.131 +387 M 0.127 +388 L 0.130 +389 Y 0.134 +390 R 0.138 +391 L 0.142 +392 G 0.149 +393 R 0.158 +394 L 0.172 +395 L 0.202 +396 L 0.255 +397 E 0.321 +398 E 0.375 +399 S 0.404 +400 T 0.424 +401 F 0.454 +402 H 0.496 +403 P 0.539 +404 L 0.573 +405 G 0.602 +406 M 0.631 +407 S 0.658 +408 G 0.669 +409 A 0.650 +410 G 0.605 +411 S 0.564 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000006538.13_ENSMUST00000164097.4_GN:Ihh_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:38.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000006538.13_ENSMUST00000164097.4_GN:Ihh_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:38.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ee978cf2a4e5371669500c723119854daf461541 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000006538.13_ENSMUST00000164097.4_GN:Ihh_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:38.caid @@ -0,0 +1,450 @@ +>ENSMUSG00000006538.13|ENSMUST00000164097.4|GN:Ihh|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:38 +1 M 0.375 +2 E 0.395 +3 S 0.426 +4 P 0.439 +5 R 0.409 +6 A 0.357 +7 T 0.336 +8 Q 0.358 +9 T 0.389 +10 P 0.419 +11 E 0.463 +12 S 0.508 +13 P 0.525 +14 K 0.508 +15 L 0.468 +16 S 0.428 +17 Q 0.421 +18 P 0.441 +19 R 0.449 +20 A 0.445 +21 H 0.454 +22 L 0.470 +23 S 0.471 +24 A 0.478 +25 H 0.516 +26 Q 0.565 +27 A 0.595 +28 P 0.602 +29 S 0.592 +30 P 0.569 +31 A 0.558 +32 A 0.585 +33 L 0.635 +34 P 0.677 +35 G 0.700 +36 Y 0.706 +37 P 0.694 +38 A 0.663 +39 M 0.618 +40 S 0.570 +41 P 0.525 +42 A 0.485 +43 W 0.454 +44 L 0.430 +45 R 0.402 +46 P 0.367 +47 R 0.328 +48 L 0.295 +49 R 0.275 +50 F 0.267 +51 C 0.259 +52 L 0.244 +53 F 0.231 +54 L 0.228 +55 L 0.229 +56 L 0.230 +57 L 0.240 +58 L 0.269 +59 L 0.318 +60 V 0.383 +61 P 0.450 +62 A 0.501 +63 A 0.533 +64 R 0.561 +65 G 0.594 +66 C 0.628 +67 G 0.658 +68 P 0.686 +69 G 0.710 +70 R 0.726 +71 V 0.732 +72 V 0.727 +73 G 0.708 +74 S 0.676 +75 R 0.633 +76 R 0.589 +77 R 0.557 +78 P 0.535 +79 P 0.504 +80 R 0.448 +81 K 0.380 +82 L 0.314 +83 V 0.259 +84 P 0.219 +85 L 0.192 +86 A 0.169 +87 Y 0.145 +88 K 0.125 +89 Q 0.111 +90 F 0.104 +91 S 0.102 +92 P 0.105 +93 N 0.112 +94 V 0.116 +95 P 0.116 +96 E 0.117 +97 K 0.124 +98 T 0.135 +99 L 0.147 +100 G 0.159 +101 A 0.169 +102 S 0.172 +103 G 0.167 +104 R 0.160 +105 Y 0.157 +106 E 0.162 +107 G 0.170 +108 K 0.173 +109 I 0.168 +110 A 0.159 +111 R 0.152 +112 S 0.147 +113 S 0.145 +114 E 0.145 +115 R 0.150 +116 F 0.159 +117 K 0.167 +118 E 0.173 +119 L 0.180 +120 T 0.192 +121 P 0.205 +122 N 0.214 +123 Y 0.212 +124 N 0.196 +125 P 0.178 +126 D 0.166 +127 I 0.163 +128 I 0.167 +129 F 0.175 +130 K 0.188 +131 D 0.203 +132 E 0.218 +133 E 0.233 +134 N 0.249 +135 T 0.265 +136 G 0.269 +137 A 0.251 +138 D 0.212 +139 R 0.171 +140 L 0.141 +141 M 0.121 +142 T 0.102 +143 Q 0.083 +144 R 0.070 +145 C 0.066 +146 K 0.069 +147 D 0.073 +148 R 0.074 +149 L 0.072 +150 N 0.071 +151 S 0.069 +152 L 0.068 +153 A 0.064 +154 I 0.059 +155 S 0.056 +156 V 0.056 +157 M 0.057 +158 N 0.057 +159 Q 0.060 +160 W 0.070 +161 P 0.085 +162 G 0.098 +163 V 0.108 +164 K 0.119 +165 L 0.134 +166 R 0.153 +167 V 0.176 +168 T 0.198 +169 E 0.214 +170 G 0.225 +171 W 0.227 +172 D 0.218 +173 E 0.209 +174 D 0.207 +175 G 0.212 +176 H 0.217 +177 H 0.221 +178 S 0.230 +179 E 0.249 +180 E 0.269 +181 S 0.271 +182 L 0.249 +183 H 0.222 +184 Y 0.207 +185 E 0.195 +186 G 0.170 +187 R 0.135 +188 A 0.104 +189 V 0.084 +190 D 0.074 +191 I 0.070 +192 T 0.070 +193 T 0.074 +194 S 0.081 +195 D 0.089 +196 R 0.098 +197 D 0.104 +198 R 0.103 +199 N 0.093 +200 K 0.080 +201 Y 0.072 +202 G 0.072 +203 L 0.075 +204 L 0.075 +205 A 0.072 +206 R 0.069 +207 L 0.067 +208 A 0.067 +209 V 0.071 +210 E 0.080 +211 A 0.093 +212 G 0.104 +213 F 0.108 +214 D 0.100 +215 W 0.086 +216 V 0.072 +217 Y 0.066 +218 Y 0.067 +219 E 0.071 +220 S 0.073 +221 K 0.069 +222 A 0.061 +223 H 0.053 +224 V 0.049 +225 H 0.048 +226 C 0.053 +227 S 0.066 +228 V 0.097 +229 K 0.155 +230 S 0.231 +231 E 0.305 +232 H 0.361 +233 S 0.395 +234 A 0.405 +235 A 0.394 +236 A 0.363 +237 K 0.313 +238 T 0.248 +239 G 0.180 +240 G 0.127 +241 C 0.094 +242 F 0.077 +243 P 0.067 +244 A 0.058 +245 G 0.050 +246 A 0.043 +247 Q 0.038 +248 V 0.035 +249 R 0.035 +250 L 0.039 +251 E 0.049 +252 N 0.061 +253 G 0.071 +254 E 0.075 +255 R 0.072 +256 V 0.067 +257 A 0.065 +258 L 0.070 +259 S 0.081 +260 A 0.090 +261 V 0.090 +262 K 0.083 +263 P 0.075 +264 G 0.073 +265 D 0.079 +266 R 0.086 +267 V 0.092 +268 L 0.098 +269 A 0.102 +270 M 0.106 +271 G 0.108 +272 E 0.106 +273 D 0.104 +274 G 0.102 +275 T 0.099 +276 P 0.090 +277 T 0.073 +278 F 0.054 +279 S 0.043 +280 D 0.040 +281 V 0.041 +282 L 0.043 +283 I 0.048 +284 F 0.055 +285 L 0.060 +286 D 0.062 +287 R 0.062 +288 E 0.061 +289 P 0.060 +290 N 0.059 +291 R 0.057 +292 L 0.053 +293 R 0.047 +294 A 0.041 +295 F 0.036 +296 Q 0.033 +297 V 0.034 +298 I 0.037 +299 E 0.043 +300 T 0.048 +301 Q 0.050 +302 D 0.051 +303 P 0.053 +304 P 0.058 +305 R 0.061 +306 R 0.058 +307 L 0.053 +308 A 0.052 +309 L 0.057 +310 T 0.065 +311 P 0.071 +312 A 0.068 +313 H 0.059 +314 L 0.051 +315 L 0.048 +316 F 0.052 +317 I 0.065 +318 A 0.081 +319 D 0.092 +320 N 0.095 +321 H 0.094 +322 T 0.093 +323 E 0.093 +324 P 0.091 +325 A 0.089 +326 A 0.089 +327 H 0.090 +328 F 0.087 +329 R 0.079 +330 A 0.066 +331 T 0.056 +332 F 0.054 +333 A 0.063 +334 S 0.076 +335 H 0.084 +336 V 0.082 +337 Q 0.071 +338 P 0.060 +339 G 0.055 +340 Q 0.057 +341 Y 0.063 +342 V 0.071 +343 L 0.080 +344 V 0.087 +345 S 0.094 +346 G 0.100 +347 V 0.103 +348 P 0.105 +349 G 0.107 +350 L 0.107 +351 Q 0.101 +352 P 0.088 +353 A 0.072 +354 R 0.060 +355 V 0.054 +356 A 0.055 +357 A 0.058 +358 V 0.063 +359 S 0.068 +360 T 0.074 +361 H 0.079 +362 V 0.082 +363 A 0.084 +364 L 0.084 +365 G 0.082 +366 S 0.078 +367 Y 0.076 +368 A 0.076 +369 P 0.078 +370 L 0.082 +371 T 0.095 +372 R 0.118 +373 H 0.137 +374 G 0.137 +375 T 0.124 +376 L 0.114 +377 V 0.112 +378 V 0.109 +379 E 0.100 +380 D 0.090 +381 V 0.081 +382 V 0.074 +383 A 0.072 +384 S 0.080 +385 C 0.095 +386 F 0.110 +387 A 0.120 +388 A 0.122 +389 V 0.118 +390 A 0.112 +391 D 0.104 +392 H 0.098 +393 H 0.096 +394 L 0.099 +395 A 0.108 +396 Q 0.121 +397 L 0.134 +398 A 0.142 +399 F 0.143 +400 W 0.138 +401 P 0.131 +402 L 0.126 +403 R 0.125 +404 L 0.135 +405 F 0.161 +406 P 0.198 +407 S 0.235 +408 L 0.264 +409 A 0.287 +410 W 0.312 +411 G 0.339 +412 S 0.363 +413 W 0.376 +414 T 0.372 +415 P 0.354 +416 S 0.330 +417 E 0.308 +418 G 0.291 +419 V 0.275 +420 H 0.252 +421 W 0.214 +422 Y 0.175 +423 P 0.148 +424 Q 0.134 +425 M 0.130 +426 L 0.133 +427 Y 0.137 +428 R 0.139 +429 L 0.143 +430 G 0.151 +431 R 0.163 +432 L 0.179 +433 L 0.209 +434 L 0.261 +435 E 0.325 +436 E 0.379 +437 S 0.408 +438 T 0.428 +439 F 0.458 +440 H 0.499 +441 P 0.541 +442 L 0.575 +443 G 0.605 +444 M 0.635 +445 S 0.662 +446 G 0.674 +447 A 0.658 +448 G 0.616 +449 S 0.577 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000007480.7_ENSMUST00000172148.5_GN:Mc5r_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000007480.7_ENSMUST00000172148.5_GN:Mc5r_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..645a474700c191725ff5019372241d982ff2b188 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000007480.7_ENSMUST00000172148.5_GN:Mc5r_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,326 @@ +>ENSMUSG00000007480.7|ENSMUST00000172148.5|GN:Mc5r|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.338 +2 N 0.332 +3 S 0.323 +4 S 0.309 +5 S 0.283 +6 T 0.253 +7 L 0.233 +8 T 0.234 +9 V 0.242 +10 L 0.246 +11 N 0.251 +12 L 0.269 +13 T 0.299 +14 L 0.332 +15 N 0.362 +16 A 0.389 +17 S 0.412 +18 E 0.434 +19 D 0.455 +20 G 0.468 +21 I 0.467 +22 L 0.462 +23 G 0.462 +24 S 0.461 +25 N 0.451 +26 V 0.431 +27 K 0.399 +28 N 0.361 +29 K 0.319 +30 S 0.272 +31 L 0.225 +32 A 0.186 +33 C 0.163 +34 E 0.155 +35 E 0.151 +36 M 0.135 +37 G 0.106 +38 I 0.076 +39 A 0.056 +40 V 0.043 +41 E 0.033 +42 V 0.025 +43 F 0.023 +44 L 0.024 +45 T 0.028 +46 L 0.033 +47 G 0.036 +48 L 0.041 +49 V 0.047 +50 S 0.052 +51 L 0.051 +52 L 0.049 +53 E 0.050 +54 N 0.051 +55 I 0.052 +56 L 0.052 +57 V 0.054 +58 I 0.056 +59 G 0.057 +60 A 0.056 +61 I 0.054 +62 V 0.054 +63 K 0.059 +64 N 0.064 +65 K 0.068 +66 N 0.069 +67 L 0.067 +68 H 0.065 +69 S 0.059 +70 P 0.049 +71 M 0.037 +72 Y 0.027 +73 F 0.023 +74 F 0.024 +75 V 0.030 +76 G 0.039 +77 S 0.045 +78 L 0.048 +79 A 0.048 +80 V 0.049 +81 A 0.048 +82 D 0.044 +83 M 0.037 +84 L 0.029 +85 V 0.024 +86 S 0.022 +87 M 0.022 +88 S 0.022 +89 N 0.022 +90 A 0.022 +91 W 0.022 +92 E 0.020 +93 T 0.019 +94 V 0.018 +95 T 0.020 +96 I 0.024 +97 Y 0.031 +98 L 0.041 +99 L 0.060 +100 N 0.089 +101 N 0.124 +102 K 0.152 +103 H 0.164 +104 L 0.161 +105 V 0.151 +106 I 0.137 +107 A 0.121 +108 D 0.101 +109 T 0.085 +110 F 0.077 +111 V 0.075 +112 R 0.073 +113 H 0.071 +114 I 0.066 +115 D 0.057 +116 N 0.046 +117 V 0.039 +118 F 0.035 +119 D 0.036 +120 S 0.038 +121 M 0.036 +122 I 0.033 +123 C 0.032 +124 I 0.034 +125 S 0.037 +126 V 0.038 +127 V 0.038 +128 A 0.038 +129 S 0.037 +130 M 0.034 +131 C 0.033 +132 S 0.034 +133 L 0.036 +134 L 0.035 +135 A 0.034 +136 I 0.035 +137 A 0.039 +138 V 0.046 +139 D 0.051 +140 R 0.051 +141 Y 0.047 +142 I 0.042 +143 T 0.040 +144 I 0.041 +145 F 0.045 +146 Y 0.048 +147 A 0.048 +148 L 0.047 +149 R 0.048 +150 Y 0.049 +151 H 0.049 +152 H 0.051 +153 I 0.054 +154 M 0.056 +155 T 0.050 +156 A 0.041 +157 R 0.035 +158 R 0.038 +159 S 0.048 +160 G 0.062 +161 V 0.071 +162 I 0.067 +163 I 0.057 +164 A 0.050 +165 C 0.047 +166 I 0.046 +167 W 0.043 +168 T 0.037 +169 F 0.032 +170 C 0.030 +171 I 0.031 +172 S 0.036 +173 C 0.043 +174 G 0.048 +175 I 0.046 +176 V 0.041 +177 F 0.039 +178 I 0.042 +179 I 0.045 +180 Y 0.047 +181 Y 0.052 +182 E 0.063 +183 S 0.070 +184 K 0.066 +185 Y 0.055 +186 V 0.045 +187 I 0.037 +188 I 0.033 +189 C 0.032 +190 L 0.035 +191 I 0.040 +192 S 0.044 +193 M 0.045 +194 F 0.041 +195 F 0.037 +196 T 0.036 +197 M 0.036 +198 L 0.036 +199 F 0.035 +200 F 0.036 +201 M 0.037 +202 V 0.036 +203 S 0.032 +204 L 0.029 +205 Y 0.027 +206 I 0.027 +207 H 0.027 +208 M 0.027 +209 F 0.026 +210 L 0.028 +211 L 0.034 +212 A 0.049 +213 R 0.068 +214 N 0.084 +215 H 0.095 +216 V 0.106 +217 K 0.127 +218 R 0.161 +219 I 0.201 +220 A 0.238 +221 A 0.265 +222 S 0.281 +223 P 0.289 +224 R 0.291 +225 Y 0.279 +226 N 0.256 +227 S 0.226 +228 V 0.197 +229 R 0.173 +230 Q 0.157 +231 R 0.146 +232 T 0.138 +233 S 0.133 +234 M 0.125 +235 K 0.107 +236 G 0.082 +237 A 0.064 +238 I 0.058 +239 T 0.057 +240 L 0.055 +241 T 0.052 +242 M 0.052 +243 L 0.053 +244 L 0.054 +245 G 0.051 +246 I 0.045 +247 F 0.038 +248 I 0.029 +249 V 0.026 +250 C 0.029 +251 W 0.038 +252 S 0.044 +253 P 0.040 +254 F 0.031 +255 F 0.025 +256 L 0.024 +257 H 0.026 +258 L 0.026 +259 I 0.025 +260 L 0.027 +261 M 0.036 +262 I 0.053 +263 S 0.079 +264 C 0.106 +265 P 0.121 +266 Q 0.121 +267 N 0.111 +268 V 0.098 +269 Y 0.084 +270 C 0.069 +271 S 0.060 +272 C 0.059 +273 F 0.061 +274 M 0.061 +275 S 0.057 +276 Y 0.052 +277 F 0.046 +278 N 0.040 +279 M 0.038 +280 Y 0.038 +281 L 0.040 +282 I 0.043 +283 L 0.049 +284 I 0.056 +285 M 0.063 +286 C 0.071 +287 N 0.075 +288 S 0.072 +289 V 0.066 +290 I 0.060 +291 D 0.056 +292 P 0.052 +293 L 0.048 +294 I 0.044 +295 Y 0.042 +296 A 0.042 +297 L 0.047 +298 R 0.052 +299 S 0.052 +300 Q 0.046 +301 E 0.041 +302 M 0.043 +303 R 0.052 +304 R 0.063 +305 T 0.066 +306 F 0.065 +307 K 0.068 +308 E 0.077 +309 I 0.088 +310 V 0.109 +311 C 0.147 +312 C 0.208 +313 H 0.279 +314 G 0.343 +315 F 0.392 +316 R 0.437 +317 R 0.486 +318 P 0.529 +319 C 0.556 +320 R 0.572 +321 L 0.587 +322 L 0.596 +323 G 0.581 +324 G 0.540 +325 Y 0.499 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000007480.7_ENSMUST00000172148.5_GN:Mc5r_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:47.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000007480.7_ENSMUST00000172148.5_GN:Mc5r_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:47.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b996b6be8b3ef90149a8770f8db2fd9d3e8dff8a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000007480.7_ENSMUST00000172148.5_GN:Mc5r_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:47.caid @@ -0,0 +1,373 @@ +>ENSMUSG00000007480.7|ENSMUST00000172148.5|GN:Mc5r|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:47 +1 M 0.377 +2 Q 0.398 +3 D 0.430 +4 Q 0.461 +5 S 0.485 +6 P 0.499 +7 V 0.500 +8 N 0.482 +9 R 0.450 +10 R 0.434 +11 F 0.453 +12 N 0.475 +13 S 0.461 +14 Q 0.433 +15 K 0.442 +16 P 0.500 +17 P 0.576 +18 G 0.626 +19 T 0.632 +20 R 0.606 +21 E 0.573 +22 E 0.537 +23 S 0.494 +24 C 0.455 +25 L 0.436 +26 P 0.436 +27 L 0.444 +28 R 0.465 +29 G 0.487 +30 A 0.487 +31 E 0.472 +32 Q 0.480 +33 N 0.527 +34 G 0.566 +35 K 0.556 +36 S 0.511 +37 D 0.459 +38 A 0.420 +39 K 0.401 +40 K 0.405 +41 W 0.427 +42 G 0.454 +43 H 0.476 +44 S 0.498 +45 L 0.522 +46 P 0.541 +47 A 0.540 +48 M 0.521 +49 N 0.502 +50 S 0.487 +51 S 0.461 +52 S 0.417 +53 T 0.369 +54 L 0.344 +55 T 0.347 +56 V 0.361 +57 L 0.371 +58 N 0.384 +59 L 0.413 +60 T 0.460 +61 L 0.510 +62 N 0.547 +63 A 0.571 +64 S 0.588 +65 E 0.607 +66 D 0.626 +67 G 0.633 +68 I 0.624 +69 L 0.614 +70 G 0.617 +71 S 0.622 +72 N 0.612 +73 V 0.579 +74 K 0.528 +75 N 0.467 +76 K 0.398 +77 S 0.324 +78 L 0.257 +79 A 0.210 +80 C 0.184 +81 E 0.170 +82 E 0.156 +83 M 0.131 +84 G 0.099 +85 I 0.071 +86 A 0.053 +87 V 0.042 +88 E 0.033 +89 V 0.025 +90 F 0.022 +91 L 0.024 +92 T 0.028 +93 L 0.032 +94 G 0.035 +95 L 0.038 +96 V 0.044 +97 S 0.047 +98 L 0.047 +99 L 0.045 +100 E 0.047 +101 N 0.049 +102 I 0.050 +103 L 0.051 +104 V 0.053 +105 I 0.055 +106 G 0.055 +107 A 0.054 +108 I 0.051 +109 V 0.050 +110 K 0.052 +111 N 0.057 +112 K 0.061 +113 N 0.062 +114 L 0.061 +115 H 0.058 +116 S 0.053 +117 P 0.043 +118 M 0.032 +119 Y 0.025 +120 F 0.022 +121 F 0.024 +122 V 0.032 +123 G 0.041 +124 S 0.048 +125 L 0.049 +126 A 0.049 +127 V 0.049 +128 A 0.048 +129 D 0.045 +130 M 0.038 +131 L 0.030 +132 V 0.024 +133 S 0.022 +134 M 0.022 +135 S 0.022 +136 N 0.022 +137 A 0.023 +138 W 0.023 +139 E 0.021 +140 T 0.019 +141 V 0.019 +142 T 0.020 +143 I 0.024 +144 Y 0.030 +145 L 0.040 +146 L 0.058 +147 N 0.087 +148 N 0.124 +149 K 0.157 +150 H 0.176 +151 L 0.179 +152 V 0.171 +153 I 0.155 +154 A 0.134 +155 D 0.111 +156 T 0.094 +157 F 0.085 +158 V 0.081 +159 R 0.079 +160 H 0.076 +161 I 0.070 +162 D 0.059 +163 N 0.048 +164 V 0.039 +165 F 0.036 +166 D 0.037 +167 S 0.038 +168 M 0.037 +169 I 0.034 +170 C 0.032 +171 I 0.034 +172 S 0.037 +173 V 0.038 +174 V 0.038 +175 A 0.038 +176 S 0.036 +177 M 0.034 +178 C 0.032 +179 S 0.033 +180 L 0.034 +181 L 0.034 +182 A 0.033 +183 I 0.035 +184 A 0.041 +185 V 0.049 +186 D 0.054 +187 R 0.054 +188 Y 0.048 +189 I 0.042 +190 T 0.039 +191 I 0.039 +192 F 0.042 +193 Y 0.044 +194 A 0.045 +195 L 0.045 +196 R 0.045 +197 Y 0.046 +198 H 0.047 +199 H 0.048 +200 I 0.052 +201 M 0.053 +202 T 0.047 +203 A 0.038 +204 R 0.032 +205 R 0.035 +206 S 0.045 +207 G 0.059 +208 V 0.067 +209 I 0.063 +210 I 0.053 +211 A 0.045 +212 C 0.042 +213 I 0.042 +214 W 0.039 +215 T 0.034 +216 F 0.029 +217 C 0.027 +218 I 0.028 +219 S 0.032 +220 C 0.039 +221 G 0.043 +222 I 0.041 +223 V 0.036 +224 F 0.035 +225 I 0.037 +226 I 0.040 +227 Y 0.042 +228 Y 0.046 +229 E 0.055 +230 S 0.060 +231 K 0.057 +232 Y 0.047 +233 V 0.039 +234 I 0.033 +235 I 0.031 +236 C 0.031 +237 L 0.034 +238 I 0.039 +239 S 0.043 +240 M 0.043 +241 F 0.040 +242 F 0.037 +243 T 0.036 +244 M 0.037 +245 L 0.037 +246 F 0.037 +247 F 0.038 +248 M 0.039 +249 V 0.038 +250 S 0.033 +251 L 0.030 +252 Y 0.027 +253 I 0.027 +254 H 0.027 +255 M 0.027 +256 F 0.027 +257 L 0.028 +258 L 0.035 +259 A 0.049 +260 R 0.068 +261 N 0.085 +262 H 0.095 +263 V 0.107 +264 K 0.129 +265 R 0.163 +266 I 0.204 +267 A 0.242 +268 A 0.269 +269 S 0.284 +270 P 0.293 +271 R 0.294 +272 Y 0.283 +273 N 0.260 +274 S 0.230 +275 V 0.201 +276 R 0.177 +277 Q 0.162 +278 R 0.152 +279 T 0.143 +280 S 0.136 +281 M 0.129 +282 K 0.112 +283 G 0.087 +284 A 0.068 +285 I 0.061 +286 T 0.060 +287 L 0.058 +288 T 0.056 +289 M 0.056 +290 L 0.057 +291 L 0.057 +292 G 0.055 +293 I 0.049 +294 F 0.041 +295 I 0.032 +296 V 0.029 +297 C 0.032 +298 W 0.042 +299 S 0.048 +300 P 0.044 +301 F 0.034 +302 F 0.028 +303 L 0.028 +304 H 0.029 +305 L 0.029 +306 I 0.028 +307 L 0.031 +308 M 0.040 +309 I 0.059 +310 S 0.088 +311 C 0.117 +312 P 0.134 +313 Q 0.134 +314 N 0.126 +315 V 0.114 +316 Y 0.100 +317 C 0.084 +318 S 0.073 +319 C 0.072 +320 F 0.074 +321 M 0.072 +322 S 0.066 +323 Y 0.059 +324 F 0.051 +325 N 0.044 +326 M 0.041 +327 Y 0.041 +328 L 0.044 +329 I 0.048 +330 L 0.053 +331 I 0.061 +332 M 0.069 +333 C 0.077 +334 N 0.081 +335 S 0.078 +336 V 0.071 +337 I 0.065 +338 D 0.060 +339 P 0.055 +340 L 0.051 +341 I 0.047 +342 Y 0.044 +343 A 0.045 +344 L 0.050 +345 R 0.055 +346 S 0.054 +347 Q 0.047 +348 E 0.039 +349 M 0.033 +350 R 0.032 +351 R 0.037 +352 T 0.045 +353 F 0.055 +354 K 0.065 +355 E 0.076 +356 I 0.087 +357 V 0.106 +358 C 0.142 +359 C 0.202 +360 H 0.275 +361 G 0.342 +362 F 0.395 +363 R 0.442 +364 R 0.493 +365 P 0.539 +366 C 0.568 +367 R 0.585 +368 L 0.601 +369 L 0.609 +370 G 0.593 +371 G 0.550 +372 Y 0.509 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000014164.16_ENSMUST00000160860.9_GN:Klhl3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000014164.16_ENSMUST00000160860.9_GN:Klhl3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4947e92721d6bf06f994e8bfef4d030293193200 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000014164.16_ENSMUST00000160860.9_GN:Klhl3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,588 @@ +>ENSMUSG00000014164.16|ENSMUST00000160860.9|GN:Klhl3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.415 +2 E 0.421 +3 G 0.423 +4 E 0.408 +5 S 0.366 +6 V 0.325 +7 K 0.327 +8 P 0.373 +9 S 0.429 +10 P 0.471 +11 Q 0.497 +12 P 0.495 +13 T 0.456 +14 A 0.412 +15 Q 0.403 +16 A 0.420 +17 E 0.432 +18 D 0.429 +19 E 0.423 +20 E 0.421 +21 K 0.423 +22 N 0.418 +23 R 0.399 +24 R 0.373 +25 T 0.352 +26 V 0.338 +27 T 0.320 +28 V 0.292 +29 N 0.257 +30 A 0.224 +31 A 0.196 +32 H 0.172 +33 M 0.147 +34 G 0.119 +35 K 0.095 +36 A 0.076 +37 F 0.064 +38 K 0.059 +39 V 0.060 +40 M 0.067 +41 N 0.080 +42 E 0.091 +43 L 0.092 +44 R 0.086 +45 S 0.081 +46 K 0.084 +47 R 0.094 +48 L 0.105 +49 L 0.104 +50 C 0.091 +51 D 0.072 +52 V 0.054 +53 M 0.044 +54 I 0.044 +55 V 0.052 +56 A 0.063 +57 E 0.072 +58 D 0.079 +59 V 0.083 +60 E 0.080 +61 V 0.073 +62 E 0.071 +63 A 0.075 +64 H 0.075 +65 R 0.067 +66 V 0.059 +67 V 0.058 +68 L 0.062 +69 A 0.066 +70 A 0.064 +71 C 0.056 +72 S 0.047 +73 P 0.040 +74 Y 0.039 +75 F 0.046 +76 C 0.060 +77 A 0.073 +78 M 0.084 +79 F 0.102 +80 T 0.129 +81 G 0.154 +82 D 0.161 +83 M 0.154 +84 S 0.147 +85 E 0.143 +86 S 0.136 +87 K 0.125 +88 A 0.115 +89 K 0.107 +90 K 0.105 +91 I 0.109 +92 E 0.117 +93 I 0.121 +94 K 0.118 +95 D 0.113 +96 V 0.109 +97 D 0.100 +98 G 0.083 +99 Q 0.066 +100 T 0.060 +101 L 0.061 +102 S 0.064 +103 K 0.064 +104 L 0.064 +105 I 0.066 +106 D 0.067 +107 Y 0.064 +108 I 0.061 +109 Y 0.060 +110 T 0.064 +111 A 0.071 +112 E 0.077 +113 I 0.080 +114 E 0.078 +115 V 0.072 +116 T 0.066 +117 E 0.062 +118 E 0.061 +119 N 0.060 +120 V 0.057 +121 Q 0.055 +122 V 0.055 +123 L 0.056 +124 L 0.053 +125 P 0.050 +126 A 0.050 +127 A 0.054 +128 S 0.057 +129 L 0.058 +130 L 0.059 +131 Q 0.059 +132 L 0.056 +133 M 0.052 +134 D 0.049 +135 V 0.049 +136 R 0.052 +137 Q 0.054 +138 N 0.059 +139 C 0.070 +140 C 0.083 +141 D 0.088 +142 F 0.082 +143 L 0.074 +144 Q 0.068 +145 S 0.066 +146 Q 0.068 +147 L 0.070 +148 H 0.070 +149 P 0.068 +150 T 0.062 +151 N 0.053 +152 C 0.046 +153 L 0.044 +154 G 0.045 +155 I 0.047 +156 R 0.048 +157 A 0.051 +158 F 0.059 +159 A 0.067 +160 D 0.070 +161 V 0.070 +162 H 0.069 +163 T 0.067 +164 C 0.063 +165 T 0.058 +166 D 0.058 +167 L 0.064 +168 L 0.075 +169 Q 0.081 +170 Q 0.081 +171 A 0.080 +172 N 0.082 +173 A 0.082 +174 Y 0.072 +175 A 0.061 +176 E 0.054 +177 Q 0.049 +178 H 0.042 +179 F 0.038 +180 P 0.041 +181 E 0.048 +182 V 0.052 +183 M 0.051 +184 L 0.050 +185 G 0.052 +186 E 0.053 +187 E 0.051 +188 F 0.045 +189 L 0.040 +190 S 0.037 +191 L 0.037 +192 S 0.037 +193 L 0.035 +194 D 0.033 +195 Q 0.031 +196 V 0.032 +197 C 0.038 +198 S 0.050 +199 L 0.064 +200 I 0.078 +201 S 0.093 +202 S 0.105 +203 D 0.106 +204 K 0.093 +205 L 0.072 +206 T 0.053 +207 V 0.040 +208 S 0.036 +209 S 0.041 +210 E 0.050 +211 E 0.059 +212 K 0.064 +213 V 0.066 +214 F 0.065 +215 E 0.062 +216 A 0.057 +217 V 0.052 +218 I 0.053 +219 S 0.060 +220 W 0.065 +221 I 0.064 +222 N 0.058 +223 Y 0.050 +224 E 0.043 +225 K 0.037 +226 E 0.034 +227 T 0.034 +228 R 0.035 +229 L 0.037 +230 D 0.041 +231 H 0.043 +232 M 0.044 +233 A 0.044 +234 K 0.044 +235 L 0.045 +236 M 0.048 +237 E 0.051 +238 H 0.052 +239 V 0.054 +240 R 0.056 +241 L 0.059 +242 P 0.061 +243 L 0.062 +244 L 0.062 +245 P 0.064 +246 R 0.067 +247 D 0.067 +248 Y 0.063 +249 L 0.060 +250 V 0.065 +251 Q 0.072 +252 T 0.073 +253 V 0.070 +254 E 0.062 +255 E 0.053 +256 E 0.046 +257 A 0.045 +258 L 0.047 +259 I 0.049 +260 K 0.049 +261 N 0.048 +262 N 0.046 +263 N 0.045 +264 T 0.046 +265 C 0.053 +266 K 0.065 +267 D 0.076 +268 F 0.080 +269 L 0.084 +270 I 0.086 +271 E 0.084 +272 A 0.075 +273 M 0.065 +274 K 0.057 +275 Y 0.054 +276 H 0.058 +277 L 0.070 +278 L 0.088 +279 P 0.106 +280 L 0.118 +281 D 0.124 +282 Q 0.130 +283 R 0.141 +284 L 0.163 +285 L 0.187 +286 I 0.198 +287 K 0.190 +288 N 0.169 +289 P 0.149 +290 R 0.143 +291 T 0.156 +292 K 0.179 +293 P 0.205 +294 R 0.233 +295 T 0.263 +296 P 0.287 +297 V 0.294 +298 S 0.280 +299 L 0.241 +300 P 0.182 +301 K 0.118 +302 V 0.067 +303 M 0.040 +304 I 0.034 +305 V 0.044 +306 V 0.066 +307 G 0.094 +308 G 0.118 +309 Q 0.124 +310 A 0.117 +311 P 0.117 +312 K 0.129 +313 A 0.138 +314 I 0.132 +315 R 0.116 +316 S 0.101 +317 V 0.088 +318 E 0.078 +319 C 0.068 +320 Y 0.062 +321 D 0.058 +322 F 0.059 +323 E 0.065 +324 E 0.075 +325 G 0.083 +326 R 0.085 +327 W 0.083 +328 D 0.084 +329 Q 0.086 +330 I 0.086 +331 A 0.083 +332 E 0.078 +333 L 0.072 +334 P 0.065 +335 S 0.063 +336 R 0.069 +337 R 0.081 +338 C 0.096 +339 R 0.104 +340 A 0.103 +341 G 0.095 +342 V 0.086 +343 V 0.080 +344 F 0.077 +345 M 0.074 +346 A 0.067 +347 G 0.053 +348 H 0.037 +349 V 0.025 +350 Y 0.024 +351 A 0.031 +352 V 0.043 +353 G 0.055 +354 G 0.066 +355 F 0.075 +356 N 0.080 +357 G 0.088 +358 S 0.101 +359 L 0.119 +360 R 0.130 +361 V 0.129 +362 R 0.122 +363 T 0.110 +364 V 0.093 +365 D 0.075 +366 V 0.063 +367 Y 0.060 +368 D 0.060 +369 G 0.060 +370 V 0.057 +371 K 0.057 +372 D 0.062 +373 Q 0.068 +374 W 0.070 +375 T 0.070 +376 S 0.073 +377 I 0.079 +378 A 0.086 +379 S 0.090 +380 M 0.088 +381 Q 0.086 +382 E 0.088 +383 R 0.093 +384 R 0.101 +385 S 0.110 +386 T 0.117 +387 L 0.118 +388 G 0.106 +389 A 0.087 +390 A 0.076 +391 V 0.076 +392 L 0.077 +393 N 0.068 +394 D 0.052 +395 L 0.035 +396 L 0.025 +397 Y 0.026 +398 A 0.036 +399 V 0.052 +400 G 0.070 +401 G 0.086 +402 F 0.096 +403 D 0.098 +404 G 0.097 +405 S 0.104 +406 T 0.119 +407 G 0.130 +408 L 0.133 +409 A 0.129 +410 S 0.120 +411 V 0.106 +412 E 0.090 +413 A 0.072 +414 Y 0.056 +415 S 0.044 +416 Y 0.039 +417 K 0.041 +418 T 0.050 +419 N 0.061 +420 E 0.070 +421 W 0.074 +422 F 0.079 +423 F 0.088 +424 V 0.097 +425 A 0.104 +426 P 0.106 +427 M 0.100 +428 N 0.092 +429 T 0.090 +430 R 0.093 +431 R 0.102 +432 S 0.118 +433 S 0.140 +434 V 0.154 +435 G 0.147 +436 V 0.128 +437 G 0.112 +438 V 0.107 +439 V 0.107 +440 E 0.099 +441 G 0.082 +442 K 0.059 +443 L 0.041 +444 Y 0.037 +445 A 0.048 +446 V 0.066 +447 G 0.089 +448 G 0.114 +449 Y 0.136 +450 D 0.145 +451 G 0.141 +452 A 0.131 +453 S 0.127 +454 R 0.133 +455 Q 0.144 +456 C 0.151 +457 L 0.149 +458 S 0.141 +459 T 0.128 +460 V 0.111 +461 E 0.094 +462 Q 0.079 +463 Y 0.071 +464 N 0.073 +465 P 0.084 +466 A 0.096 +467 T 0.102 +468 N 0.103 +469 E 0.103 +470 W 0.103 +471 I 0.105 +472 Y 0.109 +473 V 0.111 +474 A 0.111 +475 D 0.110 +476 M 0.107 +477 S 0.105 +478 T 0.109 +479 R 0.122 +480 R 0.141 +481 S 0.161 +482 G 0.173 +483 A 0.174 +484 G 0.165 +485 V 0.150 +486 G 0.136 +487 V 0.126 +488 L 0.120 +489 S 0.116 +490 G 0.106 +491 Q 0.085 +492 L 0.060 +493 Y 0.046 +494 A 0.051 +495 T 0.068 +496 G 0.092 +497 G 0.114 +498 H 0.125 +499 D 0.123 +500 G 0.116 +501 P 0.115 +502 L 0.123 +503 V 0.128 +504 R 0.128 +505 K 0.126 +506 S 0.121 +507 V 0.112 +508 E 0.099 +509 V 0.088 +510 Y 0.081 +511 D 0.080 +512 P 0.084 +513 G 0.090 +514 T 0.096 +515 N 0.100 +516 T 0.102 +517 W 0.102 +518 K 0.105 +519 Q 0.111 +520 V 0.116 +521 A 0.116 +522 D 0.111 +523 M 0.102 +524 N 0.093 +525 M 0.091 +526 C 0.104 +527 R 0.130 +528 R 0.156 +529 N 0.168 +530 A 0.164 +531 G 0.149 +532 V 0.130 +533 C 0.116 +534 A 0.109 +535 V 0.109 +536 N 0.110 +537 G 0.103 +538 L 0.082 +539 L 0.058 +540 Y 0.046 +541 V 0.052 +542 V 0.067 +543 G 0.083 +544 G 0.099 +545 D 0.113 +546 D 0.120 +547 G 0.121 +548 S 0.121 +549 C 0.125 +550 N 0.137 +551 L 0.152 +552 A 0.158 +553 S 0.146 +554 V 0.123 +555 E 0.096 +556 Y 0.075 +557 Y 0.065 +558 N 0.067 +559 P 0.077 +560 V 0.085 +561 T 0.086 +562 D 0.084 +563 K 0.083 +564 W 0.081 +565 T 0.081 +566 L 0.082 +567 L 0.084 +568 P 0.086 +569 T 0.087 +570 N 0.086 +571 M 0.085 +572 S 0.090 +573 T 0.102 +574 G 0.118 +575 R 0.133 +576 S 0.144 +577 Y 0.145 +578 A 0.134 +579 G 0.113 +580 V 0.092 +581 A 0.078 +582 V 0.070 +583 I 0.066 +584 H 0.067 +585 K 0.075 +586 S 0.088 +587 L 0.099 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000014164.16_ENSMUST00000160860.9_GN:Klhl3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000014164.16_ENSMUST00000160860.9_GN:Klhl3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..65917e41c908e837e1f8b9ca1c6a9255f2c23fc1 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000014164.16_ENSMUST00000160860.9_GN:Klhl3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid @@ -0,0 +1,598 @@ +>ENSMUSG00000014164.16|ENSMUST00000160860.9|GN:Klhl3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:10 +1 M 0.342 +2 T 0.335 +3 T 0.341 +4 N 0.364 +5 P 0.386 +6 A 0.408 +7 G 0.441 +8 P 0.468 +9 P 0.461 +10 T 0.443 +11 M 0.447 +12 E 0.459 +13 G 0.446 +14 E 0.420 +15 S 0.411 +16 V 0.416 +17 K 0.422 +18 P 0.436 +19 S 0.459 +20 P 0.488 +21 Q 0.521 +22 P 0.550 +23 T 0.557 +24 A 0.539 +25 Q 0.514 +26 A 0.499 +27 E 0.489 +28 D 0.472 +29 E 0.452 +30 E 0.440 +31 K 0.438 +32 N 0.433 +33 R 0.414 +34 R 0.385 +35 T 0.363 +36 V 0.346 +37 T 0.323 +38 V 0.290 +39 N 0.253 +40 A 0.220 +41 A 0.194 +42 H 0.172 +43 M 0.149 +44 G 0.122 +45 K 0.098 +46 A 0.078 +47 F 0.066 +48 K 0.060 +49 V 0.060 +50 M 0.068 +51 N 0.080 +52 E 0.091 +53 L 0.092 +54 R 0.086 +55 S 0.081 +56 K 0.083 +57 R 0.093 +58 L 0.103 +59 L 0.102 +60 C 0.089 +61 D 0.070 +62 V 0.053 +63 M 0.043 +64 I 0.043 +65 V 0.051 +66 A 0.062 +67 E 0.071 +68 D 0.078 +69 V 0.081 +70 E 0.078 +71 V 0.071 +72 E 0.069 +73 A 0.073 +74 H 0.074 +75 R 0.066 +76 V 0.058 +77 V 0.057 +78 L 0.060 +79 A 0.063 +80 A 0.061 +81 C 0.054 +82 S 0.045 +83 P 0.038 +84 Y 0.035 +85 F 0.036 +86 C 0.041 +87 A 0.049 +88 M 0.065 +89 F 0.090 +90 T 0.123 +91 G 0.149 +92 D 0.157 +93 M 0.151 +94 S 0.145 +95 E 0.142 +96 S 0.135 +97 K 0.123 +98 A 0.113 +99 K 0.105 +100 K 0.104 +101 I 0.109 +102 E 0.117 +103 I 0.120 +104 K 0.117 +105 D 0.112 +106 V 0.108 +107 D 0.099 +108 G 0.082 +109 Q 0.066 +110 T 0.059 +111 L 0.061 +112 S 0.063 +113 K 0.063 +114 L 0.064 +115 I 0.066 +116 D 0.066 +117 Y 0.063 +118 I 0.060 +119 Y 0.060 +120 T 0.064 +121 A 0.071 +122 E 0.078 +123 I 0.080 +124 E 0.079 +125 V 0.073 +126 T 0.067 +127 E 0.064 +128 E 0.062 +129 N 0.061 +130 V 0.058 +131 Q 0.055 +132 V 0.056 +133 L 0.057 +134 L 0.054 +135 P 0.050 +136 A 0.051 +137 A 0.055 +138 S 0.058 +139 L 0.059 +140 L 0.060 +141 Q 0.060 +142 L 0.057 +143 M 0.052 +144 D 0.049 +145 V 0.049 +146 R 0.051 +147 Q 0.054 +148 N 0.059 +149 C 0.069 +150 C 0.082 +151 D 0.086 +152 F 0.081 +153 L 0.073 +154 Q 0.067 +155 S 0.065 +156 Q 0.067 +157 L 0.069 +158 H 0.069 +159 P 0.067 +160 T 0.061 +161 N 0.052 +162 C 0.045 +163 L 0.043 +164 G 0.044 +165 I 0.046 +166 R 0.047 +167 A 0.050 +168 F 0.057 +169 A 0.065 +170 D 0.069 +171 V 0.069 +172 H 0.067 +173 T 0.065 +174 C 0.062 +175 T 0.057 +176 D 0.056 +177 L 0.063 +178 L 0.074 +179 Q 0.081 +180 Q 0.080 +181 A 0.079 +182 N 0.081 +183 A 0.080 +184 Y 0.070 +185 A 0.060 +186 E 0.053 +187 Q 0.048 +188 H 0.042 +189 F 0.037 +190 P 0.040 +191 E 0.047 +192 V 0.051 +193 M 0.050 +194 L 0.049 +195 G 0.051 +196 E 0.052 +197 E 0.050 +198 F 0.045 +199 L 0.039 +200 S 0.037 +201 L 0.036 +202 S 0.036 +203 L 0.035 +204 D 0.032 +205 Q 0.030 +206 V 0.031 +207 C 0.038 +208 S 0.049 +209 L 0.063 +210 I 0.078 +211 S 0.093 +212 S 0.104 +213 D 0.105 +214 K 0.092 +215 L 0.071 +216 T 0.052 +217 V 0.039 +218 S 0.035 +219 S 0.040 +220 E 0.049 +221 E 0.058 +222 K 0.063 +223 V 0.065 +224 F 0.064 +225 E 0.061 +226 A 0.056 +227 V 0.051 +228 I 0.052 +229 S 0.059 +230 W 0.064 +231 I 0.063 +232 N 0.057 +233 Y 0.050 +234 E 0.042 +235 K 0.036 +236 E 0.034 +237 T 0.034 +238 R 0.034 +239 L 0.037 +240 D 0.041 +241 H 0.043 +242 M 0.044 +243 A 0.044 +244 K 0.044 +245 L 0.045 +246 M 0.048 +247 E 0.051 +248 H 0.052 +249 V 0.054 +250 R 0.057 +251 L 0.060 +252 P 0.062 +253 L 0.061 +254 L 0.059 +255 P 0.054 +256 R 0.048 +257 D 0.043 +258 Y 0.041 +259 L 0.041 +260 V 0.042 +261 Q 0.046 +262 T 0.053 +263 V 0.059 +264 E 0.059 +265 E 0.053 +266 E 0.047 +267 A 0.045 +268 L 0.048 +269 I 0.049 +270 K 0.049 +271 N 0.048 +272 N 0.047 +273 N 0.045 +274 T 0.047 +275 C 0.053 +276 K 0.064 +277 D 0.074 +278 F 0.079 +279 L 0.083 +280 I 0.087 +281 E 0.084 +282 A 0.076 +283 M 0.066 +284 K 0.058 +285 Y 0.055 +286 H 0.059 +287 L 0.070 +288 L 0.089 +289 P 0.107 +290 L 0.119 +291 D 0.125 +292 Q 0.131 +293 R 0.143 +294 L 0.165 +295 L 0.189 +296 I 0.200 +297 K 0.191 +298 N 0.170 +299 P 0.149 +300 R 0.143 +301 T 0.156 +302 K 0.179 +303 P 0.205 +304 R 0.233 +305 T 0.263 +306 P 0.286 +307 V 0.293 +308 S 0.277 +309 L 0.239 +310 P 0.181 +311 K 0.117 +312 V 0.067 +313 M 0.039 +314 I 0.033 +315 V 0.044 +316 V 0.066 +317 G 0.094 +318 G 0.118 +319 Q 0.124 +320 A 0.117 +321 P 0.116 +322 K 0.128 +323 A 0.137 +324 I 0.131 +325 R 0.116 +326 S 0.100 +327 V 0.088 +328 E 0.077 +329 C 0.068 +330 Y 0.061 +331 D 0.055 +332 F 0.054 +333 E 0.058 +334 E 0.069 +335 G 0.079 +336 R 0.083 +337 W 0.082 +338 D 0.082 +339 Q 0.084 +340 I 0.084 +341 A 0.082 +342 E 0.077 +343 L 0.070 +344 P 0.064 +345 S 0.062 +346 R 0.068 +347 R 0.081 +348 C 0.096 +349 R 0.105 +350 A 0.104 +351 G 0.096 +352 V 0.087 +353 V 0.080 +354 F 0.077 +355 M 0.074 +356 A 0.067 +357 G 0.052 +358 H 0.036 +359 V 0.025 +360 Y 0.023 +361 A 0.031 +362 V 0.042 +363 G 0.054 +364 G 0.064 +365 F 0.073 +366 N 0.078 +367 G 0.084 +368 S 0.098 +369 L 0.115 +370 R 0.126 +371 V 0.127 +372 R 0.121 +373 T 0.109 +374 V 0.092 +375 D 0.074 +376 V 0.062 +377 Y 0.058 +378 D 0.058 +379 G 0.058 +380 V 0.056 +381 K 0.056 +382 D 0.060 +383 Q 0.066 +384 W 0.068 +385 T 0.069 +386 S 0.072 +387 I 0.078 +388 A 0.085 +389 S 0.089 +390 M 0.088 +391 Q 0.085 +392 E 0.087 +393 R 0.092 +394 R 0.099 +395 S 0.108 +396 T 0.116 +397 L 0.117 +398 G 0.105 +399 A 0.087 +400 A 0.076 +401 V 0.075 +402 L 0.076 +403 N 0.068 +404 D 0.052 +405 L 0.035 +406 L 0.025 +407 Y 0.026 +408 A 0.036 +409 V 0.053 +410 G 0.070 +411 G 0.087 +412 F 0.097 +413 D 0.098 +414 G 0.097 +415 S 0.104 +416 T 0.118 +417 G 0.129 +418 L 0.132 +419 A 0.129 +420 S 0.120 +421 V 0.106 +422 E 0.090 +423 A 0.072 +424 Y 0.055 +425 S 0.044 +426 Y 0.039 +427 K 0.041 +428 T 0.049 +429 N 0.060 +430 E 0.069 +431 W 0.073 +432 F 0.078 +433 F 0.087 +434 V 0.097 +435 A 0.105 +436 P 0.106 +437 M 0.100 +438 N 0.093 +439 T 0.091 +440 R 0.093 +441 R 0.101 +442 S 0.118 +443 S 0.139 +444 V 0.153 +445 G 0.147 +446 V 0.127 +447 G 0.112 +448 V 0.107 +449 V 0.106 +450 E 0.099 +451 G 0.083 +452 K 0.060 +453 L 0.041 +454 Y 0.037 +455 A 0.048 +456 V 0.067 +457 G 0.089 +458 G 0.115 +459 Y 0.138 +460 D 0.149 +461 G 0.144 +462 A 0.134 +463 S 0.129 +464 R 0.135 +465 Q 0.147 +466 C 0.154 +467 L 0.152 +468 S 0.144 +469 T 0.130 +470 V 0.114 +471 E 0.096 +472 Q 0.080 +473 Y 0.069 +474 N 0.063 +475 P 0.064 +476 A 0.071 +477 T 0.082 +478 N 0.094 +479 E 0.101 +480 W 0.103 +481 I 0.106 +482 Y 0.109 +483 V 0.112 +484 A 0.112 +485 D 0.111 +486 M 0.108 +487 S 0.106 +488 T 0.110 +489 R 0.123 +490 R 0.143 +491 S 0.162 +492 G 0.175 +493 A 0.176 +494 G 0.167 +495 V 0.153 +496 G 0.138 +497 V 0.128 +498 L 0.122 +499 S 0.118 +500 G 0.108 +501 Q 0.086 +502 L 0.060 +503 Y 0.046 +504 A 0.051 +505 T 0.068 +506 G 0.091 +507 G 0.112 +508 H 0.123 +509 D 0.121 +510 G 0.114 +511 P 0.114 +512 L 0.121 +513 V 0.127 +514 R 0.128 +515 K 0.126 +516 S 0.122 +517 V 0.113 +518 E 0.100 +519 V 0.089 +520 Y 0.082 +521 D 0.082 +522 P 0.086 +523 G 0.091 +524 T 0.096 +525 N 0.100 +526 T 0.102 +527 W 0.102 +528 K 0.105 +529 Q 0.112 +530 V 0.117 +531 A 0.117 +532 D 0.111 +533 M 0.102 +534 N 0.093 +535 M 0.091 +536 C 0.104 +537 R 0.131 +538 R 0.157 +539 N 0.169 +540 A 0.165 +541 G 0.150 +542 V 0.131 +543 C 0.116 +544 A 0.110 +545 V 0.110 +546 N 0.111 +547 G 0.104 +548 L 0.083 +549 L 0.059 +550 Y 0.047 +551 V 0.052 +552 V 0.067 +553 G 0.084 +554 G 0.100 +555 D 0.113 +556 D 0.120 +557 G 0.121 +558 S 0.120 +559 C 0.125 +560 N 0.137 +561 L 0.152 +562 A 0.158 +563 S 0.146 +564 V 0.123 +565 E 0.097 +566 Y 0.076 +567 Y 0.063 +568 N 0.060 +569 P 0.062 +570 V 0.066 +571 T 0.071 +572 D 0.076 +573 K 0.080 +574 W 0.081 +575 T 0.081 +576 L 0.082 +577 L 0.084 +578 P 0.086 +579 T 0.087 +580 N 0.086 +581 M 0.086 +582 S 0.091 +583 T 0.103 +584 G 0.118 +585 R 0.134 +586 S 0.145 +587 Y 0.146 +588 A 0.134 +589 G 0.113 +590 V 0.092 +591 A 0.078 +592 V 0.070 +593 I 0.065 +594 H 0.066 +595 K 0.074 +596 S 0.087 +597 L 0.097 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000015672.5_ENSMUST00000220621.2_GN:Mrpl32_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000015672.5_ENSMUST00000220621.2_GN:Mrpl32_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..088eab673e5f64997179a8f7d94494efa1c6d46c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000015672.5_ENSMUST00000220621.2_GN:Mrpl32_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,188 @@ +>ENSMUSG00000015672.5|ENSMUST00000220621.2|GN:Mrpl32|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.431 +2 A 0.475 +3 P 0.526 +4 S 0.544 +5 L 0.521 +6 L 0.498 +7 L 0.510 +8 L 0.546 +9 S 0.573 +10 L 0.586 +11 P 0.598 +12 W 0.617 +13 P 0.633 +14 V 0.623 +15 R 0.581 +16 P 0.521 +17 G 0.464 +18 P 0.417 +19 L 0.375 +20 Q 0.332 +21 R 0.294 +22 C 0.274 +23 W 0.270 +24 E 0.270 +25 L 0.270 +26 L 0.276 +27 Q 0.286 +28 R 0.293 +29 Q 0.305 +30 L 0.327 +31 Q 0.349 +32 Q 0.359 +33 S 0.367 +34 W 0.391 +35 S 0.428 +36 R 0.462 +37 F 0.490 +38 V 0.518 +39 S 0.549 +40 P 0.584 +41 P 0.619 +42 W 0.653 +43 A 0.692 +44 P 0.731 +45 A 0.760 +46 L 0.771 +47 A 0.765 +48 V 0.750 +49 Q 0.735 +50 R 0.726 +51 P 0.728 +52 S 0.736 +53 I 0.742 +54 L 0.744 +55 T 0.745 +56 E 0.750 +57 L 0.757 +58 A 0.762 +59 H 0.768 +60 D 0.775 +61 T 0.777 +62 C 0.772 +63 E 0.763 +64 N 0.756 +65 K 0.748 +66 E 0.732 +67 N 0.696 +68 S 0.635 +69 S 0.554 +70 F 0.472 +71 L 0.409 +72 D 0.365 +73 S 0.322 +74 I 0.288 +75 F 0.296 +76 W 0.367 +77 M 0.475 +78 A 0.572 +79 A 0.613 +80 P 0.593 +81 K 0.552 +82 N 0.537 +83 R 0.545 +84 R 0.546 +85 T 0.535 +86 I 0.520 +87 E 0.498 +88 V 0.457 +89 N 0.405 +90 R 0.362 +91 C 0.338 +92 R 0.326 +93 R 0.318 +94 R 0.317 +95 N 0.324 +96 P 0.335 +97 Q 0.356 +98 K 0.384 +99 L 0.419 +100 I 0.461 +101 K 0.507 +102 I 0.539 +103 K 0.534 +104 N 0.478 +105 N 0.376 +106 I 0.265 +107 D 0.180 +108 I 0.131 +109 C 0.108 +110 P 0.098 +111 E 0.096 +112 C 0.103 +113 G 0.120 +114 H 0.141 +115 L 0.164 +116 K 0.199 +117 Q 0.249 +118 K 0.296 +119 H 0.310 +120 V 0.280 +121 L 0.222 +122 C 0.154 +123 G 0.101 +124 Y 0.078 +125 C 0.083 +126 Y 0.101 +127 E 0.120 +128 K 0.134 +129 V 0.141 +130 R 0.141 +131 Q 0.139 +132 E 0.137 +133 T 0.130 +134 T 0.114 +135 K 0.098 +136 I 0.092 +137 R 0.096 +138 Q 0.105 +139 Q 0.120 +140 I 0.146 +141 G 0.179 +142 A 0.209 +143 Q 0.236 +144 E 0.267 +145 G 0.297 +146 G 0.314 +147 P 0.316 +148 F 0.314 +149 R 0.314 +150 A 0.314 +151 P 0.311 +152 S 0.304 +153 V 0.287 +154 E 0.258 +155 T 0.223 +156 M 0.199 +157 V 0.192 +158 L 0.199 +159 Y 0.211 +160 T 0.224 +161 G 0.230 +162 E 0.229 +163 K 0.223 +164 P 0.211 +165 S 0.203 +166 E 0.207 +167 K 0.219 +168 D 0.230 +169 Q 0.231 +170 G 0.223 +171 K 0.212 +172 R 0.204 +173 I 0.198 +174 V 0.190 +175 E 0.178 +176 R 0.167 +177 N 0.166 +178 I 0.176 +179 K 0.186 +180 R 0.188 +181 P 0.184 +182 S 0.175 +183 W 0.167 +184 F 0.170 +185 T 0.190 +186 Q 0.221 +187 N 0.245 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000015672.5_ENSMUST00000220621.2_GN:Mrpl32_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:13.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000015672.5_ENSMUST00000220621.2_GN:Mrpl32_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:13.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4ff884be26973ecc96756f448cc1662eec315904 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000015672.5_ENSMUST00000220621.2_GN:Mrpl32_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:13.caid @@ -0,0 +1,201 @@ +>ENSMUSG00000015672.5|ENSMUST00000220621.2|GN:Mrpl32|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:13 +1 M 0.407 +2 R 0.433 +3 S 0.482 +4 A 0.537 +5 R 0.577 +6 V 0.595 +7 P 0.601 +8 L 0.599 +9 C 0.588 +10 L 0.575 +11 E 0.567 +12 K 0.568 +13 I 0.579 +14 M 0.607 +15 A 0.648 +16 P 0.681 +17 S 0.685 +18 L 0.666 +19 L 0.649 +20 L 0.644 +21 L 0.643 +22 S 0.639 +23 L 0.634 +24 P 0.641 +25 W 0.663 +26 P 0.683 +27 V 0.680 +28 R 0.647 +29 P 0.597 +30 G 0.548 +31 P 0.510 +32 L 0.479 +33 Q 0.454 +34 R 0.429 +35 C 0.402 +36 W 0.377 +37 E 0.355 +38 L 0.343 +39 L 0.345 +40 Q 0.351 +41 R 0.355 +42 Q 0.367 +43 L 0.396 +44 Q 0.428 +45 Q 0.446 +46 S 0.456 +47 W 0.479 +48 S 0.516 +49 R 0.550 +50 F 0.572 +51 V 0.583 +52 S 0.598 +53 P 0.623 +54 P 0.655 +55 W 0.688 +56 A 0.722 +57 P 0.757 +58 A 0.783 +59 L 0.793 +60 A 0.786 +61 V 0.771 +62 Q 0.754 +63 R 0.745 +64 P 0.745 +65 S 0.752 +66 I 0.757 +67 L 0.757 +68 T 0.756 +69 E 0.759 +70 L 0.765 +71 A 0.769 +72 H 0.773 +73 D 0.778 +74 T 0.780 +75 C 0.775 +76 E 0.766 +77 N 0.757 +78 K 0.748 +79 E 0.730 +80 N 0.692 +81 S 0.627 +82 S 0.542 +83 F 0.457 +84 L 0.395 +85 D 0.353 +86 S 0.315 +87 I 0.285 +88 F 0.296 +89 W 0.368 +90 M 0.478 +91 A 0.574 +92 A 0.613 +93 P 0.589 +94 K 0.545 +95 N 0.527 +96 R 0.533 +97 R 0.531 +98 T 0.515 +99 I 0.495 +100 E 0.472 +101 V 0.434 +102 N 0.385 +103 R 0.344 +104 C 0.321 +105 R 0.308 +106 R 0.300 +107 R 0.296 +108 N 0.301 +109 P 0.314 +110 Q 0.338 +111 K 0.369 +112 L 0.405 +113 I 0.448 +114 K 0.495 +115 I 0.531 +116 K 0.531 +117 N 0.480 +118 N 0.382 +119 I 0.270 +120 D 0.183 +121 I 0.133 +122 C 0.109 +123 P 0.099 +124 E 0.097 +125 C 0.105 +126 G 0.122 +127 H 0.143 +128 L 0.167 +129 K 0.203 +130 Q 0.255 +131 K 0.304 +132 H 0.318 +133 V 0.288 +134 L 0.228 +135 C 0.158 +136 G 0.103 +137 Y 0.079 +138 C 0.083 +139 Y 0.101 +140 E 0.120 +141 K 0.135 +142 V 0.143 +143 R 0.143 +144 Q 0.141 +145 E 0.139 +146 T 0.132 +147 T 0.117 +148 K 0.101 +149 I 0.094 +150 R 0.097 +151 Q 0.107 +152 Q 0.122 +153 I 0.148 +154 G 0.181 +155 A 0.211 +156 Q 0.238 +157 E 0.268 +158 G 0.296 +159 G 0.312 +160 P 0.315 +161 F 0.313 +162 R 0.314 +163 A 0.315 +164 P 0.313 +165 S 0.306 +166 V 0.291 +167 E 0.261 +168 T 0.226 +169 M 0.201 +170 V 0.192 +171 L 0.197 +172 Y 0.209 +173 T 0.221 +174 G 0.227 +175 E 0.226 +176 K 0.219 +177 P 0.208 +178 S 0.199 +179 E 0.202 +180 K 0.214 +181 D 0.224 +182 Q 0.223 +183 G 0.214 +184 K 0.203 +185 R 0.195 +186 I 0.190 +187 V 0.183 +188 E 0.171 +189 R 0.161 +190 N 0.160 +191 I 0.171 +192 K 0.182 +193 R 0.186 +194 P 0.182 +195 S 0.173 +196 W 0.164 +197 F 0.167 +198 T 0.188 +199 Q 0.220 +200 N 0.244 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000018567.15_ENSMUST00000018711.15_GN:Gabarap_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000018567.15_ENSMUST00000018711.15_GN:Gabarap_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..52a7d700c3668c7c3e1bd2e5e5c8b0873706b0d7 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000018567.15_ENSMUST00000018711.15_GN:Gabarap_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,118 @@ +>ENSMUSG00000018567.15|ENSMUST00000018711.15|GN:Gabarap|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.237 +2 K 0.195 +3 F 0.139 +4 V 0.098 +5 Y 0.080 +6 K 0.080 +7 E 0.089 +8 E 0.100 +9 H 0.105 +10 P 0.096 +11 F 0.078 +12 E 0.060 +13 K 0.050 +14 R 0.049 +15 R 0.055 +16 S 0.060 +17 E 0.058 +18 G 0.057 +19 E 0.064 +20 K 0.072 +21 I 0.073 +22 R 0.071 +23 K 0.070 +24 K 0.069 +25 Y 0.067 +26 P 0.063 +27 D 0.056 +28 R 0.047 +29 V 0.039 +30 P 0.034 +31 V 0.030 +32 I 0.033 +33 V 0.045 +34 E 0.069 +35 K 0.102 +36 A 0.137 +37 P 0.160 +38 K 0.166 +39 A 0.162 +40 R 0.159 +41 I 0.160 +42 G 0.162 +43 D 0.155 +44 L 0.135 +45 D 0.110 +46 K 0.090 +47 K 0.079 +48 K 0.080 +49 Y 0.093 +50 L 0.112 +51 V 0.122 +52 P 0.122 +53 S 0.117 +54 D 0.107 +55 L 0.090 +56 T 0.068 +57 V 0.051 +58 G 0.042 +59 Q 0.038 +60 F 0.034 +61 Y 0.029 +62 F 0.026 +63 L 0.025 +64 I 0.028 +65 R 0.034 +66 K 0.041 +67 R 0.050 +68 I 0.062 +69 H 0.076 +70 L 0.094 +71 R 0.109 +72 A 0.113 +73 E 0.106 +74 D 0.092 +75 A 0.075 +76 L 0.056 +77 F 0.039 +78 F 0.032 +79 F 0.037 +80 V 0.049 +81 N 0.063 +82 N 0.075 +83 V 0.084 +84 I 0.088 +85 P 0.089 +86 P 0.086 +87 T 0.077 +88 S 0.065 +89 A 0.052 +90 T 0.041 +91 M 0.036 +92 G 0.037 +93 Q 0.039 +94 L 0.037 +95 Y 0.032 +96 Q 0.029 +97 E 0.030 +98 H 0.034 +99 H 0.043 +100 E 0.057 +101 E 0.070 +102 D 0.076 +103 F 0.070 +104 F 0.057 +105 L 0.046 +106 Y 0.042 +107 I 0.045 +108 A 0.051 +109 Y 0.061 +110 S 0.077 +111 D 0.101 +112 E 0.133 +113 S 0.176 +114 V 0.227 +115 Y 0.276 +116 G 0.313 +117 L 0.329 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000018567.15_ENSMUST00000018711.15_GN:Gabarap_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:46.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000018567.15_ENSMUST00000018711.15_GN:Gabarap_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:46.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..73f48642b7eb90e2fe4bee0dabfb4d843d1ca379 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000018567.15_ENSMUST00000018711.15_GN:Gabarap_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:46.caid @@ -0,0 +1,164 @@ +>ENSMUSG00000018567.15|ENSMUST00000018711.15|GN:Gabarap|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:46 +1 M 0.420 +2 N 0.433 +3 R 0.451 +4 E 0.453 +5 V 0.427 +6 A 0.393 +7 Q 0.394 +8 I 0.445 +9 R 0.510 +10 G 0.539 +11 S 0.517 +12 L 0.467 +13 R 0.422 +14 Q 0.418 +15 V 0.460 +16 C 0.519 +17 S 0.556 +18 S 0.557 +19 K 0.535 +20 P 0.511 +21 P 0.502 +22 P 0.506 +23 P 0.511 +24 P 0.519 +25 P 0.537 +26 P 0.565 +27 V 0.590 +28 P 0.606 +29 A 0.622 +30 P 0.644 +31 P 0.675 +32 L 0.705 +33 G 0.722 +34 S 0.721 +35 L 0.710 +36 S 0.705 +37 P 0.712 +38 A 0.717 +39 R 0.708 +40 S 0.683 +41 S 0.656 +42 P 0.635 +43 V 0.614 +44 L 0.573 +45 G 0.502 +46 R 0.407 +47 M 0.306 +48 K 0.215 +49 F 0.142 +50 V 0.097 +51 Y 0.080 +52 K 0.083 +53 E 0.094 +54 E 0.104 +55 H 0.106 +56 P 0.096 +57 F 0.077 +58 E 0.061 +59 K 0.053 +60 R 0.052 +61 R 0.057 +62 S 0.062 +63 E 0.061 +64 G 0.060 +65 E 0.067 +66 K 0.073 +67 I 0.069 +68 R 0.058 +69 K 0.051 +70 K 0.053 +71 Y 0.059 +72 P 0.060 +73 D 0.055 +74 R 0.046 +75 V 0.037 +76 P 0.031 +77 V 0.028 +78 I 0.030 +79 V 0.040 +80 E 0.062 +81 K 0.094 +82 A 0.128 +83 P 0.149 +84 K 0.155 +85 A 0.150 +86 R 0.146 +87 I 0.146 +88 G 0.148 +89 D 0.141 +90 L 0.123 +91 D 0.099 +92 K 0.078 +93 K 0.067 +94 K 0.067 +95 Y 0.082 +96 L 0.105 +97 V 0.121 +98 P 0.125 +99 S 0.119 +100 D 0.106 +101 L 0.086 +102 T 0.063 +103 V 0.047 +104 G 0.039 +105 Q 0.035 +106 F 0.032 +107 Y 0.027 +108 F 0.024 +109 L 0.023 +110 I 0.026 +111 R 0.031 +112 K 0.038 +113 R 0.047 +114 I 0.058 +115 H 0.072 +116 L 0.090 +117 R 0.106 +118 A 0.112 +119 E 0.107 +120 D 0.094 +121 A 0.077 +122 L 0.057 +123 F 0.040 +124 F 0.032 +125 F 0.036 +126 V 0.048 +127 N 0.061 +128 N 0.072 +129 V 0.080 +130 I 0.084 +131 P 0.085 +132 P 0.082 +133 T 0.075 +134 S 0.063 +135 A 0.050 +136 T 0.040 +137 M 0.035 +138 G 0.036 +139 Q 0.039 +140 L 0.037 +141 Y 0.033 +142 Q 0.031 +143 E 0.031 +144 H 0.036 +145 H 0.044 +146 E 0.058 +147 E 0.072 +148 D 0.078 +149 F 0.073 +150 F 0.059 +151 L 0.048 +152 Y 0.044 +153 I 0.046 +154 A 0.052 +155 Y 0.062 +156 S 0.078 +157 D 0.101 +158 E 0.131 +159 S 0.173 +160 V 0.223 +161 Y 0.276 +162 G 0.317 +163 L 0.337 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000018623.11_ENSMUST00000018767.9_GN:Mmp7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000018623.11_ENSMUST00000018767.9_GN:Mmp7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..125d528faf60dd91e2a92cd99470ba444998da02 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000018623.11_ENSMUST00000018767.9_GN:Mmp7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,265 @@ +>ENSMUSG00000018623.11|ENSMUST00000018767.9|GN:Mmp7|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.327 +2 Q 0.324 +3 L 0.330 +4 T 0.340 +5 L 0.340 +6 F 0.335 +7 C 0.350 +8 F 0.383 +9 V 0.407 +10 C 0.419 +11 L 0.431 +12 L 0.455 +13 P 0.485 +14 G 0.518 +15 H 0.550 +16 L 0.579 +17 A 0.601 +18 L 0.617 +19 P 0.627 +20 L 0.626 +21 S 0.609 +22 Q 0.581 +23 E 0.548 +24 A 0.502 +25 G 0.434 +26 D 0.345 +27 V 0.252 +28 S 0.174 +29 A 0.120 +30 H 0.085 +31 Q 0.062 +32 W 0.048 +33 E 0.041 +34 Q 0.038 +35 A 0.035 +36 Q 0.033 +37 N 0.033 +38 Y 0.034 +39 L 0.035 +40 R 0.037 +41 K 0.045 +42 F 0.070 +43 Y 0.118 +44 P 0.185 +45 H 0.250 +46 D 0.292 +47 S 0.308 +48 K 0.306 +49 T 0.298 +50 K 0.286 +51 K 0.263 +52 V 0.222 +53 N 0.167 +54 S 0.117 +55 L 0.085 +56 V 0.075 +57 D 0.077 +58 N 0.077 +59 L 0.072 +60 K 0.067 +61 E 0.065 +62 M 0.061 +63 Q 0.056 +64 K 0.058 +65 F 0.068 +66 F 0.087 +67 G 0.109 +68 L 0.124 +69 P 0.129 +70 M 0.126 +71 T 0.119 +72 G 0.112 +73 K 0.103 +74 L 0.087 +75 S 0.069 +76 P 0.056 +77 Y 0.053 +78 I 0.058 +79 M 0.066 +80 E 0.077 +81 I 0.086 +82 M 0.090 +83 Q 0.092 +84 K 0.093 +85 P 0.093 +86 R 0.094 +87 C 0.097 +88 G 0.107 +89 V 0.120 +90 P 0.132 +91 D 0.147 +92 V 0.169 +93 A 0.191 +94 E 0.209 +95 Y 0.229 +96 S 0.253 +97 L 0.270 +98 M 0.269 +99 P 0.252 +100 N 0.223 +101 S 0.178 +102 P 0.126 +103 K 0.081 +104 W 0.055 +105 H 0.046 +106 S 0.046 +107 R 0.049 +108 I 0.051 +109 V 0.048 +110 T 0.046 +111 Y 0.049 +112 R 0.059 +113 I 0.069 +114 V 0.072 +115 S 0.067 +116 Y 0.059 +117 T 0.055 +118 S 0.058 +119 D 0.063 +120 L 0.063 +121 P 0.059 +122 R 0.056 +123 I 0.057 +124 V 0.060 +125 V 0.065 +126 D 0.073 +127 Q 0.080 +128 I 0.076 +129 V 0.064 +130 K 0.054 +131 K 0.052 +132 A 0.058 +133 L 0.069 +134 R 0.074 +135 M 0.067 +136 W 0.054 +137 S 0.045 +138 M 0.043 +139 Q 0.042 +140 I 0.039 +141 P 0.035 +142 L 0.033 +143 N 0.032 +144 F 0.031 +145 K 0.032 +146 R 0.034 +147 V 0.039 +148 S 0.044 +149 W 0.049 +150 G 0.054 +151 T 0.057 +152 A 0.059 +153 D 0.060 +154 I 0.058 +155 I 0.056 +156 I 0.058 +157 G 0.067 +158 F 0.077 +159 A 0.086 +160 R 0.092 +161 R 0.096 +162 D 0.098 +163 H 0.096 +164 G 0.093 +165 D 0.093 +166 S 0.100 +167 F 0.113 +168 P 0.122 +169 F 0.123 +170 D 0.124 +171 G 0.130 +172 P 0.138 +173 G 0.144 +174 N 0.146 +175 T 0.146 +176 L 0.140 +177 G 0.131 +178 H 0.120 +179 A 0.113 +180 F 0.109 +181 A 0.111 +182 P 0.119 +183 G 0.131 +184 P 0.146 +185 G 0.164 +186 L 0.179 +187 G 0.182 +188 G 0.168 +189 D 0.148 +190 A 0.133 +191 H 0.131 +192 F 0.142 +193 D 0.156 +194 K 0.159 +195 D 0.149 +196 E 0.135 +197 Y 0.126 +198 W 0.129 +199 T 0.145 +200 D 0.170 +201 G 0.194 +202 E 0.208 +203 D 0.211 +204 A 0.202 +205 G 0.187 +206 V 0.171 +207 N 0.156 +208 F 0.146 +209 L 0.147 +210 F 0.162 +211 A 0.182 +212 A 0.188 +213 T 0.173 +214 H 0.156 +215 E 0.151 +216 F 0.146 +217 G 0.130 +218 H 0.112 +219 S 0.108 +220 L 0.115 +221 G 0.119 +222 L 0.114 +223 S 0.103 +224 H 0.099 +225 S 0.108 +226 S 0.128 +227 V 0.145 +228 P 0.154 +229 G 0.158 +230 T 0.161 +231 V 0.157 +232 M 0.140 +233 Y 0.118 +234 P 0.101 +235 T 0.094 +236 Y 0.091 +237 Q 0.096 +238 R 0.113 +239 D 0.138 +240 Y 0.157 +241 S 0.162 +242 E 0.153 +243 D 0.135 +244 F 0.116 +245 S 0.103 +246 L 0.095 +247 T 0.085 +248 K 0.075 +249 D 0.070 +250 D 0.073 +251 I 0.078 +252 A 0.081 +253 G 0.075 +254 I 0.064 +255 Q 0.059 +256 K 0.063 +257 L 0.077 +258 Y 0.103 +259 G 0.150 +260 K 0.219 +261 R 0.298 +262 N 0.360 +263 T 0.386 +264 L 0.387 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000018623.11_ENSMUST00000018767.9_GN:Mmp7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000018623.11_ENSMUST00000018767.9_GN:Mmp7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:3.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1ba41fd51d820f20413e0f561a902143c748fbd4 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000018623.11_ENSMUST00000018767.9_GN:Mmp7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:3.caid @@ -0,0 +1,268 @@ +>ENSMUSG00000018623.11|ENSMUST00000018767.9|GN:Mmp7|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:3 +1 M 0.353 +2 A 0.349 +3 A 0.354 +4 M 0.364 +5 Q 0.350 +6 L 0.313 +7 T 0.299 +8 L 0.322 +9 F 0.355 +10 C 0.377 +11 F 0.391 +12 V 0.401 +13 C 0.407 +14 L 0.418 +15 L 0.446 +16 P 0.490 +17 G 0.536 +18 H 0.573 +19 L 0.599 +20 A 0.616 +21 L 0.625 +22 P 0.629 +23 L 0.625 +24 S 0.607 +25 Q 0.579 +26 E 0.544 +27 A 0.496 +28 G 0.424 +29 D 0.335 +30 V 0.244 +31 S 0.170 +32 A 0.118 +33 H 0.084 +34 Q 0.062 +35 W 0.049 +36 E 0.042 +37 Q 0.038 +38 A 0.036 +39 Q 0.033 +40 N 0.033 +41 Y 0.034 +42 L 0.035 +43 R 0.037 +44 K 0.046 +45 F 0.069 +46 Y 0.117 +47 P 0.184 +48 H 0.250 +49 D 0.293 +50 S 0.308 +51 K 0.306 +52 T 0.297 +53 K 0.285 +54 K 0.261 +55 V 0.219 +56 N 0.165 +57 S 0.115 +58 L 0.084 +59 V 0.075 +60 D 0.076 +61 N 0.076 +62 L 0.071 +63 K 0.067 +64 E 0.064 +65 M 0.060 +66 Q 0.056 +67 K 0.057 +68 F 0.068 +69 F 0.087 +70 G 0.108 +71 L 0.123 +72 P 0.128 +73 M 0.125 +74 T 0.118 +75 G 0.111 +76 K 0.102 +77 L 0.087 +78 S 0.068 +79 P 0.056 +80 Y 0.053 +81 I 0.058 +82 M 0.066 +83 E 0.077 +84 I 0.086 +85 M 0.090 +86 Q 0.091 +87 K 0.092 +88 P 0.093 +89 R 0.093 +90 C 0.097 +91 G 0.106 +92 V 0.119 +93 P 0.131 +94 D 0.146 +95 V 0.168 +96 A 0.191 +97 E 0.209 +98 Y 0.229 +99 S 0.253 +100 L 0.270 +101 M 0.269 +102 P 0.252 +103 N 0.223 +104 S 0.179 +105 P 0.126 +106 K 0.081 +107 W 0.055 +108 H 0.046 +109 S 0.046 +110 R 0.049 +111 I 0.050 +112 V 0.048 +113 T 0.046 +114 Y 0.049 +115 R 0.059 +116 I 0.069 +117 V 0.072 +118 S 0.067 +119 Y 0.059 +120 T 0.056 +121 S 0.059 +122 D 0.063 +123 L 0.063 +124 P 0.059 +125 R 0.056 +126 I 0.057 +127 V 0.060 +128 V 0.065 +129 D 0.073 +130 Q 0.080 +131 I 0.076 +132 V 0.065 +133 K 0.054 +134 K 0.052 +135 A 0.058 +136 L 0.067 +137 R 0.072 +138 M 0.065 +139 W 0.053 +140 S 0.045 +141 M 0.043 +142 Q 0.042 +143 I 0.039 +144 P 0.035 +145 L 0.033 +146 N 0.032 +147 F 0.031 +148 K 0.031 +149 R 0.034 +150 V 0.039 +151 S 0.044 +152 W 0.049 +153 G 0.054 +154 T 0.057 +155 A 0.059 +156 D 0.060 +157 I 0.058 +158 I 0.056 +159 I 0.058 +160 G 0.067 +161 F 0.077 +162 A 0.086 +163 R 0.092 +164 R 0.096 +165 D 0.097 +166 H 0.096 +167 G 0.093 +168 D 0.093 +169 S 0.100 +170 F 0.113 +171 P 0.122 +172 F 0.123 +173 D 0.123 +174 G 0.129 +175 P 0.138 +176 G 0.143 +177 N 0.145 +178 T 0.145 +179 L 0.140 +180 G 0.131 +181 H 0.121 +182 A 0.113 +183 F 0.110 +184 A 0.111 +185 P 0.119 +186 G 0.131 +187 P 0.146 +188 G 0.163 +189 L 0.179 +190 G 0.182 +191 G 0.168 +192 D 0.148 +193 A 0.133 +194 H 0.131 +195 F 0.142 +196 D 0.156 +197 K 0.159 +198 D 0.149 +199 E 0.134 +200 Y 0.125 +201 W 0.129 +202 T 0.145 +203 D 0.170 +204 G 0.194 +205 E 0.209 +206 D 0.210 +207 A 0.202 +208 G 0.187 +209 V 0.171 +210 N 0.155 +211 F 0.146 +212 L 0.147 +213 F 0.162 +214 A 0.182 +215 A 0.187 +216 T 0.173 +217 H 0.156 +218 E 0.151 +219 F 0.146 +220 G 0.130 +221 H 0.112 +222 S 0.108 +223 L 0.114 +224 G 0.119 +225 L 0.114 +226 S 0.103 +227 H 0.099 +228 S 0.108 +229 S 0.128 +230 V 0.145 +231 P 0.154 +232 G 0.158 +233 T 0.161 +234 V 0.157 +235 M 0.140 +236 Y 0.118 +237 P 0.102 +238 T 0.094 +239 Y 0.092 +240 Q 0.096 +241 R 0.112 +242 D 0.137 +243 Y 0.156 +244 S 0.161 +245 E 0.152 +246 D 0.135 +247 F 0.116 +248 S 0.104 +249 L 0.095 +250 T 0.085 +251 K 0.075 +252 D 0.071 +253 D 0.073 +254 I 0.079 +255 A 0.081 +256 G 0.075 +257 I 0.065 +258 Q 0.059 +259 K 0.063 +260 L 0.077 +261 Y 0.103 +262 G 0.150 +263 K 0.219 +264 R 0.298 +265 N 0.359 +266 T 0.385 +267 L 0.386 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019232.15_ENSMUST00000072271.13_GN:Etnppl_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019232.15_ENSMUST00000072271.13_GN:Etnppl_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c378d25621e082080e29852cf7beb48a70ae53bd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019232.15_ENSMUST00000072271.13_GN:Etnppl_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,500 @@ +>ENSMUSG00000019232.15|ENSMUST00000072271.13|GN:Etnppl|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.337 +2 C 0.323 +3 E 0.289 +4 L 0.233 +5 Y 0.170 +6 S 0.123 +7 K 0.103 +8 Q 0.105 +9 D 0.116 +10 T 0.127 +11 L 0.141 +12 A 0.163 +13 L 0.184 +14 R 0.186 +15 E 0.172 +16 R 0.163 +17 H 0.172 +18 I 0.192 +19 G 0.212 +20 P 0.230 +21 S 0.249 +22 C 0.262 +23 K 0.262 +24 I 0.241 +25 F 0.208 +26 F 0.180 +27 A 0.164 +28 A 0.149 +29 D 0.132 +30 P 0.120 +31 I 0.116 +32 K 0.115 +33 I 0.111 +34 M 0.109 +35 R 0.116 +36 A 0.127 +37 Q 0.132 +38 G 0.121 +39 Q 0.097 +40 Y 0.072 +41 M 0.054 +42 F 0.049 +43 D 0.055 +44 E 0.070 +45 K 0.094 +46 G 0.117 +47 E 0.135 +48 R 0.149 +49 Y 0.162 +50 L 0.175 +51 D 0.182 +52 C 0.180 +53 I 0.176 +54 N 0.178 +55 N 0.181 +56 V 0.177 +57 A 0.163 +58 H 0.146 +59 V 0.133 +60 G 0.125 +61 H 0.122 +62 C 0.120 +63 H 0.118 +64 P 0.117 +65 E 0.119 +66 V 0.124 +67 V 0.131 +68 K 0.141 +69 A 0.154 +70 A 0.167 +71 A 0.172 +72 K 0.169 +73 Q 0.160 +74 M 0.147 +75 E 0.131 +76 L 0.120 +77 L 0.123 +78 N 0.140 +79 T 0.165 +80 N 0.182 +81 S 0.184 +82 R 0.173 +83 F 0.150 +84 L 0.122 +85 H 0.096 +86 D 0.082 +87 N 0.079 +88 I 0.080 +89 I 0.081 +90 E 0.082 +91 F 0.084 +92 A 0.087 +93 K 0.085 +94 R 0.081 +95 L 0.078 +96 T 0.076 +97 A 0.073 +98 T 0.071 +99 L 0.069 +100 P 0.064 +101 Q 0.058 +102 E 0.054 +103 L 0.054 +104 S 0.056 +105 V 0.062 +106 C 0.072 +107 Y 0.088 +108 F 0.107 +109 T 0.131 +110 N 0.156 +111 S 0.169 +112 G 0.163 +113 S 0.148 +114 E 0.137 +115 A 0.129 +116 N 0.119 +117 D 0.109 +118 L 0.099 +119 A 0.088 +120 L 0.076 +121 R 0.066 +122 L 0.058 +123 A 0.051 +124 R 0.047 +125 Q 0.046 +126 F 0.048 +127 R 0.049 +128 G 0.047 +129 H 0.043 +130 Q 0.039 +131 D 0.040 +132 V 0.046 +133 I 0.059 +134 T 0.078 +135 L 0.100 +136 D 0.110 +137 H 0.100 +138 A 0.088 +139 Y 0.089 +140 H 0.101 +141 G 0.117 +142 H 0.129 +143 L 0.137 +144 S 0.149 +145 S 0.170 +146 L 0.191 +147 I 0.196 +148 E 0.181 +149 I 0.154 +150 S 0.126 +151 P 0.102 +152 Y 0.087 +153 K 0.087 +154 F 0.099 +155 Q 0.119 +156 K 0.146 +157 G 0.177 +158 K 0.207 +159 D 0.230 +160 V 0.235 +161 K 0.216 +162 R 0.176 +163 E 0.131 +164 T 0.097 +165 V 0.085 +166 H 0.094 +167 V 0.114 +168 A 0.131 +169 P 0.139 +170 A 0.135 +171 P 0.122 +172 D 0.106 +173 T 0.092 +174 Y 0.089 +175 R 0.099 +176 G 0.118 +177 K 0.134 +178 Y 0.141 +179 R 0.137 +180 E 0.131 +181 D 0.128 +182 H 0.124 +183 E 0.117 +184 D 0.112 +185 P 0.108 +186 S 0.096 +187 T 0.077 +188 A 0.062 +189 Y 0.057 +190 A 0.058 +191 D 0.059 +192 E 0.054 +193 V 0.052 +194 K 0.057 +195 K 0.062 +196 I 0.057 +197 I 0.048 +198 E 0.042 +199 E 0.045 +200 A 0.055 +201 H 0.066 +202 S 0.074 +203 S 0.080 +204 G 0.081 +205 R 0.075 +206 K 0.064 +207 I 0.053 +208 A 0.044 +209 A 0.041 +210 F 0.044 +211 I 0.054 +212 A 0.065 +213 E 0.071 +214 S 0.069 +215 M 0.063 +216 Q 0.057 +217 S 0.054 +218 C 0.055 +219 G 0.062 +220 G 0.075 +221 Q 0.091 +222 I 0.109 +223 I 0.126 +224 P 0.134 +225 P 0.129 +226 A 0.111 +227 G 0.087 +228 Y 0.064 +229 F 0.045 +230 Q 0.032 +231 K 0.027 +232 V 0.026 +233 A 0.026 +234 E 0.026 +235 H 0.027 +236 I 0.036 +237 H 0.052 +238 K 0.065 +239 A 0.068 +240 G 0.061 +241 G 0.050 +242 V 0.041 +243 F 0.041 +244 I 0.047 +245 A 0.055 +246 D 0.059 +247 E 0.056 +248 V 0.048 +249 Q 0.041 +250 V 0.037 +251 G 0.038 +252 F 0.039 +253 G 0.040 +254 R 0.040 +255 V 0.042 +256 G 0.044 +257 R 0.046 +258 Y 0.045 +259 F 0.041 +260 W 0.036 +261 S 0.036 +262 F 0.039 +263 Q 0.044 +264 M 0.050 +265 Y 0.059 +266 G 0.071 +267 E 0.080 +268 D 0.080 +269 F 0.070 +270 V 0.060 +271 P 0.052 +272 D 0.046 +273 I 0.042 +274 V 0.042 +275 T 0.046 +276 M 0.052 +277 G 0.057 +278 K 0.059 +279 P 0.060 +280 M 0.062 +281 G 0.064 +282 N 0.069 +283 G 0.082 +284 H 0.091 +285 P 0.089 +286 I 0.075 +287 S 0.061 +288 C 0.052 +289 V 0.049 +290 V 0.047 +291 T 0.049 +292 T 0.051 +293 K 0.050 +294 E 0.048 +295 I 0.049 +296 A 0.054 +297 E 0.067 +298 A 0.085 +299 F 0.106 +300 S 0.126 +301 S 0.141 +302 S 0.156 +303 G 0.172 +304 M 0.186 +305 E 0.193 +306 Y 0.186 +307 F 0.172 +308 N 0.164 +309 T 0.172 +310 Y 0.190 +311 G 0.204 +312 G 0.212 +313 N 0.224 +314 P 0.241 +315 V 0.248 +316 S 0.234 +317 C 0.218 +318 A 0.214 +319 V 0.210 +320 G 0.191 +321 L 0.164 +322 A 0.143 +323 V 0.130 +324 L 0.118 +325 D 0.108 +326 V 0.101 +327 I 0.096 +328 E 0.089 +329 K 0.082 +330 E 0.076 +331 N 0.075 +332 L 0.078 +333 Q 0.080 +334 G 0.078 +335 N 0.072 +336 A 0.063 +337 V 0.055 +338 R 0.053 +339 V 0.054 +340 G 0.054 +341 T 0.049 +342 Y 0.048 +343 L 0.055 +344 M 0.066 +345 E 0.072 +346 L 0.071 +347 L 0.073 +348 S 0.079 +349 E 0.081 +350 Q 0.072 +351 K 0.058 +352 A 0.046 +353 K 0.040 +354 H 0.039 +355 P 0.040 +356 L 0.042 +357 I 0.042 +358 G 0.041 +359 D 0.042 +360 I 0.046 +361 R 0.049 +362 G 0.049 +363 V 0.044 +364 G 0.039 +365 L 0.034 +366 F 0.032 +367 I 0.032 +368 G 0.034 +369 I 0.042 +370 D 0.055 +371 L 0.073 +372 V 0.092 +373 K 0.107 +374 D 0.114 +375 R 0.114 +376 E 0.116 +377 K 0.120 +378 R 0.126 +379 T 0.132 +380 P 0.128 +381 A 0.108 +382 T 0.082 +383 A 0.062 +384 E 0.054 +385 A 0.053 +386 Q 0.054 +387 H 0.055 +388 I 0.054 +389 I 0.052 +390 Y 0.049 +391 E 0.052 +392 M 0.058 +393 K 0.064 +394 G 0.067 +395 K 0.065 +396 G 0.061 +397 V 0.059 +398 L 0.060 +399 L 0.066 +400 S 0.072 +401 A 0.075 +402 D 0.077 +403 G 0.086 +404 P 0.098 +405 H 0.102 +406 R 0.092 +407 N 0.075 +408 V 0.057 +409 L 0.043 +410 K 0.037 +411 I 0.038 +412 K 0.047 +413 P 0.061 +414 P 0.074 +415 M 0.082 +416 C 0.083 +417 F 0.081 +418 T 0.078 +419 E 0.073 +420 D 0.070 +421 D 0.071 +422 A 0.072 +423 K 0.069 +424 F 0.068 +425 L 0.074 +426 V 0.085 +427 D 0.089 +428 H 0.081 +429 L 0.069 +430 D 0.058 +431 G 0.050 +432 I 0.044 +433 L 0.040 +434 T 0.037 +435 V 0.037 +436 L 0.043 +437 E 0.057 +438 E 0.084 +439 A 0.128 +440 M 0.187 +441 D 0.253 +442 S 0.317 +443 K 0.380 +444 S 0.444 +445 G 0.498 +446 T 0.524 +447 V 0.516 +448 F 0.490 +449 S 0.464 +450 E 0.444 +451 N 0.428 +452 T 0.411 +453 A 0.392 +454 Y 0.376 +455 R 0.369 +456 T 0.370 +457 K 0.374 +458 M 0.390 +459 P 0.426 +460 K 0.472 +461 E 0.502 +462 I 0.510 +463 Q 0.511 +464 V 0.518 +465 E 0.537 +466 L 0.566 +467 P 0.594 +468 N 0.610 +469 L 0.615 +470 S 0.619 +471 A 0.628 +472 T 0.638 +473 E 0.645 +474 A 0.641 +475 R 0.628 +476 E 0.615 +477 I 0.613 +478 P 0.630 +479 R 0.663 +480 G 0.693 +481 K 0.702 +482 R 0.699 +483 N 0.702 +484 G 0.706 +485 V 0.696 +486 C 0.665 +487 S 0.611 +488 D 0.537 +489 Q 0.451 +490 Q 0.375 +491 A 0.338 +492 L 0.344 +493 L 0.364 +494 S 0.374 +495 K 0.381 +496 R 0.400 +497 L 0.413 +498 K 0.403 +499 T 0.383 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019232.15_ENSMUST00000072271.13_GN:Etnppl_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:40.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019232.15_ENSMUST00000072271.13_GN:Etnppl_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:40.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b7a074059fae08faca3b0adb5da8dd26bb72456a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019232.15_ENSMUST00000072271.13_GN:Etnppl_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:40.caid @@ -0,0 +1,540 @@ +>ENSMUSG00000019232.15|ENSMUST00000072271.13|GN:Etnppl|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:40 +1 M 0.392 +2 P 0.421 +3 L 0.463 +4 V 0.488 +5 T 0.478 +6 S 0.459 +7 D 0.451 +8 T 0.442 +9 Q 0.436 +10 G 0.444 +11 R 0.441 +12 R 0.402 +13 H 0.352 +14 R 0.342 +15 R 0.376 +16 G 0.409 +17 E 0.426 +18 K 0.454 +19 K 0.503 +20 S 0.558 +21 F 0.608 +22 A 0.646 +23 A 0.661 +24 S 0.653 +25 Q 0.632 +26 V 0.607 +27 T 0.585 +28 E 0.580 +29 G 0.595 +30 G 0.615 +31 T 0.622 +32 F 0.600 +33 I 0.552 +34 D 0.497 +35 L 0.465 +36 K 0.471 +37 G 0.498 +38 A 0.520 +39 A 0.524 +40 V 0.504 +41 M 0.464 +42 C 0.406 +43 E 0.334 +44 L 0.253 +45 Y 0.180 +46 S 0.131 +47 K 0.113 +48 Q 0.117 +49 D 0.130 +50 T 0.140 +51 L 0.153 +52 A 0.177 +53 L 0.201 +54 R 0.204 +55 E 0.187 +56 R 0.175 +57 H 0.185 +58 I 0.205 +59 G 0.223 +60 P 0.237 +61 S 0.253 +62 C 0.267 +63 K 0.268 +64 I 0.246 +65 F 0.210 +66 F 0.178 +67 A 0.159 +68 A 0.143 +69 D 0.125 +70 P 0.111 +71 I 0.105 +72 K 0.104 +73 I 0.105 +74 M 0.109 +75 R 0.118 +76 A 0.130 +77 Q 0.131 +78 G 0.117 +79 Q 0.093 +80 Y 0.068 +81 M 0.050 +82 F 0.045 +83 D 0.050 +84 E 0.065 +85 K 0.087 +86 G 0.111 +87 E 0.127 +88 R 0.139 +89 Y 0.150 +90 L 0.162 +91 D 0.169 +92 C 0.168 +93 I 0.167 +94 N 0.172 +95 N 0.177 +96 V 0.173 +97 A 0.158 +98 H 0.140 +99 V 0.126 +100 G 0.118 +101 H 0.114 +102 C 0.112 +103 H 0.110 +104 P 0.109 +105 E 0.111 +106 V 0.117 +107 V 0.126 +108 K 0.138 +109 A 0.152 +110 A 0.165 +111 A 0.170 +112 K 0.169 +113 Q 0.161 +114 M 0.147 +115 E 0.130 +116 L 0.119 +117 L 0.123 +118 N 0.141 +119 T 0.165 +120 N 0.180 +121 S 0.180 +122 R 0.168 +123 F 0.147 +124 L 0.122 +125 H 0.098 +126 D 0.084 +127 N 0.080 +128 I 0.080 +129 I 0.080 +130 E 0.080 +131 F 0.083 +132 A 0.085 +133 K 0.084 +134 R 0.080 +135 L 0.078 +136 T 0.077 +137 A 0.075 +138 T 0.074 +139 L 0.073 +140 P 0.067 +141 Q 0.061 +142 E 0.057 +143 L 0.058 +144 S 0.060 +145 V 0.065 +146 C 0.074 +147 Y 0.088 +148 F 0.107 +149 T 0.130 +150 N 0.156 +151 S 0.170 +152 G 0.163 +153 S 0.148 +154 E 0.137 +155 A 0.129 +156 N 0.119 +157 D 0.109 +158 L 0.100 +159 A 0.089 +160 L 0.076 +161 R 0.066 +162 L 0.057 +163 A 0.050 +164 R 0.046 +165 Q 0.046 +166 F 0.047 +167 R 0.049 +168 G 0.048 +169 H 0.044 +170 Q 0.041 +171 D 0.041 +172 V 0.048 +173 I 0.060 +174 T 0.080 +175 L 0.102 +176 D 0.111 +177 H 0.101 +178 A 0.089 +179 Y 0.091 +180 H 0.103 +181 G 0.119 +182 H 0.131 +183 L 0.140 +184 S 0.152 +185 S 0.173 +186 L 0.195 +187 I 0.201 +188 E 0.186 +189 I 0.159 +190 S 0.130 +191 P 0.106 +192 Y 0.091 +193 K 0.089 +194 F 0.100 +195 Q 0.119 +196 K 0.145 +197 G 0.176 +198 K 0.206 +199 D 0.227 +200 V 0.232 +201 K 0.213 +202 R 0.174 +203 E 0.129 +204 T 0.096 +205 V 0.084 +206 H 0.093 +207 V 0.114 +208 A 0.132 +209 P 0.140 +210 A 0.136 +211 P 0.123 +212 D 0.107 +213 T 0.093 +214 Y 0.089 +215 R 0.098 +216 G 0.115 +217 K 0.130 +218 Y 0.136 +219 R 0.131 +220 E 0.126 +221 D 0.124 +222 H 0.120 +223 E 0.115 +224 D 0.110 +225 P 0.107 +226 S 0.096 +227 T 0.077 +228 A 0.059 +229 Y 0.047 +230 A 0.040 +231 D 0.035 +232 E 0.035 +233 V 0.042 +234 K 0.054 +235 K 0.062 +236 I 0.057 +237 I 0.047 +238 E 0.041 +239 E 0.044 +240 A 0.053 +241 H 0.063 +242 S 0.071 +243 S 0.076 +244 G 0.078 +245 R 0.072 +246 K 0.061 +247 I 0.051 +248 A 0.043 +249 A 0.040 +250 F 0.044 +251 I 0.054 +252 A 0.066 +253 E 0.072 +254 S 0.069 +255 M 0.062 +256 Q 0.056 +257 S 0.053 +258 C 0.054 +259 G 0.061 +260 G 0.073 +261 Q 0.089 +262 I 0.107 +263 I 0.123 +264 P 0.131 +265 P 0.126 +266 A 0.109 +267 G 0.086 +268 Y 0.063 +269 F 0.045 +270 Q 0.033 +271 K 0.028 +272 V 0.027 +273 A 0.027 +274 E 0.027 +275 H 0.028 +276 I 0.036 +277 H 0.050 +278 K 0.063 +279 A 0.067 +280 G 0.061 +281 G 0.051 +282 V 0.043 +283 F 0.042 +284 I 0.048 +285 A 0.056 +286 D 0.060 +287 E 0.058 +288 V 0.050 +289 Q 0.042 +290 V 0.039 +291 G 0.039 +292 F 0.041 +293 G 0.041 +294 R 0.041 +295 V 0.042 +296 G 0.045 +297 R 0.047 +298 Y 0.046 +299 F 0.043 +300 W 0.038 +301 S 0.038 +302 F 0.042 +303 Q 0.048 +304 M 0.054 +305 Y 0.063 +306 G 0.076 +307 E 0.085 +308 D 0.085 +309 F 0.075 +310 V 0.064 +311 P 0.056 +312 D 0.049 +313 I 0.043 +314 V 0.042 +315 T 0.046 +316 M 0.052 +317 G 0.057 +318 K 0.059 +319 P 0.061 +320 M 0.063 +321 G 0.065 +322 N 0.072 +323 G 0.084 +324 H 0.094 +325 P 0.091 +326 I 0.076 +327 S 0.061 +328 C 0.052 +329 V 0.049 +330 V 0.048 +331 T 0.050 +332 T 0.053 +333 K 0.052 +334 E 0.050 +335 I 0.049 +336 A 0.055 +337 E 0.068 +338 A 0.087 +339 F 0.109 +340 S 0.129 +341 S 0.145 +342 S 0.159 +343 G 0.174 +344 M 0.188 +345 E 0.194 +346 Y 0.187 +347 F 0.172 +348 N 0.164 +349 T 0.172 +350 Y 0.191 +351 G 0.206 +352 G 0.216 +353 N 0.232 +354 P 0.254 +355 V 0.262 +356 S 0.247 +357 C 0.228 +358 A 0.222 +359 V 0.217 +360 G 0.196 +361 L 0.167 +362 A 0.146 +363 V 0.133 +364 L 0.122 +365 D 0.112 +366 V 0.104 +367 I 0.098 +368 E 0.091 +369 K 0.083 +370 E 0.076 +371 N 0.075 +372 L 0.079 +373 Q 0.082 +374 G 0.080 +375 N 0.073 +376 A 0.064 +377 V 0.056 +378 R 0.053 +379 V 0.055 +380 G 0.054 +381 T 0.050 +382 Y 0.049 +383 L 0.055 +384 M 0.066 +385 E 0.072 +386 L 0.072 +387 L 0.073 +388 S 0.079 +389 E 0.081 +390 Q 0.072 +391 K 0.057 +392 A 0.045 +393 K 0.039 +394 H 0.038 +395 P 0.040 +396 L 0.041 +397 I 0.041 +398 G 0.040 +399 D 0.042 +400 I 0.046 +401 R 0.049 +402 G 0.048 +403 V 0.044 +404 G 0.038 +405 L 0.034 +406 F 0.031 +407 I 0.031 +408 G 0.034 +409 I 0.042 +410 D 0.055 +411 L 0.074 +412 V 0.093 +413 K 0.108 +414 D 0.114 +415 R 0.115 +416 E 0.116 +417 K 0.120 +418 R 0.127 +419 T 0.132 +420 P 0.129 +421 A 0.109 +422 T 0.083 +423 A 0.063 +424 E 0.055 +425 A 0.055 +426 Q 0.056 +427 H 0.056 +428 I 0.055 +429 I 0.052 +430 Y 0.049 +431 E 0.051 +432 M 0.057 +433 K 0.064 +434 G 0.066 +435 K 0.064 +436 G 0.060 +437 V 0.058 +438 L 0.060 +439 L 0.067 +440 S 0.074 +441 A 0.077 +442 D 0.079 +443 G 0.088 +444 P 0.100 +445 H 0.105 +446 R 0.095 +447 N 0.076 +448 V 0.058 +449 L 0.043 +450 K 0.036 +451 I 0.037 +452 K 0.047 +453 P 0.061 +454 P 0.074 +455 M 0.082 +456 C 0.084 +457 F 0.082 +458 T 0.078 +459 E 0.074 +460 D 0.071 +461 D 0.073 +462 A 0.074 +463 K 0.071 +464 F 0.069 +465 L 0.075 +466 V 0.085 +467 D 0.088 +468 H 0.081 +469 L 0.071 +470 D 0.061 +471 G 0.054 +472 I 0.048 +473 L 0.043 +474 T 0.040 +475 V 0.041 +476 L 0.048 +477 E 0.064 +478 E 0.095 +479 A 0.143 +480 M 0.203 +481 D 0.268 +482 S 0.329 +483 K 0.384 +484 S 0.440 +485 G 0.487 +486 T 0.508 +487 V 0.496 +488 F 0.465 +489 S 0.434 +490 E 0.409 +491 N 0.387 +492 T 0.365 +493 A 0.344 +494 Y 0.327 +495 R 0.322 +496 T 0.327 +497 K 0.339 +498 M 0.363 +499 P 0.402 +500 K 0.439 +501 E 0.460 +502 I 0.469 +503 Q 0.477 +504 V 0.492 +505 E 0.520 +506 L 0.556 +507 P 0.589 +508 N 0.605 +509 L 0.610 +510 S 0.614 +511 A 0.624 +512 T 0.634 +513 E 0.637 +514 A 0.630 +515 R 0.614 +516 E 0.599 +517 I 0.595 +518 P 0.609 +519 R 0.638 +520 G 0.667 +521 K 0.680 +522 R 0.685 +523 N 0.697 +524 G 0.710 +525 V 0.707 +526 C 0.676 +527 S 0.611 +528 D 0.513 +529 Q 0.401 +530 Q 0.307 +531 A 0.253 +532 L 0.238 +533 L 0.245 +534 S 0.256 +535 K 0.258 +536 R 0.252 +537 L 0.249 +538 K 0.250 +539 T 0.251 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019432.16_ENSMUST00000173731.8_GN:Ddx39b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019432.16_ENSMUST00000173731.8_GN:Ddx39b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4a01965d8598b51ddcd7d16ffc1e6f51b2298a6c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019432.16_ENSMUST00000173731.8_GN:Ddx39b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,429 @@ +>ENSMUSG00000019432.16|ENSMUST00000173731.8|GN:Ddx39b|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.438 +2 A 0.462 +3 E 0.502 +4 N 0.548 +5 D 0.583 +6 V 0.592 +7 D 0.579 +8 N 0.553 +9 E 0.522 +10 L 0.491 +11 L 0.468 +12 D 0.456 +13 Y 0.452 +14 E 0.457 +15 D 0.474 +16 D 0.491 +17 E 0.492 +18 V 0.488 +19 E 0.516 +20 T 0.587 +21 A 0.658 +22 A 0.693 +23 G 0.700 +24 A 0.698 +25 D 0.694 +26 G 0.683 +27 T 0.665 +28 E 0.647 +29 A 0.639 +30 P 0.642 +31 A 0.649 +32 K 0.650 +33 K 0.641 +34 D 0.623 +35 V 0.596 +36 K 0.560 +37 G 0.518 +38 S 0.479 +39 Y 0.452 +40 V 0.434 +41 S 0.415 +42 I 0.385 +43 H 0.338 +44 S 0.274 +45 S 0.201 +46 G 0.135 +47 F 0.090 +48 R 0.066 +49 D 0.056 +50 F 0.056 +51 L 0.060 +52 L 0.062 +53 K 0.061 +54 P 0.058 +55 E 0.057 +56 L 0.060 +57 L 0.064 +58 R 0.066 +59 A 0.062 +60 I 0.057 +61 V 0.055 +62 D 0.057 +63 C 0.063 +64 G 0.068 +65 F 0.069 +66 E 0.069 +67 H 0.068 +68 P 0.063 +69 S 0.056 +70 E 0.052 +71 V 0.053 +72 Q 0.056 +73 H 0.055 +74 E 0.051 +75 C 0.045 +76 I 0.040 +77 P 0.037 +78 Q 0.037 +79 A 0.045 +80 I 0.061 +81 L 0.080 +82 G 0.097 +83 M 0.107 +84 D 0.109 +85 V 0.103 +86 L 0.097 +87 C 0.096 +88 Q 0.102 +89 A 0.109 +90 K 0.111 +91 S 0.112 +92 G 0.118 +93 M 0.124 +94 G 0.121 +95 K 0.109 +96 T 0.095 +97 A 0.084 +98 V 0.075 +99 F 0.068 +100 V 0.066 +101 L 0.067 +102 A 0.068 +103 T 0.067 +104 L 0.065 +105 Q 0.064 +106 Q 0.066 +107 L 0.074 +108 E 0.086 +109 P 0.098 +110 V 0.105 +111 T 0.111 +112 G 0.115 +113 Q 0.111 +114 V 0.092 +115 S 0.063 +116 V 0.041 +117 L 0.034 +118 V 0.036 +119 M 0.038 +120 C 0.036 +121 H 0.031 +122 T 0.027 +123 R 0.027 +124 E 0.031 +125 L 0.033 +126 A 0.032 +127 F 0.031 +128 Q 0.038 +129 I 0.054 +130 S 0.072 +131 K 0.076 +132 E 0.066 +133 Y 0.051 +134 E 0.039 +135 R 0.031 +136 F 0.027 +137 S 0.027 +138 K 0.028 +139 Y 0.030 +140 M 0.032 +141 P 0.034 +142 N 0.034 +143 V 0.031 +144 K 0.028 +145 V 0.024 +146 A 0.020 +147 V 0.017 +148 F 0.016 +149 F 0.018 +150 G 0.024 +151 G 0.033 +152 L 0.041 +153 S 0.044 +154 I 0.041 +155 K 0.037 +156 K 0.038 +157 D 0.046 +158 E 0.059 +159 E 0.068 +160 V 0.068 +161 L 0.061 +162 K 0.057 +163 K 0.057 +164 N 0.057 +165 C 0.053 +166 P 0.048 +167 H 0.047 +168 I 0.051 +169 V 0.055 +170 V 0.056 +171 G 0.054 +172 T 0.054 +173 P 0.054 +174 G 0.053 +175 R 0.049 +176 I 0.044 +177 L 0.041 +178 A 0.046 +179 L 0.056 +180 A 0.065 +181 R 0.069 +182 N 0.069 +183 K 0.066 +184 S 0.061 +185 L 0.055 +186 N 0.051 +187 L 0.051 +188 K 0.052 +189 H 0.050 +190 I 0.045 +191 K 0.037 +192 H 0.028 +193 F 0.022 +194 I 0.019 +195 L 0.019 +196 D 0.021 +197 E 0.023 +198 C 0.027 +199 D 0.032 +200 K 0.042 +201 M 0.052 +202 L 0.059 +203 E 0.063 +204 Q 0.067 +205 L 0.066 +206 D 0.062 +207 M 0.060 +208 R 0.062 +209 R 0.062 +210 D 0.053 +211 V 0.041 +212 Q 0.035 +213 E 0.036 +214 I 0.043 +215 F 0.051 +216 R 0.055 +217 M 0.049 +218 T 0.040 +219 P 0.035 +220 H 0.036 +221 E 0.037 +222 K 0.036 +223 Q 0.033 +224 V 0.034 +225 M 0.039 +226 M 0.046 +227 F 0.055 +228 S 0.066 +229 A 0.075 +230 T 0.084 +231 L 0.088 +232 S 0.083 +233 K 0.069 +234 E 0.055 +235 I 0.047 +236 R 0.041 +237 P 0.038 +238 V 0.036 +239 C 0.037 +240 R 0.039 +241 K 0.042 +242 F 0.049 +243 M 0.062 +244 Q 0.076 +245 D 0.086 +246 P 0.087 +247 M 0.088 +248 E 0.100 +249 I 0.129 +250 F 0.172 +251 V 0.222 +252 D 0.270 +253 D 0.304 +254 E 0.319 +255 T 0.320 +256 K 0.318 +257 L 0.308 +258 T 0.279 +259 L 0.232 +260 H 0.176 +261 G 0.124 +262 L 0.084 +263 Q 0.058 +264 Q 0.043 +265 Y 0.036 +266 Y 0.036 +267 V 0.041 +268 K 0.044 +269 L 0.043 +270 K 0.041 +271 D 0.041 +272 N 0.042 +273 E 0.042 +274 K 0.041 +275 N 0.042 +276 R 0.043 +277 K 0.042 +278 L 0.041 +279 F 0.041 +280 D 0.042 +281 L 0.045 +282 L 0.049 +283 D 0.054 +284 V 0.059 +285 L 0.058 +286 E 0.051 +287 F 0.042 +288 N 0.033 +289 Q 0.028 +290 V 0.031 +291 V 0.041 +292 I 0.052 +293 F 0.058 +294 V 0.055 +295 K 0.046 +296 S 0.038 +297 V 0.035 +298 Q 0.038 +299 R 0.042 +300 C 0.046 +301 I 0.048 +302 A 0.051 +303 L 0.059 +304 A 0.070 +305 Q 0.075 +306 L 0.073 +307 L 0.074 +308 V 0.080 +309 E 0.085 +310 Q 0.080 +311 N 0.072 +312 F 0.063 +313 P 0.056 +314 A 0.049 +315 I 0.041 +316 A 0.034 +317 I 0.031 +318 H 0.037 +319 R 0.052 +320 G 0.070 +321 M 0.080 +322 P 0.077 +323 Q 0.065 +324 E 0.051 +325 E 0.043 +326 R 0.044 +327 L 0.053 +328 S 0.063 +329 R 0.066 +330 Y 0.067 +331 Q 0.066 +332 Q 0.062 +333 F 0.056 +334 K 0.053 +335 D 0.055 +336 F 0.058 +337 Q 0.060 +338 R 0.058 +339 R 0.055 +340 I 0.055 +341 L 0.057 +342 V 0.057 +343 A 0.058 +344 T 0.067 +345 N 0.088 +346 L 0.116 +347 F 0.141 +348 G 0.151 +349 R 0.145 +350 G 0.131 +351 M 0.119 +352 D 0.110 +353 I 0.099 +354 E 0.083 +355 R 0.067 +356 V 0.054 +357 N 0.048 +358 I 0.043 +359 A 0.037 +360 F 0.035 +361 N 0.042 +362 Y 0.056 +363 D 0.074 +364 M 0.089 +365 P 0.093 +366 E 0.087 +367 D 0.080 +368 S 0.073 +369 D 0.062 +370 T 0.051 +371 Y 0.044 +372 L 0.040 +373 H 0.040 +374 R 0.046 +375 V 0.057 +376 A 0.071 +377 R 0.087 +378 A 0.103 +379 G 0.118 +380 R 0.129 +381 F 0.137 +382 G 0.138 +383 T 0.133 +384 K 0.126 +385 G 0.121 +386 L 0.116 +387 A 0.110 +388 I 0.102 +389 T 0.095 +390 F 0.096 +391 V 0.102 +392 S 0.103 +393 D 0.096 +394 E 0.088 +395 N 0.085 +396 D 0.087 +397 A 0.095 +398 K 0.100 +399 I 0.095 +400 L 0.082 +401 N 0.073 +402 D 0.071 +403 V 0.076 +404 Q 0.084 +405 D 0.086 +406 R 0.079 +407 F 0.072 +408 E 0.069 +409 V 0.073 +410 N 0.076 +411 I 0.077 +412 S 0.074 +413 E 0.071 +414 L 0.072 +415 P 0.080 +416 D 0.090 +417 E 0.094 +418 I 0.086 +419 D 0.074 +420 I 0.065 +421 S 0.063 +422 S 0.069 +423 Y 0.090 +424 I 0.132 +425 E 0.195 +426 Q 0.260 +427 T 0.305 +428 R 0.324 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019432.16_ENSMUST00000173731.8_GN:Ddx39b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:55.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019432.16_ENSMUST00000173731.8_GN:Ddx39b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:55.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..cfaed48b8c7306b1632243f25a9abcc7b93340d4 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019432.16_ENSMUST00000173731.8_GN:Ddx39b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:55.caid @@ -0,0 +1,484 @@ +>ENSMUSG00000019432.16|ENSMUST00000173731.8|GN:Ddx39b|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:55 +1 M 0.330 +2 S 0.346 +3 F 0.380 +4 S 0.418 +5 G 0.439 +6 F 0.438 +7 F 0.439 +8 V 0.452 +9 V 0.470 +10 P 0.493 +11 S 0.515 +12 P 0.510 +13 S 0.458 +14 S 0.406 +15 S 0.417 +16 V 0.478 +17 G 0.522 +18 N 0.536 +19 W 0.550 +20 C 0.563 +21 L 0.564 +22 S 0.570 +23 P 0.583 +24 C 0.588 +25 C 0.577 +26 S 0.564 +27 S 0.563 +28 T 0.572 +29 P 0.581 +30 L 0.588 +31 F 0.601 +32 G 0.623 +33 P 0.644 +34 C 0.648 +35 F 0.624 +36 L 0.576 +37 T 0.545 +38 C 0.564 +39 S 0.615 +40 G 0.657 +41 T 0.680 +42 P 0.693 +43 N 0.704 +44 S 0.706 +45 R 0.694 +46 D 0.666 +47 L 0.629 +48 P 0.598 +49 S 0.581 +50 P 0.569 +51 P 0.556 +52 A 0.571 +53 G 0.630 +54 P 0.702 +55 I 0.748 +56 M 0.766 +57 A 0.772 +58 E 0.771 +59 N 0.763 +60 D 0.749 +61 V 0.731 +62 D 0.714 +63 N 0.696 +64 E 0.674 +65 L 0.647 +66 L 0.623 +67 D 0.606 +68 Y 0.601 +69 E 0.610 +70 D 0.624 +71 D 0.627 +72 E 0.607 +73 V 0.577 +74 E 0.581 +75 T 0.639 +76 A 0.708 +77 A 0.747 +78 G 0.756 +79 A 0.754 +80 D 0.748 +81 G 0.734 +82 T 0.713 +83 E 0.695 +84 A 0.689 +85 P 0.698 +86 A 0.711 +87 K 0.717 +88 K 0.712 +89 D 0.695 +90 V 0.668 +91 K 0.631 +92 G 0.587 +93 S 0.543 +94 Y 0.508 +95 V 0.482 +96 S 0.451 +97 I 0.407 +98 H 0.347 +99 S 0.275 +100 S 0.199 +101 G 0.133 +102 F 0.088 +103 R 0.064 +104 D 0.054 +105 F 0.053 +106 L 0.056 +107 L 0.058 +108 K 0.056 +109 P 0.052 +110 E 0.050 +111 L 0.049 +112 L 0.048 +113 R 0.047 +114 A 0.046 +115 I 0.046 +116 V 0.047 +117 D 0.052 +118 C 0.058 +119 G 0.062 +120 F 0.063 +121 E 0.062 +122 H 0.061 +123 P 0.056 +124 S 0.050 +125 E 0.047 +126 V 0.049 +127 Q 0.052 +128 H 0.052 +129 E 0.048 +130 C 0.043 +131 I 0.038 +132 P 0.035 +133 Q 0.035 +134 A 0.043 +135 I 0.058 +136 L 0.077 +137 G 0.095 +138 M 0.107 +139 D 0.111 +140 V 0.106 +141 L 0.099 +142 C 0.099 +143 Q 0.105 +144 A 0.111 +145 K 0.113 +146 S 0.116 +147 G 0.124 +148 M 0.132 +149 G 0.127 +150 K 0.113 +151 T 0.098 +152 A 0.087 +153 V 0.078 +154 F 0.070 +155 V 0.066 +156 L 0.067 +157 A 0.067 +158 T 0.065 +159 L 0.063 +160 Q 0.062 +161 Q 0.066 +162 L 0.074 +163 E 0.088 +164 P 0.100 +165 V 0.106 +166 T 0.110 +167 G 0.112 +168 Q 0.108 +169 V 0.089 +170 S 0.062 +171 V 0.041 +172 L 0.034 +173 V 0.036 +174 M 0.038 +175 C 0.036 +176 H 0.030 +177 T 0.025 +178 R 0.025 +179 E 0.029 +180 L 0.031 +181 A 0.030 +182 F 0.029 +183 Q 0.036 +184 I 0.051 +185 S 0.068 +186 K 0.073 +187 E 0.063 +188 Y 0.048 +189 E 0.035 +190 R 0.028 +191 F 0.024 +192 S 0.024 +193 K 0.026 +194 Y 0.027 +195 M 0.029 +196 P 0.030 +197 N 0.029 +198 V 0.027 +199 K 0.024 +200 V 0.020 +201 A 0.017 +202 V 0.015 +203 F 0.014 +204 F 0.016 +205 G 0.021 +206 G 0.030 +207 L 0.038 +208 S 0.040 +209 I 0.037 +210 K 0.033 +211 K 0.035 +212 D 0.043 +213 E 0.056 +214 E 0.066 +215 V 0.064 +216 L 0.057 +217 K 0.053 +218 K 0.053 +219 N 0.052 +220 C 0.048 +221 P 0.043 +222 H 0.043 +223 I 0.047 +224 V 0.052 +225 V 0.053 +226 G 0.051 +227 T 0.050 +228 P 0.052 +229 G 0.052 +230 R 0.048 +231 I 0.042 +232 L 0.039 +233 A 0.042 +234 L 0.051 +235 A 0.058 +236 R 0.061 +237 N 0.060 +238 K 0.056 +239 S 0.051 +240 L 0.045 +241 N 0.043 +242 L 0.044 +243 K 0.046 +244 H 0.044 +245 I 0.039 +246 K 0.031 +247 H 0.024 +248 F 0.019 +249 I 0.017 +250 L 0.018 +251 D 0.020 +252 E 0.023 +253 C 0.026 +254 D 0.032 +255 K 0.040 +256 M 0.049 +257 L 0.055 +258 E 0.058 +259 Q 0.060 +260 L 0.060 +261 D 0.057 +262 M 0.056 +263 R 0.059 +264 R 0.060 +265 D 0.052 +266 V 0.040 +267 Q 0.033 +268 E 0.032 +269 I 0.033 +270 F 0.033 +271 R 0.032 +272 M 0.031 +273 T 0.030 +274 P 0.032 +275 H 0.035 +276 E 0.037 +277 K 0.036 +278 Q 0.034 +279 V 0.036 +280 M 0.041 +281 M 0.049 +282 F 0.058 +283 S 0.069 +284 A 0.079 +285 T 0.089 +286 L 0.094 +287 S 0.088 +288 K 0.073 +289 E 0.059 +290 I 0.051 +291 R 0.046 +292 P 0.042 +293 V 0.040 +294 C 0.042 +295 R 0.045 +296 K 0.049 +297 F 0.056 +298 M 0.069 +299 Q 0.084 +300 D 0.094 +301 P 0.095 +302 M 0.094 +303 E 0.105 +304 I 0.135 +305 F 0.180 +306 V 0.232 +307 D 0.281 +308 D 0.315 +309 E 0.328 +310 T 0.331 +311 K 0.332 +312 L 0.324 +313 T 0.295 +314 L 0.245 +315 H 0.186 +316 G 0.132 +317 L 0.090 +318 Q 0.062 +319 Q 0.045 +320 Y 0.038 +321 Y 0.038 +322 V 0.043 +323 K 0.047 +324 L 0.047 +325 K 0.045 +326 D 0.044 +327 N 0.045 +328 E 0.045 +329 K 0.043 +330 N 0.043 +331 R 0.043 +332 K 0.043 +333 L 0.041 +334 F 0.041 +335 D 0.042 +336 L 0.046 +337 L 0.050 +338 D 0.056 +339 V 0.061 +340 L 0.060 +341 E 0.054 +342 F 0.044 +343 N 0.035 +344 Q 0.030 +345 V 0.034 +346 V 0.044 +347 I 0.056 +348 F 0.062 +349 V 0.057 +350 K 0.047 +351 S 0.038 +352 V 0.036 +353 Q 0.040 +354 R 0.045 +355 C 0.048 +356 I 0.050 +357 A 0.052 +358 L 0.060 +359 A 0.071 +360 Q 0.076 +361 L 0.074 +362 L 0.074 +363 V 0.081 +364 E 0.085 +365 Q 0.081 +366 N 0.071 +367 F 0.063 +368 P 0.055 +369 A 0.049 +370 I 0.041 +371 A 0.034 +372 I 0.031 +373 H 0.037 +374 R 0.052 +375 G 0.070 +376 M 0.080 +377 P 0.077 +378 Q 0.066 +379 E 0.053 +380 E 0.044 +381 R 0.045 +382 L 0.054 +383 S 0.063 +384 R 0.066 +385 Y 0.065 +386 Q 0.064 +387 Q 0.060 +388 F 0.055 +389 K 0.054 +390 D 0.055 +391 F 0.058 +392 Q 0.058 +393 R 0.056 +394 R 0.054 +395 I 0.056 +396 L 0.058 +397 V 0.058 +398 A 0.059 +399 T 0.067 +400 N 0.087 +401 L 0.114 +402 F 0.137 +403 G 0.146 +404 R 0.139 +405 G 0.124 +406 M 0.112 +407 D 0.104 +408 I 0.093 +409 E 0.080 +410 R 0.065 +411 V 0.055 +412 N 0.049 +413 I 0.045 +414 A 0.039 +415 F 0.037 +416 N 0.043 +417 Y 0.057 +418 D 0.075 +419 M 0.089 +420 P 0.092 +421 E 0.087 +422 D 0.080 +423 S 0.073 +424 D 0.063 +425 T 0.052 +426 Y 0.045 +427 L 0.042 +428 H 0.041 +429 R 0.047 +430 V 0.059 +431 A 0.073 +432 R 0.089 +433 A 0.104 +434 G 0.118 +435 R 0.129 +436 F 0.137 +437 G 0.140 +438 T 0.137 +439 K 0.132 +440 G 0.128 +441 L 0.123 +442 A 0.116 +443 I 0.106 +444 T 0.099 +445 F 0.100 +446 V 0.105 +447 S 0.107 +448 D 0.100 +449 E 0.092 +450 N 0.088 +451 D 0.090 +452 A 0.095 +453 K 0.099 +454 I 0.095 +455 L 0.084 +456 N 0.076 +457 D 0.075 +458 V 0.080 +459 Q 0.087 +460 D 0.089 +461 R 0.083 +462 F 0.075 +463 E 0.073 +464 V 0.075 +465 N 0.079 +466 I 0.079 +467 S 0.076 +468 E 0.073 +469 L 0.073 +470 P 0.082 +471 D 0.092 +472 E 0.096 +473 I 0.089 +474 D 0.076 +475 I 0.067 +476 S 0.065 +477 S 0.071 +478 Y 0.092 +479 I 0.135 +480 E 0.201 +481 Q 0.272 +482 T 0.322 +483 R 0.345 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019795.18_ENSMUST00000162606.8_GN:Pcmt1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019795.18_ENSMUST00000162606.8_GN:Pcmt1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..902227923f5636f2a27b7086dcc5a34aca8354a9 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019795.18_ENSMUST00000162606.8_GN:Pcmt1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,229 @@ +>ENSMUSG00000019795.18|ENSMUST00000162606.8|GN:Pcmt1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.309 +2 A 0.291 +3 W 0.268 +4 K 0.254 +5 S 0.246 +6 G 0.230 +7 G 0.204 +8 A 0.173 +9 S 0.141 +10 H 0.108 +11 S 0.083 +12 E 0.072 +13 L 0.072 +14 I 0.079 +15 H 0.086 +16 N 0.086 +17 L 0.084 +18 R 0.088 +19 K 0.100 +20 N 0.109 +21 G 0.107 +22 I 0.096 +23 I 0.081 +24 K 0.068 +25 T 0.056 +26 D 0.049 +27 K 0.049 +28 V 0.056 +29 F 0.068 +30 E 0.077 +31 V 0.078 +32 M 0.074 +33 L 0.072 +34 A 0.071 +35 T 0.067 +36 D 0.057 +37 R 0.048 +38 S 0.048 +39 H 0.056 +40 Y 0.065 +41 A 0.076 +42 K 0.092 +43 S 0.111 +44 N 0.128 +45 P 0.136 +46 Y 0.139 +47 M 0.148 +48 D 0.163 +49 S 0.172 +50 P 0.167 +51 Q 0.148 +52 S 0.126 +53 I 0.115 +54 G 0.118 +55 F 0.126 +56 Q 0.129 +57 A 0.128 +58 T 0.128 +59 I 0.135 +60 S 0.146 +61 A 0.151 +62 P 0.142 +63 H 0.125 +64 M 0.110 +65 H 0.100 +66 A 0.090 +67 Y 0.080 +68 A 0.071 +69 L 0.064 +70 E 0.057 +71 L 0.051 +72 L 0.045 +73 F 0.040 +74 D 0.037 +75 Q 0.039 +76 L 0.048 +77 H 0.063 +78 E 0.077 +79 G 0.078 +80 A 0.070 +81 K 0.061 +82 A 0.055 +83 L 0.052 +84 D 0.050 +85 V 0.046 +86 G 0.042 +87 S 0.043 +88 G 0.052 +89 S 0.065 +90 G 0.072 +91 I 0.070 +92 L 0.063 +93 T 0.056 +94 A 0.050 +95 C 0.046 +96 F 0.047 +97 A 0.050 +98 R 0.053 +99 M 0.056 +100 V 0.061 +101 G 0.073 +102 N 0.088 +103 S 0.093 +104 G 0.086 +105 K 0.075 +106 V 0.065 +107 I 0.056 +108 G 0.048 +109 I 0.046 +110 D 0.046 +111 H 0.043 +112 I 0.038 +113 K 0.036 +114 E 0.040 +115 L 0.051 +116 V 0.063 +117 D 0.071 +118 D 0.071 +119 S 0.070 +120 I 0.074 +121 T 0.077 +122 N 0.071 +123 V 0.060 +124 K 0.051 +125 K 0.048 +126 D 0.047 +127 D 0.045 +128 P 0.042 +129 M 0.044 +130 L 0.052 +131 L 0.063 +132 S 0.069 +133 S 0.067 +134 G 0.057 +135 R 0.046 +136 V 0.041 +137 R 0.047 +138 L 0.060 +139 V 0.074 +140 V 0.083 +141 G 0.084 +142 D 0.084 +143 G 0.086 +144 R 0.090 +145 M 0.091 +146 G 0.086 +147 Y 0.078 +148 A 0.070 +149 E 0.064 +150 E 0.057 +151 A 0.051 +152 P 0.047 +153 Y 0.046 +154 D 0.046 +155 A 0.045 +156 I 0.043 +157 H 0.043 +158 V 0.048 +159 G 0.059 +160 A 0.080 +161 A 0.105 +162 A 0.123 +163 P 0.125 +164 V 0.116 +165 V 0.103 +166 P 0.088 +167 Q 0.076 +168 A 0.069 +169 L 0.062 +170 I 0.056 +171 D 0.052 +172 Q 0.053 +173 L 0.061 +174 K 0.072 +175 P 0.079 +176 G 0.074 +177 G 0.064 +178 R 0.063 +179 L 0.073 +180 I 0.093 +181 L 0.124 +182 P 0.158 +183 V 0.185 +184 G 0.197 +185 P 0.202 +186 A 0.204 +187 G 0.205 +188 G 0.202 +189 N 0.188 +190 Q 0.165 +191 M 0.135 +192 L 0.107 +193 E 0.084 +194 Q 0.069 +195 Y 0.063 +196 D 0.063 +197 K 0.068 +198 L 0.078 +199 Q 0.091 +200 D 0.105 +201 G 0.112 +202 S 0.105 +203 V 0.089 +204 K 0.074 +205 M 0.070 +206 K 0.074 +207 P 0.081 +208 L 0.085 +209 M 0.088 +210 G 0.089 +211 V 0.088 +212 I 0.087 +213 Y 0.091 +214 V 0.100 +215 P 0.110 +216 L 0.120 +217 T 0.137 +218 D 0.170 +219 K 0.216 +220 E 0.261 +221 K 0.299 +222 Q 0.335 +223 W 0.374 +224 S 0.418 +225 R 0.464 +226 D 0.494 +227 E 0.491 +228 L 0.472 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019795.18_ENSMUST00000162606.8_GN:Pcmt1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:58.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019795.18_ENSMUST00000162606.8_GN:Pcmt1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:58.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..61809f7e5829e7535e3cbabdb0724bcde04a6e01 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019795.18_ENSMUST00000162606.8_GN:Pcmt1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:58.caid @@ -0,0 +1,287 @@ +>ENSMUSG00000019795.18|ENSMUST00000162606.8|GN:Pcmt1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:58 +1 M 0.410 +2 P 0.438 +3 G 0.478 +4 A 0.505 +5 R 0.500 +6 I 0.473 +7 G 0.459 +8 G 0.458 +9 S 0.434 +10 G 0.397 +11 S 0.403 +12 D 0.450 +13 G 0.481 +14 S 0.494 +15 N 0.530 +16 S 0.583 +17 G 0.621 +18 R 0.637 +19 S 0.647 +20 S 0.658 +21 G 0.670 +22 D 0.680 +23 T 0.687 +24 S 0.687 +25 G 0.666 +26 A 0.603 +27 V 0.496 +28 T 0.376 +29 V 0.279 +30 W 0.222 +31 E 0.197 +32 V 0.178 +33 V 0.161 +34 S 0.155 +35 L 0.164 +36 L 0.183 +37 G 0.204 +38 K 0.227 +39 L 0.264 +40 L 0.321 +41 G 0.372 +42 T 0.377 +43 V 0.333 +44 A 0.272 +45 A 0.219 +46 L 0.180 +47 K 0.160 +48 V 0.154 +49 V 0.153 +50 L 0.149 +51 Y 0.144 +52 L 0.146 +53 L 0.158 +54 R 0.180 +55 V 0.212 +56 C 0.251 +57 F 0.287 +58 A 0.304 +59 M 0.293 +60 A 0.266 +61 W 0.238 +62 K 0.218 +63 S 0.205 +64 G 0.192 +65 G 0.174 +66 A 0.150 +67 S 0.123 +68 H 0.096 +69 S 0.075 +70 E 0.063 +71 L 0.055 +72 I 0.051 +73 H 0.052 +74 N 0.056 +75 L 0.059 +76 R 0.064 +77 K 0.076 +78 N 0.090 +79 G 0.093 +80 I 0.085 +81 I 0.072 +82 K 0.060 +83 T 0.050 +84 D 0.044 +85 K 0.041 +86 V 0.042 +87 F 0.043 +88 E 0.046 +89 V 0.051 +90 M 0.056 +91 L 0.060 +92 A 0.063 +93 T 0.060 +94 D 0.050 +95 R 0.042 +96 S 0.042 +97 H 0.048 +98 Y 0.056 +99 A 0.065 +100 K 0.079 +101 S 0.096 +102 N 0.110 +103 P 0.117 +104 Y 0.120 +105 M 0.126 +106 D 0.138 +107 S 0.148 +108 P 0.145 +109 Q 0.130 +110 S 0.111 +111 I 0.102 +112 G 0.106 +113 F 0.114 +114 Q 0.118 +115 A 0.117 +116 T 0.117 +117 I 0.124 +118 S 0.134 +119 A 0.138 +120 P 0.129 +121 H 0.114 +122 M 0.101 +123 H 0.092 +124 A 0.083 +125 Y 0.074 +126 A 0.066 +127 L 0.059 +128 E 0.053 +129 L 0.048 +130 L 0.043 +131 F 0.037 +132 D 0.035 +133 Q 0.037 +134 L 0.046 +135 H 0.060 +136 E 0.072 +137 G 0.075 +138 A 0.068 +139 K 0.060 +140 A 0.053 +141 L 0.050 +142 D 0.047 +143 V 0.044 +144 G 0.041 +145 S 0.043 +146 G 0.052 +147 S 0.064 +148 G 0.071 +149 I 0.069 +150 L 0.063 +151 T 0.055 +152 A 0.050 +153 C 0.046 +154 F 0.047 +155 A 0.051 +156 R 0.055 +157 M 0.058 +158 V 0.065 +159 G 0.078 +160 N 0.093 +161 S 0.099 +162 G 0.091 +163 K 0.078 +164 V 0.067 +165 I 0.056 +166 G 0.048 +167 I 0.046 +168 D 0.046 +169 H 0.044 +170 I 0.039 +171 K 0.038 +172 E 0.042 +173 L 0.051 +174 V 0.062 +175 D 0.069 +176 D 0.069 +177 S 0.069 +178 I 0.074 +179 T 0.076 +180 N 0.071 +181 V 0.059 +182 K 0.050 +183 K 0.046 +184 D 0.045 +185 D 0.043 +186 P 0.040 +187 M 0.042 +188 L 0.050 +189 L 0.061 +190 S 0.067 +191 S 0.065 +192 G 0.055 +193 R 0.044 +194 V 0.040 +195 R 0.046 +196 L 0.059 +197 V 0.074 +198 V 0.083 +199 G 0.085 +200 D 0.084 +201 G 0.086 +202 R 0.090 +203 M 0.090 +204 G 0.084 +205 Y 0.076 +206 A 0.068 +207 E 0.062 +208 E 0.056 +209 A 0.050 +210 P 0.047 +211 Y 0.047 +212 D 0.047 +213 A 0.046 +214 I 0.044 +215 H 0.045 +216 V 0.049 +217 G 0.061 +218 A 0.082 +219 A 0.106 +220 A 0.121 +221 P 0.122 +222 V 0.112 +223 V 0.099 +224 P 0.085 +225 Q 0.074 +226 A 0.068 +227 L 0.061 +228 I 0.054 +229 D 0.050 +230 Q 0.051 +231 L 0.058 +232 K 0.070 +233 P 0.077 +234 G 0.073 +235 G 0.065 +236 R 0.065 +237 L 0.076 +238 I 0.097 +239 L 0.127 +240 P 0.161 +241 V 0.185 +242 G 0.197 +243 P 0.200 +244 A 0.202 +245 G 0.203 +246 G 0.199 +247 N 0.187 +248 Q 0.164 +249 M 0.136 +250 L 0.108 +251 E 0.085 +252 Q 0.070 +253 Y 0.062 +254 D 0.061 +255 K 0.066 +256 L 0.076 +257 Q 0.090 +258 D 0.105 +259 G 0.112 +260 S 0.105 +261 V 0.089 +262 K 0.075 +263 M 0.071 +264 K 0.075 +265 P 0.082 +266 L 0.087 +267 M 0.089 +268 G 0.091 +269 V 0.091 +270 I 0.092 +271 Y 0.096 +272 V 0.106 +273 P 0.115 +274 L 0.124 +275 T 0.140 +276 D 0.173 +277 K 0.218 +278 E 0.264 +279 K 0.302 +280 Q 0.337 +281 W 0.374 +282 S 0.416 +283 R 0.459 +284 D 0.489 +285 E 0.487 +286 L 0.468 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019987.10_ENSMUST00000020161.10_GN:Arg1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019987.10_ENSMUST00000020161.10_GN:Arg1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..26d965725955d3b3a79509f9e9a02731dfbadebc --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019987.10_ENSMUST00000020161.10_GN:Arg1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,324 @@ +>ENSMUSG00000019987.10|ENSMUST00000020161.10|GN:Arg1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.374 +2 S 0.353 +3 S 0.313 +4 K 0.254 +5 P 0.183 +6 K 0.118 +7 S 0.076 +8 L 0.063 +9 E 0.073 +10 I 0.097 +11 I 0.125 +12 G 0.144 +13 A 0.149 +14 P 0.146 +15 F 0.144 +16 S 0.151 +17 K 0.162 +18 G 0.174 +19 Q 0.187 +20 P 0.208 +21 R 0.231 +22 G 0.246 +23 G 0.238 +24 V 0.212 +25 E 0.177 +26 K 0.144 +27 G 0.118 +28 P 0.099 +29 A 0.091 +30 A 0.093 +31 L 0.095 +32 R 0.088 +33 K 0.075 +34 A 0.065 +35 G 0.062 +36 L 0.064 +37 L 0.069 +38 E 0.071 +39 K 0.068 +40 L 0.062 +41 K 0.060 +42 E 0.063 +43 T 0.067 +44 E 0.067 +45 Y 0.065 +46 D 0.064 +47 V 0.067 +48 R 0.074 +49 D 0.085 +50 H 0.098 +51 G 0.110 +52 D 0.117 +53 L 0.113 +54 A 0.103 +55 F 0.097 +56 V 0.104 +57 D 0.124 +58 V 0.149 +59 P 0.173 +60 N 0.192 +61 D 0.210 +62 S 0.224 +63 S 0.226 +64 F 0.221 +65 Q 0.219 +66 I 0.226 +67 V 0.231 +68 K 0.223 +69 N 0.202 +70 P 0.180 +71 R 0.164 +72 S 0.155 +73 V 0.149 +74 G 0.137 +75 K 0.122 +76 A 0.111 +77 N 0.104 +78 E 0.093 +79 E 0.079 +80 L 0.067 +81 A 0.059 +82 G 0.054 +83 V 0.052 +84 V 0.056 +85 A 0.061 +86 E 0.062 +87 V 0.058 +88 Q 0.058 +89 K 0.070 +90 N 0.090 +91 G 0.107 +92 R 0.115 +93 V 0.115 +94 S 0.114 +95 V 0.117 +96 V 0.125 +97 L 0.130 +98 G 0.126 +99 G 0.119 +100 D 0.117 +101 H 0.119 +102 S 0.116 +103 L 0.105 +104 A 0.093 +105 V 0.081 +106 G 0.072 +107 S 0.067 +108 I 0.064 +109 S 0.063 +110 G 0.057 +111 H 0.049 +112 A 0.045 +113 R 0.047 +114 V 0.048 +115 H 0.047 +116 P 0.046 +117 D 0.048 +118 L 0.057 +119 C 0.077 +120 V 0.107 +121 I 0.136 +122 W 0.152 +123 V 0.149 +124 D 0.133 +125 A 0.115 +126 H 0.110 +127 T 0.114 +128 D 0.119 +129 I 0.117 +130 N 0.106 +131 T 0.097 +132 P 0.100 +133 L 0.114 +134 T 0.134 +135 T 0.152 +136 S 0.163 +137 S 0.166 +138 G 0.161 +139 N 0.155 +140 L 0.152 +141 H 0.154 +142 G 0.152 +143 Q 0.143 +144 P 0.130 +145 V 0.117 +146 S 0.109 +147 F 0.105 +148 L 0.104 +149 L 0.100 +150 K 0.096 +151 E 0.093 +152 L 0.095 +153 K 0.104 +154 G 0.121 +155 K 0.148 +156 F 0.174 +157 P 0.188 +158 D 0.186 +159 V 0.170 +160 P 0.143 +161 G 0.113 +162 F 0.089 +163 S 0.076 +164 W 0.074 +165 V 0.080 +166 T 0.082 +167 P 0.076 +168 C 0.067 +169 I 0.061 +170 S 0.059 +171 A 0.061 +172 K 0.066 +173 D 0.071 +174 I 0.079 +175 V 0.090 +176 Y 0.103 +177 I 0.113 +178 G 0.114 +179 L 0.112 +180 R 0.113 +181 D 0.119 +182 V 0.122 +183 D 0.116 +184 P 0.105 +185 G 0.094 +186 E 0.088 +187 H 0.086 +188 Y 0.084 +189 I 0.077 +190 I 0.065 +191 K 0.057 +192 T 0.058 +193 L 0.067 +194 G 0.077 +195 I 0.081 +196 K 0.074 +197 Y 0.065 +198 F 0.061 +199 S 0.065 +200 M 0.072 +201 T 0.076 +202 E 0.071 +203 V 0.062 +204 D 0.058 +205 K 0.058 +206 L 0.061 +207 G 0.059 +208 I 0.052 +209 G 0.044 +210 K 0.038 +211 V 0.034 +212 M 0.031 +213 E 0.030 +214 E 0.029 +215 T 0.027 +216 F 0.025 +217 S 0.024 +218 Y 0.026 +219 L 0.033 +220 L 0.045 +221 G 0.057 +222 R 0.065 +223 K 0.068 +224 K 0.073 +225 R 0.077 +226 P 0.078 +227 I 0.077 +228 H 0.084 +229 L 0.101 +230 S 0.126 +231 F 0.151 +232 D 0.163 +233 V 0.158 +234 D 0.145 +235 G 0.131 +236 L 0.116 +237 D 0.099 +238 P 0.086 +239 A 0.081 +240 F 0.082 +241 T 0.083 +242 P 0.085 +243 A 0.089 +244 T 0.098 +245 G 0.113 +246 T 0.134 +247 P 0.151 +248 V 0.158 +249 L 0.159 +250 G 0.156 +251 G 0.147 +252 L 0.129 +253 S 0.103 +254 Y 0.079 +255 R 0.067 +256 E 0.066 +257 G 0.068 +258 L 0.065 +259 Y 0.056 +260 I 0.047 +261 T 0.041 +262 E 0.038 +263 E 0.036 +264 I 0.034 +265 Y 0.034 +266 K 0.037 +267 T 0.041 +268 G 0.044 +269 L 0.046 +270 L 0.048 +271 S 0.050 +272 G 0.056 +273 L 0.068 +274 D 0.080 +275 I 0.086 +276 M 0.085 +277 E 0.085 +278 V 0.087 +279 N 0.092 +280 P 0.101 +281 T 0.114 +282 L 0.126 +283 G 0.127 +284 K 0.114 +285 T 0.096 +286 A 0.083 +287 E 0.079 +288 E 0.080 +289 V 0.079 +290 K 0.075 +291 S 0.072 +292 T 0.071 +293 V 0.069 +294 N 0.065 +295 T 0.061 +296 A 0.058 +297 V 0.056 +298 A 0.054 +299 L 0.050 +300 T 0.044 +301 L 0.038 +302 A 0.035 +303 C 0.038 +304 F 0.054 +305 G 0.089 +306 T 0.141 +307 Q 0.199 +308 R 0.251 +309 E 0.298 +310 G 0.342 +311 N 0.375 +312 H 0.390 +313 K 0.389 +314 P 0.379 +315 G 0.366 +316 T 0.354 +317 D 0.346 +318 Y 0.340 +319 L 0.336 +320 K 0.340 +321 P 0.347 +322 P 0.349 +323 K 0.345 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019987.10_ENSMUST00000020161.10_GN:Arg1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019987.10_ENSMUST00000020161.10_GN:Arg1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..203d3e241d72b3eb14013ba66d53cd069af05e26 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000019987.10_ENSMUST00000020161.10_GN:Arg1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid @@ -0,0 +1,336 @@ +>ENSMUSG00000019987.10|ENSMUST00000020161.10|GN:Arg1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:12 +1 M 0.365 +2 Q 0.352 +3 Q 0.354 +4 Q 0.387 +5 Q 0.436 +6 P 0.476 +7 L 0.504 +8 E 0.526 +9 P 0.538 +10 R 0.539 +11 E 0.532 +12 S 0.514 +13 M 0.476 +14 S 0.418 +15 S 0.351 +16 K 0.277 +17 P 0.198 +18 K 0.128 +19 S 0.083 +20 L 0.070 +21 E 0.080 +22 I 0.104 +23 I 0.130 +24 G 0.149 +25 A 0.153 +26 P 0.148 +27 F 0.146 +28 S 0.152 +29 K 0.163 +30 G 0.175 +31 Q 0.190 +32 P 0.212 +33 R 0.238 +34 G 0.252 +35 G 0.245 +36 V 0.217 +37 E 0.182 +38 K 0.148 +39 G 0.120 +40 P 0.101 +41 A 0.093 +42 A 0.095 +43 L 0.097 +44 R 0.089 +45 K 0.075 +46 A 0.065 +47 G 0.062 +48 L 0.065 +49 L 0.070 +50 E 0.072 +51 K 0.068 +52 L 0.060 +53 K 0.056 +54 E 0.058 +55 T 0.063 +56 E 0.065 +57 Y 0.064 +58 D 0.064 +59 V 0.067 +60 R 0.074 +61 D 0.084 +62 H 0.097 +63 G 0.108 +64 D 0.114 +65 L 0.111 +66 A 0.101 +67 F 0.096 +68 V 0.103 +69 D 0.123 +70 V 0.149 +71 P 0.173 +72 N 0.194 +73 D 0.212 +74 S 0.226 +75 S 0.229 +76 F 0.223 +77 Q 0.221 +78 I 0.227 +79 V 0.232 +80 K 0.224 +81 N 0.204 +82 P 0.183 +83 R 0.167 +84 S 0.158 +85 V 0.151 +86 G 0.139 +87 K 0.124 +88 A 0.114 +89 N 0.106 +90 E 0.095 +91 E 0.080 +92 L 0.068 +93 A 0.060 +94 G 0.055 +95 V 0.053 +96 V 0.057 +97 A 0.062 +98 E 0.062 +99 V 0.058 +100 Q 0.057 +101 K 0.068 +102 N 0.087 +103 G 0.105 +104 R 0.115 +105 V 0.116 +106 S 0.116 +107 V 0.119 +108 V 0.127 +109 L 0.131 +110 G 0.127 +111 G 0.120 +112 D 0.118 +113 H 0.121 +114 S 0.118 +115 L 0.108 +116 A 0.095 +117 V 0.084 +118 G 0.075 +119 S 0.070 +120 I 0.067 +121 S 0.066 +122 G 0.060 +123 H 0.052 +124 A 0.047 +125 R 0.049 +126 V 0.051 +127 H 0.049 +128 P 0.048 +129 D 0.050 +130 L 0.059 +131 C 0.081 +132 V 0.111 +133 I 0.140 +134 W 0.156 +135 V 0.154 +136 D 0.137 +137 A 0.119 +138 H 0.112 +139 T 0.117 +140 D 0.121 +141 I 0.118 +142 N 0.108 +143 T 0.099 +144 P 0.102 +145 L 0.117 +146 T 0.136 +147 T 0.154 +148 S 0.165 +149 S 0.168 +150 G 0.164 +151 N 0.158 +152 L 0.155 +153 H 0.156 +154 G 0.155 +155 Q 0.147 +156 P 0.133 +157 V 0.121 +158 S 0.113 +159 F 0.109 +160 L 0.108 +161 L 0.104 +162 K 0.100 +163 E 0.098 +164 L 0.100 +165 K 0.109 +166 G 0.127 +167 K 0.154 +168 F 0.179 +169 P 0.192 +170 D 0.189 +171 V 0.173 +172 P 0.146 +173 G 0.115 +174 F 0.090 +175 S 0.077 +176 W 0.075 +177 V 0.081 +178 T 0.082 +179 P 0.077 +180 C 0.069 +181 I 0.063 +182 S 0.061 +183 A 0.063 +184 K 0.068 +185 D 0.073 +186 I 0.082 +187 V 0.093 +188 Y 0.106 +189 I 0.115 +190 G 0.116 +191 L 0.113 +192 R 0.114 +193 D 0.120 +194 V 0.124 +195 D 0.117 +196 P 0.106 +197 G 0.096 +198 E 0.089 +199 H 0.087 +200 Y 0.085 +201 I 0.078 +202 I 0.065 +203 K 0.056 +204 T 0.058 +205 L 0.067 +206 G 0.077 +207 I 0.081 +208 K 0.075 +209 Y 0.066 +210 F 0.063 +211 S 0.066 +212 M 0.073 +213 T 0.076 +214 E 0.071 +215 V 0.063 +216 D 0.058 +217 K 0.058 +218 L 0.060 +219 G 0.059 +220 I 0.052 +221 G 0.044 +222 K 0.039 +223 V 0.035 +224 M 0.033 +225 E 0.032 +226 E 0.031 +227 T 0.029 +228 F 0.026 +229 S 0.025 +230 Y 0.028 +231 L 0.035 +232 L 0.046 +233 G 0.058 +234 R 0.065 +235 K 0.068 +236 K 0.073 +237 R 0.078 +238 P 0.080 +239 I 0.080 +240 H 0.088 +241 L 0.106 +242 S 0.132 +243 F 0.157 +244 D 0.169 +245 V 0.163 +246 D 0.149 +247 G 0.135 +248 L 0.119 +249 D 0.101 +250 P 0.088 +251 A 0.083 +252 F 0.084 +253 T 0.085 +254 P 0.086 +255 A 0.090 +256 T 0.100 +257 G 0.116 +258 T 0.137 +259 P 0.154 +260 V 0.161 +261 L 0.162 +262 G 0.158 +263 G 0.150 +264 L 0.131 +265 S 0.106 +266 Y 0.082 +267 R 0.070 +268 E 0.069 +269 G 0.072 +270 L 0.068 +271 Y 0.059 +272 I 0.049 +273 T 0.043 +274 E 0.039 +275 E 0.037 +276 I 0.034 +277 Y 0.034 +278 K 0.038 +279 T 0.042 +280 G 0.046 +281 L 0.049 +282 L 0.050 +283 S 0.052 +284 G 0.059 +285 L 0.070 +286 D 0.082 +287 I 0.088 +288 M 0.088 +289 E 0.088 +290 V 0.090 +291 N 0.095 +292 P 0.104 +293 T 0.118 +294 L 0.131 +295 G 0.132 +296 K 0.118 +297 T 0.100 +298 A 0.087 +299 E 0.083 +300 E 0.083 +301 V 0.082 +302 K 0.078 +303 S 0.075 +304 T 0.074 +305 V 0.072 +306 N 0.068 +307 T 0.064 +308 A 0.061 +309 V 0.058 +310 A 0.056 +311 L 0.052 +312 T 0.046 +313 L 0.039 +314 A 0.036 +315 C 0.040 +316 F 0.055 +317 G 0.092 +318 T 0.148 +319 Q 0.210 +320 R 0.266 +321 E 0.315 +322 G 0.360 +323 N 0.393 +324 H 0.409 +325 K 0.409 +326 P 0.400 +327 G 0.386 +328 T 0.370 +329 D 0.358 +330 Y 0.349 +331 L 0.344 +332 K 0.348 +333 P 0.357 +334 P 0.360 +335 K 0.356 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020125.8_ENSMUST00000046091.7_GN:Elane_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020125.8_ENSMUST00000046091.7_GN:Elane_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4dfe560f5e75cddb0c3d4dc8dba2b3e2594df689 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020125.8_ENSMUST00000046091.7_GN:Elane_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,266 @@ +>ENSMUSG00000020125.8|ENSMUST00000046091.7|GN:Elane|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.444 +2 A 0.465 +3 L 0.494 +4 G 0.505 +5 R 0.480 +6 L 0.433 +7 S 0.382 +8 S 0.332 +9 R 0.287 +10 T 0.266 +11 L 0.273 +12 A 0.289 +13 A 0.308 +14 M 0.335 +15 L 0.356 +16 L 0.358 +17 A 0.354 +18 L 0.365 +19 F 0.392 +20 L 0.426 +21 G 0.463 +22 G 0.497 +23 P 0.511 +24 A 0.493 +25 L 0.446 +26 A 0.387 +27 S 0.336 +28 E 0.301 +29 I 0.274 +30 V 0.240 +31 G 0.199 +32 G 0.162 +33 R 0.141 +34 P 0.137 +35 A 0.136 +36 R 0.130 +37 P 0.117 +38 H 0.101 +39 A 0.083 +40 W 0.064 +41 P 0.046 +42 F 0.034 +43 M 0.027 +44 A 0.028 +45 S 0.034 +46 L 0.047 +47 Q 0.063 +48 R 0.081 +49 R 0.099 +50 G 0.116 +51 G 0.118 +52 H 0.098 +53 F 0.065 +54 C 0.038 +55 G 0.026 +56 A 0.026 +57 T 0.032 +58 L 0.038 +59 I 0.040 +60 A 0.036 +61 R 0.031 +62 N 0.025 +63 F 0.021 +64 V 0.017 +65 M 0.015 +66 S 0.015 +67 A 0.018 +68 A 0.023 +69 H 0.029 +70 C 0.034 +71 V 0.040 +72 N 0.047 +73 G 0.054 +74 L 0.057 +75 N 0.054 +76 F 0.048 +77 R 0.041 +78 S 0.032 +79 V 0.025 +80 Q 0.021 +81 V 0.021 +82 V 0.025 +83 L 0.030 +84 G 0.038 +85 A 0.043 +86 H 0.043 +87 D 0.042 +88 L 0.045 +89 R 0.055 +90 R 0.070 +91 Q 0.081 +92 E 0.080 +93 R 0.070 +94 T 0.055 +95 R 0.044 +96 Q 0.037 +97 T 0.033 +98 F 0.029 +99 S 0.024 +100 V 0.021 +101 Q 0.019 +102 R 0.018 +103 I 0.019 +104 F 0.026 +105 E 0.041 +106 N 0.062 +107 G 0.082 +108 F 0.093 +109 D 0.091 +110 P 0.086 +111 S 0.089 +112 Q 0.103 +113 L 0.121 +114 L 0.124 +115 N 0.104 +116 D 0.071 +117 I 0.042 +118 V 0.024 +119 I 0.017 +120 I 0.017 +121 Q 0.021 +122 L 0.027 +123 N 0.035 +124 G 0.044 +125 S 0.055 +126 A 0.067 +127 T 0.077 +128 I 0.083 +129 N 0.084 +130 A 0.078 +131 N 0.066 +132 V 0.052 +133 Q 0.043 +134 V 0.044 +135 A 0.050 +136 Q 0.061 +137 L 0.080 +138 P 0.107 +139 A 0.133 +140 Q 0.149 +141 G 0.155 +142 Q 0.156 +143 G 0.148 +144 V 0.132 +145 G 0.114 +146 D 0.099 +147 R 0.087 +148 T 0.073 +149 P 0.056 +150 C 0.039 +151 L 0.029 +152 A 0.027 +153 M 0.030 +154 G 0.038 +155 W 0.050 +156 G 0.067 +157 R 0.083 +158 L 0.099 +159 G 0.118 +160 T 0.137 +161 N 0.148 +162 R 0.152 +163 P 0.150 +164 S 0.139 +165 P 0.120 +166 S 0.103 +167 V 0.092 +168 L 0.084 +169 Q 0.075 +170 E 0.065 +171 L 0.056 +172 N 0.048 +173 V 0.042 +174 T 0.040 +175 V 0.047 +176 V 0.059 +177 T 0.074 +178 N 0.085 +179 M 0.092 +180 C 0.097 +181 R 0.104 +182 R 0.109 +183 R 0.104 +184 V 0.086 +185 N 0.063 +186 V 0.047 +187 C 0.042 +188 T 0.047 +189 L 0.060 +190 V 0.081 +191 P 0.100 +192 R 0.112 +193 R 0.116 +194 Q 0.110 +195 A 0.098 +196 G 0.081 +197 I 0.067 +198 C 0.060 +199 F 0.061 +200 G 0.064 +201 D 0.066 +202 S 0.063 +203 G 0.060 +204 G 0.061 +205 P 0.064 +206 L 0.062 +207 V 0.055 +208 C 0.051 +209 N 0.050 +210 N 0.053 +211 L 0.055 +212 V 0.056 +213 Q 0.057 +214 G 0.057 +215 I 0.056 +216 D 0.053 +217 S 0.053 +218 F 0.060 +219 I 0.072 +220 R 0.081 +221 G 0.082 +222 G 0.081 +223 C 0.088 +224 G 0.103 +225 S 0.121 +226 G 0.133 +227 L 0.131 +228 Y 0.113 +229 P 0.087 +230 D 0.064 +231 A 0.053 +232 F 0.054 +233 A 0.063 +234 P 0.070 +235 V 0.072 +236 A 0.069 +237 E 0.067 +238 F 0.068 +239 A 0.072 +240 D 0.071 +241 W 0.060 +242 I 0.050 +243 N 0.046 +244 S 0.048 +245 I 0.056 +246 I 0.076 +247 R 0.112 +248 S 0.166 +249 H 0.228 +250 N 0.283 +251 D 0.317 +252 H 0.337 +253 L 0.354 +254 L 0.373 +255 T 0.395 +256 H 0.424 +257 P 0.456 +258 K 0.485 +259 D 0.510 +260 R 0.536 +261 E 0.560 +262 G 0.571 +263 R 0.553 +264 T 0.509 +265 N 0.467 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020125.8_ENSMUST00000046091.7_GN:Elane_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020125.8_ENSMUST00000046091.7_GN:Elane_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b28f7f83fa71c6abb263a0599924fbc790c57674 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020125.8_ENSMUST00000046091.7_GN:Elane_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid @@ -0,0 +1,276 @@ +>ENSMUSG00000020125.8|ENSMUST00000046091.7|GN:Elane|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:10 +1 M 0.412 +2 W 0.437 +3 G 0.472 +4 A 0.481 +5 A 0.443 +6 R 0.399 +7 T 0.417 +8 Q 0.502 +9 P 0.589 +10 T 0.636 +11 M 0.655 +12 A 0.661 +13 L 0.647 +14 G 0.602 +15 R 0.532 +16 L 0.462 +17 S 0.412 +18 S 0.383 +19 R 0.369 +20 T 0.360 +21 L 0.344 +22 A 0.322 +23 A 0.316 +24 M 0.328 +25 L 0.334 +26 L 0.330 +27 A 0.336 +28 L 0.359 +29 F 0.389 +30 L 0.419 +31 G 0.453 +32 G 0.486 +33 P 0.501 +34 A 0.486 +35 L 0.440 +36 A 0.382 +37 S 0.331 +38 E 0.297 +39 I 0.272 +40 V 0.240 +41 G 0.200 +42 G 0.163 +43 R 0.143 +44 P 0.139 +45 A 0.139 +46 R 0.133 +47 P 0.119 +48 H 0.102 +49 A 0.083 +50 W 0.064 +51 P 0.046 +52 F 0.034 +53 M 0.027 +54 A 0.027 +55 S 0.034 +56 L 0.047 +57 Q 0.063 +58 R 0.081 +59 R 0.099 +60 G 0.115 +61 G 0.117 +62 H 0.097 +63 F 0.064 +64 C 0.037 +65 G 0.025 +66 A 0.025 +67 T 0.032 +68 L 0.037 +69 I 0.039 +70 A 0.036 +71 R 0.030 +72 N 0.025 +73 F 0.020 +74 V 0.017 +75 M 0.015 +76 S 0.014 +77 A 0.017 +78 A 0.022 +79 H 0.028 +80 C 0.033 +81 V 0.038 +82 N 0.045 +83 G 0.052 +84 L 0.055 +85 N 0.053 +86 F 0.047 +87 R 0.040 +88 S 0.031 +89 V 0.024 +90 Q 0.021 +91 V 0.021 +92 V 0.025 +93 L 0.030 +94 G 0.037 +95 A 0.042 +96 H 0.042 +97 D 0.041 +98 L 0.044 +99 R 0.053 +100 R 0.067 +101 Q 0.078 +102 E 0.078 +103 R 0.068 +104 T 0.055 +105 R 0.044 +106 Q 0.037 +107 T 0.033 +108 F 0.028 +109 S 0.024 +110 V 0.020 +111 Q 0.018 +112 R 0.017 +113 I 0.019 +114 F 0.026 +115 E 0.041 +116 N 0.063 +117 G 0.083 +118 F 0.094 +119 D 0.093 +120 P 0.087 +121 S 0.089 +122 Q 0.104 +123 L 0.122 +124 L 0.125 +125 N 0.106 +126 D 0.072 +127 I 0.043 +128 V 0.025 +129 I 0.017 +130 I 0.017 +131 Q 0.021 +132 L 0.027 +133 N 0.035 +134 G 0.044 +135 S 0.056 +136 A 0.068 +137 T 0.078 +138 I 0.084 +139 N 0.085 +140 A 0.079 +141 N 0.066 +142 V 0.052 +143 Q 0.044 +144 V 0.044 +145 A 0.050 +146 Q 0.061 +147 L 0.080 +148 P 0.107 +149 A 0.133 +150 Q 0.149 +151 G 0.156 +152 Q 0.156 +153 G 0.149 +154 V 0.133 +155 G 0.114 +156 D 0.099 +157 R 0.087 +158 T 0.072 +159 P 0.055 +160 C 0.039 +161 L 0.030 +162 A 0.027 +163 M 0.030 +164 G 0.038 +165 W 0.051 +166 G 0.067 +167 R 0.083 +168 L 0.099 +169 G 0.118 +170 T 0.136 +171 N 0.147 +172 R 0.151 +173 P 0.149 +174 S 0.139 +175 P 0.121 +176 S 0.103 +177 V 0.093 +178 L 0.085 +179 Q 0.076 +180 E 0.066 +181 L 0.057 +182 N 0.048 +183 V 0.042 +184 T 0.040 +185 V 0.046 +186 V 0.059 +187 T 0.073 +188 N 0.084 +189 M 0.091 +190 C 0.096 +191 R 0.103 +192 R 0.109 +193 R 0.105 +194 V 0.086 +195 N 0.063 +196 V 0.047 +197 C 0.042 +198 T 0.046 +199 L 0.059 +200 V 0.079 +201 P 0.099 +202 R 0.112 +203 R 0.115 +204 Q 0.109 +205 A 0.096 +206 G 0.079 +207 I 0.066 +208 C 0.059 +209 F 0.059 +210 G 0.063 +211 D 0.065 +212 S 0.062 +213 G 0.059 +214 G 0.061 +215 P 0.064 +216 L 0.061 +217 V 0.055 +218 C 0.050 +219 N 0.050 +220 N 0.052 +221 L 0.055 +222 V 0.055 +223 Q 0.056 +224 G 0.057 +225 I 0.056 +226 D 0.052 +227 S 0.053 +228 F 0.061 +229 I 0.073 +230 R 0.081 +231 G 0.082 +232 G 0.082 +233 C 0.088 +234 G 0.103 +235 S 0.122 +236 G 0.134 +237 L 0.132 +238 Y 0.114 +239 P 0.088 +240 D 0.065 +241 A 0.053 +242 F 0.054 +243 A 0.063 +244 P 0.070 +245 V 0.072 +246 A 0.069 +247 E 0.064 +248 F 0.058 +249 A 0.051 +250 D 0.044 +251 W 0.038 +252 I 0.037 +253 N 0.039 +254 S 0.043 +255 I 0.052 +256 I 0.074 +257 R 0.112 +258 S 0.166 +259 H 0.229 +260 N 0.284 +261 D 0.319 +262 H 0.339 +263 L 0.357 +264 L 0.375 +265 T 0.397 +266 H 0.426 +267 P 0.458 +268 K 0.488 +269 D 0.514 +270 R 0.541 +271 E 0.565 +272 G 0.576 +273 R 0.559 +274 T 0.515 +275 N 0.473 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020583.5_ENSMUST00000020899.5_GN:Matn3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020583.5_ENSMUST00000020899.5_GN:Matn3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..265a7535bbd0ddd445b1e86b0f11a43190f75e8c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020583.5_ENSMUST00000020899.5_GN:Matn3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,482 @@ +>ENSMUSG00000020583.5|ENSMUST00000020899.5|GN:Matn3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.396 +2 L 0.415 +3 L 0.448 +4 S 0.489 +5 A 0.524 +6 P 0.542 +7 L 0.548 +8 R 0.556 +9 H 0.572 +10 L 0.593 +11 P 0.610 +12 G 0.605 +13 L 0.566 +14 L 0.506 +15 L 0.450 +16 L 0.419 +17 L 0.416 +18 W 0.426 +19 P 0.432 +20 L 0.428 +21 L 0.427 +22 L 0.445 +23 L 0.488 +24 P 0.544 +25 S 0.593 +26 L 0.619 +27 A 0.626 +28 A 0.624 +29 P 0.606 +30 G 0.569 +31 R 0.540 +32 L 0.534 +33 A 0.535 +34 R 0.543 +35 A 0.571 +36 S 0.588 +37 V 0.568 +38 R 0.548 +39 R 0.567 +40 L 0.593 +41 G 0.581 +42 T 0.558 +43 R 0.572 +44 V 0.619 +45 P 0.662 +46 G 0.684 +47 G 0.689 +48 S 0.689 +49 P 0.695 +50 G 0.702 +51 H 0.690 +52 L 0.646 +53 S 0.585 +54 A 0.551 +55 L 0.554 +56 A 0.561 +57 T 0.563 +58 S 0.582 +59 T 0.615 +60 R 0.640 +61 A 0.656 +62 P 0.676 +63 Y 0.699 +64 S 0.721 +65 G 0.734 +66 G 0.736 +67 R 0.725 +68 G 0.700 +69 A 0.649 +70 G 0.561 +71 V 0.442 +72 C 0.319 +73 K 0.220 +74 S 0.157 +75 R 0.118 +76 P 0.088 +77 L 0.064 +78 D 0.048 +79 L 0.038 +80 V 0.033 +81 F 0.033 +82 I 0.038 +83 I 0.045 +84 D 0.055 +85 S 0.067 +86 S 0.078 +87 R 0.084 +88 S 0.085 +89 V 0.079 +90 R 0.069 +91 P 0.062 +92 L 0.059 +93 E 0.058 +94 F 0.056 +95 T 0.051 +96 K 0.047 +97 V 0.045 +98 K 0.047 +99 T 0.051 +100 F 0.052 +101 V 0.051 +102 S 0.048 +103 R 0.044 +104 I 0.040 +105 I 0.038 +106 D 0.040 +107 T 0.042 +108 L 0.044 +109 D 0.045 +110 I 0.048 +111 G 0.055 +112 A 0.062 +113 T 0.063 +114 D 0.056 +115 T 0.046 +116 R 0.037 +117 V 0.030 +118 A 0.025 +119 V 0.023 +120 V 0.025 +121 N 0.032 +122 Y 0.040 +123 A 0.049 +124 S 0.055 +125 T 0.059 +126 V 0.060 +127 K 0.057 +128 I 0.054 +129 E 0.055 +130 F 0.057 +131 Q 0.056 +132 L 0.053 +133 N 0.051 +134 T 0.052 +135 Y 0.053 +136 S 0.052 +137 D 0.050 +138 K 0.049 +139 Q 0.052 +140 A 0.058 +141 L 0.066 +142 K 0.076 +143 Q 0.084 +144 A 0.082 +145 V 0.078 +146 A 0.082 +147 R 0.095 +148 I 0.107 +149 T 0.107 +150 P 0.101 +151 L 0.099 +152 S 0.104 +153 T 0.111 +154 G 0.115 +155 T 0.112 +156 M 0.104 +157 S 0.095 +158 G 0.087 +159 L 0.079 +160 A 0.071 +161 I 0.064 +162 Q 0.060 +163 T 0.061 +164 A 0.067 +165 M 0.073 +166 E 0.077 +167 E 0.077 +168 A 0.075 +169 F 0.075 +170 T 0.082 +171 V 0.096 +172 E 0.111 +173 A 0.125 +174 G 0.141 +175 A 0.159 +176 R 0.177 +177 G 0.189 +178 P 0.191 +179 M 0.186 +180 S 0.181 +181 N 0.175 +182 I 0.159 +183 P 0.127 +184 K 0.091 +185 V 0.063 +186 A 0.046 +187 I 0.039 +188 I 0.039 +189 V 0.047 +190 T 0.069 +191 D 0.104 +192 G 0.138 +193 R 0.151 +194 P 0.144 +195 Q 0.134 +196 D 0.131 +197 Q 0.131 +198 V 0.125 +199 N 0.113 +200 E 0.098 +201 V 0.085 +202 A 0.081 +203 A 0.083 +204 R 0.086 +205 A 0.088 +206 R 0.089 +207 A 0.087 +208 S 0.081 +209 G 0.074 +210 I 0.065 +211 E 0.051 +212 L 0.038 +213 Y 0.031 +214 A 0.034 +215 V 0.041 +216 G 0.048 +217 V 0.054 +218 D 0.060 +219 R 0.066 +220 A 0.066 +221 D 0.060 +222 M 0.054 +223 E 0.051 +224 S 0.051 +225 L 0.050 +226 K 0.047 +227 M 0.046 +228 M 0.047 +229 A 0.048 +230 S 0.045 +231 K 0.041 +232 P 0.044 +233 L 0.052 +234 E 0.056 +235 E 0.054 +236 H 0.049 +237 V 0.048 +238 F 0.052 +239 Y 0.061 +240 V 0.074 +241 E 0.084 +242 T 0.089 +243 Y 0.087 +244 G 0.079 +245 V 0.069 +246 I 0.060 +247 E 0.055 +248 K 0.054 +249 L 0.055 +250 S 0.058 +251 A 0.058 +252 R 0.060 +253 F 0.067 +254 Q 0.079 +255 E 0.087 +256 T 0.089 +257 F 0.098 +258 C 0.125 +259 A 0.158 +260 L 0.171 +261 D 0.160 +262 Q 0.139 +263 C 0.126 +264 M 0.128 +265 L 0.138 +266 G 0.148 +267 T 0.146 +268 H 0.136 +269 Q 0.123 +270 C 0.112 +271 Q 0.107 +272 H 0.115 +273 V 0.138 +274 C 0.163 +275 V 0.175 +276 S 0.172 +277 D 0.169 +278 G 0.174 +279 D 0.184 +280 G 0.180 +281 K 0.155 +282 H 0.125 +283 H 0.107 +284 C 0.105 +285 E 0.113 +286 C 0.126 +287 S 0.137 +288 Q 0.139 +289 G 0.132 +290 Y 0.127 +291 T 0.130 +292 L 0.135 +293 N 0.137 +294 A 0.135 +295 D 0.132 +296 G 0.128 +297 K 0.126 +298 T 0.129 +299 C 0.140 +300 S 0.160 +301 A 0.185 +302 I 0.200 +303 D 0.196 +304 K 0.183 +305 C 0.178 +306 A 0.186 +307 L 0.197 +308 S 0.201 +309 T 0.198 +310 H 0.189 +311 G 0.176 +312 C 0.159 +313 E 0.146 +314 Q 0.151 +315 I 0.177 +316 C 0.205 +317 V 0.215 +318 N 0.204 +319 D 0.186 +320 R 0.176 +321 N 0.173 +322 G 0.165 +323 S 0.146 +324 Y 0.122 +325 H 0.106 +326 C 0.105 +327 E 0.113 +328 C 0.125 +329 Y 0.143 +330 G 0.162 +331 G 0.174 +332 Y 0.180 +333 A 0.183 +334 L 0.174 +335 N 0.154 +336 A 0.130 +337 D 0.111 +338 R 0.107 +339 R 0.121 +340 T 0.149 +341 C 0.186 +342 A 0.225 +343 A 0.255 +344 L 0.261 +345 D 0.241 +346 K 0.216 +347 C 0.208 +348 A 0.217 +349 S 0.228 +350 G 0.228 +351 T 0.216 +352 H 0.197 +353 G 0.176 +354 C 0.156 +355 Q 0.147 +356 H 0.163 +357 I 0.202 +358 C 0.236 +359 V 0.242 +360 N 0.226 +361 D 0.210 +362 G 0.207 +363 A 0.205 +364 G 0.192 +365 S 0.163 +366 H 0.132 +367 H 0.113 +368 C 0.110 +369 E 0.114 +370 C 0.120 +371 F 0.128 +372 E 0.133 +373 G 0.134 +374 Y 0.136 +375 T 0.141 +376 L 0.144 +377 N 0.140 +378 A 0.129 +379 D 0.114 +380 K 0.106 +381 K 0.111 +382 T 0.126 +383 C 0.146 +384 S 0.171 +385 V 0.196 +386 R 0.205 +387 N 0.192 +388 K 0.173 +389 C 0.170 +390 A 0.181 +391 L 0.189 +392 G 0.186 +393 T 0.174 +394 H 0.161 +395 G 0.150 +396 C 0.140 +397 Q 0.137 +398 H 0.153 +399 I 0.187 +400 C 0.215 +401 V 0.219 +402 S 0.205 +403 D 0.189 +404 G 0.173 +405 A 0.154 +406 V 0.130 +407 A 0.108 +408 Y 0.098 +409 H 0.099 +410 C 0.109 +411 D 0.122 +412 C 0.136 +413 F 0.152 +414 P 0.166 +415 G 0.172 +416 Y 0.171 +417 T 0.167 +418 L 0.158 +419 N 0.147 +420 D 0.135 +421 D 0.125 +422 K 0.123 +423 K 0.132 +424 T 0.149 +425 C 0.177 +426 S 0.225 +427 D 0.301 +428 I 0.389 +429 E 0.459 +430 E 0.497 +431 A 0.509 +432 R 0.516 +433 S 0.531 +434 L 0.556 +435 I 0.582 +436 S 0.608 +437 I 0.635 +438 E 0.652 +439 D 0.649 +440 A 0.634 +441 C 0.620 +442 G 0.618 +443 C 0.625 +444 G 0.629 +445 A 0.614 +446 T 0.575 +447 L 0.523 +448 A 0.473 +449 F 0.428 +450 Q 0.380 +451 E 0.337 +452 K 0.319 +453 V 0.317 +454 S 0.308 +455 S 0.298 +456 H 0.294 +457 L 0.289 +458 Q 0.286 +459 K 0.300 +460 L 0.322 +461 N 0.326 +462 T 0.312 +463 K 0.303 +464 L 0.302 +465 D 0.300 +466 N 0.297 +467 I 0.297 +468 L 0.295 +469 K 0.294 +470 K 0.305 +471 L 0.332 +472 K 0.369 +473 V 0.420 +474 T 0.478 +475 E 0.531 +476 Y 0.571 +477 G 0.598 +478 Q 0.605 +479 V 0.581 +480 H 0.530 +481 R 0.485 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020583.5_ENSMUST00000020899.5_GN:Matn3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:25.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020583.5_ENSMUST00000020899.5_GN:Matn3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:25.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6b40f4a5c9678ea417ea7b75a7b4b33460889bdf --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020583.5_ENSMUST00000020899.5_GN:Matn3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:25.caid @@ -0,0 +1,507 @@ +>ENSMUSG00000020583.5|ENSMUST00000020899.5|GN:Matn3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:25 +1 M 0.378 +2 A 0.393 +3 E 0.415 +4 T 0.438 +5 S 0.460 +6 D 0.482 +7 P 0.497 +8 V 0.501 +9 Y 0.484 +10 P 0.446 +11 S 0.406 +12 Y 0.376 +13 L 0.343 +14 A 0.312 +15 A 0.320 +16 H 0.373 +17 R 0.429 +18 P 0.459 +19 R 0.488 +20 Q 0.539 +21 V 0.589 +22 V 0.622 +23 K 0.651 +24 P 0.678 +25 I 0.691 +26 M 0.689 +27 L 0.677 +28 L 0.657 +29 S 0.636 +30 A 0.621 +31 P 0.616 +32 L 0.615 +33 R 0.615 +34 H 0.621 +35 L 0.640 +36 P 0.657 +37 G 0.653 +38 L 0.614 +39 L 0.544 +40 L 0.465 +41 L 0.414 +42 L 0.411 +43 W 0.433 +44 P 0.443 +45 L 0.436 +46 L 0.431 +47 L 0.448 +48 L 0.492 +49 P 0.551 +50 S 0.602 +51 L 0.633 +52 A 0.648 +53 A 0.665 +54 P 0.688 +55 G 0.712 +56 R 0.727 +57 L 0.734 +58 A 0.735 +59 R 0.733 +60 A 0.721 +61 S 0.682 +62 V 0.623 +63 R 0.591 +64 R 0.620 +65 L 0.675 +66 G 0.702 +67 T 0.700 +68 R 0.696 +69 V 0.702 +70 P 0.713 +71 G 0.722 +72 G 0.723 +73 S 0.721 +74 P 0.724 +75 G 0.728 +76 H 0.714 +77 L 0.669 +78 S 0.609 +79 A 0.581 +80 L 0.606 +81 A 0.643 +82 T 0.660 +83 S 0.663 +84 T 0.664 +85 R 0.664 +86 A 0.669 +87 P 0.684 +88 Y 0.705 +89 S 0.724 +90 G 0.736 +91 G 0.735 +92 R 0.723 +93 G 0.697 +94 A 0.646 +95 G 0.558 +96 V 0.439 +97 C 0.316 +98 K 0.217 +99 S 0.152 +100 R 0.112 +101 P 0.084 +102 L 0.061 +103 D 0.045 +104 L 0.035 +105 V 0.031 +106 F 0.032 +107 I 0.036 +108 I 0.044 +109 D 0.054 +110 S 0.065 +111 S 0.075 +112 R 0.081 +113 S 0.082 +114 V 0.078 +115 R 0.069 +116 P 0.062 +117 L 0.059 +118 E 0.057 +119 F 0.054 +120 T 0.050 +121 K 0.045 +122 V 0.044 +123 K 0.047 +124 T 0.050 +125 F 0.052 +126 V 0.051 +127 S 0.048 +128 R 0.044 +129 I 0.040 +130 I 0.039 +131 D 0.041 +132 T 0.044 +133 L 0.046 +134 D 0.047 +135 I 0.049 +136 G 0.057 +137 A 0.065 +138 T 0.066 +139 D 0.060 +140 T 0.049 +141 R 0.039 +142 V 0.031 +143 A 0.025 +144 V 0.022 +145 V 0.024 +146 N 0.031 +147 Y 0.040 +148 A 0.048 +149 S 0.054 +150 T 0.058 +151 V 0.058 +152 K 0.055 +153 I 0.052 +154 E 0.052 +155 F 0.053 +156 Q 0.053 +157 L 0.050 +158 N 0.050 +159 T 0.051 +160 Y 0.053 +161 S 0.052 +162 D 0.049 +163 K 0.047 +164 Q 0.049 +165 A 0.055 +166 L 0.063 +167 K 0.074 +168 Q 0.082 +169 A 0.081 +170 V 0.075 +171 A 0.078 +172 R 0.091 +173 I 0.102 +174 T 0.103 +175 P 0.098 +176 L 0.096 +177 S 0.101 +178 T 0.109 +179 G 0.113 +180 T 0.110 +181 M 0.103 +182 S 0.094 +183 G 0.085 +184 L 0.077 +185 A 0.069 +186 I 0.062 +187 Q 0.059 +188 T 0.060 +189 A 0.065 +190 M 0.071 +191 E 0.074 +192 E 0.074 +193 A 0.072 +194 F 0.072 +195 T 0.078 +196 V 0.092 +197 E 0.107 +198 A 0.121 +199 G 0.137 +200 A 0.155 +201 R 0.172 +202 G 0.184 +203 P 0.185 +204 M 0.178 +205 S 0.172 +206 N 0.166 +207 I 0.150 +208 P 0.121 +209 K 0.086 +210 V 0.060 +211 A 0.045 +212 I 0.038 +213 I 0.038 +214 V 0.045 +215 T 0.065 +216 D 0.097 +217 G 0.127 +218 R 0.139 +219 P 0.131 +220 Q 0.121 +221 D 0.118 +222 Q 0.119 +223 V 0.116 +224 N 0.108 +225 E 0.094 +226 V 0.082 +227 A 0.077 +228 A 0.079 +229 R 0.079 +230 A 0.077 +231 R 0.073 +232 A 0.068 +233 S 0.066 +234 G 0.065 +235 I 0.061 +236 E 0.049 +237 L 0.037 +238 Y 0.031 +239 A 0.033 +240 V 0.040 +241 G 0.047 +242 V 0.052 +243 D 0.057 +244 R 0.062 +245 A 0.062 +246 D 0.057 +247 M 0.051 +248 E 0.049 +249 S 0.049 +250 L 0.047 +251 K 0.045 +252 M 0.044 +253 M 0.046 +254 A 0.047 +255 S 0.043 +256 K 0.041 +257 P 0.044 +258 L 0.052 +259 E 0.056 +260 E 0.054 +261 H 0.050 +262 V 0.049 +263 F 0.053 +264 Y 0.063 +265 V 0.076 +266 E 0.086 +267 T 0.090 +268 Y 0.087 +269 G 0.079 +270 V 0.070 +271 I 0.062 +272 E 0.057 +273 K 0.055 +274 L 0.056 +275 S 0.058 +276 A 0.059 +277 R 0.061 +278 F 0.069 +279 Q 0.081 +280 E 0.090 +281 T 0.093 +282 F 0.103 +283 C 0.130 +284 A 0.164 +285 L 0.178 +286 D 0.168 +287 Q 0.147 +288 C 0.133 +289 M 0.135 +290 L 0.148 +291 G 0.160 +292 T 0.160 +293 H 0.149 +294 Q 0.134 +295 C 0.122 +296 Q 0.117 +297 H 0.126 +298 V 0.153 +299 C 0.181 +300 V 0.196 +301 S 0.193 +302 D 0.188 +303 G 0.191 +304 D 0.200 +305 G 0.194 +306 K 0.167 +307 H 0.134 +308 H 0.115 +309 C 0.114 +310 E 0.123 +311 C 0.135 +312 S 0.146 +313 Q 0.148 +314 G 0.142 +315 Y 0.137 +316 T 0.140 +317 L 0.146 +318 N 0.147 +319 A 0.144 +320 D 0.140 +321 G 0.136 +322 K 0.135 +323 T 0.139 +324 C 0.150 +325 S 0.170 +326 A 0.194 +327 I 0.209 +328 D 0.204 +329 K 0.190 +330 C 0.187 +331 A 0.198 +332 L 0.210 +333 S 0.211 +334 T 0.204 +335 H 0.194 +336 G 0.181 +337 C 0.164 +338 E 0.152 +339 Q 0.160 +340 I 0.192 +341 C 0.228 +342 V 0.241 +343 N 0.226 +344 D 0.203 +345 R 0.188 +346 N 0.181 +347 G 0.171 +348 S 0.151 +349 Y 0.125 +350 H 0.107 +351 C 0.104 +352 E 0.110 +353 C 0.121 +354 Y 0.139 +355 G 0.157 +356 G 0.169 +357 Y 0.176 +358 A 0.179 +359 L 0.171 +360 N 0.152 +361 A 0.128 +362 D 0.109 +363 R 0.104 +364 R 0.119 +365 T 0.148 +366 C 0.185 +367 A 0.223 +368 A 0.250 +369 L 0.253 +370 D 0.231 +371 K 0.206 +372 C 0.198 +373 A 0.205 +374 S 0.213 +375 G 0.210 +376 T 0.197 +377 H 0.181 +378 G 0.165 +379 C 0.148 +380 Q 0.138 +381 H 0.151 +382 I 0.186 +383 C 0.219 +384 V 0.226 +385 N 0.213 +386 D 0.200 +387 G 0.198 +388 A 0.199 +389 G 0.186 +390 S 0.159 +391 H 0.129 +392 H 0.111 +393 C 0.108 +394 E 0.113 +395 C 0.120 +396 F 0.129 +397 E 0.135 +398 G 0.137 +399 Y 0.139 +400 T 0.144 +401 L 0.148 +402 N 0.145 +403 A 0.134 +404 D 0.119 +405 K 0.111 +406 K 0.116 +407 T 0.130 +408 C 0.149 +409 S 0.173 +410 V 0.197 +411 R 0.208 +412 N 0.197 +413 K 0.180 +414 C 0.174 +415 A 0.179 +416 L 0.185 +417 G 0.183 +418 T 0.174 +419 H 0.162 +420 G 0.151 +421 C 0.139 +422 Q 0.134 +423 H 0.149 +424 I 0.184 +425 C 0.217 +426 V 0.225 +427 S 0.213 +428 D 0.197 +429 G 0.182 +430 A 0.164 +431 V 0.141 +432 A 0.120 +433 Y 0.109 +434 H 0.110 +435 C 0.120 +436 D 0.132 +437 C 0.145 +438 F 0.160 +439 P 0.174 +440 G 0.182 +441 Y 0.184 +442 T 0.181 +443 L 0.173 +444 N 0.160 +445 D 0.147 +446 D 0.137 +447 K 0.137 +448 K 0.148 +449 T 0.168 +450 C 0.199 +451 S 0.252 +452 D 0.332 +453 I 0.422 +454 E 0.492 +455 E 0.524 +456 A 0.528 +457 R 0.524 +458 S 0.529 +459 L 0.548 +460 I 0.574 +461 S 0.602 +462 I 0.629 +463 E 0.645 +464 D 0.640 +465 A 0.622 +466 C 0.605 +467 G 0.601 +468 C 0.606 +469 G 0.608 +470 A 0.595 +471 T 0.564 +472 L 0.521 +473 A 0.473 +474 F 0.424 +475 Q 0.372 +476 E 0.325 +477 K 0.300 +478 V 0.291 +479 S 0.283 +480 S 0.277 +481 H 0.278 +482 L 0.276 +483 Q 0.272 +484 K 0.277 +485 L 0.283 +486 N 0.277 +487 T 0.268 +488 K 0.269 +489 L 0.278 +490 D 0.282 +491 N 0.277 +492 I 0.266 +493 L 0.252 +494 K 0.244 +495 K 0.247 +496 L 0.258 +497 K 0.277 +498 V 0.314 +499 T 0.360 +500 E 0.394 +501 Y 0.417 +502 G 0.445 +503 Q 0.471 +504 V 0.477 +505 H 0.460 +506 R 0.442 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020585.6_ENSMUST00000020909.5_GN:Laptm4a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020585.6_ENSMUST00000020909.5_GN:Laptm4a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a45f216c8ea299eb6b8c9911418e23cca68bcfd5 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020585.6_ENSMUST00000020909.5_GN:Laptm4a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,234 @@ +>ENSMUSG00000020585.6|ENSMUST00000020909.5|GN:Laptm4a|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.353 +2 V 0.370 +3 S 0.398 +4 M 0.430 +5 T 0.454 +6 F 0.466 +7 K 0.475 +8 R 0.490 +9 S 0.498 +10 R 0.482 +11 S 0.443 +12 D 0.393 +13 R 0.345 +14 F 0.304 +15 Y 0.270 +16 S 0.238 +17 T 0.202 +18 R 0.160 +19 C 0.121 +20 C 0.094 +21 G 0.080 +22 C 0.073 +23 C 0.068 +24 H 0.063 +25 V 0.057 +26 R 0.049 +27 T 0.041 +28 G 0.035 +29 T 0.030 +30 I 0.028 +31 I 0.030 +32 L 0.034 +33 G 0.036 +34 T 0.033 +35 W 0.028 +36 Y 0.027 +37 M 0.030 +38 V 0.033 +39 V 0.031 +40 N 0.029 +41 L 0.028 +42 L 0.030 +43 M 0.031 +44 A 0.034 +45 I 0.036 +46 L 0.041 +47 L 0.049 +48 T 0.056 +49 V 0.065 +50 E 0.078 +51 V 0.100 +52 T 0.135 +53 H 0.182 +54 P 0.230 +55 N 0.264 +56 S 0.282 +57 M 0.287 +58 P 0.280 +59 A 0.265 +60 V 0.247 +61 N 0.230 +62 I 0.211 +63 Q 0.195 +64 Y 0.188 +65 E 0.194 +66 V 0.209 +67 I 0.235 +68 G 0.272 +69 N 0.301 +70 Y 0.303 +71 Y 0.284 +72 S 0.258 +73 S 0.230 +74 E 0.201 +75 R 0.177 +76 M 0.163 +77 A 0.155 +78 D 0.142 +79 N 0.121 +80 A 0.101 +81 C 0.084 +82 V 0.074 +83 L 0.073 +84 F 0.077 +85 A 0.080 +86 V 0.079 +87 S 0.075 +88 V 0.067 +89 L 0.057 +90 M 0.048 +91 F 0.045 +92 I 0.049 +93 I 0.057 +94 S 0.058 +95 S 0.051 +96 M 0.043 +97 L 0.039 +98 V 0.039 +99 Y 0.043 +100 G 0.048 +101 A 0.053 +102 I 0.056 +103 S 0.057 +104 Y 0.057 +105 Q 0.055 +106 V 0.054 +107 G 0.054 +108 W 0.054 +109 L 0.050 +110 I 0.041 +111 P 0.031 +112 F 0.023 +113 F 0.019 +114 C 0.017 +115 Y 0.016 +116 R 0.018 +117 L 0.021 +118 F 0.027 +119 D 0.040 +120 F 0.053 +121 V 0.057 +122 L 0.050 +123 S 0.039 +124 C 0.031 +125 L 0.027 +126 V 0.027 +127 A 0.030 +128 I 0.035 +129 S 0.040 +130 S 0.045 +131 L 0.048 +132 T 0.049 +133 Y 0.052 +134 L 0.057 +135 P 0.060 +136 R 0.062 +137 I 0.068 +138 K 0.080 +139 E 0.089 +140 Y 0.092 +141 L 0.097 +142 D 0.114 +143 Q 0.146 +144 L 0.185 +145 P 0.219 +146 D 0.238 +147 F 0.236 +148 P 0.220 +149 Y 0.205 +150 K 0.202 +151 D 0.206 +152 D 0.207 +153 L 0.205 +154 L 0.202 +155 A 0.189 +156 L 0.160 +157 D 0.117 +158 S 0.080 +159 S 0.057 +160 C 0.048 +161 L 0.044 +162 L 0.041 +163 F 0.039 +164 I 0.036 +165 V 0.034 +166 L 0.031 +167 V 0.028 +168 F 0.027 +169 F 0.029 +170 V 0.032 +171 V 0.036 +172 F 0.040 +173 I 0.040 +174 I 0.036 +175 F 0.033 +176 K 0.033 +177 A 0.034 +178 Y 0.034 +179 L 0.034 +180 I 0.032 +181 N 0.029 +182 C 0.026 +183 V 0.025 +184 W 0.026 +185 N 0.028 +186 C 0.031 +187 Y 0.037 +188 K 0.045 +189 Y 0.057 +190 I 0.079 +191 N 0.113 +192 N 0.160 +193 R 0.225 +194 N 0.315 +195 V 0.424 +196 P 0.529 +197 E 0.606 +198 I 0.644 +199 A 0.647 +200 V 0.634 +201 Y 0.629 +202 P 0.638 +203 A 0.649 +204 F 0.646 +205 E 0.630 +206 T 0.618 +207 P 0.620 +208 P 0.630 +209 Q 0.633 +210 Y 0.627 +211 V 0.616 +212 L 0.598 +213 P 0.569 +214 T 0.532 +215 Y 0.507 +216 E 0.515 +217 M 0.548 +218 A 0.581 +219 V 0.598 +220 K 0.609 +221 I 0.630 +222 P 0.657 +223 E 0.673 +224 K 0.670 +225 E 0.655 +226 P 0.642 +227 P 0.645 +228 P 0.659 +229 P 0.669 +230 Y 0.654 +231 L 0.604 +232 P 0.532 +233 A 0.476 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020585.6_ENSMUST00000020909.5_GN:Laptm4a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:75.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020585.6_ENSMUST00000020909.5_GN:Laptm4a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:75.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c83dcff19d8981bd88cd7cc1345a39d30e98bbcb --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020585.6_ENSMUST00000020909.5_GN:Laptm4a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:75.caid @@ -0,0 +1,309 @@ +>ENSMUSG00000020585.6|ENSMUST00000020909.5|GN:Laptm4a|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:75 +1 M 0.346 +2 W 0.389 +3 Q 0.467 +4 K 0.551 +5 A 0.612 +6 E 0.644 +7 G 0.659 +8 E 0.667 +9 I 0.671 +10 P 0.679 +11 S 0.693 +12 R 0.708 +13 R 0.721 +14 P 0.734 +15 A 0.743 +16 R 0.740 +17 A 0.728 +18 A 0.720 +19 P 0.726 +20 G 0.740 +21 A 0.745 +22 Q 0.733 +23 S 0.703 +24 A 0.652 +25 G 0.570 +26 A 0.469 +27 Q 0.391 +28 E 0.358 +29 L 0.354 +30 A 0.370 +31 R 0.424 +32 A 0.510 +33 R 0.589 +34 A 0.640 +35 E 0.672 +36 G 0.699 +37 G 0.729 +38 P 0.761 +39 E 0.791 +40 D 0.808 +41 A 0.803 +42 S 0.781 +43 F 0.754 +44 G 0.731 +45 C 0.721 +46 G 0.729 +47 H 0.746 +48 R 0.762 +49 R 0.770 +50 R 0.771 +51 V 0.767 +52 V 0.758 +53 W 0.742 +54 V 0.725 +55 E 0.715 +56 P 0.719 +57 L 0.732 +58 G 0.742 +59 R 0.743 +60 K 0.732 +61 L 0.718 +62 L 0.714 +63 S 0.726 +64 G 0.742 +65 A 0.751 +66 W 0.753 +67 A 0.751 +68 R 0.741 +69 T 0.727 +70 R 0.720 +71 P 0.728 +72 A 0.741 +73 R 0.743 +74 F 0.734 +75 R 0.728 +76 M 0.729 +77 V 0.726 +78 S 0.705 +79 M 0.679 +80 T 0.666 +81 F 0.661 +82 K 0.649 +83 R 0.627 +84 S 0.594 +85 R 0.545 +86 S 0.484 +87 D 0.422 +88 R 0.369 +89 F 0.328 +90 Y 0.293 +91 S 0.256 +92 T 0.211 +93 R 0.162 +94 C 0.118 +95 C 0.090 +96 G 0.075 +97 C 0.066 +98 C 0.059 +99 H 0.055 +100 V 0.051 +101 R 0.045 +102 T 0.039 +103 G 0.033 +104 T 0.029 +105 I 0.028 +106 I 0.030 +107 L 0.036 +108 G 0.039 +109 T 0.035 +110 W 0.028 +111 Y 0.021 +112 M 0.018 +113 V 0.016 +114 V 0.017 +115 N 0.021 +116 L 0.024 +117 L 0.026 +118 M 0.028 +119 A 0.030 +120 I 0.031 +121 L 0.035 +122 L 0.040 +123 T 0.045 +124 V 0.052 +125 E 0.062 +126 V 0.080 +127 T 0.110 +128 H 0.154 +129 P 0.202 +130 N 0.239 +131 S 0.261 +132 M 0.268 +133 P 0.259 +134 A 0.241 +135 V 0.222 +136 N 0.207 +137 I 0.193 +138 Q 0.181 +139 Y 0.179 +140 E 0.185 +141 V 0.197 +142 I 0.223 +143 G 0.260 +144 N 0.291 +145 Y 0.294 +146 Y 0.274 +147 S 0.245 +148 S 0.214 +149 E 0.184 +150 R 0.161 +151 M 0.151 +152 A 0.148 +153 D 0.139 +154 N 0.121 +155 A 0.101 +156 C 0.084 +157 V 0.072 +158 L 0.064 +159 F 0.058 +160 A 0.056 +161 V 0.059 +162 S 0.063 +163 V 0.062 +164 L 0.055 +165 M 0.048 +166 F 0.046 +167 I 0.050 +168 I 0.057 +169 S 0.059 +170 S 0.051 +171 M 0.043 +172 L 0.039 +173 V 0.040 +174 Y 0.044 +175 G 0.051 +176 A 0.057 +177 I 0.062 +178 S 0.063 +179 Y 0.062 +180 Q 0.059 +181 V 0.056 +182 G 0.055 +183 W 0.055 +184 L 0.052 +185 I 0.043 +186 P 0.033 +187 F 0.025 +188 F 0.020 +189 C 0.018 +190 Y 0.017 +191 R 0.018 +192 L 0.020 +193 F 0.024 +194 D 0.028 +195 F 0.029 +196 V 0.027 +197 L 0.025 +198 S 0.025 +199 C 0.025 +200 L 0.025 +201 V 0.026 +202 A 0.029 +203 I 0.034 +204 S 0.039 +205 S 0.043 +206 L 0.045 +207 T 0.046 +208 Y 0.049 +209 L 0.054 +210 P 0.058 +211 R 0.062 +212 I 0.068 +213 K 0.080 +214 E 0.088 +215 Y 0.089 +216 L 0.091 +217 D 0.105 +218 Q 0.134 +219 L 0.170 +220 P 0.200 +221 D 0.214 +222 F 0.209 +223 P 0.191 +224 Y 0.175 +225 K 0.171 +226 D 0.174 +227 D 0.175 +228 L 0.176 +229 L 0.175 +230 A 0.165 +231 L 0.138 +232 D 0.101 +233 S 0.069 +234 S 0.050 +235 C 0.043 +236 L 0.040 +237 L 0.038 +238 F 0.036 +239 I 0.033 +240 V 0.032 +241 L 0.030 +242 V 0.027 +243 F 0.027 +244 F 0.028 +245 V 0.032 +246 V 0.036 +247 F 0.039 +248 I 0.038 +249 I 0.035 +250 F 0.032 +251 K 0.032 +252 A 0.033 +253 Y 0.033 +254 L 0.033 +255 I 0.031 +256 N 0.028 +257 C 0.026 +258 V 0.025 +259 W 0.025 +260 N 0.026 +261 C 0.029 +262 Y 0.034 +263 K 0.041 +264 Y 0.053 +265 I 0.075 +266 N 0.110 +267 N 0.158 +268 R 0.224 +269 N 0.317 +270 V 0.430 +271 P 0.539 +272 E 0.620 +273 I 0.662 +274 A 0.668 +275 V 0.656 +276 Y 0.650 +277 P 0.660 +278 A 0.675 +279 F 0.675 +280 E 0.662 +281 T 0.650 +282 P 0.653 +283 P 0.664 +284 Q 0.670 +285 Y 0.666 +286 V 0.653 +287 L 0.633 +288 P 0.604 +289 T 0.568 +290 Y 0.546 +291 E 0.554 +292 M 0.589 +293 A 0.622 +294 V 0.637 +295 K 0.644 +296 I 0.659 +297 P 0.681 +298 E 0.695 +299 K 0.693 +300 E 0.678 +301 P 0.666 +302 P 0.669 +303 P 0.685 +304 P 0.697 +305 Y 0.686 +306 L 0.640 +307 P 0.569 +308 A 0.511 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020590.17_ENSMUST00000048519.17_GN:Snx13_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020590.17_ENSMUST00000048519.17_GN:Snx13_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..87cc03302c3903355c86d6a80d37f24a0133f958 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020590.17_ENSMUST00000048519.17_GN:Snx13_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,958 @@ +>ENSMUSG00000020590.17|ENSMUST00000048519.17|GN:Snx13|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.317 +2 L 0.339 +3 T 0.376 +4 E 0.411 +5 A 0.422 +6 S 0.399 +7 L 0.357 +8 S 0.315 +9 I 0.278 +10 W 0.247 +11 G 0.220 +12 W 0.199 +13 G 0.184 +14 S 0.174 +15 L 0.165 +16 G 0.157 +17 I 0.150 +18 V 0.136 +19 L 0.118 +20 F 0.104 +21 L 0.101 +22 I 0.109 +23 T 0.121 +24 F 0.128 +25 G 0.123 +26 P 0.107 +27 F 0.092 +28 V 0.082 +29 I 0.077 +30 F 0.077 +31 Y 0.086 +32 L 0.105 +33 A 0.126 +34 F 0.139 +35 Y 0.139 +36 I 0.131 +37 L 0.120 +38 C 0.115 +39 F 0.124 +40 V 0.150 +41 G 0.180 +42 G 0.195 +43 G 0.188 +44 L 0.170 +45 V 0.153 +46 V 0.139 +47 T 0.135 +48 L 0.149 +49 L 0.185 +50 Y 0.233 +51 G 0.271 +52 K 0.293 +53 T 0.309 +54 N 0.324 +55 S 0.322 +56 E 0.297 +57 K 0.267 +58 Y 0.249 +59 L 0.241 +60 E 0.240 +61 Q 0.249 +62 C 0.267 +63 E 0.285 +64 H 0.303 +65 S 0.323 +66 F 0.350 +67 L 0.385 +68 P 0.427 +69 P 0.465 +70 T 0.488 +71 S 0.493 +72 S 0.490 +73 G 0.484 +74 V 0.466 +75 P 0.427 +76 K 0.376 +77 C 0.328 +78 L 0.288 +79 E 0.262 +80 E 0.255 +81 M 0.258 +82 K 0.263 +83 R 0.274 +84 E 0.292 +85 A 0.309 +86 R 0.316 +87 T 0.309 +88 I 0.286 +89 K 0.250 +90 I 0.212 +91 D 0.178 +92 R 0.151 +93 R 0.134 +94 L 0.129 +95 T 0.134 +96 G 0.135 +97 A 0.122 +98 N 0.101 +99 I 0.083 +100 I 0.074 +101 D 0.070 +102 E 0.070 +103 P 0.068 +104 L 0.068 +105 Q 0.072 +106 Q 0.078 +107 V 0.084 +108 I 0.083 +109 Q 0.078 +110 F 0.074 +111 S 0.075 +112 L 0.078 +113 R 0.077 +114 D 0.071 +115 Y 0.063 +116 V 0.052 +117 Q 0.042 +118 Y 0.038 +119 W 0.041 +120 Y 0.053 +121 Y 0.074 +122 T 0.099 +123 L 0.121 +124 S 0.139 +125 D 0.154 +126 D 0.163 +127 E 0.158 +128 S 0.140 +129 F 0.122 +130 L 0.114 +131 L 0.116 +132 E 0.124 +133 I 0.127 +134 R 0.121 +135 Q 0.114 +136 T 0.111 +137 L 0.104 +138 Q 0.089 +139 N 0.074 +140 A 0.064 +141 L 0.059 +142 I 0.061 +143 Q 0.073 +144 F 0.086 +145 A 0.095 +146 T 0.110 +147 R 0.138 +148 S 0.166 +149 K 0.180 +150 E 0.175 +151 I 0.152 +152 D 0.116 +153 W 0.080 +154 Q 0.058 +155 P 0.051 +156 Y 0.051 +157 F 0.053 +158 T 0.058 +159 T 0.064 +160 R 0.068 +161 I 0.067 +162 V 0.065 +163 D 0.068 +164 D 0.074 +165 F 0.077 +166 G 0.080 +167 T 0.083 +168 H 0.083 +169 L 0.080 +170 R 0.072 +171 V 0.059 +172 F 0.046 +173 R 0.038 +174 K 0.038 +175 A 0.043 +176 Q 0.053 +177 Q 0.071 +178 R 0.102 +179 V 0.143 +180 T 0.188 +181 E 0.231 +182 K 0.268 +183 D 0.287 +184 D 0.284 +185 Q 0.270 +186 V 0.254 +187 K 0.234 +188 G 0.203 +189 T 0.170 +190 A 0.144 +191 E 0.125 +192 D 0.108 +193 L 0.097 +194 V 0.090 +195 E 0.081 +196 T 0.068 +197 F 0.058 +198 F 0.058 +199 E 0.068 +200 V 0.087 +201 E 0.105 +202 V 0.115 +203 E 0.116 +204 M 0.111 +205 E 0.103 +206 K 0.101 +207 D 0.110 +208 V 0.123 +209 C 0.131 +210 R 0.127 +211 D 0.114 +212 L 0.098 +213 V 0.088 +214 C 0.086 +215 T 0.089 +216 S 0.088 +217 P 0.079 +218 K 0.067 +219 D 0.057 +220 E 0.051 +221 E 0.048 +222 G 0.047 +223 F 0.044 +224 L 0.040 +225 R 0.037 +226 D 0.038 +227 L 0.040 +228 C 0.038 +229 E 0.038 +230 V 0.041 +231 L 0.046 +232 L 0.047 +233 Y 0.047 +234 L 0.048 +235 L 0.053 +236 L 0.063 +237 P 0.078 +238 P 0.091 +239 G 0.099 +240 D 0.102 +241 F 0.102 +242 Q 0.096 +243 S 0.087 +244 K 0.075 +245 I 0.064 +246 M 0.057 +247 R 0.056 +248 Y 0.065 +249 F 0.080 +250 V 0.090 +251 R 0.090 +252 E 0.092 +253 I 0.101 +254 L 0.111 +255 A 0.118 +256 R 0.129 +257 G 0.138 +258 I 0.137 +259 L 0.122 +260 L 0.103 +261 P 0.092 +262 L 0.094 +263 I 0.107 +264 N 0.125 +265 Q 0.141 +266 L 0.145 +267 S 0.136 +268 D 0.121 +269 P 0.107 +270 D 0.092 +271 Y 0.073 +272 I 0.055 +273 N 0.044 +274 Q 0.040 +275 Y 0.042 +276 V 0.045 +277 I 0.052 +278 W 0.064 +279 M 0.082 +280 I 0.104 +281 R 0.130 +282 D 0.155 +283 S 0.169 +284 N 0.167 +285 C 0.154 +286 N 0.136 +287 Y 0.117 +288 E 0.101 +289 A 0.094 +290 F 0.093 +291 M 0.094 +292 N 0.098 +293 I 0.106 +294 I 0.115 +295 K 0.119 +296 L 0.115 +297 S 0.104 +298 D 0.092 +299 N 0.081 +300 I 0.070 +301 G 0.061 +302 E 0.059 +303 L 0.067 +304 E 0.078 +305 A 0.081 +306 V 0.071 +307 R 0.058 +308 D 0.050 +309 K 0.050 +310 A 0.057 +311 A 0.071 +312 E 0.082 +313 E 0.084 +314 L 0.081 +315 Q 0.080 +316 Y 0.077 +317 L 0.078 +318 R 0.089 +319 S 0.114 +320 L 0.147 +321 D 0.178 +322 T 0.198 +323 A 0.207 +324 G 0.205 +325 D 0.192 +326 D 0.171 +327 I 0.147 +328 N 0.124 +329 T 0.109 +330 I 0.104 +331 K 0.105 +332 N 0.108 +333 Q 0.104 +334 I 0.092 +335 N 0.077 +336 S 0.066 +337 L 0.059 +338 L 0.052 +339 F 0.044 +340 V 0.037 +341 K 0.031 +342 K 0.028 +343 V 0.028 +344 C 0.031 +345 D 0.036 +346 S 0.039 +347 R 0.041 +348 I 0.043 +349 Q 0.046 +350 R 0.052 +351 L 0.065 +352 Q 0.090 +353 S 0.126 +354 G 0.163 +355 K 0.186 +356 E 0.187 +357 I 0.172 +358 N 0.154 +359 T 0.139 +360 V 0.126 +361 K 0.114 +362 L 0.103 +363 A 0.097 +364 A 0.100 +365 N 0.111 +366 F 0.122 +367 G 0.126 +368 K 0.121 +369 L 0.107 +370 C 0.087 +371 T 0.068 +372 V 0.052 +373 P 0.038 +374 L 0.032 +375 D 0.032 +376 S 0.035 +377 I 0.036 +378 L 0.035 +379 V 0.035 +380 D 0.036 +381 N 0.034 +382 V 0.031 +383 A 0.029 +384 L 0.027 +385 Q 0.029 +386 F 0.031 +387 F 0.033 +388 M 0.036 +389 D 0.043 +390 Y 0.052 +391 M 0.056 +392 Q 0.053 +393 Q 0.050 +394 T 0.054 +395 G 0.061 +396 G 0.065 +397 Q 0.065 +398 A 0.061 +399 H 0.053 +400 L 0.044 +401 F 0.036 +402 F 0.030 +403 W 0.027 +404 M 0.027 +405 T 0.028 +406 V 0.031 +407 E 0.034 +408 G 0.033 +409 Y 0.030 +410 R 0.027 +411 V 0.029 +412 T 0.038 +413 A 0.055 +414 Q 0.075 +415 Q 0.093 +416 Q 0.107 +417 L 0.125 +418 E 0.155 +419 V 0.199 +420 L 0.251 +421 S 0.301 +422 G 0.339 +423 R 0.362 +424 Q 0.372 +425 R 0.384 +426 D 0.404 +427 G 0.428 +428 K 0.442 +429 Q 0.432 +430 Q 0.396 +431 T 0.343 +432 N 0.293 +433 Q 0.256 +434 T 0.223 +435 K 0.182 +436 G 0.136 +437 L 0.097 +438 L 0.075 +439 R 0.064 +440 A 0.063 +441 A 0.067 +442 A 0.069 +443 V 0.067 +444 G 0.063 +445 I 0.060 +446 Y 0.056 +447 E 0.054 +448 Q 0.059 +449 Y 0.071 +450 L 0.088 +451 S 0.109 +452 E 0.124 +453 K 0.126 +454 A 0.114 +455 S 0.097 +456 P 0.084 +457 R 0.075 +458 V 0.068 +459 T 0.061 +460 V 0.058 +461 D 0.056 +462 D 0.052 +463 Y 0.047 +464 L 0.050 +465 V 0.061 +466 A 0.070 +467 K 0.070 +468 L 0.064 +469 A 0.059 +470 D 0.056 +471 T 0.055 +472 L 0.059 +473 N 0.069 +474 H 0.082 +475 E 0.098 +476 D 0.112 +477 P 0.120 +478 T 0.117 +479 P 0.110 +480 E 0.107 +481 I 0.104 +482 F 0.095 +483 D 0.079 +484 D 0.066 +485 I 0.058 +486 Q 0.054 +487 R 0.056 +488 K 0.065 +489 V 0.070 +490 Y 0.063 +491 E 0.050 +492 L 0.043 +493 M 0.042 +494 L 0.043 +495 R 0.046 +496 D 0.051 +497 E 0.051 +498 R 0.044 +499 F 0.036 +500 Y 0.031 +501 P 0.028 +502 S 0.027 +503 F 0.027 +504 R 0.025 +505 Q 0.022 +506 N 0.019 +507 A 0.018 +508 L 0.019 +509 Y 0.020 +510 V 0.021 +511 R 0.023 +512 M 0.030 +513 L 0.038 +514 A 0.048 +515 E 0.059 +516 L 0.076 +517 D 0.105 +518 M 0.146 +519 L 0.198 +520 K 0.257 +521 D 0.315 +522 P 0.366 +523 S 0.416 +524 F 0.480 +525 R 0.555 +526 G 0.619 +527 S 0.659 +528 D 0.679 +529 D 0.689 +530 G 0.685 +531 D 0.651 +532 G 0.591 +533 E 0.546 +534 S 0.554 +535 F 0.593 +536 N 0.621 +537 G 0.625 +538 S 0.623 +539 P 0.633 +540 T 0.656 +541 G 0.675 +542 S 0.676 +543 I 0.657 +544 N 0.619 +545 L 0.566 +546 S 0.520 +547 L 0.512 +548 D 0.538 +549 D 0.563 +550 L 0.570 +551 S 0.572 +552 S 0.573 +553 V 0.563 +554 T 0.537 +555 S 0.494 +556 D 0.434 +557 D 0.357 +558 S 0.273 +559 V 0.190 +560 Q 0.119 +561 L 0.067 +562 H 0.036 +563 A 0.023 +564 Y 0.023 +565 I 0.029 +566 S 0.035 +567 D 0.040 +568 T 0.047 +569 G 0.056 +570 V 0.068 +571 C 0.086 +572 N 0.107 +573 D 0.124 +574 H 0.126 +575 G 0.113 +576 K 0.089 +577 T 0.062 +578 Y 0.040 +579 A 0.026 +580 L 0.019 +581 Y 0.016 +582 A 0.015 +583 I 0.017 +584 T 0.021 +585 V 0.028 +586 H 0.037 +587 R 0.051 +588 R 0.071 +589 N 0.094 +590 L 0.111 +591 N 0.120 +592 T 0.122 +593 E 0.119 +594 E 0.106 +595 M 0.088 +596 W 0.070 +597 K 0.055 +598 T 0.046 +599 Y 0.040 +600 R 0.038 +601 R 0.039 +602 Y 0.040 +603 S 0.039 +604 D 0.037 +605 F 0.034 +606 H 0.033 +607 D 0.034 +608 F 0.040 +609 H 0.052 +610 M 0.060 +611 R 0.057 +612 I 0.047 +613 T 0.041 +614 E 0.042 +615 Q 0.050 +616 F 0.061 +617 E 0.070 +618 N 0.075 +619 L 0.080 +620 S 0.093 +621 S 0.113 +622 I 0.130 +623 L 0.138 +624 K 0.143 +625 L 0.154 +626 P 0.175 +627 G 0.197 +628 K 0.205 +629 K 0.193 +630 T 0.171 +631 F 0.151 +632 N 0.138 +633 N 0.128 +634 M 0.117 +635 D 0.106 +636 R 0.096 +637 D 0.088 +638 F 0.080 +639 L 0.074 +640 E 0.074 +641 K 0.080 +642 R 0.086 +643 K 0.084 +644 K 0.079 +645 D 0.078 +646 L 0.076 +647 N 0.066 +648 A 0.055 +649 Y 0.048 +650 L 0.045 +651 Q 0.046 +652 L 0.049 +653 L 0.053 +654 L 0.052 +655 T 0.048 +656 P 0.046 +657 E 0.048 +658 M 0.051 +659 M 0.056 +660 K 0.063 +661 A 0.069 +662 S 0.068 +663 P 0.060 +664 A 0.050 +665 L 0.041 +666 A 0.035 +667 H 0.034 +668 C 0.035 +669 V 0.034 +670 Y 0.030 +671 D 0.028 +672 F 0.033 +673 L 0.048 +674 E 0.075 +675 N 0.118 +676 K 0.176 +677 A 0.240 +678 Y 0.305 +679 S 0.367 +680 K 0.415 +681 G 0.433 +682 K 0.413 +683 G 0.366 +684 D 0.311 +685 F 0.266 +686 A 0.246 +687 R 0.250 +688 K 0.256 +689 M 0.250 +690 D 0.240 +691 T 0.233 +692 F 0.233 +693 V 0.240 +694 N 0.249 +695 P 0.249 +696 L 0.238 +697 R 0.227 +698 N 0.228 +699 S 0.245 +700 M 0.279 +701 R 0.319 +702 N 0.339 +703 V 0.319 +704 S 0.284 +705 N 0.275 +706 A 0.302 +707 V 0.339 +708 K 0.365 +709 S 0.379 +710 L 0.393 +711 P 0.420 +712 D 0.446 +713 S 0.434 +714 L 0.378 +715 A 0.314 +716 E 0.282 +717 G 0.286 +718 V 0.304 +719 T 0.315 +720 K 0.319 +721 M 0.331 +722 S 0.360 +723 D 0.392 +724 N 0.407 +725 V 0.398 +726 G 0.371 +727 R 0.340 +728 M 0.327 +729 S 0.342 +730 E 0.365 +731 R 0.363 +732 L 0.333 +733 G 0.311 +734 Q 0.322 +735 D 0.352 +736 I 0.366 +737 K 0.350 +738 Q 0.315 +739 S 0.286 +740 F 0.280 +741 F 0.303 +742 K 0.347 +743 V 0.405 +744 P 0.472 +745 P 0.540 +746 L 0.598 +747 I 0.639 +748 T 0.671 +749 K 0.698 +750 T 0.711 +751 D 0.702 +752 S 0.678 +753 D 0.656 +754 P 0.647 +755 E 0.647 +756 H 0.650 +757 C 0.654 +758 R 0.660 +759 V 0.667 +760 S 0.669 +761 A 0.657 +762 Q 0.631 +763 L 0.608 +764 D 0.591 +765 D 0.567 +766 N 0.522 +767 V 0.461 +768 D 0.403 +769 D 0.354 +770 N 0.297 +771 I 0.225 +772 P 0.158 +773 L 0.116 +774 R 0.097 +775 V 0.085 +776 M 0.075 +777 L 0.071 +778 L 0.074 +779 L 0.079 +780 M 0.088 +781 D 0.105 +782 E 0.132 +783 V 0.158 +784 F 0.177 +785 D 0.186 +786 L 0.189 +787 K 0.193 +788 E 0.204 +789 R 0.217 +790 N 0.213 +791 Q 0.182 +792 W 0.136 +793 L 0.097 +794 R 0.080 +795 R 0.082 +796 N 0.087 +797 I 0.089 +798 K 0.087 +799 N 0.087 +800 L 0.086 +801 L 0.083 +802 Q 0.082 +803 Q 0.088 +804 L 0.099 +805 I 0.108 +806 R 0.117 +807 A 0.129 +808 T 0.140 +809 Y 0.148 +810 G 0.151 +811 D 0.145 +812 T 0.133 +813 I 0.123 +814 N 0.119 +815 R 0.118 +816 K 0.120 +817 I 0.131 +818 V 0.149 +819 D 0.163 +820 H 0.172 +821 V 0.174 +822 D 0.168 +823 W 0.161 +824 M 0.163 +825 T 0.168 +826 S 0.167 +827 P 0.165 +828 E 0.164 +829 Q 0.157 +830 V 0.145 +831 A 0.134 +832 D 0.132 +833 S 0.135 +834 V 0.137 +835 K 0.135 +836 R 0.138 +837 F 0.149 +838 R 0.165 +839 D 0.183 +840 A 0.198 +841 F 0.208 +842 W 0.217 +843 P 0.229 +844 N 0.240 +845 G 0.245 +846 I 0.244 +847 L 0.243 +848 A 0.249 +849 E 0.259 +850 T 0.268 +851 V 0.268 +852 P 0.260 +853 C 0.240 +854 R 0.208 +855 D 0.172 +856 K 0.144 +857 A 0.129 +858 I 0.122 +859 R 0.116 +860 M 0.110 +861 R 0.104 +862 T 0.103 +863 R 0.108 +864 I 0.117 +865 A 0.125 +866 G 0.129 +867 K 0.125 +868 T 0.117 +869 K 0.109 +870 L 0.104 +871 F 0.104 +872 A 0.110 +873 I 0.118 +874 M 0.124 +875 P 0.127 +876 D 0.129 +877 E 0.132 +878 L 0.133 +879 K 0.137 +880 H 0.148 +881 I 0.162 +882 I 0.171 +883 G 0.167 +884 A 0.151 +885 E 0.128 +886 T 0.110 +887 T 0.102 +888 R 0.101 +889 K 0.099 +890 G 0.096 +891 I 0.090 +892 L 0.087 +893 R 0.090 +894 V 0.100 +895 F 0.110 +896 E 0.120 +897 M 0.131 +898 F 0.150 +899 Q 0.182 +900 H 0.221 +901 N 0.248 +902 Q 0.242 +903 L 0.200 +904 N 0.153 +905 R 0.132 +906 R 0.136 +907 M 0.148 +908 V 0.154 +909 Y 0.155 +910 V 0.157 +911 F 0.158 +912 L 0.156 +913 E 0.150 +914 G 0.144 +915 F 0.136 +916 L 0.129 +917 E 0.129 +918 T 0.136 +919 L 0.141 +920 F 0.143 +921 P 0.146 +922 Q 0.146 +923 Y 0.137 +924 K 0.119 +925 F 0.101 +926 R 0.094 +927 E 0.095 +928 L 0.099 +929 F 0.107 +930 N 0.120 +931 K 0.134 +932 L 0.147 +933 H 0.160 +934 S 0.174 +935 R 0.186 +936 S 0.192 +937 K 0.182 +938 Q 0.162 +939 M 0.146 +940 Q 0.141 +941 K 0.148 +942 Y 0.162 +943 K 0.182 +944 Q 0.206 +945 K 0.230 +946 L 0.249 +947 Q 0.270 +948 S 0.304 +949 T 0.356 +950 Q 0.415 +951 A 0.461 +952 P 0.467 +953 S 0.431 +954 L 0.380 +955 Q 0.348 +956 K 0.342 +957 R 0.347 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020590.17_ENSMUST00000048519.17_GN:Snx13_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020590.17_ENSMUST00000048519.17_GN:Snx13_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0cd531f637c1cbc6e21b04fc6c803411e968749d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020590.17_ENSMUST00000048519.17_GN:Snx13_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid @@ -0,0 +1,959 @@ +>ENSMUSG00000020590.17|ENSMUST00000048519.17|GN:Snx13|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:1 +1 M 0.316 +2 M 0.333 +3 L 0.363 +4 T 0.401 +5 E 0.429 +6 A 0.431 +7 S 0.405 +8 L 0.367 +9 S 0.327 +10 I 0.288 +11 W 0.252 +12 G 0.223 +13 W 0.199 +14 G 0.183 +15 S 0.173 +16 L 0.165 +17 G 0.158 +18 I 0.150 +19 V 0.136 +20 L 0.118 +21 F 0.104 +22 L 0.103 +23 I 0.110 +24 T 0.122 +25 F 0.128 +26 G 0.122 +27 P 0.107 +28 F 0.091 +29 V 0.082 +30 I 0.077 +31 F 0.077 +32 Y 0.087 +33 L 0.107 +34 A 0.128 +35 F 0.141 +36 Y 0.141 +37 I 0.132 +38 L 0.121 +39 C 0.115 +40 F 0.124 +41 V 0.150 +42 G 0.180 +43 G 0.194 +44 G 0.188 +45 L 0.170 +46 V 0.153 +47 V 0.139 +48 T 0.135 +49 L 0.149 +50 L 0.185 +51 Y 0.232 +52 G 0.270 +53 K 0.291 +54 T 0.308 +55 N 0.322 +56 S 0.320 +57 E 0.296 +58 K 0.266 +59 Y 0.248 +60 L 0.240 +61 E 0.239 +62 Q 0.248 +63 C 0.266 +64 E 0.285 +65 H 0.302 +66 S 0.322 +67 F 0.348 +68 L 0.384 +69 P 0.425 +70 P 0.463 +71 T 0.486 +72 S 0.492 +73 S 0.489 +74 G 0.483 +75 V 0.465 +76 P 0.427 +77 K 0.376 +78 C 0.328 +79 L 0.289 +80 E 0.263 +81 E 0.255 +82 M 0.258 +83 K 0.263 +84 R 0.274 +85 E 0.292 +86 A 0.310 +87 R 0.316 +88 T 0.309 +89 I 0.286 +90 K 0.250 +91 I 0.212 +92 D 0.179 +93 R 0.152 +94 R 0.134 +95 L 0.130 +96 T 0.134 +97 G 0.135 +98 A 0.122 +99 N 0.101 +100 I 0.083 +101 I 0.074 +102 D 0.071 +103 E 0.070 +104 P 0.069 +105 L 0.068 +106 Q 0.072 +107 Q 0.078 +108 V 0.083 +109 I 0.083 +110 Q 0.078 +111 F 0.074 +112 S 0.075 +113 L 0.078 +114 R 0.076 +115 D 0.071 +116 Y 0.063 +117 V 0.052 +118 Q 0.042 +119 Y 0.038 +120 W 0.041 +121 Y 0.053 +122 Y 0.074 +123 T 0.099 +124 L 0.121 +125 S 0.139 +126 D 0.155 +127 D 0.164 +128 E 0.159 +129 S 0.141 +130 F 0.122 +131 L 0.114 +132 L 0.116 +133 E 0.124 +134 I 0.127 +135 R 0.121 +136 Q 0.114 +137 T 0.112 +138 L 0.105 +139 Q 0.090 +140 N 0.074 +141 A 0.064 +142 L 0.059 +143 I 0.062 +144 Q 0.073 +145 F 0.086 +146 A 0.095 +147 T 0.110 +148 R 0.137 +149 S 0.166 +150 K 0.179 +151 E 0.174 +152 I 0.152 +153 D 0.116 +154 W 0.080 +155 Q 0.058 +156 P 0.051 +157 Y 0.051 +158 F 0.053 +159 T 0.058 +160 T 0.064 +161 R 0.068 +162 I 0.067 +163 V 0.065 +164 D 0.068 +165 D 0.074 +166 F 0.077 +167 G 0.080 +168 T 0.083 +169 H 0.083 +170 L 0.079 +171 R 0.071 +172 V 0.058 +173 F 0.045 +174 R 0.038 +175 K 0.037 +176 A 0.043 +177 Q 0.053 +178 Q 0.071 +179 R 0.102 +180 V 0.144 +181 T 0.188 +182 E 0.231 +183 K 0.268 +184 D 0.287 +185 D 0.284 +186 Q 0.270 +187 V 0.254 +188 K 0.234 +189 G 0.203 +190 T 0.170 +191 A 0.144 +192 E 0.124 +193 D 0.107 +194 L 0.096 +195 V 0.090 +196 E 0.080 +197 T 0.068 +198 F 0.058 +199 F 0.057 +200 E 0.068 +201 V 0.087 +202 E 0.105 +203 V 0.115 +204 E 0.116 +205 M 0.111 +206 E 0.103 +207 K 0.101 +208 D 0.110 +209 V 0.123 +210 C 0.130 +211 R 0.126 +212 D 0.114 +213 L 0.098 +214 V 0.087 +215 C 0.086 +216 T 0.089 +217 S 0.088 +218 P 0.079 +219 K 0.067 +220 D 0.057 +221 E 0.051 +222 E 0.049 +223 G 0.047 +224 F 0.044 +225 L 0.040 +226 R 0.037 +227 D 0.039 +228 L 0.040 +229 C 0.039 +230 E 0.038 +231 V 0.041 +232 L 0.046 +233 L 0.047 +234 Y 0.047 +235 L 0.048 +236 L 0.053 +237 L 0.063 +238 P 0.078 +239 P 0.091 +240 G 0.099 +241 D 0.102 +242 F 0.102 +243 Q 0.096 +244 S 0.087 +245 K 0.075 +246 I 0.064 +247 M 0.057 +248 R 0.056 +249 Y 0.065 +250 F 0.080 +251 V 0.090 +252 R 0.089 +253 E 0.091 +254 I 0.101 +255 L 0.111 +256 A 0.118 +257 R 0.129 +258 G 0.138 +259 I 0.137 +260 L 0.122 +261 L 0.103 +262 P 0.091 +263 L 0.094 +264 I 0.107 +265 N 0.125 +266 Q 0.141 +267 L 0.145 +268 S 0.136 +269 D 0.121 +270 P 0.107 +271 D 0.092 +272 Y 0.073 +273 I 0.055 +274 N 0.044 +275 Q 0.040 +276 Y 0.042 +277 V 0.045 +278 I 0.052 +279 W 0.064 +280 M 0.082 +281 I 0.104 +282 R 0.130 +283 D 0.155 +284 S 0.169 +285 N 0.167 +286 C 0.154 +287 N 0.136 +288 Y 0.116 +289 E 0.101 +290 A 0.094 +291 F 0.093 +292 M 0.094 +293 N 0.098 +294 I 0.105 +295 I 0.115 +296 K 0.119 +297 L 0.115 +298 S 0.104 +299 D 0.092 +300 N 0.081 +301 I 0.070 +302 G 0.061 +303 E 0.059 +304 L 0.067 +305 E 0.078 +306 A 0.081 +307 V 0.072 +308 R 0.058 +309 D 0.050 +310 K 0.050 +311 A 0.057 +312 A 0.071 +313 E 0.083 +314 E 0.084 +315 L 0.082 +316 Q 0.080 +317 Y 0.077 +318 L 0.078 +319 R 0.089 +320 S 0.114 +321 L 0.147 +322 D 0.178 +323 T 0.198 +324 A 0.207 +325 G 0.205 +326 D 0.192 +327 D 0.171 +328 I 0.147 +329 N 0.124 +330 T 0.109 +331 I 0.104 +332 K 0.105 +333 N 0.108 +334 Q 0.104 +335 I 0.092 +336 N 0.077 +337 S 0.066 +338 L 0.059 +339 L 0.052 +340 F 0.044 +341 V 0.037 +342 K 0.031 +343 K 0.028 +344 V 0.028 +345 C 0.031 +346 D 0.036 +347 S 0.039 +348 R 0.041 +349 I 0.043 +350 Q 0.046 +351 R 0.052 +352 L 0.065 +353 Q 0.090 +354 S 0.126 +355 G 0.163 +356 K 0.186 +357 E 0.187 +358 I 0.172 +359 N 0.154 +360 T 0.139 +361 V 0.126 +362 K 0.114 +363 L 0.103 +364 A 0.097 +365 A 0.100 +366 N 0.111 +367 F 0.122 +368 G 0.127 +369 K 0.121 +370 L 0.107 +371 C 0.088 +372 T 0.069 +373 V 0.052 +374 P 0.039 +375 L 0.032 +376 D 0.032 +377 S 0.035 +378 I 0.036 +379 L 0.035 +380 V 0.035 +381 D 0.036 +382 N 0.034 +383 V 0.031 +384 A 0.029 +385 L 0.027 +386 Q 0.029 +387 F 0.031 +388 F 0.033 +389 M 0.036 +390 D 0.043 +391 Y 0.052 +392 M 0.056 +393 Q 0.053 +394 Q 0.050 +395 T 0.054 +396 G 0.061 +397 G 0.065 +398 Q 0.065 +399 A 0.061 +400 H 0.053 +401 L 0.044 +402 F 0.036 +403 F 0.030 +404 W 0.027 +405 M 0.027 +406 T 0.028 +407 V 0.031 +408 E 0.034 +409 G 0.033 +410 Y 0.030 +411 R 0.027 +412 V 0.029 +413 T 0.038 +414 A 0.056 +415 Q 0.076 +416 Q 0.093 +417 Q 0.107 +418 L 0.125 +419 E 0.155 +420 V 0.199 +421 L 0.251 +422 S 0.301 +423 G 0.339 +424 R 0.361 +425 Q 0.372 +426 R 0.383 +427 D 0.403 +428 G 0.427 +429 K 0.441 +430 Q 0.432 +431 Q 0.396 +432 T 0.343 +433 N 0.293 +434 Q 0.256 +435 T 0.223 +436 K 0.182 +437 G 0.136 +438 L 0.097 +439 L 0.075 +440 R 0.064 +441 A 0.063 +442 A 0.067 +443 A 0.069 +444 V 0.067 +445 G 0.063 +446 I 0.060 +447 Y 0.056 +448 E 0.054 +449 Q 0.059 +450 Y 0.071 +451 L 0.088 +452 S 0.109 +453 E 0.124 +454 K 0.126 +455 A 0.114 +456 S 0.097 +457 P 0.084 +458 R 0.075 +459 V 0.068 +460 T 0.061 +461 V 0.058 +462 D 0.056 +463 D 0.052 +464 Y 0.047 +465 L 0.050 +466 V 0.061 +467 A 0.070 +468 K 0.070 +469 L 0.064 +470 A 0.059 +471 D 0.056 +472 T 0.055 +473 L 0.059 +474 N 0.069 +475 H 0.082 +476 E 0.098 +477 D 0.112 +478 P 0.120 +479 T 0.117 +480 P 0.110 +481 E 0.107 +482 I 0.104 +483 F 0.095 +484 D 0.079 +485 D 0.066 +486 I 0.058 +487 Q 0.054 +488 R 0.057 +489 K 0.065 +490 V 0.070 +491 Y 0.063 +492 E 0.050 +493 L 0.043 +494 M 0.042 +495 L 0.043 +496 R 0.046 +497 D 0.051 +498 E 0.051 +499 R 0.044 +500 F 0.036 +501 Y 0.031 +502 P 0.028 +503 S 0.027 +504 F 0.027 +505 R 0.025 +506 Q 0.022 +507 N 0.019 +508 A 0.018 +509 L 0.019 +510 Y 0.020 +511 V 0.021 +512 R 0.023 +513 M 0.030 +514 L 0.038 +515 A 0.048 +516 E 0.059 +517 L 0.076 +518 D 0.105 +519 M 0.146 +520 L 0.199 +521 K 0.257 +522 D 0.315 +523 P 0.366 +524 S 0.416 +525 F 0.480 +526 R 0.555 +527 G 0.619 +528 S 0.659 +529 D 0.679 +530 D 0.689 +531 G 0.685 +532 D 0.651 +533 G 0.591 +534 E 0.547 +535 S 0.554 +536 F 0.593 +537 N 0.621 +538 G 0.625 +539 S 0.623 +540 P 0.633 +541 T 0.656 +542 G 0.675 +543 S 0.676 +544 I 0.657 +545 N 0.619 +546 L 0.566 +547 S 0.521 +548 L 0.512 +549 D 0.538 +550 D 0.563 +551 L 0.570 +552 S 0.572 +553 S 0.573 +554 V 0.564 +555 T 0.537 +556 S 0.495 +557 D 0.434 +558 D 0.357 +559 S 0.273 +560 V 0.190 +561 Q 0.119 +562 L 0.067 +563 H 0.036 +564 A 0.023 +565 Y 0.023 +566 I 0.029 +567 S 0.035 +568 D 0.040 +569 T 0.047 +570 G 0.056 +571 V 0.068 +572 C 0.086 +573 N 0.108 +574 D 0.124 +575 H 0.127 +576 G 0.113 +577 K 0.089 +578 T 0.062 +579 Y 0.040 +580 A 0.026 +581 L 0.019 +582 Y 0.016 +583 A 0.015 +584 I 0.017 +585 T 0.021 +586 V 0.028 +587 H 0.037 +588 R 0.051 +589 R 0.072 +590 N 0.094 +591 L 0.111 +592 N 0.120 +593 T 0.122 +594 E 0.119 +595 E 0.106 +596 M 0.088 +597 W 0.070 +598 K 0.055 +599 T 0.046 +600 Y 0.040 +601 R 0.039 +602 R 0.039 +603 Y 0.040 +604 S 0.039 +605 D 0.037 +606 F 0.034 +607 H 0.033 +608 D 0.034 +609 F 0.040 +610 H 0.052 +611 M 0.060 +612 R 0.057 +613 I 0.047 +614 T 0.041 +615 E 0.042 +616 Q 0.050 +617 F 0.061 +618 E 0.070 +619 N 0.075 +620 L 0.080 +621 S 0.093 +622 S 0.113 +623 I 0.130 +624 L 0.138 +625 K 0.143 +626 L 0.154 +627 P 0.175 +628 G 0.197 +629 K 0.205 +630 K 0.193 +631 T 0.171 +632 F 0.151 +633 N 0.138 +634 N 0.128 +635 M 0.117 +636 D 0.106 +637 R 0.096 +638 D 0.088 +639 F 0.080 +640 L 0.074 +641 E 0.074 +642 K 0.080 +643 R 0.086 +644 K 0.084 +645 K 0.080 +646 D 0.079 +647 L 0.076 +648 N 0.067 +649 A 0.055 +650 Y 0.048 +651 L 0.045 +652 Q 0.046 +653 L 0.049 +654 L 0.053 +655 L 0.052 +656 T 0.048 +657 P 0.046 +658 E 0.048 +659 M 0.051 +660 M 0.056 +661 K 0.063 +662 A 0.069 +663 S 0.069 +664 P 0.060 +665 A 0.050 +666 L 0.041 +667 A 0.035 +668 H 0.034 +669 C 0.035 +670 V 0.034 +671 Y 0.030 +672 D 0.028 +673 F 0.033 +674 L 0.048 +675 E 0.075 +676 N 0.118 +677 K 0.176 +678 A 0.240 +679 Y 0.305 +680 S 0.367 +681 K 0.416 +682 G 0.434 +683 K 0.414 +684 G 0.366 +685 D 0.311 +686 F 0.267 +687 A 0.247 +688 R 0.250 +689 K 0.256 +690 M 0.251 +691 D 0.240 +692 T 0.234 +693 F 0.234 +694 V 0.240 +695 N 0.249 +696 P 0.250 +697 L 0.239 +698 R 0.228 +699 N 0.229 +700 S 0.246 +701 M 0.279 +702 R 0.320 +703 N 0.340 +704 V 0.321 +705 S 0.287 +706 N 0.279 +707 A 0.304 +708 V 0.340 +709 K 0.366 +710 S 0.379 +711 L 0.393 +712 P 0.420 +713 D 0.446 +714 S 0.435 +715 L 0.378 +716 A 0.314 +717 E 0.282 +718 G 0.286 +719 V 0.304 +720 T 0.315 +721 K 0.319 +722 M 0.331 +723 S 0.360 +724 D 0.392 +725 N 0.407 +726 V 0.398 +727 G 0.371 +728 R 0.340 +729 M 0.327 +730 S 0.343 +731 E 0.366 +732 R 0.364 +733 L 0.334 +734 G 0.312 +735 Q 0.323 +736 D 0.352 +737 I 0.366 +738 K 0.350 +739 Q 0.316 +740 S 0.286 +741 F 0.280 +742 F 0.303 +743 K 0.348 +744 V 0.405 +745 P 0.472 +746 P 0.541 +747 L 0.598 +748 I 0.639 +749 T 0.672 +750 K 0.699 +751 T 0.712 +752 D 0.702 +753 S 0.678 +754 D 0.657 +755 P 0.648 +756 E 0.648 +757 H 0.651 +758 C 0.654 +759 R 0.660 +760 V 0.667 +761 S 0.669 +762 A 0.657 +763 Q 0.632 +764 L 0.608 +765 D 0.591 +766 D 0.568 +767 N 0.523 +768 V 0.462 +769 D 0.404 +770 D 0.355 +771 N 0.298 +772 I 0.226 +773 P 0.158 +774 L 0.116 +775 R 0.097 +776 V 0.085 +777 M 0.075 +778 L 0.071 +779 L 0.074 +780 L 0.080 +781 M 0.088 +782 D 0.105 +783 E 0.132 +784 V 0.158 +785 F 0.177 +786 D 0.186 +787 L 0.189 +788 K 0.192 +789 E 0.204 +790 R 0.216 +791 N 0.212 +792 Q 0.182 +793 W 0.136 +794 L 0.097 +795 R 0.080 +796 R 0.081 +797 N 0.087 +798 I 0.089 +799 K 0.087 +800 N 0.087 +801 L 0.086 +802 L 0.083 +803 Q 0.082 +804 Q 0.088 +805 L 0.099 +806 I 0.108 +807 R 0.117 +808 A 0.129 +809 T 0.140 +810 Y 0.148 +811 G 0.151 +812 D 0.145 +813 T 0.132 +814 I 0.122 +815 N 0.119 +816 R 0.118 +817 K 0.120 +818 I 0.131 +819 V 0.148 +820 D 0.163 +821 H 0.172 +822 V 0.174 +823 D 0.168 +824 W 0.161 +825 M 0.163 +826 T 0.168 +827 S 0.167 +828 P 0.164 +829 E 0.163 +830 Q 0.157 +831 V 0.144 +832 A 0.134 +833 D 0.131 +834 S 0.135 +835 V 0.136 +836 K 0.135 +837 R 0.138 +838 F 0.149 +839 R 0.165 +840 D 0.182 +841 A 0.197 +842 F 0.208 +843 W 0.217 +844 P 0.228 +845 N 0.240 +846 G 0.245 +847 I 0.244 +848 L 0.243 +849 A 0.249 +850 E 0.259 +851 T 0.268 +852 V 0.268 +853 P 0.260 +854 C 0.241 +855 R 0.208 +856 D 0.172 +857 K 0.144 +858 A 0.129 +859 I 0.122 +860 R 0.116 +861 M 0.110 +862 R 0.105 +863 T 0.103 +864 R 0.108 +865 I 0.117 +866 A 0.126 +867 G 0.129 +868 K 0.125 +869 T 0.117 +870 K 0.109 +871 L 0.104 +872 F 0.104 +873 A 0.110 +874 I 0.118 +875 M 0.123 +876 P 0.127 +877 D 0.129 +878 E 0.132 +879 L 0.133 +880 K 0.137 +881 H 0.148 +882 I 0.162 +883 I 0.171 +884 G 0.168 +885 A 0.151 +886 E 0.128 +887 T 0.110 +888 T 0.102 +889 R 0.101 +890 K 0.099 +891 G 0.096 +892 I 0.090 +893 L 0.087 +894 R 0.090 +895 V 0.100 +896 F 0.110 +897 E 0.120 +898 M 0.131 +899 F 0.150 +900 Q 0.182 +901 H 0.221 +902 N 0.248 +903 Q 0.242 +904 L 0.200 +905 N 0.153 +906 R 0.132 +907 R 0.136 +908 M 0.148 +909 V 0.154 +910 Y 0.155 +911 V 0.157 +912 F 0.158 +913 L 0.156 +914 E 0.150 +915 G 0.144 +916 F 0.136 +917 L 0.129 +918 E 0.129 +919 T 0.136 +920 L 0.141 +921 F 0.143 +922 P 0.145 +923 Q 0.146 +924 Y 0.137 +925 K 0.118 +926 F 0.101 +927 R 0.094 +928 E 0.095 +929 L 0.099 +930 F 0.107 +931 N 0.120 +932 K 0.134 +933 L 0.147 +934 H 0.160 +935 S 0.174 +936 R 0.186 +937 S 0.192 +938 K 0.182 +939 Q 0.162 +940 M 0.146 +941 Q 0.141 +942 K 0.148 +943 Y 0.162 +944 K 0.182 +945 Q 0.206 +946 K 0.230 +947 L 0.249 +948 Q 0.270 +949 S 0.304 +950 T 0.356 +951 Q 0.415 +952 A 0.460 +953 P 0.467 +954 S 0.431 +955 L 0.380 +956 Q 0.348 +957 K 0.342 +958 R 0.346 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020708.13_ENSMUST00000021049.9_GN:Psmc5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020708.13_ENSMUST00000021049.9_GN:Psmc5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5539cd75c8764fcfd98ea21525c4979c70fcdfa2 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020708.13_ENSMUST00000021049.9_GN:Psmc5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,407 @@ +>ENSMUSG00000020708.13|ENSMUST00000021049.9|GN:Psmc5|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.479 +2 A 0.499 +3 L 0.528 +4 D 0.554 +5 G 0.561 +6 P 0.543 +7 E 0.528 +8 Q 0.550 +9 M 0.596 +10 E 0.633 +11 L 0.653 +12 E 0.661 +13 E 0.659 +14 G 0.649 +15 K 0.637 +16 A 0.622 +17 G 0.589 +18 S 0.526 +19 G 0.438 +20 L 0.346 +21 R 0.272 +22 Q 0.223 +23 Y 0.196 +24 Y 0.186 +25 L 0.192 +26 S 0.209 +27 K 0.224 +28 I 0.227 +29 E 0.221 +30 E 0.225 +31 L 0.241 +32 Q 0.261 +33 L 0.279 +34 I 0.304 +35 V 0.328 +36 N 0.337 +37 D 0.325 +38 K 0.300 +39 S 0.278 +40 Q 0.268 +41 N 0.265 +42 L 0.259 +43 R 0.245 +44 R 0.238 +45 L 0.251 +46 Q 0.280 +47 A 0.306 +48 Q 0.315 +49 R 0.310 +50 N 0.298 +51 E 0.281 +52 L 0.262 +53 N 0.246 +54 A 0.241 +55 K 0.241 +56 V 0.237 +57 R 0.229 +58 L 0.228 +59 L 0.235 +60 R 0.249 +61 E 0.272 +62 E 0.301 +63 L 0.323 +64 Q 0.345 +65 L 0.372 +66 L 0.388 +67 Q 0.379 +68 E 0.349 +69 Q 0.309 +70 G 0.257 +71 S 0.192 +72 Y 0.127 +73 V 0.078 +74 G 0.049 +75 E 0.036 +76 V 0.033 +77 V 0.035 +78 R 0.039 +79 A 0.044 +80 M 0.049 +81 D 0.053 +82 K 0.053 +83 K 0.046 +84 K 0.035 +85 V 0.027 +86 L 0.024 +87 V 0.026 +88 K 0.032 +89 V 0.042 +90 H 0.055 +91 P 0.071 +92 E 0.082 +93 G 0.083 +94 K 0.075 +95 F 0.065 +96 V 0.057 +97 V 0.054 +98 D 0.058 +99 V 0.063 +100 D 0.066 +101 K 0.067 +102 N 0.068 +103 I 0.066 +104 D 0.059 +105 I 0.050 +106 N 0.046 +107 D 0.051 +108 V 0.062 +109 T 0.077 +110 P 0.091 +111 N 0.100 +112 C 0.100 +113 R 0.096 +114 V 0.092 +115 A 0.094 +116 L 0.100 +117 R 0.100 +118 N 0.093 +119 D 0.084 +120 S 0.079 +121 Y 0.078 +122 T 0.081 +123 L 0.086 +124 H 0.095 +125 K 0.115 +126 I 0.154 +127 L 0.211 +128 P 0.270 +129 N 0.313 +130 K 0.325 +131 V 0.302 +132 D 0.261 +133 P 0.224 +134 L 0.203 +135 V 0.195 +136 S 0.192 +137 L 0.195 +138 M 0.206 +139 M 0.222 +140 V 0.234 +141 E 0.244 +142 K 0.255 +143 V 0.252 +144 P 0.223 +145 D 0.181 +146 S 0.142 +147 T 0.111 +148 Y 0.088 +149 E 0.074 +150 M 0.067 +151 I 0.062 +152 G 0.060 +153 G 0.059 +154 L 0.056 +155 D 0.050 +156 K 0.048 +157 Q 0.054 +158 I 0.065 +159 K 0.074 +160 E 0.075 +161 I 0.067 +162 K 0.060 +163 E 0.056 +164 V 0.053 +165 I 0.050 +166 E 0.048 +167 L 0.047 +168 P 0.048 +169 V 0.052 +170 K 0.059 +171 H 0.067 +172 P 0.071 +173 E 0.074 +174 L 0.077 +175 F 0.085 +176 E 0.102 +177 A 0.128 +178 L 0.161 +179 G 0.194 +180 I 0.211 +181 A 0.202 +182 Q 0.170 +183 P 0.129 +184 K 0.094 +185 G 0.071 +186 V 0.060 +187 L 0.055 +188 L 0.053 +189 Y 0.055 +190 G 0.059 +191 P 0.062 +192 P 0.060 +193 G 0.058 +194 T 0.059 +195 G 0.064 +196 K 0.071 +197 T 0.083 +198 L 0.096 +199 L 0.103 +200 A 0.103 +201 R 0.100 +202 A 0.097 +203 V 0.091 +204 A 0.081 +205 H 0.072 +206 H 0.071 +207 T 0.078 +208 D 0.086 +209 C 0.085 +210 T 0.076 +211 F 0.065 +212 I 0.058 +213 R 0.056 +214 V 0.056 +215 S 0.058 +216 G 0.066 +217 S 0.084 +218 E 0.104 +219 L 0.115 +220 V 0.113 +221 Q 0.107 +222 K 0.105 +223 F 0.106 +224 I 0.102 +225 G 0.092 +226 E 0.081 +227 G 0.073 +228 A 0.067 +229 R 0.060 +230 M 0.053 +231 V 0.046 +232 R 0.040 +233 E 0.036 +234 L 0.033 +235 F 0.034 +236 V 0.036 +237 M 0.038 +238 A 0.039 +239 R 0.037 +240 E 0.033 +241 H 0.030 +242 A 0.029 +243 P 0.034 +244 S 0.042 +245 I 0.047 +246 I 0.046 +247 F 0.042 +248 M 0.041 +249 D 0.043 +250 E 0.047 +251 I 0.053 +252 D 0.066 +253 S 0.087 +254 I 0.113 +255 G 0.144 +256 S 0.188 +257 S 0.248 +258 R 0.314 +259 L 0.373 +260 E 0.411 +261 G 0.422 +262 G 0.407 +263 S 0.376 +264 G 0.337 +265 G 0.295 +266 D 0.249 +267 S 0.207 +268 E 0.176 +269 V 0.156 +270 Q 0.140 +271 R 0.121 +272 T 0.104 +273 M 0.091 +274 L 0.080 +275 E 0.073 +276 L 0.068 +277 L 0.065 +278 N 0.064 +279 Q 0.065 +280 L 0.070 +281 D 0.079 +282 G 0.097 +283 F 0.122 +284 E 0.144 +285 A 0.145 +286 T 0.125 +287 K 0.098 +288 N 0.076 +289 I 0.062 +290 K 0.055 +291 V 0.053 +292 I 0.055 +293 M 0.057 +294 A 0.059 +295 T 0.061 +296 N 0.065 +297 R 0.072 +298 I 0.081 +299 D 0.092 +300 I 0.101 +301 L 0.104 +302 D 0.100 +303 S 0.094 +304 A 0.092 +305 L 0.093 +306 L 0.099 +307 R 0.108 +308 P 0.114 +309 G 0.111 +310 R 0.103 +311 I 0.093 +312 D 0.082 +313 R 0.070 +314 K 0.063 +315 I 0.061 +316 E 0.071 +317 F 0.092 +318 P 0.115 +319 P 0.124 +320 P 0.116 +321 N 0.100 +322 E 0.087 +323 E 0.080 +324 A 0.071 +325 R 0.062 +326 L 0.057 +327 D 0.055 +328 I 0.054 +329 L 0.053 +330 K 0.053 +331 I 0.055 +332 H 0.057 +333 S 0.062 +334 R 0.068 +335 K 0.073 +336 M 0.075 +337 N 0.078 +338 L 0.084 +339 T 0.092 +340 R 0.101 +341 G 0.104 +342 I 0.095 +343 N 0.076 +344 L 0.058 +345 R 0.050 +346 K 0.055 +347 I 0.067 +348 A 0.078 +349 E 0.089 +350 L 0.103 +351 M 0.114 +352 P 0.115 +353 G 0.109 +354 A 0.101 +355 S 0.093 +356 G 0.084 +357 A 0.079 +358 E 0.080 +359 V 0.084 +360 K 0.087 +361 G 0.086 +362 V 0.084 +363 C 0.080 +364 T 0.074 +365 E 0.067 +366 A 0.064 +367 G 0.063 +368 M 0.064 +369 Y 0.068 +370 A 0.073 +371 L 0.077 +372 R 0.081 +373 E 0.085 +374 R 0.090 +375 R 0.098 +376 V 0.111 +377 H 0.123 +378 V 0.122 +379 T 0.108 +380 Q 0.091 +381 E 0.077 +382 D 0.068 +383 F 0.064 +384 E 0.068 +385 M 0.071 +386 A 0.065 +387 V 0.056 +388 A 0.057 +389 K 0.070 +390 V 0.086 +391 M 0.098 +392 Q 0.118 +393 K 0.161 +394 D 0.217 +395 S 0.265 +396 E 0.295 +397 K 0.316 +398 N 0.332 +399 M 0.342 +400 S 0.344 +401 I 0.338 +402 K 0.326 +403 K 0.311 +404 L 0.296 +405 W 0.283 +406 K 0.276 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020708.13_ENSMUST00000021049.9_GN:Psmc5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020708.13_ENSMUST00000021049.9_GN:Psmc5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7f2faa00a994fe311b3b9636a4f16ab91b9d10a8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000020708.13_ENSMUST00000021049.9_GN:Psmc5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid @@ -0,0 +1,417 @@ +>ENSMUSG00000020708.13|ENSMUST00000021049.9|GN:Psmc5|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:10 +1 M 0.432 +2 P 0.457 +3 A 0.498 +4 I 0.536 +5 P 0.546 +6 A 0.524 +7 E 0.507 +8 R 0.513 +9 G 0.519 +10 K 0.525 +11 M 0.560 +12 A 0.610 +13 L 0.641 +14 D 0.654 +15 G 0.672 +16 P 0.692 +17 E 0.702 +18 Q 0.701 +19 M 0.698 +20 E 0.698 +21 L 0.700 +22 E 0.698 +23 E 0.691 +24 G 0.680 +25 K 0.669 +26 A 0.655 +27 G 0.624 +28 S 0.563 +29 G 0.473 +30 L 0.375 +31 R 0.293 +32 Q 0.240 +33 Y 0.212 +34 Y 0.201 +35 L 0.205 +36 S 0.220 +37 K 0.237 +38 I 0.243 +39 E 0.245 +40 E 0.256 +41 L 0.276 +42 Q 0.295 +43 L 0.315 +44 I 0.341 +45 V 0.367 +46 N 0.377 +47 D 0.362 +48 K 0.336 +49 S 0.314 +50 Q 0.303 +51 N 0.295 +52 L 0.280 +53 R 0.259 +54 R 0.248 +55 L 0.259 +56 Q 0.288 +57 A 0.316 +58 Q 0.326 +59 R 0.318 +60 N 0.304 +61 E 0.285 +62 L 0.264 +63 N 0.249 +64 A 0.244 +65 K 0.243 +66 V 0.237 +67 R 0.228 +68 L 0.227 +69 L 0.234 +70 R 0.249 +71 E 0.274 +72 E 0.304 +73 L 0.326 +74 Q 0.347 +75 L 0.374 +76 L 0.390 +77 Q 0.380 +78 E 0.348 +79 Q 0.307 +80 G 0.254 +81 S 0.190 +82 Y 0.125 +83 V 0.077 +84 G 0.049 +85 E 0.035 +86 V 0.032 +87 V 0.034 +88 R 0.038 +89 A 0.042 +90 M 0.047 +91 D 0.051 +92 K 0.051 +93 K 0.045 +94 K 0.035 +95 V 0.026 +96 L 0.023 +97 V 0.025 +98 K 0.031 +99 V 0.040 +100 H 0.053 +101 P 0.069 +102 E 0.080 +103 G 0.082 +104 K 0.075 +105 F 0.065 +106 V 0.057 +107 V 0.054 +108 D 0.058 +109 V 0.063 +110 D 0.066 +111 K 0.067 +112 N 0.068 +113 I 0.067 +114 D 0.059 +115 I 0.050 +116 N 0.046 +117 D 0.051 +118 V 0.062 +119 T 0.076 +120 P 0.091 +121 N 0.100 +122 C 0.100 +123 R 0.095 +124 V 0.092 +125 A 0.095 +126 L 0.100 +127 R 0.100 +128 N 0.092 +129 D 0.084 +130 S 0.079 +131 Y 0.079 +132 T 0.082 +133 L 0.086 +134 H 0.095 +135 K 0.115 +136 I 0.155 +137 L 0.211 +138 P 0.271 +139 N 0.315 +140 K 0.327 +141 V 0.304 +142 D 0.262 +143 P 0.225 +144 L 0.203 +145 V 0.194 +146 S 0.192 +147 L 0.195 +148 M 0.206 +149 M 0.221 +150 V 0.233 +151 E 0.244 +152 K 0.254 +153 V 0.251 +154 P 0.222 +155 D 0.180 +156 S 0.142 +157 T 0.111 +158 Y 0.088 +159 E 0.074 +160 M 0.067 +161 I 0.063 +162 G 0.061 +163 G 0.060 +164 L 0.056 +165 D 0.051 +166 K 0.049 +167 Q 0.054 +168 I 0.065 +169 K 0.074 +170 E 0.075 +171 I 0.068 +172 K 0.061 +173 E 0.057 +174 V 0.054 +175 I 0.050 +176 E 0.048 +177 L 0.048 +178 P 0.048 +179 V 0.052 +180 K 0.060 +181 H 0.068 +182 P 0.074 +183 E 0.077 +184 L 0.079 +185 F 0.086 +186 E 0.103 +187 A 0.129 +188 L 0.162 +189 G 0.194 +190 I 0.212 +191 A 0.202 +192 Q 0.170 +193 P 0.129 +194 K 0.094 +195 G 0.072 +196 V 0.060 +197 L 0.055 +198 L 0.053 +199 Y 0.055 +200 G 0.059 +201 P 0.061 +202 P 0.060 +203 G 0.058 +204 T 0.059 +205 G 0.064 +206 K 0.071 +207 T 0.082 +208 L 0.095 +209 L 0.103 +210 A 0.102 +211 R 0.100 +212 A 0.097 +213 V 0.091 +214 A 0.081 +215 H 0.072 +216 H 0.071 +217 T 0.078 +218 D 0.086 +219 C 0.085 +220 T 0.075 +221 F 0.065 +222 I 0.058 +223 R 0.056 +224 V 0.056 +225 S 0.058 +226 G 0.066 +227 S 0.084 +228 E 0.104 +229 L 0.114 +230 V 0.113 +231 Q 0.107 +232 K 0.105 +233 F 0.106 +234 I 0.103 +235 G 0.093 +236 E 0.081 +237 G 0.073 +238 A 0.068 +239 R 0.061 +240 M 0.053 +241 V 0.046 +242 R 0.040 +243 E 0.036 +244 L 0.033 +245 F 0.034 +246 V 0.036 +247 M 0.038 +248 A 0.039 +249 R 0.037 +250 E 0.033 +251 H 0.030 +252 A 0.030 +253 P 0.034 +254 S 0.042 +255 I 0.047 +256 I 0.046 +257 F 0.042 +258 M 0.041 +259 D 0.043 +260 E 0.047 +261 I 0.053 +262 D 0.066 +263 S 0.088 +264 I 0.114 +265 G 0.146 +266 S 0.191 +267 S 0.251 +268 R 0.318 +269 L 0.377 +270 E 0.416 +271 G 0.426 +272 G 0.411 +273 S 0.380 +274 G 0.341 +275 G 0.298 +276 D 0.252 +277 S 0.210 +278 E 0.178 +279 V 0.158 +280 Q 0.142 +281 R 0.123 +282 T 0.105 +283 M 0.092 +284 L 0.081 +285 E 0.074 +286 L 0.069 +287 L 0.066 +288 N 0.065 +289 Q 0.066 +290 L 0.071 +291 D 0.080 +292 G 0.097 +293 F 0.123 +294 E 0.145 +295 A 0.146 +296 T 0.126 +297 K 0.099 +298 N 0.077 +299 I 0.062 +300 K 0.055 +301 V 0.054 +302 I 0.055 +303 M 0.057 +304 A 0.059 +305 T 0.062 +306 N 0.066 +307 R 0.073 +308 I 0.082 +309 D 0.094 +310 I 0.103 +311 L 0.105 +312 D 0.101 +313 S 0.095 +314 A 0.093 +315 L 0.094 +316 L 0.100 +317 R 0.109 +318 P 0.115 +319 G 0.112 +320 R 0.103 +321 I 0.093 +322 D 0.082 +323 R 0.071 +324 K 0.063 +325 I 0.062 +326 E 0.071 +327 F 0.092 +328 P 0.115 +329 P 0.125 +330 P 0.116 +331 N 0.100 +332 E 0.088 +333 E 0.080 +334 A 0.071 +335 R 0.062 +336 L 0.057 +337 D 0.055 +338 I 0.054 +339 L 0.053 +340 K 0.054 +341 I 0.055 +342 H 0.058 +343 S 0.062 +344 R 0.069 +345 K 0.073 +346 M 0.076 +347 N 0.079 +348 L 0.084 +349 T 0.092 +350 R 0.101 +351 G 0.104 +352 I 0.095 +353 N 0.076 +354 L 0.058 +355 R 0.050 +356 K 0.055 +357 I 0.067 +358 A 0.079 +359 E 0.090 +360 L 0.103 +361 M 0.115 +362 P 0.116 +363 G 0.110 +364 A 0.102 +365 S 0.094 +366 G 0.085 +367 A 0.080 +368 E 0.081 +369 V 0.085 +370 K 0.087 +371 G 0.086 +372 V 0.084 +373 C 0.080 +374 T 0.074 +375 E 0.067 +376 A 0.064 +377 G 0.063 +378 M 0.065 +379 Y 0.068 +380 A 0.073 +381 L 0.077 +382 R 0.081 +383 E 0.086 +384 R 0.090 +385 R 0.098 +386 V 0.111 +387 H 0.123 +388 V 0.122 +389 T 0.108 +390 Q 0.090 +391 E 0.076 +392 D 0.067 +393 F 0.064 +394 E 0.068 +395 M 0.071 +396 A 0.065 +397 V 0.056 +398 A 0.057 +399 K 0.070 +400 V 0.087 +401 M 0.099 +402 Q 0.120 +403 K 0.163 +404 D 0.220 +405 S 0.268 +406 E 0.298 +407 K 0.318 +408 N 0.334 +409 M 0.343 +410 S 0.345 +411 I 0.339 +412 K 0.327 +413 K 0.312 +414 L 0.297 +415 W 0.285 +416 K 0.277 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021130.9_ENSMUST00000219993.2_GN:Galnt16_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021130.9_ENSMUST00000219993.2_GN:Galnt16_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c735b3acbfa95dd5d280c6bcef5e57d894562d61 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021130.9_ENSMUST00000219993.2_GN:Galnt16_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,559 @@ +>ENSMUSG00000021130.9|ENSMUST00000219993.2|GN:Galnt16|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.256 +2 R 0.251 +3 K 0.250 +4 I 0.254 +5 R 0.252 +6 A 0.243 +7 N 0.237 +8 A 0.232 +9 I 0.223 +10 A 0.220 +11 I 0.235 +12 L 0.266 +13 T 0.291 +14 V 0.294 +15 A 0.286 +16 W 0.279 +17 I 0.271 +18 L 0.260 +19 G 0.257 +20 T 0.252 +21 F 0.232 +22 Y 0.199 +23 Y 0.172 +24 L 0.166 +25 W 0.184 +26 Q 0.218 +27 D 0.251 +28 N 0.262 +29 R 0.260 +30 A 0.270 +31 H 0.305 +32 A 0.346 +33 A 0.379 +34 S 0.410 +35 S 0.449 +36 S 0.478 +37 G 0.482 +38 R 0.479 +39 G 0.485 +40 A 0.488 +41 Q 0.491 +42 R 0.520 +43 A 0.562 +44 G 0.589 +45 G 0.593 +46 R 0.588 +47 P 0.582 +48 E 0.573 +49 Q 0.556 +50 L 0.520 +51 R 0.466 +52 E 0.416 +53 D 0.397 +54 R 0.410 +55 T 0.438 +56 I 0.465 +57 P 0.477 +58 L 0.466 +59 I 0.439 +60 V 0.413 +61 T 0.401 +62 G 0.398 +63 T 0.398 +64 P 0.398 +65 S 0.395 +66 K 0.375 +67 G 0.326 +68 F 0.254 +69 D 0.183 +70 E 0.135 +71 K 0.116 +72 A 0.117 +73 Y 0.124 +74 L 0.133 +75 S 0.144 +76 A 0.154 +77 K 0.159 +78 Q 0.164 +79 L 0.172 +80 K 0.181 +81 P 0.193 +82 G 0.203 +83 E 0.206 +84 D 0.197 +85 P 0.175 +86 Y 0.149 +87 R 0.127 +88 Q 0.114 +89 H 0.118 +90 A 0.144 +91 F 0.180 +92 N 0.205 +93 Q 0.208 +94 L 0.198 +95 E 0.180 +96 S 0.162 +97 D 0.150 +98 K 0.147 +99 L 0.149 +100 S 0.147 +101 S 0.142 +102 D 0.140 +103 R 0.144 +104 P 0.150 +105 I 0.157 +106 R 0.164 +107 D 0.161 +108 T 0.147 +109 R 0.126 +110 H 0.107 +111 Y 0.095 +112 S 0.091 +113 C 0.092 +114 P 0.093 +115 S 0.097 +116 L 0.104 +117 S 0.110 +118 Y 0.108 +119 S 0.099 +120 S 0.093 +121 D 0.095 +122 L 0.096 +123 P 0.089 +124 A 0.072 +125 T 0.055 +126 S 0.046 +127 V 0.043 +128 I 0.044 +129 I 0.047 +130 T 0.054 +131 F 0.060 +132 H 0.063 +133 N 0.068 +134 E 0.075 +135 A 0.076 +136 R 0.069 +137 S 0.059 +138 T 0.053 +139 L 0.055 +140 L 0.059 +141 R 0.060 +142 T 0.057 +143 V 0.055 +144 K 0.054 +145 S 0.051 +146 V 0.047 +147 L 0.044 +148 N 0.044 +149 R 0.047 +150 T 0.048 +151 P 0.047 +152 A 0.045 +153 S 0.045 +154 L 0.046 +155 I 0.044 +156 Q 0.039 +157 E 0.032 +158 I 0.028 +159 I 0.025 +160 L 0.023 +161 V 0.024 +162 D 0.026 +163 D 0.030 +164 F 0.036 +165 S 0.042 +166 S 0.047 +167 D 0.049 +168 P 0.047 +169 E 0.043 +170 D 0.039 +171 C 0.037 +172 L 0.038 +173 L 0.044 +174 L 0.049 +175 T 0.053 +176 R 0.054 +177 I 0.054 +178 P 0.047 +179 K 0.040 +180 V 0.039 +181 K 0.045 +182 C 0.054 +183 L 0.060 +184 R 0.064 +185 N 0.065 +186 D 0.065 +187 K 0.063 +188 R 0.061 +189 E 0.058 +190 G 0.056 +191 L 0.051 +192 I 0.048 +193 R 0.048 +194 S 0.048 +195 R 0.046 +196 V 0.044 +197 R 0.045 +198 G 0.049 +199 A 0.052 +200 D 0.058 +201 V 0.069 +202 A 0.082 +203 G 0.086 +204 A 0.079 +205 T 0.068 +206 V 0.056 +207 L 0.049 +208 T 0.048 +209 F 0.054 +210 L 0.061 +211 D 0.063 +212 S 0.062 +213 H 0.062 +214 C 0.068 +215 E 0.077 +216 V 0.086 +217 N 0.091 +218 V 0.088 +219 E 0.077 +220 W 0.063 +221 L 0.050 +222 Q 0.039 +223 P 0.032 +224 M 0.028 +225 L 0.028 +226 Q 0.029 +227 R 0.030 +228 V 0.032 +229 M 0.034 +230 E 0.034 +231 D 0.033 +232 H 0.033 +233 T 0.038 +234 R 0.049 +235 V 0.061 +236 V 0.070 +237 S 0.074 +238 P 0.077 +239 I 0.079 +240 I 0.082 +241 D 0.086 +242 V 0.084 +243 I 0.075 +244 S 0.064 +245 L 0.058 +246 D 0.058 +247 N 0.063 +248 F 0.070 +249 A 0.079 +250 Y 0.093 +251 L 0.118 +252 A 0.150 +253 A 0.179 +254 S 0.196 +255 A 0.198 +256 D 0.188 +257 L 0.172 +258 R 0.153 +259 G 0.134 +260 G 0.114 +261 F 0.095 +262 D 0.082 +263 W 0.076 +264 S 0.076 +265 L 0.078 +266 H 0.083 +267 F 0.086 +268 K 0.092 +269 W 0.102 +270 E 0.115 +271 Q 0.126 +272 I 0.126 +273 P 0.113 +274 L 0.094 +275 E 0.082 +276 Q 0.078 +277 K 0.081 +278 M 0.087 +279 T 0.095 +280 R 0.105 +281 T 0.113 +282 D 0.120 +283 P 0.125 +284 T 0.130 +285 K 0.136 +286 P 0.144 +287 I 0.150 +288 R 0.149 +289 T 0.136 +290 P 0.124 +291 V 0.125 +292 I 0.141 +293 A 0.155 +294 G 0.151 +295 G 0.130 +296 I 0.103 +297 F 0.084 +298 V 0.074 +299 I 0.068 +300 D 0.060 +301 K 0.055 +302 S 0.054 +303 W 0.057 +304 F 0.060 +305 N 0.063 +306 H 0.067 +307 L 0.075 +308 G 0.084 +309 K 0.091 +310 Y 0.098 +311 D 0.103 +312 A 0.103 +313 Q 0.095 +314 M 0.080 +315 D 0.066 +316 I 0.058 +317 W 0.059 +318 G 0.069 +319 G 0.084 +320 E 0.096 +321 N 0.099 +322 F 0.094 +323 E 0.087 +324 L 0.076 +325 S 0.062 +326 F 0.049 +327 R 0.039 +328 V 0.032 +329 W 0.032 +330 M 0.044 +331 C 0.066 +332 G 0.090 +333 G 0.107 +334 S 0.114 +335 L 0.117 +336 E 0.121 +337 I 0.127 +338 V 0.128 +339 P 0.118 +340 C 0.106 +341 S 0.100 +342 R 0.100 +343 V 0.098 +344 G 0.092 +345 H 0.084 +346 V 0.076 +347 F 0.073 +348 R 0.074 +349 K 0.077 +350 R 0.078 +351 H 0.079 +352 P 0.088 +353 Y 0.104 +354 N 0.123 +355 F 0.136 +356 P 0.140 +357 E 0.140 +358 G 0.138 +359 N 0.130 +360 A 0.118 +361 L 0.111 +362 T 0.112 +363 Y 0.116 +364 I 0.123 +365 R 0.133 +366 N 0.136 +367 T 0.130 +368 K 0.122 +369 R 0.116 +370 T 0.104 +371 A 0.086 +372 E 0.070 +373 V 0.061 +374 W 0.057 +375 M 0.054 +376 D 0.052 +377 E 0.051 +378 Y 0.049 +379 K 0.046 +380 Q 0.044 +381 Y 0.043 +382 Y 0.043 +383 Y 0.046 +384 E 0.053 +385 A 0.067 +386 R 0.085 +387 P 0.101 +388 S 0.113 +389 A 0.121 +390 I 0.124 +391 G 0.127 +392 K 0.134 +393 A 0.138 +394 F 0.138 +395 G 0.136 +396 S 0.129 +397 V 0.111 +398 A 0.089 +399 T 0.073 +400 R 0.068 +401 I 0.074 +402 E 0.079 +403 Q 0.076 +404 R 0.072 +405 K 0.071 +406 K 0.075 +407 M 0.078 +408 D 0.079 +409 C 0.076 +410 K 0.071 +411 S 0.066 +412 F 0.068 +413 R 0.075 +414 W 0.080 +415 Y 0.084 +416 L 0.091 +417 E 0.099 +418 N 0.102 +419 V 0.097 +420 Y 0.092 +421 P 0.097 +422 E 0.111 +423 L 0.136 +424 T 0.172 +425 V 0.211 +426 P 0.232 +427 V 0.223 +428 K 0.193 +429 E 0.162 +430 V 0.138 +431 L 0.117 +432 P 0.099 +433 G 0.086 +434 V 0.075 +435 I 0.069 +436 K 0.067 +437 Q 0.064 +438 G 0.060 +439 V 0.054 +440 N 0.051 +441 C 0.054 +442 L 0.067 +443 E 0.095 +444 S 0.143 +445 Q 0.200 +446 G 0.254 +447 Q 0.292 +448 N 0.309 +449 T 0.304 +450 A 0.284 +451 G 0.259 +452 D 0.235 +453 L 0.213 +454 L 0.193 +455 L 0.176 +456 G 0.162 +457 M 0.151 +458 G 0.140 +459 I 0.128 +460 C 0.114 +461 R 0.102 +462 G 0.092 +463 S 0.086 +464 A 0.083 +465 K 0.093 +466 S 0.116 +467 P 0.137 +468 P 0.139 +469 P 0.121 +470 A 0.097 +471 Q 0.078 +472 A 0.066 +473 W 0.062 +474 L 0.064 +475 F 0.069 +476 S 0.071 +477 D 0.070 +478 H 0.070 +479 L 0.069 +480 I 0.064 +481 Q 0.057 +482 Q 0.052 +483 Q 0.054 +484 G 0.057 +485 K 0.056 +486 C 0.053 +487 L 0.057 +488 A 0.076 +489 A 0.109 +490 T 0.146 +491 S 0.175 +492 T 0.192 +493 L 0.202 +494 M 0.210 +495 S 0.220 +496 S 0.232 +497 P 0.240 +498 G 0.236 +499 S 0.218 +500 P 0.187 +501 V 0.146 +502 I 0.109 +503 L 0.087 +504 Q 0.078 +505 T 0.077 +506 C 0.080 +507 N 0.081 +508 P 0.081 +509 K 0.085 +510 E 0.094 +511 G 0.101 +512 K 0.099 +513 Q 0.088 +514 K 0.073 +515 W 0.063 +516 R 0.064 +517 R 0.072 +518 K 0.084 +519 G 0.093 +520 S 0.098 +521 F 0.099 +522 I 0.095 +523 Q 0.088 +524 H 0.082 +525 S 0.081 +526 V 0.087 +527 S 0.098 +528 G 0.106 +529 L 0.102 +530 C 0.089 +531 L 0.076 +532 E 0.072 +533 T 0.078 +534 K 0.088 +535 P 0.099 +536 A 0.111 +537 Q 0.121 +538 L 0.122 +539 V 0.116 +540 T 0.109 +541 S 0.108 +542 K 0.111 +543 C 0.116 +544 Q 0.125 +545 T 0.141 +546 D 0.159 +547 A 0.163 +548 Q 0.149 +549 A 0.123 +550 Q 0.098 +551 Q 0.076 +552 W 0.064 +553 Q 0.065 +554 L 0.078 +555 L 0.096 +556 P 0.110 +557 H 0.120 +558 T 0.126 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021130.9_ENSMUST00000219993.2_GN:Galnt16_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:145.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021130.9_ENSMUST00000219993.2_GN:Galnt16_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:145.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..16ffdfdf3e29ff3019bd914577b75da625caf3fd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021130.9_ENSMUST00000219993.2_GN:Galnt16_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:145.caid @@ -0,0 +1,704 @@ +>ENSMUSG00000021130.9|ENSMUST00000219993.2|GN:Galnt16|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:145 +1 M 0.381 +2 K 0.411 +3 D 0.451 +4 V 0.472 +5 Q 0.466 +6 R 0.453 +7 S 0.465 +8 H 0.504 +9 P 0.540 +10 C 0.556 +11 A 0.564 +12 C 0.574 +13 I 0.577 +14 G 0.560 +15 C 0.522 +16 T 0.466 +17 A 0.402 +18 A 0.354 +19 Q 0.335 +20 L 0.322 +21 H 0.298 +22 L 0.276 +23 A 0.272 +24 L 0.282 +25 Q 0.306 +26 S 0.349 +27 V 0.399 +28 K 0.438 +29 C 0.459 +30 I 0.464 +31 S 0.463 +32 F 0.468 +33 Q 0.484 +34 L 0.510 +35 P 0.542 +36 T 0.578 +37 P 0.616 +38 S 0.653 +39 G 0.683 +40 H 0.704 +41 R 0.715 +42 G 0.715 +43 G 0.702 +44 W 0.683 +45 N 0.673 +46 P 0.672 +47 G 0.676 +48 S 0.684 +49 P 0.695 +50 R 0.706 +51 R 0.716 +52 I 0.724 +53 P 0.730 +54 V 0.734 +55 Q 0.740 +56 S 0.748 +57 Q 0.759 +58 D 0.767 +59 C 0.767 +60 L 0.758 +61 L 0.745 +62 A 0.736 +63 S 0.728 +64 L 0.720 +65 A 0.720 +66 P 0.736 +67 S 0.761 +68 E 0.780 +69 G 0.784 +70 L 0.775 +71 S 0.764 +72 E 0.757 +73 H 0.753 +74 R 0.746 +75 L 0.738 +76 N 0.732 +77 P 0.733 +78 A 0.741 +79 P 0.752 +80 E 0.754 +81 L 0.733 +82 S 0.676 +83 S 0.603 +84 Q 0.554 +85 R 0.544 +86 C 0.542 +87 R 0.554 +88 E 0.606 +89 L 0.674 +90 Q 0.721 +91 L 0.741 +92 G 0.751 +93 D 0.754 +94 S 0.755 +95 G 0.760 +96 Q 0.770 +97 G 0.777 +98 Q 0.778 +99 G 0.776 +100 S 0.770 +101 R 0.749 +102 V 0.701 +103 F 0.641 +104 A 0.617 +105 G 0.654 +106 D 0.714 +107 S 0.751 +108 G 0.757 +109 L 0.748 +110 S 0.742 +111 S 0.746 +112 P 0.758 +113 A 0.766 +114 Q 0.765 +115 A 0.755 +116 T 0.740 +117 T 0.721 +118 N 0.698 +119 G 0.662 +120 W 0.611 +121 G 0.557 +122 S 0.535 +123 K 0.564 +124 L 0.619 +125 P 0.665 +126 C 0.685 +127 S 0.668 +128 G 0.622 +129 S 0.595 +130 E 0.622 +131 S 0.677 +132 T 0.717 +133 P 0.737 +134 A 0.747 +135 S 0.754 +136 G 0.758 +137 P 0.759 +138 T 0.751 +139 R 0.733 +140 S 0.705 +141 A 0.675 +142 R 0.654 +143 P 0.650 +144 P 0.656 +145 T 0.649 +146 M 0.617 +147 R 0.575 +148 K 0.545 +149 I 0.526 +150 R 0.509 +151 A 0.497 +152 N 0.486 +153 A 0.462 +154 I 0.430 +155 A 0.409 +156 I 0.405 +157 L 0.412 +158 T 0.414 +159 V 0.394 +160 A 0.358 +161 W 0.320 +162 I 0.288 +163 L 0.268 +164 G 0.258 +165 T 0.241 +166 F 0.208 +167 Y 0.171 +168 Y 0.150 +169 L 0.152 +170 W 0.172 +171 Q 0.207 +172 D 0.250 +173 N 0.284 +174 R 0.306 +175 A 0.328 +176 H 0.361 +177 A 0.397 +178 A 0.433 +179 S 0.475 +180 S 0.526 +181 S 0.581 +182 G 0.625 +183 R 0.641 +184 G 0.621 +185 A 0.574 +186 Q 0.543 +187 R 0.562 +188 A 0.605 +189 G 0.629 +190 G 0.628 +191 R 0.619 +192 P 0.615 +193 E 0.614 +194 Q 0.600 +195 L 0.560 +196 R 0.501 +197 E 0.449 +198 D 0.428 +199 R 0.440 +200 T 0.469 +201 I 0.496 +202 P 0.504 +203 L 0.485 +204 I 0.450 +205 V 0.424 +206 T 0.418 +207 G 0.421 +208 T 0.420 +209 P 0.414 +210 S 0.406 +211 K 0.385 +212 G 0.336 +213 F 0.261 +214 D 0.186 +215 E 0.135 +216 K 0.114 +217 A 0.113 +218 Y 0.119 +219 L 0.127 +220 S 0.137 +221 A 0.145 +222 K 0.148 +223 Q 0.151 +224 L 0.158 +225 K 0.166 +226 P 0.176 +227 G 0.189 +228 E 0.196 +229 D 0.191 +230 P 0.170 +231 Y 0.142 +232 R 0.118 +233 Q 0.104 +234 H 0.108 +235 A 0.133 +236 F 0.168 +237 N 0.192 +238 Q 0.195 +239 L 0.183 +240 E 0.165 +241 S 0.147 +242 D 0.135 +243 K 0.131 +244 L 0.132 +245 S 0.131 +246 S 0.128 +247 D 0.129 +248 R 0.135 +249 P 0.142 +250 I 0.151 +251 R 0.157 +252 D 0.155 +253 T 0.140 +254 R 0.120 +255 H 0.102 +256 Y 0.091 +257 S 0.087 +258 C 0.087 +259 P 0.088 +260 S 0.091 +261 L 0.099 +262 S 0.106 +263 Y 0.104 +264 S 0.095 +265 S 0.089 +266 D 0.090 +267 L 0.093 +268 P 0.086 +269 A 0.069 +270 T 0.052 +271 S 0.042 +272 V 0.040 +273 I 0.040 +274 I 0.043 +275 T 0.049 +276 F 0.054 +277 H 0.057 +278 N 0.061 +279 E 0.067 +280 A 0.069 +281 R 0.063 +282 S 0.054 +283 T 0.049 +284 L 0.052 +285 L 0.056 +286 R 0.058 +287 T 0.056 +288 V 0.055 +289 K 0.054 +290 S 0.051 +291 V 0.045 +292 L 0.042 +293 N 0.042 +294 R 0.045 +295 T 0.047 +296 P 0.046 +297 A 0.043 +298 S 0.042 +299 L 0.043 +300 I 0.042 +301 Q 0.037 +302 E 0.031 +303 I 0.028 +304 I 0.026 +305 L 0.024 +306 V 0.024 +307 D 0.025 +308 D 0.028 +309 F 0.033 +310 S 0.040 +311 S 0.045 +312 D 0.048 +313 P 0.047 +314 E 0.043 +315 D 0.038 +316 C 0.036 +317 L 0.037 +318 L 0.042 +319 L 0.046 +320 T 0.048 +321 R 0.049 +322 I 0.048 +323 P 0.043 +324 K 0.038 +325 V 0.040 +326 K 0.047 +327 C 0.056 +328 L 0.062 +329 R 0.064 +330 N 0.065 +331 D 0.065 +332 K 0.063 +333 R 0.061 +334 E 0.060 +335 G 0.057 +336 L 0.053 +337 I 0.050 +338 R 0.050 +339 S 0.050 +340 R 0.048 +341 V 0.047 +342 R 0.049 +343 G 0.053 +344 A 0.056 +345 D 0.061 +346 V 0.073 +347 A 0.087 +348 G 0.092 +349 A 0.085 +350 T 0.073 +351 V 0.061 +352 L 0.053 +353 T 0.053 +354 F 0.060 +355 L 0.067 +356 D 0.069 +357 S 0.067 +358 H 0.066 +359 C 0.072 +360 E 0.082 +361 V 0.091 +362 N 0.096 +363 V 0.094 +364 E 0.083 +365 W 0.068 +366 L 0.054 +367 Q 0.043 +368 P 0.035 +369 M 0.032 +370 L 0.032 +371 Q 0.033 +372 R 0.034 +373 V 0.036 +374 M 0.038 +375 E 0.038 +376 D 0.038 +377 H 0.038 +378 T 0.043 +379 R 0.055 +380 V 0.069 +381 V 0.078 +382 S 0.082 +383 P 0.084 +384 I 0.086 +385 I 0.089 +386 D 0.092 +387 V 0.090 +388 I 0.078 +389 S 0.065 +390 L 0.058 +391 D 0.059 +392 N 0.065 +393 F 0.074 +394 A 0.086 +395 Y 0.103 +396 L 0.131 +397 A 0.166 +398 A 0.198 +399 S 0.215 +400 A 0.215 +401 D 0.202 +402 L 0.182 +403 R 0.161 +404 G 0.141 +405 G 0.120 +406 F 0.101 +407 D 0.088 +408 W 0.082 +409 S 0.082 +410 L 0.085 +411 H 0.090 +412 F 0.095 +413 K 0.101 +414 W 0.111 +415 E 0.124 +416 Q 0.135 +417 I 0.135 +418 P 0.122 +419 L 0.103 +420 E 0.089 +421 Q 0.085 +422 K 0.089 +423 M 0.097 +424 T 0.108 +425 R 0.120 +426 T 0.130 +427 D 0.137 +428 P 0.141 +429 T 0.145 +430 K 0.150 +431 P 0.158 +432 I 0.165 +433 R 0.162 +434 T 0.148 +435 P 0.134 +436 V 0.135 +437 I 0.152 +438 A 0.167 +439 G 0.164 +440 G 0.142 +441 I 0.113 +442 F 0.093 +443 V 0.083 +444 I 0.076 +445 D 0.068 +446 K 0.064 +447 S 0.064 +448 W 0.068 +449 F 0.071 +450 N 0.073 +451 H 0.075 +452 L 0.082 +453 G 0.090 +454 K 0.097 +455 Y 0.103 +456 D 0.108 +457 A 0.108 +458 Q 0.099 +459 M 0.084 +460 D 0.070 +461 I 0.063 +462 W 0.065 +463 G 0.077 +464 G 0.093 +465 E 0.106 +466 N 0.110 +467 F 0.106 +468 E 0.098 +469 L 0.086 +470 S 0.070 +471 F 0.054 +472 R 0.043 +473 V 0.035 +474 W 0.035 +475 M 0.047 +476 C 0.070 +477 G 0.096 +478 G 0.115 +479 S 0.124 +480 L 0.128 +481 E 0.134 +482 I 0.140 +483 V 0.140 +484 P 0.129 +485 C 0.116 +486 S 0.109 +487 R 0.108 +488 V 0.105 +489 G 0.098 +490 H 0.089 +491 V 0.081 +492 F 0.076 +493 R 0.077 +494 K 0.079 +495 R 0.081 +496 H 0.083 +497 P 0.091 +498 Y 0.108 +499 N 0.127 +500 F 0.141 +501 P 0.145 +502 E 0.145 +503 G 0.141 +504 N 0.132 +505 A 0.120 +506 L 0.115 +507 T 0.118 +508 Y 0.125 +509 I 0.134 +510 R 0.144 +511 N 0.148 +512 T 0.142 +513 K 0.133 +514 R 0.126 +515 T 0.113 +516 A 0.093 +517 E 0.075 +518 V 0.065 +519 W 0.060 +520 M 0.057 +521 D 0.056 +522 E 0.055 +523 Y 0.054 +524 K 0.050 +525 Q 0.048 +526 Y 0.047 +527 Y 0.047 +528 Y 0.049 +529 E 0.057 +530 A 0.071 +531 R 0.088 +532 P 0.104 +533 S 0.116 +534 A 0.123 +535 I 0.126 +536 G 0.130 +537 K 0.137 +538 A 0.142 +539 F 0.144 +540 G 0.144 +541 S 0.136 +542 V 0.118 +543 A 0.096 +544 T 0.078 +545 R 0.073 +546 I 0.078 +547 E 0.082 +548 Q 0.078 +549 R 0.070 +550 K 0.069 +551 K 0.074 +552 M 0.081 +553 D 0.084 +554 C 0.083 +555 K 0.078 +556 S 0.074 +557 F 0.076 +558 R 0.082 +559 W 0.087 +560 Y 0.091 +561 L 0.097 +562 E 0.104 +563 N 0.108 +564 V 0.105 +565 Y 0.101 +566 P 0.106 +567 E 0.123 +568 L 0.150 +569 T 0.188 +570 V 0.227 +571 P 0.246 +572 V 0.232 +573 K 0.197 +574 E 0.162 +575 V 0.137 +576 L 0.118 +577 P 0.103 +578 G 0.090 +579 V 0.078 +580 I 0.070 +581 K 0.065 +582 Q 0.063 +583 G 0.059 +584 V 0.055 +585 N 0.053 +586 C 0.057 +587 L 0.072 +588 E 0.103 +589 S 0.154 +590 Q 0.213 +591 G 0.268 +592 Q 0.306 +593 N 0.322 +594 T 0.316 +595 A 0.294 +596 G 0.266 +597 D 0.240 +598 L 0.217 +599 L 0.197 +600 L 0.181 +601 G 0.168 +602 M 0.157 +603 G 0.148 +604 I 0.137 +605 C 0.124 +606 R 0.110 +607 G 0.098 +608 S 0.089 +609 A 0.086 +610 K 0.096 +611 S 0.121 +612 P 0.145 +613 P 0.147 +614 P 0.126 +615 A 0.099 +616 Q 0.078 +617 A 0.064 +618 W 0.059 +619 L 0.061 +620 F 0.066 +621 S 0.069 +622 D 0.070 +623 H 0.072 +624 L 0.071 +625 I 0.066 +626 Q 0.057 +627 Q 0.053 +628 Q 0.056 +629 G 0.059 +630 K 0.059 +631 C 0.056 +632 L 0.060 +633 A 0.079 +634 A 0.113 +635 T 0.152 +636 S 0.184 +637 T 0.202 +638 L 0.211 +639 M 0.218 +640 S 0.227 +641 S 0.238 +642 P 0.245 +643 G 0.242 +644 S 0.226 +645 P 0.195 +646 V 0.153 +647 I 0.115 +648 L 0.091 +649 Q 0.083 +650 T 0.084 +651 C 0.088 +652 N 0.091 +653 P 0.092 +654 K 0.097 +655 E 0.106 +656 G 0.113 +657 K 0.109 +658 Q 0.095 +659 K 0.078 +660 W 0.066 +661 R 0.064 +662 R 0.071 +663 K 0.082 +664 G 0.090 +665 S 0.095 +666 F 0.095 +667 I 0.092 +668 Q 0.087 +669 H 0.084 +670 S 0.084 +671 V 0.091 +672 S 0.102 +673 G 0.109 +674 L 0.104 +675 C 0.090 +676 L 0.077 +677 E 0.074 +678 T 0.080 +679 K 0.090 +680 P 0.101 +681 A 0.112 +682 Q 0.120 +683 L 0.122 +684 V 0.116 +685 T 0.111 +686 S 0.111 +687 K 0.113 +688 C 0.116 +689 Q 0.124 +690 T 0.139 +691 D 0.156 +692 A 0.161 +693 Q 0.147 +694 A 0.121 +695 Q 0.094 +696 Q 0.071 +697 W 0.057 +698 Q 0.057 +699 L 0.067 +700 L 0.078 +701 P 0.087 +702 H 0.096 +703 T 0.103 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021339.5_ENSMUST00000021772.4_GN:Mrs2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021339.5_ENSMUST00000021772.4_GN:Mrs2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6933e43bdb67ae4335bd5fe89e973fe43753ac26 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021339.5_ENSMUST00000021772.4_GN:Mrs2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,435 @@ +>ENSMUSG00000021339.5|ENSMUST00000021772.4|GN:Mrs2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.389 +2 E 0.406 +3 C 0.429 +4 L 0.452 +5 R 0.473 +6 C 0.501 +7 L 0.540 +8 P 0.575 +9 G 0.591 +10 L 0.584 +11 L 0.570 +12 P 0.561 +13 R 0.559 +14 A 0.555 +15 A 0.544 +16 Q 0.532 +17 P 0.512 +18 R 0.466 +19 R 0.394 +20 A 0.324 +21 L 0.282 +22 W 0.267 +23 T 0.268 +24 A 0.271 +25 V 0.267 +26 A 0.262 +27 R 0.280 +28 L 0.331 +29 S 0.402 +30 L 0.470 +31 A 0.528 +32 A 0.580 +33 C 0.627 +34 G 0.663 +35 G 0.681 +36 R 0.681 +37 A 0.668 +38 T 0.657 +39 P 0.655 +40 L 0.655 +41 R 0.648 +42 S 0.632 +43 R 0.618 +44 S 0.624 +45 P 0.651 +46 K 0.688 +47 A 0.720 +48 S 0.738 +49 S 0.748 +50 T 0.753 +51 A 0.751 +52 R 0.743 +53 A 0.736 +54 A 0.730 +55 G 0.717 +56 D 0.688 +57 V 0.648 +58 L 0.617 +59 R 0.608 +60 F 0.613 +61 R 0.615 +62 T 0.610 +63 S 0.610 +64 D 0.621 +65 A 0.626 +66 S 0.611 +67 Q 0.589 +68 A 0.582 +69 T 0.583 +70 L 0.572 +71 A 0.549 +72 S 0.514 +73 V 0.448 +74 A 0.343 +75 Q 0.223 +76 V 0.125 +77 F 0.066 +78 A 0.039 +79 V 0.029 +80 T 0.025 +81 K 0.024 +82 F 0.025 +83 D 0.030 +84 K 0.041 +85 E 0.056 +86 G 0.069 +87 N 0.075 +88 V 0.074 +89 T 0.070 +90 S 0.064 +91 F 0.056 +92 E 0.047 +93 R 0.037 +94 K 0.030 +95 K 0.026 +96 T 0.026 +97 E 0.028 +98 L 0.030 +99 Y 0.033 +100 H 0.036 +101 E 0.041 +102 L 0.051 +103 A 0.065 +104 L 0.079 +105 Q 0.091 +106 A 0.099 +107 R 0.105 +108 D 0.110 +109 L 0.118 +110 R 0.129 +111 F 0.136 +112 Q 0.131 +113 H 0.113 +114 V 0.087 +115 M 0.064 +116 S 0.050 +117 I 0.045 +118 T 0.045 +119 T 0.049 +120 R 0.051 +121 N 0.049 +122 N 0.042 +123 R 0.035 +124 I 0.032 +125 I 0.031 +126 M 0.033 +127 R 0.035 +128 M 0.037 +129 E 0.038 +130 Y 0.040 +131 L 0.040 +132 K 0.040 +133 A 0.038 +134 V 0.035 +135 I 0.037 +136 T 0.044 +137 P 0.051 +138 E 0.053 +139 C 0.049 +140 L 0.045 +141 L 0.046 +142 I 0.052 +143 L 0.060 +144 D 0.067 +145 Y 0.071 +146 R 0.071 +147 N 0.066 +148 L 0.055 +149 N 0.043 +150 L 0.035 +151 E 0.034 +152 H 0.038 +153 W 0.042 +154 L 0.050 +155 F 0.060 +156 R 0.066 +157 E 0.065 +158 L 0.058 +159 P 0.054 +160 S 0.058 +161 Q 0.078 +162 L 0.125 +163 A 0.209 +164 G 0.315 +165 E 0.401 +166 G 0.435 +167 Q 0.423 +168 L 0.393 +169 V 0.364 +170 T 0.336 +171 Y 0.303 +172 P 0.260 +173 L 0.207 +174 P 0.154 +175 F 0.113 +176 E 0.091 +177 F 0.086 +178 R 0.091 +179 A 0.097 +180 I 0.100 +181 E 0.102 +182 A 0.111 +183 L 0.118 +184 L 0.112 +185 Q 0.092 +186 Y 0.072 +187 W 0.063 +188 I 0.063 +189 S 0.068 +190 T 0.081 +191 L 0.096 +192 R 0.107 +193 G 0.113 +194 R 0.117 +195 L 0.115 +196 S 0.109 +197 V 0.103 +198 L 0.099 +199 Q 0.091 +200 P 0.077 +201 L 0.064 +202 I 0.056 +203 L 0.053 +204 E 0.052 +205 T 0.058 +206 L 0.071 +207 D 0.089 +208 A 0.108 +209 L 0.135 +210 V 0.171 +211 D 0.207 +212 P 0.231 +213 K 0.246 +214 H 0.252 +215 S 0.247 +216 S 0.228 +217 V 0.195 +218 D 0.150 +219 R 0.107 +220 S 0.077 +221 K 0.064 +222 L 0.062 +223 H 0.065 +224 V 0.069 +225 L 0.071 +226 L 0.073 +227 Q 0.080 +228 N 0.097 +229 G 0.119 +230 K 0.141 +231 S 0.154 +232 L 0.150 +233 S 0.129 +234 E 0.109 +235 L 0.099 +236 E 0.096 +237 T 0.092 +238 D 0.082 +239 I 0.068 +240 K 0.054 +241 I 0.044 +242 F 0.038 +243 K 0.035 +244 E 0.034 +245 S 0.036 +246 I 0.039 +247 L 0.043 +248 E 0.048 +249 L 0.054 +250 L 0.059 +251 D 0.058 +252 E 0.051 +253 E 0.043 +254 E 0.035 +255 M 0.031 +256 L 0.031 +257 E 0.034 +258 E 0.038 +259 L 0.043 +260 C 0.051 +261 L 0.066 +262 T 0.089 +263 K 0.115 +264 W 0.141 +265 S 0.169 +266 D 0.200 +267 P 0.229 +268 H 0.253 +269 V 0.275 +270 F 0.306 +271 E 0.347 +272 K 0.387 +273 S 0.418 +274 S 0.432 +275 T 0.421 +276 G 0.380 +277 I 0.319 +278 D 0.248 +279 H 0.182 +280 A 0.132 +281 E 0.100 +282 E 0.089 +283 M 0.090 +284 E 0.093 +285 L 0.091 +286 L 0.085 +287 L 0.079 +288 E 0.074 +289 N 0.072 +290 Y 0.077 +291 Y 0.088 +292 R 0.098 +293 L 0.102 +294 A 0.102 +295 E 0.105 +296 D 0.112 +297 L 0.120 +298 S 0.126 +299 N 0.131 +300 E 0.136 +301 A 0.138 +302 R 0.141 +303 E 0.146 +304 L 0.147 +305 R 0.140 +306 V 0.129 +307 L 0.121 +308 I 0.117 +309 D 0.117 +310 D 0.118 +311 S 0.116 +312 Q 0.110 +313 S 0.101 +314 I 0.093 +315 I 0.091 +316 F 0.096 +317 I 0.101 +318 N 0.110 +319 L 0.131 +320 D 0.160 +321 S 0.185 +322 H 0.198 +323 R 0.209 +324 N 0.217 +325 V 0.218 +326 M 0.214 +327 M 0.213 +328 R 0.216 +329 L 0.219 +330 N 0.218 +331 L 0.209 +332 Q 0.194 +333 L 0.181 +334 T 0.179 +335 M 0.188 +336 G 0.198 +337 T 0.197 +338 F 0.183 +339 S 0.169 +340 L 0.162 +341 S 0.157 +342 L 0.151 +343 F 0.146 +344 G 0.144 +345 L 0.149 +346 M 0.166 +347 G 0.194 +348 V 0.224 +349 A 0.253 +350 F 0.279 +351 G 0.291 +352 M 0.283 +353 N 0.270 +354 L 0.269 +355 E 0.280 +356 S 0.294 +357 S 0.302 +358 L 0.301 +359 E 0.293 +360 E 0.276 +361 D 0.243 +362 H 0.197 +363 R 0.151 +364 V 0.119 +365 F 0.099 +366 W 0.089 +367 L 0.094 +368 V 0.110 +369 T 0.124 +370 G 0.121 +371 I 0.111 +372 M 0.106 +373 F 0.109 +374 M 0.113 +375 G 0.112 +376 S 0.104 +377 G 0.092 +378 L 0.081 +379 I 0.072 +380 W 0.065 +381 R 0.059 +382 R 0.058 +383 L 0.067 +384 L 0.083 +385 S 0.105 +386 F 0.131 +387 L 0.161 +388 G 0.193 +389 R 0.231 +390 Q 0.276 +391 L 0.329 +392 E 0.383 +393 A 0.438 +394 P 0.489 +395 V 0.539 +396 P 0.590 +397 P 0.638 +398 V 0.669 +399 M 0.671 +400 T 0.653 +401 S 0.632 +402 L 0.616 +403 P 0.605 +404 K 0.597 +405 K 0.586 +406 T 0.558 +407 L 0.515 +408 L 0.483 +409 A 0.479 +410 N 0.487 +411 R 0.491 +412 R 0.509 +413 M 0.554 +414 D 0.601 +415 V 0.620 +416 K 0.614 +417 N 0.603 +418 S 0.594 +419 L 0.588 +420 R 0.595 +421 P 0.629 +422 E 0.679 +423 G 0.721 +424 L 0.743 +425 G 0.744 +426 A 0.724 +427 S 0.676 +428 R 0.613 +429 T 0.583 +430 I 0.609 +431 L 0.646 +432 A 0.634 +433 S 0.572 +434 R 0.512 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021339.5_ENSMUST00000021772.4_GN:Mrs2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:45.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021339.5_ENSMUST00000021772.4_GN:Mrs2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:45.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4ce1badc8daae779b46c7a39a42791ac625c44d2 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021339.5_ENSMUST00000021772.4_GN:Mrs2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:45.caid @@ -0,0 +1,480 @@ +>ENSMUSG00000021339.5|ENSMUST00000021772.4|GN:Mrs2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:45 +1 M 0.402 +2 R 0.416 +3 G 0.435 +4 R 0.442 +5 Q 0.437 +6 R 0.447 +7 A 0.503 +8 G 0.579 +9 A 0.622 +10 G 0.611 +11 R 0.565 +12 L 0.514 +13 A 0.477 +14 Q 0.458 +15 A 0.448 +16 R 0.440 +17 C 0.434 +18 A 0.429 +19 V 0.427 +20 V 0.428 +21 A 0.429 +22 V 0.427 +23 S 0.426 +24 R 0.436 +25 L 0.460 +26 T 0.498 +27 R 0.550 +28 V 0.605 +29 P 0.652 +30 A 0.681 +31 C 0.695 +32 R 0.704 +33 T 0.717 +34 G 0.736 +35 V 0.750 +36 L 0.749 +37 G 0.730 +38 R 0.699 +39 L 0.671 +40 P 0.660 +41 G 0.669 +42 C 0.687 +43 P 0.705 +44 R 0.717 +45 A 0.720 +46 M 0.715 +47 E 0.701 +48 C 0.674 +49 L 0.639 +50 R 0.618 +51 C 0.628 +52 L 0.658 +53 P 0.686 +54 G 0.701 +55 L 0.698 +56 L 0.688 +57 P 0.686 +58 R 0.694 +59 A 0.699 +60 A 0.696 +61 Q 0.687 +62 P 0.679 +63 R 0.669 +64 R 0.652 +65 A 0.616 +66 L 0.554 +67 W 0.488 +68 T 0.452 +69 A 0.445 +70 V 0.435 +71 A 0.421 +72 R 0.436 +73 L 0.499 +74 S 0.581 +75 L 0.645 +76 A 0.684 +77 A 0.708 +78 C 0.724 +79 G 0.735 +80 G 0.740 +81 R 0.735 +82 A 0.723 +83 T 0.714 +84 P 0.711 +85 L 0.711 +86 R 0.701 +87 S 0.683 +88 R 0.667 +89 S 0.669 +90 P 0.692 +91 K 0.726 +92 A 0.754 +93 S 0.769 +94 S 0.777 +95 T 0.777 +96 A 0.770 +97 R 0.759 +98 A 0.751 +99 A 0.743 +100 G 0.727 +101 D 0.691 +102 V 0.640 +103 L 0.596 +104 R 0.579 +105 F 0.582 +106 R 0.587 +107 T 0.584 +108 S 0.581 +109 D 0.582 +110 A 0.572 +111 S 0.541 +112 Q 0.506 +113 A 0.490 +114 T 0.485 +115 L 0.470 +116 A 0.447 +117 S 0.422 +118 V 0.375 +119 A 0.294 +120 Q 0.196 +121 V 0.113 +122 F 0.061 +123 A 0.036 +124 V 0.027 +125 T 0.024 +126 K 0.023 +127 F 0.024 +128 D 0.029 +129 K 0.039 +130 E 0.054 +131 G 0.069 +132 N 0.077 +133 V 0.079 +134 T 0.076 +135 S 0.071 +136 F 0.063 +137 E 0.052 +138 R 0.040 +139 K 0.031 +140 K 0.027 +141 T 0.027 +142 E 0.029 +143 L 0.031 +144 Y 0.034 +145 H 0.037 +146 E 0.044 +147 L 0.055 +148 A 0.070 +149 L 0.083 +150 Q 0.091 +151 A 0.096 +152 R 0.102 +153 D 0.108 +154 L 0.116 +155 R 0.128 +156 F 0.137 +157 Q 0.134 +158 H 0.116 +159 V 0.091 +160 M 0.067 +161 S 0.053 +162 I 0.048 +163 T 0.050 +164 T 0.055 +165 R 0.058 +166 N 0.056 +167 N 0.048 +168 R 0.040 +169 I 0.036 +170 I 0.035 +171 M 0.037 +172 R 0.039 +173 M 0.040 +174 E 0.041 +175 Y 0.043 +176 L 0.043 +177 K 0.043 +178 A 0.041 +179 V 0.038 +180 I 0.039 +181 T 0.045 +182 P 0.052 +183 E 0.053 +184 C 0.049 +185 L 0.044 +186 L 0.046 +187 I 0.051 +188 L 0.057 +189 D 0.062 +190 Y 0.064 +191 R 0.064 +192 N 0.059 +193 L 0.049 +194 N 0.038 +195 L 0.031 +196 E 0.030 +197 H 0.033 +198 W 0.037 +199 L 0.045 +200 F 0.055 +201 R 0.062 +202 E 0.061 +203 L 0.055 +204 P 0.051 +205 S 0.054 +206 Q 0.073 +207 L 0.119 +208 A 0.199 +209 G 0.297 +210 E 0.375 +211 G 0.403 +212 Q 0.387 +213 L 0.356 +214 V 0.330 +215 T 0.308 +216 Y 0.280 +217 P 0.240 +218 L 0.192 +219 P 0.143 +220 F 0.105 +221 E 0.085 +222 F 0.081 +223 R 0.086 +224 A 0.094 +225 I 0.097 +226 E 0.099 +227 A 0.106 +228 L 0.115 +229 L 0.110 +230 Q 0.091 +231 Y 0.071 +232 W 0.062 +233 I 0.062 +234 S 0.068 +235 T 0.081 +236 L 0.096 +237 R 0.106 +238 G 0.113 +239 R 0.117 +240 L 0.115 +241 S 0.108 +242 V 0.101 +243 L 0.095 +244 Q 0.086 +245 P 0.073 +246 L 0.060 +247 I 0.053 +248 L 0.050 +249 E 0.049 +250 T 0.054 +251 L 0.067 +252 D 0.084 +253 A 0.103 +254 L 0.128 +255 V 0.163 +256 D 0.198 +257 P 0.222 +258 K 0.236 +259 H 0.244 +260 S 0.242 +261 S 0.226 +262 V 0.196 +263 D 0.152 +264 R 0.108 +265 S 0.078 +266 K 0.064 +267 L 0.061 +268 H 0.063 +269 V 0.067 +270 L 0.070 +271 L 0.073 +272 Q 0.082 +273 N 0.098 +274 G 0.120 +275 K 0.142 +276 S 0.155 +277 L 0.151 +278 S 0.130 +279 E 0.109 +280 L 0.099 +281 E 0.096 +282 T 0.091 +283 D 0.082 +284 I 0.068 +285 K 0.054 +286 I 0.044 +287 F 0.038 +288 K 0.035 +289 E 0.034 +290 S 0.036 +291 I 0.039 +292 L 0.043 +293 E 0.049 +294 L 0.056 +295 L 0.062 +296 D 0.062 +297 E 0.056 +298 E 0.047 +299 E 0.038 +300 M 0.033 +301 L 0.033 +302 E 0.036 +303 E 0.039 +304 L 0.043 +305 C 0.050 +306 L 0.065 +307 T 0.088 +308 K 0.115 +309 W 0.144 +310 S 0.174 +311 D 0.205 +312 P 0.236 +313 H 0.260 +314 V 0.282 +315 F 0.313 +316 E 0.353 +317 K 0.395 +318 S 0.427 +319 S 0.441 +320 T 0.428 +321 G 0.385 +322 I 0.321 +323 D 0.250 +324 H 0.184 +325 A 0.134 +326 E 0.103 +327 E 0.089 +328 M 0.084 +329 E 0.081 +330 L 0.075 +331 L 0.072 +332 L 0.074 +333 E 0.075 +334 N 0.075 +335 Y 0.080 +336 Y 0.090 +337 R 0.100 +338 L 0.103 +339 A 0.104 +340 E 0.108 +341 D 0.116 +342 L 0.124 +343 S 0.130 +344 N 0.135 +345 E 0.141 +346 A 0.144 +347 R 0.147 +348 E 0.153 +349 L 0.154 +350 R 0.147 +351 V 0.136 +352 L 0.126 +353 I 0.122 +354 D 0.122 +355 D 0.124 +356 S 0.123 +357 Q 0.116 +358 S 0.106 +359 I 0.096 +360 I 0.093 +361 F 0.096 +362 I 0.102 +363 N 0.112 +364 L 0.133 +365 D 0.163 +366 S 0.188 +367 H 0.203 +368 R 0.214 +369 N 0.223 +370 V 0.223 +371 M 0.217 +372 M 0.215 +373 R 0.218 +374 L 0.221 +375 N 0.220 +376 L 0.212 +377 Q 0.198 +378 L 0.186 +379 T 0.185 +380 M 0.196 +381 G 0.207 +382 T 0.203 +383 F 0.188 +384 S 0.173 +385 L 0.166 +386 S 0.160 +387 L 0.153 +388 F 0.146 +389 G 0.143 +390 L 0.148 +391 M 0.165 +392 G 0.192 +393 V 0.221 +394 A 0.248 +395 F 0.271 +396 G 0.281 +397 M 0.271 +398 N 0.256 +399 L 0.253 +400 E 0.265 +401 S 0.279 +402 S 0.288 +403 L 0.288 +404 E 0.281 +405 E 0.264 +406 D 0.232 +407 H 0.187 +408 R 0.143 +409 V 0.112 +410 F 0.093 +411 W 0.084 +412 L 0.090 +413 V 0.107 +414 T 0.121 +415 G 0.119 +416 I 0.109 +417 M 0.106 +418 F 0.109 +419 M 0.113 +420 G 0.111 +421 S 0.103 +422 G 0.090 +423 L 0.078 +424 I 0.070 +425 W 0.063 +426 R 0.058 +427 R 0.058 +428 L 0.066 +429 L 0.082 +430 S 0.104 +431 F 0.129 +432 L 0.159 +433 G 0.193 +434 R 0.230 +435 Q 0.274 +436 L 0.326 +437 E 0.382 +438 A 0.439 +439 P 0.493 +440 V 0.545 +441 P 0.596 +442 P 0.643 +443 V 0.673 +444 M 0.675 +445 T 0.658 +446 S 0.639 +447 L 0.624 +448 P 0.615 +449 K 0.610 +450 K 0.603 +451 T 0.576 +452 L 0.533 +453 L 0.501 +454 A 0.498 +455 N 0.507 +456 R 0.514 +457 R 0.533 +458 M 0.578 +459 D 0.623 +460 V 0.644 +461 K 0.641 +462 N 0.633 +463 S 0.624 +464 L 0.614 +465 R 0.618 +466 P 0.649 +467 E 0.697 +468 G 0.737 +469 L 0.757 +470 G 0.758 +471 A 0.738 +472 S 0.690 +473 R 0.626 +474 T 0.594 +475 I 0.621 +476 L 0.658 +477 A 0.649 +478 S 0.588 +479 R 0.528 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021423.7_ENSMUST00000021860.7_GN:Ly86_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021423.7_ENSMUST00000021860.7_GN:Ly86_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c9bb19d0e10c3078425363095c783a462f8c804d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021423.7_ENSMUST00000021860.7_GN:Ly86_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,163 @@ +>ENSMUSG00000021423.7|ENSMUST00000021860.7|GN:Ly86|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.420 +2 N 0.447 +3 G 0.473 +4 V 0.460 +5 A 0.397 +6 A 0.319 +7 A 0.274 +8 L 0.267 +9 L 0.270 +10 V 0.273 +11 W 0.287 +12 I 0.315 +13 L 0.352 +14 T 0.400 +15 S 0.463 +16 P 0.528 +17 S 0.575 +18 S 0.605 +19 S 0.634 +20 D 0.663 +21 H 0.680 +22 G 0.675 +23 S 0.646 +24 E 0.596 +25 N 0.529 +26 G 0.453 +27 W 0.375 +28 P 0.300 +29 K 0.229 +30 H 0.171 +31 T 0.134 +32 A 0.116 +33 C 0.113 +34 N 0.125 +35 S 0.144 +36 G 0.154 +37 G 0.148 +38 L 0.132 +39 E 0.115 +40 V 0.098 +41 V 0.084 +42 Y 0.074 +43 Q 0.074 +44 S 0.084 +45 C 0.100 +46 D 0.117 +47 P 0.130 +48 L 0.137 +49 Q 0.137 +50 D 0.125 +51 F 0.102 +52 G 0.078 +53 L 0.060 +54 S 0.053 +55 I 0.055 +56 D 0.060 +57 Q 0.064 +58 C 0.065 +59 S 0.064 +60 K 0.065 +61 Q 0.067 +62 I 0.067 +63 Q 0.062 +64 S 0.055 +65 N 0.048 +66 L 0.042 +67 N 0.038 +68 I 0.036 +69 R 0.033 +70 F 0.031 +71 G 0.032 +72 I 0.039 +73 I 0.051 +74 L 0.062 +75 R 0.065 +76 Q 0.058 +77 D 0.046 +78 I 0.034 +79 R 0.027 +80 K 0.023 +81 L 0.021 +82 F 0.021 +83 L 0.022 +84 D 0.023 +85 I 0.023 +86 T 0.024 +87 L 0.030 +88 M 0.041 +89 A 0.055 +90 K 0.065 +91 G 0.070 +92 S 0.070 +93 S 0.067 +94 I 0.061 +95 L 0.056 +96 N 0.054 +97 Y 0.053 +98 S 0.053 +99 Y 0.056 +100 P 0.063 +101 L 0.076 +102 C 0.096 +103 E 0.119 +104 E 0.140 +105 D 0.151 +106 Q 0.148 +107 P 0.137 +108 K 0.122 +109 F 0.109 +110 S 0.099 +111 F 0.093 +112 C 0.090 +113 G 0.089 +114 R 0.088 +115 R 0.091 +116 K 0.096 +117 G 0.098 +118 E 0.092 +119 Q 0.078 +120 I 0.059 +121 Y 0.047 +122 Y 0.045 +123 A 0.054 +124 G 0.066 +125 P 0.076 +126 V 0.090 +127 N 0.111 +128 N 0.138 +129 P 0.160 +130 G 0.174 +131 L 0.177 +132 D 0.171 +133 V 0.160 +134 P 0.151 +135 Q 0.138 +136 G 0.116 +137 E 0.089 +138 Y 0.064 +139 Q 0.046 +140 L 0.033 +141 L 0.024 +142 L 0.019 +143 E 0.016 +144 L 0.016 +145 Y 0.020 +146 N 0.027 +147 E 0.035 +148 N 0.040 +149 R 0.040 +150 A 0.035 +151 T 0.028 +152 V 0.022 +153 A 0.018 +154 C 0.017 +155 A 0.019 +156 N 0.021 +157 A 0.025 +158 T 0.033 +159 V 0.049 +160 T 0.074 +161 S 0.105 +162 S 0.127 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021423.7_ENSMUST00000021860.7_GN:Ly86_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:77.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021423.7_ENSMUST00000021860.7_GN:Ly86_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:77.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d15ee458361eefd92f0a4441d4490001c0d2c964 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021423.7_ENSMUST00000021860.7_GN:Ly86_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:77.caid @@ -0,0 +1,240 @@ +>ENSMUSG00000021423.7|ENSMUST00000021860.7|GN:Ly86|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:77 +1 M 0.380 +2 R 0.404 +3 A 0.433 +4 R 0.443 +5 A 0.423 +6 H 0.395 +7 T 0.378 +8 H 0.357 +9 T 0.320 +10 C 0.282 +11 Y 0.260 +12 F 0.255 +13 K 0.260 +14 Y 0.278 +15 V 0.310 +16 K 0.357 +17 A 0.405 +18 P 0.440 +19 W 0.455 +20 N 0.461 +21 S 0.469 +22 I 0.481 +23 Q 0.495 +24 M 0.518 +25 P 0.550 +26 L 0.577 +27 P 0.586 +28 A 0.569 +29 V 0.520 +30 C 0.458 +31 L 0.408 +32 C 0.373 +33 L 0.342 +34 L 0.311 +35 T 0.287 +36 V 0.280 +37 Y 0.300 +38 F 0.340 +39 P 0.376 +40 E 0.385 +41 T 0.366 +42 S 0.343 +43 I 0.336 +44 R 0.358 +45 E 0.405 +46 V 0.454 +47 K 0.488 +48 L 0.517 +49 N 0.546 +50 I 0.559 +51 L 0.553 +52 L 0.546 +53 L 0.556 +54 Q 0.581 +55 G 0.601 +56 E 0.596 +57 D 0.562 +58 E 0.513 +59 L 0.464 +60 R 0.438 +61 R 0.452 +62 S 0.490 +63 F 0.520 +64 Y 0.538 +65 W 0.563 +66 A 0.599 +67 G 0.632 +68 L 0.655 +69 P 0.672 +70 L 0.680 +71 G 0.671 +72 T 0.651 +73 H 0.641 +74 N 0.652 +75 P 0.678 +76 L 0.705 +77 A 0.723 +78 M 0.730 +79 N 0.731 +80 G 0.720 +81 V 0.683 +82 A 0.612 +83 A 0.527 +84 A 0.470 +85 L 0.458 +86 L 0.458 +87 V 0.430 +88 W 0.386 +89 I 0.359 +90 L 0.364 +91 T 0.403 +92 S 0.475 +93 P 0.558 +94 S 0.628 +95 S 0.671 +96 S 0.698 +97 D 0.718 +98 H 0.726 +99 G 0.712 +100 S 0.676 +101 E 0.622 +102 N 0.553 +103 G 0.475 +104 W 0.395 +105 P 0.316 +106 K 0.242 +107 H 0.183 +108 T 0.146 +109 A 0.129 +110 C 0.125 +111 N 0.133 +112 S 0.148 +113 G 0.156 +114 G 0.147 +115 L 0.127 +116 E 0.106 +117 V 0.086 +118 V 0.071 +119 Y 0.063 +120 Q 0.063 +121 S 0.071 +122 C 0.084 +123 D 0.100 +124 P 0.115 +125 L 0.126 +126 Q 0.128 +127 D 0.117 +128 F 0.093 +129 G 0.068 +130 L 0.051 +131 S 0.044 +132 I 0.045 +133 D 0.050 +134 Q 0.056 +135 C 0.058 +136 S 0.059 +137 K 0.060 +138 Q 0.064 +139 I 0.066 +140 Q 0.064 +141 S 0.058 +142 N 0.052 +143 L 0.045 +144 N 0.040 +145 I 0.035 +146 R 0.032 +147 F 0.029 +148 G 0.030 +149 I 0.036 +150 I 0.046 +151 L 0.056 +152 R 0.060 +153 Q 0.055 +154 D 0.044 +155 I 0.034 +156 R 0.027 +157 K 0.024 +158 L 0.022 +159 F 0.021 +160 L 0.021 +161 D 0.022 +162 I 0.024 +163 T 0.026 +164 L 0.032 +165 M 0.043 +166 A 0.056 +167 K 0.064 +168 G 0.069 +169 S 0.070 +170 S 0.068 +171 I 0.064 +172 L 0.061 +173 N 0.060 +174 Y 0.059 +175 S 0.059 +176 Y 0.061 +177 P 0.069 +178 L 0.081 +179 C 0.100 +180 E 0.123 +181 E 0.143 +182 D 0.153 +183 Q 0.150 +184 P 0.138 +185 K 0.121 +186 F 0.106 +187 S 0.095 +188 F 0.090 +189 C 0.089 +190 G 0.089 +191 R 0.089 +192 R 0.092 +193 K 0.096 +194 G 0.097 +195 E 0.088 +196 Q 0.071 +197 I 0.054 +198 Y 0.043 +199 Y 0.043 +200 A 0.052 +201 G 0.064 +202 P 0.074 +203 V 0.088 +204 N 0.111 +205 N 0.137 +206 P 0.157 +207 G 0.168 +208 L 0.169 +209 D 0.160 +210 V 0.151 +211 P 0.143 +212 Q 0.134 +213 G 0.115 +214 E 0.089 +215 Y 0.065 +216 Q 0.046 +217 L 0.032 +218 L 0.023 +219 L 0.018 +220 E 0.015 +221 L 0.015 +222 Y 0.018 +223 N 0.025 +224 E 0.033 +225 N 0.037 +226 R 0.036 +227 A 0.031 +228 T 0.025 +229 V 0.020 +230 A 0.017 +231 C 0.017 +232 A 0.019 +233 N 0.021 +234 A 0.025 +235 T 0.032 +236 V 0.047 +237 T 0.072 +238 S 0.103 +239 S 0.125 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021595.19_ENSMUST00000109699.11_GN:Nsun2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021595.19_ENSMUST00000109699.11_GN:Nsun2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..3bc0c15ec14f43cadbe56f7cc3d6b37cd16a43f4 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021595.19_ENSMUST00000109699.11_GN:Nsun2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,758 @@ +>ENSMUSG00000021595.19|ENSMUST00000109699.11|GN:Nsun2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.359 +2 G 0.379 +3 R 0.408 +4 R 0.430 +5 A 0.439 +6 R 0.444 +7 G 0.454 +8 R 0.456 +9 R 0.430 +10 F 0.386 +11 Q 0.357 +12 Q 0.361 +13 P 0.385 +14 P 0.415 +15 Q 0.458 +16 P 0.516 +17 E 0.571 +18 G 0.611 +19 E 0.627 +20 E 0.610 +21 D 0.567 +22 A 0.540 +23 S 0.564 +24 D 0.620 +25 G 0.658 +26 G 0.665 +27 R 0.658 +28 K 0.655 +29 R 0.661 +30 G 0.669 +31 Q 0.667 +32 A 0.650 +33 G 0.619 +34 W 0.588 +35 E 0.565 +36 G 0.547 +37 G 0.528 +38 Y 0.503 +39 P 0.465 +40 E 0.412 +41 I 0.346 +42 V 0.278 +43 K 0.221 +44 E 0.174 +45 N 0.131 +46 K 0.092 +47 L 0.064 +48 F 0.048 +49 E 0.038 +50 H 0.031 +51 Y 0.028 +52 Y 0.030 +53 Q 0.038 +54 E 0.050 +55 L 0.067 +56 K 0.089 +57 I 0.111 +58 V 0.124 +59 P 0.124 +60 E 0.114 +61 G 0.099 +62 E 0.084 +63 W 0.075 +64 D 0.077 +65 Q 0.088 +66 F 0.101 +67 M 0.112 +68 E 0.118 +69 S 0.122 +70 L 0.131 +71 R 0.143 +72 E 0.147 +73 P 0.136 +74 L 0.115 +75 P 0.092 +76 A 0.075 +77 T 0.067 +78 L 0.069 +79 R 0.077 +80 I 0.089 +81 T 0.097 +82 G 0.093 +83 Y 0.080 +84 K 0.066 +85 S 0.057 +86 H 0.053 +87 A 0.051 +88 K 0.050 +89 E 0.050 +90 I 0.055 +91 L 0.065 +92 H 0.074 +93 C 0.076 +94 L 0.072 +95 K 0.064 +96 N 0.056 +97 K 0.048 +98 Y 0.042 +99 F 0.039 +100 K 0.042 +101 E 0.053 +102 L 0.068 +103 E 0.082 +104 D 0.092 +105 L 0.102 +106 E 0.114 +107 V 0.127 +108 D 0.141 +109 G 0.154 +110 Q 0.160 +111 K 0.149 +112 V 0.122 +113 E 0.094 +114 V 0.078 +115 P 0.071 +116 Q 0.068 +117 P 0.067 +118 L 0.064 +119 S 0.058 +120 W 0.055 +121 Y 0.056 +122 P 0.060 +123 E 0.059 +124 E 0.052 +125 L 0.041 +126 A 0.030 +127 W 0.024 +128 H 0.024 +129 T 0.031 +130 N 0.040 +131 L 0.047 +132 S 0.051 +133 R 0.054 +134 K 0.061 +135 I 0.072 +136 L 0.083 +137 R 0.091 +138 K 0.094 +139 S 0.088 +140 P 0.073 +141 L 0.057 +142 L 0.046 +143 A 0.043 +144 K 0.047 +145 F 0.058 +146 H 0.070 +147 Q 0.077 +148 F 0.076 +149 L 0.070 +150 V 0.064 +151 S 0.060 +152 E 0.057 +153 T 0.056 +154 E 0.057 +155 S 0.061 +156 G 0.066 +157 N 0.070 +158 I 0.074 +159 S 0.079 +160 R 0.084 +161 Q 0.088 +162 E 0.092 +163 A 0.097 +164 V 0.105 +165 S 0.112 +166 M 0.109 +167 I 0.095 +168 P 0.082 +169 P 0.076 +170 L 0.074 +171 L 0.070 +172 L 0.065 +173 N 0.064 +174 V 0.068 +175 E 0.074 +176 P 0.075 +177 H 0.073 +178 H 0.071 +179 K 0.070 +180 I 0.069 +181 L 0.065 +182 D 0.062 +183 M 0.060 +184 C 0.059 +185 A 0.056 +186 A 0.054 +187 P 0.057 +188 G 0.064 +189 S 0.070 +190 K 0.072 +191 T 0.073 +192 T 0.077 +193 Q 0.081 +194 L 0.080 +195 I 0.074 +196 E 0.071 +197 M 0.070 +198 L 0.069 +199 H 0.066 +200 A 0.067 +201 D 0.072 +202 M 0.078 +203 S 0.082 +204 V 0.084 +205 P 0.087 +206 F 0.090 +207 P 0.090 +208 E 0.086 +209 G 0.083 +210 F 0.082 +211 V 0.080 +212 I 0.075 +213 A 0.070 +214 N 0.071 +215 D 0.076 +216 V 0.075 +217 D 0.066 +218 N 0.057 +219 K 0.054 +220 R 0.056 +221 C 0.056 +222 Y 0.054 +223 L 0.056 +224 L 0.057 +225 V 0.055 +226 H 0.051 +227 Q 0.049 +228 A 0.047 +229 K 0.044 +230 R 0.043 +231 L 0.050 +232 S 0.061 +233 S 0.069 +234 P 0.067 +235 C 0.058 +236 I 0.052 +237 M 0.054 +238 V 0.060 +239 V 0.064 +240 N 0.065 +241 H 0.062 +242 D 0.062 +243 A 0.064 +244 S 0.067 +245 S 0.070 +246 I 0.073 +247 P 0.072 +248 R 0.069 +249 L 0.065 +250 T 0.067 +251 V 0.080 +252 D 0.106 +253 V 0.136 +254 D 0.155 +255 G 0.161 +256 R 0.156 +257 K 0.140 +258 E 0.116 +259 I 0.089 +260 L 0.063 +261 F 0.043 +262 Y 0.033 +263 D 0.030 +264 R 0.031 +265 I 0.036 +266 L 0.046 +267 C 0.059 +268 D 0.078 +269 V 0.103 +270 P 0.125 +271 C 0.139 +272 S 0.143 +273 G 0.138 +274 D 0.129 +275 G 0.124 +276 T 0.125 +277 M 0.127 +278 R 0.129 +279 K 0.132 +280 N 0.134 +281 I 0.135 +282 D 0.135 +283 V 0.130 +284 W 0.114 +285 K 0.098 +286 K 0.090 +287 W 0.089 +288 T 0.088 +289 T 0.090 +290 L 0.098 +291 N 0.108 +292 S 0.111 +293 L 0.107 +294 Q 0.107 +295 L 0.109 +296 H 0.103 +297 G 0.092 +298 L 0.082 +299 Q 0.075 +300 L 0.066 +301 R 0.058 +302 I 0.054 +303 A 0.051 +304 T 0.047 +305 R 0.046 +306 G 0.048 +307 A 0.051 +308 E 0.055 +309 Q 0.059 +310 L 0.065 +311 A 0.071 +312 E 0.074 +313 G 0.072 +314 G 0.071 +315 R 0.076 +316 M 0.084 +317 V 0.085 +318 Y 0.076 +319 S 0.066 +320 T 0.060 +321 C 0.060 +322 S 0.064 +323 L 0.067 +324 N 0.070 +325 P 0.075 +326 V 0.079 +327 E 0.075 +328 D 0.066 +329 E 0.062 +330 A 0.068 +331 V 0.073 +332 I 0.071 +333 A 0.063 +334 A 0.058 +335 L 0.057 +336 L 0.053 +337 E 0.049 +338 K 0.050 +339 S 0.059 +340 E 0.068 +341 G 0.068 +342 A 0.063 +343 L 0.061 +344 E 0.066 +345 L 0.071 +346 A 0.072 +347 D 0.068 +348 V 0.065 +349 S 0.067 +350 A 0.068 +351 E 0.066 +352 L 0.066 +353 P 0.074 +354 G 0.087 +355 L 0.101 +356 K 0.113 +357 W 0.128 +358 M 0.142 +359 P 0.148 +360 G 0.141 +361 V 0.128 +362 S 0.116 +363 Q 0.106 +364 W 0.092 +365 K 0.077 +366 V 0.063 +367 M 0.055 +368 T 0.054 +369 R 0.062 +370 D 0.078 +371 G 0.095 +372 Q 0.107 +373 W 0.111 +374 F 0.106 +375 A 0.096 +376 D 0.084 +377 W 0.077 +378 H 0.083 +379 E 0.101 +380 V 0.122 +381 P 0.139 +382 Q 0.147 +383 G 0.146 +384 R 0.139 +385 H 0.138 +386 T 0.145 +387 Q 0.154 +388 I 0.153 +389 R 0.141 +390 P 0.126 +391 T 0.115 +392 M 0.113 +393 F 0.119 +394 P 0.128 +395 P 0.127 +396 T 0.111 +397 D 0.088 +398 L 0.070 +399 E 0.060 +400 K 0.059 +401 L 0.066 +402 Q 0.077 +403 A 0.090 +404 M 0.098 +405 H 0.101 +406 L 0.102 +407 E 0.104 +408 R 0.104 +409 C 0.108 +410 L 0.115 +411 R 0.120 +412 I 0.114 +413 L 0.103 +414 P 0.099 +415 H 0.107 +416 H 0.118 +417 Q 0.122 +418 N 0.118 +419 T 0.113 +420 G 0.111 +421 G 0.111 +422 F 0.107 +423 F 0.098 +424 V 0.085 +425 A 0.074 +426 V 0.068 +427 L 0.069 +428 V 0.075 +429 K 0.086 +430 K 0.101 +431 A 0.114 +432 P 0.125 +433 M 0.140 +434 P 0.170 +435 W 0.222 +436 N 0.291 +437 K 0.363 +438 R 0.428 +439 Q 0.487 +440 P 0.544 +441 K 0.595 +442 V 0.633 +443 Q 0.656 +444 N 0.665 +445 K 0.661 +446 S 0.650 +447 A 0.637 +448 E 0.623 +449 A 0.605 +450 R 0.591 +451 E 0.591 +452 P 0.599 +453 R 0.604 +454 V 0.601 +455 S 0.597 +456 S 0.591 +457 H 0.569 +458 V 0.530 +459 A 0.511 +460 A 0.542 +461 T 0.600 +462 E 0.642 +463 G 0.659 +464 N 0.665 +465 P 0.672 +466 S 0.670 +467 D 0.640 +468 Q 0.576 +469 S 0.493 +470 E 0.432 +471 L 0.421 +472 E 0.436 +473 S 0.439 +474 Q 0.438 +475 M 0.467 +476 I 0.533 +477 T 0.610 +478 G 0.672 +479 A 0.707 +480 G 0.719 +481 D 0.714 +482 S 0.687 +483 E 0.631 +484 T 0.558 +485 A 0.504 +486 H 0.474 +487 N 0.436 +488 T 0.391 +489 E 0.388 +490 N 0.428 +491 T 0.464 +492 E 0.493 +493 S 0.543 +494 N 0.605 +495 E 0.652 +496 K 0.687 +497 K 0.719 +498 D 0.742 +499 G 0.744 +500 V 0.720 +501 C 0.683 +502 G 0.650 +503 P 0.635 +504 P 0.638 +505 P 0.648 +506 S 0.652 +507 K 0.648 +508 K 0.636 +509 M 0.617 +510 K 0.591 +511 L 0.559 +512 F 0.519 +513 G 0.471 +514 F 0.419 +515 K 0.367 +516 E 0.314 +517 D 0.266 +518 P 0.222 +519 F 0.181 +520 V 0.147 +521 F 0.128 +522 I 0.123 +523 P 0.121 +524 E 0.115 +525 D 0.104 +526 D 0.091 +527 P 0.078 +528 L 0.067 +529 F 0.059 +530 P 0.055 +531 P 0.055 +532 I 0.058 +533 E 0.065 +534 K 0.073 +535 F 0.079 +536 Y 0.080 +537 A 0.081 +538 L 0.086 +539 D 0.094 +540 P 0.101 +541 S 0.103 +542 F 0.096 +543 P 0.083 +544 R 0.072 +545 M 0.066 +546 N 0.060 +547 L 0.050 +548 L 0.042 +549 T 0.043 +550 R 0.053 +551 T 0.067 +552 T 0.085 +553 E 0.106 +554 G 0.125 +555 K 0.129 +556 K 0.121 +557 R 0.109 +558 Q 0.095 +559 L 0.079 +560 Y 0.067 +561 M 0.064 +562 V 0.067 +563 S 0.070 +564 K 0.064 +565 E 0.054 +566 L 0.047 +567 R 0.045 +568 N 0.048 +569 V 0.056 +570 L 0.072 +571 L 0.094 +572 N 0.113 +573 N 0.124 +574 S 0.134 +575 E 0.146 +576 K 0.157 +577 M 0.167 +578 K 0.178 +579 V 0.185 +580 I 0.180 +581 N 0.163 +582 T 0.140 +583 G 0.120 +584 I 0.109 +585 K 0.105 +586 V 0.107 +587 W 0.112 +588 C 0.124 +589 R 0.148 +590 N 0.183 +591 N 0.223 +592 S 0.256 +593 G 0.270 +594 E 0.259 +595 E 0.231 +596 F 0.198 +597 D 0.168 +598 C 0.139 +599 A 0.115 +600 F 0.100 +601 R 0.095 +602 L 0.099 +603 A 0.106 +604 Q 0.107 +605 E 0.096 +606 G 0.083 +607 I 0.075 +608 Y 0.072 +609 T 0.069 +610 L 0.066 +611 Y 0.065 +612 P 0.066 +613 F 0.068 +614 I 0.072 +615 N 0.078 +616 S 0.078 +617 R 0.070 +618 I 0.063 +619 I 0.062 +620 T 0.063 +621 V 0.058 +622 S 0.046 +623 M 0.037 +624 E 0.033 +625 D 0.033 +626 V 0.034 +627 K 0.035 +628 T 0.036 +629 L 0.039 +630 L 0.040 +631 T 0.040 +632 Q 0.042 +633 E 0.046 +634 N 0.050 +635 P 0.053 +636 F 0.055 +637 F 0.060 +638 R 0.067 +639 K 0.076 +640 L 0.081 +641 S 0.078 +642 S 0.068 +643 E 0.056 +644 A 0.046 +645 Y 0.042 +646 S 0.046 +647 Q 0.054 +648 V 0.065 +649 K 0.078 +650 D 0.089 +651 L 0.098 +652 A 0.103 +653 K 0.101 +654 G 0.094 +655 S 0.083 +656 V 0.071 +657 V 0.062 +658 L 0.060 +659 K 0.069 +660 Y 0.088 +661 E 0.114 +662 P 0.145 +663 D 0.177 +664 S 0.202 +665 A 0.217 +666 N 0.224 +667 P 0.228 +668 D 0.233 +669 T 0.238 +670 L 0.232 +671 Q 0.213 +672 C 0.187 +673 P 0.166 +674 I 0.151 +675 V 0.140 +676 L 0.125 +677 C 0.110 +678 G 0.101 +679 W 0.104 +680 R 0.117 +681 G 0.129 +682 K 0.132 +683 A 0.127 +684 S 0.116 +685 I 0.104 +686 R 0.096 +687 T 0.102 +688 F 0.119 +689 V 0.134 +690 P 0.135 +691 K 0.118 +692 N 0.096 +693 E 0.079 +694 R 0.074 +695 L 0.076 +696 H 0.079 +697 Y 0.084 +698 L 0.089 +699 R 0.093 +700 M 0.100 +701 M 0.113 +702 G 0.135 +703 L 0.169 +704 E 0.218 +705 V 0.275 +706 L 0.337 +707 G 0.408 +708 E 0.480 +709 K 0.542 +710 K 0.589 +711 K 0.624 +712 E 0.649 +713 G 0.659 +714 V 0.659 +715 I 0.663 +716 L 0.679 +717 T 0.700 +718 N 0.711 +719 E 0.709 +720 N 0.695 +721 A 0.670 +722 A 0.645 +723 S 0.634 +724 P 0.640 +725 E 0.655 +726 Q 0.673 +727 P 0.692 +728 G 0.706 +729 D 0.707 +730 E 0.688 +731 D 0.642 +732 A 0.579 +733 K 0.537 +734 Q 0.532 +735 T 0.533 +736 A 0.537 +737 Q 0.573 +738 D 0.630 +739 P 0.672 +740 C 0.693 +741 V 0.709 +742 P 0.726 +743 D 0.737 +744 S 0.740 +745 V 0.746 +746 P 0.763 +747 G 0.785 +748 C 0.801 +749 D 0.804 +750 A 0.793 +751 A 0.774 +752 A 0.751 +753 A 0.730 +754 E 0.715 +755 P 0.699 +756 S 0.675 +757 R 0.653 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021595.19_ENSMUST00000109699.11_GN:Nsun2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:25.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021595.19_ENSMUST00000109699.11_GN:Nsun2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:25.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e59f3fa3203ba932f2e835fe538e90b11e11b2da --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021595.19_ENSMUST00000109699.11_GN:Nsun2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:25.caid @@ -0,0 +1,783 @@ +>ENSMUSG00000021595.19|ENSMUST00000109699.11|GN:Nsun2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:25 +1 M 0.272 +2 Q 0.273 +3 P 0.269 +4 E 0.252 +5 V 0.229 +6 Q 0.215 +7 R 0.229 +8 A 0.267 +9 C 0.304 +10 G 0.326 +11 L 0.337 +12 V 0.338 +13 G 0.327 +14 R 0.311 +15 C 0.295 +16 V 0.272 +17 R 0.243 +18 S 0.224 +19 A 0.219 +20 C 0.217 +21 A 0.214 +22 A 0.218 +23 A 0.228 +24 W 0.239 +25 A 0.259 +26 M 0.298 +27 G 0.341 +28 R 0.373 +29 R 0.400 +30 A 0.428 +31 R 0.447 +32 G 0.450 +33 R 0.434 +34 R 0.401 +35 F 0.362 +36 Q 0.339 +37 Q 0.350 +38 P 0.382 +39 P 0.417 +40 Q 0.460 +41 P 0.512 +42 E 0.567 +43 G 0.611 +44 E 0.633 +45 E 0.621 +46 D 0.580 +47 A 0.552 +48 S 0.576 +49 D 0.632 +50 G 0.675 +51 G 0.686 +52 R 0.683 +53 K 0.684 +54 R 0.694 +55 G 0.705 +56 Q 0.705 +57 A 0.691 +58 G 0.663 +59 W 0.633 +60 E 0.610 +61 G 0.588 +62 G 0.558 +63 Y 0.521 +64 P 0.474 +65 E 0.413 +66 I 0.340 +67 V 0.268 +68 K 0.208 +69 E 0.160 +70 N 0.119 +71 K 0.084 +72 L 0.059 +73 F 0.045 +74 E 0.036 +75 H 0.030 +76 Y 0.027 +77 Y 0.029 +78 Q 0.036 +79 E 0.047 +80 L 0.063 +81 K 0.083 +82 I 0.102 +83 V 0.113 +84 P 0.113 +85 E 0.103 +86 G 0.090 +87 E 0.078 +88 W 0.071 +89 D 0.074 +90 Q 0.087 +91 F 0.100 +92 M 0.109 +93 E 0.114 +94 S 0.117 +95 L 0.124 +96 R 0.134 +97 E 0.138 +98 P 0.129 +99 L 0.109 +100 P 0.088 +101 A 0.072 +102 T 0.065 +103 L 0.066 +104 R 0.074 +105 I 0.084 +106 T 0.090 +107 G 0.086 +108 Y 0.073 +109 K 0.060 +110 S 0.052 +111 H 0.048 +112 A 0.047 +113 K 0.045 +114 E 0.043 +115 I 0.042 +116 L 0.042 +117 H 0.047 +118 C 0.053 +119 L 0.058 +120 K 0.057 +121 N 0.052 +122 K 0.046 +123 Y 0.040 +124 F 0.038 +125 K 0.042 +126 E 0.053 +127 L 0.069 +128 E 0.084 +129 D 0.095 +130 L 0.106 +131 E 0.119 +132 V 0.132 +133 D 0.145 +134 G 0.158 +135 Q 0.165 +136 K 0.154 +137 V 0.127 +138 E 0.099 +139 V 0.081 +140 P 0.073 +141 Q 0.069 +142 P 0.067 +143 L 0.065 +144 S 0.059 +145 W 0.055 +146 Y 0.057 +147 P 0.061 +148 E 0.060 +149 E 0.053 +150 L 0.041 +151 A 0.030 +152 W 0.024 +153 H 0.024 +154 T 0.030 +155 N 0.039 +156 L 0.045 +157 S 0.049 +158 R 0.052 +159 K 0.059 +160 I 0.070 +161 L 0.081 +162 R 0.089 +163 K 0.092 +164 S 0.085 +165 P 0.071 +166 L 0.055 +167 L 0.044 +168 A 0.040 +169 K 0.041 +170 F 0.044 +171 H 0.045 +172 Q 0.046 +173 F 0.049 +174 L 0.052 +175 V 0.054 +176 S 0.054 +177 E 0.053 +178 T 0.052 +179 E 0.053 +180 S 0.058 +181 G 0.064 +182 N 0.068 +183 I 0.072 +184 S 0.077 +185 R 0.083 +186 Q 0.087 +187 E 0.091 +188 A 0.097 +189 V 0.104 +190 S 0.110 +191 M 0.107 +192 I 0.093 +193 P 0.080 +194 P 0.075 +195 L 0.073 +196 L 0.069 +197 L 0.064 +198 N 0.063 +199 V 0.067 +200 E 0.072 +201 P 0.073 +202 H 0.071 +203 H 0.070 +204 K 0.070 +205 I 0.068 +206 L 0.065 +207 D 0.061 +208 M 0.059 +209 C 0.057 +210 A 0.054 +211 A 0.052 +212 P 0.055 +213 G 0.062 +214 S 0.068 +215 K 0.070 +216 T 0.071 +217 T 0.074 +218 Q 0.078 +219 L 0.077 +220 I 0.072 +221 E 0.068 +222 M 0.067 +223 L 0.066 +224 H 0.063 +225 A 0.064 +226 D 0.070 +227 M 0.075 +228 S 0.079 +229 V 0.080 +230 P 0.082 +231 F 0.085 +232 P 0.085 +233 E 0.082 +234 G 0.079 +235 F 0.080 +236 V 0.079 +237 I 0.074 +238 A 0.069 +239 N 0.070 +240 D 0.075 +241 V 0.074 +242 D 0.065 +243 N 0.056 +244 K 0.053 +245 R 0.055 +246 C 0.055 +247 Y 0.053 +248 L 0.054 +249 L 0.054 +250 V 0.051 +251 H 0.047 +252 Q 0.046 +253 A 0.044 +254 K 0.042 +255 R 0.041 +256 L 0.047 +257 S 0.058 +258 S 0.067 +259 P 0.065 +260 C 0.057 +261 I 0.051 +262 M 0.052 +263 V 0.058 +264 V 0.063 +265 N 0.063 +266 H 0.061 +267 D 0.061 +268 A 0.063 +269 S 0.067 +270 S 0.070 +271 I 0.073 +272 P 0.073 +273 R 0.069 +274 L 0.065 +275 T 0.066 +276 V 0.079 +277 D 0.105 +278 V 0.135 +279 D 0.155 +280 G 0.162 +281 R 0.159 +282 K 0.143 +283 E 0.117 +284 I 0.090 +285 L 0.063 +286 F 0.044 +287 Y 0.034 +288 D 0.031 +289 R 0.031 +290 I 0.037 +291 L 0.046 +292 C 0.060 +293 D 0.080 +294 V 0.105 +295 P 0.128 +296 C 0.141 +297 S 0.145 +298 G 0.140 +299 D 0.130 +300 G 0.125 +301 T 0.127 +302 M 0.130 +303 R 0.133 +304 K 0.136 +305 N 0.138 +306 I 0.139 +307 D 0.139 +308 V 0.133 +309 W 0.117 +310 K 0.101 +311 K 0.093 +312 W 0.091 +313 T 0.091 +314 T 0.092 +315 L 0.100 +316 N 0.110 +317 S 0.113 +318 L 0.109 +319 Q 0.108 +320 L 0.110 +321 H 0.104 +322 G 0.093 +323 L 0.083 +324 Q 0.075 +325 L 0.066 +326 R 0.059 +327 I 0.055 +328 A 0.052 +329 T 0.049 +330 R 0.048 +331 G 0.050 +332 A 0.053 +333 E 0.057 +334 Q 0.061 +335 L 0.067 +336 A 0.073 +337 E 0.075 +338 G 0.072 +339 G 0.070 +340 R 0.076 +341 M 0.083 +342 V 0.084 +343 Y 0.076 +344 S 0.066 +345 T 0.060 +346 C 0.060 +347 S 0.063 +348 L 0.066 +349 N 0.070 +350 P 0.075 +351 V 0.080 +352 E 0.076 +353 D 0.067 +354 E 0.063 +355 A 0.068 +356 V 0.074 +357 I 0.071 +358 A 0.063 +359 A 0.058 +360 L 0.056 +361 L 0.052 +362 E 0.048 +363 K 0.049 +364 S 0.058 +365 E 0.066 +366 G 0.065 +367 A 0.060 +368 L 0.059 +369 E 0.064 +370 L 0.070 +371 A 0.070 +372 D 0.066 +373 V 0.063 +374 S 0.064 +375 A 0.064 +376 E 0.062 +377 L 0.062 +378 P 0.069 +379 G 0.082 +380 L 0.095 +381 K 0.109 +382 W 0.124 +383 M 0.140 +384 P 0.147 +385 G 0.140 +386 V 0.127 +387 S 0.115 +388 Q 0.105 +389 W 0.091 +390 K 0.075 +391 V 0.062 +392 M 0.054 +393 T 0.053 +394 R 0.060 +395 D 0.075 +396 G 0.091 +397 Q 0.103 +398 W 0.107 +399 F 0.104 +400 A 0.095 +401 D 0.083 +402 W 0.076 +403 H 0.081 +404 E 0.097 +405 V 0.118 +406 P 0.135 +407 Q 0.143 +408 G 0.142 +409 R 0.135 +410 H 0.134 +411 T 0.142 +412 Q 0.150 +413 I 0.149 +414 R 0.137 +415 P 0.123 +416 T 0.114 +417 M 0.112 +418 F 0.118 +419 P 0.127 +420 P 0.126 +421 T 0.110 +422 D 0.087 +423 L 0.069 +424 E 0.060 +425 K 0.059 +426 L 0.066 +427 Q 0.078 +428 A 0.090 +429 M 0.098 +430 H 0.102 +431 L 0.104 +432 E 0.105 +433 R 0.105 +434 C 0.109 +435 L 0.116 +436 R 0.121 +437 I 0.115 +438 L 0.104 +439 P 0.100 +440 H 0.109 +441 H 0.120 +442 Q 0.124 +443 N 0.120 +444 T 0.115 +445 G 0.113 +446 G 0.112 +447 F 0.109 +448 F 0.099 +449 V 0.086 +450 A 0.074 +451 V 0.069 +452 L 0.070 +453 V 0.075 +454 K 0.086 +455 K 0.101 +456 A 0.115 +457 P 0.126 +458 M 0.141 +459 P 0.171 +460 W 0.222 +461 N 0.291 +462 K 0.364 +463 R 0.429 +464 Q 0.488 +465 P 0.545 +466 K 0.595 +467 V 0.634 +468 Q 0.658 +469 N 0.668 +470 K 0.664 +471 S 0.654 +472 A 0.642 +473 E 0.628 +474 A 0.611 +475 R 0.598 +476 E 0.599 +477 P 0.609 +478 R 0.618 +479 V 0.619 +480 S 0.620 +481 S 0.621 +482 H 0.617 +483 V 0.603 +484 A 0.595 +485 A 0.610 +486 T 0.639 +487 E 0.661 +488 G 0.669 +489 N 0.673 +490 P 0.678 +491 S 0.676 +492 D 0.648 +493 Q 0.585 +494 S 0.502 +495 E 0.442 +496 L 0.431 +497 E 0.447 +498 S 0.451 +499 Q 0.450 +500 M 0.480 +501 I 0.547 +502 T 0.623 +503 G 0.683 +504 A 0.716 +505 G 0.727 +506 D 0.721 +507 S 0.693 +508 E 0.636 +509 T 0.563 +510 A 0.508 +511 H 0.479 +512 N 0.442 +513 T 0.398 +514 E 0.396 +515 N 0.436 +516 T 0.471 +517 E 0.499 +518 S 0.548 +519 N 0.610 +520 E 0.658 +521 K 0.691 +522 K 0.721 +523 D 0.743 +524 G 0.744 +525 V 0.722 +526 C 0.686 +527 G 0.654 +528 P 0.639 +529 P 0.641 +530 P 0.650 +531 S 0.655 +532 K 0.652 +533 K 0.641 +534 M 0.622 +535 K 0.597 +536 L 0.566 +537 F 0.526 +538 G 0.478 +539 F 0.425 +540 K 0.371 +541 E 0.317 +542 D 0.268 +543 P 0.223 +544 F 0.182 +545 V 0.148 +546 F 0.129 +547 I 0.124 +548 P 0.122 +549 E 0.116 +550 D 0.105 +551 D 0.092 +552 P 0.078 +553 L 0.067 +554 F 0.060 +555 P 0.056 +556 P 0.055 +557 I 0.059 +558 E 0.066 +559 K 0.074 +560 F 0.079 +561 Y 0.080 +562 A 0.081 +563 L 0.086 +564 D 0.094 +565 P 0.101 +566 S 0.103 +567 F 0.097 +568 P 0.084 +569 R 0.073 +570 M 0.067 +571 N 0.060 +572 L 0.050 +573 L 0.042 +574 T 0.044 +575 R 0.054 +576 T 0.068 +577 T 0.085 +578 E 0.107 +579 G 0.125 +580 K 0.130 +581 K 0.122 +582 R 0.109 +583 Q 0.096 +584 L 0.080 +585 Y 0.067 +586 M 0.064 +587 V 0.068 +588 S 0.070 +589 K 0.065 +590 E 0.055 +591 L 0.047 +592 R 0.045 +593 N 0.048 +594 V 0.056 +595 L 0.072 +596 L 0.094 +597 N 0.113 +598 N 0.124 +599 S 0.134 +600 E 0.145 +601 K 0.156 +602 M 0.166 +603 K 0.177 +604 V 0.185 +605 I 0.181 +606 N 0.164 +607 T 0.141 +608 G 0.121 +609 I 0.110 +610 K 0.106 +611 V 0.107 +612 W 0.113 +613 C 0.125 +614 R 0.148 +615 N 0.183 +616 N 0.223 +617 S 0.256 +618 G 0.270 +619 E 0.259 +620 E 0.231 +621 F 0.198 +622 D 0.168 +623 C 0.140 +624 A 0.115 +625 F 0.100 +626 R 0.096 +627 L 0.100 +628 A 0.107 +629 Q 0.107 +630 E 0.097 +631 G 0.083 +632 I 0.076 +633 Y 0.073 +634 T 0.070 +635 L 0.067 +636 Y 0.066 +637 P 0.067 +638 F 0.069 +639 I 0.073 +640 N 0.079 +641 S 0.080 +642 R 0.072 +643 I 0.064 +644 I 0.063 +645 T 0.064 +646 V 0.058 +647 S 0.047 +648 M 0.037 +649 E 0.033 +650 D 0.034 +651 V 0.035 +652 K 0.035 +653 T 0.036 +654 L 0.039 +655 L 0.040 +656 T 0.040 +657 Q 0.042 +658 E 0.046 +659 N 0.050 +660 P 0.053 +661 F 0.055 +662 F 0.060 +663 R 0.068 +664 K 0.076 +665 L 0.081 +666 S 0.079 +667 S 0.069 +668 E 0.057 +669 A 0.046 +670 Y 0.043 +671 S 0.046 +672 Q 0.054 +673 V 0.066 +674 K 0.078 +675 D 0.089 +676 L 0.098 +677 A 0.102 +678 K 0.101 +679 G 0.094 +680 S 0.083 +681 V 0.070 +682 V 0.061 +683 L 0.060 +684 K 0.069 +685 Y 0.088 +686 E 0.115 +687 P 0.146 +688 D 0.178 +689 S 0.204 +690 A 0.220 +691 N 0.227 +692 P 0.230 +693 D 0.236 +694 T 0.239 +695 L 0.234 +696 Q 0.215 +697 C 0.190 +698 P 0.168 +699 I 0.154 +700 V 0.142 +701 L 0.127 +702 C 0.111 +703 G 0.101 +704 W 0.105 +705 R 0.117 +706 G 0.130 +707 K 0.133 +708 A 0.128 +709 S 0.117 +710 I 0.104 +711 R 0.096 +712 T 0.102 +713 F 0.118 +714 V 0.133 +715 P 0.134 +716 K 0.118 +717 N 0.095 +718 E 0.079 +719 R 0.074 +720 L 0.075 +721 H 0.079 +722 Y 0.084 +723 L 0.089 +724 R 0.093 +725 M 0.100 +726 M 0.113 +727 G 0.135 +728 L 0.170 +729 E 0.218 +730 V 0.276 +731 L 0.339 +732 G 0.410 +733 E 0.482 +734 K 0.543 +735 K 0.589 +736 K 0.625 +737 E 0.650 +738 G 0.661 +739 V 0.660 +740 I 0.664 +741 L 0.680 +742 T 0.701 +743 N 0.712 +744 E 0.711 +745 N 0.697 +746 A 0.673 +747 A 0.648 +748 S 0.637 +749 P 0.643 +750 E 0.658 +751 Q 0.676 +752 P 0.695 +753 G 0.708 +754 D 0.710 +755 E 0.691 +756 D 0.645 +757 A 0.582 +758 K 0.541 +759 Q 0.536 +760 T 0.537 +761 A 0.542 +762 Q 0.578 +763 D 0.635 +764 P 0.676 +765 C 0.697 +766 V 0.713 +767 P 0.730 +768 D 0.741 +769 S 0.744 +770 V 0.750 +771 P 0.766 +772 G 0.788 +773 C 0.804 +774 D 0.807 +775 A 0.797 +776 A 0.777 +777 A 0.753 +778 A 0.732 +779 E 0.716 +780 P 0.698 +781 S 0.672 +782 R 0.649 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021732.15_ENSMUST00000022246.9_GN:Fgf10_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021732.15_ENSMUST00000022246.9_GN:Fgf10_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..35fcb1e678fefc8e6fbcb48b8b42d264bc1d6a6f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021732.15_ENSMUST00000022246.9_GN:Fgf10_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,210 @@ +>ENSMUSG00000021732.15|ENSMUST00000022246.9|GN:Fgf10|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.318 +2 W 0.317 +3 K 0.322 +4 W 0.334 +5 I 0.340 +6 L 0.334 +7 T 0.340 +8 H 0.369 +9 C 0.395 +10 A 0.400 +11 S 0.409 +12 A 0.446 +13 F 0.486 +14 P 0.508 +15 H 0.536 +16 L 0.588 +17 P 0.642 +18 G 0.670 +19 C 0.658 +20 C 0.608 +21 C 0.533 +22 C 0.460 +23 F 0.416 +24 L 0.404 +25 L 0.395 +26 L 0.386 +27 F 0.403 +28 L 0.440 +29 V 0.467 +30 S 0.478 +31 S 0.496 +32 F 0.544 +33 P 0.615 +34 V 0.682 +35 T 0.723 +36 C 0.737 +37 Q 0.736 +38 A 0.722 +39 L 0.684 +40 G 0.627 +41 Q 0.592 +42 D 0.611 +43 M 0.653 +44 V 0.678 +45 S 0.686 +46 Q 0.685 +47 E 0.676 +48 A 0.656 +49 T 0.626 +50 N 0.596 +51 C 0.591 +52 S 0.628 +53 S 0.680 +54 S 0.716 +55 S 0.730 +56 S 0.730 +57 S 0.721 +58 F 0.705 +59 S 0.692 +60 S 0.691 +61 P 0.704 +62 S 0.725 +63 S 0.743 +64 A 0.750 +65 G 0.746 +66 R 0.739 +67 H 0.736 +68 V 0.729 +69 R 0.711 +70 S 0.680 +71 Y 0.641 +72 N 0.600 +73 H 0.559 +74 L 0.513 +75 Q 0.452 +76 G 0.369 +77 D 0.269 +78 V 0.172 +79 R 0.099 +80 W 0.057 +81 R 0.038 +82 R 0.033 +83 L 0.037 +84 F 0.043 +85 S 0.049 +86 F 0.051 +87 T 0.049 +88 K 0.046 +89 Y 0.046 +90 F 0.045 +91 L 0.043 +92 T 0.043 +93 I 0.048 +94 E 0.060 +95 K 0.079 +96 N 0.104 +97 G 0.128 +98 K 0.139 +99 V 0.134 +100 S 0.118 +101 G 0.100 +102 T 0.083 +103 K 0.073 +104 N 0.070 +105 E 0.077 +106 D 0.088 +107 C 0.096 +108 P 0.097 +109 Y 0.093 +110 S 0.083 +111 V 0.069 +112 L 0.056 +113 E 0.050 +114 I 0.052 +115 T 0.060 +116 S 0.070 +117 V 0.081 +118 E 0.092 +119 I 0.098 +120 G 0.093 +121 V 0.081 +122 V 0.070 +123 A 0.065 +124 V 0.065 +125 K 0.067 +126 A 0.071 +127 I 0.074 +128 N 0.076 +129 S 0.075 +130 N 0.069 +131 Y 0.060 +132 Y 0.053 +133 L 0.049 +134 A 0.051 +135 M 0.058 +136 N 0.069 +137 K 0.084 +138 K 0.105 +139 G 0.126 +140 K 0.137 +141 L 0.132 +142 Y 0.117 +143 G 0.104 +144 S 0.099 +145 K 0.099 +146 E 0.096 +147 F 0.087 +148 N 0.073 +149 N 0.060 +150 D 0.054 +151 C 0.051 +152 K 0.050 +153 L 0.050 +154 K 0.054 +155 E 0.060 +156 R 0.068 +157 I 0.075 +158 E 0.081 +159 E 0.089 +160 N 0.097 +161 G 0.099 +162 Y 0.093 +163 N 0.082 +164 T 0.075 +165 Y 0.073 +166 A 0.076 +167 S 0.083 +168 F 0.092 +169 N 0.101 +170 W 0.106 +171 Q 0.109 +172 H 0.115 +173 N 0.127 +174 G 0.139 +175 R 0.139 +176 Q 0.124 +177 M 0.103 +178 Y 0.089 +179 V 0.089 +180 A 0.102 +181 L 0.121 +182 N 0.139 +183 G 0.152 +184 K 0.158 +185 G 0.157 +186 A 0.149 +187 P 0.135 +188 R 0.118 +189 R 0.104 +190 G 0.100 +191 Q 0.106 +192 K 0.119 +193 T 0.127 +194 R 0.120 +195 R 0.102 +196 K 0.088 +197 N 0.081 +198 T 0.075 +199 S 0.067 +200 A 0.058 +201 H 0.051 +202 F 0.048 +203 L 0.053 +204 P 0.065 +205 M 0.084 +206 T 0.112 +207 I 0.148 +208 Q 0.182 +209 T 0.202 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021732.15_ENSMUST00000022246.9_GN:Fgf10_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:51.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021732.15_ENSMUST00000022246.9_GN:Fgf10_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:51.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4ca1f6d9e61fa60820cb1d324a796a3b1590b573 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021732.15_ENSMUST00000022246.9_GN:Fgf10_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:51.caid @@ -0,0 +1,261 @@ +>ENSMUSG00000021732.15|ENSMUST00000022246.9|GN:Fgf10|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:51 +1 M 0.393 +2 L 0.422 +3 V 0.461 +4 H 0.490 +5 S 0.500 +6 L 0.503 +7 L 0.514 +8 A 0.529 +9 R 0.536 +10 S 0.543 +11 V 0.562 +12 P 0.592 +13 R 0.616 +14 G 0.627 +15 S 0.629 +16 Y 0.638 +17 P 0.656 +18 E 0.673 +19 A 0.674 +20 T 0.645 +21 T 0.586 +22 S 0.536 +23 S 0.530 +24 C 0.563 +25 L 0.606 +26 S 0.633 +27 A 0.631 +28 S 0.609 +29 Q 0.590 +30 Q 0.587 +31 V 0.596 +32 L 0.604 +33 P 0.599 +34 F 0.575 +35 Q 0.535 +36 Y 0.501 +37 V 0.501 +38 P 0.534 +39 S 0.582 +40 D 0.629 +41 E 0.667 +42 T 0.689 +43 I 0.694 +44 S 0.691 +45 S 0.686 +46 A 0.675 +47 E 0.649 +48 S 0.593 +49 F 0.509 +50 S 0.420 +51 T 0.357 +52 M 0.320 +53 W 0.290 +54 K 0.260 +55 W 0.238 +56 I 0.224 +57 L 0.215 +58 T 0.216 +59 H 0.231 +60 C 0.261 +61 A 0.307 +62 S 0.367 +63 A 0.424 +64 F 0.457 +65 P 0.466 +66 H 0.477 +67 L 0.504 +68 P 0.530 +69 G 0.531 +70 C 0.496 +71 C 0.430 +72 C 0.369 +73 C 0.344 +74 F 0.344 +75 L 0.335 +76 L 0.308 +77 L 0.290 +78 F 0.304 +79 L 0.334 +80 V 0.356 +81 S 0.369 +82 S 0.401 +83 F 0.472 +84 P 0.567 +85 V 0.652 +86 T 0.702 +87 C 0.723 +88 Q 0.732 +89 A 0.732 +90 L 0.705 +91 G 0.655 +92 Q 0.626 +93 D 0.649 +94 M 0.694 +95 V 0.722 +96 S 0.729 +97 Q 0.724 +98 E 0.709 +99 A 0.686 +100 T 0.654 +101 N 0.622 +102 C 0.616 +103 S 0.650 +104 S 0.702 +105 S 0.737 +106 S 0.749 +107 S 0.746 +108 S 0.735 +109 F 0.718 +110 S 0.704 +111 S 0.702 +112 P 0.712 +113 S 0.729 +114 S 0.739 +115 A 0.736 +116 G 0.723 +117 R 0.709 +118 H 0.700 +119 V 0.687 +120 R 0.661 +121 S 0.620 +122 Y 0.576 +123 N 0.540 +124 H 0.510 +125 L 0.478 +126 Q 0.431 +127 G 0.358 +128 D 0.263 +129 V 0.169 +130 R 0.097 +131 W 0.056 +132 R 0.037 +133 R 0.032 +134 L 0.035 +135 F 0.041 +136 S 0.047 +137 F 0.049 +138 T 0.049 +139 K 0.047 +140 Y 0.046 +141 F 0.045 +142 L 0.043 +143 T 0.044 +144 I 0.050 +145 E 0.062 +146 K 0.080 +147 N 0.104 +148 G 0.128 +149 K 0.141 +150 V 0.139 +151 S 0.126 +152 G 0.109 +153 T 0.093 +154 K 0.082 +155 N 0.080 +156 E 0.088 +157 D 0.101 +158 C 0.112 +159 P 0.113 +160 Y 0.107 +161 S 0.095 +162 V 0.078 +163 L 0.062 +164 E 0.056 +165 I 0.058 +166 T 0.067 +167 S 0.077 +168 V 0.086 +169 E 0.096 +170 I 0.101 +171 G 0.096 +172 V 0.083 +173 V 0.072 +174 A 0.068 +175 V 0.068 +176 K 0.071 +177 A 0.075 +178 I 0.079 +179 N 0.081 +180 S 0.078 +181 N 0.070 +182 Y 0.060 +183 Y 0.053 +184 L 0.049 +185 A 0.052 +186 M 0.059 +187 N 0.071 +188 K 0.087 +189 K 0.108 +190 G 0.128 +191 K 0.136 +192 L 0.129 +193 Y 0.112 +194 G 0.097 +195 S 0.089 +196 K 0.087 +197 E 0.083 +198 F 0.074 +199 N 0.062 +200 N 0.051 +201 D 0.044 +202 C 0.042 +203 K 0.042 +204 L 0.045 +205 K 0.050 +206 E 0.057 +207 R 0.064 +208 I 0.071 +209 E 0.077 +210 E 0.084 +211 N 0.092 +212 G 0.095 +213 Y 0.090 +214 N 0.082 +215 T 0.075 +216 Y 0.072 +217 A 0.073 +218 S 0.077 +219 F 0.084 +220 N 0.092 +221 W 0.097 +222 Q 0.100 +223 H 0.107 +224 N 0.119 +225 G 0.131 +226 R 0.132 +227 Q 0.118 +228 M 0.099 +229 Y 0.086 +230 V 0.085 +231 A 0.096 +232 L 0.114 +233 N 0.130 +234 G 0.142 +235 K 0.149 +236 G 0.149 +237 A 0.143 +238 P 0.131 +239 R 0.117 +240 R 0.104 +241 G 0.099 +242 Q 0.106 +243 K 0.120 +244 T 0.128 +245 R 0.120 +246 R 0.103 +247 K 0.089 +248 N 0.083 +249 T 0.078 +250 S 0.071 +251 A 0.062 +252 H 0.054 +253 F 0.050 +254 L 0.054 +255 P 0.065 +256 M 0.084 +257 T 0.111 +258 I 0.146 +259 Q 0.179 +260 T 0.199 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021750.17_ENSMUST00000120411.9_GN:Fam107a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021750.17_ENSMUST00000120411.9_GN:Fam107a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c7ba0b8c78a2897f03cba4cf43550d1be9fb1bed --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021750.17_ENSMUST00000120411.9_GN:Fam107a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,173 @@ +>ENSMUSG00000021750.17|ENSMUST00000120411.9|GN:Fam107a|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.480 +2 A 0.519 +3 Q 0.575 +4 K 0.628 +5 L 0.665 +6 G 0.686 +7 E 0.696 +8 W 0.703 +9 A 0.711 +10 S 0.715 +11 A 0.720 +12 P 0.726 +13 A 0.730 +14 E 0.719 +15 A 0.693 +16 T 0.659 +17 G 0.621 +18 L 0.571 +19 Y 0.507 +20 R 0.446 +21 A 0.425 +22 V 0.453 +23 L 0.501 +24 L 0.538 +25 R 0.560 +26 S 0.563 +27 A 0.543 +28 S 0.510 +29 M 0.476 +30 Y 0.446 +31 S 0.426 +32 E 0.416 +33 I 0.404 +34 Q 0.399 +35 R 0.431 +36 E 0.502 +37 R 0.576 +38 A 0.619 +39 D 0.624 +40 I 0.607 +41 E 0.595 +42 G 0.603 +43 L 0.617 +44 M 0.615 +45 A 0.598 +46 R 0.593 +47 P 0.613 +48 E 0.641 +49 Y 0.654 +50 R 0.657 +51 E 0.665 +52 W 0.680 +53 N 0.691 +54 S 0.696 +55 E 0.701 +56 L 0.709 +57 I 0.721 +58 K 0.734 +59 P 0.747 +60 K 0.758 +61 K 0.763 +62 L 0.752 +63 L 0.718 +64 N 0.662 +65 P 0.586 +66 V 0.503 +67 K 0.442 +68 A 0.408 +69 S 0.384 +70 R 0.364 +71 S 0.356 +72 H 0.351 +73 Q 0.338 +74 E 0.323 +75 L 0.315 +76 H 0.318 +77 R 0.329 +78 E 0.332 +79 L 0.318 +80 L 0.307 +81 M 0.322 +82 N 0.355 +83 H 0.383 +84 K 0.393 +85 R 0.405 +86 G 0.441 +87 L 0.496 +88 G 0.532 +89 M 0.524 +90 D 0.476 +91 S 0.417 +92 K 0.366 +93 P 0.327 +94 E 0.296 +95 L 0.265 +96 Q 0.237 +97 R 0.214 +98 V 0.201 +99 L 0.200 +100 E 0.209 +101 H 0.216 +102 R 0.213 +103 R 0.213 +104 R 0.223 +105 N 0.235 +106 Q 0.242 +107 L 0.242 +108 I 0.232 +109 K 0.213 +110 K 0.196 +111 K 0.191 +112 E 0.195 +113 E 0.201 +114 E 0.207 +115 L 0.217 +116 E 0.230 +117 A 0.244 +118 K 0.258 +119 R 0.267 +120 M 0.269 +121 Q 0.259 +122 C 0.236 +123 P 0.203 +124 F 0.172 +125 K 0.154 +126 Q 0.149 +127 E 0.153 +128 L 0.158 +129 L 0.163 +130 R 0.170 +131 R 0.180 +132 Q 0.191 +133 Q 0.204 +134 R 0.219 +135 L 0.234 +136 N 0.248 +137 Q 0.274 +138 L 0.314 +139 E 0.358 +140 N 0.405 +141 P 0.462 +142 P 0.525 +143 Q 0.577 +144 R 0.600 +145 D 0.592 +146 E 0.563 +147 D 0.527 +148 H 0.488 +149 A 0.439 +150 P 0.381 +151 E 0.329 +152 F 0.294 +153 I 0.267 +154 K 0.237 +155 V 0.213 +156 R 0.202 +157 E 0.199 +158 N 0.198 +159 L 0.195 +160 R 0.191 +161 R 0.196 +162 I 0.217 +163 T 0.258 +164 T 0.314 +165 L 0.367 +166 T 0.400 +167 S 0.421 +168 E 0.448 +169 E 0.473 +170 R 0.472 +171 A 0.439 +172 L 0.405 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021750.17_ENSMUST00000120411.9_GN:Fam107a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:76.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021750.17_ENSMUST00000120411.9_GN:Fam107a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:76.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..86fc9923df20cfb471661e1f6803f1a2c077c7ea --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021750.17_ENSMUST00000120411.9_GN:Fam107a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:76.caid @@ -0,0 +1,249 @@ +>ENSMUSG00000021750.17|ENSMUST00000120411.9|GN:Fam107a|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:76 +1 M 0.433 +2 L 0.487 +3 Q 0.562 +4 K 0.626 +5 C 0.667 +6 L 0.690 +7 D 0.702 +8 T 0.702 +9 L 0.692 +10 P 0.691 +11 L 0.716 +12 P 0.754 +13 G 0.780 +14 A 0.784 +15 Q 0.775 +16 R 0.766 +17 L 0.762 +18 P 0.766 +19 V 0.776 +20 P 0.783 +21 L 0.779 +22 G 0.767 +23 P 0.760 +24 P 0.761 +25 H 0.766 +26 T 0.772 +27 P 0.780 +28 R 0.791 +29 R 0.799 +30 S 0.790 +31 G 0.750 +32 K 0.689 +33 Q 0.660 +34 A 0.699 +35 G 0.768 +36 S 0.814 +37 R 0.828 +38 T 0.830 +39 Q 0.837 +40 P 0.851 +41 T 0.865 +42 V 0.867 +43 T 0.856 +44 R 0.839 +45 S 0.826 +46 P 0.824 +47 A 0.833 +48 G 0.845 +49 G 0.853 +50 A 0.859 +51 A 0.864 +52 G 0.867 +53 R 0.868 +54 V 0.863 +55 T 0.851 +56 I 0.834 +57 S 0.815 +58 E 0.801 +59 K 0.796 +60 L 0.797 +61 L 0.802 +62 K 0.812 +63 P 0.829 +64 S 0.844 +65 V 0.845 +66 Q 0.833 +67 A 0.821 +68 P 0.815 +69 R 0.817 +70 W 0.816 +71 G 0.804 +72 Y 0.778 +73 T 0.751 +74 A 0.734 +75 Q 0.724 +76 G 0.713 +77 M 0.684 +78 A 0.634 +79 Q 0.605 +80 K 0.636 +81 L 0.699 +82 G 0.743 +83 E 0.758 +84 W 0.764 +85 A 0.770 +86 S 0.773 +87 A 0.772 +88 P 0.772 +89 A 0.771 +90 E 0.758 +91 A 0.733 +92 T 0.703 +93 G 0.674 +94 L 0.635 +95 Y 0.588 +96 R 0.556 +97 A 0.553 +98 V 0.571 +99 L 0.591 +100 L 0.606 +101 R 0.613 +102 S 0.605 +103 A 0.584 +104 S 0.563 +105 M 0.538 +106 Y 0.507 +107 S 0.477 +108 E 0.452 +109 I 0.426 +110 Q 0.411 +111 R 0.441 +112 E 0.517 +113 R 0.594 +114 A 0.636 +115 D 0.636 +116 I 0.610 +117 E 0.586 +118 G 0.578 +119 L 0.576 +120 M 0.566 +121 A 0.554 +122 R 0.558 +123 P 0.583 +124 E 0.606 +125 Y 0.609 +126 R 0.605 +127 E 0.615 +128 W 0.637 +129 N 0.656 +130 S 0.666 +131 E 0.672 +132 L 0.683 +133 I 0.697 +134 K 0.713 +135 P 0.728 +136 K 0.742 +137 K 0.750 +138 L 0.742 +139 L 0.710 +140 N 0.652 +141 P 0.574 +142 V 0.492 +143 K 0.434 +144 A 0.405 +145 S 0.388 +146 R 0.374 +147 S 0.370 +148 H 0.365 +149 Q 0.349 +150 E 0.329 +151 L 0.316 +152 H 0.313 +153 R 0.321 +154 E 0.323 +155 L 0.311 +156 L 0.303 +157 M 0.322 +158 N 0.361 +159 H 0.393 +160 K 0.408 +161 R 0.431 +162 G 0.481 +163 L 0.542 +164 G 0.579 +165 M 0.568 +166 D 0.519 +167 S 0.456 +168 K 0.400 +169 P 0.356 +170 E 0.318 +171 L 0.282 +172 Q 0.249 +173 R 0.224 +174 V 0.208 +175 L 0.205 +176 E 0.214 +177 H 0.220 +178 R 0.220 +179 R 0.223 +180 R 0.238 +181 N 0.254 +182 Q 0.262 +183 L 0.262 +184 I 0.252 +185 K 0.232 +186 K 0.212 +187 K 0.205 +188 E 0.207 +189 E 0.211 +190 E 0.216 +191 L 0.223 +192 E 0.234 +193 A 0.247 +194 K 0.262 +195 R 0.272 +196 M 0.273 +197 Q 0.260 +198 C 0.236 +199 P 0.204 +200 F 0.174 +201 K 0.154 +202 Q 0.150 +203 E 0.157 +204 L 0.165 +205 L 0.170 +206 R 0.178 +207 R 0.190 +208 Q 0.201 +209 Q 0.213 +210 R 0.229 +211 L 0.245 +212 N 0.259 +213 Q 0.281 +214 L 0.318 +215 E 0.360 +216 N 0.405 +217 P 0.459 +218 P 0.520 +219 Q 0.571 +220 R 0.593 +221 D 0.583 +222 E 0.550 +223 D 0.508 +224 H 0.463 +225 A 0.411 +226 P 0.352 +227 E 0.302 +228 F 0.268 +229 I 0.243 +230 K 0.221 +231 V 0.207 +232 R 0.204 +233 E 0.206 +234 N 0.209 +235 L 0.209 +236 R 0.207 +237 R 0.209 +238 I 0.225 +239 T 0.259 +240 T 0.309 +241 L 0.356 +242 T 0.384 +243 S 0.406 +244 E 0.438 +245 E 0.469 +246 R 0.474 +247 A 0.447 +248 L 0.417 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021752.15_ENSMUST00000170111.3_GN:Kctd6_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021752.15_ENSMUST00000170111.3_GN:Kctd6_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..32e2a643cc0680ca288eff9a5bd67aa61f6509bb --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021752.15_ENSMUST00000170111.3_GN:Kctd6_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,238 @@ +>ENSMUSG00000021752.15|ENSMUST00000170111.3|GN:Kctd6|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.453 +2 D 0.459 +3 N 0.474 +4 G 0.489 +5 D 0.490 +6 W 0.481 +7 G 0.476 +8 Y 0.474 +9 M 0.453 +10 M 0.395 +11 S 0.309 +12 D 0.216 +13 P 0.136 +14 V 0.077 +15 T 0.045 +16 L 0.034 +17 N 0.037 +18 V 0.047 +19 G 0.062 +20 G 0.075 +21 H 0.079 +22 L 0.072 +23 Y 0.062 +24 T 0.052 +25 T 0.045 +26 S 0.038 +27 L 0.035 +28 T 0.036 +29 T 0.041 +30 L 0.047 +31 T 0.053 +32 R 0.058 +33 Y 0.064 +34 P 0.066 +35 D 0.062 +36 S 0.054 +37 M 0.050 +38 L 0.057 +39 G 0.074 +40 A 0.093 +41 M 0.114 +42 F 0.141 +43 G 0.170 +44 G 0.189 +45 D 0.198 +46 F 0.198 +47 P 0.185 +48 T 0.161 +49 A 0.141 +50 R 0.133 +51 D 0.136 +52 P 0.141 +53 Q 0.139 +54 G 0.126 +55 N 0.107 +56 Y 0.093 +57 F 0.089 +58 I 0.092 +59 D 0.095 +60 R 0.093 +61 D 0.088 +62 G 0.080 +63 P 0.070 +64 L 0.061 +65 F 0.057 +66 R 0.055 +67 Y 0.058 +68 V 0.064 +69 L 0.066 +70 N 0.065 +71 F 0.068 +72 L 0.075 +73 R 0.079 +74 T 0.076 +75 S 0.068 +76 E 0.063 +77 L 0.065 +78 T 0.078 +79 L 0.097 +80 P 0.110 +81 L 0.110 +82 D 0.101 +83 F 0.086 +84 K 0.068 +85 E 0.052 +86 F 0.042 +87 D 0.036 +88 L 0.036 +89 L 0.044 +90 R 0.057 +91 K 0.066 +92 E 0.066 +93 A 0.059 +94 D 0.049 +95 F 0.039 +96 Y 0.035 +97 Q 0.038 +98 I 0.043 +99 E 0.045 +100 P 0.048 +101 L 0.057 +102 I 0.072 +103 Q 0.084 +104 C 0.088 +105 L 0.096 +106 N 0.121 +107 D 0.166 +108 P 0.216 +109 R 0.251 +110 P 0.265 +111 L 0.272 +112 Y 0.288 +113 P 0.309 +114 M 0.311 +115 D 0.281 +116 T 0.228 +117 F 0.169 +118 E 0.115 +119 E 0.073 +120 V 0.049 +121 V 0.041 +122 E 0.040 +123 L 0.045 +124 S 0.057 +125 S 0.076 +126 T 0.105 +127 R 0.142 +128 K 0.180 +129 L 0.213 +130 S 0.239 +131 K 0.257 +132 Y 0.269 +133 S 0.274 +134 N 0.270 +135 P 0.257 +136 V 0.237 +137 A 0.210 +138 V 0.177 +139 I 0.140 +140 I 0.104 +141 T 0.076 +142 Q 0.060 +143 L 0.051 +144 T 0.046 +145 I 0.042 +146 T 0.040 +147 T 0.041 +148 K 0.045 +149 V 0.050 +150 H 0.054 +151 S 0.057 +152 L 0.061 +153 L 0.067 +154 E 0.072 +155 G 0.071 +156 I 0.065 +157 S 0.057 +158 N 0.050 +159 Y 0.046 +160 F 0.047 +161 T 0.051 +162 K 0.059 +163 W 0.071 +164 N 0.086 +165 K 0.101 +166 H 0.119 +167 M 0.143 +168 M 0.166 +169 D 0.180 +170 T 0.181 +171 R 0.171 +172 D 0.155 +173 C 0.139 +174 Q 0.123 +175 V 0.108 +176 S 0.098 +177 F 0.096 +178 T 0.105 +179 F 0.124 +180 G 0.150 +181 P 0.174 +182 C 0.186 +183 D 0.185 +184 Y 0.175 +185 H 0.159 +186 Q 0.137 +187 E 0.113 +188 V 0.091 +189 S 0.077 +190 L 0.066 +191 R 0.056 +192 V 0.049 +193 H 0.050 +194 L 0.059 +195 M 0.072 +196 E 0.080 +197 Y 0.078 +198 I 0.072 +199 T 0.072 +200 K 0.079 +201 Q 0.084 +202 G 0.081 +203 F 0.072 +204 T 0.064 +205 I 0.064 +206 R 0.069 +207 N 0.077 +208 T 0.090 +209 R 0.111 +210 V 0.140 +211 H 0.171 +212 H 0.196 +213 M 0.208 +214 S 0.206 +215 E 0.199 +216 R 0.197 +217 A 0.196 +218 N 0.193 +219 E 0.185 +220 N 0.170 +221 T 0.145 +222 V 0.116 +223 E 0.087 +224 H 0.061 +225 N 0.042 +226 W 0.031 +227 T 0.027 +228 F 0.030 +229 C 0.046 +230 R 0.083 +231 L 0.145 +232 A 0.224 +233 R 0.304 +234 K 0.374 +235 T 0.417 +236 D 0.420 +237 D 0.405 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021752.15_ENSMUST00000170111.3_GN:Kctd6_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:56.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021752.15_ENSMUST00000170111.3_GN:Kctd6_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:56.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c7d61d79e432c3b3d4fe509ac35c455251918191 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021752.15_ENSMUST00000170111.3_GN:Kctd6_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:56.caid @@ -0,0 +1,294 @@ +>ENSMUSG00000021752.15|ENSMUST00000170111.3|GN:Kctd6|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:56 +1 M 0.338 +2 L 0.335 +3 S 0.352 +4 R 0.401 +5 S 0.462 +6 P 0.500 +7 E 0.500 +8 S 0.470 +9 S 0.433 +10 R 0.421 +11 V 0.445 +12 C 0.472 +13 L 0.470 +14 S 0.435 +15 L 0.396 +16 R 0.379 +17 T 0.385 +18 L 0.389 +19 D 0.380 +20 I 0.368 +21 I 0.368 +22 L 0.388 +23 P 0.423 +24 L 0.454 +25 V 0.471 +26 F 0.483 +27 L 0.506 +28 T 0.532 +29 A 0.544 +30 T 0.556 +31 A 0.595 +32 V 0.641 +33 G 0.668 +34 S 0.677 +35 P 0.688 +36 G 0.705 +37 K 0.719 +38 E 0.726 +39 G 0.726 +40 Q 0.718 +41 G 0.700 +42 R 0.673 +43 V 0.638 +44 P 0.601 +45 W 0.571 +46 L 0.552 +47 L 0.538 +48 S 0.525 +49 S 0.514 +50 E 0.505 +51 D 0.509 +52 A 0.531 +53 V 0.558 +54 L 0.581 +55 E 0.604 +56 Q 0.622 +57 M 0.626 +58 D 0.613 +59 N 0.593 +60 G 0.569 +61 D 0.538 +62 W 0.505 +63 G 0.480 +64 Y 0.460 +65 M 0.421 +66 M 0.348 +67 S 0.257 +68 D 0.171 +69 P 0.104 +70 V 0.059 +71 T 0.035 +72 L 0.028 +73 N 0.031 +74 V 0.041 +75 G 0.056 +76 G 0.068 +77 H 0.070 +78 L 0.061 +79 Y 0.050 +80 T 0.042 +81 T 0.036 +82 S 0.032 +83 L 0.030 +84 T 0.031 +85 T 0.036 +86 L 0.041 +87 T 0.046 +88 R 0.051 +89 Y 0.057 +90 P 0.060 +91 D 0.057 +92 S 0.050 +93 M 0.047 +94 L 0.053 +95 G 0.066 +96 A 0.082 +97 M 0.097 +98 F 0.118 +99 G 0.140 +100 G 0.155 +101 D 0.162 +102 F 0.163 +103 P 0.154 +104 T 0.136 +105 A 0.121 +106 R 0.116 +107 D 0.119 +108 P 0.124 +109 Q 0.123 +110 G 0.113 +111 N 0.098 +112 Y 0.085 +113 F 0.082 +114 I 0.085 +115 D 0.087 +116 R 0.084 +117 D 0.079 +118 G 0.071 +119 P 0.063 +120 L 0.057 +121 F 0.053 +122 R 0.052 +123 Y 0.055 +124 V 0.061 +125 L 0.063 +126 N 0.062 +127 F 0.063 +128 L 0.068 +129 R 0.071 +130 T 0.068 +131 S 0.063 +132 E 0.060 +133 L 0.064 +134 T 0.078 +135 L 0.097 +136 P 0.109 +137 L 0.109 +138 D 0.101 +139 F 0.086 +140 K 0.068 +141 E 0.053 +142 F 0.043 +143 D 0.037 +144 L 0.038 +145 L 0.046 +146 R 0.058 +147 K 0.067 +148 E 0.066 +149 A 0.058 +150 D 0.048 +151 F 0.039 +152 Y 0.036 +153 Q 0.040 +154 I 0.045 +155 E 0.047 +156 P 0.049 +157 L 0.057 +158 I 0.072 +159 Q 0.083 +160 C 0.088 +161 L 0.097 +162 N 0.126 +163 D 0.177 +164 P 0.234 +165 R 0.272 +166 P 0.284 +167 L 0.287 +168 Y 0.300 +169 P 0.318 +170 M 0.318 +171 D 0.287 +172 T 0.234 +173 F 0.175 +174 E 0.119 +175 E 0.075 +176 V 0.050 +177 V 0.042 +178 E 0.042 +179 L 0.047 +180 S 0.058 +181 S 0.078 +182 T 0.106 +183 R 0.140 +184 K 0.177 +185 L 0.208 +186 S 0.232 +187 K 0.249 +188 Y 0.261 +189 S 0.266 +190 N 0.263 +191 P 0.252 +192 V 0.234 +193 A 0.209 +194 V 0.177 +195 I 0.139 +196 I 0.104 +197 T 0.076 +198 Q 0.060 +199 L 0.051 +200 T 0.046 +201 I 0.042 +202 T 0.041 +203 T 0.042 +204 K 0.045 +205 V 0.050 +206 H 0.054 +207 S 0.058 +208 L 0.062 +209 L 0.067 +210 E 0.072 +211 G 0.070 +212 I 0.063 +213 S 0.055 +214 N 0.048 +215 Y 0.044 +216 F 0.044 +217 T 0.048 +218 K 0.055 +219 W 0.066 +220 N 0.079 +221 K 0.093 +222 H 0.112 +223 M 0.137 +224 M 0.162 +225 D 0.177 +226 T 0.178 +227 R 0.168 +228 D 0.152 +229 C 0.135 +230 Q 0.119 +231 V 0.106 +232 S 0.095 +233 F 0.092 +234 T 0.099 +235 F 0.116 +236 G 0.140 +237 P 0.162 +238 C 0.174 +239 D 0.175 +240 Y 0.166 +241 H 0.152 +242 Q 0.131 +243 E 0.108 +244 V 0.088 +245 S 0.075 +246 L 0.067 +247 R 0.058 +248 V 0.051 +249 H 0.052 +250 L 0.060 +251 M 0.073 +252 E 0.081 +253 Y 0.078 +254 I 0.072 +255 T 0.073 +256 K 0.081 +257 Q 0.087 +258 G 0.085 +259 F 0.076 +260 T 0.067 +261 I 0.066 +262 R 0.071 +263 N 0.080 +264 T 0.093 +265 R 0.113 +266 V 0.140 +267 H 0.170 +268 H 0.197 +269 M 0.211 +270 S 0.210 +271 E 0.203 +272 R 0.200 +273 A 0.199 +274 N 0.194 +275 E 0.186 +276 N 0.170 +277 T 0.145 +278 V 0.116 +279 E 0.087 +280 H 0.062 +281 N 0.043 +282 W 0.031 +283 T 0.027 +284 F 0.030 +285 C 0.046 +286 R 0.084 +287 L 0.148 +288 A 0.231 +289 R 0.318 +290 K 0.396 +291 T 0.441 +292 D 0.444 +293 D 0.426 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021832.9_ENSMUST00000022380.9_GN:Psmc6_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021832.9_ENSMUST00000022380.9_GN:Psmc6_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1179b26aea9acb778b6f7482be51ce63a004ce42 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021832.9_ENSMUST00000022380.9_GN:Psmc6_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,390 @@ +>ENSMUSG00000021832.9|ENSMUST00000022380.9|GN:Psmc6|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.375 +2 A 0.356 +3 D 0.326 +4 P 0.292 +5 R 0.259 +6 D 0.227 +7 K 0.196 +8 A 0.172 +9 L 0.164 +10 Q 0.171 +11 D 0.182 +12 Y 0.182 +13 R 0.175 +14 K 0.177 +15 K 0.198 +16 L 0.241 +17 L 0.294 +18 E 0.334 +19 H 0.350 +20 K 0.354 +21 E 0.355 +22 I 0.354 +23 D 0.354 +24 G 0.349 +25 R 0.325 +26 L 0.282 +27 K 0.240 +28 E 0.218 +29 L 0.215 +30 R 0.216 +31 E 0.220 +32 Q 0.224 +33 L 0.218 +34 K 0.203 +35 E 0.191 +36 L 0.185 +37 T 0.180 +38 K 0.180 +39 Q 0.190 +40 Y 0.203 +41 E 0.212 +42 K 0.219 +43 S 0.231 +44 E 0.253 +45 N 0.283 +46 D 0.312 +47 L 0.333 +48 K 0.353 +49 A 0.382 +50 L 0.406 +51 Q 0.405 +52 S 0.384 +53 V 0.353 +54 G 0.304 +55 Q 0.232 +56 I 0.156 +57 V 0.096 +58 G 0.061 +59 E 0.045 +60 V 0.042 +61 L 0.044 +62 K 0.045 +63 Q 0.045 +64 L 0.046 +65 T 0.046 +66 E 0.044 +67 E 0.037 +68 K 0.029 +69 F 0.025 +70 I 0.026 +71 V 0.033 +72 K 0.045 +73 A 0.066 +74 T 0.095 +75 N 0.122 +76 G 0.136 +77 P 0.129 +78 R 0.109 +79 Y 0.089 +80 V 0.075 +81 V 0.068 +82 G 0.067 +83 C 0.068 +84 R 0.066 +85 R 0.064 +86 Q 0.065 +87 L 0.067 +88 D 0.064 +89 K 0.055 +90 S 0.051 +91 K 0.055 +92 L 0.068 +93 K 0.087 +94 P 0.107 +95 G 0.120 +96 T 0.120 +97 R 0.110 +98 V 0.101 +99 A 0.099 +100 L 0.097 +101 D 0.090 +102 M 0.078 +103 T 0.071 +104 T 0.071 +105 L 0.075 +106 T 0.083 +107 I 0.092 +108 M 0.100 +109 R 0.113 +110 Y 0.145 +111 L 0.197 +112 P 0.250 +113 R 0.289 +114 E 0.302 +115 V 0.285 +116 D 0.248 +117 P 0.214 +118 L 0.197 +119 V 0.195 +120 Y 0.198 +121 N 0.204 +122 M 0.216 +123 S 0.240 +124 H 0.274 +125 E 0.316 +126 D 0.351 +127 P 0.355 +128 G 0.319 +129 N 0.258 +130 V 0.190 +131 S 0.131 +132 Y 0.092 +133 S 0.073 +134 E 0.064 +135 I 0.058 +136 G 0.055 +137 G 0.053 +138 L 0.050 +139 S 0.048 +140 E 0.049 +141 Q 0.054 +142 I 0.063 +143 R 0.072 +144 E 0.074 +145 L 0.070 +146 R 0.064 +147 E 0.061 +148 V 0.058 +149 I 0.054 +150 E 0.051 +151 L 0.050 +152 P 0.050 +153 L 0.053 +154 T 0.060 +155 N 0.068 +156 P 0.075 +157 E 0.078 +158 L 0.079 +159 F 0.082 +160 Q 0.094 +161 R 0.116 +162 V 0.144 +163 G 0.173 +164 I 0.188 +165 I 0.179 +166 P 0.150 +167 P 0.113 +168 K 0.081 +169 G 0.062 +170 C 0.053 +171 L 0.050 +172 L 0.049 +173 Y 0.050 +174 G 0.052 +175 P 0.053 +176 P 0.051 +177 G 0.050 +178 T 0.053 +179 G 0.060 +180 K 0.069 +181 T 0.082 +182 L 0.097 +183 L 0.104 +184 A 0.103 +185 R 0.100 +186 A 0.098 +187 V 0.094 +188 A 0.086 +189 S 0.078 +190 Q 0.075 +191 L 0.082 +192 D 0.091 +193 C 0.092 +194 N 0.082 +195 F 0.068 +196 L 0.059 +197 K 0.054 +198 V 0.052 +199 V 0.052 +200 S 0.061 +201 S 0.081 +202 S 0.106 +203 I 0.124 +204 V 0.127 +205 D 0.123 +206 K 0.121 +207 Y 0.123 +208 I 0.120 +209 G 0.106 +210 E 0.088 +211 S 0.074 +212 A 0.064 +213 R 0.054 +214 L 0.045 +215 I 0.038 +216 R 0.034 +217 E 0.033 +218 M 0.035 +219 F 0.039 +220 N 0.043 +221 Y 0.043 +222 A 0.041 +223 R 0.037 +224 D 0.032 +225 H 0.028 +226 Q 0.026 +227 P 0.029 +228 C 0.037 +229 I 0.042 +230 I 0.042 +231 F 0.038 +232 M 0.039 +233 D 0.044 +234 E 0.051 +235 I 0.058 +236 D 0.069 +237 A 0.085 +238 I 0.106 +239 G 0.132 +240 G 0.164 +241 R 0.204 +242 R 0.246 +243 F 0.283 +244 S 0.307 +245 E 0.308 +246 G 0.283 +247 T 0.243 +248 S 0.205 +249 A 0.181 +250 D 0.166 +251 R 0.155 +252 E 0.149 +253 I 0.145 +254 Q 0.133 +255 R 0.113 +256 T 0.096 +257 L 0.085 +258 M 0.076 +259 E 0.068 +260 L 0.061 +261 L 0.058 +262 N 0.057 +263 Q 0.060 +264 M 0.067 +265 D 0.077 +266 G 0.093 +267 F 0.112 +268 D 0.127 +269 T 0.128 +270 L 0.114 +271 H 0.091 +272 R 0.069 +273 V 0.054 +274 K 0.048 +275 M 0.049 +276 I 0.053 +277 M 0.058 +278 A 0.063 +279 T 0.069 +280 N 0.077 +281 R 0.085 +282 P 0.091 +283 D 0.093 +284 T 0.096 +285 L 0.098 +286 D 0.096 +287 P 0.093 +288 A 0.091 +289 L 0.092 +290 L 0.097 +291 R 0.103 +292 P 0.106 +293 G 0.104 +294 R 0.099 +295 L 0.094 +296 D 0.086 +297 R 0.076 +298 K 0.068 +299 I 0.065 +300 H 0.069 +301 I 0.079 +302 D 0.089 +303 L 0.096 +304 P 0.099 +305 N 0.096 +306 E 0.092 +307 Q 0.087 +308 A 0.077 +309 R 0.064 +310 L 0.056 +311 D 0.053 +312 I 0.051 +313 L 0.049 +314 K 0.051 +315 I 0.056 +316 H 0.065 +317 A 0.081 +318 G 0.100 +319 P 0.112 +320 I 0.111 +321 T 0.103 +322 K 0.100 +323 H 0.102 +324 G 0.103 +325 E 0.098 +326 I 0.085 +327 D 0.068 +328 Y 0.052 +329 E 0.045 +330 A 0.048 +331 I 0.055 +332 V 0.060 +333 K 0.062 +334 L 0.065 +335 S 0.068 +336 D 0.070 +337 G 0.071 +338 F 0.070 +339 N 0.068 +340 G 0.068 +341 A 0.071 +342 D 0.077 +343 L 0.082 +344 R 0.081 +345 N 0.077 +346 V 0.074 +347 C 0.072 +348 T 0.068 +349 E 0.062 +350 A 0.058 +351 G 0.055 +352 M 0.055 +353 F 0.058 +354 A 0.065 +355 I 0.072 +356 R 0.080 +357 A 0.087 +358 D 0.093 +359 H 0.098 +360 D 0.105 +361 F 0.110 +362 V 0.107 +363 V 0.094 +364 Q 0.078 +365 E 0.064 +366 D 0.053 +367 F 0.046 +368 M 0.041 +369 K 0.040 +370 A 0.042 +371 V 0.045 +372 R 0.052 +373 K 0.067 +374 V 0.089 +375 A 0.116 +376 D 0.146 +377 S 0.181 +378 K 0.218 +379 K 0.260 +380 L 0.305 +381 E 0.346 +382 S 0.373 +383 K 0.384 +384 L 0.383 +385 D 0.379 +386 Y 0.375 +387 K 0.370 +388 P 0.361 +389 V 0.352 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021832.9_ENSMUST00000022380.9_GN:Psmc6_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021832.9_ENSMUST00000022380.9_GN:Psmc6_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b4017e7790a30ae808bed4d23631049503f52557 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021832.9_ENSMUST00000022380.9_GN:Psmc6_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid @@ -0,0 +1,404 @@ +>ENSMUSG00000021832.9|ENSMUST00000022380.9|GN:Psmc6|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:14 +1 M 0.413 +2 A 0.442 +3 L 0.488 +4 P 0.530 +5 G 0.545 +6 I 0.529 +7 P 0.502 +8 Y 0.488 +9 E 0.489 +10 R 0.493 +11 R 0.501 +12 L 0.526 +13 L 0.557 +14 I 0.560 +15 M 0.519 +16 A 0.451 +17 D 0.383 +18 P 0.331 +19 R 0.297 +20 D 0.268 +21 K 0.235 +22 A 0.203 +23 L 0.185 +24 Q 0.184 +25 D 0.188 +26 Y 0.186 +27 R 0.180 +28 K 0.184 +29 K 0.209 +30 L 0.256 +31 L 0.309 +32 E 0.344 +33 H 0.354 +34 K 0.353 +35 E 0.354 +36 I 0.358 +37 D 0.362 +38 G 0.359 +39 R 0.336 +40 L 0.291 +41 K 0.247 +42 E 0.223 +43 L 0.221 +44 R 0.225 +45 E 0.231 +46 Q 0.234 +47 L 0.227 +48 K 0.210 +49 E 0.199 +50 L 0.195 +51 T 0.193 +52 K 0.194 +53 Q 0.202 +54 Y 0.213 +55 E 0.218 +56 K 0.221 +57 S 0.227 +58 E 0.242 +59 N 0.272 +60 D 0.309 +61 L 0.340 +62 K 0.364 +63 A 0.392 +64 L 0.414 +65 Q 0.411 +66 S 0.387 +67 V 0.354 +68 G 0.304 +69 Q 0.232 +70 I 0.155 +71 V 0.095 +72 G 0.059 +73 E 0.044 +74 V 0.041 +75 L 0.042 +76 K 0.043 +77 Q 0.043 +78 L 0.044 +79 T 0.045 +80 E 0.042 +81 E 0.036 +82 K 0.029 +83 F 0.024 +84 I 0.025 +85 V 0.032 +86 K 0.043 +87 A 0.063 +88 T 0.090 +89 N 0.117 +90 G 0.130 +91 P 0.124 +92 R 0.106 +93 Y 0.087 +94 V 0.073 +95 V 0.066 +96 G 0.065 +97 C 0.065 +98 R 0.063 +99 R 0.061 +100 Q 0.062 +101 L 0.064 +102 D 0.062 +103 K 0.054 +104 S 0.050 +105 K 0.054 +106 L 0.067 +107 K 0.086 +108 P 0.105 +109 G 0.117 +110 T 0.117 +111 R 0.107 +112 V 0.098 +113 A 0.095 +114 L 0.094 +115 D 0.086 +116 M 0.076 +117 T 0.069 +118 T 0.069 +119 L 0.074 +120 T 0.082 +121 I 0.091 +122 M 0.098 +123 R 0.111 +124 Y 0.143 +125 L 0.195 +126 P 0.250 +127 R 0.291 +128 E 0.305 +129 V 0.286 +130 D 0.248 +131 P 0.213 +132 L 0.196 +133 V 0.194 +134 Y 0.198 +135 N 0.203 +136 M 0.215 +137 S 0.239 +138 H 0.273 +139 E 0.316 +140 D 0.350 +141 P 0.354 +142 G 0.320 +143 N 0.259 +144 V 0.191 +145 S 0.132 +146 Y 0.093 +147 S 0.073 +148 E 0.065 +149 I 0.060 +150 G 0.056 +151 G 0.054 +152 L 0.051 +153 S 0.049 +154 E 0.050 +155 Q 0.056 +156 I 0.067 +157 R 0.076 +158 E 0.078 +159 L 0.072 +160 R 0.066 +161 E 0.061 +162 V 0.058 +163 I 0.055 +164 E 0.052 +165 L 0.050 +166 P 0.050 +167 L 0.054 +168 T 0.061 +169 N 0.070 +170 P 0.078 +171 E 0.081 +172 L 0.081 +173 F 0.083 +174 Q 0.095 +175 R 0.116 +176 V 0.145 +177 G 0.174 +178 I 0.189 +179 I 0.180 +180 P 0.151 +181 P 0.114 +182 K 0.082 +183 G 0.063 +184 C 0.054 +185 L 0.050 +186 L 0.050 +187 Y 0.051 +188 G 0.053 +189 P 0.053 +190 P 0.051 +191 G 0.050 +192 T 0.054 +193 G 0.060 +194 K 0.069 +195 T 0.082 +196 L 0.097 +197 L 0.104 +198 A 0.104 +199 R 0.101 +200 A 0.099 +201 V 0.095 +202 A 0.087 +203 S 0.079 +204 Q 0.076 +205 L 0.082 +206 D 0.091 +207 C 0.092 +208 N 0.081 +209 F 0.068 +210 L 0.059 +211 K 0.054 +212 V 0.052 +213 V 0.053 +214 S 0.062 +215 S 0.081 +216 S 0.106 +217 I 0.123 +218 V 0.126 +219 D 0.121 +220 K 0.119 +221 Y 0.121 +222 I 0.118 +223 G 0.105 +224 E 0.088 +225 S 0.074 +226 A 0.064 +227 R 0.055 +228 L 0.046 +229 I 0.039 +230 R 0.035 +231 E 0.035 +232 M 0.039 +233 F 0.047 +234 N 0.053 +235 Y 0.052 +236 A 0.045 +237 R 0.038 +238 D 0.033 +239 H 0.028 +240 Q 0.026 +241 P 0.030 +242 C 0.038 +243 I 0.043 +244 I 0.043 +245 F 0.039 +246 M 0.039 +247 D 0.045 +248 E 0.052 +249 I 0.059 +250 D 0.070 +251 A 0.086 +252 I 0.109 +253 G 0.135 +254 G 0.168 +255 R 0.209 +256 R 0.251 +257 F 0.288 +258 S 0.311 +259 E 0.312 +260 G 0.286 +261 T 0.245 +262 S 0.208 +263 A 0.184 +264 D 0.169 +265 R 0.157 +266 E 0.151 +267 I 0.147 +268 Q 0.135 +269 R 0.115 +270 T 0.097 +271 L 0.086 +272 M 0.078 +273 E 0.069 +274 L 0.063 +275 L 0.060 +276 N 0.059 +277 Q 0.062 +278 M 0.068 +279 D 0.079 +280 G 0.094 +281 F 0.114 +282 D 0.129 +283 T 0.130 +284 L 0.116 +285 H 0.093 +286 R 0.071 +287 V 0.056 +288 K 0.049 +289 M 0.050 +290 I 0.055 +291 M 0.059 +292 A 0.064 +293 T 0.070 +294 N 0.078 +295 R 0.087 +296 P 0.093 +297 D 0.096 +298 T 0.099 +299 L 0.101 +300 D 0.100 +301 P 0.096 +302 A 0.093 +303 L 0.095 +304 L 0.099 +305 R 0.105 +306 P 0.108 +307 G 0.106 +308 R 0.100 +309 L 0.095 +310 D 0.087 +311 R 0.077 +312 K 0.069 +313 I 0.066 +314 H 0.071 +315 I 0.080 +316 D 0.091 +317 L 0.098 +318 P 0.101 +319 N 0.098 +320 E 0.094 +321 Q 0.088 +322 A 0.078 +323 R 0.065 +324 L 0.057 +325 D 0.054 +326 I 0.052 +327 L 0.050 +328 K 0.052 +329 I 0.057 +330 H 0.066 +331 A 0.082 +332 G 0.101 +333 P 0.113 +334 I 0.112 +335 T 0.105 +336 K 0.101 +337 H 0.103 +338 G 0.103 +339 E 0.098 +340 I 0.086 +341 D 0.068 +342 Y 0.052 +343 E 0.046 +344 A 0.049 +345 I 0.056 +346 V 0.061 +347 K 0.063 +348 L 0.066 +349 S 0.069 +350 D 0.071 +351 G 0.071 +352 F 0.071 +353 N 0.069 +354 G 0.069 +355 A 0.072 +356 D 0.078 +357 L 0.082 +358 R 0.081 +359 N 0.078 +360 V 0.074 +361 C 0.072 +362 T 0.068 +363 E 0.063 +364 A 0.059 +365 G 0.056 +366 M 0.055 +367 F 0.058 +368 A 0.065 +369 I 0.072 +370 R 0.080 +371 A 0.088 +372 D 0.093 +373 H 0.098 +374 D 0.105 +375 F 0.110 +376 V 0.107 +377 V 0.094 +378 Q 0.078 +379 E 0.064 +380 D 0.054 +381 F 0.046 +382 M 0.041 +383 K 0.040 +384 A 0.042 +385 V 0.045 +386 R 0.052 +387 K 0.066 +388 V 0.088 +389 A 0.113 +390 D 0.143 +391 S 0.176 +392 K 0.212 +393 K 0.254 +394 L 0.300 +395 E 0.342 +396 S 0.371 +397 K 0.384 +398 L 0.386 +399 D 0.383 +400 Y 0.382 +401 K 0.378 +402 P 0.368 +403 V 0.359 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021890.7_ENSMUST00000022446.7_GN:Eaf1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021890.7_ENSMUST00000022446.7_GN:Eaf1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d4dc702c290d26926c39138070cee08855a04a51 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021890.7_ENSMUST00000022446.7_GN:Eaf1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,269 @@ +>ENSMUSG00000021890.7|ENSMUST00000022446.7|GN:Eaf1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.595 +2 N 0.614 +3 G 0.640 +4 T 0.654 +5 A 0.653 +6 N 0.640 +7 P 0.623 +8 L 0.607 +9 L 0.581 +10 D 0.529 +11 R 0.448 +12 E 0.362 +13 E 0.292 +14 H 0.242 +15 C 0.205 +16 L 0.184 +17 R 0.181 +18 L 0.190 +19 G 0.201 +20 E 0.206 +21 S 0.201 +22 F 0.189 +23 E 0.181 +24 K 0.185 +25 R 0.200 +26 P 0.220 +27 R 0.235 +28 A 0.236 +29 S 0.223 +30 F 0.202 +31 H 0.181 +32 T 0.163 +33 I 0.151 +34 R 0.142 +35 Y 0.132 +36 D 0.123 +37 F 0.119 +38 K 0.120 +39 P 0.125 +40 A 0.134 +41 S 0.146 +42 I 0.156 +43 D 0.156 +44 T 0.149 +45 S 0.145 +46 C 0.150 +47 E 0.151 +48 G 0.143 +49 E 0.131 +50 L 0.127 +51 Q 0.132 +52 V 0.142 +53 G 0.152 +54 K 0.154 +55 G 0.144 +56 D 0.124 +57 E 0.099 +58 V 0.074 +59 T 0.058 +60 I 0.058 +61 T 0.075 +62 L 0.104 +63 P 0.135 +64 H 0.163 +65 I 0.187 +66 P 0.204 +67 G 0.206 +68 S 0.187 +69 T 0.158 +70 P 0.134 +71 P 0.117 +72 M 0.102 +73 T 0.086 +74 V 0.075 +75 F 0.068 +76 K 0.066 +77 G 0.070 +78 N 0.082 +79 K 0.098 +80 R 0.118 +81 P 0.141 +82 Y 0.167 +83 Q 0.193 +84 K 0.209 +85 D 0.207 +86 C 0.197 +87 V 0.201 +88 L 0.213 +89 I 0.205 +90 I 0.169 +91 N 0.128 +92 H 0.103 +93 D 0.101 +94 T 0.114 +95 G 0.132 +96 E 0.142 +97 Y 0.141 +98 V 0.128 +99 L 0.112 +100 E 0.103 +101 K 0.102 +102 L 0.103 +103 S 0.100 +104 S 0.096 +105 S 0.095 +106 I 0.095 +107 Q 0.092 +108 V 0.087 +109 K 0.092 +110 K 0.124 +111 T 0.201 +112 R 0.325 +113 A 0.462 +114 E 0.567 +115 G 0.619 +116 S 0.626 +117 S 0.606 +118 K 0.568 +119 I 0.519 +120 Q 0.466 +121 A 0.435 +122 R 0.451 +123 M 0.507 +124 E 0.569 +125 Q 0.612 +126 Q 0.636 +127 P 0.653 +128 A 0.667 +129 R 0.676 +130 P 0.685 +131 P 0.699 +132 Q 0.716 +133 P 0.724 +134 S 0.713 +135 Q 0.686 +136 P 0.656 +137 P 0.634 +138 P 0.622 +139 P 0.624 +140 P 0.639 +141 P 0.663 +142 P 0.692 +143 M 0.724 +144 P 0.753 +145 F 0.773 +146 R 0.783 +147 A 0.785 +148 P 0.783 +149 T 0.779 +150 K 0.779 +151 P 0.789 +152 P 0.807 +153 A 0.826 +154 G 0.838 +155 P 0.844 +156 K 0.846 +157 T 0.845 +158 S 0.844 +159 P 0.848 +160 L 0.853 +161 K 0.852 +162 D 0.841 +163 N 0.825 +164 P 0.809 +165 S 0.797 +166 P 0.785 +167 E 0.770 +168 P 0.737 +169 Q 0.676 +170 L 0.594 +171 D 0.521 +172 D 0.473 +173 I 0.436 +174 K 0.410 +175 R 0.416 +176 E 0.455 +177 L 0.502 +178 R 0.544 +179 A 0.590 +180 E 0.642 +181 V 0.683 +182 D 0.698 +183 I 0.688 +184 I 0.662 +185 E 0.641 +186 Q 0.645 +187 M 0.679 +188 S 0.727 +189 S 0.768 +190 S 0.794 +191 S 0.808 +192 G 0.816 +193 S 0.821 +194 S 0.822 +195 S 0.819 +196 S 0.813 +197 D 0.804 +198 S 0.784 +199 E 0.737 +200 S 0.669 +201 S 0.620 +202 S 0.607 +203 G 0.603 +204 S 0.606 +205 D 0.636 +206 D 0.658 +207 D 0.643 +208 S 0.633 +209 S 0.678 +210 S 0.752 +211 S 0.804 +212 A 0.824 +213 G 0.827 +214 E 0.823 +215 D 0.817 +216 N 0.811 +217 G 0.806 +218 P 0.801 +219 A 0.791 +220 S 0.766 +221 P 0.719 +222 P 0.662 +223 Q 0.639 +224 P 0.667 +225 S 0.690 +226 H 0.667 +227 Q 0.644 +228 Q 0.679 +229 P 0.749 +230 Y 0.801 +231 N 0.818 +232 S 0.815 +233 R 0.812 +234 P 0.820 +235 A 0.836 +236 V 0.850 +237 A 0.853 +238 N 0.848 +239 G 0.835 +240 T 0.817 +241 S 0.794 +242 R 0.775 +243 P 0.769 +244 Q 0.769 +245 G 0.752 +246 S 0.708 +247 S 0.650 +248 Q 0.603 +249 L 0.574 +250 M 0.554 +251 N 0.542 +252 T 0.538 +253 L 0.531 +254 R 0.521 +255 N 0.528 +256 D 0.558 +257 L 0.597 +258 Q 0.637 +259 L 0.678 +260 S 0.714 +261 E 0.739 +262 S 0.753 +263 G 0.757 +264 S 0.747 +265 D 0.721 +266 S 0.674 +267 D 0.611 +268 D 0.560 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021890.7_ENSMUST00000022446.7_GN:Eaf1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:87.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021890.7_ENSMUST00000022446.7_GN:Eaf1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:87.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..006e66e371a6c80b3ebafa53650380cdaba9ba63 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000021890.7_ENSMUST00000022446.7_GN:Eaf1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:87.caid @@ -0,0 +1,356 @@ +>ENSMUSG00000021890.7|ENSMUST00000022446.7|GN:Eaf1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:87 +1 M 0.449 +2 A 0.480 +3 L 0.525 +4 P 0.571 +5 P 0.609 +6 L 0.639 +7 F 0.669 +8 P 0.703 +9 L 0.734 +10 G 0.742 +11 R 0.712 +12 R 0.655 +13 K 0.621 +14 S 0.642 +15 L 0.699 +16 P 0.752 +17 N 0.789 +18 A 0.810 +19 G 0.820 +20 S 0.822 +21 A 0.817 +22 A 0.808 +23 A 0.790 +24 L 0.755 +25 L 0.699 +26 P 0.635 +27 Q 0.605 +28 S 0.622 +29 L 0.636 +30 S 0.615 +31 R 0.603 +32 R 0.643 +33 G 0.702 +34 V 0.734 +35 D 0.733 +36 W 0.715 +37 F 0.703 +38 P 0.710 +39 A 0.736 +40 P 0.768 +41 G 0.794 +42 G 0.811 +43 R 0.820 +44 G 0.826 +45 L 0.831 +46 G 0.835 +47 S 0.835 +48 V 0.828 +49 R 0.815 +50 A 0.805 +51 P 0.801 +52 E 0.800 +53 R 0.795 +54 C 0.792 +55 P 0.795 +56 G 0.801 +57 S 0.802 +58 A 0.796 +59 V 0.789 +60 L 0.786 +61 R 0.787 +62 A 0.788 +63 A 0.787 +64 C 0.788 +65 A 0.794 +66 G 0.802 +67 I 0.809 +68 R 0.815 +69 G 0.820 +70 D 0.822 +71 C 0.819 +72 G 0.813 +73 R 0.806 +74 A 0.796 +75 R 0.784 +76 R 0.769 +77 A 0.755 +78 P 0.747 +79 I 0.745 +80 R 0.751 +81 V 0.766 +82 P 0.787 +83 G 0.803 +84 K 0.807 +85 C 0.801 +86 K 0.798 +87 A 0.802 +88 M 0.809 +89 N 0.807 +90 G 0.792 +91 T 0.768 +92 A 0.741 +93 N 0.715 +94 P 0.695 +95 L 0.678 +96 L 0.647 +97 D 0.584 +98 R 0.494 +99 E 0.398 +100 E 0.321 +101 H 0.263 +102 C 0.219 +103 L 0.192 +104 R 0.187 +105 L 0.201 +106 G 0.215 +107 E 0.213 +108 S 0.197 +109 F 0.178 +110 E 0.167 +111 K 0.170 +112 R 0.184 +113 P 0.203 +114 R 0.216 +115 A 0.216 +116 S 0.201 +117 F 0.180 +118 H 0.160 +119 T 0.144 +120 I 0.134 +121 R 0.125 +122 Y 0.117 +123 D 0.109 +124 F 0.105 +125 K 0.106 +126 P 0.110 +127 A 0.120 +128 S 0.133 +129 I 0.144 +130 D 0.146 +131 T 0.142 +132 S 0.144 +133 C 0.158 +134 E 0.165 +135 G 0.154 +136 E 0.134 +137 L 0.121 +138 Q 0.120 +139 V 0.127 +140 G 0.137 +141 K 0.143 +142 G 0.138 +143 D 0.121 +144 E 0.095 +145 V 0.070 +146 T 0.054 +147 I 0.053 +148 T 0.069 +149 L 0.097 +150 P 0.126 +151 H 0.152 +152 I 0.174 +153 P 0.190 +154 G 0.194 +155 S 0.180 +156 T 0.154 +157 P 0.130 +158 P 0.113 +159 M 0.097 +160 T 0.081 +161 V 0.070 +162 F 0.064 +163 K 0.062 +164 G 0.066 +165 N 0.078 +166 K 0.097 +167 R 0.119 +168 P 0.146 +169 Y 0.177 +170 Q 0.209 +171 K 0.231 +172 D 0.229 +173 C 0.216 +174 V 0.215 +175 L 0.226 +176 I 0.217 +177 I 0.178 +178 N 0.132 +179 H 0.103 +180 D 0.098 +181 T 0.111 +182 G 0.130 +183 E 0.142 +184 Y 0.143 +185 V 0.132 +186 L 0.116 +187 E 0.106 +188 K 0.106 +189 L 0.108 +190 S 0.105 +191 S 0.100 +192 S 0.097 +193 I 0.095 +194 Q 0.090 +195 V 0.085 +196 K 0.088 +197 K 0.116 +198 T 0.188 +199 R 0.310 +200 A 0.452 +201 E 0.567 +202 G 0.627 +203 S 0.639 +204 S 0.621 +205 K 0.585 +206 I 0.538 +207 Q 0.485 +208 A 0.451 +209 R 0.462 +210 M 0.513 +211 E 0.575 +212 Q 0.619 +213 Q 0.644 +214 P 0.661 +215 A 0.674 +216 R 0.683 +217 P 0.691 +218 P 0.706 +219 Q 0.724 +220 P 0.733 +221 S 0.723 +222 Q 0.696 +223 P 0.665 +224 P 0.642 +225 P 0.629 +226 P 0.629 +227 P 0.641 +228 P 0.664 +229 P 0.693 +230 M 0.726 +231 P 0.758 +232 F 0.781 +233 R 0.792 +234 A 0.795 +235 P 0.794 +236 T 0.791 +237 K 0.792 +238 P 0.801 +239 P 0.818 +240 A 0.836 +241 G 0.848 +242 P 0.854 +243 K 0.856 +244 T 0.855 +245 S 0.855 +246 P 0.858 +247 L 0.864 +248 K 0.863 +249 D 0.852 +250 N 0.837 +251 P 0.822 +252 S 0.811 +253 P 0.799 +254 E 0.782 +255 P 0.748 +256 Q 0.688 +257 L 0.609 +258 D 0.538 +259 D 0.489 +260 I 0.450 +261 K 0.421 +262 R 0.426 +263 E 0.465 +264 L 0.510 +265 R 0.551 +266 A 0.596 +267 E 0.645 +268 V 0.685 +269 D 0.700 +270 I 0.688 +271 I 0.661 +272 E 0.638 +273 Q 0.640 +274 M 0.673 +275 S 0.722 +276 S 0.766 +277 S 0.795 +278 S 0.811 +279 G 0.821 +280 S 0.827 +281 S 0.829 +282 S 0.828 +283 S 0.823 +284 D 0.816 +285 S 0.796 +286 E 0.749 +287 S 0.681 +288 S 0.631 +289 S 0.618 +290 G 0.614 +291 S 0.619 +292 D 0.649 +293 D 0.672 +294 D 0.656 +295 S 0.645 +296 S 0.691 +297 S 0.765 +298 S 0.818 +299 A 0.839 +300 G 0.840 +301 E 0.836 +302 D 0.830 +303 N 0.825 +304 G 0.823 +305 P 0.820 +306 A 0.816 +307 S 0.809 +308 P 0.803 +309 P 0.804 +310 Q 0.810 +311 P 0.808 +312 S 0.772 +313 H 0.707 +314 Q 0.666 +315 Q 0.697 +316 P 0.768 +317 Y 0.822 +318 N 0.840 +319 S 0.837 +320 R 0.832 +321 P 0.838 +322 A 0.853 +323 V 0.865 +324 A 0.869 +325 N 0.863 +326 G 0.851 +327 T 0.835 +328 S 0.815 +329 R 0.797 +330 P 0.791 +331 Q 0.790 +332 G 0.777 +333 S 0.742 +334 S 0.696 +335 Q 0.659 +336 L 0.636 +337 M 0.620 +338 N 0.611 +339 T 0.608 +340 L 0.602 +341 R 0.591 +342 N 0.593 +343 D 0.613 +344 L 0.641 +345 Q 0.671 +346 L 0.703 +347 S 0.732 +348 E 0.754 +349 S 0.768 +350 G 0.772 +351 S 0.763 +352 D 0.738 +353 S 0.693 +354 D 0.632 +355 D 0.583 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022061.9_ENSMUST00000022646.9_GN:Nkx3-1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022061.9_ENSMUST00000022646.9_GN:Nkx3-1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f30f049fbfb776931657997115af6ea2c0f54e9b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022061.9_ENSMUST00000022646.9_GN:Nkx3-1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,238 @@ +>ENSMUSG00000022061.9|ENSMUST00000022646.9|GN:Nkx3-1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.539 +2 L 0.593 +3 R 0.659 +4 V 0.701 +5 A 0.713 +6 E 0.713 +7 P 0.719 +8 R 0.735 +9 E 0.759 +10 P 0.786 +11 R 0.809 +12 V 0.822 +13 E 0.825 +14 A 0.821 +15 G 0.813 +16 G 0.799 +17 R 0.776 +18 S 0.749 +19 P 0.726 +20 W 0.718 +21 A 0.728 +22 A 0.743 +23 P 0.763 +24 P 0.787 +25 T 0.809 +26 Q 0.821 +27 S 0.821 +28 K 0.813 +29 R 0.800 +30 L 0.782 +31 T 0.756 +32 S 0.721 +33 F 0.669 +34 L 0.593 +35 I 0.513 +36 Q 0.464 +37 D 0.444 +38 I 0.436 +39 L 0.450 +40 R 0.497 +41 D 0.556 +42 R 0.607 +43 A 0.652 +44 E 0.695 +45 R 0.730 +46 H 0.761 +47 G 0.788 +48 G 0.811 +49 H 0.826 +50 S 0.833 +51 G 0.831 +52 N 0.828 +53 P 0.825 +54 Q 0.821 +55 H 0.813 +56 S 0.801 +57 P 0.790 +58 D 0.788 +59 P 0.798 +60 R 0.817 +61 R 0.832 +62 D 0.836 +63 S 0.828 +64 A 0.816 +65 P 0.812 +66 E 0.821 +67 P 0.837 +68 D 0.852 +69 K 0.862 +70 A 0.866 +71 G 0.866 +72 G 0.866 +73 R 0.868 +74 G 0.865 +75 V 0.857 +76 A 0.844 +77 P 0.832 +78 E 0.824 +79 D 0.823 +80 P 0.830 +81 P 0.848 +82 S 0.867 +83 I 0.880 +84 R 0.882 +85 H 0.879 +86 S 0.878 +87 P 0.879 +88 A 0.879 +89 E 0.875 +90 T 0.869 +91 P 0.864 +92 T 0.861 +93 E 0.859 +94 P 0.860 +95 E 0.859 +96 S 0.851 +97 D 0.834 +98 A 0.811 +99 H 0.785 +100 F 0.761 +101 E 0.745 +102 T 0.733 +103 Y 0.723 +104 L 0.722 +105 L 0.732 +106 D 0.745 +107 C 0.751 +108 E 0.751 +109 H 0.749 +110 N 0.753 +111 P 0.771 +112 G 0.795 +113 D 0.813 +114 L 0.817 +115 A 0.811 +116 S 0.802 +117 A 0.798 +118 P 0.802 +119 Q 0.813 +120 V 0.818 +121 T 0.809 +122 K 0.786 +123 Q 0.762 +124 P 0.742 +125 Q 0.725 +126 K 0.701 +127 R 0.660 +128 S 0.590 +129 R 0.500 +130 A 0.407 +131 A 0.320 +132 F 0.241 +133 S 0.174 +134 H 0.120 +135 T 0.080 +136 Q 0.058 +137 V 0.053 +138 I 0.058 +139 E 0.065 +140 L 0.069 +141 E 0.069 +142 R 0.064 +143 K 0.055 +144 F 0.048 +145 S 0.045 +146 H 0.043 +147 Q 0.040 +148 K 0.038 +149 Y 0.041 +150 L 0.044 +151 S 0.046 +152 A 0.045 +153 P 0.043 +154 E 0.040 +155 R 0.039 +156 A 0.044 +157 H 0.059 +158 L 0.080 +159 A 0.096 +160 K 0.097 +161 N 0.086 +162 L 0.073 +163 K 0.064 +164 L 0.056 +165 T 0.051 +166 E 0.049 +167 T 0.051 +168 Q 0.053 +169 V 0.050 +170 K 0.042 +171 I 0.033 +172 W 0.027 +173 F 0.024 +174 Q 0.022 +175 N 0.022 +176 R 0.026 +177 R 0.033 +178 Y 0.043 +179 K 0.058 +180 T 0.085 +181 K 0.123 +182 R 0.166 +183 K 0.220 +184 Q 0.291 +185 L 0.362 +186 S 0.406 +187 E 0.438 +188 D 0.489 +189 L 0.558 +190 G 0.617 +191 V 0.654 +192 L 0.671 +193 E 0.671 +194 K 0.656 +195 N 0.638 +196 S 0.635 +197 P 0.650 +198 L 0.673 +199 S 0.695 +200 L 0.714 +201 P 0.734 +202 A 0.753 +203 L 0.764 +204 K 0.764 +205 D 0.754 +206 D 0.740 +207 S 0.731 +208 L 0.731 +209 P 0.743 +210 S 0.760 +211 T 0.773 +212 S 0.778 +213 L 0.778 +214 V 0.773 +215 S 0.757 +216 V 0.725 +217 Y 0.683 +218 T 0.642 +219 S 0.606 +220 Y 0.574 +221 P 0.547 +222 Y 0.530 +223 Y 0.534 +224 P 0.554 +225 Y 0.574 +226 L 0.591 +227 Y 0.618 +228 C 0.660 +229 L 0.699 +230 G 0.715 +231 S 0.704 +232 W 0.682 +233 H 0.665 +234 P 0.656 +235 S 0.629 +236 F 0.571 +237 W 0.515 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022061.9_ENSMUST00000022646.9_GN:Nkx3-1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022061.9_ENSMUST00000022646.9_GN:Nkx3-1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6c35d49f7608227e1a3a16ee55f17e8af036b81c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022061.9_ENSMUST00000022646.9_GN:Nkx3-1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid @@ -0,0 +1,257 @@ +>ENSMUSG00000022061.9|ENSMUST00000022646.9|GN:Nkx3-1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:19 +1 M 0.554 +2 A 0.602 +3 I 0.660 +4 S 0.700 +5 A 0.719 +6 R 0.729 +7 G 0.748 +8 P 0.781 +9 V 0.817 +10 I 0.842 +11 A 0.856 +12 K 0.859 +13 A 0.853 +14 A 0.842 +15 R 0.830 +16 S 0.825 +17 G 0.827 +18 G 0.835 +19 G 0.845 +20 M 0.854 +21 L 0.858 +22 R 0.857 +23 V 0.846 +24 A 0.828 +25 E 0.811 +26 P 0.803 +27 R 0.806 +28 E 0.819 +29 P 0.837 +30 R 0.854 +31 V 0.864 +32 E 0.866 +33 A 0.862 +34 G 0.852 +35 G 0.835 +36 R 0.811 +37 S 0.782 +38 P 0.760 +39 W 0.755 +40 A 0.763 +41 A 0.773 +42 P 0.785 +43 P 0.804 +44 T 0.824 +45 Q 0.836 +46 S 0.838 +47 K 0.833 +48 R 0.824 +49 L 0.811 +50 T 0.791 +51 S 0.761 +52 F 0.715 +53 L 0.650 +54 I 0.582 +55 Q 0.538 +56 D 0.517 +57 I 0.508 +58 L 0.524 +59 R 0.571 +60 D 0.624 +61 R 0.663 +62 A 0.695 +63 E 0.727 +64 R 0.757 +65 H 0.783 +66 G 0.807 +67 G 0.828 +68 H 0.843 +69 S 0.850 +70 G 0.849 +71 N 0.846 +72 P 0.842 +73 Q 0.837 +74 H 0.828 +75 S 0.814 +76 P 0.800 +77 D 0.796 +78 P 0.805 +79 R 0.822 +80 R 0.836 +81 D 0.840 +82 S 0.832 +83 A 0.820 +84 P 0.815 +85 E 0.822 +86 P 0.837 +87 D 0.852 +88 K 0.861 +89 A 0.865 +90 G 0.865 +91 G 0.866 +92 R 0.868 +93 G 0.867 +94 V 0.860 +95 A 0.848 +96 P 0.837 +97 E 0.828 +98 D 0.824 +99 P 0.830 +100 P 0.847 +101 S 0.866 +102 I 0.877 +103 R 0.878 +104 H 0.874 +105 S 0.871 +106 P 0.872 +107 A 0.872 +108 E 0.867 +109 T 0.860 +110 P 0.854 +111 T 0.850 +112 E 0.848 +113 P 0.848 +114 E 0.847 +115 S 0.839 +116 D 0.821 +117 A 0.796 +118 H 0.767 +119 F 0.741 +120 E 0.724 +121 T 0.712 +122 Y 0.701 +123 L 0.702 +124 L 0.716 +125 D 0.733 +126 C 0.743 +127 E 0.746 +128 H 0.745 +129 N 0.750 +130 P 0.768 +131 G 0.794 +132 D 0.814 +133 L 0.821 +134 A 0.816 +135 S 0.807 +136 A 0.802 +137 P 0.806 +138 Q 0.817 +139 V 0.822 +140 T 0.814 +141 K 0.792 +142 Q 0.769 +143 P 0.750 +144 Q 0.732 +145 K 0.708 +146 R 0.666 +147 S 0.596 +148 R 0.507 +149 A 0.413 +150 A 0.324 +151 F 0.243 +152 S 0.174 +153 H 0.120 +154 T 0.080 +155 Q 0.058 +156 V 0.053 +157 I 0.058 +158 E 0.065 +159 L 0.071 +160 E 0.072 +161 R 0.068 +162 K 0.059 +163 F 0.050 +164 S 0.046 +165 H 0.043 +166 Q 0.040 +167 K 0.039 +168 Y 0.041 +169 L 0.044 +170 S 0.046 +171 A 0.045 +172 P 0.042 +173 E 0.039 +174 R 0.038 +175 A 0.043 +176 H 0.059 +177 L 0.081 +178 A 0.098 +179 K 0.099 +180 N 0.088 +181 L 0.074 +182 K 0.063 +183 L 0.056 +184 T 0.051 +185 E 0.049 +186 T 0.051 +187 Q 0.053 +188 V 0.050 +189 K 0.042 +190 I 0.033 +191 W 0.027 +192 F 0.024 +193 Q 0.022 +194 N 0.022 +195 R 0.026 +196 R 0.034 +197 Y 0.043 +198 K 0.058 +199 T 0.084 +200 K 0.122 +201 R 0.166 +202 K 0.220 +203 Q 0.293 +204 L 0.364 +205 S 0.407 +206 E 0.437 +207 D 0.486 +208 L 0.554 +209 G 0.613 +210 V 0.651 +211 L 0.669 +212 E 0.669 +213 K 0.654 +214 N 0.637 +215 S 0.634 +216 P 0.651 +217 L 0.675 +218 S 0.696 +219 L 0.714 +220 P 0.734 +221 A 0.754 +222 L 0.767 +223 K 0.768 +224 D 0.759 +225 D 0.746 +226 S 0.737 +227 L 0.738 +228 P 0.748 +229 S 0.765 +230 T 0.777 +231 S 0.782 +232 L 0.782 +233 V 0.778 +234 S 0.762 +235 V 0.731 +236 Y 0.691 +237 T 0.650 +238 S 0.613 +239 Y 0.580 +240 P 0.554 +241 Y 0.539 +242 Y 0.545 +243 P 0.567 +244 Y 0.589 +245 L 0.608 +246 Y 0.634 +247 C 0.673 +248 L 0.709 +249 G 0.722 +250 S 0.711 +251 W 0.688 +252 H 0.671 +253 P 0.662 +254 S 0.636 +255 F 0.579 +256 W 0.524 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022109.7_ENSMUST00000022705.7_GN:Med4_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022109.7_ENSMUST00000022705.7_GN:Med4_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1cabb2943ba58532d25a7a062221a2c9ea495ba3 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022109.7_ENSMUST00000022705.7_GN:Med4_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,271 @@ +>ENSMUSG00000022109.7|ENSMUST00000022705.7|GN:Med4|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.432 +2 A 0.474 +3 A 0.533 +4 S 0.583 +5 S 0.616 +6 S 0.636 +7 G 0.649 +8 E 0.653 +9 K 0.651 +10 E 0.652 +11 K 0.663 +12 E 0.679 +13 R 0.693 +14 M 0.705 +15 G 0.720 +16 G 0.732 +17 V 0.737 +18 S 0.733 +19 G 0.722 +20 M 0.708 +21 A 0.691 +22 G 0.662 +23 L 0.598 +24 G 0.488 +25 S 0.360 +26 T 0.260 +27 R 0.207 +28 E 0.189 +29 R 0.174 +30 L 0.151 +31 L 0.131 +32 S 0.121 +33 A 0.122 +34 L 0.138 +35 E 0.161 +36 D 0.172 +37 L 0.165 +38 E 0.150 +39 V 0.134 +40 L 0.118 +41 S 0.105 +42 R 0.093 +43 E 0.080 +44 L 0.070 +45 I 0.072 +46 E 0.086 +47 M 0.100 +48 L 0.112 +49 A 0.122 +50 I 0.134 +51 S 0.149 +52 R 0.160 +53 N 0.161 +54 Q 0.155 +55 K 0.148 +56 L 0.141 +57 L 0.134 +58 Q 0.133 +59 L 0.139 +60 E 0.145 +61 E 0.144 +62 E 0.136 +63 N 0.132 +64 Q 0.135 +65 V 0.144 +66 L 0.155 +67 E 0.162 +68 L 0.160 +69 L 0.157 +70 I 0.161 +71 H 0.180 +72 R 0.208 +73 D 0.229 +74 G 0.231 +75 D 0.220 +76 F 0.211 +77 Q 0.203 +78 E 0.186 +79 L 0.162 +80 M 0.142 +81 K 0.133 +82 L 0.133 +83 A 0.140 +84 L 0.152 +85 N 0.160 +86 Q 0.160 +87 G 0.154 +88 K 0.148 +89 V 0.151 +90 H 0.170 +91 H 0.199 +92 E 0.217 +93 M 0.216 +94 Q 0.208 +95 A 0.211 +96 L 0.228 +97 E 0.253 +98 K 0.278 +99 E 0.297 +100 V 0.305 +101 E 0.299 +102 K 0.279 +103 R 0.257 +104 D 0.252 +105 S 0.267 +106 D 0.279 +107 I 0.274 +108 Q 0.260 +109 Q 0.246 +110 L 0.235 +111 Q 0.232 +112 K 0.243 +113 Q 0.255 +114 L 0.260 +115 K 0.263 +116 E 0.260 +117 A 0.245 +118 E 0.229 +119 Q 0.221 +120 I 0.214 +121 L 0.205 +122 A 0.201 +123 T 0.202 +124 A 0.196 +125 V 0.184 +126 Y 0.180 +127 Q 0.183 +128 A 0.184 +129 K 0.180 +130 E 0.171 +131 K 0.160 +132 L 0.156 +133 K 0.162 +134 S 0.167 +135 I 0.166 +136 E 0.171 +137 K 0.190 +138 A 0.213 +139 R 0.236 +140 K 0.264 +141 G 0.297 +142 A 0.319 +143 I 0.311 +144 S 0.271 +145 S 0.221 +146 E 0.184 +147 E 0.166 +148 I 0.158 +149 I 0.154 +150 K 0.158 +151 Y 0.168 +152 A 0.170 +153 H 0.165 +154 R 0.166 +155 I 0.188 +156 S 0.222 +157 A 0.255 +158 S 0.283 +159 N 0.320 +160 A 0.370 +161 V 0.424 +162 C 0.471 +163 A 0.507 +164 P 0.527 +165 L 0.524 +166 T 0.496 +167 W 0.461 +168 V 0.444 +169 P 0.442 +170 G 0.427 +171 D 0.394 +172 P 0.358 +173 R 0.336 +174 R 0.346 +175 P 0.388 +176 Y 0.436 +177 P 0.454 +178 T 0.438 +179 D 0.412 +180 L 0.397 +181 E 0.387 +182 M 0.373 +183 R 0.358 +184 S 0.362 +185 G 0.391 +186 L 0.428 +187 L 0.464 +188 G 0.516 +189 Q 0.585 +190 M 0.643 +191 N 0.669 +192 N 0.678 +193 P 0.696 +194 S 0.726 +195 T 0.758 +196 S 0.781 +197 G 0.795 +198 V 0.800 +199 N 0.795 +200 G 0.782 +201 H 0.769 +202 L 0.770 +203 P 0.788 +204 G 0.815 +205 D 0.836 +206 A 0.843 +207 L 0.839 +208 A 0.831 +209 A 0.826 +210 G 0.819 +211 R 0.810 +212 L 0.804 +213 P 0.803 +214 D 0.802 +215 V 0.791 +216 L 0.766 +217 A 0.735 +218 P 0.710 +219 Q 0.696 +220 Y 0.696 +221 P 0.710 +222 W 0.736 +223 Q 0.768 +224 S 0.793 +225 N 0.809 +226 D 0.817 +227 M 0.824 +228 S 0.826 +229 V 0.821 +230 N 0.802 +231 M 0.774 +232 L 0.749 +233 P 0.745 +234 P 0.763 +235 N 0.790 +236 H 0.808 +237 S 0.813 +238 S 0.808 +239 D 0.799 +240 F 0.789 +241 L 0.773 +242 L 0.751 +243 E 0.728 +244 P 0.720 +245 P 0.733 +246 G 0.755 +247 H 0.772 +248 N 0.778 +249 K 0.777 +250 E 0.773 +251 N 0.770 +252 E 0.768 +253 D 0.763 +254 D 0.745 +255 V 0.700 +256 E 0.637 +257 V 0.593 +258 M 0.585 +259 S 0.585 +260 T 0.592 +261 D 0.622 +262 S 0.645 +263 S 0.630 +264 S 0.618 +265 S 0.653 +266 S 0.702 +267 S 0.714 +268 D 0.680 +269 S 0.621 +270 D 0.575 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022109.7_ENSMUST00000022705.7_GN:Med4_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022109.7_ENSMUST00000022705.7_GN:Med4_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9f5889d46fdac6e74b751b5bcf1c12fe7077120b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022109.7_ENSMUST00000022705.7_GN:Med4_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid @@ -0,0 +1,280 @@ +>ENSMUSG00000022109.7|ENSMUST00000022705.7|GN:Med4|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:9 +1 M 0.371 +2 R 0.408 +3 R 0.470 +4 L 0.539 +5 V 0.594 +6 V 0.632 +7 S 0.659 +8 G 0.676 +9 A 0.680 +10 M 0.682 +11 A 0.691 +12 A 0.702 +13 S 0.703 +14 S 0.700 +15 S 0.699 +16 G 0.697 +17 E 0.691 +18 K 0.687 +19 E 0.693 +20 K 0.706 +21 E 0.721 +22 R 0.734 +23 M 0.746 +24 G 0.755 +25 G 0.760 +26 V 0.758 +27 S 0.750 +28 G 0.735 +29 M 0.716 +30 A 0.698 +31 G 0.668 +32 L 0.602 +33 G 0.491 +34 S 0.365 +35 T 0.266 +36 R 0.212 +37 E 0.192 +38 R 0.177 +39 L 0.157 +40 L 0.140 +41 S 0.135 +42 A 0.143 +43 L 0.166 +44 E 0.193 +45 D 0.202 +46 L 0.191 +47 E 0.172 +48 V 0.152 +49 L 0.133 +50 S 0.117 +51 R 0.104 +52 E 0.088 +53 L 0.076 +54 I 0.076 +55 E 0.088 +56 M 0.100 +57 L 0.110 +58 A 0.118 +59 I 0.129 +60 S 0.143 +61 R 0.154 +62 N 0.155 +63 Q 0.150 +64 K 0.144 +65 L 0.138 +66 L 0.131 +67 Q 0.130 +68 L 0.138 +69 E 0.146 +70 E 0.145 +71 E 0.138 +72 N 0.134 +73 Q 0.137 +74 V 0.147 +75 L 0.160 +76 E 0.168 +77 L 0.168 +78 L 0.164 +79 I 0.166 +80 H 0.182 +81 R 0.209 +82 D 0.230 +83 G 0.232 +84 D 0.219 +85 F 0.208 +86 Q 0.199 +87 E 0.182 +88 L 0.158 +89 M 0.139 +90 K 0.130 +91 L 0.129 +92 A 0.136 +93 L 0.148 +94 N 0.156 +95 Q 0.156 +96 G 0.150 +97 K 0.145 +98 V 0.149 +99 H 0.168 +100 H 0.196 +101 E 0.213 +102 M 0.210 +103 Q 0.201 +104 A 0.203 +105 L 0.219 +106 E 0.242 +107 K 0.264 +108 E 0.279 +109 V 0.285 +110 E 0.279 +111 K 0.262 +112 R 0.243 +113 D 0.241 +114 S 0.257 +115 D 0.270 +116 I 0.267 +117 Q 0.255 +118 Q 0.243 +119 L 0.232 +120 Q 0.230 +121 K 0.241 +122 Q 0.255 +123 L 0.263 +124 K 0.266 +125 E 0.264 +126 A 0.248 +127 E 0.231 +128 Q 0.222 +129 I 0.216 +130 L 0.207 +131 A 0.203 +132 T 0.203 +133 A 0.196 +134 V 0.184 +135 Y 0.180 +136 Q 0.184 +137 A 0.185 +138 K 0.181 +139 E 0.172 +140 K 0.161 +141 L 0.157 +142 K 0.163 +143 S 0.169 +144 I 0.169 +145 E 0.175 +146 K 0.193 +147 A 0.217 +148 R 0.240 +149 K 0.268 +150 G 0.302 +151 A 0.325 +152 I 0.318 +153 S 0.279 +154 S 0.228 +155 E 0.190 +156 E 0.172 +157 I 0.162 +158 I 0.157 +159 K 0.161 +160 Y 0.170 +161 A 0.174 +162 H 0.169 +163 R 0.171 +164 I 0.193 +165 S 0.228 +166 A 0.260 +167 S 0.288 +168 N 0.324 +169 A 0.374 +170 V 0.427 +171 C 0.473 +172 A 0.508 +173 P 0.528 +174 L 0.525 +175 T 0.496 +176 W 0.461 +177 V 0.447 +178 P 0.445 +179 G 0.431 +180 D 0.397 +181 P 0.359 +182 R 0.335 +183 R 0.342 +184 P 0.384 +185 Y 0.432 +186 P 0.453 +187 T 0.438 +188 D 0.414 +189 L 0.399 +190 E 0.389 +191 M 0.374 +192 R 0.358 +193 S 0.361 +194 G 0.388 +195 L 0.424 +196 L 0.460 +197 G 0.511 +198 Q 0.580 +199 M 0.638 +200 N 0.665 +201 N 0.675 +202 P 0.693 +203 S 0.724 +204 T 0.756 +205 S 0.779 +206 G 0.793 +207 V 0.798 +208 N 0.794 +209 G 0.781 +210 H 0.768 +211 L 0.769 +212 P 0.786 +213 G 0.813 +214 D 0.834 +215 A 0.842 +216 L 0.837 +217 A 0.830 +218 A 0.824 +219 G 0.817 +220 R 0.808 +221 L 0.802 +222 P 0.802 +223 D 0.801 +224 V 0.791 +225 L 0.766 +226 A 0.736 +227 P 0.711 +228 Q 0.697 +229 Y 0.697 +230 P 0.711 +231 W 0.736 +232 Q 0.767 +233 S 0.793 +234 N 0.809 +235 D 0.818 +236 M 0.824 +237 S 0.827 +238 V 0.822 +239 N 0.803 +240 M 0.774 +241 L 0.749 +242 P 0.744 +243 P 0.763 +244 N 0.789 +245 H 0.808 +246 S 0.813 +247 S 0.808 +248 D 0.799 +249 F 0.789 +250 L 0.773 +251 L 0.751 +252 E 0.728 +253 P 0.720 +254 P 0.732 +255 G 0.754 +256 H 0.771 +257 N 0.778 +258 K 0.777 +259 E 0.773 +260 N 0.770 +261 E 0.768 +262 D 0.764 +263 D 0.747 +264 V 0.703 +265 E 0.640 +266 V 0.596 +267 M 0.587 +268 S 0.587 +269 T 0.594 +270 D 0.624 +271 S 0.647 +272 S 0.632 +273 S 0.620 +274 S 0.654 +275 S 0.704 +276 S 0.716 +277 D 0.682 +278 S 0.623 +279 D 0.577 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022516.11_ENSMUST00000230931.2_GN:Nudt16l1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022516.11_ENSMUST00000230931.2_GN:Nudt16l1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9b8629e2422c8e785abaeca25ee44b2356b23b15 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022516.11_ENSMUST00000230931.2_GN:Nudt16l1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,212 @@ +>ENSMUSG00000022516.11|ENSMUST00000230931.2|GN:Nudt16l1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.392 +2 S 0.387 +3 T 0.382 +4 T 0.375 +5 T 0.355 +6 V 0.317 +7 P 0.264 +8 E 0.207 +9 L 0.157 +10 K 0.118 +11 Q 0.093 +12 I 0.080 +13 S 0.077 +14 R 0.080 +15 E 0.081 +16 E 0.074 +17 A 0.063 +18 M 0.060 +19 R 0.066 +20 L 0.078 +21 G 0.089 +22 P 0.094 +23 G 0.091 +24 W 0.079 +25 S 0.063 +26 H 0.048 +27 S 0.037 +28 C 0.029 +29 H 0.024 +30 A 0.021 +31 M 0.021 +32 L 0.025 +33 Y 0.035 +34 A 0.054 +35 A 0.077 +36 N 0.098 +37 P 0.114 +38 G 0.124 +39 Q 0.131 +40 L 0.139 +41 F 0.154 +42 G 0.172 +43 R 0.184 +44 I 0.178 +45 P 0.150 +46 M 0.108 +47 R 0.071 +48 F 0.049 +49 S 0.042 +50 V 0.043 +51 L 0.048 +52 M 0.055 +53 Q 0.065 +54 M 0.077 +55 R 0.088 +56 F 0.099 +57 D 0.109 +58 G 0.113 +59 L 0.107 +60 L 0.096 +61 G 0.088 +62 F 0.087 +63 P 0.086 +64 G 0.082 +65 G 0.077 +66 F 0.070 +67 V 0.063 +68 D 0.057 +69 R 0.059 +70 R 0.068 +71 F 0.076 +72 W 0.078 +73 S 0.075 +74 L 0.079 +75 E 0.091 +76 D 0.107 +77 G 0.118 +78 L 0.117 +79 N 0.109 +80 R 0.105 +81 V 0.106 +82 L 0.100 +83 G 0.088 +84 L 0.079 +85 G 0.081 +86 L 0.092 +87 G 0.103 +88 G 0.104 +89 L 0.096 +90 R 0.085 +91 L 0.070 +92 T 0.055 +93 E 0.045 +94 A 0.040 +95 D 0.035 +96 Y 0.028 +97 L 0.022 +98 S 0.019 +99 S 0.020 +100 H 0.025 +101 L 0.034 +102 T 0.048 +103 E 0.067 +104 G 0.086 +105 P 0.101 +106 H 0.106 +107 R 0.102 +108 V 0.088 +109 V 0.068 +110 A 0.048 +111 H 0.034 +112 L 0.026 +113 Y 0.023 +114 A 0.025 +115 R 0.029 +116 Q 0.033 +117 L 0.034 +118 T 0.033 +119 L 0.031 +120 E 0.031 +121 Q 0.037 +122 L 0.050 +123 H 0.067 +124 A 0.079 +125 V 0.081 +126 E 0.076 +127 I 0.071 +128 S 0.069 +129 A 0.069 +130 V 0.070 +131 H 0.071 +132 S 0.075 +133 R 0.082 +134 D 0.093 +135 H 0.105 +136 G 0.110 +137 L 0.104 +138 E 0.092 +139 V 0.082 +140 L 0.077 +141 G 0.072 +142 L 0.065 +143 V 0.058 +144 R 0.056 +145 V 0.056 +146 P 0.055 +147 L 0.054 +148 Y 0.058 +149 T 0.071 +150 Q 0.088 +151 K 0.103 +152 D 0.119 +153 R 0.136 +154 V 0.148 +155 G 0.147 +156 G 0.134 +157 F 0.115 +158 P 0.096 +159 N 0.082 +160 F 0.077 +161 L 0.078 +162 S 0.081 +163 N 0.081 +164 A 0.077 +165 F 0.070 +166 V 0.062 +167 S 0.060 +168 T 0.062 +169 A 0.061 +170 K 0.053 +171 Y 0.042 +172 Q 0.036 +173 L 0.032 +174 L 0.029 +175 F 0.027 +176 A 0.027 +177 L 0.030 +178 K 0.034 +179 V 0.039 +180 L 0.045 +181 N 0.053 +182 M 0.061 +183 M 0.071 +184 P 0.080 +185 S 0.083 +186 E 0.077 +187 K 0.069 +188 L 0.067 +189 A 0.073 +190 E 0.080 +191 A 0.084 +192 L 0.086 +193 A 0.094 +194 S 0.106 +195 A 0.113 +196 T 0.105 +197 E 0.089 +198 K 0.080 +199 Q 0.084 +200 K 0.096 +201 K 0.103 +202 A 0.102 +203 L 0.102 +204 E 0.107 +205 K 0.122 +206 L 0.152 +207 L 0.202 +208 P 0.265 +209 P 0.317 +210 S 0.339 +211 S 0.340 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022516.11_ENSMUST00000230931.2_GN:Nudt16l1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022516.11_ENSMUST00000230931.2_GN:Nudt16l1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9956dba0bac8f43b97bec4eebe2272311eda6e71 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022516.11_ENSMUST00000230931.2_GN:Nudt16l1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid @@ -0,0 +1,224 @@ +>ENSMUSG00000022516.11|ENSMUST00000230931.2|GN:Nudt16l1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:12 +1 M 0.304 +2 L 0.311 +3 V 0.326 +4 W 0.346 +5 A 0.361 +6 V 0.363 +7 G 0.354 +8 L 0.347 +9 E 0.349 +10 H 0.356 +11 I 0.361 +12 K 0.359 +13 M 0.355 +14 S 0.350 +15 T 0.346 +16 T 0.341 +17 T 0.328 +18 V 0.299 +19 P 0.253 +20 E 0.200 +21 L 0.153 +22 K 0.117 +23 Q 0.093 +24 I 0.080 +25 S 0.077 +26 R 0.079 +27 E 0.078 +28 E 0.070 +29 A 0.060 +30 M 0.058 +31 R 0.065 +32 L 0.076 +33 G 0.086 +34 P 0.089 +35 G 0.086 +36 W 0.076 +37 S 0.062 +38 H 0.049 +39 S 0.038 +40 C 0.031 +41 H 0.025 +42 A 0.022 +43 M 0.021 +44 L 0.025 +45 Y 0.036 +46 A 0.055 +47 A 0.078 +48 N 0.100 +49 P 0.116 +50 G 0.126 +51 Q 0.132 +52 L 0.140 +53 F 0.154 +54 G 0.172 +55 R 0.182 +56 I 0.174 +57 P 0.144 +58 M 0.103 +59 R 0.067 +60 F 0.047 +61 S 0.040 +62 V 0.041 +63 L 0.045 +64 M 0.051 +65 Q 0.059 +66 M 0.069 +67 R 0.079 +68 F 0.090 +69 D 0.101 +70 G 0.107 +71 L 0.102 +72 L 0.093 +73 G 0.087 +74 F 0.087 +75 P 0.086 +76 G 0.082 +77 G 0.076 +78 F 0.068 +79 V 0.060 +80 D 0.055 +81 R 0.057 +82 R 0.067 +83 F 0.076 +84 W 0.077 +85 S 0.075 +86 L 0.078 +87 E 0.091 +88 D 0.107 +89 G 0.117 +90 L 0.115 +91 N 0.107 +92 R 0.103 +93 V 0.104 +94 L 0.098 +95 G 0.086 +96 L 0.077 +97 G 0.080 +98 L 0.090 +99 G 0.101 +100 G 0.102 +101 L 0.096 +102 R 0.085 +103 L 0.071 +104 T 0.055 +105 E 0.044 +106 A 0.039 +107 D 0.034 +108 Y 0.028 +109 L 0.022 +110 S 0.019 +111 S 0.019 +112 H 0.024 +113 L 0.032 +114 T 0.045 +115 E 0.064 +116 G 0.084 +117 P 0.099 +118 H 0.105 +119 R 0.102 +120 V 0.089 +121 V 0.069 +122 A 0.049 +123 H 0.035 +124 L 0.026 +125 Y 0.023 +126 A 0.025 +127 R 0.029 +128 Q 0.033 +129 L 0.034 +130 T 0.033 +131 L 0.031 +132 E 0.031 +133 Q 0.037 +134 L 0.050 +135 H 0.067 +136 A 0.080 +137 V 0.082 +138 E 0.078 +139 I 0.074 +140 S 0.072 +141 A 0.071 +142 V 0.072 +143 H 0.074 +144 S 0.078 +145 R 0.085 +146 D 0.096 +147 H 0.108 +148 G 0.112 +149 L 0.106 +150 E 0.093 +151 V 0.083 +152 L 0.078 +153 G 0.073 +154 L 0.066 +155 V 0.059 +156 R 0.057 +157 V 0.058 +158 P 0.057 +159 L 0.056 +160 Y 0.061 +161 T 0.074 +162 Q 0.090 +163 K 0.106 +164 D 0.122 +165 R 0.138 +166 V 0.149 +167 G 0.148 +168 G 0.134 +169 F 0.114 +170 P 0.094 +171 N 0.080 +172 F 0.075 +173 L 0.077 +174 S 0.080 +175 N 0.081 +176 A 0.077 +177 F 0.070 +178 V 0.063 +179 S 0.060 +180 T 0.063 +181 A 0.062 +182 K 0.054 +183 Y 0.043 +184 Q 0.036 +185 L 0.032 +186 L 0.029 +187 F 0.027 +188 A 0.028 +189 L 0.031 +190 K 0.034 +191 V 0.038 +192 L 0.044 +193 N 0.052 +194 M 0.061 +195 M 0.071 +196 P 0.081 +197 S 0.084 +198 E 0.079 +199 K 0.070 +200 L 0.067 +201 A 0.072 +202 E 0.079 +203 A 0.082 +204 L 0.085 +205 A 0.093 +206 S 0.107 +207 A 0.115 +208 T 0.108 +209 E 0.092 +210 K 0.083 +211 Q 0.087 +212 K 0.099 +213 K 0.106 +214 A 0.105 +215 L 0.103 +216 E 0.109 +217 K 0.123 +218 L 0.153 +219 L 0.203 +220 P 0.266 +221 P 0.318 +222 S 0.341 +223 S 0.343 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022589.10_ENSMUST00000238900.3_GN:Cyp11b2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022589.10_ENSMUST00000238900.3_GN:Cyp11b2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1c940e1627060b49b68d965dd602856129c2dace --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022589.10_ENSMUST00000238900.3_GN:Cyp11b2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,501 @@ +>ENSMUSG00000022589.10|ENSMUST00000238900.3|GN:Cyp11b2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.327 +2 A 0.341 +3 L 0.368 +4 R 0.396 +5 V 0.409 +6 T 0.406 +7 A 0.401 +8 D 0.395 +9 V 0.377 +10 W 0.354 +11 L 0.346 +12 A 0.356 +13 R 0.363 +14 P 0.348 +15 W 0.324 +16 Q 0.323 +17 C 0.349 +18 L 0.378 +19 H 0.405 +20 R 0.443 +21 T 0.489 +22 R 0.533 +23 A 0.579 +24 L 0.625 +25 G 0.660 +26 T 0.674 +27 T 0.669 +28 A 0.652 +29 T 0.628 +30 L 0.599 +31 A 0.563 +32 P 0.520 +33 K 0.467 +34 T 0.400 +35 L 0.329 +36 Q 0.267 +37 P 0.224 +38 F 0.193 +39 E 0.168 +40 A 0.150 +41 I 0.134 +42 P 0.118 +43 Q 0.107 +44 Y 0.105 +45 S 0.106 +46 R 0.102 +47 N 0.090 +48 K 0.072 +49 W 0.058 +50 L 0.049 +51 K 0.047 +52 M 0.048 +53 I 0.054 +54 Q 0.068 +55 I 0.086 +56 L 0.105 +57 R 0.126 +58 E 0.147 +59 Q 0.163 +60 G 0.174 +61 Q 0.177 +62 E 0.165 +63 N 0.137 +64 L 0.108 +65 H 0.088 +66 L 0.074 +67 E 0.062 +68 M 0.053 +69 H 0.048 +70 Q 0.042 +71 V 0.036 +72 F 0.030 +73 R 0.029 +74 E 0.032 +75 L 0.035 +76 G 0.033 +77 P 0.028 +78 I 0.023 +79 F 0.021 +80 R 0.021 +81 H 0.024 +82 S 0.031 +83 V 0.044 +84 G 0.061 +85 K 0.075 +86 T 0.077 +87 Q 0.069 +88 I 0.058 +89 V 0.053 +90 S 0.057 +91 V 0.066 +92 M 0.073 +93 L 0.073 +94 P 0.067 +95 E 0.059 +96 D 0.055 +97 A 0.056 +98 E 0.064 +99 K 0.076 +100 L 0.091 +101 H 0.104 +102 Q 0.112 +103 V 0.120 +104 E 0.127 +105 S 0.127 +106 M 0.118 +107 L 0.107 +108 P 0.100 +109 R 0.096 +110 R 0.097 +111 M 0.103 +112 H 0.107 +113 L 0.109 +114 E 0.105 +115 P 0.093 +116 W 0.080 +117 V 0.074 +118 A 0.074 +119 H 0.074 +120 R 0.077 +121 E 0.090 +122 L 0.116 +123 R 0.152 +124 G 0.186 +125 L 0.199 +126 R 0.184 +127 R 0.161 +128 G 0.151 +129 V 0.151 +130 F 0.148 +131 L 0.137 +132 L 0.122 +133 N 0.107 +134 G 0.097 +135 P 0.094 +136 E 0.096 +137 W 0.096 +138 R 0.088 +139 L 0.080 +140 N 0.077 +141 R 0.080 +142 L 0.082 +143 R 0.082 +144 L 0.080 +145 N 0.079 +146 R 0.082 +147 N 0.085 +148 V 0.084 +149 L 0.086 +150 S 0.091 +151 P 0.095 +152 K 0.092 +153 A 0.082 +154 V 0.070 +155 Q 0.060 +156 K 0.056 +157 F 0.053 +158 V 0.049 +159 P 0.044 +160 M 0.041 +161 V 0.045 +162 D 0.056 +163 M 0.063 +164 V 0.060 +165 A 0.049 +166 R 0.040 +167 D 0.037 +168 F 0.041 +169 L 0.052 +170 E 0.058 +171 T 0.053 +172 L 0.043 +173 K 0.037 +174 E 0.039 +175 K 0.049 +176 V 0.063 +177 L 0.074 +178 Q 0.086 +179 N 0.101 +180 A 0.116 +181 R 0.125 +182 G 0.117 +183 S 0.093 +184 L 0.067 +185 T 0.052 +186 M 0.047 +187 D 0.043 +188 V 0.038 +189 Q 0.035 +190 Q 0.038 +191 S 0.042 +192 L 0.045 +193 F 0.047 +194 N 0.054 +195 Y 0.062 +196 T 0.068 +197 I 0.074 +198 E 0.082 +199 A 0.083 +200 S 0.072 +201 N 0.057 +202 F 0.048 +203 A 0.043 +204 L 0.044 +205 F 0.052 +206 G 0.065 +207 E 0.082 +208 R 0.104 +209 L 0.129 +210 G 0.143 +211 L 0.140 +212 L 0.127 +213 G 0.114 +214 H 0.105 +215 D 0.096 +216 L 0.085 +217 S 0.071 +218 P 0.058 +219 G 0.047 +220 S 0.039 +221 L 0.035 +222 K 0.038 +223 F 0.049 +224 I 0.062 +225 H 0.066 +226 A 0.059 +227 L 0.046 +228 H 0.034 +229 S 0.027 +230 M 0.025 +231 F 0.029 +232 K 0.034 +233 S 0.038 +234 T 0.037 +235 S 0.032 +236 Q 0.028 +237 L 0.028 +238 L 0.030 +239 F 0.033 +240 L 0.037 +241 P 0.040 +242 K 0.040 +243 S 0.037 +244 L 0.035 +245 T 0.036 +246 R 0.039 +247 W 0.044 +248 T 0.053 +249 S 0.060 +250 T 0.059 +251 R 0.054 +252 V 0.052 +253 W 0.055 +254 K 0.058 +255 E 0.060 +256 H 0.061 +257 F 0.065 +258 D 0.071 +259 A 0.074 +260 W 0.071 +261 D 0.065 +262 V 0.063 +263 I 0.066 +264 S 0.069 +265 E 0.068 +266 Y 0.059 +267 A 0.051 +268 N 0.052 +269 R 0.055 +270 C 0.051 +271 I 0.042 +272 W 0.037 +273 K 0.041 +274 V 0.052 +275 H 0.068 +276 Q 0.084 +277 E 0.095 +278 L 0.102 +279 R 0.115 +280 L 0.141 +281 G 0.174 +282 S 0.197 +283 S 0.194 +284 Q 0.168 +285 T 0.132 +286 Y 0.096 +287 S 0.065 +288 G 0.045 +289 I 0.038 +290 V 0.040 +291 A 0.045 +292 E 0.048 +293 L 0.051 +294 I 0.060 +295 S 0.079 +296 Q 0.106 +297 G 0.128 +298 S 0.132 +299 L 0.116 +300 P 0.091 +301 L 0.071 +302 D 0.062 +303 A 0.060 +304 I 0.059 +305 K 0.061 +306 A 0.073 +307 N 0.095 +308 S 0.113 +309 M 0.120 +310 E 0.122 +311 L 0.128 +312 T 0.136 +313 A 0.140 +314 G 0.140 +315 S 0.132 +316 V 0.119 +317 D 0.112 +318 T 0.109 +319 T 0.100 +320 A 0.087 +321 I 0.076 +322 P 0.069 +323 L 0.062 +324 V 0.053 +325 M 0.046 +326 T 0.043 +327 L 0.043 +328 F 0.044 +329 E 0.047 +330 L 0.049 +331 A 0.052 +332 R 0.053 +333 N 0.051 +334 P 0.045 +335 D 0.041 +336 V 0.044 +337 Q 0.055 +338 K 0.067 +339 A 0.070 +340 L 0.069 +341 R 0.071 +342 Q 0.071 +343 E 0.063 +344 S 0.051 +345 L 0.046 +346 A 0.051 +347 A 0.056 +348 E 0.062 +349 A 0.071 +350 S 0.084 +351 I 0.094 +352 A 0.097 +353 A 0.094 +354 N 0.087 +355 P 0.081 +356 Q 0.085 +357 K 0.097 +358 A 0.108 +359 M 0.107 +360 S 0.101 +361 D 0.094 +362 L 0.085 +363 P 0.074 +364 L 0.063 +365 L 0.055 +366 R 0.054 +367 A 0.061 +368 A 0.072 +369 L 0.082 +370 K 0.087 +371 E 0.090 +372 T 0.088 +373 L 0.079 +374 R 0.065 +375 L 0.052 +376 Y 0.042 +377 P 0.038 +378 V 0.041 +379 G 0.045 +380 G 0.047 +381 F 0.045 +382 L 0.042 +383 E 0.040 +384 R 0.042 +385 I 0.048 +386 L 0.055 +387 S 0.058 +388 S 0.054 +389 D 0.046 +390 L 0.040 +391 V 0.036 +392 L 0.035 +393 Q 0.040 +394 N 0.047 +395 Y 0.053 +396 H 0.056 +397 V 0.058 +398 P 0.062 +399 A 0.062 +400 G 0.057 +401 T 0.049 +402 L 0.041 +403 V 0.034 +404 L 0.031 +405 L 0.034 +406 Y 0.043 +407 L 0.052 +408 Y 0.059 +409 S 0.064 +410 M 0.070 +411 G 0.078 +412 R 0.085 +413 N 0.090 +414 P 0.093 +415 A 0.092 +416 V 0.088 +417 F 0.084 +418 P 0.081 +419 R 0.081 +420 P 0.084 +421 E 0.085 +422 R 0.083 +423 Y 0.078 +424 M 0.070 +425 P 0.063 +426 Q 0.062 +427 R 0.066 +428 W 0.073 +429 L 0.084 +430 E 0.108 +431 R 0.149 +432 K 0.186 +433 R 0.200 +434 S 0.187 +435 F 0.166 +436 Q 0.155 +437 H 0.153 +438 L 0.155 +439 A 0.154 +440 F 0.147 +441 G 0.135 +442 F 0.123 +443 G 0.115 +444 V 0.111 +445 R 0.119 +446 Q 0.140 +447 C 0.161 +448 L 0.169 +449 G 0.164 +450 R 0.150 +451 R 0.146 +452 L 0.159 +453 A 0.167 +454 E 0.153 +455 V 0.132 +456 E 0.122 +457 M 0.110 +458 M 0.089 +459 L 0.070 +460 L 0.061 +461 L 0.058 +462 H 0.053 +463 H 0.049 +464 I 0.048 +465 L 0.049 +466 K 0.049 +467 T 0.046 +468 F 0.041 +469 Q 0.040 +470 V 0.043 +471 E 0.049 +472 T 0.058 +473 L 0.072 +474 R 0.095 +475 Q 0.127 +476 E 0.152 +477 D 0.155 +478 V 0.138 +479 Q 0.116 +480 M 0.101 +481 A 0.089 +482 Y 0.075 +483 R 0.063 +484 F 0.061 +485 V 0.070 +486 L 0.085 +487 M 0.102 +488 P 0.118 +489 S 0.131 +490 S 0.137 +491 S 0.130 +492 P 0.110 +493 V 0.086 +494 L 0.067 +495 T 0.058 +496 F 0.061 +497 R 0.082 +498 P 0.123 +499 V 0.178 +500 S 0.220 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022589.10_ENSMUST00000238900.3_GN:Cyp11b2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022589.10_ENSMUST00000238900.3_GN:Cyp11b2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5bcab895fadca313f987ffd1a233a2931614fedf --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022589.10_ENSMUST00000238900.3_GN:Cyp11b2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid @@ -0,0 +1,503 @@ +>ENSMUSG00000022589.10|ENSMUST00000238900.3|GN:Cyp11b2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:2 +1 M 0.268 +2 A 0.271 +3 M 0.282 +4 A 0.294 +5 L 0.297 +6 R 0.299 +7 V 0.312 +8 T 0.332 +9 A 0.349 +10 D 0.354 +11 V 0.343 +12 W 0.328 +13 L 0.326 +14 A 0.340 +15 R 0.351 +16 P 0.344 +17 W 0.325 +18 Q 0.325 +19 C 0.352 +20 L 0.382 +21 H 0.408 +22 R 0.444 +23 T 0.488 +24 R 0.530 +25 A 0.573 +26 L 0.617 +27 G 0.651 +28 T 0.668 +29 T 0.665 +30 A 0.649 +31 T 0.627 +32 L 0.599 +33 A 0.563 +34 P 0.520 +35 K 0.466 +36 T 0.399 +37 L 0.327 +38 Q 0.266 +39 P 0.223 +40 F 0.192 +41 E 0.167 +42 A 0.149 +43 I 0.133 +44 P 0.117 +45 Q 0.106 +46 Y 0.104 +47 S 0.105 +48 R 0.101 +49 N 0.089 +50 K 0.071 +51 W 0.057 +52 L 0.049 +53 K 0.046 +54 M 0.047 +55 I 0.054 +56 Q 0.067 +57 I 0.085 +58 L 0.104 +59 R 0.124 +60 E 0.145 +61 Q 0.161 +62 G 0.173 +63 Q 0.176 +64 E 0.164 +65 N 0.137 +66 L 0.107 +67 H 0.087 +68 L 0.073 +69 E 0.061 +70 M 0.052 +71 H 0.047 +72 Q 0.042 +73 V 0.035 +74 F 0.030 +75 R 0.029 +76 E 0.032 +77 L 0.034 +78 G 0.033 +79 P 0.028 +80 I 0.023 +81 F 0.020 +82 R 0.021 +83 H 0.024 +84 S 0.031 +85 V 0.043 +86 G 0.060 +87 K 0.074 +88 T 0.077 +89 Q 0.068 +90 I 0.057 +91 V 0.053 +92 S 0.057 +93 V 0.066 +94 M 0.073 +95 L 0.073 +96 P 0.067 +97 E 0.059 +98 D 0.055 +99 A 0.056 +100 E 0.064 +101 K 0.076 +102 L 0.092 +103 H 0.104 +104 Q 0.112 +105 V 0.120 +106 E 0.127 +107 S 0.127 +108 M 0.118 +109 L 0.107 +110 P 0.100 +111 R 0.096 +112 R 0.097 +113 M 0.102 +114 H 0.107 +115 L 0.109 +116 E 0.105 +117 P 0.093 +118 W 0.079 +119 V 0.071 +120 A 0.070 +121 H 0.070 +122 R 0.075 +123 E 0.090 +124 L 0.116 +125 R 0.152 +126 G 0.186 +127 L 0.199 +128 R 0.184 +129 R 0.161 +130 G 0.151 +131 V 0.151 +132 F 0.148 +133 L 0.137 +134 L 0.122 +135 N 0.107 +136 G 0.097 +137 P 0.094 +138 E 0.096 +139 W 0.096 +140 R 0.088 +141 L 0.079 +142 N 0.077 +143 R 0.079 +144 L 0.081 +145 R 0.081 +146 L 0.080 +147 N 0.079 +148 R 0.082 +149 N 0.085 +150 V 0.084 +151 L 0.086 +152 S 0.091 +153 P 0.095 +154 K 0.092 +155 A 0.082 +156 V 0.070 +157 Q 0.060 +158 K 0.056 +159 F 0.053 +160 V 0.049 +161 P 0.044 +162 M 0.041 +163 V 0.045 +164 D 0.055 +165 M 0.062 +166 V 0.059 +167 A 0.049 +168 R 0.040 +169 D 0.037 +170 F 0.041 +171 L 0.051 +172 E 0.058 +173 T 0.053 +174 L 0.043 +175 K 0.037 +176 E 0.039 +177 K 0.049 +178 V 0.062 +179 L 0.074 +180 Q 0.086 +181 N 0.100 +182 A 0.116 +183 R 0.124 +184 G 0.117 +185 S 0.092 +186 L 0.066 +187 T 0.052 +188 M 0.047 +189 D 0.043 +190 V 0.037 +191 Q 0.035 +192 Q 0.037 +193 S 0.042 +194 L 0.044 +195 F 0.047 +196 N 0.054 +197 Y 0.062 +198 T 0.068 +199 I 0.074 +200 E 0.081 +201 A 0.082 +202 S 0.072 +203 N 0.057 +204 F 0.047 +205 A 0.043 +206 L 0.044 +207 F 0.052 +208 G 0.064 +209 E 0.081 +210 R 0.104 +211 L 0.128 +212 G 0.143 +213 L 0.140 +214 L 0.127 +215 G 0.114 +216 H 0.105 +217 D 0.096 +218 L 0.084 +219 S 0.071 +220 P 0.057 +221 G 0.047 +222 S 0.038 +223 L 0.034 +224 K 0.037 +225 F 0.046 +226 I 0.055 +227 H 0.057 +228 A 0.052 +229 L 0.042 +230 H 0.032 +231 S 0.026 +232 M 0.025 +233 F 0.029 +234 K 0.034 +235 S 0.038 +236 T 0.037 +237 S 0.032 +238 Q 0.028 +239 L 0.028 +240 L 0.030 +241 F 0.033 +242 L 0.037 +243 P 0.040 +244 K 0.040 +245 S 0.037 +246 L 0.035 +247 T 0.036 +248 R 0.039 +249 W 0.044 +250 T 0.053 +251 S 0.060 +252 T 0.059 +253 R 0.054 +254 V 0.052 +255 W 0.055 +256 K 0.058 +257 E 0.060 +258 H 0.061 +259 F 0.065 +260 D 0.071 +261 A 0.074 +262 W 0.070 +263 D 0.065 +264 V 0.061 +265 I 0.060 +266 S 0.058 +267 E 0.054 +268 Y 0.047 +269 A 0.044 +270 N 0.047 +271 R 0.051 +272 C 0.048 +273 I 0.041 +274 W 0.037 +275 K 0.041 +276 V 0.052 +277 H 0.068 +278 Q 0.083 +279 E 0.094 +280 L 0.102 +281 R 0.115 +282 L 0.141 +283 G 0.175 +284 S 0.197 +285 S 0.194 +286 Q 0.169 +287 T 0.133 +288 Y 0.096 +289 S 0.065 +290 G 0.045 +291 I 0.038 +292 V 0.040 +293 A 0.045 +294 E 0.048 +295 L 0.052 +296 I 0.060 +297 S 0.079 +298 Q 0.106 +299 G 0.128 +300 S 0.133 +301 L 0.116 +302 P 0.091 +303 L 0.071 +304 D 0.062 +305 A 0.060 +306 I 0.059 +307 K 0.061 +308 A 0.073 +309 N 0.094 +310 S 0.113 +311 M 0.120 +312 E 0.122 +313 L 0.128 +314 T 0.135 +315 A 0.139 +316 G 0.139 +317 S 0.131 +318 V 0.118 +319 D 0.111 +320 T 0.108 +321 T 0.100 +322 A 0.086 +323 I 0.076 +324 P 0.069 +325 L 0.062 +326 V 0.053 +327 M 0.046 +328 T 0.043 +329 L 0.043 +330 F 0.044 +331 E 0.047 +332 L 0.049 +333 A 0.052 +334 R 0.053 +335 N 0.051 +336 P 0.045 +337 D 0.040 +338 V 0.043 +339 Q 0.053 +340 K 0.064 +341 A 0.068 +342 L 0.068 +343 R 0.070 +344 Q 0.071 +345 E 0.063 +346 S 0.050 +347 L 0.046 +348 A 0.050 +349 A 0.056 +350 E 0.061 +351 A 0.071 +352 S 0.084 +353 I 0.094 +354 A 0.097 +355 A 0.094 +356 N 0.087 +357 P 0.081 +358 Q 0.085 +359 K 0.097 +360 A 0.107 +361 M 0.107 +362 S 0.101 +363 D 0.094 +364 L 0.085 +365 P 0.074 +366 L 0.063 +367 L 0.055 +368 R 0.054 +369 A 0.061 +370 A 0.072 +371 L 0.082 +372 K 0.087 +373 E 0.090 +374 T 0.088 +375 L 0.079 +376 R 0.065 +377 L 0.052 +378 Y 0.042 +379 P 0.038 +380 V 0.041 +381 G 0.045 +382 G 0.046 +383 F 0.045 +384 L 0.042 +385 E 0.040 +386 R 0.041 +387 I 0.047 +388 L 0.055 +389 S 0.057 +390 S 0.053 +391 D 0.046 +392 L 0.040 +393 V 0.036 +394 L 0.035 +395 Q 0.039 +396 N 0.047 +397 Y 0.053 +398 H 0.056 +399 V 0.058 +400 P 0.061 +401 A 0.062 +402 G 0.057 +403 T 0.049 +404 L 0.040 +405 V 0.034 +406 L 0.031 +407 L 0.034 +408 Y 0.043 +409 L 0.052 +410 Y 0.058 +411 S 0.064 +412 M 0.071 +413 G 0.078 +414 R 0.085 +415 N 0.090 +416 P 0.093 +417 A 0.092 +418 V 0.088 +419 F 0.084 +420 P 0.081 +421 R 0.081 +422 P 0.084 +423 E 0.085 +424 R 0.083 +425 Y 0.078 +426 M 0.069 +427 P 0.063 +428 Q 0.062 +429 R 0.066 +430 W 0.072 +431 L 0.083 +432 E 0.108 +433 R 0.148 +434 K 0.185 +435 R 0.198 +436 S 0.186 +437 F 0.166 +438 Q 0.154 +439 H 0.153 +440 L 0.155 +441 A 0.154 +442 F 0.147 +443 G 0.135 +444 F 0.123 +445 G 0.114 +446 V 0.111 +447 R 0.120 +448 Q 0.141 +449 C 0.161 +450 L 0.169 +451 G 0.164 +452 R 0.150 +453 R 0.146 +454 L 0.159 +455 A 0.167 +456 E 0.153 +457 V 0.132 +458 E 0.122 +459 M 0.110 +460 M 0.089 +461 L 0.070 +462 L 0.061 +463 L 0.058 +464 H 0.053 +465 H 0.049 +466 I 0.048 +467 L 0.049 +468 K 0.049 +469 T 0.045 +470 F 0.041 +471 Q 0.039 +472 V 0.043 +473 E 0.049 +474 T 0.058 +475 L 0.071 +476 R 0.095 +477 Q 0.126 +478 E 0.152 +479 D 0.155 +480 V 0.137 +481 Q 0.116 +482 M 0.101 +483 A 0.089 +484 Y 0.075 +485 R 0.064 +486 F 0.061 +487 V 0.070 +488 L 0.086 +489 M 0.102 +490 P 0.118 +491 S 0.131 +492 S 0.136 +493 S 0.129 +494 P 0.109 +495 V 0.085 +496 L 0.067 +497 T 0.058 +498 F 0.061 +499 R 0.081 +500 P 0.121 +501 V 0.175 +502 S 0.216 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022774.14_ENSMUST00000023460.7_GN:Ncbp2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022774.14_ENSMUST00000023460.7_GN:Ncbp2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..8907c9ab594d2b07b430a5133c2f81f5a6174486 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022774.14_ENSMUST00000023460.7_GN:Ncbp2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,157 @@ +>ENSMUSG00000022774.14|ENSMUST00000023460.7|GN:Ncbp2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.450 +2 S 0.476 +3 G 0.516 +4 G 0.546 +5 L 0.551 +6 L 0.539 +7 K 0.529 +8 A 0.522 +9 L 0.505 +10 R 0.479 +11 S 0.458 +12 D 0.439 +13 S 0.412 +14 Y 0.370 +15 V 0.320 +16 E 0.274 +17 L 0.238 +18 S 0.209 +19 E 0.182 +20 Y 0.152 +21 R 0.125 +22 D 0.109 +23 Q 0.108 +24 H 0.114 +25 F 0.122 +26 R 0.132 +27 G 0.149 +28 D 0.166 +29 N 0.168 +30 E 0.154 +31 E 0.139 +32 Q 0.133 +33 E 0.131 +34 K 0.125 +35 L 0.118 +36 L 0.111 +37 K 0.101 +38 K 0.082 +39 S 0.060 +40 C 0.044 +41 T 0.038 +42 L 0.041 +43 Y 0.051 +44 V 0.064 +45 G 0.075 +46 N 0.080 +47 L 0.077 +48 S 0.066 +49 F 0.055 +50 Y 0.049 +51 T 0.045 +52 T 0.041 +53 E 0.038 +54 E 0.039 +55 Q 0.042 +56 I 0.050 +57 Y 0.062 +58 E 0.069 +59 L 0.065 +60 F 0.055 +61 S 0.049 +62 K 0.049 +63 S 0.055 +64 G 0.065 +65 D 0.074 +66 I 0.073 +67 K 0.066 +68 K 0.060 +69 I 0.063 +70 I 0.070 +71 M 0.078 +72 G 0.085 +73 L 0.091 +74 D 0.094 +75 K 0.094 +76 M 0.097 +77 K 0.105 +78 K 0.115 +79 T 0.122 +80 A 0.115 +81 C 0.094 +82 G 0.068 +83 F 0.048 +84 C 0.038 +85 F 0.039 +86 V 0.046 +87 E 0.057 +88 Y 0.064 +89 Y 0.065 +90 S 0.061 +91 R 0.058 +92 A 0.057 +93 D 0.055 +94 A 0.054 +95 E 0.057 +96 N 0.062 +97 A 0.066 +98 M 0.067 +99 R 0.067 +100 Y 0.065 +101 I 0.059 +102 N 0.054 +103 G 0.053 +104 T 0.057 +105 R 0.062 +106 L 0.069 +107 D 0.077 +108 D 0.086 +109 R 0.097 +110 I 0.108 +111 I 0.116 +112 R 0.119 +113 T 0.118 +114 D 0.116 +115 W 0.116 +116 D 0.120 +117 A 0.124 +118 G 0.128 +119 F 0.137 +120 K 0.158 +121 E 0.193 +122 G 0.232 +123 R 0.257 +124 Q 0.251 +125 Y 0.227 +126 G 0.213 +127 R 0.227 +128 G 0.261 +129 R 0.290 +130 S 0.298 +131 G 0.309 +132 G 0.352 +133 Q 0.413 +134 V 0.452 +135 R 0.456 +136 D 0.438 +137 E 0.411 +138 Y 0.391 +139 R 0.402 +140 E 0.443 +141 D 0.476 +142 Y 0.463 +143 D 0.408 +144 A 0.347 +145 G 0.305 +146 R 0.288 +147 G 0.285 +148 G 0.290 +149 Y 0.304 +150 G 0.329 +151 K 0.360 +152 L 0.388 +153 A 0.406 +154 Q 0.417 +155 K 0.422 +156 Q 0.422 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022774.14_ENSMUST00000023460.7_GN:Ncbp2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:38.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022774.14_ENSMUST00000023460.7_GN:Ncbp2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:38.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..aa8ae831f1efd103ea702d853e1bfe3f29bc4a28 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022774.14_ENSMUST00000023460.7_GN:Ncbp2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:38.caid @@ -0,0 +1,195 @@ +>ENSMUSG00000022774.14|ENSMUST00000023460.7|GN:Ncbp2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:38 +1 M 0.395 +2 T 0.413 +3 T 0.445 +4 R 0.479 +5 L 0.505 +6 A 0.519 +7 P 0.524 +8 W 0.516 +9 F 0.488 +10 W 0.447 +11 S 0.421 +12 T 0.427 +13 P 0.438 +14 P 0.433 +15 A 0.432 +16 F 0.451 +17 P 0.472 +18 F 0.480 +19 P 0.490 +20 P 0.511 +21 P 0.533 +22 A 0.551 +23 A 0.562 +24 W 0.558 +25 F 0.534 +26 S 0.503 +27 R 0.483 +28 P 0.481 +29 W 0.494 +30 P 0.511 +31 C 0.520 +32 R 0.515 +33 V 0.502 +34 W 0.488 +35 C 0.482 +36 F 0.490 +37 C 0.512 +38 I 0.544 +39 M 0.579 +40 S 0.610 +41 G 0.634 +42 G 0.647 +43 L 0.646 +44 L 0.635 +45 K 0.623 +46 A 0.605 +47 L 0.577 +48 R 0.547 +49 S 0.525 +50 D 0.502 +51 S 0.465 +52 Y 0.411 +53 V 0.350 +54 E 0.292 +55 L 0.245 +56 S 0.208 +57 E 0.176 +58 Y 0.146 +59 R 0.120 +60 D 0.105 +61 Q 0.104 +62 H 0.109 +63 F 0.116 +64 R 0.124 +65 G 0.139 +66 D 0.155 +67 N 0.159 +68 E 0.148 +69 E 0.135 +70 Q 0.130 +71 E 0.130 +72 K 0.125 +73 L 0.117 +74 L 0.110 +75 K 0.099 +76 K 0.080 +77 S 0.058 +78 C 0.042 +79 T 0.037 +80 L 0.041 +81 Y 0.052 +82 V 0.064 +83 G 0.074 +84 N 0.078 +85 L 0.074 +86 S 0.063 +87 F 0.052 +88 Y 0.047 +89 T 0.044 +90 T 0.041 +91 E 0.039 +92 E 0.040 +93 Q 0.043 +94 I 0.050 +95 Y 0.062 +96 E 0.069 +97 L 0.065 +98 F 0.055 +99 S 0.048 +100 K 0.048 +101 S 0.054 +102 G 0.063 +103 D 0.072 +104 I 0.073 +105 K 0.066 +106 K 0.061 +107 I 0.064 +108 I 0.071 +109 M 0.078 +110 G 0.084 +111 L 0.088 +112 D 0.090 +113 K 0.090 +114 M 0.093 +115 K 0.102 +116 K 0.114 +117 T 0.121 +118 A 0.115 +119 C 0.094 +120 G 0.068 +121 F 0.048 +122 C 0.039 +123 F 0.039 +124 V 0.046 +125 E 0.056 +126 Y 0.064 +127 Y 0.064 +128 S 0.060 +129 R 0.058 +130 A 0.056 +131 D 0.054 +132 A 0.054 +133 E 0.056 +134 N 0.062 +135 A 0.066 +136 M 0.067 +137 R 0.066 +138 Y 0.064 +139 I 0.060 +140 N 0.056 +141 G 0.056 +142 T 0.060 +143 R 0.066 +144 L 0.072 +145 D 0.079 +146 D 0.088 +147 R 0.098 +148 I 0.109 +149 I 0.116 +150 R 0.119 +151 T 0.119 +152 D 0.118 +153 W 0.118 +154 D 0.123 +155 A 0.128 +156 G 0.133 +157 F 0.142 +158 K 0.164 +159 E 0.199 +160 G 0.241 +161 R 0.267 +162 Q 0.260 +163 Y 0.233 +164 G 0.216 +165 R 0.229 +166 G 0.263 +167 R 0.292 +168 S 0.301 +169 G 0.314 +170 G 0.361 +171 Q 0.428 +172 V 0.472 +173 R 0.478 +174 D 0.459 +175 E 0.429 +176 Y 0.407 +177 R 0.417 +178 E 0.459 +179 D 0.490 +180 Y 0.476 +181 D 0.419 +182 A 0.356 +183 G 0.314 +184 R 0.296 +185 G 0.292 +186 G 0.297 +187 Y 0.312 +188 G 0.339 +189 K 0.372 +190 L 0.403 +191 A 0.425 +192 Q 0.437 +193 K 0.441 +194 Q 0.441 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022871.14_ENSMUST00000232097.2_GN:Fetub_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022871.14_ENSMUST00000232097.2_GN:Fetub_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..dfe33564c9ba3fd269e75f3c38ac6a1be1e17faf --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022871.14_ENSMUST00000232097.2_GN:Fetub_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,389 @@ +>ENSMUSG00000022871.14|ENSMUST00000232097.2|GN:Fetub|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.300 +2 G 0.284 +3 L 0.257 +4 L 0.229 +5 R 0.207 +6 L 0.193 +7 L 0.189 +8 V 0.193 +9 L 0.201 +10 C 0.213 +11 T 0.233 +12 L 0.254 +13 A 0.270 +14 A 0.284 +15 C 0.306 +16 C 0.336 +17 M 0.367 +18 A 0.391 +19 R 0.414 +20 S 0.445 +21 P 0.483 +22 P 0.517 +23 A 0.537 +24 P 0.551 +25 P 0.565 +26 L 0.574 +27 P 0.570 +28 Q 0.554 +29 R 0.530 +30 P 0.494 +31 L 0.443 +32 S 0.377 +33 P 0.305 +34 L 0.239 +35 H 0.187 +36 P 0.148 +37 L 0.117 +38 G 0.094 +39 C 0.079 +40 N 0.067 +41 D 0.056 +42 S 0.045 +43 E 0.036 +44 V 0.029 +45 L 0.025 +46 A 0.024 +47 V 0.025 +48 A 0.028 +49 G 0.029 +50 F 0.029 +51 A 0.030 +52 L 0.035 +53 Q 0.043 +54 N 0.055 +55 I 0.068 +56 N 0.074 +57 R 0.073 +58 D 0.072 +59 Q 0.074 +60 K 0.082 +61 D 0.095 +62 G 0.109 +63 Y 0.114 +64 M 0.103 +65 L 0.081 +66 S 0.057 +67 L 0.039 +68 N 0.031 +69 R 0.030 +70 V 0.033 +71 H 0.036 +72 D 0.034 +73 V 0.030 +74 R 0.026 +75 E 0.025 +76 H 0.028 +77 Y 0.036 +78 Q 0.048 +79 E 0.063 +80 D 0.077 +81 M 0.083 +82 G 0.075 +83 S 0.058 +84 L 0.046 +85 F 0.045 +86 Y 0.054 +87 L 0.069 +88 T 0.082 +89 L 0.089 +90 D 0.091 +91 V 0.092 +92 L 0.099 +93 E 0.108 +94 T 0.117 +95 D 0.121 +96 C 0.119 +97 H 0.114 +98 V 0.114 +99 L 0.124 +100 S 0.143 +101 R 0.164 +102 K 0.179 +103 A 0.179 +104 Q 0.160 +105 K 0.134 +106 D 0.116 +107 C 0.112 +108 K 0.117 +109 P 0.118 +110 R 0.112 +111 M 0.103 +112 F 0.095 +113 Y 0.091 +114 E 0.093 +115 S 0.099 +116 V 0.100 +117 Y 0.089 +118 G 0.073 +119 Q 0.061 +120 C 0.051 +121 K 0.043 +122 A 0.036 +123 M 0.032 +124 F 0.031 +125 H 0.032 +126 I 0.037 +127 N 0.044 +128 K 0.053 +129 P 0.059 +130 R 0.059 +131 R 0.055 +132 V 0.050 +133 L 0.047 +134 Y 0.048 +135 L 0.053 +136 P 0.057 +137 A 0.058 +138 Y 0.058 +139 N 0.060 +140 C 0.065 +141 T 0.072 +142 L 0.082 +143 R 0.098 +144 P 0.123 +145 V 0.154 +146 S 0.182 +147 K 0.205 +148 R 0.230 +149 K 0.256 +150 T 0.274 +151 H 0.279 +152 T 0.275 +153 T 0.262 +154 C 0.235 +155 P 0.201 +156 D 0.176 +157 C 0.164 +158 P 0.158 +159 S 0.146 +160 P 0.125 +161 I 0.101 +162 D 0.079 +163 L 0.065 +164 S 0.057 +165 N 0.052 +166 P 0.046 +167 S 0.039 +168 A 0.035 +169 L 0.033 +170 E 0.034 +171 A 0.034 +172 A 0.033 +173 T 0.031 +174 E 0.030 +175 S 0.030 +176 L 0.032 +177 A 0.035 +178 K 0.042 +179 F 0.052 +180 N 0.061 +181 S 0.064 +182 K 0.065 +183 S 0.067 +184 P 0.072 +185 S 0.080 +186 K 0.090 +187 K 0.094 +188 Y 0.086 +189 E 0.070 +190 L 0.052 +191 V 0.040 +192 K 0.035 +193 V 0.035 +194 T 0.035 +195 K 0.034 +196 A 0.032 +197 M 0.032 +198 N 0.034 +199 Q 0.036 +200 W 0.039 +201 V 0.042 +202 S 0.045 +203 G 0.046 +204 P 0.045 +205 A 0.044 +206 Y 0.046 +207 Y 0.053 +208 V 0.061 +209 E 0.068 +210 Y 0.071 +211 L 0.071 +212 I 0.070 +213 K 0.077 +214 E 0.093 +215 A 0.114 +216 P 0.135 +217 C 0.156 +218 T 0.176 +219 K 0.192 +220 S 0.205 +221 Q 0.218 +222 A 0.224 +223 S 0.223 +224 C 0.227 +225 S 0.245 +226 L 0.270 +227 Q 0.288 +228 H 0.297 +229 S 0.293 +230 D 0.267 +231 S 0.224 +232 E 0.178 +233 P 0.141 +234 V 0.112 +235 G 0.093 +236 I 0.082 +237 C 0.074 +238 Q 0.067 +239 G 0.062 +240 S 0.063 +241 T 0.075 +242 V 0.099 +243 Q 0.134 +244 S 0.172 +245 S 0.202 +246 L 0.220 +247 R 0.228 +248 H 0.231 +249 V 0.234 +250 P 0.243 +251 L 0.263 +252 I 0.290 +253 Q 0.312 +254 P 0.310 +255 V 0.272 +256 E 0.211 +257 K 0.152 +258 S 0.114 +259 V 0.096 +260 T 0.088 +261 V 0.082 +262 T 0.078 +263 C 0.081 +264 E 0.097 +265 F 0.136 +266 F 0.207 +267 E 0.309 +268 S 0.419 +269 Q 0.508 +270 A 0.561 +271 Q 0.589 +272 V 0.615 +273 P 0.646 +274 G 0.673 +275 D 0.684 +276 E 0.683 +277 N 0.680 +278 P 0.680 +279 A 0.672 +280 V 0.640 +281 T 0.586 +282 Q 0.550 +283 G 0.557 +284 P 0.567 +285 Q 0.545 +286 K 0.514 +287 L 0.496 +288 P 0.467 +289 Q 0.436 +290 K 0.463 +291 N 0.555 +292 T 0.644 +293 A 0.692 +294 P 0.713 +295 T 0.724 +296 S 0.733 +297 S 0.743 +298 P 0.755 +299 S 0.760 +300 V 0.756 +301 T 0.748 +302 A 0.745 +303 P 0.752 +304 R 0.760 +305 G 0.748 +306 S 0.695 +307 I 0.617 +308 Q 0.572 +309 H 0.585 +310 L 0.610 +311 P 0.610 +312 E 0.616 +313 L 0.661 +314 D 0.714 +315 D 0.732 +316 E 0.724 +317 K 0.722 +318 P 0.739 +319 E 0.763 +320 E 0.780 +321 S 0.786 +322 K 0.783 +323 G 0.773 +324 G 0.759 +325 S 0.744 +326 P 0.732 +327 E 0.721 +328 E 0.699 +329 A 0.673 +330 F 0.665 +331 P 0.690 +332 V 0.724 +333 Q 0.739 +334 L 0.733 +335 D 0.721 +336 L 0.714 +337 T 0.709 +338 T 0.704 +339 N 0.708 +340 P 0.723 +341 Q 0.744 +342 G 0.760 +343 D 0.758 +344 T 0.732 +345 L 0.690 +346 D 0.654 +347 V 0.634 +348 S 0.618 +349 F 0.594 +350 L 0.560 +351 Y 0.526 +352 L 0.500 +353 E 0.486 +354 P 0.485 +355 G 0.499 +356 D 0.518 +357 K 0.536 +358 K 0.557 +359 L 0.577 +360 V 0.574 +361 V 0.545 +362 L 0.517 +363 P 0.522 +364 F 0.563 +365 P 0.619 +366 G 0.662 +367 K 0.673 +368 E 0.647 +369 Q 0.589 +370 R 0.523 +371 S 0.474 +372 A 0.448 +373 E 0.440 +374 C 0.462 +375 P 0.521 +376 G 0.598 +377 P 0.662 +378 E 0.695 +379 K 0.698 +380 E 0.685 +381 N 0.670 +382 N 0.661 +383 P 0.659 +384 L 0.652 +385 V 0.626 +386 L 0.576 +387 P 0.514 +388 P 0.469 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022871.14_ENSMUST00000232097.2_GN:Fetub_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022871.14_ENSMUST00000232097.2_GN:Fetub_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e02bd2f49eb8a7ba7ceceb8889d5ce3efecfd355 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022871.14_ENSMUST00000232097.2_GN:Fetub_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid @@ -0,0 +1,397 @@ +>ENSMUSG00000022871.14|ENSMUST00000232097.2|GN:Fetub|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:8 +1 M 0.340 +2 C 0.343 +3 V 0.341 +4 C 0.326 +5 H 0.298 +6 L 0.266 +7 W 0.247 +8 R 0.252 +9 M 0.268 +10 G 0.275 +11 L 0.263 +12 L 0.242 +13 R 0.225 +14 L 0.217 +15 L 0.222 +16 V 0.235 +17 L 0.249 +18 C 0.260 +19 T 0.266 +20 L 0.268 +21 A 0.275 +22 A 0.290 +23 C 0.315 +24 C 0.347 +25 M 0.378 +26 A 0.404 +27 R 0.430 +28 S 0.462 +29 P 0.499 +30 P 0.526 +31 A 0.541 +32 P 0.551 +33 P 0.564 +34 L 0.573 +35 P 0.569 +36 Q 0.553 +37 R 0.529 +38 P 0.493 +39 L 0.441 +40 S 0.376 +41 P 0.305 +42 L 0.240 +43 H 0.189 +44 P 0.150 +45 L 0.120 +46 G 0.098 +47 C 0.082 +48 N 0.069 +49 D 0.058 +50 S 0.047 +51 E 0.037 +52 V 0.030 +53 L 0.026 +54 A 0.024 +55 V 0.026 +56 A 0.028 +57 G 0.029 +58 F 0.029 +59 A 0.030 +60 L 0.035 +61 Q 0.043 +62 N 0.055 +63 I 0.067 +64 N 0.073 +65 R 0.073 +66 D 0.071 +67 Q 0.073 +68 K 0.080 +69 D 0.093 +70 G 0.106 +71 Y 0.110 +72 M 0.100 +73 L 0.078 +74 S 0.055 +75 L 0.038 +76 N 0.030 +77 R 0.030 +78 V 0.033 +79 H 0.035 +80 D 0.034 +81 V 0.029 +82 R 0.026 +83 E 0.025 +84 H 0.028 +85 Y 0.036 +86 Q 0.048 +87 E 0.063 +88 D 0.077 +89 M 0.083 +90 G 0.074 +91 S 0.059 +92 L 0.046 +93 F 0.045 +94 Y 0.055 +95 L 0.070 +96 T 0.083 +97 L 0.089 +98 D 0.090 +99 V 0.092 +100 L 0.098 +101 E 0.108 +102 T 0.117 +103 D 0.120 +104 C 0.118 +105 H 0.113 +106 V 0.113 +107 L 0.123 +108 S 0.143 +109 R 0.165 +110 K 0.181 +111 A 0.181 +112 Q 0.162 +113 K 0.135 +114 D 0.117 +115 C 0.113 +116 K 0.117 +117 P 0.118 +118 R 0.112 +119 M 0.102 +120 F 0.094 +121 Y 0.090 +122 E 0.093 +123 S 0.099 +124 V 0.100 +125 Y 0.089 +126 G 0.073 +127 Q 0.061 +128 C 0.052 +129 K 0.043 +130 A 0.036 +131 M 0.032 +132 F 0.031 +133 H 0.033 +134 I 0.037 +135 N 0.045 +136 K 0.054 +137 P 0.060 +138 R 0.060 +139 R 0.057 +140 V 0.052 +141 L 0.048 +142 Y 0.049 +143 L 0.054 +144 P 0.058 +145 A 0.059 +146 Y 0.058 +147 N 0.060 +148 C 0.065 +149 T 0.072 +150 L 0.082 +151 R 0.098 +152 P 0.124 +153 V 0.155 +154 S 0.184 +155 K 0.207 +156 R 0.232 +157 K 0.259 +158 T 0.278 +159 H 0.283 +160 T 0.279 +161 T 0.265 +162 C 0.237 +163 P 0.203 +164 D 0.177 +165 C 0.165 +166 P 0.159 +167 S 0.147 +168 P 0.126 +169 I 0.102 +170 D 0.080 +171 L 0.066 +172 S 0.057 +173 N 0.052 +174 P 0.046 +175 S 0.040 +176 A 0.035 +177 L 0.033 +178 E 0.034 +179 A 0.034 +180 A 0.033 +181 T 0.032 +182 E 0.031 +183 S 0.031 +184 L 0.032 +185 A 0.036 +186 K 0.042 +187 F 0.052 +188 N 0.061 +189 S 0.065 +190 K 0.065 +191 S 0.067 +192 P 0.071 +193 S 0.079 +194 K 0.089 +195 K 0.093 +196 Y 0.086 +197 E 0.070 +198 L 0.052 +199 V 0.040 +200 K 0.035 +201 V 0.035 +202 T 0.036 +203 K 0.034 +204 A 0.032 +205 M 0.032 +206 N 0.034 +207 Q 0.036 +208 W 0.039 +209 V 0.042 +210 S 0.045 +211 G 0.046 +212 P 0.045 +213 A 0.044 +214 Y 0.046 +215 Y 0.053 +216 V 0.061 +217 E 0.068 +218 Y 0.071 +219 L 0.071 +220 I 0.070 +221 K 0.076 +222 E 0.092 +223 A 0.113 +224 P 0.134 +225 C 0.156 +226 T 0.176 +227 K 0.192 +228 S 0.206 +229 Q 0.219 +230 A 0.226 +231 S 0.225 +232 C 0.229 +233 S 0.247 +234 L 0.271 +235 Q 0.290 +236 H 0.299 +237 S 0.295 +238 D 0.269 +239 S 0.225 +240 E 0.179 +241 P 0.141 +242 V 0.113 +243 G 0.093 +244 I 0.082 +245 C 0.075 +246 Q 0.067 +247 G 0.062 +248 S 0.064 +249 T 0.075 +250 V 0.098 +251 Q 0.133 +252 S 0.171 +253 S 0.201 +254 L 0.219 +255 R 0.228 +256 H 0.231 +257 V 0.234 +258 P 0.244 +259 L 0.264 +260 I 0.291 +261 Q 0.313 +262 P 0.312 +263 V 0.274 +264 E 0.212 +265 K 0.153 +266 S 0.115 +267 V 0.097 +268 T 0.089 +269 V 0.083 +270 T 0.079 +271 C 0.082 +272 E 0.098 +273 F 0.137 +274 F 0.208 +275 E 0.310 +276 S 0.420 +277 Q 0.510 +278 A 0.563 +279 Q 0.591 +280 V 0.617 +281 P 0.648 +282 G 0.674 +283 D 0.685 +284 E 0.684 +285 N 0.681 +286 P 0.681 +287 A 0.674 +288 V 0.641 +289 T 0.586 +290 Q 0.550 +291 G 0.557 +292 P 0.568 +293 Q 0.546 +294 K 0.516 +295 L 0.498 +296 P 0.468 +297 Q 0.433 +298 K 0.449 +299 N 0.509 +300 T 0.555 +301 A 0.580 +302 P 0.623 +303 T 0.678 +304 S 0.716 +305 S 0.737 +306 P 0.753 +307 S 0.760 +308 V 0.758 +309 T 0.750 +310 A 0.747 +311 P 0.754 +312 R 0.762 +313 G 0.750 +314 S 0.696 +315 I 0.619 +316 Q 0.574 +317 H 0.586 +318 L 0.611 +319 P 0.610 +320 E 0.615 +321 L 0.659 +322 D 0.707 +323 D 0.719 +324 E 0.707 +325 K 0.709 +326 P 0.734 +327 E 0.764 +328 E 0.783 +329 S 0.789 +330 K 0.786 +331 G 0.777 +332 G 0.763 +333 S 0.748 +334 P 0.736 +335 E 0.725 +336 E 0.705 +337 A 0.679 +338 F 0.672 +339 P 0.696 +340 V 0.730 +341 Q 0.745 +342 L 0.739 +343 D 0.727 +344 L 0.720 +345 T 0.715 +346 T 0.710 +347 N 0.714 +348 P 0.729 +349 Q 0.750 +350 G 0.766 +351 D 0.764 +352 T 0.739 +353 L 0.699 +354 D 0.664 +355 V 0.645 +356 S 0.630 +357 F 0.605 +358 L 0.570 +359 Y 0.535 +360 L 0.509 +361 E 0.496 +362 P 0.496 +363 G 0.510 +364 D 0.529 +365 K 0.545 +366 K 0.565 +367 L 0.583 +368 V 0.580 +369 V 0.553 +370 L 0.527 +371 P 0.532 +372 F 0.572 +373 P 0.627 +374 G 0.668 +375 K 0.678 +376 E 0.652 +377 Q 0.594 +378 R 0.528 +379 S 0.480 +380 A 0.453 +381 E 0.445 +382 C 0.468 +383 P 0.527 +384 G 0.605 +385 P 0.669 +386 E 0.702 +387 K 0.705 +388 E 0.691 +389 N 0.675 +390 N 0.667 +391 P 0.666 +392 L 0.660 +393 V 0.634 +394 L 0.584 +395 P 0.520 +396 P 0.474 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022974.13_ENSMUST00000118522.8_GN:Paxbp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022974.13_ENSMUST00000118522.8_GN:Paxbp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..eb727e404e9579909a707e0dfa28b6e28ab10c8a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022974.13_ENSMUST00000118522.8_GN:Paxbp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,920 @@ +>ENSMUSG00000022974.13|ENSMUST00000118522.8|GN:Paxbp1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.312 +2 F 0.330 +3 R 0.359 +4 K 0.386 +5 A 0.396 +6 R 0.399 +7 R 0.429 +8 V 0.497 +9 N 0.560 +10 V 0.590 +11 R 0.602 +12 K 0.615 +13 R 0.624 +14 N 0.620 +15 D 0.606 +16 S 0.583 +17 E 0.555 +18 E 0.532 +19 E 0.520 +20 E 0.523 +21 R 0.543 +22 E 0.573 +23 R 0.597 +24 D 0.603 +25 E 0.593 +26 E 0.571 +27 Q 0.548 +28 E 0.540 +29 P 0.558 +30 P 0.595 +31 P 0.631 +32 L 0.652 +33 L 0.659 +34 P 0.671 +35 P 0.699 +36 P 0.741 +37 A 0.777 +38 S 0.795 +39 G 0.792 +40 E 0.775 +41 E 0.760 +42 P 0.756 +43 G 0.765 +44 P 0.781 +45 G 0.799 +46 G 0.811 +47 G 0.812 +48 D 0.803 +49 R 0.793 +50 A 0.790 +51 P 0.799 +52 A 0.812 +53 G 0.820 +54 E 0.819 +55 S 0.811 +56 L 0.801 +57 L 0.794 +58 G 0.793 +59 P 0.792 +60 G 0.786 +61 P 0.775 +62 L 0.763 +63 P 0.756 +64 P 0.759 +65 P 0.771 +66 P 0.783 +67 S 0.782 +68 A 0.774 +69 H 0.774 +70 H 0.790 +71 P 0.812 +72 G 0.832 +73 L 0.843 +74 G 0.844 +75 A 0.841 +76 E 0.838 +77 A 0.838 +78 G 0.839 +79 G 0.841 +80 G 0.842 +81 I 0.842 +82 S 0.841 +83 G 0.841 +84 G 0.834 +85 A 0.823 +86 E 0.815 +87 P 0.817 +88 G 0.824 +89 N 0.823 +90 G 0.811 +91 L 0.794 +92 K 0.782 +93 P 0.775 +94 R 0.771 +95 K 0.771 +96 R 0.776 +97 P 0.782 +98 R 0.786 +99 E 0.788 +100 N 0.784 +101 K 0.775 +102 E 0.768 +103 V 0.770 +104 P 0.780 +105 R 0.788 +106 A 0.788 +107 S 0.782 +108 L 0.775 +109 L 0.775 +110 S 0.785 +111 F 0.797 +112 Q 0.806 +113 D 0.808 +114 E 0.802 +115 E 0.794 +116 E 0.786 +117 E 0.777 +118 N 0.761 +119 E 0.732 +120 E 0.695 +121 V 0.665 +122 F 0.652 +123 K 0.652 +124 V 0.648 +125 K 0.634 +126 K 0.607 +127 S 0.564 +128 S 0.509 +129 Y 0.447 +130 S 0.377 +131 K 0.311 +132 K 0.270 +133 I 0.255 +134 V 0.246 +135 K 0.235 +136 L 0.229 +137 L 0.226 +138 K 0.224 +139 K 0.227 +140 E 0.235 +141 Y 0.246 +142 K 0.257 +143 E 0.269 +144 D 0.280 +145 L 0.286 +146 E 0.296 +147 K 0.325 +148 S 0.378 +149 K 0.442 +150 I 0.504 +151 K 0.555 +152 T 0.590 +153 E 0.609 +154 L 0.628 +155 N 0.661 +156 T 0.695 +157 A 0.712 +158 A 0.712 +159 D 0.705 +160 S 0.695 +161 D 0.685 +162 Q 0.684 +163 P 0.686 +164 L 0.670 +165 D 0.633 +166 K 0.617 +167 T 0.653 +168 C 0.713 +169 H 0.755 +170 A 0.775 +171 K 0.781 +172 D 0.775 +173 T 0.765 +174 N 0.760 +175 P 0.768 +176 E 0.788 +177 D 0.811 +178 G 0.829 +179 V 0.834 +180 V 0.830 +181 I 0.822 +182 S 0.816 +183 E 0.814 +184 H 0.816 +185 G 0.823 +186 E 0.830 +187 D 0.834 +188 E 0.835 +189 M 0.832 +190 D 0.826 +191 M 0.818 +192 E 0.808 +193 S 0.797 +194 E 0.786 +195 K 0.773 +196 E 0.758 +197 E 0.742 +198 E 0.727 +199 K 0.723 +200 P 0.734 +201 K 0.757 +202 A 0.777 +203 G 0.784 +204 G 0.776 +205 A 0.759 +206 F 0.739 +207 S 0.705 +208 N 0.649 +209 A 0.589 +210 L 0.555 +211 S 0.551 +212 S 0.566 +213 L 0.591 +214 N 0.615 +215 V 0.628 +216 L 0.640 +217 R 0.664 +218 P 0.699 +219 G 0.726 +220 E 0.723 +221 I 0.675 +222 P 0.582 +223 D 0.465 +224 A 0.351 +225 A 0.267 +226 F 0.220 +227 I 0.199 +228 H 0.192 +229 A 0.194 +230 A 0.210 +231 R 0.235 +232 K 0.259 +233 K 0.273 +234 R 0.278 +235 Q 0.290 +236 L 0.316 +237 A 0.348 +238 R 0.381 +239 E 0.436 +240 L 0.515 +241 G 0.590 +242 D 0.638 +243 F 0.660 +244 T 0.679 +245 P 0.705 +246 H 0.728 +247 D 0.735 +248 S 0.727 +249 E 0.725 +250 P 0.742 +251 G 0.773 +252 K 0.803 +253 G 0.820 +254 R 0.825 +255 L 0.823 +256 V 0.816 +257 R 0.809 +258 E 0.804 +259 D 0.804 +260 E 0.807 +261 N 0.811 +262 D 0.814 +263 A 0.815 +264 S 0.814 +265 D 0.810 +266 D 0.802 +267 E 0.787 +268 D 0.766 +269 D 0.738 +270 D 0.704 +271 E 0.666 +272 K 0.638 +273 R 0.634 +274 R 0.648 +275 I 0.660 +276 V 0.659 +277 F 0.642 +278 S 0.620 +279 V 0.602 +280 K 0.579 +281 E 0.529 +282 K 0.456 +283 S 0.392 +284 Q 0.359 +285 R 0.352 +286 Q 0.361 +287 K 0.380 +288 I 0.402 +289 A 0.427 +290 E 0.460 +291 E 0.512 +292 I 0.588 +293 G 0.666 +294 I 0.725 +295 E 0.758 +296 G 0.772 +297 S 0.770 +298 D 0.760 +299 D 0.751 +300 D 0.749 +301 A 0.753 +302 L 0.758 +303 V 0.765 +304 T 0.769 +305 G 0.766 +306 E 0.749 +307 Q 0.708 +308 D 0.636 +309 E 0.544 +310 E 0.455 +311 L 0.378 +312 S 0.312 +313 R 0.262 +314 W 0.234 +315 E 0.220 +316 Q 0.218 +317 E 0.232 +318 Q 0.258 +319 I 0.285 +320 R 0.324 +321 K 0.409 +322 G 0.529 +323 I 0.634 +324 N 0.693 +325 I 0.722 +326 P 0.744 +327 Q 0.763 +328 V 0.770 +329 Q 0.762 +330 A 0.744 +331 S 0.733 +332 Q 0.738 +333 P 0.758 +334 S 0.781 +335 E 0.797 +336 V 0.799 +337 N 0.787 +338 V 0.767 +339 Y 0.748 +340 Y 0.742 +341 Q 0.751 +342 N 0.764 +343 T 0.771 +344 Y 0.770 +345 Q 0.766 +346 T 0.763 +347 M 0.766 +348 P 0.782 +349 Y 0.806 +350 G 0.824 +351 A 0.829 +352 S 0.823 +353 Y 0.813 +354 G 0.806 +355 I 0.805 +356 P 0.811 +357 Y 0.820 +358 S 0.826 +359 Y 0.825 +360 T 0.821 +361 A 0.819 +362 Y 0.824 +363 G 0.830 +364 S 0.831 +365 S 0.831 +366 D 0.831 +367 A 0.830 +368 K 0.825 +369 S 0.817 +370 Q 0.811 +371 K 0.804 +372 T 0.798 +373 D 0.794 +374 N 0.792 +375 T 0.788 +376 V 0.785 +377 P 0.784 +378 F 0.781 +379 K 0.772 +380 T 0.763 +381 P 0.761 +382 S 0.765 +383 N 0.767 +384 E 0.759 +385 M 0.743 +386 A 0.720 +387 P 0.676 +388 V 0.587 +389 T 0.455 +390 I 0.325 +391 D 0.249 +392 L 0.228 +393 V 0.227 +394 K 0.223 +395 R 0.225 +396 Q 0.238 +397 L 0.250 +398 K 0.247 +399 D 0.233 +400 R 0.219 +401 L 0.214 +402 D 0.219 +403 S 0.225 +404 M 0.222 +405 K 0.217 +406 E 0.221 +407 L 0.229 +408 H 0.228 +409 K 0.220 +410 T 0.215 +411 N 0.213 +412 Q 0.208 +413 Q 0.206 +414 Q 0.212 +415 H 0.218 +416 E 0.215 +417 K 0.208 +418 H 0.203 +419 L 0.211 +420 Q 0.231 +421 S 0.247 +422 R 0.242 +423 V 0.225 +424 D 0.213 +425 S 0.211 +426 T 0.215 +427 R 0.224 +428 A 0.234 +429 I 0.240 +430 E 0.245 +431 R 0.256 +432 L 0.276 +433 E 0.298 +434 G 0.311 +435 S 0.315 +436 S 0.315 +437 G 0.302 +438 G 0.261 +439 I 0.203 +440 G 0.152 +441 E 0.119 +442 R 0.104 +443 Y 0.102 +444 K 0.102 +445 F 0.100 +446 L 0.103 +447 Q 0.113 +448 E 0.127 +449 M 0.141 +450 R 0.151 +451 G 0.154 +452 Y 0.150 +453 V 0.145 +454 Q 0.145 +455 D 0.145 +456 L 0.137 +457 L 0.124 +458 E 0.113 +459 C 0.105 +460 F 0.101 +461 S 0.098 +462 E 0.093 +463 K 0.086 +464 V 0.080 +465 P 0.078 +466 L 0.078 +467 I 0.078 +468 N 0.081 +469 E 0.085 +470 L 0.082 +471 E 0.075 +472 S 0.069 +473 A 0.062 +474 I 0.052 +475 H 0.043 +476 Q 0.039 +477 L 0.038 +478 Y 0.036 +479 K 0.034 +480 Q 0.033 +481 R 0.036 +482 A 0.042 +483 S 0.047 +484 R 0.047 +485 L 0.047 +486 V 0.048 +487 Q 0.051 +488 R 0.056 +489 R 0.064 +490 Q 0.071 +491 D 0.077 +492 D 0.083 +493 I 0.091 +494 K 0.094 +495 D 0.095 +496 E 0.101 +497 S 0.118 +498 S 0.141 +499 E 0.173 +500 F 0.217 +501 S 0.273 +502 S 0.330 +503 H 0.374 +504 S 0.398 +505 N 0.406 +506 K 0.410 +507 A 0.421 +508 L 0.439 +509 M 0.464 +510 A 0.493 +511 P 0.514 +512 N 0.512 +513 L 0.492 +514 D 0.467 +515 S 0.443 +516 F 0.416 +517 G 0.383 +518 R 0.332 +519 D 0.261 +520 R 0.190 +521 A 0.143 +522 L 0.121 +523 Y 0.114 +524 Q 0.112 +525 E 0.114 +526 H 0.118 +527 A 0.119 +528 K 0.114 +529 R 0.109 +530 R 0.109 +531 I 0.112 +532 A 0.106 +533 E 0.092 +534 R 0.081 +535 E 0.079 +536 A 0.079 +537 R 0.078 +538 R 0.080 +539 T 0.083 +540 R 0.081 +541 R 0.082 +542 R 0.091 +543 Q 0.103 +544 A 0.111 +545 R 0.121 +546 E 0.144 +547 Q 0.178 +548 T 0.216 +549 G 0.247 +550 Q 0.269 +551 M 0.289 +552 A 0.312 +553 D 0.334 +554 H 0.341 +555 L 0.335 +556 E 0.321 +557 G 0.297 +558 L 0.260 +559 S 0.220 +560 S 0.189 +561 D 0.164 +562 D 0.142 +563 E 0.123 +564 E 0.111 +565 T 0.102 +566 S 0.093 +567 T 0.086 +568 D 0.084 +569 I 0.082 +570 T 0.078 +571 N 0.076 +572 F 0.082 +573 N 0.095 +574 L 0.104 +575 E 0.107 +576 K 0.106 +577 D 0.108 +578 R 0.110 +579 I 0.112 +580 L 0.112 +581 K 0.110 +582 E 0.106 +583 S 0.099 +584 S 0.091 +585 K 0.082 +586 V 0.074 +587 F 0.072 +588 E 0.076 +589 D 0.084 +590 V 0.086 +591 L 0.080 +592 E 0.067 +593 S 0.053 +594 F 0.045 +595 Y 0.047 +596 S 0.057 +597 I 0.071 +598 D 0.080 +599 C 0.078 +600 I 0.071 +601 K 0.064 +602 A 0.057 +603 Q 0.048 +604 F 0.041 +605 E 0.036 +606 A 0.033 +607 W 0.031 +608 R 0.029 +609 S 0.031 +610 K 0.035 +611 Y 0.039 +612 Y 0.044 +613 M 0.049 +614 S 0.054 +615 Y 0.060 +616 K 0.072 +617 D 0.088 +618 A 0.100 +619 Y 0.105 +620 I 0.108 +621 G 0.113 +622 L 0.119 +623 C 0.122 +624 L 0.119 +625 P 0.113 +626 K 0.110 +627 L 0.110 +628 F 0.108 +629 N 0.102 +630 P 0.098 +631 L 0.099 +632 I 0.102 +633 R 0.103 +634 L 0.101 +635 Q 0.099 +636 L 0.097 +637 L 0.094 +638 T 0.089 +639 W 0.086 +640 T 0.085 +641 P 0.088 +642 L 0.095 +643 E 0.105 +644 A 0.117 +645 K 0.129 +646 C 0.138 +647 R 0.136 +648 D 0.124 +649 F 0.107 +650 E 0.092 +651 T 0.080 +652 M 0.069 +653 L 0.060 +654 W 0.056 +655 F 0.056 +656 E 0.058 +657 S 0.064 +658 L 0.074 +659 L 0.088 +660 F 0.106 +661 Y 0.133 +662 G 0.172 +663 C 0.215 +664 E 0.251 +665 D 0.268 +666 R 0.272 +667 E 0.273 +668 Q 0.276 +669 E 0.276 +670 K 0.269 +671 D 0.256 +672 E 0.244 +673 A 0.240 +674 D 0.237 +675 V 0.221 +676 A 0.186 +677 L 0.149 +678 L 0.123 +679 P 0.112 +680 T 0.116 +681 I 0.129 +682 V 0.141 +683 E 0.147 +684 K 0.148 +685 V 0.147 +686 I 0.142 +687 L 0.130 +688 P 0.112 +689 K 0.096 +690 L 0.087 +691 T 0.084 +692 V 0.085 +693 I 0.088 +694 A 0.095 +695 E 0.103 +696 T 0.108 +697 M 0.111 +698 W 0.117 +699 D 0.124 +700 P 0.127 +701 F 0.124 +702 S 0.115 +703 T 0.103 +704 T 0.090 +705 Q 0.082 +706 T 0.075 +707 S 0.068 +708 R 0.063 +709 M 0.063 +710 V 0.063 +711 G 0.059 +712 I 0.053 +713 T 0.048 +714 M 0.045 +715 K 0.045 +716 L 0.051 +717 I 0.061 +718 N 0.071 +719 G 0.077 +720 Y 0.077 +721 P 0.076 +722 S 0.077 +723 V 0.086 +724 V 0.103 +725 N 0.123 +726 A 0.135 +727 D 0.132 +728 N 0.114 +729 K 0.092 +730 N 0.073 +731 T 0.060 +732 Q 0.053 +733 V 0.052 +734 Y 0.054 +735 L 0.058 +736 K 0.061 +737 A 0.065 +738 L 0.069 +739 L 0.073 +740 L 0.078 +741 R 0.088 +742 M 0.101 +743 R 0.111 +744 R 0.114 +745 T 0.118 +746 L 0.125 +747 D 0.134 +748 D 0.141 +749 D 0.141 +750 V 0.139 +751 F 0.141 +752 M 0.148 +753 P 0.152 +754 L 0.145 +755 Y 0.133 +756 P 0.123 +757 K 0.116 +758 N 0.111 +759 V 0.107 +760 L 0.107 +761 E 0.113 +762 N 0.124 +763 K 0.137 +764 N 0.145 +765 S 0.138 +766 G 0.121 +767 P 0.102 +768 Y 0.087 +769 L 0.077 +770 F 0.074 +771 F 0.077 +772 Q 0.080 +773 R 0.084 +774 Q 0.091 +775 F 0.097 +776 W 0.099 +777 S 0.100 +778 S 0.101 +779 V 0.098 +780 K 0.091 +781 L 0.084 +782 L 0.078 +783 G 0.071 +784 N 0.065 +785 F 0.065 +786 L 0.069 +787 Q 0.070 +788 W 0.068 +789 Y 0.069 +790 G 0.072 +791 I 0.074 +792 F 0.071 +793 S 0.067 +794 N 0.063 +795 K 0.061 +796 T 0.060 +797 L 0.062 +798 Q 0.065 +799 E 0.070 +800 L 0.076 +801 S 0.093 +802 I 0.127 +803 D 0.163 +804 G 0.173 +805 L 0.148 +806 L 0.110 +807 N 0.080 +808 R 0.062 +809 Y 0.053 +810 I 0.049 +811 L 0.048 +812 M 0.048 +813 A 0.053 +814 F 0.065 +815 Q 0.084 +816 N 0.101 +817 S 0.109 +818 E 0.109 +819 Y 0.105 +820 G 0.098 +821 D 0.088 +822 D 0.080 +823 S 0.079 +824 I 0.080 +825 R 0.076 +826 K 0.070 +827 A 0.069 +828 Q 0.068 +829 N 0.066 +830 V 0.064 +831 I 0.062 +832 N 0.056 +833 C 0.050 +834 F 0.047 +835 P 0.049 +836 K 0.053 +837 Q 0.059 +838 W 0.068 +839 F 0.085 +840 V 0.113 +841 N 0.147 +842 L 0.176 +843 K 0.195 +844 G 0.202 +845 E 0.197 +846 R 0.182 +847 T 0.157 +848 I 0.126 +849 S 0.101 +850 Q 0.087 +851 L 0.079 +852 E 0.069 +853 N 0.059 +854 F 0.053 +855 C 0.051 +856 R 0.049 +857 Y 0.047 +858 L 0.045 +859 V 0.045 +860 H 0.045 +861 L 0.047 +862 A 0.051 +863 D 0.055 +864 T 0.059 +865 I 0.065 +866 Y 0.075 +867 R 0.087 +868 N 0.103 +869 S 0.126 +870 I 0.154 +871 G 0.173 +872 C 0.166 +873 S 0.134 +874 D 0.100 +875 V 0.082 +876 E 0.081 +877 K 0.089 +878 R 0.094 +879 N 0.092 +880 A 0.085 +881 R 0.079 +882 E 0.074 +883 N 0.073 +884 I 0.070 +885 K 0.062 +886 Q 0.054 +887 I 0.049 +888 V 0.046 +889 K 0.044 +890 L 0.044 +891 L 0.046 +892 A 0.051 +893 S 0.060 +894 V 0.071 +895 R 0.080 +896 A 0.089 +897 L 0.095 +898 D 0.102 +899 H 0.110 +900 A 0.126 +901 I 0.151 +902 S 0.182 +903 V 0.209 +904 A 0.227 +905 S 0.236 +906 D 0.243 +907 H 0.247 +908 N 0.241 +909 V 0.224 +910 K 0.206 +911 E 0.190 +912 V 0.174 +913 K 0.153 +914 S 0.131 +915 L 0.116 +916 I 0.116 +917 E 0.131 +918 G 0.150 +919 K 0.162 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022974.13_ENSMUST00000118522.8_GN:Paxbp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:52.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022974.13_ENSMUST00000118522.8_GN:Paxbp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:52.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1053c1d46655a1de09bffdc2cddf03aa9b526a81 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000022974.13_ENSMUST00000118522.8_GN:Paxbp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:52.caid @@ -0,0 +1,972 @@ +>ENSMUSG00000022974.13|ENSMUST00000118522.8|GN:Paxbp1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:52 +1 M 0.406 +2 R 0.435 +3 N 0.484 +4 R 0.536 +5 G 0.563 +6 G 0.551 +7 A 0.532 +8 I 0.529 +9 A 0.527 +10 S 0.532 +11 Q 0.570 +12 S 0.622 +13 R 0.654 +14 D 0.666 +15 D 0.677 +16 P 0.693 +17 A 0.710 +18 G 0.725 +19 G 0.733 +20 G 0.728 +21 E 0.711 +22 L 0.696 +23 L 0.691 +24 R 0.698 +25 L 0.712 +26 R 0.724 +27 V 0.733 +28 R 0.744 +29 G 0.760 +30 G 0.774 +31 G 0.777 +32 L 0.768 +33 R 0.757 +34 A 0.753 +35 P 0.760 +36 S 0.772 +37 S 0.780 +38 S 0.785 +39 Q 0.789 +40 S 0.796 +41 A 0.804 +42 S 0.813 +43 G 0.820 +44 C 0.821 +45 E 0.820 +46 S 0.816 +47 A 0.806 +48 V 0.789 +49 T 0.769 +50 A 0.753 +51 A 0.742 +52 G 0.737 +53 M 0.732 +54 F 0.729 +55 R 0.729 +56 K 0.731 +57 A 0.734 +58 R 0.738 +59 R 0.746 +60 V 0.756 +61 N 0.761 +62 V 0.758 +63 R 0.755 +64 K 0.758 +65 R 0.761 +66 N 0.756 +67 D 0.745 +68 S 0.736 +69 E 0.729 +70 E 0.722 +71 E 0.715 +72 E 0.712 +73 R 0.714 +74 E 0.719 +75 R 0.723 +76 D 0.723 +77 E 0.712 +78 E 0.688 +79 Q 0.659 +80 E 0.638 +81 P 0.641 +82 P 0.667 +83 P 0.698 +84 L 0.716 +85 L 0.721 +86 P 0.727 +87 P 0.751 +88 P 0.786 +89 A 0.816 +90 S 0.830 +91 G 0.827 +92 E 0.814 +93 E 0.801 +94 P 0.796 +95 G 0.802 +96 P 0.813 +97 G 0.824 +98 G 0.831 +99 G 0.832 +100 D 0.826 +101 R 0.819 +102 A 0.818 +103 P 0.824 +104 A 0.833 +105 G 0.837 +106 E 0.833 +107 S 0.823 +108 L 0.811 +109 L 0.801 +110 G 0.795 +111 P 0.788 +112 G 0.779 +113 P 0.767 +114 L 0.755 +115 P 0.748 +116 P 0.747 +117 P 0.745 +118 P 0.720 +119 S 0.671 +120 A 0.640 +121 H 0.667 +122 H 0.729 +123 P 0.783 +124 G 0.815 +125 L 0.828 +126 G 0.829 +127 A 0.825 +128 E 0.821 +129 A 0.820 +130 G 0.822 +131 G 0.826 +132 G 0.829 +133 I 0.831 +134 S 0.833 +135 G 0.831 +136 G 0.823 +137 A 0.810 +138 E 0.800 +139 P 0.802 +140 G 0.810 +141 N 0.812 +142 G 0.805 +143 L 0.793 +144 K 0.784 +145 P 0.778 +146 R 0.774 +147 K 0.772 +148 R 0.773 +149 P 0.777 +150 R 0.783 +151 E 0.787 +152 N 0.785 +153 K 0.777 +154 E 0.769 +155 V 0.771 +156 P 0.782 +157 R 0.793 +158 A 0.797 +159 S 0.795 +160 L 0.792 +161 L 0.796 +162 S 0.806 +163 F 0.820 +164 Q 0.829 +165 D 0.830 +166 E 0.824 +167 E 0.815 +168 E 0.807 +169 E 0.797 +170 N 0.782 +171 E 0.758 +172 E 0.729 +173 V 0.706 +174 F 0.702 +175 K 0.709 +176 V 0.713 +177 K 0.702 +178 K 0.673 +179 S 0.626 +180 S 0.566 +181 Y 0.495 +182 S 0.411 +183 K 0.330 +184 K 0.280 +185 I 0.258 +186 V 0.241 +187 K 0.226 +188 L 0.223 +189 L 0.226 +190 K 0.228 +191 K 0.233 +192 E 0.242 +193 Y 0.253 +194 K 0.262 +195 E 0.273 +196 D 0.282 +197 L 0.287 +198 E 0.294 +199 K 0.321 +200 S 0.373 +201 K 0.437 +202 I 0.502 +203 K 0.560 +204 T 0.602 +205 E 0.624 +206 L 0.645 +207 N 0.676 +208 T 0.709 +209 A 0.726 +210 A 0.726 +211 D 0.719 +212 S 0.707 +213 D 0.698 +214 Q 0.700 +215 P 0.717 +216 L 0.741 +217 D 0.760 +218 K 0.772 +219 T 0.779 +220 C 0.783 +221 H 0.787 +222 A 0.792 +223 K 0.795 +224 D 0.790 +225 T 0.779 +226 N 0.772 +227 P 0.778 +228 E 0.796 +229 D 0.816 +230 G 0.832 +231 V 0.839 +232 V 0.836 +233 I 0.829 +234 S 0.822 +235 E 0.819 +236 H 0.822 +237 G 0.829 +238 E 0.836 +239 D 0.839 +240 E 0.838 +241 M 0.835 +242 D 0.831 +243 M 0.825 +244 E 0.817 +245 S 0.808 +246 E 0.798 +247 K 0.788 +248 E 0.776 +249 E 0.761 +250 E 0.746 +251 K 0.739 +252 P 0.747 +253 K 0.765 +254 A 0.781 +255 G 0.784 +256 G 0.773 +257 A 0.752 +258 F 0.729 +259 S 0.694 +260 N 0.636 +261 A 0.573 +262 L 0.536 +263 S 0.534 +264 S 0.551 +265 L 0.574 +266 N 0.592 +267 V 0.600 +268 L 0.610 +269 R 0.636 +270 P 0.676 +271 G 0.711 +272 E 0.715 +273 I 0.671 +274 P 0.582 +275 D 0.467 +276 A 0.356 +277 A 0.273 +278 F 0.225 +279 I 0.200 +280 H 0.187 +281 A 0.185 +282 A 0.196 +283 R 0.215 +284 K 0.235 +285 K 0.247 +286 R 0.253 +287 Q 0.266 +288 L 0.293 +289 A 0.324 +290 R 0.353 +291 E 0.401 +292 L 0.478 +293 G 0.562 +294 D 0.622 +295 F 0.655 +296 T 0.678 +297 P 0.705 +298 H 0.729 +299 D 0.738 +300 S 0.734 +301 E 0.732 +302 P 0.749 +303 G 0.779 +304 K 0.808 +305 G 0.824 +306 R 0.827 +307 L 0.823 +308 V 0.815 +309 R 0.807 +310 E 0.802 +311 D 0.804 +312 E 0.809 +313 N 0.813 +314 D 0.813 +315 A 0.811 +316 S 0.808 +317 D 0.805 +318 D 0.801 +319 E 0.791 +320 D 0.775 +321 D 0.747 +322 D 0.708 +323 E 0.666 +324 K 0.640 +325 R 0.644 +326 R 0.665 +327 I 0.683 +328 V 0.684 +329 F 0.672 +330 S 0.658 +331 V 0.647 +332 K 0.626 +333 E 0.571 +334 K 0.488 +335 S 0.413 +336 Q 0.371 +337 R 0.358 +338 Q 0.363 +339 K 0.379 +340 I 0.402 +341 A 0.430 +342 E 0.464 +343 E 0.517 +344 I 0.593 +345 G 0.674 +346 I 0.735 +347 E 0.768 +348 G 0.777 +349 S 0.770 +350 D 0.754 +351 D 0.741 +352 D 0.739 +353 A 0.746 +354 L 0.756 +355 V 0.766 +356 T 0.775 +357 G 0.775 +358 E 0.762 +359 Q 0.726 +360 D 0.662 +361 E 0.576 +362 E 0.485 +363 L 0.400 +364 S 0.327 +365 R 0.273 +366 W 0.242 +367 E 0.226 +368 Q 0.221 +369 E 0.234 +370 Q 0.261 +371 I 0.288 +372 R 0.324 +373 K 0.405 +374 G 0.526 +375 I 0.633 +376 N 0.694 +377 I 0.723 +378 P 0.745 +379 Q 0.762 +380 V 0.769 +381 Q 0.761 +382 A 0.744 +383 S 0.733 +384 Q 0.737 +385 P 0.755 +386 S 0.777 +387 E 0.792 +388 V 0.794 +389 N 0.781 +390 V 0.760 +391 Y 0.742 +392 Y 0.738 +393 Q 0.748 +394 N 0.761 +395 T 0.765 +396 Y 0.760 +397 Q 0.754 +398 T 0.751 +399 M 0.756 +400 P 0.774 +401 Y 0.798 +402 G 0.818 +403 A 0.825 +404 S 0.818 +405 Y 0.808 +406 G 0.801 +407 I 0.798 +408 P 0.802 +409 Y 0.809 +410 S 0.815 +411 Y 0.814 +412 T 0.809 +413 A 0.808 +414 Y 0.813 +415 G 0.820 +416 S 0.824 +417 S 0.825 +418 D 0.825 +419 A 0.824 +420 K 0.819 +421 S 0.813 +422 Q 0.808 +423 K 0.803 +424 T 0.799 +425 D 0.796 +426 N 0.792 +427 T 0.786 +428 V 0.781 +429 P 0.780 +430 F 0.778 +431 K 0.770 +432 T 0.762 +433 P 0.762 +434 S 0.767 +435 N 0.767 +436 E 0.757 +437 M 0.739 +438 A 0.715 +439 P 0.672 +440 V 0.588 +441 T 0.463 +442 I 0.339 +443 D 0.265 +444 L 0.244 +445 V 0.241 +446 K 0.235 +447 R 0.235 +448 Q 0.248 +449 L 0.261 +450 K 0.258 +451 D 0.244 +452 R 0.232 +453 L 0.230 +454 D 0.237 +455 S 0.243 +456 M 0.239 +457 K 0.232 +458 E 0.236 +459 L 0.247 +460 H 0.249 +461 K 0.244 +462 T 0.242 +463 N 0.241 +464 Q 0.237 +465 Q 0.236 +466 Q 0.243 +467 H 0.248 +468 E 0.244 +469 K 0.234 +470 H 0.228 +471 L 0.237 +472 Q 0.262 +473 S 0.282 +474 R 0.277 +475 V 0.255 +476 D 0.238 +477 S 0.232 +478 T 0.233 +479 R 0.240 +480 A 0.251 +481 I 0.260 +482 E 0.267 +483 R 0.279 +484 L 0.299 +485 E 0.320 +486 G 0.330 +487 S 0.331 +488 S 0.331 +489 G 0.318 +490 G 0.276 +491 I 0.218 +492 G 0.166 +493 E 0.132 +494 R 0.114 +495 Y 0.109 +496 K 0.107 +497 F 0.105 +498 L 0.110 +499 Q 0.122 +500 E 0.137 +501 M 0.151 +502 R 0.161 +503 G 0.163 +504 Y 0.157 +505 V 0.152 +506 Q 0.152 +507 D 0.151 +508 L 0.143 +509 L 0.128 +510 E 0.116 +511 C 0.109 +512 F 0.105 +513 S 0.103 +514 E 0.098 +515 K 0.090 +516 V 0.084 +517 P 0.082 +518 L 0.082 +519 I 0.083 +520 N 0.086 +521 E 0.089 +522 L 0.086 +523 E 0.078 +524 S 0.072 +525 A 0.065 +526 I 0.054 +527 H 0.045 +528 Q 0.041 +529 L 0.040 +530 Y 0.038 +531 K 0.036 +532 Q 0.035 +533 R 0.038 +534 A 0.045 +535 S 0.050 +536 R 0.051 +537 L 0.050 +538 V 0.051 +539 Q 0.055 +540 R 0.059 +541 R 0.066 +542 Q 0.073 +543 D 0.079 +544 D 0.085 +545 I 0.093 +546 K 0.096 +547 D 0.096 +548 E 0.102 +549 S 0.118 +550 S 0.142 +551 E 0.174 +552 F 0.219 +553 S 0.276 +554 S 0.335 +555 H 0.379 +556 S 0.404 +557 N 0.411 +558 K 0.415 +559 A 0.426 +560 L 0.445 +561 M 0.469 +562 A 0.496 +563 P 0.514 +564 N 0.510 +565 L 0.489 +566 D 0.462 +567 S 0.434 +568 F 0.404 +569 G 0.371 +570 R 0.324 +571 D 0.259 +572 R 0.193 +573 A 0.148 +574 L 0.128 +575 Y 0.121 +576 Q 0.119 +577 E 0.120 +578 H 0.124 +579 A 0.126 +580 K 0.122 +581 R 0.116 +582 R 0.115 +583 I 0.117 +584 A 0.111 +585 E 0.095 +586 R 0.083 +587 E 0.081 +588 A 0.081 +589 R 0.080 +590 R 0.082 +591 T 0.085 +592 R 0.082 +593 R 0.081 +594 R 0.088 +595 Q 0.099 +596 A 0.110 +597 R 0.124 +598 E 0.149 +599 Q 0.183 +600 T 0.221 +601 G 0.252 +602 Q 0.275 +603 M 0.294 +604 A 0.317 +605 D 0.337 +606 H 0.345 +607 L 0.340 +608 E 0.328 +609 G 0.306 +610 L 0.269 +611 S 0.229 +612 S 0.197 +613 D 0.173 +614 D 0.150 +615 E 0.131 +616 E 0.117 +617 T 0.107 +618 S 0.097 +619 T 0.089 +620 D 0.087 +621 I 0.086 +622 T 0.082 +623 N 0.079 +624 F 0.085 +625 N 0.097 +626 L 0.107 +627 E 0.109 +628 K 0.109 +629 D 0.110 +630 R 0.111 +631 I 0.109 +632 L 0.104 +633 K 0.099 +634 E 0.097 +635 S 0.095 +636 S 0.091 +637 K 0.083 +638 V 0.076 +639 F 0.073 +640 E 0.078 +641 D 0.085 +642 V 0.088 +643 L 0.081 +644 E 0.068 +645 S 0.054 +646 F 0.046 +647 Y 0.048 +648 S 0.058 +649 I 0.073 +650 D 0.082 +651 C 0.080 +652 I 0.072 +653 K 0.065 +654 A 0.058 +655 Q 0.050 +656 F 0.042 +657 E 0.038 +658 A 0.035 +659 W 0.032 +660 R 0.031 +661 S 0.032 +662 K 0.036 +663 Y 0.040 +664 Y 0.045 +665 M 0.050 +666 S 0.055 +667 Y 0.061 +668 K 0.073 +669 D 0.090 +670 A 0.103 +671 Y 0.107 +672 I 0.110 +673 G 0.116 +674 L 0.122 +675 C 0.125 +676 L 0.122 +677 P 0.115 +678 K 0.112 +679 L 0.113 +680 F 0.111 +681 N 0.105 +682 P 0.100 +683 L 0.101 +684 I 0.104 +685 R 0.105 +686 L 0.103 +687 Q 0.100 +688 L 0.099 +689 L 0.096 +690 T 0.092 +691 W 0.088 +692 T 0.087 +693 P 0.090 +694 L 0.098 +695 E 0.107 +696 A 0.119 +697 K 0.130 +698 C 0.139 +699 R 0.138 +700 D 0.126 +701 F 0.108 +702 E 0.093 +703 T 0.081 +704 M 0.070 +705 L 0.061 +706 W 0.057 +707 F 0.057 +708 E 0.059 +709 S 0.066 +710 L 0.076 +711 L 0.090 +712 F 0.108 +713 Y 0.136 +714 G 0.174 +715 C 0.218 +716 E 0.253 +717 D 0.271 +718 R 0.275 +719 E 0.276 +720 Q 0.279 +721 E 0.280 +722 K 0.273 +723 D 0.261 +724 E 0.250 +725 A 0.245 +726 D 0.242 +727 V 0.224 +728 A 0.188 +729 L 0.151 +730 L 0.125 +731 P 0.115 +732 T 0.119 +733 I 0.132 +734 V 0.144 +735 E 0.149 +736 K 0.150 +737 V 0.150 +738 I 0.146 +739 L 0.134 +740 P 0.115 +741 K 0.099 +742 L 0.089 +743 T 0.086 +744 V 0.087 +745 I 0.090 +746 A 0.097 +747 E 0.105 +748 T 0.111 +749 M 0.114 +750 W 0.119 +751 D 0.126 +752 P 0.129 +753 F 0.125 +754 S 0.117 +755 T 0.105 +756 T 0.094 +757 Q 0.085 +758 T 0.079 +759 S 0.071 +760 R 0.066 +761 M 0.065 +762 V 0.066 +763 G 0.061 +764 I 0.055 +765 T 0.050 +766 M 0.046 +767 K 0.045 +768 L 0.052 +769 I 0.063 +770 N 0.073 +771 G 0.079 +772 Y 0.079 +773 P 0.076 +774 S 0.078 +775 V 0.087 +776 V 0.104 +777 N 0.124 +778 A 0.136 +779 D 0.133 +780 N 0.115 +781 K 0.093 +782 N 0.074 +783 T 0.061 +784 Q 0.054 +785 V 0.052 +786 Y 0.055 +787 L 0.058 +788 K 0.062 +789 A 0.065 +790 L 0.069 +791 L 0.073 +792 L 0.078 +793 R 0.088 +794 M 0.102 +795 R 0.112 +796 R 0.116 +797 T 0.119 +798 L 0.125 +799 D 0.134 +800 D 0.140 +801 D 0.141 +802 V 0.139 +803 F 0.141 +804 M 0.149 +805 P 0.152 +806 L 0.145 +807 Y 0.133 +808 P 0.123 +809 K 0.116 +810 N 0.111 +811 V 0.107 +812 L 0.107 +813 E 0.113 +814 N 0.124 +815 K 0.137 +816 N 0.145 +817 S 0.139 +818 G 0.121 +819 P 0.102 +820 Y 0.087 +821 L 0.077 +822 F 0.075 +823 F 0.078 +824 Q 0.082 +825 R 0.086 +826 Q 0.093 +827 F 0.099 +828 W 0.101 +829 S 0.102 +830 S 0.104 +831 V 0.101 +832 K 0.094 +833 L 0.086 +834 L 0.080 +835 G 0.073 +836 N 0.067 +837 F 0.066 +838 L 0.070 +839 Q 0.071 +840 W 0.069 +841 Y 0.069 +842 G 0.073 +843 I 0.075 +844 F 0.072 +845 S 0.067 +846 N 0.064 +847 K 0.061 +848 T 0.061 +849 L 0.063 +850 Q 0.066 +851 E 0.070 +852 L 0.076 +853 S 0.093 +854 I 0.127 +855 D 0.162 +856 G 0.173 +857 L 0.148 +858 L 0.111 +859 N 0.081 +860 R 0.063 +861 Y 0.054 +862 I 0.050 +863 L 0.048 +864 M 0.049 +865 A 0.054 +866 F 0.067 +867 Q 0.085 +868 N 0.103 +869 S 0.111 +870 E 0.110 +871 Y 0.106 +872 G 0.099 +873 D 0.089 +874 D 0.081 +875 S 0.080 +876 I 0.081 +877 R 0.077 +878 K 0.072 +879 A 0.071 +880 Q 0.070 +881 N 0.067 +882 V 0.065 +883 I 0.063 +884 N 0.058 +885 C 0.052 +886 F 0.049 +887 P 0.050 +888 K 0.054 +889 Q 0.060 +890 W 0.068 +891 F 0.083 +892 V 0.109 +893 N 0.142 +894 L 0.171 +895 K 0.190 +896 G 0.197 +897 E 0.192 +898 R 0.176 +899 T 0.150 +900 I 0.120 +901 S 0.097 +902 Q 0.085 +903 L 0.079 +904 E 0.070 +905 N 0.060 +906 F 0.054 +907 C 0.052 +908 R 0.050 +909 Y 0.047 +910 L 0.046 +911 V 0.046 +912 H 0.046 +913 L 0.048 +914 A 0.052 +915 D 0.056 +916 T 0.059 +917 I 0.066 +918 Y 0.076 +919 R 0.088 +920 N 0.104 +921 S 0.127 +922 I 0.155 +923 G 0.175 +924 C 0.168 +925 S 0.137 +926 D 0.102 +927 V 0.082 +928 E 0.074 +929 K 0.073 +930 R 0.073 +931 N 0.075 +932 A 0.076 +933 R 0.076 +934 E 0.075 +935 N 0.075 +936 I 0.072 +937 K 0.064 +938 Q 0.055 +939 I 0.050 +940 V 0.047 +941 K 0.045 +942 L 0.043 +943 L 0.045 +944 A 0.049 +945 S 0.056 +946 V 0.066 +947 R 0.075 +948 A 0.083 +949 L 0.092 +950 D 0.102 +951 H 0.115 +952 A 0.134 +953 I 0.161 +954 S 0.192 +955 V 0.219 +956 A 0.237 +957 S 0.247 +958 D 0.254 +959 H 0.258 +960 N 0.252 +961 V 0.234 +962 K 0.214 +963 E 0.198 +964 V 0.180 +965 K 0.158 +966 S 0.135 +967 L 0.119 +968 I 0.118 +969 E 0.132 +970 G 0.151 +971 K 0.163 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000023064.5_ENSMUST00000023826.5_GN:Sncg_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000023064.5_ENSMUST00000023826.5_GN:Sncg_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6f28172c83d253c3211cb7182ccb90c47ffa6db7 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000023064.5_ENSMUST00000023826.5_GN:Sncg_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,124 @@ +>ENSMUSG00000023064.5|ENSMUST00000023826.5|GN:Sncg|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.246 +2 D 0.236 +3 V 0.221 +4 F 0.214 +5 K 0.219 +6 K 0.233 +7 G 0.247 +8 F 0.260 +9 S 0.272 +10 I 0.274 +11 A 0.266 +12 K 0.263 +13 E 0.279 +14 G 0.305 +15 V 0.316 +16 V 0.310 +17 G 0.299 +18 A 0.288 +19 V 0.280 +20 E 0.289 +21 K 0.312 +22 T 0.328 +23 K 0.339 +24 Q 0.355 +25 G 0.370 +26 V 0.370 +27 T 0.359 +28 E 0.342 +29 A 0.321 +30 A 0.309 +31 E 0.314 +32 K 0.322 +33 T 0.313 +34 K 0.286 +35 E 0.258 +36 G 0.239 +37 V 0.230 +38 M 0.236 +39 Y 0.265 +40 V 0.306 +41 G 0.340 +42 T 0.365 +43 K 0.384 +44 T 0.386 +45 K 0.376 +46 E 0.377 +47 N 0.380 +48 V 0.358 +49 V 0.313 +50 Q 0.284 +51 S 0.286 +52 V 0.298 +53 T 0.303 +54 S 0.303 +55 V 0.300 +56 A 0.306 +57 E 0.324 +58 K 0.344 +59 T 0.354 +60 K 0.361 +61 E 0.379 +62 Q 0.408 +63 A 0.443 +64 N 0.487 +65 A 0.525 +66 V 0.526 +67 S 0.485 +68 E 0.434 +69 A 0.405 +70 V 0.390 +71 V 0.364 +72 S 0.339 +73 S 0.334 +74 V 0.341 +75 N 0.344 +76 T 0.350 +77 V 0.370 +78 A 0.403 +79 N 0.441 +80 K 0.468 +81 T 0.468 +82 V 0.446 +83 E 0.429 +84 E 0.430 +85 A 0.437 +86 E 0.442 +87 N 0.442 +88 I 0.432 +89 V 0.410 +90 V 0.391 +91 T 0.392 +92 T 0.408 +93 G 0.427 +94 V 0.442 +95 V 0.447 +96 R 0.451 +97 K 0.473 +98 E 0.508 +99 D 0.533 +100 L 0.539 +101 E 0.544 +102 P 0.570 +103 P 0.616 +104 A 0.661 +105 Q 0.683 +106 D 0.674 +107 Q 0.634 +108 E 0.580 +109 A 0.538 +110 K 0.510 +111 E 0.468 +112 Q 0.424 +113 E 0.439 +114 E 0.515 +115 N 0.590 +116 E 0.625 +117 E 0.635 +118 A 0.639 +119 K 0.641 +120 S 0.635 +121 G 0.608 +122 E 0.556 +123 D 0.510 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000023064.5_ENSMUST00000023826.5_GN:Sncg_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:61.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000023064.5_ENSMUST00000023826.5_GN:Sncg_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:61.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..fb8b5cf28ddc389750c140773e5349e1b042ac6f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000023064.5_ENSMUST00000023826.5_GN:Sncg_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:61.caid @@ -0,0 +1,185 @@ +>ENSMUSG00000023064.5|ENSMUST00000023826.5|GN:Sncg|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:61 +1 M 0.492 +2 P 0.535 +3 S 0.589 +4 L 0.629 +5 W 0.653 +6 P 0.671 +7 A 0.688 +8 L 0.703 +9 P 0.723 +10 A 0.750 +11 P 0.782 +12 T 0.807 +13 L 0.821 +14 A 0.824 +15 R 0.818 +16 A 0.807 +17 G 0.796 +18 W 0.792 +19 A 0.800 +20 P 0.819 +21 A 0.838 +22 S 0.851 +23 S 0.854 +24 H 0.851 +25 S 0.846 +26 I 0.842 +27 N 0.843 +28 I 0.848 +29 S 0.857 +30 S 0.862 +31 A 0.863 +32 S 0.862 +33 I 0.861 +34 R 0.862 +35 G 0.865 +36 S 0.865 +37 S 0.862 +38 S 0.856 +39 R 0.851 +40 D 0.847 +41 S 0.843 +42 G 0.838 +43 C 0.835 +44 G 0.832 +45 S 0.829 +46 T 0.828 +47 P 0.832 +48 V 0.840 +49 H 0.843 +50 S 0.835 +51 L 0.818 +52 Q 0.799 +53 Q 0.786 +54 P 0.784 +55 G 0.784 +56 S 0.777 +57 I 0.756 +58 L 0.727 +59 A 0.690 +60 N 0.636 +61 T 0.557 +62 M 0.474 +63 D 0.414 +64 V 0.381 +65 F 0.373 +66 K 0.388 +67 K 0.411 +68 G 0.423 +69 F 0.434 +70 S 0.450 +71 I 0.450 +72 A 0.424 +73 K 0.408 +74 E 0.436 +75 G 0.483 +76 V 0.506 +77 V 0.501 +78 G 0.491 +79 A 0.480 +80 V 0.474 +81 E 0.483 +82 K 0.495 +83 T 0.495 +84 K 0.492 +85 Q 0.494 +86 G 0.487 +87 V 0.469 +88 T 0.447 +89 E 0.423 +90 A 0.400 +91 A 0.394 +92 E 0.412 +93 K 0.423 +94 T 0.408 +95 K 0.374 +96 E 0.341 +97 G 0.314 +98 V 0.293 +99 M 0.287 +100 Y 0.301 +101 V 0.329 +102 G 0.358 +103 T 0.386 +104 K 0.412 +105 T 0.421 +106 K 0.420 +107 E 0.429 +108 N 0.436 +109 V 0.409 +110 V 0.354 +111 Q 0.316 +112 S 0.314 +113 V 0.331 +114 T 0.346 +115 S 0.354 +116 V 0.353 +117 A 0.351 +118 E 0.357 +119 K 0.363 +120 T 0.361 +121 K 0.361 +122 E 0.375 +123 Q 0.402 +124 A 0.441 +125 N 0.491 +126 A 0.528 +127 V 0.528 +128 S 0.492 +129 E 0.451 +130 A 0.426 +131 V 0.407 +132 V 0.379 +133 S 0.355 +134 S 0.353 +135 V 0.366 +136 N 0.381 +137 T 0.398 +138 V 0.424 +139 A 0.463 +140 N 0.506 +141 K 0.531 +142 T 0.526 +143 V 0.507 +144 E 0.495 +145 E 0.494 +146 A 0.502 +147 E 0.514 +148 N 0.523 +149 I 0.517 +150 V 0.499 +151 V 0.490 +152 T 0.505 +153 T 0.541 +154 G 0.584 +155 V 0.620 +156 V 0.641 +157 R 0.647 +158 K 0.648 +159 E 0.649 +160 D 0.644 +161 L 0.629 +162 E 0.618 +163 P 0.627 +164 P 0.663 +165 A 0.705 +166 Q 0.727 +167 D 0.717 +168 Q 0.672 +169 E 0.609 +170 A 0.562 +171 K 0.534 +172 E 0.492 +173 Q 0.447 +174 E 0.463 +175 E 0.546 +176 N 0.628 +177 E 0.667 +178 E 0.679 +179 A 0.684 +180 K 0.686 +181 S 0.676 +182 G 0.644 +183 E 0.586 +184 D 0.537 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000023067.15_ENSMUST00000233296.2_GN:Cdkn1a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000023067.15_ENSMUST00000233296.2_GN:Cdkn1a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..bf6871a05fb7576825eef62dfecc0308e4a40078 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000023067.15_ENSMUST00000233296.2_GN:Cdkn1a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,160 @@ +>ENSMUSG00000023067.15|ENSMUST00000233296.2|GN:Cdkn1a|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.519 +2 S 0.552 +3 N 0.607 +4 P 0.664 +5 G 0.703 +6 D 0.716 +7 V 0.709 +8 R 0.697 +9 P 0.691 +10 V 0.695 +11 P 0.705 +12 H 0.712 +13 R 0.714 +14 S 0.712 +15 K 0.712 +16 V 0.711 +17 C 0.702 +18 R 0.682 +19 C 0.652 +20 L 0.608 +21 F 0.565 +22 G 0.544 +23 P 0.549 +24 V 0.548 +25 D 0.511 +26 S 0.443 +27 E 0.373 +28 Q 0.325 +29 L 0.301 +30 R 0.298 +31 R 0.319 +32 D 0.347 +33 C 0.348 +34 D 0.322 +35 A 0.304 +36 L 0.311 +37 M 0.329 +38 A 0.347 +39 G 0.354 +40 C 0.336 +41 L 0.297 +42 Q 0.263 +43 E 0.241 +44 A 0.224 +45 R 0.214 +46 E 0.219 +47 R 0.233 +48 W 0.244 +49 N 0.247 +50 F 0.236 +51 D 0.212 +52 F 0.184 +53 V 0.172 +54 T 0.191 +55 E 0.237 +56 T 0.289 +57 P 0.324 +58 L 0.343 +59 E 0.364 +60 G 0.399 +61 N 0.434 +62 F 0.450 +63 V 0.453 +64 W 0.466 +65 E 0.493 +66 R 0.515 +67 V 0.515 +68 R 0.514 +69 S 0.540 +70 L 0.591 +71 G 0.644 +72 L 0.680 +73 P 0.695 +74 K 0.692 +75 V 0.682 +76 Y 0.677 +77 L 0.680 +78 S 0.697 +79 P 0.729 +80 G 0.763 +81 S 0.786 +82 R 0.797 +83 S 0.801 +84 R 0.800 +85 D 0.800 +86 D 0.800 +87 L 0.801 +88 G 0.801 +89 G 0.799 +90 D 0.796 +91 K 0.794 +92 R 0.797 +93 P 0.810 +94 S 0.830 +95 T 0.846 +96 S 0.850 +97 S 0.847 +98 A 0.841 +99 L 0.831 +100 L 0.816 +101 Q 0.797 +102 G 0.780 +103 P 0.771 +104 A 0.774 +105 P 0.788 +106 E 0.803 +107 D 0.815 +108 H 0.822 +109 V 0.825 +110 A 0.825 +111 L 0.822 +112 S 0.820 +113 L 0.819 +114 S 0.822 +115 C 0.831 +116 T 0.847 +117 L 0.860 +118 V 0.859 +119 S 0.841 +120 E 0.814 +121 R 0.793 +122 P 0.785 +123 E 0.785 +124 D 0.786 +125 S 0.784 +126 P 0.784 +127 G 0.790 +128 G 0.800 +129 P 0.814 +130 G 0.828 +131 T 0.837 +132 S 0.835 +133 Q 0.823 +134 G 0.806 +135 R 0.789 +136 K 0.776 +137 R 0.767 +138 R 0.753 +139 Q 0.723 +140 T 0.672 +141 S 0.598 +142 L 0.509 +143 T 0.428 +144 D 0.387 +145 F 0.382 +146 Y 0.399 +147 H 0.440 +148 S 0.511 +149 K 0.593 +150 R 0.658 +151 R 0.699 +152 L 0.720 +153 V 0.719 +154 F 0.697 +155 C 0.659 +156 K 0.610 +157 R 0.554 +158 K 0.497 +159 P 0.456 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000023067.15_ENSMUST00000233296.2_GN:Cdkn1a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:26.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000023067.15_ENSMUST00000233296.2_GN:Cdkn1a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:26.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..667c9d248c42320bc265451529155427961e6b14 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000023067.15_ENSMUST00000233296.2_GN:Cdkn1a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:26.caid @@ -0,0 +1,186 @@ +>ENSMUSG00000023067.15|ENSMUST00000233296.2|GN:Cdkn1a|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:26 +1 M 0.494 +2 S 0.523 +3 G 0.564 +4 S 0.597 +5 P 0.608 +6 V 0.591 +7 C 0.557 +8 V 0.524 +9 Y 0.499 +10 V 0.481 +11 Y 0.471 +12 L 0.473 +13 C 0.501 +14 V 0.565 +15 P 0.650 +16 A 0.730 +17 R 0.782 +18 V 0.812 +19 T 0.829 +20 G 0.837 +21 V 0.829 +22 S 0.792 +23 A 0.736 +24 A 0.706 +25 G 0.733 +26 T 0.782 +27 M 0.808 +28 S 0.811 +29 N 0.810 +30 P 0.812 +31 G 0.814 +32 D 0.809 +33 V 0.795 +34 R 0.776 +35 P 0.763 +36 V 0.760 +37 P 0.763 +38 H 0.766 +39 R 0.765 +40 S 0.763 +41 K 0.763 +42 V 0.760 +43 C 0.749 +44 R 0.729 +45 C 0.701 +46 L 0.664 +47 F 0.624 +48 G 0.602 +49 P 0.601 +50 V 0.589 +51 D 0.544 +52 S 0.475 +53 E 0.412 +54 Q 0.373 +55 L 0.357 +56 R 0.354 +57 R 0.370 +58 D 0.395 +59 C 0.393 +60 D 0.362 +61 A 0.342 +62 L 0.347 +63 M 0.363 +64 A 0.376 +65 G 0.377 +66 C 0.349 +67 L 0.302 +68 Q 0.262 +69 E 0.236 +70 A 0.215 +71 R 0.202 +72 E 0.205 +73 R 0.218 +74 W 0.230 +75 N 0.235 +76 F 0.226 +77 D 0.202 +78 F 0.174 +79 V 0.161 +80 T 0.174 +81 E 0.209 +82 T 0.248 +83 P 0.274 +84 L 0.288 +85 E 0.309 +86 G 0.346 +87 N 0.387 +88 F 0.408 +89 V 0.413 +90 W 0.426 +91 E 0.456 +92 R 0.481 +93 V 0.486 +94 R 0.487 +95 S 0.510 +96 L 0.556 +97 G 0.610 +98 L 0.656 +99 P 0.682 +100 K 0.685 +101 V 0.675 +102 Y 0.668 +103 L 0.669 +104 S 0.685 +105 P 0.718 +106 G 0.755 +107 S 0.782 +108 R 0.794 +109 S 0.798 +110 R 0.797 +111 D 0.795 +112 D 0.794 +113 L 0.794 +114 G 0.794 +115 G 0.793 +116 D 0.790 +117 K 0.788 +118 R 0.791 +119 P 0.805 +120 S 0.825 +121 T 0.840 +122 S 0.844 +123 S 0.839 +124 A 0.831 +125 L 0.821 +126 L 0.807 +127 Q 0.789 +128 G 0.772 +129 P 0.765 +130 A 0.769 +131 P 0.784 +132 E 0.800 +133 D 0.813 +134 H 0.822 +135 V 0.826 +136 A 0.827 +137 L 0.825 +138 S 0.822 +139 L 0.823 +140 S 0.827 +141 C 0.838 +142 T 0.852 +143 L 0.863 +144 V 0.862 +145 S 0.846 +146 E 0.821 +147 R 0.800 +148 P 0.793 +149 E 0.794 +150 D 0.795 +151 S 0.793 +152 P 0.794 +153 G 0.798 +154 G 0.808 +155 P 0.821 +156 G 0.835 +157 T 0.844 +158 S 0.841 +159 Q 0.829 +160 G 0.811 +161 R 0.793 +162 K 0.781 +163 R 0.772 +164 R 0.760 +165 Q 0.731 +166 T 0.681 +167 S 0.607 +168 L 0.517 +169 T 0.435 +170 D 0.390 +171 F 0.383 +172 Y 0.398 +173 H 0.440 +174 S 0.512 +175 K 0.595 +176 R 0.661 +177 R 0.702 +178 L 0.722 +179 V 0.722 +180 F 0.702 +181 C 0.665 +182 K 0.616 +183 R 0.558 +184 K 0.497 +185 P 0.454 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000023802.5_ENSMUST00000115800.2_GN:Nox3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000023802.5_ENSMUST00000115800.2_GN:Nox3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..410c5aff4942f6999d767b05d60a3aaadd76ad11 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000023802.5_ENSMUST00000115800.2_GN:Nox3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,569 @@ +>ENSMUSG00000023802.5|ENSMUST00000115800.2|GN:Nox3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.273 +2 P 0.239 +3 V 0.195 +4 C 0.160 +5 W 0.138 +6 I 0.131 +7 L 0.137 +8 N 0.146 +9 E 0.142 +10 S 0.121 +11 G 0.094 +12 S 0.071 +13 F 0.057 +14 V 0.047 +15 V 0.041 +16 A 0.039 +17 L 0.039 +18 L 0.043 +19 W 0.053 +20 L 0.066 +21 A 0.075 +22 V 0.073 +23 N 0.065 +24 A 0.056 +25 Y 0.049 +26 L 0.045 +27 F 0.045 +28 I 0.045 +29 D 0.046 +30 T 0.047 +31 F 0.048 +32 F 0.050 +33 W 0.056 +34 Y 0.063 +35 T 0.069 +36 E 0.073 +37 E 0.074 +38 E 0.073 +39 A 0.068 +40 F 0.064 +41 F 0.064 +42 Y 0.068 +43 T 0.074 +44 R 0.085 +45 V 0.104 +46 I 0.121 +47 L 0.125 +48 G 0.114 +49 S 0.096 +50 A 0.079 +51 L 0.072 +52 A 0.071 +53 W 0.074 +54 A 0.086 +55 R 0.104 +56 A 0.115 +57 S 0.124 +58 A 0.142 +59 V 0.160 +60 C 0.156 +61 L 0.133 +62 N 0.110 +63 F 0.095 +64 N 0.086 +65 C 0.081 +66 M 0.079 +67 L 0.075 +68 I 0.069 +69 L 0.061 +70 L 0.054 +71 P 0.052 +72 V 0.051 +73 S 0.050 +74 R 0.046 +75 N 0.040 +76 F 0.035 +77 I 0.032 +78 S 0.033 +79 L 0.042 +80 V 0.058 +81 R 0.076 +82 G 0.089 +83 T 0.100 +84 S 0.103 +85 V 0.098 +86 C 0.093 +87 C 0.096 +88 R 0.104 +89 G 0.111 +90 P 0.115 +91 W 0.116 +92 R 0.112 +93 R 0.101 +94 Q 0.090 +95 L 0.082 +96 D 0.076 +97 K 0.071 +98 N 0.066 +99 L 0.057 +100 N 0.046 +101 F 0.037 +102 H 0.032 +103 K 0.035 +104 L 0.046 +105 V 0.061 +106 A 0.068 +107 Y 0.064 +108 G 0.056 +109 I 0.052 +110 A 0.049 +111 V 0.048 +112 N 0.050 +113 S 0.052 +114 V 0.048 +115 I 0.041 +116 H 0.039 +117 I 0.041 +118 V 0.046 +119 A 0.050 +120 H 0.052 +121 L 0.049 +122 F 0.045 +123 N 0.045 +124 L 0.045 +125 E 0.043 +126 R 0.041 +127 Y 0.043 +128 H 0.053 +129 L 0.070 +130 G 0.085 +131 Q 0.093 +132 A 0.093 +133 K 0.089 +134 D 0.086 +135 A 0.085 +136 E 0.081 +137 G 0.072 +138 L 0.064 +139 L 0.063 +140 A 0.068 +141 A 0.079 +142 L 0.099 +143 S 0.128 +144 K 0.163 +145 L 0.199 +146 G 0.231 +147 D 0.254 +148 A 0.265 +149 P 0.262 +150 N 0.259 +151 E 0.265 +152 S 0.275 +153 Y 0.279 +154 L 0.272 +155 N 0.256 +156 P 0.230 +157 V 0.202 +158 R 0.182 +159 T 0.178 +160 F 0.187 +161 D 0.202 +162 M 0.212 +163 G 0.206 +164 T 0.185 +165 T 0.164 +166 T 0.151 +167 E 0.140 +168 L 0.122 +169 L 0.100 +170 M 0.082 +171 T 0.074 +172 V 0.071 +173 S 0.069 +174 G 0.068 +175 I 0.070 +176 T 0.079 +177 G 0.092 +178 L 0.102 +179 G 0.106 +180 I 0.107 +181 S 0.106 +182 L 0.103 +183 A 0.099 +184 L 0.093 +185 V 0.085 +186 F 0.079 +187 I 0.076 +188 M 0.072 +189 T 0.070 +190 S 0.070 +191 S 0.069 +192 T 0.064 +193 E 0.060 +194 F 0.062 +195 I 0.064 +196 R 0.061 +197 R 0.054 +198 S 0.049 +199 S 0.046 +200 Y 0.041 +201 E 0.038 +202 L 0.037 +203 F 0.037 +204 W 0.036 +205 Y 0.036 +206 T 0.040 +207 H 0.045 +208 H 0.048 +209 I 0.049 +210 F 0.047 +211 V 0.041 +212 F 0.037 +213 F 0.039 +214 F 0.044 +215 I 0.051 +216 S 0.060 +217 L 0.067 +218 A 0.069 +219 I 0.066 +220 H 0.068 +221 G 0.081 +222 G 0.102 +223 G 0.120 +224 R 0.129 +225 I 0.135 +226 I 0.144 +227 R 0.155 +228 G 0.158 +229 Q 0.150 +230 T 0.139 +231 P 0.130 +232 E 0.117 +233 S 0.099 +234 L 0.083 +235 R 0.077 +236 L 0.080 +237 H 0.081 +238 N 0.074 +239 V 0.061 +240 T 0.051 +241 Y 0.044 +242 C 0.042 +243 R 0.045 +244 D 0.049 +245 H 0.052 +246 Y 0.055 +247 A 0.058 +248 E 0.061 +249 W 0.068 +250 Q 0.083 +251 A 0.105 +252 A 0.132 +253 A 0.160 +254 L 0.185 +255 C 0.208 +256 P 0.229 +257 V 0.243 +258 P 0.247 +259 Q 0.244 +260 F 0.241 +261 S 0.248 +262 G 0.260 +263 K 0.262 +264 E 0.236 +265 P 0.188 +266 S 0.140 +267 A 0.108 +268 W 0.088 +269 K 0.078 +270 W 0.078 +271 A 0.085 +272 L 0.090 +273 G 0.095 +274 P 0.103 +275 V 0.107 +276 V 0.099 +277 L 0.079 +278 Y 0.057 +279 A 0.043 +280 C 0.040 +281 E 0.047 +282 R 0.061 +283 I 0.076 +284 I 0.083 +285 R 0.083 +286 F 0.081 +287 W 0.086 +288 R 0.097 +289 S 0.101 +290 H 0.089 +291 Q 0.070 +292 E 0.055 +293 V 0.045 +294 V 0.038 +295 I 0.033 +296 T 0.031 +297 K 0.033 +298 V 0.039 +299 V 0.046 +300 S 0.055 +301 H 0.063 +302 P 0.066 +303 S 0.060 +304 A 0.046 +305 V 0.031 +306 L 0.021 +307 E 0.017 +308 L 0.017 +309 H 0.019 +310 M 0.023 +311 K 0.029 +312 K 0.039 +313 R 0.052 +314 D 0.064 +315 F 0.072 +316 K 0.076 +317 M 0.076 +318 A 0.071 +319 P 0.061 +320 G 0.050 +321 Q 0.043 +322 Y 0.039 +323 I 0.038 +324 F 0.040 +325 I 0.045 +326 Q 0.052 +327 C 0.058 +328 P 0.062 +329 S 0.065 +330 V 0.068 +331 S 0.069 +332 P 0.071 +333 L 0.069 +334 E 0.062 +335 W 0.051 +336 H 0.039 +337 P 0.029 +338 F 0.025 +339 T 0.027 +340 L 0.033 +341 T 0.041 +342 S 0.048 +343 A 0.055 +344 P 0.061 +345 Q 0.065 +346 E 0.063 +347 D 0.052 +348 F 0.036 +349 F 0.023 +350 S 0.017 +351 V 0.020 +352 H 0.031 +353 I 0.048 +354 R 0.066 +355 A 0.080 +356 S 0.084 +357 G 0.080 +358 D 0.072 +359 W 0.063 +360 T 0.058 +361 E 0.057 +362 A 0.059 +363 L 0.062 +364 L 0.066 +365 K 0.073 +366 A 0.083 +367 F 0.101 +368 R 0.137 +369 V 0.189 +370 E 0.245 +371 G 0.286 +372 Q 0.313 +373 A 0.329 +374 P 0.332 +375 S 0.325 +376 E 0.312 +377 L 0.290 +378 C 0.256 +379 S 0.211 +380 M 0.164 +381 P 0.123 +382 R 0.097 +383 L 0.089 +384 A 0.091 +385 V 0.094 +386 D 0.095 +387 G 0.097 +388 P 0.109 +389 F 0.133 +390 G 0.156 +391 G 0.163 +392 S 0.154 +393 L 0.138 +394 A 0.122 +395 D 0.105 +396 V 0.087 +397 F 0.076 +398 H 0.078 +399 Y 0.088 +400 P 0.095 +401 V 0.095 +402 S 0.091 +403 V 0.092 +404 C 0.096 +405 I 0.101 +406 A 0.103 +407 T 0.104 +408 G 0.108 +409 I 0.118 +410 G 0.125 +411 V 0.124 +412 T 0.112 +413 P 0.095 +414 F 0.078 +415 A 0.067 +416 S 0.061 +417 L 0.058 +418 L 0.056 +419 K 0.053 +420 S 0.047 +421 V 0.041 +422 W 0.039 +423 Y 0.041 +424 K 0.046 +425 C 0.054 +426 C 0.067 +427 E 0.084 +428 S 0.100 +429 Q 0.113 +430 S 0.122 +431 L 0.125 +432 P 0.119 +433 E 0.104 +434 L 0.086 +435 S 0.074 +436 K 0.070 +437 V 0.069 +438 Y 0.062 +439 F 0.052 +440 Y 0.048 +441 W 0.053 +442 I 0.064 +443 C 0.073 +444 R 0.078 +445 D 0.081 +446 A 0.085 +447 G 0.081 +448 A 0.068 +449 F 0.050 +450 E 0.038 +451 W 0.032 +452 F 0.032 +453 A 0.034 +454 D 0.035 +455 L 0.034 +456 L 0.033 +457 L 0.033 +458 S 0.037 +459 L 0.047 +460 E 0.061 +461 T 0.070 +462 R 0.069 +463 M 0.064 +464 S 0.062 +465 E 0.063 +466 Q 0.067 +467 G 0.076 +468 K 0.088 +469 A 0.090 +470 H 0.076 +471 L 0.053 +472 L 0.036 +473 S 0.030 +474 Y 0.032 +475 H 0.040 +476 I 0.052 +477 Y 0.064 +478 L 0.076 +479 T 0.085 +480 G 0.089 +481 W 0.093 +482 D 0.101 +483 E 0.118 +484 N 0.142 +485 Q 0.171 +486 A 0.202 +487 I 0.230 +488 H 0.248 +489 I 0.259 +490 A 0.265 +491 L 0.263 +492 H 0.252 +493 W 0.238 +494 D 0.226 +495 E 0.221 +496 S 0.227 +497 L 0.240 +498 D 0.241 +499 V 0.222 +500 I 0.197 +501 T 0.185 +502 G 0.182 +503 L 0.173 +504 K 0.160 +505 Q 0.150 +506 K 0.146 +507 A 0.147 +508 F 0.150 +509 Y 0.148 +510 G 0.138 +511 R 0.121 +512 P 0.100 +513 N 0.079 +514 W 0.068 +515 N 0.068 +516 D 0.068 +517 E 0.063 +518 F 0.061 +519 K 0.071 +520 Q 0.085 +521 I 0.092 +522 A 0.094 +523 Y 0.100 +524 N 0.112 +525 H 0.123 +526 P 0.123 +527 S 0.112 +528 S 0.098 +529 S 0.087 +530 I 0.080 +531 G 0.073 +532 V 0.064 +533 F 0.054 +534 F 0.047 +535 C 0.047 +536 G 0.052 +537 S 0.059 +538 K 0.062 +539 A 0.064 +540 M 0.072 +541 S 0.082 +542 K 0.088 +543 T 0.087 +544 L 0.086 +545 Q 0.091 +546 K 0.095 +547 M 0.093 +548 C 0.087 +549 R 0.082 +550 L 0.082 +551 Y 0.089 +552 S 0.106 +553 S 0.129 +554 V 0.152 +555 D 0.170 +556 P 0.181 +557 R 0.187 +558 G 0.182 +559 V 0.164 +560 H 0.134 +561 F 0.104 +562 Y 0.085 +563 Y 0.085 +564 N 0.100 +565 K 0.126 +566 E 0.157 +567 N 0.190 +568 F 0.212 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000023802.5_ENSMUST00000115800.2_GN:Nox3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:20.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000023802.5_ENSMUST00000115800.2_GN:Nox3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:20.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2d02d7d33656caf42aaeff29eb7202bb8fa30016 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000023802.5_ENSMUST00000115800.2_GN:Nox3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:20.caid @@ -0,0 +1,589 @@ +>ENSMUSG00000023802.5|ENSMUST00000115800.2|GN:Nox3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:20 +1 M 0.351 +2 Q 0.360 +3 R 0.378 +4 T 0.396 +5 G 0.403 +6 S 0.411 +7 N 0.434 +8 G 0.450 +9 R 0.437 +10 K 0.422 +11 G 0.429 +12 I 0.438 +13 T 0.423 +14 C 0.395 +15 W 0.373 +16 S 0.353 +17 K 0.325 +18 R 0.293 +19 S 0.261 +20 V 0.222 +21 M 0.177 +22 P 0.140 +23 V 0.120 +24 C 0.112 +25 W 0.107 +26 I 0.108 +27 L 0.117 +28 N 0.126 +29 E 0.123 +30 S 0.107 +31 G 0.086 +32 S 0.067 +33 F 0.052 +34 V 0.043 +35 V 0.037 +36 A 0.035 +37 L 0.036 +38 L 0.040 +39 W 0.050 +40 L 0.065 +41 A 0.074 +42 V 0.073 +43 N 0.066 +44 A 0.057 +45 Y 0.050 +46 L 0.047 +47 F 0.047 +48 I 0.047 +49 D 0.047 +50 T 0.048 +51 F 0.049 +52 F 0.052 +53 W 0.059 +54 Y 0.068 +55 T 0.074 +56 E 0.076 +57 E 0.077 +58 E 0.075 +59 A 0.070 +60 F 0.064 +61 F 0.064 +62 Y 0.067 +63 T 0.074 +64 R 0.085 +65 V 0.103 +66 I 0.118 +67 L 0.120 +68 G 0.107 +69 S 0.089 +70 A 0.074 +71 L 0.068 +72 A 0.068 +73 W 0.071 +74 A 0.083 +75 R 0.100 +76 A 0.111 +77 S 0.120 +78 A 0.137 +79 V 0.154 +80 C 0.151 +81 L 0.129 +82 N 0.106 +83 F 0.091 +84 N 0.082 +85 C 0.078 +86 M 0.075 +87 L 0.072 +88 I 0.066 +89 L 0.059 +90 L 0.052 +91 P 0.049 +92 V 0.049 +93 S 0.047 +94 R 0.043 +95 N 0.038 +96 F 0.034 +97 I 0.031 +98 S 0.032 +99 L 0.041 +100 V 0.056 +101 R 0.073 +102 G 0.086 +103 T 0.096 +104 S 0.100 +105 V 0.096 +106 C 0.091 +107 C 0.094 +108 R 0.102 +109 G 0.108 +110 P 0.112 +111 W 0.114 +112 R 0.111 +113 R 0.103 +114 Q 0.092 +115 L 0.084 +116 D 0.078 +117 K 0.072 +118 N 0.067 +119 L 0.057 +120 N 0.046 +121 F 0.037 +122 H 0.032 +123 K 0.035 +124 L 0.046 +125 V 0.060 +126 A 0.067 +127 Y 0.063 +128 G 0.056 +129 I 0.052 +130 A 0.049 +131 V 0.047 +132 N 0.050 +133 S 0.051 +134 V 0.048 +135 I 0.042 +136 H 0.039 +137 I 0.042 +138 V 0.047 +139 A 0.051 +140 H 0.052 +141 L 0.049 +142 F 0.045 +143 N 0.045 +144 L 0.045 +145 E 0.043 +146 R 0.041 +147 Y 0.043 +148 H 0.054 +149 L 0.072 +150 G 0.089 +151 Q 0.099 +152 A 0.099 +153 K 0.096 +154 D 0.093 +155 A 0.092 +156 E 0.086 +157 G 0.076 +158 L 0.067 +159 L 0.065 +160 A 0.069 +161 A 0.080 +162 L 0.100 +163 S 0.130 +164 K 0.164 +165 L 0.199 +166 G 0.229 +167 D 0.251 +168 A 0.259 +169 P 0.256 +170 N 0.252 +171 E 0.259 +172 S 0.271 +173 Y 0.275 +174 L 0.268 +175 N 0.251 +176 P 0.224 +177 V 0.196 +178 R 0.177 +179 T 0.173 +180 F 0.182 +181 D 0.197 +182 M 0.208 +183 G 0.203 +184 T 0.183 +185 T 0.161 +186 T 0.148 +187 E 0.137 +188 L 0.119 +189 L 0.097 +190 M 0.080 +191 T 0.072 +192 V 0.069 +193 S 0.068 +194 G 0.066 +195 I 0.069 +196 T 0.078 +197 G 0.091 +198 L 0.100 +199 G 0.104 +200 I 0.105 +201 S 0.104 +202 L 0.101 +203 A 0.097 +204 L 0.091 +205 V 0.084 +206 F 0.078 +207 I 0.074 +208 M 0.071 +209 T 0.067 +210 S 0.068 +211 S 0.067 +212 T 0.061 +213 E 0.057 +214 F 0.059 +215 I 0.061 +216 R 0.057 +217 R 0.050 +218 S 0.046 +219 S 0.042 +220 Y 0.038 +221 E 0.035 +222 L 0.035 +223 F 0.035 +224 W 0.035 +225 Y 0.036 +226 T 0.039 +227 H 0.044 +228 H 0.048 +229 I 0.049 +230 F 0.047 +231 V 0.041 +232 F 0.037 +233 F 0.039 +234 F 0.044 +235 I 0.051 +236 S 0.059 +237 L 0.067 +238 A 0.068 +239 I 0.065 +240 H 0.067 +241 G 0.080 +242 G 0.100 +243 G 0.117 +244 R 0.127 +245 I 0.132 +246 I 0.140 +247 R 0.151 +248 G 0.155 +249 Q 0.147 +250 T 0.136 +251 P 0.127 +252 E 0.114 +253 S 0.096 +254 L 0.080 +255 R 0.074 +256 L 0.077 +257 H 0.078 +258 N 0.072 +259 V 0.060 +260 T 0.050 +261 Y 0.043 +262 C 0.043 +263 R 0.046 +264 D 0.050 +265 H 0.054 +266 Y 0.057 +267 A 0.059 +268 E 0.062 +269 W 0.068 +270 Q 0.083 +271 A 0.105 +272 A 0.134 +273 A 0.163 +274 L 0.190 +275 C 0.215 +276 P 0.236 +277 V 0.250 +278 P 0.252 +279 Q 0.246 +280 F 0.242 +281 S 0.247 +282 G 0.259 +283 K 0.261 +284 E 0.235 +285 P 0.188 +286 S 0.141 +287 A 0.109 +288 W 0.089 +289 K 0.078 +290 W 0.078 +291 A 0.084 +292 L 0.090 +293 G 0.095 +294 P 0.103 +295 V 0.107 +296 V 0.099 +297 L 0.079 +298 Y 0.057 +299 A 0.043 +300 C 0.040 +301 E 0.047 +302 R 0.061 +303 I 0.076 +304 I 0.083 +305 R 0.083 +306 F 0.081 +307 W 0.086 +308 R 0.098 +309 S 0.101 +310 H 0.090 +311 Q 0.071 +312 E 0.056 +313 V 0.046 +314 V 0.038 +315 I 0.033 +316 T 0.031 +317 K 0.033 +318 V 0.039 +319 V 0.047 +320 S 0.055 +321 H 0.064 +322 P 0.067 +323 S 0.061 +324 A 0.046 +325 V 0.032 +326 L 0.022 +327 E 0.017 +328 L 0.017 +329 H 0.020 +330 M 0.024 +331 K 0.030 +332 K 0.040 +333 R 0.052 +334 D 0.065 +335 F 0.074 +336 K 0.078 +337 M 0.078 +338 A 0.072 +339 P 0.062 +340 G 0.051 +341 Q 0.043 +342 Y 0.040 +343 I 0.039 +344 F 0.041 +345 I 0.046 +346 Q 0.053 +347 C 0.059 +348 P 0.063 +349 S 0.066 +350 V 0.068 +351 S 0.070 +352 P 0.071 +353 L 0.069 +354 E 0.063 +355 W 0.051 +356 H 0.039 +357 P 0.029 +358 F 0.025 +359 T 0.027 +360 L 0.033 +361 T 0.041 +362 S 0.048 +363 A 0.055 +364 P 0.061 +365 Q 0.065 +366 E 0.063 +367 D 0.052 +368 F 0.035 +369 F 0.022 +370 S 0.017 +371 V 0.020 +372 H 0.031 +373 I 0.047 +374 R 0.065 +375 A 0.078 +376 S 0.083 +377 G 0.079 +378 D 0.071 +379 W 0.062 +380 T 0.057 +381 E 0.056 +382 A 0.057 +383 L 0.057 +384 L 0.057 +385 K 0.061 +386 A 0.072 +387 F 0.094 +388 R 0.132 +389 V 0.185 +390 E 0.240 +391 G 0.282 +392 Q 0.309 +393 A 0.325 +394 P 0.329 +395 S 0.322 +396 E 0.309 +397 L 0.287 +398 C 0.253 +399 S 0.208 +400 M 0.161 +401 P 0.122 +402 R 0.096 +403 L 0.088 +404 A 0.090 +405 V 0.093 +406 D 0.094 +407 G 0.097 +408 P 0.109 +409 F 0.131 +410 G 0.153 +411 G 0.160 +412 S 0.150 +413 L 0.134 +414 A 0.119 +415 D 0.102 +416 V 0.085 +417 F 0.075 +418 H 0.077 +419 Y 0.087 +420 P 0.095 +421 V 0.094 +422 S 0.091 +423 V 0.092 +424 C 0.097 +425 I 0.103 +426 A 0.105 +427 T 0.106 +428 G 0.110 +429 I 0.119 +430 G 0.126 +431 V 0.125 +432 T 0.113 +433 P 0.096 +434 F 0.079 +435 A 0.067 +436 S 0.060 +437 L 0.057 +438 L 0.056 +439 K 0.052 +440 S 0.046 +441 V 0.041 +442 W 0.039 +443 Y 0.041 +444 K 0.046 +445 C 0.054 +446 C 0.067 +447 E 0.084 +448 S 0.101 +449 Q 0.114 +450 S 0.122 +451 L 0.125 +452 P 0.119 +453 E 0.104 +454 L 0.086 +455 S 0.074 +456 K 0.070 +457 V 0.069 +458 Y 0.062 +459 F 0.052 +460 Y 0.048 +461 W 0.053 +462 I 0.064 +463 C 0.073 +464 R 0.078 +465 D 0.081 +466 A 0.085 +467 G 0.081 +468 A 0.067 +469 F 0.050 +470 E 0.038 +471 W 0.032 +472 F 0.032 +473 A 0.034 +474 D 0.035 +475 L 0.034 +476 L 0.033 +477 L 0.033 +478 S 0.037 +479 L 0.047 +480 E 0.061 +481 T 0.070 +482 R 0.069 +483 M 0.064 +484 S 0.061 +485 E 0.062 +486 Q 0.066 +487 G 0.076 +488 K 0.088 +489 A 0.090 +490 H 0.076 +491 L 0.054 +492 L 0.037 +493 S 0.030 +494 Y 0.032 +495 H 0.041 +496 I 0.052 +497 Y 0.063 +498 L 0.074 +499 T 0.081 +500 G 0.086 +501 W 0.089 +502 D 0.097 +503 E 0.113 +504 N 0.137 +505 Q 0.166 +506 A 0.197 +507 I 0.225 +508 H 0.242 +509 I 0.253 +510 A 0.259 +511 L 0.257 +512 H 0.246 +513 W 0.232 +514 D 0.220 +515 E 0.216 +516 S 0.224 +517 L 0.239 +518 D 0.242 +519 V 0.223 +520 I 0.199 +521 T 0.186 +522 G 0.182 +523 L 0.173 +524 K 0.159 +525 Q 0.148 +526 K 0.143 +527 A 0.144 +528 F 0.147 +529 Y 0.146 +530 G 0.137 +531 R 0.120 +532 P 0.099 +533 N 0.079 +534 W 0.068 +535 N 0.068 +536 D 0.068 +537 E 0.063 +538 F 0.061 +539 K 0.072 +540 Q 0.085 +541 I 0.092 +542 A 0.094 +543 Y 0.100 +544 N 0.112 +545 H 0.123 +546 P 0.123 +547 S 0.112 +548 S 0.098 +549 S 0.087 +550 I 0.080 +551 G 0.073 +552 V 0.064 +553 F 0.054 +554 F 0.047 +555 C 0.047 +556 G 0.052 +557 S 0.059 +558 K 0.062 +559 A 0.064 +560 M 0.072 +561 S 0.082 +562 K 0.088 +563 T 0.087 +564 L 0.086 +565 Q 0.091 +566 K 0.096 +567 M 0.093 +568 C 0.088 +569 R 0.083 +570 L 0.081 +571 Y 0.088 +572 S 0.104 +573 S 0.127 +574 V 0.150 +575 D 0.168 +576 P 0.180 +577 R 0.185 +578 G 0.181 +579 V 0.163 +580 H 0.134 +581 F 0.104 +582 Y 0.085 +583 Y 0.084 +584 N 0.099 +585 K 0.124 +586 E 0.155 +587 N 0.186 +588 F 0.209 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024006.18_ENSMUST00000119274.3_GN:Stk38_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024006.18_ENSMUST00000119274.3_GN:Stk38_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b3f07e37fd2718d1242976a39dd6e2fa6d573eb6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024006.18_ENSMUST00000119274.3_GN:Stk38_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,466 @@ +>ENSMUSG00000024006.18|ENSMUST00000119274.3|GN:Stk38|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.408 +2 A 0.438 +3 M 0.485 +4 T 0.530 +5 G 0.559 +6 S 0.571 +7 T 0.579 +8 P 0.590 +9 C 0.592 +10 S 0.570 +11 S 0.514 +12 M 0.433 +13 S 0.352 +14 N 0.294 +15 H 0.259 +16 T 0.236 +17 K 0.224 +18 E 0.223 +19 R 0.233 +20 V 0.248 +21 T 0.265 +22 M 0.282 +23 T 0.296 +24 K 0.300 +25 V 0.296 +26 T 0.289 +27 L 0.285 +28 E 0.283 +29 N 0.279 +30 F 0.266 +31 Y 0.251 +32 S 0.246 +33 N 0.249 +34 L 0.245 +35 I 0.230 +36 A 0.213 +37 Q 0.196 +38 H 0.177 +39 E 0.158 +40 E 0.141 +41 R 0.129 +42 E 0.124 +43 M 0.123 +44 R 0.121 +45 Q 0.117 +46 K 0.109 +47 K 0.094 +48 L 0.083 +49 E 0.084 +50 K 0.093 +51 V 0.098 +52 M 0.102 +53 E 0.117 +54 E 0.152 +55 E 0.191 +56 G 0.208 +57 L 0.190 +58 K 0.152 +59 D 0.118 +60 E 0.097 +61 E 0.085 +62 K 0.081 +63 R 0.087 +64 L 0.099 +65 R 0.108 +66 R 0.113 +67 S 0.118 +68 A 0.130 +69 H 0.142 +70 A 0.140 +71 R 0.125 +72 K 0.110 +73 E 0.105 +74 T 0.107 +75 E 0.113 +76 F 0.120 +77 L 0.130 +78 R 0.145 +79 L 0.159 +80 K 0.161 +81 R 0.151 +82 T 0.134 +83 R 0.111 +84 L 0.086 +85 G 0.067 +86 L 0.058 +87 E 0.055 +88 D 0.053 +89 F 0.049 +90 E 0.044 +91 S 0.042 +92 L 0.042 +93 K 0.041 +94 V 0.039 +95 I 0.036 +96 G 0.037 +97 R 0.043 +98 G 0.053 +99 A 0.060 +100 F 0.062 +101 G 0.056 +102 E 0.048 +103 V 0.038 +104 R 0.032 +105 L 0.029 +106 V 0.029 +107 Q 0.030 +108 K 0.031 +109 K 0.033 +110 D 0.038 +111 T 0.042 +112 G 0.043 +113 H 0.040 +114 V 0.035 +115 Y 0.033 +116 A 0.031 +117 M 0.031 +118 K 0.032 +119 I 0.035 +120 L 0.036 +121 R 0.035 +122 K 0.037 +123 A 0.043 +124 D 0.048 +125 M 0.050 +126 L 0.052 +127 E 0.059 +128 K 0.069 +129 E 0.077 +130 Q 0.080 +131 V 0.077 +132 G 0.071 +133 H 0.063 +134 I 0.055 +135 R 0.052 +136 A 0.054 +137 E 0.053 +138 R 0.049 +139 D 0.044 +140 I 0.042 +141 L 0.041 +142 V 0.045 +143 E 0.056 +144 A 0.070 +145 D 0.075 +146 S 0.068 +147 L 0.054 +148 W 0.043 +149 V 0.036 +150 V 0.030 +151 K 0.023 +152 M 0.017 +153 F 0.015 +154 Y 0.015 +155 S 0.016 +156 F 0.019 +157 Q 0.023 +158 D 0.027 +159 K 0.029 +160 L 0.028 +161 N 0.023 +162 L 0.019 +163 Y 0.016 +164 L 0.015 +165 I 0.016 +166 M 0.018 +167 E 0.020 +168 F 0.026 +169 L 0.036 +170 P 0.048 +171 G 0.053 +172 G 0.051 +173 D 0.044 +174 M 0.037 +175 M 0.035 +176 T 0.037 +177 L 0.042 +178 L 0.047 +179 M 0.048 +180 K 0.045 +181 K 0.041 +182 D 0.040 +183 T 0.043 +184 L 0.045 +185 T 0.043 +186 E 0.042 +187 E 0.045 +188 E 0.050 +189 T 0.051 +190 Q 0.049 +191 F 0.049 +192 Y 0.052 +193 I 0.053 +194 A 0.054 +195 E 0.055 +196 T 0.053 +197 V 0.046 +198 L 0.038 +199 A 0.034 +200 I 0.031 +201 D 0.029 +202 S 0.027 +203 I 0.028 +204 H 0.030 +205 Q 0.034 +206 L 0.039 +207 G 0.043 +208 F 0.045 +209 I 0.046 +210 H 0.048 +211 R 0.052 +212 D 0.056 +213 I 0.056 +214 K 0.054 +215 P 0.052 +216 D 0.054 +217 N 0.054 +218 L 0.052 +219 L 0.047 +220 L 0.045 +221 D 0.048 +222 S 0.057 +223 K 0.067 +224 G 0.070 +225 H 0.069 +226 V 0.069 +227 K 0.075 +228 L 0.087 +229 S 0.104 +230 D 0.130 +231 F 0.168 +232 G 0.202 +233 L 0.216 +234 C 0.208 +235 T 0.200 +236 G 0.211 +237 L 0.239 +238 K 0.270 +239 K 0.298 +240 A 0.322 +241 H 0.339 +242 R 0.345 +243 T 0.342 +244 E 0.334 +245 F 0.327 +246 Y 0.327 +247 R 0.335 +248 N 0.342 +249 L 0.344 +250 N 0.342 +251 H 0.341 +252 S 0.341 +253 L 0.343 +254 P 0.356 +255 S 0.379 +256 D 0.398 +257 F 0.402 +258 T 0.402 +259 F 0.417 +260 Q 0.435 +261 N 0.420 +262 M 0.364 +263 N 0.301 +264 S 0.252 +265 K 0.215 +266 R 0.186 +267 K 0.171 +268 A 0.169 +269 E 0.171 +270 T 0.167 +271 W 0.157 +272 K 0.148 +273 R 0.149 +274 N 0.159 +275 R 0.175 +276 R 0.196 +277 Q 0.222 +278 L 0.250 +279 A 0.275 +280 F 0.296 +281 S 0.311 +282 T 0.318 +283 V 0.317 +284 G 0.317 +285 T 0.322 +286 P 0.328 +287 D 0.322 +288 Y 0.298 +289 I 0.254 +290 A 0.199 +291 P 0.153 +292 E 0.128 +293 V 0.116 +294 F 0.110 +295 M 0.113 +296 Q 0.121 +297 T 0.122 +298 G 0.112 +299 Y 0.093 +300 N 0.078 +301 K 0.082 +302 L 0.105 +303 C 0.133 +304 D 0.143 +305 W 0.139 +306 W 0.137 +307 S 0.141 +308 L 0.134 +309 G 0.116 +310 V 0.102 +311 I 0.095 +312 M 0.087 +313 Y 0.075 +314 E 0.067 +315 M 0.062 +316 L 0.060 +317 I 0.061 +318 G 0.066 +319 Y 0.075 +320 P 0.084 +321 P 0.091 +322 F 0.093 +323 C 0.092 +324 S 0.090 +325 E 0.091 +326 T 0.089 +327 P 0.082 +328 Q 0.074 +329 E 0.071 +330 T 0.076 +331 Y 0.081 +332 K 0.084 +333 K 0.087 +334 V 0.086 +335 M 0.078 +336 N 0.066 +337 W 0.059 +338 K 0.059 +339 E 0.064 +340 T 0.070 +341 L 0.079 +342 T 0.097 +343 F 0.118 +344 P 0.133 +345 P 0.138 +346 E 0.137 +347 V 0.132 +348 P 0.120 +349 V 0.103 +350 S 0.084 +351 E 0.071 +352 K 0.065 +353 A 0.066 +354 K 0.072 +355 G 0.081 +356 L 0.086 +357 I 0.082 +358 L 0.070 +359 R 0.058 +360 F 0.054 +361 C 0.060 +362 C 0.070 +363 E 0.080 +364 W 0.093 +365 E 0.108 +366 H 0.123 +367 R 0.136 +368 I 0.144 +369 G 0.140 +370 A 0.124 +371 P 0.104 +372 G 0.089 +373 V 0.079 +374 E 0.075 +375 E 0.078 +376 I 0.085 +377 K 0.091 +378 N 0.098 +379 N 0.102 +380 L 0.097 +381 F 0.088 +382 F 0.081 +383 E 0.079 +384 G 0.077 +385 V 0.073 +386 D 0.065 +387 W 0.057 +388 E 0.055 +389 H 0.058 +390 I 0.061 +391 R 0.065 +392 E 0.078 +393 R 0.097 +394 P 0.114 +395 A 0.123 +396 A 0.128 +397 I 0.133 +398 S 0.138 +399 I 0.143 +400 E 0.150 +401 I 0.160 +402 K 0.176 +403 S 0.191 +404 I 0.195 +405 D 0.186 +406 D 0.175 +407 T 0.168 +408 S 0.166 +409 N 0.173 +410 F 0.189 +411 D 0.209 +412 E 0.231 +413 F 0.261 +414 P 0.304 +415 E 0.363 +416 S 0.431 +417 D 0.485 +418 I 0.511 +419 L 0.519 +420 K 0.533 +421 P 0.560 +422 T 0.587 +423 V 0.603 +424 T 0.604 +425 T 0.593 +426 S 0.571 +427 S 0.545 +428 H 0.523 +429 P 0.502 +430 E 0.469 +431 T 0.423 +432 D 0.376 +433 Y 0.338 +434 K 0.312 +435 N 0.284 +436 K 0.247 +437 D 0.209 +438 W 0.191 +439 V 0.202 +440 F 0.224 +441 I 0.232 +442 N 0.213 +443 Y 0.180 +444 T 0.153 +445 Y 0.148 +446 K 0.172 +447 R 0.228 +448 F 0.313 +449 E 0.408 +450 G 0.487 +451 L 0.535 +452 T 0.556 +453 A 0.567 +454 R 0.577 +455 G 0.580 +456 A 0.556 +457 I 0.508 +458 P 0.462 +459 S 0.439 +460 Y 0.442 +461 M 0.461 +462 K 0.489 +463 A 0.502 +464 A 0.484 +465 K 0.453 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024006.18_ENSMUST00000119274.3_GN:Stk38_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:84.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024006.18_ENSMUST00000119274.3_GN:Stk38_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:84.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1ca6e2c5070d0225a7cffca184ef0d6ac97b45b9 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024006.18_ENSMUST00000119274.3_GN:Stk38_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:84.caid @@ -0,0 +1,550 @@ +>ENSMUSG00000024006.18|ENSMUST00000119274.3|GN:Stk38|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:84 +1 M 0.367 +2 R 0.379 +3 S 0.395 +4 L 0.405 +5 S 0.405 +6 R 0.419 +7 G 0.467 +8 G 0.527 +9 P 0.563 +10 S 0.582 +11 P 0.599 +12 Q 0.611 +13 S 0.614 +14 E 0.615 +15 G 0.623 +16 V 0.630 +17 P 0.627 +18 G 0.611 +19 E 0.583 +20 P 0.549 +21 W 0.528 +22 P 0.537 +23 L 0.568 +24 R 0.598 +25 A 0.606 +26 A 0.594 +27 V 0.581 +28 F 0.580 +29 S 0.585 +30 G 0.585 +31 S 0.577 +32 W 0.571 +33 G 0.571 +34 S 0.561 +35 S 0.543 +36 F 0.535 +37 C 0.548 +38 P 0.557 +39 V 0.544 +40 L 0.529 +41 S 0.549 +42 R 0.595 +43 I 0.619 +44 G 0.605 +45 S 0.596 +46 C 0.628 +47 A 0.669 +48 H 0.684 +49 S 0.686 +50 E 0.694 +51 S 0.712 +52 P 0.736 +53 A 0.759 +54 C 0.774 +55 R 0.779 +56 G 0.779 +57 R 0.778 +58 S 0.776 +59 G 0.771 +60 A 0.759 +61 A 0.733 +62 R 0.682 +63 T 0.613 +64 S 0.567 +65 R 0.564 +66 L 0.563 +67 R 0.536 +68 R 0.519 +69 L 0.543 +70 C 0.578 +71 S 0.594 +72 R 0.606 +73 R 0.633 +74 P 0.670 +75 R 0.699 +76 A 0.708 +77 S 0.698 +78 L 0.687 +79 P 0.700 +80 P 0.737 +81 G 0.772 +82 S 0.789 +83 A 0.791 +84 A 0.788 +85 M 0.785 +86 A 0.781 +87 M 0.774 +88 T 0.762 +89 G 0.743 +90 S 0.723 +91 T 0.712 +92 P 0.710 +93 C 0.700 +94 S 0.663 +95 S 0.593 +96 M 0.507 +97 S 0.437 +98 N 0.390 +99 H 0.352 +100 T 0.313 +101 K 0.287 +102 E 0.278 +103 R 0.278 +104 V 0.281 +105 T 0.290 +106 M 0.304 +107 T 0.313 +108 K 0.309 +109 V 0.300 +110 T 0.292 +111 L 0.285 +112 E 0.276 +113 N 0.265 +114 F 0.248 +115 Y 0.229 +116 S 0.223 +117 N 0.228 +118 L 0.228 +119 I 0.217 +120 A 0.203 +121 Q 0.189 +122 H 0.174 +123 E 0.159 +124 E 0.143 +125 R 0.130 +126 E 0.125 +127 M 0.123 +128 R 0.121 +129 Q 0.116 +130 K 0.106 +131 K 0.090 +132 L 0.078 +133 E 0.078 +134 K 0.084 +135 V 0.085 +136 M 0.084 +137 E 0.095 +138 E 0.123 +139 E 0.158 +140 G 0.174 +141 L 0.159 +142 K 0.127 +143 D 0.099 +144 E 0.083 +145 E 0.076 +146 K 0.075 +147 R 0.083 +148 L 0.096 +149 R 0.105 +150 R 0.108 +151 S 0.112 +152 A 0.123 +153 H 0.134 +154 A 0.130 +155 R 0.112 +156 K 0.096 +157 E 0.089 +158 T 0.091 +159 E 0.096 +160 F 0.102 +161 L 0.110 +162 R 0.124 +163 L 0.139 +164 K 0.146 +165 R 0.143 +166 T 0.130 +167 R 0.110 +168 L 0.086 +169 G 0.066 +170 L 0.056 +171 E 0.053 +172 D 0.050 +173 F 0.047 +174 E 0.044 +175 S 0.043 +176 L 0.043 +177 K 0.042 +178 V 0.040 +179 I 0.036 +180 G 0.036 +181 R 0.040 +182 G 0.048 +183 A 0.055 +184 F 0.057 +185 G 0.054 +186 E 0.047 +187 V 0.039 +188 R 0.032 +189 L 0.030 +190 V 0.029 +191 Q 0.029 +192 K 0.028 +193 K 0.029 +194 D 0.032 +195 T 0.035 +196 G 0.036 +197 H 0.033 +198 V 0.031 +199 Y 0.031 +200 A 0.031 +201 M 0.030 +202 K 0.032 +203 I 0.035 +204 L 0.036 +205 R 0.035 +206 K 0.036 +207 A 0.042 +208 D 0.047 +209 M 0.050 +210 L 0.053 +211 E 0.061 +212 K 0.072 +213 E 0.081 +214 Q 0.082 +215 V 0.079 +216 G 0.073 +217 H 0.065 +218 I 0.057 +219 R 0.054 +220 A 0.056 +221 E 0.055 +222 R 0.049 +223 D 0.043 +224 I 0.040 +225 L 0.038 +226 V 0.041 +227 E 0.051 +228 A 0.063 +229 D 0.066 +230 S 0.058 +231 L 0.046 +232 W 0.037 +233 V 0.032 +234 V 0.026 +235 K 0.019 +236 M 0.014 +237 F 0.013 +238 Y 0.013 +239 S 0.014 +240 F 0.016 +241 Q 0.020 +242 D 0.024 +243 K 0.027 +244 L 0.025 +245 N 0.022 +246 L 0.018 +247 Y 0.015 +248 L 0.014 +249 I 0.015 +250 M 0.016 +251 E 0.019 +252 F 0.024 +253 L 0.035 +254 P 0.047 +255 G 0.053 +256 G 0.051 +257 D 0.044 +258 M 0.038 +259 M 0.035 +260 T 0.037 +261 L 0.042 +262 L 0.046 +263 M 0.047 +264 K 0.043 +265 K 0.039 +266 D 0.038 +267 T 0.040 +268 L 0.042 +269 T 0.042 +270 E 0.042 +271 E 0.045 +272 E 0.050 +273 T 0.051 +274 Q 0.049 +275 F 0.049 +276 Y 0.052 +277 I 0.054 +278 A 0.054 +279 E 0.056 +280 T 0.054 +281 V 0.047 +282 L 0.039 +283 A 0.034 +284 I 0.030 +285 D 0.028 +286 S 0.026 +287 I 0.027 +288 H 0.030 +289 Q 0.034 +290 L 0.039 +291 G 0.043 +292 F 0.045 +293 I 0.047 +294 H 0.049 +295 R 0.054 +296 D 0.058 +297 I 0.058 +298 K 0.055 +299 P 0.053 +300 D 0.054 +301 N 0.054 +302 L 0.051 +303 L 0.047 +304 L 0.045 +305 D 0.050 +306 S 0.060 +307 K 0.070 +308 G 0.074 +309 H 0.072 +310 V 0.072 +311 K 0.079 +312 L 0.090 +313 S 0.107 +314 D 0.133 +315 F 0.169 +316 G 0.202 +317 L 0.217 +318 C 0.211 +319 T 0.205 +320 G 0.218 +321 L 0.248 +322 K 0.282 +323 K 0.313 +324 A 0.341 +325 H 0.362 +326 R 0.373 +327 T 0.373 +328 E 0.364 +329 F 0.352 +330 Y 0.348 +331 R 0.356 +332 N 0.366 +333 L 0.370 +334 N 0.367 +335 H 0.362 +336 S 0.358 +337 L 0.360 +338 P 0.372 +339 S 0.394 +340 D 0.412 +341 F 0.414 +342 T 0.411 +343 F 0.425 +344 Q 0.442 +345 N 0.427 +346 M 0.371 +347 N 0.307 +348 S 0.260 +349 K 0.226 +350 R 0.197 +351 K 0.179 +352 A 0.174 +353 E 0.174 +354 T 0.169 +355 W 0.158 +356 K 0.150 +357 R 0.153 +358 N 0.165 +359 R 0.181 +360 R 0.205 +361 Q 0.236 +362 L 0.265 +363 A 0.287 +364 F 0.301 +365 S 0.312 +366 T 0.319 +367 V 0.321 +368 G 0.325 +369 T 0.335 +370 P 0.342 +371 D 0.335 +372 Y 0.310 +373 I 0.266 +374 A 0.209 +375 P 0.161 +376 E 0.134 +377 V 0.121 +378 F 0.114 +379 M 0.117 +380 Q 0.124 +381 T 0.126 +382 G 0.115 +383 Y 0.097 +384 N 0.083 +385 K 0.087 +386 L 0.113 +387 C 0.143 +388 D 0.155 +389 W 0.150 +390 W 0.146 +391 S 0.148 +392 L 0.140 +393 G 0.122 +394 V 0.108 +395 I 0.101 +396 M 0.093 +397 Y 0.081 +398 E 0.072 +399 M 0.067 +400 L 0.065 +401 I 0.064 +402 G 0.068 +403 Y 0.076 +404 P 0.084 +405 P 0.090 +406 F 0.091 +407 C 0.090 +408 S 0.088 +409 E 0.088 +410 T 0.087 +411 P 0.081 +412 Q 0.072 +413 E 0.070 +414 T 0.075 +415 Y 0.080 +416 K 0.084 +417 K 0.088 +418 V 0.089 +419 M 0.080 +420 N 0.066 +421 W 0.057 +422 K 0.056 +423 E 0.060 +424 T 0.065 +425 L 0.074 +426 T 0.092 +427 F 0.113 +428 P 0.127 +429 P 0.131 +430 E 0.129 +431 V 0.124 +432 P 0.114 +433 V 0.098 +434 S 0.081 +435 E 0.069 +436 K 0.064 +437 A 0.065 +438 K 0.070 +439 G 0.078 +440 L 0.083 +441 I 0.081 +442 L 0.070 +443 R 0.058 +444 F 0.055 +445 C 0.062 +446 C 0.071 +447 E 0.082 +448 W 0.095 +449 E 0.111 +450 H 0.127 +451 R 0.143 +452 I 0.152 +453 G 0.148 +454 A 0.129 +455 P 0.108 +456 G 0.091 +457 V 0.080 +458 E 0.076 +459 E 0.080 +460 I 0.087 +461 K 0.094 +462 N 0.101 +463 N 0.104 +464 L 0.099 +465 F 0.089 +466 F 0.081 +467 E 0.077 +468 G 0.075 +469 V 0.071 +470 D 0.063 +471 W 0.055 +472 E 0.053 +473 H 0.056 +474 I 0.060 +475 R 0.065 +476 E 0.078 +477 R 0.098 +478 P 0.117 +479 A 0.127 +480 A 0.133 +481 I 0.139 +482 S 0.147 +483 I 0.154 +484 E 0.162 +485 I 0.173 +486 K 0.188 +487 S 0.201 +488 I 0.205 +489 D 0.196 +490 D 0.184 +491 T 0.175 +492 S 0.172 +493 N 0.177 +494 F 0.191 +495 D 0.210 +496 E 0.231 +497 F 0.259 +498 P 0.302 +499 E 0.362 +500 S 0.429 +501 D 0.483 +502 I 0.514 +503 L 0.532 +504 K 0.555 +505 P 0.584 +506 T 0.609 +507 V 0.622 +508 T 0.621 +509 T 0.611 +510 S 0.592 +511 S 0.569 +512 H 0.548 +513 P 0.524 +514 E 0.484 +515 T 0.427 +516 D 0.372 +517 Y 0.330 +518 K 0.302 +519 N 0.277 +520 K 0.245 +521 D 0.217 +522 W 0.208 +523 V 0.228 +524 F 0.258 +525 I 0.268 +526 N 0.246 +527 Y 0.206 +528 T 0.173 +529 Y 0.167 +530 K 0.193 +531 R 0.249 +532 F 0.328 +533 E 0.410 +534 G 0.480 +535 L 0.527 +536 T 0.547 +537 A 0.550 +538 R 0.551 +539 G 0.542 +540 A 0.509 +541 I 0.462 +542 P 0.424 +543 S 0.398 +544 Y 0.378 +545 M 0.377 +546 K 0.406 +547 A 0.443 +548 A 0.459 +549 K 0.457 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024018.19_ENSMUST00000128751.3_GN:Ccdc167_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024018.19_ENSMUST00000128751.3_GN:Ccdc167_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..dfca210ddbdd8a6ecef2b4bac40e3cbc6e07fe9f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024018.19_ENSMUST00000128751.3_GN:Ccdc167_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,98 @@ +>ENSMUSG00000024018.19|ENSMUST00000128751.3|GN:Ccdc167|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.349 +2 T 0.342 +3 K 0.346 +4 K 0.368 +5 K 0.391 +6 R 0.398 +7 E 0.387 +8 N 0.360 +9 L 0.321 +10 G 0.270 +11 V 0.219 +12 A 0.183 +13 Q 0.160 +14 E 0.143 +15 I 0.128 +16 D 0.119 +17 G 0.109 +18 L 0.099 +19 E 0.096 +20 E 0.097 +21 K 0.090 +22 L 0.074 +23 S 0.060 +24 R 0.054 +25 C 0.059 +26 R 0.071 +27 K 0.083 +28 D 0.081 +29 L 0.069 +30 E 0.058 +31 A 0.053 +32 V 0.056 +33 T 0.068 +34 S 0.084 +35 Q 0.094 +36 L 0.100 +37 Y 0.113 +38 R 0.137 +39 A 0.161 +40 E 0.169 +41 L 0.157 +42 S 0.136 +43 P 0.118 +44 E 0.104 +45 D 0.092 +46 R 0.081 +47 R 0.075 +48 S 0.079 +49 L 0.091 +50 E 0.105 +51 K 0.115 +52 E 0.112 +53 K 0.100 +54 H 0.088 +55 T 0.081 +56 L 0.081 +57 M 0.089 +58 N 0.095 +59 K 0.092 +60 A 0.082 +61 S 0.072 +62 K 0.069 +63 Y 0.079 +64 E 0.095 +65 K 0.101 +66 E 0.090 +67 L 0.074 +68 K 0.066 +69 L 0.069 +70 L 0.083 +71 R 0.105 +72 H 0.126 +73 E 0.141 +74 N 0.152 +75 R 0.161 +76 K 0.168 +77 N 0.169 +78 T 0.164 +79 L 0.155 +80 L 0.149 +81 S 0.148 +82 V 0.147 +83 A 0.145 +84 I 0.141 +85 F 0.134 +86 T 0.125 +87 V 0.117 +88 F 0.108 +89 A 0.098 +90 L 0.089 +91 L 0.082 +92 Y 0.078 +93 A 0.075 +94 Y 0.079 +95 W 0.098 +96 T 0.125 +97 M 0.145 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024018.19_ENSMUST00000128751.3_GN:Ccdc167_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024018.19_ENSMUST00000128751.3_GN:Ccdc167_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..18b8afd3dfd5a87cc64f2b6a50dc2d882a0194c0 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024018.19_ENSMUST00000128751.3_GN:Ccdc167_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid @@ -0,0 +1,110 @@ +>ENSMUSG00000024018.19|ENSMUST00000128751.3|GN:Ccdc167|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:12 +1 M 0.438 +2 G 0.436 +3 W 0.429 +4 S 0.416 +5 S 0.398 +6 A 0.379 +7 E 0.361 +8 K 0.342 +9 T 0.324 +10 A 0.315 +11 S 0.317 +12 N 0.318 +13 M 0.311 +14 T 0.303 +15 K 0.305 +16 K 0.316 +17 K 0.330 +18 R 0.340 +19 E 0.344 +20 N 0.342 +21 L 0.327 +22 G 0.290 +23 V 0.243 +24 A 0.207 +25 Q 0.185 +26 E 0.164 +27 I 0.145 +28 D 0.130 +29 G 0.115 +30 L 0.098 +31 E 0.089 +32 E 0.088 +33 K 0.084 +34 L 0.073 +35 S 0.062 +36 R 0.057 +37 C 0.061 +38 R 0.073 +39 K 0.084 +40 D 0.082 +41 L 0.071 +42 E 0.061 +43 A 0.057 +44 V 0.060 +45 T 0.073 +46 S 0.089 +47 Q 0.098 +48 L 0.100 +49 Y 0.110 +50 R 0.132 +51 A 0.155 +52 E 0.164 +53 L 0.154 +54 S 0.134 +55 P 0.118 +56 E 0.106 +57 D 0.095 +58 R 0.083 +59 R 0.078 +60 S 0.081 +61 L 0.091 +62 E 0.104 +63 K 0.113 +64 E 0.110 +65 K 0.101 +66 H 0.091 +67 T 0.083 +68 L 0.082 +69 M 0.089 +70 N 0.097 +71 K 0.095 +72 A 0.085 +73 S 0.075 +74 K 0.071 +75 Y 0.080 +76 E 0.095 +77 K 0.102 +78 E 0.092 +79 L 0.077 +80 K 0.070 +81 L 0.073 +82 L 0.086 +83 R 0.106 +84 H 0.125 +85 E 0.139 +86 N 0.147 +87 R 0.152 +88 K 0.158 +89 N 0.161 +90 T 0.158 +91 L 0.152 +92 L 0.147 +93 S 0.147 +94 V 0.147 +95 A 0.143 +96 I 0.136 +97 F 0.127 +98 T 0.117 +99 V 0.107 +100 F 0.100 +101 A 0.091 +102 L 0.083 +103 L 0.077 +104 Y 0.073 +105 A 0.072 +106 Y 0.077 +107 W 0.096 +108 T 0.124 +109 M 0.145 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024182.19_ENSMUST00000074370.11_GN:Axin1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024182.19_ENSMUST00000074370.11_GN:Axin1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..246641daae1b2d27a5c5e03912a35c2d9eb1f140 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024182.19_ENSMUST00000074370.11_GN:Axin1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,864 @@ +>ENSMUSG00000024182.19|ENSMUST00000074370.11|GN:Axin1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.432 +2 N 0.468 +3 V 0.516 +4 Q 0.556 +5 E 0.584 +6 Q 0.605 +7 G 0.621 +8 F 0.638 +9 P 0.659 +10 L 0.680 +11 D 0.696 +12 L 0.710 +13 G 0.720 +14 A 0.722 +15 S 0.716 +16 F 0.712 +17 T 0.710 +18 E 0.705 +19 D 0.690 +20 A 0.666 +21 P 0.646 +22 R 0.647 +23 P 0.671 +24 P 0.706 +25 V 0.740 +26 P 0.769 +27 G 0.793 +28 E 0.807 +29 E 0.814 +30 G 0.815 +31 E 0.813 +32 L 0.807 +33 V 0.801 +34 S 0.794 +35 T 0.784 +36 D 0.767 +37 S 0.748 +38 R 0.738 +39 P 0.731 +40 V 0.704 +41 N 0.657 +42 H 0.632 +43 S 0.664 +44 F 0.726 +45 C 0.773 +46 S 0.799 +47 G 0.813 +48 K 0.821 +49 G 0.823 +50 T 0.820 +51 S 0.814 +52 I 0.809 +53 K 0.810 +54 S 0.815 +55 E 0.818 +56 T 0.816 +57 S 0.809 +58 T 0.795 +59 A 0.777 +60 T 0.764 +61 P 0.767 +62 R 0.782 +63 R 0.796 +64 S 0.798 +65 D 0.789 +66 L 0.778 +67 D 0.772 +68 L 0.766 +69 G 0.755 +70 Y 0.743 +71 E 0.741 +72 P 0.751 +73 E 0.758 +74 G 0.748 +75 S 0.711 +76 A 0.652 +77 S 0.579 +78 P 0.489 +79 T 0.381 +80 P 0.269 +81 P 0.176 +82 Y 0.115 +83 L 0.082 +84 R 0.066 +85 W 0.057 +86 A 0.048 +87 E 0.038 +88 S 0.032 +89 L 0.033 +90 H 0.039 +91 S 0.045 +92 L 0.044 +93 L 0.038 +94 D 0.033 +95 D 0.030 +96 Q 0.028 +97 D 0.028 +98 G 0.027 +99 I 0.025 +100 S 0.023 +101 L 0.024 +102 F 0.026 +103 R 0.032 +104 T 0.044 +105 F 0.061 +106 L 0.070 +107 K 0.064 +108 Q 0.051 +109 E 0.047 +110 G 0.054 +111 C 0.063 +112 A 0.066 +113 D 0.060 +114 L 0.049 +115 L 0.038 +116 D 0.031 +117 F 0.026 +118 W 0.023 +119 F 0.021 +120 A 0.022 +121 C 0.026 +122 S 0.031 +123 G 0.034 +124 F 0.034 +125 R 0.036 +126 K 0.044 +127 L 0.058 +128 E 0.076 +129 P 0.095 +130 C 0.111 +131 D 0.119 +132 S 0.118 +133 N 0.105 +134 E 0.083 +135 E 0.061 +136 K 0.049 +137 R 0.045 +138 L 0.043 +139 K 0.041 +140 L 0.039 +141 A 0.038 +142 R 0.035 +143 A 0.035 +144 I 0.036 +145 Y 0.036 +146 R 0.037 +147 K 0.043 +148 Y 0.052 +149 I 0.063 +150 L 0.084 +151 D 0.118 +152 S 0.152 +153 N 0.168 +154 G 0.165 +155 I 0.156 +156 V 0.147 +157 S 0.137 +158 R 0.126 +159 Q 0.117 +160 T 0.108 +161 K 0.093 +162 P 0.075 +163 A 0.062 +164 T 0.060 +165 K 0.068 +166 S 0.078 +167 F 0.079 +168 I 0.071 +169 K 0.063 +170 D 0.059 +171 C 0.060 +172 V 0.061 +173 M 0.064 +174 K 0.070 +175 Q 0.083 +176 Q 0.098 +177 I 0.107 +178 D 0.105 +179 P 0.102 +180 A 0.105 +181 M 0.112 +182 F 0.112 +183 D 0.099 +184 Q 0.089 +185 A 0.091 +186 Q 0.098 +187 T 0.108 +188 E 0.119 +189 I 0.124 +190 Q 0.118 +191 S 0.101 +192 T 0.082 +193 M 0.066 +194 E 0.050 +195 E 0.037 +196 N 0.030 +197 T 0.028 +198 Y 0.027 +199 P 0.026 +200 S 0.026 +201 F 0.028 +202 L 0.029 +203 K 0.029 +204 S 0.029 +205 D 0.029 +206 I 0.028 +207 Y 0.031 +208 L 0.039 +209 E 0.051 +210 Y 0.067 +211 T 0.095 +212 R 0.148 +213 T 0.232 +214 G 0.342 +215 S 0.458 +216 E 0.555 +217 S 0.622 +218 P 0.672 +219 K 0.719 +220 V 0.755 +221 C 0.773 +222 S 0.779 +223 D 0.781 +224 Q 0.785 +225 S 0.792 +226 S 0.802 +227 G 0.811 +228 S 0.818 +229 G 0.826 +230 T 0.832 +231 G 0.834 +232 K 0.831 +233 G 0.823 +234 M 0.811 +235 S 0.796 +236 G 0.776 +237 Y 0.760 +238 L 0.759 +239 P 0.775 +240 T 0.792 +241 L 0.798 +242 N 0.792 +243 E 0.779 +244 D 0.763 +245 E 0.748 +246 E 0.739 +247 W 0.745 +248 K 0.768 +249 C 0.795 +250 D 0.813 +251 Q 0.824 +252 D 0.830 +253 A 0.830 +254 D 0.824 +255 E 0.815 +256 D 0.807 +257 D 0.798 +258 G 0.785 +259 R 0.774 +260 D 0.763 +261 P 0.753 +262 L 0.744 +263 P 0.743 +264 P 0.748 +265 S 0.745 +266 R 0.726 +267 L 0.702 +268 T 0.686 +269 Q 0.688 +270 K 0.704 +271 L 0.721 +272 L 0.732 +273 L 0.742 +274 E 0.755 +275 T 0.765 +276 A 0.766 +277 A 0.765 +278 P 0.772 +279 R 0.787 +280 A 0.801 +281 P 0.809 +282 S 0.810 +283 S 0.806 +284 R 0.801 +285 R 0.795 +286 Y 0.795 +287 N 0.803 +288 E 0.813 +289 G 0.817 +290 R 0.810 +291 E 0.798 +292 L 0.784 +293 R 0.774 +294 Y 0.772 +295 G 0.775 +296 S 0.774 +297 W 0.767 +298 R 0.762 +299 E 0.757 +300 P 0.750 +301 V 0.739 +302 N 0.729 +303 P 0.728 +304 Y 0.743 +305 Y 0.769 +306 V 0.797 +307 N 0.816 +308 S 0.827 +309 G 0.835 +310 Y 0.844 +311 A 0.850 +312 L 0.850 +313 A 0.849 +314 P 0.853 +315 A 0.861 +316 T 0.867 +317 S 0.869 +318 A 0.866 +319 N 0.862 +320 D 0.856 +321 S 0.848 +322 E 0.840 +323 Q 0.837 +324 Q 0.838 +325 S 0.838 +326 L 0.835 +327 S 0.835 +328 S 0.837 +329 D 0.840 +330 A 0.840 +331 D 0.840 +332 T 0.840 +333 L 0.842 +334 S 0.845 +335 L 0.848 +336 T 0.851 +337 D 0.851 +338 S 0.848 +339 S 0.841 +340 V 0.832 +341 D 0.813 +342 G 0.775 +343 I 0.727 +344 P 0.694 +345 P 0.693 +346 Y 0.708 +347 R 0.718 +348 I 0.712 +349 R 0.692 +350 K 0.675 +351 Q 0.669 +352 H 0.666 +353 R 0.665 +354 R 0.681 +355 E 0.720 +356 M 0.761 +357 Q 0.787 +358 E 0.799 +359 S 0.798 +360 I 0.785 +361 Q 0.768 +362 V 0.759 +363 N 0.763 +364 G 0.772 +365 R 0.774 +366 V 0.768 +367 P 0.761 +368 L 0.759 +369 P 0.755 +370 H 0.742 +371 I 0.723 +372 P 0.708 +373 R 0.703 +374 T 0.706 +375 Y 0.702 +376 R 0.688 +377 M 0.678 +378 P 0.680 +379 K 0.683 +380 E 0.661 +381 I 0.607 +382 R 0.538 +383 V 0.468 +384 E 0.403 +385 P 0.355 +386 Q 0.330 +387 K 0.326 +388 F 0.331 +389 A 0.328 +390 E 0.312 +391 E 0.295 +392 L 0.276 +393 I 0.245 +394 H 0.207 +395 R 0.180 +396 L 0.163 +397 E 0.151 +398 A 0.144 +399 V 0.139 +400 Q 0.136 +401 R 0.140 +402 T 0.151 +403 R 0.167 +404 E 0.191 +405 A 0.222 +406 E 0.242 +407 E 0.246 +408 K 0.242 +409 L 0.238 +410 E 0.234 +411 E 0.230 +412 R 0.222 +413 L 0.215 +414 K 0.223 +415 R 0.248 +416 V 0.277 +417 R 0.304 +418 M 0.341 +419 E 0.406 +420 E 0.491 +421 E 0.575 +422 G 0.647 +423 E 0.704 +424 D 0.741 +425 G 0.756 +426 E 0.756 +427 M 0.754 +428 P 0.759 +429 S 0.772 +430 G 0.790 +431 P 0.805 +432 M 0.815 +433 A 0.816 +434 S 0.808 +435 H 0.797 +436 K 0.789 +437 L 0.788 +438 P 0.791 +439 S 0.792 +440 V 0.785 +441 P 0.772 +442 A 0.756 +443 W 0.740 +444 H 0.725 +445 H 0.715 +446 F 0.721 +447 P 0.748 +448 P 0.788 +449 R 0.822 +450 Y 0.838 +451 V 0.840 +452 D 0.836 +453 M 0.832 +454 G 0.830 +455 C 0.832 +456 S 0.838 +457 G 0.846 +458 L 0.852 +459 R 0.852 +460 D 0.844 +461 A 0.824 +462 H 0.796 +463 E 0.764 +464 E 0.736 +465 N 0.717 +466 P 0.718 +467 E 0.735 +468 S 0.750 +469 I 0.747 +470 L 0.717 +471 D 0.667 +472 E 0.610 +473 H 0.556 +474 V 0.517 +475 Q 0.512 +476 R 0.550 +477 V 0.604 +478 M 0.647 +479 R 0.679 +480 T 0.713 +481 P 0.753 +482 G 0.788 +483 C 0.806 +484 Q 0.806 +485 S 0.801 +486 P 0.802 +487 G 0.812 +488 P 0.825 +489 G 0.834 +490 H 0.834 +491 R 0.827 +492 S 0.821 +493 P 0.819 +494 D 0.820 +495 S 0.808 +496 G 0.764 +497 H 0.700 +498 V 0.669 +499 A 0.710 +500 K 0.783 +501 T 0.833 +502 A 0.852 +503 V 0.856 +504 L 0.857 +505 G 0.859 +506 G 0.861 +507 T 0.861 +508 A 0.860 +509 S 0.859 +510 G 0.857 +511 H 0.856 +512 G 0.855 +513 K 0.849 +514 H 0.839 +515 V 0.831 +516 P 0.833 +517 K 0.844 +518 L 0.855 +519 G 0.859 +520 L 0.858 +521 K 0.855 +522 L 0.852 +523 D 0.849 +524 T 0.844 +525 A 0.839 +526 G 0.833 +527 L 0.826 +528 H 0.823 +529 H 0.823 +530 H 0.826 +531 R 0.827 +532 H 0.826 +533 V 0.822 +534 H 0.820 +535 H 0.820 +536 H 0.818 +537 V 0.811 +538 H 0.804 +539 H 0.800 +540 N 0.796 +541 S 0.787 +542 A 0.776 +543 R 0.768 +544 P 0.772 +545 K 0.784 +546 E 0.790 +547 Q 0.778 +548 M 0.746 +549 E 0.699 +550 A 0.642 +551 E 0.577 +552 V 0.515 +553 A 0.481 +554 R 0.501 +555 R 0.567 +556 V 0.636 +557 Q 0.680 +558 S 0.700 +559 S 0.704 +560 F 0.704 +561 S 0.710 +562 W 0.727 +563 G 0.753 +564 P 0.784 +565 E 0.810 +566 T 0.827 +567 H 0.835 +568 G 0.837 +569 H 0.835 +570 A 0.831 +571 K 0.828 +572 P 0.828 +573 R 0.828 +574 S 0.826 +575 Y 0.823 +576 S 0.826 +577 E 0.840 +578 N 0.856 +579 A 0.866 +580 G 0.868 +581 T 0.866 +582 T 0.865 +583 L 0.867 +584 S 0.869 +585 A 0.871 +586 G 0.870 +587 D 0.866 +588 L 0.861 +589 A 0.854 +590 F 0.850 +591 G 0.850 +592 G 0.850 +593 K 0.848 +594 T 0.840 +595 S 0.823 +596 A 0.795 +597 P 0.748 +598 S 0.688 +599 K 0.648 +600 R 0.647 +601 N 0.656 +602 T 0.672 +603 K 0.720 +604 K 0.783 +605 A 0.822 +606 E 0.835 +607 S 0.840 +608 G 0.845 +609 K 0.849 +610 N 0.850 +611 A 0.846 +612 N 0.837 +613 A 0.823 +614 E 0.809 +615 V 0.798 +616 P 0.794 +617 S 0.793 +618 T 0.785 +619 T 0.764 +620 E 0.733 +621 D 0.692 +622 A 0.641 +623 E 0.589 +624 K 0.552 +625 N 0.533 +626 Q 0.514 +627 K 0.477 +628 I 0.423 +629 M 0.367 +630 Q 0.329 +631 W 0.316 +632 I 0.318 +633 I 0.332 +634 E 0.359 +635 G 0.395 +636 E 0.427 +637 K 0.447 +638 E 0.455 +639 I 0.466 +640 S 0.497 +641 R 0.552 +642 H 0.610 +643 R 0.657 +644 K 0.691 +645 A 0.716 +646 G 0.736 +647 H 0.756 +648 G 0.776 +649 S 0.791 +650 S 0.797 +651 G 0.798 +652 L 0.800 +653 R 0.802 +654 K 0.800 +655 Q 0.793 +656 Q 0.788 +657 A 0.789 +658 H 0.791 +659 E 0.789 +660 S 0.785 +661 S 0.783 +662 R 0.791 +663 P 0.808 +664 L 0.829 +665 S 0.842 +666 I 0.846 +667 E 0.844 +668 R 0.843 +669 P 0.845 +670 G 0.844 +671 A 0.830 +672 V 0.801 +673 H 0.769 +674 P 0.750 +675 W 0.753 +676 V 0.770 +677 S 0.785 +678 A 0.794 +679 Q 0.804 +680 L 0.818 +681 R 0.827 +682 N 0.824 +683 S 0.811 +684 V 0.799 +685 Q 0.796 +686 P 0.803 +687 S 0.813 +688 H 0.821 +689 L 0.828 +690 F 0.833 +691 I 0.833 +692 Q 0.826 +693 D 0.815 +694 P 0.798 +695 T 0.778 +696 M 0.763 +697 P 0.762 +698 P 0.774 +699 N 0.783 +700 P 0.777 +701 A 0.753 +702 P 0.721 +703 N 0.693 +704 P 0.674 +705 L 0.650 +706 T 0.602 +707 Q 0.520 +708 L 0.424 +709 E 0.349 +710 E 0.313 +711 A 0.303 +712 R 0.301 +713 R 0.302 +714 R 0.310 +715 L 0.318 +716 E 0.326 +717 E 0.346 +718 E 0.379 +719 E 0.409 +720 K 0.434 +721 R 0.465 +722 A 0.507 +723 N 0.551 +724 K 0.588 +725 L 0.618 +726 P 0.636 +727 S 0.640 +728 K 0.625 +729 Q 0.592 +730 R 0.560 +731 Y 0.552 +732 V 0.563 +733 Q 0.567 +734 A 0.558 +735 V 0.559 +736 M 0.587 +737 Q 0.637 +738 R 0.689 +739 G 0.733 +740 R 0.763 +741 T 0.781 +742 C 0.785 +743 V 0.782 +744 R 0.782 +745 P 0.788 +746 A 0.796 +747 C 0.801 +748 A 0.806 +749 P 0.814 +750 V 0.819 +751 L 0.820 +752 S 0.816 +753 V 0.809 +754 V 0.804 +755 P 0.808 +756 A 0.819 +757 V 0.829 +758 S 0.834 +759 D 0.835 +760 L 0.833 +761 E 0.831 +762 L 0.828 +763 S 0.825 +764 E 0.823 +765 T 0.820 +766 E 0.819 +767 T 0.818 +768 K 0.815 +769 S 0.811 +770 Q 0.807 +771 R 0.808 +772 K 0.811 +773 A 0.811 +774 G 0.802 +775 G 0.784 +776 G 0.756 +777 S 0.717 +778 A 0.670 +779 P 0.615 +780 P 0.540 +781 C 0.427 +782 D 0.289 +783 S 0.167 +784 I 0.085 +785 V 0.045 +786 V 0.031 +787 A 0.029 +788 Y 0.033 +789 Y 0.041 +790 F 0.052 +791 C 0.064 +792 G 0.073 +793 E 0.080 +794 P 0.085 +795 I 0.087 +796 P 0.083 +797 Y 0.073 +798 R 0.061 +799 T 0.056 +800 L 0.060 +801 V 0.072 +802 R 0.081 +803 G 0.082 +804 R 0.076 +805 A 0.067 +806 V 0.055 +807 T 0.044 +808 L 0.039 +809 G 0.038 +810 Q 0.040 +811 F 0.042 +812 K 0.046 +813 E 0.053 +814 L 0.063 +815 L 0.071 +816 T 0.078 +817 K 0.086 +818 K 0.097 +819 G 0.102 +820 S 0.095 +821 Y 0.080 +822 R 0.061 +823 Y 0.046 +824 Y 0.039 +825 F 0.041 +826 K 0.051 +827 K 0.070 +828 V 0.096 +829 S 0.126 +830 D 0.149 +831 E 0.168 +832 F 0.188 +833 D 0.209 +834 C 0.217 +835 G 0.204 +836 V 0.174 +837 V 0.140 +838 F 0.113 +839 E 0.097 +840 E 0.090 +841 V 0.089 +842 R 0.091 +843 E 0.094 +844 D 0.093 +845 E 0.088 +846 A 0.082 +847 V 0.077 +848 L 0.076 +849 P 0.078 +850 V 0.080 +851 F 0.081 +852 E 0.083 +853 E 0.087 +854 K 0.092 +855 I 0.093 +856 I 0.089 +857 G 0.082 +858 K 0.078 +859 V 0.079 +860 E 0.096 +861 K 0.137 +862 V 0.199 +863 D 0.248 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024182.19_ENSMUST00000074370.11_GN:Axin1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024182.19_ENSMUST00000074370.11_GN:Axin1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b6f1a562b590d71003d27fc0fa2b1091af59c78d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024182.19_ENSMUST00000074370.11_GN:Axin1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid @@ -0,0 +1,869 @@ +>ENSMUSG00000024182.19|ENSMUST00000074370.11|GN:Axin1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:5 +1 M 0.395 +2 Q 0.425 +3 S 0.482 +4 P 0.556 +5 K 0.627 +6 M 0.678 +7 N 0.704 +8 V 0.708 +9 Q 0.701 +10 E 0.694 +11 Q 0.692 +12 G 0.689 +13 F 0.687 +14 P 0.692 +15 L 0.703 +16 D 0.716 +17 L 0.729 +18 G 0.738 +19 A 0.739 +20 S 0.733 +21 F 0.728 +22 T 0.726 +23 E 0.722 +24 D 0.708 +25 A 0.683 +26 P 0.661 +27 R 0.659 +28 P 0.679 +29 P 0.711 +30 V 0.742 +31 P 0.770 +32 G 0.794 +33 E 0.810 +34 E 0.820 +35 G 0.824 +36 E 0.824 +37 L 0.818 +38 V 0.810 +39 S 0.802 +40 T 0.792 +41 D 0.774 +42 S 0.755 +43 R 0.744 +44 P 0.736 +45 V 0.709 +46 N 0.663 +47 H 0.639 +48 S 0.672 +49 F 0.734 +50 C 0.781 +51 S 0.807 +52 G 0.821 +53 K 0.829 +54 G 0.832 +55 T 0.829 +56 S 0.823 +57 I 0.818 +58 K 0.819 +59 S 0.824 +60 E 0.828 +61 T 0.826 +62 S 0.818 +63 T 0.804 +64 A 0.785 +65 T 0.772 +66 P 0.773 +67 R 0.787 +68 R 0.800 +69 S 0.801 +70 D 0.791 +71 L 0.780 +72 D 0.773 +73 L 0.767 +74 G 0.756 +75 Y 0.744 +76 E 0.742 +77 P 0.752 +78 E 0.759 +79 G 0.748 +80 S 0.712 +81 A 0.653 +82 S 0.579 +83 P 0.489 +84 T 0.382 +85 P 0.270 +86 P 0.176 +87 Y 0.115 +88 L 0.082 +89 R 0.066 +90 W 0.057 +91 A 0.047 +92 E 0.037 +93 S 0.031 +94 L 0.032 +95 H 0.039 +96 S 0.045 +97 L 0.044 +98 L 0.038 +99 D 0.032 +100 D 0.030 +101 Q 0.028 +102 D 0.028 +103 G 0.027 +104 I 0.025 +105 S 0.023 +106 L 0.024 +107 F 0.026 +108 R 0.032 +109 T 0.044 +110 F 0.061 +111 L 0.070 +112 K 0.064 +113 Q 0.051 +114 E 0.048 +115 G 0.055 +116 C 0.064 +117 A 0.068 +118 D 0.061 +119 L 0.050 +120 L 0.038 +121 D 0.031 +122 F 0.026 +123 W 0.023 +124 F 0.021 +125 A 0.022 +126 C 0.026 +127 S 0.031 +128 G 0.034 +129 F 0.034 +130 R 0.036 +131 K 0.044 +132 L 0.059 +133 E 0.077 +134 P 0.095 +135 C 0.111 +136 D 0.119 +137 S 0.118 +138 N 0.105 +139 E 0.083 +140 E 0.061 +141 K 0.049 +142 R 0.045 +143 L 0.042 +144 K 0.040 +145 L 0.039 +146 A 0.037 +147 R 0.035 +148 A 0.035 +149 I 0.036 +150 Y 0.035 +151 R 0.037 +152 K 0.043 +153 Y 0.052 +154 I 0.063 +155 L 0.084 +156 D 0.118 +157 S 0.151 +158 N 0.167 +159 G 0.165 +160 I 0.156 +161 V 0.147 +162 S 0.137 +163 R 0.125 +164 Q 0.117 +165 T 0.107 +166 K 0.092 +167 P 0.074 +168 A 0.061 +169 T 0.059 +170 K 0.068 +171 S 0.078 +172 F 0.079 +173 I 0.071 +174 K 0.062 +175 D 0.058 +176 C 0.059 +177 V 0.061 +178 M 0.063 +179 K 0.070 +180 Q 0.082 +181 Q 0.098 +182 I 0.106 +183 D 0.105 +184 P 0.101 +185 A 0.104 +186 M 0.111 +187 F 0.110 +188 D 0.098 +189 Q 0.088 +190 A 0.089 +191 Q 0.096 +192 T 0.105 +193 E 0.116 +194 I 0.122 +195 Q 0.117 +196 S 0.101 +197 T 0.082 +198 M 0.065 +199 E 0.050 +200 E 0.037 +201 N 0.030 +202 T 0.028 +203 Y 0.027 +204 P 0.026 +205 S 0.026 +206 F 0.028 +207 L 0.029 +208 K 0.029 +209 S 0.029 +210 D 0.028 +211 I 0.028 +212 Y 0.031 +213 L 0.039 +214 E 0.051 +215 Y 0.067 +216 T 0.095 +217 R 0.148 +218 T 0.231 +219 G 0.341 +220 S 0.457 +221 E 0.554 +222 S 0.621 +223 P 0.672 +224 K 0.718 +225 V 0.754 +226 C 0.773 +227 S 0.778 +228 D 0.780 +229 Q 0.785 +230 S 0.792 +231 S 0.802 +232 G 0.810 +233 S 0.818 +234 G 0.826 +235 T 0.832 +236 G 0.834 +237 K 0.831 +238 G 0.822 +239 M 0.810 +240 S 0.795 +241 G 0.775 +242 Y 0.758 +243 L 0.758 +244 P 0.774 +245 T 0.791 +246 L 0.797 +247 N 0.791 +248 E 0.778 +249 D 0.761 +250 E 0.746 +251 E 0.737 +252 W 0.743 +253 K 0.767 +254 C 0.794 +255 D 0.813 +256 Q 0.823 +257 D 0.829 +258 A 0.830 +259 D 0.823 +260 E 0.815 +261 D 0.807 +262 D 0.798 +263 G 0.786 +264 R 0.774 +265 D 0.764 +266 P 0.754 +267 L 0.744 +268 P 0.743 +269 P 0.749 +270 S 0.747 +271 R 0.729 +272 L 0.705 +273 T 0.689 +274 Q 0.691 +275 K 0.706 +276 L 0.722 +277 L 0.732 +278 L 0.741 +279 E 0.755 +280 T 0.764 +281 A 0.765 +282 A 0.764 +283 P 0.771 +284 R 0.786 +285 A 0.800 +286 P 0.808 +287 S 0.810 +288 S 0.807 +289 R 0.801 +290 R 0.796 +291 Y 0.796 +292 N 0.804 +293 E 0.814 +294 G 0.818 +295 R 0.812 +296 E 0.799 +297 L 0.786 +298 R 0.775 +299 Y 0.774 +300 G 0.776 +301 S 0.774 +302 W 0.768 +303 R 0.763 +304 E 0.758 +305 P 0.750 +306 V 0.739 +307 N 0.730 +308 P 0.730 +309 Y 0.744 +310 Y 0.770 +311 V 0.798 +312 N 0.817 +313 S 0.828 +314 G 0.836 +315 Y 0.846 +316 A 0.852 +317 L 0.852 +318 A 0.851 +319 P 0.855 +320 A 0.863 +321 T 0.870 +322 S 0.871 +323 A 0.869 +324 N 0.864 +325 D 0.858 +326 S 0.851 +327 E 0.843 +328 Q 0.840 +329 Q 0.841 +330 S 0.840 +331 L 0.838 +332 S 0.837 +333 S 0.840 +334 D 0.842 +335 A 0.842 +336 D 0.842 +337 T 0.843 +338 L 0.844 +339 S 0.847 +340 L 0.851 +341 T 0.854 +342 D 0.854 +343 S 0.850 +344 S 0.844 +345 V 0.835 +346 D 0.815 +347 G 0.778 +348 I 0.730 +349 P 0.697 +350 P 0.697 +351 Y 0.713 +352 R 0.723 +353 I 0.718 +354 R 0.699 +355 K 0.682 +356 Q 0.675 +357 H 0.671 +358 R 0.668 +359 R 0.684 +360 E 0.721 +361 M 0.762 +362 Q 0.788 +363 E 0.799 +364 S 0.799 +365 I 0.787 +366 Q 0.770 +367 V 0.761 +368 N 0.764 +369 G 0.773 +370 R 0.774 +371 V 0.768 +372 P 0.761 +373 L 0.758 +374 P 0.754 +375 H 0.741 +376 I 0.722 +377 P 0.706 +378 R 0.701 +379 T 0.702 +380 Y 0.698 +381 R 0.685 +382 M 0.675 +383 P 0.677 +384 K 0.680 +385 E 0.660 +386 I 0.606 +387 R 0.536 +388 V 0.466 +389 E 0.402 +390 P 0.354 +391 Q 0.329 +392 K 0.326 +393 F 0.331 +394 A 0.327 +395 E 0.312 +396 E 0.294 +397 L 0.275 +398 I 0.244 +399 H 0.207 +400 R 0.179 +401 L 0.163 +402 E 0.151 +403 A 0.143 +404 V 0.138 +405 Q 0.136 +406 R 0.139 +407 T 0.150 +408 R 0.165 +409 E 0.190 +410 A 0.220 +411 E 0.240 +412 E 0.243 +413 K 0.239 +414 L 0.235 +415 E 0.232 +416 E 0.228 +417 R 0.220 +418 L 0.214 +419 K 0.221 +420 R 0.246 +421 V 0.275 +422 R 0.302 +423 M 0.339 +424 E 0.403 +425 E 0.487 +426 E 0.571 +427 G 0.643 +428 E 0.701 +429 D 0.739 +430 G 0.754 +431 E 0.755 +432 M 0.753 +433 P 0.758 +434 S 0.771 +435 G 0.789 +436 P 0.804 +437 M 0.814 +438 A 0.815 +439 S 0.807 +440 H 0.795 +441 K 0.787 +442 L 0.786 +443 P 0.790 +444 S 0.790 +445 V 0.783 +446 P 0.770 +447 A 0.754 +448 W 0.738 +449 H 0.723 +450 H 0.714 +451 F 0.720 +452 P 0.747 +453 P 0.787 +454 R 0.821 +455 Y 0.838 +456 V 0.840 +457 D 0.835 +458 M 0.832 +459 G 0.830 +460 C 0.832 +461 S 0.838 +462 G 0.846 +463 L 0.852 +464 R 0.852 +465 D 0.844 +466 A 0.824 +467 H 0.795 +468 E 0.764 +469 E 0.736 +470 N 0.717 +471 P 0.718 +472 E 0.735 +473 S 0.750 +474 I 0.746 +475 L 0.717 +476 D 0.668 +477 E 0.610 +478 H 0.557 +479 V 0.517 +480 Q 0.512 +481 R 0.551 +482 V 0.606 +483 M 0.649 +484 R 0.681 +485 T 0.716 +486 P 0.755 +487 G 0.790 +488 C 0.808 +489 Q 0.809 +490 S 0.803 +491 P 0.804 +492 G 0.814 +493 P 0.828 +494 G 0.836 +495 H 0.836 +496 R 0.829 +497 S 0.823 +498 P 0.821 +499 D 0.821 +500 S 0.809 +501 G 0.766 +502 H 0.701 +503 V 0.671 +504 A 0.711 +505 K 0.784 +506 T 0.834 +507 A 0.854 +508 V 0.858 +509 L 0.859 +510 G 0.861 +511 G 0.863 +512 T 0.863 +513 A 0.862 +514 S 0.861 +515 G 0.859 +516 H 0.858 +517 G 0.856 +518 K 0.851 +519 H 0.841 +520 V 0.832 +521 P 0.834 +522 K 0.845 +523 L 0.856 +524 G 0.860 +525 L 0.859 +526 K 0.856 +527 L 0.853 +528 D 0.850 +529 T 0.845 +530 A 0.840 +531 G 0.833 +532 L 0.827 +533 H 0.823 +534 H 0.823 +535 H 0.825 +536 R 0.826 +537 H 0.825 +538 V 0.822 +539 H 0.820 +540 H 0.819 +541 H 0.817 +542 V 0.811 +543 H 0.803 +544 H 0.799 +545 N 0.796 +546 S 0.787 +547 A 0.776 +548 R 0.769 +549 P 0.773 +550 K 0.784 +551 E 0.790 +552 Q 0.778 +553 M 0.746 +554 E 0.699 +555 A 0.642 +556 E 0.579 +557 V 0.517 +558 A 0.483 +559 R 0.502 +560 R 0.567 +561 V 0.636 +562 Q 0.680 +563 S 0.699 +564 S 0.704 +565 F 0.703 +566 S 0.709 +567 W 0.726 +568 G 0.753 +569 P 0.783 +570 E 0.810 +571 T 0.827 +572 H 0.835 +573 G 0.836 +574 H 0.834 +575 A 0.831 +576 K 0.828 +577 P 0.827 +578 R 0.828 +579 S 0.826 +580 Y 0.822 +581 S 0.826 +582 E 0.840 +583 N 0.856 +584 A 0.866 +585 G 0.868 +586 T 0.866 +587 T 0.865 +588 L 0.866 +589 S 0.869 +590 A 0.870 +591 G 0.869 +592 D 0.866 +593 L 0.860 +594 A 0.854 +595 F 0.850 +596 G 0.849 +597 G 0.850 +598 K 0.848 +599 T 0.840 +600 S 0.823 +601 A 0.795 +602 P 0.748 +603 S 0.687 +604 K 0.647 +605 R 0.642 +606 N 0.648 +607 T 0.663 +608 K 0.713 +609 K 0.779 +610 A 0.820 +611 E 0.834 +612 S 0.839 +613 G 0.844 +614 K 0.849 +615 N 0.850 +616 A 0.846 +617 N 0.837 +618 A 0.823 +619 E 0.809 +620 V 0.798 +621 P 0.794 +622 S 0.793 +623 T 0.785 +624 T 0.764 +625 E 0.733 +626 D 0.692 +627 A 0.641 +628 E 0.588 +629 K 0.551 +630 N 0.533 +631 Q 0.513 +632 K 0.476 +633 I 0.422 +634 M 0.366 +635 Q 0.329 +636 W 0.316 +637 I 0.318 +638 I 0.331 +639 E 0.359 +640 G 0.395 +641 E 0.427 +642 K 0.447 +643 E 0.456 +644 I 0.466 +645 S 0.498 +646 R 0.552 +647 H 0.611 +648 R 0.658 +649 K 0.692 +650 A 0.716 +651 G 0.736 +652 H 0.756 +653 G 0.777 +654 S 0.791 +655 S 0.797 +656 G 0.798 +657 L 0.800 +658 R 0.802 +659 K 0.798 +660 Q 0.789 +661 Q 0.783 +662 A 0.785 +663 H 0.789 +664 E 0.789 +665 S 0.785 +666 S 0.783 +667 R 0.791 +668 P 0.808 +669 L 0.829 +670 S 0.842 +671 I 0.846 +672 E 0.844 +673 R 0.843 +674 P 0.845 +675 G 0.844 +676 A 0.830 +677 V 0.801 +678 H 0.769 +679 P 0.750 +680 W 0.753 +681 V 0.770 +682 S 0.785 +683 A 0.794 +684 Q 0.804 +685 L 0.818 +686 R 0.827 +687 N 0.824 +688 S 0.811 +689 V 0.799 +690 Q 0.796 +691 P 0.803 +692 S 0.813 +693 H 0.821 +694 L 0.828 +695 F 0.833 +696 I 0.833 +697 Q 0.826 +698 D 0.814 +699 P 0.798 +700 T 0.778 +701 M 0.763 +702 P 0.762 +703 P 0.774 +704 N 0.783 +705 P 0.777 +706 A 0.753 +707 P 0.721 +708 N 0.693 +709 P 0.674 +710 L 0.650 +711 T 0.602 +712 Q 0.520 +713 L 0.424 +714 E 0.348 +715 E 0.312 +716 A 0.303 +717 R 0.300 +718 R 0.302 +719 R 0.310 +720 L 0.318 +721 E 0.326 +722 E 0.345 +723 E 0.378 +724 E 0.408 +725 K 0.433 +726 R 0.464 +727 A 0.506 +728 N 0.550 +729 K 0.588 +730 L 0.617 +731 P 0.636 +732 S 0.640 +733 K 0.625 +734 Q 0.592 +735 R 0.560 +736 Y 0.552 +737 V 0.563 +738 Q 0.568 +739 A 0.559 +740 V 0.559 +741 M 0.587 +742 Q 0.637 +743 R 0.689 +744 G 0.733 +745 R 0.763 +746 T 0.781 +747 C 0.785 +748 V 0.782 +749 R 0.782 +750 P 0.788 +751 A 0.796 +752 C 0.801 +753 A 0.807 +754 P 0.814 +755 V 0.819 +756 L 0.820 +757 S 0.816 +758 V 0.809 +759 V 0.804 +760 P 0.808 +761 A 0.819 +762 V 0.829 +763 S 0.834 +764 D 0.835 +765 L 0.833 +766 E 0.831 +767 L 0.828 +768 S 0.825 +769 E 0.823 +770 T 0.820 +771 E 0.819 +772 T 0.818 +773 K 0.815 +774 S 0.811 +775 Q 0.807 +776 R 0.808 +777 K 0.811 +778 A 0.811 +779 G 0.802 +780 G 0.784 +781 G 0.756 +782 S 0.717 +783 A 0.670 +784 P 0.615 +785 P 0.540 +786 C 0.427 +787 D 0.289 +788 S 0.167 +789 I 0.085 +790 V 0.045 +791 V 0.031 +792 A 0.029 +793 Y 0.033 +794 Y 0.041 +795 F 0.052 +796 C 0.064 +797 G 0.073 +798 E 0.080 +799 P 0.085 +800 I 0.087 +801 P 0.083 +802 Y 0.072 +803 R 0.061 +804 T 0.056 +805 L 0.060 +806 V 0.072 +807 R 0.081 +808 G 0.082 +809 R 0.076 +810 A 0.067 +811 V 0.055 +812 T 0.044 +813 L 0.039 +814 G 0.038 +815 Q 0.040 +816 F 0.042 +817 K 0.046 +818 E 0.053 +819 L 0.063 +820 L 0.071 +821 T 0.078 +822 K 0.086 +823 K 0.097 +824 G 0.102 +825 S 0.096 +826 Y 0.080 +827 R 0.061 +828 Y 0.046 +829 Y 0.039 +830 F 0.041 +831 K 0.051 +832 K 0.070 +833 V 0.097 +834 S 0.126 +835 D 0.149 +836 E 0.168 +837 F 0.188 +838 D 0.209 +839 C 0.217 +840 G 0.204 +841 V 0.174 +842 V 0.140 +843 F 0.113 +844 E 0.097 +845 E 0.090 +846 V 0.089 +847 R 0.091 +848 E 0.094 +849 D 0.093 +850 E 0.088 +851 A 0.082 +852 V 0.077 +853 L 0.076 +854 P 0.078 +855 V 0.080 +856 F 0.081 +857 E 0.083 +858 E 0.087 +859 K 0.092 +860 I 0.093 +861 I 0.089 +862 G 0.082 +863 K 0.078 +864 V 0.079 +865 E 0.096 +866 K 0.137 +867 V 0.197 +868 D 0.247 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024446.14_ENSMUST00000025319.7_GN:Rpp21_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024446.14_ENSMUST00000025319.7_GN:Rpp21_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c691c5670448527cf7707e2f4ef5cc4e806fb7f0 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024446.14_ENSMUST00000025319.7_GN:Rpp21_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,151 @@ +>ENSMUSG00000024446.14|ENSMUST00000025319.7|GN:Rpp21|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.412 +2 A 0.403 +3 G 0.386 +4 P 0.355 +5 V 0.304 +6 K 0.237 +7 D 0.171 +8 R 0.124 +9 E 0.097 +10 A 0.083 +11 F 0.078 +12 Q 0.076 +13 R 0.072 +14 L 0.068 +15 S 0.063 +16 F 0.056 +17 L 0.053 +18 Y 0.058 +19 Q 0.069 +20 A 0.077 +21 A 0.081 +22 H 0.086 +23 C 0.096 +24 V 0.108 +25 L 0.114 +26 S 0.111 +27 Q 0.103 +28 N 0.096 +29 P 0.096 +30 E 0.099 +31 N 0.103 +32 Q 0.105 +33 A 0.108 +34 L 0.109 +35 A 0.103 +36 R 0.086 +37 F 0.068 +38 Y 0.058 +39 C 0.053 +40 H 0.051 +41 T 0.052 +42 E 0.060 +43 K 0.073 +44 T 0.082 +45 I 0.084 +46 A 0.079 +47 K 0.073 +48 R 0.073 +49 L 0.079 +50 V 0.093 +51 L 0.114 +52 R 0.136 +53 Q 0.145 +54 D 0.135 +55 P 0.117 +56 S 0.108 +57 V 0.108 +58 K 0.111 +59 R 0.110 +60 T 0.105 +61 L 0.095 +62 C 0.082 +63 R 0.074 +64 S 0.070 +65 C 0.070 +66 S 0.077 +67 S 0.090 +68 L 0.106 +69 L 0.119 +70 I 0.124 +71 P 0.128 +72 G 0.131 +73 L 0.125 +74 T 0.109 +75 C 0.095 +76 T 0.093 +77 Q 0.100 +78 R 0.110 +79 Q 0.117 +80 R 0.124 +81 R 0.134 +82 R 0.146 +83 K 0.152 +84 G 0.144 +85 Q 0.122 +86 R 0.095 +87 W 0.073 +88 T 0.060 +89 V 0.054 +90 Q 0.052 +91 T 0.052 +92 C 0.055 +93 L 0.060 +94 T 0.067 +95 C 0.076 +96 Q 0.084 +97 R 0.088 +98 S 0.092 +99 Q 0.102 +100 R 0.117 +101 F 0.139 +102 L 0.164 +103 N 0.186 +104 D 0.200 +105 P 0.208 +106 K 0.214 +107 H 0.224 +108 L 0.240 +109 L 0.263 +110 W 0.288 +111 G 0.306 +112 D 0.317 +113 R 0.336 +114 P 0.373 +115 E 0.418 +116 A 0.464 +117 Q 0.514 +118 L 0.568 +119 E 0.607 +120 N 0.622 +121 Q 0.621 +122 A 0.617 +123 D 0.608 +124 I 0.594 +125 N 0.580 +126 P 0.570 +127 S 0.566 +128 E 0.570 +129 P 0.580 +130 L 0.591 +131 P 0.599 +132 N 0.606 +133 I 0.613 +134 A 0.615 +135 D 0.615 +136 L 0.618 +137 P 0.630 +138 K 0.649 +139 E 0.661 +140 N 0.643 +141 I 0.598 +142 Q 0.575 +143 T 0.605 +144 Q 0.655 +145 A 0.678 +146 L 0.672 +147 N 0.651 +148 T 0.613 +149 S 0.556 +150 E 0.509 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024446.14_ENSMUST00000025319.7_GN:Rpp21_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:73.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024446.14_ENSMUST00000025319.7_GN:Rpp21_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:73.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d87820f0af8bd7c9ab44631ba18afa41652f6e91 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024446.14_ENSMUST00000025319.7_GN:Rpp21_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:73.caid @@ -0,0 +1,224 @@ +>ENSMUSG00000024446.14|ENSMUST00000025319.7|GN:Rpp21|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:73 +1 M 0.221 +2 Y 0.213 +3 F 0.202 +4 K 0.190 +5 I 0.174 +6 L 0.154 +7 Y 0.138 +8 L 0.138 +9 F 0.149 +10 H 0.155 +11 V 0.150 +12 Y 0.152 +13 L 0.168 +14 I 0.193 +15 R 0.228 +16 E 0.279 +17 G 0.334 +18 Y 0.388 +19 Q 0.449 +20 T 0.519 +21 R 0.574 +22 A 0.594 +23 A 0.585 +24 C 0.569 +25 T 0.560 +26 Q 0.562 +27 K 0.571 +28 T 0.584 +29 C 0.596 +30 G 0.594 +31 V 0.569 +32 L 0.530 +33 W 0.501 +34 F 0.496 +35 L 0.516 +36 T 0.554 +37 E 0.603 +38 A 0.650 +39 G 0.685 +40 A 0.702 +41 G 0.699 +42 L 0.672 +43 R 0.626 +44 A 0.577 +45 P 0.552 +46 P 0.565 +47 P 0.607 +48 P 0.653 +49 A 0.676 +50 L 0.674 +51 Q 0.657 +52 F 0.638 +53 P 0.617 +54 A 0.589 +55 D 0.545 +56 V 0.496 +57 A 0.464 +58 H 0.448 +59 C 0.430 +60 A 0.412 +61 R 0.421 +62 L 0.465 +63 G 0.513 +64 R 0.537 +65 D 0.541 +66 I 0.540 +67 R 0.551 +68 K 0.587 +69 E 0.639 +70 G 0.684 +71 Q 0.706 +72 T 0.701 +73 L 0.669 +74 M 0.607 +75 A 0.527 +76 G 0.450 +77 P 0.384 +78 V 0.316 +79 K 0.238 +80 D 0.165 +81 R 0.116 +82 E 0.090 +83 A 0.082 +84 F 0.083 +85 Q 0.084 +86 R 0.082 +87 L 0.082 +88 S 0.079 +89 F 0.071 +90 L 0.063 +91 Y 0.065 +92 Q 0.076 +93 A 0.084 +94 A 0.088 +95 H 0.093 +96 C 0.104 +97 V 0.116 +98 L 0.119 +99 S 0.112 +100 Q 0.099 +101 N 0.089 +102 P 0.087 +103 E 0.090 +104 N 0.093 +105 Q 0.096 +106 A 0.101 +107 L 0.104 +108 A 0.099 +109 R 0.082 +110 F 0.064 +111 Y 0.053 +112 C 0.048 +113 H 0.046 +114 T 0.047 +115 E 0.055 +116 K 0.066 +117 T 0.074 +118 I 0.074 +119 A 0.069 +120 K 0.065 +121 R 0.065 +122 L 0.070 +123 V 0.081 +124 L 0.098 +125 R 0.116 +126 Q 0.123 +127 D 0.114 +128 P 0.100 +129 S 0.095 +130 V 0.098 +131 K 0.099 +132 R 0.099 +133 T 0.097 +134 L 0.091 +135 C 0.080 +136 R 0.071 +137 S 0.067 +138 C 0.068 +139 S 0.075 +140 S 0.086 +141 L 0.100 +142 L 0.111 +143 I 0.117 +144 P 0.122 +145 G 0.126 +146 L 0.122 +147 T 0.107 +148 C 0.093 +149 T 0.090 +150 Q 0.097 +151 R 0.107 +152 Q 0.116 +153 R 0.124 +154 R 0.134 +155 R 0.144 +156 K 0.148 +157 G 0.139 +158 Q 0.118 +159 R 0.092 +160 W 0.071 +161 T 0.059 +162 V 0.054 +163 Q 0.054 +164 T 0.055 +165 C 0.058 +166 L 0.063 +167 T 0.071 +168 C 0.082 +169 Q 0.090 +170 R 0.096 +171 S 0.102 +172 Q 0.112 +173 R 0.129 +174 F 0.151 +175 L 0.173 +176 N 0.193 +177 D 0.207 +178 P 0.215 +179 K 0.223 +180 H 0.234 +181 L 0.251 +182 L 0.274 +183 W 0.297 +184 G 0.312 +185 D 0.318 +186 R 0.330 +187 P 0.358 +188 E 0.394 +189 A 0.433 +190 Q 0.482 +191 L 0.542 +192 E 0.590 +193 N 0.610 +194 Q 0.612 +195 A 0.610 +196 D 0.607 +197 I 0.598 +198 N 0.587 +199 P 0.578 +200 S 0.574 +201 E 0.577 +202 P 0.586 +203 L 0.599 +204 P 0.613 +205 N 0.628 +206 I 0.638 +207 A 0.641 +208 D 0.638 +209 L 0.640 +210 P 0.653 +211 K 0.675 +212 E 0.688 +213 N 0.668 +214 I 0.620 +215 Q 0.595 +216 T 0.625 +217 Q 0.675 +218 A 0.701 +219 L 0.698 +220 N 0.678 +221 T 0.639 +222 S 0.582 +223 E 0.533 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024726.11_ENSMUST00000025632.11_GN:Carnmt1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024726.11_ENSMUST00000025632.11_GN:Carnmt1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..12820af9cd1d6facc0beed46f0a6c4e2a96e20d1 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024726.11_ENSMUST00000025632.11_GN:Carnmt1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,401 @@ +>ENSMUSG00000024726.11|ENSMUST00000025632.11|GN:Carnmt1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.354 +2 Q 0.361 +3 R 0.371 +4 R 0.373 +5 Q 0.361 +6 R 0.351 +7 A 0.365 +8 P 0.388 +9 P 0.391 +10 A 0.387 +11 S 0.406 +12 Q 0.430 +13 P 0.418 +14 A 0.392 +15 Q 0.420 +16 D 0.511 +17 G 0.605 +18 G 0.651 +19 R 0.653 +20 S 0.628 +21 E 0.585 +22 D 0.524 +23 V 0.456 +24 E 0.398 +25 V 0.361 +26 Q 0.351 +27 F 0.363 +28 S 0.387 +29 A 0.416 +30 G 0.448 +31 R 0.482 +32 L 0.513 +33 G 0.529 +34 S 0.519 +35 A 0.487 +36 A 0.454 +37 P 0.434 +38 A 0.433 +39 G 0.449 +40 P 0.475 +41 P 0.495 +42 A 0.487 +43 R 0.440 +44 G 0.372 +45 T 0.309 +46 A 0.261 +47 E 0.227 +48 D 0.204 +49 E 0.186 +50 E 0.165 +51 R 0.142 +52 L 0.121 +53 E 0.102 +54 R 0.082 +55 E 0.067 +56 H 0.059 +57 F 0.057 +58 W 0.058 +59 K 0.061 +60 V 0.062 +61 I 0.058 +62 N 0.053 +63 A 0.050 +64 F 0.046 +65 R 0.043 +66 Y 0.044 +67 Y 0.049 +68 G 0.056 +69 T 0.063 +70 S 0.073 +71 M 0.081 +72 H 0.086 +73 E 0.084 +74 R 0.077 +75 V 0.068 +76 N 0.063 +77 R 0.065 +78 T 0.074 +79 E 0.084 +80 R 0.091 +81 Q 0.089 +82 F 0.083 +83 R 0.082 +84 S 0.092 +85 L 0.107 +86 P 0.112 +87 E 0.102 +88 N 0.085 +89 Q 0.071 +90 Q 0.065 +91 K 0.068 +92 L 0.077 +93 L 0.087 +94 P 0.094 +95 Q 0.096 +96 F 0.093 +97 P 0.088 +98 L 0.083 +99 H 0.084 +100 L 0.091 +101 D 0.102 +102 K 0.119 +103 I 0.133 +104 R 0.134 +105 K 0.128 +106 C 0.125 +107 I 0.124 +108 D 0.122 +109 H 0.120 +110 N 0.119 +111 Q 0.113 +112 E 0.101 +113 I 0.088 +114 L 0.075 +115 L 0.063 +116 T 0.054 +117 I 0.048 +118 V 0.043 +119 N 0.039 +120 D 0.036 +121 C 0.034 +122 I 0.035 +123 H 0.043 +124 M 0.057 +125 F 0.073 +126 E 0.089 +127 N 0.108 +128 K 0.134 +129 E 0.173 +130 Y 0.220 +131 G 0.265 +132 E 0.292 +133 D 0.299 +134 A 0.296 +135 N 0.291 +136 G 0.287 +137 K 0.280 +138 I 0.262 +139 M 0.236 +140 P 0.207 +141 A 0.177 +142 S 0.150 +143 T 0.129 +144 F 0.114 +145 D 0.102 +146 M 0.093 +147 D 0.091 +148 K 0.097 +149 L 0.099 +150 K 0.093 +151 S 0.084 +152 T 0.078 +153 L 0.073 +154 K 0.065 +155 Q 0.056 +156 F 0.048 +157 V 0.044 +158 R 0.042 +159 D 0.043 +160 W 0.049 +161 S 0.060 +162 E 0.071 +163 T 0.078 +164 G 0.079 +165 K 0.074 +166 A 0.069 +167 E 0.065 +168 R 0.061 +169 D 0.059 +170 A 0.058 +171 C 0.053 +172 Y 0.046 +173 K 0.040 +174 P 0.039 +175 I 0.042 +176 I 0.051 +177 K 0.056 +178 E 0.052 +179 I 0.044 +180 I 0.042 +181 K 0.050 +182 N 0.064 +183 F 0.075 +184 P 0.077 +185 K 0.072 +186 E 0.069 +187 R 0.070 +188 W 0.071 +189 D 0.071 +190 P 0.069 +191 S 0.065 +192 K 0.061 +193 V 0.055 +194 N 0.048 +195 I 0.042 +196 L 0.040 +197 V 0.048 +198 P 0.064 +199 G 0.087 +200 A 0.112 +201 G 0.131 +202 L 0.139 +203 G 0.138 +204 R 0.130 +205 L 0.118 +206 A 0.102 +207 W 0.088 +208 E 0.081 +209 V 0.082 +210 A 0.087 +211 M 0.089 +212 L 0.092 +213 G 0.097 +214 Y 0.103 +215 A 0.108 +216 C 0.108 +217 Q 0.106 +218 G 0.108 +219 N 0.117 +220 E 0.123 +221 W 0.112 +222 S 0.088 +223 F 0.067 +224 F 0.056 +225 M 0.051 +226 L 0.049 +227 F 0.049 +228 S 0.054 +229 S 0.057 +230 N 0.054 +231 F 0.054 +232 V 0.062 +233 L 0.073 +234 N 0.078 +235 R 0.076 +236 C 0.074 +237 S 0.074 +238 E 0.076 +239 I 0.081 +240 N 0.085 +241 K 0.087 +242 Y 0.087 +243 K 0.085 +244 L 0.080 +245 Y 0.072 +246 P 0.066 +247 W 0.064 +248 I 0.066 +249 H 0.070 +250 Q 0.073 +251 F 0.079 +252 S 0.087 +253 N 0.095 +254 N 0.101 +255 R 0.108 +256 R 0.120 +257 S 0.137 +258 A 0.152 +259 D 0.158 +260 Q 0.160 +261 I 0.163 +262 R 0.163 +263 P 0.155 +264 I 0.140 +265 L 0.128 +266 F 0.124 +267 P 0.126 +268 D 0.129 +269 V 0.125 +270 D 0.113 +271 P 0.100 +272 H 0.097 +273 S 0.107 +274 L 0.128 +275 P 0.152 +276 P 0.167 +277 G 0.166 +278 S 0.148 +279 N 0.121 +280 F 0.102 +281 S 0.100 +282 M 0.109 +283 T 0.112 +284 A 0.107 +285 G 0.095 +286 D 0.079 +287 F 0.064 +288 Q 0.055 +289 E 0.052 +290 I 0.055 +291 Y 0.061 +292 S 0.065 +293 E 0.070 +294 C 0.075 +295 N 0.076 +296 A 0.068 +297 W 0.057 +298 D 0.049 +299 C 0.046 +300 I 0.046 +301 A 0.048 +302 T 0.054 +303 C 0.065 +304 F 0.081 +305 F 0.097 +306 I 0.109 +307 D 0.115 +308 T 0.120 +309 A 0.120 +310 H 0.110 +311 N 0.093 +312 V 0.075 +313 I 0.061 +314 D 0.050 +315 Y 0.043 +316 I 0.041 +317 D 0.044 +318 T 0.049 +319 I 0.052 +320 W 0.053 +321 R 0.055 +322 I 0.057 +323 L 0.063 +324 K 0.074 +325 P 0.082 +326 G 0.083 +327 G 0.081 +328 I 0.084 +329 W 0.099 +330 I 0.124 +331 N 0.150 +332 L 0.175 +333 G 0.193 +334 P 0.196 +335 L 0.181 +336 L 0.156 +337 Y 0.137 +338 H 0.135 +339 F 0.149 +340 E 0.177 +341 N 0.214 +342 L 0.254 +343 A 0.290 +344 N 0.311 +345 E 0.316 +346 L 0.307 +347 S 0.288 +348 I 0.266 +349 E 0.240 +350 L 0.206 +351 S 0.165 +352 Y 0.128 +353 E 0.107 +354 D 0.101 +355 I 0.104 +356 K 0.105 +357 N 0.100 +358 V 0.086 +359 V 0.071 +360 L 0.064 +361 Q 0.067 +362 Y 0.074 +363 G 0.080 +364 F 0.079 +365 Q 0.071 +366 L 0.061 +367 E 0.050 +368 V 0.043 +369 E 0.041 +370 K 0.045 +371 E 0.053 +372 S 0.062 +373 V 0.069 +374 L 0.071 +375 S 0.066 +376 T 0.060 +377 Y 0.056 +378 T 0.058 +379 V 0.064 +380 N 0.074 +381 D 0.086 +382 L 0.095 +383 S 0.103 +384 M 0.114 +385 M 0.128 +386 K 0.142 +387 Y 0.150 +388 Y 0.150 +389 Y 0.139 +390 E 0.118 +391 C 0.093 +392 V 0.071 +393 L 0.055 +394 F 0.047 +395 V 0.048 +396 V 0.057 +397 R 0.077 +398 K 0.108 +399 P 0.143 +400 Q 0.166 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024726.11_ENSMUST00000025632.11_GN:Carnmt1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:76.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024726.11_ENSMUST00000025632.11_GN:Carnmt1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:76.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..cb2f3d0f512ca9fd0c14b23b43922e77a47fddab --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000024726.11_ENSMUST00000025632.11_GN:Carnmt1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:76.caid @@ -0,0 +1,477 @@ +>ENSMUSG00000024726.11|ENSMUST00000025632.11|GN:Carnmt1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:76 +1 M 0.366 +2 N 0.382 +3 A 0.408 +4 G 0.428 +5 G 0.431 +6 R 0.425 +7 G 0.420 +8 L 0.413 +9 S 0.400 +10 L 0.392 +11 V 0.396 +12 V 0.404 +13 G 0.401 +14 A 0.388 +15 C 0.382 +16 A 0.401 +17 G 0.436 +18 P 0.467 +19 E 0.476 +20 T 0.463 +21 L 0.438 +22 A 0.417 +23 E 0.423 +24 R 0.473 +25 S 0.548 +26 A 0.616 +27 N 0.667 +28 G 0.699 +29 G 0.708 +30 L 0.703 +31 R 0.704 +32 A 0.716 +33 A 0.729 +34 G 0.734 +35 A 0.732 +36 G 0.723 +37 R 0.710 +38 A 0.701 +39 A 0.698 +40 S 0.694 +41 G 0.688 +42 G 0.678 +43 L 0.666 +44 G 0.650 +45 R 0.628 +46 G 0.592 +47 R 0.544 +48 R 0.516 +49 R 0.533 +50 L 0.571 +51 E 0.591 +52 E 0.588 +53 A 0.584 +54 R 0.599 +55 P 0.633 +56 F 0.670 +57 A 0.697 +58 T 0.708 +59 T 0.713 +60 H 0.723 +61 S 0.739 +62 G 0.751 +63 A 0.754 +64 G 0.745 +65 K 0.726 +66 R 0.703 +67 R 0.673 +68 R 0.630 +69 V 0.575 +70 T 0.513 +71 P 0.452 +72 W 0.403 +73 A 0.373 +74 A 0.352 +75 A 0.337 +76 A 0.334 +77 M 0.344 +78 Q 0.374 +79 R 0.430 +80 R 0.488 +81 Q 0.515 +82 R 0.522 +83 A 0.543 +84 P 0.588 +85 P 0.640 +86 A 0.681 +87 S 0.703 +88 Q 0.715 +89 P 0.728 +90 A 0.747 +91 Q 0.764 +92 D 0.774 +93 G 0.775 +94 G 0.767 +95 R 0.753 +96 S 0.734 +97 E 0.706 +98 D 0.662 +99 V 0.603 +100 E 0.541 +101 V 0.496 +102 Q 0.484 +103 F 0.503 +104 S 0.539 +105 A 0.578 +106 G 0.612 +107 R 0.636 +108 L 0.646 +109 G 0.640 +110 S 0.616 +111 A 0.579 +112 A 0.544 +113 P 0.522 +114 A 0.515 +115 G 0.522 +116 P 0.536 +117 P 0.543 +118 A 0.523 +119 R 0.465 +120 G 0.387 +121 T 0.315 +122 A 0.260 +123 E 0.220 +124 D 0.193 +125 E 0.174 +126 E 0.151 +127 R 0.127 +128 L 0.106 +129 E 0.088 +130 R 0.071 +131 E 0.059 +132 H 0.052 +133 F 0.049 +134 W 0.051 +135 K 0.054 +136 V 0.055 +137 I 0.052 +138 N 0.047 +139 A 0.043 +140 F 0.040 +141 R 0.037 +142 Y 0.038 +143 Y 0.043 +144 G 0.049 +145 T 0.056 +146 S 0.062 +147 M 0.065 +148 H 0.063 +149 E 0.058 +150 R 0.057 +151 V 0.056 +152 N 0.057 +153 R 0.062 +154 T 0.071 +155 E 0.082 +156 R 0.090 +157 Q 0.089 +158 F 0.085 +159 R 0.085 +160 S 0.096 +161 L 0.111 +162 P 0.116 +163 E 0.104 +164 N 0.085 +165 Q 0.070 +166 Q 0.065 +167 K 0.068 +168 L 0.078 +169 L 0.090 +170 P 0.099 +171 Q 0.102 +172 F 0.099 +173 P 0.091 +174 L 0.085 +175 H 0.086 +176 L 0.093 +177 D 0.105 +178 K 0.122 +179 I 0.137 +180 R 0.138 +181 K 0.132 +182 C 0.128 +183 I 0.127 +184 D 0.124 +185 H 0.122 +186 N 0.123 +187 Q 0.118 +188 E 0.106 +189 I 0.092 +190 L 0.079 +191 L 0.067 +192 T 0.059 +193 I 0.052 +194 V 0.046 +195 N 0.041 +196 D 0.038 +197 C 0.036 +198 I 0.038 +199 H 0.046 +200 M 0.058 +201 F 0.072 +202 E 0.085 +203 N 0.102 +204 K 0.128 +205 E 0.165 +206 Y 0.213 +207 G 0.257 +208 E 0.284 +209 D 0.289 +210 A 0.283 +211 N 0.276 +212 G 0.272 +213 K 0.266 +214 I 0.251 +215 M 0.226 +216 P 0.198 +217 A 0.170 +218 S 0.144 +219 T 0.124 +220 F 0.109 +221 D 0.098 +222 M 0.089 +223 D 0.087 +224 K 0.093 +225 L 0.096 +226 K 0.092 +227 S 0.085 +228 T 0.081 +229 L 0.077 +230 K 0.069 +231 Q 0.059 +232 F 0.050 +233 V 0.045 +234 R 0.042 +235 D 0.042 +236 W 0.048 +237 S 0.058 +238 E 0.068 +239 T 0.075 +240 G 0.075 +241 K 0.071 +242 A 0.066 +243 E 0.062 +244 R 0.058 +245 D 0.057 +246 A 0.057 +247 C 0.052 +248 Y 0.045 +249 K 0.038 +250 P 0.034 +251 I 0.032 +252 I 0.031 +253 K 0.031 +254 E 0.032 +255 I 0.033 +256 I 0.037 +257 K 0.047 +258 N 0.061 +259 F 0.071 +260 P 0.073 +261 K 0.069 +262 E 0.067 +263 R 0.069 +264 W 0.071 +265 D 0.070 +266 P 0.067 +267 S 0.063 +268 K 0.059 +269 V 0.053 +270 N 0.047 +271 I 0.041 +272 L 0.040 +273 V 0.048 +274 P 0.065 +275 G 0.088 +276 A 0.113 +277 G 0.132 +278 L 0.139 +279 G 0.137 +280 R 0.129 +281 L 0.116 +282 A 0.101 +283 W 0.087 +284 E 0.079 +285 V 0.081 +286 A 0.086 +287 M 0.088 +288 L 0.091 +289 G 0.098 +290 Y 0.105 +291 A 0.110 +292 C 0.110 +293 Q 0.107 +294 G 0.109 +295 N 0.119 +296 E 0.126 +297 W 0.115 +298 S 0.091 +299 F 0.068 +300 F 0.056 +301 M 0.051 +302 L 0.048 +303 F 0.049 +304 S 0.054 +305 S 0.057 +306 N 0.054 +307 F 0.054 +308 V 0.063 +309 L 0.074 +310 N 0.079 +311 R 0.078 +312 C 0.076 +313 S 0.077 +314 E 0.080 +315 I 0.085 +316 N 0.088 +317 K 0.090 +318 Y 0.089 +319 K 0.086 +320 L 0.080 +321 Y 0.073 +322 P 0.067 +323 W 0.065 +324 I 0.067 +325 H 0.071 +326 Q 0.074 +327 F 0.079 +328 S 0.087 +329 N 0.095 +330 N 0.101 +331 R 0.108 +332 R 0.121 +333 S 0.140 +334 A 0.156 +335 D 0.161 +336 Q 0.162 +337 I 0.165 +338 R 0.164 +339 P 0.155 +340 I 0.140 +341 L 0.127 +342 F 0.123 +343 P 0.125 +344 D 0.129 +345 V 0.126 +346 D 0.115 +347 P 0.102 +348 H 0.099 +349 S 0.109 +350 L 0.130 +351 P 0.153 +352 P 0.168 +353 G 0.166 +354 S 0.148 +355 N 0.120 +356 F 0.100 +357 S 0.097 +358 M 0.106 +359 T 0.110 +360 A 0.105 +361 G 0.093 +362 D 0.077 +363 F 0.062 +364 Q 0.054 +365 E 0.051 +366 I 0.055 +367 Y 0.061 +368 S 0.066 +369 E 0.071 +370 C 0.077 +371 N 0.077 +372 A 0.069 +373 W 0.058 +374 D 0.051 +375 C 0.049 +376 I 0.048 +377 A 0.051 +378 T 0.057 +379 C 0.068 +380 F 0.084 +381 F 0.101 +382 I 0.113 +383 D 0.120 +384 T 0.125 +385 A 0.126 +386 H 0.116 +387 N 0.097 +388 V 0.078 +389 I 0.063 +390 D 0.052 +391 Y 0.044 +392 I 0.043 +393 D 0.047 +394 T 0.051 +395 I 0.054 +396 W 0.056 +397 R 0.057 +398 I 0.059 +399 L 0.066 +400 K 0.077 +401 P 0.086 +402 G 0.088 +403 G 0.085 +404 I 0.088 +405 W 0.104 +406 I 0.129 +407 N 0.157 +408 L 0.181 +409 G 0.198 +410 P 0.198 +411 L 0.181 +412 L 0.154 +413 Y 0.134 +414 H 0.131 +415 F 0.145 +416 E 0.172 +417 N 0.207 +418 L 0.247 +419 A 0.281 +420 N 0.302 +421 E 0.308 +422 L 0.301 +423 S 0.283 +424 I 0.262 +425 E 0.238 +426 L 0.205 +427 S 0.164 +428 Y 0.128 +429 E 0.105 +430 D 0.100 +431 I 0.102 +432 K 0.105 +433 N 0.100 +434 V 0.087 +435 V 0.071 +436 L 0.064 +437 Q 0.067 +438 Y 0.075 +439 G 0.081 +440 F 0.079 +441 Q 0.071 +442 L 0.060 +443 E 0.050 +444 V 0.042 +445 E 0.041 +446 K 0.045 +447 E 0.052 +448 S 0.061 +449 V 0.069 +450 L 0.071 +451 S 0.066 +452 T 0.060 +453 Y 0.058 +454 T 0.060 +455 V 0.066 +456 N 0.077 +457 D 0.089 +458 L 0.099 +459 S 0.108 +460 M 0.119 +461 M 0.134 +462 K 0.148 +463 Y 0.157 +464 Y 0.157 +465 Y 0.146 +466 E 0.124 +467 C 0.097 +468 V 0.074 +469 L 0.057 +470 F 0.049 +471 V 0.050 +472 V 0.060 +473 R 0.082 +474 K 0.118 +475 P 0.160 +476 Q 0.189 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000025170.14_ENSMUST00000106107.3_GN:Rab40b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000025170.14_ENSMUST00000106107.3_GN:Rab40b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..59a68ad14b67c53e9be4335d9f20e57da0b95511 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000025170.14_ENSMUST00000106107.3_GN:Rab40b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,279 @@ +>ENSMUSG00000025170.14|ENSMUST00000106107.3|GN:Rab40b|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.506 +2 S 0.526 +3 S 0.551 +4 L 0.567 +5 G 0.569 +6 S 0.556 +7 P 0.523 +8 V 0.463 +9 R 0.379 +10 A 0.279 +11 Y 0.183 +12 D 0.109 +13 F 0.064 +14 L 0.039 +15 L 0.025 +16 K 0.019 +17 F 0.018 +18 L 0.022 +19 L 0.028 +20 V 0.037 +21 G 0.050 +22 D 0.067 +23 S 0.081 +24 D 0.087 +25 V 0.086 +26 G 0.087 +27 K 0.094 +28 G 0.106 +29 E 0.119 +30 I 0.130 +31 L 0.135 +32 A 0.137 +33 S 0.143 +34 L 0.164 +35 Q 0.208 +36 D 0.270 +37 G 0.328 +38 A 0.364 +39 A 0.374 +40 E 0.375 +41 S 0.375 +42 P 0.374 +43 Y 0.371 +44 G 0.370 +45 H 0.364 +46 P 0.343 +47 A 0.295 +48 G 0.224 +49 I 0.154 +50 D 0.102 +51 H 0.071 +52 K 0.052 +53 T 0.043 +54 T 0.040 +55 T 0.043 +56 I 0.048 +57 L 0.052 +58 L 0.056 +59 D 0.064 +60 G 0.074 +61 R 0.081 +62 R 0.081 +63 V 0.071 +64 K 0.055 +65 L 0.041 +66 Q 0.031 +67 L 0.030 +68 W 0.039 +69 D 0.065 +70 T 0.109 +71 S 0.163 +72 G 0.208 +73 Q 0.237 +74 G 0.246 +75 R 0.232 +76 F 0.203 +77 C 0.169 +78 T 0.137 +79 I 0.108 +80 F 0.084 +81 R 0.068 +82 S 0.060 +83 Y 0.059 +84 S 0.066 +85 R 0.077 +86 G 0.088 +87 A 0.091 +88 Q 0.082 +89 G 0.065 +90 V 0.049 +91 V 0.042 +92 L 0.040 +93 V 0.039 +94 Y 0.039 +95 D 0.040 +96 I 0.043 +97 A 0.043 +98 N 0.039 +99 R 0.034 +100 W 0.034 +101 S 0.038 +102 F 0.043 +103 D 0.046 +104 G 0.044 +105 I 0.036 +106 N 0.026 +107 R 0.021 +108 W 0.027 +109 I 0.040 +110 K 0.048 +111 E 0.041 +112 I 0.028 +113 D 0.021 +114 E 0.024 +115 H 0.033 +116 A 0.046 +117 P 0.058 +118 G 0.064 +119 V 0.062 +120 P 0.052 +121 K 0.040 +122 I 0.033 +123 L 0.033 +124 V 0.035 +125 G 0.035 +126 N 0.036 +127 R 0.040 +128 L 0.045 +129 H 0.047 +130 L 0.047 +131 A 0.047 +132 F 0.046 +133 K 0.047 +134 R 0.050 +135 Q 0.059 +136 V 0.070 +137 P 0.074 +138 T 0.068 +139 E 0.059 +140 Q 0.053 +141 A 0.056 +142 Q 0.065 +143 A 0.070 +144 Y 0.064 +145 A 0.051 +146 E 0.042 +147 R 0.041 +148 L 0.049 +149 G 0.058 +150 V 0.057 +151 T 0.046 +152 F 0.034 +153 F 0.031 +154 E 0.036 +155 V 0.047 +156 S 0.062 +157 P 0.076 +158 L 0.083 +159 C 0.082 +160 N 0.075 +161 F 0.065 +162 N 0.055 +163 I 0.048 +164 T 0.043 +165 E 0.040 +166 S 0.039 +167 F 0.036 +168 T 0.035 +169 E 0.035 +170 L 0.036 +171 A 0.035 +172 R 0.035 +173 I 0.036 +174 V 0.039 +175 L 0.045 +176 L 0.059 +177 R 0.086 +178 H 0.121 +179 G 0.155 +180 M 0.178 +181 D 0.190 +182 R 0.199 +183 L 0.212 +184 W 0.235 +185 R 0.266 +186 P 0.292 +187 S 0.306 +188 K 0.303 +189 V 0.276 +190 L 0.230 +191 S 0.183 +192 L 0.148 +193 Q 0.126 +194 E 0.116 +195 L 0.113 +196 C 0.112 +197 C 0.110 +198 R 0.110 +199 A 0.112 +200 V 0.113 +201 V 0.115 +202 S 0.128 +203 C 0.145 +204 T 0.149 +205 P 0.136 +206 G 0.119 +207 H 0.106 +208 L 0.099 +209 V 0.095 +210 D 0.099 +211 K 0.113 +212 L 0.129 +213 P 0.135 +214 L 0.129 +215 P 0.110 +216 V 0.086 +217 A 0.070 +218 L 0.066 +219 R 0.070 +220 S 0.070 +221 H 0.063 +222 L 0.055 +223 K 0.055 +224 S 0.066 +225 F 0.097 +226 S 0.155 +227 M 0.235 +228 A 0.324 +229 S 0.415 +230 G 0.495 +231 L 0.554 +232 N 0.589 +233 T 0.606 +234 R 0.615 +235 M 0.627 +236 M 0.649 +237 H 0.674 +238 G 0.694 +239 R 0.705 +240 S 0.711 +241 Y 0.714 +242 S 0.707 +243 L 0.671 +244 T 0.612 +245 A 0.575 +246 N 0.593 +247 S 0.633 +248 S 0.655 +249 H 0.663 +250 K 0.672 +251 R 0.682 +252 N 0.683 +253 S 0.668 +254 F 0.629 +255 R 0.578 +256 K 0.557 +257 V 0.591 +258 R 0.648 +259 T 0.678 +260 I 0.674 +261 R 0.658 +262 P 0.653 +263 P 0.658 +264 Q 0.661 +265 S 0.660 +266 P 0.665 +267 P 0.684 +268 R 0.707 +269 N 0.720 +270 C 0.721 +271 A 0.714 +272 R 0.704 +273 N 0.695 +274 S 0.687 +275 C 0.674 +276 K 0.645 +277 I 0.591 +278 S 0.541 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000025170.14_ENSMUST00000106107.3_GN:Rab40b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000025170.14_ENSMUST00000106107.3_GN:Rab40b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..12ef734425a3e8ab72767883cca7fd65bf13030b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000025170.14_ENSMUST00000106107.3_GN:Rab40b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid @@ -0,0 +1,280 @@ +>ENSMUSG00000025170.14|ENSMUST00000106107.3|GN:Rab40b|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:1 +1 M 0.492 +2 M 0.520 +3 S 0.557 +4 S 0.582 +5 L 0.586 +6 G 0.578 +7 S 0.561 +8 P 0.529 +9 V 0.469 +10 R 0.381 +11 A 0.278 +12 Y 0.182 +13 D 0.110 +14 F 0.065 +15 L 0.040 +16 L 0.026 +17 K 0.019 +18 F 0.018 +19 L 0.021 +20 L 0.028 +21 V 0.037 +22 G 0.050 +23 D 0.067 +24 S 0.081 +25 D 0.086 +26 V 0.086 +27 G 0.087 +28 K 0.094 +29 G 0.105 +30 E 0.119 +31 I 0.129 +32 L 0.134 +33 A 0.137 +34 S 0.142 +35 L 0.163 +36 Q 0.208 +37 D 0.270 +38 G 0.329 +39 A 0.364 +40 A 0.374 +41 E 0.375 +42 S 0.375 +43 P 0.373 +44 Y 0.371 +45 G 0.369 +46 H 0.363 +47 P 0.341 +48 A 0.293 +49 G 0.223 +50 I 0.153 +51 D 0.102 +52 H 0.070 +53 K 0.052 +54 T 0.042 +55 T 0.040 +56 T 0.043 +57 I 0.047 +58 L 0.051 +59 L 0.056 +60 D 0.064 +61 G 0.073 +62 R 0.081 +63 R 0.081 +64 V 0.071 +65 K 0.055 +66 L 0.040 +67 Q 0.031 +68 L 0.029 +69 W 0.038 +70 D 0.064 +71 T 0.109 +72 S 0.162 +73 G 0.208 +74 Q 0.236 +75 G 0.244 +76 R 0.230 +77 F 0.201 +78 C 0.168 +79 T 0.136 +80 I 0.107 +81 F 0.083 +82 R 0.067 +83 S 0.059 +84 Y 0.058 +85 S 0.065 +86 R 0.077 +87 G 0.087 +88 A 0.091 +89 Q 0.082 +90 G 0.064 +91 V 0.049 +92 V 0.042 +93 L 0.039 +94 V 0.039 +95 Y 0.039 +96 D 0.040 +97 I 0.043 +98 A 0.043 +99 N 0.039 +100 R 0.034 +101 W 0.034 +102 S 0.038 +103 F 0.043 +104 D 0.046 +105 G 0.044 +106 I 0.036 +107 N 0.026 +108 R 0.021 +109 W 0.027 +110 I 0.040 +111 K 0.048 +112 E 0.041 +113 I 0.028 +114 D 0.021 +115 E 0.024 +116 H 0.033 +117 A 0.046 +118 P 0.058 +119 G 0.064 +120 V 0.062 +121 P 0.052 +122 K 0.040 +123 I 0.033 +124 L 0.033 +125 V 0.035 +126 G 0.035 +127 N 0.036 +128 R 0.039 +129 L 0.045 +130 H 0.047 +131 L 0.047 +132 A 0.047 +133 F 0.046 +134 K 0.047 +135 R 0.050 +136 Q 0.059 +137 V 0.070 +138 P 0.074 +139 T 0.068 +140 E 0.059 +141 Q 0.053 +142 A 0.056 +143 Q 0.066 +144 A 0.070 +145 Y 0.064 +146 A 0.051 +147 E 0.042 +148 R 0.041 +149 L 0.049 +150 G 0.058 +151 V 0.057 +152 T 0.046 +153 F 0.034 +154 F 0.031 +155 E 0.036 +156 V 0.047 +157 S 0.062 +158 P 0.076 +159 L 0.083 +160 C 0.082 +161 N 0.075 +162 F 0.065 +163 N 0.055 +164 I 0.048 +165 T 0.043 +166 E 0.040 +167 S 0.039 +168 F 0.036 +169 T 0.035 +170 E 0.035 +171 L 0.036 +172 A 0.035 +173 R 0.035 +174 I 0.036 +175 V 0.039 +176 L 0.045 +177 L 0.059 +178 R 0.086 +179 H 0.121 +180 G 0.154 +181 M 0.177 +182 D 0.190 +183 R 0.198 +184 L 0.211 +185 W 0.235 +186 R 0.265 +187 P 0.291 +188 S 0.305 +189 K 0.302 +190 V 0.275 +191 L 0.229 +192 S 0.182 +193 L 0.147 +194 Q 0.126 +195 E 0.115 +196 L 0.113 +197 C 0.111 +198 C 0.109 +199 R 0.110 +200 A 0.112 +201 V 0.112 +202 V 0.115 +203 S 0.128 +204 C 0.145 +205 T 0.149 +206 P 0.136 +207 G 0.118 +208 H 0.106 +209 L 0.099 +210 V 0.095 +211 D 0.099 +212 K 0.113 +213 L 0.128 +214 P 0.135 +215 L 0.129 +216 P 0.110 +217 V 0.086 +218 A 0.070 +219 L 0.066 +220 R 0.070 +221 S 0.070 +222 H 0.063 +223 L 0.055 +224 K 0.055 +225 S 0.066 +226 F 0.097 +227 S 0.154 +228 M 0.234 +229 A 0.323 +230 S 0.414 +231 G 0.495 +232 L 0.553 +233 N 0.588 +234 T 0.605 +235 R 0.614 +236 M 0.627 +237 M 0.648 +238 H 0.673 +239 G 0.693 +240 R 0.705 +241 S 0.711 +242 Y 0.714 +243 S 0.707 +244 L 0.671 +245 T 0.612 +246 A 0.576 +247 N 0.593 +248 S 0.632 +249 S 0.654 +250 H 0.660 +251 K 0.670 +252 R 0.682 +253 N 0.684 +254 S 0.668 +255 F 0.629 +256 R 0.579 +257 K 0.557 +258 V 0.592 +259 R 0.648 +260 T 0.678 +261 I 0.674 +262 R 0.658 +263 P 0.653 +264 P 0.658 +265 Q 0.661 +266 S 0.660 +267 P 0.665 +268 P 0.684 +269 R 0.707 +270 N 0.721 +271 C 0.721 +272 A 0.714 +273 R 0.704 +274 N 0.695 +275 S 0.687 +276 C 0.675 +277 K 0.645 +278 I 0.592 +279 S 0.542 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000025735.14_ENSMUST00000026831.14_GN:Rhbdl1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000025735.14_ENSMUST00000026831.14_GN:Rhbdl1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2c70890a9af20b4da13dffbc8a7e6563a825bff4 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000025735.14_ENSMUST00000026831.14_GN:Rhbdl1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,374 @@ +>ENSMUSG00000025735.14|ENSMUST00000026831.14|GN:Rhbdl1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.145 +2 D 0.116 +3 R 0.083 +4 S 0.064 +5 S 0.056 +6 L 0.055 +7 L 0.060 +8 Q 0.065 +9 L 0.061 +10 I 0.053 +11 Q 0.051 +12 E 0.059 +13 Q 0.074 +14 Q 0.091 +15 L 0.112 +16 D 0.138 +17 P 0.163 +18 E 0.178 +19 N 0.173 +20 T 0.149 +21 G 0.120 +22 F 0.096 +23 I 0.075 +24 G 0.057 +25 A 0.043 +26 D 0.036 +27 T 0.035 +28 F 0.043 +29 A 0.056 +30 G 0.068 +31 L 0.071 +32 V 0.075 +33 H 0.088 +34 S 0.107 +35 H 0.124 +36 E 0.134 +37 L 0.136 +38 P 0.129 +39 L 0.113 +40 D 0.089 +41 P 0.065 +42 T 0.044 +43 K 0.031 +44 L 0.026 +45 D 0.026 +46 M 0.028 +47 L 0.030 +48 V 0.034 +49 A 0.041 +50 L 0.053 +51 A 0.071 +52 Q 0.093 +53 S 0.110 +54 N 0.116 +55 E 0.112 +56 R 0.105 +57 G 0.098 +58 Q 0.083 +59 V 0.061 +60 C 0.040 +61 Y 0.025 +62 Q 0.020 +63 E 0.020 +64 L 0.024 +65 V 0.032 +66 D 0.047 +67 L 0.069 +68 I 0.099 +69 S 0.137 +70 S 0.176 +71 K 0.206 +72 R 0.224 +73 S 0.231 +74 S 0.226 +75 S 0.207 +76 F 0.181 +77 K 0.166 +78 R 0.169 +79 A 0.186 +80 I 0.206 +81 A 0.235 +82 N 0.277 +83 G 0.321 +84 Q 0.348 +85 R 0.354 +86 A 0.350 +87 L 0.340 +88 P 0.322 +89 R 0.303 +90 D 0.290 +91 G 0.280 +92 L 0.271 +93 L 0.271 +94 D 0.283 +95 E 0.297 +96 P 0.293 +97 G 0.266 +98 L 0.221 +99 S 0.171 +100 V 0.124 +101 Y 0.091 +102 K 0.075 +103 R 0.070 +104 F 0.071 +105 V 0.072 +106 R 0.072 +107 Y 0.069 +108 V 0.064 +109 A 0.060 +110 Y 0.064 +111 E 0.073 +112 I 0.084 +113 L 0.091 +114 P 0.096 +115 C 0.097 +116 E 0.092 +117 V 0.081 +118 D 0.069 +119 R 0.059 +120 R 0.053 +121 W 0.050 +122 Y 0.049 +123 F 0.049 +124 Y 0.050 +125 R 0.049 +126 H 0.044 +127 R 0.038 +128 T 0.033 +129 C 0.035 +130 P 0.044 +131 P 0.052 +132 P 0.050 +133 V 0.041 +134 F 0.033 +135 M 0.031 +136 A 0.033 +137 S 0.041 +138 V 0.054 +139 T 0.068 +140 L 0.075 +141 A 0.070 +142 Q 0.059 +143 I 0.048 +144 I 0.039 +145 V 0.033 +146 F 0.030 +147 L 0.028 +148 C 0.030 +149 Y 0.037 +150 G 0.048 +151 A 0.061 +152 R 0.071 +153 L 0.075 +154 N 0.073 +155 K 0.068 +156 W 0.064 +157 V 0.063 +158 L 0.066 +159 Q 0.072 +160 T 0.079 +161 Y 0.084 +162 H 0.091 +163 P 0.102 +164 E 0.119 +165 Y 0.136 +166 M 0.142 +167 K 0.133 +168 S 0.116 +169 P 0.100 +170 L 0.089 +171 V 0.081 +172 Y 0.076 +173 H 0.073 +174 P 0.072 +175 G 0.072 +176 H 0.072 +177 R 0.072 +178 A 0.074 +179 R 0.077 +180 A 0.080 +181 W 0.087 +182 R 0.099 +183 F 0.110 +184 L 0.121 +185 T 0.132 +186 Y 0.138 +187 M 0.134 +188 F 0.127 +189 M 0.124 +190 H 0.132 +191 V 0.151 +192 G 0.172 +193 L 0.194 +194 E 0.221 +195 Q 0.236 +196 L 0.217 +197 G 0.187 +198 F 0.182 +199 N 0.189 +200 A 0.176 +201 L 0.142 +202 L 0.108 +203 Q 0.082 +204 L 0.061 +205 M 0.048 +206 I 0.046 +207 G 0.047 +208 V 0.045 +209 P 0.041 +210 L 0.037 +211 E 0.036 +212 M 0.035 +213 V 0.033 +214 H 0.032 +215 G 0.030 +216 V 0.027 +217 L 0.024 +218 R 0.023 +219 I 0.025 +220 S 0.026 +221 L 0.027 +222 L 0.030 +223 Y 0.035 +224 L 0.039 +225 A 0.042 +226 G 0.042 +227 V 0.040 +228 L 0.038 +229 A 0.037 +230 G 0.038 +231 S 0.040 +232 L 0.042 +233 T 0.044 +234 V 0.047 +235 S 0.051 +236 I 0.058 +237 T 0.069 +238 D 0.082 +239 M 0.099 +240 R 0.120 +241 A 0.136 +242 P 0.134 +243 V 0.118 +244 V 0.110 +245 G 0.120 +246 G 0.140 +247 S 0.155 +248 G 0.154 +249 G 0.138 +250 V 0.118 +251 Y 0.105 +252 A 0.095 +253 L 0.084 +254 C 0.071 +255 S 0.061 +256 A 0.055 +257 H 0.050 +258 L 0.047 +259 A 0.042 +260 N 0.037 +261 V 0.036 +262 V 0.040 +263 M 0.044 +264 N 0.046 +265 W 0.047 +266 A 0.048 +267 G 0.050 +268 M 0.054 +269 R 0.059 +270 C 0.061 +271 P 0.057 +272 Y 0.048 +273 K 0.037 +274 L 0.030 +275 L 0.029 +276 R 0.039 +277 M 0.054 +278 V 0.065 +279 L 0.063 +280 A 0.053 +281 L 0.046 +282 V 0.044 +283 C 0.047 +284 M 0.049 +285 S 0.047 +286 S 0.043 +287 E 0.042 +288 V 0.043 +289 G 0.047 +290 R 0.052 +291 A 0.055 +292 V 0.056 +293 W 0.062 +294 L 0.081 +295 R 0.112 +296 F 0.154 +297 S 0.205 +298 P 0.252 +299 P 0.281 +300 L 0.291 +301 P 0.283 +302 A 0.265 +303 S 0.248 +304 G 0.244 +305 P 0.248 +306 Q 0.246 +307 P 0.227 +308 S 0.192 +309 F 0.158 +310 M 0.140 +311 A 0.138 +312 H 0.134 +313 L 0.115 +314 A 0.091 +315 G 0.073 +316 A 0.063 +317 V 0.060 +318 V 0.057 +319 G 0.054 +320 V 0.052 +321 S 0.051 +322 M 0.049 +323 G 0.048 +324 L 0.050 +325 T 0.052 +326 I 0.056 +327 L 0.062 +328 R 0.075 +329 S 0.090 +330 Y 0.102 +331 E 0.108 +332 E 0.108 +333 R 0.109 +334 L 0.113 +335 R 0.119 +336 D 0.121 +337 Q 0.115 +338 C 0.107 +339 G 0.099 +340 W 0.093 +341 W 0.089 +342 V 0.088 +343 V 0.084 +344 L 0.075 +345 L 0.068 +346 A 0.067 +347 Y 0.067 +348 G 0.063 +349 T 0.059 +350 F 0.061 +351 L 0.067 +352 L 0.069 +353 F 0.059 +354 A 0.045 +355 I 0.034 +356 F 0.030 +357 W 0.032 +358 N 0.038 +359 V 0.048 +360 F 0.063 +361 A 0.082 +362 Y 0.104 +363 D 0.132 +364 L 0.170 +365 L 0.220 +366 G 0.272 +367 A 0.314 +368 D 0.336 +369 I 0.338 +370 P 0.327 +371 P 0.313 +372 P 0.304 +373 P 0.300 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000025735.14_ENSMUST00000026831.14_GN:Rhbdl1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:56.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000025735.14_ENSMUST00000026831.14_GN:Rhbdl1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:56.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b68ff05c083757e380c1e97506091d8bbaf4a1bf --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000025735.14_ENSMUST00000026831.14_GN:Rhbdl1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:56.caid @@ -0,0 +1,430 @@ +>ENSMUSG00000025735.14|ENSMUST00000026831.14|GN:Rhbdl1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:56 +1 M 0.106 +2 R 0.096 +3 V 0.082 +4 L 0.070 +5 W 0.065 +6 L 0.070 +7 C 0.085 +8 A 0.102 +9 R 0.119 +10 W 0.141 +11 A 0.174 +12 G 0.206 +13 I 0.222 +14 S 0.217 +15 V 0.194 +16 T 0.166 +17 L 0.147 +18 S 0.142 +19 E 0.144 +20 L 0.148 +21 G 0.147 +22 E 0.140 +23 R 0.128 +24 R 0.118 +25 A 0.118 +26 E 0.128 +27 Q 0.141 +28 A 0.150 +29 E 0.165 +30 R 0.208 +31 A 0.283 +32 G 0.371 +33 R 0.453 +34 G 0.515 +35 G 0.535 +36 A 0.511 +37 E 0.483 +38 R 0.488 +39 S 0.505 +40 A 0.505 +41 E 0.497 +42 Q 0.504 +43 P 0.529 +44 L 0.566 +45 P 0.601 +46 A 0.620 +47 S 0.614 +48 A 0.593 +49 D 0.572 +50 P 0.560 +51 G 0.558 +52 P 0.564 +53 R 0.572 +54 P 0.559 +55 G 0.498 +56 S 0.391 +57 M 0.273 +58 D 0.175 +59 R 0.110 +60 S 0.075 +61 S 0.059 +62 L 0.055 +63 L 0.060 +64 Q 0.065 +65 L 0.061 +66 I 0.053 +67 Q 0.050 +68 E 0.058 +69 Q 0.072 +70 Q 0.088 +71 L 0.105 +72 D 0.128 +73 P 0.151 +74 E 0.165 +75 N 0.159 +76 T 0.136 +77 G 0.108 +78 F 0.085 +79 I 0.067 +80 G 0.051 +81 A 0.039 +82 D 0.031 +83 T 0.027 +84 F 0.028 +85 A 0.032 +86 G 0.038 +87 L 0.043 +88 V 0.053 +89 H 0.068 +90 S 0.085 +91 H 0.097 +92 E 0.103 +93 L 0.101 +94 P 0.094 +95 L 0.080 +96 D 0.064 +97 P 0.047 +98 T 0.033 +99 K 0.024 +100 L 0.020 +101 D 0.020 +102 M 0.021 +103 L 0.024 +104 V 0.027 +105 A 0.034 +106 L 0.045 +107 A 0.061 +108 Q 0.081 +109 S 0.097 +110 N 0.103 +111 E 0.100 +112 R 0.095 +113 G 0.090 +114 Q 0.076 +115 V 0.056 +116 C 0.035 +117 Y 0.021 +118 Q 0.016 +119 E 0.017 +120 L 0.020 +121 V 0.025 +122 D 0.035 +123 L 0.050 +124 I 0.071 +125 S 0.100 +126 S 0.130 +127 K 0.156 +128 R 0.175 +129 S 0.186 +130 S 0.185 +131 S 0.171 +132 F 0.152 +133 K 0.139 +134 R 0.138 +135 A 0.147 +136 I 0.163 +137 A 0.189 +138 N 0.230 +139 G 0.275 +140 Q 0.308 +141 R 0.324 +142 A 0.328 +143 L 0.321 +144 P 0.304 +145 R 0.288 +146 D 0.281 +147 G 0.278 +148 L 0.274 +149 L 0.275 +150 D 0.285 +151 E 0.295 +152 P 0.291 +153 G 0.266 +154 L 0.224 +155 S 0.175 +156 V 0.127 +157 Y 0.092 +158 K 0.073 +159 R 0.066 +160 F 0.066 +161 V 0.068 +162 R 0.069 +163 Y 0.067 +164 V 0.061 +165 A 0.058 +166 Y 0.061 +167 E 0.071 +168 I 0.082 +169 L 0.091 +170 P 0.098 +171 C 0.100 +172 E 0.095 +173 V 0.085 +174 D 0.072 +175 R 0.062 +176 R 0.056 +177 W 0.055 +178 Y 0.055 +179 F 0.055 +180 Y 0.056 +181 R 0.056 +182 H 0.050 +183 R 0.042 +184 T 0.036 +185 C 0.036 +186 P 0.043 +187 P 0.050 +188 P 0.048 +189 V 0.040 +190 F 0.033 +191 M 0.031 +192 A 0.033 +193 S 0.038 +194 V 0.045 +195 T 0.050 +196 L 0.050 +197 A 0.050 +198 Q 0.049 +199 I 0.046 +200 I 0.040 +201 V 0.035 +202 F 0.031 +203 L 0.029 +204 C 0.031 +205 Y 0.037 +206 G 0.047 +207 A 0.058 +208 R 0.067 +209 L 0.070 +210 N 0.068 +211 K 0.064 +212 W 0.061 +213 V 0.061 +214 L 0.063 +215 Q 0.068 +216 T 0.073 +217 Y 0.078 +218 H 0.082 +219 P 0.091 +220 E 0.105 +221 Y 0.119 +222 M 0.126 +223 K 0.120 +224 S 0.107 +225 P 0.095 +226 L 0.087 +227 V 0.081 +228 Y 0.077 +229 H 0.074 +230 P 0.073 +231 G 0.072 +232 H 0.071 +233 R 0.070 +234 A 0.072 +235 R 0.074 +236 A 0.077 +237 W 0.085 +238 R 0.097 +239 F 0.108 +240 L 0.119 +241 T 0.131 +242 Y 0.137 +243 M 0.134 +244 F 0.127 +245 M 0.124 +246 H 0.132 +247 V 0.150 +248 G 0.171 +249 L 0.194 +250 E 0.220 +251 Q 0.234 +252 L 0.214 +253 G 0.184 +254 F 0.180 +255 N 0.188 +256 A 0.175 +257 L 0.141 +258 L 0.107 +259 Q 0.081 +260 L 0.060 +261 M 0.047 +262 I 0.045 +263 G 0.047 +264 V 0.045 +265 P 0.041 +266 L 0.038 +267 E 0.037 +268 M 0.036 +269 V 0.035 +270 H 0.033 +271 G 0.032 +272 V 0.029 +273 L 0.026 +274 R 0.025 +275 I 0.026 +276 S 0.028 +277 L 0.029 +278 L 0.032 +279 Y 0.037 +280 L 0.041 +281 A 0.044 +282 G 0.044 +283 V 0.042 +284 L 0.040 +285 A 0.039 +286 G 0.040 +287 S 0.043 +288 L 0.045 +289 T 0.048 +290 V 0.051 +291 S 0.056 +292 I 0.063 +293 T 0.075 +294 D 0.090 +295 M 0.106 +296 R 0.127 +297 A 0.143 +298 P 0.141 +299 V 0.126 +300 V 0.117 +301 G 0.127 +302 G 0.147 +303 S 0.162 +304 G 0.161 +305 G 0.143 +306 V 0.121 +307 Y 0.105 +308 A 0.096 +309 L 0.084 +310 C 0.072 +311 S 0.062 +312 A 0.056 +313 H 0.052 +314 L 0.048 +315 A 0.043 +316 N 0.038 +317 V 0.037 +318 V 0.042 +319 M 0.047 +320 N 0.049 +321 W 0.050 +322 A 0.052 +323 G 0.055 +324 M 0.060 +325 R 0.066 +326 C 0.069 +327 P 0.063 +328 Y 0.052 +329 K 0.039 +330 L 0.031 +331 L 0.030 +332 R 0.039 +333 M 0.055 +334 V 0.065 +335 L 0.063 +336 A 0.053 +337 L 0.046 +338 V 0.044 +339 C 0.047 +340 M 0.050 +341 S 0.049 +342 S 0.046 +343 E 0.045 +344 V 0.046 +345 G 0.050 +346 R 0.055 +347 A 0.058 +348 V 0.059 +349 W 0.066 +350 L 0.084 +351 R 0.115 +352 F 0.156 +353 S 0.205 +354 P 0.250 +355 P 0.279 +356 L 0.289 +357 P 0.283 +358 A 0.265 +359 S 0.248 +360 G 0.242 +361 P 0.244 +362 Q 0.241 +363 P 0.223 +364 S 0.192 +365 F 0.161 +366 M 0.146 +367 A 0.147 +368 H 0.143 +369 L 0.123 +370 A 0.096 +371 G 0.076 +372 A 0.066 +373 V 0.062 +374 V 0.060 +375 G 0.057 +376 V 0.054 +377 S 0.053 +378 M 0.051 +379 G 0.050 +380 L 0.051 +381 T 0.054 +382 I 0.057 +383 L 0.064 +384 R 0.076 +385 S 0.091 +386 Y 0.102 +387 E 0.107 +388 E 0.107 +389 R 0.106 +390 L 0.109 +391 R 0.114 +392 D 0.115 +393 Q 0.109 +394 C 0.100 +395 G 0.094 +396 W 0.089 +397 W 0.087 +398 V 0.087 +399 V 0.084 +400 L 0.075 +401 L 0.068 +402 A 0.066 +403 Y 0.066 +404 G 0.062 +405 T 0.055 +406 F 0.049 +407 L 0.044 +408 L 0.040 +409 F 0.036 +410 A 0.032 +411 I 0.029 +412 F 0.029 +413 W 0.031 +414 N 0.037 +415 V 0.047 +416 F 0.061 +417 A 0.080 +418 Y 0.102 +419 D 0.130 +420 L 0.170 +421 L 0.221 +422 G 0.276 +423 A 0.319 +424 D 0.344 +425 I 0.347 +426 P 0.336 +427 P 0.321 +428 P 0.311 +429 P 0.306 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000025909.17_ENSMUST00000140295.8_GN:Sntg1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000025909.17_ENSMUST00000140295.8_GN:Sntg1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b19cde4c552b0dfa6af02451c6bc46a1f7f1e227 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000025909.17_ENSMUST00000140295.8_GN:Sntg1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,518 @@ +>ENSMUSG00000025909.17|ENSMUST00000140295.8|GN:Sntg1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.303 +2 D 0.302 +3 F 0.316 +4 R 0.347 +5 T 0.377 +6 T 0.378 +7 C 0.339 +8 E 0.266 +9 E 0.184 +10 T 0.115 +11 K 0.071 +12 T 0.049 +13 G 0.042 +14 V 0.042 +15 C 0.049 +16 L 0.067 +17 L 0.096 +18 Q 0.132 +19 D 0.164 +20 G 0.182 +21 N 0.185 +22 Q 0.174 +23 E 0.150 +24 P 0.121 +25 F 0.096 +26 K 0.078 +27 V 0.063 +28 R 0.050 +29 L 0.045 +30 H 0.052 +31 L 0.064 +32 A 0.071 +33 R 0.070 +34 D 0.069 +35 L 0.076 +36 L 0.092 +37 M 0.113 +38 L 0.138 +39 Q 0.170 +40 E 0.217 +41 Q 0.290 +42 D 0.383 +43 V 0.465 +44 L 0.511 +45 C 0.519 +46 V 0.506 +47 S 0.480 +48 G 0.440 +49 E 0.386 +50 P 0.326 +51 F 0.259 +52 Y 0.194 +53 S 0.141 +54 G 0.105 +55 E 0.083 +56 R 0.075 +57 T 0.074 +58 V 0.075 +59 T 0.072 +60 I 0.067 +61 R 0.065 +62 R 0.072 +63 Q 0.090 +64 T 0.119 +65 V 0.149 +66 G 0.168 +67 G 0.168 +68 F 0.148 +69 G 0.122 +70 L 0.106 +71 S 0.104 +72 I 0.107 +73 K 0.107 +74 G 0.106 +75 G 0.114 +76 A 0.131 +77 E 0.150 +78 H 0.159 +79 N 0.151 +80 I 0.129 +81 P 0.100 +82 V 0.076 +83 V 0.065 +84 I 0.065 +85 S 0.070 +86 K 0.078 +87 I 0.086 +88 S 0.088 +89 K 0.081 +90 E 0.066 +91 Q 0.054 +92 R 0.050 +93 A 0.052 +94 E 0.056 +95 L 0.063 +96 S 0.070 +97 G 0.072 +98 L 0.070 +99 L 0.065 +100 F 0.062 +101 I 0.062 +102 G 0.063 +103 D 0.061 +104 A 0.054 +105 I 0.045 +106 L 0.040 +107 Q 0.041 +108 I 0.051 +109 N 0.066 +110 G 0.080 +111 I 0.086 +112 N 0.080 +113 V 0.068 +114 R 0.056 +115 K 0.050 +116 C 0.048 +117 R 0.048 +118 H 0.048 +119 E 0.046 +120 E 0.046 +121 V 0.050 +122 V 0.060 +123 Q 0.069 +124 V 0.068 +125 L 0.064 +126 R 0.065 +127 N 0.070 +128 A 0.072 +129 G 0.069 +130 E 0.064 +131 E 0.059 +132 V 0.055 +133 T 0.049 +134 L 0.044 +135 T 0.041 +136 V 0.041 +137 S 0.044 +138 F 0.055 +139 L 0.078 +140 K 0.114 +141 R 0.157 +142 A 0.200 +143 P 0.240 +144 A 0.275 +145 F 0.312 +146 L 0.355 +147 K 0.408 +148 L 0.473 +149 P 0.545 +150 V 0.609 +151 N 0.651 +152 E 0.658 +153 D 0.623 +154 C 0.562 +155 A 0.524 +156 C 0.529 +157 A 0.541 +158 P 0.528 +159 S 0.513 +160 D 0.516 +161 Q 0.514 +162 S 0.509 +163 S 0.524 +164 G 0.535 +165 T 0.520 +166 S 0.510 +167 S 0.542 +168 P 0.593 +169 L 0.627 +170 C 0.636 +171 D 0.631 +172 S 0.626 +173 G 0.630 +174 L 0.641 +175 H 0.648 +176 L 0.638 +177 N 0.608 +178 Y 0.582 +179 H 0.587 +180 P 0.624 +181 N 0.670 +182 N 0.705 +183 T 0.721 +184 D 0.725 +185 T 0.725 +186 L 0.721 +187 S 0.710 +188 C 0.691 +189 S 0.663 +190 S 0.630 +191 W 0.605 +192 P 0.596 +193 T 0.602 +194 S 0.615 +195 P 0.623 +196 G 0.613 +197 L 0.568 +198 R 0.490 +199 W 0.401 +200 E 0.328 +201 K 0.279 +202 R 0.244 +203 W 0.218 +204 C 0.196 +205 D 0.170 +206 L 0.139 +207 R 0.116 +208 L 0.105 +209 I 0.096 +210 P 0.079 +211 L 0.056 +212 L 0.038 +213 H 0.028 +214 A 0.024 +215 R 0.024 +216 F 0.031 +217 S 0.045 +218 Q 0.062 +219 Y 0.078 +220 V 0.088 +221 P 0.094 +222 G 0.095 +223 T 0.095 +224 D 0.099 +225 L 0.108 +226 S 0.116 +227 R 0.113 +228 Q 0.099 +229 N 0.079 +230 A 0.060 +231 F 0.049 +232 Q 0.045 +233 V 0.046 +234 V 0.049 +235 A 0.056 +236 V 0.065 +237 D 0.076 +238 G 0.084 +239 V 0.084 +240 C 0.081 +241 S 0.081 +242 G 0.084 +243 I 0.089 +244 L 0.093 +245 Q 0.099 +246 C 0.109 +247 L 0.118 +248 S 0.120 +249 A 0.111 +250 E 0.093 +251 D 0.075 +252 C 0.066 +253 M 0.063 +254 D 0.066 +255 W 0.073 +256 L 0.082 +257 Q 0.086 +258 A 0.085 +259 I 0.088 +260 A 0.098 +261 S 0.110 +262 N 0.119 +263 I 0.128 +264 S 0.133 +265 N 0.130 +266 L 0.125 +267 T 0.122 +268 K 0.121 +269 H 0.118 +270 N 0.111 +271 I 0.103 +272 K 0.100 +273 K 0.101 +274 I 0.105 +275 N 0.103 +276 R 0.093 +277 N 0.083 +278 F 0.081 +279 P 0.085 +280 V 0.088 +281 N 0.089 +282 Q 0.093 +283 Q 0.098 +284 I 0.096 +285 V 0.084 +286 Y 0.071 +287 M 0.060 +288 G 0.051 +289 W 0.041 +290 C 0.033 +291 E 0.033 +292 A 0.046 +293 R 0.073 +294 E 0.107 +295 Q 0.141 +296 E 0.172 +297 S 0.196 +298 L 0.211 +299 Q 0.210 +300 D 0.192 +301 R 0.163 +302 V 0.131 +303 Y 0.104 +304 T 0.086 +305 P 0.071 +306 V 0.055 +307 F 0.040 +308 L 0.034 +309 A 0.039 +310 L 0.047 +311 R 0.050 +312 G 0.047 +313 S 0.041 +314 C 0.036 +315 L 0.034 +316 Y 0.036 +317 R 0.043 +318 F 0.054 +319 L 0.066 +320 S 0.073 +321 P 0.076 +322 P 0.075 +323 V 0.075 +324 T 0.076 +325 T 0.078 +326 W 0.078 +327 D 0.077 +328 W 0.074 +329 T 0.074 +330 R 0.076 +331 A 0.077 +332 E 0.074 +333 K 0.067 +334 T 0.058 +335 F 0.047 +336 S 0.039 +337 V 0.034 +338 C 0.032 +339 E 0.031 +340 I 0.030 +341 M 0.031 +342 C 0.039 +343 K 0.056 +344 V 0.082 +345 L 0.107 +346 K 0.125 +347 D 0.133 +348 S 0.131 +349 D 0.122 +350 L 0.114 +351 L 0.112 +352 D 0.113 +353 R 0.111 +354 R 0.103 +355 K 0.085 +356 H 0.063 +357 C 0.045 +358 F 0.037 +359 T 0.039 +360 M 0.048 +361 Q 0.063 +362 S 0.079 +363 E 0.096 +364 C 0.113 +365 G 0.123 +366 E 0.117 +367 D 0.095 +368 L 0.070 +369 Y 0.053 +370 F 0.048 +371 S 0.053 +372 V 0.067 +373 E 0.083 +374 L 0.089 +375 E 0.084 +376 S 0.072 +377 D 0.062 +378 L 0.057 +379 A 0.055 +380 Q 0.055 +381 W 0.062 +382 E 0.073 +383 R 0.079 +384 A 0.077 +385 F 0.075 +386 Q 0.076 +387 T 0.075 +388 A 0.077 +389 T 0.085 +390 F 0.096 +391 L 0.103 +392 E 0.103 +393 V 0.098 +394 E 0.087 +395 R 0.073 +396 I 0.060 +397 Q 0.051 +398 C 0.046 +399 K 0.043 +400 T 0.043 +401 Y 0.041 +402 A 0.037 +403 C 0.033 +404 V 0.031 +405 L 0.035 +406 E 0.046 +407 S 0.062 +408 H 0.073 +409 L 0.072 +410 M 0.062 +411 G 0.053 +412 L 0.051 +413 T 0.052 +414 I 0.052 +415 D 0.051 +416 F 0.050 +417 S 0.052 +418 T 0.055 +419 G 0.055 +420 F 0.053 +421 I 0.052 +422 C 0.053 +423 F 0.055 +424 D 0.060 +425 A 0.066 +426 A 0.072 +427 T 0.076 +428 K 0.078 +429 A 0.081 +430 V 0.085 +431 L 0.082 +432 W 0.072 +433 R 0.058 +434 Y 0.044 +435 K 0.033 +436 F 0.026 +437 S 0.023 +438 Q 0.024 +439 L 0.031 +440 K 0.043 +441 G 0.055 +442 S 0.065 +443 S 0.075 +444 D 0.087 +445 D 0.098 +446 G 0.103 +447 K 0.098 +448 S 0.084 +449 K 0.066 +450 I 0.052 +451 K 0.046 +452 F 0.049 +453 L 0.060 +454 F 0.078 +455 Q 0.100 +456 N 0.118 +457 P 0.124 +458 D 0.124 +459 T 0.130 +460 K 0.139 +461 Q 0.143 +462 I 0.136 +463 E 0.121 +464 A 0.106 +465 K 0.095 +466 E 0.090 +467 L 0.087 +468 E 0.083 +469 F 0.078 +470 S 0.073 +471 N 0.071 +472 L 0.071 +473 F 0.070 +474 A 0.068 +475 V 0.066 +476 L 0.063 +477 H 0.060 +478 C 0.057 +479 I 0.057 +480 H 0.060 +481 S 0.064 +482 F 0.072 +483 F 0.086 +484 A 0.102 +485 A 0.115 +486 K 0.132 +487 V 0.162 +488 A 0.206 +489 C 0.256 +490 L 0.311 +491 D 0.367 +492 P 0.413 +493 L 0.447 +494 F 0.483 +495 L 0.528 +496 G 0.571 +497 N 0.600 +498 Q 0.612 +499 A 0.616 +500 A 0.611 +501 T 0.586 +502 T 0.541 +503 A 0.511 +504 A 0.518 +505 V 0.528 +506 S 0.507 +507 S 0.488 +508 A 0.508 +509 S 0.556 +510 T 0.601 +511 S 0.635 +512 K 0.663 +513 A 0.682 +514 K 0.691 +515 H 0.685 +516 L 0.663 +517 A 0.641 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000025909.17_ENSMUST00000140295.8_GN:Sntg1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:11.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000025909.17_ENSMUST00000140295.8_GN:Sntg1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:11.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..482eba54c0bcf43f849cad8ce39c3b24538872dd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000025909.17_ENSMUST00000140295.8_GN:Sntg1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:11.caid @@ -0,0 +1,529 @@ +>ENSMUSG00000025909.17|ENSMUST00000140295.8|GN:Sntg1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:11 +1 M 0.319 +2 M 0.329 +3 T 0.351 +4 T 0.373 +5 S 0.384 +6 F 0.386 +7 T 0.396 +8 V 0.417 +9 P 0.433 +10 Q 0.425 +11 H 0.396 +12 M 0.359 +13 D 0.333 +14 F 0.332 +15 R 0.357 +16 T 0.385 +17 T 0.385 +18 C 0.342 +19 E 0.265 +20 E 0.182 +21 T 0.115 +22 K 0.073 +23 T 0.051 +24 G 0.043 +25 V 0.043 +26 C 0.050 +27 L 0.067 +28 L 0.097 +29 Q 0.133 +30 D 0.165 +31 G 0.183 +32 N 0.186 +33 Q 0.174 +34 E 0.149 +35 P 0.120 +36 F 0.094 +37 K 0.076 +38 V 0.061 +39 R 0.049 +40 L 0.045 +41 H 0.052 +42 L 0.064 +43 A 0.072 +44 R 0.071 +45 D 0.069 +46 L 0.077 +47 L 0.094 +48 M 0.116 +49 L 0.143 +50 Q 0.178 +51 E 0.229 +52 Q 0.308 +53 D 0.406 +54 V 0.490 +55 L 0.533 +56 C 0.536 +57 V 0.520 +58 S 0.492 +59 G 0.448 +60 E 0.390 +61 P 0.326 +62 F 0.257 +63 Y 0.191 +64 S 0.138 +65 G 0.103 +66 E 0.082 +67 R 0.074 +68 T 0.074 +69 V 0.075 +70 T 0.072 +71 I 0.067 +72 R 0.065 +73 R 0.071 +74 Q 0.088 +75 T 0.116 +76 V 0.146 +77 G 0.165 +78 G 0.165 +79 F 0.145 +80 G 0.119 +81 L 0.102 +82 S 0.100 +83 I 0.104 +84 K 0.104 +85 G 0.103 +86 G 0.111 +87 A 0.127 +88 E 0.145 +89 H 0.153 +90 N 0.146 +91 I 0.125 +92 P 0.097 +93 V 0.074 +94 V 0.064 +95 I 0.064 +96 S 0.068 +97 K 0.076 +98 I 0.084 +99 S 0.087 +100 K 0.080 +101 E 0.065 +102 Q 0.053 +103 R 0.049 +104 A 0.051 +105 E 0.056 +106 L 0.062 +107 S 0.069 +108 G 0.072 +109 L 0.070 +110 L 0.066 +111 F 0.063 +112 I 0.062 +113 G 0.063 +114 D 0.061 +115 A 0.055 +116 I 0.045 +117 L 0.040 +118 Q 0.041 +119 I 0.051 +120 N 0.066 +121 G 0.081 +122 I 0.087 +123 N 0.081 +124 V 0.069 +125 R 0.057 +126 K 0.050 +127 C 0.048 +128 R 0.048 +129 H 0.048 +130 E 0.046 +131 E 0.045 +132 V 0.050 +133 V 0.060 +134 Q 0.068 +135 V 0.068 +136 L 0.064 +137 R 0.065 +138 N 0.071 +139 A 0.073 +140 G 0.069 +141 E 0.064 +142 E 0.059 +143 V 0.054 +144 T 0.048 +145 L 0.043 +146 T 0.041 +147 V 0.041 +148 S 0.044 +149 F 0.055 +150 L 0.077 +151 K 0.112 +152 R 0.153 +153 A 0.195 +154 P 0.235 +155 A 0.271 +156 F 0.310 +157 L 0.353 +158 K 0.406 +159 L 0.471 +160 P 0.543 +161 V 0.608 +162 N 0.651 +163 E 0.659 +164 D 0.625 +165 C 0.564 +166 A 0.525 +167 C 0.530 +168 A 0.542 +169 P 0.528 +170 S 0.514 +171 D 0.517 +172 Q 0.516 +173 S 0.510 +174 S 0.524 +175 G 0.535 +176 T 0.520 +177 S 0.511 +178 S 0.544 +179 P 0.596 +180 L 0.629 +181 C 0.638 +182 D 0.634 +183 S 0.629 +184 G 0.632 +185 L 0.643 +186 H 0.651 +187 L 0.642 +188 N 0.614 +189 Y 0.589 +190 H 0.595 +191 P 0.631 +192 N 0.676 +193 N 0.710 +194 T 0.724 +195 D 0.728 +196 T 0.727 +197 L 0.722 +198 S 0.711 +199 C 0.692 +200 S 0.664 +201 S 0.631 +202 W 0.606 +203 P 0.598 +204 T 0.604 +205 S 0.617 +206 P 0.625 +207 G 0.614 +208 L 0.570 +209 R 0.492 +210 W 0.403 +211 E 0.329 +212 K 0.279 +213 R 0.244 +214 W 0.219 +215 C 0.198 +216 D 0.171 +217 L 0.140 +218 R 0.115 +219 L 0.104 +220 I 0.095 +221 P 0.078 +222 L 0.056 +223 L 0.038 +224 H 0.028 +225 A 0.024 +226 R 0.025 +227 F 0.032 +228 S 0.045 +229 Q 0.063 +230 Y 0.078 +231 V 0.088 +232 P 0.093 +233 G 0.095 +234 T 0.094 +235 D 0.098 +236 L 0.107 +237 S 0.114 +238 R 0.112 +239 Q 0.098 +240 N 0.078 +241 A 0.060 +242 F 0.048 +243 Q 0.045 +244 V 0.046 +245 V 0.049 +246 A 0.056 +247 V 0.065 +248 D 0.076 +249 G 0.084 +250 V 0.084 +251 C 0.080 +252 S 0.080 +253 G 0.084 +254 I 0.088 +255 L 0.092 +256 Q 0.098 +257 C 0.107 +258 L 0.117 +259 S 0.120 +260 A 0.110 +261 E 0.093 +262 D 0.075 +263 C 0.066 +264 M 0.063 +265 D 0.066 +266 W 0.073 +267 L 0.082 +268 Q 0.085 +269 A 0.084 +270 I 0.086 +271 A 0.097 +272 S 0.109 +273 N 0.118 +274 I 0.127 +275 S 0.132 +276 N 0.130 +277 L 0.125 +278 T 0.123 +279 K 0.122 +280 H 0.119 +281 N 0.112 +282 I 0.104 +283 K 0.100 +284 K 0.102 +285 I 0.106 +286 N 0.104 +287 R 0.095 +288 N 0.085 +289 F 0.082 +290 P 0.086 +291 V 0.089 +292 N 0.091 +293 Q 0.095 +294 Q 0.100 +295 I 0.098 +296 V 0.086 +297 Y 0.072 +298 M 0.061 +299 G 0.052 +300 W 0.042 +301 C 0.034 +302 E 0.034 +303 A 0.047 +304 R 0.074 +305 E 0.109 +306 Q 0.144 +307 E 0.174 +308 S 0.199 +309 L 0.214 +310 Q 0.213 +311 D 0.195 +312 R 0.166 +313 V 0.134 +314 Y 0.106 +315 T 0.088 +316 P 0.073 +317 V 0.056 +318 F 0.041 +319 L 0.035 +320 A 0.040 +321 L 0.048 +322 R 0.051 +323 G 0.048 +324 S 0.041 +325 C 0.037 +326 L 0.035 +327 Y 0.036 +328 R 0.043 +329 F 0.055 +330 L 0.066 +331 S 0.073 +332 P 0.075 +333 P 0.075 +334 V 0.074 +335 T 0.076 +336 T 0.077 +337 W 0.078 +338 D 0.076 +339 W 0.074 +340 T 0.074 +341 R 0.075 +342 A 0.076 +343 E 0.074 +344 K 0.067 +345 T 0.058 +346 F 0.048 +347 S 0.040 +348 V 0.034 +349 C 0.032 +350 E 0.031 +351 I 0.030 +352 M 0.031 +353 C 0.038 +354 K 0.055 +355 V 0.080 +356 L 0.106 +357 K 0.123 +358 D 0.130 +359 S 0.128 +360 D 0.120 +361 L 0.112 +362 L 0.110 +363 D 0.111 +364 R 0.109 +365 R 0.101 +366 K 0.084 +367 H 0.062 +368 C 0.045 +369 F 0.037 +370 T 0.038 +371 M 0.048 +372 Q 0.061 +373 S 0.077 +374 E 0.094 +375 C 0.111 +376 G 0.121 +377 E 0.115 +378 D 0.094 +379 L 0.069 +380 Y 0.052 +381 F 0.047 +382 S 0.053 +383 V 0.067 +384 E 0.082 +385 L 0.088 +386 E 0.083 +387 S 0.072 +388 D 0.062 +389 L 0.057 +390 A 0.054 +391 Q 0.055 +392 W 0.062 +393 E 0.073 +394 R 0.079 +395 A 0.078 +396 F 0.075 +397 Q 0.076 +398 T 0.075 +399 A 0.077 +400 T 0.086 +401 F 0.098 +402 L 0.104 +403 E 0.105 +404 V 0.099 +405 E 0.088 +406 R 0.074 +407 I 0.061 +408 Q 0.052 +409 C 0.046 +410 K 0.044 +411 T 0.043 +412 Y 0.041 +413 A 0.038 +414 C 0.033 +415 V 0.031 +416 L 0.036 +417 E 0.047 +418 S 0.062 +419 H 0.073 +420 L 0.072 +421 M 0.063 +422 G 0.054 +423 L 0.051 +424 T 0.052 +425 I 0.053 +426 D 0.051 +427 F 0.050 +428 S 0.053 +429 T 0.056 +430 G 0.056 +431 F 0.054 +432 I 0.053 +433 C 0.053 +434 F 0.056 +435 D 0.060 +436 A 0.066 +437 A 0.072 +438 T 0.076 +439 K 0.078 +440 A 0.082 +441 V 0.086 +442 L 0.083 +443 W 0.073 +444 R 0.058 +445 Y 0.045 +446 K 0.033 +447 F 0.026 +448 S 0.023 +449 Q 0.025 +450 L 0.032 +451 K 0.043 +452 G 0.055 +453 S 0.066 +454 S 0.076 +455 D 0.087 +456 D 0.099 +457 G 0.104 +458 K 0.099 +459 S 0.085 +460 K 0.067 +461 I 0.052 +462 K 0.046 +463 F 0.049 +464 L 0.061 +465 F 0.079 +466 Q 0.102 +467 N 0.119 +468 P 0.125 +469 D 0.126 +470 T 0.131 +471 K 0.140 +472 Q 0.144 +473 I 0.137 +474 E 0.123 +475 A 0.107 +476 K 0.096 +477 E 0.091 +478 L 0.089 +479 E 0.084 +480 F 0.079 +481 S 0.075 +482 N 0.072 +483 L 0.072 +484 F 0.071 +485 A 0.069 +486 V 0.066 +487 L 0.064 +488 H 0.061 +489 C 0.058 +490 I 0.058 +491 H 0.061 +492 S 0.065 +493 F 0.073 +494 F 0.087 +495 A 0.104 +496 A 0.117 +497 K 0.134 +498 V 0.164 +499 A 0.206 +500 C 0.256 +501 L 0.310 +502 D 0.365 +503 P 0.410 +504 L 0.445 +505 F 0.481 +506 L 0.526 +507 G 0.569 +508 N 0.598 +509 Q 0.611 +510 A 0.615 +511 A 0.610 +512 T 0.586 +513 T 0.541 +514 A 0.511 +515 A 0.519 +516 V 0.530 +517 S 0.510 +518 S 0.491 +519 A 0.512 +520 S 0.560 +521 T 0.605 +522 S 0.639 +523 K 0.666 +524 A 0.685 +525 K 0.693 +526 H 0.687 +527 L 0.664 +528 A 0.642 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026223.16_ENSMUST00000027425.16_GN:Itm2c_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026223.16_ENSMUST00000027425.16_GN:Itm2c_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2835a754c8bddff9e22f2de4121b90e7d8e64d4b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026223.16_ENSMUST00000027425.16_GN:Itm2c_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,270 @@ +>ENSMUSG00000026223.16|ENSMUST00000027425.16|GN:Itm2c|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.278 +2 V 0.292 +3 K 0.309 +4 I 0.326 +5 S 0.348 +6 F 0.389 +7 Q 0.457 +8 P 0.539 +9 A 0.606 +10 V 0.653 +11 A 0.688 +12 G 0.713 +13 I 0.725 +14 K 0.732 +15 A 0.740 +16 D 0.742 +17 K 0.726 +18 A 0.682 +19 D 0.623 +20 K 0.582 +21 A 0.572 +22 A 0.566 +23 A 0.565 +24 S 0.601 +25 G 0.664 +26 P 0.717 +27 A 0.745 +28 S 0.751 +29 A 0.740 +30 S 0.721 +31 A 0.696 +32 P 0.649 +33 A 0.562 +34 A 0.476 +35 E 0.468 +36 I 0.542 +37 L 0.627 +38 L 0.676 +39 T 0.702 +40 P 0.723 +41 A 0.735 +42 R 0.733 +43 E 0.718 +44 E 0.693 +45 R 0.673 +46 P 0.675 +47 P 0.701 +48 R 0.733 +49 H 0.753 +50 R 0.759 +51 S 0.758 +52 R 0.758 +53 K 0.758 +54 G 0.757 +55 G 0.753 +56 S 0.748 +57 V 0.738 +58 G 0.712 +59 G 0.651 +60 V 0.549 +61 C 0.431 +62 Y 0.343 +63 L 0.315 +64 S 0.331 +65 M 0.355 +66 G 0.364 +67 M 0.350 +68 V 0.320 +69 V 0.293 +70 L 0.285 +71 L 0.293 +72 M 0.298 +73 G 0.288 +74 L 0.264 +75 V 0.231 +76 F 0.196 +77 A 0.166 +78 S 0.140 +79 V 0.113 +80 Y 0.088 +81 I 0.070 +82 Y 0.059 +83 R 0.054 +84 Y 0.059 +85 F 0.072 +86 F 0.091 +87 L 0.116 +88 A 0.153 +89 Q 0.200 +90 L 0.242 +91 A 0.258 +92 R 0.244 +93 D 0.208 +94 N 0.163 +95 F 0.123 +96 F 0.097 +97 H 0.085 +98 C 0.087 +99 G 0.099 +100 V 0.122 +101 L 0.153 +102 Y 0.192 +103 E 0.236 +104 D 0.277 +105 S 0.308 +106 L 0.326 +107 S 0.334 +108 S 0.331 +109 Q 0.324 +110 I 0.321 +111 R 0.322 +112 T 0.316 +113 R 0.294 +114 L 0.254 +115 E 0.202 +116 L 0.153 +117 E 0.117 +118 E 0.092 +119 D 0.073 +120 V 0.057 +121 K 0.047 +122 I 0.043 +123 Y 0.048 +124 L 0.058 +125 E 0.066 +126 E 0.067 +127 N 0.060 +128 Y 0.055 +129 E 0.057 +130 R 0.072 +131 I 0.098 +132 N 0.133 +133 V 0.173 +134 P 0.211 +135 V 0.241 +136 P 0.260 +137 Q 0.270 +138 F 0.268 +139 G 0.254 +140 G 0.241 +141 G 0.240 +142 D 0.239 +143 P 0.216 +144 A 0.168 +145 D 0.117 +146 I 0.085 +147 I 0.072 +148 H 0.070 +149 D 0.073 +150 F 0.077 +151 Q 0.079 +152 R 0.079 +153 G 0.070 +154 L 0.052 +155 T 0.035 +156 A 0.029 +157 Y 0.037 +158 H 0.054 +159 D 0.075 +160 I 0.092 +161 S 0.102 +162 L 0.102 +163 D 0.094 +164 K 0.082 +165 C 0.073 +166 Y 0.069 +167 V 0.070 +168 I 0.073 +169 E 0.074 +170 L 0.076 +171 N 0.078 +172 T 0.080 +173 T 0.081 +174 I 0.083 +175 V 0.085 +176 L 0.086 +177 P 0.083 +178 P 0.077 +179 R 0.070 +180 N 0.065 +181 F 0.067 +182 W 0.077 +183 E 0.086 +184 L 0.089 +185 L 0.089 +186 M 0.091 +187 N 0.098 +188 V 0.109 +189 K 0.122 +190 R 0.137 +191 G 0.152 +192 T 0.157 +193 Y 0.150 +194 L 0.139 +195 P 0.127 +196 Q 0.119 +197 T 0.121 +198 Y 0.131 +199 I 0.140 +200 I 0.142 +201 Q 0.135 +202 E 0.124 +203 E 0.116 +204 M 0.111 +205 V 0.103 +206 V 0.089 +207 T 0.075 +208 E 0.065 +209 H 0.057 +210 V 0.053 +211 R 0.052 +212 D 0.053 +213 K 0.058 +214 E 0.063 +215 A 0.066 +216 L 0.065 +217 G 0.062 +218 S 0.058 +219 F 0.055 +220 I 0.056 +221 Y 0.061 +222 H 0.063 +223 L 0.058 +224 C 0.057 +225 N 0.067 +226 G 0.080 +227 K 0.086 +228 D 0.080 +229 T 0.073 +230 Y 0.071 +231 R 0.075 +232 L 0.083 +233 R 0.098 +234 R 0.130 +235 R 0.180 +236 S 0.237 +237 T 0.282 +238 R 0.311 +239 R 0.329 +240 R 0.340 +241 I 0.348 +242 N 0.352 +243 K 0.354 +244 R 0.354 +245 G 0.345 +246 G 0.322 +247 K 0.284 +248 N 0.232 +249 C 0.181 +250 N 0.139 +251 A 0.109 +252 I 0.086 +253 R 0.068 +254 H 0.057 +255 F 0.055 +256 E 0.061 +257 N 0.072 +258 T 0.081 +259 F 0.087 +260 V 0.090 +261 V 0.090 +262 E 0.086 +263 T 0.082 +264 L 0.085 +265 I 0.104 +266 C 0.145 +267 G 0.194 +268 V 0.230 +269 V 0.243 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026223.16_ENSMUST00000027425.16_GN:Itm2c_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:82.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026223.16_ENSMUST00000027425.16_GN:Itm2c_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:82.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2b9273405ecdebe622f8868b85a456b57d414458 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026223.16_ENSMUST00000027425.16_GN:Itm2c_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:82.caid @@ -0,0 +1,352 @@ +>ENSMUSG00000026223.16|ENSMUST00000027425.16|GN:Itm2c|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:82 +1 M 0.277 +2 N 0.268 +3 I 0.256 +4 S 0.246 +5 K 0.236 +6 R 0.220 +7 W 0.204 +8 K 0.194 +9 E 0.189 +10 I 0.183 +11 S 0.183 +12 A 0.195 +13 F 0.211 +14 F 0.224 +15 S 0.233 +16 Y 0.240 +17 S 0.247 +18 A 0.261 +19 A 0.289 +20 R 0.332 +21 C 0.398 +22 S 0.492 +23 S 0.594 +24 A 0.672 +25 Q 0.709 +26 A 0.716 +27 S 0.712 +28 G 0.713 +29 P 0.724 +30 S 0.740 +31 L 0.754 +32 E 0.768 +33 G 0.776 +34 G 0.765 +35 A 0.721 +36 G 0.657 +37 R 0.627 +38 V 0.665 +39 R 0.737 +40 G 0.787 +41 G 0.806 +42 D 0.806 +43 R 0.802 +44 G 0.799 +45 E 0.800 +46 D 0.803 +47 S 0.801 +48 G 0.784 +49 A 0.736 +50 I 0.671 +51 Q 0.642 +52 T 0.683 +53 S 0.750 +54 G 0.788 +55 A 0.793 +56 C 0.793 +57 G 0.805 +58 A 0.822 +59 A 0.831 +60 R 0.829 +61 S 0.820 +62 R 0.808 +63 H 0.797 +64 C 0.792 +65 D 0.794 +66 R 0.791 +67 G 0.778 +68 C 0.767 +69 T 0.767 +70 G 0.777 +71 R 0.787 +72 G 0.789 +73 C 0.787 +74 R 0.785 +75 E 0.772 +76 Q 0.724 +77 A 0.651 +78 Q 0.606 +79 V 0.622 +80 N 0.663 +81 A 0.679 +82 A 0.669 +83 M 0.653 +84 V 0.644 +85 K 0.642 +86 I 0.641 +87 S 0.644 +88 F 0.658 +89 Q 0.691 +90 P 0.738 +91 A 0.782 +92 V 0.809 +93 A 0.821 +94 G 0.822 +95 I 0.817 +96 K 0.813 +97 A 0.813 +98 D 0.814 +99 K 0.815 +100 A 0.815 +101 D 0.816 +102 K 0.816 +103 A 0.812 +104 A 0.801 +105 A 0.786 +106 S 0.774 +107 G 0.771 +108 P 0.776 +109 A 0.784 +110 S 0.783 +111 A 0.771 +112 S 0.751 +113 A 0.726 +114 P 0.688 +115 A 0.636 +116 A 0.608 +117 E 0.633 +118 I 0.682 +119 L 0.711 +120 L 0.720 +121 T 0.729 +122 P 0.745 +123 A 0.760 +124 R 0.763 +125 E 0.752 +126 E 0.733 +127 R 0.717 +128 P 0.719 +129 P 0.742 +130 R 0.769 +131 H 0.785 +132 R 0.789 +133 S 0.786 +134 R 0.784 +135 K 0.781 +136 G 0.777 +137 G 0.768 +138 S 0.755 +139 V 0.735 +140 G 0.702 +141 G 0.637 +142 V 0.532 +143 C 0.408 +144 Y 0.312 +145 L 0.271 +146 S 0.274 +147 M 0.292 +148 G 0.302 +149 M 0.293 +150 V 0.271 +151 V 0.250 +152 L 0.241 +153 L 0.242 +154 M 0.240 +155 G 0.231 +156 L 0.213 +157 V 0.190 +158 F 0.165 +159 A 0.144 +160 S 0.125 +161 V 0.104 +162 Y 0.084 +163 I 0.067 +164 Y 0.055 +165 R 0.049 +166 Y 0.051 +167 F 0.063 +168 F 0.083 +169 L 0.112 +170 A 0.153 +171 Q 0.202 +172 L 0.243 +173 A 0.259 +174 R 0.244 +175 D 0.204 +176 N 0.156 +177 F 0.113 +178 F 0.086 +179 H 0.074 +180 C 0.075 +181 G 0.088 +182 V 0.111 +183 L 0.144 +184 Y 0.183 +185 E 0.226 +186 D 0.267 +187 S 0.298 +188 L 0.318 +189 S 0.327 +190 S 0.327 +191 Q 0.322 +192 I 0.320 +193 R 0.319 +194 T 0.307 +195 R 0.276 +196 L 0.229 +197 E 0.178 +198 L 0.134 +199 E 0.103 +200 E 0.083 +201 D 0.068 +202 V 0.055 +203 K 0.046 +204 I 0.044 +205 Y 0.049 +206 L 0.060 +207 E 0.068 +208 E 0.069 +209 N 0.062 +210 Y 0.055 +211 E 0.056 +212 R 0.068 +213 I 0.091 +214 N 0.123 +215 V 0.160 +216 P 0.197 +217 V 0.228 +218 P 0.250 +219 Q 0.264 +220 F 0.265 +221 G 0.251 +222 G 0.235 +223 G 0.232 +224 D 0.229 +225 P 0.208 +226 A 0.163 +227 D 0.116 +228 I 0.086 +229 I 0.073 +230 H 0.071 +231 D 0.073 +232 F 0.076 +233 Q 0.080 +234 R 0.079 +235 G 0.070 +236 L 0.052 +237 T 0.035 +238 A 0.029 +239 Y 0.036 +240 H 0.052 +241 D 0.072 +242 I 0.089 +243 S 0.098 +244 L 0.099 +245 D 0.091 +246 K 0.080 +247 C 0.071 +248 Y 0.068 +249 V 0.069 +250 I 0.071 +251 E 0.071 +252 L 0.072 +253 N 0.074 +254 T 0.075 +255 T 0.076 +256 I 0.078 +257 V 0.079 +258 L 0.078 +259 P 0.073 +260 P 0.066 +261 R 0.060 +262 N 0.055 +263 F 0.055 +264 W 0.061 +265 E 0.069 +266 L 0.074 +267 L 0.078 +268 M 0.083 +269 N 0.091 +270 V 0.101 +271 K 0.115 +272 R 0.135 +273 G 0.152 +274 T 0.158 +275 Y 0.154 +276 L 0.146 +277 P 0.139 +278 Q 0.135 +279 T 0.137 +280 Y 0.145 +281 I 0.152 +282 I 0.151 +283 Q 0.142 +284 E 0.129 +285 E 0.120 +286 M 0.115 +287 V 0.108 +288 V 0.096 +289 T 0.084 +290 E 0.075 +291 H 0.067 +292 V 0.062 +293 R 0.061 +294 D 0.064 +295 K 0.068 +296 E 0.073 +297 A 0.074 +298 L 0.073 +299 G 0.071 +300 S 0.067 +301 F 0.061 +302 I 0.053 +303 Y 0.046 +304 H 0.041 +305 L 0.042 +306 C 0.052 +307 N 0.071 +308 G 0.088 +309 K 0.095 +310 D 0.091 +311 T 0.084 +312 Y 0.084 +313 R 0.091 +314 L 0.101 +315 R 0.117 +316 R 0.151 +317 R 0.206 +318 S 0.264 +319 T 0.309 +320 R 0.336 +321 R 0.352 +322 R 0.363 +323 I 0.369 +324 N 0.372 +325 K 0.371 +326 R 0.367 +327 G 0.356 +328 G 0.333 +329 K 0.296 +330 N 0.245 +331 C 0.193 +332 N 0.150 +333 A 0.119 +334 I 0.096 +335 R 0.077 +336 H 0.065 +337 F 0.062 +338 E 0.070 +339 N 0.082 +340 T 0.091 +341 F 0.095 +342 V 0.095 +343 V 0.093 +344 E 0.088 +345 T 0.082 +346 L 0.084 +347 I 0.103 +348 C 0.146 +349 G 0.200 +350 V 0.239 +351 V 0.254 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026531.5_ENSMUST00000027816.5_GN:Mptx1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026531.5_ENSMUST00000027816.5_GN:Mptx1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2c90837a2ad9402b22b934d2b00a2486f40037ed --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026531.5_ENSMUST00000027816.5_GN:Mptx1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,220 @@ +>ENSMUSG00000026531.5|ENSMUST00000027816.5|GN:Mptx1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.355 +2 E 0.341 +3 K 0.329 +4 L 0.329 +5 I 0.336 +6 V 0.341 +7 G 0.342 +8 I 0.327 +9 L 0.300 +10 F 0.291 +11 L 0.312 +12 S 0.340 +13 V 0.353 +14 L 0.370 +15 S 0.412 +16 G 0.466 +17 S 0.505 +18 V 0.523 +19 A 0.516 +20 E 0.476 +21 T 0.408 +22 D 0.329 +23 M 0.252 +24 K 0.183 +25 G 0.126 +26 K 0.087 +27 A 0.065 +28 F 0.060 +29 I 0.067 +30 F 0.080 +31 P 0.090 +32 Q 0.099 +33 E 0.110 +34 S 0.122 +35 S 0.125 +36 T 0.115 +37 A 0.099 +38 Y 0.085 +39 V 0.076 +40 S 0.070 +41 L 0.068 +42 I 0.071 +43 P 0.077 +44 K 0.085 +45 V 0.092 +46 R 0.094 +47 K 0.091 +48 S 0.081 +49 L 0.069 +50 Q 0.054 +51 N 0.040 +52 F 0.029 +53 T 0.022 +54 L 0.018 +55 C 0.018 +56 M 0.021 +57 K 0.024 +58 T 0.030 +59 F 0.037 +60 T 0.047 +61 D 0.055 +62 L 0.060 +63 T 0.060 +64 R 0.054 +65 P 0.045 +66 Y 0.037 +67 S 0.032 +68 I 0.030 +69 F 0.033 +70 S 0.042 +71 Y 0.054 +72 N 0.066 +73 T 0.073 +74 R 0.073 +75 N 0.069 +76 Q 0.065 +77 D 0.062 +78 N 0.061 +79 E 0.057 +80 I 0.048 +81 L 0.035 +82 L 0.027 +83 F 0.026 +84 V 0.032 +85 E 0.041 +86 N 0.052 +87 I 0.060 +88 G 0.061 +89 E 0.054 +90 Y 0.043 +91 M 0.036 +92 F 0.037 +93 Y 0.047 +94 V 0.062 +95 G 0.072 +96 N 0.076 +97 M 0.072 +98 V 0.065 +99 A 0.061 +100 T 0.063 +101 F 0.068 +102 K 0.075 +103 A 0.080 +104 P 0.081 +105 T 0.078 +106 N 0.072 +107 L 0.066 +108 P 0.056 +109 D 0.045 +110 P 0.035 +111 A 0.027 +112 R 0.020 +113 I 0.016 +114 C 0.015 +115 V 0.018 +116 N 0.022 +117 W 0.028 +118 E 0.039 +119 S 0.055 +120 G 0.071 +121 S 0.079 +122 G 0.075 +123 I 0.062 +124 A 0.046 +125 E 0.031 +126 F 0.022 +127 W 0.021 +128 L 0.027 +129 N 0.039 +130 G 0.053 +131 K 0.066 +132 P 0.076 +133 L 0.081 +134 G 0.082 +135 R 0.083 +136 K 0.085 +137 G 0.091 +138 L 0.099 +139 K 0.106 +140 K 0.110 +141 G 0.109 +142 Y 0.105 +143 T 0.101 +144 V 0.104 +145 G 0.116 +146 G 0.126 +147 D 0.120 +148 A 0.097 +149 M 0.074 +150 I 0.062 +151 T 0.063 +152 L 0.075 +153 G 0.090 +154 Q 0.102 +155 E 0.107 +156 Q 0.105 +157 D 0.103 +158 S 0.104 +159 Y 0.116 +160 G 0.135 +161 G 0.151 +162 N 0.155 +163 F 0.146 +164 D 0.132 +165 A 0.119 +166 K 0.105 +167 Q 0.093 +168 S 0.086 +169 F 0.084 +170 V 0.084 +171 G 0.080 +172 E 0.070 +173 I 0.058 +174 W 0.048 +175 D 0.043 +176 V 0.040 +177 S 0.039 +178 L 0.038 +179 W 0.036 +180 D 0.036 +181 H 0.039 +182 V 0.044 +183 V 0.049 +184 P 0.054 +185 L 0.062 +186 E 0.072 +187 K 0.080 +188 V 0.084 +189 S 0.085 +190 D 0.085 +191 S 0.084 +192 C 0.086 +193 N 0.091 +194 N 0.093 +195 G 0.088 +196 N 0.080 +197 L 0.073 +198 I 0.065 +199 N 0.056 +200 W 0.048 +201 Q 0.046 +202 A 0.050 +203 L 0.056 +204 N 0.062 +205 Y 0.071 +206 E 0.086 +207 D 0.102 +208 N 0.111 +209 G 0.106 +210 Y 0.094 +211 V 0.090 +212 V 0.101 +213 T 0.122 +214 K 0.147 +215 P 0.175 +216 K 0.202 +217 L 0.219 +218 W 0.223 +219 P 0.221 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026531.5_ENSMUST00000027816.5_GN:Mptx1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026531.5_ENSMUST00000027816.5_GN:Mptx1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ded13a4de06003d40d42072d356c85e097aed42e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026531.5_ENSMUST00000027816.5_GN:Mptx1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid @@ -0,0 +1,236 @@ +>ENSMUSG00000026531.5|ENSMUST00000027816.5|GN:Mptx1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:16 +1 M 0.344 +2 R 0.366 +3 V 0.408 +4 A 0.459 +5 D 0.504 +6 L 0.526 +7 P 0.516 +8 L 0.473 +9 L 0.413 +10 E 0.367 +11 L 0.348 +12 S 0.342 +13 K 0.342 +14 K 0.365 +15 S 0.414 +16 T 0.467 +17 M 0.501 +18 E 0.499 +19 K 0.460 +20 L 0.406 +21 I 0.376 +22 V 0.379 +23 G 0.379 +24 I 0.356 +25 L 0.338 +26 F 0.349 +27 L 0.376 +28 S 0.404 +29 V 0.432 +30 L 0.463 +31 S 0.496 +32 G 0.525 +33 S 0.547 +34 V 0.555 +35 A 0.536 +36 E 0.484 +37 T 0.408 +38 D 0.326 +39 M 0.248 +40 K 0.176 +41 G 0.119 +42 K 0.081 +43 A 0.061 +44 F 0.057 +45 I 0.064 +46 F 0.076 +47 P 0.087 +48 Q 0.096 +49 E 0.108 +50 S 0.120 +51 S 0.123 +52 T 0.114 +53 A 0.098 +54 Y 0.084 +55 V 0.075 +56 S 0.070 +57 L 0.067 +58 I 0.069 +59 P 0.075 +60 K 0.083 +61 V 0.089 +62 R 0.091 +63 K 0.088 +64 S 0.080 +65 L 0.068 +66 Q 0.054 +67 N 0.040 +68 F 0.029 +69 T 0.022 +70 L 0.018 +71 C 0.018 +72 M 0.020 +73 K 0.023 +74 T 0.028 +75 F 0.036 +76 T 0.045 +77 D 0.052 +78 L 0.057 +79 T 0.056 +80 R 0.051 +81 P 0.043 +82 Y 0.035 +83 S 0.030 +84 I 0.029 +85 F 0.032 +86 S 0.040 +87 Y 0.052 +88 N 0.064 +89 T 0.070 +90 R 0.071 +91 N 0.067 +92 Q 0.063 +93 D 0.061 +94 N 0.059 +95 E 0.056 +96 I 0.046 +97 L 0.034 +98 L 0.026 +99 F 0.025 +100 V 0.030 +101 E 0.040 +102 N 0.050 +103 I 0.058 +104 G 0.059 +105 E 0.052 +106 Y 0.042 +107 M 0.034 +108 F 0.035 +109 Y 0.045 +110 V 0.059 +111 G 0.069 +112 N 0.073 +113 M 0.070 +114 V 0.063 +115 A 0.059 +116 T 0.061 +117 F 0.067 +118 K 0.074 +119 A 0.079 +120 P 0.081 +121 T 0.077 +122 N 0.072 +123 L 0.065 +124 P 0.057 +125 D 0.045 +126 P 0.035 +127 A 0.027 +128 R 0.020 +129 I 0.016 +130 C 0.015 +131 V 0.017 +132 N 0.022 +133 W 0.028 +134 E 0.039 +135 S 0.055 +136 G 0.072 +137 S 0.080 +138 G 0.075 +139 I 0.062 +140 A 0.046 +141 E 0.031 +142 F 0.022 +143 W 0.021 +144 L 0.027 +145 N 0.039 +146 G 0.054 +147 K 0.067 +148 P 0.077 +149 L 0.082 +150 G 0.083 +151 R 0.083 +152 K 0.086 +153 G 0.092 +154 L 0.100 +155 K 0.107 +156 K 0.111 +157 G 0.110 +158 Y 0.106 +159 T 0.102 +160 V 0.105 +161 G 0.117 +162 G 0.126 +163 D 0.119 +164 A 0.096 +165 M 0.073 +166 I 0.061 +167 T 0.063 +168 L 0.074 +169 G 0.089 +170 Q 0.102 +171 E 0.107 +172 Q 0.106 +173 D 0.103 +174 S 0.104 +175 Y 0.115 +176 G 0.134 +177 G 0.150 +178 N 0.153 +179 F 0.144 +180 D 0.131 +181 A 0.117 +182 K 0.104 +183 Q 0.093 +184 S 0.085 +185 F 0.083 +186 V 0.083 +187 G 0.079 +188 E 0.070 +189 I 0.057 +190 W 0.047 +191 D 0.042 +192 V 0.040 +193 S 0.039 +194 L 0.038 +195 W 0.036 +196 D 0.035 +197 H 0.038 +198 V 0.043 +199 V 0.046 +200 P 0.046 +201 L 0.049 +202 E 0.055 +203 K 0.065 +204 V 0.074 +205 S 0.079 +206 D 0.080 +207 S 0.080 +208 C 0.083 +209 N 0.088 +210 N 0.089 +211 G 0.084 +212 N 0.077 +213 L 0.070 +214 I 0.063 +215 N 0.054 +216 W 0.046 +217 Q 0.044 +218 A 0.047 +219 L 0.053 +220 N 0.059 +221 Y 0.068 +222 E 0.083 +223 D 0.099 +224 N 0.108 +225 G 0.104 +226 Y 0.092 +227 V 0.089 +228 V 0.100 +229 T 0.121 +230 K 0.147 +231 P 0.174 +232 K 0.201 +233 L 0.218 +234 W 0.223 +235 P 0.222 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026708.17_ENSMUST00000111618.8_GN:Cenpl_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026708.17_ENSMUST00000111618.8_GN:Cenpl_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0d5a8a0309dcf9a8f3dab525ecf0eaa0ea4ce9c5 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026708.17_ENSMUST00000111618.8_GN:Cenpl_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,346 @@ +>ENSMUSG00000026708.17|ENSMUST00000111618.8|GN:Cenpl|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.466 +2 D 0.485 +3 S 0.509 +4 C 0.518 +5 D 0.501 +6 F 0.478 +7 R 0.487 +8 G 0.537 +9 L 0.584 +10 T 0.584 +11 S 0.547 +12 R 0.522 +13 R 0.543 +14 R 0.588 +15 T 0.619 +16 S 0.625 +17 N 0.611 +18 L 0.582 +19 K 0.554 +20 N 0.539 +21 Y 0.541 +22 F 0.556 +23 V 0.563 +24 G 0.532 +25 A 0.459 +26 T 0.368 +27 P 0.291 +28 L 0.241 +29 Q 0.210 +30 K 0.190 +31 R 0.180 +32 L 0.184 +33 E 0.201 +34 L 0.225 +35 V 0.250 +36 R 0.285 +37 R 0.341 +38 Q 0.411 +39 N 0.467 +40 S 0.494 +41 D 0.504 +42 F 0.515 +43 P 0.532 +44 S 0.554 +45 P 0.568 +46 S 0.571 +47 R 0.566 +48 R 0.560 +49 K 0.558 +50 I 0.562 +51 P 0.573 +52 Q 0.589 +53 C 0.591 +54 S 0.568 +55 Q 0.523 +56 L 0.468 +57 Q 0.404 +58 E 0.333 +59 D 0.261 +60 I 0.196 +61 D 0.144 +62 P 0.108 +63 Q 0.088 +64 K 0.076 +65 V 0.065 +66 A 0.057 +67 F 0.056 +68 L 0.060 +69 L 0.063 +70 H 0.061 +71 K 0.056 +72 Q 0.052 +73 W 0.050 +74 T 0.050 +75 I 0.049 +76 Y 0.048 +77 S 0.050 +78 L 0.053 +79 T 0.054 +80 P 0.051 +81 L 0.045 +82 Y 0.041 +83 K 0.038 +84 F 0.037 +85 S 0.038 +86 Y 0.038 +87 S 0.041 +88 N 0.044 +89 L 0.046 +90 K 0.045 +91 D 0.041 +92 Y 0.037 +93 S 0.034 +94 R 0.031 +95 L 0.029 +96 L 0.027 +97 S 0.026 +98 A 0.027 +99 F 0.030 +100 I 0.036 +101 V 0.043 +102 A 0.053 +103 E 0.063 +104 K 0.074 +105 Q 0.088 +106 K 0.109 +107 G 0.132 +108 V 0.147 +109 A 0.148 +110 V 0.140 +111 E 0.129 +112 V 0.121 +113 G 0.113 +114 E 0.101 +115 D 0.085 +116 F 0.067 +117 N 0.051 +118 I 0.039 +119 K 0.033 +120 V 0.031 +121 I 0.029 +122 F 0.029 +123 S 0.033 +124 T 0.042 +125 L 0.055 +126 L 0.068 +127 G 0.080 +128 V 0.087 +129 K 0.090 +130 G 0.089 +131 T 0.084 +132 Q 0.078 +133 R 0.074 +134 D 0.068 +135 H 0.060 +136 E 0.052 +137 A 0.046 +138 F 0.042 +139 L 0.041 +140 V 0.041 +141 Q 0.043 +142 I 0.047 +143 L 0.057 +144 S 0.071 +145 K 0.091 +146 S 0.114 +147 Q 0.142 +148 S 0.169 +149 S 0.184 +150 R 0.186 +151 E 0.181 +152 H 0.172 +153 R 0.155 +154 E 0.136 +155 D 0.116 +156 K 0.096 +157 V 0.076 +158 L 0.059 +159 W 0.048 +160 T 0.044 +161 G 0.039 +162 W 0.033 +163 F 0.028 +164 C 0.028 +165 C 0.034 +166 V 0.046 +167 F 0.064 +168 G 0.081 +169 E 0.096 +170 S 0.108 +171 L 0.120 +172 Q 0.130 +173 E 0.137 +174 T 0.139 +175 V 0.135 +176 S 0.126 +177 E 0.115 +178 D 0.104 +179 F 0.094 +180 T 0.089 +181 C 0.091 +182 L 0.090 +183 P 0.083 +184 L 0.076 +185 F 0.078 +186 L 0.092 +187 A 0.115 +188 N 0.145 +189 G 0.173 +190 A 0.189 +191 E 0.190 +192 S 0.179 +193 N 0.160 +194 T 0.132 +195 S 0.100 +196 L 0.077 +197 I 0.067 +198 R 0.070 +199 D 0.073 +200 W 0.065 +201 F 0.052 +202 Q 0.045 +203 K 0.046 +204 T 0.045 +205 F 0.041 +206 D 0.039 +207 C 0.042 +208 C 0.048 +209 F 0.052 +210 S 0.053 +211 P 0.054 +212 L 0.054 +213 A 0.052 +214 I 0.052 +215 S 0.057 +216 A 0.065 +217 F 0.068 +218 N 0.064 +219 L 0.053 +220 S 0.041 +221 W 0.031 +222 M 0.025 +223 A 0.023 +224 A 0.023 +225 M 0.023 +226 W 0.025 +227 T 0.029 +228 A 0.037 +229 C 0.045 +230 K 0.053 +231 M 0.061 +232 D 0.069 +233 R 0.076 +234 Y 0.085 +235 M 0.096 +236 A 0.110 +237 T 0.116 +238 T 0.109 +239 E 0.096 +240 F 0.087 +241 L 0.082 +242 W 0.084 +243 S 0.094 +244 V 0.110 +245 P 0.124 +246 C 0.131 +247 S 0.136 +248 P 0.138 +249 Q 0.140 +250 S 0.142 +251 L 0.143 +252 D 0.139 +253 I 0.129 +254 S 0.116 +255 Y 0.100 +256 A 0.082 +257 I 0.068 +258 H 0.059 +259 P 0.054 +260 E 0.050 +261 D 0.047 +262 A 0.045 +263 K 0.045 +264 A 0.047 +265 L 0.049 +266 W 0.052 +267 E 0.056 +268 S 0.064 +269 V 0.079 +270 H 0.097 +271 K 0.114 +272 T 0.129 +273 P 0.142 +274 G 0.149 +275 E 0.140 +276 V 0.119 +277 T 0.092 +278 Q 0.071 +279 E 0.059 +280 E 0.053 +281 V 0.049 +282 D 0.044 +283 L 0.040 +284 F 0.038 +285 M 0.036 +286 N 0.034 +287 C 0.034 +288 L 0.034 +289 Y 0.035 +290 S 0.038 +291 H 0.038 +292 F 0.037 +293 H 0.036 +294 R 0.038 +295 H 0.042 +296 F 0.048 +297 K 0.055 +298 I 0.062 +299 H 0.067 +300 L 0.072 +301 A 0.081 +302 A 0.093 +303 T 0.108 +304 R 0.126 +305 L 0.148 +306 V 0.169 +307 R 0.183 +308 V 0.191 +309 S 0.204 +310 T 0.224 +311 S 0.248 +312 V 0.266 +313 A 0.273 +314 S 0.268 +315 A 0.259 +316 H 0.254 +317 T 0.254 +318 D 0.255 +319 G 0.248 +320 K 0.233 +321 I 0.210 +322 K 0.186 +323 I 0.165 +324 L 0.148 +325 C 0.133 +326 H 0.116 +327 K 0.104 +328 Y 0.101 +329 L 0.105 +330 I 0.107 +331 G 0.104 +332 V 0.100 +333 L 0.096 +334 A 0.096 +335 Y 0.106 +336 M 0.124 +337 T 0.142 +338 E 0.158 +339 L 0.178 +340 A 0.205 +341 I 0.234 +342 F 0.257 +343 Q 0.273 +344 I 0.280 +345 E 0.281 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026708.17_ENSMUST00000111618.8_GN:Cenpl_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:39.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026708.17_ENSMUST00000111618.8_GN:Cenpl_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:39.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..015e4a0edec2bd16c810fac544d7c60d0633c66d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026708.17_ENSMUST00000111618.8_GN:Cenpl_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:39.caid @@ -0,0 +1,385 @@ +>ENSMUSG00000026708.17|ENSMUST00000111618.8|GN:Cenpl|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:39 +1 M 0.391 +2 T 0.422 +3 V 0.469 +4 S 0.509 +5 L 0.519 +6 R 0.495 +7 H 0.473 +8 S 0.491 +9 F 0.534 +10 G 0.560 +11 D 0.555 +12 L 0.531 +13 P 0.492 +14 S 0.443 +15 I 0.405 +16 E 0.394 +17 N 0.389 +18 V 0.364 +19 V 0.335 +20 T 0.336 +21 T 0.356 +22 L 0.361 +23 L 0.356 +24 W 0.371 +25 H 0.417 +26 T 0.482 +27 T 0.555 +28 P 0.630 +29 V 0.692 +30 E 0.730 +31 E 0.746 +32 E 0.744 +33 I 0.724 +34 A 0.691 +35 T 0.669 +36 P 0.678 +37 P 0.716 +38 E 0.758 +39 T 0.784 +40 M 0.792 +41 D 0.787 +42 S 0.772 +43 C 0.750 +44 D 0.731 +45 F 0.728 +46 R 0.739 +47 G 0.749 +48 L 0.739 +49 T 0.698 +50 S 0.636 +51 R 0.603 +52 R 0.628 +53 R 0.678 +54 T 0.709 +55 S 0.717 +56 N 0.716 +57 L 0.711 +58 K 0.701 +59 N 0.692 +60 Y 0.689 +61 F 0.694 +62 V 0.690 +63 G 0.653 +64 A 0.579 +65 T 0.490 +66 P 0.410 +67 L 0.350 +68 Q 0.304 +69 K 0.272 +70 R 0.264 +71 L 0.284 +72 E 0.325 +73 L 0.367 +74 V 0.399 +75 R 0.432 +76 R 0.484 +77 Q 0.548 +78 N 0.593 +79 S 0.604 +80 D 0.595 +81 F 0.590 +82 P 0.599 +83 S 0.621 +84 P 0.642 +85 S 0.653 +86 R 0.651 +87 R 0.641 +88 K 0.632 +89 I 0.630 +90 P 0.638 +91 Q 0.648 +92 C 0.644 +93 S 0.618 +94 Q 0.573 +95 L 0.514 +96 Q 0.443 +97 E 0.361 +98 D 0.279 +99 I 0.205 +100 D 0.145 +101 P 0.103 +102 Q 0.078 +103 K 0.066 +104 V 0.058 +105 A 0.053 +106 F 0.052 +107 L 0.054 +108 L 0.054 +109 H 0.050 +110 K 0.045 +111 Q 0.041 +112 W 0.041 +113 T 0.043 +114 I 0.043 +115 Y 0.042 +116 S 0.045 +117 L 0.050 +118 T 0.052 +119 P 0.051 +120 L 0.046 +121 Y 0.042 +122 K 0.040 +123 F 0.040 +124 S 0.041 +125 Y 0.042 +126 S 0.043 +127 N 0.046 +128 L 0.047 +129 K 0.045 +130 D 0.040 +131 Y 0.034 +132 S 0.031 +133 R 0.028 +134 L 0.026 +135 L 0.024 +136 S 0.023 +137 A 0.023 +138 F 0.027 +139 I 0.032 +140 V 0.040 +141 A 0.049 +142 E 0.060 +143 K 0.071 +144 Q 0.087 +145 K 0.111 +146 G 0.137 +147 V 0.156 +148 A 0.159 +149 V 0.150 +150 E 0.138 +151 V 0.129 +152 G 0.120 +153 E 0.108 +154 D 0.090 +155 F 0.071 +156 N 0.054 +157 I 0.040 +158 K 0.034 +159 V 0.031 +160 I 0.029 +161 F 0.029 +162 S 0.033 +163 T 0.043 +164 L 0.056 +165 L 0.070 +166 G 0.081 +167 V 0.087 +168 K 0.089 +169 G 0.087 +170 T 0.081 +171 Q 0.073 +172 R 0.068 +173 D 0.062 +174 H 0.054 +175 E 0.047 +176 A 0.042 +177 F 0.039 +178 L 0.039 +179 V 0.040 +180 Q 0.043 +181 I 0.048 +182 L 0.057 +183 S 0.072 +184 K 0.089 +185 S 0.108 +186 Q 0.131 +187 S 0.153 +188 S 0.166 +189 R 0.167 +190 E 0.162 +191 H 0.152 +192 R 0.136 +193 E 0.118 +194 D 0.101 +195 K 0.084 +196 V 0.068 +197 L 0.053 +198 W 0.043 +199 T 0.039 +200 G 0.035 +201 W 0.029 +202 F 0.024 +203 C 0.023 +204 C 0.028 +205 V 0.039 +206 F 0.055 +207 G 0.072 +208 E 0.087 +209 S 0.099 +210 L 0.109 +211 Q 0.117 +212 E 0.124 +213 T 0.127 +214 V 0.125 +215 S 0.119 +216 E 0.111 +217 D 0.099 +218 F 0.087 +219 T 0.081 +220 C 0.081 +221 L 0.080 +222 P 0.073 +223 L 0.066 +224 F 0.068 +225 L 0.081 +226 A 0.104 +227 N 0.133 +228 G 0.161 +229 A 0.176 +230 E 0.177 +231 S 0.168 +232 N 0.152 +233 T 0.126 +234 S 0.096 +235 L 0.074 +236 I 0.066 +237 R 0.069 +238 D 0.071 +239 W 0.062 +240 F 0.049 +241 Q 0.042 +242 K 0.042 +243 T 0.041 +244 F 0.037 +245 D 0.036 +246 C 0.039 +247 C 0.044 +248 F 0.047 +249 S 0.049 +250 P 0.051 +251 L 0.050 +252 A 0.047 +253 I 0.046 +254 S 0.049 +255 A 0.055 +256 F 0.058 +257 N 0.055 +258 L 0.047 +259 S 0.036 +260 W 0.027 +261 M 0.021 +262 A 0.019 +263 A 0.019 +264 M 0.019 +265 W 0.021 +266 T 0.025 +267 A 0.033 +268 C 0.043 +269 K 0.053 +270 M 0.062 +271 D 0.071 +272 R 0.079 +273 Y 0.088 +274 M 0.102 +275 A 0.117 +276 T 0.124 +277 T 0.116 +278 E 0.101 +279 F 0.091 +280 L 0.087 +281 W 0.091 +282 S 0.107 +283 V 0.129 +284 P 0.144 +285 C 0.152 +286 S 0.155 +287 P 0.156 +288 Q 0.156 +289 S 0.157 +290 L 0.157 +291 D 0.151 +292 I 0.141 +293 S 0.128 +294 Y 0.111 +295 A 0.094 +296 I 0.080 +297 H 0.071 +298 P 0.065 +299 E 0.061 +300 D 0.056 +301 A 0.052 +302 K 0.052 +303 A 0.054 +304 L 0.057 +305 W 0.061 +306 E 0.066 +307 S 0.077 +308 V 0.093 +309 H 0.113 +310 K 0.132 +311 T 0.148 +312 P 0.159 +313 G 0.160 +314 E 0.147 +315 V 0.123 +316 T 0.097 +317 Q 0.077 +318 E 0.065 +319 E 0.059 +320 V 0.054 +321 D 0.049 +322 L 0.045 +323 F 0.041 +324 M 0.038 +325 N 0.037 +326 C 0.037 +327 L 0.038 +328 Y 0.039 +329 S 0.041 +330 H 0.043 +331 F 0.041 +332 H 0.040 +333 R 0.043 +334 H 0.048 +335 F 0.054 +336 K 0.061 +337 I 0.068 +338 H 0.073 +339 L 0.080 +340 A 0.089 +341 A 0.102 +342 T 0.115 +343 R 0.131 +344 L 0.152 +345 V 0.174 +346 R 0.187 +347 V 0.190 +348 S 0.195 +349 T 0.209 +350 S 0.228 +351 V 0.242 +352 A 0.247 +353 S 0.242 +354 A 0.234 +355 H 0.231 +356 T 0.233 +357 D 0.234 +358 G 0.228 +359 K 0.214 +360 I 0.193 +361 K 0.168 +362 I 0.147 +363 L 0.129 +364 C 0.114 +365 H 0.098 +366 K 0.086 +367 Y 0.083 +368 L 0.087 +369 I 0.088 +370 G 0.085 +371 V 0.081 +372 L 0.078 +373 A 0.079 +374 Y 0.089 +375 M 0.105 +376 T 0.124 +377 E 0.141 +378 L 0.161 +379 A 0.186 +380 I 0.213 +381 F 0.235 +382 Q 0.251 +383 I 0.260 +384 E 0.262 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026895.8_ENSMUST00000070112.6_GN:Ndufa8_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026895.8_ENSMUST00000070112.6_GN:Ndufa8_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..921d63f24e35b1e4f706c6039b846555e3363de4 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026895.8_ENSMUST00000070112.6_GN:Ndufa8_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,173 @@ +>ENSMUSG00000026895.8|ENSMUST00000070112.6|GN:Ndufa8|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.437 +2 P 0.455 +3 G 0.482 +4 I 0.504 +5 V 0.510 +6 E 0.501 +7 L 0.479 +8 P 0.431 +9 T 0.361 +10 L 0.295 +11 E 0.251 +12 E 0.226 +13 L 0.217 +14 K 0.222 +15 V 0.236 +16 E 0.248 +17 E 0.252 +18 V 0.258 +19 K 0.282 +20 V 0.321 +21 S 0.345 +22 S 0.323 +23 A 0.259 +24 V 0.187 +25 L 0.139 +26 K 0.119 +27 A 0.116 +28 A 0.118 +29 A 0.113 +30 H 0.100 +31 H 0.089 +32 Y 0.085 +33 G 0.085 +34 A 0.081 +35 Q 0.071 +36 C 0.064 +37 D 0.064 +38 K 0.071 +39 T 0.086 +40 N 0.108 +41 K 0.122 +42 E 0.119 +43 F 0.101 +44 M 0.083 +45 L 0.069 +46 C 0.060 +47 R 0.058 +48 W 0.062 +49 E 0.071 +50 E 0.083 +51 K 0.101 +52 D 0.120 +53 P 0.130 +54 R 0.123 +55 R 0.105 +56 C 0.092 +57 L 0.090 +58 K 0.099 +59 E 0.111 +60 G 0.122 +61 K 0.129 +62 L 0.130 +63 V 0.129 +64 N 0.124 +65 G 0.109 +66 C 0.087 +67 A 0.072 +68 L 0.071 +69 N 0.074 +70 F 0.074 +71 F 0.071 +72 R 0.069 +73 Q 0.070 +74 I 0.071 +75 K 0.069 +76 S 0.061 +77 H 0.052 +78 C 0.047 +79 A 0.047 +80 E 0.047 +81 P 0.051 +82 F 0.059 +83 T 0.068 +84 E 0.068 +85 Y 0.062 +86 W 0.054 +87 T 0.052 +88 C 0.055 +89 L 0.064 +90 D 0.075 +91 Y 0.085 +92 S 0.090 +93 N 0.088 +94 M 0.082 +95 Q 0.080 +96 L 0.084 +97 F 0.087 +98 R 0.084 +99 H 0.074 +100 C 0.063 +101 R 0.059 +102 Q 0.061 +103 Q 0.066 +104 Q 0.074 +105 A 0.079 +106 K 0.077 +107 F 0.071 +108 D 0.066 +109 Q 0.059 +110 C 0.050 +111 V 0.045 +112 L 0.047 +113 D 0.055 +114 K 0.068 +115 L 0.086 +116 G 0.108 +117 W 0.134 +118 V 0.163 +119 R 0.199 +120 P 0.243 +121 D 0.288 +122 L 0.323 +123 G 0.348 +124 Q 0.369 +125 L 0.382 +126 S 0.381 +127 K 0.369 +128 V 0.355 +129 T 0.345 +130 K 0.339 +131 V 0.334 +132 K 0.328 +133 T 0.333 +134 D 0.356 +135 R 0.394 +136 P 0.434 +137 L 0.470 +138 P 0.497 +139 E 0.509 +140 N 0.497 +141 P 0.468 +142 Y 0.451 +143 H 0.462 +144 S 0.493 +145 R 0.526 +146 A 0.547 +147 R 0.554 +148 P 0.556 +149 E 0.570 +150 P 0.600 +151 N 0.636 +152 P 0.664 +153 V 0.674 +154 I 0.675 +155 E 0.679 +156 G 0.692 +157 D 0.705 +158 L 0.710 +159 K 0.710 +160 P 0.710 +161 A 0.708 +162 K 0.706 +163 H 0.707 +164 G 0.696 +165 T 0.645 +166 R 0.555 +167 F 0.463 +168 F 0.406 +169 F 0.394 +170 W 0.407 +171 T 0.420 +172 V 0.424 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026895.8_ENSMUST00000070112.6_GN:Ndufa8_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:34.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026895.8_ENSMUST00000070112.6_GN:Ndufa8_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:34.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d4e1a79cb262b339e9b99094d5807ff9a14793e9 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000026895.8_ENSMUST00000070112.6_GN:Ndufa8_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:34.caid @@ -0,0 +1,207 @@ +>ENSMUSG00000026895.8|ENSMUST00000070112.6|GN:Ndufa8|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:34 +1 M 0.249 +2 R 0.250 +3 R 0.251 +4 W 0.245 +5 Y 0.227 +6 R 0.207 +7 A 0.200 +8 V 0.211 +9 L 0.239 +10 A 0.292 +11 S 0.371 +12 Q 0.461 +13 R 0.545 +14 G 0.612 +15 L 0.655 +16 E 0.677 +17 G 0.686 +18 D 0.685 +19 G 0.677 +20 R 0.669 +21 H 0.669 +22 G 0.674 +23 R 0.680 +24 G 0.679 +25 H 0.669 +26 L 0.653 +27 V 0.637 +28 R 0.631 +29 V 0.643 +30 A 0.665 +31 A 0.681 +32 T 0.686 +33 A 0.678 +34 V 0.661 +35 M 0.654 +36 P 0.666 +37 G 0.684 +38 I 0.685 +39 V 0.666 +40 E 0.637 +41 L 0.597 +42 P 0.531 +43 T 0.442 +44 L 0.353 +45 E 0.286 +46 E 0.243 +47 L 0.222 +48 K 0.220 +49 V 0.227 +50 E 0.234 +51 E 0.241 +52 V 0.255 +53 K 0.289 +54 V 0.337 +55 S 0.367 +56 S 0.347 +57 A 0.279 +58 V 0.201 +59 L 0.147 +60 K 0.124 +61 A 0.122 +62 A 0.124 +63 A 0.118 +64 H 0.105 +65 H 0.093 +66 Y 0.088 +67 G 0.087 +68 A 0.082 +69 Q 0.072 +70 C 0.064 +71 D 0.064 +72 K 0.070 +73 T 0.085 +74 N 0.106 +75 K 0.119 +76 E 0.115 +77 F 0.099 +78 M 0.081 +79 L 0.067 +80 C 0.057 +81 R 0.054 +82 W 0.057 +83 E 0.063 +84 E 0.073 +85 K 0.088 +86 D 0.106 +87 P 0.116 +88 R 0.112 +89 R 0.097 +90 C 0.084 +91 L 0.083 +92 K 0.091 +93 E 0.103 +94 G 0.114 +95 K 0.120 +96 L 0.122 +97 V 0.122 +98 N 0.119 +99 G 0.104 +100 C 0.083 +101 A 0.069 +102 L 0.067 +103 N 0.070 +104 F 0.070 +105 F 0.067 +106 R 0.066 +107 Q 0.067 +108 I 0.069 +109 K 0.066 +110 S 0.059 +111 H 0.051 +112 C 0.046 +113 A 0.046 +114 E 0.046 +115 P 0.049 +116 F 0.056 +117 T 0.064 +118 E 0.064 +119 Y 0.057 +120 W 0.050 +121 T 0.048 +122 C 0.052 +123 L 0.061 +124 D 0.072 +125 Y 0.082 +126 S 0.087 +127 N 0.087 +128 M 0.084 +129 Q 0.084 +130 L 0.090 +131 F 0.095 +132 R 0.092 +133 H 0.080 +134 C 0.068 +135 R 0.062 +136 Q 0.064 +137 Q 0.069 +138 Q 0.077 +139 A 0.082 +140 K 0.081 +141 F 0.074 +142 D 0.068 +143 Q 0.061 +144 C 0.052 +145 V 0.046 +146 L 0.049 +147 D 0.058 +148 K 0.071 +149 L 0.090 +150 G 0.114 +151 W 0.142 +152 V 0.173 +153 R 0.211 +154 P 0.259 +155 D 0.307 +156 L 0.345 +157 G 0.372 +158 Q 0.392 +159 L 0.404 +160 S 0.402 +161 K 0.391 +162 V 0.377 +163 T 0.364 +164 K 0.356 +165 V 0.350 +166 K 0.344 +167 T 0.348 +168 D 0.372 +169 R 0.408 +170 P 0.446 +171 L 0.482 +172 P 0.509 +173 E 0.521 +174 N 0.509 +175 P 0.479 +176 Y 0.459 +177 H 0.467 +178 S 0.498 +179 R 0.531 +180 A 0.551 +181 R 0.556 +182 P 0.556 +183 E 0.567 +184 P 0.596 +185 N 0.632 +186 P 0.661 +187 V 0.672 +188 I 0.675 +189 E 0.681 +190 G 0.695 +191 D 0.707 +192 L 0.709 +193 K 0.710 +194 P 0.712 +195 A 0.715 +196 K 0.718 +197 H 0.721 +198 G 0.712 +199 T 0.664 +200 R 0.579 +201 F 0.490 +202 F 0.435 +203 F 0.424 +204 W 0.437 +205 T 0.445 +206 V 0.444 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000027347.20_ENSMUST00000102534.11_GN:Rasgrp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000027347.20_ENSMUST00000102534.11_GN:Rasgrp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2b6166856ff3bad2e8929bfd608739eaaa07730f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000027347.20_ENSMUST00000102534.11_GN:Rasgrp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,796 @@ +>ENSMUSG00000027347.20|ENSMUST00000102534.11|GN:Rasgrp1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.367 +2 G 0.392 +3 T 0.426 +4 L 0.448 +5 G 0.446 +6 K 0.434 +7 A 0.424 +8 R 0.409 +9 E 0.396 +10 A 0.404 +11 P 0.418 +12 R 0.423 +13 K 0.440 +14 P 0.489 +15 C 0.545 +16 H 0.583 +17 G 0.599 +18 S 0.584 +19 R 0.541 +20 A 0.512 +21 G 0.523 +22 P 0.539 +23 K 0.524 +24 A 0.505 +25 R 0.531 +26 L 0.589 +27 E 0.630 +28 A 0.634 +29 K 0.617 +30 S 0.597 +31 T 0.581 +32 N 0.568 +33 S 0.564 +34 P 0.568 +35 L 0.579 +36 P 0.587 +37 A 0.585 +38 Q 0.565 +39 P 0.520 +40 S 0.455 +41 L 0.390 +42 A 0.345 +43 Q 0.318 +44 I 0.295 +45 T 0.275 +46 Q 0.269 +47 F 0.277 +48 R 0.288 +49 M 0.293 +50 M 0.292 +51 V 0.289 +52 S 0.288 +53 L 0.292 +54 G 0.305 +55 H 0.325 +56 L 0.341 +57 A 0.328 +58 K 0.276 +59 G 0.207 +60 A 0.148 +61 S 0.107 +62 L 0.079 +63 D 0.063 +64 D 0.054 +65 L 0.047 +66 I 0.043 +67 D 0.042 +68 S 0.043 +69 C 0.045 +70 I 0.049 +71 Q 0.058 +72 S 0.075 +73 F 0.099 +74 D 0.121 +75 A 0.134 +76 D 0.135 +77 G 0.129 +78 N 0.122 +79 L 0.119 +80 C 0.118 +81 R 0.113 +82 N 0.099 +83 N 0.078 +84 Q 0.058 +85 L 0.042 +86 L 0.033 +87 Q 0.033 +88 V 0.037 +89 M 0.037 +90 L 0.030 +91 T 0.023 +92 M 0.019 +93 H 0.019 +94 R 0.020 +95 I 0.022 +96 I 0.025 +97 I 0.031 +98 S 0.039 +99 S 0.047 +100 A 0.049 +101 E 0.045 +102 L 0.040 +103 L 0.038 +104 Q 0.036 +105 K 0.034 +106 V 0.037 +107 M 0.045 +108 N 0.051 +109 L 0.047 +110 Y 0.039 +111 K 0.036 +112 D 0.038 +113 A 0.046 +114 L 0.055 +115 E 0.065 +116 K 0.077 +117 N 0.088 +118 S 0.090 +119 P 0.079 +120 G 0.063 +121 V 0.051 +122 C 0.042 +123 L 0.034 +124 K 0.029 +125 I 0.029 +126 C 0.029 +127 Y 0.026 +128 F 0.024 +129 V 0.023 +130 R 0.023 +131 Y 0.023 +132 W 0.024 +133 I 0.026 +134 T 0.026 +135 E 0.024 +136 F 0.021 +137 W 0.020 +138 I 0.023 +139 M 0.028 +140 F 0.033 +141 K 0.040 +142 M 0.048 +143 D 0.053 +144 A 0.054 +145 S 0.053 +146 L 0.056 +147 T 0.065 +148 S 0.071 +149 T 0.069 +150 M 0.060 +151 E 0.052 +152 E 0.047 +153 F 0.048 +154 Q 0.056 +155 D 0.063 +156 L 0.061 +157 V 0.059 +158 K 0.064 +159 A 0.075 +160 N 0.086 +161 G 0.092 +162 E 0.092 +163 E 0.089 +164 T 0.084 +165 H 0.081 +166 C 0.078 +167 H 0.078 +168 L 0.084 +169 I 0.096 +170 D 0.110 +171 T 0.125 +172 T 0.139 +173 Q 0.153 +174 I 0.171 +175 N 0.191 +176 S 0.207 +177 R 0.208 +178 D 0.196 +179 W 0.184 +180 S 0.183 +181 R 0.194 +182 K 0.210 +183 L 0.227 +184 T 0.245 +185 Q 0.269 +186 R 0.295 +187 I 0.317 +188 K 0.331 +189 S 0.342 +190 N 0.349 +191 T 0.347 +192 S 0.334 +193 K 0.312 +194 K 0.282 +195 R 0.251 +196 K 0.223 +197 V 0.192 +198 S 0.152 +199 L 0.109 +200 L 0.077 +201 F 0.062 +202 D 0.060 +203 H 0.063 +204 L 0.063 +205 E 0.059 +206 P 0.054 +207 E 0.052 +208 E 0.052 +209 L 0.049 +210 S 0.045 +211 E 0.042 +212 H 0.040 +213 L 0.037 +214 T 0.037 +215 Y 0.040 +216 L 0.049 +217 E 0.058 +218 F 0.065 +219 K 0.067 +220 S 0.067 +221 F 0.069 +222 R 0.075 +223 R 0.081 +224 I 0.081 +225 S 0.072 +226 F 0.059 +227 S 0.048 +228 D 0.040 +229 Y 0.035 +230 Q 0.036 +231 N 0.039 +232 Y 0.047 +233 L 0.058 +234 V 0.066 +235 N 0.071 +236 S 0.076 +237 C 0.079 +238 V 0.082 +239 K 0.090 +240 E 0.103 +241 N 0.108 +242 P 0.102 +243 T 0.094 +244 M 0.090 +245 E 0.090 +246 R 0.095 +247 S 0.100 +248 I 0.101 +249 A 0.101 +250 L 0.100 +251 C 0.100 +252 N 0.101 +253 G 0.099 +254 I 0.090 +255 S 0.079 +256 Q 0.072 +257 W 0.066 +258 V 0.060 +259 Q 0.057 +260 L 0.058 +261 M 0.062 +262 V 0.065 +263 L 0.069 +264 S 0.078 +265 R 0.087 +266 P 0.092 +267 T 0.092 +268 P 0.087 +269 Q 0.079 +270 L 0.069 +271 R 0.062 +272 A 0.059 +273 E 0.058 +274 V 0.057 +275 F 0.053 +276 I 0.047 +277 K 0.041 +278 F 0.038 +279 I 0.038 +280 H 0.042 +281 V 0.048 +282 A 0.054 +283 Q 0.058 +284 K 0.064 +285 L 0.076 +286 H 0.095 +287 Q 0.117 +288 L 0.130 +289 Q 0.126 +290 N 0.111 +291 F 0.094 +292 N 0.081 +293 T 0.072 +294 L 0.062 +295 M 0.051 +296 A 0.039 +297 V 0.032 +298 I 0.034 +299 G 0.043 +300 G 0.056 +301 L 0.071 +302 C 0.084 +303 H 0.091 +304 S 0.091 +305 S 0.084 +306 I 0.076 +307 S 0.071 +308 R 0.073 +309 L 0.077 +310 K 0.081 +311 E 0.085 +312 T 0.089 +313 S 0.091 +314 S 0.091 +315 H 0.091 +316 V 0.089 +317 P 0.079 +318 H 0.067 +319 E 0.060 +320 I 0.062 +321 N 0.071 +322 K 0.080 +323 V 0.081 +324 L 0.080 +325 G 0.078 +326 E 0.074 +327 M 0.071 +328 T 0.072 +329 E 0.077 +330 L 0.086 +331 L 0.103 +332 S 0.127 +333 S 0.150 +334 C 0.158 +335 R 0.148 +336 N 0.130 +337 Y 0.112 +338 D 0.098 +339 N 0.090 +340 Y 0.089 +341 R 0.093 +342 R 0.102 +343 A 0.110 +344 Y 0.116 +345 G 0.120 +346 E 0.121 +347 C 0.120 +348 T 0.116 +349 H 0.113 +350 F 0.111 +351 K 0.106 +352 I 0.097 +353 P 0.086 +354 I 0.074 +355 L 0.065 +356 G 0.065 +357 V 0.068 +358 H 0.072 +359 L 0.080 +360 K 0.094 +361 D 0.107 +362 L 0.112 +363 I 0.115 +364 S 0.123 +365 L 0.133 +366 Y 0.141 +367 E 0.148 +368 A 0.158 +369 M 0.170 +370 P 0.182 +371 D 0.187 +372 Y 0.179 +373 L 0.163 +374 E 0.152 +375 D 0.159 +376 G 0.171 +377 K 0.173 +378 V 0.159 +379 N 0.136 +380 V 0.117 +381 Q 0.110 +382 K 0.110 +383 L 0.110 +384 L 0.110 +385 A 0.115 +386 L 0.119 +387 Y 0.122 +388 N 0.126 +389 H 0.130 +390 I 0.127 +391 N 0.122 +392 E 0.121 +393 L 0.125 +394 V 0.128 +395 Q 0.126 +396 L 0.122 +397 Q 0.118 +398 E 0.121 +399 M 0.129 +400 A 0.138 +401 P 0.147 +402 P 0.155 +403 L 0.158 +404 D 0.150 +405 A 0.132 +406 N 0.110 +407 K 0.088 +408 D 0.070 +409 L 0.058 +410 V 0.051 +411 H 0.052 +412 L 0.056 +413 L 0.060 +414 T 0.062 +415 L 0.065 +416 S 0.066 +417 L 0.065 +418 D 0.063 +419 L 0.064 +420 Y 0.068 +421 Y 0.079 +422 T 0.096 +423 E 0.114 +424 D 0.125 +425 E 0.124 +426 I 0.120 +427 Y 0.118 +428 E 0.119 +429 L 0.121 +430 S 0.123 +431 Y 0.128 +432 A 0.132 +433 R 0.133 +434 E 0.142 +435 P 0.173 +436 R 0.226 +437 N 0.284 +438 H 0.339 +439 R 0.389 +440 A 0.438 +441 P 0.486 +442 P 0.521 +443 L 0.531 +444 T 0.519 +445 P 0.495 +446 S 0.466 +447 K 0.437 +448 P 0.414 +449 P 0.399 +450 V 0.384 +451 V 0.362 +452 V 0.337 +453 D 0.312 +454 W 0.288 +455 A 0.273 +456 S 0.274 +457 G 0.285 +458 V 0.291 +459 S 0.291 +460 P 0.286 +461 K 0.267 +462 P 0.232 +463 D 0.194 +464 P 0.167 +465 K 0.155 +466 T 0.151 +467 I 0.152 +468 S 0.150 +469 K 0.137 +470 H 0.112 +471 V 0.085 +472 Q 0.066 +473 R 0.056 +474 M 0.050 +475 V 0.045 +476 D 0.042 +477 S 0.046 +478 V 0.051 +479 F 0.055 +480 K 0.058 +481 N 0.063 +482 Y 0.076 +483 D 0.100 +484 L 0.128 +485 D 0.144 +486 Q 0.142 +487 D 0.131 +488 G 0.121 +489 Y 0.111 +490 I 0.095 +491 S 0.078 +492 Q 0.068 +493 E 0.067 +494 E 0.070 +495 F 0.073 +496 E 0.076 +497 K 0.080 +498 I 0.090 +499 A 0.108 +500 A 0.127 +501 S 0.136 +502 F 0.130 +503 P 0.117 +504 F 0.110 +505 S 0.116 +506 F 0.128 +507 C 0.135 +508 V 0.137 +509 M 0.139 +510 D 0.146 +511 K 0.153 +512 D 0.155 +513 R 0.153 +514 E 0.146 +515 G 0.137 +516 L 0.123 +517 I 0.102 +518 S 0.081 +519 R 0.068 +520 D 0.065 +521 E 0.064 +522 I 0.061 +523 T 0.055 +524 A 0.052 +525 Y 0.049 +526 F 0.045 +527 M 0.047 +528 R 0.061 +529 A 0.087 +530 S 0.119 +531 S 0.154 +532 I 0.186 +533 Y 0.215 +534 S 0.252 +535 K 0.299 +536 L 0.351 +537 G 0.396 +538 L 0.412 +539 G 0.385 +540 F 0.325 +541 P 0.258 +542 H 0.206 +543 N 0.179 +544 F 0.171 +545 Q 0.171 +546 E 0.173 +547 T 0.173 +548 T 0.172 +549 Y 0.171 +550 L 0.171 +551 K 0.170 +552 P 0.168 +553 T 0.163 +554 F 0.146 +555 C 0.122 +556 D 0.109 +557 N 0.120 +558 C 0.154 +559 A 0.194 +560 G 0.224 +561 F 0.233 +562 L 0.225 +563 W 0.208 +564 G 0.191 +565 V 0.180 +566 I 0.180 +567 K 0.187 +568 Q 0.190 +569 G 0.179 +570 Y 0.161 +571 R 0.145 +572 C 0.137 +573 K 0.135 +574 D 0.141 +575 C 0.151 +576 G 0.155 +577 M 0.147 +578 N 0.131 +579 C 0.112 +580 H 0.095 +581 K 0.087 +582 Q 0.093 +583 C 0.108 +584 K 0.122 +585 D 0.130 +586 L 0.131 +587 V 0.128 +588 V 0.123 +589 F 0.119 +590 E 0.119 +591 C 0.125 +592 K 0.151 +593 K 0.213 +594 R 0.313 +595 I 0.429 +596 K 0.532 +597 S 0.608 +598 P 0.655 +599 A 0.679 +600 I 0.687 +601 S 0.687 +602 T 0.691 +603 E 0.697 +604 N 0.696 +605 I 0.683 +606 S 0.663 +607 S 0.645 +608 V 0.633 +609 V 0.630 +610 P 0.638 +611 M 0.654 +612 S 0.666 +613 T 0.664 +614 L 0.660 +615 C 0.671 +616 P 0.702 +617 L 0.739 +618 G 0.767 +619 T 0.779 +620 K 0.779 +621 D 0.771 +622 L 0.757 +623 L 0.737 +624 H 0.720 +625 A 0.716 +626 P 0.733 +627 E 0.765 +628 E 0.799 +629 G 0.821 +630 S 0.826 +631 F 0.817 +632 I 0.803 +633 F 0.797 +634 Q 0.802 +635 N 0.810 +636 G 0.808 +637 E 0.793 +638 I 0.777 +639 V 0.769 +640 D 0.764 +641 H 0.755 +642 S 0.749 +643 E 0.753 +644 E 0.764 +645 S 0.780 +646 K 0.796 +647 D 0.813 +648 R 0.829 +649 T 0.841 +650 I 0.844 +651 M 0.841 +652 L 0.834 +653 L 0.827 +654 G 0.819 +655 V 0.813 +656 S 0.807 +657 S 0.801 +658 Q 0.798 +659 K 0.800 +660 I 0.803 +661 S 0.804 +662 V 0.801 +663 R 0.795 +664 L 0.790 +665 K 0.788 +666 R 0.796 +667 T 0.810 +668 V 0.825 +669 A 0.837 +670 H 0.847 +671 K 0.853 +672 S 0.856 +673 T 0.856 +674 Q 0.855 +675 T 0.850 +676 E 0.841 +677 S 0.830 +678 F 0.823 +679 P 0.823 +680 W 0.828 +681 V 0.834 +682 G 0.834 +683 G 0.826 +684 E 0.813 +685 T 0.800 +686 T 0.798 +687 P 0.809 +688 G 0.826 +689 H 0.837 +690 F 0.840 +691 V 0.834 +692 L 0.822 +693 S 0.811 +694 S 0.808 +695 P 0.814 +696 R 0.825 +697 K 0.835 +698 S 0.843 +699 A 0.850 +700 Q 0.856 +701 G 0.862 +702 A 0.864 +703 L 0.860 +704 Y 0.851 +705 V 0.840 +706 H 0.827 +707 S 0.814 +708 P 0.805 +709 A 0.798 +710 S 0.791 +711 P 0.784 +712 C 0.782 +713 P 0.790 +714 S 0.803 +715 P 0.816 +716 A 0.824 +717 L 0.824 +718 V 0.816 +719 R 0.805 +720 K 0.798 +721 R 0.796 +722 A 0.796 +723 F 0.790 +724 V 0.776 +725 K 0.759 +726 W 0.747 +727 E 0.740 +728 N 0.736 +729 K 0.735 +730 E 0.735 +731 S 0.729 +732 L 0.714 +733 I 0.696 +734 K 0.689 +735 P 0.701 +736 K 0.730 +737 P 0.760 +738 E 0.777 +739 L 0.775 +740 H 0.761 +741 L 0.738 +742 R 0.696 +743 L 0.626 +744 R 0.544 +745 T 0.485 +746 Y 0.464 +747 Q 0.466 +748 E 0.461 +749 L 0.441 +750 E 0.414 +751 Q 0.383 +752 E 0.350 +753 I 0.317 +754 N 0.290 +755 T 0.278 +756 L 0.289 +757 K 0.317 +758 A 0.351 +759 D 0.382 +760 N 0.401 +761 D 0.401 +762 A 0.385 +763 L 0.362 +764 K 0.343 +765 I 0.329 +766 Q 0.315 +767 L 0.294 +768 K 0.268 +769 Y 0.246 +770 A 0.241 +771 Q 0.249 +772 K 0.262 +773 K 0.281 +774 I 0.311 +775 E 0.345 +776 S 0.371 +777 L 0.393 +778 Q 0.428 +779 L 0.484 +780 G 0.542 +781 K 0.584 +782 S 0.611 +783 N 0.634 +784 H 0.658 +785 V 0.677 +786 L 0.687 +787 A 0.690 +788 Q 0.690 +789 M 0.691 +790 D 0.695 +791 H 0.707 +792 G 0.724 +793 D 0.736 +794 S 0.734 +795 A 0.725 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000027347.20_ENSMUST00000102534.11_GN:Rasgrp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:82.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000027347.20_ENSMUST00000102534.11_GN:Rasgrp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:82.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..681ae0fd33b44b222762b1bed137f5d5cd9ae19c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000027347.20_ENSMUST00000102534.11_GN:Rasgrp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:82.caid @@ -0,0 +1,878 @@ +>ENSMUSG00000027347.20|ENSMUST00000102534.11|GN:Rasgrp1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:82 +1 M 0.293 +2 I 0.296 +3 T 0.303 +4 S 0.315 +5 T 0.324 +6 P 0.315 +7 V 0.291 +8 R 0.264 +9 W 0.250 +10 L 0.257 +11 V 0.279 +12 R 0.302 +13 E 0.318 +14 S 0.333 +15 V 0.367 +16 C 0.430 +17 A 0.498 +18 R 0.551 +19 G 0.582 +20 S 0.592 +21 E 0.580 +22 R 0.559 +23 R 0.546 +24 E 0.544 +25 R 0.540 +26 A 0.531 +27 R 0.529 +28 T 0.542 +29 N 0.563 +30 F 0.583 +31 V 0.602 +32 P 0.624 +33 A 0.644 +34 G 0.661 +35 E 0.674 +36 P 0.685 +37 G 0.684 +38 S 0.652 +39 A 0.589 +40 R 0.538 +41 R 0.530 +42 A 0.537 +43 P 0.526 +44 R 0.517 +45 V 0.536 +46 V 0.554 +47 G 0.545 +48 S 0.528 +49 G 0.522 +50 L 0.519 +51 R 0.531 +52 G 0.572 +53 P 0.608 +54 A 0.604 +55 A 0.601 +56 A 0.644 +57 E 0.708 +58 G 0.747 +59 C 0.757 +60 A 0.760 +61 A 0.766 +62 P 0.773 +63 G 0.777 +64 R 0.773 +65 A 0.762 +66 D 0.753 +67 P 0.751 +68 T 0.759 +69 A 0.771 +70 L 0.780 +71 G 0.782 +72 E 0.776 +73 T 0.764 +74 A 0.756 +75 P 0.757 +76 G 0.762 +77 A 0.751 +78 Q 0.707 +79 R 0.641 +80 A 0.603 +81 A 0.627 +82 T 0.683 +83 M 0.727 +84 G 0.749 +85 T 0.758 +86 L 0.760 +87 G 0.762 +88 K 0.756 +89 A 0.737 +90 R 0.707 +91 E 0.686 +92 A 0.679 +93 P 0.680 +94 R 0.686 +95 K 0.698 +96 P 0.716 +97 C 0.731 +98 H 0.743 +99 G 0.751 +100 S 0.750 +101 R 0.739 +102 A 0.724 +103 G 0.707 +104 P 0.671 +105 K 0.615 +106 A 0.581 +107 R 0.605 +108 L 0.662 +109 E 0.702 +110 A 0.709 +111 K 0.696 +112 S 0.677 +113 T 0.658 +114 N 0.639 +115 S 0.624 +116 P 0.616 +117 L 0.617 +118 P 0.620 +119 A 0.617 +120 Q 0.595 +121 P 0.549 +122 S 0.483 +123 L 0.417 +124 A 0.369 +125 Q 0.337 +126 I 0.307 +127 T 0.281 +128 Q 0.270 +129 F 0.271 +130 R 0.271 +131 M 0.266 +132 M 0.260 +133 V 0.257 +134 S 0.258 +135 L 0.267 +136 G 0.284 +137 H 0.306 +138 L 0.322 +139 A 0.309 +140 K 0.260 +141 G 0.195 +142 A 0.140 +143 S 0.101 +144 L 0.075 +145 D 0.059 +146 D 0.050 +147 L 0.044 +148 I 0.038 +149 D 0.036 +150 S 0.037 +151 C 0.039 +152 I 0.043 +153 Q 0.053 +154 S 0.072 +155 F 0.096 +156 D 0.116 +157 A 0.127 +158 D 0.129 +159 G 0.128 +160 N 0.126 +161 L 0.123 +162 C 0.119 +163 R 0.112 +164 N 0.098 +165 N 0.079 +166 Q 0.060 +167 L 0.044 +168 L 0.034 +169 Q 0.033 +170 V 0.037 +171 M 0.037 +172 L 0.031 +173 T 0.023 +174 M 0.019 +175 H 0.019 +176 R 0.020 +177 I 0.023 +178 I 0.026 +179 I 0.031 +180 S 0.038 +181 S 0.043 +182 A 0.045 +183 E 0.041 +184 L 0.037 +185 L 0.035 +186 Q 0.033 +187 K 0.030 +188 V 0.027 +189 M 0.027 +190 N 0.028 +191 L 0.028 +192 Y 0.028 +193 K 0.030 +194 D 0.034 +195 A 0.040 +196 L 0.049 +197 E 0.060 +198 K 0.073 +199 N 0.085 +200 S 0.086 +201 P 0.074 +202 G 0.058 +203 V 0.045 +204 C 0.036 +205 L 0.030 +206 K 0.026 +207 I 0.025 +208 C 0.025 +209 Y 0.023 +210 F 0.021 +211 V 0.020 +212 R 0.020 +213 Y 0.020 +214 W 0.021 +215 I 0.023 +216 T 0.023 +217 E 0.021 +218 F 0.019 +219 W 0.019 +220 I 0.020 +221 M 0.024 +222 F 0.027 +223 K 0.033 +224 M 0.039 +225 D 0.043 +226 A 0.043 +227 S 0.041 +228 L 0.046 +229 T 0.056 +230 S 0.064 +231 T 0.061 +232 M 0.052 +233 E 0.044 +234 E 0.040 +235 F 0.043 +236 Q 0.052 +237 D 0.058 +238 L 0.055 +239 V 0.049 +240 K 0.050 +241 A 0.057 +242 N 0.065 +243 G 0.070 +244 E 0.069 +245 E 0.065 +246 T 0.062 +247 H 0.060 +248 C 0.060 +249 H 0.060 +250 L 0.064 +251 I 0.073 +252 D 0.084 +253 T 0.093 +254 T 0.103 +255 Q 0.114 +256 I 0.131 +257 N 0.151 +258 S 0.168 +259 R 0.173 +260 D 0.166 +261 W 0.159 +262 S 0.163 +263 R 0.178 +264 K 0.200 +265 L 0.223 +266 T 0.244 +267 Q 0.268 +268 R 0.293 +269 I 0.312 +270 K 0.322 +271 S 0.328 +272 N 0.332 +273 T 0.329 +274 S 0.313 +275 K 0.289 +276 K 0.260 +277 R 0.233 +278 K 0.210 +279 V 0.184 +280 S 0.148 +281 L 0.108 +282 L 0.079 +283 F 0.067 +284 D 0.066 +285 H 0.069 +286 L 0.067 +287 E 0.060 +288 P 0.054 +289 E 0.052 +290 E 0.051 +291 L 0.048 +292 S 0.044 +293 E 0.042 +294 H 0.040 +295 L 0.038 +296 T 0.038 +297 Y 0.042 +298 L 0.051 +299 E 0.061 +300 F 0.066 +301 K 0.068 +302 S 0.068 +303 F 0.071 +304 R 0.078 +305 R 0.084 +306 I 0.085 +307 S 0.076 +308 F 0.063 +309 S 0.052 +310 D 0.043 +311 Y 0.039 +312 Q 0.039 +313 N 0.042 +314 Y 0.050 +315 L 0.062 +316 V 0.072 +317 N 0.078 +318 S 0.085 +319 C 0.090 +320 V 0.093 +321 K 0.102 +322 E 0.115 +323 N 0.120 +324 P 0.114 +325 T 0.104 +326 M 0.097 +327 E 0.095 +328 R 0.098 +329 S 0.102 +330 I 0.102 +331 A 0.101 +332 L 0.099 +333 C 0.098 +334 N 0.099 +335 G 0.097 +336 I 0.088 +337 S 0.078 +338 Q 0.070 +339 W 0.064 +340 V 0.058 +341 Q 0.055 +342 L 0.058 +343 M 0.061 +344 V 0.065 +345 L 0.069 +346 S 0.079 +347 R 0.089 +348 P 0.096 +349 T 0.097 +350 P 0.093 +351 Q 0.084 +352 L 0.073 +353 R 0.065 +354 A 0.062 +355 E 0.061 +356 V 0.060 +357 F 0.056 +358 I 0.050 +359 K 0.044 +360 F 0.040 +361 I 0.041 +362 H 0.044 +363 V 0.051 +364 A 0.056 +365 Q 0.060 +366 K 0.067 +367 L 0.080 +368 H 0.100 +369 Q 0.122 +370 L 0.135 +371 Q 0.131 +372 N 0.115 +373 F 0.097 +374 N 0.084 +375 T 0.074 +376 L 0.064 +377 M 0.052 +378 A 0.040 +379 V 0.033 +380 I 0.035 +381 G 0.043 +382 G 0.055 +383 L 0.070 +384 C 0.083 +385 H 0.090 +386 S 0.090 +387 S 0.083 +388 I 0.075 +389 S 0.071 +390 R 0.073 +391 L 0.078 +392 K 0.082 +393 E 0.086 +394 T 0.089 +395 S 0.090 +396 S 0.089 +397 H 0.089 +398 V 0.086 +399 P 0.077 +400 H 0.066 +401 E 0.059 +402 I 0.062 +403 N 0.071 +404 K 0.079 +405 V 0.080 +406 L 0.079 +407 G 0.078 +408 E 0.075 +409 M 0.072 +410 T 0.072 +411 E 0.077 +412 L 0.086 +413 L 0.102 +414 S 0.127 +415 S 0.149 +416 C 0.157 +417 R 0.147 +418 N 0.128 +419 Y 0.110 +420 D 0.097 +421 N 0.089 +422 Y 0.089 +423 R 0.093 +424 R 0.102 +425 A 0.111 +426 Y 0.118 +427 G 0.122 +428 E 0.124 +429 C 0.123 +430 T 0.119 +431 H 0.116 +432 F 0.114 +433 K 0.109 +434 I 0.100 +435 P 0.088 +436 I 0.076 +437 L 0.067 +438 G 0.066 +439 V 0.070 +440 H 0.074 +441 L 0.083 +442 K 0.098 +443 D 0.111 +444 L 0.116 +445 I 0.119 +446 S 0.127 +447 L 0.138 +448 Y 0.147 +449 E 0.155 +450 A 0.165 +451 M 0.177 +452 P 0.188 +453 D 0.192 +454 Y 0.182 +455 L 0.163 +456 E 0.150 +457 D 0.156 +458 G 0.169 +459 K 0.173 +460 V 0.159 +461 N 0.137 +462 V 0.118 +463 Q 0.111 +464 K 0.112 +465 L 0.112 +466 L 0.113 +467 A 0.117 +468 L 0.120 +469 Y 0.119 +470 N 0.121 +471 H 0.127 +472 I 0.128 +473 N 0.125 +474 E 0.126 +475 L 0.130 +476 V 0.133 +477 Q 0.131 +478 L 0.127 +479 Q 0.123 +480 E 0.126 +481 M 0.133 +482 A 0.141 +483 P 0.148 +484 P 0.155 +485 L 0.158 +486 D 0.151 +487 A 0.135 +488 N 0.113 +489 K 0.092 +490 D 0.074 +491 L 0.060 +492 V 0.054 +493 H 0.055 +494 L 0.060 +495 L 0.064 +496 T 0.066 +497 L 0.068 +498 S 0.069 +499 L 0.067 +500 D 0.065 +501 L 0.064 +502 Y 0.068 +503 Y 0.078 +504 T 0.095 +505 E 0.114 +506 D 0.125 +507 E 0.126 +508 I 0.122 +509 Y 0.121 +510 E 0.123 +511 L 0.125 +512 S 0.128 +513 Y 0.134 +514 A 0.139 +515 R 0.141 +516 E 0.149 +517 P 0.182 +518 R 0.236 +519 N 0.296 +520 H 0.352 +521 R 0.401 +522 A 0.450 +523 P 0.497 +524 P 0.533 +525 L 0.546 +526 T 0.538 +527 P 0.519 +528 S 0.495 +529 K 0.470 +530 P 0.451 +531 P 0.436 +532 V 0.417 +533 V 0.389 +534 V 0.357 +535 D 0.324 +536 W 0.292 +537 A 0.273 +538 S 0.275 +539 G 0.287 +540 V 0.296 +541 S 0.301 +542 P 0.297 +543 K 0.277 +544 P 0.240 +545 D 0.201 +546 P 0.175 +547 K 0.163 +548 T 0.157 +549 I 0.154 +550 S 0.147 +551 K 0.132 +552 H 0.108 +553 V 0.083 +554 Q 0.066 +555 R 0.057 +556 M 0.051 +557 V 0.044 +558 D 0.042 +559 S 0.044 +560 V 0.050 +561 F 0.054 +562 K 0.057 +563 N 0.062 +564 Y 0.073 +565 D 0.096 +566 L 0.122 +567 D 0.138 +568 Q 0.135 +569 D 0.125 +570 G 0.117 +571 Y 0.107 +572 I 0.092 +573 S 0.075 +574 Q 0.064 +575 E 0.063 +576 E 0.065 +577 F 0.066 +578 E 0.068 +579 K 0.072 +580 I 0.081 +581 A 0.097 +582 A 0.116 +583 S 0.125 +584 F 0.120 +585 P 0.108 +586 F 0.100 +587 S 0.102 +588 F 0.109 +589 C 0.114 +590 V 0.117 +591 M 0.124 +592 D 0.134 +593 K 0.144 +594 D 0.148 +595 R 0.146 +596 E 0.139 +597 G 0.130 +598 L 0.116 +599 I 0.096 +600 S 0.077 +601 R 0.065 +602 D 0.063 +603 E 0.063 +604 I 0.059 +605 T 0.054 +606 A 0.050 +607 Y 0.046 +608 F 0.042 +609 M 0.043 +610 R 0.055 +611 A 0.078 +612 S 0.108 +613 S 0.142 +614 I 0.175 +615 Y 0.206 +616 S 0.243 +617 K 0.290 +618 L 0.340 +619 G 0.381 +620 L 0.395 +621 G 0.369 +622 F 0.311 +623 P 0.248 +624 H 0.200 +625 N 0.174 +626 F 0.167 +627 Q 0.168 +628 E 0.171 +629 T 0.172 +630 T 0.172 +631 Y 0.172 +632 L 0.172 +633 K 0.172 +634 P 0.171 +635 T 0.166 +636 F 0.149 +637 C 0.126 +638 D 0.113 +639 N 0.125 +640 C 0.159 +641 A 0.200 +642 G 0.230 +643 F 0.239 +644 L 0.230 +645 W 0.212 +646 G 0.196 +647 V 0.186 +648 I 0.187 +649 K 0.196 +650 Q 0.199 +651 G 0.187 +652 Y 0.166 +653 R 0.149 +654 C 0.140 +655 K 0.139 +656 D 0.146 +657 C 0.155 +658 G 0.158 +659 M 0.149 +660 N 0.132 +661 C 0.113 +662 H 0.096 +663 K 0.088 +664 Q 0.094 +665 C 0.109 +666 K 0.124 +667 D 0.131 +668 L 0.133 +669 V 0.129 +670 V 0.123 +671 F 0.119 +672 E 0.119 +673 C 0.126 +674 K 0.153 +675 K 0.217 +676 R 0.319 +677 I 0.436 +678 K 0.539 +679 S 0.613 +680 P 0.659 +681 A 0.682 +682 I 0.688 +683 S 0.688 +684 T 0.692 +685 E 0.699 +686 N 0.698 +687 I 0.684 +688 S 0.663 +689 S 0.644 +690 V 0.633 +691 V 0.631 +692 P 0.642 +693 M 0.659 +694 S 0.670 +695 T 0.667 +696 L 0.663 +697 C 0.674 +698 P 0.704 +699 L 0.740 +700 G 0.768 +701 T 0.780 +702 K 0.779 +703 D 0.771 +704 L 0.757 +705 L 0.737 +706 H 0.721 +707 A 0.718 +708 P 0.735 +709 E 0.767 +710 E 0.800 +711 G 0.821 +712 S 0.825 +713 F 0.816 +714 I 0.803 +715 F 0.798 +716 Q 0.804 +717 N 0.812 +718 G 0.808 +719 E 0.791 +720 I 0.773 +721 V 0.765 +722 D 0.760 +723 H 0.752 +724 S 0.746 +725 E 0.749 +726 E 0.762 +727 S 0.779 +728 K 0.795 +729 D 0.812 +730 R 0.828 +731 T 0.839 +732 I 0.843 +733 M 0.841 +734 L 0.836 +735 L 0.828 +736 G 0.820 +737 V 0.813 +738 S 0.806 +739 S 0.801 +740 Q 0.798 +741 K 0.799 +742 I 0.802 +743 S 0.802 +744 V 0.799 +745 R 0.794 +746 L 0.790 +747 K 0.790 +748 R 0.798 +749 T 0.811 +750 V 0.825 +751 A 0.838 +752 H 0.849 +753 K 0.856 +754 S 0.858 +755 T 0.857 +756 Q 0.855 +757 T 0.849 +758 E 0.839 +759 S 0.827 +760 F 0.821 +761 P 0.821 +762 W 0.828 +763 V 0.834 +764 G 0.835 +765 G 0.827 +766 E 0.814 +767 T 0.802 +768 T 0.800 +769 P 0.811 +770 G 0.827 +771 H 0.838 +772 F 0.840 +773 V 0.833 +774 L 0.820 +775 S 0.809 +776 S 0.807 +777 P 0.814 +778 R 0.825 +779 K 0.836 +780 S 0.843 +781 A 0.849 +782 Q 0.855 +783 G 0.861 +784 A 0.862 +785 L 0.858 +786 Y 0.849 +787 V 0.838 +788 H 0.825 +789 S 0.812 +790 P 0.804 +791 A 0.797 +792 S 0.790 +793 P 0.783 +794 C 0.782 +795 P 0.789 +796 S 0.802 +797 P 0.815 +798 A 0.823 +799 L 0.822 +800 V 0.814 +801 R 0.803 +802 K 0.795 +803 R 0.793 +804 A 0.792 +805 F 0.786 +806 V 0.774 +807 K 0.758 +808 W 0.746 +809 E 0.741 +810 N 0.740 +811 K 0.739 +812 E 0.737 +813 S 0.731 +814 L 0.716 +815 I 0.698 +816 K 0.690 +817 P 0.701 +818 K 0.728 +819 P 0.758 +820 E 0.773 +821 L 0.771 +822 H 0.756 +823 L 0.734 +824 R 0.692 +825 L 0.622 +826 R 0.538 +827 T 0.475 +828 Y 0.453 +829 Q 0.457 +830 E 0.454 +831 L 0.437 +832 E 0.410 +833 Q 0.379 +834 E 0.345 +835 I 0.313 +836 N 0.287 +837 T 0.276 +838 L 0.287 +839 K 0.314 +840 A 0.347 +841 D 0.375 +842 N 0.389 +843 D 0.384 +844 A 0.367 +845 L 0.349 +846 K 0.336 +847 I 0.326 +848 Q 0.312 +849 L 0.291 +850 K 0.263 +851 Y 0.241 +852 A 0.236 +853 Q 0.243 +854 K 0.256 +855 K 0.276 +856 I 0.304 +857 E 0.334 +858 S 0.360 +859 L 0.384 +860 Q 0.421 +861 L 0.478 +862 G 0.537 +863 K 0.578 +864 S 0.604 +865 N 0.626 +866 H 0.648 +867 V 0.664 +868 L 0.672 +869 A 0.675 +870 Q 0.678 +871 M 0.684 +872 D 0.691 +873 H 0.704 +874 G 0.722 +875 D 0.734 +876 S 0.731 +877 A 0.722 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000027536.7_ENSMUST00000029049.7_GN:Chmp4c_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000027536.7_ENSMUST00000029049.7_GN:Chmp4c_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6ab4539bd9f91389f59f8177471d6d4ae27b3d5c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000027536.7_ENSMUST00000029049.7_GN:Chmp4c_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,233 @@ +>ENSMUSG00000027536.7|ENSMUST00000029049.7|GN:Chmp4c|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.466 +2 S 0.490 +3 K 0.528 +4 L 0.564 +5 G 0.584 +6 K 0.590 +7 F 0.598 +8 F 0.616 +9 K 0.643 +10 G 0.673 +11 T 0.698 +12 R 0.713 +13 S 0.719 +14 S 0.714 +15 R 0.701 +16 A 0.683 +17 R 0.659 +18 A 0.623 +19 A 0.559 +20 P 0.462 +21 S 0.343 +22 A 0.231 +23 Q 0.159 +24 E 0.131 +25 A 0.126 +26 L 0.125 +27 A 0.122 +28 R 0.115 +29 L 0.103 +30 R 0.095 +31 E 0.092 +32 T 0.088 +33 E 0.079 +34 E 0.073 +35 M 0.071 +36 L 0.073 +37 A 0.077 +38 K 0.076 +39 K 0.070 +40 Q 0.061 +41 E 0.054 +42 Y 0.052 +43 L 0.057 +44 E 0.068 +45 N 0.073 +46 R 0.066 +47 I 0.052 +48 Q 0.043 +49 R 0.041 +50 E 0.047 +51 L 0.060 +52 A 0.070 +53 L 0.068 +54 A 0.058 +55 K 0.051 +56 K 0.052 +57 H 0.060 +58 G 0.073 +59 S 0.089 +60 Q 0.100 +61 N 0.103 +62 K 0.096 +63 R 0.084 +64 A 0.076 +65 A 0.073 +66 L 0.072 +67 Q 0.073 +68 A 0.078 +69 L 0.084 +70 K 0.085 +71 R 0.080 +72 K 0.072 +73 K 0.064 +74 R 0.062 +75 F 0.069 +76 E 0.078 +77 K 0.082 +78 Q 0.081 +79 L 0.085 +80 T 0.096 +81 Q 0.117 +82 V 0.150 +83 D 0.188 +84 G 0.210 +85 T 0.207 +86 L 0.198 +87 S 0.193 +88 T 0.181 +89 I 0.167 +90 E 0.164 +91 F 0.163 +92 Q 0.159 +93 R 0.164 +94 E 0.176 +95 A 0.172 +96 L 0.161 +97 E 0.162 +98 N 0.172 +99 S 0.175 +100 H 0.174 +101 T 0.177 +102 N 0.184 +103 T 0.196 +104 E 0.210 +105 V 0.211 +106 L 0.199 +107 R 0.190 +108 N 0.196 +109 M 0.203 +110 G 0.204 +111 F 0.205 +112 A 0.207 +113 A 0.210 +114 K 0.223 +115 A 0.245 +116 M 0.262 +117 K 0.273 +118 A 0.286 +119 V 0.307 +120 H 0.331 +121 D 0.356 +122 N 0.380 +123 M 0.394 +124 D 0.390 +125 L 0.372 +126 N 0.357 +127 K 0.352 +128 I 0.349 +129 D 0.343 +130 D 0.337 +131 L 0.331 +132 M 0.333 +133 Q 0.353 +134 D 0.382 +135 I 0.399 +136 T 0.402 +137 E 0.403 +138 Q 0.409 +139 Q 0.427 +140 D 0.446 +141 I 0.433 +142 A 0.393 +143 Q 0.362 +144 E 0.347 +145 I 0.327 +146 S 0.305 +147 E 0.295 +148 A 0.296 +149 F 0.304 +150 S 0.321 +151 Q 0.345 +152 R 0.374 +153 V 0.402 +154 Q 0.428 +155 F 0.442 +156 A 0.440 +157 D 0.424 +158 G 0.396 +159 F 0.352 +160 D 0.292 +161 E 0.233 +162 A 0.195 +163 E 0.177 +164 L 0.167 +165 L 0.160 +166 A 0.159 +167 E 0.162 +168 L 0.162 +169 E 0.162 +170 E 0.164 +171 L 0.171 +172 E 0.178 +173 Q 0.185 +174 E 0.193 +175 E 0.207 +176 L 0.224 +177 N 0.244 +178 K 0.274 +179 K 0.321 +180 M 0.384 +181 T 0.457 +182 S 0.533 +183 L 0.598 +184 E 0.647 +185 L 0.683 +186 P 0.707 +187 N 0.720 +188 V 0.729 +189 P 0.739 +190 S 0.751 +191 S 0.757 +192 S 0.756 +193 L 0.752 +194 P 0.751 +195 A 0.753 +196 Q 0.757 +197 P 0.765 +198 S 0.776 +199 R 0.785 +200 K 0.788 +201 A 0.779 +202 S 0.766 +203 M 0.760 +204 P 0.767 +205 S 0.780 +206 S 0.787 +207 V 0.782 +208 H 0.766 +209 R 0.747 +210 S 0.734 +211 R 0.723 +212 A 0.711 +213 A 0.694 +214 S 0.671 +215 S 0.646 +216 R 0.624 +217 R 0.613 +218 A 0.613 +219 E 0.604 +220 E 0.567 +221 D 0.513 +222 D 0.468 +223 D 0.434 +224 F 0.404 +225 K 0.386 +226 Q 0.386 +227 L 0.392 +228 A 0.392 +229 A 0.390 +230 W 0.382 +231 A 0.355 +232 T 0.326 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000027536.7_ENSMUST00000029049.7_GN:Chmp4c_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:40.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000027536.7_ENSMUST00000029049.7_GN:Chmp4c_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:40.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e02cd1377cf16a1221f93e421c6fd67d30e501c0 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000027536.7_ENSMUST00000029049.7_GN:Chmp4c_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:40.caid @@ -0,0 +1,273 @@ +>ENSMUSG00000027536.7|ENSMUST00000029049.7|GN:Chmp4c|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:40 +1 M 0.450 +2 P 0.481 +3 K 0.528 +4 S 0.571 +5 G 0.597 +6 C 0.605 +7 H 0.606 +8 L 0.612 +9 P 0.617 +10 K 0.619 +11 Q 0.616 +12 L 0.603 +13 V 0.571 +14 D 0.518 +15 S 0.450 +16 Q 0.379 +17 E 0.321 +18 L 0.285 +19 C 0.272 +20 R 0.269 +21 L 0.264 +22 R 0.257 +23 L 0.253 +24 W 0.256 +25 L 0.269 +26 T 0.297 +27 C 0.344 +28 L 0.404 +29 Q 0.471 +30 S 0.534 +31 A 0.586 +32 G 0.621 +33 T 0.642 +34 L 0.654 +35 V 0.669 +36 P 0.688 +37 H 0.701 +38 C 0.707 +39 S 0.707 +40 A 0.704 +41 M 0.704 +42 S 0.708 +43 K 0.712 +44 L 0.706 +45 G 0.691 +46 K 0.678 +47 F 0.674 +48 F 0.679 +49 K 0.694 +50 G 0.715 +51 T 0.736 +52 R 0.749 +53 S 0.754 +54 S 0.749 +55 R 0.737 +56 A 0.718 +57 R 0.694 +58 A 0.656 +59 A 0.590 +60 P 0.488 +61 S 0.363 +62 A 0.246 +63 Q 0.170 +64 E 0.140 +65 A 0.134 +66 L 0.132 +67 A 0.131 +68 R 0.127 +69 L 0.118 +70 R 0.113 +71 E 0.112 +72 T 0.107 +73 E 0.097 +74 E 0.088 +75 M 0.083 +76 L 0.083 +77 A 0.084 +78 K 0.082 +79 K 0.074 +80 Q 0.065 +81 E 0.058 +82 Y 0.054 +83 L 0.057 +84 E 0.066 +85 N 0.070 +86 R 0.061 +87 I 0.048 +88 Q 0.040 +89 R 0.038 +90 E 0.044 +91 L 0.057 +92 A 0.067 +93 L 0.065 +94 A 0.055 +95 K 0.047 +96 K 0.047 +97 H 0.053 +98 G 0.065 +99 S 0.078 +100 Q 0.087 +101 N 0.090 +102 K 0.084 +103 R 0.075 +104 A 0.070 +105 A 0.069 +106 L 0.067 +107 Q 0.066 +108 A 0.069 +109 L 0.074 +110 K 0.075 +111 R 0.072 +112 K 0.065 +113 K 0.058 +114 R 0.056 +115 F 0.062 +116 E 0.070 +117 K 0.073 +118 Q 0.072 +119 L 0.076 +120 T 0.087 +121 Q 0.108 +122 V 0.140 +123 D 0.175 +124 G 0.193 +125 T 0.191 +126 L 0.190 +127 S 0.194 +128 T 0.185 +129 I 0.168 +130 E 0.160 +131 F 0.155 +132 Q 0.148 +133 R 0.151 +134 E 0.162 +135 A 0.162 +136 L 0.155 +137 E 0.159 +138 N 0.172 +139 S 0.178 +140 H 0.181 +141 T 0.187 +142 N 0.198 +143 T 0.214 +144 E 0.230 +145 V 0.232 +146 L 0.219 +147 R 0.211 +148 N 0.218 +149 M 0.225 +150 G 0.225 +151 F 0.223 +152 A 0.223 +153 A 0.226 +154 K 0.241 +155 A 0.266 +156 M 0.285 +157 K 0.296 +158 A 0.309 +159 V 0.331 +160 H 0.356 +161 D 0.385 +162 N 0.412 +163 M 0.430 +164 D 0.430 +165 L 0.416 +166 N 0.407 +167 K 0.408 +168 I 0.408 +169 D 0.399 +170 D 0.386 +171 L 0.370 +172 M 0.363 +173 Q 0.380 +174 D 0.411 +175 I 0.430 +176 T 0.435 +177 E 0.436 +178 Q 0.441 +179 Q 0.457 +180 D 0.475 +181 I 0.461 +182 A 0.418 +183 Q 0.383 +184 E 0.366 +185 I 0.346 +186 S 0.322 +187 E 0.309 +188 A 0.307 +189 F 0.313 +190 S 0.328 +191 Q 0.352 +192 R 0.378 +193 V 0.405 +194 Q 0.428 +195 F 0.441 +196 A 0.439 +197 D 0.424 +198 G 0.395 +199 F 0.349 +200 D 0.289 +201 E 0.232 +202 A 0.195 +203 E 0.177 +204 L 0.169 +205 L 0.164 +206 A 0.163 +207 E 0.165 +208 L 0.165 +209 E 0.162 +210 E 0.164 +211 L 0.170 +212 E 0.178 +213 Q 0.184 +214 E 0.193 +215 E 0.205 +216 L 0.222 +217 N 0.242 +218 K 0.271 +219 K 0.316 +220 M 0.377 +221 T 0.448 +222 S 0.524 +223 L 0.591 +224 E 0.642 +225 L 0.679 +226 P 0.703 +227 N 0.717 +228 V 0.729 +229 P 0.742 +230 S 0.756 +231 S 0.763 +232 S 0.762 +233 L 0.759 +234 P 0.757 +235 A 0.759 +236 Q 0.763 +237 P 0.770 +238 S 0.781 +239 R 0.790 +240 K 0.794 +241 A 0.788 +242 S 0.776 +243 M 0.771 +244 P 0.777 +245 S 0.788 +246 S 0.795 +247 V 0.791 +248 H 0.775 +249 R 0.758 +250 S 0.745 +251 R 0.736 +252 A 0.724 +253 A 0.707 +254 S 0.684 +255 S 0.659 +256 R 0.635 +257 R 0.621 +258 A 0.618 +259 E 0.606 +260 E 0.567 +261 D 0.512 +262 D 0.467 +263 D 0.433 +264 F 0.405 +265 K 0.389 +266 Q 0.393 +267 L 0.403 +268 A 0.408 +269 A 0.411 +270 W 0.407 +271 A 0.382 +272 T 0.352 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000027861.14_ENSMUST00000165540.9_GN:Casq2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000027861.14_ENSMUST00000165540.9_GN:Casq2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..534e8cfc597ad5b5d1202aa673969504fda0c772 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000027861.14_ENSMUST00000165540.9_GN:Casq2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,419 @@ +>ENSMUSG00000027861.14|ENSMUST00000165540.9|GN:Casq2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.266 +2 K 0.251 +3 R 0.233 +4 I 0.222 +5 Y 0.211 +6 L 0.208 +7 L 0.221 +8 M 0.248 +9 V 0.272 +10 G 0.284 +11 V 0.280 +12 Y 0.265 +13 L 0.252 +14 L 0.263 +15 S 0.307 +16 L 0.368 +17 S 0.434 +18 G 0.498 +19 A 0.548 +20 E 0.563 +21 E 0.532 +22 G 0.467 +23 L 0.390 +24 N 0.320 +25 F 0.265 +26 P 0.221 +27 T 0.191 +28 Y 0.175 +29 D 0.169 +30 G 0.166 +31 K 0.159 +32 D 0.145 +33 R 0.129 +34 V 0.113 +35 V 0.097 +36 S 0.083 +37 L 0.076 +38 S 0.069 +39 E 0.058 +40 K 0.047 +41 N 0.041 +42 L 0.035 +43 K 0.031 +44 Q 0.031 +45 M 0.032 +46 L 0.034 +47 K 0.040 +48 R 0.046 +49 Y 0.047 +50 D 0.040 +51 L 0.031 +52 L 0.027 +53 C 0.028 +54 L 0.031 +55 Y 0.036 +56 Y 0.048 +57 H 0.071 +58 E 0.106 +59 P 0.143 +60 V 0.171 +61 S 0.183 +62 S 0.178 +63 D 0.161 +64 K 0.142 +65 V 0.127 +66 S 0.117 +67 Q 0.116 +68 K 0.124 +69 Q 0.135 +70 F 0.143 +71 Q 0.144 +72 L 0.136 +73 K 0.120 +74 E 0.108 +75 I 0.099 +76 V 0.087 +77 L 0.071 +78 E 0.058 +79 L 0.051 +80 V 0.046 +81 A 0.041 +82 Q 0.037 +83 V 0.034 +84 L 0.032 +85 E 0.032 +86 H 0.036 +87 K 0.041 +88 N 0.047 +89 I 0.047 +90 G 0.042 +91 F 0.036 +92 V 0.035 +93 M 0.039 +94 V 0.044 +95 D 0.047 +96 S 0.045 +97 R 0.041 +98 K 0.035 +99 E 0.029 +100 A 0.025 +101 K 0.025 +102 L 0.026 +103 A 0.028 +104 K 0.029 +105 R 0.031 +106 L 0.035 +107 G 0.042 +108 F 0.050 +109 S 0.056 +110 E 0.061 +111 E 0.063 +112 G 0.060 +113 S 0.052 +114 L 0.039 +115 Y 0.030 +116 V 0.028 +117 L 0.034 +118 K 0.043 +119 G 0.055 +120 D 0.068 +121 R 0.077 +122 T 0.081 +123 I 0.082 +124 E 0.083 +125 F 0.087 +126 D 0.095 +127 G 0.104 +128 E 0.109 +129 F 0.109 +130 A 0.106 +131 A 0.099 +132 D 0.090 +133 V 0.081 +134 L 0.076 +135 V 0.076 +136 E 0.080 +137 F 0.082 +138 L 0.083 +139 L 0.089 +140 D 0.105 +141 L 0.125 +142 I 0.142 +143 E 0.153 +144 D 0.153 +145 P 0.140 +146 V 0.122 +147 E 0.107 +148 I 0.099 +149 V 0.093 +150 N 0.085 +151 N 0.075 +152 K 0.065 +153 L 0.057 +154 E 0.051 +155 V 0.049 +156 Q 0.052 +157 A 0.056 +158 F 0.057 +159 E 0.055 +160 R 0.055 +161 I 0.059 +162 E 0.066 +163 D 0.069 +164 Q 0.062 +165 T 0.045 +166 K 0.029 +167 L 0.020 +168 L 0.017 +169 G 0.020 +170 F 0.028 +171 F 0.039 +172 K 0.047 +173 N 0.053 +174 E 0.056 +175 D 0.058 +176 S 0.055 +177 E 0.052 +178 Y 0.054 +179 Y 0.063 +180 K 0.069 +181 A 0.064 +182 F 0.051 +183 Q 0.042 +184 E 0.040 +185 A 0.040 +186 A 0.041 +187 E 0.038 +188 H 0.033 +189 F 0.030 +190 Q 0.029 +191 P 0.031 +192 Y 0.034 +193 I 0.037 +194 K 0.035 +195 F 0.032 +196 F 0.030 +197 A 0.032 +198 T 0.038 +199 F 0.043 +200 D 0.044 +201 K 0.039 +202 A 0.033 +203 V 0.028 +204 A 0.027 +205 K 0.029 +206 K 0.035 +207 L 0.045 +208 S 0.054 +209 L 0.061 +210 K 0.063 +211 M 0.062 +212 N 0.058 +213 E 0.052 +214 V 0.046 +215 G 0.043 +216 F 0.047 +217 Y 0.058 +218 E 0.067 +219 P 0.068 +220 F 0.064 +221 M 0.064 +222 D 0.073 +223 E 0.081 +224 P 0.079 +225 N 0.071 +226 V 0.066 +227 I 0.070 +228 P 0.075 +229 N 0.073 +230 K 0.065 +231 P 0.059 +232 Y 0.058 +233 T 0.057 +234 E 0.054 +235 E 0.050 +236 E 0.051 +237 L 0.058 +238 V 0.068 +239 E 0.076 +240 F 0.077 +241 V 0.076 +242 K 0.078 +243 E 0.084 +244 H 0.092 +245 Q 0.106 +246 R 0.122 +247 P 0.131 +248 T 0.132 +249 L 0.133 +250 R 0.136 +251 R 0.135 +252 L 0.129 +253 R 0.122 +254 P 0.120 +255 E 0.124 +256 D 0.128 +257 M 0.126 +258 F 0.122 +259 E 0.119 +260 T 0.118 +261 W 0.123 +262 T 0.142 +263 T 0.172 +264 G 0.200 +265 E 0.210 +266 D 0.201 +267 D 0.184 +268 L 0.164 +269 N 0.140 +270 G 0.110 +271 I 0.079 +272 H 0.053 +273 I 0.037 +274 V 0.031 +275 A 0.034 +276 F 0.041 +277 A 0.048 +278 E 0.053 +279 K 0.057 +280 S 0.059 +281 D 0.061 +282 P 0.062 +283 D 0.063 +284 G 0.065 +285 Y 0.068 +286 E 0.071 +287 F 0.071 +288 L 0.069 +289 E 0.065 +290 I 0.060 +291 L 0.051 +292 K 0.043 +293 Q 0.040 +294 V 0.041 +295 A 0.045 +296 R 0.048 +297 D 0.054 +298 N 0.063 +299 T 0.075 +300 D 0.086 +301 N 0.090 +302 P 0.085 +303 D 0.071 +304 L 0.056 +305 S 0.042 +306 I 0.032 +307 L 0.029 +308 W 0.035 +309 I 0.051 +310 D 0.069 +311 P 0.079 +312 D 0.080 +313 D 0.077 +314 F 0.070 +315 P 0.058 +316 L 0.045 +317 L 0.035 +318 V 0.029 +319 A 0.024 +320 Y 0.021 +321 W 0.022 +322 E 0.027 +323 K 0.035 +324 T 0.044 +325 F 0.050 +326 K 0.056 +327 I 0.059 +328 D 0.058 +329 L 0.050 +330 F 0.043 +331 K 0.039 +332 P 0.038 +333 Q 0.036 +334 I 0.035 +335 G 0.035 +336 V 0.038 +337 V 0.044 +338 N 0.052 +339 V 0.059 +340 T 0.066 +341 D 0.076 +342 A 0.088 +343 D 0.093 +344 S 0.086 +345 I 0.073 +346 W 0.070 +347 M 0.087 +348 E 0.121 +349 I 0.160 +350 P 0.196 +351 D 0.222 +352 D 0.230 +353 D 0.216 +354 D 0.189 +355 L 0.159 +356 P 0.129 +357 T 0.102 +358 A 0.081 +359 E 0.069 +360 E 0.065 +361 L 0.068 +362 E 0.074 +363 D 0.076 +364 W 0.071 +365 I 0.063 +366 E 0.058 +367 D 0.059 +368 V 0.070 +369 L 0.098 +370 S 0.140 +371 G 0.188 +372 K 0.236 +373 I 0.289 +374 N 0.357 +375 T 0.437 +376 E 0.515 +377 D 0.573 +378 D 0.606 +379 D 0.625 +380 N 0.640 +381 E 0.652 +382 D 0.663 +383 E 0.672 +384 D 0.678 +385 D 0.683 +386 D 0.684 +387 G 0.675 +388 D 0.640 +389 D 0.586 +390 N 0.552 +391 D 0.557 +392 D 0.561 +393 D 0.536 +394 D 0.512 +395 D 0.513 +396 D 0.517 +397 D 0.527 +398 D 0.565 +399 D 0.616 +400 N 0.650 +401 D 0.663 +402 N 0.660 +403 S 0.629 +404 D 0.574 +405 E 0.532 +406 D 0.522 +407 N 0.522 +408 E 0.531 +409 D 0.571 +410 S 0.629 +411 D 0.671 +412 D 0.687 +413 D 0.687 +414 D 0.678 +415 D 0.659 +416 D 0.623 +417 D 0.574 +418 E 0.534 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000027861.14_ENSMUST00000165540.9_GN:Casq2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000027861.14_ENSMUST00000165540.9_GN:Casq2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7c2e02247f94c0dc72a6796a283e3cea9d6d5acb --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000027861.14_ENSMUST00000165540.9_GN:Casq2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid @@ -0,0 +1,433 @@ +>ENSMUSG00000027861.14|ENSMUST00000165540.9|GN:Casq2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:14 +1 M 0.270 +2 I 0.274 +3 S 0.283 +4 I 0.287 +5 L 0.273 +6 E 0.254 +7 T 0.252 +8 E 0.265 +9 K 0.272 +10 Q 0.271 +11 D 0.265 +12 F 0.251 +13 S 0.232 +14 Q 0.215 +15 M 0.198 +16 K 0.182 +17 R 0.169 +18 I 0.161 +19 Y 0.154 +20 L 0.152 +21 L 0.158 +22 M 0.173 +23 V 0.189 +24 G 0.193 +25 V 0.184 +26 Y 0.173 +27 L 0.176 +28 L 0.203 +29 S 0.253 +30 L 0.316 +31 S 0.384 +32 G 0.449 +33 A 0.498 +34 E 0.515 +35 E 0.488 +36 G 0.429 +37 L 0.360 +38 N 0.298 +39 F 0.248 +40 P 0.210 +41 T 0.185 +42 Y 0.172 +43 D 0.168 +44 G 0.166 +45 K 0.158 +46 D 0.144 +47 R 0.129 +48 V 0.114 +49 V 0.097 +50 S 0.084 +51 L 0.077 +52 S 0.070 +53 E 0.058 +54 K 0.047 +55 N 0.040 +56 L 0.034 +57 K 0.030 +58 Q 0.030 +59 M 0.031 +60 L 0.033 +61 K 0.038 +62 R 0.045 +63 Y 0.046 +64 D 0.040 +65 L 0.031 +66 L 0.027 +67 C 0.028 +68 L 0.030 +69 Y 0.034 +70 Y 0.045 +71 H 0.068 +72 E 0.100 +73 P 0.135 +74 V 0.163 +75 S 0.176 +76 S 0.172 +77 D 0.156 +78 K 0.138 +79 V 0.124 +80 S 0.114 +81 Q 0.113 +82 K 0.120 +83 Q 0.130 +84 F 0.138 +85 Q 0.139 +86 L 0.130 +87 K 0.116 +88 E 0.104 +89 I 0.096 +90 V 0.084 +91 L 0.069 +92 E 0.056 +93 L 0.049 +94 V 0.045 +95 A 0.040 +96 Q 0.035 +97 V 0.032 +98 L 0.030 +99 E 0.031 +100 H 0.034 +101 K 0.040 +102 N 0.046 +103 I 0.047 +104 G 0.043 +105 F 0.036 +106 V 0.035 +107 M 0.039 +108 V 0.044 +109 D 0.046 +110 S 0.045 +111 R 0.040 +112 K 0.034 +113 E 0.029 +114 A 0.025 +115 K 0.024 +116 L 0.025 +117 A 0.027 +118 K 0.028 +119 R 0.030 +120 L 0.034 +121 G 0.042 +122 F 0.050 +123 S 0.057 +124 E 0.062 +125 E 0.064 +126 G 0.062 +127 S 0.053 +128 L 0.040 +129 Y 0.030 +130 V 0.029 +131 L 0.035 +132 K 0.044 +133 G 0.056 +134 D 0.069 +135 R 0.078 +136 T 0.082 +137 I 0.083 +138 E 0.084 +139 F 0.088 +140 D 0.097 +141 G 0.106 +142 E 0.111 +143 F 0.111 +144 A 0.107 +145 A 0.099 +146 D 0.090 +147 V 0.081 +148 L 0.074 +149 V 0.074 +150 E 0.079 +151 F 0.081 +152 L 0.082 +153 L 0.089 +154 D 0.106 +155 L 0.126 +156 I 0.143 +157 E 0.154 +158 D 0.153 +159 P 0.140 +160 V 0.122 +161 E 0.107 +162 I 0.099 +163 V 0.093 +164 N 0.085 +165 N 0.075 +166 K 0.065 +167 L 0.056 +168 E 0.049 +169 V 0.046 +170 Q 0.048 +171 A 0.053 +172 F 0.055 +173 E 0.054 +174 R 0.055 +175 I 0.059 +176 E 0.066 +177 D 0.070 +178 Q 0.062 +179 T 0.045 +180 K 0.030 +181 L 0.020 +182 L 0.017 +183 G 0.020 +184 F 0.028 +185 F 0.039 +186 K 0.047 +187 N 0.053 +188 E 0.056 +189 D 0.058 +190 S 0.055 +191 E 0.052 +192 Y 0.054 +193 Y 0.063 +194 K 0.069 +195 A 0.064 +196 F 0.051 +197 Q 0.042 +198 E 0.040 +199 A 0.040 +200 A 0.040 +201 E 0.038 +202 H 0.033 +203 F 0.029 +204 Q 0.028 +205 P 0.030 +206 Y 0.033 +207 I 0.036 +208 K 0.035 +209 F 0.031 +210 F 0.029 +211 A 0.032 +212 T 0.038 +213 F 0.042 +214 D 0.042 +215 K 0.038 +216 A 0.032 +217 V 0.027 +218 A 0.026 +219 K 0.028 +220 K 0.035 +221 L 0.044 +222 S 0.053 +223 L 0.060 +224 K 0.062 +225 M 0.061 +226 N 0.057 +227 E 0.051 +228 V 0.046 +229 G 0.043 +230 F 0.047 +231 Y 0.057 +232 E 0.067 +233 P 0.067 +234 F 0.063 +235 M 0.064 +236 D 0.072 +237 E 0.080 +238 P 0.079 +239 N 0.071 +240 V 0.066 +241 I 0.070 +242 P 0.075 +243 N 0.073 +244 K 0.066 +245 P 0.060 +246 Y 0.058 +247 T 0.058 +248 E 0.055 +249 E 0.051 +250 E 0.051 +251 L 0.058 +252 V 0.068 +253 E 0.076 +254 F 0.078 +255 V 0.077 +256 K 0.080 +257 E 0.085 +258 H 0.094 +259 Q 0.108 +260 R 0.124 +261 P 0.134 +262 T 0.134 +263 L 0.134 +264 R 0.137 +265 R 0.136 +266 L 0.131 +267 R 0.124 +268 P 0.121 +269 E 0.125 +270 D 0.130 +271 M 0.128 +272 F 0.123 +273 E 0.120 +274 T 0.119 +275 W 0.125 +276 T 0.145 +277 T 0.176 +278 G 0.204 +279 E 0.214 +280 D 0.205 +281 D 0.187 +282 L 0.167 +283 N 0.142 +284 G 0.111 +285 I 0.079 +286 H 0.053 +287 I 0.037 +288 V 0.031 +289 A 0.034 +290 F 0.042 +291 A 0.049 +292 E 0.055 +293 K 0.059 +294 S 0.061 +295 D 0.063 +296 P 0.064 +297 D 0.066 +298 G 0.067 +299 Y 0.070 +300 E 0.072 +301 F 0.072 +302 L 0.070 +303 E 0.066 +304 I 0.060 +305 L 0.052 +306 K 0.044 +307 Q 0.041 +308 V 0.042 +309 A 0.046 +310 R 0.050 +311 D 0.055 +312 N 0.065 +313 T 0.077 +314 D 0.088 +315 N 0.092 +316 P 0.087 +317 D 0.074 +318 L 0.058 +319 S 0.043 +320 I 0.033 +321 L 0.030 +322 W 0.036 +323 I 0.053 +324 D 0.071 +325 P 0.081 +326 D 0.082 +327 D 0.079 +328 F 0.072 +329 P 0.060 +330 L 0.046 +331 L 0.035 +332 V 0.029 +333 A 0.025 +334 Y 0.022 +335 W 0.022 +336 E 0.027 +337 K 0.036 +338 T 0.045 +339 F 0.051 +340 K 0.057 +341 I 0.061 +342 D 0.059 +343 L 0.052 +344 F 0.045 +345 K 0.041 +346 P 0.039 +347 Q 0.038 +348 I 0.036 +349 G 0.036 +350 V 0.039 +351 V 0.047 +352 N 0.055 +353 V 0.061 +354 T 0.067 +355 D 0.077 +356 A 0.089 +357 D 0.093 +358 S 0.086 +359 I 0.073 +360 W 0.069 +361 M 0.085 +362 E 0.119 +363 I 0.158 +364 P 0.193 +365 D 0.219 +366 D 0.227 +367 D 0.213 +368 D 0.186 +369 L 0.157 +370 P 0.128 +371 T 0.101 +372 A 0.080 +373 E 0.068 +374 E 0.065 +375 L 0.067 +376 E 0.073 +377 D 0.075 +378 W 0.070 +379 I 0.062 +380 E 0.057 +381 D 0.058 +382 V 0.069 +383 L 0.096 +384 S 0.138 +385 G 0.184 +386 K 0.231 +387 I 0.285 +388 N 0.354 +389 T 0.435 +390 E 0.514 +391 D 0.573 +392 D 0.606 +393 D 0.625 +394 N 0.639 +395 E 0.652 +396 D 0.662 +397 E 0.671 +398 D 0.678 +399 D 0.682 +400 D 0.684 +401 G 0.675 +402 D 0.640 +403 D 0.586 +404 N 0.551 +405 D 0.554 +406 D 0.555 +407 D 0.528 +408 D 0.507 +409 D 0.510 +410 D 0.515 +411 D 0.525 +412 D 0.564 +413 D 0.615 +414 N 0.650 +415 D 0.664 +416 N 0.661 +417 S 0.630 +418 D 0.574 +419 E 0.532 +420 D 0.523 +421 N 0.523 +422 E 0.531 +423 D 0.571 +424 S 0.629 +425 D 0.671 +426 D 0.687 +427 D 0.687 +428 D 0.679 +429 D 0.659 +430 D 0.623 +431 D 0.574 +432 E 0.535 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028042.16_ENSMUST00000107435.8_GN:Zbtb7b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028042.16_ENSMUST00000107435.8_GN:Zbtb7b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..10430ea206a55836206df4d5a7bd18cf217849e4 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028042.16_ENSMUST00000107435.8_GN:Zbtb7b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,545 @@ +>ENSMUSG00000028042.16|ENSMUST00000107435.8|GN:Zbtb7b|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.461 +2 G 0.484 +3 S 0.522 +4 P 0.556 +5 E 0.562 +6 D 0.527 +7 D 0.464 +8 L 0.404 +9 I 0.376 +10 G 0.381 +11 I 0.389 +12 P 0.373 +13 F 0.338 +14 P 0.303 +15 D 0.272 +16 H 0.232 +17 S 0.182 +18 S 0.138 +19 E 0.113 +20 L 0.100 +21 L 0.086 +22 S 0.071 +23 C 0.062 +24 L 0.063 +25 N 0.074 +26 E 0.083 +27 Q 0.083 +28 R 0.077 +29 Q 0.076 +30 L 0.083 +31 G 0.094 +32 H 0.098 +33 L 0.091 +34 C 0.074 +35 D 0.056 +36 L 0.042 +37 T 0.034 +38 I 0.032 +39 R 0.036 +40 T 0.042 +41 Q 0.047 +42 G 0.050 +43 L 0.052 +44 E 0.055 +45 Y 0.057 +46 R 0.062 +47 T 0.070 +48 H 0.072 +49 R 0.066 +50 A 0.058 +51 V 0.056 +52 L 0.059 +53 A 0.061 +54 A 0.059 +55 C 0.052 +56 S 0.040 +57 H 0.030 +58 Y 0.024 +59 F 0.024 +60 K 0.029 +61 K 0.040 +62 L 0.063 +63 F 0.106 +64 T 0.171 +65 E 0.254 +66 G 0.341 +67 G 0.418 +68 G 0.475 +69 G 0.510 +70 T 0.531 +71 V 0.554 +72 M 0.595 +73 G 0.648 +74 T 0.689 +75 G 0.711 +76 G 0.719 +77 G 0.722 +78 G 0.721 +79 T 0.715 +80 A 0.706 +81 S 0.696 +82 G 0.682 +83 G 0.661 +84 A 0.633 +85 G 0.592 +86 A 0.528 +87 G 0.432 +88 V 0.324 +89 C 0.237 +90 E 0.181 +91 L 0.146 +92 D 0.122 +93 F 0.106 +94 V 0.095 +95 G 0.081 +96 P 0.064 +97 E 0.052 +98 A 0.048 +99 L 0.051 +100 G 0.054 +101 A 0.056 +102 L 0.056 +103 L 0.054 +104 E 0.050 +105 F 0.046 +106 A 0.043 +107 Y 0.045 +108 T 0.047 +109 A 0.047 +110 T 0.045 +111 L 0.044 +112 T 0.045 +113 T 0.047 +114 S 0.049 +115 S 0.052 +116 A 0.053 +117 N 0.050 +118 M 0.044 +119 P 0.037 +120 A 0.032 +121 V 0.028 +122 L 0.027 +123 Q 0.030 +124 A 0.035 +125 A 0.037 +126 R 0.035 +127 L 0.032 +128 L 0.033 +129 E 0.036 +130 I 0.037 +131 P 0.036 +132 C 0.033 +133 V 0.032 +134 I 0.033 +135 A 0.037 +136 A 0.043 +137 C 0.050 +138 M 0.058 +139 E 0.067 +140 I 0.083 +141 L 0.118 +142 Q 0.178 +143 G 0.253 +144 S 0.326 +145 G 0.381 +146 L 0.417 +147 E 0.436 +148 A 0.442 +149 P 0.430 +150 S 0.400 +151 P 0.361 +152 D 0.322 +153 E 0.283 +154 D 0.235 +155 D 0.183 +156 C 0.140 +157 E 0.112 +158 R 0.096 +159 A 0.094 +160 R 0.102 +161 Q 0.113 +162 Y 0.118 +163 L 0.118 +164 E 0.124 +165 A 0.143 +166 F 0.178 +167 A 0.229 +168 T 0.300 +169 A 0.390 +170 T 0.488 +171 T 0.571 +172 T 0.626 +173 A 0.658 +174 S 0.679 +175 T 0.694 +176 S 0.703 +177 G 0.710 +178 M 0.721 +179 P 0.739 +180 N 0.758 +181 G 0.761 +182 E 0.741 +183 D 0.707 +184 S 0.680 +185 P 0.676 +186 P 0.689 +187 Q 0.704 +188 V 0.705 +189 P 0.691 +190 L 0.658 +191 L 0.614 +192 P 0.567 +193 P 0.528 +194 P 0.507 +195 P 0.514 +196 P 0.549 +197 P 0.604 +198 P 0.667 +199 R 0.725 +200 P 0.770 +201 V 0.798 +202 A 0.806 +203 R 0.799 +204 R 0.781 +205 S 0.759 +206 R 0.742 +207 K 0.740 +208 P 0.752 +209 R 0.770 +210 K 0.781 +211 A 0.769 +212 F 0.722 +213 L 0.659 +214 Q 0.632 +215 T 0.676 +216 K 0.751 +217 G 0.806 +218 A 0.828 +219 R 0.832 +220 A 0.826 +221 N 0.815 +222 H 0.799 +223 L 0.782 +224 V 0.769 +225 P 0.767 +226 E 0.771 +227 A 0.776 +228 P 0.782 +229 T 0.787 +230 V 0.786 +231 L 0.777 +232 T 0.764 +233 H 0.752 +234 P 0.747 +235 L 0.747 +236 T 0.750 +237 Y 0.751 +238 E 0.743 +239 E 0.723 +240 E 0.702 +241 E 0.695 +242 M 0.707 +243 V 0.729 +244 G 0.750 +245 R 0.766 +246 L 0.776 +247 G 0.783 +248 N 0.787 +249 S 0.788 +250 G 0.789 +251 G 0.792 +252 S 0.796 +253 G 0.798 +254 L 0.798 +255 G 0.796 +256 D 0.787 +257 S 0.764 +258 Y 0.734 +259 S 0.717 +260 P 0.727 +261 P 0.755 +262 T 0.784 +263 G 0.801 +264 A 0.802 +265 A 0.790 +266 S 0.775 +267 P 0.764 +268 A 0.758 +269 E 0.751 +270 G 0.743 +271 P 0.739 +272 L 0.741 +273 N 0.744 +274 Y 0.746 +275 E 0.747 +276 V 0.748 +277 F 0.752 +278 E 0.763 +279 G 0.773 +280 E 0.779 +281 E 0.780 +282 E 0.781 +283 E 0.783 +284 E 0.782 +285 E 0.770 +286 M 0.743 +287 A 0.708 +288 Y 0.682 +289 P 0.681 +290 P 0.704 +291 G 0.736 +292 Y 0.761 +293 G 0.776 +294 L 0.783 +295 A 0.783 +296 Q 0.780 +297 S 0.774 +298 N 0.768 +299 E 0.763 +300 P 0.759 +301 S 0.750 +302 L 0.738 +303 S 0.733 +304 P 0.743 +305 E 0.762 +306 E 0.780 +307 L 0.789 +308 G 0.785 +309 S 0.769 +310 D 0.744 +311 E 0.716 +312 D 0.682 +313 P 0.625 +314 I 0.535 +315 D 0.432 +316 P 0.352 +317 D 0.303 +318 L 0.268 +319 M 0.242 +320 A 0.232 +321 Y 0.234 +322 L 0.242 +323 S 0.262 +324 S 0.312 +325 L 0.395 +326 H 0.496 +327 Q 0.588 +328 D 0.658 +329 A 0.695 +330 L 0.709 +331 T 0.717 +332 P 0.733 +333 G 0.755 +334 L 0.773 +335 D 0.781 +336 G 0.779 +337 Q 0.771 +338 D 0.760 +339 K 0.745 +340 L 0.723 +341 V 0.695 +342 R 0.671 +343 K 0.658 +344 R 0.646 +345 R 0.617 +346 S 0.558 +347 Q 0.469 +348 M 0.360 +349 P 0.251 +350 Q 0.165 +351 E 0.112 +352 C 0.086 +353 P 0.073 +354 V 0.070 +355 C 0.074 +356 H 0.084 +357 K 0.094 +358 I 0.102 +359 I 0.115 +360 H 0.139 +361 G 0.173 +362 A 0.209 +363 G 0.234 +364 K 0.237 +365 L 0.220 +366 P 0.195 +367 R 0.173 +368 H 0.160 +369 M 0.162 +370 R 0.178 +371 T 0.204 +372 H 0.243 +373 T 0.281 +374 G 0.292 +375 E 0.261 +376 K 0.205 +377 P 0.152 +378 F 0.118 +379 A 0.098 +380 C 0.082 +381 E 0.069 +382 V 0.063 +383 C 0.066 +384 G 0.074 +385 V 0.082 +386 R 0.090 +387 F 0.100 +388 T 0.111 +389 R 0.120 +390 N 0.127 +391 D 0.132 +392 K 0.135 +393 L 0.131 +394 K 0.120 +395 I 0.107 +396 H 0.100 +397 M 0.105 +398 R 0.118 +399 K 0.134 +400 H 0.156 +401 T 0.181 +402 G 0.197 +403 E 0.189 +404 R 0.158 +405 P 0.123 +406 Y 0.099 +407 S 0.088 +408 C 0.083 +409 P 0.080 +410 H 0.076 +411 C 0.072 +412 P 0.073 +413 A 0.082 +414 R 0.093 +415 F 0.101 +416 L 0.105 +417 H 0.109 +418 S 0.118 +419 Y 0.131 +420 D 0.145 +421 L 0.152 +422 K 0.147 +423 N 0.133 +424 H 0.123 +425 M 0.130 +426 H 0.150 +427 L 0.169 +428 H 0.183 +429 T 0.202 +430 G 0.220 +431 D 0.220 +432 R 0.194 +433 P 0.155 +434 Y 0.120 +435 E 0.097 +436 C 0.082 +437 H 0.076 +438 L 0.081 +439 C 0.093 +440 H 0.104 +441 K 0.110 +442 A 0.116 +443 F 0.123 +444 A 0.126 +445 K 0.122 +446 E 0.111 +447 D 0.099 +448 H 0.091 +449 L 0.088 +450 Q 0.088 +451 R 0.094 +452 H 0.102 +453 L 0.115 +454 K 0.137 +455 G 0.165 +456 Q 0.193 +457 N 0.217 +458 C 0.251 +459 L 0.309 +460 E 0.390 +461 V 0.469 +462 R 0.525 +463 T 0.561 +464 R 0.590 +465 R 0.620 +466 R 0.650 +467 R 0.673 +468 K 0.686 +469 D 0.691 +470 D 0.690 +471 V 0.679 +472 A 0.658 +473 A 0.631 +474 P 0.601 +475 H 0.572 +476 Y 0.558 +477 P 0.575 +478 P 0.622 +479 P 0.681 +480 S 0.732 +481 T 0.760 +482 T 0.763 +483 T 0.748 +484 S 0.734 +485 S 0.736 +486 P 0.755 +487 A 0.776 +488 G 0.787 +489 L 0.781 +490 D 0.766 +491 L 0.752 +492 S 0.746 +493 N 0.744 +494 G 0.738 +495 H 0.726 +496 L 0.704 +497 D 0.662 +498 T 0.594 +499 F 0.515 +500 H 0.453 +501 L 0.410 +502 S 0.367 +503 L 0.322 +504 A 0.293 +505 R 0.291 +506 F 0.314 +507 W 0.358 +508 E 0.423 +509 Q 0.490 +510 S 0.534 +511 A 0.548 +512 T 0.545 +513 T 0.548 +514 G 0.572 +515 P 0.621 +516 P 0.678 +517 V 0.719 +518 T 0.728 +519 T 0.709 +520 Q 0.680 +521 G 0.652 +522 P 0.619 +523 P 0.581 +524 E 0.568 +525 E 0.594 +526 E 0.613 +527 E 0.594 +528 E 0.578 +529 E 0.603 +530 G 0.641 +531 T 0.660 +532 P 0.671 +533 T 0.686 +534 T 0.707 +535 P 0.734 +536 Q 0.762 +537 A 0.785 +538 E 0.802 +539 G 0.811 +540 A 0.809 +541 M 0.797 +542 E 0.775 +543 S 0.747 +544 S 0.726 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028042.16_ENSMUST00000107435.8_GN:Zbtb7b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:63.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028042.16_ENSMUST00000107435.8_GN:Zbtb7b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:63.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..52ec7f73e257194a95250f8859a5b4f808a196e0 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028042.16_ENSMUST00000107435.8_GN:Zbtb7b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:63.caid @@ -0,0 +1,608 @@ +>ENSMUSG00000028042.16|ENSMUST00000107435.8|GN:Zbtb7b|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:63 +1 M 0.337 +2 L 0.345 +3 Q 0.373 +4 K 0.421 +5 E 0.457 +6 T 0.465 +7 T 0.476 +8 R 0.514 +9 G 0.553 +10 Q 0.560 +11 L 0.543 +12 W 0.524 +13 C 0.512 +14 P 0.501 +15 S 0.484 +16 V 0.465 +17 W 0.459 +18 S 0.474 +19 P 0.483 +20 C 0.457 +21 T 0.425 +22 R 0.458 +23 I 0.563 +24 G 0.672 +25 G 0.728 +26 L 0.731 +27 G 0.695 +28 G 0.634 +29 S 0.591 +30 L 0.605 +31 T 0.652 +32 P 0.690 +33 T 0.712 +34 A 0.728 +35 P 0.745 +36 G 0.760 +37 S 0.765 +38 N 0.754 +39 Q 0.727 +40 L 0.692 +41 P 0.655 +42 S 0.626 +43 P 0.617 +44 P 0.632 +45 S 0.662 +46 P 0.694 +47 F 0.719 +48 V 0.738 +49 A 0.749 +50 C 0.748 +51 G 0.732 +52 L 0.701 +53 S 0.662 +54 S 0.628 +55 P 0.610 +56 P 0.610 +57 R 0.635 +58 P 0.680 +59 P 0.727 +60 G 0.757 +61 S 0.767 +62 E 0.765 +63 K 0.759 +64 M 0.750 +65 G 0.738 +66 S 0.725 +67 P 0.713 +68 E 0.694 +69 D 0.650 +70 D 0.580 +71 L 0.506 +72 I 0.461 +73 G 0.450 +74 I 0.441 +75 P 0.407 +76 F 0.363 +77 P 0.334 +78 D 0.311 +79 H 0.271 +80 S 0.211 +81 S 0.157 +82 E 0.126 +83 L 0.109 +84 L 0.093 +85 S 0.076 +86 C 0.066 +87 L 0.067 +88 N 0.076 +89 E 0.084 +90 Q 0.083 +91 R 0.076 +92 Q 0.072 +93 L 0.076 +94 G 0.082 +95 H 0.083 +96 L 0.076 +97 C 0.062 +98 D 0.049 +99 L 0.037 +100 T 0.030 +101 I 0.028 +102 R 0.032 +103 T 0.038 +104 Q 0.042 +105 G 0.043 +106 L 0.044 +107 E 0.046 +108 Y 0.049 +109 R 0.056 +110 T 0.067 +111 H 0.072 +112 R 0.065 +113 A 0.056 +114 V 0.052 +115 L 0.052 +116 A 0.052 +117 A 0.049 +118 C 0.042 +119 S 0.032 +120 H 0.025 +121 Y 0.021 +122 F 0.022 +123 K 0.027 +124 K 0.037 +125 L 0.057 +126 F 0.095 +127 T 0.157 +128 E 0.242 +129 G 0.339 +130 G 0.428 +131 G 0.491 +132 G 0.525 +133 T 0.543 +134 V 0.563 +135 M 0.599 +136 G 0.646 +137 T 0.682 +138 G 0.701 +139 G 0.710 +140 G 0.713 +141 G 0.712 +142 T 0.706 +143 A 0.697 +144 S 0.688 +145 G 0.675 +146 G 0.655 +147 A 0.628 +148 G 0.592 +149 A 0.534 +150 G 0.442 +151 V 0.335 +152 C 0.247 +153 E 0.188 +154 L 0.149 +155 D 0.124 +156 F 0.109 +157 V 0.099 +158 G 0.086 +159 P 0.069 +160 E 0.055 +161 A 0.050 +162 L 0.052 +163 G 0.056 +164 A 0.057 +165 L 0.056 +166 L 0.054 +167 E 0.049 +168 F 0.045 +169 A 0.042 +170 Y 0.045 +171 T 0.047 +172 A 0.048 +173 T 0.047 +174 L 0.046 +175 T 0.046 +176 T 0.047 +177 S 0.049 +178 S 0.051 +179 A 0.052 +180 N 0.049 +181 M 0.043 +182 P 0.036 +183 A 0.032 +184 V 0.029 +185 L 0.027 +186 Q 0.029 +187 A 0.034 +188 A 0.036 +189 R 0.033 +190 L 0.031 +191 L 0.031 +192 E 0.034 +193 I 0.035 +194 P 0.033 +195 C 0.030 +196 V 0.028 +197 I 0.029 +198 A 0.033 +199 A 0.038 +200 C 0.045 +201 M 0.052 +202 E 0.063 +203 I 0.080 +204 L 0.115 +205 Q 0.176 +206 G 0.254 +207 S 0.332 +208 G 0.393 +209 L 0.431 +210 E 0.447 +211 A 0.446 +212 P 0.429 +213 S 0.397 +214 P 0.358 +215 D 0.322 +216 E 0.286 +217 D 0.238 +218 D 0.184 +219 C 0.140 +220 E 0.111 +221 R 0.094 +222 A 0.091 +223 R 0.100 +224 Q 0.111 +225 Y 0.116 +226 L 0.118 +227 E 0.127 +228 A 0.149 +229 F 0.187 +230 A 0.238 +231 T 0.306 +232 A 0.393 +233 T 0.489 +234 T 0.571 +235 T 0.626 +236 A 0.658 +237 S 0.676 +238 T 0.689 +239 S 0.697 +240 G 0.704 +241 M 0.715 +242 P 0.733 +243 N 0.751 +244 G 0.754 +245 E 0.735 +246 D 0.702 +247 S 0.674 +248 P 0.669 +249 P 0.683 +250 Q 0.699 +251 V 0.703 +252 P 0.693 +253 L 0.669 +254 L 0.636 +255 P 0.600 +256 P 0.569 +257 P 0.553 +258 P 0.560 +259 P 0.589 +260 P 0.634 +261 P 0.683 +262 R 0.729 +263 P 0.766 +264 V 0.788 +265 A 0.793 +266 R 0.786 +267 R 0.769 +268 S 0.748 +269 R 0.732 +270 K 0.731 +271 P 0.744 +272 R 0.761 +273 K 0.770 +274 A 0.755 +275 F 0.707 +276 L 0.644 +277 Q 0.620 +278 T 0.664 +279 K 0.739 +280 G 0.793 +281 A 0.815 +282 R 0.817 +283 A 0.810 +284 N 0.797 +285 H 0.779 +286 L 0.761 +287 V 0.750 +288 P 0.749 +289 E 0.753 +290 A 0.759 +291 P 0.766 +292 T 0.773 +293 V 0.773 +294 L 0.763 +295 T 0.748 +296 H 0.737 +297 P 0.734 +298 L 0.739 +299 T 0.745 +300 Y 0.744 +301 E 0.723 +302 E 0.673 +303 E 0.611 +304 E 0.583 +305 M 0.615 +306 V 0.678 +307 G 0.729 +308 R 0.756 +309 L 0.770 +310 G 0.779 +311 N 0.785 +312 S 0.788 +313 G 0.790 +314 G 0.794 +315 S 0.800 +316 G 0.805 +317 L 0.807 +318 G 0.807 +319 D 0.802 +320 S 0.783 +321 Y 0.757 +322 S 0.742 +323 P 0.750 +324 P 0.775 +325 T 0.803 +326 G 0.820 +327 A 0.821 +328 A 0.811 +329 S 0.797 +330 P 0.787 +331 A 0.780 +332 E 0.772 +333 G 0.763 +334 P 0.758 +335 L 0.758 +336 N 0.761 +337 Y 0.762 +338 E 0.763 +339 V 0.765 +340 F 0.772 +341 E 0.783 +342 G 0.795 +343 E 0.801 +344 E 0.804 +345 E 0.806 +346 E 0.809 +347 E 0.809 +348 E 0.798 +349 M 0.775 +350 A 0.745 +351 Y 0.722 +352 P 0.720 +353 P 0.740 +354 G 0.767 +355 Y 0.787 +356 G 0.798 +357 L 0.802 +358 A 0.800 +359 Q 0.794 +360 S 0.786 +361 N 0.778 +362 E 0.772 +363 P 0.768 +364 S 0.760 +365 L 0.748 +366 S 0.742 +367 P 0.751 +368 E 0.770 +369 E 0.789 +370 L 0.797 +371 G 0.793 +372 S 0.776 +373 D 0.750 +374 E 0.722 +375 D 0.688 +376 P 0.630 +377 I 0.539 +378 D 0.435 +379 P 0.357 +380 D 0.311 +381 L 0.279 +382 M 0.254 +383 A 0.244 +384 Y 0.247 +385 L 0.253 +386 S 0.269 +387 S 0.315 +388 L 0.397 +389 H 0.495 +390 Q 0.584 +391 D 0.652 +392 A 0.692 +393 L 0.709 +394 T 0.719 +395 P 0.735 +396 G 0.756 +397 L 0.773 +398 D 0.780 +399 G 0.775 +400 Q 0.765 +401 D 0.753 +402 K 0.738 +403 L 0.715 +404 V 0.687 +405 R 0.661 +406 K 0.647 +407 R 0.634 +408 R 0.603 +409 S 0.542 +410 Q 0.454 +411 M 0.349 +412 P 0.245 +413 Q 0.162 +414 E 0.111 +415 C 0.084 +416 P 0.070 +417 V 0.065 +418 C 0.067 +419 H 0.075 +420 K 0.082 +421 I 0.089 +422 I 0.102 +423 H 0.126 +424 G 0.160 +425 A 0.194 +426 G 0.216 +427 K 0.220 +428 L 0.207 +429 P 0.188 +430 R 0.170 +431 H 0.160 +432 M 0.161 +433 R 0.172 +434 T 0.193 +435 H 0.226 +436 T 0.262 +437 G 0.273 +438 E 0.246 +439 K 0.196 +440 P 0.148 +441 F 0.118 +442 A 0.099 +443 C 0.083 +444 E 0.070 +445 V 0.065 +446 C 0.070 +447 G 0.079 +448 V 0.088 +449 R 0.096 +450 F 0.105 +451 T 0.115 +452 R 0.125 +453 N 0.132 +454 D 0.138 +455 K 0.143 +456 L 0.140 +457 K 0.129 +458 I 0.113 +459 H 0.103 +460 M 0.107 +461 R 0.119 +462 K 0.136 +463 H 0.158 +464 T 0.185 +465 G 0.202 +466 E 0.195 +467 R 0.164 +468 P 0.129 +469 Y 0.104 +470 S 0.093 +471 C 0.087 +472 P 0.085 +473 H 0.083 +474 C 0.080 +475 P 0.082 +476 A 0.091 +477 R 0.103 +478 F 0.111 +479 L 0.115 +480 H 0.119 +481 S 0.127 +482 Y 0.140 +483 D 0.155 +484 L 0.164 +485 K 0.160 +486 N 0.145 +487 H 0.132 +488 M 0.138 +489 H 0.158 +490 L 0.179 +491 H 0.196 +492 T 0.218 +493 G 0.238 +494 D 0.238 +495 R 0.210 +496 P 0.169 +497 Y 0.133 +498 E 0.107 +499 C 0.090 +500 H 0.083 +501 L 0.088 +502 C 0.102 +503 H 0.115 +504 K 0.122 +505 A 0.126 +506 F 0.131 +507 A 0.132 +508 K 0.126 +509 E 0.114 +510 D 0.101 +511 H 0.094 +512 L 0.091 +513 Q 0.093 +514 R 0.099 +515 H 0.107 +516 L 0.120 +517 K 0.140 +518 G 0.167 +519 Q 0.193 +520 N 0.217 +521 C 0.252 +522 L 0.314 +523 E 0.397 +524 V 0.478 +525 R 0.536 +526 T 0.571 +527 R 0.599 +528 R 0.627 +529 R 0.654 +530 R 0.675 +531 K 0.688 +532 D 0.693 +533 D 0.692 +534 V 0.680 +535 A 0.658 +536 A 0.629 +537 P 0.598 +538 H 0.569 +539 Y 0.556 +540 P 0.574 +541 P 0.620 +542 P 0.679 +543 S 0.730 +544 T 0.761 +545 T 0.766 +546 T 0.753 +547 S 0.739 +548 S 0.740 +549 P 0.757 +550 A 0.777 +551 G 0.787 +552 L 0.780 +553 D 0.765 +554 L 0.751 +555 S 0.746 +556 N 0.745 +557 G 0.739 +558 H 0.723 +559 L 0.696 +560 D 0.648 +561 T 0.570 +562 F 0.481 +563 H 0.413 +564 L 0.371 +565 S 0.335 +566 L 0.296 +567 A 0.272 +568 R 0.273 +569 F 0.297 +570 W 0.344 +571 E 0.414 +572 Q 0.484 +573 S 0.530 +574 A 0.543 +575 T 0.539 +576 T 0.541 +577 G 0.565 +578 P 0.615 +579 P 0.674 +580 V 0.717 +581 T 0.726 +582 T 0.706 +583 Q 0.677 +584 G 0.650 +585 P 0.617 +586 P 0.580 +587 E 0.569 +588 E 0.595 +589 E 0.614 +590 E 0.595 +591 E 0.579 +592 E 0.605 +593 G 0.645 +594 T 0.668 +595 P 0.679 +596 T 0.693 +597 T 0.712 +598 P 0.737 +599 Q 0.765 +600 A 0.789 +601 E 0.806 +602 G 0.815 +603 A 0.815 +604 M 0.803 +605 E 0.778 +606 S 0.744 +607 S 0.718 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028057.15_ENSMUST00000029692.15_GN:Rit1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028057.15_ENSMUST00000029692.15_GN:Rit1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..64e4d30b0af229a087308ead4e1d42b0914b2331 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028057.15_ENSMUST00000029692.15_GN:Rit1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,220 @@ +>ENSMUSG00000028057.15|ENSMUST00000029692.15|GN:Rit1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.472 +2 E 0.501 +3 S 0.541 +4 G 0.572 +5 A 0.589 +6 R 0.605 +7 P 0.632 +8 I 0.662 +9 G 0.680 +10 S 0.677 +11 S 0.657 +12 C 0.632 +13 S 0.614 +14 S 0.610 +15 P 0.616 +16 A 0.609 +17 A 0.564 +18 L 0.469 +19 S 0.337 +20 R 0.206 +21 E 0.110 +22 Y 0.057 +23 K 0.034 +24 L 0.028 +25 V 0.030 +26 M 0.035 +27 L 0.042 +28 G 0.053 +29 A 0.070 +30 G 0.088 +31 G 0.098 +32 V 0.098 +33 G 0.094 +34 K 0.092 +35 S 0.094 +36 A 0.099 +37 M 0.107 +38 T 0.112 +39 M 0.109 +40 Q 0.102 +41 F 0.097 +42 I 0.092 +43 S 0.091 +44 H 0.094 +45 R 0.102 +46 F 0.112 +47 P 0.125 +48 E 0.148 +49 D 0.175 +50 H 0.194 +51 D 0.195 +52 P 0.181 +53 T 0.155 +54 I 0.122 +55 E 0.091 +56 D 0.071 +57 A 0.058 +58 Y 0.047 +59 K 0.040 +60 I 0.036 +61 R 0.038 +62 I 0.043 +63 R 0.049 +64 I 0.058 +65 D 0.070 +66 D 0.086 +67 E 0.096 +68 P 0.094 +69 A 0.079 +70 N 0.060 +71 L 0.045 +72 D 0.036 +73 I 0.036 +74 L 0.046 +75 D 0.069 +76 T 0.106 +77 A 0.143 +78 G 0.166 +79 Q 0.169 +80 A 0.158 +81 E 0.146 +82 F 0.134 +83 T 0.117 +84 A 0.098 +85 M 0.080 +86 R 0.062 +87 D 0.048 +88 Q 0.040 +89 Y 0.039 +90 M 0.044 +91 R 0.054 +92 A 0.063 +93 G 0.068 +94 E 0.066 +95 G 0.055 +96 F 0.043 +97 I 0.037 +98 I 0.035 +99 C 0.035 +100 Y 0.037 +101 S 0.040 +102 I 0.043 +103 T 0.044 +104 D 0.041 +105 R 0.038 +106 R 0.037 +107 S 0.038 +108 F 0.038 +109 H 0.036 +110 E 0.032 +111 V 0.028 +112 R 0.024 +113 E 0.023 +114 F 0.027 +115 K 0.037 +116 Q 0.043 +117 L 0.040 +118 I 0.033 +119 Y 0.031 +120 R 0.034 +121 V 0.037 +122 R 0.038 +123 R 0.043 +124 T 0.056 +125 D 0.072 +126 D 0.079 +127 T 0.071 +128 P 0.054 +129 V 0.040 +130 V 0.034 +131 L 0.034 +132 V 0.035 +133 G 0.034 +134 N 0.033 +135 K 0.037 +136 S 0.043 +137 D 0.047 +138 L 0.047 +139 K 0.047 +140 Q 0.048 +141 L 0.048 +142 R 0.047 +143 Q 0.050 +144 V 0.057 +145 S 0.066 +146 K 0.072 +147 E 0.072 +148 E 0.067 +149 G 0.065 +150 L 0.070 +151 S 0.073 +152 L 0.070 +153 A 0.064 +154 R 0.058 +155 E 0.051 +156 F 0.051 +157 S 0.059 +158 C 0.065 +159 P 0.060 +160 F 0.048 +161 F 0.041 +162 E 0.039 +163 T 0.039 +164 S 0.042 +165 A 0.047 +166 A 0.053 +167 Y 0.057 +168 R 0.058 +169 Y 0.058 +170 Y 0.056 +171 I 0.050 +172 D 0.042 +173 D 0.037 +174 V 0.035 +175 F 0.036 +176 H 0.038 +177 A 0.038 +178 L 0.036 +179 V 0.032 +180 R 0.031 +181 E 0.035 +182 I 0.045 +183 R 0.059 +184 K 0.070 +185 K 0.070 +186 E 0.067 +187 K 0.076 +188 E 0.100 +189 L 0.131 +190 V 0.158 +191 L 0.179 +192 A 0.202 +193 M 0.230 +194 E 0.262 +195 K 0.299 +196 K 0.342 +197 A 0.391 +198 K 0.439 +199 P 0.479 +200 K 0.502 +201 N 0.499 +202 S 0.472 +203 V 0.431 +204 W 0.393 +205 K 0.373 +206 R 0.373 +207 L 0.387 +208 K 0.414 +209 S 0.453 +210 P 0.497 +211 F 0.537 +212 R 0.572 +213 R 0.602 +214 K 0.626 +215 K 0.642 +216 D 0.646 +217 S 0.628 +218 V 0.584 +219 T 0.539 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028057.15_ENSMUST00000029692.15_GN:Rit1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:50.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028057.15_ENSMUST00000029692.15_GN:Rit1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:50.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..47baebe3f320c524068266fb0f9b00df555e9e81 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028057.15_ENSMUST00000029692.15_GN:Rit1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:50.caid @@ -0,0 +1,270 @@ +>ENSMUSG00000028057.15|ENSMUST00000029692.15|GN:Rit1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:50 +1 M 0.389 +2 P 0.396 +3 R 0.405 +4 P 0.411 +5 P 0.417 +6 A 0.444 +7 P 0.498 +8 S 0.539 +9 S 0.537 +10 R 0.523 +11 T 0.538 +12 R 0.563 +13 A 0.564 +14 G 0.532 +15 P 0.473 +16 W 0.414 +17 A 0.397 +18 V 0.434 +19 G 0.481 +20 R 0.501 +21 S 0.502 +22 W 0.514 +23 E 0.543 +24 R 0.573 +25 N 0.590 +26 A 0.586 +27 G 0.561 +28 Y 0.534 +29 H 0.521 +30 P 0.522 +31 A 0.532 +32 S 0.552 +33 K 0.576 +34 L 0.590 +35 V 0.587 +36 S 0.578 +37 E 0.564 +38 E 0.537 +39 A 0.494 +40 F 0.454 +41 P 0.440 +42 R 0.466 +43 G 0.518 +44 P 0.565 +45 G 0.583 +46 L 0.573 +47 P 0.546 +48 R 0.522 +49 R 0.529 +50 T 0.582 +51 M 0.649 +52 E 0.697 +53 S 0.716 +54 G 0.713 +55 A 0.703 +56 R 0.706 +57 P 0.728 +58 I 0.758 +59 G 0.775 +60 S 0.773 +61 S 0.755 +62 C 0.728 +63 S 0.704 +64 S 0.691 +65 P 0.687 +66 A 0.673 +67 A 0.622 +68 L 0.517 +69 S 0.369 +70 R 0.223 +71 E 0.116 +72 Y 0.058 +73 K 0.034 +74 L 0.027 +75 V 0.029 +76 M 0.034 +77 L 0.041 +78 G 0.052 +79 A 0.068 +80 G 0.086 +81 G 0.095 +82 V 0.094 +83 G 0.089 +84 K 0.087 +85 S 0.088 +86 A 0.093 +87 M 0.102 +88 T 0.107 +89 M 0.104 +90 Q 0.096 +91 F 0.089 +92 I 0.083 +93 S 0.078 +94 H 0.077 +95 R 0.083 +96 F 0.091 +97 P 0.103 +98 E 0.121 +99 D 0.144 +100 H 0.160 +101 D 0.162 +102 P 0.151 +103 T 0.129 +104 I 0.101 +105 E 0.075 +106 D 0.058 +107 A 0.048 +108 Y 0.041 +109 K 0.036 +110 I 0.033 +111 R 0.033 +112 I 0.035 +113 R 0.039 +114 I 0.046 +115 D 0.059 +116 D 0.074 +117 E 0.085 +118 P 0.085 +119 A 0.072 +120 N 0.055 +121 L 0.041 +122 D 0.033 +123 I 0.033 +124 L 0.042 +125 D 0.063 +126 T 0.096 +127 A 0.132 +128 G 0.154 +129 Q 0.158 +130 A 0.150 +131 E 0.141 +132 F 0.130 +133 T 0.115 +134 A 0.096 +135 M 0.077 +136 R 0.059 +137 D 0.045 +138 Q 0.037 +139 Y 0.036 +140 M 0.041 +141 R 0.051 +142 A 0.061 +143 G 0.068 +144 E 0.066 +145 G 0.055 +146 F 0.043 +147 I 0.036 +148 I 0.034 +149 C 0.034 +150 Y 0.035 +151 S 0.037 +152 I 0.040 +153 T 0.041 +154 D 0.039 +155 R 0.037 +156 R 0.037 +157 S 0.038 +158 F 0.037 +159 H 0.035 +160 E 0.031 +161 V 0.027 +162 R 0.023 +163 E 0.019 +164 F 0.017 +165 K 0.016 +166 Q 0.017 +167 L 0.020 +168 I 0.024 +169 Y 0.030 +170 R 0.035 +171 V 0.039 +172 R 0.040 +173 R 0.044 +174 T 0.057 +175 D 0.073 +176 D 0.079 +177 T 0.071 +178 P 0.054 +179 V 0.040 +180 V 0.033 +181 L 0.033 +182 V 0.034 +183 G 0.033 +184 N 0.032 +185 K 0.035 +186 S 0.041 +187 D 0.045 +188 L 0.046 +189 K 0.046 +190 Q 0.047 +191 L 0.046 +192 R 0.046 +193 Q 0.047 +194 V 0.052 +195 S 0.055 +196 K 0.053 +197 E 0.048 +198 E 0.047 +199 G 0.053 +200 L 0.064 +201 S 0.067 +202 L 0.058 +203 A 0.043 +204 R 0.032 +205 E 0.029 +206 F 0.037 +207 S 0.049 +208 C 0.054 +209 P 0.049 +210 F 0.039 +211 F 0.035 +212 E 0.035 +213 T 0.036 +214 S 0.038 +215 A 0.043 +216 A 0.048 +217 Y 0.051 +218 R 0.052 +219 Y 0.051 +220 Y 0.050 +221 I 0.045 +222 D 0.039 +223 D 0.035 +224 V 0.034 +225 F 0.034 +226 H 0.035 +227 A 0.035 +228 L 0.034 +229 V 0.030 +230 R 0.030 +231 E 0.034 +232 I 0.044 +233 R 0.058 +234 K 0.069 +235 K 0.068 +236 E 0.065 +237 K 0.073 +238 E 0.098 +239 L 0.130 +240 V 0.158 +241 L 0.181 +242 A 0.207 +243 M 0.236 +244 E 0.269 +245 K 0.305 +246 K 0.348 +247 A 0.395 +248 K 0.442 +249 P 0.484 +250 K 0.509 +251 N 0.509 +252 S 0.483 +253 V 0.442 +254 W 0.405 +255 K 0.388 +256 R 0.390 +257 L 0.405 +258 K 0.433 +259 S 0.471 +260 P 0.514 +261 F 0.555 +262 R 0.590 +263 R 0.619 +264 K 0.643 +265 K 0.658 +266 D 0.661 +267 S 0.643 +268 V 0.598 +269 T 0.553 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028322.12_ENSMUST00000030003.10_GN:Exosc3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028322.12_ENSMUST00000030003.10_GN:Exosc3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f5a371bcaad7dc765d1ee42715bf7bcd2577a310 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028322.12_ENSMUST00000030003.10_GN:Exosc3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,275 @@ +>ENSMUSG00000028322.12|ENSMUST00000030003.10|GN:Exosc3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.365 +2 A 0.388 +3 E 0.426 +4 V 0.466 +5 L 0.492 +6 S 0.501 +7 A 0.504 +8 G 0.510 +9 P 0.518 +10 E 0.528 +11 S 0.537 +12 V 0.542 +13 A 0.536 +14 G 0.515 +15 C 0.468 +16 R 0.395 +17 A 0.310 +18 R 0.229 +19 A 0.168 +20 V 0.126 +21 H 0.098 +22 K 0.080 +23 V 0.073 +24 L 0.074 +25 N 0.081 +26 Q 0.091 +27 V 0.100 +28 V 0.104 +29 L 0.102 +30 P 0.094 +31 G 0.087 +32 E 0.080 +33 E 0.076 +34 L 0.083 +35 V 0.111 +36 L 0.167 +37 P 0.245 +38 D 0.337 +39 H 0.434 +40 E 0.522 +41 D 0.592 +42 V 0.645 +43 D 0.683 +44 G 0.706 +45 L 0.719 +46 G 0.726 +47 G 0.723 +48 A 0.706 +49 G 0.678 +50 E 0.647 +51 Q 0.623 +52 P 0.616 +53 L 0.626 +54 R 0.643 +55 L 0.654 +56 N 0.646 +57 A 0.618 +58 G 0.581 +59 A 0.544 +60 R 0.512 +61 P 0.474 +62 R 0.415 +63 L 0.337 +64 R 0.261 +65 V 0.204 +66 V 0.165 +67 C 0.142 +68 G 0.131 +69 P 0.124 +70 G 0.114 +71 L 0.103 +72 R 0.094 +73 R 0.087 +74 C 0.078 +75 G 0.069 +76 D 0.062 +77 R 0.059 +78 L 0.059 +79 L 0.061 +80 V 0.066 +81 T 0.075 +82 K 0.088 +83 C 0.100 +84 G 0.106 +85 R 0.102 +86 L 0.096 +87 R 0.100 +88 H 0.120 +89 K 0.158 +90 E 0.209 +91 P 0.264 +92 S 0.314 +93 G 0.345 +94 G 0.348 +95 G 0.320 +96 G 0.269 +97 G 0.210 +98 V 0.163 +99 Y 0.143 +100 W 0.152 +101 V 0.177 +102 D 0.197 +103 S 0.202 +104 Q 0.195 +105 Q 0.183 +106 K 0.170 +107 R 0.154 +108 Y 0.139 +109 V 0.131 +110 P 0.130 +111 V 0.128 +112 K 0.124 +113 G 0.116 +114 D 0.104 +115 H 0.086 +116 V 0.069 +117 I 0.056 +118 G 0.048 +119 I 0.044 +120 V 0.045 +121 I 0.053 +122 A 0.066 +123 K 0.079 +124 S 0.082 +125 G 0.073 +126 D 0.055 +127 I 0.041 +128 F 0.035 +129 K 0.036 +130 V 0.041 +131 D 0.046 +132 V 0.052 +133 G 0.064 +134 G 0.078 +135 S 0.088 +136 E 0.087 +137 P 0.078 +138 A 0.068 +139 S 0.062 +140 L 0.062 +141 S 0.067 +142 Y 0.077 +143 L 0.097 +144 A 0.124 +145 F 0.147 +146 E 0.155 +147 G 0.156 +148 A 0.153 +149 T 0.146 +150 K 0.137 +151 R 0.135 +152 N 0.144 +153 R 0.155 +154 P 0.159 +155 N 0.153 +156 V 0.142 +157 Q 0.132 +158 V 0.130 +159 G 0.135 +160 D 0.134 +161 L 0.119 +162 I 0.095 +163 Y 0.072 +164 G 0.058 +165 Q 0.054 +166 C 0.057 +167 V 0.067 +168 V 0.086 +169 A 0.110 +170 N 0.126 +171 K 0.135 +172 D 0.144 +173 M 0.152 +174 E 0.150 +175 P 0.137 +176 E 0.122 +177 M 0.120 +178 V 0.137 +179 C 0.168 +180 I 0.199 +181 D 0.219 +182 S 0.227 +183 C 0.228 +184 G 0.227 +185 R 0.234 +186 A 0.250 +187 N 0.263 +188 G 0.268 +189 M 0.263 +190 G 0.245 +191 V 0.216 +192 I 0.189 +193 G 0.173 +194 Q 0.160 +195 D 0.142 +196 G 0.120 +197 L 0.099 +198 L 0.084 +199 F 0.076 +200 K 0.073 +201 V 0.066 +202 T 0.052 +203 L 0.039 +204 G 0.033 +205 L 0.035 +206 I 0.042 +207 R 0.051 +208 K 0.060 +209 L 0.072 +210 L 0.090 +211 A 0.112 +212 P 0.127 +213 D 0.122 +214 C 0.099 +215 E 0.073 +216 I 0.058 +217 V 0.057 +218 Q 0.060 +219 E 0.057 +220 L 0.051 +221 G 0.047 +222 K 0.048 +223 L 0.049 +224 Y 0.048 +225 P 0.044 +226 L 0.041 +227 E 0.040 +228 I 0.040 +229 V 0.039 +230 F 0.039 +231 G 0.042 +232 M 0.048 +233 N 0.057 +234 G 0.062 +235 R 0.062 +236 I 0.061 +237 W 0.062 +238 V 0.067 +239 K 0.072 +240 A 0.076 +241 K 0.076 +242 T 0.072 +243 I 0.063 +244 Q 0.054 +245 Q 0.048 +246 T 0.048 +247 L 0.053 +248 I 0.059 +249 L 0.064 +250 A 0.064 +251 N 0.062 +252 V 0.059 +253 L 0.058 +254 E 0.057 +255 A 0.058 +256 C 0.059 +257 E 0.060 +258 H 0.060 +259 M 0.061 +260 T 0.067 +261 T 0.077 +262 E 0.083 +263 Q 0.076 +264 R 0.068 +265 K 0.069 +266 Q 0.077 +267 I 0.084 +268 F 0.092 +269 A 0.102 +270 R 0.111 +271 L 0.123 +272 A 0.144 +273 E 0.171 +274 S 0.192 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028322.12_ENSMUST00000030003.10_GN:Exosc3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028322.12_ENSMUST00000030003.10_GN:Exosc3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2098f75392736a9a8c1e52564ee4e1ffee65a4f4 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028322.12_ENSMUST00000030003.10_GN:Exosc3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid @@ -0,0 +1,280 @@ +>ENSMUSG00000028322.12|ENSMUST00000030003.10|GN:Exosc3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:5 +1 M 0.318 +2 V 0.327 +3 T 0.347 +4 P 0.370 +5 A 0.372 +6 M 0.343 +7 A 0.310 +8 E 0.307 +9 V 0.338 +10 L 0.377 +11 S 0.404 +12 A 0.416 +13 G 0.420 +14 P 0.428 +15 E 0.444 +16 S 0.464 +17 V 0.475 +18 A 0.470 +19 G 0.446 +20 C 0.399 +21 R 0.334 +22 A 0.261 +23 R 0.194 +24 A 0.144 +25 V 0.109 +26 H 0.086 +27 K 0.071 +28 V 0.066 +29 L 0.068 +30 N 0.075 +31 Q 0.085 +32 V 0.095 +33 V 0.100 +34 L 0.099 +35 P 0.092 +36 G 0.085 +37 E 0.079 +38 E 0.076 +39 L 0.083 +40 V 0.113 +41 L 0.170 +42 P 0.247 +43 D 0.339 +44 H 0.434 +45 E 0.522 +46 D 0.592 +47 V 0.647 +48 D 0.686 +49 G 0.710 +50 L 0.724 +51 G 0.732 +52 G 0.729 +53 A 0.712 +54 G 0.684 +55 E 0.652 +56 Q 0.627 +57 P 0.619 +58 L 0.627 +59 R 0.644 +60 L 0.653 +61 N 0.642 +62 A 0.612 +63 G 0.572 +64 A 0.534 +65 R 0.501 +66 P 0.463 +67 R 0.404 +68 L 0.326 +69 R 0.251 +70 V 0.196 +71 V 0.160 +72 C 0.139 +73 G 0.128 +74 P 0.121 +75 G 0.111 +76 L 0.099 +77 R 0.090 +78 R 0.083 +79 C 0.076 +80 G 0.067 +81 D 0.060 +82 R 0.058 +83 L 0.058 +84 L 0.059 +85 V 0.064 +86 T 0.073 +87 K 0.085 +88 C 0.097 +89 G 0.102 +90 R 0.099 +91 L 0.093 +92 R 0.097 +93 H 0.117 +94 K 0.154 +95 E 0.203 +96 P 0.257 +97 S 0.305 +98 G 0.335 +99 G 0.339 +100 G 0.314 +101 G 0.265 +102 G 0.207 +103 V 0.160 +104 Y 0.140 +105 W 0.149 +106 V 0.174 +107 D 0.194 +108 S 0.199 +109 Q 0.193 +110 Q 0.183 +111 K 0.170 +112 R 0.155 +113 Y 0.140 +114 V 0.132 +115 P 0.130 +116 V 0.129 +117 K 0.124 +118 G 0.116 +119 D 0.104 +120 H 0.086 +121 V 0.068 +122 I 0.055 +123 G 0.048 +124 I 0.044 +125 V 0.045 +126 I 0.053 +127 A 0.066 +128 K 0.079 +129 S 0.083 +130 G 0.073 +131 D 0.056 +132 I 0.041 +133 F 0.035 +134 K 0.037 +135 V 0.042 +136 D 0.046 +137 V 0.053 +138 G 0.065 +139 G 0.079 +140 S 0.089 +141 E 0.088 +142 P 0.078 +143 A 0.067 +144 S 0.061 +145 L 0.061 +146 S 0.066 +147 Y 0.077 +148 L 0.097 +149 A 0.125 +150 F 0.147 +151 E 0.156 +152 G 0.157 +153 A 0.154 +154 T 0.147 +155 K 0.137 +156 R 0.136 +157 N 0.144 +158 R 0.155 +159 P 0.159 +160 N 0.154 +161 V 0.142 +162 Q 0.132 +163 V 0.130 +164 G 0.135 +165 D 0.135 +166 L 0.120 +167 I 0.095 +168 Y 0.072 +169 G 0.058 +170 Q 0.054 +171 C 0.057 +172 V 0.067 +173 V 0.087 +174 A 0.110 +175 N 0.126 +176 K 0.134 +177 D 0.143 +178 M 0.151 +179 E 0.149 +180 P 0.136 +181 E 0.122 +182 M 0.119 +183 V 0.136 +184 C 0.166 +185 I 0.197 +186 D 0.217 +187 S 0.225 +188 C 0.225 +189 G 0.225 +190 R 0.231 +191 A 0.245 +192 N 0.258 +193 G 0.262 +194 M 0.258 +195 G 0.241 +196 V 0.213 +197 I 0.186 +198 G 0.170 +199 Q 0.157 +200 D 0.140 +201 G 0.118 +202 L 0.097 +203 L 0.082 +204 F 0.075 +205 K 0.072 +206 V 0.065 +207 T 0.051 +208 L 0.039 +209 G 0.033 +210 L 0.035 +211 I 0.042 +212 R 0.050 +213 K 0.059 +214 L 0.070 +215 L 0.088 +216 A 0.111 +217 P 0.125 +218 D 0.121 +219 C 0.098 +220 E 0.072 +221 I 0.058 +222 V 0.058 +223 Q 0.061 +224 E 0.058 +225 L 0.051 +226 G 0.047 +227 K 0.047 +228 L 0.049 +229 Y 0.047 +230 P 0.044 +231 L 0.041 +232 E 0.040 +233 I 0.040 +234 V 0.040 +235 F 0.039 +236 G 0.042 +237 M 0.048 +238 N 0.056 +239 G 0.062 +240 R 0.062 +241 I 0.061 +242 W 0.063 +243 V 0.067 +244 K 0.072 +245 A 0.075 +246 K 0.075 +247 T 0.071 +248 I 0.062 +249 Q 0.053 +250 Q 0.048 +251 T 0.048 +252 L 0.052 +253 I 0.059 +254 L 0.063 +255 A 0.064 +256 N 0.062 +257 V 0.059 +258 L 0.058 +259 E 0.058 +260 A 0.058 +261 C 0.059 +262 E 0.060 +263 H 0.060 +264 M 0.061 +265 T 0.067 +266 T 0.077 +267 E 0.082 +268 Q 0.076 +269 R 0.068 +270 K 0.069 +271 Q 0.077 +272 I 0.084 +273 F 0.091 +274 A 0.101 +275 R 0.111 +276 L 0.123 +277 A 0.143 +278 E 0.171 +279 S 0.192 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028647.14_ENSMUST00000106202.4_GN:Mycbp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028647.14_ENSMUST00000106202.4_GN:Mycbp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..72e8d6af521ac322b957f3835e55333477d5e3a9 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028647.14_ENSMUST00000106202.4_GN:Mycbp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,147 @@ +>ENSMUSG00000028647.14|ENSMUST00000106202.4|GN:Mycbp|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.345 +2 A 0.352 +3 H 0.354 +4 Y 0.343 +5 K 0.317 +6 A 0.283 +7 A 0.249 +8 D 0.222 +9 S 0.194 +10 K 0.162 +11 R 0.134 +12 E 0.120 +13 Q 0.118 +14 F 0.124 +15 R 0.132 +16 R 0.134 +17 Y 0.131 +18 L 0.135 +19 E 0.149 +20 K 0.168 +21 S 0.183 +22 G 0.188 +23 V 0.179 +24 L 0.159 +25 D 0.140 +26 T 0.128 +27 L 0.117 +28 T 0.102 +29 K 0.086 +30 V 0.076 +31 L 0.071 +32 V 0.069 +33 A 0.071 +34 L 0.076 +35 Y 0.083 +36 E 0.091 +37 E 0.103 +38 P 0.118 +39 E 0.131 +40 K 0.137 +41 P 0.135 +42 T 0.130 +43 S 0.124 +44 A 0.115 +45 L 0.105 +46 D 0.095 +47 F 0.091 +48 L 0.093 +49 K 0.101 +50 H 0.118 +51 H 0.159 +52 L 0.238 +53 G 0.350 +54 A 0.463 +55 A 0.539 +56 T 0.560 +57 P 0.539 +58 E 0.490 +59 N 0.433 +60 P 0.382 +61 E 0.345 +62 I 0.325 +63 E 0.314 +64 L 0.299 +65 L 0.276 +66 R 0.264 +67 L 0.266 +68 E 0.262 +69 L 0.236 +70 A 0.208 +71 E 0.199 +72 M 0.207 +73 K 0.217 +74 E 0.224 +75 K 0.224 +76 Y 0.222 +77 E 0.225 +78 A 0.224 +79 T 0.217 +80 V 0.215 +81 E 0.222 +82 E 0.225 +83 N 0.220 +84 K 0.208 +85 K 0.198 +86 L 0.196 +87 K 0.201 +88 A 0.206 +89 K 0.210 +90 V 0.212 +91 N 0.213 +92 L 0.211 +93 K 0.210 +94 K 0.214 +95 K 0.219 +96 L 0.223 +97 K 0.231 +98 L 0.244 +99 K 0.263 +100 N 0.283 +101 N 0.298 +102 L 0.312 +103 V 0.329 +104 S 0.341 +105 N 0.337 +106 D 0.319 +107 Y 0.298 +108 L 0.277 +109 T 0.259 +110 K 0.254 +111 S 0.265 +112 L 0.285 +113 L 0.314 +114 Q 0.349 +115 A 0.367 +116 R 0.370 +117 D 0.383 +118 V 0.410 +119 C 0.431 +120 S 0.445 +121 S 0.454 +122 V 0.446 +123 V 0.420 +124 E 0.401 +125 H 0.408 +126 L 0.439 +127 S 0.486 +128 G 0.537 +129 M 0.575 +130 C 0.590 +131 K 0.593 +132 G 0.605 +133 P 0.637 +134 G 0.675 +135 S 0.702 +136 H 0.713 +137 L 0.716 +138 Q 0.718 +139 H 0.718 +140 D 0.716 +141 K 0.710 +142 T 0.700 +143 R 0.683 +144 V 0.640 +145 N 0.571 +146 N 0.511 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028647.14_ENSMUST00000106202.4_GN:Mycbp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028647.14_ENSMUST00000106202.4_GN:Mycbp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c562005410f147ffd88db4529f6602fb75305557 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028647.14_ENSMUST00000106202.4_GN:Mycbp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid @@ -0,0 +1,170 @@ +>ENSMUSG00000028647.14|ENSMUST00000106202.4|GN:Mycbp|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:23 +1 M 0.472 +2 S 0.502 +3 S 0.543 +4 E 0.566 +5 A 0.555 +6 W 0.530 +7 S 0.530 +8 P 0.575 +9 P 0.640 +10 A 0.691 +11 R 0.713 +12 V 0.714 +13 S 0.703 +14 G 0.680 +15 A 0.634 +16 S 0.564 +17 Y 0.491 +18 A 0.447 +19 A 0.444 +20 V 0.463 +21 A 0.474 +22 V 0.459 +23 T 0.417 +24 M 0.369 +25 A 0.332 +26 H 0.303 +27 Y 0.276 +28 K 0.245 +29 A 0.211 +30 A 0.185 +31 D 0.169 +32 S 0.154 +33 K 0.135 +34 R 0.121 +35 E 0.112 +36 Q 0.110 +37 F 0.115 +38 R 0.123 +39 R 0.128 +40 Y 0.126 +41 L 0.129 +42 E 0.142 +43 K 0.159 +44 S 0.174 +45 G 0.181 +46 V 0.174 +47 L 0.157 +48 D 0.139 +49 T 0.128 +50 L 0.119 +51 T 0.104 +52 K 0.089 +53 V 0.078 +54 L 0.073 +55 V 0.071 +56 A 0.073 +57 L 0.078 +58 Y 0.085 +59 E 0.094 +60 E 0.105 +61 P 0.120 +62 E 0.132 +63 K 0.138 +64 P 0.135 +65 T 0.130 +66 S 0.122 +67 A 0.112 +68 L 0.101 +69 D 0.090 +70 F 0.085 +71 L 0.087 +72 K 0.095 +73 H 0.111 +74 H 0.151 +75 L 0.226 +76 G 0.336 +77 A 0.450 +78 A 0.528 +79 T 0.553 +80 P 0.531 +81 E 0.481 +82 N 0.422 +83 P 0.372 +84 E 0.336 +85 I 0.317 +86 E 0.308 +87 L 0.294 +88 L 0.272 +89 R 0.261 +90 L 0.265 +91 E 0.262 +92 L 0.237 +93 A 0.207 +94 E 0.196 +95 M 0.202 +96 K 0.210 +97 E 0.214 +98 K 0.211 +99 Y 0.205 +100 E 0.203 +101 A 0.199 +102 T 0.192 +103 V 0.192 +104 E 0.201 +105 E 0.207 +106 N 0.203 +107 K 0.194 +108 K 0.186 +109 L 0.184 +110 K 0.188 +111 A 0.193 +112 K 0.196 +113 V 0.199 +114 N 0.202 +115 L 0.203 +116 K 0.204 +117 K 0.211 +118 K 0.220 +119 L 0.229 +120 K 0.240 +121 L 0.257 +122 K 0.278 +123 N 0.297 +124 N 0.312 +125 L 0.326 +126 V 0.343 +127 S 0.354 +128 N 0.349 +129 D 0.330 +130 Y 0.308 +131 L 0.286 +132 T 0.268 +133 K 0.262 +134 S 0.270 +135 L 0.285 +136 L 0.311 +137 Q 0.346 +138 A 0.367 +139 R 0.373 +140 D 0.388 +141 V 0.414 +142 C 0.433 +143 S 0.445 +144 S 0.455 +145 V 0.450 +146 V 0.425 +147 E 0.405 +148 H 0.414 +149 L 0.448 +150 S 0.496 +151 G 0.548 +152 M 0.586 +153 C 0.601 +154 K 0.604 +155 G 0.615 +156 P 0.645 +157 G 0.683 +158 S 0.709 +159 H 0.720 +160 L 0.723 +161 Q 0.723 +162 H 0.722 +163 D 0.720 +164 K 0.713 +165 T 0.704 +166 R 0.685 +167 V 0.642 +168 N 0.572 +169 N 0.512 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028648.14_ENSMUST00000106207.8_GN:Ndufs5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028648.14_ENSMUST00000106207.8_GN:Ndufs5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..07df6ca30b6c20786de05b385e10673fbd31f009 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028648.14_ENSMUST00000106207.8_GN:Ndufs5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,107 @@ +>ENSMUSG00000028648.14|ENSMUST00000106207.8|GN:Ndufs5|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.345 +2 P 0.333 +3 F 0.315 +4 L 0.293 +5 D 0.262 +6 I 0.232 +7 Q 0.219 +8 K 0.230 +9 K 0.256 +10 L 0.283 +11 G 0.300 +12 I 0.297 +13 S 0.278 +14 L 0.252 +15 D 0.233 +16 R 0.233 +17 H 0.256 +18 F 0.295 +19 M 0.336 +20 F 0.364 +21 L 0.367 +22 S 0.344 +23 A 0.304 +24 E 0.267 +25 Q 0.240 +26 P 0.223 +27 Y 0.216 +28 K 0.224 +29 N 0.238 +30 A 0.236 +31 A 0.208 +32 R 0.166 +33 C 0.130 +34 H 0.107 +35 A 0.097 +36 F 0.098 +37 E 0.109 +38 K 0.115 +39 E 0.107 +40 W 0.092 +41 I 0.083 +42 E 0.080 +43 C 0.086 +44 A 0.106 +45 H 0.135 +46 G 0.160 +47 I 0.171 +48 G 0.165 +49 G 0.146 +50 T 0.120 +51 R 0.098 +52 A 0.083 +53 K 0.072 +54 K 0.062 +55 E 0.057 +56 C 0.058 +57 K 0.064 +58 I 0.074 +59 E 0.086 +60 F 0.097 +61 D 0.102 +62 D 0.097 +63 F 0.085 +64 E 0.075 +65 E 0.068 +66 C 0.062 +67 L 0.061 +68 L 0.066 +69 R 0.074 +70 Y 0.088 +71 K 0.109 +72 T 0.134 +73 M 0.156 +74 R 0.175 +75 R 0.190 +76 M 0.199 +77 H 0.202 +78 D 0.202 +79 I 0.197 +80 K 0.184 +81 K 0.168 +82 Q 0.153 +83 R 0.139 +84 E 0.131 +85 K 0.128 +86 L 0.125 +87 M 0.120 +88 K 0.119 +89 E 0.132 +90 G 0.161 +91 K 0.198 +92 Y 0.236 +93 T 0.279 +94 P 0.331 +95 P 0.387 +96 P 0.435 +97 H 0.472 +98 H 0.505 +99 S 0.529 +100 G 0.532 +101 R 0.512 +102 E 0.480 +103 E 0.444 +104 P 0.404 +105 R 0.365 +106 P 0.340 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028648.14_ENSMUST00000106207.8_GN:Ndufs5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:65.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028648.14_ENSMUST00000106207.8_GN:Ndufs5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:65.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0fabfdd6c02fd9f6928a648bd2c5335c965db574 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028648.14_ENSMUST00000106207.8_GN:Ndufs5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:65.caid @@ -0,0 +1,172 @@ +>ENSMUSG00000028648.14|ENSMUST00000106207.8|GN:Ndufs5|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:65 +1 M 0.377 +2 K 0.376 +3 K 0.377 +4 S 0.375 +5 R 0.362 +6 L 0.338 +7 F 0.308 +8 S 0.271 +9 L 0.227 +10 Q 0.186 +11 C 0.160 +12 D 0.144 +13 L 0.132 +14 K 0.124 +15 L 0.118 +16 A 0.111 +17 W 0.108 +18 A 0.110 +19 R 0.112 +20 W 0.109 +21 D 0.108 +22 A 0.111 +23 I 0.125 +24 W 0.161 +25 K 0.223 +26 N 0.296 +27 K 0.363 +28 K 0.421 +29 L 0.477 +30 G 0.525 +31 E 0.559 +32 K 0.585 +33 R 0.613 +34 F 0.646 +35 G 0.676 +36 A 0.693 +37 S 0.690 +38 G 0.659 +39 L 0.601 +40 A 0.537 +41 D 0.496 +42 E 0.481 +43 V 0.468 +44 P 0.447 +45 R 0.427 +46 F 0.410 +47 F 0.393 +48 S 0.370 +49 E 0.337 +50 A 0.296 +51 C 0.263 +52 H 0.251 +53 L 0.257 +54 I 0.273 +55 T 0.298 +56 L 0.332 +57 L 0.370 +58 S 0.413 +59 P 0.461 +60 G 0.500 +61 C 0.522 +62 S 0.531 +63 F 0.527 +64 T 0.502 +65 A 0.470 +66 M 0.453 +67 P 0.453 +68 F 0.444 +69 L 0.413 +70 D 0.376 +71 I 0.361 +72 Q 0.381 +73 K 0.429 +74 K 0.485 +75 L 0.532 +76 G 0.555 +77 I 0.547 +78 S 0.514 +79 L 0.463 +80 D 0.405 +81 R 0.363 +82 H 0.360 +83 F 0.383 +84 M 0.403 +85 F 0.402 +86 L 0.383 +87 S 0.353 +88 A 0.316 +89 E 0.283 +90 Q 0.258 +91 P 0.238 +92 Y 0.223 +93 K 0.222 +94 N 0.231 +95 A 0.230 +96 A 0.205 +97 R 0.164 +98 C 0.126 +99 H 0.102 +100 A 0.091 +101 F 0.094 +102 E 0.107 +103 K 0.113 +104 E 0.104 +105 W 0.088 +106 I 0.078 +107 E 0.077 +108 C 0.084 +109 A 0.104 +110 H 0.131 +111 G 0.153 +112 I 0.160 +113 G 0.151 +114 G 0.132 +115 T 0.109 +116 R 0.090 +117 A 0.079 +118 K 0.069 +119 K 0.059 +120 E 0.054 +121 C 0.055 +122 K 0.060 +123 I 0.069 +124 E 0.081 +125 F 0.092 +126 D 0.098 +127 D 0.093 +128 F 0.083 +129 E 0.074 +130 E 0.068 +131 C 0.063 +132 L 0.063 +133 L 0.068 +134 R 0.076 +135 Y 0.087 +136 K 0.103 +137 T 0.122 +138 M 0.142 +139 R 0.160 +140 R 0.171 +141 M 0.176 +142 H 0.179 +143 D 0.180 +144 I 0.176 +145 K 0.168 +146 K 0.160 +147 Q 0.151 +148 R 0.141 +149 E 0.135 +150 K 0.134 +151 L 0.133 +152 M 0.131 +153 K 0.132 +154 E 0.146 +155 G 0.178 +156 K 0.219 +157 Y 0.257 +158 T 0.294 +159 P 0.338 +160 P 0.388 +161 P 0.436 +162 H 0.478 +163 H 0.518 +164 S 0.548 +165 G 0.556 +166 R 0.540 +167 E 0.508 +168 E 0.469 +169 P 0.425 +170 R 0.382 +171 P 0.354 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028669.16_ENSMUST00000105851.9_GN:Pithd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028669.16_ENSMUST00000105851.9_GN:Pithd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a36e8136b0d1dbdbb266c6acc7a41e028d763681 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028669.16_ENSMUST00000105851.9_GN:Pithd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,212 @@ +>ENSMUSG00000028669.16|ENSMUST00000105851.9|GN:Pithd1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.428 +2 S 0.437 +3 H 0.449 +4 G 0.449 +5 H 0.433 +6 S 0.439 +7 H 0.497 +8 G 0.578 +9 G 0.631 +10 G 0.636 +11 G 0.608 +12 C 0.569 +13 R 0.542 +14 C 0.537 +15 A 0.539 +16 A 0.527 +17 E 0.488 +18 R 0.430 +19 E 0.372 +20 E 0.333 +21 P 0.309 +22 P 0.286 +23 E 0.259 +24 Q 0.236 +25 R 0.213 +26 G 0.189 +27 L 0.163 +28 A 0.138 +29 Y 0.113 +30 G 0.090 +31 L 0.072 +32 Y 0.060 +33 L 0.051 +34 R 0.046 +35 I 0.041 +36 D 0.037 +37 L 0.033 +38 E 0.029 +39 R 0.026 +40 L 0.029 +41 Q 0.038 +42 C 0.051 +43 L 0.063 +44 N 0.070 +45 E 0.079 +46 S 0.093 +47 R 0.112 +48 E 0.128 +49 G 0.131 +50 S 0.119 +51 G 0.101 +52 R 0.090 +53 G 0.089 +54 V 0.087 +55 F 0.078 +56 K 0.069 +57 P 0.063 +58 W 0.060 +59 E 0.058 +60 E 0.059 +61 R 0.064 +62 T 0.079 +63 D 0.101 +64 R 0.125 +65 S 0.138 +66 K 0.133 +67 F 0.118 +68 V 0.107 +69 E 0.107 +70 S 0.115 +71 D 0.125 +72 A 0.128 +73 D 0.123 +74 E 0.108 +75 E 0.087 +76 L 0.066 +77 L 0.052 +78 F 0.049 +79 N 0.055 +80 I 0.065 +81 P 0.071 +82 F 0.076 +83 T 0.079 +84 G 0.078 +85 N 0.074 +86 V 0.068 +87 K 0.060 +88 L 0.050 +89 K 0.042 +90 G 0.038 +91 V 0.037 +92 I 0.037 +93 I 0.042 +94 M 0.052 +95 G 0.065 +96 E 0.073 +97 D 0.077 +98 D 0.078 +99 D 0.076 +100 S 0.069 +101 H 0.061 +102 P 0.053 +103 S 0.045 +104 E 0.039 +105 M 0.033 +106 R 0.031 +107 L 0.032 +108 Y 0.037 +109 K 0.043 +110 N 0.050 +111 I 0.058 +112 P 0.064 +113 Q 0.063 +114 M 0.060 +115 S 0.057 +116 F 0.056 +117 D 0.056 +118 D 0.057 +119 T 0.060 +120 E 0.065 +121 R 0.070 +122 E 0.073 +123 P 0.069 +124 E 0.062 +125 Q 0.058 +126 T 0.059 +127 F 0.064 +128 S 0.069 +129 L 0.075 +130 N 0.080 +131 R 0.088 +132 D 0.096 +133 I 0.101 +134 T 0.101 +135 G 0.094 +136 E 0.082 +137 L 0.066 +138 E 0.052 +139 Y 0.046 +140 A 0.045 +141 T 0.045 +142 K 0.044 +143 I 0.043 +144 S 0.043 +145 R 0.042 +146 F 0.039 +147 S 0.039 +148 N 0.042 +149 V 0.041 +150 Y 0.035 +151 H 0.029 +152 L 0.026 +153 S 0.029 +154 I 0.035 +155 H 0.045 +156 I 0.056 +157 S 0.066 +158 K 0.075 +159 N 0.083 +160 F 0.089 +161 G 0.092 +162 A 0.090 +163 D 0.083 +164 T 0.071 +165 T 0.058 +166 K 0.047 +167 I 0.039 +168 F 0.032 +169 Y 0.028 +170 I 0.026 +171 G 0.028 +172 L 0.034 +173 R 0.046 +174 G 0.062 +175 E 0.082 +176 W 0.110 +177 T 0.158 +178 E 0.228 +179 L 0.313 +180 R 0.399 +181 R 0.481 +182 H 0.550 +183 E 0.597 +184 V 0.619 +185 T 0.627 +186 I 0.636 +187 C 0.648 +188 N 0.665 +189 Y 0.688 +190 E 0.707 +191 A 0.712 +192 S 0.699 +193 A 0.676 +194 N 0.656 +195 P 0.649 +196 A 0.653 +197 D 0.663 +198 H 0.672 +199 R 0.670 +200 V 0.639 +201 H 0.583 +202 Q 0.543 +203 V 0.546 +204 T 0.557 +205 P 0.544 +206 Q 0.532 +207 T 0.552 +208 H 0.582 +209 F 0.577 +210 I 0.529 +211 S 0.481 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028669.16_ENSMUST00000105851.9_GN:Pithd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:43.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028669.16_ENSMUST00000105851.9_GN:Pithd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:43.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7da5436cfeb4e19aa0a67ca489b9207f66588a68 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028669.16_ENSMUST00000105851.9_GN:Pithd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:43.caid @@ -0,0 +1,255 @@ +>ENSMUSG00000028669.16|ENSMUST00000105851.9|GN:Pithd1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:43 +1 M 0.431 +2 R 0.445 +3 R 0.480 +4 A 0.529 +5 G 0.570 +6 A 0.588 +7 P 0.586 +8 F 0.573 +9 T 0.552 +10 T 0.526 +11 P 0.495 +12 R 0.460 +13 W 0.426 +14 R 0.401 +15 R 0.390 +16 L 0.390 +17 A 0.400 +18 V 0.418 +19 V 0.447 +20 A 0.488 +21 E 0.532 +22 P 0.569 +23 S 0.593 +24 E 0.607 +25 L 0.620 +26 R 0.644 +27 V 0.680 +28 S 0.721 +29 G 0.752 +30 G 0.762 +31 A 0.758 +32 E 0.754 +33 G 0.755 +34 V 0.753 +35 T 0.740 +36 G 0.708 +37 E 0.641 +38 P 0.540 +39 A 0.457 +40 G 0.452 +41 G 0.502 +42 V 0.537 +43 A 0.554 +44 M 0.596 +45 S 0.655 +46 H 0.692 +47 G 0.702 +48 H 0.702 +49 S 0.704 +50 H 0.714 +51 G 0.728 +52 G 0.736 +53 G 0.725 +54 G 0.695 +55 C 0.662 +56 R 0.646 +57 C 0.646 +58 A 0.643 +59 A 0.619 +60 E 0.569 +61 R 0.495 +62 E 0.416 +63 E 0.355 +64 P 0.314 +65 P 0.278 +66 E 0.242 +67 Q 0.212 +68 R 0.187 +69 G 0.164 +70 L 0.141 +71 A 0.121 +72 Y 0.102 +73 G 0.084 +74 L 0.070 +75 Y 0.059 +76 L 0.051 +77 R 0.045 +78 I 0.040 +79 D 0.034 +80 L 0.030 +81 E 0.026 +82 R 0.023 +83 L 0.025 +84 Q 0.034 +85 C 0.046 +86 L 0.057 +87 N 0.064 +88 E 0.072 +89 S 0.084 +90 R 0.100 +91 E 0.115 +92 G 0.119 +93 S 0.108 +94 G 0.092 +95 R 0.083 +96 G 0.082 +97 V 0.081 +98 F 0.072 +99 K 0.063 +100 P 0.057 +101 W 0.053 +102 E 0.052 +103 E 0.053 +104 R 0.059 +105 T 0.073 +106 D 0.095 +107 R 0.119 +108 S 0.133 +109 K 0.129 +110 F 0.114 +111 V 0.103 +112 E 0.101 +113 S 0.108 +114 D 0.117 +115 A 0.121 +116 D 0.116 +117 E 0.103 +118 E 0.083 +119 L 0.063 +120 L 0.049 +121 F 0.047 +122 N 0.054 +123 I 0.063 +124 P 0.069 +125 F 0.072 +126 T 0.075 +127 G 0.075 +128 N 0.071 +129 V 0.065 +130 K 0.057 +131 L 0.048 +132 K 0.040 +133 G 0.035 +134 V 0.034 +135 I 0.035 +136 I 0.040 +137 M 0.051 +138 G 0.064 +139 E 0.072 +140 D 0.076 +141 D 0.077 +142 D 0.074 +143 S 0.067 +144 H 0.059 +145 P 0.050 +146 S 0.043 +147 E 0.036 +148 M 0.031 +149 R 0.029 +150 L 0.030 +151 Y 0.035 +152 K 0.042 +153 N 0.050 +154 I 0.059 +155 P 0.064 +156 Q 0.063 +157 M 0.059 +158 S 0.056 +159 F 0.054 +160 D 0.053 +161 D 0.054 +162 T 0.057 +163 E 0.062 +164 R 0.068 +165 E 0.070 +166 P 0.067 +167 E 0.060 +168 Q 0.055 +169 T 0.055 +170 F 0.059 +171 S 0.064 +172 L 0.070 +173 N 0.077 +174 R 0.084 +175 D 0.092 +176 I 0.096 +177 T 0.095 +178 G 0.088 +179 E 0.076 +180 L 0.061 +181 E 0.048 +182 Y 0.042 +183 A 0.042 +184 T 0.042 +185 K 0.042 +186 I 0.042 +187 S 0.042 +188 R 0.040 +189 F 0.038 +190 S 0.038 +191 N 0.040 +192 V 0.040 +193 Y 0.034 +194 H 0.028 +195 L 0.026 +196 S 0.028 +197 I 0.034 +198 H 0.043 +199 I 0.053 +200 S 0.062 +201 K 0.071 +202 N 0.079 +203 F 0.086 +204 G 0.088 +205 A 0.087 +206 D 0.081 +207 T 0.069 +208 T 0.057 +209 K 0.047 +210 I 0.039 +211 F 0.032 +212 Y 0.027 +213 I 0.026 +214 G 0.028 +215 L 0.034 +216 R 0.046 +217 G 0.062 +218 E 0.082 +219 W 0.111 +220 T 0.159 +221 E 0.230 +222 L 0.314 +223 R 0.400 +224 R 0.481 +225 H 0.549 +226 E 0.595 +227 V 0.615 +228 T 0.624 +229 I 0.636 +230 C 0.653 +231 N 0.673 +232 Y 0.695 +233 E 0.712 +234 A 0.715 +235 S 0.702 +236 A 0.679 +237 N 0.660 +238 P 0.653 +239 A 0.658 +240 D 0.672 +241 H 0.685 +242 R 0.687 +243 V 0.658 +244 H 0.603 +245 Q 0.563 +246 V 0.567 +247 T 0.580 +248 P 0.568 +249 Q 0.559 +250 T 0.583 +251 H 0.615 +252 F 0.611 +253 I 0.562 +254 S 0.512 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028811.13_ENSMUST00000106054.4_GN:Yars1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028811.13_ENSMUST00000106054.4_GN:Yars1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e3b1609f1326755f0b7163a5d7261f342693106c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028811.13_ENSMUST00000106054.4_GN:Yars1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,529 @@ +>ENSMUSG00000028811.13|ENSMUST00000106054.4|GN:Yars1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.400 +2 G 0.384 +3 D 0.352 +4 A 0.300 +5 P 0.227 +6 S 0.152 +7 P 0.097 +8 E 0.071 +9 E 0.062 +10 K 0.058 +11 L 0.056 +12 H 0.057 +13 L 0.058 +14 I 0.060 +15 T 0.062 +16 R 0.066 +17 N 0.071 +18 L 0.073 +19 Q 0.072 +20 E 0.073 +21 V 0.075 +22 L 0.071 +23 G 0.060 +24 E 0.048 +25 E 0.039 +26 K 0.036 +27 L 0.040 +28 K 0.050 +29 E 0.056 +30 I 0.052 +31 L 0.044 +32 K 0.039 +33 E 0.037 +34 R 0.038 +35 E 0.039 +36 L 0.040 +37 K 0.042 +38 V 0.045 +39 Y 0.051 +40 W 0.058 +41 G 0.066 +42 T 0.077 +43 A 0.089 +44 T 0.103 +45 T 0.115 +46 G 0.123 +47 K 0.122 +48 P 0.110 +49 H 0.087 +50 V 0.063 +51 A 0.048 +52 Y 0.039 +53 F 0.033 +54 V 0.029 +55 P 0.028 +56 M 0.028 +57 S 0.028 +58 K 0.029 +59 I 0.032 +60 A 0.036 +61 D 0.040 +62 F 0.047 +63 L 0.056 +64 K 0.069 +65 A 0.083 +66 G 0.089 +67 C 0.084 +68 E 0.070 +69 V 0.058 +70 T 0.054 +71 I 0.062 +72 L 0.077 +73 F 0.092 +74 A 0.099 +75 D 0.100 +76 L 0.098 +77 H 0.097 +78 A 0.097 +79 Y 0.100 +80 L 0.106 +81 D 0.107 +82 N 0.101 +83 M 0.099 +84 K 0.101 +85 A 0.100 +86 P 0.091 +87 W 0.080 +88 E 0.074 +89 L 0.073 +90 L 0.071 +91 E 0.067 +92 L 0.065 +93 R 0.065 +94 T 0.067 +95 S 0.066 +96 Y 0.056 +97 Y 0.042 +98 E 0.031 +99 N 0.026 +100 V 0.026 +101 I 0.027 +102 K 0.029 +103 A 0.031 +104 M 0.033 +105 L 0.036 +106 E 0.038 +107 S 0.042 +108 I 0.045 +109 G 0.049 +110 V 0.052 +111 P 0.054 +112 L 0.051 +113 E 0.044 +114 K 0.034 +115 L 0.028 +116 K 0.027 +117 F 0.030 +118 I 0.034 +119 K 0.034 +120 G 0.032 +121 T 0.028 +122 D 0.025 +123 Y 0.024 +124 Q 0.026 +125 L 0.028 +126 S 0.029 +127 K 0.031 +128 E 0.034 +129 Y 0.042 +130 T 0.055 +131 L 0.063 +132 D 0.062 +133 V 0.061 +134 Y 0.067 +135 R 0.077 +136 L 0.081 +137 S 0.078 +138 S 0.074 +139 V 0.076 +140 V 0.078 +141 T 0.075 +142 Q 0.068 +143 H 0.064 +144 D 0.066 +145 A 0.071 +146 K 0.079 +147 K 0.091 +148 A 0.103 +149 G 0.109 +150 A 0.114 +151 E 0.125 +152 V 0.143 +153 V 0.160 +154 K 0.170 +155 Q 0.176 +156 V 0.179 +157 E 0.183 +158 H 0.191 +159 P 0.197 +160 L 0.192 +161 L 0.187 +162 S 0.204 +163 G 0.248 +164 L 0.278 +165 L 0.262 +166 Y 0.219 +167 P 0.193 +168 G 0.188 +169 L 0.183 +170 Q 0.167 +171 A 0.141 +172 L 0.111 +173 D 0.083 +174 E 0.062 +175 E 0.050 +176 Y 0.046 +177 L 0.047 +178 K 0.052 +179 V 0.056 +180 D 0.055 +181 A 0.047 +182 Q 0.037 +183 F 0.033 +184 G 0.040 +185 G 0.057 +186 V 0.081 +187 D 0.100 +188 Q 0.104 +189 R 0.095 +190 K 0.085 +191 I 0.079 +192 F 0.072 +193 T 0.063 +194 F 0.055 +195 A 0.049 +196 E 0.043 +197 K 0.040 +198 Y 0.041 +199 L 0.045 +200 P 0.051 +201 A 0.058 +202 L 0.065 +203 G 0.073 +204 Y 0.082 +205 S 0.092 +206 K 0.099 +207 R 0.102 +208 V 0.107 +209 H 0.115 +210 L 0.126 +211 M 0.141 +212 N 0.159 +213 P 0.177 +214 M 0.187 +215 V 0.182 +216 P 0.168 +217 G 0.160 +218 L 0.162 +219 T 0.171 +220 G 0.190 +221 S 0.222 +222 K 0.259 +223 M 0.288 +224 S 0.304 +225 S 0.302 +226 S 0.281 +227 E 0.253 +228 E 0.229 +229 E 0.215 +230 S 0.204 +231 K 0.189 +232 I 0.165 +233 D 0.138 +234 L 0.113 +235 L 0.098 +236 D 0.088 +237 R 0.078 +238 K 0.069 +239 E 0.065 +240 D 0.070 +241 V 0.078 +242 K 0.092 +243 K 0.108 +244 K 0.118 +245 L 0.115 +246 K 0.105 +247 K 0.097 +248 A 0.088 +249 F 0.081 +250 C 0.080 +251 E 0.086 +252 P 0.090 +253 G 0.089 +254 N 0.088 +255 V 0.091 +256 E 0.094 +257 N 0.092 +258 N 0.084 +259 G 0.075 +260 V 0.066 +261 L 0.060 +262 S 0.056 +263 F 0.053 +264 I 0.050 +265 K 0.045 +266 H 0.040 +267 V 0.035 +268 L 0.034 +269 F 0.039 +270 P 0.046 +271 L 0.047 +272 K 0.041 +273 S 0.032 +274 E 0.027 +275 F 0.030 +276 V 0.040 +277 I 0.054 +278 L 0.068 +279 R 0.079 +280 D 0.090 +281 E 0.101 +282 K 0.115 +283 W 0.131 +284 G 0.142 +285 G 0.138 +286 N 0.120 +287 K 0.100 +288 T 0.087 +289 Y 0.077 +290 T 0.064 +291 V 0.051 +292 Y 0.042 +293 L 0.039 +294 E 0.041 +295 L 0.050 +296 E 0.065 +297 K 0.077 +298 D 0.084 +299 F 0.090 +300 A 0.099 +301 A 0.107 +302 E 0.110 +303 V 0.106 +304 V 0.097 +305 H 0.087 +306 P 0.084 +307 G 0.091 +308 D 0.104 +309 L 0.112 +310 K 0.111 +311 N 0.110 +312 S 0.116 +313 V 0.123 +314 E 0.124 +315 V 0.123 +316 A 0.118 +317 L 0.105 +318 N 0.087 +319 K 0.073 +320 L 0.064 +321 L 0.054 +322 D 0.047 +323 P 0.046 +324 I 0.053 +325 R 0.065 +326 E 0.071 +327 K 0.066 +328 F 0.057 +329 N 0.052 +330 T 0.053 +331 P 0.056 +332 A 0.057 +333 L 0.055 +334 K 0.056 +335 K 0.060 +336 L 0.063 +337 A 0.064 +338 S 0.067 +339 A 0.080 +340 A 0.110 +341 Y 0.164 +342 P 0.233 +343 D 0.295 +344 P 0.340 +345 S 0.382 +346 K 0.427 +347 Q 0.469 +348 K 0.496 +349 P 0.510 +350 P 0.506 +351 A 0.488 +352 K 0.487 +353 G 0.525 +354 P 0.579 +355 A 0.616 +356 K 0.625 +357 N 0.612 +358 S 0.588 +359 E 0.554 +360 P 0.502 +361 E 0.423 +362 E 0.327 +363 V 0.236 +364 I 0.168 +365 P 0.125 +366 S 0.101 +367 R 0.084 +368 L 0.069 +369 D 0.055 +370 I 0.045 +371 R 0.039 +372 V 0.037 +373 G 0.037 +374 K 0.038 +375 I 0.041 +376 L 0.045 +377 S 0.053 +378 V 0.061 +379 E 0.069 +380 K 0.077 +381 H 0.081 +382 P 0.081 +383 D 0.078 +384 A 0.075 +385 D 0.070 +386 S 0.061 +387 L 0.051 +388 Y 0.040 +389 V 0.033 +390 E 0.031 +391 K 0.032 +392 I 0.035 +393 D 0.038 +394 V 0.042 +395 G 0.045 +396 E 0.047 +397 A 0.047 +398 E 0.047 +399 P 0.046 +400 R 0.045 +401 T 0.043 +402 V 0.043 +403 V 0.045 +404 S 0.050 +405 G 0.053 +406 L 0.050 +407 V 0.045 +408 Q 0.041 +409 F 0.042 +410 V 0.044 +411 P 0.045 +412 K 0.045 +413 E 0.048 +414 E 0.055 +415 L 0.063 +416 Q 0.071 +417 D 0.077 +418 R 0.080 +419 L 0.082 +420 V 0.086 +421 V 0.093 +422 V 0.104 +423 L 0.111 +424 C 0.111 +425 N 0.109 +426 L 0.114 +427 K 0.126 +428 P 0.137 +429 Q 0.142 +430 K 0.143 +431 M 0.139 +432 R 0.138 +433 G 0.144 +434 V 0.156 +435 D 0.161 +436 S 0.151 +437 Q 0.130 +438 G 0.110 +439 M 0.096 +440 L 0.088 +441 L 0.084 +442 C 0.085 +443 A 0.092 +444 S 0.105 +445 V 0.124 +446 E 0.150 +447 G 0.175 +448 V 0.189 +449 S 0.189 +450 R 0.177 +451 Q 0.161 +452 V 0.148 +453 E 0.141 +454 P 0.144 +455 L 0.155 +456 D 0.170 +457 P 0.181 +458 P 0.180 +459 A 0.168 +460 G 0.155 +461 S 0.144 +462 A 0.133 +463 P 0.124 +464 G 0.121 +465 E 0.126 +466 R 0.132 +467 V 0.135 +468 F 0.137 +469 V 0.139 +470 Q 0.142 +471 G 0.145 +472 Y 0.148 +473 E 0.153 +474 K 0.165 +475 G 0.178 +476 Q 0.187 +477 P 0.188 +478 D 0.186 +479 E 0.188 +480 E 0.192 +481 L 0.193 +482 K 0.185 +483 P 0.172 +484 K 0.156 +485 K 0.142 +486 K 0.131 +487 V 0.120 +488 F 0.108 +489 E 0.097 +490 K 0.095 +491 L 0.099 +492 Q 0.100 +493 A 0.093 +494 D 0.084 +495 F 0.082 +496 K 0.087 +497 I 0.094 +498 S 0.101 +499 E 0.114 +500 E 0.131 +501 C 0.143 +502 I 0.142 +503 A 0.128 +504 Q 0.107 +505 W 0.088 +506 K 0.081 +507 Q 0.087 +508 T 0.094 +509 N 0.091 +510 F 0.083 +511 M 0.082 +512 T 0.088 +513 K 0.097 +514 L 0.107 +515 G 0.117 +516 F 0.123 +517 V 0.129 +518 S 0.136 +519 C 0.144 +520 K 0.150 +521 S 0.158 +522 L 0.174 +523 K 0.202 +524 G 0.237 +525 G 0.267 +526 N 0.282 +527 I 0.286 +528 S 0.287 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028811.13_ENSMUST00000106054.4_GN:Yars1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:36.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028811.13_ENSMUST00000106054.4_GN:Yars1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:36.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..fbc2edbc2c9ce9a81e9b92d662e4c6e4560037e0 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000028811.13_ENSMUST00000106054.4_GN:Yars1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:36.caid @@ -0,0 +1,565 @@ +>ENSMUSG00000028811.13|ENSMUST00000106054.4|GN:Yars1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:36 +1 M 0.381 +2 Q 0.401 +3 P 0.432 +4 D 0.454 +5 G 0.453 +6 T 0.445 +7 S 0.454 +8 V 0.478 +9 T 0.499 +10 V 0.510 +11 P 0.501 +12 G 0.460 +13 T 0.406 +14 R 0.363 +15 R 0.331 +16 R 0.309 +17 R 0.310 +18 R 0.327 +19 T 0.342 +20 R 0.363 +21 K 0.397 +22 G 0.431 +23 R 0.463 +24 G 0.502 +25 C 0.537 +26 R 0.553 +27 L 0.561 +28 S 0.571 +29 A 0.584 +30 G 0.594 +31 N 0.600 +32 R 0.611 +33 D 0.632 +34 S 0.649 +35 G 0.647 +36 A 0.620 +37 M 0.570 +38 G 0.503 +39 D 0.428 +40 A 0.344 +41 P 0.250 +42 S 0.162 +43 P 0.101 +44 E 0.073 +45 E 0.063 +46 K 0.059 +47 L 0.056 +48 H 0.056 +49 L 0.057 +50 I 0.058 +51 T 0.060 +52 R 0.064 +53 N 0.070 +54 L 0.073 +55 Q 0.075 +56 E 0.077 +57 V 0.079 +58 L 0.074 +59 G 0.062 +60 E 0.049 +61 E 0.039 +62 K 0.033 +63 L 0.031 +64 K 0.031 +65 E 0.032 +66 I 0.033 +67 L 0.034 +68 K 0.035 +69 E 0.035 +70 R 0.035 +71 E 0.036 +72 L 0.037 +73 K 0.039 +74 V 0.043 +75 Y 0.048 +76 W 0.055 +77 G 0.063 +78 T 0.073 +79 A 0.086 +80 T 0.100 +81 T 0.112 +82 G 0.120 +83 K 0.120 +84 P 0.108 +85 H 0.085 +86 V 0.062 +87 A 0.046 +88 Y 0.037 +89 F 0.031 +90 V 0.027 +91 P 0.026 +92 M 0.027 +93 S 0.027 +94 K 0.028 +95 I 0.030 +96 A 0.034 +97 D 0.039 +98 F 0.044 +99 L 0.052 +100 K 0.063 +101 A 0.075 +102 G 0.082 +103 C 0.077 +104 E 0.066 +105 V 0.055 +106 T 0.054 +107 I 0.063 +108 L 0.078 +109 F 0.092 +110 A 0.098 +111 D 0.097 +112 L 0.093 +113 H 0.092 +114 A 0.091 +115 Y 0.094 +116 L 0.099 +117 D 0.100 +118 N 0.097 +119 M 0.097 +120 K 0.101 +121 A 0.100 +122 P 0.090 +123 W 0.079 +124 E 0.075 +125 L 0.074 +126 L 0.072 +127 E 0.068 +128 L 0.064 +129 R 0.058 +130 T 0.051 +131 S 0.044 +132 Y 0.038 +133 Y 0.033 +134 E 0.028 +135 N 0.026 +136 V 0.026 +137 I 0.027 +138 K 0.029 +139 A 0.031 +140 M 0.034 +141 L 0.037 +142 E 0.040 +143 S 0.043 +144 I 0.048 +145 G 0.053 +146 V 0.057 +147 P 0.059 +148 L 0.055 +149 E 0.047 +150 K 0.037 +151 L 0.030 +152 K 0.028 +153 F 0.030 +154 I 0.034 +155 K 0.034 +156 G 0.031 +157 T 0.027 +158 D 0.025 +159 Y 0.024 +160 Q 0.025 +161 L 0.028 +162 S 0.030 +163 K 0.031 +164 E 0.033 +165 Y 0.038 +166 T 0.045 +167 L 0.051 +168 D 0.052 +169 V 0.054 +170 Y 0.063 +171 R 0.074 +172 L 0.079 +173 S 0.077 +174 S 0.075 +175 V 0.077 +176 V 0.080 +177 T 0.077 +178 Q 0.069 +179 H 0.064 +180 D 0.065 +181 A 0.070 +182 K 0.079 +183 K 0.091 +184 A 0.102 +185 G 0.108 +186 A 0.112 +187 E 0.124 +188 V 0.142 +189 V 0.158 +190 K 0.168 +191 Q 0.173 +192 V 0.175 +193 E 0.179 +194 H 0.187 +195 P 0.194 +196 L 0.191 +197 L 0.185 +198 S 0.201 +199 G 0.243 +200 L 0.272 +201 L 0.256 +202 Y 0.215 +203 P 0.189 +204 G 0.184 +205 L 0.181 +206 Q 0.167 +207 A 0.141 +208 L 0.110 +209 D 0.082 +210 E 0.061 +211 E 0.049 +212 Y 0.045 +213 L 0.046 +214 K 0.050 +215 V 0.054 +216 D 0.053 +217 A 0.046 +218 Q 0.036 +219 F 0.032 +220 G 0.038 +221 G 0.055 +222 V 0.078 +223 D 0.096 +224 Q 0.099 +225 R 0.091 +226 K 0.081 +227 I 0.074 +228 F 0.065 +229 T 0.056 +230 F 0.049 +231 A 0.046 +232 E 0.042 +233 K 0.039 +234 Y 0.040 +235 L 0.044 +236 P 0.049 +237 A 0.056 +238 L 0.063 +239 G 0.071 +240 Y 0.081 +241 S 0.091 +242 K 0.098 +243 R 0.101 +244 V 0.106 +245 H 0.114 +246 L 0.125 +247 M 0.140 +248 N 0.158 +249 P 0.176 +250 M 0.186 +251 V 0.181 +252 P 0.168 +253 G 0.160 +254 L 0.163 +255 T 0.173 +256 G 0.193 +257 S 0.228 +258 K 0.267 +259 M 0.297 +260 S 0.314 +261 S 0.311 +262 S 0.290 +263 E 0.262 +264 E 0.238 +265 E 0.222 +266 S 0.210 +267 K 0.193 +268 I 0.167 +269 D 0.138 +270 L 0.113 +271 L 0.098 +272 D 0.089 +273 R 0.079 +274 K 0.070 +275 E 0.067 +276 D 0.071 +277 V 0.079 +278 K 0.092 +279 K 0.109 +280 K 0.119 +281 L 0.117 +282 K 0.108 +283 K 0.100 +284 A 0.092 +285 F 0.084 +286 C 0.082 +287 E 0.088 +288 P 0.092 +289 G 0.091 +290 N 0.090 +291 V 0.093 +292 E 0.097 +293 N 0.095 +294 N 0.086 +295 G 0.075 +296 V 0.066 +297 L 0.060 +298 S 0.057 +299 F 0.054 +300 I 0.050 +301 K 0.045 +302 H 0.040 +303 V 0.036 +304 L 0.035 +305 F 0.040 +306 P 0.047 +307 L 0.049 +308 K 0.042 +309 S 0.033 +310 E 0.028 +311 F 0.031 +312 V 0.040 +313 I 0.054 +314 L 0.068 +315 R 0.080 +316 D 0.092 +317 E 0.104 +318 K 0.118 +319 W 0.135 +320 G 0.146 +321 G 0.142 +322 N 0.124 +323 K 0.103 +324 T 0.089 +325 Y 0.078 +326 T 0.066 +327 V 0.052 +328 Y 0.043 +329 L 0.040 +330 E 0.042 +331 L 0.051 +332 E 0.066 +333 K 0.078 +334 D 0.085 +335 F 0.091 +336 A 0.100 +337 A 0.107 +338 E 0.109 +339 V 0.105 +340 V 0.096 +341 H 0.086 +342 P 0.084 +343 G 0.093 +344 D 0.107 +345 L 0.115 +346 K 0.114 +347 N 0.112 +348 S 0.118 +349 V 0.125 +350 E 0.125 +351 V 0.123 +352 A 0.119 +353 L 0.106 +354 N 0.089 +355 K 0.075 +356 L 0.065 +357 L 0.056 +358 D 0.048 +359 P 0.047 +360 I 0.055 +361 R 0.066 +362 E 0.071 +363 K 0.066 +364 F 0.056 +365 N 0.051 +366 T 0.052 +367 P 0.055 +368 A 0.056 +369 L 0.054 +370 K 0.055 +371 K 0.059 +372 L 0.063 +373 A 0.064 +374 S 0.067 +375 A 0.080 +376 A 0.109 +377 Y 0.163 +378 P 0.233 +379 D 0.298 +380 P 0.346 +381 S 0.388 +382 K 0.432 +383 Q 0.471 +384 K 0.500 +385 P 0.525 +386 P 0.549 +387 A 0.570 +388 K 0.588 +389 G 0.607 +390 P 0.624 +391 A 0.636 +392 K 0.635 +393 N 0.621 +394 S 0.595 +395 E 0.560 +396 P 0.508 +397 E 0.428 +398 E 0.330 +399 V 0.239 +400 I 0.170 +401 P 0.127 +402 S 0.102 +403 R 0.085 +404 L 0.069 +405 D 0.055 +406 I 0.046 +407 R 0.040 +408 V 0.038 +409 G 0.038 +410 K 0.039 +411 I 0.041 +412 L 0.046 +413 S 0.053 +414 V 0.061 +415 E 0.069 +416 K 0.077 +417 H 0.082 +418 P 0.082 +419 D 0.079 +420 A 0.076 +421 D 0.070 +422 S 0.062 +423 L 0.052 +424 Y 0.041 +425 V 0.034 +426 E 0.032 +427 K 0.033 +428 I 0.036 +429 D 0.039 +430 V 0.043 +431 G 0.046 +432 E 0.047 +433 A 0.048 +434 E 0.047 +435 P 0.047 +436 R 0.046 +437 T 0.045 +438 V 0.044 +439 V 0.046 +440 S 0.051 +441 G 0.053 +442 L 0.051 +443 V 0.045 +444 Q 0.042 +445 F 0.042 +446 V 0.045 +447 P 0.045 +448 K 0.045 +449 E 0.048 +450 E 0.055 +451 L 0.064 +452 Q 0.073 +453 D 0.079 +454 R 0.083 +455 L 0.085 +456 V 0.088 +457 V 0.095 +458 V 0.106 +459 L 0.113 +460 C 0.112 +461 N 0.109 +462 L 0.115 +463 K 0.127 +464 P 0.138 +465 Q 0.144 +466 K 0.145 +467 M 0.142 +468 R 0.141 +469 G 0.147 +470 V 0.159 +471 D 0.164 +472 S 0.154 +473 Q 0.133 +474 G 0.112 +475 M 0.097 +476 L 0.088 +477 L 0.085 +478 C 0.086 +479 A 0.093 +480 S 0.107 +481 V 0.127 +482 E 0.154 +483 G 0.179 +484 V 0.194 +485 S 0.193 +486 R 0.180 +487 Q 0.163 +488 V 0.149 +489 E 0.143 +490 P 0.146 +491 L 0.157 +492 D 0.173 +493 P 0.184 +494 P 0.183 +495 A 0.171 +496 G 0.158 +497 S 0.147 +498 A 0.136 +499 P 0.127 +500 G 0.124 +501 E 0.129 +502 R 0.134 +503 V 0.137 +504 F 0.139 +505 V 0.142 +506 Q 0.145 +507 G 0.147 +508 Y 0.150 +509 E 0.155 +510 K 0.166 +511 G 0.180 +512 Q 0.189 +513 P 0.190 +514 D 0.189 +515 E 0.191 +516 E 0.197 +517 L 0.198 +518 K 0.191 +519 P 0.176 +520 K 0.160 +521 K 0.145 +522 K 0.133 +523 V 0.122 +524 F 0.108 +525 E 0.097 +526 K 0.095 +527 L 0.099 +528 Q 0.101 +529 A 0.095 +530 D 0.086 +531 F 0.082 +532 K 0.086 +533 I 0.093 +534 S 0.099 +535 E 0.111 +536 E 0.128 +537 C 0.141 +538 I 0.141 +539 A 0.128 +540 Q 0.108 +541 W 0.091 +542 K 0.085 +543 Q 0.092 +544 T 0.099 +545 N 0.096 +546 F 0.088 +547 M 0.087 +548 T 0.094 +549 K 0.102 +550 L 0.110 +551 G 0.117 +552 F 0.122 +553 V 0.127 +554 S 0.136 +555 C 0.146 +556 K 0.154 +557 S 0.163 +558 L 0.179 +559 K 0.205 +560 G 0.237 +561 G 0.265 +562 N 0.279 +563 I 0.284 +564 S 0.286 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029103.17_ENSMUST00000030986.15_GN:Lrpap1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029103.17_ENSMUST00000030986.15_GN:Lrpap1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ef7f0991647f05d044cbf4dfcea8e50257b2289f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029103.17_ENSMUST00000030986.15_GN:Lrpap1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,361 @@ +>ENSMUSG00000029103.17|ENSMUST00000030986.15|GN:Lrpap1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.412 +2 A 0.437 +3 P 0.469 +4 R 0.482 +5 R 0.475 +6 E 0.483 +7 R 0.533 +8 V 0.596 +9 S 0.626 +10 T 0.621 +11 L 0.597 +12 P 0.559 +13 R 0.504 +14 L 0.455 +15 Q 0.420 +16 L 0.374 +17 L 0.313 +18 V 0.278 +19 L 0.293 +20 L 0.339 +21 L 0.393 +22 L 0.445 +23 P 0.481 +24 L 0.495 +25 M 0.496 +26 L 0.500 +27 V 0.517 +28 P 0.553 +29 Q 0.606 +30 P 0.661 +31 I 0.700 +32 A 0.715 +33 G 0.712 +34 H 0.703 +35 G 0.690 +36 G 0.670 +37 K 0.634 +38 Y 0.591 +39 S 0.562 +40 R 0.562 +41 E 0.574 +42 K 0.575 +43 N 0.566 +44 E 0.571 +45 P 0.601 +46 E 0.634 +47 M 0.643 +48 A 0.626 +49 A 0.596 +50 K 0.564 +51 R 0.533 +52 E 0.498 +53 S 0.447 +54 G 0.378 +55 E 0.300 +56 E 0.226 +57 F 0.167 +58 R 0.128 +59 M 0.107 +60 E 0.098 +61 K 0.092 +62 L 0.084 +63 N 0.075 +64 Q 0.067 +65 L 0.059 +66 W 0.053 +67 E 0.050 +68 K 0.050 +69 A 0.053 +70 K 0.060 +71 R 0.070 +72 L 0.081 +73 H 0.089 +74 L 0.091 +75 S 0.086 +76 P 0.077 +77 V 0.068 +78 R 0.064 +79 L 0.065 +80 A 0.069 +81 E 0.077 +82 L 0.090 +83 H 0.102 +84 S 0.106 +85 D 0.101 +86 L 0.091 +87 K 0.076 +88 I 0.059 +89 Q 0.046 +90 E 0.040 +91 R 0.037 +92 D 0.036 +93 E 0.037 +94 L 0.040 +95 N 0.044 +96 W 0.050 +97 K 0.060 +98 K 0.073 +99 L 0.085 +100 K 0.096 +101 V 0.108 +102 E 0.126 +103 G 0.147 +104 L 0.162 +105 D 0.164 +106 K 0.160 +107 D 0.160 +108 G 0.160 +109 E 0.153 +110 K 0.134 +111 E 0.111 +112 A 0.092 +113 K 0.086 +114 L 0.090 +115 I 0.097 +116 H 0.101 +117 N 0.103 +118 L 0.107 +119 N 0.112 +120 V 0.111 +121 I 0.104 +122 L 0.096 +123 A 0.086 +124 R 0.079 +125 Y 0.084 +126 G 0.117 +127 L 0.189 +128 D 0.287 +129 G 0.377 +130 R 0.436 +131 K 0.469 +132 D 0.490 +133 A 0.512 +134 Q 0.538 +135 M 0.570 +136 V 0.601 +137 H 0.622 +138 S 0.634 +139 N 0.641 +140 A 0.642 +141 L 0.635 +142 N 0.619 +143 E 0.596 +144 D 0.566 +145 T 0.531 +146 Q 0.484 +147 D 0.415 +148 E 0.325 +149 L 0.239 +150 G 0.184 +151 D 0.157 +152 P 0.138 +153 R 0.115 +154 L 0.092 +155 E 0.074 +156 K 0.061 +157 L 0.052 +158 W 0.046 +159 H 0.043 +160 K 0.047 +161 A 0.060 +162 K 0.084 +163 T 0.117 +164 S 0.147 +165 G 0.158 +166 K 0.148 +167 F 0.128 +168 S 0.111 +169 S 0.095 +170 E 0.080 +171 E 0.070 +172 L 0.067 +173 D 0.067 +174 K 0.068 +175 L 0.073 +176 W 0.080 +177 R 0.081 +178 E 0.073 +179 F 0.061 +180 L 0.053 +181 H 0.049 +182 Y 0.044 +183 K 0.037 +184 E 0.032 +185 K 0.031 +186 I 0.034 +187 Q 0.040 +188 E 0.045 +189 Y 0.048 +190 N 0.050 +191 V 0.050 +192 L 0.052 +193 L 0.058 +194 D 0.065 +195 T 0.070 +196 L 0.073 +197 S 0.081 +198 R 0.091 +199 A 0.107 +200 E 0.135 +201 E 0.174 +202 G 0.214 +203 Y 0.247 +204 E 0.272 +205 N 0.287 +206 L 0.293 +207 L 0.299 +208 S 0.314 +209 P 0.334 +210 S 0.344 +211 D 0.337 +212 M 0.319 +213 A 0.305 +214 H 0.297 +215 I 0.286 +216 K 0.263 +217 S 0.229 +218 D 0.192 +219 T 0.158 +220 L 0.133 +221 I 0.119 +222 S 0.115 +223 K 0.116 +224 H 0.116 +225 S 0.115 +226 E 0.111 +227 L 0.107 +228 K 0.104 +229 D 0.105 +230 R 0.102 +231 L 0.092 +232 R 0.082 +233 S 0.078 +234 I 0.079 +235 N 0.083 +236 Q 0.085 +237 G 0.080 +238 L 0.070 +239 D 0.062 +240 R 0.060 +241 L 0.066 +242 R 0.076 +243 K 0.086 +244 V 0.106 +245 S 0.146 +246 H 0.201 +247 Q 0.262 +248 G 0.318 +249 Y 0.358 +250 G 0.375 +251 S 0.366 +252 T 0.336 +253 T 0.288 +254 E 0.232 +255 F 0.182 +256 E 0.151 +257 E 0.137 +258 P 0.128 +259 R 0.116 +260 V 0.108 +261 I 0.107 +262 D 0.104 +263 L 0.093 +264 W 0.081 +265 D 0.074 +266 L 0.074 +267 A 0.086 +268 Q 0.107 +269 S 0.129 +270 A 0.137 +271 N 0.129 +272 F 0.113 +273 T 0.100 +274 E 0.088 +275 K 0.077 +276 E 0.071 +277 L 0.071 +278 E 0.074 +279 S 0.076 +280 F 0.081 +281 R 0.091 +282 E 0.098 +283 E 0.100 +284 L 0.096 +285 K 0.087 +286 H 0.075 +287 F 0.070 +288 E 0.071 +289 A 0.069 +290 K 0.060 +291 I 0.052 +292 E 0.050 +293 K 0.050 +294 H 0.049 +295 N 0.047 +296 H 0.047 +297 Y 0.052 +298 Q 0.063 +299 K 0.072 +300 Q 0.072 +301 L 0.063 +302 E 0.054 +303 I 0.048 +304 S 0.048 +305 H 0.056 +306 Q 0.070 +307 K 0.085 +308 L 0.100 +309 K 0.120 +310 H 0.147 +311 V 0.181 +312 E 0.218 +313 S 0.255 +314 I 0.282 +315 G 0.295 +316 D 0.294 +317 P 0.282 +318 E 0.262 +319 H 0.240 +320 I 0.217 +321 S 0.194 +322 R 0.174 +323 N 0.160 +324 K 0.151 +325 E 0.146 +326 K 0.143 +327 Y 0.138 +328 V 0.132 +329 L 0.127 +330 L 0.125 +331 E 0.127 +332 E 0.128 +333 K 0.116 +334 T 0.096 +335 K 0.082 +336 E 0.078 +337 L 0.079 +338 G 0.076 +339 Y 0.072 +340 K 0.071 +341 V 0.077 +342 K 0.085 +343 K 0.090 +344 H 0.087 +345 L 0.078 +346 Q 0.069 +347 D 0.064 +348 L 0.066 +349 S 0.069 +350 S 0.070 +351 R 0.068 +352 V 0.072 +353 S 0.082 +354 R 0.096 +355 A 0.118 +356 R 0.156 +357 H 0.209 +358 N 0.261 +359 E 0.294 +360 L 0.305 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029103.17_ENSMUST00000030986.15_GN:Lrpap1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:18.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029103.17_ENSMUST00000030986.15_GN:Lrpap1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:18.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5b4293319b944ffcbb4213839b6d1e5972772348 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029103.17_ENSMUST00000030986.15_GN:Lrpap1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:18.caid @@ -0,0 +1,379 @@ +>ENSMUSG00000029103.17|ENSMUST00000030986.15|GN:Lrpap1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:18 +1 M 0.416 +2 G 0.440 +3 G 0.472 +4 P 0.485 +5 T 0.471 +6 R 0.463 +7 P 0.494 +8 S 0.547 +9 P 0.582 +10 V 0.579 +11 S 0.538 +12 L 0.467 +13 L 0.397 +14 A 0.362 +15 L 0.369 +16 Q 0.391 +17 R 0.423 +18 K 0.478 +19 M 0.547 +20 A 0.608 +21 P 0.652 +22 R 0.685 +23 R 0.711 +24 E 0.730 +25 R 0.739 +26 V 0.736 +27 S 0.721 +28 T 0.696 +29 L 0.661 +30 P 0.611 +31 R 0.552 +32 L 0.512 +33 Q 0.489 +34 L 0.444 +35 L 0.376 +36 V 0.343 +37 L 0.368 +38 L 0.417 +39 L 0.464 +40 L 0.504 +41 P 0.533 +42 L 0.545 +43 M 0.544 +44 L 0.540 +45 V 0.547 +46 P 0.575 +47 Q 0.626 +48 P 0.681 +49 I 0.720 +50 A 0.736 +51 G 0.735 +52 H 0.727 +53 G 0.716 +54 G 0.697 +55 K 0.664 +56 Y 0.625 +57 S 0.603 +58 R 0.610 +59 E 0.628 +60 K 0.630 +61 N 0.619 +62 E 0.621 +63 P 0.645 +64 E 0.671 +65 M 0.675 +66 A 0.655 +67 A 0.624 +68 K 0.589 +69 R 0.553 +70 E 0.512 +71 S 0.456 +72 G 0.381 +73 E 0.297 +74 E 0.220 +75 F 0.159 +76 R 0.119 +77 M 0.098 +78 E 0.090 +79 K 0.085 +80 L 0.080 +81 N 0.073 +82 Q 0.065 +83 L 0.057 +84 W 0.051 +85 E 0.048 +86 K 0.049 +87 A 0.052 +88 K 0.058 +89 R 0.068 +90 L 0.079 +91 H 0.087 +92 L 0.088 +93 S 0.082 +94 P 0.074 +95 V 0.065 +96 R 0.062 +97 L 0.064 +98 A 0.068 +99 E 0.076 +100 L 0.089 +101 H 0.100 +102 S 0.103 +103 D 0.099 +104 L 0.090 +105 K 0.076 +106 I 0.059 +107 Q 0.045 +108 E 0.038 +109 R 0.035 +110 D 0.034 +111 E 0.035 +112 L 0.038 +113 N 0.043 +114 W 0.049 +115 K 0.059 +116 K 0.073 +117 L 0.086 +118 K 0.097 +119 V 0.110 +120 E 0.129 +121 G 0.153 +122 L 0.170 +123 D 0.173 +124 K 0.170 +125 D 0.171 +126 G 0.172 +127 E 0.164 +128 K 0.144 +129 E 0.119 +130 A 0.099 +131 K 0.091 +132 L 0.095 +133 I 0.101 +134 H 0.104 +135 N 0.104 +136 L 0.104 +137 N 0.103 +138 V 0.100 +139 I 0.096 +140 L 0.092 +141 A 0.086 +142 R 0.081 +143 Y 0.087 +144 G 0.121 +145 L 0.195 +146 D 0.295 +147 G 0.386 +148 R 0.443 +149 K 0.474 +150 D 0.497 +151 A 0.521 +152 Q 0.550 +153 M 0.581 +154 V 0.609 +155 H 0.628 +156 S 0.639 +157 N 0.647 +158 A 0.648 +159 L 0.642 +160 N 0.626 +161 E 0.603 +162 D 0.573 +163 T 0.537 +164 Q 0.489 +165 D 0.418 +166 E 0.326 +167 L 0.239 +168 G 0.183 +169 D 0.157 +170 P 0.138 +171 R 0.116 +172 L 0.092 +173 E 0.074 +174 K 0.062 +175 L 0.053 +176 W 0.047 +177 H 0.044 +178 K 0.048 +179 A 0.061 +180 K 0.085 +181 T 0.117 +182 S 0.145 +183 G 0.155 +184 K 0.144 +185 F 0.125 +186 S 0.108 +187 S 0.093 +188 E 0.079 +189 E 0.069 +190 L 0.066 +191 D 0.066 +192 K 0.068 +193 L 0.072 +194 W 0.079 +195 R 0.080 +196 E 0.072 +197 F 0.060 +198 L 0.053 +199 H 0.049 +200 Y 0.044 +201 K 0.037 +202 E 0.032 +203 K 0.030 +204 I 0.033 +205 Q 0.038 +206 E 0.044 +207 Y 0.047 +208 N 0.048 +209 V 0.048 +210 L 0.049 +211 L 0.054 +212 D 0.061 +213 T 0.065 +214 L 0.068 +215 S 0.075 +216 R 0.087 +217 A 0.103 +218 E 0.131 +219 E 0.169 +220 G 0.208 +221 Y 0.241 +222 E 0.265 +223 N 0.279 +224 L 0.284 +225 L 0.290 +226 S 0.305 +227 P 0.325 +228 S 0.335 +229 D 0.328 +230 M 0.311 +231 A 0.297 +232 H 0.289 +233 I 0.278 +234 K 0.257 +235 S 0.225 +236 D 0.189 +237 T 0.156 +238 L 0.133 +239 I 0.119 +240 S 0.116 +241 K 0.117 +242 H 0.117 +243 S 0.115 +244 E 0.111 +245 L 0.107 +246 K 0.105 +247 D 0.106 +248 R 0.103 +249 L 0.093 +250 R 0.083 +251 S 0.077 +252 I 0.075 +253 N 0.074 +254 Q 0.073 +255 G 0.071 +256 L 0.066 +257 D 0.061 +258 R 0.061 +259 L 0.068 +260 R 0.077 +261 K 0.088 +262 V 0.107 +263 S 0.146 +264 H 0.203 +265 Q 0.264 +266 G 0.320 +267 Y 0.362 +268 G 0.380 +269 S 0.372 +270 T 0.341 +271 T 0.293 +272 E 0.236 +273 F 0.186 +274 E 0.153 +275 E 0.138 +276 P 0.129 +277 R 0.117 +278 V 0.109 +279 I 0.108 +280 D 0.105 +281 L 0.094 +282 W 0.082 +283 D 0.075 +284 L 0.076 +285 A 0.088 +286 Q 0.111 +287 S 0.133 +288 A 0.141 +289 N 0.133 +290 F 0.118 +291 T 0.105 +292 E 0.094 +293 K 0.082 +294 E 0.076 +295 L 0.075 +296 E 0.078 +297 S 0.080 +298 F 0.085 +299 R 0.094 +300 E 0.101 +301 E 0.103 +302 L 0.099 +303 K 0.089 +304 H 0.077 +305 F 0.071 +306 E 0.072 +307 A 0.070 +308 K 0.061 +309 I 0.053 +310 E 0.051 +311 K 0.051 +312 H 0.050 +313 N 0.048 +314 H 0.048 +315 Y 0.054 +316 Q 0.065 +317 K 0.075 +318 Q 0.074 +319 L 0.065 +320 E 0.056 +321 I 0.051 +322 S 0.051 +323 H 0.058 +324 Q 0.072 +325 K 0.088 +326 L 0.103 +327 K 0.124 +328 H 0.152 +329 V 0.186 +330 E 0.223 +331 S 0.259 +332 I 0.285 +333 G 0.297 +334 D 0.296 +335 P 0.284 +336 E 0.264 +337 H 0.241 +338 I 0.218 +339 S 0.195 +340 R 0.175 +341 N 0.161 +342 K 0.152 +343 E 0.148 +344 K 0.144 +345 Y 0.139 +346 V 0.134 +347 L 0.128 +348 L 0.126 +349 E 0.129 +350 E 0.128 +351 K 0.117 +352 T 0.097 +353 K 0.083 +354 E 0.079 +355 L 0.080 +356 G 0.077 +357 Y 0.073 +358 K 0.072 +359 V 0.078 +360 K 0.086 +361 K 0.091 +362 H 0.087 +363 L 0.079 +364 Q 0.070 +365 D 0.065 +366 L 0.066 +367 S 0.070 +368 S 0.070 +369 R 0.069 +370 V 0.073 +371 S 0.083 +372 R 0.097 +373 A 0.118 +374 R 0.156 +375 H 0.208 +376 N 0.259 +377 E 0.292 +378 L 0.303 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029149.15_ENSMUST00000054829.13_GN:Krtcap3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029149.15_ENSMUST00000054829.13_GN:Krtcap3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..8ca526aa96aed2684bda96b40fda094af5fbe1ff --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029149.15_ENSMUST00000054829.13_GN:Krtcap3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,241 @@ +>ENSMUSG00000029149.15|ENSMUST00000054829.13|GN:Krtcap3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.312 +2 R 0.311 +3 C 0.313 +4 C 0.318 +5 G 0.317 +6 V 0.302 +7 C 0.284 +8 A 0.272 +9 F 0.260 +10 D 0.236 +11 A 0.205 +12 A 0.175 +13 R 0.149 +14 G 0.124 +15 P 0.097 +16 R 0.072 +17 R 0.054 +18 L 0.043 +19 M 0.037 +20 R 0.037 +21 V 0.043 +22 G 0.049 +23 L 0.049 +24 A 0.043 +25 L 0.034 +26 I 0.029 +27 L 0.031 +28 V 0.038 +29 G 0.043 +30 H 0.040 +31 V 0.034 +32 N 0.030 +33 L 0.028 +34 L 0.029 +35 V 0.031 +36 G 0.033 +37 A 0.035 +38 V 0.037 +39 L 0.041 +40 H 0.046 +41 G 0.052 +42 T 0.057 +43 V 0.061 +44 L 0.069 +45 R 0.085 +46 H 0.109 +47 V 0.139 +48 A 0.168 +49 N 0.196 +50 P 0.221 +51 R 0.246 +52 G 0.268 +53 A 0.283 +54 V 0.285 +55 T 0.278 +56 P 0.265 +57 E 0.243 +58 Y 0.216 +59 T 0.190 +60 T 0.168 +61 A 0.148 +62 N 0.126 +63 V 0.099 +64 I 0.075 +65 S 0.063 +66 V 0.062 +67 G 0.069 +68 S 0.074 +69 G 0.070 +70 L 0.055 +71 L 0.038 +72 S 0.029 +73 V 0.030 +74 S 0.038 +75 V 0.045 +76 G 0.046 +77 L 0.040 +78 V 0.034 +79 A 0.031 +80 L 0.033 +81 L 0.038 +82 A 0.047 +83 S 0.058 +84 R 0.068 +85 N 0.078 +86 L 0.085 +87 L 0.086 +88 R 0.079 +89 P 0.067 +90 R 0.056 +91 L 0.047 +92 H 0.042 +93 W 0.039 +94 A 0.040 +95 L 0.047 +96 L 0.057 +97 T 0.061 +98 L 0.055 +99 A 0.045 +100 L 0.038 +101 V 0.037 +102 N 0.035 +103 L 0.033 +104 L 0.030 +105 L 0.028 +106 S 0.027 +107 A 0.026 +108 A 0.027 +109 C 0.029 +110 S 0.033 +111 M 0.035 +112 G 0.034 +113 L 0.030 +114 L 0.026 +115 L 0.026 +116 A 0.026 +117 V 0.027 +118 S 0.028 +119 L 0.030 +120 T 0.035 +121 V 0.044 +122 A 0.062 +123 N 0.090 +124 G 0.125 +125 G 0.156 +126 R 0.179 +127 R 0.198 +128 L 0.212 +129 I 0.221 +130 A 0.226 +131 D 0.239 +132 C 0.268 +133 H 0.321 +134 P 0.397 +135 G 0.472 +136 L 0.515 +137 M 0.524 +138 D 0.521 +139 P 0.526 +140 S 0.544 +141 I 0.573 +142 P 0.604 +143 L 0.624 +144 D 0.621 +145 Q 0.609 +146 G 0.608 +147 P 0.619 +148 G 0.616 +149 H 0.579 +150 T 0.507 +151 D 0.420 +152 C 0.341 +153 S 0.277 +154 F 0.225 +155 D 0.180 +156 P 0.143 +157 T 0.117 +158 R 0.100 +159 I 0.090 +160 Y 0.084 +161 D 0.081 +162 T 0.081 +163 A 0.079 +164 L 0.073 +165 A 0.061 +166 L 0.050 +167 W 0.044 +168 I 0.044 +169 P 0.047 +170 S 0.050 +171 L 0.051 +172 F 0.049 +173 M 0.051 +174 S 0.055 +175 A 0.060 +176 A 0.061 +177 E 0.057 +178 A 0.049 +179 A 0.039 +180 L 0.034 +181 S 0.033 +182 G 0.030 +183 Y 0.026 +184 C 0.020 +185 C 0.019 +186 V 0.020 +187 A 0.024 +188 A 0.032 +189 L 0.046 +190 T 0.068 +191 L 0.103 +192 R 0.154 +193 G 0.217 +194 I 0.282 +195 G 0.346 +196 P 0.396 +197 C 0.419 +198 R 0.412 +199 K 0.392 +200 E 0.375 +201 G 0.358 +202 L 0.326 +203 Q 0.286 +204 E 0.258 +205 Q 0.247 +206 L 0.242 +207 Q 0.249 +208 E 0.271 +209 L 0.294 +210 T 0.310 +211 E 0.330 +212 L 0.360 +213 E 0.387 +214 L 0.401 +215 P 0.403 +216 E 0.400 +217 C 0.392 +218 K 0.382 +219 R 0.387 +220 Q 0.417 +221 E 0.455 +222 N 0.475 +223 V 0.469 +224 Q 0.449 +225 L 0.431 +226 L 0.426 +227 H 0.436 +228 G 0.444 +229 R 0.435 +230 Q 0.428 +231 D 0.435 +232 F 0.428 +233 Q 0.400 +234 A 0.384 +235 L 0.398 +236 Q 0.427 +237 K 0.459 +238 T 0.483 +239 W 0.477 +240 V 0.454 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029149.15_ENSMUST00000054829.13_GN:Krtcap3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029149.15_ENSMUST00000054829.13_GN:Krtcap3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0c71db22afe84dadea620d9b6a17b5197f8623f2 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029149.15_ENSMUST00000054829.13_GN:Krtcap3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid @@ -0,0 +1,250 @@ +>ENSMUSG00000029149.15|ENSMUST00000054829.13|GN:Krtcap3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:9 +1 M 0.434 +2 G 0.459 +3 G 0.502 +4 G 0.542 +5 S 0.568 +6 R 0.582 +7 A 0.589 +8 A 0.576 +9 T 0.527 +10 M 0.447 +11 R 0.366 +12 C 0.308 +13 C 0.276 +14 G 0.259 +15 V 0.245 +16 C 0.234 +17 A 0.228 +18 F 0.217 +19 D 0.196 +20 A 0.170 +21 A 0.147 +22 R 0.128 +23 G 0.109 +24 P 0.088 +25 R 0.067 +26 R 0.052 +27 L 0.042 +28 M 0.037 +29 R 0.037 +30 V 0.043 +31 G 0.049 +32 L 0.049 +33 A 0.042 +34 L 0.034 +35 I 0.029 +36 L 0.031 +37 V 0.039 +38 G 0.043 +39 H 0.040 +40 V 0.034 +41 N 0.030 +42 L 0.029 +43 L 0.030 +44 V 0.032 +45 G 0.034 +46 A 0.035 +47 V 0.038 +48 L 0.042 +49 H 0.047 +50 G 0.053 +51 T 0.057 +52 V 0.061 +53 L 0.069 +54 R 0.085 +55 H 0.109 +56 V 0.138 +57 A 0.167 +58 N 0.193 +59 P 0.218 +60 R 0.242 +61 G 0.265 +62 A 0.279 +63 V 0.281 +64 T 0.274 +65 P 0.260 +66 E 0.238 +67 Y 0.210 +68 T 0.185 +69 T 0.164 +70 A 0.145 +71 N 0.124 +72 V 0.098 +73 I 0.075 +74 S 0.063 +75 V 0.063 +76 G 0.069 +77 S 0.074 +78 G 0.069 +79 L 0.054 +80 L 0.037 +81 S 0.028 +82 V 0.030 +83 S 0.037 +84 V 0.044 +85 G 0.045 +86 L 0.039 +87 V 0.033 +88 A 0.031 +89 L 0.032 +90 L 0.037 +91 A 0.046 +92 S 0.056 +93 R 0.066 +94 N 0.076 +95 L 0.084 +96 L 0.085 +97 R 0.078 +98 P 0.067 +99 R 0.056 +100 L 0.048 +101 H 0.042 +102 W 0.039 +103 A 0.041 +104 L 0.048 +105 L 0.058 +106 T 0.062 +107 L 0.056 +108 A 0.045 +109 L 0.039 +110 V 0.037 +111 N 0.036 +112 L 0.033 +113 L 0.031 +114 L 0.029 +115 S 0.028 +116 A 0.027 +117 A 0.027 +118 C 0.030 +119 S 0.034 +120 M 0.036 +121 G 0.034 +122 L 0.030 +123 L 0.026 +124 L 0.026 +125 A 0.026 +126 V 0.027 +127 S 0.028 +128 L 0.031 +129 T 0.036 +130 V 0.045 +131 A 0.064 +132 N 0.093 +133 G 0.129 +134 G 0.159 +135 R 0.181 +136 R 0.198 +137 L 0.213 +138 I 0.222 +139 A 0.229 +140 D 0.243 +141 C 0.272 +142 H 0.326 +143 P 0.403 +144 G 0.479 +145 L 0.522 +146 M 0.531 +147 D 0.526 +148 P 0.530 +149 S 0.548 +150 I 0.578 +151 P 0.609 +152 L 0.628 +153 D 0.625 +154 Q 0.612 +155 G 0.611 +156 P 0.622 +157 G 0.619 +158 H 0.580 +159 T 0.508 +160 D 0.422 +161 C 0.342 +162 S 0.277 +163 F 0.224 +164 D 0.179 +165 P 0.142 +166 T 0.115 +167 R 0.099 +168 I 0.089 +169 Y 0.083 +170 D 0.081 +171 T 0.081 +172 A 0.079 +173 L 0.073 +174 A 0.061 +175 L 0.050 +176 W 0.044 +177 I 0.043 +178 P 0.047 +179 S 0.050 +180 L 0.051 +181 F 0.049 +182 M 0.051 +183 S 0.055 +184 A 0.060 +185 A 0.061 +186 E 0.057 +187 A 0.048 +188 A 0.039 +189 L 0.034 +190 S 0.032 +191 G 0.030 +192 Y 0.025 +193 C 0.020 +194 C 0.018 +195 V 0.020 +196 A 0.024 +197 A 0.031 +198 L 0.046 +199 T 0.068 +200 L 0.102 +201 R 0.153 +202 G 0.214 +203 I 0.280 +204 G 0.345 +205 P 0.399 +206 C 0.424 +207 R 0.419 +208 K 0.397 +209 E 0.379 +210 G 0.361 +211 L 0.329 +212 Q 0.289 +213 E 0.261 +214 Q 0.249 +215 L 0.243 +216 Q 0.249 +217 E 0.270 +218 L 0.294 +219 T 0.310 +220 E 0.330 +221 L 0.359 +222 E 0.386 +223 L 0.398 +224 P 0.399 +225 E 0.396 +226 C 0.388 +227 K 0.380 +228 R 0.386 +229 Q 0.415 +230 E 0.453 +231 N 0.473 +232 V 0.466 +233 Q 0.445 +234 L 0.425 +235 L 0.419 +236 H 0.430 +237 G 0.439 +238 R 0.430 +239 Q 0.423 +240 D 0.430 +241 F 0.422 +242 Q 0.393 +243 A 0.377 +244 L 0.393 +245 Q 0.424 +246 K 0.457 +247 T 0.481 +248 W 0.475 +249 V 0.452 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029161.9_ENSMUST00000031051.9_GN:Cgref1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029161.9_ENSMUST00000031051.9_GN:Cgref1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2ef8d3cd1500f82f9cf2d8d4f068ac2316fe147c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029161.9_ENSMUST00000031051.9_GN:Cgref1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,281 @@ +>ENSMUSG00000029161.9|ENSMUST00000031051.9|GN:Cgref1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.244 +2 F 0.238 +3 Q 0.233 +4 W 0.235 +5 L 0.242 +6 M 0.253 +7 Q 0.281 +8 A 0.327 +9 L 0.370 +10 M 0.402 +11 L 0.426 +12 P 0.436 +13 L 0.424 +14 L 0.408 +15 L 0.412 +16 L 0.450 +17 P 0.517 +18 L 0.594 +19 G 0.655 +20 R 0.687 +21 A 0.693 +22 A 0.693 +23 P 0.705 +24 K 0.725 +25 D 0.736 +26 G 0.724 +27 V 0.685 +28 A 0.624 +29 R 0.547 +30 L 0.466 +31 D 0.398 +32 P 0.358 +33 E 0.347 +34 V 0.349 +35 Q 0.358 +36 Q 0.366 +37 Q 0.360 +38 L 0.332 +39 T 0.285 +40 P 0.231 +41 N 0.181 +42 P 0.142 +43 F 0.118 +44 Q 0.107 +45 P 0.097 +46 G 0.079 +47 P 0.057 +48 E 0.039 +49 Q 0.029 +50 L 0.025 +51 R 0.023 +52 H 0.021 +53 L 0.020 +54 Q 0.023 +55 N 0.031 +56 Y 0.046 +57 L 0.068 +58 K 0.090 +59 G 0.110 +60 L 0.132 +61 E 0.156 +62 K 0.180 +63 M 0.198 +64 E 0.209 +65 E 0.214 +66 D 0.216 +67 P 0.208 +68 E 0.188 +69 H 0.159 +70 M 0.127 +71 D 0.096 +72 R 0.072 +73 E 0.057 +74 Q 0.050 +75 V 0.047 +76 L 0.043 +77 L 0.040 +78 S 0.039 +79 L 0.038 +80 F 0.035 +81 A 0.031 +82 L 0.030 +83 H 0.036 +84 D 0.051 +85 Y 0.071 +86 D 0.088 +87 Q 0.099 +88 N 0.109 +89 G 0.121 +90 Q 0.128 +91 L 0.119 +92 D 0.094 +93 G 0.069 +94 L 0.052 +95 E 0.044 +96 L 0.039 +97 L 0.036 +98 S 0.034 +99 M 0.035 +100 L 0.037 +101 T 0.041 +102 A 0.054 +103 A 0.081 +104 L 0.120 +105 A 0.166 +106 P 0.207 +107 G 0.227 +108 A 0.219 +109 A 0.194 +110 H 0.172 +111 F 0.159 +112 P 0.145 +113 I 0.123 +114 N 0.099 +115 P 0.083 +116 V 0.070 +117 I 0.059 +118 L 0.053 +119 V 0.052 +120 V 0.053 +121 D 0.055 +122 S 0.060 +123 V 0.068 +124 L 0.073 +125 E 0.071 +126 T 0.067 +127 Q 0.072 +128 D 0.091 +129 L 0.122 +130 D 0.151 +131 G 0.166 +132 D 0.164 +133 G 0.153 +134 L 0.135 +135 M 0.108 +136 T 0.079 +137 P 0.059 +138 A 0.054 +139 E 0.055 +140 L 0.056 +141 I 0.062 +142 N 0.080 +143 F 0.111 +144 P 0.156 +145 E 0.224 +146 V 0.318 +147 P 0.419 +148 K 0.501 +149 H 0.554 +150 T 0.586 +151 E 0.602 +152 S 0.603 +153 L 0.605 +154 P 0.628 +155 P 0.668 +156 A 0.696 +157 L 0.699 +158 Q 0.694 +159 E 0.696 +160 P 0.709 +161 Q 0.734 +162 P 0.766 +163 A 0.792 +164 G 0.799 +165 S 0.792 +166 Q 0.787 +167 P 0.796 +168 L 0.814 +169 L 0.825 +170 A 0.821 +171 N 0.809 +172 S 0.806 +173 P 0.817 +174 L 0.833 +175 Q 0.843 +176 S 0.846 +177 E 0.843 +178 T 0.835 +179 Q 0.826 +180 Q 0.815 +181 S 0.805 +182 L 0.795 +183 G 0.783 +184 T 0.765 +185 K 0.741 +186 E 0.700 +187 I 0.631 +188 R 0.548 +189 S 0.490 +190 Q 0.469 +191 V 0.460 +192 E 0.457 +193 A 0.485 +194 K 0.557 +195 R 0.637 +196 A 0.690 +197 S 0.709 +198 L 0.712 +199 E 0.718 +200 P 0.738 +201 E 0.769 +202 Q 0.796 +203 E 0.809 +204 A 0.796 +205 G 0.749 +206 H 0.684 +207 Q 0.654 +208 T 0.694 +209 E 0.763 +210 G 0.810 +211 K 0.824 +212 V 0.820 +213 D 0.807 +214 T 0.785 +215 L 0.759 +216 S 0.741 +217 P 0.739 +218 E 0.749 +219 E 0.761 +220 E 0.772 +221 A 0.783 +222 R 0.794 +223 G 0.806 +224 Q 0.816 +225 A 0.821 +226 E 0.823 +227 S 0.821 +228 E 0.816 +229 G 0.806 +230 D 0.794 +231 V 0.783 +232 P 0.781 +233 G 0.792 +234 P 0.809 +235 R 0.823 +236 E 0.831 +237 G 0.832 +238 A 0.827 +239 E 0.823 +240 E 0.824 +241 Q 0.829 +242 V 0.830 +243 E 0.822 +244 I 0.810 +245 K 0.794 +246 D 0.775 +247 N 0.750 +248 E 0.722 +249 G 0.695 +250 E 0.654 +251 A 0.591 +252 K 0.530 +253 E 0.514 +254 L 0.547 +255 L 0.581 +256 V 0.582 +257 E 0.573 +258 T 0.582 +259 L 0.604 +260 E 0.625 +261 S 0.638 +262 L 0.641 +263 N 0.640 +264 T 0.651 +265 P 0.678 +266 N 0.712 +267 E 0.738 +268 A 0.750 +269 E 0.752 +270 A 0.752 +271 H 0.757 +272 S 0.764 +273 I 0.765 +274 Q 0.760 +275 L 0.746 +276 E 0.723 +277 N 0.689 +278 D 0.640 +279 E 0.575 +280 I 0.524 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029161.9_ENSMUST00000031051.9_GN:Cgref1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:45.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029161.9_ENSMUST00000031051.9_GN:Cgref1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:45.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..102aca7ef9a1ab69cd008812fca9d6197d0f9dd9 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029161.9_ENSMUST00000031051.9_GN:Cgref1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:45.caid @@ -0,0 +1,326 @@ +>ENSMUSG00000029161.9|ENSMUST00000031051.9|GN:Cgref1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:45 +1 M 0.433 +2 A 0.481 +3 T 0.541 +4 W 0.587 +5 S 0.617 +6 R 0.645 +7 P 0.680 +8 G 0.721 +9 E 0.752 +10 G 0.755 +11 R 0.719 +12 L 0.659 +13 R 0.625 +14 A 0.640 +15 A 0.654 +16 G 0.626 +17 R 0.599 +18 E 0.624 +19 R 0.683 +20 R 0.730 +21 G 0.742 +22 A 0.714 +23 Y 0.662 +24 R 0.637 +25 V 0.672 +26 H 0.734 +27 E 0.778 +28 A 0.793 +29 G 0.793 +30 A 0.795 +31 P 0.807 +32 V 0.823 +33 A 0.836 +34 H 0.842 +35 S 0.841 +36 A 0.836 +37 A 0.824 +38 A 0.803 +39 A 0.776 +40 A 0.747 +41 P 0.722 +42 V 0.694 +43 S 0.646 +44 S 0.568 +45 R 0.484 +46 M 0.419 +47 F 0.375 +48 Q 0.351 +49 W 0.350 +50 L 0.358 +51 M 0.365 +52 Q 0.390 +53 A 0.433 +54 L 0.470 +55 M 0.487 +56 L 0.495 +57 P 0.497 +58 L 0.486 +59 L 0.470 +60 L 0.471 +61 L 0.505 +62 P 0.572 +63 L 0.649 +64 G 0.708 +65 R 0.736 +66 A 0.740 +67 A 0.740 +68 P 0.748 +69 K 0.765 +70 D 0.774 +71 G 0.760 +72 V 0.720 +73 A 0.659 +74 R 0.583 +75 L 0.503 +76 D 0.436 +77 P 0.402 +78 E 0.397 +79 V 0.402 +80 Q 0.409 +81 Q 0.414 +82 Q 0.401 +83 L 0.360 +84 T 0.298 +85 P 0.232 +86 N 0.174 +87 P 0.133 +88 F 0.109 +89 Q 0.098 +90 P 0.087 +91 G 0.070 +92 P 0.049 +93 E 0.034 +94 Q 0.026 +95 L 0.022 +96 R 0.020 +97 H 0.018 +98 L 0.017 +99 Q 0.019 +100 N 0.025 +101 Y 0.038 +102 L 0.055 +103 K 0.071 +104 G 0.087 +105 L 0.105 +106 E 0.127 +107 K 0.149 +108 M 0.168 +109 E 0.183 +110 E 0.196 +111 D 0.206 +112 P 0.205 +113 E 0.187 +114 H 0.156 +115 M 0.122 +116 D 0.090 +117 R 0.068 +118 E 0.055 +119 Q 0.050 +120 V 0.046 +121 L 0.042 +122 L 0.039 +123 S 0.037 +124 L 0.036 +125 F 0.035 +126 A 0.031 +127 L 0.031 +128 H 0.039 +129 D 0.056 +130 Y 0.078 +131 D 0.097 +132 Q 0.110 +133 N 0.121 +134 G 0.133 +135 Q 0.137 +136 L 0.125 +137 D 0.099 +138 G 0.074 +139 L 0.058 +140 E 0.049 +141 L 0.042 +142 L 0.036 +143 S 0.033 +144 M 0.034 +145 L 0.035 +146 T 0.040 +147 A 0.053 +148 A 0.081 +149 L 0.123 +150 A 0.174 +151 P 0.221 +152 G 0.247 +153 A 0.244 +154 A 0.222 +155 H 0.200 +156 F 0.185 +157 P 0.167 +158 I 0.141 +159 N 0.116 +160 P 0.096 +161 V 0.081 +162 I 0.069 +163 L 0.064 +164 V 0.063 +165 V 0.064 +166 D 0.066 +167 S 0.070 +168 V 0.077 +169 L 0.080 +170 E 0.076 +171 T 0.071 +172 Q 0.076 +173 D 0.095 +174 L 0.127 +175 D 0.158 +176 G 0.173 +177 D 0.171 +178 G 0.159 +179 L 0.140 +180 M 0.112 +181 T 0.081 +182 P 0.059 +183 A 0.052 +184 E 0.053 +185 L 0.053 +186 I 0.057 +187 N 0.071 +188 F 0.097 +189 P 0.139 +190 E 0.205 +191 V 0.296 +192 P 0.394 +193 K 0.472 +194 H 0.523 +195 T 0.555 +196 E 0.574 +197 S 0.579 +198 L 0.585 +199 P 0.613 +200 P 0.660 +201 A 0.694 +202 L 0.701 +203 Q 0.696 +204 E 0.698 +205 P 0.712 +206 Q 0.738 +207 P 0.770 +208 A 0.796 +209 G 0.805 +210 S 0.800 +211 Q 0.798 +212 P 0.808 +213 L 0.824 +214 L 0.832 +215 A 0.825 +216 N 0.810 +217 S 0.806 +218 P 0.816 +219 L 0.831 +220 Q 0.842 +221 S 0.845 +222 E 0.841 +223 T 0.834 +224 Q 0.825 +225 Q 0.815 +226 S 0.806 +227 L 0.799 +228 G 0.790 +229 T 0.776 +230 K 0.756 +231 E 0.722 +232 I 0.661 +233 R 0.583 +234 S 0.525 +235 Q 0.506 +236 V 0.497 +237 E 0.487 +238 A 0.508 +239 K 0.576 +240 R 0.655 +241 A 0.704 +242 S 0.719 +243 L 0.719 +244 E 0.723 +245 P 0.742 +246 E 0.771 +247 Q 0.796 +248 E 0.808 +249 A 0.796 +250 G 0.751 +251 H 0.688 +252 Q 0.660 +253 T 0.698 +254 E 0.767 +255 G 0.813 +256 K 0.829 +257 V 0.825 +258 D 0.812 +259 T 0.791 +260 L 0.767 +261 S 0.751 +262 P 0.749 +263 E 0.757 +264 E 0.767 +265 E 0.776 +266 A 0.786 +267 R 0.798 +268 G 0.810 +269 Q 0.818 +270 A 0.823 +271 E 0.824 +272 S 0.822 +273 E 0.817 +274 G 0.807 +275 D 0.794 +276 V 0.782 +277 P 0.779 +278 G 0.789 +279 P 0.806 +280 R 0.821 +281 E 0.825 +282 G 0.815 +283 A 0.795 +284 E 0.783 +285 E 0.794 +286 Q 0.816 +287 V 0.828 +288 E 0.825 +289 I 0.813 +290 K 0.798 +291 D 0.779 +292 N 0.755 +293 E 0.730 +294 G 0.704 +295 E 0.665 +296 A 0.603 +297 K 0.542 +298 E 0.528 +299 L 0.572 +300 L 0.635 +301 V 0.679 +302 E 0.694 +303 T 0.686 +304 L 0.670 +305 E 0.663 +306 S 0.665 +307 L 0.666 +308 N 0.664 +309 T 0.674 +310 P 0.701 +311 N 0.733 +312 E 0.758 +313 A 0.767 +314 E 0.768 +315 A 0.767 +316 H 0.770 +317 S 0.776 +318 I 0.778 +319 Q 0.773 +320 L 0.759 +321 E 0.737 +322 N 0.703 +323 D 0.655 +324 E 0.592 +325 I 0.542 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029389.18_ENSMUST00000071057.14_GN:Ddx55_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029389.18_ENSMUST00000071057.14_GN:Ddx55_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e44b56808cf3f84e8a364d3a44f09c94d8fe657c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029389.18_ENSMUST00000071057.14_GN:Ddx55_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,601 @@ +>ENSMUSG00000029389.18|ENSMUST00000071057.14|GN:Ddx55|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.253 +2 E 0.235 +3 H 0.214 +4 V 0.197 +5 T 0.183 +6 E 0.163 +7 G 0.134 +8 A 0.101 +9 W 0.074 +10 E 0.062 +11 S 0.063 +12 L 0.069 +13 Q 0.073 +14 V 0.072 +15 P 0.068 +16 L 0.061 +17 H 0.053 +18 P 0.048 +19 R 0.047 +20 V 0.047 +21 L 0.048 +22 G 0.049 +23 A 0.046 +24 L 0.043 +25 R 0.041 +26 E 0.044 +27 L 0.050 +28 G 0.055 +29 F 0.056 +30 P 0.053 +31 H 0.048 +32 M 0.043 +33 T 0.040 +34 P 0.041 +35 V 0.045 +36 Q 0.047 +37 S 0.046 +38 A 0.043 +39 T 0.038 +40 I 0.033 +41 P 0.029 +42 L 0.029 +43 F 0.035 +44 M 0.047 +45 K 0.062 +46 N 0.078 +47 K 0.092 +48 D 0.099 +49 V 0.101 +50 A 0.102 +51 A 0.107 +52 E 0.115 +53 A 0.118 +54 V 0.116 +55 T 0.116 +56 G 0.121 +57 S 0.126 +58 G 0.124 +59 K 0.112 +60 T 0.094 +61 L 0.077 +62 A 0.065 +63 F 0.058 +64 V 0.055 +65 I 0.052 +66 P 0.048 +67 I 0.043 +68 L 0.039 +69 E 0.037 +70 I 0.038 +71 L 0.040 +72 L 0.041 +73 R 0.044 +74 R 0.054 +75 E 0.072 +76 E 0.095 +77 K 0.114 +78 L 0.121 +79 K 0.120 +80 K 0.117 +81 N 0.110 +82 Q 0.095 +83 V 0.074 +84 G 0.054 +85 A 0.041 +86 I 0.040 +87 V 0.043 +88 I 0.042 +89 T 0.037 +90 P 0.031 +91 T 0.029 +92 R 0.030 +93 E 0.035 +94 L 0.039 +95 A 0.038 +96 I 0.038 +97 Q 0.044 +98 I 0.058 +99 D 0.072 +100 E 0.075 +101 V 0.066 +102 L 0.052 +103 S 0.040 +104 H 0.032 +105 F 0.027 +106 T 0.025 +107 K 0.024 +108 H 0.024 +109 F 0.023 +110 P 0.022 +111 Q 0.020 +112 F 0.020 +113 S 0.021 +114 Q 0.024 +115 I 0.026 +116 L 0.026 +117 W 0.025 +118 I 0.025 +119 G 0.029 +120 G 0.036 +121 R 0.042 +122 N 0.043 +123 P 0.042 +124 G 0.039 +125 E 0.038 +126 D 0.044 +127 V 0.056 +128 E 0.065 +129 R 0.063 +130 F 0.055 +131 K 0.052 +132 Q 0.057 +133 H 0.062 +134 G 0.058 +135 G 0.050 +136 N 0.045 +137 I 0.046 +138 I 0.047 +139 V 0.047 +140 A 0.046 +141 T 0.045 +142 P 0.044 +143 G 0.041 +144 R 0.037 +145 L 0.033 +146 E 0.031 +147 D 0.033 +148 M 0.037 +149 F 0.044 +150 R 0.054 +151 R 0.071 +152 K 0.095 +153 A 0.118 +154 E 0.132 +155 G 0.136 +156 L 0.128 +157 D 0.107 +158 L 0.078 +159 A 0.054 +160 S 0.042 +161 C 0.042 +162 V 0.046 +163 K 0.046 +164 S 0.040 +165 L 0.032 +166 D 0.025 +167 V 0.022 +168 L 0.022 +169 V 0.022 +170 L 0.022 +171 D 0.024 +172 E 0.029 +173 A 0.034 +174 D 0.040 +175 R 0.047 +176 L 0.053 +177 L 0.055 +178 D 0.053 +179 M 0.052 +180 G 0.053 +181 F 0.053 +182 E 0.048 +183 A 0.043 +184 S 0.040 +185 I 0.039 +186 N 0.039 +187 T 0.039 +188 I 0.037 +189 L 0.036 +190 E 0.035 +191 F 0.035 +192 L 0.034 +193 P 0.035 +194 K 0.037 +195 Q 0.038 +196 R 0.037 +197 R 0.034 +198 T 0.033 +199 G 0.034 +200 L 0.039 +201 F 0.049 +202 S 0.065 +203 A 0.082 +204 T 0.094 +205 Q 0.095 +206 T 0.084 +207 Q 0.069 +208 E 0.058 +209 V 0.052 +210 E 0.052 +211 N 0.055 +212 L 0.061 +213 V 0.067 +214 R 0.071 +215 A 0.075 +216 G 0.079 +217 L 0.089 +218 R 0.103 +219 N 0.109 +220 P 0.101 +221 V 0.085 +222 R 0.079 +223 I 0.092 +224 S 0.126 +225 V 0.184 +226 K 0.264 +227 E 0.353 +228 K 0.429 +229 G 0.478 +230 V 0.502 +231 A 0.508 +232 A 0.498 +233 S 0.465 +234 S 0.411 +235 T 0.348 +236 Q 0.297 +237 K 0.270 +238 T 0.256 +239 P 0.231 +240 S 0.188 +241 R 0.139 +242 L 0.097 +243 E 0.067 +244 N 0.048 +245 H 0.036 +246 Y 0.033 +247 M 0.036 +248 I 0.042 +249 C 0.043 +250 K 0.041 +251 A 0.040 +252 D 0.043 +253 E 0.046 +254 K 0.043 +255 F 0.038 +256 N 0.035 +257 Q 0.032 +258 L 0.028 +259 V 0.025 +260 H 0.024 +261 F 0.025 +262 L 0.028 +263 R 0.029 +264 S 0.030 +265 R 0.032 +266 Q 0.034 +267 Q 0.036 +268 E 0.036 +269 K 0.033 +270 H 0.030 +271 L 0.030 +272 V 0.034 +273 F 0.038 +274 F 0.037 +275 S 0.032 +276 T 0.027 +277 C 0.024 +278 A 0.025 +279 C 0.025 +280 V 0.025 +281 E 0.025 +282 Y 0.025 +283 Y 0.026 +284 G 0.027 +285 K 0.029 +286 A 0.030 +287 L 0.031 +288 E 0.031 +289 A 0.030 +290 L 0.030 +291 L 0.032 +292 K 0.036 +293 K 0.041 +294 V 0.045 +295 K 0.047 +296 I 0.044 +297 L 0.036 +298 C 0.029 +299 I 0.026 +300 H 0.031 +301 G 0.042 +302 K 0.053 +303 M 0.059 +304 K 0.057 +305 Y 0.049 +306 K 0.043 +307 R 0.044 +308 N 0.053 +309 K 0.062 +310 I 0.066 +311 F 0.067 +312 M 0.066 +313 E 0.058 +314 F 0.045 +315 R 0.036 +316 K 0.034 +317 L 0.037 +318 Q 0.046 +319 S 0.056 +320 G 0.065 +321 I 0.068 +322 L 0.068 +323 V 0.063 +324 C 0.057 +325 T 0.056 +326 D 0.065 +327 V 0.079 +328 M 0.089 +329 A 0.092 +330 R 0.088 +331 G 0.084 +332 I 0.084 +333 D 0.087 +334 I 0.089 +335 P 0.085 +336 E 0.074 +337 V 0.059 +338 N 0.046 +339 W 0.037 +340 V 0.030 +341 L 0.029 +342 Q 0.033 +343 Y 0.046 +344 D 0.067 +345 P 0.088 +346 P 0.098 +347 S 0.096 +348 N 0.088 +349 A 0.080 +350 S 0.071 +351 A 0.062 +352 F 0.058 +353 V 0.057 +354 H 0.058 +355 R 0.062 +356 C 0.067 +357 G 0.075 +358 R 0.089 +359 T 0.110 +360 A 0.130 +361 R 0.140 +362 I 0.148 +363 G 0.161 +364 H 0.176 +365 G 0.180 +366 G 0.169 +367 S 0.146 +368 A 0.123 +369 L 0.109 +370 V 0.101 +371 F 0.095 +372 L 0.090 +373 L 0.082 +374 P 0.072 +375 M 0.062 +376 E 0.053 +377 E 0.046 +378 A 0.043 +379 Y 0.050 +380 I 0.064 +381 N 0.073 +382 F 0.072 +383 L 0.069 +384 A 0.072 +385 I 0.083 +386 N 0.095 +387 Q 0.106 +388 K 0.114 +389 C 0.120 +390 P 0.117 +391 L 0.102 +392 Q 0.084 +393 E 0.070 +394 M 0.063 +395 S 0.066 +396 L 0.079 +397 Q 0.095 +398 R 0.104 +399 N 0.103 +400 T 0.100 +401 I 0.099 +402 D 0.098 +403 L 0.093 +404 L 0.084 +405 P 0.074 +406 K 0.069 +407 L 0.074 +408 R 0.089 +409 A 0.105 +410 M 0.116 +411 A 0.125 +412 L 0.132 +413 A 0.134 +414 D 0.127 +415 R 0.115 +416 A 0.103 +417 V 0.089 +418 F 0.074 +419 E 0.064 +420 K 0.061 +421 G 0.060 +422 M 0.059 +423 K 0.059 +424 A 0.059 +425 F 0.054 +426 V 0.044 +427 S 0.036 +428 F 0.031 +429 V 0.029 +430 Q 0.031 +431 A 0.040 +432 Y 0.057 +433 A 0.076 +434 K 0.092 +435 H 0.102 +436 E 0.102 +437 C 0.096 +438 S 0.090 +439 L 0.089 +440 I 0.093 +441 F 0.097 +442 R 0.100 +443 L 0.101 +444 K 0.104 +445 D 0.103 +446 L 0.096 +447 D 0.081 +448 F 0.066 +449 A 0.056 +450 G 0.053 +451 L 0.054 +452 A 0.056 +453 R 0.057 +454 G 0.058 +455 F 0.066 +456 A 0.079 +457 L 0.090 +458 L 0.095 +459 R 0.096 +460 M 0.095 +461 P 0.094 +462 R 0.094 +463 M 0.100 +464 P 0.107 +465 E 0.113 +466 L 0.118 +467 R 0.124 +468 G 0.131 +469 K 0.136 +470 Q 0.142 +471 F 0.152 +472 P 0.162 +473 D 0.166 +474 F 0.165 +475 V 0.166 +476 P 0.176 +477 V 0.201 +478 D 0.234 +479 I 0.255 +480 D 0.252 +481 T 0.232 +482 D 0.212 +483 T 0.199 +484 I 0.192 +485 P 0.190 +486 F 0.192 +487 K 0.194 +488 D 0.188 +489 K 0.172 +490 I 0.156 +491 R 0.152 +492 E 0.159 +493 K 0.176 +494 Q 0.196 +495 R 0.211 +496 Q 0.216 +497 K 0.215 +498 L 0.213 +499 L 0.215 +500 E 0.224 +501 Q 0.239 +502 K 0.254 +503 R 0.261 +504 K 0.268 +505 E 0.285 +506 R 0.308 +507 S 0.328 +508 E 0.344 +509 N 0.359 +510 E 0.369 +511 G 0.374 +512 R 0.375 +513 K 0.380 +514 K 0.390 +515 F 0.400 +516 I 0.405 +517 K 0.400 +518 N 0.387 +519 K 0.365 +520 A 0.340 +521 W 0.318 +522 S 0.304 +523 K 0.296 +524 Q 0.291 +525 K 0.289 +526 A 0.291 +527 K 0.288 +528 K 0.276 +529 E 0.261 +530 R 0.255 +531 K 0.248 +532 K 0.242 +533 K 0.250 +534 M 0.278 +535 N 0.306 +536 A 0.322 +537 K 0.330 +538 R 0.345 +539 K 0.372 +540 K 0.407 +541 D 0.442 +542 E 0.470 +543 G 0.489 +544 S 0.497 +545 D 0.491 +546 I 0.476 +547 D 0.462 +548 D 0.449 +549 E 0.428 +550 D 0.398 +551 M 0.367 +552 E 0.340 +553 E 0.318 +554 L 0.299 +555 L 0.278 +556 N 0.249 +557 D 0.216 +558 T 0.183 +559 R 0.157 +560 L 0.143 +561 L 0.137 +562 K 0.133 +563 K 0.132 +564 F 0.143 +565 K 0.171 +566 K 0.206 +567 G 0.226 +568 K 0.214 +569 I 0.181 +570 T 0.154 +571 E 0.146 +572 E 0.147 +573 E 0.152 +574 F 0.161 +575 E 0.170 +576 K 0.178 +577 G 0.188 +578 L 0.203 +579 L 0.220 +580 T 0.245 +581 S 0.282 +582 A 0.325 +583 K 0.369 +584 R 0.418 +585 T 0.468 +586 V 0.503 +587 Q 0.519 +588 L 0.530 +589 T 0.542 +590 D 0.561 +591 L 0.587 +592 G 0.620 +593 V 0.650 +594 S 0.673 +595 D 0.687 +596 L 0.697 +597 E 0.700 +598 E 0.690 +599 D 0.667 +600 S 0.644 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029389.18_ENSMUST00000071057.14_GN:Ddx55_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:18.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029389.18_ENSMUST00000071057.14_GN:Ddx55_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:18.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..44502df6029fbae336a735ca65d1429f2739c604 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000029389.18_ENSMUST00000071057.14_GN:Ddx55_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:18.caid @@ -0,0 +1,619 @@ +>ENSMUSG00000029389.18|ENSMUST00000071057.14|GN:Ddx55|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:18 +1 M 0.248 +2 L 0.242 +3 L 0.244 +4 Q 0.271 +5 R 0.320 +6 C 0.368 +7 G 0.396 +8 R 0.411 +9 L 0.421 +10 K 0.430 +11 P 0.444 +12 A 0.464 +13 E 0.484 +14 N 0.500 +15 R 0.508 +16 G 0.502 +17 R 0.478 +18 A 0.436 +19 M 0.376 +20 E 0.311 +21 H 0.254 +22 V 0.212 +23 T 0.180 +24 E 0.150 +25 G 0.120 +26 A 0.090 +27 W 0.067 +28 E 0.058 +29 S 0.060 +30 L 0.067 +31 Q 0.072 +32 V 0.073 +33 P 0.070 +34 L 0.062 +35 H 0.054 +36 P 0.049 +37 R 0.047 +38 V 0.047 +39 L 0.048 +40 G 0.048 +41 A 0.045 +42 L 0.042 +43 R 0.040 +44 E 0.042 +45 L 0.047 +46 G 0.052 +47 F 0.052 +48 P 0.050 +49 H 0.045 +50 M 0.040 +51 T 0.037 +52 P 0.038 +53 V 0.043 +54 Q 0.045 +55 S 0.044 +56 A 0.041 +57 T 0.036 +58 I 0.032 +59 P 0.028 +60 L 0.027 +61 F 0.033 +62 M 0.045 +63 K 0.060 +64 N 0.075 +65 K 0.088 +66 D 0.095 +67 V 0.095 +68 A 0.095 +69 A 0.099 +70 E 0.105 +71 A 0.108 +72 V 0.107 +73 T 0.107 +74 G 0.113 +75 S 0.118 +76 G 0.116 +77 K 0.105 +78 T 0.088 +79 L 0.072 +80 A 0.061 +81 F 0.054 +82 V 0.051 +83 I 0.048 +84 P 0.045 +85 I 0.040 +86 L 0.036 +87 E 0.034 +88 I 0.036 +89 L 0.038 +90 L 0.039 +91 R 0.042 +92 R 0.052 +93 E 0.070 +94 E 0.093 +95 K 0.112 +96 L 0.119 +97 K 0.117 +98 K 0.114 +99 N 0.107 +100 Q 0.093 +101 V 0.072 +102 G 0.053 +103 A 0.041 +104 I 0.040 +105 V 0.043 +106 I 0.043 +107 T 0.037 +108 P 0.031 +109 T 0.028 +110 R 0.029 +111 E 0.033 +112 L 0.037 +113 A 0.037 +114 I 0.036 +115 Q 0.043 +116 I 0.057 +117 D 0.071 +118 E 0.074 +119 V 0.064 +120 L 0.051 +121 S 0.039 +122 H 0.031 +123 F 0.026 +124 T 0.024 +125 K 0.024 +126 H 0.024 +127 F 0.023 +128 P 0.022 +129 Q 0.021 +130 F 0.021 +131 S 0.022 +132 Q 0.025 +133 I 0.027 +134 L 0.027 +135 W 0.026 +136 I 0.026 +137 G 0.030 +138 G 0.036 +139 R 0.042 +140 N 0.044 +141 P 0.042 +142 G 0.039 +143 E 0.038 +144 D 0.044 +145 V 0.056 +146 E 0.065 +147 R 0.062 +148 F 0.055 +149 K 0.053 +150 Q 0.059 +151 H 0.063 +152 G 0.059 +153 G 0.050 +154 N 0.045 +155 I 0.045 +156 I 0.046 +157 V 0.046 +158 A 0.045 +159 T 0.044 +160 P 0.043 +161 G 0.040 +162 R 0.036 +163 L 0.032 +164 E 0.030 +165 D 0.032 +166 M 0.037 +167 F 0.043 +168 R 0.054 +169 R 0.071 +170 K 0.095 +171 A 0.118 +172 E 0.131 +173 G 0.134 +174 L 0.126 +175 D 0.106 +176 L 0.078 +177 A 0.054 +178 S 0.043 +179 C 0.042 +180 V 0.047 +181 K 0.047 +182 S 0.041 +183 L 0.032 +184 D 0.026 +185 V 0.023 +186 L 0.022 +187 V 0.022 +188 L 0.022 +189 D 0.024 +190 E 0.029 +191 A 0.034 +192 D 0.040 +193 R 0.047 +194 L 0.053 +195 L 0.054 +196 D 0.053 +197 M 0.052 +198 G 0.053 +199 F 0.052 +200 E 0.048 +201 A 0.043 +202 S 0.039 +203 I 0.038 +204 N 0.038 +205 T 0.037 +206 I 0.036 +207 L 0.034 +208 E 0.034 +209 F 0.033 +210 L 0.033 +211 P 0.034 +212 K 0.036 +213 Q 0.038 +214 R 0.036 +215 R 0.034 +216 T 0.033 +217 G 0.034 +218 L 0.038 +219 F 0.048 +220 S 0.062 +221 A 0.078 +222 T 0.090 +223 Q 0.091 +224 T 0.081 +225 Q 0.066 +226 E 0.056 +227 V 0.050 +228 E 0.050 +229 N 0.053 +230 L 0.059 +231 V 0.065 +232 R 0.069 +233 A 0.073 +234 G 0.077 +235 L 0.087 +236 R 0.100 +237 N 0.107 +238 P 0.099 +239 V 0.084 +240 R 0.078 +241 I 0.091 +242 S 0.125 +243 V 0.181 +244 K 0.260 +245 E 0.347 +246 K 0.422 +247 G 0.470 +248 V 0.493 +249 A 0.499 +250 A 0.490 +251 S 0.459 +252 S 0.407 +253 T 0.346 +254 Q 0.296 +255 K 0.269 +256 T 0.254 +257 P 0.229 +258 S 0.186 +259 R 0.138 +260 L 0.097 +261 E 0.068 +262 N 0.049 +263 H 0.037 +264 Y 0.034 +265 M 0.037 +266 I 0.043 +267 C 0.045 +268 K 0.042 +269 A 0.041 +270 D 0.044 +271 E 0.046 +272 K 0.043 +273 F 0.039 +274 N 0.035 +275 Q 0.032 +276 L 0.028 +277 V 0.025 +278 H 0.024 +279 F 0.026 +280 L 0.029 +281 R 0.031 +282 S 0.032 +283 R 0.034 +284 Q 0.036 +285 Q 0.038 +286 E 0.038 +287 K 0.035 +288 H 0.031 +289 L 0.032 +290 V 0.036 +291 F 0.039 +292 F 0.039 +293 S 0.034 +294 T 0.028 +295 C 0.025 +296 A 0.025 +297 C 0.026 +298 V 0.026 +299 E 0.026 +300 Y 0.026 +301 Y 0.027 +302 G 0.028 +303 K 0.029 +304 A 0.031 +305 L 0.031 +306 E 0.032 +307 A 0.031 +308 L 0.032 +309 L 0.034 +310 K 0.038 +311 K 0.043 +312 V 0.047 +313 K 0.049 +314 I 0.045 +315 L 0.037 +316 C 0.029 +317 I 0.026 +318 H 0.032 +319 G 0.043 +320 K 0.054 +321 M 0.060 +322 K 0.058 +323 Y 0.051 +324 K 0.044 +325 R 0.044 +326 N 0.053 +327 K 0.063 +328 I 0.066 +329 F 0.067 +330 M 0.066 +331 E 0.058 +332 F 0.046 +333 R 0.037 +334 K 0.035 +335 L 0.038 +336 Q 0.047 +337 S 0.058 +338 G 0.066 +339 I 0.070 +340 L 0.069 +341 V 0.063 +342 C 0.057 +343 T 0.056 +344 D 0.064 +345 V 0.077 +346 M 0.088 +347 A 0.090 +348 R 0.086 +349 G 0.082 +350 I 0.082 +351 D 0.085 +352 I 0.086 +353 P 0.083 +354 E 0.072 +355 V 0.058 +356 N 0.046 +357 W 0.037 +358 V 0.031 +359 L 0.029 +360 Q 0.033 +361 Y 0.046 +362 D 0.066 +363 P 0.087 +364 P 0.098 +365 S 0.096 +366 N 0.089 +367 A 0.081 +368 S 0.071 +369 A 0.062 +370 F 0.058 +371 V 0.057 +372 H 0.058 +373 R 0.062 +374 C 0.067 +375 G 0.074 +376 R 0.088 +377 T 0.109 +378 A 0.127 +379 R 0.137 +380 I 0.144 +381 G 0.158 +382 H 0.174 +383 G 0.179 +384 G 0.169 +385 S 0.147 +386 A 0.125 +387 L 0.110 +388 V 0.101 +389 F 0.096 +390 L 0.090 +391 L 0.082 +392 P 0.072 +393 M 0.062 +394 E 0.053 +395 E 0.046 +396 A 0.043 +397 Y 0.050 +398 I 0.064 +399 N 0.073 +400 F 0.072 +401 L 0.069 +402 A 0.072 +403 I 0.082 +404 N 0.095 +405 Q 0.106 +406 K 0.115 +407 C 0.121 +408 P 0.117 +409 L 0.103 +410 Q 0.084 +411 E 0.070 +412 M 0.063 +413 S 0.066 +414 L 0.079 +415 Q 0.095 +416 R 0.104 +417 N 0.103 +418 T 0.099 +419 I 0.098 +420 D 0.097 +421 L 0.092 +422 L 0.083 +423 P 0.073 +424 K 0.068 +425 L 0.074 +426 R 0.088 +427 A 0.105 +428 M 0.116 +429 A 0.124 +430 L 0.132 +431 A 0.133 +432 D 0.126 +433 R 0.114 +434 A 0.102 +435 V 0.089 +436 F 0.074 +437 E 0.064 +438 K 0.061 +439 G 0.060 +440 M 0.059 +441 K 0.059 +442 A 0.059 +443 F 0.054 +444 V 0.045 +445 S 0.036 +446 F 0.031 +447 V 0.029 +448 Q 0.031 +449 A 0.040 +450 Y 0.057 +451 A 0.077 +452 K 0.094 +453 H 0.103 +454 E 0.104 +455 C 0.098 +456 S 0.092 +457 L 0.091 +458 I 0.095 +459 F 0.099 +460 R 0.101 +461 L 0.102 +462 K 0.104 +463 D 0.104 +464 L 0.096 +465 D 0.081 +466 F 0.066 +467 A 0.057 +468 G 0.054 +469 L 0.055 +470 A 0.057 +471 R 0.058 +472 G 0.059 +473 F 0.067 +474 A 0.080 +475 L 0.090 +476 L 0.095 +477 R 0.096 +478 M 0.095 +479 P 0.093 +480 R 0.095 +481 M 0.100 +482 P 0.107 +483 E 0.113 +484 L 0.118 +485 R 0.124 +486 G 0.131 +487 K 0.136 +488 Q 0.142 +489 F 0.152 +490 P 0.162 +491 D 0.166 +492 F 0.165 +493 V 0.165 +494 P 0.176 +495 V 0.201 +496 D 0.234 +497 I 0.255 +498 D 0.253 +499 T 0.233 +500 D 0.213 +501 T 0.200 +502 I 0.193 +503 P 0.191 +504 F 0.193 +505 K 0.195 +506 D 0.189 +507 K 0.173 +508 I 0.157 +509 R 0.152 +510 E 0.159 +511 K 0.176 +512 Q 0.196 +513 R 0.212 +514 Q 0.217 +515 K 0.216 +516 L 0.214 +517 L 0.216 +518 E 0.225 +519 Q 0.240 +520 K 0.255 +521 R 0.262 +522 K 0.269 +523 E 0.286 +524 R 0.308 +525 S 0.327 +526 E 0.342 +527 N 0.357 +528 E 0.368 +529 G 0.372 +530 R 0.373 +531 K 0.378 +532 K 0.387 +533 F 0.398 +534 I 0.402 +535 K 0.398 +536 N 0.384 +537 K 0.362 +538 A 0.337 +539 W 0.315 +540 S 0.301 +541 K 0.295 +542 Q 0.291 +543 K 0.289 +544 A 0.291 +545 K 0.289 +546 K 0.276 +547 E 0.262 +548 R 0.257 +549 K 0.252 +550 K 0.246 +551 K 0.254 +552 M 0.281 +553 N 0.309 +554 A 0.323 +555 K 0.331 +556 R 0.346 +557 K 0.373 +558 K 0.408 +559 D 0.442 +560 E 0.470 +561 G 0.488 +562 S 0.495 +563 D 0.489 +564 I 0.475 +565 D 0.461 +566 D 0.449 +567 E 0.427 +568 D 0.396 +569 M 0.365 +570 E 0.338 +571 E 0.315 +572 L 0.297 +573 L 0.275 +574 N 0.248 +575 D 0.216 +576 T 0.184 +577 R 0.160 +578 L 0.145 +579 L 0.140 +580 K 0.136 +581 K 0.135 +582 F 0.145 +583 K 0.173 +584 K 0.209 +585 G 0.229 +586 K 0.217 +587 I 0.184 +588 T 0.156 +589 E 0.148 +590 E 0.149 +591 E 0.155 +592 F 0.164 +593 E 0.173 +594 K 0.180 +595 G 0.190 +596 L 0.205 +597 L 0.222 +598 T 0.245 +599 S 0.282 +600 A 0.325 +601 K 0.369 +602 R 0.417 +603 T 0.467 +604 V 0.502 +605 Q 0.518 +606 L 0.530 +607 T 0.542 +608 D 0.560 +609 L 0.586 +610 G 0.618 +611 V 0.647 +612 S 0.670 +613 D 0.685 +614 L 0.695 +615 E 0.698 +616 E 0.687 +617 D 0.661 +618 S 0.636 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030034.13_ENSMUST00000113935.9_GN:Ino80b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030034.13_ENSMUST00000113935.9_GN:Ino80b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0724f7c4137afd340e5ca60167d8f58da4497edd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030034.13_ENSMUST00000113935.9_GN:Ino80b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,359 @@ +>ENSMUSG00000030034.13|ENSMUST00000113935.9|GN:Ino80b|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.452 +2 S 0.489 +3 K 0.540 +4 L 0.587 +5 W 0.629 +6 R 0.675 +7 R 0.723 +8 G 0.763 +9 S 0.789 +10 T 0.806 +11 S 0.817 +12 G 0.821 +13 A 0.815 +14 M 0.799 +15 E 0.782 +16 A 0.768 +17 P 0.767 +18 E 0.783 +19 P 0.809 +20 G 0.834 +21 E 0.847 +22 T 0.852 +23 L 0.852 +24 E 0.848 +25 L 0.843 +26 S 0.840 +27 L 0.841 +28 A 0.844 +29 G 0.844 +30 A 0.839 +31 H 0.834 +32 G 0.830 +33 H 0.828 +34 G 0.823 +35 V 0.812 +36 H 0.794 +37 K 0.774 +38 K 0.747 +39 K 0.700 +40 H 0.638 +41 K 0.599 +42 K 0.611 +43 H 0.631 +44 K 0.618 +45 K 0.603 +46 K 0.623 +47 H 0.645 +48 K 0.632 +49 K 0.625 +50 K 0.671 +51 H 0.742 +52 H 0.791 +53 Q 0.811 +54 E 0.818 +55 E 0.817 +56 E 0.812 +57 A 0.808 +58 G 0.813 +59 P 0.826 +60 T 0.836 +61 L 0.835 +62 Q 0.823 +63 T 0.811 +64 P 0.807 +65 A 0.811 +66 K 0.818 +67 P 0.824 +68 Q 0.830 +69 L 0.836 +70 K 0.838 +71 L 0.834 +72 K 0.829 +73 I 0.825 +74 K 0.824 +75 L 0.824 +76 G 0.819 +77 G 0.803 +78 Q 0.777 +79 V 0.759 +80 L 0.760 +81 G 0.769 +82 T 0.775 +83 K 0.780 +84 S 0.789 +85 V 0.804 +86 P 0.825 +87 T 0.847 +88 F 0.861 +89 T 0.863 +90 V 0.857 +91 I 0.848 +92 P 0.842 +93 E 0.839 +94 G 0.839 +95 P 0.837 +96 R 0.831 +97 S 0.825 +98 P 0.826 +99 S 0.837 +100 P 0.856 +101 L 0.873 +102 M 0.882 +103 V 0.882 +104 V 0.874 +105 D 0.860 +106 N 0.840 +107 E 0.818 +108 E 0.800 +109 E 0.790 +110 P 0.790 +111 M 0.794 +112 E 0.788 +113 G 0.753 +114 V 0.682 +115 P 0.590 +116 L 0.505 +117 E 0.446 +118 Q 0.420 +119 Y 0.419 +120 R 0.440 +121 A 0.489 +122 W 0.558 +123 L 0.625 +124 D 0.671 +125 E 0.698 +126 D 0.711 +127 S 0.716 +128 N 0.714 +129 L 0.711 +130 S 0.716 +131 P 0.729 +132 S 0.747 +133 P 0.762 +134 L 0.770 +135 R 0.769 +136 D 0.763 +137 L 0.761 +138 P 0.766 +139 G 0.774 +140 D 0.771 +141 L 0.754 +142 E 0.728 +143 G 0.688 +144 Q 0.630 +145 E 0.558 +146 E 0.480 +147 E 0.400 +148 E 0.336 +149 E 0.297 +150 Q 0.274 +151 R 0.260 +152 W 0.254 +153 L 0.249 +154 D 0.247 +155 A 0.258 +156 L 0.287 +157 E 0.331 +158 K 0.397 +159 G 0.474 +160 E 0.531 +161 L 0.552 +162 D 0.541 +163 D 0.509 +164 N 0.470 +165 G 0.438 +166 D 0.416 +167 L 0.401 +168 K 0.395 +169 K 0.390 +170 E 0.362 +171 I 0.307 +172 N 0.254 +173 E 0.233 +174 R 0.245 +175 L 0.264 +176 L 0.260 +177 T 0.227 +178 A 0.183 +179 R 0.148 +180 Q 0.133 +181 R 0.141 +182 A 0.168 +183 L 0.193 +184 L 0.210 +185 Q 0.236 +186 K 0.285 +187 A 0.350 +188 R 0.416 +189 S 0.483 +190 Q 0.555 +191 P 0.629 +192 S 0.693 +193 P 0.736 +194 T 0.756 +195 L 0.764 +196 P 0.772 +197 L 0.787 +198 P 0.806 +199 V 0.823 +200 G 0.828 +201 G 0.820 +202 G 0.802 +203 C 0.779 +204 P 0.760 +205 A 0.747 +206 P 0.730 +207 A 0.694 +208 L 0.635 +209 T 0.563 +210 E 0.487 +211 E 0.412 +212 M 0.355 +213 L 0.328 +214 L 0.313 +215 K 0.289 +216 R 0.257 +217 E 0.229 +218 E 0.216 +219 R 0.216 +220 A 0.218 +221 R 0.215 +222 K 0.211 +223 R 0.214 +224 R 0.217 +225 L 0.220 +226 Q 0.230 +227 A 0.244 +228 A 0.255 +229 R 0.262 +230 R 0.274 +231 A 0.292 +232 E 0.308 +233 E 0.318 +234 H 0.326 +235 K 0.334 +236 N 0.341 +237 Q 0.349 +238 T 0.361 +239 I 0.362 +240 E 0.339 +241 R 0.310 +242 L 0.303 +243 T 0.333 +244 K 0.407 +245 T 0.508 +246 A 0.600 +247 A 0.663 +248 P 0.707 +249 S 0.740 +250 G 0.764 +251 R 0.777 +252 G 0.783 +253 G 0.785 +254 R 0.788 +255 G 0.791 +256 A 0.792 +257 A 0.791 +258 R 0.788 +259 G 0.784 +260 E 0.781 +261 R 0.779 +262 R 0.783 +263 G 0.791 +264 G 0.796 +265 R 0.791 +266 A 0.773 +267 A 0.748 +268 A 0.722 +269 P 0.702 +270 A 0.695 +271 P 0.700 +272 A 0.710 +273 P 0.705 +274 M 0.671 +275 V 0.624 +276 R 0.599 +277 Y 0.597 +278 C 0.600 +279 S 0.599 +280 G 0.597 +281 A 0.592 +282 Q 0.582 +283 G 0.567 +284 S 0.544 +285 T 0.510 +286 L 0.483 +287 S 0.489 +288 F 0.532 +289 P 0.578 +290 P 0.605 +291 G 0.616 +292 V 0.620 +293 P 0.630 +294 T 0.656 +295 P 0.696 +296 T 0.728 +297 A 0.737 +298 V 0.715 +299 A 0.677 +300 Q 0.650 +301 R 0.651 +302 P 0.668 +303 A 0.674 +304 P 0.652 +305 S 0.607 +306 G 0.545 +307 P 0.462 +308 A 0.359 +309 P 0.256 +310 R 0.176 +311 C 0.130 +312 S 0.114 +313 V 0.114 +314 P 0.112 +315 G 0.104 +316 C 0.098 +317 P 0.109 +318 H 0.132 +319 P 0.153 +320 R 0.164 +321 R 0.169 +322 Y 0.166 +323 A 0.150 +324 C 0.130 +325 S 0.117 +326 R 0.119 +327 T 0.133 +328 G 0.148 +329 Q 0.150 +330 A 0.141 +331 L 0.127 +332 C 0.108 +333 S 0.086 +334 L 0.070 +335 Q 0.062 +336 C 0.060 +337 Y 0.060 +338 R 0.058 +339 I 0.056 +340 N 0.056 +341 L 0.063 +342 Q 0.083 +343 L 0.129 +344 R 0.209 +345 L 0.316 +346 G 0.429 +347 G 0.523 +348 P 0.589 +349 E 0.627 +350 G 0.646 +351 P 0.657 +352 G 0.668 +353 S 0.682 +354 P 0.696 +355 L 0.702 +356 L 0.676 +357 A 0.614 +358 T 0.556 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030034.13_ENSMUST00000113935.9_GN:Ino80b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:17.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030034.13_ENSMUST00000113935.9_GN:Ino80b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:17.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..80d992314645d94d309c54ba75db7ba1b4237af2 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030034.13_ENSMUST00000113935.9_GN:Ino80b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:17.caid @@ -0,0 +1,376 @@ +>ENSMUSG00000030034.13|ENSMUST00000113935.9|GN:Ino80b|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:17 +1 M 0.496 +2 S 0.549 +3 A 0.620 +4 C 0.676 +5 V 0.710 +6 P 0.732 +7 T 0.745 +8 V 0.748 +9 S 0.742 +10 S 0.739 +11 P 0.749 +12 L 0.769 +13 P 0.781 +14 L 0.773 +15 Q 0.749 +16 D 0.720 +17 P 0.694 +18 M 0.678 +19 S 0.669 +20 K 0.666 +21 L 0.672 +22 W 0.697 +23 R 0.739 +24 R 0.782 +25 G 0.813 +26 S 0.830 +27 T 0.840 +28 S 0.847 +29 G 0.848 +30 A 0.841 +31 M 0.825 +32 E 0.805 +33 A 0.789 +34 P 0.786 +35 E 0.801 +36 P 0.826 +37 G 0.848 +38 E 0.860 +39 T 0.865 +40 L 0.867 +41 E 0.867 +42 L 0.865 +43 S 0.863 +44 L 0.863 +45 A 0.863 +46 G 0.861 +47 A 0.856 +48 H 0.850 +49 G 0.847 +50 H 0.845 +51 G 0.842 +52 V 0.834 +53 H 0.823 +54 K 0.811 +55 K 0.801 +56 K 0.781 +57 H 0.735 +58 K 0.670 +59 K 0.624 +60 H 0.613 +61 K 0.610 +62 K 0.614 +63 K 0.645 +64 H 0.668 +65 K 0.653 +66 K 0.643 +67 K 0.687 +68 H 0.757 +69 H 0.806 +70 Q 0.826 +71 E 0.831 +72 E 0.829 +73 E 0.823 +74 A 0.818 +75 G 0.821 +76 P 0.831 +77 T 0.840 +78 L 0.838 +79 Q 0.825 +80 T 0.812 +81 P 0.806 +82 A 0.808 +83 K 0.813 +84 P 0.818 +85 Q 0.824 +86 L 0.829 +87 K 0.830 +88 L 0.825 +89 K 0.817 +90 I 0.813 +91 K 0.814 +92 L 0.817 +93 G 0.814 +94 G 0.800 +95 Q 0.775 +96 V 0.757 +97 L 0.758 +98 G 0.767 +99 T 0.774 +100 K 0.780 +101 S 0.788 +102 V 0.800 +103 P 0.820 +104 T 0.841 +105 F 0.854 +106 T 0.855 +107 V 0.846 +108 I 0.836 +109 P 0.828 +110 E 0.826 +111 G 0.825 +112 P 0.822 +113 R 0.816 +114 S 0.809 +115 P 0.811 +116 S 0.824 +117 P 0.845 +118 L 0.863 +119 M 0.874 +120 V 0.875 +121 V 0.868 +122 D 0.854 +123 N 0.835 +124 E 0.814 +125 E 0.796 +126 E 0.788 +127 P 0.789 +128 M 0.795 +129 E 0.791 +130 G 0.759 +131 V 0.692 +132 P 0.602 +133 L 0.516 +134 E 0.455 +135 Q 0.426 +136 Y 0.425 +137 R 0.448 +138 A 0.499 +139 W 0.569 +140 L 0.635 +141 D 0.680 +142 E 0.705 +143 D 0.718 +144 S 0.723 +145 N 0.723 +146 L 0.722 +147 S 0.728 +148 P 0.742 +149 S 0.759 +150 P 0.772 +151 L 0.779 +152 R 0.778 +153 D 0.772 +154 L 0.769 +155 P 0.775 +156 G 0.782 +157 D 0.779 +158 L 0.763 +159 E 0.737 +160 G 0.696 +161 Q 0.635 +162 E 0.561 +163 E 0.481 +164 E 0.402 +165 E 0.340 +166 E 0.304 +167 Q 0.282 +168 R 0.267 +169 W 0.261 +170 L 0.256 +171 D 0.255 +172 A 0.268 +173 L 0.297 +174 E 0.339 +175 K 0.402 +176 G 0.478 +177 E 0.534 +178 L 0.554 +179 D 0.543 +180 D 0.509 +181 N 0.466 +182 G 0.429 +183 D 0.405 +184 L 0.392 +185 K 0.389 +186 K 0.384 +187 E 0.355 +188 I 0.300 +189 N 0.247 +190 E 0.225 +191 R 0.236 +192 L 0.255 +193 L 0.253 +194 T 0.222 +195 A 0.179 +196 R 0.145 +197 Q 0.131 +198 R 0.141 +199 A 0.169 +200 L 0.195 +201 L 0.213 +202 Q 0.241 +203 K 0.292 +204 A 0.358 +205 R 0.421 +206 S 0.484 +207 Q 0.554 +208 P 0.628 +209 S 0.692 +210 P 0.734 +211 T 0.754 +212 L 0.762 +213 P 0.770 +214 L 0.785 +215 P 0.804 +216 V 0.820 +217 G 0.825 +218 G 0.817 +219 G 0.798 +220 C 0.775 +221 P 0.757 +222 A 0.744 +223 P 0.728 +224 A 0.693 +225 L 0.635 +226 T 0.565 +227 E 0.491 +228 E 0.418 +229 M 0.362 +230 L 0.335 +231 L 0.320 +232 K 0.295 +233 R 0.261 +234 E 0.233 +235 E 0.218 +236 R 0.218 +237 A 0.220 +238 R 0.217 +239 K 0.214 +240 R 0.216 +241 R 0.219 +242 L 0.222 +243 Q 0.230 +244 A 0.242 +245 A 0.250 +246 R 0.256 +247 R 0.269 +248 A 0.289 +249 E 0.306 +250 E 0.317 +251 H 0.325 +252 K 0.334 +253 N 0.341 +254 Q 0.348 +255 T 0.358 +256 I 0.357 +257 E 0.334 +258 R 0.307 +259 L 0.303 +260 T 0.336 +261 K 0.412 +262 T 0.514 +263 A 0.605 +264 A 0.665 +265 P 0.707 +266 S 0.738 +267 G 0.761 +268 R 0.774 +269 G 0.779 +270 G 0.782 +271 R 0.785 +272 G 0.788 +273 A 0.790 +274 A 0.788 +275 R 0.785 +276 G 0.782 +277 E 0.779 +278 R 0.778 +279 R 0.783 +280 G 0.792 +281 G 0.797 +282 R 0.792 +283 A 0.776 +284 A 0.752 +285 A 0.727 +286 P 0.709 +287 A 0.703 +288 P 0.709 +289 A 0.721 +290 P 0.717 +291 M 0.684 +292 V 0.641 +293 R 0.621 +294 Y 0.623 +295 C 0.628 +296 S 0.626 +297 G 0.620 +298 A 0.611 +299 Q 0.599 +300 G 0.583 +301 S 0.560 +302 T 0.528 +303 L 0.502 +304 S 0.510 +305 F 0.551 +306 P 0.595 +307 P 0.619 +308 G 0.626 +309 V 0.626 +310 P 0.633 +311 T 0.659 +312 P 0.699 +313 T 0.732 +314 A 0.741 +315 V 0.722 +316 A 0.686 +317 Q 0.660 +318 R 0.660 +319 P 0.676 +320 A 0.681 +321 P 0.659 +322 S 0.614 +323 G 0.553 +324 P 0.470 +325 A 0.366 +326 P 0.261 +327 R 0.179 +328 C 0.132 +329 S 0.116 +330 V 0.115 +331 P 0.113 +332 G 0.104 +333 C 0.099 +334 P 0.109 +335 H 0.132 +336 P 0.153 +337 R 0.165 +338 R 0.171 +339 Y 0.168 +340 A 0.152 +341 C 0.132 +342 S 0.119 +343 R 0.120 +344 T 0.133 +345 G 0.148 +346 Q 0.150 +347 A 0.141 +348 L 0.127 +349 C 0.109 +350 S 0.088 +351 L 0.071 +352 Q 0.063 +353 C 0.061 +354 Y 0.061 +355 R 0.059 +356 I 0.057 +357 N 0.057 +358 L 0.064 +359 Q 0.085 +360 L 0.130 +361 R 0.210 +362 L 0.317 +363 G 0.430 +364 G 0.525 +365 P 0.591 +366 E 0.629 +367 G 0.648 +368 P 0.659 +369 G 0.671 +370 S 0.685 +371 P 0.700 +372 L 0.705 +373 L 0.679 +374 A 0.618 +375 T 0.561 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030050.5_ENSMUST00000032129.3_GN:Gkn1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030050.5_ENSMUST00000032129.3_GN:Gkn1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..60078aa5199fe0db84de792911006e1e8a248e6a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030050.5_ENSMUST00000032129.3_GN:Gkn1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,185 @@ +>ENSMUSG00000030050.5|ENSMUST00000032129.3|GN:Gkn1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.336 +2 K 0.333 +3 L 0.332 +4 T 0.328 +5 M 0.306 +6 F 0.279 +7 V 0.280 +8 V 0.311 +9 G 0.345 +10 L 0.376 +11 L 0.420 +12 G 0.468 +13 L 0.496 +14 L 0.509 +15 A 0.522 +16 A 0.526 +17 P 0.502 +18 G 0.439 +19 F 0.350 +20 A 0.263 +21 Y 0.203 +22 T 0.180 +23 V 0.191 +24 N 0.227 +25 I 0.280 +26 N 0.339 +27 G 0.391 +28 N 0.432 +29 D 0.452 +30 G 0.444 +31 N 0.425 +32 V 0.416 +33 D 0.420 +34 G 0.406 +35 S 0.357 +36 G 0.282 +37 Q 0.208 +38 Q 0.149 +39 S 0.111 +40 V 0.090 +41 S 0.084 +42 I 0.087 +43 N 0.093 +44 G 0.095 +45 V 0.093 +46 H 0.087 +47 N 0.082 +48 V 0.082 +49 A 0.091 +50 N 0.109 +51 I 0.133 +52 D 0.160 +53 N 0.186 +54 N 0.208 +55 N 0.216 +56 G 0.205 +57 W 0.177 +58 D 0.144 +59 S 0.115 +60 W 0.087 +61 N 0.064 +62 S 0.051 +63 L 0.047 +64 W 0.051 +65 D 0.058 +66 Y 0.063 +67 E 0.065 +68 N 0.060 +69 S 0.050 +70 F 0.036 +71 A 0.025 +72 A 0.022 +73 T 0.026 +74 R 0.033 +75 L 0.042 +76 F 0.052 +77 S 0.064 +78 K 0.071 +79 K 0.072 +80 S 0.069 +81 C 0.068 +82 I 0.070 +83 V 0.071 +84 H 0.070 +85 R 0.069 +86 M 0.068 +87 N 0.067 +88 K 0.070 +89 D 0.077 +90 A 0.086 +91 M 0.092 +92 P 0.091 +93 S 0.084 +94 L 0.077 +95 Q 0.072 +96 D 0.071 +97 L 0.076 +98 D 0.086 +99 T 0.095 +100 M 0.097 +101 V 0.094 +102 K 0.097 +103 E 0.113 +104 Q 0.146 +105 K 0.189 +106 G 0.224 +107 K 0.243 +108 G 0.255 +109 P 0.266 +110 G 0.274 +111 G 0.274 +112 A 0.260 +113 P 0.233 +114 P 0.200 +115 K 0.171 +116 D 0.147 +117 L 0.123 +118 M 0.103 +119 Y 0.095 +120 S 0.100 +121 V 0.103 +122 N 0.094 +123 P 0.080 +124 T 0.070 +125 R 0.065 +126 V 0.063 +127 E 0.062 +128 D 0.060 +129 L 0.058 +130 N 0.055 +131 T 0.054 +132 F 0.058 +133 G 0.064 +134 P 0.063 +135 K 0.056 +136 I 0.048 +137 A 0.043 +138 G 0.040 +139 M 0.041 +140 C 0.050 +141 R 0.074 +142 G 0.106 +143 I 0.124 +144 P 0.114 +145 T 0.090 +146 Y 0.072 +147 V 0.066 +148 A 0.069 +149 E 0.084 +150 E 0.114 +151 I 0.156 +152 P 0.198 +153 G 0.227 +154 P 0.241 +155 N 0.241 +156 Q 0.234 +157 P 0.224 +158 L 0.214 +159 Y 0.196 +160 S 0.168 +161 K 0.133 +162 K 0.100 +163 C 0.077 +164 Y 0.064 +165 T 0.057 +166 A 0.051 +167 D 0.046 +168 I 0.044 +169 L 0.049 +170 W 0.058 +171 I 0.067 +172 L 0.073 +173 R 0.074 +174 M 0.072 +175 S 0.073 +176 F 0.091 +177 C 0.140 +178 G 0.219 +179 T 0.306 +180 S 0.375 +181 V 0.411 +182 E 0.409 +183 T 0.372 +184 Y 0.334 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030050.5_ENSMUST00000032129.3_GN:Gkn1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:17.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030050.5_ENSMUST00000032129.3_GN:Gkn1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:17.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..16d74cf0921da27b6148275ca5b0a38e523328a7 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030050.5_ENSMUST00000032129.3_GN:Gkn1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:17.caid @@ -0,0 +1,202 @@ +>ENSMUSG00000030050.5|ENSMUST00000032129.3|GN:Gkn1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:17 +1 M 0.332 +2 S 0.331 +3 V 0.350 +4 S 0.398 +5 T 0.459 +6 P 0.516 +7 P 0.568 +8 D 0.610 +9 P 0.631 +10 L 0.633 +11 L 0.623 +12 H 0.611 +13 H 0.602 +14 T 0.608 +15 P 0.634 +16 A 0.663 +17 A 0.664 +18 M 0.627 +19 K 0.572 +20 L 0.517 +21 T 0.460 +22 M 0.406 +23 F 0.386 +24 V 0.409 +25 V 0.453 +26 G 0.494 +27 L 0.525 +28 L 0.544 +29 G 0.548 +30 L 0.541 +31 L 0.535 +32 A 0.536 +33 A 0.531 +34 P 0.500 +35 G 0.436 +36 F 0.347 +37 A 0.259 +38 Y 0.197 +39 T 0.174 +40 V 0.185 +41 N 0.224 +42 I 0.284 +43 N 0.349 +44 G 0.408 +45 N 0.457 +46 D 0.485 +47 G 0.481 +48 N 0.459 +49 V 0.446 +50 D 0.442 +51 G 0.422 +52 S 0.366 +53 G 0.287 +54 Q 0.211 +55 Q 0.151 +56 S 0.111 +57 V 0.090 +58 S 0.084 +59 I 0.087 +60 N 0.094 +61 G 0.097 +62 V 0.095 +63 H 0.091 +64 N 0.085 +65 V 0.084 +66 A 0.092 +67 N 0.109 +68 I 0.131 +69 D 0.157 +70 N 0.182 +71 N 0.202 +72 N 0.211 +73 G 0.199 +74 W 0.172 +75 D 0.140 +76 S 0.111 +77 W 0.085 +78 N 0.063 +79 S 0.050 +80 L 0.047 +81 W 0.050 +82 D 0.057 +83 Y 0.063 +84 E 0.064 +85 N 0.060 +86 S 0.050 +87 F 0.036 +88 A 0.025 +89 A 0.022 +90 T 0.026 +91 R 0.033 +92 L 0.041 +93 F 0.052 +94 S 0.063 +95 K 0.070 +96 K 0.071 +97 S 0.068 +98 C 0.068 +99 I 0.070 +100 V 0.071 +101 H 0.071 +102 R 0.070 +103 M 0.069 +104 N 0.068 +105 K 0.070 +106 D 0.078 +107 A 0.088 +108 M 0.094 +109 P 0.092 +110 S 0.084 +111 L 0.075 +112 Q 0.070 +113 D 0.068 +114 L 0.072 +115 D 0.082 +116 T 0.091 +117 M 0.093 +118 V 0.090 +119 K 0.093 +120 E 0.110 +121 Q 0.144 +122 K 0.188 +123 G 0.224 +124 K 0.244 +125 G 0.258 +126 P 0.272 +127 G 0.281 +128 G 0.280 +129 A 0.264 +130 P 0.235 +131 P 0.202 +132 K 0.173 +133 D 0.149 +134 L 0.125 +135 M 0.105 +136 Y 0.097 +137 S 0.102 +138 V 0.106 +139 N 0.097 +140 P 0.083 +141 T 0.072 +142 R 0.068 +143 V 0.066 +144 E 0.064 +145 D 0.061 +146 L 0.059 +147 N 0.057 +148 T 0.056 +149 F 0.060 +150 G 0.065 +151 P 0.064 +152 K 0.057 +153 I 0.049 +154 A 0.043 +155 G 0.041 +156 M 0.041 +157 C 0.050 +158 R 0.073 +159 G 0.105 +160 I 0.124 +161 P 0.115 +162 T 0.091 +163 Y 0.074 +164 V 0.068 +165 A 0.071 +166 E 0.084 +167 E 0.113 +168 I 0.154 +169 P 0.195 +170 G 0.224 +171 P 0.238 +172 N 0.238 +173 Q 0.231 +174 P 0.221 +175 L 0.211 +176 Y 0.194 +177 S 0.166 +178 K 0.131 +179 K 0.098 +180 C 0.075 +181 Y 0.062 +182 T 0.055 +183 A 0.050 +184 D 0.045 +185 I 0.044 +186 L 0.050 +187 W 0.059 +188 I 0.067 +189 L 0.073 +190 R 0.075 +191 M 0.073 +192 S 0.074 +193 F 0.093 +194 C 0.144 +195 G 0.225 +196 T 0.312 +197 S 0.378 +198 V 0.412 +199 E 0.409 +200 T 0.373 +201 Y 0.335 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030173.16_ENSMUST00000118060.8_GN:Klra5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030173.16_ENSMUST00000118060.8_GN:Klra5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e375da9560c190eb30d53175d21ef3e77dadd91b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030173.16_ENSMUST00000118060.8_GN:Klra5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,267 @@ +>ENSMUSG00000030173.16|ENSMUST00000118060.8|GN:Klra5|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.460 +2 S 0.486 +3 E 0.529 +4 P 0.571 +5 E 0.588 +6 V 0.578 +7 T 0.556 +8 Y 0.540 +9 S 0.545 +10 T 0.566 +11 V 0.586 +12 R 0.596 +13 L 0.609 +14 H 0.636 +15 K 0.671 +16 S 0.700 +17 S 0.719 +18 G 0.732 +19 L 0.737 +20 Q 0.735 +21 R 0.728 +22 L 0.726 +23 V 0.729 +24 S 0.734 +25 H 0.743 +26 E 0.757 +27 E 0.766 +28 I 0.763 +29 Q 0.760 +30 G 0.767 +31 P 0.786 +32 G 0.806 +33 E 0.817 +34 A 0.817 +35 G 0.808 +36 Y 0.792 +37 R 0.772 +38 K 0.747 +39 C 0.710 +40 S 0.656 +41 V 0.582 +42 P 0.495 +43 W 0.420 +44 Q 0.371 +45 L 0.338 +46 T 0.301 +47 V 0.259 +48 R 0.234 +49 S 0.233 +50 L 0.242 +51 G 0.242 +52 I 0.229 +53 F 0.212 +54 C 0.198 +55 F 0.192 +56 L 0.193 +57 L 0.195 +58 L 0.192 +59 V 0.186 +60 T 0.177 +61 V 0.167 +62 A 0.156 +63 V 0.145 +64 L 0.136 +65 A 0.135 +66 V 0.139 +67 K 0.144 +68 I 0.151 +69 F 0.166 +70 Q 0.191 +71 Y 0.218 +72 S 0.245 +73 Q 0.272 +74 H 0.301 +75 K 0.330 +76 Q 0.362 +77 E 0.399 +78 I 0.431 +79 H 0.443 +80 E 0.437 +81 T 0.428 +82 L 0.431 +83 N 0.445 +84 H 0.461 +85 N 0.470 +86 H 0.472 +87 N 0.470 +88 C 0.466 +89 S 0.464 +90 N 0.460 +91 M 0.437 +92 Q 0.395 +93 S 0.364 +94 D 0.349 +95 I 0.329 +96 K 0.299 +97 L 0.281 +98 K 0.285 +99 E 0.299 +100 E 0.309 +101 M 0.319 +102 L 0.339 +103 R 0.375 +104 N 0.425 +105 K 0.476 +106 S 0.507 +107 I 0.505 +108 D 0.478 +109 C 0.462 +110 S 0.474 +111 P 0.493 +112 G 0.478 +113 E 0.423 +114 E 0.357 +115 L 0.305 +116 L 0.264 +117 E 0.233 +118 S 0.214 +119 L 0.204 +120 N 0.202 +121 R 0.208 +122 E 0.218 +123 Q 0.222 +124 N 0.217 +125 R 0.211 +126 W 0.208 +127 Y 0.215 +128 S 0.243 +129 E 0.293 +130 T 0.357 +131 K 0.425 +132 T 0.499 +133 D 0.575 +134 L 0.637 +135 D 0.674 +136 S 0.688 +137 S 0.690 +138 Q 0.692 +139 D 0.696 +140 T 0.697 +141 G 0.683 +142 T 0.640 +143 G 0.553 +144 V 0.426 +145 K 0.290 +146 H 0.180 +147 W 0.110 +148 F 0.070 +149 C 0.050 +150 Y 0.040 +151 G 0.035 +152 T 0.032 +153 K 0.029 +154 C 0.027 +155 F 0.027 +156 Y 0.032 +157 F 0.044 +158 I 0.060 +159 M 0.072 +160 S 0.072 +161 K 0.059 +162 N 0.043 +163 T 0.032 +164 W 0.028 +165 S 0.030 +166 G 0.035 +167 C 0.040 +168 K 0.043 +169 Q 0.044 +170 T 0.042 +171 C 0.043 +172 Q 0.048 +173 H 0.054 +174 Y 0.058 +175 S 0.062 +176 L 0.065 +177 P 0.063 +178 L 0.059 +179 V 0.061 +180 K 0.070 +181 I 0.077 +182 E 0.073 +183 D 0.060 +184 E 0.045 +185 D 0.033 +186 E 0.025 +187 L 0.022 +188 K 0.022 +189 F 0.023 +190 L 0.024 +191 Q 0.025 +192 F 0.028 +193 Q 0.031 +194 V 0.033 +195 I 0.033 +196 S 0.032 +197 D 0.029 +198 S 0.023 +199 Y 0.017 +200 W 0.013 +201 I 0.014 +202 G 0.018 +203 L 0.022 +204 S 0.025 +205 Y 0.027 +206 D 0.030 +207 K 0.034 +208 K 0.038 +209 K 0.041 +210 K 0.043 +211 Q 0.044 +212 W 0.041 +213 A 0.036 +214 W 0.035 +215 I 0.047 +216 D 0.075 +217 N 0.113 +218 G 0.148 +219 P 0.166 +220 S 0.167 +221 K 0.164 +222 L 0.172 +223 D 0.193 +224 M 0.220 +225 K 0.248 +226 T 0.271 +227 R 0.280 +228 K 0.271 +229 M 0.249 +230 N 0.219 +231 F 0.184 +232 K 0.148 +233 P 0.116 +234 G 0.093 +235 G 0.077 +236 C 0.066 +237 I 0.056 +238 F 0.049 +239 L 0.047 +240 S 0.050 +241 K 0.057 +242 T 0.070 +243 R 0.084 +244 L 0.093 +245 E 0.092 +246 D 0.087 +247 T 0.082 +248 N 0.081 +249 C 0.081 +250 N 0.081 +251 N 0.077 +252 S 0.069 +253 Y 0.058 +254 F 0.046 +255 C 0.035 +256 I 0.027 +257 C 0.025 +258 G 0.030 +259 K 0.047 +260 K 0.081 +261 L 0.136 +262 D 0.208 +263 H 0.277 +264 F 0.323 +265 P 0.344 +266 G 0.350 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030173.16_ENSMUST00000118060.8_GN:Klra5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:44.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030173.16_ENSMUST00000118060.8_GN:Klra5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:44.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..61c524d26ce935e38d78f6bbad82506f7c491a45 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030173.16_ENSMUST00000118060.8_GN:Klra5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:44.caid @@ -0,0 +1,311 @@ +>ENSMUSG00000030173.16|ENSMUST00000118060.8|GN:Klra5|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:44 +1 M 0.485 +2 I 0.529 +3 A 0.582 +4 L 0.616 +5 Q 0.628 +6 S 0.639 +7 K 0.669 +8 G 0.710 +9 L 0.743 +10 T 0.763 +11 G 0.771 +12 R 0.766 +13 G 0.747 +14 Y 0.729 +15 R 0.726 +16 P 0.738 +17 E 0.750 +18 N 0.748 +19 A 0.728 +20 N 0.698 +21 F 0.674 +22 S 0.670 +23 P 0.674 +24 N 0.655 +25 F 0.612 +26 S 0.591 +27 L 0.625 +28 H 0.688 +29 Q 0.740 +30 N 0.770 +31 H 0.787 +32 S 0.799 +33 G 0.811 +34 R 0.821 +35 D 0.827 +36 T 0.829 +37 E 0.827 +38 H 0.825 +39 T 0.820 +40 S 0.810 +41 C 0.799 +42 T 0.797 +43 P 0.804 +44 T 0.808 +45 M 0.800 +46 S 0.786 +47 E 0.777 +48 P 0.775 +49 E 0.771 +50 V 0.762 +51 T 0.753 +52 Y 0.751 +53 S 0.759 +54 T 0.768 +55 V 0.773 +56 R 0.772 +57 L 0.773 +58 H 0.779 +59 K 0.789 +60 S 0.797 +61 S 0.804 +62 G 0.811 +63 L 0.816 +64 Q 0.818 +65 R 0.817 +66 L 0.815 +67 V 0.813 +68 S 0.813 +69 H 0.818 +70 E 0.826 +71 E 0.829 +72 I 0.825 +73 Q 0.819 +74 G 0.823 +75 P 0.835 +76 G 0.849 +77 E 0.857 +78 A 0.857 +79 G 0.849 +80 Y 0.835 +81 R 0.816 +82 K 0.791 +83 C 0.751 +84 S 0.690 +85 V 0.606 +86 P 0.510 +87 W 0.428 +88 Q 0.378 +89 L 0.345 +90 T 0.308 +91 V 0.267 +92 R 0.242 +93 S 0.241 +94 L 0.250 +95 G 0.248 +96 I 0.234 +97 F 0.216 +98 C 0.203 +99 F 0.199 +100 L 0.200 +101 L 0.200 +102 L 0.196 +103 V 0.190 +104 T 0.183 +105 V 0.176 +106 A 0.167 +107 V 0.156 +108 L 0.148 +109 A 0.146 +110 V 0.147 +111 K 0.148 +112 I 0.153 +113 F 0.164 +114 Q 0.183 +115 Y 0.207 +116 S 0.233 +117 Q 0.260 +118 H 0.288 +119 K 0.316 +120 Q 0.345 +121 E 0.376 +122 I 0.399 +123 H 0.408 +124 E 0.404 +125 T 0.399 +126 L 0.400 +127 N 0.407 +128 H 0.416 +129 N 0.424 +130 H 0.432 +131 N 0.434 +132 C 0.432 +133 S 0.435 +134 N 0.438 +135 M 0.419 +136 Q 0.378 +137 S 0.345 +138 D 0.332 +139 I 0.316 +140 K 0.288 +141 L 0.266 +142 K 0.262 +143 E 0.272 +144 E 0.286 +145 M 0.303 +146 L 0.330 +147 R 0.371 +148 N 0.421 +149 K 0.471 +150 S 0.506 +151 I 0.516 +152 D 0.506 +153 C 0.500 +154 S 0.513 +155 P 0.523 +156 G 0.499 +157 E 0.435 +158 E 0.359 +159 L 0.296 +160 L 0.248 +161 E 0.214 +162 S 0.194 +163 L 0.182 +164 N 0.180 +165 R 0.186 +166 E 0.195 +167 Q 0.197 +168 N 0.194 +169 R 0.191 +170 W 0.191 +171 Y 0.200 +172 S 0.229 +173 E 0.280 +174 T 0.345 +175 K 0.418 +176 T 0.499 +177 D 0.582 +178 L 0.650 +179 D 0.690 +180 S 0.705 +181 S 0.706 +182 Q 0.706 +183 D 0.708 +184 T 0.705 +185 G 0.687 +186 T 0.640 +187 G 0.552 +188 V 0.425 +189 K 0.288 +190 H 0.177 +191 W 0.107 +192 F 0.069 +193 C 0.050 +194 Y 0.041 +195 G 0.036 +196 T 0.033 +197 K 0.030 +198 C 0.027 +199 F 0.027 +200 Y 0.031 +201 F 0.043 +202 I 0.058 +203 M 0.071 +204 S 0.071 +205 K 0.058 +206 N 0.043 +207 T 0.031 +208 W 0.026 +209 S 0.028 +210 G 0.035 +211 C 0.044 +212 K 0.054 +213 Q 0.059 +214 T 0.054 +215 C 0.047 +216 Q 0.047 +217 H 0.050 +218 Y 0.053 +219 S 0.055 +220 L 0.058 +221 P 0.056 +222 L 0.052 +223 V 0.055 +224 K 0.064 +225 I 0.071 +226 E 0.068 +227 D 0.056 +228 E 0.042 +229 D 0.031 +230 E 0.024 +231 L 0.022 +232 K 0.022 +233 F 0.022 +234 L 0.023 +235 Q 0.024 +236 F 0.026 +237 Q 0.029 +238 V 0.031 +239 I 0.032 +240 S 0.032 +241 D 0.029 +242 S 0.023 +243 Y 0.017 +244 W 0.013 +245 I 0.014 +246 G 0.018 +247 L 0.022 +248 S 0.025 +249 Y 0.027 +250 D 0.030 +251 K 0.034 +252 K 0.038 +253 K 0.042 +254 K 0.045 +255 Q 0.046 +256 W 0.043 +257 A 0.038 +258 W 0.036 +259 I 0.048 +260 D 0.077 +261 N 0.115 +262 G 0.149 +263 P 0.166 +264 S 0.166 +265 K 0.163 +266 L 0.171 +267 D 0.192 +268 M 0.219 +269 K 0.248 +270 T 0.271 +271 R 0.280 +272 K 0.272 +273 M 0.252 +274 N 0.224 +275 F 0.191 +276 K 0.155 +277 P 0.123 +278 G 0.099 +279 G 0.082 +280 C 0.070 +281 I 0.059 +282 F 0.052 +283 L 0.050 +284 S 0.053 +285 K 0.061 +286 T 0.075 +287 R 0.090 +288 L 0.100 +289 E 0.099 +290 D 0.092 +291 T 0.087 +292 N 0.085 +293 C 0.086 +294 N 0.086 +295 N 0.082 +296 S 0.074 +297 Y 0.063 +298 F 0.050 +299 C 0.038 +300 I 0.029 +301 C 0.026 +302 G 0.032 +303 K 0.050 +304 K 0.085 +305 L 0.143 +306 D 0.218 +307 H 0.289 +308 F 0.336 +309 P 0.357 +310 G 0.361 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030235.18_ENSMUST00000032362.12_GN:Slco1c1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030235.18_ENSMUST00000032362.12_GN:Slco1c1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..bb99145bca9625a5e839808d435344d802a8f63a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030235.18_ENSMUST00000032362.12_GN:Slco1c1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,716 @@ +>ENSMUSG00000030235.18|ENSMUST00000032362.12|GN:Slco1c1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.328 +2 D 0.333 +3 T 0.339 +4 S 0.336 +5 S 0.314 +6 K 0.289 +7 E 0.287 +8 N 0.301 +9 A 0.304 +10 H 0.301 +11 L 0.314 +12 F 0.339 +13 H 0.362 +14 K 0.397 +15 N 0.449 +16 S 0.493 +17 A 0.516 +18 Q 0.537 +19 P 0.568 +20 A 0.598 +21 G 0.614 +22 G 0.620 +23 P 0.619 +24 S 0.609 +25 F 0.595 +26 T 0.582 +27 V 0.572 +28 G 0.569 +29 Y 0.588 +30 P 0.625 +31 S 0.656 +32 T 0.662 +33 E 0.642 +34 E 0.599 +35 A 0.531 +36 R 0.438 +37 P 0.332 +38 C 0.239 +39 C 0.177 +40 G 0.141 +41 K 0.115 +42 L 0.089 +43 K 0.067 +44 V 0.056 +45 F 0.053 +46 L 0.054 +47 G 0.054 +48 A 0.053 +49 L 0.051 +50 S 0.049 +51 F 0.047 +52 V 0.044 +53 Y 0.042 +54 F 0.041 +55 A 0.040 +56 K 0.038 +57 A 0.040 +58 L 0.049 +59 A 0.061 +60 E 0.079 +61 G 0.100 +62 Y 0.119 +63 L 0.129 +64 K 0.130 +65 S 0.123 +66 T 0.108 +67 V 0.090 +68 T 0.077 +69 Q 0.072 +70 I 0.073 +71 E 0.081 +72 R 0.096 +73 R 0.117 +74 F 0.134 +75 E 0.140 +76 I 0.130 +77 P 0.108 +78 S 0.087 +79 S 0.075 +80 L 0.070 +81 V 0.066 +82 G 0.062 +83 I 0.061 +84 I 0.067 +85 D 0.076 +86 G 0.080 +87 S 0.079 +88 F 0.083 +89 E 0.095 +90 I 0.101 +91 G 0.089 +92 N 0.071 +93 L 0.057 +94 L 0.052 +95 V 0.050 +96 I 0.046 +97 T 0.039 +98 F 0.037 +99 V 0.041 +100 S 0.046 +101 Y 0.050 +102 F 0.058 +103 G 0.070 +104 A 0.077 +105 K 0.073 +106 L 0.063 +107 H 0.054 +108 R 0.047 +109 P 0.043 +110 K 0.043 +111 I 0.050 +112 I 0.059 +113 G 0.067 +114 A 0.069 +115 G 0.066 +116 C 0.057 +117 L 0.050 +118 V 0.051 +119 M 0.059 +120 G 0.069 +121 F 0.074 +122 G 0.074 +123 T 0.068 +124 M 0.064 +125 L 0.067 +126 I 0.076 +127 A 0.082 +128 V 0.083 +129 P 0.084 +130 Q 0.091 +131 F 0.104 +132 F 0.120 +133 M 0.135 +134 E 0.145 +135 K 0.151 +136 Y 0.160 +137 S 0.178 +138 Y 0.208 +139 E 0.247 +140 K 0.286 +141 Y 0.324 +142 E 0.358 +143 R 0.391 +144 Y 0.429 +145 S 0.479 +146 P 0.527 +147 S 0.555 +148 S 0.552 +149 N 0.528 +150 V 0.501 +151 T 0.475 +152 P 0.446 +153 S 0.407 +154 I 0.359 +155 S 0.318 +156 P 0.294 +157 C 0.295 +158 Y 0.326 +159 L 0.384 +160 E 0.447 +161 S 0.485 +162 S 0.494 +163 S 0.497 +164 P 0.517 +165 S 0.558 +166 P 0.608 +167 S 0.650 +168 S 0.675 +169 I 0.691 +170 L 0.703 +171 G 0.711 +172 K 0.713 +173 S 0.711 +174 Q 0.710 +175 N 0.710 +176 K 0.706 +177 I 0.695 +178 S 0.677 +179 H 0.646 +180 E 0.600 +181 C 0.557 +182 V 0.540 +183 G 0.535 +184 D 0.502 +185 S 0.433 +186 S 0.353 +187 S 0.281 +188 S 0.213 +189 M 0.144 +190 W 0.088 +191 V 0.058 +192 Y 0.051 +193 V 0.059 +194 F 0.073 +195 L 0.090 +196 G 0.101 +197 N 0.098 +198 L 0.088 +199 L 0.085 +200 R 0.096 +201 G 0.113 +202 L 0.128 +203 G 0.139 +204 E 0.147 +205 T 0.146 +206 P 0.127 +207 I 0.097 +208 Q 0.075 +209 P 0.070 +210 L 0.071 +211 G 0.068 +212 I 0.062 +213 A 0.058 +214 Y 0.059 +215 L 0.060 +216 D 0.060 +217 D 0.062 +218 F 0.067 +219 A 0.071 +220 S 0.071 +221 E 0.068 +222 D 0.064 +223 N 0.059 +224 A 0.054 +225 A 0.047 +226 F 0.042 +227 Y 0.042 +228 I 0.046 +229 G 0.053 +230 C 0.062 +231 V 0.075 +232 Q 0.084 +233 T 0.085 +234 V 0.079 +235 A 0.073 +236 I 0.069 +237 I 0.069 +238 G 0.073 +239 P 0.076 +240 I 0.078 +241 F 0.081 +242 G 0.086 +243 F 0.091 +244 L 0.100 +245 L 0.113 +246 G 0.123 +247 S 0.130 +248 L 0.142 +249 C 0.159 +250 A 0.168 +251 K 0.167 +252 L 0.165 +253 Y 0.175 +254 V 0.196 +255 D 0.222 +256 I 0.245 +257 G 0.251 +258 F 0.237 +259 V 0.210 +260 N 0.190 +261 L 0.190 +262 D 0.209 +263 H 0.232 +264 I 0.238 +265 T 0.222 +266 I 0.195 +267 T 0.168 +268 P 0.150 +269 K 0.144 +270 D 0.145 +271 P 0.144 +272 Q 0.139 +273 W 0.134 +274 V 0.130 +275 G 0.125 +276 A 0.111 +277 W 0.091 +278 W 0.078 +279 L 0.077 +280 G 0.079 +281 Y 0.076 +282 L 0.077 +283 I 0.088 +284 A 0.103 +285 G 0.109 +286 F 0.101 +287 L 0.084 +288 S 0.069 +289 L 0.062 +290 L 0.064 +291 A 0.070 +292 A 0.073 +293 V 0.069 +294 P 0.063 +295 F 0.061 +296 W 0.068 +297 C 0.080 +298 L 0.093 +299 P 0.098 +300 K 0.096 +301 T 0.101 +302 L 0.122 +303 P 0.158 +304 R 0.204 +305 S 0.259 +306 Q 0.317 +307 S 0.372 +308 R 0.416 +309 E 0.454 +310 N 0.490 +311 S 0.525 +312 G 0.549 +313 S 0.554 +314 T 0.542 +315 S 0.530 +316 E 0.523 +317 K 0.511 +318 S 0.489 +319 K 0.473 +320 F 0.464 +321 I 0.455 +322 D 0.445 +323 D 0.445 +324 P 0.453 +325 I 0.465 +326 H 0.479 +327 Y 0.491 +328 Q 0.496 +329 M 0.508 +330 A 0.539 +331 P 0.578 +332 G 0.599 +333 D 0.586 +334 D 0.536 +335 K 0.464 +336 M 0.388 +337 K 0.319 +338 I 0.263 +339 M 0.228 +340 E 0.209 +341 M 0.191 +342 A 0.170 +343 K 0.156 +344 D 0.143 +345 F 0.122 +346 L 0.097 +347 P 0.081 +348 S 0.075 +349 L 0.077 +350 K 0.081 +351 T 0.080 +352 L 0.076 +353 F 0.073 +354 R 0.072 +355 N 0.070 +356 P 0.064 +357 V 0.059 +358 Y 0.055 +359 I 0.050 +360 L 0.045 +361 Y 0.046 +362 L 0.052 +363 C 0.056 +364 A 0.054 +365 S 0.049 +366 T 0.046 +367 V 0.044 +368 Q 0.044 +369 F 0.046 +370 N 0.052 +371 S 0.057 +372 L 0.064 +373 F 0.076 +374 G 0.088 +375 M 0.090 +376 V 0.086 +377 T 0.082 +378 Y 0.080 +379 K 0.078 +380 P 0.074 +381 K 0.072 +382 Y 0.069 +383 I 0.065 +384 E 0.065 +385 Q 0.075 +386 Q 0.096 +387 Y 0.117 +388 G 0.129 +389 Q 0.123 +390 S 0.104 +391 S 0.080 +392 S 0.064 +393 K 0.059 +394 A 0.057 +395 N 0.053 +396 F 0.051 +397 V 0.055 +398 I 0.060 +399 G 0.060 +400 L 0.059 +401 I 0.063 +402 N 0.071 +403 I 0.074 +404 P 0.073 +405 A 0.072 +406 V 0.074 +407 A 0.076 +408 L 0.078 +409 G 0.082 +410 I 0.084 +411 F 0.084 +412 S 0.087 +413 G 0.089 +414 G 0.085 +415 I 0.079 +416 V 0.076 +417 M 0.074 +418 K 0.069 +419 K 0.065 +420 F 0.063 +421 R 0.063 +422 L 0.058 +423 G 0.051 +424 I 0.043 +425 C 0.036 +426 E 0.033 +427 A 0.033 +428 T 0.033 +429 K 0.032 +430 L 0.030 +431 Y 0.029 +432 L 0.032 +433 G 0.036 +434 S 0.037 +435 S 0.036 +436 V 0.037 +437 F 0.037 +438 G 0.037 +439 Y 0.036 +440 L 0.039 +441 L 0.045 +442 F 0.056 +443 L 0.071 +444 S 0.087 +445 L 0.096 +446 F 0.097 +447 A 0.098 +448 L 0.104 +449 G 0.115 +450 C 0.128 +451 E 0.140 +452 N 0.146 +453 S 0.149 +454 S 0.158 +455 V 0.177 +456 A 0.200 +457 G 0.214 +458 L 0.213 +459 T 0.205 +460 V 0.197 +461 S 0.192 +462 Y 0.199 +463 Q 0.225 +464 G 0.268 +465 T 0.315 +466 K 0.352 +467 P 0.364 +468 V 0.353 +469 S 0.332 +470 Y 0.319 +471 H 0.318 +472 E 0.316 +473 R 0.302 +474 A 0.281 +475 L 0.268 +476 F 0.271 +477 S 0.271 +478 D 0.246 +479 C 0.203 +480 N 0.167 +481 S 0.147 +482 R 0.133 +483 C 0.128 +484 K 0.135 +485 C 0.154 +486 S 0.176 +487 D 0.189 +488 S 0.185 +489 K 0.171 +490 W 0.153 +491 E 0.136 +492 P 0.119 +493 M 0.101 +494 C 0.086 +495 G 0.083 +496 D 0.096 +497 N 0.122 +498 G 0.146 +499 I 0.153 +500 T 0.143 +501 Y 0.127 +502 V 0.114 +503 S 0.110 +504 A 0.111 +505 C 0.111 +506 L 0.110 +507 A 0.110 +508 G 0.111 +509 C 0.110 +510 Q 0.109 +511 S 0.109 +512 S 0.110 +513 S 0.115 +514 R 0.122 +515 S 0.132 +516 G 0.141 +517 K 0.141 +518 N 0.131 +519 I 0.117 +520 I 0.107 +521 F 0.100 +522 S 0.092 +523 N 0.081 +524 C 0.072 +525 T 0.073 +526 C 0.090 +527 V 0.126 +528 G 0.179 +529 F 0.240 +530 A 0.297 +531 A 0.339 +532 P 0.362 +533 K 0.367 +534 S 0.355 +535 G 0.327 +536 N 0.281 +537 W 0.228 +538 S 0.184 +539 G 0.157 +540 M 0.146 +541 M 0.147 +542 G 0.154 +543 R 0.164 +544 C 0.184 +545 Q 0.218 +546 K 0.252 +547 D 0.262 +548 N 0.239 +549 G 0.194 +550 C 0.147 +551 S 0.111 +552 Q 0.089 +553 M 0.079 +554 F 0.074 +555 L 0.071 +556 Y 0.071 +557 F 0.075 +558 L 0.077 +559 V 0.076 +560 I 0.074 +561 S 0.073 +562 V 0.070 +563 I 0.067 +564 T 0.070 +565 S 0.079 +566 Y 0.088 +567 T 0.096 +568 L 0.102 +569 S 0.104 +570 L 0.103 +571 G 0.107 +572 G 0.113 +573 I 0.110 +574 P 0.096 +575 G 0.085 +576 Y 0.084 +577 I 0.092 +578 L 0.097 +579 L 0.094 +580 L 0.082 +581 R 0.072 +582 C 0.070 +583 I 0.076 +584 Q 0.084 +585 P 0.089 +586 Q 0.090 +587 L 0.085 +588 K 0.075 +589 S 0.066 +590 F 0.065 +591 A 0.069 +592 L 0.072 +593 G 0.076 +594 I 0.084 +595 Y 0.090 +596 T 0.087 +597 L 0.080 +598 A 0.078 +599 V 0.076 +600 R 0.071 +601 V 0.069 +602 L 0.077 +603 A 0.089 +604 G 0.096 +605 I 0.095 +606 P 0.096 +607 A 0.100 +608 P 0.101 +609 V 0.102 +610 Y 0.114 +611 F 0.132 +612 G 0.146 +613 V 0.156 +614 L 0.173 +615 I 0.191 +616 D 0.196 +617 T 0.187 +618 S 0.177 +619 C 0.180 +620 L 0.204 +621 K 0.240 +622 W 0.272 +623 G 0.283 +624 F 0.273 +625 K 0.256 +626 K 0.243 +627 C 0.241 +628 G 0.253 +629 S 0.271 +630 R 0.276 +631 G 0.261 +632 S 0.237 +633 C 0.219 +634 R 0.216 +635 L 0.222 +636 Y 0.217 +637 D 0.190 +638 S 0.157 +639 H 0.136 +640 A 0.121 +641 F 0.101 +642 R 0.082 +643 H 0.076 +644 I 0.082 +645 Y 0.090 +646 L 0.094 +647 G 0.093 +648 L 0.091 +649 T 0.086 +650 T 0.078 +651 L 0.069 +652 L 0.065 +653 G 0.065 +654 T 0.064 +655 V 0.061 +656 S 0.062 +657 V 0.066 +658 F 0.067 +659 L 0.059 +660 S 0.049 +661 M 0.044 +662 A 0.045 +663 V 0.046 +664 L 0.047 +665 F 0.050 +666 V 0.059 +667 L 0.073 +668 K 0.091 +669 K 0.115 +670 K 0.152 +671 Y 0.205 +672 V 0.268 +673 S 0.327 +674 K 0.369 +675 H 0.393 +676 S 0.408 +677 S 0.422 +678 L 0.433 +679 I 0.435 +680 T 0.436 +681 T 0.446 +682 R 0.459 +683 E 0.466 +684 K 0.471 +685 I 0.475 +686 G 0.469 +687 M 0.453 +688 S 0.439 +689 S 0.432 +690 S 0.428 +691 I 0.422 +692 K 0.415 +693 K 0.408 +694 E 0.402 +695 T 0.387 +696 C 0.366 +697 A 0.353 +698 A 0.354 +699 R 0.357 +700 D 0.354 +701 R 0.351 +702 G 0.347 +703 L 0.329 +704 Q 0.298 +705 P 0.259 +706 K 0.225 +707 Y 0.203 +708 W 0.198 +709 P 0.205 +710 G 0.211 +711 K 0.209 +712 E 0.194 +713 T 0.175 +714 R 0.164 +715 L 0.162 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030235.18_ENSMUST00000032362.12_GN:Slco1c1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030235.18_ENSMUST00000032362.12_GN:Slco1c1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e822b6bc8504ced293eeff6f0e90a0619fe96ce9 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030235.18_ENSMUST00000032362.12_GN:Slco1c1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid @@ -0,0 +1,717 @@ +>ENSMUSG00000030235.18|ENSMUST00000032362.12|GN:Slco1c1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:1 +1 M 0.314 +2 M 0.332 +3 D 0.357 +4 T 0.374 +5 S 0.371 +6 S 0.350 +7 K 0.336 +8 E 0.344 +9 N 0.349 +10 A 0.330 +11 H 0.312 +12 L 0.319 +13 F 0.339 +14 H 0.360 +15 K 0.398 +16 N 0.454 +17 S 0.500 +18 A 0.522 +19 Q 0.542 +20 P 0.572 +21 A 0.599 +22 G 0.613 +23 G 0.619 +24 P 0.618 +25 S 0.608 +26 F 0.593 +27 T 0.580 +28 V 0.570 +29 G 0.568 +30 Y 0.587 +31 P 0.625 +32 S 0.657 +33 T 0.663 +34 E 0.642 +35 E 0.599 +36 A 0.531 +37 R 0.436 +38 P 0.330 +39 C 0.237 +40 C 0.176 +41 G 0.141 +42 K 0.115 +43 L 0.089 +44 K 0.067 +45 V 0.056 +46 F 0.053 +47 L 0.054 +48 G 0.055 +49 A 0.053 +50 L 0.051 +51 S 0.049 +52 F 0.047 +53 V 0.044 +54 Y 0.042 +55 F 0.041 +56 A 0.040 +57 K 0.038 +58 A 0.040 +59 L 0.049 +60 A 0.061 +61 E 0.078 +62 G 0.100 +63 Y 0.119 +64 L 0.128 +65 K 0.129 +66 S 0.122 +67 T 0.107 +68 V 0.090 +69 T 0.077 +70 Q 0.072 +71 I 0.073 +72 E 0.080 +73 R 0.096 +74 R 0.116 +75 F 0.134 +76 E 0.140 +77 I 0.129 +78 P 0.108 +79 S 0.087 +80 S 0.075 +81 L 0.069 +82 V 0.066 +83 G 0.062 +84 I 0.061 +85 I 0.067 +86 D 0.076 +87 G 0.080 +88 S 0.079 +89 F 0.083 +90 E 0.095 +91 I 0.101 +92 G 0.090 +93 N 0.070 +94 L 0.057 +95 L 0.052 +96 V 0.050 +97 I 0.046 +98 T 0.039 +99 F 0.037 +100 V 0.041 +101 S 0.046 +102 Y 0.050 +103 F 0.057 +104 G 0.070 +105 A 0.077 +106 K 0.073 +107 L 0.063 +108 H 0.054 +109 R 0.047 +110 P 0.043 +111 K 0.043 +112 I 0.050 +113 I 0.059 +114 G 0.067 +115 A 0.069 +116 G 0.066 +117 C 0.057 +118 L 0.050 +119 V 0.050 +120 M 0.059 +121 G 0.069 +122 F 0.074 +123 G 0.074 +124 T 0.068 +125 M 0.064 +126 L 0.067 +127 I 0.076 +128 A 0.082 +129 V 0.083 +130 P 0.084 +131 Q 0.091 +132 F 0.105 +133 F 0.121 +134 M 0.136 +135 E 0.145 +136 K 0.151 +137 Y 0.160 +138 S 0.178 +139 Y 0.208 +140 E 0.247 +141 K 0.287 +142 Y 0.324 +143 E 0.359 +144 R 0.391 +145 Y 0.430 +146 S 0.479 +147 P 0.528 +148 S 0.556 +149 S 0.553 +150 N 0.530 +151 V 0.502 +152 T 0.476 +153 P 0.447 +154 S 0.408 +155 I 0.360 +156 S 0.318 +157 P 0.294 +158 C 0.295 +159 Y 0.326 +160 L 0.384 +161 E 0.447 +162 S 0.486 +163 S 0.495 +164 S 0.498 +165 P 0.518 +166 S 0.559 +167 P 0.608 +168 S 0.650 +169 S 0.675 +170 I 0.691 +171 L 0.703 +172 G 0.711 +173 K 0.713 +174 S 0.711 +175 Q 0.710 +176 N 0.710 +177 K 0.706 +178 I 0.695 +179 S 0.676 +180 H 0.646 +181 E 0.600 +182 C 0.557 +183 V 0.540 +184 G 0.535 +185 D 0.502 +186 S 0.433 +187 S 0.353 +188 S 0.281 +189 S 0.213 +190 M 0.144 +191 W 0.088 +192 V 0.058 +193 Y 0.051 +194 V 0.059 +195 F 0.073 +196 L 0.090 +197 G 0.101 +198 N 0.098 +199 L 0.088 +200 L 0.085 +201 R 0.096 +202 G 0.113 +203 L 0.128 +204 G 0.138 +205 E 0.146 +206 T 0.146 +207 P 0.127 +208 I 0.097 +209 Q 0.075 +210 P 0.070 +211 L 0.071 +212 G 0.068 +213 I 0.062 +214 A 0.058 +215 Y 0.058 +216 L 0.059 +217 D 0.059 +218 D 0.062 +219 F 0.066 +220 A 0.071 +221 S 0.071 +222 E 0.068 +223 D 0.064 +224 N 0.059 +225 A 0.054 +226 A 0.047 +227 F 0.042 +228 Y 0.042 +229 I 0.046 +230 G 0.053 +231 C 0.062 +232 V 0.075 +233 Q 0.084 +234 T 0.084 +235 V 0.079 +236 A 0.073 +237 I 0.069 +238 I 0.069 +239 G 0.073 +240 P 0.076 +241 I 0.077 +242 F 0.081 +243 G 0.086 +244 F 0.091 +245 L 0.100 +246 L 0.113 +247 G 0.123 +248 S 0.130 +249 L 0.141 +250 C 0.159 +251 A 0.168 +252 K 0.167 +253 L 0.165 +254 Y 0.175 +255 V 0.195 +256 D 0.222 +257 I 0.245 +258 G 0.251 +259 F 0.237 +260 V 0.210 +261 N 0.190 +262 L 0.189 +263 D 0.209 +264 H 0.232 +265 I 0.238 +266 T 0.222 +267 I 0.195 +268 T 0.168 +269 P 0.150 +270 K 0.144 +271 D 0.145 +272 P 0.144 +273 Q 0.139 +274 W 0.134 +275 V 0.129 +276 G 0.124 +277 A 0.110 +278 W 0.091 +279 W 0.078 +280 L 0.077 +281 G 0.078 +282 Y 0.076 +283 L 0.077 +284 I 0.088 +285 A 0.103 +286 G 0.109 +287 F 0.101 +288 L 0.085 +289 S 0.069 +290 L 0.062 +291 L 0.064 +292 A 0.070 +293 A 0.074 +294 V 0.069 +295 P 0.063 +296 F 0.062 +297 W 0.068 +298 C 0.080 +299 L 0.093 +300 P 0.098 +301 K 0.096 +302 T 0.101 +303 L 0.121 +304 P 0.157 +305 R 0.203 +306 S 0.257 +307 Q 0.316 +308 S 0.371 +309 R 0.415 +310 E 0.453 +311 N 0.489 +312 S 0.524 +313 G 0.549 +314 S 0.553 +315 T 0.542 +316 S 0.530 +317 E 0.523 +318 K 0.510 +319 S 0.489 +320 K 0.473 +321 F 0.464 +322 I 0.455 +323 D 0.445 +324 D 0.445 +325 P 0.453 +326 I 0.465 +327 H 0.479 +328 Y 0.490 +329 Q 0.496 +330 M 0.508 +331 A 0.539 +332 P 0.578 +333 G 0.599 +334 D 0.586 +335 D 0.536 +336 K 0.463 +337 M 0.388 +338 K 0.319 +339 I 0.263 +340 M 0.228 +341 E 0.209 +342 M 0.191 +343 A 0.170 +344 K 0.156 +345 D 0.143 +346 F 0.122 +347 L 0.098 +348 P 0.081 +349 S 0.076 +350 L 0.080 +351 K 0.084 +352 T 0.082 +353 L 0.077 +354 F 0.073 +355 R 0.072 +356 N 0.070 +357 P 0.065 +358 V 0.059 +359 Y 0.055 +360 I 0.050 +361 L 0.045 +362 Y 0.046 +363 L 0.052 +364 C 0.056 +365 A 0.054 +366 S 0.049 +367 T 0.046 +368 V 0.044 +369 Q 0.044 +370 F 0.046 +371 N 0.052 +372 S 0.057 +373 L 0.064 +374 F 0.076 +375 G 0.088 +376 M 0.090 +377 V 0.086 +378 T 0.082 +379 Y 0.080 +380 K 0.078 +381 P 0.074 +382 K 0.072 +383 Y 0.069 +384 I 0.064 +385 E 0.065 +386 Q 0.075 +387 Q 0.096 +388 Y 0.117 +389 G 0.128 +390 Q 0.123 +391 S 0.104 +392 S 0.080 +393 S 0.064 +394 K 0.059 +395 A 0.057 +396 N 0.053 +397 F 0.051 +398 V 0.055 +399 I 0.060 +400 G 0.060 +401 L 0.059 +402 I 0.063 +403 N 0.071 +404 I 0.074 +405 P 0.073 +406 A 0.072 +407 V 0.074 +408 A 0.076 +409 L 0.078 +410 G 0.082 +411 I 0.083 +412 F 0.084 +413 S 0.087 +414 G 0.089 +415 G 0.084 +416 I 0.079 +417 V 0.076 +418 M 0.074 +419 K 0.069 +420 K 0.065 +421 F 0.063 +422 R 0.063 +423 L 0.058 +424 G 0.051 +425 I 0.043 +426 C 0.036 +427 E 0.033 +428 A 0.033 +429 T 0.033 +430 K 0.032 +431 L 0.030 +432 Y 0.029 +433 L 0.032 +434 G 0.036 +435 S 0.037 +436 S 0.037 +437 V 0.037 +438 F 0.037 +439 G 0.037 +440 Y 0.037 +441 L 0.039 +442 L 0.045 +443 F 0.056 +444 L 0.071 +445 S 0.087 +446 L 0.096 +447 F 0.097 +448 A 0.098 +449 L 0.104 +450 G 0.115 +451 C 0.128 +452 E 0.140 +453 N 0.146 +454 S 0.149 +455 S 0.157 +456 V 0.177 +457 A 0.200 +458 G 0.214 +459 L 0.213 +460 T 0.205 +461 V 0.197 +462 S 0.192 +463 Y 0.199 +464 Q 0.225 +465 G 0.267 +466 T 0.315 +467 K 0.351 +468 P 0.364 +469 V 0.353 +470 S 0.332 +471 Y 0.319 +472 H 0.318 +473 E 0.316 +474 R 0.302 +475 A 0.280 +476 L 0.268 +477 F 0.270 +478 S 0.271 +479 D 0.246 +480 C 0.203 +481 N 0.167 +482 S 0.146 +483 R 0.133 +484 C 0.127 +485 K 0.135 +486 C 0.154 +487 S 0.176 +488 D 0.188 +489 S 0.185 +490 K 0.171 +491 W 0.153 +492 E 0.136 +493 P 0.118 +494 M 0.100 +495 C 0.086 +496 G 0.082 +497 D 0.095 +498 N 0.121 +499 G 0.146 +500 I 0.153 +501 T 0.143 +502 Y 0.127 +503 V 0.114 +504 S 0.109 +505 A 0.111 +506 C 0.111 +507 L 0.110 +508 A 0.110 +509 G 0.111 +510 C 0.110 +511 Q 0.109 +512 S 0.109 +513 S 0.110 +514 S 0.115 +515 R 0.122 +516 S 0.132 +517 G 0.141 +518 K 0.141 +519 N 0.131 +520 I 0.117 +521 I 0.107 +522 F 0.100 +523 S 0.092 +524 N 0.080 +525 C 0.072 +526 T 0.073 +527 C 0.089 +528 V 0.126 +529 G 0.179 +530 F 0.240 +531 A 0.297 +532 A 0.339 +533 P 0.362 +534 K 0.367 +535 S 0.355 +536 G 0.327 +537 N 0.281 +538 W 0.228 +539 S 0.184 +540 G 0.157 +541 M 0.146 +542 M 0.147 +543 G 0.154 +544 R 0.164 +545 C 0.184 +546 Q 0.218 +547 K 0.252 +548 D 0.262 +549 N 0.239 +550 G 0.194 +551 C 0.147 +552 S 0.111 +553 Q 0.089 +554 M 0.079 +555 F 0.074 +556 L 0.071 +557 Y 0.073 +558 F 0.081 +559 L 0.090 +560 V 0.093 +561 I 0.087 +562 S 0.080 +563 V 0.072 +564 I 0.067 +565 T 0.070 +566 S 0.079 +567 Y 0.088 +568 T 0.095 +569 L 0.102 +570 S 0.103 +571 L 0.103 +572 G 0.107 +573 G 0.112 +574 I 0.109 +575 P 0.096 +576 G 0.085 +577 Y 0.084 +578 I 0.092 +579 L 0.097 +580 L 0.094 +581 L 0.082 +582 R 0.072 +583 C 0.070 +584 I 0.076 +585 Q 0.084 +586 P 0.089 +587 Q 0.090 +588 L 0.085 +589 K 0.075 +590 S 0.066 +591 F 0.065 +592 A 0.069 +593 L 0.072 +594 G 0.076 +595 I 0.084 +596 Y 0.090 +597 T 0.087 +598 L 0.080 +599 A 0.078 +600 V 0.076 +601 R 0.071 +602 V 0.069 +603 L 0.077 +604 A 0.089 +605 G 0.096 +606 I 0.095 +607 P 0.096 +608 A 0.100 +609 P 0.101 +610 V 0.102 +611 Y 0.114 +612 F 0.132 +613 G 0.146 +614 V 0.156 +615 L 0.173 +616 I 0.191 +617 D 0.196 +618 T 0.187 +619 S 0.177 +620 C 0.180 +621 L 0.203 +622 K 0.240 +623 W 0.271 +624 G 0.282 +625 F 0.272 +626 K 0.255 +627 K 0.243 +628 C 0.241 +629 G 0.253 +630 S 0.271 +631 R 0.276 +632 G 0.262 +633 S 0.237 +634 C 0.219 +635 R 0.216 +636 L 0.222 +637 Y 0.217 +638 D 0.190 +639 S 0.157 +640 H 0.136 +641 A 0.121 +642 F 0.101 +643 R 0.082 +644 H 0.076 +645 I 0.082 +646 Y 0.090 +647 L 0.094 +648 G 0.093 +649 L 0.091 +650 T 0.087 +651 T 0.078 +652 L 0.070 +653 L 0.066 +654 G 0.065 +655 T 0.063 +656 V 0.061 +657 S 0.062 +658 V 0.066 +659 F 0.067 +660 L 0.059 +661 S 0.049 +662 M 0.044 +663 A 0.045 +664 V 0.047 +665 L 0.047 +666 F 0.050 +667 V 0.059 +668 L 0.073 +669 K 0.091 +670 K 0.115 +671 K 0.152 +672 Y 0.205 +673 V 0.268 +674 S 0.327 +675 K 0.369 +676 H 0.393 +677 S 0.409 +678 S 0.423 +679 L 0.433 +680 I 0.435 +681 T 0.436 +682 T 0.446 +683 R 0.459 +684 E 0.466 +685 K 0.471 +686 I 0.475 +687 G 0.469 +688 M 0.453 +689 S 0.439 +690 S 0.432 +691 S 0.428 +692 I 0.422 +693 K 0.415 +694 K 0.408 +695 E 0.402 +696 T 0.388 +697 C 0.367 +698 A 0.353 +699 A 0.354 +700 R 0.358 +701 D 0.355 +702 R 0.352 +703 G 0.348 +704 L 0.330 +705 Q 0.299 +706 P 0.260 +707 K 0.226 +708 Y 0.204 +709 W 0.199 +710 P 0.206 +711 G 0.212 +712 K 0.210 +713 E 0.195 +714 T 0.176 +715 R 0.165 +716 L 0.163 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030292.11_ENSMUST00000032433.9_GN:Smco2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030292.11_ENSMUST00000032433.9_GN:Smco2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..bc74c212c89ea1ca85ee890fbd66c92deb1964c1 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030292.11_ENSMUST00000032433.9_GN:Smco2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,348 @@ +>ENSMUSG00000030292.11|ENSMUST00000032433.9|GN:Smco2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.522 +2 M 0.563 +3 S 0.618 +4 L 0.663 +5 Q 0.690 +6 L 0.705 +7 G 0.712 +8 T 0.715 +9 A 0.706 +10 G 0.678 +11 K 0.622 +12 E 0.551 +13 R 0.502 +14 Q 0.495 +15 L 0.500 +16 A 0.487 +17 E 0.484 +18 K 0.521 +19 S 0.578 +20 R 0.627 +21 D 0.666 +22 L 0.702 +23 Q 0.738 +24 N 0.769 +25 V 0.787 +26 S 0.793 +27 M 0.793 +28 T 0.794 +29 E 0.799 +30 G 0.804 +31 S 0.806 +32 E 0.807 +33 E 0.810 +34 V 0.812 +35 S 0.810 +36 E 0.791 +37 M 0.746 +38 D 0.683 +39 H 0.652 +40 I 0.683 +41 S 0.741 +42 D 0.777 +43 R 0.790 +44 P 0.798 +45 D 0.807 +46 E 0.812 +47 K 0.808 +48 D 0.800 +49 K 0.797 +50 P 0.807 +51 S 0.823 +52 E 0.835 +53 N 0.839 +54 L 0.837 +55 Q 0.832 +56 T 0.823 +57 D 0.810 +58 S 0.796 +59 L 0.787 +60 Y 0.788 +61 K 0.793 +62 M 0.797 +63 D 0.795 +64 T 0.788 +65 E 0.782 +66 K 0.780 +67 W 0.789 +68 D 0.805 +69 G 0.808 +70 L 0.774 +71 E 0.711 +72 Q 0.678 +73 E 0.714 +74 S 0.780 +75 E 0.824 +76 H 0.834 +77 S 0.822 +78 Q 0.803 +79 D 0.789 +80 P 0.789 +81 P 0.799 +82 S 0.812 +83 K 0.823 +84 P 0.831 +85 D 0.835 +86 E 0.839 +87 Q 0.841 +88 E 0.844 +89 V 0.845 +90 T 0.846 +91 L 0.841 +92 V 0.829 +93 C 0.814 +94 E 0.803 +95 G 0.803 +96 P 0.814 +97 Q 0.828 +98 V 0.836 +99 S 0.834 +100 Q 0.824 +101 L 0.815 +102 S 0.814 +103 P 0.821 +104 S 0.827 +105 T 0.823 +106 D 0.805 +107 E 0.773 +108 S 0.732 +109 T 0.696 +110 P 0.669 +111 I 0.635 +112 P 0.581 +113 E 0.508 +114 S 0.428 +115 L 0.346 +116 T 0.278 +117 H 0.241 +118 K 0.230 +119 L 0.222 +120 N 0.203 +121 Y 0.178 +122 W 0.159 +123 H 0.155 +124 A 0.166 +125 K 0.191 +126 M 0.226 +127 G 0.260 +128 L 0.281 +129 Q 0.292 +130 M 0.306 +131 K 0.327 +132 E 0.362 +133 L 0.402 +134 G 0.422 +135 A 0.416 +136 D 0.401 +137 H 0.378 +138 G 0.333 +139 D 0.264 +140 W 0.192 +141 L 0.139 +142 E 0.113 +143 R 0.101 +144 I 0.092 +145 N 0.082 +146 N 0.074 +147 I 0.068 +148 I 0.063 +149 Q 0.059 +150 N 0.055 +151 I 0.053 +152 N 0.053 +153 N 0.053 +154 T 0.053 +155 E 0.055 +156 S 0.056 +157 T 0.055 +158 V 0.055 +159 K 0.057 +160 S 0.061 +161 L 0.063 +162 L 0.066 +163 T 0.069 +164 E 0.067 +165 V 0.063 +166 I 0.064 +167 S 0.073 +168 L 0.087 +169 E 0.102 +170 N 0.117 +171 Q 0.131 +172 S 0.148 +173 K 0.177 +174 N 0.212 +175 L 0.249 +176 E 0.289 +177 D 0.319 +178 S 0.315 +179 D 0.276 +180 Q 0.228 +181 E 0.194 +182 A 0.170 +183 D 0.148 +184 I 0.127 +185 E 0.106 +186 E 0.087 +187 K 0.073 +188 I 0.065 +189 T 0.065 +190 E 0.070 +191 I 0.078 +192 R 0.083 +193 R 0.082 +194 Q 0.071 +195 L 0.057 +196 K 0.049 +197 E 0.049 +198 V 0.052 +199 N 0.057 +200 I 0.061 +201 K 0.064 +202 L 0.069 +203 T 0.079 +204 Q 0.093 +205 V 0.107 +206 D 0.116 +207 A 0.118 +208 C 0.112 +209 E 0.103 +210 E 0.095 +211 A 0.086 +212 R 0.077 +213 E 0.071 +214 L 0.068 +215 K 0.067 +216 E 0.065 +217 K 0.066 +218 L 0.072 +219 V 0.081 +220 E 0.084 +221 Q 0.075 +222 I 0.061 +223 E 0.053 +224 S 0.053 +225 F 0.063 +226 H 0.080 +227 K 0.094 +228 E 0.097 +229 M 0.093 +230 N 0.086 +231 V 0.079 +232 L 0.081 +233 N 0.090 +234 S 0.098 +235 K 0.101 +236 L 0.108 +237 E 0.126 +238 M 0.145 +239 Y 0.166 +240 Y 0.201 +241 T 0.262 +242 Q 0.356 +243 G 0.473 +244 S 0.582 +245 D 0.656 +246 A 0.693 +247 D 0.708 +248 S 0.716 +249 H 0.725 +250 N 0.733 +251 S 0.739 +252 E 0.739 +253 D 0.739 +254 V 0.738 +255 D 0.735 +256 T 0.725 +257 E 0.711 +258 Q 0.699 +259 E 0.693 +260 E 0.698 +261 P 0.710 +262 L 0.720 +263 V 0.729 +264 P 0.739 +265 E 0.748 +266 A 0.752 +267 S 0.757 +268 P 0.767 +269 S 0.781 +270 L 0.790 +271 S 0.783 +272 A 0.758 +273 S 0.724 +274 P 0.690 +275 T 0.662 +276 P 0.638 +277 P 0.609 +278 C 0.564 +279 S 0.499 +280 A 0.424 +281 V 0.353 +282 W 0.295 +283 K 0.257 +284 N 0.236 +285 A 0.221 +286 L 0.204 +287 K 0.187 +288 L 0.179 +289 F 0.176 +290 V 0.172 +291 I 0.172 +292 V 0.174 +293 Y 0.172 +294 V 0.161 +295 V 0.150 +296 T 0.149 +297 I 0.153 +298 T 0.154 +299 G 0.150 +300 L 0.147 +301 S 0.144 +302 C 0.137 +303 Y 0.126 +304 I 0.117 +305 L 0.120 +306 F 0.139 +307 V 0.167 +308 D 0.186 +309 A 0.186 +310 T 0.174 +311 F 0.164 +312 L 0.168 +313 F 0.190 +314 E 0.227 +315 R 0.262 +316 V 0.286 +317 L 0.301 +318 P 0.319 +319 S 0.339 +320 V 0.360 +321 L 0.388 +322 G 0.423 +323 H 0.440 +324 R 0.416 +325 T 0.364 +326 M 0.323 +327 W 0.316 +328 D 0.321 +329 L 0.312 +330 R 0.294 +331 E 0.290 +332 M 0.307 +333 M 0.337 +334 A 0.369 +335 P 0.404 +336 F 0.455 +337 L 0.517 +338 N 0.572 +339 L 0.614 +340 E 0.643 +341 A 0.657 +342 E 0.658 +343 D 0.648 +344 L 0.622 +345 L 0.578 +346 P 0.524 +347 S 0.484 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030292.11_ENSMUST00000032433.9_GN:Smco2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:56.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030292.11_ENSMUST00000032433.9_GN:Smco2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:56.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7ddfed803debc4140dc8afbec434352e8581fd0e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030292.11_ENSMUST00000032433.9_GN:Smco2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:56.caid @@ -0,0 +1,404 @@ +>ENSMUSG00000030292.11|ENSMUST00000032433.9|GN:Smco2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:56 +1 M 0.528 +2 S 0.576 +3 E 0.639 +4 R 0.689 +5 A 0.720 +6 G 0.742 +7 P 0.760 +8 T 0.769 +9 A 0.763 +10 S 0.740 +11 F 0.714 +12 P 0.699 +13 P 0.696 +14 Q 0.691 +15 V 0.678 +16 W 0.674 +17 N 0.692 +18 N 0.722 +19 L 0.750 +20 Q 0.773 +21 G 0.790 +22 L 0.796 +23 S 0.795 +24 S 0.797 +25 P 0.810 +26 G 0.828 +27 A 0.844 +28 R 0.852 +29 T 0.855 +30 G 0.855 +31 S 0.855 +32 A 0.854 +33 T 0.852 +34 S 0.848 +35 Q 0.847 +36 K 0.852 +37 S 0.859 +38 Q 0.866 +39 G 0.870 +40 T 0.873 +41 L 0.874 +42 S 0.873 +43 T 0.872 +44 E 0.871 +45 V 0.868 +46 A 0.855 +47 A 0.831 +48 L 0.804 +49 T 0.788 +50 P 0.790 +51 A 0.796 +52 A 0.786 +53 L 0.742 +54 S 0.678 +55 K 0.646 +56 D 0.681 +57 M 0.749 +58 M 0.800 +59 S 0.824 +60 L 0.833 +61 Q 0.835 +62 L 0.836 +63 G 0.836 +64 T 0.837 +65 A 0.834 +66 G 0.828 +67 K 0.822 +68 E 0.819 +69 R 0.817 +70 Q 0.814 +71 L 0.808 +72 A 0.803 +73 E 0.799 +74 K 0.798 +75 S 0.798 +76 R 0.798 +77 D 0.800 +78 L 0.805 +79 Q 0.816 +80 N 0.828 +81 V 0.835 +82 S 0.835 +83 M 0.830 +84 T 0.826 +85 E 0.826 +86 G 0.828 +87 S 0.828 +88 E 0.826 +89 E 0.823 +90 V 0.821 +91 S 0.814 +92 E 0.794 +93 M 0.747 +94 D 0.684 +95 H 0.652 +96 I 0.685 +97 S 0.744 +98 D 0.782 +99 R 0.795 +100 P 0.803 +101 D 0.811 +102 E 0.815 +103 K 0.813 +104 D 0.808 +105 K 0.806 +106 P 0.814 +107 S 0.826 +108 E 0.836 +109 N 0.839 +110 L 0.836 +111 Q 0.830 +112 T 0.820 +113 D 0.803 +114 S 0.773 +115 L 0.721 +116 Y 0.660 +117 K 0.632 +118 M 0.662 +119 D 0.713 +120 T 0.743 +121 E 0.748 +122 K 0.747 +123 W 0.756 +124 D 0.774 +125 G 0.780 +126 L 0.747 +127 E 0.685 +128 Q 0.652 +129 E 0.686 +130 S 0.752 +131 E 0.796 +132 H 0.806 +133 S 0.795 +134 Q 0.776 +135 D 0.761 +136 P 0.760 +137 P 0.770 +138 S 0.785 +139 K 0.797 +140 P 0.807 +141 D 0.814 +142 E 0.821 +143 Q 0.827 +144 E 0.832 +145 V 0.835 +146 T 0.836 +147 L 0.831 +148 V 0.819 +149 C 0.803 +150 E 0.792 +151 G 0.793 +152 P 0.805 +153 Q 0.820 +154 V 0.831 +155 S 0.831 +156 Q 0.822 +157 L 0.814 +158 S 0.814 +159 P 0.823 +160 S 0.830 +161 T 0.829 +162 D 0.813 +163 E 0.785 +164 S 0.749 +165 T 0.718 +166 P 0.693 +167 I 0.663 +168 P 0.612 +169 E 0.542 +170 S 0.460 +171 L 0.372 +172 T 0.291 +173 H 0.243 +174 K 0.228 +175 L 0.222 +176 N 0.207 +177 Y 0.185 +178 W 0.169 +179 H 0.166 +180 A 0.177 +181 K 0.200 +182 M 0.234 +183 G 0.268 +184 L 0.290 +185 Q 0.303 +186 M 0.317 +187 K 0.338 +188 E 0.371 +189 L 0.409 +190 G 0.430 +191 A 0.429 +192 D 0.418 +193 H 0.398 +194 G 0.353 +195 D 0.283 +196 W 0.206 +197 L 0.150 +198 E 0.121 +199 R 0.108 +200 I 0.099 +201 N 0.090 +202 N 0.082 +203 I 0.077 +204 I 0.072 +205 Q 0.066 +206 N 0.062 +207 I 0.059 +208 N 0.057 +209 N 0.054 +210 T 0.053 +211 E 0.053 +212 S 0.054 +213 T 0.053 +214 V 0.053 +215 K 0.055 +216 S 0.059 +217 L 0.062 +218 L 0.065 +219 T 0.067 +220 E 0.066 +221 V 0.062 +222 I 0.064 +223 S 0.075 +224 L 0.089 +225 E 0.104 +226 N 0.115 +227 Q 0.123 +228 S 0.136 +229 K 0.159 +230 N 0.186 +231 L 0.215 +232 E 0.249 +233 D 0.277 +234 S 0.277 +235 D 0.246 +236 Q 0.205 +237 E 0.176 +238 A 0.157 +239 D 0.139 +240 I 0.122 +241 E 0.104 +242 E 0.089 +243 K 0.078 +244 I 0.071 +245 T 0.069 +246 E 0.073 +247 I 0.080 +248 R 0.087 +249 R 0.086 +250 Q 0.076 +251 L 0.062 +252 K 0.053 +253 E 0.052 +254 V 0.056 +255 N 0.062 +256 I 0.066 +257 K 0.070 +258 L 0.075 +259 T 0.083 +260 Q 0.094 +261 V 0.108 +262 D 0.119 +263 A 0.124 +264 C 0.119 +265 E 0.110 +266 E 0.101 +267 A 0.092 +268 R 0.082 +269 E 0.076 +270 L 0.073 +271 K 0.072 +272 E 0.071 +273 K 0.072 +274 L 0.077 +275 V 0.086 +276 E 0.089 +277 Q 0.080 +278 I 0.067 +279 E 0.059 +280 S 0.059 +281 F 0.069 +282 H 0.084 +283 K 0.096 +284 E 0.099 +285 M 0.097 +286 N 0.092 +287 V 0.086 +288 L 0.087 +289 N 0.096 +290 S 0.103 +291 K 0.107 +292 L 0.120 +293 E 0.143 +294 M 0.168 +295 Y 0.194 +296 Y 0.234 +297 T 0.300 +298 Q 0.395 +299 G 0.509 +300 S 0.612 +301 D 0.681 +302 A 0.714 +303 D 0.727 +304 S 0.734 +305 H 0.742 +306 N 0.750 +307 S 0.755 +308 E 0.755 +309 D 0.755 +310 V 0.755 +311 D 0.753 +312 T 0.745 +313 E 0.731 +314 Q 0.717 +315 E 0.709 +316 E 0.713 +317 P 0.724 +318 L 0.737 +319 V 0.748 +320 P 0.758 +321 E 0.767 +322 A 0.772 +323 S 0.777 +324 P 0.786 +325 S 0.800 +326 L 0.809 +327 S 0.802 +328 A 0.778 +329 S 0.744 +330 P 0.711 +331 T 0.684 +332 P 0.662 +333 P 0.635 +334 C 0.592 +335 S 0.530 +336 A 0.456 +337 V 0.385 +338 W 0.327 +339 K 0.288 +340 N 0.270 +341 A 0.257 +342 L 0.239 +343 K 0.221 +344 L 0.211 +345 F 0.206 +346 V 0.199 +347 I 0.195 +348 V 0.197 +349 Y 0.195 +350 V 0.183 +351 V 0.170 +352 T 0.165 +353 I 0.168 +354 T 0.168 +355 G 0.163 +356 L 0.159 +357 S 0.156 +358 C 0.146 +359 Y 0.132 +360 I 0.121 +361 L 0.122 +362 F 0.140 +363 V 0.166 +364 D 0.182 +365 A 0.180 +366 T 0.166 +367 F 0.155 +368 L 0.158 +369 F 0.181 +370 E 0.218 +371 R 0.255 +372 V 0.281 +373 L 0.298 +374 P 0.315 +375 S 0.332 +376 V 0.351 +377 L 0.376 +378 G 0.408 +379 H 0.426 +380 R 0.406 +381 T 0.358 +382 M 0.320 +383 W 0.314 +384 D 0.320 +385 L 0.313 +386 R 0.298 +387 E 0.295 +388 M 0.312 +389 M 0.339 +390 A 0.369 +391 P 0.406 +392 F 0.461 +393 L 0.527 +394 N 0.582 +395 L 0.621 +396 E 0.645 +397 A 0.658 +398 E 0.661 +399 D 0.652 +400 L 0.627 +401 L 0.584 +402 P 0.530 +403 S 0.491 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030325.17_ENSMUST00000174404.8_GN:Klrb1c_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030325.17_ENSMUST00000174404.8_GN:Klrb1c_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f751c078242c55b8e820a4675476a13e07c20c4b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030325.17_ENSMUST00000174404.8_GN:Klrb1c_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,224 @@ +>ENSMUSG00000030325.17|ENSMUST00000174404.8|GN:Klrb1c|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.467 +2 D 0.499 +3 T 0.548 +4 A 0.589 +5 S 0.606 +6 I 0.600 +7 Y 0.586 +8 L 0.578 +9 G 0.572 +10 L 0.568 +11 K 0.573 +12 P 0.591 +13 P 0.615 +14 R 0.643 +15 T 0.678 +16 L 0.707 +17 G 0.714 +18 A 0.696 +19 W 0.664 +20 H 0.633 +21 E 0.622 +22 S 0.640 +23 P 0.674 +24 P 0.704 +25 S 0.719 +26 L 0.725 +27 P 0.734 +28 P 0.752 +29 D 0.766 +30 A 0.761 +31 C 0.731 +32 R 0.687 +33 C 0.645 +34 P 0.615 +35 R 0.601 +36 S 0.592 +37 H 0.575 +38 R 0.559 +39 L 0.568 +40 A 0.598 +41 L 0.614 +42 K 0.604 +43 L 0.578 +44 S 0.533 +45 C 0.467 +46 A 0.408 +47 G 0.374 +48 L 0.351 +49 I 0.329 +50 L 0.315 +51 L 0.303 +52 V 0.282 +53 L 0.266 +54 T 0.269 +55 L 0.292 +56 I 0.323 +57 G 0.343 +58 M 0.333 +59 S 0.295 +60 V 0.256 +61 L 0.234 +62 V 0.232 +63 R 0.242 +64 V 0.261 +65 L 0.287 +66 V 0.320 +67 Q 0.358 +68 K 0.404 +69 P 0.452 +70 S 0.481 +71 R 0.474 +72 E 0.440 +73 K 0.399 +74 C 0.372 +75 C 0.384 +76 V 0.438 +77 F 0.497 +78 I 0.523 +79 Q 0.521 +80 E 0.520 +81 N 0.532 +82 L 0.537 +83 N 0.530 +84 K 0.532 +85 T 0.551 +86 T 0.574 +87 D 0.581 +88 C 0.564 +89 S 0.520 +90 V 0.449 +91 N 0.354 +92 L 0.252 +93 E 0.164 +94 C 0.107 +95 P 0.078 +96 Q 0.063 +97 D 0.052 +98 W 0.045 +99 L 0.042 +100 L 0.041 +101 H 0.038 +102 R 0.036 +103 D 0.035 +104 K 0.033 +105 C 0.030 +106 F 0.029 +107 H 0.033 +108 V 0.045 +109 S 0.059 +110 Q 0.070 +111 V 0.071 +112 S 0.061 +113 N 0.047 +114 T 0.037 +115 W 0.032 +116 E 0.032 +117 E 0.035 +118 G 0.036 +119 Q 0.037 +120 A 0.039 +121 D 0.041 +122 C 0.043 +123 G 0.049 +124 R 0.057 +125 K 0.066 +126 G 0.068 +127 A 0.062 +128 T 0.051 +129 L 0.046 +130 L 0.050 +131 L 0.058 +132 I 0.063 +133 Q 0.059 +134 D 0.048 +135 Q 0.037 +136 E 0.027 +137 E 0.021 +138 L 0.018 +139 R 0.016 +140 F 0.015 +141 L 0.016 +142 L 0.018 +143 D 0.021 +144 S 0.026 +145 I 0.030 +146 K 0.033 +147 E 0.033 +148 K 0.030 +149 Y 0.026 +150 N 0.023 +151 S 0.019 +152 F 0.015 +153 W 0.012 +154 I 0.013 +155 G 0.017 +156 L 0.021 +157 R 0.024 +158 F 0.027 +159 T 0.031 +160 L 0.036 +161 P 0.041 +162 D 0.047 +163 M 0.053 +164 N 0.053 +165 W 0.046 +166 K 0.035 +167 W 0.030 +168 I 0.034 +169 N 0.045 +170 G 0.057 +171 T 0.068 +172 T 0.075 +173 F 0.080 +174 N 0.087 +175 S 0.097 +176 D 0.108 +177 V 0.122 +178 L 0.142 +179 K 0.162 +180 I 0.178 +181 T 0.189 +182 G 0.194 +183 V 0.185 +184 T 0.160 +185 E 0.131 +186 N 0.106 +187 G 0.086 +188 S 0.067 +189 C 0.052 +190 A 0.043 +191 S 0.042 +192 I 0.046 +193 L 0.052 +194 G 0.063 +195 D 0.077 +196 K 0.092 +197 V 0.102 +198 T 0.107 +199 P 0.105 +200 E 0.099 +201 S 0.095 +202 C 0.095 +203 A 0.099 +204 S 0.102 +205 D 0.098 +206 N 0.083 +207 R 0.062 +208 W 0.045 +209 I 0.037 +210 C 0.037 +211 Q 0.046 +212 K 0.071 +213 E 0.123 +214 L 0.209 +215 N 0.320 +216 H 0.433 +217 E 0.520 +218 T 0.576 +219 P 0.612 +220 S 0.630 +221 N 0.613 +222 D 0.559 +223 S 0.508 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030325.17_ENSMUST00000174404.8_GN:Klrb1c_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:48.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030325.17_ENSMUST00000174404.8_GN:Klrb1c_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:48.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6846dc1aba5b6a347038bc5f031b05fe2acc4ab1 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030325.17_ENSMUST00000174404.8_GN:Klrb1c_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:48.caid @@ -0,0 +1,272 @@ +>ENSMUSG00000030325.17|ENSMUST00000174404.8|GN:Klrb1c|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:48 +1 M 0.435 +2 E 0.464 +3 K 0.503 +4 P 0.526 +5 S 0.525 +6 E 0.540 +7 T 0.600 +8 G 0.675 +9 I 0.718 +10 S 0.731 +11 G 0.737 +12 C 0.741 +13 G 0.740 +14 N 0.734 +15 R 0.720 +16 A 0.699 +17 E 0.678 +18 H 0.667 +19 S 0.662 +20 Q 0.657 +21 R 0.652 +22 T 0.649 +23 F 0.639 +24 F 0.618 +25 C 0.585 +26 L 0.559 +27 F 0.558 +28 H 0.588 +29 L 0.633 +30 K 0.682 +31 G 0.727 +32 L 0.755 +33 G 0.760 +34 V 0.748 +35 C 0.725 +36 P 0.686 +37 F 0.638 +38 S 0.608 +39 P 0.623 +40 P 0.678 +41 V 0.740 +42 K 0.780 +43 C 0.795 +44 C 0.793 +45 I 0.783 +46 S 0.774 +47 C 0.771 +48 E 0.769 +49 M 0.767 +50 D 0.770 +51 T 0.778 +52 A 0.784 +53 S 0.781 +54 I 0.775 +55 Y 0.770 +56 L 0.766 +57 G 0.758 +58 L 0.745 +59 K 0.737 +60 P 0.743 +61 P 0.767 +62 R 0.800 +63 T 0.825 +64 L 0.835 +65 G 0.830 +66 A 0.813 +67 W 0.792 +68 H 0.771 +69 E 0.756 +70 S 0.750 +71 P 0.758 +72 P 0.772 +73 S 0.783 +74 L 0.786 +75 P 0.793 +76 P 0.806 +77 D 0.814 +78 A 0.804 +79 C 0.775 +80 R 0.740 +81 C 0.710 +82 P 0.688 +83 R 0.669 +84 S 0.651 +85 H 0.631 +86 R 0.618 +87 L 0.629 +88 A 0.655 +89 L 0.667 +90 K 0.652 +91 L 0.613 +92 S 0.550 +93 C 0.476 +94 A 0.423 +95 G 0.400 +96 L 0.379 +97 I 0.352 +98 L 0.330 +99 L 0.305 +100 V 0.273 +101 L 0.248 +102 T 0.242 +103 L 0.253 +104 I 0.271 +105 G 0.284 +106 M 0.277 +107 S 0.250 +108 V 0.221 +109 L 0.205 +110 V 0.201 +111 R 0.206 +112 V 0.218 +113 L 0.240 +114 V 0.272 +115 Q 0.315 +116 K 0.369 +117 P 0.429 +118 S 0.470 +119 R 0.473 +120 E 0.447 +121 K 0.411 +122 C 0.386 +123 C 0.390 +124 V 0.431 +125 F 0.477 +126 I 0.493 +127 Q 0.481 +128 E 0.476 +129 N 0.492 +130 L 0.511 +131 N 0.519 +132 K 0.530 +133 T 0.554 +134 T 0.579 +135 D 0.588 +136 C 0.569 +137 S 0.519 +138 V 0.446 +139 N 0.355 +140 L 0.260 +141 E 0.178 +142 C 0.123 +143 P 0.093 +144 Q 0.075 +145 D 0.061 +146 W 0.050 +147 L 0.045 +148 L 0.042 +149 H 0.039 +150 R 0.036 +151 D 0.036 +152 K 0.034 +153 C 0.032 +154 F 0.030 +155 H 0.033 +156 V 0.044 +157 S 0.059 +158 Q 0.071 +159 V 0.073 +160 S 0.064 +161 N 0.051 +162 T 0.039 +163 W 0.033 +164 E 0.034 +165 E 0.036 +166 G 0.038 +167 Q 0.039 +168 A 0.041 +169 D 0.043 +170 C 0.045 +171 G 0.051 +172 R 0.060 +173 K 0.069 +174 G 0.070 +175 A 0.062 +176 T 0.051 +177 L 0.045 +178 L 0.049 +179 L 0.057 +180 I 0.062 +181 Q 0.059 +182 D 0.049 +183 Q 0.038 +184 E 0.028 +185 E 0.022 +186 L 0.018 +187 R 0.017 +188 F 0.016 +189 L 0.017 +190 L 0.018 +191 D 0.021 +192 S 0.026 +193 I 0.029 +194 K 0.032 +195 E 0.032 +196 K 0.029 +197 Y 0.025 +198 N 0.021 +199 S 0.018 +200 F 0.014 +201 W 0.011 +202 I 0.012 +203 G 0.016 +204 L 0.020 +205 R 0.023 +206 F 0.026 +207 T 0.029 +208 L 0.034 +209 P 0.038 +210 D 0.043 +211 M 0.047 +212 N 0.046 +213 W 0.039 +214 K 0.031 +215 W 0.026 +216 I 0.029 +217 N 0.038 +218 G 0.049 +219 T 0.058 +220 T 0.065 +221 F 0.070 +222 N 0.077 +223 S 0.087 +224 D 0.098 +225 V 0.111 +226 L 0.130 +227 K 0.151 +228 I 0.170 +229 T 0.183 +230 G 0.187 +231 V 0.177 +232 T 0.151 +233 E 0.123 +234 N 0.101 +235 G 0.082 +236 S 0.064 +237 C 0.050 +238 A 0.042 +239 S 0.041 +240 I 0.043 +241 L 0.049 +242 G 0.060 +243 D 0.076 +244 K 0.093 +245 V 0.105 +246 T 0.110 +247 P 0.108 +248 E 0.101 +249 S 0.096 +250 C 0.096 +251 A 0.099 +252 S 0.102 +253 D 0.098 +254 N 0.083 +255 R 0.063 +256 W 0.046 +257 I 0.038 +258 C 0.038 +259 Q 0.048 +260 K 0.074 +261 E 0.129 +262 L 0.217 +263 N 0.332 +264 H 0.448 +265 E 0.537 +266 T 0.592 +267 P 0.627 +268 S 0.643 +269 N 0.626 +270 D 0.572 +271 S 0.521 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030340.17_ENSMUST00000081440.14_GN:Scnn1a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030340.17_ENSMUST00000081440.14_GN:Scnn1a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..fa830d4d5a5e606db6ae6998cf07f1b7fa3ebea3 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030340.17_ENSMUST00000081440.14_GN:Scnn1a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,700 @@ +>ENSMUSG00000030340.17|ENSMUST00000081440.14|GN:Scnn1a|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.321 +2 L 0.341 +3 D 0.373 +4 H 0.405 +5 T 0.430 +6 R 0.456 +7 A 0.485 +8 P 0.504 +9 E 0.501 +10 L 0.486 +11 N 0.475 +12 L 0.475 +13 D 0.482 +14 L 0.493 +15 D 0.509 +16 L 0.532 +17 D 0.557 +18 V 0.569 +19 S 0.567 +20 N 0.567 +21 S 0.587 +22 P 0.628 +23 K 0.674 +24 G 0.705 +25 S 0.715 +26 M 0.714 +27 K 0.714 +28 G 0.714 +29 N 0.701 +30 N 0.672 +31 F 0.640 +32 K 0.620 +33 E 0.610 +34 Q 0.596 +35 D 0.566 +36 L 0.523 +37 C 0.491 +38 P 0.492 +39 P 0.528 +40 L 0.570 +41 P 0.584 +42 M 0.567 +43 Q 0.566 +44 G 0.611 +45 L 0.664 +46 G 0.686 +47 K 0.675 +48 G 0.640 +49 D 0.586 +50 K 0.547 +51 R 0.551 +52 E 0.564 +53 E 0.548 +54 Q 0.531 +55 A 0.549 +56 L 0.580 +57 G 0.593 +58 P 0.594 +59 E 0.594 +60 P 0.590 +61 S 0.580 +62 E 0.567 +63 P 0.545 +64 R 0.515 +65 Q 0.477 +66 P 0.426 +67 T 0.362 +68 E 0.302 +69 E 0.262 +70 E 0.238 +71 E 0.220 +72 A 0.204 +73 L 0.192 +74 I 0.185 +75 E 0.178 +76 F 0.162 +77 H 0.134 +78 R 0.108 +79 S 0.089 +80 Y 0.074 +81 R 0.063 +82 E 0.060 +83 L 0.062 +84 F 0.064 +85 Q 0.065 +86 F 0.069 +87 F 0.077 +88 C 0.088 +89 N 0.101 +90 N 0.113 +91 T 0.114 +92 T 0.106 +93 I 0.098 +94 H 0.097 +95 G 0.103 +96 A 0.109 +97 I 0.107 +98 R 0.103 +99 L 0.105 +100 V 0.112 +101 C 0.121 +102 S 0.128 +103 K 0.131 +104 H 0.125 +105 N 0.107 +106 R 0.082 +107 M 0.062 +108 K 0.055 +109 T 0.055 +110 A 0.056 +111 F 0.058 +112 W 0.063 +113 A 0.070 +114 V 0.075 +115 L 0.078 +116 W 0.077 +117 L 0.073 +118 C 0.073 +119 T 0.077 +120 F 0.081 +121 G 0.081 +122 M 0.080 +123 M 0.081 +124 Y 0.085 +125 W 0.089 +126 Q 0.093 +127 F 0.098 +128 A 0.103 +129 L 0.104 +130 L 0.099 +131 F 0.101 +132 E 0.111 +133 E 0.118 +134 Y 0.113 +135 F 0.105 +136 S 0.102 +137 Y 0.104 +138 P 0.110 +139 V 0.121 +140 S 0.133 +141 L 0.147 +142 N 0.160 +143 I 0.167 +144 N 0.167 +145 L 0.165 +146 N 0.161 +147 S 0.153 +148 D 0.138 +149 K 0.123 +150 L 0.115 +151 V 0.111 +152 F 0.108 +153 P 0.102 +154 A 0.092 +155 V 0.081 +156 T 0.079 +157 V 0.091 +158 C 0.112 +159 T 0.126 +160 L 0.125 +161 N 0.118 +162 P 0.110 +163 Y 0.101 +164 R 0.088 +165 Y 0.078 +166 T 0.074 +167 E 0.069 +168 I 0.060 +169 K 0.050 +170 E 0.046 +171 D 0.050 +172 L 0.058 +173 E 0.068 +174 E 0.077 +175 L 0.085 +176 D 0.090 +177 R 0.092 +178 I 0.089 +179 T 0.080 +180 E 0.071 +181 Q 0.067 +182 T 0.068 +183 L 0.074 +184 F 0.083 +185 D 0.090 +186 L 0.096 +187 Y 0.109 +188 K 0.139 +189 Y 0.188 +190 N 0.246 +191 S 0.296 +192 S 0.332 +193 Y 0.368 +194 T 0.416 +195 R 0.474 +196 Q 0.532 +197 A 0.583 +198 G 0.619 +199 G 0.635 +200 R 0.631 +201 R 0.615 +202 R 0.597 +203 S 0.589 +204 T 0.591 +205 R 0.599 +206 D 0.607 +207 L 0.611 +208 R 0.606 +209 G 0.578 +210 A 0.527 +211 L 0.481 +212 P 0.459 +213 H 0.450 +214 P 0.436 +215 L 0.426 +216 Q 0.429 +217 R 0.431 +218 L 0.414 +219 R 0.385 +220 T 0.361 +221 P 0.353 +222 P 0.371 +223 P 0.420 +224 P 0.487 +225 N 0.548 +226 P 0.585 +227 A 0.605 +228 R 0.626 +229 S 0.651 +230 A 0.671 +231 R 0.684 +232 S 0.693 +233 A 0.692 +234 S 0.684 +235 S 0.675 +236 S 0.670 +237 V 0.660 +238 R 0.642 +239 D 0.615 +240 N 0.583 +241 N 0.550 +242 P 0.517 +243 Q 0.473 +244 V 0.411 +245 D 0.337 +246 R 0.268 +247 K 0.217 +248 D 0.182 +249 W 0.158 +250 K 0.141 +251 I 0.125 +252 G 0.109 +253 F 0.095 +254 Q 0.080 +255 L 0.067 +256 C 0.060 +257 N 0.060 +258 Q 0.067 +259 N 0.077 +260 K 0.088 +261 S 0.096 +262 D 0.101 +263 C 0.102 +264 F 0.099 +265 Y 0.092 +266 Q 0.081 +267 T 0.074 +268 Y 0.072 +269 S 0.074 +270 S 0.080 +271 G 0.086 +272 V 0.085 +273 D 0.074 +274 A 0.063 +275 V 0.057 +276 R 0.051 +277 E 0.044 +278 W 0.038 +279 Y 0.032 +280 R 0.029 +281 F 0.029 +282 H 0.035 +283 Y 0.049 +284 I 0.066 +285 N 0.078 +286 I 0.079 +287 L 0.077 +288 S 0.082 +289 R 0.098 +290 L 0.121 +291 P 0.149 +292 D 0.180 +293 T 0.209 +294 S 0.218 +295 P 0.205 +296 A 0.184 +297 L 0.170 +298 E 0.162 +299 E 0.151 +300 E 0.133 +301 A 0.113 +302 L 0.095 +303 G 0.076 +304 S 0.058 +305 F 0.042 +306 I 0.030 +307 F 0.024 +308 T 0.021 +309 C 0.022 +310 R 0.025 +311 F 0.031 +312 N 0.039 +313 Q 0.051 +314 A 0.063 +315 P 0.070 +316 C 0.066 +317 N 0.056 +318 Q 0.047 +319 A 0.042 +320 N 0.039 +321 Y 0.040 +322 S 0.044 +323 Q 0.051 +324 F 0.058 +325 H 0.061 +326 H 0.058 +327 P 0.049 +328 M 0.039 +329 Y 0.031 +330 G 0.027 +331 N 0.025 +332 C 0.026 +333 Y 0.031 +334 T 0.042 +335 F 0.057 +336 N 0.077 +337 N 0.103 +338 K 0.136 +339 N 0.163 +340 N 0.171 +341 S 0.156 +342 N 0.134 +343 L 0.115 +344 W 0.102 +345 M 0.096 +346 S 0.098 +347 S 0.110 +348 M 0.131 +349 P 0.156 +350 G 0.168 +351 V 0.156 +352 N 0.131 +353 N 0.108 +354 G 0.092 +355 L 0.081 +356 S 0.073 +357 L 0.068 +358 T 0.067 +359 L 0.070 +360 R 0.081 +361 T 0.095 +362 E 0.107 +363 Q 0.113 +364 N 0.113 +365 D 0.107 +366 F 0.099 +367 I 0.092 +368 P 0.090 +369 L 0.099 +370 L 0.119 +371 S 0.139 +372 T 0.146 +373 V 0.142 +374 T 0.135 +375 G 0.128 +376 A 0.121 +377 R 0.115 +378 V 0.111 +379 M 0.108 +380 V 0.109 +381 H 0.115 +382 G 0.121 +383 Q 0.124 +384 D 0.124 +385 E 0.123 +386 P 0.121 +387 A 0.119 +388 F 0.122 +389 M 0.128 +390 D 0.129 +391 D 0.122 +392 G 0.109 +393 G 0.098 +394 F 0.096 +395 N 0.102 +396 V 0.116 +397 R 0.136 +398 P 0.160 +399 G 0.182 +400 V 0.199 +401 E 0.210 +402 T 0.214 +403 S 0.206 +404 I 0.187 +405 S 0.165 +406 M 0.149 +407 R 0.139 +408 K 0.137 +409 E 0.138 +410 A 0.145 +411 L 0.156 +412 D 0.168 +413 S 0.180 +414 L 0.192 +415 G 0.210 +416 G 0.224 +417 N 0.223 +418 Y 0.209 +419 G 0.196 +420 D 0.195 +421 C 0.207 +422 T 0.226 +423 E 0.247 +424 N 0.267 +425 G 0.282 +426 S 0.287 +427 D 0.282 +428 V 0.273 +429 P 0.267 +430 V 0.262 +431 K 0.254 +432 N 0.233 +433 L 0.197 +434 Y 0.155 +435 P 0.126 +436 S 0.116 +437 K 0.117 +438 Y 0.118 +439 T 0.115 +440 Q 0.107 +441 Q 0.100 +442 V 0.098 +443 C 0.104 +444 I 0.112 +445 H 0.117 +446 S 0.122 +447 C 0.128 +448 F 0.133 +449 Q 0.134 +450 E 0.127 +451 N 0.116 +452 M 0.103 +453 I 0.093 +454 K 0.085 +455 K 0.083 +456 C 0.090 +457 G 0.103 +458 C 0.118 +459 A 0.128 +460 Y 0.124 +461 I 0.110 +462 F 0.097 +463 Y 0.095 +464 P 0.105 +465 K 0.119 +466 P 0.132 +467 K 0.139 +468 G 0.144 +469 V 0.143 +470 E 0.133 +471 F 0.118 +472 C 0.101 +473 D 0.087 +474 Y 0.076 +475 L 0.071 +476 K 0.068 +477 Q 0.065 +478 S 0.064 +479 S 0.062 +480 W 0.057 +481 G 0.050 +482 Y 0.044 +483 C 0.044 +484 Y 0.047 +485 Y 0.054 +486 K 0.065 +487 L 0.079 +488 Q 0.091 +489 A 0.103 +490 A 0.119 +491 F 0.132 +492 S 0.139 +493 L 0.143 +494 D 0.148 +495 S 0.146 +496 L 0.133 +497 G 0.114 +498 C 0.104 +499 F 0.105 +500 S 0.107 +501 K 0.107 +502 C 0.112 +503 R 0.125 +504 K 0.140 +505 P 0.156 +506 C 0.175 +507 S 0.195 +508 V 0.211 +509 T 0.218 +510 N 0.219 +511 Y 0.214 +512 K 0.203 +513 L 0.187 +514 S 0.169 +515 A 0.154 +516 G 0.145 +517 Y 0.140 +518 S 0.135 +519 R 0.127 +520 W 0.117 +521 P 0.114 +522 S 0.115 +523 V 0.109 +524 K 0.095 +525 S 0.078 +526 Q 0.065 +527 D 0.058 +528 W 0.056 +529 I 0.057 +530 F 0.060 +531 E 0.069 +532 M 0.082 +533 L 0.096 +534 S 0.109 +535 L 0.127 +536 Q 0.149 +537 N 0.171 +538 N 0.188 +539 Y 0.202 +540 T 0.214 +541 I 0.229 +542 N 0.242 +543 N 0.242 +544 K 0.220 +545 R 0.184 +546 N 0.145 +547 G 0.113 +548 V 0.095 +549 A 0.089 +550 K 0.089 +551 L 0.092 +552 N 0.093 +553 I 0.096 +554 F 0.106 +555 F 0.123 +556 K 0.143 +557 E 0.167 +558 L 0.198 +559 N 0.234 +560 Y 0.271 +561 K 0.305 +562 T 0.327 +563 N 0.326 +564 S 0.310 +565 E 0.292 +566 S 0.277 +567 P 0.257 +568 S 0.227 +569 V 0.192 +570 T 0.158 +571 M 0.132 +572 V 0.124 +573 S 0.132 +574 L 0.146 +575 L 0.158 +576 S 0.173 +577 N 0.196 +578 L 0.217 +579 G 0.221 +580 S 0.204 +581 Q 0.177 +582 W 0.150 +583 S 0.129 +584 L 0.117 +585 W 0.114 +586 F 0.123 +587 G 0.139 +588 S 0.146 +589 S 0.135 +590 V 0.114 +591 L 0.098 +592 S 0.091 +593 V 0.083 +594 V 0.073 +595 E 0.064 +596 M 0.059 +597 A 0.056 +598 E 0.052 +599 L 0.048 +600 I 0.045 +601 F 0.046 +602 D 0.049 +603 L 0.051 +604 L 0.054 +605 V 0.058 +606 I 0.063 +607 T 0.068 +608 L 0.071 +609 I 0.073 +610 M 0.077 +611 L 0.089 +612 L 0.110 +613 H 0.139 +614 R 0.171 +615 F 0.202 +616 R 0.233 +617 S 0.269 +618 R 0.313 +619 Y 0.362 +620 W 0.416 +621 S 0.479 +622 P 0.551 +623 G 0.614 +624 R 0.658 +625 G 0.682 +626 A 0.694 +627 R 0.697 +628 G 0.687 +629 A 0.648 +630 R 0.593 +631 E 0.564 +632 V 0.586 +633 A 0.619 +634 S 0.628 +635 T 0.623 +636 P 0.626 +637 A 0.630 +638 S 0.624 +639 S 0.614 +640 F 0.617 +641 P 0.636 +642 S 0.656 +643 R 0.665 +644 F 0.663 +645 C 0.663 +646 P 0.670 +647 H 0.678 +648 P 0.673 +649 T 0.652 +650 S 0.633 +651 P 0.633 +652 P 0.655 +653 P 0.683 +654 S 0.695 +655 L 0.675 +656 P 0.629 +657 Q 0.605 +658 Q 0.630 +659 G 0.668 +660 T 0.682 +661 T 0.683 +662 P 0.694 +663 P 0.712 +664 L 0.726 +665 A 0.721 +666 L 0.689 +667 T 0.636 +668 A 0.592 +669 P 0.587 +670 P 0.619 +671 P 0.659 +672 A 0.677 +673 Y 0.657 +674 A 0.610 +675 T 0.580 +676 L 0.599 +677 G 0.645 +678 P 0.678 +679 S 0.693 +680 A 0.703 +681 S 0.714 +682 P 0.727 +683 L 0.742 +684 D 0.748 +685 S 0.740 +686 A 0.729 +687 V 0.730 +688 P 0.745 +689 G 0.763 +690 S 0.764 +691 S 0.743 +692 A 0.708 +693 C 0.673 +694 A 0.645 +695 P 0.619 +696 A 0.583 +697 M 0.524 +698 A 0.447 +699 L 0.387 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030340.17_ENSMUST00000081440.14_GN:Scnn1a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030340.17_ENSMUST00000081440.14_GN:Scnn1a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..08b6469c9a1848fe05432dacf41658f8a1bc5169 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030340.17_ENSMUST00000081440.14_GN:Scnn1a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid @@ -0,0 +1,701 @@ +>ENSMUSG00000030340.17|ENSMUST00000081440.14|GN:Scnn1a|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:1 +1 M 0.308 +2 M 0.326 +3 L 0.360 +4 D 0.396 +5 H 0.420 +6 T 0.432 +7 R 0.445 +8 A 0.452 +9 P 0.435 +10 E 0.415 +11 L 0.421 +12 N 0.447 +13 L 0.466 +14 D 0.478 +15 L 0.490 +16 D 0.507 +17 L 0.530 +18 D 0.557 +19 V 0.572 +20 S 0.571 +21 N 0.570 +22 S 0.590 +23 P 0.631 +24 K 0.676 +25 G 0.706 +26 S 0.716 +27 M 0.715 +28 K 0.715 +29 G 0.715 +30 N 0.703 +31 N 0.674 +32 F 0.642 +33 K 0.622 +34 E 0.612 +35 Q 0.598 +36 D 0.568 +37 L 0.525 +38 C 0.492 +39 P 0.494 +40 P 0.530 +41 L 0.572 +42 P 0.586 +43 M 0.569 +44 Q 0.568 +45 G 0.613 +46 L 0.668 +47 G 0.691 +48 K 0.682 +49 G 0.646 +50 D 0.591 +51 K 0.551 +52 R 0.554 +53 E 0.567 +54 E 0.551 +55 Q 0.534 +56 A 0.551 +57 L 0.582 +58 G 0.595 +59 P 0.596 +60 E 0.596 +61 P 0.592 +62 S 0.582 +63 E 0.568 +64 P 0.545 +65 R 0.515 +66 Q 0.477 +67 P 0.426 +68 T 0.362 +69 E 0.303 +70 E 0.263 +71 E 0.238 +72 E 0.220 +73 A 0.204 +74 L 0.192 +75 I 0.185 +76 E 0.178 +77 F 0.162 +78 H 0.134 +79 R 0.107 +80 S 0.089 +81 Y 0.074 +82 R 0.063 +83 E 0.060 +84 L 0.062 +85 F 0.064 +86 Q 0.065 +87 F 0.069 +88 F 0.077 +89 C 0.087 +90 N 0.101 +91 N 0.113 +92 T 0.114 +93 T 0.106 +94 I 0.097 +95 H 0.096 +96 G 0.103 +97 A 0.109 +98 I 0.107 +99 R 0.103 +100 L 0.105 +101 V 0.112 +102 C 0.121 +103 S 0.128 +104 K 0.131 +105 H 0.124 +106 N 0.106 +107 R 0.082 +108 M 0.062 +109 K 0.055 +110 T 0.056 +111 A 0.056 +112 F 0.058 +113 W 0.063 +114 A 0.070 +115 V 0.075 +116 L 0.078 +117 W 0.077 +118 L 0.073 +119 C 0.073 +120 T 0.077 +121 F 0.080 +122 G 0.081 +123 M 0.080 +124 M 0.081 +125 Y 0.085 +126 W 0.089 +127 Q 0.090 +128 F 0.093 +129 A 0.098 +130 L 0.099 +131 L 0.097 +132 F 0.100 +133 E 0.111 +134 E 0.117 +135 Y 0.113 +136 F 0.105 +137 S 0.101 +138 Y 0.103 +139 P 0.110 +140 V 0.121 +141 S 0.133 +142 L 0.147 +143 N 0.160 +144 I 0.167 +145 N 0.167 +146 L 0.165 +147 N 0.161 +148 S 0.153 +149 D 0.138 +150 K 0.123 +151 L 0.115 +152 V 0.111 +153 F 0.108 +154 P 0.102 +155 A 0.092 +156 V 0.081 +157 T 0.079 +158 V 0.091 +159 C 0.112 +160 T 0.126 +161 L 0.125 +162 N 0.117 +163 P 0.110 +164 Y 0.101 +165 R 0.088 +166 Y 0.078 +167 T 0.073 +168 E 0.069 +169 I 0.060 +170 K 0.049 +171 E 0.046 +172 D 0.049 +173 L 0.057 +174 E 0.067 +175 E 0.077 +176 L 0.085 +177 D 0.090 +178 R 0.092 +179 I 0.089 +180 T 0.079 +181 E 0.071 +182 Q 0.067 +183 T 0.068 +184 L 0.074 +185 F 0.083 +186 D 0.090 +187 L 0.096 +188 Y 0.109 +189 K 0.139 +190 Y 0.189 +191 N 0.247 +192 S 0.296 +193 S 0.333 +194 Y 0.369 +195 T 0.416 +196 R 0.474 +197 Q 0.533 +198 A 0.583 +199 G 0.619 +200 G 0.635 +201 R 0.631 +202 R 0.615 +203 R 0.597 +204 S 0.588 +205 T 0.591 +206 R 0.599 +207 D 0.607 +208 L 0.612 +209 R 0.606 +210 G 0.578 +211 A 0.528 +212 L 0.481 +213 P 0.459 +214 H 0.450 +215 P 0.437 +216 L 0.426 +217 Q 0.430 +218 R 0.431 +219 L 0.414 +220 R 0.385 +221 T 0.361 +222 P 0.354 +223 P 0.372 +224 P 0.420 +225 P 0.488 +226 N 0.549 +227 P 0.586 +228 A 0.605 +229 R 0.627 +230 S 0.652 +231 A 0.672 +232 R 0.685 +233 S 0.693 +234 A 0.693 +235 S 0.685 +236 S 0.676 +237 S 0.671 +238 V 0.661 +239 R 0.643 +240 D 0.615 +241 N 0.584 +242 N 0.551 +243 P 0.517 +244 Q 0.474 +245 V 0.412 +246 D 0.337 +247 R 0.268 +248 K 0.217 +249 D 0.182 +250 W 0.158 +251 K 0.140 +252 I 0.125 +253 G 0.109 +254 F 0.095 +255 Q 0.080 +256 L 0.067 +257 C 0.060 +258 N 0.060 +259 Q 0.067 +260 N 0.077 +261 K 0.088 +262 S 0.096 +263 D 0.101 +264 C 0.102 +265 F 0.100 +266 Y 0.091 +267 Q 0.081 +268 T 0.074 +269 Y 0.072 +270 S 0.074 +271 S 0.080 +272 G 0.086 +273 V 0.085 +274 D 0.074 +275 A 0.063 +276 V 0.057 +277 R 0.051 +278 E 0.044 +279 W 0.038 +280 Y 0.032 +281 R 0.029 +282 F 0.029 +283 H 0.035 +284 Y 0.049 +285 I 0.066 +286 N 0.078 +287 I 0.079 +288 L 0.077 +289 S 0.082 +290 R 0.098 +291 L 0.121 +292 P 0.149 +293 D 0.181 +294 T 0.209 +295 S 0.219 +296 P 0.205 +297 A 0.184 +298 L 0.170 +299 E 0.163 +300 E 0.151 +301 E 0.133 +302 A 0.114 +303 L 0.095 +304 G 0.076 +305 S 0.058 +306 F 0.042 +307 I 0.030 +308 F 0.024 +309 T 0.021 +310 C 0.022 +311 R 0.025 +312 F 0.031 +313 N 0.039 +314 Q 0.051 +315 A 0.063 +316 P 0.069 +317 C 0.066 +318 N 0.056 +319 Q 0.047 +320 A 0.042 +321 N 0.039 +322 Y 0.040 +323 S 0.044 +324 Q 0.051 +325 F 0.058 +326 H 0.061 +327 H 0.058 +328 P 0.049 +329 M 0.039 +330 Y 0.031 +331 G 0.027 +332 N 0.025 +333 C 0.026 +334 Y 0.031 +335 T 0.042 +336 F 0.057 +337 N 0.077 +338 N 0.103 +339 K 0.136 +340 N 0.163 +341 N 0.171 +342 S 0.156 +343 N 0.134 +344 L 0.115 +345 W 0.102 +346 M 0.096 +347 S 0.098 +348 S 0.110 +349 M 0.131 +350 P 0.156 +351 G 0.168 +352 V 0.156 +353 N 0.131 +354 N 0.108 +355 G 0.092 +356 L 0.081 +357 S 0.073 +358 L 0.068 +359 T 0.067 +360 L 0.070 +361 R 0.081 +362 T 0.095 +363 E 0.106 +364 Q 0.113 +365 N 0.113 +366 D 0.107 +367 F 0.099 +368 I 0.092 +369 P 0.090 +370 L 0.099 +371 L 0.119 +372 S 0.139 +373 T 0.146 +374 V 0.142 +375 T 0.135 +376 G 0.128 +377 A 0.121 +378 R 0.115 +379 V 0.111 +380 M 0.108 +381 V 0.109 +382 H 0.115 +383 G 0.121 +384 Q 0.124 +385 D 0.124 +386 E 0.123 +387 P 0.121 +388 A 0.119 +389 F 0.122 +390 M 0.128 +391 D 0.129 +392 D 0.122 +393 G 0.109 +394 G 0.098 +395 F 0.096 +396 N 0.102 +397 V 0.115 +398 R 0.136 +399 P 0.160 +400 G 0.182 +401 V 0.199 +402 E 0.210 +403 T 0.214 +404 S 0.205 +405 I 0.187 +406 S 0.165 +407 M 0.149 +408 R 0.139 +409 K 0.137 +410 E 0.138 +411 A 0.144 +412 L 0.155 +413 D 0.168 +414 S 0.179 +415 L 0.192 +416 G 0.210 +417 G 0.224 +418 N 0.223 +419 Y 0.209 +420 G 0.196 +421 D 0.195 +422 C 0.207 +423 T 0.226 +424 E 0.247 +425 N 0.267 +426 G 0.282 +427 S 0.287 +428 D 0.282 +429 V 0.273 +430 P 0.267 +431 V 0.262 +432 K 0.254 +433 N 0.233 +434 L 0.197 +435 Y 0.155 +436 P 0.126 +437 S 0.116 +438 K 0.117 +439 Y 0.118 +440 T 0.114 +441 Q 0.107 +442 Q 0.100 +443 V 0.098 +444 C 0.104 +445 I 0.112 +446 H 0.117 +447 S 0.122 +448 C 0.128 +449 F 0.133 +450 Q 0.134 +451 E 0.127 +452 N 0.116 +453 M 0.104 +454 I 0.093 +455 K 0.085 +456 K 0.083 +457 C 0.090 +458 G 0.103 +459 C 0.118 +460 A 0.128 +461 Y 0.125 +462 I 0.110 +463 F 0.097 +464 Y 0.095 +465 P 0.105 +466 K 0.120 +467 P 0.132 +468 K 0.139 +469 G 0.144 +470 V 0.143 +471 E 0.134 +472 F 0.118 +473 C 0.101 +474 D 0.086 +475 Y 0.076 +476 L 0.071 +477 K 0.068 +478 Q 0.065 +479 S 0.064 +480 S 0.062 +481 W 0.057 +482 G 0.050 +483 Y 0.044 +484 C 0.044 +485 Y 0.047 +486 Y 0.054 +487 K 0.066 +488 L 0.079 +489 Q 0.091 +490 A 0.103 +491 A 0.119 +492 F 0.132 +493 S 0.139 +494 L 0.143 +495 D 0.148 +496 S 0.146 +497 L 0.133 +498 G 0.114 +499 C 0.104 +500 F 0.105 +501 S 0.107 +502 K 0.107 +503 C 0.112 +504 R 0.125 +505 K 0.140 +506 P 0.156 +507 C 0.175 +508 S 0.195 +509 V 0.211 +510 T 0.218 +511 N 0.219 +512 Y 0.214 +513 K 0.203 +514 L 0.187 +515 S 0.169 +516 A 0.155 +517 G 0.145 +518 Y 0.140 +519 S 0.135 +520 R 0.127 +521 W 0.117 +522 P 0.114 +523 S 0.115 +524 V 0.109 +525 K 0.095 +526 S 0.078 +527 Q 0.065 +528 D 0.058 +529 W 0.056 +530 I 0.057 +531 F 0.060 +532 E 0.069 +533 M 0.082 +534 L 0.096 +535 S 0.109 +536 L 0.127 +537 Q 0.149 +538 N 0.172 +539 N 0.189 +540 Y 0.202 +541 T 0.215 +542 I 0.229 +543 N 0.242 +544 N 0.242 +545 K 0.221 +546 R 0.184 +547 N 0.145 +548 G 0.114 +549 V 0.095 +550 A 0.089 +551 K 0.089 +552 L 0.092 +553 N 0.093 +554 I 0.096 +555 F 0.106 +556 F 0.123 +557 K 0.143 +558 E 0.167 +559 L 0.198 +560 N 0.234 +561 Y 0.271 +562 K 0.305 +563 T 0.326 +564 N 0.326 +565 S 0.310 +566 E 0.292 +567 S 0.277 +568 P 0.257 +569 S 0.227 +570 V 0.192 +571 T 0.157 +572 M 0.132 +573 V 0.124 +574 S 0.132 +575 L 0.146 +576 L 0.158 +577 S 0.173 +578 N 0.196 +579 L 0.217 +580 G 0.221 +581 S 0.204 +582 Q 0.177 +583 W 0.150 +584 S 0.129 +585 L 0.117 +586 W 0.114 +587 F 0.123 +588 G 0.139 +589 S 0.146 +590 S 0.135 +591 V 0.114 +592 L 0.098 +593 S 0.091 +594 V 0.083 +595 V 0.073 +596 E 0.064 +597 M 0.059 +598 A 0.056 +599 E 0.052 +600 L 0.048 +601 I 0.045 +602 F 0.046 +603 D 0.049 +604 L 0.051 +605 L 0.054 +606 V 0.058 +607 I 0.063 +608 T 0.068 +609 L 0.071 +610 I 0.073 +611 M 0.078 +612 L 0.090 +613 L 0.110 +614 H 0.139 +615 R 0.171 +616 F 0.202 +617 R 0.233 +618 S 0.269 +619 R 0.313 +620 Y 0.362 +621 W 0.415 +622 S 0.479 +623 P 0.550 +624 G 0.614 +625 R 0.658 +626 G 0.682 +627 A 0.694 +628 R 0.698 +629 G 0.687 +630 A 0.648 +631 R 0.593 +632 E 0.564 +633 V 0.586 +634 A 0.619 +635 S 0.628 +636 T 0.623 +637 P 0.626 +638 A 0.630 +639 S 0.624 +640 S 0.614 +641 F 0.617 +642 P 0.636 +643 S 0.656 +644 R 0.665 +645 F 0.663 +646 C 0.663 +647 P 0.670 +648 H 0.678 +649 P 0.672 +650 T 0.652 +651 S 0.632 +652 P 0.633 +653 P 0.655 +654 P 0.683 +655 S 0.695 +656 L 0.675 +657 P 0.629 +658 Q 0.605 +659 Q 0.630 +660 G 0.668 +661 T 0.682 +662 T 0.683 +663 P 0.694 +664 P 0.713 +665 L 0.727 +666 A 0.723 +667 L 0.690 +668 T 0.636 +669 A 0.592 +670 P 0.587 +671 P 0.619 +672 P 0.660 +673 A 0.680 +674 Y 0.667 +675 A 0.631 +676 T 0.606 +677 L 0.619 +678 G 0.655 +679 P 0.682 +680 S 0.694 +681 A 0.703 +682 S 0.714 +683 P 0.727 +684 L 0.742 +685 D 0.748 +686 S 0.740 +687 A 0.729 +688 V 0.729 +689 P 0.745 +690 G 0.762 +691 S 0.764 +692 S 0.743 +693 A 0.707 +694 C 0.671 +695 A 0.643 +696 P 0.617 +697 A 0.580 +698 M 0.521 +699 A 0.444 +700 L 0.385 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030432.13_ENSMUST00000032597.12_GN:Rpl28_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030432.13_ENSMUST00000032597.12_GN:Rpl28_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2c3183976f808c915e1f493056a057c2339b708b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030432.13_ENSMUST00000032597.12_GN:Rpl28_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,138 @@ +>ENSMUSG00000030432.13|ENSMUST00000032597.12|GN:Rpl28|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.237 +2 S 0.218 +3 A 0.193 +4 H 0.176 +5 L 0.167 +6 Q 0.154 +7 W 0.132 +8 M 0.114 +9 V 0.110 +10 V 0.112 +11 R 0.116 +12 N 0.127 +13 C 0.146 +14 S 0.164 +15 S 0.176 +16 F 0.179 +17 L 0.174 +18 I 0.163 +19 K 0.148 +20 R 0.138 +21 N 0.140 +22 K 0.152 +23 Q 0.167 +24 T 0.181 +25 Y 0.201 +26 S 0.234 +27 T 0.278 +28 E 0.309 +29 P 0.305 +30 N 0.282 +31 N 0.276 +32 L 0.298 +33 K 0.330 +34 A 0.344 +35 R 0.333 +36 N 0.308 +37 S 0.292 +38 F 0.306 +39 R 0.350 +40 Y 0.402 +41 N 0.435 +42 G 0.436 +43 L 0.409 +44 I 0.362 +45 H 0.303 +46 R 0.239 +47 K 0.179 +48 T 0.128 +49 V 0.095 +50 G 0.082 +51 V 0.086 +52 E 0.096 +53 P 0.103 +54 A 0.105 +55 A 0.109 +56 D 0.116 +57 G 0.120 +58 K 0.116 +59 G 0.102 +60 V 0.085 +61 V 0.072 +62 V 0.069 +63 V 0.073 +64 M 0.083 +65 K 0.097 +66 R 0.116 +67 R 0.139 +68 S 0.164 +69 G 0.185 +70 Q 0.190 +71 R 0.180 +72 K 0.173 +73 P 0.178 +74 A 0.184 +75 T 0.177 +76 S 0.158 +77 Y 0.135 +78 V 0.118 +79 R 0.109 +80 T 0.106 +81 T 0.102 +82 I 0.096 +83 N 0.088 +84 K 0.081 +85 N 0.079 +86 A 0.078 +87 R 0.077 +88 A 0.076 +89 T 0.079 +90 L 0.086 +91 S 0.092 +92 S 0.093 +93 I 0.091 +94 R 0.088 +95 H 0.084 +96 M 0.078 +97 I 0.075 +98 R 0.080 +99 K 0.088 +100 N 0.090 +101 K 0.086 +102 Y 0.079 +103 R 0.070 +104 P 0.063 +105 D 0.062 +106 L 0.061 +107 R 0.056 +108 M 0.050 +109 A 0.051 +110 A 0.059 +111 I 0.070 +112 R 0.077 +113 R 0.075 +114 A 0.072 +115 S 0.072 +116 A 0.074 +117 I 0.078 +118 L 0.088 +119 R 0.107 +120 S 0.139 +121 Q 0.193 +122 K 0.266 +123 P 0.336 +124 V 0.384 +125 V 0.408 +126 V 0.420 +127 K 0.428 +128 R 0.440 +129 K 0.458 +130 R 0.480 +131 T 0.504 +132 R 0.534 +133 P 0.567 +134 T 0.587 +135 K 0.576 +136 S 0.536 +137 S 0.497 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030432.13_ENSMUST00000032597.12_GN:Rpl28_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:28.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030432.13_ENSMUST00000032597.12_GN:Rpl28_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:28.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..62ac1fe2afe7072ed8238ccc8b8473ea2f149a2a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030432.13_ENSMUST00000032597.12_GN:Rpl28_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:28.caid @@ -0,0 +1,166 @@ +>ENSMUSG00000030432.13|ENSMUST00000032597.12|GN:Rpl28|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:28 +1 M 0.377 +2 R 0.386 +3 C 0.396 +4 H 0.400 +5 F 0.403 +6 K 0.428 +7 G 0.482 +8 V 0.532 +9 V 0.559 +10 P 0.571 +11 P 0.572 +12 L 0.546 +13 V 0.493 +14 S 0.447 +15 L 0.447 +16 F 0.488 +17 P 0.539 +18 S 0.589 +19 P 0.635 +20 A 0.669 +21 A 0.683 +22 I 0.681 +23 G 0.675 +24 R 0.672 +25 G 0.664 +26 A 0.634 +27 A 0.569 +28 A 0.472 +29 M 0.365 +30 S 0.273 +31 A 0.209 +32 H 0.173 +33 L 0.158 +34 Q 0.145 +35 W 0.127 +36 M 0.114 +37 V 0.114 +38 V 0.118 +39 R 0.123 +40 N 0.134 +41 C 0.153 +42 S 0.170 +43 S 0.179 +44 F 0.180 +45 L 0.174 +46 I 0.164 +47 K 0.150 +48 R 0.138 +49 N 0.136 +50 K 0.147 +51 Q 0.162 +52 T 0.178 +53 Y 0.200 +54 S 0.236 +55 T 0.282 +56 E 0.314 +57 P 0.311 +58 N 0.289 +59 N 0.284 +60 L 0.310 +61 K 0.344 +62 A 0.360 +63 R 0.350 +64 N 0.326 +65 S 0.311 +66 F 0.322 +67 R 0.360 +68 Y 0.404 +69 N 0.428 +70 G 0.424 +71 L 0.396 +72 I 0.352 +73 H 0.299 +74 R 0.240 +75 K 0.182 +76 T 0.131 +77 V 0.097 +78 G 0.082 +79 V 0.085 +80 E 0.095 +81 P 0.101 +82 A 0.103 +83 A 0.107 +84 D 0.115 +85 G 0.120 +86 K 0.116 +87 G 0.102 +88 V 0.084 +89 V 0.072 +90 V 0.069 +91 V 0.075 +92 M 0.084 +93 K 0.098 +94 R 0.115 +95 R 0.137 +96 S 0.161 +97 G 0.181 +98 Q 0.186 +99 R 0.175 +100 K 0.166 +101 P 0.170 +102 A 0.177 +103 T 0.172 +104 S 0.156 +105 Y 0.138 +106 V 0.123 +107 R 0.114 +108 T 0.109 +109 T 0.103 +110 I 0.095 +111 N 0.087 +112 K 0.080 +113 N 0.078 +114 A 0.078 +115 R 0.076 +116 A 0.075 +117 T 0.078 +118 L 0.085 +119 S 0.091 +120 S 0.092 +121 I 0.089 +122 R 0.087 +123 H 0.084 +124 M 0.079 +125 I 0.077 +126 R 0.082 +127 K 0.089 +128 N 0.092 +129 K 0.088 +130 Y 0.080 +131 R 0.070 +132 P 0.064 +133 D 0.063 +134 L 0.062 +135 R 0.057 +136 M 0.051 +137 A 0.051 +138 A 0.059 +139 I 0.071 +140 R 0.077 +141 R 0.076 +142 A 0.072 +143 S 0.072 +144 A 0.074 +145 I 0.078 +146 L 0.089 +147 R 0.107 +148 S 0.139 +149 Q 0.194 +150 K 0.267 +151 P 0.337 +152 V 0.385 +153 V 0.410 +154 V 0.421 +155 K 0.430 +156 R 0.444 +157 K 0.464 +158 R 0.488 +159 T 0.512 +160 R 0.542 +161 P 0.575 +162 T 0.595 +163 K 0.585 +164 S 0.545 +165 S 0.505 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030681.19_ENSMUST00000165096.10_GN:Mvp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030681.19_ENSMUST00000165096.10_GN:Mvp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5e9bf2cfed13ab5f43b40cdd6ef326b718805885 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030681.19_ENSMUST00000165096.10_GN:Mvp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,862 @@ +>ENSMUSG00000030681.19|ENSMUST00000165096.10|GN:Mvp|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.395 +2 A 0.394 +3 T 0.378 +4 E 0.336 +5 E 0.271 +6 A 0.206 +7 I 0.168 +8 I 0.165 +9 R 0.181 +10 I 0.194 +11 P 0.190 +12 P 0.168 +13 Y 0.135 +14 H 0.107 +15 Y 0.093 +16 I 0.096 +17 H 0.111 +18 V 0.123 +19 L 0.126 +20 D 0.121 +21 Q 0.119 +22 N 0.122 +23 S 0.124 +24 N 0.124 +25 V 0.124 +26 S 0.124 +27 R 0.124 +28 V 0.125 +29 E 0.126 +30 V 0.122 +31 G 0.111 +32 P 0.097 +33 K 0.091 +34 T 0.097 +35 Y 0.113 +36 I 0.129 +37 R 0.138 +38 Q 0.139 +39 D 0.132 +40 N 0.120 +41 E 0.106 +42 R 0.096 +43 V 0.097 +44 L 0.111 +45 F 0.132 +46 A 0.153 +47 P 0.167 +48 V 0.178 +49 R 0.187 +50 M 0.193 +51 V 0.196 +52 T 0.199 +53 V 0.199 +54 P 0.188 +55 P 0.168 +56 R 0.145 +57 H 0.131 +58 Y 0.131 +59 C 0.149 +60 I 0.184 +61 V 0.228 +62 A 0.266 +63 N 0.285 +64 P 0.285 +65 V 0.277 +66 S 0.273 +67 R 0.275 +68 D 0.278 +69 A 0.279 +70 Q 0.281 +71 S 0.291 +72 S 0.310 +73 V 0.328 +74 L 0.342 +75 F 0.355 +76 D 0.361 +77 V 0.352 +78 T 0.338 +79 G 0.339 +80 Q 0.352 +81 V 0.353 +82 R 0.331 +83 L 0.292 +84 R 0.254 +85 H 0.225 +86 A 0.206 +87 D 0.195 +88 Q 0.184 +89 E 0.171 +90 I 0.158 +91 R 0.150 +92 L 0.146 +93 A 0.139 +94 Q 0.128 +95 D 0.118 +96 P 0.115 +97 F 0.120 +98 P 0.133 +99 L 0.145 +100 Y 0.154 +101 P 0.157 +102 G 0.151 +103 E 0.138 +104 L 0.122 +105 L 0.111 +106 E 0.114 +107 K 0.130 +108 D 0.147 +109 I 0.157 +110 T 0.159 +111 P 0.158 +112 L 0.158 +113 Q 0.160 +114 V 0.167 +115 V 0.174 +116 L 0.176 +117 P 0.173 +118 N 0.161 +119 T 0.143 +120 A 0.125 +121 L 0.115 +122 H 0.116 +123 L 0.127 +124 K 0.143 +125 A 0.158 +126 L 0.167 +127 L 0.168 +128 D 0.162 +129 F 0.159 +130 E 0.162 +131 D 0.171 +132 K 0.189 +133 N 0.218 +134 G 0.248 +135 D 0.263 +136 K 0.256 +137 V 0.237 +138 M 0.219 +139 A 0.210 +140 G 0.207 +141 D 0.201 +142 E 0.186 +143 W 0.163 +144 L 0.143 +145 F 0.138 +146 E 0.142 +147 G 0.144 +148 P 0.147 +149 G 0.155 +150 T 0.161 +151 Y 0.162 +152 I 0.161 +153 P 0.157 +154 Q 0.145 +155 K 0.125 +156 E 0.104 +157 V 0.091 +158 E 0.091 +159 V 0.103 +160 V 0.122 +161 E 0.145 +162 I 0.167 +163 I 0.185 +164 Q 0.191 +165 A 0.185 +166 T 0.173 +167 V 0.160 +168 I 0.149 +169 K 0.139 +170 Q 0.129 +171 N 0.118 +172 Q 0.108 +173 A 0.098 +174 L 0.091 +175 R 0.090 +176 L 0.100 +177 R 0.118 +178 A 0.137 +179 R 0.148 +180 K 0.149 +181 E 0.145 +182 C 0.141 +183 F 0.138 +184 D 0.138 +185 R 0.146 +186 D 0.165 +187 G 0.188 +188 K 0.201 +189 E 0.197 +190 R 0.186 +191 V 0.178 +192 T 0.175 +193 G 0.174 +194 E 0.171 +195 E 0.161 +196 W 0.145 +197 L 0.129 +198 V 0.122 +199 R 0.122 +200 S 0.127 +201 V 0.137 +202 G 0.147 +203 A 0.150 +204 Y 0.148 +205 L 0.149 +206 P 0.149 +207 A 0.140 +208 V 0.119 +209 F 0.096 +210 E 0.086 +211 E 0.092 +212 V 0.111 +213 L 0.137 +214 D 0.160 +215 L 0.174 +216 V 0.177 +217 D 0.171 +218 A 0.158 +219 V 0.143 +220 I 0.130 +221 L 0.118 +222 T 0.105 +223 E 0.092 +224 K 0.085 +225 T 0.084 +226 A 0.084 +227 L 0.086 +228 H 0.091 +229 L 0.101 +230 R 0.116 +231 A 0.130 +232 R 0.136 +233 Q 0.132 +234 N 0.123 +235 F 0.114 +236 K 0.110 +237 D 0.113 +238 L 0.125 +239 R 0.144 +240 G 0.164 +241 V 0.173 +242 A 0.166 +243 H 0.152 +244 R 0.145 +245 T 0.146 +246 G 0.151 +247 E 0.151 +248 E 0.144 +249 W 0.129 +250 L 0.112 +251 V 0.100 +252 T 0.093 +253 V 0.093 +254 Q 0.098 +255 D 0.108 +256 T 0.120 +257 E 0.132 +258 A 0.141 +259 H 0.146 +260 V 0.149 +261 P 0.145 +262 D 0.130 +263 V 0.106 +264 Y 0.087 +265 E 0.078 +266 E 0.081 +267 V 0.091 +268 L 0.103 +269 G 0.112 +270 V 0.116 +271 V 0.118 +272 P 0.120 +273 I 0.126 +274 T 0.138 +275 T 0.156 +276 L 0.177 +277 G 0.183 +278 P 0.164 +279 R 0.131 +280 H 0.101 +281 Y 0.090 +282 C 0.102 +283 V 0.130 +284 I 0.163 +285 L 0.191 +286 D 0.210 +287 P 0.224 +288 M 0.226 +289 G 0.215 +290 P 0.200 +291 D 0.199 +292 G 0.214 +293 K 0.231 +294 N 0.232 +295 Q 0.218 +296 L 0.202 +297 G 0.189 +298 Q 0.177 +299 K 0.163 +300 R 0.148 +301 V 0.139 +302 V 0.137 +303 K 0.134 +304 G 0.123 +305 E 0.111 +306 K 0.108 +307 S 0.113 +308 F 0.119 +309 F 0.125 +310 L 0.130 +311 Q 0.132 +312 P 0.130 +313 G 0.126 +314 E 0.121 +315 R 0.116 +316 L 0.110 +317 E 0.107 +318 R 0.112 +319 G 0.122 +320 I 0.135 +321 Q 0.147 +322 D 0.154 +323 V 0.154 +324 Y 0.151 +325 V 0.152 +326 L 0.155 +327 S 0.153 +328 E 0.143 +329 Q 0.127 +330 Q 0.111 +331 G 0.099 +332 L 0.093 +333 L 0.097 +334 L 0.112 +335 K 0.136 +336 A 0.162 +337 L 0.189 +338 Q 0.211 +339 P 0.226 +340 L 0.242 +341 E 0.280 +342 E 0.335 +343 G 0.383 +344 E 0.403 +345 G 0.400 +346 E 0.391 +347 E 0.375 +348 K 0.351 +349 V 0.322 +350 A 0.290 +351 H 0.257 +352 Q 0.230 +353 A 0.217 +354 G 0.217 +355 D 0.217 +356 R 0.204 +357 W 0.183 +358 L 0.168 +359 I 0.162 +360 R 0.150 +361 G 0.131 +362 P 0.121 +363 L 0.129 +364 E 0.146 +365 Y 0.156 +366 V 0.159 +367 P 0.157 +368 S 0.149 +369 A 0.132 +370 K 0.109 +371 V 0.090 +372 E 0.084 +373 V 0.093 +374 V 0.112 +375 E 0.134 +376 E 0.158 +377 R 0.184 +378 Q 0.209 +379 A 0.226 +380 I 0.232 +381 P 0.226 +382 L 0.209 +383 D 0.187 +384 Q 0.166 +385 N 0.147 +386 E 0.133 +387 G 0.123 +388 I 0.119 +389 Y 0.121 +390 V 0.126 +391 Q 0.123 +392 D 0.113 +393 V 0.104 +394 K 0.107 +395 T 0.119 +396 G 0.132 +397 K 0.139 +398 V 0.138 +399 R 0.137 +400 A 0.140 +401 V 0.143 +402 I 0.141 +403 G 0.134 +404 S 0.129 +405 T 0.130 +406 Y 0.134 +407 M 0.135 +408 L 0.129 +409 T 0.120 +410 Q 0.109 +411 D 0.101 +412 E 0.094 +413 V 0.090 +414 L 0.091 +415 W 0.101 +416 E 0.119 +417 K 0.137 +418 E 0.146 +419 L 0.142 +420 P 0.133 +421 S 0.121 +422 G 0.110 +423 V 0.102 +424 E 0.103 +425 E 0.115 +426 L 0.141 +427 L 0.180 +428 N 0.229 +429 L 0.282 +430 G 0.331 +431 H 0.365 +432 D 0.385 +433 P 0.410 +434 L 0.449 +435 A 0.491 +436 D 0.519 +437 R 0.534 +438 G 0.546 +439 Q 0.562 +440 K 0.577 +441 G 0.588 +442 T 0.587 +443 A 0.578 +444 K 0.562 +445 V 0.545 +446 L 0.534 +447 Q 0.532 +448 P 0.539 +449 S 0.536 +450 A 0.503 +451 A 0.435 +452 R 0.355 +453 N 0.286 +454 K 0.240 +455 T 0.226 +456 R 0.247 +457 V 0.273 +458 V 0.270 +459 S 0.236 +460 Y 0.205 +461 R 0.196 +462 V 0.203 +463 P 0.211 +464 H 0.210 +465 N 0.198 +466 A 0.181 +467 A 0.171 +468 V 0.174 +469 Q 0.183 +470 V 0.185 +471 Y 0.170 +472 D 0.145 +473 Y 0.127 +474 R 0.124 +475 A 0.136 +476 K 0.155 +477 R 0.172 +478 A 0.180 +479 R 0.183 +480 V 0.184 +481 V 0.177 +482 F 0.159 +483 G 0.139 +484 P 0.135 +485 E 0.150 +486 L 0.171 +487 V 0.180 +488 S 0.175 +489 L 0.166 +490 D 0.159 +491 P 0.151 +492 E 0.142 +493 E 0.132 +494 Q 0.124 +495 F 0.117 +496 T 0.113 +497 V 0.113 +498 L 0.114 +499 S 0.121 +500 L 0.137 +501 S 0.153 +502 A 0.156 +503 G 0.146 +504 R 0.139 +505 P 0.148 +506 K 0.168 +507 R 0.186 +508 P 0.192 +509 H 0.192 +510 A 0.199 +511 R 0.219 +512 R 0.243 +513 A 0.258 +514 L 0.260 +515 C 0.261 +516 L 0.261 +517 L 0.249 +518 L 0.224 +519 G 0.204 +520 P 0.197 +521 D 0.193 +522 F 0.180 +523 F 0.159 +524 T 0.137 +525 D 0.117 +526 V 0.099 +527 I 0.083 +528 T 0.074 +529 I 0.074 +530 E 0.088 +531 T 0.108 +532 A 0.126 +533 D 0.132 +534 H 0.131 +535 A 0.125 +536 R 0.116 +537 L 0.106 +538 Q 0.096 +539 L 0.088 +540 Q 0.081 +541 L 0.074 +542 A 0.068 +543 Y 0.064 +544 N 0.062 +545 W 0.066 +546 H 0.076 +547 F 0.093 +548 E 0.115 +549 L 0.137 +550 K 0.158 +551 N 0.176 +552 R 0.192 +553 N 0.203 +554 D 0.209 +555 P 0.206 +556 E 0.198 +557 E 0.192 +558 T 0.187 +559 A 0.175 +560 K 0.162 +561 L 0.158 +562 F 0.158 +563 S 0.156 +564 V 0.149 +565 P 0.139 +566 D 0.125 +567 F 0.109 +568 V 0.097 +569 G 0.091 +570 D 0.090 +571 A 0.089 +572 C 0.085 +573 K 0.082 +574 A 0.082 +575 I 0.083 +576 A 0.083 +577 S 0.082 +578 R 0.086 +579 V 0.097 +580 R 0.110 +581 G 0.118 +582 A 0.121 +583 V 0.124 +584 A 0.126 +585 S 0.120 +586 V 0.105 +587 T 0.086 +588 F 0.070 +589 D 0.058 +590 D 0.051 +591 F 0.047 +592 H 0.044 +593 K 0.043 +594 N 0.045 +595 S 0.047 +596 A 0.049 +597 R 0.050 +598 I 0.052 +599 I 0.055 +600 R 0.062 +601 M 0.075 +602 A 0.098 +603 V 0.131 +604 F 0.178 +605 G 0.239 +606 F 0.301 +607 E 0.347 +608 M 0.371 +609 S 0.385 +610 E 0.401 +611 D 0.415 +612 A 0.417 +613 G 0.409 +614 P 0.406 +615 D 0.409 +616 G 0.405 +617 A 0.394 +618 L 0.381 +619 L 0.369 +620 P 0.356 +621 R 0.337 +622 A 0.311 +623 R 0.279 +624 D 0.248 +625 R 0.219 +626 A 0.193 +627 V 0.169 +628 F 0.154 +629 P 0.146 +630 Q 0.141 +631 N 0.135 +632 G 0.130 +633 L 0.127 +634 V 0.127 +635 V 0.129 +636 S 0.132 +637 S 0.132 +638 V 0.129 +639 D 0.123 +640 V 0.117 +641 Q 0.117 +642 S 0.121 +643 V 0.130 +644 E 0.139 +645 P 0.146 +646 V 0.148 +647 D 0.151 +648 Q 0.161 +649 R 0.175 +650 T 0.187 +651 R 0.197 +652 D 0.213 +653 A 0.233 +654 L 0.246 +655 Q 0.256 +656 R 0.274 +657 S 0.311 +658 V 0.361 +659 Q 0.400 +660 L 0.409 +661 A 0.394 +662 I 0.374 +663 E 0.369 +664 I 0.377 +665 T 0.390 +666 T 0.408 +667 N 0.429 +668 S 0.444 +669 Q 0.443 +670 E 0.438 +671 A 0.440 +672 A 0.443 +673 A 0.437 +674 K 0.428 +675 H 0.426 +676 E 0.424 +677 A 0.406 +678 Q 0.384 +679 R 0.380 +680 L 0.382 +681 E 0.374 +682 Q 0.375 +683 E 0.400 +684 A 0.434 +685 R 0.456 +686 G 0.459 +687 R 0.432 +688 L 0.386 +689 E 0.356 +690 R 0.364 +691 Q 0.390 +692 K 0.406 +693 I 0.407 +694 L 0.397 +695 D 0.383 +696 Q 0.378 +697 S 0.389 +698 E 0.408 +699 A 0.418 +700 E 0.420 +701 K 0.429 +702 A 0.442 +703 R 0.444 +704 K 0.443 +705 E 0.466 +706 L 0.498 +707 L 0.504 +708 E 0.490 +709 L 0.477 +710 E 0.475 +711 A 0.476 +712 M 0.479 +713 S 0.482 +714 M 0.481 +715 A 0.472 +716 V 0.459 +717 E 0.454 +718 S 0.458 +719 T 0.474 +720 G 0.507 +721 N 0.549 +722 A 0.578 +723 K 0.581 +724 A 0.567 +725 E 0.544 +726 A 0.512 +727 E 0.475 +728 S 0.454 +729 R 0.451 +730 A 0.449 +731 E 0.455 +732 A 0.487 +733 A 0.528 +734 R 0.559 +735 I 0.578 +736 E 0.588 +737 G 0.594 +738 E 0.596 +739 G 0.586 +740 S 0.553 +741 V 0.506 +742 L 0.472 +743 Q 0.463 +744 A 0.462 +745 K 0.456 +746 L 0.447 +747 K 0.436 +748 A 0.426 +749 Q 0.441 +750 A 0.493 +751 L 0.549 +752 A 0.569 +753 I 0.550 +754 E 0.516 +755 T 0.486 +756 E 0.463 +757 A 0.440 +758 E 0.409 +759 L 0.370 +760 E 0.335 +761 R 0.314 +762 V 0.310 +763 K 0.318 +764 K 0.334 +765 V 0.348 +766 R 0.361 +767 E 0.375 +768 M 0.384 +769 E 0.374 +770 L 0.352 +771 I 0.336 +772 Y 0.336 +773 S 0.343 +774 R 0.347 +775 A 0.350 +776 Q 0.358 +777 L 0.360 +778 E 0.349 +779 L 0.331 +780 E 0.309 +781 V 0.286 +782 S 0.286 +783 K 0.323 +784 A 0.381 +785 Q 0.429 +786 Q 0.453 +787 L 0.452 +788 A 0.439 +789 D 0.424 +790 V 0.410 +791 E 0.383 +792 A 0.348 +793 K 0.331 +794 K 0.345 +795 F 0.370 +796 K 0.384 +797 E 0.387 +798 M 0.383 +799 T 0.378 +800 E 0.386 +801 A 0.398 +802 L 0.393 +803 G 0.371 +804 P 0.358 +805 G 0.364 +806 T 0.386 +807 I 0.415 +808 R 0.438 +809 D 0.446 +810 L 0.444 +811 A 0.431 +812 V 0.401 +813 A 0.366 +814 G 0.350 +815 P 0.351 +816 E 0.351 +817 M 0.338 +818 Q 0.313 +819 V 0.286 +820 K 0.279 +821 L 0.298 +822 L 0.325 +823 Q 0.349 +824 S 0.378 +825 L 0.413 +826 G 0.436 +827 L 0.443 +828 K 0.454 +829 S 0.473 +830 T 0.493 +831 L 0.519 +832 I 0.558 +833 T 0.603 +834 D 0.634 +835 G 0.643 +836 S 0.632 +837 S 0.608 +838 P 0.577 +839 I 0.536 +840 N 0.479 +841 L 0.404 +842 F 0.333 +843 N 0.287 +844 T 0.268 +845 A 0.272 +846 F 0.303 +847 G 0.365 +848 L 0.446 +849 L 0.533 +850 G 0.610 +851 L 0.667 +852 G 0.699 +853 S 0.707 +854 D 0.702 +855 G 0.689 +856 Q 0.681 +857 P 0.687 +858 P 0.707 +859 V 0.724 +860 Q 0.730 +861 K 0.729 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030681.19_ENSMUST00000165096.10_GN:Mvp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030681.19_ENSMUST00000165096.10_GN:Mvp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..91e69c12212025b80defce6a5936707f93e997b0 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030681.19_ENSMUST00000165096.10_GN:Mvp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid @@ -0,0 +1,871 @@ +>ENSMUSG00000030681.19|ENSMUST00000165096.10|GN:Mvp|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:9 +1 M 0.364 +2 L 0.363 +3 G 0.361 +4 R 0.365 +5 G 0.372 +6 L 0.373 +7 G 0.380 +8 F 0.409 +9 T 0.441 +10 M 0.455 +11 A 0.448 +12 T 0.418 +13 E 0.357 +14 E 0.276 +15 A 0.205 +16 I 0.170 +17 I 0.170 +18 R 0.184 +19 I 0.194 +20 P 0.187 +21 P 0.164 +22 Y 0.133 +23 H 0.106 +24 Y 0.092 +25 I 0.095 +26 H 0.107 +27 V 0.118 +28 L 0.120 +29 D 0.116 +30 Q 0.116 +31 N 0.121 +32 S 0.125 +33 N 0.125 +34 V 0.125 +35 S 0.125 +36 R 0.124 +37 V 0.124 +38 E 0.124 +39 V 0.120 +40 G 0.109 +41 P 0.096 +42 K 0.091 +43 T 0.098 +44 Y 0.115 +45 I 0.132 +46 R 0.141 +47 Q 0.142 +48 D 0.135 +49 N 0.120 +50 E 0.105 +51 R 0.095 +52 V 0.096 +53 L 0.108 +54 F 0.128 +55 A 0.146 +56 P 0.160 +57 V 0.171 +58 R 0.181 +59 M 0.189 +60 V 0.193 +61 T 0.198 +62 V 0.198 +63 P 0.187 +64 P 0.166 +65 R 0.143 +66 H 0.129 +67 Y 0.128 +68 C 0.146 +69 I 0.179 +70 V 0.221 +71 A 0.256 +72 N 0.274 +73 P 0.275 +74 V 0.268 +75 S 0.264 +76 R 0.265 +77 D 0.267 +78 A 0.268 +79 Q 0.271 +80 S 0.283 +81 S 0.304 +82 V 0.323 +83 L 0.337 +84 F 0.350 +85 D 0.355 +86 V 0.344 +87 T 0.329 +88 G 0.327 +89 Q 0.338 +90 V 0.340 +91 R 0.321 +92 L 0.286 +93 R 0.250 +94 H 0.223 +95 A 0.206 +96 D 0.195 +97 Q 0.184 +98 E 0.169 +99 I 0.154 +100 R 0.147 +101 L 0.144 +102 A 0.137 +103 Q 0.128 +104 D 0.120 +105 P 0.117 +106 F 0.121 +107 P 0.133 +108 L 0.145 +109 Y 0.153 +110 P 0.156 +111 G 0.152 +112 E 0.140 +113 L 0.125 +114 L 0.115 +115 E 0.117 +116 K 0.132 +117 D 0.150 +118 I 0.161 +119 T 0.164 +120 P 0.163 +121 L 0.163 +122 Q 0.166 +123 V 0.173 +124 V 0.179 +125 L 0.180 +126 P 0.175 +127 N 0.162 +128 T 0.143 +129 A 0.124 +130 L 0.113 +131 H 0.113 +132 L 0.124 +133 K 0.141 +134 A 0.158 +135 L 0.168 +136 L 0.170 +137 D 0.165 +138 F 0.161 +139 E 0.164 +140 D 0.172 +141 K 0.189 +142 N 0.218 +143 G 0.248 +144 D 0.264 +145 K 0.257 +146 V 0.237 +147 M 0.219 +148 A 0.210 +149 G 0.207 +150 D 0.202 +151 E 0.187 +152 W 0.162 +153 L 0.142 +154 F 0.137 +155 E 0.142 +156 G 0.145 +157 P 0.149 +158 G 0.157 +159 T 0.163 +160 Y 0.164 +161 I 0.162 +162 P 0.158 +163 Q 0.145 +164 K 0.124 +165 E 0.103 +166 V 0.089 +167 E 0.089 +168 V 0.101 +169 V 0.119 +170 E 0.140 +171 I 0.163 +172 I 0.181 +173 Q 0.187 +174 A 0.181 +175 T 0.170 +176 V 0.158 +177 I 0.147 +178 K 0.137 +179 Q 0.126 +180 N 0.116 +181 Q 0.106 +182 A 0.096 +183 L 0.089 +184 R 0.090 +185 L 0.100 +186 R 0.118 +187 A 0.137 +188 R 0.148 +189 K 0.149 +190 E 0.144 +191 C 0.139 +192 F 0.136 +193 D 0.137 +194 R 0.144 +195 D 0.163 +196 G 0.185 +197 K 0.197 +198 E 0.193 +199 R 0.181 +200 V 0.173 +201 T 0.171 +202 G 0.171 +203 E 0.167 +204 E 0.158 +205 W 0.141 +206 L 0.125 +207 V 0.117 +208 R 0.116 +209 S 0.122 +210 V 0.132 +211 G 0.142 +212 A 0.145 +213 Y 0.143 +214 L 0.143 +215 P 0.144 +216 A 0.135 +217 V 0.114 +218 F 0.092 +219 E 0.082 +220 E 0.089 +221 V 0.108 +222 L 0.134 +223 D 0.157 +224 L 0.170 +225 V 0.173 +226 D 0.167 +227 A 0.154 +228 V 0.139 +229 I 0.127 +230 L 0.115 +231 T 0.102 +232 E 0.091 +233 K 0.084 +234 T 0.083 +235 A 0.084 +236 L 0.086 +237 H 0.090 +238 L 0.100 +239 R 0.115 +240 A 0.129 +241 R 0.135 +242 Q 0.131 +243 N 0.122 +244 F 0.114 +245 K 0.111 +246 D 0.114 +247 L 0.126 +248 R 0.145 +249 G 0.164 +250 V 0.173 +251 A 0.167 +252 H 0.153 +253 R 0.146 +254 T 0.147 +255 G 0.151 +256 E 0.152 +257 E 0.145 +258 W 0.129 +259 L 0.112 +260 V 0.099 +261 T 0.093 +262 V 0.093 +263 Q 0.098 +264 D 0.108 +265 T 0.121 +266 E 0.133 +267 A 0.142 +268 H 0.147 +269 V 0.150 +270 P 0.147 +271 D 0.132 +272 V 0.108 +273 Y 0.088 +274 E 0.080 +275 E 0.082 +276 V 0.092 +277 L 0.104 +278 G 0.113 +279 V 0.119 +280 V 0.122 +281 P 0.125 +282 I 0.131 +283 T 0.143 +284 T 0.162 +285 L 0.183 +286 G 0.190 +287 P 0.171 +288 R 0.136 +289 H 0.105 +290 Y 0.092 +291 C 0.102 +292 V 0.130 +293 I 0.165 +294 L 0.194 +295 D 0.216 +296 P 0.231 +297 M 0.235 +298 G 0.224 +299 P 0.209 +300 D 0.207 +301 G 0.224 +302 K 0.242 +303 N 0.244 +304 Q 0.229 +305 L 0.211 +306 G 0.196 +307 Q 0.184 +308 K 0.170 +309 R 0.155 +310 V 0.145 +311 V 0.143 +312 K 0.139 +313 G 0.128 +314 E 0.116 +315 K 0.113 +316 S 0.118 +317 F 0.124 +318 F 0.129 +319 L 0.135 +320 Q 0.138 +321 P 0.136 +322 G 0.131 +323 E 0.125 +324 R 0.119 +325 L 0.113 +326 E 0.110 +327 R 0.113 +328 G 0.123 +329 I 0.136 +330 Q 0.149 +331 D 0.156 +332 V 0.156 +333 Y 0.153 +334 V 0.154 +335 L 0.156 +336 S 0.154 +337 E 0.143 +338 Q 0.128 +339 Q 0.113 +340 G 0.101 +341 L 0.095 +342 L 0.099 +343 L 0.114 +344 K 0.138 +345 A 0.165 +346 L 0.191 +347 Q 0.213 +348 P 0.227 +349 L 0.243 +350 E 0.279 +351 E 0.334 +352 G 0.382 +353 E 0.401 +354 G 0.399 +355 E 0.390 +356 E 0.374 +357 K 0.349 +358 V 0.319 +359 A 0.288 +360 H 0.254 +361 Q 0.226 +362 A 0.213 +363 G 0.212 +364 D 0.212 +365 R 0.200 +366 W 0.180 +367 L 0.167 +368 I 0.161 +369 R 0.149 +370 G 0.130 +371 P 0.119 +372 L 0.127 +373 E 0.143 +374 Y 0.153 +375 V 0.156 +376 P 0.154 +377 S 0.148 +378 A 0.131 +379 K 0.108 +380 V 0.089 +381 E 0.083 +382 V 0.093 +383 V 0.111 +384 E 0.133 +385 E 0.157 +386 R 0.183 +387 Q 0.208 +388 A 0.225 +389 I 0.231 +390 P 0.225 +391 L 0.208 +392 D 0.187 +393 Q 0.166 +394 N 0.148 +395 E 0.134 +396 G 0.124 +397 I 0.120 +398 Y 0.123 +399 V 0.128 +400 Q 0.125 +401 D 0.114 +402 V 0.106 +403 K 0.108 +404 T 0.120 +405 G 0.134 +406 K 0.140 +407 V 0.138 +408 R 0.136 +409 A 0.139 +410 V 0.142 +411 I 0.141 +412 G 0.134 +413 S 0.128 +414 T 0.129 +415 Y 0.133 +416 M 0.134 +417 L 0.129 +418 T 0.119 +419 Q 0.109 +420 D 0.101 +421 E 0.095 +422 V 0.090 +423 L 0.091 +424 W 0.101 +425 E 0.120 +426 K 0.138 +427 E 0.146 +428 L 0.143 +429 P 0.133 +430 S 0.121 +431 G 0.110 +432 V 0.102 +433 E 0.102 +434 E 0.115 +435 L 0.141 +436 L 0.181 +437 N 0.230 +438 L 0.284 +439 G 0.334 +440 H 0.367 +441 D 0.388 +442 P 0.412 +443 L 0.450 +444 A 0.493 +445 D 0.522 +446 R 0.537 +447 G 0.549 +448 Q 0.563 +449 K 0.579 +450 G 0.588 +451 T 0.588 +452 A 0.578 +453 K 0.563 +454 V 0.547 +455 L 0.536 +456 Q 0.535 +457 P 0.542 +458 S 0.540 +459 A 0.506 +460 A 0.439 +461 R 0.360 +462 N 0.291 +463 K 0.245 +464 T 0.231 +465 R 0.251 +466 V 0.277 +467 V 0.273 +468 S 0.239 +469 Y 0.208 +470 R 0.198 +471 V 0.204 +472 P 0.212 +473 H 0.210 +474 N 0.198 +475 A 0.182 +476 A 0.172 +477 V 0.175 +478 Q 0.185 +479 V 0.187 +480 Y 0.171 +481 D 0.146 +482 Y 0.128 +483 R 0.125 +484 A 0.137 +485 K 0.157 +486 R 0.174 +487 A 0.182 +488 R 0.186 +489 V 0.187 +490 V 0.179 +491 F 0.161 +492 G 0.141 +493 P 0.136 +494 E 0.153 +495 L 0.174 +496 V 0.183 +497 S 0.178 +498 L 0.169 +499 D 0.161 +500 P 0.153 +501 E 0.143 +502 E 0.134 +503 Q 0.126 +504 F 0.119 +505 T 0.115 +506 V 0.115 +507 L 0.116 +508 S 0.123 +509 L 0.139 +510 S 0.155 +511 A 0.157 +512 G 0.147 +513 R 0.140 +514 P 0.148 +515 K 0.168 +516 R 0.186 +517 P 0.192 +518 H 0.192 +519 A 0.199 +520 R 0.220 +521 R 0.245 +522 A 0.261 +523 L 0.264 +524 C 0.265 +525 L 0.265 +526 L 0.251 +527 L 0.226 +528 G 0.205 +529 P 0.197 +530 D 0.194 +531 F 0.181 +532 F 0.160 +533 T 0.138 +534 D 0.118 +535 V 0.100 +536 I 0.084 +537 T 0.075 +538 I 0.075 +539 E 0.088 +540 T 0.109 +541 A 0.126 +542 D 0.133 +543 H 0.131 +544 A 0.125 +545 R 0.117 +546 L 0.106 +547 Q 0.096 +548 L 0.088 +549 Q 0.082 +550 L 0.075 +551 A 0.069 +552 Y 0.064 +553 N 0.063 +554 W 0.066 +555 H 0.076 +556 F 0.093 +557 E 0.115 +558 L 0.138 +559 K 0.159 +560 N 0.177 +561 R 0.192 +562 N 0.204 +563 D 0.209 +564 P 0.206 +565 E 0.197 +566 E 0.192 +567 T 0.187 +568 A 0.175 +569 K 0.162 +570 L 0.158 +571 F 0.158 +572 S 0.156 +573 V 0.149 +574 P 0.139 +575 D 0.126 +576 F 0.110 +577 V 0.097 +578 G 0.092 +579 D 0.090 +580 A 0.089 +581 C 0.086 +582 K 0.083 +583 A 0.083 +584 I 0.084 +585 A 0.083 +586 S 0.083 +587 R 0.087 +588 V 0.098 +589 R 0.110 +590 G 0.119 +591 A 0.122 +592 V 0.125 +593 A 0.126 +594 S 0.121 +595 V 0.106 +596 T 0.087 +597 F 0.070 +598 D 0.059 +599 D 0.052 +600 F 0.047 +601 H 0.044 +602 K 0.044 +603 N 0.046 +604 S 0.048 +605 A 0.049 +606 R 0.050 +607 I 0.052 +608 I 0.055 +609 R 0.062 +610 M 0.076 +611 A 0.099 +612 V 0.132 +613 F 0.180 +614 G 0.241 +615 F 0.303 +616 E 0.349 +617 M 0.372 +618 S 0.386 +619 E 0.402 +620 D 0.416 +621 A 0.418 +622 G 0.410 +623 P 0.407 +624 D 0.410 +625 G 0.406 +626 A 0.394 +627 L 0.381 +628 L 0.370 +629 P 0.357 +630 R 0.339 +631 A 0.312 +632 R 0.281 +633 D 0.249 +634 R 0.221 +635 A 0.194 +636 V 0.170 +637 F 0.155 +638 P 0.147 +639 Q 0.142 +640 N 0.136 +641 G 0.131 +642 L 0.128 +643 V 0.128 +644 V 0.130 +645 S 0.133 +646 S 0.133 +647 V 0.130 +648 D 0.123 +649 V 0.118 +650 Q 0.117 +651 S 0.122 +652 V 0.130 +653 E 0.140 +654 P 0.146 +655 V 0.149 +656 D 0.152 +657 Q 0.162 +658 R 0.177 +659 T 0.188 +660 R 0.198 +661 D 0.214 +662 A 0.234 +663 L 0.248 +664 Q 0.257 +665 R 0.275 +666 S 0.312 +667 V 0.362 +668 Q 0.402 +669 L 0.412 +670 A 0.396 +671 I 0.377 +672 E 0.371 +673 I 0.379 +674 T 0.392 +675 T 0.409 +676 N 0.430 +677 S 0.445 +678 Q 0.444 +679 E 0.439 +680 A 0.441 +681 A 0.445 +682 A 0.439 +683 K 0.430 +684 H 0.428 +685 E 0.426 +686 A 0.407 +687 Q 0.384 +688 R 0.380 +689 L 0.383 +690 E 0.375 +691 Q 0.376 +692 E 0.401 +693 A 0.435 +694 R 0.458 +695 G 0.460 +696 R 0.433 +697 L 0.387 +698 E 0.357 +699 R 0.364 +700 Q 0.390 +701 K 0.407 +702 I 0.407 +703 L 0.397 +704 D 0.384 +705 Q 0.378 +706 S 0.390 +707 E 0.409 +708 A 0.419 +709 E 0.421 +710 K 0.430 +711 A 0.444 +712 R 0.445 +713 K 0.445 +714 E 0.468 +715 L 0.500 +716 L 0.508 +717 E 0.493 +718 L 0.481 +719 E 0.477 +720 A 0.478 +721 M 0.480 +722 S 0.482 +723 M 0.481 +724 A 0.472 +725 V 0.460 +726 E 0.455 +727 S 0.460 +728 T 0.476 +729 G 0.509 +730 N 0.550 +731 A 0.579 +732 K 0.582 +733 A 0.567 +734 E 0.544 +735 A 0.512 +736 E 0.475 +737 S 0.454 +738 R 0.451 +739 A 0.449 +740 E 0.455 +741 A 0.487 +742 A 0.529 +743 R 0.560 +744 I 0.579 +745 E 0.589 +746 G 0.595 +747 E 0.597 +748 G 0.588 +749 S 0.556 +750 V 0.509 +751 L 0.476 +752 Q 0.466 +753 A 0.465 +754 K 0.459 +755 L 0.449 +756 K 0.438 +757 A 0.427 +758 Q 0.441 +759 A 0.493 +760 L 0.549 +761 A 0.569 +762 I 0.549 +763 E 0.515 +764 T 0.484 +765 E 0.462 +766 A 0.440 +767 E 0.409 +768 L 0.370 +769 E 0.335 +770 R 0.315 +771 V 0.311 +772 K 0.320 +773 K 0.336 +774 V 0.350 +775 R 0.362 +776 E 0.377 +777 M 0.385 +778 E 0.375 +779 L 0.353 +780 I 0.336 +781 Y 0.336 +782 S 0.344 +783 R 0.348 +784 A 0.352 +785 Q 0.361 +786 L 0.363 +787 E 0.351 +788 L 0.333 +789 E 0.310 +790 V 0.287 +791 S 0.286 +792 K 0.323 +793 A 0.382 +794 Q 0.431 +795 Q 0.455 +796 L 0.454 +797 A 0.440 +798 D 0.426 +799 V 0.411 +800 E 0.384 +801 A 0.349 +802 K 0.331 +803 K 0.345 +804 F 0.370 +805 K 0.384 +806 E 0.387 +807 M 0.383 +808 T 0.379 +809 E 0.386 +810 A 0.399 +811 L 0.394 +812 G 0.372 +813 P 0.358 +814 G 0.364 +815 T 0.385 +816 I 0.414 +817 R 0.437 +818 D 0.447 +819 L 0.445 +820 A 0.433 +821 V 0.403 +822 A 0.368 +823 G 0.351 +824 P 0.352 +825 E 0.352 +826 M 0.339 +827 Q 0.313 +828 V 0.287 +829 K 0.279 +830 L 0.298 +831 L 0.325 +832 Q 0.349 +833 S 0.378 +834 L 0.413 +835 G 0.436 +836 L 0.443 +837 K 0.454 +838 S 0.474 +839 T 0.494 +840 L 0.520 +841 I 0.560 +842 T 0.605 +843 D 0.637 +844 G 0.645 +845 S 0.634 +846 S 0.610 +847 P 0.578 +848 I 0.538 +849 N 0.480 +850 L 0.405 +851 F 0.334 +852 N 0.288 +853 T 0.269 +854 A 0.273 +855 F 0.305 +856 G 0.366 +857 L 0.448 +858 L 0.534 +859 G 0.612 +860 L 0.669 +861 G 0.700 +862 S 0.708 +863 D 0.703 +864 G 0.690 +865 Q 0.682 +866 P 0.688 +867 P 0.707 +868 V 0.725 +869 Q 0.731 +870 K 0.729 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030750.14_ENSMUST00000033006.15_GN:Nsmce1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030750.14_ENSMUST00000033006.15_GN:Nsmce1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0eb15116cfad6adb98a1df3fb0197b370e96ed25 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030750.14_ENSMUST00000033006.15_GN:Nsmce1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,267 @@ +>ENSMUSG00000030750.14|ENSMUST00000033006.15|GN:Nsmce1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.502 +2 Q 0.521 +3 G 0.553 +4 S 0.584 +5 T 0.599 +6 R 0.596 +7 R 0.576 +8 A 0.526 +9 G 0.437 +10 A 0.320 +11 M 0.205 +12 T 0.116 +13 D 0.062 +14 V 0.036 +15 H 0.026 +16 R 0.022 +17 R 0.021 +18 F 0.023 +19 L 0.027 +20 Q 0.032 +21 L 0.038 +22 L 0.046 +23 M 0.053 +24 T 0.054 +25 H 0.051 +26 G 0.046 +27 V 0.041 +28 L 0.036 +29 E 0.030 +30 E 0.026 +31 W 0.026 +32 E 0.032 +33 V 0.043 +34 R 0.058 +35 R 0.067 +36 L 0.063 +37 Q 0.050 +38 N 0.040 +39 H 0.038 +40 C 0.040 +41 Y 0.045 +42 Q 0.053 +43 V 0.068 +44 H 0.087 +45 D 0.107 +46 R 0.125 +47 N 0.136 +48 A 0.140 +49 T 0.135 +50 V 0.119 +51 D 0.091 +52 K 0.062 +53 L 0.042 +54 E 0.034 +55 D 0.037 +56 F 0.048 +57 I 0.063 +58 N 0.076 +59 N 0.082 +60 I 0.087 +61 N 0.092 +62 S 0.092 +63 V 0.084 +64 L 0.077 +65 E 0.075 +66 S 0.074 +67 L 0.069 +68 Y 0.061 +69 I 0.053 +70 E 0.049 +71 I 0.051 +72 K 0.060 +73 K 0.077 +74 G 0.093 +75 V 0.103 +76 T 0.106 +77 E 0.102 +78 D 0.096 +79 D 0.091 +80 G 0.090 +81 R 0.085 +82 P 0.074 +83 I 0.058 +84 Y 0.049 +85 A 0.052 +86 L 0.069 +87 V 0.096 +88 N 0.128 +89 L 0.156 +90 A 0.173 +91 T 0.181 +92 T 0.184 +93 S 0.184 +94 V 0.180 +95 S 0.172 +96 K 0.163 +97 M 0.149 +98 A 0.132 +99 T 0.115 +100 D 0.101 +101 F 0.093 +102 A 0.084 +103 E 0.073 +104 N 0.061 +105 E 0.052 +106 L 0.047 +107 D 0.042 +108 L 0.037 +109 F 0.033 +110 R 0.031 +111 K 0.032 +112 A 0.035 +113 L 0.038 +114 E 0.042 +115 L 0.048 +116 I 0.055 +117 V 0.060 +118 D 0.062 +119 S 0.065 +120 E 0.069 +121 T 0.072 +122 G 0.069 +123 F 0.058 +124 A 0.046 +125 S 0.036 +126 S 0.030 +127 T 0.028 +128 N 0.030 +129 I 0.033 +130 L 0.036 +131 N 0.041 +132 L 0.049 +133 V 0.058 +134 D 0.070 +135 Q 0.091 +136 L 0.120 +137 K 0.145 +138 G 0.156 +139 K 0.153 +140 K 0.139 +141 M 0.116 +142 R 0.097 +143 K 0.088 +144 K 0.087 +145 E 0.082 +146 A 0.072 +147 E 0.061 +148 Q 0.055 +149 V 0.056 +150 L 0.060 +151 Q 0.064 +152 K 0.066 +153 F 0.067 +154 V 0.066 +155 Q 0.059 +156 S 0.049 +157 K 0.042 +158 W 0.039 +159 L 0.042 +160 I 0.050 +161 E 0.057 +162 K 0.061 +163 E 0.061 +164 G 0.056 +165 E 0.047 +166 F 0.038 +167 T 0.033 +168 L 0.033 +169 H 0.034 +170 G 0.035 +171 R 0.033 +172 A 0.030 +173 I 0.030 +174 L 0.033 +175 E 0.037 +176 M 0.037 +177 E 0.033 +178 Q 0.030 +179 F 0.029 +180 I 0.028 +181 R 0.030 +182 E 0.037 +183 S 0.044 +184 Y 0.048 +185 P 0.044 +186 D 0.038 +187 S 0.034 +188 V 0.031 +189 K 0.027 +190 M 0.025 +191 C 0.025 +192 N 0.028 +193 I 0.034 +194 C 0.044 +195 H 0.056 +196 G 0.067 +197 L 0.070 +198 L 0.068 +199 I 0.063 +200 Q 0.065 +201 G 0.070 +202 Q 0.074 +203 S 0.072 +204 C 0.068 +205 E 0.067 +206 T 0.068 +207 C 0.071 +208 G 0.076 +209 I 0.076 +210 R 0.069 +211 M 0.061 +212 H 0.055 +213 L 0.054 +214 P 0.056 +215 C 0.056 +216 V 0.052 +217 A 0.045 +218 K 0.041 +219 Y 0.041 +220 F 0.044 +221 Q 0.051 +222 S 0.063 +223 I 0.076 +224 P 0.087 +225 E 0.092 +226 P 0.090 +227 H 0.083 +228 C 0.073 +229 P 0.063 +230 H 0.057 +231 C 0.055 +232 N 0.056 +233 D 0.058 +234 Y 0.058 +235 W 0.060 +236 P 0.068 +237 H 0.084 +238 D 0.101 +239 I 0.111 +240 P 0.112 +241 E 0.113 +242 V 0.118 +243 Y 0.126 +244 N 0.134 +245 P 0.145 +246 E 0.156 +247 K 0.169 +248 E 0.188 +249 R 0.221 +250 E 0.273 +251 A 0.338 +252 G 0.398 +253 I 0.438 +254 S 0.466 +255 K 0.491 +256 S 0.505 +257 S 0.493 +258 R 0.464 +259 K 0.457 +260 S 0.487 +261 L 0.521 +262 R 0.533 +263 T 0.529 +264 R 0.515 +265 Q 0.484 +266 H 0.452 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030750.14_ENSMUST00000033006.15_GN:Nsmce1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030750.14_ENSMUST00000033006.15_GN:Nsmce1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e0b7532bd10f334b6a5247769460671235e5b206 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030750.14_ENSMUST00000033006.15_GN:Nsmce1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid @@ -0,0 +1,281 @@ +>ENSMUSG00000030750.14|ENSMUST00000033006.15|GN:Nsmce1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:14 +1 M 0.360 +2 A 0.364 +3 S 0.393 +4 G 0.443 +5 V 0.475 +6 I 0.474 +7 S 0.468 +8 L 0.480 +9 V 0.501 +10 C 0.524 +11 A 0.556 +12 P 0.594 +13 S 0.626 +14 N 0.647 +15 M 0.665 +16 Q 0.682 +17 G 0.692 +18 S 0.685 +19 T 0.665 +20 R 0.639 +21 R 0.604 +22 A 0.547 +23 G 0.456 +24 A 0.339 +25 M 0.222 +26 T 0.128 +27 D 0.068 +28 V 0.038 +29 H 0.026 +30 R 0.022 +31 R 0.021 +32 F 0.023 +33 L 0.027 +34 Q 0.032 +35 L 0.038 +36 L 0.046 +37 M 0.052 +38 T 0.054 +39 H 0.050 +40 G 0.046 +41 V 0.041 +42 L 0.036 +43 E 0.030 +44 E 0.026 +45 W 0.026 +46 E 0.032 +47 V 0.043 +48 R 0.058 +49 R 0.067 +50 L 0.064 +51 Q 0.051 +52 N 0.041 +53 H 0.039 +54 C 0.041 +55 Y 0.045 +56 Q 0.052 +57 V 0.065 +58 H 0.084 +59 D 0.103 +60 R 0.120 +61 N 0.131 +62 A 0.133 +63 T 0.127 +64 V 0.111 +65 D 0.085 +66 K 0.058 +67 L 0.038 +68 E 0.031 +69 D 0.034 +70 F 0.045 +71 I 0.060 +72 N 0.073 +73 N 0.079 +74 I 0.084 +75 N 0.089 +76 S 0.089 +77 V 0.081 +78 L 0.075 +79 E 0.073 +80 S 0.073 +81 L 0.069 +82 Y 0.060 +83 I 0.052 +84 E 0.047 +85 I 0.048 +86 K 0.057 +87 K 0.073 +88 G 0.089 +89 V 0.099 +90 T 0.102 +91 E 0.099 +92 D 0.093 +93 D 0.089 +94 G 0.087 +95 R 0.083 +96 P 0.072 +97 I 0.057 +98 Y 0.048 +99 A 0.051 +100 L 0.066 +101 V 0.092 +102 N 0.122 +103 L 0.150 +104 A 0.170 +105 T 0.180 +106 T 0.185 +107 S 0.186 +108 V 0.182 +109 S 0.173 +110 K 0.163 +111 M 0.148 +112 A 0.130 +113 T 0.113 +114 D 0.101 +115 F 0.092 +116 A 0.084 +117 E 0.072 +118 N 0.060 +119 E 0.052 +120 L 0.047 +121 D 0.042 +122 L 0.036 +123 F 0.032 +124 R 0.030 +125 K 0.030 +126 A 0.034 +127 L 0.037 +128 E 0.041 +129 L 0.048 +130 I 0.055 +131 V 0.059 +132 D 0.062 +133 S 0.065 +134 E 0.070 +135 T 0.073 +136 G 0.070 +137 F 0.059 +138 A 0.047 +139 S 0.036 +140 S 0.030 +141 T 0.029 +142 N 0.030 +143 I 0.033 +144 L 0.036 +145 N 0.042 +146 L 0.049 +147 V 0.058 +148 D 0.070 +149 Q 0.092 +150 L 0.122 +151 K 0.146 +152 G 0.158 +153 K 0.155 +154 K 0.140 +155 M 0.118 +156 R 0.098 +157 K 0.089 +158 K 0.087 +159 E 0.082 +160 A 0.072 +161 E 0.061 +162 Q 0.055 +163 V 0.056 +164 L 0.061 +165 Q 0.064 +166 K 0.066 +167 F 0.068 +168 V 0.066 +169 Q 0.059 +170 S 0.050 +171 K 0.043 +172 W 0.040 +173 L 0.043 +174 I 0.050 +175 E 0.057 +176 K 0.061 +177 E 0.061 +178 G 0.056 +179 E 0.047 +180 F 0.038 +181 T 0.033 +182 L 0.033 +183 H 0.034 +184 G 0.035 +185 R 0.033 +186 A 0.030 +187 I 0.029 +188 L 0.033 +189 E 0.036 +190 M 0.036 +191 E 0.033 +192 Q 0.030 +193 F 0.028 +194 I 0.028 +195 R 0.030 +196 E 0.037 +197 S 0.045 +198 Y 0.048 +199 P 0.044 +200 D 0.038 +201 S 0.033 +202 V 0.030 +203 K 0.027 +204 M 0.025 +205 C 0.025 +206 N 0.028 +207 I 0.034 +208 C 0.043 +209 H 0.055 +210 G 0.064 +211 L 0.068 +212 L 0.066 +213 I 0.063 +214 Q 0.064 +215 G 0.070 +216 Q 0.074 +217 S 0.072 +218 C 0.069 +219 E 0.067 +220 T 0.067 +221 C 0.071 +222 G 0.075 +223 I 0.074 +224 R 0.068 +225 M 0.060 +226 H 0.055 +227 L 0.054 +228 P 0.056 +229 C 0.057 +230 V 0.052 +231 A 0.046 +232 K 0.042 +233 Y 0.042 +234 F 0.045 +235 Q 0.052 +236 S 0.063 +237 I 0.077 +238 P 0.087 +239 E 0.092 +240 P 0.091 +241 H 0.084 +242 C 0.074 +243 P 0.064 +244 H 0.058 +245 C 0.056 +246 N 0.057 +247 D 0.059 +248 Y 0.059 +249 W 0.061 +250 P 0.069 +251 H 0.084 +252 D 0.101 +253 I 0.110 +254 P 0.111 +255 E 0.112 +256 V 0.116 +257 Y 0.123 +258 N 0.131 +259 P 0.141 +260 E 0.152 +261 K 0.164 +262 E 0.183 +263 R 0.216 +264 E 0.269 +265 A 0.335 +266 G 0.397 +267 I 0.439 +268 S 0.468 +269 K 0.492 +270 S 0.506 +271 S 0.494 +272 R 0.465 +273 K 0.458 +274 S 0.490 +275 L 0.526 +276 R 0.540 +277 T 0.537 +278 R 0.522 +279 Q 0.489 +280 H 0.456 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030781.14_ENSMUST00000118169.8_GN:Slc5a2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030781.14_ENSMUST00000118169.8_GN:Slc5a2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0869f8c7bb363bafbf17eba94ad7ef46ebb3c5c8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030781.14_ENSMUST00000118169.8_GN:Slc5a2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,671 @@ +>ENSMUSG00000030781.14|ENSMUST00000118169.8|GN:Slc5a2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.316 +2 E 0.311 +3 Q 0.311 +4 H 0.322 +5 V 0.339 +6 E 0.370 +7 A 0.421 +8 G 0.475 +9 S 0.506 +10 E 0.517 +11 L 0.520 +12 G 0.518 +13 E 0.502 +14 Q 0.466 +15 K 0.415 +16 V 0.357 +17 L 0.302 +18 I 0.248 +19 D 0.197 +20 N 0.152 +21 P 0.123 +22 A 0.115 +23 D 0.112 +24 I 0.101 +25 L 0.086 +26 V 0.075 +27 I 0.070 +28 A 0.070 +29 A 0.069 +30 Y 0.064 +31 F 0.056 +32 L 0.049 +33 L 0.048 +34 V 0.051 +35 I 0.052 +36 G 0.053 +37 V 0.053 +38 G 0.049 +39 L 0.045 +40 W 0.045 +41 S 0.052 +42 M 0.067 +43 F 0.097 +44 R 0.148 +45 T 0.207 +46 N 0.245 +47 R 0.250 +48 G 0.232 +49 T 0.211 +50 V 0.194 +51 G 0.183 +52 G 0.175 +53 Y 0.165 +54 F 0.155 +55 L 0.154 +56 A 0.158 +57 G 0.153 +58 R 0.137 +59 S 0.116 +60 M 0.098 +61 V 0.084 +62 W 0.074 +63 W 0.070 +64 P 0.071 +65 V 0.073 +66 G 0.079 +67 A 0.096 +68 S 0.126 +69 L 0.161 +70 F 0.186 +71 A 0.195 +72 S 0.194 +73 N 0.187 +74 I 0.174 +75 G 0.163 +76 S 0.162 +77 G 0.168 +78 H 0.171 +79 F 0.168 +80 V 0.164 +81 G 0.165 +82 L 0.167 +83 A 0.164 +84 G 0.156 +85 T 0.148 +86 G 0.144 +87 A 0.141 +88 A 0.141 +89 S 0.148 +90 G 0.159 +91 L 0.172 +92 A 0.181 +93 V 0.179 +94 A 0.168 +95 G 0.156 +96 F 0.150 +97 E 0.144 +98 W 0.137 +99 N 0.132 +100 A 0.127 +101 L 0.116 +102 F 0.102 +103 V 0.093 +104 V 0.085 +105 L 0.071 +106 L 0.059 +107 L 0.051 +108 G 0.043 +109 W 0.035 +110 L 0.030 +111 F 0.029 +112 V 0.031 +113 P 0.033 +114 V 0.035 +115 Y 0.040 +116 L 0.051 +117 T 0.073 +118 A 0.097 +119 G 0.108 +120 V 0.100 +121 I 0.082 +122 T 0.070 +123 M 0.069 +124 P 0.074 +125 Q 0.077 +126 Y 0.077 +127 L 0.076 +128 R 0.073 +129 K 0.070 +130 R 0.071 +131 F 0.077 +132 G 0.081 +133 G 0.080 +134 H 0.071 +135 R 0.063 +136 I 0.059 +137 R 0.058 +138 L 0.059 +139 Y 0.063 +140 L 0.070 +141 S 0.072 +142 V 0.070 +143 L 0.068 +144 S 0.071 +145 L 0.068 +146 F 0.057 +147 L 0.046 +148 Y 0.039 +149 I 0.038 +150 F 0.042 +151 T 0.050 +152 K 0.063 +153 I 0.075 +154 S 0.086 +155 V 0.098 +156 D 0.108 +157 M 0.114 +158 F 0.116 +159 S 0.112 +160 G 0.104 +161 A 0.093 +162 V 0.084 +163 F 0.079 +164 I 0.072 +165 Q 0.063 +166 Q 0.057 +167 A 0.059 +168 L 0.064 +169 G 0.067 +170 W 0.063 +171 N 0.056 +172 I 0.050 +173 Y 0.051 +174 A 0.058 +175 S 0.068 +176 V 0.074 +177 I 0.077 +178 A 0.084 +179 L 0.091 +180 L 0.087 +181 G 0.076 +182 I 0.068 +183 T 0.062 +184 M 0.057 +185 I 0.052 +186 Y 0.050 +187 T 0.052 +188 V 0.059 +189 T 0.074 +190 G 0.091 +191 G 0.105 +192 L 0.118 +193 A 0.136 +194 A 0.153 +195 L 0.159 +196 M 0.157 +197 Y 0.162 +198 T 0.170 +199 D 0.166 +200 T 0.151 +201 V 0.144 +202 Q 0.150 +203 T 0.155 +204 F 0.149 +205 V 0.140 +206 I 0.129 +207 L 0.115 +208 A 0.100 +209 G 0.093 +210 A 0.086 +211 F 0.080 +212 I 0.076 +213 L 0.075 +214 T 0.071 +215 G 0.067 +216 Y 0.065 +217 A 0.063 +218 F 0.060 +219 H 0.065 +220 E 0.079 +221 V 0.097 +222 G 0.105 +223 G 0.100 +224 Y 0.091 +225 S 0.086 +226 G 0.084 +227 L 0.083 +228 F 0.081 +229 D 0.082 +230 K 0.081 +231 Y 0.084 +232 L 0.092 +233 G 0.101 +234 A 0.112 +235 M 0.128 +236 T 0.150 +237 S 0.179 +238 L 0.214 +239 T 0.252 +240 V 0.291 +241 S 0.328 +242 K 0.357 +243 D 0.375 +244 P 0.383 +245 S 0.386 +246 V 0.381 +247 G 0.367 +248 N 0.347 +249 I 0.326 +250 S 0.302 +251 S 0.274 +252 T 0.248 +253 C 0.234 +254 Y 0.240 +255 Q 0.260 +256 P 0.272 +257 R 0.268 +258 P 0.249 +259 D 0.217 +260 S 0.182 +261 Y 0.158 +262 H 0.159 +263 L 0.189 +264 L 0.239 +265 R 0.286 +266 D 0.305 +267 P 0.289 +268 V 0.256 +269 T 0.230 +270 G 0.210 +271 D 0.190 +272 L 0.166 +273 P 0.138 +274 W 0.110 +275 P 0.091 +276 A 0.085 +277 L 0.086 +278 L 0.084 +279 L 0.085 +280 G 0.093 +281 L 0.101 +282 T 0.103 +283 I 0.106 +284 V 0.121 +285 S 0.138 +286 G 0.139 +287 W 0.125 +288 Y 0.111 +289 W 0.105 +290 C 0.109 +291 S 0.122 +292 D 0.135 +293 Q 0.138 +294 V 0.132 +295 I 0.124 +296 V 0.120 +297 Q 0.123 +298 R 0.131 +299 C 0.139 +300 L 0.140 +301 A 0.135 +302 G 0.123 +303 K 0.105 +304 N 0.086 +305 L 0.074 +306 T 0.070 +307 H 0.071 +308 I 0.073 +309 K 0.077 +310 A 0.087 +311 G 0.103 +312 C 0.117 +313 I 0.122 +314 L 0.126 +315 C 0.125 +316 G 0.119 +317 Y 0.117 +318 L 0.126 +319 K 0.129 +320 L 0.114 +321 M 0.093 +322 P 0.079 +323 M 0.069 +324 F 0.059 +325 L 0.051 +326 M 0.049 +327 V 0.056 +328 M 0.066 +329 P 0.075 +330 G 0.082 +331 M 0.091 +332 I 0.099 +333 S 0.098 +334 R 0.090 +335 I 0.080 +336 L 0.075 +337 Y 0.077 +338 P 0.085 +339 D 0.102 +340 E 0.123 +341 V 0.141 +342 A 0.149 +343 C 0.152 +344 V 0.158 +345 V 0.163 +346 P 0.157 +347 E 0.141 +348 V 0.120 +349 C 0.107 +350 K 0.109 +351 R 0.120 +352 V 0.129 +353 C 0.131 +354 G 0.131 +355 T 0.135 +356 E 0.144 +357 V 0.154 +358 G 0.159 +359 C 0.157 +360 S 0.155 +361 N 0.154 +362 I 0.149 +363 A 0.133 +364 Y 0.106 +365 P 0.083 +366 R 0.073 +367 L 0.073 +368 V 0.074 +369 V 0.076 +370 K 0.083 +371 L 0.096 +372 M 0.109 +373 P 0.117 +374 N 0.116 +375 G 0.108 +376 L 0.099 +377 R 0.096 +378 G 0.100 +379 L 0.106 +380 M 0.114 +381 L 0.124 +382 A 0.135 +383 V 0.148 +384 M 0.161 +385 L 0.166 +386 A 0.166 +387 A 0.167 +388 L 0.172 +389 M 0.180 +390 S 0.192 +391 S 0.202 +392 L 0.206 +393 A 0.204 +394 S 0.199 +395 I 0.192 +396 F 0.183 +397 N 0.182 +398 S 0.188 +399 S 0.188 +400 S 0.175 +401 T 0.153 +402 L 0.130 +403 F 0.109 +404 T 0.096 +405 M 0.086 +406 D 0.075 +407 I 0.062 +408 Y 0.050 +409 T 0.045 +410 R 0.048 +411 L 0.061 +412 R 0.083 +413 P 0.107 +414 R 0.124 +415 A 0.126 +416 G 0.112 +417 D 0.093 +418 K 0.080 +419 E 0.075 +420 L 0.074 +421 L 0.078 +422 L 0.083 +423 V 0.086 +424 G 0.089 +425 R 0.096 +426 L 0.104 +427 W 0.105 +428 V 0.098 +429 V 0.091 +430 F 0.093 +431 I 0.102 +432 V 0.106 +433 A 0.100 +434 V 0.087 +435 S 0.073 +436 V 0.062 +437 A 0.059 +438 W 0.063 +439 L 0.069 +440 P 0.074 +441 V 0.077 +442 V 0.084 +443 Q 0.100 +444 A 0.120 +445 A 0.138 +446 Q 0.147 +447 G 0.148 +448 G 0.143 +449 Q 0.131 +450 L 0.116 +451 F 0.104 +452 D 0.105 +453 Y 0.118 +454 I 0.136 +455 Q 0.152 +456 S 0.166 +457 V 0.166 +458 S 0.148 +459 S 0.124 +460 Y 0.112 +461 L 0.111 +462 A 0.116 +463 P 0.118 +464 P 0.117 +465 V 0.118 +466 S 0.122 +467 A 0.121 +468 V 0.107 +469 F 0.086 +470 V 0.068 +471 L 0.057 +472 A 0.049 +473 L 0.047 +474 F 0.055 +475 V 0.075 +476 P 0.099 +477 R 0.112 +478 V 0.106 +479 N 0.087 +480 E 0.069 +481 K 0.059 +482 G 0.057 +483 A 0.057 +484 F 0.055 +485 W 0.058 +486 G 0.065 +487 L 0.074 +488 V 0.078 +489 G 0.082 +490 G 0.085 +491 L 0.086 +492 L 0.087 +493 M 0.093 +494 G 0.105 +495 L 0.115 +496 A 0.122 +497 R 0.127 +498 L 0.127 +499 I 0.123 +500 P 0.125 +501 E 0.132 +502 F 0.147 +503 F 0.178 +504 F 0.226 +505 G 0.275 +506 S 0.304 +507 G 0.303 +508 S 0.276 +509 C 0.244 +510 V 0.227 +511 R 0.230 +512 P 0.238 +513 S 0.238 +514 A 0.223 +515 C 0.200 +516 P 0.171 +517 A 0.139 +518 L 0.119 +519 F 0.124 +520 C 0.146 +521 R 0.162 +522 V 0.157 +523 H 0.135 +524 Y 0.111 +525 L 0.095 +526 Y 0.088 +527 F 0.090 +528 A 0.094 +529 I 0.095 +530 I 0.097 +531 L 0.100 +532 F 0.100 +533 I 0.099 +534 C 0.103 +535 S 0.108 +536 G 0.105 +537 I 0.096 +538 L 0.091 +539 T 0.091 +540 L 0.095 +541 G 0.104 +542 I 0.116 +543 S 0.120 +544 L 0.116 +545 C 0.115 +546 T 0.126 +547 A 0.148 +548 P 0.169 +549 I 0.181 +550 P 0.187 +551 Q 0.190 +552 K 0.189 +553 H 0.180 +554 L 0.169 +555 H 0.160 +556 R 0.149 +557 L 0.131 +558 V 0.116 +559 F 0.117 +560 S 0.133 +561 L 0.152 +562 R 0.169 +563 H 0.193 +564 S 0.229 +565 K 0.272 +566 E 0.310 +567 E 0.341 +568 R 0.373 +569 E 0.406 +570 D 0.437 +571 L 0.462 +572 D 0.479 +573 A 0.490 +574 D 0.500 +575 E 0.508 +576 L 0.513 +577 E 0.516 +578 G 0.526 +579 P 0.548 +580 A 0.584 +581 P 0.622 +582 A 0.649 +583 P 0.645 +584 V 0.612 +585 Q 0.594 +586 N 0.616 +587 G 0.635 +588 G 0.614 +589 Q 0.589 +590 E 0.609 +591 C 0.657 +592 A 0.692 +593 M 0.706 +594 E 0.709 +595 M 0.709 +596 E 0.707 +597 E 0.695 +598 V 0.669 +599 Q 0.631 +600 S 0.593 +601 P 0.557 +602 A 0.519 +603 P 0.469 +604 G 0.400 +605 L 0.320 +606 L 0.253 +607 R 0.213 +608 R 0.193 +609 C 0.184 +610 L 0.185 +611 L 0.188 +612 W 0.187 +613 F 0.198 +614 C 0.241 +615 G 0.317 +616 M 0.414 +617 S 0.510 +618 K 0.587 +619 S 0.632 +620 G 0.650 +621 S 0.642 +622 G 0.612 +623 S 0.570 +624 P 0.533 +625 P 0.505 +626 P 0.484 +627 T 0.464 +628 T 0.442 +629 E 0.418 +630 E 0.393 +631 V 0.369 +632 A 0.351 +633 A 0.343 +634 T 0.343 +635 T 0.342 +636 R 0.329 +637 R 0.308 +638 L 0.288 +639 E 0.275 +640 D 0.266 +641 I 0.258 +642 S 0.244 +643 E 0.221 +644 D 0.189 +645 P 0.152 +646 R 0.122 +647 W 0.108 +648 A 0.108 +649 R 0.111 +650 V 0.112 +651 V 0.114 +652 N 0.117 +653 L 0.121 +654 N 0.130 +655 A 0.140 +656 L 0.147 +657 L 0.157 +658 M 0.168 +659 M 0.168 +660 T 0.155 +661 V 0.139 +662 A 0.122 +663 V 0.102 +664 F 0.086 +665 L 0.080 +666 W 0.081 +667 G 0.087 +668 F 0.102 +669 Y 0.126 +670 A 0.145 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030781.14_ENSMUST00000118169.8_GN:Slc5a2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:4.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030781.14_ENSMUST00000118169.8_GN:Slc5a2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:4.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..3ab06815657ef0915dbb88392fa7b0e46652195f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030781.14_ENSMUST00000118169.8_GN:Slc5a2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:4.caid @@ -0,0 +1,675 @@ +>ENSMUSG00000030781.14|ENSMUST00000118169.8|GN:Slc5a2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:4 +1 M 0.178 +2 L 0.175 +3 E 0.178 +4 R 0.191 +5 M 0.208 +6 E 0.224 +7 Q 0.245 +8 H 0.279 +9 V 0.318 +10 E 0.358 +11 A 0.397 +12 G 0.429 +13 S 0.453 +14 E 0.470 +15 L 0.486 +16 G 0.497 +17 E 0.491 +18 Q 0.462 +19 K 0.416 +20 V 0.362 +21 L 0.308 +22 I 0.254 +23 D 0.201 +24 N 0.154 +25 P 0.124 +26 A 0.112 +27 D 0.103 +28 I 0.085 +29 L 0.066 +30 V 0.059 +31 I 0.062 +32 A 0.067 +33 A 0.068 +34 Y 0.064 +35 F 0.056 +36 L 0.049 +37 L 0.048 +38 V 0.051 +39 I 0.052 +40 G 0.053 +41 V 0.053 +42 G 0.049 +43 L 0.045 +44 W 0.045 +45 S 0.052 +46 M 0.067 +47 F 0.097 +48 R 0.147 +49 T 0.205 +50 N 0.244 +51 R 0.249 +52 G 0.233 +53 T 0.212 +54 V 0.194 +55 G 0.182 +56 G 0.174 +57 Y 0.163 +58 F 0.154 +59 L 0.153 +60 A 0.156 +61 G 0.152 +62 R 0.136 +63 S 0.115 +64 M 0.098 +65 V 0.084 +66 W 0.074 +67 W 0.070 +68 P 0.071 +69 V 0.073 +70 G 0.078 +71 A 0.096 +72 S 0.126 +73 L 0.160 +74 F 0.184 +75 A 0.194 +76 S 0.193 +77 N 0.186 +78 I 0.173 +79 G 0.162 +80 S 0.161 +81 G 0.167 +82 H 0.170 +83 F 0.167 +84 V 0.164 +85 G 0.165 +86 L 0.167 +87 A 0.164 +88 G 0.156 +89 T 0.148 +90 G 0.143 +91 A 0.140 +92 A 0.140 +93 S 0.146 +94 G 0.158 +95 L 0.171 +96 A 0.181 +97 V 0.179 +98 A 0.168 +99 G 0.156 +100 F 0.149 +101 E 0.143 +102 W 0.136 +103 N 0.131 +104 A 0.126 +105 L 0.115 +106 F 0.102 +107 V 0.093 +108 V 0.085 +109 L 0.072 +110 L 0.059 +111 L 0.051 +112 G 0.043 +113 W 0.035 +114 L 0.030 +115 F 0.029 +116 V 0.031 +117 P 0.033 +118 V 0.036 +119 Y 0.040 +120 L 0.051 +121 T 0.073 +122 A 0.097 +123 G 0.108 +124 V 0.100 +125 I 0.082 +126 T 0.070 +127 M 0.070 +128 P 0.074 +129 Q 0.077 +130 Y 0.077 +131 L 0.076 +132 R 0.073 +133 K 0.071 +134 R 0.071 +135 F 0.077 +136 G 0.082 +137 G 0.080 +138 H 0.072 +139 R 0.063 +140 I 0.060 +141 R 0.059 +142 L 0.059 +143 Y 0.063 +144 L 0.070 +145 S 0.072 +146 V 0.070 +147 L 0.068 +148 S 0.070 +149 L 0.067 +150 F 0.057 +151 L 0.045 +152 Y 0.039 +153 I 0.038 +154 F 0.041 +155 T 0.050 +156 K 0.063 +157 I 0.075 +158 S 0.086 +159 V 0.097 +160 D 0.108 +161 M 0.114 +162 F 0.115 +163 S 0.112 +164 G 0.103 +165 A 0.092 +166 V 0.084 +167 F 0.079 +168 I 0.072 +169 Q 0.063 +170 Q 0.058 +171 A 0.059 +172 L 0.064 +173 G 0.067 +174 W 0.063 +175 N 0.056 +176 I 0.050 +177 Y 0.050 +178 A 0.058 +179 S 0.068 +180 V 0.073 +181 I 0.076 +182 A 0.084 +183 L 0.090 +184 L 0.086 +185 G 0.076 +186 I 0.068 +187 T 0.062 +188 M 0.057 +189 I 0.052 +190 Y 0.050 +191 T 0.051 +192 V 0.059 +193 T 0.073 +194 G 0.090 +195 G 0.105 +196 L 0.118 +197 A 0.136 +198 A 0.153 +199 L 0.159 +200 M 0.157 +201 Y 0.161 +202 T 0.170 +203 D 0.166 +204 T 0.151 +205 V 0.144 +206 Q 0.150 +207 T 0.155 +208 F 0.149 +209 V 0.140 +210 I 0.129 +211 L 0.114 +212 A 0.100 +213 G 0.092 +214 A 0.086 +215 F 0.079 +216 I 0.075 +217 L 0.074 +218 T 0.071 +219 G 0.067 +220 Y 0.065 +221 A 0.063 +222 F 0.060 +223 H 0.064 +224 E 0.078 +225 V 0.096 +226 G 0.104 +227 G 0.099 +228 Y 0.090 +229 S 0.085 +230 G 0.084 +231 L 0.082 +232 F 0.081 +233 D 0.081 +234 K 0.081 +235 Y 0.084 +236 L 0.092 +237 G 0.101 +238 A 0.112 +239 M 0.128 +240 T 0.150 +241 S 0.178 +242 L 0.213 +243 T 0.251 +244 V 0.291 +245 S 0.327 +246 K 0.357 +247 D 0.374 +248 P 0.382 +249 S 0.385 +250 V 0.381 +251 G 0.366 +252 N 0.347 +253 I 0.326 +254 S 0.302 +255 S 0.274 +256 T 0.248 +257 C 0.234 +258 Y 0.241 +259 Q 0.260 +260 P 0.272 +261 R 0.268 +262 P 0.249 +263 D 0.217 +264 S 0.182 +265 Y 0.158 +266 H 0.159 +267 L 0.190 +268 L 0.240 +269 R 0.288 +270 D 0.306 +271 P 0.290 +272 V 0.257 +273 T 0.230 +274 G 0.210 +275 D 0.190 +276 L 0.166 +277 P 0.138 +278 W 0.110 +279 P 0.091 +280 A 0.085 +281 L 0.086 +282 L 0.085 +283 L 0.085 +284 G 0.093 +285 L 0.101 +286 T 0.103 +287 I 0.106 +288 V 0.121 +289 S 0.138 +290 G 0.139 +291 W 0.126 +292 Y 0.111 +293 W 0.105 +294 C 0.109 +295 S 0.123 +296 D 0.135 +297 Q 0.139 +298 V 0.133 +299 I 0.125 +300 V 0.120 +301 Q 0.123 +302 R 0.132 +303 C 0.139 +304 L 0.140 +305 A 0.135 +306 G 0.124 +307 K 0.105 +308 N 0.086 +309 L 0.074 +310 T 0.071 +311 H 0.072 +312 I 0.074 +313 K 0.077 +314 A 0.087 +315 G 0.104 +316 C 0.117 +317 I 0.123 +318 L 0.126 +319 C 0.125 +320 G 0.119 +321 Y 0.117 +322 L 0.126 +323 K 0.129 +324 L 0.114 +325 M 0.093 +326 P 0.079 +327 M 0.069 +328 F 0.059 +329 L 0.051 +330 M 0.049 +331 V 0.056 +332 M 0.066 +333 P 0.075 +334 G 0.082 +335 M 0.092 +336 I 0.100 +337 S 0.099 +338 R 0.090 +339 I 0.080 +340 L 0.075 +341 Y 0.077 +342 P 0.085 +343 D 0.102 +344 E 0.123 +345 V 0.140 +346 A 0.148 +347 C 0.152 +348 V 0.157 +349 V 0.163 +350 P 0.157 +351 E 0.141 +352 V 0.120 +353 C 0.106 +354 K 0.108 +355 R 0.119 +356 V 0.127 +357 C 0.129 +358 G 0.130 +359 T 0.134 +360 E 0.143 +361 V 0.153 +362 G 0.158 +363 C 0.156 +364 S 0.154 +365 N 0.154 +366 I 0.149 +367 A 0.132 +368 Y 0.106 +369 P 0.082 +370 R 0.073 +371 L 0.073 +372 V 0.074 +373 V 0.075 +374 K 0.082 +375 L 0.096 +376 M 0.108 +377 P 0.116 +378 N 0.115 +379 G 0.107 +380 L 0.098 +381 R 0.095 +382 G 0.099 +383 L 0.106 +384 M 0.114 +385 L 0.123 +386 A 0.134 +387 V 0.148 +388 M 0.160 +389 L 0.165 +390 A 0.165 +391 A 0.166 +392 L 0.171 +393 M 0.179 +394 S 0.191 +395 S 0.202 +396 L 0.205 +397 A 0.203 +398 S 0.199 +399 I 0.192 +400 F 0.183 +401 N 0.182 +402 S 0.188 +403 S 0.188 +404 S 0.175 +405 T 0.153 +406 L 0.129 +407 F 0.109 +408 T 0.095 +409 M 0.086 +410 D 0.075 +411 I 0.062 +412 Y 0.050 +413 T 0.045 +414 R 0.048 +415 L 0.061 +416 R 0.083 +417 P 0.107 +418 R 0.124 +419 A 0.125 +420 G 0.111 +421 D 0.093 +422 K 0.080 +423 E 0.075 +424 L 0.074 +425 L 0.077 +426 L 0.082 +427 V 0.084 +428 G 0.088 +429 R 0.096 +430 L 0.104 +431 W 0.105 +432 V 0.098 +433 V 0.091 +434 F 0.093 +435 I 0.102 +436 V 0.106 +437 A 0.100 +438 V 0.087 +439 S 0.073 +440 V 0.062 +441 A 0.059 +442 W 0.063 +443 L 0.069 +444 P 0.073 +445 V 0.076 +446 V 0.084 +447 Q 0.100 +448 A 0.120 +449 A 0.138 +450 Q 0.147 +451 G 0.148 +452 G 0.143 +453 Q 0.131 +454 L 0.116 +455 F 0.104 +456 D 0.105 +457 Y 0.118 +458 I 0.136 +459 Q 0.152 +460 S 0.166 +461 V 0.166 +462 S 0.148 +463 S 0.124 +464 Y 0.111 +465 L 0.111 +466 A 0.116 +467 P 0.118 +468 P 0.117 +469 V 0.118 +470 S 0.122 +471 A 0.121 +472 V 0.107 +473 F 0.086 +474 V 0.068 +475 L 0.057 +476 A 0.050 +477 L 0.048 +478 F 0.056 +479 V 0.075 +480 P 0.099 +481 R 0.113 +482 V 0.107 +483 N 0.087 +484 E 0.069 +485 K 0.060 +486 G 0.058 +487 A 0.057 +488 F 0.056 +489 W 0.058 +490 G 0.066 +491 L 0.074 +492 V 0.078 +493 G 0.082 +494 G 0.085 +495 L 0.086 +496 L 0.087 +497 M 0.093 +498 G 0.105 +499 L 0.115 +500 A 0.122 +501 R 0.127 +502 L 0.127 +503 I 0.124 +504 P 0.125 +505 E 0.133 +506 F 0.147 +507 F 0.178 +508 F 0.226 +509 G 0.275 +510 S 0.303 +511 G 0.302 +512 S 0.275 +513 C 0.243 +514 V 0.226 +515 R 0.228 +516 P 0.237 +517 S 0.236 +518 A 0.222 +519 C 0.200 +520 P 0.171 +521 A 0.139 +522 L 0.119 +523 F 0.124 +524 C 0.146 +525 R 0.162 +526 V 0.157 +527 H 0.134 +528 Y 0.110 +529 L 0.095 +530 Y 0.089 +531 F 0.090 +532 A 0.094 +533 I 0.095 +534 I 0.097 +535 L 0.100 +536 F 0.100 +537 I 0.098 +538 C 0.103 +539 S 0.108 +540 G 0.104 +541 I 0.096 +542 L 0.090 +543 T 0.090 +544 L 0.095 +545 G 0.104 +546 I 0.116 +547 S 0.120 +548 L 0.116 +549 C 0.114 +550 T 0.126 +551 A 0.148 +552 P 0.169 +553 I 0.181 +554 P 0.187 +555 Q 0.190 +556 K 0.188 +557 H 0.179 +558 L 0.168 +559 H 0.159 +560 R 0.148 +561 L 0.130 +562 V 0.116 +563 F 0.117 +564 S 0.133 +565 L 0.152 +566 R 0.170 +567 H 0.193 +568 S 0.230 +569 K 0.273 +570 E 0.310 +571 E 0.342 +572 R 0.374 +573 E 0.407 +574 D 0.439 +575 L 0.464 +576 D 0.481 +577 A 0.493 +578 D 0.503 +579 E 0.511 +580 L 0.516 +581 E 0.519 +582 G 0.528 +583 P 0.550 +584 A 0.585 +585 P 0.623 +586 A 0.650 +587 P 0.645 +588 V 0.612 +589 Q 0.594 +590 N 0.616 +591 G 0.635 +592 G 0.614 +593 Q 0.590 +594 E 0.610 +595 C 0.657 +596 A 0.692 +597 M 0.706 +598 E 0.709 +599 M 0.709 +600 E 0.707 +601 E 0.696 +602 V 0.669 +603 Q 0.632 +604 S 0.594 +605 P 0.558 +606 A 0.520 +607 P 0.469 +608 G 0.400 +609 L 0.320 +610 L 0.253 +611 R 0.213 +612 R 0.193 +613 C 0.184 +614 L 0.185 +615 L 0.188 +616 W 0.187 +617 F 0.198 +618 C 0.241 +619 G 0.317 +620 M 0.414 +621 S 0.511 +622 K 0.587 +623 S 0.633 +624 G 0.650 +625 S 0.643 +626 G 0.613 +627 S 0.571 +628 P 0.534 +629 P 0.506 +630 P 0.485 +631 T 0.465 +632 T 0.443 +633 E 0.420 +634 E 0.395 +635 V 0.370 +636 A 0.352 +637 A 0.344 +638 T 0.344 +639 T 0.342 +640 R 0.329 +641 R 0.308 +642 L 0.289 +643 E 0.275 +644 D 0.266 +645 I 0.258 +646 S 0.244 +647 E 0.221 +648 D 0.189 +649 P 0.153 +650 R 0.123 +651 W 0.109 +652 A 0.109 +653 R 0.111 +654 V 0.112 +655 V 0.114 +656 N 0.117 +657 L 0.121 +658 N 0.130 +659 A 0.140 +660 L 0.147 +661 L 0.157 +662 M 0.168 +663 M 0.167 +664 T 0.154 +665 V 0.138 +666 A 0.121 +667 V 0.101 +668 F 0.085 +669 L 0.079 +670 W 0.080 +671 G 0.086 +672 F 0.101 +673 Y 0.124 +674 A 0.144 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030968.4_ENSMUST00000033267.4_GN:Pdilt_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030968.4_ENSMUST00000033267.4_GN:Pdilt_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..581332ac55a7826bd73398b61e629558d8f378bb --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030968.4_ENSMUST00000033267.4_GN:Pdilt_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,589 @@ +>ENSMUSG00000030968.4|ENSMUST00000033267.4|GN:Pdilt|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.316 +2 E 0.309 +3 L 0.292 +4 L 0.268 +5 W 0.242 +6 T 0.218 +7 P 0.197 +8 L 0.182 +9 L 0.179 +10 L 0.189 +11 V 0.202 +12 A 0.210 +13 A 0.218 +14 C 0.233 +15 L 0.255 +16 S 0.288 +17 E 0.336 +18 V 0.390 +19 L 0.440 +20 G 0.481 +21 S 0.512 +22 P 0.534 +23 E 0.550 +24 I 0.564 +25 D 0.577 +26 T 0.575 +27 G 0.549 +28 I 0.510 +29 N 0.472 +30 I 0.432 +31 S 0.388 +32 Q 0.346 +33 P 0.307 +34 L 0.272 +35 H 0.241 +36 I 0.220 +37 L 0.203 +38 E 0.185 +39 D 0.164 +40 H 0.145 +41 N 0.129 +42 L 0.113 +43 M 0.097 +44 V 0.085 +45 L 0.074 +46 T 0.064 +47 P 0.055 +48 A 0.048 +49 G 0.046 +50 L 0.050 +51 T 0.059 +52 Q 0.065 +53 T 0.062 +54 L 0.054 +55 N 0.053 +56 E 0.057 +57 T 0.057 +58 R 0.046 +59 F 0.034 +60 L 0.028 +61 M 0.028 +62 V 0.030 +63 I 0.032 +64 F 0.035 +65 H 0.040 +66 N 0.046 +67 P 0.051 +68 S 0.053 +69 L 0.054 +70 K 0.054 +71 Q 0.055 +72 S 0.057 +73 R 0.063 +74 K 0.074 +75 L 0.082 +76 A 0.081 +77 K 0.070 +78 E 0.058 +79 L 0.048 +80 G 0.041 +81 K 0.036 +82 A 0.034 +83 A 0.032 +84 E 0.032 +85 I 0.041 +86 F 0.061 +87 G 0.091 +88 K 0.126 +89 G 0.150 +90 K 0.154 +91 N 0.138 +92 G 0.111 +93 L 0.083 +94 G 0.061 +95 F 0.046 +96 G 0.039 +97 K 0.038 +98 V 0.043 +99 D 0.046 +100 I 0.046 +101 T 0.043 +102 K 0.040 +103 E 0.037 +104 T 0.034 +105 E 0.033 +106 L 0.038 +107 Q 0.048 +108 Q 0.055 +109 E 0.053 +110 F 0.049 +111 D 0.051 +112 I 0.055 +113 T 0.054 +114 H 0.053 +115 A 0.053 +116 P 0.053 +117 E 0.048 +118 L 0.040 +119 K 0.032 +120 L 0.027 +121 F 0.027 +122 F 0.032 +123 E 0.040 +124 G 0.051 +125 N 0.059 +126 R 0.062 +127 L 0.062 +128 K 0.060 +129 P 0.058 +130 I 0.058 +131 S 0.063 +132 C 0.078 +133 K 0.098 +134 D 0.111 +135 V 0.112 +136 V 0.102 +137 E 0.087 +138 S 0.071 +139 T 0.057 +140 A 0.049 +141 L 0.047 +142 V 0.046 +143 V 0.046 +144 W 0.048 +145 L 0.051 +146 R 0.058 +147 R 0.071 +148 Q 0.090 +149 I 0.112 +150 S 0.134 +151 K 0.149 +152 K 0.149 +153 A 0.133 +154 L 0.109 +155 L 0.086 +156 F 0.071 +157 N 0.063 +158 N 0.058 +159 S 0.052 +160 D 0.045 +161 E 0.040 +162 V 0.042 +163 A 0.051 +164 D 0.058 +165 F 0.053 +166 V 0.041 +167 K 0.033 +168 S 0.029 +169 R 0.027 +170 P 0.023 +171 L 0.020 +172 V 0.020 +173 I 0.021 +174 V 0.023 +175 G 0.028 +176 F 0.037 +177 F 0.047 +178 Q 0.053 +179 D 0.056 +180 L 0.060 +181 E 0.061 +182 E 0.059 +183 E 0.052 +184 V 0.045 +185 A 0.039 +186 E 0.036 +187 L 0.035 +188 F 0.033 +189 Y 0.029 +190 D 0.027 +191 T 0.027 +192 I 0.029 +193 K 0.031 +194 D 0.035 +195 F 0.038 +196 P 0.038 +197 E 0.034 +198 L 0.030 +199 T 0.028 +200 F 0.028 +201 G 0.032 +202 A 0.038 +203 I 0.047 +204 Q 0.058 +205 I 0.070 +206 K 0.082 +207 N 0.089 +208 S 0.084 +209 F 0.073 +210 G 0.066 +211 R 0.063 +212 F 0.060 +213 H 0.059 +214 V 0.057 +215 I 0.054 +216 L 0.051 +217 D 0.046 +218 S 0.038 +219 V 0.029 +220 L 0.022 +221 V 0.020 +222 F 0.023 +223 K 0.029 +224 K 0.035 +225 G 0.040 +226 K 0.041 +227 I 0.040 +228 V 0.042 +229 K 0.049 +230 R 0.064 +231 Q 0.085 +232 E 0.108 +233 L 0.131 +234 I 0.153 +235 N 0.170 +236 D 0.175 +237 S 0.162 +238 T 0.137 +239 N 0.107 +240 K 0.081 +241 D 0.063 +242 H 0.056 +243 L 0.057 +244 N 0.063 +245 Q 0.066 +246 V 0.064 +247 I 0.060 +248 K 0.059 +249 Q 0.060 +250 Q 0.065 +251 L 0.074 +252 T 0.085 +253 G 0.096 +254 F 0.103 +255 V 0.105 +256 I 0.100 +257 E 0.093 +258 L 0.088 +259 N 0.086 +260 P 0.085 +261 E 0.082 +262 N 0.075 +263 K 0.066 +264 D 0.062 +265 L 0.060 +266 I 0.059 +267 Y 0.061 +268 E 0.070 +269 L 0.077 +270 N 0.077 +271 I 0.067 +272 L 0.052 +273 N 0.039 +274 H 0.030 +275 M 0.026 +276 L 0.027 +277 L 0.034 +278 F 0.044 +279 I 0.052 +280 S 0.057 +281 K 0.062 +282 S 0.063 +283 S 0.060 +284 E 0.056 +285 P 0.056 +286 Y 0.057 +287 S 0.056 +288 T 0.054 +289 I 0.052 +290 S 0.049 +291 R 0.044 +292 H 0.040 +293 Y 0.036 +294 R 0.032 +295 Q 0.030 +296 I 0.030 +297 A 0.031 +298 K 0.030 +299 E 0.029 +300 F 0.032 +301 Q 0.038 +302 N 0.044 +303 K 0.047 +304 I 0.046 +305 L 0.043 +306 F 0.040 +307 V 0.042 +308 L 0.051 +309 V 0.064 +310 N 0.073 +311 A 0.076 +312 D 0.078 +313 E 0.081 +314 P 0.082 +315 K 0.074 +316 N 0.059 +317 K 0.046 +318 R 0.038 +319 I 0.034 +320 F 0.034 +321 E 0.037 +322 Y 0.042 +323 F 0.049 +324 Q 0.058 +325 I 0.063 +326 S 0.064 +327 R 0.063 +328 V 0.059 +329 N 0.052 +330 V 0.043 +331 P 0.034 +332 S 0.029 +333 V 0.027 +334 Q 0.029 +335 I 0.035 +336 L 0.047 +337 N 0.064 +338 L 0.081 +339 S 0.095 +340 S 0.109 +341 D 0.118 +342 G 0.114 +343 R 0.096 +344 Y 0.078 +345 K 0.068 +346 M 0.068 +347 P 0.074 +348 T 0.081 +349 D 0.084 +350 D 0.082 +351 I 0.075 +352 N 0.068 +353 F 0.061 +354 E 0.055 +355 S 0.051 +356 L 0.049 +357 K 0.047 +358 K 0.046 +359 F 0.048 +360 C 0.050 +361 N 0.053 +362 S 0.058 +363 F 0.066 +364 L 0.077 +365 S 0.093 +366 K 0.119 +367 T 0.152 +368 A 0.189 +369 K 0.227 +370 K 0.264 +371 H 0.301 +372 K 0.335 +373 A 0.363 +374 S 0.375 +375 E 0.359 +376 E 0.321 +377 I 0.278 +378 P 0.242 +379 K 0.213 +380 Y 0.192 +381 W 0.179 +382 D 0.172 +383 Q 0.169 +384 G 0.164 +385 P 0.159 +386 V 0.153 +387 K 0.148 +388 K 0.143 +389 L 0.138 +390 V 0.134 +391 G 0.129 +392 K 0.118 +393 N 0.099 +394 F 0.078 +395 N 0.065 +396 V 0.062 +397 V 0.065 +398 V 0.071 +399 L 0.080 +400 D 0.090 +401 K 0.097 +402 E 0.098 +403 K 0.094 +404 D 0.087 +405 V 0.076 +406 F 0.063 +407 V 0.052 +408 M 0.047 +409 F 0.047 +410 Y 0.051 +411 A 0.056 +412 P 0.062 +413 W 0.064 +414 S 0.065 +415 E 0.065 +416 K 0.066 +417 C 0.069 +418 R 0.074 +419 V 0.079 +420 L 0.083 +421 L 0.081 +422 P 0.073 +423 L 0.063 +424 L 0.054 +425 E 0.049 +426 E 0.046 +427 L 0.047 +428 G 0.053 +429 I 0.057 +430 K 0.058 +431 Y 0.057 +432 Q 0.058 +433 N 0.062 +434 H 0.064 +435 S 0.061 +436 T 0.056 +437 V 0.055 +438 I 0.057 +439 I 0.062 +440 A 0.068 +441 K 0.075 +442 I 0.082 +443 D 0.086 +444 I 0.086 +445 T 0.084 +446 A 0.083 +447 N 0.083 +448 D 0.086 +449 I 0.091 +450 Q 0.101 +451 L 0.121 +452 A 0.150 +453 N 0.176 +454 P 0.183 +455 E 0.167 +456 Q 0.137 +457 Y 0.109 +458 P 0.086 +459 F 0.068 +460 F 0.060 +461 R 0.065 +462 L 0.084 +463 F 0.109 +464 P 0.127 +465 T 0.130 +466 D 0.126 +467 S 0.123 +468 Q 0.119 +469 E 0.113 +470 A 0.109 +471 V 0.108 +472 M 0.110 +473 Y 0.112 +474 K 0.113 +475 G 0.112 +476 E 0.104 +477 H 0.092 +478 T 0.083 +479 M 0.081 +480 K 0.081 +481 G 0.079 +482 F 0.073 +483 C 0.067 +484 D 0.065 +485 F 0.064 +486 L 0.063 +487 E 0.065 +488 S 0.070 +489 H 0.076 +490 V 0.085 +491 K 0.106 +492 V 0.145 +493 R 0.194 +494 I 0.246 +495 E 0.300 +496 E 0.348 +497 E 0.375 +498 D 0.379 +499 E 0.376 +500 L 0.382 +501 L 0.396 +502 Y 0.415 +503 I 0.443 +504 E 0.471 +505 Q 0.492 +506 N 0.509 +507 E 0.530 +508 E 0.558 +509 E 0.587 +510 E 0.607 +511 V 0.609 +512 L 0.596 +513 A 0.584 +514 E 0.582 +515 P 0.579 +516 E 0.555 +517 I 0.514 +518 Q 0.494 +519 L 0.516 +520 I 0.554 +521 E 0.572 +522 K 0.570 +523 L 0.567 +524 P 0.576 +525 E 0.599 +526 N 0.623 +527 P 0.638 +528 L 0.657 +529 L 0.686 +530 K 0.716 +531 I 0.737 +532 E 0.749 +533 D 0.752 +534 T 0.744 +535 S 0.731 +536 K 0.721 +537 Q 0.717 +538 D 0.716 +539 R 0.718 +540 P 0.727 +541 V 0.737 +542 K 0.737 +543 E 0.725 +544 S 0.715 +545 P 0.715 +546 V 0.721 +547 L 0.725 +548 D 0.720 +549 S 0.702 +550 I 0.681 +551 R 0.669 +552 K 0.672 +553 P 0.679 +554 E 0.681 +555 E 0.680 +556 P 0.679 +557 E 0.669 +558 R 0.631 +559 R 0.568 +560 K 0.521 +561 E 0.513 +562 T 0.509 +563 A 0.487 +564 E 0.480 +565 R 0.514 +566 E 0.566 +567 A 0.604 +568 A 0.621 +569 A 0.620 +570 A 0.612 +571 Q 0.614 +572 P 0.630 +573 K 0.644 +574 E 0.643 +575 Q 0.634 +576 P 0.631 +577 K 0.642 +578 P 0.660 +579 E 0.671 +580 R 0.665 +581 K 0.642 +582 L 0.618 +583 E 0.603 +584 V 0.585 +585 K 0.545 +586 E 0.475 +587 E 0.396 +588 L 0.343 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030968.4_ENSMUST00000033267.4_GN:Pdilt_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030968.4_ENSMUST00000033267.4_GN:Pdilt_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6735d7362c9e8cb6cc033cafff0766bbca8f80c1 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030968.4_ENSMUST00000033267.4_GN:Pdilt_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid @@ -0,0 +1,605 @@ +>ENSMUSG00000030968.4|ENSMUST00000033267.4|GN:Pdilt|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:16 +1 M 0.370 +2 W 0.394 +3 P 0.429 +4 D 0.460 +5 S 0.469 +6 P 0.454 +7 E 0.445 +8 S 0.471 +9 N 0.506 +10 P 0.511 +11 A 0.505 +12 A 0.523 +13 C 0.559 +14 R 0.587 +15 P 0.597 +16 S 0.573 +17 M 0.514 +18 E 0.449 +19 L 0.403 +20 L 0.366 +21 W 0.327 +22 T 0.298 +23 P 0.280 +24 L 0.261 +25 L 0.246 +26 L 0.250 +27 V 0.265 +28 A 0.268 +29 A 0.267 +30 C 0.276 +31 L 0.300 +32 S 0.338 +33 E 0.386 +34 V 0.433 +35 L 0.470 +36 G 0.499 +37 S 0.523 +38 P 0.544 +39 E 0.563 +40 I 0.583 +41 D 0.600 +42 T 0.603 +43 G 0.582 +44 I 0.547 +45 N 0.511 +46 I 0.470 +47 S 0.418 +48 Q 0.366 +49 P 0.321 +50 L 0.283 +51 H 0.252 +52 I 0.232 +53 L 0.216 +54 E 0.197 +55 D 0.175 +56 H 0.154 +57 N 0.134 +58 L 0.115 +59 M 0.098 +60 V 0.085 +61 L 0.074 +62 T 0.065 +63 P 0.055 +64 A 0.048 +65 G 0.045 +66 L 0.048 +67 T 0.057 +68 Q 0.064 +69 T 0.061 +70 L 0.053 +71 N 0.052 +72 E 0.057 +73 T 0.057 +74 R 0.047 +75 F 0.034 +76 L 0.028 +77 M 0.028 +78 V 0.030 +79 I 0.031 +80 F 0.034 +81 H 0.039 +82 N 0.044 +83 P 0.048 +84 S 0.050 +85 L 0.051 +86 K 0.052 +87 Q 0.052 +88 S 0.055 +89 R 0.062 +90 K 0.072 +91 L 0.080 +92 A 0.078 +93 K 0.067 +94 E 0.055 +95 L 0.045 +96 G 0.039 +97 K 0.035 +98 A 0.032 +99 A 0.030 +100 E 0.031 +101 I 0.039 +102 F 0.058 +103 G 0.087 +104 K 0.119 +105 G 0.143 +106 K 0.148 +107 N 0.134 +108 G 0.109 +109 L 0.083 +110 G 0.062 +111 F 0.047 +112 G 0.039 +113 K 0.039 +114 V 0.043 +115 D 0.047 +116 I 0.047 +117 T 0.043 +118 K 0.040 +119 E 0.037 +120 T 0.033 +121 E 0.032 +122 L 0.037 +123 Q 0.047 +124 Q 0.054 +125 E 0.052 +126 F 0.049 +127 D 0.052 +128 I 0.055 +129 T 0.055 +130 H 0.054 +131 A 0.055 +132 P 0.054 +133 E 0.049 +134 L 0.041 +135 K 0.033 +136 L 0.028 +137 F 0.028 +138 F 0.033 +139 E 0.042 +140 G 0.053 +141 N 0.061 +142 R 0.064 +143 L 0.063 +144 K 0.061 +145 P 0.059 +146 I 0.058 +147 S 0.065 +148 C 0.082 +149 K 0.102 +150 D 0.116 +151 V 0.117 +152 V 0.106 +153 E 0.090 +154 S 0.072 +155 T 0.058 +156 A 0.050 +157 L 0.047 +158 V 0.046 +159 V 0.047 +160 W 0.048 +161 L 0.051 +162 R 0.058 +163 R 0.071 +164 Q 0.090 +165 I 0.113 +166 S 0.135 +167 K 0.150 +168 K 0.149 +169 A 0.133 +170 L 0.109 +171 L 0.086 +172 F 0.071 +173 N 0.063 +174 N 0.058 +175 S 0.052 +176 D 0.045 +177 E 0.039 +178 V 0.038 +179 A 0.044 +180 D 0.048 +181 F 0.045 +182 V 0.037 +183 K 0.032 +184 S 0.030 +185 R 0.027 +186 P 0.023 +187 L 0.020 +188 V 0.020 +189 I 0.021 +190 V 0.023 +191 G 0.029 +192 F 0.038 +193 F 0.048 +194 Q 0.053 +195 D 0.057 +196 L 0.060 +197 E 0.062 +198 E 0.059 +199 E 0.052 +200 V 0.045 +201 A 0.039 +202 E 0.036 +203 L 0.035 +204 F 0.033 +205 Y 0.029 +206 D 0.027 +207 T 0.027 +208 I 0.029 +209 K 0.031 +210 D 0.034 +211 F 0.037 +212 P 0.037 +213 E 0.033 +214 L 0.029 +215 T 0.027 +216 F 0.028 +217 G 0.031 +218 A 0.038 +219 I 0.046 +220 Q 0.056 +221 I 0.068 +222 K 0.080 +223 N 0.085 +224 S 0.080 +225 F 0.070 +226 G 0.063 +227 R 0.060 +228 F 0.059 +229 H 0.057 +230 V 0.055 +231 I 0.052 +232 L 0.050 +233 D 0.045 +234 S 0.037 +235 V 0.028 +236 L 0.022 +237 V 0.020 +238 F 0.023 +239 K 0.029 +240 K 0.035 +241 G 0.039 +242 K 0.040 +243 I 0.040 +244 V 0.042 +245 K 0.049 +246 R 0.064 +247 Q 0.084 +248 E 0.107 +249 L 0.129 +250 I 0.152 +251 N 0.169 +252 D 0.174 +253 S 0.162 +254 T 0.136 +255 N 0.107 +256 K 0.081 +257 D 0.063 +258 H 0.054 +259 L 0.050 +260 N 0.048 +261 Q 0.047 +262 V 0.049 +263 I 0.053 +264 K 0.057 +265 Q 0.060 +266 Q 0.066 +267 L 0.075 +268 T 0.087 +269 G 0.097 +270 F 0.104 +271 V 0.106 +272 I 0.102 +273 E 0.095 +274 L 0.091 +275 N 0.089 +276 P 0.087 +277 E 0.084 +278 N 0.076 +279 K 0.067 +280 D 0.062 +281 L 0.061 +282 I 0.060 +283 Y 0.063 +284 E 0.071 +285 L 0.079 +286 N 0.079 +287 I 0.069 +288 L 0.054 +289 N 0.040 +290 H 0.031 +291 M 0.026 +292 L 0.028 +293 L 0.035 +294 F 0.045 +295 I 0.054 +296 S 0.059 +297 K 0.064 +298 S 0.066 +299 S 0.063 +300 E 0.059 +301 P 0.058 +302 Y 0.059 +303 S 0.058 +304 T 0.056 +305 I 0.054 +306 S 0.051 +307 R 0.046 +308 H 0.041 +309 Y 0.036 +310 R 0.033 +311 Q 0.031 +312 I 0.031 +313 A 0.032 +314 K 0.031 +315 E 0.030 +316 F 0.033 +317 Q 0.039 +318 N 0.045 +319 K 0.049 +320 I 0.048 +321 L 0.044 +322 F 0.041 +323 V 0.043 +324 L 0.053 +325 V 0.065 +326 N 0.075 +327 A 0.078 +328 D 0.080 +329 E 0.083 +330 P 0.084 +331 K 0.076 +332 N 0.061 +333 K 0.048 +334 R 0.039 +335 I 0.035 +336 F 0.035 +337 E 0.038 +338 Y 0.043 +339 F 0.050 +340 Q 0.059 +341 I 0.064 +342 S 0.065 +343 R 0.063 +344 V 0.060 +345 N 0.053 +346 V 0.043 +347 P 0.035 +348 S 0.030 +349 V 0.028 +350 Q 0.030 +351 I 0.037 +352 L 0.050 +353 N 0.067 +354 L 0.084 +355 S 0.098 +356 S 0.111 +357 D 0.119 +358 G 0.115 +359 R 0.098 +360 Y 0.078 +361 K 0.068 +362 M 0.068 +363 P 0.074 +364 T 0.080 +365 D 0.084 +366 D 0.081 +367 I 0.075 +368 N 0.068 +369 F 0.062 +370 E 0.056 +371 S 0.052 +372 L 0.049 +373 K 0.047 +374 K 0.047 +375 F 0.048 +376 C 0.051 +377 N 0.054 +378 S 0.059 +379 F 0.066 +380 L 0.077 +381 S 0.093 +382 K 0.119 +383 T 0.151 +384 A 0.188 +385 K 0.226 +386 K 0.265 +387 H 0.302 +388 K 0.338 +389 A 0.367 +390 S 0.378 +391 E 0.361 +392 E 0.322 +393 I 0.278 +394 P 0.242 +395 K 0.213 +396 Y 0.193 +397 W 0.180 +398 D 0.173 +399 Q 0.169 +400 G 0.164 +401 P 0.159 +402 V 0.153 +403 K 0.148 +404 K 0.144 +405 L 0.139 +406 V 0.135 +407 G 0.130 +408 K 0.118 +409 N 0.099 +410 F 0.078 +411 N 0.065 +412 V 0.063 +413 V 0.065 +414 V 0.072 +415 L 0.081 +416 D 0.091 +417 K 0.098 +418 E 0.099 +419 K 0.095 +420 D 0.087 +421 V 0.076 +422 F 0.063 +423 V 0.053 +424 M 0.048 +425 F 0.048 +426 Y 0.052 +427 A 0.057 +428 P 0.062 +429 W 0.065 +430 S 0.065 +431 E 0.065 +432 K 0.067 +433 C 0.070 +434 R 0.075 +435 V 0.080 +436 L 0.084 +437 L 0.082 +438 P 0.074 +439 L 0.063 +440 L 0.055 +441 E 0.050 +442 E 0.047 +443 L 0.048 +444 G 0.053 +445 I 0.058 +446 K 0.058 +447 Y 0.057 +448 Q 0.059 +449 N 0.063 +450 H 0.064 +451 S 0.061 +452 T 0.057 +453 V 0.055 +454 I 0.058 +455 I 0.063 +456 A 0.069 +457 K 0.076 +458 I 0.083 +459 D 0.087 +460 I 0.087 +461 T 0.086 +462 A 0.084 +463 N 0.084 +464 D 0.087 +465 I 0.092 +466 Q 0.103 +467 L 0.124 +468 A 0.153 +469 N 0.179 +470 P 0.187 +471 E 0.170 +472 Q 0.140 +473 Y 0.111 +474 P 0.087 +475 F 0.069 +476 F 0.061 +477 R 0.066 +478 L 0.085 +479 F 0.111 +480 P 0.130 +481 T 0.133 +482 D 0.128 +483 S 0.125 +484 Q 0.120 +485 E 0.114 +486 A 0.110 +487 V 0.110 +488 M 0.111 +489 Y 0.113 +490 K 0.114 +491 G 0.113 +492 E 0.105 +493 H 0.093 +494 T 0.084 +495 M 0.081 +496 K 0.082 +497 G 0.080 +498 F 0.073 +499 C 0.067 +500 D 0.065 +501 F 0.064 +502 L 0.064 +503 E 0.066 +504 S 0.071 +505 H 0.076 +506 V 0.085 +507 K 0.106 +508 V 0.144 +509 R 0.193 +510 I 0.245 +511 E 0.299 +512 E 0.349 +513 E 0.377 +514 D 0.381 +515 E 0.378 +516 L 0.384 +517 L 0.397 +518 Y 0.416 +519 I 0.444 +520 E 0.472 +521 Q 0.495 +522 N 0.514 +523 E 0.536 +524 E 0.563 +525 E 0.591 +526 E 0.611 +527 V 0.612 +528 L 0.598 +529 A 0.585 +530 E 0.583 +531 P 0.581 +532 E 0.557 +533 I 0.515 +534 Q 0.495 +535 L 0.519 +536 I 0.557 +537 E 0.576 +538 K 0.574 +539 L 0.570 +540 P 0.580 +541 E 0.603 +542 N 0.626 +543 P 0.641 +544 L 0.658 +545 L 0.687 +546 K 0.717 +547 I 0.738 +548 E 0.750 +549 D 0.754 +550 T 0.746 +551 S 0.733 +552 K 0.724 +553 Q 0.720 +554 D 0.718 +555 R 0.720 +556 P 0.729 +557 V 0.739 +558 K 0.738 +559 E 0.726 +560 S 0.716 +561 P 0.716 +562 V 0.723 +563 L 0.728 +564 D 0.723 +565 S 0.707 +566 I 0.686 +567 R 0.675 +568 K 0.677 +569 P 0.683 +570 E 0.684 +571 E 0.683 +572 P 0.682 +573 E 0.672 +574 R 0.634 +575 R 0.571 +576 K 0.525 +577 E 0.517 +578 T 0.514 +579 A 0.493 +580 E 0.486 +581 R 0.521 +582 E 0.574 +583 A 0.612 +584 A 0.630 +585 A 0.629 +586 A 0.620 +587 Q 0.621 +588 P 0.636 +589 K 0.649 +590 E 0.649 +591 Q 0.640 +592 P 0.637 +593 K 0.648 +594 P 0.666 +595 E 0.679 +596 R 0.676 +597 K 0.656 +598 L 0.634 +599 E 0.621 +600 V 0.605 +601 K 0.565 +602 E 0.495 +603 E 0.413 +604 L 0.358 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030980.19_ENSMUST00000106550.12_GN:Knop1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030980.19_ENSMUST00000106550.12_GN:Knop1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..35c879c204afe160c0990aa51a69a0e2b2046b58 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030980.19_ENSMUST00000106550.12_GN:Knop1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,481 @@ +>ENSMUSG00000030980.19|ENSMUST00000106550.12|GN:Knop1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.525 +2 V 0.575 +3 S 0.643 +4 K 0.699 +5 T 0.737 +6 Q 0.765 +7 K 0.790 +8 A 0.807 +9 D 0.809 +10 L 0.801 +11 G 0.791 +12 P 0.787 +13 Q 0.787 +14 L 0.788 +15 P 0.793 +16 E 0.800 +17 K 0.803 +18 K 0.803 +19 K 0.802 +20 K 0.803 +21 K 0.806 +22 K 0.812 +23 K 0.823 +24 K 0.836 +25 K 0.849 +26 R 0.859 +27 V 0.866 +28 V 0.867 +29 A 0.862 +30 N 0.849 +31 V 0.830 +32 S 0.812 +33 E 0.804 +34 P 0.808 +35 E 0.820 +36 T 0.831 +37 Q 0.840 +38 Y 0.845 +39 S 0.846 +40 V 0.843 +41 L 0.835 +42 N 0.827 +43 S 0.820 +44 N 0.817 +45 D 0.819 +46 Y 0.827 +47 F 0.837 +48 I 0.840 +49 D 0.828 +50 A 0.804 +51 S 0.788 +52 P 0.796 +53 P 0.827 +54 R 0.859 +55 A 0.874 +56 T 0.871 +57 S 0.865 +58 P 0.867 +59 S 0.877 +60 N 0.890 +61 N 0.899 +62 V 0.902 +63 D 0.901 +64 E 0.894 +65 V 0.882 +66 Q 0.869 +67 I 0.862 +68 P 0.865 +69 E 0.871 +70 I 0.874 +71 S 0.871 +72 L 0.865 +73 S 0.860 +74 K 0.856 +75 R 0.851 +76 K 0.848 +77 K 0.848 +78 K 0.852 +79 K 0.855 +80 K 0.856 +81 S 0.856 +82 C 0.855 +83 S 0.856 +84 T 0.857 +85 H 0.860 +86 L 0.863 +87 E 0.864 +88 E 0.864 +89 C 0.863 +90 L 0.860 +91 G 0.854 +92 A 0.848 +93 E 0.844 +94 P 0.846 +95 T 0.851 +96 R 0.856 +97 A 0.853 +98 R 0.842 +99 Q 0.825 +100 K 0.802 +101 K 0.772 +102 S 0.738 +103 P 0.715 +104 S 0.711 +105 P 0.717 +106 R 0.726 +107 R 0.734 +108 Q 0.743 +109 A 0.751 +110 L 0.751 +111 E 0.741 +112 Q 0.728 +113 S 0.718 +114 A 0.711 +115 E 0.703 +116 G 0.692 +117 L 0.671 +118 I 0.641 +119 R 0.611 +120 E 0.597 +121 K 0.605 +122 K 0.631 +123 K 0.666 +124 K 0.698 +125 R 0.722 +126 R 0.737 +127 K 0.750 +128 S 0.762 +129 L 0.770 +130 S 0.775 +131 K 0.776 +132 A 0.776 +133 A 0.772 +134 S 0.772 +135 Q 0.780 +136 G 0.795 +137 S 0.811 +138 G 0.821 +139 L 0.823 +140 K 0.817 +141 T 0.801 +142 S 0.779 +143 P 0.761 +144 D 0.754 +145 P 0.756 +146 K 0.751 +147 H 0.719 +148 A 0.666 +149 K 0.641 +150 E 0.678 +151 V 0.743 +152 S 0.787 +153 K 0.803 +154 A 0.811 +155 G 0.818 +156 R 0.825 +157 K 0.829 +158 S 0.830 +159 K 0.830 +160 K 0.832 +161 Q 0.835 +162 R 0.837 +163 K 0.837 +164 E 0.834 +165 K 0.830 +166 K 0.829 +167 V 0.831 +168 P 0.838 +169 D 0.847 +170 T 0.850 +171 E 0.842 +172 A 0.825 +173 L 0.806 +174 P 0.795 +175 P 0.795 +176 Q 0.796 +177 D 0.791 +178 A 0.784 +179 W 0.785 +180 L 0.797 +181 Y 0.812 +182 E 0.825 +183 A 0.833 +184 G 0.835 +185 D 0.835 +186 S 0.833 +187 L 0.829 +188 H 0.826 +189 S 0.829 +190 C 0.835 +191 L 0.843 +192 E 0.850 +193 G 0.855 +194 A 0.855 +195 E 0.847 +196 A 0.834 +197 E 0.818 +198 E 0.795 +199 Q 0.771 +200 A 0.759 +201 A 0.765 +202 L 0.781 +203 G 0.795 +204 Q 0.804 +205 K 0.808 +206 R 0.809 +207 K 0.806 +208 Q 0.796 +209 G 0.782 +210 S 0.774 +211 P 0.774 +212 R 0.783 +213 D 0.793 +214 H 0.798 +215 N 0.800 +216 M 0.801 +217 K 0.805 +218 K 0.811 +219 K 0.819 +220 K 0.825 +221 K 0.828 +222 K 0.829 +223 T 0.828 +224 H 0.831 +225 Q 0.837 +226 E 0.846 +227 G 0.855 +228 D 0.863 +229 I 0.868 +230 L 0.872 +231 L 0.872 +232 V 0.871 +233 N 0.870 +234 S 0.872 +235 R 0.875 +236 V 0.878 +237 S 0.877 +238 V 0.871 +239 E 0.861 +240 N 0.849 +241 S 0.837 +242 L 0.826 +243 K 0.819 +244 K 0.821 +245 G 0.830 +246 S 0.842 +247 K 0.851 +248 K 0.858 +249 S 0.860 +250 V 0.858 +251 K 0.853 +252 S 0.848 +253 E 0.845 +254 A 0.842 +255 L 0.836 +256 E 0.828 +257 F 0.823 +258 V 0.822 +259 P 0.825 +260 I 0.828 +261 D 0.824 +262 S 0.815 +263 P 0.807 +264 K 0.807 +265 A 0.814 +266 P 0.827 +267 G 0.844 +268 K 0.859 +269 K 0.870 +270 K 0.874 +271 V 0.876 +272 K 0.876 +273 S 0.876 +274 K 0.877 +275 K 0.878 +276 K 0.875 +277 V 0.867 +278 E 0.854 +279 Q 0.845 +280 P 0.845 +281 V 0.851 +282 G 0.858 +283 E 0.863 +284 G 0.865 +285 L 0.866 +286 A 0.864 +287 V 0.859 +288 K 0.851 +289 R 0.843 +290 K 0.835 +291 K 0.815 +292 K 0.766 +293 K 0.698 +294 K 0.664 +295 K 0.698 +296 K 0.762 +297 R 0.808 +298 K 0.827 +299 E 0.836 +300 N 0.841 +301 G 0.840 +302 V 0.831 +303 K 0.816 +304 E 0.799 +305 D 0.787 +306 P 0.785 +307 W 0.796 +308 Q 0.815 +309 E 0.835 +310 E 0.849 +311 K 0.857 +312 E 0.863 +313 E 0.867 +314 S 0.869 +315 D 0.869 +316 T 0.871 +317 D 0.873 +318 L 0.874 +319 E 0.875 +320 V 0.875 +321 V 0.871 +322 L 0.865 +323 E 0.858 +324 K 0.853 +325 K 0.851 +326 G 0.849 +327 N 0.844 +328 M 0.830 +329 D 0.805 +330 E 0.772 +331 T 0.742 +332 C 0.710 +333 I 0.660 +334 D 0.592 +335 Q 0.530 +336 V 0.485 +337 R 0.446 +338 R 0.409 +339 K 0.402 +340 A 0.436 +341 L 0.470 +342 Q 0.471 +343 E 0.463 +344 E 0.477 +345 I 0.506 +346 D 0.534 +347 R 0.574 +348 E 0.632 +349 S 0.691 +350 G 0.736 +351 K 0.768 +352 T 0.790 +353 E 0.799 +354 A 0.792 +355 S 0.780 +356 E 0.776 +357 P 0.786 +358 K 0.804 +359 K 0.821 +360 W 0.834 +361 T 0.846 +362 V 0.857 +363 G 0.862 +364 L 0.861 +365 S 0.857 +366 V 0.852 +367 K 0.847 +368 T 0.839 +369 E 0.823 +370 A 0.796 +371 S 0.764 +372 E 0.742 +373 P 0.735 +374 K 0.734 +375 K 0.728 +376 W 0.718 +377 T 0.708 +378 G 0.691 +379 T 0.643 +380 Q 0.558 +381 F 0.456 +382 G 0.369 +383 Q 0.311 +384 W 0.281 +385 D 0.281 +386 T 0.310 +387 A 0.353 +388 G 0.370 +389 F 0.337 +390 E 0.272 +391 N 0.214 +392 E 0.180 +393 E 0.167 +394 Q 0.159 +395 K 0.154 +396 L 0.165 +397 K 0.193 +398 F 0.216 +399 L 0.229 +400 K 0.252 +401 L 0.292 +402 M 0.327 +403 G 0.337 +404 G 0.343 +405 F 0.367 +406 K 0.412 +407 H 0.467 +408 L 0.523 +409 S 0.573 +410 P 0.608 +411 S 0.625 +412 F 0.629 +413 S 0.633 +414 R 0.649 +415 P 0.678 +416 P 0.711 +417 S 0.734 +418 M 0.738 +419 T 0.722 +420 I 0.693 +421 R 0.661 +422 S 0.633 +423 N 0.605 +424 M 0.568 +425 A 0.521 +426 L 0.470 +427 D 0.417 +428 K 0.369 +429 K 0.336 +430 S 0.327 +431 S 0.351 +432 E 0.390 +433 M 0.411 +434 L 0.400 +435 Q 0.376 +436 Q 0.370 +437 S 0.387 +438 L 0.408 +439 Q 0.409 +440 Q 0.385 +441 D 0.351 +442 Y 0.326 +443 D 0.307 +444 R 0.285 +445 A 0.264 +446 M 0.255 +447 S 0.256 +448 W 0.258 +449 K 0.265 +450 Y 0.294 +451 S 0.360 +452 H 0.462 +453 G 0.572 +454 A 0.662 +455 G 0.716 +456 L 0.735 +457 G 0.721 +458 F 0.687 +459 N 0.646 +460 S 0.608 +461 E 0.572 +462 A 0.533 +463 R 0.502 +464 K 0.503 +465 V 0.550 +466 F 0.620 +467 Y 0.679 +468 I 0.708 +469 D 0.712 +470 R 0.705 +471 N 0.700 +472 A 0.705 +473 S 0.720 +474 K 0.739 +475 S 0.752 +476 I 0.754 +477 K 0.743 +478 L 0.711 +479 Q 0.658 +480 D 0.611 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030980.19_ENSMUST00000106550.12_GN:Knop1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:52.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030980.19_ENSMUST00000106550.12_GN:Knop1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:52.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ded3d5c082adfde4a9c227e693b4bf2aed6144a7 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030980.19_ENSMUST00000106550.12_GN:Knop1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:52.caid @@ -0,0 +1,533 @@ +>ENSMUSG00000030980.19|ENSMUST00000106550.12|GN:Knop1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:52 +1 M 0.528 +2 D 0.578 +3 A 0.629 +4 V 0.637 +5 S 0.608 +6 T 0.597 +7 A 0.642 +8 T 0.713 +9 Q 0.763 +10 G 0.781 +11 T 0.779 +12 G 0.763 +13 R 0.745 +14 P 0.738 +15 R 0.748 +16 P 0.765 +17 G 0.779 +18 R 0.786 +19 R 0.788 +20 R 0.789 +21 I 0.790 +22 S 0.792 +23 R 0.795 +24 G 0.798 +25 R 0.802 +26 A 0.807 +27 R 0.813 +28 K 0.820 +29 S 0.827 +30 K 0.832 +31 L 0.834 +32 T 0.835 +33 S 0.838 +34 G 0.843 +35 S 0.847 +36 R 0.850 +37 L 0.853 +38 R 0.857 +39 G 0.860 +40 C 0.860 +41 S 0.857 +42 R 0.854 +43 G 0.849 +44 D 0.839 +45 A 0.825 +46 W 0.814 +47 P 0.813 +48 A 0.820 +49 S 0.827 +50 E 0.837 +51 P 0.850 +52 V 0.861 +53 M 0.866 +54 V 0.868 +55 S 0.869 +56 K 0.871 +57 T 0.873 +58 Q 0.876 +59 K 0.876 +60 A 0.873 +61 D 0.864 +62 L 0.851 +63 G 0.838 +64 P 0.831 +65 Q 0.829 +66 L 0.831 +67 P 0.839 +68 E 0.851 +69 K 0.861 +70 K 0.864 +71 K 0.864 +72 K 0.863 +73 K 0.863 +74 K 0.863 +75 K 0.866 +76 K 0.872 +77 K 0.880 +78 R 0.888 +79 V 0.893 +80 V 0.894 +81 A 0.890 +82 N 0.877 +83 V 0.859 +84 S 0.841 +85 E 0.830 +86 P 0.830 +87 E 0.835 +88 T 0.843 +89 Q 0.849 +90 Y 0.851 +91 S 0.849 +92 V 0.843 +93 L 0.834 +94 N 0.826 +95 S 0.821 +96 N 0.821 +97 D 0.825 +98 Y 0.832 +99 F 0.842 +100 I 0.845 +101 D 0.833 +102 A 0.809 +103 S 0.789 +104 P 0.792 +105 P 0.817 +106 R 0.845 +107 A 0.856 +108 T 0.852 +109 S 0.842 +110 P 0.840 +111 S 0.848 +112 N 0.860 +113 N 0.868 +114 V 0.870 +115 D 0.867 +116 E 0.859 +117 V 0.845 +118 Q 0.830 +119 I 0.821 +120 P 0.823 +121 E 0.829 +122 I 0.830 +123 S 0.826 +124 L 0.820 +125 S 0.816 +126 K 0.814 +127 R 0.812 +128 K 0.813 +129 K 0.816 +130 K 0.820 +131 K 0.824 +132 K 0.826 +133 S 0.827 +134 C 0.826 +135 S 0.827 +136 T 0.832 +137 H 0.837 +138 L 0.842 +139 E 0.845 +140 E 0.847 +141 C 0.849 +142 L 0.848 +143 G 0.844 +144 A 0.838 +145 E 0.834 +146 P 0.834 +147 T 0.840 +148 R 0.845 +149 A 0.844 +150 R 0.835 +151 Q 0.820 +152 K 0.802 +153 K 0.777 +154 S 0.749 +155 P 0.728 +156 S 0.720 +157 P 0.723 +158 R 0.731 +159 R 0.743 +160 Q 0.757 +161 A 0.765 +162 L 0.763 +163 E 0.754 +164 Q 0.744 +165 S 0.732 +166 A 0.718 +167 E 0.704 +168 G 0.691 +169 L 0.669 +170 I 0.635 +171 R 0.603 +172 E 0.586 +173 K 0.588 +174 K 0.608 +175 K 0.640 +176 K 0.675 +177 R 0.705 +178 R 0.728 +179 K 0.746 +180 S 0.762 +181 L 0.772 +182 S 0.777 +183 K 0.780 +184 A 0.782 +185 A 0.781 +186 S 0.781 +187 Q 0.787 +188 G 0.799 +189 S 0.813 +190 G 0.821 +191 L 0.823 +192 K 0.817 +193 T 0.801 +194 S 0.779 +195 P 0.759 +196 D 0.752 +197 P 0.753 +198 K 0.748 +199 H 0.718 +200 A 0.667 +201 K 0.644 +202 E 0.682 +203 V 0.747 +204 S 0.789 +205 K 0.804 +206 A 0.808 +207 G 0.812 +208 R 0.816 +209 K 0.818 +210 S 0.817 +211 K 0.816 +212 K 0.818 +213 Q 0.821 +214 R 0.823 +215 K 0.823 +216 E 0.821 +217 K 0.819 +218 K 0.819 +219 V 0.821 +220 P 0.827 +221 D 0.834 +222 T 0.835 +223 E 0.827 +224 A 0.811 +225 L 0.793 +226 P 0.781 +227 P 0.779 +228 Q 0.778 +229 D 0.771 +230 A 0.760 +231 W 0.759 +232 L 0.771 +233 Y 0.789 +234 E 0.805 +235 A 0.813 +236 G 0.816 +237 D 0.815 +238 S 0.814 +239 L 0.809 +240 H 0.806 +241 S 0.807 +242 C 0.812 +243 L 0.819 +244 E 0.827 +245 G 0.835 +246 A 0.835 +247 E 0.827 +248 A 0.814 +249 E 0.795 +250 E 0.767 +251 Q 0.737 +252 A 0.719 +253 A 0.722 +254 L 0.739 +255 G 0.759 +256 Q 0.773 +257 K 0.779 +258 R 0.780 +259 K 0.776 +260 Q 0.765 +261 G 0.752 +262 S 0.744 +263 P 0.747 +264 R 0.757 +265 D 0.767 +266 H 0.772 +267 N 0.772 +268 M 0.774 +269 K 0.780 +270 K 0.789 +271 K 0.797 +272 K 0.803 +273 K 0.806 +274 K 0.807 +275 T 0.806 +276 H 0.808 +277 Q 0.816 +278 E 0.827 +279 G 0.838 +280 D 0.846 +281 I 0.851 +282 L 0.852 +283 L 0.852 +284 V 0.851 +285 N 0.851 +286 S 0.853 +287 R 0.858 +288 V 0.863 +289 S 0.864 +290 V 0.861 +291 E 0.854 +292 N 0.845 +293 S 0.833 +294 L 0.821 +295 K 0.813 +296 K 0.814 +297 G 0.822 +298 S 0.831 +299 K 0.840 +300 K 0.847 +301 S 0.851 +302 V 0.850 +303 K 0.845 +304 S 0.840 +305 E 0.834 +306 A 0.829 +307 L 0.823 +308 E 0.818 +309 F 0.816 +310 V 0.816 +311 P 0.820 +312 I 0.823 +313 D 0.820 +314 S 0.812 +315 P 0.806 +316 K 0.807 +317 A 0.815 +318 P 0.828 +319 G 0.844 +320 K 0.860 +321 K 0.871 +322 K 0.876 +323 V 0.877 +324 K 0.878 +325 S 0.879 +326 K 0.879 +327 K 0.880 +328 K 0.879 +329 V 0.872 +330 E 0.861 +331 Q 0.853 +332 P 0.852 +333 V 0.857 +334 G 0.863 +335 E 0.866 +336 G 0.866 +337 L 0.864 +338 A 0.857 +339 V 0.835 +340 K 0.783 +341 R 0.713 +342 K 0.672 +343 K 0.683 +344 K 0.697 +345 K 0.674 +346 K 0.658 +347 K 0.697 +348 K 0.764 +349 R 0.810 +350 K 0.830 +351 E 0.838 +352 N 0.842 +353 G 0.839 +354 V 0.828 +355 K 0.812 +356 E 0.795 +357 D 0.780 +358 P 0.773 +359 W 0.779 +360 Q 0.798 +361 E 0.819 +362 E 0.835 +363 K 0.845 +364 E 0.852 +365 E 0.856 +366 S 0.857 +367 D 0.857 +368 T 0.859 +369 D 0.861 +370 L 0.864 +371 E 0.867 +372 V 0.868 +373 V 0.865 +374 L 0.859 +375 E 0.851 +376 K 0.845 +377 K 0.841 +378 G 0.838 +379 N 0.832 +380 M 0.816 +381 D 0.784 +382 E 0.743 +383 T 0.701 +384 C 0.658 +385 I 0.600 +386 D 0.529 +387 Q 0.468 +388 V 0.426 +389 R 0.386 +390 R 0.347 +391 K 0.336 +392 A 0.366 +393 L 0.405 +394 Q 0.418 +395 E 0.415 +396 E 0.428 +397 I 0.454 +398 D 0.486 +399 R 0.532 +400 E 0.597 +401 S 0.661 +402 G 0.708 +403 K 0.740 +404 T 0.760 +405 E 0.767 +406 A 0.758 +407 S 0.747 +408 E 0.747 +409 P 0.762 +410 K 0.784 +411 K 0.802 +412 W 0.816 +413 T 0.829 +414 V 0.841 +415 G 0.846 +416 L 0.844 +417 S 0.838 +418 V 0.831 +419 K 0.825 +420 T 0.816 +421 E 0.800 +422 A 0.773 +423 S 0.742 +424 E 0.722 +425 P 0.717 +426 K 0.719 +427 K 0.718 +428 W 0.713 +429 T 0.707 +430 G 0.689 +431 T 0.639 +432 Q 0.556 +433 F 0.462 +434 G 0.383 +435 Q 0.327 +436 W 0.296 +437 D 0.294 +438 T 0.323 +439 A 0.365 +440 G 0.382 +441 F 0.349 +442 E 0.283 +443 N 0.222 +444 E 0.186 +445 E 0.170 +446 Q 0.160 +447 K 0.155 +448 L 0.168 +449 K 0.196 +450 F 0.222 +451 L 0.242 +452 K 0.272 +453 L 0.317 +454 M 0.354 +455 G 0.369 +456 G 0.379 +457 F 0.407 +458 K 0.452 +459 H 0.501 +460 L 0.548 +461 S 0.589 +462 P 0.619 +463 S 0.634 +464 F 0.638 +465 S 0.640 +466 R 0.653 +467 P 0.682 +468 P 0.718 +469 S 0.745 +470 M 0.753 +471 T 0.741 +472 I 0.714 +473 R 0.684 +474 S 0.660 +475 N 0.638 +476 M 0.606 +477 A 0.562 +478 L 0.513 +479 D 0.461 +480 K 0.409 +481 K 0.366 +482 S 0.348 +483 S 0.367 +484 E 0.404 +485 M 0.424 +486 L 0.409 +487 Q 0.377 +488 Q 0.361 +489 S 0.376 +490 L 0.403 +491 Q 0.413 +492 Q 0.390 +493 D 0.354 +494 Y 0.332 +495 D 0.324 +496 R 0.310 +497 A 0.291 +498 M 0.281 +499 S 0.279 +500 W 0.278 +501 K 0.281 +502 Y 0.306 +503 S 0.367 +504 H 0.464 +505 G 0.569 +506 A 0.653 +507 G 0.703 +508 L 0.717 +509 G 0.699 +510 F 0.660 +511 N 0.612 +512 S 0.560 +513 E 0.513 +514 A 0.476 +515 R 0.457 +516 K 0.472 +517 V 0.527 +518 F 0.602 +519 Y 0.666 +520 I 0.696 +521 D 0.690 +522 R 0.668 +523 N 0.654 +524 A 0.667 +525 S 0.699 +526 K 0.727 +527 S 0.738 +528 I 0.735 +529 K 0.728 +530 L 0.723 +531 Q 0.712 +532 D 0.698 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030986.14_ENSMUST00000033290.12_GN:Dhx32_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030986.14_ENSMUST00000033290.12_GN:Dhx32_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..37370e303bd03c72e18afc3956b8da52a5aeecb6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030986.14_ENSMUST00000033290.12_GN:Dhx32_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,745 @@ +>ENSMUSG00000030986.14|ENSMUST00000033290.12|GN:Dhx32|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.370 +2 D 0.363 +3 E 0.370 +4 E 0.402 +5 E 0.437 +6 L 0.458 +7 D 0.473 +8 H 0.493 +9 P 0.509 +10 N 0.513 +11 A 0.504 +12 S 0.488 +13 P 0.469 +14 E 0.453 +15 K 0.438 +16 R 0.419 +17 Y 0.398 +18 F 0.380 +19 P 0.374 +20 E 0.403 +21 S 0.466 +22 L 0.535 +23 D 0.583 +24 S 0.610 +25 S 0.623 +26 D 0.627 +27 G 0.623 +28 D 0.613 +29 E 0.597 +30 E 0.575 +31 G 0.541 +32 V 0.498 +33 L 0.456 +34 A 0.425 +35 C 0.401 +36 E 0.368 +37 D 0.325 +38 L 0.279 +39 E 0.241 +40 L 0.212 +41 N 0.190 +42 P 0.170 +43 F 0.163 +44 D 0.176 +45 G 0.203 +46 L 0.223 +47 P 0.221 +48 Y 0.193 +49 S 0.154 +50 S 0.121 +51 R 0.103 +52 Y 0.096 +53 Y 0.095 +54 K 0.099 +55 L 0.103 +56 L 0.106 +57 K 0.106 +58 E 0.102 +59 R 0.093 +60 E 0.083 +61 E 0.078 +62 L 0.075 +63 P 0.070 +64 I 0.062 +65 W 0.056 +66 K 0.050 +67 E 0.042 +68 K 0.033 +69 Y 0.027 +70 S 0.026 +71 F 0.035 +72 M 0.050 +73 E 0.060 +74 S 0.057 +75 L 0.047 +76 L 0.042 +77 Q 0.042 +78 N 0.046 +79 Q 0.052 +80 V 0.062 +81 V 0.075 +82 V 0.086 +83 V 0.092 +84 S 0.094 +85 G 0.097 +86 D 0.107 +87 S 0.118 +88 K 0.122 +89 C 0.119 +90 G 0.114 +91 K 0.111 +92 S 0.107 +93 S 0.099 +94 Q 0.088 +95 V 0.076 +96 P 0.063 +97 Q 0.051 +98 W 0.042 +99 C 0.037 +100 A 0.035 +101 E 0.033 +102 Y 0.034 +103 C 0.037 +104 L 0.042 +105 S 0.045 +106 I 0.048 +107 H 0.053 +108 Y 0.061 +109 Q 0.071 +110 H 0.075 +111 G 0.071 +112 G 0.064 +113 V 0.058 +114 I 0.059 +115 C 0.066 +116 T 0.079 +117 Q 0.089 +118 A 0.085 +119 H 0.070 +120 K 0.055 +121 Q 0.045 +122 T 0.039 +123 A 0.037 +124 V 0.039 +125 Q 0.045 +126 L 0.052 +127 A 0.057 +128 L 0.063 +129 R 0.070 +130 V 0.075 +131 A 0.076 +132 D 0.074 +133 E 0.070 +134 M 0.067 +135 D 0.066 +136 V 0.068 +137 N 0.068 +138 I 0.066 +139 G 0.060 +140 H 0.057 +141 E 0.056 +142 V 0.057 +143 G 0.055 +144 Y 0.051 +145 V 0.050 +146 I 0.050 +147 P 0.052 +148 F 0.057 +149 E 0.067 +150 N 0.075 +151 C 0.078 +152 C 0.077 +153 T 0.075 +154 T 0.074 +155 E 0.074 +156 T 0.072 +157 I 0.071 +158 L 0.073 +159 R 0.075 +160 Y 0.074 +161 C 0.070 +162 T 0.064 +163 D 0.056 +164 D 0.049 +165 M 0.045 +166 L 0.042 +167 Q 0.038 +168 R 0.034 +169 E 0.032 +170 M 0.031 +171 M 0.029 +172 S 0.027 +173 N 0.025 +174 P 0.024 +175 F 0.024 +176 L 0.026 +177 G 0.029 +178 S 0.031 +179 Y 0.033 +180 G 0.034 +181 V 0.036 +182 I 0.040 +183 I 0.041 +184 L 0.040 +185 D 0.037 +186 D 0.034 +187 V 0.031 +188 H 0.029 +189 E 0.028 +190 R 0.031 +191 S 0.036 +192 L 0.042 +193 A 0.047 +194 T 0.048 +195 D 0.047 +196 V 0.044 +197 L 0.041 +198 L 0.036 +199 G 0.032 +200 L 0.029 +201 L 0.025 +202 K 0.023 +203 D 0.023 +204 V 0.025 +205 L 0.028 +206 L 0.031 +207 A 0.034 +208 R 0.035 +209 P 0.034 +210 E 0.031 +211 L 0.028 +212 K 0.030 +213 L 0.036 +214 I 0.044 +215 V 0.050 +216 N 0.054 +217 C 0.060 +218 S 0.065 +219 P 0.066 +220 L 0.064 +221 L 0.061 +222 T 0.057 +223 S 0.054 +224 K 0.053 +225 L 0.054 +226 S 0.057 +227 S 0.060 +228 Y 0.062 +229 Y 0.069 +230 G 0.081 +231 D 0.092 +232 V 0.092 +233 P 0.082 +234 V 0.075 +235 I 0.078 +236 E 0.088 +237 V 0.104 +238 R 0.130 +239 N 0.162 +240 K 0.186 +241 H 0.192 +242 P 0.179 +243 V 0.157 +244 E 0.135 +245 V 0.121 +246 V 0.117 +247 Y 0.122 +248 L 0.130 +249 S 0.139 +250 G 0.147 +251 A 0.151 +252 Q 0.145 +253 K 0.126 +254 D 0.101 +255 S 0.079 +256 F 0.063 +257 E 0.054 +258 S 0.049 +259 V 0.045 +260 I 0.042 +261 R 0.041 +262 L 0.041 +263 I 0.041 +264 F 0.041 +265 E 0.041 +266 I 0.045 +267 H 0.052 +268 R 0.060 +269 S 0.066 +270 G 0.066 +271 E 0.060 +272 K 0.054 +273 G 0.051 +274 D 0.052 +275 V 0.056 +276 V 0.060 +277 V 0.061 +278 F 0.058 +279 L 0.052 +280 A 0.047 +281 C 0.050 +282 E 0.061 +283 Q 0.069 +284 D 0.063 +285 I 0.049 +286 E 0.038 +287 K 0.038 +288 T 0.049 +289 Y 0.062 +290 E 0.067 +291 L 0.061 +292 V 0.056 +293 C 0.062 +294 Q 0.072 +295 E 0.081 +296 G 0.089 +297 S 0.099 +298 N 0.107 +299 L 0.109 +300 N 0.108 +301 P 0.106 +302 D 0.109 +303 V 0.113 +304 G 0.108 +305 D 0.093 +306 L 0.073 +307 V 0.059 +308 V 0.053 +309 I 0.049 +310 P 0.044 +311 L 0.041 +312 Y 0.044 +313 P 0.058 +314 K 0.081 +315 E 0.104 +316 K 0.125 +317 C 0.148 +318 S 0.176 +319 L 0.202 +320 F 0.226 +321 R 0.260 +322 P 0.302 +323 V 0.333 +324 D 0.342 +325 E 0.340 +326 T 0.336 +327 E 0.327 +328 K 0.310 +329 R 0.290 +330 C 0.271 +331 Q 0.253 +332 V 0.234 +333 Y 0.208 +334 Q 0.174 +335 R 0.142 +336 R 0.124 +337 V 0.115 +338 V 0.105 +339 L 0.092 +340 T 0.078 +341 T 0.070 +342 S 0.074 +343 C 0.085 +344 G 0.093 +345 E 0.092 +346 S 0.083 +347 L 0.075 +348 I 0.068 +349 W 0.064 +350 S 0.064 +351 H 0.063 +352 T 0.058 +353 V 0.048 +354 K 0.038 +355 F 0.032 +356 V 0.035 +357 I 0.046 +358 D 0.062 +359 V 0.076 +360 G 0.085 +361 L 0.092 +362 E 0.099 +363 R 0.103 +364 R 0.103 +365 Q 0.098 +366 V 0.093 +367 Y 0.089 +368 N 0.088 +369 P 0.089 +370 R 0.092 +371 I 0.100 +372 R 0.111 +373 A 0.118 +374 N 0.121 +375 S 0.123 +376 L 0.131 +377 V 0.141 +378 L 0.149 +379 Q 0.150 +380 P 0.137 +381 I 0.112 +382 S 0.086 +383 Q 0.068 +384 S 0.057 +385 Q 0.052 +386 A 0.051 +387 E 0.051 +388 I 0.052 +389 R 0.056 +390 K 0.061 +391 Q 0.068 +392 L 0.083 +393 L 0.107 +394 G 0.134 +395 S 0.153 +396 S 0.166 +397 P 0.172 +398 S 0.176 +399 G 0.178 +400 K 0.176 +401 L 0.167 +402 F 0.149 +403 C 0.129 +404 L 0.111 +405 Y 0.098 +406 T 0.095 +407 E 0.102 +408 E 0.111 +409 F 0.117 +410 A 0.125 +411 S 0.134 +412 K 0.140 +413 D 0.136 +414 M 0.125 +415 R 0.120 +416 P 0.130 +417 L 0.154 +418 K 0.187 +419 P 0.219 +420 A 0.239 +421 E 0.241 +422 M 0.224 +423 Q 0.193 +424 E 0.160 +425 A 0.137 +426 N 0.123 +427 L 0.109 +428 T 0.091 +429 S 0.071 +430 M 0.056 +431 V 0.049 +432 L 0.047 +433 F 0.046 +434 M 0.046 +435 K 0.045 +436 R 0.045 +437 V 0.051 +438 D 0.063 +439 I 0.081 +440 A 0.103 +441 G 0.129 +442 L 0.154 +443 G 0.168 +444 R 0.165 +445 C 0.148 +446 D 0.123 +447 F 0.101 +448 M 0.089 +449 N 0.090 +450 R 0.099 +451 P 0.106 +452 A 0.105 +453 P 0.098 +454 E 0.090 +455 S 0.084 +456 L 0.078 +457 M 0.074 +458 Q 0.077 +459 A 0.084 +460 L 0.086 +461 E 0.084 +462 D 0.085 +463 L 0.086 +464 D 0.084 +465 Y 0.079 +466 L 0.076 +467 A 0.081 +468 A 0.091 +469 L 0.099 +470 D 0.103 +471 N 0.103 +472 D 0.105 +473 G 0.107 +474 N 0.102 +475 L 0.090 +476 S 0.072 +477 E 0.059 +478 F 0.056 +479 G 0.061 +480 I 0.068 +481 I 0.073 +482 M 0.076 +483 S 0.077 +484 E 0.077 +485 F 0.081 +486 P 0.089 +487 L 0.097 +488 D 0.097 +489 P 0.087 +490 Q 0.073 +491 L 0.067 +492 S 0.068 +493 K 0.069 +494 S 0.072 +495 I 0.078 +496 L 0.083 +497 A 0.080 +498 S 0.071 +499 C 0.065 +500 E 0.066 +501 F 0.070 +502 D 0.073 +503 C 0.071 +504 V 0.066 +505 D 0.068 +506 E 0.077 +507 M 0.089 +508 L 0.097 +509 T 0.107 +510 I 0.120 +511 A 0.126 +512 A 0.118 +513 M 0.103 +514 V 0.096 +515 T 0.100 +516 A 0.111 +517 P 0.123 +518 S 0.138 +519 C 0.152 +520 F 0.157 +521 L 0.157 +522 H 0.163 +523 V 0.178 +524 P 0.193 +525 H 0.196 +526 G 0.183 +527 A 0.156 +528 E 0.125 +529 E 0.103 +530 A 0.092 +531 A 0.085 +532 V 0.078 +533 T 0.074 +534 C 0.072 +535 W 0.067 +536 K 0.063 +537 T 0.063 +538 F 0.072 +539 L 0.089 +540 H 0.107 +541 P 0.120 +542 E 0.123 +543 G 0.120 +544 D 0.113 +545 H 0.104 +546 F 0.098 +547 T 0.094 +548 L 0.089 +549 I 0.081 +550 N 0.072 +551 V 0.065 +552 Y 0.058 +553 N 0.050 +554 A 0.043 +555 Y 0.042 +556 Q 0.047 +557 D 0.056 +558 T 0.065 +559 V 0.077 +560 L 0.094 +561 N 0.113 +562 S 0.125 +563 A 0.128 +564 N 0.126 +565 E 0.120 +566 H 0.109 +567 C 0.096 +568 V 0.088 +569 E 0.085 +570 M 0.084 +571 W 0.078 +572 C 0.073 +573 H 0.072 +574 D 0.075 +575 C 0.077 +576 F 0.075 +577 L 0.072 +578 S 0.069 +579 C 0.070 +580 S 0.078 +581 A 0.087 +582 L 0.092 +583 R 0.095 +584 M 0.101 +585 A 0.109 +586 D 0.114 +587 V 0.117 +588 I 0.116 +589 R 0.110 +590 A 0.101 +591 E 0.093 +592 L 0.091 +593 L 0.092 +594 E 0.090 +595 I 0.081 +596 I 0.067 +597 K 0.057 +598 R 0.056 +599 I 0.063 +600 E 0.075 +601 L 0.085 +602 P 0.091 +603 Y 0.098 +604 A 0.116 +605 E 0.147 +606 P 0.180 +607 A 0.207 +608 F 0.228 +609 G 0.235 +610 S 0.217 +611 K 0.178 +612 E 0.137 +613 N 0.108 +614 G 0.089 +615 L 0.076 +616 N 0.067 +617 I 0.066 +618 K 0.069 +619 K 0.074 +620 A 0.076 +621 L 0.071 +622 L 0.065 +623 S 0.063 +624 G 0.062 +625 Y 0.059 +626 F 0.055 +627 M 0.055 +628 Q 0.058 +629 I 0.059 +630 A 0.059 +631 R 0.064 +632 D 0.077 +633 V 0.097 +634 D 0.121 +635 G 0.142 +636 S 0.148 +637 G 0.132 +638 N 0.100 +639 Y 0.068 +640 L 0.050 +641 M 0.046 +642 L 0.050 +643 T 0.057 +644 H 0.064 +645 K 0.075 +646 Q 0.085 +647 V 0.087 +648 A 0.082 +649 Q 0.076 +650 L 0.076 +651 H 0.076 +652 P 0.073 +653 L 0.072 +654 S 0.081 +655 S 0.099 +656 Y 0.119 +657 S 0.132 +658 I 0.134 +659 T 0.127 +660 K 0.119 +661 K 0.117 +662 M 0.116 +663 P 0.113 +664 E 0.106 +665 W 0.101 +666 V 0.097 +667 L 0.091 +668 F 0.084 +669 H 0.083 +670 Q 0.088 +671 F 0.096 +672 S 0.100 +673 I 0.098 +674 S 0.095 +675 E 0.097 +676 N 0.103 +677 N 0.105 +678 Y 0.098 +679 I 0.086 +680 R 0.076 +681 V 0.072 +682 A 0.073 +683 S 0.078 +684 A 0.082 +685 V 0.084 +686 S 0.081 +687 P 0.076 +688 E 0.069 +689 L 0.062 +690 F 0.058 +691 M 0.058 +692 Q 0.064 +693 L 0.072 +694 V 0.078 +695 P 0.077 +696 Q 0.075 +697 Y 0.078 +698 Y 0.087 +699 F 0.099 +700 S 0.117 +701 N 0.138 +702 L 0.159 +703 P 0.173 +704 P 0.175 +705 S 0.165 +706 E 0.151 +707 S 0.146 +708 K 0.156 +709 D 0.173 +710 I 0.189 +711 L 0.203 +712 Q 0.220 +713 Q 0.244 +714 A 0.281 +715 A 0.330 +716 G 0.381 +717 H 0.434 +718 L 0.488 +719 P 0.540 +720 T 0.580 +721 E 0.600 +722 T 0.597 +723 V 0.581 +724 N 0.570 +725 K 0.571 +726 D 0.567 +727 Q 0.544 +728 D 0.504 +729 V 0.463 +730 C 0.433 +731 D 0.416 +732 K 0.420 +733 C 0.452 +734 P 0.503 +735 D 0.553 +736 A 0.585 +737 T 0.595 +738 E 0.590 +739 Q 0.570 +740 R 0.531 +741 C 0.481 +742 T 0.436 +743 I 0.406 +744 Q 0.394 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030986.14_ENSMUST00000033290.12_GN:Dhx32_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030986.14_ENSMUST00000033290.12_GN:Dhx32_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..8e1ba8ff6e713a0c8df958a94f922ba2cfedc595 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000030986.14_ENSMUST00000033290.12_GN:Dhx32_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid @@ -0,0 +1,752 @@ +>ENSMUSG00000030986.14|ENSMUST00000033290.12|GN:Dhx32|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:7 +1 M 0.312 +2 S 0.322 +3 S 0.338 +4 L 0.346 +5 R 0.329 +6 E 0.305 +7 E 0.314 +8 M 0.351 +9 D 0.377 +10 E 0.386 +11 E 0.403 +12 E 0.425 +13 L 0.438 +14 D 0.451 +15 H 0.479 +16 P 0.512 +17 N 0.532 +18 A 0.529 +19 S 0.510 +20 P 0.487 +21 E 0.468 +22 K 0.449 +23 R 0.429 +24 Y 0.413 +25 F 0.411 +26 P 0.432 +27 E 0.469 +28 S 0.511 +29 L 0.547 +30 D 0.579 +31 S 0.606 +32 S 0.625 +33 D 0.635 +34 G 0.637 +35 D 0.631 +36 E 0.616 +37 E 0.592 +38 G 0.558 +39 V 0.516 +40 L 0.478 +41 A 0.449 +42 C 0.422 +43 E 0.385 +44 D 0.337 +45 L 0.287 +46 E 0.245 +47 L 0.214 +48 N 0.191 +49 P 0.171 +50 F 0.165 +51 D 0.178 +52 G 0.205 +53 L 0.226 +54 P 0.223 +55 Y 0.194 +56 S 0.155 +57 S 0.123 +58 R 0.105 +59 Y 0.097 +60 Y 0.096 +61 K 0.100 +62 L 0.103 +63 L 0.105 +64 K 0.104 +65 E 0.100 +66 R 0.093 +67 E 0.083 +68 E 0.077 +69 L 0.074 +70 P 0.069 +71 I 0.061 +72 W 0.054 +73 K 0.049 +74 E 0.041 +75 K 0.032 +76 Y 0.026 +77 S 0.026 +78 F 0.035 +79 M 0.049 +80 E 0.059 +81 S 0.056 +82 L 0.047 +83 L 0.041 +84 Q 0.042 +85 N 0.046 +86 Q 0.052 +87 V 0.062 +88 V 0.075 +89 V 0.086 +90 V 0.092 +91 S 0.093 +92 G 0.096 +93 D 0.105 +94 S 0.116 +95 K 0.121 +96 C 0.118 +97 G 0.112 +98 K 0.109 +99 S 0.105 +100 S 0.098 +101 Q 0.087 +102 V 0.074 +103 P 0.062 +104 Q 0.050 +105 W 0.041 +106 C 0.036 +107 A 0.034 +108 E 0.033 +109 Y 0.033 +110 C 0.036 +111 L 0.041 +112 S 0.044 +113 I 0.047 +114 H 0.052 +115 Y 0.061 +116 Q 0.070 +117 H 0.075 +118 G 0.071 +119 G 0.063 +120 V 0.058 +121 I 0.059 +122 C 0.066 +123 T 0.079 +124 Q 0.089 +125 A 0.085 +126 H 0.070 +127 K 0.055 +128 Q 0.044 +129 T 0.039 +130 A 0.037 +131 V 0.039 +132 Q 0.045 +133 L 0.052 +134 A 0.057 +135 L 0.062 +136 R 0.069 +137 V 0.074 +138 A 0.076 +139 D 0.073 +140 E 0.070 +141 M 0.067 +142 D 0.066 +143 V 0.067 +144 N 0.068 +145 I 0.065 +146 G 0.060 +147 H 0.056 +148 E 0.056 +149 V 0.057 +150 G 0.054 +151 Y 0.050 +152 V 0.049 +153 I 0.049 +154 P 0.051 +155 F 0.057 +156 E 0.066 +157 N 0.074 +158 C 0.077 +159 C 0.076 +160 T 0.074 +161 T 0.073 +162 E 0.073 +163 T 0.071 +164 I 0.070 +165 L 0.072 +166 R 0.074 +167 Y 0.073 +168 C 0.069 +169 T 0.063 +170 D 0.055 +171 D 0.048 +172 M 0.044 +173 L 0.041 +174 Q 0.037 +175 R 0.034 +176 E 0.031 +177 M 0.030 +178 M 0.028 +179 S 0.027 +180 N 0.025 +181 P 0.023 +182 F 0.023 +183 L 0.025 +184 G 0.028 +185 S 0.030 +186 Y 0.032 +187 G 0.033 +188 V 0.036 +189 I 0.039 +190 I 0.040 +191 L 0.039 +192 D 0.036 +193 D 0.033 +194 V 0.030 +195 H 0.028 +196 E 0.027 +197 R 0.030 +198 S 0.035 +199 L 0.041 +200 A 0.046 +201 T 0.047 +202 D 0.046 +203 V 0.043 +204 L 0.039 +205 L 0.035 +206 G 0.031 +207 L 0.028 +208 L 0.024 +209 K 0.022 +210 D 0.022 +211 V 0.024 +212 L 0.027 +213 L 0.030 +214 A 0.033 +215 R 0.034 +216 P 0.033 +217 E 0.030 +218 L 0.027 +219 K 0.029 +220 L 0.036 +221 I 0.044 +222 V 0.049 +223 N 0.053 +224 C 0.058 +225 S 0.063 +226 P 0.065 +227 L 0.063 +228 L 0.059 +229 T 0.055 +230 S 0.053 +231 K 0.052 +232 L 0.053 +233 S 0.056 +234 S 0.059 +235 Y 0.061 +236 Y 0.067 +237 G 0.079 +238 D 0.090 +239 V 0.090 +240 P 0.081 +241 V 0.074 +242 I 0.077 +243 E 0.087 +244 V 0.103 +245 R 0.129 +246 N 0.161 +247 K 0.185 +248 H 0.191 +249 P 0.179 +250 V 0.157 +251 E 0.135 +252 V 0.120 +253 V 0.117 +254 Y 0.122 +255 L 0.130 +256 S 0.138 +257 G 0.146 +258 A 0.150 +259 Q 0.144 +260 K 0.126 +261 D 0.100 +262 S 0.078 +263 F 0.063 +264 E 0.054 +265 S 0.049 +266 V 0.045 +267 I 0.042 +268 R 0.040 +269 L 0.040 +270 I 0.041 +271 F 0.041 +272 E 0.041 +273 I 0.045 +274 H 0.052 +275 R 0.060 +276 S 0.066 +277 G 0.066 +278 E 0.060 +279 K 0.054 +280 G 0.051 +281 D 0.052 +282 V 0.056 +283 V 0.060 +284 V 0.062 +285 F 0.059 +286 L 0.052 +287 A 0.047 +288 C 0.049 +289 E 0.059 +290 Q 0.066 +291 D 0.061 +292 I 0.048 +293 E 0.038 +294 K 0.038 +295 T 0.049 +296 Y 0.062 +297 E 0.067 +298 L 0.061 +299 V 0.056 +300 C 0.061 +301 Q 0.072 +302 E 0.081 +303 G 0.089 +304 S 0.098 +305 N 0.106 +306 L 0.109 +307 N 0.108 +308 P 0.106 +309 D 0.109 +310 V 0.113 +311 G 0.108 +312 D 0.093 +313 L 0.073 +314 V 0.059 +315 V 0.052 +316 I 0.048 +317 P 0.043 +318 L 0.041 +319 Y 0.045 +320 P 0.059 +321 K 0.082 +322 E 0.106 +323 K 0.126 +324 C 0.149 +325 S 0.177 +326 L 0.203 +327 F 0.227 +328 R 0.262 +329 P 0.304 +330 V 0.334 +331 D 0.343 +332 E 0.341 +333 T 0.338 +334 E 0.328 +335 K 0.311 +336 R 0.291 +337 C 0.272 +338 Q 0.253 +339 V 0.234 +340 Y 0.208 +341 Q 0.175 +342 R 0.143 +343 R 0.125 +344 V 0.115 +345 V 0.105 +346 L 0.092 +347 T 0.078 +348 T 0.071 +349 S 0.074 +350 C 0.085 +351 G 0.093 +352 E 0.091 +353 S 0.083 +354 L 0.074 +355 I 0.067 +356 W 0.063 +357 S 0.063 +358 H 0.063 +359 T 0.058 +360 V 0.048 +361 K 0.038 +362 F 0.032 +363 V 0.035 +364 I 0.046 +365 D 0.062 +366 V 0.076 +367 G 0.085 +368 L 0.093 +369 E 0.099 +370 R 0.103 +371 R 0.103 +372 Q 0.099 +373 V 0.093 +374 Y 0.089 +375 N 0.088 +376 P 0.089 +377 R 0.092 +378 I 0.100 +379 R 0.110 +380 A 0.118 +381 N 0.120 +382 S 0.123 +383 L 0.130 +384 V 0.140 +385 L 0.149 +386 Q 0.149 +387 P 0.136 +388 I 0.112 +389 S 0.086 +390 Q 0.068 +391 S 0.057 +392 Q 0.052 +393 A 0.051 +394 E 0.051 +395 I 0.052 +396 R 0.056 +397 K 0.060 +398 Q 0.067 +399 L 0.082 +400 L 0.106 +401 G 0.133 +402 S 0.153 +403 S 0.165 +404 P 0.172 +405 S 0.176 +406 G 0.178 +407 K 0.177 +408 L 0.168 +409 F 0.150 +410 C 0.129 +411 L 0.110 +412 Y 0.096 +413 T 0.088 +414 E 0.089 +415 E 0.094 +416 F 0.104 +417 A 0.118 +418 S 0.132 +419 K 0.140 +420 D 0.136 +421 M 0.125 +422 R 0.120 +423 P 0.129 +424 L 0.153 +425 K 0.187 +426 P 0.219 +427 A 0.239 +428 E 0.241 +429 M 0.224 +430 Q 0.194 +431 E 0.161 +432 A 0.138 +433 N 0.123 +434 L 0.110 +435 T 0.092 +436 S 0.072 +437 M 0.057 +438 V 0.049 +439 L 0.047 +440 F 0.046 +441 M 0.046 +442 K 0.045 +443 R 0.045 +444 V 0.051 +445 D 0.063 +446 I 0.081 +447 A 0.103 +448 G 0.129 +449 L 0.154 +450 G 0.168 +451 R 0.166 +452 C 0.148 +453 D 0.123 +454 F 0.101 +455 M 0.089 +456 N 0.090 +457 R 0.099 +458 P 0.107 +459 A 0.105 +460 P 0.098 +461 E 0.091 +462 S 0.085 +463 L 0.079 +464 M 0.074 +465 Q 0.078 +466 A 0.085 +467 L 0.088 +468 E 0.086 +469 D 0.086 +470 L 0.087 +471 D 0.085 +472 Y 0.079 +473 L 0.077 +474 A 0.082 +475 A 0.091 +476 L 0.100 +477 D 0.103 +478 N 0.104 +479 D 0.106 +480 G 0.107 +481 N 0.103 +482 L 0.090 +483 S 0.072 +484 E 0.059 +485 F 0.057 +486 G 0.062 +487 I 0.068 +488 I 0.073 +489 M 0.077 +490 S 0.077 +491 E 0.077 +492 F 0.081 +493 P 0.090 +494 L 0.098 +495 D 0.098 +496 P 0.087 +497 Q 0.074 +498 L 0.067 +499 S 0.068 +500 K 0.069 +501 S 0.072 +502 I 0.078 +503 L 0.083 +504 A 0.080 +505 S 0.072 +506 C 0.066 +507 E 0.066 +508 F 0.070 +509 D 0.073 +510 C 0.071 +511 V 0.066 +512 D 0.068 +513 E 0.077 +514 M 0.089 +515 L 0.098 +516 T 0.107 +517 I 0.120 +518 A 0.126 +519 A 0.118 +520 M 0.103 +521 V 0.096 +522 T 0.100 +523 A 0.111 +524 P 0.123 +525 S 0.138 +526 C 0.152 +527 F 0.157 +528 L 0.157 +529 H 0.163 +530 V 0.178 +531 P 0.192 +532 H 0.196 +533 G 0.183 +534 A 0.156 +535 E 0.125 +536 E 0.103 +537 A 0.092 +538 A 0.084 +539 V 0.077 +540 T 0.074 +541 C 0.072 +542 W 0.067 +543 K 0.063 +544 T 0.063 +545 F 0.072 +546 L 0.089 +547 H 0.107 +548 P 0.120 +549 E 0.123 +550 G 0.120 +551 D 0.113 +552 H 0.104 +553 F 0.098 +554 T 0.094 +555 L 0.089 +556 I 0.081 +557 N 0.072 +558 V 0.065 +559 Y 0.058 +560 N 0.050 +561 A 0.043 +562 Y 0.042 +563 Q 0.047 +564 D 0.056 +565 T 0.065 +566 V 0.077 +567 L 0.094 +568 N 0.113 +569 S 0.125 +570 A 0.128 +571 N 0.126 +572 E 0.120 +573 H 0.109 +574 C 0.096 +575 V 0.088 +576 E 0.085 +577 M 0.083 +578 W 0.078 +579 C 0.073 +580 H 0.072 +581 D 0.075 +582 C 0.077 +583 F 0.075 +584 L 0.072 +585 S 0.069 +586 C 0.070 +587 S 0.078 +588 A 0.087 +589 L 0.092 +590 R 0.095 +591 M 0.102 +592 A 0.109 +593 D 0.114 +594 V 0.117 +595 I 0.116 +596 R 0.110 +597 A 0.100 +598 E 0.093 +599 L 0.090 +600 L 0.092 +601 E 0.090 +602 I 0.081 +603 I 0.067 +604 K 0.057 +605 R 0.056 +606 I 0.063 +607 E 0.075 +608 L 0.085 +609 P 0.091 +610 Y 0.098 +611 A 0.116 +612 E 0.147 +613 P 0.180 +614 A 0.207 +615 F 0.228 +616 G 0.235 +617 S 0.217 +618 K 0.178 +619 E 0.137 +620 N 0.108 +621 G 0.090 +622 L 0.076 +623 N 0.068 +624 I 0.066 +625 K 0.069 +626 K 0.074 +627 A 0.076 +628 L 0.072 +629 L 0.065 +630 S 0.063 +631 G 0.063 +632 Y 0.059 +633 F 0.055 +634 M 0.055 +635 Q 0.058 +636 I 0.059 +637 A 0.059 +638 R 0.064 +639 D 0.077 +640 V 0.097 +641 D 0.121 +642 G 0.142 +643 S 0.149 +644 G 0.132 +645 N 0.100 +646 Y 0.068 +647 L 0.050 +648 M 0.046 +649 L 0.050 +650 T 0.057 +651 H 0.064 +652 K 0.074 +653 Q 0.085 +654 V 0.087 +655 A 0.082 +656 Q 0.076 +657 L 0.076 +658 H 0.076 +659 P 0.073 +660 L 0.072 +661 S 0.081 +662 S 0.099 +663 Y 0.119 +664 S 0.132 +665 I 0.133 +666 T 0.126 +667 K 0.119 +668 K 0.117 +669 M 0.117 +670 P 0.113 +671 E 0.106 +672 W 0.101 +673 V 0.097 +674 L 0.091 +675 F 0.084 +676 H 0.082 +677 Q 0.088 +678 F 0.096 +679 S 0.100 +680 I 0.098 +681 S 0.095 +682 E 0.097 +683 N 0.103 +684 N 0.105 +685 Y 0.098 +686 I 0.086 +687 R 0.076 +688 V 0.072 +689 A 0.073 +690 S 0.078 +691 A 0.082 +692 V 0.084 +693 S 0.082 +694 P 0.076 +695 E 0.069 +696 L 0.062 +697 F 0.058 +698 M 0.058 +699 Q 0.063 +700 L 0.072 +701 V 0.078 +702 P 0.076 +703 Q 0.074 +704 Y 0.078 +705 Y 0.087 +706 F 0.099 +707 S 0.116 +708 N 0.138 +709 L 0.159 +710 P 0.173 +711 P 0.175 +712 S 0.165 +713 E 0.151 +714 S 0.146 +715 K 0.156 +716 D 0.173 +717 I 0.189 +718 L 0.203 +719 Q 0.219 +720 Q 0.243 +721 A 0.280 +722 A 0.328 +723 G 0.380 +724 H 0.433 +725 L 0.487 +726 P 0.539 +727 T 0.578 +728 E 0.598 +729 T 0.595 +730 V 0.579 +731 N 0.568 +732 K 0.568 +733 D 0.563 +734 Q 0.539 +735 D 0.497 +736 V 0.456 +737 C 0.424 +738 D 0.408 +739 K 0.412 +740 C 0.444 +741 P 0.496 +742 D 0.547 +743 A 0.577 +744 T 0.586 +745 E 0.580 +746 Q 0.560 +747 R 0.522 +748 C 0.472 +749 T 0.428 +750 I 0.399 +751 Q 0.387 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031221.8_ENSMUST00000033570.6_GN:Igbp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031221.8_ENSMUST00000033570.6_GN:Igbp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..fee574c3b0255212e157da6788bb956b757e9048 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031221.8_ENSMUST00000033570.6_GN:Igbp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,341 @@ +>ENSMUSG00000031221.8|ENSMUST00000033570.6|GN:Igbp1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.483 +2 A 0.505 +3 A 0.538 +4 S 0.563 +5 E 0.569 +6 D 0.556 +7 E 0.526 +8 L 0.479 +9 L 0.415 +10 L 0.335 +11 P 0.246 +12 R 0.161 +13 L 0.096 +14 P 0.057 +15 E 0.038 +16 L 0.032 +17 F 0.031 +18 E 0.032 +19 T 0.036 +20 S 0.045 +21 K 0.056 +22 K 0.060 +23 L 0.053 +24 L 0.042 +25 E 0.038 +26 D 0.043 +27 V 0.057 +28 E 0.078 +29 V 0.101 +30 A 0.122 +31 T 0.135 +32 E 0.143 +33 P 0.146 +34 T 0.143 +35 G 0.132 +36 S 0.115 +37 R 0.096 +38 T 0.082 +39 I 0.074 +40 Q 0.066 +41 D 0.059 +42 K 0.057 +43 V 0.063 +44 S 0.071 +45 K 0.075 +46 G 0.072 +47 L 0.061 +48 E 0.049 +49 L 0.042 +50 L 0.038 +51 E 0.035 +52 K 0.036 +53 A 0.041 +54 A 0.049 +55 G 0.056 +56 M 0.059 +57 L 0.060 +58 S 0.062 +59 Q 0.065 +60 L 0.070 +61 D 0.078 +62 L 0.089 +63 F 0.098 +64 S 0.101 +65 R 0.101 +66 N 0.099 +67 E 0.094 +68 D 0.086 +69 L 0.080 +70 E 0.077 +71 E 0.078 +72 I 0.077 +73 A 0.071 +74 S 0.064 +75 T 0.058 +76 D 0.053 +77 L 0.045 +78 K 0.038 +79 Y 0.033 +80 L 0.032 +81 M 0.035 +82 V 0.039 +83 P 0.044 +84 A 0.051 +85 L 0.060 +86 Q 0.070 +87 G 0.078 +88 A 0.086 +89 L 0.094 +90 T 0.104 +91 M 0.116 +92 K 0.125 +93 Q 0.129 +94 V 0.130 +95 N 0.128 +96 P 0.117 +97 S 0.101 +98 K 0.088 +99 R 0.081 +100 L 0.076 +101 D 0.073 +102 H 0.077 +103 L 0.084 +104 Q 0.088 +105 R 0.087 +106 A 0.082 +107 R 0.072 +108 E 0.063 +109 H 0.060 +110 F 0.059 +111 V 0.054 +112 H 0.049 +113 F 0.047 +114 L 0.047 +115 T 0.047 +116 Q 0.048 +117 C 0.052 +118 H 0.056 +119 C 0.059 +120 Y 0.063 +121 H 0.071 +122 V 0.082 +123 A 0.097 +124 E 0.116 +125 F 0.147 +126 Q 0.200 +127 L 0.275 +128 P 0.354 +129 Q 0.421 +130 T 0.478 +131 K 0.529 +132 T 0.571 +133 N 0.598 +134 S 0.613 +135 A 0.624 +136 E 0.638 +137 N 0.652 +138 N 0.659 +139 T 0.656 +140 A 0.647 +141 S 0.632 +142 S 0.607 +143 S 0.570 +144 M 0.526 +145 A 0.477 +146 Y 0.422 +147 P 0.355 +148 N 0.278 +149 L 0.208 +150 V 0.163 +151 A 0.145 +152 M 0.141 +153 A 0.142 +154 S 0.142 +155 Q 0.136 +156 R 0.125 +157 Q 0.118 +158 A 0.117 +159 K 0.110 +160 I 0.097 +161 E 0.085 +162 R 0.076 +163 Y 0.073 +164 K 0.076 +165 Q 0.077 +166 K 0.071 +167 K 0.062 +168 E 0.056 +169 V 0.059 +170 E 0.067 +171 H 0.071 +172 R 0.062 +173 L 0.048 +174 S 0.039 +175 A 0.038 +176 L 0.041 +177 K 0.047 +178 S 0.059 +179 A 0.075 +180 V 0.095 +181 E 0.118 +182 S 0.143 +183 G 0.163 +184 Q 0.168 +185 A 0.153 +186 D 0.119 +187 D 0.084 +188 E 0.061 +189 R 0.051 +190 V 0.048 +191 R 0.049 +192 E 0.050 +193 Y 0.050 +194 H 0.048 +195 L 0.049 +196 L 0.055 +197 H 0.061 +198 L 0.061 +199 R 0.055 +200 R 0.049 +201 W 0.049 +202 I 0.052 +203 A 0.056 +204 V 0.058 +205 S 0.060 +206 L 0.063 +207 E 0.069 +208 E 0.074 +209 L 0.072 +210 E 0.064 +211 S 0.057 +212 I 0.055 +213 D 0.059 +214 Q 0.065 +215 E 0.073 +216 I 0.082 +217 K 0.089 +218 I 0.090 +219 L 0.092 +220 K 0.107 +221 E 0.144 +222 K 0.204 +223 D 0.285 +224 S 0.378 +225 P 0.469 +226 R 0.546 +227 E 0.600 +228 E 0.625 +229 T 0.633 +230 A 0.642 +231 C 0.660 +232 H 0.677 +233 S 0.684 +234 S 0.680 +235 L 0.669 +236 P 0.655 +237 E 0.639 +238 K 0.630 +239 P 0.632 +240 P 0.649 +241 M 0.671 +242 K 0.690 +243 P 0.703 +244 F 0.711 +245 I 0.710 +246 L 0.698 +247 T 0.686 +248 R 0.685 +249 N 0.684 +250 K 0.672 +251 A 0.657 +252 Q 0.648 +253 A 0.643 +254 K 0.636 +255 V 0.634 +256 F 0.651 +257 G 0.683 +258 T 0.709 +259 G 0.721 +260 Y 0.729 +261 P 0.740 +262 S 0.750 +263 L 0.745 +264 A 0.709 +265 T 0.639 +266 M 0.558 +267 T 0.485 +268 V 0.407 +269 S 0.329 +270 D 0.277 +271 W 0.249 +272 Y 0.225 +273 E 0.204 +274 Q 0.204 +275 H 0.233 +276 Q 0.286 +277 K 0.360 +278 Y 0.462 +279 G 0.569 +280 V 0.645 +281 L 0.682 +282 P 0.698 +283 D 0.707 +284 R 0.713 +285 G 0.714 +286 I 0.708 +287 A 0.694 +288 K 0.674 +289 P 0.650 +290 A 0.615 +291 S 0.562 +292 A 0.494 +293 D 0.420 +294 F 0.351 +295 Q 0.299 +296 R 0.281 +297 A 0.291 +298 A 0.309 +299 Q 0.331 +300 Q 0.364 +301 Q 0.387 +302 E 0.380 +303 D 0.359 +304 Q 0.346 +305 E 0.335 +306 Q 0.326 +307 K 0.329 +308 D 0.331 +309 E 0.314 +310 E 0.288 +311 S 0.277 +312 E 0.286 +313 E 0.305 +314 K 0.327 +315 A 0.350 +316 L 0.370 +317 H 0.386 +318 R 0.395 +319 M 0.385 +320 R 0.357 +321 E 0.322 +322 W 0.294 +323 D 0.280 +324 D 0.277 +325 W 0.282 +326 K 0.293 +327 D 0.312 +328 T 0.344 +329 H 0.398 +330 P 0.471 +331 R 0.544 +332 G 0.601 +333 Y 0.636 +334 G 0.646 +335 N 0.639 +336 R 0.636 +337 Q 0.642 +338 N 0.636 +339 M 0.600 +340 G 0.561 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031221.8_ENSMUST00000033570.6_GN:Igbp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031221.8_ENSMUST00000033570.6_GN:Igbp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..afec95ae033a2325058af40b769fba48e051ddaf --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031221.8_ENSMUST00000033570.6_GN:Igbp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid @@ -0,0 +1,360 @@ +>ENSMUSG00000031221.8|ENSMUST00000033570.6|GN:Igbp1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:19 +1 M 0.352 +2 E 0.356 +3 F 0.365 +4 T 0.380 +5 F 0.406 +6 D 0.445 +7 F 0.494 +8 G 0.539 +9 R 0.573 +10 N 0.593 +11 S 0.600 +12 S 0.590 +13 G 0.564 +14 F 0.529 +15 L 0.497 +16 S 0.480 +17 F 0.480 +18 H 0.499 +19 K 0.530 +20 M 0.566 +21 A 0.597 +22 A 0.618 +23 S 0.627 +24 E 0.622 +25 D 0.604 +26 E 0.567 +27 L 0.508 +28 L 0.427 +29 L 0.334 +30 P 0.239 +31 R 0.155 +32 L 0.094 +33 P 0.057 +34 E 0.039 +35 L 0.033 +36 F 0.032 +37 E 0.033 +38 T 0.036 +39 S 0.044 +40 K 0.055 +41 K 0.060 +42 L 0.053 +43 L 0.043 +44 E 0.039 +45 D 0.043 +46 V 0.056 +47 E 0.076 +48 V 0.098 +49 A 0.117 +50 T 0.131 +51 E 0.140 +52 P 0.145 +53 T 0.144 +54 G 0.133 +55 S 0.115 +56 R 0.096 +57 T 0.082 +58 I 0.074 +59 Q 0.067 +60 D 0.060 +61 K 0.059 +62 V 0.065 +63 S 0.073 +64 K 0.077 +65 G 0.073 +66 L 0.062 +67 E 0.050 +68 L 0.043 +69 L 0.039 +70 E 0.036 +71 K 0.036 +72 A 0.042 +73 A 0.052 +74 G 0.059 +75 M 0.061 +76 L 0.062 +77 S 0.064 +78 Q 0.066 +79 L 0.070 +80 D 0.077 +81 L 0.087 +82 F 0.096 +83 S 0.099 +84 R 0.100 +85 N 0.098 +86 E 0.094 +87 D 0.086 +88 L 0.079 +89 E 0.076 +90 E 0.077 +91 I 0.075 +92 A 0.069 +93 S 0.061 +94 T 0.056 +95 D 0.050 +96 L 0.043 +97 K 0.036 +98 Y 0.032 +99 L 0.031 +100 M 0.034 +101 V 0.038 +102 P 0.042 +103 A 0.049 +104 L 0.057 +105 Q 0.065 +106 G 0.072 +107 A 0.079 +108 L 0.088 +109 T 0.100 +110 M 0.113 +111 K 0.122 +112 Q 0.127 +113 V 0.130 +114 N 0.127 +115 P 0.116 +116 S 0.100 +117 K 0.088 +118 R 0.081 +119 L 0.076 +120 D 0.073 +121 H 0.077 +122 L 0.084 +123 Q 0.088 +124 R 0.087 +125 A 0.082 +126 R 0.071 +127 E 0.062 +128 H 0.059 +129 F 0.058 +130 V 0.053 +131 H 0.048 +132 F 0.047 +133 L 0.047 +134 T 0.047 +135 Q 0.049 +136 C 0.053 +137 H 0.057 +138 C 0.060 +139 Y 0.064 +140 H 0.072 +141 V 0.083 +142 A 0.098 +143 E 0.119 +144 F 0.151 +145 Q 0.204 +146 L 0.278 +147 P 0.354 +148 Q 0.419 +149 T 0.474 +150 K 0.526 +151 T 0.570 +152 N 0.600 +153 S 0.616 +154 A 0.628 +155 E 0.643 +156 N 0.657 +157 N 0.665 +158 T 0.663 +159 A 0.654 +160 S 0.639 +161 S 0.613 +162 S 0.576 +163 M 0.531 +164 A 0.481 +165 Y 0.425 +166 P 0.359 +167 N 0.282 +168 L 0.212 +169 V 0.167 +170 A 0.149 +171 M 0.145 +172 A 0.146 +173 S 0.146 +174 Q 0.138 +175 R 0.126 +176 Q 0.120 +177 A 0.118 +178 K 0.111 +179 I 0.099 +180 E 0.086 +181 R 0.077 +182 Y 0.073 +183 K 0.075 +184 Q 0.077 +185 K 0.071 +186 K 0.062 +187 E 0.057 +188 V 0.059 +189 E 0.067 +190 H 0.071 +191 R 0.062 +192 L 0.048 +193 S 0.040 +194 A 0.039 +195 L 0.041 +196 K 0.048 +197 S 0.060 +198 A 0.077 +199 V 0.096 +200 E 0.118 +201 S 0.142 +202 G 0.162 +203 Q 0.167 +204 A 0.152 +205 D 0.118 +206 D 0.083 +207 E 0.060 +208 R 0.050 +209 V 0.048 +210 R 0.049 +211 E 0.050 +212 Y 0.049 +213 H 0.048 +214 L 0.048 +215 L 0.053 +216 H 0.059 +217 L 0.059 +218 R 0.053 +219 R 0.048 +220 W 0.047 +221 I 0.050 +222 A 0.054 +223 V 0.057 +224 S 0.059 +225 L 0.062 +226 E 0.068 +227 E 0.073 +228 L 0.072 +229 E 0.063 +230 S 0.056 +231 I 0.055 +232 D 0.058 +233 Q 0.065 +234 E 0.073 +235 I 0.082 +236 K 0.089 +237 I 0.091 +238 L 0.093 +239 K 0.108 +240 E 0.144 +241 K 0.204 +242 D 0.285 +243 S 0.378 +244 P 0.470 +245 R 0.548 +246 E 0.602 +247 E 0.628 +248 T 0.635 +249 A 0.645 +250 C 0.663 +251 H 0.680 +252 S 0.688 +253 S 0.684 +254 L 0.673 +255 P 0.659 +256 E 0.644 +257 K 0.634 +258 P 0.637 +259 P 0.654 +260 M 0.677 +261 K 0.697 +262 P 0.710 +263 F 0.718 +264 I 0.716 +265 L 0.703 +266 T 0.690 +267 R 0.690 +268 N 0.690 +269 K 0.681 +270 A 0.668 +271 Q 0.661 +272 A 0.657 +273 K 0.650 +274 V 0.649 +275 F 0.666 +276 G 0.696 +277 T 0.720 +278 G 0.730 +279 Y 0.737 +280 P 0.748 +281 S 0.757 +282 L 0.752 +283 A 0.717 +284 T 0.647 +285 M 0.567 +286 T 0.494 +287 V 0.415 +288 S 0.337 +289 D 0.283 +290 W 0.253 +291 Y 0.228 +292 E 0.207 +293 Q 0.209 +294 H 0.241 +295 Q 0.295 +296 K 0.371 +297 Y 0.474 +298 G 0.582 +299 V 0.657 +300 L 0.694 +301 P 0.708 +302 D 0.716 +303 R 0.720 +304 G 0.721 +305 I 0.715 +306 A 0.700 +307 K 0.681 +308 P 0.657 +309 A 0.624 +310 S 0.572 +311 A 0.503 +312 D 0.427 +313 F 0.355 +314 Q 0.302 +315 R 0.284 +316 A 0.295 +317 A 0.312 +318 Q 0.335 +319 Q 0.369 +320 Q 0.394 +321 E 0.389 +322 D 0.368 +323 Q 0.352 +324 E 0.338 +325 Q 0.326 +326 K 0.327 +327 D 0.329 +328 E 0.313 +329 E 0.287 +330 S 0.277 +331 E 0.287 +332 E 0.308 +333 K 0.331 +334 A 0.354 +335 L 0.375 +336 H 0.392 +337 R 0.401 +338 M 0.391 +339 R 0.362 +340 E 0.326 +341 W 0.297 +342 D 0.283 +343 D 0.281 +344 W 0.285 +345 K 0.297 +346 D 0.317 +347 T 0.348 +348 H 0.403 +349 P 0.477 +350 R 0.549 +351 G 0.604 +352 Y 0.639 +353 G 0.649 +354 N 0.642 +355 R 0.639 +356 Q 0.645 +357 N 0.639 +358 M 0.604 +359 G 0.566 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031250.9_ENSMUST00000033602.9_GN:Tnmd_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031250.9_ENSMUST00000033602.9_GN:Tnmd_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..37f959c9a836ef1270a4f5e317c44b13cc998bf6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031250.9_ENSMUST00000033602.9_GN:Tnmd_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,318 @@ +>ENSMUSG00000031250.9|ENSMUST00000033602.9|GN:Tnmd|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.405 +2 A 0.423 +3 K 0.455 +4 N 0.497 +5 P 0.543 +6 P 0.583 +7 E 0.603 +8 N 0.599 +9 C 0.583 +10 E 0.567 +11 G 0.548 +12 C 0.511 +13 H 0.471 +14 I 0.457 +15 L 0.465 +16 N 0.460 +17 A 0.437 +18 E 0.424 +19 A 0.434 +20 L 0.457 +21 K 0.475 +22 S 0.477 +23 K 0.471 +24 K 0.478 +25 I 0.482 +26 C 0.461 +27 K 0.423 +28 S 0.386 +29 L 0.346 +30 K 0.300 +31 I 0.266 +32 C 0.254 +33 G 0.250 +34 L 0.242 +35 V 0.235 +36 F 0.232 +37 G 0.233 +38 I 0.241 +39 L 0.251 +40 A 0.253 +41 L 0.243 +42 T 0.228 +43 L 0.208 +44 I 0.182 +45 V 0.158 +46 L 0.150 +47 F 0.167 +48 W 0.205 +49 G 0.252 +50 S 0.289 +51 K 0.312 +52 H 0.332 +53 F 0.364 +54 W 0.412 +55 P 0.468 +56 E 0.503 +57 V 0.487 +58 S 0.424 +59 K 0.340 +60 K 0.260 +61 T 0.196 +62 Y 0.148 +63 D 0.115 +64 M 0.095 +65 E 0.085 +66 H 0.081 +67 T 0.083 +68 F 0.094 +69 Y 0.112 +70 S 0.131 +71 N 0.142 +72 G 0.147 +73 E 0.147 +74 K 0.140 +75 K 0.123 +76 K 0.098 +77 I 0.074 +78 Y 0.056 +79 M 0.050 +80 E 0.054 +81 I 0.064 +82 D 0.071 +83 P 0.070 +84 I 0.064 +85 T 0.059 +86 R 0.058 +87 T 0.059 +88 E 0.058 +89 I 0.056 +90 F 0.058 +91 R 0.069 +92 S 0.092 +93 G 0.125 +94 N 0.157 +95 G 0.172 +96 T 0.164 +97 D 0.143 +98 E 0.118 +99 T 0.092 +100 L 0.072 +101 E 0.061 +102 V 0.060 +103 H 0.062 +104 D 0.067 +105 F 0.073 +106 K 0.080 +107 N 0.084 +108 G 0.077 +109 Y 0.058 +110 T 0.037 +111 G 0.027 +112 I 0.027 +113 Y 0.033 +114 F 0.043 +115 V 0.057 +116 G 0.071 +117 L 0.079 +118 Q 0.079 +119 K 0.073 +120 C 0.067 +121 F 0.064 +122 I 0.062 +123 K 0.062 +124 T 0.064 +125 Q 0.072 +126 I 0.087 +127 K 0.115 +128 V 0.156 +129 I 0.205 +130 P 0.252 +131 E 0.303 +132 F 0.371 +133 S 0.456 +134 E 0.537 +135 P 0.594 +136 E 0.618 +137 E 0.603 +138 E 0.557 +139 I 0.505 +140 D 0.461 +141 E 0.423 +142 N 0.391 +143 E 0.363 +144 E 0.331 +145 I 0.290 +146 T 0.249 +147 T 0.214 +148 T 0.188 +149 F 0.173 +150 F 0.166 +151 E 0.162 +152 Q 0.156 +153 S 0.148 +154 V 0.134 +155 I 0.114 +156 W 0.095 +157 V 0.082 +158 P 0.073 +159 A 0.067 +160 E 0.066 +161 K 0.067 +162 P 0.068 +163 I 0.069 +164 E 0.071 +165 N 0.073 +166 R 0.071 +167 D 0.066 +168 F 0.064 +169 L 0.070 +170 K 0.083 +171 N 0.093 +172 S 0.089 +173 K 0.072 +174 I 0.054 +175 L 0.042 +176 E 0.037 +177 I 0.038 +178 C 0.048 +179 D 0.064 +180 N 0.080 +181 V 0.085 +182 T 0.075 +183 M 0.058 +184 Y 0.044 +185 W 0.037 +186 I 0.038 +187 N 0.046 +188 P 0.059 +189 T 0.076 +190 L 0.096 +191 I 0.118 +192 A 0.141 +193 V 0.168 +194 S 0.200 +195 E 0.237 +196 L 0.274 +197 Q 0.314 +198 D 0.357 +199 F 0.403 +200 E 0.447 +201 E 0.486 +202 D 0.513 +203 G 0.519 +204 E 0.499 +205 D 0.462 +206 L 0.430 +207 H 0.424 +208 F 0.454 +209 P 0.501 +210 T 0.543 +211 S 0.570 +212 E 0.588 +213 K 0.604 +214 K 0.620 +215 G 0.625 +216 I 0.615 +217 D 0.597 +218 Q 0.565 +219 N 0.516 +220 E 0.465 +221 Q 0.438 +222 W 0.453 +223 V 0.498 +224 V 0.551 +225 P 0.594 +226 Q 0.616 +227 V 0.619 +228 K 0.615 +229 V 0.616 +230 E 0.617 +231 K 0.608 +232 T 0.591 +233 R 0.584 +234 H 0.597 +235 T 0.620 +236 R 0.641 +237 Q 0.649 +238 A 0.638 +239 S 0.611 +240 E 0.583 +241 E 0.560 +242 D 0.547 +243 L 0.553 +244 P 0.588 +245 I 0.631 +246 N 0.646 +247 D 0.616 +248 Y 0.561 +249 T 0.520 +250 E 0.503 +251 N 0.494 +252 G 0.476 +253 I 0.444 +254 E 0.396 +255 F 0.341 +256 D 0.301 +257 P 0.283 +258 M 0.278 +259 L 0.266 +260 D 0.243 +261 E 0.215 +262 R 0.183 +263 G 0.146 +264 Y 0.108 +265 C 0.075 +266 C 0.054 +267 I 0.050 +268 Y 0.060 +269 C 0.081 +270 R 0.109 +271 R 0.140 +272 G 0.160 +273 N 0.163 +274 R 0.154 +275 Y 0.144 +276 C 0.146 +277 R 0.159 +278 R 0.167 +279 V 0.163 +280 C 0.161 +281 E 0.176 +282 P 0.197 +283 L 0.208 +284 L 0.200 +285 G 0.175 +286 Y 0.143 +287 Y 0.116 +288 P 0.095 +289 Y 0.083 +290 P 0.080 +291 Y 0.084 +292 C 0.091 +293 Y 0.106 +294 Q 0.136 +295 G 0.173 +296 G 0.195 +297 R 0.189 +298 V 0.163 +299 I 0.131 +300 C 0.107 +301 R 0.096 +302 V 0.094 +303 I 0.096 +304 M 0.097 +305 P 0.097 +306 C 0.100 +307 N 0.107 +308 W 0.117 +309 W 0.129 +310 V 0.143 +311 A 0.153 +312 R 0.166 +313 M 0.192 +314 L 0.229 +315 G 0.261 +316 R 0.278 +317 V 0.282 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031250.9_ENSMUST00000033602.9_GN:Tnmd_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:44.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031250.9_ENSMUST00000033602.9_GN:Tnmd_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:44.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..acf27a9dcf061e41240a95a216666d9759fc86d2 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031250.9_ENSMUST00000033602.9_GN:Tnmd_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:44.caid @@ -0,0 +1,362 @@ +>ENSMUSG00000031250.9|ENSMUST00000033602.9|GN:Tnmd|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:44 +1 M 0.336 +2 T 0.363 +3 Y 0.409 +4 L 0.451 +5 S 0.470 +6 H 0.481 +7 I 0.497 +8 N 0.493 +9 S 0.470 +10 A 0.469 +11 S 0.511 +12 P 0.579 +13 P 0.652 +14 A 0.708 +15 S 0.740 +16 G 0.755 +17 S 0.758 +18 R 0.752 +19 L 0.737 +20 T 0.718 +21 C 0.702 +22 N 0.701 +23 S 0.713 +24 T 0.726 +25 S 0.734 +26 A 0.737 +27 V 0.731 +28 V 0.711 +29 L 0.685 +30 S 0.659 +31 V 0.630 +32 L 0.598 +33 S 0.587 +34 K 0.610 +35 Q 0.653 +36 G 0.689 +37 K 0.707 +38 S 0.709 +39 T 0.696 +40 V 0.669 +41 C 0.646 +42 W 0.641 +43 E 0.641 +44 T 0.620 +45 M 0.577 +46 A 0.530 +47 K 0.498 +48 N 0.497 +49 P 0.539 +50 P 0.606 +51 E 0.660 +52 N 0.678 +53 C 0.671 +54 E 0.657 +55 G 0.641 +56 C 0.635 +57 H 0.659 +58 I 0.698 +59 L 0.716 +60 N 0.698 +61 A 0.658 +62 E 0.616 +63 A 0.585 +64 L 0.575 +65 K 0.575 +66 S 0.568 +67 K 0.555 +68 K 0.548 +69 I 0.537 +70 C 0.505 +71 K 0.462 +72 S 0.424 +73 L 0.382 +74 K 0.333 +75 I 0.295 +76 C 0.279 +77 G 0.271 +78 L 0.257 +79 V 0.243 +80 F 0.234 +81 G 0.231 +82 I 0.234 +83 L 0.239 +84 A 0.238 +85 L 0.227 +86 T 0.211 +87 L 0.192 +88 I 0.167 +89 V 0.145 +90 L 0.138 +91 F 0.155 +92 W 0.194 +93 G 0.240 +94 S 0.273 +95 K 0.286 +96 H 0.297 +97 F 0.324 +98 W 0.374 +99 P 0.434 +100 E 0.475 +101 V 0.467 +102 S 0.410 +103 K 0.329 +104 K 0.249 +105 T 0.184 +106 Y 0.135 +107 D 0.102 +108 M 0.083 +109 E 0.073 +110 H 0.069 +111 T 0.070 +112 F 0.078 +113 Y 0.095 +114 S 0.113 +115 N 0.127 +116 G 0.136 +117 E 0.141 +118 K 0.137 +119 K 0.121 +120 K 0.096 +121 I 0.071 +122 Y 0.053 +123 M 0.046 +124 E 0.047 +125 I 0.054 +126 D 0.060 +127 P 0.060 +128 I 0.056 +129 T 0.053 +130 R 0.053 +131 T 0.054 +132 E 0.054 +133 I 0.053 +134 F 0.056 +135 R 0.068 +136 S 0.091 +137 G 0.125 +138 N 0.159 +139 G 0.177 +140 T 0.171 +141 D 0.151 +142 E 0.125 +143 T 0.097 +144 L 0.074 +145 E 0.062 +146 V 0.059 +147 H 0.062 +148 D 0.067 +149 F 0.074 +150 K 0.081 +151 N 0.083 +152 G 0.075 +153 Y 0.055 +154 T 0.035 +155 G 0.025 +156 I 0.025 +157 Y 0.032 +158 F 0.044 +159 V 0.059 +160 G 0.073 +161 L 0.080 +162 Q 0.080 +163 K 0.074 +164 C 0.068 +165 F 0.065 +166 I 0.066 +167 K 0.068 +168 T 0.073 +169 Q 0.083 +170 I 0.101 +171 K 0.131 +172 V 0.173 +173 I 0.220 +174 P 0.268 +175 E 0.320 +176 F 0.386 +177 S 0.464 +178 E 0.538 +179 P 0.592 +180 E 0.615 +181 E 0.599 +182 E 0.553 +183 I 0.499 +184 D 0.449 +185 E 0.404 +186 N 0.366 +187 E 0.333 +188 E 0.296 +189 I 0.252 +190 T 0.210 +191 T 0.179 +192 T 0.159 +193 F 0.150 +194 F 0.148 +195 E 0.149 +196 Q 0.147 +197 S 0.141 +198 V 0.129 +199 I 0.111 +200 W 0.092 +201 V 0.078 +202 P 0.068 +203 A 0.061 +204 E 0.059 +205 K 0.059 +206 P 0.059 +207 I 0.060 +208 E 0.061 +209 N 0.062 +210 R 0.061 +211 D 0.057 +212 F 0.055 +213 L 0.060 +214 K 0.071 +215 N 0.079 +216 S 0.075 +217 K 0.062 +218 I 0.048 +219 L 0.039 +220 E 0.035 +221 I 0.037 +222 C 0.046 +223 D 0.062 +224 N 0.078 +225 V 0.083 +226 T 0.072 +227 M 0.054 +228 Y 0.041 +229 W 0.035 +230 I 0.036 +231 N 0.043 +232 P 0.056 +233 T 0.072 +234 L 0.093 +235 I 0.116 +236 A 0.141 +237 V 0.168 +238 S 0.200 +239 E 0.236 +240 L 0.272 +241 Q 0.309 +242 D 0.350 +243 F 0.395 +244 E 0.441 +245 E 0.481 +246 D 0.507 +247 G 0.511 +248 E 0.490 +249 D 0.453 +250 L 0.421 +251 H 0.418 +252 F 0.452 +253 P 0.504 +254 T 0.545 +255 S 0.569 +256 E 0.580 +257 K 0.591 +258 K 0.603 +259 G 0.606 +260 I 0.596 +261 D 0.577 +262 Q 0.545 +263 N 0.498 +264 E 0.450 +265 Q 0.427 +266 W 0.441 +267 V 0.483 +268 V 0.533 +269 P 0.572 +270 Q 0.592 +271 V 0.592 +272 K 0.587 +273 V 0.589 +274 E 0.596 +275 K 0.593 +276 T 0.581 +277 R 0.578 +278 H 0.594 +279 T 0.619 +280 R 0.641 +281 Q 0.652 +282 A 0.644 +283 S 0.623 +284 E 0.600 +285 E 0.581 +286 D 0.568 +287 L 0.573 +288 P 0.604 +289 I 0.640 +290 N 0.651 +291 D 0.621 +292 Y 0.570 +293 T 0.532 +294 E 0.514 +295 N 0.504 +296 G 0.489 +297 I 0.459 +298 E 0.413 +299 F 0.360 +300 D 0.322 +301 P 0.307 +302 M 0.300 +303 L 0.284 +304 D 0.257 +305 E 0.223 +306 R 0.186 +307 G 0.147 +308 Y 0.108 +309 C 0.074 +310 C 0.054 +311 I 0.051 +312 Y 0.062 +313 C 0.084 +314 R 0.115 +315 R 0.148 +316 G 0.170 +317 N 0.173 +318 R 0.165 +319 Y 0.156 +320 C 0.160 +321 R 0.177 +322 R 0.188 +323 V 0.182 +324 C 0.174 +325 E 0.187 +326 P 0.210 +327 L 0.224 +328 L 0.217 +329 G 0.190 +330 Y 0.155 +331 Y 0.124 +332 P 0.101 +333 Y 0.087 +334 P 0.082 +335 Y 0.084 +336 C 0.091 +337 Y 0.107 +338 Q 0.139 +339 G 0.178 +340 G 0.201 +341 R 0.197 +342 V 0.170 +343 I 0.138 +344 C 0.113 +345 R 0.102 +346 V 0.099 +347 I 0.100 +348 M 0.100 +349 P 0.099 +350 C 0.101 +351 N 0.107 +352 W 0.116 +353 W 0.131 +354 V 0.146 +355 A 0.155 +356 R 0.166 +357 M 0.190 +358 L 0.224 +359 G 0.252 +360 R 0.265 +361 V 0.267 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031495.9_ENSMUST00000011445.8_GN:Cd209d_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031495.9_ENSMUST00000011445.8_GN:Cd209d_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c3b417b44c5d50044ce227dccea339d808937a5d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031495.9_ENSMUST00000011445.8_GN:Cd209d_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,238 @@ +>ENSMUSG00000031495.9|ENSMUST00000011445.8|GN:Cd209d|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.431 +2 S 0.456 +3 D 0.489 +4 S 0.506 +5 M 0.491 +6 E 0.454 +7 S 0.432 +8 K 0.438 +9 T 0.449 +10 Q 0.460 +11 Q 0.487 +12 V 0.520 +13 V 0.539 +14 I 0.549 +15 P 0.561 +16 E 0.575 +17 D 0.582 +18 E 0.578 +19 E 0.560 +20 C 0.543 +21 L 0.546 +22 M 0.565 +23 S 0.577 +24 G 0.562 +25 T 0.515 +26 R 0.456 +27 Y 0.409 +28 S 0.387 +29 D 0.382 +30 I 0.376 +31 S 0.365 +32 S 0.360 +33 R 0.374 +34 L 0.409 +35 Q 0.450 +36 T 0.480 +37 K 0.505 +38 F 0.534 +39 G 0.558 +40 I 0.552 +41 K 0.517 +42 S 0.477 +43 L 0.460 +44 A 0.473 +45 E 0.497 +46 Y 0.514 +47 T 0.521 +48 K 0.528 +49 Q 0.528 +50 S 0.512 +51 R 0.480 +52 N 0.431 +53 P 0.368 +54 L 0.308 +55 V 0.269 +56 L 0.249 +57 Q 0.238 +58 L 0.233 +59 L 0.242 +60 S 0.259 +61 F 0.263 +62 L 0.252 +63 F 0.243 +64 L 0.247 +65 A 0.258 +66 G 0.257 +67 L 0.238 +68 L 0.211 +69 L 0.192 +70 I 0.180 +71 I 0.167 +72 L 0.157 +73 I 0.161 +74 L 0.189 +75 V 0.235 +76 S 0.289 +77 K 0.337 +78 V 0.366 +79 P 0.369 +80 S 0.351 +81 S 0.325 +82 E 0.304 +83 V 0.283 +84 Q 0.254 +85 N 0.225 +86 K 0.208 +87 I 0.200 +88 Y 0.195 +89 Q 0.191 +90 E 0.185 +91 L 0.172 +92 M 0.167 +93 Q 0.181 +94 L 0.206 +95 K 0.228 +96 A 0.251 +97 E 0.282 +98 V 0.314 +99 H 0.342 +100 D 0.361 +101 G 0.363 +102 L 0.337 +103 C 0.283 +104 Q 0.215 +105 P 0.151 +106 C 0.103 +107 A 0.074 +108 R 0.057 +109 D 0.044 +110 W 0.037 +111 T 0.033 +112 F 0.032 +113 F 0.032 +114 N 0.034 +115 G 0.036 +116 S 0.035 +117 C 0.033 +118 Y 0.031 +119 F 0.035 +120 F 0.044 +121 S 0.055 +122 K 0.064 +123 S 0.064 +124 Q 0.055 +125 R 0.041 +126 N 0.031 +127 W 0.027 +128 H 0.031 +129 N 0.038 +130 S 0.047 +131 T 0.057 +132 T 0.061 +133 A 0.056 +134 C 0.046 +135 Q 0.043 +136 E 0.050 +137 L 0.060 +138 G 0.065 +139 A 0.060 +140 Q 0.050 +141 L 0.045 +142 V 0.049 +143 I 0.058 +144 I 0.063 +145 E 0.059 +146 T 0.051 +147 D 0.041 +148 E 0.034 +149 E 0.036 +150 Q 0.044 +151 T 0.049 +152 F 0.042 +153 L 0.029 +154 Q 0.021 +155 Q 0.019 +156 T 0.023 +157 S 0.029 +158 K 0.036 +159 A 0.040 +160 R 0.041 +161 G 0.039 +162 P 0.033 +163 T 0.026 +164 W 0.021 +165 M 0.021 +166 G 0.026 +167 L 0.035 +168 S 0.046 +169 D 0.059 +170 M 0.072 +171 H 0.081 +172 N 0.087 +173 E 0.089 +174 A 0.087 +175 T 0.076 +176 W 0.058 +177 H 0.040 +178 W 0.033 +179 V 0.039 +180 D 0.054 +181 G 0.071 +182 S 0.086 +183 P 0.097 +184 L 0.106 +185 S 0.113 +186 P 0.116 +187 S 0.109 +188 F 0.095 +189 T 0.086 +190 R 0.084 +191 Y 0.087 +192 W 0.097 +193 N 0.116 +194 R 0.135 +195 G 0.142 +196 E 0.136 +197 P 0.128 +198 N 0.129 +199 N 0.139 +200 V 0.155 +201 G 0.167 +202 D 0.168 +203 E 0.152 +204 D 0.124 +205 C 0.094 +206 A 0.072 +207 E 0.061 +208 F 0.062 +209 S 0.075 +210 G 0.097 +211 D 0.113 +212 G 0.112 +213 W 0.098 +214 N 0.084 +215 D 0.080 +216 L 0.082 +217 S 0.085 +218 C 0.084 +219 D 0.081 +220 K 0.080 +221 L 0.078 +222 L 0.070 +223 F 0.057 +224 W 0.044 +225 I 0.036 +226 C 0.034 +227 K 0.037 +228 K 0.050 +229 V 0.078 +230 S 0.129 +231 T 0.201 +232 S 0.276 +233 S 0.331 +234 C 0.362 +235 T 0.376 +236 T 0.373 +237 K 0.361 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031495.9_ENSMUST00000011445.8_GN:Cd209d_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031495.9_ENSMUST00000011445.8_GN:Cd209d_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5303d2b6b076464deaa87578f7b6f9a6630f7fdf --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031495.9_ENSMUST00000011445.8_GN:Cd209d_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid @@ -0,0 +1,261 @@ +>ENSMUSG00000031495.9|ENSMUST00000011445.8|GN:Cd209d|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:23 +1 M 0.404 +2 S 0.424 +3 R 0.463 +4 K 0.511 +5 W 0.559 +6 A 0.595 +7 L 0.618 +8 G 0.634 +9 D 0.640 +10 N 0.635 +11 R 0.632 +12 S 0.635 +13 C 0.632 +14 A 0.611 +15 L 0.583 +16 S 0.551 +17 K 0.506 +18 S 0.468 +19 Q 0.485 +20 A 0.562 +21 L 0.645 +22 V 0.690 +23 T 0.702 +24 M 0.706 +25 S 0.709 +26 D 0.707 +27 S 0.701 +28 M 0.696 +29 E 0.694 +30 S 0.695 +31 K 0.699 +32 T 0.708 +33 Q 0.719 +34 Q 0.724 +35 V 0.717 +36 V 0.699 +37 I 0.679 +38 P 0.666 +39 E 0.666 +40 D 0.679 +41 E 0.692 +42 E 0.692 +43 C 0.682 +44 L 0.675 +45 M 0.676 +46 S 0.671 +47 G 0.648 +48 T 0.606 +49 R 0.557 +50 Y 0.515 +51 S 0.492 +52 D 0.477 +53 I 0.461 +54 S 0.449 +55 S 0.458 +56 R 0.486 +57 L 0.523 +58 Q 0.557 +59 T 0.583 +60 K 0.604 +61 F 0.628 +62 G 0.644 +63 I 0.633 +64 K 0.597 +65 S 0.560 +66 L 0.548 +67 A 0.562 +68 E 0.577 +69 Y 0.575 +70 T 0.564 +71 K 0.558 +72 Q 0.548 +73 S 0.524 +74 R 0.484 +75 N 0.429 +76 P 0.361 +77 L 0.297 +78 V 0.257 +79 L 0.239 +80 Q 0.231 +81 L 0.232 +82 L 0.247 +83 S 0.267 +84 F 0.274 +85 L 0.261 +86 F 0.247 +87 L 0.245 +88 A 0.250 +89 G 0.248 +90 L 0.231 +91 L 0.208 +92 L 0.192 +93 I 0.182 +94 I 0.169 +95 L 0.157 +96 I 0.159 +97 L 0.184 +98 V 0.228 +99 S 0.280 +100 K 0.328 +101 V 0.358 +102 P 0.362 +103 S 0.343 +104 S 0.317 +105 E 0.296 +106 V 0.277 +107 Q 0.251 +108 N 0.223 +109 K 0.206 +110 I 0.197 +111 Y 0.190 +112 Q 0.185 +113 E 0.178 +114 L 0.165 +115 M 0.159 +116 Q 0.172 +117 L 0.194 +118 K 0.216 +119 A 0.240 +120 E 0.270 +121 V 0.301 +122 H 0.328 +123 D 0.349 +124 G 0.355 +125 L 0.337 +126 C 0.291 +127 Q 0.227 +128 P 0.163 +129 C 0.114 +130 A 0.083 +131 R 0.064 +132 D 0.049 +133 W 0.040 +134 T 0.035 +135 F 0.034 +136 F 0.034 +137 N 0.036 +138 G 0.038 +139 S 0.037 +140 C 0.034 +141 Y 0.032 +142 F 0.035 +143 F 0.044 +144 S 0.055 +145 K 0.064 +146 S 0.065 +147 Q 0.056 +148 R 0.043 +149 N 0.032 +150 W 0.028 +151 H 0.032 +152 N 0.039 +153 S 0.048 +154 T 0.056 +155 T 0.061 +156 A 0.055 +157 C 0.046 +158 Q 0.044 +159 E 0.051 +160 L 0.062 +161 G 0.066 +162 A 0.060 +163 Q 0.050 +164 L 0.044 +165 V 0.048 +166 I 0.057 +167 I 0.063 +168 E 0.060 +169 T 0.052 +170 D 0.041 +171 E 0.035 +172 E 0.037 +173 Q 0.045 +174 T 0.050 +175 F 0.043 +176 L 0.030 +177 Q 0.021 +178 Q 0.019 +179 T 0.023 +180 S 0.030 +181 K 0.037 +182 A 0.041 +183 R 0.042 +184 G 0.040 +185 P 0.034 +186 T 0.026 +187 W 0.021 +188 M 0.021 +189 G 0.026 +190 L 0.035 +191 S 0.046 +192 D 0.059 +193 M 0.071 +194 H 0.080 +195 N 0.084 +196 E 0.086 +197 A 0.084 +198 T 0.073 +199 W 0.056 +200 H 0.039 +201 W 0.031 +202 V 0.036 +203 D 0.050 +204 G 0.067 +205 S 0.082 +206 P 0.094 +207 L 0.103 +208 S 0.112 +209 P 0.114 +210 S 0.106 +211 F 0.092 +212 T 0.083 +213 R 0.081 +214 Y 0.085 +215 W 0.095 +216 N 0.114 +217 R 0.134 +218 G 0.140 +219 E 0.134 +220 P 0.127 +221 N 0.127 +222 N 0.137 +223 V 0.153 +224 G 0.165 +225 D 0.166 +226 E 0.150 +227 D 0.123 +228 C 0.093 +229 A 0.072 +230 E 0.061 +231 F 0.062 +232 S 0.075 +233 G 0.097 +234 D 0.114 +235 G 0.113 +236 W 0.099 +237 N 0.085 +238 D 0.080 +239 L 0.083 +240 S 0.086 +241 C 0.084 +242 D 0.082 +243 K 0.080 +244 L 0.078 +245 L 0.070 +246 F 0.057 +247 W 0.044 +248 I 0.036 +249 C 0.034 +250 K 0.038 +251 K 0.051 +252 V 0.080 +253 S 0.132 +254 T 0.207 +255 S 0.285 +256 S 0.342 +257 C 0.373 +258 T 0.385 +259 T 0.379 +260 K 0.366 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031751.15_ENSMUST00000053766.14_GN:Amfr_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031751.15_ENSMUST00000053766.14_GN:Amfr_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..fc937066c3c200bd076fa0cbf51301d04ed3e83a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031751.15_ENSMUST00000053766.14_GN:Amfr_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,640 @@ +>ENSMUSG00000031751.15|ENSMUST00000053766.14|GN:Amfr|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.307 +2 P 0.290 +3 L 0.269 +4 L 0.258 +5 F 0.265 +6 L 0.285 +7 E 0.302 +8 R 0.297 +9 F 0.266 +10 P 0.222 +11 W 0.183 +12 P 0.152 +13 S 0.121 +14 L 0.087 +15 R 0.059 +16 T 0.043 +17 Y 0.039 +18 T 0.041 +19 G 0.050 +20 L 0.061 +21 S 0.071 +22 G 0.073 +23 L 0.070 +24 A 0.064 +25 L 0.059 +26 L 0.057 +27 G 0.059 +28 T 0.065 +29 I 0.071 +30 V 0.073 +31 S 0.068 +32 A 0.063 +33 Y 0.068 +34 R 0.090 +35 A 0.131 +36 L 0.193 +37 S 0.273 +38 Q 0.370 +39 P 0.475 +40 E 0.573 +41 D 0.640 +42 G 0.666 +43 S 0.660 +44 G 0.639 +45 E 0.618 +46 P 0.608 +47 E 0.609 +48 P 0.613 +49 L 0.611 +50 T 0.600 +51 A 0.582 +52 P 0.567 +53 L 0.563 +54 Q 0.579 +55 P 0.610 +56 E 0.638 +57 A 0.653 +58 R 0.657 +59 L 0.660 +60 T 0.659 +61 A 0.643 +62 G 0.603 +63 G 0.536 +64 P 0.444 +65 R 0.339 +66 A 0.241 +67 R 0.172 +68 D 0.140 +69 V 0.134 +70 A 0.135 +71 Q 0.131 +72 Y 0.121 +73 L 0.112 +74 L 0.105 +75 S 0.098 +76 D 0.085 +77 S 0.069 +78 L 0.057 +79 F 0.053 +80 V 0.056 +81 W 0.061 +82 V 0.063 +83 L 0.060 +84 V 0.058 +85 N 0.059 +86 T 0.062 +87 A 0.065 +88 C 0.065 +89 C 0.065 +90 V 0.068 +91 L 0.069 +92 M 0.064 +93 L 0.059 +94 V 0.058 +95 A 0.059 +96 K 0.058 +97 L 0.055 +98 I 0.053 +99 Q 0.052 +100 C 0.053 +101 I 0.060 +102 V 0.068 +103 F 0.077 +104 G 0.085 +105 P 0.089 +106 L 0.083 +107 R 0.068 +108 V 0.051 +109 S 0.041 +110 E 0.037 +111 R 0.035 +112 Q 0.036 +113 H 0.037 +114 L 0.040 +115 K 0.042 +116 D 0.042 +117 K 0.039 +118 F 0.034 +119 W 0.029 +120 N 0.025 +121 F 0.022 +122 I 0.020 +123 F 0.018 +124 Y 0.016 +125 K 0.017 +126 F 0.019 +127 I 0.023 +128 F 0.030 +129 I 0.045 +130 F 0.067 +131 G 0.091 +132 V 0.109 +133 L 0.118 +134 N 0.122 +135 V 0.125 +136 Q 0.126 +137 T 0.117 +138 V 0.095 +139 E 0.071 +140 E 0.056 +141 V 0.048 +142 V 0.045 +143 M 0.045 +144 W 0.045 +145 C 0.042 +146 L 0.039 +147 W 0.042 +148 F 0.052 +149 A 0.065 +150 G 0.074 +151 L 0.077 +152 V 0.074 +153 F 0.071 +154 L 0.073 +155 H 0.078 +156 L 0.079 +157 M 0.074 +158 V 0.068 +159 Q 0.066 +160 L 0.065 +161 C 0.061 +162 K 0.057 +163 D 0.054 +164 R 0.052 +165 F 0.052 +166 E 0.054 +167 Y 0.059 +168 L 0.068 +169 S 0.079 +170 F 0.094 +171 S 0.113 +172 P 0.130 +173 T 0.138 +174 T 0.127 +175 P 0.101 +176 M 0.071 +177 S 0.052 +178 S 0.043 +179 H 0.038 +180 G 0.036 +181 R 0.035 +182 V 0.033 +183 L 0.031 +184 S 0.030 +185 L 0.031 +186 L 0.031 +187 I 0.032 +188 A 0.034 +189 M 0.035 +190 L 0.038 +191 L 0.041 +192 S 0.047 +193 C 0.054 +194 C 0.061 +195 G 0.063 +196 L 0.060 +197 A 0.055 +198 V 0.051 +199 V 0.047 +200 C 0.044 +201 C 0.043 +202 V 0.045 +203 T 0.049 +204 G 0.053 +205 Y 0.057 +206 T 0.062 +207 H 0.066 +208 G 0.065 +209 M 0.058 +210 H 0.050 +211 T 0.044 +212 L 0.038 +213 A 0.032 +214 F 0.028 +215 M 0.029 +216 A 0.032 +217 A 0.038 +218 E 0.045 +219 S 0.049 +220 L 0.049 +221 L 0.046 +222 V 0.042 +223 T 0.039 +224 V 0.039 +225 R 0.039 +226 T 0.039 +227 A 0.037 +228 H 0.035 +229 V 0.032 +230 I 0.029 +231 L 0.027 +232 R 0.026 +233 Y 0.025 +234 V 0.023 +235 I 0.024 +236 H 0.028 +237 L 0.037 +238 W 0.051 +239 D 0.071 +240 L 0.095 +241 N 0.115 +242 H 0.131 +243 E 0.141 +244 G 0.141 +245 T 0.131 +246 W 0.116 +247 E 0.099 +248 G 0.083 +249 K 0.069 +250 G 0.058 +251 T 0.050 +252 Y 0.046 +253 V 0.042 +254 Y 0.042 +255 Y 0.045 +256 T 0.049 +257 D 0.050 +258 F 0.048 +259 V 0.051 +260 M 0.059 +261 E 0.065 +262 L 0.064 +263 A 0.059 +264 L 0.054 +265 L 0.051 +266 S 0.052 +267 L 0.053 +268 D 0.050 +269 L 0.045 +270 M 0.039 +271 H 0.037 +272 H 0.038 +273 I 0.040 +274 H 0.045 +275 M 0.054 +276 L 0.066 +277 L 0.083 +278 F 0.097 +279 G 0.098 +280 N 0.086 +281 I 0.077 +282 W 0.083 +283 L 0.096 +284 S 0.101 +285 M 0.092 +286 A 0.079 +287 S 0.068 +288 L 0.059 +289 V 0.054 +290 I 0.053 +291 F 0.055 +292 M 0.057 +293 Q 0.057 +294 L 0.052 +295 R 0.043 +296 Y 0.035 +297 L 0.032 +298 F 0.035 +299 H 0.044 +300 E 0.061 +301 V 0.075 +302 Q 0.079 +303 R 0.073 +304 R 0.070 +305 I 0.081 +306 R 0.100 +307 R 0.109 +308 H 0.101 +309 K 0.090 +310 N 0.085 +311 Y 0.083 +312 L 0.078 +313 R 0.073 +314 V 0.069 +315 V 0.067 +316 G 0.066 +317 N 0.067 +318 M 0.069 +319 E 0.070 +320 A 0.070 +321 R 0.073 +322 F 0.079 +323 A 0.081 +324 V 0.077 +325 A 0.071 +326 T 0.068 +327 P 0.072 +328 E 0.078 +329 E 0.079 +330 L 0.075 +331 A 0.076 +332 V 0.083 +333 N 0.096 +334 N 0.103 +335 D 0.098 +336 D 0.082 +337 C 0.064 +338 A 0.051 +339 I 0.050 +340 C 0.060 +341 W 0.078 +342 D 0.097 +343 S 0.105 +344 M 0.096 +345 Q 0.080 +346 A 0.067 +347 A 0.060 +348 R 0.058 +349 K 0.057 +350 L 0.052 +351 P 0.047 +352 C 0.049 +353 G 0.058 +354 H 0.066 +355 L 0.065 +356 F 0.056 +357 H 0.045 +358 N 0.039 +359 S 0.041 +360 C 0.047 +361 L 0.052 +362 R 0.052 +363 S 0.050 +364 W 0.050 +365 L 0.052 +366 E 0.053 +367 Q 0.055 +368 D 0.058 +369 T 0.062 +370 S 0.063 +371 C 0.060 +372 P 0.058 +373 T 0.065 +374 C 0.083 +375 R 0.108 +376 M 0.139 +377 S 0.179 +378 L 0.233 +379 N 0.298 +380 I 0.366 +381 A 0.429 +382 D 0.482 +383 G 0.531 +384 S 0.577 +385 R 0.608 +386 A 0.615 +387 R 0.604 +388 E 0.590 +389 D 0.584 +390 H 0.590 +391 Q 0.610 +392 G 0.638 +393 E 0.663 +394 N 0.671 +395 L 0.656 +396 D 0.625 +397 E 0.590 +398 N 0.567 +399 L 0.565 +400 V 0.593 +401 P 0.647 +402 V 0.700 +403 A 0.725 +404 A 0.719 +405 A 0.696 +406 E 0.673 +407 G 0.661 +408 R 0.665 +409 P 0.682 +410 R 0.696 +411 L 0.688 +412 N 0.653 +413 Q 0.599 +414 H 0.540 +415 N 0.477 +416 H 0.404 +417 F 0.323 +418 F 0.248 +419 H 0.196 +420 F 0.174 +421 D 0.175 +422 G 0.185 +423 S 0.190 +424 R 0.183 +425 I 0.169 +426 A 0.160 +427 S 0.168 +428 W 0.197 +429 L 0.242 +430 P 0.286 +431 S 0.315 +432 F 0.335 +433 S 0.365 +434 V 0.407 +435 E 0.446 +436 V 0.476 +437 M 0.504 +438 H 0.540 +439 T 0.587 +440 T 0.636 +441 N 0.669 +442 I 0.681 +443 L 0.672 +444 G 0.643 +445 I 0.593 +446 T 0.530 +447 Q 0.458 +448 A 0.383 +449 S 0.315 +450 N 0.259 +451 S 0.209 +452 Q 0.162 +453 L 0.120 +454 N 0.088 +455 A 0.069 +456 M 0.062 +457 A 0.061 +458 H 0.064 +459 Q 0.069 +460 I 0.073 +461 Q 0.070 +462 E 0.065 +463 M 0.063 +464 F 0.066 +465 P 0.074 +466 Q 0.080 +467 V 0.082 +468 P 0.076 +469 Y 0.068 +470 H 0.060 +471 L 0.054 +472 V 0.050 +473 L 0.053 +474 Q 0.064 +475 D 0.076 +476 L 0.079 +477 Q 0.072 +478 M 0.063 +479 T 0.060 +480 R 0.064 +481 S 0.070 +482 V 0.073 +483 E 0.070 +484 I 0.068 +485 T 0.073 +486 T 0.083 +487 D 0.091 +488 N 0.091 +489 I 0.089 +490 L 0.099 +491 E 0.125 +492 G 0.157 +493 R 0.182 +494 I 0.204 +495 Q 0.235 +496 V 0.287 +497 P 0.362 +498 F 0.453 +499 P 0.544 +500 T 0.619 +501 Q 0.666 +502 R 0.687 +503 S 0.689 +504 D 0.680 +505 S 0.666 +506 L 0.658 +507 R 0.665 +508 P 0.687 +509 A 0.707 +510 L 0.713 +511 N 0.708 +512 S 0.693 +513 P 0.659 +514 V 0.606 +515 E 0.575 +516 R 0.599 +517 P 0.655 +518 S 0.706 +519 P 0.743 +520 D 0.756 +521 L 0.730 +522 E 0.673 +523 E 0.638 +524 G 0.653 +525 E 0.667 +526 A 0.644 +527 S 0.624 +528 V 0.646 +529 Q 0.667 +530 T 0.646 +531 E 0.626 +532 R 0.654 +533 V 0.713 +534 P 0.758 +535 L 0.771 +536 D 0.762 +537 L 0.744 +538 S 0.738 +539 P 0.750 +540 R 0.771 +541 L 0.781 +542 E 0.777 +543 E 0.760 +544 T 0.729 +545 L 0.688 +546 D 0.658 +547 F 0.657 +548 S 0.682 +549 E 0.711 +550 V 0.726 +551 E 0.733 +552 L 0.738 +553 E 0.744 +554 P 0.749 +555 I 0.750 +556 E 0.749 +557 V 0.746 +558 E 0.739 +559 D 0.724 +560 F 0.703 +561 E 0.685 +562 A 0.677 +563 R 0.679 +564 G 0.675 +565 S 0.647 +566 R 0.594 +567 F 0.530 +568 S 0.477 +569 K 0.444 +570 S 0.418 +571 A 0.388 +572 D 0.359 +573 E 0.345 +574 R 0.344 +575 Q 0.341 +576 R 0.342 +577 M 0.367 +578 L 0.398 +579 V 0.397 +580 Q 0.372 +581 R 0.361 +582 K 0.373 +583 D 0.388 +584 D 0.387 +585 L 0.364 +586 L 0.328 +587 Q 0.295 +588 Q 0.271 +589 A 0.257 +590 R 0.254 +591 K 0.270 +592 R 0.310 +593 F 0.365 +594 L 0.427 +595 N 0.496 +596 K 0.565 +597 S 0.611 +598 S 0.626 +599 E 0.632 +600 D 0.650 +601 D 0.677 +602 G 0.695 +603 A 0.701 +604 S 0.699 +605 E 0.691 +606 R 0.679 +607 L 0.672 +608 L 0.678 +609 P 0.698 +610 S 0.724 +611 E 0.736 +612 G 0.718 +613 T 0.664 +614 S 0.593 +615 S 0.530 +616 D 0.480 +617 P 0.433 +618 V 0.385 +619 T 0.343 +620 L 0.318 +621 R 0.303 +622 R 0.289 +623 R 0.280 +624 M 0.279 +625 L 0.276 +626 A 0.270 +627 A 0.266 +628 A 0.269 +629 A 0.272 +630 E 0.276 +631 R 0.285 +632 R 0.298 +633 L 0.316 +634 Q 0.339 +635 R 0.372 +636 Q 0.416 +637 R 0.465 +638 T 0.509 +639 T 0.537 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031751.15_ENSMUST00000053766.14_GN:Amfr_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:121.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031751.15_ENSMUST00000053766.14_GN:Amfr_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:121.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..302499a5a48841580e64df8098cb19448a98c0bc --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031751.15_ENSMUST00000053766.14_GN:Amfr_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:121.caid @@ -0,0 +1,761 @@ +>ENSMUSG00000031751.15|ENSMUST00000053766.14|GN:Amfr|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:121 +1 M 0.344 +2 L 0.382 +3 Q 0.444 +4 G 0.500 +5 A 0.516 +6 G 0.490 +7 T 0.469 +8 R 0.487 +9 G 0.525 +10 P 0.552 +11 R 0.574 +12 P 0.599 +13 G 0.621 +14 P 0.625 +15 V 0.615 +16 L 0.607 +17 S 0.609 +18 G 0.601 +19 L 0.567 +20 Q 0.522 +21 S 0.509 +22 A 0.553 +23 G 0.624 +24 C 0.679 +25 G 0.710 +26 R 0.725 +27 G 0.727 +28 T 0.715 +29 K 0.688 +30 A 0.647 +31 A 0.600 +32 P 0.564 +33 P 0.547 +34 R 0.533 +35 P 0.509 +36 S 0.502 +37 R 0.543 +38 P 0.613 +39 R 0.677 +40 P 0.722 +41 A 0.754 +42 R 0.770 +43 G 0.768 +44 G 0.753 +45 G 0.732 +46 P 0.718 +47 P 0.712 +48 R 0.704 +49 V 0.675 +50 R 0.628 +51 R 0.605 +52 G 0.638 +53 S 0.691 +54 S 0.723 +55 A 0.738 +56 P 0.752 +57 A 0.770 +58 G 0.781 +59 A 0.783 +60 A 0.776 +61 A 0.766 +62 G 0.756 +63 A 0.746 +64 A 0.728 +65 R 0.707 +66 G 0.698 +67 G 0.700 +68 A 0.680 +69 A 0.632 +70 R 0.604 +71 A 0.634 +72 A 0.686 +73 R 0.719 +74 S 0.733 +75 G 0.742 +76 P 0.753 +77 A 0.765 +78 R 0.776 +79 P 0.787 +80 G 0.794 +81 A 0.791 +82 A 0.771 +83 A 0.722 +84 A 0.657 +85 A 0.628 +86 A 0.665 +87 A 0.726 +88 A 0.754 +89 A 0.741 +90 A 0.707 +91 T 0.679 +92 P 0.677 +93 E 0.699 +94 P 0.722 +95 V 0.728 +96 G 0.714 +97 A 0.680 +98 F 0.623 +99 R 0.561 +100 K 0.532 +101 A 0.557 +102 A 0.604 +103 A 0.629 +104 G 0.627 +105 A 0.608 +106 W 0.594 +107 P 0.604 +108 Q 0.638 +109 R 0.669 +110 G 0.679 +111 K 0.672 +112 P 0.668 +113 R 0.675 +114 G 0.688 +115 P 0.701 +116 E 0.714 +117 P 0.723 +118 V 0.722 +119 A 0.708 +120 A 0.680 +121 A 0.637 +122 M 0.573 +123 P 0.491 +124 L 0.411 +125 L 0.349 +126 F 0.317 +127 L 0.310 +128 E 0.312 +129 R 0.306 +130 F 0.283 +131 P 0.248 +132 W 0.212 +133 P 0.181 +134 S 0.148 +135 L 0.110 +136 R 0.077 +137 T 0.056 +138 Y 0.047 +139 T 0.047 +140 G 0.055 +141 L 0.066 +142 S 0.076 +143 G 0.080 +144 L 0.077 +145 A 0.072 +146 L 0.066 +147 L 0.063 +148 G 0.059 +149 T 0.054 +150 I 0.046 +151 V 0.039 +152 S 0.038 +153 A 0.043 +154 Y 0.055 +155 R 0.077 +156 A 0.118 +157 L 0.180 +158 S 0.264 +159 Q 0.367 +160 P 0.481 +161 E 0.585 +162 D 0.655 +163 G 0.683 +164 S 0.678 +165 G 0.658 +166 E 0.638 +167 P 0.629 +168 E 0.631 +169 P 0.638 +170 L 0.638 +171 T 0.630 +172 A 0.614 +173 P 0.598 +174 L 0.591 +175 Q 0.601 +176 P 0.623 +177 E 0.643 +178 A 0.649 +179 R 0.648 +180 L 0.649 +181 T 0.650 +182 A 0.635 +183 G 0.596 +184 G 0.529 +185 P 0.437 +186 R 0.331 +187 A 0.234 +188 R 0.168 +189 D 0.139 +190 V 0.133 +191 A 0.133 +192 Q 0.126 +193 Y 0.115 +194 L 0.106 +195 L 0.100 +196 S 0.093 +197 D 0.080 +198 S 0.066 +199 L 0.054 +200 F 0.050 +201 V 0.052 +202 W 0.056 +203 V 0.058 +204 L 0.055 +205 V 0.052 +206 N 0.053 +207 T 0.057 +208 A 0.060 +209 C 0.061 +210 C 0.063 +211 V 0.066 +212 L 0.067 +213 M 0.063 +214 L 0.058 +215 V 0.057 +216 A 0.058 +217 K 0.056 +218 L 0.054 +219 I 0.051 +220 Q 0.050 +221 C 0.053 +222 I 0.059 +223 V 0.066 +224 F 0.073 +225 G 0.081 +226 P 0.086 +227 L 0.082 +228 R 0.067 +229 V 0.051 +230 S 0.039 +231 E 0.034 +232 R 0.032 +233 Q 0.032 +234 H 0.034 +235 L 0.037 +236 K 0.040 +237 D 0.040 +238 K 0.037 +239 F 0.032 +240 W 0.027 +241 N 0.023 +242 F 0.021 +243 I 0.018 +244 F 0.016 +245 Y 0.015 +246 K 0.016 +247 F 0.017 +248 I 0.021 +249 F 0.027 +250 I 0.040 +251 F 0.060 +252 G 0.081 +253 V 0.096 +254 L 0.103 +255 N 0.105 +256 V 0.108 +257 Q 0.110 +258 T 0.104 +259 V 0.085 +260 E 0.063 +261 E 0.049 +262 V 0.042 +263 V 0.039 +264 M 0.039 +265 W 0.040 +266 C 0.038 +267 L 0.036 +268 W 0.039 +269 F 0.049 +270 A 0.062 +271 G 0.071 +272 L 0.074 +273 V 0.071 +274 F 0.068 +275 L 0.072 +276 H 0.078 +277 L 0.080 +278 M 0.075 +279 V 0.071 +280 Q 0.070 +281 L 0.068 +282 C 0.064 +283 K 0.059 +284 D 0.056 +285 R 0.055 +286 F 0.053 +287 E 0.054 +288 Y 0.057 +289 L 0.065 +290 S 0.076 +291 F 0.091 +292 S 0.110 +293 P 0.129 +294 T 0.138 +295 T 0.127 +296 P 0.101 +297 M 0.072 +298 S 0.052 +299 S 0.043 +300 H 0.038 +301 G 0.035 +302 R 0.034 +303 V 0.032 +304 L 0.029 +305 S 0.029 +306 L 0.030 +307 L 0.031 +308 I 0.033 +309 A 0.034 +310 M 0.037 +311 L 0.040 +312 L 0.044 +313 S 0.051 +314 C 0.059 +315 C 0.067 +316 G 0.069 +317 L 0.065 +318 A 0.059 +319 V 0.054 +320 V 0.050 +321 C 0.047 +322 C 0.046 +323 V 0.049 +324 T 0.054 +325 G 0.058 +326 Y 0.062 +327 T 0.067 +328 H 0.071 +329 G 0.069 +330 M 0.062 +331 H 0.054 +332 T 0.048 +333 L 0.042 +334 A 0.036 +335 F 0.031 +336 M 0.030 +337 A 0.033 +338 A 0.038 +339 E 0.045 +340 S 0.051 +341 L 0.052 +342 L 0.049 +343 V 0.045 +344 T 0.042 +345 V 0.041 +346 R 0.041 +347 T 0.041 +348 A 0.040 +349 H 0.038 +350 V 0.035 +351 I 0.031 +352 L 0.029 +353 R 0.028 +354 Y 0.027 +355 V 0.025 +356 I 0.027 +357 H 0.032 +358 L 0.041 +359 W 0.056 +360 D 0.078 +361 L 0.103 +362 N 0.124 +363 H 0.139 +364 E 0.147 +365 G 0.147 +366 T 0.137 +367 W 0.121 +368 E 0.103 +369 G 0.086 +370 K 0.072 +371 G 0.062 +372 T 0.056 +373 Y 0.051 +374 V 0.048 +375 Y 0.047 +376 Y 0.050 +377 T 0.054 +378 D 0.055 +379 F 0.053 +380 V 0.057 +381 M 0.065 +382 E 0.072 +383 L 0.071 +384 A 0.065 +385 L 0.059 +386 L 0.055 +387 S 0.055 +388 L 0.056 +389 D 0.054 +390 L 0.048 +391 M 0.042 +392 H 0.039 +393 H 0.039 +394 I 0.041 +395 H 0.046 +396 M 0.054 +397 L 0.067 +398 L 0.084 +399 F 0.097 +400 G 0.096 +401 N 0.082 +402 I 0.072 +403 W 0.076 +404 L 0.090 +405 S 0.096 +406 M 0.088 +407 A 0.077 +408 S 0.067 +409 L 0.059 +410 V 0.054 +411 I 0.054 +412 F 0.057 +413 M 0.060 +414 Q 0.060 +415 L 0.053 +416 R 0.043 +417 Y 0.036 +418 L 0.033 +419 F 0.035 +420 H 0.045 +421 E 0.061 +422 V 0.074 +423 Q 0.077 +424 R 0.069 +425 R 0.057 +426 I 0.057 +427 R 0.070 +428 R 0.085 +429 H 0.088 +430 K 0.085 +431 N 0.083 +432 Y 0.083 +433 L 0.079 +434 R 0.074 +435 V 0.070 +436 V 0.069 +437 G 0.069 +438 N 0.071 +439 M 0.075 +440 E 0.077 +441 A 0.077 +442 R 0.079 +443 F 0.084 +444 A 0.085 +445 V 0.080 +446 A 0.072 +447 T 0.068 +448 P 0.072 +449 E 0.078 +450 E 0.079 +451 L 0.076 +452 A 0.076 +453 V 0.084 +454 N 0.095 +455 N 0.102 +456 D 0.097 +457 D 0.082 +458 C 0.064 +459 A 0.051 +460 I 0.050 +461 C 0.060 +462 W 0.077 +463 D 0.096 +464 S 0.104 +465 M 0.095 +466 Q 0.080 +467 A 0.068 +468 A 0.061 +469 R 0.059 +470 K 0.058 +471 L 0.054 +472 P 0.049 +473 C 0.051 +474 G 0.060 +475 H 0.069 +476 L 0.069 +477 F 0.059 +478 H 0.047 +479 N 0.040 +480 S 0.041 +481 C 0.049 +482 L 0.054 +483 R 0.054 +484 S 0.051 +485 W 0.051 +486 L 0.052 +487 E 0.054 +488 Q 0.057 +489 D 0.062 +490 T 0.066 +491 S 0.066 +492 C 0.062 +493 P 0.061 +494 T 0.068 +495 C 0.088 +496 R 0.113 +497 M 0.143 +498 S 0.180 +499 L 0.229 +500 N 0.289 +501 I 0.352 +502 A 0.411 +503 D 0.464 +504 G 0.515 +505 S 0.564 +506 R 0.598 +507 A 0.608 +508 R 0.601 +509 E 0.593 +510 D 0.591 +511 H 0.597 +512 Q 0.614 +513 G 0.639 +514 E 0.661 +515 N 0.667 +516 L 0.651 +517 D 0.620 +518 E 0.586 +519 N 0.562 +520 L 0.561 +521 V 0.591 +522 P 0.646 +523 V 0.701 +524 A 0.725 +525 A 0.717 +526 A 0.694 +527 E 0.673 +528 G 0.663 +529 R 0.670 +530 P 0.690 +531 R 0.706 +532 L 0.701 +533 N 0.667 +534 Q 0.614 +535 H 0.555 +536 N 0.492 +537 H 0.417 +538 F 0.331 +539 F 0.253 +540 H 0.200 +541 F 0.181 +542 D 0.186 +543 G 0.198 +544 S 0.201 +545 R 0.190 +546 I 0.173 +547 A 0.166 +548 S 0.175 +549 W 0.205 +550 L 0.253 +551 P 0.302 +552 S 0.333 +553 F 0.351 +554 S 0.379 +555 V 0.420 +556 E 0.464 +557 V 0.501 +558 M 0.533 +559 H 0.568 +560 T 0.612 +561 T 0.656 +562 N 0.684 +563 I 0.692 +564 L 0.681 +565 G 0.650 +566 I 0.600 +567 T 0.536 +568 Q 0.465 +569 A 0.394 +570 S 0.331 +571 N 0.277 +572 S 0.224 +573 Q 0.171 +574 L 0.126 +575 N 0.092 +576 A 0.073 +577 M 0.065 +578 A 0.064 +579 H 0.067 +580 Q 0.072 +581 I 0.075 +582 Q 0.072 +583 E 0.066 +584 M 0.063 +585 F 0.066 +586 P 0.074 +587 Q 0.080 +588 V 0.082 +589 P 0.077 +590 Y 0.069 +591 H 0.061 +592 L 0.055 +593 V 0.050 +594 L 0.053 +595 Q 0.064 +596 D 0.077 +597 L 0.081 +598 Q 0.074 +599 M 0.064 +600 T 0.059 +601 R 0.061 +602 S 0.067 +603 V 0.069 +604 E 0.067 +605 I 0.064 +606 T 0.069 +607 T 0.079 +608 D 0.086 +609 N 0.085 +610 I 0.083 +611 L 0.093 +612 E 0.119 +613 G 0.150 +614 R 0.175 +615 I 0.196 +616 Q 0.227 +617 V 0.279 +618 P 0.354 +619 F 0.445 +620 P 0.537 +621 T 0.613 +622 Q 0.662 +623 R 0.685 +624 S 0.689 +625 D 0.681 +626 S 0.669 +627 L 0.660 +628 R 0.666 +629 P 0.685 +630 A 0.704 +631 L 0.710 +632 N 0.705 +633 S 0.693 +634 P 0.668 +635 V 0.631 +636 E 0.609 +637 R 0.627 +638 P 0.668 +639 S 0.710 +640 P 0.747 +641 D 0.775 +642 L 0.791 +643 E 0.795 +644 E 0.792 +645 G 0.779 +646 E 0.743 +647 A 0.691 +648 S 0.666 +649 V 0.696 +650 Q 0.748 +651 T 0.783 +652 E 0.790 +653 R 0.783 +654 V 0.777 +655 P 0.776 +656 L 0.772 +657 D 0.758 +658 L 0.741 +659 S 0.735 +660 P 0.748 +661 R 0.768 +662 L 0.778 +663 E 0.772 +664 E 0.754 +665 T 0.722 +666 L 0.681 +667 D 0.649 +668 F 0.645 +669 S 0.667 +670 E 0.691 +671 V 0.704 +672 E 0.710 +673 L 0.717 +674 E 0.725 +675 P 0.730 +676 I 0.730 +677 E 0.726 +678 V 0.721 +679 E 0.712 +680 D 0.695 +681 F 0.674 +682 E 0.658 +683 A 0.655 +684 R 0.662 +685 G 0.661 +686 S 0.632 +687 R 0.573 +688 F 0.507 +689 S 0.456 +690 K 0.428 +691 S 0.408 +692 A 0.381 +693 D 0.354 +694 E 0.338 +695 R 0.333 +696 Q 0.330 +697 R 0.332 +698 M 0.356 +699 L 0.384 +700 V 0.382 +701 Q 0.361 +702 R 0.358 +703 K 0.380 +704 D 0.403 +705 D 0.402 +706 L 0.375 +707 L 0.337 +708 Q 0.305 +709 Q 0.285 +710 A 0.272 +711 R 0.268 +712 K 0.283 +713 R 0.322 +714 F 0.380 +715 L 0.448 +716 N 0.520 +717 K 0.585 +718 S 0.626 +719 S 0.639 +720 E 0.644 +721 D 0.660 +722 D 0.682 +723 G 0.697 +724 A 0.700 +725 S 0.697 +726 E 0.688 +727 R 0.677 +728 L 0.671 +729 L 0.677 +730 P 0.698 +731 S 0.725 +732 E 0.740 +733 G 0.724 +734 T 0.674 +735 S 0.607 +736 S 0.546 +737 D 0.499 +738 P 0.456 +739 V 0.409 +740 T 0.367 +741 L 0.339 +742 R 0.321 +743 R 0.304 +744 R 0.289 +745 M 0.282 +746 L 0.275 +747 A 0.266 +748 A 0.262 +749 A 0.265 +750 A 0.271 +751 E 0.282 +752 R 0.300 +753 R 0.324 +754 L 0.351 +755 Q 0.382 +756 R 0.421 +757 Q 0.465 +758 R 0.508 +759 T 0.543 +760 T 0.565 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031913.10_ENSMUST00000034388.10_GN:Vps4a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031913.10_ENSMUST00000034388.10_GN:Vps4a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f262edfc2ac9ee9a08cef0b7aec259241c89984e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031913.10_ENSMUST00000034388.10_GN:Vps4a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,438 @@ +>ENSMUSG00000031913.10|ENSMUST00000034388.10|GN:Vps4a|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.365 +2 T 0.325 +3 T 0.257 +4 S 0.183 +5 T 0.123 +6 L 0.085 +7 Q 0.067 +8 K 0.062 +9 A 0.065 +10 I 0.071 +11 D 0.075 +12 L 0.075 +13 V 0.077 +14 T 0.082 +15 K 0.083 +16 A 0.081 +17 T 0.079 +18 E 0.078 +19 E 0.074 +20 D 0.075 +21 K 0.084 +22 A 0.098 +23 K 0.104 +24 N 0.096 +25 Y 0.078 +26 E 0.061 +27 E 0.055 +28 A 0.055 +29 L 0.054 +30 R 0.051 +31 L 0.048 +32 Y 0.049 +33 Q 0.050 +34 H 0.050 +35 A 0.045 +36 V 0.039 +37 E 0.033 +38 Y 0.031 +39 F 0.031 +40 L 0.035 +41 H 0.042 +42 A 0.051 +43 I 0.063 +44 K 0.080 +45 Y 0.106 +46 E 0.137 +47 A 0.165 +48 H 0.177 +49 S 0.172 +50 D 0.153 +51 K 0.129 +52 A 0.111 +53 K 0.101 +54 E 0.093 +55 S 0.086 +56 I 0.083 +57 R 0.087 +58 A 0.090 +59 K 0.087 +60 C 0.075 +61 M 0.062 +62 Q 0.054 +63 Y 0.057 +64 L 0.068 +65 D 0.074 +66 R 0.071 +67 A 0.064 +68 E 0.061 +69 K 0.062 +70 L 0.066 +71 K 0.074 +72 D 0.078 +73 Y 0.076 +74 L 0.079 +75 R 0.097 +76 N 0.128 +77 K 0.169 +78 E 0.222 +79 K 0.296 +80 H 0.386 +81 G 0.471 +82 K 0.532 +83 K 0.559 +84 P 0.553 +85 V 0.526 +86 K 0.515 +87 E 0.537 +88 N 0.555 +89 Q 0.542 +90 S 0.536 +91 E 0.576 +92 G 0.637 +93 K 0.678 +94 G 0.694 +95 S 0.697 +96 D 0.694 +97 S 0.685 +98 D 0.671 +99 S 0.652 +100 E 0.622 +101 G 0.571 +102 D 0.502 +103 N 0.424 +104 P 0.349 +105 E 0.293 +106 K 0.261 +107 K 0.234 +108 K 0.205 +109 L 0.179 +110 Q 0.161 +111 E 0.149 +112 Q 0.143 +113 L 0.143 +114 M 0.146 +115 G 0.149 +116 A 0.153 +117 V 0.163 +118 V 0.177 +119 M 0.197 +120 E 0.218 +121 K 0.225 +122 P 0.204 +123 N 0.160 +124 I 0.110 +125 R 0.072 +126 W 0.051 +127 N 0.044 +128 D 0.043 +129 V 0.042 +130 A 0.043 +131 G 0.046 +132 L 0.048 +133 E 0.049 +134 G 0.052 +135 A 0.056 +136 K 0.063 +137 E 0.077 +138 A 0.091 +139 L 0.099 +140 K 0.099 +141 E 0.093 +142 A 0.083 +143 V 0.070 +144 I 0.061 +145 L 0.057 +146 P 0.056 +147 I 0.055 +148 K 0.056 +149 F 0.059 +150 P 0.066 +151 H 0.074 +152 L 0.087 +153 F 0.104 +154 T 0.127 +155 G 0.159 +156 K 0.193 +157 R 0.213 +158 T 0.206 +159 P 0.173 +160 W 0.125 +161 R 0.084 +162 G 0.061 +163 I 0.053 +164 L 0.050 +165 L 0.050 +166 F 0.053 +167 G 0.058 +168 P 0.061 +169 P 0.061 +170 G 0.062 +171 T 0.066 +172 G 0.070 +173 K 0.069 +174 S 0.068 +175 Y 0.072 +176 L 0.082 +177 A 0.091 +178 K 0.098 +179 A 0.104 +180 V 0.106 +181 A 0.101 +182 T 0.093 +183 E 0.088 +184 A 0.090 +185 N 0.099 +186 N 0.107 +187 S 0.104 +188 T 0.086 +189 F 0.064 +190 F 0.049 +191 S 0.044 +192 V 0.043 +193 S 0.044 +194 S 0.048 +195 S 0.057 +196 D 0.067 +197 L 0.074 +198 M 0.075 +199 S 0.076 +200 K 0.081 +201 W 0.087 +202 L 0.089 +203 G 0.087 +204 E 0.081 +205 S 0.073 +206 E 0.062 +207 K 0.049 +208 L 0.039 +209 V 0.032 +210 K 0.029 +211 N 0.027 +212 L 0.026 +213 F 0.026 +214 E 0.027 +215 L 0.030 +216 A 0.035 +217 R 0.036 +218 Q 0.033 +219 H 0.029 +220 K 0.029 +221 P 0.037 +222 S 0.047 +223 I 0.053 +224 I 0.049 +225 F 0.041 +226 I 0.037 +227 D 0.037 +228 E 0.039 +229 V 0.042 +230 D 0.050 +231 S 0.065 +232 L 0.089 +233 C 0.120 +234 G 0.154 +235 S 0.183 +236 R 0.199 +237 N 0.199 +238 E 0.191 +239 N 0.179 +240 E 0.160 +241 S 0.134 +242 E 0.107 +243 A 0.087 +244 A 0.075 +245 R 0.070 +246 R 0.071 +247 I 0.073 +248 K 0.071 +249 T 0.063 +250 E 0.053 +251 F 0.045 +252 L 0.042 +253 V 0.046 +254 Q 0.059 +255 M 0.085 +256 Q 0.125 +257 G 0.171 +258 V 0.211 +259 G 0.236 +260 N 0.240 +261 N 0.221 +262 N 0.184 +263 D 0.140 +264 G 0.101 +265 T 0.074 +266 L 0.058 +267 V 0.051 +268 L 0.047 +269 G 0.047 +270 A 0.051 +271 T 0.060 +272 N 0.076 +273 I 0.093 +274 P 0.103 +275 W 0.101 +276 V 0.098 +277 L 0.098 +278 D 0.094 +279 S 0.085 +280 A 0.074 +281 I 0.068 +282 R 0.068 +283 R 0.071 +284 R 0.073 +285 F 0.073 +286 E 0.065 +287 K 0.053 +288 R 0.044 +289 I 0.044 +290 Y 0.050 +291 I 0.060 +292 P 0.068 +293 L 0.073 +294 P 0.072 +295 E 0.067 +296 E 0.060 +297 A 0.053 +298 A 0.047 +299 R 0.044 +300 A 0.045 +301 Q 0.047 +302 M 0.046 +303 F 0.045 +304 R 0.047 +305 L 0.052 +306 H 0.062 +307 L 0.076 +308 G 0.091 +309 S 0.100 +310 T 0.099 +311 P 0.090 +312 H 0.079 +313 N 0.071 +314 L 0.066 +315 T 0.061 +316 D 0.055 +317 A 0.050 +318 N 0.047 +319 I 0.044 +320 H 0.045 +321 E 0.054 +322 L 0.071 +323 A 0.084 +324 R 0.089 +325 K 0.088 +326 T 0.088 +327 E 0.089 +328 G 0.091 +329 Y 0.093 +330 S 0.093 +331 G 0.093 +332 A 0.094 +333 D 0.096 +334 I 0.093 +335 S 0.091 +336 I 0.096 +337 I 0.108 +338 V 0.115 +339 R 0.114 +340 D 0.112 +341 S 0.117 +342 L 0.123 +343 M 0.126 +344 Q 0.130 +345 P 0.138 +346 V 0.149 +347 R 0.159 +348 K 0.164 +349 V 0.161 +350 Q 0.154 +351 S 0.148 +352 A 0.145 +353 T 0.139 +354 H 0.129 +355 F 0.121 +356 K 0.122 +357 K 0.136 +358 V 0.163 +359 C 0.195 +360 G 0.217 +361 P 0.223 +362 S 0.222 +363 R 0.223 +364 T 0.233 +365 N 0.249 +366 P 0.263 +367 S 0.272 +368 V 0.273 +369 M 0.263 +370 I 0.242 +371 D 0.217 +372 D 0.193 +373 L 0.171 +374 L 0.160 +375 T 0.160 +376 P 0.168 +377 C 0.178 +378 S 0.183 +379 P 0.187 +380 G 0.194 +381 D 0.203 +382 P 0.206 +383 G 0.205 +384 A 0.208 +385 I 0.215 +386 E 0.218 +387 M 0.212 +388 T 0.198 +389 W 0.179 +390 M 0.167 +391 D 0.175 +392 V 0.200 +393 P 0.224 +394 G 0.226 +395 D 0.206 +396 K 0.180 +397 L 0.169 +398 L 0.179 +399 E 0.197 +400 P 0.205 +401 V 0.198 +402 V 0.173 +403 C 0.138 +404 M 0.107 +405 S 0.092 +406 D 0.088 +407 M 0.090 +408 L 0.097 +409 R 0.107 +410 S 0.114 +411 L 0.117 +412 A 0.122 +413 T 0.133 +414 T 0.143 +415 R 0.144 +416 P 0.142 +417 T 0.145 +418 V 0.143 +419 N 0.129 +420 A 0.110 +421 D 0.095 +422 D 0.089 +423 L 0.091 +424 L 0.090 +425 K 0.086 +426 V 0.086 +427 K 0.092 +428 K 0.095 +429 F 0.092 +430 S 0.091 +431 E 0.095 +432 D 0.105 +433 F 0.126 +434 G 0.163 +435 Q 0.219 +436 E 0.276 +437 S 0.312 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031913.10_ENSMUST00000034388.10_GN:Vps4a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:73.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031913.10_ENSMUST00000034388.10_GN:Vps4a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:73.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b2bbda6fdf99d17372d3866b460f3c5c1c50e349 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031913.10_ENSMUST00000034388.10_GN:Vps4a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:73.caid @@ -0,0 +1,511 @@ +>ENSMUSG00000031913.10|ENSMUST00000034388.10|GN:Vps4a|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:73 +1 M 0.391 +2 A 0.410 +3 T 0.442 +4 G 0.473 +5 R 0.496 +6 Q 0.517 +7 P 0.547 +8 R 0.576 +9 D 0.588 +10 S 0.577 +11 G 0.553 +12 W 0.537 +13 A 0.535 +14 A 0.528 +15 L 0.498 +16 G 0.456 +17 R 0.436 +18 A 0.446 +19 P 0.460 +20 R 0.479 +21 S 0.530 +22 P 0.605 +23 S 0.666 +24 D 0.694 +25 S 0.698 +26 A 0.695 +27 P 0.700 +28 T 0.713 +29 A 0.725 +30 S 0.728 +31 G 0.723 +32 S 0.706 +33 S 0.665 +34 A 0.603 +35 R 0.556 +36 A 0.543 +37 E 0.538 +38 S 0.542 +39 R 0.585 +40 P 0.656 +41 A 0.712 +42 G 0.730 +43 L 0.722 +44 L 0.707 +45 S 0.700 +46 G 0.696 +47 G 0.691 +48 P 0.683 +49 T 0.673 +50 T 0.657 +51 S 0.633 +52 A 0.615 +53 P 0.620 +54 P 0.637 +55 S 0.631 +56 R 0.598 +57 T 0.588 +58 E 0.637 +59 A 0.706 +60 A 0.748 +61 S 0.764 +62 S 0.773 +63 T 0.781 +64 A 0.783 +65 G 0.777 +66 C 0.761 +67 G 0.737 +68 A 0.712 +69 D 0.693 +70 P 0.677 +71 G 0.653 +72 Y 0.607 +73 E 0.530 +74 M 0.429 +75 T 0.321 +76 T 0.224 +77 S 0.149 +78 T 0.101 +79 L 0.075 +80 Q 0.065 +81 K 0.065 +82 A 0.069 +83 I 0.073 +84 D 0.071 +85 L 0.063 +86 V 0.055 +87 T 0.058 +88 K 0.066 +89 A 0.074 +90 T 0.078 +91 E 0.077 +92 E 0.072 +93 D 0.072 +94 K 0.079 +95 A 0.089 +96 K 0.093 +97 N 0.084 +98 Y 0.068 +99 E 0.055 +100 E 0.052 +101 A 0.053 +102 L 0.052 +103 R 0.048 +104 L 0.046 +105 Y 0.048 +106 Q 0.049 +107 H 0.047 +108 A 0.042 +109 V 0.035 +110 E 0.030 +111 Y 0.027 +112 F 0.028 +113 L 0.031 +114 H 0.036 +115 A 0.043 +116 I 0.054 +117 K 0.069 +118 Y 0.091 +119 E 0.116 +120 A 0.137 +121 H 0.145 +122 S 0.141 +123 D 0.128 +124 K 0.112 +125 A 0.099 +126 K 0.091 +127 E 0.084 +128 S 0.077 +129 I 0.075 +130 R 0.082 +131 A 0.087 +132 K 0.084 +133 C 0.073 +134 M 0.059 +135 Q 0.049 +136 Y 0.051 +137 L 0.062 +138 D 0.069 +139 R 0.065 +140 A 0.057 +141 E 0.051 +142 K 0.051 +143 L 0.058 +144 K 0.068 +145 D 0.074 +146 Y 0.071 +147 L 0.072 +148 R 0.086 +149 N 0.112 +150 K 0.150 +151 E 0.201 +152 K 0.273 +153 H 0.360 +154 G 0.446 +155 K 0.514 +156 K 0.563 +157 P 0.599 +158 V 0.626 +159 K 0.642 +160 E 0.638 +161 N 0.606 +162 Q 0.557 +163 S 0.538 +164 E 0.574 +165 G 0.634 +166 K 0.675 +167 G 0.692 +168 S 0.696 +169 D 0.692 +170 S 0.683 +171 D 0.668 +172 S 0.650 +173 E 0.621 +174 G 0.572 +175 D 0.503 +176 N 0.422 +177 P 0.343 +178 E 0.284 +179 K 0.250 +180 K 0.225 +181 K 0.199 +182 L 0.175 +183 Q 0.160 +184 E 0.149 +185 Q 0.143 +186 L 0.143 +187 M 0.147 +188 G 0.151 +189 A 0.157 +190 V 0.167 +191 V 0.181 +192 M 0.201 +193 E 0.220 +194 K 0.224 +195 P 0.202 +196 N 0.156 +197 I 0.106 +198 R 0.069 +199 W 0.049 +200 N 0.044 +201 D 0.042 +202 V 0.041 +203 A 0.041 +204 G 0.043 +205 L 0.045 +206 E 0.047 +207 G 0.049 +208 A 0.052 +209 K 0.060 +210 E 0.074 +211 A 0.091 +212 L 0.101 +213 K 0.102 +214 E 0.096 +215 A 0.085 +216 V 0.071 +217 I 0.061 +218 L 0.057 +219 P 0.056 +220 I 0.055 +221 K 0.056 +222 F 0.060 +223 P 0.064 +224 H 0.070 +225 L 0.081 +226 F 0.096 +227 T 0.117 +228 G 0.147 +229 K 0.180 +230 R 0.200 +231 T 0.195 +232 P 0.164 +233 W 0.119 +234 R 0.081 +235 G 0.059 +236 I 0.050 +237 L 0.047 +238 L 0.045 +239 F 0.047 +240 G 0.052 +241 P 0.055 +242 P 0.056 +243 G 0.058 +244 T 0.063 +245 G 0.067 +246 K 0.066 +247 S 0.064 +248 Y 0.068 +249 L 0.077 +250 A 0.086 +251 K 0.092 +252 A 0.096 +253 V 0.097 +254 A 0.092 +255 T 0.085 +256 E 0.080 +257 A 0.082 +258 N 0.092 +259 N 0.101 +260 S 0.099 +261 T 0.083 +262 F 0.062 +263 F 0.049 +264 S 0.045 +265 V 0.044 +266 S 0.045 +267 S 0.049 +268 S 0.058 +269 D 0.068 +270 L 0.075 +271 M 0.075 +272 S 0.075 +273 K 0.079 +274 W 0.085 +275 L 0.088 +276 G 0.086 +277 E 0.081 +278 S 0.074 +279 E 0.064 +280 K 0.051 +281 L 0.041 +282 V 0.034 +283 K 0.030 +284 N 0.027 +285 L 0.026 +286 F 0.027 +287 E 0.028 +288 L 0.032 +289 A 0.037 +290 R 0.039 +291 Q 0.036 +292 H 0.032 +293 K 0.032 +294 P 0.039 +295 S 0.050 +296 I 0.055 +297 I 0.051 +298 F 0.043 +299 I 0.039 +300 D 0.038 +301 E 0.041 +302 V 0.044 +303 D 0.052 +304 S 0.068 +305 L 0.095 +306 C 0.128 +307 G 0.165 +308 S 0.197 +309 R 0.214 +310 N 0.216 +311 E 0.209 +312 N 0.198 +313 E 0.180 +314 S 0.153 +315 E 0.123 +316 A 0.100 +317 A 0.087 +318 R 0.082 +319 R 0.082 +320 I 0.083 +321 K 0.079 +322 T 0.069 +323 E 0.058 +324 F 0.050 +325 L 0.047 +326 V 0.051 +327 Q 0.065 +328 M 0.092 +329 Q 0.135 +330 G 0.185 +331 V 0.227 +332 G 0.251 +333 N 0.255 +334 N 0.236 +335 N 0.198 +336 D 0.152 +337 G 0.109 +338 T 0.078 +339 L 0.060 +340 V 0.052 +341 L 0.049 +342 G 0.049 +343 A 0.054 +344 T 0.064 +345 N 0.080 +346 I 0.098 +347 P 0.108 +348 W 0.109 +349 V 0.110 +350 L 0.111 +351 D 0.106 +352 S 0.092 +353 A 0.078 +354 I 0.070 +355 R 0.070 +356 R 0.073 +357 R 0.076 +358 F 0.075 +359 E 0.066 +360 K 0.053 +361 R 0.044 +362 I 0.043 +363 Y 0.050 +364 I 0.060 +365 P 0.068 +366 L 0.073 +367 P 0.073 +368 E 0.068 +369 E 0.060 +370 A 0.054 +371 A 0.048 +372 R 0.045 +373 A 0.046 +374 Q 0.048 +375 M 0.047 +376 F 0.045 +377 R 0.046 +378 L 0.052 +379 H 0.062 +380 L 0.076 +381 G 0.091 +382 S 0.099 +383 T 0.098 +384 P 0.088 +385 H 0.077 +386 N 0.070 +387 L 0.065 +388 T 0.059 +389 D 0.053 +390 A 0.048 +391 N 0.045 +392 I 0.043 +393 H 0.045 +394 E 0.055 +395 L 0.072 +396 A 0.086 +397 R 0.091 +398 K 0.090 +399 T 0.090 +400 E 0.091 +401 G 0.093 +402 Y 0.096 +403 S 0.097 +404 G 0.098 +405 A 0.099 +406 D 0.100 +407 I 0.097 +408 S 0.094 +409 I 0.099 +410 I 0.110 +411 V 0.117 +412 R 0.115 +413 D 0.114 +414 S 0.120 +415 L 0.128 +416 M 0.132 +417 Q 0.136 +418 P 0.145 +419 V 0.156 +420 R 0.166 +421 K 0.171 +422 V 0.167 +423 Q 0.160 +424 S 0.154 +425 A 0.152 +426 T 0.146 +427 H 0.135 +428 F 0.126 +429 K 0.126 +430 K 0.138 +431 V 0.164 +432 C 0.195 +433 G 0.218 +434 P 0.226 +435 S 0.225 +436 R 0.226 +437 T 0.236 +438 N 0.253 +439 P 0.267 +440 S 0.277 +441 V 0.280 +442 M 0.271 +443 I 0.251 +444 D 0.226 +445 D 0.201 +446 L 0.180 +447 L 0.167 +448 T 0.166 +449 P 0.175 +450 C 0.186 +451 S 0.193 +452 P 0.198 +453 G 0.203 +454 D 0.209 +455 P 0.210 +456 G 0.209 +457 A 0.212 +458 I 0.222 +459 E 0.228 +460 M 0.224 +461 T 0.211 +462 W 0.192 +463 M 0.179 +464 D 0.186 +465 V 0.211 +466 P 0.234 +467 G 0.235 +468 D 0.213 +469 K 0.188 +470 L 0.182 +471 L 0.197 +472 E 0.217 +473 P 0.226 +474 V 0.216 +475 V 0.186 +476 C 0.147 +477 M 0.114 +478 S 0.097 +479 D 0.091 +480 M 0.087 +481 L 0.087 +482 R 0.095 +483 S 0.106 +484 L 0.115 +485 A 0.124 +486 T 0.136 +487 T 0.146 +488 R 0.146 +489 P 0.144 +490 T 0.146 +491 V 0.144 +492 N 0.129 +493 A 0.109 +494 D 0.093 +495 D 0.088 +496 L 0.089 +497 L 0.089 +498 K 0.085 +499 V 0.084 +500 K 0.088 +501 K 0.091 +502 F 0.089 +503 S 0.088 +504 E 0.095 +505 D 0.109 +506 F 0.135 +507 G 0.184 +508 Q 0.263 +509 E 0.361 +510 S 0.432 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031970.18_ENSMUST00000176155.3_GN:Dbndd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031970.18_ENSMUST00000176155.3_GN:Dbndd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..57d1446836df75b0f88d32be5ad057e6a0a409a8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031970.18_ENSMUST00000176155.3_GN:Dbndd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,161 @@ +>ENSMUSG00000031970.18|ENSMUST00000176155.3|GN:Dbndd1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.627 +2 E 0.641 +3 S 0.669 +4 P 0.706 +5 E 0.742 +6 G 0.765 +7 A 0.779 +8 G 0.793 +9 P 0.813 +10 G 0.832 +11 E 0.843 +12 I 0.844 +13 V 0.839 +14 K 0.830 +15 D 0.821 +16 V 0.814 +17 K 0.810 +18 V 0.811 +19 P 0.818 +20 Q 0.833 +21 A 0.848 +22 A 0.858 +23 L 0.863 +24 N 0.863 +25 V 0.862 +26 S 0.857 +27 A 0.849 +28 H 0.841 +29 E 0.836 +30 T 0.832 +31 G 0.829 +32 D 0.827 +33 M 0.824 +34 C 0.818 +35 R 0.813 +36 T 0.816 +37 P 0.826 +38 V 0.837 +39 A 0.844 +40 E 0.844 +41 E 0.841 +42 E 0.835 +43 E 0.831 +44 E 0.832 +45 V 0.837 +46 G 0.842 +47 I 0.842 +48 P 0.839 +49 I 0.838 +50 P 0.841 +51 A 0.850 +52 P 0.863 +53 G 0.874 +54 F 0.879 +55 L 0.875 +56 Q 0.864 +57 V 0.851 +58 T 0.835 +59 E 0.820 +60 R 0.807 +61 R 0.804 +62 Q 0.810 +63 P 0.825 +64 L 0.840 +65 S 0.851 +66 S 0.857 +67 V 0.857 +68 S 0.852 +69 S 0.846 +70 L 0.836 +71 E 0.817 +72 V 0.793 +73 H 0.770 +74 F 0.757 +75 D 0.746 +76 L 0.721 +77 L 0.672 +78 D 0.613 +79 L 0.573 +80 T 0.566 +81 E 0.588 +82 L 0.617 +83 T 0.620 +84 D 0.590 +85 M 0.549 +86 S 0.516 +87 D 0.491 +88 Q 0.485 +89 E 0.502 +90 L 0.506 +91 A 0.489 +92 E 0.499 +93 V 0.563 +94 F 0.645 +95 A 0.706 +96 D 0.742 +97 S 0.760 +98 D 0.767 +99 D 0.770 +100 E 0.777 +101 N 0.786 +102 L 0.789 +103 A 0.780 +104 T 0.764 +105 E 0.751 +106 S 0.749 +107 P 0.762 +108 A 0.779 +109 G 0.787 +110 L 0.780 +111 H 0.769 +112 P 0.770 +113 L 0.780 +114 S 0.785 +115 R 0.779 +116 A 0.766 +117 S 0.757 +118 C 0.755 +119 L 0.752 +120 R 0.742 +121 S 0.726 +122 P 0.711 +123 S 0.701 +124 W 0.700 +125 T 0.703 +126 K 0.699 +127 T 0.688 +128 R 0.689 +129 A 0.707 +130 E 0.731 +131 Q 0.747 +132 N 0.751 +133 R 0.746 +134 E 0.731 +135 K 0.708 +136 Q 0.691 +137 P 0.696 +138 P 0.717 +139 S 0.732 +140 D 0.733 +141 P 0.733 +142 E 0.743 +143 R 0.767 +144 Q 0.796 +145 G 0.819 +146 T 0.827 +147 I 0.821 +148 V 0.811 +149 D 0.804 +150 T 0.803 +151 F 0.803 +152 L 0.800 +153 T 0.790 +154 V 0.772 +155 E 0.743 +156 E 0.713 +157 P 0.688 +158 K 0.658 +159 E 0.610 +160 D 0.567 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031970.18_ENSMUST00000176155.3_GN:Dbndd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:34.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031970.18_ENSMUST00000176155.3_GN:Dbndd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:34.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..722afe92de6fb19d80286fe5d2f5213e7e372362 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000031970.18_ENSMUST00000176155.3_GN:Dbndd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:34.caid @@ -0,0 +1,195 @@ +>ENSMUSG00000031970.18|ENSMUST00000176155.3|GN:Dbndd1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:34 +1 M 0.606 +2 R 0.653 +3 C 0.711 +4 A 0.747 +5 R 0.760 +6 S 0.769 +7 P 0.786 +8 D 0.812 +9 S 0.837 +10 V 0.856 +11 V 0.867 +12 T 0.873 +13 R 0.878 +14 A 0.879 +15 V 0.873 +16 G 0.863 +17 A 0.855 +18 P 0.852 +19 G 0.847 +20 L 0.830 +21 S 0.807 +22 P 0.793 +23 P 0.796 +24 L 0.807 +25 P 0.813 +26 T 0.812 +27 P 0.814 +28 P 0.822 +29 A 0.832 +30 D 0.841 +31 P 0.853 +32 I 0.866 +33 G 0.874 +34 R 0.871 +35 M 0.859 +36 E 0.844 +37 S 0.835 +38 P 0.836 +39 E 0.844 +40 G 0.848 +41 A 0.846 +42 G 0.846 +43 P 0.854 +44 G 0.867 +45 E 0.875 +46 I 0.876 +47 V 0.873 +48 K 0.868 +49 D 0.862 +50 V 0.856 +51 K 0.850 +52 V 0.847 +53 P 0.851 +54 Q 0.864 +55 A 0.878 +56 A 0.888 +57 L 0.892 +58 N 0.892 +59 V 0.890 +60 S 0.885 +61 A 0.876 +62 H 0.867 +63 E 0.861 +64 T 0.856 +65 G 0.851 +66 D 0.846 +67 M 0.839 +68 C 0.829 +69 R 0.821 +70 T 0.823 +71 P 0.835 +72 V 0.849 +73 A 0.857 +74 E 0.858 +75 E 0.854 +76 E 0.848 +77 E 0.844 +78 E 0.845 +79 V 0.849 +80 G 0.851 +81 I 0.847 +82 P 0.842 +83 I 0.840 +84 P 0.843 +85 A 0.849 +86 P 0.859 +87 G 0.870 +88 F 0.874 +89 L 0.868 +90 Q 0.855 +91 V 0.841 +92 T 0.825 +93 E 0.810 +94 R 0.799 +95 R 0.796 +96 Q 0.804 +97 P 0.818 +98 L 0.832 +99 S 0.842 +100 S 0.847 +101 V 0.847 +102 S 0.842 +103 S 0.835 +104 L 0.823 +105 E 0.799 +106 V 0.768 +107 H 0.742 +108 F 0.732 +109 D 0.727 +110 L 0.708 +111 L 0.662 +112 D 0.604 +113 L 0.562 +114 T 0.552 +115 E 0.574 +116 L 0.604 +117 T 0.610 +118 D 0.579 +119 M 0.531 +120 S 0.488 +121 D 0.457 +122 Q 0.451 +123 E 0.468 +124 L 0.473 +125 A 0.459 +126 E 0.477 +127 V 0.549 +128 F 0.637 +129 A 0.699 +130 D 0.735 +131 S 0.753 +132 D 0.760 +133 D 0.765 +134 E 0.775 +135 N 0.789 +136 L 0.795 +137 A 0.788 +138 T 0.773 +139 E 0.760 +140 S 0.757 +141 P 0.769 +142 A 0.787 +143 G 0.795 +144 L 0.789 +145 H 0.780 +146 P 0.783 +147 L 0.796 +148 S 0.802 +149 R 0.798 +150 A 0.787 +151 S 0.778 +152 C 0.776 +153 L 0.772 +154 R 0.761 +155 S 0.745 +156 P 0.732 +157 S 0.725 +158 W 0.727 +159 T 0.731 +160 K 0.725 +161 T 0.710 +162 R 0.703 +163 A 0.714 +164 E 0.734 +165 Q 0.751 +166 N 0.758 +167 R 0.754 +168 E 0.739 +169 K 0.716 +170 Q 0.699 +171 P 0.705 +172 P 0.727 +173 S 0.742 +174 D 0.742 +175 P 0.741 +176 E 0.751 +177 R 0.775 +178 Q 0.804 +179 G 0.826 +180 T 0.834 +181 I 0.829 +182 V 0.819 +183 D 0.812 +184 T 0.810 +185 F 0.808 +186 L 0.804 +187 T 0.794 +188 V 0.776 +189 E 0.749 +190 E 0.721 +191 P 0.698 +192 K 0.672 +193 E 0.631 +194 D 0.592 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032116.19_ENSMUST00000120381.9_GN:Stt3a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032116.19_ENSMUST00000120381.9_GN:Stt3a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..77802cefef1afefcfdbf617a2ef0dac6738bf917 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032116.19_ENSMUST00000120381.9_GN:Stt3a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,706 @@ +>ENSMUSG00000032116.19|ENSMUST00000120381.9|GN:Stt3a|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.336 +2 T 0.335 +3 K 0.332 +4 L 0.328 +5 G 0.326 +6 F 0.324 +7 L 0.315 +8 R 0.291 +9 L 0.254 +10 S 0.215 +11 Y 0.182 +12 E 0.159 +13 K 0.146 +14 Q 0.135 +15 D 0.119 +16 T 0.100 +17 L 0.089 +18 L 0.086 +19 K 0.084 +20 L 0.083 +21 L 0.084 +22 I 0.088 +23 L 0.091 +24 S 0.090 +25 M 0.088 +26 A 0.088 +27 A 0.093 +28 V 0.099 +29 L 0.103 +30 S 0.104 +31 F 0.103 +32 S 0.105 +33 T 0.106 +34 R 0.096 +35 L 0.079 +36 F 0.067 +37 A 0.066 +38 V 0.074 +39 L 0.091 +40 R 0.114 +41 F 0.132 +42 E 0.140 +43 S 0.141 +44 V 0.139 +45 I 0.132 +46 H 0.125 +47 E 0.124 +48 F 0.129 +49 D 0.125 +50 P 0.106 +51 Y 0.083 +52 F 0.069 +53 N 0.063 +54 Y 0.059 +55 R 0.055 +56 T 0.055 +57 T 0.055 +58 R 0.055 +59 F 0.054 +60 L 0.058 +61 A 0.065 +62 E 0.076 +63 E 0.089 +64 G 0.097 +65 F 0.093 +66 Y 0.087 +67 K 0.089 +68 F 0.099 +69 H 0.109 +70 N 0.118 +71 W 0.129 +72 F 0.137 +73 D 0.134 +74 D 0.120 +75 R 0.099 +76 A 0.077 +77 W 0.061 +78 Y 0.058 +79 P 0.073 +80 L 0.102 +81 G 0.131 +82 R 0.148 +83 I 0.157 +84 I 0.168 +85 G 0.183 +86 G 0.194 +87 T 0.193 +88 I 0.184 +89 Y 0.173 +90 P 0.163 +91 G 0.156 +92 L 0.156 +93 M 0.153 +94 I 0.137 +95 T 0.118 +96 S 0.109 +97 A 0.109 +98 A 0.109 +99 I 0.105 +100 Y 0.101 +101 H 0.097 +102 V 0.094 +103 L 0.095 +104 H 0.101 +105 F 0.112 +106 F 0.125 +107 H 0.139 +108 I 0.145 +109 T 0.135 +110 I 0.114 +111 D 0.094 +112 I 0.085 +113 R 0.085 +114 N 0.090 +115 V 0.092 +116 C 0.092 +117 V 0.097 +118 F 0.109 +119 L 0.124 +120 A 0.136 +121 P 0.140 +122 L 0.138 +123 F 0.135 +124 S 0.134 +125 S 0.129 +126 F 0.118 +127 T 0.105 +128 T 0.090 +129 I 0.075 +130 V 0.066 +131 T 0.062 +132 Y 0.063 +133 H 0.067 +134 L 0.070 +135 T 0.070 +136 K 0.069 +137 E 0.070 +138 L 0.068 +139 K 0.062 +140 D 0.057 +141 A 0.060 +142 G 0.067 +143 A 0.070 +144 G 0.068 +145 L 0.070 +146 L 0.084 +147 A 0.105 +148 A 0.120 +149 A 0.125 +150 M 0.129 +151 I 0.131 +152 A 0.120 +153 V 0.100 +154 V 0.089 +155 P 0.092 +156 G 0.099 +157 Y 0.100 +158 I 0.097 +159 S 0.094 +160 R 0.097 +161 S 0.105 +162 V 0.116 +163 A 0.129 +164 G 0.147 +165 S 0.166 +166 Y 0.179 +167 D 0.190 +168 N 0.205 +169 E 0.209 +170 G 0.190 +171 I 0.163 +172 A 0.148 +173 I 0.141 +174 F 0.128 +175 C 0.107 +176 M 0.093 +177 L 0.086 +178 L 0.078 +179 T 0.066 +180 Y 0.056 +181 Y 0.049 +182 M 0.044 +183 W 0.043 +184 I 0.048 +185 K 0.054 +186 A 0.058 +187 V 0.064 +188 K 0.072 +189 T 0.082 +190 G 0.088 +191 S 0.083 +192 I 0.069 +193 Y 0.058 +194 W 0.055 +195 A 0.057 +196 A 0.061 +197 K 0.070 +198 C 0.084 +199 A 0.094 +200 L 0.097 +201 A 0.100 +202 Y 0.101 +203 F 0.096 +204 Y 0.089 +205 M 0.089 +206 V 0.095 +207 S 0.101 +208 S 0.101 +209 W 0.100 +210 G 0.103 +211 G 0.104 +212 Y 0.093 +213 V 0.076 +214 F 0.063 +215 L 0.060 +216 I 0.063 +217 N 0.063 +218 L 0.058 +219 I 0.051 +220 P 0.045 +221 L 0.040 +222 H 0.036 +223 V 0.033 +224 L 0.032 +225 V 0.035 +226 L 0.039 +227 M 0.043 +228 L 0.049 +229 T 0.058 +230 G 0.068 +231 R 0.075 +232 F 0.074 +233 S 0.064 +234 H 0.054 +235 R 0.048 +236 I 0.042 +237 Y 0.038 +238 V 0.036 +239 A 0.036 +240 Y 0.035 +241 C 0.034 +242 T 0.034 +243 V 0.034 +244 Y 0.037 +245 C 0.041 +246 L 0.047 +247 G 0.053 +248 T 0.057 +249 I 0.062 +250 L 0.067 +251 S 0.068 +252 M 0.065 +253 Q 0.063 +254 I 0.066 +255 S 0.067 +256 F 0.067 +257 V 0.066 +258 G 0.067 +259 F 0.067 +260 Q 0.067 +261 P 0.068 +262 V 0.070 +263 L 0.073 +264 S 0.076 +265 S 0.075 +266 E 0.070 +267 H 0.063 +268 M 0.059 +269 A 0.061 +270 A 0.067 +271 F 0.072 +272 G 0.074 +273 V 0.072 +274 F 0.070 +275 G 0.069 +276 L 0.065 +277 C 0.061 +278 Q 0.060 +279 I 0.059 +280 H 0.054 +281 A 0.049 +282 F 0.047 +283 V 0.048 +284 D 0.051 +285 Y 0.055 +286 L 0.062 +287 R 0.070 +288 S 0.082 +289 K 0.095 +290 L 0.103 +291 N 0.102 +292 P 0.096 +293 Q 0.089 +294 Q 0.078 +295 F 0.070 +296 E 0.069 +297 V 0.070 +298 L 0.069 +299 F 0.071 +300 R 0.073 +301 S 0.071 +302 V 0.066 +303 I 0.065 +304 S 0.071 +305 L 0.081 +306 V 0.093 +307 G 0.100 +308 F 0.102 +309 V 0.100 +310 L 0.098 +311 L 0.099 +312 T 0.107 +313 V 0.117 +314 G 0.124 +315 A 0.125 +316 L 0.123 +317 L 0.126 +318 M 0.134 +319 L 0.147 +320 T 0.164 +321 G 0.181 +322 K 0.190 +323 I 0.192 +324 S 0.186 +325 P 0.173 +326 W 0.158 +327 T 0.146 +328 G 0.138 +329 R 0.134 +330 F 0.135 +331 Y 0.138 +332 S 0.140 +333 L 0.146 +334 L 0.161 +335 D 0.179 +336 P 0.193 +337 S 0.196 +338 Y 0.187 +339 A 0.175 +340 K 0.173 +341 N 0.180 +342 N 0.188 +343 I 0.191 +344 P 0.194 +345 I 0.209 +346 I 0.238 +347 A 0.269 +348 S 0.285 +349 V 0.287 +350 S 0.286 +351 E 0.288 +352 H 0.286 +353 Q 0.273 +354 P 0.243 +355 T 0.198 +356 T 0.147 +357 W 0.105 +358 S 0.077 +359 S 0.062 +360 Y 0.053 +361 Y 0.049 +362 F 0.051 +363 D 0.055 +364 L 0.055 +365 Q 0.051 +366 L 0.046 +367 L 0.045 +368 V 0.045 +369 F 0.044 +370 M 0.044 +371 F 0.045 +372 P 0.048 +373 V 0.048 +374 G 0.045 +375 L 0.040 +376 Y 0.036 +377 Y 0.037 +378 C 0.043 +379 F 0.054 +380 S 0.068 +381 N 0.079 +382 L 0.082 +383 S 0.074 +384 D 0.061 +385 A 0.051 +386 R 0.048 +387 I 0.049 +388 F 0.052 +389 I 0.055 +390 I 0.060 +391 M 0.063 +392 Y 0.066 +393 G 0.068 +394 V 0.068 +395 T 0.068 +396 S 0.073 +397 M 0.079 +398 Y 0.082 +399 F 0.083 +400 S 0.089 +401 A 0.099 +402 V 0.117 +403 M 0.147 +404 V 0.182 +405 R 0.203 +406 L 0.196 +407 M 0.167 +408 L 0.139 +409 V 0.122 +410 L 0.115 +411 A 0.110 +412 P 0.102 +413 V 0.093 +414 M 0.083 +415 C 0.070 +416 I 0.058 +417 L 0.049 +418 S 0.044 +419 G 0.042 +420 I 0.045 +421 G 0.048 +422 V 0.050 +423 S 0.050 +424 Q 0.052 +425 V 0.056 +426 L 0.057 +427 S 0.057 +428 T 0.061 +429 Y 0.073 +430 M 0.092 +431 K 0.122 +432 N 0.163 +433 L 0.214 +434 D 0.266 +435 I 0.312 +436 S 0.353 +437 R 0.391 +438 P 0.423 +439 D 0.452 +440 K 0.475 +441 K 0.489 +442 S 0.499 +443 K 0.514 +444 K 0.533 +445 Q 0.547 +446 Q 0.546 +447 D 0.524 +448 S 0.480 +449 T 0.423 +450 Y 0.366 +451 P 0.310 +452 I 0.256 +453 K 0.207 +454 N 0.171 +455 E 0.149 +456 V 0.137 +457 A 0.131 +458 S 0.125 +459 G 0.120 +460 M 0.117 +461 I 0.119 +462 L 0.119 +463 V 0.115 +464 M 0.112 +465 A 0.110 +466 F 0.108 +467 F 0.102 +468 L 0.094 +469 I 0.087 +470 T 0.085 +471 Y 0.090 +472 T 0.097 +473 F 0.099 +474 H 0.099 +475 S 0.102 +476 T 0.107 +477 W 0.111 +478 V 0.115 +479 T 0.123 +480 S 0.140 +481 E 0.167 +482 A 0.197 +483 Y 0.222 +484 S 0.241 +485 S 0.260 +486 P 0.278 +487 S 0.294 +488 I 0.314 +489 V 0.339 +490 L 0.363 +491 S 0.385 +492 A 0.408 +493 R 0.429 +494 G 0.436 +495 G 0.421 +496 D 0.390 +497 G 0.360 +498 S 0.338 +499 R 0.327 +500 I 0.320 +501 I 0.305 +502 F 0.272 +503 D 0.223 +504 D 0.171 +505 F 0.129 +506 R 0.096 +507 E 0.074 +508 A 0.067 +509 Y 0.071 +510 Y 0.074 +511 W 0.070 +512 L 0.067 +513 R 0.070 +514 H 0.082 +515 N 0.098 +516 T 0.110 +517 P 0.114 +518 E 0.111 +519 D 0.105 +520 A 0.098 +521 K 0.093 +522 V 0.091 +523 M 0.096 +524 S 0.108 +525 W 0.124 +526 W 0.129 +527 D 0.117 +528 Y 0.096 +529 G 0.077 +530 Y 0.067 +531 Q 0.064 +532 I 0.063 +533 T 0.064 +534 A 0.068 +535 M 0.078 +536 A 0.089 +537 N 0.104 +538 R 0.117 +539 T 0.126 +540 I 0.129 +541 L 0.136 +542 V 0.150 +543 D 0.167 +544 N 0.176 +545 N 0.175 +546 T 0.168 +547 W 0.159 +548 N 0.149 +549 N 0.138 +550 T 0.128 +551 H 0.121 +552 I 0.116 +553 S 0.115 +554 R 0.119 +555 V 0.129 +556 G 0.137 +557 Q 0.135 +558 A 0.124 +559 M 0.116 +560 A 0.111 +561 S 0.107 +562 T 0.099 +563 E 0.086 +564 E 0.073 +565 K 0.063 +566 A 0.063 +567 Y 0.071 +568 E 0.077 +569 I 0.071 +570 M 0.059 +571 R 0.054 +572 E 0.060 +573 L 0.072 +574 D 0.077 +575 V 0.075 +576 S 0.070 +577 Y 0.068 +578 V 0.070 +579 L 0.075 +580 V 0.081 +581 I 0.090 +582 F 0.100 +583 G 0.112 +584 G 0.124 +585 L 0.133 +586 T 0.139 +587 G 0.146 +588 Y 0.158 +589 S 0.164 +590 S 0.153 +591 D 0.128 +592 D 0.101 +593 I 0.081 +594 N 0.072 +595 K 0.071 +596 F 0.072 +597 L 0.069 +598 W 0.065 +599 M 0.064 +600 V 0.068 +601 R 0.076 +602 I 0.088 +603 G 0.100 +604 G 0.108 +605 S 0.115 +606 T 0.128 +607 E 0.146 +608 T 0.163 +609 G 0.177 +610 R 0.184 +611 H 0.184 +612 I 0.175 +613 K 0.161 +614 E 0.150 +615 N 0.147 +616 D 0.145 +617 Y 0.139 +618 Y 0.131 +619 T 0.127 +620 P 0.133 +621 T 0.147 +622 G 0.165 +623 E 0.177 +624 F 0.178 +625 R 0.170 +626 V 0.164 +627 D 0.172 +628 R 0.192 +629 E 0.211 +630 G 0.219 +631 S 0.217 +632 P 0.216 +633 V 0.216 +634 L 0.212 +635 L 0.201 +636 N 0.183 +637 C 0.165 +638 L 0.153 +639 M 0.145 +640 Y 0.142 +641 K 0.145 +642 M 0.149 +643 C 0.149 +644 Y 0.148 +645 Y 0.156 +646 R 0.178 +647 F 0.206 +648 G 0.230 +649 Q 0.247 +650 V 0.261 +651 Y 0.271 +652 T 0.275 +653 E 0.272 +654 A 0.264 +655 K 0.258 +656 R 0.265 +657 P 0.291 +658 P 0.319 +659 G 0.318 +660 F 0.285 +661 D 0.239 +662 R 0.198 +663 V 0.174 +664 R 0.170 +665 N 0.184 +666 A 0.204 +667 E 0.217 +668 I 0.217 +669 G 0.209 +670 N 0.203 +671 K 0.198 +672 D 0.192 +673 F 0.183 +674 E 0.170 +675 L 0.153 +676 D 0.134 +677 V 0.115 +678 L 0.101 +679 E 0.092 +680 E 0.086 +681 A 0.081 +682 Y 0.077 +683 T 0.078 +684 T 0.085 +685 E 0.091 +686 H 0.091 +687 W 0.088 +688 L 0.083 +689 V 0.079 +690 R 0.078 +691 I 0.078 +692 Y 0.079 +693 K 0.083 +694 V 0.100 +695 K 0.133 +696 D 0.178 +697 L 0.229 +698 D 0.281 +699 N 0.333 +700 R 0.385 +701 G 0.426 +702 L 0.441 +703 S 0.430 +704 R 0.410 +705 T 0.398 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032116.19_ENSMUST00000120381.9_GN:Stt3a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:48.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032116.19_ENSMUST00000120381.9_GN:Stt3a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:48.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b6754f6aa895ba1edb46b464fae0360853b6c01b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032116.19_ENSMUST00000120381.9_GN:Stt3a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:48.caid @@ -0,0 +1,754 @@ +>ENSMUSG00000032116.19|ENSMUST00000120381.9|GN:Stt3a|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:48 +1 M 0.338 +2 R 0.346 +3 S 0.369 +4 G 0.404 +5 Q 0.439 +6 G 0.471 +7 G 0.500 +8 G 0.511 +9 P 0.487 +10 W 0.437 +11 L 0.385 +12 L 0.355 +13 S 0.354 +14 G 0.369 +15 L 0.370 +16 S 0.360 +17 A 0.374 +18 P 0.418 +19 L 0.465 +20 N 0.494 +21 G 0.502 +22 W 0.492 +23 Q 0.481 +24 G 0.476 +25 E 0.458 +26 Q 0.412 +27 S 0.351 +28 G 0.289 +29 F 0.234 +30 L 0.195 +31 R 0.172 +32 S 0.158 +33 I 0.147 +34 R 0.141 +35 E 0.139 +36 V 0.146 +37 F 0.166 +38 E 0.197 +39 Y 0.233 +40 H 0.272 +41 Q 0.317 +42 L 0.365 +43 P 0.408 +44 P 0.432 +45 I 0.429 +46 D 0.410 +47 V 0.394 +48 K 0.382 +49 M 0.367 +50 T 0.346 +51 K 0.323 +52 L 0.307 +53 G 0.297 +54 F 0.287 +55 L 0.271 +56 R 0.244 +57 L 0.209 +58 S 0.176 +59 Y 0.149 +60 E 0.129 +61 K 0.122 +62 Q 0.122 +63 D 0.119 +64 T 0.111 +65 L 0.106 +66 L 0.106 +67 K 0.106 +68 L 0.103 +69 L 0.101 +70 I 0.101 +71 L 0.102 +72 S 0.101 +73 M 0.098 +74 A 0.097 +75 A 0.100 +76 V 0.104 +77 L 0.106 +78 S 0.105 +79 F 0.104 +80 S 0.105 +81 T 0.106 +82 R 0.096 +83 L 0.078 +84 F 0.065 +85 A 0.063 +86 V 0.070 +87 L 0.086 +88 R 0.107 +89 F 0.125 +90 E 0.132 +91 S 0.131 +92 V 0.128 +93 I 0.121 +94 H 0.114 +95 E 0.114 +96 F 0.121 +97 D 0.118 +98 P 0.100 +99 Y 0.079 +100 F 0.066 +101 N 0.060 +102 Y 0.056 +103 R 0.052 +104 T 0.052 +105 T 0.053 +106 R 0.052 +107 F 0.051 +108 L 0.054 +109 A 0.060 +110 E 0.070 +111 E 0.082 +112 G 0.088 +113 F 0.084 +114 Y 0.079 +115 K 0.082 +116 F 0.093 +117 H 0.103 +118 N 0.112 +119 W 0.123 +120 F 0.131 +121 D 0.129 +122 D 0.115 +123 R 0.095 +124 A 0.074 +125 W 0.059 +126 Y 0.056 +127 P 0.072 +128 L 0.102 +129 G 0.131 +130 R 0.148 +131 I 0.157 +132 I 0.168 +133 G 0.183 +134 G 0.194 +135 T 0.194 +136 I 0.186 +137 Y 0.174 +138 P 0.162 +139 G 0.153 +140 L 0.153 +141 M 0.152 +142 I 0.136 +143 T 0.118 +144 S 0.110 +145 A 0.111 +146 A 0.108 +147 I 0.097 +148 Y 0.084 +149 H 0.075 +150 V 0.073 +151 L 0.075 +152 H 0.079 +153 F 0.087 +154 F 0.106 +155 H 0.130 +156 I 0.144 +157 T 0.136 +158 I 0.114 +159 D 0.094 +160 I 0.086 +161 R 0.087 +162 N 0.092 +163 V 0.093 +164 C 0.092 +165 V 0.095 +166 F 0.107 +167 L 0.121 +168 A 0.132 +169 P 0.135 +170 L 0.133 +171 F 0.130 +172 S 0.129 +173 S 0.124 +174 F 0.112 +175 T 0.098 +176 T 0.084 +177 I 0.070 +178 V 0.060 +179 T 0.057 +180 Y 0.058 +181 H 0.062 +182 L 0.065 +183 T 0.066 +184 K 0.065 +185 E 0.066 +186 L 0.065 +187 K 0.059 +188 D 0.054 +189 A 0.058 +190 G 0.065 +191 A 0.068 +192 G 0.066 +193 L 0.068 +194 L 0.083 +195 A 0.105 +196 A 0.120 +197 A 0.124 +198 M 0.128 +199 I 0.130 +200 A 0.118 +201 V 0.099 +202 V 0.089 +203 P 0.092 +204 G 0.099 +205 Y 0.100 +206 I 0.096 +207 S 0.091 +208 R 0.093 +209 S 0.100 +210 V 0.109 +211 A 0.123 +212 G 0.142 +213 S 0.162 +214 Y 0.177 +215 D 0.189 +216 N 0.204 +217 E 0.208 +218 G 0.190 +219 I 0.163 +220 A 0.149 +221 I 0.145 +222 F 0.132 +223 C 0.111 +224 M 0.097 +225 L 0.090 +226 L 0.081 +227 T 0.068 +228 Y 0.057 +229 Y 0.049 +230 M 0.044 +231 W 0.044 +232 I 0.048 +233 K 0.054 +234 A 0.059 +235 V 0.064 +236 K 0.074 +237 T 0.083 +238 G 0.088 +239 S 0.082 +240 I 0.068 +241 Y 0.056 +242 W 0.054 +243 A 0.056 +244 A 0.060 +245 K 0.069 +246 C 0.083 +247 A 0.093 +248 L 0.096 +249 A 0.098 +250 Y 0.099 +251 F 0.094 +252 Y 0.086 +253 M 0.086 +254 V 0.091 +255 S 0.096 +256 S 0.096 +257 W 0.095 +258 G 0.098 +259 G 0.099 +260 Y 0.090 +261 V 0.073 +262 F 0.061 +263 L 0.059 +264 I 0.062 +265 N 0.062 +266 L 0.058 +267 I 0.051 +268 P 0.045 +269 L 0.040 +270 H 0.036 +271 V 0.032 +272 L 0.032 +273 V 0.034 +274 L 0.037 +275 M 0.041 +276 L 0.046 +277 T 0.054 +278 G 0.065 +279 R 0.072 +280 F 0.072 +281 S 0.063 +282 H 0.053 +283 R 0.047 +284 I 0.042 +285 Y 0.038 +286 V 0.036 +287 A 0.035 +288 Y 0.035 +289 C 0.034 +290 T 0.034 +291 V 0.035 +292 Y 0.037 +293 C 0.042 +294 L 0.047 +295 G 0.052 +296 T 0.056 +297 I 0.061 +298 L 0.065 +299 S 0.066 +300 M 0.063 +301 Q 0.062 +302 I 0.064 +303 S 0.067 +304 F 0.067 +305 V 0.068 +306 G 0.070 +307 F 0.071 +308 Q 0.071 +309 P 0.070 +310 V 0.070 +311 L 0.072 +312 S 0.074 +313 S 0.073 +314 E 0.069 +315 H 0.062 +316 M 0.057 +317 A 0.059 +318 A 0.065 +319 F 0.071 +320 G 0.073 +321 V 0.071 +322 F 0.070 +323 G 0.068 +324 L 0.064 +325 C 0.060 +326 Q 0.059 +327 I 0.057 +328 H 0.053 +329 A 0.048 +330 F 0.047 +331 V 0.048 +332 D 0.051 +333 Y 0.055 +334 L 0.062 +335 R 0.071 +336 S 0.083 +337 K 0.098 +338 L 0.106 +339 N 0.105 +340 P 0.098 +341 Q 0.089 +342 Q 0.077 +343 F 0.069 +344 E 0.068 +345 V 0.069 +346 L 0.068 +347 F 0.070 +348 R 0.073 +349 S 0.071 +350 V 0.066 +351 I 0.065 +352 S 0.071 +353 L 0.082 +354 V 0.093 +355 G 0.101 +356 F 0.104 +357 V 0.102 +358 L 0.100 +359 L 0.102 +360 T 0.109 +361 V 0.117 +362 G 0.121 +363 A 0.118 +364 L 0.117 +365 L 0.122 +366 M 0.132 +367 L 0.144 +368 T 0.161 +369 G 0.178 +370 K 0.188 +371 I 0.190 +372 S 0.184 +373 P 0.170 +374 W 0.155 +375 T 0.144 +376 G 0.137 +377 R 0.135 +378 F 0.137 +379 Y 0.140 +380 S 0.142 +381 L 0.148 +382 L 0.163 +383 D 0.181 +384 P 0.194 +385 S 0.195 +386 Y 0.184 +387 A 0.172 +388 K 0.170 +389 N 0.178 +390 N 0.185 +391 I 0.188 +392 P 0.192 +393 I 0.207 +394 I 0.235 +395 A 0.265 +396 S 0.283 +397 V 0.286 +398 S 0.287 +399 E 0.290 +400 H 0.289 +401 Q 0.276 +402 P 0.245 +403 T 0.199 +404 T 0.148 +405 W 0.104 +406 S 0.076 +407 S 0.061 +408 Y 0.052 +409 Y 0.048 +410 F 0.050 +411 D 0.054 +412 L 0.054 +413 Q 0.050 +414 L 0.046 +415 L 0.045 +416 V 0.045 +417 F 0.044 +418 M 0.044 +419 F 0.046 +420 P 0.048 +421 V 0.048 +422 G 0.046 +423 L 0.040 +424 Y 0.036 +425 Y 0.037 +426 C 0.043 +427 F 0.053 +428 S 0.066 +429 N 0.076 +430 L 0.080 +431 S 0.073 +432 D 0.060 +433 A 0.051 +434 R 0.049 +435 I 0.050 +436 F 0.052 +437 I 0.056 +438 I 0.061 +439 M 0.065 +440 Y 0.069 +441 G 0.071 +442 V 0.070 +443 T 0.070 +444 S 0.075 +445 M 0.081 +446 Y 0.084 +447 F 0.086 +448 S 0.091 +449 A 0.101 +450 V 0.119 +451 M 0.150 +452 V 0.185 +453 R 0.207 +454 L 0.199 +455 M 0.171 +456 L 0.142 +457 V 0.125 +458 L 0.118 +459 A 0.113 +460 P 0.105 +461 V 0.095 +462 M 0.084 +463 C 0.071 +464 I 0.058 +465 L 0.049 +466 S 0.043 +467 G 0.042 +468 I 0.044 +469 G 0.048 +470 V 0.049 +471 S 0.048 +472 Q 0.051 +473 V 0.055 +474 L 0.056 +475 S 0.056 +476 T 0.061 +477 Y 0.073 +478 M 0.094 +479 K 0.124 +480 N 0.166 +481 L 0.219 +482 D 0.272 +483 I 0.318 +484 S 0.359 +485 R 0.396 +486 P 0.428 +487 D 0.458 +488 K 0.481 +489 K 0.497 +490 S 0.508 +491 K 0.522 +492 K 0.540 +493 Q 0.551 +494 Q 0.548 +495 D 0.525 +496 S 0.480 +497 T 0.422 +498 Y 0.364 +499 P 0.310 +500 I 0.256 +501 K 0.208 +502 N 0.172 +503 E 0.150 +504 V 0.138 +505 A 0.131 +506 S 0.124 +507 G 0.116 +508 M 0.109 +509 I 0.103 +510 L 0.099 +511 V 0.100 +512 M 0.105 +513 A 0.110 +514 F 0.109 +515 F 0.104 +516 L 0.096 +517 I 0.089 +518 T 0.085 +519 Y 0.084 +520 T 0.082 +521 F 0.080 +522 H 0.082 +523 S 0.084 +524 T 0.083 +525 W 0.084 +526 V 0.094 +527 T 0.113 +528 S 0.138 +529 E 0.167 +530 A 0.198 +531 Y 0.223 +532 S 0.243 +533 S 0.262 +534 P 0.282 +535 S 0.300 +536 I 0.320 +537 V 0.345 +538 L 0.369 +539 S 0.392 +540 A 0.416 +541 R 0.436 +542 G 0.442 +543 G 0.425 +544 D 0.392 +545 G 0.360 +546 S 0.339 +547 R 0.330 +548 I 0.324 +549 I 0.310 +550 F 0.277 +551 D 0.227 +552 D 0.175 +553 F 0.131 +554 R 0.097 +555 E 0.073 +556 A 0.059 +557 Y 0.056 +558 Y 0.055 +559 W 0.055 +560 L 0.059 +561 R 0.068 +562 H 0.082 +563 N 0.099 +564 T 0.111 +565 P 0.115 +566 E 0.112 +567 D 0.106 +568 A 0.099 +569 K 0.093 +570 V 0.092 +571 M 0.097 +572 S 0.110 +573 W 0.126 +574 W 0.130 +575 D 0.118 +576 Y 0.097 +577 G 0.078 +578 Y 0.067 +579 Q 0.064 +580 I 0.063 +581 T 0.064 +582 A 0.069 +583 M 0.078 +584 A 0.090 +585 N 0.104 +586 R 0.118 +587 T 0.126 +588 I 0.130 +589 L 0.137 +590 V 0.152 +591 D 0.169 +592 N 0.178 +593 N 0.178 +594 T 0.170 +595 W 0.161 +596 N 0.152 +597 N 0.141 +598 T 0.131 +599 H 0.124 +600 I 0.119 +601 S 0.117 +602 R 0.121 +603 V 0.132 +604 G 0.139 +605 Q 0.137 +606 A 0.126 +607 M 0.117 +608 A 0.113 +609 S 0.109 +610 T 0.100 +611 E 0.088 +612 E 0.073 +613 K 0.064 +614 A 0.064 +615 Y 0.072 +616 E 0.078 +617 I 0.072 +618 M 0.059 +619 R 0.054 +620 E 0.061 +621 L 0.072 +622 D 0.077 +623 V 0.075 +624 S 0.070 +625 Y 0.068 +626 V 0.070 +627 L 0.075 +628 V 0.081 +629 I 0.090 +630 F 0.100 +631 G 0.112 +632 G 0.124 +633 L 0.134 +634 T 0.139 +635 G 0.147 +636 Y 0.159 +637 S 0.165 +638 S 0.154 +639 D 0.129 +640 D 0.102 +641 I 0.082 +642 N 0.073 +643 K 0.072 +644 F 0.073 +645 L 0.070 +646 W 0.065 +647 M 0.065 +648 V 0.069 +649 R 0.077 +650 I 0.089 +651 G 0.101 +652 G 0.109 +653 S 0.116 +654 T 0.129 +655 E 0.147 +656 T 0.165 +657 G 0.179 +658 R 0.186 +659 H 0.185 +660 I 0.176 +661 K 0.162 +662 E 0.151 +663 N 0.148 +664 D 0.147 +665 Y 0.140 +666 Y 0.132 +667 T 0.128 +668 P 0.133 +669 T 0.148 +670 G 0.166 +671 E 0.178 +672 F 0.180 +673 R 0.172 +674 V 0.166 +675 D 0.174 +676 R 0.195 +677 E 0.215 +678 G 0.223 +679 S 0.221 +680 P 0.220 +681 V 0.220 +682 L 0.216 +683 L 0.204 +684 N 0.186 +685 C 0.168 +686 L 0.156 +687 M 0.147 +688 Y 0.144 +689 K 0.146 +690 M 0.149 +691 C 0.148 +692 Y 0.147 +693 Y 0.154 +694 R 0.176 +695 F 0.205 +696 G 0.229 +697 Q 0.247 +698 V 0.261 +699 Y 0.271 +700 T 0.275 +701 E 0.272 +702 A 0.264 +703 K 0.258 +704 R 0.265 +705 P 0.291 +706 P 0.320 +707 G 0.320 +708 F 0.287 +709 D 0.240 +710 R 0.200 +711 V 0.175 +712 R 0.171 +713 N 0.186 +714 A 0.206 +715 E 0.219 +716 I 0.218 +717 G 0.210 +718 N 0.203 +719 K 0.198 +720 D 0.190 +721 F 0.180 +722 E 0.167 +723 L 0.152 +724 D 0.133 +725 V 0.116 +726 L 0.102 +727 E 0.092 +728 E 0.085 +729 A 0.080 +730 Y 0.076 +731 T 0.077 +732 T 0.084 +733 E 0.090 +734 H 0.090 +735 W 0.086 +736 L 0.082 +737 V 0.078 +738 R 0.077 +739 I 0.077 +740 Y 0.078 +741 K 0.083 +742 V 0.099 +743 K 0.130 +744 D 0.173 +745 L 0.221 +746 D 0.270 +747 N 0.319 +748 R 0.366 +749 G 0.402 +750 L 0.413 +751 S 0.401 +752 R 0.383 +753 T 0.372 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032251.13_ENSMUST00000113245.9_GN:Irak1bp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032251.13_ENSMUST00000113245.9_GN:Irak1bp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..fe26e8de655f22db54588f017aab0a96ab29a7eb --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032251.13_ENSMUST00000113245.9_GN:Irak1bp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,260 @@ +>ENSMUSG00000032251.13|ENSMUST00000113245.9|GN:Irak1bp1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.405 +2 S 0.420 +3 L 0.449 +4 Q 0.487 +5 P 0.527 +6 A 0.563 +7 P 0.579 +8 A 0.558 +9 S 0.501 +10 R 0.450 +11 V 0.441 +12 F 0.463 +13 M 0.483 +14 E 0.491 +15 L 0.487 +16 V 0.472 +17 P 0.456 +18 W 0.466 +19 A 0.513 +20 D 0.574 +21 R 0.625 +22 G 0.659 +23 R 0.673 +24 E 0.670 +25 N 0.660 +26 H 0.658 +27 P 0.671 +28 I 0.692 +29 S 0.708 +30 A 0.711 +31 A 0.701 +32 E 0.684 +33 A 0.667 +34 Q 0.663 +35 P 0.675 +36 I 0.691 +37 G 0.697 +38 R 0.690 +39 R 0.687 +40 P 0.695 +41 H 0.710 +42 V 0.718 +43 A 0.706 +44 E 0.674 +45 A 0.632 +46 H 0.592 +47 P 0.550 +48 G 0.488 +49 A 0.399 +50 R 0.300 +51 E 0.227 +52 V 0.183 +53 H 0.147 +54 V 0.113 +55 S 0.092 +56 G 0.087 +57 A 0.093 +58 A 0.101 +59 E 0.102 +60 V 0.100 +61 S 0.105 +62 A 0.119 +63 S 0.127 +64 P 0.115 +65 D 0.085 +66 R 0.055 +67 A 0.036 +68 L 0.028 +69 V 0.027 +70 T 0.031 +71 V 0.035 +72 R 0.038 +73 V 0.040 +74 S 0.043 +75 S 0.049 +76 T 0.055 +77 K 0.060 +78 E 0.066 +79 V 0.070 +80 S 0.070 +81 A 0.067 +82 E 0.066 +83 A 0.072 +84 K 0.083 +85 K 0.090 +86 S 0.089 +87 V 0.085 +88 C 0.082 +89 R 0.077 +90 R 0.065 +91 L 0.050 +92 D 0.041 +93 Y 0.041 +94 I 0.049 +95 T 0.062 +96 Q 0.068 +97 S 0.061 +98 L 0.051 +99 Q 0.046 +100 Q 0.046 +101 Q 0.049 +102 G 0.053 +103 F 0.056 +104 Q 0.059 +105 A 0.057 +106 E 0.048 +107 N 0.037 +108 V 0.032 +109 T 0.037 +110 V 0.047 +111 T 0.059 +112 K 0.068 +113 N 0.071 +114 I 0.070 +115 R 0.069 +116 R 0.072 +117 V 0.077 +118 E 0.082 +119 N 0.083 +120 A 0.079 +121 Y 0.070 +122 H 0.057 +123 M 0.042 +124 E 0.030 +125 A 0.022 +126 E 0.019 +127 V 0.018 +128 C 0.017 +129 I 0.015 +130 T 0.015 +131 F 0.018 +132 T 0.023 +133 E 0.028 +134 F 0.033 +135 G 0.035 +136 K 0.035 +137 M 0.033 +138 Q 0.031 +139 N 0.030 +140 I 0.032 +141 C 0.036 +142 N 0.038 +143 F 0.040 +144 L 0.045 +145 V 0.049 +146 E 0.052 +147 K 0.054 +148 L 0.053 +149 D 0.050 +150 S 0.046 +151 S 0.043 +152 V 0.047 +153 V 0.059 +154 I 0.077 +155 S 0.091 +156 P 0.095 +157 P 0.091 +158 E 0.089 +159 F 0.093 +160 Y 0.101 +161 H 0.107 +162 T 0.112 +163 P 0.117 +164 G 0.117 +165 S 0.111 +166 V 0.101 +167 E 0.094 +168 N 0.096 +169 L 0.100 +170 R 0.100 +171 R 0.095 +172 Q 0.093 +173 A 0.095 +174 C 0.098 +175 L 0.099 +176 V 0.099 +177 A 0.097 +178 V 0.093 +179 E 0.089 +180 N 0.089 +181 A 0.094 +182 W 0.100 +183 R 0.102 +184 K 0.099 +185 A 0.093 +186 Q 0.088 +187 E 0.087 +188 V 0.087 +189 C 0.086 +190 D 0.088 +191 L 0.098 +192 V 0.113 +193 G 0.127 +194 Q 0.133 +195 T 0.131 +196 L 0.124 +197 G 0.120 +198 K 0.121 +199 P 0.119 +200 L 0.112 +201 L 0.107 +202 I 0.107 +203 K 0.114 +204 E 0.135 +205 E 0.180 +206 E 0.245 +207 T 0.316 +208 K 0.376 +209 D 0.421 +210 W 0.465 +211 E 0.517 +212 G 0.568 +213 Q 0.603 +214 T 0.624 +215 D 0.638 +216 D 0.650 +217 H 0.658 +218 Q 0.662 +219 L 0.661 +220 S 0.652 +221 R 0.640 +222 L 0.633 +223 P 0.634 +224 G 0.632 +225 T 0.607 +226 L 0.550 +227 T 0.482 +228 V 0.431 +229 Q 0.408 +230 Q 0.403 +231 K 0.402 +232 I 0.401 +233 K 0.397 +234 S 0.376 +235 A 0.328 +236 T 0.261 +237 I 0.196 +238 H 0.143 +239 A 0.103 +240 A 0.077 +241 S 0.063 +242 K 0.057 +243 V 0.053 +244 F 0.050 +245 I 0.048 +246 T 0.049 +247 F 0.059 +248 E 0.089 +249 V 0.150 +250 K 0.246 +251 G 0.361 +252 K 0.467 +253 E 0.541 +254 K 0.580 +255 K 0.591 +256 K 0.583 +257 K 0.553 +258 H 0.500 +259 L 0.453 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032251.13_ENSMUST00000113245.9_GN:Irak1bp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:53.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032251.13_ENSMUST00000113245.9_GN:Irak1bp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:53.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..df879691da83b11866180d0a6acf16cadc0580d7 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032251.13_ENSMUST00000113245.9_GN:Irak1bp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:53.caid @@ -0,0 +1,313 @@ +>ENSMUSG00000032251.13|ENSMUST00000113245.9|GN:Irak1bp1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:53 +1 M 0.458 +2 C 0.507 +3 A 0.569 +4 G 0.608 +5 L 0.616 +6 L 0.608 +7 P 0.605 +8 W 0.613 +9 G 0.617 +10 K 0.603 +11 T 0.588 +12 R 0.591 +13 S 0.586 +14 P 0.559 +15 R 0.545 +16 C 0.572 +17 S 0.602 +18 G 0.593 +19 A 0.575 +20 S 0.587 +21 I 0.600 +22 P 0.584 +23 A 0.565 +24 S 0.567 +25 S 0.571 +26 A 0.575 +27 R 0.601 +28 T 0.623 +29 S 0.610 +30 K 0.601 +31 R 0.638 +32 A 0.697 +33 A 0.732 +34 A 0.737 +35 K 0.726 +36 R 0.707 +37 H 0.682 +38 S 0.665 +39 P 0.667 +40 P 0.685 +41 S 0.701 +42 T 0.701 +43 W 0.691 +44 R 0.688 +45 C 0.699 +46 Y 0.721 +47 G 0.746 +48 N 0.765 +49 T 0.772 +50 A 0.769 +51 A 0.769 +52 P 0.777 +53 A 0.787 +54 M 0.789 +55 S 0.778 +56 L 0.759 +57 Q 0.745 +58 P 0.741 +59 A 0.751 +60 P 0.763 +61 A 0.769 +62 S 0.766 +63 R 0.757 +64 V 0.744 +65 F 0.734 +66 M 0.726 +67 E 0.713 +68 L 0.684 +69 V 0.640 +70 P 0.601 +71 W 0.601 +72 A 0.649 +73 D 0.709 +74 R 0.752 +75 G 0.772 +76 R 0.775 +77 E 0.764 +78 N 0.747 +79 H 0.740 +80 P 0.748 +81 I 0.767 +82 S 0.783 +83 A 0.788 +84 A 0.780 +85 E 0.764 +86 A 0.750 +87 Q 0.746 +88 P 0.755 +89 I 0.766 +90 G 0.764 +91 R 0.750 +92 R 0.740 +93 P 0.742 +94 H 0.753 +95 V 0.756 +96 A 0.740 +97 E 0.702 +98 A 0.654 +99 H 0.607 +100 P 0.557 +101 G 0.491 +102 A 0.398 +103 R 0.297 +104 E 0.221 +105 V 0.175 +106 H 0.139 +107 V 0.108 +108 S 0.088 +109 G 0.083 +110 A 0.088 +111 A 0.094 +112 E 0.094 +113 V 0.091 +114 S 0.096 +115 A 0.109 +116 S 0.117 +117 P 0.107 +118 D 0.080 +119 R 0.052 +120 A 0.034 +121 L 0.027 +122 V 0.026 +123 T 0.029 +124 V 0.033 +125 R 0.036 +126 V 0.039 +127 S 0.043 +128 S 0.048 +129 T 0.054 +130 K 0.061 +131 E 0.067 +132 V 0.072 +133 S 0.072 +134 A 0.067 +135 E 0.065 +136 A 0.065 +137 K 0.067 +138 K 0.070 +139 S 0.073 +140 V 0.072 +141 C 0.068 +142 R 0.060 +143 R 0.050 +144 L 0.041 +145 D 0.037 +146 Y 0.038 +147 I 0.047 +148 T 0.060 +149 Q 0.067 +150 S 0.060 +151 L 0.050 +152 Q 0.045 +153 Q 0.047 +154 Q 0.051 +155 G 0.057 +156 F 0.061 +157 Q 0.062 +158 A 0.058 +159 E 0.048 +160 N 0.037 +161 V 0.033 +162 T 0.037 +163 V 0.046 +164 T 0.057 +165 K 0.065 +166 N 0.068 +167 I 0.067 +168 R 0.067 +169 R 0.070 +170 V 0.075 +171 E 0.080 +172 N 0.081 +173 A 0.078 +174 Y 0.070 +175 H 0.057 +176 M 0.042 +177 E 0.029 +178 A 0.022 +179 E 0.018 +180 V 0.017 +181 C 0.016 +182 I 0.015 +183 T 0.014 +184 F 0.017 +185 T 0.022 +186 E 0.027 +187 F 0.032 +188 G 0.034 +189 K 0.033 +190 M 0.031 +191 Q 0.029 +192 N 0.028 +193 I 0.029 +194 C 0.031 +195 N 0.033 +196 F 0.035 +197 L 0.039 +198 V 0.043 +199 E 0.046 +200 K 0.047 +201 L 0.046 +202 D 0.043 +203 S 0.039 +204 S 0.037 +205 V 0.041 +206 V 0.054 +207 I 0.071 +208 S 0.086 +209 P 0.090 +210 P 0.086 +211 E 0.084 +212 F 0.086 +213 Y 0.092 +214 H 0.096 +215 T 0.100 +216 P 0.103 +217 G 0.105 +218 S 0.100 +219 V 0.092 +220 E 0.088 +221 N 0.091 +222 L 0.097 +223 R 0.098 +224 R 0.093 +225 Q 0.091 +226 A 0.094 +227 C 0.098 +228 L 0.099 +229 V 0.100 +230 A 0.098 +231 V 0.092 +232 E 0.088 +233 N 0.088 +234 A 0.093 +235 W 0.099 +236 R 0.101 +237 K 0.098 +238 A 0.091 +239 Q 0.085 +240 E 0.084 +241 V 0.084 +242 C 0.083 +243 D 0.085 +244 L 0.095 +245 V 0.110 +246 G 0.124 +247 Q 0.130 +248 T 0.126 +249 L 0.120 +250 G 0.117 +251 K 0.118 +252 P 0.116 +253 L 0.110 +254 L 0.104 +255 I 0.104 +256 K 0.111 +257 E 0.133 +258 E 0.179 +259 E 0.247 +260 T 0.320 +261 K 0.380 +262 D 0.423 +263 W 0.464 +264 E 0.515 +265 G 0.567 +266 Q 0.605 +267 T 0.626 +268 D 0.640 +269 D 0.650 +270 H 0.659 +271 Q 0.664 +272 L 0.663 +273 S 0.656 +274 R 0.647 +275 L 0.644 +276 P 0.648 +277 G 0.649 +278 T 0.627 +279 L 0.572 +280 T 0.505 +281 V 0.451 +282 Q 0.423 +283 Q 0.412 +284 K 0.407 +285 I 0.402 +286 K 0.394 +287 S 0.372 +288 A 0.324 +289 T 0.261 +290 I 0.198 +291 H 0.145 +292 A 0.105 +293 A 0.078 +294 S 0.064 +295 K 0.057 +296 V 0.054 +297 F 0.051 +298 I 0.050 +299 T 0.051 +300 F 0.063 +301 E 0.095 +302 V 0.159 +303 K 0.259 +304 G 0.379 +305 K 0.488 +306 E 0.565 +307 K 0.605 +308 K 0.616 +309 K 0.607 +310 K 0.575 +311 H 0.520 +312 L 0.472 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032316.9_ENSMUST00000065330.8_GN:Clk3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032316.9_ENSMUST00000065330.8_GN:Clk3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2ece8d007b3e54cd2506d970864cf9bc407f8ed3 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032316.9_ENSMUST00000065330.8_GN:Clk3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,491 @@ +>ENSMUSG00000032316.9|ENSMUST00000065330.8|GN:Clk3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.375 +2 H 0.386 +3 H 0.405 +4 C 0.422 +5 K 0.424 +6 R 0.411 +7 Y 0.394 +8 R 0.383 +9 S 0.385 +10 P 0.394 +11 E 0.398 +12 P 0.384 +13 D 0.348 +14 P 0.300 +15 Y 0.265 +16 L 0.257 +17 S 0.262 +18 Y 0.261 +19 R 0.253 +20 W 0.250 +21 K 0.267 +22 R 0.298 +23 R 0.326 +24 R 0.353 +25 S 0.399 +26 Y 0.460 +27 S 0.517 +28 R 0.568 +29 E 0.617 +30 H 0.657 +31 E 0.677 +32 G 0.670 +33 R 0.645 +34 L 0.620 +35 R 0.612 +36 Y 0.624 +37 P 0.646 +38 S 0.660 +39 R 0.651 +40 R 0.619 +41 E 0.578 +42 P 0.558 +43 P 0.584 +44 P 0.648 +45 R 0.711 +46 R 0.749 +47 S 0.763 +48 R 0.764 +49 S 0.756 +50 R 0.743 +51 S 0.731 +52 H 0.716 +53 D 0.689 +54 R 0.647 +55 I 0.604 +56 P 0.576 +57 Y 0.568 +58 Q 0.573 +59 R 0.576 +60 R 0.573 +61 Y 0.579 +62 R 0.610 +63 E 0.661 +64 H 0.710 +65 R 0.742 +66 D 0.753 +67 S 0.751 +68 D 0.744 +69 T 0.735 +70 Y 0.727 +71 R 0.725 +72 C 0.729 +73 E 0.736 +74 E 0.738 +75 R 0.733 +76 S 0.729 +77 P 0.734 +78 S 0.748 +79 F 0.766 +80 G 0.780 +81 E 0.784 +82 D 0.776 +83 C 0.760 +84 Y 0.746 +85 G 0.736 +86 S 0.720 +87 S 0.679 +88 R 0.620 +89 S 0.584 +90 R 0.596 +91 H 0.614 +92 R 0.598 +93 R 0.585 +94 R 0.618 +95 S 0.675 +96 R 0.713 +97 E 0.721 +98 R 0.713 +99 A 0.703 +100 P 0.700 +101 Y 0.707 +102 R 0.714 +103 T 0.714 +104 R 0.704 +105 K 0.680 +106 H 0.629 +107 A 0.557 +108 H 0.509 +109 H 0.515 +110 C 0.539 +111 H 0.540 +112 K 0.541 +113 R 0.571 +114 R 0.594 +115 T 0.582 +116 R 0.573 +117 S 0.607 +118 C 0.660 +119 S 0.693 +120 S 0.701 +121 A 0.697 +122 S 0.687 +123 S 0.677 +124 R 0.672 +125 S 0.673 +126 Q 0.673 +127 Q 0.671 +128 S 0.669 +129 S 0.662 +130 K 0.649 +131 R 0.636 +132 S 0.627 +133 S 0.614 +134 R 0.591 +135 S 0.561 +136 V 0.524 +137 E 0.477 +138 D 0.419 +139 D 0.353 +140 K 0.289 +141 E 0.241 +142 G 0.212 +143 H 0.190 +144 L 0.166 +145 V 0.137 +146 C 0.109 +147 R 0.086 +148 I 0.073 +149 G 0.074 +150 D 0.084 +151 W 0.087 +152 L 0.077 +153 Q 0.064 +154 E 0.060 +155 R 0.063 +156 Y 0.067 +157 E 0.070 +158 I 0.070 +159 V 0.069 +160 G 0.068 +161 N 0.066 +162 L 0.064 +163 G 0.062 +164 E 0.061 +165 G 0.062 +166 T 0.062 +167 F 0.058 +168 G 0.053 +169 K 0.045 +170 V 0.038 +171 V 0.033 +172 E 0.033 +173 C 0.040 +174 L 0.051 +175 D 0.059 +176 H 0.061 +177 A 0.062 +178 R 0.065 +179 G 0.070 +180 K 0.072 +181 S 0.072 +182 Q 0.069 +183 V 0.063 +184 A 0.054 +185 L 0.048 +186 K 0.049 +187 I 0.057 +188 I 0.066 +189 R 0.072 +190 N 0.072 +191 V 0.069 +192 G 0.066 +193 K 0.064 +194 Y 0.062 +195 R 0.057 +196 E 0.052 +197 A 0.052 +198 A 0.053 +199 R 0.056 +200 L 0.061 +201 E 0.069 +202 I 0.076 +203 N 0.077 +204 V 0.067 +205 L 0.053 +206 K 0.043 +207 K 0.040 +208 I 0.042 +209 K 0.046 +210 E 0.052 +211 K 0.060 +212 D 0.071 +213 K 0.083 +214 E 0.093 +215 N 0.097 +216 K 0.092 +217 F 0.078 +218 L 0.059 +219 C 0.040 +220 V 0.026 +221 L 0.018 +222 M 0.014 +223 S 0.013 +224 D 0.012 +225 W 0.012 +226 F 0.016 +227 N 0.022 +228 F 0.032 +229 H 0.042 +230 G 0.049 +231 H 0.047 +232 M 0.038 +233 C 0.028 +234 I 0.025 +235 A 0.029 +236 F 0.038 +237 E 0.047 +238 L 0.054 +239 L 0.057 +240 G 0.055 +241 K 0.048 +242 N 0.041 +243 T 0.038 +244 F 0.040 +245 E 0.045 +246 F 0.050 +247 L 0.055 +248 K 0.060 +249 E 0.069 +250 N 0.076 +251 N 0.076 +252 F 0.069 +253 Q 0.059 +254 P 0.052 +255 Y 0.045 +256 P 0.039 +257 L 0.033 +258 P 0.028 +259 H 0.024 +260 V 0.022 +261 R 0.024 +262 H 0.030 +263 M 0.036 +264 A 0.038 +265 Y 0.036 +266 Q 0.034 +267 L 0.034 +268 C 0.032 +269 H 0.032 +270 A 0.032 +271 L 0.030 +272 R 0.028 +273 F 0.027 +274 L 0.028 +275 H 0.030 +276 E 0.033 +277 N 0.034 +278 Q 0.034 +279 L 0.032 +280 T 0.032 +281 H 0.036 +282 T 0.046 +283 D 0.059 +284 L 0.067 +285 K 0.068 +286 P 0.069 +287 E 0.071 +288 N 0.069 +289 I 0.062 +290 L 0.053 +291 F 0.048 +292 V 0.050 +293 N 0.058 +294 S 0.071 +295 E 0.086 +296 F 0.103 +297 E 0.124 +298 T 0.148 +299 L 0.170 +300 Y 0.186 +301 N 0.194 +302 E 0.195 +303 H 0.190 +304 K 0.189 +305 S 0.197 +306 C 0.208 +307 E 0.207 +308 E 0.195 +309 K 0.176 +310 S 0.155 +311 V 0.132 +312 K 0.111 +313 N 0.093 +314 T 0.078 +315 S 0.065 +316 I 0.056 +317 R 0.051 +318 V 0.054 +319 A 0.065 +320 D 0.084 +321 F 0.103 +322 G 0.115 +323 S 0.117 +324 A 0.111 +325 T 0.103 +326 F 0.102 +327 D 0.110 +328 H 0.125 +329 E 0.146 +330 H 0.167 +331 H 0.177 +332 T 0.172 +333 T 0.160 +334 I 0.152 +335 V 0.153 +336 A 0.156 +337 T 0.158 +338 R 0.162 +339 H 0.170 +340 Y 0.171 +341 R 0.160 +342 P 0.145 +343 P 0.139 +344 E 0.144 +345 V 0.147 +346 I 0.137 +347 L 0.124 +348 E 0.118 +349 L 0.120 +350 G 0.118 +351 W 0.111 +352 A 0.105 +353 Q 0.107 +354 P 0.125 +355 C 0.155 +356 D 0.175 +357 V 0.173 +358 W 0.164 +359 S 0.160 +360 I 0.152 +361 G 0.137 +362 C 0.124 +363 I 0.117 +364 L 0.107 +365 F 0.094 +366 E 0.082 +367 Y 0.073 +368 Y 0.070 +369 R 0.075 +370 G 0.085 +371 F 0.095 +372 T 0.103 +373 L 0.109 +374 F 0.109 +375 Q 0.105 +376 T 0.100 +377 H 0.097 +378 E 0.102 +379 N 0.115 +380 R 0.127 +381 E 0.125 +382 H 0.111 +383 L 0.100 +384 V 0.100 +385 M 0.106 +386 M 0.109 +387 E 0.108 +388 K 0.109 +389 I 0.112 +390 L 0.120 +391 G 0.133 +392 P 0.140 +393 I 0.132 +394 P 0.107 +395 S 0.081 +396 H 0.065 +397 M 0.059 +398 I 0.058 +399 H 0.059 +400 R 0.061 +401 T 0.064 +402 R 0.064 +403 K 0.063 +404 Q 0.064 +405 K 0.066 +406 Y 0.066 +407 F 0.068 +408 Y 0.079 +409 K 0.103 +410 G 0.133 +411 G 0.152 +412 L 0.152 +413 V 0.141 +414 W 0.136 +415 D 0.142 +416 E 0.154 +417 N 0.162 +418 S 0.168 +419 S 0.175 +420 D 0.183 +421 G 0.188 +422 R 0.188 +423 Y 0.190 +424 V 0.196 +425 K 0.206 +426 E 0.210 +427 N 0.202 +428 C 0.182 +429 K 0.157 +430 P 0.136 +431 L 0.121 +432 K 0.113 +433 S 0.112 +434 Y 0.116 +435 M 0.122 +436 L 0.129 +437 Q 0.139 +438 D 0.147 +439 S 0.144 +440 L 0.128 +441 E 0.112 +442 H 0.107 +443 V 0.109 +444 Q 0.107 +445 L 0.103 +446 F 0.100 +447 D 0.100 +448 L 0.101 +449 M 0.101 +450 R 0.095 +451 R 0.085 +452 M 0.078 +453 L 0.080 +454 E 0.088 +455 F 0.094 +456 D 0.097 +457 P 0.096 +458 A 0.096 +459 Q 0.097 +460 R 0.095 +461 I 0.082 +462 T 0.065 +463 L 0.053 +464 A 0.051 +465 E 0.055 +466 A 0.060 +467 L 0.063 +468 L 0.066 +469 H 0.068 +470 P 0.067 +471 F 0.069 +472 F 0.082 +473 A 0.107 +474 G 0.134 +475 L 0.154 +476 T 0.172 +477 P 0.193 +478 E 0.215 +479 E 0.239 +480 R 0.267 +481 S 0.306 +482 F 0.352 +483 H 0.396 +484 S 0.429 +485 S 0.451 +486 R 0.475 +487 N 0.500 +488 P 0.511 +489 S 0.497 +490 R 0.477 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032316.9_ENSMUST00000065330.8_GN:Clk3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:148.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032316.9_ENSMUST00000065330.8_GN:Clk3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:148.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..aedfa34835749a01d556a022b30722756c52a935 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032316.9_ENSMUST00000065330.8_GN:Clk3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:148.caid @@ -0,0 +1,639 @@ +>ENSMUSG00000032316.9|ENSMUST00000065330.8|GN:Clk3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:148 +1 M 0.387 +2 P 0.405 +3 V 0.429 +4 L 0.442 +5 S 0.436 +6 A 0.431 +7 R 0.451 +8 R 0.479 +9 K 0.483 +10 R 0.479 +11 L 0.484 +12 A 0.484 +13 S 0.481 +14 T 0.506 +15 A 0.556 +16 G 0.598 +17 P 0.624 +18 R 0.643 +19 R 0.661 +20 G 0.672 +21 S 0.676 +22 G 0.676 +23 P 0.672 +24 S 0.656 +25 L 0.628 +26 A 0.591 +27 V 0.549 +28 R 0.505 +29 W 0.473 +30 V 0.472 +31 P 0.500 +32 P 0.543 +33 L 0.586 +34 G 0.625 +35 P 0.659 +36 E 0.692 +37 P 0.720 +38 S 0.741 +39 S 0.753 +40 D 0.759 +41 R 0.757 +42 G 0.751 +43 R 0.741 +44 A 0.731 +45 P 0.723 +46 M 0.719 +47 R 0.723 +48 P 0.734 +49 R 0.748 +50 G 0.759 +51 P 0.756 +52 T 0.722 +53 C 0.664 +54 S 0.633 +55 T 0.663 +56 T 0.723 +57 R 0.763 +58 R 0.779 +59 G 0.784 +60 A 0.783 +61 G 0.778 +62 R 0.771 +63 G 0.766 +64 P 0.761 +65 R 0.754 +66 L 0.745 +67 L 0.737 +68 P 0.735 +69 G 0.741 +70 P 0.755 +71 P 0.776 +72 G 0.794 +73 R 0.802 +74 D 0.800 +75 L 0.791 +76 H 0.784 +77 R 0.782 +78 C 0.778 +79 R 0.771 +80 P 0.770 +81 D 0.781 +82 P 0.796 +83 G 0.808 +84 G 0.814 +85 A 0.812 +86 G 0.800 +87 Q 0.786 +88 S 0.778 +89 P 0.779 +90 R 0.780 +91 V 0.775 +92 C 0.767 +93 E 0.761 +94 F 0.763 +95 G 0.768 +96 A 0.769 +97 R 0.761 +98 A 0.750 +99 V 0.743 +100 R 0.746 +101 P 0.762 +102 L 0.781 +103 G 0.793 +104 R 0.791 +105 V 0.777 +106 E 0.758 +107 P 0.742 +108 G 0.735 +109 P 0.741 +110 P 0.758 +111 T 0.778 +112 A 0.791 +113 A 0.794 +114 S 0.789 +115 R 0.786 +116 E 0.784 +117 G 0.779 +118 A 0.761 +119 V 0.726 +120 L 0.673 +121 P 0.616 +122 R 0.596 +123 A 0.639 +124 E 0.704 +125 A 0.746 +126 R 0.760 +127 A 0.767 +128 G 0.773 +129 S 0.778 +130 G 0.782 +131 R 0.786 +132 G 0.788 +133 A 0.786 +134 R 0.781 +135 S 0.777 +136 G 0.774 +137 E 0.770 +138 W 0.764 +139 G 0.759 +140 L 0.753 +141 A 0.746 +142 A 0.742 +143 A 0.734 +144 G 0.706 +145 A 0.664 +146 W 0.636 +147 E 0.628 +148 T 0.622 +149 M 0.611 +150 H 0.608 +151 H 0.621 +152 C 0.640 +153 K 0.654 +154 R 0.657 +155 Y 0.642 +156 R 0.621 +157 S 0.613 +158 P 0.619 +159 E 0.621 +160 P 0.594 +161 D 0.530 +162 P 0.449 +163 Y 0.391 +164 L 0.377 +165 S 0.391 +166 Y 0.409 +167 R 0.430 +168 W 0.467 +169 K 0.523 +170 R 0.580 +171 R 0.621 +172 R 0.642 +173 S 0.661 +174 Y 0.686 +175 S 0.713 +176 R 0.735 +177 E 0.750 +178 H 0.762 +179 E 0.767 +180 G 0.762 +181 R 0.749 +182 L 0.735 +183 R 0.727 +184 Y 0.730 +185 P 0.741 +186 S 0.753 +187 R 0.751 +188 R 0.732 +189 E 0.703 +190 P 0.685 +191 P 0.697 +192 P 0.734 +193 R 0.773 +194 R 0.797 +195 S 0.807 +196 R 0.808 +197 S 0.804 +198 R 0.795 +199 S 0.783 +200 H 0.768 +201 D 0.745 +202 R 0.713 +203 I 0.680 +204 P 0.657 +205 Y 0.651 +206 Q 0.660 +207 R 0.674 +208 R 0.685 +209 Y 0.698 +210 R 0.723 +211 E 0.752 +212 H 0.774 +213 R 0.783 +214 D 0.780 +215 S 0.772 +216 D 0.766 +217 T 0.764 +218 Y 0.765 +219 R 0.768 +220 C 0.771 +221 E 0.772 +222 E 0.767 +223 R 0.758 +224 S 0.751 +225 P 0.756 +226 S 0.770 +227 F 0.786 +228 G 0.799 +229 E 0.802 +230 D 0.795 +231 C 0.781 +232 Y 0.767 +233 G 0.760 +234 S 0.758 +235 S 0.756 +236 R 0.751 +237 S 0.743 +238 R 0.726 +239 H 0.686 +240 R 0.629 +241 R 0.602 +242 R 0.636 +243 S 0.699 +244 R 0.743 +245 E 0.756 +246 R 0.751 +247 A 0.743 +248 P 0.742 +249 Y 0.750 +250 R 0.760 +251 T 0.764 +252 R 0.762 +253 K 0.756 +254 H 0.745 +255 A 0.731 +256 H 0.718 +257 H 0.700 +258 C 0.664 +259 H 0.617 +260 K 0.601 +261 R 0.644 +262 R 0.711 +263 T 0.755 +264 R 0.773 +265 S 0.777 +266 C 0.772 +267 S 0.762 +268 S 0.753 +269 A 0.744 +270 S 0.732 +271 S 0.719 +272 R 0.711 +273 S 0.707 +274 Q 0.703 +275 Q 0.699 +276 S 0.696 +277 S 0.688 +278 K 0.675 +279 R 0.661 +280 S 0.652 +281 S 0.639 +282 R 0.616 +283 S 0.583 +284 V 0.543 +285 E 0.494 +286 D 0.433 +287 D 0.364 +288 K 0.295 +289 E 0.241 +290 G 0.206 +291 H 0.181 +292 L 0.157 +293 V 0.131 +294 C 0.106 +295 R 0.085 +296 I 0.073 +297 G 0.074 +298 D 0.084 +299 W 0.088 +300 L 0.077 +301 Q 0.063 +302 E 0.058 +303 R 0.060 +304 Y 0.063 +305 E 0.066 +306 I 0.067 +307 V 0.068 +308 G 0.068 +309 N 0.066 +310 L 0.063 +311 G 0.061 +312 E 0.061 +313 G 0.062 +314 T 0.062 +315 F 0.058 +316 G 0.052 +317 K 0.045 +318 V 0.038 +319 V 0.033 +320 E 0.033 +321 C 0.039 +322 L 0.048 +323 D 0.055 +324 H 0.055 +325 A 0.054 +326 R 0.057 +327 G 0.061 +328 K 0.065 +329 S 0.067 +330 Q 0.066 +331 V 0.062 +332 A 0.053 +333 L 0.047 +334 K 0.048 +335 I 0.056 +336 I 0.065 +337 R 0.071 +338 N 0.071 +339 V 0.069 +340 G 0.065 +341 K 0.064 +342 Y 0.062 +343 R 0.057 +344 E 0.053 +345 A 0.052 +346 A 0.054 +347 R 0.057 +348 L 0.062 +349 E 0.069 +350 I 0.077 +351 N 0.078 +352 V 0.068 +353 L 0.054 +354 K 0.045 +355 K 0.042 +356 I 0.043 +357 K 0.047 +358 E 0.052 +359 K 0.061 +360 D 0.072 +361 K 0.084 +362 E 0.094 +363 N 0.098 +364 K 0.092 +365 F 0.077 +366 L 0.058 +367 C 0.040 +368 V 0.026 +369 L 0.019 +370 M 0.015 +371 S 0.014 +372 D 0.012 +373 W 0.012 +374 F 0.016 +375 N 0.022 +376 F 0.032 +377 H 0.041 +378 G 0.048 +379 H 0.046 +380 M 0.037 +381 C 0.029 +382 I 0.026 +383 A 0.031 +384 F 0.041 +385 E 0.052 +386 L 0.059 +387 L 0.063 +388 G 0.062 +389 K 0.055 +390 N 0.046 +391 T 0.043 +392 F 0.045 +393 E 0.050 +394 F 0.056 +395 L 0.060 +396 K 0.064 +397 E 0.072 +398 N 0.079 +399 N 0.080 +400 F 0.073 +401 Q 0.065 +402 P 0.057 +403 Y 0.050 +404 P 0.043 +405 L 0.036 +406 P 0.030 +407 H 0.026 +408 V 0.024 +409 R 0.026 +410 H 0.032 +411 M 0.039 +412 A 0.041 +413 Y 0.039 +414 Q 0.038 +415 L 0.038 +416 C 0.037 +417 H 0.036 +418 A 0.036 +419 L 0.035 +420 R 0.032 +421 F 0.031 +422 L 0.033 +423 H 0.035 +424 E 0.038 +425 N 0.038 +426 Q 0.038 +427 L 0.036 +428 T 0.035 +429 H 0.039 +430 T 0.051 +431 D 0.065 +432 L 0.075 +433 K 0.079 +434 P 0.081 +435 E 0.082 +436 N 0.079 +437 I 0.069 +438 L 0.058 +439 F 0.052 +440 V 0.054 +441 N 0.062 +442 S 0.074 +443 E 0.089 +444 F 0.107 +445 E 0.129 +446 T 0.155 +447 L 0.177 +448 Y 0.189 +449 N 0.194 +450 E 0.192 +451 H 0.189 +452 K 0.191 +453 S 0.203 +454 C 0.215 +455 E 0.216 +456 E 0.203 +457 K 0.181 +458 S 0.156 +459 V 0.129 +460 K 0.105 +461 N 0.086 +462 T 0.072 +463 S 0.062 +464 I 0.056 +465 R 0.053 +466 V 0.057 +467 A 0.069 +468 D 0.088 +469 F 0.109 +470 G 0.122 +471 S 0.125 +472 A 0.118 +473 T 0.109 +474 F 0.105 +475 D 0.110 +476 H 0.123 +477 E 0.141 +478 H 0.161 +479 H 0.172 +480 T 0.169 +481 T 0.160 +482 I 0.156 +483 V 0.159 +484 A 0.163 +485 T 0.166 +486 R 0.173 +487 H 0.184 +488 Y 0.187 +489 R 0.178 +490 P 0.163 +491 P 0.158 +492 E 0.164 +493 V 0.167 +494 I 0.155 +495 L 0.137 +496 E 0.129 +497 L 0.128 +498 G 0.127 +499 W 0.121 +500 A 0.116 +501 Q 0.120 +502 P 0.141 +503 C 0.175 +504 D 0.197 +505 V 0.197 +506 W 0.192 +507 S 0.189 +508 I 0.179 +509 G 0.159 +510 C 0.144 +511 I 0.134 +512 L 0.123 +513 F 0.108 +514 E 0.094 +515 Y 0.084 +516 Y 0.080 +517 R 0.082 +518 G 0.090 +519 F 0.098 +520 T 0.108 +521 L 0.115 +522 F 0.117 +523 Q 0.114 +524 T 0.109 +525 H 0.107 +526 E 0.115 +527 N 0.131 +528 R 0.145 +529 E 0.143 +530 H 0.127 +531 L 0.113 +532 V 0.112 +533 M 0.118 +534 M 0.120 +535 E 0.118 +536 K 0.117 +537 I 0.121 +538 L 0.132 +539 G 0.147 +540 P 0.155 +541 I 0.146 +542 P 0.119 +543 S 0.091 +544 H 0.074 +545 M 0.069 +546 I 0.068 +547 H 0.069 +548 R 0.072 +549 T 0.074 +550 R 0.074 +551 K 0.072 +552 Q 0.073 +553 K 0.075 +554 Y 0.075 +555 F 0.076 +556 Y 0.087 +557 K 0.113 +558 G 0.145 +559 G 0.165 +560 L 0.164 +561 V 0.152 +562 W 0.147 +563 D 0.155 +564 E 0.165 +565 N 0.172 +566 S 0.176 +567 S 0.184 +568 D 0.195 +569 G 0.204 +570 R 0.208 +571 Y 0.212 +572 V 0.219 +573 K 0.227 +574 E 0.229 +575 N 0.218 +576 C 0.195 +577 K 0.170 +578 P 0.148 +579 L 0.132 +580 K 0.123 +581 S 0.122 +582 Y 0.124 +583 M 0.127 +584 L 0.132 +585 Q 0.142 +586 D 0.152 +587 S 0.151 +588 L 0.136 +589 E 0.122 +590 H 0.118 +591 V 0.122 +592 Q 0.122 +593 L 0.118 +594 F 0.117 +595 D 0.118 +596 L 0.120 +597 M 0.120 +598 R 0.114 +599 R 0.101 +600 M 0.094 +601 L 0.098 +602 E 0.108 +603 F 0.115 +604 D 0.118 +605 P 0.116 +606 A 0.114 +607 Q 0.114 +608 R 0.109 +609 I 0.094 +610 T 0.076 +611 L 0.064 +612 A 0.061 +613 E 0.065 +614 A 0.067 +615 L 0.068 +616 L 0.070 +617 H 0.072 +618 P 0.072 +619 F 0.071 +620 F 0.080 +621 A 0.101 +622 G 0.126 +623 L 0.146 +624 T 0.166 +625 P 0.189 +626 E 0.210 +627 E 0.231 +628 R 0.263 +629 S 0.312 +630 F 0.370 +631 H 0.423 +632 S 0.462 +633 S 0.483 +634 R 0.496 +635 N 0.506 +636 P 0.506 +637 S 0.491 +638 R 0.475 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032320.8_ENSMUST00000114276.3_GN:Rcn2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032320.8_ENSMUST00000114276.3_GN:Rcn2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7eb74065c27933ac331a43deed5a128be5e092f8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032320.8_ENSMUST00000114276.3_GN:Rcn2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,321 @@ +>ENSMUSG00000032320.8|ENSMUST00000114276.3|GN:Rcn2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.359 +2 R 0.379 +3 L 0.414 +4 G 0.453 +5 P 0.486 +6 R 0.518 +7 P 0.550 +8 A 0.557 +9 A 0.526 +10 L 0.486 +11 G 0.469 +12 L 0.457 +13 L 0.435 +14 L 0.411 +15 P 0.386 +16 L 0.356 +17 L 0.338 +18 L 0.352 +19 Y 0.392 +20 A 0.442 +21 A 0.495 +22 V 0.545 +23 A 0.582 +24 G 0.597 +25 A 0.589 +26 S 0.569 +27 K 0.546 +28 A 0.515 +29 E 0.468 +30 E 0.410 +31 L 0.352 +32 H 0.306 +33 Y 0.276 +34 P 0.265 +35 Q 0.272 +36 G 0.291 +37 E 0.307 +38 H 0.302 +39 R 0.281 +40 A 0.277 +41 D 0.302 +42 Y 0.320 +43 D 0.296 +44 R 0.247 +45 E 0.212 +46 A 0.201 +47 L 0.207 +48 L 0.232 +49 G 0.272 +50 V 0.305 +51 Q 0.303 +52 E 0.266 +53 D 0.220 +54 V 0.182 +55 D 0.153 +56 E 0.128 +57 Y 0.109 +58 V 0.100 +59 K 0.103 +60 L 0.112 +61 G 0.117 +62 H 0.110 +63 E 0.092 +64 E 0.076 +65 Q 0.073 +66 Q 0.080 +67 R 0.084 +68 R 0.081 +69 L 0.071 +70 Q 0.061 +71 S 0.056 +72 I 0.055 +73 I 0.052 +74 K 0.048 +75 K 0.049 +76 I 0.059 +77 D 0.079 +78 S 0.106 +79 D 0.129 +80 S 0.139 +81 D 0.143 +82 G 0.150 +83 F 0.153 +84 L 0.143 +85 T 0.118 +86 E 0.090 +87 N 0.072 +88 E 0.064 +89 L 0.060 +90 S 0.057 +91 Q 0.057 +92 W 0.057 +93 I 0.056 +94 Q 0.054 +95 M 0.055 +96 S 0.062 +97 F 0.071 +98 K 0.077 +99 H 0.079 +100 Y 0.083 +101 A 0.089 +102 M 0.091 +103 Q 0.084 +104 E 0.071 +105 A 0.061 +106 K 0.065 +107 Q 0.075 +108 Q 0.078 +109 F 0.072 +110 V 0.061 +111 E 0.056 +112 Y 0.062 +113 D 0.076 +114 K 0.095 +115 N 0.109 +116 S 0.113 +117 D 0.112 +118 G 0.112 +119 A 0.106 +120 V 0.088 +121 T 0.065 +122 W 0.051 +123 D 0.048 +124 E 0.048 +125 Y 0.044 +126 N 0.037 +127 I 0.035 +128 Q 0.043 +129 M 0.061 +130 Y 0.088 +131 D 0.120 +132 R 0.155 +133 V 0.190 +134 I 0.221 +135 D 0.247 +136 F 0.266 +137 D 0.279 +138 E 0.296 +139 N 0.326 +140 T 0.363 +141 A 0.393 +142 L 0.402 +143 D 0.388 +144 D 0.359 +145 T 0.326 +146 E 0.296 +147 E 0.267 +148 G 0.232 +149 S 0.187 +150 F 0.138 +151 R 0.100 +152 Q 0.081 +153 L 0.078 +154 H 0.083 +155 L 0.088 +156 K 0.091 +157 D 0.088 +158 K 0.082 +159 K 0.074 +160 R 0.066 +161 F 0.059 +162 E 0.057 +163 K 0.060 +164 A 0.065 +165 N 0.075 +166 Q 0.093 +167 D 0.118 +168 S 0.137 +169 G 0.144 +170 P 0.141 +171 G 0.137 +172 L 0.129 +173 S 0.112 +174 L 0.090 +175 E 0.077 +176 E 0.074 +177 F 0.074 +178 I 0.078 +179 A 0.086 +180 F 0.094 +181 E 0.098 +182 H 0.101 +183 P 0.106 +184 E 0.112 +185 E 0.116 +186 V 0.114 +187 D 0.109 +188 Y 0.103 +189 M 0.095 +190 T 0.090 +191 E 0.094 +192 F 0.102 +193 V 0.100 +194 I 0.093 +195 Q 0.094 +196 E 0.102 +197 A 0.102 +198 L 0.092 +199 E 0.083 +200 E 0.082 +201 H 0.091 +202 D 0.110 +203 K 0.140 +204 N 0.167 +205 G 0.176 +206 D 0.166 +207 G 0.150 +208 F 0.131 +209 V 0.107 +210 S 0.085 +211 L 0.078 +212 E 0.088 +213 E 0.101 +214 F 0.109 +215 L 0.117 +216 G 0.131 +217 D 0.145 +218 Y 0.158 +219 R 0.174 +220 R 0.193 +221 D 0.206 +222 P 0.207 +223 T 0.200 +224 A 0.194 +225 N 0.186 +226 E 0.173 +227 D 0.153 +228 P 0.128 +229 E 0.106 +230 W 0.091 +231 I 0.082 +232 L 0.083 +233 V 0.091 +234 E 0.100 +235 K 0.101 +236 D 0.094 +237 R 0.081 +238 F 0.073 +239 V 0.075 +240 N 0.079 +241 D 0.076 +242 Y 0.074 +243 D 0.085 +244 K 0.105 +245 D 0.122 +246 N 0.130 +247 D 0.135 +248 G 0.145 +249 R 0.152 +250 L 0.143 +251 D 0.116 +252 P 0.089 +253 Q 0.077 +254 E 0.078 +255 L 0.079 +256 L 0.079 +257 S 0.084 +258 W 0.098 +259 V 0.117 +260 V 0.142 +261 P 0.169 +262 N 0.188 +263 N 0.194 +264 Q 0.188 +265 G 0.173 +266 I 0.147 +267 A 0.120 +268 Q 0.110 +269 E 0.117 +270 E 0.121 +271 A 0.117 +272 L 0.116 +273 H 0.126 +274 L 0.130 +275 I 0.118 +276 D 0.099 +277 E 0.087 +278 M 0.084 +279 D 0.090 +280 L 0.100 +281 N 0.110 +282 S 0.121 +283 D 0.137 +284 K 0.157 +285 K 0.168 +286 L 0.158 +287 S 0.133 +288 E 0.112 +289 E 0.101 +290 E 0.090 +291 I 0.076 +292 L 0.069 +293 E 0.069 +294 N 0.070 +295 Q 0.067 +296 D 0.067 +297 L 0.067 +298 F 0.069 +299 L 0.077 +300 T 0.093 +301 S 0.106 +302 E 0.109 +303 A 0.111 +304 T 0.124 +305 D 0.147 +306 Y 0.172 +307 G 0.193 +308 R 0.219 +309 Q 0.253 +310 L 0.291 +311 H 0.326 +312 D 0.356 +313 D 0.377 +314 Y 0.391 +315 F 0.401 +316 Y 0.420 +317 H 0.452 +318 D 0.481 +319 E 0.484 +320 L 0.471 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032320.8_ENSMUST00000114276.3_GN:Rcn2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:35.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032320.8_ENSMUST00000114276.3_GN:Rcn2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:35.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a14782a79185bb3f9845bdfb0acff6cee4d79f52 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032320.8_ENSMUST00000114276.3_GN:Rcn2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:35.caid @@ -0,0 +1,356 @@ +>ENSMUSG00000032320.8|ENSMUST00000114276.3|GN:Rcn2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:35 +1 M 0.362 +2 Q 0.373 +3 R 0.392 +4 R 0.407 +5 P 0.408 +6 S 0.401 +7 V 0.400 +8 A 0.401 +9 A 0.391 +10 R 0.376 +11 E 0.371 +12 A 0.368 +13 R 0.365 +14 L 0.376 +15 P 0.412 +16 S 0.465 +17 P 0.521 +18 G 0.560 +19 S 0.561 +20 A 0.519 +21 C 0.460 +22 L 0.422 +23 P 0.410 +24 P 0.413 +25 R 0.424 +26 G 0.438 +27 F 0.434 +28 L 0.415 +29 R 0.411 +30 P 0.424 +31 R 0.419 +32 R 0.408 +33 A 0.451 +34 G 0.551 +35 A 0.637 +36 M 0.668 +37 R 0.660 +38 L 0.646 +39 G 0.645 +40 P 0.660 +41 R 0.687 +42 P 0.714 +43 A 0.724 +44 A 0.711 +45 L 0.680 +46 G 0.635 +47 L 0.585 +48 L 0.542 +49 L 0.504 +50 P 0.462 +51 L 0.439 +52 L 0.454 +53 L 0.488 +54 Y 0.512 +55 A 0.539 +56 A 0.585 +57 V 0.627 +58 A 0.642 +59 G 0.627 +60 A 0.592 +61 S 0.553 +62 K 0.524 +63 A 0.494 +64 E 0.446 +65 E 0.384 +66 L 0.325 +67 H 0.283 +68 Y 0.262 +69 P 0.258 +70 Q 0.269 +71 G 0.289 +72 E 0.307 +73 H 0.304 +74 R 0.285 +75 A 0.284 +76 D 0.318 +77 Y 0.348 +78 D 0.330 +79 R 0.275 +80 E 0.230 +81 A 0.211 +82 L 0.212 +83 L 0.227 +84 G 0.251 +85 V 0.264 +86 Q 0.253 +87 E 0.219 +88 D 0.180 +89 V 0.148 +90 D 0.123 +91 E 0.103 +92 Y 0.088 +93 V 0.082 +94 K 0.085 +95 L 0.093 +96 G 0.098 +97 H 0.091 +98 E 0.075 +99 E 0.063 +100 Q 0.063 +101 Q 0.071 +102 R 0.077 +103 R 0.073 +104 L 0.062 +105 Q 0.052 +106 S 0.046 +107 I 0.044 +108 I 0.043 +109 K 0.041 +110 K 0.044 +111 I 0.056 +112 D 0.077 +113 S 0.104 +114 D 0.126 +115 S 0.136 +116 D 0.140 +117 G 0.146 +118 F 0.148 +119 L 0.137 +120 T 0.113 +121 E 0.087 +122 N 0.071 +123 E 0.065 +124 L 0.060 +125 S 0.056 +126 Q 0.053 +127 W 0.052 +128 I 0.051 +129 Q 0.050 +130 M 0.052 +131 S 0.060 +132 F 0.069 +133 K 0.075 +134 H 0.079 +135 Y 0.084 +136 A 0.090 +137 M 0.091 +138 Q 0.083 +139 E 0.068 +140 A 0.054 +141 K 0.050 +142 Q 0.057 +143 Q 0.065 +144 F 0.067 +145 V 0.062 +146 E 0.060 +147 Y 0.065 +148 D 0.080 +149 K 0.099 +150 N 0.115 +151 S 0.122 +152 D 0.123 +153 G 0.121 +154 A 0.114 +155 V 0.094 +156 T 0.069 +157 W 0.054 +158 D 0.051 +159 E 0.052 +160 Y 0.047 +161 N 0.039 +162 I 0.037 +163 Q 0.047 +164 M 0.069 +165 Y 0.099 +166 D 0.136 +167 R 0.176 +168 V 0.212 +169 I 0.242 +170 D 0.264 +171 F 0.278 +172 D 0.289 +173 E 0.306 +174 N 0.339 +175 T 0.381 +176 A 0.414 +177 L 0.425 +178 D 0.409 +179 D 0.376 +180 T 0.338 +181 E 0.302 +182 E 0.268 +183 G 0.232 +184 S 0.187 +185 F 0.138 +186 R 0.098 +187 Q 0.079 +188 L 0.076 +189 H 0.081 +190 L 0.087 +191 K 0.090 +192 D 0.089 +193 K 0.084 +194 K 0.076 +195 R 0.067 +196 F 0.060 +197 E 0.058 +198 K 0.060 +199 A 0.064 +200 N 0.073 +201 Q 0.090 +202 D 0.112 +203 S 0.130 +204 G 0.136 +205 P 0.134 +206 G 0.132 +207 L 0.127 +208 S 0.110 +209 L 0.089 +210 E 0.075 +211 E 0.072 +212 F 0.074 +213 I 0.078 +214 A 0.085 +215 F 0.091 +216 E 0.094 +217 H 0.097 +218 P 0.102 +219 E 0.107 +220 E 0.110 +221 V 0.105 +222 D 0.097 +223 Y 0.090 +224 M 0.083 +225 T 0.079 +226 E 0.083 +227 F 0.090 +228 V 0.090 +229 I 0.085 +230 Q 0.087 +231 E 0.094 +232 A 0.094 +233 L 0.084 +234 E 0.075 +235 E 0.075 +236 H 0.084 +237 D 0.103 +238 K 0.132 +239 N 0.158 +240 G 0.167 +241 D 0.157 +242 G 0.141 +243 F 0.123 +244 V 0.101 +245 S 0.081 +246 L 0.075 +247 E 0.083 +248 E 0.096 +249 F 0.102 +250 L 0.108 +251 G 0.120 +252 D 0.134 +253 Y 0.149 +254 R 0.168 +255 R 0.190 +256 D 0.205 +257 P 0.206 +258 T 0.200 +259 A 0.194 +260 N 0.187 +261 E 0.173 +262 D 0.152 +263 P 0.127 +264 E 0.105 +265 W 0.089 +266 I 0.081 +267 L 0.081 +268 V 0.088 +269 E 0.097 +270 K 0.099 +271 D 0.093 +272 R 0.082 +273 F 0.075 +274 V 0.076 +275 N 0.079 +276 D 0.076 +277 Y 0.075 +278 D 0.087 +279 K 0.109 +280 D 0.128 +281 N 0.136 +282 D 0.141 +283 G 0.150 +284 R 0.155 +285 L 0.145 +286 D 0.118 +287 P 0.090 +288 Q 0.079 +289 E 0.080 +290 L 0.081 +291 L 0.080 +292 S 0.085 +293 W 0.098 +294 V 0.118 +295 V 0.143 +296 P 0.171 +297 N 0.192 +298 N 0.200 +299 Q 0.196 +300 G 0.180 +301 I 0.152 +302 A 0.124 +303 Q 0.114 +304 E 0.119 +305 E 0.122 +306 A 0.117 +307 L 0.116 +308 H 0.126 +309 L 0.132 +310 I 0.121 +311 D 0.103 +312 E 0.090 +313 M 0.088 +314 D 0.094 +315 L 0.106 +316 N 0.118 +317 S 0.130 +318 D 0.148 +319 K 0.171 +320 K 0.183 +321 L 0.171 +322 S 0.138 +323 E 0.105 +324 E 0.086 +325 E 0.078 +326 I 0.072 +327 L 0.070 +328 E 0.073 +329 N 0.073 +330 Q 0.072 +331 D 0.072 +332 L 0.073 +333 F 0.075 +334 L 0.083 +335 T 0.100 +336 S 0.113 +337 E 0.117 +338 A 0.117 +339 T 0.129 +340 D 0.152 +341 Y 0.177 +342 G 0.200 +343 R 0.228 +344 Q 0.263 +345 L 0.301 +346 H 0.336 +347 D 0.364 +348 D 0.386 +349 Y 0.399 +350 F 0.409 +351 Y 0.427 +352 H 0.458 +353 D 0.486 +354 E 0.489 +355 L 0.474 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032400.19_ENSMUST00000122091.8_GN:Zwilch_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032400.19_ENSMUST00000122091.8_GN:Zwilch_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e38aa52f4279f1d585764e8d0a173f5a44faf6e6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032400.19_ENSMUST00000122091.8_GN:Zwilch_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,590 @@ +>ENSMUSG00000032400.19|ENSMUST00000122091.8|GN:Zwilch|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.106 +2 W 0.097 +3 S 0.089 +4 R 0.087 +5 M 0.093 +6 N 0.097 +7 R 0.091 +8 A 0.076 +9 A 0.065 +10 E 0.066 +11 E 0.072 +12 F 0.073 +13 Y 0.072 +14 A 0.072 +15 R 0.069 +16 L 0.070 +17 R 0.086 +18 Q 0.113 +19 E 0.143 +20 F 0.172 +21 N 0.197 +22 E 0.218 +23 E 0.243 +24 K 0.275 +25 K 0.309 +26 G 0.334 +27 A 0.341 +28 S 0.328 +29 K 0.298 +30 D 0.261 +31 P 0.223 +32 F 0.192 +33 I 0.166 +34 Y 0.147 +35 E 0.132 +36 A 0.120 +37 D 0.112 +38 V 0.111 +39 Q 0.113 +40 V 0.118 +41 Q 0.127 +42 L 0.138 +43 I 0.146 +44 S 0.152 +45 K 0.164 +46 G 0.182 +47 Q 0.190 +48 P 0.177 +49 S 0.155 +50 L 0.138 +51 L 0.131 +52 K 0.131 +53 T 0.134 +54 I 0.136 +55 L 0.139 +56 N 0.144 +57 E 0.148 +58 N 0.149 +59 D 0.145 +60 S 0.139 +61 V 0.138 +62 F 0.149 +63 L 0.173 +64 V 0.200 +65 E 0.222 +66 K 0.239 +67 V 0.264 +68 V 0.309 +69 L 0.371 +70 E 0.435 +71 K 0.484 +72 E 0.518 +73 E 0.550 +74 T 0.585 +75 S 0.608 +76 Q 0.598 +77 V 0.559 +78 E 0.527 +79 E 0.520 +80 L 0.520 +81 Q 0.529 +82 S 0.566 +83 E 0.611 +84 E 0.638 +85 T 0.655 +86 A 0.673 +87 I 0.687 +88 S 0.692 +89 D 0.688 +90 L 0.676 +91 S 0.659 +92 A 0.635 +93 G 0.592 +94 E 0.521 +95 N 0.428 +96 I 0.335 +97 R 0.261 +98 P 0.204 +99 L 0.162 +100 A 0.136 +101 L 0.126 +102 P 0.123 +103 V 0.119 +104 G 0.112 +105 R 0.102 +106 A 0.091 +107 R 0.082 +108 Q 0.076 +109 L 0.077 +110 I 0.083 +111 G 0.089 +112 L 0.091 +113 Y 0.091 +114 T 0.095 +115 M 0.106 +116 A 0.126 +117 H 0.152 +118 N 0.171 +119 P 0.177 +120 N 0.172 +121 M 0.165 +122 T 0.157 +123 H 0.153 +124 L 0.157 +125 K 0.162 +126 I 0.164 +127 K 0.162 +128 Q 0.157 +129 P 0.151 +130 V 0.147 +131 T 0.145 +132 A 0.143 +133 L 0.135 +134 P 0.123 +135 P 0.112 +136 L 0.109 +137 W 0.117 +138 V 0.138 +139 R 0.176 +140 C 0.228 +141 D 0.282 +142 G 0.315 +143 S 0.317 +144 D 0.293 +145 P 0.255 +146 E 0.214 +147 G 0.177 +148 T 0.147 +149 C 0.127 +150 W 0.115 +151 L 0.109 +152 G 0.104 +153 A 0.097 +154 E 0.085 +155 L 0.072 +156 I 0.063 +157 T 0.061 +158 T 0.066 +159 N 0.072 +160 D 0.072 +161 I 0.069 +162 I 0.064 +163 A 0.062 +164 G 0.061 +165 V 0.060 +166 I 0.056 +167 L 0.053 +168 Y 0.052 +169 V 0.055 +170 L 0.063 +171 T 0.078 +172 C 0.099 +173 K 0.123 +174 A 0.148 +175 D 0.174 +176 K 0.205 +177 N 0.235 +178 Y 0.255 +179 S 0.256 +180 E 0.246 +181 D 0.233 +182 L 0.226 +183 E 0.230 +184 N 0.241 +185 L 0.254 +186 K 0.271 +187 T 0.292 +188 S 0.304 +189 H 0.296 +190 K 0.276 +191 K 0.253 +192 R 0.236 +193 H 0.225 +194 H 0.217 +195 V 0.206 +196 S 0.191 +197 A 0.176 +198 V 0.164 +199 T 0.161 +200 A 0.164 +201 R 0.171 +202 G 0.176 +203 F 0.176 +204 A 0.171 +205 Q 0.165 +206 Y 0.171 +207 E 0.194 +208 L 0.233 +209 F 0.293 +210 K 0.377 +211 S 0.471 +212 D 0.551 +213 D 0.602 +214 L 0.620 +215 D 0.614 +216 D 0.596 +217 T 0.578 +218 V 0.571 +219 A 0.575 +220 P 0.570 +221 S 0.532 +222 Q 0.454 +223 T 0.367 +224 T 0.305 +225 V 0.279 +226 T 0.265 +227 L 0.240 +228 D 0.202 +229 L 0.163 +230 S 0.136 +231 W 0.133 +232 S 0.156 +233 P 0.195 +234 V 0.231 +235 D 0.252 +236 E 0.257 +237 M 0.250 +238 L 0.239 +239 Q 0.236 +240 T 0.250 +241 P 0.284 +242 P 0.332 +243 L 0.388 +244 S 0.436 +245 S 0.445 +246 T 0.414 +247 A 0.376 +248 A 0.357 +249 L 0.349 +250 N 0.330 +251 I 0.299 +252 R 0.278 +253 V 0.280 +254 Q 0.294 +255 S 0.307 +256 G 0.317 +257 E 0.317 +258 S 0.297 +259 R 0.260 +260 G 0.222 +261 C 0.187 +262 L 0.152 +263 S 0.119 +264 H 0.094 +265 L 0.079 +266 H 0.067 +267 R 0.058 +268 E 0.050 +269 L 0.045 +270 K 0.039 +271 F 0.033 +272 L 0.027 +273 L 0.025 +274 V 0.028 +275 L 0.034 +276 A 0.043 +277 D 0.053 +278 G 0.064 +279 I 0.073 +280 R 0.083 +281 T 0.095 +282 G 0.102 +283 V 0.099 +284 T 0.090 +285 E 0.084 +286 W 0.086 +287 L 0.092 +288 E 0.099 +289 P 0.101 +290 L 0.102 +291 E 0.106 +292 T 0.107 +293 K 0.097 +294 S 0.080 +295 A 0.070 +296 L 0.071 +297 E 0.072 +298 F 0.064 +299 V 0.052 +300 Q 0.045 +301 E 0.046 +302 F 0.057 +303 L 0.076 +304 N 0.097 +305 D 0.118 +306 L 0.143 +307 N 0.178 +308 K 0.221 +309 L 0.272 +310 D 0.331 +311 E 0.392 +312 F 0.443 +313 D 0.473 +314 D 0.479 +315 S 0.469 +316 T 0.465 +317 K 0.483 +318 K 0.511 +319 D 0.536 +320 K 0.551 +321 Q 0.553 +322 K 0.534 +323 E 0.495 +324 A 0.449 +325 V 0.400 +326 N 0.337 +327 H 0.259 +328 D 0.181 +329 A 0.119 +330 A 0.080 +331 A 0.059 +332 V 0.048 +333 V 0.044 +334 R 0.043 +335 S 0.042 +336 M 0.043 +337 L 0.048 +338 L 0.058 +339 T 0.071 +340 V 0.091 +341 R 0.113 +342 G 0.126 +343 D 0.119 +344 L 0.095 +345 D 0.067 +346 F 0.045 +347 A 0.032 +348 E 0.026 +349 Q 0.022 +350 L 0.022 +351 W 0.025 +352 C 0.032 +353 R 0.041 +354 M 0.051 +355 S 0.061 +356 S 0.067 +357 S 0.065 +358 V 0.057 +359 V 0.047 +360 S 0.038 +361 Y 0.031 +362 Q 0.026 +363 D 0.022 +364 L 0.021 +365 V 0.020 +366 K 0.019 +367 C 0.017 +368 F 0.017 +369 T 0.018 +370 L 0.022 +371 I 0.033 +372 L 0.049 +373 Q 0.061 +374 S 0.062 +375 L 0.060 +376 Q 0.067 +377 R 0.084 +378 G 0.100 +379 D 0.107 +380 I 0.105 +381 Q 0.102 +382 P 0.103 +383 W 0.110 +384 L 0.126 +385 H 0.154 +386 S 0.192 +387 G 0.225 +388 S 0.235 +389 N 0.216 +390 S 0.175 +391 L 0.128 +392 L 0.092 +393 S 0.074 +394 K 0.074 +395 L 0.084 +396 I 0.100 +397 H 0.117 +398 Q 0.136 +399 S 0.168 +400 Y 0.217 +401 H 0.276 +402 G 0.325 +403 A 0.345 +404 M 0.341 +405 D 0.331 +406 S 0.328 +407 V 0.329 +408 P 0.321 +409 L 0.302 +410 S 0.276 +411 G 0.241 +412 T 0.193 +413 T 0.141 +414 P 0.100 +415 L 0.073 +416 Q 0.057 +417 M 0.049 +418 L 0.045 +419 L 0.046 +420 E 0.050 +421 I 0.053 +422 G 0.054 +423 L 0.054 +424 D 0.052 +425 K 0.048 +426 L 0.045 +427 K 0.044 +428 K 0.041 +429 D 0.036 +430 Y 0.032 +431 I 0.033 +432 S 0.040 +433 F 0.050 +434 F 0.060 +435 V 0.072 +436 S 0.086 +437 Q 0.102 +438 E 0.114 +439 L 0.123 +440 A 0.133 +441 S 0.144 +442 L 0.143 +443 N 0.133 +444 H 0.124 +445 L 0.123 +446 E 0.130 +447 Y 0.143 +448 F 0.167 +449 I 0.200 +450 S 0.232 +451 P 0.253 +452 S 0.254 +453 V 0.237 +454 S 0.209 +455 T 0.181 +456 Q 0.159 +457 E 0.144 +458 Q 0.131 +459 V 0.117 +460 C 0.107 +461 R 0.103 +462 V 0.100 +463 Q 0.092 +464 K 0.083 +465 L 0.072 +466 H 0.061 +467 H 0.050 +468 I 0.042 +469 L 0.036 +470 E 0.031 +471 I 0.027 +472 L 0.024 +473 V 0.022 +474 I 0.024 +475 C 0.028 +476 M 0.033 +477 L 0.040 +478 F 0.047 +479 I 0.055 +480 K 0.063 +481 P 0.068 +482 Q 0.069 +483 H 0.064 +484 E 0.056 +485 L 0.051 +486 L 0.049 +487 F 0.050 +488 S 0.051 +489 L 0.049 +490 T 0.047 +491 Q 0.046 +492 S 0.048 +493 C 0.057 +494 I 0.072 +495 K 0.086 +496 Y 0.092 +497 Y 0.097 +498 K 0.116 +499 Q 0.152 +500 N 0.191 +501 P 0.216 +502 L 0.221 +503 D 0.218 +504 E 0.214 +505 Q 0.209 +506 H 0.209 +507 I 0.216 +508 F 0.226 +509 Q 0.240 +510 L 0.262 +511 P 0.287 +512 V 0.317 +513 R 0.357 +514 P 0.408 +515 A 0.457 +516 A 0.495 +517 V 0.527 +518 K 0.549 +519 N 0.548 +520 L 0.521 +521 Y 0.486 +522 Q 0.466 +523 S 0.464 +524 E 0.475 +525 K 0.493 +526 P 0.513 +527 Q 0.527 +528 K 0.536 +529 W 0.551 +530 R 0.582 +531 V 0.624 +532 E 0.654 +533 L 0.654 +534 S 0.639 +535 N 0.632 +536 S 0.635 +537 Q 0.638 +538 K 0.636 +539 R 0.630 +540 V 0.615 +541 K 0.584 +542 T 0.543 +543 V 0.513 +544 W 0.508 +545 Q 0.527 +546 L 0.553 +547 S 0.570 +548 D 0.570 +549 S 0.567 +550 S 0.577 +551 P 0.599 +552 V 0.616 +553 D 0.619 +554 H 0.611 +555 S 0.590 +556 S 0.551 +557 F 0.499 +558 H 0.454 +559 R 0.424 +560 P 0.413 +561 E 0.418 +562 F 0.427 +563 P 0.420 +564 E 0.386 +565 L 0.340 +566 T 0.305 +567 L 0.291 +568 N 0.297 +569 G 0.308 +570 S 0.300 +571 L 0.268 +572 E 0.224 +573 E 0.185 +574 R 0.159 +575 T 0.145 +576 A 0.137 +577 F 0.135 +578 V 0.139 +579 N 0.147 +580 M 0.156 +581 L 0.160 +582 T 0.160 +583 C 0.157 +584 S 0.148 +585 Q 0.134 +586 V 0.122 +587 H 0.120 +588 F 0.126 +589 K 0.132 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032400.19_ENSMUST00000122091.8_GN:Zwilch_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032400.19_ENSMUST00000122091.8_GN:Zwilch_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f9210a0022f6da3f864f1f865831a576b6b8b243 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032400.19_ENSMUST00000122091.8_GN:Zwilch_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid @@ -0,0 +1,597 @@ +>ENSMUSG00000032400.19|ENSMUST00000122091.8|GN:Zwilch|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:7 +1 M 0.393 +2 D 0.411 +3 G 0.435 +4 G 0.452 +5 H 0.449 +6 G 0.416 +7 G 0.346 +8 M 0.255 +9 W 0.177 +10 S 0.130 +11 R 0.106 +12 M 0.098 +13 N 0.097 +14 R 0.092 +15 A 0.078 +16 A 0.068 +17 E 0.069 +18 E 0.075 +19 F 0.075 +20 Y 0.074 +21 A 0.074 +22 R 0.071 +23 L 0.073 +24 R 0.088 +25 Q 0.115 +26 E 0.144 +27 F 0.172 +28 N 0.196 +29 E 0.216 +30 E 0.241 +31 K 0.272 +32 K 0.304 +33 G 0.325 +34 A 0.327 +35 S 0.309 +36 K 0.276 +37 D 0.237 +38 P 0.201 +39 F 0.172 +40 I 0.150 +41 Y 0.134 +42 E 0.121 +43 A 0.110 +44 D 0.103 +45 V 0.103 +46 Q 0.106 +47 V 0.113 +48 Q 0.124 +49 L 0.136 +50 I 0.146 +51 S 0.154 +52 K 0.169 +53 G 0.187 +54 Q 0.193 +55 P 0.177 +56 S 0.151 +57 L 0.131 +58 L 0.122 +59 K 0.121 +60 T 0.125 +61 I 0.128 +62 L 0.132 +63 N 0.137 +64 E 0.140 +65 N 0.138 +66 D 0.131 +67 S 0.120 +68 V 0.114 +69 F 0.121 +70 L 0.139 +71 V 0.162 +72 E 0.184 +73 K 0.203 +74 V 0.231 +75 V 0.279 +76 L 0.346 +77 E 0.417 +78 K 0.476 +79 E 0.517 +80 E 0.554 +81 T 0.592 +82 S 0.615 +83 Q 0.604 +84 V 0.565 +85 E 0.539 +86 E 0.549 +87 L 0.572 +88 Q 0.593 +89 S 0.618 +90 E 0.638 +91 E 0.649 +92 T 0.658 +93 A 0.673 +94 I 0.685 +95 S 0.689 +96 D 0.684 +97 L 0.673 +98 S 0.659 +99 A 0.638 +100 G 0.598 +101 E 0.528 +102 N 0.435 +103 I 0.342 +104 R 0.266 +105 P 0.208 +106 L 0.165 +107 A 0.137 +108 L 0.125 +109 P 0.121 +110 V 0.117 +111 G 0.110 +112 R 0.101 +113 A 0.091 +114 R 0.081 +115 Q 0.075 +116 L 0.074 +117 I 0.080 +118 G 0.085 +119 L 0.087 +120 Y 0.087 +121 T 0.091 +122 M 0.102 +123 A 0.123 +124 H 0.150 +125 N 0.170 +126 P 0.176 +127 N 0.172 +128 M 0.164 +129 T 0.156 +130 H 0.150 +131 L 0.153 +132 K 0.158 +133 I 0.160 +134 K 0.158 +135 Q 0.153 +136 P 0.146 +137 V 0.141 +138 T 0.138 +139 A 0.135 +140 L 0.127 +141 P 0.114 +142 P 0.104 +143 L 0.101 +144 W 0.110 +145 V 0.132 +146 R 0.169 +147 C 0.219 +148 D 0.270 +149 G 0.303 +150 S 0.305 +151 D 0.281 +152 P 0.243 +153 E 0.202 +154 G 0.166 +155 T 0.136 +156 C 0.115 +157 W 0.103 +158 L 0.097 +159 G 0.092 +160 A 0.085 +161 E 0.075 +162 L 0.065 +163 I 0.057 +164 T 0.056 +165 T 0.060 +166 N 0.065 +167 D 0.066 +168 I 0.063 +169 I 0.059 +170 A 0.057 +171 G 0.057 +172 V 0.056 +173 I 0.053 +174 L 0.050 +175 Y 0.050 +176 V 0.052 +177 L 0.060 +178 T 0.073 +179 C 0.094 +180 K 0.118 +181 A 0.142 +182 D 0.166 +183 K 0.195 +184 N 0.224 +185 Y 0.243 +186 S 0.245 +187 E 0.236 +188 D 0.225 +189 L 0.219 +190 E 0.224 +191 N 0.236 +192 L 0.250 +193 K 0.268 +194 T 0.289 +195 S 0.301 +196 H 0.292 +197 K 0.270 +198 K 0.245 +199 R 0.226 +200 H 0.214 +201 H 0.204 +202 V 0.193 +203 S 0.179 +204 A 0.164 +205 V 0.154 +206 T 0.150 +207 A 0.152 +208 R 0.157 +209 G 0.161 +210 F 0.160 +211 A 0.153 +212 Q 0.148 +213 Y 0.154 +214 E 0.176 +215 L 0.214 +216 F 0.272 +217 K 0.356 +218 S 0.452 +219 D 0.532 +220 D 0.582 +221 L 0.600 +222 D 0.593 +223 D 0.572 +224 T 0.552 +225 V 0.545 +226 A 0.549 +227 P 0.543 +228 S 0.500 +229 Q 0.417 +230 T 0.328 +231 T 0.267 +232 V 0.241 +233 T 0.228 +234 L 0.207 +235 D 0.175 +236 L 0.143 +237 S 0.122 +238 W 0.121 +239 S 0.145 +240 P 0.183 +241 V 0.219 +242 D 0.241 +243 E 0.248 +244 M 0.242 +245 L 0.232 +246 Q 0.228 +247 T 0.242 +248 P 0.274 +249 P 0.319 +250 L 0.370 +251 S 0.412 +252 S 0.418 +253 T 0.385 +254 A 0.345 +255 A 0.324 +256 L 0.314 +257 N 0.296 +258 I 0.269 +259 R 0.251 +260 V 0.255 +261 Q 0.272 +262 S 0.290 +263 G 0.304 +264 E 0.307 +265 S 0.289 +266 R 0.255 +267 G 0.218 +268 C 0.183 +269 L 0.148 +270 S 0.115 +271 H 0.091 +272 L 0.076 +273 H 0.065 +274 R 0.056 +275 E 0.049 +276 L 0.044 +277 K 0.038 +278 F 0.032 +279 L 0.027 +280 L 0.025 +281 V 0.028 +282 L 0.034 +283 A 0.043 +284 D 0.054 +285 G 0.065 +286 I 0.075 +287 R 0.085 +288 T 0.098 +289 G 0.105 +290 V 0.102 +291 T 0.093 +292 E 0.088 +293 W 0.090 +294 L 0.096 +295 E 0.102 +296 P 0.104 +297 L 0.105 +298 E 0.109 +299 T 0.110 +300 K 0.100 +301 S 0.082 +302 A 0.071 +303 L 0.071 +304 E 0.072 +305 F 0.064 +306 V 0.052 +307 Q 0.045 +308 E 0.046 +309 F 0.057 +310 L 0.076 +311 N 0.097 +312 D 0.117 +313 L 0.143 +314 N 0.178 +315 K 0.221 +316 L 0.272 +317 D 0.331 +318 E 0.392 +319 F 0.443 +320 D 0.474 +321 D 0.479 +322 S 0.468 +323 T 0.464 +324 K 0.482 +325 K 0.511 +326 D 0.535 +327 K 0.550 +328 Q 0.552 +329 K 0.532 +330 E 0.492 +331 A 0.447 +332 V 0.397 +333 N 0.335 +334 H 0.258 +335 D 0.181 +336 A 0.119 +337 A 0.079 +338 A 0.059 +339 V 0.048 +340 V 0.044 +341 R 0.043 +342 S 0.043 +343 M 0.044 +344 L 0.049 +345 L 0.059 +346 T 0.073 +347 V 0.093 +348 R 0.115 +349 G 0.127 +350 D 0.120 +351 L 0.095 +352 D 0.067 +353 F 0.045 +354 A 0.032 +355 E 0.026 +356 Q 0.023 +357 L 0.023 +358 W 0.026 +359 C 0.032 +360 R 0.041 +361 M 0.052 +362 S 0.062 +363 S 0.067 +364 S 0.066 +365 V 0.058 +366 V 0.047 +367 S 0.038 +368 Y 0.031 +369 Q 0.026 +370 D 0.022 +371 L 0.021 +372 V 0.020 +373 K 0.018 +374 C 0.017 +375 F 0.016 +376 T 0.018 +377 L 0.022 +378 I 0.033 +379 L 0.049 +380 Q 0.060 +381 S 0.061 +382 L 0.059 +383 Q 0.067 +384 R 0.084 +385 G 0.101 +386 D 0.107 +387 I 0.105 +388 Q 0.103 +389 P 0.104 +390 W 0.111 +391 L 0.128 +392 H 0.156 +393 S 0.194 +394 G 0.227 +395 S 0.237 +396 N 0.217 +397 S 0.176 +398 L 0.129 +399 L 0.092 +400 S 0.075 +401 K 0.075 +402 L 0.086 +403 I 0.102 +404 H 0.120 +405 Q 0.140 +406 S 0.173 +407 Y 0.223 +408 H 0.285 +409 G 0.335 +410 A 0.357 +411 M 0.352 +412 D 0.342 +413 S 0.338 +414 V 0.338 +415 P 0.329 +416 L 0.310 +417 S 0.284 +418 G 0.247 +419 T 0.198 +420 T 0.144 +421 P 0.101 +422 L 0.074 +423 Q 0.058 +424 M 0.049 +425 L 0.045 +426 L 0.046 +427 E 0.050 +428 I 0.052 +429 G 0.053 +430 L 0.053 +431 D 0.051 +432 K 0.047 +433 L 0.044 +434 K 0.043 +435 K 0.041 +436 D 0.035 +437 Y 0.031 +438 I 0.032 +439 S 0.039 +440 F 0.050 +441 F 0.061 +442 V 0.072 +443 S 0.086 +444 Q 0.102 +445 E 0.115 +446 L 0.124 +447 A 0.135 +448 S 0.146 +449 L 0.146 +450 N 0.135 +451 H 0.126 +452 L 0.126 +453 E 0.132 +454 Y 0.145 +455 F 0.169 +456 I 0.202 +457 S 0.235 +458 P 0.256 +459 S 0.259 +460 V 0.241 +461 S 0.213 +462 T 0.184 +463 Q 0.162 +464 E 0.145 +465 Q 0.131 +466 V 0.117 +467 C 0.106 +468 R 0.102 +469 V 0.099 +470 Q 0.092 +471 K 0.082 +472 L 0.072 +473 H 0.060 +474 H 0.049 +475 I 0.041 +476 L 0.036 +477 E 0.031 +478 I 0.026 +479 L 0.023 +480 V 0.022 +481 I 0.024 +482 C 0.028 +483 M 0.033 +484 L 0.040 +485 F 0.047 +486 I 0.055 +487 K 0.063 +488 P 0.068 +489 Q 0.069 +490 H 0.063 +491 E 0.056 +492 L 0.050 +493 L 0.049 +494 F 0.050 +495 S 0.051 +496 L 0.049 +497 T 0.047 +498 Q 0.046 +499 S 0.048 +500 C 0.056 +501 I 0.072 +502 K 0.085 +503 Y 0.091 +504 Y 0.097 +505 K 0.116 +506 Q 0.152 +507 N 0.192 +508 P 0.216 +509 L 0.222 +510 D 0.219 +511 E 0.214 +512 Q 0.209 +513 H 0.209 +514 I 0.216 +515 F 0.226 +516 Q 0.241 +517 L 0.263 +518 P 0.289 +519 V 0.320 +520 R 0.359 +521 P 0.409 +522 A 0.456 +523 A 0.493 +524 V 0.524 +525 K 0.545 +526 N 0.543 +527 L 0.516 +528 Y 0.483 +529 Q 0.464 +530 S 0.464 +531 E 0.476 +532 K 0.493 +533 P 0.511 +534 Q 0.523 +535 K 0.532 +536 W 0.546 +537 R 0.578 +538 V 0.621 +539 E 0.652 +540 L 0.652 +541 S 0.638 +542 N 0.631 +543 S 0.634 +544 Q 0.636 +545 K 0.634 +546 R 0.627 +547 V 0.611 +548 K 0.580 +549 T 0.539 +550 V 0.508 +551 W 0.504 +552 Q 0.523 +553 L 0.550 +554 S 0.568 +555 D 0.570 +556 S 0.568 +557 S 0.578 +558 P 0.599 +559 V 0.616 +560 D 0.619 +561 H 0.611 +562 S 0.590 +563 S 0.550 +564 F 0.498 +565 H 0.452 +566 R 0.422 +567 P 0.412 +568 E 0.417 +569 F 0.426 +570 P 0.418 +571 E 0.385 +572 L 0.339 +573 T 0.305 +574 L 0.292 +575 N 0.297 +576 G 0.307 +577 S 0.298 +578 L 0.266 +579 E 0.222 +580 E 0.184 +581 R 0.158 +582 T 0.143 +583 A 0.135 +584 F 0.132 +585 V 0.136 +586 N 0.145 +587 M 0.154 +588 L 0.158 +589 T 0.158 +590 C 0.155 +591 S 0.146 +592 Q 0.132 +593 V 0.121 +594 H 0.119 +595 F 0.125 +596 K 0.131 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032482.10_ENSMUST00000035058.10_GN:Cspg5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032482.10_ENSMUST00000035058.10_GN:Cspg5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2af839537ba823f3c1f39eb91eb29a5b9f66abbd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032482.10_ENSMUST00000035058.10_GN:Cspg5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,567 @@ +>ENSMUSG00000032482.10|ENSMUST00000035058.10|GN:Cspg5|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.439 +2 G 0.482 +3 R 0.543 +4 A 0.599 +5 G 0.641 +6 G 0.668 +7 G 0.682 +8 G 0.681 +9 P 0.659 +10 D 0.622 +11 W 0.588 +12 G 0.572 +13 P 0.576 +14 P 0.586 +15 P 0.570 +16 V 0.510 +17 L 0.428 +18 L 0.373 +19 L 0.374 +20 L 0.421 +21 G 0.470 +22 V 0.493 +23 T 0.497 +24 L 0.497 +25 V 0.508 +26 L 0.541 +27 T 0.599 +28 A 0.660 +29 G 0.698 +30 A 0.712 +31 V 0.722 +32 P 0.738 +33 A 0.758 +34 R 0.773 +35 E 0.783 +36 T 0.791 +37 G 0.795 +38 S 0.793 +39 A 0.783 +40 I 0.771 +41 E 0.755 +42 A 0.724 +43 E 0.670 +44 E 0.601 +45 L 0.532 +46 V 0.482 +47 R 0.476 +48 S 0.517 +49 S 0.564 +50 L 0.583 +51 A 0.589 +52 W 0.607 +53 E 0.637 +54 S 0.662 +55 R 0.679 +56 A 0.694 +57 N 0.713 +58 D 0.737 +59 T 0.756 +60 R 0.764 +61 E 0.766 +62 E 0.766 +63 A 0.763 +64 G 0.758 +65 L 0.755 +66 P 0.759 +67 A 0.774 +68 A 0.794 +69 G 0.808 +70 E 0.811 +71 D 0.805 +72 E 0.797 +73 T 0.785 +74 S 0.760 +75 W 0.712 +76 T 0.654 +77 E 0.632 +78 R 0.672 +79 G 0.742 +80 S 0.792 +81 E 0.818 +82 M 0.833 +83 A 0.839 +84 A 0.836 +85 V 0.824 +86 G 0.816 +87 P 0.816 +88 G 0.822 +89 V 0.823 +90 G 0.822 +91 P 0.822 +92 E 0.826 +93 E 0.829 +94 A 0.829 +95 L 0.829 +96 E 0.832 +97 A 0.837 +98 S 0.837 +99 A 0.833 +100 A 0.830 +101 V 0.830 +102 T 0.830 +103 G 0.829 +104 T 0.824 +105 A 0.818 +106 W 0.814 +107 L 0.816 +108 E 0.820 +109 A 0.817 +110 D 0.807 +111 G 0.799 +112 P 0.805 +113 G 0.822 +114 L 0.840 +115 G 0.855 +116 G 0.865 +117 V 0.867 +118 T 0.864 +119 A 0.859 +120 E 0.854 +121 A 0.849 +122 G 0.844 +123 S 0.836 +124 G 0.814 +125 D 0.763 +126 A 0.690 +127 Q 0.642 +128 T 0.660 +129 L 0.716 +130 P 0.762 +131 A 0.771 +132 T 0.736 +133 L 0.674 +134 Q 0.641 +135 A 0.677 +136 P 0.747 +137 D 0.800 +138 E 0.827 +139 A 0.837 +140 L 0.838 +141 G 0.834 +142 S 0.826 +143 S 0.810 +144 T 0.788 +145 M 0.771 +146 P 0.770 +147 P 0.779 +148 A 0.786 +149 I 0.792 +150 P 0.803 +151 E 0.815 +152 A 0.821 +153 T 0.821 +154 E 0.819 +155 T 0.816 +156 S 0.808 +157 G 0.799 +158 P 0.796 +159 P 0.801 +160 S 0.814 +161 P 0.828 +162 A 0.837 +163 V 0.838 +164 H 0.834 +165 D 0.828 +166 K 0.824 +167 P 0.825 +168 S 0.830 +169 V 0.833 +170 G 0.830 +171 P 0.821 +172 E 0.814 +173 L 0.810 +174 P 0.811 +175 K 0.810 +176 E 0.803 +177 I 0.798 +178 P 0.802 +179 L 0.812 +180 E 0.819 +181 V 0.821 +182 R 0.820 +183 L 0.821 +184 N 0.826 +185 L 0.833 +186 G 0.837 +187 G 0.830 +188 S 0.813 +189 T 0.798 +190 P 0.796 +191 E 0.802 +192 P 0.805 +193 T 0.804 +194 F 0.806 +195 P 0.820 +196 L 0.841 +197 Q 0.859 +198 G 0.867 +199 T 0.863 +200 L 0.852 +201 E 0.842 +202 T 0.835 +203 Q 0.830 +204 P 0.829 +205 A 0.829 +206 S 0.827 +207 D 0.820 +208 I 0.812 +209 I 0.806 +210 D 0.799 +211 I 0.789 +212 D 0.774 +213 Y 0.764 +214 F 0.768 +215 E 0.785 +216 G 0.802 +217 L 0.810 +218 D 0.811 +219 S 0.811 +220 E 0.813 +221 G 0.820 +222 R 0.829 +223 G 0.836 +224 A 0.837 +225 D 0.832 +226 M 0.823 +227 G 0.811 +228 S 0.799 +229 F 0.793 +230 P 0.799 +231 G 0.810 +232 S 0.823 +233 P 0.834 +234 G 0.840 +235 T 0.837 +236 S 0.829 +237 E 0.817 +238 N 0.804 +239 H 0.799 +240 P 0.805 +241 D 0.819 +242 T 0.828 +243 E 0.827 +244 G 0.815 +245 E 0.795 +246 T 0.773 +247 P 0.751 +248 S 0.728 +249 W 0.705 +250 S 0.686 +251 L 0.674 +252 L 0.672 +253 D 0.679 +254 L 0.686 +255 Y 0.695 +256 D 0.702 +257 D 0.701 +258 F 0.696 +259 T 0.702 +260 P 0.718 +261 F 0.730 +262 D 0.732 +263 E 0.723 +264 S 0.709 +265 D 0.693 +266 F 0.683 +267 Y 0.688 +268 P 0.707 +269 T 0.725 +270 T 0.727 +271 S 0.717 +272 F 0.709 +273 Y 0.714 +274 D 0.723 +275 D 0.716 +276 L 0.678 +277 E 0.623 +278 E 0.600 +279 E 0.636 +280 E 0.696 +281 E 0.735 +282 E 0.752 +283 E 0.762 +284 E 0.774 +285 D 0.785 +286 K 0.791 +287 D 0.795 +288 T 0.798 +289 V 0.802 +290 G 0.807 +291 G 0.811 +292 G 0.811 +293 D 0.805 +294 L 0.796 +295 E 0.790 +296 D 0.785 +297 E 0.779 +298 N 0.771 +299 D 0.760 +300 L 0.749 +301 L 0.746 +302 L 0.756 +303 P 0.773 +304 S 0.787 +305 Q 0.797 +306 K 0.811 +307 P 0.828 +308 G 0.840 +309 V 0.844 +310 G 0.844 +311 P 0.843 +312 G 0.841 +313 T 0.834 +314 G 0.823 +315 Q 0.813 +316 P 0.812 +317 T 0.815 +318 N 0.810 +319 R 0.793 +320 W 0.775 +321 H 0.760 +322 A 0.744 +323 V 0.726 +324 P 0.723 +325 P 0.737 +326 Q 0.759 +327 H 0.781 +328 T 0.803 +329 L 0.818 +330 G 0.815 +331 M 0.798 +332 V 0.781 +333 P 0.772 +334 G 0.763 +335 S 0.743 +336 S 0.715 +337 I 0.693 +338 S 0.681 +339 L 0.668 +340 R 0.652 +341 P 0.644 +342 R 0.656 +343 P 0.680 +344 G 0.702 +345 D 0.714 +346 P 0.725 +347 G 0.744 +348 K 0.771 +349 D 0.791 +350 L 0.797 +351 A 0.788 +352 S 0.768 +353 G 0.735 +354 E 0.679 +355 N 0.592 +356 G 0.478 +357 T 0.360 +358 E 0.267 +359 C 0.208 +360 R 0.174 +361 V 0.151 +362 G 0.136 +363 F 0.130 +364 V 0.130 +365 R 0.131 +366 H 0.130 +367 N 0.131 +368 G 0.133 +369 S 0.130 +370 C 0.114 +371 R 0.090 +372 S 0.069 +373 V 0.062 +374 C 0.067 +375 D 0.077 +376 L 0.085 +377 F 0.088 +378 P 0.088 +379 S 0.085 +380 Y 0.079 +381 C 0.078 +382 H 0.087 +383 N 0.102 +384 G 0.112 +385 G 0.112 +386 Q 0.107 +387 C 0.101 +388 Y 0.092 +389 L 0.080 +390 V 0.072 +391 E 0.073 +392 N 0.078 +393 I 0.076 +394 G 0.068 +395 A 0.061 +396 F 0.061 +397 C 0.071 +398 R 0.089 +399 C 0.109 +400 N 0.127 +401 T 0.141 +402 Q 0.152 +403 D 0.162 +404 Y 0.171 +405 I 0.180 +406 W 0.186 +407 H 0.184 +408 K 0.169 +409 G 0.152 +410 M 0.146 +411 R 0.157 +412 C 0.180 +413 E 0.216 +414 S 0.261 +415 I 0.299 +416 I 0.313 +417 T 0.305 +418 D 0.287 +419 F 0.263 +420 Q 0.238 +421 V 0.215 +422 M 0.196 +423 C 0.186 +424 V 0.188 +425 A 0.202 +426 V 0.221 +427 G 0.239 +428 S 0.251 +429 A 0.248 +430 A 0.229 +431 L 0.206 +432 V 0.192 +433 L 0.186 +434 L 0.179 +435 L 0.163 +436 L 0.143 +437 F 0.126 +438 M 0.113 +439 M 0.097 +440 T 0.078 +441 V 0.065 +442 F 0.064 +443 F 0.077 +444 A 0.098 +445 K 0.120 +446 K 0.139 +447 L 0.155 +448 Y 0.174 +449 L 0.203 +450 L 0.241 +451 K 0.278 +452 T 0.314 +453 E 0.344 +454 N 0.357 +455 T 0.357 +456 K 0.360 +457 L 0.375 +458 R 0.397 +459 R 0.427 +460 T 0.470 +461 N 0.517 +462 K 0.554 +463 F 0.581 +464 R 0.608 +465 T 0.642 +466 P 0.680 +467 S 0.716 +468 E 0.742 +469 L 0.756 +470 H 0.761 +471 N 0.765 +472 D 0.766 +473 N 0.762 +474 F 0.756 +475 S 0.761 +476 L 0.781 +477 S 0.807 +478 T 0.828 +479 I 0.839 +480 A 0.840 +481 E 0.830 +482 G 0.812 +483 S 0.793 +484 H 0.787 +485 P 0.800 +486 N 0.819 +487 V 0.833 +488 R 0.839 +489 K 0.839 +490 F 0.836 +491 C 0.830 +492 D 0.823 +493 T 0.820 +494 P 0.822 +495 R 0.825 +496 V 0.821 +497 S 0.805 +498 S 0.788 +499 P 0.781 +500 H 0.785 +501 A 0.787 +502 R 0.773 +503 A 0.753 +504 L 0.748 +505 A 0.757 +506 H 0.762 +507 Y 0.766 +508 D 0.773 +509 N 0.779 +510 I 0.779 +511 V 0.779 +512 C 0.784 +513 Q 0.783 +514 D 0.771 +515 D 0.752 +516 P 0.736 +517 S 0.736 +518 A 0.751 +519 P 0.775 +520 H 0.798 +521 K 0.810 +522 I 0.804 +523 Q 0.781 +524 D 0.752 +525 P 0.729 +526 L 0.726 +527 K 0.741 +528 S 0.761 +529 R 0.775 +530 L 0.783 +531 K 0.788 +532 E 0.789 +533 E 0.784 +534 E 0.777 +535 S 0.775 +536 F 0.780 +537 N 0.788 +538 I 0.794 +539 Q 0.794 +540 N 0.786 +541 S 0.765 +542 M 0.744 +543 S 0.741 +544 P 0.759 +545 K 0.782 +546 L 0.799 +547 E 0.807 +548 G 0.812 +549 G 0.818 +550 K 0.823 +551 G 0.825 +552 D 0.823 +553 Q 0.818 +554 D 0.811 +555 D 0.804 +556 L 0.799 +557 G 0.796 +558 V 0.794 +559 N 0.788 +560 C 0.776 +561 L 0.763 +562 Q 0.744 +563 N 0.698 +564 N 0.601 +565 L 0.472 +566 T 0.376 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032482.10_ENSMUST00000035058.10_GN:Cspg5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:223.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032482.10_ENSMUST00000035058.10_GN:Cspg5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:223.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7ecdfe7402388add10d600d491a01ab5ebf6bf38 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032482.10_ENSMUST00000035058.10_GN:Cspg5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:223.caid @@ -0,0 +1,790 @@ +>ENSMUSG00000032482.10|ENSMUST00000035058.10|GN:Cspg5|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:223 +1 M 0.391 +2 F 0.430 +3 S 0.480 +4 L 0.522 +5 L 0.557 +6 S 0.596 +7 G 0.635 +8 R 0.662 +9 R 0.675 +10 L 0.683 +11 R 0.697 +12 V 0.702 +13 G 0.684 +14 L 0.655 +15 E 0.638 +16 N 0.629 +17 L 0.615 +18 L 0.611 +19 D 0.628 +20 T 0.648 +21 E 0.656 +22 F 0.660 +23 W 0.676 +24 I 0.705 +25 G 0.737 +26 T 0.756 +27 G 0.760 +28 Q 0.757 +29 S 0.750 +30 V 0.744 +31 P 0.743 +32 R 0.748 +33 A 0.753 +34 P 0.753 +35 L 0.752 +36 S 0.753 +37 P 0.755 +38 H 0.759 +39 W 0.772 +40 G 0.790 +41 R 0.797 +42 G 0.782 +43 L 0.757 +44 P 0.746 +45 P 0.760 +46 P 0.786 +47 V 0.800 +48 A 0.794 +49 L 0.776 +50 P 0.760 +51 S 0.751 +52 P 0.739 +53 A 0.706 +54 P 0.656 +55 S 0.636 +56 L 0.680 +57 R 0.754 +58 V 0.802 +59 S 0.819 +60 E 0.825 +61 P 0.829 +62 A 0.822 +63 T 0.803 +64 S 0.778 +65 P 0.768 +66 P 0.781 +67 P 0.807 +68 L 0.832 +69 R 0.848 +70 A 0.853 +71 R 0.850 +72 G 0.839 +73 G 0.822 +74 W 0.806 +75 V 0.797 +76 P 0.797 +77 R 0.799 +78 R 0.801 +79 S 0.799 +80 A 0.794 +81 A 0.783 +82 Q 0.757 +83 R 0.704 +84 A 0.629 +85 Q 0.578 +86 H 0.589 +87 W 0.642 +88 K 0.692 +89 R 0.721 +90 K 0.733 +91 R 0.742 +92 A 0.755 +93 P 0.775 +94 W 0.799 +95 A 0.820 +96 A 0.830 +97 A 0.826 +98 G 0.815 +99 A 0.808 +100 P 0.805 +101 V 0.802 +102 G 0.793 +103 F 0.782 +104 P 0.772 +105 Q 0.764 +106 W 0.755 +107 L 0.747 +108 C 0.737 +109 C 0.732 +110 R 0.737 +111 P 0.747 +112 C 0.758 +113 A 0.766 +114 P 0.775 +115 R 0.783 +116 L 0.787 +117 H 0.785 +118 R 0.780 +119 S 0.776 +120 P 0.778 +121 R 0.784 +122 P 0.792 +123 V 0.800 +124 P 0.809 +125 E 0.819 +126 G 0.823 +127 S 0.819 +128 D 0.808 +129 C 0.797 +130 P 0.794 +131 L 0.800 +132 A 0.807 +133 R 0.806 +134 K 0.798 +135 T 0.786 +136 E 0.773 +137 R 0.755 +138 G 0.719 +139 R 0.671 +140 R 0.647 +141 Q 0.673 +142 R 0.723 +143 D 0.759 +144 V 0.773 +145 L 0.777 +146 R 0.783 +147 G 0.792 +148 G 0.802 +149 R 0.811 +150 S 0.818 +151 G 0.824 +152 G 0.826 +153 G 0.824 +154 A 0.818 +155 E 0.810 +156 R 0.800 +157 G 0.786 +158 S 0.760 +159 G 0.709 +160 K 0.641 +161 R 0.598 +162 Q 0.605 +163 R 0.618 +164 R 0.603 +165 R 0.599 +166 G 0.648 +167 R 0.726 +168 R 0.785 +169 G 0.815 +170 G 0.827 +171 A 0.831 +172 A 0.831 +173 L 0.831 +174 G 0.833 +175 G 0.836 +176 Q 0.841 +177 R 0.846 +178 L 0.851 +179 T 0.855 +180 A 0.856 +181 A 0.856 +182 C 0.853 +183 G 0.849 +184 G 0.841 +185 S 0.824 +186 C 0.799 +187 C 0.777 +188 P 0.767 +189 P 0.772 +190 W 0.788 +191 A 0.806 +192 E 0.817 +193 A 0.817 +194 A 0.811 +195 A 0.808 +196 H 0.811 +197 G 0.816 +198 R 0.818 +199 Q 0.813 +200 A 0.800 +201 Q 0.782 +202 R 0.770 +203 P 0.770 +204 G 0.780 +205 K 0.792 +206 P 0.801 +207 R 0.805 +208 A 0.804 +209 Q 0.801 +210 P 0.802 +211 S 0.804 +212 R 0.792 +213 A 0.747 +214 H 0.678 +215 R 0.638 +216 A 0.654 +217 Q 0.686 +218 R 0.690 +219 Q 0.688 +220 G 0.711 +221 L 0.748 +222 R 0.776 +223 A 0.793 +224 M 0.804 +225 G 0.812 +226 R 0.819 +227 A 0.822 +228 G 0.823 +229 G 0.820 +230 G 0.813 +231 G 0.799 +232 P 0.781 +233 D 0.760 +234 W 0.737 +235 G 0.718 +236 P 0.712 +237 P 0.723 +238 P 0.735 +239 V 0.732 +240 L 0.715 +241 L 0.704 +242 L 0.708 +243 L 0.720 +244 G 0.722 +245 V 0.711 +246 T 0.695 +247 L 0.677 +248 V 0.660 +249 L 0.657 +250 T 0.678 +251 A 0.713 +252 G 0.741 +253 A 0.758 +254 V 0.771 +255 P 0.788 +256 A 0.807 +257 R 0.821 +258 E 0.826 +259 T 0.826 +260 G 0.824 +261 S 0.821 +262 A 0.817 +263 I 0.809 +264 E 0.793 +265 A 0.764 +266 E 0.717 +267 E 0.658 +268 L 0.603 +269 V 0.568 +270 R 0.560 +271 S 0.572 +272 S 0.585 +273 L 0.588 +274 A 0.586 +275 W 0.598 +276 E 0.623 +277 S 0.647 +278 R 0.665 +279 A 0.682 +280 N 0.704 +281 D 0.724 +282 T 0.735 +283 R 0.738 +284 E 0.738 +285 E 0.740 +286 A 0.737 +287 G 0.731 +288 L 0.728 +289 P 0.736 +290 A 0.756 +291 A 0.780 +292 G 0.797 +293 E 0.799 +294 D 0.793 +295 E 0.782 +296 T 0.769 +297 S 0.744 +298 W 0.697 +299 T 0.641 +300 E 0.621 +301 R 0.663 +302 G 0.733 +303 S 0.785 +304 E 0.811 +305 M 0.826 +306 A 0.834 +307 A 0.832 +308 V 0.822 +309 G 0.815 +310 P 0.818 +311 G 0.825 +312 V 0.826 +313 G 0.825 +314 P 0.826 +315 E 0.831 +316 E 0.836 +317 A 0.835 +318 L 0.831 +319 E 0.831 +320 A 0.834 +321 S 0.834 +322 A 0.832 +323 A 0.831 +324 V 0.834 +325 T 0.836 +326 G 0.835 +327 T 0.833 +328 A 0.830 +329 W 0.829 +330 L 0.835 +331 E 0.844 +332 A 0.847 +333 D 0.841 +334 G 0.836 +335 P 0.841 +336 G 0.854 +337 L 0.869 +338 G 0.880 +339 G 0.888 +340 V 0.889 +341 T 0.886 +342 A 0.880 +343 E 0.874 +344 A 0.870 +345 G 0.865 +346 S 0.856 +347 G 0.837 +348 D 0.791 +349 A 0.723 +350 Q 0.679 +351 T 0.692 +352 L 0.742 +353 P 0.784 +354 A 0.792 +355 T 0.755 +356 L 0.689 +357 Q 0.654 +358 A 0.691 +359 P 0.764 +360 D 0.820 +361 E 0.847 +362 A 0.858 +363 L 0.859 +364 G 0.856 +365 S 0.848 +366 S 0.834 +367 T 0.815 +368 M 0.799 +369 P 0.796 +370 P 0.800 +371 A 0.804 +372 I 0.805 +373 P 0.810 +374 E 0.818 +375 A 0.820 +376 T 0.819 +377 E 0.818 +378 T 0.815 +379 S 0.809 +380 G 0.802 +381 P 0.800 +382 P 0.805 +383 S 0.814 +384 P 0.824 +385 A 0.831 +386 V 0.831 +387 H 0.827 +388 D 0.821 +389 K 0.818 +390 P 0.821 +391 S 0.826 +392 V 0.829 +393 G 0.827 +394 P 0.821 +395 E 0.814 +396 L 0.810 +397 P 0.809 +398 K 0.807 +399 E 0.801 +400 I 0.796 +401 P 0.800 +402 L 0.807 +403 E 0.811 +404 V 0.808 +405 R 0.805 +406 L 0.805 +407 N 0.812 +408 L 0.822 +409 G 0.830 +410 G 0.829 +411 S 0.817 +412 T 0.806 +413 P 0.805 +414 E 0.811 +415 P 0.812 +416 T 0.808 +417 F 0.807 +418 P 0.816 +419 L 0.833 +420 Q 0.850 +421 G 0.857 +422 T 0.852 +423 L 0.842 +424 E 0.834 +425 T 0.829 +426 Q 0.828 +427 P 0.830 +428 A 0.832 +429 S 0.828 +430 D 0.819 +431 I 0.809 +432 I 0.801 +433 D 0.792 +434 I 0.777 +435 D 0.756 +436 Y 0.740 +437 F 0.742 +438 E 0.760 +439 G 0.779 +440 L 0.789 +441 D 0.793 +442 S 0.795 +443 E 0.799 +444 G 0.805 +445 R 0.815 +446 G 0.824 +447 A 0.828 +448 D 0.824 +449 M 0.815 +450 G 0.804 +451 S 0.792 +452 F 0.788 +453 P 0.796 +454 G 0.810 +455 S 0.823 +456 P 0.833 +457 G 0.838 +458 T 0.837 +459 S 0.830 +460 E 0.821 +461 N 0.811 +462 H 0.807 +463 P 0.814 +464 D 0.827 +465 T 0.835 +466 E 0.834 +467 G 0.823 +468 E 0.805 +469 T 0.785 +470 P 0.765 +471 S 0.744 +472 W 0.725 +473 S 0.710 +474 L 0.700 +475 L 0.696 +476 D 0.697 +477 L 0.698 +478 Y 0.703 +479 D 0.709 +480 D 0.707 +481 F 0.703 +482 T 0.713 +483 P 0.734 +484 F 0.751 +485 D 0.755 +486 E 0.746 +487 S 0.730 +488 D 0.712 +489 F 0.700 +490 Y 0.706 +491 P 0.727 +492 T 0.747 +493 T 0.748 +494 S 0.734 +495 F 0.721 +496 Y 0.723 +497 D 0.732 +498 D 0.725 +499 L 0.687 +500 E 0.633 +501 E 0.612 +502 E 0.647 +503 E 0.702 +504 E 0.737 +505 E 0.753 +506 E 0.766 +507 E 0.782 +508 D 0.796 +509 K 0.806 +510 D 0.812 +511 T 0.815 +512 V 0.817 +513 G 0.819 +514 G 0.821 +515 G 0.820 +516 D 0.815 +517 L 0.807 +518 E 0.801 +519 D 0.796 +520 E 0.791 +521 N 0.784 +522 D 0.772 +523 L 0.759 +524 L 0.753 +525 L 0.763 +526 P 0.782 +527 S 0.799 +528 Q 0.810 +529 K 0.824 +530 P 0.841 +531 G 0.854 +532 V 0.859 +533 G 0.857 +534 P 0.857 +535 G 0.855 +536 T 0.849 +537 G 0.838 +538 Q 0.828 +539 P 0.827 +540 T 0.832 +541 N 0.829 +542 R 0.816 +543 W 0.801 +544 H 0.789 +545 A 0.774 +546 V 0.758 +547 P 0.757 +548 P 0.776 +549 Q 0.801 +550 H 0.821 +551 T 0.836 +552 L 0.844 +553 G 0.839 +554 M 0.823 +555 V 0.810 +556 P 0.805 +557 G 0.800 +558 S 0.784 +559 S 0.756 +560 I 0.729 +561 S 0.712 +562 L 0.698 +563 R 0.683 +564 P 0.677 +565 R 0.689 +566 P 0.708 +567 G 0.720 +568 D 0.721 +569 P 0.723 +570 G 0.738 +571 K 0.767 +572 D 0.792 +573 L 0.801 +574 A 0.796 +575 S 0.780 +576 G 0.754 +577 E 0.710 +578 N 0.634 +579 G 0.522 +580 T 0.396 +581 E 0.290 +582 C 0.221 +583 R 0.183 +584 V 0.161 +585 G 0.147 +586 F 0.140 +587 V 0.140 +588 R 0.141 +589 H 0.140 +590 N 0.139 +591 G 0.140 +592 S 0.136 +593 C 0.122 +594 R 0.098 +595 S 0.077 +596 V 0.070 +597 C 0.076 +598 D 0.086 +599 L 0.093 +600 F 0.095 +601 P 0.096 +602 S 0.094 +603 Y 0.089 +604 C 0.088 +605 H 0.097 +606 N 0.114 +607 G 0.126 +608 G 0.125 +609 Q 0.119 +610 C 0.112 +611 Y 0.101 +612 L 0.089 +613 V 0.084 +614 E 0.089 +615 N 0.098 +616 I 0.097 +617 G 0.087 +618 A 0.077 +619 F 0.076 +620 C 0.084 +621 R 0.100 +622 C 0.120 +623 N 0.136 +624 T 0.148 +625 Q 0.159 +626 D 0.168 +627 Y 0.179 +628 I 0.191 +629 W 0.201 +630 H 0.204 +631 K 0.192 +632 G 0.176 +633 M 0.173 +634 R 0.189 +635 C 0.219 +636 E 0.263 +637 S 0.315 +638 I 0.353 +639 I 0.364 +640 T 0.350 +641 D 0.324 +642 F 0.289 +643 Q 0.255 +644 V 0.228 +645 M 0.211 +646 C 0.206 +647 V 0.214 +648 A 0.233 +649 V 0.258 +650 G 0.285 +651 S 0.304 +652 A 0.301 +653 A 0.274 +654 L 0.239 +655 V 0.211 +656 L 0.191 +657 L 0.174 +658 L 0.158 +659 L 0.143 +660 F 0.132 +661 M 0.120 +662 M 0.105 +663 T 0.087 +664 V 0.074 +665 F 0.076 +666 F 0.094 +667 A 0.121 +668 K 0.146 +669 K 0.163 +670 L 0.176 +671 Y 0.196 +672 L 0.229 +673 L 0.272 +674 K 0.313 +675 T 0.351 +676 E 0.379 +677 N 0.388 +678 T 0.383 +679 K 0.381 +680 L 0.391 +681 R 0.413 +682 R 0.445 +683 T 0.485 +684 N 0.525 +685 K 0.552 +686 F 0.573 +687 R 0.599 +688 T 0.636 +689 P 0.678 +690 S 0.717 +691 E 0.745 +692 L 0.759 +693 H 0.765 +694 N 0.768 +695 D 0.766 +696 N 0.756 +697 F 0.747 +698 S 0.752 +699 L 0.776 +700 S 0.805 +701 T 0.826 +702 I 0.837 +703 A 0.838 +704 E 0.829 +705 G 0.810 +706 S 0.787 +707 H 0.778 +708 P 0.788 +709 N 0.807 +710 V 0.820 +711 R 0.824 +712 K 0.824 +713 F 0.821 +714 C 0.815 +715 D 0.809 +716 T 0.804 +717 P 0.807 +718 R 0.811 +719 V 0.808 +720 S 0.795 +721 S 0.779 +722 P 0.772 +723 H 0.778 +724 A 0.784 +725 R 0.779 +726 A 0.765 +727 L 0.757 +728 A 0.755 +729 H 0.752 +730 Y 0.750 +731 D 0.755 +732 N 0.758 +733 I 0.757 +734 V 0.758 +735 C 0.766 +736 Q 0.771 +737 D 0.764 +738 D 0.748 +739 P 0.733 +740 S 0.731 +741 A 0.745 +742 P 0.768 +743 H 0.790 +744 K 0.800 +745 I 0.793 +746 Q 0.769 +747 D 0.739 +748 P 0.717 +749 L 0.716 +750 K 0.733 +751 S 0.755 +752 R 0.769 +753 L 0.775 +754 K 0.778 +755 E 0.777 +756 E 0.773 +757 E 0.767 +758 S 0.766 +759 F 0.771 +760 N 0.780 +761 I 0.787 +762 Q 0.789 +763 N 0.781 +764 S 0.761 +765 M 0.740 +766 S 0.736 +767 P 0.752 +768 K 0.774 +769 L 0.788 +770 E 0.796 +771 G 0.801 +772 G 0.806 +773 K 0.810 +774 G 0.811 +775 D 0.808 +776 Q 0.803 +777 D 0.794 +778 D 0.784 +779 L 0.771 +780 G 0.759 +781 V 0.742 +782 N 0.718 +783 C 0.691 +784 L 0.668 +785 Q 0.645 +786 N 0.607 +787 N 0.537 +788 L 0.443 +789 T 0.372 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032484.9_ENSMUST00000035061.9_GN:Ngp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032484.9_ENSMUST00000035061.9_GN:Ngp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b12a0b9cef0f116762985a5c1b2fcb71d089593e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032484.9_ENSMUST00000035061.9_GN:Ngp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,168 @@ +>ENSMUSG00000032484.9|ENSMUST00000035061.9|GN:Ngp|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.331 +2 A 0.324 +3 G 0.304 +4 L 0.270 +5 W 0.232 +6 K 0.205 +7 T 0.194 +8 F 0.194 +9 V 0.200 +10 L 0.216 +11 V 0.243 +12 V 0.270 +13 A 0.285 +14 L 0.295 +15 A 0.304 +16 V 0.306 +17 V 0.303 +18 S 0.301 +19 C 0.301 +20 E 0.299 +21 A 0.292 +22 L 0.275 +23 R 0.240 +24 Q 0.188 +25 L 0.128 +26 R 0.078 +27 Y 0.050 +28 E 0.036 +29 E 0.028 +30 I 0.023 +31 V 0.020 +32 D 0.018 +33 R 0.018 +34 A 0.018 +35 I 0.021 +36 E 0.025 +37 A 0.035 +38 Y 0.047 +39 N 0.057 +40 Q 0.063 +41 G 0.069 +42 R 0.078 +43 Q 0.085 +44 G 0.089 +45 R 0.092 +46 P 0.092 +47 L 0.082 +48 F 0.064 +49 R 0.048 +50 L 0.041 +51 L 0.040 +52 S 0.049 +53 A 0.069 +54 T 0.102 +55 P 0.141 +56 P 0.174 +57 S 0.190 +58 S 0.183 +59 Q 0.163 +60 N 0.141 +61 P 0.123 +62 A 0.113 +63 T 0.107 +64 N 0.099 +65 I 0.084 +66 P 0.067 +67 L 0.056 +68 Q 0.057 +69 F 0.062 +70 R 0.066 +71 I 0.070 +72 K 0.076 +73 E 0.084 +74 T 0.092 +75 E 0.098 +76 C 0.104 +77 T 0.108 +78 S 0.109 +79 T 0.111 +80 Q 0.118 +81 E 0.125 +82 R 0.125 +83 Q 0.120 +84 P 0.108 +85 K 0.092 +86 D 0.081 +87 C 0.077 +88 D 0.078 +89 F 0.081 +90 L 0.086 +91 E 0.095 +92 D 0.106 +93 G 0.111 +94 E 0.100 +95 E 0.077 +96 R 0.058 +97 N 0.047 +98 C 0.041 +99 T 0.036 +100 G 0.031 +101 K 0.029 +102 F 0.029 +103 F 0.033 +104 R 0.043 +105 R 0.054 +106 R 0.063 +107 Q 0.070 +108 S 0.075 +109 T 0.076 +110 S 0.073 +111 L 0.068 +112 T 0.063 +113 L 0.059 +114 T 0.060 +115 C 0.074 +116 D 0.109 +117 R 0.170 +118 D 0.252 +119 C 0.345 +120 S 0.438 +121 R 0.519 +122 E 0.582 +123 D 0.626 +124 T 0.654 +125 Q 0.670 +126 E 0.679 +127 T 0.681 +128 S 0.677 +129 F 0.672 +130 N 0.667 +131 D 0.661 +132 K 0.653 +133 Q 0.644 +134 D 0.633 +135 V 0.618 +136 S 0.602 +137 E 0.586 +138 K 0.566 +139 E 0.533 +140 K 0.485 +141 F 0.438 +142 E 0.406 +143 D 0.383 +144 V 0.360 +145 P 0.337 +146 P 0.318 +147 H 0.303 +148 I 0.293 +149 R 0.293 +150 N 0.297 +151 I 0.287 +152 Y 0.265 +153 E 0.255 +154 D 0.263 +155 A 0.278 +156 K 0.293 +157 Y 0.316 +158 D 0.343 +159 I 0.355 +160 I 0.352 +161 G 0.349 +162 N 0.347 +163 I 0.335 +164 L 0.317 +165 K 0.308 +166 N 0.308 +167 F 0.309 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032484.9_ENSMUST00000035061.9_GN:Ngp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:27.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032484.9_ENSMUST00000035061.9_GN:Ngp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:27.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..775f50f0902e32fc083d345ef61ddccd47ac24d4 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032484.9_ENSMUST00000035061.9_GN:Ngp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:27.caid @@ -0,0 +1,195 @@ +>ENSMUSG00000032484.9|ENSMUST00000035061.9|GN:Ngp|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:27 +1 M 0.395 +2 S 0.439 +3 P 0.507 +4 A 0.570 +5 V 0.610 +6 L 0.631 +7 G 0.646 +8 Q 0.651 +9 G 0.631 +10 S 0.589 +11 L 0.542 +12 N 0.500 +13 I 0.470 +14 I 0.465 +15 Y 0.497 +16 I 0.553 +17 K 0.608 +18 G 0.651 +19 A 0.679 +20 K 0.696 +21 S 0.708 +22 G 0.715 +23 S 0.703 +24 V 0.658 +25 S 0.588 +26 E 0.536 +27 T 0.525 +28 M 0.526 +29 A 0.503 +30 G 0.447 +31 L 0.372 +32 W 0.310 +33 K 0.282 +34 T 0.281 +35 F 0.284 +36 V 0.288 +37 L 0.311 +38 V 0.346 +39 V 0.362 +40 A 0.349 +41 L 0.334 +42 A 0.330 +43 V 0.327 +44 V 0.320 +45 S 0.317 +46 C 0.315 +47 E 0.309 +48 A 0.294 +49 L 0.268 +50 R 0.227 +51 Q 0.173 +52 L 0.117 +53 R 0.073 +54 Y 0.047 +55 E 0.035 +56 E 0.027 +57 I 0.022 +58 V 0.019 +59 D 0.018 +60 R 0.017 +61 A 0.018 +62 I 0.020 +63 E 0.025 +64 A 0.035 +65 Y 0.047 +66 N 0.057 +67 Q 0.062 +68 G 0.067 +69 R 0.074 +70 Q 0.080 +71 G 0.083 +72 R 0.086 +73 P 0.086 +74 L 0.076 +75 F 0.060 +76 R 0.045 +77 L 0.037 +78 L 0.037 +79 S 0.044 +80 A 0.061 +81 T 0.091 +82 P 0.126 +83 P 0.158 +84 S 0.173 +85 S 0.169 +86 Q 0.151 +87 N 0.132 +88 P 0.116 +89 A 0.107 +90 T 0.103 +91 N 0.096 +92 I 0.082 +93 P 0.065 +94 L 0.055 +95 Q 0.056 +96 F 0.061 +97 R 0.064 +98 I 0.068 +99 K 0.074 +100 E 0.082 +101 T 0.089 +102 E 0.094 +103 C 0.098 +104 T 0.100 +105 S 0.100 +106 T 0.103 +107 Q 0.110 +108 E 0.118 +109 R 0.119 +110 Q 0.114 +111 P 0.104 +112 K 0.090 +113 D 0.080 +114 C 0.076 +115 D 0.076 +116 F 0.077 +117 L 0.081 +118 E 0.091 +119 D 0.104 +120 G 0.110 +121 E 0.099 +122 E 0.075 +123 R 0.055 +124 N 0.044 +125 C 0.039 +126 T 0.034 +127 G 0.030 +128 K 0.027 +129 F 0.028 +130 F 0.032 +131 R 0.040 +132 R 0.051 +133 R 0.060 +134 Q 0.067 +135 S 0.074 +136 T 0.079 +137 S 0.079 +138 L 0.074 +139 T 0.068 +140 L 0.061 +141 T 0.060 +142 C 0.073 +143 D 0.110 +144 R 0.173 +145 D 0.257 +146 C 0.350 +147 S 0.442 +148 R 0.523 +149 E 0.587 +150 D 0.633 +151 T 0.662 +152 Q 0.679 +153 E 0.688 +154 T 0.690 +155 S 0.685 +156 F 0.678 +157 N 0.672 +158 D 0.665 +159 K 0.657 +160 Q 0.648 +161 D 0.638 +162 V 0.624 +163 S 0.608 +164 E 0.593 +165 K 0.574 +166 E 0.542 +167 K 0.495 +168 F 0.449 +169 E 0.415 +170 D 0.389 +171 V 0.361 +172 P 0.336 +173 P 0.317 +174 H 0.303 +175 I 0.292 +176 R 0.291 +177 N 0.294 +178 I 0.285 +179 Y 0.265 +180 E 0.257 +181 D 0.267 +182 A 0.282 +183 K 0.298 +184 Y 0.321 +185 D 0.348 +186 I 0.362 +187 I 0.362 +188 G 0.362 +189 N 0.361 +190 I 0.347 +191 L 0.326 +192 K 0.313 +193 N 0.311 +194 F 0.311 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032515.9_ENSMUST00000215916.2_GN:Csrnp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032515.9_ENSMUST00000215916.2_GN:Csrnp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1ec932c54040ab5e6883fcbe0199672b8b16a7e2 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032515.9_ENSMUST00000215916.2_GN:Csrnp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,584 @@ +>ENSMUSG00000032515.9|ENSMUST00000215916.2|GN:Csrnp1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.321 +2 T 0.333 +3 G 0.342 +4 L 0.333 +5 L 0.306 +6 K 0.281 +7 R 0.281 +8 K 0.305 +9 F 0.330 +10 D 0.341 +11 Q 0.349 +12 L 0.368 +13 E 0.397 +14 E 0.443 +15 D 0.500 +16 D 0.531 +17 S 0.518 +18 S 0.508 +19 S 0.537 +20 S 0.581 +21 S 0.606 +22 S 0.612 +23 S 0.607 +24 S 0.593 +25 F 0.582 +26 S 0.581 +27 S 0.580 +28 R 0.563 +29 L 0.538 +30 S 0.521 +31 L 0.514 +32 S 0.511 +33 S 0.521 +34 F 0.561 +35 P 0.624 +36 A 0.682 +37 S 0.713 +38 S 0.714 +39 A 0.702 +40 S 0.694 +41 P 0.699 +42 A 0.708 +43 W 0.715 +44 N 0.724 +45 S 0.731 +46 D 0.732 +47 E 0.728 +48 E 0.727 +49 G 0.732 +50 P 0.746 +51 G 0.760 +52 G 0.761 +53 Q 0.738 +54 A 0.688 +55 P 0.630 +56 Q 0.611 +57 S 0.656 +58 D 0.724 +59 Q 0.766 +60 D 0.776 +61 S 0.774 +62 C 0.772 +63 G 0.773 +64 L 0.767 +65 Q 0.744 +66 S 0.700 +67 F 0.650 +68 T 0.628 +69 P 0.648 +70 P 0.690 +71 S 0.720 +72 I 0.728 +73 L 0.717 +74 K 0.695 +75 R 0.675 +76 A 0.666 +77 P 0.664 +78 R 0.662 +79 E 0.662 +80 R 0.668 +81 P 0.669 +82 G 0.650 +83 H 0.615 +84 V 0.589 +85 A 0.574 +86 F 0.543 +87 N 0.491 +88 G 0.462 +89 I 0.471 +90 T 0.480 +91 V 0.457 +92 Y 0.407 +93 Y 0.352 +94 F 0.304 +95 P 0.266 +96 R 0.242 +97 C 0.241 +98 Q 0.252 +99 G 0.248 +100 F 0.223 +101 T 0.198 +102 S 0.184 +103 V 0.182 +104 P 0.190 +105 S 0.208 +106 R 0.234 +107 G 0.254 +108 G 0.261 +109 C 0.266 +110 T 0.283 +111 L 0.306 +112 G 0.311 +113 M 0.284 +114 A 0.239 +115 S 0.195 +116 R 0.166 +117 H 0.154 +118 S 0.152 +119 T 0.156 +120 C 0.170 +121 R 0.190 +122 L 0.200 +123 F 0.190 +124 S 0.162 +125 L 0.132 +126 A 0.108 +127 E 0.090 +128 F 0.079 +129 T 0.072 +130 Q 0.067 +131 E 0.067 +132 Q 0.073 +133 V 0.082 +134 R 0.091 +135 A 0.095 +136 R 0.092 +137 R 0.083 +138 E 0.075 +139 K 0.076 +140 L 0.084 +141 R 0.090 +142 R 0.088 +143 R 0.081 +144 L 0.075 +145 K 0.074 +146 E 0.075 +147 E 0.075 +148 K 0.070 +149 L 0.062 +150 E 0.053 +151 M 0.048 +152 L 0.047 +153 R 0.049 +154 W 0.056 +155 K 0.072 +156 F 0.099 +157 S 0.141 +158 V 0.198 +159 A 0.266 +160 G 0.335 +161 V 0.397 +162 P 0.445 +163 E 0.470 +164 S 0.470 +165 G 0.450 +166 A 0.428 +167 G 0.418 +168 V 0.412 +169 P 0.392 +170 L 0.353 +171 T 0.313 +172 A 0.294 +173 D 0.298 +174 A 0.313 +175 I 0.319 +176 D 0.302 +177 D 0.272 +178 A 0.238 +179 S 0.199 +180 V 0.156 +181 E 0.119 +182 E 0.096 +183 D 0.083 +184 L 0.075 +185 A 0.071 +186 V 0.072 +187 A 0.079 +188 V 0.089 +189 A 0.106 +190 N 0.128 +191 G 0.147 +192 R 0.157 +193 L 0.156 +194 E 0.152 +195 E 0.151 +196 A 0.153 +197 N 0.156 +198 F 0.161 +199 L 0.173 +200 Q 0.188 +201 P 0.196 +202 H 0.188 +203 P 0.163 +204 P 0.128 +205 R 0.101 +206 Q 0.090 +207 R 0.093 +208 R 0.105 +209 A 0.118 +210 L 0.125 +211 L 0.123 +212 R 0.116 +213 A 0.113 +214 S 0.116 +215 G 0.120 +216 V 0.123 +217 R 0.129 +218 R 0.138 +219 I 0.137 +220 D 0.123 +221 R 0.106 +222 E 0.094 +223 E 0.087 +224 K 0.088 +225 R 0.097 +226 E 0.108 +227 L 0.119 +228 Q 0.132 +229 V 0.150 +230 L 0.173 +231 R 0.199 +232 Q 0.221 +233 S 0.232 +234 R 0.231 +235 E 0.221 +236 D 0.202 +237 C 0.171 +238 G 0.134 +239 C 0.108 +240 H 0.101 +241 C 0.111 +242 D 0.129 +243 G 0.143 +244 V 0.147 +245 C 0.142 +246 D 0.135 +247 P 0.130 +248 E 0.122 +249 T 0.108 +250 C 0.098 +251 S 0.101 +252 C 0.114 +253 S 0.126 +254 L 0.141 +255 A 0.163 +256 G 0.184 +257 I 0.186 +258 K 0.168 +259 C 0.149 +260 Q 0.157 +261 M 0.187 +262 D 0.213 +263 H 0.219 +264 T 0.209 +265 S 0.194 +266 F 0.172 +267 P 0.145 +268 C 0.121 +269 G 0.107 +270 C 0.106 +271 C 0.120 +272 R 0.148 +273 E 0.175 +274 G 0.184 +275 C 0.178 +276 E 0.170 +277 N 0.169 +278 P 0.175 +279 N 0.186 +280 G 0.198 +281 R 0.208 +282 V 0.212 +283 E 0.206 +284 F 0.188 +285 N 0.161 +286 Q 0.135 +287 T 0.118 +288 R 0.109 +289 V 0.105 +290 Q 0.104 +291 T 0.108 +292 H 0.116 +293 F 0.119 +294 I 0.116 +295 H 0.115 +296 T 0.122 +297 L 0.132 +298 T 0.143 +299 R 0.160 +300 L 0.181 +301 Q 0.200 +302 M 0.226 +303 E 0.282 +304 Q 0.375 +305 G 0.476 +306 A 0.555 +307 E 0.606 +308 S 0.640 +309 L 0.661 +310 G 0.671 +311 D 0.666 +312 L 0.647 +313 E 0.623 +314 S 0.609 +315 P 0.613 +316 V 0.625 +317 E 0.630 +318 D 0.627 +319 T 0.629 +320 P 0.644 +321 V 0.666 +322 E 0.682 +323 Q 0.681 +324 A 0.657 +325 A 0.615 +326 L 0.577 +327 S 0.560 +328 P 0.557 +329 F 0.566 +330 P 0.593 +331 P 0.635 +332 S 0.672 +333 K 0.699 +334 P 0.726 +335 P 0.757 +336 V 0.784 +337 S 0.799 +338 S 0.804 +339 E 0.803 +340 L 0.801 +341 G 0.801 +342 D 0.796 +343 S 0.779 +344 S 0.744 +345 C 0.685 +346 S 0.616 +347 S 0.573 +348 D 0.567 +349 M 0.569 +350 T 0.576 +351 D 0.600 +352 S 0.609 +353 S 0.582 +354 T 0.565 +355 T 0.603 +356 L 0.671 +357 S 0.725 +358 S 0.753 +359 G 0.763 +360 S 0.762 +361 S 0.750 +362 E 0.738 +363 P 0.735 +364 P 0.744 +365 N 0.756 +366 H 0.764 +367 P 0.766 +368 A 0.766 +369 H 0.762 +370 P 0.756 +371 S 0.749 +372 L 0.748 +373 P 0.754 +374 G 0.764 +375 P 0.769 +376 S 0.770 +377 F 0.771 +378 R 0.774 +379 S 0.775 +380 G 0.763 +381 V 0.735 +382 D 0.701 +383 E 0.669 +384 D 0.636 +385 S 0.600 +386 L 0.570 +387 E 0.549 +388 Q 0.524 +389 I 0.501 +390 L 0.504 +391 N 0.540 +392 F 0.591 +393 S 0.633 +394 D 0.660 +395 S 0.677 +396 D 0.689 +397 L 0.702 +398 G 0.719 +399 I 0.736 +400 E 0.746 +401 E 0.747 +402 E 0.745 +403 E 0.745 +404 E 0.748 +405 E 0.755 +406 G 0.766 +407 G 0.779 +408 G 0.789 +409 V 0.792 +410 G 0.785 +411 N 0.771 +412 L 0.755 +413 D 0.737 +414 N 0.711 +415 L 0.678 +416 S 0.651 +417 C 0.632 +418 F 0.617 +419 H 0.607 +420 L 0.607 +421 A 0.608 +422 D 0.599 +423 I 0.589 +424 F 0.602 +425 G 0.645 +426 T 0.694 +427 G 0.724 +428 D 0.734 +429 P 0.734 +430 G 0.737 +431 S 0.742 +432 L 0.747 +433 A 0.748 +434 S 0.745 +435 W 0.746 +436 T 0.751 +437 H 0.758 +438 S 0.763 +439 Q 0.769 +440 S 0.778 +441 G 0.785 +442 S 0.793 +443 S 0.799 +444 L 0.803 +445 A 0.806 +446 S 0.808 +447 G 0.809 +448 I 0.804 +449 L 0.798 +450 D 0.793 +451 E 0.785 +452 N 0.772 +453 A 0.760 +454 N 0.749 +455 L 0.735 +456 D 0.715 +457 A 0.694 +458 S 0.681 +459 C 0.681 +460 F 0.691 +461 L 0.710 +462 N 0.730 +463 S 0.741 +464 G 0.748 +465 L 0.759 +466 G 0.778 +467 G 0.795 +468 L 0.805 +469 R 0.808 +470 E 0.807 +471 G 0.797 +472 S 0.782 +473 L 0.777 +474 P 0.789 +475 G 0.807 +476 S 0.816 +477 S 0.814 +478 G 0.810 +479 S 0.810 +480 P 0.818 +481 E 0.829 +482 G 0.839 +483 D 0.839 +484 A 0.830 +485 V 0.814 +486 Q 0.797 +487 S 0.780 +488 S 0.762 +489 S 0.743 +490 W 0.731 +491 D 0.728 +492 L 0.726 +493 S 0.725 +494 L 0.728 +495 S 0.736 +496 S 0.740 +497 C 0.734 +498 D 0.719 +499 S 0.698 +500 F 0.674 +501 E 0.649 +502 L 0.623 +503 L 0.607 +504 Q 0.606 +505 A 0.613 +506 L 0.617 +507 P 0.619 +508 D 0.622 +509 Y 0.626 +510 S 0.627 +511 L 0.636 +512 G 0.663 +513 P 0.693 +514 H 0.706 +515 Y 0.709 +516 T 0.722 +517 S 0.748 +518 R 0.769 +519 R 0.774 +520 V 0.766 +521 S 0.751 +522 G 0.737 +523 S 0.732 +524 P 0.740 +525 D 0.752 +526 S 0.754 +527 L 0.741 +528 E 0.714 +529 T 0.676 +530 F 0.635 +531 H 0.605 +532 P 0.592 +533 L 0.595 +534 P 0.599 +535 S 0.585 +536 F 0.556 +537 S 0.536 +538 P 0.533 +539 P 0.520 +540 R 0.481 +541 D 0.441 +542 A 0.431 +543 S 0.439 +544 T 0.440 +545 C 0.423 +546 F 0.381 +547 L 0.329 +548 E 0.296 +549 S 0.289 +550 L 0.304 +551 V 0.339 +552 G 0.382 +553 L 0.411 +554 S 0.416 +555 E 0.401 +556 P 0.361 +557 V 0.306 +558 T 0.257 +559 E 0.225 +560 V 0.203 +561 L 0.189 +562 A 0.185 +563 P 0.185 +564 L 0.181 +565 L 0.180 +566 E 0.185 +567 S 0.197 +568 Q 0.217 +569 F 0.245 +570 E 0.276 +571 D 0.296 +572 A 0.296 +573 A 0.287 +574 L 0.288 +575 A 0.300 +576 P 0.303 +577 L 0.294 +578 L 0.282 +579 E 0.272 +580 P 0.263 +581 V 0.250 +582 P 0.230 +583 V 0.213 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032515.9_ENSMUST00000215916.2_GN:Csrnp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:30.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032515.9_ENSMUST00000215916.2_GN:Csrnp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:30.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..871c66e797f3569756925105d96c5c97a72752df --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032515.9_ENSMUST00000215916.2_GN:Csrnp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:30.caid @@ -0,0 +1,614 @@ +>ENSMUSG00000032515.9|ENSMUST00000215916.2|GN:Csrnp1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:30 +1 M 0.325 +2 A 0.352 +3 R 0.404 +4 Q 0.471 +5 G 0.529 +6 A 0.551 +7 Y 0.541 +8 L 0.520 +9 L 0.500 +10 I 0.488 +11 V 0.483 +12 P 0.479 +13 L 0.477 +14 S 0.494 +15 S 0.535 +16 S 0.587 +17 Q 0.635 +18 A 0.662 +19 S 0.667 +20 V 0.661 +21 L 0.651 +22 G 0.629 +23 C 0.589 +24 W 0.546 +25 N 0.515 +26 P 0.496 +27 L 0.487 +28 H 0.488 +29 S 0.491 +30 T 0.486 +31 M 0.480 +32 T 0.472 +33 G 0.440 +34 L 0.378 +35 L 0.310 +36 K 0.265 +37 R 0.258 +38 K 0.281 +39 F 0.322 +40 D 0.368 +41 Q 0.413 +42 L 0.450 +43 E 0.482 +44 E 0.525 +45 D 0.581 +46 D 0.628 +47 S 0.654 +48 S 0.667 +49 S 0.677 +50 S 0.685 +51 S 0.690 +52 S 0.690 +53 S 0.672 +54 S 0.624 +55 F 0.567 +56 S 0.552 +57 S 0.591 +58 R 0.640 +59 L 0.659 +60 S 0.653 +61 L 0.639 +62 S 0.623 +63 S 0.620 +64 F 0.648 +65 P 0.699 +66 A 0.746 +67 S 0.770 +68 S 0.770 +69 A 0.759 +70 S 0.751 +71 P 0.754 +72 A 0.760 +73 W 0.764 +74 N 0.769 +75 S 0.773 +76 D 0.774 +77 E 0.772 +78 E 0.771 +79 G 0.777 +80 P 0.788 +81 G 0.797 +82 G 0.795 +83 Q 0.770 +84 A 0.718 +85 P 0.654 +86 Q 0.627 +87 S 0.662 +88 D 0.722 +89 Q 0.760 +90 D 0.773 +91 S 0.777 +92 C 0.779 +93 G 0.780 +94 L 0.775 +95 Q 0.753 +96 S 0.712 +97 F 0.665 +98 T 0.643 +99 P 0.660 +100 P 0.696 +101 S 0.719 +102 I 0.718 +103 L 0.701 +104 K 0.677 +105 R 0.657 +106 A 0.648 +107 P 0.646 +108 R 0.645 +109 E 0.647 +110 R 0.654 +111 P 0.658 +112 G 0.641 +113 H 0.606 +114 V 0.577 +115 A 0.557 +116 F 0.518 +117 N 0.460 +118 G 0.425 +119 I 0.432 +120 T 0.441 +121 V 0.422 +122 Y 0.378 +123 Y 0.327 +124 F 0.281 +125 P 0.245 +126 R 0.223 +127 C 0.223 +128 Q 0.233 +129 G 0.228 +130 F 0.206 +131 T 0.185 +132 S 0.177 +133 V 0.183 +134 P 0.197 +135 S 0.222 +136 R 0.253 +137 G 0.280 +138 G 0.297 +139 C 0.313 +140 T 0.338 +141 L 0.364 +142 G 0.367 +143 M 0.338 +144 A 0.289 +145 S 0.240 +146 R 0.204 +147 H 0.187 +148 S 0.179 +149 T 0.177 +150 C 0.186 +151 R 0.199 +152 L 0.196 +153 F 0.175 +154 S 0.150 +155 L 0.132 +156 A 0.118 +157 E 0.105 +158 F 0.091 +159 T 0.077 +160 Q 0.066 +161 E 0.064 +162 Q 0.068 +163 V 0.075 +164 R 0.083 +165 A 0.086 +166 R 0.081 +167 R 0.071 +168 E 0.065 +169 K 0.067 +170 L 0.076 +171 R 0.082 +172 R 0.081 +173 R 0.077 +174 L 0.073 +175 K 0.072 +176 E 0.074 +177 E 0.074 +178 K 0.069 +179 L 0.060 +180 E 0.050 +181 M 0.045 +182 L 0.045 +183 R 0.048 +184 W 0.057 +185 K 0.073 +186 F 0.101 +187 S 0.143 +188 V 0.198 +189 A 0.263 +190 G 0.328 +191 V 0.388 +192 P 0.435 +193 E 0.460 +194 S 0.456 +195 G 0.431 +196 A 0.403 +197 G 0.385 +198 V 0.371 +199 P 0.343 +200 L 0.300 +201 T 0.260 +202 A 0.239 +203 D 0.240 +204 A 0.253 +205 I 0.257 +206 D 0.241 +207 D 0.212 +208 A 0.184 +209 S 0.156 +210 V 0.125 +211 E 0.097 +212 E 0.079 +213 D 0.070 +214 L 0.064 +215 A 0.062 +216 V 0.065 +217 A 0.071 +218 V 0.081 +219 A 0.097 +220 N 0.117 +221 G 0.133 +222 R 0.141 +223 L 0.141 +224 E 0.139 +225 E 0.140 +226 A 0.143 +227 N 0.147 +228 F 0.154 +229 L 0.167 +230 Q 0.180 +231 P 0.185 +232 H 0.176 +233 P 0.152 +234 P 0.120 +235 R 0.096 +236 Q 0.086 +237 R 0.089 +238 R 0.101 +239 A 0.116 +240 L 0.124 +241 L 0.123 +242 R 0.118 +243 A 0.115 +244 S 0.117 +245 G 0.120 +246 V 0.123 +247 R 0.129 +248 R 0.138 +249 I 0.138 +250 D 0.125 +251 R 0.109 +252 E 0.097 +253 E 0.089 +254 K 0.089 +255 R 0.098 +256 E 0.111 +257 L 0.121 +258 Q 0.133 +259 V 0.153 +260 L 0.177 +261 R 0.205 +262 Q 0.230 +263 S 0.242 +264 R 0.242 +265 E 0.232 +266 D 0.213 +267 C 0.179 +268 G 0.140 +269 C 0.113 +270 H 0.107 +271 C 0.119 +272 D 0.139 +273 G 0.154 +274 V 0.160 +275 C 0.157 +276 D 0.151 +277 P 0.144 +278 E 0.134 +279 T 0.119 +280 C 0.109 +281 S 0.113 +282 C 0.127 +283 S 0.141 +284 L 0.155 +285 A 0.177 +286 G 0.200 +287 I 0.204 +288 K 0.184 +289 C 0.164 +290 Q 0.170 +291 M 0.203 +292 D 0.234 +293 H 0.244 +294 T 0.236 +295 S 0.220 +296 F 0.197 +297 P 0.167 +298 C 0.140 +299 G 0.124 +300 C 0.121 +301 C 0.136 +302 R 0.166 +303 E 0.194 +304 G 0.205 +305 C 0.199 +306 E 0.193 +307 N 0.194 +308 P 0.204 +309 N 0.221 +310 G 0.239 +311 R 0.254 +312 V 0.262 +313 E 0.255 +314 F 0.228 +315 N 0.190 +316 Q 0.154 +317 T 0.131 +318 R 0.120 +319 V 0.115 +320 Q 0.114 +321 T 0.118 +322 H 0.126 +323 F 0.127 +324 I 0.122 +325 H 0.121 +326 T 0.128 +327 L 0.138 +328 T 0.149 +329 R 0.165 +330 L 0.185 +331 Q 0.203 +332 M 0.230 +333 E 0.287 +334 Q 0.379 +335 G 0.479 +336 A 0.558 +337 E 0.611 +338 S 0.646 +339 L 0.668 +340 G 0.677 +341 D 0.671 +342 L 0.650 +343 E 0.623 +344 S 0.605 +345 P 0.606 +346 V 0.617 +347 E 0.621 +348 D 0.619 +349 T 0.623 +350 P 0.640 +351 V 0.662 +352 E 0.669 +353 Q 0.641 +354 A 0.576 +355 A 0.513 +356 L 0.498 +357 S 0.525 +358 P 0.556 +359 F 0.579 +360 P 0.610 +361 P 0.652 +362 S 0.689 +363 K 0.715 +364 P 0.740 +365 P 0.769 +366 V 0.795 +367 S 0.808 +368 S 0.811 +369 E 0.808 +370 L 0.806 +371 G 0.805 +372 D 0.799 +373 S 0.781 +374 S 0.743 +375 C 0.683 +376 S 0.613 +377 S 0.569 +378 D 0.561 +379 M 0.563 +380 T 0.568 +381 D 0.588 +382 S 0.595 +383 S 0.566 +384 T 0.549 +385 T 0.588 +386 L 0.660 +387 S 0.719 +388 S 0.751 +389 G 0.766 +390 S 0.766 +391 S 0.755 +392 E 0.742 +393 P 0.738 +394 P 0.746 +395 N 0.758 +396 H 0.766 +397 P 0.767 +398 A 0.765 +399 H 0.759 +400 P 0.750 +401 S 0.740 +402 L 0.736 +403 P 0.742 +404 G 0.752 +405 P 0.756 +406 S 0.754 +407 F 0.753 +408 R 0.757 +409 S 0.761 +410 G 0.752 +411 V 0.726 +412 D 0.694 +413 E 0.664 +414 D 0.630 +415 S 0.595 +416 L 0.566 +417 E 0.544 +418 Q 0.517 +419 I 0.488 +420 L 0.483 +421 N 0.511 +422 F 0.556 +423 S 0.599 +424 D 0.628 +425 S 0.646 +426 D 0.659 +427 L 0.673 +428 G 0.692 +429 I 0.709 +430 E 0.720 +431 E 0.721 +432 E 0.719 +433 E 0.720 +434 E 0.724 +435 E 0.733 +436 G 0.746 +437 G 0.761 +438 G 0.773 +439 V 0.777 +440 G 0.771 +441 N 0.757 +442 L 0.742 +443 D 0.724 +444 N 0.695 +445 L 0.659 +446 S 0.628 +447 C 0.605 +448 F 0.587 +449 H 0.577 +450 L 0.577 +451 A 0.581 +452 D 0.573 +453 I 0.564 +454 F 0.581 +455 G 0.629 +456 T 0.683 +457 G 0.716 +458 D 0.725 +459 P 0.726 +460 G 0.730 +461 S 0.738 +462 L 0.745 +463 A 0.747 +464 S 0.744 +465 W 0.742 +466 T 0.746 +467 H 0.752 +468 S 0.757 +469 Q 0.764 +470 S 0.773 +471 G 0.783 +472 S 0.792 +473 S 0.801 +474 L 0.808 +475 A 0.813 +476 S 0.817 +477 G 0.818 +478 I 0.813 +479 L 0.807 +480 D 0.801 +481 E 0.793 +482 N 0.781 +483 A 0.769 +484 N 0.759 +485 L 0.747 +486 D 0.729 +487 A 0.710 +488 S 0.699 +489 C 0.697 +490 F 0.705 +491 L 0.722 +492 N 0.739 +493 S 0.751 +494 G 0.759 +495 L 0.771 +496 G 0.791 +497 G 0.809 +498 L 0.819 +499 R 0.823 +500 E 0.822 +501 G 0.811 +502 S 0.797 +503 L 0.792 +504 P 0.803 +505 G 0.820 +506 S 0.829 +507 S 0.827 +508 G 0.822 +509 S 0.822 +510 P 0.830 +511 E 0.841 +512 G 0.847 +513 D 0.832 +514 A 0.783 +515 V 0.712 +516 Q 0.668 +517 S 0.680 +518 S 0.718 +519 S 0.739 +520 W 0.743 +521 D 0.742 +522 L 0.739 +523 S 0.735 +524 L 0.738 +525 S 0.747 +526 S 0.752 +527 C 0.748 +528 D 0.737 +529 S 0.720 +530 F 0.700 +531 E 0.678 +532 L 0.655 +533 L 0.638 +534 Q 0.633 +535 A 0.634 +536 L 0.634 +537 P 0.630 +538 D 0.630 +539 Y 0.634 +540 S 0.638 +541 L 0.648 +542 G 0.674 +543 P 0.702 +544 H 0.713 +545 Y 0.714 +546 T 0.727 +547 S 0.753 +548 R 0.773 +549 R 0.778 +550 V 0.770 +551 S 0.755 +552 G 0.741 +553 S 0.736 +554 P 0.743 +555 D 0.754 +556 S 0.753 +557 L 0.738 +558 E 0.710 +559 T 0.670 +560 F 0.628 +561 H 0.597 +562 P 0.586 +563 L 0.592 +564 P 0.597 +565 S 0.583 +566 F 0.550 +567 S 0.528 +568 P 0.528 +569 P 0.525 +570 R 0.496 +571 D 0.465 +572 A 0.460 +573 S 0.470 +574 T 0.471 +575 C 0.451 +576 F 0.406 +577 L 0.351 +578 E 0.318 +579 S 0.317 +580 L 0.337 +581 V 0.368 +582 G 0.398 +583 L 0.412 +584 S 0.410 +585 E 0.394 +586 P 0.361 +587 V 0.311 +588 T 0.263 +589 E 0.229 +590 V 0.205 +591 L 0.192 +592 A 0.188 +593 P 0.186 +594 L 0.179 +595 L 0.177 +596 E 0.185 +597 S 0.201 +598 Q 0.223 +599 F 0.250 +600 E 0.281 +601 D 0.303 +602 A 0.305 +603 A 0.297 +604 L 0.299 +605 A 0.309 +606 P 0.308 +607 L 0.295 +608 L 0.281 +609 E 0.272 +610 P 0.264 +611 V 0.251 +612 P 0.228 +613 V 0.207 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032667.18_ENSMUST00000057792.9_GN:Pon2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032667.18_ENSMUST00000057792.9_GN:Pon2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..32b516c9a0ee0b5beb09251d2761099fae05c1af --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032667.18_ENSMUST00000057792.9_GN:Pon2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,355 @@ +>ENSMUSG00000032667.18|ENSMUST00000057792.9|GN:Pon2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.291 +2 G 0.274 +3 R 0.256 +4 M 0.245 +5 V 0.232 +6 A 0.217 +7 L 0.210 +8 S 0.212 +9 L 0.213 +10 L 0.210 +11 G 0.209 +12 I 0.206 +13 G 0.197 +14 L 0.182 +15 A 0.167 +16 L 0.155 +17 L 0.142 +18 G 0.127 +19 E 0.110 +20 R 0.091 +21 F 0.075 +22 L 0.067 +23 A 0.065 +24 L 0.066 +25 R 0.068 +26 S 0.075 +27 R 0.087 +28 L 0.109 +29 K 0.147 +30 A 0.197 +31 S 0.241 +32 R 0.263 +33 E 0.268 +34 V 0.263 +35 E 0.251 +36 S 0.232 +37 V 0.208 +38 D 0.180 +39 L 0.150 +40 P 0.117 +41 N 0.088 +42 C 0.070 +43 H 0.070 +44 L 0.079 +45 I 0.087 +46 K 0.086 +47 G 0.078 +48 I 0.069 +49 E 0.061 +50 T 0.059 +51 G 0.063 +52 A 0.075 +53 E 0.087 +54 D 0.091 +55 I 0.083 +56 D 0.073 +57 I 0.066 +58 L 0.063 +59 P 0.062 +60 N 0.058 +61 G 0.050 +62 L 0.041 +63 A 0.035 +64 F 0.036 +65 F 0.048 +66 S 0.067 +67 V 0.085 +68 G 0.099 +69 L 0.109 +70 K 0.117 +71 F 0.123 +72 P 0.127 +73 G 0.125 +74 L 0.114 +75 H 0.100 +76 S 0.094 +77 F 0.101 +78 A 0.115 +79 P 0.132 +80 D 0.149 +81 K 0.161 +82 P 0.158 +83 G 0.135 +84 G 0.104 +85 I 0.077 +86 L 0.060 +87 M 0.055 +88 M 0.057 +89 D 0.061 +90 L 0.066 +91 K 0.074 +92 D 0.087 +93 E 0.099 +94 R 0.102 +95 P 0.097 +96 R 0.089 +97 A 0.083 +98 L 0.081 +99 E 0.081 +100 L 0.083 +101 R 0.084 +102 V 0.086 +103 S 0.086 +104 W 0.088 +105 G 0.089 +106 F 0.088 +107 D 0.083 +108 L 0.077 +109 A 0.076 +110 S 0.083 +111 F 0.091 +112 N 0.094 +113 P 0.097 +114 H 0.097 +115 G 0.088 +116 I 0.072 +117 S 0.055 +118 T 0.045 +119 F 0.048 +120 I 0.064 +121 D 0.085 +122 D 0.103 +123 D 0.110 +124 D 0.106 +125 T 0.091 +126 V 0.068 +127 Y 0.046 +128 L 0.033 +129 F 0.029 +130 V 0.032 +131 V 0.039 +132 N 0.047 +133 H 0.053 +134 P 0.055 +135 Q 0.053 +136 F 0.053 +137 K 0.054 +138 S 0.053 +139 T 0.048 +140 V 0.041 +141 E 0.035 +142 I 0.032 +143 F 0.033 +144 K 0.039 +145 F 0.045 +146 Q 0.049 +147 E 0.052 +148 E 0.059 +149 E 0.068 +150 N 0.075 +151 S 0.078 +152 L 0.077 +153 L 0.069 +154 H 0.058 +155 L 0.051 +156 K 0.052 +157 T 0.057 +158 I 0.061 +159 K 0.060 +160 H 0.056 +161 E 0.052 +162 L 0.052 +163 L 0.055 +164 P 0.059 +165 S 0.066 +166 V 0.075 +167 N 0.086 +168 D 0.089 +169 I 0.081 +170 I 0.071 +171 A 0.064 +172 V 0.060 +173 G 0.055 +174 P 0.047 +175 T 0.037 +176 H 0.030 +177 F 0.027 +178 Y 0.032 +179 A 0.047 +180 T 0.071 +181 N 0.100 +182 D 0.123 +183 H 0.133 +184 Y 0.131 +185 F 0.124 +186 S 0.119 +187 D 0.109 +188 P 0.092 +189 F 0.077 +190 L 0.073 +191 K 0.075 +192 Y 0.077 +193 L 0.080 +194 E 0.088 +195 T 0.098 +196 Y 0.106 +197 L 0.114 +198 N 0.122 +199 L 0.124 +200 H 0.118 +201 W 0.107 +202 A 0.093 +203 N 0.075 +204 V 0.056 +205 V 0.041 +206 Y 0.036 +207 Y 0.037 +208 S 0.042 +209 P 0.046 +210 E 0.052 +211 E 0.059 +212 V 0.066 +213 K 0.074 +214 L 0.084 +215 V 0.094 +216 A 0.102 +217 E 0.108 +218 G 0.110 +219 F 0.107 +220 D 0.102 +221 S 0.099 +222 A 0.098 +223 N 0.094 +224 G 0.084 +225 I 0.069 +226 N 0.058 +227 I 0.053 +228 S 0.051 +229 P 0.047 +230 D 0.041 +231 K 0.034 +232 K 0.030 +233 Y 0.029 +234 V 0.031 +235 Y 0.038 +236 V 0.052 +237 A 0.072 +238 D 0.090 +239 I 0.101 +240 L 0.103 +241 A 0.096 +242 H 0.078 +243 E 0.058 +244 I 0.045 +245 H 0.041 +246 V 0.041 +247 L 0.043 +248 E 0.046 +249 K 0.050 +250 Q 0.056 +251 P 0.060 +252 N 0.062 +253 M 0.066 +254 N 0.069 +255 L 0.068 +256 T 0.063 +257 Q 0.061 +258 L 0.064 +259 K 0.070 +260 V 0.075 +261 L 0.079 +262 Q 0.079 +263 L 0.076 +264 G 0.070 +265 T 0.063 +266 L 0.062 +267 V 0.070 +268 D 0.083 +269 N 0.090 +270 L 0.085 +271 S 0.076 +272 I 0.072 +273 D 0.074 +274 P 0.074 +275 S 0.070 +276 S 0.064 +277 G 0.058 +278 D 0.051 +279 I 0.043 +280 W 0.038 +281 V 0.042 +282 G 0.060 +283 C 0.088 +284 H 0.115 +285 P 0.129 +286 N 0.129 +287 G 0.121 +288 Q 0.112 +289 R 0.103 +290 L 0.094 +291 F 0.086 +292 V 0.083 +293 Y 0.087 +294 H 0.099 +295 P 0.121 +296 N 0.148 +297 H 0.170 +298 P 0.171 +299 P 0.149 +300 A 0.116 +301 S 0.085 +302 E 0.063 +303 V 0.047 +304 L 0.040 +305 R 0.041 +306 I 0.046 +307 Q 0.050 +308 N 0.053 +309 I 0.058 +310 L 0.069 +311 S 0.087 +312 E 0.105 +313 K 0.113 +314 P 0.105 +315 S 0.092 +316 V 0.083 +317 T 0.080 +318 T 0.078 +319 V 0.076 +320 Y 0.078 +321 I 0.085 +322 N 0.097 +323 N 0.112 +324 G 0.119 +325 S 0.115 +326 V 0.105 +327 L 0.100 +328 Q 0.101 +329 G 0.102 +330 S 0.098 +331 S 0.091 +332 V 0.082 +333 A 0.072 +334 T 0.064 +335 I 0.062 +336 Y 0.063 +337 D 0.065 +338 R 0.066 +339 K 0.064 +340 L 0.057 +341 L 0.048 +342 V 0.042 +343 G 0.045 +344 T 0.053 +345 L 0.061 +346 Y 0.065 +347 Q 0.062 +348 K 0.054 +349 A 0.044 +350 L 0.039 +351 Y 0.041 +352 C 0.051 +353 E 0.064 +354 L 0.075 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032667.18_ENSMUST00000057792.9_GN:Pon2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:55.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032667.18_ENSMUST00000057792.9_GN:Pon2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:55.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b8285b15dacd317d6cd4b155237657f34d67f95a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000032667.18_ENSMUST00000057792.9_GN:Pon2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:55.caid @@ -0,0 +1,410 @@ +>ENSMUSG00000032667.18|ENSMUST00000057792.9|GN:Pon2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:55 +1 M 0.338 +2 C 0.361 +3 G 0.394 +4 C 0.421 +5 A 0.424 +6 P 0.407 +7 R 0.390 +8 T 0.379 +9 R 0.354 +10 R 0.326 +11 R 0.343 +12 A 0.417 +13 E 0.505 +14 P 0.553 +15 G 0.532 +16 L 0.454 +17 Q 0.381 +18 S 0.370 +19 R 0.411 +20 R 0.454 +21 S 0.497 +22 G 0.553 +23 R 0.590 +24 G 0.582 +25 S 0.567 +26 G 0.589 +27 A 0.627 +28 A 0.648 +29 P 0.651 +30 R 0.645 +31 S 0.621 +32 G 0.581 +33 R 0.559 +34 G 0.585 +35 A 0.633 +36 G 0.664 +37 P 0.666 +38 A 0.637 +39 S 0.589 +40 G 0.562 +41 A 0.572 +42 A 0.580 +43 R 0.559 +44 S 0.550 +45 G 0.590 +46 P 0.648 +47 S 0.682 +48 Q 0.691 +49 T 0.689 +50 A 0.680 +51 G 0.661 +52 R 0.630 +53 S 0.591 +54 R 0.554 +55 T 0.529 +56 M 0.509 +57 G 0.471 +58 R 0.417 +59 M 0.371 +60 V 0.344 +61 A 0.329 +62 L 0.320 +63 S 0.315 +64 L 0.307 +65 L 0.298 +66 G 0.292 +67 I 0.284 +68 G 0.264 +69 L 0.231 +70 A 0.195 +71 L 0.167 +72 L 0.151 +73 G 0.139 +74 E 0.125 +75 R 0.107 +76 F 0.089 +77 L 0.077 +78 A 0.072 +79 L 0.071 +80 R 0.070 +81 S 0.072 +82 R 0.079 +83 L 0.094 +84 K 0.126 +85 A 0.172 +86 S 0.213 +87 R 0.234 +88 E 0.237 +89 V 0.231 +90 E 0.219 +91 S 0.203 +92 V 0.183 +93 D 0.159 +94 L 0.134 +95 P 0.107 +96 N 0.081 +97 C 0.066 +98 H 0.065 +99 L 0.073 +100 I 0.080 +101 K 0.078 +102 G 0.071 +103 I 0.063 +104 E 0.057 +105 T 0.056 +106 G 0.060 +107 A 0.071 +108 E 0.083 +109 D 0.087 +110 I 0.081 +111 D 0.071 +112 I 0.064 +113 L 0.061 +114 P 0.060 +115 N 0.058 +116 G 0.051 +117 L 0.043 +118 A 0.036 +119 F 0.036 +120 F 0.047 +121 S 0.066 +122 V 0.086 +123 G 0.101 +124 L 0.111 +125 K 0.116 +126 F 0.119 +127 P 0.121 +128 G 0.118 +129 L 0.110 +130 H 0.100 +131 S 0.099 +132 F 0.109 +133 A 0.125 +134 P 0.142 +135 D 0.159 +136 K 0.173 +137 P 0.170 +138 G 0.149 +139 G 0.117 +140 I 0.086 +141 L 0.067 +142 M 0.059 +143 M 0.060 +144 D 0.065 +145 L 0.070 +146 K 0.078 +147 D 0.093 +148 E 0.108 +149 R 0.115 +150 P 0.113 +151 R 0.105 +152 A 0.099 +153 L 0.095 +154 E 0.095 +155 L 0.095 +156 R 0.094 +157 V 0.092 +158 S 0.091 +159 W 0.092 +160 G 0.095 +161 F 0.095 +162 D 0.089 +163 L 0.081 +164 A 0.080 +165 S 0.087 +166 F 0.095 +167 N 0.099 +168 P 0.102 +169 H 0.101 +170 G 0.093 +171 I 0.077 +172 S 0.059 +173 T 0.049 +174 F 0.050 +175 I 0.065 +176 D 0.086 +177 D 0.105 +178 D 0.113 +179 D 0.108 +180 T 0.091 +181 V 0.067 +182 Y 0.044 +183 L 0.030 +184 F 0.027 +185 V 0.031 +186 V 0.040 +187 N 0.049 +188 H 0.056 +189 P 0.057 +190 Q 0.054 +191 F 0.052 +192 K 0.052 +193 S 0.051 +194 T 0.046 +195 V 0.039 +196 E 0.034 +197 I 0.031 +198 F 0.033 +199 K 0.038 +200 F 0.044 +201 Q 0.046 +202 E 0.047 +203 E 0.053 +204 E 0.061 +205 N 0.068 +206 S 0.071 +207 L 0.069 +208 L 0.061 +209 H 0.052 +210 L 0.045 +211 K 0.046 +212 T 0.052 +213 I 0.056 +214 K 0.055 +215 H 0.050 +216 E 0.046 +217 L 0.044 +218 L 0.046 +219 P 0.051 +220 S 0.058 +221 V 0.069 +222 N 0.080 +223 D 0.083 +224 I 0.076 +225 I 0.064 +226 A 0.056 +227 V 0.051 +228 G 0.045 +229 P 0.038 +230 T 0.029 +231 H 0.024 +232 F 0.024 +233 Y 0.030 +234 A 0.045 +235 T 0.068 +236 N 0.094 +237 D 0.113 +238 H 0.118 +239 Y 0.111 +240 F 0.102 +241 S 0.097 +242 D 0.089 +243 P 0.076 +244 F 0.066 +245 L 0.064 +246 K 0.068 +247 Y 0.070 +248 L 0.074 +249 E 0.081 +250 T 0.089 +251 Y 0.096 +252 L 0.103 +253 N 0.108 +254 L 0.109 +255 H 0.104 +256 W 0.096 +257 A 0.085 +258 N 0.070 +259 V 0.052 +260 V 0.039 +261 Y 0.033 +262 Y 0.034 +263 S 0.038 +264 P 0.042 +265 E 0.049 +266 E 0.057 +267 V 0.065 +268 K 0.073 +269 L 0.084 +270 V 0.094 +271 A 0.100 +272 E 0.104 +273 G 0.105 +274 F 0.102 +275 D 0.097 +276 S 0.094 +277 A 0.093 +278 N 0.091 +279 G 0.081 +280 I 0.067 +281 N 0.055 +282 I 0.050 +283 S 0.049 +284 P 0.046 +285 D 0.040 +286 K 0.034 +287 K 0.029 +288 Y 0.028 +289 V 0.029 +290 Y 0.035 +291 V 0.049 +292 A 0.069 +293 D 0.086 +294 I 0.097 +295 L 0.100 +296 A 0.095 +297 H 0.078 +298 E 0.058 +299 I 0.044 +300 H 0.040 +301 V 0.041 +302 L 0.043 +303 E 0.045 +304 K 0.050 +305 Q 0.056 +306 P 0.059 +307 N 0.062 +308 M 0.066 +309 N 0.070 +310 L 0.068 +311 T 0.062 +312 Q 0.060 +313 L 0.063 +314 K 0.068 +315 V 0.073 +316 L 0.077 +317 Q 0.078 +318 L 0.076 +319 G 0.071 +320 T 0.065 +321 L 0.065 +322 V 0.074 +323 D 0.086 +324 N 0.092 +325 L 0.086 +326 S 0.077 +327 I 0.075 +328 D 0.079 +329 P 0.080 +330 S 0.076 +331 S 0.070 +332 G 0.063 +333 D 0.054 +334 I 0.043 +335 W 0.037 +336 V 0.042 +337 G 0.060 +338 C 0.090 +339 H 0.120 +340 P 0.137 +341 N 0.140 +342 G 0.134 +343 Q 0.123 +344 R 0.112 +345 L 0.101 +346 F 0.092 +347 V 0.087 +348 Y 0.090 +349 H 0.102 +350 P 0.124 +351 N 0.151 +352 H 0.173 +353 P 0.177 +354 P 0.157 +355 A 0.123 +356 S 0.090 +357 E 0.065 +358 V 0.049 +359 L 0.040 +360 R 0.040 +361 I 0.046 +362 Q 0.051 +363 N 0.055 +364 I 0.061 +365 L 0.072 +366 S 0.088 +367 E 0.103 +368 K 0.107 +369 P 0.098 +370 S 0.086 +371 V 0.078 +372 T 0.076 +373 T 0.075 +374 V 0.074 +375 Y 0.076 +376 I 0.083 +377 N 0.094 +378 N 0.107 +379 G 0.114 +380 S 0.110 +381 V 0.100 +382 L 0.097 +383 Q 0.101 +384 G 0.104 +385 S 0.102 +386 S 0.097 +387 V 0.088 +388 A 0.076 +389 T 0.067 +390 I 0.063 +391 Y 0.065 +392 D 0.067 +393 R 0.068 +394 K 0.066 +395 L 0.059 +396 L 0.050 +397 V 0.045 +398 G 0.047 +399 T 0.055 +400 L 0.063 +401 Y 0.066 +402 Q 0.062 +403 K 0.053 +404 A 0.044 +405 L 0.040 +406 Y 0.043 +407 C 0.053 +408 E 0.068 +409 L 0.079 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033006.11_ENSMUST00000230532.2_GN:Sox10_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033006.11_ENSMUST00000230532.2_GN:Sox10_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1862fdb73768a28aca7a592ded5f84e50f1a63ae --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033006.11_ENSMUST00000230532.2_GN:Sox10_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,467 @@ +>ENSMUSG00000033006.11|ENSMUST00000230532.2|GN:Sox10|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.517 +2 A 0.562 +3 E 0.617 +4 E 0.657 +5 Q 0.679 +6 D 0.691 +7 L 0.701 +8 S 0.715 +9 E 0.728 +10 V 0.737 +11 E 0.740 +12 L 0.744 +13 S 0.754 +14 P 0.771 +15 V 0.784 +16 G 0.782 +17 S 0.765 +18 E 0.745 +19 E 0.739 +20 P 0.749 +21 R 0.762 +22 C 0.767 +23 L 0.765 +24 S 0.770 +25 P 0.783 +26 G 0.794 +27 S 0.783 +28 A 0.736 +29 P 0.671 +30 S 0.640 +31 L 0.678 +32 G 0.746 +33 P 0.795 +34 D 0.819 +35 G 0.829 +36 G 0.833 +37 G 0.835 +38 G 0.837 +39 G 0.840 +40 S 0.842 +41 G 0.841 +42 L 0.835 +43 R 0.822 +44 A 0.805 +45 S 0.787 +46 P 0.777 +47 G 0.780 +48 P 0.789 +49 G 0.796 +50 E 0.800 +51 L 0.803 +52 G 0.803 +53 K 0.784 +54 V 0.734 +55 K 0.667 +56 K 0.637 +57 E 0.675 +58 Q 0.745 +59 Q 0.793 +60 D 0.807 +61 G 0.799 +62 E 0.769 +63 A 0.706 +64 D 0.609 +65 D 0.493 +66 D 0.385 +67 K 0.296 +68 F 0.225 +69 P 0.168 +70 V 0.125 +71 C 0.096 +72 I 0.078 +73 R 0.067 +74 E 0.064 +75 A 0.067 +76 V 0.072 +77 S 0.079 +78 Q 0.086 +79 V 0.096 +80 L 0.106 +81 S 0.112 +82 G 0.113 +83 Y 0.106 +84 D 0.093 +85 W 0.084 +86 T 0.090 +87 L 0.110 +88 V 0.146 +89 P 0.204 +90 M 0.291 +91 P 0.395 +92 V 0.492 +93 R 0.573 +94 V 0.642 +95 N 0.693 +96 G 0.715 +97 A 0.702 +98 S 0.657 +99 K 0.593 +100 S 0.531 +101 K 0.484 +102 P 0.448 +103 H 0.416 +104 V 0.385 +105 K 0.353 +106 R 0.319 +107 P 0.272 +108 M 0.208 +109 N 0.139 +110 A 0.087 +111 F 0.062 +112 M 0.054 +113 V 0.051 +114 W 0.045 +115 A 0.038 +116 Q 0.037 +117 A 0.040 +118 A 0.043 +119 R 0.040 +120 R 0.037 +121 K 0.039 +122 L 0.045 +123 A 0.051 +124 D 0.055 +125 Q 0.061 +126 Y 0.072 +127 P 0.081 +128 H 0.083 +129 L 0.082 +130 H 0.078 +131 N 0.071 +132 A 0.065 +133 E 0.063 +134 L 0.061 +135 S 0.054 +136 K 0.044 +137 T 0.037 +138 L 0.034 +139 G 0.033 +140 K 0.032 +141 L 0.032 +142 W 0.033 +143 R 0.035 +144 L 0.038 +145 L 0.039 +146 N 0.039 +147 E 0.038 +148 S 0.040 +149 D 0.042 +150 K 0.041 +151 R 0.037 +152 P 0.035 +153 F 0.036 +154 I 0.040 +155 E 0.042 +156 E 0.042 +157 A 0.040 +158 E 0.040 +159 R 0.044 +160 L 0.052 +161 R 0.063 +162 M 0.068 +163 Q 0.066 +164 H 0.061 +165 K 0.063 +166 K 0.071 +167 D 0.084 +168 H 0.098 +169 P 0.108 +170 D 0.114 +171 Y 0.120 +172 K 0.135 +173 Y 0.169 +174 Q 0.223 +175 P 0.285 +176 R 0.354 +177 R 0.440 +178 R 0.542 +179 K 0.640 +180 N 0.712 +181 G 0.758 +182 K 0.787 +183 A 0.806 +184 A 0.817 +185 Q 0.823 +186 G 0.826 +187 E 0.823 +188 A 0.814 +189 E 0.805 +190 C 0.803 +191 P 0.811 +192 G 0.824 +193 G 0.831 +194 E 0.829 +195 A 0.820 +196 E 0.812 +197 Q 0.805 +198 G 0.795 +199 G 0.775 +200 A 0.750 +201 A 0.725 +202 A 0.690 +203 I 0.630 +204 Q 0.557 +205 A 0.518 +206 H 0.542 +207 Y 0.604 +208 K 0.669 +209 S 0.716 +210 A 0.741 +211 H 0.754 +212 L 0.767 +213 D 0.778 +214 H 0.781 +215 R 0.777 +216 H 0.779 +217 P 0.794 +218 E 0.816 +219 E 0.834 +220 G 0.840 +221 S 0.840 +222 P 0.844 +223 M 0.854 +224 S 0.862 +225 D 0.856 +226 G 0.828 +227 N 0.767 +228 P 0.689 +229 E 0.652 +230 H 0.693 +231 P 0.773 +232 S 0.834 +233 G 0.856 +234 Q 0.852 +235 S 0.837 +236 H 0.815 +237 G 0.793 +238 P 0.775 +239 P 0.762 +240 T 0.758 +241 P 0.766 +242 P 0.778 +243 T 0.784 +244 T 0.772 +245 P 0.732 +246 K 0.676 +247 T 0.653 +248 E 0.698 +249 L 0.773 +250 Q 0.826 +251 S 0.847 +252 G 0.851 +253 K 0.845 +254 A 0.834 +255 D 0.825 +256 P 0.822 +257 K 0.826 +258 R 0.834 +259 D 0.842 +260 G 0.847 +261 R 0.848 +262 S 0.847 +263 L 0.844 +264 G 0.839 +265 E 0.834 +266 G 0.827 +267 G 0.819 +268 K 0.813 +269 P 0.810 +270 H 0.804 +271 I 0.794 +272 D 0.784 +273 F 0.784 +274 G 0.793 +275 N 0.801 +276 V 0.803 +277 D 0.798 +278 I 0.791 +279 G 0.783 +280 E 0.769 +281 I 0.749 +282 S 0.731 +283 H 0.720 +284 E 0.710 +285 V 0.703 +286 M 0.710 +287 S 0.729 +288 N 0.749 +289 M 0.761 +290 E 0.765 +291 T 0.764 +292 F 0.757 +293 D 0.744 +294 V 0.731 +295 T 0.723 +296 E 0.719 +297 L 0.708 +298 D 0.682 +299 Q 0.648 +300 Y 0.622 +301 L 0.620 +302 P 0.653 +303 P 0.709 +304 N 0.759 +305 G 0.783 +306 H 0.791 +307 P 0.803 +308 G 0.823 +309 H 0.844 +310 V 0.859 +311 G 0.865 +312 S 0.863 +313 Y 0.857 +314 S 0.851 +315 A 0.845 +316 A 0.839 +317 G 0.834 +318 Y 0.832 +319 G 0.836 +320 L 0.843 +321 G 0.851 +322 S 0.857 +323 A 0.863 +324 L 0.868 +325 A 0.873 +326 V 0.873 +327 A 0.868 +328 S 0.859 +329 G 0.853 +330 H 0.853 +331 S 0.858 +332 A 0.861 +333 W 0.860 +334 I 0.851 +335 S 0.835 +336 K 0.820 +337 P 0.820 +338 P 0.839 +339 G 0.863 +340 V 0.878 +341 A 0.883 +342 L 0.883 +343 P 0.883 +344 T 0.879 +345 V 0.866 +346 S 0.850 +347 P 0.843 +348 P 0.850 +349 G 0.863 +350 V 0.870 +351 D 0.870 +352 A 0.868 +353 K 0.870 +354 A 0.875 +355 Q 0.882 +356 V 0.887 +357 K 0.889 +358 T 0.890 +359 E 0.886 +360 T 0.876 +361 T 0.861 +362 G 0.848 +363 P 0.839 +364 Q 0.834 +365 G 0.833 +366 P 0.839 +367 P 0.852 +368 H 0.867 +369 Y 0.876 +370 T 0.877 +371 D 0.872 +372 Q 0.869 +373 P 0.872 +374 S 0.880 +375 T 0.889 +376 S 0.894 +377 Q 0.895 +378 I 0.895 +379 A 0.893 +380 Y 0.892 +381 T 0.889 +382 S 0.881 +383 L 0.869 +384 S 0.854 +385 L 0.842 +386 P 0.838 +387 H 0.843 +388 Y 0.851 +389 G 0.858 +390 S 0.859 +391 A 0.855 +392 F 0.851 +393 P 0.852 +394 S 0.856 +395 I 0.856 +396 S 0.854 +397 R 0.852 +398 P 0.852 +399 Q 0.853 +400 F 0.854 +401 D 0.852 +402 Y 0.850 +403 S 0.847 +404 D 0.839 +405 H 0.829 +406 Q 0.821 +407 P 0.820 +408 S 0.822 +409 G 0.825 +410 P 0.830 +411 Y 0.839 +412 Y 0.849 +413 G 0.858 +414 H 0.864 +415 A 0.868 +416 G 0.870 +417 Q 0.869 +418 A 0.867 +419 S 0.864 +420 G 0.860 +421 L 0.855 +422 Y 0.852 +423 S 0.849 +424 A 0.841 +425 F 0.829 +426 S 0.818 +427 Y 0.808 +428 M 0.801 +429 G 0.801 +430 P 0.809 +431 S 0.818 +432 Q 0.825 +433 R 0.834 +434 P 0.849 +435 L 0.867 +436 Y 0.883 +437 T 0.893 +438 A 0.894 +439 I 0.882 +440 S 0.862 +441 D 0.842 +442 P 0.828 +443 S 0.826 +444 P 0.832 +445 S 0.841 +446 G 0.849 +447 P 0.856 +448 Q 0.858 +449 S 0.854 +450 H 0.843 +451 S 0.831 +452 P 0.822 +453 T 0.814 +454 H 0.805 +455 W 0.794 +456 E 0.788 +457 Q 0.793 +458 P 0.808 +459 V 0.827 +460 Y 0.839 +461 T 0.839 +462 T 0.826 +463 L 0.794 +464 S 0.743 +465 R 0.683 +466 P 0.639 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033006.11_ENSMUST00000230532.2_GN:Sox10_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:103.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033006.11_ENSMUST00000230532.2_GN:Sox10_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:103.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..80d8f4485a71f0ad5e5f11387a178f2041e2d3eb --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033006.11_ENSMUST00000230532.2_GN:Sox10_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:103.caid @@ -0,0 +1,570 @@ +>ENSMUSG00000033006.11|ENSMUST00000230532.2|GN:Sox10|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:103 +1 M 0.484 +2 E 0.525 +3 P 0.588 +4 S 0.652 +5 A 0.703 +6 A 0.737 +7 A 0.759 +8 Q 0.779 +9 S 0.796 +10 V 0.801 +11 S 0.792 +12 A 0.771 +13 V 0.751 +14 Q 0.745 +15 P 0.758 +16 G 0.774 +17 C 0.781 +18 L 0.776 +19 V 0.772 +20 V 0.774 +21 R 0.777 +22 I 0.773 +23 Q 0.763 +24 A 0.757 +25 P 0.759 +26 S 0.769 +27 R 0.782 +28 Q 0.796 +29 G 0.807 +30 S 0.814 +31 G 0.816 +32 L 0.816 +33 R 0.812 +34 L 0.799 +35 R 0.778 +36 A 0.754 +37 P 0.734 +38 Q 0.723 +39 P 0.715 +40 L 0.711 +41 P 0.716 +42 P 0.739 +43 S 0.774 +44 P 0.807 +45 S 0.825 +46 A 0.825 +47 S 0.809 +48 L 0.791 +49 P 0.782 +50 S 0.786 +51 P 0.796 +52 E 0.802 +53 L 0.793 +54 D 0.765 +55 R 0.719 +56 T 0.669 +57 P 0.629 +58 W 0.611 +59 D 0.616 +60 T 0.624 +61 V 0.602 +62 F 0.559 +63 H 0.535 +64 F 0.552 +65 L 0.582 +66 R 0.604 +67 T 0.629 +68 S 0.667 +69 P 0.714 +70 R 0.760 +71 L 0.795 +72 E 0.816 +73 E 0.826 +74 R 0.828 +75 S 0.828 +76 E 0.828 +77 E 0.831 +78 V 0.836 +79 G 0.840 +80 V 0.842 +81 G 0.840 +82 L 0.832 +83 F 0.818 +84 T 0.800 +85 R 0.781 +86 T 0.772 +87 P 0.776 +88 A 0.784 +89 A 0.790 +90 G 0.794 +91 P 0.804 +92 G 0.815 +93 E 0.808 +94 A 0.764 +95 A 0.693 +96 E 0.649 +97 A 0.663 +98 A 0.684 +99 A 0.669 +100 A 0.657 +101 G 0.694 +102 S 0.754 +103 D 0.792 +104 M 0.802 +105 A 0.796 +106 E 0.782 +107 E 0.769 +108 Q 0.760 +109 D 0.755 +110 L 0.755 +111 S 0.762 +112 E 0.772 +113 V 0.779 +114 E 0.777 +115 L 0.771 +116 S 0.769 +117 P 0.777 +118 V 0.788 +119 G 0.793 +120 S 0.787 +121 E 0.776 +122 E 0.768 +123 P 0.768 +124 R 0.773 +125 C 0.773 +126 L 0.767 +127 S 0.763 +128 P 0.763 +129 G 0.760 +130 S 0.738 +131 A 0.690 +132 P 0.629 +133 S 0.603 +134 L 0.643 +135 G 0.714 +136 P 0.768 +137 D 0.793 +138 G 0.802 +139 G 0.803 +140 G 0.801 +141 G 0.800 +142 G 0.800 +143 S 0.800 +144 G 0.799 +145 L 0.794 +146 R 0.785 +147 A 0.772 +148 S 0.761 +149 P 0.757 +150 G 0.765 +151 P 0.778 +152 G 0.786 +153 E 0.790 +154 L 0.790 +155 G 0.787 +156 K 0.769 +157 V 0.720 +158 K 0.652 +159 K 0.619 +160 E 0.653 +161 Q 0.716 +162 Q 0.759 +163 D 0.770 +164 G 0.755 +165 E 0.716 +166 A 0.645 +167 D 0.544 +168 D 0.434 +169 D 0.335 +170 K 0.255 +171 F 0.191 +172 P 0.139 +173 V 0.100 +174 C 0.075 +175 I 0.060 +176 R 0.050 +177 E 0.047 +178 A 0.049 +179 V 0.053 +180 S 0.057 +181 Q 0.062 +182 V 0.070 +183 L 0.080 +184 S 0.090 +185 G 0.096 +186 Y 0.094 +187 D 0.084 +188 W 0.077 +189 T 0.082 +190 L 0.102 +191 V 0.136 +192 P 0.194 +193 M 0.281 +194 P 0.385 +195 V 0.485 +196 R 0.574 +197 V 0.650 +198 N 0.705 +199 G 0.726 +200 A 0.710 +201 S 0.662 +202 K 0.595 +203 S 0.532 +204 K 0.487 +205 P 0.455 +206 H 0.429 +207 V 0.400 +208 K 0.367 +209 R 0.330 +210 P 0.281 +211 M 0.213 +212 N 0.141 +213 A 0.087 +214 F 0.061 +215 M 0.054 +216 V 0.051 +217 W 0.044 +218 A 0.037 +219 Q 0.035 +220 A 0.038 +221 A 0.040 +222 R 0.038 +223 R 0.036 +224 K 0.038 +225 L 0.043 +226 A 0.047 +227 D 0.051 +228 Q 0.057 +229 Y 0.066 +230 P 0.074 +231 H 0.075 +232 L 0.073 +233 H 0.070 +234 N 0.063 +235 A 0.056 +236 E 0.053 +237 L 0.053 +238 S 0.047 +239 K 0.039 +240 T 0.034 +241 L 0.032 +242 G 0.031 +243 K 0.029 +244 L 0.028 +245 W 0.028 +246 R 0.029 +247 L 0.031 +248 L 0.033 +249 N 0.033 +250 E 0.033 +251 S 0.035 +252 D 0.037 +253 K 0.037 +254 R 0.034 +255 P 0.031 +256 F 0.030 +257 I 0.029 +258 E 0.030 +259 E 0.031 +260 A 0.031 +261 E 0.031 +262 R 0.032 +263 L 0.038 +264 R 0.045 +265 M 0.050 +266 Q 0.051 +267 H 0.054 +268 K 0.059 +269 K 0.067 +270 D 0.079 +271 H 0.093 +272 P 0.104 +273 D 0.111 +274 Y 0.119 +275 K 0.135 +276 Y 0.169 +277 Q 0.222 +278 P 0.284 +279 R 0.351 +280 R 0.434 +281 R 0.531 +282 K 0.624 +283 N 0.692 +284 G 0.734 +285 K 0.757 +286 A 0.770 +287 A 0.777 +288 Q 0.782 +289 G 0.785 +290 E 0.784 +291 A 0.777 +292 E 0.769 +293 C 0.768 +294 P 0.778 +295 G 0.792 +296 G 0.802 +297 E 0.801 +298 A 0.793 +299 E 0.785 +300 Q 0.779 +301 G 0.768 +302 G 0.745 +303 A 0.715 +304 A 0.683 +305 A 0.640 +306 I 0.572 +307 Q 0.499 +308 A 0.460 +309 H 0.477 +310 Y 0.529 +311 K 0.589 +312 S 0.638 +313 A 0.670 +314 H 0.688 +315 L 0.708 +316 D 0.726 +317 H 0.734 +318 R 0.732 +319 H 0.736 +320 P 0.754 +321 E 0.782 +322 E 0.804 +323 G 0.811 +324 S 0.811 +325 P 0.814 +326 M 0.825 +327 S 0.834 +328 D 0.831 +329 G 0.804 +330 N 0.744 +331 P 0.668 +332 E 0.630 +333 H 0.670 +334 P 0.750 +335 S 0.812 +336 G 0.836 +337 Q 0.835 +338 S 0.821 +339 H 0.803 +340 G 0.783 +341 P 0.763 +342 P 0.746 +343 T 0.737 +344 P 0.741 +345 P 0.751 +346 T 0.756 +347 T 0.744 +348 P 0.707 +349 K 0.656 +350 T 0.637 +351 E 0.681 +352 L 0.754 +353 Q 0.807 +354 S 0.829 +355 G 0.835 +356 K 0.832 +357 A 0.826 +358 D 0.819 +359 P 0.818 +360 K 0.823 +361 R 0.831 +362 D 0.839 +363 G 0.844 +364 R 0.845 +365 S 0.843 +366 L 0.838 +367 G 0.833 +368 E 0.828 +369 G 0.821 +370 G 0.814 +371 K 0.810 +372 P 0.809 +373 H 0.805 +374 I 0.796 +375 D 0.785 +376 F 0.780 +377 G 0.785 +378 N 0.790 +379 V 0.789 +380 D 0.782 +381 I 0.773 +382 G 0.763 +383 E 0.745 +384 I 0.722 +385 S 0.705 +386 H 0.695 +387 E 0.681 +388 V 0.668 +389 M 0.671 +390 S 0.695 +391 N 0.720 +392 M 0.734 +393 E 0.739 +394 T 0.738 +395 F 0.730 +396 D 0.715 +397 V 0.699 +398 T 0.690 +399 E 0.687 +400 L 0.678 +401 D 0.654 +402 Q 0.619 +403 Y 0.586 +404 L 0.581 +405 P 0.617 +406 P 0.681 +407 N 0.736 +408 G 0.761 +409 H 0.768 +410 P 0.781 +411 G 0.801 +412 H 0.821 +413 V 0.833 +414 G 0.837 +415 S 0.834 +416 Y 0.828 +417 S 0.821 +418 A 0.814 +419 A 0.805 +420 G 0.796 +421 Y 0.791 +422 G 0.792 +423 L 0.798 +424 G 0.806 +425 S 0.813 +426 A 0.818 +427 L 0.823 +428 A 0.827 +429 V 0.825 +430 A 0.819 +431 S 0.811 +432 G 0.806 +433 H 0.805 +434 S 0.809 +435 A 0.810 +436 W 0.805 +437 I 0.794 +438 S 0.778 +439 K 0.764 +440 P 0.766 +441 P 0.787 +442 G 0.813 +443 V 0.827 +444 A 0.830 +445 L 0.831 +446 P 0.835 +447 T 0.833 +448 V 0.820 +449 S 0.803 +450 P 0.796 +451 P 0.803 +452 G 0.816 +453 V 0.823 +454 D 0.823 +455 A 0.821 +456 K 0.820 +457 A 0.823 +458 Q 0.828 +459 V 0.834 +460 K 0.839 +461 T 0.842 +462 E 0.838 +463 T 0.825 +464 T 0.807 +465 G 0.795 +466 P 0.790 +467 Q 0.789 +468 G 0.790 +469 P 0.796 +470 P 0.811 +471 H 0.828 +472 Y 0.839 +473 T 0.842 +474 D 0.838 +475 Q 0.834 +476 P 0.837 +477 S 0.845 +478 T 0.851 +479 S 0.853 +480 Q 0.853 +481 I 0.854 +482 A 0.855 +483 Y 0.853 +484 T 0.846 +485 S 0.834 +486 L 0.817 +487 S 0.800 +488 L 0.791 +489 P 0.791 +490 H 0.800 +491 Y 0.812 +492 G 0.823 +493 S 0.827 +494 A 0.822 +495 F 0.817 +496 P 0.817 +497 S 0.819 +498 I 0.819 +499 S 0.817 +500 R 0.816 +501 P 0.818 +502 Q 0.821 +503 F 0.822 +504 D 0.820 +505 Y 0.817 +506 S 0.814 +507 D 0.807 +508 H 0.797 +509 Q 0.789 +510 P 0.787 +511 S 0.790 +512 G 0.796 +513 P 0.804 +514 Y 0.816 +515 Y 0.828 +516 G 0.838 +517 H 0.845 +518 A 0.849 +519 G 0.850 +520 Q 0.848 +521 A 0.844 +522 S 0.840 +523 G 0.833 +524 L 0.826 +525 Y 0.821 +526 S 0.817 +527 A 0.809 +528 F 0.798 +529 S 0.786 +530 Y 0.772 +531 M 0.763 +532 G 0.766 +533 P 0.779 +534 S 0.794 +535 Q 0.806 +536 R 0.821 +537 P 0.839 +538 L 0.853 +539 Y 0.864 +540 T 0.870 +541 A 0.867 +542 I 0.853 +543 S 0.834 +544 D 0.817 +545 P 0.805 +546 S 0.803 +547 P 0.808 +548 S 0.818 +549 G 0.828 +550 P 0.837 +551 Q 0.844 +552 S 0.843 +553 H 0.834 +554 S 0.823 +555 P 0.814 +556 T 0.808 +557 H 0.800 +558 W 0.794 +559 E 0.792 +560 Q 0.799 +561 P 0.812 +562 V 0.824 +563 Y 0.830 +564 T 0.829 +565 T 0.820 +566 L 0.806 +567 S 0.783 +568 R 0.753 +569 P 0.729 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033420.13_ENSMUST00000042025.12_GN:Antxr1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033420.13_ENSMUST00000042025.12_GN:Antxr1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6b6ecd3c2a649557009bf04aad00782c11a192c3 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033420.13_ENSMUST00000042025.12_GN:Antxr1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,563 @@ +>ENSMUSG00000033420.13|ENSMUST00000042025.12|GN:Antxr1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.365 +2 D 0.371 +3 R 0.383 +4 A 0.394 +5 G 0.395 +6 R 0.400 +7 L 0.432 +8 G 0.476 +9 A 0.502 +10 G 0.501 +11 L 0.481 +12 R 0.447 +13 G 0.398 +14 L 0.347 +15 C 0.310 +16 V 0.282 +17 A 0.259 +18 A 0.249 +19 L 0.248 +20 V 0.252 +21 L 0.267 +22 V 0.300 +23 C 0.343 +24 A 0.384 +25 G 0.423 +26 H 0.469 +27 G 0.515 +28 G 0.546 +29 R 0.554 +30 R 0.549 +31 E 0.540 +32 D 0.521 +33 G 0.484 +34 G 0.422 +35 P 0.343 +36 A 0.260 +37 C 0.189 +38 Y 0.139 +39 G 0.108 +40 G 0.083 +41 F 0.062 +42 D 0.046 +43 L 0.035 +44 Y 0.027 +45 F 0.025 +46 I 0.027 +47 L 0.034 +48 D 0.047 +49 K 0.064 +50 S 0.080 +51 G 0.086 +52 S 0.080 +53 V 0.068 +54 L 0.057 +55 H 0.052 +56 H 0.050 +57 W 0.046 +58 N 0.040 +59 E 0.035 +60 I 0.032 +61 Y 0.031 +62 Y 0.031 +63 F 0.029 +64 V 0.027 +65 E 0.024 +66 Q 0.023 +67 L 0.022 +68 A 0.024 +69 H 0.028 +70 R 0.036 +71 F 0.046 +72 I 0.056 +73 S 0.061 +74 P 0.057 +75 Q 0.048 +76 L 0.040 +77 R 0.032 +78 M 0.025 +79 S 0.019 +80 F 0.018 +81 I 0.022 +82 V 0.030 +83 F 0.039 +84 S 0.050 +85 T 0.060 +86 R 0.065 +87 G 0.063 +88 T 0.057 +89 T 0.055 +90 L 0.058 +91 M 0.059 +92 K 0.054 +93 L 0.047 +94 T 0.042 +95 E 0.040 +96 D 0.038 +97 R 0.036 +98 E 0.034 +99 Q 0.035 +100 I 0.044 +101 R 0.060 +102 Q 0.073 +103 G 0.072 +104 L 0.064 +105 E 0.060 +106 E 0.060 +107 L 0.057 +108 Q 0.051 +109 K 0.051 +110 V 0.062 +111 L 0.086 +112 P 0.119 +113 G 0.146 +114 G 0.149 +115 D 0.129 +116 T 0.104 +117 Y 0.085 +118 M 0.073 +119 H 0.064 +120 E 0.055 +121 G 0.048 +122 F 0.043 +123 E 0.043 +124 R 0.047 +125 A 0.052 +126 S 0.056 +127 E 0.055 +128 Q 0.050 +129 I 0.046 +130 Y 0.049 +131 Y 0.060 +132 E 0.077 +133 N 0.094 +134 S 0.105 +135 Q 0.113 +136 G 0.120 +137 Y 0.124 +138 R 0.118 +139 T 0.099 +140 A 0.075 +141 S 0.055 +142 V 0.042 +143 I 0.033 +144 I 0.027 +145 A 0.025 +146 L 0.032 +147 T 0.053 +148 D 0.085 +149 G 0.116 +150 E 0.130 +151 L 0.123 +152 H 0.105 +153 E 0.089 +154 D 0.080 +155 L 0.078 +156 F 0.074 +157 F 0.066 +158 Y 0.061 +159 S 0.065 +160 E 0.073 +161 R 0.075 +162 E 0.066 +163 A 0.052 +164 N 0.042 +165 R 0.038 +166 S 0.037 +167 R 0.037 +168 D 0.041 +169 L 0.049 +170 G 0.056 +171 A 0.056 +172 I 0.048 +173 V 0.038 +174 Y 0.035 +175 C 0.041 +176 V 0.052 +177 G 0.060 +178 V 0.064 +179 K 0.072 +180 D 0.084 +181 F 0.091 +182 N 0.088 +183 E 0.083 +184 T 0.078 +185 Q 0.071 +186 L 0.062 +187 A 0.056 +188 R 0.054 +189 I 0.056 +190 A 0.061 +191 D 0.069 +192 S 0.078 +193 K 0.081 +194 D 0.076 +195 H 0.070 +196 V 0.073 +197 F 0.086 +198 P 0.104 +199 V 0.116 +200 N 0.119 +201 D 0.114 +202 G 0.107 +203 F 0.096 +204 Q 0.083 +205 A 0.069 +206 L 0.058 +207 Q 0.051 +208 G 0.047 +209 I 0.045 +210 I 0.045 +211 H 0.047 +212 S 0.051 +213 I 0.056 +214 L 0.061 +215 K 0.063 +216 K 0.059 +217 S 0.053 +218 C 0.049 +219 I 0.048 +220 E 0.045 +221 I 0.042 +222 L 0.040 +223 A 0.041 +224 A 0.043 +225 E 0.045 +226 P 0.048 +227 S 0.050 +228 T 0.049 +229 I 0.043 +230 C 0.039 +231 A 0.040 +232 G 0.042 +233 E 0.040 +234 S 0.034 +235 F 0.028 +236 Q 0.023 +237 V 0.020 +238 V 0.018 +239 V 0.019 +240 R 0.024 +241 G 0.033 +242 N 0.043 +243 G 0.051 +244 F 0.055 +245 R 0.057 +246 H 0.061 +247 A 0.066 +248 R 0.068 +249 N 0.070 +250 V 0.069 +251 D 0.060 +252 R 0.045 +253 V 0.030 +254 L 0.021 +255 C 0.018 +256 S 0.021 +257 F 0.029 +258 K 0.041 +259 I 0.052 +260 N 0.057 +261 D 0.059 +262 S 0.062 +263 V 0.065 +264 T 0.067 +265 L 0.068 +266 N 0.067 +267 E 0.065 +268 K 0.059 +269 P 0.051 +270 F 0.045 +271 A 0.043 +272 V 0.043 +273 E 0.041 +274 D 0.035 +275 T 0.026 +276 Y 0.020 +277 L 0.017 +278 L 0.021 +279 C 0.030 +280 P 0.041 +281 A 0.052 +282 P 0.061 +283 I 0.069 +284 L 0.074 +285 K 0.079 +286 E 0.087 +287 V 0.098 +288 G 0.102 +289 M 0.093 +290 K 0.077 +291 A 0.060 +292 A 0.047 +293 L 0.038 +294 Q 0.033 +295 V 0.029 +296 S 0.027 +297 M 0.030 +298 N 0.038 +299 D 0.049 +300 G 0.056 +301 L 0.058 +302 S 0.059 +303 F 0.062 +304 I 0.066 +305 S 0.072 +306 S 0.076 +307 S 0.076 +308 V 0.070 +309 I 0.060 +310 I 0.054 +311 T 0.054 +312 T 0.064 +313 T 0.091 +314 H 0.151 +315 C 0.249 +316 S 0.364 +317 D 0.447 +318 G 0.460 +319 S 0.409 +320 I 0.330 +321 L 0.265 +322 A 0.229 +323 I 0.217 +324 A 0.221 +325 L 0.234 +326 L 0.243 +327 V 0.241 +328 L 0.236 +329 F 0.235 +330 L 0.231 +331 L 0.225 +332 L 0.226 +333 A 0.231 +334 L 0.223 +335 A 0.203 +336 L 0.184 +337 L 0.170 +338 W 0.158 +339 W 0.148 +340 F 0.149 +341 W 0.167 +342 P 0.196 +343 L 0.228 +344 C 0.261 +345 C 0.310 +346 T 0.388 +347 V 0.480 +348 I 0.549 +349 I 0.578 +350 K 0.580 +351 E 0.569 +352 V 0.551 +353 P 0.544 +354 P 0.571 +355 P 0.635 +356 P 0.708 +357 V 0.762 +358 E 0.792 +359 E 0.806 +360 S 0.811 +361 E 0.810 +362 E 0.803 +363 E 0.792 +364 D 0.779 +365 D 0.763 +366 D 0.742 +367 G 0.724 +368 L 0.714 +369 P 0.717 +370 K 0.728 +371 K 0.738 +372 K 0.746 +373 W 0.755 +374 P 0.759 +375 T 0.749 +376 V 0.717 +377 D 0.675 +378 A 0.642 +379 S 0.637 +380 Y 0.662 +381 Y 0.710 +382 G 0.764 +383 G 0.803 +384 R 0.824 +385 G 0.832 +386 V 0.832 +387 G 0.829 +388 G 0.825 +389 I 0.820 +390 K 0.814 +391 R 0.809 +392 M 0.806 +393 E 0.801 +394 V 0.793 +395 R 0.787 +396 W 0.785 +397 G 0.787 +398 E 0.791 +399 K 0.796 +400 G 0.792 +401 S 0.763 +402 T 0.708 +403 E 0.652 +404 E 0.621 +405 G 0.623 +406 A 0.639 +407 K 0.645 +408 L 0.634 +409 E 0.623 +410 K 0.630 +411 A 0.650 +412 K 0.674 +413 N 0.700 +414 A 0.727 +415 R 0.744 +416 V 0.745 +417 K 0.742 +418 M 0.746 +419 P 0.755 +420 E 0.759 +421 Q 0.753 +422 E 0.735 +423 Y 0.710 +424 E 0.688 +425 F 0.681 +426 P 0.694 +427 E 0.718 +428 P 0.745 +429 R 0.771 +430 N 0.791 +431 L 0.802 +432 N 0.807 +433 N 0.804 +434 N 0.793 +435 M 0.774 +436 R 0.756 +437 R 0.742 +438 P 0.736 +439 S 0.733 +440 S 0.733 +441 P 0.732 +442 R 0.725 +443 K 0.712 +444 W 0.695 +445 Y 0.675 +446 S 0.653 +447 P 0.639 +448 I 0.640 +449 K 0.651 +450 G 0.647 +451 K 0.605 +452 L 0.537 +453 D 0.474 +454 A 0.423 +455 L 0.381 +456 W 0.355 +457 V 0.357 +458 L 0.369 +459 L 0.376 +460 R 0.396 +461 K 0.453 +462 G 0.529 +463 Y 0.583 +464 D 0.607 +465 R 0.621 +466 V 0.642 +467 S 0.674 +468 V 0.704 +469 M 0.710 +470 R 0.690 +471 P 0.668 +472 Q 0.671 +473 P 0.699 +474 G 0.732 +475 D 0.761 +476 T 0.783 +477 G 0.794 +478 R 0.793 +479 C 0.783 +480 I 0.772 +481 N 0.766 +482 F 0.766 +483 T 0.766 +484 R 0.766 +485 V 0.770 +486 K 0.777 +487 N 0.780 +488 S 0.776 +489 Q 0.776 +490 P 0.783 +491 A 0.791 +492 K 0.794 +493 Y 0.798 +494 P 0.809 +495 L 0.827 +496 N 0.840 +497 N 0.840 +498 T 0.827 +499 Y 0.810 +500 H 0.800 +501 P 0.794 +502 S 0.781 +503 S 0.764 +504 P 0.756 +505 P 0.764 +506 P 0.785 +507 A 0.804 +508 P 0.809 +509 I 0.796 +510 Y 0.771 +511 T 0.737 +512 P 0.689 +513 P 0.635 +514 P 0.619 +515 P 0.668 +516 A 0.742 +517 P 0.789 +518 H 0.798 +519 C 0.790 +520 P 0.784 +521 P 0.789 +522 P 0.804 +523 A 0.821 +524 P 0.830 +525 S 0.829 +526 A 0.820 +527 P 0.808 +528 T 0.798 +529 P 0.794 +530 P 0.796 +531 I 0.798 +532 P 0.794 +533 S 0.777 +534 P 0.735 +535 P 0.671 +536 S 0.628 +537 T 0.629 +538 L 0.633 +539 P 0.609 +540 P 0.601 +541 P 0.648 +542 P 0.716 +543 Q 0.753 +544 A 0.754 +545 P 0.745 +546 P 0.748 +547 P 0.761 +548 N 0.768 +549 R 0.759 +550 A 0.740 +551 P 0.726 +552 P 0.728 +553 P 0.737 +554 S 0.741 +555 R 0.737 +556 P 0.733 +557 P 0.740 +558 P 0.757 +559 R 0.777 +560 P 0.786 +561 S 0.779 +562 V 0.765 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033420.13_ENSMUST00000042025.12_GN:Antxr1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033420.13_ENSMUST00000042025.12_GN:Antxr1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..950d4df5c347c8bf6d2fff2004e82db32917e296 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033420.13_ENSMUST00000042025.12_GN:Antxr1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid @@ -0,0 +1,577 @@ +>ENSMUSG00000033420.13|ENSMUST00000042025.12|GN:Antxr1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:14 +1 M 0.335 +2 S 0.339 +3 H 0.358 +4 G 0.380 +5 R 0.375 +6 Q 0.346 +7 R 0.332 +8 G 0.335 +9 Q 0.344 +10 R 0.390 +11 S 0.487 +12 G 0.582 +13 C 0.628 +14 S 0.633 +15 M 0.624 +16 D 0.609 +17 R 0.580 +18 A 0.537 +19 G 0.493 +20 R 0.480 +21 L 0.514 +22 G 0.564 +23 A 0.597 +24 G 0.605 +25 L 0.593 +26 R 0.565 +27 G 0.527 +28 L 0.482 +29 C 0.432 +30 V 0.374 +31 A 0.324 +32 A 0.299 +33 L 0.293 +34 V 0.291 +35 L 0.297 +36 V 0.320 +37 C 0.353 +38 A 0.386 +39 G 0.422 +40 H 0.470 +41 G 0.523 +42 G 0.560 +43 R 0.572 +44 R 0.569 +45 E 0.560 +46 D 0.538 +47 G 0.496 +48 G 0.430 +49 P 0.349 +50 A 0.264 +51 C 0.192 +52 Y 0.142 +53 G 0.110 +54 G 0.085 +55 F 0.063 +56 D 0.047 +57 L 0.035 +58 Y 0.028 +59 F 0.025 +60 I 0.027 +61 L 0.035 +62 D 0.047 +63 K 0.065 +64 S 0.080 +65 G 0.086 +66 S 0.079 +67 V 0.067 +68 L 0.056 +69 H 0.051 +70 H 0.050 +71 W 0.046 +72 N 0.040 +73 E 0.035 +74 I 0.032 +75 Y 0.031 +76 Y 0.030 +77 F 0.029 +78 V 0.026 +79 E 0.023 +80 Q 0.022 +81 L 0.021 +82 A 0.023 +83 H 0.026 +84 R 0.034 +85 F 0.044 +86 I 0.054 +87 S 0.058 +88 P 0.054 +89 Q 0.046 +90 L 0.038 +91 R 0.031 +92 M 0.024 +93 S 0.019 +94 F 0.018 +95 I 0.022 +96 V 0.029 +97 F 0.038 +98 S 0.048 +99 T 0.058 +100 R 0.064 +101 G 0.062 +102 T 0.057 +103 T 0.055 +104 L 0.057 +105 M 0.059 +106 K 0.054 +107 L 0.047 +108 T 0.042 +109 E 0.040 +110 D 0.038 +111 R 0.036 +112 E 0.033 +113 Q 0.035 +114 I 0.044 +115 R 0.060 +116 Q 0.073 +117 G 0.072 +118 L 0.064 +119 E 0.060 +120 E 0.060 +121 L 0.057 +122 Q 0.051 +123 K 0.051 +124 V 0.063 +125 L 0.087 +126 P 0.120 +127 G 0.147 +128 G 0.150 +129 D 0.130 +130 T 0.105 +131 Y 0.086 +132 M 0.074 +133 H 0.065 +134 E 0.056 +135 G 0.048 +136 F 0.043 +137 E 0.043 +138 R 0.045 +139 A 0.046 +140 S 0.044 +141 E 0.040 +142 Q 0.038 +143 I 0.041 +144 Y 0.048 +145 Y 0.061 +146 E 0.079 +147 N 0.096 +148 S 0.108 +149 Q 0.116 +150 G 0.123 +151 Y 0.127 +152 R 0.120 +153 T 0.100 +154 A 0.076 +155 S 0.055 +156 V 0.041 +157 I 0.032 +158 I 0.026 +159 A 0.024 +160 L 0.031 +161 T 0.052 +162 D 0.084 +163 G 0.115 +164 E 0.130 +165 L 0.123 +166 H 0.106 +167 E 0.089 +168 D 0.081 +169 L 0.078 +170 F 0.073 +171 F 0.066 +172 Y 0.061 +173 S 0.064 +174 E 0.072 +175 R 0.074 +176 E 0.064 +177 A 0.050 +178 N 0.042 +179 R 0.038 +180 S 0.037 +181 R 0.038 +182 D 0.042 +183 L 0.049 +184 G 0.055 +185 A 0.055 +186 I 0.047 +187 V 0.038 +188 Y 0.034 +189 C 0.040 +190 V 0.051 +191 G 0.059 +192 V 0.063 +193 K 0.070 +194 D 0.081 +195 F 0.085 +196 N 0.075 +197 E 0.059 +198 T 0.049 +199 Q 0.047 +200 L 0.049 +201 A 0.050 +202 R 0.051 +203 I 0.054 +204 A 0.059 +205 D 0.066 +206 S 0.075 +207 K 0.079 +208 D 0.074 +209 H 0.068 +210 V 0.070 +211 F 0.083 +212 P 0.100 +213 V 0.111 +214 N 0.114 +215 D 0.110 +216 G 0.102 +217 F 0.093 +218 Q 0.080 +219 A 0.067 +220 L 0.056 +221 Q 0.049 +222 G 0.045 +223 I 0.044 +224 I 0.044 +225 H 0.046 +226 S 0.049 +227 I 0.055 +228 L 0.060 +229 K 0.062 +230 K 0.058 +231 S 0.052 +232 C 0.048 +233 I 0.047 +234 E 0.045 +235 I 0.042 +236 L 0.041 +237 A 0.042 +238 A 0.044 +239 E 0.046 +240 P 0.049 +241 S 0.051 +242 T 0.049 +243 I 0.044 +244 C 0.040 +245 A 0.041 +246 G 0.043 +247 E 0.041 +248 S 0.035 +249 F 0.028 +250 Q 0.023 +251 V 0.020 +252 V 0.018 +253 V 0.019 +254 R 0.024 +255 G 0.033 +256 N 0.044 +257 G 0.052 +258 F 0.055 +259 R 0.058 +260 H 0.062 +261 A 0.066 +262 R 0.069 +263 N 0.071 +264 V 0.070 +265 D 0.061 +266 R 0.046 +267 V 0.031 +268 L 0.021 +269 C 0.018 +270 S 0.021 +271 F 0.029 +272 K 0.041 +273 I 0.052 +274 N 0.058 +275 D 0.061 +276 S 0.064 +277 V 0.067 +278 T 0.069 +279 L 0.070 +280 N 0.069 +281 E 0.066 +282 K 0.060 +283 P 0.052 +284 F 0.046 +285 A 0.044 +286 V 0.044 +287 E 0.042 +288 D 0.035 +289 T 0.027 +290 Y 0.020 +291 L 0.017 +292 L 0.021 +293 C 0.030 +294 P 0.042 +295 A 0.054 +296 P 0.063 +297 I 0.070 +298 L 0.076 +299 K 0.081 +300 E 0.089 +301 V 0.100 +302 G 0.104 +303 M 0.095 +304 K 0.079 +305 A 0.062 +306 A 0.048 +307 L 0.039 +308 Q 0.033 +309 V 0.029 +310 S 0.028 +311 M 0.031 +312 N 0.040 +313 D 0.051 +314 G 0.058 +315 L 0.060 +316 S 0.060 +317 F 0.063 +318 I 0.068 +319 S 0.073 +320 S 0.078 +321 S 0.077 +322 V 0.071 +323 I 0.061 +324 I 0.054 +325 T 0.054 +326 T 0.063 +327 T 0.092 +328 H 0.153 +329 C 0.253 +330 S 0.372 +331 D 0.456 +332 G 0.469 +333 S 0.417 +334 I 0.336 +335 L 0.268 +336 A 0.231 +337 I 0.218 +338 A 0.222 +339 L 0.236 +340 L 0.246 +341 V 0.244 +342 L 0.241 +343 F 0.241 +344 L 0.238 +345 L 0.233 +346 L 0.235 +347 A 0.237 +348 L 0.227 +349 A 0.206 +350 L 0.187 +351 L 0.173 +352 W 0.161 +353 W 0.151 +354 F 0.152 +355 W 0.169 +356 P 0.198 +357 L 0.230 +358 C 0.263 +359 C 0.311 +360 T 0.388 +361 V 0.478 +362 I 0.548 +363 I 0.579 +364 K 0.582 +365 E 0.571 +366 V 0.551 +367 P 0.543 +368 P 0.569 +369 P 0.632 +370 P 0.705 +371 V 0.759 +372 E 0.788 +373 E 0.803 +374 S 0.808 +375 E 0.807 +376 E 0.800 +377 E 0.791 +378 D 0.779 +379 D 0.763 +380 D 0.743 +381 G 0.724 +382 L 0.715 +383 P 0.718 +384 K 0.729 +385 K 0.740 +386 K 0.747 +387 W 0.754 +388 P 0.757 +389 T 0.746 +390 V 0.714 +391 D 0.672 +392 A 0.639 +393 S 0.632 +394 Y 0.656 +395 Y 0.705 +396 G 0.759 +397 G 0.799 +398 R 0.820 +399 G 0.828 +400 V 0.828 +401 G 0.825 +402 G 0.820 +403 I 0.814 +404 K 0.806 +405 R 0.800 +406 M 0.796 +407 E 0.792 +408 V 0.785 +409 R 0.780 +410 W 0.779 +411 G 0.782 +412 E 0.786 +413 K 0.791 +414 G 0.788 +415 S 0.760 +416 T 0.706 +417 E 0.649 +418 E 0.619 +419 G 0.620 +420 A 0.635 +421 K 0.641 +422 L 0.631 +423 E 0.622 +424 K 0.629 +425 A 0.647 +426 K 0.667 +427 N 0.692 +428 A 0.721 +429 R 0.739 +430 V 0.741 +431 K 0.739 +432 M 0.745 +433 P 0.754 +434 E 0.758 +435 Q 0.751 +436 E 0.733 +437 Y 0.708 +438 E 0.687 +439 F 0.680 +440 P 0.692 +441 E 0.716 +442 P 0.743 +443 R 0.768 +444 N 0.788 +445 L 0.800 +446 N 0.804 +447 N 0.801 +448 N 0.790 +449 M 0.772 +450 R 0.753 +451 R 0.741 +452 P 0.734 +453 S 0.731 +454 S 0.731 +455 P 0.730 +456 R 0.722 +457 K 0.709 +458 W 0.695 +459 Y 0.677 +460 S 0.656 +461 P 0.640 +462 I 0.640 +463 K 0.650 +464 G 0.646 +465 K 0.603 +466 L 0.534 +467 D 0.469 +468 A 0.418 +469 L 0.376 +470 W 0.352 +471 V 0.355 +472 L 0.369 +473 L 0.377 +474 R 0.399 +475 K 0.458 +476 G 0.535 +477 Y 0.592 +478 D 0.616 +479 R 0.629 +480 V 0.648 +481 S 0.679 +482 V 0.708 +483 M 0.714 +484 R 0.695 +485 P 0.674 +486 Q 0.677 +487 P 0.704 +488 G 0.737 +489 D 0.765 +490 T 0.785 +491 G 0.795 +492 R 0.794 +493 C 0.784 +494 I 0.773 +495 N 0.767 +496 F 0.767 +497 T 0.767 +498 R 0.767 +499 V 0.772 +500 K 0.779 +501 N 0.782 +502 S 0.778 +503 Q 0.777 +504 P 0.784 +505 A 0.793 +506 K 0.796 +507 Y 0.800 +508 P 0.811 +509 L 0.828 +510 N 0.842 +511 N 0.842 +512 T 0.828 +513 Y 0.812 +514 H 0.801 +515 P 0.794 +516 S 0.782 +517 S 0.764 +518 P 0.756 +519 P 0.764 +520 P 0.785 +521 A 0.804 +522 P 0.810 +523 I 0.797 +524 Y 0.773 +525 T 0.741 +526 P 0.694 +527 P 0.642 +528 P 0.626 +529 P 0.673 +530 A 0.745 +531 P 0.790 +532 H 0.799 +533 C 0.791 +534 P 0.784 +535 P 0.789 +536 P 0.804 +537 A 0.820 +538 P 0.830 +539 S 0.829 +540 A 0.821 +541 P 0.809 +542 T 0.799 +543 P 0.794 +544 P 0.795 +545 I 0.797 +546 P 0.793 +547 S 0.777 +548 P 0.735 +549 P 0.673 +550 S 0.630 +551 T 0.630 +552 L 0.634 +553 P 0.610 +554 P 0.602 +555 P 0.650 +556 P 0.718 +557 Q 0.755 +558 A 0.756 +559 P 0.748 +560 P 0.751 +561 P 0.764 +562 N 0.771 +563 R 0.762 +564 A 0.743 +565 P 0.729 +566 P 0.731 +567 P 0.740 +568 S 0.744 +569 R 0.740 +570 P 0.735 +571 P 0.741 +572 P 0.759 +573 R 0.778 +574 P 0.787 +575 S 0.777 +576 V 0.763 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033508.9_ENSMUST00000043400.9_GN:Asprv1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033508.9_ENSMUST00000043400.9_GN:Asprv1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..93a3d6d396115b9ade70e48601efef0a6a6157c2 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033508.9_ENSMUST00000043400.9_GN:Asprv1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,257 @@ +>ENSMUSG00000033508.9|ENSMUST00000043400.9|GN:Asprv1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.415 +2 A 0.417 +3 T 0.451 +4 S 0.528 +5 G 0.612 +6 V 0.663 +7 R 0.680 +8 S 0.682 +9 K 0.680 +10 E 0.673 +11 G 0.658 +12 R 0.633 +13 R 0.597 +14 E 0.541 +15 H 0.457 +16 A 0.350 +17 F 0.248 +18 V 0.175 +19 P 0.135 +20 E 0.113 +21 P 0.097 +22 F 0.086 +23 T 0.085 +24 G 0.091 +25 T 0.094 +26 N 0.092 +27 L 0.087 +28 A 0.081 +29 P 0.070 +30 S 0.057 +31 L 0.047 +32 W 0.047 +33 L 0.056 +34 H 0.062 +35 R 0.058 +36 F 0.051 +37 E 0.049 +38 V 0.054 +39 I 0.062 +40 D 0.076 +41 D 0.098 +42 L 0.116 +43 N 0.117 +44 H 0.103 +45 W 0.087 +46 D 0.074 +47 H 0.061 +48 A 0.048 +49 T 0.038 +50 K 0.034 +51 L 0.037 +52 R 0.049 +53 F 0.067 +54 L 0.077 +55 K 0.073 +56 E 0.063 +57 S 0.056 +58 L 0.054 +59 K 0.054 +60 G 0.051 +61 D 0.046 +62 A 0.041 +63 L 0.038 +64 D 0.039 +65 V 0.042 +66 Y 0.050 +67 N 0.061 +68 G 0.076 +69 L 0.086 +70 S 0.087 +71 S 0.078 +72 Q 0.067 +73 A 0.060 +74 Q 0.054 +75 G 0.048 +76 D 0.038 +77 F 0.028 +78 S 0.023 +79 F 0.025 +80 V 0.035 +81 K 0.051 +82 Q 0.063 +83 A 0.061 +84 L 0.052 +85 L 0.049 +86 R 0.056 +87 A 0.078 +88 F 0.124 +89 G 0.211 +90 A 0.333 +91 P 0.458 +92 G 0.545 +93 E 0.580 +94 A 0.572 +95 F 0.547 +96 S 0.530 +97 E 0.522 +98 P 0.505 +99 E 0.467 +100 E 0.423 +101 I 0.382 +102 L 0.340 +103 F 0.305 +104 A 0.288 +105 N 0.288 +106 S 0.293 +107 M 0.287 +108 G 0.257 +109 K 0.202 +110 G 0.139 +111 Y 0.084 +112 Y 0.049 +113 L 0.033 +114 K 0.027 +115 G 0.027 +116 K 0.035 +117 V 0.051 +118 G 0.073 +119 H 0.093 +120 V 0.097 +121 P 0.082 +122 V 0.057 +123 R 0.035 +124 F 0.025 +125 L 0.027 +126 V 0.038 +127 D 0.056 +128 S 0.075 +129 G 0.087 +130 A 0.090 +131 Q 0.083 +132 V 0.073 +133 S 0.066 +134 V 0.058 +135 V 0.050 +136 H 0.045 +137 P 0.043 +138 A 0.043 +139 L 0.042 +140 W 0.042 +141 E 0.045 +142 E 0.053 +143 V 0.070 +144 T 0.100 +145 D 0.133 +146 G 0.155 +147 D 0.162 +148 L 0.158 +149 D 0.149 +150 T 0.141 +151 L 0.141 +152 R 0.141 +153 P 0.135 +154 F 0.123 +155 N 0.115 +156 N 0.112 +157 V 0.109 +158 V 0.105 +159 K 0.104 +160 V 0.111 +161 A 0.127 +162 N 0.141 +163 G 0.147 +164 A 0.143 +165 E 0.133 +166 M 0.119 +167 K 0.108 +168 I 0.099 +169 L 0.090 +170 G 0.078 +171 V 0.063 +172 W 0.048 +173 D 0.038 +174 T 0.031 +175 E 0.029 +176 I 0.030 +177 S 0.037 +178 L 0.045 +179 G 0.054 +180 K 0.060 +181 T 0.062 +182 K 0.061 +183 L 0.055 +184 K 0.048 +185 A 0.040 +186 E 0.033 +187 F 0.030 +188 L 0.033 +189 V 0.044 +190 A 0.061 +191 N 0.081 +192 A 0.095 +193 S 0.098 +194 A 0.092 +195 E 0.081 +196 E 0.070 +197 A 0.058 +198 I 0.047 +199 I 0.040 +200 G 0.038 +201 T 0.040 +202 D 0.042 +203 V 0.043 +204 L 0.043 +205 Q 0.045 +206 D 0.046 +207 H 0.047 +208 N 0.050 +209 A 0.057 +210 V 0.063 +211 L 0.064 +212 D 0.065 +213 F 0.068 +214 E 0.067 +215 H 0.056 +216 R 0.041 +217 T 0.031 +218 C 0.028 +219 T 0.028 +220 L 0.030 +221 K 0.034 +222 G 0.038 +223 K 0.040 +224 K 0.040 +225 F 0.042 +226 R 0.049 +227 L 0.067 +228 L 0.100 +229 P 0.149 +230 V 0.219 +231 G 0.303 +232 S 0.380 +233 S 0.428 +234 L 0.444 +235 E 0.445 +236 D 0.440 +237 E 0.430 +238 F 0.416 +239 D 0.408 +240 L 0.414 +241 E 0.441 +242 L 0.480 +243 I 0.520 +244 E 0.560 +245 E 0.598 +246 E 0.630 +247 E 0.654 +248 G 0.665 +249 S 0.661 +250 S 0.647 +251 A 0.635 +252 P 0.633 +253 E 0.631 +254 G 0.609 +255 S 0.562 +256 H 0.520 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033508.9_ENSMUST00000043400.9_GN:Asprv1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:83.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033508.9_ENSMUST00000043400.9_GN:Asprv1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:83.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7d2e72e4aabbcf0169951a464d82b06e178e26bc --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033508.9_ENSMUST00000043400.9_GN:Asprv1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:83.caid @@ -0,0 +1,340 @@ +>ENSMUSG00000033508.9|ENSMUST00000043400.9|GN:Asprv1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:83 +1 M 0.407 +2 R 0.430 +3 N 0.472 +4 P 0.521 +5 G 0.562 +6 G 0.588 +7 P 0.592 +8 G 0.562 +9 W 0.504 +10 A 0.460 +11 S 0.460 +12 K 0.484 +13 R 0.501 +14 P 0.485 +15 L 0.434 +16 Q 0.386 +17 K 0.403 +18 K 0.485 +19 Q 0.572 +20 N 0.620 +21 T 0.631 +22 A 0.622 +23 C 0.606 +24 L 0.598 +25 C 0.599 +26 A 0.602 +27 Q 0.602 +28 Q 0.605 +29 P 0.617 +30 A 0.628 +31 R 0.626 +32 H 0.603 +33 F 0.573 +34 V 0.564 +35 P 0.589 +36 A 0.631 +37 P 0.666 +38 F 0.684 +39 N 0.680 +40 S 0.636 +41 S 0.545 +42 R 0.466 +43 Q 0.478 +44 G 0.582 +45 K 0.693 +46 N 0.750 +47 T 0.758 +48 A 0.746 +49 Q 0.732 +50 P 0.723 +51 T 0.721 +52 E 0.723 +53 P 0.725 +54 S 0.726 +55 L 0.727 +56 S 0.730 +57 S 0.731 +58 V 0.728 +59 I 0.717 +60 A 0.704 +61 P 0.686 +62 T 0.653 +63 L 0.604 +64 F 0.546 +65 C 0.479 +66 A 0.404 +67 F 0.342 +68 L 0.315 +69 Y 0.327 +70 L 0.363 +71 A 0.416 +72 C 0.486 +73 V 0.557 +74 T 0.610 +75 A 0.640 +76 E 0.648 +77 L 0.643 +78 P 0.637 +79 E 0.628 +80 V 0.601 +81 S 0.562 +82 R 0.552 +83 R 0.600 +84 M 0.675 +85 A 0.734 +86 T 0.768 +87 S 0.788 +88 G 0.798 +89 V 0.795 +90 R 0.784 +91 S 0.773 +92 K 0.762 +93 E 0.746 +94 G 0.719 +95 R 0.683 +96 R 0.640 +97 E 0.580 +98 H 0.487 +99 A 0.369 +100 F 0.254 +101 V 0.172 +102 P 0.127 +103 E 0.103 +104 P 0.087 +105 F 0.077 +106 T 0.076 +107 G 0.081 +108 T 0.083 +109 N 0.080 +110 L 0.076 +111 A 0.071 +112 P 0.062 +113 S 0.050 +114 L 0.040 +115 W 0.035 +116 L 0.034 +117 H 0.035 +118 R 0.036 +119 F 0.038 +120 E 0.042 +121 V 0.047 +122 I 0.053 +123 D 0.064 +124 D 0.081 +125 L 0.095 +126 N 0.095 +127 H 0.085 +128 W 0.074 +129 D 0.064 +130 H 0.053 +131 A 0.042 +132 T 0.034 +133 K 0.031 +134 L 0.034 +135 R 0.045 +136 F 0.060 +137 L 0.069 +138 K 0.066 +139 E 0.056 +140 S 0.049 +141 L 0.048 +142 K 0.048 +143 G 0.046 +144 D 0.041 +145 A 0.036 +146 L 0.033 +147 D 0.034 +148 V 0.038 +149 Y 0.044 +150 N 0.053 +151 G 0.064 +152 L 0.072 +153 S 0.074 +154 S 0.069 +155 Q 0.062 +156 A 0.058 +157 Q 0.054 +158 G 0.047 +159 D 0.036 +160 F 0.026 +161 S 0.021 +162 F 0.023 +163 V 0.033 +164 K 0.048 +165 Q 0.059 +166 A 0.056 +167 L 0.046 +168 L 0.042 +169 R 0.047 +170 A 0.067 +171 F 0.111 +172 G 0.195 +173 A 0.315 +174 P 0.439 +175 G 0.526 +176 E 0.562 +177 A 0.557 +178 F 0.534 +179 S 0.517 +180 E 0.508 +181 P 0.490 +182 E 0.458 +183 E 0.422 +184 I 0.389 +185 L 0.352 +186 F 0.317 +187 A 0.296 +188 N 0.290 +189 S 0.289 +190 M 0.279 +191 G 0.246 +192 K 0.192 +193 G 0.129 +194 Y 0.077 +195 Y 0.045 +196 L 0.030 +197 K 0.025 +198 G 0.027 +199 K 0.035 +200 V 0.050 +201 G 0.072 +202 H 0.091 +203 V 0.094 +204 P 0.079 +205 V 0.055 +206 R 0.035 +207 F 0.025 +208 L 0.026 +209 V 0.037 +210 D 0.053 +211 S 0.069 +212 G 0.081 +213 A 0.083 +214 Q 0.079 +215 V 0.072 +216 S 0.065 +217 V 0.058 +218 V 0.049 +219 H 0.044 +220 P 0.042 +221 A 0.042 +222 L 0.040 +223 W 0.038 +224 E 0.039 +225 E 0.046 +226 V 0.061 +227 T 0.087 +228 D 0.116 +229 G 0.135 +230 D 0.141 +231 L 0.137 +232 D 0.128 +233 T 0.123 +234 L 0.124 +235 R 0.127 +236 P 0.121 +237 F 0.111 +238 N 0.103 +239 N 0.099 +240 V 0.095 +241 V 0.090 +242 K 0.090 +243 V 0.097 +244 A 0.111 +245 N 0.123 +246 G 0.128 +247 A 0.125 +248 E 0.117 +249 M 0.107 +250 K 0.097 +251 I 0.090 +252 L 0.082 +253 G 0.070 +254 V 0.056 +255 W 0.044 +256 D 0.034 +257 T 0.028 +258 E 0.026 +259 I 0.028 +260 S 0.034 +261 L 0.043 +262 G 0.052 +263 K 0.059 +264 T 0.061 +265 K 0.059 +266 L 0.053 +267 K 0.046 +268 A 0.038 +269 E 0.032 +270 F 0.028 +271 L 0.031 +272 V 0.042 +273 A 0.058 +274 N 0.078 +275 A 0.093 +276 S 0.097 +277 A 0.092 +278 E 0.082 +279 E 0.072 +280 A 0.061 +281 I 0.050 +282 I 0.042 +283 G 0.040 +284 T 0.042 +285 D 0.045 +286 V 0.046 +287 L 0.046 +288 Q 0.047 +289 D 0.049 +290 H 0.051 +291 N 0.055 +292 A 0.062 +293 V 0.067 +294 L 0.065 +295 D 0.059 +296 F 0.051 +297 E 0.044 +298 H 0.037 +299 R 0.033 +300 T 0.030 +301 C 0.030 +302 T 0.032 +303 L 0.035 +304 K 0.040 +305 G 0.044 +306 K 0.046 +307 K 0.046 +308 F 0.047 +309 R 0.053 +310 L 0.070 +311 L 0.102 +312 P 0.152 +313 V 0.226 +314 G 0.318 +315 S 0.406 +316 S 0.463 +317 L 0.485 +318 E 0.488 +319 D 0.482 +320 E 0.470 +321 F 0.454 +322 D 0.442 +323 L 0.445 +324 E 0.468 +325 L 0.506 +326 I 0.551 +327 E 0.595 +328 E 0.633 +329 E 0.663 +330 E 0.683 +331 G 0.690 +332 S 0.685 +333 S 0.670 +334 A 0.658 +335 P 0.657 +336 E 0.657 +337 G 0.634 +338 S 0.583 +339 H 0.536 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033726.9_ENSMUST00000045942.9_GN:Emx1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033726.9_ENSMUST00000045942.9_GN:Emx1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..138d6e9cd06e09093fb321a72b6b05aeb3425d50 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033726.9_ENSMUST00000045942.9_GN:Emx1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,258 @@ +>ENSMUSG00000033726.9|ENSMUST00000045942.9|GN:Emx1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.527 +2 F 0.566 +3 Q 0.623 +4 P 0.677 +5 A 0.713 +6 A 0.727 +7 K 0.726 +8 R 0.715 +9 G 0.683 +10 F 0.618 +11 T 0.538 +12 I 0.489 +13 E 0.499 +14 S 0.552 +15 L 0.612 +16 V 0.665 +17 A 0.719 +18 K 0.766 +19 D 0.797 +20 G 0.813 +21 G 0.821 +22 T 0.824 +23 G 0.820 +24 G 0.808 +25 S 0.784 +26 P 0.739 +27 G 0.680 +28 S 0.655 +29 G 0.695 +30 G 0.764 +31 A 0.805 +32 G 0.807 +33 S 0.794 +34 H 0.789 +35 P 0.802 +36 L 0.828 +37 A 0.851 +38 V 0.864 +39 A 0.862 +40 A 0.846 +41 S 0.825 +42 E 0.807 +43 E 0.802 +44 P 0.810 +45 L 0.824 +46 R 0.838 +47 P 0.850 +48 T 0.857 +49 A 0.853 +50 L 0.832 +51 N 0.804 +52 Y 0.781 +53 P 0.773 +54 H 0.783 +55 P 0.804 +56 S 0.828 +57 A 0.847 +58 A 0.860 +59 E 0.867 +60 T 0.869 +61 A 0.865 +62 F 0.860 +63 V 0.854 +64 S 0.847 +65 G 0.836 +66 F 0.830 +67 P 0.836 +68 A 0.851 +69 A 0.863 +70 A 0.868 +71 A 0.870 +72 A 0.872 +73 G 0.875 +74 A 0.877 +75 G 0.874 +76 R 0.865 +77 S 0.852 +78 L 0.838 +79 Y 0.828 +80 G 0.824 +81 G 0.827 +82 P 0.836 +83 E 0.844 +84 L 0.843 +85 V 0.834 +86 F 0.826 +87 P 0.829 +88 E 0.837 +89 A 0.839 +90 M 0.831 +91 N 0.820 +92 H 0.818 +93 P 0.830 +94 A 0.846 +95 L 0.854 +96 T 0.850 +97 V 0.841 +98 H 0.834 +99 P 0.835 +100 A 0.843 +101 H 0.853 +102 Q 0.860 +103 L 0.865 +104 G 0.869 +105 S 0.867 +106 S 0.854 +107 S 0.829 +108 L 0.798 +109 Q 0.777 +110 P 0.778 +111 P 0.795 +112 H 0.814 +113 S 0.820 +114 F 0.817 +115 F 0.814 +116 S 0.813 +117 A 0.807 +118 Q 0.791 +119 H 0.770 +120 R 0.744 +121 D 0.713 +122 P 0.678 +123 L 0.645 +124 H 0.617 +125 F 0.583 +126 Y 0.533 +127 P 0.482 +128 W 0.454 +129 V 0.461 +130 L 0.494 +131 R 0.533 +132 N 0.561 +133 R 0.581 +134 F 0.607 +135 F 0.650 +136 G 0.700 +137 H 0.740 +138 R 0.764 +139 F 0.779 +140 Q 0.792 +141 A 0.801 +142 S 0.801 +143 D 0.791 +144 V 0.781 +145 P 0.786 +146 Q 0.808 +147 D 0.833 +148 G 0.844 +149 L 0.838 +150 L 0.818 +151 L 0.792 +152 H 0.766 +153 G 0.752 +154 P 0.748 +155 F 0.745 +156 A 0.729 +157 R 0.707 +158 K 0.685 +159 P 0.666 +160 K 0.637 +161 R 0.587 +162 I 0.501 +163 R 0.389 +164 T 0.289 +165 A 0.227 +166 F 0.188 +167 S 0.151 +168 P 0.110 +169 S 0.073 +170 Q 0.049 +171 L 0.040 +172 L 0.044 +173 R 0.054 +174 L 0.064 +175 E 0.072 +176 R 0.072 +177 A 0.063 +178 F 0.051 +179 E 0.043 +180 K 0.040 +181 N 0.039 +182 H 0.038 +183 Y 0.039 +184 V 0.041 +185 V 0.042 +186 G 0.043 +187 A 0.043 +188 E 0.041 +189 R 0.040 +190 K 0.044 +191 Q 0.055 +192 L 0.069 +193 A 0.076 +194 G 0.072 +195 S 0.065 +196 L 0.062 +197 S 0.061 +198 L 0.058 +199 S 0.052 +200 E 0.048 +201 T 0.047 +202 Q 0.047 +203 V 0.045 +204 K 0.038 +205 V 0.031 +206 W 0.026 +207 F 0.023 +208 Q 0.021 +209 N 0.021 +210 R 0.021 +211 R 0.024 +212 T 0.028 +213 K 0.036 +214 Y 0.052 +215 K 0.077 +216 R 0.109 +217 Q 0.148 +218 K 0.194 +219 L 0.244 +220 E 0.288 +221 E 0.329 +222 E 0.380 +223 G 0.449 +224 P 0.526 +225 E 0.586 +226 S 0.610 +227 E 0.600 +228 Q 0.573 +229 K 0.545 +230 K 0.525 +231 K 0.511 +232 G 0.493 +233 S 0.461 +234 H 0.413 +235 H 0.360 +236 I 0.318 +237 N 0.290 +238 R 0.274 +239 W 0.270 +240 R 0.285 +241 I 0.320 +242 A 0.380 +243 T 0.465 +244 K 0.556 +245 Q 0.620 +246 A 0.650 +247 N 0.664 +248 G 0.681 +249 E 0.703 +250 D 0.727 +251 I 0.744 +252 D 0.750 +253 V 0.743 +254 T 0.719 +255 S 0.668 +256 N 0.593 +257 D 0.531 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033726.9_ENSMUST00000045942.9_GN:Emx1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033726.9_ENSMUST00000045942.9_GN:Emx1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ccfc54d9aaf206f29fdab1e6123a9318d697e864 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000033726.9_ENSMUST00000045942.9_GN:Emx1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid @@ -0,0 +1,291 @@ +>ENSMUSG00000033726.9|ENSMUST00000045942.9|GN:Emx1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:33 +1 M 0.488 +2 C 0.534 +3 Q 0.592 +4 A 0.625 +5 W 0.615 +6 C 0.578 +7 T 0.557 +8 P 0.570 +9 R 0.591 +10 T 0.616 +11 A 0.669 +12 A 0.730 +13 A 0.765 +14 P 0.775 +15 G 0.765 +16 H 0.725 +17 R 0.660 +18 A 0.619 +19 F 0.643 +20 P 0.705 +21 R 0.753 +22 A 0.774 +23 P 0.784 +24 L 0.799 +25 P 0.820 +26 H 0.838 +27 S 0.848 +28 A 0.852 +29 S 0.854 +30 A 0.856 +31 A 0.857 +32 A 0.851 +33 T 0.838 +34 M 0.817 +35 F 0.798 +36 Q 0.790 +37 P 0.797 +38 A 0.808 +39 A 0.809 +40 K 0.801 +41 R 0.786 +42 G 0.760 +43 F 0.714 +44 T 0.658 +45 I 0.622 +46 E 0.627 +47 S 0.665 +48 L 0.710 +49 V 0.747 +50 A 0.781 +51 K 0.810 +52 D 0.830 +53 G 0.843 +54 G 0.851 +55 T 0.856 +56 G 0.854 +57 G 0.849 +58 S 0.846 +59 P 0.850 +60 G 0.861 +61 S 0.869 +62 G 0.873 +63 G 0.873 +64 A 0.867 +65 G 0.853 +66 S 0.838 +67 H 0.832 +68 P 0.845 +69 L 0.867 +70 A 0.887 +71 V 0.897 +72 A 0.896 +73 A 0.882 +74 S 0.863 +75 E 0.845 +76 E 0.838 +77 P 0.841 +78 L 0.849 +79 R 0.858 +80 P 0.867 +81 T 0.872 +82 A 0.867 +83 L 0.848 +84 N 0.820 +85 Y 0.795 +86 P 0.786 +87 H 0.793 +88 P 0.812 +89 S 0.834 +90 A 0.852 +91 A 0.863 +92 E 0.868 +93 T 0.868 +94 A 0.863 +95 F 0.857 +96 V 0.851 +97 S 0.841 +98 G 0.829 +99 F 0.821 +100 P 0.828 +101 A 0.843 +102 A 0.856 +103 A 0.862 +104 A 0.861 +105 A 0.862 +106 G 0.863 +107 A 0.864 +108 G 0.859 +109 R 0.849 +110 S 0.835 +111 L 0.820 +112 Y 0.810 +113 G 0.806 +114 G 0.810 +115 P 0.821 +116 E 0.831 +117 L 0.831 +118 V 0.821 +119 F 0.811 +120 P 0.812 +121 E 0.820 +122 A 0.822 +123 M 0.814 +124 N 0.802 +125 H 0.800 +126 P 0.812 +127 A 0.831 +128 L 0.841 +129 T 0.838 +130 V 0.827 +131 H 0.819 +132 P 0.822 +133 A 0.835 +134 H 0.848 +135 Q 0.858 +136 L 0.865 +137 G 0.870 +138 S 0.869 +139 S 0.857 +140 S 0.834 +141 L 0.804 +142 Q 0.784 +143 P 0.785 +144 P 0.804 +145 H 0.824 +146 S 0.833 +147 F 0.831 +148 F 0.829 +149 S 0.828 +150 A 0.822 +151 Q 0.809 +152 H 0.789 +153 R 0.764 +154 D 0.734 +155 P 0.702 +156 L 0.674 +157 H 0.648 +158 F 0.611 +159 Y 0.557 +160 P 0.504 +161 W 0.477 +162 V 0.488 +163 L 0.522 +164 R 0.561 +165 N 0.592 +166 R 0.613 +167 F 0.637 +168 F 0.674 +169 G 0.717 +170 H 0.754 +171 R 0.777 +172 F 0.792 +173 Q 0.804 +174 A 0.813 +175 S 0.812 +176 D 0.801 +177 V 0.790 +178 P 0.794 +179 Q 0.816 +180 D 0.841 +181 G 0.853 +182 L 0.847 +183 L 0.827 +184 L 0.800 +185 H 0.773 +186 G 0.757 +187 P 0.753 +188 F 0.749 +189 A 0.733 +190 R 0.709 +191 K 0.688 +192 P 0.669 +193 K 0.643 +194 R 0.593 +195 I 0.506 +196 R 0.392 +197 T 0.291 +198 A 0.227 +199 F 0.189 +200 S 0.152 +201 P 0.112 +202 S 0.074 +203 Q 0.050 +204 L 0.041 +205 L 0.044 +206 R 0.054 +207 L 0.065 +208 E 0.072 +209 R 0.072 +210 A 0.063 +211 F 0.051 +212 E 0.043 +213 K 0.039 +214 N 0.037 +215 H 0.036 +216 Y 0.037 +217 V 0.039 +218 V 0.040 +219 G 0.042 +220 A 0.042 +221 E 0.040 +222 R 0.039 +223 K 0.043 +224 Q 0.054 +225 L 0.068 +226 A 0.075 +227 G 0.071 +228 S 0.064 +229 L 0.060 +230 S 0.058 +231 L 0.055 +232 S 0.050 +233 E 0.047 +234 T 0.046 +235 Q 0.047 +236 V 0.044 +237 K 0.038 +238 V 0.031 +239 W 0.026 +240 F 0.023 +241 Q 0.021 +242 N 0.021 +243 R 0.022 +244 R 0.025 +245 T 0.030 +246 K 0.038 +247 Y 0.054 +248 K 0.080 +249 R 0.113 +250 Q 0.153 +251 K 0.201 +252 L 0.251 +253 E 0.295 +254 E 0.335 +255 E 0.386 +256 G 0.455 +257 P 0.532 +258 E 0.592 +259 S 0.616 +260 E 0.604 +261 Q 0.574 +262 K 0.545 +263 K 0.525 +264 K 0.511 +265 G 0.493 +266 S 0.459 +267 H 0.409 +268 H 0.357 +269 I 0.316 +270 N 0.288 +271 R 0.271 +272 W 0.267 +273 R 0.283 +274 I 0.319 +275 A 0.380 +276 T 0.465 +277 K 0.557 +278 Q 0.622 +279 A 0.655 +280 N 0.672 +281 G 0.688 +282 E 0.709 +283 D 0.730 +284 I 0.744 +285 D 0.747 +286 V 0.739 +287 T 0.717 +288 S 0.669 +289 N 0.597 +290 D 0.537 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000034245.11_ENSMUST00000041736.11_GN:Hdac11_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000034245.11_ENSMUST00000041736.11_GN:Hdac11_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6319b3cca5a87d8fa62cc0c90b7ec8dc63d001ce --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000034245.11_ENSMUST00000041736.11_GN:Hdac11_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,348 @@ +>ENSMUSG00000034245.11|ENSMUST00000041736.11|GN:Hdac11|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.339 +2 P 0.316 +3 H 0.282 +4 A 0.246 +5 T 0.208 +6 Q 0.167 +7 L 0.129 +8 Y 0.104 +9 Q 0.096 +10 H 0.098 +11 V 0.101 +12 P 0.098 +13 E 0.092 +14 K 0.087 +15 R 0.082 +16 W 0.074 +17 P 0.067 +18 I 0.066 +19 V 0.072 +20 Y 0.083 +21 S 0.096 +22 P 0.103 +23 R 0.103 +24 Y 0.098 +25 N 0.091 +26 I 0.084 +27 T 0.084 +28 F 0.098 +29 M 0.124 +30 G 0.149 +31 L 0.163 +32 E 0.171 +33 K 0.179 +34 L 0.184 +35 H 0.181 +36 P 0.172 +37 F 0.160 +38 D 0.147 +39 A 0.134 +40 G 0.117 +41 K 0.096 +42 W 0.077 +43 G 0.066 +44 K 0.065 +45 V 0.071 +46 I 0.080 +47 N 0.086 +48 F 0.087 +49 L 0.086 +50 K 0.089 +51 E 0.089 +52 E 0.083 +53 K 0.075 +54 L 0.074 +55 L 0.082 +56 S 0.093 +57 D 0.099 +58 G 0.095 +59 M 0.088 +60 L 0.090 +61 V 0.102 +62 E 0.114 +63 A 0.118 +64 R 0.112 +65 E 0.098 +66 A 0.082 +67 S 0.067 +68 E 0.058 +69 E 0.055 +70 D 0.056 +71 L 0.057 +72 L 0.059 +73 V 0.062 +74 V 0.064 +75 H 0.061 +76 T 0.053 +77 R 0.048 +78 R 0.047 +79 Y 0.048 +80 L 0.047 +81 N 0.046 +82 E 0.048 +83 L 0.051 +84 K 0.053 +85 W 0.053 +86 S 0.057 +87 F 0.065 +88 V 0.073 +89 V 0.082 +90 A 0.093 +91 T 0.108 +92 I 0.124 +93 T 0.139 +94 E 0.154 +95 I 0.166 +96 P 0.167 +97 P 0.155 +98 V 0.140 +99 I 0.125 +100 F 0.109 +101 L 0.093 +102 P 0.077 +103 N 0.061 +104 F 0.052 +105 L 0.049 +106 V 0.049 +107 Q 0.054 +108 R 0.066 +109 K 0.081 +110 V 0.094 +111 L 0.104 +112 R 0.120 +113 P 0.143 +114 L 0.152 +115 R 0.138 +116 T 0.119 +117 Q 0.109 +118 T 0.100 +119 G 0.087 +120 G 0.075 +121 T 0.065 +122 I 0.054 +123 M 0.043 +124 A 0.037 +125 G 0.034 +126 K 0.034 +127 L 0.035 +128 A 0.037 +129 V 0.037 +130 E 0.037 +131 R 0.042 +132 G 0.053 +133 W 0.072 +134 A 0.097 +135 I 0.127 +136 N 0.161 +137 V 0.191 +138 G 0.208 +139 G 0.211 +140 G 0.205 +141 F 0.195 +142 H 0.182 +143 H 0.167 +144 C 0.150 +145 S 0.135 +146 S 0.136 +147 D 0.160 +148 R 0.195 +149 G 0.221 +150 G 0.230 +151 G 0.228 +152 F 0.221 +153 C 0.208 +154 A 0.186 +155 Y 0.160 +156 A 0.140 +157 D 0.122 +158 I 0.102 +159 T 0.086 +160 L 0.077 +161 A 0.068 +162 I 0.058 +163 K 0.048 +164 F 0.041 +165 L 0.037 +166 F 0.036 +167 E 0.042 +168 R 0.053 +169 V 0.066 +170 E 0.077 +171 G 0.079 +172 I 0.071 +173 S 0.060 +174 R 0.058 +175 A 0.071 +176 T 0.097 +177 I 0.130 +178 I 0.156 +179 D 0.160 +180 L 0.140 +181 D 0.113 +182 A 0.102 +183 H 0.110 +184 Q 0.124 +185 G 0.132 +186 N 0.133 +187 G 0.131 +188 H 0.123 +189 E 0.111 +190 R 0.099 +191 D 0.092 +192 F 0.090 +193 M 0.090 +194 G 0.087 +195 D 0.078 +196 K 0.064 +197 R 0.053 +198 V 0.053 +199 Y 0.065 +200 I 0.081 +201 M 0.095 +202 D 0.102 +203 V 0.100 +204 Y 0.091 +205 N 0.082 +206 R 0.076 +207 H 0.073 +208 I 0.070 +209 Y 0.070 +210 P 0.080 +211 G 0.096 +212 D 0.112 +213 R 0.125 +214 F 0.136 +215 A 0.141 +216 K 0.137 +217 E 0.129 +218 A 0.119 +219 I 0.108 +220 R 0.101 +221 R 0.108 +222 K 0.128 +223 V 0.150 +224 E 0.166 +225 L 0.175 +226 E 0.180 +227 W 0.180 +228 G 0.169 +229 T 0.149 +230 E 0.125 +231 D 0.102 +232 E 0.083 +233 E 0.072 +234 Y 0.071 +235 L 0.075 +236 E 0.074 +237 K 0.067 +238 V 0.060 +239 E 0.062 +240 R 0.063 +241 N 0.059 +242 V 0.054 +243 R 0.056 +244 R 0.060 +245 S 0.055 +246 L 0.044 +247 Q 0.039 +248 E 0.041 +249 H 0.047 +250 L 0.050 +251 P 0.052 +252 D 0.056 +253 V 0.063 +254 V 0.075 +255 V 0.093 +256 Y 0.113 +257 N 0.125 +258 A 0.125 +259 G 0.118 +260 T 0.116 +261 D 0.122 +262 V 0.124 +263 L 0.119 +264 E 0.112 +265 G 0.115 +266 D 0.127 +267 R 0.141 +268 L 0.153 +269 G 0.161 +270 G 0.161 +271 L 0.151 +272 S 0.141 +273 I 0.136 +274 S 0.132 +275 P 0.124 +276 A 0.116 +277 G 0.111 +278 I 0.104 +279 V 0.092 +280 K 0.078 +281 R 0.069 +282 D 0.065 +283 E 0.058 +284 V 0.048 +285 V 0.038 +286 F 0.031 +287 R 0.029 +288 V 0.030 +289 V 0.031 +290 R 0.034 +291 A 0.041 +292 H 0.054 +293 D 0.066 +294 I 0.071 +295 P 0.068 +296 I 0.069 +297 L 0.078 +298 M 0.088 +299 V 0.093 +300 T 0.091 +301 S 0.093 +302 G 0.101 +303 G 0.114 +304 Y 0.122 +305 Q 0.119 +306 K 0.108 +307 R 0.094 +308 T 0.081 +309 A 0.074 +310 R 0.076 +311 I 0.081 +312 I 0.078 +313 A 0.068 +314 D 0.057 +315 S 0.052 +316 I 0.051 +317 L 0.054 +318 N 0.059 +319 L 0.064 +320 H 0.068 +321 D 0.076 +322 L 0.086 +323 G 0.093 +324 L 0.101 +325 I 0.121 +326 G 0.159 +327 P 0.208 +328 E 0.262 +329 F 0.320 +330 P 0.381 +331 C 0.443 +332 V 0.497 +333 S 0.528 +334 A 0.529 +335 Q 0.513 +336 N 0.502 +337 S 0.505 +338 G 0.517 +339 I 0.528 +340 P 0.532 +341 L 0.528 +342 L 0.524 +343 S 0.528 +344 C 0.529 +345 A 0.503 +346 V 0.454 +347 P 0.415 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000034245.11_ENSMUST00000041736.11_GN:Hdac11_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000034245.11_ENSMUST00000041736.11_GN:Hdac11_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..caae6b187d075a6ceb75b73abb110d390e84cc4b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000034245.11_ENSMUST00000041736.11_GN:Hdac11_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid @@ -0,0 +1,380 @@ +>ENSMUSG00000034245.11|ENSMUST00000041736.11|GN:Hdac11|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:32 +1 M 0.363 +2 E 0.362 +3 A 0.369 +4 C 0.384 +5 V 0.387 +6 L 0.377 +7 R 0.383 +8 R 0.420 +9 P 0.453 +10 C 0.448 +11 L 0.422 +12 L 0.412 +13 H 0.420 +14 P 0.429 +15 S 0.438 +16 H 0.446 +17 P 0.448 +18 S 0.467 +19 R 0.526 +20 C 0.598 +21 G 0.640 +22 V 0.643 +23 A 0.626 +24 S 0.603 +25 R 0.592 +26 A 0.601 +27 G 0.618 +28 R 0.630 +29 A 0.636 +30 G 0.634 +31 C 0.609 +32 G 0.553 +33 M 0.480 +34 P 0.409 +35 H 0.349 +36 A 0.293 +37 T 0.235 +38 Q 0.176 +39 L 0.130 +40 Y 0.102 +41 Q 0.091 +42 H 0.091 +43 V 0.093 +44 P 0.092 +45 E 0.088 +46 K 0.085 +47 R 0.080 +48 W 0.073 +49 P 0.067 +50 I 0.065 +51 V 0.072 +52 Y 0.084 +53 S 0.098 +54 P 0.106 +55 R 0.108 +56 Y 0.103 +57 N 0.097 +58 I 0.091 +59 T 0.090 +60 F 0.103 +61 M 0.128 +62 G 0.152 +63 L 0.166 +64 E 0.177 +65 K 0.188 +66 L 0.196 +67 H 0.192 +68 P 0.178 +69 F 0.162 +70 D 0.146 +71 A 0.131 +72 G 0.115 +73 K 0.095 +74 W 0.078 +75 G 0.067 +76 K 0.066 +77 V 0.072 +78 I 0.080 +79 N 0.086 +80 F 0.086 +81 L 0.084 +82 K 0.085 +83 E 0.085 +84 E 0.078 +85 K 0.069 +86 L 0.067 +87 L 0.074 +88 S 0.085 +89 D 0.092 +90 G 0.091 +91 M 0.086 +92 L 0.090 +93 V 0.104 +94 E 0.118 +95 A 0.122 +96 R 0.115 +97 E 0.100 +98 A 0.082 +99 S 0.066 +100 E 0.056 +101 E 0.052 +102 D 0.053 +103 L 0.054 +104 L 0.056 +105 V 0.059 +106 V 0.062 +107 H 0.059 +108 T 0.052 +109 R 0.045 +110 R 0.045 +111 Y 0.046 +112 L 0.045 +113 N 0.044 +114 E 0.046 +115 L 0.049 +116 K 0.050 +117 W 0.051 +118 S 0.055 +119 F 0.062 +120 V 0.070 +121 V 0.078 +122 A 0.088 +123 T 0.102 +124 I 0.117 +125 T 0.132 +126 E 0.148 +127 I 0.163 +128 P 0.167 +129 P 0.158 +130 V 0.144 +131 I 0.128 +132 F 0.111 +133 L 0.093 +134 P 0.076 +135 N 0.061 +136 F 0.052 +137 L 0.049 +138 V 0.050 +139 Q 0.055 +140 R 0.067 +141 K 0.082 +142 V 0.095 +143 L 0.106 +144 R 0.123 +145 P 0.146 +146 L 0.154 +147 R 0.141 +148 T 0.122 +149 Q 0.111 +150 T 0.102 +151 G 0.088 +152 G 0.077 +153 T 0.067 +154 I 0.056 +155 M 0.045 +156 A 0.038 +157 G 0.035 +158 K 0.034 +159 L 0.036 +160 A 0.038 +161 V 0.038 +162 E 0.038 +163 R 0.044 +164 G 0.055 +165 W 0.074 +166 A 0.100 +167 I 0.131 +168 N 0.165 +169 V 0.196 +170 G 0.214 +171 G 0.216 +172 G 0.209 +173 F 0.197 +174 H 0.184 +175 H 0.168 +176 C 0.151 +177 S 0.136 +178 S 0.138 +179 D 0.163 +180 R 0.198 +181 G 0.222 +182 G 0.230 +183 G 0.227 +184 F 0.220 +185 C 0.207 +186 A 0.186 +187 Y 0.163 +188 A 0.144 +189 D 0.126 +190 I 0.105 +191 T 0.089 +192 L 0.080 +193 A 0.072 +194 I 0.061 +195 K 0.051 +196 F 0.044 +197 L 0.039 +198 F 0.039 +199 E 0.044 +200 R 0.054 +201 V 0.067 +202 E 0.077 +203 G 0.078 +204 I 0.069 +205 S 0.059 +206 R 0.058 +207 A 0.072 +208 T 0.100 +209 I 0.134 +210 I 0.160 +211 D 0.164 +212 L 0.143 +213 D 0.115 +214 A 0.102 +215 H 0.108 +216 Q 0.121 +217 G 0.129 +218 N 0.131 +219 G 0.129 +220 H 0.122 +221 E 0.110 +222 R 0.098 +223 D 0.091 +224 F 0.089 +225 M 0.090 +226 G 0.087 +227 D 0.077 +228 K 0.063 +229 R 0.052 +230 V 0.052 +231 Y 0.064 +232 I 0.081 +233 M 0.095 +234 D 0.102 +235 V 0.100 +236 Y 0.092 +237 N 0.081 +238 R 0.075 +239 H 0.071 +240 I 0.068 +241 Y 0.068 +242 P 0.078 +243 G 0.093 +244 D 0.109 +245 R 0.122 +246 F 0.133 +247 A 0.139 +248 K 0.137 +249 E 0.130 +250 A 0.121 +251 I 0.110 +252 R 0.103 +253 R 0.109 +254 K 0.129 +255 V 0.151 +256 E 0.166 +257 L 0.176 +258 E 0.180 +259 W 0.179 +260 G 0.168 +261 T 0.148 +262 E 0.124 +263 D 0.101 +264 E 0.082 +265 E 0.072 +266 Y 0.072 +267 L 0.075 +268 E 0.075 +269 K 0.067 +270 V 0.061 +271 E 0.062 +272 R 0.064 +273 N 0.058 +274 V 0.051 +275 R 0.050 +276 R 0.052 +277 S 0.049 +278 L 0.042 +279 Q 0.038 +280 E 0.042 +281 H 0.047 +282 L 0.049 +283 P 0.052 +284 D 0.056 +285 V 0.064 +286 V 0.077 +287 V 0.097 +288 Y 0.117 +289 N 0.130 +290 A 0.128 +291 G 0.120 +292 T 0.118 +293 D 0.124 +294 V 0.126 +295 L 0.120 +296 E 0.114 +297 G 0.116 +298 D 0.128 +299 R 0.143 +300 L 0.155 +301 G 0.164 +302 G 0.163 +303 L 0.154 +304 S 0.144 +305 I 0.139 +306 S 0.135 +307 P 0.127 +308 A 0.119 +309 G 0.114 +310 I 0.108 +311 V 0.095 +312 K 0.081 +313 R 0.073 +314 D 0.068 +315 E 0.061 +316 V 0.050 +317 V 0.039 +318 F 0.033 +319 R 0.031 +320 V 0.031 +321 V 0.033 +322 R 0.036 +323 A 0.043 +324 H 0.056 +325 D 0.069 +326 I 0.073 +327 P 0.071 +328 I 0.072 +329 L 0.081 +330 M 0.092 +331 V 0.096 +332 T 0.095 +333 S 0.096 +334 G 0.104 +335 G 0.117 +336 Y 0.124 +337 Q 0.121 +338 K 0.110 +339 R 0.095 +340 T 0.083 +341 A 0.076 +342 R 0.079 +343 I 0.084 +344 I 0.081 +345 A 0.070 +346 D 0.060 +347 S 0.054 +348 I 0.053 +349 L 0.055 +350 N 0.061 +351 L 0.065 +352 H 0.070 +353 D 0.078 +354 L 0.088 +355 G 0.095 +356 L 0.104 +357 I 0.126 +358 G 0.166 +359 P 0.218 +360 E 0.275 +361 F 0.335 +362 P 0.399 +363 C 0.464 +364 V 0.519 +365 S 0.551 +366 A 0.552 +367 Q 0.538 +368 N 0.526 +369 S 0.528 +370 G 0.539 +371 I 0.550 +372 P 0.556 +373 L 0.554 +374 L 0.551 +375 S 0.553 +376 C 0.550 +377 A 0.520 +378 V 0.467 +379 P 0.425 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000034634.8_ENSMUST00000040404.8_GN:Ly6d_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000034634.8_ENSMUST00000040404.8_GN:Ly6d_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7777cc07e5032b30dc83b0001d0b183c3475c32b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000034634.8_ENSMUST00000040404.8_GN:Ly6d_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,128 @@ +>ENSMUSG00000034634.8|ENSMUST00000040404.8|GN:Ly6d|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.206 +2 K 0.195 +3 T 0.181 +4 A 0.170 +5 L 0.163 +6 L 0.159 +7 V 0.160 +8 L 0.165 +9 L 0.177 +10 V 0.202 +11 L 0.243 +12 A 0.296 +13 V 0.337 +14 A 0.353 +15 T 0.355 +16 S 0.363 +17 P 0.375 +18 A 0.364 +19 W 0.309 +20 A 0.220 +21 L 0.133 +22 R 0.072 +23 C 0.043 +24 H 0.037 +25 V 0.042 +26 C 0.049 +27 T 0.054 +28 N 0.059 +29 S 0.065 +30 A 0.072 +31 N 0.075 +32 C 0.076 +33 K 0.075 +34 N 0.074 +35 P 0.072 +36 Q 0.069 +37 V 0.068 +38 C 0.066 +39 P 0.063 +40 S 0.056 +41 N 0.049 +42 F 0.042 +43 Y 0.034 +44 F 0.025 +45 C 0.020 +46 K 0.022 +47 T 0.031 +48 V 0.045 +49 T 0.063 +50 S 0.082 +51 V 0.100 +52 E 0.114 +53 P 0.119 +54 L 0.119 +55 N 0.117 +56 G 0.116 +57 N 0.111 +58 L 0.101 +59 V 0.081 +60 R 0.059 +61 K 0.045 +62 E 0.045 +63 C 0.053 +64 A 0.064 +65 N 0.073 +66 S 0.082 +67 C 0.100 +68 T 0.132 +69 S 0.182 +70 D 0.245 +71 Y 0.315 +72 S 0.379 +73 Q 0.426 +74 Q 0.450 +75 G 0.446 +76 H 0.417 +77 V 0.370 +78 S 0.321 +79 S 0.278 +80 G 0.241 +81 S 0.199 +82 E 0.152 +83 V 0.107 +84 T 0.072 +85 Q 0.051 +86 C 0.045 +87 C 0.049 +88 Q 0.061 +89 T 0.079 +90 D 0.098 +91 L 0.110 +92 C 0.114 +93 N 0.118 +94 E 0.136 +95 R 0.184 +96 L 0.261 +97 V 0.360 +98 S 0.467 +99 A 0.558 +100 A 0.616 +101 P 0.649 +102 G 0.671 +103 H 0.681 +104 A 0.678 +105 L 0.667 +106 L 0.660 +107 S 0.661 +108 S 0.662 +109 V 0.656 +110 T 0.652 +111 L 0.656 +112 G 0.658 +113 L 0.639 +114 A 0.604 +115 T 0.563 +116 S 0.515 +117 L 0.459 +118 S 0.407 +119 L 0.364 +120 L 0.323 +121 T 0.285 +122 V 0.258 +123 M 0.248 +124 A 0.250 +125 L 0.258 +126 C 0.262 +127 L 0.261 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000034634.8_ENSMUST00000040404.8_GN:Ly6d_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:4.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000034634.8_ENSMUST00000040404.8_GN:Ly6d_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:4.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b15cf7095d346fd14c8f896441509cb6c8caf2a8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000034634.8_ENSMUST00000040404.8_GN:Ly6d_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:4.caid @@ -0,0 +1,132 @@ +>ENSMUSG00000034634.8|ENSMUST00000040404.8|GN:Ly6d|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:4 +1 M 0.273 +2 M 0.259 +3 F 0.241 +4 R 0.225 +5 M 0.205 +6 K 0.181 +7 T 0.161 +8 A 0.150 +9 L 0.148 +10 L 0.153 +11 V 0.162 +12 L 0.172 +13 L 0.184 +14 V 0.204 +15 L 0.237 +16 A 0.282 +17 V 0.318 +18 A 0.333 +19 T 0.338 +20 S 0.353 +21 P 0.371 +22 A 0.364 +23 W 0.309 +24 A 0.221 +25 L 0.133 +26 R 0.072 +27 C 0.043 +28 H 0.036 +29 V 0.041 +30 C 0.049 +31 T 0.054 +32 N 0.059 +33 S 0.065 +34 A 0.072 +35 N 0.075 +36 C 0.075 +37 K 0.075 +38 N 0.073 +39 P 0.071 +40 Q 0.068 +41 V 0.067 +42 C 0.065 +43 P 0.062 +44 S 0.056 +45 N 0.049 +46 F 0.042 +47 Y 0.034 +48 F 0.026 +49 C 0.020 +50 K 0.022 +51 T 0.031 +52 V 0.045 +53 T 0.063 +54 S 0.082 +55 V 0.100 +56 E 0.114 +57 P 0.119 +58 L 0.118 +59 N 0.117 +60 G 0.115 +61 N 0.110 +62 L 0.099 +63 V 0.080 +64 R 0.058 +65 K 0.045 +66 E 0.044 +67 C 0.053 +68 A 0.064 +69 N 0.073 +70 S 0.082 +71 C 0.100 +72 T 0.133 +73 S 0.184 +74 D 0.248 +75 Y 0.317 +76 S 0.381 +77 Q 0.427 +78 Q 0.451 +79 G 0.447 +80 H 0.417 +81 V 0.370 +82 S 0.320 +83 S 0.278 +84 G 0.241 +85 S 0.199 +86 E 0.152 +87 V 0.107 +88 T 0.071 +89 Q 0.051 +90 C 0.045 +91 C 0.049 +92 Q 0.061 +93 T 0.079 +94 D 0.097 +95 L 0.110 +96 C 0.114 +97 N 0.117 +98 E 0.136 +99 R 0.184 +100 L 0.260 +101 V 0.359 +102 S 0.465 +103 A 0.555 +104 A 0.613 +105 P 0.648 +106 G 0.670 +107 H 0.680 +108 A 0.675 +109 L 0.663 +110 L 0.656 +111 S 0.657 +112 S 0.657 +113 V 0.649 +114 T 0.643 +115 L 0.648 +116 G 0.649 +117 L 0.629 +118 A 0.591 +119 T 0.549 +120 S 0.502 +121 L 0.449 +122 S 0.399 +123 L 0.355 +124 L 0.312 +125 T 0.273 +126 V 0.248 +127 M 0.238 +128 A 0.242 +129 L 0.253 +130 C 0.259 +131 L 0.259 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000035234.19_ENSMUST00000055245.13_GN:Abraxas1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000035234.19_ENSMUST00000055245.13_GN:Abraxas1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..19b7d28b6f6445e17eb7aef205cf4150490860f5 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000035234.19_ENSMUST00000055245.13_GN:Abraxas1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,408 @@ +>ENSMUSG00000035234.19|ENSMUST00000055245.13|GN:Abraxas1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.408 +2 E 0.395 +3 G 0.359 +4 E 0.297 +5 S 0.223 +6 T 0.158 +7 L 0.116 +8 G 0.095 +9 V 0.085 +10 L 0.080 +11 S 0.072 +12 G 0.062 +13 F 0.053 +14 V 0.047 +15 L 0.045 +16 G 0.044 +17 A 0.043 +18 L 0.043 +19 T 0.042 +20 F 0.042 +21 H 0.043 +22 H 0.048 +23 L 0.060 +24 N 0.073 +25 T 0.080 +26 D 0.079 +27 S 0.072 +28 D 0.064 +29 T 0.057 +30 E 0.049 +31 G 0.042 +32 F 0.040 +33 L 0.041 +34 L 0.045 +35 G 0.051 +36 E 0.064 +37 M 0.086 +38 K 0.119 +39 G 0.159 +40 E 0.204 +41 A 0.254 +42 K 0.312 +43 N 0.380 +44 S 0.445 +45 I 0.488 +46 T 0.496 +47 D 0.481 +48 S 0.464 +49 Q 0.456 +50 M 0.454 +51 D 0.446 +52 N 0.430 +53 V 0.406 +54 K 0.369 +55 V 0.312 +56 V 0.236 +57 Y 0.159 +58 T 0.102 +59 I 0.070 +60 D 0.058 +61 I 0.057 +62 Q 0.058 +63 K 0.058 +64 Y 0.055 +65 I 0.054 +66 P 0.054 +67 C 0.057 +68 Y 0.062 +69 R 0.068 +70 L 0.075 +71 F 0.081 +72 S 0.084 +73 F 0.088 +74 Y 0.098 +75 N 0.113 +76 S 0.130 +77 L 0.138 +78 G 0.134 +79 E 0.120 +80 V 0.099 +81 N 0.078 +82 E 0.064 +83 H 0.057 +84 A 0.051 +85 L 0.049 +86 K 0.052 +87 K 0.054 +88 V 0.049 +89 L 0.042 +90 S 0.040 +91 N 0.041 +92 V 0.043 +93 R 0.044 +94 K 0.047 +95 T 0.051 +96 V 0.053 +97 V 0.051 +98 G 0.047 +99 W 0.047 +100 Y 0.054 +101 K 0.062 +102 F 0.069 +103 R 0.075 +104 R 0.081 +105 H 0.087 +106 S 0.091 +107 D 0.090 +108 Q 0.084 +109 I 0.072 +110 M 0.059 +111 T 0.048 +112 F 0.041 +113 R 0.036 +114 E 0.033 +115 Q 0.030 +116 L 0.028 +117 L 0.027 +118 H 0.027 +119 R 0.027 +120 N 0.028 +121 L 0.028 +122 Q 0.027 +123 T 0.027 +124 H 0.031 +125 L 0.040 +126 S 0.055 +127 S 0.066 +128 P 0.067 +129 E 0.059 +130 L 0.048 +131 V 0.039 +132 F 0.033 +133 L 0.035 +134 L 0.045 +135 L 0.063 +136 T 0.085 +137 P 0.108 +138 S 0.127 +139 I 0.141 +140 T 0.151 +141 T 0.166 +142 E 0.195 +143 S 0.230 +144 C 0.251 +145 S 0.242 +146 T 0.209 +147 H 0.165 +148 C 0.126 +149 L 0.098 +150 E 0.079 +151 H 0.065 +152 A 0.053 +153 L 0.044 +154 Y 0.040 +155 K 0.043 +156 P 0.053 +157 Q 0.066 +158 R 0.075 +159 G 0.077 +160 L 0.074 +161 F 0.072 +162 H 0.072 +163 R 0.073 +164 V 0.070 +165 P 0.065 +166 L 0.062 +167 V 0.070 +168 V 0.098 +169 T 0.147 +170 N 0.209 +171 L 0.268 +172 G 0.306 +173 M 0.318 +174 S 0.313 +175 D 0.307 +176 Q 0.306 +177 L 0.307 +178 G 0.308 +179 Y 0.316 +180 K 0.343 +181 T 0.378 +182 E 0.403 +183 P 0.408 +184 A 0.395 +185 S 0.370 +186 C 0.344 +187 T 0.324 +188 S 0.299 +189 T 0.256 +190 V 0.208 +191 F 0.174 +192 S 0.163 +193 R 0.175 +194 A 0.197 +195 V 0.212 +196 R 0.217 +197 T 0.219 +198 H 0.220 +199 S 0.223 +200 S 0.230 +201 Q 0.242 +202 F 0.254 +203 F 0.274 +204 N 0.304 +205 E 0.340 +206 D 0.369 +207 G 0.382 +208 S 0.370 +209 L 0.331 +210 K 0.278 +211 E 0.233 +212 V 0.206 +213 H 0.191 +214 K 0.177 +215 I 0.161 +216 N 0.151 +217 E 0.151 +218 M 0.157 +219 Y 0.168 +220 A 0.184 +221 A 0.198 +222 V 0.202 +223 Q 0.201 +224 E 0.207 +225 E 0.216 +226 L 0.217 +227 K 0.214 +228 S 0.219 +229 I 0.224 +230 C 0.224 +231 Q 0.227 +232 K 0.239 +233 V 0.247 +234 E 0.243 +235 Q 0.232 +236 S 0.221 +237 E 0.215 +238 R 0.213 +239 E 0.212 +240 V 0.207 +241 E 0.197 +242 K 0.184 +243 L 0.173 +244 L 0.165 +245 M 0.162 +246 D 0.160 +247 V 0.158 +248 N 0.158 +249 Q 0.161 +250 L 0.165 +251 K 0.166 +252 E 0.166 +253 V 0.165 +254 R 0.168 +255 R 0.184 +256 T 0.217 +257 Q 0.257 +258 Q 0.290 +259 A 0.314 +260 R 0.344 +261 A 0.395 +262 T 0.458 +263 G 0.518 +264 A 0.566 +265 G 0.599 +266 E 0.615 +267 K 0.605 +268 N 0.570 +269 V 0.521 +270 Q 0.472 +271 R 0.431 +272 N 0.396 +273 P 0.366 +274 Q 0.343 +275 E 0.323 +276 N 0.289 +277 I 0.238 +278 L 0.189 +279 L 0.156 +280 C 0.134 +281 Q 0.121 +282 A 0.113 +283 L 0.108 +284 R 0.107 +285 T 0.118 +286 F 0.137 +287 F 0.159 +288 P 0.179 +289 E 0.198 +290 S 0.201 +291 E 0.180 +292 V 0.147 +293 L 0.124 +294 H 0.111 +295 S 0.103 +296 C 0.099 +297 V 0.103 +298 I 0.119 +299 S 0.144 +300 L 0.171 +301 K 0.201 +302 N 0.238 +303 R 0.279 +304 H 0.322 +305 I 0.372 +306 S 0.428 +307 P 0.484 +308 S 0.538 +309 G 0.581 +310 C 0.605 +311 N 0.610 +312 V 0.598 +313 N 0.567 +314 H 0.519 +315 H 0.460 +316 V 0.399 +317 D 0.345 +318 V 0.307 +319 V 0.276 +320 D 0.241 +321 Q 0.205 +322 L 0.178 +323 T 0.166 +324 L 0.162 +325 M 0.162 +326 V 0.158 +327 E 0.156 +328 Y 0.171 +329 V 0.214 +330 Y 0.291 +331 S 0.398 +332 P 0.510 +333 E 0.591 +334 A 0.627 +335 S 0.636 +336 P 0.647 +337 V 0.670 +338 P 0.698 +339 T 0.719 +340 A 0.724 +341 Q 0.714 +342 L 0.697 +343 R 0.678 +344 K 0.647 +345 R 0.609 +346 K 0.602 +347 A 0.652 +348 L 0.720 +349 D 0.760 +350 T 0.772 +351 H 0.776 +352 D 0.783 +353 Q 0.789 +354 G 0.786 +355 S 0.771 +356 V 0.750 +357 K 0.735 +358 R 0.737 +359 P 0.756 +360 R 0.779 +361 L 0.795 +362 L 0.801 +363 E 0.798 +364 T 0.790 +365 E 0.779 +366 S 0.770 +367 R 0.772 +368 P 0.785 +369 S 0.788 +370 V 0.756 +371 A 0.691 +372 A 0.645 +373 S 0.651 +374 R 0.664 +375 S 0.643 +376 R 0.631 +377 H 0.673 +378 Q 0.743 +379 D 0.792 +380 K 0.809 +381 A 0.809 +382 S 0.801 +383 S 0.791 +384 S 0.782 +385 S 0.772 +386 L 0.762 +387 D 0.755 +388 I 0.749 +389 D 0.736 +390 I 0.718 +391 E 0.706 +392 M 0.711 +393 G 0.727 +394 S 0.744 +395 P 0.757 +396 E 0.764 +397 D 0.759 +398 D 0.740 +399 A 0.710 +400 D 0.679 +401 Y 0.658 +402 P 0.648 +403 R 0.650 +404 S 0.652 +405 P 0.630 +406 T 0.574 +407 F 0.518 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000035234.19_ENSMUST00000055245.13_GN:Abraxas1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:15.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000035234.19_ENSMUST00000055245.13_GN:Abraxas1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:15.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..97085d26ccfee44f5e4821176863a967073fc2c4 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000035234.19_ENSMUST00000055245.13_GN:Abraxas1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:15.caid @@ -0,0 +1,423 @@ +>ENSMUSG00000035234.19|ENSMUST00000055245.13|GN:Abraxas1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:15 +1 M 0.379 +2 L 0.416 +3 R 0.477 +4 D 0.543 +5 S 0.598 +6 G 0.638 +7 C 0.667 +8 G 0.689 +9 G 0.700 +10 S 0.700 +11 D 0.701 +12 R 0.704 +13 G 0.702 +14 G 0.687 +15 S 0.660 +16 M 0.626 +17 E 0.574 +18 G 0.490 +19 E 0.377 +20 S 0.265 +21 T 0.179 +22 L 0.128 +23 G 0.103 +24 V 0.092 +25 L 0.084 +26 S 0.076 +27 G 0.065 +28 F 0.055 +29 V 0.049 +30 L 0.047 +31 G 0.046 +32 A 0.044 +33 L 0.043 +34 T 0.042 +35 F 0.041 +36 H 0.042 +37 H 0.048 +38 L 0.060 +39 N 0.073 +40 T 0.080 +41 D 0.077 +42 S 0.070 +43 D 0.063 +44 T 0.056 +45 E 0.048 +46 G 0.042 +47 F 0.040 +48 L 0.042 +49 L 0.046 +50 G 0.053 +51 E 0.067 +52 M 0.091 +53 K 0.125 +54 G 0.165 +55 E 0.210 +56 A 0.262 +57 K 0.323 +58 N 0.389 +59 S 0.453 +60 I 0.494 +61 T 0.502 +62 D 0.487 +63 S 0.468 +64 Q 0.459 +65 M 0.454 +66 D 0.444 +67 N 0.425 +68 V 0.397 +69 K 0.358 +70 V 0.302 +71 V 0.229 +72 Y 0.154 +73 T 0.099 +74 I 0.068 +75 D 0.056 +76 I 0.054 +77 Q 0.056 +78 K 0.055 +79 Y 0.053 +80 I 0.051 +81 P 0.051 +82 C 0.054 +83 Y 0.059 +84 R 0.064 +85 L 0.070 +86 F 0.076 +87 S 0.080 +88 F 0.085 +89 Y 0.096 +90 N 0.112 +91 S 0.127 +92 L 0.135 +93 G 0.131 +94 E 0.117 +95 V 0.097 +96 N 0.074 +97 E 0.056 +98 H 0.047 +99 A 0.044 +100 L 0.045 +101 K 0.051 +102 K 0.054 +103 V 0.049 +104 L 0.041 +105 S 0.039 +106 N 0.040 +107 V 0.041 +108 R 0.043 +109 K 0.046 +110 T 0.050 +111 V 0.052 +112 V 0.050 +113 G 0.046 +114 W 0.047 +115 Y 0.053 +116 K 0.062 +117 F 0.068 +118 R 0.074 +119 R 0.081 +120 H 0.088 +121 S 0.092 +122 D 0.092 +123 Q 0.086 +124 I 0.075 +125 M 0.061 +126 T 0.050 +127 F 0.042 +128 R 0.038 +129 E 0.034 +130 Q 0.031 +131 L 0.029 +132 L 0.028 +133 H 0.028 +134 R 0.028 +135 N 0.029 +136 L 0.029 +137 Q 0.028 +138 T 0.028 +139 H 0.032 +140 L 0.042 +141 S 0.057 +142 S 0.068 +143 P 0.069 +144 E 0.060 +145 L 0.049 +146 V 0.039 +147 F 0.033 +148 L 0.034 +149 L 0.044 +150 L 0.062 +151 T 0.085 +152 P 0.108 +153 S 0.127 +154 I 0.140 +155 T 0.149 +156 T 0.163 +157 E 0.191 +158 S 0.227 +159 C 0.248 +160 S 0.240 +161 T 0.209 +162 H 0.167 +163 C 0.127 +164 L 0.099 +165 E 0.080 +166 H 0.066 +167 A 0.054 +168 L 0.045 +169 Y 0.040 +170 K 0.043 +171 P 0.054 +172 Q 0.067 +173 R 0.076 +174 G 0.078 +175 L 0.076 +176 F 0.074 +177 H 0.074 +178 R 0.073 +179 V 0.071 +180 P 0.065 +181 L 0.062 +182 V 0.070 +183 V 0.098 +184 T 0.146 +185 N 0.207 +186 L 0.263 +187 G 0.299 +188 M 0.310 +189 S 0.306 +190 D 0.300 +191 Q 0.298 +192 L 0.297 +193 G 0.297 +194 Y 0.306 +195 K 0.333 +196 T 0.368 +197 E 0.392 +198 P 0.396 +199 A 0.383 +200 S 0.358 +201 C 0.333 +202 T 0.314 +203 S 0.290 +204 T 0.249 +205 V 0.202 +206 F 0.169 +207 S 0.160 +208 R 0.173 +209 A 0.195 +210 V 0.208 +211 R 0.212 +212 T 0.214 +213 H 0.215 +214 S 0.218 +215 S 0.226 +216 Q 0.238 +217 F 0.250 +218 F 0.269 +219 N 0.297 +220 E 0.330 +221 D 0.354 +222 G 0.364 +223 S 0.352 +224 L 0.315 +225 K 0.264 +226 E 0.222 +227 V 0.196 +228 H 0.182 +229 K 0.170 +230 I 0.157 +231 N 0.149 +232 E 0.149 +233 M 0.157 +234 Y 0.168 +235 A 0.184 +236 A 0.197 +237 V 0.201 +238 Q 0.200 +239 E 0.207 +240 E 0.216 +241 L 0.217 +242 K 0.216 +243 S 0.221 +244 I 0.226 +245 C 0.225 +246 Q 0.228 +247 K 0.240 +248 V 0.249 +249 E 0.245 +250 Q 0.233 +251 S 0.223 +252 E 0.216 +253 R 0.215 +254 E 0.214 +255 V 0.210 +256 E 0.199 +257 K 0.185 +258 L 0.173 +259 L 0.164 +260 M 0.161 +261 D 0.159 +262 V 0.157 +263 N 0.157 +264 Q 0.161 +265 L 0.166 +266 K 0.168 +267 E 0.168 +268 V 0.167 +269 R 0.171 +270 R 0.186 +271 T 0.218 +272 Q 0.258 +273 Q 0.292 +274 A 0.317 +275 R 0.348 +276 A 0.398 +277 T 0.460 +278 G 0.518 +279 A 0.564 +280 G 0.597 +281 E 0.612 +282 K 0.603 +283 N 0.569 +284 V 0.520 +285 Q 0.470 +286 R 0.428 +287 N 0.392 +288 P 0.362 +289 Q 0.339 +290 E 0.317 +291 N 0.282 +292 I 0.232 +293 L 0.185 +294 L 0.153 +295 C 0.135 +296 Q 0.123 +297 A 0.117 +298 L 0.112 +299 R 0.111 +300 T 0.121 +301 F 0.141 +302 F 0.163 +303 P 0.186 +304 E 0.206 +305 S 0.211 +306 E 0.187 +307 V 0.151 +308 L 0.124 +309 H 0.111 +310 S 0.103 +311 C 0.098 +312 V 0.102 +313 I 0.118 +314 S 0.143 +315 L 0.170 +316 K 0.200 +317 N 0.236 +318 R 0.277 +319 H 0.321 +320 I 0.371 +321 S 0.429 +322 P 0.486 +323 S 0.540 +324 G 0.582 +325 C 0.604 +326 N 0.608 +327 V 0.596 +328 N 0.567 +329 H 0.520 +330 H 0.461 +331 V 0.401 +332 D 0.347 +333 V 0.308 +334 V 0.278 +335 D 0.243 +336 Q 0.206 +337 L 0.178 +338 T 0.165 +339 L 0.160 +340 M 0.159 +341 V 0.154 +342 E 0.153 +343 Y 0.168 +344 V 0.211 +345 Y 0.288 +346 S 0.395 +347 P 0.507 +348 E 0.589 +349 A 0.625 +350 S 0.635 +351 P 0.647 +352 V 0.670 +353 P 0.698 +354 T 0.719 +355 A 0.724 +356 Q 0.714 +357 L 0.697 +358 R 0.678 +359 K 0.647 +360 R 0.610 +361 K 0.603 +362 A 0.652 +363 L 0.720 +364 D 0.761 +365 T 0.773 +366 H 0.777 +367 D 0.784 +368 Q 0.789 +369 G 0.786 +370 S 0.772 +371 V 0.752 +372 K 0.737 +373 R 0.739 +374 P 0.757 +375 R 0.779 +376 L 0.795 +377 L 0.800 +378 E 0.797 +379 T 0.789 +380 E 0.778 +381 S 0.769 +382 R 0.772 +383 P 0.784 +384 S 0.788 +385 V 0.756 +386 A 0.690 +387 A 0.645 +388 S 0.651 +389 R 0.664 +390 S 0.642 +391 R 0.629 +392 H 0.672 +393 Q 0.743 +394 D 0.793 +395 K 0.812 +396 A 0.811 +397 S 0.802 +398 S 0.793 +399 S 0.784 +400 S 0.773 +401 L 0.763 +402 D 0.757 +403 I 0.751 +404 D 0.738 +405 I 0.719 +406 E 0.707 +407 M 0.712 +408 G 0.729 +409 S 0.746 +410 P 0.759 +411 E 0.766 +412 D 0.762 +413 D 0.742 +414 A 0.712 +415 D 0.682 +416 Y 0.661 +417 P 0.653 +418 R 0.656 +419 S 0.658 +420 P 0.635 +421 T 0.577 +422 F 0.522 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000035686.9_ENSMUST00000043077.8_GN:Thrsp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000035686.9_ENSMUST00000043077.8_GN:Thrsp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..defa98958c9ae5a883f2953018e9b62aea61661f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000035686.9_ENSMUST00000043077.8_GN:Thrsp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,151 @@ +>ENSMUSG00000035686.9|ENSMUST00000043077.8|GN:Thrsp|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.290 +2 Q 0.276 +3 V 0.249 +4 L 0.216 +5 T 0.190 +6 K 0.176 +7 R 0.172 +8 Y 0.170 +9 P 0.158 +10 K 0.136 +11 N 0.113 +12 C 0.093 +13 L 0.075 +14 L 0.059 +15 T 0.048 +16 V 0.044 +17 M 0.043 +18 D 0.045 +19 R 0.048 +20 Y 0.050 +21 S 0.048 +22 A 0.045 +23 V 0.045 +24 V 0.052 +25 R 0.063 +26 N 0.072 +27 M 0.074 +28 E 0.077 +29 Q 0.087 +30 V 0.104 +31 V 0.120 +32 M 0.136 +33 I 0.142 +34 P 0.133 +35 S 0.120 +36 L 0.117 +37 L 0.133 +38 R 0.174 +39 D 0.241 +40 V 0.322 +41 Q 0.395 +42 L 0.448 +43 S 0.495 +44 G 0.547 +45 P 0.610 +46 G 0.670 +47 G 0.706 +48 S 0.707 +49 V 0.675 +50 Q 0.615 +51 D 0.537 +52 G 0.456 +53 A 0.373 +54 P 0.285 +55 D 0.203 +56 L 0.140 +57 Y 0.096 +58 T 0.065 +59 Y 0.049 +60 F 0.046 +61 T 0.054 +62 M 0.063 +63 L 0.065 +64 K 0.062 +65 S 0.060 +66 I 0.057 +67 C 0.056 +68 V 0.062 +69 E 0.074 +70 V 0.087 +71 D 0.100 +72 H 0.120 +73 G 0.146 +74 L 0.168 +75 L 0.177 +76 P 0.169 +77 R 0.151 +78 E 0.133 +79 E 0.123 +80 W 0.130 +81 Q 0.156 +82 A 0.201 +83 K 0.265 +84 V 0.353 +85 A 0.462 +86 G 0.563 +87 N 0.628 +88 E 0.659 +89 T 0.670 +90 S 0.672 +91 E 0.669 +92 A 0.669 +93 E 0.672 +94 N 0.664 +95 D 0.627 +96 A 0.572 +97 A 0.537 +98 E 0.548 +99 T 0.575 +100 E 0.584 +101 E 0.566 +102 A 0.531 +103 E 0.493 +104 E 0.468 +105 D 0.467 +106 R 0.474 +107 I 0.466 +108 S 0.436 +109 E 0.394 +110 E 0.345 +111 L 0.286 +112 D 0.217 +113 L 0.157 +114 E 0.118 +115 A 0.099 +116 Q 0.090 +117 F 0.085 +118 H 0.081 +119 L 0.078 +120 H 0.078 +121 F 0.079 +122 C 0.082 +123 S 0.088 +124 L 0.090 +125 H 0.083 +126 H 0.074 +127 I 0.072 +128 L 0.074 +129 T 0.075 +130 H 0.077 +131 L 0.082 +132 T 0.088 +133 R 0.088 +134 K 0.082 +135 A 0.075 +136 Q 0.070 +137 E 0.069 +138 V 0.073 +139 T 0.081 +140 R 0.085 +141 K 0.082 +142 Y 0.082 +143 Q 0.092 +144 E 0.116 +145 M 0.157 +146 T 0.209 +147 G 0.255 +148 Q 0.277 +149 V 0.271 +150 L 0.257 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000035686.9_ENSMUST00000043077.8_GN:Thrsp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000035686.9_ENSMUST00000043077.8_GN:Thrsp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..12f86576af314c493b6eae686e98e15381f81eda --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000035686.9_ENSMUST00000043077.8_GN:Thrsp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid @@ -0,0 +1,183 @@ +>ENSMUSG00000035686.9|ENSMUST00000043077.8|GN:Thrsp|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:32 +1 M 0.440 +2 V 0.466 +3 G 0.489 +4 L 0.485 +5 W 0.466 +6 H 0.454 +7 P 0.452 +8 V 0.443 +9 N 0.424 +10 L 0.408 +11 L 0.403 +12 S 0.403 +13 A 0.403 +14 Q 0.412 +15 K 0.438 +16 P 0.482 +17 R 0.527 +18 N 0.542 +19 S 0.507 +20 A 0.434 +21 G 0.354 +22 A 0.286 +23 V 0.232 +24 C 0.193 +25 R 0.172 +26 T 0.169 +27 L 0.170 +28 R 0.162 +29 K 0.155 +30 E 0.161 +31 A 0.175 +32 T 0.182 +33 M 0.176 +34 Q 0.161 +35 V 0.140 +36 L 0.116 +37 T 0.099 +38 K 0.096 +39 R 0.107 +40 Y 0.120 +41 P 0.122 +42 K 0.109 +43 N 0.090 +44 C 0.072 +45 L 0.057 +46 L 0.045 +47 T 0.039 +48 V 0.038 +49 M 0.039 +50 D 0.040 +51 R 0.041 +52 Y 0.044 +53 S 0.047 +54 A 0.049 +55 V 0.050 +56 V 0.054 +57 R 0.061 +58 N 0.068 +59 M 0.070 +60 E 0.072 +61 Q 0.080 +62 V 0.090 +63 V 0.101 +64 M 0.113 +65 I 0.120 +66 P 0.118 +67 S 0.114 +68 L 0.117 +69 L 0.133 +70 R 0.169 +71 D 0.226 +72 V 0.292 +73 Q 0.354 +74 L 0.410 +75 S 0.465 +76 G 0.524 +77 P 0.587 +78 G 0.646 +79 G 0.683 +80 S 0.686 +81 V 0.651 +82 Q 0.586 +83 D 0.508 +84 G 0.432 +85 A 0.354 +86 P 0.272 +87 D 0.196 +88 L 0.139 +89 Y 0.098 +90 T 0.067 +91 Y 0.048 +92 F 0.045 +93 T 0.051 +94 M 0.057 +95 L 0.056 +96 K 0.052 +97 S 0.050 +98 I 0.046 +99 C 0.044 +100 V 0.047 +101 E 0.058 +102 V 0.072 +103 D 0.091 +104 H 0.121 +105 G 0.155 +106 L 0.181 +107 L 0.187 +108 P 0.176 +109 R 0.158 +110 E 0.141 +111 E 0.134 +112 W 0.142 +113 Q 0.170 +114 A 0.220 +115 K 0.288 +116 V 0.373 +117 A 0.471 +118 G 0.562 +119 N 0.620 +120 E 0.649 +121 T 0.661 +122 S 0.663 +123 E 0.659 +124 A 0.657 +125 E 0.662 +126 N 0.665 +127 D 0.659 +128 A 0.648 +129 A 0.638 +130 E 0.623 +131 T 0.597 +132 E 0.558 +133 E 0.514 +134 A 0.470 +135 E 0.430 +136 E 0.408 +137 D 0.408 +138 R 0.419 +139 I 0.421 +140 S 0.402 +141 E 0.363 +142 E 0.313 +143 L 0.255 +144 D 0.197 +145 L 0.148 +146 E 0.117 +147 A 0.099 +148 Q 0.088 +149 F 0.082 +150 H 0.080 +151 L 0.080 +152 H 0.081 +153 F 0.085 +154 C 0.092 +155 S 0.099 +156 L 0.099 +157 H 0.089 +158 H 0.079 +159 I 0.077 +160 L 0.078 +161 T 0.077 +162 H 0.078 +163 L 0.084 +164 T 0.090 +165 R 0.088 +166 K 0.077 +167 A 0.064 +168 Q 0.054 +169 E 0.050 +170 V 0.053 +171 T 0.063 +172 R 0.070 +173 K 0.069 +174 Y 0.067 +175 Q 0.076 +176 E 0.100 +177 M 0.140 +178 T 0.191 +179 G 0.234 +180 Q 0.252 +181 V 0.246 +182 L 0.233 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036256.14_ENSMUST00000163898.6_GN:Igfbp7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036256.14_ENSMUST00000163898.6_GN:Igfbp7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1472979f472c9fa4903d3288d20f53b69990be61 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036256.14_ENSMUST00000163898.6_GN:Igfbp7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,313 @@ +>ENSMUSG00000036256.14|ENSMUST00000163898.6|GN:Igfbp7|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.441 +2 E 0.456 +3 R 0.474 +4 P 0.469 +5 P 0.431 +6 R 0.393 +7 A 0.409 +8 L 0.466 +9 L 0.505 +10 L 0.527 +11 G 0.562 +12 A 0.582 +13 A 0.550 +14 G 0.495 +15 L 0.461 +16 L 0.440 +17 L 0.413 +18 L 0.399 +19 L 0.426 +20 L 0.485 +21 P 0.548 +22 L 0.602 +23 S 0.638 +24 S 0.659 +25 S 0.667 +26 S 0.667 +27 S 0.655 +28 S 0.628 +29 D 0.574 +30 A 0.491 +31 C 0.398 +32 G 0.320 +33 P 0.263 +34 C 0.218 +35 V 0.186 +36 P 0.170 +37 A 0.168 +38 S 0.175 +39 C 0.186 +40 P 0.200 +41 A 0.213 +42 L 0.220 +43 P 0.217 +44 R 0.205 +45 L 0.192 +46 G 0.183 +47 C 0.178 +48 P 0.179 +49 L 0.188 +50 G 0.204 +51 E 0.226 +52 T 0.255 +53 R 0.290 +54 D 0.308 +55 A 0.286 +56 C 0.241 +57 G 0.197 +58 C 0.163 +59 C 0.146 +60 P 0.146 +61 V 0.155 +62 C 0.167 +63 A 0.180 +64 R 0.192 +65 G 0.192 +66 E 0.180 +67 G 0.175 +68 E 0.184 +69 P 0.198 +70 C 0.212 +71 G 0.237 +72 G 0.273 +73 G 0.309 +74 A 0.326 +75 A 0.314 +76 G 0.278 +77 R 0.234 +78 G 0.200 +79 H 0.190 +80 C 0.201 +81 A 0.206 +82 P 0.188 +83 G 0.160 +84 M 0.143 +85 E 0.143 +86 C 0.162 +87 V 0.207 +88 K 0.279 +89 S 0.364 +90 R 0.438 +91 K 0.497 +92 R 0.544 +93 R 0.585 +94 K 0.619 +95 G 0.649 +96 K 0.674 +97 A 0.692 +98 G 0.699 +99 A 0.696 +100 A 0.686 +101 A 0.663 +102 G 0.627 +103 G 0.578 +104 P 0.510 +105 A 0.419 +106 T 0.311 +107 L 0.212 +108 A 0.143 +109 V 0.108 +110 C 0.093 +111 V 0.091 +112 C 0.097 +113 K 0.105 +114 S 0.108 +115 R 0.106 +116 Y 0.100 +117 P 0.092 +118 V 0.082 +119 C 0.068 +120 G 0.058 +121 S 0.060 +122 N 0.079 +123 G 0.107 +124 I 0.127 +125 T 0.130 +126 Y 0.120 +127 P 0.104 +128 S 0.090 +129 G 0.082 +130 C 0.078 +131 Q 0.072 +132 L 0.068 +133 R 0.068 +134 A 0.070 +135 A 0.073 +136 S 0.080 +137 L 0.090 +138 R 0.103 +139 A 0.115 +140 E 0.124 +141 S 0.136 +142 R 0.155 +143 G 0.177 +144 E 0.189 +145 K 0.184 +146 A 0.162 +147 I 0.130 +148 T 0.098 +149 Q 0.079 +150 V 0.078 +151 S 0.091 +152 K 0.111 +153 G 0.137 +154 T 0.181 +155 C 0.262 +156 E 0.378 +157 Q 0.494 +158 G 0.575 +159 S 0.618 +160 L 0.638 +161 I 0.650 +162 W 0.658 +163 D 0.659 +164 T 0.654 +165 Q 0.651 +166 P 0.661 +167 A 0.679 +168 Q 0.689 +169 R 0.679 +170 S 0.653 +171 H 0.616 +172 N 0.570 +173 P 0.517 +174 Q 0.485 +175 V 0.492 +176 E 0.508 +177 N 0.496 +178 R 0.463 +179 C 0.432 +180 F 0.413 +181 R 0.404 +182 D 0.402 +183 K 0.399 +184 H 0.393 +185 S 0.382 +186 R 0.355 +187 E 0.307 +188 Q 0.246 +189 G 0.191 +190 P 0.153 +191 S 0.129 +192 I 0.113 +193 V 0.103 +194 T 0.097 +195 P 0.094 +196 P 0.093 +197 K 0.092 +198 D 0.085 +199 I 0.070 +200 W 0.053 +201 N 0.043 +202 V 0.041 +203 T 0.046 +204 G 0.054 +205 A 0.060 +206 K 0.061 +207 V 0.058 +208 F 0.051 +209 L 0.047 +210 S 0.045 +211 C 0.045 +212 E 0.046 +213 V 0.052 +214 I 0.062 +215 G 0.068 +216 I 0.063 +217 P 0.056 +218 T 0.053 +219 P 0.050 +220 V 0.044 +221 L 0.035 +222 I 0.027 +223 W 0.024 +224 N 0.028 +225 K 0.039 +226 V 0.057 +227 K 0.082 +228 R 0.113 +229 D 0.147 +230 H 0.178 +231 S 0.195 +232 G 0.195 +233 V 0.182 +234 Q 0.158 +235 R 0.131 +236 T 0.109 +237 E 0.095 +238 L 0.094 +239 L 0.109 +240 P 0.138 +241 G 0.159 +242 D 0.153 +243 R 0.124 +244 E 0.091 +245 N 0.068 +246 L 0.060 +247 A 0.062 +248 I 0.066 +249 Q 0.072 +250 T 0.084 +251 R 0.105 +252 G 0.128 +253 G 0.143 +254 P 0.140 +255 E 0.122 +256 K 0.096 +257 H 0.072 +258 E 0.058 +259 V 0.050 +260 T 0.042 +261 G 0.036 +262 W 0.034 +263 V 0.034 +264 L 0.033 +265 V 0.030 +266 S 0.028 +267 P 0.034 +268 L 0.044 +269 S 0.054 +270 K 0.063 +271 E 0.073 +272 D 0.087 +273 A 0.096 +274 G 0.089 +275 E 0.068 +276 Y 0.046 +277 E 0.031 +278 C 0.027 +279 H 0.027 +280 A 0.029 +281 S 0.033 +282 N 0.042 +283 S 0.056 +284 Q 0.067 +285 G 0.072 +286 Q 0.072 +287 A 0.069 +288 S 0.063 +289 A 0.057 +290 A 0.053 +291 A 0.049 +292 K 0.045 +293 I 0.046 +294 T 0.059 +295 V 0.096 +296 V 0.162 +297 D 0.252 +298 A 0.347 +299 L 0.429 +300 H 0.493 +301 E 0.545 +302 I 0.587 +303 P 0.618 +304 L 0.641 +305 K 0.660 +306 K 0.675 +307 G 0.689 +308 E 0.703 +309 G 0.705 +310 A 0.677 +311 Q 0.616 +312 L 0.560 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036256.14_ENSMUST00000163898.6_GN:Igfbp7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036256.14_ENSMUST00000163898.6_GN:Igfbp7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5cdda8c14c512fcd69899ee60ba8a780b5af1137 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036256.14_ENSMUST00000163898.6_GN:Igfbp7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid @@ -0,0 +1,314 @@ +>ENSMUSG00000036256.14|ENSMUST00000163898.6|GN:Igfbp7|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:1 +1 M 0.439 +2 M 0.460 +3 E 0.491 +4 R 0.515 +5 P 0.519 +6 P 0.507 +7 R 0.515 +8 A 0.552 +9 L 0.574 +10 L 0.552 +11 L 0.526 +12 G 0.515 +13 A 0.481 +14 A 0.419 +15 G 0.383 +16 L 0.380 +17 L 0.362 +18 L 0.331 +19 L 0.337 +20 L 0.397 +21 L 0.477 +22 P 0.547 +23 L 0.601 +24 S 0.638 +25 S 0.658 +26 S 0.665 +27 S 0.665 +28 S 0.654 +29 S 0.627 +30 D 0.573 +31 A 0.491 +32 C 0.400 +33 G 0.322 +34 P 0.263 +35 C 0.218 +36 V 0.185 +37 P 0.169 +38 A 0.168 +39 S 0.175 +40 C 0.186 +41 P 0.200 +42 A 0.213 +43 L 0.220 +44 P 0.216 +45 R 0.204 +46 L 0.192 +47 G 0.183 +48 C 0.178 +49 P 0.179 +50 L 0.188 +51 G 0.204 +52 E 0.225 +53 T 0.254 +54 R 0.290 +55 D 0.308 +56 A 0.286 +57 C 0.241 +58 G 0.196 +59 C 0.162 +60 C 0.145 +61 P 0.145 +62 V 0.154 +63 C 0.166 +64 A 0.179 +65 R 0.191 +66 G 0.191 +67 E 0.180 +68 G 0.174 +69 E 0.183 +70 P 0.197 +71 C 0.212 +72 G 0.237 +73 G 0.273 +74 G 0.308 +75 A 0.325 +76 A 0.314 +77 G 0.278 +78 R 0.233 +79 G 0.199 +80 H 0.189 +81 C 0.200 +82 A 0.205 +83 P 0.187 +84 G 0.159 +85 M 0.142 +86 E 0.142 +87 C 0.162 +88 V 0.206 +89 K 0.279 +90 S 0.363 +91 R 0.437 +92 K 0.495 +93 R 0.543 +94 R 0.584 +95 K 0.618 +96 G 0.648 +97 K 0.673 +98 A 0.691 +99 G 0.698 +100 A 0.696 +101 A 0.685 +102 A 0.663 +103 G 0.626 +104 G 0.576 +105 P 0.508 +106 A 0.417 +107 T 0.310 +108 L 0.211 +109 A 0.143 +110 V 0.107 +111 C 0.093 +112 V 0.091 +113 C 0.097 +114 K 0.105 +115 S 0.108 +116 R 0.106 +117 Y 0.100 +118 P 0.092 +119 V 0.082 +120 C 0.069 +121 G 0.058 +122 S 0.060 +123 N 0.079 +124 G 0.107 +125 I 0.127 +126 T 0.131 +127 Y 0.120 +128 P 0.104 +129 S 0.089 +130 G 0.082 +131 C 0.078 +132 Q 0.072 +133 L 0.068 +134 R 0.068 +135 A 0.070 +136 A 0.073 +137 S 0.079 +138 L 0.090 +139 R 0.103 +140 A 0.115 +141 E 0.124 +142 S 0.135 +143 R 0.155 +144 G 0.177 +145 E 0.189 +146 K 0.184 +147 A 0.162 +148 I 0.130 +149 T 0.097 +150 Q 0.079 +151 V 0.078 +152 S 0.091 +153 K 0.111 +154 G 0.137 +155 T 0.181 +156 C 0.262 +157 E 0.378 +158 Q 0.494 +159 G 0.575 +160 S 0.618 +161 L 0.638 +162 I 0.649 +163 W 0.658 +164 D 0.659 +165 T 0.654 +166 Q 0.651 +167 P 0.661 +168 A 0.679 +169 Q 0.689 +170 R 0.679 +171 S 0.653 +172 H 0.616 +173 N 0.570 +174 P 0.517 +175 Q 0.485 +176 V 0.492 +177 E 0.508 +178 N 0.496 +179 R 0.462 +180 C 0.432 +181 F 0.413 +182 R 0.404 +183 D 0.402 +184 K 0.398 +185 H 0.392 +186 S 0.380 +187 R 0.354 +188 E 0.306 +189 Q 0.246 +190 G 0.191 +191 P 0.153 +192 S 0.129 +193 I 0.113 +194 V 0.103 +195 T 0.098 +196 P 0.094 +197 P 0.093 +198 K 0.092 +199 D 0.085 +200 I 0.070 +201 W 0.053 +202 N 0.042 +203 V 0.041 +204 T 0.046 +205 G 0.054 +206 A 0.060 +207 K 0.061 +208 V 0.057 +209 F 0.051 +210 L 0.047 +211 S 0.045 +212 C 0.045 +213 E 0.046 +214 V 0.052 +215 I 0.062 +216 G 0.067 +217 I 0.063 +218 P 0.056 +219 T 0.053 +220 P 0.050 +221 V 0.044 +222 L 0.035 +223 I 0.027 +224 W 0.024 +225 N 0.028 +226 K 0.039 +227 V 0.057 +228 K 0.082 +229 R 0.112 +230 D 0.147 +231 H 0.178 +232 S 0.195 +233 G 0.195 +234 V 0.181 +235 Q 0.158 +236 R 0.131 +237 T 0.108 +238 E 0.095 +239 L 0.094 +240 L 0.110 +241 P 0.138 +242 G 0.159 +243 D 0.153 +244 R 0.124 +245 E 0.091 +246 N 0.068 +247 L 0.060 +248 A 0.061 +249 I 0.066 +250 Q 0.072 +251 T 0.084 +252 R 0.105 +253 G 0.128 +254 G 0.142 +255 P 0.140 +256 E 0.122 +257 K 0.095 +258 H 0.072 +259 E 0.058 +260 V 0.050 +261 T 0.042 +262 G 0.036 +263 W 0.034 +264 V 0.034 +265 L 0.033 +266 V 0.030 +267 S 0.028 +268 P 0.034 +269 L 0.044 +270 S 0.054 +271 K 0.063 +272 E 0.073 +273 D 0.087 +274 A 0.096 +275 G 0.089 +276 E 0.068 +277 Y 0.046 +278 E 0.031 +279 C 0.027 +280 H 0.027 +281 A 0.029 +282 S 0.033 +283 N 0.042 +284 S 0.056 +285 Q 0.067 +286 G 0.072 +287 Q 0.072 +288 A 0.069 +289 S 0.063 +290 A 0.058 +291 A 0.053 +292 A 0.049 +293 K 0.045 +294 I 0.046 +295 T 0.059 +296 V 0.096 +297 V 0.162 +298 D 0.252 +299 A 0.348 +300 L 0.430 +301 H 0.493 +302 E 0.545 +303 I 0.587 +304 P 0.618 +305 L 0.641 +306 K 0.659 +307 K 0.674 +308 G 0.689 +309 E 0.702 +310 G 0.705 +311 A 0.676 +312 Q 0.616 +313 L 0.560 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036309.15_ENSMUST00000109072.2_GN:Skp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036309.15_ENSMUST00000109072.2_GN:Skp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7dba4b019af6890f75683be4ee0c42848465e4bd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036309.15_ENSMUST00000109072.2_GN:Skp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,164 @@ +>ENSMUSG00000036309.15|ENSMUST00000109072.2|GN:Skp1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.223 +2 P 0.176 +3 T 0.115 +4 I 0.067 +5 K 0.040 +6 L 0.029 +7 Q 0.030 +8 S 0.041 +9 S 0.061 +10 D 0.082 +11 G 0.089 +12 E 0.078 +13 I 0.059 +14 F 0.045 +15 E 0.039 +16 V 0.036 +17 D 0.032 +18 V 0.028 +19 E 0.028 +20 I 0.031 +21 A 0.032 +22 K 0.031 +23 Q 0.030 +24 S 0.030 +25 V 0.031 +26 T 0.036 +27 I 0.050 +28 K 0.067 +29 T 0.077 +30 M 0.077 +31 L 0.079 +32 E 0.093 +33 D 0.128 +34 L 0.186 +35 G 0.255 +36 M 0.313 +37 D 0.352 +38 D 0.373 +39 E 0.379 +40 G 0.368 +41 D 0.338 +42 D 0.293 +43 D 0.238 +44 P 0.184 +45 V 0.144 +46 P 0.123 +47 L 0.116 +48 P 0.111 +49 N 0.103 +50 V 0.096 +51 N 0.086 +52 A 0.073 +53 A 0.059 +54 I 0.052 +55 L 0.050 +56 K 0.047 +57 K 0.045 +58 V 0.045 +59 I 0.043 +60 Q 0.038 +61 W 0.035 +62 C 0.035 +63 T 0.037 +64 H 0.045 +65 H 0.063 +66 K 0.090 +67 D 0.130 +68 D 0.187 +69 P 0.260 +70 P 0.340 +71 P 0.413 +72 P 0.472 +73 E 0.515 +74 D 0.540 +75 D 0.538 +76 E 0.520 +77 N 0.506 +78 K 0.504 +79 E 0.507 +80 K 0.507 +81 R 0.485 +82 T 0.426 +83 D 0.335 +84 D 0.243 +85 I 0.169 +86 P 0.113 +87 V 0.071 +88 W 0.049 +89 D 0.047 +90 Q 0.056 +91 E 0.064 +92 F 0.065 +93 L 0.064 +94 K 0.065 +95 V 0.066 +96 D 0.064 +97 Q 0.058 +98 G 0.054 +99 T 0.052 +100 L 0.050 +101 F 0.049 +102 E 0.049 +103 L 0.049 +104 I 0.047 +105 L 0.045 +106 A 0.045 +107 A 0.046 +108 N 0.048 +109 Y 0.054 +110 L 0.065 +111 D 0.074 +112 I 0.077 +113 K 0.074 +114 G 0.069 +115 L 0.067 +116 L 0.067 +117 D 0.068 +118 V 0.072 +119 T 0.080 +120 C 0.085 +121 K 0.082 +122 T 0.079 +123 V 0.084 +124 A 0.091 +125 N 0.098 +126 M 0.110 +127 I 0.126 +128 K 0.136 +129 G 0.138 +130 K 0.144 +131 T 0.152 +132 P 0.151 +133 E 0.137 +134 E 0.127 +135 I 0.126 +136 R 0.127 +137 K 0.132 +138 T 0.146 +139 F 0.167 +140 N 0.188 +141 I 0.204 +142 K 0.211 +143 N 0.206 +144 D 0.192 +145 F 0.174 +146 T 0.160 +147 E 0.154 +148 E 0.161 +149 E 0.174 +150 E 0.188 +151 A 0.202 +152 Q 0.219 +153 V 0.232 +154 R 0.237 +155 K 0.242 +156 E 0.253 +157 N 0.264 +158 Q 0.277 +159 W 0.302 +160 C 0.336 +161 E 0.359 +162 E 0.363 +163 K 0.357 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036309.15_ENSMUST00000109072.2_GN:Skp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036309.15_ENSMUST00000109072.2_GN:Skp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..639f64a53719f1c0964a238bcf9a1942345c8145 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036309.15_ENSMUST00000109072.2_GN:Skp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid @@ -0,0 +1,166 @@ +>ENSMUSG00000036309.15|ENSMUST00000109072.2|GN:Skp1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:2 +1 M 0.399 +2 Q 0.367 +3 M 0.301 +4 P 0.215 +5 T 0.132 +6 I 0.072 +7 K 0.040 +8 L 0.028 +9 Q 0.028 +10 S 0.040 +11 S 0.059 +12 D 0.080 +13 G 0.087 +14 E 0.076 +15 I 0.058 +16 F 0.044 +17 E 0.037 +18 V 0.033 +19 D 0.028 +20 V 0.026 +21 E 0.027 +22 I 0.030 +23 A 0.031 +24 K 0.030 +25 Q 0.030 +26 S 0.030 +27 V 0.031 +28 T 0.036 +29 I 0.049 +30 K 0.066 +31 T 0.076 +32 M 0.077 +33 L 0.079 +34 E 0.094 +35 D 0.130 +36 L 0.190 +37 G 0.259 +38 M 0.319 +39 D 0.358 +40 D 0.380 +41 E 0.385 +42 G 0.373 +43 D 0.343 +44 D 0.296 +45 D 0.239 +46 P 0.184 +47 V 0.143 +48 P 0.122 +49 L 0.115 +50 P 0.110 +51 N 0.103 +52 V 0.095 +53 N 0.086 +54 A 0.072 +55 A 0.059 +56 I 0.052 +57 L 0.049 +58 K 0.047 +59 K 0.045 +60 V 0.045 +61 I 0.043 +62 Q 0.039 +63 W 0.035 +64 C 0.035 +65 T 0.037 +66 H 0.045 +67 H 0.062 +68 K 0.090 +69 D 0.129 +70 D 0.187 +71 P 0.261 +72 P 0.341 +73 P 0.414 +74 P 0.473 +75 E 0.517 +76 D 0.541 +77 D 0.539 +78 E 0.520 +79 N 0.506 +80 K 0.503 +81 E 0.507 +82 K 0.506 +83 R 0.484 +84 T 0.425 +85 D 0.335 +86 D 0.243 +87 I 0.170 +88 P 0.114 +89 V 0.072 +90 W 0.049 +91 D 0.047 +92 Q 0.056 +93 E 0.064 +94 F 0.065 +95 L 0.064 +96 K 0.065 +97 V 0.067 +98 D 0.064 +99 Q 0.058 +100 G 0.054 +101 T 0.052 +102 L 0.050 +103 F 0.049 +104 E 0.049 +105 L 0.049 +106 I 0.047 +107 L 0.045 +108 A 0.045 +109 A 0.046 +110 N 0.048 +111 Y 0.055 +112 L 0.065 +113 D 0.074 +114 I 0.077 +115 K 0.074 +116 G 0.069 +117 L 0.067 +118 L 0.067 +119 D 0.068 +120 V 0.072 +121 T 0.080 +122 C 0.085 +123 K 0.082 +124 T 0.079 +125 V 0.084 +126 A 0.091 +127 N 0.098 +128 M 0.110 +129 I 0.127 +130 K 0.137 +131 G 0.139 +132 K 0.144 +133 T 0.153 +134 P 0.151 +135 E 0.138 +136 E 0.128 +137 I 0.127 +138 R 0.128 +139 K 0.133 +140 T 0.147 +141 F 0.168 +142 N 0.189 +143 I 0.205 +144 K 0.212 +145 N 0.206 +146 D 0.192 +147 F 0.175 +148 T 0.160 +149 E 0.155 +150 E 0.162 +151 E 0.175 +152 E 0.188 +153 A 0.202 +154 Q 0.219 +155 V 0.232 +156 R 0.237 +157 K 0.242 +158 E 0.253 +159 N 0.265 +160 Q 0.278 +161 W 0.302 +162 C 0.336 +163 E 0.359 +164 E 0.362 +165 K 0.356 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036372.15_ENSMUST00000040372.14_GN:Tmem258_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036372.15_ENSMUST00000040372.14_GN:Tmem258_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e8b335939fcb7cd311365b08f4284953bfb93c54 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036372.15_ENSMUST00000040372.14_GN:Tmem258_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,80 @@ +>ENSMUSG00000036372.15|ENSMUST00000040372.14|GN:Tmem258|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.471 +2 E 0.462 +3 L 0.458 +4 E 0.464 +5 A 0.463 +6 M 0.445 +7 S 0.416 +8 R 0.391 +9 Y 0.371 +10 T 0.349 +11 S 0.320 +12 P 0.282 +13 V 0.239 +14 N 0.195 +15 P 0.150 +16 A 0.110 +17 V 0.079 +18 F 0.059 +19 P 0.048 +20 H 0.044 +21 L 0.045 +22 T 0.049 +23 V 0.051 +24 V 0.055 +25 L 0.066 +26 L 0.080 +27 A 0.086 +28 I 0.079 +29 G 0.067 +30 M 0.056 +31 F 0.048 +32 F 0.046 +33 T 0.047 +34 A 0.045 +35 W 0.043 +36 F 0.044 +37 F 0.051 +38 V 0.063 +39 Y 0.080 +40 E 0.101 +41 V 0.124 +42 T 0.151 +43 S 0.181 +44 T 0.202 +45 K 0.207 +46 Y 0.199 +47 T 0.184 +48 R 0.158 +49 D 0.124 +50 I 0.092 +51 Y 0.075 +52 K 0.069 +53 E 0.066 +54 L 0.062 +55 L 0.065 +56 I 0.076 +57 S 0.086 +58 L 0.089 +59 V 0.093 +60 A 0.094 +61 S 0.086 +62 L 0.071 +63 F 0.064 +64 M 0.068 +65 G 0.078 +66 F 0.090 +67 G 0.104 +68 V 0.117 +69 L 0.122 +70 F 0.124 +71 L 0.125 +72 L 0.125 +73 L 0.124 +74 W 0.125 +75 V 0.131 +76 G 0.142 +77 I 0.156 +78 Y 0.169 +79 V 0.176 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036372.15_ENSMUST00000040372.14_GN:Tmem258_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:42.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036372.15_ENSMUST00000040372.14_GN:Tmem258_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:42.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4d2b31267e3101523487863d8bff52cbdf84fb69 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036372.15_ENSMUST00000040372.14_GN:Tmem258_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:42.caid @@ -0,0 +1,122 @@ +>ENSMUSG00000036372.15|ENSMUST00000040372.14|GN:Tmem258|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:42 +1 M 0.448 +2 G 0.474 +3 L 0.514 +4 Q 0.548 +5 V 0.554 +6 P 0.533 +7 Q 0.518 +8 C 0.525 +9 H 0.537 +10 A 0.553 +11 Q 0.600 +12 G 0.661 +13 T 0.696 +14 T 0.696 +15 S 0.680 +16 F 0.660 +17 S 0.632 +18 C 0.600 +19 C 0.567 +20 S 0.531 +21 V 0.492 +22 R 0.464 +23 L 0.469 +24 L 0.512 +25 L 0.582 +26 P 0.653 +27 T 0.704 +28 C 0.727 +29 S 0.734 +30 S 0.741 +31 G 0.750 +32 G 0.761 +33 G 0.766 +34 S 0.761 +35 V 0.741 +36 V 0.711 +37 Y 0.689 +38 P 0.689 +39 V 0.708 +40 R 0.722 +41 G 0.717 +42 K 0.695 +43 M 0.670 +44 E 0.650 +45 L 0.634 +46 E 0.622 +47 A 0.612 +48 M 0.593 +49 S 0.562 +50 R 0.520 +51 Y 0.474 +52 T 0.429 +53 S 0.384 +54 P 0.339 +55 V 0.294 +56 N 0.245 +57 P 0.191 +58 A 0.139 +59 V 0.097 +60 F 0.071 +61 P 0.058 +62 H 0.054 +63 L 0.055 +64 T 0.059 +65 V 0.061 +66 V 0.061 +67 L 0.065 +68 L 0.071 +69 A 0.074 +70 I 0.072 +71 G 0.068 +72 M 0.063 +73 F 0.058 +74 F 0.056 +75 T 0.057 +76 A 0.056 +77 W 0.054 +78 F 0.058 +79 F 0.069 +80 V 0.083 +81 Y 0.100 +82 E 0.121 +83 V 0.144 +84 T 0.171 +85 S 0.200 +86 T 0.219 +87 K 0.223 +88 Y 0.215 +89 T 0.197 +90 R 0.168 +91 D 0.131 +92 I 0.099 +93 Y 0.082 +94 K 0.077 +95 E 0.075 +96 L 0.072 +97 L 0.076 +98 I 0.089 +99 S 0.100 +100 L 0.102 +101 V 0.102 +102 A 0.103 +103 S 0.094 +104 L 0.079 +105 F 0.072 +106 M 0.077 +107 G 0.086 +108 F 0.096 +109 G 0.109 +110 V 0.119 +111 L 0.124 +112 F 0.126 +113 L 0.128 +114 L 0.129 +115 L 0.129 +116 W 0.134 +117 V 0.145 +118 G 0.163 +119 I 0.183 +120 Y 0.200 +121 V 0.209 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036647.6_ENSMUST00000040983.6_GN:Or6b9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036647.6_ENSMUST00000040983.6_GN:Or6b9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7e4375bddeb4fccbdc654ed66a2028344e832017 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036647.6_ENSMUST00000040983.6_GN:Or6b9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,317 @@ +>ENSMUSG00000036647.6|ENSMUST00000040983.6|GN:Or6b9|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.446 +2 E 0.457 +3 N 0.466 +4 I 0.454 +5 T 0.407 +6 N 0.333 +7 I 0.254 +8 S 0.189 +9 E 0.148 +10 F 0.131 +11 I 0.127 +12 L 0.128 +13 M 0.137 +14 G 0.152 +15 F 0.165 +16 P 0.166 +17 T 0.151 +18 A 0.123 +19 P 0.089 +20 W 0.062 +21 L 0.050 +22 Q 0.053 +23 I 0.064 +24 L 0.070 +25 L 0.064 +26 F 0.052 +27 S 0.041 +28 I 0.033 +29 F 0.031 +30 F 0.033 +31 I 0.037 +32 T 0.042 +33 Y 0.044 +34 V 0.044 +35 F 0.047 +36 V 0.052 +37 L 0.054 +38 L 0.055 +39 E 0.058 +40 N 0.064 +41 L 0.070 +42 V 0.072 +43 I 0.069 +44 I 0.059 +45 L 0.050 +46 T 0.045 +47 V 0.046 +48 W 0.055 +49 V 0.070 +50 T 0.082 +51 G 0.087 +52 S 0.085 +53 L 0.078 +54 H 0.068 +55 K 0.057 +56 P 0.045 +57 M 0.035 +58 Y 0.029 +59 Y 0.025 +60 F 0.025 +61 L 0.030 +62 S 0.038 +63 T 0.045 +64 M 0.050 +65 S 0.051 +66 F 0.051 +67 L 0.053 +68 E 0.061 +69 A 0.066 +70 W 0.063 +71 Y 0.057 +72 I 0.051 +73 S 0.050 +74 V 0.053 +75 T 0.058 +76 V 0.061 +77 P 0.061 +78 K 0.059 +79 M 0.058 +80 L 0.056 +81 A 0.051 +82 G 0.047 +83 F 0.044 +84 L 0.045 +85 F 0.050 +86 H 0.058 +87 P 0.064 +88 N 0.064 +89 T 0.060 +90 I 0.053 +91 S 0.046 +92 F 0.040 +93 L 0.038 +94 G 0.038 +95 C 0.037 +96 M 0.034 +97 T 0.033 +98 Q 0.033 +99 L 0.033 +100 Y 0.033 +101 F 0.030 +102 F 0.029 +103 M 0.029 +104 S 0.032 +105 L 0.035 +106 A 0.038 +107 C 0.043 +108 T 0.046 +109 E 0.048 +110 C 0.048 +111 V 0.045 +112 L 0.041 +113 L 0.036 +114 A 0.033 +115 A 0.031 +116 M 0.031 +117 A 0.033 +118 Y 0.036 +119 D 0.040 +120 R 0.041 +121 Y 0.039 +122 V 0.036 +123 A 0.035 +124 I 0.036 +125 C 0.040 +126 W 0.044 +127 P 0.047 +128 L 0.046 +129 R 0.045 +130 Y 0.046 +131 P 0.049 +132 V 0.053 +133 M 0.057 +134 M 0.057 +135 T 0.053 +136 T 0.045 +137 G 0.039 +138 F 0.037 +139 C 0.042 +140 V 0.054 +141 Q 0.067 +142 L 0.073 +143 T 0.076 +144 I 0.076 +145 S 0.071 +146 S 0.061 +147 W 0.052 +148 V 0.050 +149 S 0.054 +150 G 0.060 +151 F 0.061 +152 T 0.062 +153 I 0.064 +154 S 0.065 +155 M 0.064 +156 A 0.064 +157 K 0.066 +158 V 0.065 +159 Y 0.064 +160 F 0.068 +161 L 0.077 +162 S 0.089 +163 R 0.103 +164 V 0.110 +165 A 0.107 +166 F 0.103 +167 C 0.105 +168 G 0.111 +169 N 0.117 +170 N 0.125 +171 V 0.133 +172 L 0.132 +173 N 0.115 +174 H 0.093 +175 F 0.075 +176 F 0.065 +177 C 0.063 +178 D 0.071 +179 V 0.088 +180 S 0.106 +181 P 0.117 +182 I 0.118 +183 L 0.116 +184 K 0.115 +185 L 0.111 +186 A 0.103 +187 C 0.099 +188 M 0.106 +189 N 0.117 +190 L 0.123 +191 S 0.120 +192 M 0.113 +193 A 0.105 +194 E 0.099 +195 T 0.095 +196 V 0.095 +197 D 0.098 +198 F 0.098 +199 A 0.092 +200 L 0.083 +201 A 0.072 +202 I 0.061 +203 V 0.054 +204 I 0.051 +205 L 0.054 +206 I 0.060 +207 F 0.068 +208 P 0.071 +209 L 0.069 +210 S 0.068 +211 A 0.071 +212 T 0.071 +213 V 0.064 +214 L 0.055 +215 S 0.051 +216 Y 0.049 +217 G 0.050 +218 F 0.055 +219 I 0.065 +220 V 0.077 +221 S 0.087 +222 T 0.090 +223 V 0.091 +224 L 0.098 +225 Q 0.117 +226 I 0.140 +227 P 0.155 +228 S 0.155 +229 A 0.141 +230 T 0.121 +231 G 0.102 +232 Q 0.088 +233 R 0.081 +234 K 0.080 +235 A 0.081 +236 F 0.080 +237 S 0.080 +238 T 0.078 +239 C 0.075 +240 A 0.074 +241 S 0.073 +242 H 0.070 +243 L 0.064 +244 T 0.060 +245 V 0.058 +246 V 0.053 +247 V 0.042 +248 I 0.031 +249 F 0.025 +250 Y 0.023 +251 T 0.025 +252 A 0.028 +253 V 0.030 +254 I 0.032 +255 F 0.037 +256 M 0.049 +257 Y 0.071 +258 V 0.100 +259 R 0.129 +260 P 0.150 +261 R 0.163 +262 A 0.177 +263 I 0.190 +264 A 0.198 +265 S 0.197 +266 F 0.188 +267 N 0.174 +268 S 0.159 +269 N 0.142 +270 K 0.124 +271 L 0.108 +272 I 0.095 +273 S 0.081 +274 A 0.071 +275 I 0.072 +276 Y 0.082 +277 A 0.095 +278 V 0.105 +279 F 0.110 +280 T 0.109 +281 P 0.100 +282 M 0.089 +283 L 0.080 +284 N 0.073 +285 P 0.068 +286 I 0.066 +287 I 0.068 +288 Y 0.069 +289 C 0.074 +290 L 0.087 +291 R 0.098 +292 N 0.094 +293 K 0.077 +294 E 0.064 +295 V 0.063 +296 K 0.073 +297 D 0.082 +298 A 0.083 +299 I 0.078 +300 R 0.079 +301 K 0.089 +302 T 0.115 +303 I 0.171 +304 A 0.261 +305 G 0.367 +306 G 0.458 +307 R 0.521 +308 A 0.563 +309 P 0.595 +310 A 0.611 +311 L 0.596 +312 G 0.556 +313 E 0.520 +314 S 0.500 +315 I 0.472 +316 S 0.440 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036647.6_ENSMUST00000040983.6_GN:Or6b9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:27.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036647.6_ENSMUST00000040983.6_GN:Or6b9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:27.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..95fd017bffbf3eb8cbaa8075eb9ae190f692e1e3 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036647.6_ENSMUST00000040983.6_GN:Or6b9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:27.caid @@ -0,0 +1,344 @@ +>ENSMUSG00000036647.6|ENSMUST00000040983.6|GN:Or6b9|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:27 +1 M 0.109 +2 V 0.093 +3 L 0.075 +4 S 0.065 +5 W 0.058 +6 I 0.050 +7 L 0.043 +8 F 0.041 +9 L 0.043 +10 N 0.046 +11 F 0.046 +12 L 0.045 +13 I 0.046 +14 L 0.056 +15 A 0.076 +16 S 0.102 +17 N 0.130 +18 L 0.163 +19 L 0.206 +20 S 0.255 +21 F 0.300 +22 G 0.332 +23 D 0.341 +24 P 0.332 +25 T 0.323 +26 L 0.331 +27 W 0.358 +28 M 0.391 +29 E 0.420 +30 N 0.436 +31 I 0.427 +32 T 0.384 +33 N 0.317 +34 I 0.245 +35 S 0.185 +36 E 0.148 +37 F 0.132 +38 I 0.127 +39 L 0.127 +40 M 0.134 +41 G 0.149 +42 F 0.164 +43 P 0.167 +44 T 0.153 +45 A 0.125 +46 P 0.091 +47 W 0.063 +48 L 0.050 +49 Q 0.052 +50 I 0.061 +51 L 0.066 +52 L 0.062 +53 F 0.052 +54 S 0.043 +55 I 0.035 +56 F 0.032 +57 F 0.032 +58 I 0.036 +59 T 0.041 +60 Y 0.044 +61 V 0.045 +62 F 0.047 +63 V 0.051 +64 L 0.052 +65 L 0.053 +66 E 0.056 +67 N 0.062 +68 L 0.067 +69 V 0.068 +70 I 0.064 +71 I 0.055 +72 L 0.045 +73 T 0.039 +74 V 0.039 +75 W 0.045 +76 V 0.058 +77 T 0.069 +78 G 0.073 +79 S 0.071 +80 L 0.065 +81 H 0.058 +82 K 0.049 +83 P 0.039 +84 M 0.030 +85 Y 0.025 +86 Y 0.022 +87 F 0.022 +88 L 0.027 +89 S 0.035 +90 T 0.042 +91 M 0.047 +92 S 0.049 +93 F 0.050 +94 L 0.053 +95 E 0.059 +96 A 0.064 +97 W 0.061 +98 Y 0.054 +99 I 0.048 +100 S 0.046 +101 V 0.047 +102 T 0.050 +103 V 0.053 +104 P 0.052 +105 K 0.050 +106 M 0.049 +107 L 0.046 +108 A 0.042 +109 G 0.037 +110 F 0.035 +111 L 0.037 +112 F 0.043 +113 H 0.050 +114 P 0.056 +115 N 0.058 +116 T 0.054 +117 I 0.049 +118 S 0.043 +119 F 0.037 +120 L 0.034 +121 G 0.034 +122 C 0.034 +123 M 0.032 +124 T 0.031 +125 Q 0.031 +126 L 0.032 +127 Y 0.031 +128 F 0.029 +129 F 0.027 +130 M 0.028 +131 S 0.031 +132 L 0.034 +133 A 0.037 +134 C 0.040 +135 T 0.043 +136 E 0.043 +137 C 0.042 +138 V 0.039 +139 L 0.035 +140 L 0.033 +141 A 0.031 +142 A 0.030 +143 M 0.030 +144 A 0.032 +145 Y 0.035 +146 D 0.039 +147 R 0.040 +148 Y 0.038 +149 V 0.035 +150 A 0.034 +151 I 0.036 +152 C 0.039 +153 W 0.043 +154 P 0.046 +155 L 0.046 +156 R 0.045 +157 Y 0.046 +158 P 0.050 +159 V 0.054 +160 M 0.057 +161 M 0.058 +162 T 0.053 +163 T 0.044 +164 G 0.037 +165 F 0.034 +166 C 0.039 +167 V 0.052 +168 Q 0.062 +169 L 0.061 +170 T 0.052 +171 I 0.045 +172 S 0.043 +173 S 0.043 +174 W 0.042 +175 V 0.042 +176 S 0.048 +177 G 0.055 +178 F 0.059 +179 T 0.058 +180 I 0.058 +181 S 0.059 +182 M 0.058 +183 A 0.058 +184 K 0.061 +185 V 0.061 +186 Y 0.061 +187 F 0.064 +188 L 0.072 +189 S 0.085 +190 R 0.098 +191 V 0.106 +192 A 0.104 +193 F 0.100 +194 C 0.101 +195 G 0.106 +196 N 0.112 +197 N 0.119 +198 V 0.126 +199 L 0.124 +200 N 0.107 +201 H 0.086 +202 F 0.070 +203 F 0.061 +204 C 0.060 +205 D 0.069 +206 V 0.086 +207 S 0.103 +208 P 0.113 +209 I 0.114 +210 L 0.113 +211 K 0.112 +212 L 0.107 +213 A 0.098 +214 C 0.092 +215 M 0.097 +216 N 0.108 +217 L 0.113 +218 S 0.110 +219 M 0.103 +220 A 0.098 +221 E 0.094 +222 T 0.090 +223 V 0.089 +224 D 0.091 +225 F 0.091 +226 A 0.086 +227 L 0.077 +228 A 0.067 +229 I 0.056 +230 V 0.049 +231 I 0.047 +232 L 0.049 +233 I 0.056 +234 F 0.063 +235 P 0.066 +236 L 0.065 +237 S 0.065 +238 A 0.070 +239 T 0.072 +240 V 0.065 +241 L 0.056 +242 S 0.050 +243 Y 0.048 +244 G 0.048 +245 F 0.054 +246 I 0.063 +247 V 0.075 +248 S 0.085 +249 T 0.088 +250 V 0.088 +251 L 0.094 +252 Q 0.111 +253 I 0.132 +254 P 0.146 +255 S 0.145 +256 A 0.132 +257 T 0.115 +258 G 0.099 +259 Q 0.086 +260 R 0.080 +261 K 0.080 +262 A 0.080 +263 F 0.077 +264 S 0.076 +265 T 0.075 +266 C 0.074 +267 A 0.073 +268 S 0.072 +269 H 0.069 +270 L 0.063 +271 T 0.060 +272 V 0.059 +273 V 0.054 +274 V 0.043 +275 I 0.032 +276 F 0.025 +277 Y 0.023 +278 T 0.025 +279 A 0.027 +280 V 0.029 +281 I 0.030 +282 F 0.035 +283 M 0.046 +284 Y 0.066 +285 V 0.094 +286 R 0.125 +287 P 0.149 +288 R 0.165 +289 A 0.181 +290 I 0.198 +291 A 0.207 +292 S 0.206 +293 F 0.195 +294 N 0.178 +295 S 0.161 +296 N 0.143 +297 K 0.126 +298 L 0.110 +299 I 0.097 +300 S 0.084 +301 A 0.075 +302 I 0.076 +303 Y 0.087 +304 A 0.099 +305 V 0.108 +306 F 0.111 +307 T 0.109 +308 P 0.100 +309 M 0.088 +310 L 0.079 +311 N 0.073 +312 P 0.068 +313 I 0.066 +314 I 0.068 +315 Y 0.068 +316 C 0.073 +317 L 0.086 +318 R 0.097 +319 N 0.093 +320 K 0.077 +321 E 0.063 +322 V 0.062 +323 K 0.071 +324 D 0.080 +325 A 0.080 +326 I 0.075 +327 R 0.075 +328 K 0.085 +329 T 0.111 +330 I 0.166 +331 A 0.257 +332 G 0.363 +333 G 0.455 +334 R 0.519 +335 A 0.562 +336 P 0.594 +337 A 0.608 +338 L 0.588 +339 G 0.538 +340 E 0.499 +341 S 0.484 +342 I 0.467 +343 S 0.441 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036814.14_ENSMUST00000040960.13_GN:Slc6a20a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036814.14_ENSMUST00000040960.13_GN:Slc6a20a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ef0111625a431bb633b788febe11a72b368efcdd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036814.14_ENSMUST00000040960.13_GN:Slc6a20a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,593 @@ +>ENSMUSG00000036814.14|ENSMUST00000040960.13|GN:Slc6a20a|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.390 +2 E 0.374 +3 K 0.343 +4 A 0.297 +5 R 0.247 +6 P 0.202 +7 Q 0.166 +8 W 0.137 +9 G 0.110 +10 H 0.085 +11 P 0.069 +12 L 0.061 +13 Q 0.058 +14 F 0.055 +15 V 0.052 +16 F 0.056 +17 A 0.065 +18 C 0.076 +19 I 0.090 +20 S 0.109 +21 Y 0.124 +22 A 0.124 +23 V 0.110 +24 G 0.099 +25 L 0.102 +26 G 0.114 +27 N 0.119 +28 V 0.112 +29 W 0.102 +30 R 0.102 +31 F 0.109 +32 P 0.109 +33 Y 0.101 +34 L 0.091 +35 C 0.085 +36 Q 0.083 +37 M 0.087 +38 Y 0.099 +39 G 0.106 +40 G 0.100 +41 G 0.084 +42 S 0.068 +43 F 0.058 +44 L 0.053 +45 V 0.054 +46 P 0.058 +47 Y 0.060 +48 I 0.057 +49 I 0.053 +50 M 0.051 +51 L 0.048 +52 I 0.045 +53 V 0.049 +54 E 0.058 +55 G 0.067 +56 M 0.069 +57 P 0.067 +58 L 0.065 +59 L 0.062 +60 Y 0.059 +61 L 0.059 +62 E 0.065 +63 L 0.070 +64 A 0.074 +65 V 0.076 +66 G 0.078 +67 Q 0.084 +68 R 0.096 +69 M 0.108 +70 R 0.113 +71 Q 0.113 +72 G 0.114 +73 S 0.115 +74 I 0.111 +75 G 0.098 +76 A 0.081 +77 W 0.067 +78 R 0.059 +79 T 0.057 +80 I 0.056 +81 S 0.057 +82 P 0.061 +83 Y 0.069 +84 L 0.080 +85 S 0.093 +86 G 0.106 +87 V 0.115 +88 G 0.116 +89 V 0.110 +90 A 0.103 +91 S 0.098 +92 V 0.094 +93 V 0.087 +94 V 0.080 +95 S 0.074 +96 F 0.070 +97 F 0.068 +98 L 0.071 +99 S 0.072 +100 M 0.067 +101 Y 0.062 +102 Y 0.062 +103 N 0.063 +104 V 0.064 +105 I 0.063 +106 N 0.061 +107 A 0.057 +108 W 0.056 +109 G 0.058 +110 F 0.063 +111 W 0.070 +112 Y 0.075 +113 L 0.075 +114 F 0.074 +115 H 0.077 +116 S 0.081 +117 F 0.081 +118 Q 0.074 +119 D 0.072 +120 P 0.079 +121 L 0.091 +122 P 0.102 +123 W 0.108 +124 S 0.117 +125 V 0.138 +126 C 0.174 +127 P 0.215 +128 L 0.254 +129 N 0.287 +130 S 0.308 +131 N 0.310 +132 H 0.295 +133 T 0.279 +134 G 0.265 +135 Y 0.241 +136 D 0.205 +137 E 0.174 +138 E 0.157 +139 C 0.147 +140 E 0.141 +141 K 0.142 +142 A 0.145 +143 S 0.142 +144 S 0.131 +145 T 0.121 +146 Q 0.118 +147 Y 0.120 +148 F 0.122 +149 W 0.122 +150 Y 0.132 +151 R 0.157 +152 K 0.181 +153 T 0.194 +154 L 0.196 +155 N 0.193 +156 I 0.191 +157 S 0.189 +158 P 0.187 +159 S 0.184 +160 I 0.184 +161 Q 0.187 +162 E 0.190 +163 N 0.193 +164 G 0.194 +165 G 0.185 +166 V 0.160 +167 Q 0.127 +168 W 0.104 +169 E 0.099 +170 P 0.104 +171 A 0.112 +172 L 0.130 +173 C 0.157 +174 L 0.177 +175 T 0.177 +176 L 0.171 +177 A 0.168 +178 W 0.162 +179 L 0.146 +180 M 0.127 +181 V 0.112 +182 Y 0.102 +183 L 0.096 +184 C 0.094 +185 I 0.096 +186 L 0.100 +187 R 0.104 +188 G 0.102 +189 T 0.097 +190 E 0.097 +191 S 0.104 +192 T 0.113 +193 G 0.125 +194 K 0.140 +195 V 0.147 +196 V 0.132 +197 Y 0.101 +198 F 0.077 +199 T 0.070 +200 A 0.071 +201 S 0.071 +202 M 0.072 +203 P 0.077 +204 Y 0.085 +205 C 0.091 +206 V 0.089 +207 L 0.078 +208 I 0.062 +209 I 0.052 +210 Y 0.055 +211 L 0.067 +212 V 0.074 +213 R 0.073 +214 G 0.069 +215 L 0.068 +216 T 0.072 +217 L 0.081 +218 H 0.090 +219 G 0.091 +220 A 0.085 +221 T 0.077 +222 N 0.068 +223 G 0.061 +224 L 0.056 +225 M 0.052 +226 Y 0.047 +227 M 0.042 +228 F 0.041 +229 T 0.042 +230 P 0.044 +231 K 0.045 +232 M 0.046 +233 E 0.048 +234 Q 0.051 +235 L 0.053 +236 A 0.054 +237 N 0.054 +238 P 0.053 +239 K 0.051 +240 A 0.051 +241 W 0.052 +242 I 0.057 +243 N 0.066 +244 A 0.076 +245 A 0.081 +246 T 0.089 +247 Q 0.098 +248 I 0.098 +249 F 0.092 +250 F 0.093 +251 S 0.105 +252 L 0.122 +253 G 0.137 +254 L 0.149 +255 G 0.160 +256 F 0.172 +257 G 0.183 +258 S 0.184 +259 L 0.173 +260 I 0.159 +261 A 0.147 +262 F 0.139 +263 A 0.130 +264 S 0.119 +265 Y 0.107 +266 N 0.097 +267 E 0.089 +268 P 0.084 +269 S 0.081 +270 N 0.080 +271 N 0.078 +272 C 0.078 +273 Q 0.082 +274 K 0.089 +275 H 0.093 +276 A 0.090 +277 I 0.088 +278 I 0.096 +279 V 0.112 +280 S 0.117 +281 I 0.110 +282 I 0.109 +283 N 0.117 +284 S 0.123 +285 S 0.127 +286 T 0.137 +287 S 0.147 +288 I 0.149 +289 F 0.147 +290 A 0.144 +291 S 0.140 +292 I 0.139 +293 V 0.138 +294 T 0.134 +295 F 0.126 +296 S 0.119 +297 I 0.117 +298 Y 0.117 +299 G 0.116 +300 F 0.110 +301 K 0.102 +302 A 0.101 +303 T 0.106 +304 F 0.117 +305 N 0.128 +306 Y 0.132 +307 E 0.126 +308 N 0.115 +309 C 0.103 +310 L 0.092 +311 N 0.087 +312 K 0.084 +313 V 0.075 +314 I 0.061 +315 L 0.053 +316 L 0.054 +317 L 0.062 +318 T 0.077 +319 N 0.096 +320 S 0.115 +321 F 0.128 +322 D 0.142 +323 L 0.163 +324 E 0.188 +325 D 0.207 +326 G 0.215 +327 F 0.209 +328 L 0.190 +329 T 0.161 +330 V 0.131 +331 S 0.105 +332 N 0.084 +333 L 0.067 +334 E 0.055 +335 E 0.050 +336 V 0.054 +337 K 0.066 +338 N 0.076 +339 Y 0.078 +340 L 0.081 +341 A 0.088 +342 S 0.096 +343 T 0.098 +344 Y 0.097 +345 P 0.092 +346 N 0.082 +347 K 0.070 +348 Y 0.065 +349 S 0.068 +350 E 0.079 +351 V 0.099 +352 F 0.124 +353 P 0.148 +354 H 0.162 +355 I 0.163 +356 R 0.156 +357 N 0.146 +358 C 0.133 +359 S 0.118 +360 L 0.110 +361 E 0.113 +362 S 0.125 +363 E 0.139 +364 L 0.150 +365 D 0.161 +366 T 0.175 +367 A 0.184 +368 V 0.177 +369 Q 0.161 +370 G 0.148 +371 T 0.144 +372 G 0.140 +373 L 0.128 +374 A 0.109 +375 F 0.094 +376 I 0.090 +377 V 0.087 +378 Y 0.077 +379 T 0.066 +380 E 0.063 +381 A 0.065 +382 I 0.069 +383 K 0.072 +384 N 0.078 +385 M 0.082 +386 E 0.077 +387 V 0.067 +388 S 0.055 +389 Q 0.046 +390 L 0.041 +391 W 0.042 +392 S 0.046 +393 V 0.050 +394 L 0.056 +395 Y 0.065 +396 F 0.075 +397 F 0.084 +398 M 0.089 +399 L 0.089 +400 L 0.086 +401 M 0.085 +402 L 0.092 +403 G 0.103 +404 I 0.118 +405 G 0.138 +406 S 0.160 +407 M 0.167 +408 L 0.153 +409 G 0.135 +410 N 0.121 +411 T 0.108 +412 A 0.093 +413 A 0.083 +414 I 0.077 +415 L 0.074 +416 T 0.071 +417 P 0.067 +418 L 0.064 +419 T 0.066 +420 D 0.073 +421 S 0.079 +422 K 0.074 +423 V 0.062 +424 I 0.053 +425 S 0.052 +426 S 0.056 +427 Y 0.059 +428 L 0.056 +429 P 0.047 +430 K 0.038 +431 E 0.033 +432 A 0.033 +433 I 0.038 +434 S 0.043 +435 G 0.046 +436 L 0.048 +437 V 0.052 +438 C 0.053 +439 L 0.051 +440 I 0.049 +441 N 0.050 +442 C 0.054 +443 A 0.060 +444 V 0.068 +445 G 0.074 +446 M 0.076 +447 V 0.074 +448 F 0.071 +449 T 0.071 +450 M 0.071 +451 E 0.074 +452 A 0.076 +453 G 0.076 +454 N 0.075 +455 Y 0.075 +456 W 0.080 +457 F 0.090 +458 D 0.103 +459 I 0.115 +460 F 0.121 +461 N 0.118 +462 D 0.110 +463 Y 0.098 +464 A 0.088 +465 A 0.081 +466 T 0.075 +467 L 0.071 +468 S 0.068 +469 L 0.067 +470 L 0.068 +471 L 0.070 +472 I 0.072 +473 V 0.068 +474 L 0.058 +475 V 0.048 +476 E 0.043 +477 T 0.040 +478 I 0.036 +479 A 0.036 +480 V 0.042 +481 C 0.049 +482 Y 0.052 +483 V 0.049 +484 Y 0.048 +485 G 0.047 +486 L 0.045 +487 K 0.041 +488 R 0.041 +489 F 0.051 +490 E 0.066 +491 S 0.078 +492 D 0.080 +493 L 0.075 +494 R 0.071 +495 A 0.070 +496 M 0.072 +497 T 0.077 +498 G 0.081 +499 R 0.087 +500 T 0.087 +501 L 0.078 +502 S 0.061 +503 W 0.044 +504 Y 0.035 +505 W 0.035 +506 K 0.037 +507 V 0.039 +508 M 0.043 +509 W 0.051 +510 A 0.057 +511 F 0.059 +512 V 0.058 +513 S 0.058 +514 P 0.055 +515 L 0.053 +516 L 0.054 +517 I 0.055 +518 V 0.052 +519 G 0.049 +520 L 0.050 +521 F 0.052 +522 I 0.053 +523 F 0.054 +524 Y 0.057 +525 L 0.058 +526 S 0.060 +527 D 0.063 +528 Y 0.067 +529 I 0.076 +530 L 0.097 +531 T 0.127 +532 G 0.153 +533 T 0.166 +534 L 0.172 +535 Q 0.177 +536 Y 0.183 +537 Q 0.185 +538 A 0.184 +539 W 0.185 +540 D 0.192 +541 A 0.205 +542 T 0.220 +543 Q 0.232 +544 G 0.235 +545 Q 0.228 +546 L 0.215 +547 V 0.201 +548 T 0.190 +549 K 0.181 +550 D 0.171 +551 Y 0.156 +552 P 0.135 +553 P 0.115 +554 H 0.100 +555 A 0.093 +556 L 0.091 +557 A 0.099 +558 V 0.121 +559 I 0.148 +560 G 0.167 +561 L 0.176 +562 L 0.183 +563 V 0.189 +564 A 0.191 +565 S 0.188 +566 S 0.178 +567 T 0.157 +568 M 0.131 +569 C 0.114 +570 I 0.107 +571 P 0.097 +572 L 0.084 +573 V 0.071 +574 A 0.062 +575 L 0.056 +576 G 0.054 +577 T 0.055 +578 F 0.057 +579 I 0.059 +580 R 0.064 +581 N 0.072 +582 R 0.085 +583 L 0.115 +584 K 0.177 +585 R 0.267 +586 G 0.364 +587 G 0.438 +588 S 0.470 +589 A 0.461 +590 P 0.427 +591 V 0.389 +592 A 0.364 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036814.14_ENSMUST00000040960.13_GN:Slc6a20a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:26.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036814.14_ENSMUST00000040960.13_GN:Slc6a20a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:26.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..106efc8f5f7eb779d881385e78b4f25365a9a557 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036814.14_ENSMUST00000040960.13_GN:Slc6a20a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:26.caid @@ -0,0 +1,619 @@ +>ENSMUSG00000036814.14|ENSMUST00000040960.13|GN:Slc6a20a|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:26 +1 M 0.239 +2 R 0.241 +3 L 0.248 +4 A 0.258 +5 I 0.257 +6 K 0.253 +7 R 0.271 +8 R 0.309 +9 A 0.343 +10 S 0.372 +11 G 0.410 +12 G 0.438 +13 G 0.437 +14 Q 0.425 +15 R 0.424 +16 P 0.418 +17 G 0.391 +18 P 0.353 +19 D 0.316 +20 G 0.278 +21 E 0.243 +22 Q 0.226 +23 R 0.233 +24 A 0.251 +25 R 0.270 +26 D 0.293 +27 M 0.318 +28 E 0.333 +29 K 0.324 +30 A 0.289 +31 R 0.238 +32 P 0.191 +33 Q 0.155 +34 W 0.128 +35 G 0.104 +36 H 0.081 +37 P 0.066 +38 L 0.059 +39 Q 0.056 +40 F 0.053 +41 V 0.050 +42 F 0.053 +43 A 0.062 +44 C 0.073 +45 I 0.087 +46 S 0.106 +47 Y 0.121 +48 A 0.121 +49 V 0.109 +50 G 0.100 +51 L 0.105 +52 G 0.119 +53 N 0.124 +54 V 0.115 +55 W 0.105 +56 R 0.105 +57 F 0.112 +58 P 0.112 +59 Y 0.104 +60 L 0.094 +61 C 0.087 +62 Q 0.084 +63 M 0.088 +64 Y 0.098 +65 G 0.104 +66 G 0.098 +67 G 0.082 +68 S 0.067 +69 F 0.057 +70 L 0.052 +71 V 0.053 +72 P 0.057 +73 Y 0.058 +74 I 0.055 +75 I 0.052 +76 M 0.050 +77 L 0.047 +78 I 0.044 +79 V 0.047 +80 E 0.056 +81 G 0.064 +82 M 0.065 +83 P 0.063 +84 L 0.062 +85 L 0.059 +86 Y 0.057 +87 L 0.058 +88 E 0.063 +89 L 0.068 +90 A 0.071 +91 V 0.073 +92 G 0.075 +93 Q 0.080 +94 R 0.090 +95 M 0.100 +96 R 0.105 +97 Q 0.106 +98 G 0.109 +99 S 0.112 +100 I 0.110 +101 G 0.098 +102 A 0.082 +103 W 0.068 +104 R 0.060 +105 T 0.056 +106 I 0.055 +107 S 0.056 +108 P 0.060 +109 Y 0.068 +110 L 0.081 +111 S 0.094 +112 G 0.107 +113 V 0.116 +114 G 0.116 +115 V 0.109 +116 A 0.100 +117 S 0.095 +118 V 0.090 +119 V 0.083 +120 V 0.076 +121 S 0.071 +122 F 0.067 +123 F 0.066 +124 L 0.069 +125 S 0.070 +126 M 0.065 +127 Y 0.061 +128 Y 0.061 +129 N 0.062 +130 V 0.062 +131 I 0.062 +132 N 0.060 +133 A 0.057 +134 W 0.056 +135 G 0.058 +136 F 0.063 +137 W 0.069 +138 Y 0.074 +139 L 0.075 +140 F 0.074 +141 H 0.078 +142 S 0.083 +143 F 0.082 +144 Q 0.076 +145 D 0.073 +146 P 0.080 +147 L 0.093 +148 P 0.103 +149 W 0.108 +150 S 0.116 +151 V 0.138 +152 C 0.175 +153 P 0.217 +154 L 0.257 +155 N 0.291 +156 S 0.313 +157 N 0.314 +158 H 0.300 +159 T 0.285 +160 G 0.272 +161 Y 0.248 +162 D 0.211 +163 E 0.178 +164 E 0.159 +165 C 0.149 +166 E 0.143 +167 K 0.144 +168 A 0.148 +169 S 0.144 +170 S 0.132 +171 T 0.121 +172 Q 0.118 +173 Y 0.121 +174 F 0.123 +175 W 0.123 +176 Y 0.134 +177 R 0.158 +178 K 0.183 +179 T 0.195 +180 L 0.196 +181 N 0.192 +182 I 0.188 +183 S 0.187 +184 P 0.184 +185 S 0.181 +186 I 0.181 +187 Q 0.186 +188 E 0.190 +189 N 0.193 +190 G 0.194 +191 G 0.185 +192 V 0.160 +193 Q 0.127 +194 W 0.104 +195 E 0.100 +196 P 0.105 +197 A 0.114 +198 L 0.132 +199 C 0.160 +200 L 0.180 +201 T 0.181 +202 L 0.173 +203 A 0.166 +204 W 0.153 +205 L 0.134 +206 M 0.117 +207 V 0.107 +208 Y 0.100 +209 L 0.095 +210 C 0.092 +211 I 0.093 +212 L 0.097 +213 R 0.100 +214 G 0.098 +215 T 0.094 +216 E 0.095 +217 S 0.103 +218 T 0.113 +219 G 0.124 +220 K 0.138 +221 V 0.146 +222 V 0.131 +223 Y 0.101 +224 F 0.077 +225 T 0.070 +226 A 0.070 +227 S 0.069 +228 M 0.070 +229 P 0.076 +230 Y 0.084 +231 C 0.090 +232 V 0.088 +233 L 0.076 +234 I 0.060 +235 I 0.050 +236 Y 0.052 +237 L 0.062 +238 V 0.069 +239 R 0.069 +240 G 0.066 +241 L 0.066 +242 T 0.071 +243 L 0.079 +244 H 0.087 +245 G 0.089 +246 A 0.083 +247 T 0.075 +248 N 0.067 +249 G 0.060 +250 L 0.055 +251 M 0.050 +252 Y 0.046 +253 M 0.041 +254 F 0.040 +255 T 0.041 +256 P 0.042 +257 K 0.043 +258 M 0.044 +259 E 0.046 +260 Q 0.050 +261 L 0.053 +262 A 0.054 +263 N 0.055 +264 P 0.053 +265 K 0.052 +266 A 0.051 +267 W 0.052 +268 I 0.057 +269 N 0.066 +270 A 0.076 +271 A 0.081 +272 T 0.089 +273 Q 0.097 +274 I 0.098 +275 F 0.092 +276 F 0.093 +277 S 0.106 +278 L 0.122 +279 G 0.137 +280 L 0.149 +281 G 0.160 +282 F 0.172 +283 G 0.183 +284 S 0.185 +285 L 0.175 +286 I 0.160 +287 A 0.149 +288 F 0.141 +289 A 0.131 +290 S 0.119 +291 Y 0.107 +292 N 0.097 +293 E 0.090 +294 P 0.085 +295 S 0.083 +296 N 0.081 +297 N 0.077 +298 C 0.069 +299 Q 0.062 +300 K 0.063 +301 H 0.072 +302 A 0.081 +303 I 0.085 +304 I 0.095 +305 V 0.111 +306 S 0.116 +307 I 0.110 +308 I 0.109 +309 N 0.117 +310 S 0.123 +311 S 0.128 +312 T 0.138 +313 S 0.148 +314 I 0.150 +315 F 0.148 +316 A 0.145 +317 S 0.141 +318 I 0.140 +319 V 0.140 +320 T 0.136 +321 F 0.128 +322 S 0.121 +323 I 0.119 +324 Y 0.120 +325 G 0.119 +326 F 0.112 +327 K 0.104 +328 A 0.102 +329 T 0.108 +330 F 0.118 +331 N 0.129 +332 Y 0.134 +333 E 0.128 +334 N 0.116 +335 C 0.104 +336 L 0.093 +337 N 0.088 +338 K 0.085 +339 V 0.076 +340 I 0.063 +341 L 0.054 +342 L 0.054 +343 L 0.062 +344 T 0.077 +345 N 0.096 +346 S 0.115 +347 F 0.128 +348 D 0.141 +349 L 0.161 +350 E 0.186 +351 D 0.204 +352 G 0.210 +353 F 0.203 +354 L 0.184 +355 T 0.156 +356 V 0.128 +357 S 0.103 +358 N 0.083 +359 L 0.066 +360 E 0.055 +361 E 0.050 +362 V 0.054 +363 K 0.065 +364 N 0.075 +365 Y 0.076 +366 L 0.073 +367 A 0.074 +368 S 0.079 +369 T 0.084 +370 Y 0.089 +371 P 0.088 +372 N 0.080 +373 K 0.068 +374 Y 0.062 +375 S 0.066 +376 E 0.078 +377 V 0.097 +378 F 0.122 +379 P 0.146 +380 H 0.160 +381 I 0.161 +382 R 0.154 +383 N 0.145 +384 C 0.132 +385 S 0.118 +386 L 0.109 +387 E 0.112 +388 S 0.125 +389 E 0.139 +390 L 0.150 +391 D 0.160 +392 T 0.173 +393 A 0.181 +394 V 0.174 +395 Q 0.159 +396 G 0.147 +397 T 0.143 +398 G 0.140 +399 L 0.128 +400 A 0.109 +401 F 0.094 +402 I 0.089 +403 V 0.086 +404 Y 0.077 +405 T 0.066 +406 E 0.063 +407 A 0.066 +408 I 0.069 +409 K 0.073 +410 N 0.079 +411 M 0.082 +412 E 0.077 +413 V 0.067 +414 S 0.055 +415 Q 0.046 +416 L 0.042 +417 W 0.042 +418 S 0.046 +419 V 0.050 +420 L 0.056 +421 Y 0.065 +422 F 0.075 +423 F 0.085 +424 M 0.090 +425 L 0.090 +426 L 0.086 +427 M 0.085 +428 L 0.091 +429 G 0.102 +430 I 0.116 +431 G 0.136 +432 S 0.157 +433 M 0.164 +434 L 0.152 +435 G 0.134 +436 N 0.121 +437 T 0.108 +438 A 0.093 +439 A 0.083 +440 I 0.077 +441 L 0.074 +442 T 0.071 +443 P 0.067 +444 L 0.064 +445 T 0.066 +446 D 0.074 +447 S 0.079 +448 K 0.075 +449 V 0.063 +450 I 0.054 +451 S 0.053 +452 S 0.057 +453 Y 0.060 +454 L 0.057 +455 P 0.048 +456 K 0.039 +457 E 0.034 +458 A 0.034 +459 I 0.039 +460 S 0.044 +461 G 0.047 +462 L 0.049 +463 V 0.052 +464 C 0.053 +465 L 0.052 +466 I 0.050 +467 N 0.051 +468 C 0.055 +469 A 0.061 +470 V 0.069 +471 G 0.075 +472 M 0.077 +473 V 0.075 +474 F 0.073 +475 T 0.072 +476 M 0.073 +477 E 0.075 +478 A 0.077 +479 G 0.077 +480 N 0.076 +481 Y 0.077 +482 W 0.082 +483 F 0.092 +484 D 0.106 +485 I 0.118 +486 F 0.123 +487 N 0.121 +488 D 0.112 +489 Y 0.100 +490 A 0.089 +491 A 0.082 +492 T 0.076 +493 L 0.072 +494 S 0.069 +495 L 0.068 +496 L 0.069 +497 L 0.072 +498 I 0.073 +499 V 0.069 +500 L 0.059 +501 V 0.049 +502 E 0.044 +503 T 0.040 +504 I 0.036 +505 A 0.036 +506 V 0.042 +507 C 0.050 +508 Y 0.052 +509 V 0.050 +510 Y 0.049 +511 G 0.048 +512 L 0.046 +513 K 0.042 +514 R 0.039 +515 F 0.041 +516 E 0.045 +517 S 0.051 +518 D 0.058 +519 L 0.065 +520 R 0.068 +521 A 0.070 +522 M 0.073 +523 T 0.077 +524 G 0.082 +525 R 0.087 +526 T 0.088 +527 L 0.078 +528 S 0.061 +529 W 0.044 +530 Y 0.036 +531 W 0.035 +532 K 0.038 +533 V 0.039 +534 M 0.043 +535 W 0.051 +536 A 0.058 +537 F 0.059 +538 V 0.058 +539 S 0.058 +540 P 0.055 +541 L 0.053 +542 L 0.054 +543 I 0.055 +544 V 0.052 +545 G 0.049 +546 L 0.049 +547 F 0.050 +548 I 0.050 +549 F 0.051 +550 Y 0.055 +551 L 0.058 +552 S 0.060 +553 D 0.062 +554 Y 0.067 +555 I 0.076 +556 L 0.097 +557 T 0.127 +558 G 0.153 +559 T 0.165 +560 L 0.171 +561 Q 0.176 +562 Y 0.182 +563 Q 0.184 +564 A 0.183 +565 W 0.184 +566 D 0.192 +567 A 0.205 +568 T 0.219 +569 Q 0.231 +570 G 0.234 +571 Q 0.228 +572 L 0.215 +573 V 0.201 +574 T 0.190 +575 K 0.181 +576 D 0.171 +577 Y 0.156 +578 P 0.135 +579 P 0.115 +580 H 0.100 +581 A 0.093 +582 L 0.092 +583 A 0.101 +584 V 0.122 +585 I 0.147 +586 G 0.163 +587 L 0.170 +588 L 0.177 +589 V 0.187 +590 A 0.191 +591 S 0.188 +592 S 0.177 +593 T 0.156 +594 M 0.130 +595 C 0.114 +596 I 0.106 +597 P 0.097 +598 L 0.083 +599 V 0.070 +600 A 0.062 +601 L 0.056 +602 G 0.053 +603 T 0.054 +604 F 0.056 +605 I 0.058 +606 R 0.063 +607 N 0.071 +608 R 0.084 +609 L 0.113 +610 K 0.174 +611 R 0.262 +612 G 0.355 +613 G 0.424 +614 S 0.451 +615 A 0.437 +616 P 0.400 +617 V 0.363 +618 A 0.340 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036858.9_ENSMUST00000041012.10_GN:Ptcra_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036858.9_ENSMUST00000041012.10_GN:Ptcra_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f3398c454c7b2402b8ef41c30830833b3e515f77 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036858.9_ENSMUST00000041012.10_GN:Ptcra_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,200 @@ +>ENSMUSG00000036858.9|ENSMUST00000041012.10|GN:Ptcra|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.345 +2 A 0.342 +3 R 0.327 +4 T 0.297 +5 W 0.257 +6 L 0.224 +7 L 0.215 +8 L 0.236 +9 L 0.281 +10 L 0.338 +11 G 0.389 +12 V 0.420 +13 R 0.437 +14 C 0.462 +15 Q 0.507 +16 A 0.559 +17 L 0.605 +18 P 0.639 +19 S 0.661 +20 G 0.659 +21 I 0.619 +22 A 0.535 +23 G 0.425 +24 T 0.312 +25 P 0.214 +26 F 0.143 +27 P 0.102 +28 S 0.087 +29 L 0.088 +30 A 0.093 +31 P 0.094 +32 P 0.089 +33 I 0.083 +34 T 0.082 +35 L 0.090 +36 L 0.105 +37 V 0.116 +38 D 0.118 +39 G 0.113 +40 R 0.098 +41 Q 0.076 +42 H 0.054 +43 M 0.038 +44 L 0.028 +45 V 0.022 +46 V 0.021 +47 C 0.024 +48 L 0.032 +49 V 0.044 +50 L 0.056 +51 D 0.068 +52 A 0.078 +53 A 0.087 +54 P 0.105 +55 P 0.132 +56 G 0.156 +57 L 0.158 +58 D 0.136 +59 N 0.103 +60 P 0.071 +61 V 0.048 +62 W 0.043 +63 F 0.060 +64 S 0.096 +65 A 0.140 +66 G 0.177 +67 N 0.195 +68 G 0.192 +69 S 0.176 +70 A 0.152 +71 L 0.124 +72 D 0.098 +73 A 0.077 +74 F 0.066 +75 T 0.061 +76 Y 0.061 +77 G 0.064 +78 P 0.068 +79 S 0.074 +80 L 0.081 +81 A 0.088 +82 P 0.091 +83 D 0.090 +84 G 0.083 +85 T 0.069 +86 W 0.051 +87 T 0.035 +88 S 0.026 +89 L 0.022 +90 A 0.023 +91 Q 0.026 +92 L 0.031 +93 S 0.039 +94 L 0.047 +95 P 0.056 +96 S 0.064 +97 E 0.068 +98 E 0.067 +99 L 0.066 +100 E 0.070 +101 A 0.074 +102 W 0.070 +103 E 0.058 +104 P 0.045 +105 L 0.033 +106 V 0.027 +107 C 0.030 +108 H 0.046 +109 T 0.081 +110 R 0.134 +111 P 0.202 +112 G 0.272 +113 A 0.328 +114 G 0.354 +115 G 0.352 +116 Q 0.330 +117 N 0.292 +118 R 0.244 +119 S 0.197 +120 T 0.168 +121 H 0.158 +122 P 0.165 +123 L 0.190 +124 Q 0.244 +125 L 0.331 +126 S 0.443 +127 G 0.550 +128 E 0.628 +129 S 0.670 +130 S 0.686 +131 T 0.688 +132 A 0.679 +133 R 0.664 +134 S 0.647 +135 C 0.633 +136 F 0.624 +137 P 0.627 +138 E 0.637 +139 P 0.644 +140 L 0.637 +141 G 0.609 +142 G 0.556 +143 T 0.477 +144 Q 0.383 +145 R 0.297 +146 Q 0.234 +147 V 0.196 +148 L 0.175 +149 W 0.166 +150 L 0.170 +151 S 0.175 +152 L 0.174 +153 L 0.173 +154 R 0.173 +155 L 0.166 +156 L 0.150 +157 L 0.139 +158 F 0.136 +159 K 0.131 +160 L 0.118 +161 L 0.105 +162 L 0.103 +163 L 0.111 +164 D 0.119 +165 V 0.118 +166 L 0.114 +167 L 0.119 +168 T 0.137 +169 C 0.161 +170 S 0.182 +171 H 0.189 +172 L 0.185 +173 R 0.184 +174 L 0.194 +175 H 0.209 +176 V 0.226 +177 L 0.252 +178 A 0.290 +179 G 0.336 +180 Q 0.378 +181 H 0.409 +182 L 0.434 +183 Q 0.462 +184 P 0.502 +185 P 0.553 +186 P 0.608 +187 S 0.649 +188 R 0.665 +189 K 0.659 +190 S 0.641 +191 L 0.625 +192 P 0.626 +193 P 0.648 +194 T 0.677 +195 H 0.696 +196 R 0.689 +197 I 0.645 +198 W 0.568 +199 T 0.501 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036858.9_ENSMUST00000041012.10_GN:Ptcra_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036858.9_ENSMUST00000041012.10_GN:Ptcra_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0e2a78fb8fe518628353c2b024d919a6347c3723 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036858.9_ENSMUST00000041012.10_GN:Ptcra_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid @@ -0,0 +1,207 @@ +>ENSMUSG00000036858.9|ENSMUST00000041012.10|GN:Ptcra|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:7 +1 M 0.297 +2 L 0.285 +3 L 0.275 +4 H 0.273 +5 E 0.266 +6 W 0.248 +7 A 0.235 +8 M 0.239 +9 A 0.243 +10 R 0.232 +11 T 0.212 +12 W 0.194 +13 L 0.182 +14 L 0.179 +15 L 0.194 +16 L 0.228 +17 L 0.270 +18 G 0.304 +19 V 0.326 +20 R 0.357 +21 C 0.411 +22 Q 0.479 +23 A 0.543 +24 L 0.590 +25 P 0.621 +26 S 0.639 +27 G 0.635 +28 I 0.595 +29 A 0.514 +30 G 0.407 +31 T 0.298 +32 P 0.204 +33 F 0.135 +34 P 0.097 +35 S 0.084 +36 L 0.086 +37 A 0.093 +38 P 0.094 +39 P 0.090 +40 I 0.085 +41 T 0.084 +42 L 0.093 +43 L 0.107 +44 V 0.119 +45 D 0.121 +46 G 0.116 +47 R 0.101 +48 Q 0.078 +49 H 0.055 +50 M 0.038 +51 L 0.028 +52 V 0.022 +53 V 0.021 +54 C 0.024 +55 L 0.032 +56 V 0.042 +57 L 0.055 +58 D 0.067 +59 A 0.076 +60 A 0.085 +61 P 0.103 +62 P 0.130 +63 G 0.154 +64 L 0.156 +65 D 0.134 +66 N 0.101 +67 P 0.069 +68 V 0.047 +69 W 0.043 +70 F 0.061 +71 S 0.097 +72 A 0.140 +73 G 0.176 +74 N 0.194 +75 G 0.193 +76 S 0.177 +77 A 0.153 +78 L 0.124 +79 D 0.098 +80 A 0.078 +81 F 0.066 +82 T 0.061 +83 Y 0.062 +84 G 0.064 +85 P 0.068 +86 S 0.073 +87 L 0.080 +88 A 0.085 +89 P 0.088 +90 D 0.087 +91 G 0.080 +92 T 0.067 +93 W 0.049 +94 T 0.034 +95 S 0.025 +96 L 0.021 +97 A 0.022 +98 Q 0.025 +99 L 0.030 +100 S 0.037 +101 L 0.043 +102 P 0.046 +103 S 0.045 +104 E 0.045 +105 E 0.048 +106 L 0.056 +107 E 0.067 +108 A 0.073 +109 W 0.070 +110 E 0.058 +111 P 0.045 +112 L 0.034 +113 V 0.027 +114 C 0.030 +115 H 0.046 +116 T 0.081 +117 R 0.134 +118 P 0.201 +119 G 0.271 +120 A 0.326 +121 G 0.353 +122 G 0.350 +123 Q 0.325 +124 N 0.286 +125 R 0.236 +126 S 0.191 +127 T 0.162 +128 H 0.155 +129 P 0.165 +130 L 0.193 +131 Q 0.247 +132 L 0.334 +133 S 0.445 +134 G 0.553 +135 E 0.630 +136 S 0.671 +137 S 0.688 +138 T 0.690 +139 A 0.682 +140 R 0.668 +141 S 0.651 +142 C 0.636 +143 F 0.626 +144 P 0.628 +145 E 0.637 +146 P 0.643 +147 L 0.636 +148 G 0.608 +149 G 0.555 +150 T 0.476 +151 Q 0.383 +152 R 0.298 +153 Q 0.236 +154 V 0.198 +155 L 0.176 +156 W 0.167 +157 L 0.171 +158 S 0.177 +159 L 0.176 +160 L 0.175 +161 R 0.175 +162 L 0.168 +163 L 0.152 +164 L 0.140 +165 F 0.138 +166 K 0.133 +167 L 0.119 +168 L 0.107 +169 L 0.105 +170 L 0.114 +171 D 0.121 +172 V 0.121 +173 L 0.117 +174 L 0.121 +175 T 0.138 +176 C 0.161 +177 S 0.181 +178 H 0.186 +179 L 0.180 +180 R 0.177 +181 L 0.185 +182 H 0.200 +183 V 0.217 +184 L 0.244 +185 A 0.283 +186 G 0.329 +187 Q 0.370 +188 H 0.402 +189 L 0.429 +190 Q 0.460 +191 P 0.501 +192 P 0.554 +193 P 0.609 +194 S 0.651 +195 R 0.669 +196 K 0.663 +197 S 0.646 +198 L 0.630 +199 P 0.630 +200 P 0.652 +201 T 0.682 +202 H 0.700 +203 R 0.693 +204 I 0.649 +205 W 0.573 +206 T 0.508 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036890.14_ENSMUST00000112810.8_GN:Gtdc1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036890.14_ENSMUST00000112810.8_GN:Gtdc1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..3f6e42aedd2c87e1839840420804e411e8cd8299 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036890.14_ENSMUST00000112810.8_GN:Gtdc1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,446 @@ +>ENSMUSG00000036890.14|ENSMUST00000112810.8|GN:Gtdc1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.151 +2 S 0.122 +3 I 0.088 +4 V 0.071 +5 I 0.074 +6 I 0.090 +7 E 0.107 +8 A 0.119 +9 F 0.128 +10 Y 0.133 +11 G 0.127 +12 G 0.109 +13 S 0.088 +14 H 0.072 +15 R 0.063 +16 Q 0.064 +17 L 0.073 +18 V 0.082 +19 E 0.086 +20 L 0.081 +21 L 0.071 +22 R 0.060 +23 E 0.053 +24 E 0.051 +25 L 0.055 +26 D 0.064 +27 D 0.070 +28 C 0.070 +29 V 0.066 +30 L 0.066 +31 Y 0.075 +32 T 0.091 +33 L 0.109 +34 P 0.121 +35 A 0.122 +36 K 0.109 +37 K 0.086 +38 W 0.062 +39 H 0.046 +40 W 0.039 +41 R 0.040 +42 A 0.043 +43 R 0.042 +44 T 0.036 +45 A 0.031 +46 A 0.028 +47 L 0.028 +48 Y 0.028 +49 F 0.030 +50 S 0.035 +51 Q 0.045 +52 N 0.060 +53 I 0.078 +54 P 0.092 +55 S 0.103 +56 S 0.109 +57 E 0.104 +58 H 0.087 +59 Y 0.066 +60 R 0.053 +61 T 0.051 +62 L 0.055 +63 F 0.060 +64 A 0.065 +65 S 0.071 +66 S 0.078 +67 V 0.082 +68 L 0.080 +69 N 0.072 +70 L 0.060 +71 T 0.050 +72 E 0.043 +73 L 0.039 +74 A 0.040 +75 A 0.044 +76 L 0.048 +77 R 0.049 +78 P 0.047 +79 D 0.046 +80 L 0.048 +81 G 0.053 +82 K 0.058 +83 L 0.061 +84 K 0.067 +85 K 0.079 +86 I 0.097 +87 L 0.121 +88 Y 0.146 +89 F 0.164 +90 H 0.160 +91 E 0.142 +92 N 0.130 +93 Q 0.128 +94 L 0.130 +95 V 0.136 +96 Y 0.152 +97 P 0.171 +98 V 0.180 +99 K 0.178 +100 K 0.171 +101 Y 0.166 +102 Q 0.164 +103 E 0.164 +104 R 0.158 +105 D 0.140 +106 F 0.116 +107 Q 0.098 +108 Y 0.095 +109 G 0.097 +110 Y 0.093 +111 N 0.083 +112 Q 0.077 +113 I 0.076 +114 L 0.071 +115 S 0.066 +116 C 0.069 +117 L 0.086 +118 V 0.108 +119 A 0.122 +120 D 0.117 +121 V 0.106 +122 V 0.102 +123 V 0.104 +124 F 0.103 +125 N 0.098 +126 S 0.088 +127 S 0.074 +128 F 0.063 +129 N 0.057 +130 M 0.054 +131 E 0.053 +132 S 0.055 +133 F 0.055 +134 L 0.053 +135 T 0.052 +136 S 0.057 +137 I 0.063 +138 G 0.066 +139 K 0.069 +140 F 0.075 +141 L 0.082 +142 K 0.089 +143 L 0.096 +144 I 0.105 +145 P 0.115 +146 D 0.124 +147 H 0.130 +148 R 0.133 +149 P 0.132 +150 K 0.125 +151 D 0.112 +152 L 0.094 +153 E 0.074 +154 S 0.060 +155 I 0.054 +156 I 0.057 +157 R 0.059 +158 P 0.056 +159 K 0.056 +160 C 0.062 +161 Q 0.073 +162 V 0.079 +163 I 0.078 +164 Y 0.075 +165 F 0.077 +166 P 0.082 +167 I 0.090 +168 R 0.105 +169 F 0.123 +170 P 0.138 +171 D 0.142 +172 V 0.143 +173 S 0.151 +174 R 0.166 +175 F 0.179 +176 M 0.179 +177 P 0.169 +178 K 0.153 +179 H 0.136 +180 K 0.121 +181 I 0.109 +182 A 0.105 +183 H 0.104 +184 L 0.103 +185 R 0.104 +186 R 0.111 +187 M 0.130 +188 L 0.166 +189 S 0.215 +190 L 0.271 +191 I 0.338 +192 G 0.416 +193 D 0.483 +194 A 0.525 +195 A 0.552 +196 A 0.584 +197 S 0.616 +198 Q 0.637 +199 S 0.639 +200 V 0.627 +201 A 0.613 +202 P 0.604 +203 C 0.607 +204 P 0.621 +205 Q 0.632 +206 P 0.622 +207 G 0.592 +208 Q 0.577 +209 R 0.598 +210 V 0.612 +211 S 0.584 +212 E 0.554 +213 K 0.562 +214 S 0.580 +215 P 0.571 +216 E 0.557 +217 N 0.561 +218 C 0.564 +219 E 0.575 +220 S 0.616 +221 K 0.667 +222 S 0.688 +223 D 0.681 +224 E 0.673 +225 H 0.673 +226 P 0.676 +227 D 0.673 +228 L 0.663 +229 D 0.644 +230 A 0.619 +231 E 0.597 +232 Q 0.586 +233 E 0.588 +234 A 0.594 +235 L 0.603 +236 D 0.618 +237 N 0.640 +238 P 0.665 +239 S 0.686 +240 V 0.700 +241 H 0.704 +242 K 0.702 +243 S 0.694 +244 G 0.678 +245 S 0.661 +246 L 0.647 +247 P 0.636 +248 V 0.622 +249 S 0.603 +250 K 0.578 +251 E 0.545 +252 N 0.507 +253 L 0.467 +254 P 0.420 +255 L 0.362 +256 D 0.305 +257 P 0.277 +258 S 0.293 +259 T 0.343 +260 L 0.398 +261 L 0.442 +262 C 0.468 +263 G 0.467 +264 A 0.433 +265 E 0.383 +266 D 0.332 +267 P 0.288 +268 Q 0.258 +269 R 0.234 +270 P 0.197 +271 L 0.149 +272 H 0.109 +273 I 0.088 +274 T 0.083 +275 W 0.090 +276 P 0.102 +277 H 0.110 +278 R 0.111 +279 W 0.108 +280 E 0.100 +281 H 0.093 +282 D 0.091 +283 K 0.090 +284 D 0.083 +285 P 0.070 +286 E 0.057 +287 T 0.049 +288 F 0.044 +289 L 0.042 +290 K 0.044 +291 I 0.046 +292 L 0.043 +293 M 0.039 +294 S 0.041 +295 L 0.051 +296 K 0.066 +297 Q 0.078 +298 L 0.080 +299 N 0.074 +300 L 0.068 +301 N 0.061 +302 F 0.051 +303 H 0.041 +304 V 0.036 +305 S 0.037 +306 V 0.044 +307 L 0.055 +308 G 0.065 +309 E 0.069 +310 T 0.068 +311 F 0.070 +312 T 0.081 +313 D 0.094 +314 T 0.097 +315 P 0.089 +316 D 0.075 +317 I 0.065 +318 F 0.061 +319 S 0.062 +320 E 0.066 +321 A 0.071 +322 K 0.078 +323 K 0.084 +324 A 0.084 +325 L 0.078 +326 G 0.073 +327 S 0.066 +328 S 0.058 +329 V 0.050 +330 L 0.047 +331 H 0.052 +332 W 0.064 +333 G 0.074 +334 Y 0.074 +335 L 0.068 +336 P 0.062 +337 R 0.053 +338 K 0.042 +339 E 0.034 +340 D 0.030 +341 Y 0.033 +342 F 0.035 +343 R 0.034 +344 V 0.032 +345 L 0.032 +346 C 0.035 +347 M 0.040 +348 A 0.045 +349 D 0.046 +350 V 0.045 +351 V 0.046 +352 I 0.052 +353 S 0.060 +354 T 0.066 +355 A 0.067 +356 K 0.063 +357 H 0.055 +358 E 0.049 +359 F 0.048 +360 F 0.052 +361 G 0.056 +362 V 0.058 +363 A 0.060 +364 M 0.062 +365 L 0.061 +366 E 0.056 +367 A 0.049 +368 V 0.044 +369 Y 0.045 +370 C 0.055 +371 G 0.066 +372 C 0.074 +373 Y 0.082 +374 P 0.090 +375 L 0.096 +376 C 0.101 +377 P 0.101 +378 K 0.096 +379 A 0.086 +380 L 0.077 +381 V 0.070 +382 Y 0.064 +383 P 0.060 +384 E 0.060 +385 I 0.064 +386 F 0.066 +387 P 0.066 +388 A 0.065 +389 E 0.062 +390 Y 0.057 +391 L 0.052 +392 Y 0.050 +393 S 0.050 +394 T 0.050 +395 P 0.047 +396 E 0.044 +397 Q 0.045 +398 L 0.053 +399 S 0.063 +400 K 0.069 +401 R 0.064 +402 L 0.054 +403 K 0.047 +404 S 0.044 +405 F 0.047 +406 C 0.055 +407 K 0.066 +408 R 0.077 +409 P 0.085 +410 D 0.091 +411 I 0.092 +412 I 0.089 +413 R 0.088 +414 K 0.095 +415 H 0.106 +416 L 0.119 +417 Y 0.135 +418 K 0.154 +419 G 0.165 +420 E 0.159 +421 V 0.139 +422 A 0.116 +423 P 0.097 +424 F 0.084 +425 S 0.073 +426 W 0.065 +427 A 0.062 +428 A 0.061 +429 L 0.058 +430 H 0.054 +431 G 0.051 +432 K 0.051 +433 F 0.052 +434 R 0.055 +435 S 0.061 +436 L 0.075 +437 L 0.109 +438 T 0.171 +439 T 0.255 +440 E 0.341 +441 P 0.415 +442 R 0.472 +443 E 0.502 +444 D 0.493 +445 L 0.467 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036890.14_ENSMUST00000112810.8_GN:Gtdc1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:20.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036890.14_ENSMUST00000112810.8_GN:Gtdc1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:20.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5cd9f77469fa852f73cc55cff1945220988f38d3 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036890.14_ENSMUST00000112810.8_GN:Gtdc1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:20.caid @@ -0,0 +1,466 @@ +>ENSMUSG00000036890.14|ENSMUST00000112810.8|GN:Gtdc1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:20 +1 M 0.282 +2 W 0.300 +3 K 0.334 +4 C 0.371 +5 T 0.400 +6 R 0.426 +7 L 0.458 +8 D 0.483 +9 I 0.484 +10 S 0.485 +11 S 0.522 +12 S 0.580 +13 G 0.622 +14 S 0.636 +15 E 0.636 +16 G 0.625 +17 L 0.590 +18 N 0.526 +19 R 0.439 +20 P 0.334 +21 M 0.226 +22 S 0.139 +23 I 0.086 +24 V 0.067 +25 I 0.070 +26 I 0.083 +27 E 0.097 +28 A 0.108 +29 F 0.119 +30 Y 0.127 +31 G 0.124 +32 G 0.109 +33 S 0.090 +34 H 0.074 +35 R 0.066 +36 Q 0.066 +37 L 0.074 +38 V 0.083 +39 E 0.086 +40 L 0.081 +41 L 0.070 +42 R 0.059 +43 E 0.051 +44 E 0.049 +45 L 0.052 +46 D 0.058 +47 D 0.063 +48 C 0.063 +49 V 0.061 +50 L 0.062 +51 Y 0.070 +52 T 0.086 +53 L 0.104 +54 P 0.117 +55 A 0.120 +56 K 0.107 +57 K 0.085 +58 W 0.062 +59 H 0.047 +60 W 0.041 +61 R 0.041 +62 A 0.044 +63 R 0.043 +64 T 0.037 +65 A 0.032 +66 A 0.029 +67 L 0.028 +68 Y 0.028 +69 F 0.029 +70 S 0.034 +71 Q 0.043 +72 N 0.058 +73 I 0.074 +74 P 0.086 +75 S 0.096 +76 S 0.102 +77 E 0.098 +78 H 0.081 +79 Y 0.061 +80 R 0.049 +81 T 0.047 +82 L 0.051 +83 F 0.056 +84 A 0.061 +85 S 0.067 +86 S 0.074 +87 V 0.079 +88 L 0.078 +89 N 0.070 +90 L 0.059 +91 T 0.049 +92 E 0.042 +93 L 0.038 +94 A 0.038 +95 A 0.041 +96 L 0.045 +97 R 0.047 +98 P 0.045 +99 D 0.044 +100 L 0.046 +101 G 0.052 +102 K 0.056 +103 L 0.060 +104 K 0.066 +105 K 0.078 +106 I 0.096 +107 L 0.119 +108 Y 0.145 +109 F 0.162 +110 H 0.158 +111 E 0.140 +112 N 0.129 +113 Q 0.128 +114 L 0.130 +115 V 0.136 +116 Y 0.153 +117 P 0.172 +118 V 0.182 +119 K 0.180 +120 K 0.174 +121 Y 0.170 +122 Q 0.169 +123 E 0.170 +124 R 0.164 +125 D 0.144 +126 F 0.117 +127 Q 0.097 +128 Y 0.093 +129 G 0.096 +130 Y 0.094 +131 N 0.085 +132 Q 0.080 +133 I 0.078 +134 L 0.073 +135 S 0.068 +136 C 0.071 +137 L 0.088 +138 V 0.112 +139 A 0.126 +140 D 0.119 +141 V 0.106 +142 V 0.102 +143 V 0.104 +144 F 0.105 +145 N 0.100 +146 S 0.090 +147 S 0.076 +148 F 0.066 +149 N 0.060 +150 M 0.056 +151 E 0.055 +152 S 0.056 +153 F 0.056 +154 L 0.053 +155 T 0.052 +156 S 0.057 +157 I 0.062 +158 G 0.065 +159 K 0.068 +160 F 0.074 +161 L 0.081 +162 K 0.089 +163 L 0.097 +164 I 0.105 +165 P 0.115 +166 D 0.123 +167 H 0.128 +168 R 0.130 +169 P 0.128 +170 K 0.122 +171 D 0.110 +172 L 0.093 +173 E 0.074 +174 S 0.060 +175 I 0.055 +176 I 0.057 +177 R 0.058 +178 P 0.056 +179 K 0.055 +180 C 0.063 +181 Q 0.074 +182 V 0.080 +183 I 0.079 +184 Y 0.076 +185 F 0.077 +186 P 0.081 +187 I 0.089 +188 R 0.103 +189 F 0.122 +190 P 0.135 +191 D 0.139 +192 V 0.140 +193 S 0.147 +194 R 0.162 +195 F 0.174 +196 M 0.175 +197 P 0.165 +198 K 0.150 +199 H 0.133 +200 K 0.117 +201 I 0.107 +202 A 0.104 +203 H 0.104 +204 L 0.104 +205 R 0.105 +206 R 0.113 +207 M 0.134 +208 L 0.170 +209 S 0.219 +210 L 0.275 +211 I 0.344 +212 G 0.422 +213 D 0.490 +214 A 0.530 +215 A 0.557 +216 A 0.590 +217 S 0.623 +218 Q 0.644 +219 S 0.646 +220 V 0.634 +221 A 0.619 +222 P 0.609 +223 C 0.612 +224 P 0.625 +225 Q 0.635 +226 P 0.624 +227 G 0.593 +228 Q 0.578 +229 R 0.598 +230 V 0.612 +231 S 0.586 +232 E 0.557 +233 K 0.567 +234 S 0.584 +235 P 0.574 +236 E 0.559 +237 N 0.561 +238 C 0.565 +239 E 0.576 +240 S 0.618 +241 K 0.670 +242 S 0.692 +243 D 0.686 +244 E 0.677 +245 H 0.677 +246 P 0.680 +247 D 0.678 +248 L 0.669 +249 D 0.650 +250 A 0.624 +251 E 0.596 +252 Q 0.575 +253 E 0.569 +254 A 0.583 +255 L 0.605 +256 D 0.627 +257 N 0.650 +258 P 0.673 +259 S 0.692 +260 V 0.704 +261 H 0.707 +262 K 0.705 +263 S 0.695 +264 G 0.679 +265 S 0.662 +266 L 0.649 +267 P 0.639 +268 V 0.626 +269 S 0.608 +270 K 0.586 +271 E 0.557 +272 N 0.523 +273 L 0.485 +274 P 0.439 +275 L 0.380 +276 D 0.320 +277 P 0.289 +278 S 0.305 +279 T 0.355 +280 L 0.413 +281 L 0.458 +282 C 0.485 +283 G 0.482 +284 A 0.447 +285 E 0.393 +286 D 0.339 +287 P 0.293 +288 Q 0.262 +289 R 0.237 +290 P 0.200 +291 L 0.152 +292 H 0.112 +293 I 0.091 +294 T 0.086 +295 W 0.093 +296 P 0.105 +297 H 0.112 +298 R 0.113 +299 W 0.109 +300 E 0.102 +301 H 0.095 +302 D 0.093 +303 K 0.093 +304 D 0.086 +305 P 0.072 +306 E 0.059 +307 T 0.051 +308 F 0.045 +309 L 0.044 +310 K 0.045 +311 I 0.047 +312 L 0.045 +313 M 0.041 +314 S 0.042 +315 L 0.052 +316 K 0.067 +317 Q 0.079 +318 L 0.081 +319 N 0.076 +320 L 0.071 +321 N 0.064 +322 F 0.054 +323 H 0.043 +324 V 0.037 +325 S 0.038 +326 V 0.045 +327 L 0.056 +328 G 0.066 +329 E 0.070 +330 T 0.069 +331 F 0.071 +332 T 0.082 +333 D 0.094 +334 T 0.098 +335 P 0.090 +336 D 0.076 +337 I 0.065 +338 F 0.061 +339 S 0.063 +340 E 0.066 +341 A 0.070 +342 K 0.076 +343 K 0.082 +344 A 0.081 +345 L 0.076 +346 G 0.072 +347 S 0.066 +348 S 0.058 +349 V 0.050 +350 L 0.047 +351 H 0.052 +352 W 0.063 +353 G 0.073 +354 Y 0.073 +355 L 0.068 +356 P 0.061 +357 R 0.052 +358 K 0.042 +359 E 0.033 +360 D 0.030 +361 Y 0.033 +362 F 0.035 +363 R 0.034 +364 V 0.032 +365 L 0.032 +366 C 0.035 +367 M 0.040 +368 A 0.045 +369 D 0.047 +370 V 0.046 +371 V 0.048 +372 I 0.054 +373 S 0.062 +374 T 0.068 +375 A 0.069 +376 K 0.064 +377 H 0.056 +378 E 0.050 +379 F 0.049 +380 F 0.053 +381 G 0.056 +382 V 0.058 +383 A 0.061 +384 M 0.063 +385 L 0.062 +386 E 0.057 +387 A 0.050 +388 V 0.044 +389 Y 0.045 +390 C 0.054 +391 G 0.065 +392 C 0.074 +393 Y 0.082 +394 P 0.091 +395 L 0.098 +396 C 0.102 +397 P 0.103 +398 K 0.097 +399 A 0.087 +400 L 0.078 +401 V 0.070 +402 Y 0.064 +403 P 0.061 +404 E 0.061 +405 I 0.065 +406 F 0.067 +407 P 0.067 +408 A 0.066 +409 E 0.063 +410 Y 0.058 +411 L 0.054 +412 Y 0.052 +413 S 0.052 +414 T 0.052 +415 P 0.048 +416 E 0.045 +417 Q 0.046 +418 L 0.053 +419 S 0.063 +420 K 0.068 +421 R 0.063 +422 L 0.053 +423 K 0.046 +424 S 0.044 +425 F 0.047 +426 C 0.055 +427 K 0.067 +428 R 0.079 +429 P 0.087 +430 D 0.094 +431 I 0.097 +432 I 0.095 +433 R 0.094 +434 K 0.101 +435 H 0.114 +436 L 0.127 +437 Y 0.142 +438 K 0.160 +439 G 0.170 +440 E 0.162 +441 V 0.141 +442 A 0.117 +443 P 0.098 +444 F 0.085 +445 S 0.074 +446 W 0.066 +447 A 0.063 +448 A 0.062 +449 L 0.058 +450 H 0.053 +451 G 0.051 +452 K 0.051 +453 F 0.052 +454 R 0.054 +455 S 0.059 +456 L 0.073 +457 L 0.105 +458 T 0.167 +459 T 0.249 +460 E 0.333 +461 P 0.407 +462 R 0.465 +463 E 0.497 +464 D 0.490 +465 L 0.466 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036908.18_ENSMUST00000162708.7_GN:Unc93b1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036908.18_ENSMUST00000162708.7_GN:Unc93b1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..67e4a094557c8af3a992b2ffccf2162762097123 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036908.18_ENSMUST00000162708.7_GN:Unc93b1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,599 @@ +>ENSMUSG00000036908.18|ENSMUST00000162708.7|GN:Unc93b1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.353 +2 E 0.372 +3 V 0.396 +4 E 0.414 +5 P 0.421 +6 P 0.430 +7 L 0.463 +8 Y 0.520 +9 P 0.573 +10 V 0.593 +11 A 0.573 +12 G 0.526 +13 A 0.483 +14 A 0.456 +15 G 0.428 +16 P 0.404 +17 Q 0.429 +18 G 0.491 +19 D 0.531 +20 E 0.549 +21 D 0.583 +22 R 0.630 +23 H 0.663 +24 G 0.679 +25 V 0.683 +26 P 0.682 +27 D 0.681 +28 G 0.680 +29 P 0.676 +30 E 0.672 +31 A 0.666 +32 P 0.658 +33 L 0.648 +34 D 0.640 +35 E 0.633 +36 L 0.622 +37 V 0.601 +38 G 0.575 +39 A 0.557 +40 Y 0.549 +41 P 0.532 +42 N 0.488 +43 Y 0.417 +44 N 0.332 +45 E 0.257 +46 E 0.202 +47 E 0.165 +48 E 0.138 +49 E 0.117 +50 R 0.101 +51 R 0.091 +52 Y 0.086 +53 Y 0.084 +54 R 0.087 +55 R 0.093 +56 K 0.091 +57 R 0.081 +58 L 0.070 +59 G 0.063 +60 V 0.057 +61 V 0.051 +62 K 0.046 +63 N 0.041 +64 V 0.036 +65 L 0.031 +66 A 0.029 +67 A 0.031 +68 S 0.036 +69 T 0.038 +70 G 0.035 +71 V 0.029 +72 T 0.025 +73 L 0.023 +74 T 0.022 +75 Y 0.023 +76 G 0.026 +77 V 0.028 +78 Y 0.029 +79 L 0.030 +80 G 0.032 +81 L 0.033 +82 L 0.035 +83 Q 0.038 +84 M 0.039 +85 Q 0.036 +86 L 0.034 +87 I 0.038 +88 L 0.044 +89 H 0.051 +90 Y 0.057 +91 D 0.062 +92 E 0.067 +93 T 0.068 +94 Y 0.067 +95 R 0.073 +96 E 0.091 +97 V 0.123 +98 K 0.165 +99 Y 0.215 +100 G 0.269 +101 N 0.311 +102 M 0.328 +103 G 0.320 +104 L 0.291 +105 P 0.247 +106 D 0.196 +107 I 0.152 +108 D 0.121 +109 S 0.103 +110 K 0.096 +111 M 0.096 +112 L 0.093 +113 M 0.082 +114 G 0.069 +115 I 0.063 +116 N 0.061 +117 V 0.063 +118 T 0.066 +119 P 0.065 +120 I 0.062 +121 A 0.058 +122 A 0.053 +123 L 0.046 +124 L 0.038 +125 Y 0.034 +126 T 0.033 +127 P 0.031 +128 V 0.027 +129 L 0.026 +130 I 0.026 +131 R 0.024 +132 F 0.024 +133 F 0.026 +134 G 0.027 +135 T 0.025 +136 K 0.023 +137 W 0.022 +138 M 0.023 +139 M 0.024 +140 F 0.025 +141 L 0.027 +142 A 0.029 +143 V 0.030 +144 G 0.028 +145 I 0.024 +146 Y 0.020 +147 A 0.019 +148 L 0.020 +149 F 0.022 +150 V 0.025 +151 S 0.030 +152 T 0.035 +153 N 0.040 +154 Y 0.043 +155 W 0.046 +156 E 0.048 +157 R 0.046 +158 Y 0.040 +159 Y 0.035 +160 T 0.035 +161 L 0.039 +162 V 0.042 +163 P 0.046 +164 S 0.054 +165 A 0.064 +166 V 0.072 +167 A 0.077 +168 L 0.080 +169 G 0.083 +170 M 0.086 +171 A 0.087 +172 I 0.087 +173 V 0.086 +174 P 0.081 +175 L 0.071 +176 W 0.065 +177 A 0.068 +178 S 0.074 +179 M 0.071 +180 G 0.061 +181 N 0.050 +182 Y 0.044 +183 I 0.042 +184 T 0.040 +185 R 0.038 +186 M 0.036 +187 S 0.036 +188 Q 0.037 +189 K 0.039 +190 Y 0.043 +191 Y 0.048 +192 E 0.054 +193 Y 0.068 +194 S 0.093 +195 H 0.127 +196 Y 0.165 +197 K 0.209 +198 E 0.256 +199 Q 0.297 +200 D 0.321 +201 E 0.331 +202 Q 0.336 +203 G 0.348 +204 P 0.366 +205 Q 0.388 +206 Q 0.408 +207 R 0.420 +208 P 0.421 +209 P 0.410 +210 R 0.390 +211 G 0.361 +212 S 0.324 +213 H 0.277 +214 A 0.224 +215 P 0.174 +216 Y 0.139 +217 L 0.117 +218 L 0.099 +219 V 0.082 +220 F 0.073 +221 Q 0.069 +222 A 0.065 +223 I 0.060 +224 F 0.059 +225 Y 0.058 +226 S 0.055 +227 F 0.050 +228 F 0.049 +229 H 0.049 +230 L 0.046 +231 S 0.041 +232 F 0.037 +233 A 0.036 +234 C 0.039 +235 A 0.044 +236 Q 0.047 +237 L 0.048 +238 P 0.047 +239 M 0.046 +240 I 0.045 +241 Y 0.045 +242 F 0.051 +243 L 0.066 +244 N 0.084 +245 N 0.102 +246 Y 0.120 +247 L 0.142 +248 Y 0.170 +249 D 0.198 +250 L 0.221 +251 N 0.235 +252 H 0.245 +253 T 0.249 +254 L 0.242 +255 I 0.226 +256 N 0.208 +257 V 0.192 +258 Q 0.173 +259 S 0.157 +260 C 0.159 +261 G 0.192 +262 T 0.241 +263 K 0.288 +264 S 0.327 +265 Q 0.367 +266 G 0.410 +267 I 0.452 +268 L 0.489 +269 N 0.512 +270 G 0.508 +271 F 0.475 +272 N 0.426 +273 K 0.382 +274 T 0.361 +275 V 0.353 +276 L 0.335 +277 R 0.297 +278 T 0.257 +279 L 0.231 +280 P 0.210 +281 R 0.181 +282 S 0.145 +283 K 0.110 +284 N 0.086 +285 L 0.070 +286 I 0.063 +287 V 0.065 +288 V 0.072 +289 E 0.080 +290 S 0.083 +291 V 0.083 +292 L 0.085 +293 M 0.088 +294 A 0.087 +295 V 0.080 +296 A 0.068 +297 F 0.056 +298 L 0.049 +299 A 0.048 +300 M 0.047 +301 L 0.047 +302 M 0.051 +303 V 0.058 +304 L 0.061 +305 G 0.062 +306 L 0.067 +307 C 0.080 +308 G 0.097 +309 A 0.112 +310 A 0.120 +311 Y 0.121 +312 R 0.128 +313 P 0.147 +314 T 0.174 +315 E 0.202 +316 E 0.220 +317 I 0.223 +318 D 0.213 +319 L 0.194 +320 R 0.171 +321 S 0.149 +322 V 0.128 +323 G 0.110 +324 W 0.097 +325 G 0.091 +326 N 0.087 +327 I 0.079 +328 F 0.068 +329 Q 0.058 +330 L 0.049 +331 P 0.041 +332 F 0.036 +333 K 0.038 +334 H 0.044 +335 V 0.048 +336 R 0.049 +337 D 0.049 +338 F 0.048 +339 R 0.047 +340 L 0.046 +341 R 0.048 +342 H 0.055 +343 L 0.062 +344 V 0.063 +345 P 0.056 +346 F 0.047 +347 F 0.042 +348 I 0.039 +349 Y 0.036 +350 S 0.035 +351 G 0.035 +352 F 0.034 +353 E 0.032 +354 V 0.031 +355 L 0.034 +356 F 0.039 +357 A 0.044 +358 C 0.053 +359 T 0.065 +360 G 0.075 +361 F 0.075 +362 A 0.068 +363 L 0.065 +364 G 0.066 +365 Y 0.069 +366 G 0.070 +367 V 0.077 +368 C 0.092 +369 S 0.104 +370 M 0.104 +371 G 0.092 +372 L 0.075 +373 E 0.061 +374 R 0.057 +375 L 0.059 +376 A 0.063 +377 Y 0.070 +378 L 0.078 +379 L 0.079 +380 I 0.069 +381 A 0.059 +382 Y 0.056 +383 S 0.060 +384 L 0.063 +385 G 0.063 +386 A 0.060 +387 S 0.056 +388 A 0.053 +389 S 0.051 +390 S 0.047 +391 V 0.044 +392 L 0.045 +393 G 0.047 +394 L 0.046 +395 L 0.047 +396 G 0.052 +397 L 0.055 +398 W 0.055 +399 L 0.053 +400 P 0.050 +401 R 0.046 +402 S 0.043 +403 V 0.040 +404 P 0.038 +405 L 0.038 +406 V 0.042 +407 A 0.046 +408 G 0.047 +409 A 0.045 +410 G 0.042 +411 L 0.038 +412 H 0.035 +413 L 0.032 +414 L 0.032 +415 L 0.033 +416 T 0.033 +417 L 0.031 +418 S 0.029 +419 L 0.029 +420 F 0.030 +421 F 0.033 +422 W 0.042 +423 A 0.053 +424 P 0.064 +425 A 0.073 +426 P 0.080 +427 R 0.084 +428 V 0.089 +429 L 0.094 +430 Q 0.095 +431 H 0.086 +432 S 0.069 +433 W 0.053 +434 I 0.044 +435 F 0.041 +436 Y 0.040 +437 F 0.040 +438 V 0.040 +439 A 0.040 +440 A 0.042 +441 L 0.050 +442 W 0.066 +443 G 0.088 +444 V 0.107 +445 G 0.121 +446 S 0.128 +447 A 0.125 +448 L 0.111 +449 N 0.097 +450 K 0.089 +451 T 0.087 +452 G 0.089 +453 L 0.089 +454 S 0.083 +455 T 0.075 +456 L 0.072 +457 L 0.070 +458 G 0.065 +459 I 0.060 +460 L 0.057 +461 Y 0.058 +462 E 0.061 +463 D 0.064 +464 K 0.064 +465 E 0.060 +466 R 0.056 +467 Q 0.053 +468 D 0.052 +469 F 0.051 +470 I 0.049 +471 F 0.047 +472 T 0.048 +473 I 0.053 +474 Y 0.057 +475 H 0.058 +476 W 0.052 +477 W 0.045 +478 Q 0.040 +479 A 0.037 +480 V 0.036 +481 A 0.035 +482 I 0.033 +483 F 0.030 +484 V 0.030 +485 V 0.034 +486 Y 0.044 +487 L 0.061 +488 G 0.081 +489 S 0.095 +490 S 0.099 +491 L 0.094 +492 P 0.082 +493 M 0.068 +494 K 0.055 +495 A 0.048 +496 K 0.050 +497 L 0.056 +498 A 0.062 +499 V 0.065 +500 L 0.064 +501 L 0.060 +502 V 0.053 +503 T 0.047 +504 L 0.043 +505 V 0.042 +506 A 0.046 +507 A 0.055 +508 A 0.065 +509 A 0.067 +510 S 0.058 +511 Y 0.045 +512 L 0.038 +513 W 0.040 +514 M 0.051 +515 E 0.070 +516 Q 0.086 +517 K 0.096 +518 L 0.106 +519 Q 0.125 +520 Q 0.156 +521 G 0.199 +522 L 0.252 +523 V 0.310 +524 P 0.361 +525 R 0.400 +526 Q 0.429 +527 P 0.450 +528 R 0.464 +529 I 0.479 +530 P 0.498 +531 K 0.525 +532 P 0.557 +533 Q 0.584 +534 H 0.599 +535 K 0.606 +536 V 0.609 +537 R 0.611 +538 G 0.611 +539 Y 0.614 +540 R 0.621 +541 Y 0.633 +542 L 0.648 +543 E 0.663 +544 E 0.678 +545 D 0.691 +546 N 0.702 +547 S 0.712 +548 D 0.721 +549 E 0.727 +550 S 0.731 +551 D 0.729 +552 M 0.714 +553 E 0.664 +554 G 0.571 +555 E 0.488 +556 Q 0.495 +557 G 0.593 +558 Q 0.702 +559 G 0.763 +560 D 0.767 +561 C 0.723 +562 A 0.655 +563 E 0.616 +564 D 0.637 +565 E 0.684 +566 A 0.716 +567 P 0.732 +568 Q 0.742 +569 A 0.746 +570 G 0.746 +571 P 0.745 +572 L 0.743 +573 G 0.736 +574 A 0.721 +575 E 0.708 +576 P 0.703 +577 A 0.701 +578 G 0.698 +579 P 0.690 +580 C 0.676 +581 R 0.651 +582 K 0.620 +583 P 0.597 +584 C 0.592 +585 P 0.607 +586 Y 0.639 +587 E 0.676 +588 Q 0.704 +589 A 0.716 +590 L 0.720 +591 G 0.721 +592 G 0.722 +593 D 0.722 +594 G 0.722 +595 P 0.718 +596 E 0.702 +597 E 0.671 +598 Q 0.645 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036908.18_ENSMUST00000162708.7_GN:Unc93b1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:21.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036908.18_ENSMUST00000162708.7_GN:Unc93b1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:21.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..70b193a1cd4785307c6f7d7f6a5951e4693e365f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036908.18_ENSMUST00000162708.7_GN:Unc93b1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:21.caid @@ -0,0 +1,620 @@ +>ENSMUSG00000036908.18|ENSMUST00000162708.7|GN:Unc93b1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:21 +1 M 0.372 +2 K 0.387 +3 E 0.405 +4 V 0.413 +5 P 0.403 +6 T 0.385 +7 S 0.369 +8 C 0.362 +9 W 0.368 +10 C 0.382 +11 P 0.394 +12 E 0.394 +13 L 0.384 +14 Q 0.377 +15 A 0.392 +16 L 0.429 +17 D 0.461 +18 L 0.475 +19 D 0.480 +20 L 0.482 +21 V 0.479 +22 M 0.477 +23 E 0.479 +24 V 0.481 +25 E 0.484 +26 P 0.499 +27 P 0.529 +28 L 0.571 +29 Y 0.621 +30 P 0.670 +31 V 0.699 +32 A 0.685 +33 G 0.631 +34 A 0.579 +35 A 0.560 +36 G 0.559 +37 P 0.570 +38 Q 0.602 +39 G 0.626 +40 D 0.607 +41 E 0.578 +42 D 0.570 +43 R 0.571 +44 H 0.581 +45 G 0.620 +46 V 0.672 +47 P 0.703 +48 D 0.713 +49 G 0.711 +50 P 0.706 +51 E 0.700 +52 A 0.696 +53 P 0.695 +54 L 0.697 +55 D 0.701 +56 E 0.700 +57 L 0.690 +58 V 0.667 +59 G 0.641 +60 A 0.623 +61 Y 0.610 +62 P 0.584 +63 N 0.529 +64 Y 0.444 +65 N 0.348 +66 E 0.265 +67 E 0.205 +68 E 0.163 +69 E 0.132 +70 E 0.110 +71 R 0.094 +72 R 0.086 +73 Y 0.082 +74 Y 0.081 +75 R 0.084 +76 R 0.088 +77 K 0.085 +78 R 0.075 +79 L 0.064 +80 G 0.057 +81 V 0.053 +82 V 0.048 +83 K 0.043 +84 N 0.039 +85 V 0.034 +86 L 0.030 +87 A 0.028 +88 A 0.030 +89 S 0.035 +90 T 0.038 +91 G 0.035 +92 V 0.029 +93 T 0.024 +94 L 0.023 +95 T 0.022 +96 Y 0.023 +97 G 0.026 +98 V 0.027 +99 Y 0.028 +100 L 0.029 +101 G 0.031 +102 L 0.032 +103 L 0.033 +104 Q 0.035 +105 M 0.035 +106 Q 0.032 +107 L 0.030 +108 I 0.034 +109 L 0.041 +110 H 0.048 +111 Y 0.054 +112 D 0.060 +113 E 0.065 +114 T 0.067 +115 Y 0.069 +116 R 0.075 +117 E 0.095 +118 V 0.129 +119 K 0.172 +120 Y 0.225 +121 G 0.281 +122 N 0.325 +123 M 0.343 +124 G 0.334 +125 L 0.305 +126 P 0.260 +127 D 0.206 +128 I 0.159 +129 D 0.126 +130 S 0.105 +131 K 0.096 +132 M 0.096 +133 L 0.094 +134 M 0.083 +135 G 0.070 +136 I 0.063 +137 N 0.060 +138 V 0.062 +139 T 0.064 +140 P 0.063 +141 I 0.060 +142 A 0.056 +143 A 0.052 +144 L 0.045 +145 L 0.037 +146 Y 0.033 +147 T 0.033 +148 P 0.030 +149 V 0.027 +150 L 0.026 +151 I 0.026 +152 R 0.024 +153 F 0.024 +154 F 0.026 +155 G 0.027 +156 T 0.025 +157 K 0.022 +158 W 0.021 +159 M 0.022 +160 M 0.022 +161 F 0.023 +162 L 0.026 +163 A 0.028 +164 V 0.029 +165 G 0.027 +166 I 0.023 +167 Y 0.019 +168 A 0.019 +169 L 0.020 +170 F 0.021 +171 V 0.025 +172 S 0.030 +173 T 0.035 +174 N 0.039 +175 Y 0.042 +176 W 0.045 +177 E 0.047 +178 R 0.045 +179 Y 0.039 +180 Y 0.033 +181 T 0.033 +182 L 0.036 +183 V 0.040 +184 P 0.044 +185 S 0.052 +186 A 0.062 +187 V 0.070 +188 A 0.075 +189 L 0.077 +190 G 0.080 +191 M 0.084 +192 A 0.085 +193 I 0.084 +194 V 0.083 +195 P 0.078 +196 L 0.069 +197 W 0.063 +198 A 0.066 +199 S 0.072 +200 M 0.069 +201 G 0.059 +202 N 0.049 +203 Y 0.043 +204 I 0.041 +205 T 0.039 +206 R 0.036 +207 M 0.034 +208 S 0.033 +209 Q 0.034 +210 K 0.036 +211 Y 0.040 +212 Y 0.044 +213 E 0.050 +214 Y 0.062 +215 S 0.084 +216 H 0.116 +217 Y 0.154 +218 K 0.197 +219 E 0.244 +220 Q 0.286 +221 D 0.311 +222 E 0.322 +223 Q 0.330 +224 G 0.343 +225 P 0.361 +226 Q 0.382 +227 Q 0.401 +228 R 0.413 +229 P 0.416 +230 P 0.407 +231 R 0.388 +232 G 0.359 +233 S 0.320 +234 H 0.271 +235 A 0.215 +236 P 0.164 +237 Y 0.129 +238 L 0.109 +239 L 0.093 +240 V 0.079 +241 F 0.070 +242 Q 0.067 +243 A 0.064 +244 I 0.059 +245 F 0.058 +246 Y 0.058 +247 S 0.055 +248 F 0.050 +249 F 0.048 +250 H 0.047 +251 L 0.044 +252 S 0.039 +253 F 0.034 +254 A 0.034 +255 C 0.036 +256 A 0.041 +257 Q 0.044 +258 L 0.045 +259 P 0.045 +260 M 0.044 +261 I 0.042 +262 Y 0.042 +263 F 0.049 +264 L 0.064 +265 N 0.082 +266 N 0.101 +267 Y 0.119 +268 L 0.141 +269 Y 0.168 +270 D 0.197 +271 L 0.221 +272 N 0.237 +273 H 0.247 +274 T 0.251 +275 L 0.244 +276 I 0.226 +277 N 0.206 +278 V 0.188 +279 Q 0.170 +280 S 0.154 +281 C 0.157 +282 G 0.190 +283 T 0.240 +284 K 0.288 +285 S 0.327 +286 Q 0.367 +287 G 0.409 +288 I 0.452 +289 L 0.490 +290 N 0.514 +291 G 0.510 +292 F 0.475 +293 N 0.425 +294 K 0.383 +295 T 0.363 +296 V 0.357 +297 L 0.339 +298 R 0.301 +299 T 0.260 +300 L 0.232 +301 P 0.210 +302 R 0.180 +303 S 0.143 +304 K 0.109 +305 N 0.084 +306 L 0.069 +307 I 0.062 +308 V 0.064 +309 V 0.071 +310 E 0.079 +311 S 0.082 +312 V 0.083 +313 L 0.085 +314 M 0.088 +315 A 0.088 +316 V 0.080 +317 A 0.068 +318 F 0.056 +319 L 0.049 +320 A 0.048 +321 M 0.046 +322 L 0.046 +323 M 0.051 +324 V 0.057 +325 L 0.060 +326 G 0.062 +327 L 0.068 +328 C 0.081 +329 G 0.099 +330 A 0.114 +331 A 0.122 +332 Y 0.123 +333 R 0.130 +334 P 0.149 +335 T 0.175 +336 E 0.202 +337 E 0.220 +338 I 0.224 +339 D 0.214 +340 L 0.196 +341 R 0.172 +342 S 0.148 +343 V 0.126 +344 G 0.107 +345 W 0.094 +346 G 0.087 +347 N 0.082 +348 I 0.074 +349 F 0.064 +350 Q 0.054 +351 L 0.046 +352 P 0.038 +353 F 0.034 +354 K 0.036 +355 H 0.041 +356 V 0.045 +357 R 0.047 +358 D 0.047 +359 F 0.046 +360 R 0.045 +361 L 0.044 +362 R 0.046 +363 H 0.053 +364 L 0.061 +365 V 0.062 +366 P 0.055 +367 F 0.046 +368 F 0.040 +369 I 0.038 +370 Y 0.035 +371 S 0.034 +372 G 0.034 +373 F 0.033 +374 E 0.031 +375 V 0.030 +376 L 0.033 +377 F 0.037 +378 A 0.043 +379 C 0.052 +380 T 0.064 +381 G 0.075 +382 F 0.075 +383 A 0.069 +384 L 0.066 +385 G 0.067 +386 Y 0.070 +387 G 0.071 +388 V 0.078 +389 C 0.092 +390 S 0.104 +391 M 0.103 +392 G 0.090 +393 L 0.073 +394 E 0.060 +395 R 0.056 +396 L 0.058 +397 A 0.062 +398 Y 0.068 +399 L 0.076 +400 L 0.077 +401 I 0.067 +402 A 0.057 +403 Y 0.055 +404 S 0.058 +405 L 0.061 +406 G 0.061 +407 A 0.059 +408 S 0.056 +409 A 0.053 +410 S 0.050 +411 S 0.046 +412 V 0.043 +413 L 0.043 +414 G 0.043 +415 L 0.043 +416 L 0.044 +417 G 0.049 +418 L 0.052 +419 W 0.053 +420 L 0.052 +421 P 0.049 +422 R 0.046 +423 S 0.042 +424 V 0.040 +425 P 0.037 +426 L 0.038 +427 V 0.041 +428 A 0.045 +429 G 0.046 +430 A 0.044 +431 G 0.041 +432 L 0.037 +433 H 0.034 +434 L 0.032 +435 L 0.032 +436 L 0.033 +437 T 0.033 +438 L 0.031 +439 S 0.030 +440 L 0.030 +441 F 0.031 +442 F 0.035 +443 W 0.043 +444 A 0.055 +445 P 0.066 +446 A 0.075 +447 P 0.082 +448 R 0.086 +449 V 0.092 +450 L 0.098 +451 Q 0.098 +452 H 0.089 +453 S 0.071 +454 W 0.054 +455 I 0.045 +456 F 0.042 +457 Y 0.041 +458 F 0.041 +459 V 0.042 +460 A 0.042 +461 A 0.044 +462 L 0.052 +463 W 0.069 +464 G 0.092 +465 V 0.112 +466 G 0.126 +467 S 0.133 +468 A 0.130 +469 L 0.116 +470 N 0.102 +471 K 0.093 +472 T 0.091 +473 G 0.093 +474 L 0.092 +475 S 0.086 +476 T 0.078 +477 L 0.074 +478 L 0.072 +479 G 0.068 +480 I 0.063 +481 L 0.060 +482 Y 0.061 +483 E 0.064 +484 D 0.067 +485 K 0.067 +486 E 0.063 +487 R 0.058 +488 Q 0.055 +489 D 0.054 +490 F 0.053 +491 I 0.051 +492 F 0.049 +493 T 0.050 +494 I 0.054 +495 Y 0.059 +496 H 0.059 +497 W 0.053 +498 W 0.046 +499 Q 0.041 +500 A 0.038 +501 V 0.037 +502 A 0.036 +503 I 0.033 +504 F 0.030 +505 V 0.030 +506 V 0.034 +507 Y 0.045 +508 L 0.062 +509 G 0.083 +510 S 0.098 +511 S 0.102 +512 L 0.096 +513 P 0.084 +514 M 0.070 +515 K 0.057 +516 A 0.050 +517 K 0.051 +518 L 0.057 +519 A 0.063 +520 V 0.066 +521 L 0.066 +522 L 0.062 +523 V 0.054 +524 T 0.048 +525 L 0.044 +526 V 0.043 +527 A 0.047 +528 A 0.056 +529 A 0.066 +530 A 0.068 +531 S 0.059 +532 Y 0.046 +533 L 0.039 +534 W 0.040 +535 M 0.051 +536 E 0.070 +537 Q 0.087 +538 K 0.097 +539 L 0.107 +540 Q 0.127 +541 Q 0.159 +542 G 0.202 +543 L 0.255 +544 V 0.314 +545 P 0.365 +546 R 0.403 +547 Q 0.432 +548 P 0.452 +549 R 0.466 +550 I 0.480 +551 P 0.499 +552 K 0.526 +553 P 0.559 +554 Q 0.586 +555 H 0.600 +556 K 0.606 +557 V 0.610 +558 R 0.612 +559 G 0.612 +560 Y 0.613 +561 R 0.619 +562 Y 0.630 +563 L 0.644 +564 E 0.660 +565 E 0.676 +566 D 0.689 +567 N 0.700 +568 S 0.710 +569 D 0.719 +570 E 0.725 +571 S 0.727 +572 D 0.726 +573 M 0.711 +574 E 0.661 +575 G 0.568 +576 E 0.485 +577 Q 0.492 +578 G 0.591 +579 Q 0.701 +580 G 0.762 +581 D 0.767 +582 C 0.722 +583 A 0.654 +584 E 0.615 +585 D 0.637 +586 E 0.684 +587 A 0.716 +588 P 0.731 +589 Q 0.741 +590 A 0.746 +591 G 0.745 +592 P 0.745 +593 L 0.743 +594 G 0.735 +595 A 0.721 +596 E 0.708 +597 P 0.702 +598 A 0.700 +599 G 0.697 +600 P 0.690 +601 C 0.675 +602 R 0.651 +603 K 0.620 +604 P 0.598 +605 C 0.593 +606 P 0.608 +607 Y 0.639 +608 E 0.676 +609 Q 0.704 +610 A 0.717 +611 L 0.721 +612 G 0.723 +613 G 0.724 +614 D 0.724 +615 G 0.722 +616 P 0.717 +617 E 0.698 +618 E 0.664 +619 Q 0.636 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036949.17_ENSMUST00000082290.8_GN:Slc39a12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036949.17_ENSMUST00000082290.8_GN:Slc39a12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1c06703c00e4e10f7fd65fca51c2e2a35897bc12 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036949.17_ENSMUST00000082290.8_GN:Slc39a12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,690 @@ +>ENSMUSG00000036949.17|ENSMUST00000082290.8|GN:Slc39a12|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.162 +2 C 0.139 +3 F 0.109 +4 W 0.090 +5 T 0.085 +6 N 0.087 +7 L 0.087 +8 S 0.089 +9 V 0.089 +10 W 0.086 +11 M 0.082 +12 I 0.081 +13 L 0.083 +14 L 0.093 +15 S 0.111 +16 H 0.129 +17 S 0.141 +18 L 0.157 +19 S 0.189 +20 L 0.234 +21 V 0.276 +22 S 0.302 +23 S 0.321 +24 T 0.348 +25 E 0.390 +26 T 0.436 +27 G 0.461 +28 K 0.460 +29 T 0.456 +30 L 0.459 +31 T 0.462 +32 Q 0.462 +33 N 0.462 +34 N 0.450 +35 S 0.420 +36 R 0.374 +37 A 0.323 +38 G 0.267 +39 S 0.203 +40 Q 0.139 +41 G 0.089 +42 L 0.055 +43 L 0.034 +44 E 0.023 +45 V 0.018 +46 L 0.017 +47 R 0.019 +48 V 0.024 +49 L 0.034 +50 S 0.050 +51 A 0.064 +52 G 0.072 +53 D 0.070 +54 H 0.064 +55 W 0.064 +56 S 0.069 +57 L 0.074 +58 N 0.077 +59 H 0.075 +60 P 0.065 +61 Q 0.052 +62 S 0.042 +63 L 0.038 +64 I 0.040 +65 K 0.042 +66 I 0.042 +67 L 0.042 +68 L 0.042 +69 E 0.047 +70 R 0.060 +71 T 0.087 +72 G 0.125 +73 C 0.161 +74 P 0.184 +75 Q 0.196 +76 R 0.201 +77 T 0.201 +78 D 0.197 +79 W 0.198 +80 T 0.207 +81 Q 0.217 +82 G 0.217 +83 D 0.201 +84 C 0.174 +85 K 0.143 +86 L 0.117 +87 C 0.096 +88 L 0.080 +89 E 0.068 +90 A 0.060 +91 D 0.058 +92 A 0.062 +93 L 0.074 +94 L 0.088 +95 L 0.102 +96 T 0.120 +97 A 0.145 +98 G 0.175 +99 G 0.198 +100 N 0.198 +101 L 0.172 +102 E 0.135 +103 D 0.106 +104 E 0.090 +105 L 0.080 +106 R 0.065 +107 E 0.050 +108 E 0.041 +109 V 0.037 +110 V 0.035 +111 Q 0.035 +112 R 0.037 +113 V 0.039 +114 S 0.038 +115 L 0.037 +116 L 0.034 +117 L 0.028 +118 L 0.021 +119 Y 0.016 +120 Y 0.014 +121 I 0.014 +122 I 0.015 +123 H 0.018 +124 Q 0.023 +125 E 0.030 +126 E 0.040 +127 I 0.051 +128 C 0.061 +129 S 0.064 +130 S 0.063 +131 K 0.063 +132 L 0.063 +133 N 0.062 +134 M 0.059 +135 S 0.054 +136 N 0.047 +137 R 0.038 +138 E 0.031 +139 Y 0.027 +140 E 0.024 +141 F 0.022 +142 Y 0.023 +143 L 0.027 +144 H 0.030 +145 S 0.037 +146 L 0.052 +147 L 0.075 +148 G 0.102 +149 L 0.124 +150 R 0.137 +151 Q 0.143 +152 D 0.144 +153 E 0.138 +154 D 0.123 +155 S 0.113 +156 Y 0.115 +157 F 0.121 +158 L 0.117 +159 S 0.099 +160 E 0.075 +161 K 0.058 +162 E 0.050 +163 T 0.049 +164 D 0.047 +165 D 0.041 +166 I 0.035 +167 L 0.031 +168 A 0.030 +169 F 0.029 +170 T 0.028 +171 R 0.031 +172 K 0.041 +173 Y 0.060 +174 F 0.092 +175 G 0.135 +176 T 0.178 +177 S 0.206 +178 S 0.207 +179 S 0.187 +180 Q 0.159 +181 C 0.136 +182 M 0.120 +183 E 0.103 +184 T 0.084 +185 K 0.070 +186 I 0.067 +187 L 0.072 +188 Q 0.082 +189 R 0.093 +190 E 0.114 +191 S 0.146 +192 G 0.187 +193 I 0.226 +194 Q 0.255 +195 G 0.266 +196 S 0.259 +197 N 0.247 +198 G 0.231 +199 A 0.204 +200 D 0.160 +201 E 0.114 +202 K 0.083 +203 T 0.066 +204 L 0.056 +205 P 0.048 +206 Q 0.042 +207 L 0.040 +208 A 0.037 +209 A 0.034 +210 T 0.031 +211 I 0.029 +212 I 0.028 +213 A 0.027 +214 L 0.028 +215 S 0.031 +216 L 0.040 +217 Q 0.059 +218 G 0.085 +219 V 0.109 +220 C 0.122 +221 L 0.125 +222 G 0.121 +223 R 0.114 +224 K 0.106 +225 A 0.099 +226 L 0.092 +227 P 0.085 +228 S 0.075 +229 P 0.062 +230 D 0.048 +231 D 0.035 +232 F 0.025 +233 T 0.020 +234 E 0.020 +235 Y 0.024 +236 I 0.026 +237 F 0.027 +238 S 0.027 +239 F 0.029 +240 L 0.033 +241 N 0.038 +242 S 0.042 +243 T 0.046 +244 N 0.055 +245 T 0.068 +246 L 0.073 +247 H 0.062 +248 L 0.046 +249 S 0.037 +250 E 0.038 +251 I 0.042 +252 E 0.045 +253 Q 0.048 +254 L 0.050 +255 L 0.050 +256 N 0.052 +257 M 0.057 +258 L 0.067 +259 T 0.080 +260 T 0.094 +261 R 0.110 +262 R 0.126 +263 T 0.141 +264 C 0.159 +265 A 0.184 +266 K 0.211 +267 E 0.223 +268 D 0.212 +269 K 0.187 +270 Y 0.168 +271 L 0.167 +272 H 0.177 +273 Q 0.187 +274 Y 0.192 +275 Q 0.206 +276 R 0.240 +277 K 0.295 +278 Q 0.349 +279 N 0.385 +280 T 0.421 +281 E 0.477 +282 E 0.538 +283 H 0.578 +284 S 0.594 +285 L 0.596 +286 R 0.596 +287 D 0.603 +288 P 0.611 +289 K 0.606 +290 T 0.578 +291 S 0.540 +292 T 0.529 +293 A 0.569 +294 M 0.629 +295 D 0.667 +296 K 0.673 +297 E 0.662 +298 S 0.648 +299 D 0.637 +300 D 0.622 +301 H 0.601 +302 S 0.580 +303 P 0.564 +304 S 0.545 +305 W 0.518 +306 D 0.480 +307 Q 0.419 +308 A 0.328 +309 C 0.227 +310 F 0.143 +311 S 0.088 +312 A 0.057 +313 R 0.043 +314 Q 0.039 +315 L 0.038 +316 V 0.036 +317 E 0.035 +318 I 0.038 +319 F 0.047 +320 L 0.065 +321 Q 0.093 +322 N 0.118 +323 H 0.126 +324 S 0.117 +325 S 0.099 +326 L 0.084 +327 S 0.077 +328 I 0.070 +329 S 0.060 +330 K 0.051 +331 E 0.046 +332 D 0.045 +333 F 0.043 +334 K 0.041 +335 Q 0.043 +336 L 0.047 +337 S 0.048 +338 P 0.047 +339 G 0.044 +340 I 0.041 +341 I 0.037 +342 Q 0.036 +343 Q 0.042 +344 L 0.059 +345 L 0.087 +346 S 0.122 +347 C 0.160 +348 S 0.200 +349 C 0.246 +350 Q 0.303 +351 M 0.371 +352 P 0.438 +353 K 0.491 +354 D 0.518 +355 Q 0.519 +356 Q 0.502 +357 A 0.478 +358 K 0.454 +359 P 0.425 +360 P 0.381 +361 P 0.317 +362 T 0.248 +363 T 0.190 +364 L 0.149 +365 E 0.119 +366 K 0.096 +367 Y 0.080 +368 G 0.074 +369 Y 0.077 +370 S 0.083 +371 T 0.087 +372 V 0.092 +373 A 0.098 +374 V 0.102 +375 T 0.103 +376 L 0.104 +377 L 0.106 +378 T 0.102 +379 L 0.096 +380 G 0.094 +381 S 0.089 +382 M 0.079 +383 L 0.069 +384 G 0.064 +385 T 0.063 +386 A 0.061 +387 L 0.059 +388 V 0.061 +389 L 0.076 +390 F 0.107 +391 H 0.140 +392 S 0.157 +393 C 0.152 +394 E 0.136 +395 E 0.122 +396 N 0.106 +397 Y 0.088 +398 S 0.071 +399 L 0.062 +400 I 0.056 +401 L 0.051 +402 Q 0.045 +403 L 0.040 +404 F 0.040 +405 V 0.044 +406 G 0.049 +407 L 0.055 +408 A 0.061 +409 V 0.064 +410 G 0.070 +411 T 0.086 +412 L 0.108 +413 S 0.120 +414 G 0.120 +415 D 0.117 +416 A 0.114 +417 L 0.110 +418 L 0.110 +419 H 0.117 +420 L 0.126 +421 I 0.139 +422 P 0.164 +423 Q 0.195 +424 V 0.217 +425 L 0.239 +426 G 0.281 +427 L 0.347 +428 H 0.419 +429 K 0.477 +430 Q 0.519 +431 E 0.548 +432 A 0.566 +433 E 0.573 +434 F 0.573 +435 G 0.565 +436 H 0.554 +437 F 0.544 +438 H 0.535 +439 E 0.516 +440 S 0.470 +441 Q 0.393 +442 S 0.295 +443 P 0.200 +444 I 0.133 +445 W 0.104 +446 K 0.101 +447 L 0.099 +448 L 0.090 +449 G 0.079 +450 L 0.072 +451 L 0.070 +452 G 0.069 +453 G 0.066 +454 I 0.065 +455 H 0.067 +456 G 0.069 +457 F 0.066 +458 F 0.061 +459 L 0.065 +460 I 0.076 +461 E 0.082 +462 K 0.081 +463 C 0.084 +464 F 0.099 +465 I 0.121 +466 L 0.151 +467 L 0.199 +468 V 0.274 +469 S 0.366 +470 P 0.455 +471 N 0.527 +472 T 0.579 +473 K 0.616 +474 G 0.641 +475 L 0.655 +476 P 0.663 +477 L 0.670 +478 V 0.674 +479 N 0.673 +480 E 0.661 +481 H 0.646 +482 V 0.637 +483 G 0.636 +484 H 0.641 +485 T 0.649 +486 H 0.662 +487 H 0.682 +488 L 0.705 +489 G 0.720 +490 L 0.726 +491 N 0.732 +492 P 0.745 +493 E 0.760 +494 L 0.770 +495 N 0.774 +496 D 0.773 +497 Q 0.768 +498 S 0.764 +499 S 0.764 +500 G 0.767 +501 G 0.774 +502 K 0.778 +503 S 0.769 +504 I 0.733 +505 S 0.673 +506 T 0.639 +507 I 0.664 +508 Q 0.716 +509 L 0.746 +510 K 0.751 +511 G 0.752 +512 P 0.761 +513 E 0.777 +514 D 0.792 +515 S 0.801 +516 Q 0.806 +517 T 0.805 +518 T 0.794 +519 V 0.776 +520 L 0.764 +521 P 0.763 +522 I 0.772 +523 G 0.779 +524 N 0.777 +525 V 0.768 +526 P 0.764 +527 A 0.763 +528 S 0.755 +529 N 0.733 +530 R 0.704 +531 N 0.670 +532 G 0.622 +533 K 0.550 +534 T 0.450 +535 I 0.337 +536 S 0.233 +537 L 0.159 +538 L 0.118 +539 A 0.102 +540 I 0.096 +541 M 0.098 +542 I 0.109 +543 L 0.128 +544 V 0.143 +545 G 0.150 +546 D 0.153 +547 S 0.148 +548 L 0.134 +549 H 0.116 +550 N 0.105 +551 F 0.103 +552 A 0.101 +553 D 0.095 +554 G 0.089 +555 L 0.088 +556 V 0.089 +557 I 0.083 +558 G 0.073 +559 T 0.066 +560 A 0.066 +561 F 0.070 +562 S 0.076 +563 S 0.080 +564 S 0.078 +565 L 0.071 +566 E 0.065 +567 S 0.064 +568 G 0.064 +569 V 0.066 +570 T 0.072 +571 T 0.080 +572 T 0.087 +573 I 0.097 +574 A 0.111 +575 I 0.121 +576 L 0.116 +577 C 0.104 +578 H 0.103 +579 E 0.113 +580 I 0.118 +581 P 0.112 +582 H 0.105 +583 E 0.100 +584 M 0.094 +585 G 0.087 +586 D 0.079 +587 F 0.070 +588 A 0.063 +589 V 0.059 +590 L 0.058 +591 L 0.059 +592 S 0.063 +593 S 0.068 +594 G 0.069 +595 L 0.061 +596 S 0.049 +597 V 0.038 +598 R 0.033 +599 T 0.036 +600 A 0.041 +601 I 0.044 +602 L 0.048 +603 M 0.058 +604 N 0.070 +605 F 0.080 +606 L 0.088 +607 S 0.093 +608 A 0.088 +609 L 0.074 +610 T 0.062 +611 A 0.056 +612 F 0.052 +613 A 0.052 +614 G 0.055 +615 L 0.057 +616 Y 0.058 +617 I 0.064 +618 G 0.074 +619 L 0.083 +620 S 0.093 +621 V 0.112 +622 S 0.138 +623 A 0.157 +624 D 0.156 +625 P 0.138 +626 R 0.112 +627 V 0.089 +628 Q 0.076 +629 D 0.070 +630 W 0.069 +631 I 0.072 +632 L 0.080 +633 T 0.090 +634 V 0.101 +635 T 0.113 +636 A 0.119 +637 G 0.114 +638 M 0.103 +639 F 0.094 +640 L 0.089 +641 Y 0.084 +642 L 0.083 +643 S 0.083 +644 L 0.085 +645 V 0.090 +646 G 0.095 +647 M 0.096 +648 L 0.101 +649 P 0.114 +650 E 0.128 +651 M 0.135 +652 T 0.141 +653 H 0.154 +654 V 0.168 +655 Q 0.168 +656 T 0.154 +657 Q 0.132 +658 R 0.106 +659 P 0.078 +660 W 0.056 +661 M 0.046 +662 T 0.043 +663 F 0.040 +664 L 0.036 +665 L 0.037 +666 Q 0.043 +667 N 0.053 +668 V 0.062 +669 G 0.066 +670 L 0.065 +671 V 0.061 +672 L 0.060 +673 G 0.062 +674 W 0.064 +675 F 0.067 +676 S 0.071 +677 L 0.072 +678 L 0.073 +679 L 0.080 +680 L 0.094 +681 A 0.105 +682 V 0.115 +683 Y 0.134 +684 E 0.160 +685 Q 0.181 +686 N 0.203 +687 I 0.230 +688 K 0.253 +689 I 0.262 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036949.17_ENSMUST00000082290.8_GN:Slc39a12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036949.17_ENSMUST00000082290.8_GN:Slc39a12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7b8e671194cda17aae302fd500a28fe41185f7f0 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000036949.17_ENSMUST00000082290.8_GN:Slc39a12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid @@ -0,0 +1,706 @@ +>ENSMUSG00000036949.17|ENSMUST00000082290.8|GN:Slc39a12|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:16 +1 M 0.325 +2 K 0.347 +3 P 0.377 +4 P 0.394 +5 I 0.393 +6 H 0.391 +7 P 0.402 +8 Q 0.416 +9 H 0.428 +10 N 0.447 +11 P 0.472 +12 S 0.490 +13 P 0.490 +14 R 0.470 +15 V 0.427 +16 D 0.365 +17 M 0.298 +18 C 0.238 +19 F 0.189 +20 W 0.158 +21 T 0.146 +22 N 0.143 +23 L 0.139 +24 S 0.133 +25 V 0.124 +26 W 0.111 +27 M 0.099 +28 I 0.092 +29 L 0.089 +30 L 0.095 +31 S 0.111 +32 H 0.130 +33 S 0.147 +34 L 0.171 +35 S 0.207 +36 L 0.252 +37 V 0.292 +38 S 0.318 +39 S 0.336 +40 T 0.362 +41 E 0.407 +42 T 0.456 +43 G 0.483 +44 K 0.480 +45 T 0.472 +46 L 0.476 +47 T 0.483 +48 Q 0.489 +49 N 0.492 +50 N 0.481 +51 S 0.451 +52 R 0.406 +53 A 0.353 +54 G 0.293 +55 S 0.224 +56 Q 0.156 +57 G 0.100 +58 L 0.062 +59 L 0.038 +60 E 0.024 +61 V 0.018 +62 L 0.017 +63 R 0.018 +64 V 0.022 +65 L 0.031 +66 S 0.045 +67 A 0.057 +68 G 0.063 +69 D 0.061 +70 H 0.058 +71 W 0.059 +72 S 0.065 +73 L 0.070 +74 N 0.072 +75 H 0.069 +76 P 0.061 +77 Q 0.050 +78 S 0.041 +79 L 0.037 +80 I 0.039 +81 K 0.041 +82 I 0.041 +83 L 0.040 +84 L 0.041 +85 E 0.046 +86 R 0.061 +87 T 0.089 +88 G 0.127 +89 C 0.163 +90 P 0.186 +91 Q 0.198 +92 R 0.202 +93 T 0.202 +94 D 0.199 +95 W 0.199 +96 T 0.208 +97 Q 0.218 +98 G 0.219 +99 D 0.204 +100 C 0.178 +101 K 0.147 +102 L 0.120 +103 C 0.099 +104 L 0.083 +105 E 0.071 +106 A 0.062 +107 D 0.059 +108 A 0.063 +109 L 0.075 +110 L 0.089 +111 L 0.103 +112 T 0.121 +113 A 0.148 +114 G 0.182 +115 G 0.206 +116 N 0.206 +117 L 0.179 +118 E 0.140 +119 D 0.111 +120 E 0.096 +121 L 0.085 +122 R 0.070 +123 E 0.054 +124 E 0.044 +125 V 0.040 +126 V 0.037 +127 Q 0.036 +128 R 0.039 +129 V 0.041 +130 S 0.041 +131 L 0.039 +132 L 0.036 +133 L 0.029 +134 L 0.021 +135 Y 0.016 +136 Y 0.014 +137 I 0.013 +138 I 0.014 +139 H 0.018 +140 Q 0.023 +141 E 0.031 +142 E 0.042 +143 I 0.054 +144 C 0.063 +145 S 0.066 +146 S 0.065 +147 K 0.065 +148 L 0.066 +149 N 0.064 +150 M 0.060 +151 S 0.054 +152 N 0.046 +153 R 0.038 +154 E 0.032 +155 Y 0.028 +156 E 0.025 +157 F 0.023 +158 Y 0.024 +159 L 0.028 +160 H 0.031 +161 S 0.038 +162 L 0.053 +163 L 0.076 +164 G 0.103 +165 L 0.124 +166 R 0.137 +167 Q 0.144 +168 D 0.145 +169 E 0.138 +170 D 0.123 +171 S 0.112 +172 Y 0.113 +173 F 0.120 +174 L 0.116 +175 S 0.097 +176 E 0.074 +177 K 0.056 +178 E 0.048 +179 T 0.048 +180 D 0.046 +181 D 0.041 +182 I 0.035 +183 L 0.031 +184 A 0.029 +185 F 0.028 +186 T 0.027 +187 R 0.030 +188 K 0.040 +189 Y 0.059 +190 F 0.090 +191 G 0.132 +192 T 0.174 +193 S 0.201 +194 S 0.202 +195 S 0.181 +196 Q 0.153 +197 C 0.130 +198 M 0.114 +199 E 0.097 +200 T 0.078 +201 K 0.065 +202 I 0.062 +203 L 0.068 +204 Q 0.078 +205 R 0.090 +206 E 0.110 +207 S 0.141 +208 G 0.180 +209 I 0.218 +210 Q 0.246 +211 G 0.256 +212 S 0.250 +213 N 0.237 +214 G 0.222 +215 A 0.196 +216 D 0.155 +217 E 0.111 +218 K 0.081 +219 T 0.065 +220 L 0.054 +221 P 0.045 +222 Q 0.039 +223 L 0.037 +224 A 0.034 +225 A 0.031 +226 T 0.028 +227 I 0.027 +228 I 0.026 +229 A 0.026 +230 L 0.027 +231 S 0.030 +232 L 0.039 +233 Q 0.057 +234 G 0.081 +235 V 0.104 +236 C 0.118 +237 L 0.121 +238 G 0.118 +239 R 0.113 +240 K 0.106 +241 A 0.099 +242 L 0.093 +243 P 0.085 +244 S 0.075 +245 P 0.063 +246 D 0.049 +247 D 0.035 +248 F 0.025 +249 T 0.021 +250 E 0.021 +251 Y 0.024 +252 I 0.027 +253 F 0.027 +254 S 0.027 +255 F 0.029 +256 L 0.033 +257 N 0.038 +258 S 0.042 +259 T 0.046 +260 N 0.055 +261 T 0.068 +262 L 0.073 +263 H 0.062 +264 L 0.045 +265 S 0.037 +266 E 0.037 +267 I 0.041 +268 E 0.044 +269 Q 0.047 +270 L 0.049 +271 L 0.049 +272 N 0.050 +273 M 0.056 +274 L 0.067 +275 T 0.080 +276 T 0.094 +277 R 0.110 +278 R 0.126 +279 T 0.141 +280 C 0.159 +281 A 0.185 +282 K 0.213 +283 E 0.226 +284 D 0.215 +285 K 0.189 +286 Y 0.170 +287 L 0.168 +288 H 0.177 +289 Q 0.187 +290 Y 0.194 +291 Q 0.209 +292 R 0.244 +293 K 0.296 +294 Q 0.345 +295 N 0.380 +296 T 0.416 +297 E 0.473 +298 E 0.533 +299 H 0.573 +300 S 0.589 +301 L 0.590 +302 R 0.590 +303 D 0.597 +304 P 0.605 +305 K 0.602 +306 T 0.577 +307 S 0.540 +308 T 0.529 +309 A 0.568 +310 M 0.627 +311 D 0.665 +312 K 0.672 +313 E 0.660 +314 S 0.647 +315 D 0.637 +316 D 0.623 +317 H 0.602 +318 S 0.582 +319 P 0.566 +320 S 0.547 +321 W 0.520 +322 D 0.481 +323 Q 0.416 +324 A 0.323 +325 C 0.222 +326 F 0.140 +327 S 0.087 +328 A 0.057 +329 R 0.043 +330 Q 0.039 +331 L 0.039 +332 V 0.037 +333 E 0.036 +334 I 0.038 +335 F 0.047 +336 L 0.066 +337 Q 0.094 +338 N 0.119 +339 H 0.128 +340 S 0.117 +341 S 0.099 +342 L 0.085 +343 S 0.078 +344 I 0.072 +345 S 0.062 +346 K 0.052 +347 E 0.047 +348 D 0.045 +349 F 0.043 +350 K 0.041 +351 Q 0.043 +352 L 0.048 +353 S 0.050 +354 P 0.048 +355 G 0.045 +356 I 0.041 +357 I 0.037 +358 Q 0.037 +359 Q 0.043 +360 L 0.061 +361 L 0.089 +362 S 0.124 +363 C 0.162 +364 S 0.202 +365 C 0.248 +366 Q 0.304 +367 M 0.369 +368 P 0.435 +369 K 0.488 +370 D 0.515 +371 Q 0.516 +372 Q 0.499 +373 A 0.476 +374 K 0.451 +375 P 0.423 +376 P 0.379 +377 P 0.316 +378 T 0.247 +379 T 0.189 +380 L 0.147 +381 E 0.118 +382 K 0.096 +383 Y 0.080 +384 G 0.074 +385 Y 0.077 +386 S 0.083 +387 T 0.088 +388 V 0.093 +389 A 0.099 +390 V 0.103 +391 T 0.103 +392 L 0.104 +393 L 0.106 +394 T 0.102 +395 L 0.097 +396 G 0.094 +397 S 0.089 +398 M 0.079 +399 L 0.068 +400 G 0.063 +401 T 0.062 +402 A 0.060 +403 L 0.057 +404 V 0.059 +405 L 0.073 +406 F 0.103 +407 H 0.136 +408 S 0.153 +409 C 0.148 +410 E 0.132 +411 E 0.117 +412 N 0.102 +413 Y 0.084 +414 S 0.068 +415 L 0.059 +416 I 0.054 +417 L 0.050 +418 Q 0.044 +419 L 0.040 +420 F 0.039 +421 V 0.043 +422 G 0.048 +423 L 0.054 +424 A 0.060 +425 V 0.063 +426 G 0.069 +427 T 0.086 +428 L 0.107 +429 S 0.119 +430 G 0.119 +431 D 0.116 +432 A 0.112 +433 L 0.108 +434 L 0.109 +435 H 0.115 +436 L 0.124 +437 I 0.137 +438 P 0.161 +439 Q 0.191 +440 V 0.214 +441 L 0.235 +442 G 0.277 +443 L 0.343 +444 H 0.414 +445 K 0.472 +446 Q 0.512 +447 E 0.540 +448 A 0.558 +449 E 0.566 +450 F 0.567 +451 G 0.560 +452 H 0.550 +453 F 0.540 +454 H 0.531 +455 E 0.512 +456 S 0.466 +457 Q 0.389 +458 S 0.293 +459 P 0.199 +460 I 0.132 +461 W 0.103 +462 K 0.098 +463 L 0.097 +464 L 0.088 +465 G 0.077 +466 L 0.071 +467 L 0.069 +468 G 0.068 +469 G 0.065 +470 I 0.063 +471 H 0.065 +472 G 0.068 +473 F 0.064 +474 F 0.060 +475 L 0.064 +476 I 0.075 +477 E 0.081 +478 K 0.081 +479 C 0.084 +480 F 0.098 +481 I 0.120 +482 L 0.150 +483 L 0.199 +484 V 0.274 +485 S 0.366 +486 P 0.455 +487 N 0.526 +488 T 0.578 +489 K 0.615 +490 G 0.640 +491 L 0.655 +492 P 0.663 +493 L 0.669 +494 V 0.674 +495 N 0.672 +496 E 0.660 +497 H 0.645 +498 V 0.636 +499 G 0.635 +500 H 0.641 +501 T 0.649 +502 H 0.663 +503 H 0.683 +504 L 0.705 +505 G 0.720 +506 L 0.726 +507 N 0.733 +508 P 0.746 +509 E 0.761 +510 L 0.771 +511 N 0.776 +512 D 0.775 +513 Q 0.771 +514 S 0.768 +515 S 0.767 +516 G 0.772 +517 G 0.779 +518 K 0.783 +519 S 0.774 +520 I 0.735 +521 S 0.675 +522 T 0.640 +523 I 0.665 +524 Q 0.718 +525 L 0.749 +526 K 0.755 +527 G 0.756 +528 P 0.765 +529 E 0.781 +530 D 0.795 +531 S 0.803 +532 Q 0.808 +533 T 0.807 +534 T 0.796 +535 V 0.778 +536 L 0.765 +537 P 0.765 +538 I 0.774 +539 G 0.781 +540 N 0.779 +541 V 0.770 +542 P 0.766 +543 A 0.765 +544 S 0.756 +545 N 0.734 +546 R 0.705 +547 N 0.671 +548 G 0.624 +549 K 0.552 +550 T 0.452 +551 I 0.338 +552 S 0.234 +553 L 0.160 +554 L 0.119 +555 A 0.102 +556 I 0.097 +557 M 0.099 +558 I 0.110 +559 L 0.129 +560 V 0.144 +561 G 0.152 +562 D 0.154 +563 S 0.150 +564 L 0.136 +565 H 0.118 +566 N 0.106 +567 F 0.104 +568 A 0.103 +569 D 0.096 +570 G 0.090 +571 L 0.089 +572 V 0.089 +573 I 0.084 +574 G 0.074 +575 T 0.067 +576 A 0.066 +577 F 0.070 +578 S 0.076 +579 S 0.080 +580 S 0.078 +581 L 0.071 +582 E 0.066 +583 S 0.065 +584 G 0.065 +585 V 0.067 +586 T 0.072 +587 T 0.081 +588 T 0.088 +589 I 0.098 +590 A 0.112 +591 I 0.122 +592 L 0.117 +593 C 0.105 +594 H 0.104 +595 E 0.114 +596 I 0.119 +597 P 0.114 +598 H 0.107 +599 E 0.102 +600 M 0.096 +601 G 0.088 +602 D 0.080 +603 F 0.071 +604 A 0.064 +605 V 0.060 +606 L 0.059 +607 L 0.060 +608 S 0.063 +609 S 0.069 +610 G 0.069 +611 L 0.061 +612 S 0.049 +613 V 0.038 +614 R 0.033 +615 T 0.036 +616 A 0.041 +617 I 0.044 +618 L 0.048 +619 M 0.058 +620 N 0.070 +621 F 0.080 +622 L 0.089 +623 S 0.094 +624 A 0.089 +625 L 0.075 +626 T 0.063 +627 A 0.056 +628 F 0.053 +629 A 0.053 +630 G 0.056 +631 L 0.057 +632 Y 0.058 +633 I 0.064 +634 G 0.075 +635 L 0.084 +636 S 0.094 +637 V 0.113 +638 S 0.138 +639 A 0.157 +640 D 0.157 +641 P 0.139 +642 R 0.113 +643 V 0.090 +644 Q 0.077 +645 D 0.071 +646 W 0.070 +647 I 0.073 +648 L 0.081 +649 T 0.092 +650 V 0.103 +651 T 0.115 +652 A 0.121 +653 G 0.116 +654 M 0.104 +655 F 0.095 +656 L 0.090 +657 Y 0.086 +658 L 0.084 +659 S 0.084 +660 L 0.086 +661 V 0.091 +662 G 0.096 +663 M 0.097 +664 L 0.102 +665 P 0.114 +666 E 0.128 +667 M 0.135 +668 T 0.140 +669 H 0.152 +670 V 0.165 +671 Q 0.166 +672 T 0.152 +673 Q 0.131 +674 R 0.105 +675 P 0.078 +676 W 0.056 +677 M 0.046 +678 T 0.043 +679 F 0.040 +680 L 0.036 +681 L 0.037 +682 Q 0.044 +683 N 0.054 +684 V 0.063 +685 G 0.067 +686 L 0.066 +687 V 0.062 +688 L 0.060 +689 G 0.060 +690 W 0.060 +691 F 0.061 +692 S 0.066 +693 L 0.069 +694 L 0.072 +695 L 0.080 +696 L 0.093 +697 A 0.103 +698 V 0.113 +699 Y 0.132 +700 E 0.157 +701 Q 0.177 +702 N 0.198 +703 I 0.225 +704 K 0.247 +705 I 0.256 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000037167.6_ENSMUST00000040437.6_GN:Spaca5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000037167.6_ENSMUST00000040437.6_GN:Spaca5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..52d6953fe03770fa024c85b69d6b84e532378268 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000037167.6_ENSMUST00000040437.6_GN:Spaca5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,161 @@ +>ENSMUSG00000037167.6|ENSMUST00000040437.6|GN:Spaca5|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.298 +2 K 0.291 +3 V 0.284 +4 C 0.273 +5 S 0.250 +6 I 0.220 +7 V 0.197 +8 V 0.190 +9 V 0.195 +10 I 0.211 +11 L 0.239 +12 A 0.268 +13 V 0.285 +14 L 0.294 +15 L 0.309 +16 I 0.331 +17 A 0.348 +18 K 0.350 +19 L 0.329 +20 D 0.286 +21 A 0.228 +22 K 0.167 +23 I 0.116 +24 Y 0.080 +25 E 0.058 +26 R 0.045 +27 C 0.037 +28 E 0.032 +29 L 0.030 +30 A 0.030 +31 K 0.030 +32 K 0.030 +33 L 0.032 +34 E 0.038 +35 E 0.047 +36 A 0.058 +37 G 0.065 +38 L 0.072 +39 D 0.081 +40 G 0.089 +41 F 0.096 +42 K 0.102 +43 G 0.108 +44 Y 0.107 +45 T 0.098 +46 V 0.087 +47 G 0.075 +48 D 0.064 +49 W 0.055 +50 L 0.051 +51 C 0.052 +52 V 0.056 +53 A 0.060 +54 H 0.060 +55 Y 0.061 +56 E 0.073 +57 S 0.100 +58 G 0.129 +59 F 0.147 +60 D 0.152 +61 T 0.149 +62 S 0.141 +63 F 0.131 +64 V 0.122 +65 D 0.118 +66 H 0.121 +67 N 0.130 +68 P 0.143 +69 D 0.156 +70 G 0.160 +71 S 0.144 +72 S 0.114 +73 E 0.085 +74 Y 0.067 +75 G 0.063 +76 I 0.071 +77 F 0.084 +78 Q 0.092 +79 L 0.093 +80 N 0.088 +81 S 0.086 +82 A 0.086 +83 W 0.088 +84 W 0.094 +85 C 0.111 +86 N 0.139 +87 N 0.172 +88 G 0.196 +89 I 0.207 +90 T 0.210 +91 P 0.210 +92 T 0.209 +93 Q 0.200 +94 N 0.180 +95 L 0.153 +96 C 0.133 +97 N 0.128 +98 I 0.134 +99 D 0.139 +100 C 0.143 +101 N 0.149 +102 D 0.153 +103 L 0.149 +104 L 0.140 +105 N 0.129 +106 R 0.117 +107 H 0.108 +108 I 0.103 +109 L 0.098 +110 D 0.091 +111 D 0.080 +112 I 0.070 +113 I 0.066 +114 C 0.067 +115 A 0.068 +116 K 0.067 +117 R 0.067 +118 V 0.069 +119 A 0.069 +120 S 0.070 +121 S 0.073 +122 H 0.075 +123 K 0.074 +124 S 0.074 +125 M 0.079 +126 K 0.083 +127 A 0.081 +128 W 0.070 +129 D 0.055 +130 S 0.041 +131 W 0.033 +132 T 0.030 +133 Q 0.032 +134 H 0.036 +135 C 0.042 +136 A 0.052 +137 G 0.064 +138 H 0.072 +139 D 0.070 +140 L 0.060 +141 S 0.051 +142 E 0.047 +143 W 0.047 +144 L 0.048 +145 K 0.049 +146 G 0.051 +147 C 0.060 +148 S 0.084 +149 V 0.126 +150 R 0.184 +151 L 0.242 +152 K 0.292 +153 T 0.328 +154 D 0.352 +155 S 0.365 +156 S 0.371 +157 Y 0.372 +158 N 0.364 +159 N 0.346 +160 W 0.330 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000037167.6_ENSMUST00000040437.6_GN:Spaca5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:22.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000037167.6_ENSMUST00000040437.6_GN:Spaca5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:22.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..934ec04d1e493aa1c6aa5ae77c34ae48ba6e3bf6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000037167.6_ENSMUST00000040437.6_GN:Spaca5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:22.caid @@ -0,0 +1,183 @@ +>ENSMUSG00000037167.6|ENSMUST00000040437.6|GN:Spaca5|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:22 +1 M 0.352 +2 S 0.358 +3 L 0.367 +4 F 0.374 +5 L 0.378 +6 I 0.379 +7 I 0.376 +8 S 0.370 +9 G 0.361 +10 S 0.353 +11 E 0.343 +12 A 0.319 +13 R 0.283 +14 D 0.253 +15 H 0.238 +16 I 0.232 +17 E 0.228 +18 G 0.218 +19 L 0.200 +20 L 0.183 +21 A 0.182 +22 V 0.190 +23 M 0.194 +24 K 0.191 +25 V 0.185 +26 C 0.180 +27 S 0.175 +28 I 0.171 +29 V 0.167 +30 V 0.166 +31 V 0.166 +32 I 0.170 +33 L 0.181 +34 A 0.194 +35 V 0.199 +36 L 0.203 +37 L 0.222 +38 I 0.253 +39 A 0.282 +40 K 0.296 +41 L 0.287 +42 D 0.255 +43 A 0.207 +44 K 0.154 +45 I 0.108 +46 Y 0.074 +47 E 0.053 +48 R 0.042 +49 C 0.035 +50 E 0.031 +51 L 0.029 +52 A 0.028 +53 K 0.028 +54 K 0.029 +55 L 0.031 +56 E 0.037 +57 E 0.046 +58 A 0.055 +59 G 0.061 +60 L 0.068 +61 D 0.076 +62 G 0.084 +63 F 0.092 +64 K 0.098 +65 G 0.104 +66 Y 0.102 +67 T 0.093 +68 V 0.083 +69 G 0.072 +70 D 0.061 +71 W 0.052 +72 L 0.049 +73 C 0.049 +74 V 0.053 +75 A 0.056 +76 H 0.057 +77 Y 0.058 +78 E 0.070 +79 S 0.096 +80 G 0.125 +81 F 0.144 +82 D 0.149 +83 T 0.145 +84 S 0.138 +85 F 0.127 +86 V 0.117 +87 D 0.112 +88 H 0.114 +89 N 0.123 +90 P 0.137 +91 D 0.151 +92 G 0.155 +93 S 0.139 +94 S 0.110 +95 E 0.083 +96 Y 0.065 +97 G 0.062 +98 I 0.070 +99 F 0.083 +100 Q 0.090 +101 L 0.089 +102 N 0.085 +103 S 0.083 +104 A 0.084 +105 W 0.087 +106 W 0.095 +107 C 0.111 +108 N 0.139 +109 N 0.170 +110 G 0.195 +111 I 0.207 +112 T 0.210 +113 P 0.212 +114 T 0.211 +115 Q 0.202 +116 N 0.182 +117 L 0.153 +118 C 0.131 +119 N 0.127 +120 I 0.133 +121 D 0.138 +122 C 0.143 +123 N 0.150 +124 D 0.154 +125 L 0.150 +126 L 0.141 +127 N 0.129 +128 R 0.118 +129 H 0.109 +130 I 0.103 +131 L 0.099 +132 D 0.092 +133 D 0.081 +134 I 0.071 +135 I 0.066 +136 C 0.067 +137 A 0.067 +138 K 0.066 +139 R 0.067 +140 V 0.069 +141 A 0.070 +142 S 0.072 +143 S 0.076 +144 H 0.079 +145 K 0.079 +146 S 0.079 +147 M 0.082 +148 K 0.085 +149 A 0.082 +150 W 0.070 +151 D 0.055 +152 S 0.041 +153 W 0.033 +154 T 0.030 +155 Q 0.031 +156 H 0.036 +157 C 0.042 +158 A 0.052 +159 G 0.065 +160 H 0.073 +161 D 0.070 +162 L 0.060 +163 S 0.050 +164 E 0.046 +165 W 0.046 +166 L 0.048 +167 K 0.049 +168 G 0.052 +169 C 0.061 +170 S 0.085 +171 V 0.129 +172 R 0.188 +173 L 0.250 +174 K 0.303 +175 T 0.342 +176 D 0.367 +177 S 0.380 +178 S 0.383 +179 Y 0.381 +180 N 0.371 +181 N 0.352 +182 W 0.335 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000037254.19_ENSMUST00000042290.14_GN:Itih2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000037254.19_ENSMUST00000042290.14_GN:Itih2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..78efb7643f399795e85d45054a34f74fb47d7b5c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000037254.19_ENSMUST00000042290.14_GN:Itih2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,947 @@ +>ENSMUSG00000037254.19|ENSMUST00000042290.14|GN:Itih2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.263 +2 Q 0.258 +3 R 0.250 +4 P 0.237 +5 V 0.216 +6 C 0.193 +7 L 0.180 +8 L 0.177 +9 I 0.176 +10 W 0.174 +11 L 0.173 +12 F 0.176 +13 L 0.187 +14 L 0.219 +15 E 0.269 +16 A 0.319 +17 Q 0.355 +18 A 0.382 +19 F 0.411 +20 E 0.452 +21 I 0.503 +22 P 0.553 +23 I 0.597 +24 N 0.629 +25 G 0.641 +26 N 0.630 +27 S 0.603 +28 E 0.573 +29 F 0.545 +30 A 0.524 +31 E 0.510 +32 Y 0.502 +33 S 0.496 +34 D 0.486 +35 L 0.467 +36 V 0.437 +37 E 0.403 +38 L 0.376 +39 A 0.360 +40 P 0.360 +41 D 0.376 +42 K 0.407 +43 L 0.449 +44 P 0.497 +45 F 0.536 +46 V 0.549 +47 Q 0.540 +48 E 0.532 +49 N 0.530 +50 G 0.519 +51 R 0.497 +52 H 0.477 +53 Q 0.466 +54 R 0.469 +55 S 0.490 +56 L 0.525 +57 P 0.569 +58 E 0.614 +59 E 0.650 +60 S 0.668 +61 G 0.669 +62 E 0.665 +63 E 0.661 +64 T 0.653 +65 D 0.624 +66 T 0.561 +67 V 0.463 +68 D 0.347 +69 P 0.240 +70 V 0.159 +71 T 0.102 +72 L 0.068 +73 Y 0.052 +74 S 0.045 +75 Y 0.044 +76 K 0.045 +77 V 0.044 +78 Q 0.043 +79 S 0.043 +80 T 0.048 +81 I 0.058 +82 T 0.067 +83 S 0.067 +84 R 0.057 +85 V 0.047 +86 A 0.040 +87 T 0.038 +88 T 0.037 +89 T 0.037 +90 I 0.036 +91 Q 0.034 +92 S 0.032 +93 K 0.033 +94 L 0.040 +95 V 0.054 +96 N 0.075 +97 N 0.094 +98 S 0.106 +99 P 0.106 +100 L 0.097 +101 P 0.083 +102 Q 0.069 +103 S 0.059 +104 V 0.050 +105 V 0.043 +106 F 0.043 +107 D 0.055 +108 V 0.074 +109 Q 0.089 +110 I 0.098 +111 P 0.098 +112 K 0.088 +113 G 0.072 +114 A 0.057 +115 F 0.048 +116 I 0.046 +117 S 0.047 +118 N 0.046 +119 F 0.042 +120 T 0.038 +121 M 0.039 +122 T 0.047 +123 V 0.062 +124 N 0.077 +125 G 0.087 +126 M 0.092 +127 T 0.098 +128 F 0.109 +129 T 0.121 +130 S 0.122 +131 S 0.110 +132 I 0.092 +133 K 0.080 +134 E 0.078 +135 K 0.083 +136 T 0.085 +137 V 0.082 +138 G 0.077 +139 R 0.078 +140 A 0.078 +141 L 0.072 +142 Y 0.071 +143 S 0.081 +144 Q 0.097 +145 A 0.112 +146 R 0.130 +147 A 0.158 +148 K 0.193 +149 G 0.219 +150 K 0.223 +151 T 0.210 +152 A 0.192 +153 G 0.182 +154 W 0.185 +155 V 0.198 +156 R 0.212 +157 S 0.221 +158 R 0.223 +159 T 0.216 +160 L 0.196 +161 D 0.164 +162 M 0.127 +163 E 0.096 +164 N 0.075 +165 F 0.063 +166 N 0.056 +167 T 0.055 +168 E 0.061 +169 V 0.068 +170 N 0.071 +171 I 0.072 +172 P 0.074 +173 P 0.075 +174 G 0.076 +175 A 0.077 +176 K 0.077 +177 V 0.075 +178 Q 0.069 +179 F 0.061 +180 E 0.056 +181 L 0.051 +182 H 0.045 +183 Y 0.039 +184 Q 0.038 +185 E 0.043 +186 V 0.050 +187 K 0.056 +188 W 0.062 +189 R 0.072 +190 K 0.087 +191 L 0.098 +192 G 0.098 +193 S 0.087 +194 Y 0.070 +195 E 0.055 +196 H 0.050 +197 K 0.052 +198 I 0.057 +199 H 0.064 +200 L 0.069 +201 Q 0.072 +202 P 0.074 +203 G 0.075 +204 K 0.077 +205 L 0.078 +206 A 0.076 +207 K 0.073 +208 H 0.070 +209 L 0.068 +210 E 0.066 +211 V 0.064 +212 N 0.059 +213 V 0.054 +214 W 0.050 +215 I 0.053 +216 I 0.064 +217 E 0.080 +218 P 0.096 +219 Q 0.102 +220 G 0.097 +221 M 0.086 +222 R 0.072 +223 F 0.065 +224 L 0.069 +225 H 0.083 +226 V 0.106 +227 P 0.127 +228 D 0.137 +229 T 0.136 +230 F 0.135 +231 E 0.141 +232 G 0.148 +233 H 0.150 +234 F 0.149 +235 Q 0.144 +236 G 0.135 +237 V 0.116 +238 P 0.090 +239 V 0.068 +240 I 0.058 +241 S 0.060 +242 K 0.065 +243 G 0.066 +244 Q 0.063 +245 Q 0.056 +246 K 0.050 +247 A 0.046 +248 H 0.042 +249 V 0.039 +250 S 0.036 +251 F 0.038 +252 K 0.045 +253 P 0.053 +254 T 0.060 +255 V 0.068 +256 A 0.079 +257 Q 0.093 +258 Q 0.108 +259 R 0.130 +260 K 0.161 +261 C 0.189 +262 P 0.201 +263 N 0.193 +264 C 0.174 +265 T 0.150 +266 E 0.131 +267 T 0.121 +268 A 0.117 +269 V 0.113 +270 N 0.108 +271 G 0.098 +272 E 0.082 +273 L 0.066 +274 V 0.055 +275 V 0.049 +276 M 0.046 +277 Y 0.048 +278 D 0.059 +279 V 0.076 +280 N 0.099 +281 R 0.124 +282 E 0.145 +283 E 0.157 +284 K 0.158 +285 A 0.150 +286 G 0.134 +287 E 0.112 +288 L 0.091 +289 E 0.078 +290 V 0.073 +291 F 0.074 +292 N 0.078 +293 G 0.079 +294 Y 0.079 +295 F 0.080 +296 V 0.083 +297 H 0.084 +298 F 0.085 +299 F 0.095 +300 A 0.120 +301 P 0.157 +302 E 0.191 +303 N 0.212 +304 L 0.218 +305 D 0.213 +306 P 0.200 +307 I 0.176 +308 P 0.143 +309 K 0.115 +310 N 0.100 +311 I 0.092 +312 L 0.085 +313 F 0.082 +314 V 0.084 +315 I 0.088 +316 D 0.093 +317 V 0.100 +318 S 0.107 +319 G 0.108 +320 S 0.105 +321 M 0.098 +322 W 0.089 +323 G 0.079 +324 I 0.072 +325 K 0.067 +326 M 0.064 +327 K 0.063 +328 Q 0.063 +329 T 0.059 +330 V 0.054 +331 E 0.054 +332 A 0.058 +333 M 0.059 +334 K 0.056 +335 T 0.053 +336 I 0.054 +337 L 0.055 +338 D 0.056 +339 D 0.057 +340 L 0.057 +341 R 0.057 +342 T 0.056 +343 D 0.055 +344 D 0.049 +345 Q 0.038 +346 F 0.025 +347 S 0.018 +348 V 0.016 +349 V 0.018 +350 D 0.022 +351 F 0.027 +352 N 0.035 +353 H 0.046 +354 N 0.056 +355 V 0.058 +356 R 0.055 +357 T 0.051 +358 W 0.049 +359 R 0.051 +360 N 0.054 +361 D 0.055 +362 L 0.055 +363 V 0.055 +364 S 0.056 +365 A 0.054 +366 T 0.050 +367 K 0.045 +368 T 0.043 +369 Q 0.049 +370 I 0.064 +371 A 0.081 +372 D 0.090 +373 A 0.094 +374 K 0.095 +375 R 0.092 +376 Y 0.080 +377 I 0.067 +378 E 0.064 +379 K 0.074 +380 I 0.089 +381 Q 0.103 +382 P 0.117 +383 S 0.130 +384 G 0.135 +385 G 0.127 +386 T 0.112 +387 N 0.093 +388 I 0.074 +389 N 0.061 +390 E 0.053 +391 A 0.049 +392 L 0.046 +393 L 0.043 +394 R 0.042 +395 A 0.042 +396 I 0.043 +397 F 0.045 +398 I 0.048 +399 L 0.054 +400 N 0.063 +401 E 0.075 +402 A 0.085 +403 S 0.093 +404 N 0.106 +405 M 0.124 +406 G 0.140 +407 L 0.144 +408 L 0.137 +409 N 0.122 +410 P 0.107 +411 D 0.094 +412 S 0.082 +413 V 0.065 +414 S 0.048 +415 L 0.037 +416 I 0.032 +417 I 0.033 +418 L 0.041 +419 V 0.056 +420 S 0.080 +421 D 0.110 +422 G 0.138 +423 D 0.149 +424 P 0.140 +425 T 0.124 +426 V 0.116 +427 G 0.118 +428 E 0.125 +429 L 0.129 +430 K 0.121 +431 L 0.104 +432 S 0.086 +433 K 0.078 +434 I 0.077 +435 Q 0.074 +436 K 0.069 +437 N 0.065 +438 V 0.065 +439 K 0.067 +440 Q 0.069 +441 S 0.071 +442 I 0.071 +443 Q 0.071 +444 D 0.070 +445 N 0.065 +446 I 0.057 +447 S 0.046 +448 L 0.036 +449 F 0.032 +450 S 0.034 +451 L 0.042 +452 G 0.053 +453 I 0.063 +454 G 0.072 +455 F 0.079 +456 D 0.079 +457 V 0.068 +458 D 0.052 +459 Y 0.041 +460 D 0.038 +461 F 0.040 +462 L 0.044 +463 K 0.050 +464 R 0.056 +465 L 0.060 +466 S 0.061 +467 N 0.063 +468 E 0.069 +469 N 0.080 +470 R 0.090 +471 G 0.089 +472 I 0.081 +473 A 0.074 +474 Q 0.079 +475 R 0.098 +476 I 0.127 +477 Y 0.155 +478 G 0.173 +479 N 0.176 +480 Q 0.165 +481 D 0.145 +482 T 0.120 +483 S 0.095 +484 S 0.080 +485 Q 0.075 +486 L 0.074 +487 K 0.071 +488 K 0.067 +489 F 0.070 +490 Y 0.077 +491 N 0.078 +492 Q 0.076 +493 V 0.076 +494 S 0.079 +495 T 0.079 +496 P 0.074 +497 L 0.071 +498 L 0.072 +499 R 0.073 +500 N 0.070 +501 V 0.062 +502 Q 0.056 +503 F 0.057 +504 N 0.065 +505 Y 0.073 +506 P 0.074 +507 Q 0.070 +508 A 0.069 +509 S 0.075 +510 V 0.086 +511 T 0.092 +512 D 0.092 +513 V 0.086 +514 T 0.079 +515 Q 0.075 +516 N 0.074 +517 N 0.073 +518 F 0.066 +519 H 0.054 +520 N 0.046 +521 Y 0.047 +522 F 0.059 +523 G 0.073 +524 G 0.081 +525 S 0.082 +526 E 0.077 +527 I 0.070 +528 V 0.063 +529 V 0.055 +530 A 0.046 +531 G 0.041 +532 K 0.045 +533 F 0.055 +534 D 0.066 +535 P 0.077 +536 S 0.090 +537 K 0.103 +538 L 0.108 +539 T 0.104 +540 E 0.095 +541 V 0.084 +542 Q 0.070 +543 S 0.057 +544 I 0.048 +545 I 0.045 +546 T 0.047 +547 A 0.053 +548 T 0.061 +549 S 0.069 +550 A 0.074 +551 N 0.078 +552 T 0.083 +553 E 0.088 +554 L 0.091 +555 V 0.090 +556 L 0.088 +557 E 0.083 +558 T 0.076 +559 L 0.076 +560 S 0.086 +561 Q 0.103 +562 M 0.121 +563 D 0.135 +564 D 0.139 +565 L 0.138 +566 E 0.145 +567 E 0.168 +568 F 0.197 +569 L 0.222 +570 S 0.243 +571 K 0.270 +572 D 0.299 +573 K 0.316 +574 H 0.313 +575 A 0.293 +576 D 0.260 +577 P 0.219 +578 D 0.175 +579 F 0.134 +580 T 0.103 +581 K 0.081 +582 K 0.067 +583 L 0.062 +584 W 0.067 +585 A 0.076 +586 Y 0.085 +587 L 0.093 +588 T 0.094 +589 I 0.089 +590 N 0.084 +591 Q 0.083 +592 L 0.082 +593 L 0.083 +594 A 0.086 +595 E 0.089 +596 R 0.095 +597 S 0.104 +598 L 0.108 +599 A 0.105 +600 P 0.099 +601 T 0.091 +602 A 0.083 +603 A 0.076 +604 I 0.073 +605 K 0.071 +606 R 0.069 +607 K 0.068 +608 I 0.071 +609 T 0.071 +610 K 0.068 +611 T 0.070 +612 I 0.080 +613 L 0.091 +614 Q 0.095 +615 M 0.092 +616 S 0.092 +617 L 0.095 +618 D 0.098 +619 H 0.104 +620 H 0.118 +621 I 0.143 +622 V 0.176 +623 T 0.211 +624 P 0.236 +625 L 0.243 +626 T 0.242 +627 A 0.248 +628 M 0.264 +629 V 0.283 +630 I 0.303 +631 E 0.328 +632 N 0.352 +633 D 0.366 +634 A 0.370 +635 G 0.380 +636 D 0.403 +637 E 0.430 +638 R 0.451 +639 M 0.465 +640 L 0.467 +641 A 0.455 +642 D 0.438 +643 S 0.422 +644 P 0.408 +645 P 0.397 +646 Q 0.389 +647 D 0.382 +648 H 0.375 +649 S 0.373 +650 C 0.394 +651 C 0.449 +652 S 0.526 +653 G 0.587 +654 A 0.608 +655 L 0.595 +656 Y 0.572 +657 Y 0.565 +658 G 0.577 +659 T 0.595 +660 K 0.609 +661 V 0.615 +662 A 0.609 +663 S 0.594 +664 G 0.574 +665 P 0.551 +666 I 0.532 +667 P 0.525 +668 S 0.526 +669 W 0.523 +670 A 0.518 +671 N 0.514 +672 P 0.514 +673 S 0.523 +674 P 0.542 +675 T 0.557 +676 P 0.540 +677 M 0.477 +678 S 0.411 +679 A 0.401 +680 M 0.441 +681 L 0.471 +682 A 0.486 +683 V 0.517 +684 G 0.561 +685 A 0.589 +686 K 0.602 +687 P 0.612 +688 L 0.614 +689 E 0.599 +690 S 0.572 +691 T 0.546 +692 P 0.524 +693 P 0.498 +694 T 0.464 +695 H 0.421 +696 L 0.373 +697 N 0.325 +698 Q 0.287 +699 V 0.259 +700 E 0.227 +701 N 0.192 +702 D 0.168 +703 P 0.161 +704 H 0.159 +705 F 0.151 +706 I 0.142 +707 I 0.140 +708 Y 0.144 +709 L 0.148 +710 P 0.150 +711 K 0.149 +712 S 0.142 +713 K 0.129 +714 R 0.113 +715 N 0.095 +716 I 0.080 +717 C 0.071 +718 F 0.071 +719 N 0.080 +720 I 0.095 +721 D 0.114 +722 S 0.130 +723 E 0.135 +724 P 0.128 +725 G 0.116 +726 K 0.103 +727 I 0.091 +728 L 0.077 +729 S 0.068 +730 L 0.069 +731 V 0.081 +732 S 0.098 +733 D 0.114 +734 P 0.128 +735 E 0.137 +736 S 0.137 +737 G 0.126 +738 I 0.111 +739 V 0.102 +740 V 0.102 +741 N 0.108 +742 G 0.116 +743 Q 0.119 +744 L 0.118 +745 I 0.121 +746 G 0.131 +747 A 0.142 +748 K 0.146 +749 R 0.146 +750 A 0.152 +751 E 0.165 +752 N 0.178 +753 G 0.181 +754 K 0.169 +755 L 0.143 +756 S 0.112 +757 T 0.086 +758 Y 0.068 +759 F 0.057 +760 G 0.050 +761 K 0.044 +762 L 0.037 +763 G 0.030 +764 F 0.026 +765 Y 0.027 +766 F 0.032 +767 Q 0.043 +768 K 0.057 +769 E 0.068 +770 G 0.072 +771 M 0.068 +772 K 0.059 +773 I 0.051 +774 E 0.045 +775 I 0.044 +776 S 0.047 +777 T 0.052 +778 E 0.055 +779 T 0.056 +780 I 0.058 +781 T 0.062 +782 L 0.071 +783 S 0.083 +784 S 0.093 +785 G 0.097 +786 S 0.094 +787 S 0.089 +788 T 0.086 +789 S 0.090 +790 R 0.096 +791 L 0.098 +792 S 0.096 +793 W 0.093 +794 S 0.090 +795 D 0.086 +796 T 0.085 +797 A 0.094 +798 H 0.111 +799 L 0.129 +800 G 0.138 +801 N 0.130 +802 S 0.109 +803 R 0.086 +804 V 0.072 +805 L 0.067 +806 I 0.066 +807 S 0.068 +808 V 0.069 +809 K 0.069 +810 K 0.071 +811 E 0.073 +812 K 0.072 +813 S 0.067 +814 V 0.062 +815 T 0.060 +816 L 0.062 +817 T 0.065 +818 L 0.065 +819 N 0.066 +820 K 0.069 +821 E 0.071 +822 L 0.069 +823 F 0.065 +824 F 0.064 +825 S 0.071 +826 V 0.079 +827 L 0.083 +828 L 0.084 +829 H 0.087 +830 R 0.091 +831 V 0.095 +832 W 0.098 +833 R 0.103 +834 K 0.113 +835 H 0.128 +836 P 0.140 +837 V 0.143 +838 N 0.135 +839 V 0.118 +840 D 0.101 +841 F 0.090 +842 L 0.087 +843 G 0.087 +844 I 0.089 +845 Y 0.094 +846 A 0.103 +847 P 0.110 +848 P 0.115 +849 I 0.116 +850 D 0.112 +851 K 0.105 +852 F 0.104 +853 S 0.114 +854 P 0.126 +855 R 0.127 +856 V 0.117 +857 H 0.106 +858 G 0.099 +859 L 0.101 +860 L 0.113 +861 G 0.132 +862 Q 0.142 +863 F 0.136 +864 M 0.127 +865 Q 0.134 +866 E 0.158 +867 P 0.178 +868 A 0.179 +869 I 0.164 +870 H 0.153 +871 I 0.157 +872 F 0.180 +873 N 0.217 +874 E 0.262 +875 R 0.303 +876 P 0.324 +877 G 0.322 +878 K 0.307 +879 E 0.295 +880 P 0.288 +881 G 0.281 +882 K 0.268 +883 P 0.242 +884 E 0.209 +885 A 0.179 +886 S 0.159 +887 M 0.149 +888 E 0.147 +889 V 0.155 +890 K 0.176 +891 G 0.203 +892 H 0.227 +893 K 0.239 +894 L 0.238 +895 T 0.228 +896 V 0.219 +897 T 0.223 +898 R 0.245 +899 G 0.263 +900 L 0.254 +901 Q 0.220 +902 K 0.185 +903 D 0.164 +904 Y 0.156 +905 R 0.153 +906 T 0.156 +907 D 0.165 +908 I 0.172 +909 V 0.174 +910 F 0.183 +911 G 0.202 +912 T 0.219 +913 D 0.220 +914 V 0.201 +915 P 0.173 +916 C 0.150 +917 W 0.141 +918 F 0.147 +919 V 0.168 +920 H 0.206 +921 N 0.259 +922 S 0.311 +923 G 0.337 +924 K 0.323 +925 G 0.281 +926 F 0.246 +927 I 0.236 +928 D 0.246 +929 G 0.248 +930 H 0.228 +931 Y 0.197 +932 K 0.170 +933 D 0.149 +934 Y 0.133 +935 F 0.124 +936 V 0.123 +937 P 0.119 +938 Q 0.109 +939 L 0.094 +940 Y 0.086 +941 S 0.091 +942 F 0.111 +943 L 0.145 +944 K 0.197 +945 R 0.261 +946 P 0.309 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000037254.19_ENSMUST00000042290.14_GN:Itih2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:4.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000037254.19_ENSMUST00000042290.14_GN:Itih2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:4.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f2eeaaef865e00f3843cdfc5fa5c317d0fd330da --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000037254.19_ENSMUST00000042290.14_GN:Itih2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:4.caid @@ -0,0 +1,951 @@ +>ENSMUSG00000037254.19|ENSMUST00000042290.14|GN:Itih2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:4 +1 M 0.276 +2 S 0.272 +3 S 0.273 +4 K 0.285 +5 M 0.291 +6 Q 0.282 +7 R 0.268 +8 P 0.254 +9 V 0.235 +10 C 0.209 +11 L 0.191 +12 L 0.186 +13 I 0.182 +14 W 0.177 +15 L 0.174 +16 F 0.176 +17 L 0.188 +18 L 0.220 +19 E 0.272 +20 A 0.325 +21 Q 0.363 +22 A 0.390 +23 F 0.416 +24 E 0.451 +25 I 0.495 +26 P 0.543 +27 I 0.587 +28 N 0.622 +29 G 0.637 +30 N 0.628 +31 S 0.604 +32 E 0.576 +33 F 0.551 +34 A 0.532 +35 E 0.521 +36 Y 0.516 +37 S 0.511 +38 D 0.502 +39 L 0.483 +40 V 0.453 +41 E 0.418 +42 L 0.389 +43 A 0.372 +44 P 0.369 +45 D 0.383 +46 K 0.413 +47 L 0.455 +48 P 0.504 +49 F 0.545 +50 V 0.560 +51 Q 0.554 +52 E 0.547 +53 N 0.543 +54 G 0.528 +55 R 0.504 +56 H 0.481 +57 Q 0.469 +58 R 0.471 +59 S 0.491 +60 L 0.527 +61 P 0.572 +62 E 0.617 +63 E 0.653 +64 S 0.671 +65 G 0.672 +66 E 0.667 +67 E 0.663 +68 T 0.655 +69 D 0.625 +70 T 0.561 +71 V 0.462 +72 D 0.346 +73 P 0.240 +74 V 0.159 +75 T 0.102 +76 L 0.068 +77 Y 0.051 +78 S 0.045 +79 Y 0.044 +80 K 0.044 +81 V 0.044 +82 Q 0.042 +83 S 0.043 +84 T 0.047 +85 I 0.057 +86 T 0.066 +87 S 0.066 +88 R 0.057 +89 V 0.046 +90 A 0.040 +91 T 0.037 +92 T 0.037 +93 T 0.036 +94 I 0.035 +95 Q 0.033 +96 S 0.032 +97 K 0.033 +98 L 0.039 +99 V 0.054 +100 N 0.074 +101 N 0.093 +102 S 0.104 +103 P 0.105 +104 L 0.096 +105 P 0.082 +106 Q 0.068 +107 S 0.058 +108 V 0.050 +109 V 0.043 +110 F 0.043 +111 D 0.055 +112 V 0.073 +113 Q 0.089 +114 I 0.097 +115 P 0.097 +116 K 0.087 +117 G 0.071 +118 A 0.057 +119 F 0.048 +120 I 0.046 +121 S 0.047 +122 N 0.046 +123 F 0.042 +124 T 0.038 +125 M 0.039 +126 T 0.047 +127 V 0.062 +128 N 0.076 +129 G 0.086 +130 M 0.092 +131 T 0.098 +132 F 0.109 +133 T 0.121 +134 S 0.122 +135 S 0.110 +136 I 0.092 +137 K 0.079 +138 E 0.074 +139 K 0.074 +140 T 0.074 +141 V 0.073 +142 G 0.072 +143 R 0.076 +144 A 0.077 +145 L 0.072 +146 Y 0.070 +147 S 0.080 +148 Q 0.096 +149 A 0.111 +150 R 0.129 +151 A 0.157 +152 K 0.192 +153 G 0.217 +154 K 0.221 +155 T 0.209 +156 A 0.192 +157 G 0.182 +158 W 0.185 +159 V 0.199 +160 R 0.213 +161 S 0.222 +162 R 0.224 +163 T 0.216 +164 L 0.196 +165 D 0.165 +166 M 0.128 +167 E 0.096 +168 N 0.075 +169 F 0.063 +170 N 0.055 +171 T 0.054 +172 E 0.060 +173 V 0.067 +174 N 0.070 +175 I 0.071 +176 P 0.073 +177 P 0.074 +178 G 0.076 +179 A 0.077 +180 K 0.077 +181 V 0.074 +182 Q 0.068 +183 F 0.061 +184 E 0.056 +185 L 0.051 +186 H 0.044 +187 Y 0.039 +188 Q 0.038 +189 E 0.042 +190 V 0.050 +191 K 0.056 +192 W 0.062 +193 R 0.072 +194 K 0.087 +195 L 0.097 +196 G 0.098 +197 S 0.087 +198 Y 0.069 +199 E 0.055 +200 H 0.050 +201 K 0.052 +202 I 0.057 +203 H 0.063 +204 L 0.069 +205 Q 0.072 +206 P 0.073 +207 G 0.075 +208 K 0.077 +209 L 0.078 +210 A 0.076 +211 K 0.073 +212 H 0.070 +213 L 0.068 +214 E 0.066 +215 V 0.064 +216 N 0.060 +217 V 0.054 +218 W 0.050 +219 I 0.053 +220 I 0.064 +221 E 0.080 +222 P 0.095 +223 Q 0.101 +224 G 0.097 +225 M 0.085 +226 R 0.072 +227 F 0.064 +228 L 0.068 +229 H 0.083 +230 V 0.105 +231 P 0.127 +232 D 0.137 +233 T 0.136 +234 F 0.135 +235 E 0.141 +236 G 0.147 +237 H 0.149 +238 F 0.148 +239 Q 0.144 +240 G 0.134 +241 V 0.116 +242 P 0.090 +243 V 0.068 +244 I 0.058 +245 S 0.060 +246 K 0.064 +247 G 0.066 +248 Q 0.062 +249 Q 0.056 +250 K 0.050 +251 A 0.045 +252 H 0.042 +253 V 0.038 +254 S 0.036 +255 F 0.038 +256 K 0.045 +257 P 0.053 +258 T 0.060 +259 V 0.067 +260 A 0.079 +261 Q 0.092 +262 Q 0.107 +263 R 0.130 +264 K 0.161 +265 C 0.189 +266 P 0.201 +267 N 0.193 +268 C 0.174 +269 T 0.151 +270 E 0.132 +271 T 0.121 +272 A 0.117 +273 V 0.114 +274 N 0.108 +275 G 0.099 +276 E 0.083 +277 L 0.066 +278 V 0.055 +279 V 0.049 +280 M 0.046 +281 Y 0.048 +282 D 0.059 +283 V 0.076 +284 N 0.099 +285 R 0.124 +286 E 0.145 +287 E 0.158 +288 K 0.159 +289 A 0.151 +290 G 0.134 +291 E 0.112 +292 L 0.092 +293 E 0.078 +294 V 0.073 +295 F 0.074 +296 N 0.078 +297 G 0.079 +298 Y 0.079 +299 F 0.080 +300 V 0.083 +301 H 0.084 +302 F 0.085 +303 F 0.095 +304 A 0.120 +305 P 0.157 +306 E 0.191 +307 N 0.212 +308 L 0.219 +309 D 0.214 +310 P 0.200 +311 I 0.176 +312 P 0.144 +313 K 0.116 +314 N 0.100 +315 I 0.092 +316 L 0.085 +317 F 0.082 +318 V 0.084 +319 I 0.088 +320 D 0.093 +321 V 0.100 +322 S 0.107 +323 G 0.108 +324 S 0.105 +325 M 0.098 +326 W 0.089 +327 G 0.079 +328 I 0.072 +329 K 0.067 +330 M 0.064 +331 K 0.063 +332 Q 0.063 +333 T 0.059 +334 V 0.054 +335 E 0.054 +336 A 0.058 +337 M 0.059 +338 K 0.056 +339 T 0.053 +340 I 0.054 +341 L 0.055 +342 D 0.056 +343 D 0.057 +344 L 0.057 +345 R 0.057 +346 T 0.056 +347 D 0.055 +348 D 0.049 +349 Q 0.038 +350 F 0.025 +351 S 0.018 +352 V 0.016 +353 V 0.018 +354 D 0.022 +355 F 0.027 +356 N 0.035 +357 H 0.046 +358 N 0.056 +359 V 0.058 +360 R 0.055 +361 T 0.051 +362 W 0.049 +363 R 0.051 +364 N 0.054 +365 D 0.055 +366 L 0.055 +367 V 0.055 +368 S 0.056 +369 A 0.054 +370 T 0.050 +371 K 0.045 +372 T 0.043 +373 Q 0.049 +374 I 0.064 +375 A 0.080 +376 D 0.090 +377 A 0.094 +378 K 0.095 +379 R 0.092 +380 Y 0.080 +381 I 0.067 +382 E 0.064 +383 K 0.074 +384 I 0.089 +385 Q 0.103 +386 P 0.117 +387 S 0.130 +388 G 0.135 +389 G 0.127 +390 T 0.112 +391 N 0.093 +392 I 0.074 +393 N 0.061 +394 E 0.053 +395 A 0.049 +396 L 0.045 +397 L 0.043 +398 R 0.042 +399 A 0.042 +400 I 0.042 +401 F 0.044 +402 I 0.048 +403 L 0.053 +404 N 0.063 +405 E 0.075 +406 A 0.085 +407 S 0.093 +408 N 0.106 +409 M 0.125 +410 G 0.140 +411 L 0.144 +412 L 0.137 +413 N 0.123 +414 P 0.107 +415 D 0.094 +416 S 0.082 +417 V 0.065 +418 S 0.048 +419 L 0.037 +420 I 0.032 +421 I 0.033 +422 L 0.041 +423 V 0.056 +424 S 0.080 +425 D 0.110 +426 G 0.138 +427 D 0.149 +428 P 0.140 +429 T 0.124 +430 V 0.116 +431 G 0.118 +432 E 0.125 +433 L 0.129 +434 K 0.122 +435 L 0.104 +436 S 0.087 +437 K 0.079 +438 I 0.077 +439 Q 0.074 +440 K 0.069 +441 N 0.065 +442 V 0.065 +443 K 0.068 +444 Q 0.069 +445 S 0.071 +446 I 0.071 +447 Q 0.071 +448 D 0.070 +449 N 0.066 +450 I 0.057 +451 S 0.046 +452 L 0.037 +453 F 0.032 +454 S 0.034 +455 L 0.042 +456 G 0.053 +457 I 0.063 +458 G 0.072 +459 F 0.079 +460 D 0.079 +461 V 0.068 +462 D 0.052 +463 Y 0.041 +464 D 0.038 +465 F 0.040 +466 L 0.044 +467 K 0.050 +468 R 0.056 +469 L 0.060 +470 S 0.061 +471 N 0.063 +472 E 0.069 +473 N 0.080 +474 R 0.090 +475 G 0.090 +476 I 0.081 +477 A 0.074 +478 Q 0.079 +479 R 0.098 +480 I 0.127 +481 Y 0.156 +482 G 0.174 +483 N 0.176 +484 Q 0.166 +485 D 0.145 +486 T 0.120 +487 S 0.095 +488 S 0.080 +489 Q 0.075 +490 L 0.074 +491 K 0.071 +492 K 0.067 +493 F 0.070 +494 Y 0.077 +495 N 0.079 +496 Q 0.076 +497 V 0.076 +498 S 0.080 +499 T 0.079 +500 P 0.074 +501 L 0.071 +502 L 0.072 +503 R 0.074 +504 N 0.070 +505 V 0.062 +506 Q 0.056 +507 F 0.057 +508 N 0.065 +509 Y 0.073 +510 P 0.074 +511 Q 0.070 +512 A 0.069 +513 S 0.076 +514 V 0.086 +515 T 0.093 +516 D 0.092 +517 V 0.086 +518 T 0.079 +519 Q 0.075 +520 N 0.075 +521 N 0.073 +522 F 0.066 +523 H 0.055 +524 N 0.046 +525 Y 0.048 +526 F 0.059 +527 G 0.073 +528 G 0.081 +529 S 0.082 +530 E 0.077 +531 I 0.070 +532 V 0.063 +533 V 0.055 +534 A 0.046 +535 G 0.041 +536 K 0.045 +537 F 0.055 +538 D 0.067 +539 P 0.077 +540 S 0.090 +541 K 0.103 +542 L 0.108 +543 T 0.104 +544 E 0.095 +545 V 0.084 +546 Q 0.070 +547 S 0.057 +548 I 0.048 +549 I 0.045 +550 T 0.047 +551 A 0.053 +552 T 0.061 +553 S 0.069 +554 A 0.074 +555 N 0.078 +556 T 0.083 +557 E 0.088 +558 L 0.090 +559 V 0.090 +560 L 0.088 +561 E 0.083 +562 T 0.076 +563 L 0.076 +564 S 0.087 +565 Q 0.104 +566 M 0.122 +567 D 0.135 +568 D 0.139 +569 L 0.138 +570 E 0.145 +571 E 0.168 +572 F 0.197 +573 L 0.222 +574 S 0.243 +575 K 0.270 +576 D 0.299 +577 K 0.316 +578 H 0.313 +579 A 0.293 +580 D 0.260 +581 P 0.219 +582 D 0.175 +583 F 0.135 +584 T 0.103 +585 K 0.082 +586 K 0.067 +587 L 0.062 +588 W 0.067 +589 A 0.076 +590 Y 0.086 +591 L 0.093 +592 T 0.094 +593 I 0.089 +594 N 0.084 +595 Q 0.083 +596 L 0.082 +597 L 0.083 +598 A 0.086 +599 E 0.090 +600 R 0.096 +601 S 0.104 +602 L 0.108 +603 A 0.105 +604 P 0.099 +605 T 0.091 +606 A 0.083 +607 A 0.076 +608 I 0.073 +609 K 0.071 +610 R 0.069 +611 K 0.069 +612 I 0.071 +613 T 0.071 +614 K 0.068 +615 T 0.070 +616 I 0.080 +617 L 0.091 +618 Q 0.095 +619 M 0.093 +620 S 0.092 +621 L 0.095 +622 D 0.099 +623 H 0.104 +624 H 0.118 +625 I 0.143 +626 V 0.177 +627 T 0.211 +628 P 0.236 +629 L 0.243 +630 T 0.242 +631 A 0.248 +632 M 0.264 +633 V 0.283 +634 I 0.304 +635 E 0.328 +636 N 0.353 +637 D 0.366 +638 A 0.370 +639 G 0.381 +640 D 0.403 +641 E 0.430 +642 R 0.452 +643 M 0.466 +644 L 0.467 +645 A 0.456 +646 D 0.438 +647 S 0.422 +648 P 0.408 +649 P 0.397 +650 Q 0.389 +651 D 0.381 +652 H 0.375 +653 S 0.373 +654 C 0.394 +655 C 0.449 +656 S 0.526 +657 G 0.587 +658 A 0.608 +659 L 0.595 +660 Y 0.573 +661 Y 0.565 +662 G 0.577 +663 T 0.595 +664 K 0.609 +665 V 0.614 +666 A 0.609 +667 S 0.594 +668 G 0.574 +669 P 0.551 +670 I 0.531 +671 P 0.524 +672 S 0.525 +673 W 0.523 +674 A 0.518 +675 N 0.514 +676 P 0.515 +677 S 0.524 +678 P 0.542 +679 T 0.558 +680 P 0.541 +681 M 0.479 +682 S 0.413 +683 A 0.403 +684 M 0.442 +685 L 0.472 +686 A 0.487 +687 V 0.518 +688 G 0.561 +689 A 0.589 +690 K 0.602 +691 P 0.612 +692 L 0.614 +693 E 0.599 +694 S 0.573 +695 T 0.547 +696 P 0.524 +697 P 0.498 +698 T 0.464 +699 H 0.421 +700 L 0.373 +701 N 0.325 +702 Q 0.288 +703 V 0.259 +704 E 0.227 +705 N 0.192 +706 D 0.168 +707 P 0.161 +708 H 0.159 +709 F 0.151 +710 I 0.142 +711 I 0.140 +712 Y 0.144 +713 L 0.148 +714 P 0.150 +715 K 0.149 +716 S 0.142 +717 K 0.129 +718 R 0.112 +719 N 0.095 +720 I 0.080 +721 C 0.071 +722 F 0.071 +723 N 0.080 +724 I 0.095 +725 D 0.114 +726 S 0.130 +727 E 0.135 +728 P 0.128 +729 G 0.116 +730 K 0.103 +731 I 0.091 +732 L 0.077 +733 S 0.068 +734 L 0.069 +735 V 0.081 +736 S 0.098 +737 D 0.114 +738 P 0.127 +739 E 0.137 +740 S 0.137 +741 G 0.126 +742 I 0.111 +743 V 0.102 +744 V 0.102 +745 N 0.109 +746 G 0.117 +747 Q 0.120 +748 L 0.118 +749 I 0.121 +750 G 0.131 +751 A 0.142 +752 K 0.146 +753 R 0.146 +754 A 0.152 +755 E 0.165 +756 N 0.178 +757 G 0.182 +758 K 0.169 +759 L 0.143 +760 S 0.112 +761 T 0.086 +762 Y 0.068 +763 F 0.057 +764 G 0.050 +765 K 0.044 +766 L 0.037 +767 G 0.030 +768 F 0.026 +769 Y 0.027 +770 F 0.032 +771 Q 0.043 +772 K 0.057 +773 E 0.068 +774 G 0.072 +775 M 0.068 +776 K 0.060 +777 I 0.051 +778 E 0.045 +779 I 0.044 +780 S 0.047 +781 T 0.052 +782 E 0.055 +783 T 0.056 +784 I 0.058 +785 T 0.062 +786 L 0.071 +787 S 0.083 +788 S 0.093 +789 G 0.096 +790 S 0.094 +791 S 0.089 +792 T 0.086 +793 S 0.089 +794 R 0.095 +795 L 0.098 +796 S 0.096 +797 W 0.093 +798 S 0.090 +799 D 0.086 +800 T 0.086 +801 A 0.095 +802 H 0.111 +803 L 0.129 +804 G 0.138 +805 N 0.131 +806 S 0.109 +807 R 0.087 +808 V 0.072 +809 L 0.067 +810 I 0.066 +811 S 0.068 +812 V 0.069 +813 K 0.069 +814 K 0.071 +815 E 0.073 +816 K 0.072 +817 S 0.067 +818 V 0.062 +819 T 0.060 +820 L 0.062 +821 T 0.065 +822 L 0.065 +823 N 0.066 +824 K 0.069 +825 E 0.072 +826 L 0.070 +827 F 0.065 +828 F 0.064 +829 S 0.071 +830 V 0.079 +831 L 0.083 +832 L 0.084 +833 H 0.087 +834 R 0.091 +835 V 0.095 +836 W 0.098 +837 R 0.104 +838 K 0.114 +839 H 0.128 +840 P 0.140 +841 V 0.143 +842 N 0.135 +843 V 0.118 +844 D 0.101 +845 F 0.090 +846 L 0.087 +847 G 0.087 +848 I 0.089 +849 Y 0.094 +850 A 0.103 +851 P 0.110 +852 P 0.115 +853 I 0.116 +854 D 0.112 +855 K 0.105 +856 F 0.104 +857 S 0.114 +858 P 0.126 +859 R 0.127 +860 V 0.117 +861 H 0.106 +862 G 0.099 +863 L 0.100 +864 L 0.113 +865 G 0.132 +866 Q 0.142 +867 F 0.136 +868 M 0.127 +869 Q 0.134 +870 E 0.158 +871 P 0.178 +872 A 0.178 +873 I 0.164 +874 H 0.153 +875 I 0.157 +876 F 0.179 +877 N 0.217 +878 E 0.262 +879 R 0.303 +880 P 0.324 +881 G 0.322 +882 K 0.308 +883 E 0.295 +884 P 0.288 +885 G 0.282 +886 K 0.268 +887 P 0.242 +888 E 0.209 +889 A 0.179 +890 S 0.159 +891 M 0.149 +892 E 0.147 +893 V 0.156 +894 K 0.176 +895 G 0.204 +896 H 0.227 +897 K 0.239 +898 L 0.238 +899 T 0.228 +900 V 0.218 +901 T 0.223 +902 R 0.246 +903 G 0.265 +904 L 0.255 +905 Q 0.220 +906 K 0.185 +907 D 0.164 +908 Y 0.155 +909 R 0.153 +910 T 0.155 +911 D 0.164 +912 I 0.171 +913 V 0.173 +914 F 0.182 +915 G 0.201 +916 T 0.218 +917 D 0.219 +918 V 0.200 +919 P 0.172 +920 C 0.150 +921 W 0.141 +922 F 0.147 +923 V 0.169 +924 H 0.207 +925 N 0.260 +926 S 0.312 +927 G 0.338 +928 K 0.324 +929 G 0.283 +930 F 0.247 +931 I 0.238 +932 D 0.248 +933 G 0.250 +934 H 0.230 +935 Y 0.198 +936 K 0.171 +937 D 0.149 +938 Y 0.133 +939 F 0.124 +940 V 0.122 +941 P 0.119 +942 Q 0.109 +943 L 0.094 +944 Y 0.085 +945 S 0.091 +946 F 0.110 +947 L 0.144 +948 K 0.196 +949 R 0.260 +950 P 0.308 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000037260.9_ENSMUST00000037609.8_GN:Hgsnat_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000037260.9_ENSMUST00000037609.8_GN:Hgsnat_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..fae392cd133727047bc759fb351171a532baa004 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000037260.9_ENSMUST00000037609.8_GN:Hgsnat_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,625 @@ +>ENSMUSG00000037260.9|ENSMUST00000037609.8|GN:Hgsnat|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.274 +2 G 0.270 +3 A 0.266 +4 G 0.254 +5 P 0.224 +6 A 0.184 +7 L 0.149 +8 A 0.126 +9 A 0.110 +10 L 0.100 +11 L 0.100 +12 L 0.111 +13 A 0.126 +14 G 0.140 +15 S 0.155 +16 V 0.169 +17 L 0.182 +18 S 0.194 +19 A 0.208 +20 T 0.230 +21 L 0.264 +22 L 0.308 +23 A 0.361 +24 P 0.411 +25 G 0.438 +26 R 0.434 +27 R 0.414 +28 A 0.402 +29 E 0.402 +30 P 0.400 +31 D 0.383 +32 L 0.348 +33 D 0.309 +34 E 0.282 +35 K 0.268 +36 R 0.268 +37 N 0.276 +38 V 0.277 +39 E 0.256 +40 L 0.214 +41 K 0.165 +42 M 0.121 +43 D 0.085 +44 Q 0.059 +45 A 0.042 +46 L 0.035 +47 L 0.033 +48 L 0.035 +49 I 0.039 +50 H 0.044 +51 N 0.050 +52 E 0.057 +53 L 0.067 +54 L 0.081 +55 G 0.089 +56 T 0.082 +57 S 0.063 +58 L 0.043 +59 T 0.031 +60 V 0.026 +61 Y 0.028 +62 W 0.035 +63 K 0.047 +64 S 0.062 +65 D 0.075 +66 D 0.078 +67 C 0.070 +68 Y 0.058 +69 Q 0.047 +70 C 0.043 +71 T 0.043 +72 F 0.046 +73 Q 0.050 +74 P 0.056 +75 L 0.060 +76 A 0.065 +77 N 0.074 +78 V 0.093 +79 S 0.127 +80 H 0.181 +81 G 0.243 +82 G 0.281 +83 K 0.278 +84 P 0.241 +85 A 0.194 +86 K 0.158 +87 P 0.139 +88 S 0.132 +89 V 0.124 +90 A 0.106 +91 P 0.081 +92 V 0.058 +93 S 0.042 +94 V 0.034 +95 S 0.030 +96 T 0.029 +97 Q 0.031 +98 H 0.037 +99 G 0.045 +100 S 0.052 +101 I 0.053 +102 L 0.053 +103 Q 0.056 +104 V 0.062 +105 N 0.073 +106 S 0.084 +107 T 0.094 +108 S 0.101 +109 E 0.104 +110 E 0.105 +111 R 0.101 +112 A 0.092 +113 A 0.079 +114 C 0.065 +115 R 0.053 +116 L 0.045 +117 E 0.040 +118 Y 0.038 +119 K 0.040 +120 F 0.050 +121 G 0.072 +122 E 0.105 +123 F 0.138 +124 G 0.153 +125 N 0.140 +126 Y 0.112 +127 S 0.090 +128 L 0.080 +129 L 0.084 +130 V 0.103 +131 Q 0.135 +132 H 0.175 +133 A 0.214 +134 S 0.246 +135 S 0.264 +136 G 0.270 +137 A 0.262 +138 N 0.239 +139 K 0.204 +140 I 0.164 +141 A 0.131 +142 C 0.112 +143 D 0.103 +144 I 0.098 +145 I 0.099 +146 V 0.113 +147 N 0.140 +148 E 0.172 +149 N 0.202 +150 P 0.218 +151 V 0.213 +152 D 0.192 +153 S 0.163 +154 N 0.139 +155 L 0.121 +156 P 0.104 +157 V 0.089 +158 S 0.080 +159 I 0.080 +160 A 0.089 +161 F 0.105 +162 L 0.122 +163 V 0.137 +164 G 0.146 +165 L 0.143 +166 A 0.130 +167 L 0.115 +168 I 0.099 +169 V 0.084 +170 A 0.073 +171 V 0.067 +172 S 0.065 +173 L 0.065 +174 L 0.070 +175 R 0.080 +176 L 0.097 +177 L 0.120 +178 L 0.147 +179 S 0.172 +180 L 0.190 +181 D 0.203 +182 D 0.209 +183 V 0.207 +184 N 0.196 +185 N 0.181 +186 W 0.172 +187 I 0.167 +188 S 0.164 +189 K 0.163 +190 T 0.172 +191 I 0.192 +192 A 0.212 +193 S 0.229 +194 R 0.247 +195 E 0.265 +196 T 0.278 +197 D 0.285 +198 R 0.287 +199 L 0.287 +200 I 0.291 +201 N 0.310 +202 S 0.344 +203 E 0.384 +204 L 0.426 +205 G 0.471 +206 S 0.511 +207 P 0.528 +208 S 0.520 +209 R 0.516 +210 A 0.547 +211 D 0.600 +212 P 0.644 +213 L 0.670 +214 S 0.683 +215 A 0.678 +216 D 0.653 +217 Y 0.623 +218 Q 0.612 +219 P 0.625 +220 E 0.649 +221 T 0.665 +222 R 0.666 +223 R 0.655 +224 S 0.629 +225 S 0.577 +226 A 0.488 +227 N 0.374 +228 R 0.259 +229 L 0.166 +230 R 0.103 +231 C 0.067 +232 V 0.052 +233 D 0.050 +234 T 0.058 +235 F 0.068 +236 R 0.075 +237 G 0.077 +238 L 0.077 +239 A 0.079 +240 L 0.081 +241 V 0.079 +242 L 0.074 +243 M 0.072 +244 V 0.075 +245 F 0.084 +246 V 0.100 +247 N 0.120 +248 Y 0.142 +249 G 0.166 +250 G 0.191 +251 G 0.205 +252 K 0.201 +253 Y 0.188 +254 W 0.178 +255 Y 0.178 +256 F 0.182 +257 K 0.180 +258 H 0.165 +259 S 0.142 +260 S 0.117 +261 W 0.095 +262 N 0.080 +263 G 0.072 +264 L 0.072 +265 T 0.082 +266 V 0.105 +267 A 0.141 +268 D 0.179 +269 L 0.205 +270 V 0.203 +271 F 0.177 +272 P 0.153 +273 W 0.147 +274 F 0.142 +275 V 0.121 +276 F 0.097 +277 I 0.087 +278 M 0.088 +279 G 0.088 +280 T 0.086 +281 S 0.080 +282 I 0.071 +283 F 0.061 +284 L 0.054 +285 S 0.052 +286 M 0.053 +287 T 0.059 +288 S 0.068 +289 I 0.078 +290 L 0.090 +291 Q 0.109 +292 R 0.132 +293 G 0.142 +294 C 0.128 +295 S 0.096 +296 K 0.064 +297 L 0.047 +298 K 0.043 +299 L 0.043 +300 L 0.040 +301 G 0.038 +302 K 0.039 +303 I 0.045 +304 V 0.056 +305 W 0.074 +306 R 0.092 +307 S 0.098 +308 F 0.090 +309 L 0.080 +310 L 0.078 +311 I 0.078 +312 C 0.076 +313 I 0.078 +314 G 0.089 +315 V 0.106 +316 I 0.125 +317 I 0.149 +318 V 0.182 +319 N 0.218 +320 P 0.248 +321 N 0.267 +322 Y 0.278 +323 C 0.285 +324 L 0.290 +325 G 0.291 +326 P 0.280 +327 L 0.255 +328 S 0.223 +329 W 0.196 +330 D 0.178 +331 K 0.163 +332 V 0.147 +333 R 0.134 +334 I 0.121 +335 P 0.108 +336 G 0.100 +337 V 0.105 +338 L 0.123 +339 Q 0.147 +340 R 0.169 +341 L 0.178 +342 G 0.168 +343 V 0.144 +344 T 0.119 +345 Y 0.095 +346 F 0.076 +347 V 0.063 +348 V 0.056 +349 A 0.053 +350 V 0.050 +351 L 0.047 +352 E 0.046 +353 F 0.046 +354 F 0.050 +355 F 0.062 +356 W 0.088 +357 K 0.127 +358 P 0.175 +359 V 0.226 +360 P 0.274 +361 D 0.315 +362 S 0.338 +363 C 0.342 +364 T 0.339 +365 L 0.336 +366 E 0.331 +367 S 0.316 +368 S 0.293 +369 C 0.266 +370 F 0.233 +371 S 0.191 +372 L 0.148 +373 R 0.118 +374 D 0.102 +375 I 0.095 +376 T 0.094 +377 S 0.093 +378 S 0.084 +379 W 0.070 +380 P 0.062 +381 Q 0.064 +382 W 0.074 +383 L 0.085 +384 T 0.087 +385 I 0.081 +386 L 0.072 +387 T 0.067 +388 L 0.067 +389 E 0.070 +390 S 0.070 +391 I 0.067 +392 W 0.064 +393 L 0.061 +394 A 0.065 +395 L 0.074 +396 T 0.083 +397 F 0.093 +398 F 0.110 +399 L 0.136 +400 P 0.162 +401 V 0.180 +402 P 0.192 +403 G 0.199 +404 C 0.209 +405 P 0.226 +406 T 0.247 +407 G 0.261 +408 Y 0.264 +409 L 0.263 +410 G 0.265 +411 P 0.272 +412 G 0.283 +413 G 0.285 +414 I 0.275 +415 G 0.260 +416 D 0.248 +417 L 0.241 +418 G 0.238 +419 K 0.237 +420 Y 0.232 +421 P 0.226 +422 H 0.230 +423 C 0.247 +424 T 0.273 +425 G 0.295 +426 G 0.295 +427 A 0.270 +428 A 0.238 +429 G 0.220 +430 Y 0.211 +431 I 0.195 +432 D 0.169 +433 R 0.150 +434 L 0.149 +435 L 0.165 +436 L 0.181 +437 G 0.186 +438 D 0.178 +439 N 0.162 +440 H 0.148 +441 L 0.144 +442 Y 0.157 +443 Q 0.180 +444 H 0.196 +445 P 0.197 +446 S 0.184 +447 S 0.167 +448 T 0.149 +449 V 0.132 +450 L 0.121 +451 Y 0.116 +452 H 0.119 +453 T 0.131 +454 E 0.153 +455 V 0.183 +456 A 0.210 +457 Y 0.227 +458 D 0.236 +459 P 0.246 +460 E 0.261 +461 G 0.273 +462 V 0.279 +463 L 0.287 +464 G 0.304 +465 T 0.317 +466 I 0.312 +467 N 0.292 +468 S 0.262 +469 I 0.226 +470 V 0.195 +471 M 0.168 +472 A 0.138 +473 F 0.113 +474 L 0.097 +475 G 0.089 +476 V 0.086 +477 Q 0.088 +478 A 0.090 +479 G 0.087 +480 K 0.081 +481 I 0.076 +482 L 0.073 +483 V 0.070 +484 Y 0.070 +485 Y 0.073 +486 K 0.077 +487 D 0.081 +488 Q 0.079 +489 T 0.068 +490 K 0.055 +491 A 0.045 +492 I 0.038 +493 L 0.033 +494 T 0.031 +495 R 0.033 +496 F 0.043 +497 A 0.056 +498 A 0.063 +499 W 0.057 +500 C 0.049 +501 C 0.046 +502 I 0.052 +503 L 0.066 +504 G 0.083 +505 L 0.092 +506 I 0.090 +507 S 0.083 +508 I 0.082 +509 V 0.092 +510 L 0.110 +511 T 0.125 +512 K 0.131 +513 V 0.138 +514 S 0.151 +515 A 0.167 +516 N 0.187 +517 E 0.209 +518 G 0.224 +519 F 0.231 +520 I 0.231 +521 P 0.221 +522 I 0.198 +523 N 0.168 +524 K 0.146 +525 N 0.144 +526 L 0.155 +527 W 0.170 +528 S 0.180 +529 I 0.187 +530 S 0.202 +531 Y 0.228 +532 V 0.242 +533 T 0.231 +534 T 0.213 +535 L 0.202 +536 S 0.184 +537 C 0.156 +538 F 0.129 +539 A 0.110 +540 F 0.097 +541 F 0.092 +542 I 0.091 +543 L 0.088 +544 L 0.081 +545 I 0.071 +546 L 0.063 +547 Y 0.058 +548 P 0.057 +549 V 0.063 +550 V 0.079 +551 D 0.097 +552 V 0.109 +553 K 0.112 +554 G 0.107 +555 L 0.099 +556 W 0.092 +557 T 0.091 +558 G 0.090 +559 T 0.086 +560 P 0.080 +561 F 0.082 +562 F 0.096 +563 Y 0.118 +564 P 0.144 +565 G 0.160 +566 M 0.158 +567 N 0.145 +568 S 0.127 +569 I 0.107 +570 L 0.088 +571 V 0.076 +572 Y 0.070 +573 V 0.065 +574 G 0.064 +575 H 0.066 +576 E 0.067 +577 V 0.067 +578 L 0.070 +579 E 0.078 +580 N 0.087 +581 Y 0.092 +582 F 0.095 +583 P 0.103 +584 F 0.118 +585 Q 0.141 +586 W 0.168 +587 K 0.197 +588 L 0.233 +589 A 0.268 +590 D 0.282 +591 E 0.265 +592 Q 0.225 +593 S 0.178 +594 H 0.137 +595 K 0.110 +596 E 0.099 +597 H 0.096 +598 L 0.098 +599 I 0.109 +600 Q 0.127 +601 N 0.137 +602 I 0.135 +603 V 0.130 +604 A 0.129 +605 T 0.121 +606 A 0.105 +607 L 0.089 +608 W 0.084 +609 V 0.087 +610 L 0.088 +611 I 0.081 +612 A 0.066 +613 Y 0.052 +614 V 0.047 +615 L 0.052 +616 Y 0.061 +617 K 0.070 +618 K 0.078 +619 K 0.084 +620 L 0.087 +621 F 0.093 +622 W 0.112 +623 K 0.146 +624 I 0.176 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000037260.9_ENSMUST00000037609.8_GN:Hgsnat_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000037260.9_ENSMUST00000037609.8_GN:Hgsnat_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d69dc13fc7d0db77c97905993387f78fcf734f2f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000037260.9_ENSMUST00000037609.8_GN:Hgsnat_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid @@ -0,0 +1,657 @@ +>ENSMUSG00000037260.9|ENSMUST00000037609.8|GN:Hgsnat|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:32 +1 M 0.343 +2 T 0.357 +3 G 0.376 +4 G 0.377 +5 S 0.343 +6 S 0.292 +7 S 0.262 +8 R 0.257 +9 R 0.251 +10 R 0.235 +11 R 0.225 +12 A 0.222 +13 E 0.222 +14 E 0.232 +15 R 0.247 +16 S 0.253 +17 S 0.256 +18 A 0.280 +19 A 0.322 +20 G 0.347 +21 T 0.350 +22 E 0.344 +23 R 0.332 +24 N 0.309 +25 S 0.292 +26 R 0.291 +27 R 0.305 +28 E 0.340 +29 A 0.398 +30 V 0.454 +31 G 0.481 +32 G 0.471 +33 M 0.434 +34 G 0.388 +35 A 0.344 +36 G 0.303 +37 P 0.261 +38 A 0.219 +39 L 0.184 +40 A 0.162 +41 A 0.146 +42 L 0.135 +43 L 0.132 +44 L 0.141 +45 A 0.158 +46 G 0.174 +47 S 0.186 +48 V 0.196 +49 L 0.207 +50 S 0.222 +51 A 0.238 +52 T 0.256 +53 L 0.285 +54 L 0.330 +55 A 0.389 +56 P 0.448 +57 G 0.484 +58 R 0.482 +59 R 0.456 +60 A 0.433 +61 E 0.424 +62 P 0.421 +63 D 0.405 +64 L 0.371 +65 D 0.332 +66 E 0.302 +67 K 0.283 +68 R 0.276 +69 N 0.278 +70 V 0.273 +71 E 0.249 +72 L 0.206 +73 K 0.158 +74 M 0.116 +75 D 0.083 +76 Q 0.058 +77 A 0.042 +78 L 0.034 +79 L 0.032 +80 L 0.033 +81 I 0.036 +82 H 0.040 +83 N 0.045 +84 E 0.050 +85 L 0.061 +86 L 0.075 +87 G 0.084 +88 T 0.078 +89 S 0.060 +90 L 0.041 +91 T 0.029 +92 V 0.025 +93 Y 0.026 +94 W 0.032 +95 K 0.043 +96 S 0.056 +97 D 0.065 +98 D 0.067 +99 C 0.061 +100 Y 0.051 +101 Q 0.043 +102 C 0.040 +103 T 0.041 +104 F 0.043 +105 Q 0.048 +106 P 0.053 +107 L 0.057 +108 A 0.061 +109 N 0.070 +110 V 0.087 +111 S 0.117 +112 H 0.165 +113 G 0.221 +114 G 0.257 +115 K 0.255 +116 P 0.223 +117 A 0.184 +118 K 0.154 +119 P 0.140 +120 S 0.135 +121 V 0.126 +122 A 0.107 +123 P 0.081 +124 V 0.057 +125 S 0.041 +126 V 0.033 +127 S 0.030 +128 T 0.029 +129 Q 0.031 +130 H 0.038 +131 G 0.047 +132 S 0.054 +133 I 0.056 +134 L 0.056 +135 Q 0.058 +136 V 0.064 +137 N 0.072 +138 S 0.083 +139 T 0.094 +140 S 0.103 +141 E 0.109 +142 E 0.111 +143 R 0.107 +144 A 0.096 +145 A 0.080 +146 C 0.064 +147 R 0.052 +148 L 0.045 +149 E 0.041 +150 Y 0.040 +151 K 0.043 +152 F 0.054 +153 G 0.075 +154 E 0.107 +155 F 0.137 +156 G 0.149 +157 N 0.135 +158 Y 0.107 +159 S 0.085 +160 L 0.075 +161 L 0.078 +162 V 0.094 +163 Q 0.125 +164 H 0.164 +165 A 0.204 +166 S 0.236 +167 S 0.256 +168 G 0.262 +169 A 0.252 +170 N 0.228 +171 K 0.191 +172 I 0.151 +173 A 0.119 +174 C 0.100 +175 D 0.092 +176 I 0.088 +177 I 0.091 +178 V 0.107 +179 N 0.134 +180 E 0.167 +181 N 0.196 +182 P 0.212 +183 V 0.208 +184 D 0.186 +185 S 0.158 +186 N 0.134 +187 L 0.116 +188 P 0.100 +189 V 0.087 +190 S 0.079 +191 I 0.079 +192 A 0.090 +193 F 0.108 +194 L 0.128 +195 V 0.144 +196 G 0.154 +197 L 0.153 +198 A 0.140 +199 L 0.122 +200 I 0.104 +201 V 0.087 +202 A 0.074 +203 V 0.066 +204 S 0.064 +205 L 0.065 +206 L 0.069 +207 R 0.079 +208 L 0.095 +209 L 0.117 +210 L 0.141 +211 S 0.163 +212 L 0.180 +213 D 0.193 +214 D 0.200 +215 V 0.200 +216 N 0.191 +217 N 0.179 +218 W 0.170 +219 I 0.166 +220 S 0.163 +221 K 0.162 +222 T 0.171 +223 I 0.190 +224 A 0.211 +225 S 0.228 +226 R 0.245 +227 E 0.262 +228 T 0.275 +229 D 0.281 +230 R 0.282 +231 L 0.282 +232 I 0.287 +233 N 0.308 +234 S 0.344 +235 E 0.386 +236 L 0.430 +237 G 0.480 +238 S 0.536 +239 P 0.591 +240 S 0.632 +241 R 0.652 +242 A 0.657 +243 D 0.660 +244 P 0.667 +245 L 0.679 +246 S 0.689 +247 A 0.684 +248 D 0.659 +249 Y 0.628 +250 Q 0.617 +251 P 0.631 +252 E 0.655 +253 T 0.671 +254 R 0.673 +255 R 0.662 +256 S 0.636 +257 S 0.582 +258 A 0.493 +259 N 0.377 +260 R 0.262 +261 L 0.167 +262 R 0.103 +263 C 0.067 +264 V 0.052 +265 D 0.051 +266 T 0.058 +267 F 0.068 +268 R 0.075 +269 G 0.077 +270 L 0.077 +271 A 0.080 +272 L 0.082 +273 V 0.080 +274 L 0.075 +275 M 0.074 +276 V 0.076 +277 F 0.085 +278 V 0.101 +279 N 0.121 +280 Y 0.143 +281 G 0.168 +282 G 0.193 +283 G 0.207 +284 K 0.204 +285 Y 0.191 +286 W 0.182 +287 Y 0.183 +288 F 0.187 +289 K 0.184 +290 H 0.169 +291 S 0.144 +292 S 0.118 +293 W 0.096 +294 N 0.080 +295 G 0.073 +296 L 0.073 +297 T 0.083 +298 V 0.106 +299 A 0.142 +300 D 0.181 +301 L 0.208 +302 V 0.206 +303 F 0.179 +304 P 0.155 +305 W 0.149 +306 F 0.145 +307 V 0.123 +308 F 0.098 +309 I 0.087 +310 M 0.087 +311 G 0.088 +312 T 0.085 +313 S 0.079 +314 I 0.070 +315 F 0.060 +316 L 0.054 +317 S 0.052 +318 M 0.053 +319 T 0.059 +320 S 0.069 +321 I 0.078 +322 L 0.090 +323 Q 0.109 +324 R 0.131 +325 G 0.142 +326 C 0.128 +327 S 0.096 +328 K 0.064 +329 L 0.047 +330 K 0.043 +331 L 0.042 +332 L 0.040 +333 G 0.038 +334 K 0.039 +335 I 0.045 +336 V 0.057 +337 W 0.074 +338 R 0.093 +339 S 0.099 +340 F 0.090 +341 L 0.081 +342 L 0.079 +343 I 0.078 +344 C 0.076 +345 I 0.078 +346 G 0.089 +347 V 0.105 +348 I 0.124 +349 I 0.149 +350 V 0.181 +351 N 0.217 +352 P 0.246 +353 N 0.266 +354 Y 0.278 +355 C 0.284 +356 L 0.289 +357 G 0.291 +358 P 0.280 +359 L 0.256 +360 S 0.225 +361 W 0.198 +362 D 0.178 +363 K 0.163 +364 V 0.147 +365 R 0.134 +366 I 0.122 +367 P 0.109 +368 G 0.101 +369 V 0.106 +370 L 0.125 +371 Q 0.150 +372 R 0.173 +373 L 0.182 +374 G 0.170 +375 V 0.146 +376 T 0.119 +377 Y 0.096 +378 F 0.077 +379 V 0.063 +380 V 0.056 +381 A 0.053 +382 V 0.050 +383 L 0.048 +384 E 0.046 +385 F 0.046 +386 F 0.050 +387 F 0.062 +388 W 0.087 +389 K 0.126 +390 P 0.174 +391 V 0.224 +392 P 0.272 +393 D 0.311 +394 S 0.334 +395 C 0.338 +396 T 0.336 +397 L 0.334 +398 E 0.330 +399 S 0.315 +400 S 0.292 +401 C 0.265 +402 F 0.233 +403 S 0.191 +404 L 0.148 +405 R 0.118 +406 D 0.102 +407 I 0.095 +408 T 0.093 +409 S 0.092 +410 S 0.083 +411 W 0.069 +412 P 0.058 +413 Q 0.054 +414 W 0.055 +415 L 0.061 +416 T 0.068 +417 I 0.071 +418 L 0.069 +419 T 0.066 +420 L 0.067 +421 E 0.069 +422 S 0.070 +423 I 0.068 +424 W 0.064 +425 L 0.062 +426 A 0.065 +427 L 0.074 +428 T 0.083 +429 F 0.093 +430 F 0.110 +431 L 0.137 +432 P 0.163 +433 V 0.182 +434 P 0.193 +435 G 0.201 +436 C 0.210 +437 P 0.228 +438 T 0.250 +439 G 0.264 +440 Y 0.267 +441 L 0.266 +442 G 0.267 +443 P 0.274 +444 G 0.283 +445 G 0.285 +446 I 0.274 +447 G 0.258 +448 D 0.246 +449 L 0.239 +450 G 0.236 +451 K 0.236 +452 Y 0.232 +453 P 0.227 +454 H 0.231 +455 C 0.249 +456 T 0.276 +457 G 0.298 +458 G 0.300 +459 A 0.275 +460 A 0.243 +461 G 0.226 +462 Y 0.217 +463 I 0.200 +464 D 0.174 +465 R 0.153 +466 L 0.152 +467 L 0.167 +468 L 0.183 +469 G 0.187 +470 D 0.179 +471 N 0.164 +472 H 0.149 +473 L 0.146 +474 Y 0.160 +475 Q 0.183 +476 H 0.200 +477 P 0.201 +478 S 0.189 +479 S 0.172 +480 T 0.153 +481 V 0.136 +482 L 0.124 +483 Y 0.119 +484 H 0.122 +485 T 0.133 +486 E 0.155 +487 V 0.185 +488 A 0.212 +489 Y 0.229 +490 D 0.238 +491 P 0.249 +492 E 0.264 +493 G 0.276 +494 V 0.282 +495 L 0.292 +496 G 0.309 +497 T 0.322 +498 I 0.319 +499 N 0.300 +500 S 0.270 +501 I 0.234 +502 V 0.201 +503 M 0.172 +504 A 0.141 +505 F 0.114 +506 L 0.098 +507 G 0.089 +508 V 0.086 +509 Q 0.088 +510 A 0.091 +511 G 0.088 +512 K 0.082 +513 I 0.077 +514 L 0.073 +515 V 0.071 +516 Y 0.071 +517 Y 0.074 +518 K 0.079 +519 D 0.082 +520 Q 0.079 +521 T 0.069 +522 K 0.055 +523 A 0.045 +524 I 0.037 +525 L 0.032 +526 T 0.029 +527 R 0.029 +528 F 0.031 +529 A 0.035 +530 A 0.037 +531 W 0.037 +532 C 0.038 +533 C 0.042 +534 I 0.049 +535 L 0.058 +536 G 0.067 +537 L 0.072 +538 I 0.073 +539 S 0.075 +540 I 0.080 +541 V 0.092 +542 L 0.111 +543 T 0.126 +544 K 0.133 +545 V 0.139 +546 S 0.152 +547 A 0.168 +548 N 0.188 +549 E 0.210 +550 G 0.226 +551 F 0.233 +552 I 0.233 +553 P 0.223 +554 I 0.200 +555 N 0.169 +556 K 0.148 +557 N 0.146 +558 L 0.157 +559 W 0.173 +560 S 0.183 +561 I 0.190 +562 S 0.205 +563 Y 0.231 +564 V 0.245 +565 T 0.234 +566 T 0.216 +567 L 0.204 +568 S 0.186 +569 C 0.158 +570 F 0.131 +571 A 0.111 +572 F 0.099 +573 F 0.093 +574 I 0.092 +575 L 0.089 +576 L 0.082 +577 I 0.073 +578 L 0.064 +579 Y 0.059 +580 P 0.058 +581 V 0.063 +582 V 0.079 +583 D 0.097 +584 V 0.110 +585 K 0.112 +586 G 0.107 +587 L 0.099 +588 W 0.092 +589 T 0.090 +590 G 0.090 +591 T 0.086 +592 P 0.080 +593 F 0.082 +594 F 0.095 +595 Y 0.118 +596 P 0.144 +597 G 0.160 +598 M 0.158 +599 N 0.146 +600 S 0.129 +601 I 0.109 +602 L 0.090 +603 V 0.078 +604 Y 0.071 +605 V 0.066 +606 G 0.065 +607 H 0.067 +608 E 0.067 +609 V 0.067 +610 L 0.070 +611 E 0.078 +612 N 0.086 +613 Y 0.091 +614 F 0.094 +615 P 0.102 +616 F 0.118 +617 Q 0.142 +618 W 0.169 +619 K 0.199 +620 L 0.235 +621 A 0.270 +622 D 0.284 +623 E 0.266 +624 Q 0.226 +625 S 0.180 +626 H 0.139 +627 K 0.112 +628 E 0.100 +629 H 0.097 +630 L 0.098 +631 I 0.110 +632 Q 0.127 +633 N 0.138 +634 I 0.135 +635 V 0.131 +636 A 0.129 +637 T 0.121 +638 A 0.105 +639 L 0.089 +640 W 0.084 +641 V 0.087 +642 L 0.088 +643 I 0.081 +644 A 0.066 +645 Y 0.052 +646 V 0.048 +647 L 0.052 +648 Y 0.061 +649 K 0.070 +650 K 0.078 +651 K 0.083 +652 L 0.086 +653 F 0.093 +654 W 0.112 +655 K 0.145 +656 I 0.173 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000038286.12_ENSMUST00000040656.8_GN:Bphl_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000038286.12_ENSMUST00000040656.8_GN:Bphl_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d47cd70627c454c5e75115af297171c24c5c9ac5 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000038286.12_ENSMUST00000040656.8_GN:Bphl_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,292 @@ +>ENSMUSG00000038286.12|ENSMUST00000040656.8|GN:Bphl|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.363 +2 A 0.362 +3 T 0.381 +4 A 0.424 +5 T 0.464 +6 V 0.483 +7 R 0.486 +8 P 0.478 +9 A 0.452 +10 A 0.413 +11 Q 0.393 +12 R 0.405 +13 L 0.425 +14 R 0.434 +15 L 0.436 +16 L 0.439 +17 L 0.447 +18 S 0.466 +19 P 0.491 +20 L 0.507 +21 K 0.508 +22 S 0.507 +23 R 0.514 +24 I 0.526 +25 C 0.542 +26 V 0.560 +27 P 0.579 +28 Q 0.594 +29 A 0.604 +30 E 0.607 +31 P 0.604 +32 V 0.590 +33 A 0.560 +34 T 0.523 +35 F 0.485 +36 G 0.441 +37 T 0.377 +38 A 0.292 +39 V 0.202 +40 T 0.129 +41 S 0.081 +42 A 0.055 +43 K 0.041 +44 V 0.035 +45 A 0.036 +46 V 0.041 +47 N 0.049 +48 G 0.056 +49 V 0.056 +50 H 0.049 +51 L 0.039 +52 H 0.032 +53 Y 0.031 +54 Q 0.038 +55 R 0.051 +56 V 0.071 +57 G 0.090 +58 E 0.101 +59 G 0.098 +60 E 0.088 +61 H 0.085 +62 A 0.094 +63 I 0.108 +64 L 0.121 +65 L 0.129 +66 L 0.129 +67 P 0.121 +68 G 0.110 +69 M 0.100 +70 L 0.092 +71 G 0.082 +72 S 0.071 +73 G 0.067 +74 K 0.073 +75 T 0.082 +76 D 0.085 +77 F 0.080 +78 A 0.072 +79 P 0.066 +80 Q 0.063 +81 L 0.063 +82 Q 0.065 +83 S 0.067 +84 L 0.067 +85 N 0.064 +86 K 0.059 +87 K 0.056 +88 R 0.051 +89 F 0.045 +90 T 0.038 +91 L 0.033 +92 V 0.031 +93 A 0.037 +94 W 0.051 +95 D 0.071 +96 P 0.084 +97 R 0.084 +98 G 0.076 +99 Y 0.068 +100 G 0.065 +101 Y 0.061 +102 S 0.054 +103 R 0.052 +104 P 0.065 +105 P 0.095 +106 D 0.128 +107 R 0.150 +108 D 0.156 +109 F 0.151 +110 P 0.140 +111 R 0.122 +112 D 0.095 +113 F 0.068 +114 F 0.048 +115 E 0.037 +116 R 0.034 +117 D 0.036 +118 A 0.039 +119 K 0.041 +120 D 0.041 +121 A 0.041 +122 V 0.041 +123 D 0.039 +124 L 0.035 +125 M 0.031 +126 K 0.031 +127 A 0.034 +128 L 0.038 +129 Q 0.041 +130 F 0.042 +131 K 0.040 +132 Q 0.038 +133 V 0.039 +134 S 0.041 +135 L 0.044 +136 L 0.044 +137 G 0.044 +138 W 0.048 +139 S 0.059 +140 D 0.070 +141 G 0.073 +142 G 0.073 +143 I 0.072 +144 T 0.070 +145 A 0.066 +146 L 0.062 +147 I 0.058 +148 A 0.055 +149 A 0.048 +150 A 0.039 +151 K 0.030 +152 Y 0.026 +153 P 0.026 +154 S 0.029 +155 Y 0.035 +156 I 0.041 +157 R 0.047 +158 K 0.053 +159 M 0.059 +160 V 0.062 +161 I 0.060 +162 W 0.062 +163 G 0.073 +164 A 0.089 +165 N 0.098 +166 A 0.101 +167 Y 0.098 +168 V 0.088 +169 T 0.076 +170 E 0.069 +171 E 0.069 +172 D 0.074 +173 S 0.084 +174 R 0.092 +175 I 0.093 +176 Y 0.089 +177 Q 0.084 +178 G 0.077 +179 I 0.067 +180 R 0.059 +181 D 0.058 +182 V 0.063 +183 S 0.073 +184 K 0.084 +185 W 0.086 +186 S 0.075 +187 E 0.058 +188 K 0.043 +189 A 0.035 +190 R 0.033 +191 K 0.035 +192 P 0.039 +193 L 0.043 +194 E 0.046 +195 A 0.050 +196 L 0.055 +197 Y 0.063 +198 G 0.066 +199 Y 0.059 +200 D 0.048 +201 Y 0.043 +202 L 0.044 +203 A 0.046 +204 K 0.049 +205 T 0.053 +206 C 0.059 +207 E 0.062 +208 D 0.063 +209 W 0.066 +210 V 0.070 +211 D 0.073 +212 G 0.075 +213 I 0.076 +214 S 0.072 +215 Q 0.062 +216 F 0.052 +217 K 0.049 +218 Q 0.050 +219 L 0.054 +220 P 0.061 +221 E 0.072 +222 G 0.081 +223 N 0.084 +224 I 0.078 +225 C 0.069 +226 R 0.061 +227 H 0.055 +228 L 0.051 +229 L 0.049 +230 P 0.050 +231 L 0.052 +232 V 0.056 +233 Q 0.062 +234 C 0.072 +235 P 0.083 +236 T 0.090 +237 L 0.093 +238 I 0.092 +239 V 0.088 +240 H 0.081 +241 G 0.076 +242 E 0.076 +243 K 0.080 +244 D 0.082 +245 P 0.077 +246 L 0.066 +247 V 0.056 +248 P 0.048 +249 R 0.041 +250 F 0.037 +251 H 0.038 +252 A 0.042 +253 D 0.046 +254 F 0.052 +255 L 0.064 +256 L 0.079 +257 Q 0.086 +258 H 0.082 +259 V 0.075 +260 K 0.075 +261 G 0.080 +262 S 0.082 +263 R 0.077 +264 L 0.074 +265 H 0.080 +266 L 0.092 +267 M 0.102 +268 P 0.102 +269 E 0.090 +270 G 0.072 +271 K 0.061 +272 H 0.061 +273 N 0.065 +274 L 0.065 +275 H 0.059 +276 L 0.052 +277 R 0.045 +278 F 0.039 +279 A 0.035 +280 D 0.033 +281 E 0.034 +282 F 0.041 +283 N 0.053 +284 R 0.060 +285 L 0.056 +286 V 0.046 +287 E 0.041 +288 D 0.041 +289 F 0.047 +290 L 0.061 +291 Q 0.075 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000038286.12_ENSMUST00000040656.8_GN:Bphl_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000038286.12_ENSMUST00000040656.8_GN:Bphl_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..32cc075efffdfbd8377de8878098ef925c1dcb3e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000038286.12_ENSMUST00000040656.8_GN:Bphl_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid @@ -0,0 +1,300 @@ +>ENSMUSG00000038286.12|ENSMUST00000040656.8|GN:Bphl|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:8 +1 M 0.407 +2 E 0.423 +3 L 0.449 +4 V 0.482 +5 R 0.522 +6 P 0.566 +7 G 0.608 +8 A 0.631 +9 M 0.614 +10 A 0.563 +11 T 0.523 +12 A 0.519 +13 T 0.526 +14 V 0.517 +15 R 0.502 +16 P 0.491 +17 A 0.474 +18 A 0.446 +19 Q 0.435 +20 R 0.457 +21 L 0.487 +22 R 0.502 +23 L 0.501 +24 L 0.491 +25 L 0.483 +26 S 0.489 +27 P 0.504 +28 L 0.512 +29 K 0.510 +30 S 0.510 +31 R 0.521 +32 I 0.536 +33 C 0.553 +34 V 0.570 +35 P 0.588 +36 Q 0.601 +37 A 0.610 +38 E 0.614 +39 P 0.613 +40 V 0.601 +41 A 0.574 +42 T 0.535 +43 F 0.493 +44 G 0.447 +45 T 0.381 +46 A 0.295 +47 V 0.204 +48 T 0.130 +49 S 0.082 +50 A 0.054 +51 K 0.040 +52 V 0.034 +53 A 0.035 +54 V 0.040 +55 N 0.048 +56 G 0.055 +57 V 0.055 +58 H 0.048 +59 L 0.038 +60 H 0.031 +61 Y 0.031 +62 Q 0.038 +63 R 0.051 +64 V 0.070 +65 G 0.090 +66 E 0.101 +67 G 0.097 +68 E 0.087 +69 H 0.083 +70 A 0.092 +71 I 0.106 +72 L 0.118 +73 L 0.126 +74 L 0.127 +75 P 0.119 +76 G 0.108 +77 M 0.098 +78 L 0.090 +79 G 0.079 +80 S 0.068 +81 G 0.065 +82 K 0.071 +83 T 0.080 +84 D 0.083 +85 F 0.078 +86 A 0.070 +87 P 0.064 +88 Q 0.062 +89 L 0.062 +90 Q 0.064 +91 S 0.066 +92 L 0.067 +93 N 0.064 +94 K 0.059 +95 K 0.055 +96 R 0.051 +97 F 0.045 +98 T 0.038 +99 L 0.033 +100 V 0.031 +101 A 0.036 +102 W 0.051 +103 D 0.070 +104 P 0.083 +105 R 0.083 +106 G 0.074 +107 Y 0.067 +108 G 0.063 +109 Y 0.060 +110 S 0.053 +111 R 0.051 +112 P 0.064 +113 P 0.094 +114 D 0.127 +115 R 0.149 +116 D 0.156 +117 F 0.151 +118 P 0.140 +119 R 0.122 +120 D 0.095 +121 F 0.067 +122 F 0.047 +123 E 0.037 +124 R 0.034 +125 D 0.035 +126 A 0.039 +127 K 0.041 +128 D 0.041 +129 A 0.041 +130 V 0.041 +131 D 0.039 +132 L 0.035 +133 M 0.031 +134 K 0.031 +135 A 0.033 +136 L 0.038 +137 Q 0.041 +138 F 0.042 +139 K 0.040 +140 Q 0.039 +141 V 0.040 +142 S 0.042 +143 L 0.044 +144 L 0.044 +145 G 0.044 +146 W 0.049 +147 S 0.060 +148 D 0.070 +149 G 0.074 +150 G 0.073 +151 I 0.072 +152 T 0.070 +153 A 0.066 +154 L 0.062 +155 I 0.058 +156 A 0.055 +157 A 0.048 +158 A 0.038 +159 K 0.030 +160 Y 0.026 +161 P 0.026 +162 S 0.029 +163 Y 0.035 +164 I 0.041 +165 R 0.047 +166 K 0.053 +167 M 0.059 +168 V 0.062 +169 I 0.060 +170 W 0.062 +171 G 0.073 +172 A 0.089 +173 N 0.099 +174 A 0.102 +175 Y 0.098 +176 V 0.088 +177 T 0.076 +178 E 0.069 +179 E 0.069 +180 D 0.075 +181 S 0.085 +182 R 0.093 +183 I 0.094 +184 Y 0.089 +185 Q 0.084 +186 G 0.078 +187 I 0.068 +188 R 0.060 +189 D 0.058 +190 V 0.063 +191 S 0.073 +192 K 0.084 +193 W 0.086 +194 S 0.075 +195 E 0.057 +196 K 0.043 +197 A 0.035 +198 R 0.033 +199 K 0.035 +200 P 0.038 +201 L 0.042 +202 E 0.045 +203 A 0.049 +204 L 0.054 +205 Y 0.062 +206 G 0.064 +207 Y 0.058 +208 D 0.048 +209 Y 0.043 +210 L 0.044 +211 A 0.046 +212 K 0.048 +213 T 0.053 +214 C 0.059 +215 E 0.062 +216 D 0.063 +217 W 0.066 +218 V 0.070 +219 D 0.072 +220 G 0.074 +221 I 0.075 +222 S 0.071 +223 Q 0.061 +224 F 0.052 +225 K 0.049 +226 Q 0.050 +227 L 0.054 +228 P 0.061 +229 E 0.072 +230 G 0.081 +231 N 0.083 +232 I 0.077 +233 C 0.068 +234 R 0.060 +235 H 0.054 +236 L 0.050 +237 L 0.049 +238 P 0.050 +239 L 0.052 +240 V 0.055 +241 Q 0.062 +242 C 0.072 +243 P 0.083 +244 T 0.090 +245 L 0.093 +246 I 0.093 +247 V 0.088 +248 H 0.081 +249 G 0.076 +250 E 0.076 +251 K 0.080 +252 D 0.082 +253 P 0.077 +254 L 0.066 +255 V 0.056 +256 P 0.048 +257 R 0.041 +258 F 0.037 +259 H 0.038 +260 A 0.042 +261 D 0.046 +262 F 0.052 +263 L 0.065 +264 L 0.079 +265 Q 0.087 +266 H 0.082 +267 V 0.075 +268 K 0.075 +269 G 0.081 +270 S 0.082 +271 R 0.077 +272 L 0.074 +273 H 0.080 +274 L 0.092 +275 M 0.103 +276 P 0.103 +277 E 0.091 +278 G 0.073 +279 K 0.062 +280 H 0.062 +281 N 0.066 +282 L 0.065 +283 H 0.060 +284 L 0.052 +285 R 0.045 +286 F 0.039 +287 A 0.035 +288 D 0.033 +289 E 0.034 +290 F 0.041 +291 N 0.053 +292 R 0.061 +293 L 0.056 +294 V 0.047 +295 E 0.041 +296 D 0.041 +297 F 0.048 +298 L 0.061 +299 Q 0.075 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000038642.11_ENSMUST00000015667.9_GN:Ctss_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000038642.11_ENSMUST00000015667.9_GN:Ctss_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4763269201b928a71074f92d68d3a0dbb7a9bd4b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000038642.11_ENSMUST00000015667.9_GN:Ctss_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,342 @@ +>ENSMUSG00000038642.11|ENSMUST00000015667.9|GN:Ctss|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.396 +2 R 0.415 +3 A 0.444 +4 P 0.453 +5 G 0.420 +6 H 0.373 +7 A 0.368 +8 A 0.393 +9 I 0.387 +10 R 0.343 +11 R 0.312 +12 W 0.314 +13 L 0.322 +14 F 0.330 +15 W 0.355 +16 M 0.387 +17 P 0.406 +18 L 0.424 +19 V 0.462 +20 C 0.504 +21 S 0.529 +22 V 0.535 +23 A 0.528 +24 M 0.502 +25 E 0.453 +26 Q 0.389 +27 L 0.322 +28 Q 0.260 +29 R 0.204 +30 D 0.152 +31 P 0.105 +32 T 0.068 +33 L 0.045 +34 D 0.033 +35 Y 0.027 +36 H 0.024 +37 W 0.022 +38 D 0.021 +39 L 0.021 +40 W 0.022 +41 K 0.024 +42 K 0.028 +43 T 0.032 +44 H 0.038 +45 E 0.047 +46 K 0.061 +47 E 0.077 +48 Y 0.090 +49 K 0.095 +50 D 0.097 +51 K 0.099 +52 N 0.099 +53 E 0.094 +54 E 0.083 +55 E 0.072 +56 V 0.066 +57 R 0.065 +58 R 0.066 +59 L 0.072 +60 I 0.082 +61 W 0.088 +62 E 0.081 +63 K 0.071 +64 N 0.064 +65 L 0.060 +66 K 0.058 +67 F 0.057 +68 I 0.058 +69 M 0.058 +70 I 0.061 +71 H 0.063 +72 N 0.065 +73 L 0.067 +74 E 0.071 +75 Y 0.078 +76 S 0.086 +77 M 0.096 +78 G 0.104 +79 M 0.106 +80 H 0.100 +81 T 0.091 +82 Y 0.089 +83 Q 0.095 +84 V 0.104 +85 G 0.110 +86 M 0.109 +87 N 0.103 +88 D 0.097 +89 M 0.093 +90 G 0.089 +91 D 0.085 +92 M 0.081 +93 T 0.078 +94 N 0.074 +95 E 0.070 +96 E 0.064 +97 I 0.059 +98 L 0.057 +99 C 0.064 +100 R 0.080 +101 M 0.105 +102 G 0.134 +103 A 0.159 +104 L 0.176 +105 R 0.192 +106 I 0.212 +107 P 0.232 +108 R 0.248 +109 Q 0.259 +110 S 0.263 +111 P 0.251 +112 K 0.229 +113 T 0.208 +114 V 0.191 +115 T 0.179 +116 F 0.169 +117 R 0.162 +118 S 0.157 +119 Y 0.153 +120 S 0.150 +121 N 0.144 +122 R 0.135 +123 T 0.125 +124 L 0.116 +125 P 0.108 +126 D 0.099 +127 T 0.090 +128 V 0.080 +129 D 0.069 +130 W 0.066 +131 R 0.073 +132 E 0.085 +133 K 0.092 +134 G 0.099 +135 C 0.110 +136 V 0.120 +137 T 0.122 +138 E 0.120 +139 V 0.116 +140 K 0.110 +141 Y 0.107 +142 Q 0.110 +143 G 0.116 +144 S 0.121 +145 C 0.119 +146 G 0.113 +147 A 0.111 +148 C 0.120 +149 W 0.132 +150 A 0.138 +151 F 0.138 +152 S 0.135 +153 A 0.130 +154 V 0.120 +155 G 0.107 +156 A 0.094 +157 L 0.081 +158 E 0.071 +159 G 0.064 +160 Q 0.060 +161 L 0.057 +162 K 0.055 +163 L 0.054 +164 K 0.057 +165 T 0.065 +166 G 0.075 +167 K 0.082 +168 L 0.083 +169 I 0.078 +170 S 0.074 +171 L 0.073 +172 S 0.070 +173 A 0.063 +174 Q 0.057 +175 N 0.055 +176 L 0.058 +177 V 0.058 +178 D 0.059 +179 C 0.064 +180 S 0.078 +181 N 0.103 +182 E 0.131 +183 E 0.154 +184 K 0.172 +185 Y 0.189 +186 G 0.203 +187 N 0.204 +188 K 0.192 +189 G 0.178 +190 C 0.172 +191 G 0.169 +192 G 0.162 +193 G 0.149 +194 Y 0.129 +195 M 0.109 +196 T 0.094 +197 E 0.085 +198 A 0.076 +199 F 0.068 +200 Q 0.062 +201 Y 0.060 +202 I 0.061 +203 I 0.067 +204 D 0.084 +205 N 0.111 +206 G 0.138 +207 G 0.150 +208 I 0.144 +209 E 0.125 +210 A 0.102 +211 D 0.082 +212 A 0.070 +213 S 0.063 +214 Y 0.060 +215 P 0.060 +216 Y 0.061 +217 K 0.066 +218 A 0.073 +219 T 0.082 +220 D 0.090 +221 E 0.096 +222 K 0.099 +223 C 0.099 +224 H 0.101 +225 Y 0.104 +226 N 0.104 +227 S 0.104 +228 K 0.106 +229 N 0.109 +230 R 0.110 +231 A 0.106 +232 A 0.099 +233 T 0.089 +234 C 0.077 +235 S 0.065 +236 R 0.057 +237 Y 0.056 +238 I 0.065 +239 Q 0.082 +240 L 0.105 +241 P 0.126 +242 F 0.134 +243 G 0.126 +244 D 0.107 +245 E 0.088 +246 D 0.073 +247 A 0.064 +248 L 0.057 +249 K 0.052 +250 E 0.048 +251 A 0.045 +252 V 0.042 +253 A 0.040 +254 T 0.039 +255 K 0.040 +256 G 0.042 +257 P 0.043 +258 V 0.043 +259 S 0.044 +260 V 0.047 +261 G 0.054 +262 I 0.061 +263 D 0.064 +264 A 0.064 +265 S 0.064 +266 H 0.063 +267 S 0.061 +268 S 0.057 +269 F 0.052 +270 F 0.049 +271 F 0.046 +272 Y 0.047 +273 K 0.056 +274 S 0.074 +275 G 0.092 +276 V 0.101 +277 Y 0.101 +278 D 0.100 +279 D 0.099 +280 P 0.097 +281 S 0.098 +282 C 0.104 +283 T 0.112 +284 G 0.116 +285 N 0.108 +286 V 0.089 +287 N 0.068 +288 H 0.053 +289 G 0.046 +290 V 0.045 +291 L 0.044 +292 V 0.044 +293 V 0.046 +294 G 0.049 +295 Y 0.053 +296 G 0.055 +297 T 0.056 +298 L 0.061 +299 D 0.070 +300 G 0.075 +301 K 0.068 +302 D 0.051 +303 Y 0.035 +304 W 0.028 +305 L 0.029 +306 V 0.032 +307 K 0.037 +308 N 0.043 +309 S 0.050 +310 W 0.058 +311 G 0.068 +312 L 0.079 +313 N 0.088 +314 F 0.090 +315 G 0.090 +316 D 0.090 +317 Q 0.090 +318 G 0.084 +319 Y 0.074 +320 I 0.069 +321 R 0.073 +322 M 0.087 +323 A 0.103 +324 R 0.116 +325 N 0.127 +326 N 0.136 +327 K 0.136 +328 N 0.129 +329 H 0.123 +330 C 0.129 +331 G 0.138 +332 I 0.139 +333 A 0.126 +334 S 0.111 +335 Y 0.097 +336 C 0.086 +337 S 0.076 +338 Y 0.070 +339 P 0.072 +340 E 0.080 +341 I 0.088 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000038642.11_ENSMUST00000015667.9_GN:Ctss_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000038642.11_ENSMUST00000015667.9_GN:Ctss_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..46b1d7e8e3319f61aa6993a70ca5286387296419 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000038642.11_ENSMUST00000015667.9_GN:Ctss_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid @@ -0,0 +1,344 @@ +>ENSMUSG00000038642.11|ENSMUST00000015667.9|GN:Ctss|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:2 +1 M 0.389 +2 T 0.399 +3 M 0.422 +4 R 0.461 +5 A 0.505 +6 P 0.534 +7 G 0.528 +8 H 0.492 +9 A 0.456 +10 A 0.432 +11 I 0.394 +12 R 0.337 +13 R 0.305 +14 W 0.308 +15 L 0.317 +16 F 0.326 +17 W 0.352 +18 M 0.387 +19 P 0.409 +20 L 0.428 +21 V 0.464 +22 C 0.505 +23 S 0.527 +24 V 0.530 +25 A 0.520 +26 M 0.494 +27 E 0.446 +28 Q 0.384 +29 L 0.319 +30 Q 0.257 +31 R 0.202 +32 D 0.151 +33 P 0.104 +34 T 0.068 +35 L 0.044 +36 D 0.032 +37 Y 0.027 +38 H 0.023 +39 W 0.022 +40 D 0.021 +41 L 0.021 +42 W 0.022 +43 K 0.024 +44 K 0.028 +45 T 0.032 +46 H 0.038 +47 E 0.047 +48 K 0.061 +49 E 0.076 +50 Y 0.089 +51 K 0.095 +52 D 0.097 +53 K 0.098 +54 N 0.099 +55 E 0.094 +56 E 0.083 +57 E 0.072 +58 V 0.066 +59 R 0.064 +60 R 0.065 +61 L 0.071 +62 I 0.082 +63 W 0.087 +64 E 0.081 +65 K 0.070 +66 N 0.063 +67 L 0.060 +68 K 0.057 +69 F 0.057 +70 I 0.057 +71 M 0.058 +72 I 0.060 +73 H 0.063 +74 N 0.065 +75 L 0.067 +76 E 0.070 +77 Y 0.077 +78 S 0.086 +79 M 0.095 +80 G 0.103 +81 M 0.106 +82 H 0.100 +83 T 0.091 +84 Y 0.089 +85 Q 0.095 +86 V 0.104 +87 G 0.110 +88 M 0.109 +89 N 0.103 +90 D 0.097 +91 M 0.093 +92 G 0.089 +93 D 0.085 +94 M 0.081 +95 T 0.077 +96 N 0.074 +97 E 0.070 +98 E 0.064 +99 I 0.059 +100 L 0.057 +101 C 0.064 +102 R 0.079 +103 M 0.105 +104 G 0.134 +105 A 0.158 +106 L 0.175 +107 R 0.191 +108 I 0.211 +109 P 0.232 +110 R 0.248 +111 Q 0.259 +112 S 0.263 +113 P 0.251 +114 K 0.229 +115 T 0.208 +116 V 0.191 +117 T 0.179 +118 F 0.169 +119 R 0.162 +120 S 0.157 +121 Y 0.153 +122 S 0.150 +123 N 0.144 +124 R 0.135 +125 T 0.125 +126 L 0.116 +127 P 0.108 +128 D 0.099 +129 T 0.090 +130 V 0.079 +131 D 0.069 +132 W 0.066 +133 R 0.073 +134 E 0.085 +135 K 0.092 +136 G 0.099 +137 C 0.110 +138 V 0.120 +139 T 0.122 +140 E 0.120 +141 V 0.116 +142 K 0.110 +143 Y 0.107 +144 Q 0.110 +145 G 0.116 +146 S 0.121 +147 C 0.119 +148 G 0.113 +149 A 0.111 +150 C 0.120 +151 W 0.132 +152 A 0.138 +153 F 0.137 +154 S 0.135 +155 A 0.130 +156 V 0.120 +157 G 0.107 +158 A 0.094 +159 L 0.081 +160 E 0.071 +161 G 0.064 +162 Q 0.060 +163 L 0.057 +164 K 0.055 +165 L 0.054 +166 K 0.057 +167 T 0.065 +168 G 0.075 +169 K 0.082 +170 L 0.083 +171 I 0.078 +172 S 0.074 +173 L 0.073 +174 S 0.071 +175 A 0.063 +176 Q 0.057 +177 N 0.055 +178 L 0.058 +179 V 0.058 +180 D 0.059 +181 C 0.064 +182 S 0.078 +183 N 0.103 +184 E 0.131 +185 E 0.154 +186 K 0.172 +187 Y 0.189 +188 G 0.203 +189 N 0.204 +190 K 0.192 +191 G 0.178 +192 C 0.172 +193 G 0.169 +194 G 0.162 +195 G 0.148 +196 Y 0.129 +197 M 0.109 +198 T 0.094 +199 E 0.085 +200 A 0.076 +201 F 0.068 +202 Q 0.062 +203 Y 0.060 +204 I 0.061 +205 I 0.067 +206 D 0.084 +207 N 0.111 +208 G 0.138 +209 G 0.150 +210 I 0.144 +211 E 0.125 +212 A 0.102 +213 D 0.082 +214 A 0.070 +215 S 0.063 +216 Y 0.060 +217 P 0.060 +218 Y 0.061 +219 K 0.065 +220 A 0.073 +221 T 0.082 +222 D 0.090 +223 E 0.096 +224 K 0.099 +225 C 0.099 +226 H 0.101 +227 Y 0.103 +228 N 0.104 +229 S 0.104 +230 K 0.106 +231 N 0.109 +232 R 0.110 +233 A 0.106 +234 A 0.099 +235 T 0.089 +236 C 0.077 +237 S 0.065 +238 R 0.057 +239 Y 0.056 +240 I 0.065 +241 Q 0.082 +242 L 0.105 +243 P 0.126 +244 F 0.134 +245 G 0.126 +246 D 0.107 +247 E 0.088 +248 D 0.073 +249 A 0.064 +250 L 0.057 +251 K 0.052 +252 E 0.048 +253 A 0.045 +254 V 0.042 +255 A 0.040 +256 T 0.039 +257 K 0.040 +258 G 0.042 +259 P 0.043 +260 V 0.044 +261 S 0.044 +262 V 0.047 +263 G 0.054 +264 I 0.061 +265 D 0.065 +266 A 0.064 +267 S 0.064 +268 H 0.063 +269 S 0.061 +270 S 0.057 +271 F 0.052 +272 F 0.049 +273 F 0.046 +274 Y 0.047 +275 K 0.056 +276 S 0.074 +277 G 0.092 +278 V 0.101 +279 Y 0.101 +280 D 0.100 +281 D 0.099 +282 P 0.097 +283 S 0.098 +284 C 0.104 +285 T 0.112 +286 G 0.116 +287 N 0.108 +288 V 0.089 +289 N 0.068 +290 H 0.053 +291 G 0.046 +292 V 0.045 +293 L 0.044 +294 V 0.044 +295 V 0.046 +296 G 0.049 +297 Y 0.053 +298 G 0.055 +299 T 0.056 +300 L 0.061 +301 D 0.070 +302 G 0.075 +303 K 0.068 +304 D 0.051 +305 Y 0.035 +306 W 0.028 +307 L 0.029 +308 V 0.032 +309 K 0.037 +310 N 0.043 +311 S 0.050 +312 W 0.058 +313 G 0.068 +314 L 0.079 +315 N 0.088 +316 F 0.090 +317 G 0.090 +318 D 0.091 +319 Q 0.090 +320 G 0.084 +321 Y 0.074 +322 I 0.069 +323 R 0.073 +324 M 0.087 +325 A 0.103 +326 R 0.117 +327 N 0.128 +328 N 0.136 +329 K 0.136 +330 N 0.129 +331 H 0.123 +332 C 0.129 +333 G 0.139 +334 I 0.139 +335 A 0.127 +336 S 0.111 +337 Y 0.098 +338 C 0.086 +339 S 0.076 +340 Y 0.070 +341 P 0.072 +342 E 0.080 +343 I 0.088 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039041.16_ENSMUST00000061437.5_GN:Adrm1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039041.16_ENSMUST00000061437.5_GN:Adrm1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0fd779a076c11009e3e5c1de0b5a806e4c2bfd18 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039041.16_ENSMUST00000061437.5_GN:Adrm1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,408 @@ +>ENSMUSG00000039041.16|ENSMUST00000061437.5|GN:Adrm1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.524 +2 T 0.549 +3 T 0.590 +4 S 0.631 +5 G 0.654 +6 A 0.655 +7 L 0.651 +8 F 0.661 +9 P 0.682 +10 S 0.696 +11 L 0.698 +12 V 0.698 +13 P 0.706 +14 G 0.714 +15 S 0.709 +16 R 0.684 +17 G 0.630 +18 S 0.539 +19 S 0.408 +20 T 0.265 +21 K 0.149 +22 Y 0.079 +23 L 0.048 +24 V 0.035 +25 E 0.031 +26 F 0.032 +27 R 0.036 +28 A 0.043 +29 G 0.051 +30 K 0.062 +31 M 0.075 +32 S 0.090 +33 L 0.102 +34 K 0.113 +35 G 0.119 +36 T 0.123 +37 T 0.127 +38 V 0.135 +39 T 0.146 +40 P 0.153 +41 D 0.148 +42 K 0.131 +43 R 0.109 +44 K 0.084 +45 G 0.060 +46 L 0.040 +47 V 0.028 +48 Y 0.023 +49 I 0.026 +50 Q 0.035 +51 Q 0.049 +52 T 0.065 +53 D 0.078 +54 D 0.084 +55 S 0.081 +56 L 0.069 +57 I 0.051 +58 H 0.034 +59 F 0.025 +60 C 0.023 +61 W 0.027 +62 K 0.033 +63 D 0.040 +64 R 0.047 +65 T 0.055 +66 S 0.065 +67 G 0.076 +68 T 0.082 +69 V 0.083 +70 E 0.080 +71 D 0.076 +72 D 0.070 +73 L 0.062 +74 I 0.052 +75 I 0.046 +76 F 0.047 +77 P 0.051 +78 D 0.048 +79 D 0.037 +80 C 0.025 +81 E 0.019 +82 F 0.020 +83 K 0.027 +84 R 0.035 +85 V 0.043 +86 P 0.052 +87 Q 0.063 +88 C 0.078 +89 P 0.090 +90 S 0.093 +91 G 0.084 +92 R 0.065 +93 V 0.044 +94 Y 0.031 +95 V 0.028 +96 L 0.032 +97 K 0.039 +98 F 0.048 +99 K 0.060 +100 A 0.075 +101 G 0.088 +102 S 0.094 +103 K 0.091 +104 R 0.079 +105 L 0.061 +106 F 0.042 +107 F 0.031 +108 W 0.032 +109 M 0.045 +110 Q 0.068 +111 E 0.093 +112 P 0.109 +113 K 0.113 +114 T 0.105 +115 D 0.092 +116 Q 0.078 +117 D 0.066 +118 E 0.058 +119 E 0.053 +120 H 0.048 +121 C 0.046 +122 R 0.047 +123 K 0.048 +124 V 0.049 +125 N 0.049 +126 E 0.053 +127 C 0.063 +128 L 0.085 +129 N 0.116 +130 N 0.155 +131 P 0.211 +132 P 0.299 +133 M 0.415 +134 P 0.533 +135 G 0.626 +136 S 0.682 +137 L 0.712 +138 G 0.729 +139 A 0.736 +140 S 0.736 +141 G 0.733 +142 S 0.729 +143 S 0.723 +144 G 0.713 +145 H 0.704 +146 E 0.699 +147 L 0.696 +148 S 0.696 +149 A 0.697 +150 L 0.699 +151 G 0.706 +152 G 0.717 +153 E 0.724 +154 G 0.710 +155 G 0.664 +156 L 0.599 +157 Q 0.546 +158 S 0.524 +159 L 0.533 +160 L 0.561 +161 G 0.590 +162 N 0.597 +163 M 0.585 +164 S 0.572 +165 H 0.557 +166 S 0.535 +167 Q 0.520 +168 L 0.516 +169 M 0.515 +170 Q 0.514 +171 L 0.523 +172 I 0.551 +173 G 0.601 +174 P 0.662 +175 A 0.712 +176 G 0.741 +177 L 0.757 +178 G 0.769 +179 G 0.779 +180 L 0.784 +181 G 0.789 +182 G 0.792 +183 L 0.791 +184 G 0.784 +185 A 0.769 +186 L 0.746 +187 T 0.726 +188 G 0.718 +189 P 0.718 +190 G 0.719 +191 L 0.716 +192 A 0.715 +193 S 0.719 +194 L 0.728 +195 L 0.744 +196 G 0.761 +197 S 0.767 +198 S 0.760 +199 G 0.753 +200 P 0.759 +201 P 0.776 +202 A 0.795 +203 S 0.806 +204 S 0.804 +205 S 0.784 +206 S 0.736 +207 S 0.669 +208 S 0.631 +209 S 0.645 +210 R 0.663 +211 S 0.646 +212 Q 0.636 +213 S 0.680 +214 A 0.746 +215 A 0.785 +216 V 0.795 +217 T 0.800 +218 P 0.809 +219 S 0.821 +220 S 0.831 +221 S 0.837 +222 T 0.840 +223 S 0.842 +224 S 0.843 +225 A 0.842 +226 R 0.833 +227 A 0.819 +228 T 0.804 +229 P 0.794 +230 A 0.790 +231 P 0.785 +232 S 0.764 +233 A 0.701 +234 P 0.593 +235 A 0.496 +236 A 0.484 +237 A 0.539 +238 S 0.579 +239 A 0.596 +240 T 0.636 +241 S 0.694 +242 P 0.737 +243 S 0.761 +244 P 0.778 +245 A 0.796 +246 P 0.812 +247 S 0.823 +248 S 0.829 +249 G 0.833 +250 N 0.837 +251 G 0.839 +252 T 0.836 +253 S 0.829 +254 T 0.820 +255 A 0.804 +256 A 0.783 +257 S 0.758 +258 P 0.735 +259 T 0.714 +260 Q 0.693 +261 P 0.656 +262 I 0.586 +263 Q 0.483 +264 L 0.383 +265 S 0.320 +266 D 0.289 +267 L 0.265 +268 Q 0.242 +269 S 0.234 +270 I 0.244 +271 L 0.266 +272 A 0.302 +273 T 0.355 +274 M 0.423 +275 N 0.497 +276 V 0.562 +277 P 0.607 +278 A 0.633 +279 G 0.654 +280 P 0.673 +281 G 0.677 +282 G 0.654 +283 S 0.601 +284 Q 0.526 +285 Q 0.437 +286 V 0.343 +287 D 0.261 +288 L 0.219 +289 A 0.222 +290 S 0.235 +291 V 0.214 +292 L 0.161 +293 T 0.115 +294 P 0.095 +295 E 0.093 +296 I 0.092 +297 M 0.087 +298 A 0.090 +299 P 0.106 +300 I 0.123 +301 L 0.130 +302 A 0.131 +303 N 0.130 +304 A 0.124 +305 D 0.111 +306 V 0.096 +307 Q 0.086 +308 E 0.089 +309 R 0.098 +310 L 0.106 +311 L 0.118 +312 P 0.145 +313 Y 0.183 +314 L 0.225 +315 P 0.266 +316 S 0.302 +317 G 0.321 +318 E 0.314 +319 S 0.291 +320 L 0.263 +321 P 0.230 +322 Q 0.188 +323 T 0.146 +324 A 0.119 +325 D 0.110 +326 E 0.117 +327 I 0.129 +328 Q 0.140 +329 N 0.149 +330 T 0.151 +331 L 0.141 +332 T 0.123 +333 S 0.107 +334 P 0.099 +335 Q 0.097 +336 F 0.099 +337 Q 0.100 +338 Q 0.105 +339 A 0.112 +340 L 0.115 +341 G 0.113 +342 M 0.108 +343 F 0.102 +344 S 0.099 +345 A 0.106 +346 A 0.124 +347 L 0.148 +348 A 0.171 +349 S 0.183 +350 G 0.179 +351 Q 0.163 +352 L 0.143 +353 G 0.132 +354 P 0.130 +355 L 0.127 +356 M 0.117 +357 C 0.109 +358 Q 0.112 +359 F 0.121 +360 G 0.127 +361 L 0.122 +362 P 0.108 +363 A 0.092 +364 E 0.081 +365 A 0.078 +366 V 0.079 +367 E 0.080 +368 A 0.081 +369 A 0.087 +370 N 0.100 +371 K 0.118 +372 G 0.132 +373 D 0.130 +374 V 0.113 +375 E 0.095 +376 A 0.089 +377 F 0.095 +378 A 0.109 +379 K 0.121 +380 A 0.131 +381 M 0.145 +382 Q 0.171 +383 N 0.215 +384 N 0.286 +385 A 0.374 +386 K 0.461 +387 S 0.533 +388 D 0.591 +389 P 0.637 +390 K 0.673 +391 E 0.698 +392 G 0.710 +393 D 0.711 +394 T 0.705 +395 K 0.690 +396 D 0.653 +397 K 0.600 +398 K 0.573 +399 D 0.596 +400 E 0.639 +401 E 0.667 +402 E 0.682 +403 D 0.689 +404 M 0.681 +405 S 0.645 +406 L 0.587 +407 D 0.539 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039041.16_ENSMUST00000061437.5_GN:Adrm1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:63.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039041.16_ENSMUST00000061437.5_GN:Adrm1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:63.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..687f50a665d8847c8a055ee65adeb88e6be011b0 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039041.16_ENSMUST00000061437.5_GN:Adrm1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:63.caid @@ -0,0 +1,471 @@ +>ENSMUSG00000039041.16|ENSMUST00000061437.5|GN:Adrm1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:63 +1 M 0.322 +2 R 0.328 +3 W 0.344 +4 T 0.366 +5 V 0.384 +6 T 0.397 +7 R 0.420 +8 A 0.451 +9 N 0.469 +10 R 0.483 +11 D 0.523 +12 L 0.585 +13 V 0.648 +14 G 0.698 +15 A 0.731 +16 G 0.745 +17 R 0.746 +18 A 0.745 +19 A 0.745 +20 D 0.743 +21 G 0.735 +22 T 0.716 +23 Q 0.693 +24 S 0.666 +25 A 0.624 +26 A 0.557 +27 R 0.492 +28 A 0.479 +29 A 0.530 +30 A 0.599 +31 G 0.644 +32 R 0.660 +33 A 0.665 +34 K 0.671 +35 H 0.680 +36 G 0.688 +37 L 0.692 +38 P 0.698 +39 A 0.704 +40 R 0.701 +41 P 0.675 +42 G 0.632 +43 R 0.610 +44 R 0.642 +45 R 0.706 +46 G 0.760 +47 G 0.784 +48 R 0.782 +49 A 0.766 +50 S 0.758 +51 P 0.762 +52 D 0.768 +53 G 0.762 +54 A 0.745 +55 P 0.732 +56 R 0.733 +57 P 0.747 +58 S 0.765 +59 V 0.780 +60 S 0.794 +61 T 0.807 +62 A 0.817 +63 R 0.821 +64 M 0.822 +65 T 0.823 +66 T 0.822 +67 S 0.815 +68 G 0.799 +69 A 0.778 +70 L 0.763 +71 F 0.763 +72 P 0.773 +73 S 0.779 +74 L 0.775 +75 V 0.771 +76 P 0.772 +77 G 0.774 +78 S 0.764 +79 R 0.737 +80 G 0.681 +81 S 0.582 +82 S 0.437 +83 T 0.277 +84 K 0.149 +85 Y 0.076 +86 L 0.046 +87 V 0.034 +88 E 0.030 +89 F 0.031 +90 R 0.036 +91 A 0.042 +92 G 0.050 +93 K 0.061 +94 M 0.073 +95 S 0.086 +96 L 0.097 +97 K 0.106 +98 G 0.112 +99 T 0.115 +100 T 0.119 +101 V 0.126 +102 T 0.136 +103 P 0.142 +104 D 0.137 +105 K 0.121 +106 R 0.099 +107 K 0.076 +108 G 0.054 +109 L 0.035 +110 V 0.024 +111 Y 0.020 +112 I 0.022 +113 Q 0.029 +114 Q 0.040 +115 T 0.052 +116 D 0.063 +117 D 0.071 +118 S 0.070 +119 L 0.061 +120 I 0.045 +121 H 0.031 +122 F 0.022 +123 C 0.021 +124 W 0.024 +125 K 0.030 +126 D 0.035 +127 R 0.041 +128 T 0.048 +129 S 0.058 +130 G 0.069 +131 T 0.076 +132 V 0.077 +133 E 0.074 +134 D 0.070 +135 D 0.066 +136 L 0.059 +137 I 0.050 +138 I 0.043 +139 F 0.043 +140 P 0.046 +141 D 0.043 +142 D 0.033 +143 C 0.022 +144 E 0.017 +145 F 0.018 +146 K 0.023 +147 R 0.030 +148 V 0.037 +149 P 0.045 +150 Q 0.056 +151 C 0.069 +152 P 0.081 +153 S 0.085 +154 G 0.077 +155 R 0.060 +156 V 0.040 +157 Y 0.027 +158 V 0.025 +159 L 0.029 +160 K 0.035 +161 F 0.044 +162 K 0.057 +163 A 0.072 +164 G 0.085 +165 S 0.091 +166 K 0.088 +167 R 0.076 +168 L 0.058 +169 F 0.041 +170 F 0.030 +171 W 0.031 +172 M 0.045 +173 Q 0.069 +174 E 0.094 +175 P 0.111 +176 K 0.114 +177 T 0.106 +178 D 0.092 +179 Q 0.077 +180 D 0.063 +181 E 0.052 +182 E 0.045 +183 H 0.042 +184 C 0.042 +185 R 0.045 +186 K 0.046 +187 V 0.047 +188 N 0.047 +189 E 0.051 +190 C 0.062 +191 L 0.085 +192 N 0.118 +193 N 0.157 +194 P 0.213 +195 P 0.303 +196 M 0.421 +197 P 0.540 +198 G 0.632 +199 S 0.688 +200 L 0.720 +201 G 0.739 +202 A 0.749 +203 S 0.750 +204 G 0.748 +205 S 0.745 +206 S 0.738 +207 G 0.727 +208 H 0.718 +209 E 0.712 +210 L 0.707 +211 S 0.704 +212 A 0.703 +213 L 0.704 +214 G 0.710 +215 G 0.722 +216 E 0.729 +217 G 0.712 +218 G 0.660 +219 L 0.590 +220 Q 0.534 +221 S 0.514 +222 L 0.527 +223 L 0.561 +224 G 0.594 +225 N 0.600 +226 M 0.586 +227 S 0.569 +228 H 0.549 +229 S 0.527 +230 Q 0.513 +231 L 0.510 +232 M 0.508 +233 Q 0.509 +234 L 0.520 +235 I 0.551 +236 G 0.602 +237 P 0.663 +238 A 0.713 +239 G 0.742 +240 L 0.757 +241 G 0.769 +242 G 0.779 +243 L 0.785 +244 G 0.789 +245 G 0.791 +246 L 0.789 +247 G 0.781 +248 A 0.766 +249 L 0.744 +250 T 0.726 +251 G 0.718 +252 P 0.716 +253 G 0.713 +254 L 0.707 +255 A 0.703 +256 S 0.706 +257 L 0.715 +258 L 0.734 +259 G 0.756 +260 S 0.766 +261 S 0.761 +262 G 0.754 +263 P 0.759 +264 P 0.777 +265 A 0.798 +266 S 0.810 +267 S 0.809 +268 S 0.792 +269 S 0.747 +270 S 0.683 +271 S 0.646 +272 S 0.658 +273 R 0.672 +274 S 0.651 +275 Q 0.640 +276 S 0.684 +277 A 0.750 +278 A 0.789 +279 V 0.799 +280 T 0.803 +281 P 0.813 +282 S 0.826 +283 S 0.837 +284 S 0.843 +285 T 0.846 +286 S 0.848 +287 S 0.849 +288 A 0.847 +289 R 0.838 +290 A 0.824 +291 T 0.810 +292 P 0.799 +293 A 0.795 +294 P 0.790 +295 S 0.769 +296 A 0.706 +297 P 0.596 +298 A 0.499 +299 A 0.487 +300 A 0.542 +301 S 0.582 +302 A 0.599 +303 T 0.638 +304 S 0.695 +305 P 0.737 +306 S 0.759 +307 P 0.775 +308 A 0.793 +309 P 0.810 +310 S 0.822 +311 S 0.830 +312 G 0.835 +313 N 0.840 +314 G 0.842 +315 T 0.839 +316 S 0.833 +317 T 0.822 +318 A 0.806 +319 A 0.784 +320 S 0.760 +321 P 0.738 +322 T 0.720 +323 Q 0.702 +324 P 0.669 +325 I 0.602 +326 Q 0.502 +327 L 0.403 +328 S 0.341 +329 D 0.310 +330 L 0.283 +331 Q 0.259 +332 S 0.250 +333 I 0.261 +334 L 0.284 +335 A 0.321 +336 T 0.377 +337 M 0.449 +338 N 0.525 +339 V 0.588 +340 P 0.628 +341 A 0.651 +342 G 0.669 +343 P 0.685 +344 G 0.689 +345 G 0.666 +346 S 0.613 +347 Q 0.538 +348 Q 0.447 +349 V 0.351 +350 D 0.269 +351 L 0.228 +352 A 0.237 +353 S 0.254 +354 V 0.231 +355 L 0.173 +356 T 0.121 +357 P 0.100 +358 E 0.097 +359 I 0.094 +360 M 0.089 +361 A 0.093 +362 P 0.110 +363 I 0.127 +364 L 0.135 +365 A 0.137 +366 N 0.137 +367 A 0.131 +368 D 0.117 +369 V 0.100 +370 Q 0.091 +371 E 0.094 +372 R 0.103 +373 L 0.109 +374 L 0.120 +375 P 0.145 +376 Y 0.182 +377 L 0.223 +378 P 0.263 +379 S 0.298 +380 G 0.316 +381 E 0.306 +382 S 0.281 +383 L 0.252 +384 P 0.221 +385 Q 0.181 +386 T 0.142 +387 A 0.115 +388 D 0.107 +389 E 0.113 +390 I 0.125 +391 Q 0.136 +392 N 0.147 +393 T 0.151 +394 L 0.143 +395 T 0.127 +396 S 0.111 +397 P 0.102 +398 Q 0.100 +399 F 0.101 +400 Q 0.102 +401 Q 0.107 +402 A 0.114 +403 L 0.117 +404 G 0.114 +405 M 0.109 +406 F 0.103 +407 S 0.101 +408 A 0.109 +409 A 0.128 +410 L 0.151 +411 A 0.173 +412 S 0.184 +413 G 0.178 +414 Q 0.160 +415 L 0.140 +416 G 0.129 +417 P 0.127 +418 L 0.123 +419 M 0.114 +420 C 0.109 +421 Q 0.113 +422 F 0.122 +423 G 0.127 +424 L 0.122 +425 P 0.108 +426 A 0.092 +427 E 0.082 +428 A 0.080 +429 V 0.081 +430 E 0.081 +431 A 0.081 +432 A 0.087 +433 N 0.100 +434 K 0.117 +435 G 0.130 +436 D 0.128 +437 V 0.112 +438 E 0.095 +439 A 0.089 +440 F 0.097 +441 A 0.110 +442 K 0.122 +443 A 0.131 +444 M 0.144 +445 Q 0.170 +446 N 0.215 +447 N 0.286 +448 A 0.377 +449 K 0.467 +450 S 0.540 +451 D 0.598 +452 P 0.644 +453 K 0.680 +454 E 0.706 +455 G 0.719 +456 D 0.721 +457 T 0.720 +458 K 0.718 +459 D 0.715 +460 K 0.710 +461 K 0.709 +462 D 0.712 +463 E 0.716 +464 E 0.720 +465 E 0.724 +466 D 0.725 +467 M 0.710 +468 S 0.671 +469 L 0.615 +470 D 0.568 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039109.18_ENSMUST00000037491.11_GN:F13a1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039109.18_ENSMUST00000037491.11_GN:F13a1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..677c69430d8998f8cde81b1535c983a8814c024d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039109.18_ENSMUST00000037491.11_GN:F13a1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,733 @@ +>ENSMUSG00000039109.18|ENSMUST00000037491.11|GN:F13a1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.334 +2 S 0.327 +3 D 0.332 +4 T 0.346 +5 P 0.345 +6 A 0.334 +7 S 0.348 +8 T 0.396 +9 F 0.445 +10 G 0.480 +11 G 0.491 +12 R 0.465 +13 R 0.410 +14 A 0.365 +15 V 0.361 +16 P 0.389 +17 P 0.428 +18 N 0.470 +19 N 0.504 +20 S 0.519 +21 N 0.509 +22 A 0.480 +23 A 0.446 +24 E 0.416 +25 V 0.384 +26 D 0.345 +27 L 0.305 +28 P 0.271 +29 T 0.242 +30 E 0.218 +31 E 0.201 +32 L 0.194 +33 Q 0.200 +34 G 0.217 +35 L 0.235 +36 V 0.255 +37 P 0.284 +38 R 0.315 +39 G 0.328 +40 V 0.304 +41 N 0.256 +42 L 0.208 +43 K 0.170 +44 D 0.137 +45 Y 0.104 +46 L 0.074 +47 N 0.049 +48 V 0.034 +49 T 0.027 +50 A 0.025 +51 V 0.026 +52 H 0.031 +53 L 0.039 +54 F 0.048 +55 K 0.056 +56 E 0.061 +57 R 0.065 +58 W 0.069 +59 D 0.071 +60 S 0.071 +61 N 0.075 +62 K 0.089 +63 I 0.109 +64 D 0.121 +65 H 0.122 +66 H 0.119 +67 T 0.120 +68 D 0.121 +69 K 0.119 +70 Y 0.116 +71 D 0.116 +72 N 0.115 +73 N 0.108 +74 K 0.095 +75 L 0.076 +76 I 0.056 +77 V 0.040 +78 R 0.030 +79 R 0.026 +80 G 0.027 +81 Q 0.029 +82 T 0.029 +83 F 0.028 +84 Y 0.028 +85 I 0.029 +86 Q 0.028 +87 I 0.026 +88 D 0.026 +89 F 0.030 +90 N 0.037 +91 R 0.045 +92 P 0.049 +93 Y 0.051 +94 D 0.052 +95 P 0.052 +96 R 0.051 +97 K 0.050 +98 D 0.045 +99 L 0.035 +100 F 0.026 +101 R 0.019 +102 V 0.017 +103 E 0.019 +104 Y 0.023 +105 V 0.029 +106 I 0.037 +107 G 0.047 +108 R 0.058 +109 Y 0.067 +110 P 0.072 +111 Q 0.078 +112 E 0.091 +113 N 0.106 +114 K 0.111 +115 G 0.101 +116 T 0.081 +117 Y 0.065 +118 I 0.058 +119 P 0.060 +120 V 0.063 +121 P 0.065 +122 V 0.065 +123 V 0.065 +124 K 0.066 +125 E 0.071 +126 L 0.082 +127 Q 0.092 +128 S 0.092 +129 G 0.079 +130 K 0.061 +131 W 0.046 +132 G 0.038 +133 A 0.035 +134 K 0.035 +135 V 0.036 +136 I 0.037 +137 M 0.040 +138 N 0.044 +139 E 0.045 +140 D 0.040 +141 R 0.030 +142 S 0.022 +143 V 0.018 +144 R 0.017 +145 L 0.020 +146 S 0.027 +147 V 0.039 +148 Q 0.058 +149 S 0.078 +150 S 0.091 +151 P 0.094 +152 E 0.094 +153 C 0.095 +154 I 0.096 +155 V 0.098 +156 G 0.100 +157 K 0.099 +158 F 0.087 +159 R 0.066 +160 M 0.043 +161 Y 0.026 +162 V 0.018 +163 A 0.016 +164 V 0.019 +165 W 0.026 +166 T 0.034 +167 P 0.042 +168 Y 0.047 +169 G 0.049 +170 I 0.046 +171 L 0.043 +172 R 0.044 +173 T 0.052 +174 R 0.068 +175 R 0.090 +176 D 0.106 +177 P 0.107 +178 E 0.092 +179 T 0.070 +180 D 0.049 +181 T 0.036 +182 Y 0.034 +183 I 0.044 +184 L 0.064 +185 F 0.086 +186 N 0.105 +187 P 0.117 +188 W 0.124 +189 C 0.133 +190 E 0.143 +191 E 0.146 +192 D 0.138 +193 A 0.125 +194 V 0.113 +195 Y 0.106 +196 L 0.108 +197 D 0.113 +198 D 0.112 +199 E 0.101 +200 K 0.087 +201 E 0.074 +202 R 0.066 +203 E 0.066 +204 E 0.075 +205 Y 0.089 +206 V 0.102 +207 L 0.111 +208 N 0.115 +209 D 0.117 +210 I 0.119 +211 G 0.121 +212 V 0.120 +213 I 0.116 +214 F 0.114 +215 Y 0.121 +216 G 0.131 +217 D 0.135 +218 F 0.128 +219 K 0.119 +220 D 0.113 +221 I 0.110 +222 K 0.112 +223 S 0.117 +224 R 0.124 +225 S 0.131 +226 W 0.135 +227 S 0.131 +228 Y 0.121 +229 G 0.109 +230 Q 0.101 +231 F 0.102 +232 E 0.108 +233 D 0.114 +234 G 0.115 +235 I 0.113 +236 L 0.109 +237 D 0.101 +238 T 0.086 +239 C 0.070 +240 L 0.061 +241 Y 0.059 +242 V 0.062 +243 M 0.067 +244 D 0.074 +245 K 0.082 +246 A 0.090 +247 E 0.096 +248 M 0.098 +249 D 0.096 +250 L 0.094 +251 S 0.093 +252 G 0.093 +253 R 0.093 +254 G 0.096 +255 N 0.098 +256 P 0.093 +257 I 0.085 +258 K 0.081 +259 V 0.083 +260 S 0.089 +261 R 0.098 +262 V 0.104 +263 G 0.103 +264 S 0.098 +265 A 0.095 +266 M 0.096 +267 V 0.096 +268 N 0.096 +269 A 0.106 +270 K 0.131 +271 D 0.165 +272 D 0.196 +273 E 0.213 +274 G 0.215 +275 V 0.204 +276 L 0.185 +277 V 0.167 +278 G 0.155 +279 S 0.148 +280 W 0.141 +281 D 0.133 +282 N 0.128 +283 V 0.127 +284 Y 0.133 +285 A 0.144 +286 Y 0.157 +287 G 0.165 +288 I 0.166 +289 P 0.163 +290 P 0.158 +291 S 0.153 +292 A 0.148 +293 W 0.139 +294 T 0.125 +295 G 0.113 +296 S 0.109 +297 V 0.107 +298 D 0.104 +299 I 0.095 +300 L 0.083 +301 L 0.072 +302 E 0.066 +303 Y 0.063 +304 R 0.064 +305 S 0.074 +306 S 0.097 +307 E 0.132 +308 T 0.172 +309 P 0.207 +310 V 0.224 +311 R 0.222 +312 Y 0.209 +313 G 0.190 +314 Q 0.168 +315 C 0.154 +316 W 0.162 +317 V 0.184 +318 F 0.199 +319 A 0.197 +320 G 0.185 +321 V 0.171 +322 F 0.155 +323 N 0.140 +324 T 0.131 +325 F 0.125 +326 L 0.115 +327 R 0.107 +328 C 0.112 +329 L 0.129 +330 G 0.149 +331 I 0.158 +332 P 0.151 +333 A 0.134 +334 R 0.121 +335 V 0.115 +336 I 0.110 +337 T 0.100 +338 N 0.087 +339 Y 0.078 +340 F 0.074 +341 S 0.074 +342 A 0.076 +343 H 0.079 +344 D 0.084 +345 N 0.094 +346 D 0.106 +347 A 0.117 +348 N 0.125 +349 L 0.131 +350 Q 0.140 +351 M 0.150 +352 D 0.157 +353 I 0.159 +354 F 0.154 +355 L 0.148 +356 E 0.144 +357 E 0.142 +358 D 0.140 +359 G 0.138 +360 N 0.134 +361 V 0.133 +362 S 0.137 +363 S 0.151 +364 K 0.173 +365 L 0.192 +366 T 0.198 +367 K 0.198 +368 D 0.197 +369 S 0.190 +370 V 0.171 +371 W 0.144 +372 N 0.119 +373 Y 0.106 +374 H 0.101 +375 C 0.099 +376 W 0.097 +377 N 0.098 +378 E 0.097 +379 A 0.092 +380 W 0.090 +381 M 0.097 +382 T 0.112 +383 R 0.129 +384 P 0.143 +385 D 0.150 +386 L 0.156 +387 P 0.165 +388 V 0.177 +389 G 0.184 +390 F 0.179 +391 G 0.162 +392 G 0.139 +393 W 0.117 +394 Q 0.105 +395 A 0.106 +396 V 0.116 +397 D 0.126 +398 S 0.131 +399 T 0.134 +400 P 0.138 +401 Q 0.148 +402 E 0.160 +403 N 0.169 +404 S 0.167 +405 D 0.161 +406 G 0.155 +407 M 0.145 +408 Y 0.130 +409 R 0.112 +410 C 0.095 +411 G 0.082 +412 P 0.077 +413 A 0.076 +414 S 0.073 +415 V 0.068 +416 Q 0.067 +417 A 0.070 +418 V 0.076 +419 K 0.087 +420 H 0.101 +421 G 0.115 +422 H 0.122 +423 V 0.116 +424 C 0.102 +425 F 0.089 +426 Q 0.088 +427 F 0.101 +428 D 0.123 +429 A 0.143 +430 P 0.156 +431 F 0.159 +432 V 0.151 +433 F 0.139 +434 A 0.134 +435 E 0.136 +436 V 0.137 +437 N 0.136 +438 S 0.134 +439 D 0.125 +440 L 0.108 +441 V 0.090 +442 Y 0.080 +443 I 0.079 +444 T 0.083 +445 A 0.091 +446 K 0.102 +447 Q 0.110 +448 D 0.117 +449 G 0.126 +450 T 0.132 +451 H 0.132 +452 V 0.123 +453 V 0.110 +454 E 0.098 +455 A 0.090 +456 V 0.083 +457 D 0.079 +458 A 0.082 +459 T 0.091 +460 H 0.100 +461 I 0.108 +462 G 0.120 +463 K 0.131 +464 L 0.136 +465 I 0.132 +466 V 0.130 +467 T 0.141 +468 K 0.159 +469 Q 0.176 +470 I 0.188 +471 G 0.197 +472 G 0.198 +473 D 0.187 +474 G 0.171 +475 M 0.158 +476 Q 0.152 +477 D 0.148 +478 I 0.140 +479 T 0.131 +480 D 0.122 +481 T 0.110 +482 Y 0.099 +483 K 0.096 +484 F 0.107 +485 Q 0.128 +486 E 0.148 +487 G 0.158 +488 Q 0.156 +489 E 0.143 +490 E 0.126 +491 E 0.111 +492 R 0.104 +493 L 0.101 +494 A 0.100 +495 L 0.103 +496 E 0.107 +497 T 0.111 +498 A 0.116 +499 L 0.126 +500 M 0.140 +501 Y 0.162 +502 G 0.193 +503 A 0.229 +504 K 0.267 +505 K 0.308 +506 T 0.358 +507 L 0.414 +508 N 0.465 +509 T 0.498 +510 E 0.501 +511 G 0.479 +512 V 0.453 +513 V 0.430 +514 K 0.400 +515 S 0.352 +516 R 0.285 +517 S 0.211 +518 D 0.145 +519 V 0.099 +520 T 0.073 +521 M 0.059 +522 N 0.056 +523 F 0.061 +524 D 0.071 +525 V 0.078 +526 E 0.079 +527 N 0.071 +528 A 0.059 +529 V 0.049 +530 L 0.044 +531 G 0.042 +532 K 0.039 +533 D 0.034 +534 F 0.032 +535 K 0.036 +536 V 0.040 +537 T 0.042 +538 I 0.041 +539 T 0.041 +540 F 0.046 +541 Q 0.057 +542 N 0.070 +543 N 0.082 +544 S 0.089 +545 S 0.086 +546 N 0.074 +547 L 0.060 +548 Y 0.048 +549 T 0.038 +550 I 0.031 +551 L 0.025 +552 A 0.023 +553 Y 0.025 +554 L 0.032 +555 S 0.044 +556 G 0.056 +557 N 0.066 +558 I 0.070 +559 T 0.066 +560 F 0.062 +561 Y 0.067 +562 T 0.081 +563 G 0.095 +564 V 0.100 +565 S 0.097 +566 K 0.088 +567 K 0.080 +568 E 0.073 +569 F 0.065 +570 K 0.059 +571 K 0.058 +572 E 0.060 +573 S 0.059 +574 F 0.056 +575 E 0.054 +576 E 0.053 +577 T 0.053 +578 L 0.054 +579 D 0.059 +580 P 0.062 +581 F 0.060 +582 S 0.054 +583 S 0.047 +584 K 0.041 +585 K 0.037 +586 K 0.036 +587 E 0.036 +588 V 0.039 +589 L 0.044 +590 V 0.047 +591 R 0.043 +592 A 0.038 +593 G 0.033 +594 E 0.029 +595 Y 0.027 +596 M 0.029 +597 S 0.037 +598 H 0.048 +599 L 0.057 +600 L 0.066 +601 E 0.075 +602 Q 0.081 +603 G 0.079 +604 F 0.068 +605 L 0.056 +606 H 0.048 +607 F 0.044 +608 F 0.041 +609 V 0.037 +610 T 0.033 +611 A 0.031 +612 R 0.035 +613 I 0.046 +614 N 0.060 +615 E 0.071 +616 S 0.079 +617 R 0.086 +618 D 0.090 +619 V 0.089 +620 L 0.081 +621 A 0.069 +622 K 0.060 +623 Q 0.054 +624 K 0.049 +625 S 0.046 +626 I 0.047 +627 I 0.055 +628 L 0.070 +629 T 0.089 +630 I 0.105 +631 P 0.113 +632 K 0.109 +633 I 0.100 +634 T 0.092 +635 I 0.092 +636 K 0.101 +637 V 0.118 +638 R 0.133 +639 G 0.137 +640 A 0.126 +641 A 0.108 +642 M 0.093 +643 V 0.086 +644 G 0.084 +645 S 0.080 +646 D 0.071 +647 M 0.064 +648 V 0.061 +649 V 0.060 +650 T 0.061 +651 V 0.062 +652 E 0.066 +653 F 0.075 +654 T 0.087 +655 N 0.100 +656 P 0.111 +657 L 0.118 +658 K 0.119 +659 E 0.113 +660 T 0.105 +661 L 0.097 +662 Q 0.090 +663 N 0.081 +664 V 0.069 +665 W 0.060 +666 I 0.059 +667 H 0.067 +668 L 0.081 +669 D 0.098 +670 G 0.116 +671 P 0.126 +672 G 0.119 +673 V 0.101 +674 M 0.089 +675 R 0.088 +676 P 0.090 +677 K 0.087 +678 R 0.080 +679 K 0.072 +680 V 0.067 +681 F 0.067 +682 R 0.069 +683 E 0.076 +684 I 0.088 +685 R 0.102 +686 P 0.104 +687 N 0.093 +688 T 0.075 +689 T 0.061 +690 V 0.051 +691 Q 0.046 +692 W 0.045 +693 E 0.047 +694 E 0.053 +695 V 0.063 +696 C 0.082 +697 R 0.106 +698 P 0.129 +699 W 0.147 +700 V 0.162 +701 S 0.171 +702 G 0.167 +703 H 0.147 +704 R 0.124 +705 K 0.103 +706 L 0.085 +707 I 0.069 +708 A 0.059 +709 S 0.055 +710 M 0.057 +711 T 0.062 +712 S 0.069 +713 D 0.077 +714 S 0.085 +715 L 0.095 +716 R 0.108 +717 H 0.121 +718 V 0.126 +719 Y 0.118 +720 G 0.104 +721 E 0.088 +722 L 0.074 +723 D 0.064 +724 L 0.061 +725 Q 0.065 +726 I 0.075 +727 Q 0.093 +728 R 0.117 +729 R 0.143 +730 P 0.161 +731 T 0.168 +732 M 0.170 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039109.18_ENSMUST00000037491.11_GN:F13a1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:51.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039109.18_ENSMUST00000037491.11_GN:F13a1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:51.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..828ca618d7a3477a9da809d597d177f1bab60c02 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039109.18_ENSMUST00000037491.11_GN:F13a1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:51.caid @@ -0,0 +1,784 @@ +>ENSMUSG00000039109.18|ENSMUST00000037491.11|GN:F13a1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:51 +1 M 0.297 +2 G 0.291 +3 R 0.281 +4 R 0.267 +5 V 0.245 +6 G 0.220 +7 A 0.198 +8 V 0.180 +9 R 0.167 +10 K 0.163 +11 L 0.169 +12 F 0.175 +13 K 0.174 +14 S 0.171 +15 Q 0.179 +16 L 0.203 +17 S 0.227 +18 G 0.230 +19 H 0.213 +20 F 0.189 +21 A 0.172 +22 R 0.165 +23 V 0.167 +24 L 0.175 +25 L 0.188 +26 R 0.209 +27 K 0.241 +28 Y 0.277 +29 P 0.305 +30 E 0.323 +31 A 0.330 +32 H 0.322 +33 R 0.316 +34 E 0.328 +35 T 0.351 +36 T 0.367 +37 R 0.387 +38 A 0.419 +39 P 0.433 +40 S 0.410 +41 Q 0.377 +42 E 0.359 +43 H 0.350 +44 K 0.352 +45 Q 0.385 +46 D 0.435 +47 P 0.465 +48 V 0.471 +49 K 0.475 +50 L 0.488 +51 R 0.502 +52 M 0.513 +53 S 0.527 +54 D 0.544 +55 T 0.564 +56 P 0.579 +57 A 0.592 +58 S 0.606 +59 T 0.619 +60 F 0.631 +61 G 0.645 +62 G 0.649 +63 R 0.626 +64 R 0.578 +65 A 0.526 +66 V 0.498 +67 P 0.504 +68 P 0.537 +69 N 0.585 +70 N 0.625 +71 S 0.643 +72 N 0.635 +73 A 0.604 +74 A 0.562 +75 E 0.515 +76 V 0.455 +77 D 0.380 +78 L 0.311 +79 P 0.262 +80 T 0.234 +81 E 0.214 +82 E 0.201 +83 L 0.198 +84 Q 0.209 +85 G 0.229 +86 L 0.248 +87 V 0.268 +88 P 0.300 +89 R 0.333 +90 G 0.341 +91 V 0.308 +92 N 0.252 +93 L 0.201 +94 K 0.162 +95 D 0.128 +96 Y 0.096 +97 L 0.066 +98 N 0.043 +99 V 0.030 +100 T 0.023 +101 A 0.022 +102 V 0.024 +103 H 0.029 +104 L 0.036 +105 F 0.045 +106 K 0.052 +107 E 0.056 +108 R 0.060 +109 W 0.063 +110 D 0.066 +111 S 0.066 +112 N 0.069 +113 K 0.082 +114 I 0.101 +115 D 0.113 +116 H 0.115 +117 H 0.114 +118 T 0.114 +119 D 0.114 +120 K 0.111 +121 Y 0.109 +122 D 0.109 +123 N 0.109 +124 N 0.103 +125 K 0.091 +126 L 0.073 +127 I 0.054 +128 V 0.038 +129 R 0.029 +130 R 0.025 +131 G 0.026 +132 Q 0.029 +133 T 0.029 +134 F 0.029 +135 Y 0.029 +136 I 0.029 +137 Q 0.028 +138 I 0.026 +139 D 0.025 +140 F 0.029 +141 N 0.036 +142 R 0.044 +143 P 0.049 +144 Y 0.051 +145 D 0.052 +146 P 0.051 +147 R 0.050 +148 K 0.049 +149 D 0.044 +150 L 0.035 +151 F 0.025 +152 R 0.019 +153 V 0.017 +154 E 0.020 +155 Y 0.025 +156 V 0.031 +157 I 0.040 +158 G 0.050 +159 R 0.062 +160 Y 0.071 +161 P 0.076 +162 Q 0.081 +163 E 0.092 +164 N 0.107 +165 K 0.113 +166 G 0.104 +167 T 0.085 +168 Y 0.069 +169 I 0.062 +170 P 0.063 +171 V 0.066 +172 P 0.067 +173 V 0.067 +174 V 0.067 +175 K 0.068 +176 E 0.073 +177 L 0.083 +178 Q 0.091 +179 S 0.089 +180 G 0.076 +181 K 0.058 +182 W 0.044 +183 G 0.036 +184 A 0.033 +185 K 0.032 +186 V 0.033 +187 I 0.033 +188 M 0.037 +189 N 0.041 +190 E 0.042 +191 D 0.038 +192 R 0.029 +193 S 0.021 +194 V 0.017 +195 R 0.017 +196 L 0.019 +197 S 0.026 +198 V 0.038 +199 Q 0.055 +200 S 0.074 +201 S 0.086 +202 P 0.089 +203 E 0.090 +204 C 0.091 +205 I 0.092 +206 V 0.094 +207 G 0.097 +208 K 0.096 +209 F 0.085 +210 R 0.064 +211 M 0.041 +212 Y 0.025 +213 V 0.017 +214 A 0.015 +215 V 0.017 +216 W 0.022 +217 T 0.030 +218 P 0.037 +219 Y 0.042 +220 G 0.044 +221 I 0.041 +222 L 0.038 +223 R 0.038 +224 T 0.046 +225 R 0.061 +226 R 0.082 +227 D 0.097 +228 P 0.098 +229 E 0.084 +230 T 0.063 +231 D 0.044 +232 T 0.032 +233 Y 0.031 +234 I 0.041 +235 L 0.059 +236 F 0.081 +237 N 0.100 +238 P 0.112 +239 W 0.119 +240 C 0.128 +241 E 0.140 +242 E 0.144 +243 D 0.137 +244 A 0.124 +245 V 0.111 +246 Y 0.104 +247 L 0.105 +248 D 0.110 +249 D 0.108 +250 E 0.097 +251 K 0.083 +252 E 0.071 +253 R 0.062 +254 E 0.062 +255 E 0.072 +256 Y 0.085 +257 V 0.098 +258 L 0.106 +259 N 0.110 +260 D 0.114 +261 I 0.118 +262 G 0.121 +263 V 0.121 +264 I 0.116 +265 F 0.114 +266 Y 0.121 +267 G 0.132 +268 D 0.135 +269 F 0.128 +270 K 0.118 +271 D 0.112 +272 I 0.110 +273 K 0.112 +274 S 0.117 +275 R 0.125 +276 S 0.131 +277 W 0.134 +278 S 0.130 +279 Y 0.120 +280 G 0.109 +281 Q 0.101 +282 F 0.102 +283 E 0.108 +284 D 0.114 +285 G 0.114 +286 I 0.105 +287 L 0.090 +288 D 0.077 +289 T 0.066 +290 C 0.058 +291 L 0.055 +292 Y 0.056 +293 V 0.060 +294 M 0.065 +295 D 0.072 +296 K 0.081 +297 A 0.090 +298 E 0.096 +299 M 0.098 +300 D 0.096 +301 L 0.093 +302 S 0.092 +303 G 0.092 +304 R 0.093 +305 G 0.097 +306 N 0.099 +307 P 0.094 +308 I 0.086 +309 K 0.083 +310 V 0.085 +311 S 0.091 +312 R 0.100 +313 V 0.106 +314 G 0.105 +315 S 0.099 +316 A 0.096 +317 M 0.096 +318 V 0.096 +319 N 0.096 +320 A 0.106 +321 K 0.131 +322 D 0.166 +323 D 0.197 +324 E 0.214 +325 G 0.217 +326 V 0.205 +327 L 0.185 +328 V 0.167 +329 G 0.155 +330 S 0.148 +331 W 0.140 +332 D 0.132 +333 N 0.128 +334 V 0.127 +335 Y 0.133 +336 A 0.145 +337 Y 0.158 +338 G 0.165 +339 I 0.165 +340 P 0.162 +341 P 0.157 +342 S 0.152 +343 A 0.148 +344 W 0.139 +345 T 0.125 +346 G 0.113 +347 S 0.108 +348 V 0.106 +349 D 0.102 +350 I 0.093 +351 L 0.081 +352 L 0.071 +353 E 0.065 +354 Y 0.062 +355 R 0.064 +356 S 0.074 +357 S 0.097 +358 E 0.133 +359 T 0.175 +360 P 0.209 +361 V 0.226 +362 R 0.223 +363 Y 0.210 +364 G 0.191 +365 Q 0.168 +366 C 0.155 +367 W 0.164 +368 V 0.186 +369 F 0.201 +370 A 0.198 +371 G 0.185 +372 V 0.171 +373 F 0.155 +374 N 0.140 +375 T 0.131 +376 F 0.125 +377 L 0.116 +378 R 0.108 +379 C 0.112 +380 L 0.129 +381 G 0.149 +382 I 0.159 +383 P 0.153 +384 A 0.137 +385 R 0.124 +386 V 0.118 +387 I 0.113 +388 T 0.103 +389 N 0.090 +390 Y 0.080 +391 F 0.076 +392 S 0.075 +393 A 0.077 +394 H 0.079 +395 D 0.084 +396 N 0.093 +397 D 0.105 +398 A 0.117 +399 N 0.125 +400 L 0.133 +401 Q 0.142 +402 M 0.151 +403 D 0.159 +404 I 0.161 +405 F 0.156 +406 L 0.149 +407 E 0.144 +408 E 0.141 +409 D 0.139 +410 G 0.136 +411 N 0.132 +412 V 0.131 +413 S 0.135 +414 S 0.149 +415 K 0.172 +416 L 0.191 +417 T 0.198 +418 K 0.199 +419 D 0.198 +420 S 0.192 +421 V 0.173 +422 W 0.146 +423 N 0.121 +424 Y 0.108 +425 H 0.105 +426 C 0.103 +427 W 0.103 +428 N 0.104 +429 E 0.103 +430 A 0.097 +431 W 0.093 +432 M 0.099 +433 T 0.113 +434 R 0.130 +435 P 0.143 +436 D 0.151 +437 L 0.156 +438 P 0.165 +439 V 0.178 +440 G 0.185 +441 F 0.180 +442 G 0.164 +443 G 0.141 +444 W 0.119 +445 Q 0.107 +446 A 0.109 +447 V 0.119 +448 D 0.129 +449 S 0.135 +450 T 0.137 +451 P 0.141 +452 Q 0.151 +453 E 0.163 +454 N 0.171 +455 S 0.170 +456 D 0.164 +457 G 0.157 +458 M 0.149 +459 Y 0.134 +460 R 0.115 +461 C 0.097 +462 G 0.085 +463 P 0.079 +464 A 0.077 +465 S 0.073 +466 V 0.068 +467 Q 0.066 +468 A 0.069 +469 V 0.076 +470 K 0.087 +471 H 0.102 +472 G 0.116 +473 H 0.124 +474 V 0.118 +475 C 0.103 +476 F 0.091 +477 Q 0.090 +478 F 0.102 +479 D 0.123 +480 A 0.144 +481 P 0.157 +482 F 0.159 +483 V 0.151 +484 F 0.139 +485 A 0.135 +486 E 0.138 +487 V 0.140 +488 N 0.140 +489 S 0.138 +490 D 0.129 +491 L 0.112 +492 V 0.093 +493 Y 0.082 +494 I 0.081 +495 T 0.085 +496 A 0.093 +497 K 0.103 +498 Q 0.112 +499 D 0.118 +500 G 0.126 +501 T 0.133 +502 H 0.134 +503 V 0.125 +504 V 0.112 +505 E 0.099 +506 A 0.090 +507 V 0.083 +508 D 0.079 +509 A 0.082 +510 T 0.092 +511 H 0.101 +512 I 0.110 +513 G 0.122 +514 K 0.134 +515 L 0.138 +516 I 0.134 +517 V 0.133 +518 T 0.143 +519 K 0.161 +520 Q 0.176 +521 I 0.188 +522 G 0.197 +523 G 0.197 +524 D 0.186 +525 G 0.170 +526 M 0.157 +527 Q 0.150 +528 D 0.145 +529 I 0.138 +530 T 0.129 +531 D 0.121 +532 T 0.110 +533 Y 0.099 +534 K 0.096 +535 F 0.106 +536 Q 0.127 +537 E 0.147 +538 G 0.156 +539 Q 0.153 +540 E 0.140 +541 E 0.122 +542 E 0.108 +543 R 0.100 +544 L 0.097 +545 A 0.097 +546 L 0.101 +547 E 0.105 +548 T 0.109 +549 A 0.114 +550 L 0.123 +551 M 0.136 +552 Y 0.158 +553 G 0.189 +554 A 0.226 +555 K 0.263 +556 K 0.305 +557 T 0.355 +558 L 0.410 +559 N 0.462 +560 T 0.497 +561 E 0.501 +562 G 0.481 +563 V 0.455 +564 V 0.432 +565 K 0.401 +566 S 0.353 +567 R 0.286 +568 S 0.212 +569 D 0.147 +570 V 0.101 +571 T 0.074 +572 M 0.060 +573 N 0.056 +574 F 0.060 +575 D 0.069 +576 V 0.077 +577 E 0.077 +578 N 0.069 +579 A 0.058 +580 V 0.048 +581 L 0.044 +582 G 0.042 +583 K 0.039 +584 D 0.034 +585 F 0.032 +586 K 0.036 +587 V 0.040 +588 T 0.041 +589 I 0.040 +590 T 0.041 +591 F 0.046 +592 Q 0.056 +593 N 0.070 +594 N 0.083 +595 S 0.089 +596 S 0.087 +597 N 0.075 +598 L 0.061 +599 Y 0.048 +600 T 0.038 +601 I 0.031 +602 L 0.025 +603 A 0.023 +604 Y 0.025 +605 L 0.033 +606 S 0.044 +607 G 0.057 +608 N 0.067 +609 I 0.070 +610 T 0.066 +611 F 0.062 +612 Y 0.067 +613 T 0.080 +614 G 0.094 +615 V 0.100 +616 S 0.097 +617 K 0.089 +618 K 0.081 +619 E 0.073 +620 F 0.065 +621 K 0.059 +622 K 0.058 +623 E 0.060 +624 S 0.059 +625 F 0.056 +626 E 0.054 +627 E 0.053 +628 T 0.053 +629 L 0.054 +630 D 0.059 +631 P 0.063 +632 F 0.061 +633 S 0.054 +634 S 0.047 +635 K 0.041 +636 K 0.037 +637 K 0.036 +638 E 0.036 +639 V 0.039 +640 L 0.044 +641 V 0.046 +642 R 0.042 +643 A 0.036 +644 G 0.031 +645 E 0.027 +646 Y 0.026 +647 M 0.029 +648 S 0.037 +649 H 0.048 +650 L 0.057 +651 L 0.067 +652 E 0.076 +653 Q 0.082 +654 G 0.079 +655 F 0.068 +656 L 0.057 +657 H 0.049 +658 F 0.044 +659 F 0.041 +660 V 0.038 +661 T 0.034 +662 A 0.031 +663 R 0.035 +664 I 0.046 +665 N 0.060 +666 E 0.072 +667 S 0.081 +668 R 0.088 +669 D 0.092 +670 V 0.091 +671 L 0.082 +672 A 0.071 +673 K 0.061 +674 Q 0.055 +675 K 0.050 +676 S 0.047 +677 I 0.048 +678 I 0.057 +679 L 0.072 +680 T 0.091 +681 I 0.107 +682 P 0.114 +683 K 0.110 +684 I 0.101 +685 T 0.094 +686 I 0.093 +687 K 0.102 +688 V 0.119 +689 R 0.133 +690 G 0.137 +691 A 0.127 +692 A 0.108 +693 M 0.092 +694 V 0.085 +695 G 0.083 +696 S 0.079 +697 D 0.071 +698 M 0.064 +699 V 0.061 +700 V 0.061 +701 T 0.061 +702 V 0.063 +703 E 0.067 +704 F 0.076 +705 T 0.088 +706 N 0.101 +707 P 0.111 +708 L 0.118 +709 K 0.119 +710 E 0.113 +711 T 0.105 +712 L 0.097 +713 Q 0.090 +714 N 0.081 +715 V 0.069 +716 W 0.060 +717 I 0.058 +718 H 0.067 +719 L 0.081 +720 D 0.099 +721 G 0.117 +722 P 0.126 +723 G 0.119 +724 V 0.100 +725 M 0.088 +726 R 0.087 +727 P 0.090 +728 K 0.087 +729 R 0.080 +730 K 0.072 +731 V 0.068 +732 F 0.067 +733 R 0.070 +734 E 0.076 +735 I 0.089 +736 R 0.103 +737 P 0.106 +738 N 0.094 +739 T 0.076 +740 T 0.061 +741 V 0.051 +742 Q 0.046 +743 W 0.045 +744 E 0.047 +745 E 0.053 +746 V 0.064 +747 C 0.083 +748 R 0.108 +749 P 0.130 +750 W 0.147 +751 V 0.162 +752 S 0.172 +753 G 0.168 +754 H 0.149 +755 R 0.125 +756 K 0.104 +757 L 0.087 +758 I 0.071 +759 A 0.060 +760 S 0.056 +761 M 0.058 +762 T 0.062 +763 S 0.069 +764 D 0.077 +765 S 0.085 +766 L 0.095 +767 R 0.108 +768 H 0.122 +769 V 0.126 +770 Y 0.119 +771 G 0.104 +772 E 0.088 +773 L 0.074 +774 D 0.065 +775 L 0.062 +776 Q 0.065 +777 I 0.076 +778 Q 0.093 +779 R 0.115 +780 R 0.140 +781 P 0.157 +782 T 0.163 +783 M 0.164 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039156.20_ENSMUST00000117661.9_GN:Stim2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039156.20_ENSMUST00000117661.9_GN:Stim2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..bfbb79748d1730431a5dade93d2f677b038dc0dd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039156.20_ENSMUST00000117661.9_GN:Stim2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,747 @@ +>ENSMUSG00000039156.20|ENSMUST00000117661.9|GN:Stim2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.156 +2 L 0.157 +3 L 0.168 +4 F 0.188 +5 G 0.202 +6 L 0.204 +7 L 0.214 +8 V 0.251 +9 A 0.309 +10 G 0.363 +11 V 0.397 +12 A 0.419 +13 D 0.443 +14 G 0.463 +15 C 0.463 +16 D 0.440 +17 L 0.404 +18 V 0.374 +19 P 0.359 +20 R 0.359 +21 H 0.377 +22 L 0.420 +23 R 0.486 +24 G 0.555 +25 R 0.593 +26 R 0.582 +27 A 0.544 +28 S 0.525 +29 G 0.538 +30 S 0.551 +31 A 0.565 +32 G 0.601 +33 A 0.639 +34 A 0.651 +35 A 0.647 +36 S 0.651 +37 P 0.662 +38 S 0.664 +39 A 0.651 +40 A 0.623 +41 A 0.593 +42 A 0.580 +43 G 0.584 +44 E 0.575 +45 R 0.542 +46 Q 0.502 +47 A 0.472 +48 L 0.446 +49 L 0.410 +50 T 0.360 +51 D 0.305 +52 P 0.258 +53 C 0.225 +54 M 0.207 +55 S 0.198 +56 L 0.188 +57 S 0.176 +58 P 0.171 +59 P 0.170 +60 C 0.159 +61 F 0.140 +62 T 0.123 +63 E 0.114 +64 E 0.106 +65 D 0.094 +66 R 0.082 +67 F 0.077 +68 S 0.074 +69 L 0.071 +70 E 0.068 +71 A 0.062 +72 L 0.053 +73 Q 0.046 +74 T 0.043 +75 I 0.044 +76 H 0.048 +77 K 0.056 +78 Q 0.068 +79 M 0.082 +80 D 0.102 +81 D 0.127 +82 D 0.147 +83 K 0.154 +84 D 0.153 +85 G 0.149 +86 G 0.141 +87 I 0.123 +88 E 0.100 +89 V 0.085 +90 D 0.081 +91 E 0.080 +92 S 0.074 +93 D 0.062 +94 E 0.054 +95 F 0.056 +96 I 0.069 +97 R 0.092 +98 E 0.114 +99 D 0.118 +100 M 0.103 +101 K 0.084 +102 Y 0.075 +103 K 0.076 +104 D 0.080 +105 A 0.081 +106 T 0.080 +107 N 0.079 +108 K 0.077 +109 H 0.076 +110 S 0.080 +111 H 0.089 +112 L 0.097 +113 H 0.099 +114 R 0.098 +115 E 0.097 +116 D 0.097 +117 K 0.098 +118 H 0.094 +119 I 0.082 +120 T 0.066 +121 V 0.058 +122 E 0.065 +123 D 0.076 +124 L 0.078 +125 W 0.072 +126 K 0.071 +127 Q 0.075 +128 W 0.077 +129 K 0.078 +130 T 0.078 +131 S 0.074 +132 E 0.068 +133 V 0.062 +134 H 0.059 +135 N 0.058 +136 W 0.056 +137 T 0.053 +138 L 0.047 +139 E 0.041 +140 D 0.036 +141 T 0.033 +142 L 0.032 +143 Q 0.031 +144 W 0.031 +145 L 0.032 +146 I 0.036 +147 E 0.044 +148 F 0.049 +149 V 0.051 +150 E 0.051 +151 L 0.052 +152 P 0.051 +153 Q 0.047 +154 Y 0.042 +155 E 0.040 +156 K 0.041 +157 N 0.045 +158 F 0.051 +159 R 0.055 +160 D 0.059 +161 N 0.065 +162 N 0.068 +163 V 0.064 +164 K 0.058 +165 G 0.055 +166 T 0.056 +167 T 0.058 +168 L 0.060 +169 P 0.063 +170 R 0.068 +171 I 0.076 +172 A 0.089 +173 V 0.101 +174 H 0.109 +175 E 0.109 +176 T 0.100 +177 S 0.080 +178 F 0.059 +179 M 0.047 +180 I 0.047 +181 S 0.053 +182 Q 0.058 +183 L 0.062 +184 K 0.069 +185 I 0.080 +186 S 0.091 +187 D 0.096 +188 R 0.094 +189 S 0.087 +190 H 0.079 +191 R 0.074 +192 Q 0.072 +193 K 0.073 +194 L 0.071 +195 Q 0.067 +196 L 0.063 +197 K 0.060 +198 A 0.057 +199 L 0.054 +200 D 0.055 +201 V 0.061 +202 V 0.072 +203 L 0.084 +204 F 0.103 +205 G 0.135 +206 P 0.184 +207 L 0.247 +208 T 0.319 +209 R 0.389 +210 P 0.432 +211 P 0.428 +212 H 0.384 +213 N 0.323 +214 W 0.272 +215 M 0.252 +216 K 0.263 +217 D 0.291 +218 F 0.322 +219 I 0.356 +220 L 0.396 +221 T 0.430 +222 I 0.448 +223 S 0.458 +224 I 0.461 +225 V 0.445 +226 I 0.409 +227 G 0.366 +228 V 0.328 +229 G 0.292 +230 G 0.255 +231 C 0.216 +232 W 0.188 +233 F 0.179 +234 A 0.183 +235 Y 0.197 +236 T 0.223 +237 Q 0.257 +238 N 0.285 +239 K 0.302 +240 T 0.312 +241 S 0.319 +242 K 0.322 +243 E 0.315 +244 H 0.303 +245 V 0.295 +246 A 0.288 +247 K 0.270 +248 M 0.242 +249 M 0.223 +250 K 0.225 +251 D 0.246 +252 L 0.277 +253 E 0.306 +254 S 0.321 +255 L 0.319 +256 Q 0.315 +257 T 0.320 +258 A 0.332 +259 E 0.343 +260 Q 0.351 +261 S 0.354 +262 L 0.352 +263 M 0.349 +264 D 0.341 +265 L 0.320 +266 Q 0.286 +267 E 0.253 +268 R 0.231 +269 L 0.222 +270 E 0.218 +271 K 0.217 +272 A 0.221 +273 Q 0.232 +274 E 0.244 +275 E 0.245 +276 N 0.235 +277 R 0.228 +278 T 0.229 +279 V 0.240 +280 A 0.255 +281 V 0.268 +282 E 0.267 +283 K 0.258 +284 Q 0.251 +285 N 0.244 +286 L 0.234 +287 E 0.222 +288 R 0.214 +289 K 0.209 +290 M 0.212 +291 M 0.227 +292 D 0.249 +293 E 0.261 +294 I 0.258 +295 N 0.252 +296 Y 0.255 +297 A 0.267 +298 K 0.283 +299 E 0.294 +300 E 0.292 +301 A 0.284 +302 C 0.278 +303 R 0.273 +304 L 0.259 +305 R 0.242 +306 E 0.233 +307 L 0.238 +308 R 0.255 +309 E 0.276 +310 G 0.288 +311 A 0.287 +312 E 0.280 +313 C 0.274 +314 E 0.275 +315 L 0.287 +316 S 0.305 +317 R 0.310 +318 R 0.299 +319 Q 0.287 +320 Y 0.283 +321 A 0.282 +322 E 0.285 +323 Q 0.298 +324 E 0.309 +325 L 0.308 +326 E 0.299 +327 Q 0.294 +328 V 0.289 +329 R 0.284 +330 M 0.284 +331 A 0.283 +332 L 0.278 +333 K 0.278 +334 K 0.287 +335 A 0.301 +336 E 0.310 +337 K 0.308 +338 E 0.295 +339 F 0.284 +340 E 0.287 +341 L 0.295 +342 R 0.296 +343 S 0.284 +344 S 0.260 +345 W 0.229 +346 S 0.195 +347 V 0.163 +348 P 0.138 +349 D 0.126 +350 A 0.124 +351 L 0.120 +352 Q 0.115 +353 K 0.111 +354 W 0.108 +355 L 0.106 +356 Q 0.103 +357 L 0.096 +358 T 0.084 +359 H 0.072 +360 E 0.064 +361 V 0.058 +362 E 0.050 +363 V 0.043 +364 Q 0.037 +365 Y 0.035 +366 Y 0.039 +367 N 0.047 +368 I 0.055 +369 K 0.065 +370 R 0.080 +371 Q 0.098 +372 N 0.111 +373 A 0.122 +374 E 0.133 +375 M 0.138 +376 Q 0.136 +377 L 0.139 +378 A 0.144 +379 I 0.140 +380 A 0.132 +381 K 0.131 +382 D 0.131 +383 E 0.127 +384 A 0.125 +385 E 0.128 +386 K 0.133 +387 I 0.143 +388 K 0.159 +389 K 0.180 +390 K 0.207 +391 R 0.246 +392 S 0.290 +393 T 0.319 +394 V 0.325 +395 F 0.319 +396 G 0.311 +397 T 0.307 +398 L 0.316 +399 H 0.343 +400 V 0.371 +401 A 0.381 +402 H 0.374 +403 S 0.361 +404 S 0.345 +405 S 0.335 +406 L 0.341 +407 D 0.353 +408 E 0.342 +409 V 0.300 +410 D 0.241 +411 H 0.184 +412 K 0.144 +413 I 0.129 +414 L 0.133 +415 E 0.134 +416 A 0.125 +417 K 0.114 +418 K 0.108 +419 A 0.103 +420 L 0.098 +421 S 0.094 +422 E 0.093 +423 L 0.094 +424 T 0.097 +425 T 0.098 +426 C 0.095 +427 L 0.089 +428 R 0.081 +429 E 0.070 +430 R 0.066 +431 L 0.071 +432 F 0.076 +433 R 0.072 +434 W 0.064 +435 Q 0.060 +436 Q 0.058 +437 I 0.056 +438 E 0.057 +439 K 0.063 +440 I 0.070 +441 C 0.077 +442 G 0.081 +443 F 0.084 +444 Q 0.085 +445 I 0.087 +446 A 0.094 +447 H 0.107 +448 N 0.125 +449 S 0.150 +450 G 0.184 +451 L 0.222 +452 P 0.245 +453 S 0.248 +454 L 0.248 +455 T 0.267 +456 S 0.301 +457 S 0.330 +458 L 0.357 +459 Y 0.394 +460 S 0.430 +461 D 0.443 +462 H 0.435 +463 S 0.435 +464 W 0.463 +465 V 0.511 +466 V 0.561 +467 M 0.606 +468 P 0.650 +469 R 0.684 +470 V 0.692 +471 S 0.672 +472 I 0.647 +473 P 0.647 +474 P 0.676 +475 Y 0.719 +476 P 0.763 +477 I 0.798 +478 A 0.821 +479 G 0.834 +480 G 0.842 +481 V 0.846 +482 D 0.844 +483 D 0.837 +484 L 0.826 +485 D 0.811 +486 E 0.788 +487 D 0.762 +488 T 0.747 +489 P 0.756 +490 P 0.780 +491 I 0.802 +492 V 0.811 +493 P 0.811 +494 Q 0.813 +495 F 0.824 +496 P 0.844 +497 G 0.859 +498 T 0.860 +499 V 0.849 +500 A 0.834 +501 K 0.827 +502 P 0.832 +503 A 0.845 +504 G 0.854 +505 S 0.856 +506 L 0.853 +507 A 0.848 +508 R 0.845 +509 S 0.842 +510 S 0.837 +511 S 0.832 +512 L 0.827 +513 C 0.827 +514 R 0.832 +515 S 0.839 +516 R 0.844 +517 R 0.846 +518 S 0.842 +519 I 0.833 +520 V 0.823 +521 P 0.816 +522 S 0.814 +523 S 0.816 +524 P 0.823 +525 Q 0.835 +526 S 0.845 +527 Q 0.848 +528 R 0.841 +529 A 0.826 +530 Q 0.807 +531 L 0.793 +532 P 0.790 +533 A 0.793 +534 H 0.797 +535 A 0.803 +536 P 0.812 +537 L 0.820 +538 A 0.821 +539 A 0.814 +540 H 0.807 +541 P 0.806 +542 R 0.811 +543 H 0.817 +544 P 0.820 +545 H 0.820 +546 H 0.820 +547 P 0.821 +548 Q 0.822 +549 H 0.828 +550 P 0.837 +551 Q 0.843 +552 H 0.841 +553 S 0.831 +554 L 0.817 +555 P 0.805 +556 S 0.804 +557 P 0.814 +558 D 0.829 +559 P 0.844 +560 D 0.855 +561 I 0.860 +562 L 0.860 +563 S 0.855 +564 V 0.847 +565 S 0.836 +566 S 0.829 +567 C 0.830 +568 P 0.839 +569 A 0.850 +570 L 0.853 +571 Y 0.850 +572 R 0.846 +573 N 0.842 +574 E 0.837 +575 E 0.833 +576 E 0.831 +577 E 0.830 +578 E 0.829 +579 A 0.826 +580 I 0.820 +581 Y 0.814 +582 F 0.807 +583 T 0.801 +584 A 0.799 +585 E 0.798 +586 K 0.796 +587 Q 0.791 +588 W 0.789 +589 E 0.791 +590 V 0.800 +591 P 0.815 +592 D 0.833 +593 T 0.846 +594 A 0.851 +595 S 0.851 +596 E 0.851 +597 C 0.852 +598 D 0.849 +599 S 0.843 +600 L 0.834 +601 N 0.826 +602 S 0.821 +603 S 0.818 +604 S 0.815 +605 G 0.810 +606 R 0.802 +607 K 0.793 +608 P 0.785 +609 S 0.781 +610 P 0.786 +611 P 0.796 +612 S 0.803 +613 S 0.802 +614 L 0.796 +615 E 0.787 +616 M 0.774 +617 Y 0.762 +618 Q 0.756 +619 T 0.757 +620 L 0.759 +621 S 0.761 +622 S 0.765 +623 R 0.772 +624 K 0.781 +625 I 0.791 +626 S 0.798 +627 R 0.802 +628 D 0.804 +629 E 0.803 +630 L 0.801 +631 S 0.803 +632 L 0.808 +633 E 0.814 +634 D 0.819 +635 S 0.821 +636 S 0.820 +637 R 0.813 +638 G 0.806 +639 E 0.800 +640 S 0.797 +641 P 0.789 +642 V 0.756 +643 T 0.700 +644 A 0.671 +645 D 0.705 +646 V 0.769 +647 S 0.812 +648 R 0.824 +649 G 0.823 +650 S 0.823 +651 P 0.829 +652 E 0.842 +653 C 0.856 +654 V 0.864 +655 G 0.866 +656 L 0.864 +657 T 0.863 +658 E 0.862 +659 T 0.860 +660 K 0.856 +661 S 0.850 +662 M 0.842 +663 I 0.833 +664 F 0.825 +665 S 0.824 +666 P 0.830 +667 A 0.843 +668 S 0.855 +669 R 0.862 +670 V 0.864 +671 Y 0.864 +672 N 0.863 +673 G 0.857 +674 I 0.847 +675 L 0.837 +676 E 0.830 +677 K 0.825 +678 S 0.817 +679 C 0.809 +680 S 0.806 +681 M 0.810 +682 H 0.817 +683 Q 0.819 +684 L 0.817 +685 S 0.812 +686 S 0.805 +687 G 0.793 +688 I 0.781 +689 P 0.773 +690 V 0.771 +691 P 0.776 +692 H 0.789 +693 P 0.807 +694 R 0.823 +695 H 0.834 +696 T 0.840 +697 S 0.842 +698 C 0.842 +699 S 0.843 +700 S 0.844 +701 A 0.842 +702 G 0.837 +703 N 0.829 +704 D 0.820 +705 S 0.813 +706 K 0.813 +707 P 0.823 +708 V 0.837 +709 Q 0.845 +710 E 0.845 +711 A 0.842 +712 S 0.839 +713 N 0.840 +714 V 0.842 +715 S 0.845 +716 R 0.845 +717 V 0.839 +718 S 0.827 +719 S 0.814 +720 I 0.809 +721 P 0.815 +722 H 0.827 +723 D 0.834 +724 L 0.835 +725 C 0.833 +726 H 0.832 +727 N 0.831 +728 G 0.827 +729 E 0.820 +730 K 0.807 +731 S 0.791 +732 K 0.777 +733 K 0.769 +734 P 0.770 +735 S 0.775 +736 K 0.774 +737 I 0.759 +738 K 0.736 +739 S 0.713 +740 L 0.696 +741 F 0.686 +742 K 0.683 +743 K 0.688 +744 K 0.696 +745 S 0.702 +746 K 0.704 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039156.20_ENSMUST00000117661.9_GN:Stim2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:66.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039156.20_ENSMUST00000117661.9_GN:Stim2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:66.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..bfacab292b09a3fbc422a1d028cf60c2f55291cd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039156.20_ENSMUST00000117661.9_GN:Stim2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:66.caid @@ -0,0 +1,813 @@ +>ENSMUSG00000039156.20|ENSMUST00000117661.9|GN:Stim2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:66 +1 M 0.308 +2 N 0.328 +3 A 0.352 +4 A 0.360 +5 A 0.340 +6 S 0.316 +7 R 0.328 +8 A 0.369 +9 S 0.404 +10 R 0.430 +11 A 0.466 +12 A 0.494 +13 G 0.496 +14 E 0.496 +15 G 0.508 +16 S 0.512 +17 G 0.512 +18 S 0.545 +19 A 0.605 +20 P 0.656 +21 G 0.682 +22 G 0.687 +23 S 0.680 +24 P 0.671 +25 L 0.672 +26 P 0.681 +27 R 0.686 +28 R 0.684 +29 P 0.690 +30 G 0.709 +31 P 0.733 +32 G 0.750 +33 Q 0.755 +34 L 0.752 +35 A 0.740 +36 V 0.718 +37 S 0.691 +38 E 0.659 +39 W 0.617 +40 P 0.572 +41 A 0.557 +42 A 0.587 +43 P 0.612 +44 V 0.594 +45 S 0.572 +46 A 0.601 +47 P 0.666 +48 P 0.722 +49 A 0.752 +50 V 0.763 +51 A 0.766 +52 P 0.770 +53 G 0.774 +54 R 0.770 +55 A 0.754 +56 S 0.733 +57 G 0.715 +58 R 0.702 +59 P 0.695 +60 L 0.686 +61 R 0.669 +62 R 0.636 +63 R 0.588 +64 W 0.540 +65 A 0.506 +66 A 0.482 +67 M 0.463 +68 L 0.457 +69 L 0.465 +70 F 0.463 +71 G 0.436 +72 L 0.402 +73 L 0.393 +74 V 0.428 +75 A 0.497 +76 G 0.569 +77 V 0.615 +78 A 0.635 +79 D 0.647 +80 G 0.652 +81 C 0.646 +82 D 0.626 +83 L 0.592 +84 V 0.553 +85 P 0.530 +86 R 0.534 +87 H 0.558 +88 L 0.589 +89 R 0.626 +90 G 0.665 +91 R 0.689 +92 R 0.684 +93 A 0.665 +94 S 0.664 +95 G 0.695 +96 S 0.736 +97 A 0.759 +98 G 0.760 +99 A 0.740 +100 A 0.710 +101 A 0.688 +102 S 0.686 +103 P 0.694 +104 S 0.697 +105 A 0.687 +106 A 0.664 +107 A 0.639 +108 A 0.626 +109 G 0.620 +110 E 0.599 +111 R 0.552 +112 Q 0.500 +113 A 0.460 +114 L 0.430 +115 L 0.398 +116 T 0.355 +117 D 0.306 +118 P 0.258 +119 C 0.218 +120 M 0.193 +121 S 0.182 +122 L 0.176 +123 S 0.174 +124 P 0.179 +125 P 0.184 +126 C 0.174 +127 F 0.150 +128 T 0.126 +129 E 0.111 +130 E 0.100 +131 D 0.089 +132 R 0.080 +133 F 0.076 +134 S 0.074 +135 L 0.070 +136 E 0.065 +137 A 0.059 +138 L 0.051 +139 Q 0.044 +140 T 0.042 +141 I 0.043 +142 H 0.048 +143 K 0.058 +144 Q 0.072 +145 M 0.089 +146 D 0.111 +147 D 0.137 +148 D 0.157 +149 K 0.164 +150 D 0.162 +151 G 0.160 +152 G 0.153 +153 I 0.135 +154 E 0.110 +155 V 0.094 +156 D 0.089 +157 E 0.089 +158 S 0.082 +159 D 0.070 +160 E 0.062 +161 F 0.064 +162 I 0.078 +163 R 0.101 +164 E 0.122 +165 D 0.127 +166 M 0.112 +167 K 0.095 +168 Y 0.089 +169 K 0.093 +170 D 0.097 +171 A 0.095 +172 T 0.091 +173 N 0.088 +174 K 0.085 +175 H 0.084 +176 S 0.087 +177 H 0.098 +178 L 0.109 +179 H 0.112 +180 R 0.109 +181 E 0.105 +182 D 0.104 +183 K 0.104 +184 H 0.101 +185 I 0.089 +186 T 0.072 +187 V 0.064 +188 E 0.071 +189 D 0.083 +190 L 0.083 +191 W 0.076 +192 K 0.074 +193 Q 0.077 +194 W 0.079 +195 K 0.079 +196 T 0.077 +197 S 0.073 +198 E 0.065 +199 V 0.058 +200 H 0.055 +201 N 0.054 +202 W 0.052 +203 T 0.048 +204 L 0.043 +205 E 0.038 +206 D 0.033 +207 T 0.030 +208 L 0.029 +209 Q 0.029 +210 W 0.029 +211 L 0.030 +212 I 0.034 +213 E 0.041 +214 F 0.047 +215 V 0.049 +216 E 0.048 +217 L 0.049 +218 P 0.048 +219 Q 0.044 +220 Y 0.040 +221 E 0.038 +222 K 0.039 +223 N 0.044 +224 F 0.049 +225 R 0.052 +226 D 0.055 +227 N 0.060 +228 N 0.062 +229 V 0.059 +230 K 0.054 +231 G 0.052 +232 T 0.053 +233 T 0.055 +234 L 0.057 +235 P 0.059 +236 R 0.062 +237 I 0.069 +238 A 0.078 +239 V 0.086 +240 H 0.090 +241 E 0.089 +242 T 0.081 +243 S 0.066 +244 F 0.049 +245 M 0.041 +246 I 0.042 +247 S 0.047 +248 Q 0.052 +249 L 0.056 +250 K 0.062 +251 I 0.072 +252 S 0.082 +253 D 0.086 +254 R 0.085 +255 S 0.079 +256 H 0.073 +257 R 0.069 +258 Q 0.068 +259 K 0.068 +260 L 0.066 +261 Q 0.062 +262 L 0.058 +263 K 0.056 +264 A 0.052 +265 L 0.049 +266 D 0.049 +267 V 0.054 +268 V 0.063 +269 L 0.075 +270 F 0.094 +271 G 0.125 +272 P 0.172 +273 L 0.233 +274 T 0.304 +275 R 0.373 +276 P 0.416 +277 P 0.415 +278 H 0.375 +279 N 0.318 +280 W 0.271 +281 M 0.253 +282 K 0.265 +283 D 0.292 +284 F 0.319 +285 I 0.350 +286 L 0.389 +287 T 0.422 +288 I 0.437 +289 S 0.443 +290 I 0.448 +291 V 0.437 +292 I 0.401 +293 G 0.356 +294 V 0.316 +295 G 0.282 +296 G 0.246 +297 C 0.211 +298 W 0.188 +299 F 0.184 +300 A 0.191 +301 Y 0.205 +302 T 0.232 +303 Q 0.265 +304 N 0.293 +305 K 0.312 +306 T 0.325 +307 S 0.333 +308 K 0.336 +309 E 0.329 +310 H 0.315 +311 V 0.304 +312 A 0.295 +313 K 0.276 +314 M 0.245 +315 M 0.223 +316 K 0.224 +317 D 0.245 +318 L 0.278 +319 E 0.312 +320 S 0.330 +321 L 0.330 +322 Q 0.328 +323 T 0.335 +324 A 0.348 +325 E 0.361 +326 Q 0.374 +327 S 0.379 +328 L 0.376 +329 M 0.370 +330 D 0.361 +331 L 0.338 +332 Q 0.303 +333 E 0.269 +334 R 0.250 +335 L 0.248 +336 E 0.257 +337 K 0.263 +338 A 0.264 +339 Q 0.270 +340 E 0.282 +341 E 0.284 +342 N 0.274 +343 R 0.265 +344 T 0.266 +345 V 0.277 +346 A 0.294 +347 V 0.308 +348 E 0.306 +349 K 0.291 +350 Q 0.278 +351 N 0.269 +352 L 0.257 +353 E 0.244 +354 R 0.235 +355 K 0.231 +356 M 0.235 +357 M 0.252 +358 D 0.276 +359 E 0.289 +360 I 0.286 +361 N 0.281 +362 Y 0.286 +363 A 0.302 +364 K 0.321 +365 E 0.333 +366 E 0.330 +367 A 0.321 +368 C 0.316 +369 R 0.312 +370 L 0.302 +371 R 0.290 +372 E 0.281 +373 L 0.277 +374 R 0.282 +375 E 0.296 +376 G 0.305 +377 A 0.304 +378 E 0.297 +379 C 0.291 +380 E 0.292 +381 L 0.305 +382 S 0.324 +383 R 0.328 +384 R 0.313 +385 Q 0.297 +386 Y 0.290 +387 A 0.286 +388 E 0.290 +389 Q 0.307 +390 E 0.324 +391 L 0.324 +392 E 0.315 +393 Q 0.307 +394 V 0.298 +395 R 0.288 +396 M 0.285 +397 A 0.282 +398 L 0.276 +399 K 0.273 +400 K 0.281 +401 A 0.295 +402 E 0.304 +403 K 0.300 +404 E 0.285 +405 F 0.273 +406 E 0.275 +407 L 0.282 +408 R 0.284 +409 S 0.276 +410 S 0.256 +411 W 0.226 +412 S 0.192 +413 V 0.157 +414 P 0.132 +415 D 0.121 +416 A 0.120 +417 L 0.117 +418 Q 0.110 +419 K 0.105 +420 W 0.103 +421 L 0.101 +422 Q 0.099 +423 L 0.091 +424 T 0.078 +425 H 0.067 +426 E 0.061 +427 V 0.056 +428 E 0.050 +429 V 0.044 +430 Q 0.038 +431 Y 0.036 +432 Y 0.041 +433 N 0.050 +434 I 0.060 +435 K 0.071 +436 R 0.089 +437 Q 0.107 +438 N 0.119 +439 A 0.129 +440 E 0.140 +441 M 0.145 +442 Q 0.143 +443 L 0.146 +444 A 0.151 +445 I 0.144 +446 A 0.133 +447 K 0.129 +448 D 0.129 +449 E 0.126 +450 A 0.125 +451 E 0.128 +452 K 0.133 +453 I 0.144 +454 K 0.163 +455 K 0.186 +456 K 0.214 +457 R 0.252 +458 S 0.294 +459 T 0.323 +460 V 0.330 +461 F 0.325 +462 G 0.317 +463 T 0.313 +464 L 0.324 +465 H 0.352 +466 V 0.382 +467 A 0.394 +468 H 0.389 +469 S 0.380 +470 S 0.368 +471 S 0.359 +472 L 0.366 +473 D 0.380 +474 E 0.368 +475 V 0.322 +476 D 0.257 +477 H 0.195 +478 K 0.153 +479 I 0.141 +480 L 0.149 +481 E 0.152 +482 A 0.143 +483 K 0.130 +484 K 0.121 +485 A 0.113 +486 L 0.106 +487 S 0.102 +488 E 0.100 +489 L 0.100 +490 T 0.102 +491 T 0.103 +492 C 0.103 +493 L 0.100 +494 R 0.093 +495 E 0.081 +496 R 0.072 +497 L 0.072 +498 F 0.074 +499 R 0.071 +500 W 0.068 +501 Q 0.068 +502 Q 0.067 +503 I 0.064 +504 E 0.064 +505 K 0.069 +506 I 0.077 +507 C 0.084 +508 G 0.089 +509 F 0.091 +510 Q 0.091 +511 I 0.092 +512 A 0.098 +513 H 0.112 +514 N 0.133 +515 S 0.160 +516 G 0.194 +517 L 0.230 +518 P 0.249 +519 S 0.245 +520 L 0.239 +521 T 0.253 +522 S 0.283 +523 S 0.310 +524 L 0.339 +525 Y 0.380 +526 S 0.419 +527 D 0.430 +528 H 0.416 +529 S 0.409 +530 W 0.434 +531 V 0.487 +532 V 0.546 +533 M 0.597 +534 P 0.642 +535 R 0.676 +536 V 0.684 +537 S 0.666 +538 I 0.643 +539 P 0.646 +540 P 0.677 +541 Y 0.720 +542 P 0.763 +543 I 0.797 +544 A 0.819 +545 G 0.832 +546 G 0.841 +547 V 0.845 +548 D 0.844 +549 D 0.837 +550 L 0.826 +551 D 0.810 +552 E 0.786 +553 D 0.759 +554 T 0.745 +555 P 0.755 +556 P 0.780 +557 I 0.802 +558 V 0.811 +559 P 0.810 +560 Q 0.810 +561 F 0.821 +562 P 0.841 +563 G 0.856 +564 T 0.858 +565 V 0.848 +566 A 0.834 +567 K 0.827 +568 P 0.832 +569 A 0.843 +570 G 0.851 +571 S 0.851 +572 L 0.847 +573 A 0.843 +574 R 0.839 +575 S 0.835 +576 S 0.829 +577 S 0.823 +578 L 0.819 +579 C 0.819 +580 R 0.824 +581 S 0.831 +582 R 0.836 +583 R 0.837 +584 S 0.833 +585 I 0.825 +586 V 0.816 +587 P 0.811 +588 S 0.809 +589 S 0.811 +590 P 0.817 +591 Q 0.828 +592 S 0.837 +593 Q 0.839 +594 R 0.833 +595 A 0.817 +596 Q 0.798 +597 L 0.785 +598 P 0.782 +599 A 0.786 +600 H 0.789 +601 A 0.794 +602 P 0.803 +603 L 0.810 +604 A 0.811 +605 A 0.804 +606 H 0.798 +607 P 0.797 +608 R 0.803 +609 H 0.809 +610 P 0.813 +611 H 0.815 +612 H 0.815 +613 P 0.815 +614 Q 0.816 +615 H 0.821 +616 P 0.830 +617 Q 0.836 +618 H 0.835 +619 S 0.825 +620 L 0.811 +621 P 0.801 +622 S 0.801 +623 P 0.810 +624 D 0.825 +625 P 0.840 +626 D 0.851 +627 I 0.855 +628 L 0.854 +629 S 0.850 +630 V 0.842 +631 S 0.831 +632 S 0.823 +633 C 0.825 +634 P 0.835 +635 A 0.846 +636 L 0.850 +637 Y 0.847 +638 R 0.843 +639 N 0.840 +640 E 0.836 +641 E 0.832 +642 E 0.830 +643 E 0.829 +644 E 0.828 +645 A 0.824 +646 I 0.819 +647 Y 0.812 +648 F 0.806 +649 T 0.800 +650 A 0.798 +651 E 0.798 +652 K 0.796 +653 Q 0.793 +654 W 0.790 +655 E 0.793 +656 V 0.801 +657 P 0.816 +658 D 0.834 +659 T 0.847 +660 A 0.851 +661 S 0.851 +662 E 0.851 +663 C 0.851 +664 D 0.848 +665 S 0.842 +666 L 0.834 +667 N 0.826 +668 S 0.820 +669 S 0.817 +670 S 0.815 +671 G 0.810 +672 R 0.804 +673 K 0.796 +674 P 0.789 +675 S 0.786 +676 P 0.791 +677 P 0.801 +678 S 0.808 +679 S 0.807 +680 L 0.801 +681 E 0.791 +682 M 0.778 +683 Y 0.765 +684 Q 0.758 +685 T 0.757 +686 L 0.758 +687 S 0.760 +688 S 0.764 +689 R 0.771 +690 K 0.782 +691 I 0.793 +692 S 0.800 +693 R 0.804 +694 D 0.805 +695 E 0.804 +696 L 0.802 +697 S 0.803 +698 L 0.808 +699 E 0.814 +700 D 0.820 +701 S 0.822 +702 S 0.821 +703 R 0.815 +704 G 0.808 +705 E 0.802 +706 S 0.799 +707 P 0.791 +708 V 0.759 +709 T 0.704 +710 A 0.676 +711 D 0.710 +712 V 0.773 +713 S 0.814 +714 R 0.826 +715 G 0.825 +716 S 0.825 +717 P 0.831 +718 E 0.844 +719 C 0.857 +720 V 0.865 +721 G 0.866 +722 L 0.865 +723 T 0.864 +724 E 0.864 +725 T 0.862 +726 K 0.859 +727 S 0.853 +728 M 0.844 +729 I 0.834 +730 F 0.826 +731 S 0.825 +732 P 0.831 +733 A 0.844 +734 S 0.856 +735 R 0.862 +736 V 0.863 +737 Y 0.863 +738 N 0.862 +739 G 0.856 +740 I 0.846 +741 L 0.835 +742 E 0.828 +743 K 0.822 +744 S 0.815 +745 C 0.805 +746 S 0.801 +747 M 0.804 +748 H 0.812 +749 Q 0.815 +750 L 0.814 +751 S 0.810 +752 S 0.803 +753 G 0.792 +754 I 0.781 +755 P 0.773 +756 V 0.770 +757 P 0.775 +758 H 0.787 +759 P 0.805 +760 R 0.820 +761 H 0.831 +762 T 0.838 +763 S 0.840 +764 C 0.840 +765 S 0.841 +766 S 0.843 +767 A 0.842 +768 G 0.837 +769 N 0.830 +770 D 0.821 +771 S 0.814 +772 K 0.814 +773 P 0.825 +774 V 0.838 +775 Q 0.845 +776 E 0.845 +777 A 0.841 +778 S 0.838 +779 N 0.839 +780 V 0.841 +781 S 0.842 +782 R 0.843 +783 V 0.837 +784 S 0.825 +785 S 0.811 +786 I 0.807 +787 P 0.814 +788 H 0.826 +789 D 0.834 +790 L 0.835 +791 C 0.833 +792 H 0.832 +793 N 0.831 +794 G 0.828 +795 E 0.820 +796 K 0.808 +797 S 0.791 +798 K 0.776 +799 K 0.769 +800 P 0.771 +801 S 0.777 +802 K 0.776 +803 I 0.763 +804 K 0.741 +805 S 0.719 +806 L 0.704 +807 F 0.696 +808 K 0.695 +809 K 0.699 +810 K 0.704 +811 S 0.707 +812 K 0.707 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039917.11_ENSMUST00000043707.7_GN:Rhbdd2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039917.11_ENSMUST00000043707.7_GN:Rhbdd2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0e22c40db35134065d807bb32719d352ace4fd60 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039917.11_ENSMUST00000043707.7_GN:Rhbdd2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,362 @@ +>ENSMUSG00000039917.11|ENSMUST00000043707.7|GN:Rhbdd2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.385 +2 A 0.399 +3 A 0.417 +4 P 0.430 +5 G 0.435 +6 P 0.436 +7 A 0.432 +8 S 0.414 +9 R 0.370 +10 F 0.303 +11 W 0.246 +12 C 0.227 +13 S 0.237 +14 C 0.249 +15 P 0.249 +16 E 0.236 +17 V 0.206 +18 P 0.159 +19 S 0.109 +20 A 0.072 +21 T 0.052 +22 F 0.045 +23 F 0.045 +24 T 0.047 +25 A 0.047 +26 L 0.047 +27 L 0.048 +28 S 0.046 +29 L 0.040 +30 L 0.035 +31 V 0.042 +32 S 0.060 +33 G 0.079 +34 P 0.089 +35 R 0.092 +36 L 0.098 +37 F 0.112 +38 L 0.129 +39 L 0.148 +40 Q 0.175 +41 P 0.210 +42 P 0.248 +43 L 0.282 +44 A 0.308 +45 P 0.316 +46 S 0.300 +47 G 0.260 +48 L 0.203 +49 S 0.147 +50 L 0.109 +51 R 0.090 +52 S 0.079 +53 E 0.071 +54 A 0.069 +55 L 0.074 +56 R 0.082 +57 N 0.087 +58 W 0.087 +59 Q 0.085 +60 V 0.085 +61 Y 0.091 +62 R 0.101 +63 L 0.114 +64 V 0.130 +65 T 0.146 +66 Y 0.147 +67 I 0.128 +68 F 0.105 +69 V 0.094 +70 Y 0.100 +71 E 0.117 +72 N 0.129 +73 P 0.129 +74 V 0.121 +75 S 0.113 +76 L 0.104 +77 L 0.095 +78 C 0.092 +79 G 0.090 +80 A 0.081 +81 I 0.069 +82 I 0.060 +83 I 0.055 +84 W 0.048 +85 R 0.038 +86 F 0.030 +87 A 0.027 +88 G 0.025 +89 N 0.025 +90 F 0.027 +91 E 0.031 +92 R 0.036 +93 T 0.042 +94 V 0.050 +95 G 0.054 +96 T 0.049 +97 V 0.038 +98 R 0.028 +99 H 0.022 +100 C 0.020 +101 F 0.021 +102 F 0.024 +103 T 0.026 +104 L 0.026 +105 I 0.025 +106 F 0.025 +107 T 0.025 +108 V 0.024 +109 F 0.024 +110 S 0.027 +111 A 0.031 +112 I 0.034 +113 I 0.035 +114 Y 0.038 +115 L 0.040 +116 S 0.040 +117 F 0.044 +118 E 0.054 +119 S 0.069 +120 V 0.091 +121 S 0.117 +122 S 0.144 +123 L 0.173 +124 S 0.209 +125 K 0.250 +126 L 0.285 +127 G 0.306 +128 E 0.309 +129 V 0.287 +130 E 0.241 +131 D 0.183 +132 A 0.133 +133 R 0.107 +134 G 0.103 +135 F 0.109 +136 T 0.117 +137 P 0.120 +138 V 0.112 +139 A 0.095 +140 F 0.079 +141 A 0.069 +142 M 0.064 +143 L 0.057 +144 G 0.051 +145 V 0.051 +146 T 0.059 +147 S 0.067 +148 V 0.072 +149 R 0.078 +150 S 0.086 +151 R 0.092 +152 M 0.091 +153 R 0.086 +154 R 0.080 +155 A 0.076 +156 L 0.077 +157 V 0.086 +158 F 0.105 +159 G 0.127 +160 V 0.140 +161 V 0.133 +162 V 0.110 +163 P 0.085 +164 S 0.070 +165 V 0.062 +166 L 0.058 +167 V 0.055 +168 P 0.052 +169 W 0.050 +170 L 0.053 +171 L 0.057 +172 L 0.056 +173 C 0.053 +174 A 0.054 +175 S 0.061 +176 W 0.072 +177 L 0.087 +178 I 0.101 +179 P 0.110 +180 Q 0.113 +181 T 0.115 +182 S 0.113 +183 F 0.106 +184 L 0.104 +185 S 0.112 +186 N 0.115 +187 V 0.102 +188 S 0.078 +189 G 0.057 +190 L 0.045 +191 L 0.041 +192 I 0.040 +193 G 0.037 +194 L 0.033 +195 S 0.029 +196 Y 0.028 +197 G 0.027 +198 L 0.029 +199 T 0.033 +200 Y 0.043 +201 C 0.059 +202 Y 0.081 +203 S 0.104 +204 L 0.116 +205 D 0.112 +206 L 0.098 +207 S 0.083 +208 E 0.069 +209 R 0.058 +210 V 0.052 +211 A 0.053 +212 L 0.059 +213 K 0.065 +214 L 0.070 +215 D 0.071 +216 Q 0.069 +217 K 0.071 +218 F 0.076 +219 P 0.078 +220 F 0.073 +221 S 0.068 +222 L 0.067 +223 M 0.070 +224 R 0.080 +225 R 0.095 +226 I 0.104 +227 P 0.098 +228 L 0.082 +229 F 0.070 +230 K 0.073 +231 Y 0.090 +232 I 0.125 +233 S 0.172 +234 G 0.213 +235 S 0.235 +236 S 0.235 +237 A 0.220 +238 E 0.205 +239 R 0.201 +240 R 0.213 +241 A 0.238 +242 A 0.271 +243 Q 0.307 +244 S 0.345 +245 R 0.390 +246 R 0.448 +247 L 0.510 +248 N 0.564 +249 P 0.610 +250 A 0.657 +251 P 0.698 +252 G 0.724 +253 S 0.733 +254 Y 0.738 +255 P 0.748 +256 T 0.762 +257 Q 0.769 +258 S 0.763 +259 C 0.749 +260 H 0.739 +261 P 0.739 +262 H 0.742 +263 L 0.737 +264 T 0.729 +265 P 0.724 +266 S 0.726 +267 Y 0.735 +268 P 0.741 +269 V 0.720 +270 T 0.672 +271 Q 0.645 +272 M 0.680 +273 Q 0.745 +274 H 0.790 +275 A 0.805 +276 S 0.804 +277 G 0.801 +278 Q 0.802 +279 K 0.804 +280 L 0.795 +281 A 0.766 +282 S 0.723 +283 W 0.687 +284 P 0.688 +285 P 0.720 +286 G 0.754 +287 H 0.768 +288 M 0.768 +289 P 0.765 +290 S 0.762 +291 L 0.758 +292 P 0.754 +293 P 0.751 +294 Y 0.749 +295 Q 0.756 +296 P 0.770 +297 A 0.782 +298 S 0.786 +299 G 0.784 +300 L 0.781 +301 C 0.784 +302 Y 0.789 +303 V 0.790 +304 Q 0.782 +305 N 0.767 +306 H 0.748 +307 F 0.733 +308 G 0.730 +309 P 0.737 +310 N 0.752 +311 P 0.771 +312 N 0.793 +313 A 0.813 +314 S 0.823 +315 S 0.820 +316 V 0.811 +317 Y 0.810 +318 P 0.822 +319 A 0.842 +320 S 0.856 +321 A 0.860 +322 G 0.855 +323 T 0.848 +324 S 0.840 +325 Q 0.830 +326 G 0.811 +327 V 0.783 +328 Q 0.754 +329 P 0.738 +330 P 0.740 +331 S 0.753 +332 P 0.761 +333 I 0.757 +334 S 0.749 +335 C 0.752 +336 P 0.766 +337 G 0.778 +338 T 0.769 +339 V 0.723 +340 Y 0.658 +341 S 0.630 +342 G 0.669 +343 A 0.733 +344 L 0.771 +345 G 0.779 +346 T 0.781 +347 P 0.788 +348 G 0.791 +349 A 0.771 +350 T 0.705 +351 G 0.594 +352 S 0.493 +353 K 0.477 +354 E 0.528 +355 S 0.571 +356 S 0.595 +357 K 0.632 +358 V 0.654 +359 A 0.617 +360 M 0.535 +361 P 0.468 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039917.11_ENSMUST00000043707.7_GN:Rhbdd2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:41.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039917.11_ENSMUST00000043707.7_GN:Rhbdd2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:41.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2fc7bad17fcd3a715b09f4a5adb7cba0aee905a1 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000039917.11_ENSMUST00000043707.7_GN:Rhbdd2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:41.caid @@ -0,0 +1,403 @@ +>ENSMUSG00000039917.11|ENSMUST00000043707.7|GN:Rhbdd2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:41 +1 M 0.375 +2 G 0.405 +3 R 0.447 +4 C 0.477 +5 L 0.480 +6 R 0.469 +7 R 0.484 +8 G 0.535 +9 Q 0.582 +10 S 0.595 +11 S 0.595 +12 A 0.596 +13 V 0.577 +14 A 0.535 +15 R 0.501 +16 G 0.485 +17 D 0.447 +18 R 0.392 +19 R 0.376 +20 K 0.408 +21 E 0.447 +22 A 0.486 +23 E 0.545 +24 I 0.605 +25 E 0.641 +26 E 0.661 +27 G 0.680 +28 G 0.693 +29 G 0.693 +30 E 0.682 +31 Y 0.669 +32 R 0.655 +33 G 0.631 +34 R 0.583 +35 T 0.517 +36 L 0.455 +37 E 0.424 +38 G 0.424 +39 L 0.431 +40 A 0.444 +41 A 0.474 +42 M 0.513 +43 A 0.536 +44 A 0.529 +45 P 0.506 +46 G 0.487 +47 P 0.475 +48 A 0.460 +49 S 0.434 +50 R 0.382 +51 F 0.309 +52 W 0.246 +53 C 0.221 +54 S 0.228 +55 C 0.239 +56 P 0.237 +57 E 0.223 +58 V 0.195 +59 P 0.151 +60 S 0.104 +61 A 0.068 +62 T 0.049 +63 F 0.041 +64 F 0.041 +65 T 0.044 +66 A 0.044 +67 L 0.043 +68 L 0.044 +69 S 0.043 +70 L 0.037 +71 L 0.032 +72 V 0.036 +73 S 0.052 +74 G 0.068 +75 P 0.076 +76 R 0.078 +77 L 0.082 +78 F 0.092 +79 L 0.108 +80 L 0.127 +81 Q 0.154 +82 P 0.190 +83 P 0.227 +84 L 0.260 +85 A 0.286 +86 P 0.295 +87 S 0.278 +88 G 0.239 +89 L 0.185 +90 S 0.133 +91 L 0.097 +92 R 0.078 +93 S 0.068 +94 E 0.062 +95 A 0.060 +96 L 0.064 +97 R 0.071 +98 N 0.076 +99 W 0.076 +100 Q 0.075 +101 V 0.076 +102 Y 0.082 +103 R 0.093 +104 L 0.104 +105 V 0.121 +106 T 0.137 +107 Y 0.138 +108 I 0.121 +109 F 0.099 +110 V 0.087 +111 Y 0.091 +112 E 0.104 +113 N 0.116 +114 P 0.117 +115 V 0.113 +116 S 0.107 +117 L 0.098 +118 L 0.090 +119 C 0.088 +120 G 0.088 +121 A 0.079 +122 I 0.066 +123 I 0.057 +124 I 0.051 +125 W 0.044 +126 R 0.035 +127 F 0.028 +128 A 0.025 +129 G 0.023 +130 N 0.024 +131 F 0.026 +132 E 0.030 +133 R 0.034 +134 T 0.040 +135 V 0.048 +136 G 0.053 +137 T 0.048 +138 V 0.037 +139 R 0.028 +140 H 0.023 +141 C 0.021 +142 F 0.021 +143 F 0.024 +144 T 0.026 +145 L 0.026 +146 I 0.025 +147 F 0.025 +148 T 0.025 +149 V 0.024 +150 F 0.025 +151 S 0.029 +152 A 0.033 +153 I 0.035 +154 I 0.037 +155 Y 0.039 +156 L 0.040 +157 S 0.041 +158 F 0.045 +159 E 0.055 +160 S 0.071 +161 V 0.094 +162 S 0.123 +163 S 0.153 +164 L 0.183 +165 S 0.222 +166 K 0.264 +167 L 0.299 +168 G 0.320 +169 E 0.321 +170 V 0.297 +171 E 0.249 +172 D 0.188 +173 A 0.136 +174 R 0.109 +175 G 0.104 +176 F 0.110 +177 T 0.118 +178 P 0.121 +179 V 0.113 +180 A 0.095 +181 F 0.078 +182 A 0.069 +183 M 0.063 +184 L 0.057 +185 G 0.050 +186 V 0.051 +187 T 0.058 +188 S 0.067 +189 V 0.074 +190 R 0.081 +191 S 0.091 +192 R 0.097 +193 M 0.095 +194 R 0.088 +195 R 0.081 +196 A 0.076 +197 L 0.076 +198 V 0.085 +199 F 0.102 +200 G 0.121 +201 V 0.131 +202 V 0.124 +203 V 0.103 +204 P 0.080 +205 S 0.066 +206 V 0.058 +207 L 0.054 +208 V 0.051 +209 P 0.048 +210 W 0.047 +211 L 0.050 +212 L 0.054 +213 L 0.053 +214 C 0.050 +215 A 0.050 +216 S 0.055 +217 W 0.064 +218 L 0.078 +219 I 0.092 +220 P 0.100 +221 Q 0.103 +222 T 0.105 +223 S 0.103 +224 F 0.098 +225 L 0.099 +226 S 0.108 +227 N 0.112 +228 V 0.100 +229 S 0.076 +230 G 0.054 +231 L 0.042 +232 L 0.039 +233 I 0.038 +234 G 0.035 +235 L 0.031 +236 S 0.028 +237 Y 0.026 +238 G 0.026 +239 L 0.027 +240 T 0.031 +241 Y 0.040 +242 C 0.056 +243 Y 0.078 +244 S 0.100 +245 L 0.113 +246 D 0.110 +247 L 0.097 +248 S 0.082 +249 E 0.068 +250 R 0.057 +251 V 0.051 +252 A 0.053 +253 L 0.058 +254 K 0.063 +255 L 0.068 +256 D 0.070 +257 Q 0.070 +258 K 0.072 +259 F 0.077 +260 P 0.078 +261 F 0.073 +262 S 0.068 +263 L 0.067 +264 M 0.070 +265 R 0.079 +266 R 0.093 +267 I 0.102 +268 P 0.096 +269 L 0.080 +270 F 0.069 +271 K 0.072 +272 Y 0.089 +273 I 0.124 +274 S 0.171 +275 G 0.213 +276 S 0.235 +277 S 0.235 +278 A 0.222 +279 E 0.207 +280 R 0.203 +281 R 0.215 +282 A 0.240 +283 A 0.272 +284 Q 0.308 +285 S 0.348 +286 R 0.394 +287 R 0.453 +288 L 0.515 +289 N 0.570 +290 P 0.617 +291 A 0.664 +292 P 0.706 +293 G 0.731 +294 S 0.740 +295 Y 0.745 +296 P 0.755 +297 T 0.770 +298 Q 0.777 +299 S 0.772 +300 C 0.758 +301 H 0.748 +302 P 0.748 +303 H 0.752 +304 L 0.750 +305 T 0.742 +306 P 0.737 +307 S 0.739 +308 Y 0.748 +309 P 0.753 +310 V 0.732 +311 T 0.684 +312 Q 0.658 +313 M 0.693 +314 Q 0.759 +315 H 0.805 +316 A 0.820 +317 S 0.820 +318 G 0.818 +319 Q 0.819 +320 K 0.821 +321 L 0.814 +322 A 0.789 +323 S 0.750 +324 W 0.717 +325 P 0.716 +326 P 0.746 +327 G 0.778 +328 H 0.790 +329 M 0.789 +330 P 0.785 +331 S 0.781 +332 L 0.776 +333 P 0.772 +334 P 0.769 +335 Y 0.767 +336 Q 0.773 +337 P 0.786 +338 A 0.797 +339 S 0.800 +340 G 0.797 +341 L 0.795 +342 C 0.797 +343 Y 0.802 +344 V 0.803 +345 Q 0.795 +346 N 0.781 +347 H 0.763 +348 F 0.749 +349 G 0.745 +350 P 0.750 +351 N 0.763 +352 P 0.782 +353 N 0.803 +354 A 0.822 +355 S 0.832 +356 S 0.830 +357 V 0.822 +358 Y 0.821 +359 P 0.834 +360 A 0.852 +361 S 0.864 +362 A 0.868 +363 G 0.864 +364 T 0.857 +365 S 0.850 +366 Q 0.840 +367 G 0.822 +368 V 0.796 +369 Q 0.770 +370 P 0.755 +371 P 0.757 +372 S 0.768 +373 P 0.774 +374 I 0.770 +375 S 0.762 +376 C 0.762 +377 P 0.774 +378 G 0.784 +379 T 0.774 +380 V 0.727 +381 Y 0.660 +382 S 0.632 +383 G 0.671 +384 A 0.736 +385 L 0.775 +386 G 0.785 +387 T 0.789 +388 P 0.796 +389 G 0.800 +390 A 0.784 +391 T 0.734 +392 G 0.664 +393 S 0.623 +394 K 0.637 +395 E 0.657 +396 S 0.640 +397 S 0.623 +398 K 0.644 +399 V 0.665 +400 A 0.631 +401 M 0.551 +402 P 0.485 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040133.3_ENSMUST00000039160.3_GN:Gpr176_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040133.3_ENSMUST00000039160.3_GN:Gpr176_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..658f67c0acb0b768edfa2071cce91ff6d5215d07 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040133.3_ENSMUST00000039160.3_GN:Gpr176_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,516 @@ +>ENSMUSG00000040133.3|ENSMUST00000039160.3|GN:Gpr176|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.366 +2 G 0.389 +3 H 0.417 +4 N 0.426 +5 S 0.406 +6 S 0.385 +7 W 0.397 +8 V 0.439 +9 S 0.484 +10 P 0.505 +11 N 0.490 +12 T 0.453 +13 S 0.437 +14 H 0.476 +15 P 0.548 +16 R 0.610 +17 N 0.641 +18 T 0.644 +19 S 0.618 +20 G 0.570 +21 A 0.535 +22 E 0.545 +23 A 0.579 +24 G 0.593 +25 A 0.568 +26 N 0.518 +27 L 0.469 +28 S 0.441 +29 A 0.430 +30 F 0.418 +31 G 0.392 +32 E 0.344 +33 L 0.280 +34 S 0.216 +35 E 0.162 +36 A 0.122 +37 Q 0.094 +38 L 0.080 +39 Y 0.072 +40 R 0.062 +41 Q 0.050 +42 F 0.042 +43 T 0.040 +44 T 0.040 +45 T 0.039 +46 V 0.037 +47 Q 0.035 +48 V 0.033 +49 V 0.032 +50 I 0.034 +51 F 0.037 +52 I 0.042 +53 G 0.047 +54 S 0.048 +55 L 0.044 +56 L 0.041 +57 G 0.039 +58 N 0.039 +59 F 0.040 +60 M 0.042 +61 V 0.040 +62 L 0.036 +63 W 0.033 +64 S 0.033 +65 T 0.034 +66 C 0.038 +67 R 0.045 +68 T 0.051 +69 T 0.056 +70 V 0.061 +71 F 0.064 +72 K 0.065 +73 S 0.062 +74 V 0.054 +75 T 0.041 +76 N 0.029 +77 R 0.024 +78 F 0.024 +79 I 0.028 +80 K 0.033 +81 N 0.036 +82 L 0.038 +83 A 0.039 +84 C 0.039 +85 S 0.038 +86 G 0.038 +87 I 0.038 +88 C 0.035 +89 A 0.030 +90 S 0.026 +91 V 0.025 +92 V 0.026 +93 C 0.029 +94 V 0.033 +95 P 0.034 +96 F 0.033 +97 D 0.031 +98 I 0.032 +99 I 0.040 +100 L 0.058 +101 S 0.087 +102 S 0.122 +103 S 0.148 +104 P 0.153 +105 H 0.138 +106 C 0.116 +107 C 0.095 +108 W 0.078 +109 W 0.064 +110 I 0.054 +111 Y 0.047 +112 T 0.042 +113 M 0.038 +114 L 0.033 +115 F 0.028 +116 C 0.026 +117 K 0.026 +118 V 0.028 +119 L 0.031 +120 K 0.034 +121 F 0.036 +122 L 0.035 +123 H 0.032 +124 K 0.028 +125 V 0.026 +126 F 0.027 +127 C 0.031 +128 S 0.035 +129 V 0.036 +130 T 0.035 +131 V 0.035 +132 L 0.035 +133 S 0.032 +134 F 0.028 +135 P 0.024 +136 A 0.023 +137 I 0.024 +138 A 0.028 +139 L 0.033 +140 D 0.037 +141 R 0.039 +142 Y 0.038 +143 Y 0.041 +144 S 0.051 +145 V 0.069 +146 L 0.091 +147 Y 0.110 +148 P 0.119 +149 L 0.118 +150 E 0.115 +151 R 0.114 +152 K 0.110 +153 I 0.099 +154 S 0.085 +155 D 0.075 +156 A 0.067 +157 K 0.060 +158 S 0.058 +159 R 0.064 +160 E 0.068 +161 L 0.063 +162 V 0.052 +163 M 0.043 +164 Y 0.042 +165 I 0.044 +166 W 0.044 +167 A 0.043 +168 H 0.044 +169 A 0.047 +170 V 0.052 +171 V 0.061 +172 A 0.070 +173 S 0.074 +174 V 0.069 +175 P 0.061 +176 V 0.057 +177 F 0.056 +178 A 0.055 +179 V 0.053 +180 T 0.049 +181 N 0.047 +182 V 0.051 +183 A 0.058 +184 D 0.065 +185 I 0.071 +186 Y 0.079 +187 A 0.090 +188 M 0.095 +189 S 0.088 +190 T 0.076 +191 C 0.068 +192 T 0.071 +193 E 0.080 +194 V 0.094 +195 W 0.110 +196 S 0.122 +197 N 0.120 +198 S 0.103 +199 L 0.082 +200 G 0.066 +201 H 0.056 +202 L 0.048 +203 V 0.041 +204 Y 0.035 +205 V 0.032 +206 L 0.033 +207 I 0.036 +208 Y 0.038 +209 N 0.035 +210 V 0.031 +211 T 0.030 +212 T 0.032 +213 V 0.034 +214 I 0.035 +215 V 0.037 +216 P 0.036 +217 V 0.032 +218 A 0.030 +219 V 0.030 +220 V 0.029 +221 F 0.025 +222 L 0.024 +223 F 0.031 +224 L 0.043 +225 I 0.051 +226 L 0.047 +227 I 0.036 +228 R 0.030 +229 R 0.032 +230 A 0.037 +231 L 0.046 +232 S 0.059 +233 A 0.076 +234 S 0.091 +235 Q 0.101 +236 K 0.110 +237 K 0.125 +238 K 0.144 +239 V 0.164 +240 I 0.185 +241 I 0.210 +242 A 0.237 +243 A 0.261 +244 L 0.281 +245 R 0.301 +246 T 0.327 +247 P 0.353 +248 Q 0.373 +249 N 0.386 +250 T 0.395 +251 I 0.399 +252 S 0.393 +253 I 0.368 +254 P 0.322 +255 Y 0.271 +256 A 0.229 +257 S 0.196 +258 Q 0.166 +259 R 0.136 +260 E 0.114 +261 A 0.099 +262 E 0.085 +263 L 0.072 +264 H 0.062 +265 A 0.057 +266 T 0.053 +267 L 0.048 +268 L 0.045 +269 S 0.045 +270 M 0.045 +271 V 0.043 +272 T 0.040 +273 V 0.037 +274 F 0.033 +275 I 0.027 +276 L 0.023 +277 C 0.022 +278 S 0.025 +279 V 0.028 +280 P 0.029 +281 Y 0.027 +282 A 0.024 +283 T 0.021 +284 L 0.020 +285 V 0.019 +286 V 0.019 +287 Y 0.019 +288 Q 0.021 +289 T 0.027 +290 V 0.037 +291 L 0.053 +292 N 0.077 +293 V 0.103 +294 P 0.126 +295 N 0.139 +296 T 0.135 +297 S 0.110 +298 V 0.077 +299 F 0.052 +300 L 0.040 +301 L 0.037 +302 L 0.037 +303 T 0.039 +304 A 0.040 +305 I 0.041 +306 W 0.045 +307 L 0.052 +308 P 0.058 +309 K 0.063 +310 V 0.068 +311 S 0.070 +312 L 0.068 +313 L 0.063 +314 A 0.058 +315 N 0.054 +316 P 0.050 +317 V 0.046 +318 L 0.042 +319 F 0.038 +320 L 0.037 +321 T 0.042 +322 V 0.049 +323 N 0.049 +324 K 0.044 +325 S 0.036 +326 V 0.030 +327 R 0.027 +328 K 0.029 +329 C 0.034 +330 L 0.040 +331 V 0.049 +332 G 0.061 +333 T 0.074 +334 L 0.087 +335 V 0.100 +336 Q 0.115 +337 L 0.128 +338 H 0.140 +339 H 0.157 +340 R 0.188 +341 Y 0.231 +342 S 0.283 +343 R 0.348 +344 R 0.439 +345 N 0.544 +346 V 0.627 +347 V 0.674 +348 S 0.700 +349 T 0.718 +350 G 0.732 +351 S 0.742 +352 G 0.747 +353 V 0.746 +354 A 0.740 +355 E 0.735 +356 P 0.731 +357 S 0.726 +358 L 0.721 +359 E 0.717 +360 P 0.714 +361 S 0.706 +362 M 0.693 +363 R 0.678 +364 S 0.654 +365 G 0.618 +366 S 0.578 +367 Q 0.544 +368 L 0.501 +369 L 0.438 +370 E 0.382 +371 M 0.363 +372 F 0.387 +373 H 0.442 +374 I 0.514 +375 G 0.571 +376 Q 0.592 +377 Q 0.590 +378 Q 0.585 +379 I 0.582 +380 F 0.585 +381 K 0.605 +382 P 0.641 +383 S 0.679 +384 E 0.706 +385 D 0.714 +386 E 0.709 +387 E 0.703 +388 E 0.702 +389 S 0.700 +390 E 0.688 +391 A 0.671 +392 K 0.663 +393 Y 0.674 +394 L 0.699 +395 G 0.722 +396 S 0.734 +397 A 0.734 +398 D 0.729 +399 F 0.726 +400 Q 0.730 +401 A 0.738 +402 K 0.746 +403 E 0.751 +404 V 0.755 +405 L 0.753 +406 T 0.745 +407 S 0.734 +408 C 0.731 +409 P 0.744 +410 E 0.767 +411 G 0.784 +412 E 0.780 +413 Q 0.764 +414 E 0.752 +415 P 0.753 +416 P 0.764 +417 Q 0.771 +418 L 0.758 +419 A 0.711 +420 P 0.638 +421 S 0.586 +422 V 0.581 +423 P 0.591 +424 P 0.588 +425 P 0.606 +426 G 0.674 +427 T 0.752 +428 V 0.795 +429 D 0.801 +430 S 0.792 +431 E 0.787 +432 P 0.788 +433 R 0.788 +434 V 0.786 +435 S 0.785 +436 P 0.789 +437 V 0.797 +438 A 0.805 +439 P 0.811 +440 M 0.815 +441 E 0.816 +442 S 0.809 +443 G 0.789 +444 I 0.763 +445 F 0.745 +446 P 0.737 +447 D 0.727 +448 K 0.710 +449 Y 0.695 +450 S 0.681 +451 L 0.667 +452 Q 0.659 +453 F 0.651 +454 G 0.630 +455 F 0.601 +456 G 0.585 +457 P 0.586 +458 F 0.598 +459 E 0.609 +460 L 0.606 +461 P 0.591 +462 P 0.575 +463 Q 0.567 +464 W 0.579 +465 L 0.618 +466 S 0.672 +467 E 0.719 +468 T 0.750 +469 R 0.761 +470 N 0.757 +471 S 0.748 +472 K 0.743 +473 K 0.741 +474 R 0.738 +475 L 0.730 +476 L 0.724 +477 P 0.728 +478 P 0.742 +479 L 0.754 +480 G 0.755 +481 N 0.744 +482 T 0.732 +483 P 0.733 +484 E 0.747 +485 E 0.759 +486 L 0.754 +487 I 0.735 +488 Q 0.713 +489 T 0.697 +490 K 0.689 +491 V 0.691 +492 P 0.706 +493 R 0.719 +494 V 0.703 +495 N 0.656 +496 R 0.626 +497 V 0.651 +498 E 0.702 +499 R 0.729 +500 K 0.730 +501 M 0.723 +502 S 0.716 +503 R 0.715 +504 N 0.717 +505 N 0.707 +506 K 0.675 +507 V 0.637 +508 S 0.619 +509 I 0.625 +510 F 0.645 +511 P 0.669 +512 K 0.673 +513 V 0.640 +514 D 0.584 +515 S 0.539 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040133.3_ENSMUST00000039160.3_GN:Gpr176_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:49.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040133.3_ENSMUST00000039160.3_GN:Gpr176_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:49.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a0bf81911fc29d9dd1a4d3c09d5e1dcef045de2a --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040133.3_ENSMUST00000039160.3_GN:Gpr176_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:49.caid @@ -0,0 +1,565 @@ +>ENSMUSG00000040133.3|ENSMUST00000039160.3|GN:Gpr176|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:49 +1 M 0.345 +2 S 0.373 +3 R 0.416 +4 R 0.461 +5 E 0.490 +6 G 0.490 +7 L 0.472 +8 A 0.461 +9 G 0.461 +10 W 0.456 +11 P 0.439 +12 A 0.409 +13 L 0.380 +14 Q 0.377 +15 D 0.393 +16 A 0.394 +17 A 0.376 +18 W 0.375 +19 L 0.412 +20 P 0.469 +21 S 0.518 +22 V 0.552 +23 G 0.578 +24 P 0.600 +25 S 0.619 +26 T 0.640 +27 P 0.663 +28 G 0.677 +29 A 0.669 +30 G 0.634 +31 A 0.583 +32 A 0.531 +33 V 0.482 +34 R 0.440 +35 W 0.407 +36 A 0.388 +37 Q 0.401 +38 R 0.460 +39 P 0.550 +40 G 0.627 +41 G 0.648 +42 R 0.598 +43 A 0.514 +44 Q 0.464 +45 T 0.482 +46 P 0.529 +47 G 0.548 +48 F 0.533 +49 A 0.519 +50 M 0.534 +51 G 0.564 +52 H 0.576 +53 N 0.543 +54 S 0.478 +55 S 0.429 +56 W 0.435 +57 V 0.488 +58 S 0.551 +59 P 0.593 +60 N 0.591 +61 T 0.553 +62 S 0.528 +63 H 0.563 +64 P 0.637 +65 R 0.703 +66 N 0.739 +67 T 0.752 +68 S 0.749 +69 G 0.739 +70 A 0.729 +71 E 0.723 +72 A 0.718 +73 G 0.703 +74 A 0.668 +75 N 0.615 +76 L 0.561 +77 S 0.527 +78 A 0.508 +79 F 0.488 +80 G 0.450 +81 E 0.387 +82 L 0.308 +83 S 0.232 +84 E 0.172 +85 A 0.129 +86 Q 0.099 +87 L 0.084 +88 Y 0.075 +89 R 0.064 +90 Q 0.050 +91 F 0.041 +92 T 0.038 +93 T 0.038 +94 T 0.037 +95 V 0.035 +96 Q 0.034 +97 V 0.033 +98 V 0.032 +99 I 0.034 +100 F 0.038 +101 I 0.042 +102 G 0.045 +103 S 0.045 +104 L 0.041 +105 L 0.038 +106 G 0.037 +107 N 0.037 +108 F 0.038 +109 M 0.038 +110 V 0.036 +111 L 0.032 +112 W 0.029 +113 S 0.028 +114 T 0.029 +115 C 0.032 +116 R 0.038 +117 T 0.044 +118 T 0.049 +119 V 0.054 +120 F 0.057 +121 K 0.057 +122 S 0.054 +123 V 0.047 +124 T 0.036 +125 N 0.026 +126 R 0.022 +127 F 0.023 +128 I 0.028 +129 K 0.033 +130 N 0.037 +131 L 0.040 +132 A 0.040 +133 C 0.040 +134 S 0.040 +135 G 0.041 +136 I 0.040 +137 C 0.037 +138 A 0.031 +139 S 0.027 +140 V 0.025 +141 V 0.026 +142 C 0.029 +143 V 0.033 +144 P 0.034 +145 F 0.032 +146 D 0.030 +147 I 0.032 +148 I 0.040 +149 L 0.058 +150 S 0.087 +151 S 0.123 +152 S 0.150 +153 P 0.156 +154 H 0.144 +155 C 0.125 +156 C 0.108 +157 W 0.091 +158 W 0.075 +159 I 0.063 +160 Y 0.053 +161 T 0.045 +162 M 0.039 +163 L 0.034 +164 F 0.029 +165 C 0.027 +166 K 0.027 +167 V 0.029 +168 L 0.032 +169 K 0.034 +170 F 0.035 +171 L 0.034 +172 H 0.031 +173 K 0.027 +174 V 0.025 +175 F 0.027 +176 C 0.030 +177 S 0.034 +178 V 0.035 +179 T 0.034 +180 V 0.033 +181 L 0.033 +182 S 0.031 +183 F 0.027 +184 P 0.023 +185 A 0.022 +186 I 0.024 +187 A 0.028 +188 L 0.033 +189 D 0.038 +190 R 0.040 +191 Y 0.039 +192 Y 0.041 +193 S 0.051 +194 V 0.068 +195 L 0.089 +196 Y 0.108 +197 P 0.116 +198 L 0.113 +199 E 0.108 +200 R 0.104 +201 K 0.099 +202 I 0.086 +203 S 0.069 +204 D 0.053 +205 A 0.042 +206 K 0.037 +207 S 0.035 +208 R 0.036 +209 E 0.037 +210 L 0.037 +211 V 0.037 +212 M 0.036 +213 Y 0.038 +214 I 0.040 +215 W 0.041 +216 A 0.039 +217 H 0.040 +218 A 0.044 +219 V 0.049 +220 V 0.057 +221 A 0.066 +222 S 0.069 +223 V 0.064 +224 P 0.056 +225 V 0.051 +226 F 0.048 +227 A 0.047 +228 V 0.044 +229 T 0.041 +230 N 0.039 +231 V 0.042 +232 A 0.047 +233 D 0.052 +234 I 0.057 +235 Y 0.064 +236 A 0.074 +237 M 0.079 +238 S 0.074 +239 T 0.065 +240 C 0.060 +241 T 0.063 +242 E 0.070 +243 V 0.081 +244 W 0.095 +245 S 0.106 +246 N 0.105 +247 S 0.092 +248 L 0.074 +249 G 0.059 +250 H 0.051 +251 L 0.044 +252 V 0.037 +253 Y 0.032 +254 V 0.030 +255 L 0.030 +256 I 0.033 +257 Y 0.035 +258 N 0.032 +259 V 0.029 +260 T 0.028 +261 T 0.030 +262 V 0.032 +263 I 0.033 +264 V 0.035 +265 P 0.033 +266 V 0.030 +267 A 0.028 +268 V 0.029 +269 V 0.029 +270 F 0.025 +271 L 0.024 +272 F 0.031 +273 L 0.044 +274 I 0.051 +275 L 0.046 +276 I 0.035 +277 R 0.029 +278 R 0.030 +279 A 0.035 +280 L 0.044 +281 S 0.057 +282 A 0.075 +283 S 0.091 +284 Q 0.102 +285 K 0.113 +286 K 0.130 +287 K 0.152 +288 V 0.173 +289 I 0.196 +290 I 0.223 +291 A 0.253 +292 A 0.278 +293 L 0.298 +294 R 0.317 +295 T 0.341 +296 P 0.365 +297 Q 0.385 +298 N 0.402 +299 T 0.415 +300 I 0.421 +301 S 0.416 +302 I 0.389 +303 P 0.341 +304 Y 0.285 +305 A 0.239 +306 S 0.204 +307 Q 0.171 +308 R 0.139 +309 E 0.116 +310 A 0.101 +311 E 0.088 +312 L 0.074 +313 H 0.064 +314 A 0.058 +315 T 0.053 +316 L 0.048 +317 L 0.046 +318 S 0.046 +319 M 0.045 +320 V 0.043 +321 T 0.040 +322 V 0.038 +323 F 0.033 +324 I 0.028 +325 L 0.024 +326 C 0.024 +327 S 0.026 +328 V 0.030 +329 P 0.031 +330 Y 0.028 +331 A 0.024 +332 T 0.022 +333 L 0.021 +334 V 0.021 +335 V 0.020 +336 Y 0.020 +337 Q 0.023 +338 T 0.028 +339 V 0.039 +340 L 0.056 +341 N 0.080 +342 V 0.107 +343 P 0.130 +344 N 0.142 +345 T 0.137 +346 S 0.111 +347 V 0.077 +348 F 0.051 +349 L 0.040 +350 L 0.036 +351 L 0.036 +352 T 0.038 +353 A 0.039 +354 I 0.040 +355 W 0.044 +356 L 0.052 +357 P 0.058 +358 K 0.063 +359 V 0.068 +360 S 0.072 +361 L 0.069 +362 L 0.064 +363 A 0.059 +364 N 0.055 +365 P 0.050 +366 V 0.046 +367 L 0.041 +368 F 0.037 +369 L 0.036 +370 T 0.041 +371 V 0.047 +372 N 0.048 +373 K 0.042 +374 S 0.035 +375 V 0.029 +376 R 0.027 +377 K 0.028 +378 C 0.033 +379 L 0.039 +380 V 0.047 +381 G 0.059 +382 T 0.073 +383 L 0.085 +384 V 0.098 +385 Q 0.112 +386 L 0.124 +387 H 0.137 +388 H 0.156 +389 R 0.189 +390 Y 0.235 +391 S 0.288 +392 R 0.355 +393 R 0.445 +394 N 0.547 +395 V 0.627 +396 V 0.672 +397 S 0.696 +398 T 0.714 +399 G 0.727 +400 S 0.736 +401 G 0.739 +402 V 0.735 +403 A 0.728 +404 E 0.723 +405 P 0.720 +406 S 0.716 +407 L 0.711 +408 E 0.707 +409 P 0.703 +410 S 0.696 +411 M 0.685 +412 R 0.674 +413 S 0.658 +414 G 0.630 +415 S 0.597 +416 Q 0.564 +417 L 0.520 +418 L 0.456 +419 E 0.398 +420 M 0.380 +421 F 0.407 +422 H 0.466 +423 I 0.535 +424 G 0.585 +425 Q 0.597 +426 Q 0.587 +427 Q 0.577 +428 I 0.574 +429 F 0.580 +430 K 0.601 +431 P 0.634 +432 S 0.670 +433 E 0.695 +434 D 0.704 +435 E 0.701 +436 E 0.698 +437 E 0.702 +438 S 0.706 +439 E 0.700 +440 A 0.687 +441 K 0.680 +442 Y 0.690 +443 L 0.711 +444 G 0.731 +445 S 0.741 +446 A 0.741 +447 D 0.735 +448 F 0.733 +449 Q 0.738 +450 A 0.749 +451 K 0.761 +452 E 0.769 +453 V 0.770 +454 L 0.764 +455 T 0.752 +456 S 0.740 +457 C 0.735 +458 P 0.746 +459 E 0.767 +460 G 0.781 +461 E 0.776 +462 Q 0.760 +463 E 0.748 +464 P 0.750 +465 P 0.760 +466 Q 0.766 +467 L 0.752 +468 A 0.705 +469 P 0.634 +470 S 0.581 +471 V 0.577 +472 P 0.587 +473 P 0.584 +474 P 0.603 +475 G 0.669 +476 T 0.747 +477 V 0.789 +478 D 0.795 +479 S 0.786 +480 E 0.781 +481 P 0.781 +482 R 0.781 +483 V 0.778 +484 S 0.777 +485 P 0.783 +486 V 0.792 +487 A 0.801 +488 P 0.808 +489 M 0.812 +490 E 0.813 +491 S 0.805 +492 G 0.783 +493 I 0.756 +494 F 0.738 +495 P 0.730 +496 D 0.718 +497 K 0.701 +498 Y 0.691 +499 S 0.687 +500 L 0.684 +501 Q 0.681 +502 F 0.673 +503 G 0.650 +504 F 0.619 +505 G 0.600 +506 P 0.598 +507 F 0.606 +508 E 0.614 +509 L 0.615 +510 P 0.607 +511 P 0.596 +512 Q 0.590 +513 W 0.600 +514 L 0.635 +515 S 0.684 +516 E 0.726 +517 T 0.752 +518 R 0.761 +519 N 0.755 +520 S 0.745 +521 K 0.739 +522 K 0.736 +523 R 0.731 +524 L 0.724 +525 L 0.720 +526 P 0.725 +527 P 0.739 +528 L 0.750 +529 G 0.748 +530 N 0.733 +531 T 0.719 +532 P 0.722 +533 E 0.740 +534 E 0.755 +535 L 0.753 +536 I 0.736 +537 Q 0.716 +538 T 0.701 +539 K 0.692 +540 V 0.695 +541 P 0.710 +542 R 0.735 +543 V 0.752 +544 N 0.752 +545 R 0.745 +546 V 0.743 +547 E 0.744 +548 R 0.740 +549 K 0.730 +550 M 0.722 +551 S 0.715 +552 R 0.713 +553 N 0.711 +554 N 0.691 +555 K 0.646 +556 V 0.597 +557 S 0.573 +558 I 0.581 +559 F 0.608 +560 P 0.638 +561 K 0.644 +562 V 0.612 +563 D 0.554 +564 S 0.508 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040205.9_ENSMUST00000046611.9_GN:Cuzd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040205.9_ENSMUST00000046611.9_GN:Cuzd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..649512486e51c23a5d53a00fe156e03c69aca6cc --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040205.9_ENSMUST00000046611.9_GN:Cuzd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,608 @@ +>ENSMUSG00000040205.9|ENSMUST00000046611.9|GN:Cuzd1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.275 +2 E 0.271 +3 V 0.268 +4 T 0.265 +5 G 0.255 +6 R 0.238 +7 L 0.226 +8 F 0.220 +9 I 0.208 +10 W 0.196 +11 A 0.194 +12 I 0.199 +13 L 0.200 +14 A 0.206 +15 V 0.229 +16 S 0.274 +17 C 0.332 +18 G 0.388 +19 A 0.434 +20 Q 0.467 +21 L 0.487 +22 N 0.498 +23 S 0.511 +24 T 0.524 +25 E 0.526 +26 A 0.515 +27 E 0.493 +28 G 0.451 +29 K 0.379 +30 S 0.284 +31 R 0.194 +32 C 0.133 +33 T 0.108 +34 A 0.111 +35 S 0.129 +36 L 0.150 +37 G 0.167 +38 G 0.180 +39 A 0.185 +40 N 0.178 +41 L 0.157 +42 G 0.131 +43 E 0.109 +44 T 0.097 +45 H 0.096 +46 K 0.102 +47 A 0.111 +48 L 0.119 +49 V 0.123 +50 L 0.124 +51 Q 0.119 +52 L 0.110 +53 S 0.104 +54 A 0.103 +55 N 0.100 +56 E 0.089 +57 N 0.072 +58 C 0.057 +59 T 0.049 +60 W 0.051 +61 T 0.059 +62 I 0.065 +63 E 0.066 +64 R 0.066 +65 P 0.068 +66 E 0.071 +67 N 0.072 +68 R 0.069 +69 S 0.065 +70 I 0.064 +71 R 0.066 +72 I 0.066 +73 I 0.058 +74 F 0.044 +75 S 0.033 +76 Y 0.029 +77 I 0.033 +78 K 0.046 +79 L 0.068 +80 D 0.092 +81 P 0.111 +82 G 0.116 +83 S 0.111 +84 R 0.102 +85 C 0.094 +86 E 0.083 +87 T 0.066 +88 E 0.048 +89 N 0.036 +90 I 0.030 +91 K 0.032 +92 V 0.037 +93 F 0.044 +94 D 0.050 +95 G 0.056 +96 S 0.062 +97 S 0.067 +98 T 0.069 +99 S 0.071 +100 G 0.077 +101 P 0.084 +102 L 0.088 +103 L 0.084 +104 G 0.075 +105 K 0.066 +106 A 0.061 +107 C 0.060 +108 S 0.065 +109 R 0.076 +110 N 0.084 +111 D 0.085 +112 F 0.080 +113 V 0.068 +114 P 0.053 +115 V 0.040 +116 F 0.036 +117 E 0.039 +118 S 0.044 +119 S 0.045 +120 S 0.043 +121 N 0.040 +122 S 0.039 +123 M 0.039 +124 T 0.039 +125 F 0.040 +126 Q 0.042 +127 I 0.046 +128 V 0.057 +129 T 0.078 +130 G 0.103 +131 L 0.121 +132 T 0.129 +133 K 0.130 +134 F 0.127 +135 P 0.116 +136 R 0.100 +137 S 0.082 +138 V 0.064 +139 F 0.048 +140 I 0.035 +141 F 0.026 +142 Y 0.024 +143 Y 0.033 +144 F 0.058 +145 F 0.100 +146 S 0.152 +147 A 0.200 +148 A 0.238 +149 T 0.266 +150 V 0.278 +151 I 0.262 +152 P 0.218 +153 N 0.162 +154 C 0.119 +155 G 0.100 +156 G 0.098 +157 D 0.098 +158 L 0.088 +159 R 0.072 +160 A 0.062 +161 L 0.064 +162 E 0.076 +163 G 0.088 +164 S 0.095 +165 F 0.096 +166 S 0.094 +167 S 0.092 +168 P 0.086 +169 N 0.076 +170 Y 0.067 +171 P 0.067 +172 K 0.077 +173 P 0.088 +174 H 0.094 +175 P 0.094 +176 E 0.089 +177 L 0.085 +178 A 0.080 +179 Y 0.072 +180 C 0.061 +181 V 0.053 +182 W 0.051 +183 H 0.053 +184 I 0.056 +185 Q 0.060 +186 V 0.069 +187 G 0.078 +188 K 0.082 +189 G 0.077 +190 Y 0.069 +191 K 0.065 +192 I 0.066 +193 Q 0.069 +194 L 0.068 +195 K 0.063 +196 F 0.053 +197 T 0.041 +198 D 0.030 +199 L 0.022 +200 L 0.019 +201 L 0.020 +202 E 0.024 +203 M 0.029 +204 D 0.034 +205 E 0.040 +206 N 0.046 +207 C 0.049 +208 K 0.047 +209 F 0.039 +210 D 0.030 +211 F 0.023 +212 I 0.021 +213 A 0.022 +214 V 0.025 +215 Y 0.027 +216 D 0.030 +217 G 0.036 +218 P 0.042 +219 S 0.047 +220 T 0.047 +221 T 0.049 +222 A 0.057 +223 G 0.067 +224 L 0.072 +225 L 0.065 +226 K 0.052 +227 Q 0.041 +228 L 0.035 +229 C 0.037 +230 G 0.045 +231 R 0.057 +232 G 0.064 +233 K 0.060 +234 P 0.048 +235 T 0.038 +236 L 0.034 +237 E 0.035 +238 S 0.036 +239 S 0.036 +240 S 0.034 +241 D 0.034 +242 A 0.035 +243 M 0.037 +244 T 0.040 +245 V 0.042 +246 V 0.042 +247 L 0.041 +248 S 0.040 +249 T 0.042 +250 D 0.050 +251 Y 0.063 +252 A 0.077 +253 N 0.083 +254 S 0.078 +255 Y 0.067 +256 K 0.057 +257 G 0.049 +258 F 0.039 +259 S 0.031 +260 A 0.026 +261 S 0.024 +262 Y 0.027 +263 T 0.037 +264 S 0.058 +265 I 0.092 +266 Y 0.141 +267 I 0.198 +268 H 0.250 +269 D 0.279 +270 V 0.278 +271 N 0.243 +272 T 0.184 +273 T 0.119 +274 S 0.068 +275 L 0.038 +276 S 0.025 +277 C 0.021 +278 V 0.020 +279 S 0.018 +280 D 0.017 +281 K 0.017 +282 M 0.017 +283 R 0.018 +284 V 0.019 +285 I 0.020 +286 I 0.021 +287 S 0.024 +288 K 0.029 +289 S 0.038 +290 Y 0.049 +291 L 0.060 +292 P 0.069 +293 A 0.077 +294 L 0.086 +295 N 0.095 +296 Y 0.100 +297 N 0.097 +298 E 0.090 +299 S 0.081 +300 N 0.073 +301 L 0.070 +302 Q 0.071 +303 L 0.071 +304 N 0.069 +305 D 0.066 +306 P 0.061 +307 T 0.058 +308 C 0.062 +309 R 0.076 +310 P 0.091 +311 N 0.099 +312 V 0.094 +313 S 0.077 +314 N 0.058 +315 V 0.045 +316 I 0.037 +317 E 0.034 +318 F 0.036 +319 S 0.041 +320 I 0.044 +321 P 0.044 +322 L 0.043 +323 H 0.046 +324 E 0.051 +325 C 0.055 +326 G 0.057 +327 T 0.057 +328 V 0.059 +329 K 0.067 +330 K 0.084 +331 I 0.104 +332 E 0.114 +333 D 0.107 +334 H 0.090 +335 A 0.074 +336 I 0.066 +337 S 0.064 +338 Y 0.064 +339 T 0.065 +340 N 0.065 +341 R 0.065 +342 I 0.068 +343 T 0.081 +344 F 0.110 +345 I 0.161 +346 E 0.225 +347 S 0.285 +348 P 0.330 +349 V 0.358 +350 S 0.367 +351 A 0.358 +352 V 0.337 +353 I 0.319 +354 T 0.306 +355 R 0.290 +356 Q 0.261 +357 K 0.217 +358 L 0.167 +359 L 0.125 +360 Q 0.101 +361 I 0.090 +362 V 0.080 +363 V 0.069 +364 T 0.058 +365 C 0.055 +366 E 0.066 +367 M 0.090 +368 E 0.128 +369 Y 0.183 +370 N 0.244 +371 S 0.292 +372 T 0.313 +373 V 0.312 +374 E 0.301 +375 I 0.287 +376 M 0.266 +377 Y 0.241 +378 I 0.224 +379 T 0.227 +380 E 0.255 +381 D 0.303 +382 D 0.354 +383 I 0.387 +384 I 0.392 +385 Q 0.379 +386 N 0.360 +387 Q 0.342 +388 S 0.328 +389 V 0.315 +390 L 0.297 +391 G 0.266 +392 K 0.225 +393 Y 0.183 +394 N 0.144 +395 T 0.109 +396 S 0.079 +397 L 0.062 +398 A 0.060 +399 L 0.070 +400 Y 0.082 +401 E 0.089 +402 S 0.094 +403 D 0.098 +404 S 0.100 +405 F 0.100 +406 E 0.110 +407 N 0.130 +408 L 0.145 +409 V 0.145 +410 Q 0.132 +411 E 0.115 +412 S 0.100 +413 P 0.090 +414 Y 0.087 +415 Y 0.085 +416 V 0.088 +417 D 0.098 +418 L 0.114 +419 N 0.124 +420 Q 0.118 +421 T 0.100 +422 L 0.080 +423 F 0.068 +424 V 0.062 +425 Q 0.056 +426 A 0.049 +427 T 0.047 +428 L 0.052 +429 H 0.068 +430 T 0.093 +431 S 0.120 +432 D 0.137 +433 P 0.137 +434 S 0.122 +435 L 0.099 +436 V 0.075 +437 V 0.056 +438 F 0.043 +439 L 0.034 +440 D 0.027 +441 T 0.025 +442 C 0.029 +443 R 0.036 +444 A 0.044 +445 S 0.052 +446 P 0.058 +447 T 0.063 +448 S 0.067 +449 D 0.069 +450 F 0.068 +451 A 0.066 +452 S 0.064 +453 P 0.062 +454 T 0.059 +455 Y 0.059 +456 D 0.066 +457 L 0.080 +458 I 0.096 +459 S 0.107 +460 S 0.111 +461 G 0.111 +462 C 0.113 +463 C 0.117 +464 Q 0.121 +465 D 0.118 +466 E 0.110 +467 T 0.105 +468 C 0.108 +469 K 0.118 +470 V 0.128 +471 Y 0.135 +472 P 0.132 +473 L 0.117 +474 F 0.095 +475 G 0.075 +476 H 0.059 +477 Y 0.049 +478 G 0.042 +479 R 0.038 +480 F 0.037 +481 Q 0.040 +482 F 0.047 +483 N 0.056 +484 A 0.062 +485 F 0.064 +486 K 0.069 +487 F 0.081 +488 L 0.095 +489 K 0.101 +490 H 0.100 +491 L 0.097 +492 N 0.096 +493 S 0.093 +494 V 0.090 +495 Y 0.089 +496 L 0.095 +497 K 0.103 +498 C 0.105 +499 K 0.095 +500 I 0.078 +501 L 0.065 +502 I 0.064 +503 C 0.079 +504 D 0.105 +505 N 0.133 +506 N 0.153 +507 D 0.166 +508 Q 0.176 +509 T 0.184 +510 S 0.190 +511 R 0.196 +512 C 0.205 +513 N 0.212 +514 Q 0.212 +515 G 0.214 +516 C 0.233 +517 V 0.280 +518 P 0.339 +519 R 0.380 +520 R 0.392 +521 K 0.390 +522 R 0.393 +523 D 0.406 +524 I 0.411 +525 P 0.396 +526 S 0.361 +527 Y 0.314 +528 K 0.260 +529 W 0.206 +530 K 0.158 +531 T 0.123 +532 D 0.100 +533 S 0.087 +534 V 0.078 +535 I 0.068 +536 G 0.059 +537 P 0.058 +538 I 0.070 +539 R 0.101 +540 L 0.161 +541 K 0.258 +542 R 0.380 +543 D 0.501 +544 R 0.592 +545 S 0.649 +546 A 0.682 +547 S 0.700 +548 R 0.709 +549 D 0.712 +550 S 0.703 +551 G 0.683 +552 L 0.653 +553 L 0.612 +554 P 0.566 +555 Q 0.538 +556 I 0.537 +557 H 0.542 +558 E 0.558 +559 A 0.606 +560 E 0.660 +561 I 0.682 +562 S 0.672 +563 N 0.649 +564 Q 0.625 +565 P 0.605 +566 L 0.583 +567 S 0.548 +568 R 0.492 +569 L 0.422 +570 Y 0.364 +571 L 0.350 +572 F 0.375 +573 S 0.398 +574 F 0.395 +575 M 0.378 +576 V 0.367 +577 L 0.353 +578 A 0.335 +579 L 0.334 +580 N 0.346 +581 V 0.342 +582 V 0.317 +583 I 0.286 +584 V 0.255 +585 A 0.221 +586 I 0.185 +587 T 0.159 +588 T 0.152 +589 V 0.158 +590 K 0.158 +591 H 0.148 +592 F 0.139 +593 L 0.145 +594 N 0.155 +595 R 0.158 +596 W 0.153 +597 M 0.151 +598 D 0.159 +599 H 0.174 +600 R 0.192 +601 Y 0.211 +602 Q 0.228 +603 K 0.240 +604 L 0.250 +605 Q 0.260 +606 V 0.273 +607 Y 0.282 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040205.9_ENSMUST00000046611.9_GN:Cuzd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040205.9_ENSMUST00000046611.9_GN:Cuzd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6b459f493e5caabfa36bee77f894a2cd3aa4826e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040205.9_ENSMUST00000046611.9_GN:Cuzd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid @@ -0,0 +1,641 @@ +>ENSMUSG00000040205.9|ENSMUST00000046611.9|GN:Cuzd1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:33 +1 M 0.324 +2 A 0.331 +3 K 0.340 +4 L 0.348 +5 T 0.355 +6 R 0.369 +7 F 0.395 +8 P 0.410 +9 R 0.386 +10 Y 0.332 +11 Q 0.285 +12 E 0.263 +13 A 0.252 +14 Y 0.247 +15 K 0.259 +16 T 0.276 +17 R 0.281 +18 R 0.280 +19 I 0.282 +20 I 0.278 +21 R 0.270 +22 S 0.283 +23 L 0.313 +24 R 0.330 +25 V 0.329 +26 R 0.334 +27 A 0.348 +28 L 0.364 +29 R 0.388 +30 H 0.430 +31 P 0.476 +32 A 0.509 +33 K 0.532 +34 M 0.552 +35 E 0.564 +36 V 0.561 +37 T 0.541 +38 G 0.505 +39 R 0.458 +40 L 0.422 +41 F 0.406 +42 I 0.381 +43 W 0.334 +44 A 0.288 +45 I 0.266 +46 L 0.263 +47 A 0.268 +48 V 0.283 +49 S 0.319 +50 C 0.378 +51 G 0.443 +52 A 0.492 +53 Q 0.517 +54 L 0.523 +55 N 0.527 +56 S 0.546 +57 T 0.570 +58 E 0.580 +59 A 0.570 +60 E 0.543 +61 G 0.489 +62 K 0.401 +63 S 0.291 +64 R 0.192 +65 C 0.127 +66 T 0.102 +67 A 0.108 +68 S 0.129 +69 L 0.152 +70 G 0.172 +71 G 0.186 +72 A 0.191 +73 N 0.183 +74 L 0.160 +75 G 0.131 +76 E 0.107 +77 T 0.094 +78 H 0.091 +79 K 0.096 +80 A 0.103 +81 L 0.109 +82 V 0.113 +83 L 0.113 +84 Q 0.108 +85 L 0.100 +86 S 0.094 +87 A 0.093 +88 N 0.089 +89 E 0.080 +90 N 0.065 +91 C 0.052 +92 T 0.045 +93 W 0.046 +94 T 0.052 +95 I 0.057 +96 E 0.058 +97 R 0.058 +98 P 0.059 +99 E 0.062 +100 N 0.065 +101 R 0.064 +102 S 0.061 +103 I 0.060 +104 R 0.063 +105 I 0.063 +106 I 0.055 +107 F 0.042 +108 S 0.031 +109 Y 0.027 +110 I 0.031 +111 K 0.045 +112 L 0.066 +113 D 0.090 +114 P 0.108 +115 G 0.114 +116 S 0.109 +117 R 0.101 +118 C 0.093 +119 E 0.082 +120 T 0.065 +121 E 0.049 +122 N 0.037 +123 I 0.032 +124 K 0.033 +125 V 0.040 +126 F 0.047 +127 D 0.054 +128 G 0.060 +129 S 0.067 +130 S 0.071 +131 T 0.073 +132 S 0.075 +133 G 0.080 +134 P 0.086 +135 L 0.088 +136 L 0.084 +137 G 0.075 +138 K 0.067 +139 A 0.063 +140 C 0.063 +141 S 0.069 +142 R 0.080 +143 N 0.087 +144 D 0.088 +145 F 0.083 +146 V 0.071 +147 P 0.055 +148 V 0.041 +149 F 0.037 +150 E 0.039 +151 S 0.044 +152 S 0.046 +153 S 0.044 +154 N 0.041 +155 S 0.040 +156 M 0.040 +157 T 0.040 +158 F 0.040 +159 Q 0.043 +160 I 0.047 +161 V 0.057 +162 T 0.078 +163 G 0.102 +164 L 0.118 +165 T 0.124 +166 K 0.126 +167 F 0.123 +168 P 0.114 +169 R 0.100 +170 S 0.083 +171 V 0.066 +172 F 0.049 +173 I 0.036 +174 F 0.026 +175 Y 0.024 +176 Y 0.032 +177 F 0.056 +178 F 0.097 +179 S 0.145 +180 A 0.190 +181 A 0.226 +182 T 0.253 +183 V 0.264 +184 I 0.248 +185 P 0.205 +186 N 0.152 +187 C 0.111 +188 G 0.095 +189 G 0.094 +190 D 0.094 +191 L 0.084 +192 R 0.069 +193 A 0.059 +194 L 0.062 +195 E 0.074 +196 G 0.087 +197 S 0.093 +198 F 0.094 +199 S 0.092 +200 S 0.089 +201 P 0.083 +202 N 0.073 +203 Y 0.065 +204 P 0.065 +205 K 0.074 +206 P 0.085 +207 H 0.090 +208 P 0.089 +209 E 0.085 +210 L 0.081 +211 A 0.077 +212 Y 0.069 +213 C 0.059 +214 V 0.052 +215 W 0.051 +216 H 0.053 +217 I 0.056 +218 Q 0.060 +219 V 0.067 +220 G 0.077 +221 K 0.081 +222 G 0.076 +223 Y 0.070 +224 K 0.066 +225 I 0.067 +226 Q 0.070 +227 L 0.069 +228 K 0.063 +229 F 0.052 +230 T 0.040 +231 D 0.029 +232 L 0.021 +233 L 0.018 +234 L 0.019 +235 E 0.022 +236 M 0.027 +237 D 0.032 +238 E 0.038 +239 N 0.044 +240 C 0.047 +241 K 0.045 +242 F 0.037 +243 D 0.028 +244 F 0.022 +245 I 0.020 +246 A 0.022 +247 V 0.024 +248 Y 0.026 +249 D 0.029 +250 G 0.033 +251 P 0.039 +252 S 0.042 +253 T 0.043 +254 T 0.045 +255 A 0.054 +256 G 0.065 +257 L 0.070 +258 L 0.064 +259 K 0.052 +260 Q 0.041 +261 L 0.035 +262 C 0.037 +263 G 0.045 +264 R 0.057 +265 G 0.064 +266 K 0.060 +267 P 0.048 +268 T 0.038 +269 L 0.034 +270 E 0.035 +271 S 0.036 +272 S 0.036 +273 S 0.035 +274 D 0.034 +275 A 0.035 +276 M 0.037 +277 T 0.040 +278 V 0.042 +279 V 0.041 +280 L 0.040 +281 S 0.040 +282 T 0.042 +283 D 0.050 +284 Y 0.063 +285 A 0.078 +286 N 0.084 +287 S 0.079 +288 Y 0.068 +289 K 0.058 +290 G 0.049 +291 F 0.039 +292 S 0.031 +293 A 0.026 +294 S 0.024 +295 Y 0.027 +296 T 0.038 +297 S 0.059 +298 I 0.095 +299 Y 0.146 +300 I 0.207 +301 H 0.260 +302 D 0.291 +303 V 0.289 +304 N 0.254 +305 T 0.193 +306 T 0.125 +307 S 0.072 +308 L 0.040 +309 S 0.026 +310 C 0.022 +311 V 0.021 +312 S 0.020 +313 D 0.018 +314 K 0.017 +315 M 0.018 +316 R 0.018 +317 V 0.019 +318 I 0.021 +319 I 0.022 +320 S 0.025 +321 K 0.031 +322 S 0.041 +323 Y 0.054 +324 L 0.066 +325 P 0.075 +326 A 0.084 +327 L 0.094 +328 N 0.105 +329 Y 0.111 +330 N 0.109 +331 E 0.100 +332 S 0.089 +333 N 0.078 +334 L 0.073 +335 Q 0.073 +336 L 0.074 +337 N 0.072 +338 D 0.068 +339 P 0.063 +340 T 0.060 +341 C 0.065 +342 R 0.079 +343 P 0.095 +344 N 0.103 +345 V 0.097 +346 S 0.080 +347 N 0.061 +348 V 0.048 +349 I 0.040 +350 E 0.037 +351 F 0.038 +352 S 0.042 +353 I 0.046 +354 P 0.045 +355 L 0.044 +356 H 0.046 +357 E 0.051 +358 C 0.055 +359 G 0.057 +360 T 0.058 +361 V 0.058 +362 K 0.065 +363 K 0.081 +364 I 0.099 +365 E 0.109 +366 D 0.101 +367 H 0.085 +368 A 0.071 +369 I 0.064 +370 S 0.063 +371 Y 0.064 +372 T 0.065 +373 N 0.065 +374 R 0.065 +375 I 0.067 +376 T 0.078 +377 F 0.105 +378 I 0.152 +379 E 0.211 +380 S 0.267 +381 P 0.307 +382 V 0.330 +383 S 0.338 +384 A 0.329 +385 V 0.311 +386 I 0.295 +387 T 0.284 +388 R 0.268 +389 Q 0.242 +390 K 0.202 +391 L 0.155 +392 L 0.116 +393 Q 0.094 +394 I 0.083 +395 V 0.075 +396 V 0.064 +397 T 0.054 +398 C 0.051 +399 E 0.061 +400 M 0.085 +401 E 0.122 +402 Y 0.175 +403 N 0.233 +404 S 0.277 +405 T 0.295 +406 V 0.293 +407 E 0.283 +408 I 0.269 +409 M 0.250 +410 Y 0.227 +411 I 0.213 +412 T 0.218 +413 E 0.245 +414 D 0.290 +415 D 0.335 +416 I 0.364 +417 I 0.370 +418 Q 0.360 +419 N 0.345 +420 Q 0.330 +421 S 0.319 +422 V 0.309 +423 L 0.291 +424 G 0.261 +425 K 0.219 +426 Y 0.177 +427 N 0.139 +428 T 0.105 +429 S 0.076 +430 L 0.060 +431 A 0.059 +432 L 0.069 +433 Y 0.081 +434 E 0.087 +435 S 0.091 +436 D 0.096 +437 S 0.097 +438 F 0.098 +439 E 0.109 +440 N 0.129 +441 L 0.146 +442 V 0.146 +443 Q 0.134 +444 E 0.116 +445 S 0.100 +446 P 0.090 +447 Y 0.086 +448 Y 0.084 +449 V 0.086 +450 D 0.096 +451 L 0.113 +452 N 0.123 +453 Q 0.117 +454 T 0.099 +455 L 0.080 +456 F 0.068 +457 V 0.061 +458 Q 0.055 +459 A 0.049 +460 T 0.047 +461 L 0.053 +462 H 0.069 +463 T 0.094 +464 S 0.121 +465 D 0.139 +466 P 0.139 +467 S 0.124 +468 L 0.100 +469 V 0.076 +470 V 0.056 +471 F 0.043 +472 L 0.034 +473 D 0.028 +474 T 0.026 +475 C 0.029 +476 R 0.036 +477 A 0.045 +478 S 0.053 +479 P 0.059 +480 T 0.064 +481 S 0.068 +482 D 0.070 +483 F 0.069 +484 A 0.067 +485 S 0.065 +486 P 0.063 +487 T 0.060 +488 Y 0.060 +489 D 0.068 +490 L 0.083 +491 I 0.100 +492 S 0.111 +493 S 0.115 +494 G 0.115 +495 C 0.117 +496 C 0.121 +497 Q 0.124 +498 D 0.121 +499 E 0.113 +500 T 0.107 +501 C 0.110 +502 K 0.120 +503 V 0.131 +504 Y 0.137 +505 P 0.135 +506 L 0.121 +507 F 0.099 +508 G 0.078 +509 H 0.062 +510 Y 0.051 +511 G 0.043 +512 R 0.039 +513 F 0.038 +514 Q 0.041 +515 F 0.048 +516 N 0.056 +517 A 0.062 +518 F 0.064 +519 K 0.069 +520 F 0.082 +521 L 0.096 +522 K 0.102 +523 H 0.101 +524 L 0.098 +525 N 0.097 +526 S 0.095 +527 V 0.091 +528 Y 0.091 +529 L 0.096 +530 K 0.104 +531 C 0.105 +532 K 0.096 +533 I 0.079 +534 L 0.066 +535 I 0.064 +536 C 0.079 +537 D 0.106 +538 N 0.134 +539 N 0.154 +540 D 0.167 +541 Q 0.176 +542 T 0.183 +543 S 0.188 +544 R 0.195 +545 C 0.204 +546 N 0.211 +547 Q 0.211 +548 G 0.212 +549 C 0.232 +550 V 0.280 +551 P 0.339 +552 R 0.380 +553 R 0.392 +554 K 0.389 +555 R 0.393 +556 D 0.406 +557 I 0.411 +558 P 0.396 +559 S 0.361 +560 Y 0.314 +561 K 0.260 +562 W 0.206 +563 K 0.160 +564 T 0.125 +565 D 0.103 +566 S 0.090 +567 V 0.080 +568 I 0.069 +569 G 0.061 +570 P 0.059 +571 I 0.071 +572 R 0.102 +573 L 0.162 +574 K 0.258 +575 R 0.381 +576 D 0.500 +577 R 0.591 +578 S 0.648 +579 A 0.681 +580 S 0.699 +581 R 0.709 +582 D 0.712 +583 S 0.703 +584 G 0.683 +585 L 0.653 +586 L 0.612 +587 P 0.566 +588 Q 0.539 +589 I 0.538 +590 H 0.543 +591 E 0.560 +592 A 0.607 +593 E 0.660 +594 I 0.683 +595 S 0.673 +596 N 0.648 +597 Q 0.624 +598 P 0.603 +599 L 0.580 +600 S 0.542 +601 R 0.482 +602 L 0.409 +603 Y 0.350 +604 L 0.331 +605 F 0.351 +606 S 0.374 +607 F 0.376 +608 M 0.366 +609 V 0.359 +610 L 0.348 +611 A 0.332 +612 L 0.332 +613 N 0.343 +614 V 0.339 +615 V 0.313 +616 I 0.280 +617 V 0.246 +618 A 0.211 +619 I 0.176 +620 T 0.151 +621 T 0.144 +622 V 0.149 +623 K 0.150 +624 H 0.139 +625 F 0.130 +626 L 0.135 +627 N 0.146 +628 R 0.148 +629 W 0.143 +630 M 0.141 +631 D 0.149 +632 H 0.163 +633 R 0.179 +634 Y 0.196 +635 Q 0.210 +636 K 0.220 +637 L 0.228 +638 Q 0.236 +639 V 0.245 +640 Y 0.252 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040302.18_ENSMUST00000042753.14_GN:Rbm48_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040302.18_ENSMUST00000042753.14_GN:Rbm48_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..10b14a4b7a9927b6a9767f32b32ca00dd47e1b74 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040302.18_ENSMUST00000042753.14_GN:Rbm48_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,372 @@ +>ENSMUSG00000040302.18|ENSMUST00000042753.14|GN:Rbm48|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.462 +2 A 0.493 +3 S 0.541 +4 S 0.585 +5 D 0.615 +6 G 0.630 +7 K 0.643 +8 P 0.656 +9 G 0.660 +10 G 0.639 +11 V 0.586 +12 F 0.507 +13 D 0.430 +14 H 0.379 +15 H 0.355 +16 V 0.342 +17 Q 0.326 +18 T 0.307 +19 A 0.291 +20 V 0.282 +21 C 0.277 +22 D 0.272 +23 S 0.264 +24 R 0.255 +25 A 0.253 +26 K 0.263 +27 Y 0.276 +28 R 0.291 +29 E 0.318 +30 G 0.367 +31 R 0.430 +32 R 0.491 +33 P 0.541 +34 R 0.583 +35 A 0.614 +36 V 0.622 +37 K 0.603 +38 V 0.566 +39 Y 0.511 +40 T 0.437 +41 I 0.357 +42 N 0.286 +43 L 0.223 +44 E 0.163 +45 S 0.108 +46 Q 0.067 +47 Y 0.042 +48 L 0.032 +49 L 0.033 +50 I 0.041 +51 Q 0.053 +52 G 0.063 +53 V 0.067 +54 P 0.066 +55 A 0.067 +56 V 0.072 +57 G 0.071 +58 A 0.059 +59 M 0.043 +60 K 0.030 +61 E 0.026 +62 L 0.033 +63 V 0.046 +64 E 0.056 +65 R 0.052 +66 F 0.043 +67 A 0.036 +68 L 0.035 +69 Y 0.036 +70 G 0.040 +71 A 0.042 +72 I 0.038 +73 E 0.030 +74 Q 0.023 +75 Y 0.024 +76 N 0.035 +77 A 0.054 +78 L 0.077 +79 D 0.099 +80 E 0.117 +81 Y 0.131 +82 P 0.144 +83 A 0.156 +84 E 0.161 +85 D 0.148 +86 F 0.118 +87 T 0.082 +88 E 0.050 +89 V 0.028 +90 Y 0.017 +91 L 0.016 +92 I 0.023 +93 K 0.033 +94 F 0.043 +95 V 0.046 +96 K 0.045 +97 L 0.045 +98 Q 0.044 +99 S 0.042 +100 A 0.040 +101 R 0.041 +102 V 0.046 +103 A 0.052 +104 K 0.055 +105 K 0.052 +106 K 0.048 +107 M 0.046 +108 D 0.044 +109 E 0.042 +110 Q 0.041 +111 S 0.042 +112 F 0.047 +113 F 0.060 +114 G 0.079 +115 G 0.092 +116 L 0.092 +117 L 0.081 +118 H 0.067 +119 V 0.060 +120 C 0.066 +121 Y 0.087 +122 A 0.113 +123 P 0.128 +124 E 0.125 +125 F 0.108 +126 E 0.089 +127 T 0.076 +128 V 0.071 +129 E 0.071 +130 E 0.074 +131 T 0.080 +132 R 0.090 +133 K 0.101 +134 K 0.107 +135 L 0.112 +136 Q 0.116 +137 E 0.122 +138 R 0.129 +139 K 0.133 +140 A 0.131 +141 Y 0.124 +142 I 0.123 +143 T 0.135 +144 R 0.155 +145 V 0.181 +146 T 0.213 +147 K 0.255 +148 N 0.300 +149 Q 0.341 +150 D 0.374 +151 C 0.397 +152 Y 0.416 +153 M 0.441 +154 A 0.471 +155 K 0.498 +156 K 0.522 +157 K 0.554 +158 P 0.595 +159 V 0.640 +160 P 0.685 +161 E 0.724 +162 Q 0.757 +163 K 0.780 +164 G 0.794 +165 T 0.800 +166 K 0.800 +167 D 0.797 +168 S 0.793 +169 R 0.785 +170 Q 0.771 +171 G 0.748 +172 F 0.722 +173 H 0.705 +174 P 0.709 +175 P 0.731 +176 M 0.764 +177 P 0.796 +178 G 0.818 +179 F 0.818 +180 G 0.780 +181 T 0.718 +182 A 0.687 +183 A 0.725 +184 L 0.791 +185 N 0.830 +186 T 0.835 +187 S 0.827 +188 P 0.817 +189 E 0.808 +190 S 0.801 +191 P 0.803 +192 P 0.818 +193 E 0.839 +194 N 0.854 +195 S 0.857 +196 S 0.850 +197 S 0.839 +198 C 0.828 +199 L 0.822 +200 P 0.822 +201 Y 0.822 +202 S 0.813 +203 C 0.797 +204 E 0.781 +205 F 0.773 +206 P 0.775 +207 L 0.783 +208 S 0.794 +209 C 0.809 +210 F 0.824 +211 A 0.835 +212 S 0.842 +213 K 0.846 +214 S 0.846 +215 T 0.845 +216 C 0.843 +217 S 0.843 +218 R 0.844 +219 G 0.845 +220 E 0.848 +221 H 0.851 +222 V 0.851 +223 D 0.850 +224 R 0.850 +225 V 0.848 +226 S 0.843 +227 D 0.834 +228 S 0.812 +229 C 0.762 +230 N 0.694 +231 S 0.660 +232 A 0.694 +233 R 0.759 +234 N 0.803 +235 H 0.818 +236 G 0.822 +237 E 0.824 +238 L 0.822 +239 S 0.819 +240 R 0.816 +241 H 0.813 +242 R 0.809 +243 D 0.805 +244 H 0.799 +245 S 0.790 +246 A 0.778 +247 F 0.767 +248 S 0.768 +249 P 0.783 +250 K 0.806 +251 L 0.827 +252 Q 0.836 +253 M 0.835 +254 N 0.824 +255 T 0.809 +256 Y 0.795 +257 K 0.784 +258 N 0.774 +259 S 0.768 +260 V 0.768 +261 P 0.769 +262 C 0.772 +263 S 0.774 +264 S 0.770 +265 V 0.753 +266 Q 0.733 +267 E 0.728 +268 A 0.740 +269 I 0.753 +270 A 0.762 +271 T 0.772 +272 S 0.778 +273 Q 0.778 +274 A 0.774 +275 V 0.769 +276 G 0.760 +277 R 0.739 +278 F 0.706 +279 M 0.671 +280 P 0.648 +281 R 0.633 +282 T 0.609 +283 T 0.567 +284 Q 0.522 +285 L 0.496 +286 Q 0.490 +287 E 0.493 +288 R 0.508 +289 K 0.544 +290 R 0.590 +291 R 0.622 +292 R 0.633 +293 D 0.631 +294 C 0.620 +295 D 0.600 +296 R 0.586 +297 E 0.596 +298 L 0.635 +299 G 0.687 +300 T 0.725 +301 L 0.733 +302 L 0.720 +303 E 0.703 +304 T 0.695 +305 H 0.698 +306 T 0.710 +307 S 0.726 +308 S 0.745 +309 N 0.764 +310 E 0.780 +311 V 0.784 +312 L 0.775 +313 I 0.758 +314 G 0.744 +315 P 0.740 +316 K 0.747 +317 L 0.760 +318 P 0.775 +319 G 0.789 +320 I 0.798 +321 P 0.805 +322 T 0.812 +323 V 0.816 +324 D 0.812 +325 L 0.800 +326 Q 0.785 +327 D 0.769 +328 D 0.756 +329 S 0.740 +330 L 0.705 +331 N 0.645 +332 T 0.572 +333 T 0.503 +334 A 0.448 +335 T 0.410 +336 L 0.389 +337 I 0.369 +338 R 0.340 +339 R 0.327 +340 K 0.356 +341 L 0.407 +342 K 0.454 +343 E 0.501 +344 V 0.545 +345 I 0.569 +346 S 0.569 +347 S 0.569 +348 V 0.579 +349 P 0.603 +350 K 0.639 +351 P 0.680 +352 P 0.721 +353 E 0.758 +354 D 0.784 +355 N 0.797 +356 I 0.802 +357 K 0.804 +358 D 0.803 +359 V 0.795 +360 C 0.775 +361 T 0.748 +362 S 0.724 +363 H 0.717 +364 P 0.731 +365 G 0.754 +366 K 0.769 +367 Q 0.770 +368 R 0.753 +369 R 0.716 +370 R 0.658 +371 I 0.609 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040302.18_ENSMUST00000042753.14_GN:Rbm48_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:42.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040302.18_ENSMUST00000042753.14_GN:Rbm48_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:42.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e76424c0e9ecd0a3b5ba2a7c5bacf582399105a8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040302.18_ENSMUST00000042753.14_GN:Rbm48_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:42.caid @@ -0,0 +1,414 @@ +>ENSMUSG00000040302.18|ENSMUST00000042753.14|GN:Rbm48|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:42 +1 M 0.434 +2 I 0.483 +3 V 0.552 +4 D 0.608 +5 G 0.630 +6 V 0.620 +7 D 0.585 +8 P 0.541 +9 S 0.524 +10 A 0.547 +11 N 0.571 +12 P 0.559 +13 S 0.545 +14 T 0.575 +15 P 0.638 +16 G 0.697 +17 P 0.735 +18 S 0.751 +19 C 0.754 +20 S 0.753 +21 L 0.753 +22 I 0.752 +23 G 0.746 +24 L 0.736 +25 R 0.725 +26 G 0.706 +27 A 0.674 +28 R 0.646 +29 L 0.638 +30 A 0.652 +31 D 0.673 +32 V 0.687 +33 V 0.694 +34 L 0.701 +35 A 0.715 +36 R 0.733 +37 G 0.749 +38 T 0.761 +39 R 0.773 +40 A 0.788 +41 G 0.800 +42 K 0.803 +43 M 0.800 +44 A 0.793 +45 S 0.784 +46 S 0.771 +47 D 0.755 +48 G 0.742 +49 K 0.738 +50 P 0.744 +51 G 0.753 +52 G 0.749 +53 V 0.721 +54 F 0.670 +55 D 0.616 +56 H 0.577 +57 H 0.554 +58 V 0.540 +59 Q 0.527 +60 T 0.503 +61 A 0.469 +62 V 0.438 +63 C 0.414 +64 D 0.393 +65 S 0.371 +66 R 0.353 +67 A 0.346 +68 K 0.353 +69 Y 0.364 +70 R 0.379 +71 E 0.406 +72 G 0.455 +73 R 0.516 +74 R 0.576 +75 P 0.623 +76 R 0.660 +77 A 0.681 +78 V 0.677 +79 K 0.648 +80 V 0.600 +81 Y 0.535 +82 T 0.453 +83 I 0.367 +84 N 0.291 +85 L 0.224 +86 E 0.162 +87 S 0.106 +88 Q 0.065 +89 Y 0.041 +90 L 0.033 +91 L 0.034 +92 I 0.042 +93 Q 0.053 +94 G 0.062 +95 V 0.065 +96 P 0.063 +97 A 0.063 +98 V 0.067 +99 G 0.066 +100 A 0.055 +101 M 0.040 +102 K 0.028 +103 E 0.025 +104 L 0.032 +105 V 0.045 +106 E 0.054 +107 R 0.051 +108 F 0.041 +109 A 0.034 +110 L 0.032 +111 Y 0.034 +112 G 0.037 +113 A 0.039 +114 I 0.036 +115 E 0.029 +116 Q 0.023 +117 Y 0.024 +118 N 0.034 +119 A 0.053 +120 L 0.076 +121 D 0.098 +122 E 0.117 +123 Y 0.131 +124 P 0.143 +125 A 0.153 +126 E 0.156 +127 D 0.143 +128 F 0.115 +129 T 0.082 +130 E 0.051 +131 V 0.028 +132 Y 0.017 +133 L 0.016 +134 I 0.023 +135 K 0.034 +136 F 0.044 +137 V 0.047 +138 K 0.046 +139 L 0.045 +140 Q 0.044 +141 S 0.042 +142 A 0.040 +143 R 0.040 +144 V 0.045 +145 A 0.051 +146 K 0.053 +147 K 0.051 +148 K 0.047 +149 M 0.046 +150 D 0.044 +151 E 0.043 +152 Q 0.042 +153 S 0.043 +154 F 0.048 +155 F 0.061 +156 G 0.080 +157 G 0.093 +158 L 0.093 +159 L 0.081 +160 H 0.066 +161 V 0.060 +162 C 0.067 +163 Y 0.089 +164 A 0.115 +165 P 0.131 +166 E 0.128 +167 F 0.112 +168 E 0.093 +169 T 0.079 +170 V 0.074 +171 E 0.074 +172 E 0.076 +173 T 0.082 +174 R 0.092 +175 K 0.103 +176 K 0.109 +177 L 0.113 +178 Q 0.117 +179 E 0.122 +180 R 0.128 +181 K 0.132 +182 A 0.129 +183 Y 0.123 +184 I 0.124 +185 T 0.136 +186 R 0.157 +187 V 0.184 +188 T 0.218 +189 K 0.258 +190 N 0.298 +191 Q 0.336 +192 D 0.366 +193 C 0.389 +194 Y 0.407 +195 M 0.430 +196 A 0.458 +197 K 0.487 +198 K 0.516 +199 K 0.553 +200 P 0.597 +201 V 0.646 +202 P 0.692 +203 E 0.731 +204 Q 0.763 +205 K 0.786 +206 G 0.800 +207 T 0.805 +208 K 0.805 +209 D 0.802 +210 S 0.798 +211 R 0.790 +212 Q 0.776 +213 G 0.754 +214 F 0.730 +215 H 0.715 +216 P 0.719 +217 P 0.741 +218 M 0.772 +219 P 0.802 +220 G 0.822 +221 F 0.821 +222 G 0.783 +223 T 0.720 +224 A 0.688 +225 A 0.725 +226 L 0.792 +227 N 0.832 +228 T 0.838 +229 S 0.829 +230 P 0.819 +231 E 0.809 +232 S 0.803 +233 P 0.804 +234 P 0.817 +235 E 0.838 +236 N 0.853 +237 S 0.856 +238 S 0.849 +239 S 0.837 +240 C 0.827 +241 L 0.823 +242 P 0.823 +243 Y 0.822 +244 S 0.813 +245 C 0.796 +246 E 0.780 +247 F 0.773 +248 P 0.774 +249 L 0.781 +250 S 0.790 +251 C 0.802 +252 F 0.816 +253 A 0.828 +254 S 0.835 +255 K 0.839 +256 S 0.840 +257 T 0.839 +258 C 0.839 +259 S 0.840 +260 R 0.842 +261 G 0.843 +262 E 0.846 +263 H 0.849 +264 V 0.850 +265 D 0.849 +266 R 0.848 +267 V 0.846 +268 S 0.841 +269 D 0.832 +270 S 0.810 +271 C 0.760 +272 N 0.692 +273 S 0.657 +274 A 0.691 +275 R 0.755 +276 N 0.800 +277 H 0.816 +278 G 0.820 +279 E 0.820 +280 L 0.819 +281 S 0.816 +282 R 0.813 +283 H 0.810 +284 R 0.808 +285 D 0.805 +286 H 0.800 +287 S 0.792 +288 A 0.780 +289 F 0.770 +290 S 0.771 +291 P 0.785 +292 K 0.809 +293 L 0.830 +294 Q 0.841 +295 M 0.842 +296 N 0.834 +297 T 0.821 +298 Y 0.808 +299 K 0.797 +300 N 0.790 +301 S 0.786 +302 V 0.787 +303 P 0.791 +304 C 0.797 +305 S 0.799 +306 S 0.793 +307 V 0.775 +308 Q 0.756 +309 E 0.752 +310 A 0.765 +311 I 0.781 +312 A 0.792 +313 T 0.800 +314 S 0.803 +315 Q 0.798 +316 A 0.792 +317 V 0.788 +318 G 0.781 +319 R 0.764 +320 F 0.736 +321 M 0.707 +322 P 0.686 +323 R 0.670 +324 T 0.645 +325 T 0.601 +326 Q 0.552 +327 L 0.520 +328 Q 0.509 +329 E 0.508 +330 R 0.519 +331 K 0.550 +332 R 0.595 +333 R 0.630 +334 R 0.646 +335 D 0.652 +336 C 0.649 +337 D 0.635 +338 R 0.624 +339 E 0.635 +340 L 0.671 +341 G 0.717 +342 T 0.748 +343 L 0.753 +344 L 0.740 +345 E 0.724 +346 T 0.715 +347 H 0.718 +348 T 0.728 +349 S 0.743 +350 S 0.760 +351 N 0.778 +352 E 0.793 +353 V 0.797 +354 L 0.789 +355 I 0.773 +356 G 0.760 +357 P 0.756 +358 K 0.761 +359 L 0.772 +360 P 0.785 +361 G 0.796 +362 I 0.802 +363 P 0.807 +364 T 0.813 +365 V 0.817 +366 D 0.815 +367 L 0.805 +368 Q 0.790 +369 D 0.774 +370 D 0.760 +371 S 0.741 +372 L 0.704 +373 N 0.644 +374 T 0.574 +375 T 0.508 +376 A 0.451 +377 T 0.410 +378 L 0.389 +379 I 0.373 +380 R 0.348 +381 R 0.338 +382 K 0.370 +383 L 0.424 +384 K 0.472 +385 E 0.516 +386 V 0.557 +387 I 0.580 +388 S 0.581 +389 S 0.581 +390 V 0.590 +391 P 0.612 +392 K 0.646 +393 P 0.687 +394 P 0.728 +395 E 0.763 +396 D 0.788 +397 N 0.801 +398 I 0.805 +399 K 0.807 +400 D 0.805 +401 V 0.796 +402 C 0.776 +403 T 0.747 +404 S 0.723 +405 H 0.715 +406 P 0.729 +407 G 0.752 +408 K 0.767 +409 Q 0.768 +410 R 0.751 +411 R 0.713 +412 R 0.656 +413 I 0.608 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040521.12_ENSMUST00000040560.11_GN:Tsfm_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040521.12_ENSMUST00000040560.11_GN:Tsfm_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..fcb6968dc5fdb8b152947ae462bcffb73f3aca87 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040521.12_ENSMUST00000040560.11_GN:Tsfm_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,325 @@ +>ENSMUSG00000040521.12|ENSMUST00000040560.11|GN:Tsfm|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.391 +2 S 0.404 +3 L 0.420 +4 L 0.420 +5 R 0.397 +6 S 0.376 +7 L 0.386 +8 R 0.421 +9 F 0.464 +10 F 0.504 +11 P 0.526 +12 V 0.519 +13 A 0.512 +14 C 0.540 +15 T 0.585 +16 G 0.616 +17 R 0.623 +18 S 0.606 +19 A 0.571 +20 R 0.554 +21 A 0.581 +22 V 0.623 +23 L 0.639 +24 L 0.630 +25 Q 0.618 +26 P 0.608 +27 S 0.600 +28 Q 0.597 +29 P 0.598 +30 W 0.593 +31 L 0.583 +32 T 0.574 +33 F 0.574 +34 H 0.585 +35 A 0.604 +36 G 0.630 +37 P 0.655 +38 S 0.671 +39 L 0.669 +40 S 0.648 +41 S 0.612 +42 A 0.559 +43 A 0.479 +44 S 0.364 +45 S 0.236 +46 K 0.132 +47 E 0.072 +48 L 0.047 +49 L 0.038 +50 M 0.038 +51 K 0.047 +52 L 0.059 +53 R 0.066 +54 R 0.070 +55 K 0.076 +56 T 0.085 +57 G 0.088 +58 Y 0.078 +59 S 0.060 +60 F 0.047 +61 V 0.044 +62 N 0.046 +63 C 0.047 +64 K 0.045 +65 K 0.048 +66 A 0.057 +67 L 0.063 +68 E 0.063 +69 T 0.065 +70 C 0.078 +71 G 0.091 +72 G 0.092 +73 D 0.080 +74 L 0.064 +75 K 0.052 +76 Q 0.048 +77 A 0.054 +78 E 0.069 +79 D 0.082 +80 W 0.090 +81 L 0.097 +82 H 0.106 +83 K 0.116 +84 Q 0.126 +85 A 0.139 +86 Q 0.148 +87 K 0.149 +88 E 0.146 +89 G 0.145 +90 W 0.142 +91 S 0.135 +92 K 0.127 +93 A 0.122 +94 A 0.124 +95 K 0.132 +96 L 0.138 +97 H 0.131 +98 G 0.116 +99 R 0.101 +100 K 0.090 +101 T 0.078 +102 K 0.066 +103 E 0.058 +104 G 0.053 +105 L 0.049 +106 I 0.043 +107 G 0.040 +108 L 0.038 +109 L 0.039 +110 Q 0.041 +111 E 0.043 +112 G 0.044 +113 N 0.046 +114 T 0.047 +115 A 0.046 +116 V 0.042 +117 L 0.036 +118 V 0.031 +119 E 0.030 +120 V 0.035 +121 N 0.046 +122 C 0.061 +123 E 0.071 +124 T 0.073 +125 D 0.070 +126 F 0.069 +127 V 0.068 +128 S 0.063 +129 R 0.057 +130 N 0.052 +131 L 0.050 +132 K 0.051 +133 F 0.051 +134 Q 0.050 +135 Q 0.048 +136 L 0.048 +137 V 0.047 +138 Q 0.048 +139 Q 0.051 +140 V 0.053 +141 A 0.053 +142 L 0.050 +143 G 0.047 +144 T 0.043 +145 M 0.039 +146 A 0.036 +147 H 0.035 +148 C 0.037 +149 Q 0.045 +150 N 0.059 +151 L 0.077 +152 T 0.093 +153 D 0.099 +154 R 0.099 +155 L 0.095 +156 S 0.089 +157 T 0.083 +158 Y 0.080 +159 S 0.078 +160 K 0.079 +161 G 0.080 +162 F 0.076 +163 L 0.068 +164 N 0.059 +165 S 0.054 +166 S 0.054 +167 E 0.060 +168 L 0.069 +169 S 0.078 +170 E 0.087 +171 L 0.093 +172 A 0.095 +173 A 0.095 +174 G 0.101 +175 P 0.116 +176 D 0.132 +177 R 0.136 +178 E 0.125 +179 G 0.105 +180 S 0.084 +181 L 0.065 +182 K 0.053 +183 D 0.053 +184 Q 0.059 +185 L 0.064 +186 A 0.062 +187 L 0.055 +188 A 0.049 +189 I 0.047 +190 G 0.049 +191 K 0.054 +192 L 0.060 +193 G 0.066 +194 E 0.068 +195 N 0.066 +196 M 0.060 +197 I 0.052 +198 L 0.045 +199 K 0.038 +200 R 0.032 +201 A 0.028 +202 A 0.028 +203 W 0.030 +204 V 0.034 +205 K 0.041 +206 V 0.048 +207 P 0.053 +208 S 0.053 +209 G 0.049 +210 F 0.044 +211 Y 0.042 +212 V 0.043 +213 G 0.046 +214 S 0.052 +215 Y 0.063 +216 V 0.080 +217 H 0.100 +218 G 0.118 +219 V 0.132 +220 T 0.139 +221 Q 0.142 +222 S 0.140 +223 P 0.130 +224 S 0.118 +225 L 0.110 +226 Q 0.106 +227 N 0.101 +228 L 0.090 +229 V 0.077 +230 L 0.068 +231 G 0.065 +232 K 0.060 +233 Y 0.053 +234 G 0.048 +235 A 0.048 +236 L 0.051 +237 V 0.055 +238 I 0.060 +239 C 0.065 +240 E 0.072 +241 T 0.082 +242 P 0.097 +243 E 0.112 +244 Q 0.120 +245 I 0.118 +246 A 0.108 +247 N 0.094 +248 L 0.078 +249 E 0.066 +250 E 0.058 +251 V 0.056 +252 G 0.061 +253 R 0.071 +254 R 0.078 +255 L 0.078 +256 G 0.074 +257 Q 0.072 +258 H 0.076 +259 V 0.083 +260 V 0.090 +261 G 0.096 +262 M 0.102 +263 A 0.110 +264 P 0.119 +265 L 0.133 +266 S 0.154 +267 V 0.175 +268 G 0.192 +269 S 0.208 +270 L 0.230 +271 D 0.256 +272 D 0.283 +273 E 0.311 +274 P 0.339 +275 G 0.365 +276 G 0.378 +277 E 0.362 +278 T 0.316 +279 E 0.262 +280 T 0.222 +281 R 0.202 +282 M 0.196 +283 L 0.195 +284 P 0.188 +285 Q 0.170 +286 P 0.144 +287 Y 0.117 +288 L 0.095 +289 L 0.081 +290 D 0.076 +291 P 0.075 +292 S 0.073 +293 I 0.070 +294 T 0.068 +295 L 0.068 +296 G 0.067 +297 Q 0.068 +298 Y 0.067 +299 V 0.064 +300 Q 0.060 +301 P 0.061 +302 Q 0.062 +303 G 0.062 +304 V 0.062 +305 T 0.070 +306 V 0.087 +307 V 0.104 +308 D 0.110 +309 F 0.104 +310 V 0.097 +311 R 0.095 +312 F 0.101 +313 E 0.119 +314 C 0.154 +315 G 0.211 +316 E 0.286 +317 D 0.370 +318 E 0.453 +319 Q 0.526 +320 V 0.584 +321 A 0.617 +322 E 0.617 +323 A 0.584 +324 E 0.550 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040521.12_ENSMUST00000040560.11_GN:Tsfm_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040521.12_ENSMUST00000040560.11_GN:Tsfm_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7eb93d6656911729cac314957674743988387dcc --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040521.12_ENSMUST00000040560.11_GN:Tsfm_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid @@ -0,0 +1,332 @@ +>ENSMUSG00000040521.12|ENSMUST00000040560.11|GN:Tsfm|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:7 +1 M 0.449 +2 G 0.464 +3 G 0.484 +4 R 0.491 +5 A 0.479 +6 R 0.479 +7 G 0.510 +8 M 0.550 +9 S 0.566 +10 L 0.550 +11 L 0.503 +12 R 0.438 +13 S 0.391 +14 L 0.388 +15 R 0.417 +16 F 0.462 +17 F 0.522 +18 P 0.585 +19 V 0.631 +20 A 0.654 +21 C 0.663 +22 T 0.668 +23 G 0.672 +24 R 0.667 +25 S 0.640 +26 A 0.593 +27 R 0.563 +28 A 0.583 +29 V 0.621 +30 L 0.638 +31 L 0.632 +32 Q 0.621 +33 P 0.613 +34 S 0.607 +35 Q 0.605 +36 P 0.609 +37 W 0.609 +38 L 0.601 +39 T 0.592 +40 F 0.590 +41 H 0.597 +42 A 0.612 +43 G 0.635 +44 P 0.660 +45 S 0.676 +46 L 0.675 +47 S 0.655 +48 S 0.620 +49 A 0.568 +50 A 0.486 +51 S 0.369 +52 S 0.239 +53 K 0.133 +54 E 0.073 +55 L 0.048 +56 L 0.039 +57 M 0.039 +58 K 0.048 +59 L 0.060 +60 R 0.067 +61 R 0.070 +62 K 0.075 +63 T 0.084 +64 G 0.087 +65 Y 0.077 +66 S 0.059 +67 F 0.046 +68 V 0.043 +69 N 0.045 +70 C 0.045 +71 K 0.044 +72 K 0.047 +73 A 0.056 +74 L 0.063 +75 E 0.062 +76 T 0.064 +77 C 0.076 +78 G 0.089 +79 G 0.090 +80 D 0.078 +81 L 0.063 +82 K 0.051 +83 Q 0.047 +84 A 0.054 +85 E 0.068 +86 D 0.081 +87 W 0.089 +88 L 0.096 +89 H 0.105 +90 K 0.114 +91 Q 0.124 +92 A 0.136 +93 Q 0.144 +94 K 0.145 +95 E 0.142 +96 G 0.141 +97 W 0.137 +98 S 0.131 +99 K 0.124 +100 A 0.120 +101 A 0.122 +102 K 0.129 +103 L 0.135 +104 H 0.129 +105 G 0.114 +106 R 0.100 +107 K 0.090 +108 T 0.078 +109 K 0.066 +110 E 0.058 +111 G 0.053 +112 L 0.048 +113 I 0.043 +114 G 0.039 +115 L 0.038 +116 L 0.040 +117 Q 0.041 +118 E 0.043 +119 G 0.044 +120 N 0.046 +121 T 0.047 +122 A 0.046 +123 V 0.042 +124 L 0.036 +125 V 0.031 +126 E 0.030 +127 V 0.035 +128 N 0.046 +129 C 0.061 +130 E 0.072 +131 T 0.073 +132 D 0.071 +133 F 0.069 +134 V 0.068 +135 S 0.064 +136 R 0.057 +137 N 0.052 +138 L 0.050 +139 K 0.051 +140 F 0.051 +141 Q 0.050 +142 Q 0.048 +143 L 0.047 +144 V 0.047 +145 Q 0.048 +146 Q 0.051 +147 V 0.053 +148 A 0.052 +149 L 0.049 +150 G 0.046 +151 T 0.043 +152 M 0.039 +153 A 0.035 +154 H 0.034 +155 C 0.037 +156 Q 0.045 +157 N 0.059 +158 L 0.077 +159 T 0.093 +160 D 0.099 +161 R 0.098 +162 L 0.094 +163 S 0.088 +164 T 0.082 +165 Y 0.078 +166 S 0.077 +167 K 0.078 +168 G 0.079 +169 F 0.076 +170 L 0.068 +171 N 0.059 +172 S 0.053 +173 S 0.053 +174 E 0.059 +175 L 0.068 +176 S 0.077 +177 E 0.086 +178 L 0.092 +179 A 0.094 +180 A 0.094 +181 G 0.100 +182 P 0.116 +183 D 0.131 +184 R 0.135 +185 E 0.123 +186 G 0.103 +187 S 0.082 +188 L 0.064 +189 K 0.053 +190 D 0.052 +191 Q 0.059 +192 L 0.064 +193 A 0.061 +194 L 0.055 +195 A 0.049 +196 I 0.047 +197 G 0.049 +198 K 0.054 +199 L 0.060 +200 G 0.065 +201 E 0.067 +202 N 0.065 +203 M 0.059 +204 I 0.051 +205 L 0.044 +206 K 0.037 +207 R 0.031 +208 A 0.028 +209 A 0.027 +210 W 0.029 +211 V 0.034 +212 K 0.040 +213 V 0.047 +214 P 0.052 +215 S 0.053 +216 G 0.049 +217 F 0.044 +218 Y 0.041 +219 V 0.042 +220 G 0.045 +221 S 0.051 +222 Y 0.062 +223 V 0.079 +224 H 0.099 +225 G 0.117 +226 V 0.130 +227 T 0.138 +228 Q 0.141 +229 S 0.138 +230 P 0.128 +231 S 0.115 +232 L 0.107 +233 Q 0.104 +234 N 0.099 +235 L 0.088 +236 V 0.075 +237 L 0.067 +238 G 0.063 +239 K 0.059 +240 Y 0.052 +241 G 0.047 +242 A 0.047 +243 L 0.051 +244 V 0.055 +245 I 0.059 +246 C 0.064 +247 E 0.071 +248 T 0.082 +249 P 0.097 +250 E 0.112 +251 Q 0.121 +252 I 0.119 +253 A 0.108 +254 N 0.094 +255 L 0.078 +256 E 0.066 +257 E 0.058 +258 V 0.056 +259 G 0.061 +260 R 0.070 +261 R 0.078 +262 L 0.078 +263 G 0.073 +264 Q 0.072 +265 H 0.075 +266 V 0.082 +267 V 0.089 +268 G 0.096 +269 M 0.102 +270 A 0.110 +271 P 0.119 +272 L 0.134 +273 S 0.154 +274 V 0.176 +275 G 0.192 +276 S 0.209 +277 L 0.231 +278 D 0.258 +279 D 0.286 +280 E 0.314 +281 P 0.342 +282 G 0.368 +283 G 0.382 +284 E 0.366 +285 T 0.319 +286 E 0.264 +287 T 0.223 +288 R 0.203 +289 M 0.197 +290 L 0.196 +291 P 0.188 +292 Q 0.170 +293 P 0.145 +294 Y 0.118 +295 L 0.095 +296 L 0.081 +297 D 0.076 +298 P 0.075 +299 S 0.073 +300 I 0.070 +301 T 0.069 +302 L 0.068 +303 G 0.068 +304 Q 0.068 +305 Y 0.067 +306 V 0.064 +307 Q 0.061 +308 P 0.061 +309 Q 0.063 +310 G 0.062 +311 V 0.062 +312 T 0.070 +313 V 0.087 +314 V 0.103 +315 D 0.109 +316 F 0.104 +317 V 0.096 +318 R 0.095 +319 F 0.101 +320 E 0.119 +321 C 0.155 +322 G 0.212 +323 E 0.286 +324 D 0.370 +325 E 0.454 +326 Q 0.528 +327 V 0.586 +328 A 0.619 +329 E 0.619 +330 A 0.587 +331 E 0.553 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040596.17_ENSMUST00000131487.9_GN:Pogk_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040596.17_ENSMUST00000131487.9_GN:Pogk_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..968d3d88467ca6f0c8f8bb9fe02bcf1982df24a6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040596.17_ENSMUST00000131487.9_GN:Pogk_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,608 @@ +>ENSMUSG00000040596.17|ENSMUST00000131487.9|GN:Pogk|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.348 +2 E 0.356 +3 S 0.372 +4 R 0.398 +5 A 0.431 +6 Y 0.467 +7 P 0.497 +8 L 0.510 +9 N 0.500 +10 L 0.471 +11 T 0.422 +12 L 0.354 +13 K 0.293 +14 E 0.267 +15 E 0.273 +16 Q 0.287 +17 K 0.310 +18 E 0.354 +19 E 0.411 +20 E 0.463 +21 V 0.499 +22 E 0.507 +23 I 0.486 +24 Q 0.464 +25 E 0.470 +26 L 0.488 +27 E 0.492 +28 D 0.491 +29 G 0.500 +30 P 0.508 +31 I 0.496 +32 D 0.477 +33 M 0.481 +34 Q 0.524 +35 K 0.589 +36 V 0.641 +37 Q 0.665 +38 I 0.664 +39 C 0.650 +40 S 0.627 +41 E 0.595 +42 G 0.546 +43 A 0.473 +44 W 0.388 +45 V 0.320 +46 P 0.275 +47 A 0.235 +48 L 0.195 +49 F 0.169 +50 D 0.169 +51 E 0.183 +52 V 0.189 +53 A 0.177 +54 I 0.154 +55 Y 0.136 +56 F 0.131 +57 S 0.136 +58 D 0.146 +59 E 0.156 +60 E 0.153 +61 W 0.140 +62 E 0.138 +63 V 0.151 +64 L 0.159 +65 T 0.143 +66 E 0.118 +67 Q 0.101 +68 Q 0.094 +69 K 0.093 +70 A 0.101 +71 L 0.116 +72 Y 0.125 +73 R 0.124 +74 E 0.127 +75 V 0.138 +76 M 0.140 +77 R 0.122 +78 M 0.098 +79 N 0.084 +80 Y 0.076 +81 E 0.071 +82 T 0.072 +83 V 0.077 +84 L 0.088 +85 S 0.102 +86 L 0.112 +87 E 0.114 +88 F 0.115 +89 P 0.120 +90 F 0.130 +91 P 0.135 +92 K 0.129 +93 P 0.115 +94 D 0.101 +95 M 0.092 +96 I 0.091 +97 N 0.098 +98 R 0.115 +99 L 0.140 +100 E 0.170 +101 R 0.204 +102 D 0.241 +103 E 0.279 +104 E 0.316 +105 C 0.348 +106 P 0.373 +107 N 0.390 +108 S 0.395 +109 D 0.389 +110 E 0.382 +111 W 0.391 +112 R 0.431 +113 L 0.498 +114 Q 0.566 +115 G 0.614 +116 V 0.641 +117 T 0.658 +118 F 0.677 +119 A 0.696 +120 E 0.709 +121 N 0.715 +122 E 0.712 +123 E 0.703 +124 S 0.689 +125 D 0.671 +126 F 0.650 +127 R 0.632 +128 T 0.624 +129 P 0.625 +130 D 0.626 +131 W 0.628 +132 A 0.641 +133 S 0.665 +134 P 0.695 +135 T 0.725 +136 N 0.748 +137 A 0.748 +138 T 0.724 +139 S 0.687 +140 H 0.650 +141 F 0.623 +142 P 0.614 +143 Q 0.622 +144 P 0.642 +145 Q 0.668 +146 P 0.691 +147 F 0.704 +148 N 0.703 +149 S 0.690 +150 F 0.677 +151 G 0.671 +152 L 0.664 +153 R 0.642 +154 L 0.604 +155 P 0.561 +156 Q 0.538 +157 D 0.543 +158 I 0.559 +159 T 0.572 +160 E 0.585 +161 L 0.597 +162 P 0.590 +163 E 0.559 +164 W 0.529 +165 T 0.527 +166 E 0.549 +167 G 0.568 +168 Y 0.570 +169 P 0.557 +170 F 0.543 +171 Y 0.541 +172 M 0.550 +173 A 0.553 +174 M 0.541 +175 G 0.531 +176 F 0.548 +177 P 0.582 +178 G 0.606 +179 Y 0.589 +180 D 0.527 +181 L 0.442 +182 S 0.374 +183 A 0.350 +184 D 0.354 +185 D 0.348 +186 L 0.317 +187 A 0.283 +188 S 0.272 +189 K 0.287 +190 F 0.319 +191 Q 0.360 +192 F 0.400 +193 S 0.426 +194 R 0.426 +195 G 0.398 +196 M 0.344 +197 R 0.273 +198 R 0.201 +199 S 0.141 +200 Y 0.097 +201 D 0.071 +202 A 0.058 +203 G 0.050 +204 F 0.040 +205 K 0.033 +206 L 0.030 +207 M 0.032 +208 V 0.035 +209 V 0.035 +210 E 0.033 +211 Y 0.030 +212 A 0.029 +213 E 0.031 +214 S 0.034 +215 T 0.038 +216 N 0.040 +217 N 0.042 +218 C 0.047 +219 Q 0.060 +220 A 0.079 +221 A 0.093 +222 K 0.093 +223 Q 0.084 +224 F 0.077 +225 G 0.070 +226 V 0.058 +227 L 0.042 +228 E 0.028 +229 K 0.020 +230 N 0.016 +231 V 0.016 +232 R 0.016 +233 D 0.018 +234 W 0.020 +235 R 0.023 +236 K 0.024 +237 V 0.026 +238 K 0.030 +239 P 0.039 +240 Q 0.051 +241 L 0.066 +242 Q 0.087 +243 N 0.115 +244 A 0.140 +245 H 0.149 +246 A 0.143 +247 M 0.138 +248 R 0.147 +249 R 0.170 +250 A 0.207 +251 F 0.253 +252 R 0.308 +253 G 0.359 +254 P 0.381 +255 K 0.360 +256 N 0.308 +257 G 0.246 +258 R 0.187 +259 F 0.139 +260 A 0.103 +261 L 0.078 +262 V 0.063 +263 D 0.054 +264 Q 0.045 +265 R 0.036 +266 V 0.030 +267 A 0.027 +268 E 0.025 +269 Y 0.024 +270 V 0.024 +271 R 0.026 +272 Y 0.030 +273 M 0.039 +274 Q 0.052 +275 A 0.069 +276 K 0.089 +277 G 0.104 +278 D 0.107 +279 P 0.096 +280 I 0.075 +281 T 0.053 +282 R 0.039 +283 E 0.032 +284 A 0.033 +285 M 0.041 +286 Q 0.052 +287 L 0.057 +288 K 0.054 +289 A 0.053 +290 L 0.061 +291 E 0.066 +292 I 0.062 +293 A 0.054 +294 Q 0.050 +295 E 0.052 +296 M 0.064 +297 N 0.085 +298 I 0.105 +299 P 0.113 +300 E 0.107 +301 K 0.095 +302 G 0.085 +303 F 0.079 +304 K 0.071 +305 A 0.059 +306 S 0.047 +307 L 0.039 +308 G 0.036 +309 W 0.033 +310 C 0.027 +311 R 0.022 +312 R 0.022 +313 M 0.026 +314 M 0.032 +315 R 0.039 +316 R 0.051 +317 Y 0.077 +318 D 0.120 +319 L 0.178 +320 S 0.242 +321 L 0.303 +322 R 0.353 +323 H 0.385 +324 K 0.387 +325 V 0.362 +326 P 0.326 +327 V 0.295 +328 P 0.274 +329 Q 0.255 +330 H 0.232 +331 L 0.205 +332 A 0.172 +333 E 0.136 +334 D 0.104 +335 L 0.084 +336 T 0.070 +337 E 0.061 +338 K 0.056 +339 L 0.054 +340 V 0.051 +341 T 0.049 +342 Y 0.052 +343 Q 0.059 +344 Q 0.062 +345 S 0.058 +346 V 0.054 +347 L 0.061 +348 A 0.068 +349 L 0.065 +350 R 0.057 +351 R 0.056 +352 T 0.065 +353 H 0.075 +354 D 0.077 +355 Y 0.073 +356 E 0.065 +357 V 0.058 +358 A 0.052 +359 Q 0.044 +360 M 0.036 +361 G 0.029 +362 N 0.028 +363 A 0.036 +364 D 0.055 +365 E 0.084 +366 T 0.109 +367 P 0.123 +368 I 0.133 +369 C 0.156 +370 L 0.209 +371 E 0.294 +372 V 0.396 +373 P 0.487 +374 S 0.551 +375 R 0.597 +376 V 0.636 +377 T 0.664 +378 V 0.676 +379 D 0.677 +380 N 0.677 +381 Q 0.665 +382 G 0.631 +383 E 0.592 +384 K 0.573 +385 P 0.568 +386 I 0.552 +387 L 0.512 +388 V 0.454 +389 K 0.397 +390 T 0.356 +391 P 0.330 +392 G 0.309 +393 R 0.285 +394 E 0.249 +395 K 0.202 +396 L 0.154 +397 R 0.118 +398 I 0.093 +399 T 0.076 +400 A 0.063 +401 M 0.054 +402 L 0.048 +403 G 0.044 +404 V 0.047 +405 L 0.060 +406 A 0.081 +407 D 0.100 +408 G 0.108 +409 R 0.102 +410 K 0.094 +411 L 0.090 +412 P 0.084 +413 P 0.071 +414 Y 0.059 +415 I 0.056 +416 I 0.061 +417 L 0.067 +418 R 0.073 +419 G 0.081 +420 T 0.094 +421 Y 0.111 +422 I 0.126 +423 P 0.138 +424 P 0.151 +425 G 0.164 +426 K 0.169 +427 F 0.161 +428 P 0.142 +429 S 0.118 +430 G 0.100 +431 M 0.090 +432 E 0.085 +433 I 0.081 +434 R 0.081 +435 C 0.082 +436 H 0.078 +437 R 0.070 +438 Y 0.064 +439 G 0.063 +440 W 0.065 +441 M 0.063 +442 T 0.060 +443 E 0.056 +444 D 0.053 +445 L 0.051 +446 M 0.048 +447 Q 0.044 +448 D 0.042 +449 W 0.041 +450 L 0.042 +451 E 0.045 +452 V 0.046 +453 V 0.043 +454 W 0.037 +455 R 0.037 +456 R 0.048 +457 R 0.070 +458 T 0.103 +459 G 0.139 +460 A 0.170 +461 V 0.181 +462 P 0.169 +463 R 0.140 +464 Q 0.108 +465 R 0.080 +466 G 0.059 +467 M 0.045 +468 L 0.039 +469 I 0.040 +470 L 0.047 +471 N 0.060 +472 G 0.076 +473 F 0.085 +474 R 0.086 +475 C 0.085 +476 H 0.083 +477 A 0.077 +478 T 0.069 +479 D 0.064 +480 S 0.067 +481 V 0.078 +482 K 0.090 +483 S 0.095 +484 S 0.089 +485 M 0.083 +486 E 0.082 +487 N 0.085 +488 M 0.087 +489 N 0.089 +490 T 0.087 +491 D 0.081 +492 M 0.079 +493 V 0.086 +494 I 0.099 +495 I 0.114 +496 P 0.123 +497 G 0.126 +498 G 0.125 +499 L 0.123 +500 T 0.119 +501 S 0.109 +502 Q 0.093 +503 L 0.080 +504 Q 0.079 +505 V 0.086 +506 L 0.094 +507 D 0.098 +508 V 0.101 +509 V 0.102 +510 V 0.093 +511 Y 0.079 +512 K 0.071 +513 P 0.068 +514 L 0.067 +515 N 0.064 +516 D 0.060 +517 S 0.059 +518 V 0.063 +519 R 0.068 +520 A 0.069 +521 Q 0.070 +522 Y 0.074 +523 S 0.080 +524 N 0.081 +525 W 0.080 +526 L 0.084 +527 L 0.097 +528 A 0.123 +529 G 0.155 +530 N 0.184 +531 L 0.205 +532 A 0.221 +533 L 0.237 +534 S 0.254 +535 P 0.269 +536 T 0.281 +537 G 0.286 +538 N 0.282 +539 A 0.266 +540 K 0.241 +541 K 0.215 +542 P 0.188 +543 P 0.155 +544 L 0.123 +545 G 0.104 +546 L 0.094 +547 F 0.086 +548 L 0.076 +549 E 0.068 +550 W 0.067 +551 I 0.067 +552 M 0.067 +553 V 0.067 +554 A 0.071 +555 W 0.078 +556 N 0.091 +557 S 0.106 +558 I 0.114 +559 S 0.108 +560 S 0.098 +561 E 0.092 +562 S 0.089 +563 I 0.087 +564 V 0.087 +565 Q 0.089 +566 G 0.092 +567 F 0.093 +568 R 0.092 +569 K 0.088 +570 C 0.083 +571 H 0.082 +572 I 0.093 +573 S 0.122 +574 S 0.161 +575 N 0.200 +576 L 0.242 +577 E 0.298 +578 D 0.367 +579 E 0.423 +580 G 0.449 +581 D 0.453 +582 V 0.444 +583 L 0.424 +584 W 0.405 +585 E 0.407 +586 I 0.424 +587 E 0.435 +588 G 0.428 +589 E 0.417 +590 L 0.422 +591 P 0.444 +592 K 0.471 +593 E 0.496 +594 P 0.524 +595 P 0.559 +596 K 0.599 +597 E 0.634 +598 C 0.656 +599 G 0.677 +600 P 0.706 +601 E 0.736 +602 S 0.753 +603 V 0.752 +604 A 0.734 +605 E 0.697 +606 G 0.646 +607 D 0.604 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040596.17_ENSMUST00000131487.9_GN:Pogk_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040596.17_ENSMUST00000131487.9_GN:Pogk_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c728a02fc9f34bcae52290e30ab24bfc54fe142d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000040596.17_ENSMUST00000131487.9_GN:Pogk_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid @@ -0,0 +1,615 @@ +>ENSMUSG00000040596.17|ENSMUST00000131487.9|GN:Pogk|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:7 +1 M 0.365 +2 N 0.381 +3 L 0.408 +4 E 0.438 +5 N 0.464 +6 P 0.475 +7 E 0.475 +8 M 0.471 +9 E 0.462 +10 S 0.454 +11 R 0.460 +12 A 0.480 +13 Y 0.506 +14 P 0.530 +15 L 0.542 +16 N 0.539 +17 L 0.514 +18 T 0.464 +19 L 0.396 +20 K 0.342 +21 E 0.322 +22 E 0.322 +23 Q 0.325 +24 K 0.344 +25 E 0.394 +26 E 0.458 +27 E 0.506 +28 V 0.528 +29 E 0.518 +30 I 0.482 +31 Q 0.453 +32 E 0.457 +33 L 0.474 +34 E 0.480 +35 D 0.486 +36 G 0.504 +37 P 0.518 +38 I 0.513 +39 D 0.505 +40 M 0.521 +41 Q 0.574 +42 K 0.640 +43 V 0.688 +44 Q 0.705 +45 I 0.700 +46 C 0.682 +47 S 0.657 +48 E 0.623 +49 G 0.571 +50 A 0.492 +51 W 0.402 +52 V 0.330 +53 P 0.282 +54 A 0.241 +55 L 0.199 +56 F 0.173 +57 D 0.172 +58 E 0.184 +59 V 0.189 +60 A 0.175 +61 I 0.151 +62 Y 0.133 +63 F 0.128 +64 S 0.134 +65 D 0.145 +66 E 0.155 +67 E 0.152 +68 W 0.139 +69 E 0.137 +70 V 0.150 +71 L 0.158 +72 T 0.141 +73 E 0.116 +74 Q 0.099 +75 Q 0.093 +76 K 0.094 +77 A 0.103 +78 L 0.116 +79 Y 0.123 +80 R 0.122 +81 E 0.123 +82 V 0.134 +83 M 0.137 +84 R 0.120 +85 M 0.097 +86 N 0.082 +87 Y 0.074 +88 E 0.070 +89 T 0.070 +90 V 0.076 +91 L 0.087 +92 S 0.100 +93 L 0.110 +94 E 0.113 +95 F 0.113 +96 P 0.119 +97 F 0.129 +98 P 0.135 +99 K 0.129 +100 P 0.115 +101 D 0.100 +102 M 0.091 +103 I 0.090 +104 N 0.097 +105 R 0.113 +106 L 0.138 +107 E 0.167 +108 R 0.200 +109 D 0.236 +110 E 0.273 +111 E 0.309 +112 C 0.339 +113 P 0.363 +114 N 0.380 +115 S 0.386 +116 D 0.381 +117 E 0.374 +118 W 0.383 +119 R 0.423 +120 L 0.490 +121 Q 0.560 +122 G 0.611 +123 V 0.640 +124 T 0.658 +125 F 0.678 +126 A 0.697 +127 E 0.710 +128 N 0.715 +129 E 0.712 +130 E 0.703 +131 S 0.690 +132 D 0.673 +133 F 0.652 +134 R 0.635 +135 T 0.628 +136 P 0.629 +137 D 0.630 +138 W 0.632 +139 A 0.646 +140 S 0.671 +141 P 0.700 +142 T 0.731 +143 N 0.753 +144 A 0.753 +145 T 0.728 +146 S 0.691 +147 H 0.654 +148 F 0.627 +149 P 0.618 +150 Q 0.627 +151 P 0.647 +152 Q 0.672 +153 P 0.695 +154 F 0.708 +155 N 0.706 +156 S 0.693 +157 F 0.680 +158 G 0.675 +159 L 0.667 +160 R 0.646 +161 L 0.607 +162 P 0.564 +163 Q 0.539 +164 D 0.543 +165 I 0.558 +166 T 0.571 +167 E 0.585 +168 L 0.596 +169 P 0.589 +170 E 0.557 +171 W 0.526 +172 T 0.524 +173 E 0.546 +174 G 0.567 +175 Y 0.569 +176 P 0.556 +177 F 0.542 +178 Y 0.540 +179 M 0.550 +180 A 0.554 +181 M 0.543 +182 G 0.534 +183 F 0.550 +184 P 0.585 +185 G 0.607 +186 Y 0.589 +187 D 0.526 +188 L 0.439 +189 S 0.370 +190 A 0.346 +191 D 0.350 +192 D 0.345 +193 L 0.316 +194 A 0.283 +195 S 0.271 +196 K 0.287 +197 F 0.318 +198 Q 0.358 +199 F 0.399 +200 S 0.425 +201 R 0.424 +202 G 0.396 +203 M 0.342 +204 R 0.270 +205 R 0.199 +206 S 0.140 +207 Y 0.096 +208 D 0.071 +209 A 0.059 +210 G 0.050 +211 F 0.040 +212 K 0.033 +213 L 0.030 +214 M 0.032 +215 V 0.035 +216 V 0.035 +217 E 0.033 +218 Y 0.030 +219 A 0.029 +220 E 0.031 +221 S 0.034 +222 T 0.037 +223 N 0.039 +224 N 0.041 +225 C 0.047 +226 Q 0.060 +227 A 0.079 +228 A 0.093 +229 K 0.093 +230 Q 0.084 +231 F 0.076 +232 G 0.070 +233 V 0.058 +234 L 0.041 +235 E 0.027 +236 K 0.019 +237 N 0.016 +238 V 0.016 +239 R 0.016 +240 D 0.018 +241 W 0.020 +242 R 0.023 +243 K 0.024 +244 V 0.025 +245 K 0.030 +246 P 0.039 +247 Q 0.051 +248 L 0.066 +249 Q 0.087 +250 N 0.114 +251 A 0.139 +252 H 0.148 +253 A 0.143 +254 M 0.138 +255 R 0.147 +256 R 0.170 +257 A 0.207 +258 F 0.255 +259 R 0.310 +260 G 0.361 +261 P 0.382 +262 K 0.361 +263 N 0.309 +264 G 0.247 +265 R 0.188 +266 F 0.140 +267 A 0.104 +268 L 0.079 +269 V 0.063 +270 D 0.054 +271 Q 0.045 +272 R 0.036 +273 V 0.030 +274 A 0.027 +275 E 0.025 +276 Y 0.024 +277 V 0.025 +278 R 0.026 +279 Y 0.030 +280 M 0.039 +281 Q 0.052 +282 A 0.069 +283 K 0.090 +284 G 0.106 +285 D 0.109 +286 P 0.097 +287 I 0.076 +288 T 0.054 +289 R 0.039 +290 E 0.033 +291 A 0.034 +292 M 0.042 +293 Q 0.053 +294 L 0.058 +295 K 0.054 +296 A 0.054 +297 L 0.061 +298 E 0.067 +299 I 0.063 +300 A 0.055 +301 Q 0.051 +302 E 0.053 +303 M 0.065 +304 N 0.087 +305 I 0.108 +306 P 0.115 +307 E 0.109 +308 K 0.096 +309 G 0.086 +310 F 0.079 +311 K 0.071 +312 A 0.060 +313 S 0.047 +314 L 0.039 +315 G 0.036 +316 W 0.033 +317 C 0.027 +318 R 0.023 +319 R 0.022 +320 M 0.027 +321 M 0.033 +322 R 0.039 +323 R 0.052 +324 Y 0.077 +325 D 0.121 +326 L 0.178 +327 S 0.242 +328 L 0.303 +329 R 0.354 +330 H 0.385 +331 K 0.387 +332 V 0.362 +333 P 0.326 +334 V 0.295 +335 P 0.275 +336 Q 0.256 +337 H 0.233 +338 L 0.205 +339 A 0.173 +340 E 0.136 +341 D 0.105 +342 L 0.084 +343 T 0.071 +344 E 0.061 +345 K 0.056 +346 L 0.054 +347 V 0.051 +348 T 0.049 +349 Y 0.052 +350 Q 0.059 +351 Q 0.062 +352 S 0.058 +353 V 0.055 +354 L 0.061 +355 A 0.069 +356 L 0.066 +357 R 0.057 +358 R 0.056 +359 T 0.065 +360 H 0.075 +361 D 0.077 +362 Y 0.073 +363 E 0.065 +364 V 0.058 +365 A 0.052 +366 Q 0.044 +367 M 0.036 +368 G 0.030 +369 N 0.028 +370 A 0.036 +371 D 0.055 +372 E 0.084 +373 T 0.109 +374 P 0.123 +375 I 0.132 +376 C 0.156 +377 L 0.209 +378 E 0.293 +379 V 0.395 +380 P 0.486 +381 S 0.550 +382 R 0.596 +383 V 0.635 +384 T 0.663 +385 V 0.674 +386 D 0.675 +387 N 0.675 +388 Q 0.664 +389 G 0.630 +390 E 0.591 +391 K 0.571 +392 P 0.567 +393 I 0.551 +394 L 0.511 +395 V 0.453 +396 K 0.396 +397 T 0.355 +398 P 0.329 +399 G 0.309 +400 R 0.284 +401 E 0.249 +402 K 0.201 +403 L 0.154 +404 R 0.118 +405 I 0.094 +406 T 0.076 +407 A 0.063 +408 M 0.054 +409 L 0.048 +410 G 0.044 +411 V 0.047 +412 L 0.060 +413 A 0.081 +414 D 0.100 +415 G 0.108 +416 R 0.102 +417 K 0.094 +418 L 0.090 +419 P 0.084 +420 P 0.071 +421 Y 0.059 +422 I 0.056 +423 I 0.061 +424 L 0.067 +425 R 0.073 +426 G 0.081 +427 T 0.094 +428 Y 0.111 +429 I 0.125 +430 P 0.138 +431 P 0.151 +432 G 0.163 +433 K 0.168 +434 F 0.161 +435 P 0.142 +436 S 0.118 +437 G 0.100 +438 M 0.091 +439 E 0.085 +440 I 0.081 +441 R 0.081 +442 C 0.082 +443 H 0.078 +444 R 0.070 +445 Y 0.064 +446 G 0.064 +447 W 0.065 +448 M 0.063 +449 T 0.060 +450 E 0.056 +451 D 0.053 +452 L 0.051 +453 M 0.048 +454 Q 0.044 +455 D 0.042 +456 W 0.041 +457 L 0.042 +458 E 0.045 +459 V 0.046 +460 V 0.042 +461 W 0.037 +462 R 0.037 +463 R 0.048 +464 R 0.070 +465 T 0.103 +466 G 0.140 +467 A 0.170 +468 V 0.182 +469 P 0.169 +470 R 0.141 +471 Q 0.108 +472 R 0.081 +473 G 0.059 +474 M 0.045 +475 L 0.039 +476 I 0.040 +477 L 0.047 +478 N 0.060 +479 G 0.076 +480 F 0.085 +481 R 0.087 +482 C 0.086 +483 H 0.083 +484 A 0.077 +485 T 0.069 +486 D 0.064 +487 S 0.067 +488 V 0.078 +489 K 0.090 +490 S 0.095 +491 S 0.089 +492 M 0.083 +493 E 0.082 +494 N 0.085 +495 M 0.088 +496 N 0.089 +497 T 0.087 +498 D 0.081 +499 M 0.079 +500 V 0.086 +501 I 0.099 +502 I 0.114 +503 P 0.124 +504 G 0.126 +505 G 0.125 +506 L 0.123 +507 T 0.120 +508 S 0.109 +509 Q 0.093 +510 L 0.080 +511 Q 0.079 +512 V 0.087 +513 L 0.094 +514 D 0.098 +515 V 0.102 +516 V 0.102 +517 V 0.093 +518 Y 0.080 +519 K 0.071 +520 P 0.068 +521 L 0.067 +522 N 0.064 +523 D 0.060 +524 S 0.059 +525 V 0.065 +526 R 0.072 +527 A 0.074 +528 Q 0.074 +529 Y 0.076 +530 S 0.080 +531 N 0.082 +532 W 0.080 +533 L 0.083 +534 L 0.097 +535 A 0.123 +536 G 0.155 +537 N 0.183 +538 L 0.204 +539 A 0.221 +540 L 0.237 +541 S 0.253 +542 P 0.269 +543 T 0.281 +544 G 0.286 +545 N 0.282 +546 A 0.266 +547 K 0.241 +548 K 0.215 +549 P 0.188 +550 P 0.155 +551 L 0.123 +552 G 0.104 +553 L 0.095 +554 F 0.086 +555 L 0.076 +556 E 0.068 +557 W 0.067 +558 I 0.068 +559 M 0.067 +560 V 0.067 +561 A 0.071 +562 W 0.078 +563 N 0.091 +564 S 0.106 +565 I 0.114 +566 S 0.108 +567 S 0.098 +568 E 0.092 +569 S 0.089 +570 I 0.087 +571 V 0.087 +572 Q 0.089 +573 G 0.092 +574 F 0.093 +575 R 0.092 +576 K 0.088 +577 C 0.083 +578 H 0.082 +579 I 0.093 +580 S 0.122 +581 S 0.161 +582 N 0.201 +583 L 0.243 +584 E 0.299 +585 D 0.368 +586 E 0.425 +587 G 0.451 +588 D 0.455 +589 V 0.446 +590 L 0.425 +591 W 0.406 +592 E 0.407 +593 I 0.424 +594 E 0.434 +595 G 0.427 +596 E 0.416 +597 L 0.422 +598 P 0.444 +599 K 0.471 +600 E 0.496 +601 P 0.523 +602 P 0.558 +603 K 0.598 +604 E 0.632 +605 C 0.655 +606 G 0.675 +607 P 0.704 +608 E 0.735 +609 S 0.753 +610 V 0.751 +611 A 0.732 +612 E 0.695 +613 G 0.642 +614 D 0.600 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000041536.14_ENSMUST00000185595.7_GN:Serpina3a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000041536.14_ENSMUST00000185595.7_GN:Serpina3a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c98ba415e883457be6ad8d1d92e8ed9365448843 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000041536.14_ENSMUST00000185595.7_GN:Serpina3a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,423 @@ +>ENSMUSG00000041536.14|ENSMUST00000185595.7|GN:Serpina3a|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.267 +2 A 0.273 +3 F 0.284 +4 I 0.288 +5 A 0.279 +6 A 0.270 +7 L 0.286 +8 G 0.321 +9 L 0.349 +10 L 0.364 +11 M 0.383 +12 A 0.407 +13 G 0.424 +14 I 0.430 +15 C 0.421 +16 P 0.391 +17 A 0.346 +18 I 0.305 +19 T 0.284 +20 Y 0.278 +21 W 0.284 +22 A 0.307 +23 T 0.350 +24 A 0.410 +25 D 0.471 +26 G 0.519 +27 Q 0.554 +28 L 0.581 +29 G 0.594 +30 R 0.586 +31 H 0.563 +32 T 0.536 +33 E 0.507 +34 V 0.473 +35 Q 0.444 +36 K 0.429 +37 D 0.424 +38 R 0.424 +39 D 0.429 +40 H 0.440 +41 E 0.442 +42 I 0.415 +43 Q 0.353 +44 L 0.274 +45 D 0.199 +46 S 0.140 +47 V 0.099 +48 T 0.075 +49 L 0.064 +50 A 0.059 +51 S 0.057 +52 I 0.053 +53 N 0.049 +54 T 0.044 +55 D 0.040 +56 F 0.037 +57 A 0.034 +58 F 0.033 +59 S 0.035 +60 L 0.036 +61 Y 0.035 +62 K 0.034 +63 K 0.035 +64 L 0.040 +65 A 0.048 +66 L 0.057 +67 K 0.067 +68 N 0.075 +69 P 0.078 +70 H 0.077 +71 K 0.075 +72 N 0.075 +73 I 0.074 +74 V 0.072 +75 F 0.069 +76 S 0.067 +77 P 0.063 +78 L 0.059 +79 S 0.056 +80 I 0.052 +81 S 0.051 +82 A 0.051 +83 A 0.052 +84 L 0.056 +85 A 0.064 +86 L 0.072 +87 M 0.074 +88 S 0.075 +89 L 0.081 +90 G 0.095 +91 A 0.109 +92 K 0.113 +93 D 0.109 +94 N 0.105 +95 T 0.103 +96 L 0.102 +97 E 0.098 +98 E 0.089 +99 I 0.079 +100 L 0.070 +101 E 0.062 +102 G 0.054 +103 L 0.048 +104 K 0.049 +105 F 0.059 +106 N 0.071 +107 L 0.080 +108 T 0.085 +109 E 0.089 +110 T 0.089 +111 P 0.086 +112 E 0.079 +113 A 0.072 +114 D 0.065 +115 I 0.056 +116 H 0.048 +117 Q 0.042 +118 N 0.039 +119 F 0.037 +120 G 0.035 +121 H 0.032 +122 L 0.030 +123 L 0.031 +124 Q 0.033 +125 M 0.040 +126 L 0.054 +127 I 0.078 +128 Q 0.109 +129 P 0.141 +130 E 0.161 +131 N 0.159 +132 Q 0.139 +133 V 0.114 +134 Q 0.092 +135 I 0.075 +136 N 0.059 +137 A 0.046 +138 G 0.036 +139 N 0.030 +140 A 0.028 +141 L 0.028 +142 F 0.032 +143 I 0.037 +144 D 0.042 +145 K 0.048 +146 H 0.054 +147 L 0.057 +148 Q 0.057 +149 I 0.051 +150 L 0.043 +151 T 0.035 +152 E 0.033 +153 F 0.038 +154 K 0.049 +155 E 0.057 +156 K 0.054 +157 A 0.048 +158 R 0.046 +159 A 0.048 +160 L 0.048 +161 Y 0.044 +162 K 0.039 +163 A 0.037 +164 E 0.038 +165 A 0.043 +166 F 0.051 +167 T 0.059 +168 A 0.064 +169 D 0.063 +170 F 0.062 +171 Q 0.063 +172 L 0.065 +173 P 0.065 +174 R 0.062 +175 E 0.058 +176 A 0.055 +177 T 0.054 +178 K 0.052 +179 L 0.055 +180 I 0.066 +181 N 0.080 +182 D 0.084 +183 Y 0.078 +184 V 0.072 +185 R 0.073 +186 K 0.076 +187 Q 0.075 +188 T 0.080 +189 Q 0.096 +190 G 0.114 +191 K 0.126 +192 I 0.132 +193 K 0.135 +194 E 0.136 +195 L 0.134 +196 V 0.130 +197 S 0.124 +198 D 0.122 +199 L 0.125 +200 H 0.130 +201 R 0.136 +202 N 0.140 +203 T 0.132 +204 S 0.113 +205 M 0.095 +206 A 0.083 +207 L 0.078 +208 V 0.082 +209 N 0.092 +210 F 0.100 +211 L 0.107 +212 N 0.114 +213 F 0.115 +214 Q 0.106 +215 G 0.092 +216 F 0.082 +217 W 0.078 +218 N 0.078 +219 V 0.085 +220 T 0.103 +221 F 0.121 +222 D 0.123 +223 P 0.107 +224 E 0.087 +225 D 0.073 +226 T 0.067 +227 F 0.066 +228 L 0.066 +229 G 0.063 +230 N 0.054 +231 F 0.045 +232 T 0.039 +233 L 0.040 +234 D 0.044 +235 R 0.048 +236 K 0.051 +237 R 0.060 +238 T 0.072 +239 V 0.083 +240 N 0.088 +241 V 0.087 +242 P 0.080 +243 M 0.072 +244 M 0.069 +245 K 0.069 +246 T 0.067 +247 E 0.060 +248 E 0.051 +249 L 0.045 +250 T 0.041 +251 T 0.036 +252 N 0.031 +253 Y 0.027 +254 F 0.027 +255 R 0.031 +256 D 0.037 +257 E 0.042 +258 E 0.044 +259 M 0.042 +260 Q 0.037 +261 S 0.031 +262 T 0.026 +263 V 0.023 +264 M 0.023 +265 E 0.025 +266 L 0.027 +267 N 0.028 +268 Y 0.030 +269 I 0.032 +270 G 0.034 +271 N 0.034 +272 A 0.034 +273 S 0.033 +274 F 0.034 +275 L 0.037 +276 F 0.045 +277 I 0.057 +278 L 0.071 +279 P 0.081 +280 D 0.081 +281 Q 0.074 +282 G 0.065 +283 R 0.057 +284 I 0.051 +285 Q 0.049 +286 H 0.051 +287 V 0.053 +288 E 0.056 +289 D 0.062 +290 S 0.067 +291 L 0.068 +292 Q 0.060 +293 P 0.048 +294 Q 0.036 +295 S 0.028 +296 L 0.024 +297 R 0.024 +298 K 0.030 +299 W 0.037 +300 R 0.045 +301 K 0.054 +302 S 0.063 +303 L 0.071 +304 R 0.074 +305 P 0.070 +306 R 0.067 +307 M 0.067 +308 L 0.068 +309 D 0.065 +310 E 0.063 +311 L 0.067 +312 S 0.077 +313 L 0.088 +314 P 0.097 +315 K 0.100 +316 F 0.101 +317 S 0.102 +318 L 0.101 +319 S 0.096 +320 Q 0.088 +321 D 0.079 +322 Y 0.070 +323 N 0.063 +324 L 0.059 +325 N 0.058 +326 D 0.058 +327 I 0.059 +328 L 0.059 +329 P 0.058 +330 E 0.060 +331 L 0.068 +332 G 0.080 +333 I 0.093 +334 K 0.105 +335 E 0.115 +336 V 0.126 +337 F 0.138 +338 S 0.146 +339 T 0.144 +340 Q 0.130 +341 A 0.107 +342 D 0.089 +343 L 0.080 +344 S 0.077 +345 G 0.075 +346 I 0.072 +347 T 0.073 +348 G 0.086 +349 A 0.106 +350 K 0.123 +351 N 0.129 +352 I 0.120 +353 R 0.106 +354 V 0.094 +355 S 0.092 +356 Q 0.099 +357 M 0.113 +358 I 0.127 +359 H 0.136 +360 Q 0.139 +361 A 0.138 +362 A 0.140 +363 L 0.152 +364 D 0.174 +365 V 0.205 +366 T 0.242 +367 E 0.282 +368 T 0.321 +369 H 0.360 +370 T 0.399 +371 E 0.437 +372 A 0.468 +373 D 0.480 +374 V 0.473 +375 I 0.467 +376 T 0.474 +377 I 0.485 +378 A 0.480 +379 R 0.461 +380 Y 0.448 +381 N 0.452 +382 F 0.475 +383 Q 0.507 +384 S 0.528 +385 A 0.521 +386 K 0.484 +387 I 0.433 +388 K 0.372 +389 A 0.301 +390 K 0.235 +391 I 0.190 +392 V 0.164 +393 K 0.144 +394 V 0.121 +395 D 0.097 +396 R 0.077 +397 E 0.063 +398 F 0.052 +399 L 0.046 +400 Y 0.044 +401 L 0.047 +402 I 0.053 +403 L 0.062 +404 D 0.070 +405 P 0.071 +406 M 0.064 +407 F 0.058 +408 K 0.057 +409 S 0.060 +410 I 0.062 +411 S 0.065 +412 V 0.068 +413 M 0.069 +414 G 0.067 +415 K 0.068 +416 V 0.077 +417 I 0.093 +418 N 0.113 +419 P 0.135 +420 L 0.161 +421 T 0.191 +422 N 0.214 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000041536.14_ENSMUST00000185595.7_GN:Serpina3a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000041536.14_ENSMUST00000185595.7_GN:Serpina3a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..153d3066140b7c7dae00fc6c80891a0ffce417e8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000041536.14_ENSMUST00000185595.7_GN:Serpina3a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid @@ -0,0 +1,424 @@ +>ENSMUSG00000041536.14|ENSMUST00000185595.7|GN:Serpina3a|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:1 +1 M 0.240 +2 M 0.235 +3 A 0.231 +4 F 0.228 +5 I 0.221 +6 A 0.215 +7 A 0.230 +8 L 0.262 +9 G 0.290 +10 L 0.306 +11 L 0.326 +12 M 0.358 +13 A 0.388 +14 G 0.408 +15 I 0.417 +16 C 0.409 +17 P 0.379 +18 A 0.335 +19 I 0.297 +20 T 0.278 +21 Y 0.275 +22 W 0.282 +23 A 0.304 +24 T 0.345 +25 A 0.403 +26 D 0.465 +27 G 0.516 +28 Q 0.552 +29 L 0.578 +30 G 0.591 +31 R 0.583 +32 H 0.559 +33 T 0.531 +34 E 0.502 +35 V 0.469 +36 Q 0.441 +37 K 0.426 +38 D 0.422 +39 R 0.422 +40 D 0.429 +41 H 0.440 +42 E 0.443 +43 I 0.415 +44 Q 0.354 +45 L 0.275 +46 D 0.200 +47 S 0.141 +48 V 0.100 +49 T 0.076 +50 L 0.064 +51 A 0.059 +52 S 0.057 +53 I 0.054 +54 N 0.049 +55 T 0.044 +56 D 0.040 +57 F 0.037 +58 A 0.034 +59 F 0.033 +60 S 0.035 +61 L 0.036 +62 Y 0.035 +63 K 0.034 +64 K 0.035 +65 L 0.041 +66 A 0.049 +67 L 0.057 +68 K 0.067 +69 N 0.075 +70 P 0.078 +71 H 0.077 +72 K 0.076 +73 N 0.075 +74 I 0.074 +75 V 0.072 +76 F 0.070 +77 S 0.067 +78 P 0.063 +79 L 0.059 +80 S 0.056 +81 I 0.052 +82 S 0.051 +83 A 0.051 +84 A 0.052 +85 L 0.056 +86 A 0.064 +87 L 0.072 +88 M 0.075 +89 S 0.075 +90 L 0.081 +91 G 0.095 +92 A 0.109 +93 K 0.113 +94 D 0.109 +95 N 0.105 +96 T 0.103 +97 L 0.102 +98 E 0.098 +99 E 0.089 +100 I 0.078 +101 L 0.069 +102 E 0.062 +103 G 0.054 +104 L 0.048 +105 K 0.049 +106 F 0.059 +107 N 0.071 +108 L 0.080 +109 T 0.085 +110 E 0.089 +111 T 0.089 +112 P 0.085 +113 E 0.079 +114 A 0.072 +115 D 0.065 +116 I 0.056 +117 H 0.048 +118 Q 0.042 +119 N 0.039 +120 F 0.037 +121 G 0.035 +122 H 0.032 +123 L 0.030 +124 L 0.031 +125 Q 0.033 +126 M 0.040 +127 L 0.055 +128 I 0.078 +129 Q 0.110 +130 P 0.142 +131 E 0.162 +132 N 0.160 +133 Q 0.139 +134 V 0.114 +135 Q 0.093 +136 I 0.075 +137 N 0.059 +138 A 0.046 +139 G 0.036 +140 N 0.030 +141 A 0.028 +142 L 0.029 +143 F 0.032 +144 I 0.037 +145 D 0.043 +146 K 0.048 +147 H 0.054 +148 L 0.057 +149 Q 0.057 +150 I 0.051 +151 L 0.043 +152 T 0.035 +153 E 0.033 +154 F 0.038 +155 K 0.049 +156 E 0.056 +157 K 0.054 +158 A 0.048 +159 R 0.046 +160 A 0.048 +161 L 0.048 +162 Y 0.044 +163 K 0.039 +164 A 0.037 +165 E 0.038 +166 A 0.043 +167 F 0.051 +168 T 0.059 +169 A 0.064 +170 D 0.063 +171 F 0.062 +172 Q 0.063 +173 L 0.065 +174 P 0.065 +175 R 0.062 +176 E 0.058 +177 A 0.055 +178 T 0.053 +179 K 0.052 +180 L 0.054 +181 I 0.065 +182 N 0.079 +183 D 0.084 +184 Y 0.078 +185 V 0.072 +186 R 0.073 +187 K 0.075 +188 Q 0.075 +189 T 0.080 +190 Q 0.096 +191 G 0.114 +192 K 0.126 +193 I 0.132 +194 K 0.135 +195 E 0.136 +196 L 0.134 +197 V 0.130 +198 S 0.124 +199 D 0.123 +200 L 0.126 +201 H 0.131 +202 R 0.137 +203 N 0.140 +204 T 0.132 +205 S 0.114 +206 M 0.095 +207 A 0.083 +208 L 0.078 +209 V 0.083 +210 N 0.092 +211 F 0.101 +212 L 0.108 +213 N 0.114 +214 F 0.115 +215 Q 0.106 +216 G 0.092 +217 F 0.082 +218 W 0.078 +219 N 0.078 +220 V 0.085 +221 T 0.103 +222 F 0.121 +223 D 0.123 +224 P 0.107 +225 E 0.087 +226 D 0.073 +227 T 0.067 +228 F 0.066 +229 L 0.066 +230 G 0.063 +231 N 0.054 +232 F 0.045 +233 T 0.039 +234 L 0.040 +235 D 0.044 +236 R 0.048 +237 K 0.052 +238 R 0.060 +239 T 0.072 +240 V 0.083 +241 N 0.089 +242 V 0.087 +243 P 0.080 +244 M 0.072 +245 M 0.069 +246 K 0.069 +247 T 0.067 +248 E 0.060 +249 E 0.052 +250 L 0.046 +251 T 0.041 +252 T 0.036 +253 N 0.031 +254 Y 0.027 +255 F 0.027 +256 R 0.031 +257 D 0.037 +258 E 0.042 +259 E 0.044 +260 M 0.042 +261 Q 0.037 +262 S 0.031 +263 T 0.026 +264 V 0.023 +265 M 0.024 +266 E 0.026 +267 L 0.027 +268 N 0.028 +269 Y 0.030 +270 I 0.032 +271 G 0.034 +272 N 0.034 +273 A 0.034 +274 S 0.033 +275 F 0.034 +276 L 0.038 +277 F 0.045 +278 I 0.057 +279 L 0.071 +280 P 0.081 +281 D 0.081 +282 Q 0.074 +283 G 0.066 +284 R 0.057 +285 I 0.051 +286 Q 0.049 +287 H 0.051 +288 V 0.053 +289 E 0.056 +290 D 0.062 +291 S 0.068 +292 L 0.068 +293 Q 0.061 +294 P 0.048 +295 Q 0.036 +296 S 0.028 +297 L 0.024 +298 R 0.024 +299 K 0.030 +300 W 0.037 +301 R 0.045 +302 K 0.054 +303 S 0.063 +304 L 0.072 +305 R 0.074 +306 P 0.070 +307 R 0.067 +308 M 0.067 +309 L 0.068 +310 D 0.065 +311 E 0.064 +312 L 0.068 +313 S 0.077 +314 L 0.089 +315 P 0.097 +316 K 0.101 +317 F 0.102 +318 S 0.102 +319 L 0.101 +320 S 0.096 +321 Q 0.089 +322 D 0.079 +323 Y 0.070 +324 N 0.063 +325 L 0.059 +326 N 0.057 +327 D 0.058 +328 I 0.059 +329 L 0.059 +330 P 0.059 +331 E 0.060 +332 L 0.068 +333 G 0.080 +334 I 0.093 +335 K 0.105 +336 E 0.115 +337 V 0.126 +338 F 0.138 +339 S 0.146 +340 T 0.144 +341 Q 0.130 +342 A 0.107 +343 D 0.089 +344 L 0.080 +345 S 0.077 +346 G 0.075 +347 I 0.072 +348 T 0.073 +349 G 0.086 +350 A 0.106 +351 K 0.123 +352 N 0.129 +353 I 0.121 +354 R 0.106 +355 V 0.094 +356 S 0.092 +357 Q 0.099 +358 M 0.113 +359 I 0.127 +360 H 0.136 +361 Q 0.139 +362 A 0.138 +363 A 0.141 +364 L 0.153 +365 D 0.175 +366 V 0.206 +367 T 0.243 +368 E 0.282 +369 T 0.322 +370 H 0.360 +371 T 0.399 +372 E 0.437 +373 A 0.469 +374 D 0.481 +375 V 0.475 +376 I 0.468 +377 T 0.475 +378 I 0.485 +379 A 0.481 +380 R 0.461 +381 Y 0.447 +382 N 0.452 +383 F 0.475 +384 Q 0.507 +385 S 0.528 +386 A 0.520 +387 K 0.484 +388 I 0.433 +389 K 0.372 +390 A 0.301 +391 K 0.236 +392 I 0.190 +393 V 0.164 +394 K 0.144 +395 V 0.121 +396 D 0.097 +397 R 0.077 +398 E 0.063 +399 F 0.053 +400 L 0.046 +401 Y 0.044 +402 L 0.047 +403 I 0.053 +404 L 0.062 +405 D 0.070 +406 P 0.071 +407 M 0.065 +408 F 0.058 +409 K 0.057 +410 S 0.060 +411 I 0.063 +412 S 0.065 +413 V 0.068 +414 M 0.069 +415 G 0.067 +416 K 0.068 +417 V 0.077 +418 I 0.094 +419 N 0.113 +420 P 0.135 +421 L 0.161 +422 T 0.192 +423 N 0.214 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000041605.17_ENSMUST00000120339.8_GN:Inava_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000041605.17_ENSMUST00000120339.8_GN:Inava_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6c0c0284ea026d2a34a3c35ba203ddf769c7aea8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000041605.17_ENSMUST00000120339.8_GN:Inava_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,664 @@ +>ENSMUSG00000041605.17|ENSMUST00000120339.8|GN:Inava|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.338 +2 L 0.372 +3 Q 0.431 +4 M 0.497 +5 P 0.552 +6 K 0.590 +7 L 0.618 +8 N 0.639 +9 E 0.644 +10 I 0.638 +11 P 0.645 +12 P 0.677 +13 G 0.715 +14 R 0.735 +15 G 0.739 +16 G 0.735 +17 P 0.728 +18 G 0.721 +19 E 0.712 +20 P 0.703 +21 W 0.701 +22 G 0.701 +23 E 0.679 +24 G 0.627 +25 R 0.592 +26 W 0.617 +27 A 0.678 +28 G 0.725 +29 P 0.746 +30 T 0.754 +31 G 0.760 +32 P 0.769 +33 E 0.779 +34 A 0.783 +35 A 0.775 +36 R 0.756 +37 P 0.718 +38 A 0.670 +39 R 0.652 +40 G 0.696 +41 A 0.761 +42 R 0.801 +43 G 0.812 +44 Q 0.811 +45 A 0.806 +46 R 0.798 +47 G 0.774 +48 A 0.719 +49 R 0.643 +50 A 0.594 +51 R 0.605 +52 W 0.646 +53 D 0.669 +54 S 0.664 +55 W 0.659 +56 E 0.675 +57 H 0.700 +58 S 0.713 +59 R 0.712 +60 L 0.710 +61 P 0.715 +62 T 0.724 +63 H 0.733 +64 P 0.743 +65 G 0.760 +66 P 0.779 +67 G 0.789 +68 W 0.788 +69 D 0.780 +70 Q 0.768 +71 C 0.755 +72 S 0.750 +73 P 0.758 +74 S 0.771 +75 F 0.778 +76 L 0.776 +77 C 0.772 +78 A 0.771 +79 P 0.774 +80 S 0.780 +81 S 0.785 +82 Q 0.790 +83 K 0.797 +84 L 0.803 +85 I 0.804 +86 M 0.801 +87 E 0.797 +88 S 0.795 +89 K 0.796 +90 D 0.799 +91 E 0.804 +92 V 0.808 +93 S 0.807 +94 D 0.800 +95 S 0.789 +96 D 0.779 +97 S 0.777 +98 G 0.783 +99 I 0.788 +100 I 0.783 +101 L 0.765 +102 Q 0.743 +103 S 0.727 +104 G 0.721 +105 P 0.715 +106 D 0.707 +107 S 0.696 +108 P 0.682 +109 V 0.661 +110 S 0.622 +111 P 0.558 +112 M 0.477 +113 K 0.400 +114 E 0.343 +115 L 0.304 +116 T 0.270 +117 N 0.235 +118 A 0.202 +119 V 0.177 +120 R 0.169 +121 K 0.177 +122 Q 0.189 +123 Q 0.188 +124 R 0.177 +125 A 0.169 +126 L 0.170 +127 E 0.176 +128 A 0.183 +129 R 0.188 +130 L 0.185 +131 E 0.176 +132 A 0.167 +133 C 0.166 +134 L 0.167 +135 E 0.165 +136 E 0.156 +137 L 0.140 +138 R 0.121 +139 R 0.111 +140 L 0.113 +141 C 0.122 +142 L 0.129 +143 R 0.136 +144 E 0.146 +145 A 0.157 +146 E 0.163 +147 L 0.169 +148 T 0.182 +149 G 0.195 +150 T 0.198 +151 L 0.187 +152 P 0.169 +153 A 0.163 +154 E 0.176 +155 Y 0.195 +156 P 0.203 +157 L 0.207 +158 K 0.221 +159 P 0.254 +160 G 0.305 +161 E 0.372 +162 K 0.440 +163 A 0.488 +164 P 0.507 +165 K 0.509 +166 V 0.504 +167 R 0.498 +168 R 0.496 +169 R 0.504 +170 I 0.516 +171 G 0.520 +172 A 0.511 +173 A 0.493 +174 Y 0.471 +175 K 0.447 +176 L 0.412 +177 D 0.358 +178 E 0.300 +179 W 0.264 +180 A 0.256 +181 L 0.266 +182 H 0.271 +183 R 0.254 +184 E 0.221 +185 D 0.184 +186 P 0.149 +187 L 0.116 +188 S 0.091 +189 S 0.075 +190 L 0.064 +191 E 0.060 +192 R 0.063 +193 Q 0.066 +194 L 0.065 +195 A 0.062 +196 L 0.056 +197 Q 0.051 +198 L 0.049 +199 Q 0.048 +200 I 0.042 +201 T 0.036 +202 E 0.035 +203 A 0.038 +204 A 0.047 +205 R 0.062 +206 R 0.073 +207 L 0.076 +208 C 0.083 +209 A 0.102 +210 E 0.125 +211 E 0.140 +212 N 0.144 +213 L 0.135 +214 S 0.114 +215 R 0.091 +216 Q 0.075 +217 A 0.063 +218 R 0.054 +219 R 0.048 +220 Q 0.048 +221 R 0.056 +222 K 0.071 +223 H 0.084 +224 A 0.085 +225 A 0.076 +226 L 0.069 +227 Q 0.068 +228 E 0.068 +229 E 0.066 +230 K 0.060 +231 K 0.053 +232 L 0.050 +233 R 0.050 +234 D 0.049 +235 L 0.047 +236 Q 0.048 +237 R 0.055 +238 C 0.071 +239 L 0.099 +240 G 0.131 +241 D 0.149 +242 R 0.158 +243 R 0.179 +244 R 0.224 +245 N 0.281 +246 S 0.337 +247 E 0.396 +248 P 0.466 +249 P 0.545 +250 P 0.621 +251 T 0.675 +252 T 0.702 +253 V 0.710 +254 P 0.718 +255 S 0.731 +256 L 0.745 +257 G 0.754 +258 R 0.758 +259 E 0.761 +260 L 0.766 +261 S 0.770 +262 A 0.771 +263 S 0.769 +264 D 0.766 +265 D 0.762 +266 S 0.755 +267 S 0.744 +268 L 0.738 +269 S 0.744 +270 D 0.756 +271 G 0.768 +272 L 0.777 +273 L 0.785 +274 L 0.794 +275 E 0.801 +276 E 0.804 +277 E 0.802 +278 D 0.790 +279 S 0.770 +280 Q 0.748 +281 A 0.731 +282 P 0.719 +283 K 0.714 +284 P 0.717 +285 P 0.729 +286 P 0.742 +287 E 0.749 +288 S 0.743 +289 P 0.730 +290 A 0.720 +291 P 0.717 +292 P 0.718 +293 S 0.714 +294 R 0.704 +295 P 0.692 +296 L 0.676 +297 P 0.649 +298 P 0.611 +299 Q 0.600 +300 S 0.645 +301 L 0.716 +302 E 0.769 +303 G 0.792 +304 L 0.794 +305 Q 0.793 +306 P 0.797 +307 T 0.804 +308 G 0.812 +309 P 0.821 +310 E 0.829 +311 S 0.838 +312 G 0.843 +313 G 0.842 +314 Q 0.838 +315 E 0.830 +316 R 0.817 +317 A 0.791 +318 P 0.741 +319 I 0.671 +320 Q 0.628 +321 N 0.645 +322 S 0.694 +323 P 0.732 +324 W 0.759 +325 K 0.784 +326 E 0.804 +327 T 0.810 +328 S 0.802 +329 L 0.786 +330 D 0.766 +331 H 0.748 +332 P 0.736 +333 Y 0.734 +334 E 0.743 +335 K 0.761 +336 P 0.780 +337 R 0.798 +338 K 0.812 +339 S 0.819 +340 S 0.822 +341 E 0.825 +342 L 0.831 +343 S 0.837 +344 S 0.840 +345 E 0.836 +346 S 0.829 +347 S 0.822 +348 S 0.820 +349 P 0.823 +350 A 0.827 +351 T 0.826 +352 T 0.818 +353 P 0.808 +354 Q 0.794 +355 D 0.771 +356 Q 0.738 +357 P 0.700 +358 N 0.662 +359 P 0.623 +360 S 0.588 +361 S 0.566 +362 L 0.563 +363 W 0.575 +364 V 0.586 +365 L 0.570 +366 D 0.513 +367 A 0.431 +368 A 0.353 +369 S 0.307 +370 Y 0.302 +371 H 0.332 +372 V 0.391 +373 V 0.470 +374 P 0.559 +375 I 0.644 +376 R 0.708 +377 N 0.743 +378 V 0.762 +379 P 0.784 +380 G 0.813 +381 Q 0.838 +382 R 0.852 +383 Q 0.858 +384 G 0.862 +385 R 0.860 +386 T 0.852 +387 S 0.838 +388 A 0.826 +389 P 0.818 +390 A 0.811 +391 T 0.808 +392 P 0.815 +393 E 0.828 +394 M 0.837 +395 Q 0.839 +396 G 0.838 +397 R 0.836 +398 R 0.836 +399 G 0.836 +400 Q 0.832 +401 S 0.827 +402 Q 0.823 +403 S 0.822 +404 L 0.822 +405 R 0.822 +406 V 0.822 +407 D 0.820 +408 S 0.817 +409 F 0.819 +410 R 0.828 +411 A 0.839 +412 G 0.846 +413 A 0.847 +414 E 0.845 +415 G 0.842 +416 R 0.838 +417 G 0.830 +418 R 0.814 +419 S 0.789 +420 A 0.760 +421 F 0.741 +422 P 0.739 +423 R 0.747 +424 R 0.752 +425 R 0.753 +426 P 0.752 +427 T 0.748 +428 H 0.738 +429 Y 0.719 +430 T 0.694 +431 V 0.678 +432 T 0.679 +433 V 0.692 +434 P 0.707 +435 D 0.721 +436 S 0.722 +437 C 0.708 +438 F 0.695 +439 T 0.703 +440 P 0.729 +441 G 0.748 +442 K 0.747 +443 P 0.742 +444 P 0.747 +445 L 0.760 +446 P 0.774 +447 H 0.787 +448 P 0.802 +449 A 0.817 +450 C 0.827 +451 H 0.835 +452 S 0.840 +453 C 0.842 +454 S 0.844 +455 E 0.845 +456 D 0.843 +457 S 0.840 +458 G 0.838 +459 S 0.837 +460 D 0.822 +461 V 0.777 +462 S 0.709 +463 S 0.665 +464 I 0.684 +465 S 0.736 +466 H 0.778 +467 P 0.802 +468 T 0.818 +469 S 0.829 +470 P 0.838 +471 G 0.841 +472 S 0.833 +473 S 0.815 +474 S 0.792 +475 P 0.764 +476 D 0.724 +477 I 0.669 +478 S 0.612 +479 F 0.578 +480 L 0.578 +481 R 0.591 +482 P 0.592 +483 L 0.575 +484 C 0.549 +485 L 0.530 +486 P 0.527 +487 E 0.537 +488 P 0.564 +489 P 0.612 +490 R 0.664 +491 H 0.701 +492 R 0.717 +493 G 0.711 +494 A 0.678 +495 W 0.635 +496 G 0.613 +497 P 0.624 +498 A 0.648 +499 C 0.659 +500 G 0.646 +501 R 0.614 +502 E 0.571 +503 L 0.517 +504 A 0.450 +505 P 0.368 +506 H 0.285 +507 Y 0.224 +508 S 0.199 +509 K 0.215 +510 L 0.267 +511 L 0.332 +512 L 0.383 +513 P 0.409 +514 A 0.404 +515 G 0.367 +516 Y 0.316 +517 F 0.283 +518 P 0.273 +519 T 0.265 +520 G 0.247 +521 R 0.225 +522 Y 0.211 +523 V 0.214 +524 M 0.231 +525 V 0.256 +526 A 0.281 +527 E 0.295 +528 G 0.294 +529 H 0.291 +530 L 0.314 +531 P 0.369 +532 P 0.426 +533 G 0.435 +534 E 0.383 +535 W 0.313 +536 E 0.272 +537 L 0.262 +538 C 0.272 +539 R 0.303 +540 A 0.362 +541 A 0.437 +542 V 0.496 +543 G 0.524 +544 A 0.519 +545 A 0.493 +546 Y 0.461 +547 D 0.437 +548 E 0.418 +549 E 0.406 +550 G 0.409 +551 A 0.427 +552 P 0.455 +553 L 0.479 +554 R 0.490 +555 Y 0.490 +556 Q 0.491 +557 R 0.493 +558 L 0.503 +559 V 0.535 +560 P 0.583 +561 S 0.627 +562 H 0.656 +563 S 0.675 +564 R 0.689 +565 I 0.699 +566 V 0.709 +567 R 0.719 +568 T 0.726 +569 P 0.736 +570 S 0.748 +571 L 0.753 +572 K 0.749 +573 D 0.738 +574 S 0.731 +575 P 0.737 +576 A 0.754 +577 G 0.770 +578 R 0.775 +579 G 0.762 +580 L 0.727 +581 S 0.680 +582 K 0.637 +583 A 0.603 +584 A 0.560 +585 V 0.497 +586 S 0.421 +587 E 0.339 +588 E 0.259 +589 L 0.197 +590 K 0.159 +591 W 0.141 +592 W 0.139 +593 H 0.149 +594 E 0.167 +595 R 0.195 +596 A 0.240 +597 R 0.305 +598 L 0.381 +599 R 0.454 +600 S 0.508 +601 S 0.540 +602 R 0.564 +603 P 0.594 +604 H 0.621 +605 S 0.630 +606 L 0.632 +607 D 0.650 +608 R 0.678 +609 Q 0.687 +610 G 0.667 +611 A 0.638 +612 F 0.623 +613 R 0.624 +614 V 0.629 +615 R 0.632 +616 S 0.631 +617 L 0.637 +618 P 0.665 +619 P 0.714 +620 G 0.762 +621 R 0.791 +622 E 0.802 +623 S 0.801 +624 F 0.800 +625 G 0.799 +626 R 0.793 +627 A 0.779 +628 S 0.761 +629 G 0.746 +630 P 0.735 +631 R 0.717 +632 T 0.674 +633 Q 0.599 +634 V 0.502 +635 P 0.394 +636 P 0.287 +637 V 0.205 +638 Y 0.164 +639 V 0.164 +640 L 0.185 +641 R 0.204 +642 R 0.220 +643 S 0.241 +644 T 0.267 +645 D 0.286 +646 G 0.294 +647 A 0.275 +648 P 0.229 +649 V 0.180 +650 Q 0.151 +651 V 0.139 +652 F 0.142 +653 V 0.163 +654 P 0.191 +655 E 0.203 +656 N 0.198 +657 G 0.186 +658 E 0.171 +659 I 0.151 +660 I 0.137 +661 S 0.138 +662 Q 0.146 +663 V 0.152 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000041605.17_ENSMUST00000120339.8_GN:Inava_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000041605.17_ENSMUST00000120339.8_GN:Inava_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..368ab5aac7ff3a739c5e0ef1886c8db86de508f5 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000041605.17_ENSMUST00000120339.8_GN:Inava_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid @@ -0,0 +1,678 @@ +>ENSMUSG00000041605.17|ENSMUST00000120339.8|GN:Inava|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:14 +1 M 0.436 +2 P 0.480 +3 Q 0.551 +4 G 0.623 +5 T 0.671 +6 D 0.686 +7 V 0.679 +8 L 0.671 +9 G 0.665 +10 S 0.652 +11 L 0.635 +12 T 0.628 +13 F 0.624 +14 G 0.607 +15 M 0.572 +16 L 0.537 +17 Q 0.533 +18 M 0.566 +19 P 0.619 +20 K 0.666 +21 L 0.700 +22 N 0.716 +23 E 0.713 +24 I 0.701 +25 P 0.704 +26 P 0.730 +27 G 0.764 +28 R 0.784 +29 G 0.786 +30 G 0.779 +31 P 0.770 +32 G 0.763 +33 E 0.755 +34 P 0.745 +35 W 0.742 +36 G 0.738 +37 E 0.709 +38 G 0.651 +39 R 0.612 +40 W 0.637 +41 A 0.701 +42 G 0.750 +43 P 0.770 +44 T 0.775 +45 G 0.780 +46 P 0.789 +47 E 0.799 +48 A 0.802 +49 A 0.798 +50 R 0.795 +51 P 0.801 +52 A 0.814 +53 R 0.829 +54 G 0.840 +55 A 0.846 +56 R 0.846 +57 G 0.843 +58 Q 0.841 +59 A 0.838 +60 R 0.831 +61 G 0.807 +62 A 0.752 +63 R 0.675 +64 A 0.625 +65 R 0.638 +66 W 0.682 +67 D 0.707 +68 S 0.702 +69 W 0.695 +70 E 0.706 +71 H 0.724 +72 S 0.732 +73 R 0.729 +74 L 0.726 +75 P 0.730 +76 T 0.737 +77 H 0.743 +78 P 0.751 +79 G 0.765 +80 P 0.781 +81 G 0.789 +82 W 0.786 +83 D 0.777 +84 Q 0.765 +85 C 0.753 +86 S 0.750 +87 P 0.759 +88 S 0.773 +89 F 0.779 +90 L 0.776 +91 C 0.771 +92 A 0.769 +93 P 0.774 +94 S 0.781 +95 S 0.785 +96 Q 0.789 +97 K 0.796 +98 L 0.803 +99 I 0.803 +100 M 0.796 +101 E 0.790 +102 S 0.786 +103 K 0.786 +104 D 0.789 +105 E 0.794 +106 V 0.797 +107 S 0.795 +108 D 0.786 +109 S 0.773 +110 D 0.763 +111 S 0.762 +112 G 0.770 +113 I 0.777 +114 I 0.773 +115 L 0.757 +116 Q 0.737 +117 S 0.723 +118 G 0.717 +119 P 0.712 +120 D 0.703 +121 S 0.692 +122 P 0.679 +123 V 0.658 +124 S 0.619 +125 P 0.554 +126 M 0.473 +127 K 0.399 +128 E 0.345 +129 L 0.307 +130 T 0.271 +131 N 0.234 +132 A 0.201 +133 V 0.176 +134 R 0.166 +135 K 0.174 +136 Q 0.185 +137 Q 0.182 +138 R 0.170 +139 A 0.162 +140 L 0.164 +141 E 0.171 +142 A 0.179 +143 R 0.183 +144 L 0.181 +145 E 0.172 +146 A 0.164 +147 C 0.163 +148 L 0.164 +149 E 0.161 +150 E 0.152 +151 L 0.136 +152 R 0.118 +153 R 0.108 +154 L 0.110 +155 C 0.119 +156 L 0.127 +157 R 0.133 +158 E 0.143 +159 A 0.154 +160 E 0.159 +161 L 0.166 +162 T 0.180 +163 G 0.194 +164 T 0.199 +165 L 0.189 +166 P 0.170 +167 A 0.162 +168 E 0.174 +169 Y 0.192 +170 P 0.200 +171 L 0.203 +172 K 0.217 +173 P 0.247 +174 G 0.296 +175 E 0.360 +176 K 0.426 +177 A 0.476 +178 P 0.498 +179 K 0.502 +180 V 0.500 +181 R 0.496 +182 R 0.496 +183 R 0.503 +184 I 0.513 +185 G 0.515 +186 A 0.506 +187 A 0.490 +188 Y 0.470 +189 K 0.445 +190 L 0.408 +191 D 0.351 +192 E 0.292 +193 W 0.255 +194 A 0.247 +195 L 0.257 +196 H 0.263 +197 R 0.248 +198 E 0.217 +199 D 0.181 +200 P 0.147 +201 L 0.115 +202 S 0.090 +203 S 0.073 +204 L 0.063 +205 E 0.059 +206 R 0.061 +207 Q 0.065 +208 L 0.064 +209 A 0.060 +210 L 0.054 +211 Q 0.049 +212 L 0.047 +213 Q 0.045 +214 I 0.040 +215 T 0.035 +216 E 0.034 +217 A 0.038 +218 A 0.047 +219 R 0.061 +220 R 0.072 +221 L 0.075 +222 C 0.081 +223 A 0.098 +224 E 0.120 +225 E 0.134 +226 N 0.137 +227 L 0.127 +228 S 0.107 +229 R 0.086 +230 Q 0.071 +231 A 0.060 +232 R 0.052 +233 R 0.046 +234 Q 0.046 +235 R 0.054 +236 K 0.069 +237 H 0.082 +238 A 0.083 +239 A 0.074 +240 L 0.068 +241 Q 0.066 +242 E 0.067 +243 E 0.065 +244 K 0.059 +245 K 0.053 +246 L 0.049 +247 R 0.049 +248 D 0.049 +249 L 0.047 +250 Q 0.047 +251 R 0.054 +252 C 0.070 +253 L 0.098 +254 G 0.130 +255 D 0.148 +256 R 0.157 +257 R 0.178 +258 R 0.223 +259 N 0.280 +260 S 0.337 +261 E 0.397 +262 P 0.467 +263 P 0.546 +264 P 0.621 +265 T 0.676 +266 T 0.702 +267 V 0.710 +268 P 0.717 +269 S 0.729 +270 L 0.742 +271 G 0.751 +272 R 0.754 +273 E 0.757 +274 L 0.761 +275 S 0.766 +276 A 0.767 +277 S 0.764 +278 D 0.761 +279 D 0.757 +280 S 0.749 +281 S 0.737 +282 L 0.731 +283 S 0.737 +284 D 0.750 +285 G 0.763 +286 L 0.772 +287 L 0.780 +288 L 0.789 +289 E 0.796 +290 E 0.800 +291 E 0.799 +292 D 0.788 +293 S 0.769 +294 Q 0.747 +295 A 0.731 +296 P 0.719 +297 K 0.715 +298 P 0.719 +299 P 0.730 +300 P 0.744 +301 E 0.751 +302 S 0.745 +303 P 0.732 +304 A 0.721 +305 P 0.719 +306 P 0.720 +307 S 0.717 +308 R 0.708 +309 P 0.696 +310 L 0.681 +311 P 0.653 +312 P 0.615 +313 Q 0.604 +314 S 0.648 +315 L 0.719 +316 E 0.773 +317 G 0.796 +318 L 0.799 +319 Q 0.798 +320 P 0.802 +321 T 0.810 +322 G 0.819 +323 P 0.827 +324 E 0.836 +325 S 0.843 +326 G 0.848 +327 G 0.846 +328 Q 0.841 +329 E 0.833 +330 R 0.820 +331 A 0.795 +332 P 0.744 +333 I 0.674 +334 Q 0.631 +335 N 0.649 +336 S 0.699 +337 P 0.738 +338 W 0.765 +339 K 0.789 +340 E 0.807 +341 T 0.812 +342 S 0.805 +343 L 0.790 +344 D 0.771 +345 H 0.754 +346 P 0.741 +347 Y 0.739 +348 E 0.747 +349 K 0.764 +350 P 0.783 +351 R 0.800 +352 K 0.813 +353 S 0.820 +354 S 0.822 +355 E 0.825 +356 L 0.832 +357 S 0.838 +358 S 0.841 +359 E 0.837 +360 S 0.830 +361 S 0.823 +362 S 0.820 +363 P 0.823 +364 A 0.826 +365 T 0.824 +366 T 0.816 +367 P 0.806 +368 Q 0.792 +369 D 0.768 +370 Q 0.735 +371 P 0.698 +372 N 0.659 +373 P 0.618 +374 S 0.582 +375 S 0.559 +376 L 0.554 +377 W 0.566 +378 V 0.576 +379 L 0.561 +380 D 0.508 +381 A 0.430 +382 A 0.355 +383 S 0.308 +384 Y 0.299 +385 H 0.326 +386 V 0.383 +387 V 0.461 +388 P 0.550 +389 I 0.637 +390 R 0.702 +391 N 0.737 +392 V 0.756 +393 P 0.778 +394 G 0.808 +395 Q 0.833 +396 R 0.847 +397 Q 0.854 +398 G 0.858 +399 R 0.857 +400 T 0.848 +401 S 0.835 +402 A 0.823 +403 P 0.815 +404 A 0.808 +405 T 0.805 +406 P 0.812 +407 E 0.825 +408 M 0.835 +409 Q 0.837 +410 G 0.836 +411 R 0.835 +412 R 0.836 +413 G 0.835 +414 Q 0.831 +415 S 0.826 +416 Q 0.822 +417 S 0.821 +418 L 0.821 +419 R 0.821 +420 V 0.821 +421 D 0.818 +422 S 0.815 +423 F 0.817 +424 R 0.826 +425 A 0.838 +426 G 0.845 +427 A 0.846 +428 E 0.844 +429 G 0.841 +430 R 0.836 +431 G 0.827 +432 R 0.810 +433 S 0.783 +434 A 0.753 +435 F 0.733 +436 P 0.731 +437 R 0.739 +438 R 0.743 +439 R 0.742 +440 P 0.739 +441 T 0.733 +442 H 0.720 +443 Y 0.698 +444 T 0.672 +445 V 0.657 +446 T 0.662 +447 V 0.678 +448 P 0.698 +449 D 0.716 +450 S 0.721 +451 C 0.709 +452 F 0.697 +453 T 0.706 +454 P 0.732 +455 G 0.752 +456 K 0.752 +457 P 0.748 +458 P 0.754 +459 L 0.767 +460 P 0.780 +461 H 0.793 +462 P 0.807 +463 A 0.822 +464 C 0.832 +465 H 0.840 +466 S 0.845 +467 C 0.847 +468 S 0.849 +469 E 0.850 +470 D 0.848 +471 S 0.845 +472 G 0.843 +473 S 0.842 +474 D 0.827 +475 V 0.780 +476 S 0.708 +477 S 0.664 +478 I 0.684 +479 S 0.739 +480 H 0.783 +481 P 0.807 +482 T 0.822 +483 S 0.833 +484 P 0.842 +485 G 0.845 +486 S 0.837 +487 S 0.819 +488 S 0.796 +489 P 0.769 +490 D 0.731 +491 I 0.679 +492 S 0.626 +493 F 0.594 +494 L 0.593 +495 R 0.605 +496 P 0.606 +497 L 0.589 +498 C 0.563 +499 L 0.542 +500 P 0.535 +501 E 0.543 +502 P 0.570 +503 P 0.618 +504 R 0.670 +505 H 0.706 +506 R 0.721 +507 G 0.713 +508 A 0.679 +509 W 0.637 +510 G 0.614 +511 P 0.623 +512 A 0.644 +513 C 0.653 +514 G 0.640 +515 R 0.610 +516 E 0.568 +517 L 0.515 +518 A 0.449 +519 P 0.368 +520 H 0.286 +521 Y 0.225 +522 S 0.200 +523 K 0.215 +524 L 0.267 +525 L 0.332 +526 L 0.383 +527 P 0.408 +528 A 0.403 +529 G 0.364 +530 Y 0.312 +531 F 0.279 +532 P 0.269 +533 T 0.262 +534 G 0.243 +535 R 0.221 +536 Y 0.207 +537 V 0.209 +538 M 0.226 +539 V 0.250 +540 A 0.273 +541 E 0.286 +542 G 0.286 +543 H 0.285 +544 L 0.308 +545 P 0.363 +546 P 0.420 +547 G 0.429 +548 E 0.376 +549 W 0.306 +550 E 0.264 +551 L 0.252 +552 C 0.260 +553 R 0.289 +554 A 0.346 +555 A 0.418 +556 V 0.477 +557 G 0.506 +558 A 0.502 +559 A 0.477 +560 Y 0.446 +561 D 0.423 +562 E 0.406 +563 E 0.395 +564 G 0.399 +565 A 0.418 +566 P 0.446 +567 L 0.469 +568 R 0.479 +569 Y 0.478 +570 Q 0.478 +571 R 0.481 +572 L 0.493 +573 V 0.526 +574 P 0.573 +575 S 0.617 +576 H 0.646 +577 S 0.667 +578 R 0.682 +579 I 0.693 +580 V 0.704 +581 R 0.714 +582 T 0.723 +583 P 0.734 +584 S 0.746 +585 L 0.752 +586 K 0.748 +587 D 0.737 +588 S 0.731 +589 P 0.737 +590 A 0.754 +591 G 0.771 +592 R 0.776 +593 G 0.763 +594 L 0.729 +595 S 0.681 +596 K 0.637 +597 A 0.601 +598 A 0.557 +599 V 0.492 +600 S 0.414 +601 E 0.330 +602 E 0.249 +603 L 0.185 +604 K 0.146 +605 W 0.129 +606 W 0.129 +607 H 0.142 +608 E 0.160 +609 R 0.183 +610 A 0.221 +611 R 0.279 +612 L 0.354 +613 R 0.433 +614 S 0.494 +615 S 0.531 +616 R 0.556 +617 P 0.585 +618 H 0.611 +619 S 0.615 +620 L 0.612 +621 D 0.628 +622 R 0.656 +623 Q 0.663 +624 G 0.636 +625 A 0.602 +626 F 0.588 +627 R 0.592 +628 V 0.599 +629 R 0.606 +630 S 0.612 +631 L 0.624 +632 P 0.658 +633 P 0.710 +634 G 0.760 +635 R 0.790 +636 E 0.801 +637 S 0.801 +638 F 0.800 +639 G 0.799 +640 R 0.794 +641 A 0.780 +642 S 0.763 +643 G 0.749 +644 P 0.739 +645 R 0.720 +646 T 0.676 +647 Q 0.599 +648 V 0.499 +649 P 0.389 +650 P 0.282 +651 V 0.202 +652 Y 0.165 +653 V 0.167 +654 L 0.188 +655 R 0.207 +656 R 0.222 +657 S 0.243 +658 T 0.267 +659 D 0.286 +660 G 0.292 +661 A 0.272 +662 P 0.226 +663 V 0.178 +664 Q 0.149 +665 V 0.137 +666 F 0.140 +667 V 0.160 +668 P 0.187 +669 E 0.198 +670 N 0.194 +671 G 0.185 +672 E 0.171 +673 I 0.151 +674 I 0.137 +675 S 0.138 +676 Q 0.146 +677 V 0.152 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000041697.10_ENSMUST00000040154.10_GN:Cox6a1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000041697.10_ENSMUST00000040154.10_GN:Cox6a1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7845a72cff5e1ead9ad286ce80d4813eda12e81d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000041697.10_ENSMUST00000040154.10_GN:Cox6a1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,112 @@ +>ENSMUSG00000041697.10|ENSMUST00000040154.10|GN:Cox6a1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.469 +2 A 0.504 +3 S 0.545 +4 A 0.559 +5 V 0.543 +6 L 0.533 +7 S 0.556 +8 A 0.579 +9 S 0.566 +10 R 0.550 +11 V 0.571 +12 S 0.612 +13 R 0.644 +14 P 0.668 +15 L 0.686 +16 G 0.690 +17 R 0.682 +18 A 0.677 +19 L 0.685 +20 P 0.702 +21 G 0.714 +22 L 0.712 +23 R 0.702 +24 R 0.708 +25 P 0.737 +26 M 0.769 +27 S 0.785 +28 S 0.781 +29 G 0.768 +30 A 0.751 +31 H 0.730 +32 G 0.700 +33 E 0.659 +34 E 0.604 +35 G 0.528 +36 S 0.431 +37 A 0.330 +38 R 0.250 +39 M 0.196 +40 W 0.159 +41 K 0.136 +42 A 0.123 +43 L 0.114 +44 T 0.105 +45 Y 0.103 +46 F 0.110 +47 V 0.123 +48 A 0.139 +49 L 0.160 +50 P 0.189 +51 G 0.212 +52 V 0.215 +53 G 0.203 +54 V 0.190 +55 S 0.185 +56 M 0.183 +57 L 0.179 +58 N 0.172 +59 V 0.158 +60 F 0.143 +61 L 0.139 +62 K 0.155 +63 S 0.185 +64 R 0.219 +65 H 0.251 +66 E 0.284 +67 E 0.316 +68 H 0.338 +69 E 0.345 +70 R 0.341 +71 P 0.329 +72 P 0.316 +73 F 0.304 +74 V 0.293 +75 A 0.283 +76 Y 0.278 +77 P 0.282 +78 H 0.289 +79 L 0.290 +80 R 0.287 +81 I 0.294 +82 R 0.320 +83 T 0.358 +84 K 0.405 +85 P 0.464 +86 F 0.521 +87 P 0.547 +88 W 0.535 +89 G 0.502 +90 D 0.468 +91 G 0.442 +92 N 0.447 +93 H 0.490 +94 T 0.543 +95 L 0.571 +96 F 0.569 +97 H 0.550 +98 N 0.513 +99 P 0.460 +100 H 0.419 +101 V 0.411 +102 N 0.423 +103 P 0.434 +104 L 0.436 +105 P 0.425 +106 T 0.416 +107 G 0.425 +108 Y 0.449 +109 E 0.468 +110 D 0.469 +111 E 0.462 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000041697.10_ENSMUST00000040154.10_GN:Cox6a1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000041697.10_ENSMUST00000040154.10_GN:Cox6a1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2e56383b964c7430abf2565b5fbbbe0e82363fbf --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000041697.10_ENSMUST00000040154.10_GN:Cox6a1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid @@ -0,0 +1,113 @@ +>ENSMUSG00000041697.10|ENSMUST00000040154.10|GN:Cox6a1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:1 +1 M 0.480 +2 M 0.514 +3 A 0.561 +4 S 0.595 +5 A 0.596 +6 V 0.568 +7 L 0.556 +8 S 0.591 +9 A 0.640 +10 S 0.663 +11 R 0.662 +12 V 0.657 +13 S 0.652 +14 R 0.652 +15 P 0.666 +16 L 0.684 +17 G 0.689 +18 R 0.683 +19 A 0.679 +20 L 0.687 +21 P 0.703 +22 G 0.715 +23 L 0.712 +24 R 0.703 +25 R 0.709 +26 P 0.736 +27 M 0.768 +28 S 0.784 +29 S 0.781 +30 G 0.768 +31 A 0.752 +32 H 0.731 +33 G 0.701 +34 E 0.661 +35 E 0.607 +36 G 0.531 +37 S 0.433 +38 A 0.332 +39 R 0.252 +40 M 0.197 +41 W 0.160 +42 K 0.136 +43 A 0.124 +44 L 0.115 +45 T 0.106 +46 Y 0.103 +47 F 0.110 +48 V 0.122 +49 A 0.138 +50 L 0.160 +51 P 0.188 +52 G 0.211 +53 V 0.214 +54 G 0.202 +55 V 0.190 +56 S 0.184 +57 M 0.182 +58 L 0.178 +59 N 0.171 +60 V 0.157 +61 F 0.142 +62 L 0.139 +63 K 0.155 +64 S 0.186 +65 R 0.220 +66 H 0.252 +67 E 0.285 +68 E 0.317 +69 H 0.339 +70 E 0.346 +71 R 0.341 +72 P 0.329 +73 P 0.315 +74 F 0.303 +75 V 0.292 +76 A 0.282 +77 Y 0.278 +78 P 0.282 +79 H 0.289 +80 L 0.291 +81 R 0.287 +82 I 0.295 +83 R 0.320 +84 T 0.358 +85 K 0.404 +86 P 0.463 +87 F 0.520 +88 P 0.547 +89 W 0.534 +90 G 0.502 +91 D 0.468 +92 G 0.442 +93 N 0.447 +94 H 0.489 +95 T 0.543 +96 L 0.570 +97 F 0.569 +98 H 0.551 +99 N 0.514 +100 P 0.461 +101 H 0.421 +102 V 0.413 +103 N 0.424 +104 P 0.436 +105 L 0.437 +106 P 0.426 +107 T 0.418 +108 G 0.428 +109 Y 0.453 +110 E 0.471 +111 D 0.472 +112 E 0.464 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000042082.8_ENSMUST00000091403.6_GN:Arsb_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000042082.8_ENSMUST00000091403.6_GN:Arsb_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b859701aa77418913b0f104a583aaa6b18ff770c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000042082.8_ENSMUST00000091403.6_GN:Arsb_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,535 @@ +>ENSMUSG00000042082.8|ENSMUST00000091403.6|GN:Arsb|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.333 +2 G 0.329 +3 K 0.332 +4 L 0.343 +5 S 0.348 +6 P 0.353 +7 C 0.379 +8 T 0.411 +9 G 0.418 +10 R 0.414 +11 S 0.435 +12 R 0.478 +13 P 0.513 +14 G 0.537 +15 G 0.560 +16 P 0.581 +17 G 0.586 +18 P 0.567 +19 Q 0.515 +20 L 0.435 +21 P 0.345 +22 L 0.266 +23 L 0.212 +24 L 0.182 +25 L 0.169 +26 L 0.166 +27 L 0.167 +28 Q 0.170 +29 L 0.171 +30 L 0.166 +31 L 0.166 +32 L 0.188 +33 L 0.237 +34 L 0.305 +35 S 0.377 +36 P 0.443 +37 A 0.494 +38 R 0.524 +39 A 0.537 +40 S 0.538 +41 G 0.522 +42 A 0.478 +43 T 0.404 +44 Q 0.314 +45 P 0.228 +46 P 0.164 +47 H 0.131 +48 V 0.121 +49 V 0.116 +50 F 0.108 +51 V 0.099 +52 L 0.092 +53 A 0.089 +54 D 0.090 +55 D 0.091 +56 L 0.084 +57 G 0.072 +58 W 0.068 +59 N 0.077 +60 D 0.093 +61 L 0.107 +62 G 0.123 +63 F 0.143 +64 H 0.162 +65 G 0.169 +66 S 0.162 +67 V 0.152 +68 I 0.144 +69 R 0.135 +70 T 0.124 +71 P 0.116 +72 H 0.114 +73 L 0.113 +74 D 0.110 +75 A 0.108 +76 L 0.116 +77 A 0.130 +78 A 0.141 +79 G 0.141 +80 G 0.132 +81 V 0.123 +82 V 0.116 +83 L 0.107 +84 D 0.095 +85 N 0.085 +86 Y 0.078 +87 Y 0.074 +88 V 0.072 +89 Q 0.072 +90 P 0.079 +91 L 0.089 +92 C 0.099 +93 T 0.115 +94 P 0.138 +95 S 0.158 +96 R 0.165 +97 S 0.162 +98 Q 0.158 +99 L 0.157 +100 L 0.158 +101 T 0.157 +102 G 0.153 +103 R 0.149 +104 Y 0.144 +105 Q 0.140 +106 I 0.144 +107 H 0.160 +108 L 0.179 +109 G 0.186 +110 L 0.180 +111 Q 0.174 +112 H 0.183 +113 Y 0.212 +114 L 0.242 +115 I 0.253 +116 M 0.240 +117 T 0.212 +118 C 0.181 +119 Q 0.155 +120 P 0.142 +121 S 0.140 +122 C 0.140 +123 V 0.134 +124 P 0.118 +125 L 0.101 +126 D 0.090 +127 E 0.082 +128 K 0.076 +129 L 0.073 +130 L 0.074 +131 P 0.077 +132 Q 0.077 +133 L 0.073 +134 L 0.066 +135 K 0.063 +136 E 0.068 +137 A 0.081 +138 G 0.095 +139 Y 0.103 +140 A 0.103 +141 T 0.104 +142 H 0.114 +143 M 0.132 +144 V 0.146 +145 G 0.148 +146 K 0.143 +147 W 0.137 +148 H 0.129 +149 L 0.117 +150 G 0.103 +151 M 0.090 +152 Y 0.082 +153 R 0.081 +154 K 0.084 +155 E 0.088 +156 C 0.088 +157 L 0.081 +158 P 0.074 +159 T 0.076 +160 R 0.090 +161 R 0.113 +162 G 0.132 +163 F 0.136 +164 D 0.128 +165 T 0.125 +166 Y 0.133 +167 F 0.146 +168 G 0.154 +169 Y 0.150 +170 L 0.139 +171 L 0.127 +172 G 0.125 +173 S 0.129 +174 E 0.131 +175 D 0.131 +176 Y 0.136 +177 Y 0.148 +178 T 0.160 +179 H 0.164 +180 E 0.163 +181 A 0.159 +182 C 0.158 +183 A 0.159 +184 P 0.157 +185 I 0.152 +186 E 0.147 +187 S 0.145 +188 L 0.144 +189 N 0.143 +190 G 0.143 +191 T 0.147 +192 R 0.151 +193 C 0.150 +194 A 0.147 +195 L 0.147 +196 D 0.149 +197 L 0.144 +198 R 0.133 +199 D 0.122 +200 G 0.121 +201 E 0.132 +202 E 0.151 +203 P 0.160 +204 A 0.151 +205 K 0.134 +206 E 0.125 +207 Y 0.126 +208 N 0.126 +209 N 0.118 +210 I 0.106 +211 Y 0.100 +212 S 0.099 +213 T 0.093 +214 N 0.084 +215 I 0.080 +216 F 0.086 +217 T 0.094 +218 K 0.097 +219 R 0.095 +220 A 0.093 +221 T 0.093 +222 T 0.091 +223 V 0.085 +224 I 0.080 +225 A 0.081 +226 N 0.087 +227 H 0.091 +228 P 0.088 +229 P 0.087 +230 E 0.096 +231 K 0.113 +232 P 0.132 +233 L 0.155 +234 F 0.177 +235 L 0.187 +236 Y 0.178 +237 L 0.160 +238 A 0.139 +239 F 0.121 +240 Q 0.113 +241 S 0.114 +242 V 0.113 +243 H 0.106 +244 D 0.101 +245 P 0.108 +246 L 0.120 +247 Q 0.128 +248 V 0.124 +249 P 0.108 +250 E 0.086 +251 E 0.069 +252 Y 0.059 +253 M 0.053 +254 E 0.051 +255 P 0.056 +256 Y 0.066 +257 G 0.075 +258 F 0.082 +259 I 0.087 +260 Q 0.092 +261 D 0.097 +262 K 0.104 +263 H 0.113 +264 R 0.122 +265 R 0.135 +266 I 0.159 +267 Y 0.186 +268 A 0.204 +269 G 0.213 +270 M 0.211 +271 V 0.199 +272 S 0.187 +273 L 0.176 +274 M 0.163 +275 D 0.141 +276 E 0.115 +277 A 0.092 +278 V 0.076 +279 G 0.065 +280 N 0.060 +281 V 0.062 +282 T 0.069 +283 K 0.072 +284 A 0.065 +285 L 0.052 +286 K 0.042 +287 S 0.038 +288 H 0.035 +289 G 0.033 +290 L 0.033 +291 W 0.035 +292 N 0.039 +293 N 0.045 +294 T 0.053 +295 V 0.058 +296 F 0.059 +297 I 0.056 +298 F 0.054 +299 S 0.056 +300 T 0.060 +301 D 0.068 +302 N 0.080 +303 G 0.093 +304 G 0.100 +305 Q 0.100 +306 T 0.105 +307 R 0.120 +308 S 0.137 +309 G 0.147 +310 G 0.143 +311 N 0.133 +312 N 0.124 +313 W 0.121 +314 P 0.127 +315 L 0.133 +316 R 0.130 +317 G 0.124 +318 R 0.118 +319 K 0.113 +320 G 0.107 +321 T 0.101 +322 L 0.100 +323 W 0.103 +324 E 0.109 +325 G 0.117 +326 G 0.126 +327 I 0.135 +328 R 0.141 +329 G 0.139 +330 T 0.125 +331 G 0.100 +332 F 0.076 +333 V 0.062 +334 A 0.064 +335 S 0.079 +336 P 0.098 +337 L 0.113 +338 L 0.122 +339 K 0.129 +340 Q 0.146 +341 K 0.170 +342 G 0.188 +343 V 0.190 +344 K 0.183 +345 S 0.178 +346 R 0.183 +347 E 0.197 +348 L 0.207 +349 M 0.197 +350 H 0.172 +351 I 0.152 +352 T 0.150 +353 D 0.155 +354 W 0.149 +355 L 0.131 +356 P 0.112 +357 T 0.096 +358 L 0.083 +359 V 0.071 +360 D 0.065 +361 L 0.070 +362 A 0.086 +363 G 0.109 +364 G 0.131 +365 S 0.150 +366 T 0.175 +367 N 0.205 +368 G 0.229 +369 T 0.236 +370 K 0.218 +371 P 0.182 +372 L 0.145 +373 D 0.125 +374 G 0.121 +375 F 0.120 +376 N 0.112 +377 M 0.097 +378 W 0.080 +379 K 0.070 +380 T 0.067 +381 I 0.070 +382 S 0.075 +383 E 0.084 +384 G 0.098 +385 H 0.114 +386 P 0.124 +387 S 0.125 +388 P 0.119 +389 R 0.115 +390 V 0.116 +391 E 0.120 +392 L 0.119 +393 L 0.108 +394 H 0.097 +395 N 0.097 +396 I 0.111 +397 D 0.136 +398 Q 0.167 +399 D 0.197 +400 F 0.215 +401 F 0.226 +402 D 0.236 +403 G 0.248 +404 L 0.264 +405 P 0.288 +406 C 0.325 +407 P 0.370 +408 G 0.406 +409 K 0.415 +410 N 0.402 +411 M 0.388 +412 T 0.389 +413 P 0.394 +414 A 0.387 +415 K 0.373 +416 D 0.362 +417 D 0.359 +418 S 0.361 +419 F 0.363 +420 P 0.369 +421 L 0.387 +422 E 0.415 +423 H 0.440 +424 S 0.434 +425 A 0.386 +426 F 0.316 +427 N 0.251 +428 T 0.204 +429 S 0.172 +430 I 0.145 +431 H 0.120 +432 A 0.099 +433 G 0.085 +434 I 0.076 +435 R 0.071 +436 Y 0.066 +437 K 0.064 +438 N 0.071 +439 W 0.082 +440 K 0.092 +441 L 0.099 +442 L 0.110 +443 T 0.136 +444 G 0.175 +445 H 0.213 +446 P 0.238 +447 G 0.249 +448 C 0.251 +449 G 0.240 +450 Y 0.218 +451 W 0.197 +452 F 0.194 +453 P 0.220 +454 P 0.273 +455 P 0.332 +456 S 0.379 +457 Q 0.408 +458 S 0.426 +459 N 0.437 +460 V 0.435 +461 S 0.421 +462 E 0.410 +463 I 0.408 +464 P 0.408 +465 P 0.398 +466 V 0.377 +467 D 0.353 +468 P 0.330 +469 P 0.299 +470 T 0.252 +471 K 0.198 +472 T 0.152 +473 L 0.126 +474 W 0.126 +475 L 0.142 +476 F 0.163 +477 D 0.172 +478 I 0.166 +479 N 0.154 +480 Q 0.144 +481 D 0.137 +482 P 0.131 +483 E 0.128 +484 E 0.127 +485 R 0.128 +486 H 0.127 +487 D 0.120 +488 V 0.104 +489 S 0.085 +490 R 0.070 +491 E 0.062 +492 H 0.058 +493 P 0.054 +494 H 0.050 +495 I 0.049 +496 V 0.051 +497 Q 0.057 +498 N 0.068 +499 L 0.082 +500 L 0.093 +501 S 0.099 +502 R 0.099 +503 L 0.093 +504 Q 0.087 +505 Y 0.090 +506 Y 0.104 +507 H 0.123 +508 E 0.140 +509 H 0.155 +510 S 0.167 +511 V 0.175 +512 P 0.184 +513 S 0.194 +514 H 0.200 +515 F 0.202 +516 P 0.203 +517 P 0.205 +518 L 0.208 +519 D 0.215 +520 P 0.226 +521 R 0.240 +522 C 0.250 +523 D 0.246 +524 P 0.228 +525 K 0.212 +526 S 0.210 +527 T 0.222 +528 G 0.236 +529 V 0.244 +530 W 0.248 +531 S 0.255 +532 P 0.271 +533 W 0.291 +534 M 0.307 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000042082.8_ENSMUST00000091403.6_GN:Arsb_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:28.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000042082.8_ENSMUST00000091403.6_GN:Arsb_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:28.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..73e2bde98e36e610aa427c94871a4452bd4e21dd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000042082.8_ENSMUST00000091403.6_GN:Arsb_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:28.caid @@ -0,0 +1,563 @@ +>ENSMUSG00000042082.8|ENSMUST00000091403.6|GN:Arsb|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:28 +1 M 0.309 +2 K 0.306 +3 S 0.314 +4 C 0.334 +5 W 0.350 +6 G 0.365 +7 A 0.399 +8 R 0.436 +9 P 0.441 +10 L 0.422 +11 S 0.411 +12 S 0.409 +13 R 0.423 +14 F 0.466 +15 C 0.519 +16 R 0.551 +17 G 0.563 +18 C 0.567 +19 P 0.566 +20 Q 0.562 +21 H 0.567 +22 G 0.577 +23 L 0.565 +24 C 0.523 +25 R 0.476 +26 L 0.448 +27 L 0.435 +28 R 0.448 +29 M 0.500 +30 G 0.562 +31 K 0.599 +32 L 0.618 +33 S 0.640 +34 P 0.659 +35 C 0.658 +36 T 0.624 +37 G 0.566 +38 R 0.523 +39 S 0.536 +40 R 0.589 +41 P 0.636 +42 G 0.656 +43 G 0.657 +44 P 0.648 +45 G 0.633 +46 P 0.606 +47 Q 0.559 +48 L 0.492 +49 P 0.410 +50 L 0.323 +51 L 0.252 +52 L 0.208 +53 L 0.193 +54 L 0.194 +55 L 0.198 +56 Q 0.202 +57 L 0.204 +58 L 0.202 +59 L 0.203 +60 L 0.224 +61 L 0.270 +62 L 0.334 +63 S 0.407 +64 P 0.478 +65 A 0.533 +66 R 0.563 +67 A 0.574 +68 S 0.572 +69 G 0.551 +70 A 0.501 +71 T 0.419 +72 Q 0.323 +73 P 0.233 +74 P 0.166 +75 H 0.131 +76 V 0.120 +77 V 0.113 +78 F 0.104 +79 V 0.095 +80 L 0.088 +81 A 0.086 +82 D 0.088 +83 D 0.089 +84 L 0.082 +85 G 0.070 +86 W 0.065 +87 N 0.072 +88 D 0.087 +89 L 0.100 +90 G 0.116 +91 F 0.137 +92 H 0.156 +93 G 0.163 +94 S 0.157 +95 V 0.147 +96 I 0.139 +97 R 0.130 +98 T 0.118 +99 P 0.111 +100 H 0.109 +101 L 0.108 +102 D 0.104 +103 A 0.102 +104 L 0.109 +105 A 0.123 +106 A 0.135 +107 G 0.135 +108 G 0.127 +109 V 0.118 +110 V 0.111 +111 L 0.101 +112 D 0.090 +113 N 0.081 +114 Y 0.076 +115 Y 0.073 +116 V 0.070 +117 Q 0.071 +118 P 0.077 +119 L 0.087 +120 C 0.097 +121 T 0.112 +122 P 0.134 +123 S 0.155 +124 R 0.163 +125 S 0.161 +126 Q 0.158 +127 L 0.157 +128 L 0.158 +129 T 0.157 +130 G 0.154 +131 R 0.150 +132 Y 0.147 +133 Q 0.144 +134 I 0.148 +135 H 0.164 +136 L 0.184 +137 G 0.194 +138 L 0.190 +139 Q 0.186 +140 H 0.197 +141 Y 0.227 +142 L 0.259 +143 I 0.268 +144 M 0.251 +145 T 0.219 +146 C 0.187 +147 Q 0.161 +148 P 0.148 +149 S 0.147 +150 C 0.148 +151 V 0.140 +152 P 0.123 +153 L 0.105 +154 D 0.093 +155 E 0.086 +156 K 0.078 +157 L 0.074 +158 L 0.075 +159 P 0.077 +160 Q 0.077 +161 L 0.072 +162 L 0.066 +163 K 0.063 +164 E 0.068 +165 A 0.081 +166 G 0.095 +167 Y 0.103 +168 A 0.103 +169 T 0.103 +170 H 0.113 +171 M 0.131 +172 V 0.146 +173 G 0.148 +174 K 0.142 +175 W 0.136 +176 H 0.129 +177 L 0.117 +178 G 0.102 +179 M 0.089 +180 Y 0.081 +181 R 0.079 +182 K 0.082 +183 E 0.086 +184 C 0.086 +185 L 0.079 +186 P 0.072 +187 T 0.074 +188 R 0.087 +189 R 0.110 +190 G 0.130 +191 F 0.134 +192 D 0.126 +193 T 0.123 +194 Y 0.133 +195 F 0.147 +196 G 0.154 +197 Y 0.150 +198 L 0.138 +199 L 0.127 +200 G 0.125 +201 S 0.130 +202 E 0.133 +203 D 0.132 +204 Y 0.138 +205 Y 0.150 +206 T 0.160 +207 H 0.164 +208 E 0.161 +209 A 0.157 +210 C 0.155 +211 A 0.155 +212 P 0.153 +213 I 0.148 +214 E 0.143 +215 S 0.141 +216 L 0.140 +217 N 0.139 +218 G 0.139 +219 T 0.143 +220 R 0.147 +221 C 0.147 +222 A 0.143 +223 L 0.142 +224 D 0.144 +225 L 0.140 +226 R 0.129 +227 D 0.118 +228 G 0.115 +229 E 0.126 +230 E 0.145 +231 P 0.156 +232 A 0.148 +233 K 0.131 +234 E 0.122 +235 Y 0.122 +236 N 0.122 +237 N 0.114 +238 I 0.102 +239 Y 0.097 +240 S 0.097 +241 T 0.092 +242 N 0.083 +243 I 0.080 +244 F 0.086 +245 T 0.094 +246 K 0.097 +247 R 0.095 +248 A 0.093 +249 T 0.093 +250 T 0.091 +251 V 0.085 +252 I 0.080 +253 A 0.082 +254 N 0.088 +255 H 0.091 +256 P 0.088 +257 P 0.088 +258 E 0.097 +259 K 0.114 +260 P 0.134 +261 L 0.157 +262 F 0.180 +263 L 0.189 +264 Y 0.181 +265 L 0.163 +266 A 0.142 +267 F 0.124 +268 Q 0.116 +269 S 0.118 +270 V 0.117 +271 H 0.109 +272 D 0.104 +273 P 0.111 +274 L 0.125 +275 Q 0.133 +276 V 0.129 +277 P 0.112 +278 E 0.089 +279 E 0.071 +280 Y 0.061 +281 M 0.055 +282 E 0.054 +283 P 0.058 +284 Y 0.069 +285 G 0.079 +286 F 0.086 +287 I 0.091 +288 Q 0.095 +289 D 0.100 +290 K 0.107 +291 H 0.116 +292 R 0.124 +293 R 0.137 +294 I 0.161 +295 Y 0.188 +296 A 0.207 +297 G 0.216 +298 M 0.214 +299 V 0.204 +300 S 0.191 +301 L 0.181 +302 M 0.166 +303 D 0.144 +304 E 0.117 +305 A 0.094 +306 V 0.078 +307 G 0.067 +308 N 0.061 +309 V 0.063 +310 T 0.070 +311 K 0.074 +312 A 0.066 +313 L 0.053 +314 K 0.044 +315 S 0.039 +316 H 0.037 +317 G 0.035 +318 L 0.035 +319 W 0.038 +320 N 0.042 +321 N 0.048 +322 T 0.055 +323 V 0.060 +324 F 0.060 +325 I 0.057 +326 F 0.056 +327 S 0.057 +328 T 0.062 +329 D 0.070 +330 N 0.083 +331 G 0.096 +332 G 0.103 +333 Q 0.103 +334 T 0.108 +335 R 0.124 +336 S 0.142 +337 G 0.152 +338 G 0.148 +339 N 0.137 +340 N 0.127 +341 W 0.124 +342 P 0.130 +343 L 0.136 +344 R 0.133 +345 G 0.127 +346 R 0.121 +347 K 0.116 +348 G 0.110 +349 T 0.105 +350 L 0.104 +351 W 0.107 +352 E 0.113 +353 G 0.120 +354 G 0.129 +355 I 0.137 +356 R 0.142 +357 G 0.140 +358 T 0.125 +359 G 0.101 +360 F 0.077 +361 V 0.064 +362 A 0.066 +363 S 0.081 +364 P 0.099 +365 L 0.114 +366 L 0.121 +367 K 0.128 +368 Q 0.143 +369 K 0.166 +370 G 0.183 +371 V 0.186 +372 K 0.180 +373 S 0.175 +374 R 0.180 +375 E 0.194 +376 L 0.204 +377 M 0.195 +378 H 0.171 +379 I 0.152 +380 T 0.150 +381 D 0.154 +382 W 0.148 +383 L 0.130 +384 P 0.111 +385 T 0.095 +386 L 0.082 +387 V 0.070 +388 D 0.064 +389 L 0.068 +390 A 0.083 +391 G 0.105 +392 G 0.127 +393 S 0.146 +394 T 0.170 +395 N 0.199 +396 G 0.224 +397 T 0.231 +398 K 0.213 +399 P 0.178 +400 L 0.142 +401 D 0.122 +402 G 0.119 +403 F 0.118 +404 N 0.111 +405 M 0.096 +406 W 0.079 +407 K 0.069 +408 T 0.066 +409 I 0.068 +410 S 0.073 +411 E 0.082 +412 G 0.096 +413 H 0.113 +414 P 0.123 +415 S 0.124 +416 P 0.119 +417 R 0.115 +418 V 0.116 +419 E 0.119 +420 L 0.117 +421 L 0.107 +422 H 0.096 +423 N 0.096 +424 I 0.110 +425 D 0.136 +426 Q 0.169 +427 D 0.199 +428 F 0.218 +429 F 0.230 +430 D 0.240 +431 G 0.253 +432 L 0.269 +433 P 0.293 +434 C 0.329 +435 P 0.373 +436 G 0.409 +437 K 0.418 +438 N 0.404 +439 M 0.391 +440 T 0.391 +441 P 0.396 +442 A 0.389 +443 K 0.374 +444 D 0.364 +445 D 0.362 +446 S 0.363 +447 F 0.366 +448 P 0.372 +449 L 0.389 +450 E 0.416 +451 H 0.439 +452 S 0.432 +453 A 0.384 +454 F 0.314 +455 N 0.250 +456 T 0.205 +457 S 0.173 +458 I 0.147 +459 H 0.122 +460 A 0.100 +461 G 0.085 +462 I 0.077 +463 R 0.072 +464 Y 0.067 +465 K 0.066 +466 N 0.072 +467 W 0.084 +468 K 0.093 +469 L 0.100 +470 L 0.111 +471 T 0.137 +472 G 0.177 +473 H 0.215 +474 P 0.239 +475 G 0.251 +476 C 0.252 +477 G 0.242 +478 Y 0.220 +479 W 0.198 +480 F 0.196 +481 P 0.223 +482 P 0.275 +483 P 0.335 +484 S 0.381 +485 Q 0.408 +486 S 0.426 +487 N 0.437 +488 V 0.435 +489 S 0.422 +490 E 0.411 +491 I 0.411 +492 P 0.412 +493 P 0.403 +494 V 0.381 +495 D 0.356 +496 P 0.332 +497 P 0.300 +498 T 0.254 +499 K 0.199 +500 T 0.153 +501 L 0.128 +502 W 0.127 +503 L 0.145 +504 F 0.167 +505 D 0.177 +506 I 0.171 +507 N 0.158 +508 Q 0.147 +509 D 0.139 +510 P 0.132 +511 E 0.129 +512 E 0.129 +513 R 0.129 +514 H 0.128 +515 D 0.121 +516 V 0.105 +517 S 0.086 +518 R 0.070 +519 E 0.062 +520 H 0.058 +521 P 0.054 +522 H 0.051 +523 I 0.050 +524 V 0.051 +525 Q 0.058 +526 N 0.069 +527 L 0.083 +528 L 0.094 +529 S 0.100 +530 R 0.100 +531 L 0.095 +532 Q 0.088 +533 Y 0.091 +534 Y 0.105 +535 H 0.124 +536 E 0.142 +537 H 0.156 +538 S 0.167 +539 V 0.176 +540 P 0.185 +541 S 0.194 +542 H 0.200 +543 F 0.202 +544 P 0.203 +545 P 0.205 +546 L 0.208 +547 D 0.214 +548 P 0.223 +549 R 0.236 +550 C 0.247 +551 D 0.245 +552 P 0.228 +553 K 0.213 +554 S 0.213 +555 T 0.227 +556 G 0.243 +557 V 0.253 +558 W 0.256 +559 S 0.261 +560 P 0.272 +561 W 0.286 +562 M 0.296 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000042312.12_ENSMUST00000250017.1_GN:S100a13_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000042312.12_ENSMUST00000250017.1_GN:S100a13_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5521755e0d0b33f61d9dcf0fcd2df5d0e37dd1cd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000042312.12_ENSMUST00000250017.1_GN:S100a13_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,99 @@ +>ENSMUSG00000042312.12|ENSMUST00000250017.1|GN:S100a13|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.462 +2 A 0.478 +3 A 0.484 +4 E 0.458 +5 T 0.404 +6 L 0.335 +7 T 0.265 +8 E 0.207 +9 L 0.172 +10 E 0.159 +11 A 0.159 +12 A 0.159 +13 I 0.152 +14 E 0.136 +15 T 0.110 +16 V 0.082 +17 V 0.063 +18 S 0.053 +19 T 0.047 +20 F 0.045 +21 F 0.049 +22 T 0.057 +23 F 0.069 +24 A 0.088 +25 G 0.112 +26 R 0.136 +27 E 0.153 +28 G 0.159 +29 R 0.157 +30 K 0.152 +31 G 0.149 +32 S 0.142 +33 L 0.124 +34 N 0.097 +35 I 0.075 +36 N 0.064 +37 E 0.059 +38 F 0.053 +39 K 0.051 +40 E 0.054 +41 L 0.060 +42 A 0.068 +43 T 0.078 +44 Q 0.090 +45 Q 0.097 +46 L 0.095 +47 P 0.088 +48 H 0.085 +49 L 0.095 +50 L 0.116 +51 K 0.138 +52 D 0.149 +53 V 0.141 +54 G 0.120 +55 S 0.094 +56 L 0.073 +57 D 0.063 +58 E 0.060 +59 K 0.060 +60 M 0.061 +61 K 0.061 +62 T 0.066 +63 L 0.077 +64 D 0.097 +65 V 0.118 +66 N 0.128 +67 Q 0.124 +68 D 0.116 +69 S 0.115 +70 E 0.118 +71 L 0.113 +72 R 0.094 +73 F 0.074 +74 S 0.063 +75 E 0.063 +76 Y 0.063 +77 W 0.060 +78 R 0.058 +79 L 0.057 +80 I 0.056 +81 G 0.057 +82 E 0.063 +83 L 0.075 +84 A 0.090 +85 K 0.102 +86 E 0.106 +87 V 0.108 +88 R 0.120 +89 K 0.144 +90 E 0.175 +91 K 0.211 +92 A 0.253 +93 L 0.301 +94 G 0.345 +95 I 0.374 +96 R 0.378 +97 K 0.361 +98 K 0.341 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000042312.12_ENSMUST00000250017.1_GN:S100a13_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:62.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000042312.12_ENSMUST00000250017.1_GN:S100a13_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:62.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..20216114c2459b4e0511da163d7f8abeea0ea47b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000042312.12_ENSMUST00000250017.1_GN:S100a13_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:62.caid @@ -0,0 +1,161 @@ +>ENSMUSG00000042312.12|ENSMUST00000250017.1|GN:S100a13|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:62 +1 M 0.381 +2 A 0.388 +3 S 0.414 +4 D 0.451 +5 S 0.477 +6 R 0.502 +7 G 0.552 +8 G 0.608 +9 P 0.623 +10 L 0.597 +11 S 0.582 +12 G 0.615 +13 G 0.660 +14 G 0.676 +15 N 0.663 +16 L 0.641 +17 T 0.616 +18 L 0.584 +19 Q 0.539 +20 T 0.480 +21 W 0.424 +22 E 0.389 +23 W 0.375 +24 L 0.374 +25 S 0.376 +26 P 0.369 +27 C 0.350 +28 L 0.331 +29 V 0.328 +30 L 0.343 +31 I 0.368 +32 N 0.396 +33 F 0.417 +34 S 0.426 +35 L 0.429 +36 R 0.442 +37 A 0.482 +38 P 0.547 +39 D 0.609 +40 R 0.647 +41 L 0.662 +42 A 0.664 +43 A 0.653 +44 S 0.634 +45 H 0.620 +46 L 0.622 +47 L 0.635 +48 S 0.645 +49 R 0.649 +50 S 0.645 +51 I 0.627 +52 C 0.594 +53 V 0.554 +54 D 0.510 +55 I 0.469 +56 S 0.451 +57 S 0.464 +58 C 0.496 +59 F 0.540 +60 G 0.591 +61 I 0.627 +62 L 0.638 +63 M 0.636 +64 A 0.630 +65 A 0.605 +66 E 0.554 +67 T 0.484 +68 L 0.406 +69 T 0.326 +70 E 0.258 +71 L 0.217 +72 E 0.206 +73 A 0.212 +74 A 0.214 +75 I 0.203 +76 E 0.178 +77 T 0.142 +78 V 0.106 +79 V 0.082 +80 S 0.067 +81 T 0.056 +82 F 0.049 +83 F 0.050 +84 T 0.056 +85 F 0.066 +86 A 0.082 +87 G 0.103 +88 R 0.122 +89 E 0.134 +90 G 0.137 +91 R 0.133 +92 K 0.130 +93 G 0.129 +94 S 0.126 +95 L 0.113 +96 N 0.090 +97 I 0.071 +98 N 0.063 +99 E 0.058 +100 F 0.051 +101 K 0.047 +102 E 0.049 +103 L 0.053 +104 A 0.059 +105 T 0.065 +106 Q 0.074 +107 Q 0.079 +108 L 0.077 +109 P 0.071 +110 H 0.070 +111 L 0.080 +112 L 0.100 +113 K 0.119 +114 D 0.129 +115 V 0.125 +116 G 0.109 +117 S 0.088 +118 L 0.069 +119 D 0.058 +120 E 0.055 +121 K 0.055 +122 M 0.056 +123 K 0.058 +124 T 0.064 +125 L 0.077 +126 D 0.097 +127 V 0.116 +128 N 0.125 +129 Q 0.122 +130 D 0.115 +131 S 0.112 +132 E 0.113 +133 L 0.107 +134 R 0.088 +135 F 0.067 +136 S 0.057 +137 E 0.056 +138 Y 0.056 +139 W 0.052 +140 R 0.049 +141 L 0.048 +142 I 0.047 +143 G 0.048 +144 E 0.055 +145 L 0.069 +146 A 0.088 +147 K 0.103 +148 E 0.109 +149 V 0.111 +150 R 0.123 +151 K 0.149 +152 E 0.184 +153 K 0.221 +154 A 0.266 +155 L 0.316 +156 G 0.362 +157 I 0.391 +158 R 0.395 +159 K 0.378 +160 K 0.360 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000043017.10_ENSMUST00000144408.2_GN:Ptgir_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000043017.10_ENSMUST00000144408.2_GN:Ptgir_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0dfd6d58373e0a6a75bd2f6d5c1fe61e4945d837 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000043017.10_ENSMUST00000144408.2_GN:Ptgir_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,416 @@ +>ENSMUSG00000043017.10|ENSMUST00000144408.2|GN:Ptgir|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.333 +2 M 0.355 +3 A 0.396 +4 S 0.449 +5 D 0.494 +6 G 0.517 +7 H 0.523 +8 P 0.524 +9 G 0.528 +10 P 0.538 +11 P 0.549 +12 S 0.553 +13 V 0.549 +14 T 0.551 +15 P 0.569 +16 G 0.596 +17 S 0.623 +18 P 0.641 +19 L 0.650 +20 S 0.653 +21 A 0.653 +22 G 0.642 +23 G 0.611 +24 R 0.561 +25 E 0.511 +26 W 0.478 +27 Q 0.461 +28 G 0.449 +29 M 0.429 +30 A 0.385 +31 G 0.312 +32 S 0.223 +33 C 0.146 +34 W 0.099 +35 N 0.081 +36 I 0.080 +37 T 0.087 +38 Y 0.096 +39 V 0.102 +40 Q 0.102 +41 D 0.096 +42 S 0.088 +43 V 0.079 +44 G 0.069 +45 P 0.058 +46 A 0.048 +47 T 0.043 +48 S 0.043 +49 T 0.041 +50 L 0.038 +51 M 0.037 +52 F 0.037 +53 V 0.038 +54 A 0.040 +55 G 0.039 +56 V 0.038 +57 V 0.040 +58 G 0.044 +59 N 0.048 +60 G 0.049 +61 L 0.048 +62 A 0.046 +63 L 0.047 +64 G 0.053 +65 I 0.060 +66 L 0.066 +67 G 0.073 +68 A 0.082 +69 R 0.094 +70 R 0.109 +71 R 0.130 +72 S 0.149 +73 H 0.155 +74 P 0.143 +75 S 0.119 +76 A 0.092 +77 F 0.067 +78 A 0.046 +79 V 0.036 +80 L 0.035 +81 V 0.041 +82 T 0.050 +83 G 0.054 +84 L 0.050 +85 A 0.043 +86 V 0.040 +87 T 0.040 +88 D 0.041 +89 L 0.039 +90 L 0.034 +91 G 0.028 +92 T 0.023 +93 C 0.021 +94 F 0.021 +95 L 0.023 +96 S 0.025 +97 P 0.025 +98 A 0.023 +99 V 0.021 +100 F 0.020 +101 V 0.021 +102 A 0.024 +103 Y 0.032 +104 A 0.043 +105 R 0.054 +106 N 0.063 +107 S 0.073 +108 S 0.084 +109 L 0.098 +110 L 0.112 +111 G 0.122 +112 L 0.128 +113 A 0.137 +114 H 0.153 +115 G 0.164 +116 G 0.151 +117 T 0.114 +118 M 0.074 +119 L 0.049 +120 C 0.037 +121 D 0.032 +122 T 0.031 +123 F 0.033 +124 A 0.037 +125 F 0.039 +126 A 0.036 +127 M 0.032 +128 T 0.028 +129 F 0.027 +130 F 0.028 +131 G 0.032 +132 L 0.036 +133 A 0.038 +134 S 0.038 +135 T 0.035 +136 L 0.033 +137 I 0.032 +138 L 0.030 +139 F 0.028 +140 A 0.028 +141 M 0.032 +142 A 0.037 +143 V 0.043 +144 E 0.047 +145 R 0.048 +146 C 0.047 +147 L 0.049 +148 A 0.056 +149 L 0.064 +150 S 0.065 +151 H 0.059 +152 P 0.050 +153 Y 0.044 +154 L 0.046 +155 Y 0.052 +156 A 0.061 +157 Q 0.070 +158 L 0.077 +159 D 0.075 +160 G 0.062 +161 P 0.046 +162 R 0.034 +163 C 0.031 +164 A 0.033 +165 R 0.037 +166 F 0.045 +167 A 0.055 +168 L 0.060 +169 P 0.059 +170 S 0.057 +171 I 0.057 +172 Y 0.054 +173 A 0.048 +174 F 0.044 +175 C 0.042 +176 C 0.041 +177 L 0.045 +178 F 0.054 +179 C 0.067 +180 S 0.079 +181 L 0.088 +182 P 0.095 +183 L 0.102 +184 L 0.113 +185 G 0.125 +186 L 0.135 +187 G 0.136 +188 E 0.128 +189 H 0.118 +190 Q 0.112 +191 Q 0.109 +192 Y 0.106 +193 C 0.103 +194 P 0.096 +195 G 0.081 +196 S 0.062 +197 W 0.049 +198 C 0.049 +199 F 0.062 +200 I 0.079 +201 R 0.095 +202 M 0.110 +203 R 0.132 +204 S 0.159 +205 A 0.183 +206 Q 0.197 +207 P 0.200 +208 G 0.188 +209 G 0.158 +210 C 0.119 +211 A 0.085 +212 F 0.064 +213 S 0.057 +214 L 0.058 +215 A 0.062 +216 Y 0.064 +217 A 0.064 +218 S 0.065 +219 L 0.067 +220 M 0.067 +221 A 0.061 +222 L 0.054 +223 L 0.051 +224 V 0.056 +225 T 0.063 +226 S 0.068 +227 I 0.063 +228 F 0.051 +229 F 0.042 +230 C 0.040 +231 N 0.044 +232 G 0.048 +233 S 0.053 +234 V 0.060 +235 T 0.069 +236 L 0.073 +237 S 0.069 +238 L 0.063 +239 Y 0.064 +240 H 0.068 +241 M 0.066 +242 Y 0.063 +243 R 0.068 +244 Q 0.084 +245 Q 0.105 +246 R 0.134 +247 R 0.174 +248 H 0.230 +249 H 0.289 +250 G 0.330 +251 S 0.347 +252 F 0.350 +253 V 0.351 +254 P 0.343 +255 T 0.315 +256 S 0.274 +257 R 0.234 +258 A 0.200 +259 R 0.165 +260 E 0.129 +261 D 0.099 +262 E 0.080 +263 V 0.069 +264 Y 0.058 +265 H 0.047 +266 L 0.041 +267 I 0.038 +268 L 0.036 +269 L 0.034 +270 A 0.031 +271 L 0.031 +272 M 0.033 +273 T 0.035 +274 V 0.037 +275 I 0.038 +276 M 0.035 +277 A 0.031 +278 V 0.027 +279 C 0.028 +280 S 0.031 +281 L 0.034 +282 P 0.034 +283 L 0.031 +284 M 0.027 +285 I 0.027 +286 R 0.028 +287 G 0.027 +288 F 0.025 +289 T 0.026 +290 Q 0.036 +291 A 0.058 +292 I 0.090 +293 A 0.124 +294 P 0.152 +295 D 0.174 +296 S 0.181 +297 R 0.165 +298 E 0.140 +299 M 0.121 +300 G 0.104 +301 D 0.081 +302 L 0.059 +303 L 0.048 +304 A 0.048 +305 F 0.052 +306 R 0.058 +307 F 0.066 +308 N 0.072 +309 A 0.076 +310 F 0.082 +311 N 0.086 +312 P 0.081 +313 I 0.068 +314 L 0.054 +315 D 0.044 +316 P 0.037 +317 W 0.034 +318 V 0.030 +319 F 0.025 +320 I 0.021 +321 L 0.019 +322 F 0.021 +323 R 0.025 +324 K 0.032 +325 A 0.042 +326 V 0.052 +327 F 0.063 +328 Q 0.075 +329 R 0.088 +330 L 0.095 +331 K 0.094 +332 F 0.086 +333 W 0.075 +334 L 0.067 +335 C 0.074 +336 C 0.106 +337 L 0.161 +338 C 0.228 +339 A 0.308 +340 R 0.406 +341 S 0.508 +342 V 0.585 +343 H 0.626 +344 G 0.641 +345 D 0.638 +346 L 0.625 +347 Q 0.615 +348 A 0.619 +349 P 0.631 +350 L 0.644 +351 S 0.656 +352 R 0.675 +353 P 0.703 +354 A 0.730 +355 S 0.749 +356 G 0.752 +357 R 0.736 +358 R 0.708 +359 D 0.685 +360 P 0.681 +361 P 0.699 +362 A 0.732 +363 P 0.765 +364 T 0.776 +365 S 0.744 +366 L 0.680 +367 Q 0.642 +368 A 0.671 +369 K 0.732 +370 E 0.770 +371 G 0.770 +372 S 0.749 +373 W 0.724 +374 V 0.710 +375 P 0.711 +376 L 0.722 +377 S 0.733 +378 S 0.738 +379 W 0.747 +380 G 0.766 +381 T 0.786 +382 G 0.794 +383 Q 0.790 +384 V 0.777 +385 A 0.768 +386 P 0.769 +387 L 0.776 +388 T 0.782 +389 A 0.785 +390 V 0.785 +391 P 0.787 +392 L 0.792 +393 T 0.797 +394 G 0.799 +395 G 0.799 +396 D 0.793 +397 G 0.782 +398 C 0.769 +399 S 0.761 +400 V 0.752 +401 G 0.731 +402 M 0.698 +403 P 0.659 +404 S 0.615 +405 K 0.572 +406 S 0.549 +407 E 0.544 +408 A 0.524 +409 I 0.475 +410 A 0.424 +411 A 0.396 +412 C 0.374 +413 S 0.337 +414 L 0.303 +415 C 0.285 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000043017.10_ENSMUST00000144408.2_GN:Ptgir_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000043017.10_ENSMUST00000144408.2_GN:Ptgir_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..66e0c967a75234c4f58db13e636b7cc028538690 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000043017.10_ENSMUST00000144408.2_GN:Ptgir_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid @@ -0,0 +1,418 @@ +>ENSMUSG00000043017.10|ENSMUST00000144408.2|GN:Ptgir|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:2 +1 M 0.323 +2 K 0.344 +3 M 0.372 +4 M 0.391 +5 A 0.395 +6 S 0.408 +7 D 0.446 +8 G 0.488 +9 H 0.510 +10 P 0.518 +11 G 0.520 +12 P 0.509 +13 P 0.482 +14 S 0.466 +15 V 0.490 +16 T 0.539 +17 P 0.585 +18 G 0.620 +19 S 0.645 +20 P 0.662 +21 L 0.670 +22 S 0.671 +23 A 0.670 +24 G 0.658 +25 G 0.627 +26 R 0.578 +27 E 0.531 +28 W 0.498 +29 Q 0.480 +30 G 0.467 +31 M 0.443 +32 A 0.397 +33 G 0.320 +34 S 0.228 +35 C 0.149 +36 W 0.101 +37 N 0.084 +38 I 0.084 +39 T 0.090 +40 Y 0.098 +41 V 0.103 +42 Q 0.103 +43 D 0.097 +44 S 0.088 +45 V 0.079 +46 G 0.069 +47 P 0.058 +48 A 0.048 +49 T 0.043 +50 S 0.043 +51 T 0.041 +52 L 0.038 +53 M 0.036 +54 F 0.036 +55 V 0.038 +56 A 0.039 +57 G 0.039 +58 V 0.038 +59 V 0.040 +60 G 0.044 +61 N 0.048 +62 G 0.049 +63 L 0.048 +64 A 0.046 +65 L 0.047 +66 G 0.053 +67 I 0.060 +68 L 0.066 +69 G 0.073 +70 A 0.082 +71 R 0.094 +72 R 0.109 +73 R 0.129 +74 S 0.149 +75 H 0.155 +76 P 0.142 +77 S 0.119 +78 A 0.093 +79 F 0.067 +80 A 0.046 +81 V 0.036 +82 L 0.035 +83 V 0.041 +84 T 0.050 +85 G 0.054 +86 L 0.050 +87 A 0.043 +88 V 0.039 +89 T 0.040 +90 D 0.041 +91 L 0.039 +92 L 0.033 +93 G 0.027 +94 T 0.023 +95 C 0.021 +96 F 0.021 +97 L 0.023 +98 S 0.025 +99 P 0.025 +100 A 0.023 +101 V 0.021 +102 F 0.020 +103 V 0.021 +104 A 0.024 +105 Y 0.031 +106 A 0.042 +107 R 0.054 +108 N 0.063 +109 S 0.073 +110 S 0.084 +111 L 0.098 +112 L 0.112 +113 G 0.123 +114 L 0.129 +115 A 0.138 +116 H 0.155 +117 G 0.166 +118 G 0.153 +119 T 0.115 +120 M 0.075 +121 L 0.049 +122 C 0.037 +123 D 0.032 +124 T 0.031 +125 F 0.033 +126 A 0.037 +127 F 0.038 +128 A 0.036 +129 M 0.032 +130 T 0.028 +131 F 0.027 +132 F 0.028 +133 G 0.032 +134 L 0.036 +135 A 0.038 +136 S 0.038 +137 T 0.035 +138 L 0.033 +139 I 0.032 +140 L 0.030 +141 F 0.028 +142 A 0.028 +143 M 0.031 +144 A 0.037 +145 V 0.043 +146 E 0.047 +147 R 0.048 +148 C 0.047 +149 L 0.049 +150 A 0.056 +151 L 0.064 +152 S 0.065 +153 H 0.059 +154 P 0.050 +155 Y 0.045 +156 L 0.046 +157 Y 0.053 +158 A 0.062 +159 Q 0.071 +160 L 0.077 +161 D 0.075 +162 G 0.062 +163 P 0.046 +164 R 0.034 +165 C 0.031 +166 A 0.033 +167 R 0.037 +168 F 0.045 +169 A 0.055 +170 L 0.060 +171 P 0.059 +172 S 0.057 +173 I 0.056 +174 Y 0.053 +175 A 0.047 +176 F 0.043 +177 C 0.041 +178 C 0.041 +179 L 0.045 +180 F 0.054 +181 C 0.067 +182 S 0.079 +183 L 0.088 +184 P 0.095 +185 L 0.102 +186 L 0.113 +187 G 0.125 +188 L 0.135 +189 G 0.136 +190 E 0.128 +191 H 0.119 +192 Q 0.112 +193 Q 0.109 +194 Y 0.106 +195 C 0.103 +196 P 0.096 +197 G 0.081 +198 S 0.062 +199 W 0.049 +200 C 0.049 +201 F 0.062 +202 I 0.079 +203 R 0.095 +204 M 0.111 +205 R 0.133 +206 S 0.160 +207 A 0.184 +208 Q 0.198 +209 P 0.201 +210 G 0.188 +211 G 0.158 +212 C 0.118 +213 A 0.084 +214 F 0.064 +215 S 0.057 +216 L 0.058 +217 A 0.062 +218 Y 0.064 +219 A 0.064 +220 S 0.065 +221 L 0.067 +222 M 0.067 +223 A 0.061 +224 L 0.054 +225 L 0.051 +226 V 0.056 +227 T 0.063 +228 S 0.068 +229 I 0.063 +230 F 0.051 +231 F 0.042 +232 C 0.040 +233 N 0.044 +234 G 0.048 +235 S 0.053 +236 V 0.060 +237 T 0.068 +238 L 0.073 +239 S 0.068 +240 L 0.062 +241 Y 0.064 +242 H 0.068 +243 M 0.066 +244 Y 0.063 +245 R 0.069 +246 Q 0.085 +247 Q 0.108 +248 R 0.137 +249 R 0.177 +250 H 0.232 +251 H 0.290 +252 G 0.331 +253 S 0.347 +254 F 0.350 +255 V 0.351 +256 P 0.343 +257 T 0.316 +258 S 0.275 +259 R 0.234 +260 A 0.200 +261 R 0.166 +262 E 0.129 +263 D 0.099 +264 E 0.080 +265 V 0.069 +266 Y 0.058 +267 H 0.047 +268 L 0.041 +269 I 0.038 +270 L 0.036 +271 L 0.034 +272 A 0.031 +273 L 0.031 +274 M 0.033 +275 T 0.035 +276 V 0.037 +277 I 0.038 +278 M 0.035 +279 A 0.031 +280 V 0.027 +281 C 0.028 +282 S 0.031 +283 L 0.035 +284 P 0.034 +285 L 0.031 +286 M 0.028 +287 I 0.027 +288 R 0.028 +289 G 0.027 +290 F 0.025 +291 T 0.027 +292 Q 0.036 +293 A 0.058 +294 I 0.091 +295 A 0.125 +296 P 0.154 +297 D 0.176 +298 S 0.182 +299 R 0.167 +300 E 0.141 +301 M 0.122 +302 G 0.105 +303 D 0.082 +304 L 0.059 +305 L 0.049 +306 A 0.048 +307 F 0.052 +308 R 0.058 +309 F 0.066 +310 N 0.072 +311 A 0.076 +312 F 0.082 +313 N 0.087 +314 P 0.082 +315 I 0.068 +316 L 0.054 +317 D 0.044 +318 P 0.038 +319 W 0.034 +320 V 0.031 +321 F 0.025 +322 I 0.021 +323 L 0.019 +324 F 0.021 +325 R 0.025 +326 K 0.033 +327 A 0.042 +328 V 0.052 +329 F 0.063 +330 Q 0.075 +331 R 0.088 +332 L 0.096 +333 K 0.095 +334 F 0.086 +335 W 0.075 +336 L 0.067 +337 C 0.074 +338 C 0.107 +339 L 0.162 +340 C 0.230 +341 A 0.309 +342 R 0.407 +343 S 0.509 +344 V 0.586 +345 H 0.627 +346 G 0.641 +347 D 0.638 +348 L 0.625 +349 Q 0.615 +350 A 0.619 +351 P 0.633 +352 L 0.647 +353 S 0.660 +354 R 0.679 +355 P 0.706 +356 A 0.734 +357 S 0.753 +358 G 0.755 +359 R 0.737 +360 R 0.708 +361 D 0.685 +362 P 0.681 +363 P 0.699 +364 A 0.732 +365 P 0.765 +366 T 0.776 +367 S 0.744 +368 L 0.680 +369 Q 0.642 +370 A 0.671 +371 K 0.732 +372 E 0.769 +373 G 0.770 +374 S 0.748 +375 W 0.724 +376 V 0.710 +377 P 0.712 +378 L 0.723 +379 S 0.733 +380 S 0.739 +381 W 0.747 +382 G 0.766 +383 T 0.786 +384 G 0.795 +385 Q 0.790 +386 V 0.778 +387 A 0.769 +388 P 0.769 +389 L 0.776 +390 T 0.783 +391 A 0.785 +392 V 0.785 +393 P 0.788 +394 L 0.793 +395 T 0.798 +396 G 0.800 +397 G 0.799 +398 D 0.793 +399 G 0.782 +400 C 0.770 +401 S 0.762 +402 V 0.753 +403 G 0.732 +404 M 0.700 +405 P 0.662 +406 S 0.622 +407 K 0.584 +408 S 0.564 +409 E 0.562 +410 A 0.549 +411 I 0.511 +412 A 0.466 +413 A 0.430 +414 C 0.393 +415 S 0.346 +416 L 0.307 +417 C 0.289 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000043613.9_ENSMUST00000034497.9_GN:Mmp3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000043613.9_ENSMUST00000034497.9_GN:Mmp3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c5121dca28a86ee4077c0f0b01ff5d3cd281548f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000043613.9_ENSMUST00000034497.9_GN:Mmp3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,478 @@ +>ENSMUSG00000043613.9|ENSMUST00000034497.9|GN:Mmp3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.379 +2 K 0.387 +3 G 0.400 +4 L 0.401 +5 P 0.370 +6 V 0.316 +7 L 0.282 +8 L 0.284 +9 W 0.293 +10 L 0.296 +11 C 0.306 +12 V 0.323 +13 V 0.337 +14 V 0.347 +15 C 0.356 +16 S 0.366 +17 S 0.388 +18 Y 0.424 +19 P 0.467 +20 L 0.497 +21 H 0.508 +22 D 0.504 +23 S 0.488 +24 A 0.459 +25 R 0.413 +26 D 0.356 +27 D 0.301 +28 D 0.255 +29 A 0.212 +30 G 0.162 +31 M 0.110 +32 E 0.072 +33 L 0.050 +34 L 0.039 +35 Q 0.033 +36 K 0.032 +37 Y 0.033 +38 L 0.034 +39 E 0.035 +40 N 0.039 +41 Y 0.055 +42 Y 0.089 +43 G 0.141 +44 L 0.200 +45 A 0.251 +46 K 0.280 +47 D 0.281 +48 V 0.264 +49 K 0.247 +50 Q 0.244 +51 F 0.251 +52 I 0.256 +53 K 0.253 +54 K 0.245 +55 K 0.227 +56 D 0.194 +57 S 0.148 +58 S 0.106 +59 L 0.079 +60 I 0.070 +61 V 0.073 +62 K 0.077 +63 K 0.075 +64 I 0.070 +65 Q 0.070 +66 E 0.072 +67 M 0.070 +68 Q 0.065 +69 K 0.064 +70 F 0.074 +71 L 0.094 +72 G 0.114 +73 L 0.125 +74 E 0.126 +75 M 0.123 +76 T 0.121 +77 G 0.122 +78 K 0.121 +79 L 0.106 +80 D 0.084 +81 S 0.067 +82 N 0.064 +83 T 0.069 +84 M 0.076 +85 E 0.085 +86 L 0.093 +87 M 0.094 +88 H 0.089 +89 K 0.085 +90 P 0.084 +91 R 0.086 +92 C 0.092 +93 G 0.105 +94 V 0.123 +95 P 0.143 +96 D 0.169 +97 V 0.201 +98 G 0.229 +99 G 0.243 +100 F 0.246 +101 S 0.245 +102 T 0.241 +103 F 0.228 +104 P 0.206 +105 G 0.177 +106 S 0.143 +107 P 0.105 +108 K 0.072 +109 W 0.051 +110 R 0.044 +111 K 0.044 +112 S 0.048 +113 H 0.051 +114 I 0.049 +115 T 0.046 +116 Y 0.048 +117 R 0.056 +118 I 0.067 +119 V 0.075 +120 N 0.076 +121 Y 0.074 +122 T 0.072 +123 P 0.075 +124 D 0.078 +125 L 0.076 +126 P 0.068 +127 R 0.061 +128 Q 0.061 +129 S 0.065 +130 V 0.072 +131 D 0.078 +132 S 0.080 +133 A 0.074 +134 I 0.063 +135 E 0.054 +136 K 0.052 +137 A 0.057 +138 L 0.064 +139 K 0.067 +140 V 0.060 +141 W 0.050 +142 E 0.045 +143 E 0.046 +144 V 0.048 +145 T 0.047 +146 P 0.043 +147 L 0.041 +148 T 0.038 +149 F 0.035 +150 S 0.032 +151 R 0.031 +152 I 0.035 +153 S 0.044 +154 E 0.053 +155 G 0.060 +156 E 0.063 +157 A 0.064 +158 D 0.063 +159 I 0.059 +160 M 0.053 +161 I 0.051 +162 S 0.058 +163 F 0.075 +164 A 0.095 +165 V 0.111 +166 G 0.117 +167 E 0.113 +168 H 0.105 +169 G 0.096 +170 D 0.091 +171 F 0.096 +172 V 0.108 +173 P 0.120 +174 F 0.127 +175 D 0.134 +176 G 0.144 +177 P 0.148 +178 G 0.142 +179 T 0.133 +180 V 0.128 +181 L 0.126 +182 A 0.123 +183 H 0.116 +184 A 0.107 +185 Y 0.097 +186 A 0.090 +187 P 0.091 +188 G 0.097 +189 P 0.108 +190 G 0.121 +191 I 0.135 +192 N 0.142 +193 G 0.140 +194 D 0.132 +195 A 0.127 +196 H 0.128 +197 F 0.138 +198 D 0.150 +199 D 0.152 +200 D 0.142 +201 E 0.127 +202 R 0.118 +203 W 0.118 +204 T 0.123 +205 E 0.129 +206 D 0.131 +207 V 0.132 +208 T 0.135 +209 G 0.140 +210 T 0.142 +211 N 0.138 +212 L 0.133 +213 F 0.138 +214 L 0.158 +215 V 0.185 +216 A 0.196 +217 A 0.182 +218 H 0.164 +219 E 0.158 +220 L 0.153 +221 G 0.133 +222 H 0.110 +223 S 0.101 +224 L 0.104 +225 G 0.107 +226 L 0.101 +227 Y 0.091 +228 H 0.086 +229 S 0.091 +230 A 0.104 +231 K 0.117 +232 A 0.128 +233 E 0.141 +234 A 0.153 +235 L 0.153 +236 M 0.136 +237 Y 0.109 +238 P 0.089 +239 V 0.082 +240 Y 0.084 +241 K 0.092 +242 S 0.109 +243 S 0.127 +244 T 0.135 +245 D 0.127 +246 L 0.112 +247 S 0.099 +248 R 0.091 +249 F 0.089 +250 H 0.094 +251 L 0.099 +252 S 0.096 +253 Q 0.086 +254 D 0.078 +255 D 0.077 +256 V 0.080 +257 D 0.081 +258 G 0.076 +259 I 0.067 +260 Q 0.063 +261 S 0.066 +262 L 0.074 +263 Y 0.088 +264 G 0.117 +265 T 0.170 +266 P 0.246 +267 T 0.338 +268 A 0.431 +269 S 0.509 +270 P 0.562 +271 D 0.590 +272 V 0.600 +273 L 0.598 +274 V 0.592 +275 V 0.593 +276 P 0.605 +277 T 0.620 +278 K 0.632 +279 S 0.637 +280 N 0.632 +281 S 0.613 +282 L 0.582 +283 E 0.541 +284 P 0.489 +285 E 0.432 +286 T 0.368 +287 S 0.298 +288 P 0.228 +289 M 0.171 +290 C 0.138 +291 S 0.122 +292 S 0.110 +293 T 0.096 +294 L 0.084 +295 F 0.077 +296 F 0.076 +297 D 0.076 +298 A 0.071 +299 V 0.061 +300 S 0.053 +301 T 0.054 +302 L 0.060 +303 R 0.062 +304 G 0.054 +305 E 0.039 +306 V 0.026 +307 L 0.023 +308 F 0.034 +309 F 0.052 +310 K 0.069 +311 D 0.077 +312 R 0.073 +313 H 0.061 +314 F 0.049 +315 W 0.042 +316 R 0.040 +317 K 0.046 +318 S 0.060 +319 L 0.080 +320 R 0.102 +321 T 0.123 +322 P 0.139 +323 E 0.143 +324 P 0.135 +325 E 0.119 +326 F 0.100 +327 Y 0.082 +328 L 0.066 +329 I 0.058 +330 S 0.061 +331 S 0.071 +332 F 0.079 +333 W 0.086 +334 P 0.091 +335 S 0.090 +336 L 0.083 +337 P 0.074 +338 S 0.068 +339 N 0.071 +340 M 0.082 +341 D 0.093 +342 A 0.094 +343 A 0.083 +344 Y 0.068 +345 E 0.062 +346 V 0.068 +347 T 0.078 +348 N 0.085 +349 R 0.081 +350 D 0.064 +351 T 0.042 +352 V 0.026 +353 F 0.024 +354 I 0.036 +355 F 0.058 +356 K 0.080 +357 G 0.094 +358 N 0.094 +359 Q 0.082 +360 F 0.066 +361 W 0.057 +362 A 0.058 +363 I 0.065 +364 R 0.073 +365 G 0.083 +366 H 0.095 +367 E 0.107 +368 E 0.116 +369 L 0.120 +370 A 0.116 +371 G 0.100 +372 Y 0.082 +373 P 0.069 +374 K 0.062 +375 S 0.060 +376 I 0.062 +377 H 0.072 +378 T 0.087 +379 L 0.100 +380 G 0.105 +381 L 0.102 +382 P 0.096 +383 A 0.089 +384 T 0.083 +385 V 0.078 +386 K 0.077 +387 K 0.085 +388 I 0.098 +389 D 0.106 +390 A 0.101 +391 A 0.084 +392 I 0.067 +393 S 0.060 +394 N 0.060 +395 K 0.062 +396 E 0.060 +397 K 0.053 +398 R 0.040 +399 K 0.026 +400 T 0.016 +401 Y 0.014 +402 F 0.022 +403 F 0.036 +404 V 0.051 +405 E 0.062 +406 D 0.065 +407 K 0.060 +408 Y 0.053 +409 W 0.049 +410 R 0.051 +411 F 0.056 +412 D 0.061 +413 E 0.064 +414 K 0.070 +415 K 0.076 +416 Q 0.084 +417 S 0.094 +418 M 0.104 +419 E 0.111 +420 P 0.109 +421 G 0.097 +422 F 0.081 +423 P 0.071 +424 R 0.066 +425 K 0.062 +426 I 0.059 +427 A 0.058 +428 E 0.059 +429 D 0.063 +430 F 0.074 +431 P 0.089 +432 G 0.098 +433 V 0.094 +434 D 0.085 +435 S 0.079 +436 R 0.084 +437 V 0.094 +438 D 0.099 +439 A 0.094 +440 V 0.081 +441 F 0.070 +442 E 0.067 +443 A 0.071 +444 F 0.074 +445 G 0.067 +446 F 0.050 +447 L 0.032 +448 Y 0.025 +449 F 0.036 +450 F 0.060 +451 S 0.085 +452 G 0.101 +453 S 0.102 +454 S 0.094 +455 Q 0.082 +456 L 0.074 +457 E 0.072 +458 F 0.075 +459 D 0.078 +460 P 0.081 +461 N 0.086 +462 A 0.094 +463 K 0.103 +464 K 0.106 +465 V 0.102 +466 T 0.099 +467 H 0.105 +468 I 0.116 +469 L 0.122 +470 K 0.119 +471 S 0.112 +472 N 0.105 +473 S 0.093 +474 W 0.081 +475 F 0.081 +476 N 0.099 +477 C 0.118 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000043613.9_ENSMUST00000034497.9_GN:Mmp3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000043613.9_ENSMUST00000034497.9_GN:Mmp3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9fe13edf03f7158b98eb1e71077023120da67220 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000043613.9_ENSMUST00000034497.9_GN:Mmp3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid @@ -0,0 +1,480 @@ +>ENSMUSG00000043613.9|ENSMUST00000034497.9|GN:Mmp3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:2 +1 M 0.363 +2 K 0.374 +3 M 0.395 +4 K 0.419 +5 G 0.439 +6 L 0.455 +7 P 0.465 +8 V 0.444 +9 L 0.379 +10 L 0.301 +11 W 0.260 +12 L 0.261 +13 C 0.277 +14 V 0.298 +15 V 0.330 +16 V 0.359 +17 C 0.369 +18 S 0.371 +19 S 0.387 +20 Y 0.423 +21 P 0.466 +22 L 0.500 +23 H 0.515 +24 D 0.512 +25 S 0.493 +26 A 0.461 +27 R 0.416 +28 D 0.361 +29 D 0.305 +30 D 0.258 +31 A 0.214 +32 G 0.163 +33 M 0.111 +34 E 0.072 +35 L 0.050 +36 L 0.038 +37 Q 0.033 +38 K 0.032 +39 Y 0.034 +40 L 0.035 +41 E 0.036 +42 N 0.040 +43 Y 0.055 +44 Y 0.090 +45 G 0.142 +46 L 0.201 +47 A 0.251 +48 K 0.280 +49 D 0.280 +50 V 0.262 +51 K 0.246 +52 Q 0.243 +53 F 0.250 +54 I 0.254 +55 K 0.252 +56 K 0.244 +57 K 0.227 +58 D 0.193 +59 S 0.148 +60 S 0.106 +61 L 0.079 +62 I 0.072 +63 V 0.077 +64 K 0.082 +65 K 0.079 +66 I 0.072 +67 Q 0.070 +68 E 0.071 +69 M 0.069 +70 Q 0.064 +71 K 0.063 +72 F 0.073 +73 L 0.093 +74 G 0.113 +75 L 0.124 +76 E 0.126 +77 M 0.122 +78 T 0.120 +79 G 0.122 +80 K 0.120 +81 L 0.106 +82 D 0.083 +83 S 0.067 +84 N 0.064 +85 T 0.070 +86 M 0.079 +87 E 0.089 +88 L 0.095 +89 M 0.095 +90 H 0.090 +91 K 0.085 +92 P 0.084 +93 R 0.085 +94 C 0.092 +95 G 0.105 +96 V 0.122 +97 P 0.143 +98 D 0.170 +99 V 0.201 +100 G 0.229 +101 G 0.244 +102 F 0.247 +103 S 0.246 +104 T 0.242 +105 F 0.229 +106 P 0.207 +107 G 0.178 +108 S 0.143 +109 P 0.105 +110 K 0.072 +111 W 0.051 +112 R 0.044 +113 K 0.044 +114 S 0.048 +115 H 0.051 +116 I 0.049 +117 T 0.046 +118 Y 0.048 +119 R 0.056 +120 I 0.067 +121 V 0.075 +122 N 0.076 +123 Y 0.074 +124 T 0.072 +125 P 0.075 +126 D 0.079 +127 L 0.076 +128 P 0.068 +129 R 0.061 +130 Q 0.060 +131 S 0.065 +132 V 0.072 +133 D 0.078 +134 S 0.081 +135 A 0.074 +136 I 0.063 +137 E 0.054 +138 K 0.052 +139 A 0.057 +140 L 0.065 +141 K 0.069 +142 V 0.062 +143 W 0.051 +144 E 0.045 +145 E 0.046 +146 V 0.048 +147 T 0.047 +148 P 0.044 +149 L 0.041 +150 T 0.038 +151 F 0.035 +152 S 0.032 +153 R 0.031 +154 I 0.035 +155 S 0.043 +156 E 0.053 +157 G 0.060 +158 E 0.063 +159 A 0.064 +160 D 0.063 +161 I 0.059 +162 M 0.053 +163 I 0.051 +164 S 0.058 +165 F 0.074 +166 A 0.094 +167 V 0.110 +168 G 0.116 +169 E 0.113 +170 H 0.105 +171 G 0.096 +172 D 0.091 +173 F 0.095 +174 V 0.107 +175 P 0.119 +176 F 0.126 +177 D 0.133 +178 G 0.143 +179 P 0.147 +180 G 0.141 +181 T 0.132 +182 V 0.128 +183 L 0.126 +184 A 0.123 +185 H 0.116 +186 A 0.107 +187 Y 0.097 +188 A 0.090 +189 P 0.090 +190 G 0.097 +191 P 0.107 +192 G 0.121 +193 I 0.135 +194 N 0.142 +195 G 0.139 +196 D 0.132 +197 A 0.126 +198 H 0.128 +199 F 0.138 +200 D 0.150 +201 D 0.152 +202 D 0.142 +203 E 0.127 +204 R 0.118 +205 W 0.118 +206 T 0.123 +207 E 0.129 +208 D 0.131 +209 V 0.132 +210 T 0.134 +211 G 0.140 +212 T 0.142 +213 N 0.138 +214 L 0.133 +215 F 0.138 +216 L 0.158 +217 V 0.184 +218 A 0.196 +219 A 0.182 +220 H 0.164 +221 E 0.157 +222 L 0.152 +223 G 0.133 +224 H 0.110 +225 S 0.101 +226 L 0.104 +227 G 0.106 +228 L 0.100 +229 Y 0.091 +230 H 0.086 +231 S 0.092 +232 A 0.104 +233 K 0.117 +234 A 0.128 +235 E 0.141 +236 A 0.152 +237 L 0.153 +238 M 0.135 +239 Y 0.108 +240 P 0.088 +241 V 0.081 +242 Y 0.083 +243 K 0.092 +244 S 0.108 +245 S 0.126 +246 T 0.135 +247 D 0.127 +248 L 0.112 +249 S 0.099 +250 R 0.091 +251 F 0.089 +252 H 0.094 +253 L 0.099 +254 S 0.096 +255 Q 0.086 +256 D 0.078 +257 D 0.077 +258 V 0.081 +259 D 0.083 +260 G 0.077 +261 I 0.068 +262 Q 0.063 +263 S 0.066 +264 L 0.073 +265 Y 0.088 +266 G 0.117 +267 T 0.170 +268 P 0.246 +269 T 0.338 +270 A 0.431 +271 S 0.509 +272 P 0.561 +273 D 0.590 +274 V 0.600 +275 L 0.597 +276 V 0.591 +277 V 0.593 +278 P 0.605 +279 T 0.620 +280 K 0.631 +281 S 0.636 +282 N 0.631 +283 S 0.612 +284 L 0.582 +285 E 0.540 +286 P 0.489 +287 E 0.431 +288 T 0.368 +289 S 0.298 +290 P 0.227 +291 M 0.171 +292 C 0.138 +293 S 0.121 +294 S 0.109 +295 T 0.096 +296 L 0.084 +297 F 0.077 +298 F 0.076 +299 D 0.076 +300 A 0.071 +301 V 0.061 +302 S 0.053 +303 T 0.054 +304 L 0.060 +305 R 0.062 +306 G 0.054 +307 E 0.039 +308 V 0.026 +309 L 0.023 +310 F 0.034 +311 F 0.052 +312 K 0.069 +313 D 0.077 +314 R 0.073 +315 H 0.061 +316 F 0.049 +317 W 0.042 +318 R 0.040 +319 K 0.046 +320 S 0.060 +321 L 0.080 +322 R 0.102 +323 T 0.123 +324 P 0.139 +325 E 0.143 +326 P 0.135 +327 E 0.119 +328 F 0.100 +329 Y 0.082 +330 L 0.066 +331 I 0.058 +332 S 0.061 +333 S 0.070 +334 F 0.079 +335 W 0.086 +336 P 0.090 +337 S 0.090 +338 L 0.083 +339 P 0.074 +340 S 0.068 +341 N 0.071 +342 M 0.082 +343 D 0.093 +344 A 0.094 +345 A 0.082 +346 Y 0.068 +347 E 0.062 +348 V 0.067 +349 T 0.078 +350 N 0.085 +351 R 0.081 +352 D 0.064 +353 T 0.042 +354 V 0.026 +355 F 0.024 +356 I 0.036 +357 F 0.058 +358 K 0.080 +359 G 0.093 +360 N 0.094 +361 Q 0.082 +362 F 0.066 +363 W 0.057 +364 A 0.058 +365 I 0.065 +366 R 0.073 +367 G 0.083 +368 H 0.095 +369 E 0.107 +370 E 0.116 +371 L 0.120 +372 A 0.115 +373 G 0.100 +374 Y 0.082 +375 P 0.068 +376 K 0.062 +377 S 0.060 +378 I 0.062 +379 H 0.072 +380 T 0.086 +381 L 0.099 +382 G 0.104 +383 L 0.102 +384 P 0.096 +385 A 0.089 +386 T 0.083 +387 V 0.078 +388 K 0.077 +389 K 0.085 +390 I 0.098 +391 D 0.106 +392 A 0.101 +393 A 0.084 +394 I 0.067 +395 S 0.059 +396 N 0.060 +397 K 0.062 +398 E 0.060 +399 K 0.053 +400 R 0.040 +401 K 0.026 +402 T 0.016 +403 Y 0.014 +404 F 0.022 +405 F 0.036 +406 V 0.051 +407 E 0.062 +408 D 0.065 +409 K 0.060 +410 Y 0.053 +411 W 0.049 +412 R 0.051 +413 F 0.056 +414 D 0.061 +415 E 0.066 +416 K 0.071 +417 K 0.078 +418 Q 0.085 +419 S 0.094 +420 M 0.104 +421 E 0.111 +422 P 0.109 +423 G 0.097 +424 F 0.081 +425 P 0.071 +426 R 0.066 +427 K 0.062 +428 I 0.059 +429 A 0.058 +430 E 0.058 +431 D 0.063 +432 F 0.074 +433 P 0.089 +434 G 0.098 +435 V 0.095 +436 D 0.085 +437 S 0.079 +438 R 0.084 +439 V 0.094 +440 D 0.099 +441 A 0.094 +442 V 0.081 +443 F 0.070 +444 E 0.067 +445 A 0.071 +446 F 0.074 +447 G 0.067 +448 F 0.050 +449 L 0.032 +450 Y 0.025 +451 F 0.036 +452 F 0.060 +453 S 0.085 +454 G 0.101 +455 S 0.102 +456 S 0.093 +457 Q 0.082 +458 L 0.074 +459 E 0.072 +460 F 0.076 +461 D 0.083 +462 P 0.090 +463 N 0.097 +464 A 0.103 +465 K 0.107 +466 K 0.107 +467 V 0.102 +468 T 0.099 +469 H 0.105 +470 I 0.116 +471 L 0.122 +472 K 0.119 +473 S 0.113 +474 N 0.106 +475 S 0.094 +476 W 0.081 +477 F 0.081 +478 N 0.099 +479 C 0.118 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000043787.9_ENSMUST00000062113.9_GN:Defb12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000043787.9_ENSMUST00000062113.9_GN:Defb12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..3923f8634b3559f133ae341e017270ce03f68d25 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000043787.9_ENSMUST00000062113.9_GN:Defb12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,79 @@ +>ENSMUSG00000043787.9|ENSMUST00000062113.9|GN:Defb12|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.379 +2 A 0.353 +3 L 0.312 +4 S 0.268 +5 R 0.227 +6 E 0.189 +7 V 0.158 +8 F 0.143 +9 Y 0.149 +10 F 0.171 +11 G 0.188 +12 F 0.184 +13 A 0.165 +14 L 0.145 +15 F 0.133 +16 F 0.137 +17 I 0.166 +18 V 0.218 +19 V 0.277 +20 E 0.336 +21 L 0.400 +22 P 0.479 +23 S 0.561 +24 G 0.619 +25 S 0.643 +26 W 0.653 +27 A 0.665 +28 G 0.675 +29 L 0.673 +30 E 0.663 +31 Y 0.656 +32 S 0.653 +33 Q 0.645 +34 S 0.631 +35 F 0.624 +36 P 0.628 +37 G 0.631 +38 G 0.610 +39 E 0.546 +40 I 0.447 +41 A 0.334 +42 V 0.232 +43 C 0.158 +44 E 0.114 +45 T 0.088 +46 C 0.075 +47 R 0.077 +48 L 0.091 +49 G 0.108 +50 R 0.116 +51 G 0.111 +52 K 0.100 +53 C 0.089 +54 R 0.081 +55 R 0.079 +56 T 0.085 +57 C 0.096 +58 I 0.104 +59 E 0.105 +60 S 0.101 +61 E 0.101 +62 K 0.106 +63 I 0.110 +64 A 0.106 +65 G 0.089 +66 W 0.067 +67 C 0.050 +68 K 0.045 +69 L 0.048 +70 N 0.051 +71 F 0.049 +72 F 0.045 +73 C 0.048 +74 C 0.065 +75 R 0.101 +76 E 0.152 +77 R 0.202 +78 I 0.232 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000043787.9_ENSMUST00000062113.9_GN:Defb12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000043787.9_ENSMUST00000062113.9_GN:Defb12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d5165c8dfc1058804249602cf69a61df06e3c5c3 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000043787.9_ENSMUST00000062113.9_GN:Defb12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid @@ -0,0 +1,86 @@ +>ENSMUSG00000043787.9|ENSMUST00000062113.9|GN:Defb12|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:7 +1 M 0.491 +2 K 0.502 +3 N 0.526 +4 L 0.560 +5 P 0.593 +6 S 0.612 +7 N 0.606 +8 M 0.571 +9 A 0.508 +10 L 0.426 +11 S 0.341 +12 R 0.264 +13 E 0.205 +14 V 0.167 +15 F 0.147 +16 Y 0.145 +17 F 0.159 +18 G 0.175 +19 F 0.176 +20 A 0.164 +21 L 0.149 +22 F 0.141 +23 F 0.146 +24 I 0.175 +25 V 0.226 +26 V 0.285 +27 E 0.344 +28 L 0.409 +29 P 0.490 +30 S 0.575 +31 G 0.637 +32 S 0.666 +33 W 0.679 +34 A 0.692 +35 G 0.700 +36 L 0.697 +37 E 0.687 +38 Y 0.680 +39 S 0.676 +40 Q 0.665 +41 S 0.649 +42 F 0.639 +43 P 0.642 +44 G 0.645 +45 G 0.622 +46 E 0.558 +47 I 0.457 +48 A 0.342 +49 V 0.238 +50 C 0.163 +51 E 0.117 +52 T 0.089 +53 C 0.075 +54 R 0.076 +55 L 0.090 +56 G 0.107 +57 R 0.116 +58 G 0.111 +59 K 0.099 +60 C 0.088 +61 R 0.079 +62 R 0.077 +63 T 0.082 +64 C 0.093 +65 I 0.101 +66 E 0.101 +67 S 0.098 +68 E 0.099 +69 K 0.104 +70 I 0.109 +71 A 0.106 +72 G 0.090 +73 W 0.067 +74 C 0.050 +75 K 0.045 +76 L 0.048 +77 N 0.051 +78 F 0.048 +79 F 0.045 +80 C 0.048 +81 C 0.065 +82 R 0.101 +83 E 0.152 +84 R 0.203 +85 I 0.233 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044043.5_ENSMUST00000052387.5_GN:Pcdhb14_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044043.5_ENSMUST00000052387.5_GN:Pcdhb14_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2636a61fda987fec05c39f06af001640ee6eba93 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044043.5_ENSMUST00000052387.5_GN:Pcdhb14_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,797 @@ +>ENSMUSG00000044043.5|ENSMUST00000052387.5|GN:Pcdhb14|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.322 +2 E 0.313 +3 T 0.307 +4 S 0.308 +5 L 0.302 +6 H 0.291 +7 K 0.301 +8 A 0.328 +9 P 0.335 +10 Q 0.319 +11 K 0.312 +12 R 0.317 +13 Q 0.307 +14 V 0.281 +15 T 0.256 +16 A 0.237 +17 I 0.218 +18 I 0.201 +19 F 0.190 +20 L 0.185 +21 L 0.186 +22 L 0.202 +23 L 0.234 +24 W 0.275 +25 E 0.321 +26 A 0.363 +27 G 0.384 +28 S 0.363 +29 A 0.299 +30 T 0.216 +31 I 0.142 +32 T 0.090 +33 Y 0.060 +34 S 0.046 +35 V 0.043 +36 L 0.049 +37 E 0.062 +38 E 0.075 +39 T 0.081 +40 D 0.078 +41 R 0.072 +42 G 0.069 +43 S 0.068 +44 L 0.067 +45 V 0.063 +46 G 0.058 +47 N 0.056 +48 L 0.058 +49 A 0.063 +50 K 0.072 +51 D 0.088 +52 L 0.109 +53 G 0.125 +54 L 0.125 +55 S 0.111 +56 L 0.094 +57 R 0.082 +58 E 0.077 +59 L 0.082 +60 I 0.093 +61 T 0.107 +62 R 0.114 +63 G 0.111 +64 A 0.098 +65 Q 0.085 +66 I 0.081 +67 L 0.087 +68 S 0.105 +69 K 0.132 +70 G 0.159 +71 N 0.173 +72 K 0.165 +73 Q 0.135 +74 L 0.101 +75 L 0.081 +76 Q 0.074 +77 L 0.072 +78 E 0.070 +79 Q 0.071 +80 K 0.080 +81 S 0.090 +82 G 0.092 +83 N 0.085 +84 L 0.079 +85 L 0.080 +86 L 0.088 +87 K 0.093 +88 E 0.090 +89 K 0.080 +90 L 0.068 +91 D 0.061 +92 R 0.063 +93 E 0.076 +94 E 0.091 +95 L 0.102 +96 C 0.111 +97 G 0.120 +98 S 0.121 +99 T 0.108 +100 N 0.089 +101 P 0.076 +102 C 0.074 +103 I 0.074 +104 L 0.071 +105 H 0.065 +106 F 0.058 +107 Q 0.054 +108 V 0.053 +109 L 0.053 +110 L 0.053 +111 K 0.053 +112 S 0.052 +113 P 0.055 +114 V 0.067 +115 Q 0.089 +116 F 0.115 +117 I 0.134 +118 Q 0.138 +119 G 0.132 +120 E 0.125 +121 I 0.129 +122 Q 0.147 +123 L 0.173 +124 Q 0.193 +125 D 0.198 +126 V 0.187 +127 N 0.170 +128 D 0.156 +129 H 0.151 +130 A 0.153 +131 P 0.161 +132 E 0.172 +133 F 0.181 +134 M 0.187 +135 E 0.187 +136 D 0.176 +137 E 0.150 +138 I 0.116 +139 L 0.086 +140 L 0.065 +141 K 0.052 +142 I 0.046 +143 L 0.049 +144 E 0.066 +145 S 0.089 +146 S 0.109 +147 L 0.115 +148 P 0.110 +149 G 0.103 +150 A 0.097 +151 V 0.094 +152 F 0.094 +153 P 0.095 +154 L 0.094 +155 K 0.091 +156 I 0.093 +157 A 0.105 +158 Q 0.123 +159 D 0.142 +160 L 0.161 +161 D 0.176 +162 V 0.181 +163 G 0.174 +164 S 0.162 +165 N 0.151 +166 T 0.141 +167 V 0.126 +168 Q 0.107 +169 N 0.095 +170 Y 0.093 +171 T 0.092 +172 I 0.087 +173 S 0.081 +174 T 0.078 +175 N 0.075 +176 A 0.066 +177 H 0.056 +178 F 0.049 +179 H 0.048 +180 L 0.055 +181 L 0.067 +182 T 0.081 +183 R 0.096 +184 N 0.111 +185 H 0.125 +186 S 0.132 +187 D 0.131 +188 G 0.123 +189 R 0.110 +190 K 0.093 +191 Y 0.076 +192 P 0.066 +193 E 0.065 +194 L 0.073 +195 V 0.086 +196 L 0.098 +197 D 0.102 +198 K 0.099 +199 A 0.091 +200 L 0.078 +201 D 0.065 +202 R 0.060 +203 E 0.064 +204 E 0.070 +205 Q 0.073 +206 A 0.073 +207 Q 0.073 +208 I 0.072 +209 R 0.068 +210 L 0.061 +211 T 0.052 +212 L 0.045 +213 T 0.042 +214 A 0.042 +215 M 0.044 +216 D 0.048 +217 S 0.051 +218 G 0.051 +219 S 0.049 +220 P 0.050 +221 P 0.056 +222 K 0.064 +223 T 0.072 +224 G 0.080 +225 T 0.087 +226 T 0.089 +227 Q 0.086 +228 V 0.082 +229 V 0.083 +230 I 0.091 +231 V 0.109 +232 V 0.133 +233 L 0.155 +234 D 0.166 +235 I 0.162 +236 N 0.148 +237 D 0.135 +238 N 0.125 +239 A 0.120 +240 P 0.118 +241 E 0.117 +242 F 0.113 +243 A 0.107 +244 Q 0.103 +245 G 0.097 +246 L 0.085 +247 Y 0.069 +248 E 0.054 +249 V 0.042 +250 Q 0.035 +251 V 0.033 +252 Q 0.038 +253 E 0.050 +254 N 0.067 +255 S 0.082 +256 P 0.091 +257 V 0.092 +258 G 0.090 +259 S 0.085 +260 L 0.078 +261 V 0.071 +262 L 0.070 +263 T 0.074 +264 V 0.082 +265 S 0.087 +266 A 0.090 +267 R 0.092 +268 D 0.099 +269 L 0.117 +270 D 0.137 +271 A 0.149 +272 G 0.154 +273 T 0.155 +274 H 0.153 +275 G 0.141 +276 E 0.118 +277 L 0.089 +278 S 0.067 +279 Y 0.060 +280 S 0.066 +281 L 0.080 +282 F 0.093 +283 Q 0.099 +284 S 0.094 +285 S 0.084 +286 N 0.072 +287 Q 0.064 +288 V 0.063 +289 L 0.062 +290 Q 0.056 +291 A 0.046 +292 F 0.042 +293 E 0.044 +294 V 0.049 +295 N 0.052 +296 T 0.055 +297 D 0.060 +298 T 0.066 +299 G 0.068 +300 E 0.065 +301 I 0.062 +302 R 0.065 +303 V 0.075 +304 R 0.087 +305 K 0.093 +306 L 0.089 +307 L 0.077 +308 D 0.064 +309 F 0.056 +310 E 0.057 +311 E 0.061 +312 I 0.062 +313 Q 0.061 +314 S 0.061 +315 Y 0.061 +316 R 0.057 +317 M 0.050 +318 E 0.045 +319 I 0.041 +320 E 0.038 +321 A 0.038 +322 S 0.045 +323 D 0.060 +324 G 0.081 +325 G 0.099 +326 G 0.105 +327 L 0.098 +328 S 0.085 +329 G 0.076 +330 K 0.076 +331 C 0.081 +332 T 0.086 +333 V 0.088 +334 V 0.091 +335 I 0.100 +336 H 0.119 +337 V 0.142 +338 M 0.161 +339 D 0.169 +340 V 0.167 +341 N 0.164 +342 D 0.164 +343 N 0.165 +344 A 0.163 +345 P 0.156 +346 E 0.146 +347 L 0.140 +348 T 0.144 +349 M 0.154 +350 S 0.158 +351 V 0.150 +352 L 0.130 +353 I 0.105 +354 S 0.083 +355 E 0.069 +356 I 0.064 +357 P 0.068 +358 E 0.081 +359 N 0.106 +360 S 0.133 +361 P 0.148 +362 E 0.144 +363 T 0.128 +364 I 0.110 +365 V 0.096 +366 A 0.087 +367 I 0.083 +368 F 0.085 +369 G 0.089 +370 I 0.095 +371 S 0.102 +372 D 0.115 +373 P 0.136 +374 D 0.158 +375 S 0.173 +376 G 0.178 +377 D 0.175 +378 N 0.166 +379 G 0.150 +380 K 0.127 +381 M 0.105 +382 V 0.091 +383 C 0.088 +384 S 0.095 +385 V 0.109 +386 Q 0.129 +387 D 0.142 +388 R 0.130 +389 L 0.098 +390 P 0.069 +391 F 0.061 +392 L 0.071 +393 L 0.085 +394 K 0.095 +395 P 0.102 +396 N 0.104 +397 E 0.100 +398 E 0.087 +399 N 0.067 +400 F 0.050 +401 Y 0.044 +402 T 0.046 +403 L 0.055 +404 V 0.067 +405 T 0.082 +406 E 0.096 +407 R 0.103 +408 A 0.100 +409 L 0.086 +410 D 0.070 +411 R 0.062 +412 E 0.063 +413 S 0.067 +414 R 0.068 +415 A 0.071 +416 E 0.076 +417 Y 0.078 +418 N 0.073 +419 I 0.063 +420 T 0.053 +421 I 0.045 +422 T 0.041 +423 V 0.041 +424 S 0.044 +425 D 0.052 +426 M 0.058 +427 G 0.058 +428 T 0.054 +429 P 0.053 +430 R 0.057 +431 L 0.061 +432 T 0.063 +433 T 0.069 +434 Q 0.079 +435 H 0.090 +436 T 0.095 +437 I 0.093 +438 T 0.089 +439 V 0.094 +440 Q 0.114 +441 V 0.144 +442 S 0.171 +443 D 0.184 +444 I 0.178 +445 N 0.163 +446 D 0.150 +447 N 0.142 +448 A 0.135 +449 P 0.128 +450 A 0.119 +451 F 0.108 +452 T 0.098 +453 H 0.095 +454 T 0.097 +455 S 0.096 +456 Y 0.087 +457 T 0.073 +458 M 0.060 +459 F 0.051 +460 V 0.049 +461 R 0.057 +462 E 0.073 +463 N 0.097 +464 N 0.122 +465 S 0.137 +466 P 0.139 +467 A 0.130 +468 L 0.118 +469 H 0.108 +470 I 0.103 +471 G 0.103 +472 T 0.105 +473 I 0.109 +474 S 0.113 +475 A 0.117 +476 T 0.121 +477 D 0.129 +478 S 0.144 +479 D 0.163 +480 S 0.178 +481 G 0.188 +482 S 0.192 +483 N 0.188 +484 A 0.175 +485 H 0.152 +486 I 0.125 +487 T 0.099 +488 Y 0.086 +489 S 0.093 +490 L 0.122 +491 L 0.168 +492 P 0.213 +493 P 0.237 +494 H 0.234 +495 D 0.218 +496 P 0.201 +497 Q 0.188 +498 L 0.174 +499 A 0.159 +500 L 0.139 +501 N 0.117 +502 S 0.098 +503 L 0.084 +504 I 0.078 +505 S 0.079 +506 I 0.083 +507 N 0.086 +508 A 0.085 +509 D 0.084 +510 N 0.086 +511 G 0.089 +512 Q 0.087 +513 L 0.085 +514 F 0.089 +515 A 0.102 +516 L 0.116 +517 R 0.123 +518 A 0.119 +519 L 0.105 +520 D 0.088 +521 Y 0.081 +522 E 0.087 +523 A 0.093 +524 L 0.090 +525 Q 0.082 +526 A 0.076 +527 F 0.070 +528 E 0.059 +529 F 0.050 +530 H 0.048 +531 V 0.052 +532 G 0.058 +533 A 0.065 +534 T 0.075 +535 D 0.086 +536 G 0.094 +537 G 0.091 +538 S 0.082 +539 P 0.080 +540 A 0.089 +541 L 0.098 +542 S 0.103 +543 S 0.103 +544 Q 0.103 +545 A 0.104 +546 L 0.104 +547 V 0.103 +548 R 0.104 +549 V 0.116 +550 V 0.142 +551 V 0.176 +552 L 0.205 +553 D 0.221 +554 D 0.219 +555 N 0.205 +556 D 0.186 +557 N 0.168 +558 A 0.150 +559 P 0.131 +560 F 0.115 +561 V 0.107 +562 L 0.115 +563 Y 0.153 +564 P 0.235 +565 M 0.341 +566 Q 0.420 +567 N 0.441 +568 A 0.413 +569 S 0.366 +570 A 0.323 +571 P 0.285 +572 C 0.244 +573 T 0.202 +574 E 0.165 +575 L 0.137 +576 L 0.122 +577 P 0.122 +578 R 0.130 +579 A 0.141 +580 A 0.153 +581 E 0.162 +582 P 0.160 +583 G 0.146 +584 Y 0.126 +585 L 0.113 +586 V 0.108 +587 T 0.107 +588 K 0.107 +589 V 0.109 +590 V 0.119 +591 A 0.139 +592 V 0.159 +593 D 0.173 +594 R 0.185 +595 D 0.195 +596 S 0.201 +597 G 0.201 +598 Q 0.195 +599 N 0.181 +600 A 0.155 +601 W 0.123 +602 L 0.097 +603 S 0.085 +604 F 0.087 +605 Q 0.095 +606 L 0.097 +607 L 0.091 +608 K 0.084 +609 T 0.084 +610 T 0.096 +611 E 0.116 +612 P 0.131 +613 G 0.125 +614 L 0.104 +615 F 0.085 +616 S 0.078 +617 V 0.080 +618 W 0.082 +619 A 0.081 +620 H 0.079 +621 N 0.079 +622 G 0.078 +623 E 0.075 +624 V 0.072 +625 R 0.077 +626 T 0.089 +627 T 0.105 +628 R 0.117 +629 L 0.125 +630 L 0.130 +631 S 0.136 +632 E 0.145 +633 R 0.153 +634 D 0.151 +635 V 0.140 +636 P 0.126 +637 K 0.117 +638 H 0.110 +639 R 0.099 +640 L 0.087 +641 L 0.077 +642 L 0.072 +643 L 0.072 +644 V 0.076 +645 K 0.079 +646 D 0.083 +647 N 0.086 +648 G 0.084 +649 E 0.079 +650 P 0.076 +651 P 0.079 +652 H 0.084 +653 S 0.089 +654 A 0.096 +655 S 0.102 +656 V 0.101 +657 T 0.092 +658 L 0.081 +659 H 0.078 +660 V 0.082 +661 L 0.096 +662 L 0.126 +663 V 0.174 +664 D 0.242 +665 G 0.323 +666 F 0.405 +667 S 0.476 +668 Q 0.532 +669 P 0.577 +670 Y 0.611 +671 L 0.637 +672 P 0.654 +673 L 0.647 +674 P 0.615 +675 E 0.597 +676 V 0.619 +677 A 0.651 +678 R 0.664 +679 D 0.665 +680 P 0.660 +681 A 0.645 +682 Q 0.622 +683 E 0.589 +684 D 0.541 +685 V 0.474 +686 L 0.399 +687 T 0.333 +688 L 0.295 +689 Y 0.297 +690 L 0.333 +691 V 0.386 +692 I 0.446 +693 A 0.505 +694 L 0.553 +695 A 0.580 +696 S 0.582 +697 V 0.566 +698 S 0.538 +699 S 0.495 +700 L 0.436 +701 F 0.384 +702 L 0.355 +703 V 0.332 +704 S 0.297 +705 V 0.267 +706 L 0.255 +707 L 0.247 +708 F 0.238 +709 V 0.235 +710 G 0.235 +711 V 0.230 +712 R 0.229 +713 L 0.249 +714 C 0.285 +715 R 0.333 +716 K 0.397 +717 A 0.466 +718 G 0.518 +719 E 0.548 +720 T 0.575 +721 S 0.610 +722 L 0.648 +723 G 0.676 +724 G 0.692 +725 C 0.695 +726 S 0.692 +727 V 0.696 +728 P 0.708 +729 E 0.717 +730 G 0.715 +731 H 0.709 +732 F 0.715 +733 P 0.740 +734 G 0.771 +735 H 0.793 +736 L 0.801 +737 V 0.798 +738 D 0.791 +739 V 0.783 +740 S 0.777 +741 G 0.777 +742 T 0.782 +743 G 0.788 +744 T 0.790 +745 L 0.785 +746 S 0.777 +747 Q 0.768 +748 S 0.758 +749 Y 0.753 +750 Q 0.758 +751 Y 0.774 +752 E 0.791 +753 V 0.799 +754 C 0.798 +755 L 0.793 +756 T 0.786 +757 G 0.782 +758 G 0.786 +759 T 0.796 +760 G 0.801 +761 T 0.797 +762 N 0.782 +763 E 0.760 +764 F 0.741 +765 K 0.730 +766 F 0.723 +767 L 0.716 +768 K 0.707 +769 P 0.700 +770 V 0.700 +771 L 0.708 +772 P 0.722 +773 N 0.734 +774 F 0.741 +775 L 0.744 +776 N 0.744 +777 E 0.742 +778 G 0.742 +779 G 0.746 +780 Y 0.752 +781 R 0.755 +782 N 0.750 +783 T 0.735 +784 E 0.723 +785 E 0.724 +786 N 0.729 +787 S 0.732 +788 N 0.733 +789 F 0.735 +790 R 0.738 +791 D 0.739 +792 S 0.730 +793 L 0.707 +794 G 0.674 +795 F 0.643 +796 S 0.623 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044043.5_ENSMUST00000052387.5_GN:Pcdhb14_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044043.5_ENSMUST00000052387.5_GN:Pcdhb14_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..01d5c51de49baebf8db2b3add26fd504e1aa16cb --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044043.5_ENSMUST00000052387.5_GN:Pcdhb14_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid @@ -0,0 +1,809 @@ +>ENSMUSG00000044043.5|ENSMUST00000052387.5|GN:Pcdhb14|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:12 +1 M 0.230 +2 I 0.230 +3 I 0.236 +4 C 0.250 +5 C 0.262 +6 I 0.262 +7 F 0.262 +8 W 0.279 +9 S 0.309 +10 R 0.338 +11 G 0.356 +12 T 0.354 +13 M 0.328 +14 E 0.301 +15 T 0.307 +16 S 0.340 +17 L 0.358 +18 H 0.356 +19 K 0.365 +20 A 0.383 +21 P 0.379 +22 Q 0.360 +23 K 0.353 +24 R 0.354 +25 Q 0.337 +26 V 0.309 +27 T 0.292 +28 A 0.287 +29 I 0.275 +30 I 0.252 +31 F 0.229 +32 L 0.215 +33 L 0.210 +34 L 0.219 +35 L 0.243 +36 W 0.277 +37 E 0.317 +38 A 0.355 +39 G 0.375 +40 S 0.355 +41 A 0.293 +42 T 0.213 +43 I 0.140 +44 T 0.089 +45 Y 0.060 +46 S 0.047 +47 V 0.044 +48 L 0.050 +49 E 0.063 +50 E 0.076 +51 T 0.082 +52 D 0.079 +53 R 0.072 +54 G 0.069 +55 S 0.068 +56 L 0.066 +57 V 0.061 +58 G 0.056 +59 N 0.055 +60 L 0.058 +61 A 0.063 +62 K 0.071 +63 D 0.086 +64 L 0.106 +65 G 0.122 +66 L 0.122 +67 S 0.108 +68 L 0.092 +69 R 0.080 +70 E 0.076 +71 L 0.080 +72 I 0.090 +73 T 0.103 +74 R 0.111 +75 G 0.108 +76 A 0.095 +77 Q 0.082 +78 I 0.078 +79 L 0.084 +80 S 0.101 +81 K 0.126 +82 G 0.152 +83 N 0.167 +84 K 0.158 +85 Q 0.129 +86 L 0.097 +87 L 0.078 +88 Q 0.072 +89 L 0.070 +90 E 0.068 +91 Q 0.069 +92 K 0.077 +93 S 0.088 +94 G 0.091 +95 N 0.084 +96 L 0.077 +97 L 0.078 +98 L 0.086 +99 K 0.091 +100 E 0.087 +101 K 0.078 +102 L 0.067 +103 D 0.059 +104 R 0.061 +105 E 0.073 +106 E 0.088 +107 L 0.099 +108 C 0.107 +109 G 0.116 +110 S 0.117 +111 T 0.105 +112 N 0.087 +113 P 0.076 +114 C 0.074 +115 I 0.075 +116 L 0.072 +117 H 0.065 +118 F 0.058 +119 Q 0.054 +120 V 0.053 +121 L 0.053 +122 L 0.053 +123 K 0.053 +124 S 0.052 +125 P 0.055 +126 V 0.067 +127 Q 0.089 +128 F 0.114 +129 I 0.133 +130 Q 0.137 +131 G 0.130 +132 E 0.124 +133 I 0.129 +134 Q 0.147 +135 L 0.172 +136 Q 0.192 +137 D 0.198 +138 V 0.187 +139 N 0.171 +140 D 0.157 +141 H 0.152 +142 A 0.154 +143 P 0.162 +144 E 0.173 +145 F 0.182 +146 M 0.187 +147 E 0.188 +148 D 0.177 +149 E 0.151 +150 I 0.116 +151 L 0.085 +152 L 0.064 +153 K 0.051 +154 I 0.045 +155 L 0.048 +156 E 0.064 +157 S 0.088 +158 S 0.107 +159 L 0.113 +160 P 0.108 +161 G 0.101 +162 A 0.096 +163 V 0.093 +164 F 0.092 +165 P 0.093 +166 L 0.092 +167 K 0.089 +168 I 0.091 +169 A 0.104 +170 Q 0.122 +171 D 0.141 +172 L 0.160 +173 D 0.175 +174 V 0.180 +175 G 0.174 +176 S 0.162 +177 N 0.150 +178 T 0.139 +179 V 0.124 +180 Q 0.105 +181 N 0.093 +182 Y 0.090 +183 T 0.090 +184 I 0.085 +185 S 0.079 +186 T 0.077 +187 N 0.073 +188 A 0.065 +189 H 0.054 +190 F 0.048 +191 H 0.047 +192 L 0.054 +193 L 0.065 +194 T 0.079 +195 R 0.093 +196 N 0.108 +197 H 0.122 +198 S 0.129 +199 D 0.127 +200 G 0.120 +201 R 0.108 +202 K 0.091 +203 Y 0.075 +204 P 0.065 +205 E 0.064 +206 L 0.072 +207 V 0.085 +208 L 0.096 +209 D 0.100 +210 K 0.097 +211 A 0.089 +212 L 0.076 +213 D 0.064 +214 R 0.058 +215 E 0.062 +216 E 0.069 +217 Q 0.072 +218 A 0.071 +219 Q 0.070 +220 I 0.069 +221 R 0.066 +222 L 0.060 +223 T 0.051 +224 L 0.044 +225 T 0.041 +226 A 0.041 +227 M 0.043 +228 D 0.046 +229 S 0.050 +230 G 0.050 +231 S 0.048 +232 P 0.049 +233 P 0.055 +234 K 0.063 +235 T 0.071 +236 G 0.078 +237 T 0.085 +238 T 0.087 +239 Q 0.084 +240 V 0.081 +241 V 0.081 +242 I 0.089 +243 V 0.107 +244 V 0.131 +245 L 0.153 +246 D 0.164 +247 I 0.160 +248 N 0.147 +249 D 0.133 +250 N 0.124 +251 A 0.119 +252 P 0.118 +253 E 0.118 +254 F 0.114 +255 A 0.108 +256 Q 0.103 +257 G 0.097 +258 L 0.086 +259 Y 0.069 +260 E 0.054 +261 V 0.042 +262 Q 0.035 +263 V 0.033 +264 Q 0.038 +265 E 0.050 +266 N 0.067 +267 S 0.083 +268 P 0.092 +269 V 0.093 +270 G 0.091 +271 S 0.086 +272 L 0.078 +273 V 0.071 +274 L 0.069 +275 T 0.074 +276 V 0.081 +277 S 0.087 +278 A 0.090 +279 R 0.092 +280 D 0.100 +281 L 0.118 +282 D 0.138 +283 A 0.150 +284 G 0.155 +285 T 0.156 +286 H 0.153 +287 G 0.142 +288 E 0.119 +289 L 0.090 +290 S 0.068 +291 Y 0.061 +292 S 0.068 +293 L 0.082 +294 F 0.095 +295 Q 0.100 +296 S 0.095 +297 S 0.084 +298 N 0.073 +299 Q 0.065 +300 V 0.063 +301 L 0.062 +302 Q 0.056 +303 A 0.047 +304 F 0.042 +305 E 0.045 +306 V 0.049 +307 N 0.053 +308 T 0.056 +309 D 0.061 +310 T 0.067 +311 G 0.069 +312 E 0.066 +313 I 0.063 +314 R 0.065 +315 V 0.076 +316 R 0.088 +317 K 0.094 +318 L 0.090 +319 L 0.078 +320 D 0.064 +321 F 0.057 +322 E 0.059 +323 E 0.063 +324 I 0.063 +325 Q 0.062 +326 S 0.062 +327 Y 0.061 +328 R 0.057 +329 M 0.050 +330 E 0.045 +331 I 0.041 +332 E 0.038 +333 A 0.039 +334 S 0.045 +335 D 0.060 +336 G 0.081 +337 G 0.100 +338 G 0.106 +339 L 0.099 +340 S 0.085 +341 G 0.077 +342 K 0.077 +343 C 0.082 +344 T 0.086 +345 V 0.088 +346 V 0.091 +347 I 0.101 +348 H 0.119 +349 V 0.143 +350 M 0.162 +351 D 0.169 +352 V 0.168 +353 N 0.165 +354 D 0.165 +355 N 0.166 +356 A 0.164 +357 P 0.158 +358 E 0.148 +359 L 0.142 +360 T 0.146 +361 M 0.155 +362 S 0.160 +363 V 0.151 +364 L 0.131 +365 I 0.106 +366 S 0.084 +367 E 0.070 +368 I 0.065 +369 P 0.068 +370 E 0.081 +371 N 0.106 +372 S 0.134 +373 P 0.149 +374 E 0.145 +375 T 0.129 +376 I 0.111 +377 V 0.097 +378 A 0.088 +379 I 0.084 +380 F 0.086 +381 G 0.090 +382 I 0.095 +383 S 0.102 +384 D 0.116 +385 P 0.137 +386 D 0.159 +387 S 0.173 +388 G 0.177 +389 D 0.174 +390 N 0.165 +391 G 0.149 +392 K 0.127 +393 M 0.105 +394 V 0.091 +395 C 0.088 +396 S 0.095 +397 V 0.109 +398 Q 0.128 +399 D 0.141 +400 R 0.130 +401 L 0.097 +402 P 0.069 +403 F 0.061 +404 L 0.071 +405 L 0.085 +406 K 0.096 +407 P 0.102 +408 N 0.105 +409 E 0.101 +410 E 0.087 +411 N 0.068 +412 F 0.051 +413 Y 0.044 +414 T 0.047 +415 L 0.055 +416 V 0.067 +417 T 0.082 +418 E 0.096 +419 R 0.103 +420 A 0.100 +421 L 0.086 +422 D 0.070 +423 R 0.062 +424 E 0.063 +425 S 0.067 +426 R 0.069 +427 A 0.071 +428 E 0.076 +429 Y 0.078 +430 N 0.073 +431 I 0.064 +432 T 0.053 +433 I 0.046 +434 T 0.042 +435 V 0.041 +436 S 0.045 +437 D 0.052 +438 M 0.059 +439 G 0.059 +440 T 0.055 +441 P 0.054 +442 R 0.057 +443 L 0.061 +444 T 0.064 +445 T 0.069 +446 Q 0.080 +447 H 0.090 +448 T 0.095 +449 I 0.093 +450 T 0.089 +451 V 0.094 +452 Q 0.115 +453 V 0.145 +454 S 0.172 +455 D 0.184 +456 I 0.179 +457 N 0.164 +458 D 0.151 +459 N 0.143 +460 A 0.136 +461 P 0.128 +462 A 0.120 +463 F 0.109 +464 T 0.099 +465 H 0.095 +466 T 0.097 +467 S 0.096 +468 Y 0.087 +469 T 0.073 +470 M 0.060 +471 F 0.051 +472 V 0.049 +473 R 0.057 +474 E 0.074 +475 N 0.098 +476 N 0.123 +477 S 0.139 +478 P 0.141 +479 A 0.132 +480 L 0.119 +481 H 0.109 +482 I 0.105 +483 G 0.105 +484 T 0.107 +485 I 0.110 +486 S 0.114 +487 A 0.118 +488 T 0.122 +489 D 0.130 +490 S 0.145 +491 D 0.164 +492 S 0.179 +493 G 0.189 +494 S 0.193 +495 N 0.190 +496 A 0.176 +497 H 0.154 +498 I 0.126 +499 T 0.100 +500 Y 0.086 +501 S 0.093 +502 L 0.122 +503 L 0.168 +504 P 0.213 +505 P 0.237 +506 H 0.235 +507 D 0.219 +508 P 0.203 +509 Q 0.189 +510 L 0.176 +511 A 0.160 +512 L 0.139 +513 N 0.118 +514 S 0.098 +515 L 0.084 +516 I 0.078 +517 S 0.079 +518 I 0.084 +519 N 0.086 +520 A 0.085 +521 D 0.084 +522 N 0.086 +523 G 0.089 +524 Q 0.088 +525 L 0.085 +526 F 0.089 +527 A 0.102 +528 L 0.116 +529 R 0.122 +530 A 0.118 +531 L 0.104 +532 D 0.088 +533 Y 0.081 +534 E 0.086 +535 A 0.092 +536 L 0.089 +537 Q 0.081 +538 A 0.075 +539 F 0.069 +540 E 0.059 +541 F 0.050 +542 H 0.048 +543 V 0.052 +544 G 0.059 +545 A 0.066 +546 T 0.075 +547 D 0.086 +548 G 0.093 +549 G 0.090 +550 S 0.081 +551 P 0.080 +552 A 0.088 +553 L 0.098 +554 S 0.103 +555 S 0.104 +556 Q 0.104 +557 A 0.105 +558 L 0.105 +559 V 0.104 +560 R 0.105 +561 V 0.116 +562 V 0.142 +563 V 0.176 +564 L 0.205 +565 D 0.221 +566 D 0.219 +567 N 0.205 +568 D 0.186 +569 N 0.168 +570 A 0.150 +571 P 0.131 +572 F 0.115 +573 V 0.107 +574 L 0.115 +575 Y 0.153 +576 P 0.235 +577 M 0.340 +578 Q 0.420 +579 N 0.441 +580 A 0.413 +581 S 0.367 +582 A 0.324 +583 P 0.286 +584 C 0.245 +585 T 0.203 +586 E 0.165 +587 L 0.136 +588 L 0.122 +589 P 0.122 +590 R 0.130 +591 A 0.141 +592 A 0.153 +593 E 0.162 +594 P 0.161 +595 G 0.146 +596 Y 0.127 +597 L 0.114 +598 V 0.108 +599 T 0.107 +600 K 0.107 +601 V 0.109 +602 V 0.120 +603 A 0.139 +604 V 0.159 +605 D 0.174 +606 R 0.185 +607 D 0.196 +608 S 0.201 +609 G 0.201 +610 Q 0.196 +611 N 0.182 +612 A 0.156 +613 W 0.124 +614 L 0.098 +615 S 0.085 +616 F 0.087 +617 Q 0.095 +618 L 0.097 +619 L 0.091 +620 K 0.084 +621 T 0.084 +622 T 0.096 +623 E 0.117 +624 P 0.131 +625 G 0.126 +626 L 0.104 +627 F 0.085 +628 S 0.079 +629 V 0.081 +630 W 0.083 +631 A 0.082 +632 H 0.080 +633 N 0.079 +634 G 0.078 +635 E 0.075 +636 V 0.073 +637 R 0.077 +638 T 0.090 +639 T 0.106 +640 R 0.118 +641 L 0.125 +642 L 0.130 +643 S 0.137 +644 E 0.146 +645 R 0.153 +646 D 0.152 +647 V 0.140 +648 P 0.126 +649 K 0.117 +650 H 0.110 +651 R 0.100 +652 L 0.088 +653 L 0.077 +654 L 0.072 +655 L 0.073 +656 V 0.076 +657 K 0.080 +658 D 0.083 +659 N 0.086 +660 G 0.085 +661 E 0.079 +662 P 0.076 +663 P 0.078 +664 H 0.084 +665 S 0.089 +666 A 0.096 +667 S 0.102 +668 V 0.102 +669 T 0.092 +670 L 0.082 +671 H 0.078 +672 V 0.082 +673 L 0.096 +674 L 0.126 +675 V 0.175 +676 D 0.243 +677 G 0.325 +678 F 0.408 +679 S 0.478 +680 Q 0.535 +681 P 0.579 +682 Y 0.613 +683 L 0.638 +684 P 0.655 +685 L 0.647 +686 P 0.615 +687 E 0.597 +688 V 0.619 +689 A 0.651 +690 R 0.664 +691 D 0.664 +692 P 0.659 +693 A 0.644 +694 Q 0.621 +695 E 0.589 +696 D 0.541 +697 V 0.474 +698 L 0.399 +699 T 0.333 +700 L 0.295 +701 Y 0.297 +702 L 0.333 +703 V 0.386 +704 I 0.445 +705 A 0.505 +706 L 0.553 +707 A 0.579 +708 S 0.581 +709 V 0.564 +710 S 0.536 +711 S 0.494 +712 L 0.436 +713 F 0.383 +714 L 0.354 +715 V 0.331 +716 S 0.296 +717 V 0.267 +718 L 0.254 +719 L 0.246 +720 F 0.237 +721 V 0.233 +722 G 0.233 +723 V 0.228 +724 R 0.228 +725 L 0.246 +726 C 0.282 +727 R 0.330 +728 K 0.393 +729 A 0.460 +730 G 0.509 +731 E 0.537 +732 T 0.566 +733 S 0.606 +734 L 0.646 +735 G 0.675 +736 G 0.691 +737 C 0.694 +738 S 0.691 +739 V 0.696 +740 P 0.708 +741 E 0.717 +742 G 0.715 +743 H 0.708 +744 F 0.714 +745 P 0.739 +746 G 0.771 +747 H 0.793 +748 L 0.801 +749 V 0.798 +750 D 0.791 +751 V 0.783 +752 S 0.778 +753 G 0.777 +754 T 0.783 +755 G 0.789 +756 T 0.790 +757 L 0.785 +758 S 0.777 +759 Q 0.768 +760 S 0.758 +761 Y 0.753 +762 Q 0.758 +763 Y 0.774 +764 E 0.791 +765 V 0.799 +766 C 0.798 +767 L 0.792 +768 T 0.786 +769 G 0.782 +770 G 0.786 +771 T 0.795 +772 G 0.800 +773 T 0.796 +774 N 0.780 +775 E 0.758 +776 F 0.739 +777 K 0.728 +778 F 0.722 +779 L 0.715 +780 K 0.706 +781 P 0.698 +782 V 0.698 +783 L 0.706 +784 P 0.721 +785 N 0.733 +786 F 0.740 +787 L 0.743 +788 N 0.743 +789 E 0.741 +790 G 0.741 +791 G 0.745 +792 Y 0.751 +793 R 0.754 +794 N 0.748 +795 T 0.732 +796 E 0.720 +797 E 0.721 +798 N 0.728 +799 S 0.731 +800 N 0.733 +801 F 0.735 +802 R 0.739 +803 D 0.740 +804 S 0.730 +805 L 0.706 +806 G 0.673 +807 F 0.640 +808 S 0.619 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044217.19_ENSMUST00000169082.3_GN:Aqp5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044217.19_ENSMUST00000169082.3_GN:Aqp5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6ca52f0b63ddd16da9b8240779fdf2f09b537b2d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044217.19_ENSMUST00000169082.3_GN:Aqp5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,266 @@ +>ENSMUSG00000044217.19|ENSMUST00000169082.3|GN:Aqp5|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.201 +2 K 0.176 +3 K 0.140 +4 E 0.108 +5 V 0.086 +6 C 0.071 +7 S 0.061 +8 V 0.056 +9 A 0.053 +10 F 0.047 +11 F 0.038 +12 K 0.033 +13 A 0.034 +14 V 0.036 +15 F 0.037 +16 A 0.040 +17 E 0.044 +18 F 0.046 +19 L 0.044 +20 A 0.044 +21 T 0.045 +22 L 0.043 +23 I 0.037 +24 F 0.030 +25 V 0.027 +26 F 0.029 +27 F 0.035 +28 G 0.047 +29 L 0.064 +30 G 0.083 +31 S 0.100 +32 A 0.116 +33 L 0.136 +34 K 0.158 +35 W 0.171 +36 P 0.171 +37 S 0.165 +38 A 0.159 +39 L 0.149 +40 P 0.128 +41 T 0.104 +42 I 0.085 +43 L 0.078 +44 Q 0.079 +45 I 0.081 +46 S 0.080 +47 I 0.080 +48 A 0.085 +49 F 0.093 +50 G 0.098 +51 L 0.102 +52 A 0.105 +53 I 0.100 +54 G 0.091 +55 T 0.088 +56 L 0.092 +57 A 0.093 +58 Q 0.087 +59 A 0.080 +60 L 0.079 +61 G 0.083 +62 P 0.097 +63 V 0.118 +64 S 0.137 +65 G 0.143 +66 G 0.136 +67 H 0.125 +68 I 0.113 +69 N 0.099 +70 P 0.085 +71 A 0.074 +72 I 0.070 +73 T 0.072 +74 L 0.078 +75 A 0.081 +76 L 0.083 +77 L 0.087 +78 I 0.096 +79 G 0.102 +80 N 0.096 +81 Q 0.081 +82 I 0.064 +83 S 0.050 +84 L 0.042 +85 L 0.041 +86 R 0.048 +87 A 0.052 +88 I 0.050 +89 F 0.049 +90 Y 0.059 +91 V 0.075 +92 A 0.085 +93 A 0.083 +94 Q 0.076 +95 L 0.071 +96 V 0.068 +97 G 0.064 +98 A 0.061 +99 I 0.060 +100 A 0.060 +101 G 0.062 +102 A 0.064 +103 G 0.066 +104 I 0.067 +105 L 0.066 +106 Y 0.061 +107 W 0.060 +108 L 0.070 +109 A 0.090 +110 P 0.108 +111 G 0.118 +112 N 0.117 +113 A 0.110 +114 R 0.109 +115 G 0.118 +116 N 0.129 +117 L 0.137 +118 A 0.147 +119 V 0.162 +120 N 0.177 +121 A 0.181 +122 L 0.173 +123 S 0.158 +124 N 0.141 +125 N 0.125 +126 T 0.108 +127 T 0.088 +128 P 0.069 +129 G 0.055 +130 K 0.053 +131 A 0.058 +132 V 0.064 +133 V 0.070 +134 V 0.075 +135 E 0.078 +136 L 0.071 +137 I 0.059 +138 L 0.048 +139 T 0.045 +140 F 0.046 +141 Q 0.050 +142 L 0.051 +143 A 0.049 +144 L 0.047 +145 C 0.045 +146 I 0.046 +147 F 0.052 +148 S 0.064 +149 S 0.078 +150 T 0.086 +151 D 0.089 +152 S 0.091 +153 R 0.095 +154 R 0.102 +155 T 0.110 +156 S 0.117 +157 P 0.121 +158 V 0.122 +159 G 0.117 +160 S 0.103 +161 P 0.085 +162 A 0.068 +163 L 0.059 +164 S 0.062 +165 I 0.072 +166 G 0.081 +167 L 0.087 +168 S 0.088 +169 V 0.086 +170 T 0.083 +171 L 0.083 +172 G 0.082 +173 H 0.077 +174 L 0.072 +175 V 0.071 +176 G 0.075 +177 I 0.079 +178 Y 0.084 +179 F 0.090 +180 T 0.097 +181 G 0.107 +182 C 0.122 +183 S 0.135 +184 M 0.138 +185 N 0.134 +186 P 0.126 +187 A 0.116 +188 R 0.103 +189 S 0.091 +190 F 0.084 +191 G 0.085 +192 P 0.088 +193 A 0.090 +194 V 0.089 +195 V 0.088 +196 M 0.090 +197 N 0.095 +198 R 0.105 +199 F 0.114 +200 S 0.115 +201 P 0.109 +202 S 0.098 +203 H 0.082 +204 W 0.066 +205 V 0.055 +206 F 0.048 +207 W 0.047 +208 V 0.052 +209 G 0.059 +210 P 0.062 +211 I 0.060 +212 V 0.057 +213 G 0.055 +214 A 0.052 +215 V 0.049 +216 L 0.047 +217 A 0.046 +218 A 0.042 +219 I 0.038 +220 L 0.038 +221 Y 0.039 +222 F 0.039 +223 Y 0.040 +224 L 0.045 +225 L 0.058 +226 F 0.083 +227 P 0.117 +228 S 0.148 +229 S 0.162 +230 L 0.155 +231 S 0.140 +232 L 0.129 +233 H 0.122 +234 D 0.114 +235 R 0.109 +236 V 0.111 +237 A 0.123 +238 V 0.141 +239 V 0.167 +240 K 0.205 +241 G 0.247 +242 T 0.281 +243 Y 0.307 +244 E 0.331 +245 P 0.356 +246 E 0.374 +247 E 0.371 +248 D 0.346 +249 W 0.311 +250 E 0.281 +251 D 0.258 +252 H 0.234 +253 R 0.209 +254 E 0.192 +255 E 0.188 +256 R 0.190 +257 K 0.200 +258 K 0.223 +259 T 0.253 +260 I 0.272 +261 E 0.283 +262 L 0.304 +263 T 0.329 +264 A 0.338 +265 H 0.333 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044217.19_ENSMUST00000169082.3_GN:Aqp5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:126.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044217.19_ENSMUST00000169082.3_GN:Aqp5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:126.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..58d9be8c395adede45f2cf3848712b55c992b7cf --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044217.19_ENSMUST00000169082.3_GN:Aqp5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:126.caid @@ -0,0 +1,392 @@ +>ENSMUSG00000044217.19|ENSMUST00000169082.3|GN:Aqp5|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:126 +1 M 0.398 +2 R 0.422 +3 A 0.451 +4 T 0.462 +5 Q 0.451 +6 T 0.449 +7 A 0.487 +8 G 0.549 +9 P 0.592 +10 V 0.605 +11 Y 0.599 +12 T 0.584 +13 A 0.556 +14 A 0.509 +15 W 0.457 +16 V 0.422 +17 T 0.422 +18 W 0.459 +19 P 0.522 +20 G 0.592 +21 R 0.650 +22 V 0.692 +23 R 0.727 +24 R 0.754 +25 C 0.772 +26 A 0.775 +27 A 0.770 +28 G 0.764 +29 G 0.765 +30 P 0.775 +31 G 0.789 +32 V 0.801 +33 R 0.806 +34 G 0.807 +35 A 0.807 +36 G 0.805 +37 G 0.798 +38 C 0.780 +39 E 0.749 +40 R 0.707 +41 A 0.651 +42 P 0.594 +43 A 0.571 +44 R 0.603 +45 L 0.658 +46 A 0.698 +47 P 0.718 +48 C 0.719 +49 A 0.700 +50 L 0.671 +51 R 0.654 +52 W 0.664 +53 P 0.698 +54 L 0.741 +55 G 0.777 +56 A 0.793 +57 G 0.791 +58 A 0.778 +59 A 0.764 +60 P 0.756 +61 G 0.759 +62 P 0.773 +63 P 0.790 +64 A 0.796 +65 L 0.786 +66 C 0.767 +67 P 0.757 +68 P 0.760 +69 R 0.772 +70 G 0.778 +71 A 0.774 +72 R 0.770 +73 P 0.772 +74 L 0.775 +75 Y 0.770 +76 S 0.756 +77 A 0.739 +78 P 0.728 +79 L 0.726 +80 P 0.735 +81 G 0.750 +82 P 0.765 +83 R 0.773 +84 Q 0.772 +85 A 0.758 +86 A 0.720 +87 C 0.664 +88 H 0.633 +89 G 0.650 +90 V 0.665 +91 G 0.641 +92 T 0.621 +93 A 0.651 +94 R 0.703 +95 R 0.733 +96 A 0.740 +97 E 0.745 +98 P 0.752 +99 R 0.755 +100 R 0.749 +101 Q 0.740 +102 T 0.737 +103 P 0.742 +104 A 0.740 +105 A 0.706 +106 A 0.642 +107 S 0.598 +108 A 0.612 +109 A 0.660 +110 P 0.696 +111 T 0.705 +112 A 0.696 +113 A 0.678 +114 P 0.664 +115 R 0.658 +116 R 0.654 +117 S 0.646 +118 R 0.633 +119 C 0.618 +120 H 0.595 +121 R 0.569 +122 A 0.554 +123 P 0.548 +124 K 0.530 +125 A 0.476 +126 T 0.392 +127 M 0.303 +128 K 0.232 +129 K 0.177 +130 E 0.133 +131 V 0.098 +132 C 0.075 +133 S 0.062 +134 V 0.055 +135 A 0.052 +136 F 0.046 +137 F 0.038 +138 K 0.034 +139 A 0.035 +140 V 0.037 +141 F 0.038 +142 A 0.040 +143 E 0.043 +144 F 0.044 +145 L 0.042 +146 A 0.040 +147 T 0.041 +148 L 0.039 +149 I 0.033 +150 F 0.026 +151 V 0.023 +152 F 0.024 +153 F 0.030 +154 G 0.040 +155 L 0.055 +156 G 0.073 +157 S 0.089 +158 A 0.102 +159 L 0.118 +160 K 0.135 +161 W 0.146 +162 P 0.146 +163 S 0.144 +164 A 0.145 +165 L 0.141 +166 P 0.124 +167 T 0.101 +168 I 0.083 +169 L 0.075 +170 Q 0.076 +171 I 0.078 +172 S 0.078 +173 I 0.078 +174 A 0.083 +175 F 0.091 +176 G 0.097 +177 L 0.100 +178 A 0.102 +179 I 0.097 +180 G 0.089 +181 T 0.086 +182 L 0.090 +183 A 0.090 +184 Q 0.083 +185 A 0.076 +186 L 0.074 +187 G 0.080 +188 P 0.094 +189 V 0.118 +190 S 0.140 +191 G 0.148 +192 G 0.141 +193 H 0.129 +194 I 0.115 +195 N 0.099 +196 P 0.084 +197 A 0.074 +198 I 0.070 +199 T 0.073 +200 L 0.079 +201 A 0.081 +202 L 0.081 +203 L 0.084 +204 I 0.091 +205 G 0.096 +206 N 0.091 +207 Q 0.077 +208 I 0.061 +209 S 0.048 +210 L 0.040 +211 L 0.039 +212 R 0.046 +213 A 0.050 +214 I 0.047 +215 F 0.045 +216 Y 0.048 +217 V 0.055 +218 A 0.059 +219 A 0.061 +220 Q 0.064 +221 L 0.066 +222 V 0.066 +223 G 0.063 +224 A 0.061 +225 I 0.060 +226 A 0.061 +227 G 0.063 +228 A 0.065 +229 G 0.067 +230 I 0.068 +231 L 0.066 +232 Y 0.060 +233 W 0.058 +234 L 0.067 +235 A 0.086 +236 P 0.103 +237 G 0.111 +238 N 0.109 +239 A 0.104 +240 R 0.106 +241 G 0.117 +242 N 0.130 +243 L 0.137 +244 A 0.147 +245 V 0.163 +246 N 0.179 +247 A 0.185 +248 L 0.177 +249 S 0.161 +250 N 0.143 +251 N 0.126 +252 T 0.109 +253 T 0.090 +254 P 0.071 +255 G 0.058 +256 K 0.056 +257 A 0.062 +258 V 0.069 +259 V 0.075 +260 V 0.080 +261 E 0.081 +262 L 0.074 +263 I 0.061 +264 L 0.051 +265 T 0.047 +266 F 0.048 +267 Q 0.052 +268 L 0.053 +269 A 0.052 +270 L 0.049 +271 C 0.047 +272 I 0.047 +273 F 0.054 +274 S 0.067 +275 S 0.081 +276 T 0.090 +277 D 0.093 +278 S 0.095 +279 R 0.099 +280 R 0.107 +281 T 0.116 +282 S 0.124 +283 P 0.128 +284 V 0.129 +285 G 0.122 +286 S 0.106 +287 P 0.086 +288 A 0.068 +289 L 0.060 +290 S 0.064 +291 I 0.074 +292 G 0.084 +293 L 0.089 +294 S 0.091 +295 V 0.089 +296 T 0.088 +297 L 0.088 +298 G 0.087 +299 H 0.082 +300 L 0.077 +301 V 0.078 +302 G 0.082 +303 I 0.085 +304 Y 0.089 +305 F 0.094 +306 T 0.102 +307 G 0.114 +308 C 0.130 +309 S 0.142 +310 M 0.144 +311 N 0.138 +312 P 0.129 +313 A 0.119 +314 R 0.106 +315 S 0.094 +316 F 0.087 +317 G 0.087 +318 P 0.091 +319 A 0.092 +320 V 0.091 +321 V 0.092 +322 M 0.095 +323 N 0.103 +324 R 0.114 +325 F 0.123 +326 S 0.124 +327 P 0.118 +328 S 0.107 +329 H 0.091 +330 W 0.073 +331 V 0.061 +332 F 0.053 +333 W 0.051 +334 V 0.055 +335 G 0.062 +336 P 0.065 +337 I 0.063 +338 V 0.059 +339 G 0.057 +340 A 0.055 +341 V 0.052 +342 L 0.050 +343 A 0.048 +344 A 0.044 +345 I 0.040 +346 L 0.040 +347 Y 0.040 +348 F 0.040 +349 Y 0.042 +350 L 0.047 +351 L 0.060 +352 F 0.085 +353 P 0.120 +354 S 0.151 +355 S 0.165 +356 L 0.156 +357 S 0.140 +358 L 0.129 +359 H 0.122 +360 D 0.113 +361 R 0.107 +362 V 0.111 +363 A 0.121 +364 V 0.135 +365 V 0.157 +366 K 0.192 +367 G 0.232 +368 T 0.269 +369 Y 0.302 +370 E 0.337 +371 P 0.374 +372 E 0.402 +373 E 0.406 +374 D 0.380 +375 W 0.342 +376 E 0.310 +377 D 0.287 +378 H 0.263 +379 R 0.238 +380 E 0.224 +381 E 0.224 +382 R 0.231 +383 K 0.245 +384 K 0.281 +385 T 0.330 +386 I 0.366 +387 E 0.384 +388 L 0.398 +389 T 0.407 +390 A 0.398 +391 H 0.382 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044254.7_ENSMUST00000049507.6_GN:Pcsk9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044254.7_ENSMUST00000049507.6_GN:Pcsk9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5b7b851b34e1656d554d1b38ce062fef37733502 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044254.7_ENSMUST00000049507.6_GN:Pcsk9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,695 @@ +>ENSMUSG00000044254.7|ENSMUST00000049507.6|GN:Pcsk9|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.317 +2 G 0.311 +3 T 0.308 +4 H 0.312 +5 C 0.305 +6 S 0.287 +7 A 0.284 +8 W 0.299 +9 L 0.312 +10 R 0.324 +11 W 0.349 +12 P 0.374 +13 L 0.381 +14 L 0.374 +15 P 0.360 +16 L 0.341 +17 L 0.319 +18 P 0.301 +19 P 0.278 +20 L 0.244 +21 L 0.210 +22 L 0.192 +23 L 0.187 +24 L 0.186 +25 L 0.195 +26 L 0.225 +27 L 0.276 +28 C 0.335 +29 P 0.398 +30 T 0.476 +31 G 0.560 +32 A 0.622 +33 G 0.647 +34 A 0.643 +35 Q 0.630 +36 D 0.620 +37 E 0.609 +38 D 0.595 +39 G 0.574 +40 D 0.539 +41 Y 0.492 +42 E 0.451 +43 E 0.435 +44 L 0.445 +45 M 0.467 +46 L 0.485 +47 A 0.496 +48 L 0.503 +49 P 0.511 +50 S 0.526 +51 Q 0.554 +52 E 0.591 +53 D 0.628 +54 G 0.656 +55 L 0.666 +56 A 0.660 +57 D 0.648 +58 E 0.639 +59 A 0.638 +60 A 0.644 +61 H 0.649 +62 V 0.634 +63 A 0.583 +64 T 0.487 +65 A 0.364 +66 T 0.250 +67 F 0.176 +68 R 0.146 +69 R 0.143 +70 C 0.150 +71 S 0.153 +72 K 0.147 +73 E 0.137 +74 A 0.126 +75 W 0.115 +76 R 0.104 +77 L 0.091 +78 P 0.073 +79 G 0.053 +80 T 0.036 +81 Y 0.027 +82 I 0.025 +83 V 0.031 +84 V 0.042 +85 L 0.054 +86 M 0.066 +87 E 0.073 +88 E 0.075 +89 T 0.070 +90 Q 0.065 +91 R 0.065 +92 L 0.065 +93 Q 0.060 +94 I 0.056 +95 E 0.060 +96 Q 0.063 +97 T 0.058 +98 A 0.048 +99 H 0.042 +100 R 0.044 +101 L 0.052 +102 Q 0.065 +103 T 0.075 +104 R 0.078 +105 A 0.076 +106 A 0.074 +107 R 0.075 +108 R 0.079 +109 G 0.083 +110 Y 0.079 +111 V 0.068 +112 I 0.056 +113 K 0.051 +114 V 0.050 +115 L 0.052 +116 H 0.055 +117 I 0.060 +118 F 0.063 +119 Y 0.066 +120 D 0.066 +121 L 0.061 +122 F 0.051 +123 P 0.041 +124 G 0.033 +125 F 0.029 +126 L 0.027 +127 V 0.027 +128 K 0.027 +129 M 0.028 +130 S 0.029 +131 S 0.031 +132 D 0.034 +133 L 0.035 +134 L 0.035 +135 G 0.036 +136 L 0.041 +137 A 0.047 +138 L 0.052 +139 K 0.053 +140 L 0.053 +141 P 0.050 +142 H 0.045 +143 V 0.043 +144 E 0.045 +145 Y 0.053 +146 I 0.068 +147 E 0.087 +148 E 0.108 +149 D 0.129 +150 S 0.148 +151 F 0.162 +152 V 0.169 +153 F 0.171 +154 A 0.178 +155 Q 0.190 +156 S 0.196 +157 I 0.183 +158 P 0.151 +159 W 0.118 +160 N 0.102 +161 L 0.102 +162 E 0.103 +163 R 0.106 +164 I 0.113 +165 I 0.123 +166 P 0.139 +167 A 0.166 +168 W 0.206 +169 H 0.252 +170 Q 0.294 +171 T 0.330 +172 E 0.360 +173 E 0.384 +174 D 0.400 +175 R 0.407 +176 S 0.410 +177 P 0.413 +178 D 0.411 +179 G 0.392 +180 S 0.342 +181 S 0.266 +182 Q 0.190 +183 V 0.134 +184 E 0.103 +185 V 0.087 +186 Y 0.077 +187 L 0.071 +188 L 0.068 +189 D 0.073 +190 T 0.089 +191 S 0.107 +192 I 0.115 +193 Q 0.113 +194 G 0.109 +195 A 0.103 +196 H 0.095 +197 R 0.088 +198 E 0.085 +199 I 0.084 +200 E 0.084 +201 G 0.086 +202 R 0.088 +203 V 0.091 +204 T 0.092 +205 I 0.095 +206 T 0.100 +207 D 0.113 +208 F 0.145 +209 N 0.194 +210 S 0.246 +211 V 0.284 +212 P 0.304 +213 E 0.313 +214 E 0.322 +215 D 0.332 +216 G 0.340 +217 T 0.350 +218 R 0.366 +219 F 0.386 +220 H 0.402 +221 R 0.409 +222 Q 0.399 +223 A 0.365 +224 S 0.310 +225 K 0.248 +226 C 0.193 +227 D 0.153 +228 S 0.131 +229 H 0.127 +230 G 0.136 +231 T 0.154 +232 H 0.169 +233 L 0.171 +234 A 0.156 +235 G 0.138 +236 V 0.128 +237 V 0.124 +238 S 0.125 +239 G 0.129 +240 R 0.132 +241 D 0.130 +242 A 0.124 +243 G 0.116 +244 V 0.112 +245 A 0.112 +246 K 0.119 +247 G 0.128 +248 T 0.133 +249 S 0.131 +250 L 0.126 +251 H 0.119 +252 S 0.111 +253 L 0.102 +254 R 0.097 +255 V 0.094 +256 L 0.089 +257 N 0.085 +258 C 0.085 +259 Q 0.089 +260 G 0.091 +261 K 0.088 +262 G 0.079 +263 T 0.065 +264 V 0.052 +265 S 0.047 +266 G 0.048 +267 T 0.051 +268 L 0.051 +269 I 0.048 +270 G 0.045 +271 L 0.042 +272 E 0.037 +273 F 0.034 +274 I 0.034 +275 R 0.034 +276 K 0.035 +277 S 0.037 +278 Q 0.042 +279 L 0.052 +280 I 0.068 +281 Q 0.086 +282 P 0.100 +283 S 0.104 +284 G 0.100 +285 P 0.088 +286 L 0.075 +287 V 0.064 +288 V 0.053 +289 L 0.046 +290 L 0.045 +291 P 0.052 +292 L 0.066 +293 A 0.086 +294 G 0.111 +295 G 0.129 +296 Y 0.127 +297 S 0.104 +298 R 0.078 +299 I 0.065 +300 L 0.068 +301 N 0.077 +302 A 0.079 +303 A 0.072 +304 C 0.059 +305 R 0.048 +306 H 0.041 +307 L 0.036 +308 A 0.034 +309 R 0.034 +310 T 0.038 +311 G 0.043 +312 V 0.047 +313 V 0.046 +314 L 0.044 +315 V 0.045 +316 A 0.053 +317 A 0.066 +318 A 0.081 +319 G 0.092 +320 N 0.097 +321 F 0.096 +322 R 0.092 +323 D 0.091 +324 D 0.090 +325 A 0.082 +326 C 0.068 +327 L 0.053 +328 Y 0.044 +329 S 0.042 +330 P 0.049 +331 A 0.065 +332 S 0.084 +333 A 0.094 +334 P 0.091 +335 E 0.081 +336 V 0.070 +337 I 0.060 +338 T 0.052 +339 V 0.047 +340 G 0.046 +341 A 0.049 +342 T 0.056 +343 N 0.070 +344 A 0.090 +345 Q 0.108 +346 D 0.122 +347 Q 0.136 +348 P 0.151 +349 V 0.169 +350 T 0.189 +351 L 0.204 +352 G 0.200 +353 T 0.177 +354 L 0.144 +355 G 0.119 +356 T 0.109 +357 N 0.115 +358 F 0.123 +359 G 0.124 +360 R 0.121 +361 C 0.118 +362 V 0.116 +363 D 0.111 +364 L 0.103 +365 F 0.095 +366 A 0.094 +367 P 0.111 +368 G 0.140 +369 K 0.168 +370 D 0.181 +371 I 0.183 +372 I 0.185 +373 G 0.189 +374 A 0.191 +375 S 0.188 +376 S 0.185 +377 D 0.185 +378 C 0.183 +379 S 0.182 +380 T 0.183 +381 C 0.187 +382 F 0.185 +383 M 0.174 +384 S 0.157 +385 Q 0.147 +386 S 0.150 +387 G 0.169 +388 T 0.206 +389 S 0.252 +390 Q 0.280 +391 A 0.268 +392 A 0.227 +393 A 0.183 +394 H 0.148 +395 V 0.121 +396 A 0.098 +397 G 0.080 +398 I 0.070 +399 V 0.064 +400 A 0.059 +401 R 0.052 +402 M 0.048 +403 L 0.047 +404 S 0.047 +405 R 0.047 +406 E 0.048 +407 P 0.047 +408 T 0.045 +409 L 0.043 +410 T 0.042 +411 L 0.041 +412 A 0.040 +413 E 0.041 +414 L 0.048 +415 R 0.059 +416 Q 0.065 +417 R 0.063 +418 L 0.055 +419 I 0.047 +420 H 0.041 +421 F 0.043 +422 S 0.052 +423 T 0.065 +424 K 0.077 +425 D 0.086 +426 V 0.088 +427 I 0.089 +428 N 0.099 +429 M 0.118 +430 A 0.143 +431 W 0.172 +432 F 0.203 +433 P 0.226 +434 E 0.233 +435 D 0.228 +436 Q 0.218 +437 Q 0.210 +438 V 0.206 +439 L 0.206 +440 T 0.205 +441 P 0.193 +442 N 0.170 +443 L 0.139 +444 V 0.109 +445 A 0.093 +446 T 0.109 +447 L 0.165 +448 P 0.247 +449 P 0.329 +450 S 0.392 +451 T 0.431 +452 H 0.449 +453 E 0.455 +454 T 0.455 +455 G 0.436 +456 G 0.381 +457 Q 0.298 +458 L 0.210 +459 L 0.141 +460 C 0.097 +461 R 0.081 +462 T 0.083 +463 V 0.090 +464 W 0.098 +465 S 0.115 +466 A 0.139 +467 H 0.158 +468 S 0.165 +469 G 0.160 +470 P 0.149 +471 T 0.137 +472 R 0.125 +473 T 0.114 +474 A 0.103 +475 T 0.089 +476 A 0.078 +477 T 0.071 +478 A 0.068 +479 R 0.069 +480 C 0.076 +481 A 0.086 +482 P 0.093 +483 E 0.094 +484 E 0.093 +485 E 0.090 +486 L 0.082 +487 L 0.071 +488 S 0.062 +489 C 0.063 +490 S 0.073 +491 S 0.087 +492 F 0.104 +493 S 0.124 +494 R 0.151 +495 S 0.184 +496 G 0.214 +497 R 0.240 +498 R 0.255 +499 R 0.250 +500 G 0.224 +501 D 0.191 +502 W 0.172 +503 I 0.172 +504 E 0.185 +505 A 0.205 +506 I 0.212 +507 G 0.189 +508 G 0.148 +509 Q 0.109 +510 Q 0.079 +511 V 0.057 +512 C 0.046 +513 K 0.044 +514 A 0.052 +515 L 0.068 +516 N 0.090 +517 A 0.118 +518 F 0.151 +519 G 0.180 +520 G 0.194 +521 E 0.181 +522 G 0.146 +523 V 0.105 +524 Y 0.073 +525 A 0.053 +526 V 0.041 +527 A 0.035 +528 R 0.034 +529 C 0.036 +530 C 0.045 +531 L 0.062 +532 V 0.079 +533 P 0.089 +534 R 0.090 +535 A 0.086 +536 N 0.083 +537 C 0.081 +538 S 0.082 +539 I 0.086 +540 H 0.095 +541 N 0.112 +542 T 0.140 +543 P 0.164 +544 A 0.171 +545 A 0.164 +546 R 0.151 +547 A 0.139 +548 G 0.129 +549 L 0.116 +550 E 0.102 +551 T 0.089 +552 H 0.079 +553 V 0.074 +554 H 0.071 +555 C 0.070 +556 H 0.077 +557 Q 0.089 +558 K 0.103 +559 D 0.116 +560 H 0.126 +561 V 0.127 +562 L 0.120 +563 T 0.109 +564 G 0.104 +565 C 0.109 +566 S 0.115 +567 F 0.119 +568 H 0.124 +569 W 0.139 +570 E 0.163 +571 V 0.189 +572 E 0.212 +573 D 0.230 +574 L 0.244 +575 S 0.259 +576 V 0.278 +577 R 0.303 +578 R 0.329 +579 Q 0.351 +580 P 0.360 +581 A 0.349 +582 L 0.319 +583 R 0.281 +584 S 0.248 +585 R 0.223 +586 R 0.207 +587 Q 0.197 +588 P 0.184 +589 G 0.164 +590 Q 0.140 +591 C 0.118 +592 V 0.101 +593 G 0.090 +594 H 0.086 +595 Q 0.085 +596 A 0.084 +597 A 0.081 +598 S 0.076 +599 V 0.068 +600 Y 0.059 +601 A 0.052 +602 S 0.047 +603 C 0.047 +604 C 0.053 +605 H 0.070 +606 A 0.092 +607 P 0.105 +608 G 0.105 +609 L 0.094 +610 E 0.083 +611 C 0.077 +612 K 0.078 +613 I 0.085 +614 K 0.100 +615 E 0.125 +616 H 0.157 +617 G 0.184 +618 I 0.196 +619 S 0.192 +620 G 0.178 +621 P 0.160 +622 S 0.139 +623 E 0.117 +624 Q 0.098 +625 V 0.086 +626 T 0.080 +627 V 0.078 +628 A 0.076 +629 C 0.079 +630 E 0.091 +631 A 0.104 +632 G 0.113 +633 W 0.115 +634 T 0.115 +635 L 0.113 +636 T 0.108 +637 G 0.106 +638 C 0.109 +639 N 0.124 +640 V 0.152 +641 L 0.185 +642 P 0.209 +643 G 0.214 +644 A 0.203 +645 S 0.187 +646 L 0.171 +647 T 0.156 +648 L 0.138 +649 G 0.118 +650 A 0.103 +651 Y 0.097 +652 S 0.095 +653 V 0.091 +654 D 0.081 +655 N 0.069 +656 L 0.059 +657 C 0.055 +658 V 0.059 +659 A 0.074 +660 R 0.103 +661 V 0.144 +662 H 0.197 +663 D 0.259 +664 T 0.317 +665 A 0.361 +666 R 0.390 +667 A 0.407 +668 D 0.418 +669 R 0.424 +670 T 0.424 +671 S 0.405 +672 G 0.359 +673 E 0.292 +674 A 0.222 +675 T 0.159 +676 V 0.108 +677 A 0.072 +678 A 0.053 +679 A 0.046 +680 I 0.046 +681 C 0.049 +682 C 0.054 +683 R 0.065 +684 S 0.083 +685 R 0.104 +686 P 0.122 +687 S 0.131 +688 A 0.129 +689 K 0.118 +690 A 0.102 +691 S 0.089 +692 W 0.089 +693 V 0.100 +694 Q 0.112 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044254.7_ENSMUST00000049507.6_GN:Pcsk9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:13.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044254.7_ENSMUST00000049507.6_GN:Pcsk9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:13.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..bfac39d3af86aa6b27c820240e49daa1289ac747 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044254.7_ENSMUST00000049507.6_GN:Pcsk9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:13.caid @@ -0,0 +1,708 @@ +>ENSMUSG00000044254.7|ENSMUST00000049507.6|GN:Pcsk9|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:13 +1 M 0.327 +2 S 0.339 +3 F 0.358 +4 P 0.365 +5 R 0.349 +6 P 0.330 +7 R 0.350 +8 A 0.407 +9 P 0.448 +10 L 0.442 +11 L 0.417 +12 A 0.419 +13 P 0.456 +14 M 0.484 +15 G 0.472 +16 T 0.438 +17 H 0.410 +18 C 0.376 +19 S 0.339 +20 A 0.335 +21 W 0.369 +22 L 0.405 +23 R 0.425 +24 W 0.441 +25 P 0.458 +26 L 0.467 +27 L 0.462 +28 P 0.440 +29 L 0.405 +30 L 0.372 +31 P 0.351 +32 P 0.332 +33 L 0.302 +34 L 0.264 +35 L 0.236 +36 L 0.220 +37 L 0.211 +38 L 0.211 +39 L 0.234 +40 L 0.280 +41 C 0.337 +42 P 0.405 +43 T 0.489 +44 G 0.578 +45 A 0.643 +46 G 0.669 +47 A 0.666 +48 Q 0.653 +49 D 0.642 +50 E 0.632 +51 D 0.618 +52 G 0.600 +53 D 0.571 +54 Y 0.532 +55 E 0.499 +56 E 0.485 +57 L 0.494 +58 M 0.512 +59 L 0.528 +60 A 0.537 +61 L 0.542 +62 P 0.545 +63 S 0.556 +64 Q 0.580 +65 E 0.613 +66 D 0.647 +67 G 0.671 +68 L 0.679 +69 A 0.672 +70 D 0.659 +71 E 0.649 +72 A 0.646 +73 A 0.651 +74 H 0.654 +75 V 0.638 +76 A 0.584 +77 T 0.486 +78 A 0.361 +79 T 0.246 +80 F 0.172 +81 R 0.141 +82 R 0.137 +83 C 0.143 +84 S 0.145 +85 K 0.140 +86 E 0.131 +87 A 0.122 +88 W 0.113 +89 R 0.103 +90 L 0.090 +91 P 0.072 +92 G 0.052 +93 T 0.035 +94 Y 0.026 +95 I 0.025 +96 V 0.030 +97 V 0.041 +98 L 0.052 +99 M 0.063 +100 E 0.070 +101 E 0.071 +102 T 0.067 +103 Q 0.062 +104 R 0.063 +105 L 0.063 +106 Q 0.059 +107 I 0.055 +108 E 0.059 +109 Q 0.063 +110 T 0.057 +111 A 0.048 +112 H 0.042 +113 R 0.043 +114 L 0.052 +115 Q 0.064 +116 T 0.074 +117 R 0.076 +118 A 0.074 +119 A 0.072 +120 R 0.073 +121 R 0.078 +122 G 0.083 +123 Y 0.080 +124 V 0.069 +125 I 0.057 +126 K 0.051 +127 V 0.050 +128 L 0.052 +129 H 0.055 +130 I 0.060 +131 F 0.063 +132 Y 0.065 +133 D 0.065 +134 L 0.060 +135 F 0.051 +136 P 0.041 +137 G 0.033 +138 F 0.028 +139 L 0.027 +140 V 0.026 +141 K 0.026 +142 M 0.027 +143 S 0.029 +144 S 0.031 +145 D 0.033 +146 L 0.035 +147 L 0.035 +148 G 0.036 +149 L 0.040 +150 A 0.046 +151 L 0.051 +152 K 0.052 +153 L 0.051 +154 P 0.049 +155 H 0.044 +156 V 0.042 +157 E 0.044 +158 Y 0.052 +159 I 0.066 +160 E 0.086 +161 E 0.107 +162 D 0.128 +163 S 0.147 +164 F 0.162 +165 V 0.168 +166 F 0.170 +167 A 0.176 +168 Q 0.188 +169 S 0.195 +170 I 0.183 +171 P 0.150 +172 W 0.117 +173 N 0.102 +174 L 0.101 +175 E 0.103 +176 R 0.105 +177 I 0.112 +178 I 0.122 +179 P 0.137 +180 A 0.165 +181 W 0.205 +182 H 0.251 +183 Q 0.292 +184 T 0.326 +185 E 0.355 +186 E 0.379 +187 D 0.395 +188 R 0.403 +189 S 0.406 +190 P 0.409 +191 D 0.408 +192 G 0.389 +193 S 0.339 +194 S 0.263 +195 Q 0.187 +196 V 0.133 +197 E 0.102 +198 V 0.086 +199 Y 0.077 +200 L 0.071 +201 L 0.068 +202 D 0.072 +203 T 0.088 +204 S 0.107 +205 I 0.114 +206 Q 0.112 +207 G 0.108 +208 A 0.103 +209 H 0.094 +210 R 0.087 +211 E 0.084 +212 I 0.083 +213 E 0.083 +214 G 0.085 +215 R 0.088 +216 V 0.090 +217 T 0.092 +218 I 0.094 +219 T 0.099 +220 D 0.113 +221 F 0.144 +222 N 0.193 +223 S 0.245 +224 V 0.283 +225 P 0.302 +226 E 0.311 +227 E 0.319 +228 D 0.328 +229 G 0.336 +230 T 0.346 +231 R 0.363 +232 F 0.384 +233 H 0.400 +234 R 0.407 +235 Q 0.397 +236 A 0.363 +237 S 0.308 +238 K 0.245 +239 C 0.190 +240 D 0.151 +241 S 0.130 +242 H 0.125 +243 G 0.135 +244 T 0.153 +245 H 0.169 +246 L 0.170 +247 A 0.156 +248 G 0.138 +249 V 0.127 +250 V 0.124 +251 S 0.124 +252 G 0.129 +253 R 0.132 +254 D 0.129 +255 A 0.122 +256 G 0.115 +257 V 0.111 +258 A 0.111 +259 K 0.118 +260 G 0.127 +261 T 0.132 +262 S 0.131 +263 L 0.126 +264 H 0.119 +265 S 0.111 +266 L 0.103 +267 R 0.097 +268 V 0.094 +269 L 0.089 +270 N 0.085 +271 C 0.085 +272 Q 0.089 +273 G 0.091 +274 K 0.088 +275 G 0.079 +276 T 0.065 +277 V 0.052 +278 S 0.047 +279 G 0.048 +280 T 0.051 +281 L 0.051 +282 I 0.049 +283 G 0.046 +284 L 0.042 +285 E 0.038 +286 F 0.035 +287 I 0.034 +288 R 0.034 +289 K 0.035 +290 S 0.037 +291 Q 0.042 +292 L 0.051 +293 I 0.068 +294 Q 0.086 +295 P 0.100 +296 S 0.104 +297 G 0.100 +298 P 0.088 +299 L 0.075 +300 V 0.064 +301 V 0.053 +302 L 0.046 +303 L 0.045 +304 P 0.051 +305 L 0.065 +306 A 0.086 +307 G 0.112 +308 G 0.130 +309 Y 0.127 +310 S 0.105 +311 R 0.079 +312 I 0.066 +313 L 0.069 +314 N 0.077 +315 A 0.080 +316 A 0.072 +317 C 0.059 +318 R 0.049 +319 H 0.041 +320 L 0.037 +321 A 0.035 +322 R 0.035 +323 T 0.038 +324 G 0.044 +325 V 0.047 +326 V 0.046 +327 L 0.044 +328 V 0.046 +329 A 0.053 +330 A 0.066 +331 A 0.081 +332 G 0.092 +333 N 0.098 +334 F 0.096 +335 R 0.092 +336 D 0.091 +337 D 0.090 +338 A 0.083 +339 C 0.068 +340 L 0.054 +341 Y 0.045 +342 S 0.043 +343 P 0.049 +344 A 0.066 +345 S 0.085 +346 A 0.095 +347 P 0.092 +348 E 0.082 +349 V 0.071 +350 I 0.061 +351 T 0.052 +352 V 0.047 +353 G 0.046 +354 A 0.049 +355 T 0.056 +356 N 0.070 +357 A 0.090 +358 Q 0.108 +359 D 0.122 +360 Q 0.135 +361 P 0.151 +362 V 0.168 +363 T 0.189 +364 L 0.204 +365 G 0.201 +366 T 0.177 +367 L 0.145 +368 G 0.119 +369 T 0.110 +370 N 0.116 +371 F 0.124 +372 G 0.125 +373 R 0.121 +374 C 0.118 +375 V 0.115 +376 D 0.111 +377 L 0.103 +378 F 0.095 +379 A 0.094 +380 P 0.111 +381 G 0.141 +382 K 0.168 +383 D 0.181 +384 I 0.184 +385 I 0.186 +386 G 0.190 +387 A 0.192 +388 S 0.189 +389 S 0.185 +390 D 0.184 +391 C 0.183 +392 S 0.181 +393 T 0.182 +394 C 0.186 +395 F 0.185 +396 M 0.174 +397 S 0.157 +398 Q 0.147 +399 S 0.150 +400 G 0.169 +401 T 0.207 +402 S 0.254 +403 Q 0.283 +404 A 0.271 +405 A 0.229 +406 A 0.184 +407 H 0.149 +408 V 0.121 +409 A 0.098 +410 G 0.081 +411 I 0.070 +412 V 0.064 +413 A 0.059 +414 R 0.053 +415 M 0.048 +416 L 0.047 +417 S 0.047 +418 R 0.047 +419 E 0.048 +420 P 0.047 +421 T 0.045 +422 L 0.043 +423 T 0.042 +424 L 0.041 +425 A 0.040 +426 E 0.041 +427 L 0.048 +428 R 0.059 +429 Q 0.066 +430 R 0.063 +431 L 0.055 +432 I 0.047 +433 H 0.042 +434 F 0.043 +435 S 0.052 +436 T 0.065 +437 K 0.077 +438 D 0.085 +439 V 0.087 +440 I 0.089 +441 N 0.099 +442 M 0.118 +443 A 0.143 +444 W 0.172 +445 F 0.203 +446 P 0.226 +447 E 0.233 +448 D 0.228 +449 Q 0.218 +450 Q 0.210 +451 V 0.206 +452 L 0.207 +453 T 0.206 +454 P 0.195 +455 N 0.171 +456 L 0.140 +457 V 0.110 +458 A 0.093 +459 T 0.109 +460 L 0.164 +461 P 0.245 +462 P 0.327 +463 S 0.390 +464 T 0.429 +465 H 0.447 +466 E 0.453 +467 T 0.453 +468 G 0.434 +469 G 0.380 +470 Q 0.297 +471 L 0.210 +472 L 0.140 +473 C 0.097 +474 R 0.081 +475 T 0.083 +476 V 0.090 +477 W 0.098 +478 S 0.115 +479 A 0.139 +480 H 0.159 +481 S 0.165 +482 G 0.160 +483 P 0.149 +484 T 0.136 +485 R 0.125 +486 T 0.114 +487 A 0.103 +488 T 0.090 +489 A 0.078 +490 T 0.072 +491 A 0.069 +492 R 0.070 +493 C 0.076 +494 A 0.086 +495 P 0.093 +496 E 0.094 +497 E 0.093 +498 E 0.090 +499 L 0.083 +500 L 0.071 +501 S 0.063 +502 C 0.063 +503 S 0.073 +504 S 0.087 +505 F 0.104 +506 S 0.124 +507 R 0.151 +508 S 0.184 +509 G 0.214 +510 R 0.240 +511 R 0.255 +512 R 0.250 +513 G 0.223 +514 D 0.191 +515 W 0.172 +516 I 0.171 +517 E 0.185 +518 A 0.206 +519 I 0.213 +520 G 0.190 +521 G 0.149 +522 Q 0.109 +523 Q 0.079 +524 V 0.057 +525 C 0.046 +526 K 0.044 +527 A 0.052 +528 L 0.067 +529 N 0.090 +530 A 0.118 +531 F 0.151 +532 G 0.180 +533 G 0.194 +534 E 0.181 +535 G 0.146 +536 V 0.105 +537 Y 0.073 +538 A 0.053 +539 V 0.041 +540 A 0.035 +541 R 0.034 +542 C 0.036 +543 C 0.045 +544 L 0.062 +545 V 0.079 +546 P 0.089 +547 R 0.090 +548 A 0.086 +549 N 0.083 +550 C 0.081 +551 S 0.082 +552 I 0.086 +553 H 0.095 +554 N 0.112 +555 T 0.139 +556 P 0.163 +557 A 0.171 +558 A 0.163 +559 R 0.151 +560 A 0.139 +561 G 0.128 +562 L 0.116 +563 E 0.102 +564 T 0.088 +565 H 0.079 +566 V 0.074 +567 H 0.070 +568 C 0.070 +569 H 0.076 +570 Q 0.089 +571 K 0.103 +572 D 0.116 +573 H 0.125 +574 V 0.127 +575 L 0.119 +576 T 0.108 +577 G 0.103 +578 C 0.108 +579 S 0.114 +580 F 0.117 +581 H 0.123 +582 W 0.138 +583 E 0.161 +584 V 0.187 +585 E 0.211 +586 D 0.228 +587 L 0.242 +588 S 0.257 +589 V 0.277 +590 R 0.301 +591 R 0.327 +592 Q 0.349 +593 P 0.358 +594 A 0.347 +595 L 0.317 +596 R 0.279 +597 S 0.246 +598 R 0.221 +599 R 0.205 +600 Q 0.195 +601 P 0.182 +602 G 0.162 +603 Q 0.139 +604 C 0.117 +605 V 0.100 +606 G 0.089 +607 H 0.085 +608 Q 0.085 +609 A 0.084 +610 A 0.081 +611 S 0.075 +612 V 0.068 +613 Y 0.059 +614 A 0.052 +615 S 0.047 +616 C 0.047 +617 C 0.053 +618 H 0.070 +619 A 0.092 +620 P 0.105 +621 G 0.104 +622 L 0.094 +623 E 0.082 +624 C 0.077 +625 K 0.077 +626 I 0.085 +627 K 0.100 +628 E 0.125 +629 H 0.156 +630 G 0.184 +631 I 0.196 +632 S 0.191 +633 G 0.177 +634 P 0.159 +635 S 0.138 +636 E 0.117 +637 Q 0.098 +638 V 0.086 +639 T 0.080 +640 V 0.078 +641 A 0.076 +642 C 0.079 +643 E 0.090 +644 A 0.104 +645 G 0.112 +646 W 0.115 +647 T 0.115 +648 L 0.113 +649 T 0.109 +650 G 0.106 +651 C 0.110 +652 N 0.125 +653 V 0.152 +654 L 0.185 +655 P 0.209 +656 G 0.214 +657 A 0.203 +658 S 0.187 +659 L 0.171 +660 T 0.156 +661 L 0.138 +662 G 0.118 +663 A 0.103 +664 Y 0.096 +665 S 0.095 +666 V 0.090 +667 D 0.081 +668 N 0.069 +669 L 0.059 +670 C 0.055 +671 V 0.059 +672 A 0.074 +673 R 0.103 +674 V 0.144 +675 H 0.196 +676 D 0.257 +677 T 0.315 +678 A 0.359 +679 R 0.387 +680 A 0.404 +681 D 0.415 +682 R 0.422 +683 T 0.423 +684 S 0.405 +685 G 0.359 +686 E 0.292 +687 A 0.222 +688 T 0.159 +689 V 0.108 +690 A 0.072 +691 A 0.053 +692 A 0.046 +693 I 0.046 +694 C 0.049 +695 C 0.054 +696 R 0.065 +697 S 0.083 +698 R 0.104 +699 P 0.121 +700 S 0.130 +701 A 0.129 +702 K 0.118 +703 A 0.101 +704 S 0.089 +705 W 0.089 +706 V 0.101 +707 Q 0.113 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044505.6_ENSMUST00000050975.6_GN:Lingo4_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044505.6_ENSMUST00000050975.6_GN:Lingo4_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d96a6c1e596e1d446a8ebd72fec01c04967dc6b4 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044505.6_ENSMUST00000050975.6_GN:Lingo4_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,594 @@ +>ENSMUSG00000044505.6|ENSMUST00000050975.6|GN:Lingo4|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.348 +2 D 0.344 +3 A 0.351 +4 A 0.371 +5 T 0.387 +6 A 0.398 +7 P 0.403 +8 K 0.382 +9 Q 0.342 +10 A 0.333 +11 W 0.373 +12 L 0.427 +13 P 0.457 +14 W 0.463 +15 S 0.446 +16 P 0.395 +17 L 0.327 +18 L 0.288 +19 F 0.292 +20 L 0.307 +21 L 0.319 +22 L 0.343 +23 L 0.392 +24 P 0.455 +25 G 0.514 +26 G 0.548 +27 S 0.545 +28 I 0.499 +29 S 0.413 +30 S 0.307 +31 C 0.208 +32 P 0.131 +33 T 0.079 +34 V 0.052 +35 C 0.044 +36 D 0.050 +37 C 0.061 +38 T 0.072 +39 S 0.081 +40 Q 0.089 +41 T 0.092 +42 R 0.093 +43 A 0.093 +44 V 0.096 +45 F 0.098 +46 C 0.103 +47 A 0.109 +48 H 0.114 +49 R 0.114 +50 R 0.111 +51 L 0.105 +52 D 0.098 +53 T 0.092 +54 I 0.092 +55 P 0.096 +56 G 0.099 +57 G 0.098 +58 L 0.092 +59 P 0.092 +60 L 0.101 +61 D 0.113 +62 T 0.121 +63 E 0.126 +64 L 0.130 +65 L 0.134 +66 D 0.140 +67 L 0.145 +68 S 0.140 +69 G 0.121 +70 N 0.099 +71 R 0.090 +72 L 0.096 +73 W 0.111 +74 G 0.131 +75 L 0.146 +76 Q 0.151 +77 R 0.141 +78 G 0.119 +79 M 0.092 +80 L 0.072 +81 S 0.062 +82 R 0.060 +83 L 0.070 +84 G 0.088 +85 Q 0.105 +86 L 0.117 +87 Q 0.129 +88 E 0.136 +89 L 0.135 +90 D 0.129 +91 L 0.124 +92 S 0.119 +93 Y 0.109 +94 N 0.097 +95 Q 0.090 +96 L 0.094 +97 S 0.108 +98 T 0.131 +99 L 0.155 +100 E 0.169 +101 P 0.167 +102 G 0.147 +103 A 0.115 +104 F 0.090 +105 H 0.078 +106 G 0.077 +107 L 0.081 +108 Q 0.086 +109 S 0.090 +110 L 0.095 +111 L 0.106 +112 T 0.121 +113 L 0.134 +114 R 0.144 +115 L 0.152 +116 Q 0.150 +117 G 0.131 +118 N 0.104 +119 R 0.087 +120 L 0.088 +121 R 0.104 +122 I 0.129 +123 V 0.161 +124 G 0.188 +125 P 0.195 +126 G 0.173 +127 I 0.133 +128 F 0.098 +129 S 0.081 +130 G 0.077 +131 L 0.081 +132 T 0.089 +133 A 0.093 +134 L 0.093 +135 T 0.094 +136 L 0.105 +137 L 0.125 +138 D 0.152 +139 L 0.176 +140 R 0.182 +141 L 0.160 +142 N 0.126 +143 Q 0.103 +144 I 0.100 +145 V 0.111 +146 L 0.132 +147 F 0.155 +148 L 0.171 +149 D 0.174 +150 G 0.159 +151 A 0.130 +152 F 0.103 +153 S 0.088 +154 E 0.084 +155 L 0.085 +156 G 0.091 +157 S 0.097 +158 L 0.107 +159 Q 0.126 +160 Q 0.146 +161 L 0.157 +162 E 0.156 +163 V 0.152 +164 G 0.155 +165 D 0.156 +166 N 0.143 +167 H 0.124 +168 L 0.115 +169 V 0.127 +170 F 0.156 +171 V 0.186 +172 A 0.207 +173 P 0.213 +174 G 0.195 +175 A 0.156 +176 F 0.119 +177 A 0.100 +178 G 0.096 +179 L 0.097 +180 A 0.099 +181 K 0.098 +182 L 0.092 +183 S 0.090 +184 T 0.096 +185 I 0.106 +186 T 0.115 +187 L 0.123 +188 E 0.125 +189 R 0.117 +190 C 0.102 +191 N 0.090 +192 L 0.086 +193 S 0.091 +194 T 0.099 +195 V 0.104 +196 P 0.100 +197 G 0.094 +198 L 0.088 +199 A 0.081 +200 L 0.075 +201 A 0.074 +202 Q 0.080 +203 L 0.089 +204 P 0.096 +205 A 0.097 +206 L 0.094 +207 V 0.094 +208 A 0.099 +209 L 0.105 +210 R 0.113 +211 L 0.121 +212 R 0.126 +213 E 0.124 +214 L 0.113 +215 D 0.102 +216 I 0.103 +217 E 0.123 +218 R 0.157 +219 L 0.188 +220 P 0.201 +221 A 0.191 +222 G 0.162 +223 A 0.123 +224 L 0.092 +225 R 0.077 +226 G 0.075 +227 L 0.082 +228 G 0.095 +229 Q 0.107 +230 L 0.119 +231 K 0.135 +232 E 0.148 +233 L 0.147 +234 E 0.134 +235 I 0.116 +236 H 0.102 +237 H 0.100 +238 W 0.108 +239 P 0.115 +240 S 0.111 +241 L 0.104 +242 E 0.107 +243 A 0.123 +244 L 0.142 +245 D 0.154 +246 P 0.152 +247 G 0.135 +248 S 0.111 +249 L 0.095 +250 V 0.086 +251 G 0.075 +252 L 0.063 +253 N 0.057 +254 L 0.060 +255 S 0.072 +256 S 0.091 +257 L 0.108 +258 A 0.118 +259 I 0.118 +260 T 0.113 +261 R 0.106 +262 C 0.099 +263 N 0.092 +264 L 0.086 +265 S 0.083 +266 S 0.082 +267 V 0.079 +268 P 0.075 +269 F 0.070 +270 Q 0.067 +271 A 0.064 +272 L 0.062 +273 H 0.061 +274 H 0.062 +275 L 0.066 +276 S 0.073 +277 F 0.083 +278 L 0.097 +279 R 0.117 +280 I 0.133 +281 L 0.139 +282 D 0.137 +283 L 0.137 +284 S 0.137 +285 Q 0.131 +286 N 0.118 +287 P 0.105 +288 I 0.101 +289 S 0.107 +290 A 0.120 +291 I 0.132 +292 P 0.138 +293 A 0.138 +294 R 0.129 +295 R 0.116 +296 L 0.105 +297 S 0.096 +298 P 0.087 +299 L 0.084 +300 V 0.090 +301 R 0.100 +302 L 0.112 +303 Q 0.127 +304 E 0.142 +305 L 0.146 +306 R 0.139 +307 L 0.129 +308 S 0.117 +309 G 0.103 +310 A 0.090 +311 C 0.090 +312 L 0.105 +313 T 0.136 +314 S 0.173 +315 I 0.199 +316 A 0.203 +317 A 0.193 +318 H 0.172 +319 A 0.147 +320 F 0.130 +321 H 0.128 +322 G 0.133 +323 L 0.132 +324 T 0.118 +325 A 0.100 +326 F 0.090 +327 H 0.098 +328 L 0.125 +329 L 0.157 +330 D 0.181 +331 V 0.197 +332 A 0.202 +333 D 0.188 +334 N 0.161 +335 A 0.140 +336 L 0.136 +337 Q 0.147 +338 T 0.160 +339 L 0.161 +340 E 0.144 +341 E 0.119 +342 T 0.097 +343 A 0.083 +344 F 0.079 +345 P 0.092 +346 S 0.110 +347 P 0.123 +348 D 0.131 +349 K 0.141 +350 L 0.153 +351 V 0.166 +352 T 0.177 +353 L 0.185 +354 R 0.196 +355 L 0.212 +356 S 0.218 +357 G 0.195 +358 N 0.151 +359 P 0.110 +360 L 0.083 +361 T 0.066 +362 C 0.058 +363 D 0.060 +364 C 0.067 +365 R 0.071 +366 L 0.067 +367 L 0.055 +368 W 0.043 +369 L 0.035 +370 L 0.031 +371 R 0.030 +372 L 0.033 +373 R 0.039 +374 R 0.048 +375 R 0.059 +376 L 0.069 +377 D 0.081 +378 F 0.100 +379 G 0.124 +380 T 0.143 +381 S 0.144 +382 P 0.124 +383 P 0.096 +384 A 0.077 +385 C 0.070 +386 A 0.067 +387 G 0.060 +388 P 0.053 +389 Q 0.051 +390 H 0.052 +391 V 0.056 +392 Q 0.062 +393 G 0.068 +394 K 0.070 +395 S 0.069 +396 L 0.066 +397 R 0.064 +398 E 0.070 +399 F 0.082 +400 S 0.097 +401 D 0.113 +402 I 0.128 +403 L 0.141 +404 P 0.149 +405 P 0.148 +406 G 0.134 +407 H 0.115 +408 F 0.104 +409 T 0.101 +410 C 0.102 +411 K 0.103 +412 P 0.101 +413 A 0.098 +414 L 0.102 +415 I 0.115 +416 R 0.134 +417 K 0.154 +418 S 0.170 +419 G 0.177 +420 P 0.166 +421 R 0.140 +422 W 0.115 +423 V 0.097 +424 I 0.083 +425 A 0.076 +426 E 0.078 +427 E 0.084 +428 G 0.084 +429 G 0.079 +430 H 0.071 +431 A 0.068 +432 V 0.071 +433 F 0.081 +434 S 0.094 +435 C 0.104 +436 S 0.109 +437 G 0.116 +438 D 0.123 +439 G 0.122 +440 D 0.111 +441 P 0.102 +442 A 0.100 +443 P 0.094 +444 T 0.080 +445 V 0.064 +446 S 0.056 +447 W 0.057 +448 M 0.065 +449 R 0.079 +450 P 0.103 +451 Q 0.131 +452 G 0.153 +453 A 0.165 +454 W 0.171 +455 L 0.181 +456 G 0.189 +457 R 0.183 +458 V 0.159 +459 G 0.129 +460 R 0.107 +461 V 0.099 +462 R 0.100 +463 V 0.101 +464 L 0.102 +465 E 0.104 +466 D 0.105 +467 G 0.098 +468 T 0.083 +469 L 0.069 +470 E 0.061 +471 I 0.059 +472 R 0.061 +473 S 0.067 +474 V 0.073 +475 Q 0.079 +476 L 0.088 +477 R 0.098 +478 D 0.106 +479 R 0.107 +480 G 0.097 +481 A 0.075 +482 Y 0.055 +483 V 0.045 +484 C 0.047 +485 V 0.054 +486 V 0.059 +487 S 0.063 +488 N 0.074 +489 V 0.091 +490 A 0.106 +491 G 0.107 +492 N 0.097 +493 D 0.085 +494 S 0.076 +495 L 0.069 +496 R 0.061 +497 T 0.053 +498 W 0.049 +499 L 0.056 +500 E 0.082 +501 V 0.128 +502 I 0.194 +503 Q 0.277 +504 V 0.368 +505 E 0.456 +506 P 0.533 +507 P 0.598 +508 N 0.646 +509 G 0.672 +510 T 0.671 +511 L 0.653 +512 S 0.638 +513 D 0.636 +514 P 0.639 +515 N 0.637 +516 I 0.630 +517 T 0.632 +518 M 0.647 +519 P 0.668 +520 G 0.679 +521 I 0.677 +522 P 0.670 +523 G 0.671 +524 P 0.679 +525 F 0.678 +526 F 0.652 +527 L 0.610 +528 D 0.567 +529 S 0.529 +530 R 0.497 +531 G 0.474 +532 V 0.451 +533 A 0.429 +534 M 0.436 +535 V 0.477 +536 L 0.516 +537 A 0.523 +538 V 0.500 +539 G 0.459 +540 F 0.414 +541 L 0.381 +542 P 0.362 +543 F 0.348 +544 L 0.336 +545 T 0.335 +546 S 0.337 +547 V 0.320 +548 T 0.281 +549 L 0.244 +550 C 0.220 +551 F 0.208 +552 G 0.204 +553 L 0.201 +554 I 0.196 +555 A 0.199 +556 L 0.221 +557 W 0.261 +558 S 0.313 +559 K 0.376 +560 G 0.444 +561 K 0.505 +562 G 0.549 +563 R 0.574 +564 V 0.582 +565 K 0.570 +566 H 0.544 +567 H 0.520 +568 M 0.503 +569 T 0.486 +570 F 0.471 +571 D 0.463 +572 F 0.460 +573 V 0.463 +574 A 0.483 +575 P 0.524 +576 R 0.578 +577 P 0.632 +578 S 0.680 +579 G 0.716 +580 D 0.735 +581 K 0.740 +582 N 0.738 +583 S 0.729 +584 G 0.715 +585 G 0.692 +586 N 0.652 +587 R 0.603 +588 V 0.545 +589 T 0.472 +590 A 0.385 +591 K 0.307 +592 L 0.253 +593 F 0.226 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044505.6_ENSMUST00000050975.6_GN:Lingo4_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:25.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044505.6_ENSMUST00000050975.6_GN:Lingo4_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:25.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..95257ba8cac06b0f64a1806f77b23aa30654fcd6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044505.6_ENSMUST00000050975.6_GN:Lingo4_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:25.caid @@ -0,0 +1,619 @@ +>ENSMUSG00000044505.6|ENSMUST00000050975.6|GN:Lingo4|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:25 +1 M 0.389 +2 G 0.403 +3 Q 0.426 +4 A 0.447 +5 P 0.447 +6 A 0.422 +7 L 0.385 +8 E 0.352 +9 R 0.330 +10 C 0.318 +11 S 0.320 +12 A 0.344 +13 Q 0.381 +14 L 0.401 +15 D 0.398 +16 A 0.396 +17 T 0.410 +18 P 0.423 +19 Q 0.433 +20 L 0.463 +21 L 0.507 +22 R 0.546 +23 P 0.577 +24 Q 0.603 +25 G 0.619 +26 M 0.622 +27 D 0.614 +28 A 0.584 +29 A 0.531 +30 T 0.496 +31 A 0.504 +32 P 0.522 +33 K 0.509 +34 Q 0.488 +35 A 0.490 +36 W 0.506 +37 L 0.517 +38 P 0.521 +39 W 0.522 +40 S 0.513 +41 P 0.480 +42 L 0.430 +43 L 0.390 +44 F 0.370 +45 L 0.361 +46 L 0.361 +47 L 0.377 +48 L 0.416 +49 P 0.475 +50 G 0.532 +51 G 0.564 +52 S 0.555 +53 I 0.502 +54 S 0.411 +55 S 0.303 +56 C 0.203 +57 P 0.127 +58 T 0.077 +59 V 0.050 +60 C 0.043 +61 D 0.048 +62 C 0.058 +63 T 0.069 +64 S 0.078 +65 Q 0.086 +66 T 0.090 +67 R 0.091 +68 A 0.091 +69 V 0.093 +70 F 0.096 +71 C 0.099 +72 A 0.105 +73 H 0.109 +74 R 0.108 +75 R 0.104 +76 L 0.098 +77 D 0.092 +78 T 0.086 +79 I 0.085 +80 P 0.088 +81 G 0.091 +82 G 0.090 +83 L 0.084 +84 P 0.084 +85 L 0.093 +86 D 0.104 +87 T 0.111 +88 E 0.115 +89 L 0.118 +90 L 0.122 +91 D 0.127 +92 L 0.131 +93 S 0.127 +94 G 0.110 +95 N 0.091 +96 R 0.081 +97 L 0.086 +98 W 0.100 +99 G 0.118 +100 L 0.133 +101 Q 0.137 +102 R 0.128 +103 G 0.107 +104 M 0.082 +105 L 0.065 +106 S 0.056 +107 R 0.054 +108 L 0.063 +109 G 0.080 +110 Q 0.097 +111 L 0.111 +112 Q 0.123 +113 E 0.130 +114 L 0.129 +115 D 0.126 +116 L 0.124 +117 S 0.121 +118 Y 0.112 +119 N 0.099 +120 Q 0.092 +121 L 0.094 +122 S 0.108 +123 T 0.132 +124 L 0.155 +125 E 0.170 +126 P 0.170 +127 G 0.152 +128 A 0.122 +129 F 0.098 +130 H 0.088 +131 G 0.089 +132 L 0.095 +133 Q 0.102 +134 S 0.106 +135 L 0.111 +136 L 0.122 +137 T 0.138 +138 L 0.153 +139 R 0.164 +140 L 0.172 +141 Q 0.167 +142 G 0.143 +143 N 0.113 +144 R 0.095 +145 L 0.094 +146 R 0.109 +147 I 0.135 +148 V 0.167 +149 G 0.195 +150 P 0.202 +151 G 0.181 +152 I 0.141 +153 F 0.106 +154 S 0.088 +155 G 0.084 +156 L 0.088 +157 T 0.095 +158 A 0.098 +159 L 0.096 +160 T 0.095 +161 L 0.103 +162 L 0.122 +163 D 0.148 +164 L 0.172 +165 R 0.177 +166 L 0.156 +167 N 0.123 +168 Q 0.101 +169 I 0.097 +170 V 0.107 +171 L 0.129 +172 F 0.154 +173 L 0.170 +174 D 0.171 +175 G 0.155 +176 A 0.126 +177 F 0.100 +178 S 0.086 +179 E 0.081 +180 L 0.082 +181 G 0.086 +182 S 0.092 +183 L 0.103 +184 Q 0.122 +185 Q 0.144 +186 L 0.155 +187 E 0.153 +188 V 0.149 +189 G 0.151 +190 D 0.152 +191 N 0.137 +192 H 0.116 +193 L 0.106 +194 V 0.116 +195 F 0.144 +196 V 0.177 +197 A 0.201 +198 P 0.207 +199 G 0.188 +200 A 0.150 +201 F 0.113 +202 A 0.095 +203 G 0.091 +204 L 0.092 +205 A 0.095 +206 K 0.094 +207 L 0.089 +208 S 0.087 +209 T 0.094 +210 I 0.104 +211 T 0.113 +212 L 0.121 +213 E 0.121 +214 R 0.110 +215 C 0.093 +216 N 0.080 +217 L 0.076 +218 S 0.082 +219 T 0.092 +220 V 0.097 +221 P 0.095 +222 G 0.089 +223 L 0.083 +224 A 0.076 +225 L 0.069 +226 A 0.068 +227 Q 0.073 +228 L 0.082 +229 P 0.090 +230 A 0.092 +231 L 0.090 +232 V 0.091 +233 A 0.095 +234 L 0.102 +235 R 0.110 +236 L 0.117 +237 R 0.122 +238 E 0.118 +239 L 0.107 +240 D 0.097 +241 I 0.100 +242 E 0.122 +243 R 0.156 +244 L 0.187 +245 P 0.200 +246 A 0.190 +247 G 0.160 +248 A 0.122 +249 L 0.093 +250 R 0.079 +251 G 0.077 +252 L 0.083 +253 G 0.096 +254 Q 0.109 +255 L 0.121 +256 K 0.136 +257 E 0.147 +258 L 0.145 +259 E 0.131 +260 I 0.114 +261 H 0.101 +262 H 0.101 +263 W 0.110 +264 P 0.118 +265 S 0.115 +266 L 0.108 +267 E 0.108 +268 A 0.121 +269 L 0.139 +270 D 0.152 +271 P 0.152 +272 G 0.137 +273 S 0.116 +274 L 0.101 +275 V 0.093 +276 G 0.082 +277 L 0.069 +278 N 0.062 +279 L 0.064 +280 S 0.076 +281 S 0.095 +282 L 0.114 +283 A 0.126 +284 I 0.128 +285 T 0.123 +286 R 0.117 +287 C 0.110 +288 N 0.103 +289 L 0.098 +290 S 0.097 +291 S 0.097 +292 V 0.094 +293 P 0.088 +294 F 0.082 +295 Q 0.078 +296 A 0.076 +297 L 0.073 +298 H 0.072 +299 H 0.074 +300 L 0.079 +301 S 0.086 +302 F 0.095 +303 L 0.107 +304 R 0.125 +305 I 0.141 +306 L 0.147 +307 D 0.147 +308 L 0.147 +309 S 0.146 +310 Q 0.139 +311 N 0.126 +312 P 0.114 +313 I 0.109 +314 S 0.115 +315 A 0.128 +316 I 0.139 +317 P 0.145 +318 A 0.146 +319 R 0.139 +320 R 0.126 +321 L 0.113 +322 S 0.103 +323 P 0.094 +324 L 0.090 +325 V 0.096 +326 R 0.107 +327 L 0.119 +328 Q 0.134 +329 E 0.149 +330 L 0.154 +331 R 0.147 +332 L 0.135 +333 S 0.122 +334 G 0.105 +335 A 0.090 +336 C 0.088 +337 L 0.105 +338 T 0.139 +339 S 0.179 +340 I 0.206 +341 A 0.210 +342 A 0.198 +343 H 0.176 +344 A 0.150 +345 F 0.132 +346 H 0.129 +347 G 0.135 +348 L 0.133 +349 T 0.119 +350 A 0.101 +351 F 0.092 +352 H 0.102 +353 L 0.130 +354 L 0.159 +355 D 0.181 +356 V 0.196 +357 A 0.202 +358 D 0.189 +359 N 0.162 +360 A 0.139 +361 L 0.134 +362 Q 0.143 +363 T 0.156 +364 L 0.157 +365 E 0.139 +366 E 0.114 +367 T 0.093 +368 A 0.078 +369 F 0.075 +370 P 0.086 +371 S 0.104 +372 P 0.117 +373 D 0.125 +374 K 0.133 +375 L 0.144 +376 V 0.157 +377 T 0.168 +378 L 0.180 +379 R 0.194 +380 L 0.213 +381 S 0.220 +382 G 0.197 +383 N 0.153 +384 P 0.111 +385 L 0.083 +386 T 0.066 +387 C 0.058 +388 D 0.059 +389 C 0.065 +390 R 0.069 +391 L 0.064 +392 L 0.053 +393 W 0.042 +394 L 0.035 +395 L 0.031 +396 R 0.030 +397 L 0.033 +398 R 0.039 +399 R 0.048 +400 R 0.058 +401 L 0.068 +402 D 0.080 +403 F 0.099 +404 G 0.125 +405 T 0.145 +406 S 0.145 +407 P 0.126 +408 P 0.098 +409 A 0.079 +410 C 0.072 +411 A 0.068 +412 G 0.062 +413 P 0.054 +414 Q 0.051 +415 H 0.053 +416 V 0.057 +417 Q 0.064 +418 G 0.069 +419 K 0.072 +420 S 0.071 +421 L 0.067 +422 R 0.065 +423 E 0.070 +424 F 0.081 +425 S 0.095 +426 D 0.111 +427 I 0.126 +428 L 0.140 +429 P 0.149 +430 P 0.148 +431 G 0.135 +432 H 0.117 +433 F 0.105 +434 T 0.102 +435 C 0.103 +436 K 0.104 +437 P 0.102 +438 A 0.100 +439 L 0.103 +440 I 0.116 +441 R 0.135 +442 K 0.154 +443 S 0.170 +444 G 0.178 +445 P 0.167 +446 R 0.141 +447 W 0.116 +448 V 0.098 +449 I 0.085 +450 A 0.077 +451 E 0.079 +452 E 0.084 +453 G 0.084 +454 G 0.079 +455 H 0.072 +456 A 0.069 +457 V 0.072 +458 F 0.083 +459 S 0.098 +460 C 0.108 +461 S 0.114 +462 G 0.121 +463 D 0.129 +464 G 0.128 +465 D 0.116 +466 P 0.106 +467 A 0.103 +468 P 0.097 +469 T 0.082 +470 V 0.066 +471 S 0.058 +472 W 0.060 +473 M 0.068 +474 R 0.082 +475 P 0.106 +476 Q 0.135 +477 G 0.158 +478 A 0.171 +479 W 0.177 +480 L 0.187 +481 G 0.194 +482 R 0.186 +483 V 0.161 +484 G 0.129 +485 R 0.106 +486 V 0.099 +487 R 0.099 +488 V 0.100 +489 L 0.101 +490 E 0.104 +491 D 0.106 +492 G 0.099 +493 T 0.085 +494 L 0.070 +495 E 0.062 +496 I 0.060 +497 R 0.063 +498 S 0.069 +499 V 0.074 +500 Q 0.080 +501 L 0.088 +502 R 0.097 +503 D 0.105 +504 R 0.107 +505 G 0.096 +506 A 0.076 +507 Y 0.055 +508 V 0.045 +509 C 0.047 +510 V 0.054 +511 V 0.060 +512 S 0.064 +513 N 0.074 +514 V 0.092 +515 A 0.107 +516 G 0.108 +517 N 0.098 +518 D 0.086 +519 S 0.076 +520 L 0.069 +521 R 0.061 +522 T 0.053 +523 W 0.049 +524 L 0.056 +525 E 0.081 +526 V 0.126 +527 I 0.192 +528 Q 0.274 +529 V 0.365 +530 E 0.453 +531 P 0.530 +532 P 0.594 +533 N 0.643 +534 G 0.670 +535 T 0.672 +536 L 0.656 +537 S 0.642 +538 D 0.640 +539 P 0.641 +540 N 0.638 +541 I 0.630 +542 T 0.632 +543 M 0.648 +544 P 0.669 +545 G 0.679 +546 I 0.675 +547 P 0.668 +548 G 0.668 +549 P 0.674 +550 F 0.670 +551 F 0.642 +552 L 0.600 +553 D 0.560 +554 S 0.525 +555 R 0.493 +556 G 0.468 +557 V 0.443 +558 A 0.420 +559 M 0.427 +560 V 0.468 +561 L 0.505 +562 A 0.512 +563 V 0.490 +564 G 0.451 +565 F 0.406 +566 L 0.373 +567 P 0.353 +568 F 0.338 +569 L 0.327 +570 T 0.323 +571 S 0.321 +572 V 0.302 +573 T 0.263 +574 L 0.228 +575 C 0.205 +576 F 0.194 +577 G 0.189 +578 L 0.186 +579 I 0.182 +580 A 0.187 +581 L 0.211 +582 W 0.252 +583 S 0.306 +584 K 0.371 +585 G 0.442 +586 K 0.503 +587 G 0.545 +588 R 0.569 +589 V 0.575 +590 K 0.558 +591 H 0.525 +592 H 0.495 +593 M 0.478 +594 T 0.463 +595 F 0.450 +596 D 0.443 +597 F 0.444 +598 V 0.452 +599 A 0.476 +600 P 0.520 +601 R 0.574 +602 P 0.628 +603 S 0.676 +604 G 0.712 +605 D 0.731 +606 K 0.738 +607 N 0.736 +608 S 0.727 +609 G 0.714 +610 G 0.690 +611 N 0.650 +612 R 0.597 +613 V 0.535 +614 T 0.455 +615 A 0.363 +616 K 0.284 +617 L 0.232 +618 F 0.206 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044664.8_ENSMUST00000035715.8_GN:Prss42_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044664.8_ENSMUST00000035715.8_GN:Prss42_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6790a61fef522b53f2e14b9239f74b100aed9a77 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044664.8_ENSMUST00000035715.8_GN:Prss42_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,336 @@ +>ENSMUSG00000044664.8|ENSMUST00000035715.8|GN:Prss42|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.364 +2 A 0.375 +3 S 0.418 +4 G 0.494 +5 G 0.564 +6 G 0.594 +7 S 0.582 +8 L 0.538 +9 G 0.465 +10 L 0.384 +11 I 0.324 +12 V 0.288 +13 F 0.263 +14 L 0.254 +15 L 0.266 +16 L 0.293 +17 L 0.325 +18 Q 0.366 +19 P 0.418 +20 K 0.468 +21 P 0.503 +22 C 0.523 +23 E 0.529 +24 A 0.523 +25 W 0.512 +26 A 0.510 +27 A 0.534 +28 A 0.592 +29 S 0.652 +30 V 0.682 +31 L 0.693 +32 S 0.703 +33 T 0.711 +34 S 0.704 +35 G 0.686 +36 F 0.679 +37 P 0.695 +38 S 0.716 +39 G 0.712 +40 F 0.667 +41 S 0.602 +42 E 0.561 +43 A 0.573 +44 P 0.611 +45 R 0.632 +46 D 0.616 +47 N 0.571 +48 P 0.531 +49 P 0.531 +50 P 0.580 +51 P 0.651 +52 T 0.706 +53 R 0.732 +54 V 0.744 +55 R 0.756 +56 M 0.770 +57 S 0.782 +58 K 0.785 +59 A 0.775 +60 T 0.750 +61 T 0.712 +62 R 0.672 +63 S 0.646 +64 P 0.629 +65 F 0.603 +66 M 0.551 +67 N 0.471 +68 F 0.372 +69 S 0.271 +70 L 0.192 +71 V 0.145 +72 C 0.125 +73 G 0.125 +74 Q 0.133 +75 P 0.143 +76 F 0.147 +77 M 0.149 +78 K 0.157 +79 I 0.167 +80 M 0.173 +81 G 0.168 +82 G 0.158 +83 V 0.159 +84 D 0.174 +85 A 0.186 +86 E 0.176 +87 E 0.148 +88 G 0.117 +89 K 0.090 +90 W 0.066 +91 P 0.045 +92 W 0.030 +93 Q 0.022 +94 V 0.021 +95 S 0.024 +96 V 0.032 +97 R 0.042 +98 V 0.050 +99 R 0.059 +100 H 0.069 +101 M 0.071 +102 H 0.062 +103 V 0.045 +104 C 0.030 +105 G 0.024 +106 G 0.026 +107 S 0.034 +108 L 0.043 +109 I 0.047 +110 N 0.046 +111 S 0.040 +112 Q 0.032 +113 W 0.026 +114 V 0.021 +115 L 0.019 +116 T 0.018 +117 A 0.022 +118 A 0.030 +119 H 0.040 +120 C 0.048 +121 I 0.055 +122 Y 0.065 +123 S 0.082 +124 R 0.097 +125 I 0.096 +126 Q 0.075 +127 Y 0.049 +128 N 0.030 +129 V 0.023 +130 K 0.024 +131 V 0.029 +132 G 0.035 +133 D 0.040 +134 R 0.042 +135 S 0.041 +136 V 0.042 +137 Y 0.051 +138 R 0.071 +139 Q 0.094 +140 N 0.104 +141 T 0.095 +142 S 0.075 +143 L 0.058 +144 V 0.046 +145 I 0.038 +146 P 0.032 +147 I 0.027 +148 K 0.024 +149 T 0.023 +150 I 0.026 +151 F 0.032 +152 V 0.040 +153 H 0.046 +154 P 0.051 +155 K 0.058 +156 F 0.069 +157 S 0.082 +158 T 0.094 +159 T 0.106 +160 I 0.116 +161 V 0.125 +162 V 0.130 +163 K 0.124 +164 N 0.102 +165 D 0.071 +166 I 0.045 +167 A 0.029 +168 L 0.023 +169 L 0.022 +170 K 0.024 +171 L 0.028 +172 Q 0.033 +173 H 0.038 +174 P 0.047 +175 V 0.059 +176 N 0.074 +177 F 0.084 +178 T 0.083 +179 T 0.073 +180 N 0.061 +181 I 0.051 +182 Y 0.045 +183 P 0.042 +184 V 0.040 +185 C 0.043 +186 I 0.055 +187 P 0.071 +188 S 0.084 +189 E 0.086 +190 S 0.078 +191 F 0.068 +192 P 0.059 +193 V 0.056 +194 K 0.057 +195 A 0.059 +196 G 0.055 +197 T 0.044 +198 K 0.031 +199 C 0.022 +200 W 0.020 +201 V 0.022 +202 T 0.027 +203 G 0.034 +204 W 0.046 +205 G 0.063 +206 K 0.083 +207 L 0.105 +208 V 0.126 +209 P 0.141 +210 G 0.148 +211 A 0.153 +212 P 0.156 +213 D 0.156 +214 V 0.149 +215 P 0.132 +216 T 0.110 +217 E 0.093 +218 I 0.086 +219 L 0.084 +220 Q 0.079 +221 E 0.070 +222 V 0.059 +223 D 0.047 +224 Q 0.038 +225 N 0.035 +226 V 0.038 +227 I 0.044 +228 L 0.049 +229 Y 0.050 +230 E 0.046 +231 E 0.043 +232 C 0.049 +233 N 0.062 +234 E 0.075 +235 M 0.077 +236 L 0.075 +237 K 0.077 +238 K 0.091 +239 A 0.118 +240 T 0.152 +241 S 0.179 +242 S 0.191 +243 S 0.190 +244 V 0.180 +245 D 0.162 +246 L 0.139 +247 V 0.115 +248 K 0.090 +249 R 0.068 +250 G 0.052 +251 M 0.040 +252 V 0.034 +253 C 0.033 +254 G 0.040 +255 Y 0.052 +256 K 0.068 +257 E 0.085 +258 R 0.095 +259 G 0.094 +260 K 0.086 +261 D 0.077 +262 A 0.069 +263 C 0.063 +264 Q 0.063 +265 G 0.069 +266 D 0.076 +267 S 0.077 +268 G 0.073 +269 G 0.070 +270 P 0.066 +271 M 0.058 +272 S 0.047 +273 C 0.040 +274 E 0.040 +275 F 0.047 +276 E 0.057 +277 N 0.062 +278 K 0.059 +279 W 0.051 +280 V 0.044 +281 Q 0.043 +282 V 0.046 +283 G 0.049 +284 V 0.049 +285 V 0.048 +286 S 0.049 +287 W 0.055 +288 G 0.061 +289 I 0.063 +290 S 0.063 +291 C 0.067 +292 G 0.078 +293 R 0.089 +294 K 0.093 +295 G 0.089 +296 Y 0.080 +297 P 0.067 +298 G 0.058 +299 V 0.052 +300 Y 0.051 +301 T 0.052 +302 D 0.055 +303 V 0.058 +304 A 0.059 +305 F 0.059 +306 Y 0.061 +307 S 0.064 +308 K 0.063 +309 W 0.054 +310 L 0.044 +311 I 0.040 +312 A 0.047 +313 V 0.071 +314 V 0.114 +315 N 0.172 +316 Q 0.236 +317 A 0.294 +318 D 0.332 +319 C 0.343 +320 L 0.341 +321 H 0.333 +322 P 0.320 +323 V 0.301 +324 V 0.280 +325 F 0.264 +326 L 0.258 +327 V 0.257 +328 L 0.250 +329 L 0.245 +330 L 0.254 +331 C 0.277 +332 S 0.305 +333 L 0.329 +334 T 0.340 +335 S 0.340 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044664.8_ENSMUST00000035715.8_GN:Prss42_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044664.8_ENSMUST00000035715.8_GN:Prss42_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b628a663ab9d64adc59b5a995ccf27b7b99aa80d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000044664.8_ENSMUST00000035715.8_GN:Prss42_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid @@ -0,0 +1,344 @@ +>ENSMUSG00000044664.8|ENSMUST00000035715.8|GN:Prss42|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:8 +1 M 0.440 +2 E 0.468 +3 G 0.501 +4 G 0.501 +5 L 0.453 +6 R 0.403 +7 D 0.412 +8 D 0.455 +9 M 0.458 +10 A 0.428 +11 S 0.448 +12 G 0.534 +13 G 0.621 +14 G 0.655 +15 S 0.639 +16 L 0.585 +17 G 0.505 +18 L 0.423 +19 I 0.358 +20 V 0.307 +21 F 0.267 +22 L 0.254 +23 L 0.270 +24 L 0.297 +25 L 0.327 +26 Q 0.367 +27 P 0.420 +28 K 0.471 +29 P 0.510 +30 C 0.536 +31 E 0.551 +32 A 0.552 +33 W 0.543 +34 A 0.535 +35 A 0.551 +36 A 0.605 +37 S 0.665 +38 V 0.699 +39 L 0.711 +40 S 0.719 +41 T 0.724 +42 S 0.715 +43 G 0.696 +44 F 0.688 +45 P 0.703 +46 S 0.728 +47 G 0.740 +48 F 0.737 +49 S 0.729 +50 E 0.719 +51 A 0.704 +52 P 0.689 +53 R 0.672 +54 D 0.641 +55 N 0.592 +56 P 0.549 +57 P 0.547 +58 P 0.596 +59 P 0.667 +60 T 0.722 +61 R 0.749 +62 V 0.760 +63 R 0.770 +64 M 0.783 +65 S 0.794 +66 K 0.796 +67 A 0.785 +68 T 0.759 +69 T 0.719 +70 R 0.679 +71 S 0.651 +72 P 0.632 +73 F 0.605 +74 M 0.551 +75 N 0.469 +76 F 0.369 +77 S 0.268 +78 L 0.188 +79 V 0.142 +80 C 0.123 +81 G 0.122 +82 Q 0.130 +83 P 0.138 +84 F 0.142 +85 M 0.144 +86 K 0.152 +87 I 0.164 +88 M 0.170 +89 G 0.166 +90 G 0.158 +91 V 0.159 +92 D 0.174 +93 A 0.186 +94 E 0.176 +95 E 0.147 +96 G 0.116 +97 K 0.089 +98 W 0.065 +99 P 0.044 +100 W 0.030 +101 Q 0.022 +102 V 0.021 +103 S 0.024 +104 V 0.032 +105 R 0.041 +106 V 0.050 +107 R 0.058 +108 H 0.068 +109 M 0.070 +110 H 0.061 +111 V 0.045 +112 C 0.030 +113 G 0.024 +114 G 0.026 +115 S 0.034 +116 L 0.043 +117 I 0.048 +118 N 0.046 +119 S 0.040 +120 Q 0.032 +121 W 0.026 +122 V 0.021 +123 L 0.018 +124 T 0.018 +125 A 0.022 +126 A 0.030 +127 H 0.040 +128 C 0.049 +129 I 0.056 +130 Y 0.066 +131 S 0.082 +132 R 0.097 +133 I 0.097 +134 Q 0.076 +135 Y 0.049 +136 N 0.031 +137 V 0.023 +138 K 0.024 +139 V 0.029 +140 G 0.035 +141 D 0.040 +142 R 0.042 +143 S 0.041 +144 V 0.043 +145 Y 0.052 +146 R 0.072 +147 Q 0.094 +148 N 0.104 +149 T 0.095 +150 S 0.075 +151 L 0.057 +152 V 0.046 +153 I 0.038 +154 P 0.032 +155 I 0.027 +156 K 0.024 +157 T 0.023 +158 I 0.026 +159 F 0.032 +160 V 0.039 +161 H 0.045 +162 P 0.050 +163 K 0.058 +164 F 0.069 +165 S 0.081 +166 T 0.093 +167 T 0.104 +168 I 0.115 +169 V 0.124 +170 V 0.129 +171 K 0.123 +172 N 0.101 +173 D 0.071 +174 I 0.045 +175 A 0.029 +176 L 0.022 +177 L 0.021 +178 K 0.024 +179 L 0.028 +180 Q 0.032 +181 H 0.038 +182 P 0.046 +183 V 0.059 +184 N 0.073 +185 F 0.083 +186 T 0.082 +187 T 0.073 +188 N 0.060 +189 I 0.050 +190 Y 0.045 +191 P 0.041 +192 V 0.040 +193 C 0.043 +194 I 0.054 +195 P 0.071 +196 S 0.084 +197 E 0.085 +198 S 0.077 +199 F 0.067 +200 P 0.058 +201 V 0.055 +202 K 0.057 +203 A 0.059 +204 G 0.055 +205 T 0.044 +206 K 0.031 +207 C 0.022 +208 W 0.020 +209 V 0.022 +210 T 0.027 +211 G 0.034 +212 W 0.046 +213 G 0.062 +214 K 0.082 +215 L 0.104 +216 V 0.125 +217 P 0.140 +218 G 0.147 +219 A 0.151 +220 P 0.153 +221 D 0.153 +222 V 0.147 +223 P 0.130 +224 T 0.108 +225 E 0.092 +226 I 0.085 +227 L 0.083 +228 Q 0.079 +229 E 0.070 +230 V 0.059 +231 D 0.047 +232 Q 0.038 +233 N 0.035 +234 V 0.038 +235 I 0.044 +236 L 0.049 +237 Y 0.049 +238 E 0.045 +239 E 0.043 +240 C 0.048 +241 N 0.061 +242 E 0.073 +243 M 0.076 +244 L 0.074 +245 K 0.077 +246 K 0.091 +247 A 0.118 +248 T 0.151 +249 S 0.179 +250 S 0.190 +251 S 0.189 +252 V 0.179 +253 D 0.161 +254 L 0.138 +255 V 0.114 +256 K 0.090 +257 R 0.068 +258 G 0.052 +259 M 0.040 +260 V 0.034 +261 C 0.033 +262 G 0.040 +263 Y 0.052 +264 K 0.069 +265 E 0.086 +266 R 0.096 +267 G 0.095 +268 K 0.086 +269 D 0.078 +270 A 0.070 +271 C 0.064 +272 Q 0.063 +273 G 0.069 +274 D 0.076 +275 S 0.077 +276 G 0.073 +277 G 0.070 +278 P 0.067 +279 M 0.058 +280 S 0.047 +281 C 0.040 +282 E 0.041 +283 F 0.048 +284 E 0.057 +285 N 0.063 +286 K 0.060 +287 W 0.051 +288 V 0.045 +289 Q 0.044 +290 V 0.047 +291 G 0.049 +292 V 0.049 +293 V 0.048 +294 S 0.049 +295 W 0.055 +296 G 0.062 +297 I 0.064 +298 S 0.064 +299 C 0.068 +300 G 0.079 +301 R 0.090 +302 K 0.094 +303 G 0.090 +304 Y 0.080 +305 P 0.068 +306 G 0.058 +307 V 0.052 +308 Y 0.051 +309 T 0.053 +310 D 0.056 +311 V 0.058 +312 A 0.059 +313 F 0.056 +314 Y 0.050 +315 S 0.042 +316 K 0.035 +317 W 0.032 +318 L 0.032 +319 I 0.036 +320 A 0.047 +321 V 0.071 +322 V 0.114 +323 N 0.172 +324 Q 0.236 +325 A 0.295 +326 D 0.333 +327 C 0.345 +328 L 0.342 +329 H 0.335 +330 P 0.322 +331 V 0.305 +332 V 0.291 +333 F 0.284 +334 L 0.284 +335 V 0.283 +336 L 0.274 +337 L 0.266 +338 L 0.269 +339 C 0.285 +340 S 0.308 +341 L 0.330 +342 T 0.341 +343 S 0.341 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000045107.6_ENSMUST00000059666.6_GN:Saysd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000045107.6_ENSMUST00000059666.6_GN:Saysd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0a0548bb046dd2aee5f59f3b30fc659f468951a2 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000045107.6_ENSMUST00000059666.6_GN:Saysd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,189 @@ +>ENSMUSG00000045107.6|ENSMUST00000059666.6|GN:Saysd1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.282 +2 E 0.264 +3 Q 0.235 +4 R 0.206 +5 L 0.184 +6 A 0.172 +7 E 0.163 +8 F 0.155 +9 R 0.152 +10 E 0.159 +11 A 0.176 +12 R 0.203 +13 K 0.247 +14 R 0.314 +15 A 0.406 +16 S 0.511 +17 L 0.605 +18 V 0.667 +19 A 0.697 +20 Q 0.714 +21 P 0.737 +22 S 0.764 +23 T 0.782 +24 S 0.784 +25 S 0.778 +26 Q 0.762 +27 S 0.723 +28 V 0.668 +29 Q 0.644 +30 T 0.683 +31 S 0.749 +32 G 0.790 +33 A 0.799 +34 K 0.793 +35 A 0.784 +36 E 0.783 +37 P 0.792 +38 A 0.802 +39 A 0.805 +40 A 0.799 +41 T 0.792 +42 P 0.789 +43 K 0.785 +44 T 0.766 +45 A 0.717 +46 T 0.638 +47 G 0.536 +48 W 0.427 +49 L 0.342 +50 T 0.300 +51 R 0.305 +52 F 0.355 +53 L 0.448 +54 K 0.563 +55 R 0.665 +56 K 0.729 +57 A 0.756 +58 N 0.767 +59 P 0.780 +60 A 0.801 +61 I 0.817 +62 A 0.819 +63 Q 0.808 +64 A 0.795 +65 Q 0.787 +66 P 0.785 +67 N 0.789 +68 Q 0.794 +69 P 0.802 +70 Q 0.815 +71 E 0.830 +72 A 0.836 +73 G 0.828 +74 Q 0.814 +75 Q 0.806 +76 L 0.808 +77 P 0.815 +78 E 0.819 +79 S 0.811 +80 T 0.786 +81 A 0.748 +82 V 0.713 +83 P 0.688 +84 L 0.667 +85 P 0.644 +86 S 0.613 +87 S 0.572 +88 C 0.527 +89 R 0.485 +90 Q 0.442 +91 S 0.387 +92 F 0.336 +93 L 0.317 +94 T 0.329 +95 N 0.329 +96 I 0.286 +97 T 0.220 +98 F 0.171 +99 L 0.146 +100 K 0.134 +101 V 0.128 +102 L 0.127 +103 L 0.127 +104 W 0.124 +105 L 0.118 +106 V 0.111 +107 L 0.104 +108 L 0.098 +109 G 0.092 +110 L 0.086 +111 F 0.089 +112 V 0.106 +113 E 0.128 +114 L 0.140 +115 E 0.131 +116 F 0.109 +117 G 0.087 +118 L 0.069 +119 A 0.056 +120 Y 0.047 +121 F 0.042 +122 V 0.042 +123 L 0.044 +124 S 0.047 +125 M 0.048 +126 F 0.044 +127 Y 0.039 +128 W 0.038 +129 M 0.049 +130 Y 0.077 +131 V 0.122 +132 G 0.177 +133 T 0.243 +134 R 0.322 +135 G 0.405 +136 P 0.471 +137 E 0.505 +138 E 0.517 +139 K 0.527 +140 K 0.541 +141 E 0.557 +142 G 0.565 +143 E 0.561 +144 K 0.554 +145 S 0.548 +146 A 0.534 +147 Y 0.508 +148 S 0.486 +149 V 0.480 +150 F 0.495 +151 N 0.527 +152 P 0.569 +153 G 0.608 +154 C 0.640 +155 E 0.670 +156 A 0.697 +157 I 0.717 +158 Q 0.723 +159 G 0.707 +160 T 0.667 +161 L 0.613 +162 T 0.553 +163 A 0.490 +164 E 0.431 +165 Q 0.379 +166 L 0.333 +167 E 0.295 +168 Q 0.273 +169 E 0.273 +170 L 0.291 +171 Q 0.329 +172 L 0.392 +173 R 0.477 +174 P 0.568 +175 P 0.651 +176 Q 0.714 +177 G 0.750 +178 S 0.759 +179 R 0.745 +180 T 0.723 +181 S 0.711 +182 P 0.712 +183 S 0.717 +184 C 0.711 +185 S 0.683 +186 S 0.629 +187 Y 0.557 +188 P 0.502 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000045107.6_ENSMUST00000059666.6_GN:Saysd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000045107.6_ENSMUST00000059666.6_GN:Saysd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7b5ec60cdff137243a242e40db799e06682be43e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000045107.6_ENSMUST00000059666.6_GN:Saysd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid @@ -0,0 +1,221 @@ +>ENSMUSG00000045107.6|ENSMUST00000059666.6|GN:Saysd1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:32 +1 M 0.536 +2 Q 0.587 +3 R 0.658 +4 A 0.719 +5 G 0.755 +6 A 0.769 +7 T 0.773 +8 E 0.775 +9 G 0.774 +10 H 0.767 +11 V 0.757 +12 R 0.755 +13 R 0.765 +14 R 0.782 +15 T 0.797 +16 A 0.802 +17 A 0.798 +18 E 0.788 +19 D 0.776 +20 R 0.771 +21 P 0.775 +22 G 0.779 +23 H 0.779 +24 T 0.776 +25 P 0.777 +26 A 0.782 +27 S 0.782 +28 G 0.773 +29 R 0.750 +30 L 0.707 +31 R 0.636 +32 T 0.535 +33 M 0.417 +34 E 0.309 +35 Q 0.236 +36 R 0.200 +37 L 0.190 +38 A 0.195 +39 E 0.198 +40 F 0.191 +41 R 0.181 +42 E 0.184 +43 A 0.201 +44 R 0.229 +45 K 0.279 +46 R 0.362 +47 A 0.474 +48 S 0.589 +49 L 0.680 +50 V 0.731 +51 A 0.749 +52 Q 0.759 +53 P 0.779 +54 S 0.806 +55 T 0.824 +56 S 0.829 +57 S 0.825 +58 Q 0.809 +59 S 0.766 +60 V 0.703 +61 Q 0.672 +62 T 0.710 +63 S 0.777 +64 G 0.819 +65 A 0.827 +66 K 0.820 +67 A 0.811 +68 E 0.809 +69 P 0.817 +70 A 0.827 +71 A 0.830 +72 A 0.824 +73 T 0.816 +74 P 0.813 +75 K 0.808 +76 T 0.786 +77 A 0.734 +78 T 0.654 +79 G 0.555 +80 W 0.450 +81 L 0.366 +82 T 0.322 +83 R 0.324 +84 F 0.371 +85 L 0.463 +86 K 0.576 +87 R 0.675 +88 K 0.738 +89 A 0.765 +90 N 0.774 +91 P 0.786 +92 A 0.805 +93 I 0.820 +94 A 0.822 +95 Q 0.813 +96 A 0.800 +97 Q 0.791 +98 P 0.789 +99 N 0.792 +100 Q 0.798 +101 P 0.806 +102 Q 0.818 +103 E 0.832 +104 A 0.837 +105 G 0.828 +106 Q 0.813 +107 Q 0.804 +108 L 0.805 +109 P 0.810 +110 E 0.812 +111 S 0.802 +112 T 0.775 +113 A 0.737 +114 V 0.701 +115 P 0.674 +116 L 0.651 +117 P 0.624 +118 S 0.587 +119 S 0.541 +120 C 0.490 +121 R 0.446 +122 Q 0.404 +123 S 0.355 +124 F 0.311 +125 L 0.295 +126 T 0.305 +127 N 0.303 +128 I 0.263 +129 T 0.204 +130 F 0.161 +131 L 0.139 +132 K 0.130 +133 V 0.126 +134 L 0.127 +135 L 0.127 +136 W 0.123 +137 L 0.117 +138 V 0.109 +139 L 0.103 +140 L 0.098 +141 G 0.093 +142 L 0.088 +143 F 0.093 +144 V 0.111 +145 E 0.134 +146 L 0.145 +147 E 0.136 +148 F 0.113 +149 G 0.088 +150 L 0.070 +151 A 0.057 +152 Y 0.048 +153 F 0.043 +154 V 0.043 +155 L 0.046 +156 S 0.049 +157 M 0.049 +158 F 0.045 +159 Y 0.039 +160 W 0.038 +161 M 0.050 +162 Y 0.079 +163 V 0.123 +164 G 0.179 +165 T 0.247 +166 R 0.331 +167 G 0.422 +168 P 0.494 +169 E 0.531 +170 E 0.542 +171 K 0.550 +172 K 0.564 +173 E 0.579 +174 G 0.583 +175 E 0.572 +176 K 0.558 +177 S 0.547 +178 A 0.532 +179 Y 0.507 +180 S 0.487 +181 V 0.487 +182 F 0.506 +183 N 0.540 +184 P 0.582 +185 G 0.620 +186 C 0.649 +187 E 0.676 +188 A 0.702 +189 I 0.720 +190 Q 0.723 +191 G 0.705 +192 T 0.663 +193 L 0.609 +194 T 0.552 +195 A 0.495 +196 E 0.440 +197 Q 0.390 +198 L 0.342 +199 E 0.301 +200 Q 0.278 +201 E 0.278 +202 L 0.296 +203 Q 0.332 +204 L 0.392 +205 R 0.475 +206 P 0.566 +207 P 0.649 +208 Q 0.712 +209 G 0.749 +210 S 0.757 +211 R 0.743 +212 T 0.722 +213 S 0.710 +214 P 0.713 +215 S 0.719 +216 C 0.715 +217 S 0.690 +218 S 0.637 +219 Y 0.565 +220 P 0.510 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000045316.6_ENSMUST00000049642.7_GN:Fahd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000045316.6_ENSMUST00000049642.7_GN:Fahd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..00d6f50a900ea5609c7b1b4df3ecec774b8cd0e8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000045316.6_ENSMUST00000049642.7_GN:Fahd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,222 @@ +>ENSMUSG00000045316.6|ENSMUST00000049642.7|GN:Fahd1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.357 +2 A 0.348 +3 S 0.337 +4 T 0.323 +5 K 0.294 +6 P 0.245 +7 L 0.189 +8 S 0.143 +9 R 0.111 +10 F 0.090 +11 W 0.073 +12 E 0.058 +13 W 0.046 +14 G 0.040 +15 K 0.039 +16 N 0.043 +17 I 0.047 +18 V 0.055 +19 C 0.067 +20 V 0.079 +21 G 0.084 +22 R 0.083 +23 N 0.082 +24 Y 0.081 +25 A 0.080 +26 D 0.081 +27 H 0.082 +28 V 0.083 +29 K 0.084 +30 E 0.090 +31 M 0.105 +32 R 0.129 +33 S 0.159 +34 T 0.179 +35 V 0.178 +36 L 0.160 +37 S 0.143 +38 E 0.135 +39 P 0.125 +40 V 0.105 +41 L 0.082 +42 F 0.068 +43 L 0.065 +44 K 0.068 +45 P 0.073 +46 S 0.080 +47 T 0.088 +48 A 0.098 +49 Y 0.107 +50 A 0.116 +51 P 0.125 +52 E 0.134 +53 G 0.140 +54 S 0.140 +55 P 0.135 +56 V 0.127 +57 L 0.120 +58 M 0.115 +59 P 0.107 +60 A 0.095 +61 Y 0.087 +62 C 0.081 +63 R 0.078 +64 N 0.079 +65 L 0.085 +66 H 0.093 +67 H 0.094 +68 E 0.085 +69 V 0.072 +70 E 0.060 +71 L 0.050 +72 G 0.044 +73 V 0.048 +74 L 0.060 +75 L 0.075 +76 G 0.087 +77 K 0.093 +78 R 0.097 +79 G 0.099 +80 E 0.101 +81 A 0.104 +82 I 0.106 +83 P 0.103 +84 E 0.096 +85 A 0.088 +86 A 0.075 +87 A 0.058 +88 M 0.046 +89 D 0.040 +90 Y 0.039 +91 V 0.041 +92 A 0.044 +93 G 0.048 +94 Y 0.048 +95 A 0.047 +96 L 0.046 +97 C 0.046 +98 L 0.048 +99 D 0.052 +100 M 0.054 +101 T 0.055 +102 A 0.055 +103 R 0.057 +104 D 0.060 +105 V 0.062 +106 Q 0.064 +107 E 0.069 +108 E 0.076 +109 C 0.087 +110 K 0.101 +111 K 0.114 +112 K 0.121 +113 G 0.122 +114 L 0.115 +115 P 0.101 +116 W 0.084 +117 T 0.073 +118 L 0.071 +119 A 0.075 +120 K 0.081 +121 S 0.091 +122 F 0.108 +123 T 0.121 +124 S 0.119 +125 S 0.103 +126 C 0.084 +127 P 0.068 +128 V 0.053 +129 S 0.043 +130 A 0.037 +131 F 0.037 +132 V 0.038 +133 P 0.036 +134 K 0.034 +135 E 0.036 +136 K 0.043 +137 I 0.050 +138 P 0.053 +139 D 0.053 +140 P 0.050 +141 H 0.046 +142 A 0.041 +143 L 0.036 +144 R 0.031 +145 L 0.027 +146 W 0.024 +147 L 0.024 +148 K 0.029 +149 V 0.037 +150 N 0.046 +151 G 0.056 +152 E 0.066 +153 L 0.071 +154 R 0.070 +155 Q 0.065 +156 E 0.062 +157 G 0.060 +158 K 0.061 +159 T 0.062 +160 S 0.063 +161 S 0.063 +162 M 0.060 +163 I 0.055 +164 F 0.053 +165 S 0.051 +166 I 0.049 +167 P 0.046 +168 Y 0.044 +169 I 0.041 +170 I 0.038 +171 S 0.035 +172 Y 0.035 +173 V 0.038 +174 S 0.041 +175 K 0.045 +176 I 0.051 +177 I 0.059 +178 T 0.064 +179 L 0.063 +180 E 0.058 +181 E 0.055 +182 G 0.058 +183 D 0.065 +184 L 0.069 +185 I 0.069 +186 L 0.067 +187 T 0.069 +188 G 0.077 +189 T 0.090 +190 P 0.101 +191 K 0.105 +192 G 0.100 +193 V 0.092 +194 G 0.085 +195 P 0.078 +196 I 0.071 +197 K 0.069 +198 E 0.070 +199 N 0.072 +200 D 0.071 +201 E 0.064 +202 I 0.055 +203 E 0.048 +204 A 0.046 +205 G 0.047 +206 I 0.047 +207 D 0.046 +208 G 0.043 +209 V 0.040 +210 V 0.036 +211 S 0.035 +212 M 0.034 +213 R 0.033 +214 F 0.033 +215 K 0.038 +216 V 0.049 +217 K 0.069 +218 R 0.098 +219 S 0.135 +220 E 0.168 +221 Y 0.189 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000045316.6_ENSMUST00000049642.7_GN:Fahd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000045316.6_ENSMUST00000049642.7_GN:Fahd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:6.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..944c0683e623f12884acce8e6ff7a72f4d01bd9e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000045316.6_ENSMUST00000049642.7_GN:Fahd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:6.caid @@ -0,0 +1,228 @@ +>ENSMUSG00000045316.6|ENSMUST00000049642.7|GN:Fahd1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:6 +1 M 0.360 +2 T 0.354 +3 Q 0.368 +4 S 0.414 +5 C 0.466 +6 T 0.489 +7 M 0.478 +8 A 0.441 +9 S 0.391 +10 T 0.343 +11 K 0.298 +12 P 0.247 +13 L 0.193 +14 S 0.144 +15 R 0.111 +16 F 0.090 +17 W 0.074 +18 E 0.059 +19 W 0.047 +20 G 0.041 +21 K 0.041 +22 N 0.044 +23 I 0.048 +24 V 0.055 +25 C 0.067 +26 V 0.079 +27 G 0.084 +28 R 0.083 +29 N 0.082 +30 Y 0.081 +31 A 0.080 +32 D 0.080 +33 H 0.082 +34 V 0.082 +35 K 0.083 +36 E 0.090 +37 M 0.105 +38 R 0.131 +39 S 0.160 +40 T 0.181 +41 V 0.180 +42 L 0.162 +43 S 0.144 +44 E 0.136 +45 P 0.126 +46 V 0.106 +47 L 0.083 +48 F 0.069 +49 L 0.066 +50 K 0.070 +51 P 0.075 +52 S 0.081 +53 T 0.090 +54 A 0.100 +55 Y 0.109 +56 A 0.118 +57 P 0.127 +58 E 0.136 +59 G 0.142 +60 S 0.143 +61 P 0.136 +62 V 0.128 +63 L 0.120 +64 M 0.114 +65 P 0.105 +66 A 0.094 +67 Y 0.086 +68 C 0.081 +69 R 0.077 +70 N 0.079 +71 L 0.085 +72 H 0.093 +73 H 0.094 +74 E 0.085 +75 V 0.072 +76 E 0.059 +77 L 0.049 +78 G 0.044 +79 V 0.048 +80 L 0.061 +81 L 0.077 +82 G 0.089 +83 K 0.095 +84 R 0.098 +85 G 0.099 +86 E 0.101 +87 A 0.104 +88 I 0.106 +89 P 0.103 +90 E 0.097 +91 A 0.089 +92 A 0.075 +93 A 0.059 +94 M 0.047 +95 D 0.040 +96 Y 0.039 +97 V 0.041 +98 A 0.044 +99 G 0.047 +100 Y 0.048 +101 A 0.047 +102 L 0.046 +103 C 0.046 +104 L 0.048 +105 D 0.052 +106 M 0.054 +107 T 0.054 +108 A 0.054 +109 R 0.057 +110 D 0.060 +111 V 0.062 +112 Q 0.064 +113 E 0.069 +114 E 0.076 +115 C 0.087 +116 K 0.101 +117 K 0.114 +118 K 0.122 +119 G 0.122 +120 L 0.116 +121 P 0.101 +122 W 0.084 +123 T 0.073 +124 L 0.072 +125 A 0.076 +126 K 0.082 +127 S 0.093 +128 F 0.110 +129 T 0.123 +130 S 0.121 +131 S 0.105 +132 C 0.086 +133 P 0.069 +134 V 0.054 +135 S 0.043 +136 A 0.038 +137 F 0.037 +138 V 0.038 +139 P 0.037 +140 K 0.035 +141 E 0.037 +142 K 0.043 +143 I 0.050 +144 P 0.054 +145 D 0.053 +146 P 0.051 +147 H 0.046 +148 A 0.041 +149 L 0.036 +150 R 0.031 +151 L 0.027 +152 W 0.024 +153 L 0.024 +154 K 0.029 +155 V 0.037 +156 N 0.046 +157 G 0.057 +158 E 0.066 +159 L 0.071 +160 R 0.070 +161 Q 0.065 +162 E 0.062 +163 G 0.061 +164 K 0.061 +165 T 0.062 +166 S 0.063 +167 S 0.063 +168 M 0.060 +169 I 0.055 +170 F 0.053 +171 S 0.052 +172 I 0.050 +173 P 0.047 +174 Y 0.044 +175 I 0.042 +176 I 0.038 +177 S 0.036 +178 Y 0.036 +179 V 0.038 +180 S 0.041 +181 K 0.045 +182 I 0.051 +183 I 0.059 +184 T 0.065 +185 L 0.064 +186 E 0.059 +187 E 0.056 +188 G 0.059 +189 D 0.065 +190 L 0.069 +191 I 0.069 +192 L 0.067 +193 T 0.069 +194 G 0.077 +195 T 0.090 +196 P 0.101 +197 K 0.105 +198 G 0.100 +199 V 0.092 +200 G 0.085 +201 P 0.079 +202 I 0.072 +203 K 0.070 +204 E 0.071 +205 N 0.074 +206 D 0.072 +207 E 0.065 +208 I 0.055 +209 E 0.048 +210 A 0.046 +211 G 0.047 +212 I 0.047 +213 D 0.046 +214 G 0.043 +215 V 0.040 +216 V 0.036 +217 S 0.035 +218 M 0.035 +219 R 0.033 +220 F 0.034 +221 K 0.038 +222 V 0.051 +223 K 0.072 +224 R 0.102 +225 S 0.140 +226 E 0.174 +227 Y 0.194 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000046345.6_ENSMUST00000093183.5_GN:Smco1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000046345.6_ENSMUST00000093183.5_GN:Smco1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c56b3b421a529eb6823c2b96f77740b3e958700b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000046345.6_ENSMUST00000093183.5_GN:Smco1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,215 @@ +>ENSMUSG00000046345.6|ENSMUST00000093183.5|GN:Smco1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.395 +2 T 0.397 +3 H 0.404 +4 E 0.409 +5 T 0.403 +6 T 0.385 +7 T 0.350 +8 L 0.297 +9 I 0.241 +10 S 0.197 +11 L 0.169 +12 K 0.152 +13 E 0.144 +14 A 0.142 +15 M 0.141 +16 K 0.142 +17 R 0.147 +18 V 0.157 +19 D 0.164 +20 N 0.163 +21 K 0.156 +22 L 0.152 +23 R 0.155 +24 A 0.164 +25 L 0.174 +26 D 0.183 +27 T 0.195 +28 Q 0.207 +29 F 0.217 +30 K 0.225 +31 E 0.233 +32 L 0.240 +33 D 0.248 +34 V 0.262 +35 T 0.274 +36 K 0.270 +37 D 0.252 +38 N 0.226 +39 L 0.191 +40 T 0.155 +41 L 0.130 +42 R 0.121 +43 F 0.121 +44 E 0.124 +45 H 0.130 +46 H 0.138 +47 S 0.148 +48 K 0.163 +49 T 0.181 +50 L 0.200 +51 A 0.207 +52 S 0.197 +53 Q 0.177 +54 A 0.154 +55 A 0.131 +56 Q 0.111 +57 D 0.096 +58 E 0.081 +59 I 0.068 +60 W 0.059 +61 T 0.057 +62 A 0.059 +63 A 0.066 +64 L 0.079 +65 A 0.097 +66 L 0.110 +67 G 0.107 +68 F 0.089 +69 T 0.070 +70 S 0.058 +71 M 0.053 +72 E 0.050 +73 L 0.046 +74 N 0.042 +75 I 0.040 +76 V 0.038 +77 Y 0.035 +78 S 0.031 +79 Y 0.027 +80 V 0.024 +81 I 0.021 +82 E 0.019 +83 V 0.017 +84 L 0.016 +85 I 0.018 +86 C 0.024 +87 L 0.030 +88 H 0.034 +89 T 0.036 +90 R 0.035 +91 M 0.034 +92 L 0.037 +93 Q 0.046 +94 K 0.058 +95 L 0.065 +96 P 0.063 +97 D 0.055 +98 L 0.047 +99 V 0.042 +100 R 0.042 +101 S 0.050 +102 L 0.056 +103 P 0.052 +104 T 0.040 +105 L 0.029 +106 A 0.024 +107 S 0.024 +108 V 0.027 +109 L 0.033 +110 R 0.043 +111 R 0.053 +112 K 0.063 +113 A 0.075 +114 K 0.088 +115 N 0.094 +116 K 0.086 +117 H 0.067 +118 V 0.050 +119 R 0.041 +120 L 0.039 +121 V 0.037 +122 W 0.034 +123 E 0.032 +124 S 0.033 +125 V 0.034 +126 L 0.035 +127 Q 0.041 +128 E 0.052 +129 Y 0.064 +130 G 0.071 +131 L 0.065 +132 Q 0.051 +133 E 0.040 +134 R 0.036 +135 D 0.034 +136 V 0.031 +137 S 0.025 +138 A 0.020 +139 L 0.019 +140 C 0.019 +141 T 0.021 +142 F 0.025 +143 F 0.032 +144 I 0.042 +145 V 0.056 +146 H 0.072 +147 G 0.091 +148 N 0.107 +149 K 0.116 +150 G 0.114 +151 E 0.104 +152 H 0.091 +153 Y 0.080 +154 A 0.075 +155 A 0.073 +156 N 0.072 +157 V 0.068 +158 R 0.061 +159 R 0.054 +160 M 0.049 +161 Y 0.046 +162 I 0.043 +163 K 0.039 +164 D 0.035 +165 V 0.032 +166 S 0.032 +167 F 0.035 +168 M 0.042 +169 I 0.052 +170 T 0.062 +171 N 0.072 +172 M 0.084 +173 V 0.099 +174 K 0.112 +175 N 0.114 +176 Q 0.102 +177 A 0.084 +178 L 0.071 +179 Q 0.063 +180 D 0.061 +181 G 0.060 +182 L 0.058 +183 L 0.054 +184 R 0.051 +185 A 0.054 +186 V 0.067 +187 Q 0.079 +188 I 0.085 +189 I 0.088 +190 E 0.101 +191 K 0.128 +192 G 0.167 +193 K 0.217 +194 Q 0.268 +195 A 0.312 +196 Q 0.350 +197 D 0.385 +198 P 0.411 +199 E 0.431 +200 N 0.457 +201 S 0.489 +202 R 0.519 +203 A 0.542 +204 P 0.555 +205 L 0.553 +206 K 0.534 +207 E 0.501 +208 L 0.462 +209 M 0.438 +210 P 0.447 +211 P 0.476 +212 V 0.484 +213 K 0.455 +214 D 0.418 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000046345.6_ENSMUST00000093183.5_GN:Smco1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:37.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000046345.6_ENSMUST00000093183.5_GN:Smco1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:37.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..703eccf8c112b577695a48e00f2ba27cf7cf482f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000046345.6_ENSMUST00000093183.5_GN:Smco1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:37.caid @@ -0,0 +1,252 @@ +>ENSMUSG00000046345.6|ENSMUST00000093183.5|GN:Smco1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:37 +1 M 0.379 +2 F 0.405 +3 P 0.448 +4 S 0.499 +5 P 0.548 +6 L 0.593 +7 P 0.635 +8 V 0.664 +9 A 0.672 +10 E 0.664 +11 W 0.664 +12 K 0.682 +13 T 0.707 +14 A 0.724 +15 E 0.734 +16 G 0.745 +17 L 0.754 +18 G 0.751 +19 S 0.736 +20 Q 0.719 +21 E 0.709 +22 C 0.701 +23 S 0.690 +24 S 0.672 +25 C 0.645 +26 C 0.614 +27 V 0.586 +28 P 0.558 +29 F 0.514 +30 P 0.444 +31 F 0.359 +32 L 0.284 +33 F 0.233 +34 L 0.206 +35 L 0.206 +36 Q 0.239 +37 K 0.301 +38 M 0.372 +39 T 0.432 +40 H 0.466 +41 E 0.476 +42 T 0.468 +43 T 0.451 +44 T 0.419 +45 L 0.364 +46 I 0.300 +47 S 0.250 +48 L 0.217 +49 K 0.194 +50 E 0.180 +51 A 0.177 +52 M 0.177 +53 K 0.179 +54 R 0.188 +55 V 0.197 +56 D 0.199 +57 N 0.191 +58 K 0.180 +59 L 0.173 +60 R 0.175 +61 A 0.184 +62 L 0.193 +63 D 0.202 +64 T 0.215 +65 Q 0.230 +66 F 0.242 +67 K 0.250 +68 E 0.258 +69 L 0.263 +70 D 0.267 +71 V 0.281 +72 T 0.293 +73 K 0.286 +74 D 0.261 +75 N 0.229 +76 L 0.193 +77 T 0.158 +78 L 0.135 +79 R 0.126 +80 F 0.126 +81 E 0.132 +82 H 0.141 +83 H 0.151 +84 S 0.161 +85 K 0.173 +86 T 0.189 +87 L 0.207 +88 A 0.216 +89 S 0.209 +90 Q 0.190 +91 A 0.166 +92 A 0.141 +93 Q 0.118 +94 D 0.098 +95 E 0.081 +96 I 0.067 +97 W 0.058 +98 T 0.055 +99 A 0.056 +100 A 0.061 +101 L 0.074 +102 A 0.093 +103 L 0.110 +104 G 0.110 +105 F 0.094 +106 T 0.074 +107 S 0.061 +108 M 0.056 +109 E 0.052 +110 L 0.049 +111 N 0.046 +112 I 0.045 +113 V 0.044 +114 Y 0.040 +115 S 0.036 +116 Y 0.031 +117 V 0.027 +118 I 0.024 +119 E 0.022 +120 V 0.019 +121 L 0.017 +122 I 0.018 +123 C 0.022 +124 L 0.028 +125 H 0.034 +126 T 0.039 +127 R 0.042 +128 M 0.043 +129 L 0.045 +130 Q 0.052 +131 K 0.064 +132 L 0.070 +133 P 0.065 +134 D 0.055 +135 L 0.046 +136 V 0.041 +137 R 0.043 +138 S 0.051 +139 L 0.056 +140 P 0.051 +141 T 0.038 +142 L 0.027 +143 A 0.023 +144 S 0.023 +145 V 0.027 +146 L 0.034 +147 R 0.044 +148 R 0.054 +149 K 0.064 +150 A 0.077 +151 K 0.093 +152 N 0.101 +153 K 0.094 +154 H 0.075 +155 V 0.056 +156 R 0.044 +157 L 0.039 +158 V 0.036 +159 W 0.034 +160 E 0.033 +161 S 0.033 +162 V 0.034 +163 L 0.035 +164 Q 0.041 +165 E 0.052 +166 Y 0.066 +167 G 0.074 +168 L 0.069 +169 Q 0.055 +170 E 0.043 +171 R 0.037 +172 D 0.035 +173 V 0.032 +174 S 0.027 +175 A 0.023 +176 L 0.022 +177 C 0.022 +178 T 0.023 +179 F 0.027 +180 F 0.036 +181 I 0.048 +182 V 0.060 +183 H 0.075 +184 G 0.093 +185 N 0.108 +186 K 0.115 +187 G 0.114 +188 E 0.105 +189 H 0.094 +190 Y 0.084 +191 A 0.078 +192 A 0.073 +193 N 0.069 +194 V 0.063 +195 R 0.057 +196 R 0.052 +197 M 0.049 +198 Y 0.047 +199 I 0.044 +200 K 0.039 +201 D 0.033 +202 V 0.031 +203 S 0.031 +204 F 0.033 +205 M 0.039 +206 I 0.049 +207 T 0.059 +208 N 0.069 +209 M 0.081 +210 V 0.098 +211 K 0.113 +212 N 0.116 +213 Q 0.103 +214 A 0.085 +215 L 0.073 +216 Q 0.067 +217 D 0.064 +218 G 0.062 +219 L 0.059 +220 L 0.055 +221 R 0.053 +222 A 0.056 +223 V 0.068 +224 Q 0.081 +225 I 0.087 +226 I 0.094 +227 E 0.112 +228 K 0.142 +229 G 0.187 +230 K 0.242 +231 Q 0.299 +232 A 0.346 +233 Q 0.385 +234 D 0.420 +235 P 0.450 +236 E 0.473 +237 N 0.499 +238 S 0.529 +239 R 0.558 +240 A 0.582 +241 P 0.600 +242 L 0.607 +243 K 0.595 +244 E 0.560 +245 L 0.513 +246 M 0.482 +247 P 0.493 +248 P 0.529 +249 V 0.543 +250 K 0.513 +251 D 0.473 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000046519.17_ENSMUST00000177390.8_GN:Golph3l_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000046519.17_ENSMUST00000177390.8_GN:Golph3l_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b627a0b30717d70be68f4fb11d560523ca71436d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000046519.17_ENSMUST00000177390.8_GN:Golph3l_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,286 @@ +>ENSMUSG00000046519.17|ENSMUST00000177390.8|GN:Golph3l|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.404 +2 T 0.411 +3 T 0.431 +4 L 0.460 +5 T 0.487 +6 H 0.510 +7 R 0.539 +8 T 0.567 +9 R 0.569 +10 R 0.535 +11 T 0.492 +12 E 0.462 +13 V 0.440 +14 S 0.404 +15 K 0.371 +16 S 0.372 +17 S 0.396 +18 E 0.412 +19 K 0.424 +20 K 0.445 +21 I 0.463 +22 E 0.479 +23 S 0.514 +24 E 0.562 +25 E 0.599 +26 D 0.619 +27 T 0.622 +28 N 0.612 +29 Q 0.599 +30 E 0.586 +31 R 0.581 +32 S 0.590 +33 P 0.608 +34 D 0.616 +35 N 0.605 +36 E 0.583 +37 D 0.567 +38 P 0.560 +39 G 0.552 +40 D 0.526 +41 S 0.468 +42 K 0.383 +43 D 0.288 +44 I 0.201 +45 R 0.132 +46 L 0.086 +47 T 0.057 +48 L 0.040 +49 M 0.032 +50 E 0.028 +51 E 0.027 +52 V 0.026 +53 L 0.029 +54 L 0.040 +55 L 0.058 +56 G 0.074 +57 L 0.080 +58 K 0.080 +59 D 0.086 +60 K 0.104 +61 E 0.126 +62 G 0.140 +63 Y 0.140 +64 T 0.130 +65 S 0.120 +66 F 0.115 +67 W 0.112 +68 N 0.105 +69 D 0.092 +70 C 0.080 +71 I 0.071 +72 S 0.065 +73 S 0.065 +74 G 0.068 +75 L 0.068 +76 R 0.065 +77 G 0.066 +78 G 0.072 +79 I 0.074 +80 L 0.065 +81 I 0.055 +82 E 0.049 +83 L 0.048 +84 A 0.045 +85 M 0.044 +86 R 0.044 +87 G 0.044 +88 R 0.043 +89 I 0.044 +90 Y 0.056 +91 L 0.077 +92 E 0.102 +93 P 0.119 +94 P 0.125 +95 T 0.124 +96 M 0.122 +97 R 0.122 +98 K 0.120 +99 K 0.111 +100 R 0.096 +101 L 0.080 +102 L 0.065 +103 D 0.057 +104 R 0.056 +105 K 0.057 +106 V 0.056 +107 L 0.058 +108 L 0.062 +109 K 0.064 +110 S 0.066 +111 D 0.077 +112 S 0.095 +113 P 0.108 +114 T 0.110 +115 G 0.104 +116 D 0.091 +117 V 0.073 +118 L 0.060 +119 L 0.058 +120 D 0.059 +121 E 0.055 +122 T 0.049 +123 L 0.044 +124 K 0.042 +125 H 0.043 +126 I 0.046 +127 K 0.050 +128 A 0.052 +129 T 0.051 +130 E 0.047 +131 P 0.043 +132 T 0.042 +133 E 0.040 +134 T 0.039 +135 V 0.041 +136 Q 0.046 +137 T 0.053 +138 W 0.063 +139 I 0.074 +140 E 0.086 +141 L 0.102 +142 L 0.121 +143 T 0.136 +144 G 0.142 +145 E 0.140 +146 T 0.135 +147 W 0.132 +148 N 0.133 +149 P 0.133 +150 F 0.136 +151 K 0.145 +152 L 0.154 +153 Q 0.160 +154 Y 0.163 +155 Q 0.160 +156 L 0.147 +157 R 0.126 +158 N 0.103 +159 V 0.082 +160 R 0.066 +161 E 0.059 +162 R 0.060 +163 I 0.066 +164 A 0.072 +165 K 0.074 +166 N 0.072 +167 L 0.069 +168 V 0.070 +169 E 0.078 +170 K 0.089 +171 G 0.100 +172 I 0.109 +173 L 0.113 +174 T 0.115 +175 T 0.119 +176 E 0.130 +177 K 0.144 +178 Q 0.154 +179 N 0.156 +180 F 0.152 +181 L 0.143 +182 L 0.135 +183 F 0.136 +184 D 0.142 +185 M 0.143 +186 T 0.135 +187 T 0.123 +188 H 0.111 +189 P 0.104 +190 V 0.102 +191 T 0.104 +192 N 0.101 +193 T 0.091 +194 T 0.077 +195 E 0.066 +196 K 0.064 +197 Q 0.069 +198 R 0.072 +199 L 0.069 +200 M 0.063 +201 K 0.054 +202 K 0.046 +203 L 0.041 +204 Q 0.041 +205 D 0.046 +206 S 0.052 +207 V 0.057 +208 L 0.060 +209 E 0.063 +210 R 0.069 +211 W 0.080 +212 V 0.092 +213 N 0.100 +214 D 0.102 +215 P 0.099 +216 Q 0.097 +217 R 0.095 +218 M 0.086 +219 D 0.069 +220 R 0.051 +221 R 0.041 +222 T 0.038 +223 L 0.036 +224 A 0.035 +225 L 0.034 +226 L 0.036 +227 V 0.039 +228 L 0.042 +229 A 0.045 +230 H 0.047 +231 S 0.048 +232 S 0.048 +233 D 0.050 +234 V 0.053 +235 L 0.057 +236 E 0.062 +237 N 0.066 +238 V 0.067 +239 F 0.066 +240 S 0.067 +241 C 0.068 +242 L 0.067 +243 T 0.064 +244 D 0.059 +245 D 0.054 +246 K 0.050 +247 Y 0.050 +248 D 0.048 +249 V 0.047 +250 A 0.050 +251 M 0.060 +252 N 0.067 +253 R 0.065 +254 T 0.060 +255 K 0.060 +256 D 0.066 +257 L 0.078 +258 V 0.089 +259 E 0.094 +260 L 0.095 +261 D 0.095 +262 P 0.098 +263 E 0.108 +264 V 0.126 +265 E 0.147 +266 G 0.158 +267 T 0.156 +268 K 0.143 +269 H 0.127 +270 N 0.110 +271 A 0.094 +272 T 0.077 +273 E 0.061 +274 M 0.049 +275 I 0.042 +276 W 0.041 +277 A 0.043 +278 V 0.049 +279 L 0.056 +280 A 0.064 +281 A 0.078 +282 F 0.107 +283 N 0.151 +284 K 0.196 +285 S 0.225 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000046519.17_ENSMUST00000177390.8_GN:Golph3l_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:58.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000046519.17_ENSMUST00000177390.8_GN:Golph3l_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:58.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..baa4a59cc7cacafa99fa9b12c94f8fde565ffaf7 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000046519.17_ENSMUST00000177390.8_GN:Golph3l_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:58.caid @@ -0,0 +1,344 @@ +>ENSMUSG00000046519.17|ENSMUST00000177390.8|GN:Golph3l|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:58 +1 M 0.333 +2 C 0.361 +3 Y 0.410 +4 S 0.470 +5 L 0.524 +6 S 0.563 +7 A 0.590 +8 T 0.610 +9 K 0.623 +10 D 0.626 +11 Q 0.617 +12 E 0.591 +13 V 0.543 +14 C 0.468 +15 T 0.384 +16 L 0.318 +17 C 0.277 +18 V 0.251 +19 A 0.234 +20 E 0.226 +21 K 0.220 +22 F 0.224 +23 F 0.244 +24 T 0.270 +25 Y 0.290 +26 W 0.315 +27 N 0.366 +28 P 0.450 +29 P 0.551 +30 R 0.638 +31 V 0.693 +32 R 0.722 +33 E 0.741 +34 T 0.755 +35 G 0.759 +36 A 0.742 +37 L 0.696 +38 Q 0.633 +39 N 0.602 +40 E 0.632 +41 S 0.688 +42 A 0.721 +43 N 0.725 +44 C 0.714 +45 S 0.699 +46 L 0.684 +47 R 0.677 +48 P 0.675 +49 T 0.665 +50 A 0.635 +51 A 0.589 +52 Q 0.531 +53 E 0.474 +54 Q 0.450 +55 R 0.481 +56 Q 0.544 +57 V 0.604 +58 R 0.649 +59 M 0.678 +60 T 0.689 +61 T 0.682 +62 L 0.672 +63 T 0.672 +64 H 0.677 +65 R 0.682 +66 T 0.692 +67 R 0.705 +68 R 0.712 +69 T 0.710 +70 E 0.707 +71 V 0.709 +72 S 0.709 +73 K 0.700 +74 S 0.672 +75 S 0.612 +76 E 0.520 +77 K 0.438 +78 K 0.429 +79 I 0.476 +80 E 0.516 +81 S 0.540 +82 E 0.588 +83 E 0.652 +84 D 0.696 +85 T 0.709 +86 N 0.702 +87 Q 0.687 +88 E 0.669 +89 R 0.659 +90 S 0.662 +91 P 0.676 +92 D 0.683 +93 N 0.673 +94 E 0.653 +95 D 0.638 +96 P 0.633 +97 G 0.624 +98 D 0.590 +99 S 0.514 +100 K 0.404 +101 D 0.289 +102 I 0.191 +103 R 0.121 +104 L 0.077 +105 T 0.051 +106 L 0.037 +107 M 0.030 +108 E 0.026 +109 E 0.025 +110 V 0.024 +111 L 0.027 +112 L 0.037 +113 L 0.055 +114 G 0.070 +115 L 0.076 +116 K 0.076 +117 D 0.082 +118 K 0.100 +119 E 0.122 +120 G 0.136 +121 Y 0.133 +122 T 0.122 +123 S 0.113 +124 F 0.112 +125 W 0.111 +126 N 0.104 +127 D 0.090 +128 C 0.078 +129 I 0.069 +130 S 0.064 +131 S 0.063 +132 G 0.066 +133 L 0.066 +134 R 0.062 +135 G 0.063 +136 G 0.069 +137 I 0.071 +138 L 0.065 +139 I 0.055 +140 E 0.050 +141 L 0.049 +142 A 0.046 +143 M 0.045 +144 R 0.046 +145 G 0.046 +146 R 0.045 +147 I 0.047 +148 Y 0.058 +149 L 0.080 +150 E 0.103 +151 P 0.118 +152 P 0.123 +153 T 0.122 +154 M 0.120 +155 R 0.119 +156 K 0.116 +157 K 0.108 +158 R 0.094 +159 L 0.076 +160 L 0.061 +161 D 0.054 +162 R 0.054 +163 K 0.056 +164 V 0.055 +165 L 0.057 +166 L 0.061 +167 K 0.064 +168 S 0.069 +169 D 0.082 +170 S 0.103 +171 P 0.117 +172 T 0.118 +173 G 0.109 +174 D 0.094 +175 V 0.074 +176 L 0.061 +177 L 0.058 +178 D 0.060 +179 E 0.056 +180 T 0.049 +181 L 0.043 +182 K 0.042 +183 H 0.043 +184 I 0.045 +185 K 0.048 +186 A 0.050 +187 T 0.048 +188 E 0.045 +189 P 0.043 +190 T 0.042 +191 E 0.042 +192 T 0.041 +193 V 0.042 +194 Q 0.046 +195 T 0.054 +196 W 0.063 +197 I 0.073 +198 E 0.083 +199 L 0.098 +200 L 0.116 +201 T 0.128 +202 G 0.131 +203 E 0.125 +204 T 0.118 +205 W 0.114 +206 N 0.114 +207 P 0.116 +208 F 0.122 +209 K 0.133 +210 L 0.143 +211 Q 0.149 +212 Y 0.153 +213 Q 0.153 +214 L 0.141 +215 R 0.121 +216 N 0.098 +217 V 0.078 +218 R 0.063 +219 E 0.055 +220 R 0.056 +221 I 0.060 +222 A 0.066 +223 K 0.070 +224 N 0.069 +225 L 0.067 +226 V 0.068 +227 E 0.074 +228 K 0.083 +229 G 0.092 +230 I 0.100 +231 L 0.104 +232 T 0.107 +233 T 0.111 +234 E 0.120 +235 K 0.130 +236 Q 0.135 +237 N 0.136 +238 F 0.131 +239 L 0.123 +240 L 0.117 +241 F 0.117 +242 D 0.124 +243 M 0.127 +244 T 0.122 +245 T 0.113 +246 H 0.104 +247 P 0.098 +248 V 0.095 +249 T 0.095 +250 N 0.093 +251 T 0.084 +252 T 0.072 +253 E 0.063 +254 K 0.064 +255 Q 0.071 +256 R 0.075 +257 L 0.073 +258 M 0.065 +259 K 0.056 +260 K 0.048 +261 L 0.043 +262 Q 0.042 +263 D 0.045 +264 S 0.051 +265 V 0.056 +266 L 0.060 +267 E 0.063 +268 R 0.068 +269 W 0.077 +270 V 0.087 +271 N 0.094 +272 D 0.096 +273 P 0.095 +274 Q 0.094 +275 R 0.092 +276 M 0.082 +277 D 0.065 +278 R 0.049 +279 R 0.040 +280 T 0.037 +281 L 0.036 +282 A 0.034 +283 L 0.033 +284 L 0.035 +285 V 0.039 +286 L 0.042 +287 A 0.045 +288 H 0.047 +289 S 0.048 +290 S 0.049 +291 D 0.051 +292 V 0.055 +293 L 0.060 +294 E 0.066 +295 N 0.070 +296 V 0.071 +297 F 0.071 +298 S 0.071 +299 C 0.073 +300 L 0.072 +301 T 0.070 +302 D 0.064 +303 D 0.057 +304 K 0.052 +305 Y 0.050 +306 D 0.048 +307 V 0.047 +308 A 0.053 +309 M 0.063 +310 N 0.071 +311 R 0.069 +312 T 0.065 +313 K 0.066 +314 D 0.073 +315 L 0.084 +316 V 0.096 +317 E 0.103 +318 L 0.104 +319 D 0.103 +320 P 0.106 +321 E 0.117 +322 V 0.137 +323 E 0.160 +324 G 0.174 +325 T 0.172 +326 K 0.159 +327 H 0.142 +328 N 0.123 +329 A 0.102 +330 T 0.082 +331 E 0.065 +332 M 0.053 +333 I 0.046 +334 W 0.044 +335 A 0.046 +336 V 0.052 +337 L 0.060 +338 A 0.068 +339 A 0.082 +340 F 0.112 +341 N 0.157 +342 K 0.203 +343 S 0.233 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000047415.13_ENSMUST00000110066.8_GN:Gpr68_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000047415.13_ENSMUST00000110066.8_GN:Gpr68_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5c46f5fb14b581e5e6156d4cdaef166eebb303fc --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000047415.13_ENSMUST00000110066.8_GN:Gpr68_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,366 @@ +>ENSMUSG00000047415.13|ENSMUST00000110066.8|GN:Gpr68|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.394 +2 G 0.414 +3 N 0.448 +4 I 0.484 +5 T 0.512 +6 T 0.533 +7 E 0.548 +8 N 0.551 +9 S 0.531 +10 S 0.488 +11 L 0.426 +12 S 0.354 +13 C 0.294 +14 P 0.256 +15 I 0.232 +16 D 0.202 +17 H 0.168 +18 T 0.139 +19 I 0.118 +20 H 0.100 +21 Q 0.083 +22 T 0.069 +23 L 0.062 +24 A 0.055 +25 P 0.045 +26 V 0.036 +27 V 0.032 +28 Y 0.032 +29 V 0.034 +30 T 0.034 +31 V 0.034 +32 L 0.036 +33 V 0.041 +34 V 0.048 +35 G 0.053 +36 F 0.051 +37 P 0.044 +38 A 0.038 +39 N 0.034 +40 C 0.033 +41 L 0.031 +42 S 0.026 +43 L 0.021 +44 Y 0.018 +45 F 0.016 +46 G 0.017 +47 Y 0.020 +48 L 0.027 +49 Q 0.039 +50 I 0.055 +51 K 0.069 +52 A 0.074 +53 R 0.072 +54 N 0.066 +55 E 0.058 +56 L 0.047 +57 G 0.037 +58 V 0.031 +59 Y 0.027 +60 L 0.028 +61 C 0.032 +62 N 0.036 +63 L 0.038 +64 T 0.040 +65 I 0.041 +66 A 0.044 +67 D 0.047 +68 L 0.045 +69 F 0.041 +70 Y 0.039 +71 I 0.042 +72 C 0.048 +73 S 0.055 +74 L 0.059 +75 P 0.056 +76 F 0.050 +77 W 0.045 +78 L 0.043 +79 Q 0.044 +80 Y 0.048 +81 V 0.051 +82 L 0.056 +83 Q 0.062 +84 H 0.070 +85 D 0.074 +86 D 0.072 +87 W 0.068 +88 S 0.065 +89 H 0.062 +90 G 0.058 +91 D 0.049 +92 L 0.039 +93 S 0.032 +94 C 0.029 +95 Q 0.028 +96 V 0.029 +97 C 0.032 +98 G 0.034 +99 I 0.033 +100 L 0.032 +101 L 0.034 +102 Y 0.040 +103 E 0.048 +104 N 0.051 +105 I 0.050 +106 Y 0.047 +107 I 0.045 +108 S 0.044 +109 V 0.044 +110 G 0.042 +111 F 0.037 +112 L 0.032 +113 C 0.028 +114 C 0.027 +115 I 0.030 +116 S 0.037 +117 I 0.045 +118 D 0.050 +119 R 0.052 +120 Y 0.051 +121 L 0.053 +122 A 0.060 +123 V 0.070 +124 A 0.077 +125 H 0.076 +126 P 0.073 +127 F 0.070 +128 R 0.069 +129 F 0.069 +130 H 0.065 +131 Q 0.059 +132 F 0.054 +133 R 0.048 +134 T 0.041 +135 L 0.033 +136 K 0.028 +137 A 0.027 +138 A 0.029 +139 V 0.034 +140 G 0.039 +141 V 0.042 +142 S 0.042 +143 V 0.039 +144 L 0.039 +145 I 0.040 +146 W 0.040 +147 A 0.038 +148 K 0.036 +149 E 0.035 +150 L 0.036 +151 L 0.038 +152 T 0.041 +153 S 0.044 +154 I 0.044 +155 Y 0.045 +156 F 0.049 +157 L 0.054 +158 N 0.057 +159 H 0.058 +160 K 0.061 +161 E 0.072 +162 V 0.092 +163 I 0.120 +164 E 0.148 +165 D 0.168 +166 E 0.177 +167 D 0.175 +168 Q 0.162 +169 H 0.140 +170 R 0.111 +171 V 0.087 +172 C 0.077 +173 F 0.085 +174 E 0.102 +175 H 0.119 +176 Y 0.127 +177 P 0.122 +178 I 0.101 +179 Q 0.075 +180 A 0.056 +181 W 0.049 +182 Q 0.048 +183 R 0.049 +184 S 0.048 +185 I 0.046 +186 N 0.042 +187 Y 0.038 +188 Y 0.033 +189 R 0.028 +190 F 0.026 +191 L 0.029 +192 V 0.033 +193 G 0.035 +194 F 0.036 +195 L 0.040 +196 F 0.045 +197 P 0.044 +198 I 0.038 +199 C 0.032 +200 L 0.029 +201 L 0.028 +202 L 0.027 +203 A 0.025 +204 S 0.023 +205 Y 0.024 +206 Q 0.028 +207 G 0.037 +208 I 0.048 +209 L 0.062 +210 R 0.073 +211 A 0.076 +212 V 0.076 +213 R 0.086 +214 R 0.116 +215 S 0.162 +216 H 0.207 +217 G 0.232 +218 T 0.229 +219 Q 0.203 +220 K 0.166 +221 S 0.128 +222 R 0.098 +223 K 0.082 +224 D 0.076 +225 Q 0.069 +226 I 0.058 +227 Q 0.048 +228 R 0.044 +229 L 0.044 +230 V 0.044 +231 L 0.046 +232 S 0.048 +233 T 0.047 +234 V 0.044 +235 V 0.041 +236 I 0.039 +237 F 0.036 +238 L 0.032 +239 A 0.030 +240 C 0.030 +241 F 0.032 +242 L 0.035 +243 P 0.034 +244 Y 0.030 +245 H 0.027 +246 V 0.027 +247 L 0.029 +248 L 0.028 +249 L 0.026 +250 V 0.024 +251 R 0.024 +252 S 0.029 +253 L 0.038 +254 W 0.053 +255 E 0.070 +256 R 0.082 +257 N 0.085 +258 C 0.083 +259 E 0.081 +260 F 0.078 +261 A 0.073 +262 K 0.069 +263 S 0.064 +264 I 0.056 +265 F 0.047 +266 N 0.041 +267 V 0.038 +268 Y 0.037 +269 H 0.037 +270 F 0.039 +271 S 0.042 +272 L 0.045 +273 L 0.050 +274 L 0.055 +275 T 0.059 +276 S 0.061 +277 F 0.063 +278 N 0.066 +279 C 0.068 +280 V 0.067 +281 A 0.065 +282 D 0.061 +283 P 0.054 +284 V 0.045 +285 L 0.036 +286 Y 0.031 +287 C 0.032 +288 F 0.039 +289 V 0.050 +290 S 0.063 +291 E 0.078 +292 T 0.093 +293 T 0.103 +294 H 0.106 +295 R 0.105 +296 D 0.100 +297 L 0.093 +298 A 0.088 +299 R 0.088 +300 L 0.095 +301 R 0.111 +302 G 0.132 +303 A 0.153 +304 C 0.172 +305 L 0.189 +306 A 0.199 +307 V 0.204 +308 L 0.218 +309 T 0.262 +310 C 0.344 +311 S 0.442 +312 R 0.522 +313 T 0.573 +314 S 0.603 +315 R 0.618 +316 A 0.621 +317 R 0.617 +318 E 0.608 +319 A 0.600 +320 Y 0.604 +321 P 0.625 +322 L 0.657 +323 G 0.683 +324 A 0.701 +325 P 0.717 +326 E 0.734 +327 A 0.745 +328 S 0.751 +329 G 0.754 +330 K 0.756 +331 S 0.756 +332 G 0.755 +333 A 0.750 +334 Q 0.739 +335 G 0.719 +336 E 0.689 +337 E 0.645 +338 P 0.585 +339 E 0.507 +340 L 0.425 +341 L 0.362 +342 T 0.340 +343 K 0.347 +344 L 0.349 +345 H 0.334 +346 S 0.327 +347 A 0.349 +348 F 0.394 +349 Q 0.452 +350 T 0.512 +351 P 0.550 +352 S 0.551 +353 S 0.552 +354 L 0.592 +355 G 0.652 +356 V 0.692 +357 G 0.707 +358 G 0.710 +359 P 0.710 +360 S 0.708 +361 T 0.705 +362 V 0.691 +363 G 0.643 +364 L 0.561 +365 A 0.489 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000047415.13_ENSMUST00000110066.8_GN:Gpr68_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000047415.13_ENSMUST00000110066.8_GN:Gpr68_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1d0a29c8b94748aa4acc0495fcdd1563a2a11254 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000047415.13_ENSMUST00000110066.8_GN:Gpr68_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid @@ -0,0 +1,376 @@ +>ENSMUSG00000047415.13|ENSMUST00000110066.8|GN:Gpr68|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:10 +1 M 0.317 +2 R 0.329 +3 N 0.351 +4 K 0.373 +5 A 0.391 +6 P 0.409 +7 S 0.433 +8 G 0.451 +9 P 0.447 +10 K 0.447 +11 M 0.488 +12 G 0.556 +13 N 0.605 +14 I 0.618 +15 T 0.614 +16 T 0.608 +17 E 0.605 +18 N 0.596 +19 S 0.572 +20 S 0.526 +21 L 0.456 +22 S 0.375 +23 C 0.310 +24 P 0.274 +25 I 0.251 +26 D 0.221 +27 H 0.184 +28 T 0.151 +29 I 0.126 +30 H 0.104 +31 Q 0.083 +32 T 0.069 +33 L 0.061 +34 A 0.054 +35 P 0.044 +36 V 0.036 +37 V 0.032 +38 Y 0.032 +39 V 0.034 +40 T 0.034 +41 V 0.035 +42 L 0.036 +43 V 0.041 +44 V 0.048 +45 G 0.053 +46 F 0.051 +47 P 0.044 +48 A 0.038 +49 N 0.034 +50 C 0.033 +51 L 0.031 +52 S 0.027 +53 L 0.021 +54 Y 0.018 +55 F 0.017 +56 G 0.017 +57 Y 0.020 +58 L 0.027 +59 Q 0.039 +60 I 0.055 +61 K 0.068 +62 A 0.074 +63 R 0.072 +64 N 0.066 +65 E 0.057 +66 L 0.047 +67 G 0.037 +68 V 0.030 +69 Y 0.027 +70 L 0.028 +71 C 0.032 +72 N 0.036 +73 L 0.038 +74 T 0.039 +75 I 0.041 +76 A 0.044 +77 D 0.046 +78 L 0.044 +79 F 0.040 +80 Y 0.038 +81 I 0.041 +82 C 0.047 +83 S 0.054 +84 L 0.058 +85 P 0.055 +86 F 0.049 +87 W 0.044 +88 L 0.042 +89 Q 0.043 +90 Y 0.045 +91 V 0.049 +92 L 0.054 +93 Q 0.061 +94 H 0.069 +95 D 0.073 +96 D 0.071 +97 W 0.067 +98 S 0.063 +99 H 0.061 +100 G 0.056 +101 D 0.048 +102 L 0.038 +103 S 0.031 +104 C 0.028 +105 Q 0.027 +106 V 0.028 +107 C 0.031 +108 G 0.033 +109 I 0.032 +110 L 0.031 +111 L 0.033 +112 Y 0.040 +113 E 0.048 +114 N 0.051 +115 I 0.049 +116 Y 0.046 +117 I 0.044 +118 S 0.044 +119 V 0.044 +120 G 0.042 +121 F 0.037 +122 L 0.032 +123 C 0.028 +124 C 0.027 +125 I 0.030 +126 S 0.037 +127 I 0.046 +128 D 0.051 +129 R 0.052 +130 Y 0.052 +131 L 0.054 +132 A 0.062 +133 V 0.072 +134 A 0.078 +135 H 0.078 +136 P 0.074 +137 F 0.072 +138 R 0.071 +139 F 0.071 +140 H 0.066 +141 Q 0.060 +142 F 0.055 +143 R 0.049 +144 T 0.041 +145 L 0.033 +146 K 0.028 +147 A 0.027 +148 A 0.030 +149 V 0.034 +150 G 0.039 +151 V 0.043 +152 S 0.042 +153 V 0.039 +154 L 0.039 +155 I 0.040 +156 W 0.041 +157 A 0.038 +158 K 0.036 +159 E 0.035 +160 L 0.036 +161 L 0.038 +162 T 0.041 +163 S 0.044 +164 I 0.045 +165 Y 0.045 +166 F 0.050 +167 L 0.055 +168 N 0.057 +169 H 0.057 +170 K 0.061 +171 E 0.072 +172 V 0.092 +173 I 0.120 +174 E 0.149 +175 D 0.169 +176 E 0.178 +177 D 0.175 +178 Q 0.163 +179 H 0.141 +180 R 0.111 +181 V 0.087 +182 C 0.077 +183 F 0.084 +184 E 0.101 +185 H 0.118 +186 Y 0.126 +187 P 0.120 +188 I 0.100 +189 Q 0.074 +190 A 0.055 +191 W 0.048 +192 Q 0.048 +193 R 0.049 +194 S 0.048 +195 I 0.046 +196 N 0.042 +197 Y 0.038 +198 Y 0.033 +199 R 0.028 +200 F 0.026 +201 L 0.029 +202 V 0.033 +203 G 0.036 +204 F 0.036 +205 L 0.040 +206 F 0.045 +207 P 0.044 +208 I 0.038 +209 C 0.032 +210 L 0.030 +211 L 0.028 +212 L 0.027 +213 A 0.025 +214 S 0.023 +215 Y 0.024 +216 Q 0.028 +217 G 0.037 +218 I 0.048 +219 L 0.062 +220 R 0.073 +221 A 0.076 +222 V 0.075 +223 R 0.085 +224 R 0.115 +225 S 0.159 +226 H 0.203 +227 G 0.228 +228 T 0.225 +229 Q 0.200 +230 K 0.164 +231 S 0.126 +232 R 0.097 +233 K 0.081 +234 D 0.075 +235 Q 0.069 +236 I 0.058 +237 Q 0.048 +238 R 0.044 +239 L 0.044 +240 V 0.045 +241 L 0.047 +242 S 0.049 +243 T 0.048 +244 V 0.044 +245 V 0.041 +246 I 0.039 +247 F 0.036 +248 L 0.032 +249 A 0.030 +250 C 0.030 +251 F 0.033 +252 L 0.035 +253 P 0.034 +254 Y 0.030 +255 H 0.027 +256 V 0.027 +257 L 0.028 +258 L 0.028 +259 L 0.026 +260 V 0.023 +261 R 0.024 +262 S 0.029 +263 L 0.038 +264 W 0.053 +265 E 0.071 +266 R 0.084 +267 N 0.087 +268 C 0.085 +269 E 0.083 +270 F 0.079 +271 A 0.074 +272 K 0.069 +273 S 0.065 +274 I 0.057 +275 F 0.048 +276 N 0.041 +277 V 0.039 +278 Y 0.037 +279 H 0.037 +280 F 0.039 +281 S 0.042 +282 L 0.046 +283 L 0.050 +284 L 0.056 +285 T 0.059 +286 S 0.062 +287 F 0.064 +288 N 0.067 +289 C 0.069 +290 V 0.068 +291 A 0.066 +292 D 0.061 +293 P 0.054 +294 V 0.045 +295 L 0.037 +296 Y 0.031 +297 C 0.032 +298 F 0.040 +299 V 0.051 +300 S 0.064 +301 E 0.079 +302 T 0.093 +303 T 0.103 +304 H 0.106 +305 R 0.105 +306 D 0.100 +307 L 0.093 +308 A 0.089 +309 R 0.089 +310 L 0.096 +311 R 0.112 +312 G 0.133 +313 A 0.154 +314 C 0.174 +315 L 0.191 +316 A 0.202 +317 V 0.208 +318 L 0.221 +319 T 0.266 +320 C 0.349 +321 S 0.448 +322 R 0.529 +323 T 0.581 +324 S 0.609 +325 R 0.624 +326 A 0.627 +327 R 0.623 +328 E 0.613 +329 A 0.604 +330 Y 0.607 +331 P 0.629 +332 L 0.660 +333 G 0.686 +334 A 0.704 +335 P 0.720 +336 E 0.737 +337 A 0.749 +338 S 0.755 +339 G 0.757 +340 K 0.758 +341 S 0.758 +342 G 0.757 +343 A 0.752 +344 Q 0.741 +345 G 0.721 +346 E 0.691 +347 E 0.649 +348 P 0.590 +349 E 0.513 +350 L 0.430 +351 L 0.367 +352 T 0.345 +353 K 0.354 +354 L 0.356 +355 H 0.340 +356 S 0.333 +357 A 0.354 +358 F 0.399 +359 Q 0.456 +360 T 0.517 +361 P 0.553 +362 S 0.554 +363 S 0.554 +364 L 0.594 +365 G 0.654 +366 V 0.695 +367 G 0.710 +368 G 0.714 +369 P 0.714 +370 S 0.714 +371 T 0.712 +372 V 0.698 +373 G 0.651 +374 L 0.569 +375 A 0.497 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000048240.16_ENSMUST00000118233.8_GN:Gng7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000048240.16_ENSMUST00000118233.8_GN:Gng7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4d79174bb86996d4bd27ee6c2004a9fffb53d238 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000048240.16_ENSMUST00000118233.8_GN:Gng7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,69 @@ +>ENSMUSG00000048240.16|ENSMUST00000118233.8|GN:Gng7|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.499 +2 S 0.503 +3 G 0.502 +4 T 0.479 +5 N 0.425 +6 N 0.348 +7 V 0.272 +8 A 0.223 +9 Q 0.208 +10 A 0.210 +11 R 0.213 +12 K 0.223 +13 L 0.237 +14 V 0.247 +15 E 0.255 +16 Q 0.264 +17 L 0.268 +18 R 0.281 +19 I 0.320 +20 E 0.369 +21 A 0.404 +22 G 0.423 +23 I 0.426 +24 E 0.402 +25 R 0.356 +26 I 0.312 +27 K 0.274 +28 V 0.232 +29 S 0.196 +30 K 0.188 +31 A 0.202 +32 S 0.209 +33 S 0.203 +34 D 0.202 +35 L 0.205 +36 M 0.195 +37 G 0.175 +38 Y 0.161 +39 C 0.151 +40 E 0.136 +41 Q 0.123 +42 H 0.127 +43 A 0.156 +44 R 0.207 +45 N 0.263 +46 D 0.301 +47 P 0.309 +48 L 0.295 +49 L 0.287 +50 V 0.308 +51 G 0.356 +52 V 0.399 +53 P 0.413 +54 A 0.416 +55 S 0.436 +56 E 0.464 +57 N 0.468 +58 P 0.440 +59 F 0.403 +60 K 0.384 +61 D 0.392 +62 K 0.413 +63 K 0.429 +64 P 0.437 +65 C 0.451 +66 I 0.469 +67 I 0.471 +68 L 0.457 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000048240.16_ENSMUST00000118233.8_GN:Gng7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000048240.16_ENSMUST00000118233.8_GN:Gng7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..97b9fa8be43ded1189ac195241e9bfe3222efc80 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000048240.16_ENSMUST00000118233.8_GN:Gng7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid @@ -0,0 +1,70 @@ +>ENSMUSG00000048240.16|ENSMUST00000118233.8|GN:Gng7|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:1 +1 M 0.476 +2 M 0.496 +3 S 0.519 +4 G 0.521 +5 T 0.488 +6 N 0.423 +7 N 0.342 +8 V 0.267 +9 A 0.221 +10 Q 0.208 +11 A 0.209 +12 R 0.212 +13 K 0.221 +14 L 0.233 +15 V 0.242 +16 E 0.252 +17 Q 0.263 +18 L 0.268 +19 R 0.280 +20 I 0.317 +21 E 0.364 +22 A 0.399 +23 G 0.419 +24 I 0.423 +25 E 0.400 +26 R 0.355 +27 I 0.312 +28 K 0.274 +29 V 0.232 +30 S 0.196 +31 K 0.188 +32 A 0.201 +33 S 0.208 +34 S 0.202 +35 D 0.201 +36 L 0.204 +37 M 0.194 +38 G 0.174 +39 Y 0.160 +40 C 0.150 +41 E 0.135 +42 Q 0.122 +43 H 0.125 +44 A 0.154 +45 R 0.205 +46 N 0.261 +47 D 0.299 +48 P 0.307 +49 L 0.294 +50 L 0.287 +51 V 0.308 +52 G 0.355 +53 V 0.397 +54 P 0.410 +55 A 0.413 +56 S 0.434 +57 E 0.463 +58 N 0.468 +59 P 0.441 +60 F 0.404 +61 K 0.385 +62 D 0.391 +63 K 0.412 +64 K 0.428 +65 P 0.435 +66 C 0.448 +67 I 0.466 +68 I 0.467 +69 L 0.454 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000048429.11_ENSMUST00000062125.11_GN:Timm29_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000048429.11_ENSMUST00000062125.11_GN:Timm29_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9dda50d184d61566b3f6d5e536370c14d7ab8689 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000048429.11_ENSMUST00000062125.11_GN:Timm29_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,267 @@ +>ENSMUSG00000048429.11|ENSMUST00000062125.11|GN:Timm29|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.286 +2 V 0.281 +3 T 0.275 +4 A 0.269 +5 A 0.263 +6 L 0.255 +7 K 0.251 +8 R 0.261 +9 F 0.296 +10 W 0.368 +11 S 0.473 +12 G 0.580 +13 G 0.657 +14 H 0.700 +15 G 0.726 +16 E 0.744 +17 A 0.753 +18 G 0.752 +19 G 0.749 +20 E 0.752 +21 A 0.760 +22 G 0.768 +23 G 0.772 +24 A 0.771 +25 T 0.765 +26 T 0.754 +27 V 0.735 +28 A 0.707 +29 V 0.667 +30 K 0.611 +31 P 0.536 +32 G 0.447 +33 L 0.364 +34 W 0.308 +35 T 0.270 +36 R 0.230 +37 L 0.193 +38 S 0.175 +39 T 0.178 +40 W 0.186 +41 A 0.190 +42 G 0.191 +43 A 0.194 +44 L 0.202 +45 L 0.210 +46 R 0.218 +47 D 0.222 +48 Y 0.218 +49 A 0.215 +50 E 0.223 +51 A 0.240 +52 C 0.259 +53 G 0.272 +54 D 0.266 +55 A 0.237 +56 A 0.206 +57 A 0.189 +58 A 0.186 +59 A 0.184 +60 R 0.183 +61 A 0.183 +62 R 0.178 +63 P 0.163 +64 G 0.146 +65 R 0.134 +66 A 0.129 +67 A 0.123 +68 L 0.119 +69 Y 0.118 +70 V 0.116 +71 G 0.111 +72 L 0.109 +73 L 0.114 +74 G 0.125 +75 G 0.134 +76 A 0.137 +77 A 0.132 +78 A 0.119 +79 C 0.106 +80 C 0.101 +81 A 0.104 +82 L 0.112 +83 A 0.118 +84 P 0.117 +85 S 0.103 +86 E 0.084 +87 A 0.069 +88 A 0.061 +89 F 0.059 +90 E 0.061 +91 E 0.064 +92 A 0.068 +93 L 0.070 +94 L 0.076 +95 D 0.085 +96 A 0.095 +97 S 0.100 +98 G 0.099 +99 S 0.090 +100 L 0.082 +101 L 0.081 +102 L 0.091 +103 L 0.111 +104 A 0.128 +105 P 0.132 +106 A 0.123 +107 T 0.109 +108 R 0.097 +109 N 0.088 +110 R 0.080 +111 H 0.072 +112 S 0.065 +113 E 0.059 +114 A 0.056 +115 F 0.054 +116 L 0.052 +117 Q 0.050 +118 R 0.049 +119 L 0.048 +120 L 0.048 +121 W 0.051 +122 L 0.055 +123 R 0.061 +124 G 0.071 +125 R 0.083 +126 G 0.092 +127 R 0.098 +128 L 0.100 +129 R 0.100 +130 H 0.095 +131 V 0.087 +132 N 0.076 +133 L 0.066 +134 G 0.060 +135 F 0.058 +136 C 0.064 +137 S 0.074 +138 L 0.085 +139 V 0.095 +140 Y 0.108 +141 E 0.128 +142 A 0.154 +143 P 0.172 +144 F 0.175 +145 D 0.170 +146 A 0.168 +147 Q 0.170 +148 A 0.171 +149 S 0.165 +150 L 0.153 +151 Y 0.143 +152 Q 0.141 +153 A 0.146 +154 R 0.152 +155 C 0.158 +156 R 0.168 +157 Y 0.185 +158 L 0.204 +159 Q 0.211 +160 P 0.195 +161 R 0.163 +162 W 0.138 +163 V 0.133 +164 D 0.142 +165 F 0.145 +166 P 0.142 +167 G 0.153 +168 R 0.186 +169 I 0.211 +170 L 0.200 +171 D 0.165 +172 V 0.129 +173 G 0.100 +174 F 0.082 +175 V 0.074 +176 G 0.071 +177 R 0.065 +178 W 0.058 +179 W 0.056 +180 I 0.064 +181 L 0.082 +182 Q 0.105 +183 N 0.126 +184 R 0.150 +185 M 0.185 +186 H 0.239 +187 D 0.303 +188 C 0.361 +189 D 0.395 +190 I 0.398 +191 N 0.379 +192 D 0.349 +193 D 0.313 +194 E 0.270 +195 F 0.236 +196 L 0.220 +197 H 0.216 +198 L 0.216 +199 P 0.218 +200 A 0.224 +201 H 0.237 +202 L 0.260 +203 R 0.287 +204 V 0.309 +205 V 0.316 +206 A 0.315 +207 P 0.317 +208 H 0.333 +209 Q 0.373 +210 L 0.426 +211 H 0.455 +212 S 0.434 +213 E 0.382 +214 A 0.338 +215 N 0.316 +216 E 0.305 +217 R 0.298 +218 L 0.298 +219 F 0.296 +220 E 0.284 +221 E 0.275 +222 K 0.288 +223 Y 0.333 +224 K 0.405 +225 P 0.484 +226 I 0.535 +227 I 0.530 +228 L 0.479 +229 T 0.423 +230 D 0.383 +231 D 0.351 +232 Q 0.322 +233 V 0.300 +234 D 0.282 +235 Q 0.261 +236 A 0.239 +237 L 0.215 +238 W 0.193 +239 E 0.174 +240 E 0.158 +241 Q 0.144 +242 V 0.137 +243 L 0.140 +244 Q 0.145 +245 K 0.144 +246 E 0.142 +247 R 0.149 +248 K 0.164 +249 D 0.179 +250 R 0.191 +251 L 0.204 +252 A 0.223 +253 L 0.243 +254 S 0.263 +255 E 0.290 +256 A 0.319 +257 D 0.347 +258 S 0.377 +259 L 0.408 +260 V 0.425 +261 Q 0.422 +262 S 0.422 +263 D 0.431 +264 V 0.430 +265 S 0.406 +266 R 0.381 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000048429.11_ENSMUST00000062125.11_GN:Timm29_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:66.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000048429.11_ENSMUST00000062125.11_GN:Timm29_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:66.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c26b9fdb2cdec0e84cd91c7260544571f1d6ff98 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000048429.11_ENSMUST00000062125.11_GN:Timm29_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:66.caid @@ -0,0 +1,333 @@ +>ENSMUSG00000048429.11|ENSMUST00000062125.11|GN:Timm29|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:66 +1 M 0.386 +2 R 0.420 +3 V 0.469 +4 R 0.509 +5 A 0.526 +6 A 0.524 +7 R 0.530 +8 L 0.562 +9 P 0.604 +10 F 0.634 +11 R 0.647 +12 A 0.652 +13 H 0.651 +14 P 0.653 +15 S 0.666 +16 P 0.690 +17 H 0.719 +18 N 0.747 +19 G 0.760 +20 N 0.748 +21 I 0.707 +22 R 0.649 +23 L 0.598 +24 G 0.576 +25 P 0.581 +26 F 0.595 +27 P 0.604 +28 I 0.605 +29 V 0.597 +30 F 0.572 +31 L 0.543 +32 W 0.526 +33 E 0.511 +34 T 0.468 +35 T 0.399 +36 S 0.345 +37 C 0.336 +38 I 0.360 +39 L 0.388 +40 R 0.409 +41 L 0.431 +42 R 0.455 +43 R 0.479 +44 I 0.500 +45 Y 0.527 +46 S 0.567 +47 P 0.616 +48 A 0.660 +49 F 0.689 +50 F 0.707 +51 I 0.720 +52 P 0.729 +53 T 0.728 +54 L 0.714 +55 C 0.691 +56 V 0.667 +57 S 0.645 +58 T 0.628 +59 R 0.620 +60 L 0.618 +61 R 0.618 +62 N 0.617 +63 R 0.610 +64 R 0.593 +65 E 0.557 +66 T 0.502 +67 M 0.437 +68 V 0.375 +69 T 0.322 +70 A 0.288 +71 A 0.277 +72 L 0.278 +73 K 0.276 +74 R 0.277 +75 F 0.307 +76 W 0.391 +77 S 0.514 +78 G 0.631 +79 G 0.707 +80 H 0.749 +81 G 0.774 +82 E 0.791 +83 A 0.799 +84 G 0.798 +85 G 0.794 +86 E 0.794 +87 A 0.800 +88 G 0.806 +89 G 0.813 +90 A 0.817 +91 T 0.816 +92 T 0.807 +93 V 0.786 +94 A 0.753 +95 V 0.709 +96 K 0.648 +97 P 0.570 +98 G 0.480 +99 L 0.397 +100 W 0.337 +101 T 0.293 +102 R 0.249 +103 L 0.209 +104 S 0.191 +105 T 0.193 +106 W 0.198 +107 A 0.196 +108 G 0.196 +109 A 0.203 +110 L 0.215 +111 L 0.222 +112 R 0.223 +113 D 0.220 +114 Y 0.210 +115 A 0.204 +116 E 0.207 +117 A 0.216 +118 C 0.223 +119 G 0.228 +120 D 0.222 +121 A 0.204 +122 A 0.185 +123 A 0.175 +124 A 0.171 +125 A 0.165 +126 R 0.160 +127 A 0.157 +128 R 0.152 +129 P 0.141 +130 G 0.130 +131 R 0.125 +132 A 0.122 +133 A 0.116 +134 L 0.109 +135 Y 0.106 +136 V 0.103 +137 G 0.097 +138 L 0.092 +139 L 0.094 +140 G 0.100 +141 G 0.104 +142 A 0.104 +143 A 0.100 +144 A 0.091 +145 C 0.085 +146 C 0.084 +147 A 0.090 +148 L 0.098 +149 A 0.104 +150 P 0.103 +151 S 0.092 +152 E 0.075 +153 A 0.060 +154 A 0.053 +155 F 0.050 +156 E 0.052 +157 E 0.058 +158 A 0.062 +159 L 0.065 +160 L 0.069 +161 D 0.076 +162 A 0.084 +163 S 0.092 +164 G 0.094 +165 S 0.089 +166 L 0.081 +167 L 0.080 +168 L 0.091 +169 L 0.112 +170 A 0.135 +171 P 0.145 +172 A 0.142 +173 T 0.132 +174 R 0.120 +175 N 0.106 +176 R 0.092 +177 H 0.081 +178 S 0.072 +179 E 0.066 +180 A 0.062 +181 F 0.059 +182 L 0.055 +183 Q 0.051 +184 R 0.048 +185 L 0.046 +186 L 0.045 +187 W 0.047 +188 L 0.052 +189 R 0.059 +190 G 0.069 +191 R 0.081 +192 G 0.090 +193 R 0.093 +194 L 0.092 +195 R 0.088 +196 H 0.082 +197 V 0.075 +198 N 0.067 +199 L 0.059 +200 G 0.055 +201 F 0.055 +202 C 0.060 +203 S 0.069 +204 L 0.078 +205 V 0.083 +206 Y 0.089 +207 E 0.103 +208 A 0.124 +209 P 0.140 +210 F 0.144 +211 D 0.141 +212 A 0.140 +213 Q 0.139 +214 A 0.136 +215 S 0.128 +216 L 0.115 +217 Y 0.105 +218 Q 0.101 +219 A 0.102 +220 R 0.104 +221 C 0.112 +222 R 0.128 +223 Y 0.153 +224 L 0.173 +225 Q 0.176 +226 P 0.157 +227 R 0.127 +228 W 0.108 +229 V 0.111 +230 D 0.126 +231 F 0.134 +232 P 0.131 +233 G 0.135 +234 R 0.154 +235 I 0.170 +236 L 0.166 +237 D 0.147 +238 V 0.122 +239 G 0.098 +240 F 0.083 +241 V 0.078 +242 G 0.075 +243 R 0.067 +244 W 0.056 +245 W 0.052 +246 I 0.059 +247 L 0.076 +248 Q 0.098 +249 N 0.118 +250 R 0.139 +251 M 0.171 +252 H 0.222 +253 D 0.283 +254 C 0.337 +255 D 0.367 +256 I 0.369 +257 N 0.353 +258 D 0.332 +259 D 0.304 +260 E 0.266 +261 F 0.233 +262 L 0.218 +263 H 0.216 +264 L 0.220 +265 P 0.226 +266 A 0.233 +267 H 0.247 +268 L 0.274 +269 R 0.308 +270 V 0.335 +271 V 0.341 +272 A 0.334 +273 P 0.333 +274 H 0.350 +275 Q 0.394 +276 L 0.453 +277 H 0.486 +278 S 0.469 +279 E 0.419 +280 A 0.377 +281 N 0.360 +282 E 0.354 +283 R 0.351 +284 L 0.352 +285 F 0.346 +286 E 0.329 +287 E 0.314 +288 K 0.327 +289 Y 0.378 +290 K 0.457 +291 P 0.542 +292 I 0.595 +293 I 0.592 +294 L 0.545 +295 T 0.490 +296 D 0.443 +297 D 0.401 +298 Q 0.363 +299 V 0.338 +300 D 0.318 +301 Q 0.295 +302 A 0.269 +303 L 0.239 +304 W 0.211 +305 E 0.189 +306 E 0.173 +307 Q 0.159 +308 V 0.151 +309 L 0.154 +310 Q 0.161 +311 K 0.164 +312 E 0.167 +313 R 0.177 +314 K 0.195 +315 D 0.209 +316 R 0.220 +317 L 0.235 +318 A 0.255 +319 L 0.273 +320 S 0.292 +321 E 0.315 +322 A 0.340 +323 D 0.363 +324 S 0.388 +325 L 0.418 +326 V 0.434 +327 Q 0.431 +328 S 0.430 +329 D 0.438 +330 V 0.433 +331 S 0.406 +332 R 0.378 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000049093.10_ENSMUST00000118364.2_GN:Il23r_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000049093.10_ENSMUST00000118364.2_GN:Il23r_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..82f2360ce70f537f7a962b5d98b6c8ccb78d0092 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000049093.10_ENSMUST00000118364.2_GN:Il23r_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,645 @@ +>ENSMUSG00000049093.10|ENSMUST00000118364.2|GN:Il23r|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.259 +2 S 0.241 +3 H 0.216 +4 L 0.196 +5 T 0.182 +6 L 0.169 +7 Q 0.158 +8 L 0.150 +9 H 0.144 +10 V 0.138 +11 V 0.129 +12 I 0.122 +13 A 0.116 +14 L 0.108 +15 Y 0.100 +16 V 0.096 +17 L 0.097 +18 F 0.108 +19 R 0.137 +20 W 0.186 +21 C 0.247 +22 H 0.309 +23 G 0.366 +24 G 0.401 +25 I 0.396 +26 T 0.355 +27 S 0.298 +28 I 0.241 +29 N 0.190 +30 C 0.150 +31 S 0.123 +32 G 0.103 +33 D 0.088 +34 M 0.076 +35 W 0.066 +36 V 0.058 +37 E 0.052 +38 P 0.050 +39 G 0.049 +40 E 0.048 +41 I 0.046 +42 F 0.048 +43 Q 0.054 +44 M 0.061 +45 G 0.063 +46 M 0.057 +47 N 0.048 +48 V 0.039 +49 S 0.030 +50 I 0.023 +51 Y 0.020 +52 C 0.021 +53 Q 0.025 +54 E 0.031 +55 A 0.035 +56 L 0.038 +57 K 0.041 +58 H 0.045 +59 C 0.049 +60 R 0.054 +61 P 0.057 +62 R 0.052 +63 N 0.043 +64 L 0.035 +65 Y 0.031 +66 F 0.035 +67 Y 0.045 +68 K 0.056 +69 N 0.066 +70 G 0.076 +71 F 0.083 +72 K 0.081 +73 E 0.071 +74 E 0.061 +75 F 0.053 +76 D 0.047 +77 I 0.041 +78 T 0.037 +79 R 0.036 +80 I 0.037 +81 N 0.035 +82 R 0.031 +83 T 0.025 +84 T 0.020 +85 A 0.017 +86 R 0.017 +87 I 0.020 +88 W 0.026 +89 Y 0.034 +90 K 0.041 +91 G 0.047 +92 F 0.053 +93 S 0.056 +94 E 0.055 +95 P 0.050 +96 H 0.042 +97 A 0.035 +98 Y 0.029 +99 M 0.025 +100 H 0.024 +101 C 0.026 +102 T 0.034 +103 A 0.047 +104 E 0.069 +105 C 0.092 +106 P 0.109 +107 G 0.118 +108 H 0.123 +109 F 0.123 +110 Q 0.118 +111 E 0.106 +112 T 0.088 +113 L 0.068 +114 I 0.052 +115 C 0.046 +116 G 0.052 +117 K 0.063 +118 D 0.073 +119 I 0.080 +120 S 0.092 +121 S 0.110 +122 G 0.127 +123 H 0.135 +124 P 0.135 +125 P 0.127 +126 D 0.110 +127 A 0.089 +128 P 0.075 +129 S 0.067 +130 N 0.060 +131 L 0.047 +132 T 0.033 +133 C 0.027 +134 V 0.026 +135 I 0.027 +136 Y 0.028 +137 E 0.030 +138 Y 0.035 +139 S 0.040 +140 G 0.039 +141 N 0.033 +142 M 0.028 +143 T 0.027 +144 C 0.030 +145 T 0.035 +146 W 0.042 +147 N 0.056 +148 T 0.076 +149 G 0.096 +150 K 0.109 +151 P 0.112 +152 T 0.108 +153 Y 0.104 +154 I 0.100 +155 D 0.088 +156 T 0.067 +157 K 0.044 +158 Y 0.028 +159 I 0.023 +160 V 0.024 +161 H 0.029 +162 V 0.034 +163 K 0.041 +164 S 0.051 +165 L 0.064 +166 E 0.083 +167 T 0.106 +168 E 0.127 +169 E 0.139 +170 E 0.138 +171 Q 0.124 +172 Q 0.105 +173 Y 0.089 +174 L 0.077 +175 A 0.065 +176 S 0.051 +177 S 0.038 +178 Y 0.031 +179 V 0.032 +180 K 0.040 +181 I 0.049 +182 S 0.057 +183 T 0.064 +184 D 0.075 +185 S 0.084 +186 L 0.091 +187 Q 0.097 +188 G 0.103 +189 S 0.100 +190 R 0.084 +191 K 0.061 +192 Y 0.040 +193 L 0.029 +194 V 0.024 +195 W 0.023 +196 V 0.025 +197 Q 0.027 +198 A 0.029 +199 V 0.033 +200 N 0.043 +201 S 0.057 +202 L 0.067 +203 G 0.069 +204 M 0.064 +205 E 0.058 +206 N 0.054 +207 S 0.054 +208 Q 0.055 +209 Q 0.054 +210 L 0.053 +211 H 0.053 +212 V 0.052 +213 H 0.051 +214 L 0.052 +215 D 0.053 +216 D 0.053 +217 I 0.054 +218 V 0.065 +219 I 0.086 +220 P 0.108 +221 S 0.118 +222 A 0.110 +223 S 0.090 +224 I 0.069 +225 I 0.056 +226 S 0.055 +227 R 0.065 +228 A 0.082 +229 E 0.103 +230 T 0.120 +231 T 0.134 +232 N 0.145 +233 D 0.148 +234 T 0.138 +235 V 0.114 +236 P 0.082 +237 K 0.055 +238 T 0.037 +239 I 0.027 +240 V 0.020 +241 Y 0.018 +242 W 0.021 +243 K 0.029 +244 S 0.039 +245 K 0.046 +246 T 0.050 +247 M 0.054 +248 I 0.057 +249 E 0.054 +250 K 0.048 +251 V 0.040 +252 F 0.032 +253 C 0.026 +254 E 0.023 +255 M 0.022 +256 R 0.022 +257 Y 0.024 +258 K 0.028 +259 T 0.035 +260 T 0.044 +261 T 0.054 +262 N 0.059 +263 Q 0.058 +264 T 0.052 +265 W 0.045 +266 S 0.040 +267 V 0.040 +268 K 0.042 +269 E 0.045 +270 F 0.048 +271 D 0.050 +272 A 0.051 +273 N 0.049 +274 F 0.042 +275 T 0.032 +276 Y 0.026 +277 V 0.023 +278 Q 0.025 +279 Q 0.030 +280 S 0.036 +281 E 0.041 +282 F 0.046 +283 Y 0.055 +284 L 0.069 +285 E 0.085 +286 P 0.095 +287 D 0.094 +288 S 0.083 +289 K 0.064 +290 Y 0.046 +291 V 0.033 +292 F 0.028 +293 Q 0.026 +294 V 0.026 +295 R 0.027 +296 C 0.032 +297 Q 0.043 +298 E 0.060 +299 T 0.078 +300 G 0.087 +301 K 0.086 +302 R 0.082 +303 N 0.078 +304 W 0.075 +305 Q 0.074 +306 P 0.071 +307 W 0.064 +308 S 0.059 +309 S 0.058 +310 P 0.061 +311 F 0.066 +312 V 0.076 +313 H 0.097 +314 Q 0.136 +315 T 0.201 +316 S 0.300 +317 Q 0.422 +318 E 0.536 +319 T 0.613 +320 G 0.642 +321 K 0.635 +322 R 0.606 +323 N 0.562 +324 W 0.515 +325 Q 0.479 +326 P 0.448 +327 W 0.415 +328 S 0.400 +329 S 0.418 +330 P 0.456 +331 F 0.502 +332 V 0.551 +333 H 0.599 +334 Q 0.636 +335 T 0.657 +336 S 0.665 +337 Q 0.672 +338 T 0.671 +339 V 0.643 +340 S 0.594 +341 Q 0.574 +342 V 0.616 +343 T 0.680 +344 A 0.709 +345 K 0.687 +346 S 0.627 +347 S 0.561 +348 H 0.522 +349 E 0.506 +350 P 0.471 +351 Q 0.425 +352 K 0.438 +353 M 0.530 +354 E 0.636 +355 M 0.700 +356 L 0.723 +357 S 0.731 +358 A 0.731 +359 T 0.726 +360 I 0.722 +361 F 0.725 +362 R 0.736 +363 G 0.745 +364 H 0.753 +365 P 0.763 +366 A 0.772 +367 S 0.777 +368 G 0.777 +369 N 0.772 +370 H 0.766 +371 Q 0.761 +372 D 0.753 +373 I 0.741 +374 G 0.722 +375 L 0.701 +376 L 0.677 +377 S 0.637 +378 G 0.583 +379 M 0.547 +380 V 0.542 +381 F 0.536 +382 L 0.499 +383 A 0.434 +384 I 0.356 +385 M 0.290 +386 L 0.254 +387 P 0.238 +388 I 0.223 +389 F 0.212 +390 S 0.214 +391 L 0.224 +392 I 0.231 +393 G 0.230 +394 I 0.219 +395 F 0.208 +396 N 0.203 +397 R 0.207 +398 S 0.216 +399 L 0.220 +400 R 0.220 +401 I 0.232 +402 G 0.259 +403 I 0.280 +404 K 0.276 +405 R 0.259 +406 K 0.248 +407 V 0.249 +408 L 0.258 +409 L 0.270 +410 M 0.280 +411 I 0.280 +412 P 0.270 +413 K 0.268 +414 W 0.286 +415 L 0.321 +416 Y 0.368 +417 E 0.435 +418 D 0.519 +419 I 0.595 +420 P 0.647 +421 N 0.678 +422 M 0.695 +423 E 0.697 +424 N 0.686 +425 S 0.669 +426 N 0.638 +427 V 0.579 +428 A 0.509 +429 K 0.468 +430 L 0.466 +431 L 0.477 +432 Q 0.503 +433 E 0.566 +434 K 0.645 +435 S 0.697 +436 V 0.720 +437 F 0.734 +438 E 0.753 +439 N 0.773 +440 D 0.784 +441 N 0.785 +442 A 0.782 +443 S 0.779 +444 E 0.779 +445 Q 0.776 +446 A 0.765 +447 L 0.744 +448 Y 0.725 +449 V 0.722 +450 D 0.733 +451 P 0.746 +452 V 0.753 +453 L 0.759 +454 T 0.768 +455 E 0.774 +456 I 0.774 +457 S 0.767 +458 E 0.755 +459 I 0.745 +460 S 0.743 +461 P 0.749 +462 L 0.754 +463 E 0.755 +464 H 0.753 +465 K 0.752 +466 P 0.758 +467 T 0.769 +468 D 0.777 +469 Y 0.779 +470 K 0.780 +471 E 0.784 +472 E 0.791 +473 R 0.800 +474 L 0.811 +475 T 0.825 +476 G 0.834 +477 L 0.832 +478 L 0.822 +479 E 0.809 +480 T 0.796 +481 R 0.784 +482 D 0.777 +483 C 0.779 +484 P 0.795 +485 L 0.819 +486 G 0.840 +487 M 0.847 +488 L 0.841 +489 S 0.830 +490 T 0.820 +491 S 0.811 +492 S 0.805 +493 S 0.802 +494 V 0.797 +495 V 0.785 +496 Y 0.767 +497 I 0.759 +498 P 0.766 +499 D 0.777 +500 L 0.784 +501 N 0.787 +502 T 0.786 +503 G 0.780 +504 Y 0.779 +505 K 0.790 +506 P 0.810 +507 Q 0.824 +508 V 0.824 +509 S 0.808 +510 N 0.785 +511 V 0.769 +512 P 0.775 +513 P 0.800 +514 G 0.828 +515 G 0.843 +516 N 0.839 +517 L 0.825 +518 F 0.815 +519 I 0.810 +520 N 0.802 +521 R 0.787 +522 D 0.766 +523 E 0.742 +524 R 0.723 +525 D 0.721 +526 P 0.733 +527 T 0.749 +528 S 0.760 +529 L 0.762 +530 E 0.753 +531 T 0.737 +532 T 0.717 +533 D 0.680 +534 D 0.613 +535 H 0.528 +536 F 0.460 +537 A 0.429 +538 R 0.422 +539 L 0.425 +540 K 0.431 +541 T 0.436 +542 Y 0.446 +543 P 0.457 +544 N 0.463 +545 F 0.470 +546 Q 0.489 +547 F 0.512 +548 S 0.526 +549 A 0.525 +550 S 0.504 +551 S 0.468 +552 M 0.443 +553 A 0.448 +554 L 0.467 +555 L 0.470 +556 N 0.447 +557 K 0.406 +558 T 0.371 +559 L 0.368 +560 I 0.393 +561 L 0.421 +562 D 0.427 +563 E 0.404 +564 L 0.368 +565 C 0.350 +566 L 0.358 +567 V 0.384 +568 L 0.422 +569 N 0.473 +570 Q 0.535 +571 G 0.597 +572 E 0.642 +573 F 0.666 +574 N 0.684 +575 S 0.702 +576 L 0.713 +577 D 0.720 +578 I 0.730 +579 K 0.742 +580 N 0.747 +581 S 0.745 +582 R 0.742 +583 Q 0.746 +584 E 0.755 +585 E 0.761 +586 T 0.759 +587 S 0.753 +588 I 0.746 +589 V 0.741 +590 L 0.738 +591 Q 0.733 +592 S 0.724 +593 D 0.710 +594 S 0.696 +595 P 0.686 +596 S 0.679 +597 E 0.674 +598 T 0.670 +599 I 0.669 +600 P 0.666 +601 A 0.658 +602 Q 0.642 +603 T 0.612 +604 L 0.572 +605 L 0.535 +606 S 0.506 +607 D 0.467 +608 E 0.406 +609 F 0.345 +610 V 0.312 +611 S 0.308 +612 C 0.327 +613 L 0.355 +614 A 0.373 +615 I 0.376 +616 G 0.373 +617 N 0.362 +618 E 0.341 +619 D 0.323 +620 L 0.316 +621 P 0.307 +622 S 0.278 +623 I 0.238 +624 N 0.204 +625 S 0.185 +626 Y 0.178 +627 F 0.181 +628 P 0.193 +629 Q 0.211 +630 N 0.217 +631 V 0.194 +632 L 0.157 +633 E 0.128 +634 S 0.114 +635 H 0.104 +636 F 0.096 +637 S 0.095 +638 R 0.098 +639 I 0.099 +640 S 0.097 +641 L 0.095 +642 F 0.094 +643 Q 0.095 +644 K 0.097 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000049093.10_ENSMUST00000118364.2_GN:Il23r_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000049093.10_ENSMUST00000118364.2_GN:Il23r_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..28ace642479aeaec215a5e58e5a36b40f721dc90 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000049093.10_ENSMUST00000118364.2_GN:Il23r_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid @@ -0,0 +1,654 @@ +>ENSMUSG00000049093.10|ENSMUST00000118364.2|GN:Il23r|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:9 +1 M 0.329 +2 R 0.335 +3 G 0.336 +4 F 0.320 +5 Y 0.297 +6 Y 0.290 +7 I 0.309 +8 W 0.334 +9 D 0.342 +10 M 0.327 +11 S 0.297 +12 H 0.263 +13 L 0.236 +14 T 0.222 +15 L 0.215 +16 Q 0.204 +17 L 0.185 +18 H 0.164 +19 V 0.148 +20 V 0.140 +21 I 0.137 +22 A 0.133 +23 L 0.125 +24 Y 0.111 +25 V 0.096 +26 L 0.088 +27 F 0.094 +28 R 0.122 +29 W 0.170 +30 C 0.230 +31 H 0.293 +32 G 0.351 +33 G 0.388 +34 I 0.387 +35 T 0.348 +36 S 0.293 +37 I 0.237 +38 N 0.189 +39 C 0.151 +40 S 0.124 +41 G 0.105 +42 D 0.089 +43 M 0.076 +44 W 0.066 +45 V 0.058 +46 E 0.053 +47 P 0.050 +48 G 0.049 +49 E 0.046 +50 I 0.045 +51 F 0.048 +52 Q 0.054 +53 M 0.061 +54 G 0.063 +55 M 0.058 +56 N 0.048 +57 V 0.038 +58 S 0.030 +59 I 0.023 +60 Y 0.020 +61 C 0.020 +62 Q 0.025 +63 E 0.030 +64 A 0.034 +65 L 0.037 +66 K 0.040 +67 H 0.043 +68 C 0.047 +69 R 0.052 +70 P 0.055 +71 R 0.051 +72 N 0.042 +73 L 0.034 +74 Y 0.030 +75 F 0.033 +76 Y 0.043 +77 K 0.054 +78 N 0.064 +79 G 0.073 +80 F 0.080 +81 K 0.079 +82 E 0.070 +83 E 0.060 +84 F 0.053 +85 D 0.047 +86 I 0.040 +87 T 0.036 +88 R 0.036 +89 I 0.036 +90 N 0.035 +91 R 0.030 +92 T 0.025 +93 T 0.020 +94 A 0.017 +95 R 0.017 +96 I 0.019 +97 W 0.025 +98 Y 0.032 +99 K 0.039 +100 G 0.045 +101 F 0.051 +102 S 0.055 +103 E 0.055 +104 P 0.050 +105 H 0.042 +106 A 0.035 +107 Y 0.030 +108 M 0.026 +109 H 0.024 +110 C 0.027 +111 T 0.034 +112 A 0.048 +113 E 0.070 +114 C 0.093 +115 P 0.110 +116 G 0.120 +117 H 0.124 +118 F 0.125 +119 Q 0.120 +120 E 0.108 +121 T 0.090 +122 L 0.069 +123 I 0.053 +124 C 0.046 +125 G 0.052 +126 K 0.063 +127 D 0.073 +128 I 0.080 +129 S 0.091 +130 S 0.109 +131 G 0.126 +132 H 0.134 +133 P 0.135 +134 P 0.127 +135 D 0.110 +136 A 0.090 +137 P 0.075 +138 S 0.068 +139 N 0.060 +140 L 0.047 +141 T 0.033 +142 C 0.027 +143 V 0.027 +144 I 0.028 +145 Y 0.028 +146 E 0.030 +147 Y 0.035 +148 S 0.040 +149 G 0.039 +150 N 0.033 +151 M 0.028 +152 T 0.027 +153 C 0.030 +154 T 0.035 +155 W 0.043 +156 N 0.056 +157 T 0.076 +158 G 0.096 +159 K 0.109 +160 P 0.112 +161 T 0.108 +162 Y 0.104 +163 I 0.100 +164 D 0.088 +165 T 0.067 +166 K 0.044 +167 Y 0.028 +168 I 0.023 +169 V 0.024 +170 H 0.028 +171 V 0.034 +172 K 0.041 +173 S 0.051 +174 L 0.064 +175 E 0.082 +176 T 0.105 +177 E 0.127 +178 E 0.140 +179 E 0.139 +180 Q 0.125 +181 Q 0.105 +182 Y 0.088 +183 L 0.076 +184 A 0.064 +185 S 0.050 +186 S 0.038 +187 Y 0.031 +188 V 0.032 +189 K 0.040 +190 I 0.049 +191 S 0.056 +192 T 0.064 +193 D 0.074 +194 S 0.083 +195 L 0.090 +196 Q 0.096 +197 G 0.101 +198 S 0.099 +199 R 0.083 +200 K 0.060 +201 Y 0.040 +202 L 0.028 +203 V 0.024 +204 W 0.023 +205 V 0.025 +206 Q 0.027 +207 A 0.029 +208 V 0.033 +209 N 0.043 +210 S 0.057 +211 L 0.067 +212 G 0.069 +213 M 0.064 +214 E 0.058 +215 N 0.054 +216 S 0.054 +217 Q 0.054 +218 Q 0.053 +219 L 0.052 +220 H 0.052 +221 V 0.051 +222 H 0.050 +223 L 0.052 +224 D 0.053 +225 D 0.052 +226 I 0.054 +227 V 0.065 +228 I 0.086 +229 P 0.109 +230 S 0.119 +231 A 0.111 +232 S 0.091 +233 I 0.069 +234 I 0.057 +235 S 0.056 +236 R 0.065 +237 A 0.083 +238 E 0.103 +239 T 0.120 +240 T 0.134 +241 N 0.144 +242 D 0.148 +243 T 0.138 +244 V 0.114 +245 P 0.082 +246 K 0.055 +247 T 0.037 +248 I 0.027 +249 V 0.020 +250 Y 0.018 +251 W 0.021 +252 K 0.029 +253 S 0.039 +254 K 0.046 +255 T 0.050 +256 M 0.054 +257 I 0.057 +258 E 0.055 +259 K 0.048 +260 V 0.040 +261 F 0.032 +262 C 0.027 +263 E 0.024 +264 M 0.022 +265 R 0.022 +266 Y 0.024 +267 K 0.028 +268 T 0.035 +269 T 0.045 +270 T 0.054 +271 N 0.059 +272 Q 0.058 +273 T 0.052 +274 W 0.045 +275 S 0.040 +276 V 0.040 +277 K 0.043 +278 E 0.046 +279 F 0.048 +280 D 0.050 +281 A 0.051 +282 N 0.049 +283 F 0.042 +284 T 0.033 +285 Y 0.026 +286 V 0.024 +287 Q 0.026 +288 Q 0.030 +289 S 0.036 +290 E 0.041 +291 F 0.047 +292 Y 0.056 +293 L 0.070 +294 E 0.086 +295 P 0.096 +296 D 0.096 +297 S 0.084 +298 K 0.065 +299 Y 0.046 +300 V 0.034 +301 F 0.028 +302 Q 0.027 +303 V 0.026 +304 R 0.027 +305 C 0.032 +306 Q 0.044 +307 E 0.061 +308 T 0.079 +309 G 0.088 +310 K 0.087 +311 R 0.083 +312 N 0.080 +313 W 0.077 +314 Q 0.075 +315 P 0.072 +316 W 0.066 +317 S 0.060 +318 S 0.060 +319 P 0.062 +320 F 0.067 +321 V 0.078 +322 H 0.099 +323 Q 0.138 +324 T 0.204 +325 S 0.303 +326 Q 0.424 +327 E 0.539 +328 T 0.616 +329 G 0.645 +330 K 0.639 +331 R 0.611 +332 N 0.566 +333 W 0.519 +334 Q 0.482 +335 P 0.451 +336 W 0.419 +337 S 0.405 +338 S 0.423 +339 P 0.460 +340 F 0.504 +341 V 0.553 +342 H 0.601 +343 Q 0.637 +344 T 0.658 +345 S 0.668 +346 Q 0.675 +347 T 0.674 +348 V 0.645 +349 S 0.595 +350 Q 0.576 +351 V 0.617 +352 T 0.682 +353 A 0.712 +354 K 0.691 +355 S 0.631 +356 S 0.564 +357 H 0.525 +358 E 0.508 +359 P 0.473 +360 Q 0.427 +361 K 0.442 +362 M 0.535 +363 E 0.641 +364 M 0.705 +365 L 0.729 +366 S 0.736 +367 A 0.736 +368 T 0.731 +369 I 0.727 +370 F 0.730 +371 R 0.740 +372 G 0.749 +373 H 0.756 +374 P 0.765 +375 A 0.775 +376 S 0.779 +377 G 0.778 +378 N 0.773 +379 H 0.767 +380 Q 0.761 +381 D 0.753 +382 I 0.740 +383 G 0.719 +384 L 0.697 +385 L 0.673 +386 S 0.633 +387 G 0.580 +388 M 0.545 +389 V 0.542 +390 F 0.537 +391 L 0.500 +392 A 0.434 +393 I 0.355 +394 M 0.289 +395 L 0.253 +396 P 0.237 +397 I 0.222 +398 F 0.212 +399 S 0.213 +400 L 0.223 +401 I 0.230 +402 G 0.228 +403 I 0.217 +404 F 0.206 +405 N 0.202 +406 R 0.206 +407 S 0.215 +408 L 0.219 +409 R 0.218 +410 I 0.230 +411 G 0.257 +412 I 0.278 +413 K 0.275 +414 R 0.258 +415 K 0.248 +416 V 0.250 +417 L 0.259 +418 L 0.271 +419 M 0.282 +420 I 0.281 +421 P 0.272 +422 K 0.270 +423 W 0.289 +424 L 0.324 +425 Y 0.371 +426 E 0.437 +427 D 0.521 +428 I 0.596 +429 P 0.647 +430 N 0.679 +431 M 0.695 +432 E 0.697 +433 N 0.687 +434 S 0.669 +435 N 0.638 +436 V 0.580 +437 A 0.510 +438 K 0.469 +439 L 0.468 +440 L 0.479 +441 Q 0.506 +442 E 0.569 +443 K 0.647 +444 S 0.699 +445 V 0.721 +446 F 0.735 +447 E 0.754 +448 N 0.773 +449 D 0.783 +450 N 0.785 +451 A 0.781 +452 S 0.779 +453 E 0.778 +454 Q 0.776 +455 A 0.765 +456 L 0.744 +457 Y 0.725 +458 V 0.722 +459 D 0.733 +460 P 0.746 +461 V 0.754 +462 L 0.761 +463 T 0.769 +464 E 0.776 +465 I 0.776 +466 S 0.769 +467 E 0.758 +468 I 0.748 +469 S 0.747 +470 P 0.752 +471 L 0.757 +472 E 0.758 +473 H 0.756 +474 K 0.755 +475 P 0.761 +476 T 0.772 +477 D 0.780 +478 Y 0.783 +479 K 0.784 +480 E 0.788 +481 E 0.795 +482 R 0.804 +483 L 0.815 +484 T 0.829 +485 G 0.838 +486 L 0.836 +487 L 0.827 +488 E 0.814 +489 T 0.801 +490 R 0.790 +491 D 0.783 +492 C 0.785 +493 P 0.800 +494 L 0.823 +495 G 0.844 +496 M 0.851 +497 L 0.845 +498 S 0.834 +499 T 0.823 +500 S 0.815 +501 S 0.808 +502 S 0.805 +503 V 0.801 +504 V 0.789 +505 Y 0.772 +506 I 0.764 +507 P 0.771 +508 D 0.782 +509 L 0.788 +510 N 0.791 +511 T 0.790 +512 G 0.785 +513 Y 0.783 +514 K 0.794 +515 P 0.813 +516 Q 0.826 +517 V 0.826 +518 S 0.811 +519 N 0.788 +520 V 0.773 +521 P 0.778 +522 P 0.803 +523 G 0.831 +524 G 0.845 +525 N 0.841 +526 L 0.828 +527 F 0.818 +528 I 0.813 +529 N 0.806 +530 R 0.792 +531 D 0.771 +532 E 0.747 +533 R 0.729 +534 D 0.727 +535 P 0.738 +536 T 0.753 +537 S 0.765 +538 L 0.767 +539 E 0.759 +540 T 0.744 +541 T 0.725 +542 D 0.690 +543 D 0.626 +544 H 0.545 +545 F 0.481 +546 A 0.453 +547 R 0.450 +548 L 0.454 +549 K 0.457 +550 T 0.462 +551 Y 0.472 +552 P 0.483 +553 N 0.488 +554 F 0.494 +555 Q 0.511 +556 F 0.533 +557 S 0.545 +558 A 0.543 +559 S 0.523 +560 S 0.488 +561 M 0.462 +562 A 0.465 +563 L 0.481 +564 L 0.482 +565 N 0.458 +566 K 0.416 +567 T 0.384 +568 L 0.384 +569 I 0.412 +570 L 0.441 +571 D 0.447 +572 E 0.422 +573 L 0.386 +574 C 0.366 +575 L 0.373 +576 V 0.399 +577 L 0.436 +578 N 0.486 +579 Q 0.547 +580 G 0.607 +581 E 0.650 +582 F 0.672 +583 N 0.689 +584 S 0.705 +585 L 0.716 +586 D 0.723 +587 I 0.733 +588 K 0.744 +589 N 0.749 +590 S 0.747 +591 R 0.745 +592 Q 0.748 +593 E 0.757 +594 E 0.762 +595 T 0.761 +596 S 0.754 +597 I 0.747 +598 V 0.743 +599 L 0.741 +600 Q 0.737 +601 S 0.728 +602 D 0.714 +603 S 0.701 +604 P 0.692 +605 S 0.686 +606 E 0.680 +607 T 0.676 +608 I 0.675 +609 P 0.672 +610 A 0.666 +611 Q 0.651 +612 T 0.623 +613 L 0.584 +614 L 0.547 +615 S 0.515 +616 D 0.474 +617 E 0.414 +618 F 0.355 +619 V 0.323 +620 S 0.321 +621 C 0.340 +622 L 0.367 +623 A 0.384 +624 I 0.386 +625 G 0.381 +626 N 0.369 +627 E 0.350 +628 D 0.333 +629 L 0.329 +630 P 0.322 +631 S 0.293 +632 I 0.250 +633 N 0.213 +634 S 0.192 +635 Y 0.184 +636 F 0.187 +637 P 0.201 +638 Q 0.220 +639 N 0.226 +640 V 0.202 +641 L 0.163 +642 E 0.133 +643 S 0.117 +644 H 0.107 +645 F 0.098 +646 S 0.095 +647 R 0.097 +648 I 0.097 +649 S 0.096 +650 L 0.095 +651 F 0.096 +652 Q 0.098 +653 K 0.101 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000049241.7_ENSMUST00000164267.3_GN:Hcar1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000049241.7_ENSMUST00000164267.3_GN:Hcar1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..231a1488b70a7384e6da7a88a202a4e1400367d1 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000049241.7_ENSMUST00000164267.3_GN:Hcar1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,344 @@ +>ENSMUSG00000049241.7|ENSMUST00000164267.3|GN:Hcar1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.401 +2 D 0.401 +3 N 0.395 +4 G 0.371 +5 S 0.323 +6 C 0.270 +7 C 0.245 +8 L 0.261 +9 I 0.301 +10 E 0.331 +11 G 0.330 +12 E 0.297 +13 P 0.248 +14 I 0.198 +15 S 0.154 +16 Q 0.120 +17 V 0.096 +18 M 0.081 +19 P 0.067 +20 P 0.052 +21 L 0.042 +22 L 0.040 +23 I 0.040 +24 L 0.039 +25 V 0.037 +26 F 0.036 +27 V 0.036 +28 L 0.039 +29 G 0.042 +30 A 0.045 +31 L 0.047 +32 G 0.049 +33 N 0.052 +34 G 0.052 +35 I 0.049 +36 A 0.042 +37 L 0.034 +38 C 0.030 +39 G 0.028 +40 F 0.027 +41 C 0.030 +42 F 0.039 +43 H 0.050 +44 M 0.061 +45 K 0.067 +46 T 0.069 +47 W 0.067 +48 K 0.063 +49 S 0.056 +50 S 0.044 +51 T 0.034 +52 I 0.027 +53 Y 0.024 +54 L 0.024 +55 F 0.026 +56 N 0.028 +57 L 0.030 +58 A 0.031 +59 V 0.035 +60 A 0.044 +61 D 0.056 +62 F 0.060 +63 L 0.055 +64 L 0.046 +65 M 0.042 +66 I 0.042 +67 C 0.043 +68 L 0.045 +69 P 0.046 +70 L 0.048 +71 R 0.051 +72 T 0.054 +73 D 0.055 +74 Y 0.053 +75 Y 0.050 +76 L 0.048 +77 R 0.050 +78 R 0.054 +79 R 0.059 +80 H 0.061 +81 W 0.059 +82 I 0.058 +83 F 0.059 +84 G 0.058 +85 D 0.052 +86 I 0.045 +87 A 0.037 +88 C 0.032 +89 R 0.028 +90 L 0.026 +91 V 0.028 +92 L 0.033 +93 F 0.036 +94 K 0.036 +95 L 0.033 +96 A 0.032 +97 M 0.033 +98 N 0.036 +99 R 0.039 +100 A 0.042 +101 G 0.042 +102 S 0.039 +103 I 0.034 +104 V 0.029 +105 F 0.027 +106 L 0.026 +107 T 0.026 +108 V 0.026 +109 V 0.029 +110 A 0.036 +111 V 0.044 +112 D 0.047 +113 R 0.045 +114 Y 0.041 +115 F 0.040 +116 K 0.047 +117 V 0.063 +118 V 0.085 +119 H 0.107 +120 P 0.123 +121 H 0.134 +122 H 0.146 +123 M 0.160 +124 V 0.171 +125 N 0.170 +126 A 0.156 +127 I 0.130 +128 S 0.095 +129 N 0.063 +130 R 0.043 +131 T 0.038 +132 A 0.045 +133 A 0.057 +134 A 0.064 +135 T 0.058 +136 A 0.047 +137 C 0.039 +138 V 0.037 +139 L 0.039 +140 W 0.039 +141 T 0.038 +142 L 0.038 +143 V 0.041 +144 I 0.043 +145 L 0.044 +146 G 0.045 +147 T 0.045 +148 V 0.044 +149 Y 0.045 +150 L 0.051 +151 L 0.056 +152 M 0.062 +153 E 0.070 +154 S 0.078 +155 H 0.087 +156 L 0.102 +157 C 0.119 +158 V 0.132 +159 Q 0.141 +160 G 0.149 +161 T 0.154 +162 L 0.152 +163 S 0.138 +164 S 0.117 +165 C 0.102 +166 E 0.101 +167 S 0.115 +168 F 0.135 +169 I 0.154 +170 M 0.171 +171 E 0.192 +172 S 0.209 +173 A 0.206 +174 N 0.181 +175 G 0.144 +176 W 0.109 +177 H 0.082 +178 D 0.065 +179 V 0.053 +180 M 0.044 +181 F 0.037 +182 Q 0.031 +183 L 0.028 +184 E 0.028 +185 F 0.030 +186 F 0.035 +187 L 0.040 +188 P 0.043 +189 L 0.042 +190 T 0.042 +191 I 0.043 +192 I 0.041 +193 L 0.036 +194 F 0.031 +195 C 0.031 +196 S 0.033 +197 V 0.037 +198 N 0.042 +199 V 0.047 +200 V 0.053 +201 W 0.057 +202 S 0.056 +203 L 0.052 +204 R 0.054 +205 R 0.065 +206 R 0.082 +207 Q 0.100 +208 Q 0.115 +209 L 0.127 +210 T 0.139 +211 R 0.144 +212 Q 0.139 +213 A 0.126 +214 R 0.111 +215 M 0.098 +216 R 0.083 +217 R 0.069 +218 A 0.058 +219 T 0.054 +220 R 0.054 +221 F 0.054 +222 I 0.050 +223 M 0.043 +224 V 0.039 +225 V 0.039 +226 A 0.040 +227 S 0.041 +228 V 0.038 +229 F 0.032 +230 I 0.026 +231 T 0.023 +232 C 0.023 +233 Y 0.026 +234 L 0.029 +235 P 0.029 +236 S 0.026 +237 V 0.023 +238 L 0.021 +239 A 0.021 +240 R 0.022 +241 L 0.023 +242 Y 0.024 +243 F 0.027 +244 L 0.035 +245 W 0.052 +246 T 0.074 +247 V 0.095 +248 P 0.110 +249 T 0.119 +250 S 0.123 +251 A 0.122 +252 C 0.118 +253 D 0.112 +254 P 0.101 +255 S 0.088 +256 V 0.073 +257 H 0.059 +258 T 0.049 +259 A 0.044 +260 L 0.043 +261 H 0.044 +262 V 0.048 +263 T 0.051 +264 L 0.051 +265 S 0.049 +266 F 0.048 +267 T 0.050 +268 Y 0.056 +269 L 0.065 +270 N 0.070 +271 S 0.069 +272 M 0.063 +273 L 0.057 +274 D 0.053 +275 P 0.048 +276 L 0.041 +277 V 0.036 +278 Y 0.036 +279 Y 0.042 +280 F 0.058 +281 S 0.087 +282 S 0.125 +283 P 0.163 +284 S 0.187 +285 L 0.193 +286 P 0.189 +287 K 0.191 +288 F 0.206 +289 Y 0.224 +290 T 0.239 +291 K 0.250 +292 L 0.261 +293 T 0.275 +294 I 0.301 +295 C 0.348 +296 S 0.406 +297 L 0.456 +298 K 0.495 +299 P 0.533 +300 K 0.572 +301 R 0.609 +302 P 0.642 +303 G 0.658 +304 R 0.645 +305 T 0.610 +306 K 0.582 +307 T 0.571 +308 R 0.555 +309 R 0.542 +310 S 0.561 +311 E 0.595 +312 E 0.608 +313 M 0.601 +314 P 0.598 +315 I 0.602 +316 S 0.598 +317 N 0.572 +318 L 0.512 +319 C 0.431 +320 S 0.381 +321 K 0.406 +322 S 0.477 +323 S 0.527 +324 I 0.556 +325 D 0.605 +326 G 0.667 +327 A 0.704 +328 N 0.706 +329 R 0.691 +330 S 0.669 +331 Q 0.647 +332 R 0.639 +333 P 0.651 +334 S 0.673 +335 D 0.689 +336 G 0.685 +337 Q 0.660 +338 W 0.613 +339 D 0.552 +340 L 0.483 +341 Q 0.411 +342 V 0.345 +343 C 0.301 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000049241.7_ENSMUST00000164267.3_GN:Hcar1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000049241.7_ENSMUST00000164267.3_GN:Hcar1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..6c9e2741da2bbe4047dcb4ef75eff7bd02805c3b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000049241.7_ENSMUST00000164267.3_GN:Hcar1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid @@ -0,0 +1,352 @@ +>ENSMUSG00000049241.7|ENSMUST00000164267.3|GN:Hcar1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:8 +1 M 0.366 +2 P 0.382 +3 V 0.407 +4 L 0.438 +5 S 0.477 +6 P 0.517 +7 T 0.545 +8 A 0.550 +9 M 0.529 +10 D 0.495 +11 N 0.456 +12 G 0.406 +13 S 0.340 +14 C 0.277 +15 C 0.246 +16 L 0.256 +17 I 0.284 +18 E 0.305 +19 G 0.302 +20 E 0.274 +21 P 0.234 +22 I 0.192 +23 S 0.151 +24 Q 0.118 +25 V 0.095 +26 M 0.081 +27 P 0.067 +28 P 0.052 +29 L 0.043 +30 L 0.041 +31 I 0.041 +32 L 0.040 +33 V 0.038 +34 F 0.036 +35 V 0.036 +36 L 0.038 +37 G 0.042 +38 A 0.045 +39 L 0.047 +40 G 0.049 +41 N 0.051 +42 G 0.052 +43 I 0.049 +44 A 0.042 +45 L 0.034 +46 C 0.030 +47 G 0.028 +48 F 0.027 +49 C 0.031 +50 F 0.039 +51 H 0.050 +52 M 0.059 +53 K 0.065 +54 T 0.066 +55 W 0.064 +56 K 0.061 +57 S 0.055 +58 S 0.044 +59 T 0.033 +60 I 0.026 +61 Y 0.024 +62 L 0.024 +63 F 0.026 +64 N 0.029 +65 L 0.030 +66 A 0.032 +67 V 0.036 +68 A 0.045 +69 D 0.056 +70 F 0.060 +71 L 0.054 +72 L 0.045 +73 M 0.041 +74 I 0.041 +75 C 0.041 +76 L 0.043 +77 P 0.045 +78 L 0.046 +79 R 0.049 +80 T 0.052 +81 D 0.053 +82 Y 0.050 +83 Y 0.048 +84 L 0.047 +85 R 0.048 +86 R 0.052 +87 R 0.056 +88 H 0.058 +89 W 0.057 +90 I 0.056 +91 F 0.057 +92 G 0.056 +93 D 0.051 +94 I 0.043 +95 A 0.036 +96 C 0.030 +97 R 0.026 +98 L 0.025 +99 V 0.027 +100 L 0.032 +101 F 0.036 +102 K 0.035 +103 L 0.033 +104 A 0.031 +105 M 0.033 +106 N 0.036 +107 R 0.039 +108 A 0.042 +109 G 0.042 +110 S 0.039 +111 I 0.034 +112 V 0.029 +113 F 0.026 +114 L 0.026 +115 T 0.026 +116 V 0.026 +117 V 0.029 +118 A 0.036 +119 V 0.044 +120 D 0.047 +121 R 0.045 +122 Y 0.041 +123 F 0.040 +124 K 0.047 +125 V 0.063 +126 V 0.085 +127 H 0.107 +128 P 0.122 +129 H 0.133 +130 H 0.145 +131 M 0.160 +132 V 0.171 +133 N 0.171 +134 A 0.158 +135 I 0.131 +136 S 0.096 +137 N 0.063 +138 R 0.043 +139 T 0.038 +140 A 0.045 +141 A 0.057 +142 A 0.064 +143 T 0.059 +144 A 0.047 +145 C 0.039 +146 V 0.037 +147 L 0.039 +148 W 0.039 +149 T 0.038 +150 L 0.038 +151 V 0.041 +152 I 0.043 +153 L 0.044 +154 G 0.045 +155 T 0.045 +156 V 0.043 +157 Y 0.045 +158 L 0.050 +159 L 0.056 +160 M 0.062 +161 E 0.069 +162 S 0.077 +163 H 0.086 +164 L 0.100 +165 C 0.116 +166 V 0.129 +167 Q 0.137 +168 G 0.145 +169 T 0.150 +170 L 0.148 +171 S 0.135 +172 S 0.115 +173 C 0.100 +174 E 0.101 +175 S 0.115 +176 F 0.135 +177 I 0.153 +178 M 0.170 +179 E 0.191 +180 S 0.207 +181 A 0.204 +182 N 0.178 +183 G 0.142 +184 W 0.107 +185 H 0.081 +186 D 0.064 +187 V 0.053 +188 M 0.044 +189 F 0.037 +190 Q 0.032 +191 L 0.028 +192 E 0.028 +193 F 0.030 +194 F 0.035 +195 L 0.040 +196 P 0.043 +197 L 0.042 +198 T 0.042 +199 I 0.043 +200 I 0.041 +201 L 0.036 +202 F 0.031 +203 C 0.031 +204 S 0.033 +205 V 0.037 +206 N 0.042 +207 V 0.047 +208 V 0.052 +209 W 0.056 +210 S 0.055 +211 L 0.051 +212 R 0.053 +213 R 0.063 +214 R 0.079 +215 Q 0.096 +216 Q 0.111 +217 L 0.123 +218 T 0.134 +219 R 0.140 +220 Q 0.135 +221 A 0.122 +222 R 0.108 +223 M 0.095 +224 R 0.081 +225 R 0.067 +226 A 0.057 +227 T 0.053 +228 R 0.054 +229 F 0.053 +230 I 0.050 +231 M 0.044 +232 V 0.040 +233 V 0.039 +234 A 0.040 +235 S 0.041 +236 V 0.039 +237 F 0.033 +238 I 0.027 +239 T 0.023 +240 C 0.023 +241 Y 0.026 +242 L 0.029 +243 P 0.028 +244 S 0.026 +245 V 0.023 +246 L 0.021 +247 A 0.021 +248 R 0.022 +249 L 0.023 +250 Y 0.024 +251 F 0.026 +252 L 0.034 +253 W 0.051 +254 T 0.073 +255 V 0.094 +256 P 0.110 +257 T 0.120 +258 S 0.123 +259 A 0.122 +260 C 0.118 +261 D 0.112 +262 P 0.101 +263 S 0.088 +264 V 0.074 +265 H 0.059 +266 T 0.050 +267 A 0.045 +268 L 0.044 +269 H 0.045 +270 V 0.048 +271 T 0.051 +272 L 0.051 +273 S 0.050 +274 F 0.049 +275 T 0.051 +276 Y 0.057 +277 L 0.065 +278 N 0.071 +279 S 0.069 +280 M 0.063 +281 L 0.057 +282 D 0.053 +283 P 0.048 +284 L 0.041 +285 V 0.036 +286 Y 0.036 +287 Y 0.043 +288 F 0.058 +289 S 0.087 +290 S 0.126 +291 P 0.163 +292 S 0.187 +293 L 0.193 +294 P 0.188 +295 K 0.190 +296 F 0.205 +297 Y 0.223 +298 T 0.238 +299 K 0.251 +300 L 0.262 +301 T 0.275 +302 I 0.300 +303 C 0.347 +304 S 0.406 +305 L 0.456 +306 K 0.496 +307 P 0.534 +308 K 0.573 +309 R 0.611 +310 P 0.644 +311 G 0.662 +312 R 0.653 +313 T 0.623 +314 K 0.599 +315 T 0.585 +316 R 0.564 +317 R 0.547 +318 S 0.566 +319 E 0.600 +320 E 0.612 +321 M 0.606 +322 P 0.604 +323 I 0.608 +324 S 0.606 +325 N 0.580 +326 L 0.520 +327 C 0.438 +328 S 0.385 +329 K 0.409 +330 S 0.480 +331 S 0.530 +332 I 0.558 +333 D 0.607 +334 G 0.670 +335 A 0.706 +336 N 0.709 +337 R 0.693 +338 S 0.671 +339 Q 0.649 +340 R 0.642 +341 P 0.654 +342 S 0.676 +343 D 0.691 +344 G 0.688 +345 Q 0.663 +346 W 0.617 +347 D 0.556 +348 L 0.488 +349 Q 0.416 +350 V 0.349 +351 C 0.304 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000049353.18_ENSMUST00000180463.3_GN:Rd3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000049353.18_ENSMUST00000180463.3_GN:Rd3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..809c4c01560dc40322849221d6b78c6e778bb5ab --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000049353.18_ENSMUST00000180463.3_GN:Rd3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,196 @@ +>ENSMUSG00000049353.18|ENSMUST00000180463.3|GN:Rd3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.408 +2 S 0.428 +3 L 0.455 +4 I 0.467 +5 P 0.462 +6 W 0.460 +7 L 0.483 +8 R 0.526 +9 W 0.562 +10 N 0.577 +11 D 0.574 +12 T 0.572 +13 P 0.591 +14 P 0.626 +15 R 0.651 +16 L 0.639 +17 S 0.575 +18 A 0.462 +19 R 0.330 +20 T 0.221 +21 P 0.158 +22 A 0.130 +23 E 0.118 +24 M 0.109 +25 V 0.097 +26 L 0.086 +27 E 0.083 +28 T 0.081 +29 L 0.074 +30 M 0.065 +31 M 0.060 +32 E 0.060 +33 L 0.065 +34 A 0.074 +35 G 0.082 +36 Q 0.084 +37 M 0.081 +38 R 0.080 +39 E 0.082 +40 V 0.085 +41 E 0.094 +42 R 0.107 +43 Q 0.119 +44 Q 0.130 +45 R 0.149 +46 E 0.180 +47 R 0.216 +48 R 0.246 +49 S 0.268 +50 A 0.292 +51 V 0.320 +52 R 0.347 +53 K 0.379 +54 I 0.419 +55 C 0.454 +56 T 0.459 +57 G 0.422 +58 V 0.352 +59 D 0.276 +60 Y 0.227 +61 S 0.217 +62 W 0.230 +63 L 0.251 +64 A 0.274 +65 N 0.298 +66 T 0.320 +67 P 0.328 +68 R 0.307 +69 P 0.257 +70 T 0.198 +71 Y 0.154 +72 D 0.131 +73 I 0.123 +74 S 0.127 +75 P 0.136 +76 G 0.136 +77 E 0.124 +78 R 0.108 +79 L 0.094 +80 Q 0.081 +81 L 0.069 +82 E 0.064 +83 D 0.063 +84 V 0.064 +85 C 0.068 +86 A 0.078 +87 K 0.088 +88 I 0.092 +89 H 0.090 +90 P 0.085 +91 S 0.081 +92 Y 0.079 +93 C 0.076 +94 G 0.069 +95 P 0.058 +96 A 0.047 +97 I 0.040 +98 L 0.038 +99 R 0.044 +100 F 0.056 +101 R 0.071 +102 Q 0.080 +103 L 0.077 +104 L 0.068 +105 A 0.065 +106 E 0.069 +107 R 0.079 +108 E 0.089 +109 P 0.092 +110 E 0.087 +111 V 0.075 +112 Q 0.064 +113 E 0.057 +114 V 0.058 +115 A 0.067 +116 R 0.077 +117 L 0.081 +118 F 0.081 +119 R 0.082 +120 S 0.082 +121 V 0.071 +122 L 0.055 +123 Q 0.045 +124 E 0.045 +125 A 0.052 +126 L 0.065 +127 E 0.079 +128 K 0.084 +129 M 0.089 +130 K 0.100 +131 Q 0.115 +132 E 0.132 +133 E 0.152 +134 E 0.177 +135 A 0.199 +136 H 0.213 +137 K 0.224 +138 L 0.239 +139 T 0.263 +140 R 0.298 +141 Q 0.348 +142 W 0.411 +143 S 0.471 +144 L 0.516 +145 R 0.556 +146 P 0.609 +147 R 0.669 +148 G 0.718 +149 S 0.741 +150 L 0.745 +151 S 0.740 +152 S 0.738 +153 F 0.745 +154 K 0.759 +155 T 0.774 +156 R 0.783 +157 A 0.783 +158 R 0.775 +159 I 0.761 +160 A 0.753 +161 P 0.759 +162 F 0.776 +163 A 0.792 +164 S 0.802 +165 D 0.808 +166 I 0.816 +167 R 0.825 +168 T 0.835 +169 I 0.840 +170 S 0.838 +171 E 0.833 +172 D 0.825 +173 V 0.813 +174 E 0.789 +175 R 0.744 +176 D 0.681 +177 A 0.617 +178 P 0.582 +179 P 0.594 +180 P 0.639 +181 P 0.687 +182 R 0.715 +183 T 0.714 +184 W 0.692 +185 S 0.670 +186 M 0.665 +187 P 0.672 +188 E 0.677 +189 F 0.675 +190 R 0.673 +191 A 0.678 +192 P 0.680 +193 Q 0.658 +194 A 0.607 +195 D 0.559 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000049353.18_ENSMUST00000180463.3_GN:Rd3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:115.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000049353.18_ENSMUST00000180463.3_GN:Rd3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:115.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..3e6fce08be16967398e60eccf1a39ddb4f9b961f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000049353.18_ENSMUST00000180463.3_GN:Rd3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:115.caid @@ -0,0 +1,311 @@ +>ENSMUSG00000049353.18|ENSMUST00000180463.3|GN:Rd3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:115 +1 M 0.177 +2 L 0.175 +3 A 0.173 +4 C 0.169 +5 L 0.167 +6 Q 0.170 +7 V 0.179 +8 L 0.199 +9 Q 0.228 +10 G 0.251 +11 A 0.263 +12 V 0.280 +13 S 0.312 +14 Q 0.343 +15 L 0.366 +16 W 0.403 +17 G 0.467 +18 P 0.544 +19 T 0.600 +20 H 0.623 +21 T 0.630 +22 P 0.641 +23 Q 0.661 +24 T 0.682 +25 P 0.702 +26 A 0.716 +27 Q 0.716 +28 L 0.700 +29 G 0.678 +30 P 0.657 +31 S 0.620 +32 S 0.552 +33 S 0.476 +34 W 0.427 +35 C 0.414 +36 L 0.423 +37 Q 0.445 +38 Y 0.467 +39 N 0.477 +40 F 0.487 +41 S 0.514 +42 K 0.557 +43 R 0.602 +44 K 0.638 +45 S 0.661 +46 R 0.675 +47 K 0.686 +48 H 0.697 +49 R 0.706 +50 R 0.719 +51 Q 0.741 +52 P 0.772 +53 A 0.801 +54 V 0.817 +55 E 0.818 +56 E 0.807 +57 A 0.791 +58 E 0.777 +59 G 0.763 +60 G 0.744 +61 R 0.704 +62 G 0.639 +63 W 0.565 +64 S 0.506 +65 S 0.463 +66 L 0.416 +67 F 0.352 +68 N 0.289 +69 S 0.246 +70 C 0.225 +71 Q 0.218 +72 F 0.223 +73 A 0.238 +74 A 0.253 +75 Q 0.262 +76 L 0.263 +77 S 0.271 +78 T 0.298 +79 F 0.345 +80 P 0.400 +81 R 0.450 +82 K 0.491 +83 D 0.519 +84 Q 0.526 +85 G 0.511 +86 S 0.501 +87 L 0.516 +88 L 0.546 +89 L 0.577 +90 E 0.604 +91 C 0.605 +92 E 0.566 +93 A 0.504 +94 E 0.451 +95 S 0.409 +96 R 0.369 +97 T 0.330 +98 P 0.299 +99 T 0.277 +100 V 0.256 +101 I 0.225 +102 V 0.183 +103 A 0.142 +104 L 0.111 +105 K 0.088 +106 E 0.071 +107 V 0.059 +108 D 0.051 +109 L 0.050 +110 R 0.053 +111 R 0.061 +112 V 0.074 +113 W 0.086 +114 G 0.092 +115 A 0.096 +116 M 0.103 +117 S 0.117 +118 L 0.133 +119 I 0.140 +120 P 0.131 +121 W 0.115 +122 L 0.105 +123 R 0.109 +124 W 0.127 +125 N 0.155 +126 D 0.190 +127 T 0.229 +128 P 0.262 +129 P 0.277 +130 R 0.273 +131 L 0.261 +132 S 0.244 +133 A 0.213 +134 R 0.164 +135 T 0.116 +136 P 0.086 +137 A 0.076 +138 E 0.080 +139 M 0.087 +140 V 0.086 +141 L 0.075 +142 E 0.063 +143 T 0.057 +144 L 0.053 +145 M 0.050 +146 M 0.047 +147 E 0.046 +148 L 0.049 +149 A 0.055 +150 G 0.060 +151 Q 0.061 +152 M 0.060 +153 R 0.066 +154 E 0.075 +155 V 0.084 +156 E 0.093 +157 R 0.102 +158 Q 0.109 +159 Q 0.115 +160 R 0.126 +161 E 0.145 +162 R 0.166 +163 R 0.185 +164 S 0.201 +165 A 0.217 +166 V 0.236 +167 R 0.258 +168 K 0.281 +169 I 0.304 +170 C 0.318 +171 T 0.317 +172 G 0.297 +173 V 0.257 +174 D 0.208 +175 Y 0.173 +176 S 0.164 +177 W 0.173 +178 L 0.191 +179 A 0.215 +180 N 0.244 +181 T 0.271 +182 P 0.281 +183 R 0.267 +184 P 0.232 +185 T 0.190 +186 Y 0.157 +187 D 0.138 +188 I 0.130 +189 S 0.133 +190 P 0.143 +191 G 0.146 +192 E 0.138 +193 R 0.125 +194 L 0.112 +195 Q 0.096 +196 L 0.082 +197 E 0.076 +198 D 0.074 +199 V 0.074 +200 C 0.075 +201 A 0.078 +202 K 0.080 +203 I 0.081 +204 H 0.083 +205 P 0.086 +206 S 0.090 +207 Y 0.094 +208 C 0.095 +209 G 0.087 +210 P 0.071 +211 A 0.055 +212 I 0.045 +213 L 0.043 +214 R 0.050 +215 F 0.063 +216 R 0.077 +217 Q 0.084 +218 L 0.082 +219 L 0.075 +220 A 0.073 +221 E 0.077 +222 R 0.086 +223 E 0.093 +224 P 0.094 +225 E 0.088 +226 V 0.077 +227 Q 0.067 +228 E 0.061 +229 V 0.063 +230 A 0.072 +231 R 0.082 +232 L 0.085 +233 F 0.085 +234 R 0.085 +235 S 0.083 +236 V 0.072 +237 L 0.058 +238 Q 0.049 +239 E 0.048 +240 A 0.053 +241 L 0.067 +242 E 0.081 +243 K 0.090 +244 M 0.095 +245 K 0.105 +246 Q 0.119 +247 E 0.134 +248 E 0.152 +249 E 0.173 +250 A 0.190 +251 H 0.203 +252 K 0.217 +253 L 0.236 +254 T 0.263 +255 R 0.297 +256 Q 0.345 +257 W 0.403 +258 S 0.459 +259 L 0.501 +260 R 0.541 +261 P 0.596 +262 R 0.659 +263 G 0.709 +264 S 0.733 +265 L 0.736 +266 S 0.733 +267 S 0.732 +268 F 0.738 +269 K 0.750 +270 T 0.762 +271 R 0.767 +272 A 0.764 +273 R 0.754 +274 I 0.742 +275 A 0.736 +276 P 0.743 +277 F 0.759 +278 A 0.775 +279 S 0.785 +280 D 0.792 +281 I 0.799 +282 R 0.804 +283 T 0.797 +284 I 0.757 +285 S 0.694 +286 E 0.658 +287 D 0.686 +288 V 0.738 +289 E 0.760 +290 R 0.737 +291 D 0.686 +292 A 0.632 +293 P 0.604 +294 P 0.617 +295 P 0.660 +296 P 0.706 +297 R 0.733 +298 T 0.733 +299 W 0.714 +300 S 0.695 +301 M 0.689 +302 P 0.695 +303 E 0.698 +304 F 0.694 +305 R 0.690 +306 A 0.694 +307 P 0.696 +308 Q 0.676 +309 A 0.629 +310 D 0.584 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000050108.13_ENSMUST00000061699.12_GN:Bpifc_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000050108.13_ENSMUST00000061699.12_GN:Bpifc_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e04c72c958ea00d1890e9944e11bffe017e9c103 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000050108.13_ENSMUST00000061699.12_GN:Bpifc_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,508 @@ +>ENSMUSG00000050108.13|ENSMUST00000061699.12|GN:Bpifc|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.325 +2 R 0.321 +3 T 0.322 +4 K 0.326 +5 Q 0.317 +6 V 0.284 +7 P 0.237 +8 V 0.193 +9 L 0.161 +10 W 0.141 +11 A 0.125 +12 C 0.111 +13 F 0.105 +14 L 0.107 +15 L 0.115 +16 W 0.125 +17 S 0.142 +18 L 0.168 +19 Y 0.207 +20 I 0.250 +21 A 0.290 +22 S 0.317 +23 S 0.326 +24 Q 0.308 +25 T 0.266 +26 V 0.208 +27 Y 0.152 +28 P 0.107 +29 G 0.077 +30 I 0.061 +31 T 0.054 +32 A 0.051 +33 R 0.048 +34 I 0.042 +35 T 0.037 +36 Q 0.032 +37 R 0.030 +38 A 0.030 +39 L 0.033 +40 D 0.038 +41 Y 0.045 +42 G 0.056 +43 L 0.066 +44 Q 0.071 +45 V 0.070 +46 G 0.070 +47 M 0.077 +48 K 0.084 +49 V 0.083 +50 L 0.078 +51 E 0.074 +52 Q 0.076 +53 L 0.087 +54 A 0.103 +55 K 0.116 +56 E 0.122 +57 I 0.123 +58 V 0.119 +59 I 0.111 +60 P 0.100 +61 D 0.090 +62 L 0.082 +63 N 0.081 +64 G 0.090 +65 S 0.108 +66 E 0.130 +67 S 0.150 +68 L 0.163 +69 K 0.170 +70 F 0.171 +71 L 0.166 +72 K 0.155 +73 I 0.140 +74 D 0.127 +75 Y 0.117 +76 V 0.108 +77 K 0.099 +78 Y 0.093 +79 N 0.093 +80 F 0.098 +81 S 0.111 +82 N 0.121 +83 I 0.121 +84 K 0.113 +85 I 0.101 +86 N 0.087 +87 A 0.073 +88 F 0.061 +89 S 0.059 +90 F 0.065 +91 P 0.069 +92 N 0.062 +93 T 0.047 +94 S 0.034 +95 L 0.029 +96 A 0.032 +97 F 0.042 +98 V 0.059 +99 P 0.076 +100 G 0.087 +101 V 0.082 +102 G 0.065 +103 I 0.048 +104 R 0.041 +105 A 0.044 +106 L 0.051 +107 S 0.058 +108 N 0.062 +109 H 0.064 +110 G 0.062 +111 T 0.057 +112 A 0.053 +113 N 0.049 +114 I 0.048 +115 S 0.047 +116 T 0.047 +117 N 0.047 +118 W 0.047 +119 S 0.050 +120 V 0.058 +121 K 0.071 +122 A 0.083 +123 P 0.088 +124 L 0.090 +125 F 0.094 +126 R 0.100 +127 D 0.107 +128 S 0.115 +129 G 0.121 +130 A 0.121 +131 A 0.113 +132 N 0.099 +133 L 0.084 +134 F 0.077 +135 L 0.080 +136 S 0.086 +137 G 0.086 +138 I 0.075 +139 Y 0.062 +140 F 0.055 +141 T 0.055 +142 G 0.056 +143 I 0.053 +144 V 0.049 +145 A 0.049 +146 F 0.056 +147 T 0.068 +148 R 0.084 +149 N 0.103 +150 D 0.120 +151 F 0.128 +152 G 0.122 +153 Y 0.106 +154 P 0.087 +155 A 0.072 +156 L 0.061 +157 E 0.053 +158 L 0.050 +159 Q 0.051 +160 D 0.053 +161 C 0.052 +162 H 0.050 +163 V 0.049 +164 Q 0.051 +165 V 0.057 +166 S 0.063 +167 H 0.063 +168 A 0.059 +169 R 0.057 +170 V 0.060 +171 S 0.067 +172 F 0.075 +173 F 0.086 +174 G 0.100 +175 S 0.111 +176 L 0.115 +177 S 0.111 +178 A 0.101 +179 L 0.092 +180 Y 0.091 +181 N 0.095 +182 S 0.098 +183 F 0.103 +184 A 0.114 +185 E 0.120 +186 P 0.115 +187 M 0.104 +188 E 0.098 +189 K 0.099 +190 P 0.100 +191 I 0.099 +192 L 0.102 +193 K 0.110 +194 N 0.111 +195 L 0.101 +196 N 0.089 +197 E 0.085 +198 M 0.084 +199 L 0.080 +200 C 0.078 +201 P 0.083 +202 I 0.090 +203 A 0.088 +204 I 0.081 +205 S 0.078 +206 Q 0.082 +207 V 0.087 +208 E 0.096 +209 Q 0.109 +210 F 0.117 +211 N 0.113 +212 V 0.102 +213 N 0.092 +214 I 0.084 +215 S 0.078 +216 A 0.075 +217 L 0.072 +218 E 0.066 +219 V 0.060 +220 L 0.060 +221 T 0.067 +222 K 0.079 +223 I 0.090 +224 D 0.096 +225 N 0.095 +226 Y 0.087 +227 T 0.080 +228 V 0.075 +229 L 0.073 +230 D 0.071 +231 C 0.073 +232 S 0.082 +233 L 0.094 +234 I 0.101 +235 S 0.097 +236 P 0.087 +237 P 0.078 +238 E 0.076 +239 I 0.079 +240 T 0.085 +241 E 0.088 +242 N 0.082 +243 H 0.068 +244 L 0.052 +245 D 0.043 +246 F 0.043 +247 N 0.054 +248 L 0.067 +249 K 0.077 +250 G 0.081 +251 A 0.081 +252 F 0.083 +253 Y 0.089 +254 P 0.097 +255 L 0.101 +256 E 0.099 +257 S 0.100 +258 L 0.108 +259 V 0.122 +260 D 0.135 +261 P 0.143 +262 P 0.148 +263 F 0.152 +264 T 0.159 +265 P 0.166 +266 A 0.165 +267 P 0.151 +268 F 0.128 +269 H 0.107 +270 L 0.094 +271 P 0.087 +272 E 0.085 +273 S 0.088 +274 R 0.095 +275 D 0.104 +276 S 0.107 +277 M 0.103 +278 L 0.098 +279 Y 0.094 +280 I 0.089 +281 G 0.080 +282 I 0.070 +283 S 0.064 +284 E 0.062 +285 Y 0.060 +286 F 0.054 +287 F 0.049 +288 K 0.053 +289 S 0.062 +290 A 0.066 +291 S 0.066 +292 F 0.065 +293 A 0.067 +294 H 0.072 +295 Y 0.083 +296 V 0.095 +297 S 0.101 +298 G 0.097 +299 A 0.089 +300 L 0.083 +301 G 0.079 +302 T 0.074 +303 T 0.066 +304 L 0.057 +305 S 0.050 +306 T 0.050 +307 R 0.054 +308 E 0.060 +309 I 0.069 +310 S 0.081 +311 N 0.099 +312 Y 0.127 +313 F 0.167 +314 S 0.214 +315 Q 0.255 +316 N 0.281 +317 V 0.289 +318 Q 0.279 +319 G 0.253 +320 F 0.221 +321 G 0.195 +322 S 0.174 +323 V 0.151 +324 L 0.133 +325 S 0.130 +326 K 0.141 +327 I 0.158 +328 A 0.177 +329 E 0.196 +330 I 0.212 +331 Y 0.218 +332 V 0.207 +333 L 0.181 +334 S 0.151 +335 Q 0.123 +336 P 0.099 +337 F 0.078 +338 I 0.065 +339 L 0.059 +340 Q 0.057 +341 M 0.061 +342 M 0.076 +343 A 0.103 +344 T 0.127 +345 G 0.134 +346 P 0.120 +347 P 0.095 +348 M 0.076 +349 V 0.073 +350 N 0.084 +351 L 0.103 +352 Q 0.121 +353 R 0.127 +354 N 0.117 +355 N 0.095 +356 F 0.074 +357 S 0.061 +358 L 0.060 +359 E 0.064 +360 F 0.065 +361 P 0.060 +362 A 0.051 +363 A 0.043 +364 V 0.039 +365 I 0.040 +366 M 0.045 +367 L 0.057 +368 T 0.082 +369 Q 0.119 +370 L 0.154 +371 D 0.177 +372 N 0.183 +373 S 0.175 +374 T 0.155 +375 I 0.132 +376 Q 0.118 +377 P 0.116 +378 I 0.118 +379 V 0.117 +380 S 0.113 +381 M 0.107 +382 D 0.098 +383 F 0.089 +384 V 0.085 +385 A 0.086 +386 S 0.088 +387 T 0.087 +388 S 0.086 +389 V 0.085 +390 G 0.084 +391 L 0.084 +392 A 0.086 +393 I 0.089 +394 L 0.090 +395 G 0.090 +396 Q 0.091 +397 K 0.092 +398 L 0.090 +399 I 0.084 +400 C 0.077 +401 S 0.069 +402 L 0.061 +403 S 0.053 +404 L 0.047 +405 N 0.043 +406 R 0.039 +407 F 0.036 +408 R 0.039 +409 L 0.055 +410 S 0.088 +411 L 0.137 +412 P 0.194 +413 E 0.245 +414 N 0.284 +415 S 0.304 +416 Q 0.307 +417 R 0.298 +418 D 0.282 +419 A 0.255 +420 K 0.219 +421 V 0.178 +422 V 0.142 +423 R 0.112 +424 F 0.088 +425 E 0.072 +426 N 0.063 +427 I 0.060 +428 L 0.061 +429 S 0.064 +430 S 0.067 +431 I 0.073 +432 L 0.083 +433 H 0.092 +434 F 0.094 +435 G 0.090 +436 V 0.085 +437 L 0.087 +438 P 0.092 +439 L 0.097 +440 A 0.099 +441 N 0.099 +442 T 0.098 +443 K 0.098 +444 L 0.099 +445 Q 0.104 +446 Q 0.107 +447 G 0.107 +448 F 0.109 +449 P 0.117 +450 L 0.127 +451 P 0.126 +452 N 0.117 +453 P 0.106 +454 Y 0.098 +455 N 0.094 +456 I 0.090 +457 S 0.092 +458 F 0.104 +459 I 0.122 +460 N 0.130 +461 S 0.125 +462 D 0.110 +463 I 0.095 +464 E 0.086 +465 V 0.088 +466 L 0.096 +467 E 0.097 +468 G 0.087 +469 Y 0.071 +470 L 0.059 +471 L 0.055 +472 V 0.056 +473 S 0.062 +474 S 0.068 +475 D 0.076 +476 L 0.091 +477 A 0.118 +478 Y 0.161 +479 D 0.219 +480 T 0.280 +481 S 0.333 +482 S 0.383 +483 K 0.435 +484 P 0.490 +485 Q 0.543 +486 P 0.583 +487 N 0.603 +488 L 0.604 +489 N 0.592 +490 S 0.574 +491 W 0.558 +492 G 0.552 +493 D 0.542 +494 L 0.511 +495 N 0.462 +496 L 0.414 +497 V 0.381 +498 H 0.361 +499 R 0.351 +500 P 0.348 +501 W 0.348 +502 R 0.354 +503 E 0.364 +504 Q 0.373 +505 P 0.376 +506 T 0.377 +507 H 0.380 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000050108.13_ENSMUST00000061699.12_GN:Bpifc_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:35.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000050108.13_ENSMUST00000061699.12_GN:Bpifc_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:35.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ad7496630a8233e274803f728409b4eb5ba66cdc --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000050108.13_ENSMUST00000061699.12_GN:Bpifc_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:35.caid @@ -0,0 +1,543 @@ +>ENSMUSG00000050108.13|ENSMUST00000061699.12|GN:Bpifc|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:35 +1 M 0.199 +2 F 0.212 +3 R 0.237 +4 L 0.261 +5 L 0.275 +6 R 0.284 +7 L 0.300 +8 R 0.316 +9 S 0.326 +10 T 0.341 +11 A 0.362 +12 E 0.374 +13 N 0.382 +14 T 0.404 +15 P 0.429 +16 A 0.436 +17 S 0.439 +18 K 0.453 +19 V 0.467 +20 K 0.480 +21 G 0.505 +22 I 0.536 +23 E 0.555 +24 G 0.547 +25 T 0.501 +26 L 0.433 +27 Q 0.383 +28 L 0.369 +29 W 0.374 +30 T 0.390 +31 H 0.425 +32 P 0.476 +33 G 0.520 +34 L 0.538 +35 E 0.531 +36 M 0.510 +37 R 0.482 +38 T 0.448 +39 K 0.417 +40 Q 0.388 +41 V 0.353 +42 P 0.304 +43 V 0.249 +44 L 0.203 +45 W 0.171 +46 A 0.148 +47 C 0.133 +48 F 0.127 +49 L 0.127 +50 L 0.130 +51 W 0.136 +52 S 0.149 +53 L 0.175 +54 Y 0.213 +55 I 0.254 +56 A 0.292 +57 S 0.321 +58 S 0.332 +59 Q 0.316 +60 T 0.273 +61 V 0.214 +62 Y 0.156 +63 P 0.110 +64 G 0.080 +65 I 0.064 +66 T 0.058 +67 A 0.055 +68 R 0.051 +69 I 0.045 +70 T 0.039 +71 Q 0.034 +72 R 0.031 +73 A 0.032 +74 L 0.035 +75 D 0.039 +76 Y 0.043 +77 G 0.048 +78 L 0.052 +79 Q 0.053 +80 V 0.054 +81 G 0.061 +82 M 0.073 +83 K 0.080 +84 V 0.080 +85 L 0.074 +86 E 0.069 +87 Q 0.071 +88 L 0.081 +89 A 0.096 +90 K 0.108 +91 E 0.114 +92 I 0.114 +93 V 0.109 +94 I 0.101 +95 P 0.091 +96 D 0.081 +97 L 0.073 +98 N 0.073 +99 G 0.083 +100 S 0.099 +101 E 0.119 +102 S 0.136 +103 L 0.147 +104 K 0.151 +105 F 0.151 +106 L 0.149 +107 K 0.143 +108 I 0.134 +109 D 0.126 +110 Y 0.118 +111 V 0.109 +112 K 0.100 +113 Y 0.093 +114 N 0.091 +115 F 0.095 +116 S 0.105 +117 N 0.114 +118 I 0.114 +119 K 0.106 +120 I 0.093 +121 N 0.080 +122 A 0.067 +123 F 0.058 +124 S 0.056 +125 F 0.061 +126 P 0.064 +127 N 0.058 +128 T 0.044 +129 S 0.033 +130 L 0.028 +131 A 0.031 +132 F 0.042 +133 V 0.058 +134 P 0.076 +135 G 0.086 +136 V 0.082 +137 G 0.065 +138 I 0.049 +139 R 0.041 +140 A 0.044 +141 L 0.051 +142 S 0.058 +143 N 0.062 +144 H 0.064 +145 G 0.062 +146 T 0.057 +147 A 0.053 +148 N 0.050 +149 I 0.048 +150 S 0.047 +151 T 0.047 +152 N 0.046 +153 W 0.046 +154 S 0.049 +155 V 0.058 +156 K 0.071 +157 A 0.083 +158 P 0.088 +159 L 0.090 +160 F 0.093 +161 R 0.099 +162 D 0.106 +163 S 0.113 +164 G 0.118 +165 A 0.117 +166 A 0.109 +167 N 0.095 +168 L 0.081 +169 F 0.075 +170 L 0.079 +171 S 0.085 +172 G 0.085 +173 I 0.075 +174 Y 0.062 +175 F 0.055 +176 T 0.055 +177 G 0.056 +178 I 0.052 +179 V 0.048 +180 A 0.050 +181 F 0.057 +182 T 0.069 +183 R 0.085 +184 N 0.105 +185 D 0.122 +186 F 0.130 +187 G 0.123 +188 Y 0.106 +189 P 0.087 +190 A 0.070 +191 L 0.059 +192 E 0.052 +193 L 0.049 +194 Q 0.050 +195 D 0.052 +196 C 0.052 +197 H 0.050 +198 V 0.048 +199 Q 0.050 +200 V 0.055 +201 S 0.061 +202 H 0.062 +203 A 0.058 +204 R 0.056 +205 V 0.059 +206 S 0.065 +207 F 0.071 +208 F 0.079 +209 G 0.092 +210 S 0.103 +211 L 0.108 +212 S 0.105 +213 A 0.096 +214 L 0.087 +215 Y 0.086 +216 N 0.089 +217 S 0.093 +218 F 0.099 +219 A 0.109 +220 E 0.115 +221 P 0.110 +222 M 0.100 +223 E 0.094 +224 K 0.094 +225 P 0.095 +226 I 0.094 +227 L 0.097 +228 K 0.104 +229 N 0.106 +230 L 0.097 +231 N 0.087 +232 E 0.084 +233 M 0.083 +234 L 0.079 +235 C 0.076 +236 P 0.081 +237 I 0.087 +238 A 0.085 +239 I 0.078 +240 S 0.075 +241 Q 0.078 +242 V 0.084 +243 E 0.094 +244 Q 0.107 +245 F 0.115 +246 N 0.110 +247 V 0.100 +248 N 0.089 +249 I 0.082 +250 S 0.076 +251 A 0.074 +252 L 0.070 +253 E 0.064 +254 V 0.058 +255 L 0.058 +256 T 0.065 +257 K 0.076 +258 I 0.087 +259 D 0.093 +260 N 0.091 +261 Y 0.085 +262 T 0.078 +263 V 0.074 +264 L 0.072 +265 D 0.070 +266 C 0.072 +267 S 0.081 +268 L 0.092 +269 I 0.099 +270 S 0.095 +271 P 0.085 +272 P 0.076 +273 E 0.073 +274 I 0.076 +275 T 0.082 +276 E 0.086 +277 N 0.081 +278 H 0.067 +279 L 0.052 +280 D 0.043 +281 F 0.043 +282 N 0.053 +283 L 0.067 +284 K 0.077 +285 G 0.080 +286 A 0.080 +287 F 0.082 +288 Y 0.088 +289 P 0.096 +290 L 0.101 +291 E 0.100 +292 S 0.102 +293 L 0.111 +294 V 0.125 +295 D 0.138 +296 P 0.146 +297 P 0.150 +298 F 0.153 +299 T 0.161 +300 P 0.168 +301 A 0.168 +302 P 0.153 +303 F 0.130 +304 H 0.109 +305 L 0.095 +306 P 0.088 +307 E 0.086 +308 S 0.089 +309 R 0.096 +310 D 0.105 +311 S 0.108 +312 M 0.105 +313 L 0.099 +314 Y 0.095 +315 I 0.090 +316 G 0.082 +317 I 0.072 +318 S 0.067 +319 E 0.065 +320 Y 0.063 +321 F 0.056 +322 F 0.051 +323 K 0.055 +324 S 0.064 +325 A 0.068 +326 S 0.067 +327 F 0.066 +328 A 0.068 +329 H 0.073 +330 Y 0.084 +331 V 0.096 +332 S 0.101 +333 G 0.098 +334 A 0.090 +335 L 0.085 +336 G 0.081 +337 T 0.075 +338 T 0.067 +339 L 0.058 +340 S 0.052 +341 T 0.052 +342 R 0.057 +343 E 0.064 +344 I 0.073 +345 S 0.086 +346 N 0.105 +347 Y 0.134 +348 F 0.176 +349 S 0.223 +350 Q 0.264 +351 N 0.288 +352 V 0.295 +353 Q 0.284 +354 G 0.258 +355 F 0.227 +356 G 0.201 +357 S 0.179 +358 V 0.155 +359 L 0.137 +360 S 0.135 +361 K 0.147 +362 I 0.165 +363 A 0.184 +364 E 0.203 +365 I 0.218 +366 Y 0.222 +367 V 0.210 +368 L 0.184 +369 S 0.153 +370 Q 0.126 +371 P 0.101 +372 F 0.080 +373 I 0.067 +374 L 0.061 +375 Q 0.058 +376 M 0.062 +377 M 0.077 +378 A 0.102 +379 T 0.126 +380 G 0.133 +381 P 0.120 +382 P 0.095 +383 M 0.077 +384 V 0.074 +385 N 0.085 +386 L 0.105 +387 Q 0.123 +388 R 0.128 +389 N 0.117 +390 N 0.095 +391 F 0.073 +392 S 0.061 +393 L 0.060 +394 E 0.063 +395 F 0.065 +396 P 0.060 +397 A 0.051 +398 A 0.042 +399 V 0.038 +400 I 0.039 +401 M 0.044 +402 L 0.056 +403 T 0.081 +404 Q 0.117 +405 L 0.152 +406 D 0.175 +407 N 0.182 +408 S 0.174 +409 T 0.154 +410 I 0.132 +411 Q 0.118 +412 P 0.116 +413 I 0.118 +414 V 0.118 +415 S 0.114 +416 M 0.107 +417 D 0.098 +418 F 0.089 +419 V 0.085 +420 A 0.086 +421 S 0.088 +422 T 0.087 +423 S 0.085 +424 V 0.083 +425 G 0.083 +426 L 0.083 +427 A 0.085 +428 I 0.089 +429 L 0.092 +430 G 0.092 +431 Q 0.093 +432 K 0.095 +433 L 0.093 +434 I 0.087 +435 C 0.079 +436 S 0.071 +437 L 0.062 +438 S 0.054 +439 L 0.049 +440 N 0.045 +441 R 0.040 +442 F 0.037 +443 R 0.041 +444 L 0.057 +445 S 0.091 +446 L 0.141 +447 P 0.198 +448 E 0.250 +449 N 0.288 +450 S 0.308 +451 Q 0.310 +452 R 0.300 +453 D 0.283 +454 A 0.257 +455 K 0.220 +456 V 0.180 +457 V 0.144 +458 R 0.114 +459 F 0.090 +460 E 0.073 +461 N 0.063 +462 I 0.060 +463 L 0.062 +464 S 0.065 +465 S 0.068 +466 I 0.074 +467 L 0.085 +468 H 0.094 +469 F 0.095 +470 G 0.091 +471 V 0.087 +472 L 0.089 +473 P 0.095 +474 L 0.100 +475 A 0.100 +476 N 0.099 +477 T 0.098 +478 K 0.098 +479 L 0.101 +480 Q 0.106 +481 Q 0.110 +482 G 0.109 +483 F 0.111 +484 P 0.120 +485 L 0.130 +486 P 0.130 +487 N 0.120 +488 P 0.107 +489 Y 0.099 +490 N 0.094 +491 I 0.091 +492 S 0.093 +493 F 0.105 +494 I 0.122 +495 N 0.130 +496 S 0.125 +497 D 0.113 +498 I 0.099 +499 E 0.090 +500 V 0.091 +501 L 0.099 +502 E 0.100 +503 G 0.089 +504 Y 0.073 +505 L 0.061 +506 L 0.056 +507 V 0.058 +508 S 0.064 +509 S 0.072 +510 D 0.079 +511 L 0.093 +512 A 0.118 +513 Y 0.159 +514 D 0.213 +515 T 0.269 +516 S 0.317 +517 S 0.363 +518 K 0.413 +519 P 0.465 +520 Q 0.516 +521 P 0.556 +522 N 0.577 +523 L 0.578 +524 N 0.563 +525 S 0.541 +526 W 0.524 +527 G 0.521 +528 D 0.514 +529 L 0.479 +530 N 0.418 +531 L 0.357 +532 V 0.317 +533 H 0.297 +534 R 0.285 +535 P 0.279 +536 W 0.278 +537 R 0.283 +538 E 0.289 +539 Q 0.286 +540 P 0.274 +541 T 0.262 +542 H 0.256 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000050440.9_ENSMUST00000062620.9_GN:Hamp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000050440.9_ENSMUST00000062620.9_GN:Hamp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0886af0ec63822c69c351d3d07aeb03998fee7aa --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000050440.9_ENSMUST00000062620.9_GN:Hamp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,84 @@ +>ENSMUSG00000050440.9|ENSMUST00000062620.9|GN:Hamp|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.330 +2 A 0.299 +3 L 0.250 +4 S 0.203 +5 T 0.167 +6 R 0.143 +7 T 0.132 +8 Q 0.130 +9 A 0.132 +10 A 0.135 +11 C 0.137 +12 L 0.143 +13 L 0.148 +14 L 0.148 +15 L 0.146 +16 L 0.151 +17 L 0.170 +18 A 0.199 +19 S 0.233 +20 L 0.268 +21 S 0.305 +22 S 0.328 +23 T 0.325 +24 T 0.304 +25 Y 0.292 +26 L 0.305 +27 H 0.345 +28 Q 0.401 +29 Q 0.460 +30 M 0.514 +31 R 0.570 +32 Q 0.630 +33 T 0.684 +34 T 0.714 +35 E 0.719 +36 L 0.710 +37 Q 0.705 +38 P 0.715 +39 L 0.738 +40 H 0.760 +41 G 0.773 +42 E 0.777 +43 E 0.777 +44 S 0.776 +45 R 0.774 +46 A 0.773 +47 D 0.771 +48 I 0.766 +49 A 0.756 +50 I 0.740 +51 P 0.725 +52 M 0.711 +53 Q 0.691 +54 K 0.660 +55 R 0.629 +56 R 0.605 +57 K 0.584 +58 R 0.557 +59 D 0.521 +60 T 0.478 +61 N 0.431 +62 F 0.386 +63 P 0.335 +64 I 0.273 +65 C 0.209 +66 I 0.158 +67 F 0.123 +68 C 0.103 +69 C 0.097 +70 K 0.104 +71 C 0.117 +72 C 0.135 +73 N 0.154 +74 N 0.166 +75 S 0.163 +76 Q 0.151 +77 C 0.140 +78 G 0.135 +79 I 0.133 +80 C 0.133 +81 C 0.142 +82 K 0.161 +83 T 0.178 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000050440.9_ENSMUST00000062620.9_GN:Hamp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000050440.9_ENSMUST00000062620.9_GN:Hamp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..cd6baad335f6de457aa0c3cf56114902227f7484 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000050440.9_ENSMUST00000062620.9_GN:Hamp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid @@ -0,0 +1,85 @@ +>ENSMUSG00000050440.9|ENSMUST00000062620.9|GN:Hamp|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:1 +1 M 0.385 +2 M 0.364 +3 A 0.323 +4 L 0.270 +5 S 0.217 +6 T 0.175 +7 R 0.150 +8 T 0.143 +9 Q 0.146 +10 A 0.148 +11 A 0.145 +12 C 0.146 +13 L 0.151 +14 L 0.154 +15 L 0.151 +16 L 0.147 +17 L 0.151 +18 L 0.170 +19 A 0.201 +20 S 0.234 +21 L 0.268 +22 S 0.305 +23 S 0.331 +24 T 0.330 +25 T 0.310 +26 Y 0.299 +27 L 0.313 +28 H 0.354 +29 Q 0.411 +30 Q 0.472 +31 M 0.526 +32 R 0.580 +33 Q 0.639 +34 T 0.690 +35 T 0.718 +36 E 0.722 +37 L 0.712 +38 Q 0.706 +39 P 0.716 +40 L 0.739 +41 H 0.761 +42 G 0.774 +43 E 0.779 +44 E 0.779 +45 S 0.777 +46 R 0.776 +47 A 0.775 +48 D 0.773 +49 I 0.768 +50 A 0.757 +51 I 0.741 +52 P 0.726 +53 M 0.712 +54 Q 0.692 +55 K 0.661 +56 R 0.628 +57 R 0.603 +58 K 0.581 +59 R 0.553 +60 D 0.517 +61 T 0.474 +62 N 0.430 +63 F 0.386 +64 P 0.337 +65 I 0.276 +66 C 0.212 +67 I 0.160 +68 F 0.124 +69 C 0.103 +70 C 0.098 +71 K 0.104 +72 C 0.116 +73 C 0.134 +74 N 0.153 +75 N 0.165 +76 S 0.163 +77 Q 0.151 +78 C 0.140 +79 G 0.136 +80 I 0.135 +81 C 0.134 +82 C 0.143 +83 K 0.162 +84 T 0.179 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000050853.4_ENSMUST00000217227.2_GN:Or10d3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000050853.4_ENSMUST00000217227.2_GN:Or10d3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5e3e09ae1d3aedd1f08ed19d8838f45fbe0998da --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000050853.4_ENSMUST00000217227.2_GN:Or10d3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,313 @@ +>ENSMUSG00000050853.4|ENSMUST00000217227.2|GN:Or10d3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.393 +2 E 0.406 +3 I 0.419 +4 K 0.416 +5 N 0.388 +6 C 0.346 +7 S 0.301 +8 V 0.257 +9 V 0.211 +10 T 0.168 +11 E 0.138 +12 F 0.125 +13 I 0.125 +14 L 0.134 +15 L 0.157 +16 G 0.190 +17 I 0.219 +18 P 0.232 +19 H 0.227 +20 T 0.211 +21 E 0.188 +22 G 0.159 +23 F 0.126 +24 E 0.093 +25 T 0.066 +26 L 0.050 +27 L 0.045 +28 F 0.044 +29 V 0.042 +30 L 0.038 +31 F 0.036 +32 L 0.037 +33 P 0.040 +34 F 0.045 +35 Y 0.048 +36 A 0.050 +37 C 0.053 +38 T 0.058 +39 L 0.061 +40 V 0.061 +41 G 0.063 +42 N 0.066 +43 V 0.068 +44 S 0.067 +45 I 0.061 +46 L 0.054 +47 V 0.051 +48 A 0.054 +49 V 0.061 +50 I 0.072 +51 S 0.085 +52 S 0.093 +53 T 0.092 +54 R 0.086 +55 L 0.079 +56 H 0.071 +57 T 0.061 +58 P 0.048 +59 M 0.037 +60 Y 0.029 +61 F 0.025 +62 F 0.028 +63 L 0.036 +64 G 0.046 +65 N 0.053 +66 L 0.056 +67 S 0.055 +68 V 0.054 +69 F 0.061 +70 D 0.076 +71 M 0.090 +72 G 0.092 +73 F 0.083 +74 S 0.072 +75 S 0.068 +76 V 0.067 +77 T 0.067 +78 C 0.064 +79 P 0.058 +80 K 0.054 +81 M 0.052 +82 L 0.051 +83 F 0.049 +84 Y 0.053 +85 L 0.063 +86 M 0.075 +87 G 0.082 +88 L 0.081 +89 S 0.071 +90 R 0.058 +91 L 0.048 +92 I 0.043 +93 S 0.038 +94 Y 0.034 +95 Q 0.033 +96 D 0.033 +97 C 0.033 +98 V 0.032 +99 S 0.032 +100 Q 0.032 +101 L 0.031 +102 F 0.029 +103 F 0.026 +104 F 0.023 +105 H 0.024 +106 F 0.026 +107 L 0.030 +108 G 0.034 +109 S 0.039 +110 I 0.044 +111 E 0.044 +112 C 0.040 +113 F 0.035 +114 L 0.031 +115 Y 0.030 +116 T 0.030 +117 V 0.030 +118 M 0.032 +119 A 0.036 +120 Y 0.042 +121 D 0.048 +122 R 0.052 +123 F 0.052 +124 A 0.050 +125 A 0.048 +126 I 0.048 +127 C 0.051 +128 H 0.055 +129 P 0.056 +130 L 0.053 +131 R 0.049 +132 Y 0.047 +133 S 0.049 +134 V 0.054 +135 I 0.061 +136 M 0.067 +137 N 0.070 +138 S 0.071 +139 K 0.068 +140 I 0.061 +141 C 0.056 +142 V 0.061 +143 A 0.069 +144 L 0.069 +145 A 0.062 +146 V 0.059 +147 G 0.062 +148 T 0.067 +149 W 0.070 +150 L 0.071 +151 L 0.071 +152 G 0.068 +153 C 0.066 +154 F 0.066 +155 H 0.070 +156 S 0.074 +157 S 0.076 +158 V 0.081 +159 L 0.087 +160 T 0.089 +161 S 0.087 +162 L 0.084 +163 T 0.083 +164 F 0.087 +165 T 0.097 +166 L 0.108 +167 P 0.109 +168 Y 0.108 +169 C 0.112 +170 G 0.125 +171 P 0.141 +172 N 0.157 +173 E 0.171 +174 V 0.170 +175 D 0.149 +176 H 0.118 +177 F 0.092 +178 F 0.077 +179 C 0.074 +180 D 0.082 +181 I 0.100 +182 P 0.123 +183 A 0.142 +184 I 0.153 +185 L 0.160 +186 P 0.163 +187 L 0.165 +188 A 0.166 +189 S 0.169 +190 A 0.172 +191 D 0.168 +192 T 0.151 +193 S 0.126 +194 L 0.104 +195 A 0.093 +196 Q 0.089 +197 R 0.090 +198 V 0.092 +199 S 0.092 +200 F 0.089 +201 T 0.085 +202 N 0.081 +203 V 0.077 +204 G 0.075 +205 L 0.075 +206 V 0.076 +207 S 0.072 +208 L 0.067 +209 V 0.070 +210 C 0.082 +211 F 0.094 +212 L 0.097 +213 L 0.092 +214 I 0.080 +215 L 0.064 +216 L 0.049 +217 S 0.041 +218 Y 0.040 +219 T 0.043 +220 R 0.050 +221 I 0.063 +222 T 0.077 +223 I 0.088 +224 S 0.089 +225 I 0.085 +226 L 0.085 +227 S 0.096 +228 I 0.112 +229 Q 0.125 +230 S 0.128 +231 T 0.121 +232 E 0.110 +233 G 0.095 +234 R 0.080 +235 Q 0.069 +236 R 0.065 +237 A 0.065 +238 F 0.065 +239 S 0.066 +240 T 0.068 +241 C 0.071 +242 S 0.077 +243 A 0.081 +244 H 0.078 +245 L 0.070 +246 I 0.063 +247 A 0.058 +248 I 0.049 +249 L 0.038 +250 C 0.031 +251 A 0.032 +252 Y 0.039 +253 G 0.046 +254 P 0.047 +255 I 0.041 +256 I 0.035 +257 T 0.031 +258 I 0.034 +259 Y 0.047 +260 L 0.072 +261 Q 0.106 +262 P 0.144 +263 T 0.174 +264 P 0.182 +265 N 0.164 +266 P 0.129 +267 M 0.097 +268 L 0.077 +269 G 0.067 +270 T 0.063 +271 V 0.061 +272 V 0.057 +273 Q 0.052 +274 I 0.048 +275 L 0.051 +276 M 0.061 +277 N 0.073 +278 L 0.080 +279 V 0.081 +280 G 0.078 +281 P 0.076 +282 M 0.075 +283 L 0.074 +284 N 0.072 +285 P 0.068 +286 L 0.066 +287 I 0.066 +288 Y 0.067 +289 T 0.072 +290 L 0.084 +291 R 0.092 +292 N 0.085 +293 K 0.068 +294 E 0.055 +295 V 0.056 +296 K 0.068 +297 I 0.082 +298 A 0.088 +299 L 0.085 +300 K 0.086 +301 K 0.097 +302 I 0.124 +303 L 0.177 +304 H 0.262 +305 G 0.369 +306 K 0.473 +307 G 0.550 +308 S 0.593 +309 V 0.605 +310 S 0.584 +311 E 0.536 +312 G 0.490 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000050853.4_ENSMUST00000217227.2_GN:Or10d3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:11.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000050853.4_ENSMUST00000217227.2_GN:Or10d3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:11.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d181a280b8bd0e401d5da9eb460ed822cc8cb137 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000050853.4_ENSMUST00000217227.2_GN:Or10d3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:11.caid @@ -0,0 +1,324 @@ +>ENSMUSG00000050853.4|ENSMUST00000217227.2|GN:Or10d3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:11 +1 M 0.340 +2 L 0.355 +3 L 0.383 +4 L 0.410 +5 P 0.416 +6 L 0.403 +7 L 0.396 +8 E 0.408 +9 L 0.427 +10 P 0.439 +11 F 0.441 +12 M 0.438 +13 E 0.433 +14 I 0.422 +15 K 0.400 +16 N 0.368 +17 C 0.331 +18 S 0.296 +19 V 0.259 +20 V 0.215 +21 T 0.170 +22 E 0.138 +23 F 0.122 +24 I 0.120 +25 L 0.127 +26 L 0.149 +27 G 0.182 +28 I 0.212 +29 P 0.225 +30 H 0.221 +31 T 0.206 +32 E 0.185 +33 G 0.158 +34 F 0.125 +35 E 0.092 +36 T 0.065 +37 L 0.049 +38 L 0.044 +39 F 0.043 +40 V 0.041 +41 L 0.038 +42 F 0.036 +43 L 0.037 +44 P 0.040 +45 F 0.045 +46 Y 0.049 +47 A 0.050 +48 C 0.053 +49 T 0.058 +50 L 0.060 +51 V 0.060 +52 G 0.062 +53 N 0.065 +54 V 0.068 +55 S 0.067 +56 I 0.061 +57 L 0.054 +58 V 0.051 +59 A 0.053 +60 V 0.060 +61 I 0.070 +62 S 0.082 +63 S 0.090 +64 T 0.089 +65 R 0.083 +66 L 0.077 +67 H 0.069 +68 T 0.058 +69 P 0.046 +70 M 0.035 +71 Y 0.028 +72 F 0.024 +73 F 0.027 +74 L 0.035 +75 G 0.045 +76 N 0.053 +77 L 0.056 +78 S 0.055 +79 V 0.054 +80 F 0.059 +81 D 0.074 +82 M 0.088 +83 G 0.090 +84 F 0.081 +85 S 0.071 +86 S 0.066 +87 V 0.065 +88 T 0.064 +89 C 0.060 +90 P 0.055 +91 K 0.051 +92 M 0.049 +93 L 0.047 +94 F 0.046 +95 Y 0.049 +96 L 0.058 +97 M 0.070 +98 G 0.079 +99 L 0.079 +100 S 0.070 +101 R 0.057 +102 L 0.048 +103 I 0.042 +104 S 0.037 +105 Y 0.033 +106 Q 0.032 +107 D 0.033 +108 C 0.032 +109 V 0.031 +110 S 0.031 +111 Q 0.032 +112 L 0.031 +113 F 0.028 +114 F 0.025 +115 F 0.023 +116 H 0.024 +117 F 0.026 +118 L 0.030 +119 G 0.034 +120 S 0.039 +121 I 0.043 +122 E 0.044 +123 C 0.040 +124 F 0.035 +125 L 0.032 +126 Y 0.030 +127 T 0.030 +128 V 0.030 +129 M 0.032 +130 A 0.036 +131 Y 0.041 +132 D 0.047 +133 R 0.051 +134 F 0.052 +135 A 0.050 +136 A 0.048 +137 I 0.048 +138 C 0.051 +139 H 0.055 +140 P 0.056 +141 L 0.053 +142 R 0.049 +143 Y 0.047 +144 S 0.049 +145 V 0.054 +146 I 0.062 +147 M 0.068 +148 N 0.070 +149 S 0.071 +150 K 0.069 +151 I 0.061 +152 C 0.056 +153 V 0.061 +154 A 0.069 +155 L 0.068 +156 A 0.060 +157 V 0.056 +158 G 0.058 +159 T 0.060 +160 W 0.060 +161 L 0.059 +162 L 0.061 +163 G 0.063 +164 C 0.064 +165 F 0.066 +166 H 0.070 +167 S 0.074 +168 S 0.077 +169 V 0.081 +170 L 0.087 +171 T 0.089 +172 S 0.087 +173 L 0.084 +174 T 0.083 +175 F 0.086 +176 T 0.096 +177 L 0.106 +178 P 0.107 +179 Y 0.104 +180 C 0.109 +181 G 0.120 +182 P 0.136 +183 N 0.153 +184 E 0.166 +185 V 0.165 +186 D 0.144 +187 H 0.115 +188 F 0.090 +189 F 0.076 +190 C 0.073 +191 D 0.081 +192 I 0.099 +193 P 0.121 +194 A 0.139 +195 I 0.151 +196 L 0.157 +197 P 0.161 +198 L 0.163 +199 A 0.164 +200 S 0.165 +201 A 0.168 +202 D 0.164 +203 T 0.148 +204 S 0.123 +205 L 0.101 +206 A 0.090 +207 Q 0.087 +208 R 0.087 +209 V 0.089 +210 S 0.090 +211 F 0.088 +212 T 0.084 +213 N 0.080 +214 V 0.077 +215 G 0.074 +216 L 0.075 +217 V 0.077 +218 S 0.073 +219 L 0.067 +220 V 0.070 +221 C 0.082 +222 F 0.093 +223 L 0.096 +224 L 0.091 +225 I 0.079 +226 L 0.063 +227 L 0.049 +228 S 0.041 +229 Y 0.040 +230 T 0.043 +231 R 0.050 +232 I 0.062 +233 T 0.077 +234 I 0.088 +235 S 0.089 +236 I 0.084 +237 L 0.085 +238 S 0.095 +239 I 0.111 +240 Q 0.124 +241 S 0.127 +242 T 0.120 +243 E 0.109 +244 G 0.095 +245 R 0.080 +246 Q 0.069 +247 R 0.065 +248 A 0.064 +249 F 0.064 +250 S 0.065 +251 T 0.067 +252 C 0.070 +253 S 0.076 +254 A 0.080 +255 H 0.077 +256 L 0.070 +257 I 0.064 +258 A 0.059 +259 I 0.050 +260 L 0.039 +261 C 0.031 +262 A 0.031 +263 Y 0.039 +264 G 0.046 +265 P 0.046 +266 I 0.041 +267 I 0.035 +268 T 0.031 +269 I 0.034 +270 Y 0.047 +271 L 0.072 +272 Q 0.107 +273 P 0.146 +274 T 0.176 +275 P 0.184 +276 N 0.165 +277 P 0.130 +278 M 0.098 +279 L 0.078 +280 G 0.068 +281 T 0.064 +282 V 0.062 +283 V 0.058 +284 Q 0.052 +285 I 0.048 +286 L 0.052 +287 M 0.062 +288 N 0.074 +289 L 0.081 +290 V 0.082 +291 G 0.080 +292 P 0.077 +293 M 0.076 +294 L 0.075 +295 N 0.072 +296 P 0.069 +297 L 0.067 +298 I 0.067 +299 Y 0.068 +300 T 0.073 +301 L 0.085 +302 R 0.093 +303 N 0.086 +304 K 0.068 +305 E 0.055 +306 V 0.056 +307 K 0.068 +308 I 0.082 +309 A 0.087 +310 L 0.085 +311 K 0.085 +312 K 0.096 +313 I 0.123 +314 L 0.176 +315 H 0.261 +316 G 0.369 +317 K 0.474 +318 G 0.551 +319 S 0.594 +320 V 0.605 +321 S 0.585 +322 E 0.536 +323 G 0.490 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000051726.7_ENSMUST00000170580.3_GN:Kcnf1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000051726.7_ENSMUST00000170580.3_GN:Kcnf1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..bbba22b3a956bab999df61859205783e731a7498 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000051726.7_ENSMUST00000170580.3_GN:Kcnf1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,494 @@ +>ENSMUSG00000051726.7|ENSMUST00000170580.3|GN:Kcnf1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.386 +2 D 0.384 +3 A 0.403 +4 S 0.452 +5 A 0.504 +6 E 0.531 +7 Q 0.534 +8 S 0.530 +9 L 0.529 +10 P 0.540 +11 E 0.569 +12 P 0.607 +13 G 0.635 +14 S 0.646 +15 Q 0.649 +16 D 0.654 +17 S 0.659 +18 V 0.653 +19 A 0.628 +20 G 0.574 +21 E 0.480 +22 D 0.349 +23 I 0.214 +24 E 0.112 +25 I 0.053 +26 V 0.028 +27 V 0.023 +28 N 0.026 +29 V 0.034 +30 G 0.043 +31 G 0.052 +32 V 0.055 +33 R 0.051 +34 Q 0.045 +35 V 0.039 +36 L 0.035 +37 Y 0.032 +38 G 0.031 +39 D 0.033 +40 L 0.035 +41 L 0.037 +42 S 0.039 +43 Q 0.041 +44 Y 0.043 +45 P 0.042 +46 E 0.038 +47 T 0.035 +48 R 0.033 +49 L 0.037 +50 A 0.042 +51 E 0.046 +52 L 0.048 +53 I 0.052 +54 N 0.064 +55 C 0.083 +56 L 0.106 +57 A 0.125 +58 G 0.129 +59 G 0.114 +60 Y 0.090 +61 D 0.071 +62 T 0.059 +63 I 0.053 +64 F 0.056 +65 S 0.064 +66 L 0.070 +67 C 0.072 +68 D 0.070 +69 D 0.070 +70 Y 0.070 +71 D 0.069 +72 P 0.069 +73 G 0.070 +74 K 0.068 +75 R 0.064 +76 E 0.060 +77 F 0.058 +78 Y 0.062 +79 F 0.073 +80 D 0.085 +81 R 0.093 +82 D 0.093 +83 P 0.085 +84 D 0.073 +85 A 0.064 +86 F 0.058 +87 K 0.053 +88 C 0.049 +89 V 0.047 +90 I 0.044 +91 E 0.041 +92 V 0.040 +93 Y 0.042 +94 Y 0.047 +95 F 0.054 +96 G 0.060 +97 E 0.061 +98 V 0.062 +99 H 0.067 +100 M 0.078 +101 K 0.088 +102 K 0.096 +103 G 0.102 +104 I 0.101 +105 C 0.087 +106 P 0.064 +107 I 0.046 +108 C 0.037 +109 F 0.034 +110 K 0.033 +111 N 0.033 +112 E 0.034 +113 M 0.036 +114 D 0.038 +115 F 0.037 +116 W 0.037 +117 K 0.042 +118 V 0.051 +119 D 0.061 +120 L 0.065 +121 K 0.061 +122 F 0.051 +123 L 0.041 +124 D 0.034 +125 D 0.033 +126 C 0.037 +127 C 0.048 +128 K 0.063 +129 S 0.072 +130 H 0.068 +131 L 0.061 +132 S 0.060 +133 E 0.063 +134 K 0.070 +135 R 0.081 +136 E 0.091 +137 E 0.091 +138 L 0.086 +139 E 0.084 +140 E 0.088 +141 I 0.096 +142 A 0.105 +143 R 0.113 +144 R 0.117 +145 V 0.117 +146 Q 0.121 +147 L 0.135 +148 I 0.154 +149 L 0.171 +150 D 0.187 +151 D 0.208 +152 L 0.238 +153 G 0.272 +154 V 0.294 +155 D 0.291 +156 A 0.266 +157 A 0.232 +158 E 0.195 +159 G 0.157 +160 R 0.120 +161 W 0.091 +162 R 0.074 +163 R 0.065 +164 C 0.060 +165 Q 0.058 +166 K 0.056 +167 C 0.054 +168 V 0.054 +169 W 0.055 +170 K 0.055 +171 F 0.053 +172 L 0.051 +173 E 0.059 +174 K 0.081 +175 P 0.107 +176 E 0.117 +177 S 0.104 +178 S 0.083 +179 C 0.066 +180 P 0.057 +181 A 0.053 +182 R 0.049 +183 V 0.045 +184 V 0.042 +185 A 0.040 +186 V 0.042 +187 L 0.052 +188 S 0.066 +189 F 0.076 +190 L 0.075 +191 L 0.064 +192 I 0.052 +193 L 0.048 +194 V 0.050 +195 S 0.056 +196 S 0.059 +197 V 0.061 +198 V 0.063 +199 M 0.066 +200 C 0.075 +201 M 0.088 +202 G 0.097 +203 T 0.099 +204 I 0.103 +205 P 0.116 +206 E 0.136 +207 L 0.156 +208 Q 0.175 +209 V 0.196 +210 V 0.224 +211 D 0.257 +212 S 0.285 +213 E 0.301 +214 G 0.306 +215 N 0.299 +216 R 0.283 +217 V 0.257 +218 E 0.220 +219 H 0.172 +220 P 0.124 +221 T 0.090 +222 L 0.075 +223 E 0.069 +224 N 0.071 +225 V 0.080 +226 E 0.086 +227 T 0.084 +228 A 0.077 +229 C 0.073 +230 I 0.069 +231 G 0.063 +232 W 0.058 +233 F 0.056 +234 T 0.053 +235 L 0.052 +236 E 0.053 +237 Y 0.055 +238 L 0.056 +239 L 0.056 +240 R 0.056 +241 L 0.058 +242 F 0.063 +243 S 0.070 +244 S 0.071 +245 P 0.064 +246 N 0.051 +247 K 0.041 +248 L 0.037 +249 H 0.039 +250 F 0.041 +251 A 0.041 +252 L 0.038 +253 S 0.036 +254 F 0.037 +255 M 0.040 +256 N 0.045 +257 I 0.050 +258 V 0.054 +259 D 0.056 +260 V 0.055 +261 L 0.053 +262 A 0.052 +263 I 0.049 +264 L 0.044 +265 P 0.039 +266 F 0.035 +267 Y 0.034 +268 V 0.037 +269 S 0.042 +270 L 0.044 +271 T 0.049 +272 L 0.061 +273 T 0.078 +274 H 0.102 +275 L 0.136 +276 G 0.178 +277 A 0.212 +278 R 0.232 +279 M 0.245 +280 M 0.257 +281 E 0.268 +282 L 0.268 +283 T 0.257 +284 N 0.239 +285 V 0.217 +286 Q 0.198 +287 Q 0.186 +288 A 0.181 +289 V 0.174 +290 Q 0.162 +291 A 0.150 +292 L 0.145 +293 R 0.148 +294 I 0.153 +295 M 0.159 +296 R 0.163 +297 I 0.168 +298 A 0.172 +299 R 0.176 +300 I 0.180 +301 F 0.183 +302 K 0.182 +303 L 0.174 +304 A 0.167 +305 R 0.166 +306 H 0.172 +307 S 0.174 +308 S 0.171 +309 G 0.164 +310 L 0.153 +311 Q 0.139 +312 T 0.125 +313 L 0.111 +314 T 0.101 +315 Y 0.102 +316 A 0.107 +317 L 0.106 +318 K 0.099 +319 R 0.095 +320 S 0.089 +321 F 0.078 +322 K 0.068 +323 E 0.067 +324 L 0.070 +325 G 0.073 +326 L 0.075 +327 L 0.079 +328 L 0.082 +329 M 0.083 +330 Y 0.079 +331 L 0.075 +332 A 0.068 +333 V 0.058 +334 G 0.048 +335 I 0.042 +336 F 0.037 +337 V 0.033 +338 F 0.031 +339 S 0.031 +340 A 0.033 +341 L 0.035 +342 G 0.036 +343 Y 0.039 +344 T 0.046 +345 M 0.058 +346 E 0.071 +347 Q 0.087 +348 S 0.109 +349 H 0.137 +350 P 0.158 +351 E 0.163 +352 T 0.154 +353 L 0.140 +354 F 0.127 +355 K 0.113 +356 S 0.098 +357 I 0.084 +358 P 0.074 +359 Q 0.068 +360 S 0.065 +361 F 0.060 +362 W 0.057 +363 W 0.063 +364 A 0.074 +365 I 0.079 +366 I 0.079 +367 T 0.080 +368 M 0.082 +369 T 0.088 +370 T 0.106 +371 V 0.134 +372 G 0.156 +373 Y 0.160 +374 G 0.150 +375 D 0.136 +376 I 0.121 +377 Y 0.108 +378 P 0.098 +379 K 0.086 +380 T 0.072 +381 T 0.059 +382 L 0.054 +383 G 0.057 +384 K 0.064 +385 L 0.075 +386 N 0.086 +387 A 0.089 +388 A 0.083 +389 I 0.076 +390 S 0.073 +391 F 0.073 +392 L 0.076 +393 C 0.083 +394 G 0.094 +395 V 0.106 +396 I 0.122 +397 A 0.139 +398 I 0.151 +399 A 0.161 +400 L 0.172 +401 P 0.177 +402 I 0.165 +403 H 0.144 +404 P 0.127 +405 I 0.116 +406 I 0.103 +407 N 0.088 +408 N 0.074 +409 F 0.061 +410 V 0.050 +411 R 0.044 +412 Y 0.045 +413 Y 0.050 +414 N 0.055 +415 K 0.059 +416 Q 0.064 +417 R 0.074 +418 V 0.087 +419 L 0.103 +420 E 0.118 +421 T 0.133 +422 A 0.145 +423 A 0.159 +424 K 0.180 +425 H 0.205 +426 E 0.221 +427 L 0.225 +428 E 0.226 +429 L 0.229 +430 M 0.231 +431 E 0.239 +432 L 0.263 +433 N 0.303 +434 S 0.350 +435 S 0.402 +436 S 0.455 +437 A 0.501 +438 E 0.536 +439 G 0.566 +440 K 0.596 +441 P 0.628 +442 G 0.658 +443 G 0.667 +444 S 0.641 +445 R 0.592 +446 S 0.566 +447 D 0.582 +448 L 0.595 +449 D 0.566 +450 T 0.528 +451 L 0.532 +452 P 0.580 +453 P 0.642 +454 E 0.700 +455 P 0.744 +456 A 0.769 +457 A 0.769 +458 R 0.753 +459 E 0.729 +460 G 0.706 +461 P 0.688 +462 S 0.673 +463 W 0.655 +464 G 0.635 +465 S 0.632 +466 R 0.658 +467 L 0.696 +468 K 0.725 +469 L 0.737 +470 S 0.736 +471 H 0.723 +472 S 0.705 +473 D 0.691 +474 T 0.682 +475 F 0.679 +476 I 0.684 +477 P 0.692 +478 L 0.686 +479 L 0.659 +480 T 0.622 +481 E 0.587 +482 E 0.552 +483 K 0.520 +484 H 0.500 +485 H 0.481 +486 R 0.450 +487 T 0.425 +488 R 0.425 +489 L 0.437 +490 Q 0.442 +491 S 0.450 +492 C 0.462 +493 K 0.469 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000051726.7_ENSMUST00000170580.3_GN:Kcnf1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000051726.7_ENSMUST00000170580.3_GN:Kcnf1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..176000cdd422941a6d431b969ca8445dfe4e0278 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000051726.7_ENSMUST00000170580.3_GN:Kcnf1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid @@ -0,0 +1,506 @@ +>ENSMUSG00000051726.7|ENSMUST00000170580.3|GN:Kcnf1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:12 +1 M 0.411 +2 E 0.446 +3 P 0.491 +4 G 0.514 +5 L 0.499 +6 A 0.463 +7 S 0.448 +8 E 0.473 +9 P 0.497 +10 A 0.491 +11 G 0.485 +12 S 0.505 +13 M 0.523 +14 D 0.512 +15 A 0.499 +16 S 0.517 +17 A 0.547 +18 E 0.559 +19 Q 0.549 +20 S 0.532 +21 L 0.521 +22 P 0.530 +23 E 0.564 +24 P 0.609 +25 G 0.643 +26 S 0.657 +27 Q 0.657 +28 D 0.655 +29 S 0.653 +30 V 0.643 +31 A 0.618 +32 G 0.565 +33 E 0.471 +34 D 0.342 +35 I 0.210 +36 E 0.109 +37 I 0.052 +38 V 0.028 +39 V 0.023 +40 N 0.027 +41 V 0.034 +42 G 0.043 +43 G 0.051 +44 V 0.054 +45 R 0.051 +46 Q 0.045 +47 V 0.039 +48 L 0.035 +49 Y 0.032 +50 G 0.032 +51 D 0.034 +52 L 0.036 +53 L 0.039 +54 S 0.040 +55 Q 0.042 +56 Y 0.044 +57 P 0.043 +58 E 0.039 +59 T 0.035 +60 R 0.034 +61 L 0.036 +62 A 0.042 +63 E 0.045 +64 L 0.047 +65 I 0.051 +66 N 0.062 +67 C 0.081 +68 L 0.103 +69 A 0.122 +70 G 0.126 +71 G 0.111 +72 Y 0.087 +73 D 0.068 +74 T 0.056 +75 I 0.051 +76 F 0.053 +77 S 0.061 +78 L 0.068 +79 C 0.070 +80 D 0.069 +81 D 0.069 +82 Y 0.069 +83 D 0.069 +84 P 0.068 +85 G 0.069 +86 K 0.068 +87 R 0.064 +88 E 0.060 +89 F 0.059 +90 Y 0.063 +91 F 0.073 +92 D 0.085 +93 R 0.092 +94 D 0.091 +95 P 0.083 +96 D 0.072 +97 A 0.063 +98 F 0.058 +99 K 0.053 +100 C 0.049 +101 V 0.047 +102 I 0.044 +103 E 0.042 +104 V 0.041 +105 Y 0.042 +106 Y 0.047 +107 F 0.055 +108 G 0.061 +109 E 0.062 +110 V 0.063 +111 H 0.068 +112 M 0.079 +113 K 0.089 +114 K 0.097 +115 G 0.103 +116 I 0.102 +117 C 0.088 +118 P 0.065 +119 I 0.047 +120 C 0.038 +121 F 0.035 +122 K 0.034 +123 N 0.033 +124 E 0.035 +125 M 0.037 +126 D 0.038 +127 F 0.038 +128 W 0.038 +129 K 0.043 +130 V 0.052 +131 D 0.062 +132 L 0.067 +133 K 0.062 +134 F 0.052 +135 L 0.042 +136 D 0.035 +137 D 0.033 +138 C 0.037 +139 C 0.047 +140 K 0.061 +141 S 0.069 +142 H 0.066 +143 L 0.060 +144 S 0.058 +145 E 0.062 +146 K 0.069 +147 R 0.081 +148 E 0.090 +149 E 0.090 +150 L 0.085 +151 E 0.083 +152 E 0.087 +153 I 0.091 +154 A 0.096 +155 R 0.102 +156 R 0.109 +157 V 0.113 +158 Q 0.121 +159 L 0.137 +160 I 0.157 +161 L 0.174 +162 D 0.189 +163 D 0.209 +164 L 0.238 +165 G 0.271 +166 V 0.293 +167 D 0.291 +168 A 0.266 +169 A 0.230 +170 E 0.193 +171 G 0.155 +172 R 0.118 +173 W 0.090 +174 R 0.073 +175 R 0.064 +176 C 0.059 +177 Q 0.058 +178 K 0.056 +179 C 0.054 +180 V 0.054 +181 W 0.055 +182 K 0.055 +183 F 0.052 +184 L 0.050 +185 E 0.058 +186 K 0.080 +187 P 0.104 +188 E 0.114 +189 S 0.102 +190 S 0.080 +191 C 0.064 +192 P 0.056 +193 A 0.051 +194 R 0.048 +195 V 0.044 +196 V 0.041 +197 A 0.040 +198 V 0.042 +199 L 0.052 +200 S 0.066 +201 F 0.075 +202 L 0.074 +203 L 0.063 +204 I 0.052 +205 L 0.047 +206 V 0.050 +207 S 0.056 +208 S 0.059 +209 V 0.061 +210 V 0.063 +211 M 0.066 +212 C 0.074 +213 M 0.086 +214 G 0.095 +215 T 0.097 +216 I 0.101 +217 P 0.113 +218 E 0.132 +219 L 0.153 +220 Q 0.171 +221 V 0.192 +222 V 0.220 +223 D 0.253 +224 S 0.280 +225 E 0.297 +226 G 0.302 +227 N 0.296 +228 R 0.281 +229 V 0.256 +230 E 0.220 +231 H 0.172 +232 P 0.124 +233 T 0.090 +234 L 0.075 +235 E 0.070 +236 N 0.072 +237 V 0.081 +238 E 0.088 +239 T 0.085 +240 A 0.078 +241 C 0.074 +242 I 0.070 +243 G 0.064 +244 W 0.058 +245 F 0.056 +246 T 0.054 +247 L 0.052 +248 E 0.053 +249 Y 0.055 +250 L 0.056 +251 L 0.056 +252 R 0.057 +253 L 0.058 +254 F 0.064 +255 S 0.071 +256 S 0.072 +257 P 0.064 +258 N 0.052 +259 K 0.042 +260 L 0.038 +261 H 0.040 +262 F 0.043 +263 A 0.042 +264 L 0.039 +265 S 0.037 +266 F 0.038 +267 M 0.041 +268 N 0.046 +269 I 0.051 +270 V 0.054 +271 D 0.056 +272 V 0.056 +273 L 0.054 +274 A 0.053 +275 I 0.050 +276 L 0.045 +277 P 0.039 +278 F 0.035 +279 Y 0.034 +280 V 0.038 +281 S 0.043 +282 L 0.046 +283 T 0.050 +284 L 0.062 +285 T 0.080 +286 H 0.103 +287 L 0.138 +288 G 0.180 +289 A 0.216 +290 R 0.236 +291 M 0.248 +292 M 0.261 +293 E 0.270 +294 L 0.270 +295 T 0.259 +296 N 0.240 +297 V 0.217 +298 Q 0.197 +299 Q 0.186 +300 A 0.182 +301 V 0.176 +302 Q 0.165 +303 A 0.153 +304 L 0.147 +305 R 0.148 +306 I 0.153 +307 M 0.158 +308 R 0.162 +309 I 0.166 +310 A 0.171 +311 R 0.176 +312 I 0.181 +313 F 0.185 +314 K 0.184 +315 L 0.177 +316 A 0.169 +317 R 0.168 +318 H 0.173 +319 S 0.174 +320 S 0.171 +321 G 0.165 +322 L 0.154 +323 Q 0.140 +324 T 0.126 +325 L 0.112 +326 T 0.102 +327 Y 0.102 +328 A 0.107 +329 L 0.106 +330 K 0.099 +331 R 0.095 +332 S 0.090 +333 F 0.078 +334 K 0.068 +335 E 0.066 +336 L 0.070 +337 G 0.073 +338 L 0.075 +339 L 0.079 +340 L 0.082 +341 M 0.083 +342 Y 0.079 +343 L 0.074 +344 A 0.068 +345 V 0.058 +346 G 0.049 +347 I 0.042 +348 F 0.037 +349 V 0.033 +350 F 0.031 +351 S 0.031 +352 A 0.033 +353 L 0.034 +354 G 0.036 +355 Y 0.039 +356 T 0.046 +357 M 0.057 +358 E 0.070 +359 Q 0.085 +360 S 0.107 +361 H 0.134 +362 P 0.155 +363 E 0.160 +364 T 0.151 +365 L 0.138 +366 F 0.125 +367 K 0.111 +368 S 0.096 +369 I 0.082 +370 P 0.072 +371 Q 0.068 +372 S 0.065 +373 F 0.059 +374 W 0.057 +375 W 0.063 +376 A 0.074 +377 I 0.078 +378 I 0.079 +379 T 0.079 +380 M 0.080 +381 T 0.084 +382 T 0.100 +383 V 0.127 +384 G 0.149 +385 Y 0.155 +386 G 0.147 +387 D 0.134 +388 I 0.120 +389 Y 0.108 +390 P 0.098 +391 K 0.086 +392 T 0.071 +393 T 0.059 +394 L 0.054 +395 G 0.056 +396 K 0.064 +397 L 0.075 +398 N 0.086 +399 A 0.089 +400 A 0.083 +401 I 0.076 +402 S 0.073 +403 F 0.074 +404 L 0.076 +405 C 0.083 +406 G 0.094 +407 V 0.106 +408 I 0.122 +409 A 0.139 +410 I 0.150 +411 A 0.159 +412 L 0.170 +413 P 0.173 +414 I 0.161 +415 H 0.140 +416 P 0.124 +417 I 0.112 +418 I 0.100 +419 N 0.086 +420 N 0.073 +421 F 0.060 +422 V 0.050 +423 R 0.044 +424 Y 0.045 +425 Y 0.050 +426 N 0.055 +427 K 0.059 +428 Q 0.064 +429 R 0.073 +430 V 0.086 +431 L 0.101 +432 E 0.118 +433 T 0.132 +434 A 0.144 +435 A 0.158 +436 K 0.178 +437 H 0.202 +438 E 0.219 +439 L 0.226 +440 E 0.230 +441 L 0.235 +442 M 0.237 +443 E 0.246 +444 L 0.272 +445 N 0.313 +446 S 0.361 +447 S 0.413 +448 S 0.463 +449 A 0.506 +450 E 0.539 +451 G 0.566 +452 K 0.596 +453 P 0.629 +454 G 0.658 +455 G 0.667 +456 S 0.641 +457 R 0.593 +458 S 0.569 +459 D 0.595 +460 L 0.629 +461 D 0.629 +462 T 0.606 +463 L 0.596 +464 P 0.613 +465 P 0.654 +466 E 0.704 +467 P 0.746 +468 A 0.768 +469 A 0.768 +470 R 0.752 +471 E 0.729 +472 G 0.709 +473 P 0.695 +474 S 0.689 +475 W 0.692 +476 G 0.701 +477 S 0.713 +478 R 0.723 +479 L 0.732 +480 K 0.739 +481 L 0.743 +482 S 0.739 +483 H 0.726 +484 S 0.709 +485 D 0.697 +486 T 0.690 +487 F 0.687 +488 I 0.691 +489 P 0.698 +490 L 0.694 +491 L 0.669 +492 T 0.634 +493 E 0.601 +494 E 0.576 +495 K 0.561 +496 H 0.559 +497 H 0.566 +498 R 0.570 +499 T 0.569 +500 R 0.561 +501 L 0.549 +502 Q 0.539 +503 S 0.540 +504 C 0.549 +505 K 0.556 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000052146.17_ENSMUST00000114882.9_GN:Rps10_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000052146.17_ENSMUST00000114882.9_GN:Rps10_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0cc05befb1ff9352f42a84de575469182055cb81 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000052146.17_ENSMUST00000114882.9_GN:Rps10_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,166 @@ +>ENSMUSG00000052146.17|ENSMUST00000114882.9|GN:Rps10|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.280 +2 L 0.253 +3 M 0.209 +4 P 0.158 +5 K 0.112 +6 K 0.077 +7 N 0.056 +8 R 0.046 +9 I 0.043 +10 A 0.041 +11 I 0.038 +12 Y 0.034 +13 E 0.031 +14 L 0.030 +15 L 0.027 +16 F 0.023 +17 K 0.021 +18 E 0.023 +19 G 0.025 +20 V 0.029 +21 M 0.035 +22 V 0.043 +23 A 0.052 +24 K 0.062 +25 K 0.073 +26 D 0.085 +27 V 0.095 +28 H 0.104 +29 M 0.115 +30 P 0.126 +31 K 0.131 +32 H 0.124 +33 P 0.109 +34 E 0.094 +35 L 0.086 +36 A 0.089 +37 D 0.100 +38 K 0.114 +39 N 0.123 +40 V 0.118 +41 P 0.100 +42 N 0.078 +43 L 0.061 +44 H 0.052 +45 V 0.048 +46 M 0.048 +47 K 0.049 +48 A 0.050 +49 M 0.050 +50 Q 0.050 +51 S 0.048 +52 L 0.045 +53 K 0.041 +54 S 0.038 +55 R 0.037 +56 G 0.035 +57 Y 0.032 +58 V 0.032 +59 K 0.034 +60 E 0.042 +61 Q 0.054 +62 F 0.066 +63 A 0.071 +64 W 0.066 +65 R 0.055 +66 H 0.041 +67 F 0.030 +68 Y 0.023 +69 W 0.021 +70 Y 0.023 +71 L 0.025 +72 T 0.026 +73 N 0.026 +74 E 0.028 +75 G 0.036 +76 I 0.050 +77 Q 0.062 +78 Y 0.066 +79 L 0.069 +80 R 0.075 +81 D 0.080 +82 Y 0.078 +83 L 0.077 +84 H 0.081 +85 L 0.090 +86 P 0.098 +87 P 0.103 +88 E 0.105 +89 I 0.106 +90 V 0.118 +91 P 0.150 +92 A 0.197 +93 T 0.256 +94 L 0.329 +95 R 0.415 +96 R 0.502 +97 S 0.569 +98 R 0.614 +99 P 0.647 +100 E 0.674 +101 T 0.689 +102 G 0.688 +103 R 0.682 +104 P 0.685 +105 R 0.702 +106 P 0.721 +107 K 0.735 +108 G 0.743 +109 P 0.749 +110 E 0.749 +111 G 0.740 +112 E 0.725 +113 R 0.716 +114 P 0.719 +115 A 0.730 +116 R 0.741 +117 F 0.753 +118 T 0.765 +119 R 0.772 +120 G 0.773 +121 E 0.767 +122 A 0.755 +123 D 0.735 +124 R 0.708 +125 D 0.680 +126 T 0.658 +127 Y 0.653 +128 R 0.671 +129 R 0.703 +130 S 0.728 +131 A 0.736 +132 V 0.739 +133 P 0.755 +134 P 0.786 +135 G 0.817 +136 A 0.833 +137 D 0.837 +138 K 0.838 +139 K 0.842 +140 A 0.845 +141 E 0.844 +142 A 0.838 +143 G 0.830 +144 A 0.825 +145 G 0.821 +146 S 0.815 +147 A 0.798 +148 T 0.765 +149 E 0.720 +150 F 0.682 +151 Q 0.668 +152 F 0.679 +153 R 0.700 +154 G 0.721 +155 G 0.738 +156 F 0.749 +157 G 0.756 +158 R 0.761 +159 G 0.767 +160 R 0.764 +161 G 0.746 +162 Q 0.715 +163 P 0.669 +164 P 0.607 +165 Q 0.557 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000052146.17_ENSMUST00000114882.9_GN:Rps10_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:95.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000052146.17_ENSMUST00000114882.9_GN:Rps10_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:95.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7432314f1309c65ad49292694b80d28155b6f56e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000052146.17_ENSMUST00000114882.9_GN:Rps10_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:95.caid @@ -0,0 +1,261 @@ +>ENSMUSG00000052146.17|ENSMUST00000114882.9|GN:Rps10|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:95 +1 M 0.524 +2 R 0.555 +3 T 0.587 +4 G 0.590 +5 L 0.562 +6 S 0.547 +7 A 0.572 +8 P 0.601 +9 S 0.594 +10 A 0.582 +11 C 0.607 +12 T 0.657 +13 P 0.695 +14 A 0.718 +15 P 0.733 +16 D 0.743 +17 T 0.748 +18 T 0.752 +19 H 0.756 +20 G 0.759 +21 L 0.756 +22 A 0.751 +23 I 0.746 +24 S 0.743 +25 R 0.743 +26 W 0.752 +27 G 0.767 +28 R 0.780 +29 G 0.789 +30 G 0.796 +31 G 0.800 +32 G 0.801 +33 G 0.801 +34 G 0.801 +35 K 0.802 +36 R 0.801 +37 S 0.798 +38 G 0.792 +39 M 0.787 +40 A 0.786 +41 R 0.787 +42 T 0.785 +43 C 0.779 +44 V 0.766 +45 L 0.749 +46 A 0.730 +47 P 0.718 +48 S 0.719 +49 P 0.729 +50 L 0.743 +51 L 0.759 +52 R 0.774 +53 H 0.785 +54 C 0.790 +55 R 0.791 +56 G 0.792 +57 H 0.797 +58 P 0.806 +59 R 0.818 +60 Q 0.825 +61 R 0.819 +62 A 0.801 +63 G 0.787 +64 P 0.785 +65 A 0.791 +66 G 0.793 +67 R 0.781 +68 R 0.748 +69 S 0.687 +70 R 0.610 +71 A 0.566 +72 A 0.575 +73 R 0.591 +74 K 0.580 +75 R 0.578 +76 R 0.623 +77 C 0.690 +78 A 0.729 +79 A 0.734 +80 H 0.722 +81 A 0.710 +82 P 0.707 +83 S 0.715 +84 F 0.730 +85 P 0.753 +86 A 0.776 +87 S 0.785 +88 A 0.770 +89 S 0.741 +90 D 0.713 +91 P 0.696 +92 A 0.684 +93 A 0.658 +94 A 0.598 +95 A 0.506 +96 M 0.401 +97 L 0.307 +98 M 0.231 +99 P 0.168 +100 K 0.115 +101 K 0.076 +102 N 0.052 +103 R 0.041 +104 I 0.038 +105 A 0.036 +106 I 0.034 +107 Y 0.030 +108 E 0.029 +109 L 0.027 +110 L 0.025 +111 F 0.021 +112 K 0.020 +113 E 0.021 +114 G 0.024 +115 V 0.027 +116 M 0.032 +117 V 0.039 +118 A 0.048 +119 K 0.057 +120 K 0.068 +121 D 0.079 +122 V 0.088 +123 H 0.098 +124 M 0.110 +125 P 0.122 +126 K 0.127 +127 H 0.121 +128 P 0.107 +129 E 0.093 +130 L 0.085 +131 A 0.085 +132 D 0.094 +133 K 0.107 +134 N 0.115 +135 V 0.111 +136 P 0.094 +137 N 0.072 +138 L 0.055 +139 H 0.047 +140 V 0.044 +141 M 0.043 +142 K 0.043 +143 A 0.044 +144 M 0.046 +145 Q 0.048 +146 S 0.048 +147 L 0.045 +148 K 0.041 +149 S 0.037 +150 R 0.035 +151 G 0.034 +152 Y 0.032 +153 V 0.031 +154 K 0.034 +155 E 0.042 +156 Q 0.053 +157 F 0.062 +158 A 0.066 +159 W 0.062 +160 R 0.052 +161 H 0.039 +162 F 0.028 +163 Y 0.022 +164 W 0.021 +165 Y 0.022 +166 L 0.024 +167 T 0.025 +168 N 0.026 +169 E 0.028 +170 G 0.036 +171 I 0.048 +172 Q 0.059 +173 Y 0.061 +174 L 0.057 +175 R 0.053 +176 D 0.052 +177 Y 0.056 +178 L 0.063 +179 H 0.075 +180 L 0.086 +181 P 0.094 +182 P 0.100 +183 E 0.102 +184 I 0.103 +185 V 0.113 +186 P 0.143 +187 A 0.190 +188 T 0.250 +189 L 0.325 +190 R 0.414 +191 R 0.502 +192 S 0.570 +193 R 0.616 +194 P 0.651 +195 E 0.681 +196 T 0.696 +197 G 0.694 +198 R 0.687 +199 P 0.691 +200 R 0.708 +201 P 0.729 +202 K 0.744 +203 G 0.753 +204 P 0.761 +205 E 0.763 +206 G 0.756 +207 E 0.744 +208 R 0.738 +209 P 0.743 +210 A 0.755 +211 R 0.767 +212 F 0.779 +213 T 0.790 +214 R 0.797 +215 G 0.796 +216 E 0.789 +217 A 0.776 +218 D 0.756 +219 R 0.729 +220 D 0.703 +221 T 0.685 +222 Y 0.683 +223 R 0.700 +224 R 0.727 +225 S 0.747 +226 A 0.753 +227 V 0.755 +228 P 0.770 +229 P 0.801 +230 G 0.832 +231 A 0.848 +232 D 0.852 +233 K 0.852 +234 K 0.855 +235 A 0.858 +236 E 0.857 +237 A 0.852 +238 G 0.847 +239 A 0.844 +240 G 0.841 +241 S 0.835 +242 A 0.817 +243 T 0.784 +244 E 0.740 +245 F 0.702 +246 Q 0.689 +247 F 0.700 +248 R 0.722 +249 G 0.744 +250 G 0.763 +251 F 0.776 +252 G 0.783 +253 R 0.787 +254 G 0.792 +255 R 0.789 +256 G 0.773 +257 Q 0.744 +258 P 0.702 +259 P 0.647 +260 Q 0.605 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000053483.16_ENSMUST00000111305.8_GN:Usp21_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000053483.16_ENSMUST00000111305.8_GN:Usp21_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..87619ade4fc1373edc6ff6e3748e0b069fe544f7 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000053483.16_ENSMUST00000111305.8_GN:Usp21_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,567 @@ +>ENSMUSG00000053483.16|ENSMUST00000111305.8|GN:Usp21|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.414 +2 P 0.443 +3 Q 0.476 +4 A 0.478 +5 S 0.436 +6 E 0.394 +7 H 0.418 +8 R 0.508 +9 L 0.600 +10 G 0.647 +11 R 0.644 +12 T 0.600 +13 R 0.538 +14 E 0.514 +15 P 0.560 +16 P 0.639 +17 V 0.694 +18 N 0.713 +19 V 0.714 +20 Q 0.719 +21 P 0.735 +22 R 0.756 +23 V 0.770 +24 G 0.768 +25 A 0.743 +26 K 0.697 +27 I 0.643 +28 P 0.601 +29 F 0.578 +30 P 0.563 +31 P 0.550 +32 R 0.563 +33 A 0.618 +34 R 0.681 +35 S 0.716 +36 K 0.728 +37 E 0.735 +38 R 0.741 +39 R 0.741 +40 N 0.737 +41 P 0.732 +42 V 0.730 +43 P 0.738 +44 G 0.753 +45 P 0.767 +46 N 0.768 +47 S 0.753 +48 M 0.732 +49 L 0.715 +50 R 0.705 +51 P 0.701 +52 L 0.698 +53 P 0.696 +54 P 0.699 +55 R 0.706 +56 P 0.709 +57 G 0.708 +58 P 0.712 +59 P 0.726 +60 D 0.738 +61 E 0.733 +62 R 0.705 +63 L 0.657 +64 K 0.606 +65 K 0.593 +66 L 0.642 +67 E 0.719 +68 L 0.775 +69 G 0.802 +70 R 0.812 +71 G 0.815 +72 R 0.816 +73 T 0.816 +74 S 0.811 +75 G 0.803 +76 S 0.793 +77 R 0.786 +78 P 0.785 +79 R 0.788 +80 G 0.792 +81 P 0.795 +82 L 0.797 +83 R 0.800 +84 A 0.804 +85 D 0.807 +86 H 0.806 +87 G 0.800 +88 V 0.792 +89 P 0.787 +90 L 0.787 +91 P 0.786 +92 G 0.774 +93 S 0.755 +94 P 0.747 +95 P 0.763 +96 P 0.792 +97 A 0.813 +98 V 0.813 +99 A 0.796 +100 L 0.773 +101 P 0.759 +102 L 0.761 +103 P 0.772 +104 S 0.782 +105 R 0.787 +106 T 0.790 +107 N 0.793 +108 L 0.791 +109 A 0.784 +110 R 0.776 +111 S 0.772 +112 K 0.767 +113 S 0.763 +114 V 0.763 +115 S 0.768 +116 S 0.777 +117 G 0.783 +118 D 0.781 +119 L 0.771 +120 R 0.769 +121 P 0.783 +122 M 0.805 +123 G 0.822 +124 I 0.826 +125 A 0.820 +126 L 0.811 +127 G 0.803 +128 G 0.801 +129 H 0.806 +130 R 0.813 +131 G 0.813 +132 A 0.802 +133 G 0.777 +134 E 0.734 +135 L 0.665 +136 G 0.581 +137 A 0.521 +138 A 0.512 +139 L 0.539 +140 S 0.576 +141 R 0.616 +142 L 0.652 +143 A 0.669 +144 L 0.658 +145 R 0.637 +146 P 0.632 +147 E 0.649 +148 P 0.679 +149 P 0.709 +150 T 0.734 +151 L 0.749 +152 R 0.744 +153 R 0.720 +154 S 0.690 +155 T 0.667 +156 S 0.642 +157 L 0.613 +158 R 0.613 +159 R 0.667 +160 L 0.738 +161 G 0.777 +162 G 0.779 +163 F 0.765 +164 P 0.755 +165 G 0.754 +166 P 0.764 +167 P 0.781 +168 T 0.795 +169 L 0.801 +170 L 0.799 +171 S 0.790 +172 I 0.774 +173 R 0.756 +174 T 0.739 +175 E 0.725 +176 P 0.723 +177 P 0.736 +178 T 0.757 +179 S 0.772 +180 H 0.776 +181 G 0.769 +182 S 0.757 +183 F 0.748 +184 H 0.747 +185 M 0.747 +186 I 0.738 +187 S 0.716 +188 A 0.688 +189 R 0.662 +190 P 0.647 +191 S 0.644 +192 E 0.647 +193 P 0.640 +194 F 0.612 +195 Y 0.569 +196 S 0.524 +197 D 0.488 +198 D 0.462 +199 K 0.440 +200 M 0.424 +201 A 0.414 +202 H 0.408 +203 H 0.401 +204 T 0.388 +205 L 0.368 +206 L 0.335 +207 L 0.294 +208 G 0.255 +209 S 0.221 +210 G 0.186 +211 H 0.147 +212 V 0.113 +213 G 0.094 +214 L 0.093 +215 R 0.102 +216 N 0.109 +217 L 0.106 +218 G 0.095 +219 N 0.084 +220 T 0.078 +221 C 0.075 +222 F 0.072 +223 L 0.069 +224 N 0.067 +225 A 0.067 +226 V 0.068 +227 L 0.068 +228 Q 0.064 +229 C 0.057 +230 L 0.049 +231 S 0.041 +232 S 0.035 +233 T 0.030 +234 R 0.026 +235 P 0.024 +236 L 0.023 +237 R 0.022 +238 D 0.023 +239 F 0.025 +240 C 0.028 +241 L 0.033 +242 R 0.038 +243 R 0.045 +244 D 0.053 +245 F 0.062 +246 R 0.074 +247 Q 0.095 +248 E 0.128 +249 V 0.166 +250 P 0.202 +251 G 0.229 +252 G 0.241 +253 G 0.233 +254 R 0.209 +255 A 0.170 +256 Q 0.123 +257 E 0.083 +258 L 0.061 +259 T 0.053 +260 E 0.050 +261 A 0.046 +262 F 0.041 +263 A 0.037 +264 D 0.037 +265 V 0.040 +266 I 0.043 +267 G 0.045 +268 A 0.046 +269 L 0.050 +270 W 0.060 +271 H 0.076 +272 P 0.093 +273 D 0.109 +274 S 0.118 +275 C 0.114 +276 E 0.103 +277 A 0.094 +278 V 0.088 +279 N 0.081 +280 P 0.071 +281 T 0.058 +282 R 0.048 +283 F 0.047 +284 R 0.054 +285 A 0.060 +286 V 0.054 +287 F 0.041 +288 Q 0.030 +289 K 0.025 +290 Y 0.026 +291 V 0.034 +292 P 0.046 +293 S 0.064 +294 F 0.086 +295 S 0.106 +296 G 0.117 +297 Y 0.120 +298 S 0.116 +299 Q 0.106 +300 Q 0.094 +301 D 0.085 +302 A 0.076 +303 Q 0.068 +304 E 0.064 +305 F 0.063 +306 L 0.062 +307 K 0.061 +308 L 0.063 +309 L 0.067 +310 M 0.066 +311 E 0.062 +312 R 0.061 +313 L 0.067 +314 H 0.076 +315 L 0.087 +316 E 0.100 +317 I 0.117 +318 N 0.144 +319 R 0.184 +320 R 0.239 +321 G 0.300 +322 R 0.358 +323 R 0.413 +324 A 0.466 +325 P 0.513 +326 P 0.552 +327 I 0.579 +328 L 0.587 +329 A 0.573 +330 S 0.549 +331 G 0.528 +332 P 0.517 +333 V 0.511 +334 P 0.511 +335 S 0.524 +336 P 0.554 +337 P 0.595 +338 C 0.631 +339 R 0.654 +340 G 0.661 +341 G 0.648 +342 G 0.617 +343 A 0.573 +344 L 0.531 +345 H 0.500 +346 E 0.479 +347 E 0.454 +348 P 0.408 +349 E 0.337 +350 L 0.263 +351 S 0.199 +352 D 0.147 +353 D 0.111 +354 D 0.091 +355 R 0.082 +356 A 0.080 +357 N 0.080 +358 L 0.081 +359 M 0.081 +360 W 0.083 +361 K 0.090 +362 R 0.097 +363 Y 0.102 +364 L 0.108 +365 E 0.115 +366 R 0.115 +367 E 0.106 +368 D 0.094 +369 S 0.085 +370 K 0.086 +371 I 0.094 +372 V 0.099 +373 D 0.095 +374 L 0.084 +375 F 0.072 +376 V 0.066 +377 G 0.066 +378 Q 0.068 +379 L 0.066 +380 K 0.059 +381 S 0.053 +382 C 0.051 +383 L 0.055 +384 K 0.064 +385 C 0.071 +386 Q 0.074 +387 A 0.079 +388 C 0.094 +389 G 0.114 +390 Y 0.128 +391 R 0.135 +392 S 0.136 +393 T 0.134 +394 T 0.124 +395 F 0.107 +396 E 0.091 +397 V 0.078 +398 F 0.067 +399 C 0.057 +400 D 0.050 +401 L 0.049 +402 S 0.059 +403 L 0.083 +404 P 0.119 +405 I 0.159 +406 P 0.195 +407 K 0.233 +408 K 0.274 +409 G 0.311 +410 F 0.335 +411 A 0.346 +412 G 0.343 +413 G 0.315 +414 K 0.262 +415 V 0.199 +416 S 0.144 +417 L 0.108 +418 R 0.090 +419 D 0.085 +420 C 0.085 +421 F 0.087 +422 S 0.096 +423 L 0.111 +424 F 0.126 +425 T 0.133 +426 K 0.134 +427 E 0.133 +428 E 0.132 +429 E 0.131 +430 L 0.130 +431 E 0.133 +432 S 0.142 +433 E 0.156 +434 N 0.164 +435 A 0.157 +436 P 0.134 +437 V 0.107 +438 C 0.085 +439 D 0.071 +440 R 0.069 +441 C 0.077 +442 R 0.092 +443 Q 0.107 +444 K 0.116 +445 T 0.118 +446 R 0.121 +447 S 0.128 +448 T 0.137 +449 K 0.137 +450 K 0.125 +451 L 0.104 +452 T 0.087 +453 V 0.084 +454 Q 0.087 +455 R 0.088 +456 F 0.082 +457 P 0.073 +458 R 0.065 +459 I 0.061 +460 L 0.057 +461 V 0.055 +462 L 0.054 +463 H 0.059 +464 L 0.071 +465 N 0.091 +466 R 0.116 +467 F 0.141 +468 S 0.169 +469 T 0.199 +470 S 0.227 +471 R 0.240 +472 G 0.234 +473 S 0.217 +474 I 0.203 +475 K 0.197 +476 K 0.198 +477 S 0.201 +478 S 0.199 +479 V 0.185 +480 G 0.161 +481 V 0.135 +482 D 0.116 +483 F 0.107 +484 P 0.100 +485 L 0.089 +486 Q 0.075 +487 R 0.065 +488 L 0.065 +489 S 0.070 +490 L 0.076 +491 G 0.079 +492 D 0.078 +493 F 0.082 +494 A 0.104 +495 S 0.143 +496 D 0.188 +497 K 0.221 +498 A 0.228 +499 G 0.208 +500 S 0.170 +501 P 0.130 +502 V 0.100 +503 Y 0.083 +504 Q 0.072 +505 L 0.062 +506 Y 0.057 +507 A 0.060 +508 L 0.069 +509 C 0.084 +510 N 0.107 +511 H 0.133 +512 S 0.153 +513 G 0.161 +514 S 0.155 +515 V 0.143 +516 H 0.136 +517 Y 0.139 +518 G 0.140 +519 H 0.124 +520 Y 0.095 +521 T 0.070 +522 A 0.056 +523 L 0.050 +524 C 0.048 +525 R 0.050 +526 C 0.058 +527 Q 0.067 +528 T 0.070 +529 G 0.065 +530 W 0.056 +531 H 0.046 +532 V 0.039 +533 Y 0.036 +534 N 0.037 +535 D 0.042 +536 S 0.050 +537 R 0.059 +538 V 0.067 +539 S 0.072 +540 P 0.072 +541 V 0.068 +542 S 0.066 +543 E 0.069 +544 N 0.072 +545 Q 0.070 +546 V 0.070 +547 A 0.079 +548 S 0.092 +549 S 0.097 +550 E 0.089 +551 G 0.073 +552 Y 0.057 +553 V 0.045 +554 L 0.037 +555 F 0.033 +556 Y 0.036 +557 Q 0.051 +558 L 0.088 +559 M 0.150 +560 Q 0.221 +561 E 0.274 +562 P 0.295 +563 L 0.290 +564 R 0.276 +565 C 0.265 +566 L 0.259 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000053483.16_ENSMUST00000111305.8_GN:Usp21_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000053483.16_ENSMUST00000111305.8_GN:Usp21_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ce739497b2f18f1714b36b2446cec3e28c08885d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000053483.16_ENSMUST00000111305.8_GN:Usp21_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid @@ -0,0 +1,600 @@ +>ENSMUSG00000053483.16|ENSMUST00000111305.8|GN:Usp21|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:33 +1 M 0.290 +2 K 0.299 +3 K 0.311 +4 T 0.317 +5 A 0.308 +6 C 0.288 +7 M 0.271 +8 I 0.267 +9 A 0.271 +10 C 0.275 +11 I 0.282 +12 F 0.293 +13 S 0.300 +14 P 0.300 +15 F 0.304 +16 L 0.319 +17 I 0.336 +18 Q 0.357 +19 T 0.384 +20 L 0.402 +21 T 0.408 +22 L 0.417 +23 F 0.451 +24 S 0.508 +25 P 0.572 +26 Q 0.624 +27 V 0.655 +28 Q 0.669 +29 P 0.675 +30 V 0.677 +31 V 0.677 +32 P 0.674 +33 T 0.662 +34 M 0.630 +35 P 0.589 +36 Q 0.577 +37 A 0.608 +38 S 0.633 +39 E 0.620 +40 H 0.611 +41 R 0.653 +42 L 0.721 +43 G 0.766 +44 R 0.776 +45 T 0.763 +46 R 0.741 +47 E 0.727 +48 P 0.732 +49 P 0.753 +50 V 0.777 +51 N 0.787 +52 V 0.785 +53 Q 0.785 +54 P 0.795 +55 R 0.812 +56 V 0.824 +57 G 0.822 +58 A 0.803 +59 K 0.768 +60 I 0.726 +61 P 0.690 +62 F 0.666 +63 P 0.640 +64 P 0.610 +65 R 0.610 +66 A 0.662 +67 R 0.734 +68 S 0.780 +69 K 0.798 +70 E 0.803 +71 R 0.802 +72 R 0.796 +73 N 0.788 +74 P 0.781 +75 V 0.780 +76 P 0.788 +77 G 0.801 +78 P 0.813 +79 N 0.816 +80 S 0.807 +81 M 0.791 +82 L 0.778 +83 R 0.769 +84 P 0.762 +85 L 0.758 +86 P 0.754 +87 P 0.753 +88 R 0.753 +89 P 0.751 +90 G 0.745 +91 P 0.746 +92 P 0.754 +93 D 0.760 +94 E 0.751 +95 R 0.720 +96 L 0.667 +97 K 0.609 +98 K 0.590 +99 L 0.633 +100 E 0.705 +101 L 0.757 +102 G 0.782 +103 R 0.791 +104 G 0.793 +105 R 0.793 +106 T 0.792 +107 S 0.787 +108 G 0.779 +109 S 0.770 +110 R 0.764 +111 P 0.761 +112 R 0.764 +113 G 0.769 +114 P 0.774 +115 L 0.778 +116 R 0.780 +117 A 0.785 +118 D 0.789 +119 H 0.790 +120 G 0.782 +121 V 0.771 +122 P 0.764 +123 L 0.767 +124 P 0.770 +125 G 0.764 +126 S 0.748 +127 P 0.742 +128 P 0.756 +129 P 0.784 +130 A 0.806 +131 V 0.806 +132 A 0.789 +133 L 0.766 +134 P 0.752 +135 L 0.756 +136 P 0.770 +137 S 0.784 +138 R 0.793 +139 T 0.798 +140 N 0.803 +141 L 0.804 +142 A 0.800 +143 R 0.795 +144 S 0.791 +145 K 0.786 +146 S 0.782 +147 V 0.782 +148 S 0.787 +149 S 0.795 +150 G 0.802 +151 D 0.801 +152 L 0.795 +153 R 0.794 +154 P 0.807 +155 M 0.827 +156 G 0.843 +157 I 0.848 +158 A 0.844 +159 L 0.833 +160 G 0.824 +161 G 0.819 +162 H 0.821 +163 R 0.826 +164 G 0.825 +165 A 0.815 +166 G 0.793 +167 E 0.752 +168 L 0.683 +169 G 0.599 +170 A 0.539 +171 A 0.533 +172 L 0.563 +173 S 0.602 +174 R 0.643 +175 L 0.679 +176 A 0.692 +177 L 0.677 +178 R 0.655 +179 P 0.651 +180 E 0.672 +181 P 0.704 +182 P 0.736 +183 T 0.761 +184 L 0.775 +185 R 0.771 +186 R 0.749 +187 S 0.723 +188 T 0.713 +189 S 0.726 +190 L 0.749 +191 R 0.774 +192 R 0.797 +193 L 0.809 +194 G 0.808 +195 G 0.795 +196 F 0.779 +197 P 0.768 +198 G 0.765 +199 P 0.773 +200 P 0.788 +201 T 0.802 +202 L 0.808 +203 L 0.806 +204 S 0.797 +205 I 0.781 +206 R 0.765 +207 T 0.748 +208 E 0.736 +209 P 0.733 +210 P 0.744 +211 T 0.761 +212 S 0.773 +213 H 0.775 +214 G 0.768 +215 S 0.758 +216 F 0.751 +217 H 0.751 +218 M 0.752 +219 I 0.744 +220 S 0.724 +221 A 0.698 +222 R 0.675 +223 P 0.660 +224 S 0.654 +225 E 0.654 +226 P 0.648 +227 F 0.624 +228 Y 0.582 +229 S 0.536 +230 D 0.498 +231 D 0.470 +232 K 0.450 +233 M 0.435 +234 A 0.430 +235 H 0.427 +236 H 0.417 +237 T 0.398 +238 L 0.367 +239 L 0.328 +240 L 0.286 +241 G 0.249 +242 S 0.217 +243 G 0.183 +244 H 0.145 +245 V 0.111 +246 G 0.092 +247 L 0.091 +248 R 0.100 +249 N 0.107 +250 L 0.104 +251 G 0.093 +252 N 0.082 +253 T 0.076 +254 C 0.073 +255 F 0.070 +256 L 0.067 +257 N 0.065 +258 A 0.065 +259 V 0.067 +260 L 0.067 +261 Q 0.064 +262 C 0.057 +263 L 0.049 +264 S 0.041 +265 S 0.034 +266 T 0.029 +267 R 0.025 +268 P 0.023 +269 L 0.022 +270 R 0.022 +271 D 0.022 +272 F 0.024 +273 C 0.028 +274 L 0.032 +275 R 0.037 +276 R 0.044 +277 D 0.051 +278 F 0.060 +279 R 0.071 +280 Q 0.091 +281 E 0.122 +282 V 0.159 +283 P 0.195 +284 G 0.223 +285 G 0.236 +286 G 0.228 +287 R 0.205 +288 A 0.168 +289 Q 0.121 +290 E 0.081 +291 L 0.059 +292 T 0.051 +293 E 0.049 +294 A 0.046 +295 F 0.041 +296 A 0.038 +297 D 0.038 +298 V 0.040 +299 I 0.043 +300 G 0.045 +301 A 0.046 +302 L 0.050 +303 W 0.060 +304 H 0.076 +305 P 0.094 +306 D 0.111 +307 S 0.121 +308 C 0.118 +309 E 0.107 +310 A 0.097 +311 V 0.091 +312 N 0.083 +313 P 0.072 +314 T 0.059 +315 R 0.049 +316 F 0.047 +317 R 0.054 +318 A 0.060 +319 V 0.054 +320 F 0.041 +321 Q 0.029 +322 K 0.024 +323 Y 0.026 +324 V 0.033 +325 P 0.046 +326 S 0.065 +327 F 0.088 +328 S 0.108 +329 G 0.119 +330 Y 0.123 +331 S 0.119 +332 Q 0.108 +333 Q 0.096 +334 D 0.087 +335 A 0.078 +336 Q 0.070 +337 E 0.066 +338 F 0.065 +339 L 0.063 +340 K 0.061 +341 L 0.063 +342 L 0.067 +343 M 0.067 +344 E 0.063 +345 R 0.063 +346 L 0.069 +347 H 0.079 +348 L 0.090 +349 E 0.103 +350 I 0.120 +351 N 0.145 +352 R 0.185 +353 R 0.240 +354 G 0.301 +355 R 0.360 +356 R 0.416 +357 A 0.470 +358 P 0.518 +359 P 0.559 +360 I 0.586 +361 L 0.594 +362 A 0.578 +363 S 0.550 +364 G 0.526 +365 P 0.512 +366 V 0.506 +367 P 0.506 +368 S 0.520 +369 P 0.553 +370 P 0.595 +371 C 0.633 +372 R 0.656 +373 G 0.663 +374 G 0.649 +375 G 0.616 +376 A 0.572 +377 L 0.531 +378 H 0.500 +379 E 0.480 +380 E 0.455 +381 P 0.408 +382 E 0.337 +383 L 0.263 +384 S 0.200 +385 D 0.150 +386 D 0.114 +387 D 0.094 +388 R 0.085 +389 A 0.082 +390 N 0.082 +391 L 0.082 +392 M 0.082 +393 W 0.084 +394 K 0.091 +395 R 0.098 +396 Y 0.102 +397 L 0.108 +398 E 0.114 +399 R 0.115 +400 E 0.107 +401 D 0.095 +402 S 0.086 +403 K 0.087 +404 I 0.095 +405 V 0.100 +406 D 0.096 +407 L 0.085 +408 F 0.074 +409 V 0.068 +410 G 0.068 +411 Q 0.070 +412 L 0.067 +413 K 0.060 +414 S 0.054 +415 C 0.052 +416 L 0.056 +417 K 0.065 +418 C 0.072 +419 Q 0.075 +420 A 0.080 +421 C 0.094 +422 G 0.114 +423 Y 0.129 +424 R 0.136 +425 S 0.138 +426 T 0.136 +427 T 0.125 +428 F 0.109 +429 E 0.092 +430 V 0.079 +431 F 0.068 +432 C 0.058 +433 D 0.051 +434 L 0.050 +435 S 0.060 +436 L 0.084 +437 P 0.121 +438 I 0.160 +439 P 0.197 +440 K 0.236 +441 K 0.278 +442 G 0.315 +443 F 0.340 +444 A 0.351 +445 G 0.346 +446 G 0.318 +447 K 0.264 +448 V 0.200 +449 S 0.145 +450 L 0.109 +451 R 0.091 +452 D 0.087 +453 C 0.087 +454 F 0.089 +455 S 0.097 +456 L 0.113 +457 F 0.128 +458 T 0.135 +459 K 0.136 +460 E 0.135 +461 E 0.133 +462 E 0.132 +463 L 0.131 +464 E 0.134 +465 S 0.144 +466 E 0.159 +467 N 0.166 +468 A 0.158 +469 P 0.135 +470 V 0.108 +471 C 0.086 +472 D 0.072 +473 R 0.070 +474 C 0.079 +475 R 0.094 +476 Q 0.109 +477 K 0.119 +478 T 0.122 +479 R 0.124 +480 S 0.132 +481 T 0.140 +482 K 0.141 +483 K 0.128 +484 L 0.107 +485 T 0.090 +486 V 0.086 +487 Q 0.090 +488 R 0.091 +489 F 0.084 +490 P 0.075 +491 R 0.067 +492 I 0.062 +493 L 0.059 +494 V 0.056 +495 L 0.055 +496 H 0.061 +497 L 0.073 +498 N 0.094 +499 R 0.119 +500 F 0.145 +501 S 0.173 +502 T 0.203 +503 S 0.230 +504 R 0.243 +505 G 0.236 +506 S 0.219 +507 I 0.205 +508 K 0.199 +509 K 0.200 +510 S 0.203 +511 S 0.201 +512 V 0.188 +513 G 0.163 +514 V 0.136 +515 D 0.118 +516 F 0.109 +517 P 0.102 +518 L 0.091 +519 Q 0.077 +520 R 0.068 +521 L 0.066 +522 S 0.071 +523 L 0.077 +524 G 0.080 +525 D 0.079 +526 F 0.084 +527 A 0.105 +528 S 0.145 +529 D 0.190 +530 K 0.223 +531 A 0.230 +532 G 0.209 +533 S 0.171 +534 P 0.130 +535 V 0.101 +536 Y 0.084 +537 Q 0.073 +538 L 0.063 +539 Y 0.058 +540 A 0.062 +541 L 0.071 +542 C 0.087 +543 N 0.110 +544 H 0.137 +545 S 0.157 +546 G 0.165 +547 S 0.159 +548 V 0.147 +549 H 0.140 +550 Y 0.143 +551 G 0.143 +552 H 0.127 +553 Y 0.098 +554 T 0.071 +555 A 0.057 +556 L 0.051 +557 C 0.048 +558 R 0.051 +559 C 0.059 +560 Q 0.068 +561 T 0.071 +562 G 0.066 +563 W 0.056 +564 H 0.047 +565 V 0.040 +566 Y 0.037 +567 N 0.038 +568 D 0.043 +569 S 0.051 +570 R 0.060 +571 V 0.068 +572 S 0.072 +573 P 0.072 +574 V 0.068 +575 S 0.064 +576 E 0.065 +577 N 0.067 +578 Q 0.067 +579 V 0.069 +580 A 0.080 +581 S 0.094 +582 S 0.099 +583 E 0.091 +584 G 0.075 +585 Y 0.059 +586 V 0.047 +587 L 0.039 +588 F 0.035 +589 Y 0.037 +590 Q 0.051 +591 L 0.087 +592 M 0.145 +593 Q 0.213 +594 E 0.264 +595 P 0.282 +596 L 0.276 +597 R 0.263 +598 C 0.254 +599 L 0.250 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000053746.9_ENSMUST00000066352.6_GN:Ptrh1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000053746.9_ENSMUST00000066352.6_GN:Ptrh1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f45181e0847e6325e31c9b3742dbdf520ef05a88 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000053746.9_ENSMUST00000066352.6_GN:Ptrh1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,205 @@ +>ENSMUSG00000053746.9|ENSMUST00000066352.6|GN:Ptrh1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.385 +2 R 0.384 +3 R 0.379 +4 S 0.361 +5 W 0.328 +6 A 0.300 +7 L 0.294 +8 S 0.304 +9 R 0.318 +10 Q 0.330 +11 V 0.331 +12 S 0.312 +13 E 0.286 +14 A 0.276 +15 R 0.282 +16 F 0.279 +17 P 0.248 +18 G 0.193 +19 K 0.130 +20 R 0.080 +21 W 0.052 +22 L 0.042 +23 V 0.042 +24 A 0.046 +25 G 0.051 +26 L 0.060 +27 G 0.074 +28 N 0.094 +29 H 0.121 +30 G 0.154 +31 M 0.183 +32 P 0.193 +33 G 0.181 +34 T 0.162 +35 R 0.146 +36 H 0.135 +37 S 0.123 +38 V 0.105 +39 G 0.084 +40 M 0.068 +41 A 0.061 +42 V 0.059 +43 L 0.056 +44 G 0.049 +45 Q 0.044 +46 I 0.048 +47 A 0.057 +48 R 0.061 +49 R 0.056 +50 L 0.048 +51 G 0.044 +52 V 0.046 +53 A 0.050 +54 E 0.052 +55 N 0.052 +56 W 0.052 +57 T 0.053 +58 R 0.054 +59 D 0.057 +60 S 0.061 +61 R 0.068 +62 C 0.070 +63 A 0.066 +64 A 0.055 +65 D 0.043 +66 L 0.034 +67 A 0.032 +68 L 0.039 +69 A 0.051 +70 P 0.060 +71 L 0.062 +72 G 0.062 +73 D 0.064 +74 A 0.062 +75 Q 0.055 +76 L 0.046 +77 V 0.042 +78 L 0.046 +79 L 0.057 +80 R 0.072 +81 P 0.087 +82 R 0.094 +83 R 0.095 +84 L 0.097 +85 M 0.101 +86 N 0.099 +87 V 0.087 +88 N 0.070 +89 G 0.057 +90 R 0.047 +91 S 0.039 +92 V 0.035 +93 A 0.034 +94 R 0.035 +95 A 0.042 +96 A 0.052 +97 E 0.060 +98 L 0.059 +99 F 0.055 +100 G 0.052 +101 L 0.049 +102 T 0.044 +103 A 0.039 +104 E 0.035 +105 E 0.029 +106 I 0.026 +107 Y 0.027 +108 L 0.032 +109 V 0.041 +110 H 0.050 +111 D 0.061 +112 E 0.073 +113 L 0.082 +114 D 0.087 +115 K 0.088 +116 P 0.086 +117 L 0.082 +118 G 0.079 +119 K 0.076 +120 L 0.077 +121 A 0.083 +122 L 0.096 +123 K 0.114 +124 L 0.132 +125 G 0.146 +126 G 0.156 +127 S 0.163 +128 A 0.165 +129 R 0.159 +130 G 0.147 +131 H 0.132 +132 N 0.119 +133 G 0.111 +134 V 0.109 +135 R 0.110 +136 S 0.112 +137 C 0.115 +138 I 0.119 +139 S 0.120 +140 C 0.112 +141 L 0.098 +142 N 0.091 +143 S 0.096 +144 N 0.109 +145 A 0.120 +146 M 0.119 +147 P 0.105 +148 R 0.089 +149 L 0.078 +150 L 0.073 +151 V 0.076 +152 G 0.090 +153 I 0.110 +154 G 0.131 +155 R 0.147 +156 P 0.155 +157 T 0.155 +158 H 0.151 +159 P 0.146 +160 N 0.140 +161 M 0.139 +162 V 0.142 +163 E 0.144 +164 N 0.141 +165 H 0.133 +166 V 0.128 +167 L 0.127 +168 G 0.123 +169 C 0.112 +170 F 0.094 +171 S 0.078 +172 P 0.068 +173 E 0.063 +174 E 0.065 +175 Q 0.072 +176 E 0.079 +177 L 0.077 +178 L 0.067 +179 S 0.055 +180 P 0.046 +181 L 0.040 +182 M 0.036 +183 D 0.035 +184 Q 0.039 +185 A 0.049 +186 T 0.061 +187 D 0.065 +188 L 0.057 +189 L 0.046 +190 L 0.040 +191 D 0.042 +192 H 0.049 +193 I 0.062 +194 R 0.086 +195 A 0.127 +196 R 0.187 +197 S 0.254 +198 Q 0.314 +199 G 0.364 +200 P 0.397 +201 L 0.409 +202 S 0.400 +203 G 0.380 +204 L 0.364 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000053746.9_ENSMUST00000066352.6_GN:Ptrh1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000053746.9_ENSMUST00000066352.6_GN:Ptrh1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..74b2fa964aa357732b1e183b8d2c03cef45a791f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000053746.9_ENSMUST00000066352.6_GN:Ptrh1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid @@ -0,0 +1,219 @@ +>ENSMUSG00000053746.9|ENSMUST00000066352.6|GN:Ptrh1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:14 +1 M 0.419 +2 G 0.442 +3 V 0.475 +4 G 0.502 +5 T 0.513 +6 L 0.511 +7 K 0.503 +8 S 0.495 +9 G 0.474 +10 L 0.432 +11 F 0.384 +12 S 0.359 +13 P 0.362 +14 G 0.373 +15 M 0.370 +16 R 0.356 +17 R 0.335 +18 S 0.303 +19 W 0.261 +20 A 0.226 +21 L 0.213 +22 S 0.220 +23 R 0.237 +24 Q 0.256 +25 V 0.263 +26 S 0.252 +27 E 0.238 +28 A 0.241 +29 R 0.256 +30 F 0.259 +31 P 0.234 +32 G 0.183 +33 K 0.124 +34 R 0.076 +35 W 0.050 +36 L 0.041 +37 V 0.041 +38 A 0.045 +39 G 0.050 +40 L 0.059 +41 G 0.074 +42 N 0.094 +43 H 0.120 +44 G 0.152 +45 M 0.181 +46 P 0.190 +47 G 0.179 +48 T 0.159 +49 R 0.143 +50 H 0.132 +51 S 0.120 +52 V 0.102 +53 G 0.081 +54 M 0.067 +55 A 0.060 +56 V 0.059 +57 L 0.056 +58 G 0.049 +59 Q 0.045 +60 I 0.048 +61 A 0.056 +62 R 0.061 +63 R 0.055 +64 L 0.046 +65 G 0.042 +66 V 0.044 +67 A 0.048 +68 E 0.049 +69 N 0.049 +70 W 0.050 +71 T 0.051 +72 R 0.052 +73 D 0.055 +74 S 0.060 +75 R 0.066 +76 C 0.069 +77 A 0.064 +78 A 0.054 +79 D 0.041 +80 L 0.032 +81 A 0.030 +82 L 0.036 +83 A 0.047 +84 P 0.056 +85 L 0.059 +86 G 0.060 +87 D 0.061 +88 A 0.060 +89 Q 0.054 +90 L 0.046 +91 V 0.042 +92 L 0.046 +93 L 0.057 +94 R 0.072 +95 P 0.087 +96 R 0.094 +97 R 0.096 +98 L 0.098 +99 M 0.102 +100 N 0.099 +101 V 0.086 +102 N 0.069 +103 G 0.055 +104 R 0.045 +105 S 0.038 +106 V 0.034 +107 A 0.033 +108 R 0.034 +109 A 0.041 +110 A 0.051 +111 E 0.059 +112 L 0.058 +113 F 0.054 +114 G 0.052 +115 L 0.049 +116 T 0.044 +117 A 0.040 +118 E 0.035 +119 E 0.030 +120 I 0.026 +121 Y 0.027 +122 L 0.033 +123 V 0.041 +124 H 0.050 +125 D 0.061 +126 E 0.074 +127 L 0.083 +128 D 0.088 +129 K 0.089 +130 P 0.087 +131 L 0.083 +132 G 0.079 +133 K 0.077 +134 L 0.078 +135 A 0.084 +136 L 0.097 +137 K 0.114 +138 L 0.133 +139 G 0.148 +140 G 0.158 +141 S 0.165 +142 A 0.167 +143 R 0.161 +144 G 0.149 +145 H 0.134 +146 N 0.121 +147 G 0.113 +148 V 0.111 +149 R 0.111 +150 S 0.113 +151 C 0.117 +152 I 0.121 +153 S 0.121 +154 C 0.113 +155 L 0.100 +156 N 0.092 +157 S 0.097 +158 N 0.111 +159 A 0.121 +160 M 0.120 +161 P 0.106 +162 R 0.090 +163 L 0.078 +164 L 0.073 +165 V 0.077 +166 G 0.090 +167 I 0.111 +168 G 0.132 +169 R 0.149 +170 P 0.156 +171 T 0.156 +172 H 0.152 +173 P 0.147 +174 N 0.141 +175 M 0.139 +176 V 0.142 +177 E 0.143 +178 N 0.139 +179 H 0.132 +180 V 0.127 +181 L 0.126 +182 G 0.123 +183 C 0.111 +184 F 0.094 +185 S 0.078 +186 P 0.067 +187 E 0.063 +188 E 0.064 +189 Q 0.071 +190 E 0.078 +191 L 0.076 +192 L 0.066 +193 S 0.055 +194 P 0.046 +195 L 0.040 +196 M 0.036 +197 D 0.034 +198 Q 0.036 +199 A 0.043 +200 T 0.049 +201 D 0.049 +202 L 0.045 +203 L 0.040 +204 L 0.039 +205 D 0.043 +206 H 0.050 +207 I 0.062 +208 R 0.086 +209 A 0.128 +210 R 0.189 +211 S 0.255 +212 Q 0.316 +213 G 0.365 +214 P 0.400 +215 L 0.412 +216 S 0.404 +217 G 0.384 +218 L 0.368 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000054537.9_ENSMUST00000161306.2_GN:Tmprss11e_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000054537.9_ENSMUST00000161306.2_GN:Tmprss11e_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..578701dacef6bc178084281deeeed4c8ec6edc88 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000054537.9_ENSMUST00000161306.2_GN:Tmprss11e_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,424 @@ +>ENSMUSG00000054537.9|ENSMUST00000161306.2|GN:Tmprss11e|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.362 +2 Y 0.375 +3 R 0.400 +4 S 0.425 +5 C 0.437 +6 V 0.450 +7 V 0.487 +8 R 0.539 +9 A 0.583 +10 R 0.608 +11 K 0.619 +12 R 0.612 +13 T 0.571 +14 C 0.493 +15 V 0.398 +16 E 0.312 +17 P 0.251 +18 W 0.213 +19 V 0.194 +20 I 0.188 +21 G 0.184 +22 I 0.179 +23 I 0.176 +24 S 0.181 +25 F 0.189 +26 L 0.198 +27 S 0.200 +28 L 0.195 +29 I 0.190 +30 V 0.192 +31 L 0.195 +32 A 0.196 +33 V 0.198 +34 C 0.194 +35 I 0.179 +36 G 0.156 +37 L 0.135 +38 T 0.119 +39 V 0.105 +40 H 0.097 +41 Y 0.102 +42 V 0.124 +43 R 0.160 +44 Y 0.197 +45 N 0.216 +46 H 0.204 +47 R 0.164 +48 R 0.113 +49 T 0.068 +50 Y 0.038 +51 N 0.024 +52 Y 0.020 +53 Y 0.020 +54 S 0.021 +55 T 0.022 +56 L 0.024 +57 S 0.034 +58 F 0.052 +59 T 0.072 +60 S 0.084 +61 D 0.084 +62 K 0.077 +63 L 0.070 +64 Y 0.068 +65 S 0.074 +66 E 0.084 +67 F 0.093 +68 G 0.099 +69 R 0.101 +70 E 0.099 +71 A 0.095 +72 S 0.087 +73 K 0.082 +74 N 0.079 +75 F 0.074 +76 T 0.067 +77 E 0.064 +78 M 0.067 +79 S 0.075 +80 Q 0.078 +81 R 0.073 +82 I 0.066 +83 E 0.069 +84 T 0.075 +85 M 0.073 +86 V 0.060 +87 K 0.046 +88 H 0.038 +89 A 0.036 +90 F 0.038 +91 H 0.041 +92 K 0.043 +93 S 0.044 +94 P 0.048 +95 L 0.055 +96 R 0.060 +97 G 0.057 +98 Q 0.049 +99 L 0.039 +100 V 0.030 +101 K 0.024 +102 A 0.020 +103 H 0.018 +104 I 0.018 +105 I 0.020 +106 K 0.022 +107 F 0.027 +108 S 0.035 +109 K 0.041 +110 E 0.046 +111 D 0.052 +112 D 0.054 +113 G 0.050 +114 V 0.039 +115 L 0.028 +116 A 0.021 +117 H 0.018 +118 M 0.016 +119 L 0.015 +120 L 0.016 +121 I 0.020 +122 F 0.027 +123 R 0.040 +124 I 0.055 +125 R 0.068 +126 S 0.073 +127 T 0.069 +128 E 0.062 +129 D 0.054 +130 P 0.048 +131 E 0.047 +132 T 0.051 +133 V 0.061 +134 H 0.070 +135 K 0.071 +136 I 0.059 +137 I 0.044 +138 E 0.034 +139 Y 0.031 +140 V 0.032 +141 L 0.034 +142 H 0.038 +143 E 0.047 +144 K 0.061 +145 L 0.077 +146 K 0.097 +147 Y 0.121 +148 A 0.144 +149 T 0.157 +150 G 0.152 +151 P 0.139 +152 P 0.126 +153 N 0.120 +154 V 0.119 +155 D 0.114 +156 P 0.098 +157 E 0.072 +158 S 0.049 +159 V 0.037 +160 K 0.034 +161 I 0.039 +162 K 0.049 +163 K 0.062 +164 I 0.077 +165 N 0.097 +166 K 0.119 +167 T 0.143 +168 E 0.167 +169 S 0.189 +170 D 0.203 +171 N 0.205 +172 Y 0.192 +173 F 0.166 +174 N 0.137 +175 H 0.117 +176 C 0.108 +177 C 0.109 +178 G 0.115 +179 T 0.125 +180 R 0.143 +181 R 0.181 +182 N 0.247 +183 K 0.334 +184 S 0.417 +185 T 0.468 +186 V 0.475 +187 Q 0.454 +188 T 0.418 +189 S 0.376 +190 V 0.335 +191 R 0.303 +192 I 0.278 +193 V 0.251 +194 G 0.222 +195 G 0.199 +196 T 0.190 +197 P 0.188 +198 V 0.182 +199 E 0.163 +200 E 0.137 +201 E 0.111 +202 E 0.085 +203 W 0.060 +204 P 0.040 +205 W 0.028 +206 Q 0.022 +207 S 0.020 +208 S 0.024 +209 L 0.033 +210 R 0.046 +211 W 0.059 +212 D 0.069 +213 G 0.072 +214 S 0.068 +215 H 0.054 +216 R 0.038 +217 C 0.026 +218 G 0.022 +219 A 0.025 +220 T 0.032 +221 L 0.040 +222 I 0.043 +223 N 0.041 +224 N 0.036 +225 T 0.030 +226 W 0.026 +227 L 0.023 +228 V 0.020 +229 T 0.017 +230 A 0.018 +231 A 0.023 +232 H 0.030 +233 C 0.035 +234 F 0.037 +235 R 0.037 +236 T 0.039 +237 H 0.045 +238 K 0.054 +239 D 0.061 +240 P 0.059 +241 S 0.048 +242 R 0.034 +243 W 0.023 +244 S 0.017 +245 A 0.015 +246 T 0.016 +247 F 0.020 +248 G 0.027 +249 A 0.039 +250 T 0.051 +251 L 0.062 +252 Q 0.071 +253 P 0.077 +254 R 0.077 +255 K 0.071 +256 L 0.061 +257 T 0.050 +258 T 0.040 +259 G 0.035 +260 I 0.034 +261 R 0.035 +262 R 0.038 +263 I 0.042 +264 I 0.046 +265 V 0.049 +266 H 0.049 +267 E 0.049 +268 K 0.049 +269 Y 0.050 +270 K 0.049 +271 Y 0.052 +272 P 0.064 +273 S 0.083 +274 H 0.097 +275 D 0.098 +276 Y 0.083 +277 D 0.061 +278 I 0.040 +279 A 0.028 +280 L 0.024 +281 A 0.025 +282 E 0.029 +283 L 0.035 +284 S 0.042 +285 K 0.049 +286 P 0.059 +287 V 0.072 +288 P 0.088 +289 C 0.099 +290 T 0.097 +291 N 0.083 +292 A 0.064 +293 V 0.051 +294 H 0.044 +295 K 0.041 +296 V 0.044 +297 C 0.055 +298 L 0.076 +299 P 0.097 +300 D 0.106 +301 A 0.103 +302 N 0.093 +303 H 0.082 +304 E 0.072 +305 F 0.065 +306 Q 0.064 +307 P 0.067 +308 G 0.067 +309 Q 0.061 +310 R 0.050 +311 M 0.038 +312 F 0.030 +313 V 0.029 +314 T 0.034 +315 G 0.047 +316 F 0.067 +317 G 0.091 +318 A 0.112 +319 L 0.125 +320 K 0.140 +321 N 0.161 +322 D 0.184 +323 G 0.197 +324 F 0.192 +325 T 0.168 +326 Q 0.138 +327 N 0.116 +328 N 0.104 +329 L 0.097 +330 R 0.089 +331 Q 0.081 +332 V 0.074 +333 Q 0.067 +334 V 0.061 +335 D 0.058 +336 Y 0.059 +337 I 0.064 +338 D 0.067 +339 T 0.069 +340 Q 0.070 +341 T 0.070 +342 C 0.070 +343 N 0.080 +344 Q 0.098 +345 P 0.117 +346 Q 0.125 +347 S 0.124 +348 Y 0.123 +349 N 0.127 +350 G 0.134 +351 A 0.139 +352 I 0.133 +353 T 0.110 +354 P 0.081 +355 R 0.058 +356 M 0.045 +357 L 0.042 +358 C 0.047 +359 A 0.061 +360 G 0.079 +361 F 0.094 +362 L 0.103 +363 K 0.110 +364 G 0.114 +365 E 0.113 +366 K 0.107 +367 D 0.101 +368 A 0.094 +369 C 0.087 +370 Q 0.086 +371 G 0.093 +372 D 0.100 +373 S 0.098 +374 G 0.092 +375 G 0.091 +376 P 0.091 +377 L 0.083 +378 V 0.069 +379 T 0.061 +380 A 0.063 +381 D 0.069 +382 V 0.073 +383 R 0.075 +384 D 0.073 +385 I 0.067 +386 W 0.058 +387 Y 0.053 +388 L 0.055 +389 A 0.061 +390 G 0.064 +391 V 0.064 +392 V 0.064 +393 S 0.068 +394 W 0.076 +395 G 0.085 +396 D 0.089 +397 E 0.091 +398 C 0.096 +399 G 0.109 +400 Q 0.127 +401 P 0.137 +402 N 0.130 +403 K 0.109 +404 P 0.087 +405 G 0.072 +406 V 0.063 +407 Y 0.059 +408 T 0.060 +409 R 0.065 +410 V 0.072 +411 T 0.076 +412 A 0.074 +413 F 0.073 +414 R 0.074 +415 H 0.075 +416 W 0.073 +417 I 0.076 +418 A 0.087 +419 S 0.100 +420 N 0.111 +421 T 0.128 +422 G 0.154 +423 I 0.176 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000054537.9_ENSMUST00000161306.2_GN:Tmprss11e_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000054537.9_ENSMUST00000161306.2_GN:Tmprss11e_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..3fb70d16410a686cb6bba42d9d4d340ce72f5f5d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000054537.9_ENSMUST00000161306.2_GN:Tmprss11e_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid @@ -0,0 +1,443 @@ +>ENSMUSG00000054537.9|ENSMUST00000161306.2|GN:Tmprss11e|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:19 +1 M 0.357 +2 N 0.348 +3 T 0.350 +4 L 0.376 +5 S 0.418 +6 H 0.471 +7 G 0.531 +8 P 0.576 +9 V 0.574 +10 T 0.536 +11 T 0.518 +12 G 0.547 +13 L 0.581 +14 V 0.573 +15 T 0.521 +16 C 0.444 +17 W 0.359 +18 S 0.297 +19 A 0.287 +20 M 0.325 +21 Y 0.379 +22 R 0.434 +23 S 0.495 +24 C 0.556 +25 V 0.597 +26 V 0.615 +27 R 0.625 +28 A 0.641 +29 R 0.659 +30 K 0.669 +31 R 0.660 +32 T 0.615 +33 C 0.529 +34 V 0.426 +35 E 0.338 +36 P 0.277 +37 W 0.239 +38 V 0.220 +39 I 0.214 +40 G 0.208 +41 I 0.197 +42 I 0.191 +43 S 0.192 +44 F 0.200 +45 L 0.208 +46 S 0.209 +47 L 0.202 +48 I 0.197 +49 V 0.198 +50 L 0.199 +51 A 0.199 +52 V 0.198 +53 C 0.193 +54 I 0.178 +55 G 0.155 +56 L 0.134 +57 T 0.119 +58 V 0.106 +59 H 0.099 +60 Y 0.106 +61 V 0.127 +62 R 0.160 +63 Y 0.192 +64 N 0.207 +65 H 0.194 +66 R 0.155 +67 R 0.107 +68 T 0.064 +69 Y 0.036 +70 N 0.023 +71 Y 0.019 +72 Y 0.019 +73 S 0.020 +74 T 0.020 +75 L 0.023 +76 S 0.032 +77 F 0.049 +78 T 0.068 +79 S 0.079 +80 D 0.079 +81 K 0.072 +82 L 0.066 +83 Y 0.064 +84 S 0.070 +85 E 0.080 +86 F 0.089 +87 G 0.095 +88 R 0.096 +89 E 0.094 +90 A 0.088 +91 S 0.081 +92 K 0.076 +93 N 0.074 +94 F 0.070 +95 T 0.064 +96 E 0.061 +97 M 0.065 +98 S 0.073 +99 Q 0.077 +100 R 0.071 +101 I 0.064 +102 E 0.066 +103 T 0.072 +104 M 0.070 +105 V 0.057 +106 K 0.044 +107 H 0.036 +108 A 0.034 +109 F 0.037 +110 H 0.039 +111 K 0.041 +112 S 0.043 +113 P 0.046 +114 L 0.053 +115 R 0.059 +116 G 0.056 +117 Q 0.048 +118 L 0.038 +119 V 0.029 +120 K 0.023 +121 A 0.019 +122 H 0.017 +123 I 0.017 +124 I 0.018 +125 K 0.021 +126 F 0.026 +127 S 0.033 +128 K 0.039 +129 E 0.044 +130 D 0.050 +131 D 0.053 +132 G 0.049 +133 V 0.038 +134 L 0.027 +135 A 0.021 +136 H 0.017 +137 M 0.015 +138 L 0.015 +139 L 0.016 +140 I 0.020 +141 F 0.027 +142 R 0.039 +143 I 0.055 +144 R 0.068 +145 S 0.072 +146 T 0.069 +147 E 0.062 +148 D 0.053 +149 P 0.047 +150 E 0.046 +151 T 0.051 +152 V 0.060 +153 H 0.069 +154 K 0.070 +155 I 0.058 +156 I 0.042 +157 E 0.033 +158 Y 0.030 +159 V 0.031 +160 L 0.032 +161 H 0.036 +162 E 0.045 +163 K 0.059 +164 L 0.075 +165 K 0.094 +166 Y 0.117 +167 A 0.139 +168 T 0.151 +169 G 0.146 +170 P 0.133 +171 P 0.122 +172 N 0.116 +173 V 0.115 +174 D 0.110 +175 P 0.094 +176 E 0.069 +177 S 0.047 +178 V 0.035 +179 K 0.032 +180 I 0.037 +181 K 0.047 +182 K 0.059 +183 I 0.075 +184 N 0.094 +185 K 0.116 +186 T 0.140 +187 E 0.164 +188 S 0.184 +189 D 0.198 +190 N 0.200 +191 Y 0.188 +192 F 0.164 +193 N 0.137 +194 H 0.117 +195 C 0.109 +196 C 0.110 +197 G 0.115 +198 T 0.124 +199 R 0.142 +200 R 0.180 +201 N 0.246 +202 K 0.333 +203 S 0.417 +204 T 0.467 +205 V 0.476 +206 Q 0.455 +207 T 0.419 +208 S 0.377 +209 V 0.335 +210 R 0.304 +211 I 0.280 +212 V 0.253 +213 G 0.223 +214 G 0.200 +215 T 0.190 +216 P 0.188 +217 V 0.182 +218 E 0.163 +219 E 0.138 +220 E 0.112 +221 E 0.086 +222 W 0.060 +223 P 0.041 +224 W 0.028 +225 Q 0.022 +226 S 0.020 +227 S 0.024 +228 L 0.033 +229 R 0.046 +230 W 0.059 +231 D 0.069 +232 G 0.072 +233 S 0.067 +234 H 0.054 +235 R 0.037 +236 C 0.025 +237 G 0.022 +238 A 0.025 +239 T 0.032 +240 L 0.040 +241 I 0.043 +242 N 0.041 +243 N 0.036 +244 T 0.030 +245 W 0.026 +246 L 0.023 +247 V 0.020 +248 T 0.017 +249 A 0.018 +250 A 0.023 +251 H 0.030 +252 C 0.035 +253 F 0.037 +254 R 0.037 +255 T 0.039 +256 H 0.045 +257 K 0.054 +258 D 0.061 +259 P 0.059 +260 S 0.048 +261 R 0.034 +262 W 0.023 +263 S 0.017 +264 A 0.015 +265 T 0.016 +266 F 0.020 +267 G 0.027 +268 A 0.039 +269 T 0.051 +270 L 0.062 +271 Q 0.071 +272 P 0.076 +273 R 0.076 +274 K 0.070 +275 L 0.061 +276 T 0.050 +277 T 0.041 +278 G 0.036 +279 I 0.035 +280 R 0.036 +281 R 0.038 +282 I 0.042 +283 I 0.047 +284 V 0.050 +285 H 0.050 +286 E 0.049 +287 K 0.050 +288 Y 0.051 +289 K 0.050 +290 Y 0.052 +291 P 0.064 +292 S 0.083 +293 H 0.098 +294 D 0.099 +295 Y 0.084 +296 D 0.061 +297 I 0.040 +298 A 0.028 +299 L 0.024 +300 A 0.025 +301 E 0.029 +302 L 0.035 +303 S 0.042 +304 K 0.050 +305 P 0.060 +306 V 0.073 +307 P 0.090 +308 C 0.101 +309 T 0.100 +310 N 0.085 +311 A 0.066 +312 V 0.052 +313 H 0.045 +314 K 0.042 +315 V 0.045 +316 C 0.057 +317 L 0.077 +318 P 0.098 +319 D 0.108 +320 A 0.104 +321 N 0.095 +322 H 0.084 +323 E 0.074 +324 F 0.066 +325 Q 0.065 +326 P 0.068 +327 G 0.069 +328 Q 0.063 +329 R 0.052 +330 M 0.040 +331 F 0.031 +332 V 0.030 +333 T 0.035 +334 G 0.048 +335 F 0.068 +336 G 0.093 +337 A 0.114 +338 L 0.128 +339 K 0.142 +340 N 0.164 +341 D 0.186 +342 G 0.199 +343 F 0.194 +344 T 0.170 +345 Q 0.140 +346 N 0.118 +347 N 0.106 +348 L 0.099 +349 R 0.091 +350 Q 0.082 +351 V 0.075 +352 Q 0.068 +353 V 0.061 +354 D 0.058 +355 Y 0.060 +356 I 0.064 +357 D 0.067 +358 T 0.070 +359 Q 0.071 +360 T 0.070 +361 C 0.070 +362 N 0.080 +363 Q 0.098 +364 P 0.117 +365 Q 0.125 +366 S 0.124 +367 Y 0.123 +368 N 0.126 +369 G 0.133 +370 A 0.138 +371 I 0.132 +372 T 0.110 +373 P 0.081 +374 R 0.059 +375 M 0.046 +376 L 0.042 +377 C 0.048 +378 A 0.062 +379 G 0.080 +380 F 0.094 +381 L 0.104 +382 K 0.111 +383 G 0.116 +384 E 0.114 +385 K 0.109 +386 D 0.102 +387 A 0.095 +388 C 0.088 +389 Q 0.087 +390 G 0.094 +391 D 0.101 +392 S 0.100 +393 G 0.094 +394 G 0.092 +395 P 0.092 +396 L 0.084 +397 V 0.070 +398 T 0.062 +399 A 0.063 +400 D 0.070 +401 V 0.074 +402 R 0.076 +403 D 0.074 +404 I 0.068 +405 W 0.058 +406 Y 0.053 +407 L 0.056 +408 A 0.062 +409 G 0.065 +410 V 0.066 +411 V 0.066 +412 S 0.069 +413 W 0.077 +414 G 0.086 +415 D 0.091 +416 E 0.092 +417 C 0.097 +418 G 0.111 +419 Q 0.129 +420 P 0.139 +421 N 0.132 +422 K 0.112 +423 P 0.089 +424 G 0.073 +425 V 0.065 +426 Y 0.060 +427 T 0.061 +428 R 0.066 +429 V 0.073 +430 T 0.077 +431 A 0.075 +432 F 0.074 +433 R 0.075 +434 H 0.076 +435 W 0.073 +436 I 0.075 +437 A 0.085 +438 S 0.097 +439 N 0.109 +440 T 0.127 +441 G 0.154 +442 I 0.176 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000056394.21_ENSMUST00000177588.10_GN:Lig1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000056394.21_ENSMUST00000177588.10_GN:Lig1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..873b1f21d37f543915894967ea1d206b28d97b10 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000056394.21_ENSMUST00000177588.10_GN:Lig1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,917 @@ +>ENSMUSG00000056394.21|ENSMUST00000177588.10|GN:Lig1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.275 +2 Q 0.276 +3 R 0.277 +4 S 0.275 +5 I 0.266 +6 M 0.256 +7 S 0.262 +8 F 0.289 +9 F 0.339 +10 Q 0.407 +11 P 0.477 +12 T 0.513 +13 K 0.509 +14 E 0.502 +15 G 0.515 +16 K 0.519 +17 A 0.492 +18 K 0.469 +19 K 0.481 +20 P 0.501 +21 E 0.492 +22 K 0.481 +23 E 0.508 +24 T 0.562 +25 P 0.607 +26 S 0.634 +27 S 0.644 +28 I 0.641 +29 R 0.629 +30 E 0.611 +31 K 0.580 +32 E 0.550 +33 P 0.539 +34 P 0.542 +35 P 0.540 +36 K 0.543 +37 V 0.568 +38 A 0.584 +39 L 0.567 +40 K 0.562 +41 E 0.607 +42 R 0.669 +43 N 0.702 +44 Q 0.705 +45 V 0.698 +46 V 0.693 +47 P 0.696 +48 E 0.704 +49 S 0.704 +50 D 0.694 +51 S 0.686 +52 P 0.696 +53 V 0.720 +54 K 0.738 +55 R 0.733 +56 T 0.696 +57 G 0.640 +58 R 0.607 +59 K 0.622 +60 V 0.637 +61 A 0.613 +62 Q 0.591 +63 V 0.615 +64 L 0.665 +65 S 0.707 +66 C 0.735 +67 E 0.756 +68 G 0.768 +69 E 0.771 +70 D 0.768 +71 E 0.760 +72 D 0.746 +73 E 0.733 +74 A 0.727 +75 P 0.724 +76 G 0.711 +77 T 0.671 +78 P 0.614 +79 K 0.586 +80 V 0.616 +81 Q 0.674 +82 K 0.722 +83 P 0.754 +84 V 0.780 +85 S 0.799 +86 D 0.805 +87 S 0.798 +88 E 0.780 +89 Q 0.756 +90 S 0.733 +91 S 0.720 +92 P 0.723 +93 P 0.739 +94 S 0.760 +95 P 0.778 +96 D 0.787 +97 T 0.786 +98 C 0.779 +99 P 0.775 +100 E 0.775 +101 N 0.774 +102 S 0.771 +103 P 0.770 +104 V 0.773 +105 F 0.776 +106 N 0.771 +107 C 0.759 +108 S 0.756 +109 S 0.769 +110 P 0.790 +111 M 0.798 +112 D 0.785 +113 I 0.755 +114 S 0.722 +115 P 0.696 +116 S 0.680 +117 G 0.673 +118 F 0.677 +119 P 0.693 +120 K 0.708 +121 R 0.712 +122 R 0.709 +123 T 0.710 +124 A 0.717 +125 R 0.719 +126 K 0.710 +127 Q 0.699 +128 L 0.696 +129 P 0.692 +130 K 0.669 +131 R 0.617 +132 T 0.546 +133 I 0.491 +134 Q 0.493 +135 D 0.547 +136 T 0.596 +137 L 0.610 +138 E 0.613 +139 E 0.632 +140 Q 0.656 +141 N 0.672 +142 E 0.678 +143 D 0.680 +144 K 0.676 +145 T 0.663 +146 K 0.641 +147 T 0.603 +148 A 0.553 +149 K 0.523 +150 K 0.532 +151 R 0.541 +152 K 0.524 +153 K 0.514 +154 E 0.546 +155 E 0.591 +156 E 0.619 +157 T 0.634 +158 P 0.656 +159 K 0.683 +160 E 0.704 +161 S 0.708 +162 L 0.701 +163 A 0.687 +164 E 0.663 +165 A 0.615 +166 E 0.553 +167 D 0.511 +168 V 0.493 +169 K 0.463 +170 Q 0.426 +171 K 0.449 +172 E 0.543 +173 E 0.645 +174 K 0.711 +175 E 0.746 +176 G 0.763 +177 D 0.770 +178 Q 0.770 +179 L 0.770 +180 I 0.768 +181 V 0.765 +182 P 0.764 +183 S 0.765 +184 E 0.765 +185 P 0.763 +186 T 0.761 +187 K 0.760 +188 S 0.758 +189 P 0.759 +190 E 0.765 +191 S 0.774 +192 V 0.779 +193 T 0.776 +194 L 0.772 +195 T 0.771 +196 K 0.770 +197 T 0.769 +198 E 0.767 +199 N 0.764 +200 I 0.762 +201 P 0.766 +202 V 0.776 +203 C 0.787 +204 K 0.793 +205 A 0.796 +206 G 0.795 +207 V 0.789 +208 K 0.779 +209 L 0.769 +210 K 0.769 +211 P 0.778 +212 Q 0.788 +213 E 0.793 +214 E 0.791 +215 E 0.781 +216 Q 0.762 +217 S 0.741 +218 K 0.731 +219 P 0.737 +220 P 0.756 +221 A 0.774 +222 R 0.780 +223 G 0.768 +224 A 0.742 +225 K 0.711 +226 T 0.681 +227 L 0.654 +228 S 0.627 +229 S 0.595 +230 F 0.569 +231 F 0.564 +232 T 0.586 +233 P 0.622 +234 R 0.657 +235 K 0.688 +236 P 0.715 +237 A 0.736 +238 V 0.745 +239 K 0.745 +240 T 0.744 +241 E 0.744 +242 V 0.743 +243 K 0.740 +244 Q 0.742 +245 E 0.749 +246 E 0.755 +247 S 0.755 +248 G 0.746 +249 T 0.728 +250 L 0.706 +251 R 0.689 +252 K 0.678 +253 E 0.667 +254 E 0.647 +255 T 0.617 +256 K 0.573 +257 G 0.511 +258 T 0.426 +259 L 0.327 +260 D 0.234 +261 P 0.168 +262 A 0.134 +263 N 0.124 +264 Y 0.121 +265 N 0.114 +266 P 0.105 +267 S 0.104 +268 K 0.113 +269 N 0.124 +270 N 0.124 +271 Y 0.110 +272 H 0.089 +273 P 0.077 +274 I 0.079 +275 E 0.089 +276 D 0.096 +277 A 0.097 +278 C 0.096 +279 W 0.093 +280 K 0.088 +281 H 0.086 +282 G 0.092 +283 Q 0.101 +284 K 0.099 +285 V 0.083 +286 P 0.060 +287 F 0.041 +288 L 0.033 +289 A 0.031 +290 V 0.029 +291 A 0.026 +292 R 0.024 +293 T 0.022 +294 F 0.024 +295 E 0.031 +296 K 0.040 +297 I 0.047 +298 E 0.053 +299 E 0.060 +300 V 0.070 +301 S 0.081 +302 A 0.092 +303 R 0.099 +304 L 0.101 +305 K 0.100 +306 M 0.097 +307 V 0.096 +308 E 0.094 +309 T 0.091 +310 L 0.083 +311 S 0.072 +312 N 0.062 +313 L 0.053 +314 L 0.044 +315 R 0.039 +316 S 0.036 +317 V 0.034 +318 V 0.035 +319 A 0.042 +320 L 0.048 +321 S 0.048 +322 P 0.043 +323 P 0.039 +324 D 0.039 +325 L 0.039 +326 L 0.040 +327 P 0.043 +328 V 0.049 +329 L 0.053 +330 Y 0.055 +331 L 0.055 +332 S 0.059 +333 L 0.065 +334 N 0.076 +335 R 0.087 +336 L 0.094 +337 G 0.095 +338 P 0.096 +339 P 0.108 +340 Q 0.134 +341 Q 0.166 +342 G 0.192 +343 L 0.206 +344 E 0.207 +345 L 0.198 +346 G 0.181 +347 V 0.161 +348 G 0.135 +349 D 0.107 +350 G 0.089 +351 V 0.082 +352 L 0.077 +353 L 0.069 +354 K 0.064 +355 A 0.068 +356 V 0.078 +357 A 0.086 +358 Q 0.094 +359 A 0.100 +360 T 0.099 +361 G 0.087 +362 R 0.069 +363 Q 0.052 +364 L 0.041 +365 E 0.036 +366 S 0.037 +367 I 0.045 +368 R 0.055 +369 A 0.061 +370 E 0.059 +371 V 0.054 +372 A 0.055 +373 E 0.060 +374 K 0.069 +375 G 0.079 +376 D 0.084 +377 V 0.080 +378 G 0.072 +379 L 0.067 +380 V 0.065 +381 A 0.065 +382 E 0.072 +383 N 0.087 +384 S 0.109 +385 R 0.140 +386 S 0.183 +387 T 0.229 +388 Q 0.258 +389 R 0.259 +390 L 0.245 +391 M 0.236 +392 L 0.238 +393 P 0.235 +394 P 0.211 +395 P 0.166 +396 P 0.117 +397 L 0.079 +398 T 0.056 +399 I 0.047 +400 S 0.046 +401 G 0.048 +402 V 0.050 +403 F 0.050 +404 T 0.046 +405 K 0.046 +406 F 0.054 +407 C 0.068 +408 D 0.084 +409 I 0.096 +410 A 0.106 +411 R 0.118 +412 L 0.136 +413 T 0.155 +414 G 0.171 +415 S 0.182 +416 A 0.184 +417 S 0.172 +418 M 0.145 +419 A 0.113 +420 K 0.091 +421 K 0.080 +422 M 0.078 +423 D 0.083 +424 I 0.086 +425 I 0.084 +426 K 0.079 +427 G 0.077 +428 L 0.075 +429 F 0.074 +430 V 0.079 +431 A 0.090 +432 C 0.105 +433 R 0.116 +434 H 0.118 +435 S 0.109 +436 E 0.092 +437 A 0.073 +438 R 0.059 +439 Y 0.053 +440 I 0.053 +441 A 0.056 +442 R 0.061 +443 S 0.068 +444 L 0.079 +445 S 0.092 +446 G 0.109 +447 R 0.126 +448 L 0.135 +449 R 0.129 +450 L 0.118 +451 G 0.110 +452 L 0.104 +453 A 0.097 +454 E 0.090 +455 Q 0.084 +456 S 0.079 +457 V 0.076 +458 L 0.074 +459 A 0.075 +460 A 0.076 +461 L 0.077 +462 A 0.077 +463 Q 0.078 +464 A 0.080 +465 V 0.084 +466 S 0.095 +467 L 0.110 +468 T 0.124 +469 P 0.136 +470 P 0.147 +471 G 0.149 +472 Q 0.139 +473 E 0.122 +474 F 0.108 +475 P 0.105 +476 T 0.113 +477 A 0.129 +478 V 0.150 +479 V 0.173 +480 D 0.192 +481 A 0.199 +482 G 0.191 +483 K 0.177 +484 G 0.162 +485 K 0.148 +486 T 0.134 +487 A 0.123 +488 E 0.116 +489 A 0.111 +490 R 0.102 +491 K 0.093 +492 M 0.090 +493 W 0.090 +494 L 0.085 +495 E 0.075 +496 E 0.068 +497 Q 0.066 +498 G 0.066 +499 M 0.070 +500 I 0.080 +501 L 0.089 +502 K 0.095 +503 Q 0.098 +504 T 0.095 +505 F 0.086 +506 C 0.078 +507 E 0.075 +508 V 0.073 +509 P 0.067 +510 D 0.059 +511 L 0.052 +512 D 0.045 +513 R 0.042 +514 I 0.041 +515 I 0.039 +516 P 0.037 +517 V 0.037 +518 L 0.038 +519 L 0.037 +520 E 0.036 +521 H 0.035 +522 G 0.035 +523 L 0.036 +524 E 0.038 +525 R 0.043 +526 L 0.051 +527 P 0.061 +528 E 0.072 +529 H 0.085 +530 C 0.098 +531 K 0.112 +532 L 0.125 +533 S 0.133 +534 P 0.133 +535 G 0.133 +536 V 0.137 +537 P 0.136 +538 L 0.127 +539 K 0.110 +540 P 0.094 +541 M 0.081 +542 L 0.073 +543 A 0.073 +544 H 0.082 +545 P 0.094 +546 T 0.104 +547 R 0.109 +548 G 0.106 +549 V 0.095 +550 S 0.081 +551 E 0.071 +552 V 0.070 +553 L 0.075 +554 K 0.080 +555 R 0.077 +556 F 0.071 +557 E 0.066 +558 E 0.063 +559 V 0.058 +560 D 0.053 +561 F 0.050 +562 T 0.048 +563 C 0.045 +564 E 0.038 +565 Y 0.033 +566 K 0.032 +567 Y 0.037 +568 D 0.044 +569 G 0.052 +570 Q 0.057 +571 R 0.055 +572 A 0.048 +573 Q 0.040 +574 I 0.035 +575 H 0.035 +576 V 0.043 +577 L 0.062 +578 E 0.089 +579 G 0.113 +580 G 0.121 +581 E 0.110 +582 V 0.085 +583 K 0.060 +584 I 0.044 +585 F 0.040 +586 S 0.046 +587 R 0.058 +588 N 0.072 +589 Q 0.087 +590 E 0.098 +591 D 0.101 +592 N 0.097 +593 T 0.092 +594 G 0.088 +595 K 0.080 +596 Y 0.071 +597 P 0.061 +598 D 0.050 +599 I 0.041 +600 I 0.035 +601 S 0.033 +602 R 0.034 +603 I 0.035 +604 P 0.036 +605 K 0.039 +606 I 0.044 +607 K 0.049 +608 H 0.056 +609 P 0.063 +610 S 0.067 +611 V 0.067 +612 T 0.064 +613 S 0.059 +614 F 0.057 +615 I 0.057 +616 L 0.057 +617 D 0.057 +618 T 0.058 +619 E 0.060 +620 A 0.062 +621 V 0.064 +622 A 0.064 +623 W 0.059 +624 D 0.052 +625 R 0.051 +626 E 0.055 +627 K 0.066 +628 K 0.081 +629 Q 0.094 +630 I 0.095 +631 Q 0.086 +632 P 0.077 +633 F 0.078 +634 Q 0.093 +635 V 0.113 +636 L 0.127 +637 T 0.131 +638 T 0.140 +639 R 0.156 +640 K 0.175 +641 R 0.194 +642 K 0.218 +643 E 0.247 +644 V 0.271 +645 D 0.278 +646 A 0.261 +647 S 0.234 +648 E 0.216 +649 I 0.208 +650 Q 0.202 +651 V 0.190 +652 Q 0.165 +653 V 0.128 +654 C 0.091 +655 L 0.063 +656 Y 0.045 +657 A 0.035 +658 F 0.030 +659 D 0.027 +660 L 0.027 +661 I 0.030 +662 Y 0.036 +663 L 0.046 +664 N 0.060 +665 G 0.075 +666 E 0.091 +667 S 0.101 +668 L 0.097 +669 V 0.079 +670 R 0.062 +671 Q 0.054 +672 P 0.051 +673 L 0.048 +674 S 0.045 +675 R 0.046 +676 R 0.053 +677 R 0.065 +678 Q 0.072 +679 L 0.069 +680 L 0.062 +681 R 0.056 +682 E 0.054 +683 N 0.052 +684 F 0.053 +685 V 0.060 +686 E 0.075 +687 T 0.088 +688 E 0.091 +689 G 0.080 +690 E 0.066 +691 F 0.058 +692 V 0.057 +693 F 0.055 +694 T 0.051 +695 T 0.045 +696 S 0.042 +697 L 0.041 +698 D 0.041 +699 T 0.045 +700 K 0.049 +701 D 0.053 +702 T 0.052 +703 E 0.051 +704 Q 0.053 +705 I 0.062 +706 A 0.075 +707 E 0.081 +708 F 0.076 +709 L 0.067 +710 E 0.059 +711 Q 0.054 +712 S 0.053 +713 V 0.056 +714 K 0.062 +715 D 0.073 +716 S 0.084 +717 C 0.093 +718 E 0.099 +719 G 0.106 +720 L 0.116 +721 M 0.123 +722 V 0.122 +723 K 0.114 +724 T 0.111 +725 L 0.120 +726 D 0.132 +727 V 0.138 +728 D 0.134 +729 A 0.125 +730 T 0.117 +731 Y 0.116 +732 E 0.122 +733 I 0.133 +734 A 0.146 +735 K 0.162 +736 R 0.173 +737 S 0.176 +738 H 0.168 +739 N 0.154 +740 W 0.137 +741 L 0.124 +742 K 0.122 +743 L 0.126 +744 K 0.133 +745 K 0.134 +746 D 0.132 +747 Y 0.140 +748 L 0.171 +749 D 0.230 +750 G 0.295 +751 V 0.330 +752 G 0.310 +753 D 0.250 +754 T 0.182 +755 L 0.132 +756 D 0.103 +757 L 0.088 +758 V 0.081 +759 V 0.079 +760 I 0.085 +761 G 0.096 +762 A 0.112 +763 Y 0.126 +764 L 0.135 +765 G 0.134 +766 R 0.131 +767 G 0.136 +768 K 0.150 +769 R 0.166 +770 A 0.178 +771 G 0.183 +772 R 0.178 +773 Y 0.163 +774 G 0.140 +775 G 0.114 +776 F 0.090 +777 L 0.074 +778 L 0.068 +779 A 0.073 +780 A 0.082 +781 Y 0.087 +782 D 0.089 +783 E 0.093 +784 E 0.102 +785 S 0.115 +786 E 0.126 +787 E 0.125 +788 L 0.108 +789 Q 0.084 +790 A 0.064 +791 I 0.052 +792 C 0.051 +793 K 0.061 +794 L 0.076 +795 G 0.088 +796 T 0.094 +797 G 0.096 +798 F 0.098 +799 S 0.100 +800 D 0.101 +801 E 0.098 +802 E 0.089 +803 L 0.078 +804 E 0.068 +805 E 0.063 +806 H 0.066 +807 H 0.078 +808 Q 0.089 +809 S 0.093 +810 L 0.088 +811 Q 0.080 +812 A 0.075 +813 L 0.079 +814 V 0.090 +815 L 0.106 +816 P 0.123 +817 T 0.138 +818 P 0.140 +819 R 0.128 +820 P 0.106 +821 Y 0.088 +822 V 0.081 +823 R 0.086 +824 I 0.101 +825 D 0.122 +826 G 0.141 +827 A 0.146 +828 V 0.139 +829 A 0.124 +830 P 0.107 +831 D 0.094 +832 H 0.092 +833 W 0.102 +834 L 0.119 +835 D 0.135 +836 P 0.145 +837 S 0.145 +838 I 0.138 +839 V 0.129 +840 W 0.124 +841 E 0.125 +842 V 0.126 +843 K 0.128 +844 C 0.134 +845 A 0.149 +846 D 0.169 +847 L 0.189 +848 S 0.201 +849 L 0.198 +850 S 0.177 +851 P 0.147 +852 I 0.123 +853 Y 0.115 +854 P 0.121 +855 A 0.131 +856 A 0.140 +857 R 0.149 +858 G 0.155 +859 L 0.154 +860 V 0.149 +861 D 0.149 +862 K 0.157 +863 E 0.171 +864 K 0.183 +865 G 0.184 +866 I 0.170 +867 S 0.145 +868 L 0.122 +869 R 0.112 +870 F 0.113 +871 P 0.112 +872 R 0.100 +873 F 0.083 +874 I 0.075 +875 R 0.081 +876 V 0.094 +877 R 0.107 +878 K 0.115 +879 D 0.119 +880 K 0.121 +881 Q 0.119 +882 P 0.118 +883 E 0.124 +884 Q 0.137 +885 A 0.145 +886 T 0.140 +887 T 0.123 +888 S 0.107 +889 N 0.098 +890 Q 0.093 +891 V 0.085 +892 A 0.076 +893 S 0.072 +894 L 0.071 +895 Y 0.073 +896 R 0.081 +897 K 0.101 +898 Q 0.140 +899 S 0.194 +900 Q 0.256 +901 I 0.321 +902 Q 0.388 +903 N 0.448 +904 Q 0.496 +905 Q 0.535 +906 S 0.568 +907 S 0.590 +908 D 0.598 +909 L 0.594 +910 D 0.581 +911 S 0.562 +912 D 0.538 +913 V 0.511 +914 E 0.477 +915 D 0.436 +916 Y 0.405 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000056394.21_ENSMUST00000177588.10_GN:Lig1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000056394.21_ENSMUST00000177588.10_GN:Lig1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..8af831d51a234898d3df3286aead85f3f7a17e25 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000056394.21_ENSMUST00000177588.10_GN:Lig1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid @@ -0,0 +1,933 @@ +>ENSMUSG00000056394.21|ENSMUST00000177588.10|GN:Lig1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:16 +1 M 0.292 +2 R 0.296 +3 K 0.304 +4 K 0.312 +5 E 0.318 +6 Q 0.328 +7 E 0.351 +8 R 0.393 +9 K 0.439 +10 G 0.472 +11 E 0.490 +12 T 0.500 +13 S 0.503 +14 A 0.492 +15 A 0.475 +16 N 0.450 +17 M 0.408 +18 Q 0.361 +19 R 0.330 +20 S 0.312 +21 I 0.294 +22 M 0.279 +23 S 0.279 +24 F 0.300 +25 F 0.344 +26 Q 0.413 +27 P 0.497 +28 T 0.573 +29 K 0.623 +30 E 0.653 +31 G 0.668 +32 K 0.669 +33 A 0.658 +34 K 0.643 +35 K 0.625 +36 P 0.592 +37 E 0.543 +38 K 0.514 +39 E 0.537 +40 T 0.592 +41 P 0.642 +42 S 0.674 +43 S 0.684 +44 I 0.675 +45 R 0.655 +46 E 0.633 +47 K 0.604 +48 E 0.574 +49 P 0.557 +50 P 0.552 +51 P 0.547 +52 K 0.554 +53 V 0.587 +54 A 0.607 +55 L 0.591 +56 K 0.583 +57 E 0.626 +58 R 0.688 +59 N 0.726 +60 Q 0.735 +61 V 0.733 +62 V 0.730 +63 P 0.732 +64 E 0.738 +65 S 0.739 +66 D 0.731 +67 S 0.726 +68 P 0.736 +69 V 0.755 +70 K 0.767 +71 R 0.756 +72 T 0.713 +73 G 0.651 +74 R 0.617 +75 K 0.633 +76 V 0.648 +77 A 0.624 +78 Q 0.602 +79 V 0.628 +80 L 0.683 +81 S 0.726 +82 C 0.752 +83 E 0.768 +84 G 0.776 +85 E 0.776 +86 D 0.772 +87 E 0.764 +88 D 0.751 +89 E 0.738 +90 A 0.730 +91 P 0.725 +92 G 0.709 +93 T 0.667 +94 P 0.610 +95 K 0.582 +96 V 0.613 +97 Q 0.674 +98 K 0.724 +99 P 0.757 +100 V 0.782 +101 S 0.799 +102 D 0.804 +103 S 0.796 +104 E 0.779 +105 Q 0.757 +106 S 0.738 +107 S 0.726 +108 P 0.726 +109 P 0.738 +110 S 0.755 +111 P 0.770 +112 D 0.777 +113 T 0.774 +114 C 0.767 +115 P 0.762 +116 E 0.762 +117 N 0.762 +118 S 0.761 +119 P 0.762 +120 V 0.766 +121 F 0.771 +122 N 0.767 +123 C 0.758 +124 S 0.757 +125 S 0.772 +126 P 0.792 +127 M 0.800 +128 D 0.787 +129 I 0.758 +130 S 0.726 +131 P 0.701 +132 S 0.686 +133 G 0.679 +134 F 0.683 +135 P 0.700 +136 K 0.720 +137 R 0.727 +138 R 0.726 +139 T 0.727 +140 A 0.733 +141 R 0.735 +142 K 0.727 +143 Q 0.717 +144 L 0.713 +145 P 0.708 +146 K 0.683 +147 R 0.628 +148 T 0.553 +149 I 0.495 +150 Q 0.497 +151 D 0.553 +152 T 0.603 +153 L 0.616 +154 E 0.619 +155 E 0.639 +156 Q 0.663 +157 N 0.678 +158 E 0.685 +159 D 0.689 +160 K 0.687 +161 T 0.676 +162 K 0.653 +163 T 0.613 +164 A 0.560 +165 K 0.529 +166 K 0.539 +167 R 0.552 +168 K 0.535 +169 K 0.525 +170 E 0.557 +171 E 0.602 +172 E 0.629 +173 T 0.645 +174 P 0.666 +175 K 0.693 +176 E 0.712 +177 S 0.716 +178 L 0.707 +179 A 0.693 +180 E 0.670 +181 A 0.624 +182 E 0.564 +183 D 0.523 +184 V 0.507 +185 K 0.477 +186 Q 0.440 +187 K 0.460 +188 E 0.553 +189 E 0.655 +190 K 0.721 +191 E 0.754 +192 G 0.770 +193 D 0.777 +194 Q 0.779 +195 L 0.779 +196 I 0.778 +197 V 0.775 +198 P 0.774 +199 S 0.775 +200 E 0.774 +201 P 0.772 +202 T 0.768 +203 K 0.765 +204 S 0.762 +205 P 0.761 +206 E 0.765 +207 S 0.775 +208 V 0.781 +209 T 0.779 +210 L 0.775 +211 T 0.773 +212 K 0.774 +213 T 0.773 +214 E 0.771 +215 N 0.768 +216 I 0.765 +217 P 0.768 +218 V 0.777 +219 C 0.788 +220 K 0.795 +221 A 0.798 +222 G 0.798 +223 V 0.792 +224 K 0.782 +225 L 0.773 +226 K 0.774 +227 P 0.783 +228 Q 0.794 +229 E 0.798 +230 E 0.795 +231 E 0.785 +232 Q 0.768 +233 S 0.749 +234 K 0.740 +235 P 0.747 +236 P 0.764 +237 A 0.781 +238 R 0.786 +239 G 0.774 +240 A 0.750 +241 K 0.720 +242 T 0.689 +243 L 0.661 +244 S 0.631 +245 S 0.597 +246 F 0.567 +247 F 0.561 +248 T 0.584 +249 P 0.622 +250 R 0.659 +251 K 0.690 +252 P 0.718 +253 A 0.738 +254 V 0.748 +255 K 0.748 +256 T 0.746 +257 E 0.746 +258 V 0.744 +259 K 0.742 +260 Q 0.744 +261 E 0.750 +262 E 0.755 +263 S 0.755 +264 G 0.746 +265 T 0.728 +266 L 0.706 +267 R 0.689 +268 K 0.678 +269 E 0.668 +270 E 0.648 +271 T 0.616 +272 K 0.572 +273 G 0.510 +274 T 0.426 +275 L 0.327 +276 D 0.234 +277 P 0.168 +278 A 0.135 +279 N 0.126 +280 Y 0.123 +281 N 0.116 +282 P 0.107 +283 S 0.106 +284 K 0.116 +285 N 0.128 +286 N 0.127 +287 Y 0.112 +288 H 0.091 +289 P 0.078 +290 I 0.080 +291 E 0.090 +292 D 0.098 +293 A 0.098 +294 C 0.097 +295 W 0.094 +296 K 0.089 +297 H 0.087 +298 G 0.094 +299 Q 0.102 +300 K 0.101 +301 V 0.084 +302 P 0.060 +303 F 0.042 +304 L 0.033 +305 A 0.031 +306 V 0.030 +307 A 0.027 +308 R 0.024 +309 T 0.023 +310 F 0.025 +311 E 0.032 +312 K 0.041 +313 I 0.048 +314 E 0.054 +315 E 0.061 +316 V 0.071 +317 S 0.082 +318 A 0.093 +319 R 0.100 +320 L 0.102 +321 K 0.101 +322 M 0.098 +323 V 0.097 +324 E 0.096 +325 T 0.093 +326 L 0.084 +327 S 0.073 +328 N 0.064 +329 L 0.054 +330 L 0.046 +331 R 0.040 +332 S 0.037 +333 V 0.035 +334 V 0.036 +335 A 0.042 +336 L 0.049 +337 S 0.049 +338 P 0.044 +339 P 0.040 +340 D 0.039 +341 L 0.039 +342 L 0.040 +343 P 0.044 +344 V 0.050 +345 L 0.055 +346 Y 0.056 +347 L 0.056 +348 S 0.059 +349 L 0.066 +350 N 0.076 +351 R 0.087 +352 L 0.094 +353 G 0.095 +354 P 0.096 +355 P 0.108 +356 Q 0.134 +357 Q 0.166 +358 G 0.192 +359 L 0.206 +360 E 0.208 +361 L 0.198 +362 G 0.182 +363 V 0.162 +364 G 0.136 +365 D 0.108 +366 G 0.090 +367 V 0.083 +368 L 0.078 +369 L 0.070 +370 K 0.065 +371 A 0.069 +372 V 0.079 +373 A 0.087 +374 Q 0.095 +375 A 0.101 +376 T 0.100 +377 G 0.087 +378 R 0.069 +379 Q 0.053 +380 L 0.041 +381 E 0.036 +382 S 0.038 +383 I 0.046 +384 R 0.057 +385 A 0.063 +386 E 0.061 +387 V 0.055 +388 A 0.055 +389 E 0.060 +390 K 0.069 +391 G 0.079 +392 D 0.084 +393 V 0.081 +394 G 0.073 +395 L 0.068 +396 V 0.066 +397 A 0.066 +398 E 0.072 +399 N 0.087 +400 S 0.110 +401 R 0.141 +402 S 0.184 +403 T 0.231 +404 Q 0.260 +405 R 0.261 +406 L 0.246 +407 M 0.237 +408 L 0.239 +409 P 0.236 +410 P 0.211 +411 P 0.167 +412 P 0.118 +413 L 0.079 +414 T 0.056 +415 I 0.047 +416 S 0.046 +417 G 0.048 +418 V 0.051 +419 F 0.050 +420 T 0.047 +421 K 0.047 +422 F 0.055 +423 C 0.069 +424 D 0.085 +425 I 0.097 +426 A 0.107 +427 R 0.119 +428 L 0.137 +429 T 0.155 +430 G 0.172 +431 S 0.184 +432 A 0.186 +433 S 0.174 +434 M 0.146 +435 A 0.114 +436 K 0.092 +437 K 0.081 +438 M 0.079 +439 D 0.084 +440 I 0.087 +441 I 0.085 +442 K 0.081 +443 G 0.078 +444 L 0.076 +445 F 0.075 +446 V 0.080 +447 A 0.092 +448 C 0.106 +449 R 0.117 +450 H 0.119 +451 S 0.110 +452 E 0.093 +453 A 0.075 +454 R 0.060 +455 Y 0.054 +456 I 0.054 +457 A 0.058 +458 R 0.062 +459 S 0.069 +460 L 0.080 +461 S 0.093 +462 G 0.110 +463 R 0.127 +464 L 0.136 +465 R 0.130 +466 L 0.118 +467 G 0.110 +468 L 0.105 +469 A 0.098 +470 E 0.091 +471 Q 0.085 +472 S 0.080 +473 V 0.076 +474 L 0.075 +475 A 0.075 +476 A 0.077 +477 L 0.077 +478 A 0.077 +479 Q 0.078 +480 A 0.080 +481 V 0.084 +482 S 0.096 +483 L 0.111 +484 T 0.125 +485 P 0.137 +486 P 0.148 +487 G 0.151 +488 Q 0.141 +489 E 0.123 +490 F 0.110 +491 P 0.107 +492 T 0.115 +493 A 0.130 +494 V 0.151 +495 V 0.174 +496 D 0.194 +497 A 0.200 +498 G 0.193 +499 K 0.178 +500 G 0.163 +501 K 0.148 +502 T 0.135 +503 A 0.124 +504 E 0.117 +505 A 0.112 +506 R 0.104 +507 K 0.094 +508 M 0.091 +509 W 0.091 +510 L 0.086 +511 E 0.076 +512 E 0.069 +513 Q 0.067 +514 G 0.067 +515 M 0.071 +516 I 0.080 +517 L 0.090 +518 K 0.096 +519 Q 0.099 +520 T 0.096 +521 F 0.087 +522 C 0.079 +523 E 0.076 +524 V 0.074 +525 P 0.068 +526 D 0.060 +527 L 0.052 +528 D 0.046 +529 R 0.042 +530 I 0.041 +531 I 0.039 +532 P 0.037 +533 V 0.037 +534 L 0.038 +535 L 0.037 +536 E 0.036 +537 H 0.035 +538 G 0.035 +539 L 0.036 +540 E 0.038 +541 R 0.043 +542 L 0.051 +543 P 0.061 +544 E 0.072 +545 H 0.085 +546 C 0.099 +547 K 0.112 +548 L 0.126 +549 S 0.133 +550 P 0.133 +551 G 0.133 +552 V 0.137 +553 P 0.137 +554 L 0.127 +555 K 0.110 +556 P 0.094 +557 M 0.080 +558 L 0.072 +559 A 0.073 +560 H 0.081 +561 P 0.093 +562 T 0.103 +563 R 0.108 +564 G 0.106 +565 V 0.095 +566 S 0.081 +567 E 0.071 +568 V 0.070 +569 L 0.076 +570 K 0.080 +571 R 0.078 +572 F 0.071 +573 E 0.066 +574 E 0.063 +575 V 0.058 +576 D 0.053 +577 F 0.050 +578 T 0.048 +579 C 0.045 +580 E 0.039 +581 Y 0.033 +582 K 0.033 +583 Y 0.037 +584 D 0.045 +585 G 0.053 +586 Q 0.057 +587 R 0.055 +588 A 0.048 +589 Q 0.040 +590 I 0.035 +591 H 0.035 +592 V 0.043 +593 L 0.062 +594 E 0.089 +595 G 0.113 +596 G 0.121 +597 E 0.110 +598 V 0.085 +599 K 0.060 +600 I 0.044 +601 F 0.040 +602 S 0.046 +603 R 0.058 +604 N 0.072 +605 Q 0.087 +606 E 0.099 +607 D 0.101 +608 N 0.097 +609 T 0.093 +610 G 0.088 +611 K 0.081 +612 Y 0.072 +613 P 0.062 +614 D 0.051 +615 I 0.041 +616 I 0.035 +617 S 0.033 +618 R 0.034 +619 I 0.035 +620 P 0.036 +621 K 0.040 +622 I 0.044 +623 K 0.049 +624 H 0.056 +625 P 0.063 +626 S 0.068 +627 V 0.068 +628 T 0.064 +629 S 0.060 +630 F 0.058 +631 I 0.057 +632 L 0.057 +633 D 0.058 +634 T 0.059 +635 E 0.060 +636 A 0.062 +637 V 0.065 +638 A 0.064 +639 W 0.059 +640 D 0.053 +641 R 0.051 +642 E 0.055 +643 K 0.066 +644 K 0.082 +645 Q 0.094 +646 I 0.096 +647 Q 0.087 +648 P 0.078 +649 F 0.079 +650 Q 0.094 +651 V 0.114 +652 L 0.128 +653 T 0.133 +654 T 0.141 +655 R 0.158 +656 K 0.177 +657 R 0.196 +658 K 0.220 +659 E 0.248 +660 V 0.273 +661 D 0.279 +662 A 0.262 +663 S 0.235 +664 E 0.217 +665 I 0.209 +666 Q 0.203 +667 V 0.190 +668 Q 0.165 +669 V 0.129 +670 C 0.092 +671 L 0.064 +672 Y 0.046 +673 A 0.035 +674 F 0.030 +675 D 0.027 +676 L 0.027 +677 I 0.030 +678 Y 0.036 +679 L 0.046 +680 N 0.060 +681 G 0.075 +682 E 0.091 +683 S 0.101 +684 L 0.097 +685 V 0.080 +686 R 0.063 +687 Q 0.055 +688 P 0.052 +689 L 0.049 +690 S 0.045 +691 R 0.046 +692 R 0.054 +693 R 0.065 +694 Q 0.072 +695 L 0.070 +696 L 0.062 +697 R 0.057 +698 E 0.054 +699 N 0.052 +700 F 0.053 +701 V 0.061 +702 E 0.075 +703 T 0.089 +704 E 0.092 +705 G 0.081 +706 E 0.067 +707 F 0.058 +708 V 0.057 +709 F 0.056 +710 T 0.051 +711 T 0.045 +712 S 0.042 +713 L 0.041 +714 D 0.042 +715 T 0.045 +716 K 0.050 +717 D 0.053 +718 T 0.053 +719 E 0.051 +720 Q 0.053 +721 I 0.063 +722 A 0.075 +723 E 0.081 +724 F 0.076 +725 L 0.067 +726 E 0.059 +727 Q 0.054 +728 S 0.053 +729 V 0.056 +730 K 0.062 +731 D 0.073 +732 S 0.084 +733 C 0.093 +734 E 0.100 +735 G 0.106 +736 L 0.116 +737 M 0.124 +738 V 0.122 +739 K 0.114 +740 T 0.111 +741 L 0.119 +742 D 0.132 +743 V 0.138 +744 D 0.134 +745 A 0.125 +746 T 0.118 +747 Y 0.117 +748 E 0.123 +749 I 0.134 +750 A 0.147 +751 K 0.163 +752 R 0.174 +753 S 0.176 +754 H 0.169 +755 N 0.155 +756 W 0.138 +757 L 0.126 +758 K 0.123 +759 L 0.128 +760 K 0.134 +761 K 0.135 +762 D 0.133 +763 Y 0.141 +764 L 0.173 +765 D 0.232 +766 G 0.299 +767 V 0.333 +768 G 0.312 +769 D 0.250 +770 T 0.182 +771 L 0.132 +772 D 0.103 +773 L 0.088 +774 V 0.081 +775 V 0.079 +776 I 0.085 +777 G 0.097 +778 A 0.112 +779 Y 0.127 +780 L 0.135 +781 G 0.135 +782 R 0.133 +783 G 0.138 +784 K 0.151 +785 R 0.167 +786 A 0.179 +787 G 0.183 +788 R 0.179 +789 Y 0.163 +790 G 0.140 +791 G 0.114 +792 F 0.091 +793 L 0.074 +794 L 0.068 +795 A 0.073 +796 A 0.082 +797 Y 0.087 +798 D 0.089 +799 E 0.093 +800 E 0.102 +801 S 0.115 +802 E 0.126 +803 E 0.125 +804 L 0.108 +805 Q 0.085 +806 A 0.064 +807 I 0.052 +808 C 0.051 +809 K 0.061 +810 L 0.075 +811 G 0.088 +812 T 0.094 +813 G 0.096 +814 F 0.098 +815 S 0.100 +816 D 0.101 +817 E 0.098 +818 E 0.089 +819 L 0.078 +820 E 0.068 +821 E 0.063 +822 H 0.066 +823 H 0.078 +824 Q 0.089 +825 S 0.093 +826 L 0.088 +827 Q 0.080 +828 A 0.075 +829 L 0.078 +830 V 0.090 +831 L 0.105 +832 P 0.123 +833 T 0.137 +834 P 0.140 +835 R 0.128 +836 P 0.106 +837 Y 0.088 +838 V 0.081 +839 R 0.086 +840 I 0.100 +841 D 0.121 +842 G 0.140 +843 A 0.146 +844 V 0.139 +845 A 0.125 +846 P 0.107 +847 D 0.094 +848 H 0.092 +849 W 0.102 +850 L 0.119 +851 D 0.135 +852 P 0.145 +853 S 0.145 +854 I 0.138 +855 V 0.129 +856 W 0.124 +857 E 0.125 +858 V 0.126 +859 K 0.128 +860 C 0.134 +861 A 0.148 +862 D 0.168 +863 L 0.189 +864 S 0.201 +865 L 0.197 +866 S 0.177 +867 P 0.147 +868 I 0.123 +869 Y 0.115 +870 P 0.121 +871 A 0.131 +872 A 0.141 +873 R 0.149 +874 G 0.155 +875 L 0.154 +876 V 0.150 +877 D 0.149 +878 K 0.157 +879 E 0.170 +880 K 0.183 +881 G 0.184 +882 I 0.170 +883 S 0.145 +884 L 0.122 +885 R 0.112 +886 F 0.113 +887 P 0.112 +888 R 0.100 +889 F 0.082 +890 I 0.075 +891 R 0.081 +892 V 0.094 +893 R 0.107 +894 K 0.116 +895 D 0.120 +896 K 0.121 +897 Q 0.119 +898 P 0.118 +899 E 0.124 +900 Q 0.137 +901 A 0.146 +902 T 0.140 +903 T 0.123 +904 S 0.107 +905 N 0.099 +906 Q 0.095 +907 V 0.091 +908 A 0.089 +909 S 0.088 +910 L 0.084 +911 Y 0.080 +912 R 0.083 +913 K 0.102 +914 Q 0.141 +915 S 0.195 +916 Q 0.257 +917 I 0.321 +918 Q 0.388 +919 N 0.447 +920 Q 0.494 +921 Q 0.533 +922 S 0.566 +923 S 0.589 +924 D 0.598 +925 L 0.594 +926 D 0.581 +927 S 0.562 +928 D 0.538 +929 V 0.510 +930 E 0.475 +931 D 0.434 +932 Y 0.402 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000056426.4_ENSMUST00000070514.4_GN:Nat3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000056426.4_ENSMUST00000070514.4_GN:Nat3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ecf30c07a67a7e8341af19e1d853a81288ac7c05 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000056426.4_ENSMUST00000070514.4_GN:Nat3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,291 @@ +>ENSMUSG00000056426.4|ENSMUST00000070514.4|GN:Nat3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.122 +2 D 0.096 +3 I 0.065 +4 E 0.044 +5 A 0.037 +6 Y 0.042 +7 F 0.053 +8 E 0.064 +9 R 0.066 +10 I 0.062 +11 G 0.060 +12 Y 0.063 +13 Q 0.070 +14 K 0.081 +15 S 0.092 +16 S 0.097 +17 N 0.092 +18 K 0.078 +19 L 0.064 +20 D 0.061 +21 L 0.067 +22 Q 0.072 +23 T 0.070 +24 L 0.064 +25 T 0.060 +26 E 0.061 +27 I 0.068 +28 L 0.075 +29 Q 0.078 +30 H 0.076 +31 Q 0.074 +32 I 0.073 +33 R 0.072 +34 A 0.069 +35 I 0.061 +36 P 0.053 +37 F 0.050 +38 E 0.054 +39 N 0.059 +40 L 0.064 +41 N 0.069 +42 I 0.076 +43 H 0.089 +44 C 0.105 +45 G 0.121 +46 K 0.133 +47 T 0.136 +48 M 0.126 +49 E 0.109 +50 L 0.092 +51 S 0.081 +52 L 0.075 +53 E 0.074 +54 D 0.076 +55 T 0.078 +56 F 0.077 +57 H 0.075 +58 Q 0.078 +59 I 0.083 +60 V 0.086 +61 R 0.087 +62 K 0.091 +63 K 0.096 +64 R 0.103 +65 G 0.104 +66 G 0.096 +67 W 0.086 +68 C 0.081 +69 L 0.087 +70 Q 0.095 +71 V 0.097 +72 N 0.089 +73 H 0.079 +74 L 0.070 +75 L 0.062 +76 Y 0.054 +77 W 0.047 +78 A 0.043 +79 L 0.041 +80 A 0.042 +81 M 0.045 +82 I 0.046 +83 G 0.046 +84 F 0.045 +85 E 0.045 +86 T 0.049 +87 T 0.057 +88 M 0.066 +89 L 0.070 +90 G 0.067 +91 G 0.061 +92 C 0.056 +93 V 0.053 +94 Y 0.052 +95 V 0.054 +96 P 0.058 +97 S 0.060 +98 A 0.060 +99 C 0.061 +100 K 0.070 +101 Y 0.082 +102 S 0.093 +103 N 0.100 +104 T 0.104 +105 M 0.101 +106 I 0.090 +107 H 0.073 +108 L 0.054 +109 L 0.038 +110 L 0.029 +111 Q 0.027 +112 V 0.028 +113 T 0.034 +114 I 0.044 +115 S 0.056 +116 G 0.063 +117 K 0.060 +118 T 0.048 +119 Y 0.037 +120 I 0.032 +121 V 0.034 +122 D 0.038 +123 S 0.041 +124 A 0.045 +125 F 0.049 +126 P 0.054 +127 F 0.061 +128 S 0.074 +129 C 0.088 +130 Q 0.094 +131 L 0.089 +132 W 0.083 +133 E 0.076 +134 P 0.067 +135 L 0.056 +136 E 0.049 +137 L 0.052 +138 T 0.062 +139 S 0.075 +140 G 0.080 +141 K 0.077 +142 D 0.070 +143 Q 0.066 +144 P 0.059 +145 Q 0.050 +146 V 0.043 +147 P 0.044 +148 A 0.048 +149 I 0.050 +150 F 0.047 +151 H 0.045 +152 L 0.045 +153 R 0.046 +154 E 0.048 +155 E 0.056 +156 N 0.065 +157 G 0.069 +158 T 0.063 +159 W 0.051 +160 Y 0.041 +161 L 0.038 +162 E 0.040 +163 Q 0.046 +164 T 0.056 +165 K 0.071 +166 R 0.087 +167 Q 0.103 +168 E 0.119 +169 Y 0.135 +170 V 0.153 +171 S 0.169 +172 N 0.181 +173 Q 0.184 +174 E 0.186 +175 F 0.191 +176 I 0.204 +177 D 0.224 +178 S 0.244 +179 N 0.247 +180 F 0.234 +181 L 0.215 +182 E 0.197 +183 K 0.176 +184 N 0.148 +185 T 0.117 +186 H 0.091 +187 R 0.071 +188 K 0.057 +189 I 0.047 +190 Y 0.041 +191 S 0.038 +192 F 0.041 +193 T 0.053 +194 L 0.072 +195 E 0.088 +196 P 0.093 +197 R 0.089 +198 T 0.088 +199 I 0.096 +200 E 0.103 +201 D 0.100 +202 F 0.089 +203 W 0.078 +204 S 0.076 +205 I 0.080 +206 S 0.085 +207 T 0.088 +208 Y 0.089 +209 Y 0.089 +210 Q 0.093 +211 V 0.104 +212 S 0.118 +213 R 0.133 +214 T 0.147 +215 S 0.151 +216 V 0.137 +217 M 0.114 +218 T 0.094 +219 N 0.079 +220 T 0.069 +221 S 0.065 +222 L 0.062 +223 C 0.056 +224 S 0.048 +225 L 0.042 +226 H 0.040 +227 T 0.041 +228 K 0.040 +229 D 0.041 +230 G 0.044 +231 V 0.046 +232 H 0.045 +233 G 0.041 +234 L 0.041 +235 M 0.044 +236 G 0.049 +237 T 0.052 +238 I 0.048 +239 L 0.041 +240 A 0.040 +241 Y 0.046 +242 K 0.057 +243 K 0.066 +244 F 0.071 +245 N 0.076 +246 Y 0.080 +247 K 0.085 +248 D 0.090 +249 N 0.093 +250 I 0.094 +251 D 0.095 +252 L 0.095 +253 V 0.091 +254 E 0.082 +255 F 0.070 +256 K 0.061 +257 T 0.056 +258 L 0.058 +259 K 0.066 +260 E 0.075 +261 E 0.076 +262 E 0.069 +263 I 0.063 +264 E 0.066 +265 E 0.070 +266 V 0.067 +267 L 0.060 +268 K 0.057 +269 S 0.054 +270 V 0.051 +271 F 0.049 +272 G 0.055 +273 I 0.068 +274 H 0.084 +275 L 0.100 +276 E 0.116 +277 T 0.131 +278 K 0.145 +279 L 0.161 +280 V 0.181 +281 P 0.200 +282 K 0.217 +283 C 0.232 +284 G 0.246 +285 N 0.256 +286 V 0.257 +287 F 0.248 +288 F 0.238 +289 T 0.233 +290 I 0.232 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000056426.4_ENSMUST00000070514.4_GN:Nat3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:51.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000056426.4_ENSMUST00000070514.4_GN:Nat3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:51.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4600dddcfef86f514a8685327e799f091ce53bab --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000056426.4_ENSMUST00000070514.4_GN:Nat3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:51.caid @@ -0,0 +1,342 @@ +>ENSMUSG00000056426.4|ENSMUST00000070514.4|GN:Nat3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:51 +1 M 0.319 +2 N 0.311 +3 K 0.311 +4 R 0.323 +5 C 0.322 +6 R 0.310 +7 R 0.316 +8 A 0.340 +9 T 0.347 +10 R 0.337 +11 V 0.336 +12 A 0.346 +13 V 0.356 +14 L 0.370 +15 Q 0.391 +16 P 0.408 +17 L 0.415 +18 V 0.436 +19 T 0.488 +20 G 0.546 +21 T 0.564 +22 I 0.540 +23 S 0.504 +24 L 0.481 +25 Q 0.480 +26 G 0.498 +27 P 0.522 +28 R 0.536 +29 H 0.531 +30 E 0.514 +31 R 0.516 +32 R 0.557 +33 V 0.605 +34 A 0.620 +35 D 0.607 +36 G 0.582 +37 Q 0.541 +38 A 0.486 +39 V 0.433 +40 A 0.393 +41 V 0.360 +42 R 0.329 +43 R 0.307 +44 L 0.295 +45 E 0.288 +46 R 0.287 +47 T 0.290 +48 Q 0.288 +49 L 0.269 +50 G 0.230 +51 T 0.176 +52 M 0.122 +53 D 0.078 +54 I 0.049 +55 E 0.034 +56 A 0.028 +57 Y 0.025 +58 F 0.026 +59 E 0.029 +60 R 0.035 +61 I 0.042 +62 G 0.048 +63 Y 0.053 +64 Q 0.059 +65 K 0.068 +66 S 0.077 +67 S 0.083 +68 N 0.080 +69 K 0.068 +70 L 0.055 +71 D 0.047 +72 L 0.046 +73 Q 0.048 +74 T 0.049 +75 L 0.049 +76 T 0.050 +77 E 0.053 +78 I 0.060 +79 L 0.067 +80 Q 0.069 +81 H 0.068 +82 Q 0.067 +83 I 0.066 +84 R 0.065 +85 A 0.061 +86 I 0.053 +87 P 0.046 +88 F 0.044 +89 E 0.047 +90 N 0.053 +91 L 0.058 +92 N 0.063 +93 I 0.070 +94 H 0.081 +95 C 0.095 +96 G 0.109 +97 K 0.118 +98 T 0.119 +99 M 0.111 +100 E 0.096 +101 L 0.083 +102 S 0.075 +103 L 0.071 +104 E 0.070 +105 D 0.069 +106 T 0.067 +107 F 0.063 +108 H 0.062 +109 Q 0.066 +110 I 0.071 +111 V 0.074 +112 R 0.076 +113 K 0.080 +114 K 0.087 +115 R 0.095 +116 G 0.097 +117 G 0.091 +118 W 0.081 +119 C 0.077 +120 L 0.082 +121 Q 0.091 +122 V 0.093 +123 N 0.085 +124 H 0.074 +125 L 0.065 +126 L 0.057 +127 Y 0.049 +128 W 0.042 +129 A 0.039 +130 L 0.038 +131 A 0.039 +132 M 0.041 +133 I 0.042 +134 G 0.042 +135 F 0.041 +136 E 0.042 +137 T 0.046 +138 T 0.053 +139 M 0.060 +140 L 0.064 +141 G 0.061 +142 G 0.056 +143 C 0.052 +144 V 0.050 +145 Y 0.049 +146 V 0.051 +147 P 0.054 +148 S 0.058 +149 A 0.059 +150 C 0.063 +151 K 0.073 +152 Y 0.086 +153 S 0.097 +154 N 0.105 +155 T 0.108 +156 M 0.105 +157 I 0.094 +158 H 0.077 +159 L 0.057 +160 L 0.039 +161 L 0.030 +162 Q 0.028 +163 V 0.030 +164 T 0.037 +165 I 0.047 +166 S 0.058 +167 G 0.064 +168 K 0.060 +169 T 0.049 +170 Y 0.037 +171 I 0.032 +172 V 0.033 +173 D 0.037 +174 S 0.040 +175 A 0.044 +176 F 0.047 +177 P 0.051 +178 F 0.058 +179 S 0.071 +180 C 0.085 +181 Q 0.091 +182 L 0.087 +183 W 0.080 +184 E 0.073 +185 P 0.065 +186 L 0.055 +187 E 0.048 +188 L 0.051 +189 T 0.061 +190 S 0.073 +191 G 0.078 +192 K 0.074 +193 D 0.068 +194 Q 0.063 +195 P 0.057 +196 Q 0.049 +197 V 0.042 +198 P 0.042 +199 A 0.046 +200 I 0.047 +201 F 0.045 +202 H 0.044 +203 L 0.044 +204 R 0.045 +205 E 0.047 +206 E 0.053 +207 N 0.061 +208 G 0.065 +209 T 0.061 +210 W 0.050 +211 Y 0.041 +212 L 0.039 +213 E 0.041 +214 Q 0.048 +215 T 0.060 +216 K 0.077 +217 R 0.095 +218 Q 0.112 +219 E 0.129 +220 Y 0.145 +221 V 0.162 +222 S 0.178 +223 N 0.190 +224 Q 0.194 +225 E 0.195 +226 F 0.200 +227 I 0.212 +228 D 0.234 +229 S 0.255 +230 N 0.259 +231 F 0.245 +232 L 0.223 +233 E 0.199 +234 K 0.173 +235 N 0.142 +236 T 0.111 +237 H 0.085 +238 R 0.066 +239 K 0.054 +240 I 0.045 +241 Y 0.040 +242 S 0.038 +243 F 0.041 +244 T 0.053 +245 L 0.072 +246 E 0.087 +247 P 0.091 +248 R 0.088 +249 T 0.087 +250 I 0.094 +251 E 0.102 +252 D 0.099 +253 F 0.088 +254 W 0.077 +255 S 0.074 +256 I 0.077 +257 S 0.082 +258 T 0.086 +259 Y 0.087 +260 Y 0.087 +261 Q 0.090 +262 V 0.101 +263 S 0.115 +264 R 0.131 +265 T 0.145 +266 S 0.150 +267 V 0.138 +268 M 0.117 +269 T 0.098 +270 N 0.084 +271 T 0.074 +272 S 0.070 +273 L 0.067 +274 C 0.060 +275 S 0.050 +276 L 0.044 +277 H 0.042 +278 T 0.041 +279 K 0.040 +280 D 0.041 +281 G 0.045 +282 V 0.048 +283 H 0.046 +284 G 0.043 +285 L 0.043 +286 M 0.046 +287 G 0.052 +288 T 0.054 +289 I 0.049 +290 L 0.043 +291 A 0.042 +292 Y 0.049 +293 K 0.061 +294 K 0.072 +295 F 0.079 +296 N 0.084 +297 Y 0.089 +298 K 0.093 +299 D 0.098 +300 N 0.102 +301 I 0.105 +302 D 0.107 +303 L 0.107 +304 V 0.103 +305 E 0.092 +306 F 0.078 +307 K 0.068 +308 T 0.062 +309 L 0.061 +310 K 0.061 +311 E 0.059 +312 E 0.054 +313 E 0.051 +314 I 0.055 +315 E 0.065 +316 E 0.072 +317 V 0.070 +318 L 0.063 +319 K 0.059 +320 S 0.057 +321 V 0.054 +322 F 0.052 +323 G 0.058 +324 I 0.072 +325 H 0.089 +326 L 0.106 +327 E 0.124 +328 T 0.141 +329 K 0.157 +330 L 0.175 +331 V 0.195 +332 P 0.215 +333 K 0.234 +334 C 0.253 +335 G 0.269 +336 N 0.279 +337 V 0.280 +338 F 0.271 +339 F 0.260 +340 T 0.252 +341 I 0.248 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000057278.9_ENSMUST00000089558.7_GN:Snrpg_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000057278.9_ENSMUST00000089558.7_GN:Snrpg_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..088b9fb0e22e2c8adfd0e0a9bb56427c72aa859f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000057278.9_ENSMUST00000089558.7_GN:Snrpg_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,77 @@ +>ENSMUSG00000057278.9|ENSMUST00000089558.7|GN:Snrpg|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.516 +2 S 0.517 +3 K 0.516 +4 A 0.501 +5 H 0.468 +6 P 0.413 +7 P 0.338 +8 E 0.252 +9 L 0.174 +10 K 0.117 +11 K 0.082 +12 F 0.065 +13 M 0.057 +14 D 0.053 +15 K 0.048 +16 K 0.040 +17 L 0.032 +18 S 0.028 +19 L 0.031 +20 K 0.039 +21 L 0.050 +22 N 0.060 +23 G 0.069 +24 G 0.074 +25 R 0.072 +26 H 0.066 +27 V 0.064 +28 Q 0.067 +29 G 0.068 +30 I 0.062 +31 L 0.056 +32 R 0.056 +33 G 0.064 +34 F 0.074 +35 D 0.080 +36 P 0.076 +37 F 0.064 +38 M 0.052 +39 N 0.045 +40 L 0.042 +41 V 0.041 +42 I 0.039 +43 D 0.036 +44 E 0.035 +45 C 0.036 +46 V 0.044 +47 E 0.060 +48 M 0.083 +49 A 0.107 +50 T 0.129 +51 S 0.145 +52 G 0.151 +53 Q 0.145 +54 Q 0.129 +55 N 0.111 +56 N 0.093 +57 I 0.078 +58 G 0.069 +59 M 0.068 +60 V 0.070 +61 V 0.069 +62 I 0.064 +63 R 0.058 +64 G 0.053 +65 N 0.049 +66 S 0.048 +67 I 0.050 +68 I 0.056 +69 M 0.062 +70 L 0.066 +71 E 0.070 +72 A 0.081 +73 L 0.104 +74 E 0.141 +75 R 0.180 +76 V 0.206 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000057278.9_ENSMUST00000089558.7_GN:Snrpg_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:45.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000057278.9_ENSMUST00000089558.7_GN:Snrpg_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:45.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a78f0d2d7c63f0f328e4077929c68a6739035d9f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000057278.9_ENSMUST00000089558.7_GN:Snrpg_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:45.caid @@ -0,0 +1,122 @@ +>ENSMUSG00000057278.9|ENSMUST00000089558.7|GN:Snrpg|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:45 +1 M 0.468 +2 K 0.479 +3 G 0.487 +4 N 0.481 +5 V 0.458 +6 L 0.423 +7 R 0.389 +8 R 0.384 +9 R 0.412 +10 L 0.438 +11 A 0.447 +12 R 0.470 +13 A 0.529 +14 A 0.594 +15 V 0.636 +16 T 0.656 +17 S 0.661 +18 D 0.658 +19 T 0.650 +20 S 0.640 +21 A 0.628 +22 K 0.611 +23 P 0.589 +24 A 0.563 +25 L 0.535 +26 R 0.509 +27 A 0.488 +28 F 0.472 +29 L 0.467 +30 S 0.471 +31 L 0.477 +32 L 0.488 +33 T 0.514 +34 P 0.550 +35 S 0.590 +36 P 0.624 +37 L 0.647 +38 C 0.661 +39 R 0.670 +40 A 0.682 +41 R 0.697 +42 R 0.714 +43 G 0.732 +44 V 0.742 +45 A 0.740 +46 M 0.724 +47 S 0.695 +48 K 0.651 +49 A 0.590 +50 H 0.518 +51 P 0.442 +52 P 0.360 +53 E 0.272 +54 L 0.189 +55 K 0.126 +56 K 0.087 +57 F 0.066 +58 M 0.056 +59 D 0.051 +60 K 0.046 +61 K 0.038 +62 L 0.030 +63 S 0.027 +64 L 0.030 +65 K 0.038 +66 L 0.048 +67 N 0.058 +68 G 0.066 +69 G 0.070 +70 R 0.068 +71 H 0.063 +72 V 0.063 +73 Q 0.067 +74 G 0.069 +75 I 0.064 +76 L 0.059 +77 R 0.061 +78 G 0.070 +79 F 0.079 +80 D 0.084 +81 P 0.078 +82 F 0.066 +83 M 0.052 +84 N 0.044 +85 L 0.039 +86 V 0.038 +87 I 0.036 +88 D 0.034 +89 E 0.033 +90 C 0.035 +91 V 0.044 +92 E 0.061 +93 M 0.087 +94 A 0.118 +95 T 0.148 +96 S 0.169 +97 G 0.175 +98 Q 0.165 +99 Q 0.141 +100 N 0.114 +101 N 0.091 +102 I 0.075 +103 G 0.067 +104 M 0.066 +105 V 0.069 +106 V 0.068 +107 I 0.063 +108 R 0.056 +109 G 0.051 +110 N 0.048 +111 S 0.048 +112 I 0.052 +113 I 0.061 +114 M 0.069 +115 L 0.075 +116 E 0.080 +117 A 0.093 +118 L 0.121 +119 E 0.165 +120 R 0.212 +121 V 0.242 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000058729.14_ENSMUST00000192561.6_GN:Lin9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000058729.14_ENSMUST00000192561.6_GN:Lin9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..629fba7e5a00ac3c32e7cd47a683f6229dcc9820 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000058729.14_ENSMUST00000192561.6_GN:Lin9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,543 @@ +>ENSMUSG00000058729.14|ENSMUST00000192561.6|GN:Lin9|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.414 +2 A 0.455 +3 E 0.503 +4 L 0.519 +5 D 0.499 +6 Q 0.485 +7 L 0.519 +8 P 0.586 +9 D 0.640 +10 E 0.663 +11 S 0.661 +12 S 0.637 +13 S 0.577 +14 A 0.485 +15 K 0.418 +16 A 0.437 +17 L 0.528 +18 V 0.617 +19 S 0.661 +20 L 0.676 +21 K 0.686 +22 E 0.699 +23 G 0.702 +24 S 0.693 +25 L 0.678 +26 S 0.659 +27 N 0.622 +28 T 0.562 +29 W 0.494 +30 N 0.437 +31 E 0.403 +32 K 0.404 +33 Y 0.441 +34 S 0.497 +35 S 0.546 +36 L 0.568 +37 Q 0.571 +38 K 0.578 +39 T 0.602 +40 P 0.632 +41 V 0.656 +42 W 0.683 +43 K 0.718 +44 G 0.749 +45 R 0.765 +46 N 0.767 +47 A 0.763 +48 G 0.761 +49 P 0.763 +50 A 0.768 +51 V 0.766 +52 E 0.757 +53 M 0.746 +54 P 0.741 +55 F 0.743 +56 R 0.751 +57 N 0.756 +58 S 0.750 +59 K 0.745 +60 R 0.751 +61 S 0.762 +62 R 0.767 +63 L 0.770 +64 F 0.774 +65 S 0.777 +66 D 0.772 +67 E 0.751 +68 D 0.706 +69 D 0.645 +70 R 0.612 +71 Q 0.642 +72 I 0.701 +73 N 0.735 +74 T 0.735 +75 K 0.723 +76 S 0.722 +77 P 0.734 +78 K 0.742 +79 R 0.719 +80 N 0.667 +81 Q 0.636 +82 R 0.667 +83 V 0.726 +84 A 0.758 +85 M 0.755 +86 I 0.742 +87 P 0.743 +88 Q 0.755 +89 K 0.766 +90 F 0.772 +91 T 0.774 +92 A 0.762 +93 T 0.725 +94 M 0.675 +95 S 0.641 +96 T 0.642 +97 P 0.665 +98 D 0.685 +99 K 0.690 +100 K 0.682 +101 A 0.665 +102 S 0.637 +103 Q 0.588 +104 K 0.515 +105 I 0.426 +106 G 0.338 +107 F 0.263 +108 R 0.214 +109 L 0.192 +110 R 0.187 +111 N 0.189 +112 L 0.184 +113 L 0.166 +114 K 0.142 +115 L 0.120 +116 P 0.103 +117 K 0.091 +118 A 0.080 +119 H 0.068 +120 K 0.062 +121 W 0.068 +122 C 0.078 +123 I 0.079 +124 Y 0.072 +125 E 0.066 +126 W 0.062 +127 F 0.058 +128 Y 0.058 +129 S 0.068 +130 N 0.081 +131 I 0.093 +132 D 0.107 +133 K 0.130 +134 P 0.161 +135 L 0.197 +136 F 0.243 +137 E 0.293 +138 G 0.329 +139 D 0.332 +140 N 0.304 +141 D 0.254 +142 F 0.200 +143 C 0.158 +144 V 0.133 +145 C 0.114 +146 L 0.097 +147 K 0.084 +148 E 0.081 +149 S 0.090 +150 F 0.107 +151 P 0.123 +152 N 0.137 +153 L 0.150 +154 K 0.163 +155 T 0.177 +156 R 0.185 +157 K 0.178 +158 L 0.151 +159 T 0.116 +160 R 0.090 +161 V 0.076 +162 E 0.072 +163 W 0.074 +164 G 0.080 +165 K 0.087 +166 I 0.094 +167 R 0.103 +168 R 0.116 +169 L 0.139 +170 M 0.177 +171 G 0.224 +172 K 0.258 +173 P 0.265 +174 R 0.254 +175 R 0.235 +176 C 0.212 +177 S 0.186 +178 S 0.163 +179 A 0.142 +180 F 0.124 +181 F 0.111 +182 E 0.106 +183 E 0.107 +184 E 0.112 +185 R 0.115 +186 S 0.112 +187 A 0.107 +188 L 0.098 +189 K 0.084 +190 Q 0.068 +191 K 0.055 +192 R 0.047 +193 Q 0.042 +194 K 0.038 +195 I 0.035 +196 R 0.035 +197 L 0.040 +198 L 0.046 +199 Q 0.053 +200 Q 0.060 +201 R 0.065 +202 K 0.067 +203 V 0.068 +204 A 0.068 +205 D 0.073 +206 V 0.085 +207 S 0.102 +208 Q 0.121 +209 F 0.137 +210 K 0.148 +211 D 0.154 +212 L 0.155 +213 P 0.154 +214 D 0.153 +215 E 0.157 +216 I 0.169 +217 P 0.179 +218 L 0.171 +219 P 0.141 +220 L 0.103 +221 V 0.075 +222 I 0.063 +223 G 0.064 +224 T 0.068 +225 K 0.067 +226 V 0.062 +227 T 0.059 +228 A 0.066 +229 R 0.080 +230 L 0.094 +231 R 0.105 +232 G 0.109 +233 I 0.108 +234 H 0.106 +235 D 0.101 +236 G 0.091 +237 L 0.075 +238 F 0.058 +239 T 0.048 +240 G 0.044 +241 Q 0.044 +242 I 0.043 +243 D 0.041 +244 A 0.041 +245 V 0.042 +246 D 0.044 +247 T 0.045 +248 L 0.046 +249 N 0.044 +250 A 0.038 +251 T 0.030 +252 Y 0.026 +253 R 0.028 +254 V 0.031 +255 T 0.032 +256 F 0.034 +257 D 0.043 +258 R 0.057 +259 T 0.071 +260 G 0.080 +261 L 0.081 +262 G 0.076 +263 T 0.070 +264 H 0.067 +265 T 0.068 +266 I 0.064 +267 P 0.052 +268 D 0.038 +269 Y 0.032 +270 E 0.035 +271 V 0.045 +272 L 0.061 +273 S 0.083 +274 N 0.105 +275 E 0.121 +276 P 0.131 +277 H 0.139 +278 E 0.145 +279 T 0.143 +280 M 0.135 +281 P 0.132 +282 I 0.145 +283 S 0.167 +284 A 0.198 +285 F 0.256 +286 G 0.349 +287 Q 0.454 +288 K 0.536 +289 Q 0.580 +290 R 0.600 +291 P 0.607 +292 S 0.604 +293 R 0.588 +294 F 0.562 +295 F 0.533 +296 M 0.513 +297 T 0.519 +298 P 0.553 +299 P 0.597 +300 R 0.628 +301 L 0.630 +302 H 0.602 +303 Y 0.562 +304 T 0.545 +305 P 0.568 +306 P 0.612 +307 L 0.648 +308 Q 0.671 +309 S 0.693 +310 P 0.714 +311 I 0.733 +312 T 0.748 +313 D 0.755 +314 G 0.752 +315 D 0.742 +316 P 0.734 +317 L 0.733 +318 L 0.732 +319 G 0.720 +320 Q 0.690 +321 S 0.653 +322 P 0.628 +323 W 0.630 +324 R 0.659 +325 S 0.692 +326 K 0.713 +327 V 0.721 +328 S 0.718 +329 G 0.705 +330 S 0.679 +331 D 0.640 +332 T 0.581 +333 E 0.503 +334 T 0.420 +335 L 0.350 +336 G 0.292 +337 G 0.237 +338 F 0.183 +339 P 0.137 +340 V 0.104 +341 E 0.081 +342 F 0.064 +343 L 0.053 +344 I 0.046 +345 Q 0.045 +346 V 0.050 +347 T 0.060 +348 K 0.069 +349 L 0.072 +350 S 0.070 +351 K 0.062 +352 I 0.051 +353 L 0.045 +354 M 0.044 +355 I 0.044 +356 K 0.042 +357 K 0.041 +358 E 0.044 +359 H 0.052 +360 I 0.064 +361 K 0.072 +362 K 0.071 +363 L 0.066 +364 R 0.065 +365 E 0.065 +366 M 0.064 +367 N 0.062 +368 T 0.061 +369 E 0.059 +370 A 0.059 +371 E 0.064 +372 K 0.073 +373 L 0.084 +374 K 0.101 +375 S 0.124 +376 Y 0.147 +377 S 0.167 +378 M 0.179 +379 P 0.173 +380 I 0.145 +381 G 0.105 +382 I 0.072 +383 E 0.057 +384 F 0.058 +385 Q 0.070 +386 R 0.083 +387 R 0.088 +388 Y 0.087 +389 A 0.089 +390 T 0.090 +391 I 0.089 +392 V 0.091 +393 L 0.094 +394 E 0.090 +395 L 0.080 +396 E 0.069 +397 Q 0.060 +398 L 0.056 +399 N 0.056 +400 K 0.060 +401 D 0.064 +402 L 0.066 +403 N 0.067 +404 K 0.066 +405 V 0.071 +406 L 0.080 +407 H 0.082 +408 K 0.076 +409 V 0.071 +410 Q 0.068 +411 Q 0.064 +412 Y 0.062 +413 C 0.068 +414 Y 0.086 +415 E 0.118 +416 L 0.161 +417 A 0.208 +418 P 0.252 +419 D 0.292 +420 Q 0.328 +421 G 0.353 +422 L 0.357 +423 Q 0.354 +424 P 0.357 +425 A 0.358 +426 D 0.346 +427 Q 0.324 +428 P 0.301 +429 T 0.274 +430 D 0.241 +431 M 0.206 +432 R 0.175 +433 R 0.152 +434 R 0.136 +435 C 0.126 +436 E 0.124 +437 E 0.127 +438 E 0.126 +439 A 0.127 +440 Q 0.138 +441 E 0.159 +442 I 0.181 +443 V 0.199 +444 R 0.223 +445 Q 0.268 +446 A 0.336 +447 N 0.408 +448 S 0.461 +449 A 0.488 +450 S 0.503 +451 G 0.513 +452 Q 0.521 +453 P 0.526 +454 C 0.527 +455 V 0.511 +456 E 0.463 +457 N 0.383 +458 E 0.295 +459 N 0.221 +460 L 0.168 +461 T 0.131 +462 D 0.108 +463 L 0.098 +464 I 0.095 +465 S 0.097 +466 R 0.101 +467 L 0.102 +468 T 0.092 +469 A 0.078 +470 I 0.071 +471 L 0.076 +472 L 0.087 +473 Q 0.095 +474 I 0.096 +475 K 0.098 +476 C 0.110 +477 L 0.136 +478 A 0.173 +479 E 0.215 +480 G 0.257 +481 G 0.283 +482 D 0.277 +483 L 0.240 +484 N 0.192 +485 S 0.155 +486 F 0.137 +487 E 0.129 +488 F 0.123 +489 K 0.116 +490 S 0.113 +491 L 0.117 +492 T 0.129 +493 D 0.142 +494 S 0.149 +495 L 0.146 +496 N 0.139 +497 D 0.136 +498 I 0.143 +499 K 0.161 +500 N 0.180 +501 T 0.195 +502 I 0.207 +503 D 0.222 +504 A 0.238 +505 S 0.255 +506 N 0.274 +507 I 0.297 +508 S 0.326 +509 C 0.364 +510 F 0.408 +511 Q 0.453 +512 N 0.490 +513 N 0.508 +514 V 0.500 +515 E 0.457 +516 I 0.388 +517 H 0.316 +518 V 0.272 +519 A 0.274 +520 H 0.315 +521 I 0.369 +522 Q 0.416 +523 S 0.448 +524 G 0.468 +525 L 0.488 +526 S 0.517 +527 Q 0.557 +528 M 0.595 +529 G 0.616 +530 N 0.614 +531 L 0.599 +532 H 0.584 +533 A 0.581 +534 F 0.591 +535 A 0.613 +536 A 0.643 +537 N 0.673 +538 N 0.696 +539 T 0.708 +540 N 0.697 +541 R 0.663 +542 D 0.629 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000058729.14_ENSMUST00000192561.6_GN:Lin9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000058729.14_ENSMUST00000192561.6_GN:Lin9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..aaa684a2e6d0d44b0b22a7c9f56b97d0f7af0989 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000058729.14_ENSMUST00000192561.6_GN:Lin9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid @@ -0,0 +1,559 @@ +>ENSMUSG00000058729.14|ENSMUST00000192561.6|GN:Lin9|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:16 +1 M 0.367 +2 H 0.387 +3 R 0.421 +4 G 0.449 +5 G 0.458 +6 Q 0.464 +7 P 0.486 +8 L 0.502 +9 K 0.493 +10 K 0.497 +11 R 0.544 +12 R 0.604 +13 G 0.631 +14 S 0.623 +15 F 0.605 +16 K 0.582 +17 M 0.554 +18 A 0.554 +19 E 0.600 +20 L 0.655 +21 D 0.678 +22 Q 0.679 +23 L 0.686 +24 P 0.709 +25 D 0.733 +26 E 0.746 +27 S 0.744 +28 S 0.734 +29 S 0.722 +30 A 0.717 +31 K 0.723 +32 A 0.738 +33 L 0.751 +34 V 0.752 +35 S 0.744 +36 L 0.737 +37 K 0.737 +38 E 0.741 +39 G 0.738 +40 S 0.728 +41 L 0.716 +42 S 0.701 +43 N 0.664 +44 T 0.601 +45 W 0.532 +46 N 0.481 +47 E 0.462 +48 K 0.481 +49 Y 0.526 +50 S 0.580 +51 S 0.627 +52 L 0.652 +53 Q 0.658 +54 K 0.661 +55 T 0.673 +56 P 0.691 +57 V 0.711 +58 W 0.735 +59 K 0.765 +60 G 0.790 +61 R 0.803 +62 N 0.804 +63 A 0.800 +64 G 0.798 +65 P 0.800 +66 A 0.803 +67 V 0.799 +68 E 0.787 +69 M 0.775 +70 P 0.768 +71 F 0.768 +72 R 0.775 +73 N 0.778 +74 S 0.773 +75 K 0.767 +76 R 0.770 +77 S 0.777 +78 R 0.781 +79 L 0.783 +80 F 0.786 +81 S 0.789 +82 D 0.783 +83 E 0.763 +84 D 0.720 +85 D 0.661 +86 R 0.630 +87 Q 0.658 +88 I 0.713 +89 N 0.746 +90 T 0.747 +91 K 0.735 +92 S 0.732 +93 P 0.740 +94 K 0.744 +95 R 0.717 +96 N 0.663 +97 Q 0.632 +98 R 0.661 +99 V 0.718 +100 A 0.747 +101 M 0.742 +102 I 0.728 +103 P 0.729 +104 Q 0.740 +105 K 0.751 +106 F 0.756 +107 T 0.757 +108 A 0.744 +109 T 0.708 +110 M 0.659 +111 S 0.626 +112 T 0.628 +113 P 0.650 +114 D 0.668 +115 K 0.669 +116 K 0.659 +117 A 0.644 +118 S 0.620 +119 Q 0.578 +120 K 0.511 +121 I 0.427 +122 G 0.340 +123 F 0.266 +124 R 0.218 +125 L 0.195 +126 R 0.190 +127 N 0.194 +128 L 0.192 +129 L 0.174 +130 K 0.148 +131 L 0.124 +132 P 0.107 +133 K 0.094 +134 A 0.083 +135 H 0.071 +136 K 0.065 +137 W 0.071 +138 C 0.082 +139 I 0.082 +140 Y 0.074 +141 E 0.067 +142 W 0.063 +143 F 0.058 +144 Y 0.058 +145 S 0.067 +146 N 0.080 +147 I 0.093 +148 D 0.106 +149 K 0.128 +150 P 0.158 +151 L 0.193 +152 F 0.239 +153 E 0.288 +154 G 0.322 +155 D 0.322 +156 N 0.292 +157 D 0.241 +158 F 0.188 +159 C 0.149 +160 V 0.125 +161 C 0.107 +162 L 0.090 +163 K 0.078 +164 E 0.076 +165 S 0.086 +166 F 0.101 +167 P 0.117 +168 N 0.130 +169 L 0.143 +170 K 0.156 +171 T 0.167 +172 R 0.175 +173 K 0.168 +174 L 0.143 +175 T 0.110 +176 R 0.085 +177 V 0.071 +178 E 0.066 +179 W 0.068 +180 G 0.074 +181 K 0.082 +182 I 0.090 +183 R 0.101 +184 R 0.115 +185 L 0.137 +186 M 0.172 +187 G 0.213 +188 K 0.241 +189 P 0.247 +190 R 0.235 +191 R 0.218 +192 C 0.197 +193 S 0.174 +194 S 0.153 +195 A 0.134 +196 F 0.118 +197 F 0.106 +198 E 0.102 +199 E 0.104 +200 E 0.110 +201 R 0.112 +202 S 0.109 +203 A 0.104 +204 L 0.095 +205 K 0.081 +206 Q 0.066 +207 K 0.054 +208 R 0.046 +209 Q 0.042 +210 K 0.037 +211 I 0.034 +212 R 0.035 +213 L 0.039 +214 L 0.046 +215 Q 0.053 +216 Q 0.058 +217 R 0.063 +218 K 0.065 +219 V 0.066 +220 A 0.066 +221 D 0.071 +222 V 0.082 +223 S 0.099 +224 Q 0.118 +225 F 0.134 +226 K 0.144 +227 D 0.150 +228 L 0.151 +229 P 0.151 +230 D 0.151 +231 E 0.155 +232 I 0.165 +233 P 0.174 +234 L 0.166 +235 P 0.137 +236 L 0.101 +237 V 0.074 +238 I 0.062 +239 G 0.063 +240 T 0.067 +241 K 0.066 +242 V 0.061 +243 T 0.059 +244 A 0.065 +245 R 0.079 +246 L 0.093 +247 R 0.103 +248 G 0.107 +249 I 0.106 +250 H 0.103 +251 D 0.099 +252 G 0.089 +253 L 0.073 +254 F 0.057 +255 T 0.047 +256 G 0.044 +257 Q 0.044 +258 I 0.043 +259 D 0.042 +260 A 0.041 +261 V 0.043 +262 D 0.045 +263 T 0.046 +264 L 0.046 +265 N 0.044 +266 A 0.038 +267 T 0.030 +268 Y 0.026 +269 R 0.028 +270 V 0.030 +271 T 0.032 +272 F 0.034 +273 D 0.043 +274 R 0.058 +275 T 0.072 +276 G 0.081 +277 L 0.082 +278 G 0.078 +279 T 0.071 +280 H 0.068 +281 T 0.069 +282 I 0.066 +283 P 0.053 +284 D 0.039 +285 Y 0.033 +286 E 0.036 +287 V 0.045 +288 L 0.061 +289 S 0.083 +290 N 0.106 +291 E 0.122 +292 P 0.132 +293 H 0.140 +294 E 0.148 +295 T 0.146 +296 M 0.138 +297 P 0.137 +298 I 0.150 +299 S 0.172 +300 A 0.203 +301 F 0.260 +302 G 0.352 +303 Q 0.456 +304 K 0.537 +305 Q 0.581 +306 R 0.600 +307 P 0.606 +308 S 0.602 +309 R 0.585 +310 F 0.558 +311 F 0.528 +312 M 0.509 +313 T 0.517 +314 P 0.552 +315 P 0.597 +316 R 0.627 +317 L 0.629 +318 H 0.600 +319 Y 0.559 +320 T 0.541 +321 P 0.565 +322 P 0.610 +323 L 0.646 +324 Q 0.671 +325 S 0.694 +326 P 0.718 +327 I 0.739 +328 T 0.754 +329 D 0.763 +330 G 0.760 +331 D 0.750 +332 P 0.742 +333 L 0.741 +334 L 0.741 +335 G 0.727 +336 Q 0.697 +337 S 0.660 +338 P 0.635 +339 W 0.638 +340 R 0.667 +341 S 0.701 +342 K 0.721 +343 V 0.727 +344 S 0.723 +345 G 0.708 +346 S 0.681 +347 D 0.640 +348 T 0.581 +349 E 0.503 +350 T 0.420 +351 L 0.350 +352 G 0.292 +353 G 0.236 +354 F 0.180 +355 P 0.135 +356 V 0.102 +357 E 0.080 +358 F 0.065 +359 L 0.054 +360 I 0.047 +361 Q 0.045 +362 V 0.051 +363 T 0.061 +364 K 0.070 +365 L 0.073 +366 S 0.071 +367 K 0.063 +368 I 0.052 +369 L 0.045 +370 M 0.043 +371 I 0.043 +372 K 0.041 +373 K 0.040 +374 E 0.043 +375 H 0.051 +376 I 0.063 +377 K 0.071 +378 K 0.069 +379 L 0.064 +380 R 0.062 +381 E 0.062 +382 M 0.061 +383 N 0.060 +384 T 0.058 +385 E 0.055 +386 A 0.056 +387 E 0.061 +388 K 0.069 +389 L 0.079 +390 K 0.095 +391 S 0.117 +392 Y 0.139 +393 S 0.158 +394 M 0.169 +395 P 0.164 +396 I 0.138 +397 G 0.101 +398 I 0.070 +399 E 0.056 +400 F 0.057 +401 Q 0.070 +402 R 0.083 +403 R 0.088 +404 Y 0.087 +405 A 0.089 +406 T 0.091 +407 I 0.090 +408 V 0.091 +409 L 0.094 +410 E 0.091 +411 L 0.081 +412 E 0.070 +413 Q 0.062 +414 L 0.057 +415 N 0.058 +416 K 0.061 +417 D 0.065 +418 L 0.067 +419 N 0.068 +420 K 0.068 +421 V 0.073 +422 L 0.081 +423 H 0.083 +424 K 0.076 +425 V 0.071 +426 Q 0.068 +427 Q 0.063 +428 Y 0.061 +429 C 0.067 +430 Y 0.083 +431 E 0.112 +432 L 0.154 +433 A 0.203 +434 P 0.248 +435 D 0.289 +436 Q 0.327 +437 G 0.353 +438 L 0.360 +439 Q 0.357 +440 P 0.358 +441 A 0.358 +442 D 0.347 +443 Q 0.328 +444 P 0.305 +445 T 0.278 +446 D 0.244 +447 M 0.209 +448 R 0.178 +449 R 0.154 +450 R 0.137 +451 C 0.126 +452 E 0.125 +453 E 0.128 +454 E 0.128 +455 A 0.129 +456 Q 0.140 +457 E 0.161 +458 I 0.184 +459 V 0.204 +460 R 0.229 +461 Q 0.274 +462 A 0.342 +463 N 0.416 +464 S 0.471 +465 A 0.502 +466 S 0.519 +467 G 0.532 +468 Q 0.543 +469 P 0.551 +470 C 0.551 +471 V 0.533 +472 E 0.480 +473 N 0.396 +474 E 0.304 +475 N 0.228 +476 L 0.173 +477 T 0.135 +478 D 0.111 +479 L 0.101 +480 I 0.098 +481 S 0.098 +482 R 0.102 +483 L 0.101 +484 T 0.092 +485 A 0.079 +486 I 0.072 +487 L 0.078 +488 L 0.090 +489 Q 0.098 +490 I 0.099 +491 K 0.101 +492 C 0.114 +493 L 0.139 +494 A 0.175 +495 E 0.215 +496 G 0.255 +497 G 0.279 +498 D 0.271 +499 L 0.233 +500 N 0.185 +501 S 0.149 +502 F 0.132 +503 E 0.125 +504 F 0.119 +505 K 0.113 +506 S 0.111 +507 L 0.116 +508 T 0.127 +509 D 0.141 +510 S 0.148 +511 L 0.146 +512 N 0.140 +513 D 0.138 +514 I 0.145 +515 K 0.164 +516 N 0.184 +517 T 0.198 +518 I 0.209 +519 D 0.223 +520 A 0.239 +521 S 0.256 +522 N 0.274 +523 I 0.296 +524 S 0.325 +525 C 0.362 +526 F 0.408 +527 Q 0.454 +528 N 0.491 +529 N 0.510 +530 V 0.500 +531 E 0.457 +532 I 0.389 +533 H 0.317 +534 V 0.275 +535 A 0.279 +536 H 0.322 +537 I 0.379 +538 Q 0.426 +539 S 0.457 +540 G 0.476 +541 L 0.493 +542 S 0.521 +543 Q 0.560 +544 M 0.597 +545 G 0.614 +546 N 0.609 +547 L 0.592 +548 H 0.577 +549 A 0.574 +550 F 0.585 +551 A 0.608 +552 A 0.639 +553 N 0.670 +554 N 0.694 +555 T 0.705 +556 N 0.694 +557 R 0.658 +558 D 0.623 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000058799.17_ENSMUST00000218828.2_GN:Nap1l1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000058799.17_ENSMUST00000218828.2_GN:Nap1l1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4b34a791b7cac5878848d08fc022c27c5f37c670 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000058799.17_ENSMUST00000218828.2_GN:Nap1l1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,392 @@ +>ENSMUSG00000058799.17|ENSMUST00000218828.2|GN:Nap1l1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.371 +2 A 0.393 +3 D 0.424 +4 I 0.448 +5 D 0.446 +6 N 0.414 +7 K 0.380 +8 E 0.370 +9 Q 0.378 +10 S 0.390 +11 E 0.397 +12 L 0.393 +13 D 0.379 +14 Q 0.378 +15 D 0.404 +16 L 0.446 +17 E 0.485 +18 D 0.515 +19 V 0.530 +20 E 0.533 +21 E 0.529 +22 V 0.523 +23 E 0.511 +24 E 0.495 +25 E 0.485 +26 E 0.481 +27 T 0.471 +28 G 0.439 +29 E 0.388 +30 E 0.344 +31 T 0.326 +32 K 0.324 +33 I 0.325 +34 K 0.321 +35 A 0.311 +36 R 0.296 +37 Q 0.277 +38 L 0.257 +39 T 0.240 +40 V 0.236 +41 Q 0.240 +42 M 0.244 +43 M 0.249 +44 Q 0.259 +45 N 0.262 +46 P 0.245 +47 Q 0.216 +48 I 0.191 +49 L 0.172 +50 A 0.161 +51 A 0.155 +52 L 0.156 +53 Q 0.165 +54 E 0.188 +55 R 0.227 +56 L 0.278 +57 D 0.330 +58 G 0.373 +59 L 0.406 +60 V 0.426 +61 D 0.433 +62 T 0.429 +63 P 0.417 +64 T 0.394 +65 G 0.354 +66 Y 0.296 +67 I 0.242 +68 E 0.221 +69 S 0.234 +70 L 0.244 +71 P 0.224 +72 K 0.185 +73 V 0.152 +74 V 0.132 +75 K 0.127 +76 R 0.138 +77 R 0.155 +78 V 0.170 +79 N 0.187 +80 A 0.203 +81 L 0.211 +82 K 0.216 +83 N 0.230 +84 L 0.252 +85 Q 0.266 +86 V 0.268 +87 K 0.268 +88 C 0.272 +89 A 0.279 +90 Q 0.288 +91 I 0.286 +92 E 0.260 +93 A 0.219 +94 K 0.181 +95 F 0.155 +96 Y 0.141 +97 E 0.135 +98 E 0.136 +99 V 0.137 +100 H 0.132 +101 D 0.125 +102 L 0.119 +103 E 0.111 +104 R 0.101 +105 K 0.093 +106 Y 0.091 +107 A 0.095 +108 V 0.106 +109 L 0.116 +110 Y 0.114 +111 Q 0.100 +112 P 0.085 +113 L 0.078 +114 F 0.075 +115 D 0.075 +116 K 0.077 +117 R 0.075 +118 F 0.070 +119 E 0.066 +120 I 0.069 +121 I 0.076 +122 N 0.085 +123 A 0.093 +124 I 0.101 +125 Y 0.114 +126 E 0.132 +127 P 0.151 +128 T 0.170 +129 E 0.195 +130 E 0.230 +131 E 0.260 +132 C 0.274 +133 E 0.274 +134 W 0.282 +135 K 0.310 +136 P 0.346 +137 D 0.371 +138 E 0.379 +139 E 0.373 +140 D 0.358 +141 E 0.338 +142 V 0.307 +143 S 0.269 +144 E 0.239 +145 E 0.232 +146 L 0.237 +147 K 0.242 +148 E 0.263 +149 K 0.313 +150 A 0.376 +151 K 0.429 +152 I 0.473 +153 E 0.510 +154 D 0.530 +155 E 0.532 +156 K 0.529 +157 K 0.532 +158 D 0.533 +159 E 0.522 +160 E 0.502 +161 K 0.473 +162 E 0.435 +163 D 0.391 +164 P 0.343 +165 K 0.295 +166 G 0.248 +167 I 0.199 +168 P 0.145 +169 E 0.094 +170 F 0.056 +171 W 0.039 +172 L 0.038 +173 T 0.047 +174 V 0.060 +175 F 0.073 +176 K 0.087 +177 N 0.096 +178 V 0.095 +179 D 0.084 +180 L 0.072 +181 L 0.066 +182 S 0.068 +183 D 0.072 +184 M 0.071 +185 V 0.064 +186 Q 0.056 +187 E 0.052 +188 H 0.052 +189 D 0.052 +190 E 0.049 +191 P 0.044 +192 I 0.041 +193 L 0.039 +194 K 0.038 +195 H 0.038 +196 L 0.040 +197 K 0.043 +198 D 0.043 +199 I 0.040 +200 K 0.038 +201 V 0.038 +202 K 0.043 +203 F 0.054 +204 S 0.072 +205 D 0.094 +206 A 0.111 +207 G 0.114 +208 Q 0.106 +209 P 0.091 +210 M 0.071 +211 S 0.051 +212 F 0.038 +213 V 0.033 +214 L 0.036 +215 E 0.043 +216 F 0.048 +217 H 0.050 +218 F 0.053 +219 E 0.058 +220 P 0.057 +221 N 0.051 +222 D 0.043 +223 Y 0.040 +224 F 0.046 +225 T 0.057 +226 N 0.072 +227 E 0.085 +228 V 0.089 +229 L 0.081 +230 T 0.070 +231 K 0.064 +232 T 0.066 +233 Y 0.077 +234 R 0.096 +235 M 0.118 +236 R 0.142 +237 S 0.176 +238 E 0.218 +239 P 0.253 +240 D 0.261 +241 D 0.240 +242 S 0.208 +243 D 0.184 +244 P 0.172 +245 F 0.169 +246 S 0.175 +247 F 0.185 +248 D 0.190 +249 G 0.188 +250 P 0.179 +251 E 0.162 +252 I 0.143 +253 M 0.134 +254 G 0.136 +255 C 0.143 +256 T 0.152 +257 G 0.159 +258 C 0.158 +259 Q 0.145 +260 I 0.125 +261 D 0.108 +262 W 0.103 +263 K 0.114 +264 K 0.134 +265 G 0.157 +266 K 0.180 +267 N 0.206 +268 V 0.233 +269 T 0.251 +270 L 0.258 +271 K 0.262 +272 T 0.271 +273 I 0.285 +274 K 0.302 +275 K 0.312 +276 K 0.312 +277 Q 0.302 +278 K 0.291 +279 H 0.294 +280 K 0.317 +281 G 0.350 +282 R 0.376 +283 G 0.386 +284 T 0.380 +285 V 0.372 +286 R 0.376 +287 T 0.391 +288 V 0.400 +289 T 0.390 +290 K 0.368 +291 T 0.352 +292 V 0.342 +293 S 0.319 +294 N 0.273 +295 D 0.215 +296 S 0.161 +297 F 0.125 +298 F 0.114 +299 N 0.120 +300 F 0.129 +301 F 0.141 +302 A 0.167 +303 P 0.202 +304 P 0.234 +305 E 0.253 +306 V 0.263 +307 P 0.278 +308 E 0.304 +309 N 0.329 +310 G 0.337 +311 D 0.319 +312 L 0.285 +313 D 0.248 +314 D 0.216 +315 D 0.190 +316 A 0.172 +317 E 0.163 +318 A 0.160 +319 I 0.155 +320 L 0.143 +321 A 0.129 +322 A 0.117 +323 D 0.106 +324 F 0.098 +325 E 0.093 +326 I 0.093 +327 G 0.093 +328 H 0.091 +329 F 0.087 +330 L 0.084 +331 R 0.084 +332 E 0.086 +333 R 0.088 +334 I 0.090 +335 I 0.086 +336 P 0.077 +337 R 0.067 +338 S 0.060 +339 V 0.057 +340 L 0.054 +341 Y 0.055 +342 F 0.067 +343 T 0.093 +344 G 0.139 +345 E 0.202 +346 A 0.279 +347 I 0.368 +348 E 0.465 +349 D 0.554 +350 D 0.614 +351 D 0.643 +352 D 0.656 +353 D 0.665 +354 Y 0.675 +355 D 0.689 +356 E 0.704 +357 E 0.714 +358 G 0.717 +359 E 0.714 +360 E 0.701 +361 A 0.663 +362 D 0.608 +363 E 0.579 +364 E 0.609 +365 G 0.665 +366 E 0.705 +367 E 0.724 +368 E 0.733 +369 G 0.736 +370 D 0.730 +371 E 0.711 +372 E 0.679 +373 N 0.640 +374 D 0.608 +375 P 0.581 +376 D 0.552 +377 Y 0.524 +378 D 0.514 +379 P 0.531 +380 K 0.565 +381 K 0.596 +382 D 0.611 +383 Q 0.616 +384 N 0.625 +385 P 0.646 +386 A 0.666 +387 E 0.670 +388 C 0.650 +389 K 0.603 +390 Q 0.537 +391 Q 0.484 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000058799.17_ENSMUST00000218828.2_GN:Nap1l1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:27.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000058799.17_ENSMUST00000218828.2_GN:Nap1l1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:27.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0627d789de25d8d3944c7644495fa1624488cc30 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000058799.17_ENSMUST00000218828.2_GN:Nap1l1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:27.caid @@ -0,0 +1,419 @@ +>ENSMUSG00000058799.17|ENSMUST00000218828.2|GN:Nap1l1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:27 +1 M 0.309 +2 F 0.318 +3 F 0.338 +4 L 0.363 +5 P 0.378 +6 L 0.374 +7 S 0.352 +8 N 0.317 +9 S 0.271 +10 V 0.227 +11 L 0.201 +12 F 0.189 +13 L 0.183 +14 T 0.179 +15 L 0.177 +16 S 0.175 +17 F 0.169 +18 F 0.161 +19 L 0.155 +20 V 0.158 +21 D 0.164 +22 I 0.167 +23 W 0.168 +24 S 0.179 +25 S 0.206 +26 Y 0.242 +27 K 0.281 +28 M 0.330 +29 A 0.384 +30 D 0.421 +31 I 0.428 +32 D 0.417 +33 N 0.405 +34 K 0.398 +35 E 0.392 +36 Q 0.389 +37 S 0.396 +38 E 0.406 +39 L 0.401 +40 D 0.383 +41 Q 0.381 +42 D 0.412 +43 L 0.459 +44 E 0.502 +45 D 0.539 +46 V 0.562 +47 E 0.567 +48 E 0.561 +49 V 0.551 +50 E 0.538 +51 E 0.525 +52 E 0.519 +53 E 0.519 +54 T 0.511 +55 G 0.484 +56 E 0.441 +57 E 0.403 +58 T 0.385 +59 K 0.385 +60 I 0.391 +61 K 0.389 +62 A 0.371 +63 R 0.342 +64 Q 0.311 +65 L 0.285 +66 T 0.269 +67 V 0.266 +68 Q 0.266 +69 M 0.259 +70 M 0.254 +71 Q 0.258 +72 N 0.259 +73 P 0.239 +74 Q 0.209 +75 I 0.183 +76 L 0.166 +77 A 0.156 +78 A 0.151 +79 L 0.150 +80 Q 0.158 +81 E 0.179 +82 R 0.217 +83 L 0.262 +84 D 0.306 +85 G 0.340 +86 L 0.367 +87 V 0.386 +88 D 0.395 +89 T 0.393 +90 P 0.381 +91 T 0.358 +92 G 0.320 +93 Y 0.268 +94 I 0.219 +95 E 0.199 +96 S 0.207 +97 L 0.214 +98 P 0.195 +99 K 0.161 +100 V 0.131 +101 V 0.115 +102 K 0.113 +103 R 0.124 +104 R 0.138 +105 V 0.149 +106 N 0.163 +107 A 0.177 +108 L 0.185 +109 K 0.190 +110 N 0.203 +111 L 0.222 +112 Q 0.234 +113 V 0.235 +114 K 0.236 +115 C 0.239 +116 A 0.243 +117 Q 0.247 +118 I 0.244 +119 E 0.224 +120 A 0.192 +121 K 0.162 +122 F 0.141 +123 Y 0.129 +124 E 0.125 +125 E 0.126 +126 V 0.126 +127 H 0.122 +128 D 0.115 +129 L 0.110 +130 E 0.104 +131 R 0.095 +132 K 0.088 +133 Y 0.086 +134 A 0.091 +135 V 0.101 +136 L 0.112 +137 Y 0.111 +138 Q 0.097 +139 P 0.083 +140 L 0.075 +141 F 0.071 +142 D 0.070 +143 K 0.071 +144 R 0.069 +145 F 0.065 +146 E 0.063 +147 I 0.066 +148 I 0.074 +149 N 0.083 +150 A 0.091 +151 I 0.098 +152 Y 0.110 +153 E 0.128 +154 P 0.147 +155 T 0.165 +156 E 0.191 +157 E 0.225 +158 E 0.257 +159 C 0.273 +160 E 0.276 +161 W 0.286 +162 K 0.314 +163 P 0.351 +164 D 0.378 +165 E 0.385 +166 E 0.378 +167 D 0.362 +168 E 0.341 +169 V 0.311 +170 S 0.271 +171 E 0.241 +172 E 0.233 +173 L 0.236 +174 K 0.242 +175 E 0.263 +176 K 0.315 +177 A 0.380 +178 K 0.435 +179 I 0.479 +180 E 0.517 +181 D 0.537 +182 E 0.539 +183 K 0.538 +184 K 0.540 +185 D 0.541 +186 E 0.530 +187 E 0.509 +188 K 0.478 +189 E 0.439 +190 D 0.393 +191 P 0.344 +192 K 0.296 +193 G 0.248 +194 I 0.199 +195 P 0.145 +196 E 0.093 +197 F 0.056 +198 W 0.039 +199 L 0.038 +200 T 0.047 +201 V 0.060 +202 F 0.073 +203 K 0.086 +204 N 0.096 +205 V 0.095 +206 D 0.084 +207 L 0.071 +208 L 0.065 +209 S 0.067 +210 D 0.070 +211 M 0.070 +212 V 0.063 +213 Q 0.055 +214 E 0.051 +215 H 0.051 +216 D 0.051 +217 E 0.048 +218 P 0.043 +219 I 0.040 +220 L 0.038 +221 K 0.037 +222 H 0.037 +223 L 0.039 +224 K 0.042 +225 D 0.043 +226 I 0.040 +227 K 0.037 +228 V 0.037 +229 K 0.042 +230 F 0.052 +231 S 0.069 +232 D 0.091 +233 A 0.107 +234 G 0.110 +235 Q 0.103 +236 P 0.089 +237 M 0.069 +238 S 0.050 +239 F 0.037 +240 V 0.033 +241 L 0.036 +242 E 0.043 +243 F 0.047 +244 H 0.049 +245 F 0.052 +246 E 0.056 +247 P 0.056 +248 N 0.050 +249 D 0.042 +250 Y 0.040 +251 F 0.045 +252 T 0.056 +253 N 0.071 +254 E 0.084 +255 V 0.088 +256 L 0.080 +257 T 0.069 +258 K 0.064 +259 T 0.066 +260 Y 0.077 +261 R 0.096 +262 M 0.117 +263 R 0.142 +264 S 0.174 +265 E 0.215 +266 P 0.249 +267 D 0.256 +268 D 0.235 +269 S 0.205 +270 D 0.182 +271 P 0.171 +272 F 0.169 +273 S 0.175 +274 F 0.185 +275 D 0.190 +276 G 0.188 +277 P 0.180 +278 E 0.163 +279 I 0.144 +280 M 0.135 +281 G 0.137 +282 C 0.144 +283 T 0.153 +284 G 0.161 +285 C 0.159 +286 Q 0.146 +287 I 0.126 +288 D 0.108 +289 W 0.103 +290 K 0.114 +291 K 0.134 +292 G 0.157 +293 K 0.180 +294 N 0.206 +295 V 0.232 +296 T 0.248 +297 L 0.253 +298 K 0.254 +299 T 0.260 +300 I 0.274 +301 K 0.292 +302 K 0.305 +303 K 0.309 +304 Q 0.302 +305 K 0.294 +306 H 0.299 +307 K 0.325 +308 G 0.360 +309 R 0.386 +310 G 0.394 +311 T 0.386 +312 V 0.376 +313 R 0.379 +314 T 0.394 +315 V 0.403 +316 T 0.393 +317 K 0.373 +318 T 0.359 +319 V 0.351 +320 S 0.328 +321 N 0.281 +322 D 0.222 +323 S 0.166 +324 F 0.129 +325 F 0.118 +326 N 0.124 +327 F 0.132 +328 F 0.145 +329 A 0.171 +330 P 0.206 +331 P 0.239 +332 E 0.258 +333 V 0.268 +334 P 0.282 +335 E 0.308 +336 N 0.334 +337 G 0.342 +338 D 0.324 +339 L 0.289 +340 D 0.252 +341 D 0.219 +342 D 0.193 +343 A 0.174 +344 E 0.164 +345 A 0.160 +346 I 0.155 +347 L 0.144 +348 A 0.130 +349 A 0.118 +350 D 0.108 +351 F 0.099 +352 E 0.095 +353 I 0.095 +354 G 0.095 +355 H 0.093 +356 F 0.089 +357 L 0.086 +358 R 0.085 +359 E 0.087 +360 R 0.089 +361 I 0.090 +362 I 0.086 +363 P 0.077 +364 R 0.067 +365 S 0.061 +366 V 0.057 +367 L 0.054 +368 Y 0.056 +369 F 0.067 +370 T 0.093 +371 G 0.138 +372 E 0.201 +373 A 0.278 +374 I 0.368 +375 E 0.466 +376 D 0.555 +377 D 0.615 +378 D 0.644 +379 D 0.657 +380 D 0.666 +381 Y 0.676 +382 D 0.689 +383 E 0.704 +384 E 0.714 +385 G 0.717 +386 E 0.714 +387 E 0.702 +388 A 0.665 +389 D 0.610 +390 E 0.582 +391 E 0.611 +392 G 0.667 +393 E 0.707 +394 E 0.727 +395 E 0.737 +396 G 0.739 +397 D 0.733 +398 E 0.713 +399 E 0.681 +400 N 0.642 +401 D 0.609 +402 P 0.582 +403 D 0.552 +404 Y 0.525 +405 D 0.515 +406 P 0.533 +407 K 0.567 +408 K 0.598 +409 D 0.613 +410 Q 0.617 +411 N 0.627 +412 P 0.647 +413 A 0.668 +414 E 0.673 +415 C 0.655 +416 K 0.610 +417 Q 0.546 +418 Q 0.493 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000059208.16_ENSMUST00000148178.8_GN:Hnrnpm_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000059208.16_ENSMUST00000148178.8_GN:Hnrnpm_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..53eac8db2a9d58aea9715d73d64543ca0461ee2d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000059208.16_ENSMUST00000148178.8_GN:Hnrnpm_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,730 @@ +>ENSMUSG00000059208.16|ENSMUST00000148178.8|GN:Hnrnpm|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.398 +2 A 0.432 +3 A 0.474 +4 G 0.486 +5 V 0.446 +6 E 0.389 +7 A 0.373 +8 A 0.399 +9 A 0.420 +10 E 0.431 +11 V 0.449 +12 A 0.456 +13 A 0.437 +14 T 0.424 +15 E 0.437 +16 P 0.460 +17 K 0.489 +18 M 0.534 +19 E 0.565 +20 E 0.560 +21 E 0.555 +22 S 0.590 +23 G 0.645 +24 A 0.685 +25 P 0.705 +26 C 0.714 +27 V 0.721 +28 P 0.733 +29 S 0.751 +30 G 0.768 +31 N 0.772 +32 G 0.763 +33 A 0.748 +34 P 0.739 +35 G 0.738 +36 P 0.741 +37 K 0.741 +38 G 0.734 +39 E 0.717 +40 E 0.694 +41 R 0.669 +42 P 0.641 +43 T 0.607 +44 Q 0.567 +45 N 0.529 +46 E 0.492 +47 K 0.463 +48 R 0.462 +49 K 0.491 +50 E 0.535 +51 K 0.582 +52 N 0.627 +53 I 0.659 +54 K 0.677 +55 R 0.690 +56 G 0.704 +57 G 0.713 +58 N 0.708 +59 R 0.686 +60 F 0.658 +61 E 0.638 +62 P 0.623 +63 Y 0.604 +64 S 0.573 +65 N 0.524 +66 P 0.451 +67 T 0.352 +68 K 0.244 +69 R 0.147 +70 Y 0.080 +71 R 0.045 +72 A 0.033 +73 F 0.033 +74 I 0.037 +75 T 0.045 +76 N 0.055 +77 I 0.060 +78 P 0.058 +79 F 0.051 +80 D 0.044 +81 V 0.037 +82 K 0.028 +83 W 0.020 +84 Q 0.018 +85 S 0.021 +86 L 0.031 +87 K 0.045 +88 D 0.054 +89 L 0.053 +90 V 0.046 +91 K 0.042 +92 E 0.041 +93 K 0.042 +94 V 0.043 +95 G 0.042 +96 E 0.040 +97 V 0.038 +98 T 0.039 +99 Y 0.041 +100 V 0.048 +101 E 0.059 +102 L 0.072 +103 L 0.088 +104 M 0.102 +105 D 0.111 +106 A 0.114 +107 E 0.114 +108 G 0.112 +109 K 0.103 +110 S 0.088 +111 R 0.072 +112 G 0.057 +113 C 0.042 +114 A 0.031 +115 V 0.025 +116 V 0.027 +117 E 0.035 +118 F 0.044 +119 K 0.046 +120 M 0.041 +121 E 0.036 +122 E 0.033 +123 S 0.031 +124 M 0.030 +125 K 0.029 +126 K 0.030 +127 A 0.031 +128 A 0.032 +129 E 0.035 +130 V 0.037 +131 L 0.037 +132 N 0.037 +133 K 0.040 +134 H 0.045 +135 S 0.051 +136 L 0.060 +137 S 0.073 +138 G 0.085 +139 R 0.088 +140 P 0.079 +141 L 0.065 +142 K 0.055 +143 V 0.055 +144 K 0.068 +145 E 0.093 +146 D 0.120 +147 P 0.133 +148 D 0.131 +149 G 0.121 +150 E 0.107 +151 H 0.093 +152 A 0.085 +153 R 0.089 +154 R 0.105 +155 A 0.131 +156 M 0.165 +157 Q 0.200 +158 K 0.232 +159 V 0.257 +160 M 0.288 +161 A 0.337 +162 T 0.406 +163 T 0.482 +164 G 0.555 +165 G 0.612 +166 M 0.642 +167 G 0.644 +168 M 0.635 +169 G 0.625 +170 P 0.617 +171 G 0.610 +172 G 0.595 +173 P 0.559 +174 G 0.493 +175 M 0.407 +176 I 0.324 +177 N 0.253 +178 I 0.195 +179 P 0.152 +180 P 0.130 +181 S 0.124 +182 I 0.129 +183 L 0.143 +184 N 0.165 +185 N 0.185 +186 P 0.189 +187 N 0.176 +188 I 0.149 +189 P 0.114 +190 N 0.082 +191 E 0.062 +192 I 0.052 +193 I 0.046 +194 H 0.043 +195 A 0.042 +196 L 0.045 +197 Q 0.056 +198 A 0.070 +199 G 0.081 +200 R 0.081 +201 L 0.072 +202 G 0.056 +203 S 0.039 +204 T 0.028 +205 V 0.023 +206 F 0.022 +207 V 0.024 +208 A 0.028 +209 N 0.036 +210 L 0.040 +211 D 0.040 +212 Y 0.035 +213 K 0.032 +214 V 0.029 +215 G 0.026 +216 W 0.022 +217 K 0.019 +218 K 0.017 +219 L 0.018 +220 K 0.019 +221 E 0.022 +222 V 0.024 +223 F 0.027 +224 S 0.031 +225 M 0.037 +226 A 0.044 +227 G 0.051 +228 V 0.056 +229 V 0.055 +230 V 0.051 +231 R 0.048 +232 A 0.049 +233 D 0.057 +234 I 0.072 +235 L 0.091 +236 E 0.107 +237 D 0.116 +238 K 0.120 +239 D 0.126 +240 G 0.131 +241 K 0.125 +242 S 0.106 +243 R 0.085 +244 G 0.065 +245 I 0.047 +246 G 0.033 +247 I 0.026 +248 V 0.028 +249 T 0.034 +250 F 0.040 +251 E 0.041 +252 Q 0.038 +253 S 0.034 +254 I 0.031 +255 E 0.030 +256 A 0.031 +257 V 0.033 +258 Q 0.035 +259 A 0.036 +260 I 0.034 +261 S 0.029 +262 M 0.024 +263 F 0.023 +264 N 0.025 +265 G 0.029 +266 Q 0.033 +267 L 0.035 +268 L 0.036 +269 F 0.040 +270 D 0.048 +271 R 0.054 +272 P 0.055 +273 M 0.051 +274 H 0.046 +275 V 0.045 +276 K 0.048 +277 M 0.060 +278 D 0.081 +279 E 0.107 +280 R 0.144 +281 A 0.201 +282 L 0.280 +283 P 0.372 +284 K 0.460 +285 G 0.523 +286 D 0.541 +287 F 0.526 +288 F 0.518 +289 P 0.544 +290 P 0.592 +291 E 0.639 +292 R 0.671 +293 P 0.690 +294 Q 0.698 +295 Q 0.701 +296 L 0.706 +297 P 0.715 +298 H 0.728 +299 G 0.739 +300 L 0.747 +301 G 0.755 +302 G 0.764 +303 I 0.773 +304 G 0.778 +305 M 0.775 +306 G 0.757 +307 L 0.731 +308 G 0.716 +309 P 0.717 +310 G 0.725 +311 G 0.731 +312 Q 0.736 +313 P 0.743 +314 I 0.748 +315 D 0.747 +316 A 0.742 +317 N 0.738 +318 H 0.740 +319 L 0.754 +320 S 0.774 +321 K 0.792 +322 G 0.805 +323 I 0.813 +324 G 0.817 +325 M 0.820 +326 G 0.817 +327 N 0.806 +328 L 0.791 +329 G 0.785 +330 P 0.795 +331 A 0.809 +332 G 0.811 +333 M 0.788 +334 G 0.733 +335 M 0.660 +336 E 0.621 +337 G 0.647 +338 I 0.702 +339 G 0.742 +340 F 0.761 +341 G 0.767 +342 I 0.769 +343 N 0.773 +344 K 0.783 +345 I 0.794 +346 G 0.800 +347 G 0.795 +348 M 0.783 +349 E 0.773 +350 G 0.769 +351 P 0.772 +352 F 0.782 +353 G 0.798 +354 G 0.808 +355 G 0.806 +356 M 0.799 +357 E 0.792 +358 N 0.783 +359 M 0.771 +360 G 0.763 +361 R 0.762 +362 F 0.766 +363 G 0.768 +364 S 0.755 +365 G 0.718 +366 M 0.667 +367 N 0.620 +368 M 0.583 +369 G 0.548 +370 R 0.504 +371 I 0.460 +372 N 0.428 +373 E 0.409 +374 I 0.401 +375 L 0.399 +376 S 0.396 +377 N 0.395 +378 A 0.403 +379 L 0.425 +380 K 0.468 +381 R 0.542 +382 G 0.630 +383 E 0.698 +384 I 0.730 +385 I 0.737 +386 A 0.736 +387 K 0.736 +388 Q 0.741 +389 G 0.751 +390 G 0.768 +391 G 0.788 +392 G 0.803 +393 A 0.810 +394 G 0.805 +395 G 0.791 +396 S 0.776 +397 V 0.770 +398 P 0.772 +399 G 0.774 +400 I 0.769 +401 E 0.758 +402 R 0.746 +403 M 0.740 +404 G 0.742 +405 P 0.751 +406 G 0.756 +407 I 0.748 +408 D 0.722 +409 R 0.677 +410 I 0.636 +411 S 0.626 +412 G 0.647 +413 A 0.670 +414 G 0.683 +415 M 0.695 +416 E 0.707 +417 R 0.702 +418 M 0.680 +419 G 0.666 +420 A 0.668 +421 G 0.676 +422 L 0.680 +423 G 0.680 +424 H 0.668 +425 G 0.643 +426 M 0.618 +427 D 0.588 +428 R 0.537 +429 V 0.463 +430 G 0.386 +431 S 0.324 +432 E 0.289 +433 I 0.278 +434 E 0.283 +435 R 0.293 +436 M 0.306 +437 G 0.316 +438 L 0.319 +439 V 0.324 +440 M 0.345 +441 D 0.376 +442 R 0.399 +443 M 0.415 +444 G 0.433 +445 S 0.453 +446 V 0.476 +447 E 0.505 +448 R 0.530 +449 M 0.551 +450 G 0.574 +451 S 0.595 +452 S 0.594 +453 I 0.563 +454 E 0.507 +455 R 0.435 +456 M 0.368 +457 G 0.337 +458 P 0.347 +459 L 0.376 +460 G 0.400 +461 L 0.406 +462 D 0.389 +463 H 0.361 +464 M 0.340 +465 A 0.333 +466 S 0.331 +467 S 0.331 +468 I 0.339 +469 E 0.348 +470 R 0.347 +471 M 0.332 +472 G 0.307 +473 Q 0.284 +474 T 0.289 +475 M 0.331 +476 E 0.377 +477 R 0.391 +478 I 0.386 +479 G 0.393 +480 S 0.411 +481 G 0.426 +482 V 0.443 +483 E 0.457 +484 R 0.450 +485 M 0.433 +486 G 0.448 +487 A 0.498 +488 G 0.549 +489 M 0.583 +490 G 0.610 +491 F 0.628 +492 G 0.634 +493 L 0.636 +494 E 0.641 +495 R 0.643 +496 M 0.632 +497 A 0.605 +498 A 0.564 +499 P 0.525 +500 I 0.502 +501 D 0.486 +502 R 0.451 +503 V 0.392 +504 G 0.327 +505 Q 0.276 +506 T 0.249 +507 I 0.253 +508 E 0.285 +509 R 0.336 +510 M 0.400 +511 G 0.465 +512 S 0.506 +513 G 0.511 +514 V 0.501 +515 E 0.488 +516 R 0.466 +517 M 0.446 +518 G 0.448 +519 P 0.466 +520 A 0.483 +521 I 0.501 +522 E 0.524 +523 R 0.544 +524 M 0.568 +525 G 0.599 +526 L 0.621 +527 S 0.623 +528 M 0.610 +529 D 0.579 +530 R 0.519 +531 M 0.447 +532 V 0.403 +533 P 0.411 +534 T 0.455 +535 G 0.508 +536 M 0.560 +537 G 0.606 +538 A 0.634 +539 S 0.640 +540 L 0.629 +541 E 0.602 +542 R 0.562 +543 M 0.525 +544 G 0.508 +545 P 0.509 +546 V 0.515 +547 M 0.523 +548 D 0.528 +549 R 0.520 +550 M 0.508 +551 A 0.505 +552 T 0.501 +553 G 0.501 +554 L 0.521 +555 E 0.549 +556 R 0.551 +557 M 0.527 +558 G 0.510 +559 A 0.513 +560 N 0.521 +561 N 0.522 +562 L 0.530 +563 E 0.554 +564 R 0.571 +565 M 0.563 +566 G 0.542 +567 L 0.538 +568 E 0.559 +569 R 0.582 +570 M 0.594 +571 G 0.609 +572 A 0.632 +573 N 0.643 +574 S 0.623 +575 L 0.597 +576 E 0.595 +577 R 0.607 +578 M 0.613 +579 G 0.617 +580 L 0.631 +581 E 0.645 +582 R 0.648 +583 M 0.651 +584 G 0.670 +585 A 0.696 +586 N 0.711 +587 S 0.711 +588 L 0.706 +589 E 0.699 +590 R 0.684 +591 M 0.670 +592 G 0.677 +593 P 0.703 +594 A 0.723 +595 M 0.727 +596 G 0.728 +597 P 0.735 +598 A 0.734 +599 L 0.703 +600 G 0.649 +601 A 0.619 +602 G 0.646 +603 I 0.701 +604 E 0.742 +605 R 0.761 +606 M 0.770 +607 G 0.774 +608 L 0.774 +609 A 0.772 +610 M 0.772 +611 G 0.778 +612 G 0.789 +613 A 0.800 +614 G 0.806 +615 G 0.806 +616 A 0.798 +617 S 0.780 +618 F 0.760 +619 D 0.748 +620 R 0.738 +621 A 0.721 +622 I 0.699 +623 E 0.690 +624 M 0.701 +625 E 0.720 +626 R 0.732 +627 G 0.735 +628 N 0.735 +629 F 0.739 +630 G 0.751 +631 G 0.761 +632 S 0.764 +633 F 0.763 +634 A 0.766 +635 G 0.771 +636 S 0.774 +637 F 0.776 +638 G 0.780 +639 G 0.783 +640 A 0.778 +641 G 0.761 +642 G 0.739 +643 H 0.721 +644 A 0.717 +645 P 0.721 +646 G 0.721 +647 V 0.694 +648 A 0.625 +649 R 0.513 +650 K 0.381 +651 A 0.258 +652 C 0.162 +653 Q 0.099 +654 I 0.067 +655 F 0.055 +656 V 0.056 +657 R 0.062 +658 N 0.070 +659 L 0.074 +660 P 0.072 +661 F 0.068 +662 D 0.065 +663 F 0.058 +664 T 0.046 +665 W 0.035 +666 K 0.029 +667 M 0.029 +668 L 0.034 +669 K 0.041 +670 D 0.047 +671 K 0.048 +672 F 0.049 +673 N 0.052 +674 E 0.056 +675 C 0.060 +676 G 0.065 +677 H 0.072 +678 V 0.076 +679 L 0.074 +680 Y 0.072 +681 A 0.073 +682 D 0.078 +683 I 0.085 +684 K 0.095 +685 M 0.110 +686 E 0.128 +687 N 0.142 +688 G 0.150 +689 K 0.145 +690 S 0.128 +691 K 0.109 +692 G 0.091 +693 C 0.075 +694 G 0.060 +695 V 0.051 +696 V 0.051 +697 K 0.058 +698 F 0.066 +699 E 0.070 +700 S 0.069 +701 P 0.065 +702 E 0.060 +703 V 0.055 +704 A 0.051 +705 E 0.051 +706 R 0.053 +707 A 0.056 +708 C 0.056 +709 R 0.056 +710 M 0.056 +711 M 0.058 +712 N 0.061 +713 G 0.068 +714 M 0.077 +715 K 0.082 +716 L 0.082 +717 S 0.083 +718 G 0.091 +719 R 0.099 +720 E 0.099 +721 I 0.089 +722 D 0.075 +723 V 0.066 +724 R 0.069 +725 I 0.084 +726 D 0.111 +727 R 0.146 +728 N 0.184 +729 A 0.210 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000059208.16_ENSMUST00000148178.8_GN:Hnrnpm_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:80.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000059208.16_ENSMUST00000148178.8_GN:Hnrnpm_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:80.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..199034f815703270c7523a8f6c60709ee802b2f6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000059208.16_ENSMUST00000148178.8_GN:Hnrnpm_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:80.caid @@ -0,0 +1,810 @@ +>ENSMUSG00000059208.16|ENSMUST00000148178.8|GN:Hnrnpm|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:80 +1 M 0.411 +2 S 0.448 +3 D 0.498 +4 T 0.535 +5 Y 0.548 +6 L 0.550 +7 S 0.558 +8 P 0.579 +9 C 0.607 +10 P 0.634 +11 T 0.652 +12 T 0.656 +13 Q 0.650 +14 L 0.649 +15 Y 0.651 +16 L 0.645 +17 R 0.638 +18 T 0.649 +19 S 0.674 +20 G 0.693 +21 S 0.698 +22 E 0.685 +23 A 0.644 +24 C 0.575 +25 H 0.516 +26 W 0.490 +27 R 0.484 +28 R 0.496 +29 R 0.546 +30 G 0.615 +31 L 0.664 +32 T 0.686 +33 S 0.698 +34 R 0.704 +35 G 0.700 +36 R 0.693 +37 D 0.692 +38 P 0.700 +39 R 0.714 +40 R 0.733 +41 A 0.750 +42 G 0.756 +43 S 0.753 +44 G 0.742 +45 S 0.723 +46 R 0.700 +47 S 0.687 +48 P 0.689 +49 H 0.699 +50 K 0.713 +51 E 0.727 +52 A 0.734 +53 L 0.736 +54 L 0.743 +55 V 0.751 +56 V 0.750 +57 R 0.742 +58 G 0.733 +59 H 0.715 +60 V 0.670 +61 S 0.600 +62 A 0.530 +63 Q 0.488 +64 A 0.475 +65 Q 0.473 +66 L 0.471 +67 D 0.469 +68 R 0.472 +69 A 0.484 +70 R 0.513 +71 S 0.544 +72 L 0.553 +73 T 0.532 +74 Q 0.509 +75 S 0.517 +76 P 0.561 +77 D 0.615 +78 A 0.650 +79 E 0.663 +80 K 0.662 +81 M 0.657 +82 A 0.649 +83 A 0.637 +84 G 0.614 +85 V 0.585 +86 E 0.570 +87 A 0.577 +88 A 0.572 +89 A 0.544 +90 E 0.535 +91 V 0.568 +92 A 0.609 +93 A 0.626 +94 T 0.638 +95 E 0.666 +96 P 0.708 +97 K 0.747 +98 M 0.772 +99 E 0.781 +100 E 0.780 +101 E 0.776 +102 S 0.772 +103 G 0.767 +104 A 0.764 +105 P 0.763 +106 C 0.752 +107 V 0.712 +108 P 0.654 +109 S 0.633 +110 G 0.676 +111 N 0.741 +112 G 0.777 +113 A 0.780 +114 P 0.774 +115 G 0.771 +116 P 0.772 +117 K 0.771 +118 G 0.765 +119 E 0.752 +120 E 0.731 +121 R 0.705 +122 P 0.678 +123 T 0.651 +124 Q 0.624 +125 N 0.594 +126 E 0.560 +127 K 0.527 +128 R 0.516 +129 K 0.537 +130 E 0.573 +131 K 0.608 +132 N 0.640 +133 I 0.663 +134 K 0.675 +135 R 0.684 +136 G 0.695 +137 G 0.704 +138 N 0.697 +139 R 0.671 +140 F 0.641 +141 E 0.620 +142 P 0.602 +143 Y 0.578 +144 S 0.541 +145 N 0.490 +146 P 0.420 +147 T 0.329 +148 K 0.228 +149 R 0.138 +150 Y 0.074 +151 R 0.041 +152 A 0.029 +153 F 0.028 +154 I 0.031 +155 T 0.038 +156 N 0.048 +157 I 0.054 +158 P 0.053 +159 F 0.048 +160 D 0.043 +161 V 0.037 +162 K 0.029 +163 W 0.021 +164 Q 0.019 +165 S 0.022 +166 L 0.031 +167 K 0.045 +168 D 0.053 +169 L 0.050 +170 V 0.042 +171 K 0.037 +172 E 0.036 +173 K 0.039 +174 V 0.041 +175 G 0.042 +176 E 0.040 +177 V 0.038 +178 T 0.037 +179 Y 0.039 +180 V 0.045 +181 E 0.055 +182 L 0.068 +183 L 0.085 +184 M 0.101 +185 D 0.112 +186 A 0.114 +187 E 0.112 +188 G 0.109 +189 K 0.100 +190 S 0.083 +191 R 0.066 +192 G 0.051 +193 C 0.037 +194 A 0.027 +195 V 0.022 +196 V 0.024 +197 E 0.032 +198 F 0.040 +199 K 0.042 +200 M 0.037 +201 E 0.031 +202 E 0.027 +203 S 0.025 +204 M 0.024 +205 K 0.023 +206 K 0.024 +207 A 0.025 +208 A 0.026 +209 E 0.029 +210 V 0.031 +211 L 0.031 +212 N 0.030 +213 K 0.030 +214 H 0.033 +215 S 0.038 +216 L 0.046 +217 S 0.058 +218 G 0.068 +219 R 0.071 +220 P 0.064 +221 L 0.054 +222 K 0.047 +223 V 0.048 +224 K 0.061 +225 E 0.085 +226 D 0.109 +227 P 0.118 +228 D 0.112 +229 G 0.100 +230 E 0.087 +231 H 0.076 +232 A 0.070 +233 R 0.075 +234 R 0.090 +235 A 0.117 +236 M 0.153 +237 Q 0.193 +238 K 0.229 +239 V 0.257 +240 M 0.289 +241 A 0.339 +242 T 0.410 +243 T 0.487 +244 G 0.562 +245 G 0.621 +246 M 0.654 +247 G 0.659 +248 M 0.649 +249 G 0.636 +250 P 0.625 +251 G 0.615 +252 G 0.600 +253 P 0.564 +254 G 0.497 +255 M 0.409 +256 I 0.322 +257 N 0.248 +258 I 0.188 +259 P 0.146 +260 P 0.124 +261 S 0.119 +262 I 0.124 +263 L 0.139 +264 N 0.165 +265 N 0.187 +266 P 0.191 +267 N 0.176 +268 I 0.148 +269 P 0.114 +270 N 0.084 +271 E 0.064 +272 I 0.054 +273 I 0.048 +274 H 0.044 +275 A 0.042 +276 L 0.045 +277 Q 0.056 +278 A 0.071 +279 G 0.082 +280 R 0.082 +281 L 0.073 +282 G 0.057 +283 S 0.040 +284 T 0.029 +285 V 0.024 +286 F 0.023 +287 V 0.025 +288 A 0.030 +289 N 0.038 +290 L 0.044 +291 D 0.043 +292 Y 0.039 +293 K 0.035 +294 V 0.032 +295 G 0.029 +296 W 0.025 +297 K 0.021 +298 K 0.021 +299 L 0.025 +300 K 0.033 +301 E 0.038 +302 V 0.038 +303 F 0.036 +304 S 0.037 +305 M 0.042 +306 A 0.050 +307 G 0.058 +308 V 0.063 +309 V 0.062 +310 V 0.057 +311 R 0.052 +312 A 0.053 +313 D 0.062 +314 I 0.077 +315 L 0.097 +316 E 0.115 +317 D 0.125 +318 K 0.129 +319 D 0.136 +320 G 0.142 +321 K 0.135 +322 S 0.115 +323 R 0.091 +324 G 0.070 +325 I 0.051 +326 G 0.036 +327 I 0.029 +328 V 0.031 +329 T 0.038 +330 F 0.045 +331 E 0.046 +332 Q 0.042 +333 S 0.038 +334 I 0.035 +335 E 0.034 +336 A 0.035 +337 V 0.037 +338 Q 0.039 +339 A 0.039 +340 I 0.037 +341 S 0.032 +342 M 0.027 +343 F 0.025 +344 N 0.026 +345 G 0.030 +346 Q 0.035 +347 L 0.037 +348 L 0.038 +349 F 0.042 +350 D 0.051 +351 R 0.058 +352 P 0.059 +353 M 0.055 +354 H 0.050 +355 V 0.049 +356 K 0.053 +357 M 0.066 +358 D 0.088 +359 E 0.116 +360 R 0.154 +361 A 0.211 +362 L 0.291 +363 P 0.383 +364 K 0.471 +365 G 0.531 +366 D 0.546 +367 F 0.530 +368 F 0.523 +369 P 0.548 +370 P 0.598 +371 E 0.646 +372 R 0.678 +373 P 0.696 +374 Q 0.704 +375 Q 0.707 +376 L 0.711 +377 P 0.720 +378 H 0.733 +379 G 0.744 +380 L 0.751 +381 G 0.759 +382 G 0.768 +383 I 0.775 +384 G 0.780 +385 M 0.777 +386 G 0.758 +387 L 0.732 +388 G 0.717 +389 P 0.720 +390 G 0.729 +391 G 0.736 +392 Q 0.741 +393 P 0.747 +394 I 0.752 +395 D 0.752 +396 A 0.748 +397 N 0.744 +398 H 0.746 +399 L 0.759 +400 S 0.778 +401 K 0.795 +402 G 0.808 +403 I 0.816 +404 G 0.820 +405 M 0.823 +406 G 0.820 +407 N 0.808 +408 L 0.793 +409 G 0.789 +410 P 0.799 +411 A 0.812 +412 G 0.813 +413 M 0.790 +414 G 0.733 +415 M 0.661 +416 E 0.623 +417 G 0.650 +418 I 0.706 +419 G 0.746 +420 F 0.764 +421 G 0.771 +422 I 0.774 +423 N 0.779 +424 K 0.788 +425 I 0.800 +426 G 0.806 +427 G 0.802 +428 M 0.790 +429 E 0.780 +430 G 0.776 +431 P 0.779 +432 F 0.789 +433 G 0.805 +434 G 0.815 +435 G 0.813 +436 M 0.805 +437 E 0.798 +438 N 0.790 +439 M 0.779 +440 G 0.772 +441 R 0.771 +442 F 0.775 +443 G 0.777 +444 S 0.764 +445 G 0.730 +446 M 0.684 +447 N 0.643 +448 M 0.612 +449 G 0.582 +450 R 0.543 +451 I 0.502 +452 N 0.472 +453 E 0.453 +454 I 0.443 +455 L 0.441 +456 S 0.440 +457 N 0.440 +458 A 0.448 +459 L 0.472 +460 K 0.518 +461 R 0.588 +462 G 0.664 +463 E 0.721 +464 I 0.747 +465 I 0.753 +466 A 0.753 +467 K 0.752 +468 Q 0.753 +469 G 0.760 +470 G 0.774 +471 G 0.792 +472 G 0.807 +473 A 0.814 +474 G 0.810 +475 G 0.797 +476 S 0.784 +477 V 0.779 +478 P 0.781 +479 G 0.783 +480 I 0.778 +481 E 0.768 +482 R 0.757 +483 M 0.752 +484 G 0.755 +485 P 0.764 +486 G 0.769 +487 I 0.763 +488 D 0.740 +489 R 0.701 +490 I 0.664 +491 S 0.658 +492 G 0.680 +493 A 0.702 +494 G 0.713 +495 M 0.722 +496 E 0.732 +497 R 0.730 +498 M 0.715 +499 G 0.705 +500 A 0.707 +501 G 0.713 +502 L 0.716 +503 G 0.718 +504 H 0.708 +505 G 0.685 +506 M 0.660 +507 D 0.632 +508 R 0.582 +509 V 0.507 +510 G 0.426 +511 S 0.361 +512 E 0.325 +513 I 0.318 +514 E 0.328 +515 R 0.342 +516 M 0.356 +517 G 0.369 +518 L 0.374 +519 V 0.378 +520 M 0.399 +521 D 0.431 +522 R 0.456 +523 M 0.472 +524 G 0.487 +525 S 0.502 +526 V 0.523 +527 E 0.552 +528 R 0.580 +529 M 0.601 +530 G 0.623 +531 S 0.643 +532 S 0.643 +533 I 0.615 +534 E 0.560 +535 R 0.485 +536 M 0.413 +537 G 0.378 +538 P 0.387 +539 L 0.416 +540 G 0.440 +541 L 0.447 +542 D 0.434 +543 H 0.403 +544 M 0.366 +545 A 0.337 +546 S 0.324 +547 S 0.333 +548 I 0.359 +549 E 0.381 +550 R 0.383 +551 M 0.366 +552 G 0.336 +553 Q 0.311 +554 T 0.318 +555 M 0.367 +556 E 0.422 +557 R 0.445 +558 I 0.447 +559 G 0.462 +560 S 0.489 +561 G 0.509 +562 V 0.525 +563 E 0.539 +564 R 0.531 +565 M 0.512 +566 G 0.519 +567 A 0.560 +568 G 0.602 +569 M 0.630 +570 G 0.652 +571 F 0.666 +572 G 0.667 +573 L 0.665 +574 E 0.671 +575 R 0.675 +576 M 0.668 +577 A 0.645 +578 A 0.610 +579 P 0.575 +580 I 0.553 +581 D 0.535 +582 R 0.498 +583 V 0.438 +584 G 0.373 +585 Q 0.321 +586 T 0.298 +587 I 0.310 +588 E 0.351 +589 R 0.406 +590 M 0.470 +591 G 0.533 +592 S 0.572 +593 G 0.576 +594 V 0.564 +595 E 0.547 +596 R 0.522 +597 M 0.501 +598 G 0.503 +599 P 0.521 +600 A 0.536 +601 I 0.551 +602 E 0.572 +603 R 0.594 +604 M 0.618 +605 G 0.645 +606 L 0.663 +607 S 0.661 +608 M 0.645 +609 D 0.609 +610 R 0.543 +611 M 0.465 +612 V 0.419 +613 P 0.427 +614 T 0.474 +615 G 0.531 +616 M 0.589 +617 G 0.639 +618 A 0.668 +619 S 0.672 +620 L 0.658 +621 E 0.632 +622 R 0.598 +623 M 0.567 +624 G 0.554 +625 P 0.556 +626 V 0.561 +627 M 0.567 +628 D 0.568 +629 R 0.557 +630 M 0.543 +631 A 0.537 +632 T 0.533 +633 G 0.532 +634 L 0.550 +635 E 0.576 +636 R 0.578 +637 M 0.556 +638 G 0.541 +639 A 0.546 +640 N 0.553 +641 N 0.553 +642 L 0.561 +643 E 0.585 +644 R 0.605 +645 M 0.600 +646 G 0.581 +647 L 0.578 +648 E 0.596 +649 R 0.615 +650 M 0.625 +651 G 0.639 +652 A 0.660 +653 N 0.667 +654 S 0.647 +655 L 0.623 +656 E 0.623 +657 R 0.637 +658 M 0.643 +659 G 0.646 +660 L 0.656 +661 E 0.667 +662 R 0.669 +663 M 0.671 +664 G 0.688 +665 A 0.712 +666 N 0.725 +667 S 0.724 +668 L 0.719 +669 E 0.712 +670 R 0.699 +671 M 0.686 +672 G 0.692 +673 P 0.715 +674 A 0.734 +675 M 0.740 +676 G 0.741 +677 P 0.747 +678 A 0.744 +679 L 0.712 +680 G 0.657 +681 A 0.625 +682 G 0.652 +683 I 0.708 +684 E 0.748 +685 R 0.767 +686 M 0.776 +687 G 0.780 +688 L 0.780 +689 A 0.778 +690 M 0.778 +691 G 0.784 +692 G 0.794 +693 A 0.805 +694 G 0.811 +695 G 0.811 +696 A 0.803 +697 S 0.786 +698 F 0.767 +699 D 0.756 +700 R 0.748 +701 A 0.733 +702 I 0.713 +703 E 0.703 +704 M 0.713 +705 E 0.730 +706 R 0.740 +707 G 0.742 +708 N 0.741 +709 F 0.745 +710 G 0.756 +711 G 0.766 +712 S 0.769 +713 F 0.768 +714 A 0.771 +715 G 0.776 +716 S 0.779 +717 F 0.781 +718 G 0.786 +719 G 0.788 +720 A 0.782 +721 G 0.765 +722 G 0.744 +723 H 0.727 +724 A 0.722 +725 P 0.726 +726 G 0.724 +727 V 0.696 +728 A 0.626 +729 R 0.513 +730 K 0.380 +731 A 0.258 +732 C 0.163 +733 Q 0.100 +734 I 0.067 +735 F 0.056 +736 V 0.056 +737 R 0.061 +738 N 0.069 +739 L 0.072 +740 P 0.071 +741 F 0.067 +742 D 0.064 +743 F 0.057 +744 T 0.045 +745 W 0.034 +746 K 0.029 +747 M 0.031 +748 L 0.041 +749 K 0.055 +750 D 0.064 +751 K 0.062 +752 F 0.056 +753 N 0.055 +754 E 0.057 +755 C 0.060 +756 G 0.065 +757 H 0.071 +758 V 0.074 +759 L 0.073 +760 Y 0.070 +761 A 0.072 +762 D 0.077 +763 I 0.084 +764 K 0.094 +765 M 0.110 +766 E 0.128 +767 N 0.143 +768 G 0.151 +769 K 0.145 +770 S 0.128 +771 K 0.108 +772 G 0.090 +773 C 0.074 +774 G 0.060 +775 V 0.051 +776 V 0.051 +777 K 0.058 +778 F 0.066 +779 E 0.070 +780 S 0.069 +781 P 0.066 +782 E 0.061 +783 V 0.056 +784 A 0.052 +785 E 0.051 +786 R 0.053 +787 A 0.056 +788 C 0.056 +789 R 0.056 +790 M 0.056 +791 M 0.057 +792 N 0.059 +793 G 0.066 +794 M 0.075 +795 K 0.080 +796 L 0.081 +797 S 0.083 +798 G 0.090 +799 R 0.099 +800 E 0.100 +801 I 0.091 +802 D 0.076 +803 V 0.067 +804 R 0.069 +805 I 0.083 +806 D 0.109 +807 R 0.141 +808 N 0.174 +809 A 0.198 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000059355.14_ENSMUST00000079764.14_GN:Wdr83os_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000059355.14_ENSMUST00000079764.14_GN:Wdr83os_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..161eb93cd38a23aec8c21b44033779c7b4effb61 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000059355.14_ENSMUST00000079764.14_GN:Wdr83os_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,107 @@ +>ENSMUSG00000059355.14|ENSMUST00000079764.14|GN:Wdr83os|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.552 +2 S 0.568 +3 T 0.598 +4 N 0.631 +5 N 0.649 +6 M 0.644 +7 S 0.618 +8 D 0.581 +9 P 0.541 +10 R 0.516 +11 R 0.527 +12 P 0.570 +13 N 0.608 +14 K 0.619 +15 V 0.603 +16 L 0.568 +17 R 0.527 +18 Y 0.507 +19 K 0.522 +20 P 0.568 +21 P 0.622 +22 P 0.669 +23 S 0.699 +24 E 0.707 +25 C 0.695 +26 N 0.674 +27 P 0.658 +28 A 0.646 +29 L 0.625 +30 D 0.590 +31 D 0.553 +32 P 0.518 +33 T 0.476 +34 P 0.412 +35 D 0.320 +36 Y 0.223 +37 M 0.152 +38 N 0.117 +39 L 0.104 +40 L 0.097 +41 G 0.087 +42 M 0.073 +43 I 0.059 +44 F 0.054 +45 S 0.062 +46 M 0.071 +47 C 0.079 +48 G 0.087 +49 L 0.097 +50 M 0.105 +51 L 0.108 +52 K 0.105 +53 L 0.096 +54 K 0.083 +55 W 0.068 +56 C 0.055 +57 A 0.048 +58 W 0.048 +59 V 0.053 +60 A 0.061 +61 V 0.069 +62 Y 0.069 +63 C 0.059 +64 S 0.047 +65 F 0.044 +66 I 0.053 +67 S 0.068 +68 F 0.084 +69 A 0.105 +70 N 0.133 +71 S 0.164 +72 R 0.189 +73 S 0.201 +74 S 0.203 +75 E 0.196 +76 D 0.181 +77 T 0.157 +78 K 0.126 +79 Q 0.100 +80 M 0.082 +81 M 0.069 +82 S 0.058 +83 S 0.050 +84 F 0.044 +85 M 0.042 +86 L 0.042 +87 S 0.043 +88 I 0.043 +89 S 0.041 +90 A 0.038 +91 V 0.037 +92 V 0.038 +93 M 0.045 +94 S 0.060 +95 Y 0.086 +96 L 0.135 +97 Q 0.212 +98 N 0.306 +99 P 0.397 +100 Q 0.471 +101 P 0.516 +102 M 0.526 +103 T 0.502 +104 P 0.460 +105 P 0.411 +106 W 0.377 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000059355.14_ENSMUST00000079764.14_GN:Wdr83os_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:80.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000059355.14_ENSMUST00000079764.14_GN:Wdr83os_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:80.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c2d4d64063de256e829abdd1cc6bc7c60a5af5ee --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000059355.14_ENSMUST00000079764.14_GN:Wdr83os_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:80.caid @@ -0,0 +1,187 @@ +>ENSMUSG00000059355.14|ENSMUST00000079764.14|GN:Wdr83os|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:80 +1 M 0.357 +2 T 0.374 +3 V 0.409 +4 L 0.460 +5 G 0.511 +6 I 0.539 +7 L 0.546 +8 K 0.549 +9 S 0.550 +10 P 0.545 +11 F 0.535 +12 S 0.517 +13 F 0.490 +14 F 0.468 +15 S 0.465 +16 L 0.467 +17 D 0.448 +18 F 0.405 +19 L 0.371 +20 L 0.383 +21 S 0.445 +22 R 0.519 +23 N 0.568 +24 C 0.588 +25 F 0.599 +26 G 0.601 +27 L 0.578 +28 F 0.535 +29 S 0.487 +30 F 0.439 +31 S 0.391 +32 F 0.346 +33 F 0.314 +34 W 0.313 +35 L 0.344 +36 R 0.393 +37 V 0.450 +38 V 0.519 +39 P 0.597 +40 L 0.673 +41 T 0.734 +42 A 0.771 +43 I 0.784 +44 G 0.787 +45 N 0.789 +46 R 0.788 +47 S 0.783 +48 A 0.775 +49 G 0.770 +50 Y 0.768 +51 W 0.766 +52 C 0.765 +53 Y 0.767 +54 S 0.766 +55 K 0.753 +56 S 0.728 +57 H 0.705 +58 P 0.694 +59 S 0.692 +60 F 0.688 +61 P 0.682 +62 R 0.686 +63 P 0.696 +64 E 0.699 +65 V 0.685 +66 A 0.657 +67 L 0.636 +68 L 0.643 +69 A 0.665 +70 V 0.676 +71 K 0.676 +72 E 0.686 +73 G 0.705 +74 R 0.714 +75 R 0.717 +76 G 0.716 +77 L 0.712 +78 Q 0.710 +79 F 0.717 +80 A 0.731 +81 M 0.748 +82 S 0.770 +83 T 0.787 +84 N 0.791 +85 N 0.774 +86 M 0.739 +87 S 0.691 +88 D 0.636 +89 P 0.578 +90 R 0.540 +91 R 0.547 +92 P 0.592 +93 N 0.638 +94 K 0.660 +95 V 0.654 +96 L 0.626 +97 R 0.586 +98 Y 0.559 +99 K 0.568 +100 P 0.613 +101 P 0.669 +102 P 0.714 +103 S 0.738 +104 E 0.742 +105 C 0.726 +106 N 0.704 +107 P 0.686 +108 A 0.670 +109 L 0.646 +110 D 0.610 +111 D 0.570 +112 P 0.530 +113 T 0.484 +114 P 0.418 +115 D 0.325 +116 Y 0.226 +117 M 0.153 +118 N 0.117 +119 L 0.104 +120 L 0.098 +121 G 0.092 +122 M 0.080 +123 I 0.066 +124 F 0.060 +125 S 0.065 +126 M 0.073 +127 C 0.080 +128 G 0.087 +129 L 0.096 +130 M 0.104 +131 L 0.109 +132 K 0.108 +133 L 0.100 +134 K 0.086 +135 W 0.069 +136 C 0.056 +137 A 0.049 +138 W 0.049 +139 V 0.052 +140 A 0.054 +141 V 0.054 +142 Y 0.049 +143 C 0.042 +144 S 0.037 +145 F 0.040 +146 I 0.051 +147 S 0.068 +148 F 0.087 +149 A 0.109 +150 N 0.136 +151 S 0.166 +152 R 0.189 +153 S 0.202 +154 S 0.206 +155 E 0.201 +156 D 0.185 +157 T 0.157 +158 K 0.124 +159 Q 0.097 +160 M 0.080 +161 M 0.069 +162 S 0.060 +163 S 0.054 +164 F 0.049 +165 M 0.045 +166 L 0.044 +167 S 0.044 +168 I 0.044 +169 S 0.043 +170 A 0.041 +171 V 0.040 +172 V 0.042 +173 M 0.049 +174 S 0.064 +175 Y 0.091 +176 L 0.138 +177 Q 0.211 +178 N 0.302 +179 P 0.392 +180 Q 0.469 +181 P 0.519 +182 M 0.531 +183 T 0.507 +184 P 0.463 +185 P 0.415 +186 W 0.382 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000059741.14_ENSMUST00000079784.12_GN:Myl3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000059741.14_ENSMUST00000079784.12_GN:Myl3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f5783f983f9c436b4b9565b832c8d8d6475ed4fd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000059741.14_ENSMUST00000079784.12_GN:Myl3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,205 @@ +>ENSMUSG00000059741.14|ENSMUST00000079784.12|GN:Myl3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.424 +2 A 0.447 +3 P 0.484 +4 K 0.522 +5 K 0.554 +6 P 0.582 +7 E 0.613 +8 P 0.648 +9 K 0.677 +10 K 0.694 +11 D 0.698 +12 D 0.684 +13 A 0.641 +14 K 0.580 +15 A 0.543 +16 A 0.559 +17 A 0.603 +18 P 0.639 +19 K 0.654 +20 A 0.651 +21 A 0.638 +22 P 0.626 +23 A 0.617 +24 P 0.597 +25 A 0.558 +26 A 0.534 +27 A 0.559 +28 P 0.613 +29 A 0.654 +30 A 0.670 +31 A 0.677 +32 P 0.685 +33 A 0.690 +34 A 0.684 +35 A 0.665 +36 P 0.645 +37 E 0.632 +38 P 0.626 +39 E 0.624 +40 R 0.623 +41 P 0.623 +42 K 0.616 +43 E 0.588 +44 A 0.527 +45 E 0.439 +46 F 0.346 +47 D 0.271 +48 A 0.220 +49 S 0.195 +50 K 0.188 +51 I 0.179 +52 K 0.152 +53 I 0.115 +54 E 0.082 +55 F 0.061 +56 T 0.050 +57 P 0.043 +58 E 0.038 +59 Q 0.033 +60 I 0.030 +61 E 0.030 +62 E 0.031 +63 F 0.036 +64 K 0.046 +65 E 0.051 +66 A 0.046 +67 F 0.036 +68 L 0.030 +69 L 0.031 +70 F 0.038 +71 D 0.049 +72 R 0.067 +73 T 0.092 +74 P 0.120 +75 K 0.143 +76 G 0.152 +77 E 0.143 +78 M 0.124 +79 K 0.102 +80 I 0.080 +81 T 0.061 +82 Y 0.052 +83 G 0.054 +84 Q 0.059 +85 C 0.061 +86 G 0.063 +87 D 0.071 +88 V 0.082 +89 L 0.094 +90 R 0.112 +91 A 0.140 +92 L 0.170 +93 G 0.185 +94 Q 0.179 +95 N 0.161 +96 P 0.141 +97 T 0.122 +98 Q 0.102 +99 A 0.085 +100 E 0.070 +101 V 0.059 +102 L 0.053 +103 R 0.052 +104 V 0.058 +105 L 0.068 +106 G 0.078 +107 K 0.083 +108 P 0.080 +109 K 0.072 +110 Q 0.063 +111 E 0.057 +112 E 0.054 +113 L 0.054 +114 N 0.056 +115 S 0.060 +116 K 0.063 +117 M 0.063 +118 M 0.056 +119 D 0.043 +120 F 0.031 +121 E 0.025 +122 T 0.026 +123 F 0.028 +124 L 0.029 +125 P 0.032 +126 M 0.035 +127 L 0.038 +128 Q 0.046 +129 H 0.063 +130 I 0.087 +131 S 0.113 +132 K 0.147 +133 N 0.193 +134 K 0.240 +135 D 0.265 +136 T 0.253 +137 G 0.209 +138 T 0.156 +139 Y 0.118 +140 E 0.104 +141 D 0.100 +142 F 0.095 +143 V 0.094 +144 E 0.101 +145 G 0.107 +146 L 0.103 +147 R 0.091 +148 V 0.084 +149 F 0.086 +150 D 0.095 +151 K 0.112 +152 E 0.137 +153 G 0.160 +154 N 0.170 +155 G 0.163 +156 T 0.145 +157 V 0.120 +158 M 0.093 +159 G 0.076 +160 A 0.074 +161 E 0.083 +162 L 0.093 +163 R 0.103 +164 H 0.113 +165 V 0.127 +166 L 0.140 +167 A 0.148 +168 T 0.151 +169 L 0.155 +170 G 0.169 +171 E 0.186 +172 R 0.195 +173 L 0.189 +174 T 0.175 +175 E 0.160 +176 D 0.150 +177 E 0.140 +178 V 0.123 +179 E 0.102 +180 K 0.091 +181 L 0.091 +182 M 0.096 +183 A 0.102 +184 G 0.112 +185 Q 0.128 +186 E 0.140 +187 D 0.144 +188 S 0.146 +189 N 0.154 +190 G 0.157 +191 C 0.142 +192 I 0.113 +193 N 0.080 +194 Y 0.055 +195 E 0.045 +196 A 0.044 +197 F 0.046 +198 V 0.048 +199 K 0.054 +200 H 0.068 +201 I 0.091 +202 M 0.119 +203 A 0.151 +204 S 0.177 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000059741.14_ENSMUST00000079784.12_GN:Myl3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:31.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000059741.14_ENSMUST00000079784.12_GN:Myl3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:31.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..15df37c76eb392dda665ffc3856b193d864ebce0 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000059741.14_ENSMUST00000079784.12_GN:Myl3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:31.caid @@ -0,0 +1,236 @@ +>ENSMUSG00000059741.14|ENSMUST00000079784.12|GN:Myl3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:31 +1 M 0.396 +2 S 0.414 +3 R 0.446 +4 I 0.484 +5 K 0.517 +6 P 0.543 +7 R 0.564 +8 V 0.582 +9 V 0.590 +10 V 0.586 +11 G 0.574 +12 L 0.552 +13 T 0.518 +14 Y 0.483 +15 L 0.465 +16 T 0.462 +17 L 0.458 +18 F 0.452 +19 S 0.462 +20 F 0.490 +21 P 0.524 +22 S 0.550 +23 S 0.562 +24 L 0.565 +25 L 0.570 +26 F 0.581 +27 V 0.587 +28 I 0.591 +29 T 0.601 +30 A 0.622 +31 P 0.646 +32 M 0.665 +33 A 0.682 +34 P 0.695 +35 K 0.706 +36 K 0.710 +37 P 0.714 +38 E 0.725 +39 P 0.744 +40 K 0.764 +41 K 0.777 +42 D 0.776 +43 D 0.752 +44 A 0.698 +45 K 0.624 +46 A 0.576 +47 A 0.588 +48 A 0.636 +49 P 0.678 +50 K 0.699 +51 A 0.697 +52 A 0.683 +53 P 0.670 +54 A 0.661 +55 P 0.639 +56 A 0.596 +57 A 0.567 +58 A 0.581 +59 P 0.601 +60 A 0.590 +61 A 0.580 +62 A 0.616 +63 P 0.679 +64 A 0.723 +65 A 0.730 +66 A 0.714 +67 P 0.692 +68 E 0.679 +69 P 0.674 +70 E 0.672 +71 R 0.672 +72 P 0.675 +73 K 0.670 +74 E 0.639 +75 A 0.571 +76 E 0.472 +77 F 0.368 +78 D 0.282 +79 A 0.223 +80 S 0.192 +81 K 0.183 +82 I 0.172 +83 K 0.146 +84 I 0.109 +85 E 0.079 +86 F 0.059 +87 T 0.048 +88 P 0.041 +89 E 0.035 +90 Q 0.031 +91 I 0.029 +92 E 0.028 +93 E 0.030 +94 F 0.036 +95 K 0.045 +96 E 0.052 +97 A 0.047 +98 F 0.037 +99 L 0.031 +100 L 0.031 +101 F 0.037 +102 D 0.048 +103 R 0.065 +104 T 0.089 +105 P 0.118 +106 K 0.141 +107 G 0.150 +108 E 0.141 +109 M 0.121 +110 K 0.098 +111 I 0.076 +112 T 0.057 +113 Y 0.049 +114 G 0.052 +115 Q 0.058 +116 C 0.060 +117 G 0.064 +118 D 0.072 +119 V 0.082 +120 L 0.093 +121 R 0.109 +122 A 0.135 +123 L 0.164 +124 G 0.181 +125 Q 0.177 +126 N 0.161 +127 P 0.143 +128 T 0.123 +129 Q 0.103 +130 A 0.085 +131 E 0.071 +132 V 0.060 +133 L 0.054 +134 R 0.053 +135 V 0.060 +136 L 0.073 +137 G 0.085 +138 K 0.092 +139 P 0.090 +140 K 0.081 +141 Q 0.071 +142 E 0.063 +143 E 0.058 +144 L 0.057 +145 N 0.059 +146 S 0.064 +147 K 0.069 +148 M 0.070 +149 M 0.062 +150 D 0.048 +151 F 0.034 +152 E 0.028 +153 T 0.028 +154 F 0.029 +155 L 0.030 +156 P 0.033 +157 M 0.036 +158 L 0.039 +159 Q 0.048 +160 H 0.066 +161 I 0.091 +162 S 0.119 +163 K 0.154 +164 N 0.201 +165 K 0.248 +166 D 0.270 +167 T 0.254 +168 G 0.209 +169 T 0.156 +170 Y 0.120 +171 E 0.107 +172 D 0.103 +173 F 0.098 +174 V 0.097 +175 E 0.105 +176 G 0.111 +177 L 0.105 +178 R 0.092 +179 V 0.085 +180 F 0.085 +181 D 0.094 +182 K 0.110 +183 E 0.135 +184 G 0.159 +185 N 0.170 +186 G 0.166 +187 T 0.149 +188 V 0.124 +189 M 0.096 +190 G 0.078 +191 A 0.076 +192 E 0.084 +193 L 0.093 +194 R 0.100 +195 H 0.108 +196 V 0.119 +197 L 0.131 +198 A 0.138 +199 T 0.141 +200 L 0.144 +201 G 0.157 +202 E 0.173 +203 R 0.182 +204 L 0.177 +205 T 0.165 +206 E 0.151 +207 D 0.142 +208 E 0.133 +209 V 0.116 +210 E 0.097 +211 K 0.086 +212 L 0.086 +213 M 0.091 +214 A 0.097 +215 G 0.107 +216 Q 0.122 +217 E 0.134 +218 D 0.137 +219 S 0.140 +220 N 0.150 +221 G 0.153 +222 C 0.138 +223 I 0.108 +224 N 0.076 +225 Y 0.053 +226 E 0.043 +227 A 0.043 +228 F 0.046 +229 V 0.047 +230 K 0.053 +231 H 0.067 +232 I 0.088 +233 M 0.117 +234 A 0.152 +235 S 0.180 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000060679.15_ENSMUST00000057208.13_GN:Mrps9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000060679.15_ENSMUST00000057208.13_GN:Mrps9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1d4deb5f19a6a570e18c2b224d45c8722ea1679b --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000060679.15_ENSMUST00000057208.13_GN:Mrps9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,391 @@ +>ENSMUSG00000060679.15|ENSMUST00000057208.13|GN:Mrps9|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.360 +2 A 0.388 +3 A 0.430 +4 P 0.457 +5 C 0.452 +6 V 0.433 +7 S 0.431 +8 C 0.446 +9 G 0.451 +10 R 0.451 +11 V 0.461 +12 L 0.466 +13 S 0.444 +14 L 0.408 +15 W 0.387 +16 F 0.395 +17 T 0.429 +18 P 0.484 +19 A 0.534 +20 V 0.546 +21 R 0.524 +22 A 0.510 +23 S 0.532 +24 L 0.561 +25 C 0.569 +26 Q 0.571 +27 R 0.591 +28 P 0.626 +29 G 0.650 +30 Y 0.643 +31 W 0.604 +32 T 0.554 +33 A 0.533 +34 S 0.562 +35 A 0.612 +36 V 0.646 +37 G 0.659 +38 W 0.663 +39 Q 0.662 +40 T 0.657 +41 G 0.649 +42 T 0.640 +43 R 0.627 +44 F 0.611 +45 Q 0.586 +46 L 0.541 +47 S 0.480 +48 K 0.437 +49 L 0.435 +50 I 0.460 +51 H 0.492 +52 T 0.532 +53 T 0.567 +54 V 0.572 +55 V 0.547 +56 T 0.524 +57 T 0.520 +58 K 0.533 +59 K 0.548 +60 N 0.549 +61 V 0.530 +62 Q 0.495 +63 A 0.455 +64 S 0.419 +65 R 0.391 +66 Q 0.360 +67 E 0.310 +68 S 0.246 +69 Y 0.187 +70 T 0.148 +71 E 0.127 +72 D 0.116 +73 F 0.112 +74 I 0.115 +75 K 0.124 +76 K 0.138 +77 Q 0.150 +78 I 0.158 +79 E 0.162 +80 E 0.163 +81 F 0.157 +82 N 0.141 +83 I 0.121 +84 G 0.105 +85 K 0.092 +86 R 0.085 +87 H 0.085 +88 L 0.091 +89 A 0.099 +90 N 0.109 +91 M 0.119 +92 M 0.124 +93 G 0.123 +94 E 0.120 +95 D 0.116 +96 P 0.107 +97 E 0.093 +98 T 0.082 +99 F 0.079 +100 A 0.082 +101 E 0.085 +102 E 0.086 +103 D 0.085 +104 I 0.086 +105 D 0.085 +106 R 0.082 +107 A 0.079 +108 I 0.081 +109 A 0.095 +110 Y 0.124 +111 L 0.161 +112 F 0.195 +113 P 0.223 +114 S 0.243 +115 G 0.249 +116 L 0.236 +117 F 0.217 +118 E 0.204 +119 K 0.210 +120 R 0.237 +121 A 0.277 +122 R 0.313 +123 P 0.331 +124 M 0.323 +125 M 0.290 +126 K 0.242 +127 H 0.200 +128 P 0.186 +129 E 0.198 +130 H 0.221 +131 I 0.240 +132 F 0.255 +133 P 0.277 +134 K 0.307 +135 Q 0.335 +136 R 0.349 +137 A 0.354 +138 T 0.362 +139 Q 0.374 +140 W 0.380 +141 G 0.377 +142 E 0.364 +143 D 0.343 +144 G 0.317 +145 R 0.283 +146 P 0.241 +147 F 0.200 +148 H 0.172 +149 F 0.161 +150 L 0.166 +151 F 0.187 +152 Y 0.216 +153 T 0.237 +154 G 0.238 +155 K 0.217 +156 Q 0.188 +157 S 0.165 +158 Y 0.152 +159 Y 0.142 +160 S 0.130 +161 L 0.119 +162 M 0.112 +163 H 0.110 +164 D 0.106 +165 V 0.098 +166 Y 0.092 +167 G 0.089 +168 K 0.084 +169 V 0.081 +170 M 0.085 +171 Q 0.089 +172 L 0.088 +173 E 0.088 +174 K 0.099 +175 H 0.122 +176 R 0.158 +177 G 0.203 +178 P 0.250 +179 L 0.288 +180 S 0.318 +181 A 0.339 +182 S 0.345 +183 A 0.336 +184 E 0.314 +185 S 0.285 +186 R 0.251 +187 D 0.217 +188 L 0.190 +189 I 0.174 +190 G 0.165 +191 S 0.156 +192 R 0.143 +193 W 0.131 +194 L 0.121 +195 I 0.107 +196 K 0.091 +197 E 0.078 +198 E 0.069 +199 L 0.065 +200 E 0.068 +201 E 0.075 +202 M 0.081 +203 L 0.089 +204 V 0.103 +205 E 0.123 +206 K 0.140 +207 L 0.144 +208 S 0.135 +209 D 0.120 +210 E 0.106 +211 D 0.095 +212 Y 0.087 +213 A 0.084 +214 Q 0.088 +215 F 0.094 +216 I 0.097 +217 R 0.096 +218 L 0.091 +219 L 0.090 +220 E 0.097 +221 K 0.107 +222 L 0.109 +223 L 0.107 +224 T 0.113 +225 L 0.125 +226 P 0.134 +227 C 0.135 +228 G 0.129 +229 P 0.118 +230 A 0.106 +231 E 0.093 +232 E 0.080 +233 E 0.071 +234 F 0.067 +235 V 0.064 +236 Q 0.059 +237 R 0.055 +238 F 0.058 +239 R 0.074 +240 R 0.105 +241 S 0.150 +242 V 0.205 +243 T 0.269 +244 I 0.336 +245 Q 0.394 +246 S 0.434 +247 K 0.449 +248 K 0.443 +249 Q 0.426 +250 L 0.403 +251 I 0.374 +252 E 0.335 +253 P 0.285 +254 V 0.233 +255 Q 0.195 +256 Y 0.180 +257 D 0.185 +258 E 0.203 +259 Q 0.221 +260 G 0.221 +261 M 0.198 +262 A 0.155 +263 F 0.109 +264 S 0.077 +265 T 0.062 +266 S 0.061 +267 E 0.064 +268 G 0.067 +269 R 0.068 +270 R 0.071 +271 K 0.080 +272 S 0.095 +273 A 0.105 +274 T 0.101 +275 A 0.086 +276 Q 0.069 +277 A 0.059 +278 V 0.059 +279 V 0.069 +280 Y 0.086 +281 E 0.107 +282 H 0.133 +283 G 0.160 +284 S 0.184 +285 G 0.197 +286 K 0.194 +287 I 0.179 +288 H 0.161 +289 V 0.148 +290 N 0.138 +291 G 0.127 +292 V 0.111 +293 D 0.092 +294 Y 0.076 +295 L 0.066 +296 I 0.062 +297 Y 0.063 +298 F 0.068 +299 P 0.076 +300 I 0.081 +301 T 0.079 +302 Q 0.073 +303 D 0.072 +304 R 0.077 +305 E 0.084 +306 Q 0.085 +307 L 0.079 +308 M 0.070 +309 F 0.066 +310 P 0.064 +311 F 0.064 +312 H 0.063 +313 F 0.063 +314 L 0.062 +315 D 0.061 +316 R 0.065 +317 L 0.073 +318 E 0.079 +319 R 0.081 +320 H 0.082 +321 D 0.083 +322 V 0.080 +323 T 0.075 +324 C 0.077 +325 T 0.086 +326 V 0.097 +327 S 0.105 +328 G 0.115 +329 G 0.130 +330 G 0.145 +331 R 0.153 +332 S 0.157 +333 A 0.162 +334 Q 0.165 +335 A 0.161 +336 G 0.153 +337 A 0.145 +338 I 0.138 +339 R 0.130 +340 L 0.123 +341 A 0.121 +342 M 0.120 +343 A 0.116 +344 R 0.107 +345 A 0.096 +346 L 0.085 +347 C 0.075 +348 S 0.069 +349 F 0.066 +350 V 0.065 +351 T 0.066 +352 E 0.071 +353 D 0.077 +354 E 0.084 +355 V 0.094 +356 E 0.106 +357 W 0.113 +358 M 0.115 +359 R 0.122 +360 Q 0.137 +361 A 0.149 +362 G 0.149 +363 L 0.146 +364 L 0.151 +365 T 0.163 +366 P 0.175 +367 D 0.184 +368 P 0.194 +369 R 0.208 +370 I 0.230 +371 R 0.256 +372 E 0.278 +373 R 0.291 +374 K 0.300 +375 K 0.306 +376 P 0.312 +377 G 0.329 +378 Q 0.361 +379 E 0.400 +380 G 0.424 +381 A 0.419 +382 R 0.397 +383 R 0.384 +384 K 0.389 +385 F 0.403 +386 T 0.418 +387 W 0.432 +388 K 0.445 +389 K 0.453 +390 R 0.457 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000060679.15_ENSMUST00000057208.13_GN:Mrps9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000060679.15_ENSMUST00000057208.13_GN:Mrps9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:6.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..c3574f60b93a5ae37a633d8b2d967b70f66658fd --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000060679.15_ENSMUST00000057208.13_GN:Mrps9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:6.caid @@ -0,0 +1,397 @@ +>ENSMUSG00000060679.15|ENSMUST00000057208.13|GN:Mrps9|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:6 +1 M 0.333 +2 F 0.361 +3 L 0.409 +4 T 0.458 +5 A 0.483 +6 N 0.489 +7 M 0.503 +8 A 0.533 +9 A 0.548 +10 P 0.527 +11 C 0.485 +12 V 0.460 +13 S 0.464 +14 C 0.475 +15 G 0.471 +16 R 0.472 +17 V 0.496 +18 L 0.518 +19 S 0.506 +20 L 0.468 +21 W 0.434 +22 F 0.423 +23 T 0.441 +24 P 0.486 +25 A 0.533 +26 V 0.548 +27 R 0.529 +28 A 0.518 +29 S 0.540 +30 L 0.566 +31 C 0.565 +32 Q 0.557 +33 R 0.577 +34 P 0.619 +35 G 0.653 +36 Y 0.655 +37 W 0.627 +38 T 0.588 +39 A 0.575 +40 S 0.602 +41 A 0.645 +42 V 0.672 +43 G 0.680 +44 W 0.682 +45 Q 0.680 +46 T 0.673 +47 G 0.665 +48 T 0.657 +49 R 0.646 +50 F 0.633 +51 Q 0.612 +52 L 0.569 +53 S 0.508 +54 K 0.464 +55 L 0.465 +56 I 0.490 +57 H 0.520 +58 T 0.556 +59 T 0.587 +60 V 0.588 +61 V 0.561 +62 T 0.532 +63 T 0.524 +64 K 0.534 +65 K 0.547 +66 N 0.548 +67 V 0.529 +68 Q 0.495 +69 A 0.457 +70 S 0.422 +71 R 0.393 +72 Q 0.361 +73 E 0.309 +74 S 0.244 +75 Y 0.184 +76 T 0.146 +77 E 0.125 +78 D 0.114 +79 F 0.110 +80 I 0.113 +81 K 0.122 +82 K 0.136 +83 Q 0.149 +84 I 0.156 +85 E 0.160 +86 E 0.160 +87 F 0.153 +88 N 0.137 +89 I 0.118 +90 G 0.101 +91 K 0.089 +92 R 0.082 +93 H 0.083 +94 L 0.091 +95 A 0.102 +96 N 0.114 +97 M 0.122 +98 M 0.125 +99 G 0.123 +100 E 0.119 +101 D 0.116 +102 P 0.107 +103 E 0.093 +104 T 0.081 +105 F 0.079 +106 A 0.082 +107 E 0.086 +108 E 0.086 +109 D 0.085 +110 I 0.085 +111 D 0.084 +112 R 0.081 +113 A 0.078 +114 I 0.080 +115 A 0.094 +116 Y 0.123 +117 L 0.160 +118 F 0.194 +119 P 0.223 +120 S 0.243 +121 G 0.248 +122 L 0.236 +123 F 0.217 +124 E 0.205 +125 K 0.211 +126 R 0.237 +127 A 0.277 +128 R 0.313 +129 P 0.331 +130 M 0.322 +131 M 0.289 +132 K 0.240 +133 H 0.198 +134 P 0.183 +135 E 0.196 +136 H 0.220 +137 I 0.239 +138 F 0.254 +139 P 0.277 +140 K 0.308 +141 Q 0.335 +142 R 0.348 +143 A 0.353 +144 T 0.360 +145 Q 0.372 +146 W 0.377 +147 G 0.373 +148 E 0.360 +149 D 0.339 +150 G 0.314 +151 R 0.281 +152 P 0.240 +153 F 0.199 +154 H 0.171 +155 F 0.159 +156 L 0.163 +157 F 0.185 +158 Y 0.213 +159 T 0.234 +160 G 0.235 +161 K 0.215 +162 Q 0.187 +163 S 0.164 +164 Y 0.151 +165 Y 0.141 +166 S 0.130 +167 L 0.118 +168 M 0.111 +169 H 0.109 +170 D 0.105 +171 V 0.097 +172 Y 0.091 +173 G 0.088 +174 K 0.084 +175 V 0.081 +176 M 0.084 +177 Q 0.089 +178 L 0.088 +179 E 0.088 +180 K 0.098 +181 H 0.122 +182 R 0.157 +183 G 0.203 +184 P 0.249 +185 L 0.288 +186 S 0.318 +187 A 0.338 +188 S 0.344 +189 A 0.334 +190 E 0.312 +191 S 0.282 +192 R 0.248 +193 D 0.214 +194 L 0.188 +195 I 0.172 +196 G 0.163 +197 S 0.155 +198 R 0.142 +199 W 0.131 +200 L 0.121 +201 I 0.107 +202 K 0.091 +203 E 0.078 +204 E 0.069 +205 L 0.065 +206 E 0.068 +207 E 0.074 +208 M 0.080 +209 L 0.088 +210 V 0.101 +211 E 0.120 +212 K 0.137 +213 L 0.141 +214 S 0.133 +215 D 0.118 +216 E 0.105 +217 D 0.094 +218 Y 0.086 +219 A 0.083 +220 Q 0.088 +221 F 0.093 +222 I 0.097 +223 R 0.096 +224 L 0.091 +225 L 0.089 +226 E 0.096 +227 K 0.106 +228 L 0.108 +229 L 0.106 +230 T 0.112 +231 L 0.125 +232 P 0.134 +233 C 0.135 +234 G 0.128 +235 P 0.118 +236 A 0.106 +237 E 0.093 +238 E 0.079 +239 E 0.071 +240 F 0.067 +241 V 0.063 +242 Q 0.059 +243 R 0.055 +244 F 0.058 +245 R 0.074 +246 R 0.105 +247 S 0.149 +248 V 0.204 +249 T 0.268 +250 I 0.334 +251 Q 0.393 +252 S 0.432 +253 K 0.448 +254 K 0.442 +255 Q 0.425 +256 L 0.403 +257 I 0.374 +258 E 0.335 +259 P 0.285 +260 V 0.234 +261 Q 0.196 +262 Y 0.180 +263 D 0.185 +264 E 0.203 +265 Q 0.220 +266 G 0.221 +267 M 0.197 +268 A 0.155 +269 F 0.109 +270 S 0.076 +271 T 0.062 +272 S 0.061 +273 E 0.064 +274 G 0.066 +275 R 0.068 +276 R 0.071 +277 K 0.080 +278 S 0.095 +279 A 0.105 +280 T 0.101 +281 A 0.086 +282 Q 0.069 +283 A 0.059 +284 V 0.059 +285 V 0.069 +286 Y 0.086 +287 E 0.108 +288 H 0.133 +289 G 0.160 +290 S 0.184 +291 G 0.197 +292 K 0.195 +293 I 0.180 +294 H 0.162 +295 V 0.149 +296 N 0.139 +297 G 0.128 +298 V 0.112 +299 D 0.093 +300 Y 0.076 +301 L 0.066 +302 I 0.063 +303 Y 0.064 +304 F 0.069 +305 P 0.077 +306 I 0.081 +307 T 0.079 +308 Q 0.073 +309 D 0.072 +310 R 0.077 +311 E 0.085 +312 Q 0.086 +313 L 0.079 +314 M 0.071 +315 F 0.066 +316 P 0.065 +317 F 0.064 +318 H 0.064 +319 F 0.064 +320 L 0.062 +321 D 0.061 +322 R 0.066 +323 L 0.074 +324 E 0.080 +325 R 0.082 +326 H 0.083 +327 D 0.083 +328 V 0.080 +329 T 0.076 +330 C 0.077 +331 T 0.086 +332 V 0.097 +333 S 0.106 +334 G 0.115 +335 G 0.130 +336 G 0.146 +337 R 0.154 +338 S 0.158 +339 A 0.162 +340 Q 0.165 +341 A 0.162 +342 G 0.153 +343 A 0.145 +344 I 0.138 +345 R 0.130 +346 L 0.124 +347 A 0.121 +348 M 0.121 +349 A 0.117 +350 R 0.108 +351 A 0.097 +352 L 0.085 +353 C 0.075 +354 S 0.069 +355 F 0.066 +356 V 0.065 +357 T 0.066 +358 E 0.071 +359 D 0.077 +360 E 0.083 +361 V 0.094 +362 E 0.106 +363 W 0.113 +364 M 0.115 +365 R 0.122 +366 Q 0.137 +367 A 0.149 +368 G 0.150 +369 L 0.146 +370 L 0.152 +371 T 0.164 +372 P 0.176 +373 D 0.185 +374 P 0.194 +375 R 0.208 +376 I 0.230 +377 R 0.256 +378 E 0.278 +379 R 0.292 +380 K 0.300 +381 K 0.306 +382 P 0.312 +383 G 0.329 +384 Q 0.361 +385 E 0.400 +386 G 0.423 +387 A 0.418 +388 R 0.397 +389 R 0.383 +390 K 0.388 +391 F 0.403 +392 T 0.418 +393 W 0.432 +394 K 0.444 +395 K 0.453 +396 R 0.456 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000062683.12_ENSMUST00000185641.7_GN:Atp5mc2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000062683.12_ENSMUST00000185641.7_GN:Atp5mc2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..5492a12629fe074cc66894da4ac4e4b8a23dd154 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000062683.12_ENSMUST00000185641.7_GN:Atp5mc2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,147 @@ +>ENSMUSG00000062683.12|ENSMUST00000185641.7|GN:Atp5mc2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.431 +2 Y 0.454 +3 A 0.490 +4 C 0.528 +5 S 0.564 +6 K 0.594 +7 F 0.621 +8 V 0.650 +9 S 0.676 +10 T 0.687 +11 R 0.683 +12 S 0.679 +13 L 0.687 +14 I 0.704 +15 R 0.718 +16 S 0.721 +17 T 0.702 +18 S 0.653 +19 L 0.594 +20 R 0.571 +21 S 0.597 +22 T 0.617 +23 S 0.592 +24 Q 0.564 +25 L 0.580 +26 L 0.623 +27 S 0.655 +28 R 0.674 +29 P 0.696 +30 L 0.725 +31 S 0.748 +32 A 0.753 +33 V 0.741 +34 E 0.727 +35 L 0.723 +36 K 0.730 +37 R 0.738 +38 P 0.739 +39 Q 0.735 +40 M 0.733 +41 P 0.738 +42 T 0.744 +43 D 0.742 +44 E 0.728 +45 S 0.709 +46 L 0.697 +47 S 0.696 +48 S 0.700 +49 L 0.702 +50 A 0.699 +51 V 0.689 +52 R 0.679 +53 R 0.680 +54 P 0.694 +55 L 0.709 +56 T 0.714 +57 S 0.703 +58 L 0.685 +59 I 0.673 +60 P 0.672 +61 S 0.676 +62 R 0.678 +63 S 0.677 +64 F 0.670 +65 Q 0.648 +66 T 0.609 +67 S 0.564 +68 A 0.515 +69 I 0.457 +70 S 0.395 +71 R 0.353 +72 D 0.338 +73 I 0.326 +74 D 0.302 +75 T 0.279 +76 A 0.264 +77 A 0.247 +78 K 0.240 +79 F 0.262 +80 I 0.300 +81 G 0.325 +82 A 0.331 +83 G 0.325 +84 A 0.305 +85 A 0.273 +86 T 0.249 +87 V 0.242 +88 G 0.242 +89 V 0.246 +90 A 0.265 +91 G 0.301 +92 S 0.335 +93 G 0.343 +94 A 0.320 +95 G 0.289 +96 I 0.281 +97 G 0.296 +98 T 0.300 +99 V 0.276 +100 F 0.249 +101 G 0.238 +102 S 0.227 +103 L 0.196 +104 I 0.160 +105 I 0.139 +106 G 0.130 +107 Y 0.129 +108 A 0.133 +109 R 0.136 +110 N 0.129 +111 P 0.109 +112 S 0.085 +113 L 0.065 +114 K 0.052 +115 Q 0.051 +116 Q 0.060 +117 L 0.074 +118 F 0.085 +119 S 0.089 +120 Y 0.086 +121 A 0.079 +122 I 0.074 +123 L 0.074 +124 G 0.076 +125 F 0.072 +126 A 0.065 +127 L 0.064 +128 S 0.065 +129 E 0.065 +130 A 0.066 +131 M 0.069 +132 G 0.068 +133 L 0.060 +134 F 0.055 +135 C 0.062 +136 L 0.078 +137 M 0.089 +138 V 0.085 +139 A 0.071 +140 F 0.056 +141 L 0.053 +142 I 0.062 +143 L 0.079 +144 F 0.100 +145 A 0.124 +146 M 0.142 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000062683.12_ENSMUST00000185641.7_GN:Atp5mc2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:44.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000062683.12_ENSMUST00000185641.7_GN:Atp5mc2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:44.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..28ed3fa9cf071df534634065ecf6006874d6d244 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000062683.12_ENSMUST00000185641.7_GN:Atp5mc2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:44.caid @@ -0,0 +1,191 @@ +>ENSMUSG00000062683.12|ENSMUST00000185641.7|GN:Atp5mc2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:44 +1 M 0.529 +2 E 0.562 +3 K 0.607 +4 S 0.645 +5 D 0.669 +6 S 0.678 +7 L 0.669 +8 A 0.627 +9 P 0.544 +10 A 0.466 +11 A 0.459 +12 H 0.514 +13 A 0.557 +14 Q 0.579 +15 S 0.619 +16 L 0.671 +17 P 0.704 +18 S 0.713 +19 R 0.705 +20 F 0.694 +21 P 0.691 +22 R 0.703 +23 P 0.725 +24 R 0.749 +25 P 0.770 +26 S 0.782 +27 L 0.785 +28 S 0.780 +29 S 0.770 +30 L 0.757 +31 P 0.748 +32 W 0.750 +33 E 0.762 +34 Q 0.776 +35 P 0.788 +36 S 0.793 +37 C 0.790 +38 L 0.782 +39 G 0.770 +40 P 0.758 +41 S 0.753 +42 P 0.755 +43 L 0.763 +44 K 0.773 +45 M 0.784 +46 Y 0.790 +47 A 0.790 +48 C 0.789 +49 S 0.791 +50 K 0.794 +51 F 0.797 +52 V 0.802 +53 S 0.807 +54 T 0.811 +55 R 0.812 +56 S 0.813 +57 L 0.818 +58 I 0.826 +59 R 0.833 +60 S 0.835 +61 T 0.830 +62 S 0.824 +63 L 0.822 +64 R 0.825 +65 S 0.827 +66 T 0.824 +67 S 0.815 +68 Q 0.806 +69 L 0.798 +70 L 0.786 +71 S 0.773 +72 R 0.767 +73 P 0.775 +74 L 0.794 +75 S 0.810 +76 A 0.811 +77 V 0.798 +78 E 0.782 +79 L 0.776 +80 K 0.779 +81 R 0.783 +82 P 0.783 +83 Q 0.780 +84 M 0.779 +85 P 0.782 +86 T 0.784 +87 D 0.779 +88 E 0.766 +89 S 0.750 +90 L 0.740 +91 S 0.738 +92 S 0.742 +93 L 0.744 +94 A 0.740 +95 V 0.731 +96 R 0.722 +97 R 0.722 +98 P 0.732 +99 L 0.742 +100 T 0.742 +101 S 0.728 +102 L 0.706 +103 I 0.691 +104 P 0.690 +105 S 0.698 +106 R 0.703 +107 S 0.701 +108 F 0.688 +109 Q 0.660 +110 T 0.616 +111 S 0.566 +112 A 0.512 +113 I 0.448 +114 S 0.381 +115 R 0.334 +116 D 0.317 +117 I 0.308 +118 D 0.290 +119 T 0.271 +120 A 0.257 +121 A 0.239 +122 K 0.229 +123 F 0.248 +124 I 0.284 +125 G 0.309 +126 A 0.314 +127 G 0.307 +128 A 0.287 +129 A 0.258 +130 T 0.236 +131 V 0.229 +132 G 0.230 +133 V 0.236 +134 A 0.258 +135 G 0.295 +136 S 0.328 +137 G 0.337 +138 A 0.316 +139 G 0.289 +140 I 0.287 +141 G 0.308 +142 T 0.317 +143 V 0.292 +144 F 0.262 +145 G 0.248 +146 S 0.237 +147 L 0.206 +148 I 0.170 +149 I 0.150 +150 G 0.143 +151 Y 0.141 +152 A 0.145 +153 R 0.148 +154 N 0.140 +155 P 0.118 +156 S 0.092 +157 L 0.071 +158 K 0.057 +159 Q 0.054 +160 Q 0.062 +161 L 0.075 +162 F 0.085 +163 S 0.088 +164 Y 0.086 +165 A 0.081 +166 I 0.076 +167 L 0.077 +168 G 0.080 +169 F 0.075 +170 A 0.068 +171 L 0.066 +172 S 0.068 +173 E 0.068 +174 A 0.068 +175 M 0.071 +176 G 0.068 +177 L 0.060 +178 F 0.055 +179 C 0.063 +180 L 0.079 +181 M 0.092 +182 V 0.090 +183 A 0.075 +184 F 0.060 +185 L 0.055 +186 I 0.063 +187 L 0.079 +188 F 0.099 +189 A 0.123 +190 M 0.141 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000063873.11_ENSMUST00000110007.8_GN:Slc24a3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000063873.11_ENSMUST00000110007.8_GN:Slc24a3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d4d4853bde5e6f73a09a5bbcc0da8b755b4287bc --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000063873.11_ENSMUST00000110007.8_GN:Slc24a3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,646 @@ +>ENSMUSG00000063873.11|ENSMUST00000110007.8|GN:Slc24a3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.329 +2 P 0.346 +3 P 0.374 +4 P 0.397 +5 G 0.389 +6 D 0.336 +7 Q 0.263 +8 D 0.208 +9 C 0.183 +10 A 0.175 +11 R 0.174 +12 R 0.178 +13 R 0.182 +14 S 0.182 +15 R 0.171 +16 R 0.155 +17 R 0.142 +18 R 0.134 +19 R 0.127 +20 D 0.116 +21 L 0.101 +22 L 0.088 +23 L 0.087 +24 S 0.091 +25 Q 0.090 +26 L 0.080 +27 C 0.071 +28 F 0.066 +29 L 0.063 +30 A 0.061 +31 S 0.059 +32 V 0.054 +33 A 0.048 +34 L 0.046 +35 L 0.050 +36 L 0.058 +37 W 0.070 +38 S 0.085 +39 L 0.106 +40 S 0.135 +41 S 0.165 +42 L 0.186 +43 R 0.198 +44 E 0.211 +45 Q 0.231 +46 K 0.250 +47 E 0.261 +48 L 0.265 +49 D 0.263 +50 L 0.250 +51 M 0.233 +52 D 0.223 +53 L 0.225 +54 I 0.234 +55 G 0.248 +56 E 0.265 +57 D 0.274 +58 R 0.266 +59 K 0.249 +60 W 0.251 +61 M 0.282 +62 V 0.318 +63 G 0.337 +64 R 0.352 +65 K 0.386 +66 L 0.435 +67 M 0.485 +68 Q 0.532 +69 V 0.569 +70 N 0.593 +71 D 0.603 +72 T 0.604 +73 L 0.604 +74 T 0.617 +75 S 0.648 +76 E 0.685 +77 D 0.712 +78 A 0.722 +79 G 0.720 +80 L 0.712 +81 Q 0.697 +82 S 0.667 +83 S 0.618 +84 K 0.551 +85 N 0.478 +86 C 0.415 +87 T 0.376 +88 E 0.354 +89 P 0.339 +90 A 0.332 +91 L 0.330 +92 H 0.319 +93 E 0.301 +94 F 0.288 +95 P 0.280 +96 R 0.265 +97 D 0.234 +98 I 0.197 +99 F 0.172 +100 S 0.162 +101 N 0.156 +102 E 0.142 +103 D 0.122 +104 R 0.107 +105 R 0.103 +106 Q 0.106 +107 G 0.106 +108 A 0.097 +109 V 0.080 +110 V 0.062 +111 L 0.054 +112 H 0.058 +113 V 0.068 +114 L 0.075 +115 C 0.075 +116 A 0.071 +117 M 0.064 +118 Y 0.055 +119 M 0.045 +120 F 0.040 +121 Y 0.044 +122 A 0.052 +123 L 0.055 +124 A 0.054 +125 I 0.056 +126 V 0.061 +127 C 0.062 +128 D 0.062 +129 D 0.064 +130 F 0.066 +131 F 0.062 +132 V 0.054 +133 P 0.047 +134 S 0.043 +135 L 0.039 +136 E 0.034 +137 K 0.032 +138 I 0.031 +139 C 0.032 +140 E 0.038 +141 R 0.052 +142 L 0.069 +143 H 0.081 +144 L 0.082 +145 S 0.076 +146 E 0.070 +147 D 0.067 +148 V 0.067 +149 A 0.066 +150 G 0.065 +151 A 0.065 +152 T 0.064 +153 F 0.062 +154 M 0.062 +155 A 0.066 +156 A 0.071 +157 G 0.074 +158 S 0.079 +159 S 0.089 +160 A 0.098 +161 P 0.101 +162 E 0.100 +163 L 0.095 +164 F 0.091 +165 T 0.093 +166 S 0.098 +167 V 0.098 +168 I 0.096 +169 G 0.096 +170 V 0.100 +171 F 0.110 +172 I 0.124 +173 T 0.136 +174 K 0.140 +175 G 0.136 +176 D 0.127 +177 V 0.113 +178 G 0.095 +179 V 0.084 +180 G 0.085 +181 T 0.092 +182 I 0.098 +183 V 0.103 +184 G 0.111 +185 S 0.121 +186 A 0.122 +187 V 0.113 +188 F 0.100 +189 N 0.088 +190 I 0.074 +191 L 0.062 +192 C 0.056 +193 I 0.055 +194 I 0.053 +195 G 0.053 +196 V 0.057 +197 C 0.061 +198 G 0.065 +199 L 0.068 +200 F 0.073 +201 A 0.081 +202 G 0.088 +203 Q 0.095 +204 V 0.107 +205 V 0.119 +206 A 0.122 +207 L 0.112 +208 S 0.091 +209 S 0.068 +210 W 0.051 +211 C 0.044 +212 L 0.041 +213 L 0.041 +214 R 0.045 +215 D 0.053 +216 S 0.060 +217 I 0.062 +218 Y 0.062 +219 Y 0.064 +220 T 0.066 +221 L 0.068 +222 S 0.068 +223 V 0.065 +224 V 0.061 +225 A 0.058 +226 L 0.056 +227 I 0.054 +228 V 0.058 +229 F 0.072 +230 I 0.086 +231 Y 0.094 +232 D 0.101 +233 E 0.115 +234 K 0.128 +235 V 0.123 +236 S 0.100 +237 W 0.077 +238 W 0.072 +239 E 0.082 +240 S 0.091 +241 L 0.090 +242 V 0.089 +243 L 0.095 +244 V 0.100 +245 L 0.095 +246 M 0.078 +247 Y 0.060 +248 L 0.048 +249 I 0.043 +250 Y 0.041 +251 I 0.039 +252 V 0.038 +253 I 0.040 +254 M 0.044 +255 K 0.046 +256 Y 0.047 +257 N 0.049 +258 A 0.053 +259 C 0.057 +260 I 0.063 +261 H 0.069 +262 Q 0.073 +263 C 0.080 +264 F 0.095 +265 E 0.121 +266 R 0.158 +267 R 0.204 +268 T 0.256 +269 K 0.307 +270 G 0.356 +271 A 0.398 +272 G 0.427 +273 N 0.437 +274 M 0.435 +275 V 0.441 +276 N 0.454 +277 G 0.455 +278 L 0.445 +279 A 0.449 +280 N 0.474 +281 N 0.501 +282 A 0.518 +283 E 0.531 +284 I 0.545 +285 D 0.552 +286 D 0.544 +287 S 0.524 +288 S 0.499 +289 N 0.466 +290 C 0.421 +291 D 0.368 +292 A 0.314 +293 T 0.267 +294 V 0.233 +295 V 0.211 +296 L 0.193 +297 L 0.178 +298 K 0.171 +299 K 0.176 +300 A 0.189 +301 N 0.205 +302 F 0.220 +303 H 0.232 +304 R 0.240 +305 K 0.248 +306 A 0.253 +307 S 0.246 +308 V 0.223 +309 I 0.190 +310 M 0.151 +311 V 0.116 +312 D 0.095 +313 E 0.088 +314 L 0.087 +315 L 0.089 +316 S 0.094 +317 A 0.104 +318 Y 0.117 +319 P 0.126 +320 H 0.131 +321 Q 0.135 +322 L 0.137 +323 S 0.135 +324 F 0.126 +325 S 0.114 +326 E 0.101 +327 A 0.090 +328 G 0.082 +329 L 0.081 +330 R 0.084 +331 I 0.086 +332 M 0.082 +333 I 0.077 +334 T 0.075 +335 S 0.082 +336 H 0.096 +337 F 0.111 +338 P 0.122 +339 P 0.124 +340 K 0.122 +341 T 0.118 +342 R 0.117 +343 L 0.112 +344 S 0.099 +345 M 0.082 +346 A 0.070 +347 S 0.067 +348 R 0.070 +349 M 0.074 +350 L 0.076 +351 I 0.073 +352 N 0.069 +353 E 0.062 +354 R 0.055 +355 Q 0.056 +356 R 0.069 +357 L 0.095 +358 I 0.130 +359 N 0.169 +360 S 0.209 +361 R 0.252 +362 A 0.305 +363 Y 0.366 +364 T 0.429 +365 N 0.492 +366 G 0.546 +367 E 0.575 +368 S 0.579 +369 E 0.568 +370 V 0.550 +371 A 0.533 +372 I 0.526 +373 K 0.531 +374 I 0.546 +375 P 0.563 +376 I 0.585 +377 K 0.620 +378 H 0.665 +379 T 0.701 +380 V 0.718 +381 E 0.724 +382 N 0.721 +383 G 0.707 +384 T 0.692 +385 G 0.692 +386 P 0.704 +387 S 0.716 +388 S 0.727 +389 A 0.744 +390 P 0.765 +391 D 0.784 +392 R 0.796 +393 G 0.801 +394 V 0.799 +395 N 0.790 +396 G 0.775 +397 T 0.747 +398 R 0.687 +399 R 0.584 +400 D 0.485 +401 D 0.462 +402 I 0.503 +403 V 0.540 +404 A 0.559 +405 E 0.585 +406 T 0.596 +407 D 0.572 +408 N 0.555 +409 E 0.585 +410 T 0.640 +411 E 0.678 +412 N 0.681 +413 E 0.647 +414 N 0.592 +415 E 0.565 +416 D 0.594 +417 N 0.647 +418 E 0.680 +419 N 0.687 +420 N 0.683 +421 E 0.674 +422 N 0.661 +423 D 0.643 +424 E 0.625 +425 E 0.613 +426 E 0.609 +427 E 0.615 +428 E 0.628 +429 D 0.636 +430 E 0.631 +431 D 0.611 +432 D 0.572 +433 D 0.521 +434 E 0.467 +435 G 0.417 +436 P 0.370 +437 Y 0.323 +438 T 0.280 +439 P 0.251 +440 F 0.236 +441 D 0.227 +442 P 0.216 +443 P 0.199 +444 S 0.179 +445 G 0.153 +446 K 0.121 +447 L 0.095 +448 E 0.085 +449 T 0.092 +450 V 0.104 +451 K 0.114 +452 W 0.116 +453 A 0.112 +454 F 0.114 +455 T 0.125 +456 W 0.129 +457 P 0.117 +458 L 0.102 +459 S 0.094 +460 F 0.092 +461 V 0.095 +462 L 0.100 +463 Y 0.102 +464 F 0.105 +465 T 0.121 +466 V 0.150 +467 P 0.174 +468 N 0.183 +469 C 0.177 +470 N 0.164 +471 K 0.152 +472 P 0.146 +473 H 0.141 +474 W 0.127 +475 E 0.105 +476 K 0.082 +477 W 0.067 +478 F 0.058 +479 M 0.054 +480 V 0.058 +481 T 0.065 +482 F 0.072 +483 A 0.077 +484 S 0.084 +485 S 0.089 +486 T 0.091 +487 L 0.094 +488 W 0.097 +489 I 0.093 +490 A 0.079 +491 A 0.066 +492 F 0.060 +493 S 0.060 +494 Y 0.063 +495 M 0.067 +496 M 0.070 +497 V 0.069 +498 W 0.063 +499 M 0.057 +500 V 0.053 +501 T 0.053 +502 I 0.058 +503 I 0.066 +504 G 0.074 +505 Y 0.083 +506 T 0.100 +507 L 0.130 +508 G 0.158 +509 I 0.162 +510 P 0.141 +511 D 0.115 +512 V 0.099 +513 I 0.090 +514 M 0.077 +515 G 0.065 +516 I 0.058 +517 T 0.060 +518 F 0.067 +519 L 0.077 +520 A 0.088 +521 A 0.094 +522 G 0.094 +523 T 0.095 +524 S 0.101 +525 V 0.108 +526 P 0.110 +527 D 0.106 +528 C 0.093 +529 M 0.079 +530 A 0.068 +531 S 0.062 +532 L 0.059 +533 I 0.061 +534 V 0.070 +535 A 0.082 +536 R 0.097 +537 Q 0.116 +538 G 0.135 +539 M 0.141 +540 G 0.131 +541 D 0.118 +542 M 0.111 +543 A 0.108 +544 V 0.106 +545 S 0.107 +546 N 0.114 +547 S 0.122 +548 I 0.129 +549 G 0.141 +550 S 0.155 +551 N 0.155 +552 V 0.136 +553 F 0.108 +554 D 0.085 +555 I 0.071 +556 L 0.064 +557 I 0.059 +558 G 0.056 +559 L 0.053 +560 G 0.051 +561 L 0.050 +562 P 0.047 +563 W 0.044 +564 A 0.040 +565 L 0.039 +566 Q 0.041 +567 T 0.046 +568 L 0.057 +569 A 0.075 +570 V 0.100 +571 D 0.128 +572 Y 0.155 +573 G 0.174 +574 S 0.182 +575 Y 0.179 +576 I 0.169 +577 R 0.161 +578 L 0.163 +579 N 0.169 +580 S 0.170 +581 R 0.156 +582 G 0.127 +583 L 0.093 +584 I 0.068 +585 Y 0.059 +586 S 0.066 +587 V 0.080 +588 G 0.094 +589 L 0.102 +590 L 0.105 +591 L 0.102 +592 A 0.094 +593 S 0.083 +594 V 0.070 +595 F 0.059 +596 V 0.054 +597 T 0.055 +598 V 0.060 +599 F 0.066 +600 G 0.071 +601 V 0.073 +602 H 0.074 +603 L 0.076 +604 N 0.081 +605 K 0.086 +606 W 0.092 +607 Q 0.096 +608 L 0.092 +609 D 0.077 +610 K 0.060 +611 K 0.053 +612 L 0.057 +613 G 0.067 +614 C 0.078 +615 G 0.089 +616 C 0.098 +617 L 0.095 +618 F 0.086 +619 L 0.077 +620 Y 0.070 +621 G 0.062 +622 V 0.057 +623 F 0.056 +624 L 0.056 +625 C 0.053 +626 F 0.052 +627 S 0.054 +628 I 0.057 +629 M 0.060 +630 T 0.068 +631 E 0.078 +632 F 0.086 +633 N 0.091 +634 V 0.099 +635 F 0.113 +636 T 0.136 +637 F 0.167 +638 V 0.202 +639 N 0.231 +640 L 0.248 +641 P 0.257 +642 M 0.276 +643 C 0.315 +644 G 0.363 +645 D 0.395 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000063873.11_ENSMUST00000110007.8_GN:Slc24a3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:97.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000063873.11_ENSMUST00000110007.8_GN:Slc24a3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:97.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..205fefadf00bf589dd240ee185941d47d1a67f73 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000063873.11_ENSMUST00000110007.8_GN:Slc24a3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:97.caid @@ -0,0 +1,743 @@ +>ENSMUSG00000063873.11|ENSMUST00000110007.8|GN:Slc24a3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:97 +1 M 0.317 +2 A 0.338 +3 R 0.365 +4 E 0.386 +5 Q 0.395 +6 E 0.396 +7 R 0.397 +8 D 0.388 +9 P 0.364 +10 E 0.342 +11 R 0.336 +12 R 0.333 +13 E 0.321 +14 A 0.316 +15 A 0.324 +16 V 0.325 +17 R 0.323 +18 A 0.353 +19 S 0.410 +20 G 0.453 +21 E 0.478 +22 E 0.510 +23 E 0.531 +24 E 0.521 +25 A 0.516 +26 A 0.553 +27 G 0.612 +28 E 0.655 +29 E 0.675 +30 G 0.679 +31 L 0.676 +32 S 0.676 +33 D 0.682 +34 S 0.689 +35 D 0.695 +36 E 0.705 +37 G 0.720 +38 D 0.730 +39 G 0.728 +40 V 0.719 +41 E 0.716 +42 T 0.718 +43 G 0.718 +44 S 0.714 +45 G 0.701 +46 R 0.664 +47 E 0.609 +48 E 0.578 +49 G 0.589 +50 K 0.595 +51 Q 0.565 +52 E 0.542 +53 A 0.569 +54 A 0.622 +55 A 0.653 +56 G 0.651 +57 W 0.628 +58 E 0.595 +59 R 0.560 +60 S 0.523 +61 E 0.487 +62 D 0.459 +63 A 0.458 +64 R 0.493 +65 L 0.539 +66 L 0.570 +67 R 0.590 +68 A 0.608 +69 G 0.619 +70 L 0.628 +71 P 0.648 +72 P 0.681 +73 A 0.712 +74 A 0.734 +75 V 0.746 +76 P 0.756 +77 A 0.764 +78 A 0.768 +79 A 0.757 +80 A 0.727 +81 R 0.686 +82 D 0.653 +83 P 0.639 +84 S 0.644 +85 G 0.659 +86 R 0.672 +87 R 0.685 +88 P 0.701 +89 P 0.714 +90 G 0.714 +91 T 0.703 +92 P 0.695 +93 P 0.697 +94 G 0.699 +95 C 0.688 +96 P 0.660 +97 R 0.624 +98 M 0.594 +99 P 0.583 +100 P 0.592 +101 P 0.605 +102 G 0.585 +103 D 0.512 +104 Q 0.411 +105 D 0.330 +106 C 0.285 +107 A 0.260 +108 R 0.246 +109 R 0.246 +110 R 0.252 +111 S 0.247 +112 R 0.224 +113 R 0.193 +114 R 0.166 +115 R 0.147 +116 R 0.133 +117 D 0.119 +118 L 0.103 +119 L 0.089 +120 L 0.084 +121 S 0.087 +122 Q 0.087 +123 L 0.080 +124 C 0.073 +125 F 0.068 +126 L 0.063 +127 A 0.059 +128 S 0.056 +129 V 0.052 +130 A 0.049 +131 L 0.049 +132 L 0.050 +133 L 0.054 +134 W 0.062 +135 S 0.073 +136 L 0.090 +137 S 0.115 +138 S 0.145 +139 L 0.167 +140 R 0.180 +141 E 0.195 +142 Q 0.219 +143 K 0.242 +144 E 0.256 +145 L 0.260 +146 D 0.258 +147 L 0.244 +148 M 0.226 +149 D 0.215 +150 L 0.214 +151 I 0.218 +152 G 0.225 +153 E 0.237 +154 D 0.244 +155 R 0.235 +156 K 0.218 +157 W 0.222 +158 M 0.251 +159 V 0.283 +160 G 0.302 +161 R 0.321 +162 K 0.359 +163 L 0.408 +164 M 0.458 +165 Q 0.512 +166 V 0.562 +167 N 0.598 +168 D 0.615 +169 T 0.617 +170 L 0.618 +171 T 0.630 +172 S 0.659 +173 E 0.693 +174 D 0.718 +175 A 0.726 +176 G 0.723 +177 L 0.714 +178 Q 0.697 +179 S 0.666 +180 S 0.618 +181 K 0.559 +182 N 0.495 +183 C 0.438 +184 T 0.397 +185 E 0.369 +186 P 0.346 +187 A 0.334 +188 L 0.329 +189 H 0.320 +190 E 0.305 +191 F 0.296 +192 P 0.292 +193 R 0.279 +194 D 0.246 +195 I 0.207 +196 F 0.178 +197 S 0.165 +198 N 0.155 +199 E 0.139 +200 D 0.118 +201 R 0.105 +202 R 0.103 +203 Q 0.106 +204 G 0.105 +205 A 0.096 +206 V 0.079 +207 V 0.062 +208 L 0.054 +209 H 0.058 +210 V 0.067 +211 L 0.074 +212 C 0.075 +213 A 0.070 +214 M 0.063 +215 Y 0.053 +216 M 0.043 +217 F 0.038 +218 Y 0.043 +219 A 0.051 +220 L 0.054 +221 A 0.054 +222 I 0.057 +223 V 0.062 +224 C 0.063 +225 D 0.062 +226 D 0.063 +227 F 0.064 +228 F 0.059 +229 V 0.052 +230 P 0.046 +231 S 0.043 +232 L 0.038 +233 E 0.033 +234 K 0.030 +235 I 0.029 +236 C 0.030 +237 E 0.035 +238 R 0.046 +239 L 0.062 +240 H 0.074 +241 L 0.075 +242 S 0.069 +243 E 0.063 +244 D 0.061 +245 V 0.062 +246 A 0.062 +247 G 0.061 +248 A 0.060 +249 T 0.058 +250 F 0.056 +251 M 0.056 +252 A 0.062 +253 A 0.067 +254 G 0.070 +255 S 0.076 +256 S 0.086 +257 A 0.094 +258 P 0.098 +259 E 0.098 +260 L 0.094 +261 F 0.089 +262 T 0.091 +263 S 0.095 +264 V 0.095 +265 I 0.092 +266 G 0.092 +267 V 0.095 +268 F 0.103 +269 I 0.116 +270 T 0.126 +271 K 0.129 +272 G 0.126 +273 D 0.119 +274 V 0.106 +275 G 0.090 +276 V 0.080 +277 G 0.082 +278 T 0.091 +279 I 0.099 +280 V 0.105 +281 G 0.113 +282 S 0.121 +283 A 0.123 +284 V 0.114 +285 F 0.101 +286 N 0.087 +287 I 0.072 +288 L 0.060 +289 C 0.054 +290 I 0.052 +291 I 0.051 +292 G 0.051 +293 V 0.054 +294 C 0.059 +295 G 0.062 +296 L 0.064 +297 F 0.069 +298 A 0.076 +299 G 0.081 +300 Q 0.087 +301 V 0.099 +302 V 0.113 +303 A 0.117 +304 L 0.109 +305 S 0.089 +306 S 0.066 +307 W 0.049 +308 C 0.042 +309 L 0.040 +310 L 0.040 +311 R 0.044 +312 D 0.052 +313 S 0.059 +314 I 0.061 +315 Y 0.062 +316 Y 0.064 +317 T 0.067 +318 L 0.069 +319 S 0.070 +320 V 0.067 +321 V 0.063 +322 A 0.060 +323 L 0.059 +324 I 0.058 +325 V 0.064 +326 F 0.080 +327 I 0.096 +328 Y 0.103 +329 D 0.108 +330 E 0.121 +331 K 0.133 +332 V 0.128 +333 S 0.103 +334 W 0.079 +335 W 0.073 +336 E 0.083 +337 S 0.092 +338 L 0.091 +339 V 0.091 +340 L 0.096 +341 V 0.100 +342 L 0.093 +343 M 0.077 +344 Y 0.060 +345 L 0.049 +346 I 0.044 +347 Y 0.042 +348 I 0.040 +349 V 0.040 +350 I 0.042 +351 M 0.047 +352 K 0.048 +353 Y 0.049 +354 N 0.052 +355 A 0.056 +356 C 0.060 +357 I 0.066 +358 H 0.072 +359 Q 0.077 +360 C 0.084 +361 F 0.099 +362 E 0.124 +363 R 0.160 +364 R 0.207 +365 T 0.262 +366 K 0.318 +367 G 0.371 +368 A 0.415 +369 G 0.442 +370 N 0.448 +371 M 0.442 +372 V 0.447 +373 N 0.461 +374 G 0.463 +375 L 0.455 +376 A 0.462 +377 N 0.489 +378 N 0.513 +379 A 0.524 +380 E 0.532 +381 I 0.545 +382 D 0.551 +383 D 0.541 +384 S 0.519 +385 S 0.494 +386 N 0.463 +387 C 0.421 +388 D 0.372 +389 A 0.322 +390 T 0.278 +391 V 0.245 +392 V 0.221 +393 L 0.200 +394 L 0.183 +395 K 0.176 +396 K 0.180 +397 A 0.188 +398 N 0.197 +399 F 0.207 +400 H 0.216 +401 R 0.222 +402 K 0.226 +403 A 0.226 +404 S 0.216 +405 V 0.193 +406 I 0.164 +407 M 0.133 +408 V 0.105 +409 D 0.087 +410 E 0.082 +411 L 0.081 +412 L 0.082 +413 S 0.084 +414 A 0.091 +415 Y 0.100 +416 P 0.106 +417 H 0.110 +418 Q 0.113 +419 L 0.118 +420 S 0.119 +421 F 0.114 +422 S 0.106 +423 E 0.096 +424 A 0.087 +425 G 0.080 +426 L 0.077 +427 R 0.075 +428 I 0.074 +429 M 0.072 +430 I 0.069 +431 T 0.070 +432 S 0.077 +433 H 0.091 +434 F 0.107 +435 P 0.118 +436 P 0.122 +437 K 0.120 +438 T 0.116 +439 R 0.113 +440 L 0.107 +441 S 0.092 +442 M 0.075 +443 A 0.062 +444 S 0.058 +445 R 0.059 +446 M 0.062 +447 L 0.063 +448 I 0.063 +449 N 0.060 +450 E 0.055 +451 R 0.051 +452 Q 0.054 +453 R 0.070 +454 L 0.099 +455 I 0.136 +456 N 0.178 +457 S 0.219 +458 R 0.264 +459 A 0.323 +460 Y 0.394 +461 T 0.465 +462 N 0.529 +463 G 0.575 +464 E 0.594 +465 S 0.590 +466 E 0.574 +467 V 0.552 +468 A 0.533 +469 I 0.528 +470 K 0.536 +471 I 0.553 +472 P 0.574 +473 I 0.602 +474 K 0.643 +475 H 0.691 +476 T 0.725 +477 V 0.739 +478 E 0.742 +479 N 0.739 +480 G 0.725 +481 T 0.710 +482 G 0.708 +483 P 0.717 +484 S 0.726 +485 S 0.736 +486 A 0.751 +487 P 0.770 +488 D 0.789 +489 R 0.801 +490 G 0.806 +491 V 0.803 +492 N 0.795 +493 G 0.782 +494 T 0.761 +495 R 0.722 +496 R 0.669 +497 D 0.636 +498 D 0.644 +499 I 0.647 +500 V 0.615 +501 A 0.586 +502 E 0.592 +503 T 0.598 +504 D 0.574 +505 N 0.555 +506 E 0.580 +507 T 0.630 +508 E 0.666 +509 N 0.671 +510 E 0.640 +511 N 0.589 +512 E 0.563 +513 D 0.593 +514 N 0.645 +515 E 0.678 +516 N 0.688 +517 N 0.686 +518 E 0.678 +519 N 0.664 +520 D 0.644 +521 E 0.624 +522 E 0.610 +523 E 0.606 +524 E 0.613 +525 E 0.626 +526 D 0.636 +527 E 0.635 +528 D 0.618 +529 D 0.583 +530 D 0.535 +531 E 0.482 +532 G 0.432 +533 P 0.383 +534 Y 0.334 +535 T 0.289 +536 P 0.257 +537 F 0.240 +538 D 0.232 +539 P 0.221 +540 P 0.204 +541 S 0.185 +542 G 0.159 +543 K 0.126 +544 L 0.099 +545 E 0.090 +546 T 0.098 +547 V 0.113 +548 K 0.124 +549 W 0.126 +550 A 0.120 +551 F 0.121 +552 T 0.131 +553 W 0.135 +554 P 0.124 +555 L 0.108 +556 S 0.100 +557 F 0.099 +558 V 0.101 +559 L 0.105 +560 Y 0.106 +561 F 0.109 +562 T 0.126 +563 V 0.155 +564 P 0.179 +565 N 0.188 +566 C 0.182 +567 N 0.168 +568 K 0.157 +569 P 0.151 +570 H 0.146 +571 W 0.132 +572 E 0.107 +573 K 0.082 +574 W 0.066 +575 F 0.057 +576 M 0.055 +577 V 0.060 +578 T 0.069 +579 F 0.076 +580 A 0.080 +581 S 0.087 +582 S 0.092 +583 T 0.095 +584 L 0.098 +585 W 0.101 +586 I 0.097 +587 A 0.084 +588 A 0.070 +589 F 0.063 +590 S 0.062 +591 Y 0.064 +592 M 0.068 +593 M 0.071 +594 V 0.070 +595 W 0.065 +596 M 0.059 +597 V 0.055 +598 T 0.055 +599 I 0.061 +600 I 0.070 +601 G 0.078 +602 Y 0.086 +603 T 0.103 +604 L 0.132 +605 G 0.159 +606 I 0.163 +607 P 0.142 +608 D 0.117 +609 V 0.102 +610 I 0.092 +611 M 0.080 +612 G 0.067 +613 I 0.061 +614 T 0.063 +615 F 0.070 +616 L 0.081 +617 A 0.091 +618 A 0.097 +619 G 0.096 +620 T 0.096 +621 S 0.103 +622 V 0.111 +623 P 0.115 +624 D 0.110 +625 C 0.098 +626 M 0.083 +627 A 0.072 +628 S 0.065 +629 L 0.062 +630 I 0.064 +631 V 0.073 +632 A 0.086 +633 R 0.100 +634 Q 0.120 +635 G 0.140 +636 M 0.146 +637 G 0.137 +638 D 0.124 +639 M 0.118 +640 A 0.115 +641 V 0.112 +642 S 0.112 +643 N 0.119 +644 S 0.127 +645 I 0.134 +646 G 0.145 +647 S 0.159 +648 N 0.160 +649 V 0.141 +650 F 0.112 +651 D 0.089 +652 I 0.074 +653 L 0.066 +654 I 0.061 +655 G 0.057 +656 L 0.053 +657 G 0.051 +658 L 0.049 +659 P 0.047 +660 W 0.043 +661 A 0.039 +662 L 0.038 +663 Q 0.040 +664 T 0.045 +665 L 0.055 +666 A 0.073 +667 V 0.096 +668 D 0.123 +669 Y 0.150 +670 G 0.169 +671 S 0.179 +672 Y 0.178 +673 I 0.170 +674 R 0.163 +675 L 0.164 +676 N 0.169 +677 S 0.169 +678 R 0.155 +679 G 0.127 +680 L 0.093 +681 I 0.068 +682 Y 0.059 +683 S 0.066 +684 V 0.081 +685 G 0.095 +686 L 0.104 +687 L 0.107 +688 L 0.103 +689 A 0.095 +690 S 0.084 +691 V 0.071 +692 F 0.060 +693 V 0.055 +694 T 0.057 +695 V 0.062 +696 F 0.068 +697 G 0.074 +698 V 0.076 +699 H 0.077 +700 L 0.079 +701 N 0.083 +702 K 0.089 +703 W 0.096 +704 Q 0.100 +705 L 0.095 +706 D 0.080 +707 K 0.062 +708 K 0.055 +709 L 0.059 +710 G 0.068 +711 C 0.079 +712 G 0.091 +713 C 0.099 +714 L 0.096 +715 F 0.086 +716 L 0.077 +717 Y 0.070 +718 G 0.062 +719 V 0.057 +720 F 0.056 +721 L 0.055 +722 C 0.052 +723 F 0.051 +724 S 0.053 +725 I 0.056 +726 M 0.059 +727 T 0.068 +728 E 0.078 +729 F 0.085 +730 N 0.088 +731 V 0.094 +732 F 0.108 +733 T 0.129 +734 F 0.156 +735 V 0.189 +736 N 0.218 +737 L 0.235 +738 P 0.243 +739 M 0.258 +740 C 0.292 +741 G 0.334 +742 D 0.364 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000063935.4_ENSMUST00000073528.4_GN:Zar1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000063935.4_ENSMUST00000073528.4_GN:Zar1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..30458468e8e6c04fbf5eda2aaa39c39828f41a3c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000063935.4_ENSMUST00000073528.4_GN:Zar1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,362 @@ +>ENSMUSG00000063935.4|ENSMUST00000073528.4|GN:Zar1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.471 +2 F 0.524 +3 P 0.599 +4 A 0.661 +5 S 0.690 +6 T 0.687 +7 F 0.668 +8 H 0.648 +9 P 0.629 +10 C 0.616 +11 P 0.616 +12 H 0.636 +13 P 0.671 +14 Y 0.718 +15 P 0.767 +16 Q 0.803 +17 A 0.821 +18 T 0.825 +19 K 0.824 +20 A 0.824 +21 G 0.826 +22 D 0.826 +23 G 0.825 +24 W 0.825 +25 R 0.829 +26 F 0.835 +27 G 0.837 +28 A 0.833 +29 R 0.824 +30 G 0.806 +31 C 0.780 +32 R 0.756 +33 P 0.740 +34 A 0.735 +35 P 0.738 +36 P 0.744 +37 S 0.748 +38 F 0.746 +39 L 0.741 +40 P 0.737 +41 G 0.731 +42 Y 0.722 +43 R 0.714 +44 Q 0.713 +45 L 0.716 +46 M 0.717 +47 A 0.713 +48 A 0.705 +49 E 0.690 +50 Y 0.653 +51 V 0.587 +52 D 0.512 +53 S 0.445 +54 H 0.383 +55 Q 0.322 +56 R 0.280 +57 A 0.273 +58 Q 0.297 +59 L 0.322 +60 M 0.329 +61 A 0.329 +62 L 0.345 +63 L 0.373 +64 S 0.397 +65 R 0.417 +66 M 0.451 +67 G 0.521 +68 P 0.623 +69 R 0.718 +70 S 0.776 +71 V 0.797 +72 S 0.804 +73 S 0.817 +74 R 0.838 +75 D 0.861 +76 A 0.877 +77 A 0.880 +78 V 0.872 +79 Q 0.856 +80 V 0.838 +81 N 0.825 +82 P 0.823 +83 R 0.832 +84 R 0.851 +85 D 0.871 +86 A 0.885 +87 S 0.890 +88 V 0.886 +89 Q 0.877 +90 C 0.868 +91 S 0.864 +92 L 0.865 +93 G 0.867 +94 R 0.866 +95 R 0.863 +96 T 0.855 +97 L 0.845 +98 Q 0.838 +99 P 0.840 +100 A 0.852 +101 G 0.861 +102 C 0.863 +103 R 0.856 +104 A 0.844 +105 S 0.832 +106 P 0.830 +107 D 0.838 +108 A 0.849 +109 R 0.858 +110 S 0.861 +111 G 0.858 +112 S 0.845 +113 C 0.829 +114 Q 0.818 +115 P 0.822 +116 R 0.836 +117 G 0.850 +118 H 0.857 +119 A 0.860 +120 G 0.857 +121 A 0.847 +122 G 0.828 +123 R 0.805 +124 S 0.790 +125 P 0.791 +126 R 0.799 +127 S 0.802 +128 W 0.803 +129 Q 0.807 +130 T 0.811 +131 V 0.807 +132 A 0.804 +133 P 0.809 +134 F 0.822 +135 S 0.833 +136 S 0.835 +137 V 0.831 +138 T 0.824 +139 F 0.820 +140 C 0.820 +141 G 0.824 +142 L 0.831 +143 S 0.837 +144 S 0.843 +145 S 0.846 +146 L 0.849 +147 E 0.853 +148 V 0.859 +149 A 0.862 +150 G 0.861 +151 G 0.858 +152 R 0.853 +153 Q 0.848 +154 T 0.846 +155 P 0.848 +156 T 0.855 +157 K 0.860 +158 G 0.859 +159 E 0.850 +160 G 0.834 +161 S 0.807 +162 P 0.760 +163 A 0.699 +164 S 0.670 +165 S 0.703 +166 G 0.759 +167 T 0.787 +168 R 0.779 +169 E 0.758 +170 P 0.746 +171 E 0.747 +172 P 0.745 +173 R 0.716 +174 E 0.664 +175 V 0.636 +176 A 0.664 +177 A 0.711 +178 R 0.731 +179 K 0.730 +180 A 0.735 +181 V 0.749 +182 P 0.767 +183 Q 0.790 +184 P 0.815 +185 R 0.836 +186 S 0.848 +187 E 0.853 +188 E 0.854 +189 G 0.854 +190 D 0.850 +191 V 0.830 +192 Q 0.778 +193 A 0.706 +194 A 0.667 +195 G 0.698 +196 Q 0.762 +197 A 0.802 +198 G 0.807 +199 W 0.794 +200 E 0.773 +201 Q 0.745 +202 Q 0.717 +203 P 0.708 +204 P 0.727 +205 P 0.760 +206 E 0.788 +207 D 0.803 +208 R 0.804 +209 N 0.786 +210 S 0.740 +211 V 0.678 +212 A 0.650 +213 A 0.687 +214 M 0.749 +215 Q 0.784 +216 S 0.794 +217 E 0.801 +218 P 0.812 +219 G 0.818 +220 S 0.810 +221 E 0.787 +222 E 0.759 +223 P 0.735 +224 C 0.715 +225 P 0.685 +226 A 0.643 +227 A 0.622 +228 E 0.642 +229 M 0.658 +230 A 0.634 +231 Q 0.615 +232 D 0.650 +233 P 0.717 +234 G 0.764 +235 D 0.774 +236 S 0.760 +237 D 0.740 +238 A 0.730 +239 P 0.737 +240 R 0.750 +241 D 0.753 +242 Q 0.739 +243 A 0.718 +244 S 0.703 +245 P 0.697 +246 Q 0.687 +247 S 0.659 +248 T 0.618 +249 E 0.573 +250 Q 0.525 +251 D 0.467 +252 K 0.397 +253 E 0.323 +254 R 0.251 +255 L 0.192 +256 R 0.152 +257 F 0.130 +258 Q 0.120 +259 F 0.119 +260 L 0.121 +261 E 0.117 +262 Q 0.103 +263 K 0.081 +264 Y 0.059 +265 G 0.044 +266 Y 0.035 +267 Y 0.030 +268 H 0.029 +269 C 0.029 +270 K 0.034 +271 D 0.044 +272 C 0.058 +273 K 0.074 +274 I 0.089 +275 R 0.099 +276 W 0.102 +277 E 0.097 +278 S 0.093 +279 A 0.092 +280 Y 0.092 +281 V 0.093 +282 W 0.094 +283 C 0.095 +284 V 0.096 +285 Q 0.099 +286 G 0.102 +287 T 0.102 +288 S 0.100 +289 K 0.097 +290 V 0.093 +291 Y 0.086 +292 F 0.078 +293 K 0.067 +294 Q 0.053 +295 F 0.042 +296 C 0.036 +297 R 0.036 +298 V 0.038 +299 C 0.041 +300 E 0.043 +301 K 0.044 +302 S 0.044 +303 Y 0.043 +304 N 0.045 +305 P 0.051 +306 Y 0.063 +307 R 0.083 +308 V 0.110 +309 E 0.128 +310 D 0.126 +311 I 0.103 +312 T 0.078 +313 C 0.063 +314 Q 0.061 +315 S 0.069 +316 C 0.084 +317 K 0.101 +318 R 0.121 +319 T 0.147 +320 R 0.174 +321 C 0.202 +322 A 0.230 +323 C 0.255 +324 P 0.272 +325 V 0.279 +326 R 0.282 +327 L 0.288 +328 R 0.291 +329 H 0.288 +330 V 0.280 +331 D 0.277 +332 P 0.281 +333 K 0.292 +334 R 0.302 +335 P 0.301 +336 H 0.288 +337 R 0.264 +338 Q 0.230 +339 D 0.194 +340 L 0.162 +341 C 0.136 +342 G 0.122 +343 R 0.123 +344 C 0.141 +345 K 0.169 +346 D 0.203 +347 K 0.250 +348 R 0.313 +349 L 0.369 +350 S 0.392 +351 C 0.384 +352 D 0.366 +353 S 0.352 +354 T 0.342 +355 F 0.340 +356 S 0.350 +357 F 0.373 +358 K 0.400 +359 Y 0.410 +360 I 0.390 +361 I 0.362 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000063935.4_ENSMUST00000073528.4_GN:Zar1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000063935.4_ENSMUST00000073528.4_GN:Zar1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..330406d1cdfe4eea0f67e76f30386216de7d42c0 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000063935.4_ENSMUST00000073528.4_GN:Zar1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid @@ -0,0 +1,374 @@ +>ENSMUSG00000063935.4|ENSMUST00000073528.4|GN:Zar1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:12 +1 M 0.545 +2 A 0.594 +3 A 0.658 +4 W 0.710 +5 A 0.743 +6 G 0.760 +7 E 0.765 +8 A 0.764 +9 R 0.758 +10 D 0.750 +11 A 0.744 +12 P 0.744 +13 M 0.751 +14 F 0.764 +15 P 0.780 +16 A 0.789 +17 S 0.780 +18 T 0.752 +19 F 0.716 +20 H 0.688 +21 P 0.673 +22 C 0.668 +23 P 0.672 +24 H 0.690 +25 P 0.721 +26 Y 0.761 +27 P 0.799 +28 Q 0.828 +29 A 0.843 +30 T 0.847 +31 K 0.846 +32 A 0.845 +33 G 0.844 +34 D 0.843 +35 G 0.840 +36 W 0.837 +37 R 0.839 +38 F 0.844 +39 G 0.848 +40 A 0.846 +41 R 0.838 +42 G 0.822 +43 C 0.796 +44 R 0.769 +45 P 0.749 +46 A 0.740 +47 P 0.740 +48 P 0.745 +49 S 0.750 +50 F 0.751 +51 L 0.749 +52 P 0.746 +53 G 0.743 +54 Y 0.738 +55 R 0.734 +56 Q 0.732 +57 L 0.736 +58 M 0.738 +59 A 0.733 +60 A 0.720 +61 E 0.699 +62 Y 0.662 +63 V 0.604 +64 D 0.536 +65 S 0.473 +66 H 0.408 +67 Q 0.340 +68 R 0.290 +69 A 0.279 +70 Q 0.302 +71 L 0.328 +72 M 0.333 +73 A 0.326 +74 L 0.332 +75 L 0.350 +76 S 0.368 +77 R 0.385 +78 M 0.422 +79 G 0.498 +80 P 0.606 +81 R 0.704 +82 S 0.761 +83 V 0.781 +84 S 0.787 +85 S 0.800 +86 R 0.823 +87 D 0.848 +88 A 0.867 +89 A 0.872 +90 V 0.865 +91 Q 0.849 +92 V 0.830 +93 N 0.816 +94 P 0.812 +95 R 0.822 +96 R 0.841 +97 D 0.863 +98 A 0.880 +99 S 0.886 +100 V 0.882 +101 Q 0.872 +102 C 0.862 +103 S 0.858 +104 L 0.860 +105 G 0.861 +106 R 0.859 +107 R 0.854 +108 T 0.846 +109 L 0.834 +110 Q 0.826 +111 P 0.829 +112 A 0.841 +113 G 0.852 +114 C 0.853 +115 R 0.845 +116 A 0.833 +117 S 0.822 +118 P 0.822 +119 D 0.831 +120 A 0.843 +121 R 0.853 +122 S 0.859 +123 G 0.858 +124 S 0.848 +125 C 0.832 +126 Q 0.822 +127 P 0.825 +128 R 0.839 +129 G 0.852 +130 H 0.860 +131 A 0.862 +132 G 0.859 +133 A 0.850 +134 G 0.832 +135 R 0.810 +136 S 0.796 +137 P 0.798 +138 R 0.807 +139 S 0.811 +140 W 0.812 +141 Q 0.816 +142 T 0.819 +143 V 0.814 +144 A 0.809 +145 P 0.813 +146 F 0.825 +147 S 0.836 +148 S 0.838 +149 V 0.834 +150 T 0.828 +151 F 0.824 +152 C 0.824 +153 G 0.828 +154 L 0.833 +155 S 0.839 +156 S 0.844 +157 S 0.848 +158 L 0.851 +159 E 0.856 +160 V 0.861 +161 A 0.864 +162 G 0.863 +163 G 0.860 +164 R 0.855 +165 Q 0.850 +166 T 0.847 +167 P 0.850 +168 T 0.856 +169 K 0.862 +170 G 0.860 +171 E 0.851 +172 G 0.834 +173 S 0.807 +174 P 0.760 +175 A 0.699 +176 S 0.670 +177 S 0.702 +178 G 0.758 +179 T 0.785 +180 R 0.777 +181 E 0.758 +182 P 0.746 +183 E 0.747 +184 P 0.745 +185 R 0.716 +186 E 0.664 +187 V 0.637 +188 A 0.667 +189 A 0.720 +190 R 0.748 +191 K 0.752 +192 A 0.752 +193 V 0.758 +194 P 0.770 +195 Q 0.790 +196 P 0.814 +197 R 0.834 +198 S 0.846 +199 E 0.849 +200 E 0.850 +201 G 0.850 +202 D 0.846 +203 V 0.825 +204 Q 0.773 +205 A 0.702 +206 A 0.664 +207 G 0.695 +208 Q 0.759 +209 A 0.798 +210 G 0.802 +211 W 0.787 +212 E 0.765 +213 Q 0.737 +214 Q 0.710 +215 P 0.703 +216 P 0.722 +217 P 0.755 +218 E 0.783 +219 D 0.797 +220 R 0.797 +221 N 0.779 +222 S 0.733 +223 V 0.672 +224 A 0.644 +225 A 0.681 +226 M 0.742 +227 Q 0.778 +228 S 0.788 +229 E 0.795 +230 P 0.806 +231 G 0.812 +232 S 0.804 +233 E 0.782 +234 E 0.754 +235 P 0.730 +236 C 0.711 +237 P 0.681 +238 A 0.639 +239 A 0.619 +240 E 0.639 +241 M 0.654 +242 A 0.631 +243 Q 0.611 +244 D 0.647 +245 P 0.714 +246 G 0.760 +247 D 0.771 +248 S 0.756 +249 D 0.735 +250 A 0.724 +251 P 0.731 +252 R 0.745 +253 D 0.748 +254 Q 0.733 +255 A 0.711 +256 S 0.696 +257 P 0.689 +258 Q 0.677 +259 S 0.648 +260 T 0.605 +261 E 0.559 +262 Q 0.511 +263 D 0.453 +264 K 0.387 +265 E 0.315 +266 R 0.246 +267 L 0.189 +268 R 0.151 +269 F 0.130 +270 Q 0.121 +271 F 0.121 +272 L 0.123 +273 E 0.118 +274 Q 0.103 +275 K 0.081 +276 Y 0.059 +277 G 0.044 +278 Y 0.035 +279 Y 0.031 +280 H 0.029 +281 C 0.030 +282 K 0.035 +283 D 0.045 +284 C 0.060 +285 K 0.077 +286 I 0.093 +287 R 0.104 +288 W 0.105 +289 E 0.100 +290 S 0.096 +291 A 0.096 +292 Y 0.097 +293 V 0.098 +294 W 0.100 +295 C 0.101 +296 V 0.102 +297 Q 0.106 +298 G 0.108 +299 T 0.108 +300 S 0.106 +301 K 0.103 +302 V 0.099 +303 Y 0.092 +304 F 0.082 +305 K 0.070 +306 Q 0.056 +307 F 0.044 +308 C 0.038 +309 R 0.038 +310 V 0.040 +311 C 0.042 +312 E 0.044 +313 K 0.046 +314 S 0.045 +315 Y 0.045 +316 N 0.046 +317 P 0.052 +318 Y 0.063 +319 R 0.084 +320 V 0.110 +321 E 0.128 +322 D 0.125 +323 I 0.102 +324 T 0.077 +325 C 0.062 +326 Q 0.061 +327 S 0.069 +328 C 0.084 +329 K 0.100 +330 R 0.120 +331 T 0.144 +332 R 0.171 +333 C 0.197 +334 A 0.225 +335 C 0.249 +336 P 0.265 +337 V 0.271 +338 R 0.273 +339 L 0.278 +340 R 0.282 +341 H 0.278 +342 V 0.271 +343 D 0.268 +344 P 0.273 +345 K 0.284 +346 R 0.295 +347 P 0.295 +348 H 0.282 +349 R 0.259 +350 Q 0.227 +351 D 0.192 +352 L 0.161 +353 C 0.136 +354 G 0.121 +355 R 0.122 +356 C 0.140 +357 K 0.168 +358 D 0.202 +359 K 0.247 +360 R 0.307 +361 L 0.362 +362 S 0.386 +363 C 0.379 +364 D 0.362 +365 S 0.347 +366 T 0.336 +367 F 0.333 +368 S 0.342 +369 F 0.365 +370 K 0.391 +371 Y 0.401 +372 I 0.383 +373 I 0.358 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000066512.4_ENSMUST00000074359.4_GN:Klk1b5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000066512.4_ENSMUST00000074359.4_GN:Klk1b5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0fbdc3c3fe993d08baefa87a0038ca9ae60d6829 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000066512.4_ENSMUST00000074359.4_GN:Klk1b5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,262 @@ +>ENSMUSG00000066512.4|ENSMUST00000074359.4|GN:Klk1b5|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.309 +2 W 0.303 +3 F 0.301 +4 L 0.302 +5 I 0.292 +6 L 0.276 +7 F 0.285 +8 L 0.317 +9 A 0.349 +10 L 0.383 +11 S 0.438 +12 L 0.502 +13 G 0.550 +14 G 0.577 +15 I 0.591 +16 D 0.597 +17 A 0.589 +18 A 0.567 +19 P 0.537 +20 P 0.500 +21 V 0.453 +22 Q 0.395 +23 S 0.337 +24 R 0.287 +25 I 0.243 +26 F 0.201 +27 G 0.167 +28 G 0.144 +29 F 0.132 +30 N 0.127 +31 C 0.125 +32 E 0.125 +33 K 0.123 +34 N 0.115 +35 S 0.099 +36 Q 0.076 +37 P 0.055 +38 W 0.038 +39 Q 0.028 +40 V 0.023 +41 A 0.024 +42 V 0.029 +43 Y 0.034 +44 R 0.037 +45 F 0.036 +46 T 0.034 +47 K 0.033 +48 Y 0.030 +49 Q 0.025 +50 C 0.021 +51 G 0.020 +52 G 0.027 +53 V 0.040 +54 L 0.053 +55 L 0.057 +56 N 0.052 +57 A 0.042 +58 N 0.032 +59 W 0.025 +60 V 0.021 +61 L 0.018 +62 T 0.018 +63 A 0.021 +64 A 0.028 +65 H 0.040 +66 C 0.055 +67 H 0.070 +68 N 0.080 +69 D 0.078 +70 K 0.062 +71 Y 0.043 +72 Q 0.031 +73 V 0.026 +74 W 0.026 +75 L 0.029 +76 G 0.032 +77 K 0.035 +78 N 0.037 +79 N 0.039 +80 F 0.042 +81 F 0.047 +82 E 0.056 +83 D 0.066 +84 E 0.072 +85 P 0.071 +86 S 0.064 +87 A 0.053 +88 Q 0.041 +89 H 0.032 +90 R 0.026 +91 L 0.023 +92 V 0.022 +93 S 0.023 +94 K 0.028 +95 A 0.039 +96 I 0.055 +97 P 0.072 +98 H 0.082 +99 P 0.087 +100 D 0.093 +101 F 0.103 +102 N 0.119 +103 M 0.142 +104 S 0.179 +105 L 0.224 +106 L 0.262 +107 N 0.282 +108 E 0.287 +109 H 0.286 +110 T 0.281 +111 P 0.272 +112 Q 0.267 +113 P 0.268 +114 E 0.271 +115 D 0.271 +116 D 0.265 +117 Y 0.249 +118 S 0.212 +119 N 0.157 +120 D 0.099 +121 L 0.056 +122 M 0.033 +123 L 0.025 +124 L 0.025 +125 R 0.030 +126 L 0.039 +127 K 0.049 +128 K 0.060 +129 P 0.070 +130 A 0.081 +131 D 0.090 +132 I 0.094 +133 T 0.089 +134 D 0.077 +135 V 0.062 +136 V 0.050 +137 K 0.045 +138 P 0.046 +139 I 0.049 +140 D 0.049 +141 L 0.046 +142 P 0.043 +143 T 0.041 +144 E 0.043 +145 E 0.046 +146 P 0.049 +147 K 0.050 +148 L 0.050 +149 G 0.047 +150 S 0.042 +151 T 0.034 +152 C 0.027 +153 L 0.024 +154 A 0.026 +155 S 0.031 +156 G 0.039 +157 W 0.053 +158 G 0.069 +159 S 0.083 +160 I 0.090 +161 T 0.094 +162 P 0.097 +163 V 0.103 +164 I 0.115 +165 Y 0.133 +166 E 0.147 +167 P 0.149 +168 A 0.134 +169 D 0.112 +170 D 0.094 +171 L 0.080 +172 Q 0.068 +173 C 0.058 +174 V 0.049 +175 N 0.041 +176 F 0.038 +177 K 0.042 +178 L 0.051 +179 L 0.059 +180 P 0.059 +181 N 0.054 +182 E 0.048 +183 D 0.044 +184 C 0.044 +185 V 0.050 +186 K 0.062 +187 A 0.076 +188 H 0.088 +189 I 0.098 +190 E 0.107 +191 K 0.112 +192 V 0.105 +193 T 0.085 +194 D 0.062 +195 V 0.044 +196 M 0.033 +197 L 0.030 +198 C 0.035 +199 A 0.048 +200 G 0.064 +201 D 0.080 +202 M 0.097 +203 D 0.110 +204 G 0.115 +205 G 0.108 +206 K 0.094 +207 D 0.079 +208 T 0.066 +209 C 0.059 +210 M 0.059 +211 G 0.066 +212 D 0.071 +213 S 0.070 +214 G 0.067 +215 G 0.067 +216 P 0.066 +217 L 0.062 +218 I 0.057 +219 C 0.058 +220 D 0.066 +221 G 0.073 +222 V 0.071 +223 L 0.063 +224 H 0.055 +225 G 0.052 +226 I 0.051 +227 T 0.050 +228 S 0.054 +229 W 0.063 +230 G 0.070 +231 P 0.067 +232 S 0.056 +233 P 0.053 +234 C 0.064 +235 G 0.084 +236 K 0.102 +237 P 0.110 +238 N 0.104 +239 V 0.086 +240 P 0.066 +241 G 0.053 +242 I 0.047 +243 Y 0.046 +244 T 0.051 +245 K 0.061 +246 L 0.069 +247 I 0.070 +248 K 0.065 +249 F 0.063 +250 N 0.066 +251 S 0.067 +252 W 0.063 +253 I 0.064 +254 K 0.072 +255 D 0.078 +256 T 0.079 +257 I 0.085 +258 A 0.106 +259 K 0.135 +260 N 0.163 +261 A 0.180 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000066512.4_ENSMUST00000074359.4_GN:Klk1b5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:26.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000066512.4_ENSMUST00000074359.4_GN:Klk1b5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:26.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..3703b3d05aeb78799510a4d738b4ac18aef67187 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000066512.4_ENSMUST00000074359.4_GN:Klk1b5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:26.caid @@ -0,0 +1,288 @@ +>ENSMUSG00000066512.4|ENSMUST00000074359.4|GN:Klk1b5|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:26 +1 M 0.340 +2 R 0.352 +3 V 0.373 +4 F 0.396 +5 K 0.410 +6 V 0.409 +7 S 0.391 +8 L 0.357 +9 R 0.330 +10 S 0.346 +11 L 0.393 +12 N 0.427 +13 S 0.448 +14 S 0.483 +15 K 0.512 +16 L 0.510 +17 T 0.506 +18 A 0.532 +19 C 0.572 +20 S 0.602 +21 S 0.612 +22 W 0.596 +23 T 0.553 +24 A 0.510 +25 V 0.491 +26 T 0.467 +27 M 0.415 +28 W 0.361 +29 F 0.337 +30 L 0.330 +31 I 0.321 +32 L 0.321 +33 F 0.345 +34 L 0.385 +35 A 0.421 +36 L 0.457 +37 S 0.501 +38 L 0.553 +39 G 0.599 +40 G 0.628 +41 I 0.638 +42 D 0.632 +43 A 0.610 +44 A 0.573 +45 P 0.529 +46 P 0.484 +47 V 0.435 +48 Q 0.379 +49 S 0.322 +50 R 0.274 +51 I 0.233 +52 F 0.196 +53 G 0.165 +54 G 0.144 +55 F 0.133 +56 N 0.130 +57 C 0.130 +58 E 0.131 +59 K 0.127 +60 N 0.117 +61 S 0.099 +62 Q 0.076 +63 P 0.054 +64 W 0.038 +65 Q 0.028 +66 V 0.023 +67 A 0.023 +68 V 0.028 +69 Y 0.033 +70 R 0.035 +71 F 0.033 +72 T 0.031 +73 K 0.029 +74 Y 0.026 +75 Q 0.022 +76 C 0.018 +77 G 0.018 +78 G 0.025 +79 V 0.037 +80 L 0.049 +81 L 0.054 +82 N 0.049 +83 A 0.040 +84 N 0.031 +85 W 0.024 +86 V 0.020 +87 L 0.018 +88 T 0.017 +89 A 0.020 +90 A 0.027 +91 H 0.037 +92 C 0.051 +93 H 0.065 +94 N 0.074 +95 D 0.072 +96 K 0.058 +97 Y 0.041 +98 Q 0.030 +99 V 0.025 +100 W 0.025 +101 L 0.028 +102 G 0.031 +103 K 0.033 +104 N 0.034 +105 N 0.036 +106 F 0.038 +107 F 0.044 +108 E 0.054 +109 D 0.064 +110 E 0.070 +111 P 0.070 +112 S 0.063 +113 A 0.053 +114 Q 0.041 +115 H 0.032 +116 R 0.026 +117 L 0.023 +118 V 0.022 +119 S 0.023 +120 K 0.028 +121 A 0.039 +122 I 0.056 +123 P 0.073 +124 H 0.083 +125 P 0.088 +126 D 0.095 +127 F 0.106 +128 N 0.122 +129 M 0.144 +130 S 0.179 +131 L 0.222 +132 L 0.260 +133 N 0.281 +134 E 0.288 +135 H 0.289 +136 T 0.286 +137 P 0.280 +138 Q 0.274 +139 P 0.275 +140 E 0.278 +141 D 0.279 +142 D 0.274 +143 Y 0.257 +144 S 0.219 +145 N 0.161 +146 D 0.102 +147 L 0.058 +148 M 0.034 +149 L 0.025 +150 L 0.025 +151 R 0.030 +152 L 0.039 +153 K 0.049 +154 K 0.060 +155 P 0.072 +156 A 0.084 +157 D 0.093 +158 I 0.096 +159 T 0.091 +160 D 0.078 +161 V 0.063 +162 V 0.051 +163 K 0.046 +164 P 0.046 +165 I 0.049 +166 D 0.049 +167 L 0.047 +168 P 0.043 +169 T 0.041 +170 E 0.042 +171 E 0.046 +172 P 0.049 +173 K 0.050 +174 L 0.049 +175 G 0.047 +176 S 0.041 +177 T 0.033 +178 C 0.027 +179 L 0.024 +180 A 0.026 +181 S 0.031 +182 G 0.039 +183 W 0.052 +184 G 0.069 +185 S 0.082 +186 I 0.090 +187 T 0.093 +188 P 0.096 +189 V 0.101 +190 I 0.112 +191 Y 0.127 +192 E 0.141 +193 P 0.144 +194 A 0.131 +195 D 0.111 +196 D 0.094 +197 L 0.081 +198 Q 0.069 +199 C 0.058 +200 V 0.049 +201 N 0.041 +202 F 0.037 +203 K 0.041 +204 L 0.050 +205 L 0.058 +206 P 0.058 +207 N 0.052 +208 E 0.047 +209 D 0.043 +210 C 0.042 +211 V 0.047 +212 K 0.059 +213 A 0.073 +214 H 0.085 +215 I 0.094 +216 E 0.103 +217 K 0.108 +218 V 0.102 +219 T 0.083 +220 D 0.060 +221 V 0.043 +222 M 0.033 +223 L 0.030 +224 C 0.036 +225 A 0.048 +226 G 0.064 +227 D 0.080 +228 M 0.097 +229 D 0.110 +230 G 0.114 +231 G 0.107 +232 K 0.093 +233 D 0.078 +234 T 0.066 +235 C 0.058 +236 M 0.058 +237 G 0.064 +238 D 0.070 +239 S 0.070 +240 G 0.067 +241 G 0.067 +242 P 0.066 +243 L 0.062 +244 I 0.056 +245 C 0.057 +246 D 0.065 +247 G 0.072 +248 V 0.071 +249 L 0.063 +250 H 0.056 +251 G 0.053 +252 I 0.052 +253 T 0.051 +254 S 0.054 +255 W 0.064 +256 G 0.072 +257 P 0.068 +258 S 0.058 +259 P 0.055 +260 C 0.066 +261 G 0.086 +262 K 0.104 +263 P 0.113 +264 N 0.107 +265 V 0.089 +266 P 0.069 +267 G 0.055 +268 I 0.048 +269 Y 0.047 +270 T 0.052 +271 K 0.062 +272 L 0.071 +273 I 0.071 +274 K 0.066 +275 F 0.063 +276 N 0.066 +277 S 0.066 +278 W 0.063 +279 I 0.063 +280 K 0.072 +281 D 0.079 +282 T 0.080 +283 I 0.085 +284 A 0.105 +285 K 0.135 +286 N 0.164 +287 A 0.181 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000066735.9_ENSMUST00000051758.11_GN:Vkorc1l1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000066735.9_ENSMUST00000051758.11_GN:Vkorc1l1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..07c14cdd50353d3bbe33d4dfcd7db3d360f7f863 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000066735.9_ENSMUST00000051758.11_GN:Vkorc1l1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,177 @@ +>ENSMUSG00000066735.9|ENSMUST00000051758.11|GN:Vkorc1l1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.429 +2 A 0.441 +3 A 0.456 +4 P 0.463 +5 V 0.455 +6 L 0.428 +7 L 0.381 +8 R 0.325 +9 V 0.270 +10 S 0.218 +11 V 0.166 +12 P 0.116 +13 R 0.078 +14 W 0.057 +15 E 0.049 +16 R 0.048 +17 V 0.050 +18 A 0.052 +19 R 0.055 +20 Y 0.057 +21 A 0.058 +22 V 0.055 +23 C 0.053 +24 A 0.057 +25 A 0.064 +26 G 0.071 +27 I 0.076 +28 L 0.078 +29 L 0.071 +30 S 0.062 +31 I 0.057 +32 Y 0.057 +33 A 0.059 +34 Y 0.060 +35 H 0.061 +36 V 0.065 +37 E 0.073 +38 R 0.082 +39 E 0.091 +40 K 0.101 +41 E 0.118 +42 R 0.137 +43 D 0.154 +44 P 0.167 +45 E 0.180 +46 H 0.194 +47 R 0.200 +48 A 0.194 +49 L 0.183 +50 C 0.179 +51 D 0.179 +52 L 0.178 +53 G 0.172 +54 P 0.161 +55 W 0.146 +56 V 0.128 +57 K 0.109 +58 C 0.096 +59 S 0.101 +60 A 0.121 +61 A 0.143 +62 L 0.150 +63 A 0.140 +64 S 0.126 +65 R 0.121 +66 W 0.130 +67 G 0.148 +68 R 0.164 +69 G 0.169 +70 F 0.166 +71 G 0.156 +72 L 0.144 +73 L 0.140 +74 G 0.149 +75 S 0.162 +76 I 0.177 +77 F 0.200 +78 G 0.227 +79 K 0.246 +80 D 0.243 +81 G 0.228 +82 V 0.218 +83 L 0.217 +84 N 0.212 +85 Q 0.195 +86 P 0.168 +87 N 0.140 +88 S 0.117 +89 V 0.107 +90 F 0.113 +91 G 0.121 +92 L 0.116 +93 I 0.101 +94 F 0.089 +95 Y 0.080 +96 I 0.072 +97 L 0.064 +98 Q 0.055 +99 L 0.047 +100 L 0.046 +101 L 0.053 +102 G 0.063 +103 M 0.070 +104 T 0.078 +105 A 0.084 +106 S 0.082 +107 A 0.070 +108 V 0.055 +109 A 0.046 +110 A 0.042 +111 L 0.040 +112 V 0.038 +113 L 0.038 +114 M 0.042 +115 T 0.048 +116 S 0.054 +117 S 0.057 +118 I 0.057 +119 V 0.059 +120 S 0.060 +121 V 0.058 +122 V 0.056 +123 G 0.057 +124 S 0.057 +125 L 0.056 +126 Y 0.056 +127 L 0.055 +128 A 0.052 +129 Y 0.051 +130 I 0.057 +131 L 0.064 +132 Y 0.069 +133 F 0.074 +134 V 0.081 +135 L 0.085 +136 K 0.083 +137 E 0.076 +138 F 0.064 +139 C 0.052 +140 I 0.046 +141 I 0.047 +142 C 0.051 +143 V 0.056 +144 T 0.064 +145 T 0.069 +146 Y 0.067 +147 V 0.058 +148 L 0.049 +149 N 0.042 +150 F 0.037 +151 L 0.034 +152 L 0.032 +153 L 0.029 +154 I 0.026 +155 I 0.024 +156 N 0.023 +157 Y 0.024 +158 K 0.026 +159 R 0.029 +160 L 0.033 +161 V 0.037 +162 Y 0.043 +163 L 0.052 +164 N 0.064 +165 E 0.075 +166 A 0.084 +167 W 0.094 +168 K 0.115 +169 R 0.149 +170 Q 0.195 +171 L 0.250 +172 Q 0.308 +173 P 0.360 +174 K 0.393 +175 E 0.398 +176 D 0.389 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000066735.9_ENSMUST00000051758.11_GN:Vkorc1l1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:47.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000066735.9_ENSMUST00000051758.11_GN:Vkorc1l1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:47.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9feb411a94a4cb2c0c7283307da9f58e0e8d4aca --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000066735.9_ENSMUST00000051758.11_GN:Vkorc1l1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:47.caid @@ -0,0 +1,224 @@ +>ENSMUSG00000066735.9|ENSMUST00000051758.11|GN:Vkorc1l1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:47 +1 M 0.414 +2 G 0.454 +3 R 0.507 +4 G 0.544 +5 G 0.543 +6 G 0.514 +7 G 0.498 +8 G 0.506 +9 G 0.512 +10 G 0.517 +11 G 0.540 +12 G 0.560 +13 G 0.553 +14 G 0.554 +15 G 0.597 +16 G 0.657 +17 G 0.695 +18 G 0.706 +19 S 0.704 +20 G 0.694 +21 G 0.672 +22 G 0.634 +23 W 0.596 +24 V 0.580 +25 G 0.588 +26 P 0.609 +27 R 0.630 +28 R 0.651 +29 A 0.668 +30 A 0.675 +31 A 0.673 +32 S 0.678 +33 E 0.693 +34 V 0.712 +35 E 0.726 +36 A 0.736 +37 E 0.744 +38 G 0.750 +39 G 0.755 +40 G 0.758 +41 G 0.759 +42 G 0.760 +43 G 0.760 +44 G 0.758 +45 G 0.753 +46 G 0.742 +47 K 0.725 +48 M 0.702 +49 A 0.674 +50 A 0.643 +51 P 0.612 +52 V 0.584 +53 L 0.543 +54 L 0.475 +55 R 0.386 +56 V 0.301 +57 S 0.229 +58 V 0.170 +59 P 0.118 +60 R 0.080 +61 W 0.059 +62 E 0.051 +63 R 0.048 +64 V 0.048 +65 A 0.047 +66 R 0.045 +67 Y 0.042 +68 A 0.040 +69 V 0.042 +70 C 0.048 +71 A 0.057 +72 A 0.062 +73 G 0.061 +74 I 0.056 +75 L 0.051 +76 L 0.050 +77 S 0.050 +78 I 0.051 +79 Y 0.055 +80 A 0.058 +81 Y 0.058 +82 H 0.058 +83 V 0.061 +84 E 0.069 +85 R 0.078 +86 E 0.087 +87 K 0.098 +88 E 0.114 +89 R 0.131 +90 D 0.146 +91 P 0.157 +92 E 0.168 +93 H 0.180 +94 R 0.184 +95 A 0.177 +96 L 0.166 +97 C 0.162 +98 D 0.162 +99 L 0.162 +100 G 0.158 +101 P 0.150 +102 W 0.138 +103 V 0.122 +104 K 0.104 +105 C 0.093 +106 S 0.099 +107 A 0.121 +108 A 0.144 +109 L 0.151 +110 A 0.139 +111 S 0.124 +112 R 0.120 +113 W 0.132 +114 G 0.152 +115 R 0.166 +116 G 0.171 +117 F 0.168 +118 G 0.158 +119 L 0.145 +120 L 0.139 +121 G 0.144 +122 S 0.155 +123 I 0.168 +124 F 0.189 +125 G 0.217 +126 K 0.236 +127 D 0.236 +128 G 0.225 +129 V 0.220 +130 L 0.223 +131 N 0.218 +132 Q 0.198 +133 P 0.169 +134 N 0.140 +135 S 0.117 +136 V 0.106 +137 F 0.111 +138 G 0.117 +139 L 0.111 +140 I 0.097 +141 F 0.085 +142 Y 0.078 +143 I 0.071 +144 L 0.063 +145 Q 0.055 +146 L 0.047 +147 L 0.046 +148 L 0.054 +149 G 0.063 +150 M 0.071 +151 T 0.081 +152 A 0.089 +153 S 0.087 +154 A 0.074 +155 V 0.058 +156 A 0.048 +157 A 0.043 +158 L 0.041 +159 V 0.038 +160 L 0.038 +161 M 0.042 +162 T 0.049 +163 S 0.056 +164 S 0.059 +165 I 0.060 +166 V 0.061 +167 S 0.062 +168 V 0.060 +169 V 0.059 +170 G 0.060 +171 S 0.060 +172 L 0.059 +173 Y 0.058 +174 L 0.057 +175 A 0.054 +176 Y 0.053 +177 I 0.058 +178 L 0.065 +179 Y 0.070 +180 F 0.074 +181 V 0.081 +182 L 0.086 +183 K 0.085 +184 E 0.078 +185 F 0.066 +186 C 0.053 +187 I 0.048 +188 I 0.049 +189 C 0.053 +190 V 0.058 +191 T 0.065 +192 T 0.070 +193 Y 0.068 +194 V 0.059 +195 L 0.049 +196 N 0.042 +197 F 0.038 +198 L 0.034 +199 L 0.032 +200 L 0.028 +201 I 0.024 +202 I 0.022 +203 N 0.022 +204 Y 0.023 +205 K 0.026 +206 R 0.030 +207 L 0.034 +208 V 0.037 +209 Y 0.041 +210 L 0.047 +211 N 0.055 +212 E 0.065 +213 A 0.076 +214 W 0.088 +215 K 0.106 +216 R 0.137 +217 Q 0.185 +218 L 0.247 +219 Q 0.312 +220 P 0.368 +221 K 0.402 +222 E 0.407 +223 D 0.397 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000067604.9_ENSMUST00000088029.8_GN:Nms_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000067604.9_ENSMUST00000088029.8_GN:Nms_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..50625f472ff0bce5bc1c4573cb75c5157d922915 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000067604.9_ENSMUST00000088029.8_GN:Nms_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,154 @@ +>ENSMUSG00000067604.9|ENSMUST00000088029.8|GN:Nms|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.481 +2 K 0.503 +3 H 0.534 +4 P 0.560 +5 L 0.567 +6 P 0.547 +7 H 0.497 +8 Y 0.419 +9 S 0.319 +10 P 0.218 +11 I 0.147 +12 L 0.118 +13 F 0.118 +14 I 0.123 +15 Y 0.123 +16 C 0.121 +17 F 0.131 +18 C 0.166 +19 M 0.236 +20 L 0.335 +21 Q 0.447 +22 I 0.556 +23 P 0.651 +24 S 0.723 +25 S 0.765 +26 G 0.774 +27 A 0.759 +28 S 0.740 +29 P 0.741 +30 P 0.766 +31 L 0.793 +32 A 0.797 +33 D 0.780 +34 S 0.764 +35 P 0.768 +36 D 0.787 +37 G 0.801 +38 L 0.796 +39 D 0.766 +40 I 0.699 +41 V 0.588 +42 D 0.456 +43 P 0.344 +44 E 0.270 +45 R 0.227 +46 L 0.204 +47 A 0.203 +48 Y 0.220 +49 F 0.253 +50 L 0.305 +51 K 0.380 +52 Q 0.469 +53 R 0.546 +54 E 0.598 +55 I 0.628 +56 H 0.651 +57 S 0.670 +58 N 0.678 +59 Q 0.682 +60 P 0.699 +61 K 0.726 +62 E 0.739 +63 N 0.721 +64 Q 0.685 +65 D 0.648 +66 V 0.605 +67 Y 0.557 +68 K 0.526 +69 R 0.525 +70 F 0.536 +71 L 0.540 +72 F 0.538 +73 H 0.549 +74 Y 0.580 +75 S 0.626 +76 R 0.667 +77 T 0.693 +78 R 0.704 +79 K 0.717 +80 P 0.737 +81 T 0.761 +82 H 0.788 +83 P 0.816 +84 V 0.835 +85 S 0.840 +86 A 0.832 +87 E 0.817 +88 F 0.794 +89 A 0.765 +90 P 0.726 +91 V 0.677 +92 H 0.626 +93 P 0.587 +94 L 0.557 +95 M 0.530 +96 R 0.509 +97 L 0.489 +98 A 0.451 +99 A 0.405 +100 K 0.393 +101 L 0.436 +102 A 0.502 +103 S 0.543 +104 R 0.555 +105 R 0.567 +106 M 0.594 +107 K 0.626 +108 R 0.650 +109 L 0.662 +110 P 0.673 +111 R 0.692 +112 L 0.713 +113 L 0.728 +114 R 0.734 +115 L 0.740 +116 D 0.749 +117 S 0.762 +118 R 0.777 +119 M 0.791 +120 A 0.798 +121 T 0.792 +122 V 0.771 +123 D 0.749 +124 F 0.736 +125 P 0.734 +126 K 0.734 +127 K 0.731 +128 D 0.729 +129 P 0.733 +130 T 0.748 +131 T 0.762 +132 S 0.764 +133 L 0.751 +134 G 0.734 +135 R 0.724 +136 P 0.724 +137 F 0.731 +138 F 0.737 +139 L 0.732 +140 F 0.720 +141 R 0.714 +142 P 0.727 +143 R 0.752 +144 N 0.774 +145 G 0.783 +146 R 0.784 +147 Y 0.781 +148 T 0.773 +149 D 0.757 +150 N 0.730 +151 N 0.682 +152 F 0.611 +153 Q 0.552 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000067604.9_ENSMUST00000088029.8_GN:Nms_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:21.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000067604.9_ENSMUST00000088029.8_GN:Nms_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:21.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9c8dc4515eb3f75f669be984503f3ef6476d419c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000067604.9_ENSMUST00000088029.8_GN:Nms_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:21.caid @@ -0,0 +1,175 @@ +>ENSMUSG00000067604.9|ENSMUST00000088029.8|GN:Nms|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:21 +1 M 0.392 +2 L 0.414 +3 I 0.446 +4 T 0.478 +5 S 0.493 +6 L 0.487 +7 N 0.472 +8 R 0.457 +9 T 0.434 +10 Y 0.396 +11 L 0.371 +12 W 0.386 +13 S 0.422 +14 A 0.449 +15 K 0.482 +16 R 0.548 +17 I 0.627 +18 Q 0.683 +19 S 0.703 +20 L 0.696 +21 K 0.671 +22 M 0.648 +23 K 0.641 +24 H 0.650 +25 P 0.666 +26 L 0.677 +27 P 0.670 +28 H 0.631 +29 Y 0.550 +30 S 0.433 +31 P 0.310 +32 I 0.221 +33 L 0.180 +34 F 0.172 +35 I 0.171 +36 Y 0.169 +37 C 0.167 +38 F 0.175 +39 C 0.206 +40 M 0.273 +41 L 0.372 +42 Q 0.483 +43 I 0.588 +44 P 0.676 +45 S 0.743 +46 S 0.783 +47 G 0.793 +48 A 0.781 +49 S 0.767 +50 P 0.770 +51 P 0.795 +52 L 0.820 +53 A 0.824 +54 D 0.807 +55 S 0.791 +56 P 0.794 +57 D 0.811 +58 G 0.822 +59 L 0.818 +60 D 0.791 +61 I 0.730 +62 V 0.625 +63 D 0.496 +64 P 0.383 +65 E 0.306 +66 R 0.257 +67 L 0.230 +68 A 0.228 +69 Y 0.252 +70 F 0.300 +71 L 0.369 +72 K 0.450 +73 Q 0.527 +74 R 0.585 +75 E 0.621 +76 I 0.643 +77 H 0.664 +78 S 0.681 +79 N 0.687 +80 Q 0.688 +81 P 0.701 +82 K 0.726 +83 E 0.737 +84 N 0.716 +85 Q 0.677 +86 D 0.640 +87 V 0.600 +88 Y 0.557 +89 K 0.527 +90 R 0.521 +91 F 0.523 +92 L 0.516 +93 F 0.509 +94 H 0.518 +95 Y 0.553 +96 S 0.605 +97 R 0.652 +98 T 0.681 +99 R 0.695 +100 K 0.709 +101 P 0.730 +102 T 0.755 +103 H 0.782 +104 P 0.810 +105 V 0.828 +106 S 0.832 +107 A 0.823 +108 E 0.805 +109 F 0.781 +110 A 0.748 +111 P 0.704 +112 V 0.644 +113 H 0.581 +114 P 0.531 +115 L 0.495 +116 M 0.469 +117 R 0.456 +118 L 0.450 +119 A 0.438 +120 A 0.420 +121 K 0.417 +122 L 0.437 +123 A 0.468 +124 S 0.489 +125 R 0.499 +126 R 0.518 +127 M 0.557 +128 K 0.603 +129 R 0.638 +130 L 0.658 +131 P 0.673 +132 R 0.694 +133 L 0.718 +134 L 0.734 +135 R 0.740 +136 L 0.745 +137 D 0.753 +138 S 0.766 +139 R 0.781 +140 M 0.796 +141 A 0.806 +142 T 0.802 +143 V 0.784 +144 D 0.761 +145 F 0.747 +146 P 0.742 +147 K 0.740 +148 K 0.738 +149 D 0.735 +150 P 0.740 +151 T 0.754 +152 T 0.769 +153 S 0.771 +154 L 0.760 +155 G 0.744 +156 R 0.734 +157 P 0.735 +158 F 0.741 +159 F 0.746 +160 L 0.740 +161 F 0.726 +162 R 0.720 +163 P 0.732 +164 R 0.757 +165 N 0.779 +166 G 0.789 +167 R 0.788 +168 Y 0.784 +169 T 0.775 +170 D 0.759 +171 N 0.732 +172 N 0.682 +173 F 0.607 +174 Q 0.545 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068082.14_ENSMUST00000094715.9_GN:Grxcr1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068082.14_ENSMUST00000094715.9_GN:Grxcr1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ecc1be90838c1e01fdf33788472f0b8aa2c44097 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068082.14_ENSMUST00000094715.9_GN:Grxcr1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,291 @@ +>ENSMUSG00000068082.14|ENSMUST00000094715.9|GN:Grxcr1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.392 +2 L 0.403 +3 R 0.436 +4 R 0.492 +5 E 0.547 +6 T 0.583 +7 K 0.609 +8 P 0.636 +9 E 0.657 +10 S 0.665 +11 D 0.664 +12 R 0.666 +13 P 0.681 +14 R 0.705 +15 K 0.730 +16 V 0.748 +17 R 0.756 +18 F 0.763 +19 R 0.771 +20 I 0.774 +21 A 0.766 +22 S 0.748 +23 S 0.729 +24 H 0.721 +25 S 0.726 +26 G 0.738 +27 R 0.748 +28 V 0.760 +29 L 0.771 +30 K 0.774 +31 E 0.769 +32 V 0.763 +33 Y 0.763 +34 E 0.767 +35 D 0.769 +36 G 0.764 +37 Q 0.756 +38 A 0.759 +39 P 0.777 +40 G 0.799 +41 S 0.811 +42 L 0.811 +43 D 0.803 +44 S 0.794 +45 E 0.786 +46 C 0.780 +47 A 0.774 +48 S 0.756 +49 I 0.712 +50 C 0.649 +51 A 0.620 +52 I 0.658 +53 D 0.726 +54 G 0.769 +55 L 0.770 +56 S 0.733 +57 D 0.672 +58 S 0.627 +59 E 0.616 +60 G 0.614 +61 Q 0.626 +62 Q 0.679 +63 N 0.751 +64 G 0.796 +65 H 0.798 +66 I 0.757 +67 G 0.691 +68 S 0.653 +69 E 0.680 +70 D 0.736 +71 N 0.771 +72 E 0.780 +73 Q 0.779 +74 E 0.780 +75 K 0.778 +76 D 0.773 +77 Q 0.763 +78 D 0.751 +79 N 0.737 +80 L 0.723 +81 L 0.714 +82 V 0.705 +83 L 0.690 +84 A 0.674 +85 R 0.672 +86 T 0.680 +87 A 0.681 +88 S 0.671 +89 E 0.661 +90 K 0.664 +91 A 0.677 +92 F 0.695 +93 G 0.714 +94 T 0.736 +95 R 0.760 +96 R 0.780 +97 V 0.790 +98 N 0.786 +99 I 0.770 +100 L 0.743 +101 S 0.719 +102 K 0.714 +103 N 0.731 +104 G 0.748 +105 T 0.757 +106 V 0.762 +107 R 0.766 +108 G 0.755 +109 V 0.724 +110 K 0.693 +111 Y 0.682 +112 K 0.682 +113 V 0.674 +114 S 0.653 +115 A 0.627 +116 G 0.598 +117 Q 0.562 +118 A 0.516 +119 L 0.463 +120 F 0.418 +121 N 0.389 +122 N 0.362 +123 L 0.329 +124 T 0.305 +125 K 0.308 +126 V 0.334 +127 L 0.367 +128 Q 0.398 +129 Q 0.420 +130 P 0.428 +131 S 0.418 +132 A 0.391 +133 D 0.350 +134 L 0.298 +135 E 0.237 +136 F 0.173 +137 D 0.114 +138 R 0.069 +139 V 0.042 +140 V 0.030 +141 I 0.027 +142 Y 0.029 +143 T 0.037 +144 T 0.053 +145 C 0.075 +146 L 0.098 +147 R 0.116 +148 V 0.124 +149 V 0.122 +150 R 0.115 +151 T 0.110 +152 T 0.107 +153 F 0.101 +154 E 0.089 +155 R 0.075 +156 C 0.062 +157 E 0.051 +158 L 0.047 +159 V 0.050 +160 R 0.057 +161 K 0.061 +162 I 0.055 +163 F 0.045 +164 Q 0.040 +165 N 0.042 +166 H 0.049 +167 R 0.055 +168 V 0.054 +169 K 0.044 +170 F 0.031 +171 E 0.023 +172 E 0.022 +173 K 0.026 +174 N 0.035 +175 I 0.044 +176 A 0.050 +177 L 0.050 +178 N 0.046 +179 G 0.039 +180 D 0.033 +181 Y 0.028 +182 G 0.026 +183 K 0.025 +184 E 0.027 +185 L 0.036 +186 D 0.050 +187 E 0.057 +188 R 0.053 +189 C 0.046 +190 R 0.045 +191 R 0.052 +192 V 0.070 +193 S 0.100 +194 E 0.135 +195 A 0.156 +196 P 0.146 +197 S 0.113 +198 L 0.079 +199 P 0.056 +200 V 0.043 +201 V 0.037 +202 F 0.035 +203 I 0.039 +204 D 0.046 +205 G 0.053 +206 H 0.055 +207 Y 0.054 +208 L 0.053 +209 G 0.052 +210 G 0.049 +211 A 0.044 +212 E 0.042 +213 K 0.044 +214 I 0.052 +215 L 0.063 +216 S 0.073 +217 M 0.077 +218 N 0.077 +219 E 0.074 +220 S 0.067 +221 G 0.057 +222 E 0.047 +223 L 0.044 +224 Q 0.045 +225 D 0.048 +226 L 0.049 +227 L 0.049 +228 T 0.050 +229 K 0.054 +230 I 0.063 +231 E 0.076 +232 R 0.098 +233 V 0.129 +234 Q 0.166 +235 H 0.197 +236 P 0.212 +237 H 0.211 +238 E 0.195 +239 C 0.172 +240 P 0.161 +241 S 0.171 +242 C 0.200 +243 G 0.240 +244 G 0.280 +245 F 0.303 +246 G 0.304 +247 F 0.288 +248 L 0.255 +249 P 0.210 +250 C 0.168 +251 S 0.150 +252 V 0.156 +253 C 0.169 +254 H 0.178 +255 G 0.180 +256 S 0.176 +257 K 0.177 +258 M 0.193 +259 S 0.225 +260 V 0.265 +261 F 0.310 +262 R 0.354 +263 N 0.382 +264 C 0.384 +265 F 0.365 +266 T 0.341 +267 D 0.318 +268 A 0.303 +269 F 0.295 +270 K 0.288 +271 A 0.271 +272 L 0.245 +273 K 0.216 +274 C 0.195 +275 T 0.193 +276 A 0.207 +277 C 0.218 +278 N 0.221 +279 E 0.232 +280 N 0.252 +281 G 0.264 +282 L 0.256 +283 Q 0.232 +284 R 0.204 +285 C 0.189 +286 K 0.196 +287 N 0.215 +288 C 0.231 +289 T 0.242 +290 C 0.248 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068082.14_ENSMUST00000094715.9_GN:Grxcr1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068082.14_ENSMUST00000094715.9_GN:Grxcr1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:6.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..589c8d4076fd82389b4ffdda4dbb969a07e31220 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068082.14_ENSMUST00000094715.9_GN:Grxcr1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:6.caid @@ -0,0 +1,297 @@ +>ENSMUSG00000068082.14|ENSMUST00000094715.9|GN:Grxcr1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:6 +1 M 0.333 +2 W 0.386 +3 V 0.451 +4 E 0.478 +5 V 0.466 +6 T 0.463 +7 M 0.509 +8 L 0.578 +9 R 0.620 +10 R 0.622 +11 E 0.605 +12 T 0.587 +13 K 0.577 +14 P 0.580 +15 E 0.598 +16 S 0.619 +17 D 0.635 +18 R 0.653 +19 P 0.679 +20 R 0.711 +21 K 0.738 +22 V 0.754 +23 R 0.760 +24 F 0.767 +25 R 0.779 +26 I 0.785 +27 A 0.776 +28 S 0.753 +29 S 0.730 +30 H 0.721 +31 S 0.729 +32 G 0.739 +33 R 0.745 +34 V 0.749 +35 L 0.757 +36 K 0.760 +37 E 0.758 +38 V 0.757 +39 Y 0.761 +40 E 0.768 +41 D 0.770 +42 G 0.763 +43 Q 0.752 +44 A 0.753 +45 P 0.771 +46 G 0.795 +47 S 0.810 +48 L 0.814 +49 D 0.810 +50 S 0.804 +51 E 0.798 +52 C 0.792 +53 A 0.784 +54 S 0.766 +55 I 0.721 +56 C 0.656 +57 A 0.625 +58 I 0.662 +59 D 0.728 +60 G 0.769 +61 L 0.768 +62 S 0.728 +63 D 0.665 +64 S 0.617 +65 E 0.606 +66 G 0.606 +67 Q 0.619 +68 Q 0.673 +69 N 0.745 +70 G 0.789 +71 H 0.790 +72 I 0.749 +73 G 0.683 +74 S 0.644 +75 E 0.671 +76 D 0.728 +77 N 0.764 +78 E 0.774 +79 Q 0.773 +80 E 0.773 +81 K 0.770 +82 D 0.762 +83 Q 0.752 +84 D 0.738 +85 N 0.719 +86 L 0.704 +87 L 0.696 +88 V 0.685 +89 L 0.660 +90 A 0.636 +91 R 0.634 +92 T 0.645 +93 A 0.650 +94 S 0.644 +95 E 0.641 +96 K 0.649 +97 A 0.666 +98 F 0.687 +99 G 0.710 +100 T 0.735 +101 R 0.758 +102 R 0.776 +103 V 0.782 +104 N 0.775 +105 I 0.754 +106 L 0.719 +107 S 0.688 +108 K 0.681 +109 N 0.702 +110 G 0.726 +111 T 0.741 +112 V 0.750 +113 R 0.756 +114 G 0.748 +115 V 0.721 +116 K 0.693 +117 Y 0.682 +118 K 0.679 +119 V 0.667 +120 S 0.644 +121 A 0.619 +122 G 0.593 +123 Q 0.561 +124 A 0.520 +125 L 0.472 +126 F 0.430 +127 N 0.401 +128 N 0.371 +129 L 0.332 +130 T 0.304 +131 K 0.305 +132 V 0.329 +133 L 0.362 +134 Q 0.390 +135 Q 0.411 +136 P 0.419 +137 S 0.410 +138 A 0.386 +139 D 0.348 +140 L 0.297 +141 E 0.238 +142 F 0.174 +143 D 0.114 +144 R 0.069 +145 V 0.042 +146 V 0.030 +147 I 0.027 +148 Y 0.029 +149 T 0.037 +150 T 0.053 +151 C 0.076 +152 L 0.099 +153 R 0.118 +154 V 0.126 +155 V 0.123 +156 R 0.116 +157 T 0.111 +158 T 0.108 +159 F 0.101 +160 E 0.090 +161 R 0.075 +162 C 0.062 +163 E 0.051 +164 L 0.048 +165 V 0.051 +166 R 0.057 +167 K 0.061 +168 I 0.055 +169 F 0.045 +170 Q 0.040 +171 N 0.042 +172 H 0.049 +173 R 0.056 +174 V 0.055 +175 K 0.045 +176 F 0.032 +177 E 0.023 +178 E 0.022 +179 K 0.027 +180 N 0.036 +181 I 0.045 +182 A 0.050 +183 L 0.050 +184 N 0.046 +185 G 0.039 +186 D 0.033 +187 Y 0.028 +188 G 0.026 +189 K 0.025 +190 E 0.027 +191 L 0.036 +192 D 0.050 +193 E 0.057 +194 R 0.053 +195 C 0.046 +196 R 0.044 +197 R 0.051 +198 V 0.068 +199 S 0.099 +200 E 0.134 +201 A 0.154 +202 P 0.144 +203 S 0.112 +204 L 0.078 +205 P 0.056 +206 V 0.043 +207 V 0.037 +208 F 0.035 +209 I 0.039 +210 D 0.046 +211 G 0.052 +212 H 0.055 +213 Y 0.054 +214 L 0.053 +215 G 0.052 +216 G 0.048 +217 A 0.044 +218 E 0.041 +219 K 0.044 +220 I 0.051 +221 L 0.063 +222 S 0.073 +223 M 0.077 +224 N 0.077 +225 E 0.074 +226 S 0.067 +227 G 0.057 +228 E 0.047 +229 L 0.044 +230 Q 0.045 +231 D 0.048 +232 L 0.048 +233 L 0.048 +234 T 0.050 +235 K 0.054 +236 I 0.063 +237 E 0.077 +238 R 0.098 +239 V 0.130 +240 Q 0.168 +241 H 0.198 +242 P 0.213 +243 H 0.212 +244 E 0.196 +245 C 0.173 +246 P 0.161 +247 S 0.172 +248 C 0.201 +249 G 0.241 +250 G 0.281 +251 F 0.304 +252 G 0.305 +253 F 0.288 +254 L 0.256 +255 P 0.210 +256 C 0.168 +257 S 0.150 +258 V 0.156 +259 C 0.169 +260 H 0.178 +261 G 0.181 +262 S 0.177 +263 K 0.178 +264 M 0.195 +265 S 0.227 +266 V 0.267 +267 F 0.311 +268 R 0.355 +269 N 0.383 +270 C 0.384 +271 F 0.365 +272 T 0.341 +273 D 0.319 +274 A 0.304 +275 F 0.297 +276 K 0.289 +277 A 0.273 +278 L 0.247 +279 K 0.218 +280 C 0.196 +281 T 0.194 +282 A 0.207 +283 C 0.218 +284 N 0.222 +285 E 0.233 +286 N 0.253 +287 G 0.265 +288 L 0.258 +289 Q 0.233 +290 R 0.205 +291 C 0.190 +292 K 0.197 +293 N 0.216 +294 C 0.232 +295 T 0.242 +296 C 0.248 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068122.11_ENSMUST00000089188.9_GN:Agtr2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068122.11_ENSMUST00000089188.9_GN:Agtr2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b40c301b1113f44f98384d197b9e1cdb64f5157f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068122.11_ENSMUST00000089188.9_GN:Agtr2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,364 @@ +>ENSMUSG00000068122.11|ENSMUST00000089188.9|GN:Agtr2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.292 +2 K 0.295 +3 D 0.301 +4 N 0.305 +5 F 0.302 +6 S 0.293 +7 F 0.283 +8 A 0.277 +9 A 0.276 +10 T 0.288 +11 S 0.320 +12 R 0.353 +13 N 0.368 +14 I 0.360 +15 T 0.346 +16 S 0.344 +17 S 0.363 +18 R 0.403 +19 P 0.463 +20 F 0.538 +21 D 0.612 +22 N 0.662 +23 L 0.684 +24 N 0.689 +25 A 0.691 +26 T 0.690 +27 G 0.682 +28 T 0.665 +29 N 0.641 +30 E 0.611 +31 S 0.566 +32 A 0.497 +33 F 0.413 +34 N 0.331 +35 C 0.272 +36 S 0.246 +37 H 0.245 +38 K 0.256 +39 P 0.262 +40 S 0.254 +41 D 0.233 +42 K 0.209 +43 H 0.183 +44 L 0.154 +45 E 0.124 +46 A 0.097 +47 I 0.076 +48 P 0.057 +49 V 0.042 +50 L 0.031 +51 Y 0.027 +52 Y 0.027 +53 M 0.028 +54 I 0.030 +55 F 0.031 +56 V 0.034 +57 I 0.040 +58 G 0.044 +59 F 0.044 +60 A 0.042 +61 V 0.041 +62 N 0.040 +63 I 0.039 +64 V 0.037 +65 V 0.035 +66 V 0.035 +67 S 0.035 +68 L 0.035 +69 F 0.035 +70 C 0.043 +71 C 0.063 +72 Q 0.092 +73 K 0.120 +74 G 0.135 +75 P 0.131 +76 K 0.117 +77 K 0.100 +78 V 0.082 +79 S 0.061 +80 S 0.044 +81 I 0.033 +82 Y 0.028 +83 I 0.027 +84 F 0.030 +85 N 0.034 +86 L 0.038 +87 A 0.041 +88 L 0.045 +89 A 0.053 +90 D 0.063 +91 L 0.065 +92 L 0.060 +93 L 0.055 +94 L 0.054 +95 A 0.056 +96 T 0.056 +97 L 0.056 +98 P 0.053 +99 L 0.047 +100 W 0.041 +101 A 0.035 +102 T 0.032 +103 Y 0.032 +104 Y 0.034 +105 S 0.038 +106 Y 0.042 +107 R 0.045 +108 Y 0.046 +109 D 0.046 +110 W 0.046 +111 L 0.047 +112 F 0.050 +113 G 0.052 +114 P 0.048 +115 V 0.040 +116 M 0.032 +117 C 0.028 +118 K 0.030 +119 V 0.035 +120 F 0.042 +121 G 0.047 +122 S 0.045 +123 F 0.039 +124 L 0.036 +125 T 0.039 +126 L 0.045 +127 N 0.048 +128 M 0.048 +129 F 0.045 +130 A 0.041 +131 S 0.038 +132 I 0.034 +133 F 0.029 +134 F 0.026 +135 I 0.025 +136 T 0.026 +137 C 0.026 +138 M 0.029 +139 S 0.034 +140 V 0.040 +141 D 0.047 +142 R 0.051 +143 Y 0.051 +144 Q 0.051 +145 S 0.054 +146 V 0.059 +147 I 0.067 +148 Y 0.075 +149 P 0.084 +150 F 0.096 +151 L 0.115 +152 S 0.141 +153 Q 0.163 +154 R 0.174 +155 R 0.171 +156 N 0.150 +157 P 0.116 +158 W 0.084 +159 Q 0.066 +160 A 0.057 +161 S 0.052 +162 Y 0.050 +163 V 0.051 +164 V 0.051 +165 P 0.048 +166 L 0.048 +167 V 0.050 +168 W 0.051 +169 C 0.049 +170 M 0.049 +171 A 0.051 +172 C 0.053 +173 L 0.057 +174 S 0.062 +175 S 0.065 +176 L 0.064 +177 P 0.060 +178 T 0.054 +179 F 0.049 +180 Y 0.044 +181 F 0.040 +182 R 0.036 +183 D 0.034 +184 V 0.035 +185 R 0.037 +186 T 0.041 +187 I 0.046 +188 E 0.053 +189 Y 0.065 +190 L 0.081 +191 G 0.094 +192 V 0.098 +193 N 0.089 +194 A 0.074 +195 C 0.064 +196 I 0.067 +197 M 0.080 +198 A 0.098 +199 F 0.112 +200 P 0.113 +201 P 0.099 +202 E 0.078 +203 K 0.059 +204 Y 0.048 +205 A 0.046 +206 Q 0.048 +207 W 0.050 +208 S 0.054 +209 A 0.057 +210 G 0.059 +211 I 0.057 +212 A 0.053 +213 L 0.048 +214 M 0.042 +215 K 0.037 +216 N 0.034 +217 I 0.035 +218 L 0.040 +219 G 0.043 +220 F 0.042 +221 I 0.042 +222 I 0.043 +223 P 0.043 +224 L 0.040 +225 I 0.039 +226 F 0.040 +227 I 0.039 +228 A 0.034 +229 T 0.029 +230 C 0.027 +231 Y 0.028 +232 F 0.032 +233 G 0.039 +234 I 0.049 +235 R 0.060 +236 K 0.067 +237 H 0.067 +238 L 0.065 +239 L 0.075 +240 K 0.104 +241 T 0.151 +242 N 0.204 +243 S 0.251 +244 Y 0.286 +245 G 0.305 +246 K 0.303 +247 N 0.280 +248 R 0.237 +249 I 0.181 +250 T 0.127 +251 R 0.090 +252 D 0.071 +253 Q 0.062 +254 V 0.053 +255 L 0.048 +256 K 0.047 +257 M 0.048 +258 A 0.047 +259 A 0.047 +260 A 0.050 +261 V 0.051 +262 V 0.050 +263 L 0.048 +264 A 0.045 +265 F 0.040 +266 I 0.034 +267 I 0.029 +268 C 0.030 +269 W 0.034 +270 L 0.038 +271 P 0.038 +272 F 0.033 +273 H 0.029 +274 V 0.027 +275 L 0.027 +276 T 0.027 +277 F 0.028 +278 L 0.030 +279 D 0.033 +280 A 0.038 +281 L 0.044 +282 T 0.053 +283 W 0.066 +284 M 0.083 +285 G 0.096 +286 I 0.100 +287 I 0.096 +288 N 0.093 +289 S 0.091 +290 C 0.090 +291 E 0.090 +292 V 0.088 +293 I 0.084 +294 A 0.079 +295 V 0.075 +296 I 0.073 +297 D 0.071 +298 L 0.069 +299 A 0.069 +300 L 0.065 +301 P 0.058 +302 F 0.052 +303 A 0.049 +304 I 0.049 +305 L 0.050 +306 L 0.052 +307 G 0.057 +308 F 0.065 +309 T 0.075 +310 N 0.080 +311 S 0.078 +312 C 0.072 +313 V 0.066 +314 N 0.060 +315 P 0.053 +316 F 0.044 +317 L 0.037 +318 Y 0.032 +319 C 0.031 +320 F 0.036 +321 V 0.045 +322 G 0.051 +323 N 0.051 +324 R 0.047 +325 F 0.045 +326 Q 0.049 +327 Q 0.062 +328 K 0.077 +329 L 0.089 +330 R 0.099 +331 S 0.113 +332 V 0.140 +333 F 0.182 +334 R 0.232 +335 V 0.277 +336 P 0.307 +337 I 0.319 +338 T 0.318 +339 W 0.318 +340 L 0.335 +341 Q 0.379 +342 G 0.437 +343 K 0.481 +344 R 0.496 +345 E 0.492 +346 T 0.485 +347 M 0.473 +348 S 0.454 +349 C 0.441 +350 R 0.447 +351 K 0.474 +352 G 0.506 +353 S 0.528 +354 S 0.527 +355 L 0.504 +356 R 0.487 +357 E 0.498 +358 M 0.521 +359 D 0.527 +360 T 0.519 +361 F 0.495 +362 V 0.447 +363 S 0.401 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068122.11_ENSMUST00000089188.9_GN:Agtr2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:30.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068122.11_ENSMUST00000089188.9_GN:Agtr2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:30.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a9ba232266cef491e8e11603d79c1f24e19d0ee0 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068122.11_ENSMUST00000089188.9_GN:Agtr2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:30.caid @@ -0,0 +1,394 @@ +>ENSMUSG00000068122.11|ENSMUST00000089188.9|GN:Agtr2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:30 +1 M 0.139 +2 R 0.129 +3 E 0.117 +4 L 0.110 +5 S 0.108 +6 K 0.105 +7 L 0.097 +8 I 0.086 +9 Y 0.077 +10 D 0.072 +11 N 0.068 +12 C 0.067 +13 F 0.069 +14 K 0.074 +15 H 0.081 +16 W 0.088 +17 Q 0.095 +18 L 0.110 +19 K 0.139 +20 R 0.175 +21 C 0.202 +22 K 0.211 +23 N 0.209 +24 L 0.201 +25 E 0.189 +26 L 0.177 +27 L 0.174 +28 Q 0.180 +29 F 0.192 +30 N 0.204 +31 M 0.217 +32 K 0.239 +33 D 0.273 +34 N 0.306 +35 F 0.325 +36 S 0.326 +37 F 0.315 +38 A 0.296 +39 A 0.285 +40 T 0.303 +41 S 0.360 +42 R 0.429 +43 N 0.468 +44 I 0.461 +45 T 0.430 +46 S 0.411 +47 S 0.424 +48 R 0.469 +49 P 0.532 +50 F 0.602 +51 D 0.667 +52 N 0.710 +53 L 0.727 +54 N 0.731 +55 A 0.731 +56 T 0.729 +57 G 0.721 +58 T 0.707 +59 N 0.685 +60 E 0.654 +61 S 0.603 +62 A 0.528 +63 F 0.437 +64 N 0.348 +65 C 0.282 +66 S 0.251 +67 H 0.250 +68 K 0.262 +69 P 0.268 +70 S 0.258 +71 D 0.233 +72 K 0.205 +73 H 0.177 +74 L 0.147 +75 E 0.116 +76 A 0.090 +77 I 0.070 +78 P 0.053 +79 V 0.039 +80 L 0.030 +81 Y 0.026 +82 Y 0.026 +83 M 0.027 +84 I 0.028 +85 F 0.029 +86 V 0.032 +87 I 0.037 +88 G 0.042 +89 F 0.042 +90 A 0.040 +91 V 0.039 +92 N 0.038 +93 I 0.036 +94 V 0.034 +95 V 0.032 +96 V 0.031 +97 S 0.032 +98 L 0.032 +99 F 0.032 +100 C 0.039 +101 C 0.057 +102 Q 0.085 +103 K 0.113 +104 G 0.127 +105 P 0.124 +106 K 0.110 +107 K 0.094 +108 V 0.077 +109 S 0.058 +110 S 0.042 +111 I 0.032 +112 Y 0.027 +113 I 0.027 +114 F 0.030 +115 N 0.034 +116 L 0.038 +117 A 0.041 +118 L 0.046 +119 A 0.054 +120 D 0.063 +121 L 0.066 +122 L 0.061 +123 L 0.055 +124 L 0.053 +125 A 0.053 +126 T 0.053 +127 L 0.051 +128 P 0.049 +129 L 0.044 +130 W 0.039 +131 A 0.034 +132 T 0.032 +133 Y 0.031 +134 Y 0.033 +135 S 0.037 +136 Y 0.041 +137 R 0.045 +138 Y 0.047 +139 D 0.048 +140 W 0.047 +141 L 0.047 +142 F 0.050 +143 G 0.052 +144 P 0.049 +145 V 0.041 +146 M 0.032 +147 C 0.029 +148 K 0.030 +149 V 0.035 +150 F 0.042 +151 G 0.046 +152 S 0.044 +153 F 0.039 +154 L 0.035 +155 T 0.037 +156 L 0.042 +157 N 0.046 +158 M 0.046 +159 F 0.043 +160 A 0.040 +161 S 0.037 +162 I 0.033 +163 F 0.028 +164 F 0.025 +165 I 0.024 +166 T 0.024 +167 C 0.025 +168 M 0.027 +169 S 0.032 +170 V 0.039 +171 D 0.046 +172 R 0.050 +173 Y 0.051 +174 Q 0.051 +175 S 0.053 +176 V 0.059 +177 I 0.067 +178 Y 0.075 +179 P 0.084 +180 F 0.096 +181 L 0.116 +182 S 0.141 +183 Q 0.162 +184 R 0.171 +185 R 0.166 +186 N 0.144 +187 P 0.111 +188 W 0.080 +189 Q 0.062 +190 A 0.054 +191 S 0.049 +192 Y 0.047 +193 V 0.048 +194 V 0.048 +195 P 0.045 +196 L 0.045 +197 V 0.046 +198 W 0.046 +199 C 0.044 +200 M 0.043 +201 A 0.045 +202 C 0.048 +203 L 0.052 +204 S 0.057 +205 S 0.061 +206 L 0.060 +207 P 0.056 +208 T 0.051 +209 F 0.045 +210 Y 0.040 +211 F 0.036 +212 R 0.034 +213 D 0.032 +214 V 0.032 +215 R 0.033 +216 T 0.035 +217 I 0.038 +218 E 0.044 +219 Y 0.054 +220 L 0.069 +221 G 0.083 +222 V 0.088 +223 N 0.081 +224 A 0.068 +225 C 0.060 +226 I 0.062 +227 M 0.073 +228 A 0.090 +229 F 0.103 +230 P 0.106 +231 P 0.094 +232 E 0.073 +233 K 0.055 +234 Y 0.045 +235 A 0.043 +236 Q 0.044 +237 W 0.047 +238 S 0.051 +239 A 0.054 +240 G 0.054 +241 I 0.053 +242 A 0.050 +243 L 0.046 +244 M 0.041 +245 K 0.036 +246 N 0.034 +247 I 0.035 +248 L 0.039 +249 G 0.042 +250 F 0.041 +251 I 0.040 +252 I 0.041 +253 P 0.041 +254 L 0.039 +255 I 0.038 +256 F 0.039 +257 I 0.038 +258 A 0.034 +259 T 0.028 +260 C 0.026 +261 Y 0.027 +262 F 0.031 +263 G 0.038 +264 I 0.048 +265 R 0.059 +266 K 0.067 +267 H 0.066 +268 L 0.065 +269 L 0.075 +270 K 0.106 +271 T 0.154 +272 N 0.208 +273 S 0.257 +274 Y 0.292 +275 G 0.311 +276 K 0.308 +277 N 0.285 +278 R 0.241 +279 I 0.185 +280 T 0.129 +281 R 0.091 +282 D 0.073 +283 Q 0.063 +284 V 0.054 +285 L 0.048 +286 K 0.047 +287 M 0.047 +288 A 0.047 +289 A 0.048 +290 A 0.051 +291 V 0.053 +292 V 0.052 +293 L 0.049 +294 A 0.046 +295 F 0.041 +296 I 0.035 +297 I 0.031 +298 C 0.031 +299 W 0.036 +300 L 0.040 +301 P 0.040 +302 F 0.035 +303 H 0.030 +304 V 0.029 +305 L 0.029 +306 T 0.030 +307 F 0.030 +308 L 0.032 +309 D 0.036 +310 A 0.041 +311 L 0.047 +312 T 0.056 +313 W 0.070 +314 M 0.088 +315 G 0.103 +316 I 0.106 +317 I 0.103 +318 N 0.098 +319 S 0.095 +320 C 0.093 +321 E 0.093 +322 V 0.092 +323 I 0.088 +324 A 0.083 +325 V 0.080 +326 I 0.077 +327 D 0.074 +328 L 0.072 +329 A 0.071 +330 L 0.067 +331 P 0.059 +332 F 0.053 +333 A 0.050 +334 I 0.050 +335 L 0.051 +336 L 0.054 +337 G 0.059 +338 F 0.068 +339 T 0.077 +340 N 0.083 +341 S 0.081 +342 C 0.074 +343 V 0.068 +344 N 0.062 +345 P 0.054 +346 F 0.045 +347 L 0.038 +348 Y 0.032 +349 C 0.030 +350 F 0.035 +351 V 0.043 +352 G 0.050 +353 N 0.050 +354 R 0.046 +355 F 0.042 +356 Q 0.046 +357 Q 0.058 +358 K 0.073 +359 L 0.086 +360 R 0.097 +361 S 0.111 +362 V 0.138 +363 F 0.181 +364 R 0.231 +365 V 0.277 +366 P 0.307 +367 I 0.319 +368 T 0.317 +369 W 0.316 +370 L 0.334 +371 Q 0.380 +372 G 0.442 +373 K 0.493 +374 R 0.516 +375 E 0.518 +376 T 0.510 +377 M 0.493 +378 S 0.470 +379 C 0.455 +380 R 0.461 +381 K 0.488 +382 G 0.520 +383 S 0.541 +384 S 0.539 +385 L 0.514 +386 R 0.497 +387 E 0.513 +388 M 0.542 +389 D 0.552 +390 T 0.544 +391 F 0.518 +392 V 0.466 +393 S 0.417 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068129.6_ENSMUST00000089200.3_GN:Cst7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068129.6_ENSMUST00000089200.3_GN:Cst7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1d378db2ea02728e225e32464e89bd0eadd1486c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068129.6_ENSMUST00000089200.3_GN:Cst7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,145 @@ +>ENSMUSG00000068129.6|ENSMUST00000089200.3|GN:Cst7|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.294 +2 W 0.300 +3 L 0.306 +4 A 0.303 +5 I 0.283 +6 L 0.260 +7 L 0.257 +8 A 0.273 +9 L 0.283 +10 C 0.285 +11 C 0.301 +12 L 0.336 +13 T 0.373 +14 S 0.403 +15 D 0.437 +16 T 0.481 +17 H 0.529 +18 G 0.558 +19 A 0.551 +20 R 0.506 +21 P 0.443 +22 P 0.383 +23 D 0.333 +24 F 0.291 +25 C 0.261 +26 S 0.252 +27 K 0.269 +28 D 0.308 +29 L 0.350 +30 I 0.373 +31 S 0.368 +32 S 0.345 +33 V 0.310 +34 K 0.267 +35 P 0.225 +36 G 0.193 +37 F 0.169 +38 P 0.145 +39 K 0.116 +40 T 0.088 +41 I 0.067 +42 E 0.056 +43 T 0.054 +44 N 0.057 +45 N 0.057 +46 P 0.051 +47 G 0.042 +48 V 0.034 +49 L 0.027 +50 K 0.023 +51 A 0.022 +52 A 0.022 +53 R 0.021 +54 H 0.020 +55 S 0.020 +56 V 0.022 +57 E 0.027 +58 K 0.035 +59 F 0.047 +60 N 0.060 +61 N 0.072 +62 C 0.080 +63 T 0.079 +64 N 0.070 +65 D 0.060 +66 I 0.054 +67 F 0.054 +68 L 0.053 +69 F 0.047 +70 K 0.037 +71 E 0.027 +72 S 0.021 +73 H 0.018 +74 V 0.019 +75 S 0.021 +76 K 0.023 +77 A 0.026 +78 L 0.029 +79 V 0.033 +80 Q 0.038 +81 V 0.044 +82 V 0.047 +83 K 0.048 +84 G 0.047 +85 L 0.046 +86 K 0.045 +87 Y 0.047 +88 M 0.053 +89 L 0.061 +90 E 0.065 +91 V 0.063 +92 K 0.057 +93 I 0.052 +94 G 0.056 +95 R 0.065 +96 T 0.074 +97 T 0.075 +98 C 0.070 +99 R 0.063 +100 K 0.060 +101 T 0.067 +102 M 0.085 +103 H 0.102 +104 H 0.112 +105 Q 0.113 +106 L 0.107 +107 D 0.098 +108 N 0.089 +109 C 0.084 +110 D 0.083 +111 F 0.088 +112 Q 0.101 +113 T 0.120 +114 N 0.136 +115 P 0.138 +116 A 0.130 +117 L 0.119 +118 K 0.108 +119 R 0.095 +120 T 0.083 +121 L 0.071 +122 Y 0.060 +123 C 0.052 +124 Y 0.045 +125 S 0.040 +126 E 0.038 +127 V 0.039 +128 W 0.042 +129 V 0.048 +130 I 0.056 +131 P 0.062 +132 W 0.066 +133 L 0.069 +134 H 0.070 +135 S 0.070 +136 F 0.069 +137 E 0.071 +138 V 0.072 +139 P 0.069 +140 V 0.061 +141 L 0.054 +142 L 0.056 +143 C 0.067 +144 Q 0.080 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068129.6_ENSMUST00000089200.3_GN:Cst7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068129.6_ENSMUST00000089200.3_GN:Cst7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..dd2c60eae5a37198343de81153367d0e2bfc5f63 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068129.6_ENSMUST00000089200.3_GN:Cst7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid @@ -0,0 +1,168 @@ +>ENSMUSG00000068129.6|ENSMUST00000089200.3|GN:Cst7|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:23 +1 M 0.387 +2 P 0.388 +3 W 0.389 +4 S 0.388 +5 W 0.383 +6 S 0.375 +7 C 0.368 +8 T 0.360 +9 C 0.359 +10 R 0.392 +11 A 0.459 +12 L 0.527 +13 G 0.571 +14 P 0.601 +15 L 0.629 +16 H 0.646 +17 A 0.640 +18 P 0.599 +19 C 0.522 +20 I 0.432 +21 S 0.365 +22 P 0.336 +23 A 0.329 +24 M 0.319 +25 W 0.297 +26 L 0.272 +27 A 0.262 +28 I 0.269 +29 L 0.278 +30 L 0.277 +31 A 0.270 +32 L 0.266 +33 C 0.272 +34 C 0.296 +35 L 0.340 +36 T 0.393 +37 S 0.446 +38 D 0.500 +39 T 0.555 +40 H 0.603 +41 G 0.625 +42 A 0.609 +43 R 0.556 +44 P 0.485 +45 P 0.420 +46 D 0.371 +47 F 0.337 +48 C 0.319 +49 S 0.329 +50 K 0.367 +51 D 0.421 +52 L 0.462 +53 I 0.467 +54 S 0.435 +55 S 0.387 +56 V 0.333 +57 K 0.279 +58 P 0.232 +59 G 0.197 +60 F 0.171 +61 P 0.145 +62 K 0.115 +63 T 0.087 +64 I 0.065 +65 E 0.054 +66 T 0.052 +67 N 0.054 +68 N 0.053 +69 P 0.048 +70 G 0.040 +71 V 0.032 +72 L 0.025 +73 K 0.022 +74 A 0.021 +75 A 0.020 +76 R 0.020 +77 H 0.019 +78 S 0.019 +79 V 0.021 +80 E 0.026 +81 K 0.034 +82 F 0.045 +83 N 0.056 +84 N 0.067 +85 C 0.074 +86 T 0.073 +87 N 0.065 +88 D 0.055 +89 I 0.050 +90 F 0.049 +91 L 0.049 +92 F 0.044 +93 K 0.034 +94 E 0.025 +95 S 0.019 +96 H 0.017 +97 V 0.018 +98 S 0.020 +99 K 0.022 +100 A 0.025 +101 L 0.028 +102 V 0.032 +103 Q 0.037 +104 V 0.043 +105 V 0.047 +106 K 0.047 +107 G 0.047 +108 L 0.046 +109 K 0.046 +110 Y 0.048 +111 M 0.055 +112 L 0.063 +113 E 0.067 +114 V 0.064 +115 K 0.057 +116 I 0.053 +117 G 0.055 +118 R 0.064 +119 T 0.073 +120 T 0.074 +121 C 0.069 +122 R 0.062 +123 K 0.059 +124 T 0.067 +125 M 0.085 +126 H 0.103 +127 H 0.113 +128 Q 0.114 +129 L 0.109 +130 D 0.099 +131 N 0.090 +132 C 0.085 +133 D 0.084 +134 F 0.088 +135 Q 0.099 +136 T 0.117 +137 N 0.133 +138 P 0.136 +139 A 0.130 +140 L 0.121 +141 K 0.110 +142 R 0.097 +143 T 0.084 +144 L 0.072 +145 Y 0.061 +146 C 0.053 +147 Y 0.046 +148 S 0.041 +149 E 0.040 +150 V 0.040 +151 W 0.043 +152 V 0.049 +153 I 0.058 +154 P 0.064 +155 W 0.068 +156 L 0.071 +157 H 0.072 +158 S 0.072 +159 F 0.071 +160 E 0.071 +161 V 0.072 +162 P 0.069 +163 V 0.061 +164 L 0.055 +165 L 0.057 +166 C 0.069 +167 Q 0.082 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068328.11_ENSMUST00000092618.10_GN:Aup1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068328.11_ENSMUST00000092618.10_GN:Aup1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..63f64c574dbe6082c9092accf6dd5862001ffdd5 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068328.11_ENSMUST00000092618.10_GN:Aup1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,411 @@ +>ENSMUSG00000068328.11|ENSMUST00000092618.10|GN:Aup1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.382 +2 E 0.396 +3 P 0.419 +4 P 0.439 +5 P 0.450 +6 A 0.451 +7 P 0.442 +8 G 0.422 +9 P 0.389 +10 E 0.343 +11 R 0.293 +12 L 0.250 +13 F 0.222 +14 D 0.212 +15 S 0.214 +16 H 0.222 +17 R 0.233 +18 L 0.245 +19 P 0.258 +20 S 0.263 +21 D 0.249 +22 G 0.212 +23 F 0.168 +24 L 0.128 +25 L 0.099 +26 L 0.082 +27 A 0.078 +28 L 0.078 +29 L 0.074 +30 L 0.071 +31 Y 0.071 +32 A 0.072 +33 P 0.073 +34 V 0.077 +35 G 0.084 +36 L 0.089 +37 C 0.084 +38 L 0.076 +39 L 0.067 +40 V 0.060 +41 L 0.055 +42 R 0.049 +43 L 0.043 +44 F 0.038 +45 L 0.038 +46 G 0.038 +47 L 0.038 +48 H 0.036 +49 V 0.035 +50 F 0.034 +51 L 0.036 +52 V 0.046 +53 S 0.063 +54 C 0.079 +55 A 0.093 +56 L 0.105 +57 P 0.112 +58 D 0.107 +59 S 0.088 +60 V 0.063 +61 L 0.046 +62 R 0.038 +63 R 0.037 +64 F 0.037 +65 V 0.039 +66 V 0.043 +67 R 0.048 +68 T 0.051 +69 M 0.053 +70 C 0.055 +71 A 0.059 +72 V 0.062 +73 L 0.065 +74 G 0.063 +75 L 0.055 +76 V 0.045 +77 A 0.042 +78 R 0.050 +79 Q 0.071 +80 E 0.097 +81 D 0.124 +82 S 0.146 +83 G 0.157 +84 L 0.152 +85 R 0.135 +86 D 0.110 +87 H 0.086 +88 R 0.068 +89 V 0.055 +90 R 0.049 +91 V 0.053 +92 L 0.069 +93 I 0.089 +94 S 0.098 +95 N 0.088 +96 H 0.068 +97 V 0.051 +98 T 0.041 +99 P 0.039 +100 F 0.040 +101 D 0.044 +102 H 0.049 +103 N 0.052 +104 I 0.051 +105 V 0.046 +106 N 0.043 +107 L 0.042 +108 L 0.045 +109 T 0.055 +110 T 0.074 +111 C 0.100 +112 S 0.122 +113 T 0.129 +114 P 0.120 +115 L 0.109 +116 L 0.104 +117 N 0.107 +118 S 0.116 +119 P 0.123 +120 P 0.124 +121 S 0.120 +122 F 0.118 +123 V 0.118 +124 C 0.113 +125 W 0.104 +126 S 0.098 +127 R 0.105 +128 G 0.117 +129 F 0.125 +130 M 0.126 +131 E 0.123 +132 M 0.116 +133 D 0.107 +134 R 0.097 +135 R 0.088 +136 V 0.079 +137 E 0.069 +138 L 0.064 +139 V 0.066 +140 E 0.067 +141 S 0.059 +142 L 0.047 +143 K 0.041 +144 K 0.041 +145 F 0.047 +146 C 0.060 +147 A 0.081 +148 S 0.102 +149 T 0.113 +150 R 0.117 +151 L 0.121 +152 P 0.128 +153 P 0.130 +154 T 0.127 +155 P 0.127 +156 L 0.136 +157 L 0.149 +158 L 0.152 +159 F 0.144 +160 P 0.138 +161 E 0.144 +162 E 0.154 +163 E 0.148 +164 A 0.127 +165 T 0.109 +166 N 0.103 +167 G 0.108 +168 R 0.118 +169 E 0.125 +170 G 0.121 +171 L 0.110 +172 L 0.097 +173 R 0.087 +174 F 0.075 +175 S 0.064 +176 S 0.057 +177 W 0.054 +178 P 0.053 +179 F 0.051 +180 S 0.049 +181 I 0.047 +182 Q 0.045 +183 D 0.045 +184 V 0.050 +185 V 0.056 +186 Q 0.061 +187 P 0.060 +188 L 0.053 +189 T 0.047 +190 L 0.046 +191 Q 0.052 +192 V 0.062 +193 Q 0.074 +194 R 0.086 +195 P 0.097 +196 L 0.108 +197 V 0.116 +198 S 0.117 +199 V 0.113 +200 T 0.108 +201 V 0.106 +202 S 0.109 +203 D 0.112 +204 A 0.108 +205 S 0.093 +206 W 0.072 +207 V 0.054 +208 S 0.046 +209 E 0.045 +210 L 0.048 +211 L 0.051 +212 W 0.055 +213 S 0.057 +214 L 0.058 +215 F 0.063 +216 V 0.073 +217 P 0.079 +218 F 0.078 +219 T 0.071 +220 V 0.064 +221 Y 0.057 +222 Q 0.049 +223 V 0.041 +224 R 0.035 +225 W 0.031 +226 L 0.030 +227 H 0.031 +228 P 0.034 +229 I 0.041 +230 R 0.053 +231 R 0.070 +232 Q 0.089 +233 L 0.103 +234 G 0.110 +235 E 0.108 +236 E 0.098 +237 S 0.085 +238 E 0.075 +239 E 0.070 +240 F 0.066 +241 A 0.063 +242 L 0.060 +243 R 0.058 +244 V 0.056 +245 Q 0.054 +246 Q 0.054 +247 L 0.058 +248 V 0.067 +249 A 0.078 +250 K 0.085 +251 E 0.089 +252 L 0.099 +253 G 0.119 +254 Q 0.137 +255 I 0.141 +256 G 0.132 +257 T 0.118 +258 R 0.108 +259 L 0.098 +260 T 0.089 +261 P 0.084 +262 A 0.082 +263 D 0.079 +264 K 0.075 +265 A 0.077 +266 E 0.086 +267 H 0.101 +268 M 0.119 +269 K 0.144 +270 R 0.181 +271 Q 0.239 +272 R 0.320 +273 H 0.411 +274 P 0.490 +275 R 0.543 +276 L 0.575 +277 R 0.597 +278 P 0.621 +279 Q 0.652 +280 S 0.680 +281 V 0.693 +282 Q 0.686 +283 S 0.666 +284 S 0.644 +285 F 0.624 +286 P 0.609 +287 S 0.599 +288 P 0.592 +289 P 0.592 +290 S 0.594 +291 P 0.581 +292 S 0.535 +293 S 0.459 +294 D 0.376 +295 V 0.301 +296 Q 0.231 +297 L 0.164 +298 T 0.111 +299 T 0.081 +300 L 0.074 +301 A 0.080 +302 H 0.086 +303 R 0.085 +304 V 0.079 +305 K 0.074 +306 E 0.070 +307 V 0.067 +308 L 0.070 +309 P 0.078 +310 H 0.087 +311 V 0.089 +312 P 0.084 +313 L 0.073 +314 N 0.062 +315 V 0.054 +316 I 0.050 +317 Q 0.052 +318 R 0.062 +319 D 0.076 +320 L 0.084 +321 A 0.081 +322 R 0.075 +323 T 0.074 +324 G 0.079 +325 C 0.083 +326 V 0.079 +327 D 0.070 +328 L 0.064 +329 T 0.066 +330 I 0.072 +331 T 0.077 +332 N 0.081 +333 L 0.089 +334 L 0.105 +335 E 0.134 +336 G 0.171 +337 A 0.209 +338 V 0.247 +339 A 0.290 +340 F 0.348 +341 M 0.425 +342 P 0.512 +343 E 0.593 +344 D 0.654 +345 V 0.692 +346 T 0.713 +347 E 0.721 +348 G 0.715 +349 S 0.690 +350 Q 0.655 +351 S 0.628 +352 P 0.626 +353 P 0.646 +354 A 0.671 +355 P 0.689 +356 S 0.697 +357 A 0.699 +358 P 0.704 +359 K 0.714 +360 F 0.728 +361 P 0.743 +362 S 0.755 +363 S 0.765 +364 G 0.769 +365 L 0.758 +366 A 0.734 +367 T 0.708 +368 P 0.693 +369 Q 0.691 +370 P 0.693 +371 T 0.688 +372 A 0.664 +373 L 0.625 +374 T 0.582 +375 F 0.544 +376 A 0.512 +377 K 0.484 +378 S 0.445 +379 S 0.386 +380 W 0.317 +381 A 0.262 +382 R 0.233 +383 Q 0.229 +384 E 0.236 +385 S 0.241 +386 L 0.237 +387 Q 0.221 +388 E 0.198 +389 R 0.177 +390 K 0.164 +391 Q 0.161 +392 A 0.161 +393 L 0.158 +394 Y 0.149 +395 E 0.138 +396 Y 0.131 +397 A 0.127 +398 R 0.128 +399 R 0.133 +400 R 0.139 +401 F 0.148 +402 R 0.157 +403 E 0.170 +404 R 0.184 +405 Q 0.204 +406 A 0.236 +407 Q 0.280 +408 E 0.321 +409 A 0.345 +410 E 0.352 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068328.11_ENSMUST00000092618.10_GN:Aup1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:29.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068328.11_ENSMUST00000092618.10_GN:Aup1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:29.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..8f2bdce1ff6816e786dd333594c3e9a86951a710 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068328.11_ENSMUST00000092618.10_GN:Aup1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:29.caid @@ -0,0 +1,440 @@ +>ENSMUSG00000068328.11|ENSMUST00000092618.10|GN:Aup1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:29 +1 M 0.403 +2 P 0.429 +3 K 0.470 +4 D 0.506 +5 S 0.526 +6 A 0.534 +7 F 0.543 +8 P 0.552 +9 G 0.542 +10 A 0.496 +11 P 0.419 +12 A 0.340 +13 A 0.285 +14 L 0.254 +15 R 0.240 +16 R 0.238 +17 W 0.247 +18 R 0.263 +19 R 0.292 +20 Q 0.343 +21 R 0.406 +22 P 0.462 +23 R 0.510 +24 S 0.556 +25 P 0.597 +26 E 0.623 +27 A 0.628 +28 A 0.608 +29 A 0.562 +30 M 0.507 +31 E 0.469 +32 P 0.458 +33 P 0.467 +34 P 0.478 +35 A 0.482 +36 P 0.475 +37 G 0.458 +38 P 0.432 +39 E 0.394 +40 R 0.344 +41 L 0.292 +42 F 0.254 +43 D 0.237 +44 S 0.237 +45 H 0.245 +46 R 0.258 +47 L 0.273 +48 P 0.290 +49 S 0.301 +50 D 0.289 +51 G 0.247 +52 F 0.190 +53 L 0.142 +54 L 0.109 +55 L 0.092 +56 A 0.088 +57 L 0.088 +58 L 0.084 +59 L 0.080 +60 Y 0.080 +61 A 0.081 +62 P 0.082 +63 V 0.084 +64 G 0.093 +65 L 0.098 +66 C 0.095 +67 L 0.086 +68 L 0.077 +69 V 0.069 +70 L 0.060 +71 R 0.052 +72 L 0.045 +73 F 0.040 +74 L 0.039 +75 G 0.039 +76 L 0.038 +77 H 0.037 +78 V 0.036 +79 F 0.034 +80 L 0.035 +81 V 0.044 +82 S 0.059 +83 C 0.073 +84 A 0.085 +85 L 0.097 +86 P 0.104 +87 D 0.099 +88 S 0.081 +89 V 0.058 +90 L 0.042 +91 R 0.035 +92 R 0.034 +93 F 0.034 +94 V 0.036 +95 V 0.040 +96 R 0.044 +97 T 0.046 +98 M 0.047 +99 C 0.049 +100 A 0.052 +101 V 0.056 +102 L 0.059 +103 G 0.058 +104 L 0.051 +105 V 0.042 +106 A 0.040 +107 R 0.049 +108 Q 0.068 +109 E 0.094 +110 D 0.121 +111 S 0.144 +112 G 0.156 +113 L 0.153 +114 R 0.136 +115 D 0.112 +116 H 0.087 +117 R 0.067 +118 V 0.054 +119 R 0.048 +120 V 0.052 +121 L 0.068 +122 I 0.089 +123 S 0.098 +124 N 0.088 +125 H 0.068 +126 V 0.050 +127 T 0.041 +128 P 0.038 +129 F 0.040 +130 D 0.045 +131 H 0.050 +132 N 0.054 +133 I 0.052 +134 V 0.048 +135 N 0.044 +136 L 0.044 +137 L 0.047 +138 T 0.057 +139 T 0.076 +140 C 0.101 +141 S 0.123 +142 T 0.128 +143 P 0.119 +144 L 0.107 +145 L 0.103 +146 N 0.107 +147 S 0.116 +148 P 0.124 +149 P 0.126 +150 S 0.122 +151 F 0.120 +152 V 0.120 +153 C 0.115 +154 W 0.105 +155 S 0.098 +156 R 0.104 +157 G 0.115 +158 F 0.123 +159 M 0.125 +160 E 0.123 +161 M 0.117 +162 D 0.108 +163 R 0.097 +164 R 0.087 +165 V 0.077 +166 E 0.067 +167 L 0.062 +168 V 0.064 +169 E 0.065 +170 S 0.057 +171 L 0.045 +172 K 0.038 +173 K 0.039 +174 F 0.046 +175 C 0.059 +176 A 0.081 +177 S 0.104 +178 T 0.116 +179 R 0.120 +180 L 0.124 +181 P 0.128 +182 P 0.129 +183 T 0.125 +184 P 0.126 +185 L 0.135 +186 L 0.147 +187 L 0.151 +188 F 0.143 +189 P 0.137 +190 E 0.144 +191 E 0.154 +192 E 0.147 +193 A 0.126 +194 T 0.106 +195 N 0.099 +196 G 0.104 +197 R 0.115 +198 E 0.122 +199 G 0.120 +200 L 0.108 +201 L 0.095 +202 R 0.084 +203 F 0.073 +204 S 0.062 +205 S 0.056 +206 W 0.054 +207 P 0.052 +208 F 0.050 +209 S 0.048 +210 I 0.046 +211 Q 0.043 +212 D 0.043 +213 V 0.048 +214 V 0.055 +215 Q 0.060 +216 P 0.059 +217 L 0.053 +218 T 0.047 +219 L 0.045 +220 Q 0.049 +221 V 0.057 +222 Q 0.068 +223 R 0.079 +224 P 0.089 +225 L 0.099 +226 V 0.106 +227 S 0.108 +228 V 0.105 +229 T 0.100 +230 V 0.099 +231 S 0.101 +232 D 0.104 +233 A 0.100 +234 S 0.086 +235 W 0.067 +236 V 0.050 +237 S 0.043 +238 E 0.043 +239 L 0.046 +240 L 0.049 +241 W 0.053 +242 S 0.055 +243 L 0.056 +244 F 0.061 +245 V 0.070 +246 P 0.076 +247 F 0.076 +248 T 0.070 +249 V 0.063 +250 Y 0.056 +251 Q 0.049 +252 V 0.042 +253 R 0.036 +254 W 0.032 +255 L 0.031 +256 H 0.032 +257 P 0.034 +258 I 0.041 +259 R 0.053 +260 R 0.071 +261 Q 0.090 +262 L 0.104 +263 G 0.110 +264 E 0.108 +265 E 0.099 +266 S 0.085 +267 E 0.075 +268 E 0.069 +269 F 0.066 +270 A 0.063 +271 L 0.060 +272 R 0.057 +273 V 0.056 +274 Q 0.054 +275 Q 0.053 +276 L 0.057 +277 V 0.066 +278 A 0.077 +279 K 0.084 +280 E 0.087 +281 L 0.097 +282 G 0.117 +283 Q 0.136 +284 I 0.141 +285 G 0.132 +286 T 0.120 +287 R 0.110 +288 L 0.101 +289 T 0.092 +290 P 0.086 +291 A 0.085 +292 D 0.081 +293 K 0.077 +294 A 0.079 +295 E 0.089 +296 H 0.103 +297 M 0.123 +298 K 0.149 +299 R 0.186 +300 Q 0.244 +301 R 0.325 +302 H 0.416 +303 P 0.495 +304 R 0.549 +305 L 0.582 +306 R 0.606 +307 P 0.633 +308 Q 0.664 +309 S 0.691 +310 V 0.702 +311 Q 0.694 +312 S 0.674 +313 S 0.651 +314 F 0.631 +315 P 0.617 +316 S 0.607 +317 P 0.601 +318 P 0.601 +319 S 0.604 +320 P 0.593 +321 S 0.548 +322 S 0.473 +323 D 0.393 +324 V 0.318 +325 Q 0.245 +326 L 0.174 +327 T 0.118 +328 T 0.086 +329 L 0.078 +330 A 0.082 +331 H 0.087 +332 R 0.086 +333 V 0.081 +334 K 0.077 +335 E 0.072 +336 V 0.070 +337 L 0.073 +338 P 0.082 +339 H 0.090 +340 V 0.093 +341 P 0.087 +342 L 0.076 +343 N 0.065 +344 V 0.057 +345 I 0.052 +346 Q 0.055 +347 R 0.066 +348 D 0.080 +349 L 0.088 +350 A 0.084 +351 R 0.075 +352 T 0.073 +353 G 0.077 +354 C 0.081 +355 V 0.078 +356 D 0.070 +357 L 0.064 +358 T 0.065 +359 I 0.071 +360 T 0.076 +361 N 0.080 +362 L 0.087 +363 L 0.104 +364 E 0.132 +365 G 0.167 +366 A 0.203 +367 V 0.239 +368 A 0.282 +369 F 0.341 +370 M 0.421 +371 P 0.511 +372 E 0.595 +373 D 0.656 +374 V 0.693 +375 T 0.714 +376 E 0.723 +377 G 0.716 +378 S 0.692 +379 Q 0.657 +380 S 0.631 +381 P 0.629 +382 P 0.649 +383 A 0.674 +384 P 0.691 +385 S 0.697 +386 A 0.699 +387 P 0.703 +388 K 0.713 +389 F 0.728 +390 P 0.745 +391 S 0.758 +392 S 0.768 +393 G 0.771 +394 L 0.761 +395 A 0.737 +396 T 0.711 +397 P 0.696 +398 Q 0.694 +399 P 0.697 +400 T 0.691 +401 A 0.667 +402 L 0.626 +403 T 0.582 +404 F 0.541 +405 A 0.504 +406 K 0.472 +407 S 0.432 +408 S 0.374 +409 W 0.307 +410 A 0.254 +411 R 0.227 +412 Q 0.225 +413 E 0.234 +414 S 0.240 +415 L 0.236 +416 Q 0.220 +417 E 0.197 +418 R 0.177 +419 K 0.166 +420 Q 0.163 +421 A 0.163 +422 L 0.159 +423 Y 0.148 +424 E 0.137 +425 Y 0.127 +426 A 0.119 +427 R 0.114 +428 R 0.115 +429 R 0.124 +430 F 0.136 +431 R 0.150 +432 E 0.167 +433 R 0.187 +434 Q 0.210 +435 A 0.243 +436 Q 0.290 +437 E 0.336 +438 A 0.364 +439 E 0.373 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068407.4_ENSMUST00000227764.2_GN:Rnase12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068407.4_ENSMUST00000227764.2_GN:Rnase12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d20348b27b27496f102e6291765758fc2d540d7c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068407.4_ENSMUST00000227764.2_GN:Rnase12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,146 @@ +>ENSMUSG00000068407.4|ENSMUST00000227764.2|GN:Rnase12|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.235 +2 V 0.208 +3 L 0.177 +4 M 0.160 +5 V 0.156 +6 V 0.156 +7 V 0.155 +8 F 0.153 +9 L 0.151 +10 L 0.153 +11 L 0.167 +12 L 0.193 +13 F 0.231 +14 W 0.277 +15 E 0.324 +16 N 0.358 +17 E 0.375 +18 L 0.382 +19 T 0.388 +20 E 0.392 +21 D 0.387 +22 V 0.368 +23 V 0.325 +24 L 0.261 +25 T 0.194 +26 S 0.139 +27 I 0.102 +28 E 0.082 +29 Q 0.071 +30 L 0.061 +31 H 0.052 +32 V 0.050 +33 D 0.055 +34 Y 0.065 +35 P 0.078 +36 Q 0.093 +37 N 0.106 +38 A 0.107 +39 V 0.095 +40 P 0.078 +41 L 0.066 +42 R 0.057 +43 Y 0.047 +44 C 0.038 +45 N 0.034 +46 Y 0.034 +47 M 0.036 +48 I 0.039 +49 L 0.044 +50 Q 0.055 +51 R 0.068 +52 V 0.082 +53 I 0.096 +54 R 0.107 +55 E 0.110 +56 P 0.106 +57 D 0.096 +58 H 0.085 +59 R 0.076 +60 C 0.067 +61 R 0.057 +62 K 0.052 +63 V 0.049 +64 H 0.046 +65 V 0.043 +66 F 0.043 +67 I 0.047 +68 H 0.054 +69 E 0.060 +70 R 0.064 +71 P 0.064 +72 Q 0.061 +73 K 0.056 +74 I 0.050 +75 N 0.044 +76 R 0.039 +77 V 0.034 +78 C 0.030 +79 T 0.030 +80 S 0.035 +81 S 0.041 +82 K 0.047 +83 K 0.054 +84 M 0.064 +85 S 0.080 +86 C 0.101 +87 P 0.124 +88 N 0.142 +89 D 0.148 +90 S 0.137 +91 D 0.111 +92 L 0.079 +93 F 0.055 +94 C 0.045 +95 F 0.050 +96 Q 0.064 +97 S 0.081 +98 E 0.093 +99 T 0.095 +100 K 0.088 +101 F 0.077 +102 R 0.067 +103 M 0.061 +104 T 0.059 +105 V 0.058 +106 C 0.058 +107 Q 0.063 +108 L 0.071 +109 I 0.081 +110 D 0.087 +111 G 0.084 +112 T 0.074 +113 T 0.060 +114 Y 0.052 +115 P 0.052 +116 A 0.058 +117 C 0.064 +118 R 0.070 +119 Y 0.079 +120 Q 0.090 +121 I 0.102 +122 S 0.113 +123 P 0.124 +124 I 0.134 +125 K 0.141 +126 G 0.144 +127 F 0.146 +128 V 0.143 +129 L 0.127 +130 V 0.098 +131 T 0.069 +132 C 0.052 +133 D 0.055 +134 D 0.074 +135 L 0.096 +136 G 0.106 +137 P 0.104 +138 V 0.095 +139 D 0.090 +140 L 0.090 +141 Q 0.099 +142 G 0.119 +143 Y 0.146 +144 V 0.172 +145 E 0.189 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068407.4_ENSMUST00000227764.2_GN:Rnase12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:24.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068407.4_ENSMUST00000227764.2_GN:Rnase12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:24.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a95d7d63b774a684ae0776d7670d303d8e54049c --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000068407.4_ENSMUST00000227764.2_GN:Rnase12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:24.caid @@ -0,0 +1,170 @@ +>ENSMUSG00000068407.4|ENSMUST00000227764.2|GN:Rnase12|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:24 +1 M 0.357 +2 L 0.372 +3 S 0.399 +4 V 0.419 +5 R 0.424 +6 T 0.428 +7 R 0.440 +8 A 0.433 +9 K 0.416 +10 R 0.448 +11 A 0.538 +12 G 0.624 +13 V 0.660 +14 Q 0.659 +15 A 0.644 +16 R 0.623 +17 D 0.592 +18 V 0.549 +19 K 0.500 +20 G 0.442 +21 I 0.369 +22 L 0.290 +23 P 0.233 +24 L 0.207 +25 M 0.197 +26 V 0.186 +27 L 0.173 +28 M 0.163 +29 V 0.156 +30 V 0.150 +31 V 0.141 +32 F 0.126 +33 L 0.111 +34 L 0.103 +35 L 0.110 +36 L 0.133 +37 F 0.170 +38 W 0.221 +39 E 0.278 +40 N 0.330 +41 E 0.367 +42 L 0.392 +43 T 0.405 +44 E 0.404 +45 D 0.391 +46 V 0.365 +47 V 0.318 +48 L 0.250 +49 T 0.181 +50 S 0.127 +51 I 0.093 +52 E 0.074 +53 Q 0.066 +54 L 0.060 +55 H 0.053 +56 V 0.052 +57 D 0.057 +58 Y 0.067 +59 P 0.080 +60 Q 0.093 +61 N 0.104 +62 A 0.104 +63 V 0.091 +64 P 0.074 +65 L 0.062 +66 R 0.053 +67 Y 0.044 +68 C 0.035 +69 N 0.031 +70 Y 0.032 +71 M 0.034 +72 I 0.038 +73 L 0.043 +74 Q 0.052 +75 R 0.062 +76 V 0.073 +77 I 0.084 +78 R 0.095 +79 E 0.101 +80 P 0.100 +81 D 0.091 +82 H 0.081 +83 R 0.073 +84 C 0.064 +85 R 0.056 +86 K 0.051 +87 V 0.049 +88 H 0.046 +89 V 0.044 +90 F 0.044 +91 I 0.048 +92 H 0.055 +93 E 0.062 +94 R 0.065 +95 P 0.064 +96 Q 0.060 +97 K 0.055 +98 I 0.048 +99 N 0.043 +100 R 0.039 +101 V 0.034 +102 C 0.031 +103 T 0.031 +104 S 0.036 +105 S 0.043 +106 K 0.049 +107 K 0.056 +108 M 0.067 +109 S 0.082 +110 C 0.102 +111 P 0.124 +112 N 0.141 +113 D 0.147 +114 S 0.137 +115 D 0.112 +116 L 0.081 +117 F 0.057 +118 C 0.046 +119 F 0.050 +120 Q 0.064 +121 S 0.081 +122 E 0.092 +123 T 0.094 +124 K 0.086 +125 F 0.074 +126 R 0.064 +127 M 0.058 +128 T 0.057 +129 V 0.057 +130 C 0.057 +131 Q 0.062 +132 L 0.071 +133 I 0.081 +134 D 0.087 +135 G 0.084 +136 T 0.074 +137 T 0.061 +138 Y 0.053 +139 P 0.055 +140 A 0.062 +141 C 0.068 +142 R 0.074 +143 Y 0.083 +144 Q 0.095 +145 I 0.107 +146 S 0.119 +147 P 0.130 +148 I 0.139 +149 K 0.144 +150 G 0.146 +151 F 0.147 +152 V 0.143 +153 L 0.126 +154 V 0.098 +155 T 0.069 +156 C 0.052 +157 D 0.056 +158 D 0.074 +159 L 0.095 +160 G 0.106 +161 P 0.102 +162 V 0.094 +163 D 0.088 +164 L 0.088 +165 Q 0.097 +166 G 0.116 +167 Y 0.142 +168 V 0.167 +169 E 0.182 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000069516.9_ENSMUST00000092163.9_GN:Lyz2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000069516.9_ENSMUST00000092163.9_GN:Lyz2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..9f5563f228046aec1e072d0c4d728ee605697486 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000069516.9_ENSMUST00000092163.9_GN:Lyz2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,149 @@ +>ENSMUSG00000069516.9|ENSMUST00000092163.9|GN:Lyz2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.384 +2 K 0.394 +3 T 0.407 +4 L 0.401 +5 L 0.365 +6 T 0.328 +7 L 0.330 +8 G 0.362 +9 L 0.378 +10 L 0.375 +11 L 0.382 +12 L 0.404 +13 S 0.427 +14 V 0.448 +15 T 0.456 +16 A 0.429 +17 Q 0.360 +18 A 0.267 +19 K 0.184 +20 V 0.124 +21 Y 0.086 +22 E 0.063 +23 R 0.049 +24 C 0.041 +25 E 0.037 +26 F 0.039 +27 A 0.047 +28 R 0.053 +29 T 0.051 +30 L 0.046 +31 K 0.046 +32 R 0.051 +33 N 0.058 +34 G 0.066 +35 M 0.074 +36 A 0.082 +37 G 0.086 +38 Y 0.092 +39 Y 0.106 +40 G 0.123 +41 V 0.127 +42 S 0.114 +43 L 0.093 +44 A 0.074 +45 D 0.061 +46 W 0.054 +47 V 0.053 +48 C 0.056 +49 L 0.062 +50 A 0.068 +51 Q 0.069 +52 H 0.067 +53 E 0.071 +54 S 0.086 +55 N 0.108 +56 Y 0.128 +57 N 0.143 +58 T 0.157 +59 R 0.172 +60 A 0.180 +61 T 0.174 +62 N 0.157 +63 Y 0.139 +64 N 0.133 +65 R 0.140 +66 G 0.152 +67 D 0.159 +68 Q 0.155 +69 S 0.137 +70 T 0.109 +71 D 0.083 +72 Y 0.066 +73 G 0.062 +74 I 0.069 +75 F 0.081 +76 Q 0.090 +77 I 0.090 +78 N 0.085 +79 S 0.081 +80 R 0.081 +81 Y 0.085 +82 W 0.094 +83 C 0.113 +84 N 0.145 +85 D 0.181 +86 G 0.208 +87 K 0.217 +88 T 0.218 +89 P 0.221 +90 R 0.228 +91 A 0.230 +92 V 0.219 +93 N 0.195 +94 A 0.165 +95 C 0.144 +96 G 0.138 +97 I 0.140 +98 N 0.139 +99 C 0.138 +100 S 0.140 +101 A 0.143 +102 L 0.142 +103 L 0.137 +104 Q 0.131 +105 D 0.126 +106 D 0.118 +107 I 0.105 +108 T 0.092 +109 A 0.083 +110 A 0.076 +111 I 0.069 +112 Q 0.065 +113 C 0.064 +114 A 0.063 +115 K 0.061 +116 R 0.062 +117 V 0.064 +118 V 0.064 +119 R 0.064 +120 D 0.070 +121 P 0.083 +122 Q 0.093 +123 G 0.096 +124 I 0.093 +125 R 0.089 +126 A 0.083 +127 W 0.070 +128 V 0.055 +129 A 0.043 +130 W 0.037 +131 R 0.034 +132 A 0.036 +133 H 0.038 +134 C 0.042 +135 Q 0.050 +136 N 0.061 +137 R 0.071 +138 D 0.072 +139 L 0.065 +140 S 0.056 +141 Q 0.049 +142 Y 0.043 +143 I 0.040 +144 R 0.041 +145 N 0.048 +146 C 0.065 +147 G 0.090 +148 V 0.112 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000069516.9_ENSMUST00000092163.9_GN:Lyz2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:15.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000069516.9_ENSMUST00000092163.9_GN:Lyz2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:15.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..84d74986dad226c01c69d915f11798c07597f470 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000069516.9_ENSMUST00000092163.9_GN:Lyz2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:15.caid @@ -0,0 +1,164 @@ +>ENSMUSG00000069516.9|ENSMUST00000092163.9|GN:Lyz2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:15 +1 M 0.348 +2 L 0.372 +3 S 0.405 +4 L 0.419 +5 V 0.396 +6 S 0.369 +7 Q 0.393 +8 Q 0.462 +9 L 0.518 +10 T 0.532 +11 Q 0.533 +12 P 0.544 +13 P 0.554 +14 V 0.553 +15 T 0.545 +16 M 0.534 +17 K 0.518 +18 T 0.497 +19 L 0.471 +20 L 0.440 +21 T 0.426 +22 L 0.452 +23 G 0.491 +24 L 0.504 +25 L 0.485 +26 L 0.458 +27 L 0.439 +28 S 0.436 +29 V 0.447 +30 T 0.450 +31 A 0.422 +32 Q 0.353 +33 A 0.262 +34 K 0.179 +35 V 0.120 +36 Y 0.083 +37 E 0.061 +38 R 0.048 +39 C 0.039 +40 E 0.034 +41 F 0.031 +42 A 0.032 +43 R 0.034 +44 T 0.036 +45 L 0.038 +46 K 0.042 +47 R 0.049 +48 N 0.057 +49 G 0.064 +50 M 0.072 +51 A 0.080 +52 G 0.085 +53 Y 0.091 +54 Y 0.104 +55 G 0.120 +56 V 0.124 +57 S 0.112 +58 L 0.091 +59 A 0.072 +60 D 0.059 +61 W 0.052 +62 V 0.051 +63 C 0.054 +64 L 0.060 +65 A 0.065 +66 Q 0.066 +67 H 0.064 +68 E 0.068 +69 S 0.083 +70 N 0.104 +71 Y 0.125 +72 N 0.141 +73 T 0.155 +74 R 0.169 +75 A 0.178 +76 T 0.171 +77 N 0.153 +78 Y 0.135 +79 N 0.129 +80 R 0.136 +81 G 0.149 +82 D 0.157 +83 Q 0.154 +84 S 0.136 +85 T 0.109 +86 D 0.082 +87 Y 0.066 +88 G 0.061 +89 I 0.068 +90 F 0.081 +91 Q 0.089 +92 I 0.089 +93 N 0.084 +94 S 0.080 +95 R 0.081 +96 Y 0.084 +97 W 0.094 +98 C 0.113 +99 N 0.144 +100 D 0.180 +101 G 0.206 +102 K 0.215 +103 T 0.216 +104 P 0.220 +105 R 0.228 +106 A 0.231 +107 V 0.220 +108 N 0.195 +109 A 0.165 +110 C 0.143 +111 G 0.137 +112 I 0.139 +113 N 0.138 +114 C 0.137 +115 S 0.139 +116 A 0.143 +117 L 0.141 +118 L 0.135 +119 Q 0.129 +120 D 0.124 +121 D 0.116 +122 I 0.103 +123 T 0.091 +124 A 0.083 +125 A 0.075 +126 I 0.068 +127 Q 0.064 +128 C 0.063 +129 A 0.062 +130 K 0.061 +131 R 0.062 +132 V 0.065 +133 V 0.065 +134 R 0.065 +135 D 0.071 +136 P 0.084 +137 Q 0.095 +138 G 0.098 +139 I 0.094 +140 R 0.090 +141 A 0.082 +142 W 0.069 +143 V 0.054 +144 A 0.042 +145 W 0.036 +146 R 0.034 +147 A 0.035 +148 H 0.038 +149 C 0.041 +150 Q 0.049 +151 N 0.061 +152 R 0.070 +153 D 0.071 +154 L 0.065 +155 S 0.056 +156 Q 0.048 +157 Y 0.042 +158 I 0.040 +159 R 0.040 +160 N 0.047 +161 C 0.064 +162 G 0.089 +163 V 0.110 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000070645.6_ENSMUST00000094556.3_GN:Ren1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000070645.6_ENSMUST00000094556.3_GN:Ren1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..dfa7a5cc971f99f9bc1e6ae2338232aa4f15ff1f --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000070645.6_ENSMUST00000094556.3_GN:Ren1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,403 @@ +>ENSMUSG00000070645.6|ENSMUST00000094556.3|GN:Ren1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.365 +2 D 0.356 +3 R 0.363 +4 R 0.395 +5 R 0.425 +6 M 0.429 +7 P 0.409 +8 L 0.374 +9 W 0.333 +10 A 0.303 +11 L 0.292 +12 L 0.292 +13 L 0.304 +14 L 0.335 +15 W 0.382 +16 S 0.429 +17 P 0.465 +18 C 0.482 +19 T 0.488 +20 F 0.496 +21 S 0.516 +22 L 0.543 +23 P 0.565 +24 T 0.569 +25 R 0.543 +26 T 0.478 +27 A 0.381 +28 T 0.276 +29 F 0.192 +30 E 0.139 +31 R 0.109 +32 I 0.095 +33 P 0.094 +34 L 0.102 +35 K 0.120 +36 K 0.144 +37 M 0.157 +38 P 0.147 +39 S 0.122 +40 V 0.104 +41 R 0.101 +42 E 0.105 +43 I 0.108 +44 L 0.110 +45 E 0.119 +46 E 0.140 +47 R 0.167 +48 G 0.185 +49 V 0.179 +50 D 0.156 +51 M 0.132 +52 T 0.124 +53 R 0.125 +54 L 0.128 +55 S 0.128 +56 A 0.131 +57 E 0.142 +58 W 0.166 +59 G 0.195 +60 V 0.219 +61 F 0.240 +62 T 0.265 +63 K 0.300 +64 R 0.337 +65 P 0.362 +66 S 0.367 +67 L 0.363 +68 T 0.364 +69 N 0.374 +70 L 0.381 +71 T 0.372 +72 S 0.352 +73 P 0.330 +74 V 0.303 +75 V 0.263 +76 L 0.208 +77 T 0.153 +78 N 0.115 +79 Y 0.098 +80 L 0.090 +81 N 0.081 +82 T 0.068 +83 Q 0.058 +84 Y 0.051 +85 Y 0.048 +86 G 0.047 +87 E 0.048 +88 I 0.052 +89 G 0.058 +90 I 0.064 +91 G 0.065 +92 T 0.063 +93 P 0.066 +94 P 0.075 +95 Q 0.083 +96 T 0.082 +97 F 0.071 +98 K 0.057 +99 V 0.048 +100 I 0.053 +101 F 0.073 +102 D 0.090 +103 T 0.092 +104 G 0.084 +105 S 0.078 +106 A 0.075 +107 N 0.074 +108 L 0.075 +109 W 0.077 +110 V 0.081 +111 P 0.084 +112 S 0.086 +113 T 0.088 +114 K 0.090 +115 C 0.091 +116 S 0.091 +117 R 0.089 +118 L 0.089 +119 Y 0.093 +120 L 0.101 +121 A 0.106 +122 C 0.105 +123 G 0.098 +124 I 0.092 +125 H 0.090 +126 S 0.091 +127 L 0.092 +128 Y 0.092 +129 E 0.095 +130 S 0.100 +131 S 0.104 +132 D 0.104 +133 S 0.101 +134 S 0.100 +135 S 0.100 +136 Y 0.102 +137 M 0.108 +138 E 0.121 +139 N 0.138 +140 G 0.146 +141 S 0.135 +142 D 0.110 +143 F 0.086 +144 T 0.071 +145 I 0.067 +146 H 0.068 +147 Y 0.070 +148 G 0.075 +149 S 0.084 +150 G 0.096 +151 R 0.109 +152 V 0.118 +153 K 0.119 +154 G 0.118 +155 F 0.118 +156 L 0.114 +157 S 0.106 +158 Q 0.091 +159 D 0.072 +160 S 0.052 +161 V 0.038 +162 T 0.033 +163 V 0.039 +164 G 0.057 +165 G 0.081 +166 I 0.100 +167 T 0.103 +168 V 0.091 +169 T 0.075 +170 Q 0.061 +171 T 0.050 +172 F 0.045 +173 G 0.047 +174 E 0.052 +175 V 0.059 +176 T 0.067 +177 E 0.074 +178 L 0.074 +179 P 0.067 +180 L 0.058 +181 I 0.055 +182 P 0.060 +183 F 0.070 +184 M 0.080 +185 L 0.089 +186 A 0.092 +187 K 0.089 +188 F 0.081 +189 D 0.074 +190 G 0.068 +191 V 0.064 +192 L 0.065 +193 G 0.068 +194 M 0.073 +195 G 0.081 +196 F 0.094 +197 P 0.107 +198 A 0.112 +199 Q 0.113 +200 A 0.119 +201 V 0.134 +202 G 0.152 +203 G 0.162 +204 V 0.152 +205 T 0.122 +206 P 0.088 +207 V 0.064 +208 F 0.055 +209 D 0.056 +210 H 0.060 +211 I 0.067 +212 L 0.077 +213 S 0.083 +214 Q 0.080 +215 G 0.072 +216 V 0.064 +217 L 0.059 +218 K 0.055 +219 E 0.052 +220 E 0.049 +221 V 0.046 +222 F 0.043 +223 S 0.042 +224 V 0.044 +225 Y 0.049 +226 Y 0.063 +227 N 0.084 +228 R 0.108 +229 G 0.125 +230 S 0.128 +231 H 0.123 +232 L 0.120 +233 L 0.118 +234 G 0.109 +235 G 0.096 +236 E 0.087 +237 V 0.084 +238 V 0.085 +239 L 0.091 +240 G 0.101 +241 G 0.110 +242 S 0.111 +243 D 0.102 +244 P 0.088 +245 Q 0.079 +246 H 0.080 +247 Y 0.088 +248 Q 0.100 +249 G 0.109 +250 N 0.111 +251 F 0.105 +252 H 0.098 +253 Y 0.093 +254 V 0.092 +255 S 0.090 +256 I 0.084 +257 S 0.071 +258 K 0.056 +259 T 0.044 +260 D 0.038 +261 S 0.038 +262 W 0.042 +263 Q 0.045 +264 I 0.048 +265 T 0.049 +266 M 0.047 +267 K 0.045 +268 G 0.046 +269 V 0.050 +270 S 0.058 +271 V 0.067 +272 G 0.074 +273 S 0.079 +274 S 0.085 +275 T 0.093 +276 L 0.100 +277 L 0.102 +278 C 0.099 +279 E 0.091 +280 E 0.077 +281 G 0.064 +282 C 0.054 +283 A 0.049 +284 V 0.049 +285 V 0.056 +286 V 0.070 +287 D 0.085 +288 T 0.093 +289 G 0.093 +290 S 0.088 +291 S 0.079 +292 F 0.074 +293 I 0.078 +294 S 0.090 +295 A 0.101 +296 P 0.100 +297 T 0.086 +298 S 0.069 +299 S 0.058 +300 L 0.052 +301 K 0.052 +302 L 0.058 +303 I 0.069 +304 M 0.083 +305 Q 0.095 +306 A 0.099 +307 L 0.097 +308 G 0.094 +309 A 0.093 +310 K 0.094 +311 E 0.096 +312 K 0.097 +313 R 0.094 +314 I 0.088 +315 E 0.083 +316 E 0.081 +317 Y 0.081 +318 V 0.081 +319 V 0.077 +320 N 0.067 +321 C 0.061 +322 S 0.064 +323 Q 0.076 +324 V 0.088 +325 P 0.097 +326 T 0.101 +327 L 0.098 +328 P 0.085 +329 D 0.064 +330 I 0.043 +331 S 0.029 +332 F 0.027 +333 D 0.035 +334 L 0.051 +335 G 0.069 +336 G 0.080 +337 R 0.076 +338 A 0.064 +339 Y 0.054 +340 T 0.054 +341 L 0.056 +342 S 0.054 +343 S 0.048 +344 T 0.043 +345 D 0.042 +346 Y 0.043 +347 V 0.050 +348 L 0.064 +349 Q 0.088 +350 Y 0.114 +351 P 0.136 +352 N 0.153 +353 R 0.167 +354 R 0.173 +355 D 0.164 +356 K 0.142 +357 L 0.116 +358 C 0.093 +359 T 0.076 +360 L 0.065 +361 A 0.058 +362 L 0.055 +363 H 0.058 +364 A 0.069 +365 M 0.086 +366 D 0.105 +367 I 0.121 +368 P 0.128 +369 P 0.127 +370 P 0.120 +371 T 0.111 +372 G 0.099 +373 P 0.088 +374 V 0.080 +375 W 0.074 +376 V 0.068 +377 L 0.063 +378 G 0.063 +379 A 0.067 +380 T 0.068 +381 F 0.061 +382 I 0.052 +383 R 0.048 +384 K 0.048 +385 F 0.046 +386 Y 0.045 +387 T 0.046 +388 E 0.049 +389 F 0.053 +390 D 0.058 +391 R 0.063 +392 H 0.067 +393 N 0.069 +394 N 0.071 +395 R 0.076 +396 I 0.082 +397 G 0.084 +398 F 0.086 +399 A 0.090 +400 L 0.099 +401 A 0.114 +402 R 0.128 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000070645.6_ENSMUST00000094556.3_GN:Ren1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000070645.6_ENSMUST00000094556.3_GN:Ren1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..64043c5e1df8f966ad49fd4b641fcc93c7a6e1e3 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000070645.6_ENSMUST00000094556.3_GN:Ren1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid @@ -0,0 +1,426 @@ +>ENSMUSG00000070645.6|ENSMUST00000094556.3|GN:Ren1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:23 +1 M 0.295 +2 V 0.320 +3 C 0.352 +4 I 0.369 +5 K 0.372 +6 E 0.389 +7 G 0.436 +8 S 0.491 +9 G 0.512 +10 G 0.495 +11 L 0.468 +12 G 0.443 +13 Y 0.400 +14 T 0.349 +15 A 0.338 +16 L 0.375 +17 R 0.422 +18 K 0.456 +19 P 0.483 +20 W 0.516 +21 L 0.553 +22 N 0.577 +23 Q 0.577 +24 M 0.561 +25 D 0.544 +26 R 0.533 +27 R 0.524 +28 R 0.506 +29 M 0.480 +30 P 0.460 +31 L 0.453 +32 W 0.455 +33 A 0.453 +34 L 0.431 +35 L 0.394 +36 L 0.371 +37 L 0.384 +38 W 0.422 +39 S 0.473 +40 P 0.525 +41 C 0.559 +42 T 0.563 +43 F 0.554 +44 S 0.554 +45 L 0.567 +46 P 0.581 +47 T 0.580 +48 R 0.552 +49 T 0.484 +50 A 0.383 +51 T 0.275 +52 F 0.191 +53 E 0.138 +54 R 0.108 +55 I 0.096 +56 P 0.095 +57 L 0.104 +58 K 0.123 +59 K 0.149 +60 M 0.163 +61 P 0.153 +62 S 0.127 +63 V 0.108 +64 R 0.105 +65 E 0.109 +66 I 0.111 +67 L 0.113 +68 E 0.121 +69 E 0.140 +70 R 0.163 +71 G 0.176 +72 V 0.169 +73 D 0.144 +74 M 0.122 +75 T 0.114 +76 R 0.117 +77 L 0.120 +78 S 0.121 +79 A 0.124 +80 E 0.136 +81 W 0.160 +82 G 0.189 +83 V 0.213 +84 F 0.234 +85 T 0.260 +86 K 0.295 +87 R 0.335 +88 P 0.363 +89 S 0.371 +90 L 0.370 +91 T 0.374 +92 N 0.387 +93 L 0.395 +94 T 0.386 +95 S 0.365 +96 P 0.342 +97 V 0.313 +98 V 0.270 +99 L 0.212 +100 T 0.154 +101 N 0.114 +102 Y 0.096 +103 L 0.089 +104 N 0.079 +105 T 0.067 +106 Q 0.057 +107 Y 0.050 +108 Y 0.047 +109 G 0.046 +110 E 0.047 +111 I 0.050 +112 G 0.057 +113 I 0.063 +114 G 0.064 +115 T 0.062 +116 P 0.066 +117 P 0.076 +118 Q 0.084 +119 T 0.082 +120 F 0.071 +121 K 0.057 +122 V 0.048 +123 I 0.053 +124 F 0.072 +125 D 0.089 +126 T 0.091 +127 G 0.084 +128 S 0.078 +129 A 0.075 +130 N 0.074 +131 L 0.075 +132 W 0.078 +133 V 0.082 +134 P 0.085 +135 S 0.086 +136 T 0.088 +137 K 0.090 +138 C 0.092 +139 S 0.091 +140 R 0.089 +141 L 0.089 +142 Y 0.094 +143 L 0.101 +144 A 0.107 +145 C 0.105 +146 G 0.099 +147 I 0.094 +148 H 0.092 +149 S 0.093 +150 L 0.093 +151 Y 0.092 +152 E 0.093 +153 S 0.097 +154 S 0.101 +155 D 0.101 +156 S 0.100 +157 S 0.098 +158 S 0.098 +159 Y 0.100 +160 M 0.106 +161 E 0.119 +162 N 0.136 +163 G 0.144 +164 S 0.133 +165 D 0.109 +166 F 0.085 +167 T 0.071 +168 I 0.067 +169 H 0.069 +170 Y 0.071 +171 G 0.076 +172 S 0.084 +173 G 0.096 +174 R 0.109 +175 V 0.117 +176 K 0.118 +177 G 0.117 +178 F 0.116 +179 L 0.113 +180 S 0.104 +181 Q 0.090 +182 D 0.071 +183 S 0.051 +184 V 0.037 +185 T 0.032 +186 V 0.038 +187 G 0.055 +188 G 0.078 +189 I 0.095 +190 T 0.097 +191 V 0.086 +192 T 0.071 +193 Q 0.058 +194 T 0.049 +195 F 0.044 +196 G 0.046 +197 E 0.051 +198 V 0.057 +199 T 0.065 +200 E 0.071 +201 L 0.071 +202 P 0.064 +203 L 0.055 +204 I 0.053 +205 P 0.058 +206 F 0.068 +207 M 0.078 +208 L 0.087 +209 A 0.090 +210 K 0.087 +211 F 0.079 +212 D 0.072 +213 G 0.066 +214 V 0.062 +215 L 0.062 +216 G 0.065 +217 M 0.070 +218 G 0.078 +219 F 0.091 +220 P 0.103 +221 A 0.108 +222 Q 0.108 +223 A 0.114 +224 V 0.128 +225 G 0.145 +226 G 0.155 +227 V 0.146 +228 T 0.117 +229 P 0.084 +230 V 0.061 +231 F 0.053 +232 D 0.053 +233 H 0.057 +234 I 0.064 +235 L 0.074 +236 S 0.080 +237 Q 0.077 +238 G 0.067 +239 V 0.059 +240 L 0.055 +241 K 0.052 +242 E 0.050 +243 E 0.048 +244 V 0.045 +245 F 0.043 +246 S 0.041 +247 V 0.043 +248 Y 0.049 +249 Y 0.061 +250 N 0.081 +251 R 0.104 +252 G 0.121 +253 S 0.124 +254 H 0.120 +255 L 0.118 +256 L 0.117 +257 G 0.108 +258 G 0.095 +259 E 0.086 +260 V 0.083 +261 V 0.084 +262 L 0.091 +263 G 0.101 +264 G 0.110 +265 S 0.111 +266 D 0.103 +267 P 0.089 +268 Q 0.079 +269 H 0.080 +270 Y 0.089 +271 Q 0.101 +272 G 0.111 +273 N 0.113 +274 F 0.107 +275 H 0.100 +276 Y 0.095 +277 V 0.093 +278 S 0.092 +279 I 0.085 +280 S 0.072 +281 K 0.057 +282 T 0.044 +283 D 0.038 +284 S 0.038 +285 W 0.041 +286 Q 0.045 +287 I 0.047 +288 T 0.048 +289 M 0.046 +290 K 0.044 +291 G 0.045 +292 V 0.049 +293 S 0.056 +294 V 0.065 +295 G 0.073 +296 S 0.080 +297 S 0.087 +298 T 0.095 +299 L 0.101 +300 L 0.103 +301 C 0.100 +302 E 0.092 +303 E 0.080 +304 G 0.067 +305 C 0.057 +306 A 0.051 +307 V 0.051 +308 V 0.058 +309 V 0.072 +310 D 0.087 +311 T 0.096 +312 G 0.096 +313 S 0.090 +314 S 0.081 +315 F 0.075 +316 I 0.080 +317 S 0.093 +318 A 0.104 +319 P 0.103 +320 T 0.089 +321 S 0.072 +322 S 0.059 +323 L 0.053 +324 K 0.053 +325 L 0.059 +326 I 0.069 +327 M 0.083 +328 Q 0.094 +329 A 0.099 +330 L 0.098 +331 G 0.096 +332 A 0.096 +333 K 0.097 +334 E 0.097 +335 K 0.097 +336 R 0.094 +337 I 0.088 +338 E 0.084 +339 E 0.083 +340 Y 0.083 +341 V 0.083 +342 V 0.078 +343 N 0.068 +344 C 0.062 +345 S 0.065 +346 Q 0.077 +347 V 0.090 +348 P 0.098 +349 T 0.101 +350 L 0.098 +351 P 0.085 +352 D 0.064 +353 I 0.043 +354 S 0.030 +355 F 0.027 +356 D 0.035 +357 L 0.052 +358 G 0.070 +359 G 0.080 +360 R 0.076 +361 A 0.063 +362 Y 0.054 +363 T 0.053 +364 L 0.056 +365 S 0.054 +366 S 0.048 +367 T 0.043 +368 D 0.041 +369 Y 0.043 +370 V 0.049 +371 L 0.063 +372 Q 0.086 +373 Y 0.112 +374 P 0.134 +375 N 0.151 +376 R 0.166 +377 R 0.172 +378 D 0.163 +379 K 0.142 +380 L 0.115 +381 C 0.092 +382 T 0.075 +383 L 0.064 +384 A 0.058 +385 L 0.054 +386 H 0.057 +387 A 0.069 +388 M 0.086 +389 D 0.106 +390 I 0.122 +391 P 0.129 +392 P 0.128 +393 P 0.121 +394 T 0.112 +395 G 0.101 +396 P 0.089 +397 V 0.081 +398 W 0.075 +399 V 0.069 +400 L 0.064 +401 G 0.064 +402 A 0.068 +403 T 0.069 +404 F 0.062 +405 I 0.053 +406 R 0.049 +407 K 0.049 +408 F 0.047 +409 Y 0.046 +410 T 0.047 +411 E 0.050 +412 F 0.054 +413 D 0.058 +414 R 0.063 +415 H 0.066 +416 N 0.068 +417 N 0.071 +418 R 0.076 +419 I 0.082 +420 G 0.085 +421 F 0.087 +422 A 0.091 +423 L 0.100 +424 A 0.116 +425 R 0.130 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000073775.5_ENSMUST00000102738.4_GN:Kti12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000073775.5_ENSMUST00000102738.4_GN:Kti12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..2baae4934b83c7bd21ae1a20f062cf4882687a41 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000073775.5_ENSMUST00000102738.4_GN:Kti12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,352 @@ +>ENSMUSG00000073775.5|ENSMUST00000102738.4|GN:Kti12|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.108 +2 P 0.091 +3 L 0.072 +4 V 0.060 +5 V 0.054 +6 V 0.053 +7 C 0.057 +8 G 0.064 +9 L 0.069 +10 P 0.070 +11 S 0.065 +12 S 0.058 +13 G 0.051 +14 K 0.043 +15 S 0.039 +16 Q 0.039 +17 R 0.043 +18 T 0.045 +19 E 0.043 +20 E 0.044 +21 L 0.053 +22 R 0.065 +23 R 0.070 +24 A 0.064 +25 L 0.057 +26 A 0.055 +27 S 0.060 +28 E 0.072 +29 G 0.082 +30 R 0.081 +31 A 0.068 +32 V 0.053 +33 Y 0.044 +34 V 0.044 +35 V 0.046 +36 D 0.046 +37 D 0.047 +38 A 0.052 +39 S 0.064 +40 V 0.081 +41 L 0.100 +42 G 0.120 +43 A 0.136 +44 Q 0.144 +45 D 0.141 +46 P 0.131 +47 T 0.119 +48 V 0.111 +49 Y 0.113 +50 G 0.119 +51 D 0.116 +52 S 0.103 +53 A 0.088 +54 G 0.076 +55 E 0.066 +56 K 0.059 +57 A 0.058 +58 L 0.062 +59 R 0.061 +60 A 0.057 +61 A 0.054 +62 L 0.059 +63 R 0.068 +64 A 0.069 +65 A 0.059 +66 V 0.046 +67 E 0.040 +68 R 0.039 +69 R 0.044 +70 L 0.052 +71 S 0.062 +72 R 0.074 +73 Q 0.091 +74 D 0.108 +75 V 0.116 +76 V 0.110 +77 I 0.091 +78 L 0.070 +79 D 0.057 +80 S 0.057 +81 V 0.067 +82 N 0.076 +83 Y 0.075 +84 I 0.064 +85 K 0.052 +86 G 0.043 +87 F 0.039 +88 R 0.036 +89 Y 0.033 +90 E 0.033 +91 L 0.037 +92 Y 0.042 +93 C 0.046 +94 L 0.048 +95 A 0.050 +96 R 0.057 +97 A 0.068 +98 A 0.082 +99 R 0.093 +100 T 0.097 +101 P 0.089 +102 L 0.073 +103 C 0.060 +104 L 0.056 +105 L 0.057 +106 Y 0.058 +107 C 0.059 +108 V 0.065 +109 R 0.076 +110 P 0.093 +111 N 0.116 +112 W 0.147 +113 P 0.183 +114 S 0.214 +115 R 0.231 +116 E 0.235 +117 L 0.245 +118 R 0.273 +119 E 0.314 +120 A 0.355 +121 S 0.394 +122 A 0.438 +123 S 0.483 +124 E 0.516 +125 N 0.530 +126 R 0.525 +127 D 0.504 +128 L 0.474 +129 A 0.446 +130 V 0.421 +131 S 0.400 +132 V 0.382 +133 S 0.372 +134 W 0.377 +135 R 0.403 +136 P 0.448 +137 R 0.501 +138 A 0.554 +139 E 0.601 +140 T 0.639 +141 G 0.666 +142 G 0.687 +143 K 0.701 +144 S 0.707 +145 Q 0.707 +146 A 0.706 +147 A 0.707 +148 G 0.706 +149 A 0.691 +150 V 0.649 +151 E 0.589 +152 E 0.556 +153 Q 0.573 +154 R 0.605 +155 A 0.616 +156 T 0.619 +157 S 0.639 +158 P 0.675 +159 V 0.708 +160 A 0.731 +161 N 0.742 +162 G 0.745 +163 G 0.736 +164 V 0.716 +165 L 0.694 +166 A 0.679 +167 A 0.662 +168 V 0.639 +169 S 0.624 +170 K 0.622 +171 E 0.621 +172 L 0.605 +173 D 0.580 +174 P 0.568 +175 E 0.575 +176 E 0.583 +177 I 0.579 +178 L 0.576 +179 P 0.587 +180 S 0.614 +181 N 0.645 +182 P 0.674 +183 S 0.699 +184 A 0.709 +185 V 0.694 +186 M 0.668 +187 T 0.659 +188 P 0.673 +189 G 0.693 +190 S 0.702 +191 E 0.700 +192 K 0.690 +193 S 0.672 +194 A 0.650 +195 E 0.631 +196 P 0.607 +197 A 0.558 +198 S 0.476 +199 C 0.378 +200 A 0.288 +201 F 0.216 +202 P 0.163 +203 P 0.124 +204 E 0.096 +205 V 0.079 +206 L 0.072 +207 E 0.072 +208 S 0.080 +209 L 0.092 +210 A 0.097 +211 L 0.092 +212 R 0.087 +213 F 0.089 +214 E 0.098 +215 S 0.107 +216 P 0.108 +217 D 0.102 +218 S 0.093 +219 R 0.089 +220 N 0.091 +221 R 0.093 +222 W 0.088 +223 D 0.075 +224 R 0.060 +225 P 0.049 +226 L 0.045 +227 F 0.044 +228 T 0.046 +229 V 0.052 +230 V 0.063 +231 G 0.076 +232 L 0.086 +233 E 0.088 +234 E 0.082 +235 P 0.070 +236 L 0.055 +237 P 0.040 +238 L 0.030 +239 A 0.026 +240 E 0.026 +241 I 0.028 +242 R 0.029 +243 S 0.030 +244 A 0.035 +245 L 0.045 +246 F 0.066 +247 E 0.096 +248 N 0.127 +249 R 0.151 +250 A 0.171 +251 P 0.197 +252 P 0.230 +253 P 0.267 +254 H 0.308 +255 Q 0.356 +256 S 0.408 +257 T 0.454 +258 Q 0.488 +259 S 0.514 +260 Q 0.526 +261 P 0.520 +262 L 0.497 +263 A 0.466 +264 S 0.426 +265 G 0.365 +266 S 0.285 +267 F 0.203 +268 L 0.141 +269 H 0.110 +270 Q 0.110 +271 L 0.124 +272 D 0.135 +273 Q 0.136 +274 A 0.126 +275 T 0.104 +276 S 0.080 +277 Q 0.065 +278 V 0.059 +279 L 0.057 +280 T 0.054 +281 A 0.053 +282 V 0.053 +283 M 0.054 +284 E 0.056 +285 A 0.059 +286 Q 0.063 +287 K 0.070 +288 S 0.081 +289 A 0.096 +290 V 0.108 +291 P 0.111 +292 G 0.105 +293 D 0.096 +294 F 0.093 +295 L 0.099 +296 K 0.110 +297 L 0.123 +298 P 0.134 +299 G 0.145 +300 T 0.156 +301 T 0.162 +302 E 0.157 +303 P 0.141 +304 L 0.124 +305 R 0.110 +306 F 0.099 +307 T 0.089 +308 R 0.078 +309 P 0.068 +310 L 0.059 +311 T 0.051 +312 L 0.046 +313 A 0.043 +314 E 0.044 +315 L 0.050 +316 S 0.058 +317 R 0.063 +318 L 0.058 +319 R 0.048 +320 R 0.040 +321 Q 0.037 +322 F 0.044 +323 I 0.057 +324 S 0.068 +325 Y 0.072 +326 T 0.075 +327 K 0.085 +328 M 0.103 +329 H 0.121 +330 P 0.133 +331 N 0.139 +332 N 0.141 +333 E 0.135 +334 N 0.121 +335 L 0.103 +336 P 0.088 +337 Q 0.073 +338 L 0.059 +339 A 0.049 +340 N 0.044 +341 M 0.044 +342 F 0.050 +343 L 0.061 +344 Q 0.069 +345 Y 0.068 +346 L 0.065 +347 N 0.065 +348 Q 0.069 +349 S 0.080 +350 L 0.096 +351 H 0.109 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000073775.5_ENSMUST00000102738.4_GN:Kti12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000073775.5_ENSMUST00000102738.4_GN:Kti12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1fc46ecf1e7a51261539f3a78a208ebbe24ef893 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000073775.5_ENSMUST00000102738.4_GN:Kti12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid @@ -0,0 +1,357 @@ +>ENSMUSG00000073775.5|ENSMUST00000102738.4|GN:Kti12|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:5 +1 M 0.384 +2 P 0.365 +3 L 0.325 +4 E 0.266 +5 I 0.194 +6 M 0.127 +7 P 0.080 +8 L 0.057 +9 V 0.050 +10 V 0.049 +11 V 0.049 +12 C 0.054 +13 G 0.061 +14 L 0.066 +15 P 0.066 +16 S 0.061 +17 S 0.054 +18 G 0.048 +19 K 0.041 +20 S 0.038 +21 Q 0.039 +22 R 0.043 +23 T 0.045 +24 E 0.042 +25 E 0.043 +26 L 0.052 +27 R 0.065 +28 R 0.069 +29 A 0.063 +30 L 0.056 +31 A 0.055 +32 S 0.060 +33 E 0.071 +34 G 0.080 +35 R 0.078 +36 A 0.064 +37 V 0.050 +38 Y 0.043 +39 V 0.043 +40 V 0.045 +41 D 0.045 +42 D 0.046 +43 A 0.051 +44 S 0.063 +45 V 0.080 +46 L 0.099 +47 G 0.119 +48 A 0.135 +49 Q 0.145 +50 D 0.144 +51 P 0.134 +52 T 0.122 +53 V 0.114 +54 Y 0.116 +55 G 0.122 +56 D 0.120 +57 S 0.106 +58 A 0.090 +59 G 0.077 +60 E 0.066 +61 K 0.058 +62 A 0.058 +63 L 0.061 +64 R 0.060 +65 A 0.056 +66 A 0.053 +67 L 0.058 +68 R 0.067 +69 A 0.068 +70 A 0.058 +71 V 0.045 +72 E 0.038 +73 R 0.037 +74 R 0.042 +75 L 0.048 +76 S 0.056 +77 R 0.065 +78 Q 0.077 +79 D 0.090 +80 V 0.097 +81 V 0.094 +82 I 0.082 +83 L 0.066 +84 D 0.055 +85 S 0.055 +86 V 0.065 +87 N 0.074 +88 Y 0.073 +89 I 0.062 +90 K 0.050 +91 G 0.042 +92 F 0.038 +93 R 0.034 +94 Y 0.031 +95 E 0.032 +96 L 0.035 +97 Y 0.040 +98 C 0.044 +99 L 0.045 +100 A 0.048 +101 R 0.054 +102 A 0.066 +103 A 0.079 +104 R 0.091 +105 T 0.095 +106 P 0.087 +107 L 0.071 +108 C 0.057 +109 L 0.053 +110 L 0.055 +111 Y 0.056 +112 C 0.058 +113 V 0.064 +114 R 0.077 +115 P 0.095 +116 N 0.120 +117 W 0.152 +118 P 0.190 +119 S 0.222 +120 R 0.239 +121 E 0.243 +122 L 0.252 +123 R 0.281 +124 E 0.322 +125 A 0.363 +126 S 0.401 +127 A 0.443 +128 S 0.486 +129 E 0.520 +130 N 0.534 +131 R 0.530 +132 D 0.510 +133 L 0.481 +134 A 0.454 +135 V 0.430 +136 S 0.408 +137 V 0.389 +138 S 0.377 +139 W 0.382 +140 R 0.410 +141 P 0.458 +142 R 0.513 +143 A 0.566 +144 E 0.613 +145 T 0.648 +146 G 0.673 +147 G 0.693 +148 K 0.707 +149 S 0.712 +150 Q 0.712 +151 A 0.710 +152 A 0.710 +153 G 0.708 +154 A 0.693 +155 V 0.650 +156 E 0.590 +157 E 0.557 +158 Q 0.575 +159 R 0.608 +160 A 0.621 +161 T 0.624 +162 S 0.643 +163 P 0.677 +164 V 0.711 +165 A 0.734 +166 N 0.745 +167 G 0.747 +168 G 0.738 +169 V 0.718 +170 L 0.697 +171 A 0.683 +172 A 0.669 +173 V 0.648 +174 S 0.633 +175 K 0.631 +176 E 0.629 +177 L 0.611 +178 D 0.585 +179 P 0.572 +180 E 0.579 +181 E 0.589 +182 I 0.587 +183 L 0.583 +184 P 0.594 +185 S 0.620 +186 N 0.650 +187 P 0.678 +188 S 0.703 +189 A 0.712 +190 V 0.696 +191 M 0.669 +192 T 0.660 +193 P 0.675 +194 G 0.694 +195 S 0.703 +196 E 0.701 +197 K 0.691 +198 S 0.672 +199 A 0.650 +200 E 0.631 +201 P 0.607 +202 A 0.557 +203 S 0.476 +204 C 0.379 +205 A 0.289 +206 F 0.216 +207 P 0.163 +208 P 0.124 +209 E 0.096 +210 V 0.079 +211 L 0.071 +212 E 0.071 +213 S 0.079 +214 L 0.091 +215 A 0.096 +216 L 0.092 +217 R 0.086 +218 F 0.089 +219 E 0.098 +220 S 0.106 +221 P 0.108 +222 D 0.102 +223 S 0.093 +224 R 0.088 +225 N 0.089 +226 R 0.090 +227 W 0.085 +228 D 0.072 +229 R 0.058 +230 P 0.048 +231 L 0.044 +232 F 0.044 +233 T 0.047 +234 V 0.053 +235 V 0.064 +236 G 0.078 +237 L 0.088 +238 E 0.090 +239 E 0.083 +240 P 0.071 +241 L 0.055 +242 P 0.040 +243 L 0.029 +244 A 0.025 +245 E 0.026 +246 I 0.027 +247 R 0.028 +248 S 0.030 +249 A 0.034 +250 L 0.045 +251 F 0.065 +252 E 0.094 +253 N 0.123 +254 R 0.146 +255 A 0.167 +256 P 0.195 +257 P 0.231 +258 P 0.270 +259 H 0.312 +260 Q 0.361 +261 S 0.411 +262 T 0.455 +263 Q 0.487 +264 S 0.511 +265 Q 0.524 +266 P 0.518 +267 L 0.496 +268 A 0.467 +269 S 0.428 +270 G 0.368 +271 S 0.287 +272 F 0.204 +273 L 0.140 +274 H 0.110 +275 Q 0.109 +276 L 0.123 +277 D 0.134 +278 Q 0.136 +279 A 0.126 +280 T 0.105 +281 S 0.081 +282 Q 0.065 +283 V 0.060 +284 L 0.057 +285 T 0.055 +286 A 0.054 +287 V 0.054 +288 M 0.055 +289 E 0.057 +290 A 0.060 +291 Q 0.064 +292 K 0.071 +293 S 0.083 +294 A 0.097 +295 V 0.110 +296 P 0.113 +297 G 0.107 +298 D 0.098 +299 F 0.095 +300 L 0.100 +301 K 0.112 +302 L 0.125 +303 P 0.135 +304 G 0.146 +305 T 0.157 +306 T 0.163 +307 E 0.157 +308 P 0.142 +309 L 0.124 +310 R 0.110 +311 F 0.099 +312 T 0.089 +313 R 0.078 +314 P 0.067 +315 L 0.059 +316 T 0.051 +317 L 0.046 +318 A 0.043 +319 E 0.044 +320 L 0.050 +321 S 0.059 +322 R 0.063 +323 L 0.059 +324 R 0.049 +325 R 0.040 +326 Q 0.037 +327 F 0.043 +328 I 0.056 +329 S 0.067 +330 Y 0.071 +331 T 0.074 +332 K 0.085 +333 M 0.103 +334 H 0.121 +335 P 0.133 +336 N 0.139 +337 N 0.141 +338 E 0.135 +339 N 0.120 +340 L 0.102 +341 P 0.087 +342 Q 0.072 +343 L 0.058 +344 A 0.049 +345 N 0.044 +346 M 0.044 +347 F 0.050 +348 L 0.060 +349 Q 0.068 +350 Y 0.068 +351 L 0.065 +352 N 0.065 +353 Q 0.069 +354 S 0.079 +355 L 0.096 +356 H 0.109 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000074211.5_ENSMUST00000098586.5_GN:Sdhaf1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000074211.5_ENSMUST00000098586.5_GN:Sdhaf1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4082d3fae9ef6557ebf956c7f4b3d175151ffb64 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000074211.5_ENSMUST00000098586.5_GN:Sdhaf1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,119 @@ +>ENSMUSG00000074211.5|ENSMUST00000098586.5|GN:Sdhaf1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.409 +2 S 0.392 +3 R 0.349 +4 P 0.278 +5 S 0.196 +6 R 0.128 +7 L 0.084 +8 Q 0.061 +9 R 0.051 +10 Q 0.048 +11 V 0.050 +12 L 0.055 +13 S 0.061 +14 L 0.062 +15 Y 0.061 +16 R 0.064 +17 E 0.067 +18 L 0.063 +19 L 0.058 +20 R 0.058 +21 A 0.069 +22 G 0.088 +23 R 0.109 +24 G 0.126 +25 T 0.130 +26 P 0.118 +27 G 0.097 +28 A 0.074 +29 E 0.057 +30 A 0.048 +31 R 0.046 +32 V 0.047 +33 R 0.046 +34 A 0.043 +35 E 0.043 +36 F 0.045 +37 R 0.047 +38 Q 0.051 +39 H 0.063 +40 A 0.086 +41 S 0.114 +42 L 0.138 +43 P 0.152 +44 R 0.154 +45 T 0.145 +46 D 0.125 +47 V 0.099 +48 L 0.077 +49 R 0.065 +50 I 0.058 +51 E 0.051 +52 Y 0.046 +53 L 0.050 +54 Y 0.061 +55 R 0.069 +56 R 0.067 +57 G 0.058 +58 R 0.049 +59 R 0.044 +60 Q 0.045 +61 L 0.051 +62 Q 0.064 +63 L 0.084 +64 L 0.113 +65 R 0.154 +66 S 0.208 +67 G 0.276 +68 H 0.343 +69 A 0.390 +70 T 0.407 +71 A 0.393 +72 M 0.363 +73 G 0.337 +74 T 0.331 +75 F 0.351 +76 V 0.395 +77 R 0.457 +78 P 0.522 +79 R 0.578 +80 G 0.622 +81 P 0.657 +82 A 0.683 +83 E 0.699 +84 E 0.709 +85 P 0.721 +86 G 0.736 +87 D 0.748 +88 A 0.750 +89 T 0.745 +90 A 0.745 +91 P 0.756 +92 G 0.772 +93 T 0.782 +94 R 0.781 +95 L 0.770 +96 D 0.755 +97 D 0.740 +98 G 0.726 +99 G 0.711 +100 A 0.703 +101 P 0.709 +102 K 0.724 +103 N 0.732 +104 S 0.724 +105 C 0.705 +106 E 0.692 +107 D 0.686 +108 T 0.666 +109 G 0.626 +110 A 0.605 +111 R 0.639 +112 E 0.697 +113 T 0.728 +114 R 0.721 +115 S 0.688 +116 D 0.635 +117 G 0.570 +118 R 0.520 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000074211.5_ENSMUST00000098586.5_GN:Sdhaf1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:89.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000074211.5_ENSMUST00000098586.5_GN:Sdhaf1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:89.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..99bc9501ba0eaf0cebf3136fc8374f4fb47a4323 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000074211.5_ENSMUST00000098586.5_GN:Sdhaf1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:89.caid @@ -0,0 +1,208 @@ +>ENSMUSG00000074211.5|ENSMUST00000098586.5|GN:Sdhaf1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:89 +1 M 0.463 +2 L 0.501 +3 P 0.557 +4 L 0.608 +5 K 0.639 +6 F 0.651 +7 R 0.653 +8 N 0.648 +9 I 0.637 +10 Q 0.629 +11 D 0.631 +12 C 0.634 +13 K 0.629 +14 A 0.625 +15 L 0.637 +16 K 0.661 +17 N 0.686 +18 Y 0.705 +19 S 0.716 +20 L 0.713 +21 E 0.698 +22 W 0.688 +23 P 0.700 +24 G 0.729 +25 A 0.752 +26 P 0.759 +27 E 0.756 +28 T 0.755 +29 P 0.764 +30 P 0.784 +31 T 0.805 +32 S 0.819 +33 R 0.822 +34 A 0.817 +35 S 0.803 +36 Q 0.784 +37 D 0.760 +38 V 0.734 +39 L 0.705 +40 Q 0.674 +41 Y 0.651 +42 W 0.657 +43 P 0.700 +44 I 0.756 +45 R 0.800 +46 C 0.824 +47 G 0.836 +48 S 0.842 +49 A 0.847 +50 G 0.849 +51 E 0.852 +52 Q 0.854 +53 E 0.856 +54 A 0.856 +55 G 0.854 +56 L 0.850 +57 L 0.844 +58 A 0.835 +59 D 0.824 +60 V 0.818 +61 P 0.822 +62 V 0.828 +63 A 0.827 +64 L 0.821 +65 P 0.816 +66 V 0.814 +67 S 0.812 +68 F 0.809 +69 S 0.805 +70 A 0.799 +71 L 0.794 +72 C 0.797 +73 V 0.807 +74 G 0.813 +75 A 0.811 +76 V 0.804 +77 L 0.800 +78 P 0.805 +79 A 0.816 +80 S 0.819 +81 V 0.812 +82 G 0.804 +83 P 0.806 +84 H 0.814 +85 R 0.819 +86 D 0.817 +87 A 0.805 +88 A 0.780 +89 V 0.732 +90 M 0.656 +91 S 0.560 +92 R 0.450 +93 P 0.329 +94 S 0.216 +95 R 0.131 +96 L 0.083 +97 Q 0.060 +98 R 0.050 +99 Q 0.046 +100 V 0.046 +101 L 0.049 +102 S 0.053 +103 L 0.056 +104 Y 0.058 +105 R 0.062 +106 E 0.066 +107 L 0.062 +108 L 0.055 +109 R 0.055 +110 A 0.064 +111 G 0.079 +112 R 0.097 +113 G 0.114 +114 T 0.120 +115 P 0.109 +116 G 0.087 +117 A 0.066 +118 E 0.050 +119 A 0.042 +120 R 0.042 +121 V 0.044 +122 R 0.043 +123 A 0.041 +124 E 0.042 +125 F 0.044 +126 R 0.046 +127 Q 0.047 +128 H 0.056 +129 A 0.075 +130 S 0.099 +131 L 0.120 +132 P 0.132 +133 R 0.134 +134 T 0.128 +135 D 0.114 +136 V 0.093 +137 L 0.073 +138 R 0.061 +139 I 0.054 +140 E 0.047 +141 Y 0.042 +142 L 0.043 +143 Y 0.049 +144 R 0.053 +145 R 0.051 +146 G 0.046 +147 R 0.041 +148 R 0.038 +149 Q 0.039 +150 L 0.045 +151 Q 0.057 +152 L 0.074 +153 L 0.097 +154 R 0.127 +155 S 0.168 +156 G 0.223 +157 H 0.283 +158 A 0.330 +159 T 0.348 +160 A 0.336 +161 M 0.309 +162 G 0.291 +163 T 0.290 +164 F 0.308 +165 V 0.349 +166 R 0.410 +167 P 0.485 +168 R 0.560 +169 G 0.624 +170 P 0.673 +171 A 0.704 +172 E 0.720 +173 E 0.733 +174 P 0.750 +175 G 0.769 +176 D 0.783 +177 A 0.783 +178 T 0.776 +179 A 0.775 +180 P 0.787 +181 G 0.807 +182 T 0.822 +183 R 0.823 +184 L 0.812 +185 D 0.796 +186 D 0.782 +187 G 0.770 +188 G 0.759 +189 A 0.755 +190 P 0.764 +191 K 0.778 +192 N 0.772 +193 S 0.726 +194 C 0.655 +195 E 0.613 +196 D 0.630 +197 T 0.655 +198 G 0.643 +199 A 0.632 +200 R 0.669 +201 E 0.729 +202 T 0.761 +203 R 0.753 +204 S 0.721 +205 D 0.667 +206 G 0.599 +207 R 0.547 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000074340.10_ENSMUST00000000573.9_GN:Ovgp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000074340.10_ENSMUST00000000573.9_GN:Ovgp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f7bd42c332d938cb2ab3b3c0d782f27ac8d40756 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000074340.10_ENSMUST00000000573.9_GN:Ovgp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,722 @@ +>ENSMUSG00000074340.10|ENSMUST00000000573.9|GN:Ovgp1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.238 +2 G 0.220 +3 R 0.191 +4 L 0.166 +5 L 0.158 +6 L 0.166 +7 L 0.185 +8 A 0.206 +9 G 0.214 +10 L 0.209 +11 V 0.211 +12 L 0.233 +13 L 0.265 +14 M 0.297 +15 K 0.327 +16 H 0.360 +17 S 0.387 +18 D 0.391 +19 G 0.361 +20 T 0.296 +21 A 0.213 +22 Y 0.136 +23 K 0.084 +24 L 0.055 +25 V 0.041 +26 C 0.036 +27 Y 0.035 +28 F 0.035 +29 T 0.033 +30 N 0.035 +31 W 0.043 +32 A 0.056 +33 H 0.071 +34 S 0.089 +35 R 0.110 +36 P 0.130 +37 G 0.142 +38 P 0.146 +39 A 0.142 +40 S 0.129 +41 I 0.106 +42 M 0.082 +43 P 0.067 +44 H 0.065 +45 D 0.069 +46 L 0.072 +47 D 0.068 +48 P 0.063 +49 F 0.062 +50 L 0.067 +51 C 0.069 +52 T 0.063 +53 H 0.055 +54 L 0.050 +55 I 0.048 +56 F 0.047 +57 A 0.046 +58 F 0.047 +59 A 0.050 +60 S 0.055 +61 M 0.061 +62 S 0.067 +63 N 0.074 +64 N 0.080 +65 Q 0.084 +66 I 0.088 +67 V 0.094 +68 A 0.099 +69 K 0.095 +70 N 0.083 +71 L 0.072 +72 Q 0.070 +73 D 0.075 +74 E 0.082 +75 N 0.084 +76 V 0.078 +77 L 0.067 +78 Y 0.055 +79 P 0.049 +80 E 0.048 +81 F 0.045 +82 N 0.042 +83 K 0.044 +84 L 0.050 +85 K 0.056 +86 E 0.059 +87 R 0.061 +88 N 0.064 +89 R 0.067 +90 E 0.068 +91 L 0.068 +92 K 0.068 +93 T 0.068 +94 L 0.067 +95 L 0.068 +96 S 0.076 +97 I 0.093 +98 G 0.107 +99 G 0.109 +100 W 0.099 +101 N 0.086 +102 F 0.078 +103 G 0.072 +104 T 0.065 +105 S 0.058 +106 R 0.054 +107 F 0.055 +108 T 0.061 +109 A 0.070 +110 M 0.080 +111 L 0.085 +112 S 0.084 +113 T 0.077 +114 L 0.067 +115 A 0.059 +116 N 0.052 +117 R 0.046 +118 E 0.042 +119 K 0.040 +120 F 0.038 +121 I 0.035 +122 D 0.034 +123 S 0.040 +124 V 0.051 +125 I 0.062 +126 S 0.065 +127 F 0.057 +128 L 0.044 +129 R 0.036 +130 I 0.034 +131 H 0.039 +132 G 0.045 +133 F 0.050 +134 D 0.048 +135 G 0.041 +136 L 0.035 +137 D 0.032 +138 L 0.033 +139 F 0.039 +140 F 0.050 +141 L 0.066 +142 Y 0.085 +143 P 0.100 +144 G 0.107 +145 L 0.108 +146 R 0.110 +147 G 0.114 +148 S 0.113 +149 P 0.107 +150 P 0.100 +151 H 0.097 +152 D 0.094 +153 R 0.087 +154 W 0.080 +155 N 0.075 +156 F 0.070 +157 L 0.061 +158 F 0.055 +159 L 0.051 +160 I 0.048 +161 E 0.047 +162 E 0.052 +163 L 0.064 +164 Q 0.075 +165 F 0.078 +166 A 0.072 +167 F 0.066 +168 E 0.070 +169 R 0.075 +170 E 0.072 +171 A 0.066 +172 L 0.063 +173 L 0.067 +174 T 0.079 +175 Q 0.092 +176 H 0.101 +177 P 0.102 +178 R 0.093 +179 L 0.077 +180 L 0.063 +181 L 0.053 +182 S 0.048 +183 A 0.049 +184 A 0.056 +185 V 0.064 +186 S 0.070 +187 G 0.075 +188 I 0.077 +189 P 0.073 +190 S 0.065 +191 I 0.057 +192 I 0.050 +193 H 0.045 +194 T 0.044 +195 S 0.045 +196 Y 0.045 +197 D 0.043 +198 A 0.039 +199 L 0.037 +200 L 0.038 +201 L 0.041 +202 G 0.044 +203 R 0.050 +204 R 0.057 +205 L 0.060 +206 D 0.054 +207 F 0.045 +208 I 0.040 +209 N 0.044 +210 V 0.054 +211 L 0.067 +212 S 0.076 +213 Y 0.080 +214 D 0.082 +215 L 0.083 +216 H 0.076 +217 G 0.067 +218 S 0.061 +219 W 0.060 +220 E 0.064 +221 K 0.075 +222 F 0.090 +223 T 0.106 +224 G 0.119 +225 H 0.130 +226 N 0.145 +227 S 0.165 +228 P 0.178 +229 L 0.174 +230 F 0.157 +231 S 0.134 +232 L 0.113 +233 P 0.100 +234 E 0.096 +235 D 0.099 +236 S 0.107 +237 K 0.120 +238 S 0.131 +239 S 0.127 +240 A 0.108 +241 Y 0.089 +242 A 0.077 +243 M 0.069 +244 N 0.060 +245 Y 0.056 +246 W 0.061 +247 R 0.074 +248 K 0.085 +249 L 0.091 +250 G 0.094 +251 T 0.098 +252 P 0.100 +253 A 0.101 +254 D 0.101 +255 K 0.098 +256 L 0.094 +257 I 0.091 +258 M 0.092 +259 G 0.094 +260 F 0.094 +261 P 0.086 +262 T 0.075 +263 Y 0.067 +264 G 0.064 +265 R 0.065 +266 N 0.065 +267 F 0.067 +268 Y 0.073 +269 L 0.081 +270 L 0.086 +271 K 0.088 +272 E 0.096 +273 S 0.108 +274 K 0.119 +275 N 0.125 +276 G 0.127 +277 L 0.128 +278 Q 0.130 +279 T 0.134 +280 A 0.137 +281 S 0.143 +282 M 0.157 +283 G 0.177 +284 P 0.192 +285 A 0.199 +286 S 0.203 +287 P 0.200 +288 G 0.181 +289 K 0.148 +290 Y 0.120 +291 T 0.112 +292 K 0.120 +293 Q 0.132 +294 A 0.133 +295 G 0.119 +296 F 0.094 +297 L 0.070 +298 A 0.051 +299 Y 0.041 +300 Y 0.039 +301 E 0.039 +302 V 0.037 +303 C 0.034 +304 S 0.033 +305 F 0.036 +306 V 0.040 +307 Q 0.047 +308 R 0.058 +309 A 0.069 +310 K 0.070 +311 K 0.067 +312 H 0.066 +313 W 0.068 +314 I 0.067 +315 D 0.063 +316 Y 0.061 +317 Q 0.063 +318 Y 0.068 +319 V 0.070 +320 P 0.065 +321 Y 0.057 +322 A 0.051 +323 F 0.048 +324 K 0.050 +325 G 0.055 +326 K 0.060 +327 E 0.059 +328 W 0.053 +329 L 0.045 +330 G 0.043 +331 Y 0.050 +332 D 0.063 +333 D 0.072 +334 T 0.073 +335 I 0.068 +336 S 0.059 +337 F 0.050 +338 S 0.043 +339 Y 0.040 +340 K 0.039 +341 A 0.038 +342 M 0.035 +343 Y 0.033 +344 V 0.033 +345 K 0.037 +346 R 0.048 +347 E 0.066 +348 H 0.084 +349 F 0.089 +350 G 0.078 +351 G 0.064 +352 A 0.058 +353 M 0.058 +354 V 0.060 +355 W 0.062 +356 T 0.066 +357 L 0.070 +358 D 0.072 +359 M 0.073 +360 D 0.075 +361 D 0.081 +362 V 0.093 +363 R 0.107 +364 G 0.114 +365 T 0.107 +366 F 0.097 +367 C 0.094 +368 G 0.103 +369 N 0.113 +370 G 0.114 +371 P 0.104 +372 F 0.087 +373 P 0.071 +374 L 0.061 +375 V 0.057 +376 H 0.057 +377 I 0.059 +378 L 0.058 +379 N 0.058 +380 E 0.064 +381 L 0.079 +382 L 0.109 +383 V 0.161 +384 Q 0.238 +385 T 0.328 +386 E 0.404 +387 S 0.448 +388 N 0.465 +389 S 0.472 +390 T 0.477 +391 P 0.481 +392 L 0.476 +393 P 0.461 +394 Q 0.439 +395 F 0.416 +396 W 0.398 +397 F 0.396 +398 T 0.420 +399 S 0.470 +400 S 0.528 +401 V 0.569 +402 N 0.575 +403 A 0.551 +404 S 0.529 +405 G 0.542 +406 P 0.588 +407 G 0.640 +408 S 0.675 +409 E 0.691 +410 N 0.694 +411 T 0.693 +412 A 0.691 +413 L 0.688 +414 T 0.686 +415 E 0.689 +416 V 0.685 +417 L 0.672 +418 T 0.673 +419 T 0.697 +420 D 0.724 +421 T 0.725 +422 I 0.697 +423 K 0.655 +424 I 0.608 +425 L 0.579 +426 P 0.585 +427 P 0.624 +428 G 0.671 +429 G 0.701 +430 E 0.705 +431 A 0.686 +432 M 0.662 +433 T 0.653 +434 T 0.658 +435 E 0.654 +436 V 0.630 +437 H 0.597 +438 R 0.564 +439 R 0.522 +440 Y 0.482 +441 E 0.476 +442 N 0.515 +443 M 0.569 +444 T 0.607 +445 T 0.627 +446 V 0.635 +447 P 0.644 +448 S 0.664 +449 D 0.688 +450 G 0.702 +451 S 0.698 +452 V 0.684 +453 T 0.676 +454 P 0.675 +455 G 0.677 +456 G 0.671 +457 T 0.653 +458 A 0.628 +459 S 0.612 +460 P 0.618 +461 R 0.634 +462 K 0.644 +463 H 0.643 +464 A 0.634 +465 V 0.620 +466 T 0.615 +467 P 0.630 +468 E 0.657 +469 N 0.681 +470 N 0.691 +471 T 0.689 +472 M 0.687 +473 A 0.695 +474 A 0.705 +475 E 0.700 +476 A 0.676 +477 K 0.633 +478 T 0.576 +479 M 0.524 +480 S 0.491 +481 T 0.465 +482 L 0.429 +483 D 0.390 +484 F 0.362 +485 F 0.348 +486 S 0.352 +487 K 0.382 +488 T 0.426 +489 T 0.469 +490 T 0.505 +491 G 0.531 +492 V 0.529 +493 S 0.494 +494 K 0.462 +495 T 0.468 +496 T 0.501 +497 T 0.534 +498 G 0.555 +499 I 0.563 +500 S 0.558 +501 K 0.540 +502 T 0.521 +503 T 0.517 +504 T 0.530 +505 G 0.546 +506 V 0.559 +507 S 0.571 +508 K 0.578 +509 T 0.576 +510 T 0.575 +511 T 0.588 +512 G 0.614 +513 V 0.636 +514 S 0.638 +515 K 0.618 +516 A 0.589 +517 T 0.566 +518 A 0.546 +519 G 0.506 +520 I 0.442 +521 S 0.370 +522 K 0.304 +523 T 0.246 +524 I 0.203 +525 P 0.187 +526 E 0.203 +527 I 0.242 +528 S 0.287 +529 K 0.331 +530 A 0.381 +531 T 0.441 +532 A 0.504 +533 G 0.551 +534 V 0.576 +535 S 0.581 +536 K 0.572 +537 T 0.556 +538 T 0.549 +539 T 0.556 +540 G 0.564 +541 V 0.568 +542 S 0.565 +543 K 0.551 +544 T 0.533 +545 T 0.532 +546 T 0.546 +547 G 0.554 +548 I 0.548 +549 S 0.537 +550 K 0.515 +551 T 0.486 +552 I 0.477 +553 T 0.504 +554 G 0.548 +555 V 0.579 +556 S 0.585 +557 K 0.572 +558 T 0.556 +559 T 0.555 +560 T 0.569 +561 G 0.587 +562 I 0.601 +563 S 0.602 +564 K 0.583 +565 T 0.556 +566 T 0.550 +567 T 0.566 +568 G 0.585 +569 I 0.595 +570 S 0.592 +571 K 0.564 +572 T 0.525 +573 T 0.509 +574 T 0.517 +575 G 0.520 +576 V 0.502 +577 S 0.465 +578 K 0.418 +579 I 0.386 +580 T 0.398 +581 T 0.450 +582 G 0.511 +583 V 0.557 +584 S 0.577 +585 K 0.573 +586 T 0.562 +587 T 0.562 +588 T 0.574 +589 G 0.590 +590 I 0.603 +591 S 0.604 +592 K 0.586 +593 T 0.560 +594 T 0.551 +595 T 0.562 +596 G 0.579 +597 I 0.592 +598 S 0.593 +599 Q 0.567 +600 T 0.524 +601 T 0.494 +602 T 0.496 +603 G 0.518 +604 I 0.536 +605 S 0.541 +606 K 0.536 +607 T 0.521 +608 T 0.495 +609 T 0.473 +610 D 0.486 +611 I 0.541 +612 S 0.604 +613 K 0.640 +614 T 0.642 +615 T 0.625 +616 T 0.609 +617 G 0.595 +618 I 0.562 +619 S 0.509 +620 K 0.472 +621 T 0.478 +622 T 0.516 +623 P 0.569 +624 G 0.617 +625 I 0.634 +626 S 0.616 +627 K 0.590 +628 T 0.576 +629 T 0.579 +630 P 0.602 +631 G 0.636 +632 M 0.659 +633 T 0.667 +634 V 0.677 +635 I 0.696 +636 V 0.712 +637 Q 0.715 +638 T 0.708 +639 Q 0.695 +640 A 0.665 +641 N 0.620 +642 E 0.597 +643 A 0.617 +644 E 0.632 +645 T 0.608 +646 T 0.587 +647 A 0.613 +648 T 0.661 +649 M 0.690 +650 D 0.693 +651 H 0.683 +652 Q 0.669 +653 S 0.654 +654 V 0.645 +655 T 0.653 +656 P 0.678 +657 T 0.704 +658 E 0.707 +659 M 0.673 +660 D 0.611 +661 T 0.553 +662 T 0.520 +663 L 0.501 +664 F 0.485 +665 Y 0.480 +666 L 0.479 +667 K 0.460 +668 T 0.418 +669 M 0.383 +670 T 0.396 +671 P 0.454 +672 S 0.510 +673 E 0.524 +674 K 0.508 +675 E 0.493 +676 T 0.497 +677 S 0.506 +678 R 0.500 +679 K 0.488 +680 K 0.482 +681 T 0.480 +682 M 0.476 +683 V 0.467 +684 L 0.453 +685 E 0.429 +686 K 0.396 +687 A 0.363 +688 T 0.342 +689 V 0.349 +690 S 0.378 +691 P 0.405 +692 R 0.410 +693 E 0.400 +694 M 0.392 +695 S 0.387 +696 A 0.383 +697 T 0.390 +698 P 0.411 +699 N 0.433 +700 G 0.429 +701 Q 0.387 +702 S 0.325 +703 K 0.265 +704 T 0.215 +705 L 0.176 +706 K 0.149 +707 W 0.131 +708 A 0.121 +709 S 0.119 +710 L 0.123 +711 I 0.137 +712 T 0.160 +713 E 0.186 +714 V 0.202 +715 E 0.200 +716 T 0.182 +717 Y 0.161 +718 S 0.151 +719 Q 0.155 +720 D 0.167 +721 G 0.177 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000074340.10_ENSMUST00000000573.9_GN:Ovgp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000074340.10_ENSMUST00000000573.9_GN:Ovgp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..e521176b77152a35f5b1477773d73976de6fb5cb --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000074340.10_ENSMUST00000000573.9_GN:Ovgp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid @@ -0,0 +1,745 @@ +>ENSMUSG00000074340.10|ENSMUST00000000573.9|GN:Ovgp1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:23 +1 M 0.160 +2 L 0.151 +3 Q 0.145 +4 V 0.149 +5 S 0.152 +6 Q 0.146 +7 L 0.139 +8 L 0.138 +9 L 0.145 +10 K 0.158 +11 S 0.171 +12 L 0.180 +13 E 0.184 +14 L 0.191 +15 H 0.201 +16 H 0.210 +17 Q 0.218 +18 S 0.224 +19 Y 0.222 +20 Q 0.221 +21 A 0.226 +22 V 0.230 +23 E 0.226 +24 M 0.215 +25 G 0.200 +26 R 0.181 +27 L 0.163 +28 L 0.154 +29 L 0.154 +30 L 0.161 +31 A 0.171 +32 G 0.175 +33 L 0.166 +34 V 0.153 +35 L 0.155 +36 L 0.181 +37 M 0.225 +38 K 0.275 +39 H 0.323 +40 S 0.360 +41 D 0.372 +42 G 0.347 +43 T 0.286 +44 A 0.206 +45 Y 0.131 +46 K 0.080 +47 L 0.052 +48 V 0.039 +49 C 0.034 +50 Y 0.033 +51 F 0.032 +52 T 0.031 +53 N 0.033 +54 W 0.041 +55 A 0.053 +56 H 0.066 +57 S 0.083 +58 R 0.103 +59 P 0.122 +60 G 0.134 +61 P 0.138 +62 A 0.134 +63 S 0.121 +64 I 0.098 +65 M 0.076 +66 P 0.064 +67 H 0.062 +68 D 0.065 +69 L 0.067 +70 D 0.063 +71 P 0.058 +72 F 0.058 +73 L 0.061 +74 C 0.063 +75 T 0.058 +76 H 0.051 +77 L 0.046 +78 I 0.044 +79 F 0.043 +80 A 0.042 +81 F 0.043 +82 A 0.045 +83 S 0.050 +84 M 0.055 +85 S 0.062 +86 N 0.069 +87 N 0.076 +88 Q 0.081 +89 I 0.085 +90 V 0.091 +91 A 0.095 +92 K 0.091 +93 N 0.078 +94 L 0.067 +95 Q 0.066 +96 D 0.071 +97 E 0.077 +98 N 0.079 +99 V 0.073 +100 L 0.062 +101 Y 0.051 +102 P 0.046 +103 E 0.044 +104 F 0.042 +105 N 0.040 +106 K 0.042 +107 L 0.047 +108 K 0.053 +109 E 0.055 +110 R 0.057 +111 N 0.060 +112 R 0.063 +113 E 0.065 +114 L 0.066 +115 K 0.067 +116 T 0.068 +117 L 0.067 +118 L 0.069 +119 S 0.078 +120 I 0.094 +121 G 0.108 +122 G 0.109 +123 W 0.097 +124 N 0.084 +125 F 0.077 +126 G 0.071 +127 T 0.065 +128 S 0.058 +129 R 0.055 +130 F 0.056 +131 T 0.063 +132 A 0.072 +133 M 0.081 +134 L 0.086 +135 S 0.084 +136 T 0.077 +137 L 0.067 +138 A 0.059 +139 N 0.053 +140 R 0.047 +141 E 0.043 +142 K 0.040 +143 F 0.038 +144 I 0.035 +145 D 0.034 +146 S 0.040 +147 V 0.050 +148 I 0.061 +149 S 0.065 +150 F 0.056 +151 L 0.044 +152 R 0.036 +153 I 0.035 +154 H 0.040 +155 G 0.047 +156 F 0.051 +157 D 0.049 +158 G 0.041 +159 L 0.035 +160 D 0.032 +161 L 0.033 +162 F 0.038 +163 F 0.048 +164 L 0.064 +165 Y 0.082 +166 P 0.097 +167 G 0.104 +168 L 0.107 +169 R 0.110 +170 G 0.114 +171 S 0.113 +172 P 0.106 +173 P 0.099 +174 H 0.096 +175 D 0.093 +176 R 0.086 +177 W 0.078 +178 N 0.073 +179 F 0.067 +180 L 0.059 +181 F 0.053 +182 L 0.050 +183 I 0.048 +184 E 0.048 +185 E 0.052 +186 L 0.063 +187 Q 0.074 +188 F 0.078 +189 A 0.072 +190 F 0.066 +191 E 0.069 +192 R 0.073 +193 E 0.071 +194 A 0.064 +195 L 0.061 +196 L 0.065 +197 T 0.076 +198 Q 0.089 +199 H 0.098 +200 P 0.098 +201 R 0.089 +202 L 0.074 +203 L 0.060 +204 L 0.050 +205 S 0.046 +206 A 0.047 +207 A 0.054 +208 V 0.062 +209 S 0.070 +210 G 0.076 +211 I 0.077 +212 P 0.073 +213 S 0.065 +214 I 0.056 +215 I 0.048 +216 H 0.043 +217 T 0.042 +218 S 0.044 +219 Y 0.044 +220 D 0.042 +221 A 0.039 +222 L 0.037 +223 L 0.038 +224 L 0.040 +225 G 0.043 +226 R 0.048 +227 R 0.054 +228 L 0.057 +229 D 0.052 +230 F 0.043 +231 I 0.039 +232 N 0.042 +233 V 0.053 +234 L 0.066 +235 S 0.075 +236 Y 0.078 +237 D 0.080 +238 L 0.080 +239 H 0.074 +240 G 0.065 +241 S 0.059 +242 W 0.059 +243 E 0.063 +244 K 0.074 +245 F 0.090 +246 T 0.106 +247 G 0.119 +248 H 0.131 +249 N 0.145 +250 S 0.164 +251 P 0.177 +252 L 0.173 +253 F 0.157 +254 S 0.135 +255 L 0.114 +256 P 0.100 +257 E 0.097 +258 D 0.100 +259 S 0.107 +260 K 0.121 +261 S 0.132 +262 S 0.128 +263 A 0.109 +264 Y 0.089 +265 A 0.077 +266 M 0.068 +267 N 0.060 +268 Y 0.056 +269 W 0.061 +270 R 0.073 +271 K 0.084 +272 L 0.090 +273 G 0.094 +274 T 0.098 +275 P 0.101 +276 A 0.103 +277 D 0.103 +278 K 0.100 +279 L 0.096 +280 I 0.093 +281 M 0.094 +282 G 0.097 +283 F 0.096 +284 P 0.087 +285 T 0.075 +286 Y 0.066 +287 G 0.063 +288 R 0.064 +289 N 0.064 +290 F 0.067 +291 Y 0.074 +292 L 0.082 +293 L 0.087 +294 K 0.090 +295 E 0.098 +296 S 0.110 +297 K 0.121 +298 N 0.127 +299 G 0.128 +300 L 0.129 +301 Q 0.133 +302 T 0.138 +303 A 0.142 +304 S 0.147 +305 M 0.163 +306 G 0.184 +307 P 0.199 +308 A 0.206 +309 S 0.209 +310 P 0.205 +311 G 0.185 +312 K 0.151 +313 Y 0.123 +314 T 0.114 +315 K 0.123 +316 Q 0.136 +317 A 0.138 +318 G 0.123 +319 F 0.097 +320 L 0.072 +321 A 0.053 +322 Y 0.043 +323 Y 0.040 +324 E 0.041 +325 V 0.038 +326 C 0.035 +327 S 0.034 +328 F 0.037 +329 V 0.041 +330 Q 0.048 +331 R 0.060 +332 A 0.070 +333 K 0.072 +334 K 0.068 +335 H 0.068 +336 W 0.070 +337 I 0.069 +338 D 0.066 +339 Y 0.064 +340 Q 0.066 +341 Y 0.070 +342 V 0.072 +343 P 0.067 +344 Y 0.059 +345 A 0.053 +346 F 0.050 +347 K 0.051 +348 G 0.057 +349 K 0.061 +350 E 0.061 +351 W 0.054 +352 L 0.046 +353 G 0.043 +354 Y 0.050 +355 D 0.063 +356 D 0.072 +357 T 0.074 +358 I 0.068 +359 S 0.060 +360 F 0.051 +361 S 0.044 +362 Y 0.041 +363 K 0.040 +364 A 0.039 +365 M 0.036 +366 Y 0.034 +367 V 0.033 +368 K 0.036 +369 R 0.047 +370 E 0.065 +371 H 0.084 +372 F 0.089 +373 G 0.079 +374 G 0.065 +375 A 0.058 +376 M 0.058 +377 V 0.060 +378 W 0.062 +379 T 0.066 +380 L 0.070 +381 D 0.072 +382 M 0.073 +383 D 0.075 +384 D 0.081 +385 V 0.093 +386 R 0.107 +387 G 0.113 +388 T 0.106 +389 F 0.096 +390 C 0.094 +391 G 0.103 +392 N 0.113 +393 G 0.115 +394 P 0.104 +395 F 0.087 +396 P 0.071 +397 L 0.061 +398 V 0.057 +399 H 0.057 +400 I 0.059 +401 L 0.059 +402 N 0.059 +403 E 0.065 +404 L 0.080 +405 L 0.110 +406 V 0.162 +407 Q 0.240 +408 T 0.332 +409 E 0.410 +410 S 0.453 +411 N 0.470 +412 S 0.476 +413 T 0.481 +414 P 0.483 +415 L 0.477 +416 P 0.459 +417 Q 0.436 +418 F 0.413 +419 W 0.396 +420 F 0.393 +421 T 0.417 +422 S 0.466 +423 S 0.522 +424 V 0.563 +425 N 0.570 +426 A 0.547 +427 S 0.527 +428 G 0.542 +429 P 0.590 +430 G 0.642 +431 S 0.677 +432 E 0.693 +433 N 0.695 +434 T 0.693 +435 A 0.692 +436 L 0.688 +437 T 0.687 +438 E 0.689 +439 V 0.685 +440 L 0.674 +441 T 0.676 +442 T 0.701 +443 D 0.727 +444 T 0.726 +445 I 0.698 +446 K 0.656 +447 I 0.611 +448 L 0.582 +449 P 0.590 +450 P 0.630 +451 G 0.675 +452 G 0.704 +453 E 0.707 +454 A 0.688 +455 M 0.665 +456 T 0.656 +457 T 0.660 +458 E 0.655 +459 V 0.630 +460 H 0.599 +461 R 0.566 +462 R 0.523 +463 Y 0.480 +464 E 0.471 +465 N 0.509 +466 M 0.562 +467 T 0.602 +468 T 0.623 +469 V 0.634 +470 P 0.647 +471 S 0.668 +472 D 0.694 +473 G 0.708 +474 S 0.704 +475 V 0.691 +476 T 0.683 +477 P 0.684 +478 G 0.685 +479 G 0.678 +480 T 0.659 +481 A 0.632 +482 S 0.617 +483 P 0.622 +484 R 0.638 +485 K 0.646 +486 H 0.645 +487 A 0.636 +488 V 0.623 +489 T 0.619 +490 P 0.634 +491 E 0.662 +492 N 0.686 +493 N 0.696 +494 T 0.695 +495 M 0.694 +496 A 0.702 +497 A 0.713 +498 E 0.710 +499 A 0.688 +500 K 0.647 +501 T 0.591 +502 M 0.539 +503 S 0.506 +504 T 0.478 +505 L 0.440 +506 D 0.399 +507 F 0.367 +508 F 0.350 +509 S 0.354 +510 K 0.383 +511 T 0.428 +512 T 0.474 +513 T 0.515 +514 G 0.545 +515 V 0.542 +516 S 0.505 +517 K 0.470 +518 T 0.473 +519 T 0.506 +520 T 0.540 +521 G 0.563 +522 I 0.571 +523 S 0.565 +524 K 0.545 +525 T 0.524 +526 T 0.521 +527 T 0.536 +528 G 0.555 +529 V 0.569 +530 S 0.580 +531 K 0.588 +532 T 0.586 +533 T 0.585 +534 T 0.598 +535 G 0.624 +536 V 0.644 +537 S 0.643 +538 K 0.620 +539 A 0.589 +540 T 0.567 +541 A 0.546 +542 G 0.507 +543 I 0.441 +544 S 0.367 +545 K 0.300 +546 T 0.244 +547 I 0.204 +548 P 0.188 +549 E 0.205 +550 I 0.244 +551 S 0.290 +552 K 0.336 +553 A 0.389 +554 T 0.451 +555 A 0.514 +556 G 0.561 +557 V 0.584 +558 S 0.589 +559 K 0.578 +560 T 0.560 +561 T 0.552 +562 T 0.559 +563 G 0.566 +564 V 0.570 +565 S 0.567 +566 K 0.554 +567 T 0.537 +568 T 0.536 +569 T 0.552 +570 G 0.561 +571 I 0.556 +572 S 0.545 +573 K 0.523 +574 T 0.495 +575 I 0.486 +576 T 0.514 +577 G 0.559 +578 V 0.590 +579 S 0.596 +580 K 0.583 +581 T 0.566 +582 T 0.564 +583 T 0.577 +584 G 0.595 +585 I 0.608 +586 S 0.609 +587 K 0.588 +588 T 0.561 +589 T 0.555 +590 T 0.574 +591 G 0.595 +592 I 0.607 +593 S 0.604 +594 K 0.577 +595 T 0.539 +596 T 0.522 +597 T 0.529 +598 G 0.533 +599 V 0.515 +600 S 0.478 +601 K 0.430 +602 I 0.398 +603 T 0.408 +604 T 0.459 +605 G 0.521 +606 V 0.566 +607 S 0.584 +608 K 0.578 +609 T 0.567 +610 T 0.568 +611 T 0.582 +612 G 0.600 +613 I 0.613 +614 S 0.615 +615 K 0.596 +616 T 0.569 +617 T 0.559 +618 T 0.570 +619 G 0.588 +620 I 0.600 +621 S 0.599 +622 Q 0.573 +623 T 0.530 +624 T 0.502 +625 T 0.506 +626 G 0.529 +627 I 0.547 +628 S 0.550 +629 K 0.542 +630 T 0.526 +631 T 0.500 +632 T 0.480 +633 D 0.495 +634 I 0.549 +635 S 0.610 +636 K 0.644 +637 T 0.645 +638 T 0.628 +639 T 0.614 +640 G 0.600 +641 I 0.567 +642 S 0.514 +643 K 0.477 +644 T 0.480 +645 T 0.517 +646 P 0.570 +647 G 0.618 +648 I 0.634 +649 S 0.616 +650 K 0.592 +651 T 0.580 +652 T 0.585 +653 P 0.609 +654 G 0.642 +655 M 0.663 +656 T 0.671 +657 V 0.681 +658 I 0.699 +659 V 0.713 +660 Q 0.716 +661 T 0.709 +662 Q 0.695 +663 A 0.665 +664 N 0.620 +665 E 0.598 +666 A 0.622 +667 E 0.648 +668 T 0.638 +669 T 0.623 +670 A 0.639 +671 T 0.670 +672 M 0.687 +673 D 0.686 +674 H 0.676 +675 Q 0.663 +676 S 0.650 +677 V 0.643 +678 T 0.652 +679 P 0.679 +680 T 0.709 +681 E 0.723 +682 M 0.718 +683 D 0.696 +684 T 0.658 +685 T 0.603 +686 L 0.542 +687 F 0.498 +688 Y 0.482 +689 L 0.478 +690 K 0.458 +691 T 0.416 +692 M 0.381 +693 T 0.395 +694 P 0.455 +695 S 0.513 +696 E 0.529 +697 K 0.512 +698 E 0.499 +699 T 0.507 +700 S 0.520 +701 R 0.521 +702 K 0.513 +703 K 0.509 +704 T 0.508 +705 M 0.504 +706 V 0.496 +707 L 0.480 +708 E 0.452 +709 K 0.414 +710 A 0.376 +711 T 0.353 +712 V 0.361 +713 S 0.395 +714 P 0.430 +715 R 0.444 +716 E 0.441 +717 M 0.434 +718 S 0.424 +719 A 0.413 +720 T 0.412 +721 P 0.429 +722 N 0.447 +723 G 0.440 +724 Q 0.395 +725 S 0.331 +726 K 0.270 +727 T 0.221 +728 L 0.184 +729 K 0.156 +730 W 0.136 +731 A 0.124 +732 S 0.121 +733 L 0.125 +734 I 0.140 +735 T 0.165 +736 E 0.191 +737 V 0.206 +738 E 0.203 +739 T 0.184 +740 Y 0.163 +741 S 0.153 +742 Q 0.156 +743 D 0.167 +744 G 0.177 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000074397.6_ENSMUST00000098837.3_GN:Foxr1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000074397.6_ENSMUST00000098837.3_GN:Foxr1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..af21fee849fab9f2ab4a13a188de80861e85d41e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000074397.6_ENSMUST00000098837.3_GN:Foxr1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,224 @@ +>ENSMUSG00000074397.6|ENSMUST00000098837.3|GN:Foxr1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.536 +2 G 0.537 +3 N 0.526 +4 E 0.485 +5 C 0.413 +6 F 0.336 +7 L 0.283 +8 T 0.256 +9 F 0.230 +10 T 0.194 +11 T 0.161 +12 T 0.148 +13 H 0.149 +14 L 0.144 +15 S 0.125 +16 E 0.102 +17 A 0.086 +18 E 0.079 +19 Q 0.080 +20 K 0.090 +21 L 0.105 +22 A 0.123 +23 L 0.142 +24 Y 0.160 +25 R 0.181 +26 L 0.199 +27 Q 0.209 +28 L 0.215 +29 V 0.235 +30 E 0.285 +31 P 0.366 +32 P 0.461 +33 K 0.548 +34 L 0.618 +35 P 0.669 +36 L 0.702 +37 E 0.721 +38 K 0.729 +39 K 0.729 +40 T 0.722 +41 N 0.710 +42 P 0.702 +43 D 0.697 +44 K 0.684 +45 D 0.662 +46 G 0.649 +47 P 0.650 +48 D 0.650 +49 I 0.635 +50 K 0.609 +51 P 0.589 +52 N 0.584 +53 L 0.582 +54 W 0.560 +55 M 0.513 +56 W 0.454 +57 V 0.393 +58 N 0.335 +59 P 0.292 +60 N 0.272 +61 M 0.272 +62 V 0.297 +63 Y 0.366 +64 P 0.483 +65 P 0.622 +66 G 0.734 +67 K 0.801 +68 L 0.834 +69 E 0.852 +70 V 0.862 +71 A 0.861 +72 V 0.852 +73 K 0.840 +74 E 0.829 +75 E 0.820 +76 D 0.809 +77 Q 0.798 +78 S 0.788 +79 A 0.777 +80 L 0.767 +81 S 0.755 +82 A 0.741 +83 F 0.733 +84 Q 0.741 +85 P 0.758 +86 A 0.761 +87 L 0.725 +88 K 0.664 +89 E 0.633 +90 E 0.668 +91 E 0.735 +92 D 0.782 +93 S 0.800 +94 C 0.805 +95 S 0.809 +96 E 0.814 +97 A 0.816 +98 S 0.815 +99 E 0.809 +100 V 0.793 +101 Q 0.768 +102 Q 0.741 +103 P 0.722 +104 L 0.716 +105 P 0.724 +106 P 0.738 +107 C 0.737 +108 R 0.699 +109 Q 0.632 +110 K 0.580 +111 R 0.567 +112 K 0.570 +113 Q 0.588 +114 R 0.642 +115 R 0.708 +116 S 0.744 +117 T 0.746 +118 V 0.735 +119 P 0.729 +120 L 0.733 +121 P 0.741 +122 L 0.750 +123 A 0.759 +124 P 0.765 +125 G 0.767 +126 R 0.754 +127 R 0.727 +128 A 0.691 +129 P 0.650 +130 L 0.599 +131 E 0.531 +132 N 0.446 +133 P 0.363 +134 W 0.308 +135 R 0.292 +136 L 0.306 +137 P 0.333 +138 Q 0.354 +139 A 0.345 +140 I 0.309 +141 S 0.272 +142 P 0.251 +143 E 0.240 +144 G 0.227 +145 R 0.213 +146 L 0.200 +147 W 0.181 +148 S 0.159 +149 R 0.145 +150 P 0.137 +151 P 0.120 +152 L 0.093 +153 H 0.065 +154 Y 0.046 +155 F 0.036 +156 H 0.034 +157 L 0.037 +158 I 0.043 +159 A 0.049 +160 L 0.055 +161 A 0.062 +162 L 0.068 +163 R 0.070 +164 N 0.071 +165 S 0.077 +166 P 0.091 +167 P 0.109 +168 C 0.122 +169 G 0.120 +170 L 0.101 +171 S 0.077 +172 V 0.058 +173 Q 0.046 +174 Q 0.042 +175 I 0.043 +176 Y 0.044 +177 S 0.043 +178 F 0.041 +179 T 0.044 +180 R 0.052 +181 Q 0.065 +182 N 0.081 +183 I 0.100 +184 C 0.121 +185 L 0.147 +186 L 0.185 +187 S 0.234 +188 A 0.285 +189 Q 0.326 +190 E 0.349 +191 H 0.354 +192 N 0.353 +193 H 0.353 +194 S 0.358 +195 Y 0.375 +196 P 0.401 +197 F 0.421 +198 A 0.418 +199 T 0.392 +200 Y 0.357 +201 N 0.332 +202 P 0.328 +203 A 0.341 +204 V 0.361 +205 P 0.378 +206 Q 0.383 +207 I 0.371 +208 P 0.345 +209 I 0.309 +210 L 0.272 +211 L 0.251 +212 G 0.253 +213 R 0.273 +214 Y 0.303 +215 S 0.334 +216 F 0.360 +217 S 0.382 +218 Y 0.409 +219 P 0.447 +220 V 0.489 +221 P 0.520 +222 K 0.523 +223 D 0.512 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000074397.6_ENSMUST00000098837.3_GN:Foxr1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:81.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000074397.6_ENSMUST00000098837.3_GN:Foxr1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:81.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..40c36c2a2809cfd9019d681bc535f447a9576785 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000074397.6_ENSMUST00000098837.3_GN:Foxr1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:81.caid @@ -0,0 +1,305 @@ +>ENSMUSG00000074397.6|ENSMUST00000098837.3|GN:Foxr1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:81 +1 M 0.346 +2 S 0.338 +3 A 0.320 +4 S 0.288 +5 W 0.244 +6 M 0.199 +7 N 0.162 +8 P 0.136 +9 Q 0.117 +10 A 0.105 +11 I 0.098 +12 L 0.100 +13 S 0.115 +14 I 0.140 +15 C 0.169 +16 R 0.196 +17 G 0.220 +18 A 0.241 +19 A 0.266 +20 L 0.299 +21 L 0.330 +22 T 0.346 +23 A 0.345 +24 P 0.335 +25 T 0.324 +26 C 0.319 +27 D 0.324 +28 C 0.341 +29 P 0.368 +30 R 0.404 +31 F 0.443 +32 E 0.477 +33 E 0.502 +34 A 0.523 +35 P 0.553 +36 S 0.585 +37 T 0.598 +38 Q 0.578 +39 A 0.544 +40 S 0.525 +41 L 0.531 +42 S 0.544 +43 V 0.542 +44 S 0.513 +45 C 0.465 +46 T 0.423 +47 P 0.405 +48 H 0.404 +49 N 0.390 +50 S 0.349 +51 S 0.292 +52 P 0.241 +53 L 0.204 +54 A 0.180 +55 L 0.163 +56 K 0.146 +57 V 0.130 +58 D 0.120 +59 P 0.117 +60 K 0.113 +61 F 0.106 +62 Q 0.100 +63 D 0.099 +64 R 0.101 +65 N 0.098 +66 F 0.088 +67 W 0.080 +68 A 0.083 +69 S 0.097 +70 L 0.115 +71 H 0.134 +72 G 0.158 +73 Q 0.185 +74 V 0.201 +75 P 0.193 +76 G 0.164 +77 L 0.128 +78 L 0.103 +79 D 0.095 +80 W 0.104 +81 D 0.122 +82 M 0.139 +83 G 0.142 +84 N 0.127 +85 E 0.104 +86 C 0.083 +87 F 0.073 +88 L 0.072 +89 T 0.072 +90 F 0.068 +91 T 0.065 +92 T 0.067 +93 T 0.075 +94 H 0.084 +95 L 0.084 +96 S 0.077 +97 E 0.071 +98 A 0.069 +99 E 0.070 +100 Q 0.074 +101 K 0.084 +102 L 0.093 +103 A 0.097 +104 L 0.102 +105 Y 0.108 +106 R 0.116 +107 L 0.121 +108 Q 0.122 +109 L 0.128 +110 V 0.154 +111 E 0.206 +112 P 0.282 +113 P 0.364 +114 K 0.437 +115 L 0.506 +116 P 0.576 +117 L 0.634 +118 E 0.669 +119 K 0.684 +120 K 0.685 +121 T 0.674 +122 N 0.656 +123 P 0.639 +124 D 0.625 +125 K 0.603 +126 D 0.572 +127 G 0.548 +128 P 0.531 +129 D 0.506 +130 I 0.460 +131 K 0.399 +132 P 0.340 +133 N 0.287 +134 L 0.238 +135 W 0.193 +136 M 0.160 +137 W 0.144 +138 V 0.140 +139 N 0.144 +140 P 0.154 +141 N 0.173 +142 M 0.202 +143 V 0.249 +144 Y 0.329 +145 P 0.450 +146 P 0.588 +147 G 0.698 +148 K 0.761 +149 L 0.792 +150 E 0.810 +151 V 0.818 +152 A 0.816 +153 V 0.805 +154 K 0.793 +155 E 0.785 +156 E 0.777 +157 D 0.767 +158 Q 0.756 +159 S 0.743 +160 A 0.727 +161 L 0.712 +162 S 0.697 +163 A 0.682 +164 F 0.677 +165 Q 0.693 +166 P 0.723 +167 A 0.735 +168 L 0.705 +169 K 0.645 +170 E 0.615 +171 E 0.649 +172 E 0.715 +173 D 0.764 +174 S 0.784 +175 C 0.791 +176 S 0.794 +177 E 0.798 +178 A 0.799 +179 S 0.798 +180 E 0.792 +181 V 0.776 +182 Q 0.750 +183 Q 0.724 +184 P 0.705 +185 L 0.700 +186 P 0.707 +187 P 0.708 +188 C 0.669 +189 R 0.576 +190 Q 0.482 +191 K 0.460 +192 R 0.503 +193 K 0.545 +194 Q 0.577 +195 R 0.632 +196 R 0.695 +197 S 0.729 +198 T 0.731 +199 V 0.722 +200 P 0.718 +201 L 0.723 +202 P 0.733 +203 L 0.742 +204 A 0.749 +205 P 0.755 +206 G 0.755 +207 R 0.743 +208 R 0.715 +209 A 0.678 +210 P 0.634 +211 L 0.576 +212 E 0.502 +213 N 0.417 +214 P 0.338 +215 W 0.284 +216 R 0.267 +217 L 0.280 +218 P 0.308 +219 Q 0.329 +220 A 0.325 +221 I 0.296 +222 S 0.264 +223 P 0.246 +224 E 0.238 +225 G 0.230 +226 R 0.220 +227 L 0.209 +228 W 0.190 +229 S 0.165 +230 R 0.149 +231 P 0.140 +232 P 0.125 +233 L 0.100 +234 H 0.073 +235 Y 0.053 +236 F 0.043 +237 H 0.040 +238 L 0.044 +239 I 0.052 +240 A 0.059 +241 L 0.067 +242 A 0.076 +243 L 0.084 +244 R 0.085 +245 N 0.081 +246 S 0.085 +247 P 0.100 +248 P 0.121 +249 C 0.135 +250 G 0.131 +251 L 0.110 +252 S 0.085 +253 V 0.065 +254 Q 0.053 +255 Q 0.048 +256 I 0.047 +257 Y 0.047 +258 S 0.044 +259 F 0.043 +260 T 0.046 +261 R 0.055 +262 Q 0.067 +263 N 0.084 +264 I 0.102 +265 C 0.123 +266 L 0.151 +267 L 0.194 +268 S 0.249 +269 A 0.301 +270 Q 0.341 +271 E 0.361 +272 H 0.365 +273 N 0.363 +274 H 0.362 +275 S 0.368 +276 Y 0.387 +277 P 0.419 +278 F 0.444 +279 A 0.445 +280 T 0.418 +281 Y 0.382 +282 N 0.358 +283 P 0.359 +284 A 0.380 +285 V 0.407 +286 P 0.427 +287 Q 0.427 +288 I 0.408 +289 P 0.377 +290 I 0.338 +291 L 0.300 +292 L 0.278 +293 G 0.278 +294 R 0.295 +295 Y 0.320 +296 S 0.347 +297 F 0.372 +298 S 0.397 +299 Y 0.427 +300 P 0.465 +301 V 0.504 +302 P 0.529 +303 K 0.527 +304 D 0.512 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000078157.2_ENSMUST00000104962.2_GN:Fem1al_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000078157.2_ENSMUST00000104962.2_GN:Fem1al_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a15938003466f90fa8108ca68af00c562ab3f147 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000078157.2_ENSMUST00000104962.2_GN:Fem1al_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,655 @@ +>ENSMUSG00000078157.2|ENSMUST00000104962.2|GN:Fem1al|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.183 +2 D 0.150 +3 L 0.109 +4 H 0.080 +5 T 0.066 +6 A 0.060 +7 V 0.061 +8 Y 0.065 +9 N 0.067 +10 A 0.061 +11 A 0.053 +12 H 0.051 +13 D 0.057 +14 G 0.064 +15 K 0.065 +16 L 0.057 +17 P 0.047 +18 L 0.043 +19 L 0.048 +20 Q 0.062 +21 K 0.073 +22 L 0.074 +23 L 0.068 +24 A 0.063 +25 S 0.064 +26 R 0.070 +27 G 0.078 +28 R 0.086 +29 E 0.088 +30 E 0.085 +31 L 0.086 +32 E 0.094 +33 E 0.102 +34 L 0.110 +35 L 0.115 +36 G 0.115 +37 E 0.108 +38 V 0.104 +39 A 0.110 +40 G 0.118 +41 G 0.117 +42 G 0.099 +43 T 0.074 +44 P 0.057 +45 L 0.053 +46 L 0.063 +47 I 0.076 +48 A 0.083 +49 A 0.079 +50 R 0.075 +51 R 0.076 +52 G 0.077 +53 H 0.073 +54 L 0.063 +55 D 0.054 +56 V 0.050 +57 V 0.046 +58 E 0.040 +59 Y 0.035 +60 L 0.036 +61 V 0.047 +62 D 0.062 +63 H 0.074 +64 C 0.081 +65 G 0.087 +66 A 0.093 +67 S 0.093 +68 V 0.092 +69 E 0.094 +70 A 0.094 +71 S 0.091 +72 G 0.090 +73 S 0.096 +74 V 0.113 +75 H 0.132 +76 F 0.148 +77 D 0.160 +78 G 0.164 +79 E 0.155 +80 T 0.137 +81 I 0.115 +82 E 0.092 +83 G 0.074 +84 A 0.060 +85 P 0.051 +86 P 0.046 +87 L 0.046 +88 W 0.053 +89 A 0.064 +90 A 0.073 +91 S 0.076 +92 A 0.080 +93 A 0.085 +94 G 0.085 +95 H 0.077 +96 L 0.065 +97 A 0.057 +98 V 0.055 +99 V 0.054 +100 R 0.051 +101 S 0.050 +102 L 0.058 +103 L 0.074 +104 H 0.088 +105 R 0.093 +106 G 0.094 +107 A 0.095 +108 S 0.093 +109 V 0.086 +110 N 0.078 +111 R 0.071 +112 T 0.066 +113 T 0.065 +114 C 0.065 +115 T 0.063 +116 N 0.059 +117 S 0.054 +118 T 0.052 +119 P 0.052 +120 L 0.053 +121 R 0.059 +122 A 0.071 +123 A 0.081 +124 C 0.084 +125 F 0.084 +126 N 0.085 +127 G 0.083 +128 H 0.074 +129 L 0.062 +130 D 0.054 +131 V 0.050 +132 V 0.048 +133 R 0.048 +134 C 0.053 +135 L 0.062 +136 V 0.074 +137 G 0.087 +138 E 0.094 +139 H 0.094 +140 K 0.096 +141 A 0.100 +142 D 0.102 +143 L 0.100 +144 E 0.097 +145 V 0.092 +146 A 0.090 +147 N 0.095 +148 R 0.102 +149 H 0.103 +150 G 0.095 +151 H 0.080 +152 T 0.065 +153 C 0.053 +154 L 0.044 +155 M 0.041 +156 I 0.041 +157 S 0.041 +158 C 0.042 +159 Y 0.047 +160 K 0.058 +161 G 0.068 +162 H 0.069 +163 R 0.062 +164 E 0.056 +165 I 0.054 +166 A 0.051 +167 R 0.045 +168 Y 0.043 +169 L 0.052 +170 L 0.070 +171 E 0.083 +172 R 0.088 +173 G 0.094 +174 A 0.101 +175 Q 0.100 +176 V 0.089 +177 N 0.078 +178 R 0.074 +179 R 0.077 +180 S 0.085 +181 A 0.093 +182 K 0.099 +183 G 0.096 +184 N 0.085 +185 T 0.069 +186 A 0.054 +187 L 0.045 +188 H 0.044 +189 D 0.049 +190 C 0.053 +191 A 0.056 +192 E 0.060 +193 S 0.068 +194 G 0.075 +195 S 0.074 +196 L 0.067 +197 E 0.060 +198 I 0.055 +199 L 0.050 +200 Q 0.044 +201 L 0.039 +202 L 0.040 +203 L 0.045 +204 S 0.054 +205 C 0.068 +206 H 0.084 +207 A 0.098 +208 R 0.101 +209 M 0.094 +210 E 0.086 +211 R 0.086 +212 D 0.090 +213 G 0.093 +214 Y 0.089 +215 G 0.081 +216 M 0.071 +217 T 0.062 +218 P 0.056 +219 L 0.055 +220 L 0.061 +221 A 0.072 +222 A 0.079 +223 S 0.077 +224 I 0.069 +225 T 0.064 +226 G 0.062 +227 H 0.059 +228 T 0.054 +229 N 0.052 +230 I 0.054 +231 V 0.055 +232 E 0.054 +233 Y 0.057 +234 L 0.069 +235 I 0.092 +236 Q 0.131 +237 E 0.192 +238 Q 0.267 +239 P 0.342 +240 S 0.406 +241 H 0.464 +242 E 0.514 +243 Q 0.553 +244 L 0.582 +245 S 0.606 +246 G 0.617 +247 T 0.614 +248 E 0.606 +249 L 0.607 +250 P 0.621 +251 G 0.638 +252 E 0.638 +253 G 0.603 +254 S 0.544 +255 S 0.506 +256 Q 0.520 +257 M 0.563 +258 A 0.598 +259 G 0.614 +260 N 0.615 +261 H 0.605 +262 C 0.588 +263 S 0.571 +264 T 0.563 +265 P 0.561 +266 E 0.566 +267 D 0.576 +268 A 0.592 +269 E 0.607 +270 Q 0.609 +271 Y 0.584 +272 E 0.526 +273 S 0.445 +274 C 0.374 +275 C 0.327 +276 P 0.289 +277 T 0.247 +278 S 0.203 +279 R 0.163 +280 E 0.129 +281 A 0.103 +282 A 0.085 +283 V 0.073 +284 E 0.064 +285 A 0.055 +286 L 0.051 +287 E 0.052 +288 L 0.054 +289 L 0.052 +290 G 0.044 +291 A 0.034 +292 T 0.028 +293 Y 0.028 +294 V 0.035 +295 D 0.049 +296 K 0.068 +297 K 0.084 +298 R 0.094 +299 D 0.097 +300 L 0.094 +301 L 0.088 +302 G 0.082 +303 A 0.074 +304 L 0.062 +305 K 0.053 +306 H 0.053 +307 W 0.056 +308 R 0.057 +309 R 0.060 +310 A 0.070 +311 M 0.083 +312 E 0.093 +313 L 0.096 +314 R 0.099 +315 H 0.114 +316 Q 0.145 +317 G 0.183 +318 G 0.208 +319 G 0.211 +320 F 0.207 +321 L 0.214 +322 P 0.234 +323 K 0.262 +324 P 0.292 +325 E 0.320 +326 P 0.342 +327 Q 0.350 +328 Q 0.332 +329 L 0.284 +330 V 0.223 +331 L 0.172 +332 A 0.139 +333 Y 0.124 +334 D 0.125 +335 Y 0.139 +336 S 0.158 +337 R 0.170 +338 E 0.169 +339 V 0.153 +340 T 0.130 +341 T 0.113 +342 P 0.107 +343 Q 0.102 +344 E 0.092 +345 L 0.080 +346 E 0.072 +347 A 0.070 +348 L 0.069 +349 I 0.069 +350 T 0.072 +351 D 0.077 +352 P 0.081 +353 D 0.084 +354 E 0.087 +355 M 0.092 +356 R 0.103 +357 M 0.114 +358 Q 0.117 +359 A 0.116 +360 L 0.116 +361 L 0.116 +362 I 0.112 +363 R 0.107 +364 E 0.109 +365 R 0.117 +366 I 0.128 +367 L 0.135 +368 G 0.139 +369 P 0.140 +370 S 0.136 +371 H 0.130 +372 P 0.125 +373 D 0.119 +374 T 0.104 +375 S 0.081 +376 Y 0.059 +377 Y 0.046 +378 I 0.040 +379 R 0.040 +380 Y 0.044 +381 R 0.047 +382 G 0.047 +383 A 0.043 +384 V 0.042 +385 Y 0.046 +386 A 0.057 +387 D 0.073 +388 S 0.088 +389 G 0.100 +390 N 0.103 +391 F 0.095 +392 E 0.082 +393 R 0.070 +394 C 0.062 +395 I 0.058 +396 R 0.056 +397 L 0.055 +398 W 0.056 +399 K 0.058 +400 Y 0.062 +401 A 0.065 +402 L 0.068 +403 D 0.069 +404 M 0.069 +405 Q 0.074 +406 Q 0.088 +407 N 0.105 +408 N 0.118 +409 L 0.127 +410 E 0.136 +411 P 0.143 +412 L 0.138 +413 S 0.122 +414 P 0.101 +415 M 0.083 +416 T 0.073 +417 A 0.065 +418 S 0.058 +419 S 0.054 +420 F 0.054 +421 L 0.054 +422 S 0.053 +423 F 0.051 +424 A 0.049 +425 E 0.047 +426 L 0.047 +427 F 0.049 +428 S 0.052 +429 Y 0.059 +430 V 0.070 +431 L 0.091 +432 Q 0.123 +433 D 0.164 +434 H 0.205 +435 S 0.242 +436 A 0.277 +437 K 0.308 +438 G 0.328 +439 N 0.324 +440 L 0.295 +441 G 0.247 +442 M 0.194 +443 Q 0.146 +444 L 0.108 +445 D 0.085 +446 F 0.073 +447 A 0.068 +448 D 0.067 +449 L 0.069 +450 I 0.067 +451 G 0.059 +452 V 0.050 +453 L 0.045 +454 S 0.042 +455 K 0.040 +456 G 0.045 +457 V 0.056 +458 R 0.064 +459 E 0.060 +460 V 0.052 +461 E 0.048 +462 R 0.052 +463 A 0.063 +464 L 0.084 +465 Q 0.114 +466 L 0.144 +467 P 0.163 +468 K 0.170 +469 E 0.172 +470 P 0.172 +471 D 0.164 +472 D 0.143 +473 S 0.111 +474 A 0.080 +475 Q 0.062 +476 F 0.057 +477 T 0.056 +478 K 0.055 +479 A 0.056 +480 I 0.055 +481 A 0.049 +482 I 0.043 +483 I 0.039 +484 L 0.036 +485 H 0.034 +486 L 0.035 +487 L 0.040 +488 Y 0.047 +489 L 0.054 +490 L 0.062 +491 E 0.069 +492 K 0.077 +493 V 0.087 +494 E 0.099 +495 C 0.110 +496 T 0.110 +497 P 0.102 +498 R 0.089 +499 Q 0.075 +500 E 0.062 +501 H 0.056 +502 L 0.056 +503 K 0.062 +504 H 0.068 +505 Q 0.068 +506 T 0.064 +507 V 0.060 +508 Y 0.058 +509 R 0.056 +510 L 0.059 +511 L 0.068 +512 K 0.076 +513 C 0.085 +514 A 0.093 +515 P 0.096 +516 R 0.095 +517 G 0.100 +518 K 0.117 +519 N 0.133 +520 G 0.130 +521 F 0.107 +522 T 0.079 +523 P 0.060 +524 L 0.051 +525 H 0.055 +526 M 0.069 +527 A 0.087 +528 V 0.104 +529 D 0.126 +530 K 0.158 +531 E 0.195 +532 T 0.228 +533 T 0.255 +534 N 0.276 +535 V 0.286 +536 G 0.284 +537 Q 0.271 +538 Y 0.252 +539 H 0.231 +540 V 0.207 +541 G 0.177 +542 V 0.150 +543 F 0.132 +544 P 0.121 +545 S 0.110 +546 L 0.096 +547 Q 0.084 +548 V 0.082 +549 V 0.085 +550 K 0.089 +551 V 0.090 +552 L 0.092 +553 L 0.093 +554 D 0.092 +555 C 0.098 +556 G 0.118 +557 A 0.144 +558 D 0.162 +559 P 0.163 +560 D 0.151 +561 S 0.133 +562 R 0.114 +563 D 0.107 +564 F 0.114 +565 D 0.120 +566 N 0.116 +567 N 0.104 +568 S 0.092 +569 P 0.082 +570 L 0.076 +571 H 0.077 +572 I 0.083 +573 A 0.088 +574 A 0.089 +575 Q 0.091 +576 N 0.099 +577 N 0.110 +578 C 0.117 +579 P 0.115 +580 A 0.112 +581 I 0.113 +582 M 0.112 +583 D 0.103 +584 A 0.094 +585 L 0.094 +586 I 0.104 +587 E 0.114 +588 A 0.115 +589 G 0.115 +590 A 0.119 +591 H 0.128 +592 M 0.136 +593 D 0.136 +594 A 0.129 +595 T 0.122 +596 N 0.121 +597 T 0.121 +598 F 0.116 +599 K 0.106 +600 K 0.095 +601 T 0.089 +602 A 0.092 +603 Y 0.100 +604 E 0.109 +605 L 0.120 +606 L 0.137 +607 D 0.159 +608 S 0.181 +609 K 0.200 +610 L 0.220 +611 L 0.247 +612 A 0.278 +613 K 0.303 +614 S 0.317 +615 T 0.323 +616 V 0.324 +617 Q 0.317 +618 P 0.301 +619 F 0.280 +620 N 0.256 +621 Y 0.226 +622 V 0.191 +623 T 0.162 +624 L 0.145 +625 Q 0.137 +626 C 0.140 +627 L 0.151 +628 A 0.160 +629 A 0.158 +630 R 0.155 +631 A 0.159 +632 L 0.165 +633 D 0.166 +634 R 0.164 +635 N 0.163 +636 K 0.164 +637 V 0.160 +638 P 0.155 +639 Y 0.157 +640 K 0.171 +641 G 0.191 +642 F 0.201 +643 I 0.194 +644 P 0.176 +645 E 0.157 +646 E 0.144 +647 L 0.134 +648 E 0.126 +649 A 0.122 +650 F 0.119 +651 I 0.120 +652 Q 0.133 +653 L 0.156 +654 H 0.176 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000078157.2_ENSMUST00000104962.2_GN:Fem1al_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:17.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000078157.2_ENSMUST00000104962.2_GN:Fem1al_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:17.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7a628b80a622f1f6f6ceb6a64089c9516b58b0b6 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000078157.2_ENSMUST00000104962.2_GN:Fem1al_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:17.caid @@ -0,0 +1,672 @@ +>ENSMUSG00000078157.2|ENSMUST00000104962.2|GN:Fem1al|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:17 +1 M 0.313 +2 S 0.320 +3 L 0.345 +4 A 0.390 +5 T 0.445 +6 G 0.495 +7 G 0.531 +8 P 0.536 +9 A 0.504 +10 R 0.472 +11 S 0.473 +12 S 0.490 +13 S 0.497 +14 E 0.491 +15 A 0.472 +16 S 0.427 +17 S 0.354 +18 M 0.267 +19 D 0.187 +20 L 0.126 +21 H 0.090 +22 T 0.074 +23 A 0.068 +24 V 0.067 +25 Y 0.068 +26 N 0.068 +27 A 0.061 +28 A 0.052 +29 H 0.050 +30 D 0.056 +31 G 0.064 +32 K 0.065 +33 L 0.056 +34 P 0.045 +35 L 0.041 +36 L 0.047 +37 Q 0.061 +38 K 0.072 +39 L 0.072 +40 L 0.065 +41 A 0.061 +42 S 0.061 +43 R 0.064 +44 G 0.068 +45 R 0.070 +46 E 0.069 +47 E 0.066 +48 L 0.068 +49 E 0.072 +50 E 0.079 +51 L 0.090 +52 L 0.102 +53 G 0.107 +54 E 0.103 +55 V 0.100 +56 A 0.104 +57 G 0.112 +58 G 0.110 +59 G 0.093 +60 T 0.069 +61 P 0.053 +62 L 0.050 +63 L 0.060 +64 I 0.073 +65 A 0.080 +66 A 0.077 +67 R 0.072 +68 R 0.072 +69 G 0.073 +70 H 0.069 +71 L 0.060 +72 D 0.052 +73 V 0.047 +74 V 0.044 +75 E 0.038 +76 Y 0.032 +77 L 0.033 +78 V 0.043 +79 D 0.056 +80 H 0.066 +81 C 0.072 +82 G 0.079 +83 A 0.085 +84 S 0.087 +85 V 0.086 +86 E 0.087 +87 A 0.087 +88 S 0.083 +89 G 0.080 +90 S 0.086 +91 V 0.100 +92 H 0.118 +93 F 0.135 +94 D 0.149 +95 G 0.156 +96 E 0.149 +97 T 0.133 +98 I 0.112 +99 E 0.091 +100 G 0.073 +101 A 0.060 +102 P 0.051 +103 P 0.046 +104 L 0.046 +105 W 0.052 +106 A 0.063 +107 A 0.072 +108 S 0.075 +109 A 0.078 +110 A 0.083 +111 G 0.083 +112 H 0.076 +113 L 0.066 +114 A 0.060 +115 V 0.059 +116 V 0.058 +117 R 0.054 +118 S 0.052 +119 L 0.060 +120 L 0.075 +121 H 0.089 +122 R 0.096 +123 G 0.100 +124 A 0.103 +125 S 0.103 +126 V 0.098 +127 N 0.090 +128 R 0.082 +129 T 0.077 +130 T 0.074 +131 C 0.073 +132 T 0.070 +133 N 0.064 +134 S 0.059 +135 T 0.056 +136 P 0.055 +137 L 0.055 +138 R 0.062 +139 A 0.073 +140 A 0.083 +141 C 0.086 +142 F 0.087 +143 N 0.089 +144 G 0.088 +145 H 0.078 +146 L 0.065 +147 D 0.056 +148 V 0.051 +149 V 0.048 +150 R 0.049 +151 C 0.054 +152 L 0.064 +153 V 0.077 +154 G 0.092 +155 E 0.099 +156 H 0.098 +157 K 0.099 +158 A 0.102 +159 D 0.103 +160 L 0.100 +161 E 0.096 +162 V 0.092 +163 A 0.090 +164 N 0.094 +165 R 0.101 +166 H 0.103 +167 G 0.095 +168 H 0.079 +169 T 0.063 +170 C 0.050 +171 L 0.042 +172 M 0.038 +173 I 0.038 +174 S 0.039 +175 C 0.039 +176 Y 0.045 +177 K 0.057 +178 G 0.067 +179 H 0.067 +180 R 0.060 +181 E 0.054 +182 I 0.052 +183 A 0.049 +184 R 0.043 +185 Y 0.041 +186 L 0.051 +187 L 0.068 +188 E 0.081 +189 R 0.086 +190 G 0.091 +191 A 0.097 +192 Q 0.096 +193 V 0.085 +194 N 0.075 +195 R 0.071 +196 R 0.074 +197 S 0.082 +198 A 0.091 +199 K 0.096 +200 G 0.094 +201 N 0.083 +202 T 0.067 +203 A 0.052 +204 L 0.044 +205 H 0.043 +206 D 0.048 +207 C 0.052 +208 A 0.055 +209 E 0.059 +210 S 0.065 +211 G 0.071 +212 S 0.071 +213 L 0.065 +214 E 0.059 +215 I 0.054 +216 L 0.049 +217 Q 0.043 +218 L 0.039 +219 L 0.038 +220 L 0.043 +221 S 0.051 +222 C 0.063 +223 H 0.079 +224 A 0.093 +225 R 0.096 +226 M 0.090 +227 E 0.083 +228 R 0.082 +229 D 0.085 +230 G 0.088 +231 Y 0.085 +232 G 0.078 +233 M 0.069 +234 T 0.061 +235 P 0.056 +236 L 0.055 +237 L 0.061 +238 A 0.071 +239 A 0.078 +240 S 0.076 +241 I 0.068 +242 T 0.062 +243 G 0.060 +244 H 0.058 +245 T 0.054 +246 N 0.052 +247 I 0.054 +248 V 0.055 +249 E 0.055 +250 Y 0.058 +251 L 0.070 +252 I 0.093 +253 Q 0.133 +254 E 0.194 +255 Q 0.271 +256 P 0.346 +257 S 0.411 +258 H 0.469 +259 E 0.519 +260 Q 0.558 +261 L 0.587 +262 S 0.612 +263 G 0.625 +264 T 0.623 +265 E 0.614 +266 L 0.612 +267 P 0.624 +268 G 0.641 +269 E 0.641 +270 G 0.608 +271 S 0.550 +272 S 0.513 +273 Q 0.528 +274 M 0.571 +275 A 0.604 +276 G 0.619 +277 N 0.618 +278 H 0.606 +279 C 0.586 +280 S 0.568 +281 T 0.558 +282 P 0.556 +283 E 0.561 +284 D 0.571 +285 A 0.586 +286 E 0.600 +287 Q 0.599 +288 Y 0.574 +289 E 0.516 +290 S 0.438 +291 C 0.369 +292 C 0.322 +293 P 0.285 +294 T 0.244 +295 S 0.201 +296 R 0.162 +297 E 0.129 +298 A 0.102 +299 A 0.084 +300 V 0.073 +301 E 0.063 +302 A 0.055 +303 L 0.051 +304 E 0.052 +305 L 0.055 +306 L 0.053 +307 G 0.045 +308 A 0.035 +309 T 0.029 +310 Y 0.029 +311 V 0.036 +312 D 0.051 +313 K 0.069 +314 K 0.086 +315 R 0.096 +316 D 0.099 +317 L 0.096 +318 L 0.091 +319 G 0.085 +320 A 0.075 +321 L 0.063 +322 K 0.054 +323 H 0.054 +324 W 0.057 +325 R 0.058 +326 R 0.061 +327 A 0.070 +328 M 0.083 +329 E 0.093 +330 L 0.096 +331 R 0.100 +332 H 0.114 +333 Q 0.144 +334 G 0.182 +335 G 0.206 +336 G 0.209 +337 F 0.206 +338 L 0.214 +339 P 0.235 +340 K 0.263 +341 P 0.293 +342 E 0.322 +343 P 0.345 +344 Q 0.354 +345 Q 0.336 +346 L 0.287 +347 V 0.226 +348 L 0.174 +349 A 0.141 +350 Y 0.124 +351 D 0.125 +352 Y 0.139 +353 S 0.157 +354 R 0.169 +355 E 0.168 +356 V 0.151 +357 T 0.129 +358 T 0.112 +359 P 0.105 +360 Q 0.101 +361 E 0.092 +362 L 0.079 +363 E 0.072 +364 A 0.069 +365 L 0.069 +366 I 0.069 +367 T 0.072 +368 D 0.076 +369 P 0.080 +370 D 0.083 +371 E 0.087 +372 M 0.092 +373 R 0.103 +374 M 0.114 +375 Q 0.118 +376 A 0.116 +377 L 0.117 +378 L 0.117 +379 I 0.113 +380 R 0.108 +381 E 0.109 +382 R 0.118 +383 I 0.127 +384 L 0.134 +385 G 0.138 +386 P 0.138 +387 S 0.134 +388 H 0.128 +389 P 0.123 +390 D 0.117 +391 T 0.102 +392 S 0.080 +393 Y 0.058 +394 Y 0.046 +395 I 0.040 +396 R 0.040 +397 Y 0.044 +398 R 0.048 +399 G 0.047 +400 A 0.044 +401 V 0.042 +402 Y 0.046 +403 A 0.057 +404 D 0.073 +405 S 0.089 +406 G 0.101 +407 N 0.104 +408 F 0.097 +409 E 0.084 +410 R 0.071 +411 C 0.063 +412 I 0.060 +413 R 0.057 +414 L 0.055 +415 W 0.056 +416 K 0.058 +417 Y 0.062 +418 A 0.067 +419 L 0.070 +420 D 0.070 +421 M 0.070 +422 Q 0.075 +423 Q 0.088 +424 N 0.104 +425 N 0.117 +426 L 0.128 +427 E 0.139 +428 P 0.147 +429 L 0.142 +430 S 0.125 +431 P 0.102 +432 M 0.085 +433 T 0.074 +434 A 0.066 +435 S 0.058 +436 S 0.054 +437 F 0.054 +438 L 0.054 +439 S 0.052 +440 F 0.050 +441 A 0.048 +442 E 0.047 +443 L 0.047 +444 F 0.050 +445 S 0.054 +446 Y 0.061 +447 V 0.074 +448 L 0.096 +449 Q 0.130 +450 D 0.172 +451 H 0.215 +452 S 0.252 +453 A 0.287 +454 K 0.318 +455 G 0.336 +456 N 0.332 +457 L 0.302 +458 G 0.253 +459 M 0.199 +460 Q 0.150 +461 L 0.111 +462 D 0.087 +463 F 0.075 +464 A 0.070 +465 D 0.069 +466 L 0.071 +467 I 0.069 +468 G 0.061 +469 V 0.052 +470 L 0.047 +471 S 0.044 +472 K 0.042 +473 G 0.046 +474 V 0.057 +475 R 0.064 +476 E 0.061 +477 V 0.053 +478 E 0.050 +479 R 0.053 +480 A 0.064 +481 L 0.086 +482 Q 0.116 +483 L 0.146 +484 P 0.165 +485 K 0.171 +486 E 0.173 +487 P 0.173 +488 D 0.165 +489 D 0.144 +490 S 0.112 +491 A 0.081 +492 Q 0.064 +493 F 0.059 +494 T 0.059 +495 K 0.058 +496 A 0.059 +497 I 0.058 +498 A 0.052 +499 I 0.045 +500 I 0.041 +501 L 0.037 +502 H 0.035 +503 L 0.036 +504 L 0.041 +505 Y 0.048 +506 L 0.055 +507 L 0.063 +508 E 0.069 +509 K 0.077 +510 V 0.086 +511 E 0.099 +512 C 0.109 +513 T 0.109 +514 P 0.101 +515 R 0.088 +516 Q 0.074 +517 E 0.062 +518 H 0.055 +519 L 0.055 +520 K 0.058 +521 H 0.060 +522 Q 0.058 +523 T 0.056 +524 V 0.057 +525 Y 0.058 +526 R 0.057 +527 L 0.061 +528 L 0.069 +529 K 0.077 +530 C 0.086 +531 A 0.094 +532 P 0.097 +533 R 0.096 +534 G 0.101 +535 K 0.118 +536 N 0.134 +537 G 0.132 +538 F 0.109 +539 T 0.081 +540 P 0.061 +541 L 0.052 +542 H 0.055 +543 M 0.069 +544 A 0.087 +545 V 0.105 +546 D 0.127 +547 K 0.158 +548 E 0.194 +549 T 0.226 +550 T 0.252 +551 N 0.273 +552 V 0.283 +553 G 0.282 +554 Q 0.269 +555 Y 0.250 +556 H 0.230 +557 V 0.205 +558 G 0.176 +559 V 0.149 +560 F 0.132 +561 P 0.121 +562 S 0.111 +563 L 0.096 +564 Q 0.084 +565 V 0.081 +566 V 0.085 +567 K 0.089 +568 V 0.091 +569 L 0.093 +570 L 0.093 +571 D 0.092 +572 C 0.098 +573 G 0.118 +574 A 0.144 +575 D 0.162 +576 P 0.163 +577 D 0.152 +578 S 0.133 +579 R 0.115 +580 D 0.108 +581 F 0.115 +582 D 0.121 +583 N 0.117 +584 N 0.105 +585 S 0.093 +586 P 0.083 +587 L 0.076 +588 H 0.077 +589 I 0.084 +590 A 0.089 +591 A 0.089 +592 Q 0.091 +593 N 0.099 +594 N 0.110 +595 C 0.117 +596 P 0.115 +597 A 0.113 +598 I 0.114 +599 M 0.113 +600 D 0.104 +601 A 0.095 +602 L 0.095 +603 I 0.105 +604 E 0.114 +605 A 0.116 +606 G 0.115 +607 A 0.120 +608 H 0.129 +609 M 0.137 +610 D 0.136 +611 A 0.130 +612 T 0.124 +613 N 0.123 +614 T 0.122 +615 F 0.117 +616 K 0.107 +617 K 0.095 +618 T 0.090 +619 A 0.092 +620 Y 0.100 +621 E 0.109 +622 L 0.121 +623 L 0.137 +624 D 0.159 +625 S 0.181 +626 K 0.200 +627 L 0.219 +628 L 0.245 +629 A 0.277 +630 K 0.301 +631 S 0.314 +632 T 0.319 +633 V 0.319 +634 Q 0.312 +635 P 0.296 +636 F 0.274 +637 N 0.250 +638 Y 0.222 +639 V 0.188 +640 T 0.160 +641 L 0.143 +642 Q 0.136 +643 C 0.139 +644 L 0.151 +645 A 0.159 +646 A 0.158 +647 R 0.154 +648 A 0.157 +649 L 0.163 +650 D 0.163 +651 R 0.161 +652 N 0.161 +653 K 0.161 +654 V 0.158 +655 P 0.152 +656 Y 0.153 +657 K 0.168 +658 G 0.189 +659 F 0.199 +660 I 0.193 +661 P 0.175 +662 E 0.156 +663 E 0.142 +664 L 0.132 +665 E 0.125 +666 A 0.120 +667 F 0.117 +668 I 0.118 +669 Q 0.130 +670 L 0.152 +671 H 0.172 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000079677.3_ENSMUST00000010348.7_GN:Fdx2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000079677.3_ENSMUST00000010348.7_GN:Fdx2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7e5dfcb16ff0c73c4245ea0d2adee78257b78439 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000079677.3_ENSMUST00000010348.7_GN:Fdx2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,175 @@ +>ENSMUSG00000079677.3|ENSMUST00000010348.7|GN:Fdx2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.435 +2 A 0.433 +3 A 0.454 +4 S 0.505 +5 M 0.553 +6 A 0.575 +7 R 0.588 +8 G 0.614 +9 V 0.642 +10 S 0.658 +11 A 0.666 +12 R 0.672 +13 V 0.673 +14 L 0.668 +15 L 0.663 +16 R 0.664 +17 A 0.671 +18 A 0.677 +19 G 0.679 +20 G 0.679 +21 S 0.671 +22 W 0.660 +23 G 0.661 +24 P 0.675 +25 R 0.692 +26 A 0.700 +27 G 0.688 +28 H 0.648 +29 A 0.593 +30 A 0.567 +31 V 0.595 +32 T 0.640 +33 S 0.663 +34 R 0.671 +35 T 0.687 +36 F 0.712 +37 G 0.736 +38 T 0.749 +39 T 0.748 +40 G 0.739 +41 E 0.729 +42 R 0.726 +43 R 0.731 +44 A 0.738 +45 G 0.742 +46 E 0.740 +47 E 0.732 +48 A 0.715 +49 A 0.683 +50 D 0.638 +51 S 0.588 +52 P 0.534 +53 E 0.474 +54 L 0.406 +55 P 0.331 +56 R 0.254 +57 D 0.178 +58 V 0.113 +59 V 0.066 +60 N 0.039 +61 V 0.025 +62 V 0.021 +63 F 0.023 +64 V 0.030 +65 D 0.043 +66 R 0.058 +67 S 0.071 +68 G 0.077 +69 K 0.075 +70 R 0.067 +71 I 0.057 +72 P 0.046 +73 V 0.036 +74 R 0.030 +75 G 0.030 +76 K 0.036 +77 V 0.047 +78 G 0.055 +79 D 0.059 +80 N 0.062 +81 V 0.066 +82 L 0.068 +83 Y 0.067 +84 L 0.066 +85 A 0.065 +86 Q 0.065 +87 R 0.064 +88 H 0.068 +89 G 0.079 +90 V 0.097 +91 D 0.122 +92 L 0.148 +93 E 0.165 +94 G 0.166 +95 A 0.155 +96 C 0.141 +97 E 0.135 +98 A 0.134 +99 S 0.135 +100 L 0.139 +101 A 0.149 +102 C 0.153 +103 S 0.146 +104 T 0.132 +105 C 0.113 +106 H 0.091 +107 V 0.072 +108 Y 0.066 +109 V 0.068 +110 S 0.071 +111 E 0.068 +112 A 0.061 +113 H 0.057 +114 L 0.060 +115 D 0.067 +116 L 0.079 +117 L 0.096 +118 P 0.117 +119 P 0.133 +120 P 0.132 +121 E 0.113 +122 E 0.091 +123 R 0.077 +124 E 0.074 +125 D 0.078 +126 D 0.086 +127 M 0.095 +128 L 0.103 +129 D 0.106 +130 M 0.110 +131 A 0.115 +132 P 0.120 +133 L 0.124 +134 L 0.124 +135 Q 0.113 +136 E 0.092 +137 N 0.073 +138 S 0.061 +139 R 0.055 +140 L 0.049 +141 G 0.044 +142 C 0.042 +143 Q 0.042 +144 I 0.042 +145 V 0.041 +146 L 0.039 +147 T 0.040 +148 P 0.047 +149 E 0.058 +150 L 0.068 +151 E 0.074 +152 G 0.072 +153 V 0.066 +154 E 0.057 +155 F 0.054 +156 A 0.065 +157 L 0.087 +158 P 0.115 +159 K 0.148 +160 I 0.182 +161 T 0.212 +162 R 0.243 +163 N 0.281 +164 F 0.322 +165 Y 0.359 +166 V 0.396 +167 D 0.438 +168 G 0.477 +169 H 0.500 +170 I 0.504 +171 P 0.492 +172 K 0.469 +173 P 0.436 +174 H 0.409 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000079677.3_ENSMUST00000010348.7_GN:Fdx2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000079677.3_ENSMUST00000010348.7_GN:Fdx2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..a95844239ab1bdaea0a959c3aa2808238df831e2 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000079677.3_ENSMUST00000010348.7_GN:Fdx2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid @@ -0,0 +1,185 @@ +>ENSMUSG00000079677.3|ENSMUST00000010348.7|GN:Fdx2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:10 +1 M 0.484 +2 L 0.499 +3 G 0.524 +4 L 0.551 +5 P 0.571 +6 V 0.580 +7 T 0.588 +8 W 0.603 +9 P 0.623 +10 I 0.639 +11 M 0.653 +12 A 0.667 +13 A 0.674 +14 S 0.671 +15 M 0.668 +16 A 0.670 +17 R 0.678 +18 G 0.685 +19 V 0.683 +20 S 0.657 +21 A 0.609 +22 R 0.582 +23 V 0.614 +24 L 0.675 +25 L 0.719 +26 R 0.737 +27 A 0.739 +28 A 0.732 +29 G 0.724 +30 G 0.716 +31 S 0.703 +32 W 0.690 +33 G 0.688 +34 P 0.699 +35 R 0.712 +36 A 0.719 +37 G 0.708 +38 H 0.669 +39 A 0.612 +40 A 0.585 +41 V 0.613 +42 T 0.660 +43 S 0.685 +44 R 0.692 +45 T 0.705 +46 F 0.727 +47 G 0.748 +48 T 0.760 +49 T 0.760 +50 G 0.752 +51 E 0.745 +52 R 0.744 +53 R 0.749 +54 A 0.755 +55 G 0.757 +56 E 0.755 +57 E 0.748 +58 A 0.732 +59 A 0.700 +60 D 0.654 +61 S 0.602 +62 P 0.546 +63 E 0.483 +64 L 0.410 +65 P 0.332 +66 R 0.252 +67 D 0.176 +68 V 0.111 +69 V 0.065 +70 N 0.038 +71 V 0.025 +72 V 0.021 +73 F 0.022 +74 V 0.029 +75 D 0.041 +76 R 0.056 +77 S 0.069 +78 G 0.075 +79 K 0.072 +80 R 0.065 +81 I 0.055 +82 P 0.045 +83 V 0.035 +84 R 0.029 +85 G 0.029 +86 K 0.035 +87 V 0.045 +88 G 0.053 +89 D 0.056 +90 N 0.058 +91 V 0.062 +92 L 0.064 +93 Y 0.063 +94 L 0.062 +95 A 0.063 +96 Q 0.062 +97 R 0.062 +98 H 0.066 +99 G 0.077 +100 V 0.095 +101 D 0.120 +102 L 0.147 +103 E 0.164 +104 G 0.165 +105 A 0.153 +106 C 0.140 +107 E 0.134 +108 A 0.134 +109 S 0.134 +110 L 0.138 +111 A 0.147 +112 C 0.151 +113 S 0.144 +114 T 0.130 +115 C 0.111 +116 H 0.089 +117 V 0.071 +118 Y 0.065 +119 V 0.067 +120 S 0.069 +121 E 0.066 +122 A 0.060 +123 H 0.056 +124 L 0.059 +125 D 0.066 +126 L 0.078 +127 L 0.096 +128 P 0.117 +129 P 0.133 +130 P 0.132 +131 E 0.113 +132 E 0.091 +133 R 0.077 +134 E 0.074 +135 D 0.078 +136 D 0.086 +137 M 0.096 +138 L 0.103 +139 D 0.106 +140 M 0.110 +141 A 0.115 +142 P 0.120 +143 L 0.125 +144 L 0.125 +145 Q 0.113 +146 E 0.092 +147 N 0.073 +148 S 0.062 +149 R 0.055 +150 L 0.049 +151 G 0.044 +152 C 0.042 +153 Q 0.042 +154 I 0.042 +155 V 0.041 +156 L 0.039 +157 T 0.041 +158 P 0.047 +159 E 0.058 +160 L 0.068 +161 E 0.074 +162 G 0.073 +163 V 0.066 +164 E 0.057 +165 F 0.054 +166 A 0.065 +167 L 0.087 +168 P 0.115 +169 K 0.149 +170 I 0.182 +171 T 0.212 +172 R 0.243 +173 N 0.280 +174 F 0.319 +175 Y 0.355 +176 V 0.392 +177 D 0.434 +178 G 0.474 +179 H 0.497 +180 I 0.501 +181 P 0.489 +182 K 0.465 +183 P 0.432 +184 H 0.405 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000090125.4_ENSMUST00000053491.9_GN:Pou3f1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000090125.4_ENSMUST00000053491.9_GN:Pou3f1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b2607fae8f3f3b553dff2761649acd04f1dbedf9 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000090125.4_ENSMUST00000053491.9_GN:Pou3f1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,450 @@ +>ENSMUSG00000090125.4|ENSMUST00000053491.9|GN:Pou3f1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.477 +2 A 0.519 +3 T 0.563 +4 T 0.572 +5 A 0.540 +6 Q 0.515 +7 Y 0.540 +8 L 0.603 +9 P 0.663 +10 R 0.706 +11 G 0.738 +12 P 0.765 +13 G 0.788 +14 G 0.803 +15 G 0.808 +16 A 0.804 +17 G 0.797 +18 G 0.790 +19 T 0.783 +20 G 0.776 +21 P 0.768 +22 L 0.748 +23 M 0.713 +24 H 0.670 +25 P 0.629 +26 D 0.582 +27 A 0.516 +28 A 0.442 +29 A 0.398 +30 A 0.399 +31 A 0.416 +32 A 0.422 +33 A 0.415 +34 A 0.415 +35 A 0.430 +36 E 0.450 +37 R 0.474 +38 L 0.505 +39 H 0.538 +40 A 0.555 +41 G 0.540 +42 A 0.487 +43 A 0.416 +44 Y 0.361 +45 R 0.337 +46 E 0.327 +47 V 0.315 +48 Q 0.309 +49 K 0.322 +50 L 0.359 +51 M 0.417 +52 H 0.486 +53 H 0.544 +54 E 0.585 +55 W 0.625 +56 L 0.677 +57 G 0.735 +58 A 0.780 +59 G 0.801 +60 A 0.805 +61 G 0.800 +62 H 0.800 +63 P 0.808 +64 V 0.819 +65 G 0.822 +66 L 0.811 +67 A 0.789 +68 H 0.771 +69 P 0.764 +70 Q 0.766 +71 W 0.774 +72 L 0.790 +73 P 0.813 +74 T 0.838 +75 G 0.855 +76 G 0.863 +77 G 0.864 +78 G 0.859 +79 G 0.850 +80 G 0.837 +81 D 0.823 +82 W 0.813 +83 A 0.811 +84 G 0.810 +85 G 0.808 +86 P 0.809 +87 H 0.816 +88 L 0.826 +89 E 0.836 +90 H 0.845 +91 G 0.853 +92 K 0.859 +93 A 0.864 +94 G 0.868 +95 G 0.870 +96 G 0.872 +97 G 0.873 +98 T 0.874 +99 G 0.873 +100 R 0.870 +101 A 0.864 +102 D 0.858 +103 D 0.852 +104 G 0.847 +105 G 0.843 +106 G 0.839 +107 G 0.831 +108 G 0.818 +109 G 0.798 +110 F 0.766 +111 H 0.714 +112 A 0.649 +113 R 0.615 +114 L 0.647 +115 V 0.713 +116 H 0.763 +117 Q 0.782 +118 G 0.785 +119 A 0.782 +120 A 0.780 +121 H 0.781 +122 A 0.787 +123 G 0.788 +124 A 0.780 +125 A 0.764 +126 W 0.754 +127 A 0.761 +128 Q 0.781 +129 G 0.801 +130 G 0.815 +131 T 0.819 +132 A 0.818 +133 H 0.815 +134 H 0.811 +135 L 0.809 +136 G 0.813 +137 P 0.822 +138 A 0.823 +139 M 0.814 +140 S 0.800 +141 P 0.790 +142 S 0.791 +143 P 0.802 +144 G 0.817 +145 A 0.827 +146 G 0.828 +147 G 0.819 +148 G 0.801 +149 H 0.779 +150 Q 0.758 +151 P 0.745 +152 Q 0.743 +153 P 0.752 +154 L 0.767 +155 G 0.782 +156 L 0.794 +157 Y 0.802 +158 A 0.810 +159 Q 0.812 +160 A 0.801 +161 A 0.783 +162 Y 0.773 +163 P 0.786 +164 G 0.813 +165 G 0.838 +166 G 0.848 +167 G 0.846 +168 G 0.838 +169 G 0.826 +170 L 0.818 +171 A 0.818 +172 G 0.825 +173 M 0.832 +174 L 0.840 +175 A 0.850 +176 A 0.857 +177 G 0.859 +178 G 0.857 +179 G 0.854 +180 G 0.846 +181 A 0.834 +182 G 0.821 +183 P 0.812 +184 G 0.797 +185 L 0.761 +186 H 0.711 +187 H 0.684 +188 A 0.704 +189 L 0.746 +190 H 0.779 +191 E 0.797 +192 D 0.808 +193 G 0.815 +194 H 0.821 +195 E 0.827 +196 A 0.829 +197 Q 0.822 +198 L 0.809 +199 E 0.792 +200 P 0.775 +201 S 0.759 +202 P 0.757 +203 P 0.774 +204 P 0.802 +205 H 0.827 +206 L 0.841 +207 G 0.847 +208 A 0.843 +209 H 0.822 +210 G 0.769 +211 H 0.695 +212 A 0.656 +213 H 0.688 +214 G 0.754 +215 H 0.799 +216 A 0.814 +217 H 0.814 +218 A 0.809 +219 G 0.797 +220 G 0.766 +221 L 0.708 +222 H 0.640 +223 A 0.612 +224 A 0.646 +225 A 0.703 +226 A 0.734 +227 H 0.736 +228 L 0.735 +229 H 0.746 +230 P 0.772 +231 G 0.803 +232 A 0.826 +233 G 0.838 +234 G 0.843 +235 G 0.846 +236 G 0.847 +237 S 0.846 +238 S 0.842 +239 V 0.835 +240 G 0.827 +241 E 0.816 +242 H 0.797 +243 S 0.767 +244 D 0.723 +245 E 0.672 +246 D 0.611 +247 A 0.531 +248 P 0.426 +249 S 0.312 +250 S 0.216 +251 D 0.151 +252 D 0.111 +253 L 0.088 +254 E 0.072 +255 Q 0.059 +256 F 0.048 +257 A 0.041 +258 K 0.038 +259 Q 0.037 +260 F 0.039 +261 K 0.043 +262 Q 0.050 +263 R 0.057 +264 R 0.063 +265 I 0.067 +266 K 0.072 +267 L 0.078 +268 G 0.080 +269 F 0.073 +270 T 0.061 +271 Q 0.052 +272 A 0.051 +273 D 0.056 +274 V 0.063 +275 G 0.069 +276 L 0.069 +277 A 0.065 +278 L 0.063 +279 G 0.067 +280 T 0.076 +281 L 0.091 +282 Y 0.115 +283 G 0.139 +284 N 0.147 +285 V 0.135 +286 F 0.111 +287 S 0.087 +288 Q 0.068 +289 T 0.058 +290 T 0.058 +291 I 0.065 +292 C 0.075 +293 R 0.089 +294 F 0.105 +295 E 0.117 +296 A 0.118 +297 L 0.116 +298 Q 0.117 +299 L 0.115 +300 S 0.105 +301 F 0.087 +302 K 0.072 +303 N 0.063 +304 M 0.059 +305 C 0.059 +306 K 0.062 +307 L 0.062 +308 K 0.055 +309 P 0.047 +310 L 0.041 +311 L 0.037 +312 N 0.033 +313 K 0.029 +314 W 0.028 +315 L 0.031 +316 E 0.038 +317 E 0.055 +318 T 0.087 +319 D 0.131 +320 S 0.181 +321 S 0.232 +322 S 0.283 +323 G 0.323 +324 S 0.336 +325 P 0.317 +326 T 0.278 +327 N 0.239 +328 L 0.211 +329 D 0.195 +330 K 0.191 +331 I 0.202 +332 A 0.237 +333 A 0.293 +334 Q 0.348 +335 G 0.385 +336 R 0.401 +337 K 0.401 +338 R 0.390 +339 K 0.371 +340 K 0.341 +341 R 0.305 +342 T 0.272 +343 S 0.244 +344 I 0.218 +345 E 0.187 +346 V 0.149 +347 G 0.111 +348 V 0.086 +349 K 0.076 +350 G 0.075 +351 A 0.076 +352 L 0.079 +353 E 0.085 +354 S 0.088 +355 H 0.083 +356 F 0.075 +357 L 0.070 +358 K 0.068 +359 C 0.068 +360 P 0.069 +361 K 0.072 +362 P 0.075 +363 S 0.077 +364 A 0.077 +365 H 0.074 +366 E 0.065 +367 I 0.057 +368 T 0.060 +369 G 0.076 +370 L 0.092 +371 A 0.095 +372 D 0.085 +373 S 0.071 +374 L 0.065 +375 Q 0.065 +376 L 0.064 +377 E 0.058 +378 K 0.054 +379 E 0.054 +380 V 0.055 +381 V 0.052 +382 R 0.044 +383 V 0.035 +384 W 0.028 +385 F 0.025 +386 C 0.023 +387 N 0.026 +388 R 0.032 +389 R 0.041 +390 Q 0.053 +391 K 0.070 +392 E 0.105 +393 K 0.166 +394 R 0.255 +395 M 0.368 +396 T 0.492 +397 P 0.604 +398 A 0.685 +399 A 0.729 +400 G 0.742 +401 A 0.731 +402 G 0.706 +403 H 0.681 +404 P 0.670 +405 P 0.674 +406 M 0.681 +407 D 0.684 +408 D 0.674 +409 V 0.654 +410 Y 0.645 +411 A 0.663 +412 P 0.701 +413 G 0.736 +414 E 0.754 +415 L 0.760 +416 G 0.767 +417 P 0.783 +418 G 0.804 +419 G 0.821 +420 G 0.825 +421 S 0.812 +422 A 0.787 +423 S 0.760 +424 P 0.746 +425 P 0.744 +426 S 0.737 +427 A 0.714 +428 P 0.679 +429 P 0.649 +430 P 0.640 +431 P 0.659 +432 P 0.701 +433 P 0.748 +434 A 0.777 +435 A 0.771 +436 L 0.723 +437 H 0.653 +438 H 0.615 +439 H 0.643 +440 H 0.703 +441 H 0.746 +442 H 0.764 +443 T 0.770 +444 L 0.771 +445 P 0.774 +446 G 0.770 +447 S 0.740 +448 V 0.677 +449 Q 0.619 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000090125.4_ENSMUST00000053491.9_GN:Pou3f1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:96.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000090125.4_ENSMUST00000053491.9_GN:Pou3f1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:96.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ef6274a6a92dc173b9d00f0804ab8f98a415389e --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000090125.4_ENSMUST00000053491.9_GN:Pou3f1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:96.caid @@ -0,0 +1,546 @@ +>ENSMUSG00000090125.4|ENSMUST00000053491.9|GN:Pou3f1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:96 +1 M 0.452 +2 N 0.477 +3 E 0.507 +4 A 0.519 +5 P 0.512 +6 A 0.519 +7 A 0.553 +8 N 0.578 +9 Q 0.565 +10 H 0.555 +11 C 0.586 +12 R 0.635 +13 R 0.662 +14 A 0.669 +15 G 0.673 +16 P 0.682 +17 R 0.695 +18 E 0.707 +19 R 0.715 +20 D 0.719 +21 P 0.724 +22 I 0.734 +23 A 0.747 +24 S 0.755 +25 S 0.742 +26 G 0.697 +27 L 0.635 +28 Q 0.608 +29 A 0.648 +30 P 0.720 +31 A 0.773 +32 A 0.796 +33 G 0.802 +34 G 0.803 +35 H 0.802 +36 G 0.800 +37 G 0.791 +38 R 0.775 +39 R 0.758 +40 P 0.749 +41 G 0.751 +42 P 0.761 +43 G 0.768 +44 G 0.757 +45 G 0.711 +46 R 0.644 +47 R 0.612 +48 L 0.645 +49 R 0.707 +50 G 0.748 +51 Q 0.766 +52 P 0.780 +53 M 0.797 +54 G 0.813 +55 G 0.823 +56 G 0.828 +57 R 0.829 +58 G 0.827 +59 G 0.822 +60 A 0.816 +61 P 0.812 +62 E 0.812 +63 R 0.813 +64 P 0.812 +65 A 0.812 +66 G 0.815 +67 P 0.818 +68 G 0.818 +69 F 0.818 +70 K 0.823 +71 P 0.834 +72 A 0.844 +73 E 0.849 +74 R 0.848 +75 G 0.846 +76 G 0.841 +77 G 0.834 +78 A 0.826 +79 R 0.816 +80 R 0.808 +81 R 0.799 +82 S 0.787 +83 E 0.771 +84 A 0.755 +85 A 0.743 +86 A 0.734 +87 A 0.733 +88 A 0.745 +89 G 0.763 +90 R 0.778 +91 R 0.790 +92 R 0.799 +93 A 0.805 +94 R 0.808 +95 G 0.812 +96 G 0.818 +97 M 0.821 +98 A 0.820 +99 T 0.811 +100 T 0.793 +101 A 0.767 +102 Q 0.740 +103 Y 0.721 +104 L 0.717 +105 P 0.728 +106 R 0.745 +107 G 0.763 +108 P 0.780 +109 G 0.796 +110 G 0.809 +111 G 0.816 +112 A 0.817 +113 G 0.815 +114 G 0.810 +115 T 0.802 +116 G 0.794 +117 P 0.784 +118 L 0.763 +119 M 0.731 +120 H 0.696 +121 P 0.670 +122 D 0.648 +123 A 0.617 +124 A 0.583 +125 A 0.558 +126 A 0.538 +127 A 0.517 +128 A 0.495 +129 A 0.474 +130 A 0.462 +131 A 0.463 +132 E 0.469 +133 R 0.478 +134 L 0.493 +135 H 0.518 +136 A 0.542 +137 G 0.540 +138 A 0.497 +139 A 0.430 +140 Y 0.375 +141 R 0.350 +142 E 0.336 +143 V 0.314 +144 Q 0.291 +145 K 0.285 +146 L 0.301 +147 M 0.336 +148 H 0.381 +149 H 0.424 +150 E 0.466 +151 W 0.518 +152 L 0.587 +153 G 0.665 +154 A 0.729 +155 G 0.763 +156 A 0.771 +157 G 0.767 +158 H 0.766 +159 P 0.773 +160 V 0.784 +161 G 0.786 +162 L 0.774 +163 A 0.751 +164 H 0.733 +165 P 0.727 +166 Q 0.728 +167 W 0.734 +168 L 0.751 +169 P 0.780 +170 T 0.810 +171 G 0.833 +172 G 0.845 +173 G 0.847 +174 G 0.843 +175 G 0.833 +176 G 0.816 +177 D 0.796 +178 W 0.781 +179 A 0.776 +180 G 0.776 +181 G 0.777 +182 P 0.782 +183 H 0.791 +184 L 0.803 +185 E 0.815 +186 H 0.826 +187 G 0.837 +188 K 0.846 +189 A 0.852 +190 G 0.856 +191 G 0.860 +192 G 0.863 +193 G 0.866 +194 T 0.868 +195 G 0.868 +196 R 0.866 +197 A 0.862 +198 D 0.856 +199 D 0.849 +200 G 0.842 +201 G 0.836 +202 G 0.830 +203 G 0.823 +204 G 0.812 +205 G 0.795 +206 F 0.767 +207 H 0.720 +208 A 0.658 +209 R 0.624 +210 L 0.652 +211 V 0.715 +212 H 0.763 +213 Q 0.781 +214 G 0.783 +215 A 0.780 +216 A 0.779 +217 H 0.783 +218 A 0.790 +219 G 0.793 +220 A 0.785 +221 A 0.769 +222 W 0.759 +223 A 0.765 +224 Q 0.783 +225 G 0.799 +226 G 0.806 +227 T 0.805 +228 A 0.800 +229 H 0.795 +230 H 0.791 +231 L 0.790 +232 G 0.795 +233 P 0.802 +234 A 0.800 +235 M 0.789 +236 S 0.775 +237 P 0.768 +238 S 0.770 +239 P 0.782 +240 G 0.797 +241 A 0.808 +242 G 0.808 +243 G 0.800 +244 G 0.785 +245 H 0.763 +246 Q 0.740 +247 P 0.724 +248 Q 0.721 +249 P 0.728 +250 L 0.741 +251 G 0.753 +252 L 0.761 +253 Y 0.768 +254 A 0.773 +255 Q 0.772 +256 A 0.761 +257 A 0.744 +258 Y 0.738 +259 P 0.754 +260 G 0.785 +261 G 0.810 +262 G 0.820 +263 G 0.818 +264 G 0.810 +265 G 0.799 +266 L 0.789 +267 A 0.787 +268 G 0.791 +269 M 0.796 +270 L 0.803 +271 A 0.813 +272 A 0.820 +273 G 0.822 +274 G 0.820 +275 G 0.816 +276 G 0.808 +277 A 0.793 +278 G 0.781 +279 P 0.774 +280 G 0.771 +281 L 0.768 +282 H 0.765 +283 H 0.763 +284 A 0.758 +285 L 0.752 +286 H 0.751 +287 E 0.758 +288 D 0.768 +289 G 0.774 +290 H 0.779 +291 E 0.784 +292 A 0.786 +293 Q 0.780 +294 L 0.768 +295 E 0.752 +296 P 0.732 +297 S 0.715 +298 P 0.714 +299 P 0.736 +300 P 0.770 +301 H 0.797 +302 L 0.813 +303 G 0.820 +304 A 0.818 +305 H 0.798 +306 G 0.748 +307 H 0.677 +308 A 0.638 +309 H 0.670 +310 G 0.734 +311 H 0.777 +312 A 0.790 +313 H 0.789 +314 A 0.785 +315 G 0.773 +316 G 0.741 +317 L 0.682 +318 H 0.615 +319 A 0.585 +320 A 0.615 +321 A 0.670 +322 A 0.701 +323 H 0.705 +324 L 0.706 +325 H 0.721 +326 P 0.752 +327 G 0.784 +328 A 0.808 +329 G 0.820 +330 G 0.825 +331 G 0.826 +332 G 0.826 +333 S 0.826 +334 S 0.823 +335 V 0.817 +336 G 0.811 +337 E 0.801 +338 H 0.785 +339 S 0.759 +340 D 0.722 +341 E 0.677 +342 D 0.623 +343 A 0.549 +344 P 0.450 +345 S 0.338 +346 S 0.239 +347 D 0.169 +348 D 0.123 +349 L 0.095 +350 E 0.076 +351 Q 0.061 +352 F 0.050 +353 A 0.042 +354 K 0.039 +355 Q 0.039 +356 F 0.041 +357 K 0.046 +358 Q 0.053 +359 R 0.060 +360 R 0.066 +361 I 0.071 +362 K 0.078 +363 L 0.086 +364 G 0.090 +365 F 0.083 +366 T 0.069 +367 Q 0.058 +368 A 0.055 +369 D 0.060 +370 V 0.067 +371 G 0.070 +372 L 0.069 +373 A 0.066 +374 L 0.066 +375 G 0.073 +376 T 0.083 +377 L 0.099 +378 Y 0.123 +379 G 0.146 +380 N 0.154 +381 V 0.140 +382 F 0.116 +383 S 0.092 +384 Q 0.072 +385 T 0.061 +386 T 0.061 +387 I 0.068 +388 C 0.079 +389 R 0.093 +390 F 0.111 +391 E 0.123 +392 A 0.124 +393 L 0.121 +394 Q 0.120 +395 L 0.119 +396 S 0.109 +397 F 0.093 +398 K 0.079 +399 N 0.069 +400 M 0.064 +401 C 0.064 +402 K 0.066 +403 L 0.065 +404 K 0.058 +405 P 0.050 +406 L 0.045 +407 L 0.041 +408 N 0.036 +409 K 0.032 +410 W 0.031 +411 L 0.034 +412 E 0.042 +413 E 0.061 +414 T 0.094 +415 D 0.140 +416 S 0.192 +417 S 0.244 +418 S 0.292 +419 G 0.325 +420 S 0.330 +421 P 0.303 +422 T 0.263 +423 N 0.226 +424 L 0.200 +425 D 0.186 +426 K 0.181 +427 I 0.190 +428 A 0.223 +429 A 0.277 +430 Q 0.332 +431 G 0.371 +432 R 0.391 +433 K 0.396 +434 R 0.393 +435 K 0.381 +436 K 0.356 +437 R 0.322 +438 T 0.290 +439 S 0.262 +440 I 0.231 +441 E 0.193 +442 V 0.151 +443 G 0.113 +444 V 0.089 +445 K 0.079 +446 G 0.076 +447 A 0.077 +448 L 0.081 +449 E 0.088 +450 S 0.092 +451 H 0.089 +452 F 0.082 +453 L 0.078 +454 K 0.077 +455 C 0.077 +456 P 0.078 +457 K 0.081 +458 P 0.084 +459 S 0.085 +460 A 0.085 +461 H 0.082 +462 E 0.074 +463 I 0.066 +464 T 0.071 +465 G 0.086 +466 L 0.102 +467 A 0.104 +468 D 0.093 +469 S 0.080 +470 L 0.074 +471 Q 0.075 +472 L 0.074 +473 E 0.068 +474 K 0.063 +475 E 0.062 +476 V 0.063 +477 V 0.059 +478 R 0.051 +479 V 0.041 +480 W 0.033 +481 F 0.029 +482 C 0.028 +483 N 0.031 +484 R 0.038 +485 R 0.049 +486 Q 0.062 +487 K 0.083 +488 E 0.122 +489 K 0.189 +490 R 0.283 +491 M 0.394 +492 T 0.511 +493 P 0.615 +494 A 0.687 +495 A 0.723 +496 G 0.729 +497 A 0.713 +498 G 0.684 +499 H 0.658 +500 P 0.648 +501 P 0.654 +502 M 0.663 +503 D 0.663 +504 D 0.647 +505 V 0.621 +506 Y 0.608 +507 A 0.630 +508 P 0.675 +509 G 0.715 +510 E 0.735 +511 L 0.741 +512 G 0.747 +513 P 0.761 +514 G 0.782 +515 G 0.796 +516 G 0.793 +517 S 0.771 +518 A 0.736 +519 S 0.703 +520 P 0.686 +521 P 0.681 +522 S 0.670 +523 A 0.642 +524 P 0.608 +525 P 0.585 +526 P 0.587 +527 P 0.617 +528 P 0.667 +529 P 0.718 +530 A 0.751 +531 A 0.748 +532 L 0.704 +533 H 0.639 +534 H 0.602 +535 H 0.624 +536 H 0.670 +537 H 0.698 +538 H 0.704 +539 T 0.705 +540 L 0.707 +541 P 0.712 +542 G 0.715 +543 S 0.699 +544 V 0.661 +545 Q 0.627 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000090266.11_ENSMUST00000106370.10_GN:Mettl23_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000090266.11_ENSMUST00000106370.10_GN:Mettl23_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..226143e1887c814c74f827ad3d1c9ebb09d9a5f8 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000090266.11_ENSMUST00000106370.10_GN:Mettl23_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,254 @@ +>ENSMUSG00000090266.11|ENSMUST00000106370.10|GN:Mettl23|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.430 +2 D 0.429 +3 S 0.429 +4 V 0.428 +5 R 0.419 +6 P 0.405 +7 R 0.392 +8 A 0.371 +9 P 0.336 +10 W 0.301 +11 A 0.287 +12 P 0.298 +13 P 0.323 +14 P 0.349 +15 D 0.361 +16 P 0.367 +17 A 0.399 +18 S 0.464 +19 L 0.527 +20 D 0.558 +21 S 0.563 +22 P 0.559 +23 T 0.552 +24 C 0.540 +25 E 0.528 +26 P 0.512 +27 G 0.478 +28 L 0.422 +29 M 0.353 +30 A 0.279 +31 G 0.207 +32 T 0.143 +33 Q 0.093 +34 L 0.058 +35 F 0.039 +36 R 0.037 +37 F 0.051 +38 R 0.078 +39 E 0.117 +40 E 0.159 +41 P 0.199 +42 V 0.232 +43 P 0.261 +44 G 0.285 +45 G 0.289 +46 N 0.266 +47 R 0.220 +48 A 0.169 +49 V 0.127 +50 L 0.100 +51 E 0.087 +52 V 0.084 +53 R 0.085 +54 V 0.091 +55 P 0.100 +56 Q 0.114 +57 V 0.132 +58 L 0.146 +59 H 0.150 +60 V 0.146 +61 Q 0.143 +62 Y 0.146 +63 G 0.150 +64 M 0.150 +65 Y 0.141 +66 V 0.120 +67 W 0.094 +68 P 0.072 +69 C 0.061 +70 A 0.056 +71 V 0.053 +72 V 0.050 +73 L 0.046 +74 A 0.041 +75 Q 0.036 +76 Y 0.031 +77 L 0.030 +78 W 0.029 +79 F 0.026 +80 H 0.024 +81 R 0.027 +82 R 0.033 +83 S 0.046 +84 L 0.065 +85 P 0.081 +86 G 0.084 +87 K 0.075 +88 A 0.062 +89 V 0.049 +90 L 0.040 +91 E 0.036 +92 V 0.034 +93 G 0.032 +94 A 0.032 +95 G 0.033 +96 V 0.038 +97 S 0.044 +98 L 0.048 +99 P 0.046 +100 G 0.044 +101 I 0.045 +102 L 0.046 +103 A 0.047 +104 A 0.050 +105 K 0.064 +106 C 0.086 +107 G 0.105 +108 A 0.107 +109 K 0.092 +110 V 0.071 +111 I 0.053 +112 L 0.041 +113 S 0.038 +114 D 0.043 +115 S 0.053 +116 S 0.064 +117 E 0.072 +118 F 0.072 +119 P 0.063 +120 H 0.054 +121 C 0.055 +122 L 0.064 +123 D 0.068 +124 I 0.061 +125 C 0.050 +126 R 0.042 +127 Q 0.043 +128 S 0.051 +129 C 0.066 +130 Q 0.078 +131 M 0.078 +132 N 0.068 +133 N 0.057 +134 L 0.052 +135 P 0.052 +136 Q 0.055 +137 V 0.058 +138 E 0.062 +139 V 0.067 +140 V 0.071 +141 G 0.073 +142 L 0.072 +143 T 0.070 +144 W 0.072 +145 G 0.076 +146 H 0.075 +147 I 0.066 +148 S 0.055 +149 K 0.049 +150 D 0.050 +151 I 0.055 +152 L 0.062 +153 S 0.073 +154 L 0.085 +155 P 0.090 +156 P 0.085 +157 Q 0.073 +158 D 0.063 +159 I 0.053 +160 I 0.044 +161 L 0.037 +162 G 0.036 +163 S 0.042 +164 D 0.058 +165 V 0.079 +166 F 0.094 +167 F 0.097 +168 E 0.095 +169 P 0.092 +170 E 0.087 +171 D 0.079 +172 F 0.068 +173 E 0.059 +174 S 0.051 +175 I 0.045 +176 L 0.040 +177 A 0.037 +178 T 0.034 +179 V 0.032 +180 Y 0.031 +181 F 0.031 +182 L 0.033 +183 M 0.037 +184 Q 0.041 +185 K 0.047 +186 N 0.053 +187 P 0.055 +188 K 0.055 +189 V 0.049 +190 Q 0.041 +191 F 0.033 +192 W 0.029 +193 S 0.033 +194 T 0.043 +195 Y 0.054 +196 Q 0.063 +197 V 0.070 +198 R 0.080 +199 S 0.093 +200 A 0.107 +201 D 0.113 +202 W 0.108 +203 S 0.094 +204 L 0.079 +205 E 0.070 +206 G 0.066 +207 L 0.063 +208 L 0.058 +209 Y 0.052 +210 K 0.048 +211 W 0.045 +212 D 0.045 +213 M 0.044 +214 K 0.044 +215 C 0.046 +216 V 0.054 +217 H 0.065 +218 I 0.074 +219 P 0.076 +220 L 0.075 +221 E 0.072 +222 S 0.073 +223 F 0.082 +224 D 0.102 +225 A 0.126 +226 D 0.141 +227 K 0.144 +228 E 0.141 +229 D 0.144 +230 I 0.159 +231 A 0.180 +232 E 0.200 +233 S 0.219 +234 T 0.242 +235 L 0.261 +236 P 0.262 +237 G 0.238 +238 R 0.196 +239 H 0.147 +240 T 0.101 +241 V 0.068 +242 E 0.050 +243 M 0.042 +244 L 0.039 +245 I 0.041 +246 I 0.049 +247 S 0.071 +248 F 0.115 +249 A 0.176 +250 K 0.237 +251 D 0.281 +252 S 0.304 +253 F 0.312 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000090266.11_ENSMUST00000106370.10_GN:Mettl23_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:66.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000090266.11_ENSMUST00000106370.10_GN:Mettl23_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:66.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..98c9b68b82206490c94001753b4f41e09a949fe7 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000090266.11_ENSMUST00000106370.10_GN:Mettl23_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:66.caid @@ -0,0 +1,320 @@ +>ENSMUSG00000090266.11|ENSMUST00000106370.10|GN:Mettl23|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:66 +1 M 0.373 +2 R 0.384 +3 S 0.428 +4 A 0.503 +5 I 0.569 +6 G 0.596 +7 L 0.596 +8 S 0.584 +9 D 0.558 +10 L 0.518 +11 P 0.484 +12 D 0.473 +13 P 0.479 +14 P 0.487 +15 S 0.477 +16 C 0.457 +17 T 0.461 +18 P 0.498 +19 I 0.531 +20 G 0.528 +21 R 0.520 +22 H 0.541 +23 V 0.564 +24 G 0.556 +25 K 0.540 +26 V 0.547 +27 A 0.561 +28 S 0.561 +29 P 0.557 +30 T 0.560 +31 P 0.571 +32 C 0.585 +33 P 0.595 +34 S 0.592 +35 L 0.576 +36 L 0.551 +37 W 0.527 +38 P 0.511 +39 T 0.501 +40 Q 0.488 +41 H 0.477 +42 F 0.488 +43 R 0.527 +44 L 0.585 +45 R 0.642 +46 V 0.682 +47 A 0.696 +48 S 0.687 +49 L 0.664 +50 R 0.646 +51 S 0.649 +52 P 0.672 +53 S 0.704 +54 G 0.731 +55 R 0.745 +56 A 0.747 +57 R 0.743 +58 C 0.729 +59 G 0.702 +60 L 0.664 +61 R 0.631 +62 L 0.616 +63 P 0.615 +64 V 0.620 +65 F 0.627 +66 A 0.629 +67 M 0.620 +68 D 0.598 +69 S 0.563 +70 V 0.523 +71 R 0.484 +72 P 0.455 +73 R 0.441 +74 A 0.425 +75 P 0.392 +76 W 0.358 +77 A 0.350 +78 P 0.372 +79 P 0.419 +80 P 0.476 +81 D 0.522 +82 P 0.551 +83 A 0.581 +84 S 0.614 +85 L 0.638 +86 D 0.647 +87 S 0.646 +88 P 0.642 +89 T 0.631 +90 C 0.613 +91 E 0.588 +92 P 0.554 +93 G 0.503 +94 L 0.432 +95 M 0.351 +96 A 0.270 +97 G 0.195 +98 T 0.133 +99 Q 0.086 +100 L 0.054 +101 F 0.036 +102 R 0.033 +103 F 0.045 +104 R 0.071 +105 E 0.106 +106 E 0.145 +107 P 0.179 +108 V 0.206 +109 P 0.230 +110 G 0.253 +111 G 0.263 +112 N 0.246 +113 R 0.205 +114 A 0.157 +115 V 0.117 +116 L 0.091 +117 E 0.078 +118 V 0.072 +119 R 0.071 +120 V 0.073 +121 P 0.077 +122 Q 0.084 +123 V 0.097 +124 L 0.111 +125 H 0.119 +126 V 0.122 +127 Q 0.125 +128 Y 0.131 +129 G 0.138 +130 M 0.139 +131 Y 0.130 +132 V 0.110 +133 W 0.085 +134 P 0.066 +135 C 0.056 +136 A 0.052 +137 V 0.048 +138 V 0.044 +139 L 0.040 +140 A 0.035 +141 Q 0.031 +142 Y 0.027 +143 L 0.026 +144 W 0.026 +145 F 0.024 +146 H 0.023 +147 R 0.025 +148 R 0.033 +149 S 0.046 +150 L 0.064 +151 P 0.079 +152 G 0.081 +153 K 0.072 +154 A 0.060 +155 V 0.049 +156 L 0.039 +157 E 0.034 +158 V 0.032 +159 G 0.031 +160 A 0.031 +161 G 0.033 +162 V 0.039 +163 S 0.046 +164 L 0.050 +165 P 0.047 +166 G 0.044 +167 I 0.045 +168 L 0.046 +169 A 0.046 +170 A 0.051 +171 K 0.066 +172 C 0.090 +173 G 0.112 +174 A 0.113 +175 K 0.096 +176 V 0.073 +177 I 0.054 +178 L 0.041 +179 S 0.037 +180 D 0.041 +181 S 0.051 +182 S 0.063 +183 E 0.072 +184 F 0.073 +185 P 0.064 +186 H 0.054 +187 C 0.053 +188 L 0.060 +189 D 0.065 +190 I 0.059 +191 C 0.049 +192 R 0.042 +193 Q 0.043 +194 S 0.052 +195 C 0.066 +196 Q 0.076 +197 M 0.074 +198 N 0.063 +199 N 0.051 +200 L 0.045 +201 P 0.045 +202 Q 0.047 +203 V 0.049 +204 E 0.052 +205 V 0.057 +206 V 0.062 +207 G 0.065 +208 L 0.064 +209 T 0.063 +210 W 0.065 +211 G 0.069 +212 H 0.066 +213 I 0.056 +214 S 0.045 +215 K 0.040 +216 D 0.040 +217 I 0.044 +218 L 0.051 +219 S 0.062 +220 L 0.073 +221 P 0.079 +222 P 0.074 +223 Q 0.064 +224 D 0.055 +225 I 0.048 +226 I 0.041 +227 L 0.036 +228 G 0.035 +229 S 0.040 +230 D 0.054 +231 V 0.072 +232 F 0.084 +233 F 0.086 +234 E 0.084 +235 P 0.082 +236 E 0.078 +237 D 0.071 +238 F 0.062 +239 E 0.053 +240 S 0.046 +241 I 0.040 +242 L 0.037 +243 A 0.034 +244 T 0.032 +245 V 0.030 +246 Y 0.029 +247 F 0.029 +248 L 0.030 +249 M 0.033 +250 Q 0.037 +251 K 0.042 +252 N 0.046 +253 P 0.049 +254 K 0.049 +255 V 0.045 +256 Q 0.038 +257 F 0.031 +258 W 0.028 +259 S 0.032 +260 T 0.040 +261 Y 0.050 +262 Q 0.058 +263 V 0.064 +264 R 0.072 +265 S 0.085 +266 A 0.099 +267 D 0.106 +268 W 0.101 +269 S 0.089 +270 L 0.076 +271 E 0.068 +272 G 0.064 +273 L 0.062 +274 L 0.058 +275 Y 0.053 +276 K 0.049 +277 W 0.047 +278 D 0.046 +279 M 0.045 +280 K 0.045 +281 C 0.048 +282 V 0.055 +283 H 0.066 +284 I 0.074 +285 P 0.076 +286 L 0.075 +287 E 0.073 +288 S 0.074 +289 F 0.083 +290 D 0.104 +291 A 0.128 +292 D 0.144 +293 K 0.147 +294 E 0.143 +295 D 0.145 +296 I 0.159 +297 A 0.181 +298 E 0.202 +299 S 0.223 +300 T 0.249 +301 L 0.271 +302 P 0.275 +303 G 0.253 +304 R 0.209 +305 H 0.157 +306 T 0.108 +307 V 0.072 +308 E 0.052 +309 M 0.044 +310 L 0.042 +311 I 0.045 +312 I 0.054 +313 S 0.078 +314 F 0.123 +315 A 0.186 +316 K 0.247 +317 D 0.290 +318 S 0.312 +319 F 0.319 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000096630.3_ENSMUST00000032238.5_GN:Vmn2r26_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000096630.3_ENSMUST00000032238.5_GN:Vmn2r26_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0224103955b9482567aff3116ce30e0d0036080d --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000096630.3_ENSMUST00000032238.5_GN:Vmn2r26_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,856 @@ +>ENSMUSG00000096630.3|ENSMUST00000032238.5|GN:Vmn2r26|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.206 +2 K 0.195 +3 L 0.184 +4 L 0.181 +5 T 0.188 +6 A 0.200 +7 F 0.210 +8 S 0.205 +9 P 0.187 +10 L 0.165 +11 V 0.151 +12 V 0.146 +13 L 0.149 +14 I 0.157 +15 L 0.168 +16 F 0.183 +17 Q 0.203 +18 E 0.223 +19 Q 0.232 +20 I 0.225 +21 S 0.211 +22 C 0.198 +23 Y 0.187 +24 Y 0.176 +25 L 0.171 +26 T 0.176 +27 K 0.188 +28 Y 0.197 +29 A 0.193 +30 S 0.172 +31 S 0.141 +32 G 0.112 +33 Y 0.094 +34 Y 0.090 +35 Q 0.096 +36 D 0.104 +37 A 0.103 +38 D 0.090 +39 F 0.075 +40 V 0.064 +41 I 0.059 +42 G 0.057 +43 G 0.061 +44 L 0.068 +45 F 0.081 +46 S 0.106 +47 L 0.144 +48 R 0.195 +49 V 0.268 +50 T 0.375 +51 D 0.505 +52 G 0.620 +53 D 0.688 +54 T 0.706 +55 F 0.696 +56 I 0.682 +57 S 0.679 +58 R 0.687 +59 S 0.695 +60 G 0.692 +61 V 0.671 +62 E 0.640 +63 D 0.610 +64 T 0.585 +65 S 0.565 +66 H 0.547 +67 I 0.513 +68 A 0.447 +69 E 0.360 +70 Y 0.282 +71 V 0.229 +72 F 0.193 +73 A 0.161 +74 D 0.131 +75 L 0.105 +76 I 0.086 +77 K 0.074 +78 Y 0.070 +79 Y 0.072 +80 Q 0.075 +81 H 0.075 +82 I 0.073 +83 L 0.071 +84 A 0.071 +85 M 0.070 +86 V 0.063 +87 F 0.054 +88 A 0.049 +89 I 0.048 +90 E 0.050 +91 K 0.056 +92 I 0.064 +93 N 0.071 +94 K 0.076 +95 D 0.083 +96 P 0.087 +97 N 0.086 +98 I 0.080 +99 L 0.077 +100 F 0.085 +101 N 0.099 +102 K 0.111 +103 S 0.112 +104 L 0.106 +105 G 0.098 +106 F 0.090 +107 F 0.083 +108 L 0.079 +109 F 0.081 +110 N 0.087 +111 V 0.095 +112 N 0.102 +113 F 0.105 +114 I 0.101 +115 E 0.089 +116 M 0.073 +117 K 0.059 +118 A 0.055 +119 A 0.060 +120 E 0.071 +121 G 0.083 +122 S 0.100 +123 M 0.121 +124 A 0.139 +125 L 0.158 +126 L 0.183 +127 S 0.209 +128 G 0.221 +129 E 0.217 +130 S 0.211 +131 P 0.223 +132 P 0.256 +133 I 0.288 +134 P 0.304 +135 N 0.302 +136 Y 0.282 +137 S 0.255 +138 C 0.240 +139 R 0.238 +140 P 0.236 +141 E 0.224 +142 K 0.204 +143 T 0.178 +144 D 0.148 +145 K 0.121 +146 L 0.099 +147 V 0.081 +148 A 0.068 +149 V 0.057 +150 I 0.051 +151 G 0.055 +152 G 0.071 +153 I 0.092 +154 S 0.106 +155 T 0.107 +156 S 0.099 +157 I 0.087 +158 S 0.075 +159 I 0.066 +160 Q 0.065 +161 I 0.067 +162 S 0.067 +163 R 0.063 +164 V 0.059 +165 L 0.057 +166 S 0.056 +167 L 0.057 +168 Y 0.060 +169 N 0.066 +170 V 0.072 +171 P 0.077 +172 Q 0.077 +173 I 0.076 +174 S 0.079 +175 Y 0.092 +176 A 0.114 +177 P 0.130 +178 F 0.132 +179 D 0.131 +180 Q 0.144 +181 I 0.176 +182 L 0.219 +183 G 0.258 +184 T 0.283 +185 R 0.295 +186 V 0.300 +187 Q 0.299 +188 L 0.292 +189 Q 0.284 +190 S 0.273 +191 P 0.247 +192 Y 0.208 +193 Q 0.174 +194 F 0.159 +195 S 0.159 +196 M 0.160 +197 H 0.147 +198 T 0.119 +199 A 0.090 +200 A 0.069 +201 L 0.058 +202 Y 0.052 +203 Q 0.047 +204 G 0.044 +205 I 0.041 +206 V 0.038 +207 Q 0.034 +208 L 0.032 +209 L 0.033 +210 L 0.036 +211 Y 0.039 +212 F 0.041 +213 T 0.038 +214 W 0.033 +215 I 0.030 +216 W 0.030 +217 V 0.031 +218 G 0.034 +219 L 0.040 +220 V 0.050 +221 V 0.059 +222 P 0.063 +223 D 0.060 +224 D 0.053 +225 M 0.044 +226 R 0.037 +227 G 0.032 +228 E 0.032 +229 L 0.036 +230 Y 0.045 +231 L 0.056 +232 R 0.062 +233 D 0.059 +234 I 0.055 +235 T 0.058 +236 K 0.060 +237 E 0.055 +238 M 0.050 +239 I 0.056 +240 S 0.065 +241 H 0.066 +242 G 0.057 +243 I 0.046 +244 C 0.037 +245 F 0.031 +246 A 0.030 +247 F 0.031 +248 A 0.034 +249 E 0.039 +250 K 0.045 +251 V 0.053 +252 T 0.067 +253 E 0.087 +254 Y 0.110 +255 S 0.126 +256 S 0.125 +257 M 0.110 +258 D 0.089 +259 T 0.072 +260 V 0.056 +261 N 0.041 +262 W 0.029 +263 K 0.024 +264 H 0.027 +265 F 0.036 +266 M 0.049 +267 E 0.058 +268 R 0.057 +269 L 0.049 +270 T 0.043 +271 L 0.039 +272 T 0.039 +273 P 0.040 +274 V 0.038 +275 I 0.035 +276 I 0.031 +277 T 0.031 +278 V 0.035 +279 G 0.041 +280 D 0.044 +281 T 0.041 +282 H 0.035 +283 S 0.030 +284 L 0.028 +285 L 0.025 +286 R 0.023 +287 I 0.022 +288 V 0.022 +289 Y 0.020 +290 F 0.018 +291 V 0.018 +292 I 0.020 +293 F 0.023 +294 Y 0.027 +295 N 0.034 +296 L 0.045 +297 S 0.056 +298 G 0.060 +299 N 0.055 +300 V 0.044 +301 W 0.036 +302 I 0.032 +303 T 0.033 +304 T 0.039 +305 S 0.050 +306 D 0.060 +307 W 0.065 +308 Y 0.065 +309 I 0.066 +310 T 0.076 +311 T 0.095 +312 L 0.115 +313 P 0.130 +314 F 0.137 +315 E 0.136 +316 Q 0.125 +317 N 0.108 +318 L 0.089 +319 I 0.075 +320 Y 0.067 +321 T 0.064 +322 H 0.068 +323 F 0.079 +324 G 0.091 +325 G 0.095 +326 G 0.090 +327 L 0.084 +328 S 0.083 +329 F 0.088 +330 S 0.098 +331 F 0.113 +332 H 0.130 +333 M 0.148 +334 D 0.159 +335 E 0.157 +336 I 0.142 +337 L 0.119 +338 G 0.099 +339 F 0.088 +340 K 0.086 +341 D 0.087 +342 F 0.083 +343 L 0.078 +344 R 0.075 +345 S 0.073 +346 V 0.072 +347 Q 0.069 +348 P 0.066 +349 R 0.064 +350 K 0.067 +351 Y 0.074 +352 P 0.078 +353 H 0.074 +354 D 0.062 +355 I 0.047 +356 F 0.036 +357 I 0.030 +358 R 0.030 +359 H 0.034 +360 V 0.042 +361 W 0.050 +362 S 0.058 +363 S 0.068 +364 L 0.085 +365 F 0.119 +366 G 0.177 +367 C 0.248 +368 P 0.305 +369 H 0.329 +370 Y 0.327 +371 Y 0.316 +372 Q 0.301 +373 H 0.281 +374 R 0.261 +375 L 0.250 +376 W 0.248 +377 D 0.245 +378 L 0.238 +379 S 0.228 +380 Q 0.218 +381 C 0.201 +382 E 0.181 +383 P 0.170 +384 N 0.177 +385 G 0.192 +386 S 0.204 +387 L 0.209 +388 S 0.210 +389 T 0.209 +390 R 0.204 +391 P 0.194 +392 L 0.183 +393 H 0.170 +394 A 0.157 +395 W 0.147 +396 D 0.142 +397 M 0.142 +398 N 0.139 +399 T 0.128 +400 S 0.113 +401 P 0.101 +402 Y 0.099 +403 S 0.105 +404 Y 0.120 +405 K 0.140 +406 V 0.155 +407 Y 0.162 +408 A 0.161 +409 A 0.152 +410 V 0.136 +411 Y 0.121 +412 A 0.110 +413 I 0.096 +414 A 0.077 +415 Q 0.061 +416 A 0.053 +417 L 0.050 +418 H 0.050 +419 E 0.055 +420 E 0.069 +421 L 0.094 +422 S 0.131 +423 L 0.180 +424 R 0.238 +425 V 0.296 +426 E 0.346 +427 G 0.381 +428 D 0.395 +429 S 0.387 +430 S 0.361 +431 N 0.324 +432 K 0.287 +433 C 0.258 +434 L 0.237 +435 L 0.213 +436 Q 0.179 +437 A 0.144 +438 P 0.112 +439 L 0.087 +440 P 0.070 +441 W 0.063 +442 K 0.063 +443 L 0.066 +444 H 0.066 +445 P 0.067 +446 F 0.077 +447 L 0.100 +448 Q 0.131 +449 K 0.172 +450 G 0.221 +451 Q 0.272 +452 L 0.325 +453 G 0.383 +454 R 0.441 +455 S 0.483 +456 T 0.499 +457 N 0.492 +458 E 0.476 +459 E 0.459 +460 N 0.445 +461 T 0.434 +462 V 0.425 +463 N 0.409 +464 K 0.379 +465 E 0.337 +466 V 0.284 +467 S 0.224 +468 A 0.163 +469 I 0.112 +470 K 0.075 +471 L 0.056 +472 D 0.050 +473 I 0.050 +474 F 0.057 +475 N 0.072 +476 Y 0.095 +477 Q 0.124 +478 S 0.158 +479 L 0.188 +480 Q 0.206 +481 S 0.206 +482 G 0.191 +483 T 0.169 +484 E 0.148 +485 A 0.129 +486 H 0.114 +487 V 0.105 +488 K 0.101 +489 V 0.098 +490 G 0.091 +491 E 0.080 +492 F 0.071 +493 V 0.071 +494 F 0.088 +495 D 0.114 +496 S 0.133 +497 H 0.139 +498 S 0.134 +499 V 0.125 +500 Q 0.114 +501 H 0.105 +502 L 0.102 +503 S 0.104 +504 L 0.107 +505 N 0.107 +506 D 0.104 +507 K 0.104 +508 I 0.103 +509 I 0.099 +510 T 0.097 +511 W 0.101 +512 G 0.107 +513 K 0.106 +514 H 0.099 +515 R 0.095 +516 S 0.105 +517 Q 0.128 +518 T 0.153 +519 P 0.171 +520 L 0.183 +521 S 0.200 +522 V 0.223 +523 C 0.245 +524 S 0.256 +525 Q 0.250 +526 S 0.227 +527 C 0.199 +528 P 0.178 +529 F 0.159 +530 G 0.143 +531 F 0.139 +532 S 0.152 +533 K 0.172 +534 T 0.187 +535 A 0.199 +536 V 0.212 +537 E 0.220 +538 G 0.217 +539 K 0.208 +540 P 0.199 +541 F 0.190 +542 C 0.185 +543 C 0.185 +544 F 0.190 +545 D 0.195 +546 C 0.194 +547 V 0.186 +548 P 0.179 +549 C 0.182 +550 P 0.195 +551 D 0.201 +552 G 0.194 +553 E 0.191 +554 I 0.205 +555 A 0.232 +556 N 0.262 +557 K 0.287 +558 T 0.293 +559 D 0.276 +560 M 0.251 +561 D 0.238 +562 Q 0.232 +563 C 0.220 +564 I 0.199 +565 K 0.178 +566 C 0.164 +567 P 0.156 +568 E 0.147 +569 D 0.135 +570 Q 0.124 +571 Y 0.118 +572 P 0.120 +573 N 0.130 +574 K 0.141 +575 Q 0.144 +576 R 0.148 +577 N 0.166 +578 Q 0.199 +579 C 0.230 +580 L 0.249 +581 P 0.250 +582 K 0.237 +583 I 0.216 +584 M 0.194 +585 V 0.178 +586 F 0.169 +587 L 0.168 +588 A 0.171 +589 H 0.166 +590 E 0.149 +591 D 0.125 +592 P 0.104 +593 L 0.092 +594 G 0.086 +595 T 0.086 +596 V 0.092 +597 L 0.103 +598 V 0.113 +599 S 0.118 +600 L 0.122 +601 A 0.127 +602 I 0.130 +603 S 0.127 +604 L 0.123 +605 S 0.122 +606 A 0.119 +607 F 0.114 +608 S 0.110 +609 A 0.111 +610 M 0.114 +611 I 0.112 +612 L 0.102 +613 G 0.089 +614 L 0.077 +615 F 0.066 +616 I 0.057 +617 C 0.052 +618 Y 0.050 +619 R 0.053 +620 E 0.064 +621 T 0.081 +622 P 0.102 +623 I 0.111 +624 V 0.100 +625 R 0.080 +626 A 0.067 +627 N 0.061 +628 N 0.054 +629 R 0.049 +630 N 0.048 +631 L 0.053 +632 S 0.058 +633 Y 0.063 +634 L 0.066 +635 L 0.070 +636 L 0.076 +637 I 0.080 +638 S 0.082 +639 L 0.084 +640 K 0.085 +641 L 0.085 +642 C 0.092 +643 F 0.108 +644 S 0.129 +645 C 0.143 +646 S 0.147 +647 L 0.141 +648 M 0.125 +649 F 0.109 +650 I 0.108 +651 G 0.122 +652 Q 0.136 +653 P 0.133 +654 R 0.114 +655 T 0.090 +656 V 0.070 +657 T 0.059 +658 C 0.053 +659 V 0.048 +660 L 0.044 +661 R 0.042 +662 Q 0.043 +663 I 0.047 +664 I 0.053 +665 F 0.061 +666 G 0.070 +667 I 0.074 +668 V 0.071 +669 F 0.064 +670 S 0.059 +671 I 0.056 +672 V 0.054 +673 I 0.054 +674 S 0.054 +675 A 0.057 +676 I 0.062 +677 L 0.066 +678 A 0.067 +679 K 0.067 +680 T 0.065 +681 F 0.065 +682 I 0.065 +683 V 0.065 +684 V 0.063 +685 M 0.066 +686 A 0.078 +687 F 0.101 +688 K 0.135 +689 A 0.176 +690 I 0.223 +691 K 0.272 +692 P 0.313 +693 G 0.336 +694 S 0.337 +695 I 0.325 +696 L 0.307 +697 K 0.290 +698 M 0.275 +699 G 0.255 +700 M 0.221 +701 V 0.179 +702 T 0.138 +703 R 0.105 +704 L 0.086 +705 S 0.082 +706 N 0.087 +707 A 0.091 +708 I 0.088 +709 V 0.079 +710 C 0.074 +711 C 0.080 +712 G 0.095 +713 S 0.109 +714 I 0.112 +715 I 0.108 +716 Q 0.104 +717 V 0.103 +718 C 0.102 +719 I 0.098 +720 C 0.092 +721 A 0.085 +722 V 0.080 +723 W 0.081 +724 L 0.087 +725 G 0.096 +726 T 0.109 +727 Y 0.124 +728 P 0.144 +729 P 0.167 +730 F 0.191 +731 P 0.213 +732 D 0.225 +733 V 0.221 +734 D 0.207 +735 M 0.195 +736 H 0.196 +737 S 0.210 +738 E 0.229 +739 F 0.241 +740 G 0.246 +741 Q 0.244 +742 I 0.236 +743 I 0.223 +744 L 0.206 +745 W 0.192 +746 C 0.189 +747 N 0.200 +748 E 0.214 +749 G 0.210 +750 S 0.176 +751 T 0.131 +752 L 0.100 +753 A 0.089 +754 F 0.089 +755 Y 0.097 +756 C 0.113 +757 V 0.126 +758 L 0.128 +759 G 0.130 +760 Y 0.138 +761 L 0.144 +762 G 0.138 +763 F 0.129 +764 L 0.125 +765 A 0.127 +766 S 0.129 +767 L 0.130 +768 S 0.128 +769 L 0.124 +770 L 0.120 +771 I 0.114 +772 A 0.106 +773 F 0.105 +774 L 0.118 +775 A 0.138 +776 R 0.153 +777 R 0.165 +778 L 0.179 +779 P 0.190 +780 D 0.188 +781 S 0.178 +782 F 0.168 +783 N 0.157 +784 E 0.143 +785 A 0.130 +786 K 0.120 +787 T 0.116 +788 I 0.111 +789 T 0.104 +790 F 0.099 +791 S 0.099 +792 M 0.101 +793 L 0.102 +794 V 0.100 +795 F 0.093 +796 C 0.085 +797 S 0.078 +798 V 0.077 +799 W 0.080 +800 I 0.078 +801 S 0.073 +802 F 0.071 +803 V 0.078 +804 P 0.088 +805 A 0.099 +806 Y 0.110 +807 L 0.124 +808 S 0.143 +809 S 0.165 +810 K 0.184 +811 G 0.192 +812 K 0.185 +813 T 0.171 +814 M 0.159 +815 V 0.154 +816 A 0.154 +817 V 0.152 +818 E 0.146 +819 I 0.141 +820 L 0.141 +821 S 0.143 +822 I 0.139 +823 L 0.131 +824 A 0.126 +825 S 0.125 +826 S 0.123 +827 A 0.120 +828 G 0.118 +829 L 0.112 +830 L 0.100 +831 G 0.087 +832 C 0.077 +833 I 0.068 +834 F 0.063 +835 L 0.068 +836 P 0.075 +837 K 0.078 +838 C 0.076 +839 Y 0.080 +840 V 0.094 +841 I 0.117 +842 L 0.155 +843 L 0.215 +844 K 0.291 +845 S 0.365 +846 G 0.419 +847 G 0.446 +848 H 0.446 +849 S 0.432 +850 R 0.418 +851 K 0.408 +852 K 0.395 +853 F 0.378 +854 F 0.365 +855 K 0.359 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000096630.3_ENSMUST00000032238.5_GN:Vmn2r26_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000096630.3_ENSMUST00000032238.5_GN:Vmn2r26_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ee25ea05fccdd266aba51a15db07abd0c35e0090 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000096630.3_ENSMUST00000032238.5_GN:Vmn2r26_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid @@ -0,0 +1,889 @@ +>ENSMUSG00000096630.3|ENSMUST00000032238.5|GN:Vmn2r26|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:33 +1 M 0.100 +2 F 0.097 +3 Y 0.099 +4 L 0.109 +5 F 0.122 +6 V 0.138 +7 D 0.161 +8 V 0.187 +9 L 0.207 +10 S 0.221 +11 E 0.239 +12 S 0.268 +13 I 0.303 +14 S 0.337 +15 P 0.362 +16 R 0.370 +17 F 0.357 +18 S 0.338 +19 T 0.337 +20 E 0.364 +21 Q 0.392 +22 I 0.391 +23 S 0.364 +24 G 0.337 +25 S 0.307 +26 Y 0.265 +27 R 0.217 +28 L 0.183 +29 F 0.168 +30 I 0.166 +31 N 0.170 +32 V 0.179 +33 S 0.184 +34 M 0.182 +35 K 0.182 +36 L 0.188 +37 L 0.197 +38 T 0.205 +39 A 0.210 +40 F 0.210 +41 S 0.200 +42 P 0.182 +43 L 0.166 +44 V 0.155 +45 V 0.150 +46 L 0.151 +47 I 0.161 +48 L 0.178 +49 F 0.199 +50 Q 0.221 +51 E 0.241 +52 Q 0.250 +53 I 0.243 +54 S 0.226 +55 C 0.205 +56 Y 0.181 +57 Y 0.161 +58 L 0.151 +59 T 0.158 +60 K 0.176 +61 Y 0.194 +62 A 0.198 +63 S 0.181 +64 S 0.150 +65 G 0.122 +66 Y 0.105 +67 Y 0.100 +68 Q 0.105 +69 D 0.113 +70 A 0.112 +71 D 0.098 +72 F 0.080 +73 V 0.067 +74 I 0.059 +75 G 0.056 +76 G 0.059 +77 L 0.067 +78 F 0.080 +79 S 0.104 +80 L 0.139 +81 R 0.184 +82 V 0.247 +83 T 0.346 +84 D 0.473 +85 G 0.592 +86 D 0.668 +87 T 0.697 +88 F 0.695 +89 I 0.687 +90 S 0.686 +91 R 0.696 +92 S 0.705 +93 G 0.699 +94 V 0.676 +95 E 0.644 +96 D 0.614 +97 T 0.590 +98 S 0.569 +99 H 0.551 +100 I 0.520 +101 A 0.460 +102 E 0.375 +103 Y 0.296 +104 V 0.238 +105 F 0.197 +106 A 0.160 +107 D 0.127 +108 L 0.100 +109 I 0.081 +110 K 0.070 +111 Y 0.067 +112 Y 0.068 +113 Q 0.070 +114 H 0.071 +115 I 0.069 +116 L 0.068 +117 A 0.069 +118 M 0.068 +119 V 0.060 +120 F 0.051 +121 A 0.046 +122 I 0.045 +123 E 0.047 +124 K 0.053 +125 I 0.061 +126 N 0.068 +127 K 0.074 +128 D 0.079 +129 P 0.084 +130 N 0.083 +131 I 0.078 +132 L 0.075 +133 F 0.082 +134 N 0.097 +135 K 0.107 +136 S 0.108 +137 L 0.102 +138 G 0.095 +139 F 0.088 +140 F 0.082 +141 L 0.078 +142 F 0.079 +143 N 0.086 +144 V 0.095 +145 N 0.103 +146 F 0.106 +147 I 0.102 +148 E 0.089 +149 M 0.071 +150 K 0.056 +151 A 0.051 +152 A 0.056 +153 E 0.065 +154 G 0.076 +155 S 0.092 +156 M 0.111 +157 A 0.131 +158 L 0.152 +159 L 0.178 +160 S 0.206 +161 G 0.222 +162 E 0.220 +163 S 0.215 +164 P 0.227 +165 P 0.259 +166 I 0.291 +167 P 0.308 +168 N 0.305 +169 Y 0.284 +170 S 0.257 +171 C 0.244 +172 R 0.245 +173 P 0.245 +174 E 0.231 +175 K 0.208 +176 T 0.178 +177 D 0.146 +178 K 0.118 +179 L 0.096 +180 V 0.078 +181 A 0.065 +182 V 0.054 +183 I 0.048 +184 G 0.051 +185 G 0.066 +186 I 0.086 +187 S 0.101 +188 T 0.103 +189 S 0.095 +190 I 0.083 +191 S 0.070 +192 I 0.061 +193 Q 0.059 +194 I 0.061 +195 S 0.061 +196 R 0.058 +197 V 0.054 +198 L 0.052 +199 S 0.052 +200 L 0.053 +201 Y 0.056 +202 N 0.061 +203 V 0.067 +204 P 0.072 +205 Q 0.073 +206 I 0.073 +207 S 0.075 +208 Y 0.088 +209 A 0.109 +210 P 0.125 +211 F 0.127 +212 D 0.127 +213 Q 0.140 +214 I 0.170 +215 L 0.212 +216 G 0.248 +217 T 0.271 +218 R 0.285 +219 V 0.293 +220 Q 0.294 +221 L 0.288 +222 Q 0.281 +223 S 0.269 +224 P 0.244 +225 Y 0.204 +226 Q 0.169 +227 F 0.152 +228 S 0.152 +229 M 0.153 +230 H 0.140 +231 T 0.115 +232 A 0.087 +233 A 0.068 +234 L 0.057 +235 Y 0.051 +236 Q 0.047 +237 G 0.043 +238 I 0.040 +239 V 0.036 +240 Q 0.033 +241 L 0.031 +242 L 0.032 +243 L 0.034 +244 Y 0.037 +245 F 0.038 +246 T 0.035 +247 W 0.031 +248 I 0.028 +249 W 0.028 +250 V 0.029 +251 G 0.032 +252 L 0.038 +253 V 0.048 +254 V 0.057 +255 P 0.061 +256 D 0.058 +257 D 0.051 +258 M 0.042 +259 R 0.034 +260 G 0.031 +261 E 0.030 +262 L 0.034 +263 Y 0.043 +264 L 0.054 +265 R 0.061 +266 D 0.058 +267 I 0.054 +268 T 0.057 +269 K 0.059 +270 E 0.054 +271 M 0.049 +272 I 0.054 +273 S 0.062 +274 H 0.062 +275 G 0.055 +276 I 0.044 +277 C 0.035 +278 F 0.030 +279 A 0.029 +280 F 0.030 +281 A 0.033 +282 E 0.039 +283 K 0.045 +284 V 0.054 +285 T 0.067 +286 E 0.088 +287 Y 0.112 +288 S 0.129 +289 S 0.129 +290 M 0.113 +291 D 0.091 +292 T 0.073 +293 V 0.058 +294 N 0.042 +295 W 0.029 +296 K 0.024 +297 H 0.027 +298 F 0.036 +299 M 0.049 +300 E 0.057 +301 R 0.056 +302 L 0.049 +303 T 0.042 +304 L 0.039 +305 T 0.039 +306 P 0.040 +307 V 0.039 +308 I 0.034 +309 I 0.030 +310 T 0.030 +311 V 0.034 +312 G 0.040 +313 D 0.042 +314 T 0.040 +315 H 0.034 +316 S 0.029 +317 L 0.026 +318 L 0.024 +319 R 0.022 +320 I 0.021 +321 V 0.021 +322 Y 0.019 +323 F 0.018 +324 V 0.018 +325 I 0.019 +326 F 0.022 +327 Y 0.026 +328 N 0.034 +329 L 0.045 +330 S 0.057 +331 G 0.061 +332 N 0.055 +333 V 0.045 +334 W 0.036 +335 I 0.032 +336 T 0.034 +337 T 0.041 +338 S 0.052 +339 D 0.062 +340 W 0.067 +341 Y 0.067 +342 I 0.069 +343 T 0.079 +344 T 0.099 +345 L 0.120 +346 P 0.135 +347 F 0.142 +348 E 0.138 +349 Q 0.125 +350 N 0.107 +351 L 0.088 +352 I 0.074 +353 Y 0.066 +354 T 0.064 +355 H 0.069 +356 F 0.080 +357 G 0.091 +358 G 0.094 +359 G 0.089 +360 L 0.083 +361 S 0.081 +362 F 0.087 +363 S 0.098 +364 F 0.114 +365 H 0.132 +366 M 0.149 +367 D 0.159 +368 E 0.156 +369 I 0.141 +370 L 0.119 +371 G 0.099 +372 F 0.089 +373 K 0.088 +374 D 0.089 +375 F 0.085 +376 L 0.080 +377 R 0.076 +378 S 0.074 +379 V 0.072 +380 Q 0.069 +381 P 0.066 +382 R 0.065 +383 K 0.068 +384 Y 0.075 +385 P 0.079 +386 H 0.074 +387 D 0.062 +388 I 0.047 +389 F 0.035 +390 I 0.030 +391 R 0.030 +392 H 0.034 +393 V 0.042 +394 W 0.050 +395 S 0.058 +396 S 0.068 +397 L 0.086 +398 F 0.120 +399 G 0.180 +400 C 0.253 +401 P 0.313 +402 H 0.338 +403 Y 0.336 +404 Y 0.323 +405 Q 0.306 +406 H 0.284 +407 R 0.263 +408 L 0.252 +409 W 0.250 +410 D 0.247 +411 L 0.239 +412 S 0.229 +413 Q 0.219 +414 C 0.202 +415 E 0.182 +416 P 0.171 +417 N 0.178 +418 G 0.194 +419 S 0.207 +420 L 0.213 +421 S 0.214 +422 T 0.212 +423 R 0.205 +424 P 0.194 +425 L 0.183 +426 H 0.170 +427 A 0.158 +428 W 0.148 +429 D 0.144 +430 M 0.143 +431 N 0.139 +432 T 0.128 +433 S 0.112 +434 P 0.100 +435 Y 0.098 +436 S 0.105 +437 Y 0.120 +438 K 0.139 +439 V 0.154 +440 Y 0.160 +441 A 0.159 +442 A 0.151 +443 V 0.136 +444 Y 0.121 +445 A 0.110 +446 I 0.095 +447 A 0.076 +448 Q 0.060 +449 A 0.052 +450 L 0.049 +451 H 0.049 +452 E 0.054 +453 E 0.068 +454 L 0.092 +455 S 0.128 +456 L 0.177 +457 R 0.236 +458 V 0.294 +459 E 0.344 +460 G 0.380 +461 D 0.395 +462 S 0.388 +463 S 0.362 +464 N 0.324 +465 K 0.284 +466 C 0.254 +467 L 0.233 +468 L 0.208 +469 Q 0.174 +470 A 0.138 +471 P 0.107 +472 L 0.082 +473 P 0.066 +474 W 0.060 +475 K 0.061 +476 L 0.064 +477 H 0.064 +478 P 0.065 +479 F 0.076 +480 L 0.098 +481 Q 0.130 +482 K 0.170 +483 G 0.219 +484 Q 0.270 +485 L 0.323 +486 G 0.380 +487 R 0.437 +488 S 0.478 +489 T 0.491 +490 N 0.482 +491 E 0.465 +492 E 0.449 +493 N 0.436 +494 T 0.426 +495 V 0.417 +496 N 0.402 +497 K 0.375 +498 E 0.337 +499 V 0.286 +500 S 0.227 +501 A 0.166 +502 I 0.113 +503 K 0.077 +504 L 0.057 +505 D 0.051 +506 I 0.051 +507 F 0.058 +508 N 0.072 +509 Y 0.094 +510 Q 0.122 +511 S 0.154 +512 L 0.183 +513 Q 0.201 +514 S 0.202 +515 G 0.187 +516 T 0.165 +517 E 0.144 +518 A 0.125 +519 H 0.111 +520 V 0.103 +521 K 0.100 +522 V 0.097 +523 G 0.090 +524 E 0.079 +525 F 0.070 +526 V 0.071 +527 F 0.087 +528 D 0.112 +529 S 0.132 +530 H 0.137 +531 S 0.132 +532 V 0.124 +533 Q 0.113 +534 H 0.104 +535 L 0.102 +536 S 0.104 +537 L 0.107 +538 N 0.107 +539 D 0.106 +540 K 0.105 +541 I 0.103 +542 I 0.099 +543 T 0.097 +544 W 0.102 +545 G 0.108 +546 K 0.107 +547 H 0.099 +548 R 0.095 +549 S 0.105 +550 Q 0.128 +551 T 0.153 +552 P 0.171 +553 L 0.185 +554 S 0.203 +555 V 0.227 +556 C 0.248 +557 S 0.259 +558 Q 0.253 +559 S 0.229 +560 C 0.201 +561 P 0.179 +562 F 0.161 +563 G 0.145 +564 F 0.141 +565 S 0.155 +566 K 0.175 +567 T 0.190 +568 A 0.202 +569 V 0.214 +570 E 0.222 +571 G 0.220 +572 K 0.211 +573 P 0.203 +574 F 0.194 +575 C 0.189 +576 C 0.188 +577 F 0.192 +578 D 0.197 +579 C 0.196 +580 V 0.189 +581 P 0.181 +582 C 0.185 +583 P 0.199 +584 D 0.205 +585 G 0.198 +586 E 0.195 +587 I 0.209 +588 A 0.235 +589 N 0.265 +590 K 0.291 +591 T 0.298 +592 D 0.280 +593 M 0.255 +594 D 0.241 +595 Q 0.235 +596 C 0.222 +597 I 0.201 +598 K 0.179 +599 C 0.164 +600 P 0.156 +601 E 0.147 +602 D 0.136 +603 Q 0.124 +604 Y 0.119 +605 P 0.122 +606 N 0.132 +607 K 0.142 +608 Q 0.146 +609 R 0.149 +610 N 0.167 +611 Q 0.200 +612 C 0.231 +613 L 0.250 +614 P 0.250 +615 K 0.236 +616 I 0.215 +617 M 0.194 +618 V 0.177 +619 F 0.169 +620 L 0.168 +621 A 0.171 +622 H 0.167 +623 E 0.150 +624 D 0.125 +625 P 0.104 +626 L 0.091 +627 G 0.085 +628 T 0.085 +629 V 0.090 +630 L 0.101 +631 V 0.110 +632 S 0.115 +633 L 0.119 +634 A 0.126 +635 I 0.129 +636 S 0.125 +637 L 0.118 +638 S 0.113 +639 A 0.110 +640 F 0.106 +641 S 0.106 +642 A 0.110 +643 M 0.113 +644 I 0.111 +645 L 0.101 +646 G 0.088 +647 L 0.076 +648 F 0.065 +649 I 0.057 +650 C 0.051 +651 Y 0.050 +652 R 0.053 +653 E 0.063 +654 T 0.080 +655 P 0.101 +656 I 0.110 +657 V 0.099 +658 R 0.080 +659 A 0.067 +660 N 0.060 +661 N 0.054 +662 R 0.048 +663 N 0.048 +664 L 0.053 +665 S 0.059 +666 Y 0.063 +667 L 0.066 +668 L 0.070 +669 L 0.075 +670 I 0.079 +671 S 0.081 +672 L 0.083 +673 K 0.084 +674 L 0.085 +675 C 0.091 +676 F 0.107 +677 S 0.126 +678 C 0.140 +679 S 0.145 +680 L 0.139 +681 M 0.124 +682 F 0.109 +683 I 0.108 +684 G 0.122 +685 Q 0.136 +686 P 0.133 +687 R 0.114 +688 T 0.090 +689 V 0.070 +690 T 0.058 +691 C 0.052 +692 V 0.047 +693 L 0.043 +694 R 0.041 +695 Q 0.042 +696 I 0.046 +697 I 0.052 +698 F 0.061 +699 G 0.070 +700 I 0.073 +701 V 0.070 +702 F 0.064 +703 S 0.059 +704 I 0.056 +705 V 0.054 +706 I 0.053 +707 S 0.054 +708 A 0.057 +709 I 0.062 +710 L 0.066 +711 A 0.067 +712 K 0.067 +713 T 0.065 +714 F 0.064 +715 I 0.064 +716 V 0.063 +717 V 0.062 +718 M 0.064 +719 A 0.076 +720 F 0.100 +721 K 0.133 +722 A 0.173 +723 I 0.220 +724 K 0.269 +725 P 0.311 +726 G 0.334 +727 S 0.337 +728 I 0.325 +729 L 0.308 +730 K 0.291 +731 M 0.276 +732 G 0.255 +733 M 0.221 +734 V 0.178 +735 T 0.137 +736 R 0.103 +737 L 0.084 +738 S 0.081 +739 N 0.086 +740 A 0.090 +741 I 0.087 +742 V 0.079 +743 C 0.074 +744 C 0.079 +745 G 0.094 +746 S 0.108 +747 I 0.112 +748 I 0.108 +749 Q 0.104 +750 V 0.102 +751 C 0.102 +752 I 0.098 +753 C 0.092 +754 A 0.084 +755 V 0.080 +756 W 0.080 +757 L 0.087 +758 G 0.096 +759 T 0.109 +760 Y 0.125 +761 P 0.145 +762 P 0.168 +763 F 0.192 +764 P 0.214 +765 D 0.225 +766 V 0.222 +767 D 0.207 +768 M 0.195 +769 H 0.196 +770 S 0.212 +771 E 0.232 +772 F 0.245 +773 G 0.249 +774 Q 0.248 +775 I 0.239 +776 I 0.225 +777 L 0.207 +778 W 0.193 +779 C 0.189 +780 N 0.200 +781 E 0.214 +782 G 0.210 +783 S 0.176 +784 T 0.131 +785 L 0.100 +786 A 0.088 +787 F 0.088 +788 Y 0.096 +789 C 0.112 +790 V 0.125 +791 L 0.127 +792 G 0.129 +793 Y 0.137 +794 L 0.142 +795 G 0.136 +796 F 0.127 +797 L 0.124 +798 A 0.125 +799 S 0.127 +800 L 0.128 +801 S 0.126 +802 L 0.122 +803 L 0.118 +804 I 0.112 +805 A 0.104 +806 F 0.104 +807 L 0.117 +808 A 0.136 +809 R 0.151 +810 R 0.162 +811 L 0.177 +812 P 0.187 +813 D 0.186 +814 S 0.177 +815 F 0.167 +816 N 0.156 +817 E 0.142 +818 A 0.129 +819 K 0.119 +820 T 0.115 +821 I 0.111 +822 T 0.103 +823 F 0.098 +824 S 0.098 +825 M 0.100 +826 L 0.100 +827 V 0.098 +828 F 0.092 +829 C 0.084 +830 S 0.078 +831 V 0.076 +832 W 0.078 +833 I 0.076 +834 S 0.071 +835 F 0.069 +836 V 0.076 +837 P 0.086 +838 A 0.097 +839 Y 0.108 +840 L 0.122 +841 S 0.141 +842 S 0.165 +843 K 0.184 +844 G 0.192 +845 K 0.186 +846 T 0.172 +847 M 0.159 +848 V 0.155 +849 A 0.154 +850 V 0.152 +851 E 0.146 +852 I 0.141 +853 L 0.141 +854 S 0.143 +855 I 0.138 +856 L 0.130 +857 A 0.126 +858 S 0.125 +859 S 0.123 +860 A 0.120 +861 G 0.118 +862 L 0.112 +863 L 0.099 +864 G 0.086 +865 C 0.076 +866 I 0.067 +867 F 0.062 +868 L 0.066 +869 P 0.074 +870 K 0.077 +871 C 0.075 +872 Y 0.079 +873 V 0.093 +874 I 0.116 +875 L 0.154 +876 L 0.215 +877 K 0.292 +878 S 0.366 +879 G 0.421 +880 G 0.448 +881 H 0.448 +882 S 0.434 +883 R 0.420 +884 K 0.409 +885 K 0.395 +886 F 0.378 +887 F 0.364 +888 K 0.358 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000118506.3_ENSMUST00000238911.2_GN:Cfap141_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000118506.3_ENSMUST00000238911.2_GN:Cfap141_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..aecd6c039939dad90dd61354a8437315d81198bb --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000118506.3_ENSMUST00000238911.2_GN:Cfap141_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid @@ -0,0 +1,102 @@ +>ENSMUSG00000118506.3|ENSMUST00000238911.2|GN:Cfap141|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 +1 M 0.236 +2 S 0.235 +3 A 0.231 +4 E 0.221 +5 K 0.206 +6 M 0.184 +7 T 0.155 +8 K 0.126 +9 L 0.106 +10 E 0.095 +11 E 0.089 +12 N 0.086 +13 L 0.083 +14 Q 0.080 +15 R 0.078 +16 A 0.080 +17 V 0.089 +18 A 0.098 +19 L 0.096 +20 K 0.084 +21 K 0.075 +22 T 0.078 +23 V 0.088 +24 D 0.097 +25 R 0.102 +26 W 0.105 +27 R 0.105 +28 N 0.097 +29 F 0.083 +30 H 0.069 +31 I 0.065 +32 H 0.073 +33 C 0.090 +34 M 0.106 +35 W 0.115 +36 Q 0.119 +37 T 0.121 +38 T 0.124 +39 L 0.124 +40 D 0.121 +41 Q 0.120 +42 R 0.121 +43 R 0.118 +44 N 0.110 +45 L 0.102 +46 F 0.101 +47 A 0.108 +48 A 0.123 +49 L 0.142 +50 R 0.163 +51 M 0.186 +52 K 0.203 +53 D 0.209 +54 T 0.207 +55 K 0.206 +56 E 0.215 +57 Q 0.230 +58 E 0.233 +59 L 0.217 +60 A 0.196 +61 L 0.186 +62 S 0.185 +63 N 0.179 +64 K 0.166 +65 Q 0.158 +66 L 0.162 +67 L 0.164 +68 V 0.153 +69 V 0.133 +70 R 0.116 +71 Q 0.103 +72 A 0.095 +73 A 0.090 +74 L 0.086 +75 H 0.078 +76 E 0.067 +77 L 0.060 +78 F 0.059 +79 E 0.059 +80 K 0.062 +81 E 0.068 +82 Y 0.070 +83 Q 0.065 +84 Q 0.061 +85 Y 0.067 +86 Q 0.080 +87 Q 0.089 +88 E 0.090 +89 L 0.086 +90 N 0.082 +91 Q 0.082 +92 M 0.089 +93 G 0.103 +94 K 0.121 +95 A 0.137 +96 F 0.146 +97 Y 0.154 +98 E 0.172 +99 E 0.196 +100 R 0.212 +101 L 0.216 diff --git a/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000118506.3_ENSMUST00000238911.2_GN:Cfap141_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000118506.3_ENSMUST00000238911.2_GN:Cfap141_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f6040e31dcceb711f18ed1bd206f038ebc287622 --- /dev/null +++ b/havana_hard_negatives/ENSMUSG00000118506.3_ENSMUST00000238911.2_GN:Cfap141_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid @@ -0,0 +1,107 @@ +>ENSMUSG00000118506.3|ENSMUST00000238911.2|GN:Cfap141|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:5 +1 M 0.378 +2 S 0.379 +3 V 0.379 +4 V 0.362 +5 D 0.323 +6 M 0.271 +7 S 0.223 +8 A 0.184 +9 E 0.155 +10 K 0.137 +11 M 0.127 +12 T 0.114 +13 K 0.104 +14 L 0.102 +15 E 0.105 +16 E 0.104 +17 N 0.097 +18 L 0.088 +19 Q 0.080 +20 R 0.076 +21 A 0.078 +22 V 0.088 +23 A 0.096 +24 L 0.094 +25 K 0.083 +26 K 0.074 +27 T 0.076 +28 V 0.087 +29 D 0.097 +30 R 0.104 +31 W 0.106 +32 R 0.104 +33 N 0.095 +34 F 0.081 +35 H 0.068 +36 I 0.065 +37 H 0.075 +38 C 0.093 +39 M 0.110 +40 W 0.119 +41 Q 0.121 +42 T 0.123 +43 T 0.126 +44 L 0.127 +45 D 0.125 +46 Q 0.123 +47 R 0.122 +48 R 0.119 +49 N 0.112 +50 L 0.105 +51 F 0.103 +52 A 0.110 +53 A 0.124 +54 L 0.142 +55 R 0.163 +56 M 0.185 +57 K 0.202 +58 D 0.207 +59 T 0.205 +60 K 0.205 +61 E 0.214 +62 Q 0.228 +63 E 0.232 +64 L 0.214 +65 A 0.191 +66 L 0.179 +67 S 0.177 +68 N 0.171 +69 K 0.159 +70 Q 0.151 +71 L 0.152 +72 L 0.152 +73 V 0.140 +74 V 0.123 +75 R 0.109 +76 Q 0.098 +77 A 0.090 +78 A 0.086 +79 L 0.084 +80 H 0.077 +81 E 0.067 +82 L 0.060 +83 F 0.058 +84 E 0.059 +85 K 0.064 +86 E 0.072 +87 Y 0.075 +88 Q 0.068 +89 Q 0.062 +90 Y 0.068 +91 Q 0.080 +92 Q 0.088 +93 E 0.087 +94 L 0.083 +95 N 0.078 +96 Q 0.076 +97 M 0.079 +98 G 0.089 +99 K 0.104 +100 A 0.117 +101 F 0.128 +102 Y 0.140 +103 E 0.164 +104 E 0.193 +105 R 0.210 +106 L 0.213