diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000005772_ENSDART00000025214_GN:tsr2_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000005772_ENSDART00000025214_GN:tsr2_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 671bab553a50ad3045f3c8254891d47aa39644e5..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000005772_ENSDART00000025214_GN:tsr2_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,183 +0,0 @@ ->ENSDARG00000005772|ENSDART00000025214|GN:tsr2|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.334 -2 A 0.311 -3 P 0.274 -4 L 0.229 -5 S 0.176 -6 S 0.122 -7 S 0.079 -8 T 0.050 -9 R 0.034 -10 E 0.027 -11 V 0.024 -12 F 0.025 -13 S 0.030 -14 E 0.037 -15 A 0.042 -16 V 0.044 -17 R 0.046 -18 A 0.048 -19 V 0.049 -20 L 0.049 -21 E 0.050 -22 T 0.050 -23 W 0.048 -24 P 0.044 -25 V 0.040 -26 L 0.041 -27 Q 0.044 -28 I 0.047 -29 A 0.051 -30 V 0.059 -31 D 0.072 -32 N 0.089 -33 G 0.106 -34 F 0.118 -35 G 0.124 -36 G 0.122 -37 A 0.114 -38 F 0.104 -39 S 0.094 -40 Q 0.081 -41 Q 0.069 -42 K 0.064 -43 A 0.063 -44 E 0.057 -45 W 0.047 -46 M 0.040 -47 V 0.035 -48 D 0.034 -49 A 0.036 -50 L 0.036 -51 Q 0.034 -52 Q 0.030 -53 Y 0.030 -54 F 0.036 -55 T 0.046 -56 D 0.057 -57 N 0.066 -58 G 0.071 -59 D 0.071 -60 L 0.066 -61 Q 0.058 -62 Q 0.049 -63 D 0.042 -64 E 0.039 -65 V 0.039 -66 E 0.038 -67 D 0.037 -68 F 0.037 -69 I 0.038 -70 S 0.041 -71 E 0.045 -72 L 0.049 -73 M 0.056 -74 N 0.065 -75 N 0.074 -76 E 0.079 -77 F 0.080 -78 N 0.081 -79 T 0.086 -80 V 0.097 -81 V 0.111 -82 D 0.126 -83 D 0.133 -84 G 0.123 -85 S 0.101 -86 L 0.077 -87 P 0.061 -88 Q 0.054 -89 V 0.051 -90 A 0.047 -91 Q 0.044 -92 Q 0.042 -93 V 0.041 -94 C 0.039 -95 G 0.037 -96 M 0.035 -97 F 0.034 -98 Q 0.034 -99 Q 0.038 -100 C 0.046 -101 E 0.056 -102 Q 0.066 -103 G 0.072 -104 R 0.072 -105 L 0.065 -106 A 0.055 -107 E 0.052 -108 V 0.057 -109 R 0.068 -110 E 0.077 -111 Q 0.074 -112 I 0.065 -113 L 0.061 -114 K 0.071 -115 L 0.093 -116 K 0.127 -117 Q 0.171 -118 K 0.232 -119 K 0.318 -120 T 0.420 -121 S 0.514 -122 S 0.584 -123 G 0.631 -124 R 0.659 -125 A 0.671 -126 K 0.673 -127 A 0.672 -128 T 0.676 -129 P 0.689 -130 A 0.703 -131 Q 0.714 -132 T 0.722 -133 P 0.733 -134 Q 0.749 -135 D 0.762 -136 D 0.768 -137 D 0.768 -138 D 0.767 -139 D 0.768 -140 D 0.769 -141 D 0.769 -142 E 0.761 -143 E 0.730 -144 E 0.680 -145 A 0.653 -146 M 0.681 -147 D 0.735 -148 C 0.772 -149 E 0.789 -150 G 0.800 -151 G 0.808 -152 S 0.811 -153 A 0.798 -154 V 0.756 -155 A 0.694 -156 S 0.661 -157 V 0.697 -158 S 0.765 -159 S 0.811 -160 T 0.825 -161 A 0.826 -162 V 0.822 -163 N 0.815 -164 D 0.804 -165 L 0.793 -166 H 0.786 -167 H 0.784 -168 E 0.782 -169 E 0.771 -170 E 0.748 -171 E 0.720 -172 D 0.694 -173 D 0.675 -174 G 0.669 -175 W 0.679 -176 T 0.695 -177 V 0.698 -178 V 0.669 -179 R 0.610 -180 R 0.535 -181 K 0.461 -182 K 0.413 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000005772_ENSDART00000025214_GN:tsr2_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000005772_ENSDART00000025214_GN:tsr2_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:5.caid deleted file mode 100644 index cf9ce8f289d3a617eeac48bee6b901be46e8aa5c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000005772_ENSDART00000025214_GN:tsr2_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:5.caid +++ /dev/null @@ -1,188 +0,0 @@ ->ENSDARG00000005772|ENSDART00000025214|GN:tsr2|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:5 -1 M 0.351 -2 L 0.366 -3 V 0.391 -4 F 0.413 -5 K 0.416 -6 M 0.391 -7 A 0.348 -8 P 0.297 -9 L 0.239 -10 S 0.176 -11 S 0.119 -12 S 0.074 -13 T 0.046 -14 R 0.031 -15 E 0.025 -16 V 0.023 -17 F 0.024 -18 S 0.029 -19 E 0.037 -20 A 0.042 -21 V 0.044 -22 R 0.047 -23 A 0.049 -24 V 0.050 -25 L 0.049 -26 E 0.050 -27 T 0.051 -28 W 0.049 -29 P 0.044 -30 V 0.041 -31 L 0.042 -32 Q 0.044 -33 I 0.047 -34 A 0.050 -35 V 0.058 -36 D 0.072 -37 N 0.091 -38 G 0.109 -39 F 0.122 -40 G 0.128 -41 G 0.126 -42 A 0.118 -43 F 0.108 -44 S 0.097 -45 Q 0.084 -46 Q 0.072 -47 K 0.066 -48 A 0.064 -49 E 0.058 -50 W 0.048 -51 M 0.040 -52 V 0.036 -53 D 0.035 -54 A 0.037 -55 L 0.037 -56 Q 0.034 -57 Q 0.031 -58 Y 0.031 -59 F 0.036 -60 T 0.046 -61 D 0.056 -62 N 0.065 -63 G 0.070 -64 D 0.071 -65 L 0.066 -66 Q 0.058 -67 Q 0.050 -68 D 0.043 -69 E 0.040 -70 V 0.039 -71 E 0.039 -72 D 0.038 -73 F 0.037 -74 I 0.038 -75 S 0.041 -76 E 0.045 -77 L 0.049 -78 M 0.056 -79 N 0.065 -80 N 0.074 -81 E 0.079 -82 F 0.080 -83 N 0.081 -84 T 0.087 -85 V 0.098 -86 V 0.112 -87 D 0.127 -88 D 0.135 -89 G 0.126 -90 S 0.103 -91 L 0.079 -92 P 0.063 -93 Q 0.056 -94 V 0.053 -95 A 0.049 -96 Q 0.045 -97 Q 0.043 -98 V 0.041 -99 C 0.039 -100 G 0.037 -101 M 0.035 -102 F 0.034 -103 Q 0.035 -104 Q 0.038 -105 C 0.046 -106 E 0.056 -107 Q 0.066 -108 G 0.072 -109 R 0.072 -110 L 0.065 -111 A 0.056 -112 E 0.052 -113 V 0.057 -114 R 0.068 -115 E 0.077 -116 Q 0.075 -117 I 0.066 -118 L 0.062 -119 K 0.072 -120 L 0.095 -121 K 0.129 -122 Q 0.174 -123 K 0.237 -124 K 0.324 -125 T 0.426 -126 S 0.518 -127 S 0.588 -128 G 0.635 -129 R 0.663 -130 A 0.675 -131 K 0.676 -132 A 0.674 -133 T 0.677 -134 P 0.689 -135 A 0.703 -136 Q 0.713 -137 T 0.720 -138 P 0.732 -139 Q 0.747 -140 D 0.760 -141 D 0.766 -142 D 0.766 -143 D 0.765 -144 D 0.765 -145 D 0.767 -146 D 0.767 -147 E 0.758 -148 E 0.727 -149 E 0.676 -150 A 0.649 -151 M 0.678 -152 D 0.734 -153 C 0.772 -154 E 0.788 -155 G 0.798 -156 G 0.805 -157 S 0.808 -158 A 0.796 -159 V 0.754 -160 A 0.692 -161 S 0.660 -162 V 0.696 -163 S 0.763 -164 S 0.809 -165 T 0.824 -166 A 0.824 -167 V 0.820 -168 N 0.813 -169 D 0.802 -170 L 0.791 -171 H 0.785 -172 H 0.784 -173 E 0.782 -174 E 0.771 -175 E 0.748 -176 E 0.720 -177 D 0.694 -178 D 0.674 -179 G 0.668 -180 W 0.678 -181 T 0.695 -182 V 0.697 -183 V 0.667 -184 R 0.607 -185 R 0.531 -186 K 0.458 -187 K 0.410 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000007678_ENSDART00000033361_GN:ttyh3b_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000007678_ENSDART00000033361_GN:ttyh3b_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index d9618524cbb8b36f5cdfffe891015e783d36d96a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000007678_ENSDART00000033361_GN:ttyh3b_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,561 +0,0 @@ ->ENSDARG00000007678|ENSDART00000033361|GN:ttyh3b|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.281 -2 A 0.280 -3 A 0.270 -4 V 0.249 -5 V 0.221 -6 N 0.198 -7 Y 0.185 -8 S 0.175 -9 P 0.152 -10 P 0.119 -11 W 0.091 -12 W 0.082 -13 V 0.084 -14 N 0.085 -15 L 0.090 -16 F 0.107 -17 H 0.137 -18 R 0.171 -19 L 0.201 -20 P 0.215 -21 H 0.210 -22 F 0.199 -23 N 0.192 -24 L 0.193 -25 Q 0.198 -26 F 0.209 -27 Q 0.226 -28 Q 0.243 -29 T 0.247 -30 S 0.235 -31 S 0.217 -32 D 0.201 -33 F 0.191 -34 R 0.186 -35 P 0.177 -36 D 0.160 -37 D 0.138 -38 S 0.123 -39 D 0.119 -40 Y 0.122 -41 Q 0.128 -42 K 0.134 -43 A 0.135 -44 V 0.136 -45 L 0.148 -46 L 0.161 -47 L 0.154 -48 G 0.126 -49 A 0.097 -50 A 0.081 -51 A 0.077 -52 L 0.076 -53 V 0.075 -54 C 0.075 -55 L 0.074 -56 A 0.074 -57 L 0.074 -58 D 0.073 -59 L 0.066 -60 L 0.056 -61 F 0.050 -62 L 0.046 -63 L 0.043 -64 F 0.040 -65 Y 0.040 -66 S 0.038 -67 F 0.036 -68 W 0.035 -69 L 0.039 -70 C 0.053 -71 C 0.082 -72 C 0.127 -73 R 0.182 -74 R 0.234 -75 K 0.274 -76 N 0.304 -77 H 0.327 -78 D 0.346 -79 S 0.358 -80 P 0.355 -81 N 0.330 -82 A 0.279 -83 D 0.207 -84 C 0.134 -85 C 0.084 -86 C 0.064 -87 T 0.060 -88 A 0.056 -89 W 0.051 -90 C 0.047 -91 V 0.048 -92 I 0.053 -93 I 0.059 -94 A 0.061 -95 T 0.058 -96 L 0.055 -97 V 0.059 -98 C 0.070 -99 S 0.082 -100 A 0.088 -101 G 0.089 -102 I 0.090 -103 A 0.091 -104 V 0.087 -105 G 0.082 -106 F 0.086 -107 Y 0.099 -108 G 0.110 -109 N 0.115 -110 G 0.118 -111 E 0.121 -112 T 0.128 -113 C 0.139 -114 D 0.151 -115 G 0.155 -116 V 0.150 -117 T 0.141 -118 R 0.129 -119 L 0.116 -120 T 0.108 -121 Y 0.107 -122 S 0.106 -123 L 0.108 -124 R 0.113 -125 H 0.113 -126 A 0.106 -127 N 0.100 -128 Q 0.099 -129 T 0.107 -130 V 0.125 -131 A 0.148 -132 G 0.157 -133 I 0.144 -134 D 0.121 -135 K 0.101 -136 L 0.084 -137 V 0.075 -138 S 0.074 -139 E 0.073 -140 S 0.069 -141 T 0.065 -142 S 0.069 -143 S 0.076 -144 L 0.087 -145 N 0.101 -146 E 0.112 -147 T 0.109 -148 L 0.092 -149 M 0.073 -150 E 0.062 -151 G 0.056 -152 L 0.055 -153 V 0.056 -154 Q 0.056 -155 L 0.051 -156 E 0.046 -157 T 0.044 -158 V 0.045 -159 Y 0.047 -160 S 0.051 -161 K 0.059 -162 Q 0.068 -163 T 0.075 -164 D 0.076 -165 Y 0.076 -166 L 0.080 -167 S 0.084 -168 I 0.084 -169 V 0.085 -170 Q 0.094 -171 K 0.103 -172 L 0.105 -173 Q 0.103 -174 G 0.100 -175 Q 0.099 -176 L 0.106 -177 D 0.121 -178 E 0.127 -179 L 0.117 -180 I 0.105 -181 N 0.099 -182 L 0.103 -183 M 0.125 -184 L 0.163 -185 G 0.199 -186 V 0.214 -187 P 0.214 -188 F 0.221 -189 W 0.246 -190 S 0.282 -191 S 0.308 -192 N 0.310 -193 D 0.291 -194 L 0.259 -195 S 0.220 -196 L 0.183 -197 D 0.161 -198 H 0.154 -199 L 0.153 -200 A 0.155 -201 S 0.163 -202 I 0.175 -203 T 0.180 -204 E 0.168 -205 Q 0.143 -206 Y 0.119 -207 D 0.100 -208 W 0.083 -209 Y 0.071 -210 R 0.068 -211 W 0.068 -212 L 0.064 -213 G 0.059 -214 Y 0.058 -215 L 0.058 -216 G 0.056 -217 L 0.053 -218 L 0.048 -219 L 0.041 -220 F 0.036 -221 D 0.034 -222 V 0.033 -223 I 0.031 -224 I 0.029 -225 C 0.028 -226 L 0.026 -227 L 0.026 -228 V 0.029 -229 L 0.033 -230 V 0.038 -231 G 0.045 -232 L 0.053 -233 I 0.059 -234 R 0.064 -235 N 0.068 -236 S 0.067 -237 R 0.058 -238 S 0.049 -239 I 0.044 -240 L 0.042 -241 I 0.040 -242 G 0.039 -243 V 0.039 -244 C 0.038 -245 F 0.038 -246 L 0.042 -247 G 0.044 -248 V 0.042 -249 L 0.038 -250 T 0.037 -251 L 0.037 -252 V 0.036 -253 I 0.038 -254 S 0.043 -255 W 0.052 -256 A 0.059 -257 S 0.062 -258 L 0.062 -259 G 0.061 -260 L 0.062 -261 E 0.062 -262 F 0.059 -263 S 0.054 -264 F 0.051 -265 A 0.055 -266 V 0.065 -267 G 0.077 -268 A 0.086 -269 S 0.087 -270 D 0.082 -271 F 0.079 -272 C 0.079 -273 V 0.077 -274 S 0.072 -275 P 0.070 -276 D 0.071 -277 S 0.073 -278 Y 0.072 -279 I 0.070 -280 T 0.069 -281 K 0.072 -282 V 0.076 -283 T 0.084 -284 R 0.098 -285 E 0.115 -286 N 0.124 -287 A 0.119 -288 V 0.105 -289 I 0.090 -290 N 0.079 -291 Q 0.077 -292 D 0.081 -293 I 0.084 -294 L 0.079 -295 Q 0.069 -296 Y 0.062 -297 Y 0.063 -298 L 0.069 -299 K 0.081 -300 C 0.104 -301 S 0.133 -302 M 0.160 -303 G 0.180 -304 Q 0.193 -305 T 0.198 -306 N 0.188 -307 P 0.161 -308 F 0.124 -309 Q 0.092 -310 Q 0.076 -311 K 0.076 -312 L 0.085 -313 S 0.099 -314 G 0.109 -315 S 0.108 -316 H 0.102 -317 K 0.096 -318 A 0.088 -319 L 0.082 -320 V 0.077 -321 E 0.076 -322 M 0.078 -323 Q 0.083 -324 D 0.083 -325 D 0.074 -326 V 0.062 -327 S 0.054 -328 E 0.050 -329 L 0.047 -330 L 0.044 -331 R 0.042 -332 S 0.044 -333 A 0.047 -334 I 0.051 -335 R 0.056 -336 D 0.063 -337 F 0.069 -338 P 0.071 -339 K 0.072 -340 T 0.077 -341 K 0.083 -342 S 0.085 -343 N 0.081 -344 L 0.077 -345 E 0.080 -346 E 0.088 -347 M 0.098 -348 Q 0.110 -349 G 0.119 -350 V 0.123 -351 L 0.127 -352 N 0.132 -353 S 0.128 -354 T 0.116 -355 E 0.102 -356 V 0.087 -357 S 0.074 -358 L 0.068 -359 H 0.074 -360 H 0.091 -361 L 0.110 -362 T 0.124 -363 A 0.126 -364 L 0.118 -365 V 0.104 -366 D 0.094 -367 C 0.098 -368 R 0.114 -369 S 0.125 -370 L 0.118 -371 H 0.104 -372 M 0.093 -373 D 0.088 -374 Y 0.082 -375 V 0.078 -376 Q 0.078 -377 A 0.081 -378 L 0.082 -379 T 0.077 -380 G 0.071 -381 L 0.068 -382 C 0.073 -383 Y 0.083 -384 D 0.093 -385 G 0.099 -386 V 0.101 -387 E 0.099 -388 G 0.092 -389 L 0.082 -390 I 0.071 -391 Y 0.063 -392 L 0.061 -393 V 0.057 -394 L 0.049 -395 F 0.042 -396 S 0.039 -397 F 0.037 -398 V 0.038 -399 T 0.039 -400 A 0.038 -401 L 0.034 -402 M 0.031 -403 F 0.029 -404 S 0.029 -405 S 0.028 -406 I 0.028 -407 V 0.032 -408 C 0.039 -409 S 0.050 -410 V 0.059 -411 P 0.064 -412 H 0.068 -413 T 0.079 -414 W 0.101 -415 Q 0.140 -416 S 0.193 -417 K 0.252 -418 R 0.308 -419 S 0.364 -420 E 0.426 -421 E 0.492 -422 E 0.551 -423 D 0.601 -424 G 0.642 -425 D 0.670 -426 E 0.682 -427 T 0.684 -428 S 0.686 -429 A 0.692 -430 T 0.703 -431 L 0.712 -432 G 0.716 -433 S 0.711 -434 R 0.699 -435 A 0.692 -436 P 0.696 -437 H 0.710 -438 D 0.722 -439 N 0.721 -440 L 0.711 -441 Y 0.704 -442 R 0.705 -443 V 0.705 -444 H 0.702 -445 M 0.706 -446 P 0.722 -447 S 0.742 -448 L 0.757 -449 Y 0.769 -450 S 0.784 -451 C 0.800 -452 G 0.813 -453 S 0.819 -454 S 0.821 -455 T 0.824 -456 Y 0.831 -457 G 0.838 -458 S 0.839 -459 E 0.832 -460 A 0.820 -461 S 0.808 -462 L 0.804 -463 P 0.811 -464 A 0.821 -465 A 0.817 -466 A 0.777 -467 H 0.711 -468 T 0.673 -469 V 0.704 -470 S 0.763 -471 N 0.798 -472 A 0.806 -473 P 0.807 -474 V 0.809 -475 T 0.804 -476 E 0.780 -477 Y 0.726 -478 M 0.660 -479 S 0.633 -480 Q 0.673 -481 N 0.741 -482 A 0.787 -483 N 0.800 -484 F 0.798 -485 Q 0.797 -486 T 0.803 -487 P 0.815 -488 R 0.827 -489 C 0.831 -490 E 0.827 -491 N 0.819 -492 T 0.815 -493 P 0.821 -494 L 0.832 -495 I 0.841 -496 G 0.838 -497 R 0.819 -498 E 0.793 -499 S 0.774 -500 P 0.768 -501 P 0.770 -502 P 0.768 -503 S 0.751 -504 Y 0.723 -505 T 0.695 -506 S 0.672 -507 S 0.644 -508 M 0.595 -509 R 0.540 -510 A 0.520 -511 K 0.558 -512 Y 0.624 -513 L 0.679 -514 A 0.708 -515 T 0.713 -516 S 0.705 -517 R 0.699 -518 P 0.707 -519 D 0.721 -520 Q 0.733 -521 P 0.746 -522 R 0.765 -523 P 0.788 -524 T 0.806 -525 E 0.815 -526 S 0.819 -527 Q 0.820 -528 N 0.816 -529 G 0.805 -530 L 0.793 -531 E 0.784 -532 P 0.781 -533 N 0.778 -534 M 0.776 -535 R 0.777 -536 P 0.780 -537 D 0.784 -538 L 0.785 -539 T 0.782 -540 S 0.775 -541 R 0.765 -542 S 0.758 -543 A 0.759 -544 P 0.764 -545 N 0.767 -546 S 0.770 -547 R 0.775 -548 P 0.788 -549 N 0.805 -550 S 0.812 -551 A 0.802 -552 I 0.783 -553 H 0.771 -554 R 0.777 -555 P 0.792 -556 H 0.804 -557 S 0.806 -558 A 0.789 -559 I 0.755 -560 H 0.726 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000007678_ENSDART00000033361_GN:ttyh3b_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000007678_ENSDART00000033361_GN:ttyh3b_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:3.caid deleted file mode 100644 index b6a5fd43e3b2ed5cee11b30d5ae322bd1e50cf10..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000007678_ENSDART00000033361_GN:ttyh3b_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:3.caid +++ /dev/null @@ -1,564 +0,0 @@ ->ENSDARG00000007678|ENSDART00000033361|GN:ttyh3b|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:3 -1 M 0.329 -2 N 0.335 -3 A 0.343 -4 M 0.342 -5 A 0.325 -6 A 0.291 -7 V 0.251 -8 V 0.214 -9 N 0.190 -10 Y 0.179 -11 S 0.170 -12 P 0.148 -13 P 0.114 -14 W 0.088 -15 W 0.080 -16 V 0.083 -17 N 0.085 -18 L 0.090 -19 F 0.108 -20 H 0.137 -21 R 0.170 -22 L 0.198 -23 P 0.210 -24 H 0.205 -25 F 0.193 -26 N 0.187 -27 L 0.188 -28 Q 0.194 -29 F 0.207 -30 Q 0.225 -31 Q 0.242 -32 T 0.246 -33 S 0.234 -34 S 0.215 -35 D 0.200 -36 F 0.190 -37 R 0.185 -38 P 0.177 -39 D 0.160 -40 D 0.138 -41 S 0.122 -42 D 0.118 -43 Y 0.122 -44 Q 0.129 -45 K 0.134 -46 A 0.135 -47 V 0.138 -48 L 0.151 -49 L 0.164 -50 L 0.156 -51 G 0.126 -52 A 0.096 -53 A 0.080 -54 A 0.076 -55 L 0.074 -56 V 0.073 -57 C 0.073 -58 L 0.072 -59 A 0.072 -60 L 0.073 -61 D 0.072 -62 L 0.065 -63 L 0.056 -64 F 0.049 -65 L 0.046 -66 L 0.042 -67 F 0.040 -68 Y 0.039 -69 S 0.038 -70 F 0.035 -71 W 0.035 -72 L 0.039 -73 C 0.053 -74 C 0.081 -75 C 0.126 -76 R 0.180 -77 R 0.231 -78 K 0.272 -79 N 0.301 -80 H 0.324 -81 D 0.343 -82 S 0.355 -83 P 0.352 -84 N 0.328 -85 A 0.278 -86 D 0.206 -87 C 0.133 -88 C 0.084 -89 C 0.064 -90 T 0.060 -91 A 0.056 -92 W 0.051 -93 C 0.047 -94 V 0.048 -95 I 0.053 -96 I 0.059 -97 A 0.061 -98 T 0.058 -99 L 0.055 -100 V 0.059 -101 C 0.070 -102 S 0.082 -103 A 0.088 -104 G 0.089 -105 I 0.090 -106 A 0.091 -107 V 0.087 -108 G 0.082 -109 F 0.085 -110 Y 0.098 -111 G 0.109 -112 N 0.114 -113 G 0.117 -114 E 0.121 -115 T 0.127 -116 C 0.139 -117 D 0.152 -118 G 0.156 -119 V 0.150 -120 T 0.141 -121 R 0.129 -122 L 0.116 -123 T 0.109 -124 Y 0.107 -125 S 0.106 -126 L 0.108 -127 R 0.113 -128 H 0.113 -129 A 0.106 -130 N 0.099 -131 Q 0.100 -132 T 0.107 -133 V 0.126 -134 A 0.148 -135 G 0.157 -136 I 0.143 -137 D 0.119 -138 K 0.098 -139 L 0.082 -140 V 0.074 -141 S 0.074 -142 E 0.073 -143 S 0.069 -144 T 0.065 -145 S 0.069 -146 S 0.076 -147 L 0.087 -148 N 0.101 -149 E 0.111 -150 T 0.108 -151 L 0.091 -152 M 0.073 -153 E 0.061 -154 G 0.056 -155 L 0.054 -156 V 0.055 -157 Q 0.055 -158 L 0.051 -159 E 0.046 -160 T 0.044 -161 V 0.045 -162 Y 0.047 -163 S 0.051 -164 K 0.058 -165 Q 0.067 -166 T 0.074 -167 D 0.075 -168 Y 0.076 -169 L 0.080 -170 S 0.084 -171 I 0.083 -172 V 0.085 -173 Q 0.094 -174 K 0.103 -175 L 0.105 -176 Q 0.102 -177 G 0.099 -178 Q 0.098 -179 L 0.106 -180 D 0.121 -181 E 0.127 -182 L 0.119 -183 I 0.106 -184 N 0.100 -185 L 0.104 -186 M 0.126 -187 L 0.164 -188 G 0.199 -189 V 0.214 -190 P 0.215 -191 F 0.221 -192 W 0.246 -193 S 0.282 -194 S 0.307 -195 N 0.309 -196 D 0.289 -197 L 0.257 -198 S 0.218 -199 L 0.181 -200 D 0.159 -201 H 0.153 -202 L 0.156 -203 A 0.162 -204 S 0.172 -205 I 0.182 -206 T 0.183 -207 E 0.168 -208 Q 0.142 -209 Y 0.118 -210 D 0.099 -211 W 0.082 -212 Y 0.070 -213 R 0.068 -214 W 0.068 -215 L 0.064 -216 G 0.059 -217 Y 0.058 -218 L 0.058 -219 G 0.056 -220 L 0.053 -221 L 0.048 -222 L 0.041 -223 F 0.036 -224 D 0.034 -225 V 0.032 -226 I 0.031 -227 I 0.029 -228 C 0.027 -229 L 0.026 -230 L 0.026 -231 V 0.029 -232 L 0.033 -233 V 0.038 -234 G 0.045 -235 L 0.052 -236 I 0.058 -237 R 0.063 -238 N 0.068 -239 S 0.066 -240 R 0.058 -241 S 0.049 -242 I 0.044 -243 L 0.042 -244 I 0.040 -245 G 0.039 -246 V 0.039 -247 C 0.038 -248 F 0.039 -249 L 0.042 -250 G 0.044 -251 V 0.042 -252 L 0.038 -253 T 0.037 -254 L 0.037 -255 V 0.037 -256 I 0.038 -257 S 0.043 -258 W 0.052 -259 A 0.059 -260 S 0.062 -261 L 0.061 -262 G 0.061 -263 L 0.062 -264 E 0.062 -265 F 0.059 -266 S 0.054 -267 F 0.052 -268 A 0.056 -269 V 0.066 -270 G 0.078 -271 A 0.086 -272 S 0.087 -273 D 0.082 -274 F 0.080 -275 C 0.080 -276 V 0.077 -277 S 0.072 -278 P 0.069 -279 D 0.071 -280 S 0.073 -281 Y 0.072 -282 I 0.070 -283 T 0.069 -284 K 0.071 -285 V 0.076 -286 T 0.084 -287 R 0.098 -288 E 0.114 -289 N 0.124 -290 A 0.119 -291 V 0.106 -292 I 0.090 -293 N 0.079 -294 Q 0.077 -295 D 0.081 -296 I 0.084 -297 L 0.079 -298 Q 0.070 -299 Y 0.063 -300 Y 0.063 -301 L 0.069 -302 K 0.082 -303 C 0.104 -304 S 0.134 -305 M 0.161 -306 G 0.181 -307 Q 0.194 -308 T 0.199 -309 N 0.189 -310 P 0.162 -311 F 0.125 -312 Q 0.093 -313 Q 0.077 -314 K 0.076 -315 L 0.085 -316 S 0.099 -317 G 0.109 -318 S 0.108 -319 H 0.102 -320 K 0.096 -321 A 0.089 -322 L 0.082 -323 V 0.078 -324 E 0.076 -325 M 0.078 -326 Q 0.083 -327 D 0.084 -328 D 0.074 -329 V 0.062 -330 S 0.054 -331 E 0.051 -332 L 0.047 -333 L 0.044 -334 R 0.042 -335 S 0.044 -336 A 0.047 -337 I 0.051 -338 R 0.056 -339 D 0.063 -340 F 0.068 -341 P 0.070 -342 K 0.072 -343 T 0.077 -344 K 0.083 -345 S 0.085 -346 N 0.081 -347 L 0.077 -348 E 0.080 -349 E 0.087 -350 M 0.098 -351 Q 0.110 -352 G 0.119 -353 V 0.123 -354 L 0.127 -355 N 0.131 -356 S 0.128 -357 T 0.115 -358 E 0.101 -359 V 0.087 -360 S 0.073 -361 L 0.067 -362 H 0.074 -363 H 0.091 -364 L 0.110 -365 T 0.123 -366 A 0.126 -367 L 0.118 -368 V 0.103 -369 D 0.093 -370 C 0.098 -371 R 0.114 -372 S 0.124 -373 L 0.118 -374 H 0.104 -375 M 0.094 -376 D 0.088 -377 Y 0.083 -378 V 0.079 -379 Q 0.079 -380 A 0.081 -381 L 0.082 -382 T 0.077 -383 G 0.071 -384 L 0.069 -385 C 0.073 -386 Y 0.083 -387 D 0.093 -388 G 0.099 -389 V 0.101 -390 E 0.099 -391 G 0.092 -392 L 0.082 -393 I 0.071 -394 Y 0.063 -395 L 0.061 -396 V 0.057 -397 L 0.050 -398 F 0.043 -399 S 0.039 -400 F 0.037 -401 V 0.038 -402 T 0.039 -403 A 0.038 -404 L 0.035 -405 M 0.031 -406 F 0.029 -407 S 0.029 -408 S 0.028 -409 I 0.028 -410 V 0.032 -411 C 0.039 -412 S 0.049 -413 V 0.059 -414 P 0.064 -415 H 0.068 -416 T 0.078 -417 W 0.100 -418 Q 0.139 -419 S 0.192 -420 K 0.251 -421 R 0.307 -422 S 0.364 -423 E 0.426 -424 E 0.492 -425 E 0.552 -426 D 0.602 -427 G 0.642 -428 D 0.670 -429 E 0.683 -430 T 0.685 -431 S 0.687 -432 A 0.693 -433 T 0.703 -434 L 0.712 -435 G 0.716 -436 S 0.710 -437 R 0.699 -438 A 0.691 -439 P 0.695 -440 H 0.710 -441 D 0.722 -442 N 0.721 -443 L 0.710 -444 Y 0.704 -445 R 0.705 -446 V 0.705 -447 H 0.702 -448 M 0.706 -449 P 0.722 -450 S 0.742 -451 L 0.757 -452 Y 0.770 -453 S 0.784 -454 C 0.801 -455 G 0.814 -456 S 0.820 -457 S 0.822 -458 T 0.825 -459 Y 0.832 -460 G 0.839 -461 S 0.840 -462 E 0.833 -463 A 0.821 -464 S 0.808 -465 L 0.803 -466 P 0.808 -467 A 0.818 -468 A 0.814 -469 A 0.776 -470 H 0.711 -471 T 0.674 -472 V 0.704 -473 S 0.764 -474 N 0.799 -475 A 0.808 -476 P 0.809 -477 V 0.810 -478 T 0.805 -479 E 0.781 -480 Y 0.727 -481 M 0.661 -482 S 0.633 -483 Q 0.673 -484 N 0.742 -485 A 0.788 -486 N 0.801 -487 F 0.799 -488 Q 0.798 -489 T 0.804 -490 P 0.816 -491 R 0.828 -492 C 0.832 -493 E 0.827 -494 N 0.820 -495 T 0.816 -496 P 0.821 -497 L 0.833 -498 I 0.842 -499 G 0.838 -500 R 0.819 -501 E 0.794 -502 S 0.775 -503 P 0.768 -504 P 0.770 -505 P 0.768 -506 S 0.751 -507 Y 0.723 -508 T 0.695 -509 S 0.673 -510 S 0.644 -511 M 0.595 -512 R 0.539 -513 A 0.519 -514 K 0.557 -515 Y 0.623 -516 L 0.677 -517 A 0.706 -518 T 0.711 -519 S 0.703 -520 R 0.698 -521 P 0.706 -522 D 0.721 -523 Q 0.733 -524 P 0.746 -525 R 0.765 -526 P 0.787 -527 T 0.805 -528 E 0.815 -529 S 0.819 -530 Q 0.820 -531 N 0.816 -532 G 0.805 -533 L 0.792 -534 E 0.784 -535 P 0.781 -536 N 0.778 -537 M 0.776 -538 R 0.777 -539 P 0.780 -540 D 0.784 -541 L 0.785 -542 T 0.782 -543 S 0.775 -544 R 0.764 -545 S 0.758 -546 A 0.758 -547 P 0.763 -548 N 0.767 -549 S 0.769 -550 R 0.775 -551 P 0.788 -552 N 0.804 -553 S 0.811 -554 A 0.801 -555 I 0.782 -556 H 0.771 -557 R 0.776 -558 P 0.791 -559 H 0.804 -560 S 0.805 -561 A 0.789 -562 I 0.755 -563 H 0.725 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000007760_ENSDART00000130967_GN:spg21_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000007760_ENSDART00000130967_GN:spg21_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 6fe887b7d2959f137619ca01074a8c106ae6b491..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000007760_ENSDART00000130967_GN:spg21_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,312 +0,0 @@ ->ENSDARG00000007760|ENSDART00000130967|GN:spg21|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.286 -2 E 0.273 -3 E 0.254 -4 I 0.226 -5 S 0.190 -6 V 0.152 -7 S 0.120 -8 P 0.098 -9 D 0.085 -10 Y 0.076 -11 N 0.069 -12 W 0.067 -13 F 0.066 -14 R 0.063 -15 S 0.059 -16 T 0.059 -17 V 0.058 -18 P 0.051 -19 L 0.041 -20 K 0.034 -21 R 0.033 -22 I 0.038 -23 I 0.048 -24 V 0.065 -25 D 0.084 -26 D 0.098 -27 D 0.102 -28 D 0.094 -29 S 0.082 -30 K 0.070 -31 V 0.059 -32 W 0.048 -33 S 0.038 -34 L 0.035 -35 Y 0.043 -36 D 0.061 -37 A 0.080 -38 G 0.092 -39 P 0.092 -40 K 0.083 -41 S 0.075 -42 I 0.071 -43 R 0.069 -44 C 0.070 -45 P 0.074 -46 I 0.080 -47 I 0.087 -48 F 0.098 -49 L 0.110 -50 P 0.115 -51 P 0.106 -52 V 0.092 -53 S 0.087 -54 G 0.087 -55 T 0.084 -56 A 0.079 -57 E 0.076 -58 V 0.074 -59 F 0.070 -60 F 0.061 -61 Q 0.051 -62 Q 0.042 -63 V 0.037 -64 L 0.034 -65 A 0.034 -66 L 0.038 -67 S 0.046 -68 G 0.057 -69 W 0.070 -70 G 0.077 -71 Y 0.072 -72 R 0.059 -73 V 0.047 -74 I 0.041 -75 S 0.042 -76 L 0.051 -77 Q 0.069 -78 Y 0.086 -79 P 0.094 -80 V 0.090 -81 Y 0.080 -82 W 0.069 -83 D 0.058 -84 L 0.048 -85 L 0.040 -86 E 0.034 -87 F 0.031 -88 C 0.028 -89 D 0.025 -90 G 0.024 -91 F 0.022 -92 R 0.021 -93 K 0.019 -94 L 0.019 -95 L 0.020 -96 D 0.022 -97 H 0.025 -98 L 0.028 -99 Q 0.031 -100 L 0.032 -101 D 0.032 -102 K 0.032 -103 V 0.032 -104 H 0.034 -105 L 0.035 -106 F 0.033 -107 G 0.029 -108 A 0.029 -109 S 0.035 -110 L 0.044 -111 G 0.051 -112 G 0.054 -113 F 0.052 -114 L 0.049 -115 A 0.045 -116 Q 0.041 -117 K 0.040 -118 F 0.042 -119 A 0.045 -120 E 0.046 -121 V 0.049 -122 T 0.059 -123 Y 0.075 -124 K 0.093 -125 S 0.103 -126 P 0.096 -127 R 0.081 -128 V 0.070 -129 H 0.065 -130 S 0.066 -131 L 0.071 -132 V 0.076 -133 L 0.078 -134 C 0.081 -135 N 0.091 -136 S 0.104 -137 F 0.114 -138 S 0.122 -139 D 0.128 -140 T 0.132 -141 S 0.139 -142 I 0.152 -143 F 0.176 -144 N 0.206 -145 Q 0.229 -146 T 0.236 -147 W 0.230 -148 T 0.220 -149 A 0.207 -150 N 0.188 -151 S 0.163 -152 F 0.140 -153 W 0.126 -154 L 0.119 -155 M 0.112 -156 P 0.097 -157 S 0.077 -158 F 0.061 -159 M 0.052 -160 L 0.049 -161 K 0.050 -162 K 0.054 -163 I 0.060 -164 V 0.069 -165 L 0.086 -166 G 0.106 -167 N 0.124 -168 F 0.136 -169 A 0.151 -170 K 0.174 -171 G 0.195 -172 P 0.197 -173 V 0.176 -174 D 0.144 -175 P 0.121 -176 K 0.111 -177 M 0.104 -178 A 0.092 -179 D 0.077 -180 A 0.065 -181 I 0.056 -182 D 0.050 -183 F 0.049 -184 M 0.055 -185 V 0.066 -186 D 0.072 -187 R 0.068 -188 L 0.058 -189 E 0.050 -190 S 0.045 -191 L 0.044 -192 N 0.044 -193 Q 0.043 -194 S 0.044 -195 E 0.045 -196 L 0.046 -197 A 0.046 -198 S 0.048 -199 R 0.055 -200 L 0.063 -201 T 0.068 -202 L 0.071 -203 N 0.071 -204 C 0.067 -205 Q 0.062 -206 N 0.060 -207 S 0.063 -208 Y 0.070 -209 V 0.074 -210 E 0.072 -211 P 0.065 -212 H 0.061 -213 K 0.060 -214 I 0.063 -215 K 0.071 -216 D 0.085 -217 I 0.097 -218 A 0.098 -219 V 0.091 -220 T 0.086 -221 I 0.082 -222 M 0.079 -223 D 0.077 -224 V 0.078 -225 F 0.082 -226 D 0.091 -227 Q 0.097 -228 S 0.096 -229 A 0.092 -230 L 0.088 -231 S 0.082 -232 Q 0.072 -233 E 0.061 -234 A 0.055 -235 K 0.053 -236 E 0.054 -237 E 0.057 -238 M 0.063 -239 Y 0.070 -240 K 0.071 -241 L 0.063 -242 Y 0.054 -243 P 0.052 -244 N 0.058 -245 A 0.064 -246 R 0.065 -247 R 0.065 -248 A 0.068 -249 H 0.072 -250 L 0.075 -251 K 0.076 -252 T 0.074 -253 G 0.073 -254 G 0.076 -255 N 0.084 -256 F 0.089 -257 P 0.087 -258 Y 0.080 -259 L 0.071 -260 C 0.062 -261 R 0.052 -262 S 0.046 -263 A 0.043 -264 E 0.040 -265 V 0.037 -266 N 0.037 -267 L 0.037 -268 Y 0.037 -269 I 0.037 -270 Q 0.036 -271 I 0.033 -272 H 0.030 -273 L 0.030 -274 R 0.034 -275 Q 0.046 -276 F 0.070 -277 H 0.102 -278 G 0.138 -279 T 0.172 -280 R 0.202 -281 Y 0.231 -282 A 0.260 -283 A 0.286 -284 I 0.301 -285 S 0.310 -286 P 0.315 -287 E 0.311 -288 M 0.291 -289 V 0.262 -290 S 0.236 -291 A 0.221 -292 E 0.208 -293 E 0.193 -294 L 0.181 -295 E 0.179 -296 V 0.185 -297 Q 0.192 -298 R 0.208 -299 T 0.248 -300 H 0.309 -301 L 0.371 -302 S 0.421 -303 N 0.460 -304 N 0.481 -305 S 0.483 -306 E 0.492 -307 S 0.531 -308 E 0.570 -309 D 0.566 -310 E 0.521 -311 S 0.477 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000007760_ENSDART00000130967_GN:spg21_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000007760_ENSDART00000130967_GN:spg21_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:3.caid deleted file mode 100644 index 5093225e94de70e4edd1c30df2b36df186299b57..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000007760_ENSDART00000130967_GN:spg21_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:3.caid +++ /dev/null @@ -1,315 +0,0 @@ ->ENSDARG00000007760|ENSDART00000130967|GN:spg21|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:3 -1 M 0.328 -2 S 0.329 -3 A 0.330 -4 M 0.323 -5 E 0.299 -6 E 0.263 -7 I 0.222 -8 S 0.182 -9 V 0.145 -10 S 0.115 -11 P 0.094 -12 D 0.081 -13 Y 0.072 -14 N 0.066 -15 W 0.065 -16 F 0.064 -17 R 0.060 -18 S 0.057 -19 T 0.056 -20 V 0.055 -21 P 0.049 -22 L 0.040 -23 K 0.033 -24 R 0.032 -25 I 0.036 -26 I 0.046 -27 V 0.062 -28 D 0.080 -29 D 0.094 -30 D 0.098 -31 D 0.091 -32 S 0.079 -33 K 0.068 -34 V 0.057 -35 W 0.046 -36 S 0.037 -37 L 0.034 -38 Y 0.042 -39 D 0.060 -40 A 0.080 -41 G 0.092 -42 P 0.092 -43 K 0.083 -44 S 0.075 -45 I 0.071 -46 R 0.069 -47 C 0.070 -48 P 0.074 -49 I 0.080 -50 I 0.087 -51 F 0.097 -52 L 0.110 -53 P 0.114 -54 P 0.105 -55 V 0.091 -56 S 0.086 -57 G 0.086 -58 T 0.083 -59 A 0.077 -60 E 0.074 -61 V 0.073 -62 F 0.069 -63 F 0.061 -64 Q 0.051 -65 Q 0.042 -66 V 0.036 -67 L 0.033 -68 A 0.034 -69 L 0.038 -70 S 0.046 -71 G 0.057 -72 W 0.069 -73 G 0.076 -74 Y 0.071 -75 R 0.059 -76 V 0.047 -77 I 0.040 -78 S 0.042 -79 L 0.051 -80 Q 0.069 -81 Y 0.086 -82 P 0.094 -83 V 0.090 -84 Y 0.080 -85 W 0.068 -86 D 0.058 -87 L 0.048 -88 L 0.040 -89 E 0.034 -90 F 0.031 -91 C 0.028 -92 D 0.026 -93 G 0.024 -94 F 0.022 -95 R 0.021 -96 K 0.019 -97 L 0.019 -98 L 0.019 -99 D 0.021 -100 H 0.024 -101 L 0.028 -102 Q 0.031 -103 L 0.032 -104 D 0.032 -105 K 0.031 -106 V 0.032 -107 H 0.034 -108 L 0.035 -109 F 0.033 -110 G 0.030 -111 A 0.029 -112 S 0.035 -113 L 0.044 -114 G 0.051 -115 G 0.054 -116 F 0.052 -117 L 0.049 -118 A 0.045 -119 Q 0.041 -120 K 0.040 -121 F 0.042 -122 A 0.045 -123 E 0.046 -124 V 0.049 -125 T 0.059 -126 Y 0.075 -127 K 0.094 -128 S 0.103 -129 P 0.096 -130 R 0.082 -131 V 0.070 -132 H 0.065 -133 S 0.066 -134 L 0.072 -135 V 0.076 -136 L 0.078 -137 C 0.081 -138 N 0.091 -139 S 0.104 -140 F 0.115 -141 S 0.123 -142 D 0.129 -143 T 0.133 -144 S 0.139 -145 I 0.153 -146 F 0.177 -147 N 0.207 -148 Q 0.230 -149 T 0.236 -150 W 0.230 -151 T 0.220 -152 A 0.207 -153 N 0.188 -154 S 0.162 -155 F 0.140 -156 W 0.126 -157 L 0.119 -158 M 0.112 -159 P 0.097 -160 S 0.077 -161 F 0.061 -162 M 0.051 -163 L 0.049 -164 K 0.051 -165 K 0.055 -166 I 0.060 -167 V 0.070 -168 L 0.086 -169 G 0.107 -170 N 0.124 -171 F 0.136 -172 A 0.151 -173 K 0.173 -174 G 0.194 -175 P 0.196 -176 V 0.174 -177 D 0.143 -178 P 0.120 -179 K 0.111 -180 M 0.104 -181 A 0.092 -182 D 0.077 -183 A 0.064 -184 I 0.056 -185 D 0.050 -186 F 0.048 -187 M 0.055 -188 V 0.066 -189 D 0.072 -190 R 0.068 -191 L 0.058 -192 E 0.050 -193 S 0.045 -194 L 0.044 -195 N 0.044 -196 Q 0.043 -197 S 0.043 -198 E 0.045 -199 L 0.046 -200 A 0.046 -201 S 0.049 -202 R 0.055 -203 L 0.063 -204 T 0.069 -205 L 0.072 -206 N 0.071 -207 C 0.067 -208 Q 0.062 -209 N 0.060 -210 S 0.063 -211 Y 0.069 -212 V 0.074 -213 E 0.072 -214 P 0.065 -215 H 0.060 -216 K 0.060 -217 I 0.063 -218 K 0.070 -219 D 0.085 -220 I 0.097 -221 A 0.098 -222 V 0.091 -223 T 0.086 -224 I 0.082 -225 M 0.079 -226 D 0.078 -227 V 0.078 -228 F 0.082 -229 D 0.091 -230 Q 0.097 -231 S 0.097 -232 A 0.093 -233 L 0.089 -234 S 0.082 -235 Q 0.072 -236 E 0.062 -237 A 0.055 -238 K 0.053 -239 E 0.054 -240 E 0.057 -241 M 0.063 -242 Y 0.071 -243 K 0.071 -244 L 0.063 -245 Y 0.053 -246 P 0.052 -247 N 0.058 -248 A 0.063 -249 R 0.065 -250 R 0.065 -251 A 0.067 -252 H 0.071 -253 L 0.075 -254 K 0.076 -255 T 0.074 -256 G 0.073 -257 G 0.076 -258 N 0.084 -259 F 0.090 -260 P 0.087 -261 Y 0.080 -262 L 0.072 -263 C 0.062 -264 R 0.052 -265 S 0.046 -266 A 0.043 -267 E 0.040 -268 V 0.038 -269 N 0.037 -270 L 0.038 -271 Y 0.037 -272 I 0.037 -273 Q 0.036 -274 I 0.033 -275 H 0.030 -276 L 0.030 -277 R 0.034 -278 Q 0.046 -279 F 0.069 -280 H 0.101 -281 G 0.137 -282 T 0.172 -283 R 0.202 -284 Y 0.230 -285 A 0.259 -286 A 0.284 -287 I 0.299 -288 S 0.308 -289 P 0.313 -290 E 0.309 -291 M 0.289 -292 V 0.260 -293 S 0.235 -294 A 0.220 -295 E 0.207 -296 E 0.192 -297 L 0.181 -298 E 0.180 -299 V 0.185 -300 Q 0.192 -301 R 0.208 -302 T 0.249 -303 H 0.310 -304 L 0.373 -305 S 0.425 -306 N 0.464 -307 N 0.485 -308 S 0.486 -309 E 0.495 -310 S 0.534 -311 E 0.573 -312 D 0.570 -313 E 0.526 -314 S 0.481 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000008105_ENSDART00000007857_GN:mettl2a_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000008105_ENSDART00000007857_GN:mettl2a_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index d58cc3d6db94841c331fee10c9f31be89a4d44c4..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000008105_ENSDART00000007857_GN:mettl2a_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,354 +0,0 @@ ->ENSDARG00000008105|ENSDART00000007857|GN:mettl2a|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.312 -2 A 0.322 -3 A 0.359 -4 P 0.413 -5 A 0.445 -6 V 0.438 -7 A 0.428 -8 A 0.445 -9 D 0.471 -10 S 0.480 -11 P 0.469 -12 V 0.441 -13 I 0.407 -14 E 0.394 -15 N 0.414 -16 M 0.443 -17 P 0.469 -18 E 0.516 -19 T 0.600 -20 A 0.684 -21 G 0.728 -22 G 0.736 -23 A 0.727 -24 T 0.714 -25 E 0.700 -26 N 0.681 -27 S 0.653 -28 A 0.615 -29 E 0.573 -30 A 0.529 -31 Q 0.482 -32 K 0.432 -33 R 0.379 -34 P 0.322 -35 Q 0.263 -36 F 0.209 -37 G 0.169 -38 T 0.142 -39 R 0.128 -40 F 0.128 -41 L 0.137 -42 T 0.148 -43 D 0.154 -44 P 0.154 -45 R 0.156 -46 Q 0.160 -47 V 0.163 -48 F 0.163 -49 Q 0.160 -50 H 0.153 -51 N 0.146 -52 A 0.140 -53 W 0.139 -54 D 0.140 -55 N 0.140 -56 V 0.138 -57 E 0.132 -58 W 0.123 -59 S 0.113 -60 A 0.101 -61 E 0.094 -62 Q 0.095 -63 E 0.102 -64 E 0.111 -65 A 0.117 -66 A 0.120 -67 L 0.123 -68 K 0.124 -69 K 0.126 -70 V 0.133 -71 Q 0.152 -72 E 0.174 -73 N 0.188 -74 S 0.194 -75 Q 0.199 -76 P 0.210 -77 L 0.222 -78 P 0.225 -79 A 0.215 -80 E 0.195 -81 K 0.174 -82 Q 0.160 -83 E 0.155 -84 E 0.153 -85 F 0.147 -86 D 0.136 -87 D 0.116 -88 R 0.093 -89 A 0.075 -90 N 0.065 -91 E 0.057 -92 Y 0.050 -93 W 0.047 -94 N 0.048 -95 D 0.051 -96 F 0.052 -97 Y 0.052 -98 T 0.054 -99 I 0.056 -100 H 0.057 -101 E 0.059 -102 N 0.067 -103 R 0.076 -104 F 0.081 -105 F 0.083 -106 K 0.083 -107 D 0.078 -108 R 0.068 -109 H 0.054 -110 W 0.041 -111 L 0.034 -112 F 0.031 -113 T 0.033 -114 E 0.036 -115 F 0.036 -116 P 0.036 -117 E 0.040 -118 L 0.054 -119 A 0.079 -120 P 0.111 -121 Q 0.149 -122 Q 0.191 -123 K 0.233 -124 H 0.275 -125 L 0.325 -126 R 0.382 -127 G 0.430 -128 A 0.447 -129 E 0.433 -130 E 0.403 -131 K 0.376 -132 E 0.350 -133 S 0.315 -134 L 0.282 -135 E 0.270 -136 H 0.284 -137 M 0.316 -138 L 0.368 -139 N 0.431 -140 G 0.486 -141 E 0.526 -142 D 0.553 -143 V 0.567 -144 S 0.567 -145 S 0.556 -146 N 0.536 -147 H 0.512 -148 T 0.484 -149 H 0.450 -150 D 0.416 -151 E 0.390 -152 F 0.376 -153 P 0.371 -154 G 0.368 -155 A 0.350 -156 S 0.305 -157 A 0.235 -158 S 0.160 -159 Y 0.100 -160 R 0.066 -161 I 0.052 -162 L 0.048 -163 E 0.048 -164 V 0.050 -165 G 0.056 -166 C 0.071 -167 G 0.092 -168 V 0.115 -169 G 0.127 -170 N 0.120 -171 T 0.098 -172 V 0.075 -173 F 0.063 -174 P 0.061 -175 I 0.066 -176 L 0.070 -177 K 0.071 -178 T 0.073 -179 N 0.078 -180 N 0.089 -181 D 0.099 -182 P 0.100 -183 G 0.089 -184 L 0.072 -185 F 0.055 -186 V 0.041 -187 Y 0.033 -188 C 0.030 -189 C 0.034 -190 D 0.042 -191 F 0.050 -192 S 0.052 -193 S 0.048 -194 T 0.043 -195 A 0.047 -196 V 0.060 -197 D 0.074 -198 L 0.081 -199 V 0.079 -200 K 0.071 -201 S 0.063 -202 N 0.057 -203 P 0.057 -204 E 0.057 -205 Y 0.055 -206 D 0.045 -207 P 0.033 -208 S 0.025 -209 R 0.022 -210 C 0.025 -211 H 0.030 -212 A 0.036 -213 F 0.042 -214 V 0.045 -215 H 0.047 -216 D 0.049 -217 M 0.054 -218 S 0.064 -219 D 0.076 -220 E 0.085 -221 S 0.088 -222 G 0.082 -223 E 0.071 -224 Y 0.062 -225 P 0.059 -226 M 0.063 -227 P 0.071 -228 D 0.075 -229 H 0.073 -230 S 0.063 -231 L 0.053 -232 D 0.046 -233 V 0.043 -234 I 0.044 -235 V 0.047 -236 L 0.051 -237 I 0.059 -238 F 0.071 -239 V 0.082 -240 L 0.085 -241 S 0.080 -242 A 0.074 -243 L 0.067 -244 H 0.057 -245 P 0.048 -246 E 0.041 -247 K 0.039 -248 M 0.039 -249 Q 0.038 -250 K 0.034 -251 S 0.032 -252 I 0.034 -253 N 0.039 -254 R 0.043 -255 L 0.045 -256 G 0.046 -257 R 0.048 -258 L 0.053 -259 L 0.064 -260 K 0.078 -261 P 0.085 -262 G 0.082 -263 G 0.073 -264 V 0.067 -265 L 0.066 -266 L 0.069 -267 L 0.079 -268 R 0.096 -269 D 0.111 -270 Y 0.115 -271 G 0.112 -272 R 0.106 -273 Y 0.095 -274 D 0.083 -275 M 0.075 -276 A 0.072 -277 Q 0.075 -278 L 0.083 -279 R 0.101 -280 F 0.128 -281 K 0.159 -282 K 0.178 -283 G 0.178 -284 R 0.167 -285 C 0.156 -286 L 0.151 -287 S 0.151 -288 E 0.151 -289 N 0.144 -290 F 0.132 -291 Y 0.120 -292 V 0.111 -293 R 0.107 -294 G 0.110 -295 D 0.114 -296 G 0.113 -297 T 0.106 -298 R 0.099 -299 V 0.092 -300 Y 0.086 -301 F 0.082 -302 F 0.079 -303 T 0.074 -304 Q 0.067 -305 D 0.064 -306 E 0.066 -307 L 0.071 -308 H 0.079 -309 D 0.083 -310 L 0.077 -311 F 0.068 -312 S 0.064 -313 S 0.070 -314 A 0.082 -315 G 0.088 -316 L 0.082 -317 E 0.071 -318 K 0.060 -319 L 0.054 -320 Q 0.051 -321 N 0.051 -322 L 0.053 -323 V 0.055 -324 D 0.057 -325 R 0.057 -326 R 0.057 -327 L 0.057 -328 Q 0.058 -329 V 0.059 -330 N 0.067 -331 R 0.083 -332 G 0.101 -333 K 0.113 -334 Q 0.115 -335 L 0.111 -336 T 0.104 -337 M 0.095 -338 Y 0.085 -339 R 0.073 -340 V 0.059 -341 W 0.046 -342 V 0.035 -343 Q 0.029 -344 C 0.026 -345 K 0.027 -346 Y 0.034 -347 R 0.050 -348 K 0.082 -349 V 0.134 -350 L 0.202 -351 A 0.268 -352 P 0.309 -353 T 0.323 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000008105_ENSDART00000007857_GN:mettl2a_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:13.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000008105_ENSDART00000007857_GN:mettl2a_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:13.caid deleted file mode 100644 index d6eee107253fd362894b13eafc72e927e3edd5ed..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000008105_ENSDART00000007857_GN:mettl2a_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:13.caid +++ /dev/null @@ -1,367 +0,0 @@ ->ENSDARG00000008105|ENSDART00000007857|GN:mettl2a|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:13 -1 M 0.356 -2 Q 0.357 -3 N 0.362 -4 S 0.373 -5 H 0.386 -6 V 0.402 -7 H 0.418 -8 P 0.418 -9 V 0.394 -10 R 0.373 -11 V 0.384 -12 S 0.411 -13 I 0.426 -14 M 0.439 -15 A 0.475 -16 A 0.529 -17 P 0.578 -18 A 0.609 -19 V 0.628 -20 A 0.640 -21 A 0.639 -22 D 0.628 -23 S 0.609 -24 P 0.579 -25 V 0.527 -26 I 0.468 -27 E 0.438 -28 N 0.450 -29 M 0.473 -30 P 0.492 -31 E 0.536 -32 T 0.619 -33 A 0.701 -34 G 0.744 -35 G 0.750 -36 A 0.740 -37 T 0.726 -38 E 0.712 -39 N 0.694 -40 S 0.666 -41 A 0.631 -42 E 0.591 -43 A 0.549 -44 Q 0.501 -45 K 0.447 -46 R 0.391 -47 P 0.333 -48 Q 0.274 -49 F 0.220 -50 G 0.178 -51 T 0.149 -52 R 0.133 -53 F 0.131 -54 L 0.139 -55 T 0.151 -56 D 0.158 -57 P 0.159 -58 R 0.161 -59 Q 0.165 -60 V 0.167 -61 F 0.164 -62 Q 0.158 -63 H 0.151 -64 N 0.143 -65 A 0.138 -66 W 0.137 -67 D 0.137 -68 N 0.136 -69 V 0.134 -70 E 0.129 -71 W 0.121 -72 S 0.111 -73 A 0.100 -74 E 0.093 -75 Q 0.094 -76 E 0.100 -77 E 0.109 -78 A 0.116 -79 A 0.119 -80 L 0.121 -81 K 0.123 -82 K 0.124 -83 V 0.131 -84 Q 0.149 -85 E 0.171 -86 N 0.185 -87 S 0.191 -88 Q 0.197 -89 P 0.207 -90 L 0.218 -91 P 0.221 -92 A 0.212 -93 E 0.192 -94 K 0.171 -95 Q 0.156 -96 E 0.151 -97 E 0.147 -98 F 0.142 -99 D 0.131 -100 D 0.112 -101 R 0.089 -102 A 0.072 -103 N 0.063 -104 E 0.055 -105 Y 0.048 -106 W 0.044 -107 N 0.046 -108 D 0.048 -109 F 0.049 -110 Y 0.049 -111 T 0.052 -112 I 0.055 -113 H 0.056 -114 E 0.059 -115 N 0.067 -116 R 0.076 -117 F 0.081 -118 F 0.083 -119 K 0.084 -120 D 0.080 -121 R 0.070 -122 H 0.055 -123 W 0.042 -124 L 0.035 -125 F 0.032 -126 T 0.034 -127 E 0.037 -128 F 0.037 -129 P 0.037 -130 E 0.042 -131 L 0.057 -132 A 0.084 -133 P 0.120 -134 Q 0.162 -135 Q 0.207 -136 K 0.252 -137 H 0.295 -138 L 0.347 -139 R 0.405 -140 G 0.451 -141 A 0.468 -142 E 0.452 -143 E 0.421 -144 K 0.392 -145 E 0.364 -146 S 0.328 -147 L 0.294 -148 E 0.282 -149 H 0.296 -150 M 0.330 -151 L 0.385 -152 N 0.452 -153 G 0.511 -154 E 0.553 -155 D 0.582 -156 V 0.596 -157 S 0.594 -158 S 0.580 -159 N 0.557 -160 H 0.530 -161 T 0.498 -162 H 0.461 -163 D 0.425 -164 E 0.398 -165 F 0.385 -166 P 0.383 -167 G 0.382 -168 A 0.365 -169 S 0.317 -170 A 0.243 -171 S 0.163 -172 Y 0.101 -173 R 0.066 -174 I 0.052 -175 L 0.048 -176 E 0.047 -177 V 0.049 -178 G 0.055 -179 C 0.070 -180 G 0.091 -181 V 0.113 -182 G 0.125 -183 N 0.119 -184 T 0.096 -185 V 0.074 -186 F 0.061 -187 P 0.060 -188 I 0.064 -189 L 0.068 -190 K 0.070 -191 T 0.073 -192 N 0.079 -193 N 0.088 -194 D 0.096 -195 P 0.096 -196 G 0.086 -197 L 0.069 -198 F 0.052 -199 V 0.039 -200 Y 0.031 -201 C 0.028 -202 C 0.032 -203 D 0.041 -204 F 0.049 -205 S 0.051 -206 S 0.046 -207 T 0.042 -208 A 0.046 -209 V 0.059 -210 D 0.073 -211 L 0.079 -212 V 0.077 -213 K 0.069 -214 S 0.060 -215 N 0.055 -216 P 0.054 -217 E 0.054 -218 Y 0.051 -219 D 0.042 -220 P 0.031 -221 S 0.023 -222 R 0.021 -223 C 0.024 -224 H 0.029 -225 A 0.035 -226 F 0.040 -227 V 0.044 -228 H 0.046 -229 D 0.048 -230 M 0.053 -231 S 0.063 -232 D 0.075 -233 E 0.083 -234 S 0.086 -235 G 0.080 -236 E 0.069 -237 Y 0.060 -238 P 0.057 -239 M 0.062 -240 P 0.070 -241 D 0.075 -242 H 0.072 -243 S 0.063 -244 L 0.053 -245 D 0.046 -246 V 0.043 -247 I 0.043 -248 V 0.047 -249 L 0.051 -250 I 0.059 -251 F 0.071 -252 V 0.082 -253 L 0.084 -254 S 0.080 -255 A 0.074 -256 L 0.066 -257 H 0.057 -258 P 0.048 -259 E 0.042 -260 K 0.039 -261 M 0.039 -262 Q 0.037 -263 K 0.034 -264 S 0.032 -265 I 0.033 -266 N 0.038 -267 R 0.043 -268 L 0.045 -269 G 0.047 -270 R 0.049 -271 L 0.054 -272 L 0.065 -273 K 0.079 -274 P 0.087 -275 G 0.083 -276 G 0.073 -277 V 0.067 -278 L 0.066 -279 L 0.070 -280 L 0.079 -281 R 0.096 -282 D 0.111 -283 Y 0.116 -284 G 0.113 -285 R 0.107 -286 Y 0.096 -287 D 0.084 -288 M 0.075 -289 A 0.073 -290 Q 0.076 -291 L 0.085 -292 R 0.102 -293 F 0.130 -294 K 0.161 -295 K 0.181 -296 G 0.181 -297 R 0.170 -298 C 0.160 -299 L 0.155 -300 S 0.155 -301 E 0.155 -302 N 0.147 -303 F 0.135 -304 Y 0.123 -305 V 0.114 -306 R 0.110 -307 G 0.113 -308 D 0.118 -309 G 0.116 -310 T 0.109 -311 R 0.101 -312 V 0.094 -313 Y 0.088 -314 F 0.083 -315 F 0.080 -316 T 0.074 -317 Q 0.068 -318 D 0.065 -319 E 0.066 -320 L 0.072 -321 H 0.080 -322 D 0.084 -323 L 0.079 -324 F 0.069 -325 S 0.065 -326 S 0.071 -327 A 0.083 -328 G 0.089 -329 L 0.083 -330 E 0.071 -331 K 0.060 -332 L 0.054 -333 Q 0.051 -334 N 0.051 -335 L 0.053 -336 V 0.055 -337 D 0.057 -338 R 0.058 -339 R 0.058 -340 L 0.058 -341 Q 0.057 -342 V 0.059 -343 N 0.066 -344 R 0.081 -345 G 0.099 -346 K 0.110 -347 Q 0.113 -348 L 0.109 -349 T 0.102 -350 M 0.094 -351 Y 0.084 -352 R 0.072 -353 V 0.059 -354 W 0.046 -355 V 0.035 -356 Q 0.029 -357 C 0.027 -358 K 0.028 -359 Y 0.034 -360 R 0.051 -361 K 0.083 -362 V 0.136 -363 L 0.205 -364 A 0.271 -365 P 0.312 -366 T 0.326 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000017657_ENSDART00000004295_GN:zgc:112163_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000017657_ENSDART00000004295_GN:zgc:112163_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index e00fdc5ebc259f833241764f7949e2465e797584..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000017657_ENSDART00000004295_GN:zgc:112163_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,260 +0,0 @@ ->ENSDARG00000017657|ENSDART00000004295|GN:zgc:112163|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.351 -2 V 0.349 -3 A 0.338 -4 S 0.309 -5 S 0.257 -6 P 0.195 -7 E 0.140 -8 T 0.105 -9 L 0.088 -10 I 0.082 -11 S 0.078 -12 A 0.070 -13 A 0.066 -14 Q 0.073 -15 K 0.086 -16 C 0.093 -17 L 0.095 -18 C 0.100 -19 S 0.110 -20 R 0.123 -21 K 0.137 -22 K 0.148 -23 R 0.159 -24 L 0.168 -25 S 0.171 -26 P 0.161 -27 S 0.138 -28 S 0.113 -29 C 0.088 -30 L 0.065 -31 E 0.046 -32 V 0.037 -33 T 0.033 -34 I 0.029 -35 H 0.028 -36 I 0.029 -37 I 0.034 -38 A 0.044 -39 V 0.058 -40 D 0.075 -41 L 0.090 -42 G 0.097 -43 V 0.086 -44 K 0.064 -45 P 0.044 -46 A 0.033 -47 L 0.033 -48 L 0.043 -49 Y 0.063 -50 D 0.089 -51 S 0.110 -52 N 0.117 -53 G 0.111 -54 A 0.097 -55 S 0.081 -56 P 0.064 -57 D 0.050 -58 Q 0.040 -59 L 0.034 -60 Q 0.032 -61 L 0.033 -62 Y 0.038 -63 L 0.044 -64 H 0.051 -65 S 0.059 -66 L 0.071 -67 Q 0.085 -68 E 0.099 -69 S 0.110 -70 S 0.113 -71 V 0.107 -72 V 0.097 -73 S 0.088 -74 N 0.079 -75 S 0.067 -76 L 0.053 -77 R 0.042 -78 I 0.036 -79 M 0.038 -80 S 0.048 -81 I 0.061 -82 N 0.070 -83 D 0.070 -84 N 0.063 -85 T 0.051 -86 F 0.043 -87 I 0.043 -88 I 0.047 -89 N 0.051 -90 P 0.050 -91 D 0.045 -92 I 0.041 -93 M 0.042 -94 K 0.048 -95 S 0.053 -96 H 0.057 -97 L 0.059 -98 G 0.062 -99 E 0.066 -100 L 0.071 -101 L 0.073 -102 K 0.076 -103 S 0.084 -104 K 0.097 -105 S 0.113 -106 L 0.125 -107 P 0.122 -108 L 0.105 -109 I 0.087 -110 D 0.076 -111 V 0.071 -112 C 0.073 -113 S 0.079 -114 S 0.088 -115 R 0.095 -116 K 0.096 -117 R 0.093 -118 P 0.084 -119 V 0.068 -120 L 0.049 -121 C 0.036 -122 A 0.033 -123 F 0.037 -124 E 0.045 -125 R 0.049 -126 S 0.047 -127 A 0.045 -128 E 0.044 -129 E 0.045 -130 M 0.043 -131 V 0.041 -132 R 0.039 -133 S 0.037 -134 F 0.036 -135 L 0.036 -136 E 0.040 -137 V 0.049 -138 F 0.063 -139 M 0.078 -140 N 0.093 -141 G 0.101 -142 L 0.099 -143 D 0.090 -144 L 0.084 -145 V 0.085 -146 V 0.091 -147 L 0.091 -148 E 0.084 -149 E 0.073 -150 E 0.063 -151 L 0.054 -152 Y 0.048 -153 K 0.048 -154 D 0.050 -155 W 0.048 -156 N 0.040 -157 L 0.033 -158 C 0.032 -159 T 0.036 -160 F 0.040 -161 F 0.044 -162 G 0.048 -163 I 0.051 -164 L 0.049 -165 L 0.047 -166 G 0.049 -167 Y 0.052 -168 P 0.052 -169 A 0.048 -170 S 0.042 -171 Y 0.039 -172 W 0.039 -173 F 0.042 -174 E 0.051 -175 Q 0.069 -176 T 0.093 -177 Q 0.114 -178 G 0.123 -179 F 0.118 -180 E 0.109 -181 N 0.105 -182 C 0.103 -183 L 0.100 -184 S 0.096 -185 M 0.091 -186 T 0.084 -187 P 0.074 -188 L 0.066 -189 V 0.060 -190 V 0.055 -191 C 0.048 -192 T 0.044 -193 V 0.042 -194 W 0.041 -195 V 0.039 -196 R 0.036 -197 W 0.034 -198 Q 0.035 -199 I 0.038 -200 H 0.042 -201 E 0.047 -202 I 0.052 -203 K 0.057 -204 Q 0.064 -205 R 0.071 -206 C 0.076 -207 C 0.075 -208 L 0.069 -209 Y 0.061 -210 S 0.054 -211 F 0.053 -212 S 0.056 -213 V 0.060 -214 P 0.059 -215 E 0.053 -216 E 0.045 -217 L 0.040 -218 W 0.037 -219 S 0.034 -220 D 0.034 -221 V 0.040 -222 Q 0.051 -223 S 0.056 -224 H 0.049 -225 I 0.036 -226 Q 0.028 -227 R 0.029 -228 W 0.038 -229 T 0.053 -230 D 0.062 -231 H 0.059 -232 L 0.056 -233 R 0.062 -234 E 0.074 -235 R 0.082 -236 F 0.089 -237 S 0.098 -238 K 0.111 -239 Q 0.130 -240 T 0.152 -241 V 0.169 -242 L 0.176 -243 T 0.174 -244 D 0.175 -245 I 0.182 -246 C 0.194 -247 F 0.208 -248 S 0.225 -249 R 0.245 -250 D 0.272 -251 T 0.302 -252 V 0.333 -253 T 0.366 -254 L 0.406 -255 P 0.447 -256 S 0.476 -257 V 0.474 -258 T 0.440 -259 L 0.404 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000017657_ENSDART00000004295_GN:zgc:112163_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:8.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000017657_ENSDART00000004295_GN:zgc:112163_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:8.caid deleted file mode 100644 index 8e82017ce8ae1294a3ef59c3c8620a3fcc10db4b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000017657_ENSDART00000004295_GN:zgc:112163_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:8.caid +++ /dev/null @@ -1,268 +0,0 @@ ->ENSDARG00000017657|ENSDART00000004295|GN:zgc:112163|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:8 -1 M 0.332 -2 T 0.342 -3 H 0.369 -4 L 0.410 -5 E 0.455 -6 R 0.498 -7 G 0.529 -8 A 0.536 -9 M 0.514 -10 V 0.468 -11 A 0.404 -12 S 0.327 -13 S 0.248 -14 P 0.179 -15 E 0.130 -16 T 0.103 -17 L 0.089 -18 I 0.083 -19 S 0.078 -20 A 0.069 -21 A 0.059 -22 Q 0.059 -23 K 0.068 -24 C 0.080 -25 L 0.093 -26 C 0.106 -27 S 0.119 -28 R 0.131 -29 K 0.144 -30 K 0.157 -31 R 0.169 -32 L 0.181 -33 S 0.187 -34 P 0.176 -35 S 0.150 -36 S 0.120 -37 C 0.091 -38 L 0.065 -39 E 0.046 -40 V 0.036 -41 T 0.032 -42 I 0.029 -43 H 0.028 -44 I 0.031 -45 I 0.036 -46 A 0.046 -47 V 0.061 -48 D 0.077 -49 L 0.094 -50 G 0.101 -51 V 0.090 -52 K 0.068 -53 P 0.046 -54 A 0.035 -55 L 0.035 -56 L 0.045 -57 Y 0.066 -58 D 0.092 -59 S 0.113 -60 N 0.120 -61 G 0.113 -62 A 0.098 -63 S 0.081 -64 P 0.063 -65 D 0.048 -66 Q 0.038 -67 L 0.032 -68 Q 0.030 -69 L 0.030 -70 Y 0.034 -71 L 0.039 -72 H 0.045 -73 S 0.054 -74 L 0.067 -75 Q 0.082 -76 E 0.097 -77 S 0.108 -78 S 0.110 -79 V 0.102 -80 V 0.092 -81 S 0.084 -82 N 0.075 -83 S 0.063 -84 L 0.051 -85 R 0.041 -86 I 0.035 -87 M 0.038 -88 S 0.047 -89 I 0.059 -90 N 0.068 -91 D 0.068 -92 N 0.060 -93 T 0.049 -94 F 0.041 -95 I 0.041 -96 I 0.045 -97 N 0.049 -98 P 0.048 -99 D 0.043 -100 I 0.039 -101 M 0.040 -102 K 0.045 -103 S 0.049 -104 H 0.052 -105 L 0.055 -106 G 0.058 -107 E 0.063 -108 L 0.067 -109 L 0.070 -110 K 0.074 -111 S 0.082 -112 K 0.097 -113 S 0.115 -114 L 0.127 -115 P 0.123 -116 L 0.106 -117 I 0.087 -118 D 0.077 -119 V 0.073 -120 C 0.074 -121 S 0.081 -122 S 0.090 -123 R 0.096 -124 K 0.098 -125 R 0.095 -126 P 0.086 -127 V 0.070 -128 L 0.051 -129 C 0.038 -130 A 0.034 -131 F 0.039 -132 E 0.047 -133 R 0.050 -134 S 0.048 -135 A 0.045 -136 E 0.044 -137 E 0.044 -138 M 0.042 -139 V 0.040 -140 R 0.038 -141 S 0.036 -142 F 0.035 -143 L 0.036 -144 E 0.040 -145 V 0.049 -146 F 0.061 -147 M 0.076 -148 N 0.091 -149 G 0.100 -150 L 0.098 -151 D 0.090 -152 L 0.084 -153 V 0.085 -154 V 0.090 -155 L 0.090 -156 E 0.083 -157 E 0.073 -158 E 0.064 -159 L 0.055 -160 Y 0.048 -161 K 0.048 -162 D 0.050 -163 W 0.047 -164 N 0.039 -165 L 0.032 -166 C 0.031 -167 T 0.035 -168 F 0.040 -169 F 0.044 -170 G 0.048 -171 I 0.050 -172 L 0.048 -173 L 0.046 -174 G 0.048 -175 Y 0.051 -176 P 0.051 -177 A 0.046 -178 S 0.040 -179 Y 0.037 -180 W 0.037 -181 F 0.040 -182 E 0.049 -183 Q 0.066 -184 T 0.090 -185 Q 0.110 -186 G 0.119 -187 F 0.114 -188 E 0.104 -189 N 0.099 -190 C 0.097 -191 L 0.094 -192 S 0.091 -193 M 0.087 -194 T 0.080 -195 P 0.070 -196 L 0.062 -197 V 0.056 -198 V 0.051 -199 C 0.045 -200 T 0.041 -201 V 0.039 -202 W 0.039 -203 V 0.037 -204 R 0.034 -205 W 0.033 -206 Q 0.034 -207 I 0.037 -208 H 0.041 -209 E 0.047 -210 I 0.053 -211 K 0.057 -212 Q 0.063 -213 R 0.069 -214 C 0.074 -215 C 0.073 -216 L 0.068 -217 Y 0.060 -218 S 0.055 -219 F 0.053 -220 S 0.057 -221 V 0.061 -222 P 0.060 -223 E 0.053 -224 E 0.045 -225 L 0.041 -226 W 0.038 -227 S 0.035 -228 D 0.035 -229 V 0.041 -230 Q 0.052 -231 S 0.057 -232 H 0.050 -233 I 0.037 -234 Q 0.029 -235 R 0.030 -236 W 0.040 -237 T 0.054 -238 D 0.062 -239 H 0.060 -240 L 0.057 -241 R 0.063 -242 E 0.075 -243 R 0.084 -244 F 0.091 -245 S 0.100 -246 K 0.113 -247 Q 0.131 -248 T 0.152 -249 V 0.169 -250 L 0.175 -251 T 0.174 -252 D 0.175 -253 I 0.183 -254 C 0.195 -255 F 0.209 -256 S 0.225 -257 R 0.245 -258 D 0.273 -259 T 0.305 -260 V 0.337 -261 T 0.371 -262 L 0.410 -263 P 0.451 -264 S 0.479 -265 V 0.478 -266 T 0.444 -267 L 0.407 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000023712_ENSDART00000028225_GN:mao_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000023712_ENSDART00000028225_GN:mao_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index ff88f18039b49b526d2857f880b12f37018e28dd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000023712_ENSDART00000028225_GN:mao_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,523 +0,0 @@ ->ENSDARG00000023712|ENSDART00000028225|GN:mao|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.381 -2 T 0.359 -3 A 0.311 -4 N 0.239 -5 A 0.162 -6 Y 0.103 -7 D 0.069 -8 V 0.055 -9 I 0.052 -10 V 0.051 -11 I 0.047 -12 G 0.042 -13 G 0.040 -14 G 0.045 -15 I 0.055 -16 S 0.061 -17 G 0.061 -18 L 0.061 -19 S 0.066 -20 A 0.073 -21 A 0.073 -22 K 0.066 -23 L 0.059 -24 L 0.055 -25 V 0.056 -26 D 0.066 -27 S 0.082 -28 G 0.096 -29 L 0.102 -30 N 0.103 -31 P 0.104 -32 V 0.109 -33 V 0.122 -34 L 0.138 -35 E 0.145 -36 A 0.141 -37 R 0.139 -38 S 0.150 -39 R 0.171 -40 V 0.186 -41 G 0.186 -42 G 0.177 -43 R 0.163 -44 T 0.146 -45 Y 0.130 -46 T 0.120 -47 V 0.120 -48 Q 0.126 -49 N 0.129 -50 K 0.125 -51 E 0.114 -52 T 0.102 -53 K 0.092 -54 W 0.091 -55 V 0.099 -56 D 0.108 -57 L 0.111 -58 G 0.111 -59 G 0.123 -60 A 0.149 -61 Y 0.174 -62 I 0.181 -63 G 0.169 -64 P 0.148 -65 T 0.127 -66 Q 0.107 -67 N 0.090 -68 R 0.082 -69 I 0.083 -70 L 0.086 -71 R 0.085 -72 I 0.077 -73 A 0.063 -74 K 0.051 -75 Q 0.051 -76 Y 0.064 -77 G 0.086 -78 V 0.107 -79 K 0.121 -80 T 0.129 -81 Y 0.141 -82 K 0.160 -83 V 0.182 -84 N 0.198 -85 E 0.202 -86 E 0.193 -87 E 0.170 -88 S 0.137 -89 L 0.104 -90 V 0.082 -91 H 0.075 -92 Y 0.080 -93 V 0.090 -94 K 0.099 -95 G 0.104 -96 K 0.110 -97 S 0.121 -98 Y 0.135 -99 P 0.143 -100 F 0.143 -101 K 0.140 -102 G 0.140 -103 P 0.143 -104 F 0.143 -105 P 0.138 -106 P 0.126 -107 M 0.111 -108 W 0.097 -109 N 0.085 -110 P 0.074 -111 F 0.066 -112 A 0.059 -113 Y 0.056 -114 M 0.056 -115 D 0.061 -116 Y 0.063 -117 N 0.064 -118 N 0.067 -119 L 0.073 -120 W 0.078 -121 R 0.076 -122 T 0.071 -123 M 0.071 -124 D 0.077 -125 K 0.082 -126 M 0.080 -127 G 0.079 -128 M 0.086 -129 E 0.100 -130 I 0.108 -131 P 0.105 -132 K 0.098 -133 E 0.094 -134 A 0.088 -135 P 0.080 -136 W 0.077 -137 R 0.080 -138 A 0.084 -139 P 0.079 -140 H 0.068 -141 A 0.058 -142 E 0.051 -143 E 0.051 -144 W 0.054 -145 D 0.054 -146 K 0.049 -147 M 0.042 -148 T 0.035 -149 M 0.030 -150 Q 0.027 -151 Q 0.025 -152 L 0.025 -153 F 0.027 -154 D 0.034 -155 K 0.046 -156 I 0.062 -157 C 0.080 -158 W 0.094 -159 T 0.096 -160 R 0.085 -161 S 0.069 -162 A 0.059 -163 R 0.056 -164 R 0.059 -165 F 0.061 -166 A 0.061 -167 T 0.060 -168 L 0.061 -169 F 0.063 -170 V 0.065 -171 N 0.067 -172 V 0.075 -173 N 0.085 -174 V 0.088 -175 T 0.087 -176 S 0.083 -177 E 0.079 -178 P 0.076 -179 H 0.076 -180 E 0.076 -181 V 0.070 -182 S 0.060 -183 A 0.051 -184 L 0.050 -185 W 0.053 -186 F 0.055 -187 L 0.054 -188 W 0.053 -189 Y 0.055 -190 V 0.062 -191 K 0.075 -192 Q 0.093 -193 C 0.110 -194 G 0.120 -195 G 0.120 -196 T 0.117 -197 M 0.122 -198 R 0.137 -199 I 0.153 -200 F 0.171 -201 S 0.199 -202 T 0.234 -203 T 0.257 -204 N 0.257 -205 G 0.243 -206 G 0.223 -207 Q 0.201 -208 E 0.170 -209 R 0.135 -210 K 0.103 -211 F 0.084 -212 A 0.078 -213 G 0.082 -214 G 0.092 -215 A 0.098 -216 N 0.097 -217 Q 0.094 -218 I 0.094 -219 S 0.093 -220 E 0.092 -221 G 0.096 -222 M 0.103 -223 A 0.107 -224 R 0.100 -225 E 0.085 -226 L 0.072 -227 G 0.069 -228 D 0.070 -229 R 0.076 -230 V 0.085 -231 K 0.090 -232 L 0.086 -233 S 0.073 -234 R 0.058 -235 A 0.050 -236 V 0.050 -237 C 0.056 -238 S 0.060 -239 I 0.061 -240 D 0.061 -241 Q 0.061 -242 T 0.064 -243 G 0.064 -244 D 0.057 -245 L 0.046 -246 V 0.035 -247 E 0.029 -248 V 0.028 -249 R 0.030 -250 T 0.035 -251 V 0.045 -252 N 0.059 -253 E 0.071 -254 E 0.073 -255 V 0.066 -256 Y 0.058 -257 K 0.054 -258 A 0.055 -259 K 0.061 -260 Y 0.073 -261 V 0.092 -262 I 0.110 -263 L 0.115 -264 A 0.107 -265 I 0.100 -266 P 0.100 -267 P 0.103 -268 G 0.103 -269 L 0.101 -270 N 0.099 -271 L 0.094 -272 K 0.087 -273 I 0.080 -274 H 0.072 -275 F 0.065 -276 N 0.064 -277 P 0.074 -278 E 0.089 -279 L 0.096 -280 P 0.090 -281 P 0.080 -282 L 0.074 -283 R 0.072 -284 N 0.074 -285 Q 0.080 -286 L 0.084 -287 I 0.085 -288 H 0.084 -289 R 0.087 -290 V 0.093 -291 P 0.096 -292 M 0.092 -293 G 0.084 -294 S 0.073 -295 V 0.057 -296 I 0.043 -297 K 0.033 -298 C 0.027 -299 M 0.024 -300 V 0.026 -301 Y 0.032 -302 Y 0.041 -303 K 0.048 -304 E 0.052 -305 N 0.054 -306 F 0.057 -307 W 0.064 -308 R 0.076 -309 K 0.090 -310 K 0.100 -311 G 0.110 -312 Y 0.118 -313 C 0.120 -314 G 0.112 -315 S 0.100 -316 M 0.089 -317 V 0.079 -318 I 0.074 -319 E 0.077 -320 E 0.089 -321 E 0.107 -322 D 0.123 -323 A 0.128 -324 P 0.119 -325 I 0.100 -326 G 0.083 -327 L 0.076 -328 T 0.078 -329 L 0.085 -330 D 0.094 -331 D 0.102 -332 T 0.108 -333 K 0.119 -334 P 0.135 -335 D 0.153 -336 G 0.158 -337 S 0.142 -338 V 0.112 -339 P 0.084 -340 A 0.063 -341 I 0.050 -342 M 0.044 -343 G 0.044 -344 F 0.050 -345 I 0.057 -346 L 0.062 -347 A 0.068 -348 R 0.075 -349 K 0.081 -350 S 0.084 -351 R 0.086 -352 K 0.087 -353 L 0.085 -354 A 0.079 -355 N 0.072 -356 L 0.066 -357 T 0.061 -358 R 0.056 -359 D 0.050 -360 E 0.046 -361 R 0.043 -362 K 0.045 -363 R 0.049 -364 R 0.051 -365 I 0.051 -366 C 0.050 -367 E 0.050 -368 I 0.051 -369 Y 0.051 -370 A 0.049 -371 R 0.046 -372 V 0.046 -373 L 0.053 -374 G 0.065 -375 S 0.074 -376 E 0.078 -377 E 0.079 -378 A 0.083 -379 L 0.090 -380 Y 0.093 -381 P 0.087 -382 V 0.069 -383 H 0.049 -384 Y 0.035 -385 E 0.030 -386 E 0.035 -387 K 0.044 -388 N 0.056 -389 W 0.066 -390 C 0.069 -391 E 0.064 -392 E 0.056 -393 E 0.054 -394 Y 0.063 -395 S 0.084 -396 G 0.110 -397 G 0.132 -398 C 0.147 -399 Y 0.155 -400 T 0.157 -401 A 0.154 -402 Y 0.150 -403 F 0.150 -404 P 0.155 -405 P 0.158 -406 G 0.152 -407 I 0.134 -408 M 0.109 -409 T 0.092 -410 Q 0.087 -411 F 0.089 -412 G 0.093 -413 R 0.099 -414 V 0.109 -415 L 0.122 -416 R 0.132 -417 E 0.137 -418 P 0.132 -419 V 0.115 -420 G 0.096 -421 R 0.087 -422 L 0.087 -423 Y 0.091 -424 F 0.093 -425 A 0.100 -426 G 0.123 -427 T 0.166 -428 E 0.213 -429 T 0.233 -430 A 0.216 -431 T 0.181 -432 E 0.152 -433 W 0.142 -434 S 0.147 -435 G 0.164 -436 Y 0.187 -437 M 0.208 -438 E 0.219 -439 G 0.220 -440 A 0.211 -441 V 0.195 -442 Q 0.174 -443 A 0.155 -444 G 0.140 -445 E 0.128 -446 R 0.120 -447 A 0.111 -448 S 0.103 -449 R 0.098 -450 E 0.098 -451 V 0.101 -452 M 0.101 -453 C 0.098 -454 A 0.099 -455 M 0.107 -456 G 0.115 -457 K 0.118 -458 L 0.116 -459 H 0.116 -460 A 0.123 -461 S 0.134 -462 Q 0.141 -463 I 0.138 -464 W 0.134 -465 Q 0.148 -466 S 0.187 -467 E 0.236 -468 P 0.268 -469 E 0.278 -470 S 0.281 -471 M 0.290 -472 D 0.303 -473 V 0.309 -474 P 0.305 -475 A 0.295 -476 R 0.289 -477 P 0.288 -478 F 0.285 -479 V 0.272 -480 T 0.250 -481 T 0.224 -482 F 0.202 -483 W 0.194 -484 E 0.209 -485 R 0.246 -486 N 0.293 -487 L 0.332 -488 P 0.354 -489 S 0.352 -490 V 0.330 -491 G 0.303 -492 G 0.286 -493 F 0.284 -494 L 0.291 -495 K 0.308 -496 F 0.344 -497 M 0.385 -498 G 0.413 -499 V 0.422 -500 S 0.413 -501 S 0.385 -502 F 0.348 -503 L 0.318 -504 A 0.292 -505 A 0.271 -506 A 0.260 -507 T 0.247 -508 A 0.225 -509 A 0.204 -510 G 0.194 -511 L 0.190 -512 V 0.191 -513 A 0.196 -514 C 0.206 -515 K 0.226 -516 K 0.262 -517 G 0.302 -518 L 0.320 -519 L 0.313 -520 P 0.290 -521 R 0.265 -522 C 0.249 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000023712_ENSDART00000028225_GN:mao_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:20.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000023712_ENSDART00000028225_GN:mao_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:20.caid deleted file mode 100644 index 41c4c0a36f37688d67f94c0573a09edc16ebafc8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000023712_ENSDART00000028225_GN:mao_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:20.caid +++ /dev/null @@ -1,543 +0,0 @@ ->ENSDARG00000023712|ENSDART00000028225|GN:mao|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:20 -1 M 0.339 -2 R 0.343 -3 S 0.364 -4 G 0.388 -5 S 0.381 -6 S 0.356 -7 S 0.368 -8 A 0.421 -9 L 0.469 -10 S 0.489 -11 A 0.488 -12 T 0.466 -13 E 0.428 -14 Q 0.410 -15 T 0.436 -16 R 0.483 -17 T 0.521 -18 D 0.536 -19 S 0.528 -20 T 0.499 -21 M 0.456 -22 T 0.398 -23 A 0.326 -24 N 0.242 -25 A 0.162 -26 Y 0.103 -27 D 0.070 -28 V 0.055 -29 I 0.051 -30 V 0.049 -31 I 0.045 -32 G 0.040 -33 G 0.039 -34 G 0.045 -35 I 0.055 -36 S 0.061 -37 G 0.061 -38 L 0.061 -39 S 0.067 -40 A 0.073 -41 A 0.073 -42 K 0.067 -43 L 0.061 -44 L 0.057 -45 V 0.058 -46 D 0.068 -47 S 0.084 -48 G 0.096 -49 L 0.102 -50 N 0.102 -51 P 0.102 -52 V 0.107 -53 V 0.119 -54 L 0.135 -55 E 0.143 -56 A 0.141 -57 R 0.139 -58 S 0.150 -59 R 0.171 -60 V 0.186 -61 G 0.186 -62 G 0.176 -63 R 0.162 -64 T 0.144 -65 Y 0.128 -66 T 0.118 -67 V 0.117 -68 Q 0.123 -69 N 0.126 -70 K 0.121 -71 E 0.110 -72 T 0.098 -73 K 0.088 -74 W 0.087 -75 V 0.095 -76 D 0.106 -77 L 0.109 -78 G 0.109 -79 G 0.121 -80 A 0.146 -81 Y 0.169 -82 I 0.174 -83 G 0.162 -84 P 0.143 -85 T 0.123 -86 Q 0.104 -87 N 0.088 -88 R 0.078 -89 I 0.072 -90 L 0.065 -91 R 0.058 -92 I 0.054 -93 A 0.050 -94 K 0.047 -95 Q 0.049 -96 Y 0.063 -97 G 0.085 -98 V 0.106 -99 K 0.119 -100 T 0.127 -101 Y 0.139 -102 K 0.159 -103 V 0.181 -104 N 0.195 -105 E 0.199 -106 E 0.189 -107 E 0.167 -108 S 0.136 -109 L 0.105 -110 V 0.083 -111 H 0.076 -112 Y 0.081 -113 V 0.091 -114 K 0.099 -115 G 0.104 -116 K 0.111 -117 S 0.123 -118 Y 0.137 -119 P 0.146 -120 F 0.148 -121 K 0.146 -122 G 0.147 -123 P 0.151 -124 F 0.151 -125 P 0.145 -126 P 0.132 -127 M 0.116 -128 W 0.102 -129 N 0.089 -130 P 0.077 -131 F 0.068 -132 A 0.061 -133 Y 0.056 -134 M 0.056 -135 D 0.060 -136 Y 0.063 -137 N 0.062 -138 N 0.063 -139 L 0.063 -140 W 0.059 -141 R 0.053 -142 T 0.052 -143 M 0.060 -144 D 0.072 -145 K 0.080 -146 M 0.079 -147 G 0.077 -148 M 0.085 -149 E 0.099 -150 I 0.107 -151 P 0.104 -152 K 0.098 -153 E 0.093 -154 A 0.087 -155 P 0.080 -156 W 0.077 -157 R 0.081 -158 A 0.084 -159 P 0.080 -160 H 0.069 -161 A 0.058 -162 E 0.052 -163 E 0.051 -164 W 0.054 -165 D 0.054 -166 K 0.049 -167 M 0.042 -168 T 0.036 -169 M 0.030 -170 Q 0.027 -171 Q 0.025 -172 L 0.025 -173 F 0.027 -174 D 0.034 -175 K 0.046 -176 I 0.062 -177 C 0.080 -178 W 0.094 -179 T 0.096 -180 R 0.085 -181 S 0.069 -182 A 0.059 -183 R 0.057 -184 R 0.059 -185 F 0.062 -186 A 0.062 -187 T 0.061 -188 L 0.063 -189 F 0.065 -190 V 0.066 -191 N 0.069 -192 V 0.076 -193 N 0.085 -194 V 0.088 -195 T 0.086 -196 S 0.081 -197 E 0.077 -198 P 0.074 -199 H 0.075 -200 E 0.075 -201 V 0.070 -202 S 0.059 -203 A 0.051 -204 L 0.050 -205 W 0.053 -206 F 0.054 -207 L 0.053 -208 W 0.053 -209 Y 0.055 -210 V 0.061 -211 K 0.074 -212 Q 0.091 -213 C 0.108 -214 G 0.117 -215 G 0.118 -216 T 0.116 -217 M 0.122 -218 R 0.137 -219 I 0.154 -220 F 0.172 -221 S 0.200 -222 T 0.235 -223 T 0.257 -224 N 0.257 -225 G 0.243 -226 G 0.223 -227 Q 0.200 -228 E 0.169 -229 R 0.133 -230 K 0.102 -231 F 0.082 -232 A 0.077 -233 G 0.082 -234 G 0.093 -235 A 0.099 -236 N 0.097 -237 Q 0.094 -238 I 0.093 -239 S 0.093 -240 E 0.092 -241 G 0.095 -242 M 0.103 -243 A 0.107 -244 R 0.100 -245 E 0.085 -246 L 0.073 -247 G 0.069 -248 D 0.071 -249 R 0.076 -250 V 0.085 -251 K 0.090 -252 L 0.086 -253 S 0.073 -254 R 0.058 -255 A 0.050 -256 V 0.050 -257 C 0.056 -258 S 0.060 -259 I 0.062 -260 D 0.061 -261 Q 0.062 -262 T 0.064 -263 G 0.064 -264 D 0.057 -265 L 0.046 -266 V 0.035 -267 E 0.029 -268 V 0.028 -269 R 0.030 -270 T 0.035 -271 V 0.045 -272 N 0.060 -273 E 0.073 -274 E 0.075 -275 V 0.067 -276 Y 0.058 -277 K 0.054 -278 A 0.055 -279 K 0.062 -280 Y 0.075 -281 V 0.094 -282 I 0.111 -283 L 0.116 -284 A 0.109 -285 I 0.100 -286 P 0.100 -287 P 0.103 -288 G 0.103 -289 L 0.102 -290 N 0.100 -291 L 0.096 -292 K 0.089 -293 I 0.082 -294 H 0.074 -295 F 0.066 -296 N 0.065 -297 P 0.076 -298 E 0.090 -299 L 0.097 -300 P 0.091 -301 P 0.081 -302 L 0.074 -303 R 0.073 -304 N 0.075 -305 Q 0.080 -306 L 0.085 -307 I 0.086 -308 H 0.086 -309 R 0.089 -310 V 0.095 -311 P 0.098 -312 M 0.094 -313 G 0.086 -314 S 0.074 -315 V 0.058 -316 I 0.044 -317 K 0.034 -318 C 0.028 -319 M 0.025 -320 V 0.027 -321 Y 0.033 -322 Y 0.042 -323 K 0.049 -324 E 0.052 -325 N 0.054 -326 F 0.058 -327 W 0.065 -328 R 0.077 -329 K 0.090 -330 K 0.101 -331 G 0.111 -332 Y 0.119 -333 C 0.120 -334 G 0.112 -335 S 0.101 -336 M 0.090 -337 V 0.081 -338 I 0.075 -339 E 0.079 -340 E 0.091 -341 E 0.108 -342 D 0.124 -343 A 0.129 -344 P 0.120 -345 I 0.101 -346 G 0.084 -347 L 0.077 -348 T 0.080 -349 L 0.087 -350 D 0.096 -351 D 0.103 -352 T 0.109 -353 K 0.119 -354 P 0.136 -355 D 0.154 -356 G 0.158 -357 S 0.142 -358 V 0.113 -359 P 0.084 -360 A 0.064 -361 I 0.051 -362 M 0.045 -363 G 0.045 -364 F 0.051 -365 I 0.058 -366 L 0.063 -367 A 0.068 -368 R 0.075 -369 K 0.081 -370 S 0.084 -371 R 0.086 -372 K 0.086 -373 L 0.085 -374 A 0.079 -375 N 0.072 -376 L 0.066 -377 T 0.061 -378 R 0.056 -379 D 0.051 -380 E 0.046 -381 R 0.044 -382 K 0.045 -383 R 0.049 -384 R 0.051 -385 I 0.051 -386 C 0.050 -387 E 0.050 -388 I 0.051 -389 Y 0.051 -390 A 0.049 -391 R 0.046 -392 V 0.047 -393 L 0.054 -394 G 0.065 -395 S 0.074 -396 E 0.078 -397 E 0.079 -398 A 0.084 -399 L 0.091 -400 Y 0.094 -401 P 0.088 -402 V 0.070 -403 H 0.050 -404 Y 0.036 -405 E 0.031 -406 E 0.036 -407 K 0.045 -408 N 0.057 -409 W 0.067 -410 C 0.070 -411 E 0.065 -412 E 0.057 -413 E 0.055 -414 Y 0.064 -415 S 0.086 -416 G 0.112 -417 G 0.135 -418 C 0.149 -419 Y 0.157 -420 T 0.160 -421 A 0.158 -422 Y 0.153 -423 F 0.152 -424 P 0.156 -425 P 0.159 -426 G 0.153 -427 I 0.135 -428 M 0.110 -429 T 0.093 -430 Q 0.088 -431 F 0.090 -432 G 0.093 -433 R 0.099 -434 V 0.111 -435 L 0.123 -436 R 0.135 -437 E 0.140 -438 P 0.135 -439 V 0.118 -440 G 0.099 -441 R 0.088 -442 L 0.089 -443 Y 0.092 -444 F 0.095 -445 A 0.102 -446 G 0.124 -447 T 0.168 -448 E 0.215 -449 T 0.235 -450 A 0.219 -451 T 0.183 -452 E 0.154 -453 W 0.143 -454 S 0.149 -455 G 0.165 -456 Y 0.188 -457 M 0.208 -458 E 0.218 -459 G 0.218 -460 A 0.210 -461 V 0.194 -462 Q 0.173 -463 A 0.154 -464 G 0.139 -465 E 0.128 -466 R 0.119 -467 A 0.111 -468 S 0.102 -469 R 0.097 -470 E 0.098 -471 V 0.101 -472 M 0.100 -473 C 0.097 -474 A 0.099 -475 M 0.107 -476 G 0.115 -477 K 0.116 -478 L 0.114 -479 H 0.114 -480 A 0.121 -481 S 0.132 -482 Q 0.140 -483 I 0.138 -484 W 0.134 -485 Q 0.149 -486 S 0.190 -487 E 0.240 -488 P 0.274 -489 E 0.285 -490 S 0.289 -491 M 0.298 -492 D 0.309 -493 V 0.314 -494 P 0.309 -495 A 0.299 -496 R 0.294 -497 P 0.294 -498 F 0.293 -499 V 0.282 -500 T 0.258 -501 T 0.229 -502 F 0.205 -503 W 0.196 -504 E 0.212 -505 R 0.249 -506 N 0.295 -507 L 0.336 -508 P 0.357 -509 S 0.355 -510 V 0.332 -511 G 0.305 -512 G 0.289 -513 F 0.287 -514 L 0.294 -515 K 0.311 -516 F 0.346 -517 M 0.388 -518 G 0.415 -519 V 0.422 -520 S 0.412 -521 S 0.384 -522 F 0.346 -523 L 0.313 -524 A 0.285 -525 A 0.263 -526 A 0.250 -527 T 0.237 -528 A 0.215 -529 A 0.192 -530 G 0.176 -531 L 0.167 -532 V 0.166 -533 A 0.174 -534 C 0.187 -535 K 0.208 -536 K 0.244 -537 G 0.279 -538 L 0.293 -539 L 0.282 -540 P 0.257 -541 R 0.231 -542 C 0.216 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000024771_ENSDART00000033574_GN:slc24a5_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000024771_ENSDART00000033574_GN:slc24a5_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 91d3d365c3c349a17930b5e1b585a809d08b8d7d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000024771_ENSDART00000033574_GN:slc24a5_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,514 +0,0 @@ ->ENSDARG00000024771|ENSDART00000033574|GN:slc24a5|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.251 -2 R 0.248 -3 T 0.243 -4 D 0.230 -5 V 0.204 -6 F 0.176 -7 L 0.161 -8 Q 0.164 -9 R 0.171 -10 R 0.171 -11 K 0.163 -12 R 0.152 -13 R 0.137 -14 D 0.116 -15 V 0.093 -16 L 0.076 -17 L 0.069 -18 S 0.068 -19 I 0.065 -20 I 0.063 -21 A 0.065 -22 L 0.066 -23 L 0.058 -24 L 0.046 -25 L 0.038 -26 I 0.034 -27 F 0.032 -28 A 0.030 -29 I 0.031 -30 V 0.035 -31 H 0.039 -32 L 0.044 -33 V 0.056 -34 F 0.083 -35 C 0.125 -36 A 0.175 -37 G 0.223 -38 L 0.262 -39 S 0.295 -40 F 0.325 -41 Q 0.350 -42 G 0.370 -43 S 0.380 -44 S 0.372 -45 S 0.347 -46 A 0.321 -47 R 0.306 -48 V 0.294 -49 R 0.281 -50 R 0.291 -51 D 0.334 -52 L 0.389 -53 E 0.429 -54 N 0.449 -55 A 0.451 -56 S 0.434 -57 E 0.407 -58 C 0.386 -59 V 0.377 -60 Q 0.371 -61 P 0.363 -62 Q 0.353 -63 S 0.345 -64 S 0.333 -65 E 0.318 -66 F 0.307 -67 P 0.294 -68 E 0.268 -69 G 0.225 -70 F 0.179 -71 F 0.145 -72 T 0.130 -73 V 0.127 -74 Q 0.122 -75 E 0.111 -76 R 0.101 -77 K 0.102 -78 D 0.105 -79 G 0.101 -80 G 0.088 -81 I 0.071 -82 L 0.054 -83 I 0.044 -84 Y 0.043 -85 F 0.050 -86 M 0.059 -87 I 0.065 -88 I 0.063 -89 F 0.057 -90 Y 0.050 -91 M 0.045 -92 L 0.046 -93 L 0.052 -94 S 0.059 -95 V 0.060 -96 S 0.055 -97 I 0.053 -98 V 0.055 -99 C 0.057 -100 D 0.059 -101 E 0.062 -102 Y 0.063 -103 F 0.059 -104 L 0.053 -105 P 0.047 -106 S 0.043 -107 L 0.037 -108 E 0.032 -109 V 0.030 -110 I 0.030 -111 S 0.033 -112 E 0.042 -113 R 0.061 -114 L 0.086 -115 G 0.102 -116 L 0.100 -117 S 0.084 -118 Q 0.070 -119 D 0.064 -120 V 0.063 -121 A 0.061 -122 G 0.060 -123 A 0.059 -124 T 0.058 -125 F 0.055 -126 M 0.055 -127 A 0.057 -128 A 0.061 -129 G 0.064 -130 S 0.070 -131 S 0.079 -132 A 0.085 -133 P 0.084 -134 E 0.080 -135 L 0.074 -136 V 0.067 -137 T 0.067 -138 A 0.069 -139 F 0.069 -140 L 0.069 -141 G 0.074 -142 V 0.086 -143 F 0.104 -144 V 0.124 -145 T 0.141 -146 K 0.148 -147 G 0.146 -148 D 0.135 -149 I 0.116 -150 G 0.095 -151 V 0.081 -152 S 0.079 -153 T 0.087 -154 I 0.094 -155 M 0.098 -156 G 0.104 -157 S 0.109 -158 A 0.107 -159 V 0.098 -160 Y 0.087 -161 N 0.077 -162 L 0.066 -163 L 0.056 -164 C 0.050 -165 I 0.046 -166 C 0.043 -167 A 0.044 -168 A 0.051 -169 C 0.059 -170 G 0.066 -171 L 0.073 -172 L 0.079 -173 S 0.083 -174 S 0.087 -175 A 0.094 -176 V 0.105 -177 G 0.114 -178 R 0.114 -179 L 0.102 -180 S 0.083 -181 C 0.065 -182 W 0.052 -183 P 0.047 -184 L 0.044 -185 F 0.043 -186 R 0.046 -187 D 0.053 -188 C 0.061 -189 V 0.067 -190 A 0.071 -191 Y 0.073 -192 S 0.072 -193 I 0.069 -194 S 0.065 -195 V 0.060 -196 A 0.054 -197 A 0.051 -198 V 0.050 -199 I 0.056 -200 A 0.072 -201 I 0.092 -202 I 0.107 -203 S 0.112 -204 D 0.118 -205 N 0.130 -206 R 0.136 -207 V 0.122 -208 Y 0.093 -209 W 0.070 -210 Y 0.069 -211 D 0.082 -212 G 0.093 -213 A 0.097 -214 C 0.102 -215 L 0.108 -216 L 0.109 -217 L 0.098 -218 V 0.080 -219 Y 0.061 -220 G 0.049 -221 V 0.046 -222 Y 0.052 -223 V 0.062 -224 A 0.066 -225 V 0.062 -226 L 0.055 -227 C 0.050 -228 F 0.050 -229 D 0.054 -230 L 0.059 -231 K 0.062 -232 I 0.066 -233 S 0.074 -234 E 0.085 -235 Y 0.092 -236 V 0.095 -237 M 0.101 -238 Q 0.117 -239 R 0.144 -240 F 0.180 -241 S 0.212 -242 P 0.229 -243 C 0.225 -244 C 0.214 -245 W 0.219 -246 C 0.255 -247 L 0.318 -248 K 0.397 -249 P 0.477 -250 R 0.544 -251 D 0.587 -252 R 0.608 -253 D 0.617 -254 S 0.621 -255 G 0.617 -256 E 0.605 -257 Q 0.592 -258 Q 0.590 -259 P 0.604 -260 L 0.625 -261 V 0.637 -262 G 0.633 -263 W 0.618 -264 S 0.603 -265 D 0.589 -266 D 0.566 -267 S 0.538 -268 S 0.524 -269 L 0.527 -270 R 0.522 -271 V 0.494 -272 Q 0.473 -273 R 0.494 -274 R 0.537 -275 S 0.566 -276 R 0.585 -277 N 0.613 -278 D 0.644 -279 S 0.668 -280 G 0.682 -281 I 0.685 -282 F 0.677 -283 Q 0.662 -284 D 0.642 -285 D 0.614 -286 S 0.579 -287 G 0.541 -288 Y 0.510 -289 S 0.493 -290 H 0.482 -291 L 0.457 -292 S 0.420 -293 L 0.390 -294 S 0.380 -295 L 0.394 -296 H 0.429 -297 G 0.470 -298 L 0.508 -299 N 0.538 -300 E 0.555 -301 I 0.552 -302 S 0.535 -303 D 0.517 -304 E 0.500 -305 H 0.476 -306 K 0.443 -307 S 0.404 -308 V 0.366 -309 F 0.338 -310 S 0.309 -311 M 0.272 -312 P 0.232 -313 D 0.198 -314 H 0.164 -315 D 0.127 -316 L 0.095 -317 K 0.081 -318 R 0.082 -319 I 0.092 -320 L 0.107 -321 W 0.118 -322 V 0.122 -323 L 0.126 -324 S 0.135 -325 L 0.137 -326 P 0.122 -327 V 0.104 -328 S 0.093 -329 T 0.092 -330 L 0.100 -331 L 0.115 -332 F 0.125 -333 V 0.129 -334 S 0.139 -335 V 0.158 -336 P 0.175 -337 D 0.180 -338 C 0.172 -339 R 0.157 -340 R 0.141 -341 P 0.130 -342 F 0.124 -343 W 0.115 -344 K 0.100 -345 N 0.082 -346 F 0.068 -347 Y 0.057 -348 M 0.053 -349 L 0.055 -350 T 0.061 -351 F 0.066 -352 L 0.070 -353 M 0.076 -354 S 0.082 -355 A 0.087 -356 V 0.092 -357 W 0.098 -358 I 0.094 -359 S 0.078 -360 A 0.063 -361 F 0.058 -362 T 0.060 -363 Y 0.061 -364 V 0.060 -365 L 0.059 -366 V 0.057 -367 W 0.052 -368 M 0.047 -369 V 0.045 -370 T 0.046 -371 I 0.052 -372 V 0.060 -373 G 0.069 -374 E 0.077 -375 T 0.093 -376 L 0.122 -377 G 0.151 -378 I 0.157 -379 P 0.136 -380 D 0.109 -381 T 0.092 -382 V 0.082 -383 M 0.070 -384 G 0.058 -385 M 0.051 -386 T 0.054 -387 L 0.063 -388 L 0.072 -389 A 0.080 -390 A 0.084 -391 G 0.084 -392 T 0.087 -393 S 0.095 -394 I 0.101 -395 P 0.099 -396 D 0.092 -397 T 0.079 -398 V 0.065 -399 A 0.056 -400 S 0.052 -401 V 0.050 -402 M 0.051 -403 V 0.057 -404 A 0.067 -405 R 0.078 -406 E 0.090 -407 G 0.099 -408 K 0.098 -409 S 0.090 -410 D 0.085 -411 M 0.086 -412 A 0.089 -413 M 0.090 -414 S 0.095 -415 N 0.106 -416 I 0.117 -417 V 0.122 -418 G 0.130 -419 S 0.139 -420 N 0.138 -421 V 0.121 -422 F 0.096 -423 D 0.075 -424 M 0.061 -425 L 0.053 -426 C 0.046 -427 L 0.041 -428 G 0.038 -429 L 0.036 -430 P 0.033 -431 W 0.030 -432 F 0.028 -433 I 0.028 -434 Q 0.030 -435 T 0.036 -436 V 0.049 -437 F 0.072 -438 V 0.102 -439 D 0.135 -440 V 0.169 -441 G 0.199 -442 S 0.219 -443 P 0.220 -444 V 0.206 -445 D 0.193 -446 V 0.189 -447 N 0.191 -448 S 0.188 -449 S 0.171 -450 G 0.136 -451 L 0.097 -452 V 0.069 -453 F 0.059 -454 M 0.060 -455 S 0.067 -456 C 0.073 -457 T 0.078 -458 L 0.081 -459 L 0.078 -460 L 0.072 -461 S 0.067 -462 I 0.062 -463 I 0.055 -464 F 0.049 -465 L 0.046 -466 F 0.042 -467 L 0.040 -468 A 0.043 -469 V 0.047 -470 H 0.054 -471 I 0.063 -472 N 0.075 -473 G 0.087 -474 W 0.096 -475 K 0.100 -476 L 0.093 -477 D 0.076 -478 W 0.058 -479 K 0.050 -480 L 0.052 -481 G 0.059 -482 L 0.068 -483 V 0.081 -484 C 0.095 -485 L 0.104 -486 A 0.102 -487 C 0.090 -488 Y 0.073 -489 I 0.059 -490 L 0.054 -491 F 0.060 -492 A 0.071 -493 T 0.078 -494 L 0.076 -495 S 0.070 -496 I 0.068 -497 L 0.072 -498 Y 0.085 -499 E 0.104 -500 L 0.128 -501 G 0.152 -502 I 0.172 -503 I 0.192 -504 G 0.219 -505 N 0.254 -506 N 0.280 -507 P 0.281 -508 I 0.263 -509 R 0.252 -510 S 0.267 -511 C 0.306 -512 S 0.349 -513 D 0.377 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000024771_ENSDART00000033574_GN:slc24a5_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000024771_ENSDART00000033574_GN:slc24a5_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:1.caid deleted file mode 100644 index 76861bd38c1bbbc97b43e724a8b52e17e774f4d9..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000024771_ENSDART00000033574_GN:slc24a5_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:1.caid +++ /dev/null @@ -1,515 +0,0 @@ ->ENSDARG00000024771|ENSDART00000033574|GN:slc24a5|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:1 -1 M 0.266 -2 M 0.265 -3 R 0.262 -4 T 0.254 -5 D 0.233 -6 V 0.198 -7 F 0.168 -8 L 0.157 -9 Q 0.163 -10 R 0.172 -11 R 0.173 -12 K 0.167 -13 R 0.154 -14 R 0.137 -15 D 0.116 -16 V 0.093 -17 L 0.076 -18 L 0.069 -19 S 0.067 -20 I 0.062 -21 I 0.053 -22 A 0.047 -23 L 0.042 -24 L 0.039 -25 L 0.036 -26 L 0.035 -27 I 0.033 -28 F 0.032 -29 A 0.030 -30 I 0.031 -31 V 0.035 -32 H 0.039 -33 L 0.044 -34 V 0.056 -35 F 0.083 -36 C 0.126 -37 A 0.176 -38 G 0.224 -39 L 0.263 -40 S 0.297 -41 F 0.327 -42 Q 0.353 -43 G 0.375 -44 S 0.386 -45 S 0.378 -46 S 0.352 -47 A 0.326 -48 R 0.313 -49 V 0.305 -50 R 0.300 -51 R 0.314 -52 D 0.355 -53 L 0.406 -54 E 0.441 -55 N 0.458 -56 A 0.457 -57 S 0.437 -58 E 0.409 -59 C 0.386 -60 V 0.376 -61 Q 0.370 -62 P 0.362 -63 Q 0.352 -64 S 0.343 -65 S 0.331 -66 E 0.317 -67 F 0.306 -68 P 0.293 -69 E 0.267 -70 G 0.225 -71 F 0.178 -72 F 0.145 -73 T 0.130 -74 V 0.127 -75 Q 0.122 -76 E 0.110 -77 R 0.101 -78 K 0.101 -79 D 0.105 -80 G 0.101 -81 G 0.088 -82 I 0.071 -83 L 0.054 -84 I 0.044 -85 Y 0.043 -86 F 0.049 -87 M 0.059 -88 I 0.065 -89 I 0.063 -90 F 0.057 -91 Y 0.050 -92 M 0.045 -93 L 0.046 -94 L 0.052 -95 S 0.059 -96 V 0.059 -97 S 0.055 -98 I 0.053 -99 V 0.055 -100 C 0.057 -101 D 0.059 -102 E 0.062 -103 Y 0.063 -104 F 0.059 -105 L 0.053 -106 P 0.047 -107 S 0.043 -108 L 0.037 -109 E 0.032 -110 V 0.030 -111 I 0.030 -112 S 0.033 -113 E 0.042 -114 R 0.061 -115 L 0.086 -116 G 0.102 -117 L 0.100 -118 S 0.084 -119 Q 0.070 -120 D 0.064 -121 V 0.063 -122 A 0.061 -123 G 0.060 -124 A 0.059 -125 T 0.058 -126 F 0.055 -127 M 0.055 -128 A 0.057 -129 A 0.061 -130 G 0.064 -131 S 0.070 -132 S 0.079 -133 A 0.085 -134 P 0.084 -135 E 0.081 -136 L 0.074 -137 V 0.068 -138 T 0.067 -139 A 0.069 -140 F 0.069 -141 L 0.069 -142 G 0.074 -143 V 0.087 -144 F 0.105 -145 V 0.125 -146 T 0.141 -147 K 0.149 -148 G 0.147 -149 D 0.135 -150 I 0.117 -151 G 0.095 -152 V 0.081 -153 S 0.079 -154 T 0.087 -155 I 0.094 -156 M 0.098 -157 G 0.104 -158 S 0.109 -159 A 0.107 -160 V 0.098 -161 Y 0.088 -162 N 0.077 -163 L 0.066 -164 L 0.056 -165 C 0.050 -166 I 0.046 -167 C 0.043 -168 A 0.044 -169 A 0.051 -170 C 0.059 -171 G 0.066 -172 L 0.073 -173 L 0.079 -174 S 0.083 -175 S 0.087 -176 A 0.094 -177 V 0.105 -178 G 0.114 -179 R 0.114 -180 L 0.102 -181 S 0.084 -182 C 0.065 -183 W 0.052 -184 P 0.047 -185 L 0.044 -186 F 0.043 -187 R 0.046 -188 D 0.053 -189 C 0.061 -190 V 0.068 -191 A 0.072 -192 Y 0.074 -193 S 0.073 -194 I 0.070 -195 S 0.065 -196 V 0.060 -197 A 0.055 -198 A 0.051 -199 V 0.050 -200 I 0.056 -201 A 0.072 -202 I 0.092 -203 I 0.107 -204 S 0.112 -205 D 0.118 -206 N 0.130 -207 R 0.136 -208 V 0.122 -209 Y 0.093 -210 W 0.070 -211 Y 0.069 -212 D 0.082 -213 G 0.093 -214 A 0.097 -215 C 0.102 -216 L 0.108 -217 L 0.109 -218 L 0.098 -219 V 0.080 -220 Y 0.061 -221 G 0.049 -222 V 0.046 -223 Y 0.052 -224 V 0.062 -225 A 0.066 -226 V 0.062 -227 L 0.055 -228 C 0.050 -229 F 0.051 -230 D 0.055 -231 L 0.059 -232 K 0.062 -233 I 0.066 -234 S 0.075 -235 E 0.086 -236 Y 0.092 -237 V 0.095 -238 M 0.101 -239 Q 0.117 -240 R 0.145 -241 F 0.180 -242 S 0.213 -243 P 0.229 -244 C 0.225 -245 C 0.214 -246 W 0.219 -247 C 0.255 -248 L 0.319 -249 K 0.398 -250 P 0.478 -251 R 0.545 -252 D 0.588 -253 R 0.609 -254 D 0.619 -255 S 0.622 -256 G 0.618 -257 E 0.606 -258 Q 0.593 -259 Q 0.590 -260 P 0.605 -261 L 0.625 -262 V 0.638 -263 G 0.634 -264 W 0.618 -265 S 0.603 -266 D 0.590 -267 D 0.566 -268 S 0.538 -269 S 0.525 -270 L 0.528 -271 R 0.523 -272 V 0.494 -273 Q 0.473 -274 R 0.494 -275 R 0.538 -276 S 0.569 -277 R 0.589 -278 N 0.616 -279 D 0.646 -280 S 0.669 -281 G 0.683 -282 I 0.686 -283 F 0.678 -284 Q 0.664 -285 D 0.643 -286 D 0.615 -287 S 0.581 -288 G 0.543 -289 Y 0.512 -290 S 0.495 -291 H 0.483 -292 L 0.458 -293 S 0.421 -294 L 0.391 -295 S 0.381 -296 L 0.396 -297 H 0.430 -298 G 0.472 -299 L 0.510 -300 N 0.541 -301 E 0.557 -302 I 0.554 -303 S 0.537 -304 D 0.519 -305 E 0.501 -306 H 0.477 -307 K 0.444 -308 S 0.404 -309 V 0.367 -310 F 0.338 -311 S 0.309 -312 M 0.272 -313 P 0.232 -314 D 0.198 -315 H 0.164 -316 D 0.126 -317 L 0.095 -318 K 0.080 -319 R 0.082 -320 I 0.092 -321 L 0.107 -322 W 0.118 -323 V 0.122 -324 L 0.126 -325 S 0.135 -326 L 0.136 -327 P 0.122 -328 V 0.104 -329 S 0.094 -330 T 0.092 -331 L 0.100 -332 L 0.115 -333 F 0.126 -334 V 0.129 -335 S 0.139 -336 V 0.158 -337 P 0.175 -338 D 0.180 -339 C 0.172 -340 R 0.157 -341 R 0.141 -342 P 0.130 -343 F 0.124 -344 W 0.115 -345 K 0.100 -346 N 0.082 -347 F 0.068 -348 Y 0.057 -349 M 0.053 -350 L 0.055 -351 T 0.061 -352 F 0.066 -353 L 0.070 -354 M 0.076 -355 S 0.082 -356 A 0.087 -357 V 0.092 -358 W 0.098 -359 I 0.094 -360 S 0.078 -361 A 0.063 -362 F 0.058 -363 T 0.060 -364 Y 0.061 -365 V 0.060 -366 L 0.059 -367 V 0.057 -368 W 0.052 -369 M 0.047 -370 V 0.045 -371 T 0.046 -372 I 0.052 -373 V 0.060 -374 G 0.069 -375 E 0.077 -376 T 0.093 -377 L 0.122 -378 G 0.151 -379 I 0.157 -380 P 0.136 -381 D 0.108 -382 T 0.092 -383 V 0.082 -384 M 0.070 -385 G 0.058 -386 M 0.051 -387 T 0.054 -388 L 0.063 -389 L 0.072 -390 A 0.080 -391 A 0.084 -392 G 0.084 -393 T 0.087 -394 S 0.095 -395 I 0.101 -396 P 0.100 -397 D 0.092 -398 T 0.079 -399 V 0.065 -400 A 0.056 -401 S 0.052 -402 V 0.050 -403 M 0.051 -404 V 0.057 -405 A 0.068 -406 R 0.079 -407 E 0.090 -408 G 0.099 -409 K 0.098 -410 S 0.091 -411 D 0.085 -412 M 0.086 -413 A 0.089 -414 M 0.090 -415 S 0.095 -416 N 0.106 -417 I 0.117 -418 V 0.122 -419 G 0.130 -420 S 0.139 -421 N 0.138 -422 V 0.121 -423 F 0.096 -424 D 0.075 -425 M 0.061 -426 L 0.053 -427 C 0.046 -428 L 0.041 -429 G 0.038 -430 L 0.036 -431 P 0.033 -432 W 0.030 -433 F 0.028 -434 I 0.028 -435 Q 0.030 -436 T 0.036 -437 V 0.049 -438 F 0.072 -439 V 0.102 -440 D 0.136 -441 V 0.169 -442 G 0.200 -443 S 0.219 -444 P 0.220 -445 V 0.206 -446 D 0.193 -447 V 0.189 -448 N 0.191 -449 S 0.188 -450 S 0.171 -451 G 0.136 -452 L 0.097 -453 V 0.069 -454 F 0.059 -455 M 0.060 -456 S 0.067 -457 C 0.073 -458 T 0.078 -459 L 0.081 -460 L 0.078 -461 L 0.072 -462 S 0.067 -463 I 0.062 -464 I 0.055 -465 F 0.049 -466 L 0.046 -467 F 0.042 -468 L 0.041 -469 A 0.043 -470 V 0.047 -471 H 0.054 -472 I 0.063 -473 N 0.075 -474 G 0.087 -475 W 0.096 -476 K 0.100 -477 L 0.094 -478 D 0.076 -479 W 0.058 -480 K 0.050 -481 L 0.052 -482 G 0.059 -483 L 0.068 -484 V 0.081 -485 C 0.095 -486 L 0.104 -487 A 0.102 -488 C 0.090 -489 Y 0.073 -490 I 0.059 -491 L 0.054 -492 F 0.060 -493 A 0.071 -494 T 0.078 -495 L 0.076 -496 S 0.070 -497 I 0.068 -498 L 0.072 -499 Y 0.085 -500 E 0.104 -501 L 0.128 -502 G 0.152 -503 I 0.172 -504 I 0.192 -505 G 0.219 -506 N 0.254 -507 N 0.280 -508 P 0.281 -509 I 0.263 -510 R 0.252 -511 S 0.267 -512 C 0.305 -513 S 0.349 -514 D 0.377 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000037318_ENSDART00000124539_GN:ddost_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000037318_ENSDART00000124539_GN:ddost_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 11246419b2b190df4d464fed7711d9976a444955..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000037318_ENSDART00000124539_GN:ddost_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,442 +0,0 @@ ->ENSDARG00000037318|ENSDART00000124539|GN:ddost|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.355 -2 A 0.360 -3 T 0.386 -4 A 0.433 -5 L 0.473 -6 S 0.488 -7 G 0.482 -8 G 0.455 -9 F 0.400 -10 S 0.334 -11 K 0.283 -12 N 0.253 -13 A 0.230 -14 L 0.206 -15 F 0.192 -16 I 0.194 -17 L 0.206 -18 S 0.228 -19 A 0.254 -20 A 0.272 -21 L 0.279 -22 M 0.284 -23 L 0.298 -24 Q 0.315 -25 A 0.324 -26 V 0.317 -27 L 0.290 -28 G 0.245 -29 D 0.188 -30 G 0.135 -31 K 0.098 -32 T 0.082 -33 L 0.079 -34 V 0.083 -35 L 0.087 -36 L 0.086 -37 D 0.085 -38 N 0.084 -39 P 0.082 -40 N 0.080 -41 I 0.075 -42 R 0.071 -43 D 0.071 -44 T 0.071 -45 H 0.065 -46 S 0.053 -47 I 0.045 -48 F 0.046 -49 F 0.055 -50 R 0.058 -51 S 0.052 -52 L 0.042 -53 A 0.040 -54 D 0.050 -55 R 0.070 -56 G 0.087 -57 F 0.087 -58 D 0.073 -59 L 0.055 -60 T 0.045 -61 F 0.046 -62 K 0.054 -63 T 0.067 -64 A 0.087 -65 D 0.112 -66 D 0.133 -67 P 0.139 -68 G 0.125 -69 L 0.102 -70 S 0.081 -71 L 0.069 -72 L 0.068 -73 K 0.076 -74 Y 0.086 -75 G 0.092 -76 Q 0.090 -77 F 0.081 -78 L 0.071 -79 Y 0.068 -80 D 0.069 -81 H 0.070 -82 L 0.070 -83 I 0.075 -84 L 0.085 -85 F 0.096 -86 S 0.103 -87 P 0.107 -88 S 0.109 -89 V 0.110 -90 E 0.111 -91 D 0.112 -92 F 0.118 -93 G 0.127 -94 G 0.131 -95 N 0.126 -96 I 0.111 -97 N 0.091 -98 V 0.070 -99 E 0.054 -100 T 0.046 -101 I 0.046 -102 T 0.047 -103 A 0.047 -104 F 0.048 -105 I 0.054 -106 D 0.063 -107 G 0.073 -108 G 0.081 -109 G 0.087 -110 N 0.099 -111 V 0.119 -112 L 0.139 -113 V 0.151 -114 A 0.156 -115 A 0.153 -116 S 0.145 -117 S 0.136 -118 D 0.128 -119 I 0.122 -120 G 0.116 -121 D 0.109 -122 P 0.098 -123 L 0.083 -124 R 0.070 -125 E 0.065 -126 L 0.066 -127 G 0.070 -128 S 0.076 -129 E 0.083 -130 C 0.094 -131 G 0.109 -132 I 0.124 -133 E 0.131 -134 F 0.130 -135 D 0.128 -136 E 0.126 -137 E 0.119 -138 K 0.112 -139 T 0.112 -140 A 0.117 -141 V 0.118 -142 I 0.112 -143 D 0.102 -144 H 0.092 -145 H 0.082 -146 N 0.076 -147 Y 0.076 -148 D 0.083 -149 I 0.095 -150 S 0.115 -151 D 0.143 -152 P 0.168 -153 G 0.177 -154 E 0.169 -155 H 0.149 -156 T 0.125 -157 L 0.103 -158 I 0.091 -159 V 0.093 -160 A 0.105 -161 D 0.115 -162 P 0.114 -163 E 0.105 -164 N 0.096 -165 L 0.094 -166 L 0.100 -167 K 0.109 -168 A 0.114 -169 P 0.111 -170 T 0.105 -171 I 0.102 -172 V 0.106 -173 G 0.118 -174 K 0.129 -175 P 0.135 -176 T 0.137 -177 D 0.141 -178 K 0.142 -179 P 0.135 -180 V 0.119 -181 L 0.103 -182 F 0.098 -183 K 0.106 -184 G 0.120 -185 V 0.131 -186 G 0.136 -187 M 0.138 -188 V 0.141 -189 A 0.145 -190 D 0.152 -191 P 0.165 -192 D 0.179 -193 N 0.180 -194 P 0.161 -195 L 0.137 -196 V 0.124 -197 L 0.122 -198 D 0.121 -199 I 0.117 -200 L 0.122 -201 T 0.143 -202 G 0.173 -203 S 0.188 -204 S 0.183 -205 T 0.166 -206 S 0.149 -207 Y 0.131 -208 S 0.112 -209 Y 0.102 -210 F 0.109 -211 P 0.127 -212 D 0.143 -213 R 0.149 -214 P 0.147 -215 I 0.140 -216 T 0.134 -217 Q 0.132 -218 Y 0.133 -219 P 0.132 -220 H 0.131 -221 A 0.134 -222 V 0.138 -223 G 0.140 -224 K 0.134 -225 N 0.119 -226 T 0.107 -227 L 0.106 -228 L 0.115 -229 I 0.125 -230 A 0.133 -231 G 0.143 -232 L 0.158 -233 Q 0.174 -234 A 0.186 -235 R 0.186 -236 N 0.175 -237 N 0.161 -238 A 0.155 -239 R 0.162 -240 V 0.177 -241 V 0.193 -242 F 0.206 -243 S 0.214 -244 G 0.209 -245 S 0.193 -246 L 0.174 -247 H 0.155 -248 F 0.132 -249 F 0.108 -250 S 0.093 -251 D 0.090 -252 A 0.096 -253 F 0.104 -254 F 0.113 -255 N 0.127 -256 S 0.142 -257 A 0.149 -258 V 0.149 -259 Q 0.148 -260 K 0.155 -261 A 0.170 -262 A 0.184 -263 T 0.195 -264 G 0.203 -265 S 0.207 -266 K 0.202 -267 R 0.190 -268 Y 0.176 -269 E 0.162 -270 Q 0.145 -271 T 0.124 -272 G 0.108 -273 N 0.100 -274 Q 0.096 -275 D 0.093 -276 L 0.090 -277 A 0.087 -278 E 0.083 -279 A 0.081 -280 L 0.081 -281 S 0.075 -282 R 0.062 -283 W 0.050 -284 V 0.045 -285 F 0.048 -286 K 0.060 -287 E 0.073 -288 A 0.082 -289 G 0.086 -290 V 0.086 -291 L 0.084 -292 R 0.082 -293 V 0.083 -294 G 0.083 -295 D 0.077 -296 V 0.066 -297 T 0.061 -298 H 0.068 -299 H 0.086 -300 P 0.108 -301 V 0.123 -302 G 0.124 -303 E 0.120 -304 S 0.122 -305 T 0.132 -306 P 0.140 -307 P 0.141 -308 A 0.132 -309 A 0.118 -310 Y 0.102 -311 T 0.090 -312 V 0.087 -313 T 0.091 -314 D 0.090 -315 L 0.079 -316 V 0.062 -317 E 0.049 -318 Y 0.044 -319 G 0.046 -320 I 0.051 -321 V 0.056 -322 I 0.061 -323 E 0.065 -324 M 0.071 -325 L 0.082 -326 S 0.102 -327 G 0.121 -328 G 0.128 -329 K 0.120 -330 W 0.103 -331 V 0.089 -332 P 0.081 -333 F 0.081 -334 D 0.091 -335 G 0.109 -336 D 0.123 -337 D 0.119 -338 I 0.101 -339 Q 0.085 -340 L 0.081 -341 E 0.087 -342 F 0.093 -343 V 0.096 -344 R 0.099 -345 I 0.107 -346 D 0.115 -347 P 0.117 -348 F 0.111 -349 V 0.103 -350 R 0.098 -351 T 0.095 -352 Y 0.092 -353 L 0.090 -354 K 0.087 -355 K 0.086 -356 N 0.087 -357 G 0.086 -358 G 0.077 -359 K 0.061 -360 Y 0.045 -361 S 0.037 -362 V 0.040 -363 Q 0.053 -364 F 0.076 -365 K 0.107 -366 L 0.135 -367 P 0.152 -368 D 0.157 -369 V 0.159 -370 Y 0.158 -371 G 0.152 -372 V 0.137 -373 F 0.118 -374 Q 0.101 -375 F 0.092 -376 K 0.093 -377 V 0.098 -378 D 0.100 -379 Y 0.102 -380 N 0.104 -381 R 0.108 -382 L 0.112 -383 G 0.114 -384 Y 0.116 -385 T 0.116 -386 H 0.117 -387 L 0.117 -388 Y 0.115 -389 S 0.114 -390 S 0.113 -391 T 0.112 -392 Q 0.108 -393 V 0.108 -394 S 0.118 -395 V 0.140 -396 R 0.170 -397 P 0.202 -398 L 0.229 -399 Q 0.249 -400 H 0.262 -401 T 0.268 -402 Q 0.278 -403 Y 0.297 -404 E 0.321 -405 R 0.337 -406 F 0.340 -407 I 0.331 -408 P 0.305 -409 S 0.267 -410 A 0.233 -411 F 0.209 -412 P 0.197 -413 Y 0.199 -414 Y 0.213 -415 A 0.233 -416 S 0.247 -417 A 0.256 -418 F 0.270 -419 S 0.282 -420 M 0.285 -421 M 0.281 -422 A 0.269 -423 G 0.243 -424 L 0.208 -425 F 0.179 -426 V 0.159 -427 F 0.141 -428 S 0.127 -429 V 0.127 -430 V 0.142 -431 F 0.161 -432 L 0.183 -433 H 0.217 -434 M 0.266 -435 R 0.326 -436 E 0.391 -437 K 0.451 -438 E 0.493 -439 K 0.508 -440 S 0.497 -441 D 0.480 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000037318_ENSDART00000124539_GN:ddost_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:25.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000037318_ENSDART00000124539_GN:ddost_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:25.caid deleted file mode 100644 index 61fea63e832710268544ca004fb01cfc58b875f6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000037318_ENSDART00000124539_GN:ddost_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:25.caid +++ /dev/null @@ -1,467 +0,0 @@ ->ENSDARG00000037318|ENSDART00000124539|GN:ddost|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:25 -1 M 0.354 -2 A 0.378 -3 T 0.419 -4 D 0.446 -5 C 0.427 -6 L 0.384 -7 S 0.373 -8 V 0.394 -9 R 0.401 -10 E 0.398 -11 T 0.416 -12 A 0.455 -13 T 0.499 -14 P 0.542 -15 A 0.573 -16 T 0.582 -17 L 0.572 -18 T 0.545 -19 C 0.496 -20 K 0.433 -21 R 0.391 -22 R 0.387 -23 R 0.404 -24 T 0.441 -25 T 0.497 -26 M 0.533 -27 A 0.525 -28 T 0.505 -29 A 0.514 -30 L 0.542 -31 S 0.560 -32 G 0.552 -33 G 0.514 -34 F 0.447 -35 S 0.368 -36 K 0.304 -37 N 0.262 -38 A 0.233 -39 L 0.210 -40 F 0.200 -41 I 0.205 -42 L 0.222 -43 S 0.246 -44 A 0.272 -45 A 0.287 -46 L 0.290 -47 M 0.291 -48 L 0.298 -49 Q 0.308 -50 A 0.313 -51 V 0.305 -52 L 0.281 -53 G 0.239 -54 D 0.185 -55 G 0.133 -56 K 0.097 -57 T 0.081 -58 L 0.078 -59 V 0.082 -60 L 0.086 -61 L 0.084 -62 D 0.081 -63 N 0.079 -64 P 0.077 -65 N 0.075 -66 I 0.071 -67 R 0.068 -68 D 0.068 -69 T 0.069 -70 H 0.063 -71 S 0.051 -72 I 0.043 -73 F 0.042 -74 F 0.047 -75 R 0.049 -76 S 0.044 -77 L 0.037 -78 A 0.036 -79 D 0.046 -80 R 0.066 -81 G 0.082 -82 F 0.083 -83 D 0.069 -84 L 0.052 -85 T 0.042 -86 F 0.043 -87 K 0.050 -88 T 0.063 -89 A 0.082 -90 D 0.106 -91 D 0.127 -92 P 0.132 -93 G 0.119 -94 L 0.096 -95 S 0.077 -96 L 0.066 -97 L 0.065 -98 K 0.073 -99 Y 0.082 -100 G 0.088 -101 Q 0.086 -102 F 0.078 -103 L 0.068 -104 Y 0.066 -105 D 0.068 -106 H 0.069 -107 L 0.070 -108 I 0.075 -109 L 0.085 -110 F 0.095 -111 S 0.102 -112 P 0.105 -113 S 0.107 -114 V 0.110 -115 E 0.111 -116 D 0.113 -117 F 0.118 -118 G 0.127 -119 G 0.131 -120 N 0.127 -121 I 0.113 -122 N 0.093 -123 V 0.072 -124 E 0.056 -125 T 0.047 -126 I 0.046 -127 T 0.046 -128 A 0.045 -129 F 0.047 -130 I 0.053 -131 D 0.064 -132 G 0.074 -133 G 0.082 -134 G 0.088 -135 N 0.101 -136 V 0.121 -137 L 0.140 -138 V 0.153 -139 A 0.156 -140 A 0.153 -141 S 0.146 -142 S 0.138 -143 D 0.133 -144 I 0.129 -145 G 0.123 -146 D 0.115 -147 P 0.103 -148 L 0.086 -149 R 0.072 -150 E 0.066 -151 L 0.067 -152 G 0.071 -153 S 0.076 -154 E 0.083 -155 C 0.094 -156 G 0.109 -157 I 0.124 -158 E 0.131 -159 F 0.131 -160 D 0.130 -161 E 0.128 -162 E 0.121 -163 K 0.113 -164 T 0.112 -165 A 0.117 -166 V 0.118 -167 I 0.112 -168 D 0.102 -169 H 0.091 -170 H 0.082 -171 N 0.075 -172 Y 0.075 -173 D 0.082 -174 I 0.095 -175 S 0.115 -176 D 0.143 -177 P 0.168 -178 G 0.177 -179 E 0.168 -180 H 0.148 -181 T 0.124 -182 L 0.102 -183 I 0.090 -184 V 0.093 -185 A 0.105 -186 D 0.114 -187 P 0.114 -188 E 0.105 -189 N 0.096 -190 L 0.093 -191 L 0.099 -192 K 0.109 -193 A 0.114 -194 P 0.112 -195 T 0.106 -196 I 0.103 -197 V 0.106 -198 G 0.117 -199 K 0.128 -200 P 0.133 -201 T 0.135 -202 D 0.139 -203 K 0.142 -204 P 0.134 -205 V 0.119 -206 L 0.104 -207 F 0.099 -208 K 0.107 -209 G 0.121 -210 V 0.133 -211 G 0.139 -212 M 0.140 -213 V 0.143 -214 A 0.147 -215 D 0.153 -216 P 0.165 -217 D 0.179 -218 N 0.181 -219 P 0.162 -220 L 0.138 -221 V 0.124 -222 L 0.122 -223 D 0.120 -224 I 0.116 -225 L 0.121 -226 T 0.143 -227 G 0.173 -228 S 0.188 -229 S 0.182 -230 T 0.166 -231 S 0.149 -232 Y 0.130 -233 S 0.111 -234 Y 0.101 -235 F 0.107 -236 P 0.125 -237 D 0.141 -238 R 0.147 -239 P 0.146 -240 I 0.140 -241 T 0.135 -242 Q 0.134 -243 Y 0.135 -244 P 0.135 -245 H 0.133 -246 A 0.136 -247 V 0.140 -248 G 0.142 -249 K 0.135 -250 N 0.121 -251 T 0.108 -252 L 0.107 -253 L 0.117 -254 I 0.127 -255 A 0.134 -256 G 0.144 -257 L 0.159 -258 Q 0.176 -259 A 0.188 -260 R 0.188 -261 N 0.177 -262 N 0.163 -263 A 0.157 -264 R 0.164 -265 V 0.179 -266 V 0.195 -267 F 0.208 -268 S 0.216 -269 G 0.211 -270 S 0.195 -271 L 0.176 -272 H 0.157 -273 F 0.133 -274 F 0.110 -275 S 0.094 -276 D 0.090 -277 A 0.096 -278 F 0.105 -279 F 0.114 -280 N 0.129 -281 S 0.144 -282 A 0.152 -283 V 0.151 -284 Q 0.150 -285 K 0.156 -286 A 0.170 -287 A 0.185 -288 T 0.196 -289 G 0.204 -290 S 0.209 -291 K 0.204 -292 R 0.192 -293 Y 0.179 -294 E 0.166 -295 Q 0.148 -296 T 0.127 -297 G 0.111 -298 N 0.102 -299 Q 0.098 -300 D 0.094 -301 L 0.091 -302 A 0.088 -303 E 0.084 -304 A 0.082 -305 L 0.082 -306 S 0.076 -307 R 0.063 -308 W 0.051 -309 V 0.045 -310 F 0.049 -311 K 0.061 -312 E 0.075 -313 A 0.084 -314 G 0.088 -315 V 0.088 -316 L 0.086 -317 R 0.084 -318 V 0.085 -319 G 0.085 -320 D 0.079 -321 V 0.068 -322 T 0.062 -323 H 0.069 -324 H 0.087 -325 P 0.110 -326 V 0.124 -327 G 0.125 -328 E 0.121 -329 S 0.123 -330 T 0.133 -331 P 0.143 -332 P 0.143 -333 A 0.135 -334 A 0.120 -335 Y 0.104 -336 T 0.091 -337 V 0.089 -338 T 0.093 -339 D 0.092 -340 L 0.081 -341 V 0.064 -342 E 0.050 -343 Y 0.045 -344 G 0.047 -345 I 0.052 -346 V 0.057 -347 I 0.062 -348 E 0.066 -349 M 0.072 -350 L 0.083 -351 S 0.103 -352 G 0.121 -353 G 0.126 -354 K 0.118 -355 W 0.102 -356 V 0.088 -357 P 0.081 -358 F 0.082 -359 D 0.092 -360 G 0.110 -361 D 0.123 -362 D 0.119 -363 I 0.101 -364 Q 0.086 -365 L 0.082 -366 E 0.087 -367 F 0.093 -368 V 0.097 -369 R 0.100 -370 I 0.108 -371 D 0.116 -372 P 0.118 -373 F 0.111 -374 V 0.103 -375 R 0.099 -376 T 0.096 -377 Y 0.093 -378 L 0.090 -379 K 0.088 -380 K 0.086 -381 N 0.087 -382 G 0.087 -383 G 0.078 -384 K 0.061 -385 Y 0.045 -386 S 0.037 -387 V 0.040 -388 Q 0.053 -389 F 0.077 -390 K 0.108 -391 L 0.137 -392 P 0.155 -393 D 0.160 -394 V 0.162 -395 Y 0.161 -396 G 0.154 -397 V 0.139 -398 F 0.120 -399 Q 0.102 -400 F 0.093 -401 K 0.094 -402 V 0.098 -403 D 0.101 -404 Y 0.102 -405 N 0.105 -406 R 0.109 -407 L 0.114 -408 G 0.117 -409 Y 0.118 -410 T 0.119 -411 H 0.120 -412 L 0.119 -413 Y 0.117 -414 S 0.115 -415 S 0.115 -416 T 0.113 -417 Q 0.109 -418 V 0.110 -419 S 0.121 -420 V 0.143 -421 R 0.173 -422 P 0.205 -423 L 0.232 -424 Q 0.252 -425 H 0.264 -426 T 0.271 -427 Q 0.281 -428 Y 0.301 -429 E 0.325 -430 R 0.340 -431 F 0.342 -432 I 0.332 -433 P 0.306 -434 S 0.269 -435 A 0.234 -436 F 0.210 -437 P 0.199 -438 Y 0.200 -439 Y 0.216 -440 A 0.237 -441 S 0.251 -442 A 0.261 -443 F 0.275 -444 S 0.288 -445 M 0.292 -446 M 0.288 -447 A 0.276 -448 G 0.248 -449 L 0.212 -450 F 0.183 -451 V 0.163 -452 F 0.144 -453 S 0.129 -454 V 0.129 -455 V 0.142 -456 F 0.160 -457 L 0.182 -458 H 0.216 -459 M 0.266 -460 R 0.327 -461 E 0.395 -462 K 0.458 -463 E 0.503 -464 K 0.520 -465 S 0.511 -466 D 0.495 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000040008_ENSDART00000058530_GN:neurod6a_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000040008_ENSDART00000058530_GN:neurod6a_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 3fd48cddfaf998621425deb5b9c1cd77518ac14c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000040008_ENSDART00000058530_GN:neurod6a_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,328 +0,0 @@ ->ENSDARG00000040008|ENSDART00000058530|GN:neurod6a|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.475 -2 L 0.512 -3 T 0.563 -4 L 0.605 -5 P 0.628 -6 F 0.637 -7 E 0.649 -8 D 0.672 -9 P 0.700 -10 V 0.723 -11 I 0.739 -12 M 0.750 -13 D 0.754 -14 T 0.753 -15 Q 0.748 -16 F 0.747 -17 G 0.744 -18 A 0.733 -19 N 0.717 -20 F 0.709 -21 P 0.721 -22 R 0.746 -23 D 0.771 -24 C 0.787 -25 V 0.799 -26 G 0.810 -27 D 0.818 -28 L 0.820 -29 K 0.819 -30 G 0.816 -31 N 0.808 -32 K 0.794 -33 Q 0.782 -34 E 0.777 -35 P 0.778 -36 F 0.782 -37 E 0.790 -38 K 0.797 -39 E 0.800 -40 E 0.796 -41 T 0.786 -42 L 0.772 -43 S 0.759 -44 H 0.755 -45 V 0.760 -46 M 0.771 -47 D 0.779 -48 D 0.781 -49 D 0.776 -50 D 0.769 -51 S 0.767 -52 E 0.773 -53 K 0.781 -54 D 0.785 -55 E 0.783 -56 D 0.781 -57 E 0.783 -58 R 0.793 -59 E 0.806 -60 D 0.816 -61 G 0.816 -62 Q 0.809 -63 D 0.800 -64 E 0.790 -65 N 0.780 -66 G 0.771 -67 L 0.766 -68 P 0.766 -69 R 0.768 -70 R 0.763 -71 R 0.751 -72 G 0.738 -73 P 0.728 -74 R 0.718 -75 K 0.703 -76 K 0.672 -77 K 0.617 -78 M 0.545 -79 T 0.475 -80 K 0.417 -81 A 0.368 -82 R 0.326 -83 V 0.295 -84 D 0.282 -85 R 0.276 -86 V 0.262 -87 K 0.242 -88 V 0.232 -89 R 0.242 -90 R 0.256 -91 M 0.260 -92 E 0.251 -93 A 0.243 -94 N 0.244 -95 A 0.254 -96 R 0.265 -97 E 0.273 -98 R 0.277 -99 N 0.279 -100 R 0.279 -101 M 0.279 -102 H 0.284 -103 G 0.290 -104 L 0.276 -105 N 0.241 -106 N 0.201 -107 A 0.171 -108 L 0.148 -109 D 0.134 -110 S 0.129 -111 L 0.126 -112 R 0.122 -113 K 0.119 -114 V 0.116 -115 V 0.109 -116 P 0.107 -117 C 0.120 -118 Y 0.141 -119 S 0.159 -120 K 0.167 -121 T 0.171 -122 Q 0.177 -123 K 0.177 -124 L 0.162 -125 S 0.132 -126 K 0.103 -127 I 0.091 -128 E 0.096 -129 T 0.106 -130 L 0.113 -131 R 0.121 -132 L 0.133 -133 A 0.132 -134 K 0.107 -135 N 0.074 -136 Y 0.053 -137 I 0.044 -138 W 0.039 -139 A 0.039 -140 L 0.041 -141 S 0.044 -142 E 0.046 -143 I 0.049 -144 L 0.058 -145 S 0.074 -146 T 0.091 -147 G 0.102 -148 K 0.107 -149 R 0.103 -150 P 0.090 -151 D 0.074 -152 L 0.062 -153 L 0.053 -154 T 0.045 -155 F 0.039 -156 V 0.036 -157 Q 0.036 -158 T 0.039 -159 L 0.048 -160 C 0.065 -161 K 0.089 -162 G 0.112 -163 L 0.121 -164 S 0.116 -165 Q 0.104 -166 P 0.091 -167 T 0.079 -168 T 0.071 -169 N 0.073 -170 L 0.082 -171 V 0.093 -172 A 0.103 -173 G 0.114 -174 C 0.123 -175 L 0.129 -176 Q 0.132 -177 L 0.138 -178 N 0.152 -179 A 0.178 -180 R 0.212 -181 N 0.254 -182 F 0.319 -183 I 0.414 -184 P 0.526 -185 D 0.623 -186 Q 0.685 -187 I 0.718 -188 S 0.739 -189 G 0.758 -190 E 0.768 -191 A 0.767 -192 S 0.756 -193 F 0.745 -194 S 0.731 -195 G 0.707 -196 R 0.673 -197 S 0.642 -198 P 0.631 -199 Y 0.647 -200 E 0.674 -201 S 0.677 -202 V 0.634 -203 Y 0.572 -204 S 0.552 -205 T 0.597 -206 Y 0.663 -207 H 0.712 -208 S 0.747 -209 P 0.782 -210 S 0.813 -211 V 0.830 -212 V 0.831 -213 T 0.826 -214 P 0.822 -215 S 0.823 -216 G 0.828 -217 P 0.836 -218 S 0.843 -219 V 0.846 -220 D 0.842 -221 A 0.830 -222 V 0.816 -223 K 0.808 -224 P 0.813 -225 F 0.824 -226 R 0.829 -227 S 0.822 -228 F 0.810 -229 N 0.799 -230 Y 0.792 -231 C 0.791 -232 S 0.792 -233 S 0.792 -234 Y 0.789 -235 E 0.784 -236 S 0.777 -237 F 0.772 -238 Y 0.774 -239 E 0.782 -240 S 0.783 -241 V 0.776 -242 S 0.775 -243 P 0.788 -244 E 0.808 -245 C 0.819 -246 G 0.819 -247 S 0.814 -248 P 0.812 -249 Q 0.812 -250 F 0.809 -251 E 0.803 -252 G 0.796 -253 P 0.787 -254 L 0.771 -255 S 0.755 -256 P 0.748 -257 P 0.750 -258 I 0.749 -259 N 0.746 -260 F 0.753 -261 N 0.770 -262 G 0.785 -263 I 0.792 -264 F 0.797 -265 S 0.802 -266 L 0.801 -267 K 0.793 -268 H 0.782 -269 E 0.775 -270 E 0.778 -271 P 0.790 -272 V 0.805 -273 E 0.817 -274 Y 0.824 -275 G 0.827 -276 K 0.822 -277 S 0.808 -278 C 0.793 -279 H 0.788 -280 Y 0.795 -281 G 0.809 -282 T 0.819 -283 R 0.820 -284 Y 0.813 -285 C 0.801 -286 A 0.788 -287 V 0.780 -288 P 0.787 -289 P 0.811 -290 R 0.839 -291 A 0.861 -292 S 0.870 -293 I 0.869 -294 G 0.864 -295 Q 0.862 -296 S 0.861 -297 A 0.860 -298 R 0.859 -299 G 0.855 -300 S 0.846 -301 S 0.828 -302 D 0.802 -303 L 0.773 -304 H 0.750 -305 F 0.742 -306 P 0.751 -307 Y 0.769 -308 D 0.780 -309 I 0.777 -310 H 0.770 -311 L 0.769 -312 R 0.771 -313 G 0.763 -314 Q 0.745 -315 F 0.728 -316 Y 0.730 -317 P 0.752 -318 V 0.779 -319 Q 0.794 -320 D 0.797 -321 E 0.790 -322 L 0.780 -323 N 0.766 -324 T 0.743 -325 F 0.693 -326 H 0.617 -327 N 0.552 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000040008_ENSDART00000058530_GN:neurod6a_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:64.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000040008_ENSDART00000058530_GN:neurod6a_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:64.caid deleted file mode 100644 index 6c5023f2c5cc88d7f35e7b9cd1ccdd727dc4b70a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000040008_ENSDART00000058530_GN:neurod6a_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:64.caid +++ /dev/null @@ -1,392 +0,0 @@ ->ENSDARG00000040008|ENSDART00000058530|GN:neurod6a|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:64 -1 M 0.442 -2 A 0.481 -3 W 0.544 -4 V 0.613 -5 P 0.666 -6 A 0.694 -7 L 0.709 -8 A 0.725 -9 V 0.741 -10 G 0.750 -11 I 0.757 -12 S 0.763 -13 V 0.760 -14 I 0.747 -15 S 0.737 -16 L 0.741 -17 S 0.753 -18 A 0.760 -19 R 0.763 -20 Q 0.769 -21 G 0.777 -22 E 0.781 -23 Q 0.780 -24 W 0.779 -25 G 0.779 -26 G 0.775 -27 E 0.762 -28 K 0.741 -29 T 0.721 -30 A 0.704 -31 R 0.684 -32 A 0.645 -33 V 0.591 -34 H 0.568 -35 L 0.601 -36 L 0.656 -37 K 0.693 -38 H 0.712 -39 H 0.728 -40 A 0.746 -41 G 0.764 -42 K 0.778 -43 K 0.789 -44 K 0.796 -45 V 0.801 -46 Q 0.801 -47 N 0.796 -48 R 0.788 -49 K 0.782 -50 Y 0.784 -51 E 0.792 -52 N 0.798 -53 C 0.799 -54 H 0.799 -55 L 0.802 -56 T 0.811 -57 P 0.825 -58 S 0.839 -59 Y 0.849 -60 S 0.855 -61 S 0.862 -62 K 0.869 -63 S 0.874 -64 T 0.875 -65 M 0.869 -66 L 0.859 -67 T 0.846 -68 L 0.833 -69 P 0.822 -70 F 0.817 -71 E 0.818 -72 D 0.829 -73 P 0.844 -74 V 0.858 -75 I 0.864 -76 M 0.864 -77 D 0.860 -78 T 0.856 -79 Q 0.851 -80 F 0.849 -81 G 0.845 -82 A 0.835 -83 N 0.820 -84 F 0.811 -85 P 0.818 -86 R 0.836 -87 D 0.855 -88 C 0.866 -89 V 0.869 -90 G 0.870 -91 D 0.870 -92 L 0.867 -93 K 0.863 -94 G 0.858 -95 N 0.849 -96 K 0.836 -97 Q 0.824 -98 E 0.817 -99 P 0.814 -100 F 0.816 -101 E 0.822 -102 K 0.825 -103 E 0.823 -104 E 0.817 -105 T 0.808 -106 L 0.798 -107 S 0.792 -108 H 0.792 -109 V 0.794 -110 M 0.797 -111 D 0.798 -112 D 0.793 -113 D 0.783 -114 D 0.772 -115 S 0.767 -116 E 0.770 -117 K 0.776 -118 D 0.779 -119 E 0.776 -120 D 0.772 -121 E 0.772 -122 R 0.781 -123 E 0.796 -124 D 0.807 -125 G 0.809 -126 Q 0.801 -127 D 0.790 -128 E 0.777 -129 N 0.765 -130 G 0.757 -131 L 0.753 -132 P 0.755 -133 R 0.758 -134 R 0.753 -135 R 0.742 -136 G 0.729 -137 P 0.720 -138 R 0.713 -139 K 0.701 -140 K 0.674 -141 K 0.626 -142 M 0.559 -143 T 0.485 -144 K 0.415 -145 A 0.354 -146 R 0.304 -147 V 0.266 -148 D 0.246 -149 R 0.237 -150 V 0.226 -151 K 0.210 -152 V 0.200 -153 R 0.205 -154 R 0.216 -155 M 0.220 -156 E 0.214 -157 A 0.209 -158 N 0.213 -159 A 0.225 -160 R 0.239 -161 E 0.249 -162 R 0.252 -163 N 0.255 -164 R 0.257 -165 M 0.260 -166 H 0.268 -167 G 0.276 -168 L 0.265 -169 N 0.233 -170 N 0.198 -171 A 0.169 -172 L 0.148 -173 D 0.135 -174 S 0.129 -175 L 0.124 -176 R 0.119 -177 K 0.119 -178 V 0.117 -179 V 0.110 -180 P 0.108 -181 C 0.119 -182 Y 0.138 -183 S 0.154 -184 K 0.162 -185 T 0.169 -186 Q 0.180 -187 K 0.185 -188 L 0.169 -189 S 0.136 -190 K 0.103 -191 I 0.088 -192 E 0.093 -193 T 0.103 -194 L 0.110 -195 R 0.118 -196 L 0.129 -197 A 0.127 -198 K 0.102 -199 N 0.070 -200 Y 0.049 -201 I 0.040 -202 W 0.036 -203 A 0.035 -204 L 0.038 -205 S 0.039 -206 E 0.040 -207 I 0.042 -208 L 0.049 -209 S 0.062 -210 T 0.077 -211 G 0.087 -212 K 0.091 -213 R 0.087 -214 P 0.076 -215 D 0.063 -216 L 0.053 -217 L 0.047 -218 T 0.041 -219 F 0.036 -220 V 0.034 -221 Q 0.034 -222 T 0.035 -223 L 0.041 -224 C 0.056 -225 K 0.078 -226 G 0.099 -227 L 0.108 -228 S 0.102 -229 Q 0.091 -230 P 0.080 -231 T 0.069 -232 T 0.063 -233 N 0.065 -234 L 0.073 -235 V 0.082 -236 A 0.091 -237 G 0.099 -238 C 0.105 -239 L 0.108 -240 Q 0.109 -241 L 0.114 -242 N 0.129 -243 A 0.155 -244 R 0.190 -245 N 0.234 -246 F 0.301 -247 I 0.397 -248 P 0.505 -249 D 0.598 -250 Q 0.661 -251 I 0.697 -252 S 0.724 -253 G 0.746 -254 E 0.759 -255 A 0.758 -256 S 0.749 -257 F 0.738 -258 S 0.723 -259 G 0.699 -260 R 0.665 -261 S 0.637 -262 P 0.627 -263 Y 0.642 -264 E 0.668 -265 S 0.671 -266 V 0.629 -267 Y 0.568 -268 S 0.549 -269 T 0.594 -270 Y 0.660 -271 H 0.709 -272 S 0.747 -273 P 0.783 -274 S 0.814 -275 V 0.832 -276 V 0.834 -277 T 0.830 -278 P 0.827 -279 S 0.828 -280 G 0.834 -281 P 0.843 -282 S 0.850 -283 V 0.852 -284 D 0.847 -285 A 0.835 -286 V 0.820 -287 K 0.812 -288 P 0.816 -289 F 0.827 -290 R 0.834 -291 S 0.829 -292 F 0.818 -293 N 0.809 -294 Y 0.805 -295 C 0.806 -296 S 0.808 -297 S 0.807 -298 Y 0.804 -299 E 0.800 -300 S 0.796 -301 F 0.792 -302 Y 0.796 -303 E 0.804 -304 S 0.808 -305 V 0.802 -306 S 0.800 -307 P 0.812 -308 E 0.830 -309 C 0.841 -310 G 0.840 -311 S 0.834 -312 P 0.831 -313 Q 0.830 -314 F 0.827 -315 E 0.822 -316 G 0.815 -317 P 0.805 -318 L 0.789 -319 S 0.773 -320 P 0.766 -321 P 0.768 -322 I 0.768 -323 N 0.766 -324 F 0.772 -325 N 0.789 -326 G 0.803 -327 I 0.810 -328 F 0.815 -329 S 0.820 -330 L 0.821 -331 K 0.814 -332 H 0.804 -333 E 0.799 -334 E 0.802 -335 P 0.813 -336 V 0.826 -337 E 0.836 -338 Y 0.843 -339 G 0.847 -340 K 0.843 -341 S 0.831 -342 C 0.817 -343 H 0.811 -344 Y 0.816 -345 G 0.828 -346 T 0.837 -347 R 0.837 -348 Y 0.828 -349 C 0.816 -350 A 0.805 -351 V 0.799 -352 P 0.805 -353 P 0.826 -354 R 0.853 -355 A 0.873 -356 S 0.882 -357 I 0.881 -358 G 0.877 -359 Q 0.874 -360 S 0.871 -361 A 0.869 -362 R 0.866 -363 G 0.863 -364 S 0.854 -365 S 0.837 -366 D 0.812 -367 L 0.784 -368 H 0.764 -369 F 0.757 -370 P 0.767 -371 Y 0.783 -372 D 0.793 -373 I 0.790 -374 H 0.783 -375 L 0.781 -376 R 0.782 -377 G 0.773 -378 Q 0.752 -379 F 0.734 -380 Y 0.735 -381 P 0.757 -382 V 0.783 -383 Q 0.799 -384 D 0.801 -385 E 0.796 -386 L 0.787 -387 N 0.773 -388 T 0.749 -389 F 0.699 -390 H 0.621 -391 N 0.555 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000041503_ENSDART00000060840_GN:med4_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000041503_ENSDART00000060840_GN:med4_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index a27fa9b51e6a8b1857f2200291439d2068652883..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000041503_ENSDART00000060840_GN:med4_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,255 +0,0 @@ ->ENSDARG00000041503|ENSDART00000060840|GN:med4|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.479 -2 A 0.517 -3 A 0.564 -4 A 0.591 -5 A 0.586 -6 A 0.543 -7 D 0.456 -8 K 0.338 -9 S 0.225 -10 T 0.149 -11 K 0.115 -12 E 0.105 -13 R 0.096 -14 L 0.083 -15 L 0.073 -16 S 0.067 -17 T 0.064 -18 L 0.067 -19 D 0.075 -20 D 0.077 -21 L 0.070 -22 E 0.062 -23 V 0.059 -24 L 0.057 -25 S 0.056 -26 R 0.055 -27 E 0.052 -28 L 0.050 -29 I 0.052 -30 E 0.057 -31 M 0.062 -32 L 0.068 -33 A 0.081 -34 L 0.103 -35 S 0.132 -36 R 0.162 -37 S 0.187 -38 Q 0.209 -39 K 0.235 -40 L 0.260 -41 P 0.272 -42 P 0.264 -43 P 0.241 -44 G 0.209 -45 E 0.173 -46 D 0.140 -47 T 0.112 -48 L 0.094 -49 I 0.086 -50 L 0.087 -51 E 0.088 -52 L 0.085 -53 L 0.081 -54 I 0.077 -55 Q 0.076 -56 R 0.080 -57 D 0.090 -58 K 0.096 -59 E 0.096 -60 F 0.097 -61 Q 0.103 -62 E 0.102 -63 L 0.097 -64 M 0.096 -65 Q 0.099 -66 T 0.104 -67 A 0.116 -68 L 0.135 -69 E 0.150 -70 Q 0.153 -71 G 0.146 -72 R 0.134 -73 V 0.126 -74 H 0.134 -75 Q 0.154 -76 E 0.169 -77 M 0.170 -78 Q 0.167 -79 S 0.172 -80 L 0.188 -81 E 0.211 -82 K 0.238 -83 E 0.259 -84 V 0.267 -85 E 0.263 -86 K 0.252 -87 R 0.244 -88 D 0.251 -89 S 0.270 -90 D 0.286 -91 I 0.286 -92 Q 0.277 -93 Q 0.266 -94 L 0.253 -95 Q 0.247 -96 K 0.254 -97 Q 0.263 -98 L 0.264 -99 K 0.262 -100 E 0.256 -101 A 0.240 -102 E 0.223 -103 H 0.216 -104 I 0.211 -105 L 0.202 -106 A 0.197 -107 T 0.194 -108 A 0.186 -109 V 0.175 -110 Y 0.170 -111 Q 0.173 -112 A 0.173 -113 K 0.168 -114 E 0.159 -115 K 0.151 -116 L 0.148 -117 K 0.152 -118 S 0.156 -119 I 0.157 -120 D 0.167 -121 K 0.190 -122 A 0.218 -123 R 0.245 -124 K 0.276 -125 G 0.307 -126 S 0.324 -127 I 0.311 -128 S 0.271 -129 S 0.223 -130 E 0.188 -131 E 0.170 -132 I 0.160 -133 I 0.153 -134 K 0.155 -135 Y 0.164 -136 A 0.167 -137 H 0.162 -138 R 0.165 -139 I 0.190 -140 S 0.228 -141 A 0.263 -142 S 0.289 -143 N 0.318 -144 A 0.359 -145 V 0.408 -146 C 0.460 -147 A 0.511 -148 P 0.548 -149 L 0.554 -150 N 0.518 -151 W 0.466 -152 V 0.435 -153 P 0.428 -154 G 0.420 -155 D 0.399 -156 P 0.371 -157 R 0.352 -158 R 0.362 -159 P 0.403 -160 Y 0.449 -161 P 0.467 -162 T 0.453 -163 D 0.428 -164 L 0.411 -165 E 0.399 -166 M 0.386 -167 R 0.378 -168 S 0.386 -169 G 0.414 -170 M 0.454 -171 L 0.500 -172 G 0.556 -173 N 0.617 -174 M 0.667 -175 S 0.696 -176 N 0.713 -177 M 0.728 -178 S 0.743 -179 T 0.758 -180 N 0.770 -181 G 0.781 -182 V 0.786 -183 N 0.781 -184 G 0.766 -185 H 0.751 -186 L 0.750 -187 P 0.768 -188 G 0.793 -189 D 0.813 -190 A 0.818 -191 L 0.813 -192 A 0.807 -193 A 0.806 -194 G 0.805 -195 R 0.801 -196 L 0.797 -197 P 0.797 -198 D 0.796 -199 V 0.784 -200 L 0.758 -201 T 0.726 -202 P 0.702 -203 Q 0.693 -204 Y 0.697 -205 P 0.713 -206 W 0.739 -207 Q 0.772 -208 S 0.799 -209 T 0.815 -210 D 0.821 -211 V 0.821 -212 S 0.817 -213 M 0.810 -214 G 0.798 -215 I 0.781 -216 L 0.765 -217 P 0.762 -218 P 0.773 -219 H 0.791 -220 H 0.805 -221 G 0.811 -222 N 0.810 -223 D 0.804 -224 F 0.796 -225 G 0.782 -226 L 0.759 -227 E 0.736 -228 P 0.728 -229 P 0.740 -230 G 0.761 -231 H 0.776 -232 N 0.781 -233 K 0.780 -234 E 0.778 -235 N 0.775 -236 E 0.771 -237 D 0.764 -238 D 0.745 -239 V 0.701 -240 E 0.637 -241 A 0.593 -242 M 0.584 -243 S 0.583 -244 T 0.589 -245 D 0.618 -246 S 0.641 -247 S 0.626 -248 S 0.612 -249 S 0.643 -250 S 0.689 -251 S 0.700 -252 D 0.666 -253 S 0.609 -254 D 0.564 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000041503_ENSDART00000060840_GN:med4_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:8.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000041503_ENSDART00000060840_GN:med4_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:8.caid deleted file mode 100644 index beb9a7a421ebedcd6f62a6705c203de75b172f04..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000041503_ENSDART00000060840_GN:med4_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:8.caid +++ /dev/null @@ -1,263 +0,0 @@ ->ENSDARG00000041503|ENSDART00000060840|GN:med4|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:8 -1 M 0.316 -2 R 0.310 -3 T 0.300 -4 E 0.288 -5 R 0.275 -6 E 0.270 -7 T 0.276 -8 I 0.285 -9 M 0.299 -10 A 0.322 -11 A 0.351 -12 A 0.378 -13 A 0.398 -14 A 0.394 -15 D 0.347 -16 K 0.265 -17 S 0.181 -18 T 0.126 -19 K 0.106 -20 E 0.103 -21 R 0.098 -22 L 0.084 -23 L 0.074 -24 S 0.069 -25 T 0.065 -26 L 0.067 -27 D 0.074 -28 D 0.075 -29 L 0.067 -30 E 0.059 -31 V 0.055 -32 L 0.054 -33 S 0.054 -34 R 0.054 -35 E 0.052 -36 L 0.051 -37 I 0.055 -38 E 0.061 -39 M 0.067 -40 L 0.073 -41 A 0.087 -42 L 0.109 -43 S 0.136 -44 R 0.162 -45 S 0.180 -46 Q 0.196 -47 K 0.218 -48 L 0.243 -49 P 0.257 -50 P 0.250 -51 P 0.227 -52 G 0.194 -53 E 0.159 -54 D 0.126 -55 T 0.100 -56 L 0.083 -57 I 0.078 -58 L 0.080 -59 E 0.082 -60 L 0.080 -61 L 0.077 -62 I 0.075 -63 Q 0.074 -64 R 0.078 -65 D 0.087 -66 K 0.094 -67 E 0.094 -68 F 0.096 -69 Q 0.102 -70 E 0.101 -71 L 0.095 -72 M 0.093 -73 Q 0.097 -74 T 0.101 -75 A 0.113 -76 L 0.133 -77 E 0.147 -78 Q 0.148 -79 G 0.140 -80 R 0.129 -81 V 0.125 -82 H 0.135 -83 Q 0.156 -84 E 0.170 -85 M 0.170 -86 Q 0.165 -87 S 0.169 -88 L 0.183 -89 E 0.205 -90 K 0.230 -91 E 0.250 -92 V 0.258 -93 E 0.253 -94 K 0.242 -95 R 0.233 -96 D 0.238 -97 S 0.256 -98 D 0.270 -99 I 0.268 -100 Q 0.258 -101 Q 0.247 -102 L 0.236 -103 Q 0.232 -104 K 0.237 -105 Q 0.244 -106 L 0.244 -107 K 0.242 -108 E 0.236 -109 A 0.223 -110 E 0.210 -111 H 0.206 -112 I 0.202 -113 L 0.195 -114 A 0.191 -115 T 0.190 -116 A 0.184 -117 V 0.174 -118 Y 0.169 -119 Q 0.171 -120 A 0.172 -121 K 0.167 -122 E 0.159 -123 K 0.150 -124 L 0.147 -125 K 0.152 -126 S 0.157 -127 I 0.158 -128 D 0.169 -129 K 0.194 -130 A 0.223 -131 R 0.251 -132 K 0.282 -133 G 0.314 -134 S 0.332 -135 I 0.320 -136 S 0.280 -137 S 0.229 -138 E 0.192 -139 E 0.173 -140 I 0.162 -141 I 0.154 -142 K 0.156 -143 Y 0.165 -144 A 0.169 -145 H 0.165 -146 R 0.168 -147 I 0.191 -148 S 0.228 -149 A 0.261 -150 S 0.287 -151 N 0.316 -152 A 0.358 -153 V 0.410 -154 C 0.463 -155 A 0.515 -156 P 0.553 -157 L 0.558 -158 N 0.521 -159 W 0.467 -160 V 0.435 -161 P 0.428 -162 G 0.419 -163 D 0.395 -164 P 0.363 -165 R 0.341 -166 R 0.348 -167 P 0.387 -168 Y 0.434 -169 P 0.457 -170 T 0.447 -171 D 0.426 -172 L 0.408 -173 E 0.392 -174 M 0.375 -175 R 0.364 -176 S 0.372 -177 G 0.401 -178 M 0.441 -179 L 0.485 -180 G 0.537 -181 N 0.598 -182 M 0.650 -183 S 0.681 -184 N 0.700 -185 M 0.716 -186 S 0.733 -187 T 0.749 -188 N 0.763 -189 G 0.775 -190 V 0.781 -191 N 0.776 -192 G 0.761 -193 H 0.747 -194 L 0.746 -195 P 0.763 -196 G 0.789 -197 D 0.809 -198 A 0.815 -199 L 0.810 -200 A 0.804 -201 A 0.803 -202 G 0.802 -203 R 0.798 -204 L 0.795 -205 P 0.796 -206 D 0.794 -207 V 0.782 -208 L 0.755 -209 T 0.723 -210 P 0.699 -211 Q 0.691 -212 Y 0.696 -213 P 0.712 -214 W 0.738 -215 Q 0.770 -216 S 0.797 -217 T 0.813 -218 D 0.819 -219 V 0.819 -220 S 0.816 -221 M 0.808 -222 G 0.796 -223 I 0.779 -224 L 0.764 -225 P 0.761 -226 P 0.772 -227 H 0.790 -228 H 0.805 -229 G 0.811 -230 N 0.809 -231 D 0.803 -232 F 0.795 -233 G 0.780 -234 L 0.756 -235 E 0.732 -236 P 0.724 -237 P 0.736 -238 G 0.757 -239 H 0.772 -240 N 0.777 -241 K 0.777 -242 E 0.775 -243 N 0.773 -244 E 0.770 -245 D 0.763 -246 D 0.744 -247 V 0.700 -248 E 0.636 -249 A 0.591 -250 M 0.583 -251 S 0.582 -252 T 0.588 -253 D 0.618 -254 S 0.640 -255 S 0.624 -256 S 0.610 -257 S 0.641 -258 S 0.687 -259 S 0.698 -260 D 0.663 -261 S 0.604 -262 D 0.558 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000042874_ENSDART00000062930_GN:phlda2_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000042874_ENSDART00000062930_GN:phlda2_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 91c661db7974f70c53aaf2409cdee39d7b7e3cb5..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000042874_ENSDART00000062930_GN:phlda2_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,137 +0,0 @@ ->ENSDARG00000042874|ENSDART00000062930|GN:phlda2|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.523 -2 T 0.535 -3 G 0.550 -4 S 0.547 -5 D 0.507 -6 I 0.427 -7 S 0.326 -8 H 0.231 -9 I 0.156 -10 L 0.104 -11 K 0.072 -12 E 0.056 -13 G 0.049 -14 E 0.045 -15 L 0.045 -16 E 0.052 -17 K 0.072 -18 R 0.103 -19 S 0.140 -20 D 0.172 -21 N 0.189 -22 L 0.188 -23 L 0.177 -24 Q 0.161 -25 F 0.137 -26 W 0.107 -27 K 0.077 -28 R 0.052 -29 K 0.035 -30 T 0.025 -31 C 0.023 -32 V 0.028 -33 L 0.034 -34 T 0.036 -35 T 0.032 -36 D 0.027 -37 S 0.025 -38 L 0.026 -39 N 0.032 -40 I 0.042 -41 Y 0.059 -42 T 0.078 -43 D 0.095 -44 Q 0.108 -45 Q 0.118 -46 K 0.128 -47 K 0.145 -48 N 0.163 -49 K 0.169 -50 S 0.158 -51 K 0.135 -52 E 0.110 -53 L 0.085 -54 K 0.061 -55 L 0.040 -56 Q 0.029 -57 S 0.024 -58 I 0.023 -59 K 0.023 -60 K 0.025 -61 V 0.028 -62 D 0.033 -63 C 0.041 -64 V 0.054 -65 E 0.068 -66 H 0.078 -67 T 0.081 -68 G 0.075 -69 K 0.061 -70 F 0.044 -71 V 0.030 -72 Y 0.020 -73 F 0.016 -74 T 0.015 -75 I 0.017 -76 V 0.022 -77 T 0.031 -78 T 0.041 -79 D 0.049 -80 N 0.054 -81 K 0.052 -82 E 0.046 -83 I 0.037 -84 D 0.029 -85 F 0.025 -86 R 0.028 -87 C 0.038 -88 S 0.050 -89 D 0.059 -90 E 0.061 -91 K 0.062 -92 N 0.062 -93 C 0.060 -94 W 0.056 -95 N 0.051 -96 A 0.044 -97 V 0.038 -98 I 0.032 -99 A 0.029 -100 I 0.027 -101 A 0.030 -102 L 0.038 -103 V 0.052 -104 N 0.068 -105 F 0.086 -106 Q 0.108 -107 N 0.134 -108 R 0.164 -109 K 0.200 -110 A 0.243 -111 I 0.292 -112 Q 0.351 -113 G 0.419 -114 F 0.485 -115 K 0.535 -116 T 0.563 -117 Q 0.574 -118 K 0.576 -119 E 0.574 -120 S 0.571 -121 E 0.568 -122 N 0.566 -123 T 0.568 -124 S 0.571 -125 L 0.558 -126 G 0.520 -127 Q 0.483 -128 Q 0.465 -129 E 0.454 -130 R 0.449 -131 C 0.474 -132 M 0.517 -133 A 0.538 -134 R 0.524 -135 A 0.493 -136 P 0.468 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000042874_ENSDART00000062930_GN:phlda2_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:38.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000042874_ENSDART00000062930_GN:phlda2_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:38.caid deleted file mode 100644 index 18f60a7477201dba5fee59e894cc1052a07afc4c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000042874_ENSDART00000062930_GN:phlda2_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:38.caid +++ /dev/null @@ -1,175 +0,0 @@ ->ENSDARG00000042874|ENSDART00000062930|GN:phlda2|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:38 -1 M 0.444 -2 K 0.445 -3 K 0.453 -4 H 0.473 -5 S 0.500 -6 V 0.513 -7 G 0.487 -8 R 0.422 -9 R 0.346 -10 L 0.286 -11 Q 0.246 -12 Q 0.226 -13 R 0.222 -14 L 0.229 -15 Y 0.248 -16 E 0.281 -17 A 0.320 -18 L 0.356 -19 G 0.384 -20 H 0.404 -21 S 0.411 -22 Y 0.402 -23 S 0.383 -24 C 0.367 -25 L 0.361 -26 F 0.370 -27 I 0.402 -28 H 0.449 -29 S 0.486 -30 P 0.500 -31 A 0.504 -32 I 0.518 -33 A 0.546 -34 R 0.578 -35 N 0.610 -36 V 0.633 -37 G 0.641 -38 K 0.636 -39 M 0.630 -40 T 0.625 -41 G 0.608 -42 S 0.565 -43 D 0.491 -44 I 0.392 -45 S 0.290 -46 H 0.202 -47 I 0.136 -48 L 0.091 -49 K 0.063 -50 E 0.050 -51 G 0.045 -52 E 0.041 -53 L 0.041 -54 E 0.048 -55 K 0.065 -56 R 0.094 -57 S 0.130 -58 D 0.161 -59 N 0.177 -60 L 0.175 -61 L 0.161 -62 Q 0.144 -63 F 0.121 -64 W 0.094 -65 K 0.068 -66 R 0.046 -67 K 0.031 -68 T 0.022 -69 C 0.021 -70 V 0.025 -71 L 0.031 -72 T 0.033 -73 T 0.029 -74 D 0.024 -75 S 0.021 -76 L 0.022 -77 N 0.026 -78 I 0.035 -79 Y 0.048 -80 T 0.064 -81 D 0.078 -82 Q 0.089 -83 Q 0.097 -84 K 0.106 -85 K 0.121 -86 N 0.139 -87 K 0.148 -88 S 0.140 -89 K 0.121 -90 E 0.099 -91 L 0.077 -92 K 0.055 -93 L 0.037 -94 Q 0.026 -95 S 0.022 -96 I 0.022 -97 K 0.022 -98 K 0.024 -99 V 0.028 -100 D 0.034 -101 C 0.042 -102 V 0.053 -103 E 0.064 -104 H 0.072 -105 T 0.073 -106 G 0.068 -107 K 0.056 -108 F 0.042 -109 V 0.029 -110 Y 0.020 -111 F 0.015 -112 T 0.014 -113 I 0.016 -114 V 0.021 -115 T 0.029 -116 T 0.039 -117 D 0.047 -118 N 0.052 -119 K 0.051 -120 E 0.045 -121 I 0.036 -122 D 0.028 -123 F 0.024 -124 R 0.025 -125 C 0.033 -126 S 0.044 -127 D 0.051 -128 E 0.051 -129 K 0.048 -130 N 0.046 -131 C 0.046 -132 W 0.043 -133 N 0.039 -134 A 0.034 -135 V 0.030 -136 I 0.027 -137 A 0.025 -138 I 0.024 -139 A 0.027 -140 L 0.035 -141 V 0.047 -142 N 0.061 -143 F 0.079 -144 Q 0.103 -145 N 0.131 -146 R 0.160 -147 K 0.194 -148 A 0.233 -149 I 0.278 -150 Q 0.335 -151 G 0.407 -152 F 0.478 -153 K 0.531 -154 T 0.559 -155 Q 0.567 -156 K 0.565 -157 E 0.563 -158 S 0.564 -159 E 0.567 -160 N 0.573 -161 T 0.580 -162 S 0.585 -163 L 0.571 -164 G 0.532 -165 Q 0.493 -166 Q 0.474 -167 E 0.461 -168 R 0.456 -169 C 0.481 -170 M 0.523 -171 A 0.544 -172 R 0.531 -173 A 0.499 -174 P 0.473 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000053194_ENSDART00000075187_GN:pdzd11_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000053194_ENSDART00000075187_GN:pdzd11_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index c1972897bb3cf8860700541a278c787e59ae02d5..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000053194_ENSDART00000075187_GN:pdzd11_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,143 +0,0 @@ ->ENSDARG00000053194|ENSDART00000075187|GN:pdzd11|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.478 -2 D 0.497 -3 Q 0.531 -4 K 0.567 -5 I 0.590 -6 P 0.600 -7 Y 0.605 -8 D 0.601 -9 D 0.586 -10 Y 0.572 -11 Q 0.583 -12 L 0.620 -13 P 0.661 -14 V 0.681 -15 V 0.678 -16 F 0.666 -17 L 0.658 -18 P 0.653 -19 S 0.642 -20 Y 0.614 -21 E 0.578 -22 N 0.560 -23 P 0.572 -24 P 0.595 -25 A 0.593 -26 W 0.561 -27 I 0.531 -28 P 0.534 -29 P 0.570 -30 Q 0.610 -31 E 0.629 -32 R 0.621 -33 I 0.596 -34 H 0.566 -35 H 0.545 -36 P 0.541 -37 D 0.544 -38 Y 0.539 -39 N 0.517 -40 N 0.467 -41 E 0.395 -42 L 0.328 -43 A 0.283 -44 Q 0.256 -45 F 0.228 -46 L 0.187 -47 P 0.141 -48 R 0.106 -49 T 0.087 -50 I 0.076 -51 V 0.067 -52 L 0.064 -53 K 0.074 -54 K 0.093 -55 P 0.114 -56 P 0.130 -57 G 0.142 -58 A 0.145 -59 Q 0.134 -60 L 0.111 -61 G 0.088 -62 F 0.079 -63 N 0.083 -64 I 0.087 -65 R 0.087 -66 G 0.088 -67 G 0.098 -68 K 0.118 -69 A 0.139 -70 S 0.150 -71 Q 0.143 -72 L 0.121 -73 G 0.091 -74 I 0.063 -75 F 0.047 -76 I 0.045 -77 S 0.053 -78 K 0.066 -79 V 0.079 -80 V 0.084 -81 P 0.076 -82 D 0.061 -83 S 0.046 -84 D 0.038 -85 A 0.036 -86 H 0.039 -87 R 0.046 -88 A 0.053 -89 G 0.060 -90 L 0.063 -91 Q 0.064 -92 E 0.063 -93 G 0.059 -94 D 0.052 -95 Q 0.044 -96 V 0.038 -97 L 0.036 -98 S 0.037 -99 V 0.041 -100 N 0.047 -101 E 0.054 -102 V 0.060 -103 D 0.061 -104 F 0.057 -105 Q 0.051 -106 D 0.047 -107 I 0.047 -108 E 0.047 -109 H 0.044 -110 S 0.040 -111 R 0.039 -112 A 0.045 -113 V 0.057 -114 E 0.064 -115 I 0.062 -116 L 0.054 -117 K 0.052 -118 T 0.054 -119 A 0.056 -120 R 0.053 -121 E 0.047 -122 I 0.041 -123 L 0.037 -124 M 0.035 -125 K 0.036 -126 V 0.039 -127 R 0.049 -128 Y 0.065 -129 F 0.083 -130 P 0.098 -131 Y 0.112 -132 N 0.126 -133 Y 0.145 -134 Q 0.167 -135 R 0.190 -136 Q 0.212 -137 K 0.235 -138 E 0.267 -139 R 0.318 -140 T 0.376 -141 V 0.410 -142 H 0.416 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000053194_ENSDART00000075187_GN:pdzd11_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000053194_ENSDART00000075187_GN:pdzd11_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:14.caid deleted file mode 100644 index 299d14b64f1edb9ebb3de80b15dbb56543e88fbb..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000053194_ENSDART00000075187_GN:pdzd11_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:14.caid +++ /dev/null @@ -1,157 +0,0 @@ ->ENSDARG00000053194|ENSDART00000075187|GN:pdzd11|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:14 -1 M 0.374 -2 T 0.384 -3 L 0.405 -4 L 0.430 -5 I 0.449 -6 F 0.459 -7 F 0.465 -8 L 0.470 -9 T 0.476 -10 S 0.504 -11 S 0.567 -12 S 0.635 -13 T 0.671 -14 N 0.676 -15 M 0.671 -16 D 0.668 -17 Q 0.671 -18 K 0.675 -19 I 0.676 -20 P 0.672 -21 Y 0.665 -22 D 0.652 -23 D 0.634 -24 Y 0.621 -25 Q 0.632 -26 L 0.668 -27 P 0.706 -28 V 0.725 -29 V 0.720 -30 F 0.703 -31 L 0.686 -32 P 0.674 -33 S 0.658 -34 Y 0.629 -35 E 0.594 -36 N 0.574 -37 P 0.582 -38 P 0.599 -39 A 0.594 -40 W 0.561 -41 I 0.531 -42 P 0.538 -43 P 0.580 -44 Q 0.626 -45 E 0.647 -46 R 0.639 -47 I 0.614 -48 H 0.586 -49 H 0.567 -50 P 0.565 -51 D 0.571 -52 Y 0.569 -53 N 0.548 -54 N 0.496 -55 E 0.420 -56 L 0.346 -57 A 0.295 -58 Q 0.262 -59 F 0.229 -60 L 0.185 -61 P 0.139 -62 R 0.106 -63 T 0.089 -64 I 0.078 -65 V 0.067 -66 L 0.063 -67 K 0.072 -68 K 0.090 -69 P 0.110 -70 P 0.127 -71 G 0.138 -72 A 0.139 -73 Q 0.127 -74 L 0.104 -75 G 0.081 -76 F 0.072 -77 N 0.076 -78 I 0.082 -79 R 0.083 -80 G 0.086 -81 G 0.096 -82 K 0.115 -83 A 0.136 -84 S 0.146 -85 Q 0.140 -86 L 0.118 -87 G 0.089 -88 I 0.061 -89 F 0.046 -90 I 0.044 -91 S 0.051 -92 K 0.064 -93 V 0.077 -94 V 0.082 -95 P 0.075 -96 D 0.060 -97 S 0.045 -98 D 0.037 -99 A 0.035 -100 H 0.038 -101 R 0.044 -102 A 0.052 -103 G 0.058 -104 L 0.061 -105 Q 0.062 -106 E 0.061 -107 G 0.058 -108 D 0.051 -109 Q 0.043 -110 V 0.037 -111 L 0.035 -112 S 0.036 -113 V 0.041 -114 N 0.047 -115 E 0.054 -116 V 0.060 -117 D 0.062 -118 F 0.057 -119 Q 0.051 -120 D 0.047 -121 I 0.047 -122 E 0.047 -123 H 0.044 -124 S 0.039 -125 R 0.038 -126 A 0.044 -127 V 0.056 -128 E 0.064 -129 I 0.061 -130 L 0.054 -131 K 0.051 -132 T 0.054 -133 A 0.055 -134 R 0.053 -135 E 0.047 -136 I 0.041 -137 L 0.037 -138 M 0.035 -139 K 0.036 -140 V 0.039 -141 R 0.049 -142 Y 0.064 -143 F 0.083 -144 P 0.098 -145 Y 0.110 -146 N 0.124 -147 Y 0.141 -148 Q 0.162 -149 R 0.183 -150 Q 0.203 -151 K 0.225 -152 E 0.258 -153 R 0.311 -154 T 0.369 -155 V 0.404 -156 H 0.410 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000058202_ENSDART00000081025_GN:pex16_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000058202_ENSDART00000081025_GN:pex16_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index e8e3cd1a3e4043145c8fc792e0e4fdd3ef1efa6c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000058202_ENSDART00000081025_GN:pex16_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,336 +0,0 @@ ->ENSDARG00000058202|ENSDART00000081025|GN:pex16|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.184 -2 E 0.161 -3 K 0.135 -4 L 0.122 -5 S 0.119 -6 R 0.111 -7 V 0.096 -8 F 0.085 -9 E 0.081 -10 R 0.080 -11 Y 0.085 -12 Q 0.092 -13 E 0.092 -14 Y 0.086 -15 V 0.083 -16 R 0.091 -17 T 0.101 -18 S 0.100 -19 P 0.083 -20 A 0.063 -21 A 0.051 -22 A 0.047 -23 S 0.048 -24 H 0.053 -25 L 0.059 -26 E 0.061 -27 S 0.058 -28 T 0.054 -29 V 0.055 -30 R 0.062 -31 A 0.063 -32 L 0.055 -33 S 0.046 -34 Y 0.043 -35 L 0.049 -36 I 0.064 -37 A 0.086 -38 G 0.112 -39 R 0.135 -40 F 0.150 -41 S 0.154 -42 D 0.147 -43 S 0.130 -44 H 0.107 -45 E 0.089 -46 I 0.081 -47 S 0.079 -48 E 0.079 -49 L 0.075 -50 V 0.069 -51 Y 0.066 -52 S 0.067 -53 A 0.069 -54 S 0.067 -55 N 0.062 -56 L 0.056 -57 L 0.053 -58 V 0.054 -59 L 0.056 -60 L 0.058 -61 N 0.063 -62 D 0.071 -63 G 0.076 -64 I 0.078 -65 L 0.078 -66 R 0.080 -67 K 0.091 -68 N 0.110 -69 L 0.129 -70 S 0.145 -71 R 0.161 -72 T 0.179 -73 L 0.188 -74 P 0.177 -75 M 0.147 -76 S 0.109 -77 I 0.075 -78 S 0.053 -79 Q 0.045 -80 Q 0.045 -81 K 0.051 -82 L 0.062 -83 L 0.073 -84 T 0.079 -85 W 0.082 -86 L 0.088 -87 S 0.099 -88 V 0.104 -89 L 0.099 -90 E 0.090 -91 Y 0.085 -92 V 0.079 -93 E 0.068 -94 V 0.055 -95 F 0.048 -96 V 0.048 -97 E 0.049 -98 M 0.049 -99 A 0.051 -100 A 0.055 -101 A 0.062 -102 K 0.069 -103 M 0.079 -104 W 0.088 -105 G 0.090 -106 D 0.081 -107 A 0.068 -108 G 0.056 -109 R 0.049 -110 W 0.047 -111 L 0.052 -112 V 0.059 -113 I 0.062 -114 V 0.062 -115 L 0.066 -116 I 0.074 -117 Q 0.082 -118 I 0.086 -119 A 0.080 -120 K 0.068 -121 A 0.056 -122 V 0.049 -123 L 0.044 -124 R 0.041 -125 C 0.037 -126 L 0.035 -127 L 0.035 -128 L 0.036 -129 F 0.036 -130 W 0.039 -131 Y 0.050 -132 K 0.068 -133 S 0.090 -134 G 0.105 -135 I 0.111 -136 Q 0.110 -137 T 0.109 -138 S 0.117 -139 P 0.142 -140 P 0.181 -141 I 0.230 -142 I 0.286 -143 P 0.344 -144 L 0.399 -145 D 0.443 -146 R 0.470 -147 D 0.480 -148 S 0.484 -149 Q 0.503 -150 L 0.545 -151 C 0.596 -152 S 0.640 -153 Q 0.671 -154 D 0.680 -155 N 0.654 -156 N 0.600 -157 E 0.562 -158 E 0.574 -159 E 0.609 -160 D 0.623 -161 D 0.606 -162 E 0.565 -163 D 0.508 -164 S 0.447 -165 S 0.399 -166 F 0.375 -167 V 0.375 -168 G 0.401 -169 Q 0.438 -170 R 0.463 -171 S 0.472 -172 G 0.476 -173 R 0.480 -174 V 0.480 -175 V 0.483 -176 R 0.505 -177 P 0.554 -178 L 0.613 -179 G 0.653 -180 S 0.664 -181 A 0.651 -182 P 0.621 -183 S 0.581 -184 L 0.539 -185 Q 0.502 -186 S 0.488 -187 R 0.512 -188 L 0.570 -189 W 0.630 -190 G 0.667 -191 L 0.679 -192 P 0.678 -193 R 0.675 -194 K 0.674 -195 K 0.670 -196 K 0.659 -197 V 0.645 -198 S 0.633 -199 R 0.618 -200 N 0.582 -201 Q 0.523 -202 E 0.461 -203 E 0.418 -204 E 0.394 -205 L 0.379 -206 Y 0.366 -207 S 0.350 -208 S 0.329 -209 P 0.299 -210 T 0.260 -211 P 0.217 -212 L 0.174 -213 G 0.135 -214 L 0.106 -215 Q 0.095 -216 E 0.095 -217 T 0.100 -218 I 0.111 -219 A 0.134 -220 E 0.154 -221 S 0.155 -222 L 0.140 -223 Y 0.131 -224 I 0.128 -225 A 0.119 -226 R 0.103 -227 P 0.087 -228 L 0.077 -229 L 0.073 -230 H 0.071 -231 L 0.065 -232 A 0.057 -233 S 0.054 -234 L 0.057 -235 G 0.065 -236 I 0.075 -237 C 0.088 -238 G 0.098 -239 K 0.098 -240 R 0.086 -241 S 0.070 -242 W 0.058 -243 K 0.054 -244 P 0.055 -245 W 0.056 -246 I 0.057 -247 L 0.061 -248 S 0.067 -249 G 0.071 -250 L 0.070 -251 L 0.069 -252 E 0.067 -253 I 0.062 -254 T 0.055 -255 S 0.052 -256 F 0.052 -257 S 0.057 -258 L 0.069 -259 L 0.087 -260 S 0.105 -261 D 0.121 -262 M 0.134 -263 K 0.142 -264 A 0.141 -265 L 0.129 -266 N 0.108 -267 R 0.085 -268 R 0.068 -269 E 0.061 -270 R 0.061 -271 A 0.066 -272 E 0.071 -273 M 0.074 -274 R 0.072 -275 R 0.069 -276 R 0.070 -277 A 0.079 -278 F 0.093 -279 L 0.104 -280 L 0.103 -281 L 0.093 -282 Y 0.080 -283 Y 0.069 -284 L 0.063 -285 L 0.062 -286 R 0.062 -287 S 0.060 -288 P 0.055 -289 F 0.050 -290 Y 0.048 -291 D 0.052 -292 R 0.059 -293 Y 0.065 -294 S 0.067 -295 E 0.064 -296 T 0.061 -297 K 0.060 -298 I 0.064 -299 L 0.071 -300 F 0.075 -301 L 0.069 -302 L 0.060 -303 R 0.054 -304 F 0.055 -305 L 0.069 -306 A 0.097 -307 D 0.138 -308 Y 0.179 -309 V 0.201 -310 P 0.193 -311 G 0.162 -312 V 0.124 -313 G 0.094 -314 L 0.079 -315 V 0.076 -316 A 0.080 -317 R 0.086 -318 P 0.091 -319 L 0.096 -320 M 0.096 -321 E 0.093 -322 Y 0.091 -323 L 0.096 -324 P 0.100 -325 I 0.101 -326 W 0.106 -327 Q 0.123 -328 K 0.148 -329 I 0.178 -330 Y 0.212 -331 F 0.244 -332 Y 0.267 -333 N 0.275 -334 W 0.276 -335 G 0.275 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000058202_ENSDART00000081025_GN:pex16_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000058202_ENSDART00000081025_GN:pex16_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:5.caid deleted file mode 100644 index 02bd2f1212f63565bdd8388f2dd9630545b7e00c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000058202_ENSDART00000081025_GN:pex16_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:5.caid +++ /dev/null @@ -1,341 +0,0 @@ ->ENSDARG00000058202|ENSDART00000081025|GN:pex16|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:5 -1 M 0.242 -2 S 0.226 -3 V 0.199 -4 L 0.170 -5 Y 0.146 -6 M 0.127 -7 E 0.111 -8 K 0.101 -9 L 0.101 -10 S 0.105 -11 R 0.102 -12 V 0.090 -13 F 0.080 -14 E 0.075 -15 R 0.073 -16 Y 0.073 -17 Q 0.074 -18 E 0.072 -19 Y 0.071 -20 V 0.076 -21 R 0.090 -22 T 0.103 -23 S 0.102 -24 P 0.086 -25 A 0.065 -26 A 0.052 -27 A 0.048 -28 S 0.049 -29 H 0.053 -30 L 0.058 -31 E 0.061 -32 S 0.058 -33 T 0.053 -34 V 0.055 -35 R 0.060 -36 A 0.062 -37 L 0.054 -38 S 0.046 -39 Y 0.043 -40 L 0.050 -41 I 0.065 -42 A 0.087 -43 G 0.114 -44 R 0.138 -45 F 0.153 -46 S 0.156 -47 D 0.148 -48 S 0.129 -49 H 0.107 -50 E 0.090 -51 I 0.082 -52 S 0.080 -53 E 0.080 -54 L 0.075 -55 V 0.069 -56 Y 0.065 -57 S 0.066 -58 A 0.068 -59 S 0.067 -60 N 0.061 -61 L 0.055 -62 L 0.052 -63 V 0.053 -64 L 0.055 -65 L 0.057 -66 N 0.062 -67 D 0.069 -68 G 0.074 -69 I 0.076 -70 L 0.075 -71 R 0.078 -72 K 0.089 -73 N 0.107 -74 L 0.127 -75 S 0.143 -76 R 0.159 -77 T 0.177 -78 L 0.187 -79 P 0.176 -80 M 0.146 -81 S 0.108 -82 I 0.074 -83 S 0.053 -84 Q 0.044 -85 Q 0.045 -86 K 0.051 -87 L 0.061 -88 L 0.072 -89 T 0.078 -90 W 0.081 -91 L 0.087 -92 S 0.097 -93 V 0.103 -94 L 0.097 -95 E 0.088 -96 Y 0.082 -97 V 0.077 -98 E 0.067 -99 V 0.054 -100 F 0.048 -101 V 0.047 -102 E 0.049 -103 M 0.049 -104 A 0.050 -105 A 0.055 -106 A 0.061 -107 K 0.069 -108 M 0.078 -109 W 0.088 -110 G 0.090 -111 D 0.081 -112 A 0.068 -113 G 0.057 -114 R 0.049 -115 W 0.048 -116 L 0.054 -117 V 0.060 -118 I 0.063 -119 V 0.063 -120 L 0.067 -121 I 0.074 -122 Q 0.083 -123 I 0.086 -124 A 0.081 -125 K 0.068 -126 A 0.056 -127 V 0.049 -128 L 0.045 -129 R 0.041 -130 C 0.038 -131 L 0.036 -132 L 0.036 -133 L 0.036 -134 F 0.036 -135 W 0.039 -136 Y 0.049 -137 K 0.068 -138 S 0.089 -139 G 0.105 -140 I 0.111 -141 Q 0.110 -142 T 0.109 -143 S 0.117 -144 P 0.140 -145 P 0.179 -146 I 0.227 -147 I 0.282 -148 P 0.341 -149 L 0.396 -150 D 0.440 -151 R 0.466 -152 D 0.475 -153 S 0.479 -154 Q 0.498 -155 L 0.541 -156 C 0.593 -157 S 0.639 -158 Q 0.672 -159 D 0.685 -160 N 0.671 -161 N 0.634 -162 E 0.605 -163 E 0.608 -164 E 0.626 -165 D 0.630 -166 D 0.608 -167 E 0.567 -168 D 0.511 -169 S 0.450 -170 S 0.403 -171 F 0.378 -172 V 0.378 -173 G 0.405 -174 Q 0.442 -175 R 0.468 -176 S 0.476 -177 G 0.479 -178 R 0.482 -179 V 0.483 -180 V 0.486 -181 R 0.508 -182 P 0.557 -183 L 0.615 -184 G 0.654 -185 S 0.663 -186 A 0.650 -187 P 0.621 -188 S 0.581 -189 L 0.539 -190 Q 0.502 -191 S 0.486 -192 R 0.510 -193 L 0.568 -194 W 0.629 -195 G 0.666 -196 L 0.679 -197 P 0.678 -198 R 0.675 -199 K 0.673 -200 K 0.669 -201 K 0.658 -202 V 0.643 -203 S 0.631 -204 R 0.617 -205 N 0.583 -206 Q 0.525 -207 E 0.465 -208 E 0.422 -209 E 0.398 -210 L 0.382 -211 Y 0.369 -212 S 0.352 -213 S 0.330 -214 P 0.299 -215 T 0.260 -216 P 0.217 -217 L 0.175 -218 G 0.136 -219 L 0.107 -220 Q 0.095 -221 E 0.096 -222 T 0.101 -223 I 0.112 -224 A 0.134 -225 E 0.155 -226 S 0.155 -227 L 0.141 -228 Y 0.132 -229 I 0.128 -230 A 0.119 -231 R 0.103 -232 P 0.088 -233 L 0.077 -234 L 0.073 -235 H 0.071 -236 L 0.066 -237 A 0.057 -238 S 0.054 -239 L 0.057 -240 G 0.065 -241 I 0.075 -242 C 0.088 -243 G 0.098 -244 K 0.098 -245 R 0.087 -246 S 0.070 -247 W 0.058 -248 K 0.054 -249 P 0.055 -250 W 0.057 -251 I 0.057 -252 L 0.061 -253 S 0.067 -254 G 0.071 -255 L 0.071 -256 L 0.070 -257 E 0.068 -258 I 0.062 -259 T 0.056 -260 S 0.052 -261 F 0.053 -262 S 0.057 -263 L 0.069 -264 L 0.087 -265 S 0.106 -266 D 0.122 -267 M 0.135 -268 K 0.143 -269 A 0.143 -270 L 0.131 -271 N 0.109 -272 R 0.087 -273 R 0.070 -274 E 0.062 -275 R 0.062 -276 A 0.066 -277 E 0.072 -278 M 0.075 -279 R 0.073 -280 R 0.070 -281 R 0.071 -282 A 0.080 -283 F 0.095 -284 L 0.106 -285 L 0.105 -286 L 0.094 -287 Y 0.082 -288 Y 0.071 -289 L 0.064 -290 L 0.063 -291 R 0.063 -292 S 0.061 -293 P 0.056 -294 F 0.051 -295 Y 0.049 -296 D 0.053 -297 R 0.060 -298 Y 0.066 -299 S 0.068 -300 E 0.065 -301 T 0.061 -302 K 0.060 -303 I 0.065 -304 L 0.072 -305 F 0.075 -306 L 0.070 -307 L 0.060 -308 R 0.054 -309 F 0.056 -310 L 0.069 -311 A 0.098 -312 D 0.138 -313 Y 0.179 -314 V 0.201 -315 P 0.192 -316 G 0.161 -317 V 0.123 -318 G 0.093 -319 L 0.078 -320 V 0.075 -321 A 0.079 -322 R 0.085 -323 P 0.091 -324 L 0.095 -325 M 0.096 -326 E 0.093 -327 Y 0.092 -328 L 0.096 -329 P 0.101 -330 I 0.101 -331 W 0.107 -332 Q 0.124 -333 K 0.150 -334 I 0.180 -335 Y 0.215 -336 F 0.248 -337 Y 0.269 -338 N 0.277 -339 W 0.276 -340 G 0.275 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000058730_ENSDART00000066703_GN:rdh10a_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000058730_ENSDART00000066703_GN:rdh10a_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 811e14e3fc329d835535ee94d89d2061568b5fae..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000058730_ENSDART00000066703_GN:rdh10a_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,340 +0,0 @@ ->ENSDARG00000058730|ENSDART00000066703|GN:rdh10a|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.205 -2 N 0.180 -3 I 0.144 -4 F 0.115 -5 V 0.100 -6 E 0.091 -7 F 0.081 -8 F 0.076 -9 L 0.080 -10 V 0.087 -11 M 0.089 -12 L 0.090 -13 K 0.094 -14 V 0.097 -15 C 0.093 -16 W 0.087 -17 A 0.084 -18 I 0.081 -19 V 0.077 -20 M 0.076 -21 A 0.079 -22 G 0.081 -23 F 0.080 -24 K 0.079 -25 W 0.081 -26 L 0.091 -27 I 0.109 -28 R 0.131 -29 P 0.143 -30 K 0.138 -31 E 0.123 -32 K 0.111 -33 S 0.107 -34 V 0.104 -35 A 0.096 -36 G 0.079 -37 Q 0.059 -38 V 0.043 -39 C 0.034 -40 V 0.031 -41 I 0.030 -42 T 0.032 -43 G 0.039 -44 A 0.048 -45 G 0.055 -46 G 0.058 -47 G 0.057 -48 L 0.053 -49 G 0.046 -50 R 0.040 -51 L 0.038 -52 F 0.041 -53 A 0.041 -54 K 0.037 -55 E 0.031 -56 F 0.029 -57 A 0.035 -58 R 0.046 -59 R 0.062 -60 R 0.078 -61 A 0.087 -62 T 0.081 -63 L 0.066 -64 V 0.051 -65 L 0.043 -66 W 0.040 -67 D 0.041 -68 I 0.044 -69 N 0.048 -70 S 0.050 -71 H 0.047 -72 S 0.041 -73 N 0.037 -74 E 0.038 -75 E 0.045 -76 T 0.059 -77 A 0.074 -78 E 0.081 -79 M 0.077 -80 V 0.073 -81 R 0.080 -82 Q 0.088 -83 I 0.091 -84 Y 0.091 -85 R 0.102 -86 E 0.136 -87 Q 0.199 -88 D 0.283 -89 N 0.366 -90 P 0.431 -91 M 0.481 -92 S 0.529 -93 K 0.573 -94 E 0.603 -95 G 0.619 -96 A 0.628 -97 V 0.636 -98 G 0.641 -99 G 0.632 -100 V 0.599 -101 E 0.543 -102 E 0.477 -103 V 0.410 -104 P 0.343 -105 P 0.278 -106 F 0.219 -107 Q 0.171 -108 P 0.135 -109 Q 0.107 -110 V 0.085 -111 Y 0.070 -112 T 0.059 -113 Y 0.050 -114 V 0.044 -115 L 0.039 -116 D 0.038 -117 V 0.040 -118 G 0.040 -119 K 0.037 -120 R 0.034 -121 E 0.032 -122 S 0.032 -123 V 0.038 -124 Y 0.049 -125 S 0.058 -126 T 0.059 -127 A 0.058 -128 E 0.056 -129 K 0.050 -130 V 0.047 -131 R 0.054 -132 K 0.061 -133 E 0.060 -134 V 0.054 -135 G 0.049 -136 E 0.047 -137 V 0.044 -138 D 0.044 -139 L 0.047 -140 L 0.051 -141 I 0.056 -142 N 0.060 -143 N 0.065 -144 A 0.069 -145 G 0.070 -146 V 0.070 -147 V 0.070 -148 S 0.071 -149 G 0.076 -150 H 0.085 -151 H 0.096 -152 L 0.102 -153 L 0.105 -154 E 0.109 -155 C 0.110 -156 P 0.100 -157 D 0.084 -158 E 0.070 -159 L 0.063 -160 I 0.062 -161 E 0.063 -162 R 0.062 -163 T 0.060 -164 M 0.059 -165 V 0.061 -166 V 0.064 -167 N 0.065 -168 C 0.066 -169 H 0.072 -170 A 0.079 -171 H 0.075 -172 F 0.062 -173 W 0.051 -174 T 0.048 -175 T 0.048 -176 K 0.048 -177 A 0.045 -178 F 0.042 -179 L 0.038 -180 P 0.035 -181 K 0.034 -182 M 0.036 -183 L 0.040 -184 E 0.045 -185 M 0.048 -186 N 0.050 -187 H 0.051 -188 G 0.055 -189 H 0.060 -190 I 0.062 -191 V 0.061 -192 T 0.062 -193 V 0.071 -194 A 0.084 -195 S 0.096 -196 S 0.108 -197 L 0.120 -198 G 0.126 -199 L 0.124 -200 F 0.119 -201 S 0.120 -202 T 0.123 -203 A 0.124 -204 G 0.121 -205 V 0.115 -206 E 0.107 -207 D 0.100 -208 Y 0.099 -209 C 0.108 -210 A 0.117 -211 S 0.116 -212 K 0.107 -213 F 0.095 -214 G 0.083 -215 A 0.073 -216 I 0.071 -217 G 0.076 -218 F 0.079 -219 H 0.073 -220 E 0.061 -221 S 0.056 -222 L 0.060 -223 S 0.066 -224 H 0.067 -225 E 0.065 -226 I 0.064 -227 Q 0.069 -228 A 0.079 -229 S 0.086 -230 E 0.088 -231 K 0.087 -232 D 0.085 -233 G 0.082 -234 I 0.072 -235 K 0.058 -236 M 0.046 -237 T 0.043 -238 L 0.048 -239 V 0.056 -240 C 0.061 -241 P 0.064 -242 Y 0.067 -243 L 0.072 -244 V 0.076 -245 D 0.076 -246 T 0.075 -247 G 0.076 -248 M 0.081 -249 F 0.092 -250 R 0.109 -251 G 0.131 -252 C 0.152 -253 R 0.162 -254 I 0.158 -255 R 0.145 -256 K 0.133 -257 E 0.126 -258 I 0.118 -259 E 0.107 -260 P 0.101 -261 F 0.107 -262 L 0.122 -263 P 0.137 -264 P 0.136 -265 L 0.121 -266 R 0.104 -267 P 0.088 -268 E 0.074 -269 F 0.063 -270 C 0.057 -271 V 0.052 -272 K 0.050 -273 Q 0.054 -274 A 0.058 -275 M 0.058 -276 R 0.057 -277 A 0.061 -278 I 0.070 -279 L 0.082 -280 T 0.095 -281 D 0.105 -282 Q 0.110 -283 P 0.111 -284 M 0.109 -285 I 0.101 -286 C 0.088 -287 T 0.072 -288 P 0.060 -289 R 0.054 -290 I 0.049 -291 V 0.044 -292 Y 0.039 -293 M 0.039 -294 V 0.043 -295 N 0.046 -296 F 0.048 -297 M 0.051 -298 K 0.056 -299 S 0.061 -300 I 0.064 -301 L 0.067 -302 P 0.071 -303 F 0.071 -304 E 0.068 -305 A 0.067 -306 I 0.074 -307 V 0.086 -308 C 0.093 -309 M 0.090 -310 Y 0.085 -311 R 0.086 -312 F 0.093 -313 L 0.102 -314 G 0.110 -315 A 0.116 -316 D 0.119 -317 K 0.118 -318 C 0.113 -319 M 0.108 -320 Y 0.106 -321 P 0.105 -322 F 0.102 -323 L 0.100 -324 A 0.105 -325 Q 0.117 -326 R 0.132 -327 K 0.150 -328 E 0.176 -329 A 0.208 -330 M 0.242 -331 N 0.273 -332 N 0.302 -333 N 0.325 -334 E 0.341 -335 A 0.362 -336 K 0.394 -337 N 0.423 -338 G 0.430 -339 I 0.421 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000058730_ENSDART00000066703_GN:rdh10a_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000058730_ENSDART00000066703_GN:rdh10a_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:2.caid deleted file mode 100644 index 932a19c20a39267e341f192c9ada54b42ce5b1fd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000058730_ENSDART00000066703_GN:rdh10a_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:2.caid +++ /dev/null @@ -1,342 +0,0 @@ ->ENSDARG00000058730|ENSDART00000066703|GN:rdh10a|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:2 -1 M 0.218 -2 V 0.199 -3 M 0.178 -4 N 0.159 -5 I 0.136 -6 F 0.112 -7 V 0.094 -8 E 0.084 -9 F 0.076 -10 F 0.072 -11 L 0.077 -12 V 0.085 -13 M 0.087 -14 L 0.088 -15 K 0.092 -16 V 0.096 -17 C 0.093 -18 W 0.087 -19 A 0.083 -20 I 0.079 -21 V 0.075 -22 M 0.073 -23 A 0.076 -24 G 0.077 -25 F 0.076 -26 K 0.075 -27 W 0.078 -28 L 0.088 -29 I 0.108 -30 R 0.130 -31 P 0.143 -32 K 0.138 -33 E 0.123 -34 K 0.112 -35 S 0.108 -36 V 0.105 -37 A 0.097 -38 G 0.080 -39 Q 0.059 -40 V 0.043 -41 C 0.034 -42 V 0.031 -43 I 0.030 -44 T 0.032 -45 G 0.038 -46 A 0.047 -47 G 0.054 -48 G 0.057 -49 G 0.057 -50 L 0.053 -51 G 0.046 -52 R 0.040 -53 L 0.038 -54 F 0.040 -55 A 0.041 -56 K 0.037 -57 E 0.030 -58 F 0.029 -59 A 0.035 -60 R 0.046 -61 R 0.061 -62 R 0.077 -63 A 0.086 -64 T 0.080 -65 L 0.065 -66 V 0.051 -67 L 0.042 -68 W 0.040 -69 D 0.041 -70 I 0.044 -71 N 0.048 -72 S 0.050 -73 H 0.047 -74 S 0.041 -75 N 0.037 -76 E 0.038 -77 E 0.045 -78 T 0.059 -79 A 0.075 -80 E 0.081 -81 M 0.077 -82 V 0.074 -83 R 0.080 -84 Q 0.089 -85 I 0.091 -86 Y 0.091 -87 R 0.102 -88 E 0.137 -89 Q 0.200 -90 D 0.283 -91 N 0.366 -92 P 0.431 -93 M 0.481 -94 S 0.528 -95 K 0.572 -96 E 0.602 -97 G 0.618 -98 A 0.627 -99 V 0.635 -100 G 0.640 -101 G 0.630 -102 V 0.597 -103 E 0.541 -104 E 0.476 -105 V 0.409 -106 P 0.343 -107 P 0.278 -108 F 0.219 -109 Q 0.172 -110 P 0.135 -111 Q 0.107 -112 V 0.086 -113 Y 0.070 -114 T 0.059 -115 Y 0.050 -116 V 0.044 -117 L 0.039 -118 D 0.038 -119 V 0.040 -120 G 0.040 -121 K 0.038 -122 R 0.034 -123 E 0.032 -124 S 0.032 -125 V 0.038 -126 Y 0.050 -127 S 0.058 -128 T 0.059 -129 A 0.059 -130 E 0.057 -131 K 0.050 -132 V 0.047 -133 R 0.054 -134 K 0.061 -135 E 0.060 -136 V 0.054 -137 G 0.050 -138 E 0.047 -139 V 0.045 -140 D 0.045 -141 L 0.047 -142 L 0.051 -143 I 0.056 -144 N 0.060 -145 N 0.065 -146 A 0.069 -147 G 0.070 -148 V 0.071 -149 V 0.071 -150 S 0.072 -151 G 0.076 -152 H 0.086 -153 H 0.096 -154 L 0.103 -155 L 0.106 -156 E 0.109 -157 C 0.110 -158 P 0.101 -159 D 0.084 -160 E 0.070 -161 L 0.063 -162 I 0.062 -163 E 0.063 -164 R 0.062 -165 T 0.060 -166 M 0.059 -167 V 0.061 -168 V 0.064 -169 N 0.065 -170 C 0.066 -171 H 0.073 -172 A 0.080 -173 H 0.076 -174 F 0.062 -175 W 0.051 -176 T 0.048 -177 T 0.049 -178 K 0.048 -179 A 0.046 -180 F 0.042 -181 L 0.038 -182 P 0.035 -183 K 0.034 -184 M 0.036 -185 L 0.040 -186 E 0.045 -187 M 0.049 -188 N 0.050 -189 H 0.051 -190 G 0.055 -191 H 0.060 -192 I 0.062 -193 V 0.061 -194 T 0.062 -195 V 0.071 -196 A 0.083 -197 S 0.096 -198 S 0.108 -199 L 0.120 -200 G 0.126 -201 L 0.124 -202 F 0.119 -203 S 0.120 -204 T 0.123 -205 A 0.123 -206 G 0.120 -207 V 0.115 -208 E 0.107 -209 D 0.099 -210 Y 0.099 -211 C 0.108 -212 A 0.116 -213 S 0.115 -214 K 0.107 -215 F 0.095 -216 G 0.082 -217 A 0.073 -218 I 0.071 -219 G 0.076 -220 F 0.079 -221 H 0.073 -222 E 0.062 -223 S 0.057 -224 L 0.063 -225 S 0.072 -226 H 0.075 -227 E 0.071 -228 I 0.067 -229 Q 0.071 -230 A 0.079 -231 S 0.086 -232 E 0.088 -233 K 0.086 -234 D 0.085 -235 G 0.082 -236 I 0.072 -237 K 0.058 -238 M 0.046 -239 T 0.043 -240 L 0.048 -241 V 0.056 -242 C 0.061 -243 P 0.064 -244 Y 0.067 -245 L 0.072 -246 V 0.076 -247 D 0.076 -248 T 0.075 -249 G 0.076 -250 M 0.082 -251 F 0.092 -252 R 0.109 -253 G 0.131 -254 C 0.152 -255 R 0.162 -256 I 0.158 -257 R 0.145 -258 K 0.134 -259 E 0.126 -260 I 0.118 -261 E 0.107 -262 P 0.101 -263 F 0.106 -264 L 0.122 -265 P 0.136 -266 P 0.136 -267 L 0.121 -268 R 0.104 -269 P 0.088 -270 E 0.074 -271 F 0.063 -272 C 0.057 -273 V 0.052 -274 K 0.050 -275 Q 0.054 -276 A 0.058 -277 M 0.058 -278 R 0.057 -279 A 0.061 -280 I 0.070 -281 L 0.082 -282 T 0.095 -283 D 0.104 -284 Q 0.109 -285 P 0.111 -286 M 0.109 -287 I 0.102 -288 C 0.088 -289 T 0.072 -290 P 0.060 -291 R 0.054 -292 I 0.049 -293 V 0.044 -294 Y 0.039 -295 M 0.039 -296 V 0.042 -297 N 0.046 -298 F 0.048 -299 M 0.051 -300 K 0.056 -301 S 0.061 -302 I 0.064 -303 L 0.067 -304 P 0.071 -305 F 0.071 -306 E 0.068 -307 A 0.067 -308 I 0.074 -309 V 0.087 -310 C 0.093 -311 M 0.090 -312 Y 0.085 -313 R 0.085 -314 F 0.092 -315 L 0.102 -316 G 0.110 -317 A 0.116 -318 D 0.119 -319 K 0.118 -320 C 0.114 -321 M 0.109 -322 Y 0.107 -323 P 0.106 -324 F 0.102 -325 L 0.101 -326 A 0.105 -327 Q 0.117 -328 R 0.132 -329 K 0.150 -330 E 0.176 -331 A 0.208 -332 M 0.241 -333 N 0.272 -334 N 0.301 -335 N 0.323 -336 E 0.340 -337 A 0.360 -338 K 0.392 -339 N 0.422 -340 G 0.429 -341 I 0.420 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000070579_ENSDART00000103785_GN:ggact.3_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000070579_ENSDART00000103785_GN:ggact.3_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 258c7a4788a5a57224f55f3e1fac8fd9ddc13e0c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000070579_ENSDART00000103785_GN:ggact.3_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,153 +0,0 @@ ->ENSDARG00000070579|ENSDART00000103785|GN:ggact.3|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.259 -2 S 0.214 -3 T 0.150 -4 H 0.095 -5 H 0.059 -6 V 0.042 -7 F 0.036 -8 V 0.034 -9 Y 0.036 -10 G 0.043 -11 S 0.058 -12 L 0.072 -13 K 0.080 -14 K 0.083 -15 G 0.082 -16 Q 0.079 -17 P 0.076 -18 N 0.073 -19 H 0.073 -20 H 0.080 -21 E 0.092 -22 L 0.109 -23 L 0.127 -24 N 0.144 -25 S 0.156 -26 N 0.164 -27 N 0.166 -28 G 0.154 -29 Q 0.129 -30 A 0.099 -31 E 0.075 -32 F 0.060 -33 I 0.051 -34 T 0.047 -35 C 0.047 -36 A 0.050 -37 Q 0.055 -38 T 0.064 -39 K 0.075 -40 E 0.081 -41 P 0.080 -42 Y 0.078 -43 P 0.079 -44 L 0.082 -45 V 0.084 -46 I 0.085 -47 A 0.086 -48 T 0.091 -49 K 0.097 -50 H 0.099 -51 N 0.094 -52 I 0.088 -53 P 0.086 -54 F 0.088 -55 L 0.094 -56 L 0.102 -57 N 0.108 -58 V 0.114 -59 P 0.121 -60 G 0.128 -61 S 0.130 -62 G 0.128 -63 K 0.129 -64 Q 0.132 -65 V 0.127 -66 S 0.107 -67 G 0.082 -68 E 0.063 -69 I 0.051 -70 Y 0.046 -71 S 0.046 -72 V 0.049 -73 D 0.051 -74 Q 0.051 -75 K 0.052 -76 M 0.056 -77 L 0.065 -78 E 0.072 -79 F 0.070 -80 L 0.062 -81 D 0.055 -82 W 0.050 -83 F 0.046 -84 E 0.042 -85 K 0.038 -86 C 0.038 -87 P 0.039 -88 D 0.040 -89 W 0.042 -90 Y 0.045 -91 Q 0.044 -92 R 0.042 -93 T 0.040 -94 S 0.040 -95 I 0.040 -96 Q 0.037 -97 L 0.038 -98 E 0.046 -99 I 0.066 -100 L 0.097 -101 K 0.130 -102 G 0.157 -103 N 0.171 -104 G 0.175 -105 E 0.173 -106 S 0.169 -107 G 0.160 -108 R 0.143 -109 I 0.121 -110 E 0.094 -111 E 0.071 -112 A 0.057 -113 S 0.052 -114 V 0.051 -115 Y 0.051 -116 S 0.052 -117 K 0.058 -118 I 0.068 -119 N 0.080 -120 F 0.088 -121 E 0.092 -122 P 0.094 -123 D 0.095 -124 W 0.094 -125 L 0.091 -126 N 0.087 -127 K 0.083 -128 P 0.081 -129 T 0.084 -130 H 0.096 -131 E 0.115 -132 S 0.137 -133 Y 0.155 -134 D 0.177 -135 T 0.216 -136 N 0.270 -137 G 0.321 -138 D 0.348 -139 H 0.355 -140 G 0.350 -141 L 0.339 -142 K 0.327 -143 F 0.324 -144 V 0.342 -145 C 0.385 -146 R 0.446 -147 E 0.506 -148 D 0.548 -149 R 0.565 -150 K 0.558 -151 D 0.528 -152 D 0.499 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000070579_ENSDART00000103785_GN:ggact.3_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:35.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000070579_ENSDART00000103785_GN:ggact.3_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:35.caid deleted file mode 100644 index 8606bc2607ef8c996b96c30627846a37a4581913..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000070579_ENSDART00000103785_GN:ggact.3_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:35.caid +++ /dev/null @@ -1,188 +0,0 @@ ->ENSDARG00000070579|ENSDART00000103785|GN:ggact.3|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:35 -1 M 0.393 -2 K 0.416 -3 L 0.450 -4 L 0.464 -5 I 0.439 -6 K 0.405 -7 H 0.415 -8 S 0.470 -9 V 0.524 -10 R 0.557 -11 P 0.581 -12 S 0.600 -13 R 0.613 -14 K 0.623 -15 K 0.632 -16 G 0.636 -17 F 0.631 -18 F 0.625 -19 S 0.621 -20 I 0.612 -21 L 0.604 -22 S 0.606 -23 V 0.617 -24 L 0.627 -25 V 0.636 -26 M 0.644 -27 N 0.652 -28 S 0.661 -29 T 0.668 -30 M 0.673 -31 N 0.675 -32 T 0.673 -33 T 0.656 -34 V 0.617 -35 S 0.542 -36 M 0.429 -37 S 0.297 -38 T 0.180 -39 H 0.101 -40 H 0.059 -41 V 0.041 -42 F 0.036 -43 V 0.035 -44 Y 0.035 -45 G 0.040 -46 S 0.053 -47 L 0.066 -48 K 0.074 -49 K 0.077 -50 G 0.077 -51 Q 0.076 -52 P 0.074 -53 N 0.072 -54 H 0.072 -55 H 0.078 -56 E 0.089 -57 L 0.104 -58 L 0.122 -59 N 0.139 -60 S 0.152 -61 N 0.159 -62 N 0.159 -63 G 0.146 -64 Q 0.120 -65 A 0.092 -66 E 0.071 -67 F 0.057 -68 I 0.049 -69 T 0.045 -70 C 0.045 -71 A 0.048 -72 Q 0.052 -73 T 0.061 -74 K 0.071 -75 E 0.078 -76 P 0.077 -77 Y 0.076 -78 P 0.077 -79 L 0.078 -80 V 0.079 -81 I 0.080 -82 A 0.081 -83 T 0.085 -84 K 0.091 -85 H 0.093 -86 N 0.088 -87 I 0.082 -88 P 0.081 -89 F 0.083 -90 L 0.089 -91 L 0.096 -92 N 0.102 -93 V 0.107 -94 P 0.113 -95 G 0.119 -96 S 0.123 -97 G 0.122 -98 K 0.123 -99 Q 0.126 -100 V 0.121 -101 S 0.101 -102 G 0.077 -103 E 0.059 -104 I 0.048 -105 Y 0.042 -106 S 0.041 -107 V 0.042 -108 D 0.044 -109 Q 0.045 -110 K 0.048 -111 M 0.054 -112 L 0.063 -113 E 0.071 -114 F 0.069 -115 L 0.060 -116 D 0.053 -117 W 0.049 -118 F 0.045 -119 E 0.041 -120 K 0.038 -121 C 0.037 -122 P 0.038 -123 D 0.039 -124 W 0.041 -125 Y 0.043 -126 Q 0.042 -127 R 0.040 -128 T 0.039 -129 S 0.039 -130 I 0.038 -131 Q 0.036 -132 L 0.037 -133 E 0.045 -134 I 0.064 -135 L 0.093 -136 K 0.124 -137 G 0.150 -138 N 0.166 -139 G 0.172 -140 E 0.174 -141 S 0.173 -142 G 0.165 -143 R 0.149 -144 I 0.125 -145 E 0.097 -146 E 0.072 -147 A 0.057 -148 S 0.052 -149 V 0.051 -150 Y 0.052 -151 S 0.055 -152 K 0.061 -153 I 0.073 -154 N 0.083 -155 F 0.090 -156 E 0.094 -157 P 0.096 -158 D 0.096 -159 W 0.094 -160 L 0.090 -161 N 0.085 -162 K 0.082 -163 P 0.080 -164 T 0.085 -165 H 0.098 -166 E 0.120 -167 S 0.142 -168 Y 0.159 -169 D 0.179 -170 T 0.216 -171 N 0.271 -172 G 0.323 -173 D 0.352 -174 H 0.360 -175 G 0.356 -176 L 0.345 -177 K 0.332 -178 F 0.330 -179 V 0.349 -180 C 0.393 -181 R 0.454 -182 E 0.514 -183 D 0.554 -184 R 0.568 -185 K 0.557 -186 D 0.526 -187 D 0.496 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000071669_ENSDART00000021657_GN:smyd5_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000071669_ENSDART00000021657_GN:smyd5_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index f987b2f63a7d1ea47511dedea12c9bf40514e655..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000071669_ENSDART00000021657_GN:smyd5_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,416 +0,0 @@ ->ENSDARG00000071669|ENSDART00000021657|GN:smyd5|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.367 -2 A 0.359 -3 A 0.338 -4 P 0.299 -5 V 0.247 -6 D 0.195 -7 D 0.152 -8 M 0.116 -9 F 0.091 -10 S 0.080 -11 R 0.082 -12 C 0.088 -13 V 0.092 -14 D 0.096 -15 S 0.105 -16 A 0.117 -17 K 0.124 -18 A 0.122 -19 S 0.105 -20 N 0.077 -21 C 0.050 -22 V 0.035 -23 D 0.032 -24 V 0.036 -25 R 0.045 -26 F 0.057 -27 I 0.066 -28 N 0.071 -29 N 0.074 -30 V 0.077 -31 K 0.077 -32 G 0.074 -33 K 0.072 -34 G 0.074 -35 L 0.077 -36 F 0.082 -37 A 0.089 -38 K 0.097 -39 K 0.104 -40 P 0.110 -41 F 0.115 -42 K 0.118 -43 K 0.124 -44 G 0.135 -45 D 0.149 -46 T 0.158 -47 I 0.161 -48 F 0.159 -49 I 0.156 -50 E 0.153 -51 R 0.146 -52 P 0.139 -53 L 0.133 -54 V 0.128 -55 S 0.122 -56 S 0.112 -57 Q 0.101 -58 F 0.095 -59 L 0.095 -60 W 0.097 -61 N 0.097 -62 A 0.098 -63 L 0.104 -64 Y 0.114 -65 K 0.121 -66 Y 0.118 -67 R 0.105 -68 A 0.088 -69 C 0.071 -70 E 0.058 -71 Y 0.051 -72 C 0.051 -73 L 0.057 -74 R 0.068 -75 A 0.079 -76 L 0.086 -77 E 0.084 -78 T 0.078 -79 A 0.073 -80 E 0.068 -81 E 0.064 -82 N 0.062 -83 A 0.064 -84 R 0.071 -85 R 0.083 -86 L 0.097 -87 S 0.108 -88 G 0.113 -89 L 0.112 -90 P 0.106 -91 A 0.098 -92 L 0.097 -93 I 0.100 -94 L 0.103 -95 P 0.101 -96 H 0.095 -97 P 0.090 -98 E 0.089 -99 L 0.095 -100 C 0.108 -101 K 0.128 -102 V 0.149 -103 R 0.163 -104 P 0.164 -105 D 0.151 -106 R 0.130 -107 H 0.110 -108 Q 0.097 -109 A 0.092 -110 C 0.092 -111 P 0.097 -112 Q 0.103 -113 C 0.104 -114 Q 0.100 -115 V 0.097 -116 M 0.101 -117 Y 0.109 -118 C 0.110 -119 S 0.095 -120 S 0.077 -121 E 0.068 -122 C 0.070 -123 R 0.076 -124 Q 0.077 -125 A 0.070 -126 A 0.059 -127 M 0.053 -128 D 0.051 -129 Q 0.049 -130 Y 0.047 -131 H 0.045 -132 K 0.047 -133 I 0.051 -134 L 0.054 -135 C 0.056 -136 L 0.062 -137 G 0.072 -138 P 0.084 -139 S 0.095 -140 N 0.107 -141 D 0.119 -142 D 0.128 -143 P 0.130 -144 D 0.126 -145 H 0.116 -146 P 0.100 -147 V 0.082 -148 N 0.068 -149 K 0.061 -150 L 0.059 -151 Q 0.057 -152 D 0.057 -153 A 0.056 -154 W 0.055 -155 R 0.057 -156 S 0.062 -157 V 0.067 -158 H 0.069 -159 F 0.070 -160 P 0.075 -161 P 0.084 -162 E 0.095 -163 T 0.100 -164 S 0.098 -165 S 0.088 -166 V 0.076 -167 M 0.066 -168 I 0.059 -169 L 0.055 -170 A 0.049 -171 K 0.044 -172 M 0.038 -173 V 0.034 -174 A 0.034 -175 T 0.035 -176 I 0.035 -177 K 0.033 -178 Q 0.033 -179 T 0.035 -180 Q 0.039 -181 D 0.041 -182 K 0.038 -183 E 0.031 -184 R 0.025 -185 W 0.022 -186 Q 0.026 -187 R 0.034 -188 L 0.042 -189 F 0.046 -190 T 0.046 -191 N 0.046 -192 F 0.047 -193 C 0.051 -194 S 0.064 -195 R 0.083 -196 T 0.099 -197 A 0.102 -198 N 0.094 -199 E 0.085 -200 E 0.082 -201 E 0.082 -202 E 0.080 -203 I 0.072 -204 V 0.062 -205 H 0.055 -206 K 0.055 -207 L 0.058 -208 L 0.061 -209 G 0.061 -210 E 0.058 -211 K 0.053 -212 F 0.048 -213 Q 0.045 -214 G 0.044 -215 Q 0.043 -216 L 0.042 -217 G 0.041 -218 L 0.042 -219 L 0.047 -220 R 0.057 -221 N 0.064 -222 L 0.058 -223 F 0.046 -224 T 0.037 -225 T 0.034 -226 A 0.032 -227 L 0.028 -228 Y 0.026 -229 E 0.027 -230 D 0.030 -231 R 0.032 -232 L 0.035 -233 S 0.037 -234 Q 0.035 -235 W 0.032 -236 F 0.031 -237 T 0.032 -238 P 0.034 -239 E 0.036 -240 G 0.039 -241 F 0.044 -242 R 0.052 -243 S 0.067 -244 L 0.080 -245 F 0.085 -246 S 0.084 -247 L 0.088 -248 V 0.093 -249 G 0.096 -250 T 0.095 -251 N 0.098 -252 G 0.107 -253 Q 0.123 -254 G 0.140 -255 I 0.154 -256 G 0.161 -257 T 0.155 -258 S 0.138 -259 S 0.114 -260 L 0.093 -261 S 0.079 -262 Q 0.071 -263 W 0.069 -264 V 0.073 -265 H 0.080 -266 A 0.082 -267 C 0.081 -268 D 0.081 -269 A 0.084 -270 L 0.091 -271 E 0.100 -272 L 0.106 -273 P 0.102 -274 R 0.089 -275 Q 0.074 -276 Q 0.066 -277 R 0.066 -278 E 0.069 -279 Q 0.074 -280 L 0.082 -281 D 0.092 -282 A 0.099 -283 F 0.098 -284 I 0.089 -285 D 0.078 -286 Q 0.072 -287 L 0.072 -288 Y 0.078 -289 K 0.088 -290 D 0.096 -291 I 0.097 -292 D 0.096 -293 K 0.100 -294 E 0.116 -295 T 0.140 -296 G 0.167 -297 D 0.190 -298 F 0.198 -299 L 0.186 -300 N 0.166 -301 C 0.147 -302 E 0.133 -303 G 0.121 -304 S 0.112 -305 G 0.108 -306 L 0.105 -307 F 0.094 -308 L 0.083 -309 L 0.083 -310 Q 0.092 -311 S 0.097 -312 S 0.093 -313 C 0.084 -314 N 0.078 -315 H 0.077 -316 S 0.080 -317 C 0.087 -318 V 0.091 -319 P 0.089 -320 N 0.084 -321 A 0.082 -322 E 0.087 -323 A 0.095 -324 S 0.103 -325 F 0.109 -326 P 0.109 -327 E 0.102 -328 N 0.089 -329 N 0.077 -330 F 0.068 -331 L 0.065 -332 L 0.066 -333 H 0.071 -334 L 0.082 -335 T 0.103 -336 A 0.127 -337 L 0.144 -338 G 0.149 -339 D 0.149 -340 I 0.153 -341 G 0.161 -342 P 0.171 -343 G 0.178 -344 E 0.181 -345 E 0.181 -346 I 0.173 -347 C 0.158 -348 I 0.147 -349 S 0.141 -350 Y 0.139 -351 L 0.144 -352 D 0.158 -353 C 0.168 -354 C 0.164 -355 Q 0.154 -356 R 0.151 -357 D 0.154 -358 R 0.153 -359 S 0.143 -360 R 0.121 -361 H 0.098 -362 S 0.087 -363 R 0.090 -364 H 0.098 -365 K 0.102 -366 I 0.098 -367 L 0.088 -368 R 0.073 -369 E 0.060 -370 N 0.051 -371 Y 0.048 -372 L 0.049 -373 F 0.053 -374 I 0.054 -375 C 0.050 -376 S 0.046 -377 C 0.049 -378 Q 0.059 -379 K 0.070 -380 C 0.077 -381 L 0.084 -382 S 0.104 -383 Q 0.142 -384 M 0.193 -385 D 0.249 -386 D 0.304 -387 A 0.351 -388 D 0.382 -389 M 0.404 -390 T 0.432 -391 S 0.463 -392 E 0.482 -393 D 0.487 -394 E 0.491 -395 E 0.507 -396 E 0.538 -397 V 0.576 -398 E 0.611 -399 G 0.634 -400 E 0.632 -401 G 0.593 -402 E 0.533 -403 T 0.492 -404 E 0.487 -405 G 0.491 -406 E 0.496 -407 D 0.518 -408 M 0.536 -409 E 0.524 -410 D 0.511 -411 E 0.531 -412 M 0.558 -413 T 0.554 -414 D 0.515 -415 V 0.477 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000071669_ENSDART00000021657_GN:smyd5_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:28.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000071669_ENSDART00000021657_GN:smyd5_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:28.caid deleted file mode 100644 index 3a8ed6e8a8e0fb7836f3a7f6987bd9e60f886d8d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000071669_ENSDART00000021657_GN:smyd5_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:28.caid +++ /dev/null @@ -1,444 +0,0 @@ ->ENSDARG00000071669|ENSDART00000021657|GN:smyd5|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:28 -1 M 0.232 -2 L 0.219 -3 K 0.208 -4 K 0.214 -5 E 0.228 -6 R 0.231 -7 R 0.227 -8 S 0.236 -9 L 0.255 -10 S 0.262 -11 R 0.251 -12 T 0.240 -13 L 0.238 -14 I 0.242 -15 G 0.245 -16 Q 0.246 -17 V 0.242 -18 E 0.230 -19 R 0.216 -20 L 0.211 -21 E 0.216 -22 V 0.222 -23 K 0.227 -24 M 0.242 -25 L 0.267 -26 I 0.293 -27 S 0.317 -28 N 0.342 -29 M 0.360 -30 A 0.358 -31 A 0.331 -32 P 0.287 -33 V 0.237 -34 D 0.193 -35 D 0.159 -36 M 0.130 -37 F 0.108 -38 S 0.097 -39 R 0.096 -40 C 0.099 -41 V 0.101 -42 D 0.102 -43 S 0.108 -44 A 0.117 -45 K 0.122 -46 A 0.119 -47 S 0.102 -48 N 0.075 -49 C 0.049 -50 V 0.035 -51 D 0.032 -52 V 0.037 -53 R 0.047 -54 F 0.059 -55 I 0.068 -56 N 0.073 -57 N 0.076 -58 V 0.077 -59 K 0.075 -60 G 0.071 -61 K 0.069 -62 G 0.071 -63 L 0.074 -64 F 0.080 -65 A 0.088 -66 K 0.096 -67 K 0.105 -68 P 0.112 -69 F 0.116 -70 K 0.118 -71 K 0.121 -72 G 0.129 -73 D 0.142 -74 T 0.151 -75 I 0.155 -76 F 0.155 -77 I 0.154 -78 E 0.151 -79 R 0.145 -80 P 0.138 -81 L 0.133 -82 V 0.129 -83 S 0.122 -84 S 0.111 -85 Q 0.099 -86 F 0.093 -87 L 0.092 -88 W 0.094 -89 N 0.094 -90 A 0.096 -91 L 0.102 -92 Y 0.111 -93 K 0.115 -94 Y 0.111 -95 R 0.100 -96 A 0.084 -97 C 0.068 -98 E 0.056 -99 Y 0.049 -100 C 0.049 -101 L 0.055 -102 R 0.065 -103 A 0.078 -104 L 0.085 -105 E 0.085 -106 T 0.079 -107 A 0.073 -108 E 0.067 -109 E 0.063 -110 N 0.061 -111 A 0.062 -112 R 0.069 -113 R 0.080 -114 L 0.094 -115 S 0.105 -116 G 0.111 -117 L 0.110 -118 P 0.105 -119 A 0.101 -120 L 0.102 -121 I 0.106 -122 L 0.108 -123 P 0.105 -124 H 0.099 -125 P 0.093 -126 E 0.092 -127 L 0.099 -128 C 0.114 -129 K 0.136 -130 V 0.158 -131 R 0.173 -132 P 0.174 -133 D 0.161 -134 R 0.137 -135 H 0.115 -136 Q 0.099 -137 A 0.093 -138 C 0.092 -139 P 0.096 -140 Q 0.103 -141 C 0.105 -142 Q 0.103 -143 V 0.102 -144 M 0.106 -145 Y 0.114 -146 C 0.113 -147 S 0.097 -148 S 0.077 -149 E 0.068 -150 C 0.070 -151 R 0.075 -152 Q 0.076 -153 A 0.069 -154 A 0.058 -155 M 0.052 -156 D 0.050 -157 Q 0.049 -158 Y 0.046 -159 H 0.044 -160 K 0.046 -161 I 0.050 -162 L 0.053 -163 C 0.055 -164 L 0.062 -165 G 0.073 -166 P 0.085 -167 S 0.096 -168 N 0.107 -169 D 0.119 -170 D 0.127 -171 P 0.128 -172 D 0.123 -173 H 0.113 -174 P 0.098 -175 V 0.080 -176 N 0.067 -177 K 0.060 -178 L 0.057 -179 Q 0.057 -180 D 0.056 -181 A 0.055 -182 W 0.055 -183 R 0.057 -184 S 0.062 -185 V 0.066 -186 H 0.067 -187 F 0.067 -188 P 0.071 -189 P 0.081 -190 E 0.091 -191 T 0.097 -192 S 0.094 -193 S 0.085 -194 V 0.074 -195 M 0.064 -196 I 0.058 -197 L 0.054 -198 A 0.048 -199 K 0.042 -200 M 0.037 -201 V 0.033 -202 A 0.032 -203 T 0.032 -204 I 0.032 -205 K 0.030 -206 Q 0.030 -207 T 0.033 -208 Q 0.036 -209 D 0.038 -210 K 0.035 -211 E 0.028 -212 R 0.022 -213 W 0.020 -214 Q 0.023 -215 R 0.030 -216 L 0.038 -217 F 0.042 -218 T 0.042 -219 N 0.041 -220 F 0.042 -221 C 0.046 -222 S 0.057 -223 R 0.075 -224 T 0.091 -225 A 0.095 -226 N 0.087 -227 E 0.079 -228 E 0.077 -229 E 0.077 -230 E 0.074 -231 I 0.066 -232 V 0.056 -233 H 0.049 -234 K 0.048 -235 L 0.052 -236 L 0.055 -237 G 0.056 -238 E 0.053 -239 K 0.049 -240 F 0.044 -241 Q 0.041 -242 G 0.040 -243 Q 0.039 -244 L 0.039 -245 G 0.038 -246 L 0.039 -247 L 0.045 -248 R 0.056 -249 N 0.062 -250 L 0.057 -251 F 0.044 -252 T 0.035 -253 T 0.031 -254 A 0.029 -255 L 0.026 -256 Y 0.025 -257 E 0.026 -258 D 0.029 -259 R 0.032 -260 L 0.035 -261 S 0.038 -262 Q 0.036 -263 W 0.033 -264 F 0.032 -265 T 0.033 -266 P 0.034 -267 E 0.036 -268 G 0.039 -269 F 0.044 -270 R 0.052 -271 S 0.067 -272 L 0.080 -273 F 0.084 -274 S 0.084 -275 L 0.087 -276 V 0.092 -277 G 0.095 -278 T 0.095 -279 N 0.098 -280 G 0.107 -281 Q 0.123 -282 G 0.139 -283 I 0.153 -284 G 0.159 -285 T 0.154 -286 S 0.138 -287 S 0.115 -288 L 0.094 -289 S 0.079 -290 Q 0.067 -291 W 0.058 -292 V 0.053 -293 H 0.055 -294 A 0.063 -295 C 0.073 -296 D 0.081 -297 A 0.087 -298 L 0.094 -299 E 0.104 -300 L 0.110 -301 P 0.107 -302 R 0.093 -303 Q 0.077 -304 Q 0.065 -305 R 0.060 -306 E 0.060 -307 Q 0.066 -308 L 0.078 -309 D 0.090 -310 A 0.098 -311 F 0.096 -312 I 0.089 -313 D 0.080 -314 Q 0.076 -315 L 0.077 -316 Y 0.084 -317 K 0.095 -318 D 0.103 -319 I 0.104 -320 D 0.101 -321 K 0.104 -322 E 0.118 -323 T 0.142 -324 G 0.171 -325 D 0.195 -326 F 0.203 -327 L 0.191 -328 N 0.170 -329 C 0.151 -330 E 0.136 -331 G 0.124 -332 S 0.115 -333 G 0.111 -334 L 0.107 -335 F 0.096 -336 L 0.085 -337 L 0.085 -338 Q 0.094 -339 S 0.099 -340 S 0.095 -341 C 0.086 -342 N 0.080 -343 H 0.079 -344 S 0.083 -345 C 0.090 -346 V 0.094 -347 P 0.092 -348 N 0.087 -349 A 0.085 -350 E 0.089 -351 A 0.097 -352 S 0.104 -353 F 0.110 -354 P 0.109 -355 E 0.100 -356 N 0.087 -357 N 0.075 -358 F 0.066 -359 L 0.064 -360 L 0.066 -361 H 0.071 -362 L 0.083 -363 T 0.103 -364 A 0.127 -365 L 0.144 -366 G 0.150 -367 D 0.150 -368 I 0.154 -369 G 0.162 -370 P 0.172 -371 G 0.178 -372 E 0.181 -373 E 0.180 -374 I 0.172 -375 C 0.158 -376 I 0.148 -377 S 0.143 -378 Y 0.141 -379 L 0.145 -380 D 0.157 -381 C 0.167 -382 C 0.163 -383 Q 0.153 -384 R 0.150 -385 D 0.153 -386 R 0.154 -387 S 0.144 -388 R 0.123 -389 H 0.100 -390 S 0.089 -391 R 0.091 -392 H 0.098 -393 K 0.102 -394 I 0.099 -395 L 0.088 -396 R 0.074 -397 E 0.060 -398 N 0.051 -399 Y 0.048 -400 L 0.049 -401 F 0.054 -402 I 0.055 -403 C 0.051 -404 S 0.047 -405 C 0.051 -406 Q 0.060 -407 K 0.071 -408 C 0.078 -409 L 0.085 -410 S 0.105 -411 Q 0.143 -412 M 0.194 -413 D 0.249 -414 D 0.306 -415 A 0.354 -416 D 0.387 -417 M 0.412 -418 T 0.442 -419 S 0.473 -420 E 0.491 -421 D 0.496 -422 E 0.500 -423 E 0.516 -424 E 0.546 -425 V 0.584 -426 E 0.619 -427 G 0.642 -428 E 0.640 -429 G 0.602 -430 E 0.541 -431 T 0.499 -432 E 0.494 -433 G 0.497 -434 E 0.502 -435 D 0.525 -436 M 0.543 -437 E 0.530 -438 D 0.519 -439 E 0.541 -440 M 0.572 -441 T 0.569 -442 D 0.528 -443 V 0.487 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000086458_ENSDART00000127600_GN:hdac10_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000086458_ENSDART00000127600_GN:hdac10_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 192f11bb2e897aaf426ce2ca620116f3ee4ae511..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000086458_ENSDART00000127600_GN:hdac10_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,676 +0,0 @@ ->ENSDARG00000086458|ENSDART00000127600|GN:hdac10|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.320 -2 A 0.289 -3 S 0.230 -4 G 0.160 -5 S 0.104 -6 A 0.076 -7 L 0.072 -8 I 0.079 -9 F 0.087 -10 D 0.094 -11 E 0.103 -12 E 0.109 -13 M 0.110 -14 S 0.107 -15 R 0.107 -16 Y 0.112 -17 K 0.124 -18 L 0.143 -19 L 0.168 -20 W 0.196 -21 T 0.218 -22 D 0.230 -23 P 0.235 -24 A 0.240 -25 C 0.239 -26 E 0.230 -27 I 0.220 -28 E 0.215 -29 V 0.208 -30 P 0.189 -31 E 0.163 -32 R 0.139 -33 L 0.121 -34 T 0.109 -35 V 0.107 -36 S 0.115 -37 Y 0.122 -38 E 0.121 -39 A 0.115 -40 L 0.107 -41 R 0.098 -42 T 0.090 -43 H 0.087 -44 G 0.091 -45 L 0.098 -46 A 0.102 -47 Q 0.103 -48 R 0.104 -49 C 0.110 -50 K 0.119 -51 A 0.128 -52 V 0.128 -53 P 0.117 -54 V 0.104 -55 R 0.097 -56 Q 0.092 -57 A 0.085 -58 T 0.079 -59 E 0.081 -60 Q 0.087 -61 E 0.088 -62 I 0.083 -63 L 0.080 -64 L 0.084 -65 A 0.088 -66 H 0.082 -67 S 0.068 -68 E 0.056 -69 E 0.051 -70 Y 0.048 -71 L 0.045 -72 E 0.043 -73 A 0.046 -74 V 0.054 -75 K 0.062 -76 Q 0.071 -77 T 0.081 -78 P 0.088 -79 G 0.089 -80 M 0.084 -81 N 0.075 -82 V 0.064 -83 E 0.058 -84 E 0.060 -85 L 0.070 -86 M 0.086 -87 A 0.101 -88 F 0.110 -89 S 0.109 -90 K 0.103 -91 K 0.098 -92 Y 0.099 -93 N 0.106 -94 D 0.117 -95 V 0.125 -96 Y 0.124 -97 F 0.115 -98 H 0.105 -99 Q 0.105 -100 N 0.114 -101 I 0.122 -102 Y 0.126 -103 H 0.135 -104 C 0.148 -105 A 0.151 -106 K 0.138 -107 L 0.127 -108 A 0.124 -109 A 0.118 -110 G 0.107 -111 A 0.098 -112 T 0.088 -113 L 0.073 -114 Q 0.059 -115 L 0.050 -116 V 0.047 -117 D 0.044 -118 S 0.044 -119 V 0.046 -120 M 0.049 -121 K 0.052 -122 R 0.057 -123 E 0.060 -124 V 0.062 -125 R 0.069 -126 N 0.086 -127 G 0.113 -128 M 0.144 -129 A 0.170 -130 L 0.187 -131 V 0.198 -132 R 0.204 -133 P 0.201 -134 P 0.186 -135 G 0.167 -136 H 0.155 -137 H 0.151 -138 S 0.147 -139 Q 0.142 -140 R 0.146 -141 S 0.168 -142 A 0.199 -143 A 0.213 -144 N 0.204 -145 G 0.189 -146 F 0.183 -147 C 0.178 -148 V 0.167 -149 F 0.153 -150 N 0.143 -151 N 0.132 -152 V 0.118 -153 A 0.106 -154 I 0.098 -155 A 0.087 -156 A 0.074 -157 L 0.064 -158 Y 0.056 -159 A 0.049 -160 K 0.043 -161 K 0.041 -162 N 0.042 -163 Y 0.044 -164 N 0.046 -165 L 0.046 -166 N 0.048 -167 R 0.058 -168 I 0.079 -169 L 0.108 -170 I 0.140 -171 V 0.161 -172 D 0.156 -173 W 0.127 -174 D 0.093 -175 V 0.072 -176 H 0.068 -177 H 0.076 -178 G 0.090 -179 Q 0.107 -180 G 0.121 -181 I 0.122 -182 Q 0.112 -183 Y 0.101 -184 C 0.093 -185 F 0.085 -186 E 0.077 -187 E 0.072 -188 D 0.071 -189 P 0.070 -190 S 0.072 -191 V 0.077 -192 L 0.083 -193 Y 0.086 -194 F 0.087 -195 S 0.087 -196 W 0.084 -197 H 0.078 -198 R 0.074 -199 Y 0.076 -200 E 0.086 -201 H 0.098 -202 Q 0.102 -203 S 0.097 -204 F 0.088 -205 W 0.086 -206 P 0.095 -207 N 0.112 -208 L 0.127 -209 P 0.137 -210 E 0.142 -211 S 0.141 -212 D 0.135 -213 Y 0.130 -214 S 0.134 -215 S 0.145 -216 V 0.154 -217 G 0.156 -218 K 0.157 -219 G 0.168 -220 K 0.194 -221 G 0.222 -222 S 0.233 -223 G 0.228 -224 F 0.219 -225 N 0.219 -226 I 0.221 -227 N 0.217 -228 L 0.201 -229 P 0.180 -230 W 0.161 -231 N 0.146 -232 K 0.141 -233 V 0.146 -234 G 0.152 -235 M 0.146 -236 T 0.132 -237 N 0.123 -238 S 0.124 -239 D 0.121 -240 Y 0.109 -241 L 0.098 -242 A 0.095 -243 A 0.096 -244 F 0.089 -245 F 0.077 -246 H 0.067 -247 V 0.059 -248 L 0.048 -249 L 0.037 -250 P 0.031 -251 V 0.028 -252 A 0.026 -253 Y 0.028 -254 E 0.033 -255 F 0.042 -256 D 0.051 -257 P 0.061 -258 E 0.075 -259 L 0.098 -260 V 0.131 -261 I 0.166 -262 V 0.191 -263 S 0.199 -264 A 0.187 -265 G 0.169 -266 F 0.162 -267 D 0.165 -268 S 0.164 -269 A 0.151 -270 I 0.137 -271 G 0.131 -272 D 0.131 -273 P 0.129 -274 E 0.127 -275 G 0.129 -276 E 0.131 -277 M 0.129 -278 C 0.125 -279 A 0.120 -280 L 0.113 -281 P 0.103 -282 E 0.093 -283 I 0.087 -284 F 0.084 -285 A 0.082 -286 H 0.080 -287 L 0.078 -288 T 0.078 -289 H 0.076 -290 L 0.073 -291 L 0.066 -292 M 0.053 -293 P 0.041 -294 L 0.036 -295 A 0.042 -296 A 0.055 -297 G 0.069 -298 K 0.083 -299 M 0.099 -300 C 0.118 -301 V 0.133 -302 V 0.140 -303 L 0.138 -304 E 0.131 -305 G 0.126 -306 G 0.125 -307 Y 0.121 -308 N 0.111 -309 L 0.102 -310 T 0.100 -311 S 0.102 -312 L 0.099 -313 G 0.095 -314 Q 0.097 -315 S 0.102 -316 V 0.101 -317 C 0.098 -318 Q 0.096 -319 T 0.092 -320 V 0.086 -321 H 0.085 -322 S 0.090 -323 L 0.098 -324 L 0.117 -325 G 0.149 -326 D 0.185 -327 P 0.209 -328 T 0.219 -329 P 0.226 -330 R 0.242 -331 I 0.263 -332 S 0.277 -333 G 0.272 -334 L 0.252 -335 G 0.228 -336 T 0.209 -337 A 0.190 -338 C 0.164 -339 D 0.135 -340 S 0.116 -341 A 0.107 -342 L 0.104 -343 E 0.104 -344 S 0.106 -345 I 0.107 -346 Q 0.109 -347 N 0.113 -348 V 0.116 -349 R 0.114 -350 N 0.114 -351 V 0.117 -352 Q 0.114 -353 S 0.102 -354 S 0.085 -355 Y 0.070 -356 W 0.062 -357 S 0.061 -358 S 0.069 -359 F 0.084 -360 K 0.108 -361 H 0.149 -362 L 0.215 -363 A 0.294 -364 Q 0.370 -365 S 0.433 -366 E 0.482 -367 T 0.519 -368 N 0.542 -369 P 0.554 -370 K 0.563 -371 R 0.582 -372 P 0.616 -373 R 0.657 -374 L 0.693 -375 D 0.713 -376 A 0.715 -377 T 0.707 -378 N 0.694 -379 G 0.667 -380 G 0.608 -381 P 0.512 -382 K 0.425 -383 E 0.413 -384 S 0.479 -385 S 0.564 -386 E 0.624 -387 P 0.658 -388 A 0.674 -389 S 0.673 -390 E 0.660 -391 S 0.648 -392 N 0.642 -393 P 0.642 -394 K 0.646 -395 K 0.653 -396 T 0.660 -397 A 0.657 -398 Q 0.629 -399 D 0.569 -400 I 0.488 -401 V 0.415 -402 W 0.374 -403 P 0.369 -404 E 0.373 -405 P 0.357 -406 L 0.323 -407 K 0.290 -408 R 0.267 -409 M 0.252 -410 P 0.242 -411 A 0.239 -412 S 0.243 -413 V 0.249 -414 R 0.250 -415 T 0.241 -416 V 0.228 -417 V 0.220 -418 V 0.222 -419 P 0.235 -420 P 0.251 -421 P 0.258 -422 G 0.253 -423 V 0.238 -424 E 0.225 -425 L 0.222 -426 T 0.234 -427 L 0.258 -428 P 0.279 -429 K 0.285 -430 N 0.281 -431 C 0.282 -432 Q 0.302 -433 H 0.348 -434 S 0.399 -435 G 0.423 -436 D 0.405 -437 I 0.353 -438 S 0.280 -439 E 0.204 -440 S 0.146 -441 T 0.116 -442 A 0.106 -443 K 0.103 -444 E 0.095 -445 V 0.084 -446 Q 0.079 -447 R 0.081 -448 I 0.083 -449 R 0.082 -450 D 0.082 -451 K 0.087 -452 H 0.094 -453 F 0.099 -454 H 0.102 -455 D 0.108 -456 L 0.118 -457 T 0.130 -458 D 0.139 -459 Q 0.141 -460 N 0.137 -461 I 0.130 -462 L 0.122 -463 R 0.118 -464 S 0.118 -465 L 0.117 -466 G 0.109 -467 N 0.095 -468 I 0.080 -469 I 0.067 -470 S 0.060 -471 V 0.056 -472 L 0.055 -473 D 0.058 -474 R 0.066 -475 M 0.076 -476 M 0.084 -477 R 0.087 -478 S 0.087 -479 D 0.083 -480 E 0.078 -481 V 0.075 -482 C 0.077 -483 N 0.084 -484 G 0.098 -485 C 0.120 -486 V 0.143 -487 V 0.161 -488 V 0.164 -489 S 0.151 -490 D 0.133 -491 L 0.121 -492 S 0.112 -493 V 0.101 -494 S 0.091 -495 V 0.083 -496 Q 0.079 -497 C 0.077 -498 A 0.081 -499 L 0.087 -500 Q 0.086 -501 H 0.082 -502 A 0.078 -503 L 0.074 -504 T 0.069 -505 E 0.065 -506 P 0.066 -507 A 0.070 -508 E 0.080 -509 R 0.103 -510 V 0.137 -511 L 0.172 -512 V 0.196 -513 V 0.203 -514 Y 0.191 -515 V 0.168 -516 G 0.148 -517 D 0.140 -518 G 0.145 -519 E 0.156 -520 L 0.170 -521 P 0.178 -522 V 0.176 -523 K 0.171 -524 T 0.174 -525 N 0.185 -526 D 0.191 -527 G 0.180 -528 K 0.157 -529 V 0.141 -530 F 0.146 -531 L 0.165 -532 V 0.181 -533 Q 0.179 -534 I 0.162 -535 C 0.145 -536 T 0.141 -537 K 0.150 -538 E 0.167 -539 T 0.190 -540 E 0.217 -541 D 0.242 -542 K 0.255 -543 C 0.248 -544 V 0.218 -545 N 0.183 -546 R 0.158 -547 L 0.148 -548 S 0.147 -549 L 0.151 -550 C 0.157 -551 L 0.157 -552 R 0.154 -553 E 0.155 -554 G 0.161 -555 E 0.159 -556 S 0.145 -557 L 0.128 -558 T 0.118 -559 A 0.119 -560 G 0.122 -561 F 0.120 -562 M 0.116 -563 Q 0.118 -564 A 0.121 -565 L 0.120 -566 L 0.113 -567 G 0.104 -568 L 0.089 -569 I 0.069 -570 L 0.051 -571 P 0.039 -572 V 0.033 -573 A 0.033 -574 Y 0.037 -575 E 0.045 -576 F 0.055 -577 N 0.063 -578 P 0.069 -579 A 0.076 -580 L 0.088 -581 V 0.107 -582 L 0.130 -583 G 0.152 -584 I 0.161 -585 V 0.153 -586 G 0.140 -587 E 0.136 -588 T 0.142 -589 A 0.151 -590 A 0.159 -591 K 0.167 -592 T 0.173 -593 G 0.171 -594 L 0.161 -595 M 0.148 -596 T 0.131 -597 V 0.112 -598 W 0.097 -599 G 0.090 -600 H 0.089 -601 M 0.088 -602 T 0.083 -603 C 0.078 -604 L 0.075 -605 I 0.072 -606 Q 0.064 -607 G 0.056 -608 L 0.055 -609 A 0.063 -610 R 0.077 -611 G 0.092 -612 R 0.109 -613 T 0.125 -614 L 0.135 -615 T 0.132 -616 L 0.117 -617 L 0.099 -618 Q 0.088 -619 G 0.086 -620 Y 0.090 -621 D 0.098 -622 K 0.109 -623 D 0.117 -624 L 0.119 -625 L 0.117 -626 E 0.116 -627 L 0.116 -628 T 0.117 -629 V 0.118 -630 S 0.122 -631 A 0.127 -632 L 0.137 -633 S 0.156 -634 G 0.186 -635 A 0.216 -636 S 0.234 -637 I 0.240 -638 S 0.242 -639 P 0.246 -640 L 0.251 -641 G 0.254 -642 P 0.248 -643 L 0.234 -644 R 0.214 -645 A 0.187 -646 L 0.156 -647 K 0.130 -648 P 0.115 -649 E 0.110 -650 D 0.108 -651 V 0.110 -652 E 0.114 -653 M 0.116 -654 M 0.115 -655 E 0.113 -656 K 0.112 -657 Q 0.112 -658 R 0.112 -659 Q 0.113 -660 R 0.115 -661 L 0.113 -662 Q 0.108 -663 E 0.101 -664 R 0.096 -665 W 0.096 -666 G 0.102 -667 L 0.110 -668 L 0.119 -669 R 0.135 -670 C 0.162 -671 T 0.199 -672 V 0.238 -673 S 0.274 -674 E 0.306 -675 S 0.326 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000086458_ENSDART00000127600_GN:hdac10_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:48.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000086458_ENSDART00000127600_GN:hdac10_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:48.caid deleted file mode 100644 index 97bbb54e4d8fd81422ac3cfbdb622c27d02278ff..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000086458_ENSDART00000127600_GN:hdac10_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:48.caid +++ /dev/null @@ -1,724 +0,0 @@ ->ENSDARG00000086458|ENSDART00000127600|GN:hdac10|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:48 -1 M 0.276 -2 F 0.298 -3 V 0.326 -4 I 0.334 -5 K 0.309 -6 R 0.272 -7 R 0.250 -8 K 0.246 -9 R 0.250 -10 T 0.269 -11 K 0.294 -12 K 0.299 -13 K 0.288 -14 K 0.299 -15 H 0.341 -16 D 0.380 -17 T 0.409 -18 F 0.446 -19 E 0.490 -20 P 0.518 -21 A 0.518 -22 S 0.488 -23 F 0.429 -24 A 0.362 -25 S 0.308 -26 V 0.265 -27 T 0.226 -28 K 0.196 -29 Y 0.178 -30 I 0.165 -31 L 0.154 -32 Q 0.146 -33 V 0.137 -34 L 0.123 -35 L 0.116 -36 C 0.127 -37 C 0.149 -38 L 0.175 -39 F 0.200 -40 H 0.226 -41 R 0.252 -42 R 0.272 -43 Q 0.293 -44 T 0.320 -45 K 0.354 -46 S 0.387 -47 V 0.409 -48 K 0.409 -49 M 0.379 -50 A 0.318 -51 S 0.237 -52 G 0.159 -53 S 0.103 -54 A 0.076 -55 L 0.072 -56 I 0.079 -57 F 0.087 -58 D 0.094 -59 E 0.103 -60 E 0.111 -61 M 0.113 -62 S 0.112 -63 R 0.113 -64 Y 0.119 -65 K 0.130 -66 L 0.146 -67 L 0.167 -68 W 0.190 -69 T 0.209 -70 D 0.220 -71 P 0.226 -72 A 0.232 -73 C 0.234 -74 E 0.225 -75 I 0.213 -76 E 0.207 -77 V 0.197 -78 P 0.177 -79 E 0.152 -80 R 0.131 -81 L 0.115 -82 T 0.104 -83 V 0.103 -84 S 0.111 -85 Y 0.116 -86 E 0.114 -87 A 0.106 -88 L 0.098 -89 R 0.089 -90 T 0.081 -91 H 0.078 -92 G 0.082 -93 L 0.088 -94 A 0.091 -95 Q 0.091 -96 R 0.093 -97 C 0.098 -98 K 0.108 -99 A 0.118 -100 V 0.119 -101 P 0.109 -102 V 0.097 -103 R 0.091 -104 Q 0.087 -105 A 0.081 -106 T 0.075 -107 E 0.077 -108 Q 0.083 -109 E 0.083 -110 I 0.078 -111 L 0.075 -112 L 0.079 -113 A 0.083 -114 H 0.077 -115 S 0.064 -116 E 0.051 -117 E 0.046 -118 Y 0.043 -119 L 0.039 -120 E 0.038 -121 A 0.041 -122 V 0.049 -123 K 0.058 -124 Q 0.068 -125 T 0.077 -126 P 0.083 -127 G 0.083 -128 M 0.078 -129 N 0.069 -130 V 0.059 -131 E 0.053 -132 E 0.054 -133 L 0.062 -134 M 0.073 -135 A 0.086 -136 F 0.098 -137 S 0.101 -138 K 0.096 -139 K 0.092 -140 Y 0.095 -141 N 0.104 -142 D 0.118 -143 V 0.129 -144 Y 0.129 -145 F 0.119 -146 H 0.107 -147 Q 0.106 -148 N 0.114 -149 I 0.122 -150 Y 0.126 -151 H 0.135 -152 C 0.148 -153 A 0.150 -154 K 0.137 -155 L 0.126 -156 A 0.122 -157 A 0.116 -158 G 0.106 -159 A 0.097 -160 T 0.087 -161 L 0.072 -162 Q 0.057 -163 L 0.048 -164 V 0.044 -165 D 0.041 -166 S 0.042 -167 V 0.044 -168 M 0.046 -169 K 0.049 -170 R 0.053 -171 E 0.058 -172 V 0.061 -173 R 0.068 -174 N 0.086 -175 G 0.114 -176 M 0.146 -177 A 0.172 -178 L 0.188 -179 V 0.197 -180 R 0.202 -181 P 0.198 -182 P 0.183 -183 G 0.163 -184 H 0.152 -185 H 0.149 -186 S 0.147 -187 Q 0.142 -188 R 0.147 -189 S 0.171 -190 A 0.202 -191 A 0.216 -192 N 0.206 -193 G 0.190 -194 F 0.183 -195 C 0.178 -196 V 0.166 -197 F 0.153 -198 N 0.143 -199 N 0.133 -200 V 0.119 -201 A 0.107 -202 I 0.099 -203 A 0.089 -204 A 0.075 -205 L 0.064 -206 Y 0.056 -207 A 0.048 -208 K 0.042 -209 K 0.039 -210 N 0.040 -211 Y 0.042 -212 N 0.044 -213 L 0.045 -214 N 0.048 -215 R 0.059 -216 I 0.081 -217 L 0.112 -218 I 0.143 -219 V 0.164 -220 D 0.158 -221 W 0.127 -222 D 0.092 -223 V 0.070 -224 H 0.065 -225 H 0.073 -226 G 0.086 -227 Q 0.103 -228 G 0.116 -229 I 0.118 -230 Q 0.108 -231 Y 0.097 -232 C 0.090 -233 F 0.082 -234 E 0.074 -235 E 0.069 -236 D 0.067 -237 P 0.067 -238 S 0.069 -239 V 0.074 -240 L 0.080 -241 Y 0.083 -242 F 0.085 -243 S 0.085 -244 W 0.082 -245 H 0.076 -246 R 0.071 -247 Y 0.073 -248 E 0.083 -249 H 0.095 -250 Q 0.099 -251 S 0.093 -252 F 0.084 -253 W 0.082 -254 P 0.092 -255 N 0.108 -256 L 0.124 -257 P 0.134 -258 E 0.140 -259 S 0.140 -260 D 0.134 -261 Y 0.128 -262 S 0.131 -263 S 0.141 -264 V 0.150 -265 G 0.152 -266 K 0.153 -267 G 0.163 -268 K 0.188 -269 G 0.216 -270 S 0.228 -271 G 0.224 -272 F 0.217 -273 N 0.217 -274 I 0.220 -275 N 0.216 -276 L 0.201 -277 P 0.180 -278 W 0.160 -279 N 0.147 -280 K 0.142 -281 V 0.148 -282 G 0.154 -283 M 0.148 -284 T 0.134 -285 N 0.125 -286 S 0.126 -287 D 0.124 -288 Y 0.112 -289 L 0.101 -290 A 0.099 -291 A 0.099 -292 F 0.092 -293 F 0.079 -294 H 0.069 -295 V 0.060 -296 L 0.049 -297 L 0.039 -298 P 0.032 -299 V 0.029 -300 A 0.027 -301 Y 0.029 -302 E 0.035 -303 F 0.043 -304 D 0.053 -305 P 0.063 -306 E 0.077 -307 L 0.100 -308 V 0.134 -309 I 0.170 -310 V 0.196 -311 S 0.203 -312 A 0.191 -313 G 0.173 -314 F 0.166 -315 D 0.169 -316 S 0.167 -317 A 0.154 -318 I 0.139 -319 G 0.133 -320 D 0.133 -321 P 0.131 -322 E 0.129 -323 G 0.131 -324 E 0.134 -325 M 0.133 -326 C 0.129 -327 A 0.124 -328 L 0.117 -329 P 0.106 -330 E 0.096 -331 I 0.089 -332 F 0.086 -333 A 0.084 -334 H 0.082 -335 L 0.081 -336 T 0.080 -337 H 0.079 -338 L 0.076 -339 L 0.068 -340 M 0.055 -341 P 0.042 -342 L 0.037 -343 A 0.044 -344 A 0.057 -345 G 0.071 -346 K 0.085 -347 M 0.102 -348 C 0.120 -349 V 0.135 -350 V 0.143 -351 L 0.142 -352 E 0.135 -353 G 0.129 -354 G 0.127 -355 Y 0.123 -356 N 0.113 -357 L 0.104 -358 T 0.103 -359 S 0.104 -360 L 0.101 -361 G 0.097 -362 Q 0.099 -363 S 0.103 -364 V 0.103 -365 C 0.100 -366 Q 0.098 -367 T 0.094 -368 V 0.089 -369 H 0.087 -370 S 0.091 -371 L 0.099 -372 L 0.117 -373 G 0.150 -374 D 0.187 -375 P 0.211 -376 T 0.221 -377 P 0.229 -378 R 0.244 -379 I 0.264 -380 S 0.277 -381 G 0.273 -382 L 0.253 -383 G 0.229 -384 T 0.210 -385 A 0.191 -386 C 0.164 -387 D 0.136 -388 S 0.118 -389 A 0.109 -390 L 0.104 -391 E 0.104 -392 S 0.107 -393 I 0.108 -394 Q 0.110 -395 N 0.114 -396 V 0.116 -397 R 0.115 -398 N 0.115 -399 V 0.117 -400 Q 0.114 -401 S 0.101 -402 S 0.083 -403 Y 0.068 -404 W 0.060 -405 S 0.061 -406 S 0.069 -407 F 0.084 -408 K 0.109 -409 H 0.151 -410 L 0.217 -411 A 0.298 -412 Q 0.375 -413 S 0.439 -414 E 0.488 -415 T 0.523 -416 N 0.544 -417 P 0.554 -418 K 0.562 -419 R 0.581 -420 P 0.614 -421 R 0.654 -422 L 0.689 -423 D 0.708 -424 A 0.711 -425 T 0.704 -426 N 0.692 -427 G 0.666 -428 G 0.608 -429 P 0.516 -430 K 0.433 -431 E 0.421 -432 S 0.482 -433 S 0.562 -434 E 0.620 -435 P 0.655 -436 A 0.671 -437 S 0.671 -438 E 0.660 -439 S 0.648 -440 N 0.644 -441 P 0.646 -442 K 0.651 -443 K 0.658 -444 T 0.665 -445 A 0.659 -446 Q 0.627 -447 D 0.564 -448 I 0.482 -449 V 0.410 -450 W 0.373 -451 P 0.372 -452 E 0.376 -453 P 0.358 -454 L 0.324 -455 K 0.293 -456 R 0.272 -457 M 0.258 -458 P 0.251 -459 A 0.251 -460 S 0.258 -461 V 0.265 -462 R 0.263 -463 T 0.251 -464 V 0.238 -465 V 0.229 -466 V 0.231 -467 P 0.242 -468 P 0.256 -469 P 0.262 -470 G 0.255 -471 V 0.239 -472 E 0.224 -473 L 0.220 -474 T 0.233 -475 L 0.258 -476 P 0.281 -477 K 0.289 -478 N 0.287 -479 C 0.289 -480 Q 0.308 -481 H 0.351 -482 S 0.401 -483 G 0.427 -484 D 0.412 -485 I 0.361 -486 S 0.287 -487 E 0.209 -488 S 0.149 -489 T 0.118 -490 A 0.109 -491 K 0.106 -492 E 0.099 -493 V 0.088 -494 Q 0.082 -495 R 0.083 -496 I 0.085 -497 R 0.083 -498 D 0.083 -499 K 0.089 -500 H 0.096 -501 F 0.100 -502 H 0.102 -503 D 0.106 -504 L 0.115 -505 T 0.127 -506 D 0.137 -507 Q 0.140 -508 N 0.137 -509 I 0.131 -510 L 0.124 -511 R 0.120 -512 S 0.121 -513 L 0.121 -514 G 0.113 -515 N 0.099 -516 I 0.083 -517 I 0.069 -518 S 0.059 -519 V 0.054 -520 L 0.052 -521 D 0.056 -522 R 0.066 -523 M 0.076 -524 M 0.083 -525 R 0.086 -526 S 0.085 -527 D 0.082 -528 E 0.079 -529 V 0.078 -530 C 0.079 -531 N 0.086 -532 G 0.100 -533 C 0.121 -534 V 0.145 -535 V 0.165 -536 V 0.168 -537 S 0.156 -538 D 0.140 -539 L 0.128 -540 S 0.118 -541 V 0.106 -542 S 0.094 -543 V 0.085 -544 Q 0.080 -545 C 0.078 -546 A 0.083 -547 L 0.089 -548 Q 0.089 -549 H 0.084 -550 A 0.080 -551 L 0.077 -552 T 0.072 -553 E 0.068 -554 P 0.068 -555 A 0.071 -556 E 0.081 -557 R 0.102 -558 V 0.134 -559 L 0.167 -560 V 0.190 -561 V 0.198 -562 Y 0.190 -563 V 0.170 -564 G 0.150 -565 D 0.142 -566 G 0.145 -567 E 0.155 -568 L 0.167 -569 P 0.172 -570 V 0.167 -571 K 0.161 -572 T 0.165 -573 N 0.177 -574 D 0.185 -575 G 0.176 -576 K 0.157 -577 V 0.144 -578 F 0.150 -579 L 0.167 -580 V 0.182 -581 Q 0.180 -582 I 0.164 -583 C 0.148 -584 T 0.144 -585 K 0.152 -586 E 0.168 -587 T 0.192 -588 E 0.218 -589 D 0.243 -590 K 0.257 -591 C 0.250 -592 V 0.221 -593 N 0.186 -594 R 0.160 -595 L 0.147 -596 S 0.145 -597 L 0.149 -598 C 0.154 -599 L 0.154 -600 R 0.151 -601 E 0.153 -602 G 0.159 -603 E 0.159 -604 S 0.146 -605 L 0.130 -606 T 0.120 -607 A 0.121 -608 G 0.123 -609 F 0.120 -610 M 0.117 -611 Q 0.119 -612 A 0.122 -613 L 0.119 -614 L 0.112 -615 G 0.103 -616 L 0.089 -617 I 0.069 -618 L 0.051 -619 P 0.039 -620 V 0.033 -621 A 0.032 -622 Y 0.036 -623 E 0.045 -624 F 0.055 -625 N 0.063 -626 P 0.069 -627 A 0.075 -628 L 0.086 -629 V 0.105 -630 L 0.129 -631 G 0.152 -632 I 0.161 -633 V 0.153 -634 G 0.140 -635 E 0.136 -636 T 0.142 -637 A 0.151 -638 A 0.159 -639 K 0.167 -640 T 0.174 -641 G 0.173 -642 L 0.163 -643 M 0.149 -644 T 0.133 -645 V 0.113 -646 W 0.098 -647 G 0.090 -648 H 0.089 -649 M 0.088 -650 T 0.083 -651 C 0.078 -652 L 0.076 -653 I 0.073 -654 Q 0.065 -655 G 0.057 -656 L 0.057 -657 A 0.065 -658 R 0.078 -659 G 0.094 -660 R 0.110 -661 T 0.127 -662 L 0.138 -663 T 0.135 -664 L 0.119 -665 L 0.101 -666 Q 0.090 -667 G 0.088 -668 Y 0.091 -669 D 0.099 -670 K 0.109 -671 D 0.116 -672 L 0.117 -673 L 0.116 -674 E 0.116 -675 L 0.117 -676 T 0.118 -677 V 0.119 -678 S 0.123 -679 A 0.128 -680 L 0.139 -681 S 0.159 -682 G 0.188 -683 A 0.217 -684 S 0.234 -685 I 0.238 -686 S 0.239 -687 P 0.242 -688 L 0.248 -689 G 0.252 -690 P 0.246 -691 L 0.231 -692 R 0.210 -693 A 0.183 -694 L 0.152 -695 K 0.126 -696 P 0.112 -697 E 0.106 -698 D 0.098 -699 V 0.090 -700 E 0.089 -701 M 0.094 -702 M 0.098 -703 E 0.100 -704 K 0.101 -705 Q 0.104 -706 R 0.108 -707 Q 0.112 -708 R 0.114 -709 L 0.111 -710 Q 0.106 -711 E 0.099 -712 R 0.096 -713 W 0.097 -714 G 0.103 -715 L 0.112 -716 L 0.120 -717 R 0.134 -718 C 0.158 -719 T 0.191 -720 V 0.227 -721 S 0.262 -722 E 0.294 -723 S 0.316 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000099640_ENSDART00000162928_GN:eed_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000099640_ENSDART00000162928_GN:eed_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 2e43b9e2edad5b7a417e4162267d2c9ee8dee3fc..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000099640_ENSDART00000162928_GN:eed_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,444 +0,0 @@ ->ENSDARG00000099640|ENSDART00000162928|GN:eed|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.322 -2 K 0.331 -3 M 0.348 -4 R 0.356 -5 R 0.347 -6 K 0.339 -7 M 0.362 -8 S 0.419 -9 E 0.484 -10 P 0.530 -11 H 0.539 -12 G 0.518 -13 E 0.500 -14 A 0.497 -15 G 0.488 -16 N 0.467 -17 E 0.459 -18 M 0.455 -19 P 0.430 -20 N 0.397 -21 K 0.374 -22 K 0.349 -23 Q 0.323 -24 K 0.327 -25 L 0.368 -26 S 0.416 -27 S 0.468 -28 D 0.535 -29 E 0.593 -30 N 0.619 -31 S 0.628 -32 N 0.641 -33 P 0.660 -34 D 0.678 -35 L 0.691 -36 S 0.700 -37 G 0.701 -38 D 0.693 -39 D 0.681 -40 N 0.670 -41 D 0.663 -42 D 0.650 -43 A 0.613 -44 V 0.560 -45 S 0.539 -46 V 0.576 -47 E 0.640 -48 S 0.681 -49 G 0.688 -50 T 0.669 -51 H 0.640 -52 P 0.616 -53 E 0.603 -54 R 0.600 -55 P 0.601 -56 D 0.608 -57 T 0.628 -58 P 0.659 -59 T 0.692 -60 N 0.713 -61 T 0.714 -62 A 0.698 -63 S 0.684 -64 A 0.689 -65 P 0.704 -66 G 0.708 -67 R 0.697 -68 K 0.679 -69 S 0.661 -70 W 0.645 -71 G 0.629 -72 K 0.603 -73 G 0.560 -74 K 0.510 -75 W 0.468 -76 K 0.439 -77 S 0.415 -78 K 0.381 -79 K 0.325 -80 C 0.253 -81 K 0.178 -82 Y 0.114 -83 S 0.070 -84 F 0.048 -85 K 0.041 -86 C 0.041 -87 V 0.043 -88 N 0.044 -89 S 0.043 -90 L 0.044 -91 K 0.049 -92 E 0.060 -93 D 0.078 -94 H 0.097 -95 G 0.111 -96 Q 0.113 -97 P 0.101 -98 L 0.083 -99 F 0.068 -100 G 0.061 -101 V 0.061 -102 Q 0.065 -103 F 0.074 -104 N 0.084 -105 W 0.094 -106 H 0.102 -107 S 0.106 -108 K 0.111 -109 E 0.119 -110 G 0.126 -111 D 0.122 -112 P 0.102 -113 L 0.074 -114 V 0.052 -115 F 0.042 -116 A 0.038 -117 T 0.040 -118 V 0.052 -119 G 0.070 -120 S 0.083 -121 N 0.080 -122 R 0.065 -123 V 0.051 -124 T 0.044 -125 L 0.040 -126 Y 0.038 -127 E 0.039 -128 C 0.045 -129 H 0.057 -130 S 0.070 -131 Q 0.079 -132 G 0.078 -133 E 0.069 -134 I 0.057 -135 R 0.047 -136 L 0.042 -137 L 0.039 -138 Q 0.036 -139 S 0.035 -140 Y 0.037 -141 V 0.046 -142 D 0.060 -143 A 0.076 -144 D 0.090 -145 A 0.095 -146 D 0.088 -147 E 0.073 -148 N 0.056 -149 F 0.040 -150 Y 0.030 -151 T 0.024 -152 C 0.021 -153 A 0.022 -154 W 0.028 -155 T 0.041 -156 F 0.065 -157 D 0.096 -158 C 0.123 -159 S 0.137 -160 S 0.138 -161 S 0.129 -162 H 0.108 -163 P 0.080 -164 L 0.054 -165 L 0.037 -166 A 0.030 -167 V 0.032 -168 A 0.048 -169 G 0.074 -170 S 0.098 -171 R 0.106 -172 G 0.094 -173 I 0.072 -174 I 0.053 -175 R 0.043 -176 I 0.038 -177 I 0.034 -178 N 0.029 -179 H 0.027 -180 I 0.029 -181 T 0.036 -182 M 0.046 -183 Q 0.055 -184 C 0.056 -185 V 0.048 -186 K 0.037 -187 H 0.032 -188 Y 0.030 -189 V 0.031 -190 G 0.037 -191 H 0.049 -192 G 0.064 -193 N 0.078 -194 A 0.084 -195 I 0.078 -196 N 0.065 -197 E 0.056 -198 L 0.054 -199 K 0.058 -200 F 0.065 -201 H 0.072 -202 P 0.072 -203 R 0.065 -204 D 0.054 -205 P 0.042 -206 N 0.032 -207 L 0.027 -208 L 0.025 -209 L 0.028 -210 S 0.038 -211 V 0.061 -212 S 0.090 -213 K 0.110 -214 D 0.110 -215 H 0.091 -216 A 0.068 -217 L 0.052 -218 R 0.045 -219 L 0.042 -220 W 0.039 -221 N 0.035 -222 I 0.034 -223 Q 0.035 -224 T 0.035 -225 D 0.034 -226 T 0.034 -227 L 0.036 -228 V 0.039 -229 A 0.046 -230 I 0.055 -231 F 0.067 -232 G 0.082 -233 G 0.097 -234 V 0.105 -235 E 0.102 -236 G 0.092 -237 H 0.081 -238 R 0.077 -239 D 0.082 -240 E 0.088 -241 V 0.088 -242 L 0.079 -243 S 0.068 -244 A 0.060 -245 D 0.060 -246 F 0.067 -247 D 0.080 -248 L 0.094 -249 L 0.097 -250 G 0.085 -251 E 0.067 -252 K 0.053 -253 I 0.047 -254 M 0.046 -255 S 0.053 -256 C 0.073 -257 G 0.107 -258 M 0.142 -259 D 0.151 -260 H 0.126 -261 S 0.090 -262 L 0.069 -263 K 0.066 -264 L 0.067 -265 W 0.065 -266 R 0.060 -267 L 0.055 -268 D 0.050 -269 S 0.046 -270 E 0.042 -271 R 0.039 -272 L 0.040 -273 Q 0.042 -274 R 0.047 -275 A 0.058 -276 I 0.079 -277 R 0.110 -278 G 0.143 -279 S 0.170 -280 Y 0.195 -281 E 0.229 -282 Y 0.271 -283 N 0.306 -284 P 0.321 -285 S 0.323 -286 K 0.321 -287 T 0.325 -288 N 0.331 -289 R 0.330 -290 P 0.316 -291 F 0.287 -292 V 0.251 -293 S 0.218 -294 Q 0.194 -295 K 0.178 -296 I 0.159 -297 H 0.136 -298 F 0.118 -299 P 0.112 -300 D 0.104 -301 F 0.090 -302 S 0.077 -303 T 0.076 -304 R 0.085 -305 D 0.089 -306 I 0.088 -307 H 0.091 -308 R 0.100 -309 N 0.107 -310 Y 0.105 -311 V 0.093 -312 D 0.079 -313 C 0.067 -314 V 0.063 -315 R 0.067 -316 W 0.073 -317 L 0.074 -318 G 0.068 -319 D 0.061 -320 L 0.057 -321 I 0.053 -322 L 0.052 -323 S 0.057 -324 K 0.075 -325 S 0.098 -326 C 0.115 -327 E 0.116 -328 N 0.101 -329 A 0.078 -330 I 0.059 -331 V 0.053 -332 C 0.058 -333 W 0.076 -334 K 0.110 -335 P 0.159 -336 G 0.217 -337 R 0.269 -338 M 0.306 -339 E 0.323 -340 D 0.326 -341 D 0.323 -342 I 0.320 -343 D 0.318 -344 R 0.318 -345 I 0.312 -346 K 0.300 -347 P 0.285 -348 N 0.269 -349 E 0.246 -350 S 0.213 -351 N 0.173 -352 V 0.133 -353 T 0.104 -354 I 0.088 -355 L 0.077 -356 G 0.067 -357 R 0.058 -358 F 0.055 -359 D 0.061 -360 Y 0.076 -361 S 0.097 -362 Q 0.122 -363 C 0.158 -364 D 0.204 -365 I 0.245 -366 W 0.261 -367 Y 0.245 -368 M 0.202 -369 R 0.147 -370 F 0.102 -371 S 0.075 -372 M 0.063 -373 D 0.060 -374 F 0.058 -375 W 0.054 -376 Q 0.048 -377 K 0.048 -378 M 0.053 -379 L 0.059 -380 A 0.062 -381 L 0.071 -382 G 0.093 -383 N 0.125 -384 Q 0.150 -385 V 0.154 -386 G 0.135 -387 K 0.103 -388 L 0.075 -389 Y 0.064 -390 V 0.072 -391 W 0.088 -392 D 0.104 -393 L 0.115 -394 E 0.119 -395 V 0.118 -396 E 0.114 -397 D 0.106 -398 P 0.100 -399 H 0.099 -400 K 0.102 -401 A 0.106 -402 K 0.106 -403 C 0.103 -404 T 0.094 -405 T 0.082 -406 L 0.073 -407 T 0.075 -408 L 0.084 -409 P 0.094 -410 R 0.101 -411 C 0.105 -412 T 0.108 -413 S 0.110 -414 A 0.105 -415 I 0.096 -416 R 0.086 -417 Q 0.077 -418 T 0.067 -419 S 0.058 -420 F 0.056 -421 S 0.063 -422 R 0.075 -423 D 0.080 -424 S 0.075 -425 S 0.066 -426 I 0.058 -427 L 0.050 -428 I 0.042 -429 A 0.039 -430 V 0.047 -431 C 0.068 -432 D 0.089 -433 D 0.095 -434 A 0.083 -435 S 0.064 -436 I 0.051 -437 W 0.046 -438 R 0.047 -439 W 0.054 -440 D 0.072 -441 R 0.104 -442 L 0.142 -443 R 0.169 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000099640_ENSDART00000162928_GN:eed_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:11.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000099640_ENSDART00000162928_GN:eed_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:11.caid deleted file mode 100644 index b83020aedf5d881087f14b7081086851f7990d4e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000099640_ENSDART00000162928_GN:eed_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:11.caid +++ /dev/null @@ -1,455 +0,0 @@ ->ENSDARG00000099640|ENSDART00000162928|GN:eed|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:11 -1 M 0.268 -2 F 0.269 -3 C 0.271 -4 F 0.267 -5 P 0.248 -6 T 0.215 -7 V 0.172 -8 W 0.131 -9 H 0.103 -10 R 0.089 -11 W 0.088 -12 M 0.096 -13 K 0.111 -14 M 0.128 -15 R 0.149 -16 R 0.181 -17 K 0.228 -18 M 0.288 -19 S 0.360 -20 E 0.440 -21 P 0.520 -22 H 0.591 -23 G 0.640 -24 E 0.654 -25 A 0.629 -26 G 0.573 -27 N 0.521 -28 E 0.498 -29 M 0.483 -30 P 0.449 -31 N 0.414 -32 K 0.393 -33 K 0.368 -34 Q 0.339 -35 K 0.344 -36 L 0.388 -37 S 0.438 -38 S 0.490 -39 D 0.555 -40 E 0.607 -41 N 0.625 -42 S 0.628 -43 N 0.643 -44 P 0.665 -45 D 0.682 -46 L 0.693 -47 S 0.702 -48 G 0.704 -49 D 0.698 -50 D 0.688 -51 N 0.680 -52 D 0.676 -53 D 0.665 -54 A 0.630 -55 V 0.578 -56 S 0.558 -57 V 0.598 -58 E 0.662 -59 S 0.702 -60 G 0.709 -61 T 0.693 -62 H 0.669 -63 P 0.648 -64 E 0.637 -65 R 0.634 -66 P 0.634 -67 D 0.639 -68 T 0.657 -69 P 0.686 -70 T 0.715 -71 N 0.732 -72 T 0.731 -73 A 0.714 -74 S 0.701 -75 A 0.705 -76 P 0.720 -77 G 0.724 -78 R 0.713 -79 K 0.695 -80 S 0.676 -81 W 0.659 -82 G 0.641 -83 K 0.615 -84 G 0.574 -85 K 0.524 -86 W 0.482 -87 K 0.453 -88 S 0.428 -89 K 0.391 -90 K 0.333 -91 C 0.259 -92 K 0.182 -93 Y 0.117 -94 S 0.072 -95 F 0.049 -96 K 0.041 -97 C 0.041 -98 V 0.044 -99 N 0.044 -100 S 0.043 -101 L 0.044 -102 K 0.048 -103 E 0.058 -104 D 0.075 -105 H 0.094 -106 G 0.108 -107 Q 0.110 -108 P 0.099 -109 L 0.082 -110 F 0.067 -111 G 0.060 -112 V 0.060 -113 Q 0.065 -114 F 0.074 -115 N 0.084 -116 W 0.094 -117 H 0.101 -118 S 0.106 -119 K 0.110 -120 E 0.118 -121 G 0.126 -122 D 0.124 -123 P 0.104 -124 L 0.076 -125 V 0.054 -126 F 0.043 -127 A 0.039 -128 T 0.042 -129 V 0.053 -130 G 0.072 -131 S 0.086 -132 N 0.083 -133 R 0.068 -134 V 0.053 -135 T 0.046 -136 L 0.042 -137 Y 0.040 -138 E 0.041 -139 C 0.048 -140 H 0.060 -141 S 0.074 -142 Q 0.082 -143 G 0.082 -144 E 0.072 -145 I 0.059 -146 R 0.048 -147 L 0.041 -148 L 0.037 -149 Q 0.034 -150 S 0.033 -151 Y 0.036 -152 V 0.045 -153 D 0.059 -154 A 0.074 -155 D 0.087 -156 A 0.091 -157 D 0.085 -158 E 0.072 -159 N 0.055 -160 F 0.040 -161 Y 0.030 -162 T 0.023 -163 C 0.020 -164 A 0.021 -165 W 0.026 -166 T 0.038 -167 F 0.060 -168 D 0.088 -169 C 0.112 -170 S 0.126 -171 S 0.127 -172 S 0.119 -173 H 0.100 -174 P 0.074 -175 L 0.051 -176 L 0.035 -177 A 0.028 -178 V 0.031 -179 A 0.046 -180 G 0.071 -181 S 0.096 -182 R 0.103 -183 G 0.091 -184 I 0.069 -185 I 0.051 -186 R 0.041 -187 I 0.036 -188 I 0.032 -189 N 0.028 -190 H 0.026 -191 I 0.027 -192 T 0.033 -193 M 0.043 -194 Q 0.052 -195 C 0.053 -196 V 0.045 -197 K 0.035 -198 H 0.029 -199 Y 0.027 -200 V 0.029 -201 G 0.035 -202 H 0.045 -203 G 0.059 -204 N 0.072 -205 A 0.077 -206 I 0.072 -207 N 0.061 -208 E 0.054 -209 L 0.052 -210 K 0.056 -211 F 0.064 -212 H 0.069 -213 P 0.068 -214 R 0.060 -215 D 0.049 -216 P 0.038 -217 N 0.029 -218 L 0.025 -219 L 0.024 -220 L 0.026 -221 S 0.036 -222 V 0.057 -223 S 0.085 -224 K 0.105 -225 D 0.105 -226 H 0.087 -227 A 0.065 -228 L 0.050 -229 R 0.044 -230 L 0.041 -231 W 0.039 -232 N 0.035 -233 I 0.034 -234 Q 0.034 -235 T 0.034 -236 D 0.033 -237 T 0.033 -238 L 0.034 -239 V 0.039 -240 A 0.046 -241 I 0.056 -242 F 0.068 -243 G 0.084 -244 G 0.100 -245 V 0.108 -246 E 0.105 -247 G 0.094 -248 H 0.082 -249 R 0.077 -250 D 0.080 -251 E 0.086 -252 V 0.086 -253 L 0.077 -254 S 0.066 -255 A 0.058 -256 D 0.057 -257 F 0.063 -258 D 0.074 -259 L 0.087 -260 L 0.090 -261 G 0.081 -262 E 0.065 -263 K 0.052 -264 I 0.046 -265 M 0.046 -266 S 0.053 -267 C 0.075 -268 G 0.111 -269 M 0.148 -270 D 0.157 -271 H 0.130 -272 S 0.092 -273 L 0.070 -274 K 0.066 -275 L 0.068 -276 W 0.067 -277 R 0.062 -278 L 0.056 -279 D 0.052 -280 S 0.047 -281 E 0.043 -282 R 0.040 -283 L 0.041 -284 Q 0.044 -285 R 0.048 -286 A 0.059 -287 I 0.080 -288 R 0.112 -289 G 0.147 -290 S 0.175 -291 Y 0.202 -292 E 0.236 -293 Y 0.278 -294 N 0.313 -295 P 0.329 -296 S 0.331 -297 K 0.331 -298 T 0.334 -299 N 0.340 -300 R 0.340 -301 P 0.325 -302 F 0.296 -303 V 0.260 -304 S 0.226 -305 Q 0.202 -306 K 0.186 -307 I 0.167 -308 H 0.143 -309 F 0.124 -310 P 0.115 -311 D 0.105 -312 F 0.090 -313 S 0.076 -314 T 0.076 -315 R 0.085 -316 D 0.090 -317 I 0.090 -318 H 0.093 -319 R 0.105 -320 N 0.113 -321 Y 0.111 -322 V 0.099 -323 D 0.083 -324 C 0.071 -325 V 0.067 -326 R 0.070 -327 W 0.075 -328 L 0.075 -329 G 0.069 -330 D 0.063 -331 L 0.059 -332 I 0.057 -333 L 0.054 -334 S 0.059 -335 K 0.076 -336 S 0.099 -337 C 0.114 -338 E 0.114 -339 N 0.099 -340 A 0.077 -341 I 0.059 -342 V 0.054 -343 C 0.060 -344 W 0.080 -345 K 0.116 -346 P 0.167 -347 G 0.225 -348 R 0.278 -349 M 0.313 -350 E 0.327 -351 D 0.328 -352 D 0.324 -353 I 0.320 -354 D 0.317 -355 R 0.315 -356 I 0.309 -357 K 0.297 -358 P 0.283 -359 N 0.265 -360 E 0.240 -361 S 0.206 -362 N 0.166 -363 V 0.127 -364 T 0.099 -365 I 0.083 -366 L 0.074 -367 G 0.064 -368 R 0.056 -369 F 0.053 -370 D 0.058 -371 Y 0.071 -372 S 0.089 -373 Q 0.113 -374 C 0.148 -375 D 0.195 -376 I 0.237 -377 W 0.256 -378 Y 0.242 -379 M 0.200 -380 R 0.146 -381 F 0.101 -382 S 0.075 -383 M 0.063 -384 D 0.059 -385 F 0.057 -386 W 0.052 -387 Q 0.046 -388 K 0.045 -389 M 0.051 -390 L 0.057 -391 A 0.061 -392 L 0.069 -393 G 0.090 -394 N 0.121 -395 Q 0.145 -396 V 0.150 -397 G 0.132 -398 K 0.101 -399 L 0.073 -400 Y 0.063 -401 V 0.069 -402 W 0.084 -403 D 0.097 -404 L 0.106 -405 E 0.111 -406 V 0.111 -407 E 0.108 -408 D 0.102 -409 P 0.097 -410 H 0.098 -411 K 0.103 -412 A 0.108 -413 K 0.110 -414 C 0.106 -415 T 0.097 -416 T 0.084 -417 L 0.075 -418 T 0.077 -419 L 0.086 -420 P 0.097 -421 R 0.105 -422 C 0.109 -423 T 0.112 -424 S 0.114 -425 A 0.109 -426 I 0.099 -427 R 0.089 -428 Q 0.079 -429 T 0.069 -430 S 0.060 -431 F 0.058 -432 S 0.066 -433 R 0.078 -434 D 0.084 -435 S 0.079 -436 S 0.069 -437 I 0.060 -438 L 0.051 -439 I 0.043 -440 A 0.040 -441 V 0.050 -442 C 0.072 -443 D 0.093 -444 D 0.099 -445 A 0.086 -446 S 0.067 -447 I 0.052 -448 W 0.047 -449 R 0.048 -450 W 0.055 -451 D 0.074 -452 R 0.106 -453 L 0.145 -454 R 0.173 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000100588_ENSDART00000161212_GN:rpl36_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000100588_ENSDART00000161212_GN:rpl36_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index dbb4dca9a52ecb1193bb35e0dfbaccad39d2ab0e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000100588_ENSDART00000161212_GN:rpl36_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,106 +0,0 @@ ->ENSDARG00000100588|ENSDART00000161212|GN:rpl36|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.427 -2 V 0.453 -3 V 0.506 -4 R 0.573 -5 Y 0.630 -6 P 0.663 -7 M 0.660 -8 A 0.622 -9 V 0.574 -10 G 0.562 -11 L 0.587 -12 N 0.602 -13 K 0.589 -14 G 0.585 -15 H 0.611 -16 K 0.651 -17 V 0.681 -18 T 0.701 -19 K 0.717 -20 N 0.726 -21 V 0.717 -22 S 0.686 -23 K 0.640 -24 P 0.592 -25 K 0.552 -26 H 0.516 -27 S 0.473 -28 R 0.437 -29 R 0.432 -30 R 0.454 -31 G 0.465 -32 R 0.439 -33 L 0.383 -34 T 0.320 -35 K 0.277 -36 H 0.258 -37 A 0.252 -38 K 0.255 -39 F 0.273 -40 A 0.298 -41 R 0.324 -42 D 0.358 -43 L 0.392 -44 I 0.390 -45 R 0.345 -46 E 0.286 -47 V 0.245 -48 C 0.232 -49 G 0.229 -50 F 0.213 -51 A 0.177 -52 P 0.132 -53 Y 0.094 -54 E 0.072 -55 R 0.061 -56 R 0.054 -57 A 0.051 -58 M 0.054 -59 E 0.060 -60 L 0.065 -61 L 0.067 -62 K 0.067 -63 V 0.067 -64 S 0.064 -65 K 0.059 -66 D 0.051 -67 K 0.045 -68 R 0.045 -69 A 0.048 -70 L 0.050 -71 K 0.052 -72 F 0.055 -73 I 0.055 -74 K 0.049 -75 K 0.043 -76 R 0.044 -77 V 0.049 -78 G 0.055 -79 T 0.059 -80 H 0.062 -81 I 0.063 -82 R 0.063 -83 A 0.062 -84 K 0.061 -85 R 0.062 -86 K 0.066 -87 R 0.074 -88 E 0.078 -89 E 0.075 -90 L 0.070 -91 S 0.070 -92 N 0.070 -93 T 0.062 -94 L 0.053 -95 A 0.052 -96 A 0.057 -97 M 0.068 -98 R 0.089 -99 K 0.126 -100 A 0.174 -101 A 0.223 -102 A 0.266 -103 K 0.296 -104 K 0.310 -105 E 0.312 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000100588_ENSDART00000161212_GN:rpl36_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:11.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000100588_ENSDART00000161212_GN:rpl36_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:11.caid deleted file mode 100644 index 06009264d779f28f456063dcac6f6e8baf9546b4..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000100588_ENSDART00000161212_GN:rpl36_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:11.caid +++ /dev/null @@ -1,117 +0,0 @@ ->ENSDARG00000100588|ENSDART00000161212|GN:rpl36|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:11 -1 M 0.415 -2 T 0.425 -3 I 0.440 -4 E 0.449 -5 L 0.454 -6 F 0.473 -7 C 0.517 -8 V 0.575 -9 S 0.617 -10 A 0.622 -11 E 0.594 -12 M 0.560 -13 V 0.551 -14 V 0.580 -15 R 0.631 -16 Y 0.675 -17 P 0.694 -18 M 0.679 -19 A 0.636 -20 V 0.588 -21 G 0.575 -22 L 0.600 -23 N 0.618 -24 K 0.611 -25 G 0.610 -26 H 0.635 -27 K 0.673 -28 V 0.703 -29 T 0.723 -30 K 0.737 -31 N 0.742 -32 V 0.730 -33 S 0.698 -34 K 0.650 -35 P 0.600 -36 K 0.556 -37 H 0.514 -38 S 0.467 -39 R 0.431 -40 R 0.431 -41 R 0.459 -42 G 0.473 -43 R 0.447 -44 L 0.389 -45 T 0.325 -46 K 0.281 -47 H 0.263 -48 A 0.258 -49 K 0.265 -50 F 0.289 -51 A 0.321 -52 R 0.350 -53 D 0.385 -54 L 0.420 -55 I 0.420 -56 R 0.375 -57 E 0.312 -58 V 0.265 -59 C 0.247 -60 G 0.240 -61 F 0.221 -62 A 0.183 -63 P 0.138 -64 Y 0.099 -65 E 0.077 -66 R 0.065 -67 R 0.057 -68 A 0.054 -69 M 0.057 -70 E 0.063 -71 L 0.068 -72 L 0.071 -73 K 0.071 -74 V 0.070 -75 S 0.067 -76 K 0.061 -77 D 0.052 -78 K 0.046 -79 R 0.046 -80 A 0.049 -81 L 0.052 -82 K 0.054 -83 F 0.056 -84 I 0.056 -85 K 0.050 -86 K 0.044 -87 R 0.045 -88 V 0.051 -89 G 0.056 -90 T 0.061 -91 H 0.063 -92 I 0.064 -93 R 0.064 -94 A 0.064 -95 K 0.064 -96 R 0.064 -97 K 0.069 -98 R 0.076 -99 E 0.080 -100 E 0.077 -101 L 0.072 -102 S 0.072 -103 N 0.071 -104 T 0.063 -105 L 0.054 -106 A 0.053 -107 A 0.059 -108 M 0.070 -109 R 0.093 -110 K 0.132 -111 A 0.181 -112 A 0.231 -113 A 0.274 -114 K 0.304 -115 K 0.319 -116 E 0.322 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000104413_ENSDART00000162875_GN:rogdi_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000104413_ENSDART00000162875_GN:rogdi_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 7e87e100cb3d6e9b8681ed69a8203708c83e73fc..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000104413_ENSDART00000162875_GN:rogdi_species:danio_rerio_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,285 +0,0 @@ ->ENSDARG00000104413|ENSDART00000162875|GN:rogdi|species:danio_rerio|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.322 -2 T 0.323 -3 A 0.327 -4 A 0.328 -5 S 0.318 -6 Q 0.305 -7 A 0.296 -8 E 0.277 -9 R 0.237 -10 T 0.188 -11 V 0.147 -12 L 0.119 -13 E 0.100 -14 E 0.088 -15 E 0.079 -16 F 0.069 -17 N 0.057 -18 W 0.047 -19 L 0.043 -20 L 0.044 -21 K 0.046 -22 E 0.051 -23 E 0.056 -24 V 0.064 -25 H 0.073 -26 A 0.076 -27 V 0.070 -28 L 0.061 -29 K 0.055 -30 Q 0.056 -31 L 0.061 -32 Q 0.070 -33 D 0.076 -34 I 0.073 -35 L 0.066 -36 K 0.060 -37 E 0.056 -38 A 0.054 -39 S 0.059 -40 R 0.074 -41 R 0.095 -42 F 0.124 -43 S 0.165 -44 M 0.221 -45 P 0.282 -46 S 0.334 -47 P 0.365 -48 G 0.369 -49 L 0.341 -50 E 0.298 -51 G 0.264 -52 Q 0.245 -53 L 0.233 -54 K 0.218 -55 Q 0.200 -56 E 0.188 -57 N 0.193 -58 F 0.224 -59 I 0.268 -60 L 0.297 -61 G 0.290 -62 S 0.253 -63 S 0.212 -64 T 0.185 -65 M 0.166 -66 D 0.148 -67 Q 0.132 -68 V 0.122 -69 K 0.116 -70 G 0.110 -71 V 0.103 -72 L 0.100 -73 T 0.113 -74 L 0.139 -75 Q 0.159 -76 G 0.159 -77 E 0.146 -78 A 0.130 -79 L 0.113 -80 T 0.103 -81 Q 0.106 -82 A 0.119 -83 D 0.130 -84 I 0.136 -85 N 0.143 -86 I 0.151 -87 K 0.156 -88 V 0.156 -89 A 0.154 -90 K 0.147 -91 S 0.136 -92 S 0.125 -93 Q 0.116 -94 V 0.109 -95 M 0.100 -96 H 0.089 -97 F 0.082 -98 A 0.084 -99 F 0.088 -100 R 0.089 -101 D 0.087 -102 D 0.085 -103 K 0.078 -104 Q 0.065 -105 W 0.053 -106 K 0.045 -107 L 0.040 -108 Q 0.038 -109 Q 0.039 -110 I 0.046 -111 Q 0.053 -112 D 0.060 -113 A 0.066 -114 R 0.071 -115 N 0.071 -116 H 0.066 -117 V 0.064 -118 N 0.067 -119 Q 0.069 -120 A 0.067 -121 L 0.069 -122 Q 0.080 -123 L 0.098 -124 L 0.120 -125 S 0.138 -126 S 0.144 -127 R 0.136 -128 D 0.124 -129 D 0.114 -130 S 0.104 -131 Y 0.093 -132 H 0.088 -133 F 0.088 -134 K 0.091 -135 T 0.093 -136 G 0.091 -137 A 0.086 -138 E 0.083 -139 V 0.084 -140 N 0.086 -141 K 0.081 -142 L 0.068 -143 M 0.052 -144 D 0.043 -145 A 0.041 -146 I 0.048 -147 M 0.058 -148 L 0.063 -149 Q 0.057 -150 L 0.045 -151 T 0.041 -152 R 0.044 -153 A 0.050 -154 R 0.057 -155 N 0.068 -156 R 0.086 -157 L 0.112 -158 T 0.142 -159 T 0.167 -160 P 0.177 -161 A 0.169 -162 S 0.151 -163 M 0.136 -164 T 0.133 -165 L 0.138 -166 P 0.140 -167 E 0.137 -168 L 0.135 -169 A 0.144 -170 A 0.163 -171 S 0.180 -172 G 0.175 -173 L 0.150 -174 M 0.122 -175 K 0.102 -176 M 0.090 -177 F 0.085 -178 T 0.091 -179 P 0.105 -180 P 0.119 -181 M 0.128 -182 P 0.128 -183 G 0.118 -184 D 0.104 -185 V 0.092 -186 M 0.081 -187 V 0.070 -188 N 0.059 -189 F 0.051 -190 Y 0.049 -191 I 0.051 -192 N 0.054 -193 L 0.058 -194 S 0.060 -195 K 0.061 -196 L 0.059 -197 C 0.054 -198 L 0.047 -199 T 0.044 -200 V 0.043 -201 Y 0.044 -202 Q 0.048 -203 L 0.057 -204 H 0.072 -205 V 0.097 -206 L 0.134 -207 Q 0.183 -208 P 0.232 -209 N 0.265 -210 T 0.282 -211 T 0.291 -212 K 0.304 -213 N 0.321 -214 F 0.344 -215 K 0.379 -216 P 0.426 -217 A 0.465 -218 G 0.467 -219 S 0.431 -220 S 0.387 -221 V 0.363 -222 L 0.364 -223 H 0.375 -224 N 0.376 -225 P 0.353 -226 G 0.318 -227 A 0.288 -228 M 0.275 -229 F 0.279 -230 E 0.293 -231 H 0.302 -232 N 0.302 -233 N 0.293 -234 T 0.273 -235 K 0.241 -236 F 0.205 -237 E 0.173 -238 V 0.150 -239 S 0.139 -240 H 0.136 -241 V 0.142 -242 H 0.154 -243 K 0.161 -244 V 0.155 -245 E 0.142 -246 C 0.135 -247 V 0.137 -248 V 0.142 -249 P 0.147 -250 W 0.154 -251 L 0.158 -252 N 0.160 -253 D 0.162 -254 T 0.160 -255 L 0.147 -256 V 0.127 -257 F 0.110 -258 F 0.100 -259 T 0.096 -260 I 0.097 -261 S 0.100 -262 L 0.105 -263 Q 0.106 -264 L 0.104 -265 C 0.100 -266 Q 0.104 -267 Q 0.115 -268 L 0.128 -269 K 0.139 -270 D 0.149 -271 K 0.166 -272 I 0.189 -273 S 0.215 -274 V 0.234 -275 F 0.243 -276 S 0.245 -277 S 0.246 -278 F 0.252 -279 W 0.268 -280 N 0.293 -281 Y 0.320 -282 R 0.338 -283 P 0.344 -284 F 0.341 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000104413_ENSDART00000162875_GN:rogdi_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000104413_ENSDART00000162875_GN:rogdi_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:14.caid deleted file mode 100644 index 325f4b7d2866f4099890f235ff3bbddb761ae547..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSDARG00000104413_ENSDART00000162875_GN:rogdi_species:danio_rerio_type:n_terminal_n_term:14.caid +++ /dev/null @@ -1,299 +0,0 @@ ->ENSDARG00000104413|ENSDART00000162875|GN:rogdi|species:danio_rerio|type:n_terminal|n_term:14 -1 M 0.383 -2 L 0.402 -3 G 0.423 -4 A 0.423 -5 E 0.386 -6 R 0.326 -7 S 0.268 -8 T 0.226 -9 L 0.196 -10 S 0.171 -11 E 0.151 -12 V 0.140 -13 A 0.141 -14 K 0.153 -15 M 0.166 -16 T 0.176 -17 A 0.188 -18 A 0.203 -19 S 0.217 -20 Q 0.231 -21 A 0.241 -22 E 0.232 -23 R 0.196 -24 T 0.153 -25 V 0.121 -26 L 0.103 -27 E 0.091 -28 E 0.084 -29 E 0.077 -30 F 0.068 -31 N 0.057 -32 W 0.048 -33 L 0.044 -34 L 0.046 -35 K 0.048 -36 E 0.050 -37 E 0.054 -38 V 0.056 -39 H 0.056 -40 A 0.055 -41 V 0.054 -42 L 0.054 -43 K 0.057 -44 Q 0.063 -45 L 0.070 -46 Q 0.077 -47 D 0.081 -48 I 0.076 -49 L 0.068 -50 K 0.063 -51 E 0.059 -52 A 0.057 -53 S 0.062 -54 R 0.077 -55 R 0.099 -56 F 0.126 -57 S 0.165 -58 M 0.218 -59 P 0.276 -60 S 0.323 -61 P 0.352 -62 G 0.355 -63 L 0.330 -64 E 0.289 -65 G 0.255 -66 Q 0.234 -67 L 0.217 -68 K 0.198 -69 Q 0.179 -70 E 0.165 -71 N 0.167 -72 F 0.190 -73 I 0.225 -74 L 0.249 -75 G 0.242 -76 S 0.210 -77 S 0.177 -78 T 0.158 -79 M 0.148 -80 D 0.138 -81 Q 0.128 -82 V 0.121 -83 K 0.114 -84 G 0.104 -85 V 0.094 -86 L 0.090 -87 T 0.100 -88 L 0.123 -89 Q 0.141 -90 G 0.142 -91 E 0.132 -92 A 0.119 -93 L 0.105 -94 T 0.095 -95 Q 0.098 -96 A 0.112 -97 D 0.125 -98 I 0.133 -99 N 0.138 -100 I 0.142 -101 K 0.142 -102 V 0.140 -103 A 0.137 -104 K 0.135 -105 S 0.132 -106 S 0.126 -107 Q 0.119 -108 V 0.111 -109 M 0.099 -110 H 0.085 -111 F 0.078 -112 A 0.082 -113 F 0.088 -114 R 0.091 -115 D 0.090 -116 D 0.088 -117 K 0.081 -118 Q 0.068 -119 W 0.056 -120 K 0.047 -121 L 0.041 -122 Q 0.038 -123 Q 0.039 -124 I 0.046 -125 Q 0.055 -126 D 0.061 -127 A 0.066 -128 R 0.070 -129 N 0.071 -130 H 0.066 -131 V 0.064 -132 N 0.069 -133 Q 0.071 -134 A 0.069 -135 L 0.070 -136 Q 0.081 -137 L 0.100 -138 L 0.124 -139 S 0.144 -140 S 0.150 -141 R 0.140 -142 D 0.127 -143 D 0.115 -144 S 0.105 -145 Y 0.096 -146 H 0.092 -147 F 0.093 -148 K 0.094 -149 T 0.094 -150 G 0.091 -151 A 0.086 -152 E 0.082 -153 V 0.083 -154 N 0.084 -155 K 0.080 -156 L 0.066 -157 M 0.051 -158 D 0.042 -159 A 0.041 -160 I 0.048 -161 M 0.058 -162 L 0.063 -163 Q 0.056 -164 L 0.045 -165 T 0.041 -166 R 0.045 -167 A 0.052 -168 R 0.060 -169 N 0.070 -170 R 0.086 -171 L 0.110 -172 T 0.136 -173 T 0.158 -174 P 0.168 -175 A 0.162 -176 S 0.146 -177 M 0.132 -178 T 0.128 -179 L 0.133 -180 P 0.136 -181 E 0.134 -182 L 0.134 -183 A 0.145 -184 A 0.166 -185 S 0.184 -186 G 0.181 -187 L 0.156 -188 M 0.129 -189 K 0.108 -190 M 0.094 -191 F 0.088 -192 T 0.092 -193 P 0.104 -194 P 0.117 -195 M 0.125 -196 P 0.126 -197 G 0.119 -198 D 0.107 -199 V 0.096 -200 M 0.085 -201 V 0.073 -202 N 0.060 -203 F 0.053 -204 Y 0.052 -205 I 0.057 -206 N 0.062 -207 L 0.064 -208 S 0.064 -209 K 0.063 -210 L 0.061 -211 C 0.056 -212 L 0.050 -213 T 0.046 -214 V 0.045 -215 Y 0.046 -216 Q 0.049 -217 L 0.057 -218 H 0.073 -219 V 0.098 -220 L 0.136 -221 Q 0.184 -222 P 0.231 -223 N 0.263 -224 T 0.276 -225 T 0.281 -226 K 0.288 -227 N 0.303 -228 F 0.329 -229 K 0.368 -230 P 0.420 -231 A 0.459 -232 G 0.456 -233 S 0.415 -234 S 0.368 -235 V 0.343 -236 L 0.345 -237 H 0.359 -238 N 0.365 -239 P 0.348 -240 G 0.317 -241 A 0.290 -242 M 0.276 -243 F 0.278 -244 E 0.292 -245 H 0.307 -246 N 0.312 -247 N 0.304 -248 T 0.280 -249 K 0.247 -250 F 0.210 -251 E 0.175 -252 V 0.149 -253 S 0.137 -254 H 0.137 -255 V 0.147 -256 H 0.159 -257 K 0.162 -258 V 0.153 -259 E 0.141 -260 C 0.136 -261 V 0.140 -262 V 0.144 -263 P 0.147 -264 W 0.150 -265 L 0.152 -266 N 0.153 -267 D 0.156 -268 T 0.156 -269 L 0.147 -270 V 0.133 -271 F 0.120 -272 F 0.111 -273 T 0.106 -274 I 0.105 -275 S 0.107 -276 L 0.110 -277 Q 0.112 -278 L 0.110 -279 C 0.108 -280 Q 0.113 -281 Q 0.125 -282 L 0.139 -283 K 0.148 -284 D 0.157 -285 K 0.170 -286 I 0.192 -287 S 0.218 -288 V 0.238 -289 F 0.248 -290 S 0.250 -291 S 0.251 -292 F 0.256 -293 W 0.271 -294 N 0.295 -295 Y 0.320 -296 R 0.336 -297 P 0.339 -298 F 0.336 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000018869.19_ENST00000586929.6_GN:ZNF582_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000018869.19_ENST00000586929.6_GN:ZNF582_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index c17e14b34d6eba9772792f55ea547d726019d6bd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000018869.19_ENST00000586929.6_GN:ZNF582_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,518 +0,0 @@ ->ENSG00000018869.19|ENST00000586929.6|GN:ZNF582|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.369 -2 S 0.361 -3 L 0.341 -4 G 0.303 -5 S 0.247 -6 E 0.192 -7 L 0.155 -8 F 0.140 -9 R 0.139 -10 D 0.143 -11 V 0.145 -12 A 0.136 -13 I 0.118 -14 V 0.102 -15 F 0.093 -16 S 0.089 -17 Q 0.089 -18 E 0.093 -19 E 0.095 -20 W 0.096 -21 Q 0.110 -22 W 0.138 -23 L 0.160 -24 A 0.158 -25 P 0.140 -26 A 0.120 -27 Q 0.103 -28 R 0.091 -29 D 0.092 -30 L 0.104 -31 Y 0.118 -32 R 0.126 -33 D 0.130 -34 V 0.128 -35 M 0.114 -36 L 0.092 -37 E 0.074 -38 T 0.065 -39 Y 0.061 -40 S 0.060 -41 N 0.066 -42 L 0.078 -43 V 0.097 -44 S 0.116 -45 L 0.131 -46 G 0.136 -47 L 0.132 -48 A 0.123 -49 V 0.114 -50 S 0.109 -51 K 0.108 -52 P 0.105 -53 D 0.097 -54 V 0.088 -55 I 0.084 -56 S 0.090 -57 F 0.101 -58 L 0.113 -59 E 0.127 -60 Q 0.144 -61 G 0.160 -62 K 0.170 -63 E 0.175 -64 P 0.191 -65 W 0.234 -66 M 0.312 -67 V 0.411 -68 E 0.511 -69 R 0.590 -70 V 0.632 -71 V 0.635 -72 S 0.625 -73 G 0.628 -74 G 0.645 -75 L 0.666 -76 C 0.687 -77 P 0.707 -78 V 0.712 -79 L 0.703 -80 E 0.692 -81 S 0.682 -82 R 0.670 -83 Y 0.658 -84 D 0.652 -85 T 0.652 -86 K 0.650 -87 E 0.632 -88 L 0.596 -89 F 0.547 -90 P 0.510 -91 K 0.519 -92 Q 0.580 -93 H 0.645 -94 V 0.672 -95 Y 0.666 -96 E 0.646 -97 V 0.621 -98 E 0.595 -99 S 0.579 -100 P 0.566 -101 Q 0.537 -102 W 0.496 -103 E 0.475 -104 I 0.480 -105 M 0.480 -106 E 0.466 -107 S 0.456 -108 L 0.440 -109 T 0.416 -110 S 0.424 -111 Y 0.484 -112 G 0.558 -113 L 0.598 -114 E 0.592 -115 C 0.563 -116 S 0.539 -117 S 0.526 -118 F 0.514 -119 Q 0.499 -120 D 0.478 -121 D 0.442 -122 W 0.392 -123 E 0.351 -124 C 0.336 -125 R 0.347 -126 N 0.375 -127 Q 0.410 -128 F 0.431 -129 D 0.427 -130 R 0.415 -131 Q 0.419 -132 Q 0.441 -133 G 0.461 -134 N 0.462 -135 P 0.451 -136 D 0.447 -137 R 0.456 -138 H 0.456 -139 F 0.431 -140 H 0.397 -141 Q 0.389 -142 M 0.403 -143 I 0.401 -144 I 0.367 -145 R 0.323 -146 H 0.298 -147 E 0.301 -148 E 0.326 -149 M 0.374 -150 P 0.440 -151 T 0.505 -152 F 0.546 -153 D 0.553 -154 Q 0.539 -155 H 0.511 -156 A 0.473 -157 S 0.431 -158 L 0.399 -159 T 0.379 -160 F 0.359 -161 Y 0.339 -162 Q 0.330 -163 K 0.334 -164 I 0.337 -165 H 0.327 -166 T 0.313 -167 R 0.309 -168 E 0.314 -169 K 0.314 -170 P 0.301 -171 F 0.281 -172 G 0.260 -173 Y 0.239 -174 N 0.217 -175 K 0.198 -176 C 0.189 -177 R 0.189 -178 K 0.187 -179 D 0.178 -180 F 0.162 -181 W 0.150 -182 Q 0.148 -183 K 0.159 -184 E 0.177 -185 L 0.193 -186 L 0.205 -187 I 0.209 -188 N 0.201 -189 H 0.194 -190 Q 0.206 -191 G 0.230 -192 I 0.241 -193 Y 0.228 -194 T 0.208 -195 N 0.197 -196 E 0.190 -197 K 0.172 -198 P 0.139 -199 Y 0.105 -200 K 0.081 -201 C 0.067 -202 K 0.062 -203 E 0.063 -204 C 0.068 -205 G 0.074 -206 K 0.082 -207 A 0.089 -208 F 0.094 -209 K 0.101 -210 Y 0.117 -211 G 0.138 -212 S 0.153 -213 R 0.159 -214 L 0.164 -215 I 0.167 -216 Q 0.166 -217 H 0.166 -218 E 0.176 -219 N 0.190 -220 I 0.196 -221 H 0.200 -222 S 0.210 -223 G 0.217 -224 K 0.203 -225 K 0.163 -226 P 0.112 -227 Y 0.074 -228 E 0.054 -229 C 0.048 -230 K 0.050 -231 E 0.057 -232 C 0.067 -233 G 0.077 -234 K 0.088 -235 A 0.098 -236 F 0.109 -237 N 0.119 -238 S 0.126 -239 G 0.128 -240 S 0.127 -241 N 0.127 -242 F 0.128 -243 I 0.131 -244 Q 0.135 -245 H 0.138 -246 Q 0.148 -247 R 0.160 -248 V 0.169 -249 H 0.180 -250 T 0.195 -251 G 0.205 -252 E 0.195 -253 K 0.165 -254 P 0.127 -255 Y 0.098 -256 E 0.084 -257 C 0.079 -258 K 0.080 -259 D 0.085 -260 C 0.092 -261 E 0.099 -262 K 0.105 -263 A 0.114 -264 F 0.121 -265 S 0.127 -266 R 0.136 -267 S 0.158 -268 S 0.191 -269 Q 0.215 -270 L 0.212 -271 I 0.191 -272 E 0.172 -273 H 0.171 -274 Q 0.185 -275 R 0.201 -276 T 0.211 -277 H 0.219 -278 T 0.232 -279 G 0.240 -280 E 0.225 -281 K 0.186 -282 P 0.139 -283 Y 0.104 -284 Q 0.084 -285 C 0.073 -286 K 0.070 -287 E 0.077 -288 C 0.088 -289 G 0.099 -290 K 0.106 -291 A 0.110 -292 F 0.111 -293 N 0.105 -294 R 0.099 -295 I 0.102 -296 S 0.118 -297 H 0.133 -298 L 0.137 -299 K 0.136 -300 V 0.136 -301 H 0.141 -302 Y 0.159 -303 R 0.183 -304 I 0.203 -305 H 0.218 -306 T 0.232 -307 G 0.239 -308 E 0.224 -309 K 0.186 -310 P 0.142 -311 Y 0.111 -312 A 0.094 -313 C 0.083 -314 K 0.079 -315 E 0.084 -316 C 0.096 -317 G 0.108 -318 K 0.119 -319 T 0.127 -320 F 0.132 -321 S 0.132 -322 H 0.135 -323 R 0.147 -324 S 0.165 -325 Q 0.178 -326 L 0.178 -327 I 0.170 -328 Q 0.159 -329 H 0.148 -330 Q 0.145 -331 T 0.155 -332 V 0.172 -333 H 0.195 -334 T 0.225 -335 G 0.252 -336 R 0.258 -337 K 0.233 -338 L 0.189 -339 Y 0.146 -340 E 0.115 -341 C 0.096 -342 K 0.088 -343 E 0.091 -344 C 0.100 -345 G 0.109 -346 K 0.118 -347 A 0.129 -348 F 0.142 -349 N 0.157 -350 Q 0.174 -351 G 0.185 -352 S 0.185 -353 T 0.182 -354 L 0.184 -355 I 0.191 -356 R 0.197 -357 H 0.203 -358 Q 0.217 -359 R 0.239 -360 I 0.260 -361 H 0.278 -362 T 0.291 -363 G 0.292 -364 E 0.272 -365 K 0.235 -366 P 0.199 -367 Y 0.178 -368 E 0.159 -369 C 0.130 -370 K 0.105 -371 V 0.097 -372 C 0.104 -373 G 0.113 -374 K 0.117 -375 A 0.119 -376 F 0.122 -377 R 0.125 -378 V 0.130 -379 S 0.140 -380 S 0.155 -381 Q 0.167 -382 L 0.169 -383 K 0.167 -384 Q 0.168 -385 H 0.176 -386 Q 0.191 -387 R 0.205 -388 I 0.213 -389 H 0.223 -390 T 0.238 -391 G 0.247 -392 E 0.236 -393 K 0.202 -394 P 0.161 -395 Y 0.132 -396 Q 0.114 -397 C 0.096 -398 K 0.082 -399 V 0.080 -400 C 0.089 -401 G 0.099 -402 R 0.108 -403 A 0.115 -404 F 0.123 -405 K 0.127 -406 R 0.130 -407 V 0.139 -408 S 0.161 -409 H 0.180 -410 L 0.184 -411 T 0.178 -412 V 0.177 -413 H 0.184 -414 Y 0.210 -415 R 0.247 -416 I 0.272 -417 H 0.281 -418 T 0.291 -419 G 0.299 -420 E 0.285 -421 K 0.242 -422 P 0.192 -423 Y 0.156 -424 E 0.133 -425 C 0.116 -426 K 0.106 -427 E 0.110 -428 C 0.123 -429 G 0.136 -430 K 0.144 -431 A 0.150 -432 F 0.155 -433 S 0.159 -434 H 0.162 -435 C 0.165 -436 S 0.173 -437 Q 0.188 -438 L 0.209 -439 I 0.225 -440 H 0.224 -441 H 0.219 -442 Q 0.234 -443 V 0.265 -444 I 0.289 -445 H 0.311 -446 T 0.350 -447 E 0.403 -448 K 0.448 -449 K 0.468 -450 P 0.473 -451 Y 0.476 -452 E 0.473 -453 Y 0.459 -454 K 0.446 -455 E 0.454 -456 C 0.483 -457 E 0.516 -458 K 0.544 -459 T 0.570 -460 L 0.596 -461 S 0.619 -462 H 0.632 -463 D 0.627 -464 S 0.607 -465 T 0.581 -466 T 0.551 -467 V 0.518 -468 Q 0.509 -469 P 0.539 -470 Q 0.567 -471 R 0.553 -472 M 0.528 -473 H 0.535 -474 N 0.558 -475 R 0.571 -476 E 0.584 -477 T 0.608 -478 H 0.634 -479 V 0.644 -480 N 0.634 -481 I 0.603 -482 I 0.555 -483 N 0.502 -484 V 0.458 -485 E 0.433 -486 K 0.420 -487 P 0.409 -488 S 0.397 -489 I 0.386 -490 S 0.371 -491 S 0.349 -492 Y 0.313 -493 P 0.261 -494 L 0.211 -495 L 0.183 -496 I 0.180 -497 I 0.188 -498 R 0.199 -499 E 0.210 -500 F 0.217 -501 M 0.225 -502 L 0.248 -503 A 0.302 -504 S 0.376 -505 N 0.443 -506 H 0.492 -507 M 0.542 -508 N 0.590 -509 G 0.623 -510 S 0.641 -511 N 0.648 -512 G 0.640 -513 E 0.610 -514 S 0.565 -515 P 0.503 -516 L 0.429 -517 A 0.372 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000018869.19_ENST00000586929.6_GN:ZNF582_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:31.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000018869.19_ENST00000586929.6_GN:ZNF582_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:31.caid deleted file mode 100644 index 02af5fabe7207f14d0cafbe64a205739255d2f3a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000018869.19_ENST00000586929.6_GN:ZNF582_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:31.caid +++ /dev/null @@ -1,549 +0,0 @@ ->ENSG00000018869.19|ENST00000586929.6|GN:ZNF582|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:31 -1 M 0.393 -2 D 0.424 -3 P 0.464 -4 L 0.493 -5 A 0.508 -6 L 0.514 -7 P 0.504 -8 S 0.479 -9 Q 0.457 -10 D 0.449 -11 S 0.436 -12 A 0.415 -13 L 0.396 -14 P 0.382 -15 Q 0.384 -16 E 0.421 -17 R 0.475 -18 N 0.507 -19 Q 0.515 -20 K 0.516 -21 E 0.507 -22 D 0.462 -23 L 0.380 -24 S 0.290 -25 A 0.217 -26 L 0.171 -27 E 0.146 -28 I 0.133 -29 L 0.127 -30 K 0.132 -31 V 0.152 -32 M 0.179 -33 S 0.204 -34 L 0.215 -35 G 0.205 -36 S 0.176 -37 E 0.144 -38 L 0.125 -39 F 0.122 -40 R 0.129 -41 D 0.142 -42 V 0.149 -43 A 0.142 -44 I 0.124 -45 V 0.106 -46 F 0.094 -47 S 0.089 -48 Q 0.089 -49 E 0.093 -50 E 0.095 -51 W 0.096 -52 Q 0.109 -53 W 0.137 -54 L 0.160 -55 A 0.158 -56 P 0.139 -57 A 0.117 -58 Q 0.098 -59 R 0.087 -60 D 0.087 -61 L 0.101 -62 Y 0.116 -63 R 0.127 -64 D 0.133 -65 V 0.131 -66 M 0.117 -67 L 0.094 -68 E 0.074 -69 T 0.065 -70 Y 0.060 -71 S 0.057 -72 N 0.060 -73 L 0.067 -74 V 0.078 -75 S 0.093 -76 L 0.107 -77 G 0.113 -78 L 0.109 -79 A 0.100 -80 V 0.093 -81 S 0.089 -82 K 0.088 -83 P 0.085 -84 D 0.080 -85 V 0.073 -86 I 0.070 -87 S 0.075 -88 F 0.085 -89 L 0.096 -90 E 0.110 -91 Q 0.126 -92 G 0.142 -93 K 0.150 -94 E 0.153 -95 P 0.166 -96 W 0.204 -97 M 0.274 -98 V 0.369 -99 E 0.468 -100 R 0.546 -101 V 0.580 -102 V 0.575 -103 S 0.564 -104 G 0.576 -105 G 0.608 -106 L 0.641 -107 C 0.669 -108 P 0.689 -109 V 0.692 -110 L 0.681 -111 E 0.669 -112 S 0.659 -113 R 0.647 -114 Y 0.634 -115 D 0.626 -116 T 0.621 -117 K 0.615 -118 E 0.596 -119 L 0.559 -120 F 0.514 -121 P 0.484 -122 K 0.500 -123 Q 0.563 -124 H 0.628 -125 V 0.657 -126 Y 0.651 -127 E 0.631 -128 V 0.602 -129 E 0.574 -130 S 0.556 -131 P 0.541 -132 Q 0.512 -133 W 0.473 -134 E 0.451 -135 I 0.453 -136 M 0.449 -137 E 0.433 -138 S 0.421 -139 L 0.403 -140 T 0.383 -141 S 0.398 -142 Y 0.463 -143 G 0.544 -144 L 0.593 -145 E 0.596 -146 C 0.571 -147 S 0.545 -148 S 0.528 -149 F 0.512 -150 Q 0.497 -151 D 0.479 -152 D 0.449 -153 W 0.402 -154 E 0.362 -155 C 0.348 -156 R 0.361 -157 N 0.393 -158 Q 0.428 -159 F 0.446 -160 D 0.440 -161 R 0.427 -162 Q 0.429 -163 Q 0.448 -164 G 0.466 -165 N 0.466 -166 P 0.452 -167 D 0.445 -168 R 0.452 -169 H 0.452 -170 F 0.428 -171 H 0.399 -172 Q 0.396 -173 M 0.415 -174 I 0.416 -175 I 0.378 -176 R 0.329 -177 H 0.301 -178 E 0.303 -179 E 0.327 -180 M 0.371 -181 P 0.435 -182 T 0.501 -183 F 0.540 -184 D 0.541 -185 Q 0.515 -186 H 0.476 -187 A 0.430 -188 S 0.389 -189 L 0.364 -190 T 0.354 -191 F 0.343 -192 Y 0.327 -193 Q 0.322 -194 K 0.332 -195 I 0.342 -196 H 0.335 -197 T 0.319 -198 R 0.311 -199 E 0.316 -200 K 0.318 -201 P 0.306 -202 F 0.285 -203 G 0.261 -204 Y 0.236 -205 N 0.210 -206 K 0.186 -207 C 0.172 -208 R 0.170 -209 K 0.169 -210 D 0.161 -211 F 0.147 -212 W 0.137 -213 Q 0.138 -214 K 0.150 -215 E 0.167 -216 L 0.182 -217 L 0.193 -218 I 0.198 -219 N 0.194 -220 H 0.190 -221 Q 0.201 -222 G 0.220 -223 I 0.224 -224 Y 0.209 -225 T 0.189 -226 N 0.179 -227 E 0.172 -228 K 0.156 -229 P 0.126 -230 Y 0.096 -231 K 0.075 -232 C 0.063 -233 K 0.058 -234 E 0.060 -235 C 0.064 -236 G 0.070 -237 K 0.077 -238 A 0.083 -239 F 0.087 -240 K 0.093 -241 Y 0.109 -242 G 0.131 -243 S 0.149 -244 R 0.159 -245 L 0.167 -246 I 0.173 -247 Q 0.171 -248 H 0.168 -249 E 0.176 -250 N 0.187 -251 I 0.190 -252 H 0.191 -253 S 0.200 -254 G 0.208 -255 K 0.197 -256 K 0.160 -257 P 0.111 -258 Y 0.074 -259 E 0.055 -260 C 0.049 -261 K 0.051 -262 E 0.059 -263 C 0.070 -264 G 0.079 -265 K 0.089 -266 A 0.100 -267 F 0.112 -268 N 0.122 -269 S 0.129 -270 G 0.131 -271 S 0.132 -272 N 0.134 -273 F 0.138 -274 I 0.142 -275 Q 0.143 -276 H 0.144 -277 Q 0.154 -278 R 0.169 -279 V 0.181 -280 H 0.194 -281 T 0.213 -282 G 0.225 -283 E 0.216 -284 K 0.182 -285 P 0.141 -286 Y 0.109 -287 E 0.092 -288 C 0.087 -289 K 0.089 -290 D 0.097 -291 C 0.106 -292 E 0.113 -293 K 0.122 -294 A 0.131 -295 F 0.139 -296 S 0.144 -297 R 0.151 -298 S 0.175 -299 S 0.214 -300 Q 0.241 -301 L 0.235 -302 I 0.209 -303 E 0.185 -304 H 0.180 -305 Q 0.194 -306 R 0.214 -307 T 0.227 -308 H 0.239 -309 T 0.253 -310 G 0.259 -311 E 0.243 -312 K 0.201 -313 P 0.151 -314 Y 0.113 -315 Q 0.090 -316 C 0.078 -317 K 0.075 -318 E 0.083 -319 C 0.096 -320 G 0.106 -321 K 0.114 -322 A 0.120 -323 F 0.122 -324 N 0.117 -325 R 0.110 -326 I 0.114 -327 S 0.131 -328 H 0.146 -329 L 0.149 -330 K 0.146 -331 V 0.145 -332 H 0.152 -333 Y 0.172 -334 R 0.199 -335 I 0.220 -336 H 0.234 -337 T 0.245 -338 G 0.248 -339 E 0.230 -340 K 0.191 -341 P 0.147 -342 Y 0.117 -343 A 0.100 -344 C 0.088 -345 K 0.082 -346 E 0.086 -347 C 0.098 -348 G 0.111 -349 K 0.123 -350 T 0.131 -351 F 0.136 -352 S 0.137 -353 H 0.141 -354 R 0.152 -355 S 0.169 -356 Q 0.181 -357 L 0.181 -358 I 0.173 -359 Q 0.162 -360 H 0.152 -361 Q 0.149 -362 T 0.158 -363 V 0.174 -364 H 0.196 -365 T 0.226 -366 G 0.251 -367 R 0.256 -368 K 0.232 -369 L 0.189 -370 Y 0.148 -371 E 0.118 -372 C 0.098 -373 K 0.088 -374 E 0.088 -375 C 0.095 -376 G 0.103 -377 K 0.113 -378 A 0.125 -379 F 0.140 -380 N 0.158 -381 Q 0.177 -382 G 0.188 -383 S 0.189 -384 T 0.187 -385 L 0.192 -386 I 0.201 -387 R 0.208 -388 H 0.213 -389 Q 0.225 -390 R 0.243 -391 I 0.257 -392 H 0.267 -393 T 0.275 -394 G 0.274 -395 E 0.256 -396 K 0.222 -397 P 0.188 -398 Y 0.166 -399 E 0.148 -400 C 0.122 -401 K 0.098 -402 V 0.091 -403 C 0.098 -404 G 0.107 -405 K 0.113 -406 A 0.117 -407 F 0.121 -408 R 0.124 -409 V 0.129 -410 S 0.140 -411 S 0.156 -412 Q 0.168 -413 L 0.172 -414 K 0.169 -415 Q 0.168 -416 H 0.175 -417 Q 0.189 -418 R 0.202 -419 I 0.209 -420 H 0.216 -421 T 0.230 -422 G 0.240 -423 E 0.231 -424 K 0.199 -425 P 0.158 -426 Y 0.127 -427 Q 0.109 -428 C 0.093 -429 K 0.081 -430 V 0.079 -431 C 0.087 -432 G 0.097 -433 R 0.105 -434 A 0.114 -435 F 0.123 -436 K 0.130 -437 R 0.134 -438 V 0.145 -439 S 0.169 -440 H 0.191 -441 L 0.197 -442 T 0.195 -443 V 0.195 -444 H 0.200 -445 Y 0.224 -446 R 0.259 -447 I 0.282 -448 H 0.291 -449 T 0.301 -450 G 0.310 -451 E 0.296 -452 K 0.253 -453 P 0.201 -454 Y 0.161 -455 E 0.135 -456 C 0.116 -457 K 0.107 -458 E 0.111 -459 C 0.127 -460 G 0.144 -461 K 0.154 -462 A 0.160 -463 F 0.165 -464 S 0.169 -465 H 0.172 -466 C 0.177 -467 S 0.187 -468 Q 0.204 -469 L 0.226 -470 I 0.242 -471 H 0.239 -472 H 0.230 -473 Q 0.243 -474 V 0.273 -475 I 0.295 -476 H 0.313 -477 T 0.349 -478 E 0.401 -479 K 0.448 -480 K 0.473 -481 P 0.480 -482 Y 0.482 -483 E 0.475 -484 Y 0.451 -485 K 0.428 -486 E 0.431 -487 C 0.461 -488 E 0.499 -489 K 0.534 -490 T 0.567 -491 L 0.599 -492 S 0.622 -493 H 0.632 -494 D 0.625 -495 S 0.601 -496 T 0.570 -497 T 0.533 -498 V 0.499 -499 Q 0.490 -500 P 0.519 -501 Q 0.542 -502 R 0.525 -503 M 0.498 -504 H 0.499 -505 N 0.505 -506 R 0.495 -507 E 0.496 -508 T 0.526 -509 H 0.562 -510 V 0.579 -511 N 0.567 -512 I 0.527 -513 I 0.469 -514 N 0.413 -515 V 0.375 -516 E 0.358 -517 K 0.348 -518 P 0.335 -519 S 0.321 -520 I 0.312 -521 S 0.302 -522 S 0.284 -523 Y 0.248 -524 P 0.196 -525 L 0.145 -526 L 0.115 -527 I 0.108 -528 I 0.113 -529 R 0.126 -530 E 0.145 -531 F 0.162 -532 M 0.178 -533 L 0.210 -534 A 0.274 -535 S 0.357 -536 N 0.431 -537 H 0.485 -538 M 0.532 -539 N 0.573 -540 G 0.596 -541 S 0.605 -542 N 0.608 -543 G 0.591 -544 E 0.546 -545 S 0.482 -546 P 0.409 -547 L 0.337 -548 A 0.287 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000041880.16_ENST00000398755.8_GN:PARP3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000041880.16_ENST00000398755.8_GN:PARP3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index e64b5dfe950137df668873205ace01fcaf98a1bd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000041880.16_ENST00000398755.8_GN:PARP3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,534 +0,0 @@ ->ENSG00000041880.16|ENST00000398755.8|GN:PARP3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.367 -2 A 0.377 -3 P 0.393 -4 K 0.406 -5 P 0.409 -6 K 0.403 -7 P 0.389 -8 W 0.372 -9 V 0.354 -10 Q 0.351 -11 T 0.378 -12 E 0.426 -13 G 0.465 -14 P 0.482 -15 E 0.477 -16 K 0.457 -17 K 0.454 -18 K 0.493 -19 G 0.553 -20 R 0.594 -21 Q 0.606 -22 A 0.597 -23 G 0.568 -24 R 0.523 -25 E 0.469 -26 E 0.414 -27 D 0.357 -28 P 0.297 -29 F 0.243 -30 R 0.207 -31 S 0.191 -32 T 0.185 -33 A 0.185 -34 E 0.190 -35 A 0.196 -36 L 0.204 -37 K 0.222 -38 A 0.252 -39 I 0.284 -40 P 0.309 -41 A 0.323 -42 E 0.316 -43 K 0.284 -44 R 0.244 -45 I 0.210 -46 I 0.184 -47 R 0.161 -48 V 0.144 -49 D 0.136 -50 P 0.128 -51 T 0.117 -52 C 0.107 -53 P 0.104 -54 L 0.107 -55 S 0.115 -56 S 0.127 -57 N 0.140 -58 P 0.146 -59 G 0.142 -60 T 0.126 -61 Q 0.104 -62 V 0.084 -63 Y 0.073 -64 E 0.069 -65 D 0.067 -66 Y 0.061 -67 N 0.054 -68 C 0.051 -69 T 0.054 -70 L 0.060 -71 N 0.068 -72 Q 0.074 -73 T 0.076 -74 N 0.079 -75 I 0.089 -76 E 0.100 -77 N 0.105 -78 N 0.099 -79 N 0.091 -80 N 0.083 -81 K 0.074 -82 F 0.062 -83 Y 0.050 -84 I 0.042 -85 I 0.040 -86 Q 0.042 -87 L 0.045 -88 L 0.046 -89 Q 0.047 -90 D 0.048 -91 S 0.050 -92 N 0.048 -93 R 0.041 -94 F 0.033 -95 F 0.029 -96 T 0.028 -97 C 0.029 -98 W 0.035 -99 N 0.047 -100 R 0.062 -101 W 0.076 -102 G 0.088 -103 R 0.096 -104 V 0.103 -105 G 0.114 -106 E 0.130 -107 V 0.150 -108 G 0.165 -109 Q 0.168 -110 S 0.156 -111 K 0.138 -112 I 0.123 -113 N 0.113 -114 H 0.106 -115 F 0.097 -116 T 0.082 -117 R 0.064 -118 L 0.048 -119 E 0.035 -120 D 0.023 -121 A 0.013 -122 K 0.009 -123 K 0.012 -124 D 0.024 -125 F 0.044 -126 E 0.063 -127 K 0.071 -128 K 0.067 -129 F 0.064 -130 R 0.070 -131 E 0.080 -132 K 0.085 -133 T 0.083 -134 K 0.079 -135 N 0.075 -136 N 0.071 -137 W 0.065 -138 A 0.059 -139 E 0.055 -140 R 0.057 -141 D 0.064 -142 H 0.075 -143 F 0.083 -144 V 0.090 -145 S 0.100 -146 H 0.114 -147 P 0.130 -148 G 0.138 -149 K 0.135 -150 Y 0.126 -151 T 0.120 -152 L 0.124 -153 I 0.140 -154 E 0.168 -155 V 0.216 -156 Q 0.285 -157 A 0.368 -158 E 0.446 -159 D 0.508 -160 E 0.556 -161 A 0.592 -162 Q 0.619 -163 E 0.640 -164 A 0.654 -165 V 0.654 -166 V 0.644 -167 K 0.628 -168 V 0.607 -169 D 0.581 -170 R 0.560 -171 G 0.556 -172 P 0.571 -173 V 0.592 -174 R 0.604 -175 T 0.595 -176 V 0.560 -177 T 0.503 -178 K 0.435 -179 R 0.372 -180 V 0.325 -181 Q 0.290 -182 P 0.254 -183 C 0.212 -184 S 0.174 -185 L 0.143 -186 D 0.116 -187 P 0.093 -188 A 0.081 -189 T 0.082 -190 Q 0.092 -191 K 0.103 -192 L 0.103 -193 I 0.090 -194 T 0.075 -195 N 0.068 -196 I 0.067 -197 F 0.068 -198 S 0.068 -199 K 0.063 -200 E 0.058 -201 M 0.058 -202 F 0.065 -203 K 0.077 -204 N 0.090 -205 T 0.097 -206 M 0.102 -207 A 0.107 -208 L 0.111 -209 M 0.112 -210 D 0.107 -211 L 0.097 -212 D 0.085 -213 V 0.076 -214 K 0.075 -215 K 0.079 -216 M 0.089 -217 P 0.104 -218 L 0.122 -219 G 0.138 -220 K 0.143 -221 L 0.130 -222 S 0.102 -223 K 0.072 -224 Q 0.052 -225 Q 0.044 -226 I 0.045 -227 A 0.050 -228 R 0.054 -229 G 0.055 -230 F 0.054 -231 E 0.051 -232 A 0.049 -233 L 0.051 -234 E 0.057 -235 A 0.062 -236 L 0.063 -237 E 0.061 -238 E 0.062 -239 A 0.070 -240 L 0.086 -241 K 0.115 -242 G 0.156 -243 P 0.199 -244 T 0.235 -245 D 0.257 -246 G 0.259 -247 G 0.235 -248 Q 0.189 -249 S 0.138 -250 L 0.103 -251 E 0.089 -252 E 0.087 -253 L 0.089 -254 S 0.090 -255 S 0.089 -256 H 0.083 -257 F 0.075 -258 Y 0.068 -259 T 0.063 -260 V 0.062 -261 I 0.066 -262 P 0.081 -263 H 0.104 -264 N 0.128 -265 F 0.150 -266 G 0.173 -267 H 0.193 -268 S 0.205 -269 Q 0.207 -270 P 0.198 -271 P 0.179 -272 P 0.147 -273 I 0.111 -274 N 0.083 -275 S 0.069 -276 P 0.063 -277 E 0.060 -278 L 0.056 -279 L 0.054 -280 Q 0.054 -281 A 0.055 -282 K 0.055 -283 K 0.056 -284 D 0.061 -285 M 0.067 -286 L 0.068 -287 L 0.065 -288 V 0.064 -289 L 0.063 -290 A 0.063 -291 D 0.064 -292 I 0.065 -293 E 0.067 -294 L 0.070 -295 A 0.078 -296 Q 0.091 -297 A 0.104 -298 L 0.115 -299 Q 0.131 -300 A 0.157 -301 V 0.192 -302 S 0.227 -303 E 0.258 -304 Q 0.285 -305 E 0.306 -306 K 0.317 -307 T 0.312 -308 V 0.292 -309 E 0.265 -310 E 0.238 -311 V 0.208 -312 P 0.173 -313 H 0.140 -314 P 0.120 -315 L 0.112 -316 D 0.114 -317 R 0.117 -318 D 0.117 -319 Y 0.113 -320 Q 0.108 -321 L 0.099 -322 L 0.082 -323 K 0.062 -324 C 0.047 -325 Q 0.041 -326 L 0.043 -327 Q 0.049 -328 L 0.056 -329 L 0.061 -330 D 0.063 -331 S 0.064 -332 G 0.063 -333 A 0.059 -334 P 0.056 -335 E 0.058 -336 Y 0.064 -337 K 0.066 -338 V 0.058 -339 I 0.046 -340 Q 0.039 -341 T 0.037 -342 Y 0.038 -343 L 0.040 -344 E 0.046 -345 Q 0.057 -346 T 0.075 -347 G 0.096 -348 S 0.113 -349 N 0.123 -350 H 0.125 -351 R 0.124 -352 C 0.118 -353 P 0.107 -354 T 0.092 -355 L 0.079 -356 Q 0.070 -357 H 0.065 -358 I 0.063 -359 W 0.061 -360 K 0.061 -361 V 0.066 -362 N 0.081 -363 Q 0.101 -364 E 0.113 -365 G 0.110 -366 E 0.102 -367 E 0.098 -368 D 0.097 -369 R 0.094 -370 F 0.090 -371 Q 0.090 -372 A 0.094 -373 H 0.100 -374 S 0.108 -375 K 0.118 -376 L 0.124 -377 G 0.121 -378 N 0.113 -379 R 0.106 -380 K 0.102 -381 L 0.094 -382 L 0.082 -383 W 0.072 -384 H 0.067 -385 G 0.063 -386 T 0.062 -387 N 0.066 -388 M 0.071 -389 A 0.075 -390 V 0.076 -391 V 0.076 -392 A 0.078 -393 A 0.081 -394 I 0.090 -395 L 0.103 -396 T 0.114 -397 S 0.121 -398 G 0.128 -399 L 0.136 -400 R 0.148 -401 I 0.163 -402 M 0.187 -403 P 0.217 -404 H 0.246 -405 S 0.265 -406 G 0.270 -407 G 0.255 -408 R 0.228 -409 V 0.201 -410 G 0.185 -411 K 0.172 -412 G 0.154 -413 I 0.129 -414 Y 0.106 -415 F 0.091 -416 A 0.084 -417 S 0.082 -418 E 0.082 -419 N 0.082 -420 S 0.080 -421 K 0.078 -422 S 0.076 -423 A 0.070 -424 G 0.062 -425 Y 0.057 -426 V 0.056 -427 I 0.062 -428 G 0.080 -429 M 0.107 -430 K 0.139 -431 C 0.165 -432 G 0.175 -433 A 0.162 -434 H 0.133 -435 H 0.103 -436 V 0.084 -437 G 0.078 -438 Y 0.081 -439 M 0.088 -440 F 0.096 -441 L 0.103 -442 G 0.107 -443 E 0.107 -444 V 0.108 -445 A 0.110 -446 L 0.116 -447 G 0.123 -448 R 0.128 -449 E 0.132 -450 H 0.136 -451 H 0.139 -452 I 0.137 -453 N 0.133 -454 T 0.135 -455 D 0.141 -456 N 0.144 -457 P 0.137 -458 S 0.124 -459 L 0.114 -460 K 0.113 -461 S 0.119 -462 P 0.128 -463 P 0.130 -464 P 0.126 -465 G 0.119 -466 F 0.114 -467 D 0.116 -468 S 0.126 -469 V 0.140 -470 I 0.154 -471 A 0.166 -472 R 0.180 -473 G 0.202 -474 H 0.231 -475 T 0.254 -476 E 0.266 -477 P 0.267 -478 D 0.265 -479 P 0.262 -480 T 0.258 -481 Q 0.249 -482 D 0.237 -483 T 0.228 -484 E 0.221 -485 L 0.210 -486 E 0.195 -487 L 0.181 -488 D 0.173 -489 G 0.171 -490 Q 0.169 -491 Q 0.165 -492 V 0.162 -493 V 0.164 -494 V 0.172 -495 P 0.185 -496 Q 0.201 -497 G 0.222 -498 Q 0.244 -499 P 0.261 -500 V 0.271 -501 P 0.273 -502 C 0.269 -503 P 0.258 -504 E 0.248 -505 F 0.247 -506 S 0.249 -507 S 0.248 -508 S 0.244 -509 T 0.241 -510 F 0.236 -511 S 0.222 -512 Q 0.198 -513 S 0.169 -514 E 0.142 -515 Y 0.122 -516 L 0.109 -517 I 0.099 -518 Y 0.092 -519 Q 0.091 -520 E 0.092 -521 S 0.089 -522 Q 0.080 -523 C 0.072 -524 R 0.065 -525 L 0.057 -526 R 0.048 -527 Y 0.041 -528 L 0.039 -529 L 0.044 -530 E 0.055 -531 V 0.073 -532 H 0.097 -533 L 0.116 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000041880.16_ENST00000398755.8_GN:PARP3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000041880.16_ENST00000398755.8_GN:PARP3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid deleted file mode 100644 index 0e4cd10cd58f3053a2cbeb6b922c591f25d28fb8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000041880.16_ENST00000398755.8_GN:PARP3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid +++ /dev/null @@ -1,541 +0,0 @@ ->ENSG00000041880.16|ENST00000398755.8|GN:PARP3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:7 -1 M 0.266 -2 S 0.259 -3 L 0.258 -4 L 0.262 -5 F 0.257 -6 L 0.249 -7 A 0.259 -8 M 0.294 -9 A 0.333 -10 P 0.360 -11 K 0.379 -12 P 0.394 -13 K 0.400 -14 P 0.395 -15 W 0.382 -16 V 0.370 -17 Q 0.373 -18 T 0.405 -19 E 0.457 -20 G 0.504 -21 P 0.536 -22 E 0.554 -23 K 0.561 -24 K 0.566 -25 K 0.578 -26 G 0.595 -27 R 0.606 -28 Q 0.607 -29 A 0.595 -30 G 0.566 -31 R 0.523 -32 E 0.473 -33 E 0.421 -34 D 0.364 -35 P 0.302 -36 F 0.247 -37 R 0.212 -38 S 0.196 -39 T 0.191 -40 A 0.193 -41 E 0.199 -42 A 0.205 -43 L 0.212 -44 K 0.228 -45 A 0.256 -46 I 0.287 -47 P 0.312 -48 A 0.326 -49 E 0.318 -50 K 0.286 -51 R 0.245 -52 I 0.211 -53 I 0.185 -54 R 0.162 -55 V 0.146 -56 D 0.137 -57 P 0.129 -58 T 0.117 -59 C 0.107 -60 P 0.103 -61 L 0.106 -62 S 0.114 -63 S 0.125 -64 N 0.136 -65 P 0.142 -66 G 0.137 -67 T 0.122 -68 Q 0.102 -69 V 0.083 -70 Y 0.072 -71 E 0.069 -72 D 0.067 -73 Y 0.061 -74 N 0.054 -75 C 0.051 -76 T 0.053 -77 L 0.059 -78 N 0.067 -79 Q 0.073 -80 T 0.075 -81 N 0.078 -82 I 0.087 -83 E 0.099 -84 N 0.103 -85 N 0.097 -86 N 0.089 -87 N 0.081 -88 K 0.073 -89 F 0.062 -90 Y 0.050 -91 I 0.042 -92 I 0.039 -93 Q 0.041 -94 L 0.044 -95 L 0.046 -96 Q 0.046 -97 D 0.047 -98 S 0.049 -99 N 0.047 -100 R 0.040 -101 F 0.033 -102 F 0.029 -103 T 0.028 -104 C 0.029 -105 W 0.035 -106 N 0.047 -107 R 0.062 -108 W 0.076 -109 G 0.087 -110 R 0.096 -111 V 0.103 -112 G 0.114 -113 E 0.131 -114 V 0.151 -115 G 0.166 -116 Q 0.169 -117 S 0.158 -118 K 0.140 -119 I 0.125 -120 N 0.115 -121 H 0.108 -122 F 0.099 -123 T 0.083 -124 R 0.065 -125 L 0.049 -126 E 0.036 -127 D 0.023 -128 A 0.013 -129 K 0.009 -130 K 0.013 -131 D 0.025 -132 F 0.044 -133 E 0.063 -134 K 0.072 -135 K 0.067 -136 F 0.063 -137 R 0.069 -138 E 0.079 -139 K 0.084 -140 T 0.083 -141 K 0.079 -142 N 0.075 -143 N 0.071 -144 W 0.066 -145 A 0.059 -146 E 0.055 -147 R 0.057 -148 D 0.064 -149 H 0.074 -150 F 0.083 -151 V 0.090 -152 S 0.099 -153 H 0.114 -154 P 0.129 -155 G 0.137 -156 K 0.135 -157 Y 0.126 -158 T 0.120 -159 L 0.124 -160 I 0.140 -161 E 0.169 -162 V 0.217 -163 Q 0.288 -164 A 0.372 -165 E 0.451 -166 D 0.513 -167 E 0.561 -168 A 0.597 -169 Q 0.624 -170 E 0.646 -171 A 0.659 -172 V 0.659 -173 V 0.648 -174 K 0.632 -175 V 0.611 -176 D 0.585 -177 R 0.563 -178 G 0.559 -179 P 0.573 -180 V 0.593 -181 R 0.605 -182 T 0.596 -183 V 0.561 -184 T 0.503 -185 K 0.436 -186 R 0.373 -187 V 0.326 -188 Q 0.290 -189 P 0.253 -190 C 0.212 -191 S 0.173 -192 L 0.143 -193 D 0.116 -194 P 0.093 -195 A 0.081 -196 T 0.081 -197 Q 0.091 -198 K 0.102 -199 L 0.102 -200 I 0.090 -201 T 0.075 -202 N 0.067 -203 I 0.067 -204 F 0.068 -205 S 0.068 -206 K 0.063 -207 E 0.058 -208 M 0.057 -209 F 0.064 -210 K 0.077 -211 N 0.089 -212 T 0.096 -213 M 0.101 -214 A 0.106 -215 L 0.111 -216 M 0.112 -217 D 0.107 -218 L 0.097 -219 D 0.085 -220 V 0.076 -221 K 0.075 -222 K 0.079 -223 M 0.089 -224 P 0.104 -225 L 0.123 -226 G 0.138 -227 K 0.143 -228 L 0.130 -229 S 0.102 -230 K 0.072 -231 Q 0.052 -232 Q 0.044 -233 I 0.045 -234 A 0.050 -235 R 0.054 -236 G 0.055 -237 F 0.054 -238 E 0.051 -239 A 0.050 -240 L 0.051 -241 E 0.057 -242 A 0.063 -243 L 0.064 -244 E 0.062 -245 E 0.063 -246 A 0.070 -247 L 0.087 -248 K 0.116 -249 G 0.157 -250 P 0.201 -251 T 0.237 -252 D 0.258 -253 G 0.260 -254 G 0.236 -255 Q 0.190 -256 S 0.138 -257 L 0.104 -258 E 0.090 -259 E 0.088 -260 L 0.089 -261 S 0.091 -262 S 0.089 -263 H 0.083 -264 F 0.075 -265 Y 0.068 -266 T 0.063 -267 V 0.062 -268 I 0.066 -269 P 0.081 -270 H 0.104 -271 N 0.128 -272 F 0.150 -273 G 0.173 -274 H 0.193 -275 S 0.206 -276 Q 0.207 -277 P 0.199 -278 P 0.179 -279 P 0.147 -280 I 0.112 -281 N 0.084 -282 S 0.069 -283 P 0.064 -284 E 0.060 -285 L 0.057 -286 L 0.054 -287 Q 0.054 -288 A 0.055 -289 K 0.055 -290 K 0.057 -291 D 0.062 -292 M 0.067 -293 L 0.068 -294 L 0.066 -295 V 0.064 -296 L 0.064 -297 A 0.063 -298 D 0.064 -299 I 0.065 -300 E 0.067 -301 L 0.070 -302 A 0.078 -303 Q 0.091 -304 A 0.104 -305 L 0.115 -306 Q 0.131 -307 A 0.157 -308 V 0.191 -309 S 0.226 -310 E 0.257 -311 Q 0.284 -312 E 0.305 -313 K 0.316 -314 T 0.311 -315 V 0.290 -316 E 0.264 -317 E 0.238 -318 V 0.208 -319 P 0.173 -320 H 0.140 -321 P 0.120 -322 L 0.112 -323 D 0.114 -324 R 0.118 -325 D 0.117 -326 Y 0.113 -327 Q 0.108 -328 L 0.099 -329 L 0.082 -330 K 0.062 -331 C 0.048 -332 Q 0.042 -333 L 0.043 -334 Q 0.049 -335 L 0.056 -336 L 0.061 -337 D 0.063 -338 S 0.064 -339 G 0.063 -340 A 0.060 -341 P 0.057 -342 E 0.059 -343 Y 0.065 -344 K 0.067 -345 V 0.059 -346 I 0.047 -347 Q 0.039 -348 T 0.038 -349 Y 0.038 -350 L 0.040 -351 E 0.046 -352 Q 0.058 -353 T 0.076 -354 G 0.097 -355 S 0.114 -356 N 0.124 -357 H 0.127 -358 R 0.125 -359 C 0.120 -360 P 0.108 -361 T 0.093 -362 L 0.080 -363 Q 0.070 -364 H 0.065 -365 I 0.063 -366 W 0.062 -367 K 0.062 -368 V 0.067 -369 N 0.082 -370 Q 0.102 -371 E 0.114 -372 G 0.111 -373 E 0.103 -374 E 0.098 -375 D 0.097 -376 R 0.094 -377 F 0.090 -378 Q 0.090 -379 A 0.094 -380 H 0.100 -381 S 0.108 -382 K 0.118 -383 L 0.124 -384 G 0.122 -385 N 0.114 -386 R 0.107 -387 K 0.103 -388 L 0.095 -389 L 0.083 -390 W 0.073 -391 H 0.067 -392 G 0.064 -393 T 0.063 -394 N 0.067 -395 M 0.072 -396 A 0.075 -397 V 0.076 -398 V 0.077 -399 A 0.078 -400 A 0.082 -401 I 0.090 -402 L 0.103 -403 T 0.114 -404 S 0.121 -405 G 0.128 -406 L 0.137 -407 R 0.148 -408 I 0.164 -409 M 0.187 -410 P 0.217 -411 H 0.245 -412 S 0.265 -413 G 0.269 -414 G 0.256 -415 R 0.228 -416 V 0.202 -417 G 0.186 -418 K 0.174 -419 G 0.155 -420 I 0.130 -421 Y 0.107 -422 F 0.092 -423 A 0.084 -424 S 0.082 -425 E 0.083 -426 N 0.083 -427 S 0.081 -428 K 0.079 -429 S 0.077 -430 A 0.071 -431 G 0.063 -432 Y 0.058 -433 V 0.057 -434 I 0.063 -435 G 0.080 -436 M 0.108 -437 K 0.140 -438 C 0.166 -439 G 0.176 -440 A 0.163 -441 H 0.134 -442 H 0.104 -443 V 0.085 -444 G 0.079 -445 Y 0.082 -446 M 0.089 -447 F 0.097 -448 L 0.104 -449 G 0.108 -450 E 0.109 -451 V 0.109 -452 A 0.111 -453 L 0.117 -454 G 0.124 -455 R 0.129 -456 E 0.133 -457 H 0.137 -458 H 0.140 -459 I 0.138 -460 N 0.135 -461 T 0.136 -462 D 0.142 -463 N 0.144 -464 P 0.138 -465 S 0.125 -466 L 0.115 -467 K 0.114 -468 S 0.120 -469 P 0.129 -470 P 0.132 -471 P 0.128 -472 G 0.120 -473 F 0.116 -474 D 0.118 -475 S 0.128 -476 V 0.142 -477 I 0.157 -478 A 0.169 -479 R 0.183 -480 G 0.206 -481 H 0.234 -482 T 0.257 -483 E 0.268 -484 P 0.270 -485 D 0.267 -486 P 0.265 -487 T 0.261 -488 Q 0.252 -489 D 0.240 -490 T 0.229 -491 E 0.222 -492 L 0.211 -493 E 0.196 -494 L 0.182 -495 D 0.175 -496 G 0.173 -497 Q 0.171 -498 Q 0.166 -499 V 0.163 -500 V 0.165 -501 V 0.174 -502 P 0.187 -503 Q 0.204 -504 G 0.225 -505 Q 0.246 -506 P 0.263 -507 V 0.272 -508 P 0.275 -509 C 0.271 -510 P 0.261 -511 E 0.252 -512 F 0.250 -513 S 0.253 -514 S 0.251 -515 S 0.247 -516 T 0.244 -517 F 0.238 -518 S 0.223 -519 Q 0.198 -520 S 0.169 -521 E 0.142 -522 Y 0.123 -523 L 0.110 -524 I 0.099 -525 Y 0.092 -526 Q 0.092 -527 E 0.093 -528 S 0.090 -529 Q 0.081 -530 C 0.073 -531 R 0.066 -532 L 0.057 -533 R 0.048 -534 Y 0.041 -535 L 0.040 -536 L 0.045 -537 E 0.055 -538 V 0.073 -539 H 0.097 -540 L 0.115 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000051596.11_ENST00000265097.9_GN:THOC3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000051596.11_ENST00000265097.9_GN:THOC3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index c0489ead55f6e7e1704cf12490c498f52d1ad8a4..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000051596.11_ENST00000265097.9_GN:THOC3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,352 +0,0 @@ ->ENSG00000051596.11|ENST00000265097.9|GN:THOC3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.326 -2 A 0.356 -3 V 0.404 -4 P 0.434 -5 A 0.415 -6 A 0.370 -7 A 0.364 -8 M 0.413 -9 G 0.461 -10 P 0.479 -11 S 0.500 -12 A 0.544 -13 L 0.567 -14 G 0.538 -15 Q 0.504 -16 S 0.522 -17 G 0.580 -18 P 0.633 -19 G 0.653 -20 S 0.641 -21 M 0.614 -22 A 0.597 -23 P 0.594 -24 W 0.591 -25 C 0.581 -26 S 0.567 -27 V 0.546 -28 S 0.520 -29 S 0.503 -30 G 0.502 -31 P 0.502 -32 S 0.486 -33 R 0.462 -34 Y 0.444 -35 V 0.424 -36 L 0.383 -37 G 0.322 -38 M 0.263 -39 Q 0.230 -40 E 0.221 -41 L 0.216 -42 F 0.202 -43 R 0.182 -44 G 0.166 -45 H 0.148 -46 S 0.122 -47 K 0.094 -48 T 0.072 -49 R 0.058 -50 E 0.050 -51 F 0.046 -52 L 0.044 -53 A 0.044 -54 H 0.044 -55 S 0.048 -56 A 0.055 -57 K 0.065 -58 V 0.071 -59 H 0.067 -60 S 0.057 -61 V 0.047 -62 A 0.040 -63 W 0.039 -64 S 0.044 -65 C 0.051 -66 D 0.054 -67 G 0.051 -68 R 0.046 -69 R 0.044 -70 L 0.044 -71 A 0.046 -72 S 0.051 -73 G 0.065 -74 S 0.085 -75 F 0.104 -76 D 0.107 -77 K 0.089 -78 T 0.060 -79 A 0.039 -80 S 0.031 -81 V 0.029 -82 F 0.031 -83 L 0.036 -84 L 0.042 -85 E 0.048 -86 K 0.049 -87 D 0.050 -88 R 0.052 -89 L 0.053 -90 V 0.053 -91 K 0.053 -92 E 0.053 -93 N 0.050 -94 N 0.045 -95 Y 0.043 -96 R 0.045 -97 G 0.052 -98 H 0.062 -99 G 0.071 -100 D 0.076 -101 S 0.074 -102 V 0.066 -103 D 0.058 -104 Q 0.052 -105 L 0.049 -106 C 0.049 -107 W 0.054 -108 H 0.061 -109 P 0.062 -110 S 0.057 -111 N 0.049 -112 P 0.040 -113 D 0.030 -114 L 0.022 -115 F 0.020 -116 V 0.024 -117 T 0.037 -118 A 0.064 -119 S 0.098 -120 G 0.121 -121 D 0.120 -122 K 0.097 -123 T 0.073 -124 I 0.063 -125 R 0.062 -126 I 0.061 -127 W 0.053 -128 D 0.042 -129 V 0.035 -130 R 0.037 -131 T 0.047 -132 T 0.060 -133 K 0.071 -134 C 0.072 -135 I 0.066 -136 A 0.060 -137 T 0.059 -138 V 0.060 -139 N 0.064 -140 T 0.072 -141 K 0.081 -142 G 0.083 -143 E 0.074 -144 N 0.058 -145 I 0.042 -146 N 0.032 -147 I 0.028 -148 C 0.029 -149 W 0.036 -150 S 0.049 -151 P 0.062 -152 D 0.068 -153 G 0.063 -154 Q 0.052 -155 T 0.042 -156 I 0.035 -157 A 0.034 -158 V 0.038 -159 G 0.051 -160 N 0.066 -161 K 0.075 -162 D 0.071 -163 D 0.059 -164 V 0.046 -165 V 0.039 -166 T 0.037 -167 F 0.039 -168 I 0.043 -169 D 0.046 -170 A 0.047 -171 K 0.046 -172 T 0.048 -173 H 0.056 -174 R 0.068 -175 S 0.075 -176 K 0.075 -177 A 0.070 -178 E 0.065 -179 E 0.061 -180 Q 0.056 -181 F 0.049 -182 K 0.044 -183 F 0.040 -184 E 0.040 -185 V 0.039 -186 N 0.037 -187 E 0.034 -188 I 0.030 -189 S 0.028 -190 W 0.032 -191 N 0.043 -192 N 0.055 -193 D 0.058 -194 N 0.049 -195 N 0.036 -196 M 0.027 -197 F 0.022 -198 F 0.021 -199 L 0.026 -200 T 0.040 -201 N 0.064 -202 G 0.089 -203 N 0.103 -204 G 0.099 -205 C 0.080 -206 I 0.062 -207 N 0.053 -208 I 0.051 -209 L 0.048 -210 S 0.041 -211 Y 0.036 -212 P 0.038 -213 E 0.046 -214 L 0.051 -215 K 0.053 -216 P 0.054 -217 V 0.054 -218 Q 0.055 -219 S 0.055 -220 I 0.054 -221 N 0.052 -222 A 0.049 -223 H 0.047 -224 P 0.048 -225 S 0.050 -226 N 0.050 -227 C 0.048 -228 I 0.045 -229 C 0.044 -230 I 0.049 -231 K 0.056 -232 F 0.066 -233 D 0.076 -234 P 0.081 -235 M 0.078 -236 G 0.065 -237 K 0.047 -238 Y 0.035 -239 F 0.031 -240 A 0.034 -241 T 0.045 -242 G 0.068 -243 S 0.097 -244 A 0.119 -245 D 0.119 -246 A 0.097 -247 L 0.070 -248 V 0.050 -249 S 0.043 -250 L 0.042 -251 W 0.042 -252 D 0.041 -253 V 0.039 -254 D 0.041 -255 E 0.043 -256 L 0.044 -257 V 0.044 -258 C 0.042 -259 V 0.039 -260 R 0.039 -261 C 0.044 -262 F 0.051 -263 S 0.058 -264 R 0.061 -265 L 0.063 -266 D 0.067 -267 W 0.070 -268 P 0.067 -269 V 0.058 -270 R 0.050 -271 T 0.045 -272 L 0.043 -273 S 0.041 -274 F 0.041 -275 S 0.047 -276 H 0.064 -277 D 0.082 -278 G 0.086 -279 K 0.076 -280 M 0.060 -281 L 0.048 -282 A 0.042 -283 S 0.042 -284 A 0.054 -285 S 0.075 -286 E 0.092 -287 D 0.094 -288 H 0.079 -289 F 0.059 -290 I 0.048 -291 D 0.045 -292 I 0.045 -293 A 0.043 -294 E 0.040 -295 V 0.040 -296 E 0.046 -297 T 0.058 -298 G 0.068 -299 D 0.071 -300 K 0.067 -301 L 0.058 -302 W 0.050 -303 E 0.046 -304 V 0.050 -305 Q 0.061 -306 C 0.072 -307 E 0.076 -308 S 0.073 -309 P 0.064 -310 T 0.057 -311 F 0.056 -312 T 0.060 -313 V 0.062 -314 A 0.062 -315 W 0.066 -316 H 0.076 -317 P 0.085 -318 K 0.086 -319 R 0.080 -320 P 0.074 -321 L 0.072 -322 L 0.069 -323 A 0.064 -324 F 0.063 -325 A 0.080 -326 C 0.125 -327 D 0.202 -328 D 0.297 -329 K 0.378 -330 D 0.420 -331 G 0.419 -332 K 0.393 -333 Y 0.367 -334 D 0.353 -335 S 0.347 -336 S 0.339 -337 R 0.324 -338 E 0.295 -339 A 0.248 -340 G 0.188 -341 T 0.131 -342 V 0.091 -343 K 0.072 -344 L 0.071 -345 F 0.090 -346 G 0.140 -347 L 0.223 -348 P 0.323 -349 N 0.399 -350 D 0.425 -351 S 0.418 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000051596.11_ENST00000265097.9_GN:THOC3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000051596.11_ENST00000265097.9_GN:THOC3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid deleted file mode 100644 index cd3c3a120049334715dee2e716dced415b7643ad..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000051596.11_ENST00000265097.9_GN:THOC3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid +++ /dev/null @@ -1,379 +0,0 @@ ->ENSG00000051596.11|ENST00000265097.9|GN:THOC3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:27 -1 M 0.341 -2 R 0.346 -3 A 0.368 -4 A 0.401 -5 A 0.422 -6 A 0.441 -7 P 0.482 -8 G 0.527 -9 L 0.539 -10 T 0.517 -11 A 0.480 -12 P 0.428 -13 W 0.367 -14 R 0.320 -15 L 0.305 -16 L 0.307 -17 Q 0.318 -18 C 0.344 -19 C 0.379 -20 E 0.412 -21 L 0.448 -22 E 0.494 -23 A 0.543 -24 G 0.584 -25 E 0.614 -26 L 0.634 -27 G 0.641 -28 M 0.636 -29 A 0.621 -30 V 0.587 -31 P 0.540 -32 A 0.513 -33 A 0.521 -34 A 0.539 -35 M 0.550 -36 G 0.552 -37 P 0.534 -38 S 0.505 -39 A 0.504 -40 L 0.531 -41 G 0.539 -42 Q 0.531 -43 S 0.557 -44 G 0.619 -45 P 0.673 -46 G 0.693 -47 S 0.681 -48 M 0.660 -49 A 0.652 -50 P 0.657 -51 W 0.659 -52 C 0.650 -53 S 0.632 -54 V 0.607 -55 S 0.581 -56 S 0.566 -57 G 0.568 -58 P 0.572 -59 S 0.566 -60 R 0.553 -61 Y 0.537 -62 V 0.507 -63 L 0.447 -64 G 0.365 -65 M 0.291 -66 Q 0.251 -67 E 0.238 -68 L 0.228 -69 F 0.206 -70 R 0.181 -71 G 0.159 -72 H 0.138 -73 S 0.111 -74 K 0.084 -75 T 0.064 -76 R 0.052 -77 E 0.045 -78 F 0.041 -79 L 0.039 -80 A 0.038 -81 H 0.040 -82 S 0.043 -83 A 0.050 -84 K 0.059 -85 V 0.065 -86 H 0.063 -87 S 0.054 -88 V 0.046 -89 A 0.040 -90 W 0.039 -91 S 0.043 -92 C 0.050 -93 D 0.053 -94 G 0.050 -95 R 0.045 -96 R 0.043 -97 L 0.043 -98 A 0.045 -99 S 0.050 -100 G 0.062 -101 S 0.082 -102 F 0.100 -103 D 0.103 -104 K 0.085 -105 T 0.058 -106 A 0.039 -107 S 0.030 -108 V 0.028 -109 F 0.029 -110 L 0.033 -111 L 0.038 -112 E 0.044 -113 K 0.046 -114 D 0.048 -115 R 0.051 -116 L 0.053 -117 V 0.054 -118 K 0.055 -119 E 0.055 -120 N 0.052 -121 N 0.048 -122 Y 0.045 -123 R 0.048 -124 G 0.055 -125 H 0.066 -126 G 0.075 -127 D 0.081 -128 S 0.079 -129 V 0.072 -130 D 0.063 -131 Q 0.057 -132 L 0.054 -133 C 0.053 -134 W 0.057 -135 H 0.064 -136 P 0.065 -137 S 0.061 -138 N 0.056 -139 P 0.047 -140 D 0.036 -141 L 0.027 -142 F 0.024 -143 V 0.027 -144 T 0.042 -145 A 0.071 -146 S 0.107 -147 G 0.133 -148 D 0.131 -149 K 0.105 -150 T 0.078 -151 I 0.066 -152 R 0.066 -153 I 0.066 -154 W 0.059 -155 D 0.047 -156 V 0.039 -157 R 0.040 -158 T 0.050 -159 T 0.064 -160 K 0.074 -161 C 0.073 -162 I 0.065 -163 A 0.057 -164 T 0.055 -165 V 0.056 -166 N 0.061 -167 T 0.070 -168 K 0.082 -169 G 0.086 -170 E 0.078 -171 N 0.060 -172 I 0.043 -173 N 0.032 -174 I 0.028 -175 C 0.030 -176 W 0.037 -177 S 0.049 -178 P 0.063 -179 D 0.068 -180 G 0.063 -181 Q 0.052 -182 T 0.042 -183 I 0.035 -184 A 0.033 -185 V 0.036 -186 G 0.048 -187 N 0.064 -188 K 0.073 -189 D 0.070 -190 D 0.058 -191 V 0.045 -192 V 0.037 -193 T 0.035 -194 F 0.037 -195 I 0.041 -196 D 0.044 -197 A 0.045 -198 K 0.045 -199 T 0.046 -200 H 0.053 -201 R 0.064 -202 S 0.071 -203 K 0.071 -204 A 0.067 -205 E 0.064 -206 E 0.061 -207 Q 0.055 -208 F 0.049 -209 K 0.043 -210 F 0.039 -211 E 0.038 -212 V 0.037 -213 N 0.035 -214 E 0.032 -215 I 0.028 -216 S 0.027 -217 W 0.030 -218 N 0.040 -219 N 0.051 -220 D 0.053 -221 N 0.044 -222 N 0.032 -223 M 0.023 -224 F 0.019 -225 F 0.018 -226 L 0.023 -227 T 0.037 -228 N 0.059 -229 G 0.083 -230 N 0.097 -231 G 0.093 -232 C 0.075 -233 I 0.058 -234 N 0.050 -235 I 0.048 -236 L 0.045 -237 S 0.039 -238 Y 0.034 -239 P 0.036 -240 E 0.043 -241 L 0.049 -242 K 0.052 -243 P 0.054 -244 V 0.054 -245 Q 0.055 -246 S 0.055 -247 I 0.054 -248 N 0.052 -249 A 0.049 -250 H 0.047 -251 P 0.046 -252 S 0.046 -253 N 0.046 -254 C 0.044 -255 I 0.043 -256 C 0.043 -257 I 0.047 -258 K 0.054 -259 F 0.063 -260 D 0.072 -261 P 0.079 -262 M 0.077 -263 G 0.065 -264 K 0.048 -265 Y 0.035 -266 F 0.031 -267 A 0.035 -268 T 0.047 -269 G 0.070 -270 S 0.100 -271 A 0.122 -272 D 0.120 -273 A 0.098 -274 L 0.070 -275 V 0.050 -276 S 0.043 -277 L 0.042 -278 W 0.042 -279 D 0.041 -280 V 0.039 -281 D 0.041 -282 E 0.045 -283 L 0.047 -284 V 0.048 -285 C 0.045 -286 V 0.041 -287 R 0.040 -288 C 0.045 -289 F 0.053 -290 S 0.062 -291 R 0.066 -292 L 0.070 -293 D 0.076 -294 W 0.080 -295 P 0.076 -296 V 0.065 -297 R 0.055 -298 T 0.050 -299 L 0.047 -300 S 0.045 -301 F 0.044 -302 S 0.051 -303 H 0.069 -304 D 0.089 -305 G 0.095 -306 K 0.084 -307 M 0.067 -308 L 0.053 -309 A 0.045 -310 S 0.046 -311 A 0.059 -312 S 0.082 -313 E 0.100 -314 D 0.101 -315 H 0.085 -316 F 0.064 -317 I 0.051 -318 D 0.049 -319 I 0.049 -320 A 0.047 -321 E 0.044 -322 V 0.044 -323 E 0.050 -324 T 0.060 -325 G 0.070 -326 D 0.072 -327 K 0.068 -328 L 0.058 -329 W 0.050 -330 E 0.047 -331 V 0.052 -332 Q 0.064 -333 C 0.075 -334 E 0.080 -335 S 0.076 -336 P 0.067 -337 T 0.059 -338 F 0.058 -339 T 0.061 -340 V 0.063 -341 A 0.063 -342 W 0.067 -343 H 0.077 -344 P 0.087 -345 K 0.087 -346 R 0.081 -347 P 0.075 -348 L 0.074 -349 L 0.073 -350 A 0.067 -351 F 0.064 -352 A 0.078 -353 C 0.121 -354 D 0.196 -355 D 0.290 -356 K 0.371 -357 D 0.413 -358 G 0.411 -359 K 0.385 -360 Y 0.359 -361 D 0.347 -362 S 0.343 -363 S 0.337 -364 R 0.324 -365 E 0.295 -366 A 0.248 -367 G 0.187 -368 T 0.130 -369 V 0.090 -370 K 0.071 -371 L 0.069 -372 F 0.087 -373 G 0.135 -374 L 0.217 -375 P 0.316 -376 N 0.393 -377 D 0.421 -378 S 0.417 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000064547.15_ENST00000407877.8_GN:LPAR2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000064547.15_ENST00000407877.8_GN:LPAR2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index d9b60c5e4cf7864dae084a2153adea2a60334de5..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000064547.15_ENST00000407877.8_GN:LPAR2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,349 +0,0 @@ ->ENSG00000064547.15|ENST00000407877.8|GN:LPAR2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.268 -2 G 0.240 -3 Q 0.200 -4 C 0.162 -5 Y 0.130 -6 Y 0.107 -7 N 0.097 -8 E 0.100 -9 T 0.109 -10 I 0.121 -11 G 0.133 -12 F 0.145 -13 F 0.158 -14 Y 0.179 -15 N 0.206 -16 N 0.232 -17 S 0.252 -18 G 0.259 -19 K 0.253 -20 E 0.243 -21 L 0.236 -22 S 0.226 -23 S 0.208 -24 H 0.179 -25 W 0.147 -26 R 0.117 -27 P 0.093 -28 K 0.073 -29 D 0.055 -30 V 0.041 -31 V 0.034 -32 V 0.033 -33 V 0.036 -34 A 0.037 -35 L 0.039 -36 G 0.041 -37 L 0.045 -38 T 0.050 -39 V 0.055 -40 S 0.057 -41 V 0.056 -42 L 0.055 -43 V 0.054 -44 L 0.051 -45 L 0.048 -46 T 0.048 -47 N 0.049 -48 L 0.050 -49 L 0.050 -50 V 0.050 -51 I 0.049 -52 A 0.049 -53 A 0.050 -54 I 0.052 -55 A 0.057 -56 S 0.062 -57 N 0.063 -58 R 0.060 -59 R 0.056 -60 F 0.053 -61 H 0.050 -62 Q 0.046 -63 P 0.040 -64 I 0.033 -65 Y 0.028 -66 Y 0.027 -67 L 0.028 -68 L 0.033 -69 G 0.040 -70 N 0.045 -71 L 0.049 -72 A 0.052 -73 A 0.051 -74 A 0.045 -75 D 0.037 -76 L 0.030 -77 F 0.026 -78 A 0.024 -79 G 0.023 -80 V 0.022 -81 A 0.020 -82 Y 0.019 -83 L 0.019 -84 F 0.020 -85 L 0.021 -86 M 0.025 -87 F 0.033 -88 H 0.048 -89 T 0.067 -90 G 0.082 -91 P 0.089 -92 R 0.089 -93 T 0.086 -94 A 0.084 -95 R 0.082 -96 L 0.082 -97 S 0.080 -98 L 0.072 -99 E 0.059 -100 G 0.044 -101 W 0.033 -102 F 0.026 -103 L 0.024 -104 R 0.026 -105 Q 0.031 -106 G 0.034 -107 L 0.034 -108 L 0.032 -109 D 0.034 -110 T 0.036 -111 S 0.038 -112 L 0.038 -113 T 0.037 -114 A 0.036 -115 S 0.035 -116 V 0.034 -117 A 0.036 -118 T 0.039 -119 L 0.040 -120 L 0.039 -121 A 0.037 -122 I 0.035 -123 A 0.037 -124 V 0.042 -125 E 0.046 -126 R 0.049 -127 H 0.048 -128 R 0.049 -129 S 0.055 -130 V 0.064 -131 M 0.079 -132 A 0.099 -133 V 0.122 -134 Q 0.152 -135 L 0.185 -136 H 0.207 -137 S 0.209 -138 R 0.188 -139 L 0.150 -140 P 0.108 -141 R 0.073 -142 G 0.052 -143 R 0.045 -144 V 0.048 -145 V 0.058 -146 M 0.064 -147 L 0.061 -148 I 0.053 -149 V 0.049 -150 G 0.050 -151 V 0.052 -152 W 0.053 -153 V 0.053 -154 A 0.055 -155 A 0.058 -156 L 0.060 -157 G 0.062 -158 L 0.065 -159 G 0.067 -160 L 0.070 -161 L 0.075 -162 P 0.081 -163 A 0.085 -164 H 0.086 -165 S 0.087 -166 W 0.089 -167 H 0.087 -168 C 0.082 -169 L 0.079 -170 C 0.079 -171 A 0.086 -172 L 0.097 -173 D 0.110 -174 R 0.125 -175 C 0.140 -176 S 0.148 -177 R 0.146 -178 M 0.139 -179 A 0.125 -180 P 0.108 -181 L 0.097 -182 L 0.094 -183 S 0.092 -184 R 0.081 -185 S 0.067 -186 Y 0.056 -187 L 0.050 -188 A 0.046 -189 V 0.042 -190 W 0.039 -191 A 0.042 -192 L 0.049 -193 S 0.056 -194 S 0.058 -195 L 0.056 -196 L 0.053 -197 V 0.051 -198 F 0.049 -199 L 0.046 -200 L 0.047 -201 M 0.052 -202 V 0.060 -203 A 0.063 -204 V 0.054 -205 Y 0.041 -206 T 0.035 -207 R 0.037 -208 I 0.045 -209 F 0.054 -210 F 0.059 -211 Y 0.056 -212 V 0.053 -213 R 0.059 -214 R 0.069 -215 R 0.077 -216 V 0.086 -217 Q 0.104 -218 R 0.126 -219 M 0.149 -220 A 0.171 -221 E 0.193 -222 H 0.216 -223 V 0.234 -224 S 0.247 -225 C 0.254 -226 H 0.250 -227 P 0.229 -228 R 0.197 -229 Y 0.165 -230 R 0.139 -231 E 0.115 -232 T 0.094 -233 T 0.080 -234 L 0.072 -235 S 0.067 -236 L 0.061 -237 V 0.055 -238 K 0.051 -239 T 0.046 -240 V 0.040 -241 V 0.036 -242 I 0.036 -243 I 0.041 -244 L 0.045 -245 G 0.046 -246 A 0.043 -247 F 0.036 -248 V 0.029 -249 V 0.027 -250 C 0.031 -251 W 0.039 -252 T 0.044 -253 P 0.042 -254 G 0.036 -255 Q 0.031 -256 V 0.031 -257 V 0.032 -258 L 0.032 -259 L 0.032 -260 L 0.036 -261 D 0.044 -262 G 0.057 -263 L 0.076 -264 G 0.098 -265 C 0.121 -266 E 0.136 -267 S 0.140 -268 C 0.132 -269 N 0.116 -270 V 0.093 -271 L 0.071 -272 A 0.055 -273 V 0.046 -274 E 0.038 -275 K 0.033 -276 Y 0.033 -277 F 0.036 -278 L 0.041 -279 L 0.045 -280 L 0.050 -281 A 0.055 -282 E 0.062 -283 A 0.067 -284 N 0.067 -285 S 0.061 -286 L 0.052 -287 V 0.047 -288 N 0.044 -289 A 0.042 -290 A 0.041 -291 V 0.041 -292 Y 0.041 -293 S 0.046 -294 C 0.056 -295 R 0.065 -296 D 0.063 -297 A 0.053 -298 E 0.042 -299 M 0.035 -300 R 0.036 -301 R 0.041 -302 T 0.048 -303 F 0.052 -304 R 0.055 -305 R 0.058 -306 L 0.061 -307 L 0.068 -308 C 0.089 -309 C 0.127 -310 A 0.180 -311 C 0.239 -312 L 0.299 -313 R 0.363 -314 Q 0.429 -315 S 0.483 -316 T 0.516 -317 R 0.542 -318 E 0.575 -319 S 0.604 -320 V 0.616 -321 H 0.624 -322 Y 0.646 -323 T 0.673 -324 S 0.682 -325 S 0.674 -326 A 0.667 -327 Q 0.673 -328 G 0.694 -329 G 0.717 -330 A 0.732 -331 S 0.733 -332 T 0.726 -333 R 0.717 -334 I 0.708 -335 M 0.697 -336 L 0.689 -337 P 0.689 -338 E 0.695 -339 N 0.699 -340 G 0.701 -341 H 0.710 -342 P 0.728 -343 L 0.747 -344 M 0.750 -345 D 0.727 -346 S 0.673 -347 T 0.591 -348 L 0.524 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000064547.15_ENST00000407877.8_GN:LPAR2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000064547.15_ENST00000407877.8_GN:LPAR2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid deleted file mode 100644 index ef4599ce0277ce91115b2fdc631e2412804cdb81..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000064547.15_ENST00000407877.8_GN:LPAR2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid +++ /dev/null @@ -1,352 +0,0 @@ ->ENSG00000064547.15|ENST00000407877.8|GN:LPAR2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 -1 M 0.189 -2 V 0.191 -3 I 0.196 -4 M 0.196 -5 G 0.184 -6 Q 0.158 -7 C 0.129 -8 Y 0.106 -9 Y 0.093 -10 N 0.089 -11 E 0.094 -12 T 0.102 -13 I 0.113 -14 G 0.127 -15 F 0.141 -16 F 0.159 -17 Y 0.184 -18 N 0.212 -19 N 0.234 -20 S 0.250 -21 G 0.256 -22 K 0.250 -23 E 0.239 -24 L 0.230 -25 S 0.219 -26 S 0.200 -27 H 0.173 -28 W 0.143 -29 R 0.114 -30 P 0.092 -31 K 0.073 -32 D 0.055 -33 V 0.041 -34 V 0.034 -35 V 0.033 -36 V 0.036 -37 A 0.037 -38 L 0.039 -39 G 0.041 -40 L 0.045 -41 T 0.050 -42 V 0.055 -43 S 0.057 -44 V 0.055 -45 L 0.055 -46 V 0.054 -47 L 0.051 -48 L 0.048 -49 T 0.048 -50 N 0.049 -51 L 0.050 -52 L 0.051 -53 V 0.050 -54 I 0.049 -55 A 0.049 -56 A 0.050 -57 I 0.051 -58 A 0.056 -59 S 0.060 -60 N 0.062 -61 R 0.059 -62 R 0.055 -63 F 0.052 -64 H 0.049 -65 Q 0.045 -66 P 0.039 -67 I 0.033 -68 Y 0.028 -69 Y 0.026 -70 L 0.028 -71 L 0.033 -72 G 0.039 -73 N 0.045 -74 L 0.049 -75 A 0.052 -76 A 0.051 -77 A 0.044 -78 D 0.036 -79 L 0.030 -80 F 0.026 -81 A 0.024 -82 G 0.023 -83 V 0.021 -84 A 0.019 -85 Y 0.018 -86 L 0.018 -87 F 0.019 -88 L 0.020 -89 M 0.024 -90 F 0.032 -91 H 0.047 -92 T 0.065 -93 G 0.081 -94 P 0.087 -95 R 0.087 -96 T 0.084 -97 A 0.082 -98 R 0.080 -99 L 0.080 -100 S 0.079 -101 L 0.071 -102 E 0.058 -103 G 0.043 -104 W 0.032 -105 F 0.026 -106 L 0.024 -107 R 0.026 -108 Q 0.030 -109 G 0.034 -110 L 0.033 -111 L 0.032 -112 D 0.034 -113 T 0.036 -114 S 0.038 -115 L 0.038 -116 T 0.037 -117 A 0.036 -118 S 0.035 -119 V 0.034 -120 A 0.036 -121 T 0.038 -122 L 0.040 -123 L 0.039 -124 A 0.036 -125 I 0.035 -126 A 0.037 -127 V 0.042 -128 E 0.046 -129 R 0.049 -130 H 0.048 -131 R 0.049 -132 S 0.055 -133 V 0.064 -134 M 0.079 -135 A 0.098 -136 V 0.122 -137 Q 0.151 -138 L 0.184 -139 H 0.207 -140 S 0.209 -141 R 0.188 -142 L 0.150 -143 P 0.108 -144 R 0.073 -145 G 0.052 -146 R 0.045 -147 V 0.048 -148 V 0.058 -149 M 0.064 -150 L 0.061 -151 I 0.053 -152 V 0.049 -153 G 0.050 -154 V 0.053 -155 W 0.053 -156 V 0.053 -157 A 0.056 -158 A 0.059 -159 L 0.060 -160 G 0.063 -161 L 0.066 -162 G 0.068 -163 L 0.070 -164 L 0.076 -165 P 0.082 -166 A 0.086 -167 H 0.087 -168 S 0.089 -169 W 0.090 -170 H 0.088 -171 C 0.083 -172 L 0.079 -173 C 0.079 -174 A 0.085 -175 L 0.096 -176 D 0.108 -177 R 0.122 -178 C 0.136 -179 S 0.144 -180 R 0.142 -181 M 0.134 -182 A 0.122 -183 P 0.106 -184 L 0.095 -185 L 0.093 -186 S 0.090 -187 R 0.080 -188 S 0.066 -189 Y 0.056 -190 L 0.050 -191 A 0.047 -192 V 0.042 -193 W 0.039 -194 A 0.042 -195 L 0.049 -196 S 0.056 -197 S 0.058 -198 L 0.056 -199 L 0.053 -200 V 0.051 -201 F 0.049 -202 L 0.047 -203 L 0.047 -204 M 0.052 -205 V 0.061 -206 A 0.063 -207 V 0.054 -208 Y 0.042 -209 T 0.035 -210 R 0.037 -211 I 0.045 -212 F 0.055 -213 F 0.060 -214 Y 0.056 -215 V 0.053 -216 R 0.059 -217 R 0.069 -218 R 0.077 -219 V 0.086 -220 Q 0.104 -221 R 0.126 -222 M 0.149 -223 A 0.171 -224 E 0.193 -225 H 0.215 -226 V 0.234 -227 S 0.247 -228 C 0.254 -229 H 0.250 -230 P 0.230 -231 R 0.197 -232 Y 0.165 -233 R 0.140 -234 E 0.116 -235 T 0.094 -236 T 0.080 -237 L 0.073 -238 S 0.067 -239 L 0.061 -240 V 0.056 -241 K 0.052 -242 T 0.047 -243 V 0.041 -244 V 0.036 -245 I 0.037 -246 I 0.041 -247 L 0.045 -248 G 0.046 -249 A 0.043 -250 F 0.037 -251 V 0.030 -252 V 0.027 -253 C 0.031 -254 W 0.039 -255 T 0.045 -256 P 0.043 -257 G 0.036 -258 Q 0.031 -259 V 0.031 -260 V 0.031 -261 L 0.031 -262 L 0.031 -263 L 0.035 -264 D 0.043 -265 G 0.056 -266 L 0.075 -267 G 0.098 -268 C 0.120 -269 E 0.136 -270 S 0.140 -271 C 0.132 -272 N 0.116 -273 V 0.093 -274 L 0.070 -275 A 0.055 -276 V 0.046 -277 E 0.039 -278 K 0.033 -279 Y 0.033 -280 F 0.036 -281 L 0.041 -282 L 0.046 -283 L 0.051 -284 A 0.056 -285 E 0.063 -286 A 0.068 -287 N 0.068 -288 S 0.061 -289 L 0.053 -290 V 0.047 -291 N 0.044 -292 A 0.042 -293 A 0.042 -294 V 0.042 -295 Y 0.042 -296 S 0.046 -297 C 0.057 -298 R 0.065 -299 D 0.064 -300 A 0.054 -301 E 0.043 -302 M 0.036 -303 R 0.036 -304 R 0.041 -305 T 0.048 -306 F 0.052 -307 R 0.055 -308 R 0.058 -309 L 0.061 -310 L 0.069 -311 C 0.089 -312 C 0.128 -313 A 0.181 -314 C 0.240 -315 L 0.300 -316 R 0.364 -317 Q 0.430 -318 S 0.485 -319 T 0.517 -320 R 0.543 -321 E 0.577 -322 S 0.607 -323 V 0.619 -324 H 0.628 -325 Y 0.650 -326 T 0.674 -327 S 0.682 -328 S 0.674 -329 A 0.666 -330 Q 0.673 -331 G 0.693 -332 G 0.717 -333 A 0.731 -334 S 0.733 -335 T 0.726 -336 R 0.718 -337 I 0.709 -338 M 0.698 -339 L 0.689 -340 P 0.689 -341 E 0.694 -342 N 0.698 -343 G 0.701 -344 H 0.710 -345 P 0.729 -346 L 0.748 -347 M 0.751 -348 D 0.728 -349 S 0.674 -350 T 0.592 -351 L 0.525 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000077984.7_ENST00000480798.2_GN:CST7_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000077984.7_ENST00000480798.2_GN:CST7_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index a82653cc4dae0372186d91f85abe353edc5ded35..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000077984.7_ENST00000480798.2_GN:CST7_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,146 +0,0 @@ ->ENSG00000077984.7|ENST00000480798.2|GN:CST7|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.439 -2 R 0.472 -3 A 0.515 -4 A 0.529 -5 G 0.496 -6 T 0.443 -7 L 0.401 -8 L 0.357 -9 A 0.305 -10 F 0.273 -11 C 0.275 -12 C 0.300 -13 L 0.341 -14 V 0.392 -15 L 0.437 -16 S 0.475 -17 T 0.517 -18 T 0.561 -19 G 0.594 -20 G 0.609 -21 P 0.605 -22 S 0.591 -23 P 0.575 -24 D 0.559 -25 T 0.537 -26 C 0.521 -27 S 0.525 -28 Q 0.539 -29 D 0.541 -30 L 0.520 -31 N 0.486 -32 S 0.449 -33 R 0.411 -34 V 0.364 -35 K 0.309 -36 P 0.259 -37 G 0.222 -38 F 0.195 -39 P 0.167 -40 K 0.136 -41 T 0.103 -42 I 0.077 -43 K 0.062 -44 T 0.057 -45 N 0.057 -46 D 0.056 -47 P 0.052 -48 G 0.044 -49 V 0.035 -50 L 0.028 -51 Q 0.024 -52 A 0.022 -53 A 0.021 -54 R 0.021 -55 Y 0.019 -56 S 0.020 -57 V 0.022 -58 E 0.027 -59 K 0.036 -60 F 0.047 -61 N 0.060 -62 N 0.073 -63 C 0.084 -64 T 0.086 -65 N 0.079 -66 D 0.068 -67 M 0.061 -68 F 0.059 -69 L 0.059 -70 F 0.054 -71 K 0.044 -72 E 0.033 -73 S 0.026 -74 R 0.024 -75 I 0.023 -76 T 0.023 -77 R 0.023 -78 A 0.024 -79 L 0.027 -80 V 0.031 -81 Q 0.037 -82 I 0.042 -83 V 0.046 -84 K 0.046 -85 G 0.046 -86 L 0.046 -87 K 0.046 -88 Y 0.050 -89 M 0.057 -90 L 0.065 -91 E 0.070 -92 V 0.068 -93 E 0.060 -94 I 0.054 -95 G 0.056 -96 R 0.065 -97 T 0.074 -98 T 0.078 -99 C 0.076 -100 K 0.072 -101 K 0.071 -102 N 0.075 -103 Q 0.084 -104 H 0.090 -105 L 0.090 -106 R 0.086 -107 L 0.080 -108 D 0.074 -109 D 0.071 -110 C 0.073 -111 D 0.080 -112 F 0.092 -113 Q 0.111 -114 T 0.133 -115 N 0.150 -116 H 0.156 -117 T 0.150 -118 L 0.140 -119 K 0.127 -120 Q 0.115 -121 T 0.101 -122 L 0.085 -123 S 0.069 -124 C 0.056 -125 Y 0.047 -126 S 0.041 -127 E 0.039 -128 V 0.039 -129 W 0.041 -130 V 0.046 -131 V 0.054 -132 P 0.060 -133 W 0.063 -134 L 0.064 -135 Q 0.064 -136 H 0.062 -137 F 0.062 -138 E 0.065 -139 V 0.069 -140 P 0.068 -141 V 0.061 -142 L 0.054 -143 R 0.054 -144 C 0.063 -145 H 0.073 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000077984.7_ENST00000480798.2_GN:CST7_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000077984.7_ENST00000480798.2_GN:CST7_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid deleted file mode 100644 index d33a81f5c04b0ca6308938ee5595ebf6341b1cb0..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000077984.7_ENST00000480798.2_GN:CST7_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid +++ /dev/null @@ -1,168 +0,0 @@ ->ENSG00000077984.7|ENST00000480798.2|GN:CST7|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:22 -1 M 0.400 -2 L 0.434 -3 P 0.479 -4 E 0.503 -5 K 0.494 -6 A 0.480 -7 L 0.498 -8 H 0.537 -9 G 0.557 -10 H 0.535 -11 P 0.490 -12 Q 0.474 -13 L 0.515 -14 P 0.581 -15 R 0.629 -16 T 0.648 -17 V 0.647 -18 P 0.623 -19 T 0.583 -20 R 0.567 -21 A 0.602 -22 A 0.660 -23 M 0.703 -24 R 0.728 -25 A 0.741 -26 A 0.741 -27 G 0.723 -28 T 0.680 -29 L 0.607 -30 L 0.519 -31 A 0.451 -32 F 0.415 -33 C 0.400 -34 C 0.403 -35 L 0.431 -36 V 0.472 -37 L 0.507 -38 S 0.539 -39 T 0.577 -40 T 0.615 -41 G 0.641 -42 G 0.651 -43 P 0.644 -44 S 0.627 -45 P 0.607 -46 D 0.589 -47 T 0.569 -48 C 0.559 -49 S 0.574 -50 Q 0.598 -51 D 0.603 -52 L 0.582 -53 N 0.540 -54 S 0.491 -55 R 0.437 -56 V 0.375 -57 K 0.311 -58 P 0.257 -59 G 0.219 -60 F 0.192 -61 P 0.165 -62 K 0.134 -63 T 0.102 -64 I 0.075 -65 K 0.059 -66 T 0.054 -67 N 0.054 -68 D 0.054 -69 P 0.049 -70 G 0.042 -71 V 0.034 -72 L 0.027 -73 Q 0.022 -74 A 0.021 -75 A 0.020 -76 R 0.019 -77 Y 0.018 -78 S 0.019 -79 V 0.021 -80 E 0.026 -81 K 0.034 -82 F 0.044 -83 N 0.057 -84 N 0.069 -85 C 0.079 -86 T 0.080 -87 N 0.074 -88 D 0.063 -89 M 0.057 -90 F 0.055 -91 L 0.054 -92 F 0.050 -93 K 0.040 -94 E 0.031 -95 S 0.025 -96 R 0.023 -97 I 0.022 -98 T 0.022 -99 R 0.022 -100 A 0.023 -101 L 0.026 -102 V 0.030 -103 Q 0.035 -104 I 0.041 -105 V 0.044 -106 K 0.045 -107 G 0.046 -108 L 0.046 -109 K 0.047 -110 Y 0.050 -111 M 0.058 -112 L 0.066 -113 E 0.071 -114 V 0.068 -115 E 0.060 -116 I 0.054 -117 G 0.055 -118 R 0.064 -119 T 0.073 -120 T 0.077 -121 C 0.075 -122 K 0.071 -123 K 0.070 -124 N 0.074 -125 Q 0.083 -126 H 0.090 -127 L 0.090 -128 R 0.086 -129 L 0.080 -130 D 0.074 -131 D 0.071 -132 C 0.074 -133 D 0.080 -134 F 0.092 -135 Q 0.109 -136 T 0.129 -137 N 0.146 -138 H 0.152 -139 T 0.149 -140 L 0.139 -141 K 0.127 -142 Q 0.115 -143 T 0.101 -144 L 0.085 -145 S 0.070 -146 C 0.057 -147 Y 0.047 -148 S 0.042 -149 E 0.040 -150 V 0.040 -151 W 0.042 -152 V 0.047 -153 V 0.055 -154 P 0.061 -155 W 0.064 -156 L 0.065 -157 Q 0.064 -158 H 0.062 -159 F 0.062 -160 E 0.065 -161 V 0.068 -162 P 0.066 -163 V 0.060 -164 L 0.053 -165 R 0.054 -166 C 0.064 -167 H 0.074 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000080644.17_ENST00000326828.6_GN:CHRNA3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000080644.17_ENST00000326828.6_GN:CHRNA3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index e44872da398de1bc385e7dace521908c366caf95..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000080644.17_ENST00000326828.6_GN:CHRNA3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,506 +0,0 @@ ->ENSG00000080644.17|ENST00000326828.6|GN:CHRNA3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.369 -2 G 0.372 -3 S 0.391 -4 G 0.415 -5 P 0.407 -6 L 0.379 -7 S 0.392 -8 L 0.458 -9 P 0.517 -10 L 0.520 -11 A 0.475 -12 L 0.413 -13 S 0.359 -14 P 0.318 -15 P 0.283 -16 R 0.245 -17 L 0.210 -18 L 0.183 -19 L 0.171 -20 L 0.174 -21 L 0.184 -22 L 0.199 -23 L 0.220 -24 S 0.255 -25 L 0.300 -26 L 0.354 -27 P 0.413 -28 V 0.468 -29 A 0.497 -30 R 0.486 -31 A 0.432 -32 S 0.344 -33 E 0.247 -34 A 0.167 -35 E 0.114 -36 H 0.081 -37 R 0.062 -38 L 0.053 -39 F 0.051 -40 E 0.052 -41 R 0.053 -42 L 0.055 -43 F 0.061 -44 E 0.072 -45 D 0.082 -46 Y 0.087 -47 N 0.091 -48 E 0.099 -49 I 0.112 -50 I 0.122 -51 R 0.125 -52 P 0.125 -53 V 0.133 -54 A 0.150 -55 N 0.164 -56 V 0.168 -57 S 0.165 -58 D 0.161 -59 P 0.147 -60 V 0.121 -61 I 0.092 -62 I 0.069 -63 H 0.053 -64 F 0.043 -65 E 0.041 -66 V 0.044 -67 S 0.047 -68 M 0.049 -69 S 0.052 -70 Q 0.053 -71 L 0.053 -72 V 0.056 -73 K 0.060 -74 V 0.059 -75 D 0.053 -76 E 0.046 -77 V 0.043 -78 N 0.041 -79 Q 0.038 -80 I 0.034 -81 M 0.029 -82 E 0.025 -83 T 0.023 -84 N 0.025 -85 L 0.028 -86 W 0.033 -87 L 0.037 -88 K 0.039 -89 Q 0.041 -90 I 0.045 -91 W 0.051 -92 N 0.060 -93 D 0.068 -94 Y 0.074 -95 K 0.075 -96 L 0.070 -97 K 0.065 -98 W 0.063 -99 N 0.064 -100 P 0.064 -101 S 0.068 -102 D 0.079 -103 Y 0.098 -104 G 0.115 -105 G 0.119 -106 A 0.107 -107 E 0.089 -108 F 0.079 -109 M 0.081 -110 R 0.085 -111 V 0.084 -112 P 0.078 -113 A 0.072 -114 Q 0.067 -115 K 0.062 -116 I 0.059 -117 W 0.060 -118 K 0.066 -119 P 0.075 -120 D 0.083 -121 I 0.085 -122 V 0.083 -123 L 0.081 -124 Y 0.085 -125 N 0.097 -126 N 0.119 -127 A 0.146 -128 V 0.173 -129 G 0.195 -130 D 0.213 -131 F 0.229 -132 Q 0.247 -133 V 0.263 -134 D 0.268 -135 D 0.249 -136 K 0.209 -137 T 0.157 -138 K 0.107 -139 A 0.070 -140 L 0.052 -141 L 0.051 -142 K 0.065 -143 Y 0.088 -144 T 0.114 -145 G 0.130 -146 E 0.129 -147 V 0.121 -148 T 0.115 -149 W 0.120 -150 I 0.132 -151 P 0.140 -152 P 0.133 -153 A 0.114 -154 I 0.091 -155 F 0.074 -156 K 0.068 -157 S 0.072 -158 S 0.080 -159 C 0.086 -160 K 0.087 -161 I 0.082 -162 D 0.073 -163 V 0.062 -164 T 0.052 -165 Y 0.044 -166 F 0.041 -167 P 0.042 -168 F 0.046 -169 D 0.051 -170 Y 0.054 -171 Q 0.053 -172 N 0.050 -173 C 0.047 -174 T 0.043 -175 M 0.040 -176 K 0.038 -177 F 0.039 -178 G 0.043 -179 S 0.050 -180 W 0.057 -181 S 0.060 -182 Y 0.057 -183 D 0.053 -184 K 0.052 -185 A 0.054 -186 K 0.054 -187 I 0.051 -188 D 0.052 -189 L 0.061 -190 V 0.077 -191 L 0.094 -192 I 0.107 -193 G 0.114 -194 S 0.112 -195 S 0.101 -196 M 0.089 -197 N 0.083 -198 L 0.083 -199 K 0.085 -200 D 0.084 -201 Y 0.083 -202 W 0.087 -203 E 0.095 -204 S 0.098 -205 G 0.090 -206 E 0.081 -207 W 0.081 -208 A 0.086 -209 I 0.085 -210 I 0.080 -211 K 0.081 -212 A 0.088 -213 P 0.091 -214 G 0.086 -215 Y 0.079 -216 K 0.077 -217 H 0.081 -218 D 0.087 -219 I 0.093 -220 K 0.094 -221 Y 0.089 -222 N 0.081 -223 C 0.076 -224 C 0.079 -225 E 0.088 -226 E 0.098 -227 I 0.104 -228 Y 0.104 -229 P 0.097 -230 D 0.083 -231 I 0.065 -232 T 0.050 -233 Y 0.040 -234 S 0.033 -235 L 0.030 -236 Y 0.031 -237 I 0.038 -238 R 0.050 -239 R 0.065 -240 L 0.074 -241 P 0.071 -242 L 0.058 -243 F 0.046 -244 Y 0.041 -245 T 0.041 -246 I 0.046 -247 N 0.057 -248 L 0.074 -249 I 0.090 -250 I 0.100 -251 P 0.104 -252 C 0.107 -253 L 0.106 -254 L 0.103 -255 I 0.100 -256 S 0.098 -257 F 0.095 -258 L 0.093 -259 T 0.090 -260 V 0.084 -261 L 0.080 -262 V 0.078 -263 F 0.077 -264 Y 0.076 -265 L 0.078 -266 P 0.083 -267 S 0.091 -268 D 0.100 -269 C 0.103 -270 G 0.096 -271 E 0.082 -272 K 0.065 -273 V 0.053 -274 T 0.052 -275 L 0.063 -276 C 0.079 -277 I 0.091 -278 S 0.098 -279 V 0.101 -280 L 0.098 -281 L 0.095 -282 S 0.096 -283 L 0.102 -284 T 0.109 -285 V 0.115 -286 F 0.114 -287 L 0.111 -288 L 0.116 -289 V 0.133 -290 I 0.158 -291 T 0.180 -292 E 0.190 -293 T 0.193 -294 I 0.198 -295 P 0.207 -296 S 0.214 -297 T 0.211 -298 S 0.200 -299 L 0.182 -300 V 0.157 -301 I 0.128 -302 P 0.100 -303 L 0.081 -304 I 0.072 -305 G 0.071 -306 E 0.070 -307 Y 0.066 -308 L 0.059 -309 L 0.057 -310 F 0.062 -311 T 0.074 -312 M 0.085 -313 I 0.087 -314 F 0.080 -315 V 0.070 -316 T 0.064 -317 L 0.067 -318 S 0.077 -319 I 0.090 -320 V 0.098 -321 I 0.101 -322 T 0.098 -323 V 0.097 -324 F 0.102 -325 V 0.111 -326 L 0.119 -327 N 0.123 -328 V 0.125 -329 H 0.123 -330 Y 0.123 -331 R 0.128 -332 T 0.135 -333 P 0.140 -334 T 0.145 -335 T 0.156 -336 H 0.172 -337 T 0.182 -338 M 0.175 -339 P 0.147 -340 S 0.111 -341 W 0.082 -342 V 0.067 -343 K 0.062 -344 T 0.062 -345 V 0.071 -346 F 0.093 -347 L 0.118 -348 N 0.128 -349 L 0.120 -350 L 0.110 -351 P 0.109 -352 R 0.118 -353 V 0.135 -354 M 0.163 -355 F 0.206 -356 M 0.265 -357 T 0.336 -358 R 0.419 -359 P 0.510 -360 T 0.594 -361 S 0.654 -362 N 0.689 -363 E 0.705 -364 G 0.709 -365 N 0.699 -366 A 0.677 -367 Q 0.655 -368 K 0.643 -369 P 0.646 -370 R 0.660 -371 P 0.682 -372 L 0.706 -373 Y 0.724 -374 G 0.729 -375 A 0.719 -376 E 0.696 -377 L 0.670 -378 S 0.652 -379 N 0.639 -380 L 0.623 -381 N 0.606 -382 C 0.603 -383 F 0.623 -384 S 0.652 -385 R 0.672 -386 A 0.673 -387 E 0.661 -388 S 0.648 -389 K 0.635 -390 G 0.614 -391 C 0.590 -392 K 0.580 -393 E 0.582 -394 G 0.588 -395 Y 0.594 -396 P 0.595 -397 C 0.604 -398 Q 0.633 -399 D 0.668 -400 G 0.675 -401 M 0.651 -402 C 0.622 -403 G 0.596 -404 Y 0.556 -405 C 0.503 -406 H 0.468 -407 H 0.484 -408 R 0.553 -409 R 0.636 -410 I 0.693 -411 K 0.715 -412 I 0.715 -413 S 0.704 -414 N 0.692 -415 F 0.689 -416 S 0.699 -417 A 0.712 -418 N 0.714 -419 L 0.708 -420 T 0.701 -421 R 0.697 -422 S 0.694 -423 S 0.690 -424 S 0.685 -425 S 0.681 -426 E 0.675 -427 S 0.663 -428 V 0.651 -429 D 0.643 -430 A 0.627 -431 V 0.588 -432 L 0.532 -433 S 0.479 -434 L 0.442 -435 S 0.416 -436 A 0.387 -437 L 0.346 -438 S 0.305 -439 P 0.277 -440 E 0.259 -441 I 0.243 -442 K 0.235 -443 E 0.236 -444 A 0.237 -445 I 0.236 -446 Q 0.243 -447 S 0.258 -448 V 0.267 -449 K 0.269 -450 Y 0.274 -451 I 0.283 -452 A 0.295 -453 E 0.312 -454 N 0.325 -455 M 0.328 -456 K 0.330 -457 A 0.335 -458 Q 0.337 -459 N 0.331 -460 E 0.319 -461 A 0.303 -462 K 0.284 -463 E 0.260 -464 I 0.231 -465 Q 0.203 -466 D 0.182 -467 D 0.168 -468 W 0.162 -469 K 0.170 -470 Y 0.192 -471 V 0.212 -472 A 0.220 -473 M 0.221 -474 V 0.225 -475 I 0.220 -476 D 0.192 -477 R 0.154 -478 I 0.127 -479 F 0.112 -480 L 0.101 -481 W 0.092 -482 V 0.090 -483 F 0.096 -484 T 0.101 -485 L 0.101 -486 V 0.094 -487 C 0.085 -488 I 0.078 -489 L 0.076 -490 G 0.078 -491 T 0.079 -492 A 0.083 -493 G 0.091 -494 L 0.095 -495 F 0.092 -496 L 0.094 -497 Q 0.108 -498 P 0.132 -499 L 0.166 -500 M 0.212 -501 A 0.271 -502 R 0.339 -503 E 0.408 -504 D 0.468 -505 A 0.506 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000080644.17_ENST00000326828.6_GN:CHRNA3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:65.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000080644.17_ENST00000326828.6_GN:CHRNA3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:65.caid deleted file mode 100644 index f4097b5c352d0a92fa85c23de1a15941a74f1a97..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000080644.17_ENST00000326828.6_GN:CHRNA3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:65.caid +++ /dev/null @@ -1,571 +0,0 @@ ->ENSG00000080644.17|ENST00000326828.6|GN:CHRNA3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:65 -1 M 0.349 -2 V 0.362 -3 P 0.381 -4 V 0.399 -5 L 0.408 -6 P 0.404 -7 R 0.405 -8 V 0.431 -9 R 0.464 -10 G 0.476 -11 R 0.467 -12 W 0.465 -13 K 0.489 -14 P 0.539 -15 S 0.599 -16 G 0.644 -17 G 0.659 -18 E 0.645 -19 A 0.605 -20 E 0.550 -21 R 0.514 -22 S 0.524 -23 P 0.541 -24 A 0.523 -25 R 0.499 -26 L 0.512 -27 R 0.554 -28 P 0.594 -29 H 0.625 -30 G 0.648 -31 S 0.661 -32 R 0.669 -33 S 0.681 -34 G 0.691 -35 V 0.689 -36 C 0.672 -37 A 0.632 -38 G 0.577 -39 A 0.536 -40 A 0.525 -41 R 0.525 -42 G 0.531 -43 E 0.554 -44 A 0.564 -45 V 0.542 -46 S 0.529 -47 A 0.556 -48 T 0.594 -49 A 0.612 -50 A 0.620 -51 P 0.637 -52 A 0.662 -53 P 0.682 -54 D 0.690 -55 R 0.687 -56 P 0.683 -57 G 0.682 -58 P 0.674 -59 R 0.642 -60 P 0.593 -61 A 0.567 -62 R 0.587 -63 P 0.613 -64 P 0.605 -65 A 0.597 -66 M 0.627 -67 G 0.674 -68 S 0.701 -69 G 0.710 -70 P 0.707 -71 L 0.697 -72 S 0.692 -73 L 0.696 -74 P 0.694 -75 L 0.663 -76 A 0.589 -77 L 0.499 -78 S 0.428 -79 P 0.384 -80 P 0.343 -81 R 0.298 -82 L 0.255 -83 L 0.222 -84 L 0.207 -85 L 0.208 -86 L 0.218 -87 L 0.228 -88 L 0.243 -89 S 0.268 -90 L 0.305 -91 L 0.353 -92 P 0.413 -93 V 0.470 -94 A 0.496 -95 R 0.478 -96 A 0.419 -97 S 0.332 -98 E 0.238 -99 A 0.161 -100 E 0.111 -101 H 0.079 -102 R 0.059 -103 L 0.050 -104 F 0.048 -105 E 0.049 -106 R 0.050 -107 L 0.052 -108 F 0.058 -109 E 0.068 -110 D 0.078 -111 Y 0.084 -112 N 0.088 -113 E 0.096 -114 I 0.108 -115 I 0.119 -116 R 0.121 -117 P 0.121 -118 V 0.127 -119 A 0.143 -120 N 0.157 -121 V 0.161 -122 S 0.158 -123 D 0.154 -124 P 0.141 -125 V 0.116 -126 I 0.088 -127 I 0.066 -128 H 0.049 -129 F 0.040 -130 E 0.038 -131 V 0.040 -132 S 0.043 -133 M 0.046 -134 S 0.049 -135 Q 0.050 -136 L 0.051 -137 V 0.054 -138 K 0.058 -139 V 0.057 -140 D 0.050 -141 E 0.043 -142 V 0.040 -143 N 0.038 -144 Q 0.036 -145 I 0.032 -146 M 0.028 -147 E 0.024 -148 T 0.022 -149 N 0.023 -150 L 0.027 -151 W 0.031 -152 L 0.035 -153 K 0.037 -154 Q 0.039 -155 I 0.043 -156 W 0.050 -157 N 0.058 -158 D 0.066 -159 Y 0.072 -160 K 0.073 -161 L 0.068 -162 K 0.062 -163 W 0.059 -164 N 0.059 -165 P 0.060 -166 S 0.065 -167 D 0.077 -168 Y 0.097 -169 G 0.114 -170 G 0.118 -171 A 0.106 -172 E 0.088 -173 F 0.079 -174 M 0.081 -175 R 0.085 -176 V 0.083 -177 P 0.076 -178 A 0.069 -179 Q 0.065 -180 K 0.061 -181 I 0.058 -182 W 0.058 -183 K 0.063 -184 P 0.071 -185 D 0.078 -186 I 0.080 -187 V 0.078 -188 L 0.076 -189 Y 0.079 -190 N 0.092 -191 N 0.114 -192 A 0.142 -193 V 0.169 -194 G 0.190 -195 D 0.205 -196 F 0.218 -197 Q 0.233 -198 V 0.248 -199 D 0.251 -200 D 0.233 -201 K 0.195 -202 T 0.147 -203 K 0.100 -204 A 0.065 -205 L 0.048 -206 L 0.047 -207 K 0.059 -208 Y 0.082 -209 T 0.108 -210 G 0.124 -211 E 0.125 -212 V 0.117 -213 T 0.111 -214 W 0.115 -215 I 0.127 -216 P 0.136 -217 P 0.130 -218 A 0.112 -219 I 0.090 -220 F 0.073 -221 K 0.065 -222 S 0.067 -223 S 0.073 -224 C 0.077 -225 K 0.078 -226 I 0.073 -227 D 0.066 -228 V 0.057 -229 T 0.047 -230 Y 0.041 -231 F 0.037 -232 P 0.038 -233 F 0.042 -234 D 0.047 -235 Y 0.050 -236 Q 0.049 -237 N 0.047 -238 C 0.044 -239 T 0.042 -240 M 0.039 -241 K 0.038 -242 F 0.038 -243 G 0.041 -244 S 0.047 -245 W 0.053 -246 S 0.056 -247 Y 0.053 -248 D 0.049 -249 K 0.048 -250 A 0.050 -251 K 0.049 -252 I 0.047 -253 D 0.049 -254 L 0.058 -255 V 0.073 -256 L 0.089 -257 I 0.102 -258 G 0.110 -259 S 0.108 -260 S 0.097 -261 M 0.085 -262 N 0.079 -263 L 0.079 -264 K 0.081 -265 D 0.081 -266 Y 0.080 -267 W 0.084 -268 E 0.092 -269 S 0.094 -270 G 0.086 -271 E 0.077 -272 W 0.077 -273 A 0.081 -274 I 0.080 -275 I 0.075 -276 K 0.077 -277 A 0.083 -278 P 0.086 -279 G 0.081 -280 Y 0.074 -281 K 0.073 -282 H 0.078 -283 D 0.085 -284 I 0.092 -285 K 0.094 -286 Y 0.089 -287 N 0.081 -288 C 0.076 -289 C 0.079 -290 E 0.088 -291 E 0.098 -292 I 0.104 -293 Y 0.104 -294 P 0.097 -295 D 0.082 -296 I 0.065 -297 T 0.050 -298 Y 0.040 -299 S 0.033 -300 L 0.030 -301 Y 0.031 -302 I 0.038 -303 R 0.050 -304 R 0.065 -305 L 0.076 -306 P 0.074 -307 L 0.061 -308 F 0.049 -309 Y 0.045 -310 T 0.045 -311 I 0.051 -312 N 0.063 -313 L 0.080 -314 I 0.095 -315 I 0.105 -316 P 0.109 -317 C 0.110 -318 L 0.109 -319 L 0.106 -320 I 0.102 -321 S 0.098 -322 F 0.096 -323 L 0.093 -324 T 0.090 -325 V 0.084 -326 L 0.080 -327 V 0.080 -328 F 0.079 -329 Y 0.079 -330 L 0.082 -331 P 0.087 -332 S 0.096 -333 D 0.106 -334 C 0.110 -335 G 0.103 -336 E 0.087 -337 K 0.068 -338 V 0.055 -339 T 0.054 -340 L 0.065 -341 C 0.081 -342 I 0.094 -343 S 0.101 -344 V 0.103 -345 L 0.099 -346 L 0.096 -347 S 0.096 -348 L 0.098 -349 T 0.100 -350 V 0.103 -351 F 0.105 -352 L 0.107 -353 L 0.117 -354 V 0.138 -355 I 0.165 -356 T 0.186 -357 E 0.195 -358 T 0.197 -359 I 0.202 -360 P 0.210 -361 S 0.216 -362 T 0.212 -363 S 0.200 -364 L 0.180 -365 V 0.155 -366 I 0.126 -367 P 0.100 -368 L 0.081 -369 I 0.071 -370 G 0.069 -371 E 0.068 -372 Y 0.064 -373 L 0.057 -374 L 0.054 -375 F 0.056 -376 T 0.060 -377 M 0.060 -378 I 0.058 -379 F 0.056 -380 V 0.056 -381 T 0.058 -382 L 0.062 -383 S 0.067 -384 I 0.071 -385 V 0.075 -386 I 0.082 -387 T 0.089 -388 V 0.094 -389 F 0.102 -390 V 0.113 -391 L 0.121 -392 N 0.125 -393 V 0.126 -394 H 0.124 -395 Y 0.124 -396 R 0.128 -397 T 0.134 -398 P 0.138 -399 T 0.141 -400 T 0.151 -401 H 0.166 -402 T 0.176 -403 M 0.169 -404 P 0.142 -405 S 0.107 -406 W 0.079 -407 V 0.066 -408 K 0.060 -409 T 0.060 -410 V 0.068 -411 F 0.090 -412 L 0.113 -413 N 0.123 -414 L 0.116 -415 L 0.107 -416 P 0.106 -417 R 0.115 -418 V 0.132 -419 M 0.158 -420 F 0.199 -421 M 0.256 -422 T 0.328 -423 R 0.413 -424 P 0.506 -425 T 0.591 -426 S 0.652 -427 N 0.687 -428 E 0.705 -429 G 0.709 -430 N 0.700 -431 A 0.678 -432 Q 0.655 -433 K 0.642 -434 P 0.643 -435 R 0.655 -436 P 0.676 -437 L 0.700 -438 Y 0.720 -439 G 0.725 -440 A 0.714 -441 E 0.691 -442 L 0.666 -443 S 0.650 -444 N 0.641 -445 L 0.628 -446 N 0.613 -447 C 0.612 -448 F 0.633 -449 S 0.664 -450 R 0.685 -451 A 0.686 -452 E 0.675 -453 S 0.665 -454 K 0.654 -455 G 0.635 -456 C 0.614 -457 K 0.606 -458 E 0.610 -459 G 0.617 -460 Y 0.621 -461 P 0.619 -462 C 0.625 -463 Q 0.652 -464 D 0.685 -465 G 0.691 -466 M 0.667 -467 C 0.638 -468 G 0.615 -469 Y 0.589 -470 C 0.571 -471 H 0.584 -472 H 0.623 -473 R 0.666 -474 R 0.699 -475 I 0.721 -476 K 0.731 -477 I 0.731 -478 S 0.723 -479 N 0.711 -480 F 0.705 -481 S 0.713 -482 A 0.727 -483 N 0.731 -484 L 0.727 -485 T 0.724 -486 R 0.723 -487 S 0.721 -488 S 0.718 -489 S 0.713 -490 S 0.709 -491 E 0.702 -492 S 0.688 -493 V 0.675 -494 D 0.666 -495 A 0.649 -496 V 0.610 -497 L 0.556 -498 S 0.503 -499 L 0.464 -500 S 0.437 -501 A 0.407 -502 L 0.365 -503 S 0.324 -504 P 0.296 -505 E 0.277 -506 I 0.261 -507 K 0.254 -508 E 0.256 -509 A 0.253 -510 I 0.246 -511 Q 0.249 -512 S 0.264 -513 V 0.277 -514 K 0.284 -515 Y 0.291 -516 I 0.299 -517 A 0.311 -518 E 0.327 -519 N 0.339 -520 M 0.344 -521 K 0.348 -522 A 0.356 -523 Q 0.359 -524 N 0.350 -525 E 0.332 -526 A 0.312 -527 K 0.291 -528 E 0.266 -529 I 0.235 -530 Q 0.206 -531 D 0.184 -532 D 0.170 -533 W 0.165 -534 K 0.176 -535 Y 0.201 -536 V 0.223 -537 A 0.231 -538 M 0.232 -539 V 0.235 -540 I 0.228 -541 D 0.199 -542 R 0.159 -543 I 0.130 -544 F 0.114 -545 L 0.102 -546 W 0.092 -547 V 0.088 -548 F 0.088 -549 T 0.086 -550 L 0.081 -551 V 0.079 -552 C 0.077 -553 I 0.075 -554 L 0.074 -555 G 0.075 -556 T 0.076 -557 A 0.081 -558 G 0.089 -559 L 0.092 -560 F 0.089 -561 L 0.090 -562 Q 0.103 -563 P 0.127 -564 L 0.163 -565 M 0.210 -566 A 0.269 -567 R 0.333 -568 E 0.395 -569 D 0.445 -570 A 0.475 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000081842.18_ENST00000529310.6_GN:PCDHA6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000081842.18_ENST00000529310.6_GN:PCDHA6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index ca67274ce4fa53214bfae17b45bbc32fbf5cdb8b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000081842.18_ENST00000529310.6_GN:PCDHA6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,951 +0,0 @@ ->ENSG00000081842.18|ENST00000529310.6|GN:PCDHA6|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.337 -2 V 0.345 -3 F 0.362 -4 T 0.388 -5 P 0.413 -6 E 0.424 -7 D 0.430 -8 R 0.438 -9 L 0.441 -10 G 0.425 -11 K 0.397 -12 Q 0.376 -13 C 0.350 -14 L 0.307 -15 L 0.267 -16 L 0.245 -17 P 0.228 -18 L 0.210 -19 L 0.198 -20 L 0.194 -21 L 0.194 -22 A 0.202 -23 A 0.226 -24 W 0.262 -25 K 0.303 -26 V 0.343 -27 G 0.365 -28 S 0.347 -29 G 0.287 -30 Q 0.206 -31 L 0.131 -32 H 0.079 -33 Y 0.052 -34 S 0.043 -35 V 0.044 -36 P 0.051 -37 E 0.062 -38 E 0.074 -39 A 0.081 -40 K 0.080 -41 H 0.074 -42 G 0.069 -43 T 0.064 -44 F 0.058 -45 V 0.054 -46 G 0.051 -47 R 0.052 -48 I 0.056 -49 A 0.064 -50 Q 0.075 -51 D 0.091 -52 L 0.109 -53 G 0.121 -54 L 0.123 -55 E 0.117 -56 L 0.114 -57 A 0.112 -58 E 0.115 -59 L 0.124 -60 V 0.137 -61 P 0.135 -62 R 0.114 -63 L 0.088 -64 F 0.075 -65 R 0.080 -66 M 0.093 -67 A 0.105 -68 S 0.114 -69 K 0.125 -70 D 0.137 -71 R 0.147 -72 E 0.142 -73 D 0.119 -74 L 0.089 -75 L 0.067 -76 E 0.057 -77 V 0.054 -78 N 0.052 -79 L 0.053 -80 Q 0.059 -81 N 0.068 -82 G 0.072 -83 I 0.068 -84 L 0.063 -85 F 0.065 -86 V 0.075 -87 N 0.084 -88 S 0.085 -89 R 0.078 -90 I 0.069 -91 D 0.064 -92 R 0.067 -93 E 0.079 -94 E 0.092 -95 L 0.103 -96 C 0.113 -97 G 0.125 -98 R 0.135 -99 S 0.139 -100 A 0.133 -101 E 0.119 -102 C 0.102 -103 S 0.087 -104 I 0.077 -105 H 0.068 -106 L 0.058 -107 E 0.049 -108 V 0.043 -109 I 0.041 -110 V 0.041 -111 D 0.041 -112 R 0.043 -113 P 0.048 -114 L 0.059 -115 Q 0.074 -116 V 0.087 -117 F 0.095 -118 H 0.097 -119 V 0.094 -120 D 0.094 -121 V 0.106 -122 E 0.131 -123 V 0.158 -124 R 0.176 -125 D 0.181 -126 I 0.175 -127 N 0.166 -128 D 0.158 -129 N 0.150 -130 P 0.141 -131 P 0.138 -132 L 0.144 -133 F 0.154 -134 P 0.158 -135 V 0.153 -136 E 0.140 -137 E 0.120 -138 Q 0.098 -139 R 0.079 -140 V 0.065 -141 L 0.054 -142 I 0.046 -143 Y 0.046 -144 E 0.055 -145 S 0.069 -146 R 0.082 -147 L 0.090 -148 P 0.093 -149 D 0.093 -150 S 0.094 -151 V 0.094 -152 F 0.094 -153 P 0.098 -154 L 0.108 -155 E 0.120 -156 G 0.127 -157 A 0.127 -158 S 0.127 -159 D 0.131 -160 A 0.142 -161 D 0.153 -162 V 0.160 -163 G 0.162 -164 S 0.158 -165 N 0.148 -166 S 0.128 -167 I 0.102 -168 L 0.082 -169 T 0.073 -170 Y 0.073 -171 K 0.076 -172 L 0.076 -173 S 0.073 -174 S 0.068 -175 S 0.061 -176 E 0.054 -177 Y 0.049 -178 F 0.049 -179 G 0.054 -180 L 0.064 -181 D 0.078 -182 V 0.097 -183 K 0.124 -184 I 0.154 -185 N 0.175 -186 S 0.181 -187 D 0.173 -188 D 0.159 -189 N 0.141 -190 K 0.117 -191 Q 0.090 -192 I 0.069 -193 G 0.059 -194 L 0.061 -195 L 0.069 -196 L 0.078 -197 K 0.081 -198 K 0.079 -199 S 0.073 -200 L 0.066 -201 D 0.061 -202 R 0.062 -203 E 0.071 -204 E 0.082 -205 A 0.087 -206 P 0.089 -207 A 0.090 -208 H 0.088 -209 N 0.079 -210 L 0.065 -211 F 0.051 -212 L 0.042 -213 T 0.040 -214 A 0.043 -215 T 0.050 -216 D 0.060 -217 G 0.067 -218 G 0.064 -219 K 0.055 -220 P 0.050 -221 E 0.050 -222 L 0.054 -223 T 0.058 -224 G 0.068 -225 T 0.081 -226 V 0.088 -227 Q 0.084 -228 L 0.074 -229 L 0.068 -230 V 0.075 -231 T 0.096 -232 V 0.124 -233 L 0.148 -234 D 0.157 -235 V 0.150 -236 N 0.137 -237 D 0.124 -238 N 0.114 -239 A 0.108 -240 P 0.103 -241 T 0.099 -242 F 0.090 -243 E 0.078 -244 Q 0.070 -245 S 0.067 -246 E 0.063 -247 Y 0.055 -248 E 0.046 -249 V 0.036 -250 R 0.029 -251 I 0.026 -252 F 0.031 -253 E 0.046 -254 N 0.065 -255 A 0.080 -256 D 0.083 -257 N 0.078 -258 G 0.074 -259 T 0.072 -260 T 0.070 -261 V 0.070 -262 I 0.073 -263 R 0.081 -264 L 0.087 -265 N 0.092 -266 A 0.094 -267 S 0.098 -268 D 0.105 -269 R 0.118 -270 D 0.133 -271 E 0.140 -272 G 0.141 -273 A 0.139 -274 N 0.134 -275 G 0.123 -276 A 0.105 -277 I 0.082 -278 S 0.061 -279 Y 0.053 -280 S 0.056 -281 F 0.066 -282 N 0.076 -283 S 0.082 -284 L 0.081 -285 V 0.075 -286 A 0.064 -287 A 0.053 -288 M 0.046 -289 V 0.045 -290 I 0.045 -291 D 0.041 -292 H 0.035 -293 F 0.033 -294 S 0.036 -295 I 0.041 -296 D 0.045 -297 R 0.048 -298 N 0.051 -299 T 0.054 -300 G 0.055 -301 E 0.055 -302 I 0.057 -303 V 0.064 -304 I 0.076 -305 R 0.091 -306 G 0.100 -307 N 0.097 -308 L 0.083 -309 D 0.066 -310 F 0.058 -311 E 0.060 -312 Q 0.066 -313 E 0.065 -314 N 0.061 -315 L 0.059 -316 Y 0.061 -317 K 0.058 -318 I 0.049 -319 L 0.039 -320 I 0.033 -321 D 0.032 -322 A 0.034 -323 T 0.039 -324 D 0.044 -325 K 0.048 -326 G 0.049 -327 H 0.048 -328 P 0.052 -329 P 0.059 -330 M 0.063 -331 A 0.063 -332 G 0.061 -333 H 0.062 -334 C 0.064 -335 T 0.067 -336 V 0.070 -337 L 0.074 -338 V 0.085 -339 R 0.108 -340 I 0.139 -341 L 0.165 -342 D 0.175 -343 K 0.170 -344 N 0.162 -345 D 0.157 -346 N 0.153 -347 V 0.146 -348 P 0.135 -349 E 0.124 -350 I 0.117 -351 A 0.117 -352 L 0.123 -353 T 0.132 -354 S 0.139 -355 L 0.136 -356 S 0.118 -357 L 0.090 -358 P 0.067 -359 V 0.055 -360 R 0.058 -361 E 0.076 -362 D 0.103 -363 A 0.123 -364 Q 0.127 -365 F 0.125 -366 G 0.124 -367 T 0.121 -368 V 0.109 -369 I 0.092 -370 A 0.077 -371 L 0.067 -372 I 0.062 -373 S 0.067 -374 V 0.078 -375 N 0.092 -376 D 0.108 -377 L 0.128 -378 D 0.147 -379 S 0.158 -380 G 0.162 -381 A 0.161 -382 N 0.157 -383 G 0.150 -384 Q 0.137 -385 V 0.119 -386 N 0.100 -387 C 0.090 -388 S 0.092 -389 L 0.103 -390 T 0.117 -391 P 0.127 -392 H 0.122 -393 V 0.098 -394 P 0.074 -395 F 0.065 -396 K 0.069 -397 L 0.073 -398 V 0.073 -399 S 0.070 -400 T 0.066 -401 F 0.059 -402 K 0.050 -403 N 0.041 -404 Y 0.036 -405 Y 0.038 -406 S 0.047 -407 L 0.061 -408 V 0.078 -409 L 0.093 -410 D 0.101 -411 S 0.100 -412 A 0.090 -413 L 0.077 -414 D 0.066 -415 R 0.062 -416 E 0.066 -417 S 0.072 -418 V 0.075 -419 S 0.080 -420 A 0.086 -421 Y 0.085 -422 E 0.074 -423 L 0.058 -424 V 0.044 -425 V 0.038 -426 T 0.037 -427 A 0.043 -428 R 0.053 -429 D 0.064 -430 G 0.070 -431 G 0.067 -432 S 0.060 -433 P 0.057 -434 S 0.058 -435 L 0.057 -436 W 0.057 -437 A 0.063 -438 T 0.075 -439 A 0.085 -440 S 0.092 -441 L 0.095 -442 S 0.099 -443 V 0.111 -444 E 0.136 -445 V 0.168 -446 A 0.192 -447 D 0.195 -448 M 0.182 -449 N 0.164 -450 D 0.152 -451 N 0.144 -452 A 0.134 -453 P 0.126 -454 A 0.121 -455 F 0.117 -456 A 0.114 -457 Q 0.115 -458 P 0.117 -459 E 0.111 -460 Y 0.094 -461 T 0.074 -462 V 0.059 -463 F 0.050 -464 V 0.047 -465 K 0.052 -466 E 0.066 -467 N 0.090 -468 N 0.119 -469 P 0.140 -470 P 0.142 -471 G 0.127 -472 C 0.106 -473 H 0.088 -474 I 0.076 -475 F 0.075 -476 T 0.083 -477 V 0.098 -478 S 0.114 -479 A 0.126 -480 R 0.134 -481 D 0.141 -482 A 0.153 -483 D 0.167 -484 A 0.174 -485 Q 0.177 -486 E 0.179 -487 N 0.178 -488 A 0.166 -489 L 0.141 -490 V 0.111 -491 S 0.088 -492 Y 0.079 -493 S 0.082 -494 L 0.087 -495 V 0.093 -496 E 0.101 -497 R 0.114 -498 R 0.130 -499 V 0.150 -500 G 0.171 -501 E 0.183 -502 R 0.177 -503 A 0.157 -504 L 0.134 -505 S 0.109 -506 S 0.086 -507 Y 0.069 -508 I 0.062 -509 S 0.062 -510 V 0.067 -511 H 0.070 -512 A 0.072 -513 E 0.077 -514 S 0.083 -515 G 0.085 -516 K 0.083 -517 V 0.082 -518 Y 0.092 -519 A 0.112 -520 L 0.133 -521 Q 0.145 -522 P 0.142 -523 L 0.126 -524 D 0.106 -525 H 0.093 -526 E 0.093 -527 E 0.098 -528 L 0.094 -529 E 0.081 -530 L 0.069 -531 L 0.061 -532 Q 0.056 -533 F 0.052 -534 Q 0.048 -535 V 0.046 -536 S 0.047 -537 A 0.052 -538 R 0.059 -539 D 0.069 -540 A 0.076 -541 G 0.076 -542 V 0.071 -543 P 0.069 -544 P 0.076 -545 L 0.084 -546 G 0.089 -547 S 0.095 -548 N 0.104 -549 V 0.109 -550 T 0.104 -551 L 0.096 -552 Q 0.097 -553 V 0.112 -554 F 0.141 -555 V 0.174 -556 L 0.198 -557 D 0.207 -558 E 0.203 -559 N 0.197 -560 D 0.191 -561 N 0.185 -562 A 0.171 -563 P 0.151 -564 A 0.135 -565 L 0.133 -566 L 0.151 -567 A 0.200 -568 P 0.295 -569 R 0.428 -570 V 0.554 -571 G 0.630 -572 G 0.655 -573 T 0.649 -574 G 0.618 -575 G 0.553 -576 A 0.453 -577 V 0.341 -578 S 0.241 -579 E 0.166 -580 L 0.121 -581 V 0.101 -582 P 0.101 -583 R 0.110 -584 S 0.124 -585 L 0.141 -586 G 0.160 -587 A 0.169 -588 G 0.157 -589 Q 0.132 -590 V 0.110 -591 V 0.099 -592 A 0.096 -593 K 0.095 -594 V 0.096 -595 R 0.105 -596 A 0.123 -597 V 0.144 -598 D 0.163 -599 A 0.183 -600 D 0.198 -601 S 0.201 -602 G 0.194 -603 Y 0.181 -604 N 0.164 -605 A 0.141 -606 W 0.115 -607 L 0.095 -608 S 0.088 -609 Y 0.096 -610 E 0.117 -611 L 0.147 -612 Q 0.190 -613 P 0.242 -614 P 0.286 -615 A 0.307 -616 S 0.305 -617 S 0.288 -618 A 0.253 -619 R 0.200 -620 F 0.142 -621 P 0.100 -622 F 0.086 -623 R 0.094 -624 V 0.112 -625 G 0.124 -626 L 0.120 -627 Y 0.107 -628 T 0.095 -629 G 0.084 -630 E 0.075 -631 I 0.073 -632 S 0.081 -633 T 0.098 -634 T 0.114 -635 R 0.123 -636 V 0.126 -637 L 0.129 -638 D 0.138 -639 E 0.155 -640 A 0.169 -641 D 0.170 -642 S 0.157 -643 P 0.136 -644 R 0.119 -645 H 0.104 -646 R 0.089 -647 L 0.075 -648 L 0.064 -649 V 0.061 -650 L 0.064 -651 V 0.071 -652 K 0.077 -653 D 0.081 -654 H 0.084 -655 G 0.081 -656 E 0.075 -657 P 0.073 -658 A 0.076 -659 L 0.079 -660 T 0.081 -661 A 0.085 -662 T 0.091 -663 A 0.094 -664 T 0.094 -665 V 0.090 -666 L 0.084 -667 V 0.084 -668 S 0.096 -669 L 0.129 -670 V 0.191 -671 E 0.286 -672 S 0.404 -673 G 0.513 -674 Q 0.588 -675 A 0.636 -676 P 0.677 -677 K 0.713 -678 A 0.737 -679 S 0.747 -680 S 0.751 -681 R 0.756 -682 A 0.766 -683 S 0.779 -684 V 0.785 -685 G 0.780 -686 A 0.767 -687 A 0.757 -688 G 0.756 -689 P 0.762 -690 E 0.768 -691 A 0.770 -692 A 0.761 -693 L 0.737 -694 V 0.698 -695 D 0.641 -696 V 0.564 -697 N 0.471 -698 V 0.385 -699 Y 0.333 -700 L 0.324 -701 I 0.346 -702 I 0.388 -703 A 0.439 -704 I 0.484 -705 C 0.512 -706 A 0.527 -707 V 0.538 -708 S 0.547 -709 S 0.548 -710 L 0.527 -711 L 0.485 -712 V 0.433 -713 L 0.373 -714 T 0.317 -715 L 0.279 -716 L 0.262 -717 L 0.253 -718 Y 0.248 -719 T 0.258 -720 A 0.286 -721 L 0.326 -722 R 0.373 -723 C 0.421 -724 S 0.463 -725 A 0.504 -726 P 0.559 -727 P 0.628 -728 T 0.693 -729 E 0.738 -730 G 0.763 -731 A 0.771 -732 C 0.769 -733 T 0.763 -734 A 0.755 -735 D 0.751 -736 K 0.754 -737 P 0.764 -738 T 0.778 -739 L 0.790 -740 V 0.795 -741 C 0.792 -742 S 0.787 -743 S 0.787 -744 A 0.793 -745 V 0.799 -746 G 0.798 -747 S 0.790 -748 W 0.778 -749 S 0.762 -750 Y 0.734 -751 S 0.687 -752 Q 0.629 -753 Q 0.606 -754 R 0.649 -755 R 0.723 -756 Q 0.779 -757 R 0.805 -758 V 0.812 -759 C 0.809 -760 S 0.802 -761 G 0.794 -762 E 0.789 -763 G 0.786 -764 P 0.790 -765 P 0.803 -766 K 0.817 -767 M 0.824 -768 D 0.820 -769 L 0.811 -770 M 0.797 -771 A 0.781 -772 F 0.766 -773 S 0.758 -774 P 0.757 -775 S 0.752 -776 L 0.744 -777 S 0.738 -778 P 0.745 -779 C 0.767 -780 P 0.796 -781 I 0.821 -782 M 0.835 -783 M 0.840 -784 G 0.838 -785 K 0.831 -786 A 0.813 -787 E 0.766 -788 N 0.698 -789 Q 0.660 -790 D 0.689 -791 L 0.750 -792 N 0.790 -793 E 0.801 -794 D 0.797 -795 H 0.788 -796 D 0.779 -797 A 0.772 -798 K 0.767 -799 P 0.765 -800 R 0.762 -801 Q 0.755 -802 P 0.745 -803 N 0.737 -804 P 0.733 -805 D 0.730 -806 W 0.733 -807 R 0.741 -808 Y 0.753 -809 S 0.763 -810 A 0.770 -811 S 0.775 -812 L 0.779 -813 R 0.785 -814 A 0.792 -815 G 0.797 -816 M 0.802 -817 H 0.810 -818 S 0.818 -819 S 0.824 -820 V 0.827 -821 H 0.829 -822 L 0.832 -823 E 0.834 -824 E 0.833 -825 A 0.832 -826 G 0.832 -827 I 0.832 -828 L 0.826 -829 R 0.814 -830 A 0.801 -831 G 0.791 -832 P 0.788 -833 G 0.791 -834 G 0.795 -835 P 0.796 -836 D 0.788 -837 Q 0.771 -838 Q 0.755 -839 W 0.752 -840 P 0.765 -841 T 0.772 -842 V 0.743 -843 S 0.681 -844 S 0.636 -845 A 0.645 -846 T 0.676 -847 P 0.689 -848 E 0.703 -849 P 0.742 -850 E 0.791 -851 A 0.822 -852 G 0.829 -853 E 0.821 -854 V 0.804 -855 S 0.789 -856 P 0.790 -857 P 0.808 -858 V 0.829 -859 G 0.843 -860 A 0.845 -861 G 0.840 -862 V 0.832 -863 N 0.823 -864 S 0.816 -865 N 0.806 -866 S 0.794 -867 W 0.782 -868 T 0.773 -869 F 0.765 -870 K 0.757 -871 Y 0.754 -872 G 0.758 -873 P 0.767 -874 G 0.780 -875 N 0.794 -876 P 0.803 -877 K 0.805 -878 Q 0.800 -879 S 0.795 -880 G 0.796 -881 P 0.800 -882 G 0.802 -883 E 0.799 -884 L 0.796 -885 P 0.801 -886 D 0.809 -887 K 0.809 -888 F 0.799 -889 I 0.790 -890 I 0.790 -891 P 0.796 -892 G 0.804 -893 S 0.813 -894 P 0.826 -895 A 0.838 -896 I 0.844 -897 I 0.841 -898 S 0.832 -899 I 0.818 -900 R 0.801 -901 Q 0.786 -902 E 0.777 -903 P 0.775 -904 T 0.782 -905 N 0.793 -906 S 0.801 -907 Q 0.800 -908 I 0.793 -909 D 0.787 -910 K 0.783 -911 S 0.783 -912 D 0.785 -913 F 0.787 -914 I 0.788 -915 T 0.790 -916 F 0.790 -917 G 0.783 -918 K 0.765 -919 K 0.735 -920 E 0.685 -921 E 0.619 -922 T 0.582 -923 K 0.605 -924 K 0.658 -925 K 0.697 -926 K 0.717 -927 K 0.729 -928 K 0.735 -929 K 0.737 -930 K 0.740 -931 G 0.742 -932 N 0.728 -933 K 0.674 -934 T 0.572 -935 Q 0.475 -936 E 0.454 -937 K 0.498 -938 K 0.540 -939 E 0.571 -940 K 0.629 -941 G 0.703 -942 N 0.753 -943 S 0.774 -944 T 0.783 -945 T 0.791 -946 D 0.797 -947 N 0.795 -948 S 0.784 -949 D 0.767 -950 Q 0.755 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000081842.18_ENST00000529310.6_GN:PCDHA6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:9.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000081842.18_ENST00000529310.6_GN:PCDHA6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:9.caid deleted file mode 100644 index 4dfe793f3f87e741dfeba9d2e1a0953188e0c042..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000081842.18_ENST00000529310.6_GN:PCDHA6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:9.caid +++ /dev/null @@ -1,960 +0,0 @@ ->ENSG00000081842.18|ENST00000529310.6|GN:PCDHA6|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:9 -1 M 0.342 -2 E 0.357 -3 I 0.376 -4 K 0.386 -5 P 0.385 -6 E 0.389 -7 V 0.409 -8 F 0.426 -9 D 0.423 -10 M 0.407 -11 V 0.388 -12 F 0.378 -13 T 0.390 -14 P 0.426 -15 E 0.457 -16 D 0.458 -17 R 0.438 -18 L 0.415 -19 G 0.380 -20 K 0.333 -21 Q 0.306 -22 C 0.304 -23 L 0.297 -24 L 0.276 -25 L 0.253 -26 P 0.230 -27 L 0.209 -28 L 0.199 -29 L 0.199 -30 L 0.202 -31 A 0.210 -32 A 0.229 -33 W 0.257 -34 K 0.293 -35 V 0.331 -36 G 0.353 -37 S 0.337 -38 G 0.281 -39 Q 0.203 -40 L 0.130 -41 H 0.079 -42 Y 0.052 -43 S 0.043 -44 V 0.044 -45 P 0.052 -46 E 0.063 -47 E 0.075 -48 A 0.083 -49 K 0.082 -50 H 0.076 -51 G 0.071 -52 T 0.065 -53 F 0.059 -54 V 0.053 -55 G 0.051 -56 R 0.052 -57 I 0.056 -58 A 0.064 -59 Q 0.075 -60 D 0.090 -61 L 0.108 -62 G 0.120 -63 L 0.121 -64 E 0.116 -65 L 0.113 -66 A 0.112 -67 E 0.114 -68 L 0.123 -69 V 0.135 -70 P 0.133 -71 R 0.111 -72 L 0.086 -73 F 0.073 -74 R 0.077 -75 M 0.090 -76 A 0.102 -77 S 0.110 -78 K 0.121 -79 D 0.134 -80 R 0.144 -81 E 0.140 -82 D 0.117 -83 L 0.087 -84 L 0.066 -85 E 0.056 -86 V 0.053 -87 N 0.051 -88 L 0.052 -89 Q 0.058 -90 N 0.067 -91 G 0.070 -92 I 0.066 -93 L 0.061 -94 F 0.063 -95 V 0.073 -96 N 0.082 -97 S 0.084 -98 R 0.077 -99 I 0.068 -100 D 0.062 -101 R 0.065 -102 E 0.076 -103 E 0.090 -104 L 0.101 -105 C 0.110 -106 G 0.122 -107 R 0.132 -108 S 0.136 -109 A 0.132 -110 E 0.119 -111 C 0.102 -112 S 0.088 -113 I 0.078 -114 H 0.068 -115 L 0.058 -116 E 0.049 -117 V 0.043 -118 I 0.041 -119 V 0.041 -120 D 0.042 -121 R 0.043 -122 P 0.049 -123 L 0.060 -124 Q 0.075 -125 V 0.088 -126 F 0.096 -127 H 0.097 -128 V 0.094 -129 D 0.094 -130 V 0.107 -131 E 0.132 -132 V 0.160 -133 R 0.178 -134 D 0.182 -135 I 0.176 -136 N 0.167 -137 D 0.158 -138 N 0.150 -139 P 0.141 -140 P 0.138 -141 L 0.145 -142 F 0.156 -143 P 0.160 -144 V 0.155 -145 E 0.142 -146 E 0.121 -147 Q 0.098 -148 R 0.078 -149 V 0.064 -150 L 0.053 -151 I 0.046 -152 Y 0.045 -153 E 0.054 -154 S 0.069 -155 R 0.081 -156 L 0.089 -157 P 0.092 -158 D 0.093 -159 S 0.093 -160 V 0.093 -161 F 0.092 -162 P 0.096 -163 L 0.105 -164 E 0.117 -165 G 0.124 -166 A 0.125 -167 S 0.126 -168 D 0.130 -169 A 0.141 -170 D 0.153 -171 V 0.160 -172 G 0.161 -173 S 0.158 -174 N 0.147 -175 S 0.127 -176 I 0.102 -177 L 0.081 -178 T 0.071 -179 Y 0.072 -180 K 0.076 -181 L 0.076 -182 S 0.072 -183 S 0.067 -184 S 0.060 -185 E 0.053 -186 Y 0.048 -187 F 0.048 -188 G 0.053 -189 L 0.063 -190 D 0.076 -191 V 0.095 -192 K 0.121 -193 I 0.149 -194 N 0.171 -195 S 0.177 -196 D 0.170 -197 D 0.156 -198 N 0.138 -199 K 0.115 -200 Q 0.089 -201 I 0.068 -202 G 0.058 -203 L 0.059 -204 L 0.068 -205 L 0.076 -206 K 0.080 -207 K 0.078 -208 S 0.072 -209 L 0.065 -210 D 0.059 -211 R 0.061 -212 E 0.070 -213 E 0.080 -214 A 0.086 -215 P 0.087 -216 A 0.088 -217 H 0.086 -218 N 0.077 -219 L 0.063 -220 F 0.050 -221 L 0.041 -222 T 0.039 -223 A 0.042 -224 T 0.049 -225 D 0.059 -226 G 0.065 -227 G 0.063 -228 K 0.054 -229 P 0.049 -230 E 0.050 -231 L 0.053 -232 T 0.057 -233 G 0.067 -234 T 0.079 -235 V 0.087 -236 Q 0.083 -237 L 0.073 -238 L 0.067 -239 V 0.074 -240 T 0.094 -241 V 0.122 -242 L 0.146 -243 D 0.155 -244 V 0.149 -245 N 0.136 -246 D 0.123 -247 N 0.114 -248 A 0.107 -249 P 0.103 -250 T 0.098 -251 F 0.089 -252 E 0.078 -253 Q 0.070 -254 S 0.067 -255 E 0.063 -256 Y 0.056 -257 E 0.046 -258 V 0.036 -259 R 0.029 -260 I 0.026 -261 F 0.032 -262 E 0.046 -263 N 0.066 -264 A 0.081 -265 D 0.084 -266 N 0.079 -267 G 0.075 -268 T 0.073 -269 T 0.071 -270 V 0.070 -271 I 0.074 -272 R 0.081 -273 L 0.088 -274 N 0.093 -275 A 0.096 -276 S 0.099 -277 D 0.107 -278 R 0.121 -279 D 0.135 -280 E 0.142 -281 G 0.143 -282 A 0.140 -283 N 0.135 -284 G 0.124 -285 A 0.106 -286 I 0.082 -287 S 0.062 -288 Y 0.054 -289 S 0.057 -290 F 0.067 -291 N 0.077 -292 S 0.083 -293 L 0.083 -294 V 0.076 -295 A 0.065 -296 A 0.054 -297 M 0.048 -298 V 0.047 -299 I 0.046 -300 D 0.042 -301 H 0.036 -302 F 0.034 -303 S 0.036 -304 I 0.042 -305 D 0.046 -306 R 0.049 -307 N 0.052 -308 T 0.056 -309 G 0.057 -310 E 0.057 -311 I 0.059 -312 V 0.066 -313 I 0.079 -314 R 0.094 -315 G 0.103 -316 N 0.100 -317 L 0.085 -318 D 0.068 -319 F 0.060 -320 E 0.062 -321 Q 0.068 -322 E 0.067 -323 N 0.062 -324 L 0.061 -325 Y 0.062 -326 K 0.059 -327 I 0.050 -328 L 0.040 -329 I 0.033 -330 D 0.032 -331 A 0.035 -332 T 0.040 -333 D 0.045 -334 K 0.049 -335 G 0.049 -336 H 0.049 -337 P 0.053 -338 P 0.060 -339 M 0.065 -340 A 0.064 -341 G 0.063 -342 H 0.063 -343 C 0.066 -344 T 0.069 -345 V 0.071 -346 L 0.075 -347 V 0.087 -348 R 0.110 -349 I 0.141 -350 L 0.166 -351 D 0.175 -352 K 0.170 -353 N 0.162 -354 D 0.158 -355 N 0.154 -356 V 0.147 -357 P 0.136 -358 E 0.124 -359 I 0.117 -360 A 0.117 -361 L 0.123 -362 T 0.131 -363 S 0.138 -364 L 0.135 -365 S 0.117 -366 L 0.089 -367 P 0.066 -368 V 0.055 -369 R 0.058 -370 E 0.076 -371 D 0.103 -372 A 0.122 -373 Q 0.126 -374 F 0.123 -375 G 0.122 -376 T 0.119 -377 V 0.107 -378 I 0.091 -379 A 0.077 -380 L 0.066 -381 I 0.062 -382 S 0.067 -383 V 0.078 -384 N 0.091 -385 D 0.106 -386 L 0.126 -387 D 0.144 -388 S 0.156 -389 G 0.159 -390 A 0.157 -391 N 0.154 -392 G 0.146 -393 Q 0.134 -394 V 0.116 -395 N 0.098 -396 C 0.088 -397 S 0.090 -398 L 0.100 -399 T 0.114 -400 P 0.125 -401 H 0.119 -402 V 0.096 -403 P 0.072 -404 F 0.064 -405 K 0.067 -406 L 0.072 -407 V 0.072 -408 S 0.069 -409 T 0.065 -410 F 0.058 -411 K 0.049 -412 N 0.040 -413 Y 0.036 -414 Y 0.038 -415 S 0.047 -416 L 0.061 -417 V 0.078 -418 L 0.093 -419 D 0.100 -420 S 0.098 -421 A 0.089 -422 L 0.076 -423 D 0.065 -424 R 0.061 -425 E 0.065 -426 S 0.071 -427 V 0.075 -428 S 0.079 -429 A 0.085 -430 Y 0.085 -431 E 0.074 -432 L 0.058 -433 V 0.044 -434 V 0.038 -435 T 0.038 -436 A 0.043 -437 R 0.053 -438 D 0.064 -439 G 0.070 -440 G 0.067 -441 S 0.060 -442 P 0.057 -443 S 0.058 -444 L 0.057 -445 W 0.057 -446 A 0.063 -447 T 0.075 -448 A 0.085 -449 S 0.091 -450 L 0.094 -451 S 0.097 -452 V 0.109 -453 E 0.135 -454 V 0.168 -455 A 0.192 -456 D 0.196 -457 M 0.183 -458 N 0.166 -459 D 0.154 -460 N 0.145 -461 A 0.136 -462 P 0.127 -463 A 0.122 -464 F 0.118 -465 A 0.115 -466 Q 0.116 -467 P 0.118 -468 E 0.112 -469 Y 0.095 -470 T 0.075 -471 V 0.059 -472 F 0.050 -473 V 0.047 -474 K 0.052 -475 E 0.066 -476 N 0.090 -477 N 0.120 -478 P 0.142 -479 P 0.144 -480 G 0.130 -481 C 0.109 -482 H 0.091 -483 I 0.079 -484 F 0.077 -485 T 0.085 -486 V 0.100 -487 S 0.115 -488 A 0.128 -489 R 0.136 -490 D 0.144 -491 A 0.157 -492 D 0.171 -493 A 0.178 -494 Q 0.181 -495 E 0.183 -496 N 0.182 -497 A 0.169 -498 L 0.143 -499 V 0.113 -500 S 0.089 -501 Y 0.080 -502 S 0.083 -503 L 0.088 -504 V 0.094 -505 E 0.102 -506 R 0.114 -507 R 0.130 -508 V 0.149 -509 G 0.171 -510 E 0.184 -511 R 0.178 -512 A 0.157 -513 L 0.133 -514 S 0.109 -515 S 0.086 -516 Y 0.069 -517 I 0.062 -518 S 0.062 -519 V 0.067 -520 H 0.070 -521 A 0.072 -522 E 0.077 -523 S 0.083 -524 G 0.086 -525 K 0.084 -526 V 0.083 -527 Y 0.092 -528 A 0.112 -529 L 0.134 -530 Q 0.145 -531 P 0.142 -532 L 0.126 -533 D 0.105 -534 H 0.092 -535 E 0.093 -536 E 0.097 -537 L 0.093 -538 E 0.081 -539 L 0.068 -540 L 0.061 -541 Q 0.056 -542 F 0.051 -543 Q 0.048 -544 V 0.047 -545 S 0.048 -546 A 0.052 -547 R 0.060 -548 D 0.069 -549 A 0.076 -550 G 0.076 -551 V 0.070 -552 P 0.069 -553 P 0.076 -554 L 0.084 -555 G 0.089 -556 S 0.095 -557 N 0.104 -558 V 0.109 -559 T 0.104 -560 L 0.097 -561 Q 0.097 -562 V 0.112 -563 F 0.141 -564 V 0.174 -565 L 0.198 -566 D 0.207 -567 E 0.204 -568 N 0.197 -569 D 0.192 -570 N 0.185 -571 A 0.171 -572 P 0.152 -573 A 0.136 -574 L 0.133 -575 L 0.151 -576 A 0.200 -577 P 0.294 -578 R 0.426 -579 V 0.552 -580 G 0.628 -581 G 0.652 -582 T 0.646 -583 G 0.617 -584 G 0.552 -585 A 0.453 -586 V 0.341 -587 S 0.241 -588 E 0.166 -589 L 0.120 -590 V 0.101 -591 P 0.101 -592 R 0.110 -593 S 0.124 -594 L 0.141 -595 G 0.160 -596 A 0.169 -597 G 0.157 -598 Q 0.132 -599 V 0.110 -600 V 0.099 -601 A 0.096 -602 K 0.095 -603 V 0.096 -604 R 0.105 -605 A 0.123 -606 V 0.144 -607 D 0.164 -608 A 0.184 -609 D 0.199 -610 S 0.202 -611 G 0.195 -612 Y 0.182 -613 N 0.165 -614 A 0.142 -615 W 0.117 -616 L 0.096 -617 S 0.088 -618 Y 0.097 -619 E 0.118 -620 L 0.148 -621 Q 0.190 -622 P 0.243 -623 P 0.288 -624 A 0.309 -625 S 0.307 -626 S 0.290 -627 A 0.255 -628 R 0.202 -629 F 0.143 -630 P 0.101 -631 F 0.086 -632 R 0.094 -633 V 0.113 -634 G 0.124 -635 L 0.121 -636 Y 0.108 -637 T 0.096 -638 G 0.085 -639 E 0.076 -640 I 0.073 -641 S 0.081 -642 T 0.098 -643 T 0.115 -644 R 0.124 -645 V 0.127 -646 L 0.130 -647 D 0.139 -648 E 0.155 -649 A 0.169 -650 D 0.171 -651 S 0.157 -652 P 0.137 -653 R 0.119 -654 H 0.104 -655 R 0.089 -656 L 0.075 -657 L 0.064 -658 V 0.061 -659 L 0.064 -660 V 0.071 -661 K 0.077 -662 D 0.082 -663 H 0.084 -664 G 0.081 -665 E 0.075 -666 P 0.073 -667 A 0.076 -668 L 0.079 -669 T 0.081 -670 A 0.085 -671 T 0.091 -672 A 0.094 -673 T 0.094 -674 V 0.090 -675 L 0.085 -676 V 0.084 -677 S 0.096 -678 L 0.130 -679 V 0.192 -680 E 0.288 -681 S 0.406 -682 G 0.514 -683 Q 0.589 -684 A 0.637 -685 P 0.678 -686 K 0.714 -687 A 0.737 -688 S 0.748 -689 S 0.752 -690 R 0.757 -691 A 0.766 -692 S 0.779 -693 V 0.786 -694 G 0.781 -695 A 0.767 -696 A 0.757 -697 G 0.756 -698 P 0.762 -699 E 0.769 -700 A 0.771 -701 A 0.762 -702 L 0.738 -703 V 0.699 -704 D 0.643 -705 V 0.566 -706 N 0.473 -707 V 0.387 -708 Y 0.334 -709 L 0.325 -710 I 0.348 -711 I 0.390 -712 A 0.441 -713 I 0.486 -714 C 0.515 -715 A 0.529 -716 V 0.538 -717 S 0.547 -718 S 0.549 -719 L 0.528 -720 L 0.486 -721 V 0.433 -722 L 0.374 -723 T 0.317 -724 L 0.279 -725 L 0.263 -726 L 0.255 -727 Y 0.250 -728 T 0.260 -729 A 0.288 -730 L 0.327 -731 R 0.374 -732 C 0.422 -733 S 0.463 -734 A 0.503 -735 P 0.558 -736 P 0.627 -737 T 0.692 -738 E 0.738 -739 G 0.762 -740 A 0.770 -741 C 0.769 -742 T 0.763 -743 A 0.755 -744 D 0.751 -745 K 0.753 -746 P 0.764 -747 T 0.778 -748 L 0.790 -749 V 0.795 -750 C 0.792 -751 S 0.787 -752 S 0.786 -753 A 0.792 -754 V 0.798 -755 G 0.798 -756 S 0.790 -757 W 0.778 -758 S 0.761 -759 Y 0.733 -760 S 0.685 -761 Q 0.627 -762 Q 0.605 -763 R 0.648 -764 R 0.722 -765 Q 0.778 -766 R 0.804 -767 V 0.812 -768 C 0.809 -769 S 0.802 -770 G 0.794 -771 E 0.789 -772 G 0.786 -773 P 0.790 -774 P 0.803 -775 K 0.817 -776 M 0.824 -777 D 0.821 -778 L 0.811 -779 M 0.798 -780 A 0.781 -781 F 0.766 -782 S 0.759 -783 P 0.757 -784 S 0.752 -785 L 0.744 -786 S 0.739 -787 P 0.746 -788 C 0.768 -789 P 0.797 -790 I 0.822 -791 M 0.836 -792 M 0.840 -793 G 0.838 -794 K 0.832 -795 A 0.813 -796 E 0.766 -797 N 0.698 -798 Q 0.660 -799 D 0.689 -800 L 0.750 -801 N 0.790 -802 E 0.801 -803 D 0.796 -804 H 0.788 -805 D 0.779 -806 A 0.772 -807 K 0.767 -808 P 0.765 -809 R 0.762 -810 Q 0.755 -811 P 0.745 -812 N 0.737 -813 P 0.732 -814 D 0.730 -815 W 0.733 -816 R 0.741 -817 Y 0.753 -818 S 0.763 -819 A 0.770 -820 S 0.775 -821 L 0.780 -822 R 0.786 -823 A 0.793 -824 G 0.798 -825 M 0.803 -826 H 0.810 -827 S 0.819 -828 S 0.825 -829 V 0.827 -830 H 0.829 -831 L 0.832 -832 E 0.834 -833 E 0.834 -834 A 0.832 -835 G 0.832 -836 I 0.832 -837 L 0.826 -838 R 0.815 -839 A 0.801 -840 G 0.792 -841 P 0.789 -842 G 0.792 -843 G 0.796 -844 P 0.796 -845 D 0.788 -846 Q 0.772 -847 Q 0.755 -848 W 0.753 -849 P 0.765 -850 T 0.772 -851 V 0.743 -852 S 0.681 -853 S 0.638 -854 A 0.653 -855 T 0.697 -856 P 0.730 -857 E 0.754 -858 P 0.783 -859 E 0.812 -860 A 0.829 -861 G 0.831 -862 E 0.821 -863 V 0.804 -864 S 0.789 -865 P 0.791 -866 P 0.808 -867 V 0.829 -868 G 0.842 -869 A 0.845 -870 G 0.840 -871 V 0.831 -872 N 0.823 -873 S 0.815 -874 N 0.806 -875 S 0.793 -876 W 0.782 -877 T 0.773 -878 F 0.764 -879 K 0.756 -880 Y 0.753 -881 G 0.757 -882 P 0.767 -883 G 0.780 -884 N 0.793 -885 P 0.803 -886 K 0.804 -887 Q 0.799 -888 S 0.794 -889 G 0.795 -890 P 0.799 -891 G 0.801 -892 E 0.798 -893 L 0.796 -894 P 0.801 -895 D 0.808 -896 K 0.808 -897 F 0.798 -898 I 0.790 -899 I 0.789 -900 P 0.796 -901 G 0.804 -902 S 0.813 -903 P 0.825 -904 A 0.838 -905 I 0.844 -906 I 0.841 -907 S 0.831 -908 I 0.817 -909 R 0.799 -910 Q 0.784 -911 E 0.775 -912 P 0.773 -913 T 0.780 -914 N 0.791 -915 S 0.799 -916 Q 0.799 -917 I 0.792 -918 D 0.786 -919 K 0.783 -920 S 0.783 -921 D 0.784 -922 F 0.786 -923 I 0.788 -924 T 0.790 -925 F 0.790 -926 G 0.782 -927 K 0.764 -928 K 0.734 -929 E 0.683 -930 E 0.618 -931 T 0.581 -932 K 0.603 -933 K 0.654 -934 K 0.693 -935 K 0.714 -936 K 0.727 -937 K 0.734 -938 K 0.737 -939 K 0.740 -940 G 0.741 -941 N 0.726 -942 K 0.672 -943 T 0.572 -944 Q 0.475 -945 E 0.453 -946 K 0.498 -947 K 0.540 -948 E 0.571 -949 K 0.629 -950 G 0.702 -951 N 0.753 -952 S 0.774 -953 T 0.783 -954 T 0.790 -955 D 0.796 -956 N 0.794 -957 S 0.783 -958 D 0.766 -959 Q 0.753 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000094661.3_ENST00000641398.1_GN:OR1I1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000094661.3_ENST00000641398.1_GN:OR1I1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index ebb5c2827ded74ce62f05a94ca019d06d5c69675..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000094661.3_ENST00000641398.1_GN:OR1I1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,356 +0,0 @@ ->ENSG00000094661.3|ENST00000641398.1|GN:OR1I1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.429 -2 E 0.455 -3 P 0.493 -4 E 0.524 -5 K 0.530 -6 Q 0.501 -7 T 0.437 -8 E 0.352 -9 I 0.266 -10 S 0.195 -11 E 0.149 -12 F 0.127 -13 F 0.120 -14 L 0.123 -15 Q 0.135 -16 G 0.153 -17 L 0.172 -18 S 0.192 -19 E 0.201 -20 K 0.192 -21 P 0.164 -22 E 0.129 -23 H 0.097 -24 Q 0.073 -25 T 0.057 -26 L 0.048 -27 L 0.047 -28 F 0.048 -29 T 0.046 -30 M 0.043 -31 F 0.041 -32 L 0.045 -33 S 0.050 -34 T 0.054 -35 Y 0.053 -36 L 0.052 -37 V 0.054 -38 T 0.058 -39 I 0.059 -40 I 0.062 -41 G 0.067 -42 N 0.071 -43 A 0.073 -44 L 0.071 -45 I 0.067 -46 I 0.061 -47 L 0.058 -48 A 0.058 -49 I 0.060 -50 I 0.063 -51 T 0.069 -52 D 0.075 -53 S 0.077 -54 H 0.073 -55 L 0.067 -56 H 0.059 -57 T 0.051 -58 P 0.042 -59 M 0.035 -60 Y 0.030 -61 F 0.026 -62 F 0.025 -63 L 0.029 -64 F 0.037 -65 N 0.047 -66 L 0.053 -67 S 0.055 -68 L 0.055 -69 V 0.060 -70 D 0.070 -71 T 0.077 -72 L 0.076 -73 L 0.070 -74 S 0.066 -75 S 0.065 -76 T 0.066 -77 T 0.069 -78 V 0.070 -79 P 0.068 -80 K 0.067 -81 M 0.067 -82 L 0.068 -83 A 0.071 -84 N 0.076 -85 I 0.082 -86 Q 0.090 -87 A 0.099 -88 Q 0.101 -89 S 0.092 -90 R 0.079 -91 A 0.070 -92 I 0.063 -93 P 0.054 -94 F 0.044 -95 V 0.039 -96 G 0.038 -97 C 0.037 -98 L 0.037 -99 T 0.037 -100 Q 0.038 -101 M 0.039 -102 Y 0.038 -103 A 0.035 -104 F 0.030 -105 H 0.027 -106 L 0.027 -107 F 0.030 -108 G 0.036 -109 T 0.043 -110 M 0.047 -111 D 0.047 -112 S 0.043 -113 F 0.038 -114 L 0.035 -115 L 0.034 -116 A 0.032 -117 V 0.031 -118 M 0.032 -119 A 0.037 -120 I 0.042 -121 D 0.046 -122 R 0.046 -123 F 0.044 -124 V 0.041 -125 A 0.040 -126 I 0.043 -127 V 0.048 -128 H 0.052 -129 P 0.052 -130 Q 0.047 -131 R 0.041 -132 Y 0.038 -133 L 0.039 -134 V 0.045 -135 L 0.053 -136 M 0.059 -137 C 0.059 -138 S 0.054 -139 P 0.048 -140 V 0.046 -141 C 0.052 -142 G 0.063 -143 L 0.071 -144 L 0.070 -145 L 0.065 -146 G 0.066 -147 A 0.071 -148 S 0.075 -149 W 0.073 -150 M 0.069 -151 I 0.070 -152 T 0.078 -153 N 0.089 -154 L 0.097 -155 Q 0.097 -156 S 0.087 -157 L 0.076 -158 I 0.071 -159 H 0.072 -160 T 0.072 -161 C 0.073 -162 L 0.080 -163 M 0.091 -164 A 0.101 -165 Q 0.108 -166 L 0.113 -167 T 0.117 -168 F 0.127 -169 C 0.142 -170 A 0.155 -171 G 0.163 -172 S 0.172 -173 E 0.179 -174 I 0.172 -175 S 0.145 -176 H 0.110 -177 F 0.084 -178 F 0.071 -179 C 0.072 -180 D 0.085 -181 L 0.105 -182 M 0.126 -183 P 0.142 -184 L 0.152 -185 L 0.159 -186 K 0.168 -187 L 0.176 -188 S 0.181 -189 G 0.187 -190 S 0.194 -191 D 0.194 -192 T 0.181 -193 H 0.160 -194 T 0.144 -195 N 0.134 -196 E 0.127 -197 L 0.123 -198 V 0.124 -199 I 0.125 -200 F 0.118 -201 A 0.106 -202 F 0.092 -203 G 0.080 -204 I 0.070 -205 V 0.067 -206 V 0.074 -207 G 0.087 -208 T 0.099 -209 S 0.105 -210 P 0.098 -211 F 0.083 -212 S 0.072 -213 C 0.069 -214 I 0.068 -215 L 0.059 -216 L 0.046 -217 S 0.038 -218 Y 0.035 -219 I 0.036 -220 R 0.039 -221 I 0.039 -222 F 0.037 -223 W 0.037 -224 T 0.043 -225 V 0.054 -226 F 0.073 -227 K 0.099 -228 I 0.124 -229 P 0.137 -230 S 0.135 -231 T 0.122 -232 R 0.103 -233 G 0.084 -234 K 0.069 -235 W 0.063 -236 K 0.066 -237 A 0.068 -238 F 0.066 -239 S 0.062 -240 T 0.062 -241 C 0.063 -242 G 0.064 -243 L 0.062 -244 H 0.057 -245 L 0.053 -246 T 0.053 -247 V 0.055 -248 V 0.052 -249 S 0.042 -250 L 0.033 -251 S 0.029 -252 Y 0.030 -253 G 0.033 -254 T 0.035 -255 I 0.034 -256 F 0.034 -257 A 0.040 -258 V 0.056 -259 Y 0.082 -260 L 0.119 -261 Q 0.166 -262 P 0.218 -263 T 0.269 -264 S 0.304 -265 P 0.314 -266 S 0.297 -267 S 0.261 -268 S 0.215 -269 Q 0.175 -270 K 0.151 -271 D 0.137 -272 K 0.125 -273 A 0.109 -274 A 0.091 -275 A 0.077 -276 L 0.074 -277 M 0.082 -278 C 0.096 -279 G 0.109 -280 V 0.117 -281 F 0.122 -282 I 0.121 -283 P 0.111 -284 M 0.095 -285 L 0.085 -286 N 0.078 -287 P 0.069 -288 F 0.062 -289 I 0.058 -290 Y 0.058 -291 S 0.063 -292 I 0.075 -293 R 0.085 -294 N 0.082 -295 K 0.070 -296 D 0.059 -297 M 0.053 -298 K 0.052 -299 A 0.056 -300 A 0.066 -301 L 0.077 -302 G 0.086 -303 K 0.094 -304 L 0.110 -305 I 0.147 -306 G 0.210 -307 K 0.287 -308 V 0.362 -309 A 0.421 -310 V 0.464 -311 P 0.492 -312 C 0.508 -313 P 0.511 -314 R 0.512 -315 P 0.518 -316 E 0.528 -317 Q 0.529 -318 L 0.515 -319 L 0.496 -320 D 0.485 -321 V 0.478 -322 Y 0.477 -323 H 0.491 -324 V 0.526 -325 P 0.572 -326 G 0.613 -327 S 0.636 -328 L 0.635 -329 L 0.607 -330 A 0.563 -331 A 0.540 -332 R 0.565 -333 D 0.610 -334 T 0.632 -335 E 0.626 -336 M 0.614 -337 H 0.614 -338 P 0.629 -339 I 0.645 -340 P 0.652 -341 Y 0.660 -342 P 0.679 -343 G 0.698 -344 G 0.684 -345 V 0.634 -346 Q 0.597 -347 S 0.617 -348 L 0.670 -349 A 0.705 -350 G 0.709 -351 N 0.695 -352 R 0.673 -353 D 0.637 -354 M 0.583 -355 E 0.538 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000094661.3_ENST00000641398.1_GN:OR1I1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000094661.3_ENST00000641398.1_GN:OR1I1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid deleted file mode 100644 index 24f890758490d7f5964e312726965cc70d2e80cc..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000094661.3_ENST00000641398.1_GN:OR1I1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid +++ /dev/null @@ -1,375 +0,0 @@ ->ENSG00000094661.3|ENST00000641398.1|GN:OR1I1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:19 -1 M 0.365 -2 N 0.390 -3 P 0.414 -4 S 0.406 -5 H 0.357 -6 R 0.295 -7 H 0.272 -8 Q 0.315 -9 A 0.393 -10 N 0.448 -11 P 0.459 -12 S 0.460 -13 D 0.480 -14 H 0.508 -15 S 0.525 -16 H 0.535 -17 R 0.544 -18 P 0.548 -19 Y 0.546 -20 M 0.546 -21 E 0.555 -22 P 0.571 -23 E 0.582 -24 K 0.575 -25 Q 0.538 -26 T 0.467 -27 E 0.374 -28 I 0.281 -29 S 0.204 -30 E 0.153 -31 F 0.127 -32 F 0.118 -33 L 0.120 -34 Q 0.131 -35 G 0.148 -36 L 0.169 -37 S 0.189 -38 E 0.199 -39 K 0.189 -40 P 0.161 -41 E 0.126 -42 H 0.095 -43 Q 0.072 -44 T 0.055 -45 L 0.047 -46 L 0.046 -47 F 0.047 -48 T 0.045 -49 M 0.042 -50 F 0.042 -51 L 0.046 -52 S 0.052 -53 T 0.055 -54 Y 0.054 -55 L 0.052 -56 V 0.055 -57 T 0.059 -58 I 0.060 -59 I 0.063 -60 G 0.068 -61 N 0.073 -62 A 0.074 -63 L 0.073 -64 I 0.069 -65 I 0.063 -66 L 0.059 -67 A 0.059 -68 I 0.059 -69 I 0.062 -70 T 0.068 -71 D 0.075 -72 S 0.076 -73 H 0.072 -74 L 0.065 -75 H 0.057 -76 T 0.049 -77 P 0.041 -78 M 0.034 -79 Y 0.028 -80 F 0.025 -81 F 0.024 -82 L 0.028 -83 F 0.037 -84 N 0.047 -85 L 0.054 -86 S 0.055 -87 L 0.055 -88 V 0.060 -89 D 0.070 -90 T 0.077 -91 L 0.076 -92 L 0.070 -93 S 0.066 -94 S 0.065 -95 T 0.066 -96 T 0.067 -97 V 0.067 -98 P 0.064 -99 K 0.062 -100 M 0.062 -101 L 0.062 -102 A 0.064 -103 N 0.068 -104 I 0.073 -105 Q 0.082 -106 A 0.091 -107 Q 0.094 -108 S 0.087 -109 R 0.076 -110 A 0.068 -111 I 0.061 -112 P 0.052 -113 F 0.042 -114 V 0.038 -115 G 0.037 -116 C 0.036 -117 L 0.035 -118 T 0.035 -119 Q 0.036 -120 M 0.037 -121 Y 0.037 -122 A 0.034 -123 F 0.029 -124 H 0.027 -125 L 0.027 -126 F 0.030 -127 G 0.036 -128 T 0.043 -129 M 0.047 -130 D 0.047 -131 S 0.043 -132 F 0.038 -133 L 0.035 -134 L 0.034 -135 A 0.033 -136 V 0.031 -137 M 0.033 -138 A 0.038 -139 I 0.043 -140 D 0.047 -141 R 0.048 -142 F 0.045 -143 V 0.042 -144 A 0.041 -145 I 0.044 -146 V 0.049 -147 H 0.054 -148 P 0.054 -149 Q 0.049 -150 R 0.043 -151 Y 0.040 -152 L 0.041 -153 V 0.047 -154 L 0.056 -155 M 0.062 -156 C 0.062 -157 S 0.056 -158 P 0.050 -159 V 0.048 -160 C 0.053 -161 G 0.063 -162 L 0.070 -163 L 0.069 -164 L 0.065 -165 G 0.066 -166 A 0.071 -167 S 0.073 -168 W 0.068 -169 M 0.063 -170 I 0.064 -171 T 0.069 -172 N 0.074 -173 L 0.079 -174 Q 0.082 -175 S 0.080 -176 L 0.074 -177 I 0.072 -178 H 0.073 -179 T 0.072 -180 C 0.074 -181 L 0.081 -182 M 0.092 -183 A 0.102 -184 Q 0.110 -185 L 0.114 -186 T 0.118 -187 F 0.126 -188 C 0.140 -189 A 0.152 -190 G 0.161 -191 S 0.170 -192 E 0.177 -193 I 0.171 -194 S 0.144 -195 H 0.109 -196 F 0.083 -197 F 0.071 -198 C 0.073 -199 D 0.086 -200 L 0.106 -201 M 0.127 -202 P 0.142 -203 L 0.152 -204 L 0.159 -205 K 0.168 -206 L 0.174 -207 S 0.179 -208 G 0.184 -209 S 0.191 -210 D 0.191 -211 T 0.178 -212 H 0.158 -213 T 0.142 -214 N 0.132 -215 E 0.125 -216 L 0.122 -217 V 0.124 -218 I 0.125 -219 F 0.119 -220 A 0.107 -221 F 0.093 -222 G 0.081 -223 I 0.071 -224 V 0.068 -225 V 0.075 -226 G 0.088 -227 T 0.100 -228 S 0.106 -229 P 0.100 -230 F 0.085 -231 S 0.074 -232 C 0.072 -233 I 0.070 -234 L 0.061 -235 L 0.048 -236 S 0.040 -237 Y 0.037 -238 I 0.037 -239 R 0.040 -240 I 0.040 -241 F 0.038 -242 W 0.038 -243 T 0.044 -244 V 0.056 -245 F 0.074 -246 K 0.101 -247 I 0.125 -248 P 0.139 -249 S 0.137 -250 T 0.124 -251 R 0.105 -252 G 0.086 -253 K 0.072 -254 W 0.067 -255 K 0.069 -256 A 0.072 -257 F 0.069 -258 S 0.066 -259 T 0.066 -260 C 0.068 -261 G 0.069 -262 L 0.066 -263 H 0.061 -264 L 0.056 -265 T 0.055 -266 V 0.056 -267 V 0.053 -268 S 0.043 -269 L 0.033 -270 S 0.029 -271 Y 0.030 -272 G 0.033 -273 T 0.034 -274 I 0.033 -275 F 0.034 -276 A 0.040 -277 V 0.057 -278 Y 0.083 -279 L 0.121 -280 Q 0.170 -281 P 0.224 -282 T 0.276 -283 S 0.313 -284 P 0.323 -285 S 0.306 -286 S 0.268 -287 S 0.222 -288 Q 0.181 -289 K 0.156 -290 D 0.142 -291 K 0.130 -292 A 0.113 -293 A 0.095 -294 A 0.081 -295 L 0.077 -296 M 0.085 -297 C 0.100 -298 G 0.112 -299 V 0.120 -300 F 0.125 -301 I 0.124 -302 P 0.113 -303 M 0.098 -304 L 0.087 -305 N 0.080 -306 P 0.071 -307 F 0.064 -308 I 0.060 -309 Y 0.060 -310 S 0.065 -311 I 0.077 -312 R 0.087 -313 N 0.085 -314 K 0.072 -315 D 0.060 -316 M 0.053 -317 K 0.051 -318 A 0.055 -319 A 0.065 -320 L 0.076 -321 G 0.086 -322 K 0.093 -323 L 0.110 -324 I 0.147 -325 G 0.209 -326 K 0.286 -327 V 0.362 -328 A 0.422 -329 V 0.466 -330 P 0.496 -331 C 0.513 -332 P 0.519 -333 R 0.522 -334 P 0.532 -335 E 0.546 -336 Q 0.549 -337 L 0.534 -338 L 0.514 -339 D 0.501 -340 V 0.494 -341 Y 0.491 -342 H 0.504 -343 V 0.539 -344 P 0.588 -345 G 0.634 -346 S 0.659 -347 L 0.656 -348 L 0.623 -349 A 0.574 -350 A 0.550 -351 R 0.577 -352 D 0.624 -353 T 0.648 -354 E 0.642 -355 M 0.628 -356 H 0.625 -357 P 0.639 -358 I 0.654 -359 P 0.661 -360 Y 0.669 -361 P 0.688 -362 G 0.705 -363 G 0.690 -364 V 0.639 -365 Q 0.603 -366 S 0.624 -367 L 0.677 -368 A 0.713 -369 G 0.718 -370 N 0.704 -371 R 0.682 -372 D 0.647 -373 M 0.596 -374 E 0.552 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000100121.14_ENST00000448514.3_GN:GGTLC2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000100121.14_ENST00000448514.3_GN:GGTLC2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 319de3e1ad71d0a1dfe559e5d6860217e2d2ff54..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000100121.14_ENST00000448514.3_GN:GGTLC2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,219 +0,0 @@ ->ENSG00000100121.14|ENST00000448514.3|GN:GGTLC2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.291 -2 T 0.267 -3 S 0.227 -4 E 0.185 -5 F 0.157 -6 F 0.147 -7 A 0.150 -8 A 0.158 -9 Q 0.167 -10 L 0.175 -11 R 0.178 -12 A 0.178 -13 Q 0.187 -14 I 0.203 -15 S 0.207 -16 D 0.198 -17 D 0.189 -18 T 0.184 -19 T 0.179 -20 H 0.169 -21 P 0.155 -22 I 0.143 -23 S 0.136 -24 Y 0.136 -25 Y 0.147 -26 K 0.169 -27 P 0.198 -28 E 0.219 -29 F 0.231 -30 Y 0.239 -31 T 0.246 -32 P 0.252 -33 V 0.255 -34 D 0.256 -35 G 0.253 -36 G 0.247 -37 T 0.242 -38 A 0.234 -39 H 0.219 -40 L 0.199 -41 S 0.181 -42 V 0.169 -43 V 0.160 -44 A 0.150 -45 E 0.147 -46 D 0.164 -47 G 0.199 -48 S 0.234 -49 A 0.254 -50 V 0.264 -51 S 0.271 -52 A 0.276 -53 T 0.283 -54 S 0.293 -55 T 0.298 -56 I 0.284 -57 N 0.252 -58 L 0.223 -59 Y 0.213 -60 F 0.218 -61 G 0.224 -62 S 0.223 -63 K 0.219 -64 V 0.216 -65 R 0.211 -66 S 0.199 -67 P 0.182 -68 V 0.173 -69 S 0.182 -70 E 0.211 -71 I 0.253 -72 L 0.294 -73 F 0.330 -74 N 0.363 -75 D 0.384 -76 E 0.374 -77 M 0.332 -78 D 0.282 -79 D 0.249 -80 F 0.239 -81 S 0.241 -82 S 0.246 -83 P 0.252 -84 N 0.258 -85 I 0.262 -86 T 0.270 -87 N 0.284 -88 E 0.299 -89 F 0.308 -90 G 0.314 -91 V 0.323 -92 P 0.335 -93 P 0.341 -94 S 0.346 -95 P 0.355 -96 A 0.369 -97 N 0.370 -98 F 0.346 -99 I 0.316 -100 Q 0.312 -101 P 0.348 -102 G 0.410 -103 K 0.476 -104 Q 0.524 -105 P 0.541 -106 L 0.538 -107 S 0.525 -108 S 0.493 -109 M 0.439 -110 C 0.383 -111 P 0.346 -112 T 0.322 -113 I 0.290 -114 M 0.248 -115 V 0.211 -116 G 0.195 -117 Q 0.203 -118 D 0.222 -119 G 0.237 -120 Q 0.236 -121 P 0.218 -122 P 0.192 -123 S 0.169 -124 H 0.157 -125 A 0.156 -126 D 0.163 -127 H 0.177 -128 T 0.191 -129 P 0.198 -130 M 0.188 -131 P 0.163 -132 Q 0.139 -133 A 0.126 -134 I 0.116 -135 I 0.101 -136 Y 0.087 -137 N 0.083 -138 L 0.086 -139 W 0.089 -140 F 0.092 -141 G 0.094 -142 Y 0.091 -143 D 0.089 -144 V 0.092 -145 K 0.099 -146 R 0.110 -147 A 0.120 -148 V 0.126 -149 E 0.129 -150 E 0.134 -151 P 0.137 -152 R 0.133 -153 L 0.121 -154 H 0.105 -155 N 0.086 -156 Q 0.069 -157 L 0.059 -158 L 0.055 -159 P 0.058 -160 N 0.065 -161 V 0.071 -162 T 0.072 -163 T 0.067 -164 V 0.064 -165 E 0.071 -166 R 0.089 -167 N 0.112 -168 I 0.125 -169 D 0.120 -170 Q 0.107 -171 A 0.100 -172 V 0.099 -173 T 0.100 -174 A 0.097 -175 A 0.088 -176 L 0.075 -177 E 0.068 -178 T 0.069 -179 R 0.076 -180 H 0.087 -181 H 0.099 -182 H 0.105 -183 T 0.106 -184 Q 0.106 -185 I 0.108 -186 A 0.110 -187 S 0.116 -188 T 0.123 -189 F 0.122 -190 I 0.109 -191 A 0.094 -192 V 0.089 -193 V 0.091 -194 Q 0.089 -195 A 0.078 -196 I 0.062 -197 V 0.052 -198 R 0.055 -199 T 0.070 -200 A 0.090 -201 G 0.107 -202 G 0.118 -203 W 0.129 -204 A 0.141 -205 A 0.147 -206 A 0.141 -207 S 0.130 -208 D 0.126 -209 S 0.138 -210 R 0.168 -211 K 0.217 -212 G 0.283 -213 G 0.357 -214 E 0.418 -215 P 0.443 -216 A 0.427 -217 G 0.389 -218 Y 0.359 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000100121.14_ENST00000448514.3_GN:GGTLC2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000100121.14_ENST00000448514.3_GN:GGTLC2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid deleted file mode 100644 index 2b92e103e91a27f6430cc0f321703ac39f13da97..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000100121.14_ENST00000448514.3_GN:GGTLC2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid +++ /dev/null @@ -1,242 +0,0 @@ ->ENSG00000100121.14|ENST00000448514.3|GN:GGTLC2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:23 -1 M 0.540 -2 A 0.539 -3 G 0.541 -4 G 0.552 -5 G 0.564 -6 R 0.570 -7 G 0.570 -8 G 0.566 -9 S 0.552 -10 C 0.532 -11 N 0.515 -12 R 0.508 -13 P 0.504 -14 A 0.497 -15 L 0.480 -16 G 0.447 -17 S 0.389 -18 R 0.317 -19 Q 0.258 -20 V 0.231 -21 V 0.223 -22 H 0.214 -23 N 0.205 -24 M 0.202 -25 T 0.193 -26 S 0.168 -27 E 0.134 -28 F 0.112 -29 F 0.109 -30 A 0.123 -31 A 0.142 -32 Q 0.160 -33 L 0.175 -34 R 0.180 -35 A 0.178 -36 Q 0.180 -37 I 0.186 -38 S 0.184 -39 D 0.174 -40 D 0.169 -41 T 0.170 -42 T 0.168 -43 H 0.159 -44 P 0.144 -45 I 0.130 -46 S 0.122 -47 Y 0.123 -48 Y 0.136 -49 K 0.161 -50 P 0.190 -51 E 0.214 -52 F 0.231 -53 Y 0.243 -54 T 0.250 -55 P 0.254 -56 V 0.255 -57 D 0.255 -58 G 0.253 -59 G 0.248 -60 T 0.243 -61 A 0.236 -62 H 0.220 -63 L 0.200 -64 S 0.181 -65 V 0.170 -66 V 0.161 -67 A 0.151 -68 E 0.148 -69 D 0.166 -70 G 0.201 -71 S 0.234 -72 A 0.253 -73 V 0.262 -74 S 0.268 -75 A 0.273 -76 T 0.277 -77 S 0.283 -78 T 0.285 -79 I 0.270 -80 N 0.239 -81 L 0.210 -82 Y 0.200 -83 F 0.206 -84 G 0.212 -85 S 0.211 -86 K 0.208 -87 V 0.205 -88 R 0.202 -89 S 0.192 -90 P 0.177 -91 V 0.169 -92 S 0.179 -93 E 0.209 -94 I 0.252 -95 L 0.294 -96 F 0.330 -97 N 0.362 -98 D 0.381 -99 E 0.368 -100 M 0.323 -101 D 0.274 -102 D 0.243 -103 F 0.233 -104 S 0.235 -105 S 0.240 -106 P 0.245 -107 N 0.249 -108 I 0.252 -109 T 0.258 -110 N 0.270 -111 E 0.284 -112 F 0.294 -113 G 0.302 -114 V 0.312 -115 P 0.319 -116 P 0.312 -117 S 0.293 -118 P 0.279 -119 A 0.286 -120 N 0.305 -121 F 0.309 -122 I 0.300 -123 Q 0.302 -124 P 0.330 -125 G 0.375 -126 K 0.432 -127 Q 0.485 -128 P 0.516 -129 L 0.524 -130 S 0.520 -131 S 0.499 -132 M 0.454 -133 C 0.403 -134 P 0.367 -135 T 0.342 -136 I 0.311 -137 M 0.269 -138 V 0.233 -139 G 0.216 -140 Q 0.223 -141 D 0.240 -142 G 0.253 -143 Q 0.250 -144 P 0.230 -145 P 0.201 -146 S 0.177 -147 H 0.164 -148 A 0.161 -149 D 0.167 -150 H 0.180 -151 T 0.196 -152 P 0.204 -153 M 0.194 -154 P 0.169 -155 Q 0.145 -156 A 0.132 -157 I 0.123 -158 I 0.107 -159 Y 0.092 -160 N 0.088 -161 L 0.090 -162 W 0.094 -163 F 0.097 -164 G 0.097 -165 Y 0.093 -166 D 0.091 -167 V 0.094 -168 K 0.101 -169 R 0.112 -170 A 0.123 -171 V 0.129 -172 E 0.132 -173 E 0.138 -174 P 0.142 -175 R 0.137 -176 L 0.126 -177 H 0.109 -178 N 0.090 -179 Q 0.074 -180 L 0.064 -181 L 0.059 -182 P 0.061 -183 N 0.068 -184 V 0.075 -185 T 0.075 -186 T 0.069 -187 V 0.065 -188 E 0.070 -189 R 0.088 -190 N 0.110 -191 I 0.123 -192 D 0.120 -193 Q 0.109 -194 A 0.103 -195 V 0.102 -196 T 0.102 -197 A 0.097 -198 A 0.087 -199 L 0.074 -200 E 0.067 -201 T 0.067 -202 R 0.074 -203 H 0.084 -204 H 0.095 -205 H 0.101 -206 T 0.103 -207 Q 0.104 -208 I 0.107 -209 A 0.111 -210 S 0.118 -211 T 0.127 -212 F 0.126 -213 I 0.113 -214 A 0.099 -215 V 0.093 -216 V 0.095 -217 Q 0.092 -218 A 0.081 -219 I 0.065 -220 V 0.054 -221 R 0.057 -222 T 0.071 -223 A 0.091 -224 G 0.109 -225 G 0.121 -226 W 0.132 -227 A 0.144 -228 A 0.150 -229 A 0.144 -230 S 0.133 -231 D 0.129 -232 S 0.141 -233 R 0.170 -234 K 0.219 -235 G 0.287 -236 G 0.362 -237 E 0.425 -238 P 0.451 -239 A 0.436 -240 G 0.399 -241 Y 0.370 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000101440.11_ENST00000374954.4_GN:ASIP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000101440.11_ENST00000374954.4_GN:ASIP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 5c2f1c4c269eb02723c98c727cbcebd78b6c4771..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000101440.11_ENST00000374954.4_GN:ASIP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,133 +0,0 @@ ->ENSG00000101440.11|ENST00000374954.4|GN:ASIP|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.270 -2 D 0.238 -3 V 0.191 -4 T 0.149 -5 R 0.124 -6 L 0.116 -7 L 0.119 -8 L 0.131 -9 A 0.142 -10 T 0.145 -11 L 0.140 -12 L 0.132 -13 V 0.122 -14 F 0.111 -15 L 0.105 -16 C 0.116 -17 F 0.154 -18 F 0.226 -19 T 0.328 -20 A 0.437 -21 N 0.525 -22 S 0.578 -23 H 0.602 -24 L 0.618 -25 P 0.641 -26 P 0.673 -27 E 0.709 -28 E 0.737 -29 K 0.750 -30 L 0.754 -31 R 0.755 -32 D 0.752 -33 D 0.740 -34 R 0.732 -35 S 0.741 -36 L 0.765 -37 R 0.788 -38 S 0.806 -39 N 0.819 -40 S 0.827 -41 S 0.830 -42 V 0.826 -43 N 0.820 -44 L 0.816 -45 L 0.810 -46 D 0.801 -47 V 0.796 -48 P 0.802 -49 S 0.816 -50 V 0.829 -51 S 0.836 -52 I 0.840 -53 V 0.837 -54 A 0.818 -55 L 0.771 -56 N 0.709 -57 K 0.677 -58 K 0.708 -59 S 0.768 -60 K 0.809 -61 Q 0.823 -62 I 0.823 -63 G 0.817 -64 R 0.813 -65 K 0.812 -66 A 0.811 -67 A 0.805 -68 E 0.798 -69 K 0.794 -70 K 0.793 -71 R 0.794 -72 S 0.797 -73 S 0.801 -74 K 0.803 -75 K 0.802 -76 E 0.802 -77 A 0.802 -78 S 0.797 -79 M 0.789 -80 K 0.782 -81 K 0.775 -82 V 0.762 -83 V 0.740 -84 R 0.716 -85 P 0.701 -86 R 0.692 -87 T 0.685 -88 P 0.671 -89 L 0.635 -90 S 0.569 -91 A 0.477 -92 P 0.382 -93 C 0.308 -94 V 0.265 -95 A 0.236 -96 T 0.200 -97 R 0.160 -98 N 0.128 -99 S 0.106 -100 C 0.093 -101 K 0.093 -102 P 0.104 -103 P 0.121 -104 A 0.135 -105 P 0.136 -106 A 0.124 -107 C 0.112 -108 C 0.107 -109 D 0.108 -110 P 0.105 -111 C 0.099 -112 A 0.097 -113 S 0.098 -114 C 0.095 -115 Q 0.082 -116 C 0.068 -117 R 0.061 -118 F 0.061 -119 F 0.064 -120 R 0.065 -121 S 0.064 -122 A 0.059 -123 C 0.056 -124 S 0.060 -125 C 0.074 -126 R 0.101 -127 V 0.135 -128 L 0.166 -129 S 0.187 -130 L 0.199 -131 N 0.205 -132 C 0.205 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000101440.11_ENST00000374954.4_GN:ASIP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:4.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000101440.11_ENST00000374954.4_GN:ASIP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:4.caid deleted file mode 100644 index 01ba29a5b00f0fe2fc17b37c789ddf8b6be26277..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000101440.11_ENST00000374954.4_GN:ASIP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:4.caid +++ /dev/null @@ -1,137 +0,0 @@ ->ENSG00000101440.11|ENST00000374954.4|GN:ASIP|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:4 -1 M 0.443 -2 P 0.470 -3 P 0.495 -4 G 0.482 -5 M 0.419 -6 D 0.328 -7 V 0.239 -8 T 0.175 -9 R 0.142 -10 L 0.132 -11 L 0.136 -12 L 0.149 -13 A 0.163 -14 T 0.166 -15 L 0.155 -16 L 0.139 -17 V 0.124 -18 F 0.110 -19 L 0.104 -20 C 0.117 -21 F 0.159 -22 F 0.236 -23 T 0.339 -24 A 0.447 -25 N 0.534 -26 S 0.587 -27 H 0.613 -28 L 0.627 -29 P 0.647 -30 P 0.680 -31 E 0.717 -32 E 0.746 -33 K 0.761 -34 L 0.765 -35 R 0.765 -36 D 0.762 -37 D 0.751 -38 R 0.742 -39 S 0.750 -40 L 0.770 -41 R 0.791 -42 S 0.808 -43 N 0.820 -44 S 0.829 -45 S 0.833 -46 V 0.829 -47 N 0.824 -48 L 0.820 -49 L 0.815 -50 D 0.806 -51 V 0.801 -52 P 0.808 -53 S 0.822 -54 V 0.835 -55 S 0.842 -56 I 0.846 -57 V 0.843 -58 A 0.823 -59 L 0.774 -60 N 0.708 -61 K 0.675 -62 K 0.707 -63 S 0.770 -64 K 0.812 -65 Q 0.827 -66 I 0.827 -67 G 0.822 -68 R 0.817 -69 K 0.816 -70 A 0.815 -71 A 0.809 -72 E 0.801 -73 K 0.796 -74 K 0.794 -75 R 0.795 -76 S 0.797 -77 S 0.801 -78 K 0.803 -79 K 0.804 -80 E 0.804 -81 A 0.803 -82 S 0.798 -83 M 0.790 -84 K 0.782 -85 K 0.776 -86 V 0.763 -87 V 0.741 -88 R 0.718 -89 P 0.703 -90 R 0.694 -91 T 0.687 -92 P 0.673 -93 L 0.638 -94 S 0.571 -95 A 0.479 -96 P 0.382 -97 C 0.308 -98 V 0.265 -99 A 0.237 -100 T 0.202 -101 R 0.162 -102 N 0.129 -103 S 0.107 -104 C 0.094 -105 K 0.094 -106 P 0.105 -107 P 0.123 -108 A 0.137 -109 P 0.138 -110 A 0.126 -111 C 0.113 -112 C 0.109 -113 D 0.110 -114 P 0.106 -115 C 0.100 -116 A 0.097 -117 S 0.098 -118 C 0.095 -119 Q 0.083 -120 C 0.070 -121 R 0.062 -122 F 0.062 -123 F 0.064 -124 R 0.065 -125 S 0.064 -126 A 0.060 -127 C 0.057 -128 S 0.060 -129 C 0.074 -130 R 0.101 -131 V 0.136 -132 L 0.166 -133 S 0.187 -134 L 0.201 -135 N 0.206 -136 C 0.207 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000104974.12_ENST00000251372.8_GN:LILRA1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000104974.12_ENST00000251372.8_GN:LILRA1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 123d2fe1eb3c7284287cb3cdad7e92556b231cba..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000104974.12_ENST00000251372.8_GN:LILRA1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,490 +0,0 @@ ->ENSG00000104974.12|ENST00000251372.8|GN:LILRA1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.349 -2 T 0.354 -3 P 0.349 -4 I 0.321 -5 V 0.275 -6 T 0.234 -7 V 0.219 -8 L 0.228 -9 I 0.246 -10 C 0.261 -11 L 0.271 -12 R 0.279 -13 L 0.291 -14 S 0.318 -15 L 0.366 -16 G 0.427 -17 P 0.481 -18 R 0.522 -19 T 0.554 -20 H 0.581 -21 V 0.601 -22 Q 0.604 -23 A 0.581 -24 G 0.520 -25 T 0.421 -26 L 0.307 -27 P 0.207 -28 K 0.138 -29 P 0.098 -30 T 0.078 -31 L 0.068 -32 W 0.061 -33 A 0.053 -34 E 0.047 -35 P 0.044 -36 G 0.046 -37 S 0.050 -38 V 0.052 -39 I 0.052 -40 T 0.057 -41 Q 0.067 -42 G 0.079 -43 S 0.081 -44 P 0.069 -45 V 0.053 -46 T 0.040 -47 L 0.033 -48 W 0.031 -49 C 0.036 -50 Q 0.046 -51 G 0.057 -52 I 0.066 -53 L 0.069 -54 E 0.069 -55 T 0.064 -56 Q 0.055 -57 E 0.043 -58 Y 0.034 -59 R 0.032 -60 L 0.034 -61 Y 0.041 -62 R 0.055 -63 E 0.078 -64 K 0.109 -65 K 0.137 -66 T 0.154 -67 A 0.158 -68 P 0.146 -69 W 0.125 -70 I 0.108 -71 T 0.107 -72 R 0.120 -73 I 0.134 -74 P 0.134 -75 Q 0.119 -76 E 0.100 -77 I 0.080 -78 V 0.066 -79 K 0.058 -80 K 0.056 -81 G 0.053 -82 Q 0.047 -83 F 0.041 -84 P 0.039 -85 I 0.040 -86 P 0.043 -87 S 0.047 -88 I 0.051 -89 T 0.053 -90 W 0.053 -91 E 0.054 -92 H 0.058 -93 T 0.064 -94 G 0.063 -95 R 0.052 -96 Y 0.040 -97 R 0.032 -98 C 0.033 -99 F 0.039 -100 Y 0.051 -101 G 0.068 -102 S 0.084 -103 H 0.095 -104 T 0.101 -105 A 0.104 -106 G 0.099 -107 W 0.094 -108 S 0.095 -109 E 0.097 -110 P 0.096 -111 S 0.093 -112 D 0.090 -113 P 0.086 -114 L 0.081 -115 E 0.079 -116 L 0.082 -117 V 0.093 -118 V 0.109 -119 T 0.124 -120 G 0.134 -121 A 0.139 -122 Y 0.135 -123 I 0.122 -124 K 0.104 -125 P 0.089 -126 T 0.079 -127 L 0.073 -128 S 0.069 -129 A 0.064 -130 L 0.059 -131 P 0.058 -132 S 0.061 -133 P 0.064 -134 V 0.068 -135 V 0.074 -136 T 0.081 -137 S 0.087 -138 G 0.090 -139 G 0.086 -140 N 0.073 -141 V 0.059 -142 T 0.046 -143 L 0.037 -144 H 0.032 -145 C 0.033 -146 V 0.038 -147 S 0.045 -148 Q 0.051 -149 V 0.055 -150 A 0.058 -151 F 0.058 -152 G 0.054 -153 S 0.046 -154 F 0.038 -155 I 0.037 -156 L 0.046 -157 C 0.061 -158 K 0.080 -159 E 0.100 -160 G 0.121 -161 E 0.143 -162 D 0.159 -163 E 0.163 -164 H 0.153 -165 P 0.133 -166 Q 0.113 -167 C 0.096 -168 L 0.089 -169 N 0.093 -170 S 0.113 -171 Q 0.138 -172 P 0.154 -173 R 0.150 -174 T 0.133 -175 H 0.111 -176 G 0.089 -177 W 0.070 -178 S 0.055 -179 R 0.044 -180 A 0.037 -181 I 0.032 -182 F 0.031 -183 S 0.031 -184 V 0.033 -185 G 0.039 -186 P 0.052 -187 V 0.070 -188 S 0.087 -189 P 0.098 -190 S 0.105 -191 R 0.107 -192 R 0.097 -193 W 0.076 -194 S 0.054 -195 Y 0.039 -196 R 0.036 -197 C 0.041 -198 Y 0.053 -199 A 0.065 -200 Y 0.075 -201 D 0.081 -202 S 0.085 -203 N 0.088 -204 S 0.087 -205 P 0.086 -206 H 0.086 -207 V 0.086 -208 W 0.088 -209 S 0.094 -210 L 0.100 -211 P 0.100 -212 S 0.100 -213 D 0.101 -214 L 0.099 -215 L 0.093 -216 E 0.087 -217 L 0.086 -218 L 0.095 -219 V 0.111 -220 L 0.126 -221 G 0.136 -222 V 0.140 -223 S 0.138 -224 K 0.128 -225 K 0.110 -226 P 0.093 -227 S 0.079 -228 L 0.068 -229 S 0.061 -230 V 0.054 -231 Q 0.049 -232 P 0.047 -233 G 0.050 -234 P 0.055 -235 I 0.060 -236 V 0.069 -237 A 0.081 -238 P 0.093 -239 G 0.097 -240 E 0.089 -241 S 0.074 -242 L 0.058 -243 T 0.047 -244 L 0.043 -245 Q 0.043 -246 C 0.046 -247 V 0.050 -248 S 0.055 -249 D 0.059 -250 V 0.062 -251 S 0.064 -252 Y 0.060 -253 D 0.050 -254 R 0.038 -255 F 0.031 -256 V 0.031 -257 L 0.036 -258 Y 0.045 -259 K 0.058 -260 E 0.071 -261 G 0.080 -262 E 0.085 -263 R 0.087 -264 D 0.086 -265 F 0.083 -266 L 0.083 -267 Q 0.091 -268 L 0.110 -269 P 0.138 -270 G 0.168 -271 P 0.193 -272 Q 0.207 -273 P 0.201 -274 Q 0.179 -275 A 0.151 -276 G 0.122 -277 L 0.096 -278 S 0.074 -279 Q 0.058 -280 A 0.047 -281 N 0.043 -282 F 0.044 -283 T 0.045 -284 L 0.043 -285 G 0.041 -286 P 0.040 -287 V 0.042 -288 S 0.047 -289 R 0.055 -290 S 0.067 -291 Y 0.082 -292 G 0.096 -293 G 0.099 -294 Q 0.084 -295 Y 0.062 -296 R 0.050 -297 C 0.051 -298 S 0.059 -299 G 0.070 -300 A 0.079 -301 Y 0.087 -302 N 0.092 -303 L 0.094 -304 S 0.098 -305 S 0.101 -306 E 0.103 -307 W 0.106 -308 S 0.114 -309 A 0.121 -310 P 0.124 -311 S 0.126 -312 D 0.131 -313 P 0.128 -314 L 0.116 -315 D 0.104 -316 I 0.101 -317 L 0.113 -318 I 0.138 -319 A 0.166 -320 G 0.184 -321 Q 0.187 -322 F 0.182 -323 R 0.175 -324 G 0.163 -325 R 0.144 -326 P 0.122 -327 F 0.102 -328 I 0.087 -329 S 0.077 -330 V 0.070 -331 H 0.070 -332 P 0.079 -333 G 0.097 -334 P 0.116 -335 T 0.131 -336 V 0.145 -337 A 0.154 -338 S 0.154 -339 G 0.144 -340 E 0.129 -341 N 0.110 -342 V 0.090 -343 T 0.070 -344 L 0.054 -345 L 0.049 -346 C 0.052 -347 Q 0.062 -348 S 0.074 -349 W 0.087 -350 G 0.097 -351 P 0.097 -352 F 0.086 -353 H 0.070 -354 T 0.057 -355 F 0.052 -356 L 0.054 -357 L 0.062 -358 T 0.082 -359 K 0.114 -360 A 0.151 -361 G 0.181 -362 A 0.200 -363 A 0.209 -364 D 0.207 -365 A 0.189 -366 P 0.158 -367 L 0.127 -368 R 0.108 -369 L 0.100 -370 R 0.101 -371 S 0.110 -372 I 0.122 -373 H 0.124 -374 E 0.110 -375 Y 0.087 -376 P 0.068 -377 K 0.060 -378 Y 0.058 -379 Q 0.055 -380 A 0.051 -381 E 0.050 -382 F 0.052 -383 P 0.053 -384 M 0.050 -385 S 0.046 -386 P 0.049 -387 V 0.059 -388 T 0.072 -389 S 0.085 -390 A 0.099 -391 H 0.119 -392 S 0.141 -393 G 0.147 -394 T 0.125 -395 Y 0.092 -396 R 0.072 -397 C 0.070 -398 Y 0.078 -399 G 0.087 -400 S 0.096 -401 L 0.104 -402 S 0.113 -403 S 0.119 -404 N 0.120 -405 P 0.119 -406 Y 0.117 -407 L 0.117 -408 L 0.118 -409 S 0.122 -410 H 0.126 -411 P 0.126 -412 S 0.126 -413 D 0.131 -414 S 0.139 -415 L 0.147 -416 E 0.149 -417 L 0.149 -418 M 0.173 -419 V 0.242 -420 S 0.359 -421 G 0.496 -422 A 0.611 -423 A 0.680 -424 E 0.700 -425 T 0.685 -426 L 0.651 -427 S 0.625 -428 P 0.623 -429 P 0.644 -430 Q 0.670 -431 N 0.683 -432 K 0.674 -433 S 0.637 -434 D 0.583 -435 S 0.553 -436 K 0.565 -437 A 0.578 -438 G 0.557 -439 A 0.534 -440 A 0.532 -441 N 0.531 -442 T 0.526 -443 L 0.541 -444 S 0.561 -445 P 0.557 -446 S 0.548 -447 Q 0.553 -448 N 0.556 -449 K 0.563 -450 T 0.595 -451 A 0.636 -452 S 0.659 -453 H 0.665 -454 P 0.667 -455 Q 0.659 -456 D 0.634 -457 Y 0.595 -458 T 0.555 -459 V 0.523 -460 E 0.507 -461 N 0.501 -462 L 0.500 -463 I 0.506 -464 R 0.525 -465 M 0.546 -466 G 0.551 -467 I 0.534 -468 A 0.492 -469 G 0.428 -470 L 0.361 -471 V 0.313 -472 L 0.281 -473 V 0.256 -474 V 0.240 -475 L 0.232 -476 G 0.219 -477 I 0.202 -478 L 0.186 -479 L 0.179 -480 F 0.184 -481 E 0.201 -482 A 0.221 -483 Q 0.242 -484 H 0.269 -485 S 0.306 -486 Q 0.345 -487 R 0.390 -488 S 0.441 -489 L 0.480 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000104974.12_ENST00000251372.8_GN:LILRA1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000104974.12_ENST00000251372.8_GN:LILRA1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid deleted file mode 100644 index ca46a6c0ac54fb369225642c255b03ec9a490aa8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000104974.12_ENST00000251372.8_GN:LILRA1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid +++ /dev/null @@ -1,507 +0,0 @@ ->ENSG00000104974.12|ENST00000251372.8|GN:LILRA1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:17 -1 M 0.341 -2 H 0.347 -3 R 0.374 -4 G 0.414 -5 L 0.430 -6 I 0.421 -7 H 0.421 -8 P 0.428 -9 Q 0.408 -10 S 0.385 -11 R 0.420 -12 A 0.511 -13 V 0.596 -14 G 0.644 -15 G 0.670 -16 D 0.672 -17 A 0.636 -18 M 0.583 -19 T 0.540 -20 P 0.498 -21 I 0.428 -22 V 0.344 -23 T 0.286 -24 V 0.262 -25 L 0.254 -26 I 0.252 -27 C 0.262 -28 L 0.280 -29 R 0.296 -30 L 0.311 -31 S 0.335 -32 L 0.374 -33 G 0.425 -34 P 0.480 -35 R 0.526 -36 T 0.563 -37 H 0.589 -38 V 0.606 -39 Q 0.608 -40 A 0.583 -41 G 0.521 -42 T 0.421 -43 L 0.306 -44 P 0.207 -45 K 0.138 -46 P 0.099 -47 T 0.080 -48 L 0.069 -49 W 0.062 -50 A 0.054 -51 E 0.047 -52 P 0.043 -53 G 0.045 -54 S 0.049 -55 V 0.051 -56 I 0.052 -57 T 0.056 -58 Q 0.066 -59 G 0.077 -60 S 0.078 -61 P 0.067 -62 V 0.052 -63 T 0.039 -64 L 0.032 -65 W 0.030 -66 C 0.035 -67 Q 0.045 -68 G 0.056 -69 I 0.064 -70 L 0.067 -71 E 0.066 -72 T 0.061 -73 Q 0.052 -74 E 0.040 -75 Y 0.032 -76 R 0.029 -77 L 0.032 -78 Y 0.039 -79 R 0.052 -80 E 0.075 -81 K 0.104 -82 K 0.131 -83 T 0.149 -84 A 0.154 -85 P 0.144 -86 W 0.123 -87 I 0.106 -88 T 0.104 -89 R 0.118 -90 I 0.132 -91 P 0.132 -92 Q 0.118 -93 E 0.097 -94 I 0.078 -95 V 0.064 -96 K 0.056 -97 K 0.055 -98 G 0.052 -99 Q 0.046 -100 F 0.040 -101 P 0.038 -102 I 0.039 -103 P 0.042 -104 S 0.046 -105 I 0.051 -106 T 0.053 -107 W 0.053 -108 E 0.054 -109 H 0.058 -110 T 0.063 -111 G 0.062 -112 R 0.052 -113 Y 0.040 -114 R 0.033 -115 C 0.033 -116 F 0.039 -117 Y 0.050 -118 G 0.067 -119 S 0.082 -120 H 0.092 -121 T 0.099 -122 A 0.102 -123 G 0.099 -124 W 0.095 -125 S 0.095 -126 E 0.098 -127 P 0.096 -128 S 0.093 -129 D 0.090 -130 P 0.086 -131 L 0.082 -132 E 0.080 -133 L 0.083 -134 V 0.093 -135 V 0.108 -136 T 0.123 -137 G 0.134 -138 A 0.139 -139 Y 0.135 -140 I 0.122 -141 K 0.104 -142 P 0.088 -143 T 0.079 -144 L 0.073 -145 S 0.068 -146 A 0.064 -147 L 0.059 -148 P 0.059 -149 S 0.061 -150 P 0.064 -151 V 0.069 -152 V 0.075 -153 T 0.081 -154 S 0.087 -155 G 0.090 -156 G 0.085 -157 N 0.072 -158 V 0.058 -159 T 0.046 -160 L 0.037 -161 H 0.032 -162 C 0.033 -163 V 0.038 -164 S 0.045 -165 Q 0.051 -166 V 0.055 -167 A 0.057 -168 F 0.057 -169 G 0.053 -170 S 0.045 -171 F 0.037 -172 I 0.036 -173 L 0.044 -174 C 0.060 -175 K 0.078 -176 E 0.099 -177 G 0.120 -178 E 0.142 -179 D 0.157 -180 E 0.160 -181 H 0.150 -182 P 0.130 -183 Q 0.110 -184 C 0.095 -185 L 0.087 -186 N 0.092 -187 S 0.112 -188 Q 0.137 -189 P 0.152 -190 R 0.147 -191 T 0.129 -192 H 0.107 -193 G 0.086 -194 W 0.068 -195 S 0.054 -196 R 0.043 -197 A 0.036 -198 I 0.032 -199 F 0.030 -200 S 0.031 -201 V 0.032 -202 G 0.038 -203 P 0.051 -204 V 0.069 -205 S 0.085 -206 P 0.096 -207 S 0.103 -208 R 0.103 -209 R 0.093 -210 W 0.073 -211 S 0.052 -212 Y 0.038 -213 R 0.034 -214 C 0.040 -215 Y 0.051 -216 A 0.063 -217 Y 0.072 -218 D 0.077 -219 S 0.082 -220 N 0.084 -221 S 0.084 -222 P 0.082 -223 H 0.082 -224 V 0.082 -225 W 0.085 -226 S 0.091 -227 L 0.096 -228 P 0.097 -229 S 0.097 -230 D 0.098 -231 L 0.097 -232 L 0.092 -233 E 0.086 -234 L 0.086 -235 L 0.096 -236 V 0.113 -237 L 0.128 -238 G 0.139 -239 V 0.143 -240 S 0.141 -241 K 0.129 -242 K 0.111 -243 P 0.093 -244 S 0.079 -245 L 0.069 -246 S 0.061 -247 V 0.055 -248 Q 0.050 -249 P 0.048 -250 G 0.051 -251 P 0.056 -252 I 0.062 -253 V 0.070 -254 A 0.082 -255 P 0.095 -256 G 0.099 -257 E 0.091 -258 S 0.075 -259 L 0.059 -260 T 0.048 -261 L 0.044 -262 Q 0.044 -263 C 0.046 -264 V 0.051 -265 S 0.056 -266 D 0.060 -267 V 0.063 -268 S 0.065 -269 Y 0.061 -270 D 0.051 -271 R 0.039 -272 F 0.032 -273 V 0.031 -274 L 0.037 -275 Y 0.047 -276 K 0.060 -277 E 0.072 -278 G 0.082 -279 E 0.087 -280 R 0.090 -281 D 0.089 -282 F 0.087 -283 L 0.086 -284 Q 0.094 -285 L 0.113 -286 P 0.141 -287 G 0.171 -288 P 0.197 -289 Q 0.210 -290 P 0.204 -291 Q 0.182 -292 A 0.152 -293 G 0.123 -294 L 0.097 -295 S 0.075 -296 Q 0.058 -297 A 0.047 -298 N 0.043 -299 F 0.044 -300 T 0.046 -301 L 0.045 -302 G 0.043 -303 P 0.042 -304 V 0.044 -305 S 0.049 -306 R 0.058 -307 S 0.070 -308 Y 0.085 -309 G 0.099 -310 G 0.102 -311 Q 0.086 -312 Y 0.063 -313 R 0.051 -314 C 0.052 -315 S 0.061 -316 G 0.072 -317 A 0.082 -318 Y 0.090 -319 N 0.094 -320 L 0.097 -321 S 0.100 -322 S 0.103 -323 E 0.106 -324 W 0.108 -325 S 0.116 -326 A 0.124 -327 P 0.127 -328 S 0.129 -329 D 0.134 -330 P 0.131 -331 L 0.119 -332 D 0.107 -333 I 0.104 -334 L 0.115 -335 I 0.139 -336 A 0.166 -337 G 0.182 -338 Q 0.184 -339 F 0.181 -340 R 0.175 -341 G 0.163 -342 R 0.145 -343 P 0.122 -344 F 0.102 -345 I 0.087 -346 S 0.077 -347 V 0.070 -348 H 0.069 -349 P 0.078 -350 G 0.095 -351 P 0.114 -352 T 0.130 -353 V 0.145 -354 A 0.155 -355 S 0.155 -356 G 0.146 -357 E 0.130 -358 N 0.111 -359 V 0.091 -360 T 0.070 -361 L 0.055 -362 L 0.049 -363 C 0.053 -364 Q 0.062 -365 S 0.075 -366 W 0.087 -367 G 0.096 -368 P 0.096 -369 F 0.085 -370 H 0.069 -371 T 0.056 -372 F 0.052 -373 L 0.054 -374 L 0.063 -375 T 0.082 -376 K 0.114 -377 A 0.150 -378 G 0.179 -379 A 0.197 -380 A 0.205 -381 D 0.203 -382 A 0.186 -383 P 0.155 -384 L 0.125 -385 R 0.107 -386 L 0.100 -387 R 0.101 -388 S 0.110 -389 I 0.122 -390 H 0.124 -391 E 0.110 -392 Y 0.086 -393 P 0.068 -394 K 0.060 -395 Y 0.058 -396 Q 0.055 -397 A 0.051 -398 E 0.050 -399 F 0.052 -400 P 0.053 -401 M 0.050 -402 S 0.046 -403 P 0.049 -404 V 0.059 -405 T 0.073 -406 S 0.085 -407 A 0.099 -408 H 0.119 -409 S 0.142 -410 G 0.148 -411 T 0.126 -412 Y 0.093 -413 R 0.073 -414 C 0.071 -415 Y 0.078 -416 G 0.087 -417 S 0.095 -418 L 0.104 -419 S 0.112 -420 S 0.119 -421 N 0.121 -422 P 0.120 -423 Y 0.119 -424 L 0.118 -425 L 0.119 -426 S 0.122 -427 H 0.126 -428 P 0.126 -429 S 0.126 -430 D 0.132 -431 S 0.141 -432 L 0.149 -433 E 0.151 -434 L 0.152 -435 M 0.175 -436 V 0.244 -437 S 0.359 -438 G 0.495 -439 A 0.610 -440 A 0.678 -441 E 0.699 -442 T 0.683 -443 L 0.649 -444 S 0.620 -445 P 0.617 -446 P 0.637 -447 Q 0.663 -448 N 0.676 -449 K 0.668 -450 S 0.632 -451 D 0.579 -452 S 0.547 -453 K 0.555 -454 A 0.564 -455 G 0.541 -456 A 0.520 -457 A 0.524 -458 N 0.526 -459 T 0.522 -460 L 0.538 -461 S 0.558 -462 P 0.556 -463 S 0.554 -464 Q 0.575 -465 N 0.601 -466 K 0.619 -467 T 0.640 -468 A 0.660 -469 S 0.668 -470 H 0.670 -471 P 0.673 -472 Q 0.668 -473 D 0.648 -474 Y 0.614 -475 T 0.576 -476 V 0.545 -477 E 0.527 -478 N 0.519 -479 L 0.515 -480 I 0.517 -481 R 0.532 -482 M 0.550 -483 G 0.553 -484 I 0.535 -485 A 0.495 -486 G 0.431 -487 L 0.363 -488 V 0.313 -489 L 0.280 -490 V 0.256 -491 V 0.242 -492 L 0.235 -493 G 0.226 -494 I 0.214 -495 L 0.204 -496 L 0.204 -497 F 0.217 -498 E 0.241 -499 A 0.264 -500 Q 0.285 -501 H 0.310 -502 S 0.340 -503 Q 0.374 -504 R 0.417 -505 S 0.467 -506 L 0.504 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000105668.8_ENST00000222275.3_GN:UPK1A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000105668.8_ENST00000222275.3_GN:UPK1A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 5e4fbf8648618ed16d069cd06cc32a116711dad6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000105668.8_ENST00000222275.3_GN:UPK1A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,259 +0,0 @@ ->ENSG00000105668.8|ENST00000222275.3|GN:UPK1A|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.330 -2 A 0.336 -3 S 0.351 -4 A 0.374 -5 A 0.398 -6 A 0.418 -7 A 0.430 -8 E 0.428 -9 A 0.405 -10 E 0.361 -11 K 0.306 -12 G 0.244 -13 S 0.178 -14 P 0.119 -15 V 0.079 -16 V 0.060 -17 V 0.050 -18 G 0.042 -19 L 0.034 -20 L 0.030 -21 V 0.030 -22 V 0.033 -23 G 0.039 -24 N 0.040 -25 I 0.035 -26 I 0.029 -27 I 0.024 -28 L 0.022 -29 L 0.024 -30 S 0.028 -31 G 0.032 -32 L 0.033 -33 S 0.033 -34 L 0.033 -35 F 0.033 -36 A 0.034 -37 E 0.036 -38 T 0.035 -39 I 0.032 -40 W 0.033 -41 V 0.038 -42 T 0.045 -43 A 0.055 -44 D 0.068 -45 Q 0.084 -46 Y 0.106 -47 R 0.135 -48 V 0.166 -49 Y 0.200 -50 P 0.235 -51 L 0.270 -52 M 0.304 -53 G 0.334 -54 V 0.350 -55 S 0.348 -56 G 0.330 -57 K 0.303 -58 D 0.272 -59 D 0.239 -60 V 0.206 -61 F 0.173 -62 A 0.140 -63 G 0.108 -64 A 0.080 -65 W 0.063 -66 I 0.055 -67 A 0.049 -68 I 0.044 -69 F 0.042 -70 C 0.043 -71 G 0.043 -72 F 0.039 -73 S 0.032 -74 F 0.026 -75 F 0.024 -76 M 0.026 -77 V 0.032 -78 A 0.034 -79 S 0.034 -80 F 0.033 -81 G 0.038 -82 V 0.046 -83 G 0.055 -84 A 0.062 -85 A 0.064 -86 L 0.061 -87 C 0.057 -88 R 0.054 -89 R 0.049 -90 R 0.042 -91 S 0.037 -92 M 0.035 -93 V 0.034 -94 L 0.032 -95 T 0.033 -96 Y 0.043 -97 L 0.056 -98 V 0.063 -99 L 0.058 -100 M 0.044 -101 L 0.032 -102 I 0.028 -103 V 0.033 -104 Y 0.044 -105 I 0.051 -106 F 0.047 -107 E 0.036 -108 C 0.027 -109 A 0.021 -110 S 0.020 -111 C 0.020 -112 I 0.022 -113 T 0.028 -114 S 0.033 -115 Y 0.035 -116 T 0.035 -117 H 0.036 -118 R 0.039 -119 D 0.043 -120 Y 0.048 -121 M 0.060 -122 V 0.080 -123 S 0.100 -124 N 0.111 -125 P 0.106 -126 S 0.089 -127 L 0.073 -128 I 0.070 -129 T 0.072 -130 K 0.069 -131 Q 0.057 -132 M 0.047 -133 L 0.048 -134 T 0.057 -135 F 0.070 -136 Y 0.084 -137 S 0.100 -138 A 0.114 -139 D 0.122 -140 T 0.122 -141 D 0.115 -142 Q 0.106 -143 G 0.094 -144 Q 0.082 -145 E 0.071 -146 L 0.062 -147 T 0.055 -148 R 0.050 -149 L 0.046 -150 W 0.042 -151 D 0.036 -152 R 0.031 -153 V 0.028 -154 M 0.029 -155 I 0.032 -156 E 0.035 -157 Q 0.034 -158 E 0.029 -159 C 0.025 -160 C 0.028 -161 G 0.043 -162 T 0.068 -163 S 0.094 -164 G 0.111 -165 P 0.115 -166 M 0.109 -167 D 0.097 -168 W 0.084 -169 V 0.077 -170 N 0.081 -171 F 0.091 -172 T 0.101 -173 S 0.110 -174 A 0.118 -175 F 0.121 -176 R 0.125 -177 A 0.133 -178 A 0.141 -179 T 0.145 -180 P 0.143 -181 E 0.137 -182 V 0.130 -183 V 0.122 -184 F 0.119 -185 P 0.121 -186 W 0.118 -187 P 0.106 -188 P 0.091 -189 L 0.081 -190 C 0.077 -191 C 0.081 -192 R 0.097 -193 R 0.124 -194 T 0.156 -195 G 0.182 -196 N 0.199 -197 F 0.212 -198 I 0.227 -199 P 0.236 -200 L 0.229 -201 N 0.203 -202 E 0.175 -203 E 0.159 -204 G 0.147 -205 C 0.129 -206 R 0.109 -207 L 0.101 -208 G 0.103 -209 H 0.109 -210 M 0.112 -211 D 0.115 -212 Y 0.115 -213 L 0.112 -214 F 0.105 -215 T 0.098 -216 K 0.093 -217 G 0.087 -218 C 0.077 -219 F 0.068 -220 E 0.067 -221 H 0.075 -222 I 0.086 -223 G 0.099 -224 H 0.109 -225 A 0.110 -226 I 0.100 -227 D 0.087 -228 S 0.078 -229 Y 0.074 -230 T 0.068 -231 W 0.061 -232 G 0.060 -233 I 0.062 -234 S 0.062 -235 W 0.062 -236 F 0.066 -237 G 0.069 -238 F 0.067 -239 A 0.063 -240 I 0.058 -241 L 0.050 -242 M 0.040 -243 W 0.033 -244 T 0.030 -245 L 0.028 -246 P 0.030 -247 V 0.038 -248 M 0.049 -249 L 0.054 -250 I 0.045 -251 A 0.032 -252 M 0.023 -253 Y 0.023 -254 F 0.028 -255 Y 0.038 -256 T 0.054 -257 M 0.078 -258 L 0.098 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000105668.8_ENST00000222275.3_GN:UPK1A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000105668.8_ENST00000222275.3_GN:UPK1A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid deleted file mode 100644 index bb9eb7da29a0e4ffb0a01047859b03faf3a38839..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000105668.8_ENST00000222275.3_GN:UPK1A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid +++ /dev/null @@ -1,260 +0,0 @@ ->ENSG00000105668.8|ENST00000222275.3|GN:UPK1A|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:1 -1 M 0.318 -2 M 0.319 -3 A 0.327 -4 S 0.343 -5 A 0.362 -6 A 0.384 -7 A 0.410 -8 A 0.433 -9 E 0.433 -10 A 0.404 -11 E 0.357 -12 K 0.301 -13 G 0.239 -14 S 0.173 -15 P 0.116 -16 V 0.078 -17 V 0.060 -18 V 0.051 -19 G 0.042 -20 L 0.034 -21 L 0.030 -22 V 0.030 -23 V 0.033 -24 G 0.039 -25 N 0.040 -26 I 0.036 -27 I 0.029 -28 I 0.024 -29 L 0.022 -30 L 0.024 -31 S 0.028 -32 G 0.032 -33 L 0.033 -34 S 0.033 -35 L 0.033 -36 F 0.033 -37 A 0.034 -38 E 0.036 -39 T 0.035 -40 I 0.032 -41 W 0.033 -42 V 0.038 -43 T 0.046 -44 A 0.056 -45 D 0.069 -46 Q 0.085 -47 Y 0.108 -48 R 0.136 -49 V 0.168 -50 Y 0.202 -51 P 0.238 -52 L 0.272 -53 M 0.306 -54 G 0.336 -55 V 0.352 -56 S 0.348 -57 G 0.330 -58 K 0.303 -59 D 0.272 -60 D 0.239 -61 V 0.206 -62 F 0.172 -63 A 0.139 -64 G 0.107 -65 A 0.080 -66 W 0.063 -67 I 0.054 -68 A 0.049 -69 I 0.044 -70 F 0.042 -71 C 0.043 -72 G 0.043 -73 F 0.039 -74 S 0.032 -75 F 0.026 -76 F 0.024 -77 M 0.026 -78 V 0.032 -79 A 0.035 -80 S 0.034 -81 F 0.033 -82 G 0.037 -83 V 0.046 -84 G 0.055 -85 A 0.062 -86 A 0.064 -87 L 0.061 -88 C 0.057 -89 R 0.054 -90 R 0.049 -91 R 0.042 -92 S 0.037 -93 M 0.035 -94 V 0.034 -95 L 0.032 -96 T 0.034 -97 Y 0.043 -98 L 0.056 -99 V 0.064 -100 L 0.058 -101 M 0.044 -102 L 0.032 -103 I 0.028 -104 V 0.034 -105 Y 0.045 -106 I 0.051 -107 F 0.047 -108 E 0.036 -109 C 0.027 -110 A 0.021 -111 S 0.020 -112 C 0.020 -113 I 0.022 -114 T 0.028 -115 S 0.033 -116 Y 0.036 -117 T 0.035 -118 H 0.036 -119 R 0.039 -120 D 0.043 -121 Y 0.049 -122 M 0.061 -123 V 0.080 -124 S 0.101 -125 N 0.112 -126 P 0.107 -127 S 0.089 -128 L 0.074 -129 I 0.070 -130 T 0.073 -131 K 0.069 -132 Q 0.057 -133 M 0.047 -134 L 0.048 -135 T 0.058 -136 F 0.070 -137 Y 0.084 -138 S 0.100 -139 A 0.114 -140 D 0.122 -141 T 0.122 -142 D 0.116 -143 Q 0.106 -144 G 0.094 -145 Q 0.082 -146 E 0.071 -147 L 0.062 -148 T 0.055 -149 R 0.050 -150 L 0.047 -151 W 0.042 -152 D 0.036 -153 R 0.031 -154 V 0.028 -155 M 0.029 -156 I 0.032 -157 E 0.035 -158 Q 0.034 -159 E 0.029 -160 C 0.025 -161 C 0.028 -162 G 0.043 -163 T 0.068 -164 S 0.094 -165 G 0.111 -166 P 0.115 -167 M 0.109 -168 D 0.097 -169 W 0.084 -170 V 0.077 -171 N 0.081 -172 F 0.091 -173 T 0.101 -174 S 0.111 -175 A 0.118 -176 F 0.122 -177 R 0.126 -178 A 0.134 -179 A 0.142 -180 T 0.146 -181 P 0.144 -182 E 0.138 -183 V 0.130 -184 V 0.123 -185 F 0.120 -186 P 0.121 -187 W 0.118 -188 P 0.106 -189 P 0.091 -190 L 0.081 -191 C 0.077 -192 C 0.081 -193 R 0.097 -194 R 0.124 -195 T 0.156 -196 G 0.181 -197 N 0.198 -198 F 0.212 -199 I 0.227 -200 P 0.236 -201 L 0.229 -202 N 0.203 -203 E 0.176 -204 E 0.159 -205 G 0.148 -206 C 0.129 -207 R 0.109 -208 L 0.101 -209 G 0.104 -210 H 0.109 -211 M 0.113 -212 D 0.115 -213 Y 0.116 -214 L 0.113 -215 F 0.106 -216 T 0.098 -217 K 0.093 -218 G 0.087 -219 C 0.077 -220 F 0.068 -221 E 0.067 -222 H 0.075 -223 I 0.087 -224 G 0.099 -225 H 0.109 -226 A 0.110 -227 I 0.100 -228 D 0.087 -229 S 0.078 -230 Y 0.074 -231 T 0.068 -232 W 0.061 -233 G 0.060 -234 I 0.062 -235 S 0.062 -236 W 0.062 -237 F 0.066 -238 G 0.070 -239 F 0.068 -240 A 0.063 -241 I 0.058 -242 L 0.050 -243 M 0.040 -244 W 0.034 -245 T 0.030 -246 L 0.029 -247 P 0.030 -248 V 0.038 -249 M 0.049 -250 L 0.054 -251 I 0.045 -252 A 0.032 -253 M 0.023 -254 Y 0.023 -255 F 0.029 -256 Y 0.038 -257 T 0.054 -258 M 0.078 -259 L 0.098 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000106392.12_ENST00000436587.7_GN:C1GALT1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000106392.12_ENST00000436587.7_GN:C1GALT1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 64c8846320ba0819cb618f7cd4b77ae0148d8c03..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000106392.12_ENST00000436587.7_GN:C1GALT1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,364 +0,0 @@ ->ENSG00000106392.12|ENST00000436587.7|GN:C1GALT1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.373 -2 A 0.368 -3 S 0.356 -4 K 0.335 -5 S 0.305 -6 W 0.266 -7 L 0.232 -8 N 0.214 -9 F 0.205 -10 L 0.202 -11 T 0.209 -12 F 0.229 -13 L 0.261 -14 C 0.300 -15 G 0.334 -16 S 0.349 -17 A 0.348 -18 I 0.343 -19 G 0.328 -20 F 0.294 -21 L 0.255 -22 L 0.229 -23 C 0.220 -24 S 0.217 -25 Q 0.213 -26 L 0.217 -27 F 0.238 -28 S 0.267 -29 I 0.295 -30 L 0.329 -31 L 0.375 -32 G 0.426 -33 E 0.467 -34 K 0.489 -35 V 0.493 -36 D 0.488 -37 T 0.485 -38 Q 0.492 -39 P 0.501 -40 N 0.500 -41 V 0.484 -42 L 0.462 -43 H 0.452 -44 N 0.458 -45 D 0.466 -46 P 0.474 -47 H 0.503 -48 A 0.558 -49 R 0.611 -50 H 0.645 -51 S 0.669 -52 D 0.696 -53 D 0.715 -54 N 0.715 -55 G 0.699 -56 Q 0.675 -57 N 0.639 -58 H 0.582 -59 L 0.523 -60 E 0.506 -61 G 0.536 -62 Q 0.572 -63 M 0.585 -64 N 0.592 -65 F 0.610 -66 N 0.631 -67 A 0.640 -68 D 0.634 -69 S 0.618 -70 S 0.598 -71 Q 0.567 -72 H 0.518 -73 K 0.452 -74 D 0.389 -75 E 0.343 -76 N 0.311 -77 T 0.281 -78 D 0.253 -79 I 0.226 -80 A 0.200 -81 E 0.179 -82 N 0.160 -83 L 0.140 -84 Y 0.117 -85 Q 0.098 -86 K 0.083 -87 V 0.069 -88 R 0.051 -89 I 0.035 -90 L 0.024 -91 C 0.020 -92 W 0.021 -93 V 0.028 -94 M 0.038 -95 T 0.050 -96 G 0.056 -97 P 0.056 -98 Q 0.052 -99 N 0.045 -100 L 0.041 -101 E 0.041 -102 K 0.044 -103 K 0.046 -104 A 0.046 -105 K 0.048 -106 H 0.051 -107 V 0.049 -108 K 0.041 -109 A 0.033 -110 T 0.028 -111 W 0.029 -112 A 0.032 -113 Q 0.038 -114 R 0.044 -115 C 0.046 -116 N 0.041 -117 K 0.032 -118 V 0.025 -119 L 0.024 -120 F 0.029 -121 M 0.040 -122 S 0.054 -123 S 0.068 -124 E 0.079 -125 E 0.084 -126 N 0.081 -127 K 0.074 -128 D 0.069 -129 F 0.071 -130 P 0.076 -131 A 0.082 -132 V 0.088 -133 G 0.097 -134 L 0.109 -135 K 0.125 -136 T 0.139 -137 K 0.145 -138 E 0.144 -139 G 0.141 -140 R 0.136 -141 D 0.123 -142 Q 0.105 -143 L 0.088 -144 Y 0.078 -145 W 0.070 -146 K 0.061 -147 T 0.054 -148 I 0.048 -149 K 0.043 -150 A 0.037 -151 F 0.031 -152 Q 0.028 -153 Y 0.027 -154 V 0.026 -155 H 0.026 -156 E 0.027 -157 H 0.028 -158 Y 0.029 -159 L 0.032 -160 E 0.037 -161 D 0.041 -162 A 0.043 -163 D 0.039 -164 W 0.033 -165 F 0.028 -166 L 0.029 -167 K 0.036 -168 A 0.046 -169 D 0.057 -170 D 0.068 -171 D 0.076 -172 T 0.080 -173 Y 0.077 -174 V 0.068 -175 I 0.056 -176 L 0.046 -177 D 0.043 -178 N 0.043 -179 L 0.045 -180 R 0.044 -181 W 0.042 -182 L 0.040 -183 L 0.039 -184 S 0.039 -185 K 0.043 -186 Y 0.050 -187 D 0.056 -188 P 0.059 -189 E 0.063 -190 E 0.069 -191 P 0.075 -192 I 0.080 -193 Y 0.082 -194 F 0.080 -195 G 0.079 -196 R 0.080 -197 R 0.079 -198 F 0.071 -199 K 0.062 -200 P 0.062 -201 Y 0.075 -202 V 0.094 -203 K 0.115 -204 Q 0.133 -205 G 0.150 -206 Y 0.165 -207 M 0.176 -208 S 0.186 -209 G 0.200 -210 G 0.212 -211 A 0.203 -212 G 0.167 -213 Y 0.126 -214 V 0.103 -215 L 0.092 -216 S 0.082 -217 K 0.072 -218 E 0.065 -219 A 0.062 -220 L 0.058 -221 K 0.053 -222 R 0.050 -223 F 0.052 -224 V 0.056 -225 D 0.061 -226 A 0.067 -227 F 0.074 -228 K 0.082 -229 T 0.090 -230 D 0.095 -231 K 0.095 -232 C 0.094 -233 T 0.094 -234 H 0.093 -235 S 0.087 -236 S 0.079 -237 S 0.074 -238 I 0.075 -239 E 0.079 -240 D 0.083 -241 L 0.088 -242 A 0.092 -243 L 0.091 -244 G 0.085 -245 R 0.081 -246 C 0.079 -247 M 0.080 -248 E 0.084 -249 I 0.092 -250 M 0.104 -251 N 0.122 -252 V 0.139 -253 E 0.149 -254 A 0.153 -255 G 0.162 -256 D 0.173 -257 S 0.177 -258 R 0.170 -259 D 0.162 -260 T 0.166 -261 I 0.179 -262 G 0.186 -263 K 0.178 -264 E 0.161 -265 T 0.144 -266 F 0.135 -267 H 0.135 -268 P 0.135 -269 F 0.130 -270 V 0.120 -271 P 0.110 -272 E 0.101 -273 H 0.096 -274 H 0.094 -275 L 0.099 -276 I 0.110 -277 K 0.127 -278 G 0.140 -279 Y 0.142 -280 L 0.136 -281 P 0.129 -282 R 0.124 -283 T 0.123 -284 F 0.123 -285 W 0.123 -286 Y 0.123 -287 W 0.119 -288 N 0.110 -289 Y 0.104 -290 N 0.111 -291 Y 0.136 -292 Y 0.174 -293 P 0.212 -294 P 0.232 -295 V 0.231 -296 E 0.226 -297 G 0.234 -298 P 0.247 -299 G 0.248 -300 C 0.236 -301 C 0.224 -302 S 0.219 -303 D 0.219 -304 L 0.222 -305 A 0.221 -306 V 0.212 -307 S 0.199 -308 F 0.190 -309 H 0.189 -310 Y 0.194 -311 V 0.199 -312 D 0.192 -313 S 0.171 -314 T 0.147 -315 T 0.132 -316 M 0.128 -317 Y 0.132 -318 E 0.136 -319 L 0.134 -320 E 0.128 -321 Y 0.124 -322 L 0.125 -323 V 0.130 -324 Y 0.135 -325 H 0.144 -326 L 0.159 -327 R 0.178 -328 P 0.192 -329 Y 0.197 -330 G 0.196 -331 Y 0.197 -332 L 0.203 -333 Y 0.220 -334 R 0.248 -335 Y 0.278 -336 Q 0.298 -337 P 0.299 -338 T 0.281 -339 L 0.250 -340 P 0.212 -341 E 0.174 -342 R 0.145 -343 I 0.129 -344 L 0.123 -345 K 0.126 -346 E 0.133 -347 I 0.144 -348 S 0.163 -349 Q 0.198 -350 A 0.243 -351 N 0.281 -352 K 0.301 -353 N 0.316 -354 E 0.346 -355 D 0.391 -356 T 0.438 -357 K 0.478 -358 V 0.504 -359 K 0.517 -360 L 0.512 -361 G 0.485 -362 N 0.443 -363 P 0.410 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000106392.12_ENST00000436587.7_GN:C1GALT1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:8.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000106392.12_ENST00000436587.7_GN:C1GALT1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:8.caid deleted file mode 100644 index 1e600a700a73985847a6278284a50d4d1e746519..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000106392.12_ENST00000436587.7_GN:C1GALT1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:8.caid +++ /dev/null @@ -1,372 +0,0 @@ ->ENSG00000106392.12|ENST00000436587.7|GN:C1GALT1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:8 -1 M 0.337 -2 S 0.342 -3 E 0.344 -4 I 0.335 -5 H 0.311 -6 F 0.285 -7 R 0.278 -8 E 0.302 -9 M 0.340 -10 A 0.363 -11 S 0.354 -12 K 0.324 -13 S 0.289 -14 W 0.259 -15 L 0.240 -16 N 0.229 -17 F 0.218 -18 L 0.207 -19 T 0.206 -20 F 0.219 -21 L 0.250 -22 C 0.291 -23 G 0.327 -24 S 0.344 -25 A 0.347 -26 I 0.349 -27 G 0.338 -28 F 0.306 -29 L 0.267 -30 L 0.241 -31 C 0.233 -32 S 0.229 -33 Q 0.224 -34 L 0.229 -35 F 0.252 -36 S 0.283 -37 I 0.310 -38 L 0.340 -39 L 0.382 -40 G 0.432 -41 E 0.475 -42 K 0.502 -43 V 0.512 -44 D 0.509 -45 T 0.508 -46 Q 0.515 -47 P 0.525 -48 N 0.524 -49 V 0.506 -50 L 0.483 -51 H 0.472 -52 N 0.480 -53 D 0.492 -54 P 0.501 -55 H 0.528 -56 A 0.580 -57 R 0.630 -58 H 0.660 -59 S 0.683 -60 D 0.707 -61 D 0.724 -62 N 0.723 -63 G 0.707 -64 Q 0.684 -65 N 0.648 -66 H 0.592 -67 L 0.533 -68 E 0.514 -69 G 0.543 -70 Q 0.578 -71 M 0.590 -72 N 0.596 -73 F 0.613 -74 N 0.634 -75 A 0.643 -76 D 0.636 -77 S 0.619 -78 S 0.597 -79 Q 0.565 -80 H 0.515 -81 K 0.449 -82 D 0.385 -83 E 0.339 -84 N 0.308 -85 T 0.279 -86 D 0.252 -87 I 0.225 -88 A 0.199 -89 E 0.177 -90 N 0.158 -91 L 0.138 -92 Y 0.116 -93 Q 0.097 -94 K 0.083 -95 V 0.069 -96 R 0.052 -97 I 0.035 -98 L 0.024 -99 C 0.020 -100 W 0.021 -101 V 0.028 -102 M 0.039 -103 T 0.050 -104 G 0.056 -105 P 0.056 -106 Q 0.052 -107 N 0.046 -108 L 0.041 -109 E 0.041 -110 K 0.044 -111 K 0.046 -112 A 0.046 -113 K 0.048 -114 H 0.051 -115 V 0.049 -116 K 0.041 -117 A 0.033 -118 T 0.029 -119 W 0.029 -120 A 0.033 -121 Q 0.038 -122 R 0.045 -123 C 0.047 -124 N 0.042 -125 K 0.033 -126 V 0.026 -127 L 0.025 -128 F 0.030 -129 M 0.040 -130 S 0.055 -131 S 0.069 -132 E 0.081 -133 E 0.086 -134 N 0.083 -135 K 0.076 -136 D 0.071 -137 F 0.072 -138 P 0.078 -139 A 0.083 -140 V 0.089 -141 G 0.098 -142 L 0.111 -143 K 0.126 -144 T 0.141 -145 K 0.147 -146 E 0.146 -147 G 0.143 -148 R 0.137 -149 D 0.124 -150 Q 0.106 -151 L 0.089 -152 Y 0.078 -153 W 0.070 -154 K 0.062 -155 T 0.054 -156 I 0.048 -157 K 0.043 -158 A 0.037 -159 F 0.031 -160 Q 0.028 -161 Y 0.027 -162 V 0.026 -163 H 0.026 -164 E 0.026 -165 H 0.028 -166 Y 0.029 -167 L 0.032 -168 E 0.037 -169 D 0.042 -170 A 0.043 -171 D 0.039 -172 W 0.033 -173 F 0.028 -174 L 0.029 -175 K 0.036 -176 A 0.046 -177 D 0.057 -178 D 0.068 -179 D 0.076 -180 T 0.079 -181 Y 0.076 -182 V 0.067 -183 I 0.055 -184 L 0.046 -185 D 0.043 -186 N 0.044 -187 L 0.045 -188 R 0.044 -189 W 0.042 -190 L 0.041 -191 L 0.039 -192 S 0.039 -193 K 0.043 -194 Y 0.049 -195 D 0.054 -196 P 0.057 -197 E 0.062 -198 E 0.068 -199 P 0.074 -200 I 0.080 -201 Y 0.082 -202 F 0.081 -203 G 0.079 -204 R 0.080 -205 R 0.079 -206 F 0.071 -207 K 0.062 -208 P 0.061 -209 Y 0.073 -210 V 0.092 -211 K 0.113 -212 Q 0.131 -213 G 0.148 -214 Y 0.163 -215 M 0.175 -216 S 0.185 -217 G 0.199 -218 G 0.211 -219 A 0.202 -220 G 0.166 -221 Y 0.126 -222 V 0.103 -223 L 0.092 -224 S 0.082 -225 K 0.072 -226 E 0.064 -227 A 0.061 -228 L 0.057 -229 K 0.052 -230 R 0.049 -231 F 0.051 -232 V 0.055 -233 D 0.060 -234 A 0.066 -235 F 0.073 -236 K 0.081 -237 T 0.089 -238 D 0.094 -239 K 0.094 -240 C 0.093 -241 T 0.093 -242 H 0.092 -243 S 0.086 -244 S 0.078 -245 S 0.073 -246 I 0.075 -247 E 0.079 -248 D 0.083 -249 L 0.088 -250 A 0.092 -251 L 0.090 -252 G 0.085 -253 R 0.081 -254 C 0.079 -255 M 0.080 -256 E 0.084 -257 I 0.091 -258 M 0.104 -259 N 0.122 -260 V 0.140 -261 E 0.150 -262 A 0.154 -263 G 0.163 -264 D 0.174 -265 S 0.178 -266 R 0.171 -267 D 0.164 -268 T 0.168 -269 I 0.181 -270 G 0.188 -271 K 0.180 -272 E 0.163 -273 T 0.146 -274 F 0.137 -275 H 0.136 -276 P 0.136 -277 F 0.130 -278 V 0.120 -279 P 0.109 -280 E 0.101 -281 H 0.096 -282 H 0.095 -283 L 0.100 -284 I 0.113 -285 K 0.130 -286 G 0.144 -287 Y 0.146 -288 L 0.140 -289 P 0.132 -290 R 0.127 -291 T 0.126 -292 F 0.125 -293 W 0.125 -294 Y 0.124 -295 W 0.121 -296 N 0.112 -297 Y 0.106 -298 N 0.112 -299 Y 0.138 -300 Y 0.177 -301 P 0.215 -302 P 0.236 -303 V 0.235 -304 E 0.231 -305 G 0.239 -306 P 0.252 -307 G 0.253 -308 C 0.240 -309 C 0.227 -310 S 0.221 -311 D 0.221 -312 L 0.223 -313 A 0.222 -314 V 0.213 -315 S 0.201 -316 F 0.192 -317 H 0.190 -318 Y 0.196 -319 V 0.201 -320 D 0.194 -321 S 0.173 -322 T 0.149 -323 T 0.134 -324 M 0.130 -325 Y 0.133 -326 E 0.137 -327 L 0.135 -328 E 0.128 -329 Y 0.124 -330 L 0.125 -331 V 0.129 -332 Y 0.134 -333 H 0.143 -334 L 0.158 -335 R 0.177 -336 P 0.191 -337 Y 0.196 -338 G 0.196 -339 Y 0.196 -340 L 0.202 -341 Y 0.219 -342 R 0.247 -343 Y 0.278 -344 Q 0.299 -345 P 0.300 -346 T 0.282 -347 L 0.251 -348 P 0.213 -349 E 0.174 -350 R 0.146 -351 I 0.130 -352 L 0.124 -353 K 0.126 -354 E 0.134 -355 I 0.144 -356 S 0.163 -357 Q 0.198 -358 A 0.244 -359 N 0.282 -360 K 0.301 -361 N 0.317 -362 E 0.347 -363 D 0.391 -364 T 0.437 -365 K 0.477 -366 V 0.505 -367 K 0.518 -368 L 0.514 -369 G 0.487 -370 N 0.445 -371 P 0.412 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000106483.13_ENST00000436072.7_GN:SFRP4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000106483.13_ENST00000436072.7_GN:SFRP4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index c02a036ac50ca903eaa82c62f0d93388e3c6fbf2..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000106483.13_ENST00000436072.7_GN:SFRP4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,347 +0,0 @@ ->ENSG00000106483.13|ENST00000436072.7|GN:SFRP4|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.215 -2 F 0.196 -3 L 0.173 -4 S 0.159 -5 I 0.153 -6 L 0.149 -7 V 0.147 -8 A 0.145 -9 L 0.144 -10 C 0.145 -11 L 0.150 -12 W 0.156 -13 L 0.166 -14 H 0.186 -15 L 0.224 -16 A 0.274 -17 L 0.328 -18 G 0.377 -19 V 0.409 -20 R 0.403 -21 G 0.352 -22 A 0.270 -23 P 0.185 -24 C 0.119 -25 E 0.080 -26 A 0.061 -27 V 0.052 -28 R 0.048 -29 I 0.045 -30 P 0.043 -31 M 0.044 -32 C 0.046 -33 R 0.052 -34 H 0.057 -35 M 0.058 -36 P 0.057 -37 W 0.059 -38 N 0.068 -39 I 0.082 -40 T 0.090 -41 R 0.086 -42 M 0.075 -43 P 0.071 -44 N 0.079 -45 H 0.095 -46 L 0.113 -47 H 0.126 -48 H 0.133 -49 S 0.139 -50 T 0.144 -51 Q 0.145 -52 E 0.139 -53 N 0.133 -54 A 0.128 -55 I 0.123 -56 L 0.115 -57 A 0.105 -58 I 0.095 -59 E 0.087 -60 Q 0.084 -61 Y 0.084 -62 E 0.083 -63 E 0.081 -64 L 0.084 -65 V 0.092 -66 D 0.100 -67 V 0.104 -68 N 0.104 -69 C 0.103 -70 S 0.097 -71 A 0.086 -72 V 0.074 -73 L 0.062 -74 R 0.050 -75 F 0.043 -76 F 0.044 -77 L 0.050 -78 C 0.055 -79 A 0.058 -80 M 0.058 -81 Y 0.056 -82 A 0.051 -83 P 0.048 -84 I 0.047 -85 C 0.045 -86 T 0.046 -87 L 0.050 -88 E 0.058 -89 F 0.069 -90 L 0.084 -91 H 0.102 -92 D 0.124 -93 P 0.138 -94 I 0.139 -95 K 0.125 -96 P 0.102 -97 C 0.078 -98 K 0.063 -99 S 0.058 -100 V 0.055 -101 C 0.051 -102 Q 0.049 -103 R 0.054 -104 A 0.059 -105 R 0.062 -106 D 0.061 -107 D 0.058 -108 C 0.054 -109 E 0.051 -110 P 0.052 -111 L 0.057 -112 M 0.063 -113 K 0.066 -114 M 0.070 -115 Y 0.082 -116 N 0.101 -117 H 0.121 -118 S 0.130 -119 W 0.124 -120 P 0.109 -121 E 0.093 -122 S 0.078 -123 L 0.066 -124 A 0.058 -125 C 0.054 -126 D 0.055 -127 E 0.060 -128 L 0.068 -129 P 0.078 -130 V 0.091 -131 Y 0.105 -132 D 0.110 -133 R 0.103 -134 G 0.091 -135 V 0.087 -136 C 0.096 -137 I 0.112 -138 S 0.136 -139 P 0.172 -140 E 0.218 -141 A 0.270 -142 I 0.328 -143 V 0.390 -144 T 0.442 -145 D 0.469 -146 L 0.474 -147 P 0.477 -148 E 0.491 -149 D 0.508 -150 V 0.517 -151 K 0.519 -152 W 0.524 -153 I 0.528 -154 D 0.515 -155 I 0.483 -156 T 0.457 -157 P 0.457 -158 D 0.478 -159 M 0.504 -160 M 0.527 -161 V 0.542 -162 Q 0.543 -163 E 0.535 -164 R 0.525 -165 P 0.521 -166 L 0.515 -167 D 0.495 -168 V 0.455 -169 D 0.412 -170 C 0.385 -171 K 0.384 -172 R 0.396 -173 L 0.402 -174 S 0.399 -175 P 0.385 -176 D 0.352 -177 R 0.297 -178 C 0.233 -179 K 0.184 -180 C 0.163 -181 K 0.166 -182 K 0.173 -183 V 0.171 -184 K 0.152 -185 P 0.121 -186 T 0.088 -187 L 0.061 -188 A 0.045 -189 T 0.037 -190 Y 0.034 -191 L 0.037 -192 S 0.044 -193 K 0.051 -194 N 0.053 -195 Y 0.047 -196 S 0.038 -197 Y 0.031 -198 V 0.029 -199 I 0.030 -200 H 0.032 -201 A 0.034 -202 K 0.034 -203 I 0.037 -204 K 0.044 -205 A 0.056 -206 V 0.071 -207 Q 0.085 -208 R 0.097 -209 S 0.105 -210 G 0.106 -211 C 0.099 -212 N 0.086 -213 E 0.070 -214 V 0.055 -215 T 0.042 -216 T 0.032 -217 V 0.026 -218 V 0.024 -219 D 0.024 -220 V 0.026 -221 K 0.030 -222 E 0.036 -223 I 0.041 -224 F 0.046 -225 K 0.053 -226 S 0.065 -227 S 0.078 -228 S 0.089 -229 P 0.100 -230 I 0.109 -231 P 0.107 -232 R 0.093 -233 T 0.078 -234 Q 0.070 -235 V 0.067 -236 P 0.064 -237 L 0.067 -238 I 0.078 -239 T 0.091 -240 N 0.097 -241 S 0.093 -242 S 0.083 -243 C 0.072 -244 Q 0.066 -245 C 0.067 -246 P 0.076 -247 H 0.088 -248 I 0.094 -249 L 0.091 -250 P 0.085 -251 H 0.080 -252 Q 0.075 -253 D 0.066 -254 V 0.056 -255 L 0.046 -256 I 0.040 -257 M 0.034 -258 C 0.031 -259 Y 0.032 -260 E 0.041 -261 W 0.055 -262 R 0.069 -263 S 0.080 -264 R 0.087 -265 M 0.087 -266 M 0.084 -267 L 0.085 -268 L 0.089 -269 E 0.087 -270 N 0.073 -271 C 0.057 -272 L 0.048 -273 V 0.048 -274 E 0.053 -275 K 0.059 -276 W 0.062 -277 R 0.066 -278 D 0.077 -279 Q 0.094 -280 L 0.106 -281 S 0.107 -282 K 0.099 -283 R 0.090 -284 S 0.088 -285 I 0.087 -286 Q 0.082 -287 W 0.074 -288 E 0.068 -289 E 0.065 -290 R 0.065 -291 L 0.069 -292 Q 0.077 -293 E 0.089 -294 Q 0.103 -295 R 0.122 -296 R 0.148 -297 T 0.181 -298 V 0.216 -299 Q 0.249 -300 D 0.276 -301 K 0.297 -302 K 0.320 -303 K 0.354 -304 T 0.412 -305 A 0.487 -306 G 0.561 -307 R 0.614 -308 T 0.641 -309 S 0.642 -310 R 0.624 -311 S 0.600 -312 N 0.585 -313 P 0.585 -314 P 0.600 -315 K 0.623 -316 P 0.643 -317 K 0.653 -318 G 0.651 -319 K 0.646 -320 P 0.642 -321 P 0.638 -322 A 0.638 -323 P 0.645 -324 K 0.652 -325 P 0.654 -326 A 0.653 -327 S 0.649 -328 P 0.625 -329 K 0.582 -330 K 0.556 -331 N 0.561 -332 I 0.569 -333 K 0.579 -334 T 0.609 -335 R 0.630 -336 S 0.610 -337 A 0.588 -338 Q 0.607 -339 K 0.646 -340 R 0.666 -341 T 0.667 -342 N 0.664 -343 P 0.654 -344 K 0.626 -345 R 0.578 -346 V 0.536 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000106483.13_ENST00000436072.7_GN:SFRP4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000106483.13_ENST00000436072.7_GN:SFRP4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid deleted file mode 100644 index 91003071b00594f3e6da07645802c5b40475f203..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000106483.13_ENST00000436072.7_GN:SFRP4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid +++ /dev/null @@ -1,369 +0,0 @@ ->ENSG00000106483.13|ENST00000436072.7|GN:SFRP4|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:22 -1 M 0.391 -2 R 0.416 -3 V 0.450 -4 A 0.462 -5 G 0.433 -6 R 0.398 -7 E 0.419 -8 G 0.496 -9 R 0.571 -10 F 0.612 -11 L 0.637 -12 S 0.660 -13 A 0.678 -14 G 0.689 -15 V 0.691 -16 A 0.677 -17 A 0.645 -18 R 0.611 -19 E 0.589 -20 G 0.567 -21 S 0.515 -22 A 0.431 -23 M 0.341 -24 F 0.268 -25 L 0.221 -26 S 0.197 -27 I 0.190 -28 L 0.187 -29 V 0.181 -30 A 0.173 -31 L 0.167 -32 C 0.159 -33 L 0.150 -34 W 0.143 -35 L 0.143 -36 H 0.157 -37 L 0.188 -38 A 0.236 -39 L 0.296 -40 G 0.352 -41 V 0.386 -42 R 0.383 -43 G 0.336 -44 A 0.259 -45 P 0.177 -46 C 0.113 -47 E 0.075 -48 A 0.057 -49 V 0.049 -50 R 0.045 -51 I 0.043 -52 P 0.043 -53 M 0.043 -54 C 0.046 -55 R 0.051 -56 H 0.057 -57 M 0.058 -58 P 0.057 -59 W 0.058 -60 N 0.067 -61 I 0.081 -62 T 0.090 -63 R 0.086 -64 M 0.075 -65 P 0.070 -66 N 0.077 -67 H 0.094 -68 L 0.110 -69 H 0.122 -70 H 0.128 -71 S 0.133 -72 T 0.139 -73 Q 0.140 -74 E 0.136 -75 N 0.130 -76 A 0.126 -77 I 0.121 -78 L 0.114 -79 A 0.104 -80 I 0.093 -81 E 0.085 -82 Q 0.082 -83 Y 0.082 -84 E 0.080 -85 E 0.078 -86 L 0.081 -87 V 0.089 -88 D 0.097 -89 V 0.101 -90 N 0.101 -91 C 0.100 -92 S 0.094 -93 A 0.083 -94 V 0.072 -95 L 0.060 -96 R 0.049 -97 F 0.042 -98 F 0.044 -99 L 0.050 -100 C 0.055 -101 A 0.058 -102 M 0.057 -103 Y 0.054 -104 A 0.050 -105 P 0.047 -106 I 0.045 -107 C 0.044 -108 T 0.045 -109 L 0.049 -110 E 0.059 -111 F 0.071 -112 L 0.086 -113 H 0.105 -114 D 0.127 -115 P 0.141 -116 I 0.141 -117 K 0.126 -118 P 0.102 -119 C 0.077 -120 K 0.062 -121 S 0.058 -122 V 0.055 -123 C 0.051 -124 Q 0.050 -125 R 0.055 -126 A 0.061 -127 R 0.063 -128 D 0.062 -129 D 0.060 -130 C 0.056 -131 E 0.053 -132 P 0.053 -133 L 0.058 -134 M 0.063 -135 K 0.066 -136 M 0.071 -137 Y 0.083 -138 N 0.103 -139 H 0.124 -140 S 0.133 -141 W 0.127 -142 P 0.111 -143 E 0.094 -144 S 0.079 -145 L 0.067 -146 A 0.058 -147 C 0.055 -148 D 0.056 -149 E 0.061 -150 L 0.070 -151 P 0.081 -152 V 0.094 -153 Y 0.107 -154 D 0.112 -155 R 0.105 -156 G 0.092 -157 V 0.088 -158 C 0.097 -159 I 0.113 -160 S 0.138 -161 P 0.174 -162 E 0.222 -163 A 0.278 -164 I 0.340 -165 V 0.403 -166 T 0.455 -167 D 0.480 -168 L 0.483 -169 P 0.485 -170 E 0.499 -171 D 0.515 -172 V 0.522 -173 K 0.524 -174 W 0.529 -175 I 0.533 -176 D 0.520 -177 I 0.488 -178 T 0.462 -179 P 0.461 -180 D 0.482 -181 M 0.509 -182 M 0.534 -183 V 0.551 -184 Q 0.555 -185 E 0.546 -186 R 0.534 -187 P 0.527 -188 L 0.520 -189 D 0.498 -190 V 0.458 -191 D 0.413 -192 C 0.385 -193 K 0.385 -194 R 0.397 -195 L 0.403 -196 S 0.399 -197 P 0.384 -198 D 0.351 -199 R 0.296 -200 C 0.231 -201 K 0.182 -202 C 0.162 -203 K 0.164 -204 K 0.171 -205 V 0.170 -206 K 0.151 -207 P 0.120 -208 T 0.087 -209 L 0.061 -210 A 0.045 -211 T 0.037 -212 Y 0.035 -213 L 0.037 -214 S 0.044 -215 K 0.052 -216 N 0.053 -217 Y 0.048 -218 S 0.039 -219 Y 0.032 -220 V 0.029 -221 I 0.031 -222 H 0.033 -223 A 0.035 -224 K 0.035 -225 I 0.037 -226 K 0.045 -227 A 0.057 -228 V 0.071 -229 Q 0.085 -230 R 0.097 -231 S 0.104 -232 G 0.105 -233 C 0.098 -234 N 0.085 -235 E 0.070 -236 V 0.055 -237 T 0.041 -238 T 0.032 -239 V 0.026 -240 V 0.024 -241 D 0.024 -242 V 0.026 -243 K 0.030 -244 E 0.036 -245 I 0.041 -246 F 0.046 -247 K 0.053 -248 S 0.064 -249 S 0.077 -250 S 0.087 -251 P 0.099 -252 I 0.108 -253 P 0.106 -254 R 0.092 -255 T 0.078 -256 Q 0.070 -257 V 0.067 -258 P 0.064 -259 L 0.067 -260 I 0.079 -261 T 0.092 -262 N 0.098 -263 S 0.093 -264 S 0.083 -265 C 0.072 -266 Q 0.066 -267 C 0.067 -268 P 0.077 -269 H 0.089 -270 I 0.095 -271 L 0.092 -272 P 0.086 -273 H 0.081 -274 Q 0.076 -275 D 0.067 -276 V 0.056 -277 L 0.047 -278 I 0.040 -279 M 0.035 -280 C 0.031 -281 Y 0.033 -282 E 0.041 -283 W 0.055 -284 R 0.069 -285 S 0.081 -286 R 0.088 -287 M 0.089 -288 M 0.086 -289 L 0.086 -290 L 0.091 -291 E 0.089 -292 N 0.075 -293 C 0.059 -294 L 0.049 -295 V 0.049 -296 E 0.054 -297 K 0.060 -298 W 0.063 -299 R 0.068 -300 D 0.079 -301 Q 0.095 -302 L 0.107 -303 S 0.108 -304 K 0.100 -305 R 0.091 -306 S 0.089 -307 I 0.089 -308 Q 0.084 -309 W 0.075 -310 E 0.068 -311 E 0.065 -312 R 0.065 -313 L 0.069 -314 Q 0.078 -315 E 0.089 -316 Q 0.104 -317 R 0.123 -318 R 0.149 -319 T 0.182 -320 V 0.218 -321 Q 0.251 -322 D 0.278 -323 K 0.300 -324 K 0.322 -325 K 0.355 -326 T 0.411 -327 A 0.486 -328 G 0.560 -329 R 0.614 -330 T 0.641 -331 S 0.644 -332 R 0.627 -333 S 0.603 -334 N 0.587 -335 P 0.588 -336 P 0.604 -337 K 0.628 -338 P 0.649 -339 K 0.659 -340 G 0.659 -341 K 0.654 -342 P 0.650 -343 P 0.647 -344 A 0.648 -345 P 0.656 -346 K 0.665 -347 P 0.669 -348 A 0.670 -349 S 0.667 -350 P 0.644 -351 K 0.601 -352 K 0.572 -353 N 0.572 -354 I 0.576 -355 K 0.584 -356 T 0.615 -357 R 0.635 -358 S 0.615 -359 A 0.593 -360 Q 0.614 -361 K 0.655 -362 R 0.677 -363 T 0.678 -364 N 0.673 -365 P 0.662 -366 K 0.635 -367 R 0.589 -368 V 0.550 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000108576.11_ENST00000650711.1_GN:SLC6A4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000108576.11_ENST00000650711.1_GN:SLC6A4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 1a11d35806f3f7963b4c1e0c03b2134922619fab..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000108576.11_ENST00000650711.1_GN:SLC6A4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,631 +0,0 @@ ->ENSG00000108576.11|ENST00000650711.1|GN:SLC6A4|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.357 -2 E 0.373 -3 T 0.403 -4 T 0.444 -5 P 0.479 -6 L 0.496 -7 N 0.495 -8 S 0.473 -9 Q 0.441 -10 K 0.433 -11 Q 0.463 -12 L 0.499 -13 S 0.517 -14 A 0.525 -15 C 0.543 -16 E 0.571 -17 D 0.601 -18 G 0.629 -19 E 0.649 -20 D 0.656 -21 C 0.650 -22 Q 0.646 -23 E 0.654 -24 N 0.665 -25 G 0.654 -26 V 0.600 -27 L 0.505 -28 Q 0.421 -29 K 0.407 -30 V 0.450 -31 V 0.494 -32 P 0.525 -33 T 0.566 -34 P 0.621 -35 G 0.673 -36 D 0.706 -37 K 0.717 -38 V 0.712 -39 E 0.702 -40 S 0.694 -41 G 0.682 -42 Q 0.646 -43 I 0.591 -44 S 0.563 -45 N 0.583 -46 G 0.602 -47 Y 0.583 -48 S 0.564 -49 A 0.584 -50 V 0.621 -51 P 0.654 -52 S 0.685 -53 P 0.719 -54 G 0.742 -55 A 0.751 -56 G 0.747 -57 D 0.735 -58 D 0.714 -59 T 0.683 -60 R 0.650 -61 H 0.628 -62 S 0.631 -63 I 0.652 -64 P 0.677 -65 A 0.695 -66 T 0.688 -67 T 0.649 -68 T 0.593 -69 T 0.552 -70 L 0.541 -71 V 0.545 -72 A 0.546 -73 E 0.535 -74 L 0.514 -75 H 0.484 -76 Q 0.446 -77 G 0.395 -78 E 0.333 -79 R 0.269 -80 E 0.213 -81 T 0.172 -82 W 0.140 -83 G 0.113 -84 K 0.093 -85 K 0.082 -86 V 0.079 -87 D 0.077 -88 F 0.070 -89 L 0.063 -90 L 0.065 -91 S 0.075 -92 V 0.085 -93 I 0.096 -94 G 0.112 -95 Y 0.127 -96 A 0.128 -97 V 0.115 -98 D 0.105 -99 L 0.110 -100 G 0.122 -101 N 0.127 -102 V 0.119 -103 W 0.110 -104 R 0.109 -105 F 0.111 -106 P 0.109 -107 Y 0.099 -108 I 0.089 -109 C 0.081 -110 Y 0.080 -111 Q 0.088 -112 N 0.100 -113 G 0.104 -114 G 0.095 -115 G 0.079 -116 A 0.064 -117 F 0.054 -118 L 0.048 -119 L 0.049 -120 P 0.054 -121 Y 0.056 -122 T 0.052 -123 I 0.049 -124 M 0.048 -125 A 0.046 -126 I 0.044 -127 F 0.047 -128 G 0.056 -129 G 0.063 -130 I 0.064 -131 P 0.061 -132 L 0.058 -133 F 0.055 -134 Y 0.053 -135 M 0.057 -136 E 0.065 -137 L 0.072 -138 A 0.077 -139 L 0.078 -140 G 0.076 -141 Q 0.076 -142 Y 0.080 -143 H 0.087 -144 R 0.092 -145 N 0.095 -146 G 0.098 -147 C 0.097 -148 I 0.089 -149 S 0.076 -150 I 0.064 -151 W 0.056 -152 R 0.052 -153 K 0.049 -154 I 0.049 -155 C 0.050 -156 P 0.054 -157 I 0.061 -158 F 0.070 -159 K 0.081 -160 G 0.095 -161 I 0.105 -162 G 0.104 -163 Y 0.094 -164 A 0.088 -165 I 0.088 -166 C 0.088 -167 I 0.083 -168 I 0.077 -169 A 0.073 -170 F 0.071 -171 Y 0.071 -172 I 0.071 -173 A 0.069 -174 S 0.064 -175 Y 0.061 -176 Y 0.062 -177 N 0.062 -178 T 0.061 -179 I 0.060 -180 M 0.059 -181 A 0.058 -182 W 0.060 -183 A 0.066 -184 L 0.072 -185 Y 0.076 -186 Y 0.081 -187 L 0.085 -188 I 0.089 -189 S 0.094 -190 S 0.098 -191 F 0.097 -192 T 0.094 -193 D 0.095 -194 Q 0.098 -195 L 0.101 -196 P 0.101 -197 W 0.100 -198 T 0.103 -199 S 0.113 -200 C 0.126 -201 K 0.136 -202 N 0.142 -203 S 0.145 -204 W 0.145 -205 N 0.148 -206 T 0.162 -207 G 0.183 -208 N 0.205 -209 C 0.217 -210 T 0.216 -211 N 0.210 -212 Y 0.205 -213 F 0.210 -214 S 0.228 -215 E 0.252 -216 D 0.270 -217 N 0.274 -218 I 0.269 -219 T 0.262 -220 W 0.255 -221 T 0.246 -222 L 0.237 -223 H 0.227 -224 S 0.215 -225 T 0.196 -226 S 0.174 -227 P 0.154 -228 A 0.139 -229 E 0.133 -230 E 0.131 -231 F 0.130 -232 Y 0.130 -233 T 0.141 -234 R 0.161 -235 H 0.177 -236 V 0.178 -237 L 0.169 -238 Q 0.166 -239 I 0.177 -240 H 0.202 -241 R 0.228 -242 S 0.240 -243 K 0.237 -244 G 0.223 -245 L 0.204 -246 Q 0.188 -247 D 0.182 -248 L 0.188 -249 G 0.200 -250 G 0.202 -251 I 0.182 -252 S 0.142 -253 W 0.105 -254 Q 0.090 -255 L 0.094 -256 A 0.106 -257 L 0.124 -258 C 0.148 -259 I 0.164 -260 M 0.164 -261 L 0.157 -262 I 0.150 -263 F 0.137 -264 T 0.115 -265 V 0.095 -266 I 0.083 -267 Y 0.075 -268 F 0.070 -269 S 0.069 -270 I 0.070 -271 W 0.074 -272 K 0.079 -273 G 0.081 -274 V 0.081 -275 K 0.085 -276 T 0.094 -277 S 0.105 -278 G 0.113 -279 K 0.125 -280 V 0.136 -281 V 0.130 -282 W 0.104 -283 V 0.081 -284 T 0.072 -285 A 0.069 -286 T 0.066 -287 F 0.066 -288 P 0.072 -289 Y 0.081 -290 I 0.088 -291 I 0.084 -292 L 0.071 -293 S 0.055 -294 V 0.046 -295 L 0.046 -296 L 0.049 -297 V 0.054 -298 R 0.059 -299 G 0.066 -300 A 0.075 -301 T 0.088 -302 L 0.105 -303 P 0.116 -304 G 0.112 -305 A 0.095 -306 W 0.075 -307 R 0.060 -308 G 0.050 -309 V 0.044 -310 L 0.041 -311 F 0.038 -312 Y 0.036 -313 L 0.036 -314 K 0.038 -315 P 0.041 -316 N 0.043 -317 W 0.042 -318 Q 0.043 -319 K 0.046 -320 L 0.050 -321 L 0.053 -322 E 0.055 -323 T 0.057 -324 G 0.061 -325 V 0.063 -326 W 0.063 -327 I 0.066 -328 D 0.075 -329 A 0.084 -330 A 0.089 -331 A 0.095 -332 Q 0.102 -333 I 0.102 -334 F 0.097 -335 F 0.100 -336 S 0.114 -337 L 0.130 -338 G 0.142 -339 P 0.151 -340 G 0.164 -341 F 0.182 -342 G 0.194 -343 V 0.190 -344 L 0.172 -345 L 0.157 -346 A 0.149 -347 F 0.145 -348 A 0.135 -349 S 0.118 -350 Y 0.100 -351 N 0.085 -352 K 0.075 -353 F 0.073 -354 N 0.078 -355 N 0.082 -356 N 0.077 -357 C 0.067 -358 Y 0.060 -359 Q 0.065 -360 D 0.076 -361 A 0.083 -362 L 0.086 -363 V 0.096 -364 T 0.112 -365 S 0.117 -366 V 0.110 -367 V 0.105 -368 N 0.107 -369 C 0.108 -370 M 0.109 -371 T 0.116 -372 S 0.124 -373 F 0.129 -374 V 0.131 -375 S 0.129 -376 G 0.124 -377 F 0.121 -378 V 0.120 -379 I 0.117 -380 F 0.109 -381 T 0.100 -382 V 0.096 -383 L 0.098 -384 G 0.100 -385 Y 0.095 -386 M 0.084 -387 A 0.078 -388 E 0.080 -389 M 0.088 -390 R 0.101 -391 N 0.118 -392 E 0.130 -393 D 0.133 -394 V 0.128 -395 S 0.123 -396 E 0.125 -397 V 0.134 -398 A 0.144 -399 K 0.149 -400 D 0.151 -401 A 0.148 -402 G 0.135 -403 P 0.118 -404 S 0.105 -405 L 0.094 -406 L 0.082 -407 F 0.070 -408 I 0.065 -409 T 0.065 -410 Y 0.063 -411 A 0.062 -412 E 0.063 -413 A 0.066 -414 I 0.068 -415 A 0.071 -416 N 0.075 -417 M 0.077 -418 P 0.072 -419 A 0.062 -420 S 0.051 -421 T 0.043 -422 F 0.039 -423 F 0.041 -424 A 0.045 -425 I 0.050 -426 I 0.055 -427 F 0.063 -428 F 0.071 -429 L 0.080 -430 M 0.086 -431 L 0.089 -432 I 0.090 -433 T 0.092 -434 L 0.099 -435 G 0.110 -436 L 0.124 -437 D 0.141 -438 S 0.155 -439 T 0.155 -440 F 0.139 -441 A 0.119 -442 G 0.108 -443 L 0.104 -444 E 0.100 -445 G 0.092 -446 V 0.081 -447 I 0.073 -448 T 0.068 -449 A 0.065 -450 V 0.060 -451 L 0.054 -452 D 0.049 -453 E 0.046 -454 F 0.044 -455 P 0.039 -456 H 0.033 -457 V 0.032 -458 W 0.036 -459 A 0.042 -460 K 0.043 -461 R 0.039 -462 R 0.035 -463 E 0.033 -464 R 0.035 -465 F 0.041 -466 V 0.048 -467 L 0.053 -468 A 0.058 -469 V 0.065 -470 V 0.065 -471 I 0.060 -472 T 0.056 -473 C 0.056 -474 F 0.059 -475 F 0.064 -476 G 0.070 -477 S 0.074 -478 L 0.075 -479 V 0.077 -480 T 0.082 -481 L 0.089 -482 T 0.099 -483 F 0.106 -484 G 0.106 -485 G 0.097 -486 A 0.084 -487 Y 0.077 -488 V 0.077 -489 V 0.084 -490 K 0.098 -491 L 0.116 -492 L 0.129 -493 E 0.132 -494 E 0.126 -495 Y 0.113 -496 A 0.098 -497 T 0.086 -498 G 0.078 -499 P 0.073 -500 A 0.070 -501 V 0.071 -502 L 0.074 -503 T 0.078 -504 V 0.080 -505 A 0.076 -506 L 0.068 -507 I 0.062 -508 E 0.059 -509 A 0.054 -510 V 0.045 -511 A 0.040 -512 V 0.040 -513 S 0.043 -514 W 0.045 -515 F 0.046 -516 Y 0.047 -517 G 0.048 -518 I 0.045 -519 T 0.040 -520 Q 0.038 -521 F 0.039 -522 C 0.041 -523 R 0.045 -524 D 0.052 -525 V 0.058 -526 K 0.060 -527 E 0.061 -528 M 0.064 -529 L 0.070 -530 G 0.081 -531 F 0.097 -532 S 0.107 -533 P 0.100 -534 G 0.078 -535 W 0.055 -536 F 0.041 -537 W 0.037 -538 R 0.038 -539 I 0.038 -540 C 0.041 -541 W 0.048 -542 V 0.055 -543 A 0.057 -544 I 0.058 -545 S 0.057 -546 P 0.053 -547 L 0.048 -548 F 0.046 -549 L 0.045 -550 L 0.047 -551 F 0.054 -552 I 0.063 -553 I 0.068 -554 C 0.072 -555 S 0.079 -556 F 0.090 -557 L 0.102 -558 M 0.119 -559 S 0.141 -560 P 0.160 -561 P 0.170 -562 Q 0.174 -563 L 0.178 -564 R 0.179 -565 L 0.174 -566 F 0.166 -567 Q 0.163 -568 Y 0.164 -569 N 0.156 -570 Y 0.132 -571 P 0.102 -572 Y 0.081 -573 W 0.077 -574 S 0.085 -575 I 0.094 -576 I 0.100 -577 L 0.112 -578 G 0.129 -579 Y 0.145 -580 C 0.165 -581 I 0.200 -582 G 0.240 -583 T 0.262 -584 S 0.249 -585 S 0.212 -586 F 0.166 -587 I 0.126 -588 C 0.101 -589 I 0.089 -590 P 0.078 -591 T 0.065 -592 Y 0.057 -593 I 0.055 -594 A 0.054 -595 Y 0.053 -596 R 0.058 -597 L 0.068 -598 I 0.085 -599 I 0.106 -600 T 0.126 -601 P 0.132 -602 G 0.125 -603 T 0.114 -604 F 0.107 -605 K 0.105 -606 E 0.108 -607 R 0.115 -608 I 0.126 -609 I 0.139 -610 K 0.150 -611 S 0.157 -612 I 0.159 -613 T 0.161 -614 P 0.173 -615 E 0.200 -616 T 0.237 -617 P 0.279 -618 T 0.321 -619 E 0.358 -620 I 0.381 -621 P 0.386 -622 C 0.376 -623 G 0.362 -624 D 0.345 -625 I 0.324 -626 R 0.303 -627 L 0.294 -628 N 0.303 -629 A 0.326 -630 V 0.346 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000108576.11_ENST00000650711.1_GN:SLC6A4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:42.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000108576.11_ENST00000650711.1_GN:SLC6A4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:42.caid deleted file mode 100644 index 588144cf5c5d45134ce5a6183daf94615580057e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000108576.11_ENST00000650711.1_GN:SLC6A4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:42.caid +++ /dev/null @@ -1,673 +0,0 @@ ->ENSG00000108576.11|ENST00000650711.1|GN:SLC6A4|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:42 -1 M 0.332 -2 S 0.348 -3 Q 0.374 -4 S 0.395 -5 R 0.397 -6 R 0.395 -7 V 0.408 -8 N 0.425 -9 P 0.431 -10 D 0.448 -11 D 0.493 -12 R 0.545 -13 E 0.577 -14 L 0.594 -15 G 0.613 -16 G 0.629 -17 D 0.630 -18 P 0.613 -19 Q 0.575 -20 I 0.531 -21 Q 0.520 -22 A 0.564 -23 P 0.632 -24 R 0.681 -25 D 0.706 -26 Q 0.719 -27 L 0.726 -28 G 0.725 -29 S 0.719 -30 L 0.712 -31 A 0.703 -32 D 0.690 -33 G 0.670 -34 H 0.635 -35 Q 0.575 -36 C 0.501 -37 H 0.450 -38 L 0.436 -39 L 0.434 -40 T 0.426 -41 S 0.435 -42 R 0.475 -43 M 0.527 -44 E 0.567 -45 T 0.596 -46 T 0.622 -47 P 0.645 -48 L 0.661 -49 N 0.658 -50 S 0.623 -51 Q 0.571 -52 K 0.554 -53 Q 0.592 -54 L 0.648 -55 S 0.686 -56 A 0.707 -57 C 0.724 -58 E 0.737 -59 D 0.749 -60 G 0.758 -61 E 0.763 -62 D 0.758 -63 C 0.750 -64 Q 0.747 -65 E 0.751 -66 N 0.753 -67 G 0.737 -68 V 0.690 -69 L 0.624 -70 Q 0.584 -71 K 0.599 -72 V 0.630 -73 V 0.638 -74 P 0.640 -75 T 0.664 -76 P 0.703 -77 G 0.742 -78 D 0.767 -79 K 0.777 -80 V 0.776 -81 E 0.772 -82 S 0.767 -83 G 0.749 -84 Q 0.702 -85 I 0.637 -86 S 0.604 -87 N 0.623 -88 G 0.643 -89 Y 0.623 -90 S 0.603 -91 A 0.629 -92 V 0.678 -93 P 0.716 -94 S 0.742 -95 P 0.763 -96 G 0.774 -97 A 0.776 -98 G 0.769 -99 D 0.756 -100 D 0.733 -101 T 0.697 -102 R 0.657 -103 H 0.630 -104 S 0.629 -105 I 0.646 -106 P 0.667 -107 A 0.679 -108 T 0.666 -109 T 0.618 -110 T 0.552 -111 T 0.501 -112 L 0.479 -113 V 0.475 -114 A 0.472 -115 E 0.463 -116 L 0.449 -117 H 0.434 -118 Q 0.414 -119 G 0.381 -120 E 0.331 -121 R 0.273 -122 E 0.220 -123 T 0.178 -124 W 0.144 -125 G 0.115 -126 K 0.093 -127 K 0.081 -128 V 0.077 -129 D 0.075 -130 F 0.068 -131 L 0.061 -132 L 0.062 -133 S 0.071 -134 V 0.080 -135 I 0.091 -136 G 0.108 -137 Y 0.124 -138 A 0.125 -139 V 0.112 -140 D 0.101 -141 L 0.104 -142 G 0.116 -143 N 0.122 -144 V 0.116 -145 W 0.108 -146 R 0.108 -147 F 0.111 -148 P 0.107 -149 Y 0.097 -150 I 0.087 -151 C 0.081 -152 Y 0.081 -153 Q 0.089 -154 N 0.102 -155 G 0.107 -156 G 0.099 -157 G 0.083 -158 A 0.067 -159 F 0.056 -160 L 0.049 -161 L 0.049 -162 P 0.053 -163 Y 0.055 -164 T 0.052 -165 I 0.048 -166 M 0.047 -167 A 0.045 -168 I 0.044 -169 F 0.048 -170 G 0.056 -171 G 0.063 -172 I 0.065 -173 P 0.063 -174 L 0.060 -175 F 0.057 -176 Y 0.056 -177 M 0.060 -178 E 0.068 -179 L 0.074 -180 A 0.078 -181 L 0.079 -182 G 0.078 -183 Q 0.080 -184 Y 0.085 -185 H 0.092 -186 R 0.096 -187 N 0.098 -188 G 0.098 -189 C 0.096 -190 I 0.087 -191 S 0.073 -192 I 0.061 -193 W 0.053 -194 R 0.049 -195 K 0.048 -196 I 0.047 -197 C 0.048 -198 P 0.051 -199 I 0.057 -200 F 0.066 -201 K 0.077 -202 G 0.092 -203 I 0.102 -204 G 0.101 -205 Y 0.093 -206 A 0.089 -207 I 0.091 -208 C 0.092 -209 I 0.087 -210 I 0.080 -211 A 0.075 -212 F 0.073 -213 Y 0.071 -214 I 0.072 -215 A 0.070 -216 S 0.065 -217 Y 0.061 -218 Y 0.062 -219 N 0.062 -220 T 0.061 -221 I 0.060 -222 M 0.059 -223 A 0.059 -224 W 0.061 -225 A 0.067 -226 L 0.072 -227 Y 0.077 -228 Y 0.081 -229 L 0.085 -230 I 0.087 -231 S 0.091 -232 S 0.095 -233 F 0.094 -234 T 0.090 -235 D 0.090 -236 Q 0.094 -237 L 0.097 -238 P 0.097 -239 W 0.096 -240 T 0.098 -241 S 0.107 -242 C 0.120 -243 K 0.130 -244 N 0.136 -245 S 0.139 -246 W 0.138 -247 N 0.141 -248 T 0.155 -249 G 0.177 -250 N 0.200 -251 C 0.212 -252 T 0.212 -253 N 0.205 -254 Y 0.201 -255 F 0.206 -256 S 0.224 -257 E 0.248 -258 D 0.266 -259 N 0.271 -260 I 0.267 -261 T 0.260 -262 W 0.252 -263 T 0.244 -264 L 0.236 -265 H 0.228 -266 S 0.218 -267 T 0.199 -268 S 0.176 -269 P 0.155 -270 A 0.140 -271 E 0.134 -272 E 0.133 -273 F 0.131 -274 Y 0.131 -275 T 0.141 -276 R 0.161 -277 H 0.177 -278 V 0.180 -279 L 0.174 -280 Q 0.172 -281 I 0.184 -282 H 0.209 -283 R 0.235 -284 S 0.248 -285 K 0.246 -286 G 0.232 -287 L 0.214 -288 Q 0.197 -289 D 0.189 -290 L 0.194 -291 G 0.205 -292 G 0.207 -293 I 0.185 -294 S 0.144 -295 W 0.106 -296 Q 0.091 -297 L 0.095 -298 A 0.106 -299 L 0.123 -300 C 0.147 -301 I 0.164 -302 M 0.165 -303 L 0.158 -304 I 0.151 -305 F 0.138 -306 T 0.117 -307 V 0.097 -308 I 0.085 -309 Y 0.078 -310 F 0.074 -311 S 0.074 -312 I 0.076 -313 W 0.080 -314 K 0.084 -315 G 0.086 -316 V 0.086 -317 K 0.090 -318 T 0.100 -319 S 0.110 -320 G 0.117 -321 K 0.129 -322 V 0.140 -323 V 0.133 -324 W 0.107 -325 V 0.082 -326 T 0.073 -327 A 0.071 -328 T 0.068 -329 F 0.068 -330 P 0.073 -331 Y 0.083 -332 I 0.089 -333 I 0.086 -334 L 0.072 -335 S 0.056 -336 V 0.047 -337 L 0.046 -338 L 0.050 -339 V 0.055 -340 R 0.061 -341 G 0.068 -342 A 0.078 -343 T 0.092 -344 L 0.110 -345 P 0.121 -346 G 0.117 -347 A 0.100 -348 W 0.079 -349 R 0.064 -350 G 0.053 -351 V 0.047 -352 L 0.043 -353 F 0.039 -354 Y 0.037 -355 L 0.037 -356 K 0.040 -357 P 0.043 -358 N 0.044 -359 W 0.043 -360 Q 0.043 -361 K 0.046 -362 L 0.050 -363 L 0.053 -364 E 0.054 -365 T 0.056 -366 G 0.059 -367 V 0.061 -368 W 0.061 -369 I 0.064 -370 D 0.074 -371 A 0.083 -372 A 0.088 -373 A 0.094 -374 Q 0.101 -375 I 0.101 -376 F 0.096 -377 F 0.099 -378 S 0.111 -379 L 0.126 -380 G 0.138 -381 P 0.148 -382 G 0.161 -383 F 0.179 -384 G 0.192 -385 V 0.187 -386 L 0.170 -387 L 0.155 -388 A 0.148 -389 F 0.144 -390 A 0.134 -391 S 0.117 -392 Y 0.100 -393 N 0.085 -394 K 0.075 -395 F 0.073 -396 N 0.078 -397 N 0.081 -398 N 0.076 -399 C 0.066 -400 Y 0.059 -401 Q 0.063 -402 D 0.074 -403 A 0.081 -404 L 0.084 -405 V 0.095 -406 T 0.111 -407 S 0.116 -408 V 0.109 -409 V 0.104 -410 N 0.106 -411 C 0.106 -412 M 0.107 -413 T 0.113 -414 S 0.121 -415 F 0.125 -416 V 0.128 -417 S 0.126 -418 G 0.122 -419 F 0.119 -420 V 0.119 -421 I 0.116 -422 F 0.108 -423 T 0.099 -424 V 0.095 -425 L 0.097 -426 G 0.099 -427 Y 0.094 -428 M 0.084 -429 A 0.078 -430 E 0.080 -431 M 0.088 -432 R 0.102 -433 N 0.119 -434 E 0.132 -435 D 0.135 -436 V 0.130 -437 S 0.125 -438 E 0.127 -439 V 0.137 -440 A 0.146 -441 K 0.152 -442 D 0.154 -443 A 0.151 -444 G 0.138 -445 P 0.120 -446 S 0.107 -447 L 0.097 -448 L 0.084 -449 F 0.072 -450 I 0.067 -451 T 0.067 -452 Y 0.066 -453 A 0.064 -454 E 0.065 -455 A 0.069 -456 I 0.070 -457 A 0.073 -458 N 0.077 -459 M 0.079 -460 P 0.074 -461 A 0.064 -462 S 0.053 -463 T 0.045 -464 F 0.041 -465 F 0.042 -466 A 0.047 -467 I 0.051 -468 I 0.057 -469 F 0.065 -470 F 0.074 -471 L 0.082 -472 M 0.089 -473 L 0.092 -474 I 0.093 -475 T 0.094 -476 L 0.102 -477 G 0.114 -478 L 0.128 -479 D 0.145 -480 S 0.160 -481 T 0.159 -482 F 0.143 -483 A 0.123 -484 G 0.111 -485 L 0.108 -486 E 0.103 -487 G 0.095 -488 V 0.083 -489 I 0.074 -490 T 0.070 -491 A 0.067 -492 V 0.062 -493 L 0.056 -494 D 0.050 -495 E 0.048 -496 F 0.046 -497 P 0.041 -498 H 0.035 -499 V 0.033 -500 W 0.038 -501 A 0.044 -502 K 0.045 -503 R 0.041 -504 R 0.037 -505 E 0.034 -506 R 0.036 -507 F 0.043 -508 V 0.050 -509 L 0.054 -510 A 0.060 -511 V 0.066 -512 V 0.065 -513 I 0.059 -514 T 0.055 -515 C 0.056 -516 F 0.060 -517 F 0.066 -518 G 0.073 -519 S 0.077 -520 L 0.078 -521 V 0.080 -522 T 0.085 -523 L 0.092 -524 T 0.102 -525 F 0.109 -526 G 0.109 -527 G 0.099 -528 A 0.086 -529 Y 0.079 -530 V 0.079 -531 V 0.087 -532 K 0.101 -533 L 0.119 -534 L 0.131 -535 E 0.134 -536 E 0.128 -537 Y 0.114 -538 A 0.099 -539 T 0.086 -540 G 0.079 -541 P 0.074 -542 A 0.072 -543 V 0.073 -544 L 0.077 -545 T 0.081 -546 V 0.082 -547 A 0.078 -548 L 0.070 -549 I 0.063 -550 E 0.060 -551 A 0.055 -552 V 0.046 -553 A 0.041 -554 V 0.041 -555 S 0.044 -556 W 0.045 -557 F 0.046 -558 Y 0.048 -559 G 0.048 -560 I 0.045 -561 T 0.040 -562 Q 0.038 -563 F 0.039 -564 C 0.042 -565 R 0.046 -566 D 0.054 -567 V 0.060 -568 K 0.062 -569 E 0.062 -570 M 0.065 -571 L 0.071 -572 G 0.082 -573 F 0.098 -574 S 0.108 -575 P 0.100 -576 G 0.078 -577 W 0.055 -578 F 0.041 -579 W 0.038 -580 R 0.038 -581 I 0.039 -582 C 0.042 -583 W 0.049 -584 V 0.056 -585 A 0.058 -586 I 0.058 -587 S 0.058 -588 P 0.054 -589 L 0.049 -590 F 0.046 -591 L 0.046 -592 L 0.048 -593 F 0.054 -594 I 0.063 -595 I 0.069 -596 C 0.072 -597 S 0.080 -598 F 0.090 -599 L 0.102 -600 M 0.119 -601 S 0.142 -602 P 0.161 -603 P 0.170 -604 Q 0.174 -605 L 0.177 -606 R 0.179 -607 L 0.174 -608 F 0.166 -609 Q 0.164 -610 Y 0.165 -611 N 0.157 -612 Y 0.133 -613 P 0.103 -614 Y 0.082 -615 W 0.078 -616 S 0.086 -617 I 0.095 -618 I 0.101 -619 L 0.114 -620 G 0.131 -621 Y 0.148 -622 C 0.169 -623 I 0.204 -624 G 0.245 -625 T 0.267 -626 S 0.253 -627 S 0.214 -628 F 0.168 -629 I 0.126 -630 C 0.100 -631 I 0.088 -632 P 0.078 -633 T 0.065 -634 Y 0.056 -635 I 0.054 -636 A 0.053 -637 Y 0.053 -638 R 0.058 -639 L 0.068 -640 I 0.084 -641 I 0.106 -642 T 0.126 -643 P 0.132 -644 G 0.125 -645 T 0.114 -646 F 0.107 -647 K 0.106 -648 E 0.108 -649 R 0.116 -650 I 0.127 -651 I 0.139 -652 K 0.149 -653 S 0.155 -654 I 0.156 -655 T 0.157 -656 P 0.166 -657 E 0.190 -658 T 0.225 -659 P 0.266 -660 T 0.308 -661 E 0.345 -662 I 0.369 -663 P 0.375 -664 C 0.366 -665 G 0.352 -666 D 0.336 -667 I 0.317 -668 R 0.297 -669 L 0.288 -670 N 0.297 -671 A 0.320 -672 V 0.339 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000108688.11_ENST00000378569.2_GN:CCL7_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000108688.11_ENST00000378569.2_GN:CCL7_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index e50906b752811da7dfa505c3f882541fa7031727..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000108688.11_ENST00000378569.2_GN:CCL7_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,100 +0,0 @@ ->ENSG00000108688.11|ENST00000378569.2|GN:CCL7|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.381 -2 K 0.386 -3 A 0.389 -4 S 0.373 -5 A 0.327 -6 A 0.273 -7 L 0.241 -8 L 0.239 -9 C 0.253 -10 L 0.285 -11 L 0.345 -12 L 0.425 -13 T 0.500 -14 A 0.550 -15 A 0.570 -16 A 0.568 -17 F 0.567 -18 S 0.590 -19 P 0.639 -20 Q 0.690 -21 G 0.723 -22 L 0.730 -23 A 0.721 -24 Q 0.715 -25 P 0.721 -26 V 0.732 -27 G 0.732 -28 I 0.711 -29 N 0.663 -30 T 0.586 -31 S 0.477 -32 T 0.350 -33 T 0.229 -34 C 0.138 -35 C 0.088 -36 Y 0.071 -37 R 0.073 -38 F 0.078 -39 I 0.080 -40 N 0.084 -41 K 0.092 -42 K 0.099 -43 I 0.095 -44 P 0.082 -45 K 0.066 -46 Q 0.056 -47 R 0.050 -48 L 0.044 -49 E 0.040 -50 S 0.041 -51 Y 0.050 -52 R 0.068 -53 R 0.090 -54 T 0.109 -55 T 0.123 -56 S 0.129 -57 S 0.123 -58 H 0.108 -59 C 0.094 -60 P 0.086 -61 R 0.083 -62 E 0.075 -63 A 0.058 -64 V 0.038 -65 I 0.026 -66 F 0.024 -67 K 0.031 -68 T 0.043 -69 K 0.058 -70 L 0.074 -71 D 0.085 -72 K 0.086 -73 E 0.077 -74 I 0.066 -75 C 0.064 -76 A 0.070 -77 D 0.075 -78 P 0.070 -79 T 0.057 -80 Q 0.043 -81 K 0.034 -82 W 0.030 -83 V 0.029 -84 Q 0.031 -85 D 0.037 -86 F 0.047 -87 M 0.063 -88 K 0.078 -89 H 0.089 -90 L 0.103 -91 D 0.129 -92 K 0.170 -93 K 0.230 -94 T 0.305 -95 Q 0.383 -96 T 0.443 -97 P 0.463 -98 K 0.444 -99 L 0.415 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000108688.11_ENST00000378569.2_GN:CCL7_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000108688.11_ENST00000378569.2_GN:CCL7_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid deleted file mode 100644 index 1e87f55534982a7e964038c5401f750568d5624a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000108688.11_ENST00000378569.2_GN:CCL7_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid +++ /dev/null @@ -1,110 +0,0 @@ ->ENSG00000108688.11|ENST00000378569.2|GN:CCL7|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:10 -1 M 0.417 -2 W 0.451 -3 K 0.500 -4 P 0.546 -5 M 0.578 -6 P 0.600 -7 S 0.618 -8 P 0.632 -9 S 0.634 -10 N 0.621 -11 M 0.602 -12 K 0.591 -13 A 0.578 -14 S 0.537 -15 A 0.461 -16 A 0.376 -17 L 0.309 -18 L 0.274 -19 C 0.264 -20 L 0.283 -21 L 0.335 -22 L 0.411 -23 T 0.486 -24 A 0.540 -25 A 0.565 -26 A 0.567 -27 F 0.568 -28 S 0.592 -29 P 0.640 -30 Q 0.691 -31 G 0.725 -32 L 0.734 -33 A 0.726 -34 Q 0.719 -35 P 0.725 -36 V 0.737 -37 G 0.736 -38 I 0.714 -39 N 0.664 -40 T 0.582 -41 S 0.471 -42 T 0.344 -43 T 0.224 -44 C 0.135 -45 C 0.085 -46 Y 0.070 -47 R 0.072 -48 F 0.077 -49 I 0.080 -50 N 0.083 -51 K 0.091 -52 K 0.098 -53 I 0.094 -54 P 0.080 -55 K 0.065 -56 Q 0.055 -57 R 0.049 -58 L 0.045 -59 E 0.041 -60 S 0.041 -61 Y 0.050 -62 R 0.067 -63 R 0.088 -64 T 0.107 -65 T 0.120 -66 S 0.126 -67 S 0.119 -68 H 0.105 -69 C 0.091 -70 P 0.084 -71 R 0.081 -72 E 0.073 -73 A 0.057 -74 V 0.038 -75 I 0.026 -76 F 0.024 -77 K 0.031 -78 T 0.043 -79 K 0.058 -80 L 0.074 -81 D 0.085 -82 K 0.086 -83 E 0.077 -84 I 0.067 -85 C 0.065 -86 A 0.071 -87 D 0.076 -88 P 0.071 -89 T 0.058 -90 Q 0.044 -91 K 0.034 -92 W 0.030 -93 V 0.030 -94 Q 0.032 -95 D 0.037 -96 F 0.048 -97 M 0.064 -98 K 0.078 -99 H 0.089 -100 L 0.101 -101 D 0.125 -102 K 0.166 -103 K 0.227 -104 T 0.304 -105 Q 0.383 -106 T 0.443 -107 P 0.465 -108 K 0.448 -109 L 0.421 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000108700.5_ENST00000394620.2_GN:CCL8_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000108700.5_ENST00000394620.2_GN:CCL8_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index d91fa8e9ab2ff1aced0d5da34969103a52f54cc7..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000108700.5_ENST00000394620.2_GN:CCL8_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,100 +0,0 @@ ->ENSG00000108700.5|ENST00000394620.2|GN:CCL8|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.327 -2 K 0.310 -3 V 0.288 -4 S 0.267 -5 A 0.242 -6 A 0.216 -7 L 0.200 -8 L 0.197 -9 C 0.205 -10 L 0.224 -11 L 0.262 -12 L 0.317 -13 M 0.373 -14 A 0.419 -15 A 0.451 -16 T 0.474 -17 F 0.503 -18 S 0.554 -19 P 0.620 -20 Q 0.678 -21 G 0.712 -22 L 0.720 -23 A 0.711 -24 Q 0.703 -25 P 0.707 -26 D 0.711 -27 S 0.695 -28 V 0.650 -29 S 0.580 -30 I 0.493 -31 P 0.391 -32 I 0.283 -33 T 0.185 -34 C 0.114 -35 C 0.078 -36 F 0.071 -37 N 0.077 -38 V 0.082 -39 I 0.085 -40 N 0.090 -41 R 0.101 -42 K 0.108 -43 I 0.103 -44 P 0.086 -45 I 0.066 -46 Q 0.052 -47 R 0.045 -48 L 0.039 -49 E 0.035 -50 S 0.032 -51 Y 0.035 -52 T 0.044 -53 R 0.055 -54 I 0.064 -55 T 0.071 -56 N 0.076 -57 I 0.078 -58 Q 0.074 -59 C 0.069 -60 P 0.067 -61 K 0.066 -62 E 0.060 -63 A 0.046 -64 V 0.031 -65 I 0.022 -66 F 0.022 -67 K 0.030 -68 T 0.043 -69 K 0.061 -70 R 0.079 -71 G 0.093 -72 K 0.096 -73 E 0.088 -74 V 0.077 -75 C 0.074 -76 A 0.080 -77 D 0.085 -78 P 0.079 -79 K 0.064 -80 E 0.050 -81 R 0.042 -82 W 0.038 -83 V 0.037 -84 R 0.039 -85 D 0.045 -86 S 0.054 -87 M 0.064 -88 K 0.069 -89 H 0.065 -90 L 0.063 -91 D 0.072 -92 Q 0.088 -93 I 0.103 -94 F 0.118 -95 Q 0.143 -96 N 0.179 -97 L 0.217 -98 K 0.246 -99 P 0.259 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000108700.5_ENST00000394620.2_GN:CCL8_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000108700.5_ENST00000394620.2_GN:CCL8_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid deleted file mode 100644 index 8380d7d5954e8531091261039811826b9340caf3..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000108700.5_ENST00000394620.2_GN:CCL8_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid +++ /dev/null @@ -1,110 +0,0 @@ ->ENSG00000108700.5|ENST00000394620.2|GN:CCL8|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:10 -1 M 0.431 -2 L 0.457 -3 K 0.497 -4 L 0.534 -5 T 0.555 -6 P 0.560 -7 L 0.561 -8 P 0.567 -9 S 0.573 -10 K 0.567 -11 M 0.544 -12 K 0.510 -13 V 0.468 -14 S 0.413 -15 A 0.347 -16 A 0.284 -17 L 0.239 -18 L 0.221 -19 C 0.225 -20 L 0.240 -21 L 0.267 -22 L 0.309 -23 M 0.359 -24 A 0.403 -25 A 0.435 -26 T 0.459 -27 F 0.493 -28 S 0.547 -29 P 0.615 -30 Q 0.675 -31 G 0.712 -32 L 0.722 -33 A 0.715 -34 Q 0.709 -35 P 0.713 -36 D 0.717 -37 S 0.700 -38 V 0.652 -39 S 0.579 -40 I 0.488 -41 P 0.385 -42 I 0.278 -43 T 0.182 -44 C 0.112 -45 C 0.076 -46 F 0.069 -47 N 0.075 -48 V 0.080 -49 I 0.083 -50 N 0.089 -51 R 0.100 -52 K 0.107 -53 I 0.102 -54 P 0.085 -55 I 0.065 -56 Q 0.052 -57 R 0.044 -58 L 0.040 -59 E 0.035 -60 S 0.033 -61 Y 0.035 -62 T 0.043 -63 R 0.053 -64 I 0.061 -65 T 0.067 -66 N 0.072 -67 I 0.074 -68 Q 0.071 -69 C 0.067 -70 P 0.066 -71 K 0.065 -72 E 0.059 -73 A 0.046 -74 V 0.031 -75 I 0.022 -76 F 0.022 -77 K 0.029 -78 T 0.043 -79 K 0.060 -80 R 0.078 -81 G 0.092 -82 K 0.096 -83 E 0.089 -84 V 0.079 -85 C 0.076 -86 A 0.081 -87 D 0.085 -88 P 0.079 -89 K 0.064 -90 E 0.050 -91 R 0.042 -92 W 0.038 -93 V 0.037 -94 R 0.040 -95 D 0.046 -96 S 0.055 -97 M 0.066 -98 K 0.070 -99 H 0.066 -100 L 0.063 -101 D 0.072 -102 Q 0.087 -103 I 0.102 -104 F 0.119 -105 Q 0.145 -106 N 0.183 -107 L 0.222 -108 K 0.251 -109 P 0.264 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000111701.7_ENST00000229304.5_GN:APOBEC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000111701.7_ENST00000229304.5_GN:APOBEC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 9489db0d9f979f43f593e7db7f464bdab845c73b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000111701.7_ENST00000229304.5_GN:APOBEC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,237 +0,0 @@ ->ENSG00000111701.7|ENST00000229304.5|GN:APOBEC1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.428 -2 T 0.443 -3 S 0.478 -4 E 0.522 -5 K 0.559 -6 G 0.581 -7 P 0.590 -8 S 0.582 -9 T 0.544 -10 G 0.469 -11 D 0.374 -12 P 0.286 -13 T 0.219 -14 L 0.171 -15 R 0.140 -16 R 0.124 -17 R 0.118 -18 I 0.111 -19 E 0.099 -20 P 0.086 -21 W 0.079 -22 E 0.076 -23 F 0.077 -24 D 0.079 -25 V 0.078 -26 F 0.075 -27 Y 0.072 -28 D 0.073 -29 P 0.078 -30 R 0.084 -31 E 0.090 -32 L 0.092 -33 R 0.087 -34 K 0.075 -35 E 0.059 -36 A 0.042 -37 C 0.030 -38 L 0.023 -39 L 0.020 -40 Y 0.019 -41 E 0.021 -42 I 0.025 -43 K 0.033 -44 W 0.045 -45 G 0.058 -46 M 0.071 -47 S 0.080 -48 R 0.087 -49 K 0.090 -50 I 0.087 -51 W 0.077 -52 R 0.066 -53 S 0.061 -54 S 0.062 -55 G 0.067 -56 K 0.076 -57 N 0.087 -58 T 0.094 -59 T 0.090 -60 N 0.079 -61 H 0.070 -62 V 0.065 -63 E 0.061 -64 V 0.055 -65 N 0.048 -66 F 0.043 -67 I 0.039 -68 K 0.038 -69 K 0.039 -70 F 0.042 -71 T 0.051 -72 S 0.069 -73 E 0.093 -74 R 0.115 -75 D 0.134 -76 F 0.147 -77 H 0.154 -78 P 0.154 -79 S 0.148 -80 M 0.134 -81 S 0.115 -82 C 0.096 -83 S 0.085 -84 I 0.078 -85 T 0.071 -86 W 0.061 -87 F 0.053 -88 L 0.052 -89 S 0.057 -90 W 0.067 -91 S 0.073 -92 P 0.070 -93 C 0.059 -94 W 0.048 -95 E 0.044 -96 C 0.050 -97 S 0.062 -98 Q 0.071 -99 A 0.071 -100 I 0.070 -101 R 0.073 -102 E 0.072 -103 F 0.062 -104 L 0.053 -105 S 0.050 -106 R 0.051 -107 H 0.056 -108 P 0.063 -109 G 0.066 -110 V 0.063 -111 T 0.058 -112 L 0.054 -113 V 0.053 -114 I 0.051 -115 Y 0.047 -116 V 0.040 -117 A 0.034 -118 R 0.033 -119 L 0.036 -120 F 0.040 -121 W 0.044 -122 H 0.049 -123 M 0.053 -124 D 0.056 -125 Q 0.057 -126 Q 0.055 -127 N 0.052 -128 R 0.049 -129 Q 0.048 -130 G 0.048 -131 L 0.048 -132 R 0.048 -133 D 0.050 -134 L 0.055 -135 V 0.061 -136 N 0.067 -137 S 0.077 -138 G 0.087 -139 V 0.092 -140 T 0.088 -141 I 0.081 -142 Q 0.078 -143 I 0.076 -144 M 0.070 -145 R 0.059 -146 A 0.049 -147 S 0.042 -148 E 0.038 -149 Y 0.037 -150 Y 0.037 -151 H 0.039 -152 C 0.042 -153 W 0.047 -154 R 0.055 -155 N 0.065 -156 F 0.074 -157 V 0.086 -158 N 0.109 -159 Y 0.147 -160 P 0.192 -161 P 0.229 -162 G 0.252 -163 D 0.260 -164 E 0.254 -165 A 0.236 -166 H 0.212 -167 W 0.188 -168 P 0.169 -169 Q 0.156 -170 Y 0.147 -171 P 0.135 -172 P 0.111 -173 L 0.086 -174 W 0.070 -175 M 0.064 -176 M 0.059 -177 L 0.056 -178 Y 0.055 -179 A 0.055 -180 L 0.054 -181 E 0.055 -182 L 0.058 -183 H 0.059 -184 C 0.059 -185 I 0.062 -186 I 0.073 -187 L 0.096 -188 S 0.137 -189 L 0.189 -190 P 0.236 -191 P 0.268 -192 C 0.284 -193 L 0.283 -194 K 0.261 -195 I 0.227 -196 S 0.199 -197 R 0.186 -198 R 0.181 -199 W 0.174 -200 Q 0.161 -201 N 0.147 -202 H 0.131 -203 L 0.112 -204 T 0.097 -205 F 0.091 -206 F 0.095 -207 R 0.106 -208 L 0.119 -209 H 0.131 -210 L 0.146 -211 Q 0.173 -212 N 0.208 -213 C 0.238 -214 H 0.256 -215 Y 0.272 -216 Q 0.294 -217 T 0.314 -218 I 0.322 -219 P 0.323 -220 P 0.331 -221 H 0.353 -222 I 0.384 -223 L 0.406 -224 L 0.411 -225 A 0.409 -226 T 0.407 -227 G 0.405 -228 L 0.401 -229 I 0.401 -230 H 0.407 -231 P 0.420 -232 S 0.435 -233 V 0.441 -234 A 0.426 -235 W 0.391 -236 R 0.361 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000111701.7_ENST00000229304.5_GN:APOBEC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000111701.7_ENST00000229304.5_GN:APOBEC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid deleted file mode 100644 index e9b9379072743108311611bd3701d9b6609e0875..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000111701.7_ENST00000229304.5_GN:APOBEC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid +++ /dev/null @@ -1,249 +0,0 @@ ->ENSG00000111701.7|ENST00000229304.5|GN:APOBEC1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:12 -1 M 0.288 -2 T 0.307 -3 P 0.340 -4 E 0.367 -5 E 0.372 -6 E 0.354 -7 V 0.332 -8 Q 0.333 -9 R 0.374 -10 Q 0.440 -11 S 0.504 -12 T 0.549 -13 M 0.573 -14 T 0.582 -15 S 0.587 -16 E 0.592 -17 K 0.595 -18 G 0.596 -19 P 0.597 -20 S 0.589 -21 T 0.554 -22 G 0.482 -23 D 0.390 -24 P 0.304 -25 T 0.237 -26 L 0.187 -27 R 0.152 -28 R 0.132 -29 R 0.123 -30 I 0.115 -31 E 0.101 -32 P 0.085 -33 W 0.076 -34 E 0.073 -35 F 0.074 -36 D 0.077 -37 V 0.077 -38 F 0.074 -39 Y 0.071 -40 D 0.073 -41 P 0.078 -42 R 0.083 -43 E 0.088 -44 L 0.090 -45 R 0.086 -46 K 0.074 -47 E 0.057 -48 A 0.041 -49 C 0.029 -50 L 0.022 -51 L 0.019 -52 Y 0.019 -53 E 0.020 -54 I 0.024 -55 K 0.031 -56 W 0.042 -57 G 0.056 -58 M 0.068 -59 S 0.077 -60 R 0.084 -61 K 0.088 -62 I 0.085 -63 W 0.074 -64 R 0.064 -65 S 0.058 -66 S 0.059 -67 G 0.064 -68 K 0.073 -69 N 0.084 -70 T 0.090 -71 T 0.087 -72 N 0.076 -73 H 0.067 -74 V 0.063 -75 E 0.059 -76 V 0.053 -77 N 0.046 -78 F 0.041 -79 I 0.038 -80 K 0.037 -81 K 0.037 -82 F 0.040 -83 T 0.049 -84 S 0.066 -85 E 0.088 -86 R 0.110 -87 D 0.128 -88 F 0.141 -89 H 0.148 -90 P 0.149 -91 S 0.143 -92 M 0.131 -93 S 0.112 -94 C 0.095 -95 S 0.084 -96 I 0.078 -97 T 0.071 -98 W 0.061 -99 F 0.053 -100 L 0.051 -101 S 0.056 -102 W 0.065 -103 S 0.072 -104 P 0.068 -105 C 0.057 -106 W 0.047 -107 E 0.043 -108 C 0.049 -109 S 0.062 -110 Q 0.070 -111 A 0.070 -112 I 0.069 -113 R 0.072 -114 E 0.071 -115 F 0.062 -116 L 0.052 -117 S 0.049 -118 R 0.051 -119 H 0.056 -120 P 0.063 -121 G 0.066 -122 V 0.063 -123 T 0.058 -124 L 0.054 -125 V 0.053 -126 I 0.051 -127 Y 0.047 -128 V 0.040 -129 A 0.034 -130 R 0.033 -131 L 0.036 -132 F 0.040 -133 W 0.044 -134 H 0.049 -135 M 0.053 -136 D 0.057 -137 Q 0.058 -138 Q 0.056 -139 N 0.053 -140 R 0.050 -141 Q 0.049 -142 G 0.049 -143 L 0.049 -144 R 0.048 -145 D 0.050 -146 L 0.054 -147 V 0.059 -148 N 0.064 -149 S 0.074 -150 G 0.086 -151 V 0.092 -152 T 0.088 -153 I 0.081 -154 Q 0.078 -155 I 0.076 -156 M 0.070 -157 R 0.059 -158 A 0.048 -159 S 0.041 -160 E 0.038 -161 Y 0.037 -162 Y 0.038 -163 H 0.040 -164 C 0.042 -165 W 0.047 -166 R 0.055 -167 N 0.065 -168 F 0.073 -169 V 0.084 -170 N 0.107 -171 Y 0.145 -172 P 0.189 -173 P 0.227 -174 G 0.249 -175 D 0.256 -176 E 0.250 -177 A 0.232 -178 H 0.207 -179 W 0.184 -180 P 0.165 -181 Q 0.153 -182 Y 0.144 -183 P 0.132 -184 P 0.109 -185 L 0.084 -186 W 0.069 -187 M 0.063 -188 M 0.059 -189 L 0.055 -190 Y 0.055 -191 A 0.054 -192 L 0.053 -193 E 0.054 -194 L 0.057 -195 H 0.057 -196 C 0.056 -197 I 0.060 -198 I 0.071 -199 L 0.095 -200 S 0.137 -201 L 0.189 -202 P 0.236 -203 P 0.267 -204 C 0.282 -205 L 0.280 -206 K 0.258 -207 I 0.225 -208 S 0.197 -209 R 0.185 -210 R 0.181 -211 W 0.174 -212 Q 0.164 -213 N 0.151 -214 H 0.134 -215 L 0.114 -216 T 0.098 -217 F 0.092 -218 F 0.091 -219 R 0.096 -220 L 0.107 -221 H 0.121 -222 L 0.142 -223 Q 0.173 -224 N 0.210 -225 C 0.241 -226 H 0.260 -227 Y 0.277 -228 Q 0.300 -229 T 0.320 -230 I 0.329 -231 P 0.331 -232 P 0.340 -233 H 0.366 -234 I 0.399 -235 L 0.422 -236 L 0.429 -237 A 0.426 -238 T 0.423 -239 G 0.419 -240 L 0.413 -241 I 0.413 -242 H 0.419 -243 P 0.433 -244 S 0.449 -245 V 0.457 -246 A 0.441 -247 W 0.405 -248 R 0.373 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000112599.9_ENST00000230361.4_GN:GUCA1B_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000112599.9_ENST00000230361.4_GN:GUCA1B_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 2bf1b656b051fcd5a5826d23d56c0e878e394471..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000112599.9_ENST00000230361.4_GN:GUCA1B_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,201 +0,0 @@ ->ENSG00000112599.9|ENST00000230361.4|GN:GUCA1B|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.402 -2 G 0.384 -3 Q 0.344 -4 E 0.280 -5 F 0.206 -6 S 0.142 -7 W 0.105 -8 E 0.095 -9 E 0.098 -10 A 0.102 -11 E 0.104 -12 A 0.107 -13 A 0.109 -14 G 0.105 -15 E 0.096 -16 I 0.086 -17 D 0.078 -18 V 0.073 -19 A 0.067 -20 E 0.053 -21 L 0.037 -22 Q 0.025 -23 E 0.022 -24 W 0.029 -25 Y 0.043 -26 K 0.050 -27 K 0.043 -28 F 0.032 -29 V 0.029 -30 M 0.036 -31 E 0.048 -32 C 0.060 -33 P 0.068 -34 S 0.072 -35 G 0.074 -36 T 0.073 -37 L 0.065 -38 F 0.051 -39 M 0.038 -40 H 0.032 -41 E 0.032 -42 F 0.035 -43 K 0.042 -44 R 0.053 -45 F 0.065 -46 F 0.077 -47 K 0.094 -48 V 0.119 -49 T 0.144 -50 D 0.160 -51 D 0.165 -52 E 0.168 -53 E 0.166 -54 A 0.151 -55 S 0.125 -56 Q 0.097 -57 Y 0.076 -58 V 0.062 -59 E 0.058 -60 G 0.060 -61 M 0.063 -62 F 0.063 -63 R 0.060 -64 A 0.058 -65 F 0.061 -66 D 0.075 -67 K 0.099 -68 N 0.120 -69 G 0.124 -70 D 0.110 -71 N 0.095 -72 T 0.089 -73 I 0.083 -74 D 0.069 -75 F 0.055 -76 L 0.050 -77 E 0.052 -78 Y 0.051 -79 V 0.047 -80 A 0.046 -81 A 0.047 -82 L 0.045 -83 N 0.044 -84 L 0.049 -85 V 0.060 -86 L 0.072 -87 R 0.079 -88 G 0.078 -89 T 0.071 -90 L 0.062 -91 E 0.058 -92 H 0.056 -93 K 0.053 -94 L 0.050 -95 K 0.051 -96 W 0.057 -97 T 0.065 -98 F 0.071 -99 K 0.073 -100 I 0.070 -101 Y 0.066 -102 D 0.072 -103 K 0.091 -104 D 0.112 -105 G 0.121 -106 N 0.118 -107 G 0.111 -108 C 0.103 -109 I 0.091 -110 D 0.076 -111 R 0.067 -112 L 0.067 -113 E 0.067 -114 L 0.059 -115 L 0.049 -116 N 0.042 -117 I 0.039 -118 V 0.038 -119 E 0.039 -120 G 0.041 -121 I 0.043 -122 Y 0.047 -123 Q 0.052 -124 L 0.057 -125 K 0.064 -126 K 0.080 -127 A 0.103 -128 C 0.127 -129 R 0.151 -130 R 0.180 -131 E 0.214 -132 L 0.248 -133 Q 0.277 -134 T 0.299 -135 E 0.314 -136 Q 0.324 -137 G 0.325 -138 Q 0.303 -139 L 0.251 -140 L 0.180 -141 T 0.115 -142 P 0.075 -143 E 0.059 -144 E 0.057 -145 V 0.057 -146 V 0.053 -147 D 0.047 -148 R 0.043 -149 I 0.044 -150 F 0.045 -151 L 0.045 -152 L 0.049 -153 V 0.061 -154 D 0.083 -155 E 0.115 -156 N 0.146 -157 G 0.159 -158 D 0.155 -159 G 0.150 -160 Q 0.144 -161 L 0.127 -162 S 0.098 -163 L 0.070 -164 N 0.052 -165 E 0.043 -166 F 0.038 -167 V 0.036 -168 E 0.039 -169 G 0.047 -170 A 0.052 -171 R 0.054 -172 R 0.053 -173 D 0.051 -174 K 0.048 -175 W 0.045 -176 V 0.045 -177 M 0.050 -178 K 0.057 -179 M 0.065 -180 L 0.077 -181 Q 0.098 -182 M 0.125 -183 D 0.145 -184 M 0.146 -185 N 0.134 -186 P 0.126 -187 S 0.127 -188 S 0.131 -189 W 0.126 -190 L 0.118 -191 A 0.117 -192 Q 0.121 -193 Q 0.128 -194 R 0.146 -195 R 0.184 -196 K 0.240 -197 S 0.298 -198 A 0.339 -199 M 0.351 -200 F 0.347 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000112599.9_ENST00000230361.4_GN:GUCA1B_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000112599.9_ENST00000230361.4_GN:GUCA1B_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid deleted file mode 100644 index 269bf0351adf2fe8e1afc3f966fe8aa3f5045d59..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000112599.9_ENST00000230361.4_GN:GUCA1B_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid +++ /dev/null @@ -1,207 +0,0 @@ ->ENSG00000112599.9|ENST00000230361.4|GN:GUCA1B|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:6 -1 M 0.281 -2 L 0.298 -3 L 0.336 -4 R 0.392 -5 A 0.439 -6 S 0.456 -7 M 0.443 -8 G 0.407 -9 Q 0.345 -10 E 0.265 -11 F 0.185 -12 S 0.125 -13 W 0.094 -14 E 0.088 -15 E 0.093 -16 A 0.097 -17 E 0.098 -18 A 0.100 -19 A 0.102 -20 G 0.099 -21 E 0.093 -22 I 0.084 -23 D 0.077 -24 V 0.073 -25 A 0.067 -26 E 0.053 -27 L 0.037 -28 Q 0.025 -29 E 0.022 -30 W 0.029 -31 Y 0.042 -32 K 0.049 -33 K 0.042 -34 F 0.032 -35 V 0.028 -36 M 0.035 -37 E 0.047 -38 C 0.059 -39 P 0.066 -40 S 0.069 -41 G 0.071 -42 T 0.070 -43 L 0.063 -44 F 0.050 -45 M 0.037 -46 H 0.032 -47 E 0.032 -48 F 0.035 -49 K 0.041 -50 R 0.052 -51 F 0.064 -52 F 0.075 -53 K 0.091 -54 V 0.115 -55 T 0.139 -56 D 0.155 -57 D 0.161 -58 E 0.165 -59 E 0.164 -60 A 0.150 -61 S 0.123 -62 Q 0.096 -63 Y 0.074 -64 V 0.061 -65 E 0.056 -66 G 0.058 -67 M 0.061 -68 F 0.061 -69 R 0.058 -70 A 0.056 -71 F 0.059 -72 D 0.073 -73 K 0.095 -74 N 0.116 -75 G 0.119 -76 D 0.106 -77 N 0.092 -78 T 0.087 -79 I 0.081 -80 D 0.067 -81 F 0.053 -82 L 0.048 -83 E 0.049 -84 Y 0.048 -85 V 0.045 -86 A 0.044 -87 A 0.046 -88 L 0.045 -89 N 0.043 -90 L 0.049 -91 V 0.060 -92 L 0.071 -93 R 0.078 -94 G 0.078 -95 T 0.070 -96 L 0.061 -97 E 0.057 -98 H 0.055 -99 K 0.052 -100 L 0.049 -101 K 0.050 -102 W 0.056 -103 T 0.064 -104 F 0.070 -105 K 0.072 -106 I 0.069 -107 Y 0.066 -108 D 0.072 -109 K 0.090 -110 D 0.112 -111 G 0.121 -112 N 0.117 -113 G 0.110 -114 C 0.103 -115 I 0.091 -116 D 0.076 -117 R 0.067 -118 L 0.067 -119 E 0.067 -120 L 0.060 -121 L 0.049 -122 N 0.042 -123 I 0.039 -124 V 0.039 -125 E 0.039 -126 G 0.041 -127 I 0.043 -128 Y 0.048 -129 Q 0.053 -130 L 0.057 -131 K 0.065 -132 K 0.082 -133 A 0.105 -134 C 0.129 -135 R 0.154 -136 R 0.183 -137 E 0.218 -138 L 0.253 -139 Q 0.281 -140 T 0.301 -141 E 0.315 -142 Q 0.326 -143 G 0.326 -144 Q 0.304 -145 L 0.251 -146 L 0.180 -147 T 0.115 -148 P 0.075 -149 E 0.059 -150 E 0.057 -151 V 0.057 -152 V 0.053 -153 D 0.047 -154 R 0.044 -155 I 0.044 -156 F 0.045 -157 L 0.046 -158 L 0.049 -159 V 0.060 -160 D 0.082 -161 E 0.115 -162 N 0.146 -163 G 0.159 -164 D 0.155 -165 G 0.150 -166 Q 0.144 -167 L 0.127 -168 S 0.098 -169 L 0.070 -170 N 0.053 -171 E 0.044 -172 F 0.038 -173 V 0.036 -174 E 0.039 -175 G 0.046 -176 A 0.052 -177 R 0.054 -178 R 0.053 -179 D 0.050 -180 K 0.047 -181 W 0.044 -182 V 0.044 -183 M 0.049 -184 K 0.056 -185 M 0.064 -186 L 0.076 -187 Q 0.097 -188 M 0.125 -189 D 0.144 -190 M 0.145 -191 N 0.134 -192 P 0.125 -193 S 0.126 -194 S 0.130 -195 W 0.127 -196 L 0.123 -197 A 0.123 -198 Q 0.126 -199 Q 0.130 -200 R 0.145 -201 R 0.182 -202 K 0.238 -203 S 0.297 -204 A 0.337 -205 M 0.349 -206 F 0.346 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000123171.8_ENST00000242819.7_GN:CCDC70_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000123171.8_ENST00000242819.7_GN:CCDC70_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 014cd0aaf6b164f73368f735b7bd2c6fda1f3643..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000123171.8_ENST00000242819.7_GN:CCDC70_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,223 +0,0 @@ ->ENSG00000123171.8|ENST00000242819.7|GN:CCDC70|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.352 -2 F 0.363 -3 S 0.387 -4 F 0.419 -5 K 0.448 -6 V 0.461 -7 S 0.453 -8 R 0.435 -9 W 0.424 -10 M 0.425 -11 G 0.416 -12 L 0.390 -13 A 0.369 -14 C 0.366 -15 F 0.378 -16 R 0.406 -17 S 0.450 -18 L 0.493 -19 A 0.518 -20 A 0.520 -21 S 0.500 -22 S 0.462 -23 P 0.405 -24 S 0.339 -25 I 0.284 -26 R 0.255 -27 Q 0.242 -28 K 0.234 -29 K 0.227 -30 L 0.225 -31 M 0.224 -32 H 0.222 -33 K 0.218 -34 L 0.222 -35 Q 0.242 -36 E 0.271 -37 E 0.296 -38 K 0.313 -39 A 0.317 -40 F 0.302 -41 R 0.276 -42 E 0.258 -43 E 0.255 -44 M 0.255 -45 K 0.252 -46 I 0.245 -47 F 0.239 -48 R 0.242 -49 E 0.252 -50 K 0.263 -51 I 0.275 -52 E 0.289 -53 D 0.297 -54 F 0.296 -55 R 0.295 -56 E 0.290 -57 E 0.269 -58 M 0.245 -59 W 0.237 -60 T 0.253 -61 F 0.288 -62 R 0.333 -63 G 0.368 -64 K 0.373 -65 I 0.352 -66 H 0.328 -67 A 0.309 -68 F 0.293 -69 R 0.291 -70 G 0.306 -71 Q 0.323 -72 I 0.339 -73 L 0.361 -74 G 0.368 -75 F 0.341 -76 W 0.305 -77 E 0.295 -78 E 0.306 -79 E 0.313 -80 R 0.314 -81 P 0.318 -82 F 0.328 -83 W 0.352 -84 E 0.387 -85 E 0.406 -86 E 0.386 -87 K 0.342 -88 T 0.308 -89 F 0.296 -90 W 0.302 -91 K 0.324 -92 E 0.355 -93 E 0.376 -94 K 0.372 -95 S 0.342 -96 F 0.295 -97 W 0.262 -98 E 0.259 -99 M 0.276 -100 E 0.298 -101 K 0.320 -102 S 0.328 -103 F 0.316 -104 R 0.305 -105 E 0.312 -106 E 0.326 -107 E 0.323 -108 K 0.298 -109 T 0.264 -110 F 0.234 -111 W 0.218 -112 K 0.216 -113 K 0.217 -114 Y 0.215 -115 R 0.217 -116 T 0.228 -117 F 0.245 -118 W 0.271 -119 K 0.307 -120 E 0.341 -121 D 0.366 -122 K 0.379 -123 A 0.386 -124 F 0.392 -125 W 0.404 -126 K 0.427 -127 E 0.446 -128 D 0.441 -129 N 0.399 -130 A 0.337 -131 L 0.285 -132 W 0.258 -133 E 0.246 -134 R 0.244 -135 D 0.252 -136 R 0.262 -137 N 0.263 -138 L 0.253 -139 L 0.255 -140 Q 0.280 -141 E 0.317 -142 D 0.344 -143 K 0.354 -144 A 0.346 -145 L 0.325 -146 W 0.310 -147 E 0.317 -148 E 0.334 -149 E 0.337 -150 K 0.319 -151 A 0.297 -152 L 0.284 -153 W 0.279 -154 V 0.279 -155 E 0.284 -156 E 0.289 -157 R 0.289 -158 A 0.280 -159 L 0.267 -160 L 0.269 -161 E 0.299 -162 G 0.340 -163 E 0.369 -164 K 0.378 -165 A 0.364 -166 L 0.335 -167 W 0.317 -168 E 0.327 -169 D 0.343 -170 K 0.344 -171 T 0.339 -172 S 0.339 -173 L 0.341 -174 W 0.343 -175 E 0.351 -176 E 0.359 -177 E 0.350 -178 N 0.325 -179 A 0.300 -180 L 0.283 -181 W 0.264 -182 E 0.239 -183 E 0.217 -184 E 0.201 -185 R 0.191 -186 A 0.188 -187 F 0.187 -188 W 0.189 -189 M 0.198 -190 E 0.220 -191 N 0.260 -192 N 0.316 -193 G 0.383 -194 H 0.444 -195 I 0.491 -196 A 0.532 -197 G 0.569 -198 E 0.590 -199 Q 0.588 -200 M 0.569 -201 L 0.543 -202 E 0.515 -203 D 0.496 -204 G 0.501 -205 P 0.537 -206 H 0.586 -207 N 0.620 -208 A 0.621 -209 N 0.590 -210 R 0.541 -211 G 0.495 -212 Q 0.485 -213 R 0.524 -214 L 0.575 -215 L 0.594 -216 A 0.586 -217 F 0.574 -218 S 0.569 -219 R 0.571 -220 G 0.568 -221 R 0.548 -222 A 0.523 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000123171.8_ENST00000242819.7_GN:CCDC70_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:11.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000123171.8_ENST00000242819.7_GN:CCDC70_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:11.caid deleted file mode 100644 index f900724a136a4609561849528f99385f1605cacd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000123171.8_ENST00000242819.7_GN:CCDC70_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:11.caid +++ /dev/null @@ -1,234 +0,0 @@ ->ENSG00000123171.8|ENST00000242819.7|GN:CCDC70|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:11 -1 M 0.391 -2 A 0.412 -3 T 0.443 -4 P 0.467 -5 P 0.463 -6 F 0.430 -7 R 0.389 -8 L 0.360 -9 I 0.351 -10 R 0.352 -11 K 0.354 -12 M 0.356 -13 F 0.368 -14 S 0.390 -15 F 0.417 -16 K 0.444 -17 V 0.461 -18 S 0.462 -19 R 0.450 -20 W 0.445 -21 M 0.451 -22 G 0.449 -23 L 0.435 -24 A 0.433 -25 C 0.449 -26 F 0.467 -27 R 0.484 -28 S 0.504 -29 L 0.523 -30 A 0.527 -31 A 0.515 -32 S 0.490 -33 S 0.452 -34 P 0.400 -35 S 0.339 -36 I 0.288 -37 R 0.260 -38 Q 0.251 -39 K 0.250 -40 K 0.255 -41 L 0.264 -42 M 0.271 -43 H 0.272 -44 K 0.266 -45 L 0.268 -46 Q 0.289 -47 E 0.323 -48 E 0.350 -49 K 0.364 -50 A 0.362 -51 F 0.338 -52 R 0.305 -53 E 0.283 -54 E 0.280 -55 M 0.284 -56 K 0.283 -57 I 0.273 -58 F 0.262 -59 R 0.259 -60 E 0.267 -61 K 0.276 -62 I 0.284 -63 E 0.294 -64 D 0.298 -65 F 0.292 -66 R 0.285 -67 E 0.277 -68 E 0.258 -69 M 0.235 -70 W 0.227 -71 T 0.242 -72 F 0.275 -73 R 0.316 -74 G 0.349 -75 K 0.356 -76 I 0.339 -77 H 0.319 -78 A 0.302 -79 F 0.288 -80 R 0.287 -81 G 0.300 -82 Q 0.315 -83 I 0.332 -84 L 0.355 -85 G 0.364 -86 F 0.337 -87 W 0.301 -88 E 0.290 -89 E 0.300 -90 E 0.309 -91 R 0.312 -92 P 0.316 -93 F 0.325 -94 W 0.346 -95 E 0.375 -96 E 0.391 -97 E 0.371 -98 K 0.331 -99 T 0.299 -100 F 0.285 -101 W 0.285 -102 K 0.304 -103 E 0.338 -104 E 0.362 -105 K 0.361 -106 S 0.333 -107 F 0.290 -108 W 0.256 -109 E 0.249 -110 M 0.262 -111 E 0.283 -112 K 0.305 -113 S 0.315 -114 F 0.307 -115 R 0.301 -116 E 0.315 -117 E 0.335 -118 E 0.336 -119 K 0.313 -120 T 0.279 -121 F 0.247 -122 W 0.229 -123 K 0.225 -124 K 0.224 -125 Y 0.222 -126 R 0.225 -127 T 0.237 -128 F 0.254 -129 W 0.279 -130 K 0.313 -131 E 0.347 -132 D 0.371 -133 K 0.386 -134 A 0.394 -135 F 0.401 -136 W 0.414 -137 K 0.435 -138 E 0.454 -139 D 0.448 -140 N 0.406 -141 A 0.343 -142 L 0.290 -143 W 0.261 -144 E 0.247 -145 R 0.243 -146 D 0.248 -147 R 0.257 -148 N 0.258 -149 L 0.250 -150 L 0.254 -151 Q 0.280 -152 E 0.316 -153 D 0.344 -154 K 0.355 -155 A 0.347 -156 L 0.326 -157 W 0.310 -158 E 0.316 -159 E 0.332 -160 E 0.335 -161 K 0.318 -162 A 0.298 -163 L 0.287 -164 W 0.282 -165 V 0.282 -166 E 0.287 -167 E 0.293 -168 R 0.294 -169 A 0.286 -170 L 0.273 -171 L 0.275 -172 E 0.306 -173 G 0.349 -174 E 0.379 -175 K 0.386 -176 A 0.369 -177 L 0.339 -178 W 0.321 -179 E 0.331 -180 D 0.346 -181 K 0.345 -182 T 0.336 -183 S 0.337 -184 L 0.341 -185 W 0.344 -186 E 0.350 -187 E 0.356 -188 E 0.348 -189 N 0.324 -190 A 0.301 -191 L 0.286 -192 W 0.267 -193 E 0.243 -194 E 0.221 -195 E 0.205 -196 R 0.195 -197 A 0.191 -198 F 0.190 -199 W 0.191 -200 M 0.198 -201 E 0.219 -202 N 0.257 -203 N 0.311 -204 G 0.375 -205 H 0.432 -206 I 0.479 -207 A 0.521 -208 G 0.560 -209 E 0.582 -210 Q 0.581 -211 M 0.565 -212 L 0.543 -213 E 0.518 -214 D 0.500 -215 G 0.505 -216 P 0.541 -217 H 0.589 -218 N 0.623 -219 A 0.623 -220 N 0.592 -221 R 0.544 -222 G 0.499 -223 Q 0.489 -224 R 0.528 -225 L 0.578 -226 L 0.598 -227 A 0.590 -228 F 0.579 -229 S 0.574 -230 R 0.575 -231 G 0.574 -232 R 0.556 -233 A 0.532 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000123569.10_ENST00000217926.7_GN:H2BW1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000123569.10_ENST00000217926.7_GN:H2BW1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 062ed488d8b2d83de933011b1f122987972a3143..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000123569.10_ENST00000217926.7_GN:H2BW1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,148 +0,0 @@ ->ENSG00000123569.10|ENST00000217926.7|GN:H2BW1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.465 -2 A 0.499 -3 G 0.540 -4 P 0.558 -5 S 0.545 -6 S 0.541 -7 E 0.580 -8 T 0.636 -9 T 0.665 -10 S 0.654 -11 E 0.610 -12 E 0.555 -13 Q 0.527 -14 L 0.548 -15 I 0.591 -16 T 0.621 -17 Q 0.640 -18 E 0.664 -19 P 0.696 -20 K 0.725 -21 E 0.747 -22 A 0.760 -23 N 0.763 -24 S 0.755 -25 T 0.731 -26 T 0.681 -27 S 0.615 -28 Q 0.575 -29 K 0.593 -30 Q 0.638 -31 S 0.667 -32 K 0.675 -33 Q 0.679 -34 R 0.687 -35 K 0.696 -36 R 0.705 -37 G 0.705 -38 R 0.694 -39 H 0.680 -40 G 0.674 -41 P 0.680 -42 R 0.689 -43 R 0.694 -44 C 0.691 -45 H 0.684 -46 S 0.669 -47 N 0.640 -48 C 0.591 -49 R 0.521 -50 G 0.434 -51 D 0.334 -52 S 0.235 -53 F 0.151 -54 A 0.092 -55 T 0.056 -56 Y 0.039 -57 F 0.035 -58 R 0.041 -59 R 0.058 -60 V 0.078 -61 L 0.091 -62 K 0.097 -63 Q 0.106 -64 V 0.120 -65 H 0.133 -66 Q 0.143 -67 G 0.154 -68 L 0.161 -69 S 0.155 -70 L 0.139 -71 S 0.123 -72 R 0.114 -73 E 0.115 -74 A 0.117 -75 V 0.111 -76 S 0.104 -77 V 0.099 -78 M 0.098 -79 D 0.107 -80 S 0.127 -81 L 0.148 -82 V 0.158 -83 H 0.154 -84 D 0.143 -85 I 0.134 -86 L 0.123 -87 D 0.105 -88 R 0.087 -89 I 0.077 -90 A 0.073 -91 T 0.066 -92 E 0.056 -93 A 0.049 -94 G 0.047 -95 H 0.049 -96 L 0.052 -97 A 0.058 -98 R 0.069 -99 S 0.083 -100 T 0.095 -101 K 0.100 -102 R 0.104 -103 Q 0.115 -104 T 0.128 -105 I 0.125 -106 T 0.102 -107 A 0.075 -108 W 0.058 -109 E 0.052 -110 T 0.051 -111 R 0.051 -112 M 0.051 -113 A 0.052 -114 V 0.057 -115 R 0.068 -116 L 0.083 -117 L 0.100 -118 L 0.112 -119 P 0.115 -120 G 0.113 -121 Q 0.110 -122 M 0.103 -123 G 0.094 -124 K 0.088 -125 L 0.090 -126 A 0.099 -127 E 0.113 -128 S 0.129 -129 E 0.139 -130 G 0.138 -131 T 0.129 -132 K 0.121 -133 A 0.119 -134 V 0.115 -135 L 0.103 -136 R 0.084 -137 T 0.070 -138 S 0.066 -139 L 0.073 -140 Y 0.088 -141 A 0.107 -142 I 0.129 -143 Q 0.158 -144 Q 0.194 -145 Q 0.229 -146 R 0.254 -147 K 0.265 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000123569.10_ENST00000217926.7_GN:H2BW1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000123569.10_ENST00000217926.7_GN:H2BW1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid deleted file mode 100644 index 0a1e0d5d7dca24d3f2bd4b13a12ce52c1cd58b33..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000123569.10_ENST00000217926.7_GN:H2BW1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid +++ /dev/null @@ -1,154 +0,0 @@ ->ENSG00000123569.10|ENST00000217926.7|GN:H2BW1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:6 -1 M 0.470 -2 A 0.518 -3 T 0.574 -4 A 0.593 -5 S 0.569 -6 A 0.551 -7 M 0.580 -8 A 0.639 -9 G 0.686 -10 P 0.712 -11 S 0.724 -12 S 0.729 -13 E 0.726 -14 T 0.719 -15 T 0.707 -16 S 0.684 -17 E 0.638 -18 E 0.582 -19 Q 0.558 -20 L 0.587 -21 I 0.638 -22 T 0.670 -23 Q 0.683 -24 E 0.696 -25 P 0.717 -26 K 0.740 -27 E 0.758 -28 A 0.767 -29 N 0.767 -30 S 0.757 -31 T 0.731 -32 T 0.681 -33 S 0.613 -34 Q 0.574 -35 K 0.594 -36 Q 0.642 -37 S 0.672 -38 K 0.682 -39 Q 0.687 -40 R 0.695 -41 K 0.704 -42 R 0.712 -43 G 0.712 -44 R 0.700 -45 H 0.685 -46 G 0.679 -47 P 0.685 -48 R 0.695 -49 R 0.700 -50 C 0.698 -51 H 0.690 -52 S 0.675 -53 N 0.646 -54 C 0.595 -55 R 0.524 -56 G 0.435 -57 D 0.334 -58 S 0.234 -59 F 0.151 -60 A 0.092 -61 T 0.056 -62 Y 0.039 -63 F 0.035 -64 R 0.043 -65 R 0.061 -66 V 0.082 -67 L 0.095 -68 K 0.099 -69 Q 0.107 -70 V 0.120 -71 H 0.132 -72 Q 0.141 -73 G 0.152 -74 L 0.159 -75 S 0.153 -76 L 0.137 -77 S 0.121 -78 R 0.113 -79 E 0.115 -80 A 0.116 -81 V 0.111 -82 S 0.104 -83 V 0.099 -84 M 0.098 -85 D 0.107 -86 S 0.127 -87 L 0.148 -88 V 0.158 -89 H 0.154 -90 D 0.143 -91 I 0.135 -92 L 0.124 -93 D 0.107 -94 R 0.088 -95 I 0.078 -96 A 0.074 -97 T 0.067 -98 E 0.056 -99 A 0.049 -100 G 0.047 -101 H 0.049 -102 L 0.052 -103 A 0.058 -104 R 0.068 -105 S 0.082 -106 T 0.094 -107 K 0.099 -108 R 0.103 -109 Q 0.115 -110 T 0.128 -111 I 0.125 -112 T 0.102 -113 A 0.075 -114 W 0.058 -115 E 0.052 -116 T 0.051 -117 R 0.051 -118 M 0.051 -119 A 0.052 -120 V 0.057 -121 R 0.068 -122 L 0.084 -123 L 0.101 -124 L 0.113 -125 P 0.117 -126 G 0.115 -127 Q 0.111 -128 M 0.104 -129 G 0.094 -130 K 0.089 -131 L 0.091 -132 A 0.100 -133 E 0.113 -134 S 0.129 -135 E 0.140 -136 G 0.139 -137 T 0.129 -138 K 0.121 -139 A 0.120 -140 V 0.116 -141 L 0.103 -142 R 0.084 -143 T 0.069 -144 S 0.065 -145 L 0.072 -146 Y 0.087 -147 A 0.106 -148 I 0.128 -149 Q 0.158 -150 Q 0.194 -151 Q 0.229 -152 R 0.254 -153 K 0.265 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000124089.4_ENST00000243911.2_GN:MC3R_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000124089.4_ENST00000243911.2_GN:MC3R_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 619f64e0863f737fea66dbb29f688e3eaa6ba20f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000124089.4_ENST00000243911.2_GN:MC3R_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,324 +0,0 @@ ->ENSG00000124089.4|ENST00000243911.2|GN:MC3R|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.349 -2 N 0.355 -3 A 0.367 -4 S 0.378 -5 C 0.388 -6 C 0.408 -7 L 0.449 -8 P 0.496 -9 S 0.526 -10 V 0.533 -11 Q 0.536 -12 P 0.546 -13 T 0.566 -14 L 0.595 -15 P 0.631 -16 N 0.665 -17 G 0.679 -18 S 0.668 -19 E 0.644 -20 H 0.621 -21 L 0.606 -22 Q 0.601 -23 A 0.607 -24 P 0.619 -25 F 0.627 -26 F 0.627 -27 S 0.615 -28 N 0.595 -29 Q 0.577 -30 S 0.563 -31 S 0.538 -32 S 0.485 -33 A 0.406 -34 F 0.321 -35 C 0.255 -36 E 0.213 -37 Q 0.183 -38 V 0.154 -39 F 0.128 -40 I 0.106 -41 K 0.085 -42 P 0.064 -43 E 0.043 -44 V 0.029 -45 F 0.024 -46 L 0.026 -47 S 0.030 -48 L 0.036 -49 G 0.040 -50 I 0.045 -51 V 0.051 -52 S 0.055 -53 L 0.054 -54 L 0.052 -55 E 0.054 -56 N 0.055 -57 I 0.054 -58 L 0.051 -59 V 0.048 -60 I 0.045 -61 L 0.045 -62 A 0.047 -63 V 0.051 -64 V 0.058 -65 R 0.069 -66 N 0.079 -67 G 0.085 -68 N 0.085 -69 L 0.080 -70 H 0.073 -71 S 0.062 -72 P 0.048 -73 M 0.034 -74 Y 0.024 -75 F 0.019 -76 F 0.019 -77 L 0.023 -78 C 0.031 -79 S 0.039 -80 L 0.043 -81 A 0.044 -82 V 0.044 -83 A 0.043 -84 D 0.040 -85 M 0.035 -86 L 0.027 -87 V 0.022 -88 S 0.021 -89 V 0.021 -90 S 0.020 -91 N 0.019 -92 A 0.018 -93 L 0.019 -94 E 0.022 -95 T 0.026 -96 I 0.028 -97 M 0.028 -98 I 0.029 -99 A 0.032 -100 I 0.043 -101 V 0.065 -102 H 0.097 -103 S 0.129 -104 D 0.146 -105 Y 0.145 -106 L 0.135 -107 T 0.125 -108 F 0.123 -109 E 0.122 -110 D 0.114 -111 Q 0.096 -112 F 0.082 -113 I 0.078 -114 Q 0.079 -115 H 0.077 -116 M 0.071 -117 D 0.061 -118 N 0.051 -119 I 0.044 -120 F 0.040 -121 D 0.040 -122 S 0.040 -123 M 0.038 -124 I 0.034 -125 C 0.032 -126 I 0.032 -127 S 0.033 -128 L 0.034 -129 V 0.035 -130 A 0.036 -131 S 0.036 -132 I 0.034 -133 C 0.033 -134 N 0.035 -135 L 0.037 -136 L 0.037 -137 A 0.035 -138 I 0.036 -139 A 0.040 -140 V 0.046 -141 D 0.050 -142 R 0.050 -143 Y 0.046 -144 V 0.041 -145 T 0.039 -146 I 0.040 -147 F 0.044 -148 Y 0.046 -149 A 0.047 -150 L 0.048 -151 R 0.050 -152 Y 0.052 -153 H 0.052 -154 S 0.049 -155 I 0.048 -156 M 0.049 -157 T 0.051 -158 V 0.054 -159 R 0.055 -160 K 0.052 -161 A 0.051 -162 L 0.059 -163 T 0.066 -164 L 0.063 -165 I 0.053 -166 V 0.045 -167 A 0.042 -168 I 0.041 -169 W 0.037 -170 V 0.032 -171 C 0.031 -172 C 0.034 -173 G 0.038 -174 V 0.040 -175 C 0.043 -176 G 0.046 -177 V 0.045 -178 V 0.041 -179 F 0.043 -180 I 0.048 -181 V 0.053 -182 Y 0.057 -183 S 0.066 -184 E 0.077 -185 S 0.081 -186 K 0.072 -187 M 0.057 -188 V 0.045 -189 I 0.038 -190 V 0.034 -191 C 0.032 -192 L 0.033 -193 I 0.036 -194 T 0.042 -195 M 0.048 -196 F 0.050 -197 F 0.049 -198 A 0.047 -199 M 0.047 -200 M 0.047 -201 L 0.049 -202 L 0.054 -203 M 0.059 -204 G 0.056 -205 T 0.046 -206 L 0.034 -207 Y 0.027 -208 V 0.024 -209 H 0.026 -210 M 0.033 -211 F 0.044 -212 L 0.052 -213 F 0.055 -214 A 0.059 -215 R 0.071 -216 L 0.086 -217 H 0.099 -218 V 0.116 -219 K 0.143 -220 R 0.182 -221 I 0.225 -222 A 0.263 -223 A 0.296 -224 L 0.330 -225 P 0.368 -226 P 0.416 -227 A 0.469 -228 D 0.517 -229 G 0.539 -230 V 0.529 -231 A 0.501 -232 P 0.469 -233 Q 0.431 -234 Q 0.378 -235 H 0.313 -236 S 0.249 -237 C 0.200 -238 M 0.167 -239 K 0.133 -240 G 0.098 -241 A 0.073 -242 V 0.065 -243 T 0.064 -244 I 0.061 -245 T 0.057 -246 I 0.055 -247 L 0.056 -248 L 0.055 -249 G 0.051 -250 V 0.044 -251 F 0.036 -252 I 0.028 -253 F 0.024 -254 C 0.025 -255 W 0.031 -256 A 0.035 -257 P 0.034 -258 F 0.028 -259 F 0.024 -260 L 0.023 -261 H 0.024 -262 L 0.024 -263 V 0.023 -264 L 0.023 -265 I 0.026 -266 I 0.034 -267 T 0.048 -268 C 0.066 -269 P 0.082 -270 T 0.090 -271 N 0.091 -272 P 0.086 -273 Y 0.082 -274 C 0.081 -275 I 0.083 -276 C 0.087 -277 Y 0.091 -278 T 0.092 -279 A 0.089 -280 H 0.079 -281 F 0.063 -282 N 0.050 -283 T 0.043 -284 Y 0.042 -285 L 0.043 -286 V 0.047 -287 L 0.053 -288 I 0.061 -289 M 0.068 -290 C 0.076 -291 N 0.080 -292 S 0.078 -293 V 0.072 -294 I 0.067 -295 D 0.062 -296 P 0.056 -297 L 0.050 -298 I 0.045 -299 Y 0.041 -300 A 0.042 -301 F 0.048 -302 R 0.057 -303 S 0.061 -304 L 0.058 -305 E 0.051 -306 L 0.047 -307 R 0.048 -308 N 0.054 -309 T 0.062 -310 F 0.070 -311 R 0.078 -312 E 0.086 -313 I 0.102 -314 L 0.141 -315 C 0.210 -316 G 0.301 -317 C 0.396 -318 N 0.484 -319 G 0.551 -320 M 0.583 -321 N 0.571 -322 L 0.524 -323 G 0.479 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000124089.4_ENST00000243911.2_GN:MC3R_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:37.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000124089.4_ENST00000243911.2_GN:MC3R_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:37.caid deleted file mode 100644 index d563cdcd7ad998e00401dbf86267fe078b955da8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000124089.4_ENST00000243911.2_GN:MC3R_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:37.caid +++ /dev/null @@ -1,361 +0,0 @@ ->ENSG00000124089.4|ENST00000243911.2|GN:MC3R|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:37 -1 M 0.298 -2 S 0.303 -3 I 0.317 -4 Q 0.339 -5 K 0.362 -6 T 0.378 -7 Y 0.390 -8 L 0.409 -9 E 0.432 -10 G 0.441 -11 D 0.426 -12 F 0.405 -13 V 0.400 -14 F 0.412 -15 P 0.420 -16 V 0.409 -17 S 0.379 -18 S 0.343 -19 S 0.305 -20 S 0.264 -21 F 0.229 -22 L 0.212 -23 R 0.215 -24 T 0.224 -25 L 0.231 -26 L 0.238 -27 E 0.244 -28 P 0.248 -29 Q 0.252 -30 L 0.257 -31 G 0.257 -32 S 0.247 -33 A 0.227 -34 L 0.208 -35 L 0.197 -36 T 0.196 -37 A 0.202 -38 M 0.218 -39 N 0.240 -40 A 0.259 -41 S 0.270 -42 C 0.285 -43 C 0.326 -44 L 0.398 -45 P 0.483 -46 S 0.552 -47 V 0.591 -48 Q 0.614 -49 P 0.634 -50 T 0.651 -51 L 0.666 -52 P 0.686 -53 N 0.708 -54 G 0.720 -55 S 0.715 -56 E 0.700 -57 H 0.685 -58 L 0.675 -59 Q 0.673 -60 A 0.681 -61 P 0.695 -62 F 0.707 -63 F 0.715 -64 S 0.716 -65 N 0.709 -66 Q 0.696 -67 S 0.677 -68 S 0.642 -69 S 0.578 -70 A 0.482 -71 F 0.373 -72 C 0.285 -73 E 0.230 -74 Q 0.191 -75 V 0.154 -76 F 0.121 -77 I 0.095 -78 K 0.074 -79 P 0.055 -80 E 0.038 -81 V 0.027 -82 F 0.023 -83 L 0.025 -84 S 0.030 -85 L 0.036 -86 G 0.040 -87 I 0.044 -88 V 0.049 -89 S 0.052 -90 L 0.051 -91 L 0.050 -92 E 0.052 -93 N 0.054 -94 I 0.052 -95 L 0.049 -96 V 0.045 -97 I 0.042 -98 L 0.041 -99 A 0.042 -100 V 0.044 -101 V 0.049 -102 R 0.059 -103 N 0.069 -104 G 0.075 -105 N 0.075 -106 L 0.071 -107 H 0.064 -108 S 0.054 -109 P 0.043 -110 M 0.031 -111 Y 0.022 -112 F 0.018 -113 F 0.018 -114 L 0.023 -115 C 0.031 -116 S 0.039 -117 L 0.043 -118 A 0.044 -119 V 0.044 -120 A 0.043 -121 D 0.040 -122 M 0.035 -123 L 0.028 -124 V 0.022 -125 S 0.021 -126 V 0.021 -127 S 0.020 -128 N 0.019 -129 A 0.018 -130 L 0.018 -131 E 0.021 -132 T 0.025 -133 I 0.028 -134 M 0.029 -135 I 0.030 -136 A 0.033 -137 I 0.043 -138 V 0.064 -139 H 0.096 -140 S 0.130 -141 D 0.151 -142 Y 0.156 -143 L 0.148 -144 T 0.139 -145 F 0.134 -146 E 0.131 -147 D 0.120 -148 Q 0.101 -149 F 0.086 -150 I 0.081 -151 Q 0.081 -152 H 0.080 -153 M 0.073 -154 D 0.062 -155 N 0.051 -156 I 0.044 -157 F 0.040 -158 D 0.039 -159 S 0.040 -160 M 0.037 -161 I 0.034 -162 C 0.031 -163 I 0.031 -164 S 0.031 -165 L 0.033 -166 V 0.034 -167 A 0.035 -168 S 0.035 -169 I 0.033 -170 C 0.032 -171 N 0.034 -172 L 0.036 -173 L 0.035 -174 A 0.034 -175 I 0.035 -176 A 0.040 -177 V 0.047 -178 D 0.051 -179 R 0.050 -180 Y 0.045 -181 V 0.039 -182 T 0.037 -183 I 0.038 -184 F 0.041 -185 Y 0.043 -186 A 0.044 -187 L 0.045 -188 R 0.047 -189 Y 0.048 -190 H 0.048 -191 S 0.047 -192 I 0.047 -193 M 0.048 -194 T 0.050 -195 V 0.052 -196 R 0.052 -197 K 0.049 -198 A 0.049 -199 L 0.057 -200 T 0.064 -201 L 0.060 -202 I 0.050 -203 V 0.042 -204 A 0.039 -205 I 0.037 -206 W 0.034 -207 V 0.029 -208 C 0.027 -209 C 0.030 -210 G 0.033 -211 V 0.036 -212 C 0.039 -213 G 0.041 -214 V 0.039 -215 V 0.035 -216 F 0.037 -217 I 0.042 -218 V 0.046 -219 Y 0.050 -220 S 0.057 -221 E 0.066 -222 S 0.068 -223 K 0.060 -224 M 0.047 -225 V 0.037 -226 I 0.032 -227 V 0.030 -228 C 0.029 -229 L 0.030 -230 I 0.034 -231 T 0.041 -232 M 0.046 -233 F 0.048 -234 F 0.047 -235 A 0.045 -236 M 0.045 -237 M 0.046 -238 L 0.048 -239 L 0.054 -240 M 0.060 -241 G 0.057 -242 T 0.046 -243 L 0.034 -244 Y 0.026 -245 V 0.023 -246 H 0.023 -247 M 0.025 -248 F 0.028 -249 L 0.031 -250 F 0.038 -251 A 0.049 -252 R 0.066 -253 L 0.084 -254 H 0.097 -255 V 0.114 -256 K 0.141 -257 R 0.180 -258 I 0.222 -259 A 0.261 -260 A 0.296 -261 L 0.332 -262 P 0.372 -263 P 0.419 -264 A 0.472 -265 D 0.518 -266 G 0.539 -267 V 0.528 -268 A 0.499 -269 P 0.466 -270 Q 0.426 -271 Q 0.374 -272 H 0.310 -273 S 0.246 -274 C 0.198 -275 M 0.166 -276 K 0.133 -277 G 0.097 -278 A 0.072 -279 V 0.064 -280 T 0.064 -281 I 0.062 -282 T 0.058 -283 I 0.057 -284 L 0.058 -285 L 0.057 -286 G 0.053 -287 V 0.047 -288 F 0.038 -289 I 0.030 -290 F 0.025 -291 C 0.027 -292 W 0.033 -293 A 0.038 -294 P 0.037 -295 F 0.031 -296 F 0.026 -297 L 0.026 -298 H 0.027 -299 L 0.026 -300 V 0.024 -301 L 0.024 -302 I 0.028 -303 I 0.037 -304 T 0.052 -305 C 0.071 -306 P 0.088 -307 T 0.097 -308 N 0.099 -309 P 0.096 -310 Y 0.093 -311 C 0.094 -312 I 0.096 -313 C 0.099 -314 Y 0.101 -315 T 0.100 -316 A 0.095 -317 H 0.084 -318 F 0.067 -319 N 0.053 -320 T 0.046 -321 Y 0.045 -322 L 0.047 -323 V 0.051 -324 L 0.058 -325 I 0.066 -326 M 0.073 -327 C 0.080 -328 N 0.085 -329 S 0.083 -330 V 0.077 -331 I 0.071 -332 D 0.065 -333 P 0.059 -334 L 0.053 -335 I 0.047 -336 Y 0.043 -337 A 0.043 -338 F 0.049 -339 R 0.058 -340 S 0.061 -341 L 0.057 -342 E 0.051 -343 L 0.046 -344 R 0.046 -345 N 0.053 -346 T 0.061 -347 F 0.068 -348 R 0.076 -349 E 0.084 -350 I 0.099 -351 L 0.137 -352 C 0.206 -353 G 0.297 -354 C 0.393 -355 N 0.483 -356 G 0.552 -357 M 0.584 -358 N 0.574 -359 L 0.528 -360 G 0.483 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000124143.12_ENST00000373345.9_GN:ARHGAP40_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000124143.12_ENST00000373345.9_GN:ARHGAP40_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index f692e603da30e4b12a275a170d39b231eb3c5369..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000124143.12_ENST00000373345.9_GN:ARHGAP40_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,676 +0,0 @@ ->ENSG00000124143.12|ENST00000373345.9|GN:ARHGAP40|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.370 -2 A 0.406 -3 E 0.465 -4 P 0.522 -5 A 0.559 -6 L 0.574 -7 L 0.574 -8 P 0.556 -9 A 0.520 -10 A 0.494 -11 Q 0.508 -12 M 0.540 -13 E 0.550 -14 R 0.538 -15 L 0.532 -16 A 0.553 -17 P 0.592 -18 G 0.635 -19 P 0.662 -20 L 0.664 -21 A 0.650 -22 S 0.635 -23 P 0.632 -24 C 0.642 -25 P 0.653 -26 R 0.652 -27 I 0.633 -28 P 0.601 -29 R 0.564 -30 A 0.517 -31 R 0.455 -32 I 0.387 -33 A 0.327 -34 R 0.287 -35 R 0.275 -36 C 0.286 -37 A 0.297 -38 Q 0.310 -39 R 0.349 -40 W 0.420 -41 A 0.505 -42 D 0.581 -43 L 0.636 -44 G 0.669 -45 C 0.687 -46 S 0.693 -47 S 0.695 -48 G 0.699 -49 P 0.711 -50 S 0.729 -51 S 0.747 -52 G 0.758 -53 R 0.759 -54 M 0.750 -55 D 0.730 -56 Q 0.699 -57 L 0.662 -58 P 0.620 -59 Q 0.576 -60 K 0.557 -61 N 0.577 -62 L 0.612 -63 L 0.637 -64 R 0.654 -65 L 0.671 -66 H 0.693 -67 P 0.724 -68 A 0.757 -69 G 0.781 -70 S 0.789 -71 A 0.789 -72 G 0.788 -73 C 0.787 -74 S 0.786 -75 T 0.787 -76 G 0.785 -77 V 0.772 -78 E 0.738 -79 S 0.683 -80 S 0.607 -81 S 0.520 -82 M 0.449 -83 D 0.406 -84 G 0.356 -85 F 0.277 -86 W 0.194 -87 M 0.145 -88 E 0.129 -89 V 0.131 -90 E 0.140 -91 Q 0.152 -92 I 0.166 -93 Q 0.182 -94 Q 0.204 -95 R 0.230 -96 D 0.265 -97 E 0.311 -98 L 0.363 -99 R 0.415 -100 E 0.472 -101 E 0.536 -102 D 0.596 -103 S 0.641 -104 G 0.671 -105 G 0.686 -106 N 0.682 -107 E 0.659 -108 G 0.616 -109 Q 0.561 -110 L 0.510 -111 P 0.471 -112 E 0.436 -113 E 0.396 -114 G 0.338 -115 E 0.260 -116 A 0.188 -117 E 0.142 -118 S 0.116 -119 Q 0.100 -120 W 0.091 -121 L 0.090 -122 Q 0.099 -123 D 0.120 -124 T 0.142 -125 G 0.155 -126 L 0.160 -127 S 0.165 -128 G 0.167 -129 L 0.169 -130 L 0.182 -131 G 0.208 -132 G 0.233 -133 L 0.245 -134 G 0.242 -135 L 0.231 -136 D 0.220 -137 G 0.204 -138 D 0.174 -139 H 0.135 -140 Q 0.104 -141 E 0.090 -142 L 0.091 -143 L 0.105 -144 S 0.131 -145 T 0.161 -146 L 0.174 -147 T 0.155 -148 Q 0.118 -149 T 0.090 -150 Q 0.076 -151 V 0.068 -152 A 0.063 -153 A 0.062 -154 V 0.063 -155 C 0.060 -156 R 0.054 -157 R 0.052 -158 L 0.052 -159 D 0.050 -160 I 0.044 -161 Y 0.037 -162 A 0.035 -163 R 0.042 -164 S 0.056 -165 V 0.076 -166 R 0.099 -167 R 0.127 -168 Q 0.167 -169 H 0.220 -170 K 0.282 -171 T 0.339 -172 P 0.368 -173 V 0.354 -174 R 0.308 -175 D 0.262 -176 V 0.248 -177 R 0.267 -178 D 0.291 -179 V 0.306 -180 F 0.335 -181 G 0.387 -182 V 0.443 -183 F 0.497 -184 N 0.558 -185 S 0.621 -186 G 0.668 -187 K 0.693 -188 M 0.706 -189 S 0.716 -190 S 0.729 -191 E 0.742 -192 N 0.752 -193 G 0.752 -194 D 0.733 -195 S 0.686 -196 G 0.619 -197 M 0.569 -198 K 0.544 -199 G 0.503 -200 A 0.447 -201 Q 0.438 -202 L 0.484 -203 S 0.524 -204 S 0.544 -205 G 0.564 -206 A 0.565 -207 S 0.530 -208 K 0.504 -209 F 0.539 -210 P 0.624 -211 P 0.704 -212 A 0.752 -213 A 0.772 -214 E 0.780 -215 P 0.786 -216 G 0.794 -217 G 0.797 -218 L 0.792 -219 Q 0.782 -220 E 0.772 -221 Q 0.764 -222 A 0.751 -223 G 0.722 -224 R 0.671 -225 E 0.603 -226 E 0.528 -227 A 0.452 -228 F 0.385 -229 N 0.333 -230 M 0.296 -231 D 0.263 -232 S 0.230 -233 A 0.201 -234 Y 0.185 -235 S 0.182 -236 E 0.177 -237 Q 0.162 -238 A 0.147 -239 A 0.146 -240 V 0.160 -241 L 0.179 -242 L 0.204 -243 Q 0.242 -244 R 0.296 -245 S 0.369 -246 R 0.459 -247 P 0.556 -248 S 0.641 -249 R 0.700 -250 G 0.731 -251 G 0.737 -252 T 0.723 -253 S 0.693 -254 A 0.654 -255 W 0.620 -256 G 0.597 -257 K 0.573 -258 C 0.530 -259 S 0.469 -260 L 0.405 -261 P 0.355 -262 K 0.329 -263 F 0.328 -264 T 0.328 -265 V 0.310 -266 P 0.282 -267 K 0.260 -268 G 0.247 -269 R 0.234 -270 L 0.215 -271 G 0.193 -272 V 0.169 -273 T 0.146 -274 R 0.128 -275 I 0.117 -276 G 0.115 -277 D 0.116 -278 L 0.114 -279 S 0.103 -280 L 0.088 -281 Q 0.077 -282 D 0.070 -283 M 0.067 -284 R 0.065 -285 K 0.067 -286 V 0.072 -287 P 0.076 -288 S 0.080 -289 L 0.087 -290 A 0.094 -291 L 0.097 -292 I 0.096 -293 E 0.094 -294 L 0.093 -295 T 0.092 -296 A 0.088 -297 L 0.085 -298 C 0.084 -299 D 0.089 -300 I 0.100 -301 L 0.116 -302 G 0.134 -303 L 0.149 -304 D 0.156 -305 L 0.156 -306 K 0.159 -307 R 0.180 -308 S 0.222 -309 K 0.272 -310 A 0.314 -311 G 0.335 -312 K 0.337 -313 W 0.335 -314 K 0.332 -315 A 0.319 -316 A 0.283 -317 E 0.228 -318 T 0.173 -319 R 0.137 -320 L 0.123 -321 F 0.123 -322 G 0.129 -323 V 0.132 -324 P 0.128 -325 L 0.117 -326 D 0.103 -327 S 0.095 -328 L 0.098 -329 L 0.104 -330 E 0.105 -331 A 0.104 -332 D 0.104 -333 H 0.104 -334 K 0.108 -335 V 0.116 -336 L 0.123 -337 P 0.121 -338 S 0.112 -339 T 0.106 -340 Q 0.106 -341 V 0.103 -342 P 0.092 -343 L 0.076 -344 V 0.064 -345 L 0.057 -346 Q 0.053 -347 A 0.053 -348 L 0.059 -349 L 0.067 -350 S 0.068 -351 C 0.061 -352 L 0.052 -353 E 0.046 -354 K 0.048 -355 R 0.055 -356 G 0.065 -357 L 0.074 -358 D 0.083 -359 M 0.093 -360 E 0.105 -361 G 0.114 -362 I 0.116 -363 L 0.115 -364 R 0.120 -365 V 0.132 -366 P 0.141 -367 G 0.138 -368 S 0.118 -369 Q 0.090 -370 A 0.067 -371 R 0.054 -372 V 0.050 -373 K 0.051 -374 G 0.055 -375 L 0.058 -376 E 0.059 -377 Q 0.056 -378 K 0.051 -379 L 0.048 -380 E 0.048 -381 R 0.047 -382 D 0.046 -383 F 0.049 -384 Y 0.059 -385 A 0.072 -386 G 0.082 -387 L 0.083 -388 F 0.074 -389 S 0.062 -390 W 0.056 -391 D 0.059 -392 E 0.068 -393 V 0.079 -394 H 0.092 -395 H 0.109 -396 N 0.127 -397 D 0.136 -398 A 0.134 -399 S 0.131 -400 D 0.131 -401 L 0.125 -402 L 0.107 -403 K 0.085 -404 R 0.068 -405 F 0.058 -406 I 0.055 -407 R 0.056 -408 K 0.062 -409 L 0.066 -410 P 0.064 -411 T 0.062 -412 P 0.064 -413 L 0.066 -414 L 0.064 -415 T 0.062 -416 A 0.064 -417 E 0.066 -418 Y 0.062 -419 L 0.054 -420 P 0.048 -421 A 0.046 -422 F 0.046 -423 A 0.052 -424 V 0.060 -425 V 0.067 -426 P 0.072 -427 N 0.076 -428 I 0.077 -429 P 0.072 -430 N 0.061 -431 L 0.051 -432 K 0.045 -433 Q 0.041 -434 R 0.042 -435 L 0.047 -436 Q 0.053 -437 V 0.059 -438 L 0.062 -439 H 0.065 -440 L 0.067 -441 L 0.067 -442 I 0.062 -443 L 0.058 -444 I 0.059 -445 L 0.061 -446 P 0.060 -447 E 0.057 -448 P 0.055 -449 N 0.056 -450 R 0.057 -451 N 0.061 -452 A 0.068 -453 L 0.073 -454 K 0.077 -455 A 0.080 -456 L 0.079 -457 L 0.071 -458 E 0.060 -459 F 0.049 -460 L 0.042 -461 R 0.040 -462 K 0.043 -463 V 0.052 -464 V 0.059 -465 A 0.060 -466 R 0.060 -467 E 0.063 -468 Q 0.073 -469 H 0.084 -470 N 0.090 -471 K 0.090 -472 M 0.084 -473 T 0.074 -474 L 0.066 -475 R 0.066 -476 N 0.072 -477 V 0.077 -478 S 0.076 -479 T 0.075 -480 V 0.075 -481 M 0.073 -482 A 0.066 -483 P 0.059 -484 N 0.058 -485 L 0.066 -486 F 0.090 -487 L 0.139 -488 H 0.203 -489 Q 0.263 -490 G 0.307 -491 R 0.337 -492 P 0.352 -493 P 0.353 -494 K 0.344 -495 L 0.332 -496 P 0.317 -497 K 0.294 -498 G 0.258 -499 K 0.219 -500 E 0.187 -501 K 0.164 -502 Q 0.148 -503 L 0.136 -504 A 0.122 -505 E 0.104 -506 G 0.086 -507 A 0.073 -508 A 0.068 -509 E 0.070 -510 V 0.073 -511 V 0.071 -512 Q 0.062 -513 I 0.052 -514 M 0.046 -515 V 0.042 -516 H 0.039 -517 Y 0.040 -518 Q 0.045 -519 D 0.049 -520 L 0.049 -521 L 0.046 -522 W 0.046 -523 T 0.050 -524 V 0.054 -525 A 0.053 -526 S 0.050 -527 F 0.048 -528 L 0.054 -529 V 0.066 -530 A 0.077 -531 Q 0.080 -532 V 0.085 -533 R 0.103 -534 K 0.137 -535 L 0.183 -536 N 0.227 -537 D 0.255 -538 S 0.266 -539 S 0.273 -540 S 0.287 -541 R 0.312 -542 R 0.338 -543 P 0.350 -544 Q 0.343 -545 L 0.327 -546 C 0.309 -547 D 0.287 -548 A 0.261 -549 G 0.229 -550 L 0.195 -551 K 0.166 -552 T 0.147 -553 W 0.139 -554 L 0.138 -555 R 0.147 -556 R 0.163 -557 M 0.188 -558 H 0.224 -559 A 0.273 -560 D 0.334 -561 R 0.400 -562 D 0.466 -563 K 0.529 -564 A 0.588 -565 G 0.641 -566 D 0.673 -567 G 0.675 -568 L 0.645 -569 E 0.590 -570 A 0.518 -571 T 0.437 -572 P 0.350 -573 K 0.263 -574 V 0.185 -575 A 0.128 -576 K 0.095 -577 I 0.083 -578 Q 0.083 -579 V 0.084 -580 V 0.082 -581 W 0.082 -582 P 0.089 -583 I 0.103 -584 K 0.116 -585 D 0.120 -586 P 0.115 -587 L 0.108 -588 K 0.105 -589 V 0.104 -590 P 0.104 -591 L 0.104 -592 T 0.106 -593 P 0.110 -594 S 0.107 -595 T 0.097 -596 K 0.084 -597 V 0.077 -598 A 0.077 -599 H 0.077 -600 V 0.075 -601 L 0.074 -602 R 0.075 -603 Q 0.084 -604 F 0.107 -605 T 0.146 -606 E 0.195 -607 H 0.250 -608 L 0.320 -609 S 0.409 -610 P 0.504 -611 G 0.582 -612 S 0.632 -613 K 0.657 -614 G 0.665 -615 Q 0.665 -616 E 0.662 -617 D 0.651 -618 S 0.628 -619 E 0.597 -620 D 0.560 -621 M 0.519 -622 D 0.473 -623 S 0.426 -624 L 0.389 -625 L 0.380 -626 L 0.411 -627 H 0.457 -628 H 0.487 -629 R 0.492 -630 S 0.479 -631 M 0.445 -632 E 0.384 -633 S 0.305 -634 A 0.228 -635 N 0.165 -636 I 0.120 -637 L 0.091 -638 L 0.080 -639 Y 0.088 -640 E 0.110 -641 V 0.133 -642 G 0.142 -643 G 0.137 -644 N 0.123 -645 I 0.109 -646 N 0.095 -647 E 0.085 -648 H 0.083 -649 R 0.093 -650 L 0.105 -651 D 0.103 -652 P 0.086 -653 D 0.064 -654 A 0.046 -655 Y 0.034 -656 L 0.029 -657 L 0.030 -658 D 0.034 -659 L 0.041 -660 Y 0.049 -661 R 0.062 -662 A 0.082 -663 N 0.106 -664 P 0.128 -665 H 0.139 -666 G 0.134 -667 E 0.117 -668 W 0.098 -669 V 0.085 -670 L 0.080 -671 K 0.088 -672 Q 0.109 -673 N 0.134 -674 P 0.151 -675 T 0.157 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000124143.12_ENST00000373345.9_GN:ARHGAP40_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:42.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000124143.12_ENST00000373345.9_GN:ARHGAP40_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:42.caid deleted file mode 100644 index 1a783d1b3e853474cc4056d90670cb5a26bf1228..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000124143.12_ENST00000373345.9_GN:ARHGAP40_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:42.caid +++ /dev/null @@ -1,718 +0,0 @@ ->ENSG00000124143.12|ENST00000373345.9|GN:ARHGAP40|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:42 -1 M 0.364 -2 R 0.387 -3 V 0.427 -4 S 0.473 -5 G 0.507 -6 N 0.519 -7 W 0.518 -8 V 0.516 -9 R 0.512 -10 H 0.517 -11 G 0.545 -12 G 0.588 -13 P 0.623 -14 T 0.634 -15 S 0.617 -16 L 0.587 -17 L 0.573 -18 P 0.584 -19 L 0.603 -20 T 0.617 -21 L 0.631 -22 P 0.644 -23 I 0.650 -24 E 0.648 -25 S 0.643 -26 A 0.648 -27 P 0.663 -28 R 0.682 -29 R 0.700 -30 Q 0.708 -31 H 0.708 -32 H 0.708 -33 D 0.711 -34 R 0.718 -35 P 0.724 -36 G 0.728 -37 S 0.730 -38 S 0.730 -39 R 0.726 -40 C 0.723 -41 Q 0.727 -42 P 0.737 -43 M 0.745 -44 A 0.749 -45 E 0.751 -46 P 0.747 -47 A 0.734 -48 L 0.716 -49 L 0.696 -50 P 0.664 -51 A 0.618 -52 A 0.595 -53 Q 0.627 -54 M 0.685 -55 E 0.721 -56 R 0.726 -57 L 0.720 -58 A 0.718 -59 P 0.728 -60 G 0.748 -61 P 0.765 -62 L 0.768 -63 A 0.756 -64 S 0.739 -65 P 0.729 -66 C 0.730 -67 P 0.736 -68 R 0.738 -69 I 0.732 -70 P 0.725 -71 R 0.715 -72 A 0.685 -73 R 0.620 -74 I 0.533 -75 A 0.447 -76 R 0.385 -77 R 0.361 -78 C 0.366 -79 A 0.379 -80 Q 0.400 -81 R 0.451 -82 W 0.528 -83 A 0.609 -84 D 0.673 -85 L 0.712 -86 G 0.734 -87 C 0.745 -88 S 0.749 -89 S 0.749 -90 G 0.751 -91 P 0.759 -92 S 0.771 -93 S 0.782 -94 G 0.786 -95 R 0.783 -96 M 0.771 -97 D 0.748 -98 Q 0.717 -99 L 0.682 -100 P 0.639 -101 Q 0.590 -102 K 0.566 -103 N 0.584 -104 L 0.616 -105 L 0.637 -106 R 0.649 -107 L 0.665 -108 H 0.691 -109 P 0.726 -110 A 0.759 -111 G 0.780 -112 S 0.787 -113 A 0.787 -114 G 0.785 -115 C 0.783 -116 S 0.780 -117 T 0.777 -118 G 0.772 -119 V 0.755 -120 E 0.718 -121 S 0.661 -122 S 0.583 -123 S 0.490 -124 M 0.408 -125 D 0.354 -126 G 0.308 -127 F 0.242 -128 W 0.172 -129 M 0.128 -130 E 0.113 -131 V 0.115 -132 E 0.125 -133 Q 0.137 -134 I 0.148 -135 Q 0.159 -136 Q 0.174 -137 R 0.197 -138 D 0.231 -139 E 0.275 -140 L 0.321 -141 R 0.362 -142 E 0.412 -143 E 0.478 -144 D 0.550 -145 S 0.611 -146 G 0.653 -147 G 0.674 -148 N 0.673 -149 E 0.653 -150 G 0.614 -151 Q 0.562 -152 L 0.509 -153 P 0.467 -154 E 0.431 -155 E 0.391 -156 G 0.334 -157 E 0.257 -158 A 0.185 -159 E 0.139 -160 S 0.112 -161 Q 0.095 -162 W 0.087 -163 L 0.086 -164 Q 0.098 -165 D 0.122 -166 T 0.148 -167 G 0.162 -168 L 0.169 -169 S 0.175 -170 G 0.178 -171 L 0.179 -172 L 0.191 -173 G 0.216 -174 G 0.240 -175 L 0.248 -176 G 0.241 -177 L 0.229 -178 D 0.218 -179 G 0.200 -180 D 0.168 -181 H 0.128 -182 Q 0.097 -183 E 0.083 -184 L 0.085 -185 L 0.099 -186 S 0.126 -187 T 0.158 -188 L 0.175 -189 T 0.157 -190 Q 0.119 -191 T 0.089 -192 Q 0.074 -193 V 0.066 -194 A 0.063 -195 A 0.063 -196 V 0.064 -197 C 0.061 -198 R 0.055 -199 R 0.051 -200 L 0.050 -201 D 0.049 -202 I 0.043 -203 Y 0.036 -204 A 0.034 -205 R 0.042 -206 S 0.057 -207 V 0.079 -208 R 0.102 -209 R 0.129 -210 Q 0.163 -211 H 0.208 -212 K 0.261 -213 T 0.311 -214 P 0.337 -215 V 0.326 -216 R 0.287 -217 D 0.249 -218 V 0.239 -219 R 0.259 -220 D 0.285 -221 V 0.307 -222 F 0.343 -223 G 0.399 -224 V 0.458 -225 F 0.514 -226 N 0.576 -227 S 0.638 -228 G 0.686 -229 K 0.713 -230 M 0.728 -231 S 0.740 -232 S 0.753 -233 E 0.764 -234 N 0.770 -235 G 0.767 -236 D 0.747 -237 S 0.697 -238 G 0.630 -239 M 0.580 -240 K 0.554 -241 G 0.510 -242 A 0.453 -243 Q 0.446 -244 L 0.495 -245 S 0.539 -246 S 0.567 -247 G 0.606 -248 A 0.644 -249 S 0.653 -250 K 0.644 -251 F 0.648 -252 P 0.682 -253 P 0.728 -254 A 0.762 -255 A 0.778 -256 E 0.785 -257 P 0.792 -258 G 0.799 -259 G 0.801 -260 L 0.794 -261 Q 0.782 -262 E 0.770 -263 Q 0.761 -264 A 0.751 -265 G 0.727 -266 R 0.682 -267 E 0.621 -268 E 0.551 -269 A 0.478 -270 F 0.414 -271 N 0.365 -272 M 0.331 -273 D 0.300 -274 S 0.265 -275 A 0.232 -276 Y 0.212 -277 S 0.205 -278 E 0.197 -279 Q 0.179 -280 A 0.159 -281 A 0.155 -282 V 0.168 -283 L 0.187 -284 L 0.211 -285 Q 0.249 -286 R 0.305 -287 S 0.379 -288 R 0.470 -289 P 0.568 -290 S 0.654 -291 R 0.714 -292 G 0.742 -293 G 0.747 -294 T 0.732 -295 S 0.704 -296 A 0.668 -297 W 0.636 -298 G 0.614 -299 K 0.588 -300 C 0.543 -301 S 0.480 -302 L 0.413 -303 P 0.360 -304 K 0.334 -305 F 0.334 -306 T 0.337 -307 V 0.319 -308 P 0.289 -309 K 0.265 -310 G 0.250 -311 R 0.240 -312 L 0.226 -313 G 0.205 -314 V 0.181 -315 T 0.157 -316 R 0.137 -317 I 0.125 -318 G 0.123 -319 D 0.125 -320 L 0.124 -321 S 0.113 -322 L 0.098 -323 Q 0.085 -324 D 0.077 -325 M 0.072 -326 R 0.070 -327 K 0.072 -328 V 0.076 -329 P 0.080 -330 S 0.085 -331 L 0.092 -332 A 0.101 -333 L 0.106 -334 I 0.105 -335 E 0.102 -336 L 0.102 -337 T 0.100 -338 A 0.096 -339 L 0.092 -340 C 0.092 -341 D 0.097 -342 I 0.108 -343 L 0.125 -344 G 0.143 -345 L 0.158 -346 D 0.165 -347 L 0.164 -348 K 0.166 -349 R 0.186 -350 S 0.226 -351 K 0.278 -352 A 0.321 -353 G 0.340 -354 K 0.338 -355 W 0.331 -356 K 0.326 -357 A 0.312 -358 A 0.277 -359 E 0.222 -360 T 0.167 -361 R 0.130 -362 L 0.117 -363 F 0.120 -364 G 0.127 -365 V 0.132 -366 P 0.129 -367 L 0.117 -368 D 0.103 -369 S 0.097 -370 L 0.100 -371 L 0.106 -372 E 0.107 -373 A 0.104 -374 D 0.102 -375 H 0.101 -376 K 0.104 -377 V 0.113 -378 L 0.121 -379 P 0.118 -380 S 0.109 -381 T 0.102 -382 Q 0.102 -383 V 0.099 -384 P 0.089 -385 L 0.075 -386 V 0.064 -387 L 0.057 -388 Q 0.053 -389 A 0.054 -390 L 0.061 -391 L 0.068 -392 S 0.070 -393 C 0.062 -394 L 0.052 -395 E 0.046 -396 K 0.048 -397 R 0.055 -398 G 0.064 -399 L 0.074 -400 D 0.082 -401 M 0.092 -402 E 0.103 -403 G 0.113 -404 I 0.115 -405 L 0.114 -406 R 0.118 -407 V 0.129 -408 P 0.138 -409 G 0.135 -410 S 0.116 -411 Q 0.090 -412 A 0.067 -413 R 0.054 -414 V 0.050 -415 K 0.052 -416 G 0.055 -417 L 0.058 -418 E 0.059 -419 Q 0.056 -420 K 0.051 -421 L 0.048 -422 E 0.047 -423 R 0.046 -424 D 0.045 -425 F 0.048 -426 Y 0.058 -427 A 0.072 -428 G 0.083 -429 L 0.084 -430 F 0.075 -431 S 0.063 -432 W 0.057 -433 D 0.061 -434 E 0.070 -435 V 0.081 -436 H 0.095 -437 H 0.112 -438 N 0.130 -439 D 0.139 -440 A 0.137 -441 S 0.133 -442 D 0.133 -443 L 0.127 -444 L 0.110 -445 K 0.087 -446 R 0.069 -447 F 0.059 -448 I 0.056 -449 R 0.058 -450 K 0.064 -451 L 0.068 -452 P 0.066 -453 T 0.064 -454 P 0.066 -455 L 0.068 -456 L 0.066 -457 T 0.064 -458 A 0.065 -459 E 0.067 -460 Y 0.063 -461 L 0.056 -462 P 0.049 -463 A 0.047 -464 F 0.047 -465 A 0.053 -466 V 0.061 -467 V 0.069 -468 P 0.073 -469 N 0.078 -470 I 0.080 -471 P 0.074 -472 N 0.063 -473 L 0.053 -474 K 0.046 -475 Q 0.043 -476 R 0.044 -477 L 0.049 -478 Q 0.056 -479 V 0.061 -480 L 0.064 -481 H 0.066 -482 L 0.069 -483 L 0.068 -484 I 0.064 -485 L 0.061 -486 I 0.061 -487 L 0.063 -488 P 0.062 -489 E 0.059 -490 P 0.058 -491 N 0.058 -492 R 0.059 -493 N 0.064 -494 A 0.070 -495 L 0.076 -496 K 0.080 -497 A 0.082 -498 L 0.081 -499 L 0.074 -500 E 0.062 -501 F 0.051 -502 L 0.044 -503 R 0.041 -504 K 0.045 -505 V 0.054 -506 V 0.061 -507 A 0.063 -508 R 0.061 -509 E 0.065 -510 Q 0.075 -511 H 0.086 -512 N 0.092 -513 K 0.092 -514 M 0.086 -515 T 0.076 -516 L 0.068 -517 R 0.069 -518 N 0.076 -519 V 0.080 -520 S 0.079 -521 T 0.077 -522 V 0.078 -523 M 0.075 -524 A 0.068 -525 P 0.061 -526 N 0.060 -527 L 0.067 -528 F 0.091 -529 L 0.140 -530 H 0.204 -531 Q 0.263 -532 G 0.308 -533 R 0.337 -534 P 0.352 -535 P 0.352 -536 K 0.342 -537 L 0.330 -538 P 0.317 -539 K 0.293 -540 G 0.257 -541 K 0.218 -542 E 0.187 -543 K 0.164 -544 Q 0.149 -545 L 0.136 -546 A 0.123 -547 E 0.105 -548 G 0.087 -549 A 0.074 -550 A 0.069 -551 E 0.071 -552 V 0.075 -553 V 0.072 -554 Q 0.063 -555 I 0.053 -556 M 0.047 -557 V 0.043 -558 H 0.040 -559 Y 0.040 -560 Q 0.045 -561 D 0.049 -562 L 0.049 -563 L 0.046 -564 W 0.045 -565 T 0.049 -566 V 0.053 -567 A 0.053 -568 S 0.050 -569 F 0.048 -570 L 0.054 -571 V 0.066 -572 A 0.076 -573 Q 0.079 -574 V 0.084 -575 R 0.101 -576 K 0.135 -577 L 0.179 -578 N 0.220 -579 D 0.247 -580 S 0.258 -581 S 0.265 -582 S 0.279 -583 R 0.304 -584 R 0.330 -585 P 0.342 -586 Q 0.337 -587 L 0.321 -588 C 0.302 -589 D 0.281 -590 A 0.254 -591 G 0.222 -592 L 0.188 -593 K 0.160 -594 T 0.143 -595 W 0.136 -596 L 0.136 -597 R 0.145 -598 R 0.161 -599 M 0.185 -600 H 0.221 -601 A 0.270 -602 D 0.328 -603 R 0.392 -604 D 0.458 -605 K 0.523 -606 A 0.586 -607 G 0.640 -608 D 0.674 -609 G 0.674 -610 L 0.644 -611 E 0.588 -612 A 0.516 -613 T 0.434 -614 P 0.348 -615 K 0.262 -616 V 0.185 -617 A 0.128 -618 K 0.095 -619 I 0.083 -620 Q 0.083 -621 V 0.083 -622 V 0.082 -623 W 0.081 -624 P 0.089 -625 I 0.103 -626 K 0.116 -627 D 0.120 -628 P 0.115 -629 L 0.109 -630 K 0.106 -631 V 0.106 -632 P 0.105 -633 L 0.105 -634 T 0.108 -635 P 0.112 -636 S 0.110 -637 T 0.099 -638 K 0.086 -639 V 0.078 -640 A 0.077 -641 H 0.078 -642 V 0.075 -643 L 0.074 -644 R 0.076 -645 Q 0.084 -646 F 0.106 -647 T 0.144 -648 E 0.191 -649 H 0.246 -650 L 0.317 -651 S 0.408 -652 P 0.504 -653 G 0.583 -654 S 0.633 -655 K 0.659 -656 G 0.667 -657 Q 0.668 -658 E 0.664 -659 D 0.653 -660 S 0.631 -661 E 0.599 -662 D 0.562 -663 M 0.520 -664 D 0.474 -665 S 0.426 -666 L 0.387 -667 L 0.378 -668 L 0.409 -669 H 0.456 -670 H 0.488 -671 R 0.494 -672 S 0.479 -673 M 0.442 -674 E 0.380 -675 S 0.302 -676 A 0.226 -677 N 0.165 -678 I 0.121 -679 L 0.092 -680 L 0.080 -681 Y 0.087 -682 E 0.109 -683 V 0.131 -684 G 0.140 -685 G 0.135 -686 N 0.123 -687 I 0.109 -688 N 0.095 -689 E 0.084 -690 H 0.082 -691 R 0.092 -692 L 0.105 -693 D 0.104 -694 P 0.087 -695 D 0.064 -696 A 0.046 -697 Y 0.035 -698 L 0.030 -699 L 0.030 -700 D 0.034 -701 L 0.039 -702 Y 0.047 -703 R 0.059 -704 A 0.079 -705 N 0.103 -706 P 0.123 -707 H 0.134 -708 G 0.131 -709 E 0.116 -710 W 0.097 -711 V 0.084 -712 L 0.079 -713 K 0.086 -714 Q 0.107 -715 N 0.132 -716 P 0.149 -717 T 0.155 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000127530.4_ENST00000641666.2_GN:OR7C1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000127530.4_ENST00000641666.2_GN:OR7C1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index dba05f2e9e00885bdc3cfacd354662f1d117fe8a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000127530.4_ENST00000641666.2_GN:OR7C1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,321 +0,0 @@ ->ENSG00000127530.4|ENST00000641666.2|GN:OR7C1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.445 -2 E 0.461 -3 T 0.489 -4 G 0.513 -5 N 0.514 -6 Q 0.486 -7 T 0.433 -8 H 0.368 -9 A 0.299 -10 Q 0.235 -11 E 0.187 -12 F 0.161 -13 L 0.152 -14 L 0.152 -15 L 0.162 -16 G 0.176 -17 F 0.187 -18 S 0.190 -19 A 0.180 -20 T 0.157 -21 S 0.128 -22 E 0.101 -23 I 0.081 -24 Q 0.068 -25 F 0.061 -26 I 0.057 -27 L 0.055 -28 F 0.053 -29 G 0.049 -30 L 0.044 -31 F 0.043 -32 L 0.044 -33 S 0.047 -34 M 0.048 -35 Y 0.047 -36 L 0.048 -37 V 0.055 -38 T 0.061 -39 F 0.064 -40 T 0.065 -41 G 0.070 -42 N 0.076 -43 L 0.080 -44 L 0.081 -45 I 0.079 -46 I 0.073 -47 L 0.068 -48 A 0.068 -49 I 0.073 -50 C 0.083 -51 S 0.095 -52 D 0.100 -53 S 0.097 -54 H 0.090 -55 L 0.083 -56 H 0.073 -57 T 0.061 -58 P 0.048 -59 M 0.038 -60 Y 0.032 -61 F 0.028 -62 F 0.030 -63 L 0.037 -64 S 0.046 -65 N 0.055 -66 L 0.060 -67 S 0.062 -68 F 0.062 -69 A 0.065 -70 D 0.073 -71 L 0.079 -72 C 0.078 -73 F 0.072 -74 T 0.069 -75 S 0.068 -76 T 0.069 -77 T 0.070 -78 V 0.071 -79 P 0.071 -80 K 0.070 -81 M 0.069 -82 L 0.068 -83 L 0.068 -84 N 0.068 -85 I 0.069 -86 L 0.074 -87 T 0.084 -88 Q 0.092 -89 N 0.088 -90 K 0.075 -91 F 0.060 -92 I 0.050 -93 T 0.044 -94 Y 0.040 -95 A 0.039 -96 G 0.040 -97 C 0.039 -98 L 0.038 -99 S 0.037 -100 Q 0.037 -101 I 0.037 -102 F 0.034 -103 F 0.031 -104 F 0.028 -105 T 0.027 -106 S 0.027 -107 F 0.028 -108 G 0.032 -109 C 0.040 -110 L 0.048 -111 D 0.053 -112 N 0.053 -113 L 0.049 -114 L 0.045 -115 L 0.042 -116 T 0.039 -117 V 0.036 -118 M 0.035 -119 A 0.036 -120 Y 0.040 -121 D 0.044 -122 R 0.045 -123 F 0.044 -124 V 0.042 -125 A 0.043 -126 V 0.047 -127 C 0.052 -128 H 0.058 -129 P 0.059 -130 L 0.056 -131 H 0.052 -132 Y 0.049 -133 T 0.050 -134 V 0.055 -135 I 0.064 -136 M 0.073 -137 N 0.076 -138 P 0.076 -139 Q 0.072 -140 L 0.063 -141 C 0.059 -142 G 0.065 -143 L 0.073 -144 L 0.077 -145 V 0.080 -146 L 0.085 -147 G 0.087 -148 S 0.081 -149 W 0.072 -150 C 0.065 -151 I 0.067 -152 S 0.072 -153 V 0.076 -154 M 0.081 -155 G 0.088 -156 S 0.090 -157 L 0.087 -158 L 0.087 -159 E 0.090 -160 T 0.088 -161 L 0.086 -162 T 0.085 -163 V 0.086 -164 L 0.089 -165 R 0.097 -166 L 0.105 -167 S 0.106 -168 F 0.106 -169 C 0.116 -170 T 0.131 -171 E 0.148 -172 M 0.161 -173 E 0.171 -174 I 0.169 -175 P 0.149 -176 H 0.119 -177 F 0.093 -178 F 0.079 -179 C 0.076 -180 D 0.083 -181 L 0.096 -182 L 0.110 -183 E 0.122 -184 V 0.130 -185 L 0.136 -186 K 0.139 -187 L 0.134 -188 A 0.124 -189 C 0.117 -190 S 0.121 -191 D 0.129 -192 T 0.131 -193 F 0.122 -194 I 0.112 -195 N 0.105 -196 N 0.102 -197 V 0.100 -198 V 0.099 -199 I 0.095 -200 Y 0.088 -201 F 0.084 -202 A 0.083 -203 T 0.082 -204 G 0.079 -205 V 0.077 -206 L 0.077 -207 G 0.076 -208 V 0.071 -209 I 0.068 -210 S 0.070 -211 F 0.072 -212 T 0.076 -213 G 0.080 -214 I 0.077 -215 F 0.064 -216 F 0.051 -217 S 0.044 -218 Y 0.041 -219 Y 0.041 -220 K 0.047 -221 I 0.058 -222 V 0.071 -223 F 0.082 -224 S 0.085 -225 I 0.084 -226 L 0.087 -227 R 0.101 -228 I 0.123 -229 S 0.144 -230 S 0.156 -231 A 0.157 -232 G 0.145 -233 R 0.123 -234 K 0.103 -235 H 0.092 -236 K 0.092 -237 A 0.093 -238 F 0.092 -239 S 0.091 -240 T 0.091 -241 C 0.091 -242 G 0.091 -243 S 0.088 -244 H 0.080 -245 L 0.071 -246 S 0.065 -247 V 0.061 -248 V 0.054 -249 T 0.042 -250 L 0.032 -251 F 0.027 -252 Y 0.028 -253 G 0.032 -254 T 0.036 -255 G 0.040 -256 F 0.043 -257 G 0.042 -258 V 0.040 -259 Y 0.040 -260 L 0.048 -261 S 0.066 -262 S 0.095 -263 A 0.133 -264 A 0.172 -265 T 0.202 -266 P 0.213 -267 S 0.204 -268 S 0.180 -269 R 0.150 -270 T 0.127 -271 S 0.114 -272 L 0.107 -273 V 0.100 -274 A 0.094 -275 S 0.087 -276 V 0.084 -277 M 0.090 -278 Y 0.103 -279 T 0.115 -280 M 0.124 -281 V 0.130 -282 T 0.131 -283 P 0.122 -284 M 0.108 -285 L 0.098 -286 N 0.090 -287 P 0.083 -288 F 0.080 -289 I 0.082 -290 Y 0.085 -291 S 0.092 -292 L 0.106 -293 R 0.117 -294 N 0.109 -295 T 0.089 -296 D 0.074 -297 M 0.071 -298 K 0.077 -299 R 0.085 -300 A 0.089 -301 L 0.091 -302 G 0.098 -303 R 0.105 -304 L 0.111 -305 L 0.121 -306 S 0.143 -307 R 0.179 -308 A 0.223 -309 T 0.273 -310 F 0.324 -311 F 0.380 -312 N 0.444 -313 G 0.505 -314 D 0.536 -315 I 0.517 -316 T 0.471 -317 A 0.448 -318 G 0.454 -319 L 0.452 -320 S 0.434 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000127530.4_ENST00000641666.2_GN:OR7C1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:25.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000127530.4_ENST00000641666.2_GN:OR7C1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:25.caid deleted file mode 100644 index bb70ababf6e49b1ca843d6e14341e0b3b5f2c2f9..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000127530.4_ENST00000641666.2_GN:OR7C1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:25.caid +++ /dev/null @@ -1,346 +0,0 @@ ->ENSG00000127530.4|ENST00000641666.2|GN:OR7C1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:25 -1 M 0.240 -2 V 0.231 -3 A 0.228 -4 K 0.241 -5 K 0.259 -6 R 0.273 -7 M 0.283 -8 E 0.299 -9 E 0.322 -10 F 0.345 -11 Q 0.368 -12 M 0.396 -13 P 0.423 -14 Q 0.437 -15 K 0.435 -16 K 0.433 -17 T 0.443 -18 A 0.457 -19 R 0.456 -20 K 0.437 -21 S 0.418 -22 Y 0.419 -23 F 0.441 -24 I 0.476 -25 P 0.510 -26 M 0.540 -27 E 0.564 -28 T 0.578 -29 G 0.577 -30 N 0.555 -31 Q 0.512 -32 T 0.452 -33 H 0.383 -34 A 0.311 -35 Q 0.243 -36 E 0.192 -37 F 0.163 -38 L 0.152 -39 L 0.152 -40 L 0.161 -41 G 0.176 -42 F 0.187 -43 S 0.190 -44 A 0.180 -45 T 0.157 -46 S 0.128 -47 E 0.101 -48 I 0.080 -49 Q 0.065 -50 F 0.056 -51 I 0.051 -52 L 0.050 -53 F 0.052 -54 G 0.050 -55 L 0.047 -56 F 0.046 -57 L 0.048 -58 S 0.050 -59 M 0.050 -60 Y 0.048 -61 L 0.048 -62 V 0.054 -63 T 0.060 -64 F 0.063 -65 T 0.065 -66 G 0.071 -67 N 0.077 -68 L 0.082 -69 L 0.084 -70 I 0.082 -71 I 0.075 -72 L 0.069 -73 A 0.067 -74 I 0.071 -75 C 0.079 -76 S 0.090 -77 D 0.095 -78 S 0.093 -79 H 0.087 -80 L 0.078 -81 H 0.069 -82 T 0.057 -83 P 0.046 -84 M 0.036 -85 Y 0.030 -86 F 0.027 -87 F 0.029 -88 L 0.037 -89 S 0.047 -90 N 0.056 -91 L 0.061 -92 S 0.062 -93 F 0.062 -94 A 0.065 -95 D 0.073 -96 L 0.079 -97 C 0.078 -98 F 0.073 -99 T 0.069 -100 S 0.068 -101 T 0.067 -102 T 0.067 -103 V 0.067 -104 P 0.065 -105 K 0.063 -106 M 0.062 -107 L 0.060 -108 L 0.059 -109 N 0.058 -110 I 0.059 -111 L 0.065 -112 T 0.075 -113 Q 0.084 -114 N 0.082 -115 K 0.070 -116 F 0.057 -117 I 0.047 -118 T 0.041 -119 Y 0.038 -120 A 0.037 -121 G 0.039 -122 C 0.038 -123 L 0.036 -124 S 0.035 -125 Q 0.035 -126 I 0.035 -127 F 0.033 -128 F 0.030 -129 F 0.027 -130 T 0.026 -131 S 0.026 -132 F 0.028 -133 G 0.032 -134 C 0.039 -135 L 0.047 -136 D 0.052 -137 N 0.052 -138 L 0.048 -139 L 0.044 -140 L 0.041 -141 T 0.038 -142 V 0.036 -143 M 0.035 -144 A 0.036 -145 Y 0.040 -146 D 0.043 -147 R 0.045 -148 F 0.044 -149 V 0.042 -150 A 0.043 -151 V 0.047 -152 C 0.053 -153 H 0.058 -154 P 0.060 -155 L 0.056 -156 H 0.052 -157 Y 0.050 -158 T 0.051 -159 V 0.057 -160 I 0.066 -161 M 0.075 -162 N 0.078 -163 P 0.077 -164 Q 0.071 -165 L 0.063 -166 C 0.059 -167 G 0.065 -168 L 0.072 -169 L 0.075 -170 V 0.076 -171 L 0.079 -172 G 0.081 -173 S 0.077 -174 W 0.068 -175 C 0.063 -176 I 0.066 -177 S 0.072 -178 V 0.077 -179 M 0.082 -180 G 0.089 -181 S 0.092 -182 L 0.089 -183 L 0.089 -184 E 0.091 -185 T 0.089 -186 L 0.086 -187 T 0.086 -188 V 0.086 -189 L 0.090 -190 R 0.098 -191 L 0.106 -192 S 0.107 -193 F 0.107 -194 C 0.114 -195 T 0.129 -196 E 0.145 -197 M 0.159 -198 E 0.168 -199 I 0.166 -200 P 0.146 -201 H 0.116 -202 F 0.091 -203 F 0.077 -204 C 0.076 -205 D 0.084 -206 L 0.097 -207 L 0.110 -208 E 0.120 -209 V 0.128 -210 L 0.133 -211 K 0.135 -212 L 0.130 -213 A 0.119 -214 C 0.112 -215 S 0.115 -216 D 0.123 -217 T 0.125 -218 F 0.117 -219 I 0.108 -220 N 0.101 -221 N 0.098 -222 V 0.097 -223 V 0.097 -224 I 0.093 -225 Y 0.087 -226 F 0.082 -227 A 0.082 -228 T 0.081 -229 G 0.079 -230 V 0.077 -231 L 0.078 -232 G 0.076 -233 V 0.072 -234 I 0.069 -235 S 0.070 -236 F 0.073 -237 T 0.076 -238 G 0.080 -239 I 0.077 -240 F 0.065 -241 F 0.052 -242 S 0.044 -243 Y 0.041 -244 Y 0.042 -245 K 0.047 -246 I 0.058 -247 V 0.071 -248 F 0.082 -249 S 0.085 -250 I 0.084 -251 L 0.086 -252 R 0.100 -253 I 0.122 -254 S 0.143 -255 S 0.157 -256 A 0.159 -257 G 0.148 -258 R 0.126 -259 K 0.105 -260 H 0.094 -261 K 0.093 -262 A 0.094 -263 F 0.093 -264 S 0.092 -265 T 0.092 -266 C 0.092 -267 G 0.092 -268 S 0.088 -269 H 0.081 -270 L 0.071 -271 S 0.066 -272 V 0.062 -273 V 0.055 -274 T 0.043 -275 L 0.032 -276 F 0.027 -277 Y 0.028 -278 G 0.031 -279 T 0.035 -280 G 0.039 -281 F 0.042 -282 G 0.042 -283 V 0.039 -284 Y 0.039 -285 L 0.047 -286 S 0.066 -287 S 0.095 -288 A 0.135 -289 A 0.176 -290 T 0.209 -291 P 0.223 -292 S 0.215 -293 S 0.190 -294 R 0.159 -295 T 0.135 -296 S 0.121 -297 L 0.113 -298 V 0.106 -299 A 0.099 -300 S 0.091 -301 V 0.089 -302 M 0.095 -303 Y 0.108 -304 T 0.120 -305 M 0.128 -306 V 0.134 -307 T 0.134 -308 P 0.124 -309 M 0.111 -310 L 0.100 -311 N 0.092 -312 P 0.085 -313 F 0.082 -314 I 0.084 -315 Y 0.087 -316 S 0.094 -317 L 0.109 -318 R 0.119 -319 N 0.111 -320 T 0.091 -321 D 0.074 -322 M 0.070 -323 K 0.077 -324 R 0.085 -325 A 0.088 -326 L 0.091 -327 G 0.097 -328 R 0.105 -329 L 0.111 -330 L 0.121 -331 S 0.143 -332 R 0.179 -333 A 0.224 -334 T 0.274 -335 F 0.328 -336 F 0.387 -337 N 0.455 -338 G 0.519 -339 D 0.551 -340 I 0.530 -341 T 0.483 -342 A 0.458 -343 G 0.463 -344 L 0.461 -345 S 0.442 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000128016.9_ENST00000597629.3_GN:ZFP36_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000128016.9_ENST00000597629.3_GN:ZFP36_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 0d761de2e737b86c929630eafebdb64db7872dc9..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000128016.9_ENST00000597629.3_GN:ZFP36_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,327 +0,0 @@ ->ENSG00000128016.9|ENST00000597629.3|GN:ZFP36|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.361 -2 D 0.361 -3 L 0.371 -4 T 0.395 -5 A 0.416 -6 I 0.422 -7 Y 0.425 -8 E 0.448 -9 S 0.487 -10 L 0.531 -11 L 0.577 -12 S 0.624 -13 L 0.659 -14 S 0.680 -15 P 0.697 -16 D 0.711 -17 V 0.718 -18 P 0.724 -19 V 0.737 -20 P 0.760 -21 S 0.786 -22 D 0.806 -23 H 0.815 -24 G 0.806 -25 G 0.763 -26 T 0.696 -27 E 0.651 -28 S 0.667 -29 S 0.715 -30 P 0.750 -31 G 0.753 -32 W 0.719 -33 G 0.662 -34 S 0.630 -35 S 0.659 -36 G 0.720 -37 P 0.767 -38 W 0.791 -39 S 0.803 -40 L 0.808 -41 S 0.813 -42 P 0.822 -43 S 0.830 -44 D 0.832 -45 S 0.828 -46 S 0.826 -47 P 0.834 -48 S 0.851 -49 G 0.868 -50 V 0.876 -51 T 0.875 -52 S 0.866 -53 R 0.858 -54 L 0.855 -55 P 0.861 -56 G 0.872 -57 R 0.882 -58 S 0.888 -59 T 0.890 -60 S 0.892 -61 L 0.893 -62 V 0.891 -63 E 0.886 -64 G 0.878 -65 R 0.871 -66 S 0.861 -67 C 0.844 -68 G 0.816 -69 W 0.782 -70 V 0.751 -71 P 0.736 -72 P 0.742 -73 P 0.765 -74 P 0.792 -75 G 0.810 -76 F 0.818 -77 A 0.824 -78 P 0.834 -79 L 0.845 -80 A 0.851 -81 P 0.854 -82 R 0.858 -83 L 0.862 -84 G 0.865 -85 P 0.869 -86 E 0.869 -87 L 0.862 -88 S 0.851 -89 P 0.843 -90 S 0.842 -91 P 0.845 -92 T 0.847 -93 S 0.848 -94 P 0.851 -95 T 0.853 -96 A 0.845 -97 T 0.821 -98 S 0.778 -99 T 0.717 -100 T 0.638 -101 P 0.541 -102 S 0.435 -103 R 0.341 -104 Y 0.269 -105 K 0.215 -106 T 0.178 -107 E 0.156 -108 L 0.138 -109 C 0.110 -110 R 0.080 -111 T 0.059 -112 F 0.051 -113 S 0.052 -114 E 0.058 -115 S 0.068 -116 G 0.078 -117 R 0.085 -118 C 0.088 -119 R 0.095 -120 Y 0.113 -121 G 0.136 -122 A 0.154 -123 K 0.164 -124 C 0.173 -125 Q 0.192 -126 F 0.219 -127 A 0.230 -128 H 0.210 -129 G 0.180 -130 L 0.172 -131 G 0.188 -132 E 0.220 -133 L 0.270 -134 R 0.344 -135 Q 0.432 -136 A 0.497 -137 N 0.504 -138 R 0.454 -139 H 0.375 -140 P 0.303 -141 K 0.256 -142 Y 0.230 -143 K 0.209 -144 T 0.188 -145 E 0.169 -146 L 0.145 -147 C 0.111 -148 H 0.077 -149 K 0.054 -150 F 0.048 -151 Y 0.052 -152 L 0.059 -153 Q 0.067 -154 G 0.077 -155 R 0.084 -156 C 0.088 -157 P 0.096 -158 Y 0.112 -159 G 0.130 -160 S 0.142 -161 R 0.145 -162 C 0.141 -163 H 0.132 -164 F 0.124 -165 I 0.127 -166 H 0.151 -167 N 0.200 -168 P 0.264 -169 S 0.341 -170 E 0.436 -171 D 0.536 -172 L 0.614 -173 A 0.659 -174 A 0.679 -175 P 0.687 -176 G 0.685 -177 H 0.682 -178 P 0.694 -179 P 0.723 -180 V 0.756 -181 L 0.780 -182 R 0.794 -183 Q 0.800 -184 S 0.797 -185 I 0.787 -186 S 0.779 -187 F 0.781 -188 S 0.787 -189 G 0.793 -190 L 0.798 -191 P 0.806 -192 S 0.817 -193 G 0.826 -194 R 0.827 -195 R 0.816 -196 T 0.792 -197 S 0.760 -198 P 0.739 -199 P 0.745 -200 P 0.773 -201 P 0.809 -202 G 0.836 -203 L 0.849 -204 A 0.846 -205 G 0.822 -206 P 0.754 -207 S 0.635 -208 L 0.526 -209 S 0.509 -210 S 0.566 -211 S 0.613 -212 S 0.639 -213 F 0.694 -214 S 0.767 -215 P 0.817 -216 S 0.831 -217 S 0.820 -218 S 0.800 -219 P 0.784 -220 P 0.785 -221 P 0.802 -222 P 0.826 -223 G 0.842 -224 D 0.847 -225 L 0.843 -226 P 0.836 -227 L 0.829 -228 S 0.827 -229 P 0.832 -230 S 0.841 -231 A 0.849 -232 F 0.850 -233 S 0.846 -234 A 0.837 -235 A 0.830 -236 P 0.829 -237 G 0.831 -238 T 0.836 -239 P 0.844 -240 L 0.849 -241 A 0.839 -242 R 0.811 -243 R 0.776 -244 D 0.747 -245 P 0.734 -246 T 0.728 -247 P 0.710 -248 V 0.657 -249 C 0.573 -250 C 0.491 -251 P 0.444 -252 S 0.444 -253 C 0.477 -254 R 0.521 -255 R 0.565 -256 A 0.612 -257 T 0.668 -258 P 0.725 -259 I 0.769 -260 S 0.790 -261 V 0.789 -262 W 0.777 -263 G 0.778 -264 P 0.798 -265 L 0.825 -266 G 0.843 -267 G 0.849 -268 L 0.844 -269 V 0.829 -270 R 0.811 -271 T 0.803 -272 P 0.811 -273 S 0.831 -274 V 0.849 -275 Q 0.859 -276 S 0.859 -277 L 0.851 -278 G 0.837 -279 S 0.821 -280 D 0.810 -281 P 0.810 -282 D 0.813 -283 E 0.802 -284 Y 0.760 -285 A 0.698 -286 S 0.670 -287 S 0.712 -288 G 0.785 -289 S 0.834 -290 S 0.850 -291 L 0.848 -292 G 0.842 -293 G 0.834 -294 S 0.825 -295 D 0.816 -296 S 0.812 -297 P 0.816 -298 V 0.825 -299 F 0.835 -300 E 0.842 -301 A 0.848 -302 G 0.847 -303 V 0.833 -304 F 0.808 -305 A 0.782 -306 P 0.768 -307 P 0.776 -308 Q 0.800 -309 P 0.828 -310 V 0.845 -311 A 0.847 -312 A 0.839 -313 P 0.827 -314 R 0.816 -315 R 0.807 -316 L 0.802 -317 P 0.803 -318 I 0.812 -319 F 0.826 -320 N 0.837 -321 R 0.839 -322 I 0.830 -323 S 0.803 -324 V 0.752 -325 S 0.682 -326 E 0.627 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000128016.9_ENST00000597629.3_GN:ZFP36_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000128016.9_ENST00000597629.3_GN:ZFP36_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid deleted file mode 100644 index 5a758b34c4d3134c71cb5aafaf260a97ee481855..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000128016.9_ENST00000597629.3_GN:ZFP36_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid +++ /dev/null @@ -1,333 +0,0 @@ ->ENSG00000128016.9|ENST00000597629.3|GN:ZFP36|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:6 -1 M 0.516 -2 A 0.548 -3 N 0.591 -4 R 0.629 -5 Y 0.652 -6 T 0.643 -7 M 0.589 -8 D 0.500 -9 L 0.411 -10 T 0.359 -11 A 0.339 -12 I 0.323 -13 Y 0.305 -14 E 0.319 -15 S 0.379 -16 L 0.461 -17 L 0.541 -18 S 0.609 -19 L 0.659 -20 S 0.691 -21 P 0.714 -22 D 0.731 -23 V 0.739 -24 P 0.744 -25 V 0.756 -26 P 0.777 -27 S 0.799 -28 D 0.816 -29 H 0.823 -30 G 0.813 -31 G 0.774 -32 T 0.710 -33 E 0.668 -34 S 0.683 -35 S 0.728 -36 P 0.761 -37 G 0.763 -38 W 0.728 -39 G 0.669 -40 S 0.634 -41 S 0.662 -42 G 0.724 -43 P 0.773 -44 W 0.799 -45 S 0.810 -46 L 0.815 -47 S 0.820 -48 P 0.828 -49 S 0.837 -50 D 0.839 -51 S 0.834 -52 S 0.832 -53 P 0.841 -54 S 0.858 -55 G 0.875 -56 V 0.884 -57 T 0.882 -58 S 0.874 -59 R 0.866 -60 L 0.863 -61 P 0.868 -62 G 0.879 -63 R 0.888 -64 S 0.892 -65 T 0.894 -66 S 0.895 -67 L 0.895 -68 V 0.892 -69 E 0.886 -70 G 0.879 -71 R 0.871 -72 S 0.861 -73 C 0.845 -74 G 0.817 -75 W 0.782 -76 V 0.751 -77 P 0.735 -78 P 0.741 -79 P 0.765 -80 P 0.792 -81 G 0.809 -82 F 0.815 -83 A 0.821 -84 P 0.831 -85 L 0.842 -86 A 0.848 -87 P 0.852 -88 R 0.856 -89 L 0.860 -90 G 0.863 -91 P 0.866 -92 E 0.865 -93 L 0.858 -94 S 0.847 -95 P 0.839 -96 S 0.837 -97 P 0.839 -98 T 0.841 -99 S 0.841 -100 P 0.844 -101 T 0.846 -102 A 0.839 -103 T 0.815 -104 S 0.772 -105 T 0.711 -106 T 0.632 -107 P 0.536 -108 S 0.432 -109 R 0.340 -110 Y 0.269 -111 K 0.215 -112 T 0.178 -113 E 0.157 -114 L 0.139 -115 C 0.112 -116 R 0.082 -117 T 0.061 -118 F 0.053 -119 S 0.054 -120 E 0.061 -121 S 0.070 -122 G 0.081 -123 R 0.087 -124 C 0.090 -125 R 0.097 -126 Y 0.115 -127 G 0.140 -128 A 0.158 -129 K 0.168 -130 C 0.177 -131 Q 0.197 -132 F 0.224 -133 A 0.235 -134 H 0.214 -135 G 0.185 -136 L 0.176 -137 G 0.193 -138 E 0.226 -139 L 0.277 -140 R 0.352 -141 Q 0.442 -142 A 0.507 -143 N 0.515 -144 R 0.463 -145 H 0.383 -146 P 0.308 -147 K 0.259 -148 Y 0.232 -149 K 0.210 -150 T 0.189 -151 E 0.170 -152 L 0.146 -153 C 0.112 -154 H 0.077 -155 K 0.055 -156 F 0.048 -157 Y 0.052 -158 L 0.059 -159 Q 0.068 -160 G 0.077 -161 R 0.084 -162 C 0.088 -163 P 0.096 -164 Y 0.111 -165 G 0.129 -166 S 0.141 -167 R 0.145 -168 C 0.140 -169 H 0.130 -170 F 0.122 -171 I 0.125 -172 H 0.150 -173 N 0.198 -174 P 0.262 -175 S 0.339 -176 E 0.435 -177 D 0.535 -178 L 0.614 -179 A 0.658 -180 A 0.678 -181 P 0.685 -182 G 0.684 -183 H 0.680 -184 P 0.692 -185 P 0.721 -186 V 0.755 -187 L 0.780 -188 R 0.794 -189 Q 0.800 -190 S 0.797 -191 I 0.787 -192 S 0.779 -193 F 0.780 -194 S 0.786 -195 G 0.791 -196 L 0.796 -197 P 0.804 -198 S 0.814 -199 G 0.823 -200 R 0.824 -201 R 0.813 -202 T 0.788 -203 S 0.756 -204 P 0.735 -205 P 0.740 -206 P 0.769 -207 P 0.804 -208 G 0.832 -209 L 0.845 -210 A 0.843 -211 G 0.818 -212 P 0.751 -213 S 0.633 -214 L 0.525 -215 S 0.508 -216 S 0.564 -217 S 0.611 -218 S 0.638 -219 F 0.691 -220 S 0.765 -221 P 0.815 -222 S 0.829 -223 S 0.818 -224 S 0.798 -225 P 0.783 -226 P 0.784 -227 P 0.802 -228 P 0.825 -229 G 0.841 -230 D 0.845 -231 L 0.841 -232 P 0.834 -233 L 0.828 -234 S 0.826 -235 P 0.831 -236 S 0.840 -237 A 0.847 -238 F 0.849 -239 S 0.844 -240 A 0.835 -241 A 0.829 -242 P 0.828 -243 G 0.830 -244 T 0.835 -245 P 0.843 -246 L 0.847 -247 A 0.838 -248 R 0.810 -249 R 0.774 -250 D 0.746 -251 P 0.733 -252 T 0.727 -253 P 0.709 -254 V 0.657 -255 C 0.572 -256 C 0.489 -257 P 0.443 -258 S 0.445 -259 C 0.480 -260 R 0.528 -261 R 0.573 -262 A 0.619 -263 T 0.672 -264 P 0.727 -265 I 0.769 -266 S 0.789 -267 V 0.786 -268 W 0.775 -269 G 0.777 -270 P 0.798 -271 L 0.825 -272 G 0.844 -273 G 0.851 -274 L 0.846 -275 V 0.832 -276 R 0.815 -277 T 0.807 -278 P 0.815 -279 S 0.834 -280 V 0.852 -281 Q 0.861 -282 S 0.862 -283 L 0.854 -284 G 0.839 -285 S 0.824 -286 D 0.815 -287 P 0.814 -288 D 0.817 -289 E 0.806 -290 Y 0.763 -291 A 0.700 -292 S 0.673 -293 S 0.715 -294 G 0.789 -295 S 0.838 -296 S 0.854 -297 L 0.852 -298 G 0.846 -299 G 0.839 -300 S 0.830 -301 D 0.821 -302 S 0.817 -303 P 0.820 -304 V 0.829 -305 F 0.838 -306 E 0.845 -307 A 0.850 -308 G 0.849 -309 V 0.836 -310 F 0.811 -311 A 0.785 -312 P 0.772 -313 P 0.780 -314 Q 0.805 -315 P 0.832 -316 V 0.849 -317 A 0.851 -318 A 0.842 -319 P 0.830 -320 R 0.818 -321 R 0.809 -322 L 0.804 -323 P 0.806 -324 I 0.815 -325 F 0.828 -326 N 0.839 -327 R 0.842 -328 I 0.832 -329 S 0.805 -330 V 0.754 -331 S 0.683 -332 E 0.628 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000128617.3_ENST00000249389.3_GN:OPN1SW_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000128617.3_ENST00000249389.3_GN:OPN1SW_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 2bcb9e19f3e65631a6962f325009c26c60f616b1..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000128617.3_ENST00000249389.3_GN:OPN1SW_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,346 +0,0 @@ ->ENSG00000128617.3|ENST00000249389.3|GN:OPN1SW|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.292 -2 S 0.286 -3 E 0.273 -4 E 0.246 -5 E 0.205 -6 F 0.162 -7 Y 0.131 -8 L 0.120 -9 F 0.126 -10 K 0.142 -11 N 0.159 -12 I 0.170 -13 S 0.179 -14 S 0.194 -15 V 0.218 -16 G 0.231 -17 P 0.222 -18 W 0.204 -19 D 0.190 -20 G 0.176 -21 P 0.160 -22 Q 0.147 -23 Y 0.144 -24 H 0.147 -25 I 0.143 -26 A 0.127 -27 P 0.102 -28 V 0.076 -29 W 0.054 -30 A 0.043 -31 F 0.038 -32 Y 0.038 -33 L 0.040 -34 Q 0.044 -35 A 0.049 -36 A 0.054 -37 F 0.063 -38 M 0.072 -39 G 0.072 -40 T 0.062 -41 V 0.048 -42 F 0.041 -43 L 0.043 -44 I 0.050 -45 G 0.054 -46 F 0.053 -47 P 0.049 -48 L 0.050 -49 N 0.054 -50 A 0.057 -51 M 0.057 -52 V 0.053 -53 L 0.047 -54 V 0.045 -55 A 0.045 -56 T 0.046 -57 L 0.044 -58 R 0.043 -59 Y 0.043 -60 K 0.045 -61 K 0.047 -62 L 0.049 -63 R 0.051 -64 Q 0.052 -65 P 0.050 -66 L 0.046 -67 N 0.043 -68 Y 0.044 -69 I 0.044 -70 L 0.044 -71 V 0.043 -72 N 0.044 -73 V 0.046 -74 S 0.048 -75 F 0.048 -76 G 0.049 -77 G 0.048 -78 F 0.045 -79 L 0.041 -80 L 0.036 -81 C 0.032 -82 I 0.030 -83 F 0.030 -84 S 0.033 -85 V 0.037 -86 F 0.041 -87 P 0.044 -88 V 0.047 -89 F 0.052 -90 V 0.061 -91 A 0.070 -92 S 0.076 -93 C 0.082 -94 N 0.088 -95 G 0.088 -96 Y 0.081 -97 F 0.072 -98 V 0.065 -99 F 0.061 -100 G 0.057 -101 R 0.051 -102 H 0.043 -103 V 0.038 -104 C 0.036 -105 A 0.036 -106 L 0.038 -107 E 0.041 -108 G 0.042 -109 F 0.041 -110 L 0.039 -111 G 0.036 -112 T 0.035 -113 V 0.035 -114 A 0.035 -115 G 0.036 -116 L 0.038 -117 V 0.037 -118 T 0.035 -119 G 0.032 -120 W 0.032 -121 S 0.033 -122 L 0.032 -123 A 0.029 -124 F 0.028 -125 L 0.031 -126 A 0.036 -127 F 0.041 -128 E 0.043 -129 R 0.042 -130 Y 0.040 -131 I 0.041 -132 V 0.050 -133 I 0.070 -134 C 0.099 -135 K 0.128 -136 P 0.145 -137 F 0.146 -138 G 0.140 -139 N 0.132 -140 F 0.120 -141 R 0.100 -142 F 0.076 -143 S 0.055 -144 S 0.040 -145 K 0.035 -146 H 0.037 -147 A 0.046 -148 L 0.060 -149 T 0.070 -150 V 0.069 -151 V 0.061 -152 L 0.057 -153 A 0.059 -154 T 0.063 -155 W 0.065 -156 T 0.067 -157 I 0.072 -158 G 0.077 -159 I 0.082 -160 G 0.087 -161 V 0.096 -162 S 0.104 -163 I 0.106 -164 P 0.105 -165 P 0.103 -166 F 0.102 -167 F 0.102 -168 G 0.102 -169 W 0.100 -170 S 0.099 -171 R 0.104 -172 F 0.117 -173 I 0.131 -174 P 0.136 -175 E 0.132 -176 G 0.124 -177 L 0.117 -178 Q 0.110 -179 C 0.102 -180 S 0.098 -181 C 0.106 -182 G 0.125 -183 P 0.140 -184 D 0.141 -185 W 0.131 -186 Y 0.128 -187 T 0.144 -188 V 0.172 -189 G 0.194 -190 T 0.202 -191 K 0.195 -192 Y 0.177 -193 R 0.150 -194 S 0.119 -195 E 0.095 -196 S 0.082 -197 Y 0.077 -198 T 0.072 -199 W 0.069 -200 F 0.069 -201 L 0.067 -202 F 0.060 -203 I 0.053 -204 F 0.050 -205 C 0.051 -206 F 0.053 -207 I 0.060 -208 V 0.069 -209 P 0.072 -210 L 0.065 -211 S 0.058 -212 L 0.056 -213 I 0.054 -214 C 0.047 -215 F 0.039 -216 S 0.033 -217 Y 0.031 -218 T 0.036 -219 Q 0.046 -220 L 0.057 -221 L 0.069 -222 R 0.076 -223 A 0.074 -224 L 0.071 -225 K 0.078 -226 A 0.093 -227 V 0.108 -228 A 0.126 -229 A 0.148 -230 Q 0.173 -231 Q 0.196 -232 Q 0.214 -233 E 0.223 -234 S 0.219 -235 A 0.204 -236 T 0.187 -237 T 0.167 -238 Q 0.146 -239 K 0.130 -240 A 0.117 -241 E 0.105 -242 R 0.095 -243 E 0.088 -244 V 0.080 -245 S 0.069 -246 R 0.060 -247 M 0.055 -248 V 0.051 -249 V 0.047 -250 V 0.048 -251 M 0.054 -252 V 0.060 -253 G 0.060 -254 S 0.054 -255 F 0.044 -256 C 0.035 -257 V 0.030 -258 C 0.031 -259 Y 0.035 -260 V 0.039 -261 P 0.040 -262 Y 0.039 -263 A 0.035 -264 A 0.033 -265 F 0.033 -266 A 0.035 -267 M 0.037 -268 Y 0.039 -269 M 0.043 -270 V 0.050 -271 N 0.059 -272 N 0.071 -273 R 0.088 -274 N 0.112 -275 H 0.138 -276 G 0.151 -277 L 0.144 -278 D 0.119 -279 L 0.089 -280 R 0.067 -281 L 0.055 -282 V 0.051 -283 T 0.053 -284 I 0.057 -285 P 0.059 -286 S 0.059 -287 F 0.060 -288 F 0.064 -289 S 0.069 -290 K 0.076 -291 S 0.081 -292 A 0.079 -293 C 0.070 -294 I 0.060 -295 Y 0.056 -296 N 0.056 -297 P 0.058 -298 I 0.059 -299 I 0.056 -300 Y 0.049 -301 C 0.043 -302 F 0.046 -303 M 0.053 -304 N 0.051 -305 K 0.042 -306 Q 0.032 -307 F 0.027 -308 Q 0.027 -309 A 0.031 -310 C 0.036 -311 I 0.039 -312 M 0.041 -313 K 0.043 -314 M 0.053 -315 V 0.079 -316 C 0.129 -317 G 0.198 -318 K 0.270 -319 A 0.326 -320 M 0.365 -321 T 0.395 -322 D 0.420 -323 E 0.435 -324 S 0.442 -325 D 0.448 -326 T 0.456 -327 C 0.469 -328 S 0.492 -329 S 0.520 -330 Q 0.525 -331 K 0.490 -332 T 0.443 -333 E 0.434 -334 V 0.465 -335 S 0.493 -336 T 0.519 -337 V 0.566 -338 S 0.618 -339 S 0.644 -340 T 0.646 -341 Q 0.640 -342 V 0.626 -343 G 0.593 -344 P 0.544 -345 N 0.503 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000128617.3_ENST00000249389.3_GN:OPN1SW_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000128617.3_ENST00000249389.3_GN:OPN1SW_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid deleted file mode 100644 index 1712376ac7777780420beb6fc0c9c710d5da4475..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000128617.3_ENST00000249389.3_GN:OPN1SW_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid +++ /dev/null @@ -1,349 +0,0 @@ ->ENSG00000128617.3|ENST00000249389.3|GN:OPN1SW|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 -1 M 0.298 -2 R 0.295 -3 K 0.279 -4 M 0.248 -5 S 0.214 -6 E 0.188 -7 E 0.167 -8 E 0.143 -9 F 0.118 -10 Y 0.102 -11 L 0.099 -12 F 0.109 -13 K 0.127 -14 N 0.145 -15 I 0.158 -16 S 0.169 -17 S 0.188 -18 V 0.215 -19 G 0.232 -20 P 0.225 -21 W 0.207 -22 D 0.193 -23 G 0.179 -24 P 0.161 -25 Q 0.145 -26 Y 0.139 -27 H 0.140 -28 I 0.136 -29 A 0.122 -30 P 0.099 -31 V 0.074 -32 W 0.053 -33 A 0.042 -34 F 0.038 -35 Y 0.037 -36 L 0.039 -37 Q 0.044 -38 A 0.049 -39 A 0.054 -40 F 0.062 -41 M 0.072 -42 G 0.072 -43 T 0.062 -44 V 0.049 -45 F 0.041 -46 L 0.043 -47 I 0.049 -48 G 0.054 -49 F 0.052 -50 P 0.049 -51 L 0.050 -52 N 0.054 -53 A 0.057 -54 M 0.057 -55 V 0.053 -56 L 0.047 -57 V 0.045 -58 A 0.045 -59 T 0.045 -60 L 0.043 -61 R 0.042 -62 Y 0.043 -63 K 0.045 -64 K 0.046 -65 L 0.048 -66 R 0.050 -67 Q 0.051 -68 P 0.050 -69 L 0.046 -70 N 0.043 -71 Y 0.043 -72 I 0.044 -73 L 0.043 -74 V 0.042 -75 N 0.044 -76 V 0.046 -77 S 0.047 -78 F 0.048 -79 G 0.048 -80 G 0.048 -81 F 0.045 -82 L 0.040 -83 L 0.036 -84 C 0.032 -85 I 0.029 -86 F 0.030 -87 S 0.032 -88 V 0.037 -89 F 0.041 -90 P 0.044 -91 V 0.046 -92 F 0.051 -93 V 0.060 -94 A 0.069 -95 S 0.074 -96 C 0.080 -97 N 0.085 -98 G 0.085 -99 Y 0.078 -100 F 0.069 -101 V 0.063 -102 F 0.060 -103 G 0.056 -104 R 0.050 -105 H 0.043 -106 V 0.037 -107 C 0.035 -108 A 0.035 -109 L 0.038 -110 E 0.040 -111 G 0.042 -112 F 0.041 -113 L 0.039 -114 G 0.036 -115 T 0.035 -116 V 0.035 -117 A 0.035 -118 G 0.036 -119 L 0.038 -120 V 0.038 -121 T 0.035 -122 G 0.032 -123 W 0.032 -124 S 0.033 -125 L 0.032 -126 A 0.029 -127 F 0.028 -128 L 0.031 -129 A 0.036 -130 F 0.041 -131 E 0.044 -132 R 0.043 -133 Y 0.040 -134 I 0.041 -135 V 0.050 -136 I 0.070 -137 C 0.099 -138 K 0.128 -139 P 0.146 -140 F 0.147 -141 G 0.141 -142 N 0.133 -143 F 0.121 -144 R 0.101 -145 F 0.077 -146 S 0.055 -147 S 0.040 -148 K 0.035 -149 H 0.038 -150 A 0.047 -151 L 0.060 -152 T 0.070 -153 V 0.069 -154 V 0.061 -155 L 0.057 -156 A 0.059 -157 T 0.063 -158 W 0.065 -159 T 0.067 -160 I 0.072 -161 G 0.077 -162 I 0.082 -163 G 0.088 -164 V 0.097 -165 S 0.104 -166 I 0.107 -167 P 0.106 -168 P 0.104 -169 F 0.103 -170 F 0.103 -171 G 0.102 -172 W 0.100 -173 S 0.098 -174 R 0.102 -175 F 0.115 -176 I 0.129 -177 P 0.134 -178 E 0.130 -179 G 0.122 -180 L 0.116 -181 Q 0.109 -182 C 0.101 -183 S 0.098 -184 C 0.106 -185 G 0.125 -186 P 0.140 -187 D 0.141 -188 W 0.131 -189 Y 0.128 -190 T 0.144 -191 V 0.172 -192 G 0.195 -193 T 0.202 -194 K 0.195 -195 Y 0.177 -196 R 0.150 -197 S 0.119 -198 E 0.095 -199 S 0.082 -200 Y 0.077 -201 T 0.072 -202 W 0.069 -203 F 0.069 -204 L 0.067 -205 F 0.060 -206 I 0.053 -207 F 0.051 -208 C 0.051 -209 F 0.053 -210 I 0.060 -211 V 0.069 -212 P 0.072 -213 L 0.065 -214 S 0.058 -215 L 0.056 -216 I 0.054 -217 C 0.047 -218 F 0.039 -219 S 0.033 -220 Y 0.031 -221 T 0.036 -222 Q 0.046 -223 L 0.058 -224 L 0.069 -225 R 0.076 -226 A 0.074 -227 L 0.071 -228 K 0.078 -229 A 0.093 -230 V 0.109 -231 A 0.126 -232 A 0.148 -233 Q 0.173 -234 Q 0.196 -235 Q 0.214 -236 E 0.223 -237 S 0.219 -238 A 0.205 -239 T 0.187 -240 T 0.167 -241 Q 0.147 -242 K 0.130 -243 A 0.117 -244 E 0.105 -245 R 0.095 -246 E 0.088 -247 V 0.080 -248 S 0.069 -249 R 0.061 -250 M 0.056 -251 V 0.051 -252 V 0.047 -253 V 0.048 -254 M 0.054 -255 V 0.060 -256 G 0.060 -257 S 0.054 -258 F 0.044 -259 C 0.035 -260 V 0.031 -261 C 0.031 -262 Y 0.035 -263 V 0.039 -264 P 0.040 -265 Y 0.039 -266 A 0.035 -267 A 0.033 -268 F 0.033 -269 A 0.035 -270 M 0.037 -271 Y 0.039 -272 M 0.043 -273 V 0.050 -274 N 0.059 -275 N 0.071 -276 R 0.088 -277 N 0.112 -278 H 0.137 -279 G 0.150 -280 L 0.143 -281 D 0.118 -282 L 0.089 -283 R 0.067 -284 L 0.055 -285 V 0.051 -286 T 0.053 -287 I 0.057 -288 P 0.060 -289 S 0.060 -290 F 0.061 -291 F 0.064 -292 S 0.070 -293 K 0.077 -294 S 0.082 -295 A 0.080 -296 C 0.071 -297 I 0.061 -298 Y 0.056 -299 N 0.056 -300 P 0.058 -301 I 0.059 -302 I 0.057 -303 Y 0.049 -304 C 0.044 -305 F 0.047 -306 M 0.053 -307 N 0.052 -308 K 0.042 -309 Q 0.032 -310 F 0.027 -311 Q 0.027 -312 A 0.031 -313 C 0.036 -314 I 0.039 -315 M 0.041 -316 K 0.043 -317 M 0.053 -318 V 0.080 -319 C 0.129 -320 G 0.198 -321 K 0.270 -322 A 0.328 -323 M 0.368 -324 T 0.399 -325 D 0.424 -326 E 0.439 -327 S 0.445 -328 D 0.451 -329 T 0.459 -330 C 0.470 -331 S 0.493 -332 S 0.519 -333 Q 0.521 -334 K 0.482 -335 T 0.433 -336 E 0.427 -337 V 0.462 -338 S 0.492 -339 T 0.519 -340 V 0.566 -341 S 0.618 -342 S 0.644 -343 T 0.647 -344 Q 0.641 -345 V 0.626 -346 G 0.594 -347 P 0.545 -348 N 0.504 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000130024.16_ENST00000339209.9_GN:PHF10_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000130024.16_ENST00000339209.9_GN:PHF10_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index d4ce76b1aeff788692af6ae9b61e459b80fc02aa..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000130024.16_ENST00000339209.9_GN:PHF10_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,499 +0,0 @@ ->ENSG00000130024.16|ENST00000339209.9|GN:PHF10|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.400 -2 A 0.422 -3 A 0.456 -4 A 0.497 -5 A 0.539 -6 G 0.578 -7 P 0.604 -8 G 0.596 -9 A 0.545 -10 A 0.489 -11 L 0.472 -12 S 0.491 -13 P 0.525 -14 R 0.565 -15 P 0.597 -16 C 0.597 -17 D 0.565 -18 S 0.547 -19 D 0.574 -20 P 0.625 -21 A 0.664 -22 T 0.692 -23 P 0.716 -24 G 0.729 -25 A 0.722 -26 Q 0.691 -27 S 0.640 -28 P 0.587 -29 K 0.570 -30 D 0.598 -31 D 0.618 -32 N 0.597 -33 E 0.580 -34 D 0.602 -35 N 0.638 -36 S 0.664 -37 N 0.688 -38 D 0.707 -39 G 0.707 -40 T 0.692 -41 Q 0.678 -42 P 0.673 -43 S 0.673 -44 K 0.674 -45 R 0.678 -46 R 0.686 -47 R 0.701 -48 M 0.720 -49 G 0.735 -50 S 0.741 -51 G 0.739 -52 D 0.733 -53 S 0.723 -54 S 0.715 -55 R 0.715 -56 S 0.723 -57 C 0.730 -58 E 0.732 -59 T 0.726 -60 S 0.714 -61 S 0.697 -62 Q 0.676 -63 D 0.648 -64 L 0.598 -65 G 0.521 -66 F 0.433 -67 S 0.356 -68 Y 0.298 -69 Y 0.259 -70 P 0.231 -71 A 0.207 -72 E 0.178 -73 N 0.142 -74 L 0.108 -75 I 0.082 -76 E 0.064 -77 Y 0.055 -78 K 0.055 -79 W 0.064 -80 P 0.086 -81 P 0.117 -82 D 0.144 -83 E 0.156 -84 T 0.149 -85 G 0.127 -86 E 0.095 -87 Y 0.062 -88 Y 0.036 -89 M 0.022 -90 L 0.017 -91 Q 0.018 -92 E 0.024 -93 Q 0.029 -94 V 0.033 -95 S 0.038 -96 E 0.041 -97 Y 0.042 -98 L 0.040 -99 G 0.038 -100 V 0.038 -101 T 0.039 -102 S 0.038 -103 F 0.038 -104 K 0.039 -105 R 0.045 -106 K 0.056 -107 Y 0.071 -108 P 0.084 -109 D 0.090 -110 L 0.088 -111 E 0.078 -112 R 0.064 -113 R 0.054 -114 D 0.052 -115 L 0.052 -116 S 0.047 -117 H 0.036 -118 K 0.025 -119 E 0.019 -120 K 0.019 -121 L 0.023 -122 Y 0.029 -123 L 0.037 -124 R 0.045 -125 E 0.055 -126 L 0.064 -127 N 0.070 -128 V 0.072 -129 I 0.073 -130 T 0.075 -131 E 0.078 -132 T 0.084 -133 Q 0.098 -134 C 0.117 -135 T 0.130 -136 L 0.126 -137 G 0.102 -138 L 0.071 -139 T 0.044 -140 A 0.027 -141 L 0.020 -142 R 0.019 -143 S 0.020 -144 D 0.023 -145 E 0.025 -146 V 0.024 -147 I 0.024 -148 D 0.026 -149 L 0.028 -150 M 0.029 -151 I 0.028 -152 K 0.029 -153 E 0.032 -154 Y 0.036 -155 P 0.036 -156 A 0.032 -157 K 0.028 -158 H 0.025 -159 A 0.024 -160 E 0.025 -161 Y 0.029 -162 S 0.034 -163 V 0.038 -164 I 0.042 -165 L 0.049 -166 Q 0.060 -167 E 0.069 -168 K 0.078 -169 E 0.089 -170 R 0.106 -171 Q 0.123 -172 R 0.135 -173 I 0.142 -174 T 0.151 -175 D 0.169 -176 H 0.190 -177 Y 0.206 -178 K 0.219 -179 E 0.228 -180 Y 0.232 -181 S 0.232 -182 Q 0.242 -183 M 0.269 -184 Q 0.308 -185 Q 0.351 -186 Q 0.396 -187 N 0.446 -188 T 0.494 -189 Q 0.521 -190 K 0.511 -191 V 0.470 -192 E 0.411 -193 A 0.346 -194 S 0.286 -195 K 0.241 -196 V 0.213 -197 P 0.199 -198 E 0.197 -199 Y 0.207 -200 I 0.216 -201 K 0.219 -202 K 0.226 -203 A 0.241 -204 A 0.248 -205 K 0.245 -206 K 0.247 -207 A 0.257 -208 A 0.260 -209 E 0.248 -210 F 0.229 -211 N 0.212 -212 S 0.198 -213 N 0.187 -214 L 0.178 -215 N 0.166 -216 R 0.154 -217 E 0.146 -218 R 0.143 -219 M 0.144 -220 E 0.148 -221 E 0.156 -222 R 0.169 -223 R 0.190 -224 A 0.216 -225 Y 0.240 -226 F 0.259 -227 D 0.270 -228 L 0.267 -229 Q 0.258 -230 T 0.261 -231 H 0.281 -232 V 0.309 -233 I 0.340 -234 Q 0.386 -235 V 0.443 -236 P 0.484 -237 Q 0.496 -238 G 0.482 -239 K 0.452 -240 Y 0.423 -241 K 0.406 -242 V 0.406 -243 L 0.417 -244 P 0.428 -245 T 0.434 -246 E 0.435 -247 R 0.423 -248 T 0.406 -249 K 0.406 -250 V 0.426 -251 S 0.451 -252 S 0.472 -253 Y 0.500 -254 P 0.533 -255 V 0.559 -256 A 0.579 -257 L 0.597 -258 I 0.599 -259 P 0.581 -260 G 0.561 -261 Q 0.549 -262 F 0.530 -263 Q 0.491 -264 E 0.453 -265 Y 0.438 -266 Y 0.430 -267 K 0.398 -268 R 0.344 -269 Y 0.289 -270 S 0.249 -271 P 0.231 -272 D 0.230 -273 E 0.231 -274 L 0.222 -275 R 0.215 -276 Y 0.230 -277 L 0.273 -278 P 0.334 -279 L 0.395 -280 N 0.446 -281 T 0.482 -282 A 0.504 -283 L 0.513 -284 Y 0.519 -285 E 0.537 -286 P 0.574 -287 P 0.615 -288 L 0.643 -289 D 0.653 -290 P 0.652 -291 E 0.656 -292 L 0.672 -293 P 0.701 -294 A 0.732 -295 L 0.753 -296 D 0.763 -297 S 0.763 -298 D 0.760 -299 G 0.757 -300 D 0.755 -301 S 0.754 -302 D 0.753 -303 D 0.751 -304 G 0.749 -305 E 0.749 -306 D 0.749 -307 G 0.746 -308 R 0.737 -309 G 0.713 -310 D 0.663 -311 E 0.599 -312 K 0.564 -313 R 0.581 -314 K 0.606 -315 N 0.598 -316 K 0.582 -317 G 0.585 -318 T 0.593 -319 S 0.612 -320 D 0.664 -321 S 0.727 -322 S 0.765 -323 S 0.784 -324 G 0.797 -325 N 0.804 -326 V 0.802 -327 S 0.796 -328 E 0.789 -329 G 0.776 -330 E 0.759 -331 S 0.747 -332 P 0.749 -333 P 0.764 -334 D 0.780 -335 S 0.788 -336 Q 0.786 -337 E 0.778 -338 D 0.763 -339 S 0.747 -340 F 0.738 -341 Q 0.739 -342 G 0.740 -343 R 0.725 -344 Q 0.684 -345 K 0.628 -346 S 0.601 -347 K 0.628 -348 D 0.676 -349 K 0.700 -350 A 0.692 -351 A 0.672 -352 T 0.658 -353 P 0.662 -354 R 0.679 -355 K 0.690 -356 D 0.685 -357 G 0.676 -358 P 0.677 -359 K 0.690 -360 R 0.704 -361 S 0.707 -362 V 0.699 -363 L 0.690 -364 S 0.681 -365 K 0.661 -366 S 0.628 -367 V 0.592 -368 P 0.563 -369 G 0.533 -370 Y 0.492 -371 K 0.452 -372 P 0.424 -373 K 0.403 -374 V 0.375 -375 I 0.330 -376 P 0.272 -377 N 0.210 -378 A 0.154 -379 I 0.108 -380 C 0.074 -381 G 0.054 -382 I 0.051 -383 C 0.061 -384 L 0.083 -385 K 0.117 -386 G 0.154 -387 K 0.188 -388 E 0.221 -389 S 0.252 -390 N 0.271 -391 K 0.277 -392 K 0.277 -393 G 0.280 -394 K 0.282 -395 A 0.268 -396 E 0.236 -397 S 0.191 -398 L 0.146 -399 I 0.109 -400 H 0.087 -401 C 0.077 -402 S 0.075 -403 Q 0.079 -404 C 0.090 -405 E 0.104 -406 N 0.115 -407 S 0.117 -408 G 0.112 -409 H 0.105 -410 P 0.103 -411 S 0.110 -412 C 0.121 -413 L 0.132 -414 D 0.141 -415 M 0.142 -416 T 0.131 -417 M 0.111 -418 E 0.094 -419 L 0.082 -420 V 0.075 -421 S 0.075 -422 M 0.079 -423 I 0.085 -424 K 0.090 -425 T 0.091 -426 Y 0.090 -427 P 0.082 -428 W 0.070 -429 Q 0.060 -430 C 0.059 -431 M 0.067 -432 E 0.078 -433 C 0.081 -434 K 0.074 -435 T 0.063 -436 C 0.056 -437 I 0.056 -438 I 0.064 -439 C 0.080 -440 G 0.098 -441 Q 0.114 -442 P 0.123 -443 H 0.125 -444 H 0.125 -445 E 0.129 -446 E 0.130 -447 E 0.128 -448 M 0.126 -449 M 0.126 -450 F 0.123 -451 C 0.114 -452 D 0.104 -453 M 0.099 -454 C 0.103 -455 D 0.113 -456 R 0.121 -457 G 0.122 -458 Y 0.112 -459 H 0.097 -460 T 0.090 -461 F 0.096 -462 C 0.110 -463 V 0.119 -464 G 0.122 -465 L 0.126 -466 G 0.133 -467 A 0.142 -468 I 0.149 -469 P 0.154 -470 S 0.156 -471 G 0.150 -472 R 0.131 -473 W 0.103 -474 I 0.079 -475 C 0.063 -476 D 0.062 -477 C 0.075 -478 C 0.108 -479 Q 0.160 -480 R 0.230 -481 A 0.309 -482 P 0.388 -483 P 0.462 -484 T 0.527 -485 P 0.577 -486 R 0.616 -487 K 0.650 -488 V 0.678 -489 G 0.694 -490 R 0.702 -491 R 0.710 -492 G 0.721 -493 K 0.733 -494 N 0.739 -495 S 0.740 -496 K 0.735 -497 E 0.723 -498 G 0.712 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000130024.16_ENST00000339209.9_GN:PHF10_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:66.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000130024.16_ENST00000339209.9_GN:PHF10_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:66.caid deleted file mode 100644 index a7798c9f48567958ea6596b20038695bdd568bb9..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000130024.16_ENST00000339209.9_GN:PHF10_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:66.caid +++ /dev/null @@ -1,565 +0,0 @@ ->ENSG00000130024.16|ENST00000339209.9|GN:PHF10|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:66 -1 M 0.325 -2 A 0.354 -3 V 0.397 -4 A 0.428 -5 A 0.424 -6 A 0.407 -7 L 0.413 -8 A 0.439 -9 G 0.457 -10 R 0.469 -11 G 0.487 -12 A 0.500 -13 R 0.517 -14 G 0.561 -15 G 0.610 -16 R 0.631 -17 G 0.626 -18 R 0.623 -19 P 0.640 -20 P 0.675 -21 G 0.712 -22 G 0.734 -23 R 0.740 -24 A 0.737 -25 E 0.730 -26 G 0.715 -27 A 0.694 -28 G 0.683 -29 P 0.687 -30 G 0.696 -31 R 0.696 -32 R 0.689 -33 G 0.671 -34 A 0.625 -35 R 0.552 -36 A 0.486 -37 A 0.445 -38 A 0.408 -39 A 0.368 -40 A 0.340 -41 A 0.323 -42 A 0.309 -43 A 0.310 -44 A 0.336 -45 A 0.373 -46 A 0.410 -47 A 0.445 -48 A 0.483 -49 A 0.524 -50 G 0.555 -51 T 0.561 -52 R 0.538 -53 R 0.510 -54 R 0.498 -55 R 0.501 -56 R 0.510 -57 R 0.526 -58 R 0.557 -59 R 0.595 -60 R 0.627 -61 R 0.658 -62 G 0.694 -63 A 0.727 -64 L 0.749 -65 G 0.764 -66 L 0.774 -67 M 0.781 -68 A 0.783 -69 A 0.777 -70 A 0.763 -71 A 0.751 -72 G 0.749 -73 P 0.760 -74 G 0.774 -75 A 0.779 -76 A 0.771 -77 L 0.754 -78 S 0.738 -79 P 0.736 -80 R 0.749 -81 P 0.770 -82 C 0.787 -83 D 0.792 -84 S 0.788 -85 D 0.783 -86 P 0.779 -87 A 0.781 -88 T 0.789 -89 P 0.801 -90 G 0.809 -91 A 0.802 -92 Q 0.773 -93 S 0.717 -94 P 0.651 -95 K 0.625 -96 D 0.665 -97 D 0.727 -98 N 0.764 -99 E 0.776 -100 D 0.778 -101 N 0.775 -102 S 0.769 -103 N 0.763 -104 D 0.754 -105 G 0.738 -106 T 0.719 -107 Q 0.707 -108 P 0.705 -109 S 0.707 -110 K 0.711 -111 R 0.719 -112 R 0.733 -113 R 0.750 -114 M 0.766 -115 G 0.776 -116 S 0.778 -117 G 0.773 -118 D 0.764 -119 S 0.751 -120 S 0.739 -121 R 0.733 -122 S 0.733 -123 C 0.733 -124 E 0.726 -125 T 0.711 -126 S 0.691 -127 S 0.669 -128 Q 0.646 -129 D 0.615 -130 L 0.564 -131 G 0.489 -132 F 0.403 -133 S 0.324 -134 Y 0.262 -135 Y 0.220 -136 P 0.192 -137 A 0.172 -138 E 0.152 -139 N 0.126 -140 L 0.098 -141 I 0.076 -142 E 0.061 -143 Y 0.053 -144 K 0.054 -145 W 0.063 -146 P 0.084 -147 P 0.115 -148 D 0.142 -149 E 0.154 -150 T 0.149 -151 G 0.128 -152 E 0.096 -153 Y 0.063 -154 Y 0.036 -155 M 0.021 -156 L 0.016 -157 Q 0.017 -158 E 0.023 -159 Q 0.028 -160 V 0.032 -161 S 0.035 -162 E 0.038 -163 Y 0.039 -164 L 0.038 -165 G 0.037 -166 V 0.038 -167 T 0.039 -168 S 0.038 -169 F 0.037 -170 K 0.038 -171 R 0.043 -172 K 0.053 -173 Y 0.067 -174 P 0.079 -175 D 0.086 -176 L 0.085 -177 E 0.075 -178 R 0.061 -179 R 0.052 -180 D 0.050 -181 L 0.050 -182 S 0.045 -183 H 0.034 -184 K 0.023 -185 E 0.017 -186 K 0.016 -187 L 0.019 -188 Y 0.024 -189 L 0.031 -190 R 0.038 -191 E 0.047 -192 L 0.056 -193 N 0.062 -194 V 0.064 -195 I 0.065 -196 T 0.066 -197 E 0.067 -198 T 0.070 -199 Q 0.080 -200 C 0.095 -201 T 0.106 -202 L 0.103 -203 G 0.084 -204 L 0.059 -205 T 0.037 -206 A 0.024 -207 L 0.018 -208 R 0.017 -209 S 0.018 -210 D 0.020 -211 E 0.021 -212 V 0.020 -213 I 0.021 -214 D 0.023 -215 L 0.025 -216 M 0.025 -217 I 0.024 -218 K 0.025 -219 E 0.027 -220 Y 0.030 -221 P 0.029 -222 A 0.026 -223 K 0.022 -224 H 0.019 -225 A 0.018 -226 E 0.018 -227 Y 0.020 -228 S 0.024 -229 V 0.026 -230 I 0.030 -231 L 0.037 -232 Q 0.047 -233 E 0.056 -234 K 0.064 -235 E 0.071 -236 R 0.080 -237 Q 0.090 -238 R 0.101 -239 I 0.111 -240 T 0.123 -241 D 0.139 -242 H 0.158 -243 Y 0.176 -244 K 0.193 -245 E 0.207 -246 Y 0.215 -247 S 0.219 -248 Q 0.227 -249 M 0.248 -250 Q 0.281 -251 Q 0.319 -252 Q 0.361 -253 N 0.409 -254 T 0.455 -255 Q 0.481 -256 K 0.472 -257 V 0.433 -258 E 0.379 -259 A 0.321 -260 S 0.267 -261 K 0.227 -262 V 0.202 -263 P 0.187 -264 E 0.185 -265 Y 0.193 -266 I 0.203 -267 K 0.207 -268 K 0.217 -269 A 0.235 -270 A 0.245 -271 K 0.243 -272 K 0.246 -273 A 0.256 -274 A 0.258 -275 E 0.246 -276 F 0.226 -277 N 0.207 -278 S 0.191 -279 N 0.179 -280 L 0.171 -281 N 0.163 -282 R 0.155 -283 E 0.150 -284 R 0.148 -285 M 0.148 -286 E 0.152 -287 E 0.160 -288 R 0.174 -289 R 0.196 -290 A 0.224 -291 Y 0.249 -292 F 0.268 -293 D 0.279 -294 L 0.279 -295 Q 0.274 -296 T 0.283 -297 H 0.309 -298 V 0.340 -299 I 0.373 -300 Q 0.421 -301 V 0.480 -302 P 0.524 -303 Q 0.536 -304 G 0.521 -305 K 0.492 -306 Y 0.463 -307 K 0.444 -308 V 0.440 -309 L 0.446 -310 P 0.455 -311 T 0.465 -312 E 0.472 -313 R 0.466 -314 T 0.450 -315 K 0.443 -316 V 0.456 -317 S 0.477 -318 S 0.496 -319 Y 0.521 -320 P 0.547 -321 V 0.566 -322 A 0.581 -323 L 0.596 -324 I 0.599 -325 P 0.586 -326 G 0.572 -327 Q 0.566 -328 F 0.552 -329 Q 0.519 -330 E 0.487 -331 Y 0.476 -332 Y 0.470 -333 K 0.438 -334 R 0.382 -335 Y 0.322 -336 S 0.276 -337 P 0.254 -338 D 0.252 -339 E 0.251 -340 L 0.237 -341 R 0.224 -342 Y 0.236 -343 L 0.284 -344 P 0.350 -345 L 0.414 -346 N 0.460 -347 T 0.488 -348 A 0.504 -349 L 0.512 -350 Y 0.516 -351 E 0.533 -352 P 0.570 -353 P 0.614 -354 L 0.645 -355 D 0.654 -356 P 0.652 -357 E 0.654 -358 L 0.672 -359 P 0.702 -360 A 0.733 -361 L 0.754 -362 D 0.762 -363 S 0.763 -364 D 0.760 -365 G 0.757 -366 D 0.754 -367 S 0.753 -368 D 0.751 -369 D 0.749 -370 G 0.748 -371 E 0.748 -372 D 0.748 -373 G 0.744 -374 R 0.734 -375 G 0.709 -376 D 0.660 -377 E 0.596 -378 K 0.559 -379 R 0.575 -380 K 0.600 -381 N 0.592 -382 K 0.575 -383 G 0.578 -384 T 0.587 -385 S 0.606 -386 D 0.656 -387 S 0.715 -388 S 0.752 -389 S 0.771 -390 G 0.785 -391 N 0.792 -392 V 0.788 -393 S 0.781 -394 E 0.773 -395 G 0.759 -396 E 0.741 -397 S 0.729 -398 P 0.732 -399 P 0.749 -400 D 0.766 -401 S 0.774 -402 Q 0.773 -403 E 0.763 -404 D 0.747 -405 S 0.730 -406 F 0.720 -407 Q 0.724 -408 G 0.729 -409 R 0.716 -410 Q 0.675 -411 K 0.619 -412 S 0.593 -413 K 0.621 -414 D 0.669 -415 K 0.693 -416 A 0.684 -417 A 0.662 -418 T 0.646 -419 P 0.649 -420 R 0.665 -421 K 0.676 -422 D 0.672 -423 G 0.663 -424 P 0.665 -425 K 0.678 -426 R 0.690 -427 S 0.689 -428 V 0.675 -429 L 0.662 -430 S 0.653 -431 K 0.634 -432 S 0.599 -433 V 0.562 -434 P 0.538 -435 G 0.514 -436 Y 0.479 -437 K 0.440 -438 P 0.413 -439 K 0.392 -440 V 0.365 -441 I 0.324 -442 P 0.269 -443 N 0.210 -444 A 0.156 -445 I 0.111 -446 C 0.075 -447 G 0.056 -448 I 0.053 -449 C 0.064 -450 L 0.088 -451 K 0.124 -452 G 0.164 -453 K 0.202 -454 E 0.236 -455 S 0.266 -456 N 0.283 -457 K 0.288 -458 K 0.289 -459 G 0.292 -460 K 0.293 -461 A 0.279 -462 E 0.245 -463 S 0.199 -464 L 0.152 -465 I 0.115 -466 H 0.093 -467 C 0.083 -468 S 0.082 -469 Q 0.087 -470 C 0.098 -471 E 0.113 -472 N 0.124 -473 S 0.126 -474 G 0.119 -475 H 0.111 -476 P 0.109 -477 S 0.116 -478 C 0.128 -479 L 0.139 -480 D 0.147 -481 M 0.146 -482 T 0.133 -483 M 0.112 -484 E 0.095 -485 L 0.084 -486 V 0.078 -487 S 0.078 -488 M 0.083 -489 I 0.090 -490 K 0.095 -491 T 0.097 -492 Y 0.095 -493 P 0.087 -494 W 0.075 -495 Q 0.065 -496 C 0.063 -497 M 0.071 -498 E 0.082 -499 C 0.085 -500 K 0.077 -501 T 0.066 -502 C 0.058 -503 I 0.058 -504 I 0.066 -505 C 0.083 -506 G 0.102 -507 Q 0.119 -508 P 0.128 -509 H 0.131 -510 H 0.132 -511 E 0.135 -512 E 0.137 -513 E 0.135 -514 M 0.133 -515 M 0.134 -516 F 0.132 -517 C 0.122 -518 D 0.111 -519 M 0.105 -520 C 0.109 -521 D 0.119 -522 R 0.128 -523 G 0.128 -524 Y 0.117 -525 H 0.101 -526 T 0.091 -527 F 0.096 -528 C 0.109 -529 V 0.118 -530 G 0.122 -531 L 0.126 -532 G 0.134 -533 A 0.143 -534 I 0.149 -535 P 0.154 -536 S 0.157 -537 G 0.151 -538 R 0.132 -539 W 0.104 -540 I 0.079 -541 C 0.063 -542 D 0.061 -543 C 0.074 -544 C 0.105 -545 Q 0.156 -546 R 0.224 -547 A 0.302 -548 P 0.382 -549 P 0.458 -550 T 0.523 -551 P 0.572 -552 R 0.609 -553 K 0.644 -554 V 0.674 -555 G 0.693 -556 R 0.703 -557 R 0.712 -558 G 0.725 -559 K 0.736 -560 N 0.742 -561 S 0.740 -562 K 0.730 -563 E 0.710 -564 G 0.692 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000131042.16_ENST00000314446.10_GN:LILRB2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000131042.16_ENST00000314446.10_GN:LILRB2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 9d3c1faf24d009407a11f4d330ef9d6ee0a6872e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000131042.16_ENST00000314446.10_GN:LILRB2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,598 +0,0 @@ ->ENSG00000131042.16|ENST00000314446.10|GN:LILRB2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.310 -2 T 0.309 -3 P 0.298 -4 I 0.273 -5 V 0.238 -6 T 0.210 -7 V 0.199 -8 L 0.201 -9 I 0.210 -10 C 0.232 -11 L 0.267 -12 G 0.297 -13 L 0.310 -14 S 0.324 -15 L 0.363 -16 G 0.417 -17 P 0.467 -18 R 0.508 -19 T 0.544 -20 R 0.571 -21 V 0.580 -22 Q 0.566 -23 T 0.528 -24 G 0.466 -25 T 0.381 -26 I 0.288 -27 P 0.202 -28 K 0.137 -29 P 0.096 -30 T 0.073 -31 L 0.062 -32 W 0.056 -33 A 0.052 -34 E 0.048 -35 P 0.047 -36 D 0.050 -37 S 0.053 -38 V 0.052 -39 I 0.051 -40 T 0.054 -41 Q 0.065 -42 G 0.077 -43 S 0.080 -44 P 0.070 -45 V 0.055 -46 T 0.044 -47 L 0.040 -48 S 0.042 -49 C 0.049 -50 Q 0.060 -51 G 0.072 -52 S 0.079 -53 L 0.082 -54 E 0.081 -55 A 0.074 -56 Q 0.061 -57 E 0.047 -58 Y 0.037 -59 R 0.034 -60 L 0.038 -61 Y 0.050 -62 R 0.075 -63 E 0.113 -64 K 0.154 -65 K 0.182 -66 S 0.185 -67 A 0.169 -68 S 0.145 -69 W 0.125 -70 I 0.111 -71 T 0.106 -72 R 0.109 -73 I 0.111 -74 R 0.108 -75 P 0.098 -76 E 0.085 -77 L 0.075 -78 V 0.067 -79 K 0.064 -80 N 0.061 -81 G 0.054 -82 Q 0.044 -83 F 0.037 -84 H 0.037 -85 I 0.039 -86 P 0.043 -87 S 0.046 -88 I 0.048 -89 T 0.048 -90 W 0.047 -91 E 0.049 -92 H 0.054 -93 T 0.060 -94 G 0.060 -95 R 0.050 -96 Y 0.038 -97 G 0.032 -98 C 0.031 -99 Q 0.035 -100 Y 0.039 -101 Y 0.044 -102 S 0.047 -103 R 0.051 -104 A 0.055 -105 R 0.060 -106 W 0.066 -107 S 0.075 -108 E 0.081 -109 L 0.083 -110 S 0.083 -111 D 0.082 -112 P 0.075 -113 L 0.067 -114 V 0.066 -115 L 0.075 -116 V 0.090 -117 M 0.107 -118 T 0.124 -119 G 0.139 -120 A 0.147 -121 Y 0.143 -122 P 0.127 -123 K 0.105 -124 P 0.087 -125 T 0.075 -126 L 0.068 -127 S 0.062 -128 A 0.056 -129 Q 0.053 -130 P 0.054 -131 S 0.060 -132 P 0.067 -133 V 0.073 -134 V 0.080 -135 T 0.088 -136 S 0.095 -137 G 0.097 -138 G 0.089 -139 R 0.074 -140 V 0.059 -141 T 0.048 -142 L 0.043 -143 Q 0.042 -144 C 0.045 -145 E 0.050 -146 S 0.056 -147 Q 0.061 -148 V 0.065 -149 A 0.070 -150 F 0.073 -151 G 0.070 -152 G 0.059 -153 F 0.047 -154 I 0.041 -155 L 0.048 -156 C 0.064 -157 K 0.086 -158 E 0.111 -159 G 0.138 -160 E 0.161 -161 D 0.173 -162 E 0.171 -163 H 0.154 -164 P 0.133 -165 Q 0.114 -166 C 0.103 -167 L 0.101 -168 N 0.108 -169 S 0.126 -170 Q 0.151 -171 P 0.168 -172 H 0.167 -173 A 0.153 -174 R 0.132 -175 G 0.111 -176 S 0.091 -177 S 0.074 -178 R 0.059 -179 A 0.047 -180 I 0.038 -181 F 0.033 -182 S 0.033 -183 V 0.038 -184 G 0.053 -185 P 0.080 -186 V 0.112 -187 S 0.136 -188 P 0.146 -189 N 0.149 -190 R 0.146 -191 R 0.132 -192 W 0.108 -193 S 0.082 -194 H 0.060 -195 R 0.048 -196 C 0.047 -197 Y 0.056 -198 G 0.067 -199 Y 0.076 -200 D 0.081 -201 L 0.082 -202 N 0.082 -203 S 0.081 -204 P 0.082 -205 Y 0.085 -206 V 0.089 -207 W 0.094 -208 S 0.104 -209 S 0.112 -210 P 0.113 -211 S 0.111 -212 D 0.111 -213 L 0.108 -214 L 0.100 -215 E 0.091 -216 L 0.091 -217 L 0.106 -218 V 0.129 -219 P 0.145 -220 G 0.149 -221 V 0.145 -222 S 0.136 -223 K 0.121 -224 K 0.102 -225 P 0.083 -226 S 0.070 -227 L 0.062 -228 S 0.057 -229 V 0.052 -230 Q 0.048 -231 P 0.048 -232 G 0.051 -233 P 0.055 -234 V 0.059 -235 M 0.066 -236 A 0.078 -237 P 0.089 -238 G 0.091 -239 E 0.082 -240 S 0.066 -241 L 0.052 -242 T 0.043 -243 L 0.040 -244 Q 0.039 -245 C 0.040 -246 V 0.042 -247 S 0.047 -248 D 0.056 -249 V 0.066 -250 G 0.071 -251 Y 0.067 -252 D 0.052 -253 R 0.037 -254 F 0.028 -255 V 0.028 -256 L 0.033 -257 Y 0.043 -258 K 0.055 -259 E 0.068 -260 G 0.077 -261 E 0.082 -262 R 0.084 -263 D 0.086 -264 L 0.086 -265 R 0.087 -266 Q 0.092 -267 L 0.105 -268 P 0.123 -269 G 0.141 -270 R 0.161 -271 Q 0.176 -272 P 0.177 -273 Q 0.164 -274 A 0.141 -275 G 0.116 -276 L 0.094 -277 S 0.075 -278 Q 0.059 -279 A 0.048 -280 N 0.042 -281 F 0.042 -282 T 0.042 -283 L 0.041 -284 G 0.039 -285 P 0.038 -286 V 0.041 -287 S 0.045 -288 R 0.053 -289 S 0.064 -290 Y 0.076 -291 G 0.089 -292 G 0.091 -293 Q 0.076 -294 Y 0.056 -295 R 0.045 -296 C 0.045 -297 Y 0.054 -298 G 0.066 -299 A 0.079 -300 H 0.090 -301 N 0.098 -302 L 0.102 -303 S 0.103 -304 S 0.104 -305 E 0.106 -306 C 0.110 -307 S 0.117 -308 A 0.122 -309 P 0.122 -310 S 0.121 -311 D 0.123 -312 P 0.118 -313 L 0.106 -314 D 0.093 -315 I 0.086 -316 L 0.092 -317 I 0.110 -318 T 0.132 -319 G 0.148 -320 Q 0.152 -321 I 0.150 -322 R 0.148 -323 G 0.142 -324 T 0.127 -325 P 0.107 -326 F 0.088 -327 I 0.076 -328 S 0.069 -329 V 0.065 -330 Q 0.066 -331 P 0.075 -332 G 0.093 -333 P 0.113 -334 T 0.130 -335 V 0.141 -336 A 0.146 -337 S 0.143 -338 G 0.132 -339 E 0.117 -340 N 0.101 -341 V 0.084 -342 T 0.065 -343 L 0.052 -344 L 0.047 -345 C 0.049 -346 Q 0.054 -347 S 0.057 -348 W 0.058 -349 R 0.062 -350 Q 0.066 -351 F 0.066 -352 H 0.058 -353 T 0.049 -354 F 0.044 -355 L 0.045 -356 L 0.052 -357 T 0.070 -358 K 0.100 -359 A 0.135 -360 G 0.165 -361 A 0.188 -362 A 0.203 -363 D 0.205 -364 A 0.190 -365 P 0.159 -366 L 0.128 -367 R 0.109 -368 L 0.100 -369 R 0.101 -370 S 0.108 -371 I 0.117 -372 H 0.117 -373 E 0.102 -374 Y 0.081 -375 P 0.065 -376 K 0.061 -377 Y 0.060 -378 Q 0.056 -379 A 0.052 -380 E 0.052 -381 F 0.055 -382 P 0.056 -383 M 0.051 -384 S 0.046 -385 P 0.046 -386 V 0.053 -387 T 0.064 -388 S 0.075 -389 A 0.088 -390 H 0.106 -391 A 0.123 -392 G 0.125 -393 T 0.105 -394 Y 0.078 -395 R 0.063 -396 C 0.064 -397 Y 0.073 -398 G 0.083 -399 S 0.093 -400 L 0.102 -401 N 0.110 -402 S 0.113 -403 D 0.111 -404 P 0.107 -405 Y 0.107 -406 L 0.109 -407 L 0.110 -408 S 0.113 -409 H 0.117 -410 P 0.120 -411 S 0.123 -412 E 0.129 -413 P 0.133 -414 L 0.130 -415 E 0.125 -416 L 0.128 -417 V 0.155 -418 V 0.222 -419 S 0.333 -420 G 0.467 -421 P 0.590 -422 S 0.671 -423 M 0.707 -424 G 0.705 -425 S 0.677 -426 S 0.643 -427 P 0.627 -428 P 0.639 -429 P 0.666 -430 T 0.688 -431 G 0.686 -432 P 0.648 -433 I 0.585 -434 S 0.543 -435 T 0.553 -436 P 0.577 -437 G 0.573 -438 P 0.558 -439 E 0.555 -440 D 0.552 -441 Q 0.557 -442 P 0.595 -443 L 0.652 -444 T 0.698 -445 P 0.721 -446 T 0.712 -447 G 0.677 -448 S 0.652 -449 D 0.667 -450 P 0.704 -451 Q 0.733 -452 S 0.745 -453 G 0.744 -454 L 0.729 -455 G 0.701 -456 R 0.666 -457 H 0.636 -458 L 0.620 -459 G 0.609 -460 V 0.585 -461 V 0.549 -462 I 0.515 -463 G 0.491 -464 I 0.468 -465 L 0.438 -466 V 0.405 -467 A 0.379 -468 V 0.364 -469 V 0.353 -470 L 0.339 -471 L 0.322 -472 L 0.302 -473 L 0.280 -474 L 0.253 -475 L 0.228 -476 L 0.210 -477 L 0.195 -478 L 0.181 -479 F 0.170 -480 L 0.165 -481 I 0.166 -482 L 0.179 -483 R 0.205 -484 H 0.240 -485 R 0.282 -486 R 0.334 -487 Q 0.400 -488 G 0.464 -489 K 0.513 -490 H 0.547 -491 W 0.579 -492 T 0.609 -493 S 0.628 -494 T 0.637 -495 Q 0.642 -496 R 0.646 -497 K 0.648 -498 A 0.637 -499 D 0.599 -500 F 0.544 -501 Q 0.524 -502 H 0.572 -503 P 0.656 -504 A 0.726 -505 G 0.764 -506 A 0.777 -507 V 0.777 -508 G 0.773 -509 P 0.773 -510 E 0.780 -511 P 0.789 -512 T 0.799 -513 D 0.807 -514 R 0.811 -515 G 0.810 -516 L 0.803 -517 Q 0.796 -518 W 0.792 -519 R 0.792 -520 S 0.795 -521 S 0.803 -522 P 0.816 -523 A 0.832 -524 A 0.845 -525 D 0.848 -526 A 0.841 -527 Q 0.829 -528 E 0.820 -529 E 0.814 -530 N 0.807 -531 L 0.802 -532 Y 0.802 -533 A 0.805 -534 A 0.809 -535 V 0.811 -536 K 0.810 -537 D 0.804 -538 T 0.796 -539 Q 0.794 -540 P 0.804 -541 E 0.824 -542 D 0.843 -543 G 0.852 -544 V 0.853 -545 E 0.849 -546 M 0.843 -547 D 0.837 -548 T 0.834 -549 R 0.835 -550 A 0.837 -551 A 0.836 -552 A 0.826 -553 S 0.812 -554 E 0.798 -555 A 0.791 -556 P 0.793 -557 Q 0.800 -558 D 0.806 -559 V 0.807 -560 T 0.806 -561 Y 0.805 -562 A 0.801 -563 Q 0.788 -564 L 0.773 -565 H 0.761 -566 S 0.753 -567 L 0.733 -568 T 0.689 -569 L 0.634 -570 R 0.610 -571 R 0.641 -572 K 0.689 -573 A 0.707 -574 T 0.693 -575 E 0.677 -576 P 0.680 -577 P 0.708 -578 P 0.749 -579 S 0.780 -580 Q 0.786 -581 E 0.769 -582 R 0.741 -583 E 0.721 -584 P 0.717 -585 P 0.726 -586 A 0.740 -587 E 0.756 -588 P 0.771 -589 S 0.782 -590 I 0.789 -591 Y 0.796 -592 A 0.803 -593 T 0.801 -594 L 0.783 -595 A 0.753 -596 I 0.718 -597 H 0.693 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000131042.16_ENST00000314446.10_GN:LILRB2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000131042.16_ENST00000314446.10_GN:LILRB2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid deleted file mode 100644 index f337fc878900075488caf401388e5749fcccd7d7..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000131042.16_ENST00000314446.10_GN:LILRB2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid +++ /dev/null @@ -1,615 +0,0 @@ ->ENSG00000131042.16|ENST00000314446.10|GN:LILRB2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:17 -1 M 0.331 -2 H 0.339 -3 R 0.368 -4 G 0.402 -5 L 0.403 -6 I 0.382 -7 H 0.386 -8 P 0.410 -9 Q 0.407 -10 S 0.389 -11 R 0.424 -12 A 0.517 -13 V 0.602 -14 G 0.649 -15 G 0.673 -16 D 0.675 -17 A 0.642 -18 M 0.591 -19 T 0.548 -20 P 0.504 -21 I 0.437 -22 V 0.358 -23 T 0.309 -24 V 0.294 -25 L 0.291 -26 I 0.288 -27 C 0.299 -28 L 0.324 -29 G 0.346 -30 L 0.357 -31 S 0.370 -32 L 0.398 -33 G 0.440 -34 P 0.486 -35 R 0.529 -36 T 0.566 -37 R 0.589 -38 V 0.593 -39 Q 0.575 -40 T 0.535 -41 G 0.470 -42 T 0.383 -43 I 0.288 -44 P 0.202 -45 K 0.137 -46 P 0.097 -47 T 0.076 -48 L 0.065 -49 W 0.058 -50 A 0.053 -51 E 0.048 -52 P 0.047 -53 D 0.050 -54 S 0.053 -55 V 0.053 -56 I 0.051 -57 T 0.054 -58 Q 0.065 -59 G 0.077 -60 S 0.080 -61 P 0.069 -62 V 0.054 -63 T 0.043 -64 L 0.039 -65 S 0.041 -66 C 0.047 -67 Q 0.058 -68 G 0.069 -69 S 0.076 -70 L 0.079 -71 E 0.077 -72 A 0.070 -73 Q 0.058 -74 E 0.044 -75 Y 0.035 -76 R 0.032 -77 L 0.036 -78 Y 0.049 -79 R 0.073 -80 E 0.110 -81 K 0.150 -82 K 0.175 -83 S 0.177 -84 A 0.160 -85 S 0.138 -86 W 0.119 -87 I 0.107 -88 T 0.102 -89 R 0.106 -90 I 0.110 -91 R 0.107 -92 P 0.097 -93 E 0.083 -94 L 0.072 -95 V 0.065 -96 K 0.062 -97 N 0.059 -98 G 0.053 -99 Q 0.044 -100 F 0.037 -101 H 0.036 -102 I 0.039 -103 P 0.042 -104 S 0.045 -105 I 0.047 -106 T 0.047 -107 W 0.046 -108 E 0.048 -109 H 0.053 -110 T 0.059 -111 G 0.058 -112 R 0.049 -113 Y 0.038 -114 G 0.032 -115 C 0.031 -116 Q 0.034 -117 Y 0.039 -118 Y 0.043 -119 S 0.046 -120 R 0.050 -121 A 0.054 -122 R 0.059 -123 W 0.066 -124 S 0.074 -125 E 0.081 -126 L 0.083 -127 S 0.084 -128 D 0.083 -129 P 0.076 -130 L 0.068 -131 V 0.068 -132 L 0.077 -133 V 0.092 -134 M 0.109 -135 T 0.126 -136 G 0.141 -137 A 0.149 -138 Y 0.145 -139 P 0.129 -140 K 0.106 -141 P 0.086 -142 T 0.075 -143 L 0.068 -144 S 0.062 -145 A 0.056 -146 Q 0.053 -147 P 0.055 -148 S 0.061 -149 P 0.067 -150 V 0.073 -151 V 0.080 -152 T 0.087 -153 S 0.093 -154 G 0.094 -155 G 0.087 -156 R 0.073 -157 V 0.058 -158 T 0.048 -159 L 0.043 -160 Q 0.042 -161 C 0.045 -162 E 0.050 -163 S 0.056 -164 Q 0.061 -165 V 0.065 -166 A 0.070 -167 F 0.073 -168 G 0.070 -169 G 0.059 -170 F 0.046 -171 I 0.040 -172 L 0.046 -173 C 0.062 -174 K 0.083 -175 E 0.109 -176 G 0.136 -177 E 0.159 -178 D 0.170 -179 E 0.167 -180 H 0.150 -181 P 0.129 -182 Q 0.111 -183 C 0.101 -184 L 0.099 -185 N 0.106 -186 S 0.125 -187 Q 0.149 -188 P 0.165 -189 H 0.164 -190 A 0.149 -191 R 0.129 -192 G 0.108 -193 S 0.089 -194 S 0.072 -195 R 0.058 -196 A 0.046 -197 I 0.038 -198 F 0.033 -199 S 0.032 -200 V 0.037 -201 G 0.052 -202 P 0.078 -203 V 0.110 -204 S 0.133 -205 P 0.142 -206 N 0.145 -207 R 0.141 -208 R 0.127 -209 W 0.104 -210 S 0.078 -211 H 0.057 -212 R 0.046 -213 C 0.046 -214 Y 0.054 -215 G 0.065 -216 Y 0.074 -217 D 0.078 -218 L 0.080 -219 N 0.079 -220 S 0.078 -221 P 0.079 -222 Y 0.082 -223 V 0.086 -224 W 0.091 -225 S 0.101 -226 S 0.109 -227 P 0.110 -228 S 0.108 -229 D 0.109 -230 L 0.106 -231 L 0.097 -232 E 0.089 -233 L 0.089 -234 L 0.105 -235 V 0.129 -236 P 0.146 -237 G 0.152 -238 V 0.148 -239 S 0.139 -240 K 0.123 -241 K 0.103 -242 P 0.084 -243 S 0.071 -244 L 0.063 -245 S 0.057 -246 V 0.053 -247 Q 0.049 -248 P 0.049 -249 G 0.053 -250 P 0.057 -251 V 0.061 -252 M 0.067 -253 A 0.079 -254 P 0.091 -255 G 0.093 -256 E 0.083 -257 S 0.068 -258 L 0.054 -259 T 0.044 -260 L 0.041 -261 Q 0.040 -262 C 0.041 -263 V 0.043 -264 S 0.048 -265 D 0.057 -266 V 0.066 -267 G 0.072 -268 Y 0.067 -269 D 0.053 -270 R 0.037 -271 F 0.029 -272 V 0.028 -273 L 0.034 -274 Y 0.044 -275 K 0.057 -276 E 0.069 -277 G 0.079 -278 E 0.084 -279 R 0.087 -280 D 0.089 -281 L 0.089 -282 R 0.089 -283 Q 0.094 -284 L 0.107 -285 P 0.124 -286 G 0.144 -287 R 0.164 -288 Q 0.179 -289 P 0.180 -290 Q 0.166 -291 A 0.143 -292 G 0.117 -293 L 0.095 -294 S 0.075 -295 Q 0.059 -296 A 0.048 -297 N 0.043 -298 F 0.042 -299 T 0.043 -300 L 0.042 -301 G 0.040 -302 P 0.040 -303 V 0.042 -304 S 0.047 -305 R 0.055 -306 S 0.066 -307 Y 0.079 -308 G 0.092 -309 G 0.094 -310 Q 0.079 -311 Y 0.058 -312 R 0.046 -313 C 0.046 -314 Y 0.055 -315 G 0.068 -316 A 0.082 -317 H 0.093 -318 N 0.101 -319 L 0.105 -320 S 0.106 -321 S 0.107 -322 E 0.109 -323 C 0.114 -324 S 0.120 -325 A 0.125 -326 P 0.124 -327 S 0.124 -328 D 0.126 -329 P 0.122 -330 L 0.110 -331 D 0.097 -332 I 0.090 -333 L 0.096 -334 I 0.113 -335 T 0.135 -336 G 0.150 -337 Q 0.154 -338 I 0.152 -339 R 0.150 -340 G 0.144 -341 T 0.129 -342 P 0.108 -343 F 0.089 -344 I 0.077 -345 S 0.070 -346 V 0.066 -347 Q 0.067 -348 P 0.076 -349 G 0.094 -350 P 0.114 -351 T 0.130 -352 V 0.142 -353 A 0.148 -354 S 0.144 -355 G 0.133 -356 E 0.119 -357 N 0.103 -358 V 0.085 -359 T 0.066 -360 L 0.053 -361 L 0.048 -362 C 0.050 -363 Q 0.055 -364 S 0.058 -365 W 0.059 -366 R 0.063 -367 Q 0.067 -368 F 0.067 -369 H 0.059 -370 T 0.049 -371 F 0.045 -372 L 0.046 -373 L 0.053 -374 T 0.070 -375 K 0.099 -376 A 0.133 -377 G 0.163 -378 A 0.185 -379 A 0.199 -380 D 0.202 -381 A 0.187 -382 P 0.157 -383 L 0.126 -384 R 0.107 -385 L 0.099 -386 R 0.099 -387 S 0.107 -388 I 0.116 -389 H 0.116 -390 E 0.102 -391 Y 0.080 -392 P 0.065 -393 K 0.060 -394 Y 0.059 -395 Q 0.056 -396 A 0.052 -397 E 0.052 -398 F 0.055 -399 P 0.055 -400 M 0.051 -401 S 0.045 -402 P 0.046 -403 V 0.053 -404 T 0.063 -405 S 0.074 -406 A 0.088 -407 H 0.105 -408 A 0.123 -409 G 0.126 -410 T 0.106 -411 Y 0.079 -412 R 0.064 -413 C 0.065 -414 Y 0.074 -415 G 0.084 -416 S 0.093 -417 L 0.102 -418 N 0.110 -419 S 0.113 -420 D 0.111 -421 P 0.108 -422 Y 0.108 -423 L 0.109 -424 L 0.110 -425 S 0.113 -426 H 0.118 -427 P 0.120 -428 S 0.124 -429 E 0.130 -430 P 0.133 -431 L 0.130 -432 E 0.125 -433 L 0.128 -434 V 0.156 -435 V 0.224 -436 S 0.334 -437 G 0.469 -438 P 0.591 -439 S 0.672 -440 M 0.708 -441 G 0.705 -442 S 0.678 -443 S 0.644 -444 P 0.629 -445 P 0.641 -446 P 0.669 -447 T 0.692 -448 G 0.689 -449 P 0.651 -450 I 0.588 -451 S 0.547 -452 T 0.557 -453 P 0.581 -454 G 0.578 -455 P 0.563 -456 E 0.558 -457 D 0.553 -458 Q 0.557 -459 P 0.595 -460 L 0.653 -461 T 0.702 -462 P 0.734 -463 T 0.748 -464 G 0.747 -465 S 0.740 -466 D 0.737 -467 P 0.741 -468 Q 0.746 -469 S 0.750 -470 G 0.747 -471 L 0.733 -472 G 0.706 -473 R 0.673 -474 H 0.644 -475 L 0.628 -476 G 0.616 -477 V 0.592 -478 V 0.556 -479 I 0.522 -480 G 0.498 -481 I 0.476 -482 L 0.448 -483 V 0.416 -484 A 0.392 -485 V 0.379 -486 V 0.367 -487 L 0.352 -488 L 0.332 -489 L 0.311 -490 L 0.287 -491 L 0.260 -492 L 0.234 -493 L 0.215 -494 L 0.200 -495 L 0.185 -496 F 0.173 -497 L 0.168 -498 I 0.170 -499 L 0.183 -500 R 0.209 -501 H 0.243 -502 R 0.285 -503 R 0.339 -504 Q 0.405 -505 G 0.471 -506 K 0.521 -507 H 0.556 -508 W 0.587 -509 T 0.615 -510 S 0.633 -511 T 0.643 -512 Q 0.650 -513 R 0.657 -514 K 0.660 -515 A 0.648 -516 D 0.606 -517 F 0.549 -518 Q 0.528 -519 H 0.574 -520 P 0.658 -521 A 0.729 -522 G 0.767 -523 A 0.780 -524 V 0.780 -525 G 0.776 -526 P 0.776 -527 E 0.782 -528 P 0.791 -529 T 0.800 -530 D 0.808 -531 R 0.813 -532 G 0.812 -533 L 0.805 -534 Q 0.798 -535 W 0.794 -536 R 0.795 -537 S 0.798 -538 S 0.805 -539 P 0.818 -540 A 0.834 -541 A 0.846 -542 D 0.848 -543 A 0.841 -544 Q 0.830 -545 E 0.821 -546 E 0.815 -547 N 0.809 -548 L 0.804 -549 Y 0.803 -550 A 0.806 -551 A 0.810 -552 V 0.811 -553 K 0.809 -554 D 0.804 -555 T 0.797 -556 Q 0.794 -557 P 0.805 -558 E 0.825 -559 D 0.843 -560 G 0.852 -561 V 0.853 -562 E 0.849 -563 M 0.843 -564 D 0.837 -565 T 0.834 -566 R 0.834 -567 A 0.837 -568 A 0.835 -569 A 0.826 -570 S 0.811 -571 E 0.797 -572 A 0.790 -573 P 0.792 -574 Q 0.799 -575 D 0.805 -576 V 0.806 -577 T 0.805 -578 Y 0.803 -579 A 0.799 -580 Q 0.786 -581 L 0.771 -582 H 0.759 -583 S 0.751 -584 L 0.732 -585 T 0.690 -586 L 0.639 -587 R 0.617 -588 R 0.647 -589 K 0.693 -590 A 0.710 -591 T 0.696 -592 E 0.680 -593 P 0.682 -594 P 0.709 -595 P 0.749 -596 S 0.780 -597 Q 0.786 -598 E 0.769 -599 R 0.742 -600 E 0.722 -601 P 0.718 -602 P 0.727 -603 A 0.741 -604 E 0.757 -605 P 0.771 -606 S 0.782 -607 I 0.789 -608 Y 0.796 -609 A 0.803 -610 T 0.801 -611 L 0.783 -612 A 0.753 -613 I 0.717 -614 H 0.691 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000131482.11_ENST00000253801.7_GN:G6PC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000131482.11_ENST00000253801.7_GN:G6PC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index caf9065ce81a4cf87228eb900fee397c2041f487..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000131482.11_ENST00000253801.7_GN:G6PC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,358 +0,0 @@ ->ENSG00000131482.11|ENST00000253801.7|GN:G6PC1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.205 -2 E 0.199 -3 E 0.184 -4 G 0.159 -5 M 0.129 -6 N 0.102 -7 V 0.086 -8 L 0.082 -9 H 0.083 -10 D 0.080 -11 F 0.073 -12 G 0.068 -13 I 0.068 -14 Q 0.069 -15 S 0.072 -16 T 0.078 -17 H 0.084 -18 Y 0.087 -19 L 0.086 -20 Q 0.084 -21 V 0.081 -22 N 0.075 -23 Y 0.070 -24 Q 0.067 -25 D 0.062 -26 S 0.054 -27 Q 0.045 -28 D 0.040 -29 W 0.042 -30 F 0.052 -31 I 0.064 -32 L 0.076 -33 V 0.087 -34 S 0.095 -35 V 0.096 -36 I 0.093 -37 A 0.092 -38 D 0.093 -39 L 0.088 -40 R 0.076 -41 N 0.060 -42 A 0.048 -43 F 0.042 -44 Y 0.042 -45 V 0.044 -46 L 0.043 -47 F 0.037 -48 P 0.028 -49 I 0.022 -50 W 0.022 -51 F 0.025 -52 H 0.032 -53 L 0.037 -54 Q 0.035 -55 E 0.031 -56 A 0.030 -57 V 0.032 -58 G 0.033 -59 I 0.032 -60 K 0.031 -61 L 0.031 -62 L 0.031 -63 W 0.031 -64 V 0.033 -65 A 0.036 -66 V 0.040 -67 I 0.045 -68 G 0.049 -69 D 0.048 -70 W 0.043 -71 L 0.037 -72 N 0.034 -73 L 0.032 -74 V 0.032 -75 F 0.035 -76 K 0.042 -77 W 0.051 -78 I 0.059 -79 L 0.067 -80 F 0.075 -81 G 0.081 -82 Q 0.084 -83 R 0.080 -84 P 0.071 -85 Y 0.062 -86 W 0.057 -87 W 0.057 -88 V 0.058 -89 L 0.062 -90 D 0.072 -91 T 0.086 -92 D 0.097 -93 Y 0.108 -94 Y 0.122 -95 S 0.139 -96 N 0.154 -97 T 0.162 -98 S 0.169 -99 V 0.177 -100 P 0.183 -101 L 0.187 -102 I 0.195 -103 K 0.206 -104 Q 0.216 -105 F 0.221 -106 P 0.219 -107 V 0.212 -108 T 0.201 -109 C 0.191 -110 E 0.183 -111 T 0.176 -112 G 0.170 -113 P 0.159 -114 G 0.148 -115 S 0.152 -116 P 0.172 -117 S 0.188 -118 G 0.179 -119 H 0.157 -120 A 0.140 -121 M 0.132 -122 G 0.125 -123 T 0.118 -124 A 0.107 -125 G 0.089 -126 V 0.066 -127 Y 0.046 -128 Y 0.035 -129 V 0.029 -130 M 0.025 -131 V 0.025 -132 T 0.027 -133 S 0.028 -134 T 0.028 -135 L 0.029 -136 S 0.035 -137 I 0.048 -138 F 0.073 -139 Q 0.107 -140 G 0.142 -141 K 0.169 -142 I 0.183 -143 K 0.182 -144 P 0.165 -145 T 0.143 -146 Y 0.123 -147 R 0.107 -148 F 0.090 -149 R 0.070 -150 C 0.059 -151 L 0.063 -152 N 0.074 -153 V 0.078 -154 I 0.071 -155 L 0.066 -156 W 0.072 -157 L 0.081 -158 G 0.081 -159 F 0.068 -160 W 0.055 -161 A 0.049 -162 V 0.050 -163 Q 0.050 -164 L 0.049 -165 N 0.049 -166 V 0.052 -167 C 0.053 -168 L 0.055 -169 S 0.060 -170 R 0.072 -171 I 0.088 -172 Y 0.103 -173 L 0.111 -174 A 0.110 -175 A 0.103 -176 H 0.095 -177 F 0.089 -178 P 0.085 -179 H 0.083 -180 Q 0.085 -181 V 0.084 -182 V 0.075 -183 A 0.065 -184 G 0.059 -185 V 0.059 -186 L 0.061 -187 S 0.060 -188 G 0.056 -189 I 0.050 -190 A 0.048 -191 V 0.050 -192 A 0.048 -193 E 0.041 -194 T 0.034 -195 F 0.033 -196 S 0.037 -197 H 0.046 -198 I 0.059 -199 H 0.072 -200 S 0.078 -201 I 0.074 -202 Y 0.067 -203 N 0.063 -204 A 0.059 -205 S 0.053 -206 L 0.043 -207 K 0.034 -208 K 0.029 -209 Y 0.033 -210 F 0.045 -211 L 0.054 -212 I 0.051 -213 T 0.041 -214 F 0.034 -215 F 0.033 -216 L 0.035 -217 F 0.035 -218 S 0.032 -219 F 0.030 -220 A 0.029 -221 I 0.031 -222 G 0.037 -223 F 0.047 -224 Y 0.060 -225 L 0.068 -226 L 0.067 -227 L 0.064 -228 K 0.064 -229 G 0.070 -230 L 0.082 -231 G 0.094 -232 V 0.098 -233 D 0.092 -234 L 0.082 -235 L 0.072 -236 W 0.062 -237 T 0.056 -238 L 0.054 -239 E 0.052 -240 K 0.049 -241 A 0.048 -242 Q 0.049 -243 R 0.051 -244 W 0.055 -245 C 0.061 -246 E 0.073 -247 Q 0.089 -248 P 0.107 -249 E 0.123 -250 W 0.136 -251 V 0.147 -252 H 0.156 -253 I 0.160 -254 D 0.154 -255 T 0.136 -256 T 0.118 -257 P 0.105 -258 F 0.098 -259 A 0.090 -260 S 0.081 -261 L 0.073 -262 L 0.068 -263 K 0.066 -264 N 0.062 -265 L 0.055 -266 G 0.045 -267 T 0.036 -268 L 0.031 -269 F 0.030 -270 G 0.032 -271 L 0.037 -272 G 0.044 -273 L 0.053 -274 A 0.060 -275 L 0.066 -276 N 0.079 -277 S 0.098 -278 S 0.117 -279 M 0.127 -280 Y 0.131 -281 R 0.143 -282 E 0.169 -283 S 0.202 -284 C 0.226 -285 K 0.235 -286 G 0.229 -287 K 0.202 -288 L 0.160 -289 S 0.119 -290 K 0.087 -291 W 0.065 -292 L 0.050 -293 P 0.043 -294 F 0.041 -295 R 0.041 -296 L 0.042 -297 S 0.046 -298 S 0.048 -299 I 0.048 -300 V 0.047 -301 A 0.049 -302 S 0.050 -303 L 0.048 -304 V 0.044 -305 L 0.043 -306 L 0.043 -307 H 0.045 -308 V 0.053 -309 F 0.070 -310 D 0.095 -311 S 0.128 -312 L 0.171 -313 K 0.211 -314 P 0.229 -315 P 0.216 -316 S 0.186 -317 Q 0.157 -318 V 0.129 -319 E 0.097 -320 L 0.070 -321 V 0.055 -322 F 0.050 -323 Y 0.049 -324 V 0.051 -325 L 0.055 -326 S 0.058 -327 F 0.057 -328 C 0.052 -329 K 0.048 -330 S 0.045 -331 A 0.043 -332 V 0.042 -333 V 0.041 -334 P 0.039 -335 L 0.036 -336 A 0.035 -337 S 0.037 -338 V 0.040 -339 S 0.045 -340 V 0.050 -341 I 0.050 -342 P 0.045 -343 Y 0.041 -344 C 0.044 -345 L 0.058 -346 A 0.081 -347 Q 0.112 -348 V 0.153 -349 L 0.213 -350 G 0.286 -351 Q 0.360 -352 P 0.419 -353 H 0.460 -354 K 0.479 -355 K 0.469 -356 S 0.430 -357 L 0.392 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000131482.11_ENST00000253801.7_GN:G6PC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000131482.11_ENST00000253801.7_GN:G6PC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid deleted file mode 100644 index 9874ec0f9cdcf0034e4602bcf338637fbe933d4e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000131482.11_ENST00000253801.7_GN:G6PC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid +++ /dev/null @@ -1,360 +0,0 @@ ->ENSG00000131482.11|ENST00000253801.7|GN:G6PC1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:2 -1 M 0.218 -2 R 0.201 -3 M 0.186 -4 E 0.180 -5 E 0.172 -6 G 0.154 -7 M 0.127 -8 N 0.102 -9 V 0.086 -10 L 0.081 -11 H 0.081 -12 D 0.077 -13 F 0.071 -14 G 0.067 -15 I 0.068 -16 Q 0.069 -17 S 0.072 -18 T 0.078 -19 H 0.084 -20 Y 0.087 -21 L 0.086 -22 Q 0.084 -23 V 0.081 -24 N 0.075 -25 Y 0.070 -26 Q 0.067 -27 D 0.062 -28 S 0.054 -29 Q 0.045 -30 D 0.040 -31 W 0.042 -32 F 0.051 -33 I 0.064 -34 L 0.076 -35 V 0.088 -36 S 0.096 -37 V 0.096 -38 I 0.093 -39 A 0.092 -40 D 0.092 -41 L 0.089 -42 R 0.077 -43 N 0.061 -44 A 0.048 -45 F 0.043 -46 Y 0.042 -47 V 0.044 -48 L 0.043 -49 F 0.037 -50 P 0.028 -51 I 0.023 -52 W 0.022 -53 F 0.026 -54 H 0.032 -55 L 0.037 -56 Q 0.035 -57 E 0.031 -58 A 0.030 -59 V 0.031 -60 G 0.032 -61 I 0.032 -62 K 0.031 -63 L 0.031 -64 L 0.031 -65 W 0.031 -66 V 0.033 -67 A 0.036 -68 V 0.040 -69 I 0.045 -70 G 0.049 -71 D 0.048 -72 W 0.043 -73 L 0.037 -74 N 0.034 -75 L 0.032 -76 V 0.031 -77 F 0.035 -78 K 0.042 -79 W 0.051 -80 I 0.060 -81 L 0.068 -82 F 0.075 -83 G 0.080 -84 Q 0.083 -85 R 0.080 -86 P 0.071 -87 Y 0.062 -88 W 0.057 -89 W 0.056 -90 V 0.058 -91 L 0.062 -92 D 0.072 -93 T 0.086 -94 D 0.097 -95 Y 0.107 -96 Y 0.121 -97 S 0.138 -98 N 0.153 -99 T 0.162 -100 S 0.170 -101 V 0.177 -102 P 0.183 -103 L 0.188 -104 I 0.195 -105 K 0.206 -106 Q 0.216 -107 F 0.221 -108 P 0.219 -109 V 0.211 -110 T 0.201 -111 C 0.190 -112 E 0.182 -113 T 0.175 -114 G 0.169 -115 P 0.158 -116 G 0.147 -117 S 0.151 -118 P 0.171 -119 S 0.186 -120 G 0.178 -121 H 0.156 -122 A 0.139 -123 M 0.131 -124 G 0.125 -125 T 0.117 -126 A 0.106 -127 G 0.089 -128 V 0.066 -129 Y 0.046 -130 Y 0.035 -131 V 0.029 -132 M 0.025 -133 V 0.025 -134 T 0.026 -135 S 0.028 -136 T 0.028 -137 L 0.029 -138 S 0.035 -139 I 0.048 -140 F 0.074 -141 Q 0.108 -142 G 0.143 -143 K 0.170 -144 I 0.184 -145 K 0.183 -146 P 0.167 -147 T 0.144 -148 Y 0.124 -149 R 0.108 -150 F 0.090 -151 R 0.070 -152 C 0.059 -153 L 0.063 -154 N 0.075 -155 V 0.078 -156 I 0.071 -157 L 0.066 -158 W 0.072 -159 L 0.082 -160 G 0.081 -161 F 0.068 -162 W 0.055 -163 A 0.049 -164 V 0.050 -165 Q 0.050 -166 L 0.049 -167 N 0.049 -168 V 0.052 -169 C 0.053 -170 L 0.055 -171 S 0.060 -172 R 0.072 -173 I 0.087 -174 Y 0.102 -175 L 0.110 -176 A 0.110 -177 A 0.103 -178 H 0.095 -179 F 0.089 -180 P 0.084 -181 H 0.083 -182 Q 0.085 -183 V 0.083 -184 V 0.075 -185 A 0.065 -186 G 0.060 -187 V 0.060 -188 L 0.062 -189 S 0.062 -190 G 0.057 -191 I 0.050 -192 A 0.048 -193 V 0.050 -194 A 0.048 -195 E 0.041 -196 T 0.034 -197 F 0.033 -198 S 0.037 -199 H 0.046 -200 I 0.059 -201 H 0.072 -202 S 0.077 -203 I 0.074 -204 Y 0.067 -205 N 0.063 -206 A 0.059 -207 S 0.053 -208 L 0.043 -209 K 0.034 -210 K 0.029 -211 Y 0.033 -212 F 0.045 -213 L 0.054 -214 I 0.051 -215 T 0.041 -216 F 0.034 -217 F 0.033 -218 L 0.035 -219 F 0.035 -220 S 0.032 -221 F 0.030 -222 A 0.029 -223 I 0.031 -224 G 0.036 -225 F 0.047 -226 Y 0.060 -227 L 0.067 -228 L 0.067 -229 L 0.063 -230 K 0.064 -231 G 0.070 -232 L 0.082 -233 G 0.094 -234 V 0.097 -235 D 0.092 -236 L 0.082 -237 L 0.072 -238 W 0.062 -239 T 0.056 -240 L 0.054 -241 E 0.051 -242 K 0.048 -243 A 0.047 -244 Q 0.049 -245 R 0.051 -246 W 0.055 -247 C 0.061 -248 E 0.073 -249 Q 0.089 -250 P 0.106 -251 E 0.122 -252 W 0.136 -253 V 0.147 -254 H 0.156 -255 I 0.160 -256 D 0.154 -257 T 0.136 -258 T 0.117 -259 P 0.105 -260 F 0.098 -261 A 0.090 -262 S 0.081 -263 L 0.073 -264 L 0.068 -265 K 0.066 -266 N 0.062 -267 L 0.055 -268 G 0.045 -269 T 0.036 -270 L 0.031 -271 F 0.030 -272 G 0.032 -273 L 0.037 -274 G 0.044 -275 L 0.052 -276 A 0.059 -277 L 0.066 -278 N 0.079 -279 S 0.098 -280 S 0.117 -281 M 0.127 -282 Y 0.132 -283 R 0.144 -284 E 0.170 -285 S 0.203 -286 C 0.227 -287 K 0.237 -288 G 0.231 -289 K 0.204 -290 L 0.162 -291 S 0.120 -292 K 0.088 -293 W 0.066 -294 L 0.050 -295 P 0.043 -296 F 0.041 -297 R 0.041 -298 L 0.042 -299 S 0.046 -300 S 0.049 -301 I 0.048 -302 V 0.048 -303 A 0.049 -304 S 0.050 -305 L 0.048 -306 V 0.044 -307 L 0.043 -308 L 0.043 -309 H 0.045 -310 V 0.053 -311 F 0.070 -312 D 0.095 -313 S 0.129 -314 L 0.171 -315 K 0.211 -316 P 0.229 -317 P 0.216 -318 S 0.187 -319 Q 0.158 -320 V 0.129 -321 E 0.097 -322 L 0.070 -323 V 0.055 -324 F 0.050 -325 Y 0.049 -326 V 0.051 -327 L 0.055 -328 S 0.059 -329 F 0.057 -330 C 0.052 -331 K 0.048 -332 S 0.045 -333 A 0.043 -334 V 0.042 -335 V 0.041 -336 P 0.039 -337 L 0.036 -338 A 0.035 -339 S 0.037 -340 V 0.040 -341 S 0.045 -342 V 0.050 -343 I 0.050 -344 P 0.045 -345 Y 0.041 -346 C 0.044 -347 L 0.058 -348 A 0.081 -349 Q 0.112 -350 V 0.153 -351 L 0.213 -352 G 0.287 -353 Q 0.361 -354 P 0.421 -355 H 0.462 -356 K 0.481 -357 K 0.470 -358 S 0.431 -359 L 0.393 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000133063.17_ENST00000367229.6_GN:CHIT1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000133063.17_ENST00000367229.6_GN:CHIT1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index a094dcbe240aa328039dca8d157ece041d27a668..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000133063.17_ENST00000367229.6_GN:CHIT1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,467 +0,0 @@ ->ENSG00000133063.17|ENST00000367229.6|GN:CHIT1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.369 -2 V 0.362 -3 R 0.367 -4 S 0.385 -5 V 0.381 -6 A 0.352 -7 W 0.344 -8 A 0.364 -9 G 0.367 -10 F 0.351 -11 M 0.365 -12 V 0.412 -13 L 0.443 -14 L 0.440 -15 M 0.428 -16 I 0.428 -17 P 0.438 -18 W 0.443 -19 G 0.422 -20 S 0.362 -21 A 0.274 -22 A 0.185 -23 K 0.116 -24 L 0.073 -25 V 0.051 -26 C 0.043 -27 Y 0.041 -28 F 0.041 -29 T 0.039 -30 N 0.039 -31 W 0.044 -32 A 0.053 -33 Q 0.061 -34 Y 0.071 -35 R 0.086 -36 Q 0.104 -37 G 0.117 -38 E 0.124 -39 A 0.124 -40 R 0.115 -41 F 0.096 -42 L 0.077 -43 P 0.068 -44 K 0.069 -45 D 0.071 -46 L 0.070 -47 D 0.063 -48 P 0.056 -49 S 0.055 -50 L 0.061 -51 C 0.065 -52 T 0.062 -53 H 0.056 -54 L 0.053 -55 I 0.052 -56 Y 0.051 -57 A 0.052 -58 F 0.054 -59 A 0.058 -60 G 0.063 -61 M 0.065 -62 T 0.067 -63 N 0.071 -64 H 0.076 -65 Q 0.081 -66 L 0.086 -67 S 0.089 -68 T 0.090 -69 T 0.087 -70 E 0.080 -71 W 0.073 -72 N 0.064 -73 D 0.054 -74 E 0.045 -75 T 0.040 -76 L 0.038 -77 Y 0.038 -78 Q 0.041 -79 E 0.044 -80 F 0.046 -81 N 0.048 -82 G 0.054 -83 L 0.059 -84 K 0.062 -85 K 0.059 -86 M 0.058 -87 N 0.061 -88 P 0.067 -89 K 0.071 -90 L 0.071 -91 K 0.071 -92 T 0.070 -93 L 0.068 -94 L 0.069 -95 A 0.078 -96 I 0.094 -97 G 0.107 -98 G 0.108 -99 W 0.099 -100 N 0.088 -101 F 0.081 -102 G 0.075 -103 T 0.068 -104 Q 0.062 -105 K 0.056 -106 F 0.054 -107 T 0.057 -108 D 0.065 -109 M 0.074 -110 V 0.080 -111 A 0.081 -112 T 0.078 -113 A 0.072 -114 N 0.065 -115 N 0.056 -116 R 0.047 -117 Q 0.040 -118 T 0.038 -119 F 0.043 -120 V 0.052 -121 N 0.059 -122 S 0.062 -123 A 0.064 -124 I 0.067 -125 R 0.066 -126 F 0.056 -127 L 0.043 -128 R 0.034 -129 K 0.031 -130 Y 0.034 -131 S 0.040 -132 F 0.046 -133 D 0.047 -134 G 0.044 -135 L 0.042 -136 D 0.043 -137 L 0.046 -138 D 0.051 -139 W 0.057 -140 E 0.066 -141 Y 0.077 -142 P 0.087 -143 G 0.091 -144 S 0.092 -145 Q 0.097 -146 G 0.105 -147 S 0.112 -148 P 0.111 -149 A 0.104 -150 V 0.095 -151 D 0.090 -152 K 0.086 -153 E 0.080 -154 R 0.076 -155 F 0.075 -156 T 0.071 -157 T 0.065 -158 L 0.059 -159 V 0.056 -160 Q 0.055 -161 D 0.063 -162 L 0.077 -163 A 0.090 -164 N 0.092 -165 A 0.083 -166 F 0.074 -167 Q 0.075 -168 Q 0.079 -169 E 0.077 -170 A 0.072 -171 Q 0.070 -172 T 0.078 -173 S 0.093 -174 G 0.108 -175 K 0.116 -176 E 0.116 -177 R 0.106 -178 L 0.089 -179 L 0.073 -180 L 0.060 -181 S 0.053 -182 A 0.056 -183 A 0.066 -184 V 0.077 -185 P 0.083 -186 A 0.082 -187 G 0.080 -188 Q 0.075 -189 T 0.067 -190 Y 0.059 -191 V 0.053 -192 D 0.051 -193 A 0.052 -194 G 0.053 -195 Y 0.052 -196 E 0.049 -197 V 0.048 -198 D 0.049 -199 K 0.050 -200 I 0.051 -201 A 0.054 -202 Q 0.062 -203 N 0.070 -204 L 0.069 -205 D 0.057 -206 F 0.043 -207 V 0.037 -208 N 0.039 -209 L 0.048 -210 M 0.057 -211 A 0.063 -212 Y 0.063 -213 D 0.064 -214 F 0.064 -215 H 0.060 -216 G 0.055 -217 S 0.052 -218 W 0.053 -219 E 0.058 -220 K 0.067 -221 V 0.080 -222 T 0.093 -223 G 0.105 -224 H 0.115 -225 N 0.128 -226 S 0.144 -227 P 0.157 -228 L 0.160 -229 Y 0.155 -230 K 0.146 -231 R 0.136 -232 Q 0.130 -233 E 0.136 -234 E 0.151 -235 S 0.162 -236 G 0.163 -237 A 0.158 -238 A 0.152 -239 A 0.146 -240 S 0.137 -241 L 0.127 -242 N 0.118 -243 V 0.108 -244 D 0.098 -245 A 0.091 -246 A 0.082 -247 V 0.071 -248 Q 0.060 -249 Q 0.056 -250 W 0.063 -251 L 0.077 -252 Q 0.090 -253 K 0.095 -254 G 0.095 -255 T 0.093 -256 P 0.090 -257 A 0.089 -258 S 0.091 -259 K 0.091 -260 L 0.091 -261 I 0.090 -262 L 0.093 -263 G 0.099 -264 M 0.102 -265 P 0.095 -266 T 0.083 -267 Y 0.075 -268 G 0.074 -269 R 0.078 -270 S 0.082 -271 F 0.087 -272 T 0.095 -273 L 0.103 -274 A 0.109 -275 S 0.112 -276 S 0.115 -277 S 0.115 -278 D 0.110 -279 T 0.106 -280 R 0.108 -281 V 0.120 -282 G 0.137 -283 A 0.151 -284 P 0.157 -285 A 0.160 -286 T 0.170 -287 G 0.191 -288 S 0.213 -289 G 0.230 -290 T 0.242 -291 P 0.242 -292 G 0.221 -293 P 0.181 -294 F 0.144 -295 T 0.127 -296 K 0.135 -297 E 0.151 -298 G 0.158 -299 G 0.145 -300 M 0.117 -301 L 0.087 -302 A 0.064 -303 Y 0.051 -304 Y 0.049 -305 E 0.050 -306 V 0.049 -307 C 0.049 -308 S 0.055 -309 W 0.070 -310 K 0.086 -311 G 0.096 -312 A 0.094 -313 T 0.083 -314 K 0.072 -315 Q 0.068 -316 R 0.069 -317 I 0.072 -318 Q 0.076 -319 D 0.080 -320 Q 0.086 -321 K 0.089 -322 V 0.086 -323 P 0.076 -324 Y 0.066 -325 I 0.061 -326 F 0.061 -327 R 0.064 -328 D 0.069 -329 N 0.071 -330 Q 0.067 -331 W 0.059 -332 V 0.051 -333 G 0.050 -334 F 0.059 -335 D 0.075 -336 D 0.086 -337 V 0.088 -338 E 0.083 -339 S 0.074 -340 F 0.063 -341 K 0.053 -342 T 0.046 -343 K 0.042 -344 V 0.041 -345 S 0.042 -346 Y 0.048 -347 L 0.059 -348 K 0.077 -349 Q 0.097 -350 K 0.113 -351 G 0.120 -352 L 0.110 -353 G 0.089 -354 G 0.068 -355 A 0.059 -356 M 0.060 -357 V 0.065 -358 W 0.070 -359 A 0.074 -360 L 0.076 -361 D 0.076 -362 L 0.076 -363 D 0.078 -364 D 0.084 -365 F 0.094 -366 A 0.107 -367 G 0.112 -368 F 0.107 -369 S 0.095 -370 C 0.086 -371 N 0.087 -372 Q 0.094 -373 G 0.099 -374 R 0.097 -375 Y 0.086 -376 P 0.073 -377 L 0.062 -378 I 0.058 -379 Q 0.059 -380 T 0.061 -381 L 0.060 -382 R 0.059 -383 Q 0.064 -384 E 0.076 -385 L 0.093 -386 S 0.122 -387 L 0.165 -388 P 0.223 -389 Y 0.300 -390 L 0.398 -391 P 0.496 -392 S 0.568 -393 G 0.601 -394 T 0.611 -395 P 0.612 -396 E 0.610 -397 L 0.598 -398 E 0.576 -399 V 0.557 -400 P 0.553 -401 K 0.566 -402 P 0.588 -403 G 0.608 -404 Q 0.620 -405 P 0.625 -406 S 0.626 -407 E 0.628 -408 P 0.635 -409 E 0.635 -410 H 0.624 -411 G 0.608 -412 P 0.601 -413 S 0.601 -414 P 0.595 -415 G 0.561 -416 Q 0.482 -417 D 0.368 -418 T 0.252 -419 F 0.169 -420 C 0.129 -421 Q 0.119 -422 G 0.122 -423 K 0.132 -424 A 0.142 -425 D 0.146 -426 G 0.141 -427 L 0.135 -428 Y 0.135 -429 P 0.140 -430 N 0.137 -431 P 0.124 -432 R 0.111 -433 E 0.106 -434 R 0.101 -435 S 0.088 -436 S 0.067 -437 F 0.053 -438 Y 0.053 -439 S 0.065 -440 C 0.082 -441 A 0.103 -442 A 0.124 -443 G 0.140 -444 R 0.147 -445 L 0.145 -446 F 0.138 -447 Q 0.129 -448 Q 0.118 -449 S 0.113 -450 C 0.123 -451 P 0.142 -452 T 0.156 -453 G 0.159 -454 L 0.152 -455 V 0.139 -456 F 0.125 -457 S 0.112 -458 N 0.101 -459 S 0.091 -460 C 0.087 -461 K 0.092 -462 C 0.109 -463 C 0.135 -464 T 0.165 -465 W 0.196 -466 N 0.217 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000133063.17_ENST00000367229.6_GN:CHIT1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000133063.17_ENST00000367229.6_GN:CHIT1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid deleted file mode 100644 index 1aa9c6e32efaa77e87a03fec53e4025eb202e385..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000133063.17_ENST00000367229.6_GN:CHIT1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid +++ /dev/null @@ -1,477 +0,0 @@ ->ENSG00000133063.17|ENST00000367229.6|GN:CHIT1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:10 -1 M 0.402 -2 G 0.412 -3 C 0.426 -4 S 0.433 -5 L 0.421 -6 P 0.398 -7 L 0.393 -8 S 0.407 -9 C 0.402 -10 I 0.378 -11 M 0.381 -12 V 0.414 -13 R 0.438 -14 S 0.452 -15 V 0.478 -16 A 0.495 -17 W 0.481 -18 A 0.459 -19 G 0.443 -20 F 0.411 -21 M 0.366 -22 V 0.355 -23 L 0.389 -24 L 0.422 -25 M 0.431 -26 I 0.432 -27 P 0.439 -28 W 0.442 -29 G 0.418 -30 S 0.357 -31 A 0.270 -32 A 0.183 -33 K 0.115 -34 L 0.072 -35 V 0.050 -36 C 0.042 -37 Y 0.040 -38 F 0.039 -39 T 0.038 -40 N 0.038 -41 W 0.043 -42 A 0.052 -43 Q 0.060 -44 Y 0.070 -45 R 0.084 -46 Q 0.101 -47 G 0.115 -48 E 0.121 -49 A 0.122 -50 R 0.113 -51 F 0.094 -52 L 0.076 -53 P 0.067 -54 K 0.068 -55 D 0.071 -56 L 0.070 -57 D 0.063 -58 P 0.056 -59 S 0.055 -60 L 0.060 -61 C 0.064 -62 T 0.061 -63 H 0.054 -64 L 0.051 -65 I 0.050 -66 Y 0.049 -67 A 0.049 -68 F 0.051 -69 A 0.055 -70 G 0.059 -71 M 0.062 -72 T 0.065 -73 N 0.069 -74 H 0.074 -75 Q 0.080 -76 L 0.084 -77 S 0.087 -78 T 0.088 -79 T 0.085 -80 E 0.079 -81 W 0.071 -82 N 0.062 -83 D 0.052 -84 E 0.043 -85 T 0.039 -86 L 0.037 -87 Y 0.037 -88 Q 0.040 -89 E 0.044 -90 F 0.045 -91 N 0.047 -92 G 0.052 -93 L 0.058 -94 K 0.060 -95 K 0.058 -96 M 0.056 -97 N 0.059 -98 P 0.065 -99 K 0.069 -100 L 0.071 -101 K 0.071 -102 T 0.070 -103 L 0.068 -104 L 0.069 -105 A 0.078 -106 I 0.094 -107 G 0.108 -108 G 0.109 -109 W 0.099 -110 N 0.087 -111 F 0.080 -112 G 0.075 -113 T 0.069 -114 Q 0.062 -115 K 0.056 -116 F 0.054 -117 T 0.058 -118 D 0.066 -119 M 0.075 -120 V 0.081 -121 A 0.081 -122 T 0.078 -123 A 0.073 -124 N 0.065 -125 N 0.057 -126 R 0.048 -127 Q 0.040 -128 T 0.037 -129 F 0.037 -130 V 0.040 -131 N 0.044 -132 S 0.050 -133 A 0.058 -134 I 0.063 -135 R 0.063 -136 F 0.054 -137 L 0.042 -138 R 0.034 -139 K 0.032 -140 Y 0.034 -141 S 0.041 -142 F 0.047 -143 D 0.048 -144 G 0.045 -145 L 0.042 -146 D 0.043 -147 L 0.046 -148 D 0.051 -149 W 0.057 -150 E 0.066 -151 Y 0.077 -152 P 0.086 -153 G 0.091 -154 S 0.092 -155 Q 0.097 -156 G 0.106 -157 S 0.112 -158 P 0.111 -159 A 0.104 -160 V 0.095 -161 D 0.090 -162 K 0.086 -163 E 0.080 -164 R 0.076 -165 F 0.075 -166 T 0.071 -167 T 0.065 -168 L 0.059 -169 V 0.056 -170 Q 0.056 -171 D 0.063 -172 L 0.077 -173 A 0.091 -174 N 0.092 -175 A 0.083 -176 F 0.075 -177 Q 0.076 -178 Q 0.079 -179 E 0.077 -180 A 0.071 -181 Q 0.070 -182 T 0.077 -183 S 0.092 -184 G 0.107 -185 K 0.116 -186 E 0.114 -187 R 0.104 -188 L 0.088 -189 L 0.071 -190 L 0.059 -191 S 0.052 -192 A 0.055 -193 A 0.065 -194 V 0.077 -195 P 0.083 -196 A 0.083 -197 G 0.081 -198 Q 0.076 -199 T 0.068 -200 Y 0.059 -201 V 0.052 -202 D 0.051 -203 A 0.052 -204 G 0.053 -205 Y 0.051 -206 E 0.049 -207 V 0.048 -208 D 0.049 -209 K 0.050 -210 I 0.050 -211 A 0.053 -212 Q 0.061 -213 N 0.068 -214 L 0.067 -215 D 0.056 -216 F 0.042 -217 V 0.036 -218 N 0.039 -219 L 0.047 -220 M 0.057 -221 A 0.062 -222 Y 0.063 -223 D 0.063 -224 F 0.063 -225 H 0.060 -226 G 0.054 -227 S 0.051 -228 W 0.053 -229 E 0.057 -230 K 0.067 -231 V 0.079 -232 T 0.092 -233 G 0.104 -234 H 0.115 -235 N 0.128 -236 S 0.144 -237 P 0.157 -238 L 0.160 -239 Y 0.155 -240 K 0.146 -241 R 0.136 -242 Q 0.130 -243 E 0.137 -244 E 0.152 -245 S 0.163 -246 G 0.164 -247 A 0.159 -248 A 0.153 -249 A 0.146 -250 S 0.138 -251 L 0.128 -252 N 0.118 -253 V 0.108 -254 D 0.099 -255 A 0.091 -256 A 0.083 -257 V 0.071 -258 Q 0.060 -259 Q 0.056 -260 W 0.063 -261 L 0.077 -262 Q 0.089 -263 K 0.095 -264 G 0.096 -265 T 0.093 -266 P 0.091 -267 A 0.090 -268 S 0.091 -269 K 0.092 -270 L 0.091 -271 I 0.091 -272 L 0.094 -273 G 0.101 -274 M 0.103 -275 P 0.096 -276 T 0.083 -277 Y 0.074 -278 G 0.074 -279 R 0.078 -280 S 0.082 -281 F 0.087 -282 T 0.095 -283 L 0.104 -284 A 0.109 -285 S 0.112 -286 S 0.115 -287 S 0.115 -288 D 0.111 -289 T 0.106 -290 R 0.109 -291 V 0.121 -292 G 0.138 -293 A 0.153 -294 P 0.159 -295 A 0.161 -296 T 0.172 -297 G 0.193 -298 S 0.215 -299 G 0.232 -300 T 0.244 -301 P 0.243 -302 G 0.222 -303 P 0.182 -304 F 0.144 -305 T 0.128 -306 K 0.136 -307 E 0.153 -308 G 0.160 -309 G 0.146 -310 M 0.118 -311 L 0.088 -312 A 0.065 -313 Y 0.052 -314 Y 0.050 -315 E 0.051 -316 V 0.050 -317 C 0.049 -318 S 0.056 -319 W 0.071 -320 K 0.088 -321 G 0.097 -322 A 0.095 -323 T 0.085 -324 K 0.074 -325 Q 0.069 -326 R 0.070 -327 I 0.073 -328 Q 0.077 -329 D 0.082 -330 Q 0.088 -331 K 0.091 -332 V 0.087 -333 P 0.076 -334 Y 0.066 -335 I 0.061 -336 F 0.061 -337 R 0.065 -338 D 0.070 -339 N 0.072 -340 Q 0.068 -341 W 0.060 -342 V 0.052 -343 G 0.050 -344 F 0.059 -345 D 0.075 -346 D 0.087 -347 V 0.088 -348 E 0.083 -349 S 0.075 -350 F 0.064 -351 K 0.054 -352 T 0.046 -353 K 0.043 -354 V 0.041 -355 S 0.042 -356 Y 0.047 -357 L 0.057 -358 K 0.071 -359 Q 0.090 -360 K 0.108 -361 G 0.117 -362 L 0.110 -363 G 0.089 -364 G 0.068 -365 A 0.059 -366 M 0.060 -367 V 0.065 -368 W 0.070 -369 A 0.074 -370 L 0.076 -371 D 0.076 -372 L 0.076 -373 D 0.078 -374 D 0.084 -375 F 0.094 -376 A 0.107 -377 G 0.112 -378 F 0.106 -379 S 0.094 -380 C 0.086 -381 N 0.087 -382 Q 0.093 -383 G 0.099 -384 R 0.097 -385 Y 0.087 -386 P 0.073 -387 L 0.063 -388 I 0.059 -389 Q 0.060 -390 T 0.061 -391 L 0.060 -392 R 0.060 -393 Q 0.065 -394 E 0.077 -395 L 0.095 -396 S 0.124 -397 L 0.168 -398 P 0.227 -399 Y 0.305 -400 L 0.403 -401 P 0.501 -402 S 0.571 -403 G 0.604 -404 T 0.612 -405 P 0.613 -406 E 0.610 -407 L 0.598 -408 E 0.577 -409 V 0.558 -410 P 0.554 -411 K 0.567 -412 P 0.589 -413 G 0.608 -414 Q 0.621 -415 P 0.626 -416 S 0.628 -417 E 0.632 -418 P 0.638 -419 E 0.639 -420 H 0.627 -421 G 0.612 -422 P 0.604 -423 S 0.604 -424 P 0.597 -425 G 0.562 -426 Q 0.483 -427 D 0.369 -428 T 0.253 -429 F 0.170 -430 C 0.130 -431 Q 0.119 -432 G 0.123 -433 K 0.133 -434 A 0.143 -435 D 0.147 -436 G 0.142 -437 L 0.137 -438 Y 0.137 -439 P 0.141 -440 N 0.138 -441 P 0.125 -442 R 0.113 -443 E 0.108 -444 R 0.103 -445 S 0.089 -446 S 0.068 -447 F 0.054 -448 Y 0.054 -449 S 0.065 -450 C 0.083 -451 A 0.104 -452 A 0.125 -453 G 0.142 -454 R 0.148 -455 L 0.146 -456 F 0.139 -457 Q 0.130 -458 Q 0.119 -459 S 0.114 -460 C 0.125 -461 P 0.144 -462 T 0.158 -463 G 0.161 -464 L 0.153 -465 V 0.140 -466 F 0.126 -467 S 0.113 -468 N 0.102 -469 S 0.092 -470 C 0.087 -471 K 0.093 -472 C 0.110 -473 C 0.137 -474 T 0.169 -475 W 0.202 -476 N 0.224 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000133101.11_ENST00000255465.8_GN:CCNA1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000133101.11_ENST00000255465.8_GN:CCNA1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 15bee5fb347cf157c5206fe6a412653820e1009e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000133101.11_ENST00000255465.8_GN:CCNA1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,422 +0,0 @@ ->ENSG00000133101.11|ENST00000255465.8|GN:CCNA1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.382 -2 H 0.402 -3 C 0.432 -4 S 0.460 -5 N 0.481 -6 P 0.503 -7 K 0.542 -8 S 0.602 -9 G 0.654 -10 V 0.678 -11 V 0.684 -12 L 0.689 -13 A 0.680 -14 T 0.636 -15 V 0.569 -16 A 0.517 -17 R 0.504 -18 G 0.521 -19 P 0.553 -20 D 0.578 -21 A 0.576 -22 C 0.553 -23 Q 0.552 -24 I 0.598 -25 L 0.658 -26 T 0.681 -27 R 0.671 -28 A 0.656 -29 P 0.652 -30 L 0.655 -31 G 0.651 -32 Q 0.629 -33 D 0.604 -34 P 0.601 -35 P 0.626 -36 Q 0.651 -37 R 0.649 -38 T 0.619 -39 V 0.594 -40 L 0.606 -41 G 0.641 -42 L 0.653 -43 L 0.639 -44 T 0.635 -45 A 0.661 -46 N 0.697 -47 G 0.717 -48 Q 0.720 -49 Y 0.721 -50 R 0.726 -51 R 0.725 -52 T 0.705 -53 C 0.660 -54 G 0.605 -55 Q 0.578 -56 G 0.603 -57 I 0.652 -58 T 0.683 -59 R 0.687 -60 I 0.678 -61 R 0.672 -62 C 0.681 -63 Y 0.705 -64 S 0.740 -65 G 0.770 -66 S 0.785 -67 E 0.779 -68 N 0.752 -69 A 0.713 -70 F 0.687 -71 P 0.697 -72 P 0.738 -73 A 0.781 -74 G 0.803 -75 K 0.801 -76 K 0.786 -77 A 0.771 -78 L 0.765 -79 P 0.770 -80 D 0.783 -81 C 0.793 -82 G 0.792 -83 V 0.776 -84 Q 0.748 -85 E 0.718 -86 P 0.700 -87 P 0.703 -88 K 0.719 -89 Q 0.722 -90 G 0.698 -91 F 0.667 -92 D 0.645 -93 I 0.624 -94 Y 0.600 -95 M 0.592 -96 D 0.607 -97 E 0.622 -98 L 0.632 -99 E 0.651 -100 Q 0.686 -101 G 0.725 -102 D 0.751 -103 R 0.759 -104 D 0.753 -105 S 0.737 -106 C 0.723 -107 S 0.718 -108 V 0.724 -109 R 0.733 -110 E 0.735 -111 G 0.722 -112 M 0.697 -113 A 0.674 -114 F 0.666 -115 E 0.675 -116 D 0.681 -117 V 0.679 -118 Y 0.679 -119 E 0.684 -120 V 0.687 -121 D 0.682 -122 T 0.675 -123 G 0.666 -124 T 0.654 -125 L 0.641 -126 K 0.623 -127 S 0.589 -128 D 0.532 -129 L 0.468 -130 H 0.426 -131 F 0.417 -132 L 0.427 -133 L 0.439 -134 D 0.451 -135 F 0.474 -136 N 0.515 -137 T 0.562 -138 V 0.605 -139 S 0.639 -140 P 0.660 -141 M 0.666 -142 L 0.653 -143 V 0.623 -144 D 0.588 -145 S 0.559 -146 S 0.543 -147 L 0.543 -148 L 0.561 -149 S 0.584 -150 Q 0.591 -151 S 0.571 -152 E 0.537 -153 D 0.515 -154 I 0.527 -155 S 0.566 -156 S 0.607 -157 L 0.636 -158 G 0.648 -159 T 0.639 -160 D 0.603 -161 V 0.548 -162 I 0.483 -163 N 0.411 -164 V 0.336 -165 T 0.270 -166 E 0.220 -167 Y 0.181 -168 A 0.147 -169 E 0.120 -170 E 0.106 -171 I 0.104 -172 Y 0.105 -173 Q 0.101 -174 Y 0.094 -175 L 0.089 -176 R 0.091 -177 E 0.093 -178 A 0.093 -179 E 0.090 -180 I 0.087 -181 R 0.086 -182 H 0.086 -183 R 0.092 -184 P 0.097 -185 K 0.096 -186 A 0.086 -187 H 0.076 -188 Y 0.068 -189 M 0.063 -190 K 0.060 -191 K 0.063 -192 Q 0.068 -193 P 0.074 -194 D 0.078 -195 I 0.077 -196 T 0.071 -197 E 0.061 -198 G 0.054 -199 M 0.051 -200 R 0.052 -201 T 0.056 -202 I 0.062 -203 L 0.064 -204 V 0.061 -205 D 0.053 -206 W 0.044 -207 L 0.037 -208 V 0.033 -209 E 0.032 -210 V 0.030 -211 G 0.031 -212 E 0.036 -213 E 0.042 -214 Y 0.049 -215 K 0.055 -216 L 0.057 -217 R 0.055 -218 A 0.050 -219 E 0.046 -220 T 0.044 -221 L 0.041 -222 Y 0.037 -223 L 0.033 -224 A 0.030 -225 V 0.028 -226 N 0.026 -227 F 0.026 -228 L 0.028 -229 D 0.030 -230 R 0.032 -231 F 0.035 -232 L 0.040 -233 S 0.044 -234 C 0.047 -235 M 0.052 -236 S 0.059 -237 V 0.061 -238 L 0.057 -239 R 0.052 -240 G 0.050 -241 K 0.050 -242 L 0.054 -243 Q 0.061 -244 L 0.072 -245 V 0.079 -246 G 0.079 -247 T 0.076 -248 A 0.077 -249 A 0.079 -250 M 0.076 -251 L 0.074 -252 L 0.077 -253 A 0.081 -254 S 0.079 -255 K 0.071 -256 Y 0.066 -257 E 0.068 -258 E 0.074 -259 I 0.083 -260 Y 0.092 -261 P 0.095 -262 P 0.089 -263 E 0.077 -264 V 0.064 -265 D 0.055 -266 E 0.052 -267 F 0.053 -268 V 0.053 -269 Y 0.049 -270 I 0.046 -271 T 0.050 -272 D 0.061 -273 D 0.068 -274 T 0.065 -275 Y 0.058 -276 T 0.055 -277 K 0.061 -278 R 0.066 -279 Q 0.064 -280 L 0.060 -281 L 0.063 -282 K 0.067 -283 M 0.064 -284 E 0.054 -285 H 0.044 -286 L 0.038 -287 L 0.036 -288 L 0.036 -289 K 0.038 -290 V 0.042 -291 L 0.048 -292 A 0.054 -293 F 0.062 -294 D 0.074 -295 L 0.085 -296 T 0.091 -297 V 0.088 -298 P 0.076 -299 T 0.059 -300 T 0.046 -301 N 0.036 -302 Q 0.029 -303 F 0.024 -304 L 0.021 -305 L 0.021 -306 Q 0.022 -307 Y 0.026 -308 L 0.031 -309 R 0.039 -310 R 0.050 -311 Q 0.064 -312 G 0.074 -313 V 0.075 -314 C 0.067 -315 V 0.057 -316 R 0.050 -317 T 0.046 -318 E 0.048 -319 N 0.051 -320 L 0.051 -321 A 0.048 -322 K 0.045 -323 Y 0.044 -324 V 0.047 -325 A 0.052 -326 E 0.057 -327 L 0.060 -328 S 0.061 -329 L 0.059 -330 L 0.056 -331 E 0.055 -332 A 0.056 -333 D 0.057 -334 P 0.058 -335 F 0.063 -336 L 0.072 -337 K 0.079 -338 Y 0.082 -339 L 0.085 -340 P 0.091 -341 S 0.106 -342 L 0.128 -343 I 0.140 -344 A 0.128 -345 A 0.103 -346 A 0.086 -347 A 0.078 -348 F 0.074 -349 C 0.077 -350 L 0.083 -351 A 0.088 -352 N 0.087 -353 Y 0.084 -354 T 0.081 -355 V 0.076 -356 N 0.069 -357 K 0.064 -358 H 0.061 -359 F 0.061 -360 W 0.063 -361 P 0.064 -362 E 0.062 -363 T 0.060 -364 L 0.058 -365 A 0.056 -366 A 0.056 -367 F 0.055 -368 T 0.055 -369 G 0.058 -370 Y 0.062 -371 S 0.067 -372 L 0.070 -373 S 0.074 -374 E 0.077 -375 I 0.075 -376 V 0.064 -377 P 0.053 -378 C 0.049 -379 L 0.050 -380 S 0.050 -381 E 0.050 -382 L 0.053 -383 H 0.056 -384 K 0.059 -385 A 0.063 -386 Y 0.071 -387 L 0.085 -388 D 0.108 -389 I 0.134 -390 P 0.153 -391 H 0.164 -392 R 0.170 -393 P 0.169 -394 Q 0.159 -395 Q 0.143 -396 A 0.125 -397 I 0.111 -398 R 0.105 -399 E 0.107 -400 K 0.113 -401 Y 0.118 -402 K 0.118 -403 A 0.115 -404 S 0.116 -405 K 0.127 -406 Y 0.147 -407 L 0.171 -408 C 0.188 -409 V 0.192 -410 S 0.186 -411 L 0.178 -412 M 0.174 -413 E 0.173 -414 P 0.174 -415 P 0.175 -416 A 0.181 -417 V 0.190 -418 L 0.196 -419 L 0.197 -420 L 0.199 -421 Q 0.202 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000133101.11_ENST00000255465.8_GN:CCNA1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:44.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000133101.11_ENST00000255465.8_GN:CCNA1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:44.caid deleted file mode 100644 index 7fb004e0542ccf81e3cf45da037e7de429157f1f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000133101.11_ENST00000255465.8_GN:CCNA1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:44.caid +++ /dev/null @@ -1,466 +0,0 @@ ->ENSG00000133101.11|ENST00000255465.8|GN:CCNA1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:44 -1 M 0.399 -2 E 0.422 -3 T 0.458 -4 G 0.500 -5 F 0.544 -6 P 0.575 -7 A 0.575 -8 I 0.547 -9 M 0.527 -10 Y 0.548 -11 P 0.599 -12 G 0.646 -13 S 0.663 -14 F 0.657 -15 I 0.652 -16 G 0.651 -17 G 0.633 -18 W 0.589 -19 G 0.542 -20 E 0.529 -21 E 0.558 -22 Y 0.592 -23 L 0.595 -24 S 0.569 -25 W 0.548 -26 E 0.551 -27 G 0.578 -28 P 0.611 -29 G 0.637 -30 L 0.650 -31 P 0.652 -32 D 0.639 -33 F 0.600 -34 V 0.538 -35 F 0.480 -36 Q 0.469 -37 Q 0.522 -38 Q 0.607 -39 P 0.681 -40 V 0.729 -41 E 0.757 -42 S 0.774 -43 E 0.783 -44 A 0.784 -45 M 0.779 -46 H 0.767 -47 C 0.748 -48 S 0.725 -49 N 0.706 -50 P 0.705 -51 K 0.727 -52 S 0.758 -53 G 0.779 -54 V 0.786 -55 V 0.789 -56 L 0.792 -57 A 0.790 -58 T 0.773 -59 V 0.741 -60 A 0.705 -61 R 0.678 -62 G 0.667 -63 P 0.677 -64 D 0.705 -65 A 0.740 -66 C 0.772 -67 Q 0.793 -68 I 0.800 -69 L 0.795 -70 T 0.778 -71 R 0.755 -72 A 0.735 -73 P 0.726 -74 L 0.723 -75 G 0.708 -76 Q 0.675 -77 D 0.642 -78 P 0.641 -79 P 0.675 -80 Q 0.718 -81 R 0.743 -82 T 0.744 -83 V 0.737 -84 L 0.740 -85 G 0.754 -86 L 0.755 -87 L 0.736 -88 T 0.718 -89 A 0.725 -90 N 0.746 -91 G 0.756 -92 Q 0.747 -93 Y 0.739 -94 R 0.745 -95 R 0.755 -96 T 0.754 -97 C 0.748 -98 G 0.746 -99 Q 0.748 -100 G 0.747 -101 I 0.747 -102 T 0.747 -103 R 0.742 -104 I 0.731 -105 R 0.722 -106 C 0.723 -107 Y 0.734 -108 S 0.754 -109 G 0.772 -110 S 0.779 -111 E 0.772 -112 N 0.747 -113 A 0.710 -114 F 0.684 -115 P 0.692 -116 P 0.730 -117 A 0.772 -118 G 0.795 -119 K 0.794 -120 K 0.778 -121 A 0.760 -122 L 0.752 -123 P 0.758 -124 D 0.774 -125 C 0.788 -126 G 0.790 -127 V 0.773 -128 Q 0.741 -129 E 0.705 -130 P 0.682 -131 P 0.684 -132 K 0.702 -133 Q 0.710 -134 G 0.694 -135 F 0.665 -136 D 0.639 -137 I 0.613 -138 Y 0.589 -139 M 0.586 -140 D 0.606 -141 E 0.624 -142 L 0.635 -143 E 0.655 -144 Q 0.690 -145 G 0.727 -146 D 0.753 -147 R 0.764 -148 D 0.764 -149 S 0.757 -150 C 0.749 -151 S 0.745 -152 V 0.748 -153 R 0.755 -154 E 0.757 -155 G 0.748 -156 M 0.729 -157 A 0.710 -158 F 0.703 -159 E 0.712 -160 D 0.723 -161 V 0.727 -162 Y 0.731 -163 E 0.737 -164 V 0.737 -165 D 0.728 -166 T 0.718 -167 G 0.709 -168 T 0.699 -169 L 0.687 -170 K 0.667 -171 S 0.627 -172 D 0.566 -173 L 0.505 -174 H 0.472 -175 F 0.475 -176 L 0.491 -177 L 0.500 -178 D 0.505 -179 F 0.523 -180 N 0.559 -181 T 0.600 -182 V 0.636 -183 S 0.664 -184 P 0.683 -185 M 0.686 -186 L 0.668 -187 V 0.632 -188 D 0.592 -189 S 0.566 -190 S 0.559 -191 L 0.568 -192 L 0.589 -193 S 0.608 -194 Q 0.608 -195 S 0.582 -196 E 0.543 -197 D 0.517 -198 I 0.527 -199 S 0.567 -200 S 0.610 -201 L 0.639 -202 G 0.653 -203 T 0.645 -204 D 0.610 -205 V 0.554 -206 I 0.486 -207 N 0.408 -208 V 0.328 -209 T 0.261 -210 E 0.212 -211 Y 0.176 -212 A 0.144 -213 E 0.118 -214 E 0.104 -215 I 0.101 -216 Y 0.102 -217 Q 0.099 -218 Y 0.092 -219 L 0.088 -220 R 0.089 -221 E 0.092 -222 A 0.091 -223 E 0.088 -224 I 0.086 -225 R 0.084 -226 H 0.083 -227 R 0.087 -228 P 0.093 -229 K 0.091 -230 A 0.082 -231 H 0.072 -232 Y 0.065 -233 M 0.059 -234 K 0.057 -235 K 0.060 -236 Q 0.065 -237 P 0.070 -238 D 0.074 -239 I 0.073 -240 T 0.067 -241 E 0.059 -242 G 0.053 -243 M 0.050 -244 R 0.051 -245 T 0.055 -246 I 0.060 -247 L 0.062 -248 V 0.059 -249 D 0.052 -250 W 0.043 -251 L 0.036 -252 V 0.033 -253 E 0.031 -254 V 0.030 -255 G 0.031 -256 E 0.036 -257 E 0.042 -258 Y 0.048 -259 K 0.054 -260 L 0.056 -261 R 0.054 -262 A 0.049 -263 E 0.045 -264 T 0.044 -265 L 0.041 -266 Y 0.037 -267 L 0.033 -268 A 0.030 -269 V 0.028 -270 N 0.026 -271 F 0.026 -272 L 0.028 -273 D 0.030 -274 R 0.032 -275 F 0.035 -276 L 0.041 -277 S 0.044 -278 C 0.048 -279 M 0.054 -280 S 0.060 -281 V 0.063 -282 L 0.059 -283 R 0.054 -284 G 0.052 -285 K 0.052 -286 L 0.055 -287 Q 0.062 -288 L 0.073 -289 V 0.080 -290 G 0.080 -291 T 0.078 -292 A 0.079 -293 A 0.081 -294 M 0.078 -295 L 0.076 -296 L 0.079 -297 A 0.083 -298 S 0.081 -299 K 0.074 -300 Y 0.069 -301 E 0.071 -302 E 0.077 -303 I 0.086 -304 Y 0.095 -305 P 0.098 -306 P 0.092 -307 E 0.080 -308 V 0.067 -309 D 0.057 -310 E 0.054 -311 F 0.056 -312 V 0.057 -313 Y 0.053 -314 I 0.050 -315 T 0.055 -316 D 0.066 -317 D 0.074 -318 T 0.071 -319 Y 0.062 -320 T 0.058 -321 K 0.063 -322 R 0.067 -323 Q 0.065 -324 L 0.061 -325 L 0.063 -326 K 0.067 -327 M 0.064 -328 E 0.054 -329 H 0.044 -330 L 0.038 -331 L 0.036 -332 L 0.036 -333 K 0.038 -334 V 0.042 -335 L 0.047 -336 A 0.053 -337 F 0.061 -338 D 0.072 -339 L 0.084 -340 T 0.090 -341 V 0.088 -342 P 0.075 -343 T 0.060 -344 T 0.046 -345 N 0.037 -346 Q 0.030 -347 F 0.025 -348 L 0.022 -349 L 0.022 -350 Q 0.024 -351 Y 0.027 -352 L 0.031 -353 R 0.039 -354 R 0.050 -355 Q 0.063 -356 G 0.072 -357 V 0.073 -358 C 0.066 -359 V 0.057 -360 R 0.050 -361 T 0.047 -362 E 0.049 -363 N 0.053 -364 L 0.054 -365 A 0.051 -366 K 0.048 -367 Y 0.047 -368 V 0.049 -369 A 0.053 -370 E 0.058 -371 L 0.060 -372 S 0.061 -373 L 0.059 -374 L 0.056 -375 E 0.054 -376 A 0.055 -377 D 0.056 -378 P 0.057 -379 F 0.063 -380 L 0.072 -381 K 0.080 -382 Y 0.083 -383 L 0.085 -384 P 0.092 -385 S 0.107 -386 L 0.129 -387 I 0.140 -388 A 0.128 -389 A 0.103 -390 A 0.086 -391 A 0.077 -392 F 0.074 -393 C 0.077 -394 L 0.084 -395 A 0.088 -396 N 0.088 -397 Y 0.086 -398 T 0.083 -399 V 0.078 -400 N 0.071 -401 K 0.065 -402 H 0.062 -403 F 0.063 -404 W 0.065 -405 P 0.066 -406 E 0.064 -407 T 0.062 -408 L 0.059 -409 A 0.057 -410 A 0.057 -411 F 0.056 -412 T 0.057 -413 G 0.060 -414 Y 0.064 -415 S 0.068 -416 L 0.072 -417 S 0.076 -418 E 0.079 -419 I 0.077 -420 V 0.066 -421 P 0.054 -422 C 0.049 -423 L 0.050 -424 S 0.050 -425 E 0.051 -426 L 0.053 -427 H 0.057 -428 K 0.060 -429 A 0.064 -430 Y 0.073 -431 L 0.088 -432 D 0.111 -433 I 0.139 -434 P 0.159 -435 H 0.170 -436 R 0.176 -437 P 0.176 -438 Q 0.166 -439 Q 0.149 -440 A 0.131 -441 I 0.116 -442 R 0.109 -443 E 0.110 -444 K 0.116 -445 Y 0.122 -446 K 0.122 -447 A 0.120 -448 S 0.122 -449 K 0.135 -450 Y 0.157 -451 L 0.182 -452 C 0.201 -453 V 0.205 -454 S 0.198 -455 L 0.188 -456 M 0.182 -457 E 0.180 -458 P 0.179 -459 P 0.178 -460 A 0.181 -461 V 0.189 -462 L 0.197 -463 L 0.201 -464 L 0.208 -465 Q 0.216 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000134389.12_ENST00000256785.5_GN:CFHR5_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000134389.12_ENST00000256785.5_GN:CFHR5_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index e58b855f16b0e8585fe0382669237a6d56ccf5bc..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000134389.12_ENST00000256785.5_GN:CFHR5_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,570 +0,0 @@ ->ENSG00000134389.12|ENST00000256785.5|GN:CFHR5|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.254 -2 L 0.248 -3 L 0.246 -4 L 0.249 -5 F 0.245 -6 S 0.234 -7 V 0.234 -8 I 0.243 -9 L 0.242 -10 I 0.234 -11 S 0.239 -12 W 0.259 -13 V 0.284 -14 S 0.324 -15 T 0.390 -16 V 0.463 -17 G 0.514 -18 G 0.529 -19 E 0.498 -20 G 0.415 -21 T 0.304 -22 L 0.210 -23 C 0.157 -24 D 0.133 -25 F 0.121 -26 P 0.111 -27 K 0.102 -28 I 0.095 -29 H 0.090 -30 H 0.084 -31 G 0.081 -32 F 0.085 -33 L 0.101 -34 Y 0.127 -35 D 0.159 -36 E 0.193 -37 E 0.222 -38 D 0.237 -39 Y 0.228 -40 N 0.198 -41 P 0.158 -42 F 0.126 -43 S 0.106 -44 Q 0.094 -45 V 0.087 -46 P 0.084 -47 T 0.087 -48 G 0.093 -49 E 0.091 -50 V 0.078 -51 F 0.063 -52 Y 0.054 -53 Y 0.055 -54 S 0.066 -55 C 0.080 -56 E 0.091 -57 Y 0.095 -58 N 0.097 -59 F 0.102 -60 V 0.112 -61 S 0.122 -62 P 0.128 -63 S 0.127 -64 K 0.116 -65 S 0.102 -66 F 0.090 -67 W 0.080 -68 T 0.071 -69 R 0.063 -70 I 0.058 -71 T 0.056 -72 C 0.061 -73 T 0.072 -74 E 0.084 -75 E 0.090 -76 G 0.083 -77 W 0.068 -78 S 0.056 -79 P 0.053 -80 T 0.057 -81 P 0.064 -82 K 0.073 -83 C 0.084 -84 L 0.087 -85 R 0.080 -86 M 0.074 -87 C 0.082 -88 S 0.100 -89 F 0.115 -90 P 0.120 -91 F 0.116 -92 V 0.108 -93 K 0.098 -94 N 0.088 -95 G 0.085 -96 H 0.095 -97 S 0.117 -98 E 0.146 -99 S 0.173 -100 S 0.179 -101 G 0.157 -102 L 0.116 -103 I 0.080 -104 H 0.061 -105 L 0.058 -106 E 0.064 -107 G 0.073 -108 D 0.082 -109 T 0.087 -110 V 0.085 -111 Q 0.077 -112 I 0.070 -113 I 0.071 -114 C 0.080 -115 N 0.090 -116 T 0.093 -117 G 0.090 -118 Y 0.086 -119 S 0.085 -120 L 0.089 -121 Q 0.099 -122 N 0.110 -123 N 0.118 -124 E 0.114 -125 K 0.098 -126 N 0.080 -127 I 0.067 -128 S 0.063 -129 C 0.066 -130 V 0.073 -131 E 0.079 -132 R 0.083 -133 G 0.082 -134 W 0.080 -135 S 0.085 -136 T 0.096 -137 P 0.100 -138 P 0.097 -139 I 0.094 -140 C 0.101 -141 S 0.114 -142 F 0.127 -143 T 0.134 -144 K 0.129 -145 G 0.118 -146 E 0.113 -147 C 0.121 -148 H 0.136 -149 V 0.153 -150 P 0.170 -151 I 0.182 -152 L 0.179 -153 E 0.160 -154 A 0.132 -155 N 0.108 -156 V 0.095 -157 D 0.087 -158 A 0.081 -159 Q 0.081 -160 P 0.088 -161 K 0.093 -162 K 0.084 -163 E 0.067 -164 S 0.052 -165 Y 0.044 -166 K 0.043 -167 V 0.045 -168 G 0.050 -169 D 0.054 -170 V 0.056 -171 L 0.054 -172 K 0.051 -173 F 0.050 -174 S 0.057 -175 C 0.071 -176 R 0.089 -177 K 0.101 -178 N 0.104 -179 L 0.104 -180 I 0.108 -181 R 0.117 -182 V 0.123 -183 G 0.118 -184 S 0.103 -185 D 0.084 -186 S 0.066 -187 V 0.052 -188 Q 0.043 -189 C 0.042 -190 Y 0.049 -191 Q 0.062 -192 F 0.073 -193 G 0.074 -194 W 0.067 -195 S 0.065 -196 P 0.077 -197 N 0.090 -198 F 0.089 -199 P 0.083 -200 T 0.094 -201 C 0.133 -202 K 0.193 -203 G 0.245 -204 Q 0.262 -205 V 0.233 -206 R 0.182 -207 S 0.144 -208 C 0.138 -209 G 0.155 -210 P 0.168 -211 P 0.165 -212 P 0.154 -213 Q 0.141 -214 L 0.127 -215 S 0.110 -216 N 0.095 -217 G 0.087 -218 E 0.087 -219 V 0.094 -220 K 0.109 -221 E 0.126 -222 I 0.132 -223 R 0.119 -224 K 0.095 -225 E 0.075 -226 E 0.065 -227 Y 0.063 -228 G 0.062 -229 H 0.059 -230 N 0.056 -231 E 0.054 -232 V 0.055 -233 V 0.056 -234 E 0.055 -235 Y 0.054 -236 D 0.057 -237 C 0.070 -238 N 0.083 -239 P 0.088 -240 N 0.079 -241 F 0.067 -242 I 0.060 -243 I 0.063 -244 N 0.073 -245 G 0.079 -246 P 0.074 -247 K 0.063 -248 K 0.052 -249 I 0.047 -250 Q 0.047 -251 C 0.052 -252 V 0.061 -253 D 0.068 -254 G 0.069 -255 E 0.064 -256 W 0.059 -257 T 0.061 -258 T 0.067 -259 L 0.069 -260 P 0.070 -261 T 0.081 -262 C 0.111 -263 V 0.156 -264 E 0.200 -265 Q 0.220 -266 V 0.205 -267 K 0.167 -268 T 0.139 -269 C 0.141 -270 G 0.162 -271 Y 0.178 -272 I 0.178 -273 P 0.169 -274 E 0.157 -275 L 0.138 -276 E 0.113 -277 Y 0.093 -278 G 0.086 -279 Y 0.089 -280 V 0.091 -281 Q 0.093 -282 P 0.104 -283 S 0.115 -284 V 0.107 -285 P 0.083 -286 P 0.060 -287 Y 0.051 -288 Q 0.052 -289 H 0.059 -290 G 0.070 -291 V 0.082 -292 S 0.089 -293 V 0.090 -294 E 0.085 -295 V 0.079 -296 N 0.081 -297 C 0.093 -298 R 0.110 -299 N 0.118 -300 E 0.113 -301 Y 0.103 -302 A 0.099 -303 M 0.103 -304 I 0.107 -305 G 0.103 -306 N 0.090 -307 N 0.075 -308 M 0.062 -309 I 0.055 -310 T 0.054 -311 C 0.060 -312 I 0.070 -313 N 0.079 -314 G 0.083 -315 I 0.081 -316 W 0.079 -317 T 0.085 -318 E 0.093 -319 L 0.093 -320 P 0.088 -321 M 0.090 -322 C 0.110 -323 V 0.141 -324 A 0.176 -325 T 0.212 -326 H 0.242 -327 Q 0.250 -328 L 0.232 -329 K 0.196 -330 R 0.163 -331 C 0.152 -332 K 0.167 -333 I 0.199 -334 A 0.228 -335 G 0.236 -336 V 0.223 -337 N 0.204 -338 I 0.187 -339 K 0.175 -340 T 0.169 -341 L 0.174 -342 L 0.183 -343 K 0.190 -344 L 0.192 -345 S 0.187 -346 G 0.167 -347 K 0.136 -348 E 0.109 -349 F 0.095 -350 N 0.093 -351 H 0.096 -352 N 0.101 -353 S 0.108 -354 R 0.110 -355 I 0.103 -356 R 0.090 -357 Y 0.081 -358 R 0.083 -359 C 0.091 -360 S 0.097 -361 D 0.094 -362 I 0.091 -363 F 0.093 -364 R 0.102 -365 Y 0.113 -366 R 0.115 -367 H 0.106 -368 S 0.095 -369 V 0.093 -370 C 0.102 -371 I 0.117 -372 N 0.126 -373 G 0.127 -374 K 0.117 -375 W 0.103 -376 N 0.101 -377 P 0.120 -378 E 0.145 -379 V 0.157 -380 D 0.166 -381 C 0.193 -382 T 0.251 -383 E 0.319 -384 K 0.364 -385 R 0.360 -386 E 0.309 -387 Q 0.239 -388 F 0.190 -389 C 0.179 -390 P 0.195 -391 P 0.210 -392 P 0.216 -393 P 0.218 -394 Q 0.219 -395 I 0.213 -396 P 0.194 -397 N 0.172 -398 A 0.169 -399 Q 0.189 -400 N 0.213 -401 M 0.227 -402 T 0.227 -403 T 0.209 -404 T 0.177 -405 V 0.141 -406 N 0.113 -407 Y 0.102 -408 Q 0.103 -409 D 0.107 -410 G 0.113 -411 E 0.119 -412 K 0.121 -413 V 0.116 -414 A 0.103 -415 V 0.093 -416 L 0.094 -417 C 0.109 -418 K 0.127 -419 E 0.136 -420 N 0.129 -421 Y 0.117 -422 L 0.112 -423 L 0.121 -424 P 0.135 -425 E 0.143 -426 A 0.138 -427 K 0.120 -428 E 0.098 -429 I 0.082 -430 V 0.079 -431 C 0.087 -432 K 0.101 -433 D 0.110 -434 G 0.108 -435 R 0.098 -436 W 0.091 -437 Q 0.096 -438 S 0.109 -439 L 0.118 -440 P 0.123 -441 R 0.134 -442 C 0.163 -443 V 0.206 -444 E 0.242 -445 S 0.255 -446 T 0.239 -447 A 0.206 -448 Y 0.179 -449 C 0.180 -450 G 0.202 -451 P 0.222 -452 P 0.227 -453 P 0.222 -454 S 0.211 -455 I 0.194 -456 N 0.174 -457 N 0.156 -458 G 0.152 -459 D 0.161 -460 T 0.177 -461 T 0.199 -462 S 0.224 -463 F 0.234 -464 P 0.216 -465 L 0.175 -466 S 0.134 -467 V 0.111 -468 Y 0.112 -469 P 0.128 -470 P 0.144 -471 G 0.153 -472 S 0.153 -473 T 0.146 -474 V 0.136 -475 T 0.125 -476 Y 0.117 -477 R 0.119 -478 C 0.131 -479 Q 0.148 -480 S 0.158 -481 F 0.162 -482 Y 0.169 -483 K 0.179 -484 L 0.185 -485 Q 0.180 -486 G 0.165 -487 S 0.144 -488 V 0.123 -489 T 0.104 -490 V 0.092 -491 T 0.087 -492 C 0.091 -493 R 0.099 -494 N 0.105 -495 K 0.107 -496 Q 0.107 -497 W 0.115 -498 S 0.136 -499 E 0.162 -500 P 0.176 -501 P 0.172 -502 R 0.161 -503 C 0.153 -504 L 0.144 -505 D 0.126 -506 P 0.107 -507 C 0.102 -508 V 0.109 -509 V 0.114 -510 S 0.112 -511 E 0.113 -512 E 0.122 -513 N 0.135 -514 M 0.147 -515 N 0.161 -516 K 0.173 -517 N 0.179 -518 N 0.174 -519 I 0.161 -520 Q 0.145 -521 L 0.136 -522 K 0.145 -523 W 0.169 -524 R 0.198 -525 N 0.221 -526 D 0.224 -527 G 0.199 -528 K 0.158 -529 L 0.122 -530 Y 0.105 -531 A 0.105 -532 K 0.114 -533 T 0.126 -534 G 0.138 -535 D 0.145 -536 A 0.145 -537 V 0.139 -538 E 0.129 -539 F 0.120 -540 Q 0.114 -541 C 0.109 -542 K 0.101 -543 F 0.095 -544 P 0.094 -545 H 0.106 -546 K 0.128 -547 A 0.152 -548 M 0.169 -549 I 0.177 -550 S 0.180 -551 S 0.177 -552 P 0.164 -553 P 0.141 -554 F 0.117 -555 R 0.104 -556 A 0.100 -557 I 0.100 -558 C 0.104 -559 Q 0.112 -560 E 0.123 -561 G 0.131 -562 K 0.135 -563 F 0.135 -564 E 0.135 -565 Y 0.136 -566 P 0.137 -567 I 0.139 -568 C 0.146 -569 E 0.154 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000134389.12_ENST00000256785.5_GN:CFHR5_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000134389.12_ENST00000256785.5_GN:CFHR5_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid deleted file mode 100644 index 4a170001b6be3622fc8ae9230abccb9788b3a809..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000134389.12_ENST00000256785.5_GN:CFHR5_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid +++ /dev/null @@ -1,594 +0,0 @@ ->ENSG00000134389.12|ENST00000256785.5|GN:CFHR5|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:24 -1 M 0.328 -2 K 0.324 -3 A 0.332 -4 D 0.343 -5 L 0.328 -6 K 0.288 -7 Q 0.257 -8 H 0.245 -9 H 0.247 -10 H 0.269 -11 H 0.310 -12 W 0.350 -13 S 0.367 -14 I 0.358 -15 F 0.329 -16 S 0.303 -17 Y 0.304 -18 I 0.328 -19 R 0.349 -20 L 0.356 -21 R 0.363 -22 L 0.369 -23 P 0.367 -24 S 0.362 -25 M 0.354 -26 L 0.328 -27 L 0.294 -28 L 0.289 -29 F 0.310 -30 S 0.319 -31 V 0.309 -32 I 0.303 -33 L 0.309 -34 I 0.313 -35 S 0.314 -36 W 0.317 -37 V 0.331 -38 S 0.366 -39 T 0.422 -40 V 0.486 -41 G 0.535 -42 G 0.547 -43 E 0.507 -44 G 0.415 -45 T 0.300 -46 L 0.206 -47 C 0.155 -48 D 0.134 -49 F 0.124 -50 P 0.115 -51 K 0.106 -52 I 0.099 -53 H 0.092 -54 H 0.084 -55 G 0.079 -56 F 0.084 -57 L 0.099 -58 Y 0.125 -59 D 0.157 -60 E 0.192 -61 E 0.221 -62 D 0.234 -63 Y 0.223 -64 N 0.191 -65 P 0.151 -66 F 0.118 -67 S 0.097 -68 Q 0.084 -69 V 0.076 -70 P 0.073 -71 T 0.076 -72 G 0.081 -73 E 0.079 -74 V 0.068 -75 F 0.055 -76 Y 0.048 -77 Y 0.051 -78 S 0.061 -79 C 0.074 -80 E 0.084 -81 Y 0.086 -82 N 0.087 -83 F 0.092 -84 V 0.101 -85 S 0.110 -86 P 0.117 -87 S 0.117 -88 K 0.109 -89 S 0.097 -90 F 0.086 -91 W 0.076 -92 T 0.067 -93 R 0.059 -94 I 0.053 -95 T 0.051 -96 C 0.056 -97 T 0.067 -98 E 0.079 -99 E 0.084 -100 G 0.079 -101 W 0.064 -102 S 0.053 -103 P 0.051 -104 T 0.056 -105 P 0.062 -106 K 0.071 -107 C 0.080 -108 L 0.083 -109 R 0.077 -110 M 0.073 -111 C 0.083 -112 S 0.102 -113 F 0.118 -114 P 0.123 -115 F 0.120 -116 V 0.111 -117 K 0.099 -118 N 0.090 -119 G 0.090 -120 H 0.102 -121 S 0.125 -122 E 0.157 -123 S 0.186 -124 S 0.194 -125 G 0.171 -126 L 0.128 -127 I 0.090 -128 H 0.070 -129 L 0.067 -130 E 0.073 -131 G 0.081 -132 D 0.090 -133 T 0.094 -134 V 0.092 -135 Q 0.083 -136 I 0.076 -137 I 0.077 -138 C 0.087 -139 N 0.098 -140 T 0.101 -141 G 0.097 -142 Y 0.092 -143 S 0.091 -144 L 0.095 -145 Q 0.104 -146 N 0.115 -147 N 0.122 -148 E 0.118 -149 K 0.103 -150 N 0.084 -151 I 0.071 -152 S 0.068 -153 C 0.071 -154 V 0.077 -155 E 0.083 -156 R 0.088 -157 G 0.086 -158 W 0.083 -159 S 0.088 -160 T 0.098 -161 P 0.102 -162 P 0.097 -163 I 0.094 -164 C 0.101 -165 S 0.114 -166 F 0.126 -167 T 0.131 -168 K 0.125 -169 G 0.113 -170 E 0.108 -171 C 0.116 -172 H 0.131 -173 V 0.150 -174 P 0.168 -175 I 0.181 -176 L 0.179 -177 E 0.161 -178 A 0.133 -179 N 0.109 -180 V 0.095 -181 D 0.086 -182 A 0.079 -183 Q 0.078 -184 P 0.085 -185 K 0.090 -186 K 0.081 -187 E 0.064 -188 S 0.050 -189 Y 0.043 -190 K 0.042 -191 V 0.044 -192 G 0.049 -193 D 0.053 -194 V 0.055 -195 L 0.053 -196 K 0.049 -197 F 0.048 -198 S 0.055 -199 C 0.069 -200 R 0.086 -201 K 0.097 -202 N 0.098 -203 L 0.095 -204 I 0.097 -205 R 0.104 -206 V 0.110 -207 G 0.106 -208 S 0.093 -209 D 0.076 -210 S 0.060 -211 V 0.048 -212 Q 0.040 -213 C 0.038 -214 Y 0.044 -215 Q 0.056 -216 F 0.066 -217 G 0.067 -218 W 0.060 -219 S 0.058 -220 P 0.069 -221 N 0.080 -222 F 0.079 -223 P 0.076 -224 T 0.087 -225 C 0.125 -226 K 0.183 -227 G 0.236 -228 Q 0.254 -229 V 0.229 -230 R 0.180 -231 S 0.142 -232 C 0.136 -233 G 0.152 -234 P 0.164 -235 P 0.160 -236 P 0.148 -237 Q 0.136 -238 L 0.122 -239 S 0.108 -240 N 0.094 -241 G 0.086 -242 E 0.086 -243 V 0.093 -244 K 0.108 -245 E 0.125 -246 I 0.131 -247 R 0.118 -248 K 0.095 -249 E 0.075 -250 E 0.064 -251 Y 0.061 -252 G 0.060 -253 H 0.058 -254 N 0.054 -255 E 0.053 -256 V 0.054 -257 V 0.055 -258 E 0.054 -259 Y 0.054 -260 D 0.058 -261 C 0.071 -262 N 0.085 -263 P 0.088 -264 N 0.080 -265 F 0.067 -266 I 0.060 -267 I 0.065 -268 N 0.075 -269 G 0.081 -270 P 0.077 -271 K 0.065 -272 K 0.053 -273 I 0.047 -274 Q 0.046 -275 C 0.052 -276 V 0.059 -277 D 0.066 -278 G 0.068 -279 E 0.063 -280 W 0.059 -281 T 0.062 -282 T 0.068 -283 L 0.071 -284 P 0.073 -285 T 0.084 -286 C 0.115 -287 V 0.162 -288 E 0.208 -289 Q 0.229 -290 V 0.213 -291 K 0.174 -292 T 0.145 -293 C 0.146 -294 G 0.167 -295 Y 0.183 -296 I 0.184 -297 P 0.176 -298 E 0.165 -299 L 0.145 -300 E 0.120 -301 Y 0.099 -302 G 0.092 -303 Y 0.095 -304 V 0.096 -305 Q 0.098 -306 P 0.110 -307 S 0.123 -308 V 0.116 -309 P 0.090 -310 P 0.066 -311 Y 0.056 -312 Q 0.058 -313 H 0.065 -314 G 0.077 -315 V 0.088 -316 S 0.095 -317 V 0.095 -318 E 0.090 -319 V 0.083 -320 N 0.085 -321 C 0.099 -322 R 0.118 -323 N 0.127 -324 E 0.121 -325 Y 0.109 -326 A 0.105 -327 M 0.110 -328 I 0.114 -329 G 0.110 -330 N 0.097 -331 N 0.080 -332 M 0.067 -333 I 0.059 -334 T 0.058 -335 C 0.064 -336 I 0.076 -337 N 0.086 -338 G 0.091 -339 I 0.088 -340 W 0.086 -341 T 0.091 -342 E 0.099 -343 L 0.099 -344 P 0.093 -345 M 0.095 -346 C 0.114 -347 V 0.145 -348 A 0.180 -349 T 0.215 -350 H 0.243 -351 Q 0.251 -352 L 0.233 -353 K 0.197 -354 R 0.165 -355 C 0.155 -356 K 0.171 -357 I 0.205 -358 A 0.236 -359 G 0.243 -360 V 0.228 -361 N 0.207 -362 I 0.190 -363 K 0.177 -364 T 0.171 -365 L 0.175 -366 L 0.183 -367 K 0.189 -368 L 0.191 -369 S 0.186 -370 G 0.167 -371 K 0.137 -372 E 0.111 -373 F 0.098 -374 N 0.095 -375 H 0.097 -376 N 0.103 -377 S 0.108 -378 R 0.109 -379 I 0.101 -380 R 0.088 -381 Y 0.078 -382 R 0.080 -383 C 0.088 -384 S 0.092 -385 D 0.089 -386 I 0.085 -387 F 0.087 -388 R 0.097 -389 Y 0.109 -390 R 0.111 -391 H 0.103 -392 S 0.093 -393 V 0.091 -394 C 0.102 -395 I 0.116 -396 N 0.125 -397 G 0.125 -398 K 0.115 -399 W 0.101 -400 N 0.098 -401 P 0.117 -402 E 0.140 -403 V 0.153 -404 D 0.161 -405 C 0.189 -406 T 0.247 -407 E 0.316 -408 K 0.361 -409 R 0.359 -410 E 0.309 -411 Q 0.239 -412 F 0.190 -413 C 0.180 -414 P 0.196 -415 P 0.211 -416 P 0.218 -417 P 0.220 -418 Q 0.221 -419 I 0.214 -420 P 0.195 -421 N 0.173 -422 A 0.171 -423 Q 0.190 -424 N 0.214 -425 M 0.229 -426 T 0.229 -427 T 0.212 -428 T 0.180 -429 V 0.142 -430 N 0.115 -431 Y 0.104 -432 Q 0.105 -433 D 0.110 -434 G 0.116 -435 E 0.121 -436 K 0.122 -437 V 0.116 -438 A 0.104 -439 V 0.094 -440 L 0.096 -441 C 0.111 -442 K 0.130 -443 E 0.139 -444 N 0.132 -445 Y 0.120 -446 L 0.116 -447 L 0.125 -448 P 0.138 -449 E 0.145 -450 A 0.139 -451 K 0.120 -452 E 0.097 -453 I 0.082 -454 V 0.078 -455 C 0.088 -456 K 0.102 -457 D 0.112 -458 G 0.109 -459 R 0.099 -460 W 0.092 -461 Q 0.097 -462 S 0.111 -463 L 0.121 -464 P 0.127 -465 R 0.138 -466 C 0.167 -467 V 0.210 -468 E 0.248 -469 S 0.261 -470 T 0.245 -471 A 0.211 -472 Y 0.184 -473 C 0.184 -474 G 0.206 -475 P 0.226 -476 P 0.231 -477 P 0.226 -478 S 0.214 -479 I 0.197 -480 N 0.177 -481 N 0.160 -482 G 0.156 -483 D 0.165 -484 T 0.181 -485 T 0.203 -486 S 0.229 -487 F 0.240 -488 P 0.221 -489 L 0.180 -490 S 0.138 -491 V 0.115 -492 Y 0.116 -493 P 0.132 -494 P 0.149 -495 G 0.158 -496 S 0.158 -497 T 0.151 -498 V 0.140 -499 T 0.128 -500 Y 0.120 -501 R 0.121 -502 C 0.133 -503 Q 0.150 -504 S 0.160 -505 F 0.164 -506 Y 0.170 -507 K 0.181 -508 L 0.187 -509 Q 0.182 -510 G 0.167 -511 S 0.147 -512 V 0.125 -513 T 0.106 -514 V 0.094 -515 T 0.088 -516 C 0.092 -517 R 0.100 -518 N 0.106 -519 K 0.108 -520 Q 0.108 -521 W 0.115 -522 S 0.136 -523 E 0.161 -524 P 0.176 -525 P 0.172 -526 R 0.161 -527 C 0.153 -528 L 0.145 -529 D 0.126 -530 P 0.107 -531 C 0.102 -532 V 0.109 -533 V 0.115 -534 S 0.114 -535 E 0.116 -536 E 0.126 -537 N 0.138 -538 M 0.149 -539 N 0.161 -540 K 0.174 -541 N 0.179 -542 N 0.174 -543 I 0.161 -544 Q 0.144 -545 L 0.135 -546 K 0.144 -547 W 0.168 -548 R 0.196 -549 N 0.218 -550 D 0.222 -551 G 0.198 -552 K 0.157 -553 L 0.121 -554 Y 0.105 -555 A 0.105 -556 K 0.114 -557 T 0.127 -558 G 0.139 -559 D 0.146 -560 A 0.146 -561 V 0.139 -562 E 0.129 -563 F 0.120 -564 Q 0.114 -565 C 0.108 -566 K 0.101 -567 F 0.094 -568 P 0.094 -569 H 0.106 -570 K 0.128 -571 A 0.151 -572 M 0.167 -573 I 0.176 -574 S 0.179 -575 S 0.176 -576 P 0.164 -577 P 0.142 -578 F 0.118 -579 R 0.104 -580 A 0.101 -581 I 0.101 -582 C 0.105 -583 Q 0.114 -584 E 0.125 -585 G 0.133 -586 K 0.137 -587 F 0.137 -588 E 0.138 -589 Y 0.140 -590 P 0.141 -591 I 0.143 -592 C 0.148 -593 E 0.155 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000135744.9_ENST00000366667.6_GN:AGT_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000135744.9_ENST00000366667.6_GN:AGT_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index a8854fd4e63e97d51bfb345d50eb7c82fb79253e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000135744.9_ENST00000366667.6_GN:AGT_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,477 +0,0 @@ ->ENSG00000135744.9|ENST00000366667.6|GN:AGT|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.356 -2 A 0.383 -3 P 0.426 -4 A 0.465 -5 G 0.471 -6 V 0.429 -7 S 0.353 -8 L 0.278 -9 R 0.229 -10 A 0.207 -11 T 0.197 -12 I 0.186 -13 L 0.175 -14 C 0.170 -15 L 0.174 -16 L 0.183 -17 A 0.206 -18 W 0.250 -19 A 0.309 -20 G 0.368 -21 L 0.415 -22 A 0.442 -23 A 0.433 -24 G 0.385 -25 D 0.321 -26 R 0.264 -27 V 0.222 -28 Y 0.189 -29 I 0.165 -30 H 0.148 -31 P 0.135 -32 F 0.126 -33 H 0.128 -34 L 0.142 -35 V 0.159 -36 I 0.165 -37 H 0.156 -38 N 0.136 -39 E 0.115 -40 S 0.100 -41 T 0.093 -42 C 0.089 -43 E 0.090 -44 Q 0.098 -45 L 0.114 -46 A 0.140 -47 K 0.177 -48 A 0.221 -49 N 0.260 -50 A 0.285 -51 G 0.296 -52 K 0.294 -53 P 0.281 -54 K 0.263 -55 D 0.247 -56 P 0.233 -57 T 0.220 -58 F 0.215 -59 I 0.228 -60 P 0.254 -61 A 0.283 -62 P 0.301 -63 I 0.304 -64 Q 0.295 -65 A 0.288 -66 K 0.284 -67 T 0.284 -68 S 0.285 -69 P 0.279 -70 V 0.252 -71 D 0.203 -72 E 0.154 -73 K 0.126 -74 A 0.117 -75 L 0.115 -76 Q 0.114 -77 D 0.115 -78 Q 0.118 -79 L 0.119 -80 V 0.121 -81 L 0.123 -82 V 0.126 -83 A 0.128 -84 A 0.127 -85 K 0.123 -86 L 0.122 -87 D 0.125 -88 T 0.125 -89 E 0.113 -90 D 0.089 -91 K 0.070 -92 L 0.059 -93 R 0.052 -94 A 0.047 -95 A 0.047 -96 M 0.050 -97 V 0.051 -98 G 0.048 -99 M 0.044 -100 L 0.042 -101 A 0.042 -102 N 0.040 -103 F 0.039 -104 L 0.037 -105 G 0.036 -106 F 0.036 -107 R 0.036 -108 I 0.038 -109 Y 0.044 -110 G 0.053 -111 M 0.066 -112 H 0.077 -113 S 0.079 -114 E 0.077 -115 L 0.078 -116 W 0.088 -117 G 0.106 -118 V 0.123 -119 V 0.134 -120 H 0.134 -121 G 0.125 -122 A 0.116 -123 T 0.110 -124 V 0.103 -125 L 0.094 -126 S 0.083 -127 P 0.073 -128 T 0.065 -129 A 0.059 -130 V 0.054 -131 F 0.050 -132 G 0.050 -133 T 0.051 -134 L 0.053 -135 A 0.058 -136 S 0.062 -137 L 0.063 -138 Y 0.062 -139 L 0.064 -140 G 0.070 -141 A 0.075 -142 L 0.076 -143 D 0.074 -144 H 0.075 -145 T 0.080 -146 A 0.087 -147 D 0.090 -148 R 0.083 -149 L 0.071 -150 Q 0.057 -151 A 0.046 -152 I 0.043 -153 L 0.055 -154 G 0.083 -155 V 0.117 -156 P 0.142 -157 W 0.151 -158 K 0.149 -159 D 0.147 -160 K 0.150 -161 N 0.155 -162 C 0.163 -163 T 0.173 -164 S 0.182 -165 R 0.177 -166 L 0.151 -167 D 0.115 -168 A 0.083 -169 H 0.063 -170 K 0.053 -171 V 0.051 -172 L 0.051 -173 S 0.046 -174 A 0.038 -175 L 0.031 -176 Q 0.028 -177 A 0.029 -178 V 0.032 -179 Q 0.037 -180 G 0.043 -181 L 0.049 -182 L 0.060 -183 V 0.084 -184 A 0.116 -185 Q 0.152 -186 G 0.188 -187 R 0.219 -188 A 0.236 -189 D 0.237 -190 S 0.225 -191 Q 0.208 -192 A 0.187 -193 Q 0.158 -194 L 0.122 -195 L 0.086 -196 L 0.057 -197 S 0.038 -198 T 0.029 -199 V 0.025 -200 V 0.023 -201 G 0.024 -202 V 0.026 -203 F 0.035 -204 T 0.052 -205 A 0.073 -206 P 0.088 -207 G 0.094 -208 L 0.093 -209 H 0.087 -210 L 0.077 -211 K 0.062 -212 Q 0.048 -213 P 0.038 -214 F 0.034 -215 V 0.034 -216 Q 0.034 -217 G 0.034 -218 L 0.033 -219 A 0.031 -220 L 0.029 -221 Y 0.028 -222 T 0.030 -223 P 0.036 -224 V 0.044 -225 V 0.052 -226 L 0.057 -227 P 0.056 -228 R 0.050 -229 S 0.044 -230 L 0.040 -231 D 0.040 -232 F 0.043 -233 T 0.045 -234 E 0.044 -235 L 0.043 -236 D 0.041 -237 V 0.040 -238 A 0.041 -239 A 0.043 -240 E 0.044 -241 K 0.046 -242 I 0.052 -243 D 0.062 -244 R 0.066 -245 F 0.057 -246 M 0.043 -247 Q 0.035 -248 A 0.036 -249 V 0.043 -250 T 0.055 -251 G 0.074 -252 W 0.105 -253 K 0.144 -254 T 0.182 -255 G 0.204 -256 C 0.212 -257 S 0.212 -258 L 0.210 -259 M 0.212 -260 G 0.218 -261 A 0.216 -262 S 0.200 -263 V 0.172 -264 D 0.141 -265 S 0.114 -266 T 0.093 -267 L 0.079 -268 A 0.070 -269 F 0.066 -270 N 0.069 -271 T 0.078 -272 Y 0.089 -273 V 0.096 -274 H 0.096 -275 F 0.090 -276 Q 0.085 -277 G 0.084 -278 K 0.088 -279 M 0.096 -280 K 0.111 -281 G 0.136 -282 F 0.163 -283 S 0.178 -284 L 0.170 -285 L 0.149 -286 A 0.127 -287 E 0.105 -288 P 0.083 -289 Q 0.068 -290 E 0.060 -291 F 0.058 -292 W 0.058 -293 V 0.060 -294 D 0.064 -295 N 0.067 -296 S 0.072 -297 T 0.079 -298 S 0.089 -299 V 0.095 -300 S 0.095 -301 V 0.088 -302 P 0.079 -303 M 0.073 -304 L 0.073 -305 S 0.076 -306 G 0.078 -307 M 0.077 -308 G 0.069 -309 T 0.055 -310 F 0.039 -311 Q 0.028 -312 H 0.023 -313 W 0.023 -314 S 0.029 -315 D 0.036 -316 I 0.042 -317 Q 0.044 -318 D 0.043 -319 N 0.037 -320 F 0.030 -321 S 0.025 -322 V 0.025 -323 T 0.028 -324 Q 0.032 -325 V 0.032 -326 P 0.030 -327 F 0.028 -328 T 0.030 -329 E 0.033 -330 S 0.034 -331 A 0.034 -332 C 0.034 -333 L 0.038 -334 L 0.045 -335 L 0.052 -336 I 0.060 -337 Q 0.067 -338 P 0.072 -339 H 0.070 -340 Y 0.064 -341 A 0.059 -342 S 0.057 -343 D 0.056 -344 L 0.056 -345 D 0.057 -346 K 0.056 -347 V 0.054 -348 E 0.055 -349 G 0.060 -350 L 0.068 -351 T 0.074 -352 F 0.077 -353 Q 0.075 -354 Q 0.070 -355 N 0.062 -356 S 0.055 -357 L 0.053 -358 N 0.055 -359 W 0.057 -360 M 0.057 -361 K 0.056 -362 K 0.060 -363 L 0.068 -364 S 0.075 -365 P 0.075 -366 R 0.072 -367 T 0.072 -368 I 0.073 -369 H 0.072 -370 L 0.073 -371 T 0.078 -372 M 0.089 -373 P 0.101 -374 Q 0.108 -375 L 0.111 -376 V 0.115 -377 L 0.121 -378 Q 0.126 -379 G 0.120 -380 S 0.103 -381 Y 0.083 -382 D 0.073 -383 L 0.074 -384 Q 0.078 -385 D 0.078 -386 L 0.069 -387 L 0.058 -388 A 0.052 -389 Q 0.051 -390 A 0.054 -391 E 0.065 -392 L 0.081 -393 P 0.097 -394 A 0.110 -395 I 0.119 -396 L 0.127 -397 H 0.135 -398 T 0.139 -399 E 0.129 -400 L 0.107 -401 N 0.087 -402 L 0.074 -403 Q 0.068 -404 K 0.063 -405 L 0.063 -406 S 0.072 -407 N 0.093 -408 D 0.116 -409 R 0.128 -410 I 0.123 -411 R 0.110 -412 V 0.102 -413 G 0.103 -414 E 0.108 -415 V 0.114 -416 L 0.121 -417 N 0.130 -418 S 0.139 -419 I 0.145 -420 F 0.148 -421 F 0.155 -422 E 0.176 -423 L 0.210 -424 E 0.254 -425 A 0.298 -426 D 0.337 -427 E 0.371 -428 R 0.408 -429 E 0.456 -430 P 0.511 -431 T 0.558 -432 E 0.588 -433 S 0.596 -434 T 0.586 -435 Q 0.567 -436 Q 0.549 -437 L 0.526 -438 N 0.493 -439 K 0.449 -440 P 0.393 -441 E 0.328 -442 V 0.265 -443 L 0.214 -444 E 0.180 -445 V 0.155 -446 T 0.132 -447 L 0.108 -448 N 0.087 -449 R 0.069 -450 P 0.057 -451 F 0.050 -452 L 0.048 -453 F 0.049 -454 A 0.050 -455 V 0.050 -456 Y 0.050 -457 D 0.051 -458 Q 0.058 -459 S 0.066 -460 A 0.071 -461 T 0.069 -462 A 0.065 -463 L 0.063 -464 H 0.062 -465 F 0.063 -466 L 0.062 -467 G 0.061 -468 R 0.064 -469 V 0.074 -470 A 0.090 -471 N 0.109 -472 P 0.134 -473 L 0.165 -474 S 0.206 -475 T 0.248 -476 A 0.276 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000135744.9_ENST00000366667.6_GN:AGT_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:9.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000135744.9_ENST00000366667.6_GN:AGT_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:9.caid deleted file mode 100644 index 44cb1727ab11a1de93e1eb7a35082d370e14a600..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000135744.9_ENST00000366667.6_GN:AGT_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:9.caid +++ /dev/null @@ -1,486 +0,0 @@ ->ENSG00000135744.9|ENST00000366667.6|GN:AGT|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:9 -1 M 0.334 -2 R 0.328 -3 K 0.337 -4 R 0.370 -5 A 0.401 -6 P 0.410 -7 Q 0.424 -8 S 0.463 -9 E 0.502 -10 M 0.524 -11 A 0.549 -12 P 0.584 -13 A 0.606 -14 G 0.585 -15 V 0.515 -16 S 0.413 -17 L 0.312 -18 R 0.246 -19 A 0.221 -20 T 0.214 -21 I 0.201 -22 L 0.188 -23 C 0.183 -24 L 0.185 -25 L 0.192 -26 A 0.212 -27 W 0.251 -28 A 0.303 -29 G 0.356 -30 L 0.404 -31 A 0.433 -32 A 0.421 -33 G 0.369 -34 D 0.305 -35 R 0.251 -36 V 0.212 -37 Y 0.181 -38 I 0.158 -39 H 0.143 -40 P 0.132 -41 F 0.125 -42 H 0.129 -43 L 0.144 -44 V 0.162 -45 I 0.170 -46 H 0.163 -47 N 0.144 -48 E 0.124 -49 S 0.109 -50 T 0.099 -51 C 0.095 -52 E 0.095 -53 Q 0.102 -54 L 0.116 -55 A 0.138 -56 K 0.173 -57 A 0.220 -58 N 0.263 -59 A 0.291 -60 G 0.302 -61 K 0.298 -62 P 0.284 -63 K 0.265 -64 D 0.247 -65 P 0.232 -66 T 0.218 -67 F 0.213 -68 I 0.226 -69 P 0.253 -70 A 0.283 -71 P 0.302 -72 I 0.304 -73 Q 0.294 -74 A 0.285 -75 K 0.281 -76 T 0.282 -77 S 0.284 -78 P 0.278 -79 V 0.251 -80 D 0.201 -81 E 0.152 -82 K 0.123 -83 A 0.114 -84 L 0.112 -85 Q 0.111 -86 D 0.112 -87 Q 0.115 -88 L 0.116 -89 V 0.117 -90 L 0.120 -91 V 0.123 -92 A 0.125 -93 A 0.124 -94 K 0.120 -95 L 0.118 -96 D 0.119 -97 T 0.119 -98 E 0.106 -99 D 0.084 -100 K 0.066 -101 L 0.056 -102 R 0.050 -103 A 0.046 -104 A 0.046 -105 M 0.048 -106 V 0.049 -107 G 0.047 -108 M 0.043 -109 L 0.041 -110 A 0.041 -111 N 0.039 -112 F 0.037 -113 L 0.036 -114 G 0.035 -115 F 0.035 -116 R 0.035 -117 I 0.037 -118 Y 0.043 -119 G 0.053 -120 M 0.065 -121 H 0.076 -122 S 0.080 -123 E 0.078 -124 L 0.081 -125 W 0.092 -126 G 0.111 -127 V 0.128 -128 V 0.139 -129 H 0.138 -130 G 0.128 -131 A 0.118 -132 T 0.112 -133 V 0.105 -134 L 0.096 -135 S 0.084 -136 P 0.074 -137 T 0.065 -138 A 0.059 -139 V 0.053 -140 F 0.050 -141 G 0.049 -142 T 0.049 -143 L 0.052 -144 A 0.056 -145 S 0.061 -146 L 0.062 -147 Y 0.061 -148 L 0.063 -149 G 0.070 -150 A 0.076 -151 L 0.077 -152 D 0.075 -153 H 0.076 -154 T 0.081 -155 A 0.087 -156 D 0.090 -157 R 0.083 -158 L 0.071 -159 Q 0.057 -160 A 0.046 -161 I 0.043 -162 L 0.054 -163 G 0.082 -164 V 0.116 -165 P 0.140 -166 W 0.148 -167 K 0.146 -168 D 0.144 -169 K 0.147 -170 N 0.153 -171 C 0.160 -172 T 0.170 -173 S 0.179 -174 R 0.174 -175 L 0.148 -176 D 0.113 -177 A 0.081 -178 H 0.061 -179 K 0.052 -180 V 0.050 -181 L 0.049 -182 S 0.045 -183 A 0.038 -184 L 0.030 -185 Q 0.028 -186 A 0.029 -187 V 0.032 -188 Q 0.037 -189 G 0.042 -190 L 0.047 -191 L 0.058 -192 V 0.080 -193 A 0.111 -194 Q 0.145 -195 G 0.180 -196 R 0.210 -197 A 0.227 -198 D 0.228 -199 S 0.218 -200 Q 0.202 -201 A 0.182 -202 Q 0.152 -203 L 0.116 -204 L 0.081 -205 L 0.054 -206 S 0.036 -207 T 0.028 -208 V 0.024 -209 V 0.022 -210 G 0.023 -211 V 0.026 -212 F 0.034 -213 T 0.050 -214 A 0.071 -215 P 0.085 -216 G 0.091 -217 L 0.090 -218 H 0.085 -219 L 0.075 -220 K 0.060 -221 Q 0.046 -222 P 0.037 -223 F 0.033 -224 V 0.032 -225 Q 0.032 -226 G 0.032 -227 L 0.031 -228 A 0.029 -229 L 0.027 -230 Y 0.026 -231 T 0.028 -232 P 0.033 -233 V 0.042 -234 V 0.050 -235 L 0.056 -236 P 0.055 -237 R 0.050 -238 S 0.043 -239 L 0.039 -240 D 0.039 -241 F 0.042 -242 T 0.044 -243 E 0.043 -244 L 0.042 -245 D 0.040 -246 V 0.038 -247 A 0.038 -248 A 0.038 -249 E 0.038 -250 K 0.041 -251 I 0.049 -252 D 0.060 -253 R 0.064 -254 F 0.055 -255 M 0.042 -256 Q 0.034 -257 A 0.034 -258 V 0.041 -259 T 0.054 -260 G 0.073 -261 W 0.104 -262 K 0.144 -263 T 0.181 -264 G 0.204 -265 C 0.212 -266 S 0.212 -267 L 0.210 -268 M 0.213 -269 G 0.217 -270 A 0.214 -271 S 0.198 -272 V 0.171 -273 D 0.141 -274 S 0.115 -275 T 0.094 -276 L 0.080 -277 A 0.071 -278 F 0.066 -279 N 0.069 -280 T 0.079 -281 Y 0.089 -282 V 0.096 -283 H 0.096 -284 F 0.090 -285 Q 0.085 -286 G 0.085 -287 K 0.089 -288 M 0.097 -289 K 0.113 -290 G 0.139 -291 F 0.168 -292 S 0.183 -293 L 0.175 -294 L 0.154 -295 A 0.131 -296 E 0.108 -297 P 0.086 -298 Q 0.070 -299 E 0.062 -300 F 0.059 -301 W 0.060 -302 V 0.062 -303 D 0.066 -304 N 0.070 -305 S 0.074 -306 T 0.082 -307 S 0.091 -308 V 0.098 -309 S 0.098 -310 V 0.090 -311 P 0.081 -312 M 0.075 -313 L 0.074 -314 S 0.077 -315 G 0.079 -316 M 0.078 -317 G 0.070 -318 T 0.055 -319 F 0.039 -320 Q 0.028 -321 H 0.023 -322 W 0.023 -323 S 0.029 -324 D 0.036 -325 I 0.042 -326 Q 0.044 -327 D 0.042 -328 N 0.036 -329 F 0.029 -330 S 0.024 -331 V 0.024 -332 T 0.028 -333 Q 0.031 -334 V 0.032 -335 P 0.030 -336 F 0.028 -337 T 0.029 -338 E 0.031 -339 S 0.033 -340 A 0.033 -341 C 0.034 -342 L 0.038 -343 L 0.044 -344 L 0.052 -345 I 0.059 -346 Q 0.066 -347 P 0.070 -348 H 0.069 -349 Y 0.063 -350 A 0.058 -351 S 0.056 -352 D 0.055 -353 L 0.055 -354 D 0.056 -355 K 0.055 -356 V 0.054 -357 E 0.054 -358 G 0.059 -359 L 0.066 -360 T 0.072 -361 F 0.075 -362 Q 0.073 -363 Q 0.068 -364 N 0.060 -365 S 0.054 -366 L 0.051 -367 N 0.053 -368 W 0.056 -369 M 0.056 -370 K 0.055 -371 K 0.060 -372 L 0.068 -373 S 0.074 -374 P 0.074 -375 R 0.072 -376 T 0.072 -377 I 0.072 -378 H 0.072 -379 L 0.072 -380 T 0.077 -381 M 0.089 -382 P 0.101 -383 Q 0.108 -384 L 0.111 -385 V 0.115 -386 L 0.121 -387 Q 0.126 -388 G 0.120 -389 S 0.102 -390 Y 0.082 -391 D 0.070 -392 L 0.064 -393 Q 0.060 -394 D 0.055 -395 L 0.050 -396 L 0.048 -397 A 0.048 -398 Q 0.049 -399 A 0.053 -400 E 0.064 -401 L 0.080 -402 P 0.095 -403 A 0.108 -404 I 0.117 -405 L 0.124 -406 H 0.132 -407 T 0.136 -408 E 0.127 -409 L 0.106 -410 N 0.086 -411 L 0.073 -412 Q 0.066 -413 K 0.062 -414 L 0.061 -415 S 0.071 -416 N 0.092 -417 D 0.116 -418 R 0.128 -419 I 0.123 -420 R 0.110 -421 V 0.102 -422 G 0.103 -423 E 0.108 -424 V 0.114 -425 L 0.121 -426 N 0.130 -427 S 0.139 -428 I 0.145 -429 F 0.148 -430 F 0.156 -431 E 0.177 -432 L 0.211 -433 E 0.254 -434 A 0.298 -435 D 0.336 -436 E 0.370 -437 R 0.407 -438 E 0.455 -439 P 0.509 -440 T 0.557 -441 E 0.587 -442 S 0.595 -443 T 0.584 -444 Q 0.565 -445 Q 0.547 -446 L 0.524 -447 N 0.492 -448 K 0.449 -449 P 0.394 -450 E 0.329 -451 V 0.266 -452 L 0.215 -453 E 0.181 -454 V 0.156 -455 T 0.133 -456 L 0.109 -457 N 0.088 -458 R 0.070 -459 P 0.058 -460 F 0.051 -461 L 0.048 -462 F 0.049 -463 A 0.050 -464 V 0.050 -465 Y 0.050 -466 D 0.051 -467 Q 0.057 -468 S 0.065 -469 A 0.069 -470 T 0.068 -471 A 0.065 -472 L 0.063 -473 H 0.062 -474 F 0.062 -475 L 0.062 -476 G 0.061 -477 R 0.064 -478 V 0.074 -479 A 0.090 -480 N 0.110 -481 P 0.134 -482 L 0.167 -483 S 0.208 -484 T 0.252 -485 A 0.282 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000138085.19_ENST00000380171.9_GN:ATRAID_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000138085.19_ENST00000380171.9_GN:ATRAID_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 0a4ddaa838a3acfc2089130c6fb6fc0effda0b4c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000138085.19_ENST00000380171.9_GN:ATRAID_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,230 +0,0 @@ ->ENSG00000138085.19|ENST00000380171.9|GN:ATRAID|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.407 -2 A 0.438 -3 P 0.486 -4 H 0.540 -5 D 0.593 -6 P 0.635 -7 G 0.662 -8 S 0.667 -9 L 0.645 -10 T 0.604 -11 T 0.572 -12 L 0.561 -13 V 0.549 -14 P 0.519 -15 W 0.484 -16 A 0.452 -17 A 0.414 -18 A 0.380 -19 L 0.370 -20 L 0.376 -21 L 0.385 -22 A 0.401 -23 L 0.436 -24 G 0.477 -25 V 0.506 -26 E 0.515 -27 R 0.503 -28 A 0.468 -29 L 0.410 -30 A 0.333 -31 L 0.249 -32 P 0.170 -33 E 0.106 -34 I 0.067 -35 C 0.048 -36 T 0.043 -37 Q 0.049 -38 C 0.062 -39 P 0.076 -40 G 0.086 -41 S 0.091 -42 V 0.091 -43 Q 0.086 -44 N 0.081 -45 L 0.077 -46 S 0.074 -47 K 0.074 -48 V 0.074 -49 A 0.070 -50 F 0.066 -51 Y 0.064 -52 C 0.065 -53 K 0.071 -54 T 0.082 -55 T 0.097 -56 R 0.113 -57 E 0.132 -58 L 0.149 -59 M 0.151 -60 L 0.134 -61 H 0.107 -62 A 0.081 -63 R 0.063 -64 C 0.054 -65 C 0.055 -66 L 0.061 -67 N 0.071 -68 Q 0.084 -69 K 0.098 -70 G 0.105 -71 T 0.102 -72 I 0.093 -73 L 0.084 -74 G 0.081 -75 L 0.087 -76 D 0.105 -77 L 0.126 -78 Q 0.137 -79 N 0.129 -80 C 0.107 -81 S 0.087 -82 L 0.081 -83 E 0.090 -84 D 0.106 -85 P 0.120 -86 G 0.127 -87 P 0.123 -88 N 0.108 -89 F 0.088 -90 H 0.070 -91 Q 0.059 -92 A 0.056 -93 H 0.061 -94 T 0.072 -95 T 0.087 -96 V 0.103 -97 I 0.116 -98 I 0.126 -99 D 0.132 -100 L 0.132 -101 Q 0.128 -102 A 0.121 -103 N 0.110 -104 P 0.098 -105 L 0.093 -106 K 0.100 -107 G 0.110 -108 D 0.114 -109 L 0.110 -110 A 0.101 -111 N 0.085 -112 T 0.070 -113 F 0.061 -114 R 0.060 -115 G 0.063 -116 F 0.070 -117 T 0.077 -118 Q 0.080 -119 L 0.081 -120 Q 0.086 -121 T 0.095 -122 L 0.099 -123 I 0.093 -124 L 0.079 -125 P 0.066 -126 Q 0.061 -127 H 0.062 -128 V 0.067 -129 N 0.074 -130 C 0.084 -131 P 0.099 -132 G 0.113 -133 G 0.117 -134 I 0.107 -135 N 0.094 -136 A 0.088 -137 W 0.089 -138 N 0.091 -139 T 0.091 -140 I 0.090 -141 T 0.089 -142 S 0.088 -143 Y 0.090 -144 I 0.093 -145 D 0.096 -146 N 0.094 -147 Q 0.089 -148 I 0.086 -149 C 0.095 -150 Q 0.115 -151 G 0.136 -152 Q 0.148 -153 K 0.146 -154 N 0.141 -155 L 0.151 -156 C 0.183 -157 N 0.224 -158 N 0.258 -159 T 0.276 -160 G 0.285 -161 D 0.286 -162 P 0.274 -163 E 0.248 -164 M 0.215 -165 C 0.189 -166 P 0.170 -167 E 0.156 -168 N 0.146 -169 G 0.147 -170 S 0.164 -171 C 0.187 -172 V 0.198 -173 P 0.189 -174 D 0.170 -175 G 0.158 -176 P 0.160 -177 G 0.168 -178 L 0.164 -179 L 0.145 -180 Q 0.126 -181 C 0.121 -182 V 0.133 -183 C 0.156 -184 A 0.176 -185 D 0.182 -186 G 0.177 -187 F 0.165 -188 H 0.153 -189 G 0.148 -190 Y 0.152 -191 K 0.164 -192 C 0.190 -193 M 0.252 -194 R 0.356 -195 Q 0.463 -196 G 0.513 -197 S 0.481 -198 F 0.395 -199 S 0.297 -200 L 0.215 -201 L 0.163 -202 M 0.142 -203 F 0.137 -204 F 0.142 -205 G 0.157 -206 I 0.179 -207 L 0.195 -208 G 0.195 -209 A 0.184 -210 T 0.172 -211 T 0.162 -212 L 0.156 -213 S 0.152 -214 V 0.146 -215 S 0.134 -216 I 0.117 -217 L 0.099 -218 L 0.085 -219 W 0.079 -220 A 0.080 -221 T 0.091 -222 Q 0.115 -223 R 0.152 -224 R 0.201 -225 K 0.259 -226 A 0.318 -227 K 0.363 -228 T 0.384 -229 S 0.386 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000138085.19_ENST00000380171.9_GN:ATRAID_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:55.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000138085.19_ENST00000380171.9_GN:ATRAID_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:55.caid deleted file mode 100644 index b3104431879032fea95d0de754eb03877831d746..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000138085.19_ENST00000380171.9_GN:ATRAID_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:55.caid +++ /dev/null @@ -1,285 +0,0 @@ ->ENSG00000138085.19|ENST00000380171.9|GN:ATRAID|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:55 -1 M 0.391 -2 K 0.411 -3 T 0.450 -4 S 0.493 -5 A 0.518 -6 E 0.526 -7 L 0.529 -8 H 0.521 -9 E 0.491 -10 Q 0.460 -11 E 0.460 -12 K 0.491 -13 P 0.534 -14 P 0.582 -15 S 0.628 -16 S 0.666 -17 P 0.695 -18 R 0.712 -19 A 0.718 -20 T 0.719 -21 G 0.722 -22 P 0.731 -23 G 0.738 -24 R 0.728 -25 L 0.687 -26 G 0.629 -27 H 0.600 -28 A 0.632 -29 R 0.691 -30 G 0.731 -31 R 0.747 -32 G 0.750 -33 P 0.748 -34 D 0.735 -35 A 0.697 -36 L 0.639 -37 R 0.610 -38 G 0.632 -39 G 0.654 -40 A 0.632 -41 A 0.604 -42 G 0.617 -43 P 0.638 -44 G 0.624 -45 R 0.596 -46 A 0.585 -47 S 0.578 -48 S 0.579 -49 G 0.604 -50 A 0.621 -51 P 0.605 -52 R 0.595 -53 E 0.630 -54 R 0.682 -55 K 0.715 -56 M 0.730 -57 A 0.739 -58 P 0.744 -59 H 0.749 -60 D 0.759 -61 P 0.774 -62 G 0.787 -63 S 0.792 -64 L 0.789 -65 T 0.776 -66 T 0.755 -67 L 0.724 -68 V 0.683 -69 P 0.639 -70 W 0.599 -71 A 0.561 -72 A 0.516 -73 A 0.481 -74 L 0.483 -75 L 0.507 -76 L 0.525 -77 A 0.537 -78 L 0.553 -79 G 0.575 -80 V 0.590 -81 E 0.583 -82 R 0.553 -83 A 0.501 -84 L 0.427 -85 A 0.340 -86 L 0.253 -87 P 0.174 -88 E 0.111 -89 I 0.069 -90 C 0.048 -91 T 0.041 -92 Q 0.045 -93 C 0.056 -94 P 0.067 -95 G 0.076 -96 S 0.080 -97 V 0.079 -98 Q 0.074 -99 N 0.068 -100 L 0.064 -101 S 0.061 -102 K 0.060 -103 V 0.061 -104 A 0.057 -105 F 0.051 -106 Y 0.048 -107 C 0.047 -108 K 0.051 -109 T 0.061 -110 T 0.075 -111 R 0.092 -112 E 0.111 -113 L 0.127 -114 M 0.130 -115 L 0.117 -116 H 0.096 -117 A 0.074 -118 R 0.058 -119 C 0.050 -120 C 0.049 -121 L 0.052 -122 N 0.059 -123 Q 0.072 -124 K 0.086 -125 G 0.096 -126 T 0.097 -127 I 0.092 -128 L 0.086 -129 G 0.083 -130 L 0.089 -131 D 0.105 -132 L 0.125 -133 Q 0.134 -134 N 0.127 -135 C 0.109 -136 S 0.091 -137 L 0.086 -138 E 0.096 -139 D 0.111 -140 P 0.123 -141 G 0.128 -142 P 0.123 -143 N 0.107 -144 F 0.088 -145 H 0.071 -146 Q 0.061 -147 A 0.059 -148 H 0.065 -149 T 0.076 -150 T 0.090 -151 V 0.106 -152 I 0.121 -153 I 0.134 -154 D 0.141 -155 L 0.141 -156 Q 0.135 -157 A 0.127 -158 N 0.119 -159 P 0.113 -160 L 0.113 -161 K 0.123 -162 G 0.133 -163 D 0.132 -164 L 0.122 -165 A 0.108 -166 N 0.092 -167 T 0.077 -168 F 0.067 -169 R 0.066 -170 G 0.069 -171 F 0.076 -172 T 0.083 -173 Q 0.085 -174 L 0.084 -175 Q 0.087 -176 T 0.096 -177 L 0.102 -178 I 0.096 -179 L 0.081 -180 P 0.068 -181 Q 0.062 -182 H 0.064 -183 V 0.069 -184 N 0.074 -185 C 0.082 -186 P 0.096 -187 G 0.109 -188 G 0.111 -189 I 0.100 -190 N 0.085 -191 A 0.078 -192 W 0.079 -193 N 0.084 -194 T 0.086 -195 I 0.086 -196 T 0.084 -197 S 0.082 -198 Y 0.083 -199 I 0.087 -200 D 0.090 -201 N 0.089 -202 Q 0.083 -203 I 0.080 -204 C 0.088 -205 Q 0.107 -206 G 0.127 -207 Q 0.139 -208 K 0.137 -209 N 0.133 -210 L 0.142 -211 C 0.171 -212 N 0.210 -213 N 0.242 -214 T 0.261 -215 G 0.270 -216 D 0.271 -217 P 0.257 -218 E 0.229 -219 M 0.195 -220 C 0.170 -221 P 0.154 -222 E 0.144 -223 N 0.137 -224 G 0.140 -225 S 0.160 -226 C 0.185 -227 V 0.196 -228 P 0.186 -229 D 0.166 -230 G 0.155 -231 P 0.158 -232 G 0.166 -233 L 0.161 -234 L 0.141 -235 Q 0.121 -236 C 0.116 -237 V 0.129 -238 C 0.152 -239 A 0.173 -240 D 0.180 -241 G 0.174 -242 F 0.162 -243 H 0.151 -244 G 0.147 -245 Y 0.152 -246 K 0.165 -247 C 0.191 -248 M 0.251 -249 R 0.353 -250 Q 0.462 -251 G 0.516 -252 S 0.487 -253 F 0.402 -254 S 0.302 -255 L 0.219 -256 L 0.167 -257 M 0.146 -258 F 0.142 -259 F 0.147 -260 G 0.162 -261 I 0.186 -262 L 0.208 -263 G 0.215 -264 A 0.209 -265 T 0.195 -266 T 0.181 -267 L 0.171 -268 S 0.164 -269 V 0.156 -270 S 0.143 -271 I 0.126 -272 L 0.108 -273 L 0.095 -274 W 0.087 -275 A 0.087 -276 T 0.097 -277 Q 0.121 -278 R 0.159 -279 R 0.208 -280 K 0.267 -281 A 0.331 -282 K 0.382 -283 T 0.407 -284 S 0.412 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000139132.16_ENST00000534526.7_GN:FGD4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000139132.16_ENST00000534526.7_GN:FGD4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 0010c4846577b05d600cc49b6f05cc88ac951224..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000139132.16_ENST00000534526.7_GN:FGD4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,904 +0,0 @@ ->ENSG00000139132.16|ENST00000534526.7|GN:FGD4|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.399 -2 S 0.432 -3 D 0.486 -4 E 0.543 -5 G 0.588 -6 G 0.607 -7 S 0.602 -8 N 0.576 -9 F 0.542 -10 R 0.525 -11 R 0.538 -12 V 0.562 -13 A 0.570 -14 I 0.560 -15 R 0.548 -16 R 0.538 -17 K 0.536 -18 S 0.554 -19 N 0.595 -20 P 0.627 -21 S 0.629 -22 Y 0.613 -23 L 0.607 -24 P 0.624 -25 P 0.655 -26 G 0.679 -27 V 0.685 -28 P 0.678 -29 R 0.667 -30 P 0.657 -31 W 0.654 -32 S 0.661 -33 R 0.681 -34 P 0.707 -35 A 0.730 -36 S 0.742 -37 H 0.751 -38 L 0.767 -39 G 0.784 -40 R 0.791 -41 V 0.776 -42 G 0.727 -43 T 0.656 -44 A 0.614 -45 A 0.635 -46 F 0.692 -47 K 0.740 -48 G 0.761 -49 Q 0.761 -50 V 0.754 -51 P 0.755 -52 S 0.770 -53 G 0.788 -54 A 0.798 -55 T 0.798 -56 G 0.795 -57 S 0.787 -58 S 0.776 -59 T 0.767 -60 C 0.767 -61 P 0.774 -62 K 0.783 -63 I 0.787 -64 A 0.779 -65 L 0.762 -66 V 0.748 -67 P 0.749 -68 P 0.765 -69 C 0.785 -70 S 0.801 -71 T 0.809 -72 S 0.813 -73 S 0.814 -74 T 0.815 -75 T 0.816 -76 T 0.817 -77 L 0.819 -78 V 0.821 -79 G 0.823 -80 E 0.825 -81 N 0.826 -82 V 0.824 -83 S 0.820 -84 E 0.815 -85 E 0.813 -86 E 0.808 -87 A 0.803 -88 Q 0.801 -89 G 0.805 -90 I 0.810 -91 N 0.810 -92 G 0.800 -93 N 0.784 -94 R 0.773 -95 P 0.770 -96 A 0.775 -97 K 0.780 -98 H 0.781 -99 S 0.777 -100 A 0.769 -101 A 0.758 -102 S 0.747 -103 P 0.741 -104 K 0.743 -105 P 0.744 -106 Q 0.737 -107 V 0.725 -108 P 0.717 -109 P 0.719 -110 K 0.718 -111 P 0.691 -112 L 0.643 -113 H 0.622 -114 L 0.661 -115 Q 0.723 -116 N 0.761 -117 S 0.774 -118 P 0.781 -119 S 0.789 -120 S 0.794 -121 N 0.791 -122 I 0.780 -123 H 0.762 -124 Q 0.744 -125 T 0.736 -126 P 0.740 -127 R 0.753 -128 H 0.766 -129 K 0.772 -130 A 0.770 -131 L 0.766 -132 P 0.768 -133 S 0.774 -134 A 0.778 -135 K 0.782 -136 P 0.785 -137 R 0.775 -138 M 0.731 -139 E 0.660 -140 E 0.615 -141 I 0.635 -142 K 0.697 -143 P 0.752 -144 A 0.785 -145 S 0.799 -146 A 0.799 -147 S 0.794 -148 C 0.786 -149 V 0.774 -150 S 0.759 -151 K 0.745 -152 E 0.734 -153 K 0.728 -154 P 0.722 -155 S 0.710 -156 K 0.685 -157 V 0.656 -158 S 0.634 -159 D 0.607 -160 L 0.563 -161 I 0.522 -162 S 0.516 -163 R 0.552 -164 F 0.614 -165 E 0.678 -166 G 0.728 -167 G 0.754 -168 S 0.758 -169 S 0.747 -170 L 0.734 -171 S 0.726 -172 N 0.721 -173 Y 0.715 -174 S 0.715 -175 D 0.724 -176 L 0.737 -177 K 0.751 -178 K 0.768 -179 E 0.785 -180 S 0.796 -181 A 0.798 -182 V 0.795 -183 N 0.789 -184 L 0.778 -185 N 0.765 -186 A 0.757 -187 P 0.756 -188 R 0.759 -189 T 0.768 -190 P 0.784 -191 G 0.800 -192 R 0.809 -193 H 0.808 -194 G 0.799 -195 L 0.783 -196 T 0.760 -197 T 0.736 -198 T 0.719 -199 P 0.708 -200 Q 0.681 -201 Q 0.635 -202 K 0.607 -203 L 0.623 -204 L 0.639 -205 S 0.614 -206 Q 0.588 -207 H 0.617 -208 L 0.686 -209 P 0.749 -210 Q 0.789 -211 R 0.810 -212 Q 0.819 -213 G 0.822 -214 N 0.821 -215 D 0.816 -216 T 0.809 -217 D 0.806 -218 K 0.805 -219 T 0.806 -220 Q 0.802 -221 G 0.783 -222 A 0.734 -223 Q 0.665 -224 T 0.627 -225 C 0.652 -226 V 0.707 -227 A 0.743 -228 N 0.751 -229 G 0.740 -230 V 0.721 -231 M 0.707 -232 A 0.704 -233 A 0.709 -234 Q 0.718 -235 N 0.729 -236 Q 0.738 -237 M 0.746 -238 E 0.752 -239 C 0.753 -240 E 0.749 -241 E 0.744 -242 E 0.743 -243 K 0.742 -244 A 0.740 -245 A 0.736 -246 T 0.734 -247 L 0.737 -248 S 0.745 -249 S 0.751 -250 D 0.755 -251 T 0.758 -252 S 0.760 -253 I 0.758 -254 Q 0.750 -255 A 0.738 -256 S 0.723 -257 E 0.702 -258 P 0.665 -259 L 0.617 -260 L 0.595 -261 D 0.624 -262 T 0.672 -263 H 0.703 -264 I 0.721 -265 V 0.741 -266 N 0.759 -267 G 0.773 -268 E 0.782 -269 R 0.789 -270 D 0.792 -271 E 0.792 -272 T 0.788 -273 A 0.781 -274 T 0.774 -275 A 0.770 -276 P 0.768 -277 A 0.768 -278 S 0.772 -279 P 0.783 -280 T 0.798 -281 T 0.810 -282 D 0.816 -283 S 0.819 -284 C 0.823 -285 D 0.827 -286 G 0.828 -287 N 0.824 -288 A 0.815 -289 S 0.801 -290 D 0.785 -291 S 0.767 -292 S 0.745 -293 Y 0.727 -294 R 0.720 -295 T 0.726 -296 P 0.734 -297 G 0.739 -298 I 0.742 -299 G 0.746 -300 P 0.750 -301 V 0.755 -302 L 0.766 -303 P 0.778 -304 L 0.789 -305 E 0.797 -306 E 0.804 -307 R 0.806 -308 G 0.803 -309 A 0.793 -310 E 0.778 -311 T 0.762 -312 E 0.749 -313 T 0.742 -314 K 0.739 -315 V 0.737 -316 Q 0.733 -317 E 0.730 -318 R 0.727 -319 E 0.722 -320 N 0.707 -321 G 0.683 -322 E 0.662 -323 S 0.657 -324 P 0.669 -325 L 0.687 -326 E 0.699 -327 L 0.702 -328 E 0.700 -329 Q 0.698 -330 L 0.695 -331 D 0.684 -332 Q 0.661 -333 H 0.633 -334 H 0.607 -335 E 0.573 -336 M 0.506 -337 K 0.396 -338 E 0.271 -339 T 0.170 -340 N 0.112 -341 E 0.088 -342 Q 0.080 -343 K 0.073 -344 L 0.062 -345 H 0.051 -346 K 0.046 -347 I 0.047 -348 A 0.052 -349 N 0.061 -350 E 0.068 -351 L 0.068 -352 L 0.066 -353 L 0.077 -354 T 0.099 -355 E 0.117 -356 R 0.117 -357 A 0.103 -358 Y 0.086 -359 V 0.071 -360 N 0.063 -361 R 0.061 -362 L 0.060 -363 D 0.055 -364 L 0.049 -365 L 0.044 -366 D 0.043 -367 Q 0.040 -368 V 0.034 -369 F 0.026 -370 Y 0.020 -371 C 0.018 -372 K 0.020 -373 L 0.023 -374 L 0.026 -375 E 0.031 -376 E 0.038 -377 A 0.050 -378 N 0.064 -379 R 0.077 -380 G 0.084 -381 S 0.085 -382 F 0.083 -383 P 0.078 -384 A 0.067 -385 E 0.055 -386 M 0.047 -387 V 0.046 -388 N 0.048 -389 K 0.051 -390 I 0.053 -391 F 0.051 -392 S 0.049 -393 N 0.051 -394 I 0.059 -395 S 0.063 -396 S 0.062 -397 I 0.057 -398 N 0.052 -399 A 0.048 -400 F 0.048 -401 H 0.054 -402 S 0.060 -403 K 0.059 -404 F 0.053 -405 L 0.046 -406 L 0.039 -407 P 0.034 -408 E 0.031 -409 L 0.032 -410 E 0.032 -411 K 0.032 -412 R 0.031 -413 M 0.032 -414 Q 0.034 -415 E 0.035 -416 W 0.034 -417 E 0.033 -418 T 0.033 -419 T 0.033 -420 P 0.037 -421 R 0.043 -422 I 0.052 -423 G 0.059 -424 D 0.063 -425 I 0.063 -426 L 0.060 -427 Q 0.056 -428 K 0.056 -429 L 0.059 -430 A 0.063 -431 P 0.064 -432 F 0.061 -433 L 0.056 -434 K 0.050 -435 M 0.046 -436 Y 0.041 -437 G 0.039 -438 E 0.044 -439 Y 0.053 -440 V 0.061 -441 K 0.068 -442 G 0.071 -443 F 0.067 -444 D 0.059 -445 N 0.055 -446 A 0.050 -447 M 0.043 -448 E 0.037 -449 L 0.035 -450 V 0.037 -451 K 0.040 -452 N 0.044 -453 M 0.047 -454 T 0.046 -455 E 0.043 -456 R 0.041 -457 I 0.039 -458 P 0.036 -459 Q 0.032 -460 F 0.028 -461 K 0.027 -462 S 0.030 -463 V 0.035 -464 V 0.039 -465 E 0.042 -466 E 0.046 -467 I 0.052 -468 Q 0.057 -469 K 0.058 -470 Q 0.059 -471 K 0.065 -472 I 0.074 -473 C 0.080 -474 G 0.081 -475 S 0.078 -476 L 0.072 -477 T 0.067 -478 L 0.065 -479 Q 0.065 -480 H 0.073 -481 H 0.091 -482 M 0.110 -483 L 0.120 -484 E 0.122 -485 P 0.117 -486 V 0.107 -487 Q 0.099 -488 R 0.097 -489 I 0.094 -490 P 0.084 -491 R 0.069 -492 Y 0.055 -493 E 0.043 -494 M 0.035 -495 L 0.034 -496 L 0.036 -497 K 0.040 -498 D 0.042 -499 Y 0.043 -500 L 0.046 -501 R 0.052 -502 K 0.060 -503 L 0.069 -504 P 0.076 -505 P 0.081 -506 D 0.085 -507 S 0.090 -508 L 0.093 -509 D 0.089 -510 W 0.077 -511 N 0.062 -512 D 0.053 -513 A 0.051 -514 K 0.055 -515 K 0.065 -516 S 0.074 -517 L 0.083 -518 E 0.086 -519 I 0.080 -520 I 0.069 -521 S 0.058 -522 T 0.053 -523 A 0.051 -524 A 0.053 -525 S 0.058 -526 H 0.065 -527 S 0.073 -528 N 0.086 -529 S 0.105 -530 A 0.126 -531 I 0.148 -532 R 0.169 -533 K 0.180 -534 M 0.173 -535 E 0.155 -536 N 0.136 -537 L 0.117 -538 K 0.096 -539 K 0.075 -540 L 0.060 -541 L 0.053 -542 E 0.053 -543 I 0.055 -544 Y 0.059 -545 E 0.062 -546 M 0.068 -547 L 0.078 -548 G 0.090 -549 E 0.100 -550 E 0.105 -551 E 0.104 -552 D 0.099 -553 I 0.097 -554 V 0.101 -555 N 0.105 -556 P 0.101 -557 S 0.087 -558 N 0.069 -559 E 0.053 -560 L 0.041 -561 I 0.033 -562 K 0.029 -563 E 0.029 -564 G 0.029 -565 Q 0.028 -566 I 0.028 -567 L 0.034 -568 K 0.047 -569 L 0.069 -570 A 0.097 -571 A 0.125 -572 R 0.144 -573 N 0.152 -574 T 0.150 -575 S 0.139 -576 A 0.119 -577 Q 0.093 -578 E 0.067 -579 R 0.045 -580 Y 0.030 -581 L 0.023 -582 F 0.024 -583 L 0.026 -584 F 0.026 -585 N 0.023 -586 N 0.019 -587 M 0.017 -588 L 0.019 -589 L 0.026 -590 Y 0.040 -591 C 0.061 -592 V 0.081 -593 P 0.100 -594 K 0.119 -595 F 0.138 -596 S 0.153 -597 L 0.163 -598 V 0.167 -599 G 0.160 -600 S 0.136 -601 K 0.103 -602 F 0.075 -603 T 0.059 -604 V 0.054 -605 R 0.050 -606 T 0.046 -607 R 0.043 -608 V 0.039 -609 G 0.033 -610 I 0.027 -611 D 0.024 -612 G 0.025 -613 M 0.029 -614 K 0.037 -615 I 0.050 -616 V 0.067 -617 E 0.085 -618 T 0.103 -619 Q 0.116 -620 N 0.119 -621 E 0.109 -622 E 0.095 -623 Y 0.084 -624 P 0.071 -625 H 0.055 -626 T 0.038 -627 F 0.030 -628 Q 0.031 -629 V 0.041 -630 S 0.056 -631 G 0.069 -632 K 0.075 -633 E 0.074 -634 R 0.065 -635 T 0.055 -636 L 0.048 -637 E 0.047 -638 L 0.051 -639 Q 0.059 -640 A 0.072 -641 S 0.088 -642 S 0.098 -643 A 0.096 -644 Q 0.082 -645 D 0.067 -646 K 0.055 -647 E 0.048 -648 E 0.047 -649 W 0.053 -650 I 0.063 -651 K 0.068 -652 A 0.063 -653 L 0.053 -654 Q 0.046 -655 E 0.043 -656 T 0.043 -657 I 0.050 -658 D 0.061 -659 A 0.074 -660 F 0.088 -661 H 0.106 -662 Q 0.127 -663 R 0.148 -664 H 0.165 -665 E 0.183 -666 T 0.204 -667 F 0.224 -668 R 0.240 -669 N 0.258 -670 A 0.285 -671 I 0.321 -672 A 0.359 -673 K 0.397 -674 D 0.431 -675 N 0.459 -676 D 0.479 -677 I 0.492 -678 H 0.499 -679 S 0.497 -680 E 0.477 -681 V 0.445 -682 S 0.416 -683 T 0.392 -684 A 0.364 -685 E 0.323 -686 L 0.278 -687 G 0.247 -688 K 0.231 -689 R 0.216 -690 A 0.199 -691 P 0.187 -692 R 0.183 -693 W 0.180 -694 I 0.167 -695 R 0.143 -696 D 0.119 -697 N 0.105 -698 E 0.100 -699 V 0.095 -700 T 0.088 -701 M 0.079 -702 C 0.068 -703 M 0.061 -704 K 0.063 -705 C 0.074 -706 K 0.092 -707 E 0.115 -708 P 0.136 -709 F 0.148 -710 N 0.143 -711 A 0.129 -712 L 0.124 -713 T 0.136 -714 R 0.164 -715 R 0.196 -716 R 0.216 -717 H 0.210 -718 H 0.182 -719 C 0.157 -720 R 0.153 -721 A 0.162 -722 C 0.166 -723 G 0.159 -724 Y 0.142 -725 V 0.120 -726 V 0.100 -727 C 0.089 -728 W 0.087 -729 K 0.091 -730 C 0.092 -731 S 0.091 -732 D 0.089 -733 Y 0.091 -734 K 0.093 -735 A 0.092 -736 Q 0.087 -737 L 0.083 -738 E 0.083 -739 Y 0.096 -740 D 0.125 -741 G 0.161 -742 G 0.188 -743 K 0.192 -744 L 0.172 -745 S 0.138 -746 K 0.106 -747 V 0.087 -748 C 0.077 -749 K 0.068 -750 D 0.062 -751 C 0.065 -752 Y 0.078 -753 Q 0.101 -754 I 0.134 -755 I 0.182 -756 S 0.245 -757 G 0.317 -758 F 0.389 -759 T 0.452 -760 D 0.490 -761 S 0.493 -762 E 0.476 -763 E 0.457 -764 K 0.445 -765 K 0.437 -766 R 0.429 -767 K 0.415 -768 G 0.397 -769 I 0.377 -770 L 0.355 -771 E 0.331 -772 I 0.310 -773 E 0.295 -774 S 0.286 -775 A 0.276 -776 E 0.259 -777 V 0.237 -778 S 0.217 -779 G 0.197 -780 N 0.172 -781 S 0.141 -782 V 0.110 -783 V 0.085 -784 C 0.067 -785 S 0.052 -786 F 0.041 -787 L 0.035 -788 Q 0.036 -789 Y 0.044 -790 M 0.058 -791 E 0.074 -792 K 0.085 -793 S 0.090 -794 K 0.092 -795 P 0.094 -796 W 0.093 -797 Q 0.087 -798 K 0.072 -799 A 0.053 -800 W 0.039 -801 C 0.039 -802 V 0.052 -803 I 0.069 -804 P 0.079 -805 K 0.079 -806 Q 0.072 -807 D 0.068 -808 P 0.065 -809 L 0.062 -810 V 0.059 -811 L 0.060 -812 Y 0.069 -813 M 0.086 -814 Y 0.108 -815 G 0.123 -816 A 0.123 -817 P 0.114 -818 Q 0.110 -819 D 0.115 -820 V 0.126 -821 R 0.128 -822 A 0.117 -823 Q 0.098 -824 A 0.084 -825 T 0.080 -826 I 0.079 -827 P 0.075 -828 L 0.068 -829 L 0.063 -830 G 0.061 -831 Y 0.058 -832 V 0.057 -833 V 0.063 -834 D 0.080 -835 E 0.108 -836 M 0.141 -837 P 0.162 -838 R 0.162 -839 S 0.151 -840 A 0.143 -841 D 0.139 -842 L 0.134 -843 P 0.119 -844 H 0.094 -845 S 0.070 -846 F 0.054 -847 K 0.047 -848 L 0.048 -849 T 0.054 -850 Q 0.063 -851 S 0.071 -852 K 0.075 -853 S 0.075 -854 V 0.072 -855 H 0.067 -856 S 0.061 -857 F 0.059 -858 A 0.064 -859 A 0.078 -860 D 0.097 -861 S 0.110 -862 E 0.105 -863 E 0.089 -864 L 0.072 -865 K 0.060 -866 Q 0.053 -867 K 0.048 -868 W 0.046 -869 L 0.047 -870 K 0.047 -871 V 0.046 -872 I 0.050 -873 L 0.060 -874 L 0.072 -875 A 0.090 -876 V 0.129 -877 T 0.195 -878 G 0.283 -879 E 0.377 -880 T 0.463 -881 P 0.531 -882 G 0.578 -883 G 0.605 -884 P 0.617 -885 N 0.621 -886 E 0.625 -887 H 0.633 -888 P 0.645 -889 A 0.657 -890 T 0.664 -891 L 0.660 -892 D 0.637 -893 D 0.604 -894 H 0.585 -895 P 0.594 -896 E 0.624 -897 P 0.657 -898 K 0.676 -899 K 0.667 -900 K 0.624 -901 S 0.561 -902 E 0.499 -903 C 0.460 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000139132.16_ENST00000534526.7_GN:FGD4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000139132.16_ENST00000534526.7_GN:FGD4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid deleted file mode 100644 index 396a90bce8883048d75e95442ee427dd3a61f301..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000139132.16_ENST00000534526.7_GN:FGD4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid +++ /dev/null @@ -1,931 +0,0 @@ ->ENSG00000139132.16|ENST00000534526.7|GN:FGD4|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:27 -1 M 0.367 -2 Q 0.380 -3 A 0.400 -4 T 0.420 -5 P 0.433 -6 P 0.441 -7 R 0.465 -8 G 0.504 -9 R 0.517 -10 S 0.496 -11 R 0.493 -12 L 0.534 -13 D 0.571 -14 G 0.563 -15 S 0.537 -16 G 0.514 -17 R 0.475 -18 S 0.439 -19 R 0.468 -20 G 0.564 -21 A 0.653 -22 A 0.692 -23 V 0.703 -24 E 0.716 -25 P 0.737 -26 G 0.755 -27 R 0.760 -28 M 0.755 -29 S 0.749 -30 D 0.747 -31 E 0.751 -32 G 0.755 -33 G 0.754 -34 S 0.744 -35 N 0.729 -36 F 0.717 -37 R 0.716 -38 R 0.722 -39 V 0.727 -40 A 0.725 -41 I 0.715 -42 R 0.703 -43 R 0.687 -44 K 0.671 -45 S 0.666 -46 N 0.681 -47 P 0.698 -48 S 0.699 -49 Y 0.683 -50 L 0.670 -51 P 0.677 -52 P 0.700 -53 G 0.722 -54 V 0.729 -55 P 0.727 -56 R 0.724 -57 P 0.723 -58 W 0.725 -59 S 0.731 -60 R 0.744 -61 P 0.763 -62 A 0.781 -63 S 0.791 -64 H 0.799 -65 L 0.809 -66 G 0.821 -67 R 0.829 -68 V 0.829 -69 G 0.823 -70 T 0.814 -71 A 0.805 -72 A 0.799 -73 F 0.799 -74 K 0.803 -75 G 0.805 -76 Q 0.800 -77 V 0.793 -78 P 0.794 -79 S 0.804 -80 G 0.818 -81 A 0.825 -82 T 0.824 -83 G 0.820 -84 S 0.812 -85 S 0.801 -86 T 0.791 -87 C 0.787 -88 P 0.790 -89 K 0.794 -90 I 0.793 -91 A 0.782 -92 L 0.765 -93 V 0.752 -94 P 0.754 -95 P 0.769 -96 C 0.788 -97 S 0.802 -98 T 0.810 -99 S 0.813 -100 S 0.814 -101 T 0.814 -102 T 0.813 -103 T 0.812 -104 L 0.812 -105 V 0.813 -106 G 0.812 -107 E 0.812 -108 N 0.811 -109 V 0.808 -110 S 0.804 -111 E 0.800 -112 E 0.798 -113 E 0.794 -114 A 0.789 -115 Q 0.788 -116 G 0.793 -117 I 0.799 -118 N 0.799 -119 G 0.790 -120 N 0.775 -121 R 0.763 -122 P 0.760 -123 A 0.764 -124 K 0.770 -125 H 0.771 -126 S 0.767 -127 A 0.760 -128 A 0.750 -129 S 0.740 -130 P 0.737 -131 K 0.740 -132 P 0.743 -133 Q 0.738 -134 V 0.729 -135 P 0.724 -136 P 0.729 -137 K 0.730 -138 P 0.704 -139 L 0.656 -140 H 0.635 -141 L 0.675 -142 Q 0.739 -143 N 0.778 -144 S 0.791 -145 P 0.798 -146 S 0.805 -147 S 0.811 -148 N 0.809 -149 I 0.799 -150 H 0.782 -151 Q 0.765 -152 T 0.757 -153 P 0.762 -154 R 0.775 -155 H 0.788 -156 K 0.793 -157 A 0.789 -158 L 0.783 -159 P 0.783 -160 S 0.788 -161 A 0.792 -162 K 0.796 -163 P 0.803 -164 R 0.809 -165 M 0.806 -166 E 0.791 -167 E 0.774 -168 I 0.765 -169 K 0.769 -170 P 0.785 -171 A 0.802 -172 S 0.812 -173 A 0.813 -174 S 0.810 -175 C 0.802 -176 V 0.790 -177 S 0.775 -178 K 0.760 -179 E 0.747 -180 K 0.738 -181 P 0.730 -182 S 0.714 -183 K 0.686 -184 V 0.652 -185 S 0.627 -186 D 0.599 -187 L 0.557 -188 I 0.517 -189 S 0.514 -190 R 0.555 -191 F 0.621 -192 E 0.687 -193 G 0.736 -194 G 0.762 -195 S 0.766 -196 S 0.756 -197 L 0.744 -198 S 0.737 -199 N 0.729 -200 Y 0.720 -201 S 0.718 -202 D 0.726 -203 L 0.739 -204 K 0.752 -205 K 0.768 -206 E 0.783 -207 S 0.793 -208 A 0.794 -209 V 0.791 -210 N 0.786 -211 L 0.775 -212 N 0.763 -213 A 0.755 -214 P 0.754 -215 R 0.758 -216 T 0.768 -217 P 0.783 -218 G 0.800 -219 R 0.809 -220 H 0.809 -221 G 0.800 -222 L 0.784 -223 T 0.761 -224 T 0.735 -225 T 0.716 -226 P 0.703 -227 Q 0.675 -228 Q 0.628 -229 K 0.600 -230 L 0.616 -231 L 0.631 -232 S 0.606 -233 Q 0.581 -234 H 0.610 -235 L 0.679 -236 P 0.744 -237 Q 0.785 -238 R 0.807 -239 Q 0.818 -240 G 0.822 -241 N 0.821 -242 D 0.815 -243 T 0.808 -244 D 0.804 -245 K 0.803 -246 T 0.803 -247 Q 0.799 -248 G 0.779 -249 A 0.730 -250 Q 0.662 -251 T 0.624 -252 C 0.650 -253 V 0.705 -254 A 0.743 -255 N 0.752 -256 G 0.740 -257 V 0.721 -258 M 0.706 -259 A 0.702 -260 A 0.706 -261 Q 0.717 -262 N 0.729 -263 Q 0.739 -264 M 0.748 -265 E 0.754 -266 C 0.755 -267 E 0.750 -268 E 0.744 -269 E 0.742 -270 K 0.742 -271 A 0.739 -272 A 0.735 -273 T 0.733 -274 L 0.738 -275 S 0.747 -276 S 0.755 -277 D 0.760 -278 T 0.764 -279 S 0.767 -280 I 0.765 -281 Q 0.758 -282 A 0.747 -283 S 0.734 -284 E 0.727 -285 P 0.727 -286 L 0.731 -287 L 0.738 -288 D 0.740 -289 T 0.737 -290 H 0.732 -291 I 0.736 -292 V 0.749 -293 N 0.765 -294 G 0.776 -295 E 0.784 -296 R 0.790 -297 D 0.794 -298 E 0.795 -299 T 0.792 -300 A 0.785 -301 T 0.778 -302 A 0.773 -303 P 0.772 -304 A 0.773 -305 S 0.779 -306 P 0.792 -307 T 0.809 -308 T 0.822 -309 D 0.829 -310 S 0.833 -311 C 0.835 -312 D 0.837 -313 G 0.838 -314 N 0.834 -315 A 0.825 -316 S 0.812 -317 D 0.797 -318 S 0.780 -319 S 0.760 -320 Y 0.744 -321 R 0.739 -322 T 0.744 -323 P 0.752 -324 G 0.756 -325 I 0.758 -326 G 0.761 -327 P 0.764 -328 V 0.769 -329 L 0.778 -330 P 0.789 -331 L 0.800 -332 E 0.809 -333 E 0.815 -334 R 0.816 -335 G 0.811 -336 A 0.801 -337 E 0.786 -338 T 0.770 -339 E 0.757 -340 T 0.749 -341 K 0.747 -342 V 0.746 -343 Q 0.744 -344 E 0.741 -345 R 0.739 -346 E 0.734 -347 N 0.718 -348 G 0.693 -349 E 0.671 -350 S 0.664 -351 P 0.676 -352 L 0.695 -353 E 0.707 -354 L 0.708 -355 E 0.706 -356 Q 0.704 -357 L 0.701 -358 D 0.691 -359 Q 0.669 -360 H 0.641 -361 H 0.614 -362 E 0.577 -363 M 0.506 -364 K 0.394 -365 E 0.268 -366 T 0.168 -367 N 0.112 -368 E 0.090 -369 Q 0.082 -370 K 0.075 -371 L 0.064 -372 H 0.053 -373 K 0.047 -374 I 0.048 -375 A 0.055 -376 N 0.064 -377 E 0.070 -378 L 0.069 -379 L 0.067 -380 L 0.078 -381 T 0.101 -382 E 0.119 -383 R 0.119 -384 A 0.105 -385 Y 0.087 -386 V 0.072 -387 N 0.063 -388 R 0.062 -389 L 0.061 -390 D 0.056 -391 L 0.049 -392 L 0.044 -393 D 0.043 -394 Q 0.040 -395 V 0.033 -396 F 0.025 -397 Y 0.019 -398 C 0.017 -399 K 0.019 -400 L 0.022 -401 L 0.026 -402 E 0.030 -403 E 0.037 -404 A 0.048 -405 N 0.062 -406 R 0.074 -407 G 0.081 -408 S 0.082 -409 F 0.082 -410 P 0.077 -411 A 0.067 -412 E 0.055 -413 M 0.047 -414 V 0.045 -415 N 0.047 -416 K 0.051 -417 I 0.053 -418 F 0.051 -419 S 0.048 -420 N 0.051 -421 I 0.058 -422 S 0.063 -423 S 0.062 -424 I 0.057 -425 N 0.053 -426 A 0.048 -427 F 0.048 -428 H 0.054 -429 S 0.060 -430 K 0.059 -431 F 0.053 -432 L 0.046 -433 L 0.039 -434 P 0.034 -435 E 0.031 -436 L 0.032 -437 E 0.033 -438 K 0.032 -439 R 0.032 -440 M 0.033 -441 Q 0.036 -442 E 0.037 -443 W 0.036 -444 E 0.034 -445 T 0.034 -446 T 0.035 -447 P 0.038 -448 R 0.045 -449 I 0.053 -450 G 0.061 -451 D 0.065 -452 I 0.065 -453 L 0.061 -454 Q 0.057 -455 K 0.056 -456 L 0.060 -457 A 0.064 -458 P 0.065 -459 F 0.062 -460 L 0.057 -461 K 0.051 -462 M 0.046 -463 Y 0.042 -464 G 0.040 -465 E 0.046 -466 Y 0.054 -467 V 0.063 -468 K 0.070 -469 G 0.073 -470 F 0.068 -471 D 0.061 -472 N 0.056 -473 A 0.051 -474 M 0.044 -475 E 0.038 -476 L 0.036 -477 V 0.038 -478 K 0.041 -479 N 0.045 -480 M 0.049 -481 T 0.048 -482 E 0.045 -483 R 0.043 -484 I 0.041 -485 P 0.038 -486 Q 0.033 -487 F 0.029 -488 K 0.028 -489 S 0.031 -490 V 0.036 -491 V 0.040 -492 E 0.043 -493 E 0.047 -494 I 0.054 -495 Q 0.058 -496 K 0.059 -497 Q 0.061 -498 K 0.067 -499 I 0.075 -500 C 0.082 -501 G 0.083 -502 S 0.079 -503 L 0.073 -504 T 0.068 -505 L 0.066 -506 Q 0.067 -507 H 0.075 -508 H 0.093 -509 M 0.112 -510 L 0.123 -511 E 0.125 -512 P 0.120 -513 V 0.111 -514 Q 0.102 -515 R 0.100 -516 I 0.096 -517 P 0.086 -518 R 0.071 -519 Y 0.056 -520 E 0.044 -521 M 0.036 -522 L 0.035 -523 L 0.037 -524 K 0.040 -525 D 0.042 -526 Y 0.044 -527 L 0.047 -528 R 0.052 -529 K 0.061 -530 L 0.070 -531 P 0.077 -532 P 0.082 -533 D 0.086 -534 S 0.090 -535 L 0.093 -536 D 0.089 -537 W 0.076 -538 N 0.062 -539 D 0.053 -540 A 0.051 -541 K 0.056 -542 K 0.066 -543 S 0.076 -544 L 0.084 -545 E 0.087 -546 I 0.082 -547 I 0.070 -548 S 0.060 -549 T 0.055 -550 A 0.053 -551 A 0.054 -552 S 0.058 -553 H 0.065 -554 S 0.074 -555 N 0.087 -556 S 0.106 -557 A 0.129 -558 I 0.151 -559 R 0.172 -560 K 0.183 -561 M 0.176 -562 E 0.158 -563 N 0.139 -564 L 0.119 -565 K 0.097 -566 K 0.076 -567 L 0.061 -568 L 0.053 -569 E 0.053 -570 I 0.056 -571 Y 0.059 -572 E 0.062 -573 M 0.068 -574 L 0.079 -575 G 0.090 -576 E 0.101 -577 E 0.106 -578 E 0.105 -579 D 0.100 -580 I 0.098 -581 V 0.102 -582 N 0.106 -583 P 0.102 -584 S 0.089 -585 N 0.071 -586 E 0.054 -587 L 0.041 -588 I 0.033 -589 K 0.030 -590 E 0.029 -591 G 0.029 -592 Q 0.028 -593 I 0.029 -594 L 0.034 -595 K 0.048 -596 L 0.070 -597 A 0.099 -598 A 0.127 -599 R 0.146 -600 N 0.154 -601 T 0.151 -602 S 0.140 -603 A 0.120 -604 Q 0.094 -605 E 0.068 -606 R 0.046 -607 Y 0.030 -608 L 0.023 -609 F 0.024 -610 L 0.027 -611 F 0.027 -612 N 0.023 -613 N 0.019 -614 M 0.017 -615 L 0.019 -616 L 0.026 -617 Y 0.041 -618 C 0.062 -619 V 0.083 -620 P 0.102 -621 K 0.121 -622 F 0.140 -623 S 0.156 -624 L 0.166 -625 V 0.170 -626 G 0.162 -627 S 0.138 -628 K 0.104 -629 F 0.075 -630 T 0.060 -631 V 0.054 -632 R 0.050 -633 T 0.046 -634 R 0.043 -635 V 0.039 -636 G 0.033 -637 I 0.027 -638 D 0.024 -639 G 0.025 -640 M 0.030 -641 K 0.038 -642 I 0.050 -643 V 0.067 -644 E 0.086 -645 T 0.104 -646 Q 0.117 -647 N 0.119 -648 E 0.110 -649 E 0.096 -650 Y 0.084 -651 P 0.071 -652 H 0.055 -653 T 0.039 -654 F 0.030 -655 Q 0.031 -656 V 0.041 -657 S 0.056 -658 G 0.069 -659 K 0.075 -660 E 0.074 -661 R 0.065 -662 T 0.055 -663 L 0.049 -664 E 0.048 -665 L 0.052 -666 Q 0.060 -667 A 0.073 -668 S 0.088 -669 S 0.099 -670 A 0.096 -671 Q 0.083 -672 D 0.067 -673 K 0.055 -674 E 0.049 -675 E 0.048 -676 W 0.053 -677 I 0.063 -678 K 0.069 -679 A 0.063 -680 L 0.053 -681 Q 0.047 -682 E 0.043 -683 T 0.044 -684 I 0.050 -685 D 0.062 -686 A 0.075 -687 F 0.090 -688 H 0.108 -689 Q 0.129 -690 R 0.150 -691 H 0.167 -692 E 0.186 -693 T 0.207 -694 F 0.229 -695 R 0.247 -696 N 0.266 -697 A 0.292 -698 I 0.326 -699 A 0.363 -700 K 0.400 -701 D 0.434 -702 N 0.462 -703 D 0.482 -704 I 0.494 -705 H 0.501 -706 S 0.499 -707 E 0.480 -708 V 0.448 -709 S 0.419 -710 T 0.396 -711 A 0.367 -712 E 0.325 -713 L 0.280 -714 G 0.249 -715 K 0.232 -716 R 0.218 -717 A 0.201 -718 P 0.188 -719 R 0.184 -720 W 0.181 -721 I 0.169 -722 R 0.145 -723 D 0.120 -724 N 0.107 -725 E 0.101 -726 V 0.096 -727 T 0.089 -728 M 0.079 -729 C 0.069 -730 M 0.062 -731 K 0.064 -732 C 0.076 -733 K 0.094 -734 E 0.116 -735 P 0.138 -736 F 0.149 -737 N 0.144 -738 A 0.130 -739 L 0.124 -740 T 0.137 -741 R 0.166 -742 R 0.198 -743 R 0.219 -744 H 0.213 -745 H 0.185 -746 C 0.159 -747 R 0.155 -748 A 0.164 -749 C 0.168 -750 G 0.161 -751 Y 0.143 -752 V 0.121 -753 V 0.101 -754 C 0.089 -755 W 0.088 -756 K 0.092 -757 C 0.093 -758 S 0.091 -759 D 0.090 -760 Y 0.091 -761 K 0.094 -762 A 0.093 -763 Q 0.089 -764 L 0.084 -765 E 0.084 -766 Y 0.097 -767 D 0.127 -768 G 0.164 -769 G 0.191 -770 K 0.195 -771 L 0.175 -772 S 0.139 -773 K 0.107 -774 V 0.088 -775 C 0.077 -776 K 0.069 -777 D 0.063 -778 C 0.065 -779 Y 0.079 -780 Q 0.102 -781 I 0.135 -782 I 0.183 -783 S 0.246 -784 G 0.317 -785 F 0.389 -786 T 0.451 -787 D 0.488 -788 S 0.491 -789 E 0.474 -790 E 0.455 -791 K 0.443 -792 K 0.436 -793 R 0.428 -794 K 0.414 -795 G 0.395 -796 I 0.376 -797 L 0.355 -798 E 0.333 -799 I 0.313 -800 E 0.300 -801 S 0.292 -802 A 0.283 -803 E 0.266 -804 V 0.244 -805 S 0.222 -806 G 0.200 -807 N 0.174 -808 S 0.143 -809 V 0.111 -810 V 0.085 -811 C 0.067 -812 S 0.052 -813 F 0.041 -814 L 0.035 -815 Q 0.036 -816 Y 0.044 -817 M 0.058 -818 E 0.074 -819 K 0.085 -820 S 0.090 -821 K 0.092 -822 P 0.094 -823 W 0.094 -824 Q 0.088 -825 K 0.073 -826 A 0.053 -827 W 0.040 -828 C 0.039 -829 V 0.052 -830 I 0.069 -831 P 0.080 -832 K 0.079 -833 Q 0.072 -834 D 0.068 -835 P 0.065 -836 L 0.062 -837 V 0.059 -838 L 0.060 -839 Y 0.069 -840 M 0.086 -841 Y 0.108 -842 G 0.123 -843 A 0.123 -844 P 0.115 -845 Q 0.111 -846 D 0.116 -847 V 0.127 -848 R 0.129 -849 A 0.117 -850 Q 0.099 -851 A 0.085 -852 T 0.080 -853 I 0.079 -854 P 0.075 -855 L 0.068 -856 L 0.063 -857 G 0.061 -858 Y 0.058 -859 V 0.058 -860 V 0.063 -861 D 0.080 -862 E 0.109 -863 M 0.142 -864 P 0.163 -865 R 0.163 -866 S 0.153 -867 A 0.144 -868 D 0.140 -869 L 0.134 -870 P 0.119 -871 H 0.095 -872 S 0.070 -873 F 0.054 -874 K 0.047 -875 L 0.048 -876 T 0.054 -877 Q 0.063 -878 S 0.071 -879 K 0.075 -880 S 0.075 -881 V 0.072 -882 H 0.067 -883 S 0.061 -884 F 0.059 -885 A 0.064 -886 A 0.078 -887 D 0.097 -888 S 0.109 -889 E 0.105 -890 E 0.089 -891 L 0.071 -892 K 0.060 -893 Q 0.053 -894 K 0.047 -895 W 0.046 -896 L 0.047 -897 K 0.047 -898 V 0.046 -899 I 0.050 -900 L 0.060 -901 L 0.072 -902 A 0.090 -903 V 0.129 -904 T 0.195 -905 G 0.282 -906 E 0.376 -907 T 0.463 -908 P 0.531 -909 G 0.577 -910 G 0.604 -911 P 0.616 -912 N 0.620 -913 E 0.624 -914 H 0.631 -915 P 0.641 -916 A 0.652 -917 T 0.659 -918 L 0.654 -919 D 0.631 -920 D 0.599 -921 H 0.580 -922 P 0.590 -923 E 0.621 -924 P 0.653 -925 K 0.672 -926 K 0.661 -927 K 0.616 -928 S 0.552 -929 E 0.489 -930 C 0.450 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000139800.9_ENST00000267294.5_GN:ZIC5_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000139800.9_ENST00000267294.5_GN:ZIC5_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 14120b6214d783bce8990fce7f422cef6a39c3df..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000139800.9_ENST00000267294.5_GN:ZIC5_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,640 +0,0 @@ ->ENSG00000139800.9|ENST00000267294.5|GN:ZIC5|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.419 -2 E 0.453 -3 P 0.508 -4 P 0.566 -5 L 0.608 -6 S 0.629 -7 K 0.635 -8 R 0.637 -9 N 0.645 -10 P 0.664 -11 P 0.691 -12 A 0.709 -13 L 0.708 -14 R 0.702 -15 L 0.706 -16 A 0.719 -17 D 0.729 -18 L 0.736 -19 A 0.742 -20 T 0.743 -21 A 0.740 -22 Q 0.739 -23 V 0.742 -24 Q 0.750 -25 P 0.762 -26 L 0.777 -27 Q 0.788 -28 N 0.789 -29 M 0.782 -30 T 0.772 -31 G 0.765 -32 F 0.766 -33 P 0.778 -34 A 0.788 -35 L 0.782 -36 A 0.759 -37 G 0.736 -38 P 0.732 -39 P 0.749 -40 A 0.771 -41 H 0.780 -42 S 0.774 -43 Q 0.752 -44 L 0.703 -45 R 0.637 -46 A 0.597 -47 A 0.615 -48 V 0.662 -49 A 0.697 -50 H 0.714 -51 L 0.724 -52 R 0.740 -53 L 0.760 -54 R 0.778 -55 D 0.788 -56 L 0.791 -57 G 0.790 -58 A 0.791 -59 D 0.796 -60 P 0.806 -61 G 0.822 -62 V 0.835 -63 A 0.835 -64 T 0.820 -65 T 0.802 -66 P 0.793 -67 L 0.789 -68 G 0.786 -69 P 0.783 -70 E 0.771 -71 H 0.734 -72 M 0.675 -73 A 0.645 -74 Q 0.668 -75 A 0.690 -76 S 0.666 -77 T 0.643 -78 L 0.674 -79 G 0.731 -80 L 0.766 -81 S 0.776 -82 P 0.784 -83 P 0.800 -84 S 0.817 -85 Q 0.824 -86 A 0.818 -87 F 0.808 -88 P 0.799 -89 A 0.793 -90 H 0.788 -91 P 0.787 -92 E 0.790 -93 A 0.796 -94 P 0.801 -95 A 0.801 -96 A 0.783 -97 A 0.733 -98 A 0.665 -99 R 0.631 -100 A 0.666 -101 A 0.731 -102 A 0.773 -103 L 0.781 -104 V 0.769 -105 A 0.753 -106 H 0.748 -107 P 0.762 -108 G 0.787 -109 A 0.807 -110 G 0.810 -111 S 0.802 -112 Y 0.799 -113 P 0.807 -114 C 0.820 -115 G 0.830 -116 G 0.835 -117 G 0.837 -118 S 0.835 -119 S 0.832 -120 G 0.825 -121 A 0.814 -122 Q 0.800 -123 P 0.786 -124 S 0.765 -125 A 0.728 -126 P 0.668 -127 P 0.602 -128 P 0.578 -129 P 0.614 -130 A 0.672 -131 P 0.705 -132 P 0.712 -133 L 0.712 -134 P 0.714 -135 P 0.717 -136 T 0.718 -137 P 0.713 -138 S 0.703 -139 P 0.692 -140 P 0.685 -141 P 0.683 -142 P 0.685 -143 P 0.690 -144 P 0.692 -145 P 0.691 -146 P 0.698 -147 P 0.720 -148 P 0.756 -149 P 0.792 -150 A 0.818 -151 L 0.832 -152 S 0.837 -153 G 0.839 -154 Y 0.840 -155 T 0.841 -156 T 0.840 -157 T 0.838 -158 N 0.836 -159 S 0.835 -160 G 0.837 -161 G 0.840 -162 G 0.842 -163 G 0.841 -164 S 0.836 -165 S 0.831 -166 G 0.827 -167 K 0.823 -168 G 0.815 -169 H 0.805 -170 S 0.797 -171 R 0.792 -172 D 0.789 -173 F 0.787 -174 V 0.787 -175 L 0.792 -176 R 0.798 -177 R 0.803 -178 D 0.803 -179 L 0.799 -180 S 0.797 -181 A 0.795 -182 T 0.793 -183 A 0.795 -184 P 0.807 -185 A 0.825 -186 A 0.838 -187 A 0.840 -188 M 0.835 -189 H 0.828 -190 G 0.822 -191 A 0.822 -192 P 0.829 -193 L 0.836 -194 G 0.825 -195 G 0.779 -196 E 0.707 -197 Q 0.667 -198 R 0.699 -199 S 0.764 -200 G 0.808 -201 T 0.821 -202 G 0.816 -203 S 0.804 -204 P 0.791 -205 Q 0.778 -206 H 0.766 -207 P 0.753 -208 A 0.740 -209 P 0.733 -210 P 0.739 -211 P 0.758 -212 H 0.780 -213 S 0.798 -214 A 0.810 -215 G 0.820 -216 M 0.827 -217 F 0.830 -218 I 0.830 -219 S 0.828 -220 A 0.827 -221 S 0.827 -222 G 0.829 -223 T 0.829 -224 Y 0.823 -225 A 0.813 -226 G 0.805 -227 P 0.805 -228 D 0.812 -229 G 0.818 -230 S 0.817 -231 G 0.810 -232 G 0.804 -233 P 0.800 -234 A 0.792 -235 L 0.783 -236 F 0.781 -237 P 0.792 -238 A 0.803 -239 L 0.805 -240 H 0.799 -241 D 0.792 -242 T 0.788 -243 P 0.790 -244 G 0.795 -245 A 0.800 -246 P 0.802 -247 G 0.797 -248 G 0.781 -249 H 0.757 -250 P 0.738 -251 H 0.736 -252 P 0.750 -253 L 0.767 -254 N 0.776 -255 G 0.776 -256 Q 0.772 -257 M 0.765 -258 R 0.756 -259 L 0.739 -260 G 0.701 -261 L 0.631 -262 A 0.532 -263 A 0.433 -264 A 0.369 -265 A 0.347 -266 A 0.358 -267 A 0.385 -268 A 0.413 -269 A 0.436 -270 A 0.452 -271 E 0.469 -272 L 0.498 -273 Y 0.542 -274 G 0.592 -275 R 0.628 -276 A 0.642 -277 E 0.644 -278 P 0.652 -279 P 0.675 -280 F 0.705 -281 A 0.728 -282 P 0.746 -283 R 0.761 -284 S 0.769 -285 G 0.764 -286 D 0.749 -287 A 0.727 -288 H 0.693 -289 Y 0.637 -290 G 0.569 -291 A 0.495 -292 V 0.410 -293 A 0.325 -294 A 0.269 -295 A 0.253 -296 A 0.257 -297 A 0.268 -298 A 0.289 -299 A 0.328 -300 L 0.384 -301 H 0.453 -302 G 0.528 -303 Y 0.593 -304 G 0.644 -305 A 0.681 -306 V 0.703 -307 N 0.710 -308 L 0.709 -309 N 0.706 -310 L 0.697 -311 N 0.664 -312 L 0.606 -313 A 0.554 -314 A 0.533 -315 A 0.536 -316 A 0.552 -317 A 0.582 -318 A 0.618 -319 A 0.638 -320 A 0.636 -321 A 0.628 -322 G 0.637 -323 P 0.670 -324 G 0.714 -325 P 0.748 -326 H 0.767 -327 L 0.767 -328 Q 0.751 -329 H 0.720 -330 H 0.675 -331 A 0.612 -332 P 0.550 -333 P 0.525 -334 P 0.548 -335 A 0.580 -336 P 0.593 -337 P 0.600 -338 P 0.620 -339 P 0.654 -340 P 0.696 -341 A 0.738 -342 P 0.767 -343 A 0.776 -344 Q 0.773 -345 H 0.770 -346 P 0.773 -347 H 0.775 -348 Q 0.771 -349 H 0.764 -350 H 0.763 -351 P 0.770 -352 H 0.780 -353 L 0.790 -354 P 0.798 -355 G 0.798 -356 A 0.787 -357 A 0.762 -358 G 0.727 -359 A 0.684 -360 F 0.627 -361 L 0.564 -362 R 0.518 -363 Y 0.507 -364 M 0.521 -365 R 0.540 -366 Q 0.551 -367 P 0.540 -368 I 0.490 -369 K 0.403 -370 Q 0.300 -371 E 0.205 -372 L 0.132 -373 I 0.089 -374 C 0.073 -375 K 0.083 -376 W 0.117 -377 I 0.169 -378 D 0.237 -379 P 0.330 -380 D 0.439 -381 E 0.529 -382 L 0.571 -383 A 0.565 -384 G 0.528 -385 L 0.484 -386 P 0.455 -387 P 0.448 -388 P 0.449 -389 P 0.446 -390 P 0.437 -391 P 0.426 -392 P 0.411 -393 P 0.391 -394 P 0.376 -395 P 0.376 -396 P 0.393 -397 P 0.428 -398 P 0.481 -399 P 0.549 -400 P 0.609 -401 A 0.633 -402 G 0.597 -403 G 0.507 -404 A 0.387 -405 K 0.274 -406 P 0.187 -407 C 0.129 -408 S 0.098 -409 K 0.090 -410 T 0.097 -411 F 0.105 -412 G 0.103 -413 T 0.097 -414 M 0.096 -415 H 0.100 -416 E 0.105 -417 L 0.108 -418 V 0.102 -419 N 0.087 -420 H 0.070 -421 V 0.058 -422 T 0.053 -423 V 0.052 -424 E 0.057 -425 H 0.074 -426 V 0.108 -427 G 0.154 -428 G 0.198 -429 P 0.219 -430 E 0.210 -431 Q 0.177 -432 S 0.135 -433 S 0.100 -434 H 0.077 -435 V 0.063 -436 C 0.055 -437 F 0.053 -438 W 0.055 -439 E 0.060 -440 D 0.064 -441 C 0.067 -442 P 0.072 -443 R 0.083 -444 E 0.097 -445 G 0.112 -446 K 0.125 -447 P 0.130 -448 F 0.123 -449 K 0.105 -450 A 0.091 -451 K 0.092 -452 Y 0.108 -453 K 0.128 -454 L 0.138 -455 I 0.129 -456 N 0.113 -457 H 0.102 -458 I 0.104 -459 R 0.111 -460 V 0.116 -461 H 0.125 -462 T 0.145 -463 G 0.168 -464 E 0.176 -465 K 0.165 -466 P 0.149 -467 F 0.144 -468 P 0.148 -469 C 0.153 -470 P 0.161 -471 F 0.166 -472 P 0.160 -473 G 0.146 -474 C 0.136 -475 G 0.136 -476 K 0.145 -477 V 0.158 -478 F 0.167 -479 A 0.167 -480 R 0.167 -481 S 0.182 -482 E 0.215 -483 N 0.240 -484 L 0.231 -485 K 0.194 -486 I 0.156 -487 H 0.140 -488 K 0.150 -489 R 0.172 -490 T 0.194 -491 H 0.217 -492 T 0.243 -493 G 0.260 -494 E 0.252 -495 K 0.217 -496 P 0.175 -497 F 0.144 -498 K 0.128 -499 C 0.127 -500 E 0.138 -501 F 0.148 -502 D 0.144 -503 G 0.124 -504 C 0.103 -505 D 0.100 -506 R 0.121 -507 K 0.160 -508 F 0.193 -509 A 0.204 -510 N 0.202 -511 S 0.205 -512 S 0.217 -513 D 0.227 -514 R 0.229 -515 K 0.227 -516 K 0.224 -517 H 0.222 -518 S 0.225 -519 H 0.226 -520 V 0.227 -521 H 0.233 -522 T 0.244 -523 S 0.254 -524 D 0.253 -525 K 0.234 -526 P 0.198 -527 Y 0.157 -528 Y 0.131 -529 C 0.126 -530 K 0.140 -531 I 0.157 -532 R 0.159 -533 G 0.144 -534 C 0.126 -535 D 0.120 -536 K 0.128 -537 S 0.140 -538 Y 0.150 -539 T 0.156 -540 H 0.156 -541 P 0.145 -542 S 0.128 -543 S 0.114 -544 L 0.108 -545 R 0.107 -546 K 0.103 -547 H 0.093 -548 M 0.084 -549 K 0.089 -550 I 0.120 -551 H 0.188 -552 C 0.287 -553 K 0.387 -554 S 0.467 -555 P 0.531 -556 P 0.586 -557 P 0.633 -558 S 0.668 -559 P 0.691 -560 G 0.707 -561 P 0.721 -562 L 0.732 -563 G 0.737 -564 Y 0.738 -565 S 0.741 -566 S 0.744 -567 V 0.739 -568 G 0.728 -569 T 0.722 -570 P 0.728 -571 V 0.737 -572 G 0.738 -573 A 0.731 -574 P 0.724 -575 L 0.721 -576 S 0.728 -577 P 0.740 -578 V 0.747 -579 L 0.744 -580 D 0.737 -581 P 0.731 -582 A 0.734 -583 R 0.750 -584 S 0.772 -585 H 0.789 -586 S 0.796 -587 S 0.792 -588 T 0.777 -589 L 0.758 -590 S 0.745 -591 P 0.739 -592 Q 0.731 -593 V 0.709 -594 T 0.671 -595 N 0.619 -596 L 0.560 -597 N 0.503 -598 E 0.461 -599 W 0.460 -600 Y 0.511 -601 V 0.584 -602 C 0.643 -603 Q 0.679 -604 A 0.699 -605 S 0.708 -606 G 0.707 -607 A 0.705 -608 P 0.710 -609 S 0.715 -610 H 0.712 -611 L 0.700 -612 H 0.685 -613 T 0.674 -614 P 0.655 -615 S 0.624 -616 S 0.615 -617 N 0.657 -618 G 0.718 -619 T 0.754 -620 T 0.760 -621 S 0.751 -622 E 0.734 -623 T 0.705 -624 E 0.657 -625 D 0.593 -626 E 0.527 -627 E 0.467 -628 I 0.417 -629 Y 0.379 -630 G 0.353 -631 N 0.330 -632 P 0.304 -633 E 0.270 -634 V 0.232 -635 V 0.205 -636 R 0.198 -637 T 0.199 -638 I 0.196 -639 H 0.192 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000139800.9_ENST00000267294.5_GN:ZIC5_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000139800.9_ENST00000267294.5_GN:ZIC5_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid deleted file mode 100644 index 6ec460ca5cea9a7f9716ce872ff2efbca159de63..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000139800.9_ENST00000267294.5_GN:ZIC5_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid +++ /dev/null @@ -1,664 +0,0 @@ ->ENSG00000139800.9|ENST00000267294.5|GN:ZIC5|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:24 -1 M 0.422 -2 F 0.485 -3 L 0.569 -4 K 0.634 -5 A 0.666 -6 G 0.670 -7 R 0.664 -8 G 0.663 -9 N 0.663 -10 K 0.662 -11 V 0.671 -12 P 0.699 -13 P 0.731 -14 V 0.748 -15 R 0.742 -16 V 0.720 -17 Y 0.689 -18 G 0.665 -19 P 0.660 -20 D 0.674 -21 C 0.697 -22 V 0.723 -23 V 0.739 -24 L 0.732 -25 M 0.699 -26 E 0.667 -27 P 0.662 -28 P 0.684 -29 L 0.709 -30 S 0.717 -31 K 0.703 -32 R 0.678 -33 N 0.668 -34 P 0.692 -35 P 0.736 -36 A 0.766 -37 L 0.768 -38 R 0.757 -39 L 0.750 -40 A 0.750 -41 D 0.756 -42 L 0.762 -43 A 0.760 -44 T 0.745 -45 A 0.731 -46 Q 0.730 -47 V 0.741 -48 Q 0.760 -49 P 0.779 -50 L 0.796 -51 Q 0.805 -52 N 0.806 -53 M 0.799 -54 T 0.790 -55 G 0.784 -56 F 0.789 -57 P 0.801 -58 A 0.808 -59 L 0.799 -60 A 0.774 -61 G 0.749 -62 P 0.745 -63 P 0.763 -64 A 0.785 -65 H 0.796 -66 S 0.798 -67 Q 0.797 -68 L 0.795 -69 R 0.789 -70 A 0.776 -71 A 0.756 -72 V 0.739 -73 A 0.734 -74 H 0.738 -75 L 0.746 -76 R 0.757 -77 L 0.772 -78 R 0.785 -79 D 0.790 -80 L 0.790 -81 G 0.786 -82 A 0.785 -83 D 0.787 -84 P 0.795 -85 G 0.810 -86 V 0.825 -87 A 0.826 -88 T 0.811 -89 T 0.793 -90 P 0.782 -91 L 0.775 -92 G 0.770 -93 P 0.765 -94 E 0.753 -95 H 0.716 -96 M 0.660 -97 A 0.631 -98 Q 0.653 -99 A 0.674 -100 S 0.651 -101 T 0.628 -102 L 0.657 -103 G 0.711 -104 L 0.742 -105 S 0.749 -106 P 0.755 -107 P 0.772 -108 S 0.789 -109 Q 0.796 -110 A 0.791 -111 F 0.779 -112 P 0.769 -113 A 0.762 -114 H 0.758 -115 P 0.759 -116 E 0.766 -117 A 0.774 -118 P 0.780 -119 A 0.780 -120 A 0.761 -121 A 0.712 -122 A 0.645 -123 R 0.612 -124 A 0.646 -125 A 0.711 -126 A 0.755 -127 L 0.765 -128 V 0.756 -129 A 0.744 -130 H 0.742 -131 P 0.758 -132 G 0.785 -133 A 0.805 -134 G 0.809 -135 S 0.804 -136 Y 0.803 -137 P 0.812 -138 C 0.826 -139 G 0.837 -140 G 0.843 -141 G 0.845 -142 S 0.844 -143 S 0.842 -144 G 0.835 -145 A 0.824 -146 Q 0.810 -147 P 0.795 -148 S 0.773 -149 A 0.734 -150 P 0.673 -151 P 0.605 -152 P 0.570 -153 P 0.584 -154 A 0.608 -155 P 0.624 -156 P 0.650 -157 L 0.685 -158 P 0.712 -159 P 0.723 -160 T 0.724 -161 P 0.717 -162 S 0.705 -163 P 0.691 -164 P 0.681 -165 P 0.676 -166 P 0.674 -167 P 0.675 -168 P 0.676 -169 P 0.677 -170 P 0.687 -171 P 0.715 -172 P 0.756 -173 P 0.795 -174 A 0.824 -175 L 0.838 -176 S 0.843 -177 G 0.843 -178 Y 0.843 -179 T 0.843 -180 T 0.842 -181 T 0.839 -182 N 0.837 -183 S 0.836 -184 G 0.837 -185 G 0.840 -186 G 0.842 -187 G 0.841 -188 S 0.836 -189 S 0.831 -190 G 0.827 -191 K 0.822 -192 G 0.815 -193 H 0.805 -194 S 0.798 -195 R 0.795 -196 D 0.793 -197 F 0.792 -198 V 0.792 -199 L 0.795 -200 R 0.799 -201 R 0.802 -202 D 0.801 -203 L 0.797 -204 S 0.793 -205 A 0.792 -206 T 0.791 -207 A 0.794 -208 P 0.807 -209 A 0.826 -210 A 0.839 -211 A 0.840 -212 M 0.835 -213 H 0.827 -214 G 0.820 -215 A 0.819 -216 P 0.824 -217 L 0.829 -218 G 0.818 -219 G 0.771 -220 E 0.699 -221 Q 0.659 -222 R 0.688 -223 S 0.751 -224 G 0.794 -225 T 0.806 -226 G 0.803 -227 S 0.793 -228 P 0.780 -229 Q 0.767 -230 H 0.755 -231 P 0.742 -232 A 0.730 -233 P 0.723 -234 P 0.729 -235 P 0.747 -236 H 0.767 -237 S 0.784 -238 A 0.797 -239 G 0.807 -240 M 0.815 -241 F 0.819 -242 I 0.819 -243 S 0.815 -244 A 0.812 -245 S 0.812 -246 G 0.816 -247 T 0.818 -248 Y 0.814 -249 A 0.804 -250 G 0.797 -251 P 0.798 -252 D 0.806 -253 G 0.812 -254 S 0.810 -255 G 0.803 -256 G 0.797 -257 P 0.792 -258 A 0.784 -259 L 0.773 -260 F 0.772 -261 P 0.783 -262 A 0.796 -263 L 0.799 -264 H 0.794 -265 D 0.788 -266 T 0.785 -267 P 0.786 -268 G 0.791 -269 A 0.795 -270 P 0.796 -271 G 0.791 -272 G 0.774 -273 H 0.749 -274 P 0.729 -275 H 0.727 -276 P 0.741 -277 L 0.758 -278 N 0.768 -279 G 0.771 -280 Q 0.769 -281 M 0.765 -282 R 0.756 -283 L 0.735 -284 G 0.690 -285 L 0.613 -286 A 0.510 -287 A 0.410 -288 A 0.347 -289 A 0.329 -290 A 0.347 -291 A 0.379 -292 A 0.408 -293 A 0.433 -294 A 0.458 -295 E 0.486 -296 L 0.521 -297 Y 0.564 -298 G 0.609 -299 R 0.642 -300 A 0.657 -301 E 0.661 -302 P 0.670 -303 P 0.694 -304 F 0.722 -305 A 0.744 -306 P 0.759 -307 R 0.772 -308 S 0.780 -309 G 0.776 -310 D 0.764 -311 A 0.746 -312 H 0.711 -313 Y 0.654 -314 G 0.584 -315 A 0.506 -316 V 0.418 -317 A 0.329 -318 A 0.270 -319 A 0.252 -320 A 0.258 -321 A 0.274 -322 A 0.305 -323 A 0.353 -324 L 0.415 -325 H 0.485 -326 G 0.555 -327 Y 0.616 -328 G 0.663 -329 A 0.698 -330 V 0.720 -331 N 0.727 -332 L 0.725 -333 N 0.721 -334 L 0.708 -335 N 0.669 -336 L 0.604 -337 A 0.547 -338 A 0.523 -339 A 0.525 -340 A 0.543 -341 A 0.577 -342 A 0.617 -343 A 0.641 -344 A 0.641 -345 A 0.633 -346 G 0.642 -347 P 0.675 -348 G 0.718 -349 P 0.752 -350 H 0.770 -351 L 0.771 -352 Q 0.756 -353 H 0.727 -354 H 0.682 -355 A 0.619 -356 P 0.556 -357 P 0.530 -358 P 0.553 -359 A 0.585 -360 P 0.598 -361 P 0.606 -362 P 0.627 -363 P 0.660 -364 P 0.699 -365 A 0.738 -366 P 0.764 -367 A 0.773 -368 Q 0.771 -369 H 0.769 -370 P 0.772 -371 H 0.774 -372 Q 0.770 -373 H 0.762 -374 H 0.760 -375 P 0.767 -376 H 0.777 -377 L 0.787 -378 P 0.795 -379 G 0.796 -380 A 0.784 -381 A 0.759 -382 G 0.721 -383 A 0.672 -384 F 0.612 -385 L 0.551 -386 R 0.508 -387 Y 0.500 -388 M 0.518 -389 R 0.539 -390 Q 0.549 -391 P 0.536 -392 I 0.483 -393 K 0.395 -394 Q 0.292 -395 E 0.200 -396 L 0.131 -397 I 0.091 -398 C 0.076 -399 K 0.087 -400 W 0.122 -401 I 0.174 -402 D 0.240 -403 P 0.330 -404 D 0.437 -405 E 0.525 -406 L 0.565 -407 A 0.559 -408 G 0.526 -409 L 0.487 -410 P 0.462 -411 P 0.457 -412 P 0.460 -413 P 0.458 -414 P 0.450 -415 P 0.439 -416 P 0.423 -417 P 0.404 -418 P 0.390 -419 P 0.390 -420 P 0.409 -421 P 0.446 -422 P 0.498 -423 P 0.562 -424 P 0.616 -425 A 0.635 -426 G 0.600 -427 G 0.511 -428 A 0.393 -429 K 0.281 -430 P 0.194 -431 C 0.136 -432 S 0.103 -433 K 0.094 -434 T 0.099 -435 F 0.105 -436 G 0.103 -437 T 0.096 -438 M 0.094 -439 H 0.098 -440 E 0.104 -441 L 0.107 -442 V 0.101 -443 N 0.086 -444 H 0.069 -445 V 0.057 -446 T 0.053 -447 V 0.053 -448 E 0.059 -449 H 0.078 -450 V 0.115 -451 G 0.164 -452 G 0.209 -453 P 0.231 -454 E 0.221 -455 Q 0.185 -456 S 0.141 -457 S 0.105 -458 H 0.081 -459 V 0.067 -460 C 0.059 -461 F 0.057 -462 W 0.059 -463 E 0.065 -464 D 0.070 -465 C 0.074 -466 P 0.079 -467 R 0.089 -468 E 0.103 -469 G 0.118 -470 K 0.131 -471 P 0.137 -472 F 0.129 -473 K 0.109 -474 A 0.095 -475 K 0.097 -476 Y 0.116 -477 K 0.138 -478 L 0.148 -479 I 0.138 -480 N 0.119 -481 H 0.108 -482 I 0.111 -483 R 0.118 -484 V 0.124 -485 H 0.136 -486 T 0.159 -487 G 0.183 -488 E 0.191 -489 K 0.177 -490 P 0.159 -491 F 0.152 -492 P 0.153 -493 C 0.155 -494 P 0.161 -495 F 0.166 -496 P 0.161 -497 G 0.148 -498 C 0.138 -499 G 0.138 -500 K 0.147 -501 V 0.159 -502 F 0.168 -503 A 0.168 -504 R 0.169 -505 S 0.186 -506 E 0.222 -507 N 0.249 -508 L 0.240 -509 K 0.202 -510 I 0.163 -511 H 0.146 -512 K 0.155 -513 R 0.177 -514 T 0.197 -515 H 0.218 -516 T 0.244 -517 G 0.259 -518 E 0.248 -519 K 0.212 -520 P 0.170 -521 F 0.139 -522 K 0.123 -523 C 0.121 -524 E 0.129 -525 F 0.138 -526 D 0.132 -527 G 0.113 -528 C 0.093 -529 D 0.090 -530 R 0.112 -531 K 0.150 -532 F 0.182 -533 A 0.194 -534 N 0.193 -535 S 0.196 -536 S 0.207 -537 D 0.216 -538 R 0.221 -539 K 0.224 -540 K 0.225 -541 H 0.224 -542 S 0.225 -543 H 0.223 -544 V 0.218 -545 H 0.219 -546 T 0.228 -547 S 0.237 -548 D 0.238 -549 K 0.221 -550 P 0.187 -551 Y 0.150 -552 Y 0.126 -553 C 0.122 -554 K 0.136 -555 I 0.152 -556 R 0.154 -557 G 0.139 -558 C 0.123 -559 D 0.118 -560 K 0.126 -561 S 0.138 -562 Y 0.148 -563 T 0.154 -564 H 0.153 -565 P 0.143 -566 S 0.125 -567 S 0.112 -568 L 0.106 -569 R 0.106 -570 K 0.102 -571 H 0.091 -572 M 0.082 -573 K 0.086 -574 I 0.116 -575 H 0.182 -576 C 0.278 -577 K 0.377 -578 S 0.459 -579 P 0.526 -580 P 0.583 -581 P 0.629 -582 S 0.663 -583 P 0.685 -584 G 0.701 -585 P 0.715 -586 L 0.726 -587 G 0.731 -588 Y 0.731 -589 S 0.734 -590 S 0.737 -591 V 0.733 -592 G 0.722 -593 T 0.716 -594 P 0.723 -595 V 0.733 -596 G 0.733 -597 A 0.727 -598 P 0.720 -599 L 0.718 -600 S 0.724 -601 P 0.736 -602 V 0.742 -603 L 0.740 -604 D 0.733 -605 P 0.728 -606 A 0.731 -607 R 0.747 -608 S 0.769 -609 H 0.787 -610 S 0.794 -611 S 0.790 -612 T 0.775 -613 L 0.757 -614 S 0.744 -615 P 0.739 -616 Q 0.731 -617 V 0.711 -618 T 0.674 -619 N 0.621 -620 L 0.562 -621 N 0.505 -622 E 0.464 -623 W 0.464 -624 Y 0.512 -625 V 0.583 -626 C 0.642 -627 Q 0.678 -628 A 0.699 -629 S 0.707 -630 G 0.706 -631 A 0.704 -632 P 0.709 -633 S 0.713 -634 H 0.711 -635 L 0.699 -636 H 0.685 -637 T 0.675 -638 P 0.656 -639 S 0.625 -640 S 0.616 -641 N 0.658 -642 G 0.720 -643 T 0.755 -644 T 0.760 -645 S 0.750 -646 E 0.732 -647 T 0.702 -648 E 0.654 -649 D 0.591 -650 E 0.526 -651 E 0.468 -652 I 0.419 -653 Y 0.382 -654 G 0.356 -655 N 0.332 -656 P 0.304 -657 E 0.268 -658 V 0.229 -659 V 0.201 -660 R 0.194 -661 T 0.196 -662 I 0.196 -663 H 0.194 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000142224.18_ENST00000659997.3_GN:IL19_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000142224.18_ENST00000659997.3_GN:IL19_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 689cac7ebdff86752c4f8df82d633d16c12ad0ba..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000142224.18_ENST00000659997.3_GN:IL19_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,178 +0,0 @@ ->ENSG00000142224.18|ENST00000659997.3|GN:IL19|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.373 -2 K 0.376 -3 L 0.379 -4 Q 0.371 -5 C 0.348 -6 V 0.323 -7 S 0.316 -8 L 0.321 -9 W 0.330 -10 L 0.343 -11 L 0.355 -12 G 0.348 -13 T 0.330 -14 I 0.323 -15 L 0.336 -16 I 0.349 -17 L 0.355 -18 C 0.362 -19 S 0.386 -20 V 0.423 -21 D 0.459 -22 N 0.475 -23 H 0.464 -24 G 0.428 -25 L 0.372 -26 R 0.302 -27 R 0.237 -28 C 0.189 -29 L 0.158 -30 I 0.140 -31 S 0.131 -32 T 0.123 -33 D 0.108 -34 M 0.089 -35 H 0.077 -36 H 0.072 -37 I 0.065 -38 E 0.055 -39 E 0.046 -40 S 0.040 -41 F 0.035 -42 Q 0.034 -43 E 0.036 -44 I 0.041 -45 K 0.048 -46 R 0.057 -47 A 0.065 -48 I 0.072 -49 Q 0.083 -50 A 0.103 -51 K 0.131 -52 D 0.162 -53 T 0.192 -54 F 0.208 -55 P 0.202 -56 N 0.177 -57 V 0.147 -58 T 0.122 -59 I 0.105 -60 L 0.098 -61 S 0.096 -62 T 0.096 -63 L 0.094 -64 E 0.090 -65 T 0.085 -66 L 0.083 -67 Q 0.086 -68 I 0.089 -69 I 0.085 -70 K 0.078 -71 P 0.072 -72 L 0.067 -73 D 0.056 -74 V 0.041 -75 C 0.033 -76 C 0.032 -77 V 0.035 -78 T 0.039 -79 K 0.041 -80 N 0.042 -81 L 0.041 -82 L 0.037 -83 A 0.032 -84 F 0.027 -85 Y 0.028 -86 V 0.036 -87 D 0.048 -88 R 0.056 -89 V 0.058 -90 F 0.063 -91 K 0.077 -92 D 0.094 -93 H 0.103 -94 Q 0.101 -95 E 0.094 -96 P 0.087 -97 N 0.078 -98 P 0.069 -99 K 0.063 -100 I 0.060 -101 L 0.056 -102 R 0.050 -103 K 0.045 -104 I 0.045 -105 S 0.047 -106 S 0.052 -107 I 0.062 -108 A 0.071 -109 N 0.071 -110 S 0.058 -111 F 0.042 -112 L 0.033 -113 Y 0.030 -114 M 0.036 -115 Q 0.048 -116 K 0.053 -117 T 0.047 -118 L 0.035 -119 R 0.028 -120 Q 0.027 -121 C 0.030 -122 Q 0.038 -123 E 0.050 -124 Q 0.065 -125 R 0.078 -126 Q 0.082 -127 C 0.077 -128 H 0.067 -129 C 0.056 -130 R 0.051 -131 Q 0.051 -132 E 0.053 -133 A 0.055 -134 T 0.059 -135 N 0.060 -136 A 0.057 -137 T 0.053 -138 R 0.051 -139 V 0.054 -140 I 0.058 -141 H 0.065 -142 D 0.074 -143 N 0.082 -144 Y 0.087 -145 D 0.090 -146 Q 0.092 -147 L 0.091 -148 E 0.086 -149 V 0.077 -150 H 0.071 -151 A 0.069 -152 A 0.071 -153 A 0.080 -154 I 0.089 -155 K 0.095 -156 S 0.098 -157 L 0.098 -158 G 0.094 -159 E 0.084 -160 L 0.069 -161 D 0.053 -162 V 0.042 -163 F 0.037 -164 L 0.035 -165 A 0.032 -166 W 0.031 -167 I 0.031 -168 N 0.033 -169 K 0.035 -170 N 0.038 -171 H 0.042 -172 E 0.046 -173 V 0.052 -174 M 0.067 -175 F 0.096 -176 S 0.132 -177 A 0.157 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000142224.18_ENST00000659997.3_GN:IL19_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:38.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000142224.18_ENST00000659997.3_GN:IL19_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:38.caid deleted file mode 100644 index 025db8a5650660ae48ad14578bbf2e76df613eab..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000142224.18_ENST00000659997.3_GN:IL19_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:38.caid +++ /dev/null @@ -1,216 +0,0 @@ ->ENSG00000142224.18|ENST00000659997.3|GN:IL19|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:38 -1 M 0.356 -2 C 0.394 -3 T 0.464 -4 E 0.545 -5 G 0.606 -6 A 0.632 -7 F 0.644 -8 P 0.665 -9 H 0.694 -10 R 0.715 -11 S 0.714 -12 A 0.690 -13 C 0.658 -14 S 0.639 -15 L 0.630 -16 P 0.605 -17 L 0.560 -18 T 0.529 -19 H 0.535 -20 V 0.542 -21 H 0.523 -22 T 0.511 -23 H 0.543 -24 I 0.599 -25 H 0.640 -26 V 0.657 -27 C 0.666 -28 V 0.681 -29 P 0.699 -30 V 0.708 -31 L 0.708 -32 W 0.702 -33 G 0.688 -34 S 0.661 -35 V 0.638 -36 P 0.644 -37 R 0.677 -38 G 0.711 -39 M 0.720 -40 K 0.709 -41 L 0.697 -42 Q 0.689 -43 C 0.674 -44 V 0.644 -45 S 0.605 -46 L 0.579 -47 W 0.578 -48 L 0.595 -49 L 0.616 -50 G 0.622 -51 T 0.602 -52 I 0.564 -53 L 0.529 -54 I 0.503 -55 L 0.476 -56 C 0.458 -57 S 0.462 -58 V 0.485 -59 D 0.504 -60 N 0.508 -61 H 0.492 -62 G 0.456 -63 L 0.394 -64 R 0.315 -65 R 0.242 -66 C 0.190 -67 L 0.157 -68 I 0.137 -69 S 0.126 -70 T 0.117 -71 D 0.103 -72 M 0.085 -73 H 0.074 -74 H 0.069 -75 I 0.063 -76 E 0.053 -77 E 0.045 -78 S 0.040 -79 F 0.035 -80 Q 0.033 -81 E 0.034 -82 I 0.038 -83 K 0.042 -84 R 0.049 -85 A 0.057 -86 I 0.064 -87 Q 0.073 -88 A 0.090 -89 K 0.115 -90 D 0.145 -91 T 0.172 -92 F 0.188 -93 P 0.182 -94 N 0.159 -95 V 0.130 -96 T 0.106 -97 I 0.090 -98 L 0.084 -99 S 0.084 -100 T 0.085 -101 L 0.084 -102 E 0.080 -103 T 0.076 -104 L 0.075 -105 Q 0.080 -106 I 0.083 -107 I 0.081 -108 K 0.075 -109 P 0.071 -110 L 0.066 -111 D 0.055 -112 V 0.041 -113 C 0.032 -114 C 0.031 -115 V 0.033 -116 T 0.036 -117 K 0.039 -118 N 0.040 -119 L 0.039 -120 L 0.035 -121 A 0.030 -122 F 0.026 -123 Y 0.026 -124 V 0.033 -125 D 0.044 -126 R 0.051 -127 V 0.052 -128 F 0.056 -129 K 0.069 -130 D 0.086 -131 H 0.096 -132 Q 0.097 -133 E 0.093 -134 P 0.088 -135 N 0.080 -136 P 0.071 -137 K 0.065 -138 I 0.062 -139 L 0.058 -140 R 0.051 -141 K 0.047 -142 I 0.046 -143 S 0.049 -144 S 0.054 -145 I 0.064 -146 A 0.074 -147 N 0.073 -148 S 0.060 -149 F 0.044 -150 L 0.033 -151 Y 0.031 -152 M 0.037 -153 Q 0.048 -154 K 0.053 -155 T 0.047 -156 L 0.035 -157 R 0.028 -158 Q 0.027 -159 C 0.031 -160 Q 0.039 -161 E 0.052 -162 Q 0.068 -163 R 0.079 -164 Q 0.083 -165 C 0.077 -166 H 0.067 -167 C 0.058 -168 R 0.053 -169 Q 0.054 -170 E 0.058 -171 A 0.061 -172 T 0.064 -173 N 0.064 -174 A 0.060 -175 T 0.054 -176 R 0.051 -177 V 0.054 -178 I 0.059 -179 H 0.066 -180 D 0.075 -181 N 0.083 -182 Y 0.087 -183 D 0.089 -184 Q 0.091 -185 L 0.090 -186 E 0.085 -187 V 0.078 -188 H 0.073 -189 A 0.072 -190 A 0.076 -191 A 0.086 -192 I 0.098 -193 K 0.104 -194 S 0.106 -195 L 0.106 -196 G 0.102 -197 E 0.092 -198 L 0.076 -199 D 0.058 -200 V 0.046 -201 F 0.041 -202 L 0.037 -203 A 0.034 -204 W 0.031 -205 I 0.031 -206 N 0.033 -207 K 0.035 -208 N 0.039 -209 H 0.043 -210 E 0.046 -211 V 0.053 -212 M 0.069 -213 F 0.099 -214 S 0.137 -215 A 0.164 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000142538.3_ENST00000270631.2_GN:PTH2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000142538.3_ENST00000270631.2_GN:PTH2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 31e5bcc9fff5946d3de31c207814040977d12133..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000142538.3_ENST00000270631.2_GN:PTH2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,101 +0,0 @@ ->ENSG00000142538.3|ENST00000270631.2|GN:PTH2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.475 -2 E 0.497 -3 T 0.529 -4 R 0.558 -5 Q 0.571 -6 V 0.559 -7 S 0.515 -8 R 0.447 -9 S 0.365 -10 P 0.282 -11 R 0.217 -12 V 0.178 -13 R 0.160 -14 L 0.156 -15 L 0.157 -16 L 0.160 -17 L 0.162 -18 L 0.159 -19 L 0.156 -20 L 0.161 -21 L 0.177 -22 L 0.201 -23 V 0.236 -24 V 0.282 -25 P 0.344 -26 W 0.431 -27 G 0.525 -28 V 0.594 -29 R 0.637 -30 T 0.671 -31 A 0.697 -32 S 0.709 -33 G 0.708 -34 V 0.696 -35 A 0.675 -36 L 0.660 -37 P 0.670 -38 P 0.703 -39 V 0.738 -40 G 0.749 -41 V 0.720 -42 L 0.662 -43 S 0.606 -44 L 0.582 -45 R 0.589 -46 P 0.616 -47 P 0.657 -48 G 0.696 -49 R 0.715 -50 A 0.712 -51 W 0.693 -52 A 0.663 -53 D 0.626 -54 P 0.590 -55 A 0.569 -56 T 0.569 -57 P 0.591 -58 R 0.629 -59 P 0.667 -60 R 0.690 -61 R 0.695 -62 S 0.687 -63 L 0.666 -64 A 0.631 -65 L 0.575 -66 A 0.494 -67 D 0.395 -68 D 0.304 -69 A 0.238 -70 A 0.197 -71 F 0.165 -72 R 0.140 -73 E 0.124 -74 R 0.119 -75 A 0.121 -76 R 0.128 -77 L 0.134 -78 L 0.136 -79 A 0.133 -80 A 0.127 -81 L 0.118 -82 E 0.108 -83 R 0.103 -84 R 0.105 -85 H 0.113 -86 W 0.126 -87 L 0.144 -88 N 0.162 -89 S 0.176 -90 Y 0.188 -91 M 0.206 -92 H 0.235 -93 K 0.270 -94 L 0.304 -95 L 0.336 -96 V 0.368 -97 L 0.392 -98 D 0.402 -99 A 0.401 -100 P 0.398 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000142538.3_ENST00000270631.2_GN:PTH2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000142538.3_ENST00000270631.2_GN:PTH2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid deleted file mode 100644 index 7fcaea438a6a37c04139c3aad5bd16d84d7140f6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000142538.3_ENST00000270631.2_GN:PTH2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid +++ /dev/null @@ -1,125 +0,0 @@ ->ENSG00000142538.3|ENST00000270631.2|GN:PTH2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:24 -1 M 0.492 -2 H 0.536 -3 G 0.588 -4 G 0.606 -5 A 0.586 -6 R 0.575 -7 G 0.610 -8 S 0.668 -9 G 0.712 -10 P 0.735 -11 G 0.745 -12 C 0.744 -13 S 0.741 -14 P 0.744 -15 T 0.753 -16 E 0.765 -17 P 0.778 -18 L 0.788 -19 S 0.796 -20 G 0.799 -21 S 0.803 -22 P 0.812 -23 Q 0.825 -24 V 0.834 -25 M 0.833 -26 E 0.821 -27 T 0.804 -28 R 0.784 -29 Q 0.755 -30 V 0.707 -31 S 0.630 -32 R 0.528 -33 S 0.418 -34 P 0.321 -35 R 0.252 -36 V 0.211 -37 R 0.190 -38 L 0.182 -39 L 0.184 -40 L 0.194 -41 L 0.198 -42 L 0.191 -43 L 0.181 -44 L 0.181 -45 L 0.191 -46 L 0.210 -47 V 0.241 -48 V 0.282 -49 P 0.339 -50 W 0.425 -51 G 0.525 -52 V 0.602 -53 R 0.652 -54 T 0.693 -55 A 0.724 -56 S 0.740 -57 G 0.742 -58 V 0.733 -59 A 0.716 -60 L 0.701 -61 P 0.708 -62 P 0.737 -63 V 0.770 -64 G 0.783 -65 V 0.761 -66 L 0.709 -67 S 0.657 -68 L 0.632 -69 R 0.634 -70 P 0.654 -71 P 0.687 -72 G 0.720 -73 R 0.736 -74 A 0.730 -75 W 0.709 -76 A 0.680 -77 D 0.645 -78 P 0.613 -79 A 0.593 -80 T 0.593 -81 P 0.613 -82 R 0.649 -83 P 0.685 -84 R 0.706 -85 R 0.707 -86 S 0.691 -87 L 0.664 -88 A 0.625 -89 L 0.569 -90 A 0.491 -91 D 0.396 -92 D 0.306 -93 A 0.240 -94 A 0.198 -95 F 0.168 -96 R 0.143 -97 E 0.128 -98 R 0.122 -99 A 0.124 -100 R 0.128 -101 L 0.131 -102 L 0.129 -103 A 0.124 -104 A 0.117 -105 L 0.108 -106 E 0.099 -107 R 0.095 -108 R 0.099 -109 H 0.108 -110 W 0.122 -111 L 0.139 -112 N 0.158 -113 S 0.173 -114 Y 0.187 -115 M 0.204 -116 H 0.231 -117 K 0.267 -118 L 0.306 -119 L 0.344 -120 V 0.383 -121 L 0.413 -122 D 0.423 -123 A 0.419 -124 P 0.413 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000143067.6_ENST00000421812.3_GN:ZNF697_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000143067.6_ENST00000421812.3_GN:ZNF697_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 1fd3c9ddf9ebc1b3a1932625916dd873f8c07054..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000143067.6_ENST00000421812.3_GN:ZNF697_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,546 +0,0 @@ ->ENSG00000143067.6|ENST00000421812.3|GN:ZNF697|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.393 -2 K 0.417 -3 Q 0.457 -4 E 0.502 -5 D 0.527 -6 N 0.524 -7 Q 0.524 -8 G 0.549 -9 V 0.560 -10 C 0.530 -11 A 0.499 -12 H 0.508 -13 Q 0.529 -14 D 0.525 -15 S 0.514 -16 E 0.522 -17 D 0.535 -18 K 0.551 -19 G 0.584 -20 M 0.604 -21 G 0.585 -22 S 0.566 -23 D 0.592 -24 F 0.646 -25 E 0.690 -26 D 0.712 -27 S 0.719 -28 E 0.718 -29 D 0.716 -30 R 0.714 -31 E 0.710 -32 G 0.706 -33 D 0.700 -34 P 0.687 -35 E 0.657 -36 E 0.612 -37 R 0.594 -38 E 0.622 -39 M 0.644 -40 G 0.619 -41 S 0.577 -42 N 0.560 -43 P 0.561 -44 H 0.582 -45 D 0.643 -46 T 0.714 -47 N 0.756 -48 K 0.765 -49 R 0.762 -50 E 0.753 -51 G 0.739 -52 H 0.727 -53 P 0.728 -54 E 0.745 -55 P 0.770 -56 E 0.793 -57 M 0.804 -58 G 0.797 -59 S 0.770 -60 N 0.718 -61 P 0.655 -62 Q 0.628 -63 D 0.665 -64 S 0.722 -65 R 0.754 -66 H 0.765 -67 R 0.777 -68 E 0.785 -69 A 0.782 -70 V 0.776 -71 P 0.780 -72 D 0.789 -73 I 0.794 -74 C 0.796 -75 T 0.800 -76 E 0.805 -77 G 0.807 -78 Q 0.804 -79 L 0.794 -80 S 0.771 -81 E 0.728 -82 E 0.675 -83 E 0.652 -84 G 0.683 -85 V 0.736 -86 S 0.773 -87 V 0.793 -88 R 0.804 -89 G 0.807 -90 E 0.805 -91 E 0.801 -92 D 0.797 -93 D 0.792 -94 Q 0.788 -95 S 0.790 -96 G 0.795 -97 V 0.799 -98 A 0.797 -99 D 0.790 -100 M 0.774 -101 A 0.753 -102 M 0.734 -103 F 0.730 -104 P 0.738 -105 G 0.748 -106 L 0.750 -107 S 0.746 -108 E 0.742 -109 S 0.735 -110 D 0.718 -111 S 0.682 -112 I 0.624 -113 S 0.563 -114 R 0.542 -115 S 0.582 -116 L 0.649 -117 R 0.702 -118 E 0.732 -119 D 0.745 -120 D 0.752 -121 D 0.757 -122 E 0.764 -123 S 0.772 -124 A 0.777 -125 G 0.777 -126 E 0.765 -127 N 0.730 -128 R 0.679 -129 L 0.648 -130 E 0.663 -131 E 0.697 -132 E 0.706 -133 E 0.681 -134 E 0.637 -135 Q 0.595 -136 P 0.572 -137 A 0.576 -138 P 0.599 -139 P 0.629 -140 V 0.651 -141 L 0.660 -142 P 0.659 -143 W 0.660 -144 R 0.673 -145 R 0.694 -146 H 0.709 -147 L 0.717 -148 S 0.725 -149 L 0.735 -150 G 0.742 -151 S 0.746 -152 R 0.749 -153 H 0.750 -154 R 0.748 -155 G 0.742 -156 D 0.733 -157 K 0.725 -158 P 0.724 -159 A 0.729 -160 H 0.734 -161 R 0.735 -162 R 0.731 -163 F 0.726 -164 H 0.716 -165 R 0.698 -166 L 0.673 -167 H 0.659 -168 H 0.672 -169 P 0.705 -170 M 0.730 -171 A 0.722 -172 V 0.680 -173 D 0.631 -174 L 0.595 -175 G 0.564 -176 E 0.522 -177 L 0.470 -178 D 0.427 -179 S 0.419 -180 L 0.434 -181 V 0.447 -182 A 0.455 -183 S 0.470 -184 I 0.478 -185 M 0.462 -186 D 0.426 -187 A 0.368 -188 P 0.285 -189 T 0.197 -190 I 0.133 -191 C 0.101 -192 P 0.091 -193 D 0.097 -194 C 0.112 -195 G 0.124 -196 E 0.126 -197 S 0.122 -198 F 0.117 -199 S 0.108 -200 P 0.096 -201 G 0.090 -202 A 0.091 -203 A 0.090 -204 F 0.086 -205 L 0.083 -206 Q 0.080 -207 H 0.078 -208 Q 0.080 -209 R 0.089 -210 I 0.105 -211 H 0.132 -212 R 0.168 -213 L 0.207 -214 A 0.245 -215 E 0.284 -216 A 0.321 -217 A 0.359 -218 A 0.403 -219 A 0.452 -220 A 0.495 -221 S 0.533 -222 L 0.573 -223 E 0.617 -224 P 0.655 -225 F 0.680 -226 G 0.690 -227 L 0.691 -228 A 0.688 -229 G 0.681 -230 E 0.658 -231 C 0.612 -232 D 0.560 -233 A 0.543 -234 M 0.578 -235 V 0.632 -236 G 0.663 -237 M 0.673 -238 M 0.684 -239 G 0.705 -240 V 0.732 -241 G 0.754 -242 V 0.768 -243 A 0.772 -244 G 0.771 -245 G 0.770 -246 F 0.768 -247 G 0.760 -248 A 0.744 -249 G 0.727 -250 P 0.717 -251 P 0.715 -252 L 0.705 -253 A 0.676 -254 R 0.632 -255 P 0.581 -256 P 0.521 -257 R 0.439 -258 E 0.342 -259 K 0.246 -260 P 0.169 -261 F 0.119 -262 R 0.094 -263 C 0.086 -264 G 0.087 -265 E 0.092 -266 C 0.097 -267 G 0.101 -268 K 0.106 -269 G 0.113 -270 F 0.115 -271 S 0.108 -272 R 0.100 -273 N 0.101 -274 T 0.113 -275 Y 0.131 -276 L 0.144 -277 T 0.148 -278 N 0.141 -279 H 0.133 -280 L 0.136 -281 R 0.151 -282 L 0.168 -283 H 0.185 -284 T 0.203 -285 G 0.217 -286 E 0.211 -287 R 0.182 -288 P 0.141 -289 N 0.105 -290 L 0.081 -291 C 0.070 -292 A 0.069 -293 D 0.074 -294 C 0.082 -295 G 0.090 -296 K 0.101 -297 S 0.114 -298 F 0.123 -299 S 0.124 -300 W 0.123 -301 R 0.126 -302 A 0.129 -303 D 0.132 -304 L 0.136 -305 L 0.141 -306 K 0.144 -307 H 0.152 -308 R 0.176 -309 R 0.210 -310 L 0.234 -311 H 0.243 -312 T 0.248 -313 G 0.254 -314 E 0.242 -315 K 0.208 -316 P 0.166 -317 Y 0.137 -318 P 0.121 -319 C 0.112 -320 P 0.107 -321 E 0.110 -322 C 0.119 -323 G 0.128 -324 E 0.132 -325 A 0.129 -326 F 0.123 -327 S 0.115 -328 L 0.110 -329 S 0.110 -330 S 0.109 -331 H 0.102 -332 L 0.092 -333 L 0.084 -334 S 0.079 -335 H 0.080 -336 R 0.090 -337 R 0.111 -338 A 0.138 -339 H 0.175 -340 A 0.227 -341 A 0.283 -342 A 0.330 -343 S 0.371 -344 G 0.415 -345 A 0.459 -346 G 0.483 -347 A 0.475 -348 A 0.440 -349 A 0.384 -350 L 0.313 -351 R 0.238 -352 P 0.176 -353 F 0.134 -354 A 0.110 -355 C 0.098 -356 G 0.096 -357 E 0.100 -358 C 0.108 -359 G 0.117 -360 K 0.127 -361 G 0.138 -362 F 0.144 -363 V 0.145 -364 R 0.148 -365 R 0.162 -366 S 0.188 -367 H 0.212 -368 L 0.223 -369 A 0.223 -370 N 0.215 -371 H 0.205 -372 Q 0.202 -373 R 0.207 -374 I 0.213 -375 H 0.219 -376 T 0.227 -377 G 0.227 -378 E 0.208 -379 K 0.173 -380 P 0.141 -381 H 0.125 -382 G 0.120 -383 C 0.115 -384 G 0.108 -385 E 0.104 -386 C 0.102 -387 G 0.103 -388 K 0.109 -389 R 0.118 -390 F 0.125 -391 S 0.126 -392 W 0.125 -393 R 0.126 -394 S 0.131 -395 D 0.141 -396 L 0.155 -397 V 0.167 -398 K 0.174 -399 H 0.179 -400 Q 0.189 -401 R 0.201 -402 V 0.210 -403 H 0.220 -404 T 0.233 -405 G 0.238 -406 E 0.222 -407 K 0.186 -408 P 0.143 -409 Y 0.111 -410 M 0.091 -411 C 0.081 -412 S 0.080 -413 E 0.085 -414 C 0.094 -415 G 0.102 -416 E 0.109 -417 T 0.112 -418 F 0.112 -419 S 0.110 -420 V 0.110 -421 S 0.116 -422 S 0.128 -423 H 0.138 -424 L 0.141 -425 F 0.138 -426 T 0.137 -427 H 0.144 -428 K 0.167 -429 R 0.197 -430 T 0.223 -431 H 0.245 -432 S 0.261 -433 G 0.259 -434 E 0.233 -435 R 0.189 -436 P 0.142 -437 Y 0.106 -438 V 0.085 -439 C 0.077 -440 R 0.079 -441 E 0.090 -442 C 0.103 -443 G 0.115 -444 K 0.126 -445 G 0.138 -446 F 0.150 -447 G 0.156 -448 R 0.159 -449 N 0.170 -450 S 0.193 -451 H 0.216 -452 L 0.226 -453 V 0.225 -454 N 0.214 -455 H 0.199 -456 L 0.197 -457 R 0.215 -458 V 0.237 -459 H 0.253 -460 T 0.266 -461 G 0.270 -462 E 0.250 -463 K 0.206 -464 P 0.159 -465 F 0.127 -466 R 0.112 -467 C 0.108 -468 G 0.108 -469 Q 0.108 -470 C 0.107 -471 E 0.114 -472 K 0.130 -473 R 0.152 -474 F 0.171 -475 S 0.182 -476 D 0.180 -477 F 0.166 -478 S 0.152 -479 T 0.148 -480 L 0.151 -481 T 0.160 -482 Q 0.173 -483 H 0.190 -484 Q 0.216 -485 R 0.246 -486 T 0.274 -487 H 0.297 -488 T 0.314 -489 G 0.319 -490 E 0.300 -491 K 0.256 -492 P 0.202 -493 Y 0.156 -494 T 0.124 -495 C 0.107 -496 I 0.104 -497 E 0.113 -498 C 0.130 -499 G 0.144 -500 K 0.148 -501 S 0.147 -502 F 0.145 -503 I 0.148 -504 Q 0.159 -505 S 0.174 -506 S 0.185 -507 H 0.188 -508 L 0.182 -509 I 0.174 -510 R 0.167 -511 H 0.163 -512 R 0.168 -513 R 0.182 -514 I 0.200 -515 H 0.220 -516 T 0.242 -517 G 0.261 -518 N 0.263 -519 K 0.244 -520 P 0.215 -521 H 0.191 -522 K 0.175 -523 C 0.165 -524 A 0.162 -525 G 0.164 -526 C 0.164 -527 G 0.160 -528 K 0.152 -529 G 0.144 -530 F 0.140 -531 R 0.139 -532 Y 0.140 -533 K 0.142 -534 T 0.141 -535 H 0.137 -536 L 0.135 -537 A 0.136 -538 Q 0.135 -539 H 0.128 -540 Q 0.118 -541 K 0.109 -542 L 0.100 -543 H 0.094 -544 L 0.092 -545 C 0.093 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000143067.6_ENST00000421812.3_GN:ZNF697_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:63.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000143067.6_ENST00000421812.3_GN:ZNF697_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:63.caid deleted file mode 100644 index 4c399ed5d5aa61575d1cf34134ff2861f5588e21..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000143067.6_ENST00000421812.3_GN:ZNF697_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:63.caid +++ /dev/null @@ -1,609 +0,0 @@ ->ENSG00000143067.6|ENST00000421812.3|GN:ZNF697|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:63 -1 M 0.379 -2 W 0.412 -3 R 0.463 -4 G 0.507 -5 A 0.515 -6 G 0.490 -7 R 0.478 -8 R 0.507 -9 R 0.547 -10 L 0.564 -11 R 0.573 -12 L 0.598 -13 E 0.642 -14 G 0.687 -15 G 0.715 -16 D 0.713 -17 S 0.674 -18 D 0.614 -19 A 0.580 -20 R 0.595 -21 G 0.617 -22 N 0.603 -23 R 0.583 -24 T 0.598 -25 V 0.636 -26 P 0.669 -27 P 0.697 -28 T 0.719 -29 T 0.730 -30 E 0.737 -31 G 0.746 -32 G 0.748 -33 I 0.735 -34 R 0.718 -35 D 0.710 -36 P 0.715 -37 R 0.726 -38 R 0.730 -39 N 0.703 -40 Q 0.649 -41 A 0.617 -42 Q 0.645 -43 G 0.702 -44 G 0.738 -45 A 0.746 -46 W 0.743 -47 K 0.740 -48 A 0.736 -49 R 0.729 -50 R 0.724 -51 R 0.721 -52 D 0.709 -53 S 0.680 -54 W 0.650 -55 S 0.640 -56 P 0.657 -57 P 0.689 -58 L 0.716 -59 L 0.728 -60 F 0.725 -61 S 0.712 -62 S 0.693 -63 W 0.670 -64 M 0.640 -65 K 0.607 -66 Q 0.607 -67 E 0.660 -68 D 0.733 -69 N 0.780 -70 Q 0.802 -71 G 0.813 -72 V 0.820 -73 C 0.821 -74 A 0.818 -75 H 0.817 -76 Q 0.816 -77 D 0.815 -78 S 0.811 -79 E 0.809 -80 D 0.811 -81 K 0.811 -82 G 0.794 -83 M 0.746 -84 G 0.675 -85 S 0.633 -86 D 0.656 -87 F 0.713 -88 E 0.757 -89 D 0.774 -90 S 0.777 -91 E 0.775 -92 D 0.771 -93 R 0.768 -94 E 0.763 -95 G 0.758 -96 D 0.750 -97 P 0.732 -98 E 0.694 -99 E 0.640 -100 R 0.614 -101 E 0.636 -102 M 0.656 -103 G 0.628 -104 S 0.585 -105 N 0.568 -106 P 0.567 -107 H 0.586 -108 D 0.645 -109 T 0.718 -110 N 0.761 -111 K 0.772 -112 R 0.768 -113 E 0.758 -114 G 0.745 -115 H 0.733 -116 P 0.732 -117 E 0.745 -118 P 0.767 -119 E 0.784 -120 M 0.790 -121 G 0.780 -122 S 0.751 -123 N 0.697 -124 P 0.634 -125 Q 0.607 -126 D 0.644 -127 S 0.703 -128 R 0.740 -129 H 0.754 -130 R 0.764 -131 E 0.771 -132 A 0.768 -133 V 0.763 -134 P 0.764 -135 D 0.771 -136 I 0.775 -137 C 0.778 -138 T 0.782 -139 E 0.788 -140 G 0.793 -141 Q 0.794 -142 L 0.793 -143 S 0.789 -144 E 0.785 -145 E 0.785 -146 E 0.789 -147 G 0.794 -148 V 0.796 -149 S 0.796 -150 V 0.800 -151 R 0.806 -152 G 0.808 -153 E 0.806 -154 E 0.803 -155 D 0.799 -156 D 0.794 -157 Q 0.791 -158 S 0.792 -159 G 0.797 -160 V 0.800 -161 A 0.801 -162 D 0.797 -163 M 0.783 -164 A 0.762 -165 M 0.744 -166 F 0.738 -167 P 0.747 -168 G 0.760 -169 L 0.767 -170 S 0.766 -171 E 0.760 -172 S 0.751 -173 D 0.730 -174 S 0.688 -175 I 0.622 -176 S 0.558 -177 R 0.542 -178 S 0.589 -179 L 0.663 -180 R 0.720 -181 E 0.753 -182 D 0.769 -183 D 0.778 -184 D 0.785 -185 E 0.792 -186 S 0.798 -187 A 0.801 -188 G 0.802 -189 E 0.802 -190 N 0.800 -191 R 0.795 -192 L 0.789 -193 E 0.783 -194 E 0.774 -195 E 0.753 -196 E 0.719 -197 E 0.676 -198 Q 0.636 -199 P 0.615 -200 A 0.618 -201 P 0.640 -202 P 0.666 -203 V 0.684 -204 L 0.691 -205 P 0.692 -206 W 0.695 -207 R 0.707 -208 R 0.724 -209 H 0.738 -210 L 0.748 -211 S 0.758 -212 L 0.769 -213 G 0.776 -214 S 0.780 -215 R 0.781 -216 H 0.781 -217 R 0.776 -218 G 0.768 -219 D 0.759 -220 K 0.751 -221 P 0.749 -222 A 0.753 -223 H 0.758 -224 R 0.759 -225 R 0.757 -226 F 0.752 -227 H 0.744 -228 R 0.731 -229 L 0.713 -230 H 0.702 -231 H 0.711 -232 P 0.737 -233 M 0.756 -234 A 0.748 -235 V 0.710 -236 D 0.665 -237 L 0.631 -238 G 0.602 -239 E 0.568 -240 L 0.528 -241 D 0.495 -242 S 0.486 -243 L 0.493 -244 V 0.492 -245 A 0.482 -246 S 0.474 -247 I 0.461 -248 M 0.432 -249 D 0.390 -250 A 0.335 -251 P 0.259 -252 T 0.178 -253 I 0.119 -254 C 0.091 -255 P 0.084 -256 D 0.090 -257 C 0.104 -258 G 0.114 -259 E 0.113 -260 S 0.107 -261 F 0.101 -262 S 0.092 -263 P 0.083 -264 G 0.081 -265 A 0.086 -266 A 0.088 -267 F 0.085 -268 L 0.082 -269 Q 0.079 -270 H 0.079 -271 Q 0.083 -272 R 0.095 -273 I 0.114 -274 H 0.141 -275 R 0.175 -276 L 0.210 -277 A 0.246 -278 E 0.285 -279 A 0.323 -280 A 0.360 -281 A 0.400 -282 A 0.443 -283 A 0.482 -284 S 0.519 -285 L 0.563 -286 E 0.612 -287 P 0.654 -288 F 0.681 -289 G 0.692 -290 L 0.692 -291 A 0.690 -292 G 0.685 -293 E 0.662 -294 C 0.615 -295 D 0.561 -296 A 0.539 -297 M 0.571 -298 V 0.623 -299 G 0.654 -300 M 0.665 -301 M 0.679 -302 G 0.704 -303 V 0.732 -304 G 0.752 -305 V 0.763 -306 A 0.765 -307 G 0.764 -308 G 0.763 -309 F 0.762 -310 G 0.756 -311 A 0.742 -312 G 0.725 -313 P 0.717 -314 P 0.715 -315 L 0.708 -316 A 0.684 -317 R 0.648 -318 P 0.609 -319 P 0.562 -320 R 0.489 -321 E 0.391 -322 K 0.285 -323 P 0.197 -324 F 0.141 -325 R 0.113 -326 C 0.106 -327 G 0.110 -328 E 0.118 -329 C 0.125 -330 G 0.132 -331 K 0.141 -332 G 0.154 -333 F 0.159 -334 S 0.150 -335 R 0.136 -336 N 0.132 -337 T 0.143 -338 Y 0.160 -339 L 0.175 -340 T 0.179 -341 N 0.170 -342 H 0.158 -343 L 0.163 -344 R 0.185 -345 L 0.209 -346 H 0.229 -347 T 0.248 -348 G 0.257 -349 E 0.244 -350 R 0.208 -351 P 0.163 -352 N 0.123 -353 L 0.095 -354 C 0.079 -355 A 0.073 -356 D 0.076 -357 C 0.082 -358 G 0.089 -359 K 0.100 -360 S 0.115 -361 F 0.127 -362 S 0.130 -363 W 0.132 -364 R 0.136 -365 A 0.140 -366 D 0.142 -367 L 0.146 -368 L 0.153 -369 K 0.160 -370 H 0.167 -371 R 0.185 -372 R 0.212 -373 L 0.230 -374 H 0.236 -375 T 0.241 -376 G 0.243 -377 E 0.228 -378 K 0.196 -379 P 0.160 -380 Y 0.137 -381 P 0.125 -382 C 0.114 -383 P 0.103 -384 E 0.099 -385 C 0.102 -386 G 0.109 -387 E 0.113 -388 A 0.113 -389 F 0.110 -390 S 0.105 -391 L 0.102 -392 S 0.103 -393 S 0.101 -394 H 0.095 -395 L 0.088 -396 L 0.084 -397 S 0.082 -398 H 0.086 -399 R 0.098 -400 R 0.118 -401 A 0.139 -402 H 0.170 -403 A 0.216 -404 A 0.266 -405 A 0.308 -406 S 0.346 -407 G 0.388 -408 A 0.430 -409 G 0.454 -410 A 0.449 -411 A 0.417 -412 A 0.366 -413 L 0.301 -414 R 0.232 -415 P 0.174 -416 F 0.135 -417 A 0.113 -418 C 0.102 -419 G 0.099 -420 E 0.104 -421 C 0.110 -422 G 0.116 -423 K 0.120 -424 G 0.125 -425 F 0.129 -426 V 0.132 -427 R 0.140 -428 R 0.160 -429 S 0.188 -430 H 0.213 -431 L 0.224 -432 A 0.221 -433 N 0.212 -434 H 0.207 -435 Q 0.212 -436 R 0.219 -437 I 0.221 -438 H 0.223 -439 T 0.229 -440 G 0.229 -441 E 0.211 -442 K 0.176 -443 P 0.143 -444 H 0.127 -445 G 0.124 -446 C 0.123 -447 G 0.120 -448 E 0.117 -449 C 0.115 -450 G 0.115 -451 K 0.120 -452 R 0.128 -453 F 0.133 -454 S 0.131 -455 W 0.128 -456 R 0.131 -457 S 0.141 -458 D 0.155 -459 L 0.170 -460 V 0.181 -461 K 0.186 -462 H 0.189 -463 Q 0.201 -464 R 0.218 -465 V 0.232 -466 H 0.247 -467 T 0.266 -468 G 0.276 -469 E 0.262 -470 K 0.221 -471 P 0.171 -472 Y 0.131 -473 M 0.106 -474 C 0.095 -475 S 0.098 -476 E 0.109 -477 C 0.120 -478 G 0.128 -479 E 0.134 -480 T 0.137 -481 F 0.136 -482 S 0.133 -483 V 0.134 -484 S 0.142 -485 S 0.155 -486 H 0.164 -487 L 0.164 -488 F 0.156 -489 T 0.149 -490 H 0.155 -491 K 0.181 -492 R 0.219 -493 T 0.258 -494 H 0.290 -495 S 0.311 -496 G 0.306 -497 E 0.272 -498 R 0.218 -499 P 0.163 -500 Y 0.120 -501 V 0.092 -502 C 0.079 -503 R 0.080 -504 E 0.092 -505 C 0.110 -506 G 0.127 -507 K 0.144 -508 G 0.161 -509 F 0.175 -510 G 0.179 -511 R 0.180 -512 N 0.192 -513 S 0.220 -514 H 0.247 -515 L 0.254 -516 V 0.245 -517 N 0.228 -518 H 0.207 -519 L 0.202 -520 R 0.219 -521 V 0.246 -522 H 0.273 -523 T 0.295 -524 G 0.301 -525 E 0.277 -526 K 0.229 -527 P 0.178 -528 F 0.141 -529 R 0.121 -530 C 0.110 -531 G 0.104 -532 Q 0.100 -533 C 0.097 -534 E 0.103 -535 K 0.120 -536 R 0.141 -537 F 0.160 -538 S 0.169 -539 D 0.167 -540 F 0.156 -541 S 0.146 -542 T 0.144 -543 L 0.150 -544 T 0.164 -545 Q 0.185 -546 H 0.213 -547 Q 0.246 -548 R 0.276 -549 T 0.296 -550 H 0.311 -551 T 0.323 -552 G 0.321 -553 E 0.296 -554 K 0.249 -555 P 0.195 -556 Y 0.150 -557 T 0.119 -558 C 0.103 -559 I 0.101 -560 E 0.111 -561 C 0.128 -562 G 0.141 -563 K 0.143 -564 S 0.138 -565 F 0.134 -566 I 0.139 -567 Q 0.154 -568 S 0.173 -569 S 0.185 -570 H 0.187 -571 L 0.182 -572 I 0.179 -573 R 0.177 -574 H 0.178 -575 R 0.186 -576 R 0.198 -577 I 0.209 -578 H 0.224 -579 T 0.243 -580 G 0.259 -581 N 0.261 -582 K 0.245 -583 P 0.220 -584 H 0.199 -585 K 0.184 -586 C 0.172 -587 A 0.169 -588 G 0.171 -589 C 0.174 -590 G 0.172 -591 K 0.166 -592 G 0.158 -593 F 0.152 -594 R 0.147 -595 Y 0.146 -596 K 0.148 -597 T 0.149 -598 H 0.147 -599 L 0.144 -600 A 0.141 -601 Q 0.136 -602 H 0.129 -603 Q 0.122 -604 K 0.114 -605 L 0.103 -606 H 0.092 -607 L 0.086 -608 C 0.085 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000143107.11_ENST00000370017.9_GN:FNDC7_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000143107.11_ENST00000370017.9_GN:FNDC7_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 7bd5e29bd8c484a71ef74bfd81dde503a671ca46..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000143107.11_ENST00000370017.9_GN:FNDC7_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,734 +0,0 @@ ->ENSG00000143107.11|ENST00000370017.9|GN:FNDC7|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.369 -2 A 0.381 -3 G 0.396 -4 G 0.394 -5 R 0.359 -6 E 0.318 -7 T 0.312 -8 C 0.341 -9 L 0.368 -10 P 0.371 -11 L 0.347 -12 I 0.303 -13 G 0.256 -14 F 0.227 -15 I 0.215 -16 L 0.209 -17 I 0.210 -18 C 0.217 -19 L 0.231 -20 K 0.263 -21 M 0.321 -22 V 0.386 -23 A 0.437 -24 S 0.468 -25 A 0.473 -26 K 0.438 -27 S 0.368 -28 A 0.286 -29 P 0.210 -30 E 0.149 -31 I 0.106 -32 P 0.080 -33 T 0.063 -34 I 0.053 -35 D 0.048 -36 Q 0.048 -37 A 0.049 -38 Y 0.050 -39 S 0.050 -40 K 0.047 -41 L 0.042 -42 S 0.036 -43 N 0.031 -44 S 0.028 -45 I 0.028 -46 T 0.030 -47 V 0.032 -48 E 0.035 -49 W 0.038 -50 A 0.046 -51 T 0.059 -52 V 0.075 -53 P 0.084 -54 G 0.082 -55 A 0.069 -56 T 0.052 -57 S 0.038 -58 Y 0.032 -59 L 0.033 -60 L 0.037 -61 T 0.044 -62 A 0.054 -63 E 0.066 -64 D 0.074 -65 G 0.079 -66 D 0.081 -67 T 0.083 -68 V 0.083 -69 I 0.080 -70 E 0.073 -71 T 0.064 -72 T 0.057 -73 V 0.054 -74 A 0.051 -75 N 0.045 -76 S 0.039 -77 P 0.040 -78 G 0.044 -79 T 0.046 -80 V 0.047 -81 T 0.052 -82 G 0.063 -83 L 0.079 -84 K 0.094 -85 A 0.102 -86 A 0.097 -87 T 0.082 -88 W 0.063 -89 Y 0.049 -90 E 0.040 -91 I 0.033 -92 T 0.029 -93 I 0.030 -94 R 0.034 -95 S 0.040 -96 I 0.047 -97 S 0.058 -98 A 0.072 -99 A 0.083 -100 G 0.084 -101 R 0.077 -102 S 0.071 -103 Q 0.071 -104 A 0.075 -105 S 0.080 -106 P 0.080 -107 P 0.073 -108 K 0.064 -109 Q 0.058 -110 A 0.058 -111 K 0.066 -112 T 0.083 -113 V 0.104 -114 L 0.125 -115 A 0.134 -116 A 0.124 -117 P 0.101 -118 I 0.078 -119 L 0.063 -120 E 0.056 -121 V 0.052 -122 S 0.051 -123 S 0.054 -124 P 0.058 -125 S 0.059 -126 S 0.053 -127 D 0.042 -128 S 0.033 -129 I 0.028 -130 L 0.029 -131 V 0.032 -132 Q 0.037 -133 W 0.042 -134 E 0.047 -135 A 0.054 -136 V 0.060 -137 Y 0.063 -138 M 0.063 -139 A 0.057 -140 I 0.045 -141 A 0.031 -142 F 0.022 -143 S 0.021 -144 V 0.024 -145 S 0.032 -146 I 0.044 -147 M 0.062 -148 R 0.089 -149 A 0.121 -150 N 0.153 -151 G 0.179 -152 L 0.191 -153 G 0.186 -154 S 0.165 -155 I 0.134 -156 W 0.106 -157 K 0.085 -158 E 0.071 -159 N 0.063 -160 T 0.060 -161 T 0.056 -162 N 0.050 -163 T 0.043 -164 S 0.039 -165 L 0.038 -166 T 0.041 -167 F 0.049 -168 T 0.062 -169 S 0.077 -170 L 0.093 -171 E 0.108 -172 A 0.116 -173 G 0.113 -174 T 0.097 -175 L 0.073 -176 Y 0.051 -177 T 0.037 -178 I 0.029 -179 K 0.026 -180 A 0.027 -181 Y 0.030 -182 A 0.036 -183 W 0.044 -184 N 0.059 -185 A 0.077 -186 N 0.095 -187 R 0.110 -188 I 0.125 -189 P 0.135 -190 G 0.137 -191 D 0.126 -192 D 0.106 -193 S 0.087 -194 T 0.073 -195 C 0.066 -196 N 0.063 -197 Q 0.069 -198 R 0.082 -199 T 0.102 -200 S 0.124 -201 P 0.141 -202 R 0.140 -203 A 0.121 -204 P 0.096 -205 A 0.077 -206 N 0.064 -207 I 0.050 -208 Q 0.038 -209 V 0.030 -210 S 0.029 -211 F 0.036 -212 D 0.050 -213 S 0.066 -214 G 0.075 -215 A 0.068 -216 L 0.051 -217 K 0.035 -218 A 0.025 -219 S 0.020 -220 F 0.019 -221 S 0.021 -222 W 0.027 -223 A 0.035 -224 R 0.047 -225 A 0.064 -226 E 0.078 -227 G 0.081 -228 A 0.069 -229 F 0.048 -230 N 0.030 -231 Y 0.021 -232 T 0.020 -233 V 0.022 -234 M 0.028 -235 A 0.037 -236 L 0.049 -237 S 0.064 -238 D 0.078 -239 S 0.087 -240 S 0.086 -241 E 0.079 -242 L 0.069 -243 T 0.059 -244 C 0.052 -245 S 0.047 -246 T 0.043 -247 T 0.039 -248 F 0.035 -249 S 0.034 -250 S 0.034 -251 C 0.036 -252 T 0.036 -253 I 0.036 -254 S 0.038 -255 S 0.045 -256 L 0.057 -257 Q 0.071 -258 C 0.084 -259 G 0.089 -260 T 0.084 -261 E 0.068 -262 Y 0.051 -263 L 0.039 -264 I 0.033 -265 S 0.031 -266 V 0.032 -267 L 0.035 -268 A 0.039 -269 S 0.046 -270 N 0.057 -271 D 0.069 -272 A 0.078 -273 G 0.078 -274 S 0.075 -275 S 0.074 -276 K 0.076 -277 S 0.079 -278 S 0.085 -279 S 0.086 -280 A 0.079 -281 M 0.067 -282 T 0.058 -283 L 0.059 -284 K 0.069 -285 T 0.088 -286 V 0.109 -287 A 0.121 -288 C 0.122 -289 A 0.115 -290 P 0.104 -291 G 0.092 -292 R 0.077 -293 V 0.062 -294 T 0.052 -295 I 0.049 -296 Q 0.050 -297 E 0.054 -298 D 0.061 -299 P 0.066 -300 P 0.064 -301 G 0.056 -302 H 0.045 -303 L 0.036 -304 S 0.031 -305 V 0.031 -306 A 0.033 -307 W 0.037 -308 S 0.043 -309 S 0.050 -310 V 0.059 -311 D 0.067 -312 L 0.072 -313 G 0.070 -314 D 0.056 -315 Y 0.039 -316 Y 0.027 -317 V 0.024 -318 V 0.026 -319 F 0.033 -320 V 0.042 -321 K 0.055 -322 S 0.074 -323 D 0.099 -324 D 0.122 -325 G 0.131 -326 L 0.121 -327 E 0.100 -328 V 0.080 -329 H 0.067 -330 C 0.062 -331 N 0.063 -332 T 0.064 -333 S 0.062 -334 L 0.057 -335 T 0.052 -336 Q 0.050 -337 C 0.050 -338 N 0.053 -339 F 0.058 -340 L 0.065 -341 S 0.071 -342 E 0.078 -343 C 0.090 -344 G 0.101 -345 F 0.098 -346 T 0.080 -347 Y 0.057 -348 F 0.041 -349 I 0.034 -350 S 0.032 -351 V 0.035 -352 F 0.043 -353 V 0.056 -354 Y 0.068 -355 N 0.079 -356 K 0.089 -357 A 0.098 -358 G 0.100 -359 Q 0.098 -360 S 0.099 -361 P 0.103 -362 L 0.106 -363 G 0.109 -364 D 0.111 -365 I 0.107 -366 F 0.098 -367 N 0.087 -368 Y 0.081 -369 T 0.085 -370 T 0.105 -371 A 0.131 -372 P 0.147 -373 C 0.147 -374 C 0.135 -375 P 0.121 -376 S 0.112 -377 D 0.106 -378 I 0.099 -379 N 0.089 -380 P 0.078 -381 V 0.068 -382 L 0.064 -383 V 0.062 -384 S 0.057 -385 S 0.047 -386 D 0.036 -387 R 0.029 -388 V 0.028 -389 E 0.031 -390 I 0.036 -391 V 0.042 -392 W 0.051 -393 S 0.068 -394 P 0.091 -395 V 0.116 -396 R 0.132 -397 G 0.129 -398 A 0.106 -399 E 0.075 -400 L 0.051 -401 Y 0.039 -402 E 0.037 -403 T 0.040 -404 K 0.045 -405 A 0.053 -406 V 0.065 -407 D 0.081 -408 G 0.100 -409 Y 0.117 -410 N 0.128 -411 M 0.131 -412 V 0.125 -413 E 0.111 -414 C 0.094 -415 N 0.079 -416 D 0.071 -417 T 0.067 -418 T 0.064 -419 P 0.060 -420 A 0.058 -421 C 0.059 -422 T 0.060 -423 L 0.062 -424 S 0.068 -425 A 0.077 -426 L 0.087 -427 E 0.099 -428 C 0.109 -429 D 0.116 -430 T 0.115 -431 K 0.104 -432 Y 0.088 -433 N 0.075 -434 I 0.066 -435 T 0.060 -436 V 0.059 -437 Y 0.062 -438 S 0.067 -439 F 0.071 -440 N 0.075 -441 E 0.084 -442 V 0.098 -443 R 0.113 -444 G 0.123 -445 S 0.129 -446 N 0.133 -447 M 0.136 -448 S 0.133 -449 C 0.126 -450 T 0.119 -451 P 0.111 -452 Q 0.101 -453 F 0.090 -454 I 0.085 -455 T 0.097 -456 T 0.124 -457 A 0.154 -458 P 0.170 -459 C 0.166 -460 S 0.147 -461 P 0.126 -462 E 0.111 -463 I 0.105 -464 K 0.102 -465 N 0.095 -466 V 0.083 -467 S 0.073 -468 R 0.070 -469 D 0.072 -470 A 0.069 -471 F 0.059 -472 S 0.046 -473 M 0.036 -474 I 0.032 -475 N 0.033 -476 V 0.039 -477 H 0.046 -478 W 0.056 -479 R 0.073 -480 S 0.098 -481 T 0.127 -482 N 0.150 -483 D 0.160 -484 D 0.152 -485 A 0.126 -486 T 0.092 -487 Y 0.064 -488 T 0.052 -489 V 0.054 -490 T 0.066 -491 A 0.086 -492 Q 0.110 -493 G 0.134 -494 E 0.149 -495 K 0.148 -496 G 0.136 -497 L 0.122 -498 Y 0.113 -499 Q 0.103 -500 C 0.092 -501 S 0.085 -502 S 0.086 -503 T 0.092 -504 G 0.096 -505 E 0.092 -506 S 0.083 -507 C 0.076 -508 T 0.077 -509 M 0.085 -510 R 0.100 -511 G 0.120 -512 L 0.137 -513 P 0.145 -514 C 0.145 -515 G 0.141 -516 S 0.132 -517 V 0.114 -518 F 0.093 -519 S 0.077 -520 V 0.068 -521 T 0.063 -522 A 0.063 -523 V 0.068 -524 A 0.077 -525 E 0.087 -526 T 0.099 -527 Q 0.114 -528 A 0.129 -529 G 0.138 -530 R 0.141 -531 S 0.144 -532 L 0.154 -533 P 0.163 -534 S 0.163 -535 Y 0.155 -536 S 0.144 -537 V 0.140 -538 P 0.143 -539 L 0.153 -540 E 0.166 -541 T 0.177 -542 V 0.186 -543 P 0.189 -544 C 0.182 -545 C 0.165 -546 P 0.147 -547 T 0.132 -548 G 0.119 -549 L 0.101 -550 T 0.082 -551 V 0.068 -552 T 0.059 -553 Q 0.055 -554 I 0.053 -555 T 0.049 -556 Q 0.043 -557 S 0.038 -558 V 0.039 -559 I 0.043 -560 N 0.048 -561 V 0.052 -562 S 0.054 -563 W 0.054 -564 T 0.061 -565 I 0.081 -566 G 0.105 -567 R 0.120 -568 V 0.117 -569 A 0.099 -570 Q 0.076 -571 T 0.054 -572 H 0.041 -573 V 0.037 -574 A 0.042 -575 V 0.051 -576 L 0.063 -577 E 0.077 -578 S 0.099 -579 H 0.126 -580 T 0.149 -581 G 0.158 -582 Q 0.152 -583 S 0.137 -584 K 0.118 -585 C 0.101 -586 H 0.090 -587 T 0.085 -588 H 0.080 -589 Q 0.075 -590 N 0.073 -591 H 0.076 -592 C 0.079 -593 L 0.079 -594 L 0.077 -595 G 0.077 -596 C 0.077 -597 I 0.081 -598 T 0.094 -599 C 0.117 -600 G 0.140 -601 I 0.146 -602 N 0.128 -603 Y 0.099 -604 T 0.075 -605 V 0.061 -606 T 0.054 -607 L 0.054 -608 K 0.060 -609 A 0.071 -610 I 0.083 -611 S 0.097 -612 A 0.115 -613 T 0.131 -614 G 0.137 -615 L 0.129 -616 T 0.120 -617 A 0.120 -618 D 0.122 -619 C 0.117 -620 S 0.109 -621 Y 0.105 -622 Q 0.102 -623 S 0.099 -624 Y 0.098 -625 F 0.107 -626 S 0.133 -627 G 0.170 -628 A 0.198 -629 C 0.198 -630 C 0.177 -631 P 0.152 -632 L 0.133 -633 G 0.113 -634 V 0.090 -635 K 0.070 -636 L 0.060 -637 Y 0.064 -638 R 0.077 -639 L 0.088 -640 G 0.085 -641 P 0.072 -642 N 0.059 -643 G 0.050 -644 I 0.046 -645 R 0.045 -646 I 0.049 -647 Y 0.058 -648 W 0.073 -649 Q 0.097 -650 A 0.126 -651 S 0.151 -652 R 0.165 -653 G 0.162 -654 S 0.140 -655 A 0.108 -656 N 0.078 -657 Y 0.062 -658 S 0.060 -659 T 0.066 -660 D 0.077 -661 L 0.092 -662 Y 0.111 -663 G 0.130 -664 S 0.141 -665 K 0.141 -666 G 0.134 -667 I 0.126 -668 F 0.119 -669 T 0.114 -670 C 0.118 -671 T 0.134 -672 P 0.156 -673 S 0.169 -674 A 0.168 -675 G 0.152 -676 L 0.129 -677 S 0.105 -678 F 0.091 -679 C 0.089 -680 D 0.091 -681 V 0.095 -682 T 0.102 -683 E 0.113 -684 I 0.119 -685 P 0.120 -686 C 0.124 -687 G 0.132 -688 D 0.133 -689 V 0.118 -690 Y 0.096 -691 T 0.081 -692 V 0.074 -693 M 0.075 -694 V 0.082 -695 S 0.092 -696 P 0.100 -697 V 0.108 -698 A 0.124 -699 K 0.152 -700 T 0.185 -701 G 0.207 -702 L 0.207 -703 K 0.187 -704 L 0.161 -705 T 0.144 -706 F 0.141 -707 C 0.147 -708 P 0.150 -709 K 0.140 -710 K 0.117 -711 I 0.091 -712 Y 0.071 -713 S 0.064 -714 V 0.069 -715 T 0.080 -716 C 0.091 -717 S 0.099 -718 G 0.101 -719 S 0.099 -720 T 0.094 -721 L 0.091 -722 G 0.092 -723 M 0.096 -724 V 0.097 -725 I 0.096 -726 Y 0.098 -727 R 0.106 -728 G 0.118 -729 K 0.130 -730 R 0.141 -731 N 0.154 -732 E 0.169 -733 E 0.179 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000143107.11_ENST00000370017.9_GN:FNDC7_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:4.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000143107.11_ENST00000370017.9_GN:FNDC7_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:4.caid deleted file mode 100644 index e96fc05686f5644795a98e33bf72aebd36116f25..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000143107.11_ENST00000370017.9_GN:FNDC7_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:4.caid +++ /dev/null @@ -1,738 +0,0 @@ ->ENSG00000143107.11|ENST00000370017.9|GN:FNDC7|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:4 -1 M 0.327 -2 S 0.322 -3 N 0.327 -4 R 0.344 -5 M 0.359 -6 A 0.377 -7 G 0.411 -8 G 0.437 -9 R 0.429 -10 E 0.412 -11 T 0.414 -12 C 0.422 -13 L 0.418 -14 P 0.407 -15 L 0.384 -16 I 0.340 -17 G 0.289 -18 F 0.254 -19 I 0.235 -20 L 0.222 -21 I 0.218 -22 C 0.224 -23 L 0.237 -24 K 0.267 -25 M 0.323 -26 V 0.386 -27 A 0.436 -28 S 0.466 -29 A 0.471 -30 K 0.437 -31 S 0.369 -32 A 0.287 -33 P 0.211 -34 E 0.150 -35 I 0.107 -36 P 0.080 -37 T 0.063 -38 I 0.053 -39 D 0.049 -40 Q 0.048 -41 A 0.049 -42 Y 0.051 -43 S 0.051 -44 K 0.048 -45 L 0.043 -46 S 0.036 -47 N 0.031 -48 S 0.028 -49 I 0.028 -50 T 0.030 -51 V 0.032 -52 E 0.035 -53 W 0.038 -54 A 0.045 -55 T 0.059 -56 V 0.074 -57 P 0.083 -58 G 0.082 -59 A 0.069 -60 T 0.051 -61 S 0.037 -62 Y 0.032 -63 L 0.032 -64 L 0.036 -65 T 0.043 -66 A 0.053 -67 E 0.065 -68 D 0.074 -69 G 0.078 -70 D 0.080 -71 T 0.081 -72 V 0.082 -73 I 0.079 -74 E 0.071 -75 T 0.063 -76 T 0.056 -77 V 0.053 -78 A 0.050 -79 N 0.044 -80 S 0.039 -81 P 0.039 -82 G 0.043 -83 T 0.045 -84 V 0.046 -85 T 0.051 -86 G 0.062 -87 L 0.078 -88 K 0.093 -89 A 0.101 -90 A 0.096 -91 T 0.081 -92 W 0.063 -93 Y 0.050 -94 E 0.040 -95 I 0.033 -96 T 0.029 -97 I 0.030 -98 R 0.034 -99 S 0.040 -100 I 0.047 -101 S 0.058 -102 A 0.072 -103 A 0.083 -104 G 0.084 -105 R 0.077 -106 S 0.071 -107 Q 0.071 -108 A 0.075 -109 S 0.079 -110 P 0.079 -111 P 0.073 -112 K 0.064 -113 Q 0.058 -114 A 0.058 -115 K 0.067 -116 T 0.084 -117 V 0.106 -118 L 0.126 -119 A 0.135 -120 A 0.125 -121 P 0.101 -122 I 0.078 -123 L 0.063 -124 E 0.056 -125 V 0.052 -126 S 0.052 -127 S 0.054 -128 P 0.058 -129 S 0.059 -130 S 0.053 -131 D 0.042 -132 S 0.033 -133 I 0.028 -134 L 0.028 -135 V 0.032 -136 Q 0.037 -137 W 0.042 -138 E 0.048 -139 A 0.054 -140 V 0.061 -141 Y 0.065 -142 M 0.065 -143 A 0.058 -144 I 0.045 -145 A 0.031 -146 F 0.022 -147 S 0.021 -148 V 0.024 -149 S 0.032 -150 I 0.044 -151 M 0.062 -152 R 0.089 -153 A 0.121 -154 N 0.153 -155 G 0.179 -156 L 0.192 -157 G 0.187 -158 S 0.165 -159 I 0.134 -160 W 0.105 -161 K 0.084 -162 E 0.071 -163 N 0.063 -164 T 0.059 -165 T 0.055 -166 N 0.049 -167 T 0.043 -168 S 0.039 -169 L 0.038 -170 T 0.041 -171 F 0.049 -172 T 0.062 -173 S 0.077 -174 L 0.093 -175 E 0.108 -176 A 0.117 -177 G 0.113 -178 T 0.097 -179 L 0.073 -180 Y 0.051 -181 T 0.037 -182 I 0.029 -183 K 0.026 -184 A 0.027 -185 Y 0.031 -186 A 0.036 -187 W 0.044 -188 N 0.058 -189 A 0.076 -190 N 0.094 -191 R 0.109 -192 I 0.124 -193 P 0.134 -194 G 0.136 -195 D 0.125 -196 D 0.105 -197 S 0.086 -198 T 0.072 -199 C 0.065 -200 N 0.063 -201 Q 0.068 -202 R 0.082 -203 T 0.101 -204 S 0.124 -205 P 0.141 -206 R 0.140 -207 A 0.121 -208 P 0.096 -209 A 0.077 -210 N 0.063 -211 I 0.049 -212 Q 0.037 -213 V 0.030 -214 S 0.029 -215 F 0.035 -216 D 0.049 -217 S 0.066 -218 G 0.074 -219 A 0.067 -220 L 0.050 -221 K 0.034 -222 A 0.024 -223 S 0.020 -224 F 0.019 -225 S 0.021 -226 W 0.026 -227 A 0.035 -228 R 0.047 -229 A 0.063 -230 E 0.077 -231 G 0.080 -232 A 0.068 -233 F 0.048 -234 N 0.030 -235 Y 0.021 -236 T 0.020 -237 V 0.022 -238 M 0.028 -239 A 0.037 -240 L 0.049 -241 S 0.064 -242 D 0.078 -243 S 0.087 -244 S 0.086 -245 E 0.079 -246 L 0.069 -247 T 0.059 -248 C 0.051 -249 S 0.047 -250 T 0.043 -251 T 0.039 -252 F 0.035 -253 S 0.033 -254 S 0.034 -255 C 0.036 -256 T 0.036 -257 I 0.036 -258 S 0.038 -259 S 0.045 -260 L 0.057 -261 Q 0.071 -262 C 0.083 -263 G 0.089 -264 T 0.084 -265 E 0.068 -266 Y 0.051 -267 L 0.039 -268 I 0.033 -269 S 0.031 -270 V 0.032 -271 L 0.035 -272 A 0.039 -273 S 0.046 -274 N 0.056 -275 D 0.069 -276 A 0.078 -277 G 0.078 -278 S 0.075 -279 S 0.074 -280 K 0.075 -281 S 0.078 -282 S 0.082 -283 S 0.083 -284 A 0.076 -285 M 0.065 -286 T 0.058 -287 L 0.059 -288 K 0.070 -289 T 0.089 -290 V 0.110 -291 A 0.122 -292 C 0.123 -293 A 0.116 -294 P 0.105 -295 G 0.093 -296 R 0.078 -297 V 0.063 -298 T 0.053 -299 I 0.049 -300 Q 0.050 -301 E 0.055 -302 D 0.062 -303 P 0.066 -304 P 0.065 -305 G 0.057 -306 H 0.045 -307 L 0.036 -308 S 0.031 -309 V 0.031 -310 A 0.034 -311 W 0.038 -312 S 0.044 -313 S 0.051 -314 V 0.059 -315 D 0.068 -316 L 0.073 -317 G 0.071 -318 D 0.057 -319 Y 0.039 -320 Y 0.027 -321 V 0.024 -322 V 0.027 -323 F 0.033 -324 V 0.042 -325 K 0.055 -326 S 0.074 -327 D 0.100 -328 D 0.123 -329 G 0.132 -330 L 0.122 -331 E 0.101 -332 V 0.081 -333 H 0.068 -334 C 0.063 -335 N 0.063 -336 T 0.065 -337 S 0.063 -338 L 0.058 -339 T 0.053 -340 Q 0.050 -341 C 0.051 -342 N 0.053 -343 F 0.059 -344 L 0.066 -345 S 0.071 -346 E 0.079 -347 C 0.091 -348 G 0.102 -349 F 0.099 -350 T 0.080 -351 Y 0.058 -352 F 0.042 -353 I 0.034 -354 S 0.032 -355 V 0.035 -356 F 0.043 -357 V 0.056 -358 Y 0.068 -359 N 0.079 -360 K 0.090 -361 A 0.098 -362 G 0.100 -363 Q 0.099 -364 S 0.100 -365 P 0.103 -366 L 0.107 -367 G 0.110 -368 D 0.112 -369 I 0.108 -370 F 0.099 -371 N 0.088 -372 Y 0.081 -373 T 0.086 -374 T 0.105 -375 A 0.131 -376 P 0.148 -377 C 0.148 -378 C 0.136 -379 P 0.121 -380 S 0.112 -381 D 0.106 -382 I 0.099 -383 N 0.089 -384 P 0.077 -385 V 0.068 -386 L 0.064 -387 V 0.062 -388 S 0.057 -389 S 0.047 -390 D 0.036 -391 R 0.029 -392 V 0.028 -393 E 0.031 -394 I 0.036 -395 V 0.042 -396 W 0.051 -397 S 0.067 -398 P 0.091 -399 V 0.116 -400 R 0.132 -401 G 0.128 -402 A 0.106 -403 E 0.075 -404 L 0.051 -405 Y 0.039 -406 E 0.037 -407 T 0.040 -408 K 0.045 -409 A 0.053 -410 V 0.064 -411 D 0.080 -412 G 0.099 -413 Y 0.116 -414 N 0.128 -415 M 0.131 -416 V 0.124 -417 E 0.111 -418 C 0.094 -419 N 0.079 -420 D 0.071 -421 T 0.067 -422 T 0.064 -423 P 0.060 -424 A 0.058 -425 C 0.059 -426 T 0.060 -427 L 0.062 -428 S 0.068 -429 A 0.077 -430 L 0.087 -431 E 0.099 -432 C 0.109 -433 D 0.116 -434 T 0.115 -435 K 0.104 -436 Y 0.089 -437 N 0.075 -438 I 0.066 -439 T 0.060 -440 V 0.059 -441 Y 0.062 -442 S 0.067 -443 F 0.071 -444 N 0.076 -445 E 0.084 -446 V 0.098 -447 R 0.113 -448 G 0.124 -449 S 0.129 -450 N 0.134 -451 M 0.137 -452 S 0.134 -453 C 0.127 -454 T 0.119 -455 P 0.112 -456 Q 0.101 -457 F 0.090 -458 I 0.085 -459 T 0.097 -460 T 0.125 -461 A 0.155 -462 P 0.171 -463 C 0.167 -464 S 0.148 -465 P 0.126 -466 E 0.111 -467 I 0.105 -468 K 0.103 -469 N 0.096 -470 V 0.083 -471 S 0.073 -472 R 0.071 -473 D 0.072 -474 A 0.069 -475 F 0.059 -476 S 0.046 -477 M 0.037 -478 I 0.033 -479 N 0.034 -480 V 0.039 -481 H 0.047 -482 W 0.057 -483 R 0.073 -484 S 0.099 -485 T 0.128 -486 N 0.151 -487 D 0.161 -488 D 0.153 -489 A 0.127 -490 T 0.092 -491 Y 0.064 -492 T 0.052 -493 V 0.055 -494 T 0.067 -495 A 0.086 -496 Q 0.111 -497 G 0.135 -498 E 0.150 -499 K 0.149 -500 G 0.136 -501 L 0.123 -502 Y 0.113 -503 Q 0.104 -504 C 0.093 -505 S 0.085 -506 S 0.086 -507 T 0.093 -508 G 0.097 -509 E 0.092 -510 S 0.083 -511 C 0.077 -512 T 0.078 -513 M 0.086 -514 R 0.101 -515 G 0.120 -516 L 0.138 -517 P 0.146 -518 C 0.146 -519 G 0.142 -520 S 0.132 -521 V 0.114 -522 F 0.093 -523 S 0.077 -524 V 0.068 -525 T 0.063 -526 A 0.063 -527 V 0.068 -528 A 0.077 -529 E 0.087 -530 T 0.099 -531 Q 0.114 -532 A 0.129 -533 G 0.138 -534 R 0.141 -535 S 0.145 -536 L 0.154 -537 P 0.163 -538 S 0.163 -539 Y 0.155 -540 S 0.145 -541 V 0.140 -542 P 0.143 -543 L 0.153 -544 E 0.167 -545 T 0.178 -546 V 0.186 -547 P 0.189 -548 C 0.182 -549 C 0.165 -550 P 0.147 -551 T 0.133 -552 G 0.119 -553 L 0.101 -554 T 0.082 -555 V 0.068 -556 T 0.059 -557 Q 0.055 -558 I 0.053 -559 T 0.049 -560 Q 0.042 -561 S 0.038 -562 V 0.039 -563 I 0.043 -564 N 0.048 -565 V 0.052 -566 S 0.053 -567 W 0.054 -568 T 0.061 -569 I 0.080 -570 G 0.105 -571 R 0.120 -572 V 0.116 -573 A 0.099 -574 Q 0.075 -575 T 0.054 -576 H 0.041 -577 V 0.037 -578 A 0.041 -579 V 0.051 -580 L 0.062 -581 E 0.077 -582 S 0.099 -583 H 0.126 -584 T 0.149 -585 G 0.158 -586 Q 0.152 -587 S 0.137 -588 K 0.118 -589 C 0.101 -590 H 0.090 -591 T 0.085 -592 H 0.080 -593 Q 0.075 -594 N 0.073 -595 H 0.076 -596 C 0.079 -597 L 0.079 -598 L 0.077 -599 G 0.076 -600 C 0.077 -601 I 0.081 -602 T 0.094 -603 C 0.117 -604 G 0.140 -605 I 0.146 -606 N 0.128 -607 Y 0.098 -608 T 0.075 -609 V 0.061 -610 T 0.054 -611 L 0.054 -612 K 0.060 -613 A 0.070 -614 I 0.083 -615 S 0.097 -616 A 0.115 -617 T 0.131 -618 G 0.137 -619 L 0.129 -620 T 0.121 -621 A 0.121 -622 D 0.122 -623 C 0.117 -624 S 0.109 -625 Y 0.105 -626 Q 0.102 -627 S 0.099 -628 Y 0.098 -629 F 0.107 -630 S 0.133 -631 G 0.170 -632 A 0.198 -633 C 0.199 -634 C 0.177 -635 P 0.152 -636 L 0.132 -637 G 0.112 -638 V 0.090 -639 K 0.070 -640 L 0.060 -641 Y 0.064 -642 R 0.077 -643 L 0.088 -644 G 0.085 -645 P 0.072 -646 N 0.059 -647 G 0.050 -648 I 0.045 -649 R 0.045 -650 I 0.049 -651 Y 0.058 -652 W 0.073 -653 Q 0.097 -654 A 0.126 -655 S 0.151 -656 R 0.165 -657 G 0.161 -658 S 0.140 -659 A 0.107 -660 N 0.078 -661 Y 0.061 -662 S 0.059 -663 T 0.066 -664 D 0.077 -665 L 0.092 -666 Y 0.111 -667 G 0.130 -668 S 0.141 -669 K 0.141 -670 G 0.134 -671 I 0.125 -672 F 0.118 -673 T 0.114 -674 C 0.118 -675 T 0.134 -676 P 0.155 -677 S 0.169 -678 A 0.167 -679 G 0.152 -680 L 0.128 -681 S 0.105 -682 F 0.091 -683 C 0.089 -684 D 0.091 -685 V 0.095 -686 T 0.102 -687 E 0.112 -688 I 0.119 -689 P 0.120 -690 C 0.123 -691 G 0.132 -692 D 0.133 -693 V 0.118 -694 Y 0.096 -695 T 0.081 -696 V 0.074 -697 M 0.075 -698 V 0.082 -699 S 0.092 -700 P 0.100 -701 V 0.108 -702 A 0.124 -703 K 0.152 -704 T 0.185 -705 G 0.207 -706 L 0.207 -707 K 0.187 -708 L 0.161 -709 T 0.144 -710 F 0.141 -711 C 0.147 -712 P 0.150 -713 K 0.140 -714 K 0.117 -715 I 0.091 -716 Y 0.071 -717 S 0.065 -718 V 0.069 -719 T 0.080 -720 C 0.091 -721 S 0.098 -722 G 0.101 -723 S 0.098 -724 T 0.093 -725 L 0.090 -726 G 0.091 -727 M 0.095 -728 V 0.096 -729 I 0.095 -730 Y 0.097 -731 R 0.105 -732 G 0.117 -733 K 0.129 -734 R 0.140 -735 N 0.153 -736 E 0.167 -737 E 0.177 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000143627.19_ENST00000342741.6_GN:PKLR_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000143627.19_ENST00000342741.6_GN:PKLR_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 3bc0a76327ccb5a022f7fcfc7ff8591508ef29ac..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000143627.19_ENST00000342741.6_GN:PKLR_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,575 +0,0 @@ ->ENSG00000143627.19|ENST00000342741.6|GN:PKLR|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.278 -2 S 0.283 -3 I 0.290 -4 Q 0.293 -5 E 0.292 -6 N 0.280 -7 I 0.256 -8 S 0.226 -9 S 0.197 -10 L 0.177 -11 Q 0.170 -12 L 0.168 -13 R 0.160 -14 S 0.148 -15 W 0.138 -16 V 0.128 -17 S 0.113 -18 K 0.105 -19 S 0.109 -20 Q 0.119 -21 R 0.130 -22 D 0.147 -23 L 0.169 -24 A 0.191 -25 K 0.215 -26 S 0.251 -27 I 0.300 -28 L 0.349 -29 I 0.384 -30 G 0.402 -31 A 0.404 -32 P 0.401 -33 G 0.413 -34 G 0.446 -35 P 0.480 -36 A 0.487 -37 G 0.465 -38 Y 0.437 -39 L 0.412 -40 R 0.379 -41 R 0.333 -42 A 0.291 -43 S 0.265 -44 V 0.243 -45 A 0.216 -46 Q 0.193 -47 L 0.185 -48 T 0.193 -49 Q 0.223 -50 E 0.270 -51 L 0.311 -52 G 0.329 -53 T 0.329 -54 A 0.322 -55 F 0.313 -56 F 0.305 -57 Q 0.299 -58 Q 0.297 -59 Q 0.300 -60 Q 0.304 -61 L 0.303 -62 P 0.294 -63 A 0.277 -64 A 0.256 -65 M 0.240 -66 A 0.236 -67 D 0.240 -68 T 0.244 -69 F 0.247 -70 L 0.258 -71 E 0.290 -72 H 0.348 -73 L 0.410 -74 C 0.452 -75 L 0.483 -76 L 0.512 -77 D 0.513 -78 I 0.466 -79 D 0.396 -80 S 0.342 -81 E 0.306 -82 P 0.268 -83 V 0.225 -84 A 0.184 -85 A 0.150 -86 R 0.119 -87 S 0.088 -88 T 0.065 -89 S 0.052 -90 I 0.047 -91 I 0.045 -92 A 0.046 -93 T 0.050 -94 I 0.056 -95 G 0.061 -96 P 0.065 -97 A 0.068 -98 S 0.067 -99 R 0.064 -100 S 0.062 -101 V 0.063 -102 E 0.062 -103 R 0.058 -104 L 0.053 -105 K 0.051 -106 E 0.052 -107 M 0.054 -108 I 0.056 -109 K 0.057 -110 A 0.059 -111 G 0.058 -112 M 0.054 -113 N 0.054 -114 I 0.061 -115 A 0.072 -116 R 0.081 -117 L 0.083 -118 N 0.081 -119 F 0.080 -120 S 0.085 -121 H 0.094 -122 G 0.097 -123 S 0.095 -124 H 0.092 -125 E 0.087 -126 Y 0.077 -127 H 0.063 -128 A 0.055 -129 E 0.055 -130 S 0.062 -131 I 0.074 -132 A 0.081 -133 N 0.077 -134 V 0.064 -135 R 0.054 -136 E 0.052 -137 A 0.056 -138 V 0.060 -139 E 0.065 -140 S 0.080 -141 F 0.103 -142 A 0.127 -143 G 0.139 -144 S 0.133 -145 P 0.115 -146 L 0.098 -147 S 0.087 -148 Y 0.079 -149 R 0.073 -150 P 0.068 -151 V 0.064 -152 A 0.063 -153 I 0.067 -154 A 0.080 -155 L 0.101 -156 D 0.127 -157 T 0.150 -158 K 0.168 -159 G 0.178 -160 P 0.181 -161 E 0.176 -162 I 0.162 -163 R 0.140 -164 T 0.120 -165 G 0.114 -166 I 0.123 -167 L 0.138 -168 Q 0.148 -169 G 0.151 -170 G 0.153 -171 P 0.150 -172 E 0.141 -173 S 0.128 -174 E 0.114 -175 V 0.101 -176 E 0.088 -177 L 0.074 -178 V 0.063 -179 K 0.059 -180 G 0.060 -181 S 0.059 -182 Q 0.055 -183 V 0.051 -184 L 0.053 -185 V 0.059 -186 T 0.066 -187 V 0.073 -188 D 0.077 -189 P 0.077 -190 A 0.073 -191 F 0.070 -192 R 0.070 -193 T 0.073 -194 R 0.080 -195 G 0.088 -196 N 0.093 -197 A 0.091 -198 N 0.081 -199 T 0.066 -200 V 0.049 -201 W 0.037 -202 V 0.032 -203 D 0.033 -204 Y 0.037 -205 P 0.040 -206 N 0.039 -207 I 0.036 -208 V 0.037 -209 R 0.045 -210 V 0.055 -211 V 0.059 -212 P 0.058 -213 V 0.055 -214 G 0.053 -215 G 0.051 -216 R 0.047 -217 I 0.042 -218 Y 0.040 -219 I 0.040 -220 D 0.043 -221 D 0.048 -222 G 0.051 -223 L 0.051 -224 I 0.047 -225 S 0.041 -226 L 0.038 -227 V 0.038 -228 V 0.038 -229 Q 0.040 -230 K 0.045 -231 I 0.049 -232 G 0.052 -233 P 0.049 -234 E 0.043 -235 G 0.034 -236 L 0.026 -237 V 0.024 -238 T 0.031 -239 Q 0.045 -240 V 0.062 -241 E 0.078 -242 N 0.090 -243 G 0.098 -244 G 0.099 -245 V 0.095 -246 L 0.090 -247 G 0.086 -248 S 0.084 -249 R 0.086 -250 K 0.094 -251 G 0.108 -252 V 0.122 -253 N 0.137 -254 L 0.152 -255 P 0.165 -256 G 0.174 -257 A 0.178 -258 Q 0.178 -259 V 0.178 -260 D 0.182 -261 L 0.186 -262 P 0.179 -263 G 0.160 -264 L 0.131 -265 S 0.100 -266 E 0.076 -267 Q 0.069 -268 D 0.075 -269 V 0.084 -270 R 0.086 -271 D 0.080 -272 L 0.068 -273 R 0.056 -274 F 0.050 -275 G 0.050 -276 V 0.052 -277 E 0.054 -278 H 0.056 -279 G 0.053 -280 V 0.048 -281 D 0.044 -282 I 0.043 -283 V 0.043 -284 F 0.044 -285 A 0.046 -286 S 0.052 -287 F 0.060 -288 V 0.065 -289 R 0.064 -290 K 0.059 -291 A 0.055 -292 S 0.051 -293 D 0.048 -294 V 0.047 -295 A 0.050 -296 A 0.056 -297 V 0.066 -298 R 0.077 -299 A 0.083 -300 A 0.079 -301 L 0.072 -302 G 0.066 -303 P 0.062 -304 E 0.059 -305 G 0.055 -306 H 0.053 -307 G 0.052 -308 I 0.052 -309 K 0.048 -310 I 0.042 -311 I 0.037 -312 S 0.037 -313 K 0.043 -314 I 0.048 -315 E 0.045 -316 N 0.040 -317 H 0.042 -318 E 0.048 -319 G 0.050 -320 V 0.047 -321 K 0.039 -322 R 0.032 -323 F 0.029 -324 D 0.031 -325 E 0.037 -326 I 0.041 -327 L 0.044 -328 E 0.047 -329 V 0.050 -330 S 0.050 -331 D 0.045 -332 G 0.039 -333 I 0.038 -334 M 0.042 -335 V 0.046 -336 A 0.047 -337 R 0.051 -338 G 0.062 -339 D 0.078 -340 L 0.086 -341 G 0.083 -342 I 0.078 -343 E 0.078 -344 I 0.081 -345 P 0.077 -346 A 0.066 -347 E 0.055 -348 K 0.050 -349 V 0.046 -350 F 0.043 -351 L 0.043 -352 A 0.047 -353 Q 0.049 -354 K 0.045 -355 M 0.041 -356 M 0.039 -357 I 0.038 -358 G 0.038 -359 R 0.039 -360 C 0.041 -361 N 0.047 -362 L 0.053 -363 A 0.059 -364 G 0.066 -365 K 0.077 -366 P 0.089 -367 V 0.099 -368 V 0.107 -369 C 0.113 -370 A 0.118 -371 T 0.125 -372 Q 0.133 -373 M 0.135 -374 L 0.125 -375 E 0.108 -376 S 0.094 -377 M 0.085 -378 I 0.076 -379 T 0.069 -380 K 0.071 -381 P 0.085 -382 R 0.103 -383 P 0.111 -384 T 0.103 -385 R 0.090 -386 A 0.083 -387 E 0.083 -388 T 0.086 -389 S 0.096 -390 D 0.111 -391 V 0.121 -392 A 0.125 -393 N 0.130 -394 A 0.133 -395 V 0.131 -396 L 0.131 -397 D 0.137 -398 G 0.145 -399 A 0.140 -400 D 0.124 -401 C 0.111 -402 I 0.110 -403 M 0.118 -404 L 0.127 -405 S 0.134 -406 G 0.136 -407 E 0.130 -408 T 0.119 -409 A 0.108 -410 K 0.102 -411 G 0.100 -412 N 0.101 -413 F 0.101 -414 P 0.098 -415 V 0.097 -416 E 0.099 -417 A 0.104 -418 V 0.108 -419 K 0.112 -420 M 0.115 -421 Q 0.113 -422 H 0.108 -423 A 0.108 -424 I 0.112 -425 A 0.114 -426 R 0.118 -427 E 0.129 -428 A 0.142 -429 E 0.147 -430 A 0.142 -431 A 0.127 -432 V 0.103 -433 Y 0.077 -434 H 0.059 -435 R 0.053 -436 Q 0.055 -437 L 0.063 -438 F 0.074 -439 E 0.079 -440 E 0.075 -441 L 0.066 -442 R 0.065 -443 R 0.077 -444 A 0.100 -445 A 0.125 -446 P 0.139 -447 L 0.141 -448 S 0.136 -449 R 0.129 -450 D 0.119 -451 P 0.108 -452 T 0.102 -453 E 0.102 -454 V 0.106 -455 T 0.107 -456 A 0.108 -457 I 0.109 -458 G 0.108 -459 A 0.104 -460 V 0.098 -461 E 0.093 -462 A 0.088 -463 A 0.083 -464 F 0.081 -465 K 0.084 -466 C 0.088 -467 C 0.086 -468 A 0.076 -469 A 0.064 -470 A 0.056 -471 I 0.056 -472 I 0.065 -473 V 0.075 -474 L 0.081 -475 T 0.086 -476 T 0.098 -477 T 0.117 -478 G 0.133 -479 R 0.133 -480 S 0.121 -481 A 0.110 -482 Q 0.110 -483 L 0.121 -484 L 0.128 -485 S 0.114 -486 R 0.092 -487 Y 0.081 -488 R 0.083 -489 P 0.092 -490 R 0.099 -491 A 0.099 -492 A 0.090 -493 V 0.074 -494 I 0.060 -495 A 0.055 -496 V 0.057 -497 T 0.064 -498 R 0.071 -499 S 0.071 -500 A 0.064 -501 Q 0.056 -502 A 0.051 -503 A 0.051 -504 R 0.057 -505 Q 0.067 -506 V 0.072 -507 H 0.068 -508 L 0.062 -509 C 0.061 -510 R 0.062 -511 G 0.064 -512 V 0.066 -513 F 0.069 -514 P 0.070 -515 L 0.070 -516 L 0.070 -517 Y 0.074 -518 R 0.085 -519 E 0.107 -520 P 0.134 -521 P 0.151 -522 E 0.149 -523 A 0.135 -524 I 0.114 -525 W 0.094 -526 A 0.080 -527 D 0.076 -528 D 0.079 -529 V 0.079 -530 D 0.071 -531 R 0.061 -532 R 0.054 -533 V 0.050 -534 Q 0.047 -535 F 0.045 -536 G 0.048 -537 I 0.056 -538 E 0.065 -539 S 0.069 -540 G 0.068 -541 K 0.069 -542 L 0.076 -543 R 0.088 -544 G 0.095 -545 F 0.095 -546 L 0.093 -547 R 0.096 -548 V 0.106 -549 G 0.118 -550 D 0.123 -551 L 0.118 -552 V 0.110 -553 I 0.107 -554 V 0.109 -555 V 0.108 -556 T 0.106 -557 G 0.108 -558 W 0.116 -559 R 0.128 -560 P 0.143 -561 G 0.167 -562 S 0.203 -563 G 0.240 -564 Y 0.256 -565 T 0.249 -566 N 0.231 -567 I 0.210 -568 M 0.181 -569 R 0.151 -570 V 0.128 -571 L 0.117 -572 S 0.121 -573 I 0.139 -574 S 0.158 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000143627.19_ENST00000342741.6_GN:PKLR_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:11.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000143627.19_ENST00000342741.6_GN:PKLR_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:11.caid deleted file mode 100644 index 72d0bbedc5e8930ebd0187980fdaee6ddbc0d1d2..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000143627.19_ENST00000342741.6_GN:PKLR_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:11.caid +++ /dev/null @@ -1,586 +0,0 @@ ->ENSG00000143627.19|ENST00000342741.6|GN:PKLR|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:11 -1 M 0.350 -2 V 0.363 -3 P 0.380 -4 Q 0.382 -5 P 0.356 -6 Q 0.318 -7 A 0.307 -8 H 0.330 -9 T 0.356 -10 E 0.373 -11 S 0.382 -12 M 0.377 -13 S 0.362 -14 I 0.354 -15 Q 0.356 -16 E 0.360 -17 N 0.351 -18 I 0.319 -19 S 0.277 -20 S 0.245 -21 L 0.224 -22 Q 0.212 -23 L 0.201 -24 R 0.187 -25 S 0.172 -26 W 0.163 -27 V 0.151 -28 S 0.134 -29 K 0.124 -30 S 0.128 -31 Q 0.138 -32 R 0.149 -33 D 0.164 -34 L 0.185 -35 A 0.205 -36 K 0.230 -37 S 0.274 -38 I 0.334 -39 L 0.389 -40 I 0.421 -41 G 0.429 -42 A 0.422 -43 P 0.415 -44 G 0.426 -45 G 0.460 -46 P 0.495 -47 A 0.505 -48 G 0.486 -49 Y 0.457 -50 L 0.431 -51 R 0.395 -52 R 0.345 -53 A 0.298 -54 S 0.267 -55 V 0.243 -56 A 0.217 -57 Q 0.195 -58 L 0.187 -59 T 0.193 -60 Q 0.222 -61 E 0.269 -62 L 0.307 -63 G 0.319 -64 T 0.315 -65 A 0.307 -66 F 0.300 -67 F 0.294 -68 Q 0.291 -69 Q 0.290 -70 Q 0.294 -71 Q 0.298 -72 L 0.295 -73 P 0.284 -74 A 0.265 -75 A 0.244 -76 M 0.230 -77 A 0.228 -78 D 0.233 -79 T 0.238 -80 F 0.241 -81 L 0.251 -82 E 0.283 -83 H 0.341 -84 L 0.402 -85 C 0.445 -86 L 0.476 -87 L 0.505 -88 D 0.505 -89 I 0.457 -90 D 0.387 -91 S 0.333 -92 E 0.298 -93 P 0.261 -94 V 0.220 -95 A 0.182 -96 A 0.149 -97 R 0.118 -98 S 0.088 -99 T 0.065 -100 S 0.052 -101 I 0.047 -102 I 0.045 -103 A 0.046 -104 T 0.050 -105 I 0.056 -106 G 0.061 -107 P 0.065 -108 A 0.068 -109 S 0.068 -110 R 0.064 -111 S 0.059 -112 V 0.056 -113 E 0.054 -114 R 0.051 -115 L 0.050 -116 K 0.051 -117 E 0.053 -118 M 0.055 -119 I 0.056 -120 K 0.058 -121 A 0.059 -122 G 0.058 -123 M 0.055 -124 N 0.055 -125 I 0.062 -126 A 0.073 -127 R 0.082 -128 L 0.084 -129 N 0.082 -130 F 0.081 -131 S 0.087 -132 H 0.096 -133 G 0.100 -134 S 0.097 -135 H 0.093 -136 E 0.088 -137 Y 0.078 -138 H 0.064 -139 A 0.056 -140 E 0.055 -141 S 0.062 -142 I 0.072 -143 A 0.078 -144 N 0.075 -145 V 0.063 -146 R 0.054 -147 E 0.053 -148 A 0.057 -149 V 0.061 -150 E 0.066 -151 S 0.081 -152 F 0.105 -153 A 0.128 -154 G 0.140 -155 S 0.133 -156 P 0.114 -157 L 0.096 -158 S 0.085 -159 Y 0.078 -160 R 0.072 -161 P 0.067 -162 V 0.063 -163 A 0.062 -164 I 0.067 -165 A 0.080 -166 L 0.101 -167 D 0.126 -168 T 0.150 -169 K 0.168 -170 G 0.178 -171 P 0.180 -172 E 0.175 -173 I 0.160 -174 R 0.138 -175 T 0.118 -176 G 0.111 -177 I 0.121 -178 L 0.136 -179 Q 0.146 -180 G 0.150 -181 G 0.151 -182 P 0.148 -183 E 0.139 -184 S 0.125 -185 E 0.112 -186 V 0.099 -187 E 0.086 -188 L 0.073 -189 V 0.063 -190 K 0.059 -191 G 0.059 -192 S 0.059 -193 Q 0.055 -194 V 0.051 -195 L 0.053 -196 V 0.059 -197 T 0.066 -198 V 0.073 -199 D 0.077 -200 P 0.076 -201 A 0.072 -202 F 0.069 -203 R 0.068 -204 T 0.071 -205 R 0.078 -206 G 0.086 -207 N 0.091 -208 A 0.089 -209 N 0.080 -210 T 0.064 -211 V 0.049 -212 W 0.037 -213 V 0.032 -214 D 0.033 -215 Y 0.037 -216 P 0.040 -217 N 0.038 -218 I 0.035 -219 V 0.036 -220 R 0.044 -221 V 0.054 -222 V 0.058 -223 P 0.056 -224 V 0.054 -225 G 0.052 -226 G 0.050 -227 R 0.046 -228 I 0.042 -229 Y 0.039 -230 I 0.039 -231 D 0.042 -232 D 0.047 -233 G 0.050 -234 L 0.050 -235 I 0.046 -236 S 0.041 -237 L 0.037 -238 V 0.037 -239 V 0.037 -240 Q 0.040 -241 K 0.044 -242 I 0.049 -243 G 0.052 -244 P 0.049 -245 E 0.043 -246 G 0.033 -247 L 0.025 -248 V 0.023 -249 T 0.030 -250 Q 0.044 -251 V 0.062 -252 E 0.078 -253 N 0.090 -254 G 0.098 -255 G 0.099 -256 V 0.095 -257 L 0.090 -258 G 0.086 -259 S 0.084 -260 R 0.086 -261 K 0.094 -262 G 0.108 -263 V 0.123 -264 N 0.138 -265 L 0.152 -266 P 0.165 -267 G 0.175 -268 A 0.180 -269 Q 0.180 -270 V 0.181 -271 D 0.186 -272 L 0.191 -273 P 0.186 -274 G 0.166 -275 L 0.136 -276 S 0.103 -277 E 0.079 -278 Q 0.071 -279 D 0.077 -280 V 0.085 -281 R 0.087 -282 D 0.081 -283 L 0.069 -284 R 0.057 -285 F 0.052 -286 G 0.051 -287 V 0.054 -288 E 0.056 -289 H 0.058 -290 G 0.055 -291 V 0.050 -292 D 0.046 -293 I 0.045 -294 V 0.045 -295 F 0.045 -296 A 0.048 -297 S 0.055 -298 F 0.064 -299 V 0.070 -300 R 0.068 -301 K 0.062 -302 A 0.058 -303 S 0.054 -304 D 0.050 -305 V 0.049 -306 A 0.052 -307 A 0.059 -308 V 0.069 -309 R 0.079 -310 A 0.085 -311 A 0.082 -312 L 0.075 -313 G 0.069 -314 P 0.066 -315 E 0.063 -316 G 0.060 -317 H 0.057 -318 G 0.056 -319 I 0.055 -320 K 0.051 -321 I 0.044 -322 I 0.039 -323 S 0.039 -324 K 0.045 -325 I 0.050 -326 E 0.047 -327 N 0.042 -328 H 0.044 -329 E 0.050 -330 G 0.052 -331 V 0.048 -332 K 0.040 -333 R 0.033 -334 F 0.030 -335 D 0.032 -336 E 0.038 -337 I 0.043 -338 L 0.046 -339 E 0.049 -340 V 0.053 -341 S 0.053 -342 D 0.047 -343 G 0.041 -344 I 0.040 -345 M 0.044 -346 V 0.048 -347 A 0.049 -348 R 0.053 -349 G 0.064 -350 D 0.079 -351 L 0.087 -352 G 0.083 -353 I 0.078 -354 E 0.078 -355 I 0.081 -356 P 0.076 -357 A 0.065 -358 E 0.055 -359 K 0.049 -360 V 0.046 -361 F 0.042 -362 L 0.043 -363 A 0.048 -364 Q 0.050 -365 K 0.047 -366 M 0.042 -367 M 0.039 -368 I 0.039 -369 G 0.039 -370 R 0.039 -371 C 0.042 -372 N 0.047 -373 L 0.053 -374 A 0.059 -375 G 0.066 -376 K 0.077 -377 P 0.089 -378 V 0.100 -379 V 0.108 -380 C 0.114 -381 A 0.119 -382 T 0.126 -383 Q 0.133 -384 M 0.135 -385 L 0.125 -386 E 0.108 -387 S 0.094 -388 M 0.085 -389 I 0.077 -390 T 0.070 -391 K 0.072 -392 P 0.086 -393 R 0.104 -394 P 0.112 -395 T 0.104 -396 R 0.090 -397 A 0.084 -398 E 0.084 -399 T 0.087 -400 S 0.096 -401 D 0.111 -402 V 0.121 -403 A 0.125 -404 N 0.129 -405 A 0.132 -406 V 0.130 -407 L 0.130 -408 D 0.136 -409 G 0.143 -410 A 0.139 -411 D 0.123 -412 C 0.111 -413 I 0.110 -414 M 0.118 -415 L 0.128 -416 S 0.135 -417 G 0.137 -418 E 0.131 -419 T 0.120 -420 A 0.109 -421 K 0.103 -422 G 0.101 -423 N 0.102 -424 F 0.101 -425 P 0.099 -426 V 0.097 -427 E 0.099 -428 A 0.104 -429 V 0.108 -430 K 0.112 -431 M 0.115 -432 Q 0.112 -433 H 0.107 -434 A 0.106 -435 I 0.110 -436 A 0.113 -437 R 0.118 -438 E 0.129 -439 A 0.142 -440 E 0.147 -441 A 0.143 -442 A 0.128 -443 V 0.103 -444 Y 0.076 -445 H 0.057 -446 R 0.049 -447 Q 0.049 -448 L 0.059 -449 F 0.071 -450 E 0.078 -451 E 0.074 -452 L 0.066 -453 R 0.065 -454 R 0.077 -455 A 0.100 -456 A 0.125 -457 P 0.140 -458 L 0.142 -459 S 0.137 -460 R 0.130 -461 D 0.120 -462 P 0.109 -463 T 0.103 -464 E 0.103 -465 V 0.106 -466 T 0.108 -467 A 0.109 -468 I 0.111 -469 G 0.109 -470 A 0.105 -471 V 0.099 -472 E 0.094 -473 A 0.089 -474 A 0.083 -475 F 0.081 -476 K 0.084 -477 C 0.088 -478 C 0.086 -479 A 0.077 -480 A 0.065 -481 A 0.056 -482 I 0.056 -483 I 0.065 -484 V 0.076 -485 L 0.082 -486 T 0.087 -487 T 0.098 -488 T 0.118 -489 G 0.134 -490 R 0.134 -491 S 0.122 -492 A 0.111 -493 Q 0.111 -494 L 0.122 -495 L 0.129 -496 S 0.115 -497 R 0.093 -498 Y 0.081 -499 R 0.084 -500 P 0.092 -501 R 0.100 -502 A 0.100 -503 A 0.090 -504 V 0.074 -505 I 0.061 -506 A 0.055 -507 V 0.057 -508 T 0.064 -509 R 0.071 -510 S 0.071 -511 A 0.064 -512 Q 0.056 -513 A 0.051 -514 A 0.051 -515 R 0.057 -516 Q 0.067 -517 V 0.072 -518 H 0.068 -519 L 0.062 -520 C 0.061 -521 R 0.063 -522 G 0.064 -523 V 0.066 -524 F 0.069 -525 P 0.070 -526 L 0.070 -527 L 0.070 -528 Y 0.074 -529 R 0.084 -530 E 0.107 -531 P 0.133 -532 P 0.150 -533 E 0.148 -534 A 0.134 -535 I 0.114 -536 W 0.093 -537 A 0.079 -538 D 0.076 -539 D 0.079 -540 V 0.079 -541 D 0.071 -542 R 0.061 -543 R 0.055 -544 V 0.050 -545 Q 0.047 -546 F 0.042 -547 G 0.039 -548 I 0.038 -549 E 0.042 -550 S 0.051 -551 G 0.059 -552 K 0.066 -553 L 0.076 -554 R 0.088 -555 G 0.095 -556 F 0.095 -557 L 0.093 -558 R 0.095 -559 V 0.106 -560 G 0.118 -561 D 0.123 -562 L 0.118 -563 V 0.110 -564 I 0.107 -565 V 0.109 -566 V 0.109 -567 T 0.106 -568 G 0.108 -569 W 0.116 -570 R 0.128 -571 P 0.143 -572 G 0.167 -573 S 0.204 -574 G 0.241 -575 Y 0.257 -576 T 0.250 -577 N 0.232 -578 I 0.210 -579 M 0.181 -580 R 0.151 -581 V 0.128 -582 L 0.117 -583 S 0.121 -584 I 0.139 -585 S 0.158 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000144182.18_ENST00000651691.1_GN:LIPT1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000144182.18_ENST00000651691.1_GN:LIPT1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 846e98cee0f508ecdd96662ee0d778509cea61bb..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000144182.18_ENST00000651691.1_GN:LIPT1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,374 +0,0 @@ ->ENSG00000144182.18|ENST00000651691.1|GN:LIPT1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.318 -2 L 0.333 -3 I 0.354 -4 P 0.365 -5 F 0.361 -6 S 0.347 -7 M 0.331 -8 K 0.318 -9 N 0.310 -10 C 0.300 -11 F 0.282 -12 Q 0.272 -13 L 0.281 -14 L 0.297 -15 C 0.307 -16 N 0.316 -17 C 0.334 -18 Q 0.367 -19 V 0.410 -20 P 0.456 -21 A 0.490 -22 A 0.499 -23 G 0.479 -24 F 0.438 -25 K 0.390 -26 K 0.341 -27 T 0.288 -28 V 0.227 -29 K 0.164 -30 N 0.114 -31 G 0.082 -32 L 0.064 -33 I 0.057 -34 L 0.058 -35 Q 0.063 -36 S 0.067 -37 I 0.067 -38 S 0.066 -39 N 0.068 -40 D 0.070 -41 V 0.071 -42 Y 0.070 -43 Q 0.067 -44 N 0.061 -45 L 0.054 -46 A 0.049 -47 V 0.043 -48 E 0.038 -49 D 0.035 -50 W 0.032 -51 I 0.029 -52 H 0.029 -53 D 0.031 -54 H 0.033 -55 M 0.035 -56 N 0.038 -57 L 0.045 -58 E 0.058 -59 G 0.073 -60 K 0.082 -61 P 0.077 -62 I 0.064 -63 L 0.050 -64 F 0.041 -65 F 0.040 -66 W 0.048 -67 Q 0.064 -68 N 0.083 -69 S 0.096 -70 P 0.100 -71 S 0.104 -72 V 0.112 -73 V 0.116 -74 I 0.110 -75 G 0.101 -76 R 0.094 -77 H 0.094 -78 Q 0.094 -79 N 0.088 -80 P 0.079 -81 W 0.073 -82 Q 0.072 -83 E 0.074 -84 C 0.073 -85 N 0.066 -86 L 0.059 -87 N 0.056 -88 L 0.059 -89 M 0.066 -90 R 0.078 -91 E 0.096 -92 E 0.120 -93 G 0.148 -94 I 0.167 -95 K 0.169 -96 L 0.163 -97 A 0.164 -98 R 0.176 -99 R 0.199 -100 R 0.231 -101 S 0.265 -102 G 0.289 -103 G 0.297 -104 G 0.293 -105 T 0.279 -106 V 0.245 -107 Y 0.195 -108 H 0.151 -109 D 0.127 -110 M 0.121 -111 G 0.119 -112 N 0.109 -113 I 0.091 -114 N 0.070 -115 L 0.052 -116 T 0.040 -117 F 0.033 -118 F 0.031 -119 T 0.035 -120 T 0.043 -121 K 0.052 -122 K 0.061 -123 K 0.068 -124 Y 0.070 -125 D 0.068 -126 R 0.063 -127 M 0.058 -128 E 0.052 -129 N 0.047 -130 L 0.044 -131 K 0.043 -132 L 0.044 -133 I 0.042 -134 V 0.039 -135 R 0.040 -136 A 0.046 -137 L 0.053 -138 N 0.057 -139 A 0.058 -140 V 0.059 -141 Q 0.064 -142 P 0.070 -143 Q 0.074 -144 L 0.073 -145 D 0.067 -146 V 0.060 -147 Q 0.056 -148 A 0.057 -149 T 0.062 -150 K 0.068 -151 R 0.074 -152 F 0.080 -153 D 0.082 -154 L 0.075 -155 L 0.063 -156 L 0.053 -157 D 0.050 -158 G 0.053 -159 Q 0.060 -160 F 0.070 -161 K 0.082 -162 I 0.096 -163 S 0.114 -164 G 0.140 -165 T 0.173 -166 A 0.196 -167 S 0.192 -168 K 0.166 -169 I 0.138 -170 G 0.115 -171 R 0.095 -172 T 0.076 -173 T 0.060 -174 A 0.049 -175 Y 0.042 -176 H 0.040 -177 H 0.042 -178 C 0.047 -179 T 0.057 -180 L 0.069 -181 L 0.078 -182 C 0.085 -183 S 0.094 -184 T 0.103 -185 D 0.107 -186 G 0.108 -187 T 0.112 -188 F 0.126 -189 L 0.145 -190 S 0.154 -191 S 0.149 -192 L 0.142 -193 L 0.148 -194 K 0.172 -195 S 0.204 -196 P 0.227 -197 Y 0.238 -198 Q 0.248 -199 G 0.265 -200 I 0.286 -201 R 0.301 -202 S 0.301 -203 N 0.294 -204 A 0.288 -205 T 0.286 -206 A 0.287 -207 S 0.285 -208 I 0.268 -209 P 0.234 -210 S 0.186 -211 L 0.137 -212 V 0.102 -213 K 0.086 -214 N 0.082 -215 L 0.081 -216 L 0.082 -217 E 0.085 -218 K 0.088 -219 D 0.087 -220 P 0.081 -221 T 0.075 -222 L 0.070 -223 T 0.065 -224 C 0.058 -225 E 0.053 -226 V 0.053 -227 L 0.053 -228 M 0.051 -229 N 0.046 -230 A 0.043 -231 V 0.042 -232 A 0.042 -233 T 0.043 -234 E 0.044 -235 Y 0.044 -236 A 0.043 -237 A 0.043 -238 Y 0.042 -239 H 0.040 -240 Q 0.042 -241 I 0.049 -242 D 0.055 -243 N 0.057 -244 H 0.054 -245 I 0.050 -246 H 0.046 -247 L 0.045 -248 I 0.045 -249 N 0.047 -250 P 0.051 -251 T 0.053 -252 D 0.052 -253 E 0.050 -254 T 0.049 -255 L 0.050 -256 F 0.052 -257 P 0.056 -258 G 0.059 -259 I 0.062 -260 N 0.067 -261 S 0.073 -262 K 0.078 -263 A 0.084 -264 K 0.085 -265 E 0.078 -266 L 0.066 -267 Q 0.057 -268 T 0.055 -269 W 0.060 -270 E 0.067 -271 W 0.069 -272 I 0.067 -273 Y 0.070 -274 G 0.081 -275 K 0.095 -276 T 0.103 -277 P 0.103 -278 K 0.101 -279 F 0.099 -280 S 0.093 -281 I 0.079 -282 N 0.060 -283 T 0.043 -284 S 0.033 -285 F 0.031 -286 H 0.035 -287 V 0.046 -288 L 0.058 -289 Y 0.068 -290 E 0.074 -291 Q 0.078 -292 S 0.083 -293 H 0.082 -294 L 0.074 -295 E 0.061 -296 I 0.049 -297 K 0.040 -298 V 0.036 -299 F 0.035 -300 I 0.038 -301 D 0.043 -302 I 0.051 -303 K 0.061 -304 N 0.073 -305 G 0.083 -306 R 0.086 -307 I 0.077 -308 E 0.062 -309 I 0.049 -310 C 0.043 -311 N 0.044 -312 I 0.054 -313 E 0.069 -314 A 0.081 -315 P 0.082 -316 D 0.078 -317 H 0.076 -318 W 0.078 -319 L 0.079 -320 P 0.076 -321 L 0.070 -322 E 0.063 -323 I 0.056 -324 R 0.050 -325 D 0.048 -326 K 0.049 -327 L 0.055 -328 N 0.062 -329 S 0.069 -330 S 0.070 -331 L 0.069 -332 I 0.070 -333 G 0.074 -334 S 0.078 -335 K 0.078 -336 F 0.075 -337 C 0.072 -338 P 0.071 -339 T 0.072 -340 E 0.074 -341 T 0.072 -342 T 0.068 -343 M 0.065 -344 L 0.068 -345 T 0.077 -346 N 0.085 -347 I 0.082 -348 L 0.070 -349 L 0.064 -350 R 0.076 -351 T 0.107 -352 C 0.143 -353 P 0.165 -354 Q 0.171 -355 D 0.168 -356 H 0.159 -357 K 0.140 -358 L 0.117 -359 N 0.097 -360 S 0.077 -361 K 0.057 -362 W 0.044 -363 N 0.038 -364 I 0.039 -365 L 0.046 -366 C 0.059 -367 E 0.071 -368 K 0.076 -369 I 0.079 -370 K 0.088 -371 G 0.104 -372 I 0.121 -373 M 0.133 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000144182.18_ENST00000651691.1_GN:LIPT1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000144182.18_ENST00000651691.1_GN:LIPT1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid deleted file mode 100644 index e65ef868005d196668e5fbf07589b414814fad84..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000144182.18_ENST00000651691.1_GN:LIPT1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid +++ /dev/null @@ -1,394 +0,0 @@ ->ENSG00000144182.18|ENST00000651691.1|GN:LIPT1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:20 -1 M 0.313 -2 T 0.308 -3 H 0.313 -4 F 0.323 -5 S 0.320 -6 S 0.312 -7 S 0.335 -8 S 0.378 -9 P 0.393 -10 H 0.388 -11 E 0.426 -12 A 0.517 -13 V 0.596 -14 G 0.627 -15 T 0.627 -16 T 0.618 -17 G 0.604 -18 S 0.586 -19 R 0.569 -20 S 0.555 -21 M 0.541 -22 L 0.522 -23 I 0.494 -24 P 0.454 -25 F 0.412 -26 S 0.373 -27 M 0.345 -28 K 0.329 -29 N 0.323 -30 C 0.313 -31 F 0.291 -32 Q 0.274 -33 L 0.276 -34 L 0.288 -35 C 0.298 -36 N 0.307 -37 C 0.325 -38 Q 0.357 -39 V 0.398 -40 P 0.442 -41 A 0.477 -42 A 0.492 -43 G 0.479 -44 F 0.444 -45 K 0.397 -46 K 0.349 -47 T 0.297 -48 V 0.235 -49 K 0.169 -50 N 0.116 -51 G 0.082 -52 L 0.064 -53 I 0.056 -54 L 0.058 -55 Q 0.063 -56 S 0.065 -57 I 0.065 -58 S 0.064 -59 N 0.066 -60 D 0.068 -61 V 0.069 -62 Y 0.068 -63 Q 0.065 -64 N 0.059 -65 L 0.053 -66 A 0.048 -67 V 0.042 -68 E 0.037 -69 D 0.034 -70 W 0.031 -71 I 0.028 -72 H 0.028 -73 D 0.029 -74 H 0.031 -75 M 0.032 -76 N 0.035 -77 L 0.043 -78 E 0.055 -79 G 0.070 -80 K 0.078 -81 P 0.074 -82 I 0.061 -83 L 0.048 -84 F 0.040 -85 F 0.039 -86 W 0.046 -87 Q 0.061 -88 N 0.079 -89 S 0.092 -90 P 0.097 -91 S 0.101 -92 V 0.110 -93 V 0.114 -94 I 0.109 -95 G 0.099 -96 R 0.093 -97 H 0.093 -98 Q 0.093 -99 N 0.088 -100 P 0.078 -101 W 0.072 -102 Q 0.071 -103 E 0.073 -104 C 0.072 -105 N 0.065 -106 L 0.057 -107 N 0.054 -108 L 0.057 -109 M 0.064 -110 R 0.076 -111 E 0.093 -112 E 0.118 -113 G 0.147 -114 I 0.166 -115 K 0.168 -116 L 0.161 -117 A 0.161 -118 R 0.173 -119 R 0.197 -120 R 0.230 -121 S 0.266 -122 G 0.290 -123 G 0.296 -124 G 0.291 -125 T 0.275 -126 V 0.242 -127 Y 0.193 -128 H 0.149 -129 D 0.126 -130 M 0.120 -131 G 0.117 -132 N 0.108 -133 I 0.090 -134 N 0.070 -135 L 0.053 -136 T 0.041 -137 F 0.034 -138 F 0.032 -139 T 0.036 -140 T 0.044 -141 K 0.053 -142 K 0.063 -143 K 0.070 -144 Y 0.072 -145 D 0.069 -146 R 0.064 -147 M 0.059 -148 E 0.053 -149 N 0.047 -150 L 0.044 -151 K 0.044 -152 L 0.044 -153 I 0.042 -154 V 0.039 -155 R 0.040 -156 A 0.046 -157 L 0.053 -158 N 0.057 -159 A 0.058 -160 V 0.060 -161 Q 0.064 -162 P 0.071 -163 Q 0.075 -164 L 0.073 -165 D 0.067 -166 V 0.059 -167 Q 0.055 -168 A 0.057 -169 T 0.062 -170 K 0.068 -171 R 0.074 -172 F 0.080 -173 D 0.082 -174 L 0.075 -175 L 0.063 -176 L 0.052 -177 D 0.049 -178 G 0.053 -179 Q 0.060 -180 F 0.070 -181 K 0.083 -182 I 0.098 -183 S 0.117 -184 G 0.143 -185 T 0.178 -186 A 0.202 -187 S 0.198 -188 K 0.170 -189 I 0.140 -190 G 0.116 -191 R 0.095 -192 T 0.077 -193 T 0.061 -194 A 0.049 -195 Y 0.043 -196 H 0.041 -197 H 0.043 -198 C 0.049 -199 T 0.058 -200 L 0.069 -201 L 0.077 -202 C 0.084 -203 S 0.093 -204 T 0.101 -205 D 0.106 -206 G 0.107 -207 T 0.111 -208 F 0.126 -209 L 0.145 -210 S 0.154 -211 S 0.149 -212 L 0.142 -213 L 0.148 -214 K 0.171 -215 S 0.201 -216 P 0.224 -217 Y 0.235 -218 Q 0.244 -219 G 0.260 -220 I 0.280 -221 R 0.293 -222 S 0.293 -223 N 0.285 -224 A 0.278 -225 T 0.275 -226 A 0.276 -227 S 0.274 -228 I 0.259 -229 P 0.226 -230 S 0.180 -231 L 0.133 -232 V 0.100 -233 K 0.084 -234 N 0.080 -235 L 0.080 -236 L 0.080 -237 E 0.083 -238 K 0.087 -239 D 0.086 -240 P 0.081 -241 T 0.075 -242 L 0.070 -243 T 0.065 -244 C 0.058 -245 E 0.054 -246 V 0.053 -247 L 0.054 -248 M 0.051 -249 N 0.046 -250 A 0.043 -251 V 0.042 -252 A 0.041 -253 T 0.042 -254 E 0.044 -255 Y 0.044 -256 A 0.043 -257 A 0.042 -258 Y 0.041 -259 H 0.040 -260 Q 0.042 -261 I 0.049 -262 D 0.056 -263 N 0.058 -264 H 0.055 -265 I 0.050 -266 H 0.047 -267 L 0.045 -268 I 0.045 -269 N 0.047 -270 P 0.050 -271 T 0.053 -272 D 0.053 -273 E 0.051 -274 T 0.050 -275 L 0.051 -276 F 0.054 -277 P 0.057 -278 G 0.058 -279 I 0.055 -280 N 0.051 -281 S 0.053 -282 K 0.062 -283 A 0.075 -284 K 0.082 -285 E 0.078 -286 L 0.067 -287 Q 0.059 -288 T 0.056 -289 W 0.061 -290 E 0.069 -291 W 0.071 -292 I 0.069 -293 Y 0.071 -294 G 0.083 -295 K 0.097 -296 T 0.104 -297 P 0.104 -298 K 0.103 -299 F 0.101 -300 S 0.094 -301 I 0.079 -302 N 0.060 -303 T 0.043 -304 S 0.034 -305 F 0.032 -306 H 0.037 -307 V 0.048 -308 L 0.062 -309 Y 0.071 -310 E 0.077 -311 Q 0.081 -312 S 0.086 -313 H 0.085 -314 L 0.076 -315 E 0.063 -316 I 0.050 -317 K 0.042 -318 V 0.037 -319 F 0.037 -320 I 0.040 -321 D 0.045 -322 I 0.053 -323 K 0.063 -324 N 0.075 -325 G 0.085 -326 R 0.087 -327 I 0.078 -328 E 0.062 -329 I 0.049 -330 C 0.043 -331 N 0.045 -332 I 0.054 -333 E 0.070 -334 A 0.081 -335 P 0.083 -336 D 0.079 -337 H 0.078 -338 W 0.080 -339 L 0.080 -340 P 0.076 -341 L 0.069 -342 E 0.062 -343 I 0.055 -344 R 0.050 -345 D 0.048 -346 K 0.049 -347 L 0.053 -348 N 0.059 -349 S 0.064 -350 S 0.066 -351 L 0.067 -352 I 0.069 -353 G 0.074 -354 S 0.079 -355 K 0.079 -356 F 0.075 -357 C 0.072 -358 P 0.071 -359 T 0.072 -360 E 0.074 -361 T 0.073 -362 T 0.068 -363 M 0.062 -364 L 0.058 -365 T 0.058 -366 N 0.060 -367 I 0.061 -368 L 0.059 -369 L 0.059 -370 R 0.074 -371 T 0.105 -372 C 0.141 -373 P 0.163 -374 Q 0.169 -375 D 0.166 -376 H 0.157 -377 K 0.138 -378 L 0.116 -379 N 0.096 -380 S 0.076 -381 K 0.057 -382 W 0.043 -383 N 0.038 -384 I 0.039 -385 L 0.045 -386 C 0.058 -387 E 0.070 -388 K 0.075 -389 I 0.077 -390 K 0.086 -391 G 0.102 -392 I 0.120 -393 M 0.133 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000145050.19_ENST00000528157.7_GN:MANF_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000145050.19_ENST00000528157.7_GN:MANF_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 482b9f9d3b1bedb129466ba7f4bf2644bd295085..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000145050.19_ENST00000528157.7_GN:MANF_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,183 +0,0 @@ ->ENSG00000145050.19|ENST00000528157.7|GN:MANF|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.426 -2 R 0.442 -3 R 0.465 -4 M 0.478 -5 W 0.477 -6 A 0.486 -7 T 0.521 -8 Q 0.549 -9 G 0.534 -10 L 0.498 -11 A 0.465 -12 V 0.421 -13 A 0.374 -14 L 0.375 -15 A 0.427 -16 L 0.478 -17 S 0.496 -18 V 0.496 -19 L 0.507 -20 P 0.536 -21 G 0.562 -22 S 0.555 -23 R 0.503 -24 A 0.419 -25 L 0.337 -26 R 0.287 -27 P 0.269 -28 G 0.257 -29 D 0.226 -30 C 0.173 -31 E 0.112 -32 V 0.062 -33 C 0.035 -34 I 0.025 -35 S 0.026 -36 Y 0.029 -37 L 0.031 -38 G 0.030 -39 R 0.030 -40 F 0.037 -41 Y 0.050 -42 Q 0.059 -43 D 0.061 -44 L 0.060 -45 K 0.063 -46 D 0.073 -47 R 0.086 -48 D 0.099 -49 V 0.105 -50 T 0.099 -51 F 0.088 -52 S 0.078 -53 P 0.070 -54 A 0.063 -55 T 0.058 -56 I 0.058 -57 E 0.064 -58 N 0.068 -59 E 0.063 -60 L 0.052 -61 I 0.041 -62 K 0.035 -63 F 0.032 -64 C 0.033 -65 R 0.041 -66 E 0.053 -67 A 0.064 -68 R 0.069 -69 G 0.067 -70 K 0.062 -71 E 0.057 -72 N 0.052 -73 R 0.046 -74 L 0.039 -75 C 0.037 -76 Y 0.043 -77 Y 0.056 -78 I 0.071 -79 G 0.085 -80 A 0.100 -81 T 0.120 -82 D 0.143 -83 D 0.162 -84 A 0.170 -85 A 0.164 -86 T 0.146 -87 K 0.122 -88 I 0.098 -89 I 0.081 -90 N 0.071 -91 E 0.067 -92 V 0.065 -93 S 0.062 -94 K 0.057 -95 P 0.054 -96 L 0.055 -97 A 0.059 -98 H 0.064 -99 H 0.066 -100 I 0.062 -101 P 0.052 -102 V 0.040 -103 E 0.031 -104 K 0.028 -105 I 0.028 -106 C 0.030 -107 E 0.034 -108 K 0.040 -109 L 0.047 -110 K 0.053 -111 K 0.056 -112 K 0.057 -113 D 0.057 -114 S 0.059 -115 Q 0.064 -116 I 0.073 -117 C 0.086 -118 E 0.110 -119 L 0.146 -120 K 0.194 -121 Y 0.251 -122 D 0.303 -123 K 0.331 -124 Q 0.330 -125 I 0.304 -126 D 0.265 -127 L 0.232 -128 S 0.216 -129 T 0.208 -130 V 0.191 -131 D 0.159 -132 L 0.123 -133 K 0.096 -134 K 0.083 -135 L 0.073 -136 R 0.062 -137 V 0.053 -138 K 0.052 -139 E 0.055 -140 L 0.060 -141 K 0.069 -142 K 0.079 -143 I 0.083 -144 L 0.080 -145 D 0.072 -146 D 0.064 -147 W 0.063 -148 G 0.073 -149 E 0.090 -150 T 0.105 -151 C 0.114 -152 K 0.121 -153 G 0.124 -154 C 0.118 -155 A 0.103 -156 E 0.084 -157 K 0.067 -158 S 0.057 -159 D 0.052 -160 Y 0.054 -161 I 0.061 -162 R 0.065 -163 K 0.061 -164 I 0.054 -165 N 0.050 -166 E 0.049 -167 L 0.051 -168 M 0.056 -169 P 0.064 -170 K 0.083 -171 Y 0.120 -172 A 0.175 -173 P 0.235 -174 K 0.283 -175 A 0.321 -176 A 0.353 -177 S 0.379 -178 A 0.400 -179 R 0.419 -180 T 0.429 -181 D 0.421 -182 L 0.404 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000145050.19_ENST00000528157.7_GN:MANF_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000145050.19_ENST00000528157.7_GN:MANF_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid deleted file mode 100644 index af4120be48b6c77d95065c6866a135913b6b8bd8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000145050.19_ENST00000528157.7_GN:MANF_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid +++ /dev/null @@ -1,186 +0,0 @@ ->ENSG00000145050.19|ENST00000528157.7|GN:MANF|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 -1 M 0.396 -2 R 0.414 -3 R 0.445 -4 M 0.465 -5 R 0.462 -6 R 0.462 -7 M 0.495 -8 W 0.548 -9 A 0.584 -10 T 0.593 -11 Q 0.579 -12 G 0.544 -13 L 0.518 -14 A 0.524 -15 V 0.538 -16 A 0.530 -17 L 0.516 -18 A 0.517 -19 L 0.524 -20 S 0.521 -21 V 0.513 -22 L 0.519 -23 P 0.543 -24 G 0.566 -25 S 0.558 -26 R 0.505 -27 A 0.421 -28 L 0.341 -29 R 0.291 -30 P 0.272 -31 G 0.260 -32 D 0.229 -33 C 0.175 -34 E 0.113 -35 V 0.063 -36 C 0.035 -37 I 0.025 -38 S 0.026 -39 Y 0.029 -40 L 0.031 -41 G 0.030 -42 R 0.031 -43 F 0.038 -44 Y 0.050 -45 Q 0.060 -46 D 0.062 -47 L 0.060 -48 K 0.063 -49 D 0.073 -50 R 0.087 -51 D 0.100 -52 V 0.105 -53 T 0.099 -54 F 0.088 -55 S 0.078 -56 P 0.070 -57 A 0.063 -58 T 0.058 -59 I 0.061 -60 E 0.070 -61 N 0.076 -62 E 0.070 -63 L 0.056 -64 I 0.043 -65 K 0.035 -66 F 0.032 -67 C 0.033 -68 R 0.041 -69 E 0.053 -70 A 0.065 -71 R 0.069 -72 G 0.067 -73 K 0.062 -74 E 0.057 -75 N 0.052 -76 R 0.046 -77 L 0.039 -78 C 0.037 -79 Y 0.043 -80 Y 0.056 -81 I 0.071 -82 G 0.085 -83 A 0.100 -84 T 0.120 -85 D 0.143 -86 D 0.162 -87 A 0.170 -88 A 0.164 -89 T 0.146 -90 K 0.123 -91 I 0.099 -92 I 0.081 -93 N 0.071 -94 E 0.068 -95 V 0.065 -96 S 0.062 -97 K 0.057 -98 P 0.054 -99 L 0.055 -100 A 0.059 -101 H 0.064 -102 H 0.066 -103 I 0.062 -104 P 0.052 -105 V 0.040 -106 E 0.031 -107 K 0.028 -108 I 0.028 -109 C 0.031 -110 E 0.034 -111 K 0.040 -112 L 0.047 -113 K 0.053 -114 K 0.057 -115 K 0.057 -116 D 0.057 -117 S 0.059 -118 Q 0.064 -119 I 0.073 -120 C 0.086 -121 E 0.110 -122 L 0.145 -123 K 0.194 -124 Y 0.251 -125 D 0.303 -126 K 0.332 -127 Q 0.331 -128 I 0.305 -129 D 0.266 -130 L 0.234 -131 S 0.218 -132 T 0.210 -133 V 0.192 -134 D 0.160 -135 L 0.124 -136 K 0.097 -137 K 0.084 -138 L 0.074 -139 R 0.063 -140 V 0.054 -141 K 0.052 -142 E 0.055 -143 L 0.061 -144 K 0.070 -145 K 0.080 -146 I 0.084 -147 L 0.081 -148 D 0.073 -149 D 0.065 -150 W 0.064 -151 G 0.074 -152 E 0.091 -153 T 0.106 -154 C 0.116 -155 K 0.122 -156 G 0.125 -157 C 0.119 -158 A 0.104 -159 E 0.084 -160 K 0.068 -161 S 0.057 -162 D 0.052 -163 Y 0.054 -164 I 0.061 -165 R 0.066 -166 K 0.062 -167 I 0.055 -168 N 0.050 -169 E 0.050 -170 L 0.051 -171 M 0.056 -172 P 0.064 -173 K 0.083 -174 Y 0.120 -175 A 0.176 -176 P 0.236 -177 K 0.285 -178 A 0.324 -179 A 0.356 -180 S 0.383 -181 A 0.406 -182 R 0.425 -183 T 0.435 -184 D 0.426 -185 L 0.408 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000146910.14_ENST00000636446.2_GN:CNPY1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000146910.14_ENST00000636446.2_GN:CNPY1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index be42a18a815816a30df03d30aa359c0de9883bdd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000146910.14_ENST00000636446.2_GN:CNPY1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,146 +0,0 @@ ->ENSG00000146910.14|ENST00000636446.2|GN:CNPY1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.112 -2 D 0.109 -3 E 0.100 -4 I 0.090 -5 E 0.086 -6 H 0.082 -7 D 0.072 -8 I 0.059 -9 T 0.056 -10 K 0.064 -11 A 0.074 -12 R 0.079 -13 Q 0.087 -14 K 0.107 -15 K 0.148 -16 T 0.207 -17 K 0.278 -18 V 0.349 -19 G 0.413 -20 S 0.461 -21 F 0.485 -22 R 0.479 -23 I 0.454 -24 N 0.437 -25 P 0.434 -26 D 0.438 -27 G 0.434 -28 T 0.411 -29 Q 0.375 -30 E 0.344 -31 R 0.328 -32 R 0.327 -33 K 0.327 -34 I 0.301 -35 P 0.239 -36 L 0.166 -37 A 0.112 -38 Q 0.088 -39 S 0.084 -40 E 0.088 -41 A 0.086 -42 F 0.076 -43 L 0.062 -44 T 0.054 -45 D 0.053 -46 L 0.053 -47 L 0.050 -48 E 0.046 -49 K 0.043 -50 V 0.043 -51 C 0.043 -52 E 0.044 -53 R 0.048 -54 M 0.051 -55 N 0.055 -56 D 0.058 -57 Y 0.057 -58 K 0.055 -59 L 0.058 -60 E 0.070 -61 E 0.089 -62 D 0.106 -63 P 0.113 -64 V 0.109 -65 T 0.103 -66 K 0.096 -67 E 0.086 -68 R 0.073 -69 T 0.062 -70 F 0.058 -71 K 0.062 -72 R 0.078 -73 F 0.105 -74 A 0.136 -75 P 0.163 -76 R 0.183 -77 K 0.196 -78 G 0.192 -79 D 0.171 -80 K 0.145 -81 I 0.127 -82 Y 0.123 -83 Q 0.128 -84 E 0.134 -85 F 0.132 -86 K 0.124 -87 K 0.117 -88 L 0.115 -89 Y 0.115 -90 F 0.114 -91 Y 0.111 -92 S 0.106 -93 D 0.095 -94 A 0.080 -95 Y 0.067 -96 R 0.059 -97 P 0.055 -98 L 0.055 -99 K 0.056 -100 F 0.058 -101 A 0.059 -102 C 0.057 -103 E 0.056 -104 T 0.058 -105 I 0.059 -106 I 0.056 -107 E 0.052 -108 E 0.049 -109 Y 0.046 -110 E 0.043 -111 D 0.040 -112 E 0.040 -113 I 0.044 -114 S 0.054 -115 S 0.061 -116 L 0.058 -117 I 0.048 -118 A 0.040 -119 Q 0.039 -120 E 0.043 -121 T 0.049 -122 H 0.051 -123 Y 0.048 -124 L 0.042 -125 A 0.036 -126 D 0.033 -127 K 0.035 -128 L 0.042 -129 C 0.055 -130 S 0.071 -131 E 0.087 -132 K 0.098 -133 S 0.109 -134 D 0.131 -135 L 0.172 -136 C 0.241 -137 E 0.334 -138 T 0.427 -139 S 0.497 -140 A 0.540 -141 N 0.568 -142 H 0.583 -143 T 0.574 -144 E 0.534 -145 L 0.493 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000146910.14_ENST00000636446.2_GN:CNPY1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000146910.14_ENST00000636446.2_GN:CNPY1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid deleted file mode 100644 index dfd06fa4cec364229d39ab8e9f7b415cdcfde941..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000146910.14_ENST00000636446.2_GN:CNPY1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid +++ /dev/null @@ -1,165 +0,0 @@ ->ENSG00000146910.14|ENST00000636446.2|GN:CNPY1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:19 -1 M 0.427 -2 V 0.435 -3 A 0.446 -4 D 0.450 -5 T 0.439 -6 C 0.418 -7 N 0.397 -8 P 0.374 -9 S 0.343 -10 N 0.301 -11 S 0.248 -12 G 0.186 -13 G 0.124 -14 Q 0.076 -15 A 0.047 -16 C 0.034 -17 R 0.033 -18 A 0.039 -19 L 0.043 -20 M 0.043 -21 D 0.040 -22 E 0.041 -23 I 0.047 -24 E 0.058 -25 H 0.064 -26 D 0.058 -27 I 0.047 -28 T 0.045 -29 K 0.055 -30 A 0.067 -31 R 0.073 -32 Q 0.083 -33 K 0.109 -34 K 0.159 -35 T 0.229 -36 K 0.307 -37 V 0.381 -38 G 0.443 -39 S 0.483 -40 F 0.490 -41 R 0.464 -42 I 0.428 -43 N 0.408 -44 P 0.407 -45 D 0.411 -46 G 0.404 -47 T 0.380 -48 Q 0.349 -49 E 0.328 -50 R 0.320 -51 R 0.324 -52 K 0.327 -53 I 0.304 -54 P 0.243 -55 L 0.168 -56 A 0.111 -57 Q 0.083 -58 S 0.078 -59 E 0.080 -60 A 0.079 -61 F 0.070 -62 L 0.058 -63 T 0.052 -64 D 0.052 -65 L 0.052 -66 L 0.049 -67 E 0.044 -68 K 0.042 -69 V 0.041 -70 C 0.040 -71 E 0.040 -72 R 0.042 -73 M 0.045 -74 N 0.047 -75 D 0.048 -76 Y 0.045 -77 K 0.041 -78 L 0.043 -79 E 0.054 -80 E 0.072 -81 D 0.086 -82 P 0.092 -83 V 0.090 -84 T 0.086 -85 K 0.082 -86 E 0.074 -87 R 0.062 -88 T 0.051 -89 F 0.046 -90 K 0.050 -91 R 0.068 -92 F 0.096 -93 A 0.128 -94 P 0.154 -95 R 0.170 -96 K 0.180 -97 G 0.176 -98 D 0.159 -99 K 0.137 -100 I 0.125 -101 Y 0.125 -102 Q 0.132 -103 E 0.138 -104 F 0.137 -105 K 0.128 -106 K 0.119 -107 L 0.117 -108 Y 0.121 -109 F 0.122 -110 Y 0.118 -111 S 0.107 -112 D 0.091 -113 A 0.075 -114 Y 0.061 -115 R 0.049 -116 P 0.041 -117 L 0.039 -118 K 0.037 -119 F 0.035 -120 A 0.033 -121 C 0.036 -122 E 0.043 -123 T 0.051 -124 I 0.055 -125 I 0.054 -126 E 0.050 -127 E 0.047 -128 Y 0.044 -129 E 0.042 -130 D 0.039 -131 E 0.039 -132 I 0.044 -133 S 0.054 -134 S 0.062 -135 L 0.059 -136 I 0.049 -137 A 0.043 -138 Q 0.044 -139 E 0.050 -140 T 0.056 -141 H 0.056 -142 Y 0.050 -143 L 0.039 -144 A 0.030 -145 D 0.027 -146 K 0.028 -147 L 0.035 -148 C 0.048 -149 S 0.065 -150 E 0.080 -151 K 0.089 -152 S 0.092 -153 D 0.100 -154 L 0.129 -155 C 0.197 -156 E 0.301 -157 T 0.411 -158 S 0.493 -159 A 0.542 -160 N 0.572 -161 H 0.589 -162 T 0.580 -163 E 0.540 -164 L 0.499 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000149243.18_ENST00000539798.3_GN:KLHL35_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000149243.18_ENST00000539798.3_GN:KLHL35_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index ea475e3bc4f1ecf525bcdb12e91095c885db4793..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000149243.18_ENST00000539798.3_GN:KLHL35_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,584 +0,0 @@ ->ENSG00000149243.18|ENST00000539798.3|GN:KLHL35|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.366 -2 R 0.363 -3 Q 0.374 -4 G 0.398 -5 H 0.416 -6 A 0.438 -7 P 0.481 -8 E 0.525 -9 E 0.545 -10 S 0.552 -11 E 0.569 -12 P 0.592 -13 G 0.600 -14 C 0.589 -15 E 0.574 -16 A 0.568 -17 P 0.562 -18 C 0.540 -19 A 0.502 -20 G 0.449 -21 P 0.382 -22 C 0.309 -23 H 0.243 -24 A 0.191 -25 Q 0.150 -26 R 0.120 -27 V 0.098 -28 L 0.082 -29 Q 0.073 -30 A 0.069 -31 L 0.073 -32 N 0.080 -33 A 0.083 -34 Y 0.079 -35 R 0.074 -36 R 0.080 -37 S 0.097 -38 G 0.116 -39 T 0.122 -40 L 0.109 -41 T 0.084 -42 D 0.061 -43 V 0.044 -44 V 0.035 -45 L 0.034 -46 R 0.041 -47 A 0.053 -48 G 0.063 -49 G 0.066 -50 R 0.065 -51 D 0.065 -52 F 0.069 -53 P 0.074 -54 C 0.078 -55 H 0.076 -56 R 0.066 -57 A 0.055 -58 A 0.053 -59 L 0.060 -60 S 0.073 -61 A 0.085 -62 G 0.085 -63 S 0.073 -64 A 0.057 -65 Y 0.047 -66 F 0.050 -67 R 0.065 -68 S 0.081 -69 L 0.094 -70 F 0.115 -71 A 0.151 -72 A 0.198 -73 G 0.245 -74 R 0.288 -75 P 0.316 -76 E 0.323 -77 R 0.306 -78 G 0.275 -79 P 0.243 -80 A 0.217 -81 V 0.201 -82 V 0.191 -83 P 0.184 -84 V 0.188 -85 V 0.209 -86 P 0.240 -87 V 0.269 -88 A 0.300 -89 P 0.331 -90 E 0.355 -91 A 0.371 -92 P 0.378 -93 G 0.364 -94 T 0.326 -95 S 0.274 -96 P 0.235 -97 A 0.218 -98 G 0.204 -99 A 0.172 -100 A 0.126 -101 A 0.086 -102 A 0.062 -103 L 0.052 -104 A 0.049 -105 V 0.049 -106 V 0.050 -107 L 0.050 -108 D 0.049 -109 Y 0.048 -110 V 0.048 -111 Y 0.054 -112 G 0.066 -113 A 0.081 -114 G 0.090 -115 V 0.090 -116 R 0.085 -117 L 0.080 -118 R 0.075 -119 A 0.070 -120 E 0.065 -121 D 0.059 -122 E 0.051 -123 A 0.044 -124 A 0.038 -125 A 0.035 -126 V 0.035 -127 L 0.035 -128 A 0.037 -129 L 0.039 -130 A 0.040 -131 E 0.041 -132 R 0.046 -133 L 0.055 -134 G 0.064 -135 V 0.065 -136 A 0.058 -137 G 0.050 -138 L 0.043 -139 R 0.039 -140 E 0.037 -141 A 0.040 -142 C 0.049 -143 V 0.061 -144 R 0.067 -145 F 0.063 -146 L 0.057 -147 E 0.056 -148 G 0.057 -149 R 0.059 -150 L 0.062 -151 R 0.063 -152 A 0.060 -153 A 0.052 -154 N 0.045 -155 S 0.039 -156 L 0.036 -157 A 0.035 -158 L 0.035 -159 R 0.034 -160 R 0.036 -161 V 0.041 -162 A 0.047 -163 A 0.051 -164 A 0.051 -165 F 0.052 -166 S 0.052 -167 L 0.050 -168 A 0.044 -169 P 0.040 -170 L 0.044 -171 A 0.055 -172 E 0.065 -173 R 0.070 -174 C 0.076 -175 G 0.088 -176 R 0.095 -177 V 0.088 -178 L 0.074 -179 R 0.059 -180 Q 0.047 -181 A 0.037 -182 F 0.030 -183 A 0.029 -184 E 0.031 -185 V 0.030 -186 A 0.026 -187 R 0.023 -188 H 0.024 -189 A 0.027 -190 D 0.030 -191 F 0.031 -192 L 0.031 -193 E 0.031 -194 L 0.033 -195 A 0.034 -196 P 0.032 -197 D 0.028 -198 E 0.025 -199 V 0.025 -200 V 0.030 -201 A 0.038 -202 L 0.051 -203 L 0.068 -204 A 0.087 -205 D 0.098 -206 P 0.096 -207 A 0.081 -208 L 0.062 -209 G 0.046 -210 V 0.035 -211 A 0.030 -212 R 0.033 -213 E 0.040 -214 E 0.047 -215 A 0.051 -216 V 0.052 -217 F 0.051 -218 E 0.049 -219 A 0.047 -220 A 0.045 -221 M 0.045 -222 R 0.050 -223 W 0.054 -224 V 0.056 -225 R 0.055 -226 H 0.052 -227 D 0.049 -228 A 0.047 -229 P 0.047 -230 A 0.047 -231 R 0.047 -232 R 0.049 -233 G 0.051 -234 Q 0.051 -235 L 0.047 -236 R 0.042 -237 R 0.038 -238 L 0.038 -239 L 0.041 -240 E 0.043 -241 H 0.044 -242 V 0.045 -243 R 0.046 -244 L 0.047 -245 P 0.047 -246 L 0.045 -247 L 0.043 -248 A 0.046 -249 P 0.053 -250 A 0.057 -251 Y 0.050 -252 F 0.040 -253 L 0.034 -254 E 0.036 -255 K 0.042 -256 V 0.049 -257 E 0.052 -258 A 0.053 -259 D 0.050 -260 E 0.048 -261 L 0.046 -262 L 0.047 -263 Q 0.050 -264 A 0.055 -265 C 0.060 -266 G 0.061 -267 E 0.058 -268 C 0.052 -269 R 0.047 -270 P 0.048 -271 L 0.055 -272 L 0.066 -273 L 0.073 -274 E 0.069 -275 A 0.057 -276 R 0.046 -277 A 0.040 -278 C 0.042 -279 F 0.055 -280 I 0.082 -281 L 0.126 -282 G 0.178 -283 R 0.226 -284 E 0.257 -285 A 0.268 -286 G 0.263 -287 A 0.248 -288 L 0.231 -289 R 0.218 -290 T 0.212 -291 R 0.207 -292 P 0.197 -293 R 0.188 -294 R 0.186 -295 F 0.193 -296 M 0.196 -297 D 0.185 -298 L 0.155 -299 A 0.113 -300 E 0.072 -301 V 0.042 -302 I 0.025 -303 V 0.023 -304 V 0.032 -305 I 0.050 -306 G 0.074 -307 G 0.099 -308 C 0.124 -309 D 0.144 -310 R 0.154 -311 K 0.151 -312 G 0.145 -313 L 0.148 -314 L 0.159 -315 K 0.168 -316 L 0.163 -317 P 0.141 -318 F 0.106 -319 A 0.073 -320 D 0.051 -321 A 0.043 -322 Y 0.043 -323 H 0.045 -324 P 0.049 -325 E 0.053 -326 S 0.059 -327 Q 0.065 -328 R 0.070 -329 W 0.075 -330 T 0.080 -331 P 0.080 -332 L 0.078 -333 P 0.077 -334 S 0.078 -335 L 0.076 -336 P 0.071 -337 G 0.065 -338 Y 0.065 -339 T 0.075 -340 R 0.093 -341 S 0.108 -342 E 0.114 -343 F 0.111 -344 A 0.101 -345 A 0.086 -346 C 0.073 -347 A 0.066 -348 L 0.061 -349 R 0.054 -350 N 0.044 -351 D 0.034 -352 V 0.026 -353 Y 0.023 -354 V 0.031 -355 S 0.045 -356 G 0.061 -357 G 0.072 -358 H 0.080 -359 I 0.089 -360 N 0.103 -361 S 0.116 -362 H 0.116 -363 D 0.101 -364 V 0.079 -365 W 0.058 -366 M 0.042 -367 F 0.033 -368 S 0.029 -369 S 0.030 -370 H 0.033 -371 L 0.040 -372 H 0.046 -373 T 0.049 -374 W 0.050 -375 I 0.052 -376 K 0.057 -377 V 0.064 -378 A 0.068 -379 S 0.067 -380 L 0.063 -381 H 0.060 -382 K 0.061 -383 G 0.068 -384 R 0.079 -385 W 0.090 -386 R 0.097 -387 H 0.096 -388 K 0.089 -389 M 0.080 -390 A 0.077 -391 V 0.081 -392 V 0.085 -393 Q 0.080 -394 G 0.065 -395 Q 0.046 -396 L 0.030 -397 F 0.023 -398 A 0.028 -399 V 0.038 -400 G 0.052 -401 G 0.066 -402 F 0.076 -403 D 0.080 -404 G 0.083 -405 L 0.092 -406 R 0.107 -407 R 0.117 -408 L 0.118 -409 H 0.111 -410 S 0.100 -411 V 0.086 -412 E 0.070 -413 R 0.057 -414 Y 0.048 -415 D 0.044 -416 P 0.045 -417 F 0.049 -418 S 0.056 -419 N 0.064 -420 T 0.072 -421 W 0.081 -422 A 0.091 -423 A 0.098 -424 A 0.100 -425 A 0.099 -426 P 0.097 -427 L 0.092 -428 P 0.084 -429 E 0.080 -430 A 0.084 -431 V 0.093 -432 S 0.101 -433 S 0.106 -434 A 0.106 -435 A 0.100 -436 V 0.094 -437 A 0.091 -438 S 0.094 -439 C 0.098 -440 A 0.097 -441 G 0.083 -442 K 0.060 -443 L 0.040 -444 F 0.034 -445 V 0.044 -446 I 0.063 -447 G 0.083 -448 G 0.099 -449 A 0.110 -450 R 0.119 -451 Q 0.130 -452 G 0.147 -453 G 0.160 -454 V 0.160 -455 N 0.149 -456 T 0.137 -457 D 0.126 -458 K 0.112 -459 V 0.094 -460 Q 0.077 -461 C 0.066 -462 F 0.061 -463 D 0.062 -464 P 0.065 -465 K 0.069 -466 E 0.074 -467 D 0.079 -468 R 0.082 -469 W 0.083 -470 S 0.087 -471 L 0.095 -472 R 0.101 -473 S 0.105 -474 P 0.107 -475 A 0.104 -476 P 0.097 -477 F 0.094 -478 S 0.101 -479 Q 0.117 -480 R 0.132 -481 C 0.139 -482 L 0.136 -483 E 0.123 -484 A 0.110 -485 V 0.105 -486 S 0.110 -487 L 0.117 -488 E 0.115 -489 D 0.101 -490 T 0.078 -491 I 0.056 -492 Y 0.048 -493 V 0.059 -494 M 0.085 -495 G 0.113 -496 G 0.133 -497 L 0.143 -498 M 0.144 -499 S 0.141 -500 K 0.128 -501 I 0.107 -502 F 0.088 -503 T 0.080 -504 Y 0.084 -505 D 0.094 -506 P 0.103 -507 G 0.108 -508 T 0.110 -509 D 0.110 -510 V 0.110 -511 W 0.111 -512 G 0.115 -513 E 0.116 -514 A 0.114 -515 A 0.110 -516 V 0.105 -517 L 0.102 -518 P 0.102 -519 S 0.112 -520 P 0.133 -521 V 0.158 -522 E 0.174 -523 S 0.176 -524 C 0.163 -525 G 0.138 -526 V 0.109 -527 T 0.091 -528 V 0.091 -529 C 0.101 -530 D 0.108 -531 G 0.101 -532 K 0.079 -533 V 0.057 -534 H 0.048 -535 I 0.058 -536 L 0.081 -537 G 0.111 -538 G 0.142 -539 R 0.165 -540 D 0.173 -541 D 0.169 -542 R 0.164 -543 G 0.165 -544 E 0.164 -545 S 0.155 -546 T 0.145 -547 D 0.135 -548 K 0.120 -549 V 0.097 -550 F 0.077 -551 T 0.068 -552 F 0.069 -553 D 0.073 -554 P 0.079 -555 S 0.088 -556 S 0.099 -557 G 0.108 -558 Q 0.109 -559 V 0.103 -560 E 0.097 -561 V 0.092 -562 Q 0.087 -563 P 0.086 -564 S 0.087 -565 L 0.089 -566 Q 0.093 -567 R 0.104 -568 C 0.123 -569 T 0.147 -570 S 0.165 -571 S 0.162 -572 H 0.137 -573 G 0.101 -574 C 0.074 -575 V 0.065 -576 T 0.074 -577 I 0.087 -578 I 0.096 -579 Q 0.102 -580 S 0.114 -581 L 0.134 -582 G 0.157 -583 R 0.173 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000149243.18_ENST00000539798.3_GN:KLHL35_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000149243.18_ENST00000539798.3_GN:KLHL35_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid deleted file mode 100644 index 2fd6ee32213e4102e0132cdc30b204268091c965..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000149243.18_ENST00000539798.3_GN:KLHL35_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid +++ /dev/null @@ -1,587 +0,0 @@ ->ENSG00000149243.18|ENST00000539798.3|GN:KLHL35|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 -1 M 0.314 -2 A 0.317 -3 R 0.334 -4 M 0.359 -5 R 0.379 -6 Q 0.401 -7 G 0.443 -8 H 0.492 -9 A 0.526 -10 P 0.539 -11 E 0.542 -12 E 0.540 -13 S 0.544 -14 E 0.561 -15 P 0.587 -16 G 0.604 -17 C 0.599 -18 E 0.584 -19 A 0.576 -20 P 0.570 -21 C 0.551 -22 A 0.514 -23 G 0.460 -24 P 0.393 -25 C 0.321 -26 H 0.253 -27 A 0.196 -28 Q 0.153 -29 R 0.121 -30 V 0.099 -31 L 0.083 -32 Q 0.073 -33 A 0.070 -34 L 0.073 -35 N 0.080 -36 A 0.083 -37 Y 0.078 -38 R 0.074 -39 R 0.080 -40 S 0.097 -41 G 0.115 -42 T 0.121 -43 L 0.108 -44 T 0.084 -45 D 0.060 -46 V 0.044 -47 V 0.035 -48 L 0.034 -49 R 0.041 -50 A 0.052 -51 G 0.062 -52 G 0.065 -53 R 0.064 -54 D 0.065 -55 F 0.068 -56 P 0.073 -57 C 0.077 -58 H 0.075 -59 R 0.065 -60 A 0.055 -61 A 0.052 -62 L 0.059 -63 S 0.071 -64 A 0.082 -65 G 0.082 -66 S 0.071 -67 A 0.055 -68 Y 0.046 -69 F 0.050 -70 R 0.064 -71 S 0.080 -72 L 0.093 -73 F 0.113 -74 A 0.148 -75 A 0.194 -76 G 0.242 -77 R 0.285 -78 P 0.315 -79 E 0.322 -80 R 0.305 -81 G 0.275 -82 P 0.243 -83 A 0.217 -84 V 0.201 -85 V 0.191 -86 P 0.183 -87 V 0.187 -88 V 0.208 -89 P 0.238 -90 V 0.267 -91 A 0.298 -92 P 0.328 -93 E 0.352 -94 A 0.369 -95 P 0.375 -96 G 0.363 -97 T 0.325 -98 S 0.273 -99 P 0.234 -100 A 0.217 -101 G 0.203 -102 A 0.171 -103 A 0.126 -104 A 0.086 -105 A 0.062 -106 L 0.052 -107 A 0.049 -108 V 0.049 -109 V 0.050 -110 L 0.050 -111 D 0.049 -112 Y 0.048 -113 V 0.048 -114 Y 0.054 -115 G 0.066 -116 A 0.081 -117 G 0.090 -118 V 0.090 -119 R 0.085 -120 L 0.080 -121 R 0.075 -122 A 0.071 -123 E 0.066 -124 D 0.059 -125 E 0.052 -126 A 0.044 -127 A 0.038 -128 A 0.035 -129 V 0.035 -130 L 0.035 -131 A 0.037 -132 L 0.039 -133 A 0.040 -134 E 0.041 -135 R 0.046 -136 L 0.055 -137 G 0.064 -138 V 0.065 -139 A 0.058 -140 G 0.050 -141 L 0.043 -142 R 0.039 -143 E 0.037 -144 A 0.040 -145 C 0.049 -146 V 0.061 -147 R 0.067 -148 F 0.063 -149 L 0.057 -150 E 0.055 -151 G 0.056 -152 R 0.058 -153 L 0.061 -154 R 0.063 -155 A 0.059 -156 A 0.052 -157 N 0.044 -158 S 0.039 -159 L 0.036 -160 A 0.035 -161 L 0.035 -162 R 0.034 -163 R 0.036 -164 V 0.041 -165 A 0.047 -166 A 0.050 -167 A 0.051 -168 F 0.051 -169 S 0.052 -170 L 0.049 -171 A 0.044 -172 P 0.040 -173 L 0.043 -174 A 0.053 -175 E 0.063 -176 R 0.068 -177 C 0.075 -178 G 0.087 -179 R 0.094 -180 V 0.087 -181 L 0.073 -182 R 0.059 -183 Q 0.047 -184 A 0.036 -185 F 0.030 -186 A 0.029 -187 E 0.031 -188 V 0.030 -189 A 0.026 -190 R 0.023 -191 H 0.023 -192 A 0.026 -193 D 0.029 -194 F 0.030 -195 L 0.030 -196 E 0.031 -197 L 0.033 -198 A 0.033 -199 P 0.032 -200 D 0.028 -201 E 0.025 -202 V 0.025 -203 V 0.030 -204 A 0.038 -205 L 0.051 -206 L 0.068 -207 A 0.086 -208 D 0.098 -209 P 0.095 -210 A 0.081 -211 L 0.062 -212 G 0.046 -213 V 0.034 -214 A 0.029 -215 R 0.032 -216 E 0.040 -217 E 0.047 -218 A 0.051 -219 V 0.052 -220 F 0.051 -221 E 0.049 -222 A 0.047 -223 A 0.045 -224 M 0.045 -225 R 0.049 -226 W 0.054 -227 V 0.056 -228 R 0.054 -229 H 0.052 -230 D 0.049 -231 A 0.047 -232 P 0.047 -233 A 0.047 -234 R 0.047 -235 R 0.049 -236 G 0.051 -237 Q 0.051 -238 L 0.047 -239 R 0.042 -240 R 0.038 -241 L 0.038 -242 L 0.041 -243 E 0.043 -244 H 0.044 -245 V 0.045 -246 R 0.046 -247 L 0.047 -248 P 0.047 -249 L 0.045 -250 L 0.043 -251 A 0.046 -252 P 0.053 -253 A 0.057 -254 Y 0.050 -255 F 0.040 -256 L 0.034 -257 E 0.036 -258 K 0.042 -259 V 0.049 -260 E 0.053 -261 A 0.053 -262 D 0.051 -263 E 0.048 -264 L 0.047 -265 L 0.047 -266 Q 0.050 -267 A 0.055 -268 C 0.060 -269 G 0.061 -270 E 0.058 -271 C 0.052 -272 R 0.047 -273 P 0.048 -274 L 0.055 -275 L 0.067 -276 L 0.073 -277 E 0.069 -278 A 0.057 -279 R 0.046 -280 A 0.040 -281 C 0.042 -282 F 0.055 -283 I 0.082 -284 L 0.126 -285 G 0.179 -286 R 0.227 -287 E 0.257 -288 A 0.268 -289 G 0.264 -290 A 0.249 -291 L 0.231 -292 R 0.219 -293 T 0.213 -294 R 0.207 -295 P 0.197 -296 R 0.188 -297 R 0.186 -298 F 0.192 -299 M 0.195 -300 D 0.184 -301 L 0.155 -302 A 0.113 -303 E 0.072 -304 V 0.042 -305 I 0.025 -306 V 0.023 -307 V 0.032 -308 I 0.050 -309 G 0.074 -310 G 0.099 -311 C 0.124 -312 D 0.144 -313 R 0.153 -314 K 0.150 -315 G 0.145 -316 L 0.147 -317 L 0.159 -318 K 0.168 -319 L 0.164 -320 P 0.141 -321 F 0.106 -322 A 0.073 -323 D 0.051 -324 A 0.043 -325 Y 0.043 -326 H 0.045 -327 P 0.049 -328 E 0.053 -329 S 0.059 -330 Q 0.065 -331 R 0.070 -332 W 0.075 -333 T 0.079 -334 P 0.080 -335 L 0.078 -336 P 0.077 -337 S 0.078 -338 L 0.076 -339 P 0.070 -340 G 0.065 -341 Y 0.065 -342 T 0.075 -343 R 0.093 -344 S 0.109 -345 E 0.115 -346 F 0.112 -347 A 0.102 -348 A 0.087 -349 C 0.073 -350 A 0.066 -351 L 0.061 -352 R 0.054 -353 N 0.044 -354 D 0.034 -355 V 0.025 -356 Y 0.023 -357 V 0.031 -358 S 0.045 -359 G 0.060 -360 G 0.072 -361 H 0.079 -362 I 0.089 -363 N 0.103 -364 S 0.115 -365 H 0.116 -366 D 0.101 -367 V 0.079 -368 W 0.057 -369 M 0.041 -370 F 0.033 -371 S 0.029 -372 S 0.029 -373 H 0.033 -374 L 0.039 -375 H 0.046 -376 T 0.049 -377 W 0.050 -378 I 0.052 -379 K 0.057 -380 V 0.064 -381 A 0.068 -382 S 0.067 -383 L 0.063 -384 H 0.060 -385 K 0.061 -386 G 0.068 -387 R 0.079 -388 W 0.090 -389 R 0.096 -390 H 0.097 -391 K 0.090 -392 M 0.080 -393 A 0.077 -394 V 0.081 -395 V 0.085 -396 Q 0.080 -397 G 0.065 -398 Q 0.046 -399 L 0.030 -400 F 0.024 -401 A 0.028 -402 V 0.039 -403 G 0.052 -404 G 0.066 -405 F 0.076 -406 D 0.080 -407 G 0.083 -408 L 0.092 -409 R 0.106 -410 R 0.117 -411 L 0.118 -412 H 0.111 -413 S 0.100 -414 V 0.086 -415 E 0.070 -416 R 0.057 -417 Y 0.048 -418 D 0.044 -419 P 0.045 -420 F 0.049 -421 S 0.056 -422 N 0.064 -423 T 0.072 -424 W 0.081 -425 A 0.090 -426 A 0.097 -427 A 0.100 -428 A 0.099 -429 P 0.097 -430 L 0.092 -431 P 0.084 -432 E 0.080 -433 A 0.083 -434 V 0.092 -435 S 0.101 -436 S 0.106 -437 A 0.105 -438 A 0.100 -439 V 0.094 -440 A 0.091 -441 S 0.094 -442 C 0.098 -443 A 0.097 -444 G 0.083 -445 K 0.060 -446 L 0.040 -447 F 0.034 -448 V 0.045 -449 I 0.063 -450 G 0.083 -451 G 0.100 -452 A 0.112 -453 R 0.120 -454 Q 0.131 -455 G 0.148 -456 G 0.161 -457 V 0.161 -458 N 0.150 -459 T 0.139 -460 D 0.128 -461 K 0.113 -462 V 0.094 -463 Q 0.078 -464 C 0.067 -465 F 0.062 -466 D 0.062 -467 P 0.064 -468 K 0.068 -469 E 0.073 -470 D 0.080 -471 R 0.083 -472 W 0.084 -473 S 0.088 -474 L 0.095 -475 R 0.101 -476 S 0.105 -477 P 0.107 -478 A 0.104 -479 P 0.098 -480 F 0.095 -481 S 0.102 -482 Q 0.117 -483 R 0.132 -484 C 0.139 -485 L 0.136 -486 E 0.124 -487 A 0.110 -488 V 0.105 -489 S 0.111 -490 L 0.117 -491 E 0.115 -492 D 0.101 -493 T 0.079 -494 I 0.057 -495 Y 0.048 -496 V 0.060 -497 M 0.085 -498 G 0.113 -499 G 0.134 -500 L 0.143 -501 M 0.144 -502 S 0.141 -503 K 0.128 -504 I 0.107 -505 F 0.088 -506 T 0.080 -507 Y 0.084 -508 D 0.094 -509 P 0.103 -510 G 0.108 -511 T 0.110 -512 D 0.110 -513 V 0.110 -514 W 0.111 -515 G 0.114 -516 E 0.116 -517 A 0.114 -518 A 0.109 -519 V 0.105 -520 L 0.101 -521 P 0.101 -522 S 0.112 -523 P 0.133 -524 V 0.157 -525 E 0.174 -526 S 0.176 -527 C 0.163 -528 G 0.138 -529 V 0.109 -530 T 0.091 -531 V 0.091 -532 C 0.100 -533 D 0.107 -534 G 0.101 -535 K 0.079 -536 V 0.057 -537 H 0.048 -538 I 0.059 -539 L 0.082 -540 G 0.112 -541 G 0.142 -542 R 0.165 -543 D 0.172 -544 D 0.168 -545 R 0.164 -546 G 0.165 -547 E 0.163 -548 S 0.155 -549 T 0.145 -550 D 0.135 -551 K 0.120 -552 V 0.097 -553 F 0.077 -554 T 0.068 -555 F 0.069 -556 D 0.073 -557 P 0.078 -558 S 0.087 -559 S 0.099 -560 G 0.108 -561 Q 0.109 -562 V 0.103 -563 E 0.097 -564 V 0.092 -565 Q 0.087 -566 P 0.086 -567 S 0.087 -568 L 0.089 -569 Q 0.093 -570 R 0.103 -571 C 0.122 -572 T 0.146 -573 S 0.164 -574 S 0.162 -575 H 0.136 -576 G 0.101 -577 C 0.073 -578 V 0.065 -579 T 0.073 -580 I 0.086 -581 I 0.094 -582 Q 0.100 -583 S 0.112 -584 L 0.132 -585 G 0.156 -586 R 0.172 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000152133.18_ENST00000674370.2_GN:GPATCH11_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000152133.18_ENST00000674370.2_GN:GPATCH11_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index b076397fe55eb947a51390e4f115aa229962ca60..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000152133.18_ENST00000674370.2_GN:GPATCH11_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,264 +0,0 @@ ->ENSG00000152133.18|ENST00000674370.2|GN:GPATCH11|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.457 -2 K 0.490 -3 L 0.542 -4 N 0.594 -5 M 0.627 -6 A 0.636 -7 E 0.627 -8 E 0.611 -9 E 0.600 -10 D 0.598 -11 Y 0.597 -12 M 0.586 -13 S 0.573 -14 D 0.572 -15 S 0.588 -16 F 0.611 -17 I 0.631 -18 N 0.646 -19 V 0.660 -20 Q 0.664 -21 E 0.653 -22 D 0.636 -23 I 0.632 -24 R 0.638 -25 P 0.645 -26 G 0.645 -27 L 0.634 -28 P 0.598 -29 M 0.520 -30 L 0.409 -31 R 0.306 -32 Q 0.242 -33 I 0.216 -34 R 0.206 -35 E 0.196 -36 A 0.188 -37 R 0.181 -38 R 0.178 -39 K 0.181 -40 E 0.191 -41 E 0.201 -42 K 0.209 -43 Q 0.220 -44 Q 0.239 -45 E 0.268 -46 A 0.309 -47 N 0.364 -48 L 0.426 -49 K 0.477 -50 N 0.500 -51 R 0.497 -52 Q 0.482 -53 K 0.460 -54 S 0.425 -55 L 0.372 -56 K 0.315 -57 E 0.274 -58 E 0.254 -59 E 0.248 -60 Q 0.250 -61 E 0.255 -62 R 0.270 -63 R 0.294 -64 D 0.316 -65 I 0.329 -66 G 0.331 -67 L 0.325 -68 K 0.321 -69 N 0.321 -70 A 0.311 -71 L 0.283 -72 G 0.251 -73 C 0.236 -74 E 0.235 -75 N 0.225 -76 K 0.200 -77 G 0.175 -78 F 0.163 -79 A 0.163 -80 L 0.166 -81 L 0.169 -82 Q 0.176 -83 K 0.192 -84 M 0.210 -85 G 0.219 -86 Y 0.216 -87 K 0.217 -88 S 0.234 -89 G 0.269 -90 Q 0.315 -91 A 0.357 -92 L 0.378 -93 G 0.385 -94 K 0.406 -95 S 0.451 -96 G 0.494 -97 G 0.509 -98 G 0.492 -99 I 0.465 -100 V 0.468 -101 E 0.517 -102 P 0.582 -103 I 0.628 -104 P 0.647 -105 L 0.649 -106 N 0.633 -107 I 0.597 -108 K 0.552 -109 T 0.521 -110 G 0.518 -111 K 0.542 -112 S 0.577 -113 G 0.584 -114 I 0.531 -115 G 0.435 -116 H 0.352 -117 E 0.304 -118 A 0.278 -119 S 0.262 -120 L 0.253 -121 K 0.247 -122 R 0.240 -123 K 0.236 -124 A 0.235 -125 E 0.230 -126 E 0.215 -127 K 0.196 -128 L 0.177 -129 E 0.159 -130 S 0.148 -131 Y 0.144 -132 R 0.148 -133 K 0.160 -134 K 0.179 -135 I 0.200 -136 H 0.215 -137 M 0.224 -138 K 0.230 -139 N 0.231 -140 Q 0.229 -141 A 0.225 -142 E 0.218 -143 E 0.205 -144 K 0.193 -145 A 0.182 -146 A 0.167 -147 E 0.152 -148 Q 0.143 -149 F 0.144 -150 R 0.154 -151 M 0.172 -152 R 0.195 -153 L 0.213 -154 K 0.220 -155 N 0.219 -156 K 0.209 -157 Q 0.189 -158 D 0.168 -159 E 0.156 -160 M 0.144 -161 K 0.123 -162 L 0.099 -163 E 0.083 -164 G 0.076 -165 D 0.071 -166 L 0.067 -167 R 0.063 -168 R 0.057 -169 S 0.053 -170 Q 0.050 -171 R 0.047 -172 A 0.043 -173 C 0.042 -174 Q 0.043 -175 Q 0.045 -176 L 0.049 -177 D 0.054 -178 V 0.060 -179 Q 0.067 -180 K 0.078 -181 N 0.094 -182 I 0.113 -183 Q 0.133 -184 V 0.148 -185 P 0.152 -186 R 0.146 -187 E 0.134 -188 A 0.118 -189 W 0.102 -190 Y 0.103 -191 W 0.135 -192 L 0.199 -193 R 0.288 -194 L 0.379 -195 E 0.449 -196 E 0.483 -197 E 0.493 -198 T 0.503 -199 E 0.528 -200 E 0.554 -201 D 0.568 -202 E 0.575 -203 E 0.585 -204 E 0.601 -205 K 0.617 -206 E 0.628 -207 Q 0.630 -208 D 0.624 -209 E 0.604 -210 D 0.570 -211 E 0.528 -212 Y 0.490 -213 K 0.454 -214 S 0.402 -215 E 0.325 -216 D 0.238 -217 L 0.163 -218 S 0.113 -219 V 0.088 -220 L 0.077 -221 E 0.073 -222 K 0.073 -223 L 0.076 -224 Q 0.078 -225 I 0.080 -226 L 0.083 -227 T 0.083 -228 S 0.075 -229 Y 0.061 -230 L 0.051 -231 R 0.051 -232 E 0.061 -233 E 0.071 -234 H 0.071 -235 L 0.059 -236 Y 0.045 -237 C 0.039 -238 I 0.042 -239 W 0.055 -240 C 0.074 -241 G 0.094 -242 T 0.106 -243 A 0.111 -244 Y 0.108 -245 E 0.099 -246 D 0.088 -247 K 0.079 -248 E 0.073 -249 D 0.072 -250 L 0.076 -251 S 0.083 -252 S 0.090 -253 N 0.100 -254 C 0.115 -255 P 0.132 -256 G 0.148 -257 P 0.164 -258 T 0.182 -259 S 0.206 -260 A 0.228 -261 D 0.238 -262 H 0.235 -263 D 0.229 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000152133.18_ENST00000674370.2_GN:GPATCH11_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000152133.18_ENST00000674370.2_GN:GPATCH11_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid deleted file mode 100644 index b76d7987e346a2ac9dfbf6b140ebaec7a63ddc4c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000152133.18_ENST00000674370.2_GN:GPATCH11_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid +++ /dev/null @@ -1,286 +0,0 @@ ->ENSG00000152133.18|ENST00000674370.2|GN:GPATCH11|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:22 -1 M 0.405 -2 R 0.425 -3 S 0.467 -4 A 0.517 -5 R 0.555 -6 S 0.571 -7 T 0.572 -8 A 0.553 -9 L 0.511 -10 N 0.466 -11 R 0.436 -12 G 0.412 -13 E 0.378 -14 Q 0.337 -15 R 0.306 -16 A 0.283 -17 V 0.259 -18 R 0.238 -19 Y 0.234 -20 Y 0.253 -21 S 0.294 -22 H 0.351 -23 M 0.422 -24 K 0.504 -25 L 0.581 -26 N 0.634 -27 M 0.657 -28 A 0.657 -29 E 0.642 -30 E 0.622 -31 E 0.611 -32 D 0.613 -33 Y 0.611 -34 M 0.591 -35 S 0.564 -36 D 0.554 -37 S 0.566 -38 F 0.591 -39 I 0.616 -40 N 0.639 -41 V 0.657 -42 Q 0.663 -43 E 0.648 -44 D 0.627 -45 I 0.621 -46 R 0.632 -47 P 0.644 -48 G 0.649 -49 L 0.642 -50 P 0.607 -51 M 0.532 -52 L 0.427 -53 R 0.330 -54 Q 0.270 -55 I 0.242 -56 R 0.226 -57 E 0.213 -58 A 0.205 -59 R 0.201 -60 R 0.200 -61 K 0.202 -62 E 0.209 -63 E 0.216 -64 K 0.219 -65 Q 0.227 -66 Q 0.244 -67 E 0.271 -68 A 0.310 -69 N 0.363 -70 L 0.423 -71 K 0.471 -72 N 0.492 -73 R 0.485 -74 Q 0.466 -75 K 0.443 -76 S 0.407 -77 L 0.352 -78 K 0.293 -79 E 0.252 -80 E 0.233 -81 E 0.229 -82 Q 0.233 -83 E 0.239 -84 R 0.252 -85 R 0.274 -86 D 0.294 -87 I 0.308 -88 G 0.315 -89 L 0.314 -90 K 0.311 -91 N 0.310 -92 A 0.300 -93 L 0.274 -94 G 0.243 -95 C 0.228 -96 E 0.225 -97 N 0.214 -98 K 0.191 -99 G 0.168 -100 F 0.160 -101 A 0.163 -102 L 0.167 -103 L 0.169 -104 Q 0.173 -105 K 0.186 -106 M 0.205 -107 G 0.216 -108 Y 0.216 -109 K 0.217 -110 S 0.234 -111 G 0.270 -112 Q 0.316 -113 A 0.357 -114 L 0.374 -115 G 0.377 -116 K 0.396 -117 S 0.442 -118 G 0.490 -119 G 0.508 -120 G 0.492 -121 I 0.463 -122 V 0.463 -123 E 0.509 -124 P 0.572 -125 I 0.616 -126 P 0.637 -127 L 0.640 -128 N 0.626 -129 I 0.591 -130 K 0.548 -131 T 0.521 -132 G 0.519 -133 K 0.544 -134 S 0.579 -135 G 0.587 -136 I 0.535 -137 G 0.441 -138 H 0.358 -139 E 0.309 -140 A 0.282 -141 S 0.264 -142 L 0.253 -143 K 0.245 -144 R 0.238 -145 K 0.234 -146 A 0.234 -147 E 0.230 -148 E 0.216 -149 K 0.197 -150 L 0.176 -151 E 0.157 -152 S 0.144 -153 Y 0.139 -154 R 0.143 -155 K 0.154 -156 K 0.173 -157 I 0.194 -158 H 0.210 -159 M 0.220 -160 K 0.227 -161 N 0.230 -162 Q 0.230 -163 A 0.227 -164 E 0.220 -165 E 0.208 -166 K 0.196 -167 A 0.184 -168 A 0.169 -169 E 0.154 -170 Q 0.146 -171 F 0.147 -172 R 0.156 -173 M 0.173 -174 R 0.196 -175 L 0.214 -176 K 0.222 -177 N 0.223 -178 K 0.214 -179 Q 0.193 -180 D 0.172 -181 E 0.160 -182 M 0.149 -183 K 0.128 -184 L 0.102 -185 E 0.085 -186 G 0.078 -187 D 0.072 -188 L 0.068 -189 R 0.064 -190 R 0.059 -191 S 0.054 -192 Q 0.051 -193 R 0.049 -194 A 0.045 -195 C 0.043 -196 Q 0.043 -197 Q 0.046 -198 L 0.049 -199 D 0.054 -200 V 0.059 -201 Q 0.065 -202 K 0.075 -203 N 0.088 -204 I 0.105 -205 Q 0.123 -206 V 0.138 -207 P 0.144 -208 R 0.140 -209 E 0.130 -210 A 0.114 -211 W 0.098 -212 Y 0.098 -213 W 0.129 -214 L 0.191 -215 R 0.278 -216 L 0.368 -217 E 0.438 -218 E 0.473 -219 E 0.484 -220 T 0.496 -221 E 0.522 -222 E 0.549 -223 D 0.564 -224 E 0.571 -225 E 0.582 -226 E 0.598 -227 K 0.614 -228 E 0.626 -229 Q 0.630 -230 D 0.624 -231 E 0.605 -232 D 0.572 -233 E 0.531 -234 Y 0.494 -235 K 0.460 -236 S 0.408 -237 E 0.330 -238 D 0.241 -239 L 0.164 -240 S 0.114 -241 V 0.089 -242 L 0.078 -243 E 0.074 -244 K 0.074 -245 L 0.077 -246 Q 0.079 -247 I 0.081 -248 L 0.084 -249 T 0.085 -250 S 0.077 -251 Y 0.063 -252 L 0.052 -253 R 0.052 -254 E 0.062 -255 E 0.072 -256 H 0.072 -257 L 0.060 -258 Y 0.047 -259 C 0.040 -260 I 0.044 -261 W 0.057 -262 C 0.077 -263 G 0.097 -264 T 0.110 -265 A 0.114 -266 Y 0.112 -267 E 0.102 -268 D 0.091 -269 K 0.081 -270 E 0.075 -271 D 0.074 -272 L 0.078 -273 S 0.085 -274 S 0.092 -275 N 0.102 -276 C 0.117 -277 P 0.135 -278 G 0.152 -279 P 0.167 -280 T 0.186 -281 S 0.209 -282 A 0.231 -283 D 0.241 -284 H 0.238 -285 D 0.231 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000153485.7_ENST00000415050.3_GN:LYSET_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000153485.7_ENST00000415050.3_GN:LYSET_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 03d9e24c8e1ace76b009f23100991705c19d0870..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000153485.7_ENST00000415050.3_GN:LYSET_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,164 +0,0 @@ ->ENSG00000153485.7|ENST00000415050.3|GN:LYSET|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.400 -2 P 0.413 -3 K 0.426 -4 P 0.422 -5 P 0.387 -6 D 0.332 -7 Y 0.284 -8 S 0.258 -9 E 0.254 -10 L 0.263 -11 S 0.275 -12 D 0.282 -13 S 0.283 -14 L 0.282 -15 T 0.289 -16 L 0.312 -17 A 0.347 -18 V 0.379 -19 G 0.392 -20 T 0.384 -21 G 0.362 -22 R 0.339 -23 F 0.313 -24 S 0.275 -25 G 0.223 -26 P 0.171 -27 L 0.132 -28 H 0.111 -29 R 0.100 -30 A 0.093 -31 W 0.091 -32 R 0.092 -33 M 0.093 -34 M 0.086 -35 N 0.068 -36 F 0.050 -37 R 0.037 -38 Q 0.033 -39 R 0.032 -40 M 0.032 -41 G 0.034 -42 W 0.034 -43 I 0.034 -44 G 0.033 -45 V 0.034 -46 G 0.035 -47 L 0.032 -48 Y 0.029 -49 L 0.027 -50 L 0.025 -51 A 0.023 -52 S 0.021 -53 A 0.020 -54 A 0.019 -55 A 0.018 -56 F 0.018 -57 Y 0.019 -58 Y 0.023 -59 V 0.028 -60 F 0.037 -61 E 0.050 -62 I 0.062 -63 S 0.069 -64 E 0.070 -65 T 0.071 -66 Y 0.075 -67 N 0.082 -68 R 0.085 -69 L 0.081 -70 A 0.078 -71 L 0.088 -72 E 0.105 -73 H 0.119 -74 I 0.127 -75 Q 0.144 -76 Q 0.179 -77 H 0.229 -78 P 0.276 -79 E 0.310 -80 E 0.335 -81 P 0.362 -82 L 0.388 -83 E 0.401 -84 G 0.386 -85 T 0.342 -86 T 0.282 -87 W 0.230 -88 T 0.203 -89 H 0.198 -90 S 0.194 -91 L 0.179 -92 K 0.157 -93 A 0.144 -94 Q 0.143 -95 L 0.153 -96 L 0.163 -97 S 0.161 -98 L 0.139 -99 P 0.105 -100 F 0.075 -101 W 0.057 -102 V 0.047 -103 W 0.040 -104 T 0.036 -105 V 0.035 -106 I 0.035 -107 F 0.033 -108 L 0.030 -109 V 0.027 -110 P 0.023 -111 Y 0.020 -112 L 0.018 -113 Q 0.017 -114 M 0.016 -115 F 0.016 -116 L 0.016 -117 F 0.019 -118 L 0.021 -119 Y 0.025 -120 S 0.032 -121 C 0.047 -122 T 0.068 -123 R 0.092 -124 A 0.107 -125 D 0.111 -126 P 0.110 -127 K 0.111 -128 T 0.112 -129 V 0.107 -130 G 0.094 -131 Y 0.083 -132 C 0.080 -133 I 0.080 -134 I 0.072 -135 P 0.058 -136 I 0.045 -137 C 0.037 -138 L 0.031 -139 A 0.029 -140 V 0.032 -141 I 0.042 -142 C 0.057 -143 N 0.075 -144 R 0.090 -145 H 0.092 -146 Q 0.082 -147 A 0.074 -148 F 0.076 -149 V 0.088 -150 K 0.101 -151 A 0.114 -152 S 0.128 -153 N 0.146 -154 Q 0.160 -155 I 0.170 -156 S 0.184 -157 R 0.211 -158 L 0.250 -159 Q 0.293 -160 L 0.330 -161 I 0.353 -162 D 0.358 -163 T 0.355 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000153485.7_ENST00000415050.3_GN:LYSET_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000153485.7_ENST00000415050.3_GN:LYSET_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid deleted file mode 100644 index 530f58d00a0d63b6cdb40c84c4ed072b41e7e2ba..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000153485.7_ENST00000415050.3_GN:LYSET_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid +++ /dev/null @@ -1,170 +0,0 @@ ->ENSG00000153485.7|ENST00000415050.3|GN:LYSET|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:6 -1 M 0.406 -2 L 0.431 -3 A 0.468 -4 F 0.492 -5 S 0.483 -6 E 0.449 -7 M 0.415 -8 P 0.398 -9 K 0.391 -10 P 0.378 -11 P 0.348 -12 D 0.305 -13 Y 0.265 -14 S 0.245 -15 E 0.250 -16 L 0.271 -17 S 0.293 -18 D 0.304 -19 S 0.308 -20 L 0.315 -21 T 0.329 -22 L 0.357 -23 A 0.392 -24 V 0.417 -25 G 0.420 -26 T 0.404 -27 G 0.379 -28 R 0.356 -29 F 0.332 -30 S 0.292 -31 G 0.238 -32 P 0.185 -33 L 0.146 -34 H 0.125 -35 R 0.114 -36 A 0.105 -37 W 0.101 -38 R 0.101 -39 M 0.101 -40 M 0.092 -41 N 0.074 -42 F 0.054 -43 R 0.041 -44 Q 0.035 -45 R 0.033 -46 M 0.034 -47 G 0.036 -48 W 0.037 -49 I 0.036 -50 G 0.036 -51 V 0.036 -52 G 0.036 -53 L 0.033 -54 Y 0.030 -55 L 0.028 -56 L 0.026 -57 A 0.023 -58 S 0.022 -59 A 0.021 -60 A 0.019 -61 A 0.018 -62 F 0.018 -63 Y 0.019 -64 Y 0.022 -65 V 0.027 -66 F 0.035 -67 E 0.048 -68 I 0.059 -69 S 0.067 -70 E 0.070 -71 T 0.072 -72 Y 0.077 -73 N 0.084 -74 R 0.087 -75 L 0.081 -76 A 0.076 -77 L 0.081 -78 E 0.097 -79 H 0.112 -80 I 0.122 -81 Q 0.140 -82 Q 0.176 -83 H 0.227 -84 P 0.274 -85 E 0.309 -86 E 0.335 -87 P 0.363 -88 L 0.390 -89 E 0.402 -90 G 0.385 -91 T 0.339 -92 T 0.278 -93 W 0.226 -94 T 0.199 -95 H 0.192 -96 S 0.188 -97 L 0.173 -98 K 0.154 -99 A 0.140 -100 Q 0.138 -101 L 0.147 -102 L 0.158 -103 S 0.157 -104 L 0.137 -105 P 0.104 -106 F 0.074 -107 W 0.056 -108 V 0.046 -109 W 0.040 -110 T 0.036 -111 V 0.035 -112 I 0.035 -113 F 0.033 -114 L 0.031 -115 V 0.029 -116 P 0.025 -117 Y 0.021 -118 L 0.019 -119 Q 0.018 -120 M 0.017 -121 F 0.017 -122 L 0.018 -123 F 0.020 -124 L 0.022 -125 Y 0.025 -126 S 0.032 -127 C 0.047 -128 T 0.068 -129 R 0.091 -130 A 0.107 -131 D 0.111 -132 P 0.111 -133 K 0.113 -134 T 0.114 -135 V 0.108 -136 G 0.095 -137 Y 0.084 -138 C 0.082 -139 I 0.084 -140 I 0.078 -141 P 0.065 -142 I 0.051 -143 C 0.041 -144 L 0.034 -145 A 0.031 -146 V 0.034 -147 I 0.042 -148 C 0.056 -149 N 0.072 -150 R 0.086 -151 H 0.089 -152 Q 0.083 -153 A 0.078 -154 F 0.085 -155 V 0.100 -156 K 0.114 -157 A 0.124 -158 S 0.135 -159 N 0.151 -160 Q 0.165 -161 I 0.175 -162 S 0.188 -163 R 0.214 -164 L 0.252 -165 Q 0.292 -166 L 0.328 -167 I 0.352 -168 D 0.358 -169 T 0.356 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000153684.16_ENST00000526619.7_GN:GOLGA8F_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000153684.16_ENST00000526619.7_GN:GOLGA8F_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 637c0649a8f42426f698558cd35ff20c1865c915..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000153684.16_ENST00000526619.7_GN:GOLGA8F_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,637 +0,0 @@ ->ENSG00000153684.16|ENST00000526619.7|GN:GOLGA8F|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.332 -2 A 0.334 -3 E 0.328 -4 E 0.309 -5 T 0.283 -6 R 0.258 -7 Q 0.245 -8 S 0.243 -9 K 0.245 -10 L 0.245 -11 A 0.247 -12 A 0.250 -13 A 0.245 -14 K 0.229 -15 R 0.216 -16 K 0.211 -17 L 0.210 -18 K 0.210 -19 E 0.214 -20 Y 0.223 -21 W 0.240 -22 Q 0.274 -23 R 0.332 -24 N 0.412 -25 S 0.502 -26 P 0.586 -27 G 0.650 -28 V 0.693 -29 P 0.720 -30 A 0.739 -31 G 0.750 -32 A 0.752 -33 K 0.749 -34 R 0.748 -35 N 0.746 -36 R 0.740 -37 K 0.737 -38 T 0.732 -39 N 0.704 -40 G 0.652 -41 S 0.617 -42 I 0.629 -43 H 0.647 -44 E 0.636 -45 T 0.631 -46 A 0.675 -47 T 0.744 -48 S 0.794 -49 G 0.814 -50 G 0.815 -51 C 0.804 -52 H 0.794 -53 S 0.796 -54 P 0.810 -55 G 0.828 -56 D 0.841 -57 S 0.846 -58 A 0.846 -59 T 0.847 -60 G 0.848 -61 I 0.847 -62 H 0.841 -63 G 0.830 -64 E 0.816 -65 S 0.806 -66 P 0.807 -67 T 0.816 -68 S 0.823 -69 S 0.826 -70 A 0.827 -71 T 0.829 -72 L 0.829 -73 K 0.826 -74 D 0.817 -75 L 0.799 -76 E 0.784 -77 S 0.779 -78 P 0.785 -79 C 0.792 -80 Q 0.796 -81 E 0.795 -82 L 0.788 -83 A 0.775 -84 V 0.755 -85 V 0.736 -86 P 0.718 -87 D 0.694 -88 S 0.657 -89 R 0.620 -90 S 0.603 -91 V 0.591 -92 K 0.551 -93 V 0.493 -94 S 0.446 -95 Q 0.404 -96 L 0.355 -97 K 0.321 -98 N 0.318 -99 T 0.329 -100 I 0.335 -101 K 0.343 -102 S 0.356 -103 L 0.368 -104 K 0.385 -105 Q 0.407 -106 Q 0.419 -107 N 0.420 -108 K 0.420 -109 Q 0.416 -110 V 0.406 -111 E 0.399 -112 H 0.383 -113 Q 0.346 -114 L 0.307 -115 E 0.290 -116 E 0.288 -117 E 0.288 -118 K 0.293 -119 K 0.304 -120 A 0.311 -121 N 0.311 -122 N 0.311 -123 E 0.313 -124 K 0.319 -125 Q 0.337 -126 K 0.363 -127 A 0.373 -128 E 0.359 -129 R 0.331 -130 E 0.300 -131 L 0.270 -132 E 0.246 -133 V 0.227 -134 Q 0.209 -135 I 0.192 -136 Q 0.179 -137 R 0.169 -138 L 0.165 -139 N 0.172 -140 I 0.193 -141 Q 0.221 -142 K 0.253 -143 G 0.284 -144 K 0.305 -145 L 0.313 -146 N 0.315 -147 T 0.311 -148 D 0.286 -149 L 0.240 -150 Y 0.198 -151 H 0.180 -152 T 0.186 -153 K 0.210 -154 R 0.239 -155 S 0.251 -156 L 0.239 -157 R 0.214 -158 Y 0.194 -159 F 0.195 -160 E 0.223 -161 E 0.262 -162 E 0.288 -163 S 0.296 -164 K 0.294 -165 D 0.282 -166 L 0.267 -167 A 0.259 -168 V 0.254 -169 R 0.241 -170 L 0.228 -171 Q 0.222 -172 H 0.223 -173 S 0.232 -174 L 0.258 -175 Q 0.295 -176 R 0.321 -177 K 0.332 -178 G 0.334 -179 E 0.326 -180 L 0.315 -181 E 0.313 -182 R 0.321 -183 A 0.327 -184 L 0.331 -185 S 0.338 -186 A 0.339 -187 V 0.324 -188 T 0.305 -189 A 0.293 -190 T 0.292 -191 Q 0.300 -192 K 0.308 -193 K 0.312 -194 K 0.316 -195 A 0.329 -196 E 0.347 -197 R 0.368 -198 Q 0.397 -199 F 0.429 -200 S 0.440 -201 S 0.426 -202 R 0.400 -203 S 0.372 -204 K 0.346 -205 A 0.330 -206 R 0.331 -207 M 0.341 -208 E 0.343 -209 W 0.326 -210 K 0.295 -211 L 0.268 -212 E 0.254 -213 Q 0.248 -214 S 0.244 -215 M 0.250 -216 R 0.263 -217 E 0.268 -218 Q 0.260 -219 A 0.251 -220 L 0.250 -221 L 0.258 -222 K 0.280 -223 A 0.302 -224 Q 0.306 -225 L 0.297 -226 T 0.293 -227 Q 0.296 -228 L 0.308 -229 K 0.335 -230 E 0.358 -231 S 0.349 -232 L 0.315 -233 K 0.276 -234 E 0.238 -235 V 0.204 -236 Q 0.186 -237 L 0.180 -238 E 0.172 -239 R 0.162 -240 D 0.159 -241 E 0.159 -242 Y 0.157 -243 A 0.158 -244 E 0.163 -245 H 0.166 -246 L 0.168 -247 K 0.178 -248 G 0.195 -249 E 0.203 -250 R 0.198 -251 A 0.188 -252 R 0.180 -253 W 0.177 -254 Q 0.181 -255 Q 0.189 -256 R 0.199 -257 M 0.207 -258 R 0.214 -259 K 0.218 -260 M 0.218 -261 S 0.217 -262 Q 0.212 -263 E 0.201 -264 V 0.190 -265 C 0.191 -266 S 0.203 -267 L 0.215 -268 K 0.227 -269 K 0.239 -270 E 0.250 -271 K 0.262 -272 K 0.276 -273 H 0.288 -274 D 0.294 -275 K 0.297 -276 Y 0.301 -277 R 0.302 -278 V 0.291 -279 E 0.268 -280 K 0.243 -281 L 0.228 -282 E 0.227 -283 R 0.231 -284 S 0.235 -285 L 0.239 -286 S 0.247 -287 K 0.261 -288 L 0.284 -289 K 0.319 -290 H 0.364 -291 Q 0.406 -292 M 0.436 -293 A 0.459 -294 E 0.488 -295 P 0.526 -296 L 0.564 -297 P 0.598 -298 P 0.630 -299 E 0.659 -300 P 0.684 -301 P 0.702 -302 A 0.712 -303 V 0.706 -304 P 0.674 -305 S 0.617 -306 E 0.554 -307 V 0.498 -308 E 0.447 -309 L 0.394 -310 Q 0.355 -311 H 0.338 -312 L 0.336 -313 R 0.339 -314 K 0.341 -315 E 0.336 -316 L 0.320 -317 E 0.304 -318 R 0.307 -319 V 0.343 -320 A 0.400 -321 G 0.432 -322 E 0.410 -323 L 0.358 -324 Q 0.314 -325 A 0.288 -326 Q 0.273 -327 V 0.267 -328 E 0.260 -329 Y 0.254 -330 N 0.262 -331 Q 0.285 -332 R 0.310 -333 I 0.338 -334 S 0.376 -335 L 0.409 -336 L 0.413 -337 N 0.402 -338 E 0.399 -339 G 0.402 -340 Q 0.397 -341 K 0.389 -342 E 0.377 -343 R 0.350 -344 L 0.312 -345 R 0.284 -346 E 0.271 -347 Q 0.264 -348 E 0.260 -349 E 0.260 -350 R 0.267 -351 L 0.287 -352 Q 0.320 -353 E 0.358 -354 Q 0.389 -355 Q 0.409 -356 E 0.419 -357 R 0.424 -358 L 0.437 -359 P 0.470 -360 E 0.514 -361 Q 0.549 -362 E 0.569 -363 E 0.574 -364 R 0.562 -365 L 0.546 -366 Q 0.547 -367 Q 0.567 -368 L 0.578 -369 A 0.563 -370 E 0.535 -371 P 0.523 -372 Q 0.539 -373 N 0.571 -374 S 0.597 -375 F 0.615 -376 K 0.637 -377 E 0.660 -378 L 0.670 -379 N 0.669 -380 N 0.664 -381 E 0.655 -382 N 0.641 -383 K 0.622 -384 S 0.589 -385 V 0.527 -386 L 0.439 -387 Q 0.364 -388 L 0.330 -389 E 0.323 -390 Q 0.314 -391 Q 0.297 -392 V 0.274 -393 K 0.252 -394 E 0.237 -395 L 0.236 -396 Q 0.245 -397 E 0.251 -398 K 0.254 -399 L 0.267 -400 G 0.298 -401 K 0.334 -402 E 0.354 -403 R 0.351 -404 L 0.340 -405 E 0.341 -406 A 0.364 -407 A 0.408 -408 S 0.470 -409 Q 0.525 -410 Q 0.552 -411 K 0.548 -412 Q 0.532 -413 Q 0.516 -414 L 0.507 -415 T 0.510 -416 A 0.529 -417 Q 0.559 -418 L 0.591 -419 S 0.616 -420 L 0.631 -421 M 0.633 -422 A 0.633 -423 L 0.645 -424 P 0.676 -425 G 0.716 -426 E 0.749 -427 G 0.768 -428 D 0.777 -429 G 0.781 -430 G 0.784 -431 G 0.788 -432 H 0.791 -433 L 0.793 -434 D 0.795 -435 S 0.795 -436 E 0.793 -437 G 0.788 -438 E 0.780 -439 E 0.769 -440 A 0.758 -441 P 0.748 -442 R 0.741 -443 P 0.741 -444 I 0.748 -445 P 0.760 -446 S 0.768 -447 I 0.771 -448 P 0.774 -449 Q 0.778 -450 D 0.780 -451 L 0.777 -452 E 0.774 -453 S 0.767 -454 R 0.750 -455 E 0.723 -456 A 0.696 -457 M 0.683 -458 S 0.678 -459 G 0.656 -460 F 0.612 -461 M 0.570 -462 D 0.550 -463 H 0.534 -464 L 0.513 -465 E 0.502 -466 E 0.515 -467 K 0.527 -468 A 0.506 -469 D 0.458 -470 L 0.421 -471 S 0.419 -472 E 0.429 -473 L 0.415 -474 V 0.375 -475 E 0.340 -476 K 0.329 -477 E 0.339 -478 E 0.356 -479 L 0.357 -480 G 0.324 -481 F 0.265 -482 F 0.209 -483 Q 0.174 -484 Y 0.159 -485 Y 0.156 -486 R 0.163 -487 E 0.180 -488 R 0.209 -489 C 0.252 -490 H 0.311 -491 Q 0.384 -492 K 0.459 -493 V 0.520 -494 Y 0.569 -495 H 0.621 -496 P 0.675 -497 I 0.718 -498 T 0.743 -499 K 0.760 -500 P 0.780 -501 G 0.805 -502 G 0.826 -503 S 0.837 -504 A 0.841 -505 K 0.839 -506 D 0.830 -507 A 0.816 -508 A 0.805 -509 P 0.800 -510 G 0.788 -511 G 0.734 -512 G 0.627 -513 H 0.528 -514 H 0.526 -515 Q 0.624 -516 A 0.734 -517 G 0.796 -518 P 0.821 -519 G 0.834 -520 Q 0.843 -521 G 0.849 -522 G 0.851 -523 D 0.849 -524 E 0.844 -525 G 0.826 -526 E 0.779 -527 A 0.714 -528 A 0.682 -529 G 0.720 -530 A 0.790 -531 A 0.838 -532 G 0.858 -533 D 0.864 -534 G 0.865 -535 V 0.864 -536 A 0.862 -537 A 0.858 -538 G 0.851 -539 G 0.840 -540 D 0.828 -541 Y 0.819 -542 K 0.814 -543 G 0.809 -544 H 0.805 -545 S 0.803 -546 K 0.806 -547 F 0.812 -548 L 0.819 -549 V 0.821 -550 T 0.814 -551 A 0.800 -552 Q 0.788 -553 N 0.786 -554 P 0.789 -555 A 0.790 -556 H 0.785 -557 E 0.781 -558 P 0.782 -559 S 0.789 -560 P 0.799 -561 G 0.805 -562 A 0.806 -563 P 0.807 -564 A 0.813 -565 P 0.824 -566 Q 0.838 -567 E 0.850 -568 L 0.856 -569 G 0.856 -570 A 0.849 -571 A 0.838 -572 H 0.828 -573 K 0.824 -574 H 0.827 -575 G 0.832 -576 D 0.833 -577 L 0.831 -578 C 0.828 -579 E 0.827 -580 V 0.827 -581 S 0.827 -582 L 0.826 -583 T 0.824 -584 D 0.817 -585 S 0.804 -586 V 0.794 -587 E 0.796 -588 P 0.810 -589 V 0.825 -590 Q 0.834 -591 G 0.836 -592 E 0.834 -593 A 0.830 -594 R 0.822 -595 E 0.811 -596 G 0.798 -597 S 0.788 -598 P 0.783 -599 H 0.783 -600 D 0.784 -601 N 0.784 -602 P 0.782 -603 T 0.780 -604 A 0.778 -605 Q 0.778 -606 P 0.773 -607 I 0.740 -608 V 0.682 -609 Q 0.646 -610 D 0.664 -611 H 0.706 -612 Q 0.729 -613 E 0.734 -614 H 0.740 -615 P 0.758 -616 G 0.781 -617 L 0.798 -618 G 0.794 -619 S 0.763 -620 N 0.708 -621 C 0.649 -622 C 0.600 -623 V 0.551 -624 P 0.485 -625 F 0.409 -626 F 0.342 -627 C 0.286 -628 W 0.243 -629 A 0.225 -630 W 0.239 -631 L 0.278 -632 P 0.328 -633 R 0.375 -634 R 0.396 -635 R 0.386 -636 R 0.366 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000153684.16_ENST00000526619.7_GN:GOLGA8F_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000153684.16_ENST00000526619.7_GN:GOLGA8F_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid deleted file mode 100644 index d76f2b3238a3ec15973168224efd3821c26b90bd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000153684.16_ENST00000526619.7_GN:GOLGA8F_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid +++ /dev/null @@ -1,649 +0,0 @@ ->ENSG00000153684.16|ENST00000526619.7|GN:GOLGA8F|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:12 -1 M 0.417 -2 W 0.452 -3 P 0.504 -4 Q 0.545 -5 A 0.562 -6 R 0.561 -7 L 0.563 -8 P 0.579 -9 P 0.603 -10 H 0.624 -11 P 0.634 -12 A 0.622 -13 M 0.584 -14 A 0.531 -15 E 0.478 -16 E 0.428 -17 T 0.380 -18 R 0.343 -19 Q 0.323 -20 S 0.311 -21 K 0.297 -22 L 0.283 -23 A 0.277 -24 A 0.279 -25 A 0.273 -26 K 0.256 -27 R 0.239 -28 K 0.233 -29 L 0.236 -30 K 0.239 -31 E 0.246 -32 Y 0.256 -33 W 0.273 -34 Q 0.306 -35 R 0.362 -36 N 0.436 -37 S 0.518 -38 P 0.597 -39 G 0.661 -40 V 0.704 -41 P 0.732 -42 A 0.753 -43 G 0.766 -44 A 0.769 -45 K 0.766 -46 R 0.755 -47 N 0.727 -48 R 0.684 -49 K 0.662 -50 T 0.674 -51 N 0.681 -52 G 0.652 -53 S 0.626 -54 I 0.644 -55 H 0.670 -56 E 0.668 -57 T 0.667 -58 A 0.707 -59 T 0.767 -60 S 0.811 -61 G 0.829 -62 G 0.829 -63 C 0.819 -64 H 0.808 -65 S 0.808 -66 P 0.820 -67 G 0.836 -68 D 0.847 -69 S 0.852 -70 A 0.851 -71 T 0.851 -72 G 0.853 -73 I 0.852 -74 H 0.846 -75 G 0.836 -76 E 0.822 -77 S 0.813 -78 P 0.814 -79 T 0.822 -80 S 0.828 -81 S 0.830 -82 A 0.830 -83 T 0.830 -84 L 0.830 -85 K 0.827 -86 D 0.818 -87 L 0.800 -88 E 0.785 -89 S 0.780 -90 P 0.784 -91 C 0.789 -92 Q 0.790 -93 E 0.787 -94 L 0.778 -95 A 0.762 -96 V 0.741 -97 V 0.720 -98 P 0.703 -99 D 0.679 -100 S 0.638 -101 R 0.596 -102 S 0.576 -103 V 0.565 -104 K 0.529 -105 V 0.473 -106 S 0.426 -107 Q 0.387 -108 L 0.344 -109 K 0.315 -110 N 0.313 -111 T 0.323 -112 I 0.325 -113 K 0.329 -114 S 0.340 -115 L 0.349 -116 K 0.363 -117 Q 0.382 -118 Q 0.397 -119 N 0.407 -120 K 0.414 -121 Q 0.412 -122 V 0.401 -123 E 0.392 -124 H 0.377 -125 Q 0.343 -126 L 0.308 -127 E 0.294 -128 E 0.294 -129 E 0.294 -130 K 0.300 -131 K 0.313 -132 A 0.321 -133 N 0.322 -134 N 0.324 -135 E 0.325 -136 K 0.328 -137 Q 0.344 -138 K 0.368 -139 A 0.376 -140 E 0.358 -141 R 0.327 -142 E 0.295 -143 L 0.266 -144 E 0.243 -145 V 0.224 -146 Q 0.205 -147 I 0.187 -148 Q 0.172 -149 R 0.163 -150 L 0.160 -151 N 0.168 -152 I 0.188 -153 Q 0.215 -154 K 0.247 -155 G 0.279 -156 K 0.301 -157 L 0.311 -158 N 0.315 -159 T 0.311 -160 D 0.285 -161 L 0.239 -162 Y 0.199 -163 H 0.182 -164 T 0.189 -165 K 0.214 -166 R 0.243 -167 S 0.257 -168 L 0.245 -169 R 0.219 -170 Y 0.200 -171 F 0.202 -172 E 0.232 -173 E 0.273 -174 E 0.299 -175 S 0.306 -176 K 0.304 -177 D 0.292 -178 L 0.276 -179 A 0.268 -180 V 0.261 -181 R 0.248 -182 L 0.236 -183 Q 0.233 -184 H 0.235 -185 S 0.247 -186 L 0.276 -187 Q 0.316 -188 R 0.345 -189 K 0.357 -190 G 0.359 -191 E 0.350 -192 L 0.337 -193 E 0.337 -194 R 0.343 -195 A 0.344 -196 L 0.342 -197 S 0.343 -198 A 0.339 -199 V 0.320 -200 T 0.298 -201 A 0.284 -202 T 0.281 -203 Q 0.288 -204 K 0.296 -205 K 0.299 -206 K 0.303 -207 A 0.316 -208 E 0.332 -209 R 0.350 -210 Q 0.377 -211 F 0.406 -212 S 0.418 -213 S 0.406 -214 R 0.385 -215 S 0.362 -216 K 0.338 -217 A 0.323 -218 R 0.325 -219 M 0.337 -220 E 0.340 -221 W 0.324 -222 K 0.295 -223 L 0.270 -224 E 0.258 -225 Q 0.251 -226 S 0.247 -227 M 0.252 -228 R 0.264 -229 E 0.267 -230 Q 0.258 -231 A 0.249 -232 L 0.247 -233 L 0.256 -234 K 0.278 -235 A 0.300 -236 Q 0.304 -237 L 0.296 -238 T 0.293 -239 Q 0.297 -240 L 0.312 -241 K 0.342 -242 E 0.365 -243 S 0.354 -244 L 0.317 -245 K 0.277 -246 E 0.238 -247 V 0.204 -248 Q 0.185 -249 L 0.179 -250 E 0.171 -251 R 0.160 -252 D 0.157 -253 E 0.156 -254 Y 0.154 -255 A 0.155 -256 E 0.160 -257 H 0.163 -258 L 0.166 -259 K 0.178 -260 G 0.195 -261 E 0.204 -262 R 0.200 -263 A 0.192 -264 R 0.185 -265 W 0.182 -266 Q 0.184 -267 Q 0.192 -268 R 0.202 -269 M 0.212 -270 R 0.219 -271 K 0.223 -272 M 0.224 -273 S 0.222 -274 Q 0.216 -275 E 0.205 -276 V 0.195 -277 C 0.197 -278 S 0.209 -279 L 0.222 -280 K 0.236 -281 K 0.249 -282 E 0.261 -283 K 0.276 -284 K 0.292 -285 H 0.305 -286 D 0.310 -287 K 0.313 -288 Y 0.319 -289 R 0.320 -290 V 0.310 -291 E 0.287 -292 K 0.260 -293 L 0.243 -294 E 0.240 -295 R 0.243 -296 S 0.245 -297 L 0.248 -298 S 0.257 -299 K 0.271 -300 L 0.293 -301 K 0.328 -302 H 0.374 -303 Q 0.418 -304 M 0.448 -305 A 0.470 -306 E 0.498 -307 P 0.534 -308 L 0.570 -309 P 0.603 -310 P 0.635 -311 E 0.665 -312 P 0.690 -313 P 0.709 -314 A 0.719 -315 V 0.713 -316 P 0.683 -317 S 0.629 -318 E 0.567 -319 V 0.511 -320 E 0.457 -321 L 0.402 -322 Q 0.362 -323 H 0.345 -324 L 0.343 -325 R 0.345 -326 K 0.346 -327 E 0.341 -328 L 0.326 -329 E 0.312 -330 R 0.316 -331 V 0.354 -332 A 0.413 -333 G 0.446 -334 E 0.424 -335 L 0.370 -336 Q 0.324 -337 A 0.297 -338 Q 0.282 -339 V 0.275 -340 E 0.268 -341 Y 0.262 -342 N 0.270 -343 Q 0.295 -344 R 0.322 -345 I 0.352 -346 S 0.391 -347 L 0.424 -348 L 0.429 -349 N 0.418 -350 E 0.416 -351 G 0.420 -352 Q 0.415 -353 K 0.406 -354 E 0.391 -355 R 0.361 -356 L 0.321 -357 R 0.291 -358 E 0.276 -359 Q 0.269 -360 E 0.265 -361 E 0.265 -362 R 0.272 -363 L 0.292 -364 Q 0.326 -365 E 0.364 -366 Q 0.395 -367 Q 0.414 -368 E 0.422 -369 R 0.424 -370 L 0.436 -371 P 0.469 -372 E 0.513 -373 Q 0.548 -374 E 0.569 -375 E 0.574 -376 R 0.560 -377 L 0.543 -378 Q 0.543 -379 Q 0.561 -380 L 0.572 -381 A 0.556 -382 E 0.527 -383 P 0.513 -384 Q 0.529 -385 N 0.561 -386 S 0.587 -387 F 0.606 -388 K 0.630 -389 E 0.655 -390 L 0.667 -391 N 0.667 -392 N 0.663 -393 E 0.654 -394 N 0.641 -395 K 0.623 -396 S 0.591 -397 V 0.528 -398 L 0.440 -399 Q 0.366 -400 L 0.333 -401 E 0.327 -402 Q 0.320 -403 Q 0.304 -404 V 0.282 -405 K 0.259 -406 E 0.243 -407 L 0.241 -408 Q 0.250 -409 E 0.257 -410 K 0.260 -411 L 0.272 -412 G 0.303 -413 K 0.340 -414 E 0.360 -415 R 0.356 -416 L 0.345 -417 E 0.345 -418 A 0.366 -419 A 0.410 -420 S 0.471 -421 Q 0.527 -422 Q 0.554 -423 K 0.553 -424 Q 0.538 -425 Q 0.521 -426 L 0.511 -427 T 0.514 -428 A 0.533 -429 Q 0.563 -430 L 0.595 -431 S 0.620 -432 L 0.635 -433 M 0.637 -434 A 0.635 -435 L 0.647 -436 P 0.676 -437 G 0.716 -438 E 0.749 -439 G 0.768 -440 D 0.777 -441 G 0.781 -442 G 0.785 -443 G 0.788 -444 H 0.792 -445 L 0.794 -446 D 0.796 -447 S 0.796 -448 E 0.795 -449 G 0.790 -450 E 0.782 -451 E 0.772 -452 A 0.761 -453 P 0.752 -454 R 0.746 -455 P 0.745 -456 I 0.753 -457 P 0.765 -458 S 0.772 -459 I 0.775 -460 P 0.778 -461 Q 0.782 -462 D 0.784 -463 L 0.782 -464 E 0.778 -465 S 0.772 -466 R 0.756 -467 E 0.731 -468 A 0.705 -469 M 0.693 -470 S 0.687 -471 G 0.666 -472 F 0.623 -473 M 0.582 -474 D 0.563 -475 H 0.548 -476 L 0.526 -477 E 0.515 -478 E 0.527 -479 K 0.538 -480 A 0.516 -481 D 0.467 -482 L 0.431 -483 S 0.430 -484 E 0.440 -485 L 0.427 -486 V 0.387 -487 E 0.352 -488 K 0.341 -489 E 0.351 -490 E 0.367 -491 L 0.367 -492 G 0.333 -493 F 0.273 -494 F 0.216 -495 Q 0.181 -496 Y 0.165 -497 Y 0.163 -498 R 0.170 -499 E 0.188 -500 R 0.218 -501 C 0.262 -502 H 0.322 -503 Q 0.396 -504 K 0.469 -505 V 0.527 -506 Y 0.575 -507 H 0.625 -508 P 0.678 -509 I 0.720 -510 T 0.745 -511 K 0.762 -512 P 0.782 -513 G 0.807 -514 G 0.828 -515 S 0.840 -516 A 0.843 -517 K 0.840 -518 D 0.832 -519 A 0.818 -520 A 0.807 -521 P 0.802 -522 G 0.789 -523 G 0.735 -524 G 0.628 -525 H 0.529 -526 H 0.527 -527 Q 0.624 -528 A 0.734 -529 G 0.796 -530 P 0.821 -531 G 0.834 -532 Q 0.843 -533 G 0.849 -534 G 0.851 -535 D 0.850 -536 E 0.844 -537 G 0.826 -538 E 0.779 -539 A 0.713 -540 A 0.681 -541 G 0.719 -542 A 0.789 -543 A 0.838 -544 G 0.857 -545 D 0.863 -546 G 0.864 -547 V 0.863 -548 A 0.861 -549 A 0.857 -550 G 0.851 -551 G 0.840 -552 D 0.827 -553 Y 0.818 -554 K 0.813 -555 G 0.809 -556 H 0.804 -557 S 0.803 -558 K 0.805 -559 F 0.811 -560 L 0.818 -561 V 0.820 -562 T 0.814 -563 A 0.800 -564 Q 0.788 -565 N 0.786 -566 P 0.789 -567 A 0.789 -568 H 0.784 -569 E 0.780 -570 P 0.781 -571 S 0.788 -572 P 0.797 -573 G 0.804 -574 A 0.805 -575 P 0.805 -576 A 0.811 -577 P 0.822 -578 Q 0.836 -579 E 0.848 -580 L 0.855 -581 G 0.855 -582 A 0.848 -583 A 0.837 -584 H 0.827 -585 K 0.823 -586 H 0.826 -587 G 0.831 -588 D 0.832 -589 L 0.830 -590 C 0.827 -591 E 0.826 -592 V 0.826 -593 S 0.827 -594 L 0.826 -595 T 0.824 -596 D 0.817 -597 S 0.804 -598 V 0.794 -599 E 0.796 -600 P 0.810 -601 V 0.825 -602 Q 0.834 -603 G 0.836 -604 E 0.834 -605 A 0.830 -606 R 0.822 -607 E 0.811 -608 G 0.799 -609 S 0.788 -610 P 0.784 -611 H 0.784 -612 D 0.785 -613 N 0.785 -614 P 0.783 -615 T 0.781 -616 A 0.779 -617 Q 0.779 -618 P 0.773 -619 I 0.740 -620 V 0.681 -621 Q 0.645 -622 D 0.663 -623 H 0.705 -624 Q 0.729 -625 E 0.734 -626 H 0.740 -627 P 0.758 -628 G 0.781 -629 L 0.797 -630 G 0.793 -631 S 0.760 -632 N 0.703 -633 C 0.641 -634 C 0.592 -635 V 0.542 -636 P 0.476 -637 F 0.401 -638 F 0.335 -639 C 0.281 -640 W 0.239 -641 A 0.221 -642 W 0.236 -643 L 0.276 -644 P 0.328 -645 R 0.375 -646 R 0.397 -647 R 0.387 -648 R 0.368 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000156206.14_ENST00000286732.5_GN:CFAP161_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000156206.14_ENST00000286732.5_GN:CFAP161_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index c708c76df55d914cc6db3926bf1ca59d7b6bded7..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000156206.14_ENST00000286732.5_GN:CFAP161_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,302 +0,0 @@ ->ENSG00000156206.14|ENST00000286732.5|GN:CFAP161|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.391 -2 A 0.404 -3 Q 0.426 -4 N 0.446 -5 V 0.460 -6 Y 0.483 -7 G 0.531 -8 P 0.591 -9 G 0.621 -10 V 0.603 -11 R 0.563 -12 I 0.543 -13 G 0.548 -14 N 0.538 -15 W 0.492 -16 N 0.432 -17 E 0.384 -18 D 0.351 -19 V 0.325 -20 Y 0.305 -21 L 0.292 -22 E 0.274 -23 E 0.247 -24 E 0.218 -25 L 0.195 -26 M 0.177 -27 K 0.162 -28 D 0.147 -29 F 0.138 -30 L 0.134 -31 E 0.139 -32 K 0.152 -33 R 0.175 -34 D 0.203 -35 K 0.228 -36 G 0.238 -37 K 0.230 -38 L 0.215 -39 L 0.200 -40 I 0.184 -41 Q 0.169 -42 R 0.161 -43 S 0.163 -44 R 0.170 -45 R 0.178 -46 L 0.182 -47 K 0.178 -48 Q 0.164 -49 N 0.147 -50 L 0.132 -51 L 0.119 -52 R 0.110 -53 P 0.106 -54 M 0.109 -55 Q 0.116 -56 L 0.124 -57 S 0.130 -58 V 0.133 -59 T 0.131 -60 E 0.125 -61 D 0.114 -62 G 0.103 -63 Y 0.089 -64 I 0.072 -65 H 0.058 -66 Y 0.052 -67 G 0.057 -68 D 0.066 -69 K 0.069 -70 V 0.068 -71 M 0.073 -72 L 0.094 -73 V 0.129 -74 N 0.163 -75 P 0.178 -76 D 0.181 -77 D 0.192 -78 P 0.212 -79 D 0.222 -80 T 0.210 -81 E 0.185 -82 A 0.159 -83 D 0.137 -84 V 0.126 -85 F 0.124 -86 L 0.127 -87 R 0.128 -88 G 0.126 -89 D 0.126 -90 L 0.124 -91 S 0.117 -92 L 0.110 -93 C 0.110 -94 M 0.117 -95 T 0.128 -96 P 0.139 -97 D 0.145 -98 E 0.145 -99 I 0.146 -100 Q 0.157 -101 S 0.177 -102 H 0.201 -103 L 0.222 -104 K 0.237 -105 D 0.242 -106 E 0.235 -107 L 0.218 -108 E 0.200 -109 V 0.186 -110 P 0.179 -111 C 0.171 -112 G 0.155 -113 L 0.134 -114 S 0.110 -115 A 0.091 -116 V 0.078 -117 Q 0.071 -118 A 0.071 -119 K 0.083 -120 T 0.104 -121 P 0.121 -122 I 0.124 -123 G 0.112 -124 R 0.095 -125 N 0.078 -126 T 0.062 -127 F 0.052 -128 I 0.053 -129 I 0.061 -130 L 0.074 -131 S 0.086 -132 V 0.094 -133 H 0.100 -134 R 0.110 -135 D 0.121 -136 A 0.124 -137 T 0.114 -138 G 0.099 -139 Q 0.087 -140 V 0.077 -141 L 0.065 -142 R 0.054 -143 Y 0.048 -144 G 0.050 -145 Q 0.054 -146 D 0.056 -147 F 0.058 -148 C 0.065 -149 L 0.081 -150 G 0.104 -151 I 0.123 -152 T 0.133 -153 G 0.142 -154 G 0.153 -155 F 0.158 -156 D 0.153 -157 N 0.143 -158 K 0.127 -159 M 0.107 -160 L 0.088 -161 Y 0.075 -162 L 0.071 -163 S 0.081 -164 S 0.103 -165 D 0.129 -166 H 0.148 -167 R 0.157 -168 T 0.163 -169 L 0.169 -170 L 0.175 -171 K 0.179 -172 S 0.178 -173 S 0.173 -174 K 0.160 -175 R 0.144 -176 S 0.131 -177 W 0.125 -178 L 0.124 -179 Q 0.123 -180 E 0.121 -181 V 0.112 -182 Y 0.096 -183 L 0.083 -184 T 0.081 -185 D 0.088 -186 E 0.097 -187 V 0.102 -188 S 0.101 -189 H 0.094 -190 V 0.083 -191 N 0.069 -192 C 0.056 -193 W 0.047 -194 Q 0.046 -195 A 0.052 -196 A 0.064 -197 F 0.079 -198 P 0.092 -199 D 0.098 -200 P 0.097 -201 Q 0.087 -202 L 0.076 -203 R 0.072 -204 L 0.076 -205 E 0.078 -206 Y 0.076 -207 E 0.074 -208 G 0.077 -209 F 0.085 -210 P 0.090 -211 V 0.088 -212 P 0.080 -213 A 0.075 -214 N 0.076 -215 A 0.081 -216 K 0.087 -217 I 0.095 -218 L 0.107 -219 I 0.123 -220 N 0.139 -221 H 0.142 -222 C 0.126 -223 H 0.104 -224 T 0.092 -225 N 0.091 -226 R 0.094 -227 G 0.093 -228 L 0.089 -229 A 0.086 -230 A 0.087 -231 H 0.091 -232 R 0.094 -233 H 0.094 -234 L 0.091 -235 F 0.089 -236 L 0.094 -237 S 0.102 -238 T 0.105 -239 Y 0.101 -240 F 0.100 -241 G 0.105 -242 K 0.112 -243 E 0.111 -244 A 0.104 -245 E 0.099 -246 V 0.096 -247 V 0.090 -248 A 0.085 -249 H 0.089 -250 T 0.104 -251 Y 0.128 -252 L 0.151 -253 D 0.161 -254 S 0.151 -255 H 0.133 -256 R 0.122 -257 V 0.122 -258 E 0.125 -259 K 0.120 -260 P 0.106 -261 R 0.088 -262 N 0.071 -263 H 0.056 -264 W 0.046 -265 M 0.042 -266 L 0.048 -267 V 0.069 -268 T 0.103 -269 G 0.145 -270 N 0.186 -271 P 0.217 -272 R 0.245 -273 D 0.283 -274 A 0.334 -275 S 0.381 -276 S 0.410 -277 S 0.419 -278 M 0.416 -279 L 0.408 -280 D 0.403 -281 L 0.406 -282 P 0.418 -283 K 0.433 -284 P 0.438 -285 P 0.418 -286 T 0.376 -287 E 0.339 -288 D 0.320 -289 T 0.303 -290 R 0.283 -291 A 0.281 -292 M 0.300 -293 E 0.319 -294 Q 0.342 -295 A 0.391 -296 M 0.465 -297 G 0.535 -298 L 0.575 -299 D 0.573 -300 T 0.532 -301 Q 0.488 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000156206.14_ENST00000286732.5_GN:CFAP161_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000156206.14_ENST00000286732.5_GN:CFAP161_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid deleted file mode 100644 index bf164e11dfc75f984a3509e5f22133d5453e5d49..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000156206.14_ENST00000286732.5_GN:CFAP161_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid +++ /dev/null @@ -1,316 +0,0 @@ ->ENSG00000156206.14|ENST00000286732.5|GN:CFAP161|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:14 -1 M 0.430 -2 V 0.453 -3 S 0.492 -4 E 0.540 -5 G 0.585 -6 G 0.617 -7 P 0.627 -8 L 0.604 -9 A 0.555 -10 E 0.522 -11 Q 0.547 -12 Q 0.608 -13 G 0.655 -14 A 0.669 -15 M 0.665 -16 A 0.657 -17 Q 0.644 -18 N 0.616 -19 V 0.579 -20 Y 0.560 -21 G 0.585 -22 P 0.638 -23 G 0.669 -24 V 0.655 -25 R 0.619 -26 I 0.599 -27 G 0.601 -28 N 0.589 -29 W 0.538 -30 N 0.471 -31 E 0.416 -32 D 0.380 -33 V 0.351 -34 Y 0.326 -35 L 0.306 -36 E 0.285 -37 E 0.258 -38 E 0.228 -39 L 0.202 -40 M 0.180 -41 K 0.161 -42 D 0.146 -43 F 0.137 -44 L 0.136 -45 E 0.141 -46 K 0.155 -47 R 0.178 -48 D 0.208 -49 K 0.235 -50 G 0.246 -51 K 0.239 -52 L 0.224 -53 L 0.209 -54 I 0.191 -55 Q 0.173 -56 R 0.164 -57 S 0.165 -58 R 0.173 -59 R 0.182 -60 L 0.188 -61 K 0.181 -62 Q 0.165 -63 N 0.146 -64 L 0.129 -65 L 0.115 -66 R 0.105 -67 P 0.102 -68 M 0.105 -69 Q 0.112 -70 L 0.119 -71 S 0.124 -72 V 0.126 -73 T 0.125 -74 E 0.119 -75 D 0.110 -76 G 0.100 -77 Y 0.086 -78 I 0.070 -79 H 0.056 -80 Y 0.051 -81 G 0.056 -82 D 0.063 -83 K 0.066 -84 V 0.065 -85 M 0.071 -86 L 0.092 -87 V 0.128 -88 N 0.163 -89 P 0.177 -90 D 0.178 -91 D 0.188 -92 P 0.209 -93 D 0.220 -94 T 0.209 -95 E 0.185 -96 A 0.158 -97 D 0.136 -98 V 0.123 -99 F 0.119 -100 L 0.120 -101 R 0.120 -102 G 0.120 -103 D 0.123 -104 L 0.122 -105 S 0.116 -106 L 0.111 -107 C 0.113 -108 M 0.120 -109 T 0.130 -110 P 0.140 -111 D 0.145 -112 E 0.143 -113 I 0.143 -114 Q 0.153 -115 S 0.172 -116 H 0.195 -117 L 0.216 -118 K 0.231 -119 D 0.237 -120 E 0.233 -121 L 0.219 -122 E 0.202 -123 V 0.189 -124 P 0.182 -125 C 0.174 -126 G 0.159 -127 L 0.138 -128 S 0.114 -129 A 0.095 -130 V 0.083 -131 Q 0.075 -132 A 0.075 -133 K 0.087 -134 T 0.108 -135 P 0.127 -136 I 0.129 -137 G 0.117 -138 R 0.099 -139 N 0.080 -140 T 0.063 -141 F 0.053 -142 I 0.053 -143 I 0.061 -144 L 0.073 -145 S 0.085 -146 V 0.094 -147 H 0.101 -148 R 0.112 -149 D 0.125 -150 A 0.129 -151 T 0.118 -152 G 0.102 -153 Q 0.089 -154 V 0.079 -155 L 0.067 -156 R 0.055 -157 Y 0.049 -158 G 0.051 -159 Q 0.055 -160 D 0.056 -161 F 0.058 -162 C 0.066 -163 L 0.082 -164 G 0.105 -165 I 0.124 -166 T 0.135 -167 G 0.146 -168 G 0.157 -169 F 0.160 -170 D 0.155 -171 N 0.143 -172 K 0.127 -173 M 0.106 -174 L 0.088 -175 Y 0.075 -176 L 0.071 -177 S 0.081 -178 S 0.105 -179 D 0.131 -180 H 0.150 -181 R 0.160 -182 T 0.165 -183 L 0.172 -184 L 0.179 -185 K 0.183 -186 S 0.182 -187 S 0.175 -188 K 0.162 -189 R 0.144 -190 S 0.131 -191 W 0.125 -192 L 0.124 -193 Q 0.124 -194 E 0.121 -195 V 0.112 -196 Y 0.095 -197 L 0.082 -198 T 0.079 -199 D 0.086 -200 E 0.095 -201 V 0.099 -202 S 0.098 -203 H 0.091 -204 V 0.081 -205 N 0.067 -206 C 0.055 -207 W 0.046 -208 Q 0.045 -209 A 0.051 -210 A 0.063 -211 F 0.078 -212 P 0.091 -213 D 0.097 -214 P 0.096 -215 Q 0.085 -216 L 0.074 -217 R 0.070 -218 L 0.073 -219 E 0.075 -220 Y 0.074 -221 E 0.072 -222 G 0.075 -223 F 0.083 -224 P 0.089 -225 V 0.087 -226 P 0.080 -227 A 0.076 -228 N 0.077 -229 A 0.082 -230 K 0.087 -231 I 0.095 -232 L 0.106 -233 I 0.123 -234 N 0.139 -235 H 0.141 -236 C 0.125 -237 H 0.104 -238 T 0.092 -239 N 0.092 -240 R 0.095 -241 G 0.094 -242 L 0.090 -243 A 0.087 -244 A 0.088 -245 H 0.091 -246 R 0.094 -247 H 0.094 -248 L 0.090 -249 F 0.089 -250 L 0.094 -251 S 0.102 -252 T 0.105 -253 Y 0.101 -254 F 0.099 -255 G 0.104 -256 K 0.111 -257 E 0.110 -258 A 0.103 -259 E 0.099 -260 V 0.096 -261 V 0.090 -262 A 0.086 -263 H 0.090 -264 T 0.106 -265 Y 0.130 -266 L 0.153 -267 D 0.162 -268 S 0.152 -269 H 0.134 -270 R 0.124 -271 V 0.124 -272 E 0.127 -273 K 0.121 -274 P 0.107 -275 R 0.090 -276 N 0.072 -277 H 0.058 -278 W 0.047 -279 M 0.043 -280 L 0.050 -281 V 0.069 -282 T 0.103 -283 G 0.144 -284 N 0.182 -285 P 0.210 -286 R 0.235 -287 D 0.269 -288 A 0.316 -289 S 0.362 -290 S 0.391 -291 S 0.401 -292 M 0.399 -293 L 0.394 -294 D 0.393 -295 L 0.400 -296 P 0.415 -297 K 0.433 -298 P 0.441 -299 P 0.425 -300 T 0.387 -301 E 0.351 -302 D 0.331 -303 T 0.311 -304 R 0.289 -305 A 0.286 -306 M 0.306 -307 E 0.326 -308 Q 0.348 -309 A 0.398 -310 M 0.471 -311 G 0.540 -312 L 0.579 -313 D 0.576 -314 T 0.533 -315 Q 0.489 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000160991.18_ENST00000495936.7_GN:ORAI2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000160991.18_ENST00000495936.7_GN:ORAI2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 5ef93785186d9acedd4c7da0ac1fa61cac9f1787..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000160991.18_ENST00000495936.7_GN:ORAI2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,255 +0,0 @@ ->ENSG00000160991.18|ENST00000495936.7|GN:ORAI2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.436 -2 S 0.456 -3 A 0.484 -4 E 0.508 -5 L 0.524 -6 N 0.538 -7 V 0.553 -8 P 0.561 -9 I 0.554 -10 D 0.536 -11 P 0.518 -12 S 0.511 -13 A 0.518 -14 P 0.538 -15 A 0.559 -16 C 0.570 -17 P 0.578 -18 E 0.598 -19 P 0.624 -20 G 0.643 -21 H 0.651 -22 K 0.640 -23 G 0.596 -24 M 0.514 -25 D 0.415 -26 Y 0.322 -27 R 0.253 -28 D 0.217 -29 W 0.209 -30 V 0.210 -31 R 0.213 -32 R 0.223 -33 S 0.236 -34 Y 0.240 -35 L 0.238 -36 E 0.250 -37 L 0.284 -38 V 0.333 -39 T 0.385 -40 S 0.425 -41 N 0.429 -42 H 0.396 -43 H 0.356 -44 S 0.332 -45 V 0.316 -46 Q 0.300 -47 A 0.280 -48 L 0.256 -49 S 0.231 -50 W 0.212 -51 R 0.198 -52 K 0.177 -53 L 0.147 -54 Y 0.118 -55 L 0.101 -56 S 0.094 -57 R 0.089 -58 A 0.084 -59 K 0.083 -60 L 0.085 -61 K 0.089 -62 A 0.096 -63 S 0.102 -64 S 0.099 -65 R 0.087 -66 T 0.075 -67 S 0.070 -68 A 0.071 -69 L 0.076 -70 L 0.081 -71 S 0.084 -72 G 0.087 -73 F 0.094 -74 A 0.107 -75 M 0.126 -76 V 0.155 -77 A 0.188 -78 M 0.215 -79 V 0.227 -80 E 0.228 -81 V 0.222 -82 Q 0.213 -83 L 0.209 -84 E 0.212 -85 T 0.215 -86 Q 0.210 -87 Y 0.193 -88 Q 0.166 -89 Y 0.138 -90 P 0.109 -91 R 0.081 -92 P 0.060 -93 L 0.048 -94 L 0.044 -95 I 0.047 -96 A 0.051 -97 F 0.057 -98 S 0.059 -99 A 0.058 -100 C 0.058 -101 T 0.062 -102 T 0.064 -103 V 0.060 -104 L 0.051 -105 V 0.045 -106 A 0.041 -107 V 0.040 -108 H 0.041 -109 L 0.043 -110 F 0.045 -111 A 0.048 -112 L 0.049 -113 L 0.046 -114 I 0.043 -115 S 0.044 -116 T 0.051 -117 C 0.066 -118 I 0.087 -119 L 0.101 -120 P 0.101 -121 N 0.092 -122 V 0.088 -123 E 0.098 -124 A 0.124 -125 V 0.170 -126 S 0.231 -127 N 0.289 -128 I 0.332 -129 H 0.366 -130 N 0.391 -131 L 0.400 -132 N 0.396 -133 S 0.401 -134 I 0.417 -135 S 0.423 -136 E 0.411 -137 S 0.389 -138 P 0.365 -139 H 0.331 -140 E 0.285 -141 R 0.241 -142 M 0.209 -143 H 0.180 -144 P 0.144 -145 Y 0.113 -146 I 0.096 -147 E 0.089 -148 L 0.083 -149 A 0.073 -150 W 0.061 -151 G 0.051 -152 F 0.047 -153 S 0.046 -154 T 0.048 -155 V 0.050 -156 L 0.053 -157 G 0.056 -158 I 0.056 -159 L 0.053 -160 L 0.049 -161 F 0.049 -162 L 0.049 -163 A 0.050 -164 E 0.053 -165 V 0.055 -166 V 0.054 -167 L 0.050 -168 L 0.046 -169 C 0.044 -170 W 0.047 -171 I 0.059 -172 K 0.082 -173 F 0.122 -174 L 0.189 -175 P 0.278 -176 V 0.368 -177 D 0.432 -178 A 0.460 -179 R 0.464 -180 R 0.461 -181 Q 0.460 -182 P 0.460 -183 G 0.461 -184 P 0.471 -185 P 0.495 -186 P 0.529 -187 G 0.559 -188 P 0.571 -189 G 0.556 -190 S 0.503 -191 H 0.417 -192 T 0.318 -193 G 0.232 -194 W 0.171 -195 Q 0.133 -196 A 0.110 -197 A 0.097 -198 L 0.090 -199 V 0.086 -200 S 0.085 -201 T 0.083 -202 I 0.078 -203 I 0.073 -204 M 0.073 -205 V 0.073 -206 P 0.071 -207 V 0.067 -208 G 0.063 -209 L 0.058 -210 I 0.052 -211 F 0.048 -212 V 0.044 -213 V 0.043 -214 F 0.043 -215 T 0.045 -216 I 0.047 -217 H 0.051 -218 F 0.055 -219 Y 0.058 -220 R 0.063 -221 S 0.070 -222 L 0.079 -223 V 0.090 -224 R 0.107 -225 H 0.124 -226 K 0.130 -227 T 0.130 -228 E 0.135 -229 R 0.146 -230 H 0.156 -231 N 0.163 -232 R 0.168 -233 E 0.172 -234 I 0.171 -235 E 0.166 -236 E 0.159 -237 L 0.152 -238 H 0.147 -239 K 0.146 -240 L 0.145 -241 K 0.140 -242 V 0.137 -243 Q 0.148 -244 L 0.174 -245 D 0.210 -246 G 0.245 -247 H 0.268 -248 E 0.275 -249 R 0.280 -250 S 0.302 -251 L 0.336 -252 Q 0.358 -253 V 0.356 -254 L 0.343 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000160991.18_ENST00000495936.7_GN:ORAI2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000160991.18_ENST00000495936.7_GN:ORAI2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid deleted file mode 100644 index 835181d9a96b4fa21040493b73c335c6bb7e8521..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000160991.18_ENST00000495936.7_GN:ORAI2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid +++ /dev/null @@ -1,262 +0,0 @@ ->ENSG00000160991.18|ENST00000495936.7|GN:ORAI2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:7 -1 M 0.438 -2 T 0.477 -3 C 0.531 -4 L 0.577 -5 A 0.611 -6 P 0.635 -7 T 0.652 -8 M 0.657 -9 S 0.647 -10 A 0.628 -11 E 0.608 -12 L 0.596 -13 N 0.596 -14 V 0.601 -15 P 0.599 -16 I 0.586 -17 D 0.565 -18 P 0.548 -19 S 0.544 -20 A 0.558 -21 P 0.585 -22 A 0.612 -23 C 0.625 -24 P 0.628 -25 E 0.636 -26 P 0.651 -27 G 0.663 -28 H 0.667 -29 K 0.653 -30 G 0.605 -31 M 0.523 -32 D 0.427 -33 Y 0.334 -34 R 0.262 -35 D 0.222 -36 W 0.212 -37 V 0.214 -38 R 0.219 -39 R 0.234 -40 S 0.251 -41 Y 0.255 -42 L 0.251 -43 E 0.264 -44 L 0.304 -45 V 0.358 -46 T 0.417 -47 S 0.461 -48 N 0.468 -49 H 0.435 -50 H 0.392 -51 S 0.363 -52 V 0.340 -53 Q 0.316 -54 A 0.290 -55 L 0.263 -56 S 0.235 -57 W 0.215 -58 R 0.200 -59 K 0.179 -60 L 0.149 -61 Y 0.119 -62 L 0.102 -63 S 0.095 -64 R 0.090 -65 A 0.084 -66 K 0.083 -67 L 0.084 -68 K 0.087 -69 A 0.094 -70 S 0.100 -71 S 0.096 -72 R 0.084 -73 T 0.073 -74 S 0.068 -75 A 0.070 -76 L 0.075 -77 L 0.080 -78 S 0.083 -79 G 0.087 -80 F 0.094 -81 A 0.107 -82 M 0.127 -83 V 0.155 -84 A 0.189 -85 M 0.216 -86 V 0.229 -87 E 0.229 -88 V 0.222 -89 Q 0.213 -90 L 0.209 -91 E 0.211 -92 T 0.214 -93 Q 0.209 -94 Y 0.192 -95 Q 0.166 -96 Y 0.138 -97 P 0.109 -98 R 0.081 -99 P 0.060 -100 L 0.048 -101 L 0.044 -102 I 0.047 -103 A 0.052 -104 F 0.057 -105 S 0.060 -106 A 0.058 -107 C 0.057 -108 T 0.060 -109 T 0.062 -110 V 0.058 -111 L 0.050 -112 V 0.045 -113 A 0.041 -114 V 0.041 -115 H 0.042 -116 L 0.043 -117 F 0.045 -118 A 0.048 -119 L 0.048 -120 L 0.045 -121 I 0.043 -122 S 0.044 -123 T 0.051 -124 C 0.067 -125 I 0.088 -126 L 0.103 -127 P 0.103 -128 N 0.094 -129 V 0.091 -130 E 0.101 -131 A 0.128 -132 V 0.175 -133 S 0.236 -134 N 0.294 -135 I 0.337 -136 H 0.371 -137 N 0.396 -138 L 0.405 -139 N 0.402 -140 S 0.407 -141 I 0.422 -142 S 0.429 -143 E 0.416 -144 S 0.393 -145 P 0.367 -146 H 0.332 -147 E 0.285 -148 R 0.241 -149 M 0.209 -150 H 0.179 -151 P 0.143 -152 Y 0.112 -153 I 0.095 -154 E 0.088 -155 L 0.081 -156 A 0.071 -157 W 0.060 -158 G 0.051 -159 F 0.046 -160 S 0.046 -161 T 0.048 -162 V 0.050 -163 L 0.053 -164 G 0.056 -165 I 0.056 -166 L 0.053 -167 L 0.049 -168 F 0.048 -169 L 0.049 -170 A 0.050 -171 E 0.053 -172 V 0.055 -173 V 0.054 -174 L 0.050 -175 L 0.046 -176 C 0.044 -177 W 0.047 -178 I 0.059 -179 K 0.082 -180 F 0.122 -181 L 0.189 -182 P 0.278 -183 V 0.368 -184 D 0.431 -185 A 0.459 -186 R 0.462 -187 R 0.460 -188 Q 0.460 -189 P 0.460 -190 G 0.462 -191 P 0.472 -192 P 0.496 -193 P 0.531 -194 G 0.561 -195 P 0.574 -196 G 0.558 -197 S 0.505 -198 H 0.417 -199 T 0.318 -200 G 0.232 -201 W 0.171 -202 Q 0.133 -203 A 0.111 -204 A 0.097 -205 L 0.089 -206 V 0.086 -207 S 0.085 -208 T 0.083 -209 I 0.078 -210 I 0.073 -211 M 0.072 -212 V 0.073 -213 P 0.071 -214 V 0.067 -215 G 0.063 -216 L 0.057 -217 I 0.051 -218 F 0.047 -219 V 0.044 -220 V 0.042 -221 F 0.042 -222 T 0.044 -223 I 0.047 -224 H 0.051 -225 F 0.055 -226 Y 0.058 -227 R 0.063 -228 S 0.070 -229 L 0.078 -230 V 0.090 -231 R 0.106 -232 H 0.122 -233 K 0.129 -234 T 0.129 -235 E 0.133 -236 R 0.144 -237 H 0.154 -238 N 0.161 -239 R 0.166 -240 E 0.170 -241 I 0.169 -242 E 0.164 -243 E 0.158 -244 L 0.150 -245 H 0.145 -246 K 0.144 -247 L 0.144 -248 K 0.139 -249 V 0.137 -250 Q 0.147 -251 L 0.173 -252 D 0.209 -253 G 0.245 -254 H 0.269 -255 E 0.276 -256 R 0.282 -257 S 0.304 -258 L 0.338 -259 Q 0.359 -260 V 0.357 -261 L 0.344 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000161921.18_ENST00000293778.12_GN:CXCL16_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000161921.18_ENST00000293778.12_GN:CXCL16_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 1ba2fef685e28654745648b8b49b3db7d9b59530..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000161921.18_ENST00000293778.12_GN:CXCL16_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,255 +0,0 @@ ->ENSG00000161921.18|ENST00000293778.12|GN:CXCL16|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.470 -2 G 0.490 -3 R 0.508 -4 D 0.503 -5 L 0.473 -6 R 0.434 -7 P 0.393 -8 G 0.338 -9 S 0.262 -10 R 0.182 -11 V 0.123 -12 L 0.096 -13 L 0.093 -14 L 0.094 -15 L 0.089 -16 L 0.079 -17 L 0.072 -18 L 0.072 -19 L 0.078 -20 L 0.092 -21 V 0.115 -22 Y 0.154 -23 L 0.215 -24 T 0.298 -25 Q 0.396 -26 P 0.504 -27 G 0.604 -28 N 0.677 -29 G 0.716 -30 N 0.731 -31 E 0.729 -32 G 0.711 -33 S 0.671 -34 V 0.604 -35 T 0.506 -36 G 0.383 -37 S 0.258 -38 C 0.161 -39 Y 0.108 -40 C 0.096 -41 G 0.108 -42 K 0.127 -43 R 0.145 -44 I 0.154 -45 S 0.153 -46 S 0.147 -47 D 0.141 -48 S 0.138 -49 P 0.130 -50 P 0.114 -51 S 0.093 -52 V 0.072 -53 Q 0.057 -54 F 0.049 -55 M 0.045 -56 N 0.042 -57 R 0.037 -58 L 0.036 -59 R 0.042 -60 K 0.054 -61 H 0.067 -62 L 0.076 -63 R 0.081 -64 A 0.082 -65 Y 0.080 -66 H 0.074 -67 R 0.067 -68 C 0.061 -69 L 0.055 -70 Y 0.047 -71 Y 0.036 -72 T 0.027 -73 R 0.024 -74 F 0.029 -75 Q 0.037 -76 L 0.045 -77 L 0.050 -78 S 0.054 -79 W 0.055 -80 S 0.052 -81 V 0.048 -82 C 0.053 -83 G 0.071 -84 G 0.090 -85 N 0.094 -86 K 0.080 -87 D 0.060 -88 P 0.044 -89 W 0.033 -90 V 0.026 -91 Q 0.022 -92 E 0.023 -93 L 0.025 -94 M 0.027 -95 S 0.028 -96 C 0.026 -97 L 0.026 -98 D 0.030 -99 L 0.040 -100 K 0.053 -101 E 0.074 -102 C 0.109 -103 G 0.157 -104 H 0.210 -105 A 0.257 -106 Y 0.294 -107 S 0.324 -108 G 0.353 -109 I 0.383 -110 V 0.418 -111 A 0.454 -112 H 0.482 -113 Q 0.503 -114 K 0.527 -115 H 0.555 -116 L 0.586 -117 L 0.618 -118 P 0.649 -119 T 0.672 -120 S 0.686 -121 P 0.704 -122 P 0.723 -123 I 0.717 -124 S 0.680 -125 Q 0.661 -126 A 0.701 -127 S 0.770 -128 E 0.820 -129 G 0.840 -130 A 0.844 -131 S 0.838 -132 S 0.826 -133 D 0.808 -134 I 0.785 -135 H 0.760 -136 T 0.728 -137 P 0.679 -138 A 0.619 -139 Q 0.593 -140 M 0.617 -141 L 0.640 -142 L 0.625 -143 S 0.616 -144 T 0.653 -145 L 0.713 -146 Q 0.757 -147 S 0.780 -148 T 0.786 -149 Q 0.786 -150 R 0.789 -151 P 0.800 -152 T 0.815 -153 L 0.829 -154 P 0.845 -155 V 0.861 -156 G 0.872 -157 S 0.876 -158 L 0.874 -159 S 0.870 -160 S 0.865 -161 D 0.859 -162 K 0.851 -163 E 0.839 -164 L 0.822 -165 T 0.806 -166 R 0.800 -167 P 0.806 -168 N 0.820 -169 E 0.829 -170 T 0.817 -171 T 0.770 -172 I 0.703 -173 H 0.670 -174 T 0.706 -175 A 0.770 -176 G 0.810 -177 H 0.822 -178 S 0.827 -179 L 0.830 -180 A 0.824 -181 A 0.813 -182 G 0.804 -183 P 0.807 -184 E 0.819 -185 A 0.830 -186 G 0.835 -187 E 0.833 -188 N 0.825 -189 Q 0.813 -190 K 0.803 -191 Q 0.805 -192 P 0.817 -193 E 0.831 -194 K 0.838 -195 N 0.835 -196 A 0.827 -197 G 0.822 -198 P 0.823 -199 T 0.824 -200 A 0.815 -201 R 0.792 -202 T 0.754 -203 S 0.698 -204 A 0.626 -205 T 0.546 -206 V 0.474 -207 P 0.412 -208 V 0.361 -209 L 0.331 -210 C 0.327 -211 L 0.329 -212 L 0.312 -213 A 0.278 -214 I 0.248 -215 I 0.223 -216 F 0.200 -217 I 0.182 -218 L 0.174 -219 T 0.168 -220 A 0.157 -221 A 0.144 -222 L 0.132 -223 S 0.119 -224 Y 0.105 -225 V 0.102 -226 L 0.119 -227 C 0.150 -228 K 0.185 -229 R 0.228 -230 R 0.288 -231 R 0.368 -232 G 0.456 -233 Q 0.533 -234 S 0.596 -235 P 0.647 -236 Q 0.683 -237 S 0.701 -238 S 0.702 -239 P 0.696 -240 D 0.691 -241 L 0.692 -242 P 0.697 -243 V 0.696 -244 H 0.688 -245 Y 0.683 -246 I 0.692 -247 P 0.711 -248 V 0.729 -249 A 0.737 -250 P 0.737 -251 D 0.726 -252 S 0.688 -253 N 0.618 -254 T 0.556 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000161921.18_ENST00000293778.12_GN:CXCL16_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000161921.18_ENST00000293778.12_GN:CXCL16_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid deleted file mode 100644 index 4a9d8c9c4f787edc0ff717c4050f5e0cab48cb82..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000161921.18_ENST00000293778.12_GN:CXCL16_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid +++ /dev/null @@ -1,274 +0,0 @@ ->ENSG00000161921.18|ENST00000293778.12|GN:CXCL16|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:19 -1 M 0.485 -2 S 0.523 -3 G 0.560 -4 S 0.553 -5 Q 0.492 -6 S 0.431 -7 E 0.441 -8 V 0.521 -9 A 0.603 -10 P 0.651 -11 S 0.676 -12 P 0.691 -13 Q 0.698 -14 S 0.703 -15 P 0.710 -16 R 0.718 -17 S 0.727 -18 P 0.738 -19 E 0.749 -20 M 0.753 -21 G 0.741 -22 R 0.709 -23 D 0.660 -24 L 0.602 -25 R 0.548 -26 P 0.497 -27 G 0.430 -28 S 0.336 -29 R 0.235 -30 V 0.159 -31 L 0.121 -32 L 0.112 -33 L 0.111 -34 L 0.105 -35 L 0.094 -36 L 0.085 -37 L 0.083 -38 L 0.088 -39 L 0.101 -40 V 0.123 -41 Y 0.159 -42 L 0.215 -43 T 0.293 -44 Q 0.391 -45 P 0.501 -46 G 0.606 -47 N 0.683 -48 G 0.724 -49 N 0.740 -50 E 0.739 -51 G 0.722 -52 S 0.684 -53 V 0.617 -54 T 0.516 -55 G 0.389 -56 S 0.260 -57 C 0.162 -58 Y 0.109 -59 C 0.097 -60 G 0.109 -61 K 0.129 -62 R 0.146 -63 I 0.156 -64 S 0.155 -65 S 0.148 -66 D 0.142 -67 S 0.138 -68 P 0.130 -69 P 0.114 -70 S 0.093 -71 V 0.072 -72 Q 0.056 -73 F 0.046 -74 M 0.042 -75 N 0.039 -76 R 0.035 -77 L 0.034 -78 R 0.040 -79 K 0.051 -80 H 0.063 -81 L 0.072 -82 R 0.077 -83 A 0.077 -84 Y 0.075 -85 H 0.069 -86 R 0.063 -87 C 0.057 -88 L 0.052 -89 Y 0.045 -90 Y 0.035 -91 T 0.027 -92 R 0.023 -93 F 0.027 -94 Q 0.035 -95 L 0.043 -96 L 0.049 -97 S 0.054 -98 W 0.056 -99 S 0.053 -100 V 0.049 -101 C 0.053 -102 G 0.069 -103 G 0.087 -104 N 0.090 -105 K 0.077 -106 D 0.059 -107 P 0.043 -108 W 0.032 -109 V 0.025 -110 Q 0.022 -111 E 0.023 -112 L 0.025 -113 M 0.028 -114 S 0.028 -115 C 0.026 -116 L 0.026 -117 D 0.030 -118 L 0.040 -119 K 0.054 -120 E 0.075 -121 C 0.110 -122 G 0.157 -123 H 0.207 -124 A 0.251 -125 Y 0.286 -126 S 0.315 -127 G 0.343 -128 I 0.370 -129 V 0.402 -130 A 0.437 -131 H 0.466 -132 Q 0.489 -133 K 0.515 -134 H 0.547 -135 L 0.581 -136 L 0.617 -137 P 0.652 -138 T 0.676 -139 S 0.693 -140 P 0.716 -141 P 0.751 -142 I 0.785 -143 S 0.805 -144 Q 0.815 -145 A 0.826 -146 S 0.838 -147 E 0.847 -148 G 0.852 -149 A 0.851 -150 S 0.845 -151 S 0.833 -152 D 0.815 -153 I 0.791 -154 H 0.765 -155 T 0.733 -156 P 0.683 -157 A 0.623 -158 Q 0.600 -159 M 0.637 -160 L 0.693 -161 L 0.725 -162 S 0.740 -163 T 0.753 -164 L 0.764 -165 Q 0.775 -166 S 0.786 -167 T 0.791 -168 Q 0.791 -169 R 0.795 -170 P 0.807 -171 T 0.822 -172 L 0.836 -173 P 0.850 -174 V 0.865 -175 G 0.876 -176 S 0.879 -177 L 0.876 -178 S 0.872 -179 S 0.867 -180 D 0.861 -181 K 0.853 -182 E 0.842 -183 L 0.826 -184 T 0.811 -185 R 0.805 -186 P 0.811 -187 N 0.824 -188 E 0.833 -189 T 0.822 -190 T 0.776 -191 I 0.708 -192 H 0.674 -193 T 0.711 -194 A 0.776 -195 G 0.818 -196 H 0.832 -197 S 0.836 -198 L 0.835 -199 A 0.828 -200 A 0.817 -201 G 0.808 -202 P 0.811 -203 E 0.823 -204 A 0.834 -205 G 0.837 -206 E 0.835 -207 N 0.827 -208 Q 0.816 -209 K 0.807 -210 Q 0.808 -211 P 0.819 -212 E 0.831 -213 K 0.837 -214 N 0.833 -215 A 0.824 -216 G 0.819 -217 P 0.821 -218 T 0.821 -219 A 0.812 -220 R 0.787 -221 T 0.748 -222 S 0.693 -223 A 0.620 -224 T 0.541 -225 V 0.470 -226 P 0.411 -227 V 0.362 -228 L 0.332 -229 C 0.327 -230 L 0.329 -231 L 0.311 -232 A 0.275 -233 I 0.241 -234 I 0.214 -235 F 0.191 -236 I 0.175 -237 L 0.167 -238 T 0.163 -239 A 0.153 -240 A 0.140 -241 L 0.129 -242 S 0.116 -243 Y 0.103 -244 V 0.102 -245 L 0.120 -246 C 0.152 -247 K 0.189 -248 R 0.233 -249 R 0.294 -250 R 0.374 -251 G 0.462 -252 Q 0.539 -253 S 0.602 -254 P 0.653 -255 Q 0.689 -256 S 0.707 -257 S 0.709 -258 P 0.702 -259 D 0.697 -260 L 0.699 -261 P 0.704 -262 V 0.704 -263 H 0.699 -264 Y 0.694 -265 I 0.701 -266 P 0.719 -267 V 0.735 -268 A 0.743 -269 P 0.742 -270 D 0.730 -271 S 0.692 -272 N 0.623 -273 T 0.562 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000162040.7_ENST00000454677.3_GN:HS3ST6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000162040.7_ENST00000454677.3_GN:HS3ST6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 50829210dc94ffccfd9fd7c85a44dc2974f2981b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000162040.7_ENST00000454677.3_GN:HS3ST6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,343 +0,0 @@ ->ENSG00000162040.7|ENST00000454677.3|GN:HS3ST6|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.401 -2 A 0.422 -3 G 0.450 -4 S 0.457 -5 G 0.427 -6 G 0.389 -7 L 0.395 -8 G 0.432 -9 G 0.435 -10 G 0.410 -11 A 0.427 -12 G 0.497 -13 G 0.552 -14 G 0.557 -15 Q 0.557 -16 G 0.598 -17 A 0.660 -18 G 0.705 -19 A 0.728 -20 G 0.741 -21 Q 0.748 -22 G 0.751 -23 A 0.752 -24 A 0.751 -25 L 0.745 -26 R 0.731 -27 A 0.710 -28 S 0.689 -29 R 0.674 -30 A 0.663 -31 P 0.638 -32 M 0.586 -33 L 0.522 -34 L 0.487 -35 V 0.496 -36 A 0.520 -37 L 0.533 -38 V 0.545 -39 L 0.564 -40 G 0.562 -41 A 0.514 -42 Y 0.441 -43 C 0.384 -44 L 0.359 -45 C 0.358 -46 A 0.376 -47 L 0.417 -48 P 0.482 -49 G 0.548 -50 R 0.582 -51 C 0.586 -52 P 0.594 -53 P 0.618 -54 A 0.641 -55 A 0.642 -56 R 0.626 -57 A 0.612 -58 P 0.608 -59 A 0.612 -60 P 0.619 -61 A 0.629 -62 P 0.641 -63 A 0.649 -64 P 0.656 -65 S 0.672 -66 E 0.697 -67 P 0.723 -68 S 0.744 -69 S 0.759 -70 S 0.761 -71 V 0.749 -72 H 0.736 -73 R 0.735 -74 P 0.743 -75 G 0.749 -76 A 0.753 -77 P 0.756 -78 G 0.759 -79 L 0.757 -80 P 0.749 -81 L 0.726 -82 A 0.678 -83 S 0.613 -84 G 0.559 -85 P 0.528 -86 G 0.498 -87 R 0.441 -88 R 0.352 -89 R 0.257 -90 F 0.182 -91 P 0.130 -92 Q 0.094 -93 A 0.069 -94 L 0.057 -95 I 0.056 -96 V 0.063 -97 G 0.071 -98 V 0.075 -99 K 0.074 -100 K 0.074 -101 G 0.079 -102 G 0.086 -103 T 0.087 -104 R 0.082 -105 A 0.081 -106 L 0.083 -107 L 0.085 -108 E 0.083 -109 F 0.080 -110 L 0.074 -111 R 0.067 -112 L 0.062 -113 H 0.060 -114 P 0.058 -115 D 0.059 -116 V 0.065 -117 R 0.077 -118 A 0.092 -119 L 0.104 -120 G 0.110 -121 S 0.110 -122 E 0.105 -123 P 0.097 -124 H 0.082 -125 F 0.067 -126 F 0.055 -127 D 0.049 -128 R 0.049 -129 C 0.054 -130 Y 0.061 -131 E 0.064 -132 R 0.063 -133 G 0.060 -134 L 0.058 -135 A 0.059 -136 W 0.056 -137 Y 0.050 -138 R 0.048 -139 S 0.055 -140 L 0.072 -141 M 0.091 -142 P 0.105 -143 R 0.113 -144 T 0.119 -145 L 0.129 -146 D 0.144 -147 G 0.158 -148 Q 0.160 -149 I 0.145 -150 T 0.122 -151 M 0.105 -152 E 0.102 -153 K 0.115 -154 T 0.133 -155 P 0.146 -156 S 0.147 -157 Y 0.135 -158 F 0.115 -159 V 0.100 -160 T 0.092 -161 R 0.085 -162 E 0.075 -163 A 0.064 -164 P 0.056 -165 R 0.055 -166 R 0.055 -167 I 0.054 -168 H 0.052 -169 A 0.055 -170 M 0.060 -171 S 0.067 -172 P 0.076 -173 D 0.082 -174 T 0.081 -175 K 0.075 -176 L 0.071 -177 I 0.070 -178 V 0.077 -179 V 0.093 -180 V 0.112 -181 R 0.116 -182 N 0.101 -183 P 0.077 -184 V 0.057 -185 T 0.045 -186 R 0.039 -187 A 0.035 -188 I 0.032 -189 S 0.034 -190 D 0.040 -191 Y 0.047 -192 A 0.050 -193 Q 0.051 -194 T 0.055 -195 L 0.064 -196 S 0.079 -197 K 0.102 -198 T 0.128 -199 P 0.149 -200 G 0.155 -201 L 0.148 -202 P 0.131 -203 S 0.107 -204 F 0.085 -205 R 0.074 -206 A 0.076 -207 L 0.088 -208 A 0.102 -209 F 0.120 -210 R 0.142 -211 H 0.164 -212 G 0.176 -213 L 0.177 -214 G 0.175 -215 P 0.169 -216 V 0.154 -217 D 0.128 -218 T 0.104 -219 A 0.090 -220 W 0.085 -221 S 0.086 -222 A 0.094 -223 V 0.106 -224 R 0.115 -225 I 0.118 -226 G 0.114 -227 L 0.101 -228 Y 0.083 -229 A 0.067 -230 Q 0.057 -231 H 0.052 -232 L 0.051 -233 D 0.049 -234 H 0.046 -235 W 0.040 -236 L 0.037 -237 R 0.039 -238 Y 0.044 -239 F 0.046 -240 P 0.045 -241 L 0.042 -242 S 0.038 -243 H 0.035 -244 F 0.038 -245 L 0.048 -246 F 0.065 -247 V 0.083 -248 S 0.089 -249 G 0.080 -250 E 0.065 -251 R 0.054 -252 L 0.048 -253 V 0.046 -254 S 0.047 -255 D 0.049 -256 P 0.052 -257 A 0.053 -258 G 0.052 -259 E 0.049 -260 V 0.046 -261 G 0.046 -262 R 0.047 -263 V 0.052 -264 Q 0.060 -265 D 0.064 -266 F 0.059 -267 L 0.055 -268 G 0.059 -269 L 0.070 -270 K 0.080 -271 R 0.084 -272 V 0.086 -273 V 0.086 -274 T 0.083 -275 D 0.074 -276 K 0.062 -277 H 0.055 -278 F 0.057 -279 Y 0.065 -280 F 0.071 -281 N 0.073 -282 A 0.075 -283 T 0.080 -284 K 0.087 -285 G 0.097 -286 F 0.111 -287 P 0.124 -288 C 0.133 -289 L 0.146 -290 K 0.177 -291 K 0.226 -292 A 0.278 -293 Q 0.315 -294 G 0.329 -295 G 0.325 -296 S 0.313 -297 R 0.300 -298 P 0.295 -299 R 0.307 -300 C 0.334 -301 L 0.359 -302 G 0.369 -303 K 0.364 -304 S 0.352 -305 K 0.338 -306 G 0.321 -307 R 0.301 -308 P 0.275 -309 H 0.248 -310 P 0.226 -311 R 0.209 -312 V 0.189 -313 P 0.163 -314 Q 0.138 -315 A 0.120 -316 L 0.113 -317 V 0.113 -318 R 0.118 -319 R 0.126 -320 L 0.134 -321 Q 0.137 -322 E 0.134 -323 F 0.127 -324 Y 0.118 -325 R 0.102 -326 P 0.086 -327 F 0.079 -328 N 0.080 -329 R 0.081 -330 R 0.083 -331 F 0.088 -332 Y 0.096 -333 Q 0.099 -334 M 0.098 -335 T 0.094 -336 G 0.092 -337 Q 0.096 -338 D 0.100 -339 F 0.101 -340 G 0.104 -341 W 0.118 -342 G 0.136 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000162040.7_ENST00000454677.3_GN:HS3ST6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000162040.7_ENST00000454677.3_GN:HS3ST6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid deleted file mode 100644 index 381d57f6062ea3c1f4b24c78cf8dec6d3dc29e4f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000162040.7_ENST00000454677.3_GN:HS3ST6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid +++ /dev/null @@ -1,360 +0,0 @@ ->ENSG00000162040.7|ENST00000454677.3|GN:HS3ST6|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:17 -1 M 0.391 -2 R 0.402 -3 A 0.417 -4 R 0.426 -5 L 0.428 -6 L 0.431 -7 P 0.447 -8 P 0.479 -9 L 0.519 -10 P 0.548 -11 G 0.547 -12 L 0.509 -13 E 0.450 -14 R 0.413 -15 R 0.425 -16 D 0.460 -17 P 0.479 -18 M 0.498 -19 A 0.542 -20 G 0.577 -21 S 0.573 -22 G 0.564 -23 G 0.584 -24 L 0.601 -25 G 0.585 -26 G 0.566 -27 G 0.567 -28 A 0.571 -29 G 0.584 -30 G 0.619 -31 G 0.643 -32 Q 0.625 -33 G 0.609 -34 A 0.645 -35 G 0.706 -36 A 0.746 -37 G 0.749 -38 Q 0.712 -39 G 0.652 -40 A 0.619 -41 A 0.646 -42 L 0.697 -43 R 0.724 -44 A 0.718 -45 S 0.698 -46 R 0.685 -47 A 0.678 -48 P 0.659 -49 M 0.610 -50 L 0.545 -51 L 0.507 -52 V 0.516 -53 A 0.544 -54 L 0.561 -55 V 0.576 -56 L 0.594 -57 G 0.593 -58 A 0.551 -59 Y 0.486 -60 C 0.431 -61 L 0.401 -62 C 0.394 -63 A 0.410 -64 L 0.450 -65 P 0.513 -66 G 0.575 -67 R 0.605 -68 C 0.606 -69 P 0.613 -70 P 0.639 -71 A 0.665 -72 A 0.669 -73 R 0.654 -74 A 0.638 -75 P 0.635 -76 A 0.640 -77 P 0.648 -78 A 0.658 -79 P 0.666 -80 A 0.670 -81 P 0.673 -82 S 0.686 -83 E 0.708 -84 P 0.731 -85 S 0.751 -86 S 0.765 -87 S 0.767 -88 V 0.755 -89 H 0.742 -90 R 0.739 -91 P 0.746 -92 G 0.750 -93 A 0.752 -94 P 0.754 -95 G 0.755 -96 L 0.751 -97 P 0.743 -98 L 0.721 -99 A 0.673 -100 S 0.609 -101 G 0.555 -102 P 0.522 -103 G 0.489 -104 R 0.429 -105 R 0.341 -106 R 0.249 -107 F 0.177 -108 P 0.128 -109 Q 0.092 -110 A 0.068 -111 L 0.056 -112 I 0.056 -113 V 0.062 -114 G 0.071 -115 V 0.075 -116 K 0.074 -117 K 0.073 -118 G 0.079 -119 G 0.086 -120 T 0.087 -121 R 0.082 -122 A 0.081 -123 L 0.083 -124 L 0.085 -125 E 0.084 -126 F 0.081 -127 L 0.076 -128 R 0.070 -129 L 0.064 -130 H 0.061 -131 P 0.060 -132 D 0.061 -133 V 0.068 -134 R 0.081 -135 A 0.096 -136 L 0.108 -137 G 0.113 -138 S 0.111 -139 E 0.105 -140 P 0.097 -141 H 0.083 -142 F 0.068 -143 F 0.055 -144 D 0.049 -145 R 0.048 -146 C 0.053 -147 Y 0.060 -148 E 0.063 -149 R 0.063 -150 G 0.059 -151 L 0.057 -152 A 0.057 -153 W 0.055 -154 Y 0.050 -155 R 0.047 -156 S 0.055 -157 L 0.072 -158 M 0.092 -159 P 0.107 -160 R 0.115 -161 T 0.121 -162 L 0.129 -163 D 0.142 -164 G 0.156 -165 Q 0.157 -166 I 0.142 -167 T 0.119 -168 M 0.102 -169 E 0.100 -170 K 0.112 -171 T 0.130 -172 P 0.142 -173 S 0.144 -174 Y 0.132 -175 F 0.114 -176 V 0.099 -177 T 0.091 -178 R 0.085 -179 E 0.074 -180 A 0.063 -181 P 0.056 -182 R 0.055 -183 R 0.055 -184 I 0.053 -185 H 0.052 -186 A 0.054 -187 M 0.059 -188 S 0.065 -189 P 0.074 -190 D 0.080 -191 T 0.080 -192 K 0.075 -193 L 0.070 -194 I 0.070 -195 V 0.076 -196 V 0.092 -197 V 0.111 -198 R 0.116 -199 N 0.101 -200 P 0.078 -201 V 0.058 -202 T 0.045 -203 R 0.039 -204 A 0.035 -205 I 0.032 -206 S 0.034 -207 D 0.040 -208 Y 0.046 -209 A 0.049 -210 Q 0.050 -211 T 0.053 -212 L 0.062 -213 S 0.077 -214 K 0.099 -215 T 0.124 -216 P 0.144 -217 G 0.150 -218 L 0.143 -219 P 0.126 -220 S 0.103 -221 F 0.082 -222 R 0.071 -223 A 0.073 -224 L 0.084 -225 A 0.099 -226 F 0.115 -227 R 0.137 -228 H 0.159 -229 G 0.171 -230 L 0.174 -231 G 0.172 -232 P 0.167 -233 V 0.152 -234 D 0.128 -235 T 0.103 -236 A 0.089 -237 W 0.083 -238 S 0.084 -239 A 0.092 -240 V 0.105 -241 R 0.114 -242 I 0.118 -243 G 0.114 -244 L 0.101 -245 Y 0.083 -246 A 0.067 -247 Q 0.057 -248 H 0.052 -249 L 0.050 -250 D 0.049 -251 H 0.046 -252 W 0.040 -253 L 0.037 -254 R 0.039 -255 Y 0.044 -256 F 0.047 -257 P 0.046 -258 L 0.043 -259 S 0.039 -260 H 0.036 -261 F 0.038 -262 L 0.048 -263 F 0.066 -264 V 0.084 -265 S 0.090 -266 G 0.080 -267 E 0.066 -268 R 0.055 -269 L 0.049 -270 V 0.047 -271 S 0.047 -272 D 0.050 -273 P 0.053 -274 A 0.054 -275 G 0.053 -276 E 0.050 -277 V 0.047 -278 G 0.046 -279 R 0.047 -280 V 0.051 -281 Q 0.059 -282 D 0.063 -283 F 0.059 -284 L 0.055 -285 G 0.060 -286 L 0.071 -287 K 0.083 -288 R 0.089 -289 V 0.090 -290 V 0.090 -291 T 0.087 -292 D 0.077 -293 K 0.064 -294 H 0.057 -295 F 0.059 -296 Y 0.068 -297 F 0.074 -298 N 0.076 -299 A 0.077 -300 T 0.081 -301 K 0.088 -302 G 0.099 -303 F 0.113 -304 P 0.127 -305 C 0.136 -306 L 0.149 -307 K 0.181 -308 K 0.231 -309 A 0.284 -310 Q 0.320 -311 G 0.332 -312 G 0.328 -313 S 0.316 -314 R 0.303 -315 P 0.298 -316 R 0.312 -317 C 0.339 -318 L 0.365 -319 G 0.375 -320 K 0.369 -321 S 0.354 -322 K 0.338 -323 G 0.321 -324 R 0.300 -325 P 0.275 -326 H 0.248 -327 P 0.226 -328 R 0.209 -329 V 0.189 -330 P 0.165 -331 Q 0.140 -332 A 0.123 -333 L 0.116 -334 V 0.116 -335 R 0.120 -336 R 0.127 -337 L 0.134 -338 Q 0.137 -339 E 0.132 -340 F 0.126 -341 Y 0.118 -342 R 0.102 -343 P 0.086 -344 F 0.079 -345 N 0.080 -346 R 0.081 -347 R 0.084 -348 F 0.089 -349 Y 0.096 -350 Q 0.099 -351 M 0.098 -352 T 0.094 -353 G 0.092 -354 Q 0.094 -355 D 0.098 -356 F 0.099 -357 G 0.102 -358 W 0.116 -359 G 0.134 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000162078.13_ENST00000382280.8_GN:ZG16B_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000162078.13_ENST00000382280.8_GN:ZG16B_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 9a617716a115c96e29d510c0d8f8ab0f73456493..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000162078.13_ENST00000382280.8_GN:ZG16B_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,173 +0,0 @@ ->ENSG00000162078.13|ENST00000382280.8|GN:ZG16B|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.292 -2 L 0.294 -3 L 0.307 -4 L 0.322 -5 L 0.318 -6 T 0.308 -7 L 0.331 -8 A 0.387 -9 L 0.432 -10 L 0.439 -11 G 0.418 -12 G 0.386 -13 P 0.349 -14 T 0.307 -15 W 0.261 -16 A 0.217 -17 G 0.183 -18 K 0.162 -19 M 0.151 -20 Y 0.144 -21 G 0.140 -22 P 0.144 -23 G 0.151 -24 G 0.154 -25 G 0.147 -26 K 0.133 -27 Y 0.112 -28 F 0.094 -29 S 0.087 -30 T 0.096 -31 T 0.112 -32 E 0.124 -33 D 0.123 -34 Y 0.110 -35 D 0.094 -36 H 0.078 -37 E 0.062 -38 I 0.046 -39 T 0.034 -40 G 0.028 -41 L 0.028 -42 R 0.031 -43 V 0.036 -44 S 0.044 -45 V 0.053 -46 G 0.060 -47 L 0.062 -48 L 0.061 -49 L 0.056 -50 V 0.051 -51 K 0.044 -52 S 0.040 -53 V 0.039 -54 Q 0.040 -55 V 0.040 -56 K 0.042 -57 L 0.048 -58 G 0.055 -59 D 0.058 -60 S 0.056 -61 W 0.054 -62 D 0.058 -63 V 0.066 -64 K 0.072 -65 L 0.081 -66 G 0.099 -67 A 0.123 -68 L 0.140 -69 G 0.139 -70 G 0.126 -71 N 0.107 -72 T 0.088 -73 Q 0.072 -74 E 0.061 -75 V 0.053 -76 T 0.048 -77 L 0.050 -78 Q 0.057 -79 P 0.060 -80 G 0.054 -81 E 0.043 -82 Y 0.035 -83 I 0.031 -84 T 0.028 -85 K 0.025 -86 V 0.023 -87 F 0.022 -88 V 0.023 -89 A 0.025 -90 F 0.028 -91 Q 0.029 -92 A 0.030 -93 F 0.033 -94 L 0.036 -95 R 0.037 -96 G 0.035 -97 M 0.030 -98 V 0.024 -99 M 0.020 -100 Y 0.022 -101 T 0.027 -102 S 0.034 -103 K 0.040 -104 D 0.042 -105 R 0.042 -106 Y 0.042 -107 F 0.042 -108 Y 0.043 -109 F 0.046 -110 G 0.054 -111 K 0.064 -112 L 0.072 -113 D 0.073 -114 G 0.070 -115 Q 0.066 -116 I 0.063 -117 S 0.058 -118 S 0.054 -119 A 0.053 -120 Y 0.054 -121 P 0.057 -122 S 0.067 -123 Q 0.083 -124 E 0.098 -125 G 0.100 -126 Q 0.090 -127 V 0.076 -128 L 0.066 -129 V 0.063 -130 G 0.067 -131 I 0.071 -132 Y 0.070 -133 G 0.068 -134 Q 0.066 -135 Y 0.067 -136 Q 0.072 -137 L 0.079 -138 L 0.082 -139 G 0.079 -140 I 0.072 -141 K 0.066 -142 S 0.061 -143 I 0.056 -144 G 0.051 -145 F 0.046 -146 E 0.048 -147 W 0.064 -148 N 0.108 -149 Y 0.184 -150 P 0.282 -151 L 0.381 -152 E 0.466 -153 E 0.530 -154 P 0.568 -155 T 0.583 -156 T 0.582 -157 E 0.579 -158 P 0.587 -159 P 0.607 -160 V 0.627 -161 N 0.632 -162 L 0.622 -163 T 0.604 -164 Y 0.592 -165 S 0.590 -166 A 0.585 -167 N 0.578 -168 S 0.585 -169 P 0.601 -170 V 0.595 -171 G 0.553 -172 R 0.508 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000162078.13_ENST00000382280.8_GN:ZG16B_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000162078.13_ENST00000382280.8_GN:ZG16B_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid deleted file mode 100644 index b1f4e91f975a9350c3159ef929a48c709fdecb8d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000162078.13_ENST00000382280.8_GN:ZG16B_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid +++ /dev/null @@ -1,179 +0,0 @@ ->ENSG00000162078.13|ENST00000382280.8|GN:ZG16B|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:6 -1 M 0.418 -2 H 0.444 -3 R 0.481 -4 P 0.489 -5 E 0.441 -6 A 0.364 -7 M 0.317 -8 L 0.312 -9 L 0.319 -10 L 0.337 -11 L 0.382 -12 T 0.435 -13 L 0.463 -14 A 0.467 -15 L 0.465 -16 L 0.460 -17 G 0.442 -18 G 0.413 -19 P 0.376 -20 T 0.334 -21 W 0.285 -22 A 0.234 -23 G 0.190 -24 K 0.162 -25 M 0.147 -26 Y 0.137 -27 G 0.131 -28 P 0.132 -29 G 0.138 -30 G 0.142 -31 G 0.138 -32 K 0.127 -33 Y 0.108 -34 F 0.090 -35 S 0.083 -36 T 0.091 -37 T 0.107 -38 E 0.120 -39 D 0.120 -40 Y 0.108 -41 D 0.092 -42 H 0.077 -43 E 0.061 -44 I 0.045 -45 T 0.033 -46 G 0.027 -47 L 0.027 -48 R 0.030 -49 V 0.036 -50 S 0.044 -51 V 0.053 -52 G 0.060 -53 L 0.062 -54 L 0.060 -55 L 0.055 -56 V 0.050 -57 K 0.044 -58 S 0.040 -59 V 0.039 -60 Q 0.039 -61 V 0.039 -62 K 0.042 -63 L 0.047 -64 G 0.053 -65 D 0.056 -66 S 0.054 -67 W 0.052 -68 D 0.056 -69 V 0.064 -70 K 0.070 -71 L 0.079 -72 G 0.096 -73 A 0.120 -74 L 0.137 -75 G 0.137 -76 G 0.124 -77 N 0.106 -78 T 0.088 -79 Q 0.072 -80 E 0.060 -81 V 0.052 -82 T 0.047 -83 L 0.049 -84 Q 0.057 -85 P 0.060 -86 G 0.054 -87 E 0.043 -88 Y 0.035 -89 I 0.031 -90 T 0.028 -91 K 0.025 -92 V 0.023 -93 F 0.022 -94 V 0.023 -95 A 0.025 -96 F 0.028 -97 Q 0.029 -98 A 0.030 -99 F 0.033 -100 L 0.036 -101 R 0.037 -102 G 0.035 -103 M 0.030 -104 V 0.024 -105 M 0.020 -106 Y 0.022 -107 T 0.027 -108 S 0.034 -109 K 0.040 -110 D 0.042 -111 R 0.042 -112 Y 0.042 -113 F 0.042 -114 Y 0.043 -115 F 0.046 -116 G 0.055 -117 K 0.066 -118 L 0.073 -119 D 0.074 -120 G 0.071 -121 Q 0.067 -122 I 0.064 -123 S 0.059 -124 S 0.055 -125 A 0.054 -126 Y 0.055 -127 P 0.058 -128 S 0.068 -129 Q 0.084 -130 E 0.099 -131 G 0.101 -132 Q 0.091 -133 V 0.077 -134 L 0.066 -135 V 0.063 -136 G 0.067 -137 I 0.071 -138 Y 0.070 -139 G 0.068 -140 Q 0.066 -141 Y 0.067 -142 Q 0.072 -143 L 0.079 -144 L 0.082 -145 G 0.079 -146 I 0.072 -147 K 0.066 -148 S 0.060 -149 I 0.055 -150 G 0.050 -151 F 0.045 -152 E 0.047 -153 W 0.063 -154 N 0.108 -155 Y 0.186 -156 P 0.286 -157 L 0.387 -158 E 0.473 -159 E 0.537 -160 P 0.578 -161 T 0.593 -162 T 0.592 -163 E 0.586 -164 P 0.592 -165 P 0.612 -166 V 0.633 -167 N 0.640 -168 L 0.631 -169 T 0.613 -170 Y 0.602 -171 S 0.599 -172 A 0.594 -173 N 0.586 -174 S 0.591 -175 P 0.605 -176 V 0.598 -177 G 0.555 -178 R 0.509 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000163283.7_ENST00000392027.3_GN:ALPP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000163283.7_ENST00000392027.3_GN:ALPP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index d26a28cfbd7325fb84360186ed7140d2c17a5529..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000163283.7_ENST00000392027.3_GN:ALPP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,536 +0,0 @@ ->ENSG00000163283.7|ENST00000392027.3|GN:ALPP|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.290 -2 L 0.286 -3 G 0.275 -4 P 0.253 -5 C 0.221 -6 M 0.186 -7 L 0.158 -8 L 0.142 -9 L 0.140 -10 L 0.147 -11 L 0.162 -12 L 0.185 -13 L 0.215 -14 G 0.243 -15 L 0.261 -16 R 0.270 -17 L 0.281 -18 Q 0.301 -19 L 0.328 -20 S 0.352 -21 L 0.365 -22 G 0.361 -23 I 0.344 -24 I 0.316 -25 P 0.280 -26 V 0.239 -27 E 0.200 -28 E 0.171 -29 E 0.153 -30 N 0.145 -31 P 0.144 -32 D 0.148 -33 F 0.153 -34 W 0.159 -35 N 0.164 -36 R 0.176 -37 E 0.194 -38 A 0.205 -39 A 0.204 -40 E 0.202 -41 A 0.203 -42 L 0.201 -43 G 0.195 -44 A 0.190 -45 A 0.185 -46 K 0.184 -47 K 0.194 -48 L 0.210 -49 Q 0.217 -50 P 0.209 -51 A 0.196 -52 Q 0.187 -53 T 0.182 -54 A 0.173 -55 A 0.158 -56 K 0.146 -57 N 0.148 -58 L 0.160 -59 I 0.166 -60 I 0.156 -61 F 0.136 -62 L 0.124 -63 G 0.126 -64 D 0.138 -65 G 0.144 -66 M 0.138 -67 G 0.124 -68 V 0.115 -69 S 0.118 -70 T 0.125 -71 V 0.128 -72 T 0.128 -73 A 0.131 -74 A 0.131 -75 R 0.124 -76 I 0.113 -77 L 0.111 -78 K 0.118 -79 G 0.128 -80 Q 0.135 -81 K 0.143 -82 K 0.153 -83 D 0.164 -84 K 0.171 -85 L 0.173 -86 G 0.174 -87 P 0.181 -88 E 0.194 -89 I 0.204 -90 P 0.200 -91 L 0.182 -92 A 0.165 -93 M 0.154 -94 D 0.147 -95 R 0.139 -96 F 0.134 -97 P 0.132 -98 Y 0.131 -99 V 0.132 -100 A 0.143 -101 L 0.167 -102 S 0.194 -103 K 0.216 -104 T 0.229 -105 Y 0.230 -106 N 0.219 -107 V 0.197 -108 D 0.174 -109 K 0.165 -110 H 0.188 -111 V 0.247 -112 P 0.320 -113 D 0.371 -114 S 0.390 -115 G 0.389 -116 A 0.376 -117 T 0.344 -118 A 0.300 -119 T 0.258 -120 A 0.225 -121 Y 0.206 -122 L 0.201 -123 C 0.214 -124 G 0.247 -125 V 0.285 -126 K 0.308 -127 G 0.309 -128 N 0.299 -129 F 0.296 -130 Q 0.305 -131 T 0.317 -132 I 0.327 -133 G 0.344 -134 L 0.360 -135 S 0.358 -136 A 0.329 -137 A 0.283 -138 A 0.235 -139 R 0.195 -140 F 0.168 -141 N 0.154 -142 Q 0.151 -143 C 0.162 -144 N 0.184 -145 T 0.206 -146 T 0.219 -147 R 0.226 -148 G 0.232 -149 N 0.231 -150 E 0.216 -151 V 0.189 -152 I 0.159 -153 S 0.132 -154 V 0.112 -155 M 0.097 -156 N 0.087 -157 R 0.080 -158 A 0.078 -159 K 0.084 -160 K 0.097 -161 A 0.114 -162 G 0.132 -163 K 0.151 -164 S 0.176 -165 V 0.211 -166 G 0.249 -167 V 0.275 -168 V 0.269 -169 T 0.229 -170 T 0.176 -171 T 0.133 -172 R 0.113 -173 V 0.107 -174 Q 0.110 -175 H 0.118 -176 A 0.131 -177 S 0.145 -178 P 0.154 -179 A 0.159 -180 G 0.158 -181 T 0.152 -182 Y 0.142 -183 A 0.132 -184 H 0.123 -185 T 0.115 -186 V 0.112 -187 N 0.115 -188 R 0.125 -189 N 0.138 -190 W 0.146 -191 Y 0.145 -192 S 0.139 -193 D 0.136 -194 A 0.134 -195 D 0.131 -196 V 0.126 -197 P 0.121 -198 A 0.112 -199 S 0.102 -200 A 0.091 -201 R 0.081 -202 Q 0.076 -203 E 0.083 -204 G 0.099 -205 C 0.117 -206 Q 0.126 -207 D 0.124 -208 I 0.116 -209 A 0.110 -210 T 0.105 -211 Q 0.101 -212 L 0.096 -213 I 0.091 -214 S 0.085 -215 N 0.082 -216 M 0.081 -217 D 0.086 -218 I 0.096 -219 D 0.107 -220 V 0.109 -221 I 0.101 -222 L 0.089 -223 G 0.085 -224 G 0.094 -225 G 0.113 -226 R 0.132 -227 K 0.145 -228 Y 0.150 -229 M 0.155 -230 F 0.168 -231 R 0.190 -232 M 0.210 -233 G 0.220 -234 T 0.224 -235 P 0.221 -236 D 0.214 -237 P 0.204 -238 E 0.201 -239 Y 0.204 -240 P 0.210 -241 D 0.212 -242 D 0.212 -243 Y 0.220 -244 S 0.238 -245 Q 0.259 -246 G 0.266 -247 G 0.252 -248 T 0.219 -249 R 0.185 -250 L 0.168 -251 D 0.169 -252 G 0.172 -253 K 0.162 -254 N 0.141 -255 L 0.117 -256 V 0.096 -257 Q 0.079 -258 E 0.069 -259 W 0.069 -260 L 0.074 -261 A 0.077 -262 K 0.076 -263 R 0.078 -264 Q 0.086 -265 G 0.093 -266 A 0.097 -267 R 0.101 -268 Y 0.109 -269 V 0.116 -270 W 0.116 -271 N 0.108 -272 R 0.097 -273 T 0.085 -274 E 0.073 -275 L 0.064 -276 M 0.059 -277 Q 0.060 -278 A 0.065 -279 S 0.068 -280 L 0.067 -281 D 0.066 -282 P 0.068 -283 S 0.073 -284 V 0.080 -285 T 0.092 -286 H 0.114 -287 L 0.144 -288 M 0.170 -289 G 0.181 -290 L 0.180 -291 F 0.171 -292 E 0.161 -293 P 0.154 -294 G 0.152 -295 D 0.153 -296 M 0.155 -297 K 0.153 -298 Y 0.148 -299 E 0.146 -300 I 0.146 -301 H 0.146 -302 R 0.143 -303 D 0.135 -304 S 0.128 -305 T 0.121 -306 L 0.121 -307 D 0.127 -308 P 0.137 -309 S 0.144 -310 L 0.140 -311 M 0.126 -312 E 0.111 -313 M 0.107 -314 T 0.104 -315 E 0.092 -316 A 0.075 -317 A 0.064 -318 L 0.061 -319 R 0.065 -320 L 0.072 -321 L 0.079 -322 S 0.086 -323 R 0.099 -324 N 0.119 -325 P 0.140 -326 R 0.151 -327 G 0.153 -328 F 0.160 -329 F 0.175 -330 L 0.192 -331 F 0.205 -332 V 0.212 -333 E 0.207 -334 G 0.192 -335 G 0.178 -336 R 0.169 -337 I 0.159 -338 D 0.146 -339 H 0.133 -340 G 0.125 -341 H 0.130 -342 H 0.146 -343 E 0.166 -344 S 0.180 -345 R 0.181 -346 A 0.175 -347 Y 0.171 -348 R 0.178 -349 A 0.192 -350 L 0.205 -351 T 0.210 -352 E 0.206 -353 T 0.195 -354 I 0.181 -355 M 0.168 -356 F 0.152 -357 D 0.131 -358 D 0.110 -359 A 0.094 -360 I 0.082 -361 E 0.075 -362 R 0.076 -363 A 0.085 -364 G 0.098 -365 Q 0.109 -366 L 0.112 -367 T 0.104 -368 S 0.093 -369 E 0.087 -370 E 0.086 -371 D 0.088 -372 T 0.098 -373 L 0.120 -374 S 0.149 -375 L 0.178 -376 V 0.200 -377 T 0.205 -378 A 0.194 -379 D 0.174 -380 H 0.157 -381 S 0.152 -382 H 0.165 -383 V 0.196 -384 F 0.234 -385 S 0.269 -386 F 0.288 -387 G 0.284 -388 G 0.261 -389 Y 0.237 -390 P 0.224 -391 L 0.218 -392 R 0.213 -393 G 0.216 -394 S 0.225 -395 S 0.230 -396 I 0.231 -397 F 0.244 -398 G 0.266 -399 L 0.273 -400 A 0.254 -401 P 0.221 -402 G 0.194 -403 K 0.180 -404 A 0.176 -405 R 0.177 -406 D 0.184 -407 R 0.201 -408 K 0.219 -409 A 0.228 -410 Y 0.230 -411 T 0.231 -412 V 0.236 -413 L 0.248 -414 L 0.267 -415 Y 0.286 -416 G 0.295 -417 N 0.299 -418 G 0.312 -419 P 0.331 -420 G 0.331 -421 Y 0.300 -422 V 0.255 -423 L 0.224 -424 K 0.220 -425 D 0.236 -426 G 0.255 -427 A 0.258 -428 R 0.247 -429 P 0.231 -430 D 0.213 -431 V 0.192 -432 T 0.177 -433 E 0.175 -434 S 0.182 -435 E 0.192 -436 S 0.206 -437 G 0.224 -438 S 0.236 -439 P 0.238 -440 E 0.236 -441 Y 0.243 -442 R 0.258 -443 Q 0.276 -444 Q 0.287 -445 S 0.294 -446 A 0.302 -447 V 0.308 -448 P 0.304 -449 L 0.289 -450 D 0.271 -451 E 0.265 -452 E 0.280 -453 T 0.309 -454 H 0.342 -455 A 0.371 -456 G 0.399 -457 E 0.424 -458 D 0.430 -459 V 0.400 -460 A 0.337 -461 V 0.265 -462 F 0.204 -463 A 0.163 -464 R 0.141 -465 G 0.137 -466 P 0.137 -467 Q 0.134 -468 A 0.133 -469 H 0.143 -470 L 0.170 -471 V 0.210 -472 H 0.251 -473 G 0.276 -474 V 0.273 -475 Q 0.252 -476 E 0.226 -477 Q 0.202 -478 T 0.186 -479 F 0.176 -480 I 0.163 -481 A 0.144 -482 H 0.127 -483 V 0.115 -484 M 0.103 -485 A 0.093 -486 F 0.090 -487 A 0.090 -488 A 0.088 -489 C 0.085 -490 L 0.084 -491 E 0.087 -492 P 0.099 -493 Y 0.124 -494 T 0.163 -495 A 0.213 -496 C 0.273 -497 D 0.344 -498 L 0.414 -499 A 0.473 -500 P 0.523 -501 P 0.576 -502 A 0.629 -503 G 0.666 -504 T 0.683 -505 T 0.687 -506 D 0.678 -507 A 0.658 -508 A 0.634 -509 H 0.625 -510 P 0.632 -511 G 0.641 -512 R 0.641 -513 S 0.639 -514 V 0.640 -515 V 0.640 -516 P 0.632 -517 A 0.608 -518 L 0.571 -519 L 0.534 -520 P 0.511 -521 L 0.492 -522 L 0.468 -523 A 0.460 -524 G 0.477 -525 T 0.486 -526 L 0.466 -527 L 0.456 -528 L 0.481 -529 L 0.512 -530 E 0.518 -531 T 0.505 -532 A 0.489 -533 T 0.478 -534 A 0.476 -535 P 0.479 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000163283.7_ENST00000392027.3_GN:ALPP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000163283.7_ENST00000392027.3_GN:ALPP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid deleted file mode 100644 index fc2b8708948b703f474bf2b3d880c2ef38c99e1a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000163283.7_ENST00000392027.3_GN:ALPP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid +++ /dev/null @@ -1,551 +0,0 @@ ->ENSG00000163283.7|ENST00000392027.3|GN:ALPP|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:15 -1 M 0.341 -2 P 0.343 -3 R 0.356 -4 I 0.378 -5 P 0.388 -6 A 0.393 -7 S 0.410 -8 P 0.420 -9 L 0.397 -10 S 0.363 -11 C 0.353 -12 C 0.370 -13 P 0.393 -14 P 0.410 -15 D 0.410 -16 M 0.396 -17 L 0.374 -18 G 0.347 -19 P 0.313 -20 C 0.271 -21 M 0.225 -22 L 0.188 -23 L 0.168 -24 L 0.161 -25 L 0.161 -26 L 0.166 -27 L 0.180 -28 L 0.202 -29 G 0.222 -30 L 0.231 -31 R 0.235 -32 L 0.246 -33 Q 0.270 -34 L 0.302 -35 S 0.333 -36 L 0.353 -37 G 0.354 -38 I 0.340 -39 I 0.311 -40 P 0.274 -41 V 0.234 -42 E 0.198 -43 E 0.170 -44 E 0.154 -45 N 0.147 -46 P 0.147 -47 D 0.152 -48 F 0.160 -49 W 0.168 -50 N 0.175 -51 R 0.190 -52 E 0.211 -53 A 0.223 -54 A 0.220 -55 E 0.214 -56 A 0.213 -57 L 0.210 -58 G 0.204 -59 A 0.197 -60 A 0.190 -61 K 0.187 -62 K 0.196 -63 L 0.210 -64 Q 0.215 -65 P 0.206 -66 A 0.194 -67 Q 0.186 -68 T 0.181 -69 A 0.172 -70 A 0.157 -71 K 0.145 -72 N 0.147 -73 L 0.158 -74 I 0.163 -75 I 0.152 -76 F 0.133 -77 L 0.122 -78 G 0.126 -79 D 0.138 -80 G 0.144 -81 M 0.138 -82 G 0.125 -83 V 0.115 -84 S 0.117 -85 T 0.124 -86 V 0.126 -87 T 0.126 -88 A 0.129 -89 A 0.130 -90 R 0.123 -91 I 0.112 -92 L 0.110 -93 K 0.117 -94 G 0.127 -95 Q 0.133 -96 K 0.139 -97 K 0.149 -98 D 0.160 -99 K 0.167 -100 L 0.168 -101 G 0.170 -102 P 0.177 -103 E 0.191 -104 I 0.203 -105 P 0.199 -106 L 0.182 -107 A 0.165 -108 M 0.154 -109 D 0.146 -110 R 0.139 -111 F 0.133 -112 P 0.130 -113 Y 0.129 -114 V 0.131 -115 A 0.143 -116 L 0.167 -117 S 0.195 -118 K 0.218 -119 T 0.232 -120 Y 0.234 -121 N 0.222 -122 V 0.200 -123 D 0.177 -124 K 0.168 -125 H 0.192 -126 V 0.251 -127 P 0.322 -128 D 0.371 -129 S 0.387 -130 G 0.385 -131 A 0.372 -132 T 0.342 -133 A 0.300 -134 T 0.258 -135 A 0.226 -136 Y 0.207 -137 L 0.202 -138 C 0.215 -139 G 0.249 -140 V 0.288 -141 K 0.312 -142 G 0.312 -143 N 0.302 -144 F 0.298 -145 Q 0.307 -146 T 0.319 -147 I 0.331 -148 G 0.349 -149 L 0.366 -150 S 0.363 -151 A 0.334 -152 A 0.286 -153 A 0.236 -154 R 0.194 -155 F 0.166 -156 N 0.151 -157 Q 0.149 -158 C 0.159 -159 N 0.181 -160 T 0.204 -161 T 0.217 -162 R 0.224 -163 G 0.231 -164 N 0.232 -165 E 0.219 -166 V 0.192 -167 I 0.161 -168 S 0.134 -169 V 0.113 -170 M 0.099 -171 N 0.088 -172 R 0.081 -173 A 0.079 -174 K 0.084 -175 K 0.097 -176 A 0.114 -177 G 0.133 -178 K 0.152 -179 S 0.178 -180 V 0.213 -181 G 0.251 -182 V 0.276 -183 V 0.269 -184 T 0.229 -185 T 0.176 -186 T 0.134 -187 R 0.114 -188 V 0.108 -189 Q 0.110 -190 H 0.118 -191 A 0.131 -192 S 0.144 -193 P 0.152 -194 A 0.156 -195 G 0.155 -196 T 0.148 -197 Y 0.139 -198 A 0.129 -199 H 0.120 -200 T 0.113 -201 V 0.110 -202 N 0.113 -203 R 0.123 -204 N 0.136 -205 W 0.143 -206 Y 0.142 -207 S 0.137 -208 D 0.134 -209 A 0.132 -210 D 0.129 -211 V 0.124 -212 P 0.118 -213 A 0.110 -214 S 0.101 -215 A 0.090 -216 R 0.079 -217 Q 0.075 -218 E 0.081 -219 G 0.097 -220 C 0.115 -221 Q 0.124 -222 D 0.121 -223 I 0.115 -224 A 0.109 -225 T 0.104 -226 Q 0.099 -227 L 0.095 -228 I 0.089 -229 S 0.083 -230 N 0.079 -231 M 0.078 -232 D 0.083 -233 I 0.095 -234 D 0.106 -235 V 0.109 -236 I 0.102 -237 L 0.091 -238 G 0.086 -239 G 0.096 -240 G 0.114 -241 R 0.132 -242 K 0.144 -243 Y 0.149 -244 M 0.153 -245 F 0.166 -246 R 0.188 -247 M 0.208 -248 G 0.220 -249 T 0.224 -250 P 0.223 -251 D 0.215 -252 P 0.206 -253 E 0.201 -254 Y 0.205 -255 P 0.211 -256 D 0.212 -257 D 0.212 -258 Y 0.220 -259 S 0.239 -260 Q 0.259 -261 G 0.266 -262 G 0.251 -263 T 0.218 -264 R 0.184 -265 L 0.168 -266 D 0.169 -267 G 0.173 -268 K 0.163 -269 N 0.142 -270 L 0.118 -271 V 0.096 -272 Q 0.079 -273 E 0.070 -274 W 0.069 -275 L 0.075 -276 A 0.078 -277 K 0.077 -278 R 0.079 -279 Q 0.088 -280 G 0.095 -281 A 0.099 -282 R 0.102 -283 Y 0.110 -284 V 0.118 -285 W 0.117 -286 N 0.108 -287 R 0.096 -288 T 0.084 -289 E 0.073 -290 L 0.064 -291 M 0.060 -292 Q 0.061 -293 A 0.066 -294 S 0.070 -295 L 0.069 -296 D 0.068 -297 P 0.070 -298 S 0.076 -299 V 0.083 -300 T 0.094 -301 H 0.116 -302 L 0.145 -303 M 0.171 -304 G 0.182 -305 L 0.181 -306 F 0.173 -307 E 0.163 -308 P 0.156 -309 G 0.154 -310 D 0.156 -311 M 0.158 -312 K 0.155 -313 Y 0.150 -314 E 0.148 -315 I 0.148 -316 H 0.148 -317 R 0.145 -318 D 0.138 -319 S 0.130 -320 T 0.124 -321 L 0.123 -322 D 0.130 -323 P 0.140 -324 S 0.146 -325 L 0.142 -326 M 0.128 -327 E 0.113 -328 M 0.108 -329 T 0.106 -330 E 0.094 -331 A 0.077 -332 A 0.065 -333 L 0.062 -334 R 0.066 -335 L 0.074 -336 L 0.080 -337 S 0.087 -338 R 0.100 -339 N 0.121 -340 P 0.142 -341 R 0.152 -342 G 0.155 -343 F 0.162 -344 F 0.177 -345 L 0.195 -346 F 0.208 -347 V 0.215 -348 E 0.210 -349 G 0.195 -350 G 0.181 -351 R 0.171 -352 I 0.161 -353 D 0.148 -354 H 0.134 -355 G 0.126 -356 H 0.131 -357 H 0.147 -358 E 0.167 -359 S 0.181 -360 R 0.183 -361 A 0.176 -362 Y 0.172 -363 R 0.179 -364 A 0.193 -365 L 0.207 -366 T 0.212 -367 E 0.207 -368 T 0.195 -369 I 0.182 -370 M 0.169 -371 F 0.153 -372 D 0.131 -373 D 0.110 -374 A 0.094 -375 I 0.082 -376 E 0.075 -377 R 0.077 -378 A 0.086 -379 G 0.098 -380 Q 0.109 -381 L 0.111 -382 T 0.103 -383 S 0.093 -384 E 0.087 -385 E 0.086 -386 D 0.088 -387 T 0.099 -388 L 0.121 -389 S 0.151 -390 L 0.180 -391 V 0.202 -392 T 0.207 -393 A 0.195 -394 D 0.174 -395 H 0.157 -396 S 0.152 -397 H 0.165 -398 V 0.196 -399 F 0.235 -400 S 0.269 -401 F 0.289 -402 G 0.285 -403 G 0.263 -404 Y 0.239 -405 P 0.227 -406 L 0.221 -407 R 0.216 -408 G 0.219 -409 S 0.227 -410 S 0.232 -411 I 0.232 -412 F 0.244 -413 G 0.266 -414 L 0.274 -415 A 0.254 -416 P 0.222 -417 G 0.195 -418 K 0.181 -419 A 0.177 -420 R 0.177 -421 D 0.185 -422 R 0.202 -423 K 0.220 -424 A 0.229 -425 Y 0.230 -426 T 0.230 -427 V 0.235 -428 L 0.247 -429 L 0.267 -430 Y 0.287 -431 G 0.298 -432 N 0.302 -433 G 0.314 -434 P 0.333 -435 G 0.333 -436 Y 0.302 -437 V 0.257 -438 L 0.226 -439 K 0.221 -440 D 0.238 -441 G 0.257 -442 A 0.260 -443 R 0.248 -444 P 0.232 -445 D 0.214 -446 V 0.194 -447 T 0.178 -448 E 0.176 -449 S 0.182 -450 E 0.192 -451 S 0.206 -452 G 0.224 -453 S 0.237 -454 P 0.239 -455 E 0.238 -456 Y 0.245 -457 R 0.261 -458 Q 0.279 -459 Q 0.292 -460 S 0.299 -461 A 0.306 -462 V 0.311 -463 P 0.307 -464 L 0.291 -465 D 0.273 -466 E 0.267 -467 E 0.282 -468 T 0.311 -469 H 0.342 -470 A 0.371 -471 G 0.399 -472 E 0.425 -473 D 0.432 -474 V 0.402 -475 A 0.339 -476 V 0.267 -477 F 0.206 -478 A 0.165 -479 R 0.144 -480 G 0.139 -481 P 0.140 -482 Q 0.136 -483 A 0.134 -484 H 0.144 -485 L 0.172 -486 V 0.213 -487 H 0.256 -488 G 0.280 -489 V 0.277 -490 Q 0.256 -491 E 0.229 -492 Q 0.205 -493 T 0.188 -494 F 0.178 -495 I 0.164 -496 A 0.145 -497 H 0.128 -498 V 0.116 -499 M 0.104 -500 A 0.094 -501 F 0.090 -502 A 0.090 -503 A 0.089 -504 C 0.085 -505 L 0.083 -506 E 0.086 -507 P 0.098 -508 Y 0.123 -509 T 0.162 -510 A 0.212 -511 C 0.272 -512 D 0.343 -513 L 0.413 -514 A 0.472 -515 P 0.523 -516 P 0.575 -517 A 0.627 -518 G 0.663 -519 T 0.680 -520 T 0.683 -521 D 0.674 -522 A 0.653 -523 A 0.630 -524 H 0.621 -525 P 0.628 -526 G 0.635 -527 R 0.634 -528 S 0.631 -529 V 0.631 -530 V 0.629 -531 P 0.618 -532 A 0.592 -533 L 0.551 -534 L 0.511 -535 P 0.483 -536 L 0.463 -537 L 0.443 -538 A 0.440 -539 G 0.461 -540 T 0.470 -541 L 0.450 -542 L 0.441 -543 L 0.464 -544 L 0.490 -545 E 0.492 -546 T 0.478 -547 A 0.465 -548 T 0.456 -549 A 0.453 -550 P 0.455 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000163463.14_ENST00000295682.6_GN:KRTCAP2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000163463.14_ENST00000295682.6_GN:KRTCAP2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index d1df83bdf3894682cf78c3de0cd502ab7cfe16ee..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000163463.14_ENST00000295682.6_GN:KRTCAP2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,137 +0,0 @@ ->ENSG00000163463.14|ENST00000295682.6|GN:KRTCAP2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.425 -2 V 0.397 -3 V 0.341 -4 G 0.266 -5 T 0.195 -6 G 0.140 -7 T 0.102 -8 S 0.081 -9 L 0.074 -10 A 0.073 -11 L 0.072 -12 S 0.075 -13 S 0.083 -14 L 0.085 -15 L 0.076 -16 S 0.064 -17 L 0.060 -18 L 0.065 -19 L 0.076 -20 F 0.086 -21 A 0.091 -22 G 0.093 -23 M 0.093 -24 Q 0.091 -25 M 0.086 -26 Y 0.082 -27 S 0.084 -28 R 0.093 -29 Q 0.108 -30 L 0.124 -31 A 0.136 -32 S 0.137 -33 T 0.122 -34 E 0.094 -35 W 0.069 -36 L 0.056 -37 T 0.051 -38 I 0.050 -39 Q 0.052 -40 G 0.056 -41 G 0.058 -42 L 0.058 -43 L 0.060 -44 G 0.062 -45 S 0.058 -46 G 0.049 -47 L 0.041 -48 F 0.035 -49 V 0.034 -50 F 0.038 -51 S 0.047 -52 L 0.055 -53 T 0.060 -54 A 0.064 -55 F 0.073 -56 N 0.084 -57 N 0.094 -58 L 0.099 -59 E 0.098 -60 N 0.093 -61 L 0.093 -62 V 0.114 -63 F 0.157 -64 G 0.209 -65 K 0.243 -66 G 0.248 -67 F 0.231 -68 Q 0.203 -69 A 0.173 -70 K 0.140 -71 I 0.106 -72 F 0.077 -73 P 0.059 -74 E 0.051 -75 I 0.049 -76 L 0.048 -77 L 0.051 -78 C 0.055 -79 L 0.057 -80 L 0.059 -81 L 0.060 -82 A 0.062 -83 L 0.063 -84 F 0.064 -85 A 0.070 -86 S 0.079 -87 G 0.087 -88 L 0.094 -89 I 0.095 -90 H 0.091 -91 R 0.083 -92 V 0.077 -93 C 0.073 -94 V 0.065 -95 T 0.056 -96 T 0.048 -97 C 0.044 -98 F 0.041 -99 I 0.038 -100 F 0.037 -101 S 0.038 -102 M 0.039 -103 V 0.039 -104 G 0.037 -105 L 0.035 -106 Y 0.034 -107 Y 0.036 -108 I 0.045 -109 N 0.056 -110 K 0.071 -111 I 0.090 -112 S 0.114 -113 S 0.133 -114 T 0.148 -115 L 0.167 -116 Y 0.201 -117 Q 0.258 -118 A 0.328 -119 A 0.397 -120 A 0.455 -121 P 0.500 -122 V 0.530 -123 L 0.550 -124 T 0.573 -125 P 0.605 -126 A 0.636 -127 K 0.652 -128 V 0.650 -129 T 0.631 -130 G 0.605 -131 K 0.586 -132 S 0.582 -133 K 0.576 -134 K 0.545 -135 R 0.490 -136 N 0.446 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000163463.14_ENST00000295682.6_GN:KRTCAP2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000163463.14_ENST00000295682.6_GN:KRTCAP2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid deleted file mode 100644 index e300e99ef2159aeb052944c7b8d3538f5637bf19..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000163463.14_ENST00000295682.6_GN:KRTCAP2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid +++ /dev/null @@ -1,163 +0,0 @@ ->ENSG00000163463.14|ENST00000295682.6|GN:KRTCAP2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:26 -1 M 0.431 -2 R 0.460 -3 I 0.503 -4 A 0.539 -5 N 0.555 -6 R 0.556 -7 T 0.555 -8 R 0.563 -9 F 0.574 -10 S 0.582 -11 S 0.579 -12 P 0.567 -13 F 0.559 -14 L 0.570 -15 A 0.604 -16 R 0.648 -17 G 0.684 -18 A 0.698 -19 G 0.691 -20 W 0.683 -21 T 0.688 -22 H 0.702 -23 G 0.714 -24 R 0.721 -25 G 0.722 -26 M 0.711 -27 M 0.680 -28 V 0.615 -29 V 0.508 -30 G 0.381 -31 T 0.267 -32 G 0.185 -33 T 0.129 -34 S 0.092 -35 L 0.070 -36 A 0.061 -37 L 0.060 -38 S 0.067 -39 S 0.076 -40 L 0.077 -41 L 0.071 -42 S 0.063 -43 L 0.062 -44 L 0.067 -45 L 0.078 -46 F 0.088 -47 A 0.094 -48 G 0.097 -49 M 0.098 -50 Q 0.097 -51 M 0.093 -52 Y 0.090 -53 S 0.091 -54 R 0.098 -55 Q 0.111 -56 L 0.124 -57 A 0.135 -58 S 0.136 -59 T 0.122 -60 E 0.095 -61 W 0.070 -62 L 0.057 -63 T 0.053 -64 I 0.052 -65 Q 0.054 -66 G 0.057 -67 G 0.058 -68 L 0.058 -69 L 0.059 -70 G 0.061 -71 S 0.057 -72 G 0.049 -73 L 0.041 -74 F 0.036 -75 V 0.034 -76 F 0.038 -77 S 0.047 -78 L 0.054 -79 T 0.059 -80 A 0.063 -81 F 0.071 -82 N 0.081 -83 N 0.091 -84 L 0.097 -85 E 0.096 -86 N 0.090 -87 L 0.090 -88 V 0.110 -89 F 0.153 -90 G 0.206 -91 K 0.244 -92 G 0.252 -93 F 0.237 -94 Q 0.212 -95 A 0.182 -96 K 0.148 -97 I 0.110 -98 F 0.079 -99 P 0.061 -100 E 0.053 -101 I 0.051 -102 L 0.050 -103 L 0.052 -104 C 0.057 -105 L 0.060 -106 L 0.061 -107 L 0.062 -108 A 0.063 -109 L 0.062 -110 F 0.063 -111 A 0.069 -112 S 0.078 -113 G 0.086 -114 L 0.092 -115 I 0.094 -116 H 0.090 -117 R 0.083 -118 V 0.078 -119 C 0.074 -120 V 0.066 -121 T 0.056 -122 T 0.049 -123 C 0.044 -124 F 0.041 -125 I 0.038 -126 F 0.038 -127 S 0.040 -128 M 0.041 -129 V 0.040 -130 G 0.039 -131 L 0.037 -132 Y 0.036 -133 Y 0.040 -134 I 0.052 -135 N 0.069 -136 K 0.087 -137 I 0.106 -138 S 0.125 -139 S 0.141 -140 T 0.155 -141 L 0.174 -142 Y 0.211 -143 Q 0.270 -144 A 0.343 -145 A 0.414 -146 A 0.473 -147 P 0.518 -148 V 0.549 -149 L 0.568 -150 T 0.591 -151 P 0.623 -152 A 0.655 -153 K 0.673 -154 V 0.673 -155 T 0.660 -156 G 0.640 -157 K 0.625 -158 S 0.617 -159 K 0.602 -160 K 0.563 -161 R 0.505 -162 N 0.460 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000164022.19_ENST00000672341.1_GN:AIMP1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000164022.19_ENST00000672341.1_GN:AIMP1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index bce878ed1db4e4e9637bf26b6636d08435e3eeac..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000164022.19_ENST00000672341.1_GN:AIMP1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,313 +0,0 @@ ->ENSG00000164022.19|ENST00000672341.1|GN:AIMP1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.330 -2 A 0.319 -3 N 0.299 -4 N 0.268 -5 D 0.229 -6 A 0.194 -7 V 0.173 -8 L 0.164 -9 K 0.163 -10 R 0.167 -11 L 0.177 -12 E 0.188 -13 Q 0.197 -14 K 0.208 -15 G 0.224 -16 A 0.239 -17 E 0.250 -18 A 0.248 -19 D 0.231 -20 Q 0.208 -21 I 0.188 -22 I 0.169 -23 E 0.151 -24 Y 0.137 -25 L 0.133 -26 K 0.139 -27 Q 0.149 -28 Q 0.148 -29 V 0.134 -30 S 0.120 -31 L 0.116 -32 L 0.121 -33 K 0.131 -34 E 0.141 -35 K 0.154 -36 A 0.169 -37 I 0.183 -38 L 0.190 -39 Q 0.193 -40 A 0.196 -41 T 0.196 -42 L 0.196 -43 R 0.198 -44 E 0.199 -45 E 0.190 -46 K 0.176 -47 K 0.165 -48 L 0.161 -49 R 0.166 -50 V 0.182 -51 E 0.201 -52 N 0.208 -53 A 0.207 -54 K 0.215 -55 L 0.234 -56 K 0.250 -57 K 0.260 -58 E 0.266 -59 I 0.264 -60 E 0.250 -61 E 0.234 -62 L 0.223 -63 K 0.214 -64 Q 0.208 -65 E 0.204 -66 L 0.199 -67 I 0.194 -68 Q 0.193 -69 A 0.195 -70 E 0.192 -71 I 0.195 -72 Q 0.223 -73 N 0.274 -74 G 0.330 -75 V 0.371 -76 K 0.401 -77 Q 0.440 -78 I 0.496 -79 P 0.557 -80 F 0.611 -81 P 0.654 -82 S 0.682 -83 G 0.696 -84 T 0.705 -85 P 0.717 -86 L 0.734 -87 H 0.753 -88 A 0.767 -89 N 0.770 -90 S 0.765 -91 M 0.758 -92 V 0.756 -93 S 0.757 -94 E 0.757 -95 N 0.753 -96 V 0.743 -97 I 0.737 -98 Q 0.738 -99 S 0.742 -100 T 0.747 -101 A 0.754 -102 V 0.761 -103 T 0.769 -104 T 0.772 -105 V 0.770 -106 S 0.766 -107 S 0.765 -108 G 0.766 -109 T 0.768 -110 K 0.770 -111 E 0.771 -112 Q 0.770 -113 I 0.766 -114 K 0.761 -115 G 0.754 -116 G 0.744 -117 T 0.731 -118 G 0.716 -119 D 0.693 -120 E 0.645 -121 K 0.576 -122 K 0.517 -123 A 0.494 -124 K 0.488 -125 E 0.488 -126 K 0.508 -127 I 0.527 -128 E 0.521 -129 K 0.513 -130 K 0.544 -131 G 0.597 -132 E 0.637 -133 K 0.657 -134 K 0.673 -135 E 0.690 -136 K 0.703 -137 K 0.710 -138 Q 0.716 -139 Q 0.723 -140 S 0.733 -141 I 0.744 -142 A 0.748 -143 G 0.742 -144 S 0.722 -145 A 0.686 -146 D 0.625 -147 S 0.539 -148 K 0.431 -149 P 0.318 -150 I 0.217 -151 D 0.143 -152 V 0.100 -153 S 0.082 -154 R 0.074 -155 L 0.063 -156 D 0.050 -157 L 0.039 -158 R 0.033 -159 I 0.031 -160 G 0.031 -161 C 0.030 -162 I 0.030 -163 I 0.032 -164 T 0.037 -165 A 0.044 -166 R 0.053 -167 K 0.064 -168 H 0.073 -169 P 0.077 -170 D 0.076 -171 A 0.071 -172 D 0.063 -173 S 0.053 -174 L 0.042 -175 Y 0.032 -176 V 0.026 -177 E 0.024 -178 E 0.025 -179 V 0.029 -180 D 0.034 -181 V 0.038 -182 G 0.041 -183 E 0.042 -184 I 0.041 -185 A 0.040 -186 P 0.039 -187 R 0.038 -188 T 0.035 -189 V 0.033 -190 V 0.034 -191 S 0.038 -192 G 0.044 -193 L 0.047 -194 V 0.047 -195 N 0.045 -196 H 0.044 -197 V 0.043 -198 P 0.040 -199 L 0.037 -200 E 0.037 -201 Q 0.040 -202 M 0.046 -203 Q 0.054 -204 N 0.062 -205 R 0.066 -206 M 0.066 -207 V 0.064 -208 I 0.066 -209 L 0.072 -210 L 0.081 -211 C 0.087 -212 N 0.089 -213 L 0.092 -214 K 0.100 -215 P 0.110 -216 A 0.115 -217 K 0.114 -218 M 0.108 -219 R 0.104 -220 G 0.109 -221 V 0.118 -222 L 0.122 -223 S 0.112 -224 Q 0.095 -225 A 0.080 -226 M 0.071 -227 V 0.066 -228 M 0.064 -229 C 0.065 -230 A 0.071 -231 S 0.079 -232 S 0.086 -233 P 0.091 -234 E 0.094 -235 K 0.094 -236 I 0.092 -237 E 0.091 -238 I 0.095 -239 L 0.108 -240 A 0.125 -241 P 0.139 -242 P 0.141 -243 N 0.135 -244 G 0.126 -245 S 0.117 -246 V 0.106 -247 P 0.096 -248 G 0.094 -249 D 0.100 -250 R 0.105 -251 I 0.104 -252 T 0.098 -253 F 0.097 -254 D 0.105 -255 A 0.120 -256 F 0.135 -257 P 0.147 -258 G 0.153 -259 E 0.154 -260 P 0.149 -261 D 0.143 -262 K 0.143 -263 E 0.147 -264 L 0.145 -265 N 0.133 -266 P 0.118 -267 K 0.107 -268 K 0.103 -269 K 0.101 -270 I 0.095 -271 W 0.084 -272 E 0.076 -273 Q 0.078 -274 I 0.086 -275 Q 0.088 -276 P 0.086 -277 D 0.083 -278 L 0.085 -279 H 0.092 -280 T 0.102 -281 N 0.117 -282 D 0.134 -283 E 0.149 -284 C 0.151 -285 V 0.138 -286 A 0.116 -287 T 0.096 -288 Y 0.087 -289 K 0.092 -290 G 0.107 -291 V 0.114 -292 P 0.103 -293 F 0.084 -294 E 0.072 -295 V 0.076 -296 K 0.091 -297 G 0.108 -298 K 0.117 -299 G 0.117 -300 V 0.111 -301 C 0.106 -302 R 0.103 -303 A 0.106 -304 Q 0.116 -305 T 0.132 -306 M 0.152 -307 S 0.172 -308 N 0.190 -309 S 0.201 -310 G 0.199 -311 I 0.186 -312 K 0.174 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000164022.19_ENST00000672341.1_GN:AIMP1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:9.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000164022.19_ENST00000672341.1_GN:AIMP1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:9.caid deleted file mode 100644 index 6c3bb274cc6a10ef5a8c54b81e46f68c3ecb1c16..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000164022.19_ENST00000672341.1_GN:AIMP1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:9.caid +++ /dev/null @@ -1,322 +0,0 @@ ->ENSG00000164022.19|ENST00000672341.1|GN:AIMP1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:9 -1 M 0.201 -2 I 0.190 -3 F 0.177 -4 C 0.163 -5 R 0.152 -6 L 0.152 -7 L 0.170 -8 A 0.205 -9 K 0.244 -10 M 0.284 -11 A 0.320 -12 N 0.330 -13 N 0.302 -14 D 0.253 -15 A 0.216 -16 V 0.198 -17 L 0.188 -18 K 0.180 -19 R 0.179 -20 L 0.186 -21 E 0.195 -22 Q 0.203 -23 K 0.215 -24 G 0.231 -25 A 0.247 -26 E 0.260 -27 A 0.260 -28 D 0.242 -29 Q 0.219 -30 I 0.200 -31 I 0.182 -32 E 0.164 -33 Y 0.150 -34 L 0.145 -35 K 0.151 -36 Q 0.158 -37 Q 0.157 -38 V 0.143 -39 S 0.129 -40 L 0.125 -41 L 0.131 -42 K 0.140 -43 E 0.151 -44 K 0.164 -45 A 0.181 -46 I 0.196 -47 L 0.205 -48 Q 0.209 -49 A 0.212 -50 T 0.213 -51 L 0.215 -52 R 0.220 -53 E 0.221 -54 E 0.212 -55 K 0.198 -56 K 0.185 -57 L 0.176 -58 R 0.176 -59 V 0.189 -60 E 0.206 -61 N 0.212 -62 A 0.211 -63 K 0.219 -64 L 0.238 -65 K 0.254 -66 K 0.262 -67 E 0.266 -68 I 0.262 -69 E 0.247 -70 E 0.231 -71 L 0.221 -72 K 0.215 -73 Q 0.210 -74 E 0.207 -75 L 0.201 -76 I 0.193 -77 Q 0.191 -78 A 0.192 -79 E 0.188 -80 I 0.193 -81 Q 0.221 -82 N 0.272 -83 G 0.328 -84 V 0.370 -85 K 0.401 -86 Q 0.441 -87 I 0.497 -88 P 0.557 -89 F 0.611 -90 P 0.656 -91 S 0.685 -92 G 0.698 -93 T 0.706 -94 P 0.717 -95 L 0.733 -96 H 0.751 -97 A 0.764 -98 N 0.767 -99 S 0.759 -100 M 0.751 -101 V 0.749 -102 S 0.749 -103 E 0.749 -104 N 0.742 -105 V 0.731 -106 I 0.724 -107 Q 0.725 -108 S 0.730 -109 T 0.736 -110 A 0.743 -111 V 0.752 -112 T 0.760 -113 T 0.764 -114 V 0.763 -115 S 0.760 -116 S 0.760 -117 G 0.763 -118 T 0.765 -119 K 0.768 -120 E 0.770 -121 Q 0.770 -122 I 0.766 -123 K 0.761 -124 G 0.755 -125 G 0.745 -126 T 0.734 -127 G 0.720 -128 D 0.698 -129 E 0.650 -130 K 0.580 -131 K 0.521 -132 A 0.498 -133 K 0.492 -134 E 0.493 -135 K 0.512 -136 I 0.532 -137 E 0.524 -138 K 0.515 -139 K 0.545 -140 G 0.597 -141 E 0.636 -142 K 0.656 -143 K 0.673 -144 E 0.690 -145 K 0.703 -146 K 0.710 -147 Q 0.716 -148 Q 0.723 -149 S 0.734 -150 I 0.745 -151 A 0.750 -152 G 0.744 -153 S 0.724 -154 A 0.687 -155 D 0.626 -156 S 0.540 -157 K 0.432 -158 P 0.319 -159 I 0.218 -160 D 0.144 -161 V 0.101 -162 S 0.083 -163 R 0.075 -164 L 0.064 -165 D 0.051 -166 L 0.039 -167 R 0.033 -168 I 0.031 -169 G 0.031 -170 C 0.030 -171 I 0.030 -172 I 0.032 -173 T 0.037 -174 A 0.044 -175 R 0.053 -176 K 0.064 -177 H 0.073 -178 P 0.077 -179 D 0.076 -180 A 0.071 -181 D 0.064 -182 S 0.054 -183 L 0.043 -184 Y 0.033 -185 V 0.026 -186 E 0.024 -187 E 0.025 -188 V 0.029 -189 D 0.034 -190 V 0.038 -191 G 0.041 -192 E 0.042 -193 I 0.041 -194 A 0.040 -195 P 0.039 -196 R 0.037 -197 T 0.035 -198 V 0.033 -199 V 0.034 -200 S 0.038 -201 G 0.043 -202 L 0.046 -203 V 0.046 -204 N 0.045 -205 H 0.044 -206 V 0.042 -207 P 0.040 -208 L 0.037 -209 E 0.037 -210 Q 0.040 -211 M 0.046 -212 Q 0.054 -213 N 0.062 -214 R 0.066 -215 M 0.066 -216 V 0.064 -217 I 0.066 -218 L 0.073 -219 L 0.082 -220 C 0.088 -221 N 0.090 -222 L 0.093 -223 K 0.101 -224 P 0.110 -225 A 0.115 -226 K 0.114 -227 M 0.108 -228 R 0.104 -229 G 0.108 -230 V 0.118 -231 L 0.121 -232 S 0.112 -233 Q 0.095 -234 A 0.080 -235 M 0.071 -236 V 0.066 -237 M 0.064 -238 C 0.066 -239 A 0.072 -240 S 0.079 -241 S 0.086 -242 P 0.091 -243 E 0.094 -244 K 0.094 -245 I 0.092 -246 E 0.091 -247 I 0.095 -248 L 0.107 -249 A 0.125 -250 P 0.139 -251 P 0.142 -252 N 0.135 -253 G 0.126 -254 S 0.117 -255 V 0.106 -256 P 0.096 -257 G 0.094 -258 D 0.100 -259 R 0.105 -260 I 0.104 -261 T 0.098 -262 F 0.098 -263 D 0.106 -264 A 0.122 -265 F 0.138 -266 P 0.149 -267 G 0.155 -268 E 0.155 -269 P 0.150 -270 D 0.144 -271 K 0.145 -272 E 0.149 -273 L 0.146 -274 N 0.134 -275 P 0.119 -276 K 0.108 -277 K 0.104 -278 K 0.102 -279 I 0.095 -280 W 0.084 -281 E 0.077 -282 Q 0.079 -283 I 0.086 -284 Q 0.089 -285 P 0.086 -286 D 0.084 -287 L 0.086 -288 H 0.092 -289 T 0.103 -290 N 0.118 -291 D 0.135 -292 E 0.149 -293 C 0.152 -294 V 0.139 -295 A 0.117 -296 T 0.097 -297 Y 0.088 -298 K 0.093 -299 G 0.107 -300 V 0.114 -301 P 0.104 -302 F 0.084 -303 E 0.073 -304 V 0.077 -305 K 0.092 -306 G 0.109 -307 K 0.118 -308 G 0.117 -309 V 0.111 -310 C 0.106 -311 R 0.104 -312 A 0.107 -313 Q 0.117 -314 T 0.133 -315 M 0.153 -316 S 0.173 -317 N 0.191 -318 S 0.203 -319 G 0.201 -320 I 0.187 -321 K 0.176 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000164690.8_ENST00000297261.7_GN:SHH_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000164690.8_ENST00000297261.7_GN:SHH_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 7e08609e3ebb44d470e8f90eb614c112add39ed5..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000164690.8_ENST00000297261.7_GN:SHH_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,463 +0,0 @@ ->ENSG00000164690.8|ENST00000297261.7|GN:SHH|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.176 -2 L 0.164 -3 L 0.151 -4 L 0.144 -5 A 0.144 -6 R 0.145 -7 C 0.143 -8 L 0.139 -9 L 0.139 -10 L 0.142 -11 V 0.148 -12 L 0.161 -13 V 0.181 -14 S 0.202 -15 S 0.221 -16 L 0.240 -17 L 0.265 -18 V 0.298 -19 C 0.333 -20 S 0.366 -21 G 0.396 -22 L 0.426 -23 A 0.459 -24 C 0.496 -25 G 0.535 -26 P 0.570 -27 G 0.594 -28 R 0.605 -29 G 0.608 -30 F 0.606 -31 G 0.599 -32 K 0.585 -33 R 0.568 -34 R 0.551 -35 H 0.532 -36 P 0.503 -37 K 0.460 -38 K 0.407 -39 L 0.353 -40 T 0.305 -41 P 0.268 -42 L 0.239 -43 A 0.210 -44 Y 0.182 -45 K 0.160 -46 Q 0.148 -47 F 0.144 -48 I 0.143 -49 P 0.142 -50 N 0.138 -51 V 0.130 -52 A 0.123 -53 E 0.121 -54 K 0.129 -55 T 0.141 -56 L 0.153 -57 G 0.165 -58 A 0.175 -59 S 0.176 -60 G 0.168 -61 R 0.157 -62 Y 0.152 -63 E 0.156 -64 G 0.164 -65 K 0.164 -66 I 0.155 -67 S 0.145 -68 R 0.138 -69 N 0.135 -70 S 0.134 -71 E 0.133 -72 R 0.136 -73 F 0.142 -74 K 0.149 -75 E 0.156 -76 L 0.167 -77 T 0.180 -78 P 0.195 -79 N 0.205 -80 Y 0.205 -81 N 0.193 -82 P 0.176 -83 D 0.163 -84 I 0.160 -85 I 0.165 -86 F 0.175 -87 K 0.189 -88 D 0.205 -89 E 0.221 -90 E 0.236 -91 N 0.250 -92 T 0.263 -93 G 0.264 -94 A 0.243 -95 D 0.203 -96 R 0.163 -97 L 0.137 -98 M 0.120 -99 T 0.103 -100 Q 0.083 -101 R 0.070 -102 C 0.068 -103 K 0.074 -104 D 0.080 -105 K 0.079 -106 L 0.074 -107 N 0.071 -108 A 0.071 -109 L 0.075 -110 A 0.078 -111 I 0.076 -112 S 0.069 -113 V 0.062 -114 M 0.057 -115 N 0.055 -116 Q 0.057 -117 W 0.066 -118 P 0.079 -119 G 0.092 -120 V 0.102 -121 K 0.113 -122 L 0.128 -123 R 0.148 -124 V 0.171 -125 T 0.193 -126 E 0.209 -127 G 0.218 -128 W 0.218 -129 D 0.210 -130 E 0.201 -131 D 0.199 -132 G 0.204 -133 H 0.209 -134 H 0.213 -135 S 0.220 -136 E 0.237 -137 E 0.256 -138 S 0.260 -139 L 0.243 -140 H 0.221 -141 Y 0.208 -142 E 0.195 -143 G 0.170 -144 R 0.135 -145 A 0.103 -146 V 0.083 -147 D 0.073 -148 I 0.070 -149 T 0.069 -150 T 0.073 -151 S 0.080 -152 D 0.088 -153 R 0.098 -154 D 0.105 -155 R 0.103 -156 S 0.093 -157 K 0.080 -158 Y 0.072 -159 G 0.072 -160 M 0.076 -161 L 0.077 -162 A 0.074 -163 R 0.071 -164 L 0.069 -165 A 0.069 -166 V 0.074 -167 E 0.083 -168 A 0.095 -169 G 0.105 -170 F 0.108 -171 D 0.100 -172 W 0.085 -173 V 0.072 -174 Y 0.067 -175 Y 0.069 -176 E 0.076 -177 S 0.079 -178 K 0.076 -179 A 0.068 -180 H 0.059 -181 I 0.054 -182 H 0.053 -183 C 0.058 -184 S 0.073 -185 V 0.106 -186 K 0.161 -187 A 0.226 -188 E 0.288 -189 N 0.340 -190 S 0.376 -191 V 0.389 -192 A 0.376 -193 A 0.346 -194 K 0.300 -195 S 0.240 -196 G 0.176 -197 G 0.125 -198 C 0.092 -199 F 0.077 -200 P 0.072 -201 G 0.068 -202 S 0.062 -203 A 0.053 -204 T 0.047 -205 V 0.046 -206 H 0.050 -207 L 0.057 -208 E 0.065 -209 Q 0.076 -210 G 0.083 -211 G 0.082 -212 T 0.075 -213 K 0.067 -214 L 0.065 -215 V 0.073 -216 K 0.090 -217 D 0.105 -218 L 0.108 -219 S 0.098 -220 P 0.087 -221 G 0.083 -222 D 0.088 -223 R 0.093 -224 V 0.095 -225 L 0.097 -226 A 0.100 -227 A 0.102 -228 D 0.100 -229 D 0.095 -230 Q 0.091 -231 G 0.090 -232 R 0.087 -233 L 0.079 -234 L 0.066 -235 Y 0.050 -236 S 0.038 -237 D 0.031 -238 F 0.028 -239 L 0.030 -240 T 0.035 -241 F 0.042 -242 L 0.051 -243 D 0.057 -244 R 0.061 -245 D 0.065 -246 D 0.069 -247 G 0.074 -248 A 0.073 -249 K 0.065 -250 K 0.052 -251 V 0.040 -252 F 0.030 -253 Y 0.027 -254 V 0.030 -255 I 0.036 -256 E 0.043 -257 T 0.046 -258 R 0.046 -259 E 0.046 -260 P 0.053 -261 R 0.063 -262 E 0.068 -263 R 0.064 -264 L 0.058 -265 L 0.055 -266 L 0.057 -267 T 0.060 -268 A 0.060 -269 A 0.055 -270 H 0.048 -271 L 0.043 -272 L 0.045 -273 F 0.059 -274 V 0.092 -275 A 0.146 -276 P 0.221 -277 H 0.309 -278 N 0.395 -279 D 0.463 -280 S 0.508 -281 A 0.537 -282 T 0.557 -283 G 0.574 -284 E 0.592 -285 P 0.613 -286 E 0.634 -287 A 0.649 -288 S 0.655 -289 S 0.650 -290 G 0.633 -291 S 0.605 -292 G 0.579 -293 P 0.569 -294 P 0.575 -295 S 0.577 -296 G 0.553 -297 G 0.498 -298 A 0.418 -299 L 0.330 -300 G 0.254 -301 P 0.197 -302 R 0.151 -303 A 0.107 -304 L 0.074 -305 F 0.059 -306 A 0.061 -307 S 0.072 -308 R 0.084 -309 V 0.088 -310 R 0.083 -311 P 0.076 -312 G 0.071 -313 Q 0.069 -314 R 0.064 -315 V 0.057 -316 Y 0.055 -317 V 0.060 -318 V 0.073 -319 A 0.090 -320 E 0.108 -321 R 0.123 -322 D 0.135 -323 G 0.141 -324 D 0.141 -325 R 0.135 -326 R 0.121 -327 L 0.105 -328 L 0.089 -329 P 0.072 -330 A 0.057 -331 A 0.045 -332 V 0.039 -333 H 0.038 -334 S 0.041 -335 V 0.045 -336 T 0.050 -337 L 0.054 -338 S 0.059 -339 E 0.064 -340 E 0.070 -341 A 0.075 -342 A 0.075 -343 G 0.074 -344 A 0.073 -345 Y 0.076 -346 A 0.081 -347 P 0.084 -348 L 0.086 -349 T 0.095 -350 A 0.112 -351 Q 0.125 -352 G 0.126 -353 T 0.119 -354 I 0.118 -355 L 0.123 -356 I 0.122 -357 N 0.111 -358 R 0.096 -359 V 0.081 -360 L 0.070 -361 A 0.066 -362 S 0.070 -363 C 0.080 -364 Y 0.092 -365 A 0.104 -366 V 0.111 -367 I 0.110 -368 E 0.103 -369 E 0.095 -370 H 0.091 -371 S 0.090 -372 W 0.093 -373 A 0.102 -374 H 0.115 -375 R 0.129 -376 A 0.142 -377 F 0.154 -378 A 0.156 -379 P 0.146 -380 F 0.131 -381 R 0.117 -382 L 0.108 -383 A 0.105 -384 H 0.107 -385 A 0.111 -386 L 0.116 -387 L 0.128 -388 A 0.154 -389 A 0.201 -390 L 0.272 -391 A 0.365 -392 P 0.458 -393 A 0.528 -394 R 0.574 -395 T 0.605 -396 D 0.628 -397 R 0.649 -398 G 0.666 -399 G 0.680 -400 D 0.691 -401 S 0.697 -402 G 0.701 -403 G 0.704 -404 G 0.707 -405 D 0.703 -406 R 0.695 -407 G 0.689 -408 G 0.690 -409 G 0.696 -410 G 0.698 -411 G 0.691 -412 R 0.676 -413 V 0.656 -414 A 0.637 -415 L 0.621 -416 T 0.619 -417 A 0.639 -418 P 0.673 -419 G 0.698 -420 A 0.700 -421 A 0.683 -422 D 0.667 -423 A 0.665 -424 P 0.678 -425 G 0.688 -426 A 0.674 -427 G 0.628 -428 A 0.553 -429 T 0.470 -430 A 0.397 -431 G 0.338 -432 I 0.287 -433 H 0.237 -434 W 0.186 -435 Y 0.143 -436 S 0.117 -437 Q 0.107 -438 L 0.106 -439 L 0.108 -440 Y 0.111 -441 Q 0.115 -442 I 0.119 -443 G 0.127 -444 T 0.139 -445 W 0.154 -446 L 0.175 -447 L 0.209 -448 D 0.255 -449 S 0.299 -450 E 0.327 -451 A 0.343 -452 L 0.358 -453 H 0.374 -454 P 0.383 -455 L 0.383 -456 G 0.385 -457 M 0.404 -458 A 0.437 -459 V 0.459 -460 K 0.455 -461 S 0.433 -462 S 0.413 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000164690.8_ENST00000297261.7_GN:SHH_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000164690.8_ENST00000297261.7_GN:SHH_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid deleted file mode 100644 index c09d233c216819e9827e1bd38e600d5de9c6acf4..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000164690.8_ENST00000297261.7_GN:SHH_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid +++ /dev/null @@ -1,466 +0,0 @@ ->ENSG00000164690.8|ENST00000297261.7|GN:SHH|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 -1 M 0.281 -2 G 0.265 -3 E 0.229 -4 M 0.185 -5 L 0.149 -6 L 0.129 -7 L 0.119 -8 A 0.116 -9 R 0.118 -10 C 0.123 -11 L 0.129 -12 L 0.136 -13 L 0.144 -14 V 0.152 -15 L 0.162 -16 V 0.174 -17 S 0.187 -18 S 0.200 -19 L 0.217 -20 L 0.245 -21 V 0.283 -22 C 0.323 -23 S 0.359 -24 G 0.390 -25 L 0.418 -26 A 0.450 -27 C 0.489 -28 G 0.530 -29 P 0.567 -30 G 0.593 -31 R 0.605 -32 G 0.608 -33 F 0.607 -34 G 0.602 -35 K 0.590 -36 R 0.574 -37 R 0.557 -38 H 0.537 -39 P 0.508 -40 K 0.465 -41 K 0.411 -42 L 0.356 -43 T 0.307 -44 P 0.269 -45 L 0.239 -46 A 0.210 -47 Y 0.182 -48 K 0.160 -49 Q 0.148 -50 F 0.144 -51 I 0.143 -52 P 0.141 -53 N 0.137 -54 V 0.130 -55 A 0.122 -56 E 0.120 -57 K 0.128 -58 T 0.139 -59 L 0.151 -60 G 0.163 -61 A 0.173 -62 S 0.174 -63 G 0.166 -64 R 0.155 -65 Y 0.151 -66 E 0.155 -67 G 0.162 -68 K 0.163 -69 I 0.154 -70 S 0.143 -71 R 0.137 -72 N 0.134 -73 S 0.133 -74 E 0.132 -75 R 0.135 -76 F 0.141 -77 K 0.148 -78 E 0.156 -79 L 0.167 -80 T 0.180 -81 P 0.194 -82 N 0.205 -83 Y 0.205 -84 N 0.193 -85 P 0.175 -86 D 0.163 -87 I 0.160 -88 I 0.165 -89 F 0.176 -90 K 0.190 -91 D 0.206 -92 E 0.222 -93 E 0.236 -94 N 0.250 -95 T 0.263 -96 G 0.265 -97 A 0.243 -98 D 0.203 -99 R 0.163 -100 L 0.137 -101 M 0.120 -102 T 0.103 -103 Q 0.083 -104 R 0.070 -105 C 0.068 -106 K 0.074 -107 D 0.080 -108 K 0.079 -109 L 0.074 -110 N 0.071 -111 A 0.071 -112 L 0.075 -113 A 0.078 -114 I 0.076 -115 S 0.069 -116 V 0.062 -117 M 0.057 -118 N 0.055 -119 Q 0.057 -120 W 0.066 -121 P 0.080 -122 G 0.092 -123 V 0.103 -124 K 0.114 -125 L 0.129 -126 R 0.148 -127 V 0.172 -128 T 0.194 -129 E 0.210 -130 G 0.219 -131 W 0.220 -132 D 0.211 -133 E 0.202 -134 D 0.201 -135 G 0.205 -136 H 0.210 -137 H 0.214 -138 S 0.221 -139 E 0.238 -140 E 0.257 -141 S 0.261 -142 L 0.244 -143 H 0.222 -144 Y 0.209 -145 E 0.196 -146 G 0.171 -147 R 0.136 -148 A 0.103 -149 V 0.083 -150 D 0.074 -151 I 0.070 -152 T 0.070 -153 T 0.073 -154 S 0.080 -155 D 0.089 -156 R 0.098 -157 D 0.105 -158 R 0.103 -159 S 0.093 -160 K 0.080 -161 Y 0.072 -162 G 0.072 -163 M 0.076 -164 L 0.077 -165 A 0.074 -166 R 0.071 -167 L 0.069 -168 A 0.069 -169 V 0.074 -170 E 0.084 -171 A 0.095 -172 G 0.105 -173 F 0.108 -174 D 0.100 -175 W 0.085 -176 V 0.072 -177 Y 0.067 -178 Y 0.069 -179 E 0.075 -180 S 0.079 -181 K 0.075 -182 A 0.067 -183 H 0.059 -184 I 0.053 -185 H 0.053 -186 C 0.058 -187 S 0.073 -188 V 0.107 -189 K 0.162 -190 A 0.228 -191 E 0.291 -192 N 0.342 -193 S 0.378 -194 V 0.391 -195 A 0.378 -196 A 0.347 -197 K 0.301 -198 S 0.240 -199 G 0.176 -200 G 0.125 -201 C 0.092 -202 F 0.077 -203 P 0.072 -204 G 0.068 -205 S 0.062 -206 A 0.053 -207 T 0.046 -208 V 0.046 -209 H 0.050 -210 L 0.057 -211 E 0.065 -212 Q 0.076 -213 G 0.083 -214 G 0.082 -215 T 0.075 -216 K 0.067 -217 L 0.065 -218 V 0.073 -219 K 0.090 -220 D 0.105 -221 L 0.108 -222 S 0.098 -223 P 0.087 -224 G 0.084 -225 D 0.088 -226 R 0.093 -227 V 0.095 -228 L 0.097 -229 A 0.100 -230 A 0.102 -231 D 0.100 -232 D 0.095 -233 Q 0.091 -234 G 0.090 -235 R 0.087 -236 L 0.079 -237 L 0.066 -238 Y 0.050 -239 S 0.038 -240 D 0.031 -241 F 0.028 -242 L 0.030 -243 T 0.035 -244 F 0.042 -245 L 0.051 -246 D 0.057 -247 R 0.061 -248 D 0.065 -249 D 0.069 -250 G 0.074 -251 A 0.073 -252 K 0.065 -253 K 0.052 -254 V 0.040 -255 F 0.030 -256 Y 0.027 -257 V 0.030 -258 I 0.036 -259 E 0.043 -260 T 0.046 -261 R 0.046 -262 E 0.046 -263 P 0.053 -264 R 0.063 -265 E 0.068 -266 R 0.064 -267 L 0.058 -268 L 0.055 -269 L 0.057 -270 T 0.060 -271 A 0.060 -272 A 0.055 -273 H 0.048 -274 L 0.043 -275 L 0.045 -276 F 0.060 -277 V 0.092 -278 A 0.146 -279 P 0.221 -280 H 0.309 -281 N 0.395 -282 D 0.463 -283 S 0.508 -284 A 0.537 -285 T 0.557 -286 G 0.574 -287 E 0.592 -288 P 0.613 -289 E 0.634 -290 A 0.649 -291 S 0.655 -292 S 0.651 -293 G 0.634 -294 S 0.606 -295 G 0.580 -296 P 0.570 -297 P 0.576 -298 S 0.578 -299 G 0.554 -300 G 0.499 -301 A 0.419 -302 L 0.330 -303 G 0.254 -304 P 0.198 -305 R 0.151 -306 A 0.108 -307 L 0.074 -308 F 0.059 -309 A 0.061 -310 S 0.072 -311 R 0.084 -312 V 0.088 -313 R 0.083 -314 P 0.076 -315 G 0.072 -316 Q 0.069 -317 R 0.064 -318 V 0.058 -319 Y 0.055 -320 V 0.060 -321 V 0.074 -322 A 0.091 -323 E 0.108 -324 R 0.124 -325 D 0.136 -326 G 0.141 -327 D 0.142 -328 R 0.135 -329 R 0.122 -330 L 0.106 -331 L 0.089 -332 P 0.073 -333 A 0.057 -334 A 0.045 -335 V 0.039 -336 H 0.038 -337 S 0.041 -338 V 0.045 -339 T 0.050 -340 L 0.055 -341 S 0.059 -342 E 0.065 -343 E 0.071 -344 A 0.075 -345 A 0.076 -346 G 0.074 -347 A 0.073 -348 Y 0.076 -349 A 0.081 -350 P 0.085 -351 L 0.087 -352 T 0.095 -353 A 0.112 -354 Q 0.126 -355 G 0.126 -356 T 0.120 -357 I 0.119 -358 L 0.124 -359 I 0.123 -360 N 0.112 -361 R 0.096 -362 V 0.081 -363 L 0.070 -364 A 0.066 -365 S 0.070 -366 C 0.080 -367 Y 0.093 -368 A 0.104 -369 V 0.111 -370 I 0.110 -371 E 0.103 -372 E 0.095 -373 H 0.091 -374 S 0.090 -375 W 0.093 -376 A 0.101 -377 H 0.115 -378 R 0.129 -379 A 0.142 -380 F 0.154 -381 A 0.157 -382 P 0.147 -383 F 0.130 -384 R 0.117 -385 L 0.108 -386 A 0.105 -387 H 0.107 -388 A 0.111 -389 L 0.116 -390 L 0.128 -391 A 0.154 -392 A 0.200 -393 L 0.271 -394 A 0.365 -395 P 0.458 -396 A 0.528 -397 R 0.574 -398 T 0.605 -399 D 0.628 -400 R 0.648 -401 G 0.666 -402 G 0.680 -403 D 0.690 -404 S 0.696 -405 G 0.700 -406 G 0.704 -407 G 0.706 -408 D 0.703 -409 R 0.695 -410 G 0.689 -411 G 0.690 -412 G 0.696 -413 G 0.699 -414 G 0.692 -415 R 0.677 -416 V 0.659 -417 A 0.640 -418 L 0.624 -419 T 0.622 -420 A 0.642 -421 P 0.675 -422 G 0.700 -423 A 0.702 -424 A 0.685 -425 D 0.668 -426 A 0.667 -427 P 0.679 -428 G 0.689 -429 A 0.675 -430 G 0.628 -431 A 0.554 -432 T 0.471 -433 A 0.398 -434 G 0.338 -435 I 0.287 -436 H 0.238 -437 W 0.187 -438 Y 0.143 -439 S 0.118 -440 Q 0.108 -441 L 0.106 -442 L 0.108 -443 Y 0.112 -444 Q 0.115 -445 I 0.119 -446 G 0.128 -447 T 0.140 -448 W 0.154 -449 L 0.175 -450 L 0.210 -451 D 0.257 -452 S 0.302 -453 E 0.330 -454 A 0.345 -455 L 0.360 -456 H 0.376 -457 P 0.385 -458 L 0.384 -459 G 0.386 -460 M 0.406 -461 A 0.439 -462 V 0.461 -463 K 0.458 -464 S 0.436 -465 S 0.415 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000164749.13_ENST00000396423.4_GN:HNF4G_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000164749.13_ENST00000396423.4_GN:HNF4G_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index d18a0298ed47a91035e35725a60558d994a2c742..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000164749.13_ENST00000396423.4_GN:HNF4G_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,456 +0,0 @@ ->ENSG00000164749.13|ENST00000396423.4|GN:HNF4G|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.375 -2 M 0.391 -3 R 0.417 -4 V 0.446 -5 S 0.477 -6 E 0.508 -7 P 0.533 -8 I 0.542 -9 L 0.538 -10 D 0.529 -11 M 0.513 -12 D 0.489 -13 M 0.467 -14 A 0.460 -15 N 0.466 -16 Y 0.477 -17 S 0.488 -18 E 0.487 -19 V 0.470 -20 L 0.451 -21 D 0.446 -22 P 0.445 -23 T 0.430 -24 Y 0.400 -25 T 0.370 -26 T 0.341 -27 L 0.311 -28 E 0.278 -29 F 0.245 -30 E 0.214 -31 T 0.197 -32 M 0.197 -33 Q 0.213 -34 I 0.244 -35 L 0.297 -36 Y 0.372 -37 N 0.454 -38 S 0.523 -39 S 0.570 -40 D 0.599 -41 S 0.615 -42 S 0.621 -43 A 0.627 -44 P 0.643 -45 E 0.668 -46 T 0.691 -47 S 0.703 -48 M 0.706 -49 N 0.702 -50 T 0.693 -51 T 0.686 -52 D 0.681 -53 N 0.666 -54 G 0.616 -55 V 0.514 -56 N 0.373 -57 C 0.232 -58 L 0.129 -59 C 0.071 -60 A 0.047 -61 I 0.045 -62 C 0.061 -63 G 0.089 -64 D 0.120 -65 R 0.148 -66 A 0.174 -67 T 0.198 -68 G 0.210 -69 K 0.199 -70 H 0.181 -71 Y 0.179 -72 G 0.187 -73 A 0.182 -74 S 0.165 -75 S 0.148 -76 C 0.131 -77 D 0.111 -78 G 0.097 -79 C 0.089 -80 K 0.081 -81 G 0.072 -82 F 0.069 -83 F 0.068 -84 R 0.067 -85 R 0.067 -86 S 0.073 -87 I 0.080 -88 R 0.087 -89 K 0.091 -90 S 0.091 -91 H 0.089 -92 V 0.083 -93 Y 0.076 -94 S 0.069 -95 C 0.065 -96 R 0.063 -97 F 0.059 -98 S 0.054 -99 R 0.050 -100 Q 0.052 -101 C 0.060 -102 V 0.072 -103 V 0.082 -104 D 0.085 -105 K 0.084 -106 D 0.087 -107 K 0.094 -108 R 0.102 -109 N 0.107 -110 Q 0.111 -111 C 0.106 -112 R 0.093 -113 Y 0.080 -114 C 0.074 -115 R 0.073 -116 L 0.072 -117 R 0.068 -118 K 0.063 -119 C 0.061 -120 F 0.062 -121 R 0.067 -122 A 0.073 -123 G 0.081 -124 M 0.091 -125 K 0.107 -126 K 0.132 -127 E 0.162 -128 A 0.187 -129 V 0.203 -130 Q 0.226 -131 N 0.273 -132 E 0.346 -133 R 0.427 -134 D 0.494 -135 R 0.536 -136 I 0.554 -137 S 0.558 -138 T 0.557 -139 R 0.556 -140 R 0.557 -141 S 0.557 -142 T 0.557 -143 F 0.553 -144 D 0.532 -145 G 0.477 -146 S 0.397 -147 N 0.309 -148 I 0.230 -149 P 0.165 -150 S 0.122 -151 I 0.095 -152 N 0.076 -153 T 0.065 -154 L 0.066 -155 A 0.075 -156 Q 0.082 -157 A 0.082 -158 E 0.080 -159 V 0.079 -160 R 0.084 -161 S 0.099 -162 R 0.128 -163 Q 0.169 -164 I 0.217 -165 S 0.273 -166 V 0.338 -167 S 0.414 -168 S 0.492 -169 P 0.563 -170 G 0.615 -171 S 0.641 -172 S 0.640 -173 T 0.617 -174 D 0.578 -175 I 0.525 -176 N 0.462 -177 V 0.393 -178 K 0.326 -179 K 0.278 -180 I 0.250 -181 A 0.222 -182 S 0.182 -183 I 0.143 -184 G 0.124 -185 D 0.119 -186 V 0.112 -187 C 0.103 -188 E 0.096 -189 S 0.093 -190 M 0.092 -191 K 0.093 -192 Q 0.092 -193 Q 0.086 -194 L 0.074 -195 L 0.064 -196 V 0.060 -197 L 0.062 -198 V 0.067 -199 E 0.069 -200 W 0.062 -201 A 0.055 -202 K 0.053 -203 Y 0.057 -204 I 0.060 -205 P 0.060 -206 A 0.058 -207 F 0.057 -208 C 0.059 -209 E 0.066 -210 L 0.073 -211 P 0.077 -212 L 0.074 -213 D 0.066 -214 D 0.056 -215 Q 0.048 -216 V 0.047 -217 A 0.052 -218 L 0.060 -219 L 0.064 -220 R 0.060 -221 A 0.050 -222 H 0.042 -223 A 0.037 -224 G 0.037 -225 E 0.037 -226 H 0.037 -227 L 0.038 -228 L 0.040 -229 L 0.040 -230 G 0.040 -231 A 0.042 -232 T 0.045 -233 K 0.046 -234 R 0.045 -235 S 0.045 -236 M 0.048 -237 M 0.056 -238 Y 0.065 -239 K 0.068 -240 D 0.066 -241 I 0.061 -242 L 0.057 -243 L 0.057 -244 L 0.067 -245 G 0.086 -246 N 0.104 -247 N 0.110 -248 Y 0.102 -249 V 0.089 -250 I 0.085 -251 H 0.097 -252 R 0.122 -253 N 0.145 -254 S 0.157 -255 C 0.155 -256 E 0.142 -257 V 0.122 -258 E 0.099 -259 I 0.079 -260 S 0.065 -261 R 0.060 -262 V 0.062 -263 A 0.067 -264 N 0.076 -265 R 0.088 -266 V 0.099 -267 L 0.107 -268 D 0.105 -269 E 0.093 -270 L 0.075 -271 V 0.062 -272 R 0.055 -273 P 0.053 -274 F 0.055 -275 Q 0.062 -276 E 0.072 -277 I 0.076 -278 Q 0.073 -279 I 0.066 -280 D 0.058 -281 D 0.053 -282 N 0.049 -283 E 0.048 -284 Y 0.048 -285 A 0.047 -286 C 0.049 -287 L 0.052 -288 K 0.055 -289 A 0.054 -290 I 0.051 -291 V 0.046 -292 F 0.043 -293 F 0.047 -294 D 0.062 -295 P 0.084 -296 D 0.103 -297 A 0.111 -298 K 0.107 -299 G 0.097 -300 L 0.089 -301 S 0.086 -302 D 0.086 -303 P 0.083 -304 V 0.077 -305 K 0.073 -306 I 0.077 -307 K 0.089 -308 N 0.100 -309 M 0.097 -310 R 0.082 -311 F 0.066 -312 Q 0.061 -313 V 0.064 -314 Q 0.067 -315 I 0.066 -316 G 0.063 -317 L 0.061 -318 E 0.061 -319 D 0.059 -320 Y 0.057 -321 I 0.058 -322 N 0.062 -323 D 0.068 -324 R 0.077 -325 Q 0.091 -326 Y 0.106 -327 D 0.120 -328 S 0.130 -329 R 0.128 -330 G 0.110 -331 R 0.086 -332 F 0.069 -333 G 0.065 -334 E 0.069 -335 L 0.076 -336 L 0.083 -337 L 0.091 -338 L 0.100 -339 L 0.104 -340 P 0.103 -341 T 0.103 -342 L 0.109 -343 Q 0.116 -344 S 0.120 -345 I 0.116 -346 T 0.104 -347 W 0.091 -348 Q 0.086 -349 M 0.091 -350 I 0.098 -351 E 0.096 -352 Q 0.085 -353 I 0.072 -354 Q 0.062 -355 F 0.057 -356 V 0.056 -357 K 0.056 -358 L 0.062 -359 F 0.077 -360 G 0.096 -361 M 0.106 -362 V 0.105 -363 K 0.099 -364 I 0.090 -365 D 0.078 -366 N 0.064 -367 L 0.054 -368 L 0.052 -369 Q 0.058 -370 E 0.070 -371 M 0.092 -372 L 0.141 -373 L 0.228 -374 G 0.348 -375 G 0.473 -376 A 0.570 -377 S 0.625 -378 N 0.646 -379 D 0.648 -380 G 0.643 -381 S 0.633 -382 H 0.621 -383 L 0.608 -384 H 0.599 -385 H 0.600 -386 P 0.614 -387 M 0.636 -388 H 0.668 -389 P 0.702 -390 H 0.721 -391 L 0.713 -392 S 0.685 -393 Q 0.657 -394 D 0.642 -395 P 0.638 -396 L 0.650 -397 T 0.678 -398 G 0.710 -399 Q 0.727 -400 T 0.727 -401 I 0.716 -402 L 0.702 -403 L 0.692 -404 G 0.694 -405 P 0.707 -406 M 0.723 -407 S 0.734 -408 T 0.741 -409 L 0.747 -410 V 0.753 -411 H 0.758 -412 A 0.763 -413 D 0.762 -414 Q 0.749 -415 I 0.728 -416 S 0.712 -417 T 0.708 -418 P 0.708 -419 E 0.704 -420 T 0.694 -421 P 0.683 -422 L 0.674 -423 P 0.668 -424 S 0.666 -425 P 0.672 -426 P 0.687 -427 Q 0.703 -428 G 0.705 -429 S 0.674 -430 G 0.604 -431 Q 0.512 -432 E 0.430 -433 Q 0.371 -434 Y 0.337 -435 K 0.331 -436 I 0.339 -437 A 0.330 -438 A 0.310 -439 N 0.310 -440 Q 0.335 -441 A 0.365 -442 S 0.391 -443 V 0.404 -444 I 0.386 -445 S 0.341 -446 H 0.304 -447 Q 0.315 -448 H 0.363 -449 L 0.409 -450 S 0.435 -451 K 0.455 -452 Q 0.472 -453 K 0.472 -454 Q 0.449 -455 L 0.421 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000164749.13_ENST00000396423.4_GN:HNF4G_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000164749.13_ENST00000396423.4_GN:HNF4G_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid deleted file mode 100644 index 9e1cde7509f656d9af4bcb2e9fd883ec900a5d53..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000164749.13_ENST00000396423.4_GN:HNF4G_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid +++ /dev/null @@ -1,462 +0,0 @@ ->ENSG00000164749.13|ENST00000396423.4|GN:HNF4G|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:6 -1 M 0.304 -2 C 0.322 -3 V 0.354 -4 S 0.385 -5 K 0.404 -6 S 0.423 -7 M 0.464 -8 M 0.511 -9 R 0.537 -10 V 0.538 -11 S 0.537 -12 E 0.550 -13 P 0.566 -14 I 0.571 -15 L 0.565 -16 D 0.556 -17 M 0.542 -18 D 0.524 -19 M 0.512 -20 A 0.514 -21 N 0.520 -22 Y 0.526 -23 S 0.534 -24 E 0.529 -25 V 0.503 -26 L 0.473 -27 D 0.461 -28 P 0.460 -29 T 0.449 -30 Y 0.424 -31 T 0.394 -32 T 0.363 -33 L 0.329 -34 E 0.293 -35 F 0.256 -36 E 0.225 -37 T 0.209 -38 M 0.211 -39 Q 0.227 -40 I 0.258 -41 L 0.311 -42 Y 0.386 -43 N 0.468 -44 S 0.535 -45 S 0.579 -46 D 0.606 -47 S 0.621 -48 S 0.627 -49 A 0.635 -50 P 0.654 -51 E 0.680 -52 T 0.702 -53 S 0.713 -54 M 0.714 -55 N 0.710 -56 T 0.701 -57 T 0.694 -58 D 0.689 -59 N 0.673 -60 G 0.622 -61 V 0.520 -62 N 0.378 -63 C 0.236 -64 L 0.131 -65 C 0.072 -66 A 0.047 -67 I 0.045 -68 C 0.061 -69 G 0.088 -70 D 0.118 -71 R 0.145 -72 A 0.169 -73 T 0.190 -74 G 0.202 -75 K 0.193 -76 H 0.178 -77 Y 0.178 -78 G 0.186 -79 A 0.182 -80 S 0.165 -81 S 0.148 -82 C 0.131 -83 D 0.111 -84 G 0.096 -85 C 0.088 -86 K 0.080 -87 G 0.072 -88 F 0.069 -89 F 0.068 -90 R 0.066 -91 R 0.067 -92 S 0.072 -93 I 0.079 -94 R 0.085 -95 K 0.089 -96 S 0.090 -97 H 0.089 -98 V 0.083 -99 Y 0.076 -100 S 0.069 -101 C 0.065 -102 R 0.062 -103 F 0.059 -104 S 0.054 -105 R 0.050 -106 Q 0.052 -107 C 0.061 -108 V 0.073 -109 V 0.082 -110 D 0.085 -111 K 0.084 -112 D 0.087 -113 K 0.094 -114 R 0.102 -115 N 0.107 -116 Q 0.111 -117 C 0.107 -118 R 0.094 -119 Y 0.080 -120 C 0.074 -121 R 0.074 -122 L 0.072 -123 R 0.068 -124 K 0.063 -125 C 0.061 -126 F 0.062 -127 R 0.067 -128 A 0.073 -129 G 0.081 -130 M 0.091 -131 K 0.107 -132 K 0.132 -133 E 0.162 -134 A 0.187 -135 V 0.203 -136 Q 0.226 -137 N 0.273 -138 E 0.345 -139 R 0.426 -140 D 0.493 -141 R 0.536 -142 I 0.556 -143 S 0.560 -144 T 0.559 -145 R 0.558 -146 R 0.558 -147 S 0.557 -148 T 0.557 -149 F 0.553 -150 D 0.532 -151 G 0.477 -152 S 0.396 -153 N 0.309 -154 I 0.229 -155 P 0.165 -156 S 0.121 -157 I 0.094 -158 N 0.075 -159 T 0.065 -160 L 0.066 -161 A 0.074 -162 Q 0.082 -163 A 0.082 -164 E 0.079 -165 V 0.079 -166 R 0.083 -167 S 0.098 -168 R 0.127 -169 Q 0.168 -170 I 0.217 -171 S 0.272 -172 V 0.338 -173 S 0.414 -174 S 0.492 -175 P 0.563 -176 G 0.615 -177 S 0.640 -178 S 0.639 -179 T 0.616 -180 D 0.576 -181 I 0.523 -182 N 0.460 -183 V 0.392 -184 K 0.325 -185 K 0.277 -186 I 0.250 -187 A 0.222 -188 S 0.182 -189 I 0.143 -190 G 0.124 -191 D 0.119 -192 V 0.112 -193 C 0.103 -194 E 0.096 -195 S 0.093 -196 M 0.093 -197 K 0.093 -198 Q 0.093 -199 Q 0.086 -200 L 0.075 -201 L 0.064 -202 V 0.060 -203 L 0.063 -204 V 0.067 -205 E 0.069 -206 W 0.062 -207 A 0.054 -208 K 0.053 -209 Y 0.057 -210 I 0.060 -211 P 0.060 -212 A 0.058 -213 F 0.057 -214 C 0.059 -215 E 0.065 -216 L 0.072 -217 P 0.076 -218 L 0.074 -219 D 0.066 -220 D 0.056 -221 Q 0.048 -222 V 0.047 -223 A 0.052 -224 L 0.060 -225 L 0.064 -226 R 0.060 -227 A 0.050 -228 H 0.042 -229 A 0.037 -230 G 0.037 -231 E 0.037 -232 H 0.037 -233 L 0.038 -234 L 0.040 -235 L 0.040 -236 G 0.040 -237 A 0.042 -238 T 0.045 -239 K 0.046 -240 R 0.045 -241 S 0.045 -242 M 0.048 -243 M 0.056 -244 Y 0.065 -245 K 0.069 -246 D 0.066 -247 I 0.061 -248 L 0.057 -249 L 0.057 -250 L 0.067 -251 G 0.086 -252 N 0.104 -253 N 0.110 -254 Y 0.102 -255 V 0.090 -256 I 0.086 -257 H 0.098 -258 R 0.123 -259 N 0.146 -260 S 0.158 -261 C 0.156 -262 E 0.143 -263 V 0.122 -264 E 0.099 -265 I 0.079 -266 S 0.065 -267 R 0.060 -268 V 0.062 -269 A 0.067 -270 N 0.076 -271 R 0.088 -272 V 0.100 -273 L 0.107 -274 D 0.105 -275 E 0.092 -276 L 0.075 -277 V 0.061 -278 R 0.055 -279 P 0.053 -280 F 0.055 -281 Q 0.062 -282 E 0.072 -283 I 0.076 -284 Q 0.073 -285 I 0.066 -286 D 0.059 -287 D 0.053 -288 N 0.050 -289 E 0.049 -290 Y 0.048 -291 A 0.047 -292 C 0.049 -293 L 0.052 -294 K 0.055 -295 A 0.054 -296 I 0.051 -297 V 0.046 -298 F 0.043 -299 F 0.048 -300 D 0.063 -301 P 0.085 -302 D 0.105 -303 A 0.113 -304 K 0.108 -305 G 0.098 -306 L 0.090 -307 S 0.087 -308 D 0.087 -309 P 0.084 -310 V 0.077 -311 K 0.073 -312 I 0.078 -313 K 0.090 -314 N 0.100 -315 M 0.098 -316 R 0.083 -317 F 0.067 -318 Q 0.061 -319 V 0.064 -320 Q 0.068 -321 I 0.066 -322 G 0.063 -323 L 0.062 -324 E 0.061 -325 D 0.059 -326 Y 0.057 -327 I 0.058 -328 N 0.063 -329 D 0.069 -330 R 0.078 -331 Q 0.091 -332 Y 0.106 -333 D 0.120 -334 S 0.130 -335 R 0.128 -336 G 0.110 -337 R 0.086 -338 F 0.070 -339 G 0.066 -340 E 0.070 -341 L 0.076 -342 L 0.083 -343 L 0.092 -344 L 0.101 -345 L 0.105 -346 P 0.104 -347 T 0.105 -348 L 0.110 -349 Q 0.117 -350 S 0.121 -351 I 0.117 -352 T 0.105 -353 W 0.092 -354 Q 0.087 -355 M 0.092 -356 I 0.098 -357 E 0.096 -358 Q 0.085 -359 I 0.072 -360 Q 0.062 -361 F 0.057 -362 V 0.055 -363 K 0.056 -364 L 0.061 -365 F 0.077 -366 G 0.095 -367 M 0.104 -368 V 0.104 -369 K 0.097 -370 I 0.088 -371 D 0.076 -372 N 0.063 -373 L 0.053 -374 L 0.051 -375 Q 0.057 -376 E 0.069 -377 M 0.092 -378 L 0.140 -379 L 0.227 -380 G 0.346 -381 G 0.472 -382 A 0.569 -383 S 0.624 -384 N 0.645 -385 D 0.648 -386 G 0.642 -387 S 0.633 -388 H 0.621 -389 L 0.608 -390 H 0.599 -391 H 0.601 -392 P 0.614 -393 M 0.637 -394 H 0.669 -395 P 0.703 -396 H 0.722 -397 L 0.714 -398 S 0.687 -399 Q 0.660 -400 D 0.644 -401 P 0.641 -402 L 0.652 -403 T 0.681 -404 G 0.712 -405 Q 0.729 -406 T 0.728 -407 I 0.717 -408 L 0.703 -409 L 0.693 -410 G 0.695 -411 P 0.708 -412 M 0.723 -413 S 0.734 -414 T 0.741 -415 L 0.746 -416 V 0.750 -417 H 0.754 -418 A 0.757 -419 D 0.758 -420 Q 0.747 -421 I 0.728 -422 S 0.713 -423 T 0.709 -424 P 0.710 -425 E 0.706 -426 T 0.697 -427 P 0.686 -428 L 0.677 -429 P 0.670 -430 S 0.668 -431 P 0.675 -432 P 0.690 -433 Q 0.705 -434 G 0.707 -435 S 0.678 -436 G 0.611 -437 Q 0.522 -438 E 0.441 -439 Q 0.381 -440 Y 0.345 -441 K 0.339 -442 I 0.347 -443 A 0.339 -444 A 0.320 -445 N 0.321 -446 Q 0.346 -447 A 0.376 -448 S 0.402 -449 V 0.414 -450 I 0.394 -451 S 0.346 -452 H 0.308 -453 Q 0.318 -454 H 0.367 -455 L 0.414 -456 S 0.441 -457 K 0.460 -458 Q 0.477 -459 K 0.477 -460 Q 0.453 -461 L 0.425 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000165131.8_ENST00000409607.5_GN:LLCFC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000165131.8_ENST00000409607.5_GN:LLCFC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index d90437e7b78b5ec6e5ee89cf0064df8d9d224ed3..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000165131.8_ENST00000409607.5_GN:LLCFC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,123 +0,0 @@ ->ENSG00000165131.8|ENST00000409607.5|GN:LLCFC1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.437 -2 P 0.463 -3 P 0.497 -4 L 0.518 -5 A 0.504 -6 P 0.454 -7 Q 0.389 -8 L 0.334 -9 C 0.301 -10 R 0.285 -11 A 0.275 -12 V 0.260 -13 F 0.240 -14 L 0.224 -15 V 0.219 -16 P 0.217 -17 I 0.210 -18 L 0.203 -19 L 0.209 -20 L 0.236 -21 L 0.288 -22 Q 0.362 -23 V 0.452 -24 K 0.546 -25 P 0.632 -26 L 0.697 -27 N 0.733 -28 G 0.745 -29 S 0.743 -30 P 0.741 -31 G 0.750 -32 P 0.768 -33 K 0.790 -34 D 0.805 -35 G 0.809 -36 S 0.803 -37 Q 0.793 -38 T 0.783 -39 E 0.772 -40 K 0.759 -41 T 0.749 -42 P 0.749 -43 S 0.757 -44 A 0.766 -45 D 0.769 -46 Q 0.767 -47 N 0.762 -48 Q 0.758 -49 E 0.756 -50 Q 0.749 -51 F 0.733 -52 E 0.701 -53 E 0.655 -54 H 0.614 -55 F 0.590 -56 V 0.575 -57 A 0.568 -58 S 0.578 -59 S 0.588 -60 V 0.574 -61 G 0.546 -62 E 0.514 -63 M 0.466 -64 W 0.404 -65 Q 0.371 -66 V 0.393 -67 V 0.449 -68 D 0.496 -69 M 0.516 -70 A 0.515 -71 Q 0.517 -72 Q 0.534 -73 E 0.563 -74 E 0.585 -75 D 0.592 -76 Q 0.597 -77 S 0.614 -78 S 0.642 -79 K 0.667 -80 T 0.676 -81 A 0.668 -82 A 0.645 -83 V 0.608 -84 H 0.560 -85 K 0.508 -86 H 0.465 -87 S 0.433 -88 F 0.404 -89 H 0.365 -90 L 0.322 -91 S 0.292 -92 F 0.284 -93 C 0.306 -94 F 0.357 -95 S 0.408 -96 L 0.435 -97 A 0.443 -98 S 0.443 -99 V 0.429 -100 M 0.407 -101 V 0.398 -102 F 0.412 -103 S 0.440 -104 G 0.468 -105 G 0.491 -106 P 0.497 -107 L 0.469 -108 R 0.425 -109 R 0.400 -110 T 0.399 -111 F 0.405 -112 P 0.409 -113 N 0.396 -114 I 0.359 -115 Q 0.311 -116 L 0.280 -117 C 0.275 -118 F 0.284 -119 M 0.290 -120 L 0.288 -121 T 0.283 -122 H 0.279 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000165131.8_ENST00000409607.5_GN:LLCFC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:25.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000165131.8_ENST00000409607.5_GN:LLCFC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:25.caid deleted file mode 100644 index 5a8acf13f94881314b3d7f5e536d9c37e05ec7d7..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000165131.8_ENST00000409607.5_GN:LLCFC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:25.caid +++ /dev/null @@ -1,148 +0,0 @@ ->ENSG00000165131.8|ENST00000409607.5|GN:LLCFC1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:25 -1 M 0.466 -2 G 0.509 -3 Q 0.572 -4 E 0.628 -5 V 0.664 -6 H 0.686 -7 G 0.702 -8 S 0.714 -9 C 0.728 -10 W 0.748 -11 A 0.772 -12 L 0.786 -13 G 0.789 -14 A 0.789 -15 G 0.792 -16 G 0.798 -17 G 0.802 -18 Q 0.799 -19 R 0.795 -20 Q 0.796 -21 W 0.801 -22 V 0.807 -23 G 0.806 -24 R 0.789 -25 S 0.760 -26 M 0.730 -27 P 0.712 -28 P 0.704 -29 L 0.691 -30 A 0.665 -31 P 0.634 -32 Q 0.613 -33 L 0.599 -34 C 0.574 -35 R 0.534 -36 A 0.483 -37 V 0.424 -38 F 0.367 -39 L 0.325 -40 V 0.304 -41 P 0.291 -42 I 0.274 -43 L 0.260 -44 L 0.260 -45 L 0.280 -46 L 0.324 -47 Q 0.392 -48 V 0.481 -49 K 0.577 -50 P 0.663 -51 L 0.726 -52 N 0.760 -53 G 0.769 -54 S 0.766 -55 P 0.765 -56 G 0.774 -57 P 0.793 -58 K 0.812 -59 D 0.826 -60 G 0.830 -61 S 0.825 -62 Q 0.816 -63 T 0.807 -64 E 0.796 -65 K 0.782 -66 T 0.771 -67 P 0.769 -68 S 0.775 -69 A 0.781 -70 D 0.783 -71 Q 0.779 -72 N 0.772 -73 Q 0.767 -74 E 0.762 -75 Q 0.752 -76 F 0.731 -77 E 0.691 -78 E 0.635 -79 H 0.584 -80 F 0.554 -81 V 0.535 -82 A 0.527 -83 S 0.538 -84 S 0.548 -85 V 0.533 -86 G 0.503 -87 E 0.474 -88 M 0.442 -89 W 0.410 -90 Q 0.398 -91 V 0.409 -92 V 0.432 -93 D 0.453 -94 M 0.464 -95 A 0.464 -96 Q 0.467 -97 Q 0.484 -98 E 0.512 -99 E 0.530 -100 D 0.530 -101 Q 0.531 -102 S 0.550 -103 S 0.584 -104 K 0.618 -105 T 0.635 -106 A 0.629 -107 A 0.604 -108 V 0.560 -109 H 0.505 -110 K 0.451 -111 H 0.409 -112 S 0.378 -113 F 0.349 -114 H 0.315 -115 L 0.282 -116 S 0.261 -117 F 0.259 -118 C 0.276 -119 F 0.315 -120 S 0.359 -121 L 0.391 -122 A 0.412 -123 S 0.427 -124 V 0.427 -125 M 0.420 -126 V 0.424 -127 F 0.447 -128 S 0.475 -129 G 0.501 -130 G 0.522 -131 P 0.524 -132 L 0.493 -133 R 0.447 -134 R 0.422 -135 T 0.420 -136 F 0.424 -137 P 0.427 -138 N 0.416 -139 I 0.383 -140 Q 0.342 -141 L 0.317 -142 C 0.319 -143 F 0.336 -144 M 0.350 -145 L 0.348 -146 T 0.334 -147 H 0.321 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000166148.4_ENST00000299178.4_GN:AVPR1A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000166148.4_ENST00000299178.4_GN:AVPR1A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 9dbeec9dcc98f7f2d3063d40b321fcba6517c8e9..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000166148.4_ENST00000299178.4_GN:AVPR1A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,419 +0,0 @@ ->ENSG00000166148.4|ENST00000299178.4|GN:AVPR1A|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.265 -2 R 0.279 -3 L 0.309 -4 S 0.357 -5 A 0.419 -6 G 0.485 -7 P 0.543 -8 D 0.581 -9 A 0.595 -10 G 0.596 -11 P 0.600 -12 S 0.606 -13 G 0.596 -14 N 0.559 -15 S 0.505 -16 S 0.453 -17 P 0.410 -18 W 0.380 -19 W 0.370 -20 P 0.375 -21 L 0.395 -22 A 0.440 -23 T 0.510 -24 G 0.580 -25 A 0.625 -26 G 0.639 -27 N 0.619 -28 T 0.564 -29 S 0.486 -30 R 0.431 -31 E 0.429 -32 A 0.471 -33 E 0.529 -34 A 0.589 -35 L 0.637 -36 G 0.663 -37 E 0.664 -38 G 0.639 -39 N 0.592 -40 G 0.542 -41 P 0.503 -42 P 0.476 -43 R 0.447 -44 D 0.404 -45 V 0.345 -46 R 0.277 -47 N 0.216 -48 E 0.175 -49 E 0.153 -50 L 0.135 -51 A 0.111 -52 K 0.084 -53 L 0.064 -54 E 0.053 -55 I 0.047 -56 A 0.042 -57 V 0.039 -58 L 0.038 -59 A 0.039 -60 V 0.041 -61 T 0.041 -62 F 0.039 -63 A 0.035 -64 V 0.033 -65 A 0.031 -66 V 0.031 -67 L 0.034 -68 G 0.039 -69 N 0.044 -70 S 0.049 -71 S 0.052 -72 V 0.050 -73 L 0.044 -74 L 0.041 -75 A 0.044 -76 L 0.052 -77 H 0.064 -78 R 0.082 -79 T 0.106 -80 P 0.128 -81 R 0.138 -82 K 0.132 -83 T 0.115 -84 S 0.093 -85 R 0.073 -86 M 0.055 -87 H 0.041 -88 L 0.032 -89 F 0.029 -90 I 0.030 -91 R 0.033 -92 H 0.037 -93 L 0.040 -94 S 0.043 -95 L 0.044 -96 A 0.044 -97 D 0.044 -98 L 0.041 -99 A 0.035 -100 V 0.029 -101 A 0.027 -102 F 0.028 -103 F 0.030 -104 Q 0.033 -105 V 0.035 -106 L 0.035 -107 P 0.033 -108 Q 0.030 -109 M 0.029 -110 C 0.028 -111 W 0.030 -112 D 0.032 -113 I 0.037 -114 T 0.043 -115 Y 0.049 -116 R 0.056 -117 F 0.062 -118 R 0.069 -119 G 0.073 -120 P 0.068 -121 D 0.055 -122 W 0.040 -123 L 0.029 -124 C 0.024 -125 R 0.023 -126 V 0.026 -127 V 0.029 -128 K 0.031 -129 H 0.030 -130 L 0.027 -131 Q 0.027 -132 V 0.031 -133 F 0.034 -134 G 0.036 -135 M 0.036 -136 F 0.036 -137 A 0.035 -138 S 0.034 -139 A 0.033 -140 Y 0.031 -141 M 0.029 -142 L 0.028 -143 V 0.028 -144 V 0.028 -145 M 0.030 -146 T 0.033 -147 A 0.037 -148 D 0.039 -149 R 0.039 -150 Y 0.038 -151 I 0.039 -152 A 0.045 -153 V 0.057 -154 C 0.074 -155 H 0.094 -156 P 0.110 -157 L 0.124 -158 K 0.143 -159 T 0.166 -160 L 0.182 -161 Q 0.184 -162 Q 0.167 -163 P 0.135 -164 A 0.099 -165 R 0.071 -166 R 0.057 -167 S 0.057 -168 R 0.065 -169 L 0.070 -170 M 0.065 -171 I 0.055 -172 A 0.049 -173 A 0.048 -174 A 0.051 -175 W 0.051 -176 V 0.051 -177 L 0.053 -178 S 0.056 -179 F 0.060 -180 V 0.065 -181 L 0.074 -182 S 0.079 -183 T 0.076 -184 P 0.066 -185 Q 0.057 -186 Y 0.051 -187 F 0.048 -188 V 0.047 -189 F 0.045 -190 S 0.047 -191 M 0.054 -192 I 0.067 -193 E 0.085 -194 V 0.107 -195 N 0.130 -196 N 0.144 -197 V 0.142 -198 T 0.130 -199 K 0.118 -200 A 0.107 -201 R 0.090 -202 D 0.073 -203 C 0.064 -204 W 0.067 -205 A 0.077 -206 T 0.088 -207 F 0.095 -208 I 0.095 -209 Q 0.086 -210 P 0.075 -211 W 0.069 -212 G 0.067 -213 S 0.065 -214 R 0.060 -215 A 0.055 -216 Y 0.053 -217 V 0.055 -218 T 0.058 -219 W 0.060 -220 M 0.061 -221 T 0.058 -222 G 0.055 -223 G 0.052 -224 I 0.048 -225 F 0.045 -226 V 0.048 -227 A 0.054 -228 P 0.055 -229 V 0.049 -230 V 0.045 -231 I 0.047 -232 L 0.051 -233 G 0.051 -234 T 0.045 -235 C 0.038 -236 Y 0.033 -237 G 0.032 -238 F 0.034 -239 I 0.035 -240 C 0.036 -241 Y 0.038 -242 N 0.042 -243 I 0.047 -244 W 0.056 -245 C 0.078 -246 N 0.110 -247 V 0.147 -248 R 0.193 -249 G 0.253 -250 K 0.316 -251 T 0.366 -252 A 0.398 -253 S 0.419 -254 R 0.438 -255 Q 0.452 -256 S 0.462 -257 K 0.480 -258 G 0.502 -259 A 0.498 -260 E 0.470 -261 Q 0.458 -262 A 0.491 -263 G 0.538 -264 V 0.559 -265 A 0.555 -266 F 0.551 -267 Q 0.564 -268 K 0.589 -269 G 0.610 -270 F 0.620 -271 L 0.628 -272 L 0.636 -273 A 0.645 -274 P 0.650 -275 C 0.649 -276 V 0.642 -277 S 0.626 -278 S 0.598 -279 V 0.555 -280 K 0.499 -281 S 0.426 -282 I 0.339 -283 S 0.256 -284 R 0.191 -285 A 0.147 -286 K 0.121 -287 I 0.105 -288 R 0.089 -289 T 0.075 -290 V 0.066 -291 K 0.061 -292 M 0.057 -293 T 0.050 -294 F 0.045 -295 V 0.044 -296 I 0.048 -297 V 0.051 -298 T 0.051 -299 A 0.048 -300 Y 0.041 -301 I 0.034 -302 V 0.029 -303 C 0.027 -304 W 0.029 -305 A 0.031 -306 P 0.031 -307 F 0.029 -308 F 0.027 -309 I 0.028 -310 I 0.031 -311 Q 0.033 -312 M 0.035 -313 W 0.035 -314 S 0.037 -315 V 0.047 -316 W 0.065 -317 D 0.084 -318 P 0.095 -319 M 0.103 -320 S 0.117 -321 V 0.133 -322 W 0.149 -323 T 0.170 -324 E 0.196 -325 S 0.209 -326 E 0.194 -327 N 0.155 -328 P 0.114 -329 T 0.083 -330 I 0.064 -331 T 0.056 -332 I 0.055 -333 T 0.056 -334 A 0.057 -335 L 0.061 -336 L 0.067 -337 G 0.073 -338 S 0.080 -339 L 0.086 -340 N 0.088 -341 S 0.083 -342 C 0.074 -343 C 0.068 -344 N 0.063 -345 P 0.058 -346 W 0.052 -347 I 0.047 -348 Y 0.042 -349 M 0.041 -350 F 0.047 -351 F 0.062 -352 S 0.080 -353 G 0.094 -354 H 0.103 -355 L 0.107 -356 L 0.111 -357 Q 0.122 -358 D 0.140 -359 C 0.155 -360 V 0.162 -361 Q 0.165 -362 S 0.172 -363 F 0.177 -364 P 0.176 -365 C 0.175 -366 C 0.185 -367 Q 0.210 -368 N 0.239 -369 M 0.253 -370 K 0.250 -371 E 0.248 -372 K 0.260 -373 F 0.277 -374 N 0.289 -375 K 0.301 -376 E 0.320 -377 D 0.336 -378 T 0.341 -379 D 0.337 -380 S 0.320 -381 M 0.290 -382 S 0.265 -383 R 0.265 -384 R 0.286 -385 Q 0.308 -386 T 0.337 -387 F 0.381 -388 Y 0.433 -389 S 0.482 -390 N 0.525 -391 N 0.554 -392 R 0.575 -393 S 0.604 -394 P 0.647 -395 T 0.691 -396 N 0.719 -397 S 0.728 -398 T 0.728 -399 G 0.726 -400 M 0.722 -401 W 0.717 -402 K 0.711 -403 D 0.705 -404 S 0.702 -405 P 0.706 -406 K 0.719 -407 S 0.729 -408 S 0.728 -409 K 0.713 -410 S 0.691 -411 I 0.666 -412 K 0.644 -413 F 0.634 -414 I 0.639 -415 P 0.643 -416 V 0.620 -417 S 0.563 -418 T 0.511 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000166148.4_ENST00000299178.4_GN:AVPR1A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000166148.4_ENST00000299178.4_GN:AVPR1A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid deleted file mode 100644 index 4d9555fc0321d103c7ef83ec31c43404db7261b1..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000166148.4_ENST00000299178.4_GN:AVPR1A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid +++ /dev/null @@ -1,422 +0,0 @@ ->ENSG00000166148.4|ENST00000299178.4|GN:AVPR1A|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 -1 M 0.316 -2 D 0.328 -3 S 0.347 -4 M 0.364 -5 R 0.367 -6 L 0.359 -7 S 0.373 -8 A 0.432 -9 G 0.510 -10 P 0.573 -11 D 0.608 -12 A 0.621 -13 G 0.623 -14 P 0.625 -15 S 0.628 -16 G 0.615 -17 N 0.572 -18 S 0.513 -19 S 0.458 -20 P 0.416 -21 W 0.388 -22 W 0.379 -23 P 0.383 -24 L 0.397 -25 A 0.436 -26 T 0.506 -27 G 0.582 -28 A 0.635 -29 G 0.654 -30 N 0.638 -31 T 0.585 -32 S 0.510 -33 R 0.456 -34 E 0.461 -35 A 0.508 -36 E 0.566 -37 A 0.618 -38 L 0.656 -39 G 0.675 -40 E 0.671 -41 G 0.643 -42 N 0.595 -43 G 0.544 -44 P 0.507 -45 P 0.482 -46 R 0.456 -47 D 0.415 -48 V 0.356 -49 R 0.286 -50 N 0.222 -51 E 0.179 -52 E 0.154 -53 L 0.135 -54 A 0.111 -55 K 0.083 -56 L 0.063 -57 E 0.052 -58 I 0.046 -59 A 0.041 -60 V 0.038 -61 L 0.038 -62 A 0.039 -63 V 0.041 -64 T 0.041 -65 F 0.038 -66 A 0.034 -67 V 0.032 -68 A 0.031 -69 V 0.031 -70 L 0.034 -71 G 0.038 -72 N 0.043 -73 S 0.048 -74 S 0.051 -75 V 0.049 -76 L 0.044 -77 L 0.041 -78 A 0.043 -79 L 0.051 -80 H 0.063 -81 R 0.081 -82 T 0.105 -83 P 0.127 -84 R 0.136 -85 K 0.131 -86 T 0.114 -87 S 0.092 -88 R 0.072 -89 M 0.054 -90 H 0.040 -91 L 0.032 -92 F 0.029 -93 I 0.030 -94 R 0.033 -95 H 0.037 -96 L 0.040 -97 S 0.043 -98 L 0.044 -99 A 0.044 -100 D 0.044 -101 L 0.040 -102 A 0.034 -103 V 0.029 -104 A 0.027 -105 F 0.028 -106 F 0.030 -107 Q 0.033 -108 V 0.035 -109 L 0.035 -110 P 0.033 -111 Q 0.030 -112 M 0.029 -113 C 0.029 -114 W 0.030 -115 D 0.032 -116 I 0.036 -117 T 0.043 -118 Y 0.050 -119 R 0.056 -120 F 0.062 -121 R 0.069 -122 G 0.073 -123 P 0.069 -124 D 0.056 -125 W 0.040 -126 L 0.029 -127 C 0.024 -128 R 0.023 -129 V 0.026 -130 V 0.030 -131 K 0.031 -132 H 0.030 -133 L 0.027 -134 Q 0.027 -135 V 0.031 -136 F 0.034 -137 G 0.036 -138 M 0.036 -139 F 0.036 -140 A 0.035 -141 S 0.034 -142 A 0.032 -143 Y 0.030 -144 M 0.029 -145 L 0.028 -146 V 0.027 -147 V 0.027 -148 M 0.029 -149 T 0.033 -150 A 0.037 -151 D 0.039 -152 R 0.039 -153 Y 0.038 -154 I 0.039 -155 A 0.045 -156 V 0.057 -157 C 0.074 -158 H 0.094 -159 P 0.110 -160 L 0.124 -161 K 0.143 -162 T 0.165 -163 L 0.182 -164 Q 0.184 -165 Q 0.167 -166 P 0.135 -167 A 0.098 -168 R 0.070 -169 R 0.057 -170 S 0.057 -171 R 0.065 -172 L 0.070 -173 M 0.065 -174 I 0.055 -175 A 0.048 -176 A 0.048 -177 A 0.051 -178 W 0.051 -179 V 0.051 -180 L 0.052 -181 S 0.056 -182 F 0.060 -183 V 0.065 -184 L 0.074 -185 S 0.079 -186 T 0.076 -187 P 0.066 -188 Q 0.057 -189 Y 0.051 -190 F 0.048 -191 V 0.046 -192 F 0.045 -193 S 0.047 -194 M 0.054 -195 I 0.067 -196 E 0.085 -197 V 0.107 -198 N 0.129 -199 N 0.143 -200 V 0.141 -201 T 0.129 -202 K 0.118 -203 A 0.107 -204 R 0.090 -205 D 0.073 -206 C 0.064 -207 W 0.067 -208 A 0.076 -209 T 0.087 -210 F 0.095 -211 I 0.095 -212 Q 0.086 -213 P 0.075 -214 W 0.068 -215 G 0.067 -216 S 0.064 -217 R 0.059 -218 A 0.054 -219 Y 0.053 -220 V 0.055 -221 T 0.057 -222 W 0.060 -223 M 0.061 -224 T 0.058 -225 G 0.055 -226 G 0.051 -227 I 0.048 -228 F 0.045 -229 V 0.048 -230 A 0.053 -231 P 0.054 -232 V 0.049 -233 V 0.045 -234 I 0.047 -235 L 0.051 -236 G 0.050 -237 T 0.045 -238 C 0.038 -239 Y 0.033 -240 G 0.032 -241 F 0.034 -242 I 0.035 -243 C 0.035 -244 Y 0.037 -245 N 0.041 -246 I 0.046 -247 W 0.056 -248 C 0.078 -249 N 0.109 -250 V 0.146 -251 R 0.193 -252 G 0.252 -253 K 0.316 -254 T 0.367 -255 A 0.398 -256 S 0.419 -257 R 0.438 -258 Q 0.452 -259 S 0.462 -260 K 0.481 -261 G 0.502 -262 A 0.498 -263 E 0.469 -264 Q 0.458 -265 A 0.490 -266 G 0.538 -267 V 0.559 -268 A 0.554 -269 F 0.550 -270 Q 0.563 -271 K 0.588 -272 G 0.609 -273 F 0.619 -274 L 0.627 -275 L 0.636 -276 A 0.645 -277 P 0.650 -278 C 0.649 -279 V 0.642 -280 S 0.626 -281 S 0.599 -282 V 0.556 -283 K 0.500 -284 S 0.426 -285 I 0.340 -286 S 0.256 -287 R 0.191 -288 A 0.147 -289 K 0.121 -290 I 0.105 -291 R 0.090 -292 T 0.075 -293 V 0.066 -294 K 0.061 -295 M 0.056 -296 T 0.050 -297 F 0.045 -298 V 0.044 -299 I 0.048 -300 V 0.051 -301 T 0.051 -302 A 0.048 -303 Y 0.041 -304 I 0.034 -305 V 0.029 -306 C 0.027 -307 W 0.029 -308 A 0.031 -309 P 0.031 -310 F 0.029 -311 F 0.027 -312 I 0.028 -313 I 0.031 -314 Q 0.034 -315 M 0.035 -316 W 0.035 -317 S 0.037 -318 V 0.047 -319 W 0.066 -320 D 0.085 -321 P 0.096 -322 M 0.104 -323 S 0.118 -324 V 0.134 -325 W 0.150 -326 T 0.170 -327 E 0.196 -328 S 0.209 -329 E 0.194 -330 N 0.156 -331 P 0.114 -332 T 0.083 -333 I 0.064 -334 T 0.056 -335 I 0.055 -336 T 0.056 -337 A 0.058 -338 L 0.061 -339 L 0.067 -340 G 0.073 -341 S 0.080 -342 L 0.086 -343 N 0.088 -344 S 0.083 -345 C 0.074 -346 C 0.068 -347 N 0.063 -348 P 0.058 -349 W 0.052 -350 I 0.047 -351 Y 0.042 -352 M 0.041 -353 F 0.047 -354 F 0.062 -355 S 0.079 -356 G 0.093 -357 H 0.103 -358 L 0.106 -359 L 0.110 -360 Q 0.121 -361 D 0.139 -362 C 0.154 -363 V 0.161 -364 Q 0.165 -365 S 0.171 -366 F 0.176 -367 P 0.175 -368 C 0.174 -369 C 0.184 -370 Q 0.209 -371 N 0.238 -372 M 0.252 -373 K 0.250 -374 E 0.248 -375 K 0.259 -376 F 0.277 -377 N 0.289 -378 K 0.300 -379 E 0.319 -380 D 0.336 -381 T 0.341 -382 D 0.337 -383 S 0.322 -384 M 0.297 -385 S 0.278 -386 R 0.281 -387 R 0.298 -388 Q 0.314 -389 T 0.338 -390 F 0.381 -391 Y 0.432 -392 S 0.482 -393 N 0.524 -394 N 0.553 -395 R 0.575 -396 S 0.604 -397 P 0.647 -398 T 0.691 -399 N 0.719 -400 S 0.729 -401 T 0.729 -402 G 0.726 -403 M 0.722 -404 W 0.717 -405 K 0.712 -406 D 0.706 -407 S 0.703 -408 P 0.707 -409 K 0.720 -410 S 0.730 -411 S 0.729 -412 K 0.715 -413 S 0.694 -414 I 0.669 -415 K 0.647 -416 F 0.636 -417 I 0.641 -418 P 0.645 -419 V 0.621 -420 S 0.564 -421 T 0.512 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000168124.4_ENST00000304646.3_GN:OR1F1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000168124.4_ENST00000304646.3_GN:OR1F1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index a38c7747950604a222c566ffe9640e646d441c18..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000168124.4_ENST00000304646.3_GN:OR1F1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,313 +0,0 @@ ->ENSG00000168124.4|ENST00000304646.3|GN:OR1F1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.456 -2 S 0.472 -3 G 0.498 -4 T 0.521 -5 N 0.526 -6 Q 0.499 -7 S 0.437 -8 S 0.354 -9 V 0.270 -10 S 0.202 -11 E 0.158 -12 F 0.136 -13 L 0.128 -14 L 0.128 -15 L 0.136 -16 G 0.151 -17 L 0.168 -18 S 0.185 -19 R 0.196 -20 Q 0.191 -21 P 0.170 -22 Q 0.140 -23 Q 0.108 -24 Q 0.081 -25 H 0.061 -26 L 0.053 -27 L 0.057 -28 F 0.067 -29 V 0.068 -30 F 0.057 -31 F 0.045 -32 L 0.041 -33 S 0.044 -34 M 0.048 -35 Y 0.050 -36 L 0.051 -37 A 0.054 -38 T 0.057 -39 V 0.057 -40 L 0.059 -41 G 0.064 -42 N 0.070 -43 L 0.072 -44 L 0.073 -45 I 0.071 -46 I 0.064 -47 L 0.058 -48 S 0.059 -49 V 0.067 -50 S 0.076 -51 I 0.083 -52 D 0.084 -53 S 0.079 -54 C 0.074 -55 L 0.070 -56 H 0.065 -57 T 0.056 -58 P 0.045 -59 M 0.035 -60 Y 0.029 -61 F 0.026 -62 F 0.029 -63 L 0.038 -64 S 0.050 -65 N 0.061 -66 L 0.065 -67 S 0.063 -68 F 0.058 -69 V 0.056 -70 D 0.060 -71 I 0.065 -72 C 0.065 -73 F 0.060 -74 S 0.056 -75 F 0.056 -76 T 0.060 -77 T 0.065 -78 V 0.069 -79 P 0.069 -80 K 0.067 -81 M 0.065 -82 L 0.064 -83 A 0.062 -84 N 0.060 -85 H 0.062 -86 I 0.071 -87 L 0.083 -88 E 0.089 -89 T 0.083 -90 Q 0.072 -91 T 0.060 -92 I 0.051 -93 S 0.044 -94 F 0.037 -95 C 0.035 -96 G 0.035 -97 C 0.036 -98 L 0.036 -99 T 0.038 -100 Q 0.040 -101 M 0.041 -102 Y 0.041 -103 F 0.038 -104 V 0.035 -105 F 0.032 -106 M 0.032 -107 F 0.034 -108 V 0.040 -109 D 0.048 -110 M 0.053 -111 D 0.054 -112 N 0.050 -113 F 0.044 -114 L 0.039 -115 L 0.035 -116 A 0.033 -117 V 0.032 -118 M 0.032 -119 A 0.034 -120 Y 0.037 -121 D 0.039 -122 H 0.040 -123 F 0.038 -124 V 0.038 -125 A 0.040 -126 V 0.045 -127 C 0.052 -128 H 0.059 -129 P 0.063 -130 L 0.063 -131 H 0.062 -132 Y 0.062 -133 T 0.064 -134 A 0.067 -135 K 0.072 -136 M 0.076 -137 T 0.077 -138 H 0.075 -139 Q 0.070 -140 L 0.061 -141 C 0.058 -142 A 0.065 -143 L 0.075 -144 L 0.080 -145 V 0.081 -146 A 0.081 -147 G 0.075 -148 L 0.066 -149 W 0.058 -150 V 0.058 -151 V 0.066 -152 A 0.076 -153 N 0.080 -154 L 0.081 -155 N 0.082 -156 V 0.082 -157 L 0.079 -158 L 0.079 -159 H 0.081 -160 T 0.083 -161 L 0.086 -162 L 0.097 -163 M 0.111 -164 A 0.119 -165 P 0.119 -166 L 0.115 -167 S 0.109 -168 F 0.108 -169 C 0.116 -170 A 0.129 -171 D 0.143 -172 N 0.154 -173 A 0.163 -174 I 0.162 -175 T 0.145 -176 H 0.117 -177 F 0.091 -178 F 0.074 -179 C 0.070 -180 D 0.079 -181 V 0.099 -182 T 0.122 -183 P 0.137 -184 L 0.143 -185 L 0.143 -186 K 0.141 -187 L 0.135 -188 S 0.126 -189 C 0.123 -190 S 0.132 -191 D 0.145 -192 T 0.148 -193 H 0.141 -194 L 0.137 -195 N 0.141 -196 E 0.147 -197 V 0.147 -198 I 0.143 -199 I 0.136 -200 L 0.127 -201 S 0.120 -202 E 0.115 -203 G 0.106 -204 A 0.088 -205 L 0.072 -206 V 0.065 -207 M 0.065 -208 I 0.070 -209 T 0.077 -210 P 0.077 -211 F 0.070 -212 L 0.066 -213 C 0.071 -214 I 0.074 -215 L 0.070 -216 A 0.061 -217 S 0.053 -218 Y 0.049 -219 M 0.049 -220 H 0.055 -221 I 0.067 -222 T 0.079 -223 C 0.089 -224 T 0.092 -225 V 0.093 -226 L 0.102 -227 K 0.124 -228 V 0.149 -229 P 0.164 -230 S 0.162 -231 T 0.147 -232 K 0.126 -233 G 0.104 -234 R 0.085 -235 W 0.075 -236 K 0.076 -237 A 0.079 -238 F 0.081 -239 S 0.084 -240 T 0.087 -241 C 0.090 -242 G 0.090 -243 S 0.086 -244 H 0.078 -245 L 0.070 -246 A 0.065 -247 V 0.063 -248 V 0.055 -249 L 0.043 -250 L 0.032 -251 F 0.027 -252 Y 0.028 -253 S 0.031 -254 T 0.034 -255 I 0.035 -256 I 0.035 -257 A 0.039 -258 V 0.052 -259 Y 0.077 -260 F 0.117 -261 N 0.167 -262 P 0.215 -263 L 0.253 -264 S 0.278 -265 S 0.286 -266 H 0.273 -267 S 0.244 -268 A 0.209 -269 E 0.183 -270 K 0.168 -271 D 0.156 -272 T 0.141 -273 M 0.125 -274 A 0.111 -275 T 0.098 -276 V 0.089 -277 L 0.093 -278 Y 0.105 -279 T 0.118 -280 V 0.126 -281 V 0.131 -282 T 0.130 -283 P 0.120 -284 M 0.104 -285 L 0.093 -286 N 0.084 -287 P 0.075 -288 F 0.070 -289 I 0.070 -290 Y 0.074 -291 S 0.083 -292 L 0.100 -293 R 0.113 -294 N 0.109 -295 R 0.091 -296 Y 0.073 -297 L 0.064 -298 K 0.062 -299 G 0.066 -300 A 0.072 -301 L 0.082 -302 K 0.093 -303 K 0.102 -304 V 0.110 -305 V 0.123 -306 G 0.147 -307 R 0.178 -308 V 0.212 -309 V 0.244 -310 F 0.267 -311 S 0.278 -312 V 0.281 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000168124.4_ENST00000304646.3_GN:OR1F1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000168124.4_ENST00000304646.3_GN:OR1F1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid deleted file mode 100644 index 7850bf60f241438248a2e6f2a49b417d92385a54..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000168124.4_ENST00000304646.3_GN:OR1F1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:10.caid +++ /dev/null @@ -1,323 +0,0 @@ ->ENSG00000168124.4|ENST00000304646.3|GN:OR1F1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:10 -1 M 0.409 -2 G 0.426 -3 D 0.447 -4 R 0.452 -5 R 0.437 -6 A 0.429 -7 D 0.456 -8 P 0.501 -9 R 0.535 -10 P 0.554 -11 M 0.570 -12 S 0.584 -13 G 0.591 -14 T 0.584 -15 N 0.563 -16 Q 0.520 -17 S 0.452 -18 S 0.366 -19 V 0.281 -20 S 0.211 -21 E 0.165 -22 F 0.141 -23 L 0.131 -24 L 0.129 -25 L 0.136 -26 G 0.151 -27 L 0.170 -28 S 0.188 -29 R 0.198 -30 Q 0.193 -31 P 0.172 -32 Q 0.142 -33 Q 0.110 -34 Q 0.082 -35 H 0.061 -36 L 0.050 -37 L 0.048 -38 F 0.049 -39 V 0.045 -40 F 0.039 -41 F 0.036 -42 L 0.039 -43 S 0.044 -44 M 0.049 -45 Y 0.050 -46 L 0.051 -47 A 0.055 -48 T 0.058 -49 V 0.058 -50 L 0.060 -51 G 0.066 -52 N 0.072 -53 L 0.075 -54 L 0.076 -55 I 0.074 -56 I 0.067 -57 L 0.060 -58 S 0.060 -59 V 0.067 -60 S 0.077 -61 I 0.084 -62 D 0.085 -63 S 0.081 -64 C 0.076 -65 L 0.071 -66 H 0.066 -67 T 0.057 -68 P 0.046 -69 M 0.035 -70 Y 0.029 -71 F 0.026 -72 F 0.029 -73 L 0.038 -74 S 0.051 -75 N 0.062 -76 L 0.066 -77 S 0.064 -78 F 0.059 -79 V 0.056 -80 D 0.059 -81 I 0.064 -82 C 0.064 -83 F 0.060 -84 S 0.056 -85 F 0.056 -86 T 0.060 -87 T 0.064 -88 V 0.068 -89 P 0.068 -90 K 0.066 -91 M 0.064 -92 L 0.063 -93 A 0.060 -94 N 0.058 -95 H 0.060 -96 I 0.069 -97 L 0.082 -98 E 0.088 -99 T 0.083 -100 Q 0.071 -101 T 0.059 -102 I 0.051 -103 S 0.043 -104 F 0.037 -105 C 0.035 -106 G 0.036 -107 C 0.036 -108 L 0.036 -109 T 0.037 -110 Q 0.039 -111 M 0.040 -112 Y 0.040 -113 F 0.038 -114 V 0.035 -115 F 0.033 -116 M 0.032 -117 F 0.035 -118 V 0.041 -119 D 0.048 -120 M 0.054 -121 D 0.054 -122 N 0.051 -123 F 0.045 -124 L 0.040 -125 L 0.036 -126 A 0.034 -127 V 0.033 -128 M 0.033 -129 A 0.035 -130 Y 0.038 -131 D 0.041 -132 H 0.041 -133 F 0.040 -134 V 0.039 -135 A 0.042 -136 V 0.046 -137 C 0.054 -138 H 0.061 -139 P 0.065 -140 L 0.065 -141 H 0.064 -142 Y 0.065 -143 T 0.066 -144 A 0.070 -145 K 0.075 -146 M 0.080 -147 T 0.080 -148 H 0.078 -149 Q 0.071 -150 L 0.062 -151 C 0.058 -152 A 0.065 -153 L 0.075 -154 L 0.080 -155 V 0.081 -156 A 0.081 -157 G 0.075 -158 L 0.066 -159 W 0.058 -160 V 0.057 -161 V 0.066 -162 A 0.077 -163 N 0.082 -164 L 0.083 -165 N 0.084 -166 V 0.083 -167 L 0.080 -168 L 0.080 -169 H 0.082 -170 T 0.084 -171 L 0.087 -172 L 0.098 -173 M 0.112 -174 A 0.120 -175 P 0.121 -176 L 0.116 -177 S 0.111 -178 F 0.110 -179 C 0.117 -180 A 0.130 -181 D 0.143 -182 N 0.154 -183 A 0.164 -184 I 0.163 -185 T 0.146 -186 H 0.117 -187 F 0.091 -188 F 0.075 -189 C 0.071 -190 D 0.080 -191 V 0.100 -192 T 0.123 -193 P 0.138 -194 L 0.144 -195 L 0.144 -196 K 0.142 -197 L 0.136 -198 S 0.126 -199 C 0.122 -200 S 0.131 -201 D 0.144 -202 T 0.148 -203 H 0.141 -204 L 0.137 -205 N 0.141 -206 E 0.145 -207 V 0.146 -208 I 0.142 -209 I 0.136 -210 L 0.128 -211 S 0.121 -212 E 0.117 -213 G 0.107 -214 A 0.089 -215 L 0.073 -216 V 0.065 -217 M 0.065 -218 I 0.071 -219 T 0.077 -220 P 0.078 -221 F 0.071 -222 L 0.067 -223 C 0.072 -224 I 0.076 -225 L 0.071 -226 A 0.062 -227 S 0.055 -228 Y 0.050 -229 M 0.050 -230 H 0.056 -231 I 0.068 -232 T 0.080 -233 C 0.089 -234 T 0.092 -235 V 0.094 -236 L 0.103 -237 K 0.125 -238 V 0.151 -239 P 0.166 -240 S 0.164 -241 T 0.150 -242 K 0.128 -243 G 0.106 -244 R 0.087 -245 W 0.078 -246 K 0.079 -247 A 0.082 -248 F 0.084 -249 S 0.087 -250 T 0.091 -251 C 0.094 -252 G 0.095 -253 S 0.091 -254 H 0.082 -255 L 0.072 -256 A 0.067 -257 V 0.065 -258 V 0.057 -259 L 0.044 -260 L 0.033 -261 F 0.028 -262 Y 0.028 -263 S 0.031 -264 T 0.034 -265 I 0.035 -266 I 0.035 -267 A 0.040 -268 V 0.053 -269 Y 0.078 -270 F 0.119 -271 N 0.170 -272 P 0.219 -273 L 0.258 -274 S 0.284 -275 S 0.292 -276 H 0.279 -277 S 0.249 -278 A 0.214 -279 E 0.188 -280 K 0.173 -281 D 0.161 -282 T 0.145 -283 M 0.129 -284 A 0.115 -285 T 0.101 -286 V 0.092 -287 L 0.095 -288 Y 0.108 -289 T 0.121 -290 V 0.129 -291 V 0.134 -292 T 0.133 -293 P 0.122 -294 M 0.107 -295 L 0.095 -296 N 0.086 -297 P 0.077 -298 F 0.071 -299 I 0.072 -300 Y 0.076 -301 S 0.086 -302 L 0.104 -303 R 0.117 -304 N 0.112 -305 R 0.093 -306 Y 0.075 -307 L 0.066 -308 K 0.064 -309 G 0.067 -310 A 0.074 -311 L 0.083 -312 K 0.094 -313 K 0.103 -314 V 0.111 -315 V 0.124 -316 G 0.148 -317 R 0.179 -318 V 0.213 -319 V 0.245 -320 F 0.269 -321 S 0.281 -322 V 0.283 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000169550.14_ENST00000529533.6_GN:MUC15_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000169550.14_ENST00000529533.6_GN:MUC15_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index ec4d2e6a237f1c818ec55fe358047e1bede1bbb6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000169550.14_ENST00000529533.6_GN:MUC15_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,362 +0,0 @@ ->ENSG00000169550.14|ENST00000529533.6|GN:MUC15|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.357 -2 G 0.382 -3 I 0.397 -4 I 0.381 -5 Q 0.349 -6 S 0.326 -7 I 0.324 -8 L 0.350 -9 A 0.415 -10 T 0.507 -11 S 0.583 -12 R 0.615 -13 D 0.606 -14 C 0.578 -15 Y 0.558 -16 S 0.558 -17 F 0.573 -18 K 0.589 -19 K 0.601 -20 K 0.615 -21 P 0.636 -22 I 0.661 -23 P 0.681 -24 K 0.690 -25 K 0.685 -26 P 0.655 -27 T 0.585 -28 M 0.480 -29 L 0.377 -30 A 0.310 -31 L 0.277 -32 A 0.260 -33 K 0.248 -34 I 0.232 -35 L 0.213 -36 L 0.202 -37 I 0.203 -38 S 0.208 -39 T 0.209 -40 L 0.211 -41 F 0.218 -42 Y 0.232 -43 S 0.260 -44 L 0.312 -45 L 0.400 -46 S 0.511 -47 G 0.613 -48 S 0.688 -49 H 0.740 -50 G 0.777 -51 K 0.803 -52 E 0.820 -53 N 0.829 -54 Q 0.834 -55 D 0.836 -56 I 0.837 -57 N 0.834 -58 T 0.825 -59 T 0.809 -60 Q 0.790 -61 N 0.768 -62 I 0.736 -63 A 0.701 -64 E 0.680 -65 V 0.679 -66 F 0.690 -67 K 0.709 -68 T 0.732 -69 M 0.747 -70 E 0.748 -71 N 0.747 -72 K 0.762 -73 P 0.796 -74 I 0.833 -75 S 0.860 -76 L 0.875 -77 E 0.882 -78 S 0.885 -79 E 0.882 -80 A 0.875 -81 N 0.864 -82 L 0.852 -83 N 0.845 -84 S 0.844 -85 D 0.846 -86 K 0.850 -87 E 0.854 -88 N 0.851 -89 I 0.831 -90 T 0.781 -91 T 0.711 -92 S 0.677 -93 N 0.714 -94 L 0.783 -95 K 0.830 -96 A 0.841 -97 S 0.827 -98 H 0.802 -99 S 0.786 -100 P 0.789 -101 P 0.809 -102 L 0.826 -103 N 0.832 -104 L 0.831 -105 P 0.834 -106 N 0.842 -107 N 0.852 -108 S 0.860 -109 H 0.867 -110 G 0.870 -111 I 0.869 -112 T 0.863 -113 D 0.857 -114 F 0.853 -115 S 0.853 -116 S 0.857 -117 N 0.860 -118 S 0.860 -119 S 0.859 -120 A 0.855 -121 E 0.852 -122 H 0.851 -123 S 0.855 -124 L 0.857 -125 G 0.856 -126 S 0.848 -127 L 0.837 -128 K 0.832 -129 P 0.838 -130 T 0.850 -131 S 0.860 -132 T 0.859 -133 I 0.847 -134 S 0.826 -135 T 0.801 -136 S 0.782 -137 P 0.784 -138 P 0.804 -139 L 0.825 -140 I 0.835 -141 H 0.832 -142 S 0.822 -143 F 0.805 -144 V 0.782 -145 S 0.759 -146 K 0.740 -147 V 0.724 -148 P 0.718 -149 W 0.729 -150 N 0.752 -151 A 0.780 -152 P 0.804 -153 I 0.819 -154 A 0.826 -155 D 0.826 -156 E 0.822 -157 D 0.816 -158 L 0.815 -159 L 0.822 -160 P 0.835 -161 I 0.846 -162 S 0.843 -163 A 0.822 -164 H 0.799 -165 P 0.793 -166 N 0.805 -167 A 0.821 -168 T 0.835 -169 P 0.848 -170 A 0.858 -171 L 0.857 -172 S 0.847 -173 S 0.833 -174 E 0.819 -175 N 0.801 -176 F 0.783 -177 T 0.775 -178 W 0.781 -179 S 0.789 -180 L 0.778 -181 V 0.748 -182 N 0.726 -183 D 0.729 -184 T 0.740 -185 V 0.736 -186 K 0.724 -187 T 0.724 -188 P 0.740 -189 D 0.760 -190 N 0.775 -191 S 0.786 -192 S 0.798 -193 I 0.809 -194 T 0.823 -195 V 0.840 -196 S 0.855 -197 I 0.863 -198 L 0.862 -199 S 0.852 -200 S 0.838 -201 E 0.825 -202 P 0.816 -203 T 0.815 -204 S 0.819 -205 P 0.825 -206 S 0.828 -207 V 0.828 -208 T 0.831 -209 P 0.840 -210 L 0.847 -211 I 0.843 -212 V 0.829 -213 E 0.818 -214 P 0.817 -215 S 0.826 -216 G 0.840 -217 W 0.855 -218 L 0.869 -219 T 0.876 -220 T 0.873 -221 N 0.864 -222 S 0.854 -223 D 0.846 -224 S 0.841 -225 F 0.838 -226 T 0.833 -227 G 0.823 -228 F 0.810 -229 T 0.806 -230 P 0.813 -231 Y 0.827 -232 Q 0.839 -233 E 0.847 -234 K 0.849 -235 T 0.846 -236 T 0.838 -237 L 0.829 -238 Q 0.827 -239 P 0.834 -240 T 0.841 -241 L 0.844 -242 K 0.843 -243 F 0.842 -244 T 0.840 -245 N 0.836 -246 N 0.828 -247 S 0.821 -248 K 0.816 -249 L 0.815 -250 F 0.820 -251 P 0.830 -252 N 0.837 -253 T 0.837 -254 S 0.828 -255 D 0.819 -256 P 0.814 -257 Q 0.812 -258 K 0.807 -259 E 0.791 -260 N 0.755 -261 R 0.699 -262 N 0.636 -263 T 0.587 -264 G 0.559 -265 I 0.542 -266 V 0.524 -267 F 0.506 -268 G 0.498 -269 A 0.497 -270 I 0.481 -271 L 0.449 -272 G 0.425 -273 A 0.405 -274 I 0.366 -275 L 0.320 -276 G 0.294 -277 V 0.282 -278 S 0.261 -279 L 0.230 -280 L 0.203 -281 T 0.187 -282 L 0.182 -283 V 0.180 -284 G 0.171 -285 Y 0.160 -286 L 0.168 -287 L 0.211 -288 C 0.284 -289 G 0.368 -290 K 0.456 -291 R 0.543 -292 K 0.616 -293 T 0.662 -294 D 0.680 -295 S 0.681 -296 F 0.678 -297 S 0.680 -298 H 0.691 -299 R 0.711 -300 R 0.736 -301 L 0.754 -302 Y 0.759 -303 D 0.758 -304 D 0.754 -305 R 0.751 -306 N 0.754 -307 E 0.770 -308 P 0.795 -309 V 0.818 -310 L 0.829 -311 R 0.831 -312 L 0.828 -313 D 0.820 -314 N 0.809 -315 A 0.801 -316 P 0.804 -317 E 0.817 -318 P 0.833 -319 Y 0.842 -320 D 0.845 -321 V 0.844 -322 S 0.846 -323 F 0.849 -324 G 0.853 -325 N 0.853 -326 S 0.848 -327 S 0.837 -328 Y 0.821 -329 Y 0.808 -330 N 0.806 -331 P 0.817 -332 T 0.836 -333 L 0.853 -334 N 0.860 -335 D 0.857 -336 S 0.848 -337 A 0.837 -338 M 0.830 -339 P 0.831 -340 E 0.840 -341 S 0.848 -342 E 0.851 -343 E 0.850 -344 N 0.847 -345 A 0.843 -346 R 0.840 -347 D 0.834 -348 G 0.822 -349 I 0.804 -350 P 0.789 -351 M 0.778 -352 D 0.764 -353 D 0.745 -354 I 0.728 -355 P 0.732 -356 P 0.757 -357 L 0.783 -358 R 0.786 -359 T 0.750 -360 S 0.684 -361 V 0.628 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000169550.14_ENST00000529533.6_GN:MUC15_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:89.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000169550.14_ENST00000529533.6_GN:MUC15_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:89.caid deleted file mode 100644 index dc18f65cf817490b44fdd788f7f095b4abc336fa..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000169550.14_ENST00000529533.6_GN:MUC15_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:89.caid +++ /dev/null @@ -1,451 +0,0 @@ ->ENSG00000169550.14|ENST00000529533.6|GN:MUC15|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:89 -1 M 0.469 -2 L 0.518 -3 T 0.575 -4 A 0.585 -5 E 0.531 -6 K 0.468 -7 Q 0.473 -8 V 0.535 -9 S 0.578 -10 Q 0.601 -11 V 0.651 -12 P 0.724 -13 G 0.780 -14 R 0.808 -15 S 0.821 -16 V 0.826 -17 T 0.825 -18 Q 0.819 -19 A 0.809 -20 R 0.797 -21 Y 0.785 -22 S 0.782 -23 Q 0.789 -24 P 0.802 -25 H 0.812 -26 L 0.812 -27 I 0.800 -28 L 0.776 -29 F 0.744 -30 P 0.708 -31 W 0.683 -32 H 0.685 -33 P 0.719 -34 P 0.770 -35 A 0.816 -36 Q 0.841 -37 C 0.849 -38 D 0.849 -39 I 0.845 -40 V 0.835 -41 T 0.812 -42 L 0.778 -43 N 0.747 -44 P 0.736 -45 S 0.746 -46 V 0.766 -47 F 0.785 -48 S 0.800 -49 N 0.812 -50 A 0.820 -51 R 0.825 -52 Q 0.827 -53 I 0.831 -54 P 0.834 -55 F 0.834 -56 R 0.832 -57 Q 0.828 -58 D 0.822 -59 N 0.813 -60 C 0.805 -61 D 0.799 -62 I 0.795 -63 S 0.786 -64 V 0.766 -65 P 0.731 -66 D 0.675 -67 C 0.604 -68 K 0.535 -69 Y 0.478 -70 L 0.433 -71 L 0.399 -72 S 0.377 -73 L 0.360 -74 K 0.335 -75 L 0.298 -76 L 0.259 -77 L 0.229 -78 L 0.207 -79 A 0.187 -80 I 0.170 -81 V 0.159 -82 S 0.161 -83 F 0.171 -84 S 0.181 -85 F 0.185 -86 F 0.195 -87 I 0.224 -88 C 0.275 -89 K 0.344 -90 M 0.426 -91 G 0.500 -92 I 0.531 -93 I 0.518 -94 Q 0.496 -95 S 0.482 -96 I 0.464 -97 L 0.447 -98 A 0.453 -99 T 0.473 -100 S 0.479 -101 R 0.476 -102 D 0.474 -103 C 0.466 -104 Y 0.457 -105 S 0.468 -106 F 0.502 -107 K 0.535 -108 K 0.552 -109 K 0.563 -110 P 0.583 -111 I 0.612 -112 P 0.638 -113 K 0.653 -114 K 0.656 -115 P 0.638 -116 T 0.585 -117 M 0.502 -118 L 0.424 -119 A 0.380 -120 L 0.361 -121 A 0.340 -122 K 0.309 -123 I 0.271 -124 L 0.234 -125 L 0.210 -126 I 0.198 -127 S 0.190 -128 T 0.182 -129 L 0.178 -130 F 0.177 -131 Y 0.179 -132 S 0.193 -133 L 0.228 -134 L 0.297 -135 S 0.397 -136 G 0.506 -137 S 0.600 -138 H 0.676 -139 G 0.734 -140 K 0.773 -141 E 0.795 -142 N 0.805 -143 Q 0.809 -144 D 0.809 -145 I 0.805 -146 N 0.787 -147 T 0.738 -148 T 0.666 -149 Q 0.614 -150 N 0.599 -151 I 0.578 -152 A 0.528 -153 E 0.491 -154 V 0.505 -155 F 0.553 -156 K 0.608 -157 T 0.660 -158 M 0.700 -159 E 0.719 -160 N 0.726 -161 K 0.743 -162 P 0.778 -163 I 0.814 -164 S 0.841 -165 L 0.856 -166 E 0.863 -167 S 0.866 -168 E 0.865 -169 A 0.859 -170 N 0.849 -171 L 0.839 -172 N 0.833 -173 S 0.832 -174 D 0.833 -175 K 0.836 -176 E 0.841 -177 N 0.840 -178 I 0.822 -179 T 0.772 -180 T 0.704 -181 S 0.671 -182 N 0.708 -183 L 0.777 -184 K 0.824 -185 A 0.838 -186 S 0.827 -187 H 0.806 -188 S 0.792 -189 P 0.797 -190 P 0.819 -191 L 0.838 -192 N 0.846 -193 L 0.847 -194 P 0.850 -195 N 0.857 -196 N 0.865 -197 S 0.873 -198 H 0.878 -199 G 0.880 -200 I 0.879 -201 T 0.872 -202 D 0.865 -203 F 0.860 -204 S 0.860 -205 S 0.862 -206 N 0.863 -207 S 0.863 -208 S 0.861 -209 A 0.857 -210 E 0.854 -211 H 0.854 -212 S 0.856 -213 L 0.860 -214 G 0.859 -215 S 0.853 -216 L 0.843 -217 K 0.839 -218 P 0.844 -219 T 0.856 -220 S 0.866 -221 T 0.866 -222 I 0.855 -223 S 0.834 -224 T 0.808 -225 S 0.789 -226 P 0.791 -227 P 0.811 -228 L 0.831 -229 I 0.839 -230 H 0.837 -231 S 0.830 -232 F 0.817 -233 V 0.800 -234 S 0.781 -235 K 0.762 -236 V 0.745 -237 P 0.737 -238 W 0.744 -239 N 0.763 -240 A 0.788 -241 P 0.811 -242 I 0.826 -243 A 0.832 -244 D 0.830 -245 E 0.823 -246 D 0.815 -247 L 0.810 -248 L 0.816 -249 P 0.830 -250 I 0.842 -251 S 0.839 -252 A 0.820 -253 H 0.800 -254 P 0.795 -255 N 0.803 -256 A 0.814 -257 T 0.824 -258 P 0.836 -259 A 0.846 -260 L 0.845 -261 S 0.835 -262 S 0.821 -263 E 0.805 -264 N 0.785 -265 F 0.766 -266 T 0.759 -267 W 0.769 -268 S 0.780 -269 L 0.774 -270 V 0.751 -271 N 0.733 -272 D 0.734 -273 T 0.737 -274 V 0.726 -275 K 0.713 -276 T 0.715 -277 P 0.734 -278 D 0.757 -279 N 0.772 -280 S 0.782 -281 S 0.792 -282 I 0.803 -283 T 0.817 -284 V 0.834 -285 S 0.848 -286 I 0.854 -287 L 0.853 -288 S 0.844 -289 S 0.831 -290 E 0.819 -291 P 0.814 -292 T 0.816 -293 S 0.823 -294 P 0.831 -295 S 0.835 -296 V 0.834 -297 T 0.837 -298 P 0.846 -299 L 0.852 -300 I 0.848 -301 V 0.836 -302 E 0.827 -303 P 0.829 -304 S 0.839 -305 G 0.854 -306 W 0.867 -307 L 0.880 -308 T 0.887 -309 T 0.886 -310 N 0.879 -311 S 0.869 -312 D 0.862 -313 S 0.858 -314 F 0.856 -315 T 0.852 -316 G 0.843 -317 F 0.831 -318 T 0.827 -319 P 0.834 -320 Y 0.847 -321 Q 0.858 -322 E 0.863 -323 K 0.864 -324 T 0.859 -325 T 0.849 -326 L 0.838 -327 Q 0.835 -328 P 0.841 -329 T 0.850 -330 L 0.855 -331 K 0.856 -332 F 0.857 -333 T 0.857 -334 N 0.856 -335 N 0.851 -336 S 0.846 -337 K 0.842 -338 L 0.841 -339 F 0.844 -340 P 0.850 -341 N 0.854 -342 T 0.850 -343 S 0.841 -344 D 0.832 -345 P 0.828 -346 Q 0.827 -347 K 0.826 -348 E 0.818 -349 N 0.794 -350 R 0.753 -351 N 0.707 -352 T 0.669 -353 G 0.648 -354 I 0.632 -355 V 0.605 -356 F 0.570 -357 G 0.549 -358 A 0.543 -359 I 0.526 -360 L 0.490 -361 G 0.464 -362 A 0.449 -363 I 0.414 -364 L 0.363 -365 G 0.327 -366 V 0.306 -367 S 0.277 -368 L 0.241 -369 L 0.209 -370 T 0.191 -371 L 0.184 -372 V 0.182 -373 G 0.174 -374 Y 0.163 -375 L 0.171 -376 L 0.215 -377 C 0.290 -378 G 0.375 -379 K 0.460 -380 R 0.542 -381 K 0.612 -382 T 0.657 -383 D 0.675 -384 S 0.676 -385 F 0.673 -386 S 0.676 -387 H 0.687 -388 R 0.709 -389 R 0.736 -390 L 0.756 -391 Y 0.762 -392 D 0.762 -393 D 0.758 -394 R 0.754 -395 N 0.756 -396 E 0.771 -397 P 0.795 -398 V 0.817 -399 L 0.828 -400 R 0.830 -401 L 0.826 -402 D 0.818 -403 N 0.806 -404 A 0.798 -405 P 0.803 -406 E 0.818 -407 P 0.835 -408 Y 0.845 -409 D 0.847 -410 V 0.846 -411 S 0.847 -412 F 0.851 -413 G 0.853 -414 N 0.853 -415 S 0.846 -416 S 0.835 -417 Y 0.819 -418 Y 0.807 -419 N 0.805 -420 P 0.817 -421 T 0.836 -422 L 0.852 -423 N 0.857 -424 D 0.853 -425 S 0.843 -426 A 0.832 -427 M 0.825 -428 P 0.826 -429 E 0.835 -430 S 0.845 -431 E 0.848 -432 E 0.848 -433 N 0.845 -434 A 0.841 -435 R 0.838 -436 D 0.833 -437 G 0.821 -438 I 0.804 -439 P 0.790 -440 M 0.781 -441 D 0.770 -442 D 0.750 -443 I 0.732 -444 P 0.734 -445 P 0.757 -446 L 0.783 -447 R 0.788 -448 T 0.756 -449 S 0.697 -450 V 0.645 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000169814.19_ENST00000643237.3_GN:BTD_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000169814.19_ENST00000643237.3_GN:BTD_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 19af48955114c1c8f000cdead03927e91c231a2f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000169814.19_ENST00000643237.3_GN:BTD_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,524 +0,0 @@ ->ENSG00000169814.19|ENST00000643237.3|GN:BTD|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.363 -2 S 0.381 -3 G 0.404 -4 A 0.404 -5 R 0.364 -6 S 0.309 -7 K 0.283 -8 L 0.291 -9 A 0.299 -10 L 0.299 -11 F 0.303 -12 L 0.313 -13 C 0.323 -14 G 0.327 -15 C 0.317 -16 Y 0.294 -17 V 0.278 -18 V 0.303 -19 A 0.373 -20 L 0.454 -21 G 0.518 -22 A 0.559 -23 H 0.589 -24 T 0.617 -25 G 0.638 -26 E 0.648 -27 E 0.649 -28 S 0.644 -29 V 0.628 -30 A 0.600 -31 D 0.560 -32 H 0.506 -33 H 0.437 -34 E 0.352 -35 A 0.255 -36 E 0.160 -37 Y 0.090 -38 Y 0.053 -39 V 0.041 -40 A 0.041 -41 A 0.047 -42 V 0.055 -43 Y 0.064 -44 E 0.073 -45 H 0.083 -46 P 0.098 -47 S 0.118 -48 I 0.141 -49 L 0.162 -50 S 0.181 -51 L 0.200 -52 N 0.215 -53 P 0.221 -54 L 0.221 -55 A 0.216 -56 L 0.200 -57 I 0.173 -58 S 0.143 -59 R 0.118 -60 Q 0.103 -61 E 0.099 -62 A 0.103 -63 L 0.111 -64 E 0.119 -65 L 0.121 -66 M 0.113 -67 N 0.101 -68 Q 0.095 -69 N 0.096 -70 L 0.098 -71 D 0.095 -72 I 0.087 -73 Y 0.082 -74 E 0.080 -75 Q 0.077 -76 Q 0.067 -77 V 0.055 -78 M 0.047 -79 T 0.047 -80 A 0.054 -81 A 0.064 -82 Q 0.074 -83 K 0.082 -84 D 0.085 -85 V 0.082 -86 Q 0.079 -87 I 0.079 -88 I 0.078 -89 V 0.073 -90 F 0.067 -91 P 0.067 -92 E 0.072 -93 D 0.077 -94 G 0.077 -95 I 0.073 -96 H 0.073 -97 G 0.084 -98 F 0.097 -99 N 0.106 -100 F 0.107 -101 T 0.103 -102 R 0.091 -103 T 0.075 -104 S 0.063 -105 I 0.059 -106 Y 0.063 -107 P 0.071 -108 F 0.079 -109 L 0.085 -110 D 0.091 -111 F 0.098 -112 M 0.103 -113 P 0.099 -114 S 0.086 -115 P 0.074 -116 Q 0.069 -117 V 0.070 -118 V 0.074 -119 R 0.078 -120 W 0.083 -121 N 0.084 -122 P 0.082 -123 C 0.079 -124 L 0.080 -125 E 0.084 -126 P 0.090 -127 H 0.096 -128 R 0.103 -129 F 0.116 -130 N 0.130 -131 D 0.132 -132 T 0.117 -133 E 0.098 -134 V 0.090 -135 L 0.089 -136 Q 0.085 -137 R 0.074 -138 L 0.065 -139 S 0.060 -140 C 0.058 -141 M 0.055 -142 A 0.054 -143 I 0.053 -144 R 0.052 -145 G 0.052 -146 D 0.054 -147 M 0.057 -148 F 0.060 -149 L 0.062 -150 V 0.065 -151 A 0.070 -152 N 0.078 -153 L 0.085 -154 G 0.091 -155 T 0.097 -156 K 0.103 -157 E 0.108 -158 P 0.114 -159 C 0.116 -160 H 0.114 -161 S 0.110 -162 S 0.111 -163 D 0.118 -164 P 0.132 -165 R 0.151 -166 C 0.162 -167 P 0.155 -168 K 0.139 -169 D 0.126 -170 G 0.121 -171 R 0.126 -172 Y 0.132 -173 Q 0.132 -174 F 0.125 -175 N 0.115 -176 T 0.102 -177 N 0.087 -178 V 0.074 -179 V 0.067 -180 F 0.066 -181 S 0.073 -182 N 0.088 -183 N 0.102 -184 G 0.106 -185 T 0.102 -186 L 0.097 -187 V 0.096 -188 D 0.096 -189 R 0.092 -190 Y 0.087 -191 R 0.084 -192 K 0.085 -193 H 0.086 -194 N 0.087 -195 L 0.088 -196 Y 0.092 -197 F 0.099 -198 E 0.104 -199 A 0.104 -200 A 0.105 -201 F 0.112 -202 D 0.125 -203 V 0.137 -204 P 0.142 -205 L 0.144 -206 K 0.146 -207 V 0.150 -208 D 0.149 -209 L 0.137 -210 I 0.117 -211 T 0.093 -212 F 0.075 -213 D 0.065 -214 T 0.063 -215 P 0.062 -216 F 0.062 -217 A 0.062 -218 G 0.065 -219 R 0.070 -220 F 0.075 -221 G 0.081 -222 I 0.090 -223 F 0.101 -224 T 0.118 -225 C 0.137 -226 F 0.149 -227 D 0.146 -228 I 0.123 -229 L 0.092 -230 F 0.065 -231 F 0.048 -232 D 0.036 -233 P 0.028 -234 A 0.023 -235 I 0.023 -236 R 0.026 -237 V 0.028 -238 L 0.031 -239 R 0.037 -240 D 0.047 -241 Y 0.055 -242 K 0.060 -243 V 0.065 -244 K 0.078 -245 H 0.099 -246 V 0.118 -247 V 0.126 -248 Y 0.125 -249 P 0.123 -250 T 0.127 -251 A 0.132 -252 W 0.131 -253 M 0.117 -254 N 0.095 -255 Q 0.076 -256 L 0.067 -257 P 0.070 -258 L 0.079 -259 L 0.083 -260 A 0.076 -261 A 0.062 -262 I 0.050 -263 E 0.042 -264 I 0.040 -265 Q 0.042 -266 K 0.045 -267 A 0.046 -268 F 0.047 -269 A 0.048 -270 V 0.048 -271 A 0.049 -272 F 0.053 -273 G 0.060 -274 I 0.068 -275 N 0.077 -276 V 0.085 -277 L 0.090 -278 A 0.091 -279 A 0.089 -280 N 0.086 -281 V 0.083 -282 H 0.081 -283 H 0.080 -284 P 0.083 -285 V 0.091 -286 L 0.103 -287 G 0.115 -288 M 0.123 -289 T 0.128 -290 G 0.134 -291 S 0.142 -292 G 0.147 -293 I 0.141 -294 H 0.123 -295 T 0.103 -296 P 0.093 -297 L 0.096 -298 E 0.110 -299 S 0.127 -300 F 0.137 -301 W 0.136 -302 Y 0.133 -303 H 0.133 -304 D 0.137 -305 M 0.138 -306 E 0.134 -307 N 0.128 -308 P 0.125 -309 K 0.128 -310 S 0.137 -311 H 0.143 -312 L 0.142 -313 I 0.132 -314 I 0.115 -315 A 0.100 -316 Q 0.087 -317 V 0.081 -318 A 0.091 -319 K 0.131 -320 N 0.202 -321 P 0.288 -322 V 0.376 -323 G 0.465 -324 L 0.550 -325 I 0.613 -326 G 0.646 -327 A 0.658 -328 E 0.660 -329 N 0.655 -330 A 0.646 -331 T 0.635 -332 G 0.614 -333 E 0.569 -334 T 0.503 -335 D 0.435 -336 P 0.381 -337 S 0.344 -338 H 0.317 -339 S 0.294 -340 K 0.272 -341 F 0.254 -342 L 0.245 -343 K 0.244 -344 I 0.251 -345 L 0.264 -346 S 0.288 -347 G 0.320 -348 D 0.354 -349 P 0.378 -350 Y 0.388 -351 C 0.388 -352 E 0.387 -353 K 0.390 -354 D 0.397 -355 A 0.406 -356 Q 0.419 -357 E 0.436 -358 V 0.443 -359 H 0.423 -360 C 0.388 -361 D 0.354 -362 E 0.322 -363 A 0.285 -364 T 0.244 -365 K 0.210 -366 W 0.195 -367 N 0.193 -368 V 0.192 -369 N 0.187 -370 A 0.181 -371 P 0.171 -372 P 0.155 -373 T 0.138 -374 F 0.126 -375 H 0.118 -376 S 0.112 -377 E 0.108 -378 M 0.107 -379 M 0.108 -380 Y 0.108 -381 D 0.108 -382 N 0.106 -383 F 0.102 -384 T 0.098 -385 L 0.096 -386 V 0.096 -387 P 0.093 -388 V 0.088 -389 W 0.084 -390 G 0.082 -391 K 0.079 -392 E 0.078 -393 G 0.079 -394 Y 0.081 -395 L 0.084 -396 H 0.084 -397 V 0.085 -398 C 0.089 -399 S 0.093 -400 N 0.092 -401 G 0.084 -402 L 0.078 -403 C 0.079 -404 C 0.089 -405 Y 0.102 -406 L 0.110 -407 L 0.109 -408 Y 0.101 -409 E 0.095 -410 R 0.095 -411 P 0.100 -412 T 0.110 -413 L 0.120 -414 S 0.121 -415 K 0.114 -416 E 0.107 -417 L 0.105 -418 Y 0.108 -419 A 0.114 -420 L 0.123 -421 G 0.134 -422 V 0.143 -423 F 0.141 -424 D 0.127 -425 G 0.111 -426 L 0.099 -427 H 0.094 -428 T 0.089 -429 V 0.079 -430 H 0.067 -431 G 0.063 -432 T 0.072 -433 Y 0.090 -434 Y 0.105 -435 I 0.110 -436 Q 0.104 -437 V 0.094 -438 C 0.088 -439 A 0.090 -440 L 0.097 -441 V 0.104 -442 R 0.110 -443 C 0.122 -444 G 0.135 -445 G 0.139 -446 L 0.129 -447 G 0.114 -448 F 0.103 -449 D 0.098 -450 T 0.096 -451 C 0.098 -452 G 0.104 -453 Q 0.112 -454 E 0.117 -455 I 0.116 -456 T 0.113 -457 E 0.112 -458 A 0.110 -459 T 0.104 -460 G 0.097 -461 I 0.091 -462 F 0.087 -463 E 0.087 -464 F 0.087 -465 H 0.086 -466 L 0.085 -467 W 0.082 -468 G 0.076 -469 N 0.066 -470 F 0.056 -471 S 0.052 -472 T 0.053 -473 S 0.060 -474 Y 0.070 -475 I 0.081 -476 F 0.090 -477 P 0.096 -478 L 0.101 -479 F 0.114 -480 L 0.135 -481 T 0.154 -482 S 0.160 -483 G 0.151 -484 M 0.140 -485 T 0.141 -486 L 0.155 -487 E 0.179 -488 V 0.200 -489 P 0.208 -490 D 0.201 -491 Q 0.186 -492 L 0.174 -493 G 0.163 -494 W 0.151 -495 E 0.134 -496 N 0.113 -497 D 0.094 -498 H 0.081 -499 Y 0.075 -500 F 0.074 -501 L 0.077 -502 R 0.086 -503 K 0.096 -504 S 0.106 -505 R 0.114 -506 L 0.125 -507 S 0.140 -508 S 0.151 -509 G 0.155 -510 L 0.145 -511 V 0.125 -512 T 0.106 -513 A 0.096 -514 A 0.093 -515 L 0.096 -516 Y 0.101 -517 G 0.106 -518 R 0.109 -519 L 0.114 -520 Y 0.133 -521 E 0.171 -522 R 0.219 -523 D 0.254 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000169814.19_ENST00000643237.3_GN:BTD_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000169814.19_ENST00000643237.3_GN:BTD_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid deleted file mode 100644 index 2767e7a8d07f80563f8a79e00cfb7a8df2ca1996..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000169814.19_ENST00000643237.3_GN:BTD_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid +++ /dev/null @@ -1,544 +0,0 @@ ->ENSG00000169814.19|ENST00000643237.3|GN:BTD|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:20 -1 M 0.273 -2 A 0.280 -3 H 0.302 -4 A 0.333 -5 H 0.352 -6 I 0.358 -7 Q 0.373 -8 G 0.397 -9 G 0.395 -10 R 0.369 -11 R 0.367 -12 A 0.387 -13 K 0.382 -14 S 0.357 -15 R 0.373 -16 F 0.437 -17 V 0.492 -18 V 0.506 -19 C 0.497 -20 I 0.483 -21 M 0.472 -22 S 0.480 -23 G 0.516 -24 A 0.556 -25 R 0.574 -26 S 0.570 -27 K 0.551 -28 L 0.514 -29 A 0.468 -30 L 0.443 -31 F 0.450 -32 L 0.466 -33 C 0.474 -34 G 0.482 -35 C 0.491 -36 Y 0.497 -37 V 0.502 -38 V 0.505 -39 A 0.511 -40 L 0.524 -41 G 0.546 -42 A 0.568 -43 H 0.591 -44 T 0.618 -45 G 0.644 -46 E 0.660 -47 E 0.666 -48 S 0.662 -49 V 0.648 -50 A 0.622 -51 D 0.583 -52 H 0.527 -53 H 0.454 -54 E 0.364 -55 A 0.261 -56 E 0.163 -57 Y 0.090 -58 Y 0.053 -59 V 0.041 -60 A 0.042 -61 A 0.047 -62 V 0.055 -63 Y 0.064 -64 E 0.073 -65 H 0.083 -66 P 0.097 -67 S 0.118 -68 I 0.140 -69 L 0.159 -70 S 0.177 -71 L 0.196 -72 N 0.211 -73 P 0.217 -74 L 0.216 -75 A 0.209 -76 L 0.192 -77 I 0.165 -78 S 0.136 -79 R 0.111 -80 Q 0.097 -81 E 0.094 -82 A 0.099 -83 L 0.108 -84 E 0.116 -85 L 0.118 -86 M 0.110 -87 N 0.098 -88 Q 0.092 -89 N 0.092 -90 L 0.093 -91 D 0.089 -92 I 0.082 -93 Y 0.078 -94 E 0.078 -95 Q 0.075 -96 Q 0.065 -97 V 0.053 -98 M 0.045 -99 T 0.045 -100 A 0.051 -101 A 0.060 -102 Q 0.069 -103 K 0.077 -104 D 0.082 -105 V 0.080 -106 Q 0.078 -107 I 0.079 -108 I 0.078 -109 V 0.073 -110 F 0.067 -111 P 0.066 -112 E 0.071 -113 D 0.076 -114 G 0.076 -115 I 0.071 -116 H 0.071 -117 G 0.081 -118 F 0.094 -119 N 0.102 -120 F 0.104 -121 T 0.100 -122 R 0.089 -123 T 0.073 -124 S 0.062 -125 I 0.059 -126 Y 0.063 -127 P 0.071 -128 F 0.079 -129 L 0.086 -130 D 0.092 -131 F 0.101 -132 M 0.106 -133 P 0.101 -134 S 0.087 -135 P 0.075 -136 Q 0.070 -137 V 0.071 -138 V 0.075 -139 R 0.078 -140 W 0.083 -141 N 0.084 -142 P 0.082 -143 C 0.079 -144 L 0.079 -145 E 0.084 -146 P 0.090 -147 H 0.096 -148 R 0.104 -149 F 0.118 -150 N 0.132 -151 D 0.134 -152 T 0.118 -153 E 0.098 -154 V 0.089 -155 L 0.087 -156 Q 0.083 -157 R 0.072 -158 L 0.063 -159 S 0.059 -160 C 0.056 -161 M 0.054 -162 A 0.053 -163 I 0.052 -164 R 0.052 -165 G 0.052 -166 D 0.053 -167 M 0.055 -168 F 0.059 -169 L 0.061 -170 V 0.063 -171 A 0.069 -172 N 0.077 -173 L 0.084 -174 G 0.090 -175 T 0.096 -176 K 0.102 -177 E 0.107 -178 P 0.111 -179 C 0.113 -180 H 0.111 -181 S 0.107 -182 S 0.108 -183 D 0.115 -184 P 0.129 -185 R 0.149 -186 C 0.159 -187 P 0.153 -188 K 0.136 -189 D 0.123 -190 G 0.119 -191 R 0.124 -192 Y 0.131 -193 Q 0.131 -194 F 0.124 -195 N 0.115 -196 T 0.102 -197 N 0.087 -198 V 0.074 -199 V 0.067 -200 F 0.066 -201 S 0.073 -202 N 0.087 -203 N 0.100 -204 G 0.105 -205 T 0.100 -206 L 0.096 -207 V 0.095 -208 D 0.095 -209 R 0.091 -210 Y 0.086 -211 R 0.083 -212 K 0.084 -213 H 0.086 -214 N 0.086 -215 L 0.087 -216 Y 0.091 -217 F 0.098 -218 E 0.103 -219 A 0.103 -220 A 0.103 -221 F 0.110 -222 D 0.122 -223 V 0.133 -224 P 0.140 -225 L 0.141 -226 K 0.144 -227 V 0.147 -228 D 0.146 -229 L 0.135 -230 I 0.115 -231 T 0.091 -232 F 0.073 -233 D 0.063 -234 T 0.061 -235 P 0.061 -236 F 0.061 -237 A 0.061 -238 G 0.064 -239 R 0.069 -240 F 0.074 -241 G 0.081 -242 I 0.089 -243 F 0.101 -244 T 0.117 -245 C 0.136 -246 F 0.148 -247 D 0.145 -248 I 0.123 -249 L 0.091 -250 F 0.065 -251 F 0.047 -252 D 0.035 -253 P 0.027 -254 A 0.023 -255 I 0.023 -256 R 0.026 -257 V 0.028 -258 L 0.031 -259 R 0.037 -260 D 0.046 -261 Y 0.054 -262 K 0.059 -263 V 0.065 -264 K 0.078 -265 H 0.099 -266 V 0.119 -267 V 0.127 -268 Y 0.125 -269 P 0.124 -270 T 0.128 -271 A 0.133 -272 W 0.132 -273 M 0.118 -274 N 0.096 -275 Q 0.076 -276 L 0.067 -277 P 0.070 -278 L 0.080 -279 L 0.084 -280 A 0.077 -281 A 0.063 -282 I 0.050 -283 E 0.042 -284 I 0.041 -285 Q 0.043 -286 K 0.045 -287 A 0.046 -288 F 0.047 -289 A 0.048 -290 V 0.048 -291 A 0.049 -292 F 0.053 -293 G 0.060 -294 I 0.068 -295 N 0.077 -296 V 0.085 -297 L 0.090 -298 A 0.091 -299 A 0.089 -300 N 0.086 -301 V 0.083 -302 H 0.081 -303 H 0.080 -304 P 0.083 -305 V 0.091 -306 L 0.104 -307 G 0.116 -308 M 0.124 -309 T 0.129 -310 G 0.135 -311 S 0.143 -312 G 0.148 -313 I 0.142 -314 H 0.124 -315 T 0.104 -316 P 0.093 -317 L 0.095 -318 E 0.110 -319 S 0.126 -320 F 0.136 -321 W 0.136 -322 Y 0.133 -323 H 0.133 -324 D 0.136 -325 M 0.137 -326 E 0.133 -327 N 0.128 -328 P 0.124 -329 K 0.128 -330 S 0.137 -331 H 0.144 -332 L 0.144 -333 I 0.133 -334 I 0.117 -335 A 0.101 -336 Q 0.088 -337 V 0.081 -338 A 0.091 -339 K 0.130 -340 N 0.201 -341 P 0.286 -342 V 0.374 -343 G 0.464 -344 L 0.549 -345 I 0.613 -346 G 0.646 -347 A 0.658 -348 E 0.660 -349 N 0.655 -350 A 0.645 -351 T 0.634 -352 G 0.613 -353 E 0.569 -354 T 0.503 -355 D 0.434 -356 P 0.380 -357 S 0.343 -358 H 0.316 -359 S 0.293 -360 K 0.272 -361 F 0.253 -362 L 0.244 -363 K 0.244 -364 I 0.250 -365 L 0.263 -366 S 0.286 -367 G 0.318 -368 D 0.352 -369 P 0.376 -370 Y 0.387 -371 C 0.389 -372 E 0.388 -373 K 0.390 -374 D 0.396 -375 A 0.405 -376 Q 0.417 -377 E 0.434 -378 V 0.439 -379 H 0.419 -380 C 0.383 -381 D 0.349 -382 E 0.317 -383 A 0.281 -384 T 0.239 -385 K 0.205 -386 W 0.190 -387 N 0.189 -388 V 0.187 -389 N 0.183 -390 A 0.177 -391 P 0.168 -392 P 0.153 -393 T 0.136 -394 F 0.124 -395 H 0.116 -396 S 0.110 -397 E 0.107 -398 M 0.107 -399 M 0.109 -400 Y 0.109 -401 D 0.108 -402 N 0.105 -403 F 0.102 -404 T 0.097 -405 L 0.095 -406 V 0.095 -407 P 0.092 -408 V 0.087 -409 W 0.083 -410 G 0.081 -411 K 0.079 -412 E 0.077 -413 G 0.078 -414 Y 0.080 -415 L 0.084 -416 H 0.085 -417 V 0.085 -418 C 0.090 -419 S 0.094 -420 N 0.092 -421 G 0.084 -422 L 0.078 -423 C 0.080 -424 C 0.089 -425 Y 0.102 -426 L 0.110 -427 L 0.108 -428 Y 0.100 -429 E 0.094 -430 R 0.094 -431 P 0.100 -432 T 0.111 -433 L 0.121 -434 S 0.123 -435 K 0.116 -436 E 0.109 -437 L 0.107 -438 Y 0.110 -439 A 0.116 -440 L 0.125 -441 G 0.137 -442 V 0.146 -443 F 0.143 -444 D 0.129 -445 G 0.112 -446 L 0.101 -447 H 0.096 -448 T 0.091 -449 V 0.080 -450 H 0.068 -451 G 0.064 -452 T 0.073 -453 Y 0.090 -454 Y 0.105 -455 I 0.110 -456 Q 0.105 -457 V 0.095 -458 C 0.090 -459 A 0.091 -460 L 0.098 -461 V 0.105 -462 R 0.110 -463 C 0.122 -464 G 0.135 -465 G 0.139 -466 L 0.129 -467 G 0.114 -468 F 0.103 -469 D 0.098 -470 T 0.097 -471 C 0.099 -472 G 0.105 -473 Q 0.113 -474 E 0.118 -475 I 0.118 -476 T 0.115 -477 E 0.113 -478 A 0.111 -479 T 0.105 -480 G 0.098 -481 I 0.092 -482 F 0.089 -483 E 0.088 -484 F 0.088 -485 H 0.087 -486 L 0.085 -487 W 0.083 -488 G 0.076 -489 N 0.066 -490 F 0.057 -491 S 0.053 -492 T 0.055 -493 S 0.062 -494 Y 0.073 -495 I 0.085 -496 F 0.093 -497 P 0.098 -498 L 0.103 -499 F 0.115 -500 L 0.135 -501 T 0.154 -502 S 0.161 -503 G 0.153 -504 M 0.142 -505 T 0.142 -506 L 0.158 -507 E 0.182 -508 V 0.206 -509 P 0.218 -510 D 0.212 -511 Q 0.198 -512 L 0.184 -513 G 0.171 -514 W 0.156 -515 E 0.137 -516 N 0.115 -517 D 0.096 -518 H 0.083 -519 Y 0.077 -520 F 0.076 -521 L 0.080 -522 R 0.089 -523 K 0.101 -524 S 0.110 -525 R 0.117 -526 L 0.128 -527 S 0.141 -528 S 0.152 -529 G 0.154 -530 L 0.144 -531 V 0.126 -532 T 0.108 -533 A 0.100 -534 A 0.099 -535 L 0.103 -536 Y 0.107 -537 G 0.110 -538 R 0.109 -539 L 0.111 -540 Y 0.128 -541 E 0.164 -542 R 0.213 -543 D 0.250 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170634.13_ENST00000394666.9_GN:ACYP2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170634.13_ENST00000394666.9_GN:ACYP2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 6746668c5943810c4672db68919ab88869749cce..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170634.13_ENST00000394666.9_GN:ACYP2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,100 +0,0 @@ ->ENSG00000170634.13|ENST00000394666.9|GN:ACYP2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.451 -2 S 0.455 -3 T 0.457 -4 A 0.434 -5 Q 0.368 -6 S 0.270 -7 L 0.172 -8 K 0.100 -9 S 0.058 -10 V 0.040 -11 D 0.033 -12 Y 0.032 -13 E 0.037 -14 V 0.049 -15 F 0.065 -16 G 0.080 -17 R 0.094 -18 V 0.109 -19 Q 0.121 -20 G 0.123 -21 V 0.112 -22 C 0.094 -23 F 0.073 -24 R 0.057 -25 M 0.048 -26 Y 0.046 -27 T 0.050 -28 E 0.059 -29 D 0.063 -30 E 0.058 -31 A 0.049 -32 R 0.044 -33 K 0.045 -34 I 0.046 -35 G 0.047 -36 V 0.047 -37 V 0.044 -38 G 0.041 -39 W 0.040 -40 V 0.046 -41 K 0.058 -42 N 0.073 -43 T 0.084 -44 S 0.090 -45 K 0.090 -46 G 0.084 -47 T 0.070 -48 V 0.056 -49 T 0.045 -50 G 0.041 -51 Q 0.043 -52 V 0.049 -53 Q 0.055 -54 G 0.057 -55 P 0.053 -56 E 0.043 -57 D 0.034 -58 K 0.029 -59 V 0.027 -60 N 0.029 -61 S 0.036 -62 M 0.048 -63 K 0.063 -64 S 0.071 -65 W 0.069 -66 L 0.066 -67 S 0.067 -68 K 0.071 -69 V 0.078 -70 G 0.091 -71 S 0.102 -72 P 0.105 -73 S 0.101 -74 S 0.094 -75 R 0.084 -76 I 0.074 -77 D 0.065 -78 R 0.058 -79 T 0.055 -80 N 0.053 -81 F 0.051 -82 S 0.050 -83 N 0.050 -84 E 0.050 -85 K 0.049 -86 T 0.051 -87 I 0.057 -88 S 0.064 -89 K 0.070 -90 L 0.075 -91 E 0.078 -92 Y 0.078 -93 S 0.075 -94 N 0.075 -95 F 0.082 -96 S 0.092 -97 I 0.105 -98 R 0.118 -99 Y 0.127 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170634.13_ENST00000394666.9_GN:ACYP2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:28.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170634.13_ENST00000394666.9_GN:ACYP2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:28.caid deleted file mode 100644 index 88dc69df6dc82bdedb157a32038a249f8b734f32..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170634.13_ENST00000394666.9_GN:ACYP2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:28.caid +++ /dev/null @@ -1,128 +0,0 @@ ->ENSG00000170634.13|ENST00000394666.9|GN:ACYP2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:28 -1 M 0.418 -2 C 0.448 -3 P 0.497 -4 L 0.542 -5 P 0.558 -6 L 0.545 -7 A 0.545 -8 A 0.587 -9 A 0.644 -10 A 0.675 -11 V 0.676 -12 A 0.660 -13 A 0.644 -14 P 0.634 -15 R 0.629 -16 A 0.619 -17 P 0.588 -18 L 0.543 -19 R 0.524 -20 L 0.558 -21 L 0.617 -22 N 0.660 -23 R 0.684 -24 G 0.703 -25 L 0.718 -26 A 0.726 -27 A 0.724 -28 A 0.712 -29 M 0.692 -30 S 0.666 -31 T 0.624 -32 A 0.548 -33 Q 0.431 -34 S 0.298 -35 L 0.184 -36 K 0.105 -37 S 0.059 -38 V 0.039 -39 D 0.031 -40 Y 0.030 -41 E 0.036 -42 V 0.049 -43 F 0.064 -44 G 0.079 -45 R 0.095 -46 V 0.112 -47 Q 0.126 -48 G 0.129 -49 V 0.119 -50 C 0.099 -51 F 0.078 -52 R 0.061 -53 M 0.051 -54 Y 0.047 -55 T 0.048 -56 E 0.053 -57 D 0.054 -58 E 0.050 -59 A 0.043 -60 R 0.040 -61 K 0.040 -62 I 0.042 -63 G 0.045 -64 V 0.046 -65 V 0.044 -66 G 0.041 -67 W 0.040 -68 V 0.045 -69 K 0.055 -70 N 0.068 -71 T 0.079 -72 S 0.085 -73 K 0.086 -74 G 0.079 -75 T 0.067 -76 V 0.054 -77 T 0.045 -78 G 0.042 -79 Q 0.045 -80 V 0.051 -81 Q 0.057 -82 G 0.058 -83 P 0.053 -84 E 0.043 -85 D 0.034 -86 K 0.028 -87 V 0.026 -88 N 0.028 -89 S 0.032 -90 M 0.038 -91 K 0.043 -92 S 0.045 -93 W 0.049 -94 L 0.055 -95 S 0.063 -96 K 0.069 -97 V 0.075 -98 G 0.086 -99 S 0.097 -100 P 0.100 -101 S 0.097 -102 S 0.091 -103 R 0.083 -104 I 0.074 -105 D 0.065 -106 R 0.058 -107 T 0.054 -108 N 0.050 -109 F 0.046 -110 S 0.044 -111 N 0.043 -112 E 0.042 -113 K 0.041 -114 T 0.043 -115 I 0.047 -116 S 0.054 -117 K 0.061 -118 L 0.066 -119 E 0.070 -120 Y 0.071 -121 S 0.071 -122 N 0.073 -123 F 0.079 -124 S 0.089 -125 I 0.100 -126 R 0.112 -127 Y 0.121 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170835.17_ENST00000372080.8_GN:CEL_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170835.17_ENST00000372080.8_GN:CEL_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index c337b94e9652328ab7d74204ef78423daac0585e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170835.17_ENST00000372080.8_GN:CEL_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,754 +0,0 @@ ->ENSG00000170835.17|ENST00000372080.8|GN:CEL|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.277 -2 G 0.263 -3 R 0.240 -4 L 0.220 -5 Q 0.207 -6 L 0.204 -7 V 0.214 -8 V 0.235 -9 L 0.255 -10 G 0.267 -11 L 0.266 -12 T 0.248 -13 C 0.228 -14 C 0.230 -15 W 0.264 -16 A 0.317 -17 V 0.368 -18 A 0.408 -19 S 0.428 -20 A 0.419 -21 A 0.374 -22 K 0.308 -23 L 0.239 -24 G 0.177 -25 A 0.128 -26 V 0.099 -27 Y 0.089 -28 T 0.096 -29 E 0.111 -30 G 0.123 -31 G 0.126 -32 F 0.120 -33 V 0.110 -34 E 0.100 -35 G 0.093 -36 V 0.093 -37 N 0.102 -38 K 0.120 -39 K 0.148 -40 L 0.179 -41 G 0.201 -42 L 0.210 -43 L 0.204 -44 G 0.182 -45 D 0.148 -46 S 0.113 -47 V 0.087 -48 D 0.072 -49 I 0.071 -50 F 0.085 -51 K 0.109 -52 G 0.137 -53 I 0.159 -54 P 0.170 -55 F 0.177 -56 A 0.187 -57 A 0.192 -58 P 0.184 -59 T 0.167 -60 K 0.148 -61 A 0.135 -62 L 0.130 -63 E 0.135 -64 N 0.147 -65 P 0.164 -66 Q 0.181 -67 P 0.193 -68 H 0.195 -69 P 0.191 -70 G 0.183 -71 W 0.177 -72 Q 0.180 -73 G 0.188 -74 T 0.193 -75 L 0.191 -76 K 0.183 -77 A 0.171 -78 K 0.158 -79 N 0.146 -80 F 0.135 -81 K 0.129 -82 K 0.128 -83 R 0.131 -84 C 0.139 -85 L 0.153 -86 Q 0.169 -87 A 0.179 -88 T 0.176 -89 I 0.165 -90 T 0.154 -91 Q 0.149 -92 D 0.150 -93 S 0.150 -94 T 0.147 -95 Y 0.140 -96 G 0.132 -97 D 0.129 -98 E 0.134 -99 D 0.138 -100 C 0.127 -101 L 0.104 -102 Y 0.080 -103 L 0.065 -104 N 0.056 -105 I 0.052 -106 W 0.053 -107 V 0.066 -108 P 0.092 -109 Q 0.124 -110 G 0.148 -111 R 0.156 -112 K 0.152 -113 Q 0.147 -114 V 0.148 -115 S 0.152 -116 R 0.154 -117 D 0.148 -118 L 0.136 -119 P 0.126 -120 V 0.123 -121 M 0.122 -122 I 0.117 -123 W 0.109 -124 I 0.102 -125 Y 0.096 -126 G 0.091 -127 G 0.087 -128 A 0.086 -129 F 0.091 -130 L 0.099 -131 M 0.107 -132 G 0.119 -133 S 0.144 -134 G 0.190 -135 H 0.252 -136 G 0.306 -137 A 0.324 -138 N 0.303 -139 F 0.260 -140 L 0.224 -141 N 0.213 -142 N 0.215 -143 Y 0.209 -144 L 0.191 -145 Y 0.166 -146 D 0.138 -147 G 0.109 -148 E 0.083 -149 E 0.066 -150 I 0.057 -151 A 0.051 -152 T 0.050 -153 R 0.054 -154 G 0.057 -155 N 0.059 -156 V 0.061 -157 I 0.063 -158 V 0.064 -159 V 0.062 -160 T 0.056 -161 F 0.052 -162 N 0.052 -163 Y 0.057 -164 R 0.063 -165 V 0.071 -166 G 0.080 -167 P 0.088 -168 L 0.094 -169 G 0.095 -170 F 0.093 -171 L 0.092 -172 S 0.096 -173 T 0.100 -174 G 0.102 -175 D 0.104 -176 A 0.107 -177 N 0.108 -178 L 0.101 -179 P 0.091 -180 G 0.083 -181 N 0.080 -182 Y 0.077 -183 G 0.075 -184 L 0.075 -185 R 0.078 -186 D 0.079 -187 Q 0.074 -188 H 0.066 -189 M 0.061 -190 A 0.057 -191 I 0.053 -192 A 0.048 -193 W 0.045 -194 V 0.044 -195 K 0.044 -196 R 0.045 -197 N 0.045 -198 I 0.044 -199 A 0.045 -200 A 0.046 -201 F 0.047 -202 G 0.050 -203 G 0.059 -204 D 0.069 -205 P 0.072 -206 N 0.066 -207 N 0.056 -208 I 0.049 -209 T 0.046 -210 L 0.046 -211 F 0.048 -212 G 0.049 -213 E 0.051 -214 S 0.057 -215 A 0.066 -216 G 0.076 -217 G 0.083 -218 A 0.087 -219 S 0.086 -220 V 0.084 -221 S 0.084 -222 L 0.087 -223 Q 0.091 -224 T 0.088 -225 L 0.079 -226 S 0.069 -227 P 0.065 -228 Y 0.066 -229 N 0.069 -230 K 0.066 -231 G 0.058 -232 L 0.047 -233 I 0.042 -234 R 0.045 -235 R 0.058 -236 A 0.074 -237 I 0.086 -238 S 0.089 -239 Q 0.084 -240 S 0.079 -241 G 0.080 -242 V 0.087 -243 A 0.093 -244 L 0.095 -245 S 0.093 -246 P 0.092 -247 W 0.093 -248 V 0.093 -249 I 0.095 -250 Q 0.100 -251 K 0.107 -252 N 0.105 -253 P 0.088 -254 L 0.066 -255 F 0.049 -256 W 0.040 -257 A 0.037 -258 K 0.035 -259 K 0.034 -260 V 0.035 -261 A 0.036 -262 E 0.038 -263 K 0.043 -264 V 0.053 -265 G 0.067 -266 C 0.085 -267 P 0.100 -268 V 0.110 -269 G 0.109 -270 D 0.099 -271 A 0.083 -272 A 0.067 -273 R 0.055 -274 M 0.048 -275 A 0.045 -276 Q 0.046 -277 C 0.050 -278 L 0.052 -279 K 0.052 -280 V 0.055 -281 T 0.063 -282 D 0.068 -283 P 0.064 -284 R 0.058 -285 A 0.055 -286 L 0.056 -287 T 0.060 -288 L 0.069 -289 A 0.084 -290 Y 0.106 -291 K 0.135 -292 V 0.169 -293 P 0.198 -294 L 0.218 -295 A 0.231 -296 G 0.236 -297 L 0.230 -298 E 0.211 -299 Y 0.181 -300 P 0.149 -301 M 0.125 -302 L 0.111 -303 H 0.103 -304 Y 0.096 -305 V 0.091 -306 G 0.091 -307 F 0.096 -308 V 0.105 -309 P 0.115 -310 V 0.122 -311 I 0.124 -312 D 0.121 -313 G 0.115 -314 D 0.111 -315 F 0.111 -316 I 0.117 -317 P 0.124 -318 A 0.130 -319 D 0.129 -320 P 0.119 -321 I 0.106 -322 N 0.096 -323 L 0.090 -324 Y 0.085 -325 A 0.082 -326 N 0.083 -327 A 0.091 -328 A 0.110 -329 D 0.140 -330 I 0.171 -331 D 0.192 -332 Y 0.202 -333 I 0.205 -334 A 0.203 -335 G 0.197 -336 T 0.188 -337 N 0.182 -338 N 0.178 -339 M 0.170 -340 D 0.151 -341 G 0.123 -342 H 0.097 -343 I 0.081 -344 F 0.074 -345 A 0.072 -346 S 0.074 -347 I 0.081 -348 D 0.090 -349 M 0.102 -350 P 0.117 -351 A 0.131 -352 I 0.137 -353 N 0.137 -354 K 0.143 -355 G 0.157 -356 N 0.170 -357 K 0.174 -358 K 0.163 -359 V 0.137 -360 T 0.106 -361 E 0.083 -362 E 0.074 -363 D 0.068 -364 F 0.059 -365 Y 0.051 -366 K 0.047 -367 L 0.042 -368 V 0.038 -369 S 0.036 -370 E 0.039 -371 F 0.044 -372 T 0.048 -373 I 0.058 -374 T 0.077 -375 K 0.100 -376 G 0.116 -377 L 0.116 -378 R 0.107 -379 G 0.094 -380 A 0.083 -381 K 0.076 -382 T 0.074 -383 T 0.073 -384 F 0.069 -385 D 0.059 -386 V 0.047 -387 Y 0.039 -388 T 0.036 -389 E 0.043 -390 S 0.060 -391 W 0.084 -392 A 0.109 -393 Q 0.130 -394 D 0.143 -395 P 0.143 -396 S 0.128 -397 Q 0.106 -398 E 0.089 -399 N 0.080 -400 K 0.079 -401 K 0.086 -402 K 0.101 -403 T 0.115 -404 V 0.123 -405 V 0.129 -406 D 0.136 -407 F 0.138 -408 E 0.131 -409 T 0.118 -410 D 0.104 -411 V 0.088 -412 L 0.074 -413 F 0.066 -414 L 0.065 -415 V 0.065 -416 P 0.064 -417 T 0.062 -418 E 0.058 -419 I 0.053 -420 A 0.052 -421 L 0.054 -422 A 0.055 -423 Q 0.053 -424 H 0.051 -425 R 0.051 -426 A 0.054 -427 N 0.058 -428 A 0.063 -429 K 0.073 -430 S 0.089 -431 A 0.107 -432 K 0.120 -433 T 0.122 -434 Y 0.118 -435 A 0.114 -436 Y 0.111 -437 L 0.112 -438 F 0.118 -439 S 0.132 -440 H 0.149 -441 P 0.162 -442 S 0.166 -443 R 0.164 -444 M 0.159 -445 P 0.146 -446 V 0.128 -447 Y 0.112 -448 P 0.103 -449 K 0.101 -450 W 0.109 -451 V 0.126 -452 G 0.145 -453 A 0.163 -454 D 0.182 -455 H 0.202 -456 A 0.221 -457 D 0.232 -458 D 0.223 -459 I 0.191 -460 Q 0.155 -461 Y 0.131 -462 V 0.119 -463 F 0.116 -464 G 0.124 -465 K 0.136 -466 P 0.141 -467 F 0.136 -468 A 0.131 -469 T 0.130 -470 P 0.131 -471 T 0.131 -472 G 0.127 -473 Y 0.115 -474 R 0.103 -475 P 0.101 -476 Q 0.112 -477 D 0.123 -478 R 0.127 -479 T 0.127 -480 V 0.128 -481 S 0.131 -482 K 0.133 -483 A 0.134 -484 M 0.131 -485 I 0.123 -486 A 0.107 -487 Y 0.091 -488 W 0.077 -489 T 0.066 -490 N 0.060 -491 F 0.057 -492 A 0.060 -493 K 0.073 -494 T 0.097 -495 G 0.129 -496 D 0.154 -497 P 0.163 -498 N 0.163 -499 M 0.175 -500 G 0.201 -501 D 0.222 -502 S 0.227 -503 A 0.214 -504 V 0.190 -505 P 0.164 -506 T 0.140 -507 H 0.120 -508 W 0.103 -509 E 0.090 -510 P 0.082 -511 Y 0.076 -512 T 0.075 -513 T 0.082 -514 E 0.098 -515 N 0.118 -516 S 0.135 -517 G 0.142 -518 Y 0.141 -519 L 0.134 -520 E 0.129 -521 I 0.129 -522 T 0.145 -523 K 0.182 -524 K 0.242 -525 M 0.314 -526 G 0.372 -527 S 0.387 -528 S 0.350 -529 S 0.282 -530 M 0.214 -531 K 0.167 -532 R 0.144 -533 S 0.137 -534 L 0.129 -535 R 0.117 -536 T 0.104 -537 N 0.095 -538 F 0.086 -539 L 0.076 -540 R 0.066 -541 Y 0.061 -542 W 0.059 -543 T 0.064 -544 L 0.081 -545 T 0.110 -546 Y 0.148 -547 L 0.198 -548 A 0.262 -549 L 0.332 -550 P 0.398 -551 T 0.453 -552 V 0.495 -553 T 0.527 -554 D 0.554 -555 Q 0.565 -556 E 0.550 -557 A 0.521 -558 T 0.506 -559 P 0.522 -560 V 0.558 -561 P 0.586 -562 P 0.594 -563 T 0.591 -564 G 0.574 -565 D 0.517 -566 S 0.441 -567 E 0.412 -568 A 0.435 -569 T 0.465 -570 P 0.500 -571 V 0.560 -572 P 0.611 -573 P 0.617 -574 T 0.618 -575 G 0.661 -576 D 0.721 -577 S 0.757 -578 E 0.766 -579 T 0.765 -580 A 0.761 -581 P 0.757 -582 V 0.755 -583 P 0.756 -584 P 0.754 -585 T 0.756 -586 G 0.768 -587 D 0.781 -588 S 0.786 -589 G 0.779 -590 A 0.767 -591 P 0.757 -592 P 0.754 -593 V 0.760 -594 P 0.767 -595 P 0.767 -596 T 0.764 -597 G 0.766 -598 D 0.772 -599 S 0.774 -600 G 0.767 -601 A 0.756 -602 P 0.741 -603 P 0.728 -604 V 0.722 -605 P 0.720 -606 P 0.715 -607 T 0.715 -608 G 0.729 -609 D 0.749 -610 S 0.762 -611 G 0.762 -612 A 0.756 -613 P 0.750 -614 P 0.747 -615 V 0.750 -616 P 0.755 -617 P 0.755 -618 T 0.752 -619 G 0.753 -620 D 0.758 -621 S 0.757 -622 G 0.750 -623 A 0.740 -624 P 0.729 -625 P 0.721 -626 V 0.718 -627 P 0.721 -628 P 0.721 -629 T 0.720 -630 G 0.726 -631 D 0.736 -632 S 0.743 -633 G 0.741 -634 A 0.734 -635 P 0.727 -636 P 0.724 -637 V 0.728 -638 P 0.738 -639 P 0.746 -640 T 0.752 -641 G 0.759 -642 D 0.765 -643 S 0.767 -644 G 0.762 -645 A 0.754 -646 P 0.747 -647 P 0.741 -648 V 0.739 -649 P 0.739 -650 P 0.735 -651 T 0.729 -652 G 0.729 -653 D 0.731 -654 S 0.730 -655 G 0.725 -656 A 0.721 -657 P 0.720 -658 P 0.722 -659 V 0.728 -660 P 0.738 -661 P 0.747 -662 T 0.753 -663 G 0.756 -664 D 0.756 -665 S 0.752 -666 G 0.746 -667 A 0.742 -668 P 0.739 -669 P 0.738 -670 V 0.737 -671 P 0.733 -672 P 0.724 -673 T 0.715 -674 G 0.716 -675 D 0.723 -676 A 0.726 -677 G 0.724 -678 P 0.724 -679 P 0.730 -680 P 0.741 -681 V 0.750 -682 P 0.755 -683 P 0.754 -684 T 0.753 -685 G 0.755 -686 D 0.755 -687 S 0.746 -688 G 0.732 -689 A 0.723 -690 P 0.722 -691 P 0.727 -692 V 0.734 -693 P 0.739 -694 P 0.739 -695 T 0.741 -696 G 0.753 -697 D 0.769 -698 S 0.780 -699 G 0.784 -700 A 0.786 -701 P 0.789 -702 P 0.790 -703 V 0.785 -704 T 0.775 -705 P 0.762 -706 T 0.757 -707 G 0.767 -708 D 0.773 -709 S 0.766 -710 E 0.758 -711 T 0.763 -712 A 0.776 -713 P 0.784 -714 V 0.775 -715 P 0.736 -716 P 0.674 -717 T 0.634 -718 G 0.649 -719 D 0.684 -720 S 0.692 -721 G 0.667 -722 A 0.618 -723 P 0.562 -724 P 0.538 -725 V 0.573 -726 P 0.630 -727 P 0.664 -728 T 0.678 -729 G 0.695 -730 D 0.703 -731 S 0.689 -732 E 0.663 -733 A 0.637 -734 A 0.614 -735 P 0.605 -736 V 0.610 -737 P 0.622 -738 P 0.628 -739 T 0.623 -740 D 0.602 -741 D 0.566 -742 S 0.527 -743 K 0.503 -744 E 0.491 -745 A 0.469 -746 Q 0.413 -747 M 0.333 -748 P 0.264 -749 A 0.221 -750 V 0.194 -751 I 0.169 -752 R 0.149 -753 F 0.137 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170835.17_ENST00000372080.8_GN:CEL_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170835.17_ENST00000372080.8_GN:CEL_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid deleted file mode 100644 index 8ecd9e21a4a65a99c85ae9f503a214bf5340846f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170835.17_ENST00000372080.8_GN:CEL_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid +++ /dev/null @@ -1,757 +0,0 @@ ->ENSG00000170835.17|ENST00000372080.8|GN:CEL|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 -1 M 0.242 -2 L 0.240 -3 T 0.247 -4 M 0.262 -5 G 0.259 -6 R 0.233 -7 L 0.204 -8 Q 0.189 -9 L 0.185 -10 V 0.190 -11 V 0.209 -12 L 0.235 -13 G 0.253 -14 L 0.260 -15 T 0.264 -16 C 0.265 -17 C 0.267 -18 W 0.288 -19 A 0.329 -20 V 0.374 -21 A 0.405 -22 S 0.420 -23 A 0.412 -24 A 0.372 -25 K 0.308 -26 L 0.238 -27 G 0.175 -28 A 0.127 -29 V 0.098 -30 Y 0.088 -31 T 0.095 -32 E 0.110 -33 G 0.122 -34 G 0.125 -35 F 0.119 -36 V 0.111 -37 E 0.101 -38 G 0.094 -39 V 0.094 -40 N 0.103 -41 K 0.121 -42 K 0.149 -43 L 0.180 -44 G 0.203 -45 L 0.212 -46 L 0.205 -47 G 0.182 -48 D 0.148 -49 S 0.113 -50 V 0.087 -51 D 0.072 -52 I 0.072 -53 F 0.085 -54 K 0.109 -55 G 0.137 -56 I 0.159 -57 P 0.170 -58 F 0.177 -59 A 0.186 -60 A 0.191 -61 P 0.183 -62 T 0.166 -63 K 0.148 -64 A 0.135 -65 L 0.129 -66 E 0.134 -67 N 0.147 -68 P 0.164 -69 Q 0.181 -70 P 0.192 -71 H 0.195 -72 P 0.190 -73 G 0.181 -74 W 0.176 -75 Q 0.180 -76 G 0.188 -77 T 0.192 -78 L 0.191 -79 K 0.183 -80 A 0.171 -81 K 0.158 -82 N 0.145 -83 F 0.135 -84 K 0.128 -85 K 0.127 -86 R 0.130 -87 C 0.138 -88 L 0.152 -89 Q 0.168 -90 A 0.178 -91 T 0.175 -92 I 0.164 -93 T 0.153 -94 Q 0.149 -95 D 0.149 -96 S 0.150 -97 T 0.147 -98 Y 0.140 -99 G 0.132 -100 D 0.130 -101 E 0.134 -102 D 0.138 -103 C 0.127 -104 L 0.104 -105 Y 0.080 -106 L 0.065 -107 N 0.056 -108 I 0.052 -109 W 0.053 -110 V 0.066 -111 P 0.092 -112 Q 0.124 -113 G 0.148 -114 R 0.156 -115 K 0.152 -116 Q 0.148 -117 V 0.149 -118 S 0.153 -119 R 0.154 -120 D 0.148 -121 L 0.136 -122 P 0.126 -123 V 0.123 -124 M 0.122 -125 I 0.117 -126 W 0.109 -127 I 0.102 -128 Y 0.096 -129 G 0.092 -130 G 0.088 -131 A 0.087 -132 F 0.091 -133 L 0.099 -134 M 0.108 -135 G 0.119 -136 S 0.144 -137 G 0.191 -138 H 0.254 -139 G 0.307 -140 A 0.326 -141 N 0.304 -142 F 0.261 -143 L 0.224 -144 N 0.212 -145 N 0.214 -146 Y 0.209 -147 L 0.191 -148 Y 0.166 -149 D 0.138 -150 G 0.108 -151 E 0.082 -152 E 0.066 -153 I 0.057 -154 A 0.051 -155 T 0.050 -156 R 0.054 -157 G 0.057 -158 N 0.059 -159 V 0.060 -160 I 0.063 -161 V 0.064 -162 V 0.062 -163 T 0.056 -164 F 0.052 -165 N 0.052 -166 Y 0.057 -167 R 0.063 -168 V 0.071 -169 G 0.080 -170 P 0.089 -171 L 0.095 -172 G 0.096 -173 F 0.093 -174 L 0.092 -175 S 0.096 -176 T 0.100 -177 G 0.102 -178 D 0.104 -179 A 0.107 -180 N 0.108 -181 L 0.101 -182 P 0.091 -183 G 0.083 -184 N 0.080 -185 Y 0.077 -186 G 0.075 -187 L 0.075 -188 R 0.078 -189 D 0.079 -190 Q 0.074 -191 H 0.066 -192 M 0.061 -193 A 0.057 -194 I 0.053 -195 A 0.048 -196 W 0.045 -197 V 0.044 -198 K 0.044 -199 R 0.045 -200 N 0.044 -201 I 0.044 -202 A 0.045 -203 A 0.046 -204 F 0.046 -205 G 0.050 -206 G 0.059 -207 D 0.069 -208 P 0.072 -209 N 0.066 -210 N 0.056 -211 I 0.049 -212 T 0.046 -213 L 0.046 -214 F 0.047 -215 G 0.049 -216 E 0.051 -217 S 0.056 -218 A 0.066 -219 G 0.075 -220 G 0.083 -221 A 0.086 -222 S 0.086 -223 V 0.084 -224 S 0.083 -225 L 0.087 -226 Q 0.091 -227 T 0.088 -228 L 0.078 -229 S 0.068 -230 P 0.064 -231 Y 0.066 -232 N 0.068 -233 K 0.066 -234 G 0.057 -235 L 0.047 -236 I 0.042 -237 R 0.045 -238 R 0.058 -239 A 0.074 -240 I 0.086 -241 S 0.088 -242 Q 0.084 -243 S 0.079 -244 G 0.080 -245 V 0.086 -246 A 0.093 -247 L 0.095 -248 S 0.093 -249 P 0.092 -250 W 0.093 -251 V 0.093 -252 I 0.095 -253 Q 0.100 -254 K 0.107 -255 N 0.105 -256 P 0.088 -257 L 0.066 -258 F 0.049 -259 W 0.040 -260 A 0.037 -261 K 0.035 -262 K 0.034 -263 V 0.035 -264 A 0.036 -265 E 0.038 -266 K 0.043 -267 V 0.053 -268 G 0.068 -269 C 0.085 -270 P 0.101 -271 V 0.110 -272 G 0.109 -273 D 0.099 -274 A 0.083 -275 A 0.067 -276 R 0.055 -277 M 0.048 -278 A 0.045 -279 Q 0.046 -280 C 0.050 -281 L 0.053 -282 K 0.052 -283 V 0.056 -284 T 0.064 -285 D 0.068 -286 P 0.065 -287 R 0.058 -288 A 0.055 -289 L 0.056 -290 T 0.060 -291 L 0.069 -292 A 0.085 -293 Y 0.107 -294 K 0.136 -295 V 0.169 -296 P 0.199 -297 L 0.219 -298 A 0.231 -299 G 0.236 -300 L 0.231 -301 E 0.211 -302 Y 0.181 -303 P 0.150 -304 M 0.125 -305 L 0.111 -306 H 0.103 -307 Y 0.097 -308 V 0.092 -309 G 0.091 -310 F 0.096 -311 V 0.105 -312 P 0.116 -313 V 0.123 -314 I 0.124 -315 D 0.121 -316 G 0.115 -317 D 0.111 -318 F 0.111 -319 I 0.117 -320 P 0.124 -321 A 0.130 -322 D 0.129 -323 P 0.119 -324 I 0.106 -325 N 0.096 -326 L 0.090 -327 Y 0.085 -328 A 0.082 -329 N 0.083 -330 A 0.091 -331 A 0.111 -332 D 0.140 -333 I 0.171 -334 D 0.193 -335 Y 0.203 -336 I 0.206 -337 A 0.203 -338 G 0.196 -339 T 0.188 -340 N 0.182 -341 N 0.178 -342 M 0.170 -343 D 0.151 -344 G 0.123 -345 H 0.096 -346 I 0.081 -347 F 0.074 -348 A 0.072 -349 S 0.074 -350 I 0.081 -351 D 0.090 -352 M 0.102 -353 P 0.117 -354 A 0.131 -355 I 0.137 -356 N 0.137 -357 K 0.143 -358 G 0.157 -359 N 0.170 -360 K 0.174 -361 K 0.163 -362 V 0.137 -363 T 0.105 -364 E 0.083 -365 E 0.073 -366 D 0.067 -367 F 0.058 -368 Y 0.051 -369 K 0.047 -370 L 0.042 -371 V 0.038 -372 S 0.036 -373 E 0.039 -374 F 0.044 -375 T 0.048 -376 I 0.057 -377 T 0.076 -378 K 0.099 -379 G 0.115 -380 L 0.116 -381 R 0.106 -382 G 0.094 -383 A 0.083 -384 K 0.076 -385 T 0.074 -386 T 0.073 -387 F 0.068 -388 D 0.059 -389 V 0.047 -390 Y 0.038 -391 T 0.036 -392 E 0.043 -393 S 0.060 -394 W 0.084 -395 A 0.108 -396 Q 0.129 -397 D 0.143 -398 P 0.143 -399 S 0.128 -400 Q 0.106 -401 E 0.089 -402 N 0.080 -403 K 0.079 -404 K 0.086 -405 K 0.101 -406 T 0.115 -407 V 0.123 -408 V 0.129 -409 D 0.136 -410 F 0.138 -411 E 0.131 -412 T 0.118 -413 D 0.104 -414 V 0.088 -415 L 0.074 -416 F 0.066 -417 L 0.064 -418 V 0.064 -419 P 0.064 -420 T 0.062 -421 E 0.058 -422 I 0.053 -423 A 0.052 -424 L 0.054 -425 A 0.055 -426 Q 0.053 -427 H 0.050 -428 R 0.051 -429 A 0.053 -430 N 0.058 -431 A 0.063 -432 K 0.073 -433 S 0.089 -434 A 0.108 -435 K 0.120 -436 T 0.122 -437 Y 0.118 -438 A 0.114 -439 Y 0.111 -440 L 0.112 -441 F 0.118 -442 S 0.132 -443 H 0.148 -444 P 0.161 -445 S 0.165 -446 R 0.164 -447 M 0.159 -448 P 0.146 -449 V 0.128 -450 Y 0.112 -451 P 0.103 -452 K 0.101 -453 W 0.109 -454 V 0.126 -455 G 0.145 -456 A 0.163 -457 D 0.182 -458 H 0.202 -459 A 0.221 -460 D 0.232 -461 D 0.222 -462 I 0.190 -463 Q 0.155 -464 Y 0.131 -465 V 0.119 -466 F 0.116 -467 G 0.123 -468 K 0.136 -469 P 0.141 -470 F 0.136 -471 A 0.131 -472 T 0.130 -473 P 0.131 -474 T 0.131 -475 G 0.127 -476 Y 0.115 -477 R 0.103 -478 P 0.101 -479 Q 0.112 -480 D 0.123 -481 R 0.127 -482 T 0.127 -483 V 0.129 -484 S 0.131 -485 K 0.133 -486 A 0.134 -487 M 0.131 -488 I 0.123 -489 A 0.107 -490 Y 0.090 -491 W 0.076 -492 T 0.066 -493 N 0.060 -494 F 0.057 -495 A 0.060 -496 K 0.073 -497 T 0.097 -498 G 0.129 -499 D 0.154 -500 P 0.163 -501 N 0.163 -502 M 0.175 -503 G 0.201 -504 D 0.222 -505 S 0.227 -506 A 0.214 -507 V 0.190 -508 P 0.164 -509 T 0.140 -510 H 0.120 -511 W 0.103 -512 E 0.090 -513 P 0.082 -514 Y 0.076 -515 T 0.075 -516 T 0.082 -517 E 0.098 -518 N 0.118 -519 S 0.135 -520 G 0.142 -521 Y 0.141 -522 L 0.135 -523 E 0.129 -524 I 0.129 -525 T 0.145 -526 K 0.182 -527 K 0.243 -528 M 0.314 -529 G 0.373 -530 S 0.388 -531 S 0.350 -532 S 0.282 -533 M 0.215 -534 K 0.167 -535 R 0.144 -536 S 0.136 -537 L 0.129 -538 R 0.116 -539 T 0.104 -540 N 0.094 -541 F 0.086 -542 L 0.075 -543 R 0.066 -544 Y 0.060 -545 W 0.059 -546 T 0.064 -547 L 0.081 -548 T 0.110 -549 Y 0.148 -550 L 0.198 -551 A 0.262 -552 L 0.332 -553 P 0.398 -554 T 0.454 -555 V 0.496 -556 T 0.529 -557 D 0.555 -558 Q 0.566 -559 E 0.551 -560 A 0.522 -561 T 0.507 -562 P 0.524 -563 V 0.567 -564 P 0.613 -565 P 0.646 -566 T 0.656 -567 G 0.625 -568 D 0.543 -569 S 0.450 -570 E 0.414 -571 A 0.436 -572 T 0.465 -573 P 0.500 -574 V 0.561 -575 P 0.611 -576 P 0.618 -577 T 0.618 -578 G 0.661 -579 D 0.722 -580 S 0.758 -581 E 0.767 -582 T 0.766 -583 A 0.762 -584 P 0.757 -585 V 0.756 -586 P 0.756 -587 P 0.755 -588 T 0.756 -589 G 0.768 -590 D 0.782 -591 S 0.786 -592 G 0.780 -593 A 0.769 -594 P 0.760 -595 P 0.757 -596 V 0.763 -597 P 0.770 -598 P 0.770 -599 T 0.767 -600 G 0.769 -601 D 0.774 -602 S 0.774 -603 G 0.768 -604 A 0.756 -605 P 0.741 -606 P 0.729 -607 V 0.723 -608 P 0.721 -609 P 0.716 -610 T 0.716 -611 G 0.730 -612 D 0.750 -613 S 0.762 -614 G 0.763 -615 A 0.757 -616 P 0.750 -617 P 0.748 -618 V 0.751 -619 P 0.756 -620 P 0.756 -621 T 0.753 -622 G 0.754 -623 D 0.758 -624 S 0.758 -625 G 0.751 -626 A 0.741 -627 P 0.730 -628 P 0.722 -629 V 0.719 -630 P 0.722 -631 P 0.722 -632 T 0.722 -633 G 0.728 -634 D 0.738 -635 S 0.743 -636 G 0.742 -637 A 0.735 -638 P 0.728 -639 P 0.724 -640 V 0.729 -641 P 0.739 -642 P 0.747 -643 T 0.753 -644 G 0.760 -645 D 0.766 -646 S 0.768 -647 G 0.763 -648 A 0.755 -649 P 0.747 -650 P 0.742 -651 V 0.740 -652 P 0.740 -653 P 0.736 -654 T 0.730 -655 G 0.730 -656 D 0.732 -657 S 0.731 -658 G 0.726 -659 A 0.721 -660 P 0.721 -661 P 0.723 -662 V 0.729 -663 P 0.739 -664 P 0.748 -665 T 0.754 -666 G 0.756 -667 D 0.756 -668 S 0.752 -669 G 0.747 -670 A 0.742 -671 P 0.740 -672 P 0.739 -673 V 0.738 -674 P 0.734 -675 P 0.725 -676 T 0.716 -677 G 0.717 -678 D 0.724 -679 A 0.727 -680 G 0.725 -681 P 0.725 -682 P 0.731 -683 P 0.742 -684 V 0.751 -685 P 0.756 -686 P 0.755 -687 T 0.754 -688 G 0.756 -689 D 0.756 -690 S 0.746 -691 G 0.733 -692 A 0.723 -693 P 0.722 -694 P 0.727 -695 V 0.734 -696 P 0.740 -697 P 0.741 -698 T 0.744 -699 G 0.755 -700 D 0.770 -701 S 0.780 -702 G 0.784 -703 A 0.786 -704 P 0.789 -705 P 0.790 -706 V 0.785 -707 T 0.775 -708 P 0.762 -709 T 0.758 -710 G 0.767 -711 D 0.774 -712 S 0.767 -713 E 0.759 -714 T 0.764 -715 A 0.777 -716 P 0.785 -717 V 0.778 -718 P 0.745 -719 P 0.691 -720 T 0.656 -721 G 0.667 -722 D 0.693 -723 S 0.696 -724 G 0.669 -725 A 0.620 -726 P 0.563 -727 P 0.539 -728 V 0.574 -729 P 0.633 -730 P 0.667 -731 T 0.682 -732 G 0.698 -733 D 0.704 -734 S 0.690 -735 E 0.664 -736 A 0.637 -737 A 0.614 -738 P 0.605 -739 V 0.610 -740 P 0.621 -741 P 0.628 -742 T 0.623 -743 D 0.601 -744 D 0.565 -745 S 0.527 -746 K 0.502 -747 E 0.490 -748 A 0.467 -749 Q 0.411 -750 M 0.331 -751 P 0.262 -752 A 0.219 -753 V 0.191 -754 I 0.167 -755 R 0.147 -756 F 0.135 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170915.10_ENST00000442253.3_GN:PAQR8_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170915.10_ENST00000442253.3_GN:PAQR8_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index b0289d7e6a2f6176f743872feb3b4e1ffdb0a4a4..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170915.10_ENST00000442253.3_GN:PAQR8_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,355 +0,0 @@ ->ENSG00000170915.10|ENST00000442253.3|GN:PAQR8|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.249 -2 T 0.233 -3 T 0.214 -4 A 0.199 -5 I 0.185 -6 L 0.177 -7 E 0.180 -8 R 0.195 -9 L 0.212 -10 S 0.234 -11 T 0.262 -12 L 0.290 -13 S 0.313 -14 V 0.332 -15 S 0.347 -16 G 0.348 -17 Q 0.336 -18 Q 0.330 -19 L 0.340 -20 R 0.367 -21 R 0.402 -22 L 0.422 -23 P 0.406 -24 K 0.364 -25 I 0.324 -26 L 0.301 -27 E 0.297 -28 D 0.311 -29 G 0.330 -30 L 0.333 -31 P 0.309 -32 K 0.268 -33 M 0.227 -34 P 0.193 -35 C 0.167 -36 T 0.148 -37 V 0.128 -38 P 0.105 -39 E 0.084 -40 T 0.072 -41 D 0.071 -42 V 0.075 -43 P 0.080 -44 Q 0.088 -45 L 0.097 -46 F 0.103 -47 R 0.107 -48 E 0.117 -49 P 0.133 -50 Y 0.145 -51 I 0.141 -52 R 0.129 -53 T 0.122 -54 G 0.122 -55 Y 0.120 -56 R 0.115 -57 P 0.109 -58 T 0.103 -59 G 0.099 -60 H 0.094 -61 E 0.087 -62 W 0.080 -63 R 0.074 -64 Y 0.072 -65 Y 0.073 -66 F 0.080 -67 F 0.090 -68 S 0.095 -69 L 0.086 -70 F 0.068 -71 Q 0.054 -72 K 0.047 -73 H 0.047 -74 N 0.053 -75 E 0.064 -76 V 0.083 -77 V 0.103 -78 N 0.111 -79 V 0.104 -80 W 0.104 -81 T 0.124 -82 H 0.138 -83 L 0.126 -84 L 0.104 -85 A 0.094 -86 A 0.090 -87 L 0.081 -88 A 0.066 -89 V 0.055 -90 L 0.054 -91 L 0.054 -92 R 0.048 -93 F 0.040 -94 W 0.039 -95 A 0.049 -96 F 0.067 -97 A 0.091 -98 E 0.118 -99 A 0.141 -100 E 0.149 -101 A 0.145 -102 L 0.136 -103 P 0.126 -104 W 0.116 -105 A 0.107 -106 S 0.096 -107 T 0.080 -108 H 0.063 -109 S 0.049 -110 L 0.042 -111 P 0.038 -112 L 0.036 -113 L 0.034 -114 L 0.032 -115 F 0.033 -116 I 0.038 -117 L 0.046 -118 S 0.053 -119 S 0.055 -120 I 0.052 -121 T 0.046 -122 Y 0.040 -123 L 0.039 -124 T 0.043 -125 C 0.050 -126 S 0.056 -127 L 0.056 -128 L 0.056 -129 A 0.059 -130 H 0.061 -131 L 0.060 -132 L 0.057 -133 Q 0.058 -134 S 0.065 -135 K 0.074 -136 S 0.077 -137 E 0.073 -138 L 0.063 -139 S 0.054 -140 H 0.048 -141 Y 0.047 -142 T 0.047 -143 F 0.045 -144 Y 0.042 -145 F 0.039 -146 V 0.038 -147 D 0.040 -148 Y 0.049 -149 V 0.062 -150 G 0.076 -151 V 0.082 -152 S 0.077 -153 V 0.065 -154 Y 0.056 -155 Q 0.052 -156 Y 0.052 -157 G 0.051 -158 S 0.048 -159 A 0.044 -160 L 0.038 -161 A 0.034 -162 H 0.032 -163 F 0.032 -164 F 0.035 -165 Y 0.039 -166 S 0.041 -167 S 0.040 -168 D 0.035 -169 Q 0.030 -170 A 0.027 -171 W 0.026 -172 Y 0.025 -173 D 0.024 -174 R 0.021 -175 F 0.019 -176 W 0.019 -177 L 0.020 -178 F 0.023 -179 F 0.028 -180 L 0.030 -181 P 0.030 -182 A 0.030 -183 A 0.031 -184 A 0.032 -185 F 0.034 -186 C 0.037 -187 G 0.040 -188 W 0.040 -189 L 0.040 -190 S 0.041 -191 C 0.040 -192 A 0.037 -193 G 0.034 -194 C 0.033 -195 C 0.033 -196 Y 0.031 -197 A 0.030 -198 K 0.031 -199 Y 0.036 -200 R 0.044 -201 Y 0.052 -202 R 0.058 -203 R 0.065 -204 P 0.074 -205 Y 0.077 -206 P 0.069 -207 V 0.056 -208 M 0.044 -209 R 0.037 -210 K 0.033 -211 I 0.031 -212 C 0.031 -213 Q 0.033 -214 V 0.038 -215 V 0.044 -216 P 0.049 -217 A 0.053 -218 G 0.054 -219 L 0.054 -220 A 0.052 -221 F 0.049 -222 I 0.045 -223 L 0.042 -224 D 0.041 -225 I 0.041 -226 S 0.040 -227 P 0.038 -228 V 0.035 -229 A 0.029 -230 H 0.025 -231 R 0.022 -232 V 0.024 -233 A 0.031 -234 L 0.045 -235 C 0.062 -236 H 0.075 -237 L 0.083 -238 A 0.091 -239 G 0.097 -240 C 0.099 -241 Q 0.098 -242 E 0.095 -243 Q 0.086 -244 A 0.069 -245 A 0.048 -246 W 0.033 -247 Y 0.029 -248 H 0.032 -249 T 0.035 -250 L 0.040 -251 Q 0.049 -252 I 0.061 -253 L 0.063 -254 F 0.053 -255 F 0.040 -256 L 0.031 -257 V 0.028 -258 S 0.026 -259 A 0.026 -260 Y 0.027 -261 F 0.033 -262 F 0.041 -263 S 0.047 -264 C 0.052 -265 P 0.053 -266 V 0.050 -267 P 0.045 -268 E 0.042 -269 K 0.045 -270 Y 0.055 -271 F 0.074 -272 P 0.094 -273 G 0.107 -274 S 0.107 -275 C 0.099 -276 D 0.088 -277 I 0.078 -278 V 0.073 -279 G 0.081 -280 H 0.106 -281 G 0.139 -282 H 0.160 -283 Q 0.154 -284 I 0.134 -285 F 0.113 -286 H 0.095 -287 A 0.080 -288 F 0.072 -289 L 0.067 -290 S 0.061 -291 I 0.054 -292 C 0.051 -293 T 0.052 -294 L 0.052 -295 S 0.051 -296 Q 0.050 -297 L 0.052 -298 E 0.053 -299 A 0.053 -300 I 0.049 -301 L 0.043 -302 L 0.040 -303 D 0.040 -304 Y 0.045 -305 Q 0.053 -306 G 0.056 -307 R 0.052 -308 Q 0.046 -309 E 0.045 -310 I 0.045 -311 F 0.045 -312 L 0.046 -313 Q 0.053 -314 R 0.064 -315 H 0.073 -316 G 0.078 -317 P 0.075 -318 L 0.063 -319 S 0.051 -320 V 0.042 -321 H 0.036 -322 M 0.034 -323 A 0.036 -324 C 0.043 -325 L 0.050 -326 S 0.055 -327 F 0.056 -328 F 0.057 -329 F 0.060 -330 L 0.061 -331 A 0.059 -332 A 0.059 -333 C 0.064 -334 S 0.066 -335 A 0.063 -336 A 0.062 -337 T 0.068 -338 A 0.077 -339 A 0.081 -340 L 0.075 -341 L 0.066 -342 R 0.058 -343 H 0.057 -344 K 0.067 -345 V 0.088 -346 K 0.113 -347 A 0.131 -348 R 0.142 -349 L 0.157 -350 T 0.185 -351 K 0.225 -352 K 0.267 -353 D 0.294 -354 S 0.303 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170915.10_ENST00000442253.3_GN:PAQR8_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170915.10_ENST00000442253.3_GN:PAQR8_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid deleted file mode 100644 index cd3f7416a3da98b594a48cf1ea7ffae4c8562303..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170915.10_ENST00000442253.3_GN:PAQR8_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid +++ /dev/null @@ -1,360 +0,0 @@ ->ENSG00000170915.10|ENST00000442253.3|GN:PAQR8|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:5 -1 M 0.247 -2 R 0.236 -3 A 0.227 -4 A 0.223 -5 A 0.214 -6 M 0.194 -7 T 0.168 -8 T 0.146 -9 A 0.135 -10 I 0.132 -11 L 0.135 -12 E 0.145 -13 R 0.157 -14 L 0.171 -15 S 0.193 -16 T 0.223 -17 L 0.255 -18 S 0.285 -19 V 0.317 -20 S 0.348 -21 G 0.365 -22 Q 0.361 -23 Q 0.350 -24 L 0.347 -25 R 0.364 -26 R 0.395 -27 L 0.415 -28 P 0.399 -29 K 0.357 -30 I 0.320 -31 L 0.300 -32 E 0.298 -33 D 0.312 -34 G 0.329 -35 L 0.331 -36 P 0.307 -37 K 0.268 -38 M 0.227 -39 P 0.194 -40 C 0.168 -41 T 0.149 -42 V 0.129 -43 P 0.106 -44 E 0.085 -45 T 0.074 -46 D 0.073 -47 V 0.078 -48 P 0.083 -49 Q 0.090 -50 L 0.098 -51 F 0.104 -52 R 0.107 -53 E 0.116 -54 P 0.133 -55 Y 0.144 -56 I 0.141 -57 R 0.129 -58 T 0.122 -59 G 0.121 -60 Y 0.119 -61 R 0.114 -62 P 0.107 -63 T 0.102 -64 G 0.098 -65 H 0.093 -66 E 0.086 -67 W 0.078 -68 R 0.073 -69 Y 0.071 -70 Y 0.072 -71 F 0.079 -72 F 0.089 -73 S 0.094 -74 L 0.085 -75 F 0.068 -76 Q 0.054 -77 K 0.047 -78 H 0.047 -79 N 0.052 -80 E 0.064 -81 V 0.083 -82 V 0.103 -83 N 0.111 -84 V 0.104 -85 W 0.105 -86 T 0.126 -87 H 0.140 -88 L 0.127 -89 L 0.105 -90 A 0.094 -91 A 0.090 -92 L 0.080 -93 A 0.065 -94 V 0.054 -95 L 0.053 -96 L 0.053 -97 R 0.047 -98 F 0.039 -99 W 0.038 -100 A 0.048 -101 F 0.067 -102 A 0.090 -103 E 0.118 -104 A 0.141 -105 E 0.150 -106 A 0.146 -107 L 0.137 -108 P 0.127 -109 W 0.117 -110 A 0.107 -111 S 0.096 -112 T 0.080 -113 H 0.063 -114 S 0.049 -115 L 0.042 -116 P 0.038 -117 L 0.036 -118 L 0.034 -119 L 0.032 -120 F 0.033 -121 I 0.038 -122 L 0.046 -123 S 0.054 -124 S 0.056 -125 I 0.053 -126 T 0.046 -127 Y 0.040 -128 L 0.039 -129 T 0.043 -130 C 0.051 -131 S 0.056 -132 L 0.056 -133 L 0.056 -134 A 0.059 -135 H 0.062 -136 L 0.060 -137 L 0.058 -138 Q 0.059 -139 S 0.066 -140 K 0.074 -141 S 0.078 -142 E 0.073 -143 L 0.064 -144 S 0.054 -145 H 0.048 -146 Y 0.047 -147 T 0.047 -148 F 0.045 -149 Y 0.042 -150 F 0.040 -151 V 0.038 -152 D 0.041 -153 Y 0.049 -154 V 0.062 -155 G 0.076 -156 V 0.083 -157 S 0.077 -158 V 0.065 -159 Y 0.056 -160 Q 0.052 -161 Y 0.052 -162 G 0.051 -163 S 0.048 -164 A 0.044 -165 L 0.038 -166 A 0.034 -167 H 0.032 -168 F 0.032 -169 F 0.035 -170 Y 0.038 -171 S 0.041 -172 S 0.040 -173 D 0.035 -174 Q 0.030 -175 A 0.027 -176 W 0.026 -177 Y 0.025 -178 D 0.024 -179 R 0.021 -180 F 0.019 -181 W 0.019 -182 L 0.020 -183 F 0.023 -184 F 0.028 -185 L 0.030 -186 P 0.030 -187 A 0.030 -188 A 0.031 -189 A 0.032 -190 F 0.034 -191 C 0.038 -192 G 0.040 -193 W 0.040 -194 L 0.040 -195 S 0.041 -196 C 0.041 -197 A 0.038 -198 G 0.035 -199 C 0.034 -200 C 0.033 -201 Y 0.032 -202 A 0.030 -203 K 0.031 -204 Y 0.036 -205 R 0.044 -206 Y 0.052 -207 R 0.058 -208 R 0.065 -209 P 0.074 -210 Y 0.077 -211 P 0.069 -212 V 0.056 -213 M 0.044 -214 R 0.037 -215 K 0.033 -216 I 0.031 -217 C 0.031 -218 Q 0.033 -219 V 0.038 -220 V 0.044 -221 P 0.049 -222 A 0.053 -223 G 0.055 -224 L 0.054 -225 A 0.053 -226 F 0.049 -227 I 0.045 -228 L 0.042 -229 D 0.041 -230 I 0.041 -231 S 0.040 -232 P 0.039 -233 V 0.035 -234 A 0.029 -235 H 0.025 -236 R 0.022 -237 V 0.024 -238 A 0.031 -239 L 0.046 -240 C 0.062 -241 H 0.075 -242 L 0.084 -243 A 0.092 -244 G 0.097 -245 C 0.099 -246 Q 0.098 -247 E 0.095 -248 Q 0.086 -249 A 0.069 -250 A 0.048 -251 W 0.033 -252 Y 0.029 -253 H 0.032 -254 T 0.036 -255 L 0.040 -256 Q 0.050 -257 I 0.061 -258 L 0.063 -259 F 0.053 -260 F 0.040 -261 L 0.031 -262 V 0.028 -263 S 0.026 -264 A 0.026 -265 Y 0.027 -266 F 0.033 -267 F 0.041 -268 S 0.048 -269 C 0.052 -270 P 0.054 -271 V 0.051 -272 P 0.045 -273 E 0.042 -274 K 0.045 -275 Y 0.056 -276 F 0.075 -277 P 0.095 -278 G 0.107 -279 S 0.108 -280 C 0.100 -281 D 0.089 -282 I 0.078 -283 V 0.074 -284 G 0.082 -285 H 0.107 -286 G 0.140 -287 H 0.161 -288 Q 0.155 -289 I 0.135 -290 F 0.114 -291 H 0.095 -292 A 0.081 -293 F 0.072 -294 L 0.068 -295 S 0.062 -296 I 0.055 -297 C 0.052 -298 T 0.053 -299 L 0.053 -300 S 0.051 -301 Q 0.051 -302 L 0.052 -303 E 0.054 -304 A 0.053 -305 I 0.049 -306 L 0.043 -307 L 0.040 -308 D 0.041 -309 Y 0.046 -310 Q 0.053 -311 G 0.057 -312 R 0.052 -313 Q 0.047 -314 E 0.046 -315 I 0.046 -316 F 0.045 -317 L 0.047 -318 Q 0.054 -319 R 0.064 -320 H 0.074 -321 G 0.079 -322 P 0.075 -323 L 0.064 -324 S 0.051 -325 V 0.042 -326 H 0.036 -327 M 0.034 -328 A 0.036 -329 C 0.043 -330 L 0.050 -331 S 0.055 -332 F 0.056 -333 F 0.057 -334 F 0.060 -335 L 0.061 -336 A 0.059 -337 A 0.059 -338 C 0.064 -339 S 0.066 -340 A 0.063 -341 A 0.062 -342 T 0.068 -343 A 0.078 -344 A 0.081 -345 L 0.075 -346 L 0.066 -347 R 0.058 -348 H 0.057 -349 K 0.067 -350 V 0.088 -351 K 0.113 -352 A 0.130 -353 R 0.141 -354 L 0.156 -355 T 0.184 -356 K 0.225 -357 K 0.267 -358 D 0.294 -359 S 0.303 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170929.6_ENST00000641627.1_GN:OR1M1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170929.6_ENST00000641627.1_GN:OR1M1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 41d9b82ec9604bb5da6b3144a4404998074bfbcf..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170929.6_ENST00000641627.1_GN:OR1M1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,314 +0,0 @@ ->ENSG00000170929.6|ENST00000641627.1|GN:OR1M1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.429 -2 E 0.449 -3 P 0.481 -4 R 0.509 -5 N 0.518 -6 Q 0.499 -7 T 0.452 -8 S 0.385 -9 A 0.307 -10 S 0.232 -11 Q 0.176 -12 F 0.145 -13 I 0.134 -14 L 0.137 -15 L 0.151 -16 G 0.174 -17 L 0.198 -18 S 0.217 -19 E 0.226 -20 K 0.218 -21 P 0.194 -22 E 0.160 -23 Q 0.127 -24 E 0.097 -25 T 0.072 -26 L 0.054 -27 L 0.046 -28 F 0.042 -29 S 0.039 -30 L 0.036 -31 F 0.037 -32 F 0.041 -33 C 0.046 -34 M 0.050 -35 Y 0.050 -36 L 0.050 -37 V 0.050 -38 M 0.052 -39 V 0.053 -40 V 0.058 -41 G 0.065 -42 N 0.070 -43 L 0.071 -44 L 0.071 -45 I 0.069 -46 I 0.064 -47 L 0.061 -48 A 0.064 -49 I 0.072 -50 S 0.082 -51 I 0.088 -52 D 0.088 -53 S 0.084 -54 H 0.077 -55 L 0.070 -56 H 0.063 -57 T 0.055 -58 P 0.045 -59 M 0.036 -60 Y 0.030 -61 F 0.027 -62 F 0.029 -63 L 0.036 -64 A 0.047 -65 N 0.057 -66 L 0.060 -67 S 0.058 -68 L 0.053 -69 V 0.052 -70 D 0.055 -71 F 0.058 -72 C 0.058 -73 L 0.057 -74 A 0.058 -75 T 0.061 -76 N 0.064 -77 T 0.067 -78 I 0.067 -79 P 0.066 -80 K 0.064 -81 M 0.064 -82 L 0.065 -83 V 0.067 -84 S 0.073 -85 L 0.082 -86 Q 0.095 -87 T 0.112 -88 G 0.124 -89 S 0.123 -90 K 0.106 -91 A 0.084 -92 I 0.065 -93 S 0.050 -94 Y 0.041 -95 P 0.035 -96 C 0.033 -97 C 0.031 -98 L 0.030 -99 I 0.031 -100 Q 0.031 -101 M 0.031 -102 Y 0.029 -103 F 0.025 -104 F 0.023 -105 H 0.024 -106 F 0.026 -107 F 0.030 -108 G 0.035 -109 I 0.040 -110 V 0.044 -111 D 0.044 -112 S 0.043 -113 V 0.041 -114 I 0.039 -115 I 0.036 -116 A 0.034 -117 M 0.032 -118 M 0.032 -119 A 0.034 -120 Y 0.038 -121 D 0.041 -122 R 0.043 -123 F 0.041 -124 V 0.040 -125 A 0.041 -126 I 0.045 -127 C 0.050 -128 H 0.056 -129 P 0.058 -130 L 0.056 -131 H 0.053 -132 Y 0.051 -133 A 0.050 -134 K 0.052 -135 I 0.059 -136 M 0.066 -137 S 0.070 -138 L 0.070 -139 R 0.066 -140 L 0.058 -141 C 0.053 -142 R 0.060 -143 L 0.068 -144 L 0.067 -145 V 0.059 -146 G 0.053 -147 A 0.054 -148 L 0.063 -149 W 0.073 -150 A 0.077 -151 F 0.074 -152 S 0.068 -153 C 0.064 -154 F 0.064 -155 I 0.069 -156 S 0.070 -157 L 0.068 -158 T 0.066 -159 H 0.067 -160 I 0.066 -161 L 0.067 -162 L 0.073 -163 M 0.081 -164 A 0.091 -165 R 0.099 -166 L 0.104 -167 V 0.104 -168 F 0.107 -169 C 0.118 -170 G 0.134 -171 S 0.148 -172 H 0.159 -173 E 0.166 -174 V 0.162 -175 P 0.140 -176 H 0.107 -177 Y 0.081 -178 F 0.068 -179 C 0.070 -180 D 0.084 -181 L 0.106 -182 T 0.128 -183 P 0.142 -184 I 0.146 -185 L 0.146 -186 R 0.146 -187 L 0.142 -188 S 0.134 -189 C 0.130 -190 T 0.135 -191 D 0.143 -192 T 0.140 -193 S 0.127 -194 V 0.115 -195 N 0.112 -196 R 0.113 -197 I 0.113 -198 F 0.106 -199 I 0.093 -200 L 0.084 -201 I 0.082 -202 V 0.085 -203 A 0.086 -204 G 0.079 -205 M 0.069 -206 V 0.063 -207 I 0.066 -208 A 0.075 -209 T 0.083 -210 P 0.081 -211 F 0.070 -212 V 0.061 -213 C 0.062 -214 I 0.064 -215 L 0.059 -216 A 0.051 -217 S 0.046 -218 Y 0.044 -219 A 0.045 -220 R 0.052 -221 I 0.064 -222 L 0.079 -223 V 0.091 -224 A 0.096 -225 I 0.097 -226 M 0.104 -227 K 0.125 -228 V 0.153 -229 P 0.177 -230 S 0.188 -231 A 0.186 -232 G 0.171 -233 G 0.143 -234 R 0.113 -235 K 0.095 -236 K 0.091 -237 A 0.090 -238 F 0.087 -239 S 0.086 -240 T 0.088 -241 C 0.091 -242 S 0.092 -243 S 0.091 -244 H 0.086 -245 L 0.078 -246 S 0.073 -247 V 0.070 -248 V 0.061 -249 A 0.047 -250 L 0.035 -251 F 0.030 -252 Y 0.032 -253 G 0.037 -254 T 0.040 -255 T 0.041 -256 I 0.042 -257 G 0.045 -258 V 0.053 -259 Y 0.070 -260 L 0.097 -261 C 0.126 -262 P 0.151 -263 S 0.167 -264 S 0.174 -265 V 0.169 -266 L 0.157 -267 T 0.143 -268 T 0.130 -269 V 0.119 -270 K 0.115 -271 E 0.114 -272 K 0.115 -273 A 0.112 -274 S 0.103 -275 A 0.090 -276 V 0.082 -277 M 0.088 -278 Y 0.103 -279 T 0.118 -280 A 0.128 -281 V 0.134 -282 T 0.135 -283 P 0.126 -284 M 0.111 -285 L 0.100 -286 N 0.091 -287 P 0.083 -288 F 0.079 -289 I 0.082 -290 Y 0.087 -291 S 0.097 -292 L 0.117 -293 R 0.133 -294 N 0.130 -295 R 0.113 -296 D 0.095 -297 L 0.083 -298 K 0.078 -299 G 0.079 -300 A 0.083 -301 L 0.088 -302 R 0.096 -303 K 0.105 -304 L 0.113 -305 V 0.127 -306 N 0.156 -307 R 0.199 -308 K 0.252 -309 I 0.303 -310 T 0.347 -311 S 0.374 -312 S 0.377 -313 S 0.367 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170929.6_ENST00000641627.1_GN:OR1M1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170929.6_ENST00000641627.1_GN:OR1M1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid deleted file mode 100644 index aef9f2a84f2587658e40729980ad282d82dcc1d0..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000170929.6_ENST00000641627.1_GN:OR1M1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid +++ /dev/null @@ -1,328 +0,0 @@ ->ENSG00000170929.6|ENST00000641627.1|GN:OR1M1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:14 -1 M 0.348 -2 V 0.362 -3 S 0.387 -4 R 0.414 -5 R 0.427 -6 G 0.419 -7 K 0.407 -8 I 0.409 -9 A 0.417 -10 Q 0.427 -11 G 0.446 -12 I 0.467 -13 T 0.479 -14 P 0.488 -15 M 0.501 -16 E 0.520 -17 P 0.542 -18 R 0.556 -19 N 0.556 -20 Q 0.532 -21 T 0.480 -22 S 0.407 -23 A 0.324 -24 S 0.244 -25 Q 0.183 -26 F 0.149 -27 I 0.136 -28 L 0.138 -29 L 0.152 -30 G 0.174 -31 L 0.199 -32 S 0.219 -33 E 0.228 -34 K 0.219 -35 P 0.194 -36 E 0.161 -37 Q 0.127 -38 E 0.097 -39 T 0.071 -40 L 0.054 -41 L 0.045 -42 F 0.042 -43 S 0.038 -44 L 0.036 -45 F 0.037 -46 F 0.042 -47 C 0.047 -48 M 0.050 -49 Y 0.051 -50 L 0.050 -51 V 0.051 -52 M 0.052 -53 V 0.054 -54 V 0.059 -55 G 0.066 -56 N 0.071 -57 L 0.074 -58 L 0.074 -59 I 0.072 -60 I 0.067 -61 L 0.063 -62 A 0.065 -63 I 0.072 -64 S 0.081 -65 I 0.087 -66 D 0.087 -67 S 0.083 -68 H 0.076 -69 L 0.069 -70 H 0.061 -71 T 0.053 -72 P 0.044 -73 M 0.035 -74 Y 0.029 -75 F 0.027 -76 F 0.028 -77 L 0.036 -78 A 0.048 -79 N 0.058 -80 L 0.061 -81 S 0.058 -82 L 0.053 -83 V 0.051 -84 D 0.054 -85 F 0.057 -86 C 0.057 -87 L 0.057 -88 A 0.057 -89 T 0.060 -90 N 0.064 -91 T 0.066 -92 I 0.065 -93 P 0.063 -94 K 0.061 -95 M 0.061 -96 L 0.061 -97 V 0.063 -98 S 0.068 -99 L 0.076 -100 Q 0.089 -101 T 0.107 -102 G 0.120 -103 S 0.119 -104 K 0.103 -105 A 0.082 -106 I 0.063 -107 S 0.049 -108 Y 0.039 -109 P 0.035 -110 C 0.032 -111 C 0.031 -112 L 0.029 -113 I 0.029 -114 Q 0.030 -115 M 0.030 -116 Y 0.028 -117 F 0.024 -118 F 0.023 -119 H 0.024 -120 F 0.026 -121 F 0.030 -122 G 0.035 -123 I 0.040 -124 V 0.043 -125 D 0.044 -126 S 0.043 -127 V 0.042 -128 I 0.039 -129 I 0.037 -130 A 0.034 -131 M 0.032 -132 M 0.032 -133 A 0.034 -134 Y 0.038 -135 D 0.042 -136 R 0.044 -137 F 0.042 -138 V 0.041 -139 A 0.041 -140 I 0.045 -141 C 0.051 -142 H 0.057 -143 P 0.059 -144 L 0.057 -145 H 0.054 -146 Y 0.052 -147 A 0.051 -148 K 0.054 -149 I 0.061 -150 M 0.069 -151 S 0.072 -152 L 0.071 -153 R 0.065 -154 L 0.057 -155 C 0.053 -156 R 0.059 -157 L 0.068 -158 L 0.067 -159 V 0.059 -160 G 0.053 -161 A 0.052 -162 L 0.054 -163 W 0.055 -164 A 0.056 -165 F 0.057 -166 S 0.060 -167 C 0.062 -168 F 0.065 -169 I 0.069 -170 S 0.071 -171 L 0.069 -172 T 0.067 -173 H 0.067 -174 I 0.066 -175 L 0.067 -176 L 0.073 -177 M 0.082 -178 A 0.091 -179 R 0.100 -180 L 0.105 -181 V 0.106 -182 F 0.108 -183 C 0.118 -184 G 0.133 -185 S 0.147 -186 H 0.158 -187 E 0.166 -188 V 0.162 -189 P 0.140 -190 H 0.107 -191 Y 0.081 -192 F 0.068 -193 C 0.070 -194 D 0.085 -195 L 0.107 -196 T 0.129 -197 P 0.142 -198 I 0.146 -199 L 0.146 -200 R 0.145 -201 L 0.141 -202 S 0.132 -203 C 0.128 -204 T 0.133 -205 D 0.141 -206 T 0.139 -207 S 0.127 -208 V 0.116 -209 N 0.112 -210 R 0.113 -211 I 0.112 -212 F 0.105 -213 I 0.093 -214 L 0.084 -215 I 0.082 -216 V 0.086 -217 A 0.087 -218 G 0.080 -219 M 0.069 -220 V 0.064 -221 I 0.067 -222 A 0.076 -223 T 0.084 -224 P 0.082 -225 F 0.070 -226 V 0.062 -227 C 0.062 -228 I 0.064 -229 L 0.059 -230 A 0.052 -231 S 0.046 -232 Y 0.044 -233 A 0.046 -234 R 0.053 -235 I 0.064 -236 L 0.079 -237 V 0.092 -238 A 0.097 -239 I 0.097 -240 M 0.104 -241 K 0.125 -242 V 0.153 -243 P 0.177 -244 S 0.189 -245 A 0.188 -246 G 0.173 -247 G 0.145 -248 R 0.115 -249 K 0.097 -250 K 0.092 -251 A 0.091 -252 F 0.089 -253 S 0.088 -254 T 0.091 -255 C 0.093 -256 S 0.095 -257 S 0.093 -258 H 0.087 -259 L 0.079 -260 S 0.074 -261 V 0.071 -262 V 0.062 -263 A 0.048 -264 L 0.036 -265 F 0.031 -266 Y 0.033 -267 G 0.037 -268 T 0.040 -269 T 0.041 -270 I 0.042 -271 G 0.045 -272 V 0.054 -273 Y 0.071 -274 L 0.098 -275 C 0.129 -276 P 0.155 -277 S 0.173 -278 S 0.180 -279 V 0.176 -280 L 0.164 -281 T 0.150 -282 T 0.135 -283 V 0.124 -284 K 0.119 -285 E 0.118 -286 K 0.118 -287 A 0.115 -288 S 0.106 -289 A 0.093 -290 V 0.085 -291 M 0.090 -292 Y 0.105 -293 T 0.120 -294 A 0.130 -295 V 0.136 -296 T 0.137 -297 P 0.128 -298 M 0.114 -299 L 0.102 -300 N 0.093 -301 P 0.085 -302 F 0.081 -303 I 0.083 -304 Y 0.088 -305 S 0.099 -306 L 0.119 -307 R 0.135 -308 N 0.133 -309 R 0.115 -310 D 0.097 -311 L 0.084 -312 K 0.079 -313 G 0.080 -314 A 0.084 -315 L 0.089 -316 R 0.097 -317 K 0.105 -318 L 0.113 -319 V 0.127 -320 N 0.155 -321 R 0.199 -322 K 0.253 -323 I 0.306 -324 T 0.351 -325 S 0.380 -326 S 0.383 -327 S 0.372 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000171130.20_ENST00000425642.3_GN:ATP6V0E2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000171130.20_ENST00000425642.3_GN:ATP6V0E2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index d8e8a8ba788a74beb9573e8468978f6ee5137faf..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000171130.20_ENST00000425642.3_GN:ATP6V0E2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,82 +0,0 @@ ->ENSG00000171130.20|ENST00000425642.3|GN:ATP6V0E2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.371 -2 T 0.355 -3 A 0.324 -4 H 0.280 -5 S 0.224 -6 F 0.163 -7 A 0.109 -8 L 0.072 -9 P 0.050 -10 V 0.039 -11 I 0.035 -12 I 0.033 -13 F 0.035 -14 T 0.040 -15 T 0.046 -16 F 0.051 -17 W 0.056 -18 G 0.058 -19 L 0.061 -20 V 0.068 -21 G 0.078 -22 I 0.085 -23 A 0.091 -24 G 0.099 -25 P 0.108 -26 W 0.124 -27 F 0.150 -28 V 0.181 -29 P 0.197 -30 K 0.192 -31 G 0.171 -32 P 0.144 -33 N 0.118 -34 R 0.095 -35 G 0.082 -36 V 0.082 -37 I 0.088 -38 I 0.093 -39 T 0.097 -40 M 0.113 -41 L 0.142 -42 V 0.163 -43 A 0.164 -44 T 0.153 -45 A 0.142 -46 V 0.127 -47 C 0.114 -48 C 0.115 -49 Y 0.124 -50 L 0.130 -51 F 0.130 -52 W 0.137 -53 L 0.152 -54 I 0.170 -55 A 0.193 -56 I 0.223 -57 L 0.248 -58 A 0.256 -59 Q 0.251 -60 L 0.250 -61 N 0.264 -62 P 0.297 -63 L 0.343 -64 F 0.390 -65 G 0.422 -66 P 0.424 -67 Q 0.398 -68 L 0.349 -69 K 0.287 -70 N 0.234 -71 E 0.200 -72 T 0.178 -73 I 0.161 -74 W 0.155 -75 Y 0.164 -76 V 0.181 -77 R 0.198 -78 F 0.214 -79 L 0.233 -80 W 0.251 -81 E 0.262 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000171130.20_ENST00000425642.3_GN:ATP6V0E2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000171130.20_ENST00000425642.3_GN:ATP6V0E2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid deleted file mode 100644 index a60a5fa574c4f8880251f4e7790e2729dc176044..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000171130.20_ENST00000425642.3_GN:ATP6V0E2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid +++ /dev/null @@ -1,112 +0,0 @@ ->ENSG00000171130.20|ENST00000425642.3|GN:ATP6V0E2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:30 -1 M 0.432 -2 L 0.465 -3 S 0.510 -4 A 0.547 -5 L 0.569 -6 P 0.575 -7 G 0.565 -8 W 0.542 -9 G 0.507 -10 P 0.466 -11 A 0.451 -12 H 0.482 -13 L 0.530 -14 Q 0.565 -15 R 0.587 -16 P 0.605 -17 L 0.617 -18 L 0.624 -19 G 0.623 -20 P 0.611 -21 A 0.590 -22 S 0.563 -23 C 0.537 -24 L 0.534 -25 G 0.559 -26 I 0.590 -27 L 0.605 -28 R 0.605 -29 P 0.596 -30 A 0.571 -31 M 0.525 -32 T 0.468 -33 A 0.405 -34 H 0.335 -35 S 0.261 -36 F 0.188 -37 A 0.127 -38 L 0.085 -39 P 0.061 -40 V 0.048 -41 I 0.043 -42 I 0.041 -43 F 0.043 -44 T 0.048 -45 T 0.056 -46 F 0.062 -47 W 0.067 -48 G 0.070 -49 L 0.071 -50 V 0.078 -51 G 0.088 -52 I 0.095 -53 A 0.100 -54 G 0.107 -55 P 0.116 -56 W 0.132 -57 F 0.159 -58 V 0.190 -59 P 0.207 -60 K 0.202 -61 G 0.181 -62 P 0.153 -63 N 0.123 -64 R 0.099 -65 G 0.084 -66 V 0.082 -67 I 0.086 -68 I 0.089 -69 T 0.092 -70 M 0.104 -71 L 0.127 -72 V 0.145 -73 A 0.149 -74 T 0.144 -75 A 0.137 -76 V 0.126 -77 C 0.116 -78 C 0.117 -79 Y 0.128 -80 L 0.135 -81 F 0.137 -82 W 0.145 -83 L 0.162 -84 I 0.182 -85 A 0.208 -86 I 0.241 -87 L 0.267 -88 A 0.275 -89 Q 0.266 -90 L 0.259 -91 N 0.271 -92 P 0.308 -93 L 0.360 -94 F 0.412 -95 G 0.444 -96 P 0.445 -97 Q 0.414 -98 L 0.359 -99 K 0.292 -100 N 0.236 -101 E 0.202 -102 T 0.179 -103 I 0.162 -104 W 0.154 -105 Y 0.160 -106 V 0.176 -107 R 0.195 -108 F 0.214 -109 L 0.235 -110 W 0.254 -111 E 0.265 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000171501.11_ENST00000373688.3_GN:OR1N2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000171501.11_ENST00000373688.3_GN:OR1N2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index d97b2e42afa5798574615eb720ee383dc1293268..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000171501.11_ENST00000373688.3_GN:OR1N2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,317 +0,0 @@ ->ENSG00000171501.11|ENST00000373688.3|GN:OR1N2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.423 -2 G 0.453 -3 K 0.500 -4 P 0.542 -5 G 0.566 -6 R 0.570 -7 V 0.562 -8 N 0.542 -9 Q 0.503 -10 T 0.438 -11 T 0.358 -12 V 0.278 -13 S 0.214 -14 D 0.173 -15 F 0.152 -16 L 0.141 -17 L 0.138 -18 L 0.148 -19 G 0.166 -20 L 0.186 -21 S 0.202 -22 E 0.209 -23 W 0.206 -24 P 0.191 -25 E 0.165 -26 E 0.134 -27 Q 0.103 -28 P 0.076 -29 L 0.058 -30 L 0.051 -31 F 0.049 -32 G 0.047 -33 I 0.042 -34 F 0.040 -35 L 0.043 -36 G 0.048 -37 M 0.052 -38 Y 0.052 -39 L 0.052 -40 V 0.055 -41 T 0.059 -42 M 0.061 -43 V 0.063 -44 G 0.068 -45 N 0.073 -46 L 0.075 -47 L 0.076 -48 I 0.074 -49 I 0.069 -50 L 0.065 -51 A 0.068 -52 I 0.078 -53 S 0.091 -54 S 0.100 -55 D 0.102 -56 P 0.095 -57 H 0.084 -58 L 0.073 -59 H 0.063 -60 T 0.053 -61 P 0.043 -62 M 0.034 -63 Y 0.029 -64 F 0.026 -65 F 0.027 -66 L 0.033 -67 A 0.044 -68 N 0.053 -69 L 0.058 -70 S 0.059 -71 L 0.058 -72 T 0.061 -73 D 0.070 -74 A 0.077 -75 C 0.075 -76 F 0.069 -77 T 0.065 -78 S 0.065 -79 A 0.067 -80 S 0.069 -81 I 0.070 -82 P 0.070 -83 K 0.069 -84 M 0.069 -85 L 0.070 -86 A 0.070 -87 N 0.072 -88 I 0.077 -89 H 0.086 -90 T 0.099 -91 Q 0.106 -92 S 0.099 -93 Q 0.084 -94 I 0.068 -95 I 0.057 -96 S 0.048 -97 Y 0.042 -98 S 0.039 -99 G 0.039 -100 C 0.038 -101 L 0.036 -102 A 0.035 -103 Q 0.035 -104 L 0.036 -105 Y 0.034 -106 F 0.030 -107 L 0.027 -108 L 0.026 -109 M 0.028 -110 F 0.033 -111 G 0.040 -112 G 0.049 -113 L 0.055 -114 D 0.056 -115 N 0.052 -116 C 0.046 -117 L 0.041 -118 L 0.039 -119 A 0.037 -120 V 0.035 -121 M 0.034 -122 A 0.035 -123 Y 0.038 -124 D 0.041 -125 R 0.043 -126 Y 0.042 -127 V 0.041 -128 A 0.043 -129 I 0.049 -130 C 0.058 -131 Q 0.067 -132 P 0.073 -133 L 0.075 -134 H 0.075 -135 Y 0.075 -136 S 0.076 -137 T 0.080 -138 S 0.085 -139 M 0.087 -140 S 0.085 -141 P 0.080 -142 Q 0.073 -143 L 0.063 -144 C 0.059 -145 A 0.064 -146 L 0.070 -147 M 0.066 -148 L 0.057 -149 G 0.049 -150 V 0.046 -151 C 0.046 -152 W 0.044 -153 V 0.045 -154 L 0.049 -155 T 0.055 -156 N 0.059 -157 C 0.061 -158 P 0.064 -159 A 0.065 -160 L 0.066 -161 M 0.068 -162 H 0.070 -163 T 0.069 -164 L 0.070 -165 L 0.075 -166 L 0.082 -167 T 0.090 -168 R 0.100 -169 V 0.105 -170 A 0.099 -171 F 0.092 -172 C 0.095 -173 A 0.107 -174 Q 0.124 -175 K 0.141 -176 A 0.156 -177 I 0.159 -178 P 0.141 -179 H 0.110 -180 F 0.084 -181 Y 0.070 -182 C 0.071 -183 D 0.082 -184 P 0.097 -185 S 0.109 -186 A 0.116 -187 L 0.121 -188 L 0.124 -189 K 0.124 -190 L 0.119 -191 A 0.114 -192 C 0.114 -193 S 0.125 -194 D 0.139 -195 T 0.144 -196 H 0.140 -197 V 0.135 -198 N 0.134 -199 E 0.135 -200 L 0.132 -201 M 0.126 -202 I 0.115 -203 I 0.101 -204 T 0.089 -205 M 0.080 -206 G 0.070 -207 L 0.058 -208 L 0.048 -209 F 0.046 -210 L 0.050 -211 T 0.058 -212 V 0.067 -213 P 0.071 -214 L 0.069 -215 L 0.067 -216 L 0.070 -217 I 0.071 -218 V 0.062 -219 F 0.050 -220 S 0.042 -221 Y 0.039 -222 V 0.041 -223 R 0.045 -224 I 0.046 -225 F 0.045 -226 W 0.047 -227 A 0.054 -228 V 0.061 -229 F 0.071 -230 V 0.090 -231 I 0.116 -232 S 0.144 -233 S 0.167 -234 P 0.178 -235 G 0.167 -236 G 0.136 -237 R 0.102 -238 W 0.083 -239 K 0.079 -240 A 0.080 -241 F 0.078 -242 S 0.078 -243 T 0.079 -244 C 0.081 -245 G 0.083 -246 S 0.083 -247 H 0.077 -248 L 0.069 -249 T 0.064 -250 V 0.063 -251 V 0.057 -252 L 0.045 -253 L 0.035 -254 F 0.030 -255 Y 0.032 -256 G 0.037 -257 S 0.042 -258 L 0.046 -259 M 0.048 -260 G 0.053 -261 V 0.064 -262 Y 0.082 -263 L 0.107 -264 L 0.136 -265 P 0.166 -266 P 0.194 -267 S 0.217 -268 T 0.229 -269 Y 0.228 -270 S 0.212 -271 T 0.188 -272 E 0.166 -273 R 0.151 -274 E 0.140 -275 S 0.126 -276 R 0.113 -277 A 0.102 -278 A 0.091 -279 V 0.086 -280 L 0.091 -281 Y 0.107 -282 M 0.120 -283 V 0.126 -284 I 0.128 -285 I 0.126 -286 P 0.117 -287 T 0.104 -288 L 0.094 -289 N 0.087 -290 P 0.081 -291 F 0.079 -292 I 0.080 -293 Y 0.083 -294 S 0.090 -295 L 0.106 -296 R 0.120 -297 N 0.116 -298 R 0.098 -299 D 0.082 -300 M 0.077 -301 K 0.083 -302 E 0.090 -303 A 0.091 -304 L 0.086 -305 G 0.083 -306 K 0.087 -307 L 0.100 -308 F 0.128 -309 V 0.179 -310 S 0.252 -311 G 0.323 -312 K 0.371 -313 T 0.390 -314 F 0.379 -315 F 0.344 -316 L 0.310 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000171501.11_ENST00000373688.3_GN:OR1N2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000171501.11_ENST00000373688.3_GN:OR1N2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid deleted file mode 100644 index f0880057293ab9cf6147d0c9f671acc293a5b47c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000171501.11_ENST00000373688.3_GN:OR1N2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid +++ /dev/null @@ -1,331 +0,0 @@ ->ENSG00000171501.11|ENST00000373688.3|GN:OR1N2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:14 -1 M 0.280 -2 E 0.278 -3 G 0.265 -4 F 0.239 -5 Y 0.209 -6 L 0.190 -7 R 0.186 -8 R 0.192 -9 S 0.200 -10 H 0.217 -11 E 0.242 -12 L 0.277 -13 Q 0.328 -14 G 0.391 -15 M 0.448 -16 G 0.490 -17 K 0.526 -18 P 0.560 -19 G 0.584 -20 R 0.591 -21 V 0.584 -22 N 0.563 -23 Q 0.523 -24 T 0.456 -25 T 0.371 -26 V 0.286 -27 S 0.218 -28 D 0.174 -29 F 0.151 -30 L 0.141 -31 L 0.140 -32 L 0.151 -33 G 0.170 -34 L 0.191 -35 S 0.206 -36 E 0.214 -37 W 0.210 -38 P 0.193 -39 E 0.166 -40 E 0.133 -41 Q 0.102 -42 P 0.075 -43 L 0.057 -44 L 0.050 -45 F 0.049 -46 G 0.047 -47 I 0.043 -48 F 0.041 -49 L 0.045 -50 G 0.050 -51 M 0.053 -52 Y 0.052 -53 L 0.052 -54 V 0.055 -55 T 0.059 -56 M 0.061 -57 V 0.063 -58 G 0.068 -59 N 0.074 -60 L 0.077 -61 L 0.078 -62 I 0.076 -63 I 0.071 -64 L 0.066 -65 A 0.068 -66 I 0.077 -67 S 0.089 -68 S 0.098 -69 D 0.100 -70 P 0.094 -71 H 0.084 -72 L 0.072 -73 H 0.062 -74 T 0.052 -75 P 0.042 -76 M 0.034 -77 Y 0.028 -78 F 0.026 -79 F 0.027 -80 L 0.033 -81 A 0.044 -82 N 0.053 -83 L 0.058 -84 S 0.059 -85 L 0.058 -86 T 0.061 -87 D 0.070 -88 A 0.077 -89 C 0.075 -90 F 0.069 -91 T 0.066 -92 S 0.066 -93 A 0.067 -94 S 0.067 -95 I 0.067 -96 P 0.066 -97 K 0.065 -98 M 0.066 -99 L 0.066 -100 A 0.066 -101 N 0.067 -102 I 0.071 -103 H 0.081 -104 T 0.095 -105 Q 0.103 -106 S 0.097 -107 Q 0.082 -108 I 0.067 -109 I 0.055 -110 S 0.047 -111 Y 0.040 -112 S 0.038 -113 G 0.038 -114 C 0.037 -115 L 0.035 -116 A 0.033 -117 Q 0.034 -118 L 0.035 -119 Y 0.033 -120 F 0.029 -121 L 0.026 -122 L 0.025 -123 M 0.028 -124 F 0.033 -125 G 0.040 -126 G 0.049 -127 L 0.055 -128 D 0.056 -129 N 0.051 -130 C 0.045 -131 L 0.040 -132 L 0.038 -133 A 0.037 -134 V 0.035 -135 M 0.034 -136 A 0.035 -137 Y 0.037 -138 D 0.041 -139 R 0.043 -140 Y 0.042 -141 V 0.041 -142 A 0.043 -143 I 0.049 -144 C 0.058 -145 Q 0.067 -146 P 0.073 -147 L 0.076 -148 H 0.076 -149 Y 0.077 -150 S 0.078 -151 T 0.082 -152 S 0.088 -153 M 0.090 -154 S 0.087 -155 P 0.081 -156 Q 0.073 -157 L 0.063 -158 C 0.058 -159 A 0.064 -160 L 0.070 -161 M 0.067 -162 L 0.058 -163 G 0.050 -164 V 0.047 -165 C 0.046 -166 W 0.045 -167 V 0.045 -168 L 0.050 -169 T 0.056 -170 N 0.059 -171 C 0.062 -172 P 0.064 -173 A 0.066 -174 L 0.066 -175 M 0.069 -176 H 0.070 -177 T 0.069 -178 L 0.069 -179 L 0.075 -180 L 0.082 -181 T 0.090 -182 R 0.100 -183 V 0.105 -184 A 0.100 -185 F 0.093 -186 C 0.095 -187 A 0.106 -188 Q 0.122 -189 K 0.139 -190 A 0.154 -191 I 0.157 -192 P 0.139 -193 H 0.109 -194 F 0.083 -195 Y 0.070 -196 C 0.071 -197 D 0.082 -198 P 0.097 -199 S 0.109 -200 A 0.115 -201 L 0.120 -202 L 0.123 -203 K 0.123 -204 L 0.118 -205 A 0.112 -206 C 0.112 -207 S 0.122 -208 D 0.137 -209 T 0.143 -210 H 0.140 -211 V 0.135 -212 N 0.133 -213 E 0.133 -214 L 0.130 -215 M 0.124 -216 I 0.115 -217 I 0.102 -218 T 0.090 -219 M 0.081 -220 G 0.072 -221 L 0.059 -222 L 0.049 -223 F 0.046 -224 L 0.051 -225 T 0.058 -226 V 0.067 -227 P 0.070 -228 L 0.066 -229 L 0.063 -230 L 0.067 -231 I 0.069 -232 V 0.062 -233 F 0.050 -234 S 0.042 -235 Y 0.040 -236 V 0.042 -237 R 0.046 -238 I 0.047 -239 F 0.045 -240 W 0.047 -241 A 0.054 -242 V 0.061 -243 F 0.071 -244 V 0.090 -245 I 0.116 -246 S 0.144 -247 S 0.168 -248 P 0.180 -249 G 0.170 -250 G 0.138 -251 R 0.104 -252 W 0.084 -253 K 0.080 -254 A 0.081 -255 F 0.080 -256 S 0.079 -257 T 0.080 -258 C 0.083 -259 G 0.085 -260 S 0.084 -261 H 0.078 -262 L 0.069 -263 T 0.065 -264 V 0.063 -265 V 0.057 -266 L 0.046 -267 L 0.035 -268 F 0.031 -269 Y 0.032 -270 G 0.037 -271 S 0.042 -272 L 0.046 -273 M 0.048 -274 G 0.051 -275 V 0.061 -276 Y 0.078 -277 L 0.104 -278 L 0.135 -279 P 0.167 -280 P 0.197 -281 S 0.222 -282 T 0.236 -283 Y 0.235 -284 S 0.219 -285 T 0.194 -286 E 0.171 -287 R 0.156 -288 E 0.144 -289 S 0.130 -290 R 0.117 -291 A 0.105 -292 A 0.095 -293 V 0.089 -294 L 0.094 -295 Y 0.110 -296 M 0.123 -297 V 0.128 -298 I 0.130 -299 I 0.127 -300 P 0.118 -301 T 0.105 -302 L 0.095 -303 N 0.088 -304 P 0.082 -305 F 0.080 -306 I 0.082 -307 Y 0.084 -308 S 0.091 -309 L 0.108 -310 R 0.123 -311 N 0.119 -312 R 0.100 -313 D 0.084 -314 M 0.078 -315 K 0.083 -316 E 0.091 -317 A 0.092 -318 L 0.087 -319 G 0.084 -320 K 0.089 -321 L 0.102 -322 F 0.131 -323 V 0.183 -324 S 0.256 -325 G 0.327 -326 K 0.375 -327 T 0.395 -328 F 0.385 -329 F 0.349 -330 L 0.315 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000171936.3_ENST00000641646.1_GN:OR10H3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000171936.3_ENST00000641646.1_GN:OR10H3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 53a12d61d70ffc3d34935bd16b38ffee8ea75893..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000171936.3_ENST00000641646.1_GN:OR10H3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,317 +0,0 @@ ->ENSG00000171936.3|ENST00000641646.1|GN:OR10H3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.447 -2 P 0.457 -3 G 0.468 -4 Q 0.468 -5 N 0.452 -6 Y 0.416 -7 R 0.360 -8 T 0.291 -9 I 0.223 -10 S 0.168 -11 E 0.134 -12 F 0.122 -13 I 0.122 -14 L 0.126 -15 S 0.138 -16 G 0.158 -17 F 0.178 -18 S 0.190 -19 A 0.188 -20 F 0.173 -21 P 0.150 -22 Q 0.125 -23 Q 0.101 -24 L 0.082 -25 L 0.067 -26 P 0.055 -27 V 0.048 -28 L 0.051 -29 F 0.061 -30 L 0.065 -31 L 0.058 -32 Y 0.046 -33 L 0.038 -34 L 0.037 -35 M 0.039 -36 F 0.041 -37 L 0.043 -38 F 0.047 -39 T 0.052 -40 L 0.055 -41 L 0.057 -42 G 0.061 -43 N 0.066 -44 L 0.071 -45 L 0.073 -46 I 0.069 -47 M 0.059 -48 A 0.051 -49 T 0.047 -50 V 0.045 -51 W 0.046 -52 I 0.051 -53 E 0.058 -54 R 0.064 -55 R 0.068 -56 L 0.069 -57 H 0.065 -58 T 0.058 -59 P 0.047 -60 M 0.036 -61 Y 0.027 -62 L 0.023 -63 F 0.022 -64 L 0.029 -65 C 0.040 -66 A 0.049 -67 L 0.052 -68 S 0.051 -69 I 0.051 -70 S 0.054 -71 E 0.059 -72 I 0.061 -73 L 0.059 -74 F 0.054 -75 T 0.051 -76 V 0.051 -77 A 0.053 -78 I 0.057 -79 T 0.060 -80 P 0.059 -81 R 0.058 -82 M 0.056 -83 L 0.053 -84 A 0.047 -85 D 0.041 -86 L 0.040 -87 L 0.046 -88 F 0.056 -89 T 0.064 -90 H 0.064 -91 R 0.058 -92 S 0.052 -93 I 0.045 -94 T 0.039 -95 F 0.033 -96 V 0.032 -97 A 0.032 -98 C 0.033 -99 A 0.031 -100 I 0.031 -101 Q 0.030 -102 M 0.030 -103 F 0.029 -104 F 0.027 -105 S 0.025 -106 F 0.024 -107 M 0.024 -108 F 0.024 -109 G 0.026 -110 F 0.031 -111 T 0.035 -112 H 0.038 -113 S 0.038 -114 F 0.037 -115 L 0.035 -116 L 0.034 -117 M 0.032 -118 V 0.031 -119 M 0.030 -120 G 0.032 -121 Y 0.036 -122 D 0.039 -123 H 0.040 -124 Y 0.039 -125 V 0.037 -126 T 0.038 -127 I 0.043 -128 C 0.049 -129 H 0.054 -130 P 0.055 -131 L 0.053 -132 H 0.052 -133 Y 0.052 -134 N 0.055 -135 M 0.061 -136 L 0.070 -137 M 0.078 -138 S 0.081 -139 P 0.081 -140 R 0.077 -141 G 0.070 -142 C 0.066 -143 A 0.071 -144 H 0.079 -145 L 0.084 -146 V 0.084 -147 A 0.080 -148 W 0.073 -149 T 0.067 -150 W 0.066 -151 A 0.072 -152 G 0.079 -153 G 0.079 -154 S 0.074 -155 V 0.071 -156 M 0.072 -157 G 0.072 -158 M 0.072 -159 M 0.073 -160 V 0.075 -161 T 0.074 -162 M 0.070 -163 M 0.067 -164 V 0.068 -165 F 0.073 -166 H 0.083 -167 L 0.090 -168 T 0.092 -169 F 0.097 -170 C 0.107 -171 G 0.118 -172 S 0.127 -173 N 0.137 -174 V 0.144 -175 I 0.139 -176 H 0.117 -177 H 0.088 -178 F 0.065 -179 L 0.053 -180 C 0.051 -181 H 0.055 -182 V 0.065 -183 L 0.078 -184 S 0.091 -185 L 0.102 -186 L 0.110 -187 K 0.117 -188 L 0.124 -189 A 0.131 -190 C 0.143 -191 G 0.164 -192 S 0.185 -193 K 0.192 -194 T 0.180 -195 S 0.158 -196 S 0.140 -197 V 0.130 -198 I 0.128 -199 M 0.128 -200 G 0.126 -201 V 0.118 -202 M 0.104 -203 L 0.087 -204 V 0.073 -205 C 0.068 -206 V 0.068 -207 T 0.071 -208 A 0.074 -209 L 0.075 -210 I 0.072 -211 G 0.072 -212 C 0.071 -213 L 0.068 -214 F 0.066 -215 L 0.069 -216 I 0.070 -217 I 0.065 -218 L 0.056 -219 S 0.050 -220 F 0.045 -221 V 0.042 -222 F 0.046 -223 I 0.058 -224 V 0.073 -225 A 0.084 -226 A 0.085 -227 I 0.081 -228 L 0.085 -229 R 0.101 -230 I 0.124 -231 P 0.144 -232 S 0.150 -233 A 0.142 -234 E 0.125 -235 G 0.107 -236 R 0.093 -237 H 0.086 -238 K 0.082 -239 T 0.078 -240 F 0.075 -241 S 0.073 -242 T 0.070 -243 C 0.066 -244 V 0.062 -245 S 0.060 -246 H 0.056 -247 L 0.051 -248 T 0.049 -249 V 0.049 -250 V 0.045 -251 V 0.037 -252 M 0.029 -253 H 0.023 -254 Y 0.022 -255 S 0.023 -256 F 0.027 -257 A 0.032 -258 S 0.037 -259 L 0.042 -260 I 0.053 -261 Y 0.075 -262 L 0.109 -263 K 0.148 -264 P 0.185 -265 K 0.210 -266 G 0.221 -267 L 0.217 -268 H 0.195 -269 S 0.163 -270 M 0.131 -271 Y 0.112 -272 S 0.102 -273 D 0.096 -274 A 0.089 -275 L 0.084 -276 M 0.080 -277 A 0.076 -278 T 0.071 -279 T 0.072 -280 Y 0.078 -281 T 0.086 -282 V 0.093 -283 F 0.097 -284 T 0.097 -285 P 0.090 -286 F 0.082 -287 L 0.078 -288 S 0.076 -289 P 0.074 -290 I 0.073 -291 I 0.077 -292 F 0.081 -293 S 0.087 -294 L 0.100 -295 R 0.111 -296 N 0.106 -297 K 0.088 -298 E 0.073 -299 L 0.069 -300 K 0.076 -301 N 0.083 -302 A 0.083 -303 I 0.080 -304 N 0.078 -305 K 0.077 -306 N 0.076 -307 F 0.086 -308 C 0.113 -309 R 0.158 -310 R 0.221 -311 F 0.296 -312 C 0.371 -313 P 0.430 -314 L 0.455 -315 S 0.442 -316 S 0.415 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000171936.3_ENST00000641646.1_GN:OR10H3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:11.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000171936.3_ENST00000641646.1_GN:OR10H3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:11.caid deleted file mode 100644 index 0a424e33ac0d067b55ade8abd2a636afd7c15176..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000171936.3_ENST00000641646.1_GN:OR10H3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:11.caid +++ /dev/null @@ -1,328 +0,0 @@ ->ENSG00000171936.3|ENST00000641646.1|GN:OR10H3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:11 -1 M 0.352 -2 L 0.371 -3 K 0.405 -4 N 0.447 -5 S 0.485 -6 G 0.511 -7 I 0.527 -8 N 0.536 -9 T 0.531 -10 V 0.511 -11 S 0.495 -12 M 0.499 -13 P 0.514 -14 G 0.522 -15 Q 0.515 -16 N 0.491 -17 Y 0.447 -18 R 0.381 -19 T 0.304 -20 I 0.229 -21 S 0.170 -22 E 0.133 -23 F 0.120 -24 I 0.120 -25 L 0.125 -26 S 0.138 -27 G 0.157 -28 F 0.177 -29 S 0.189 -30 A 0.188 -31 F 0.174 -32 P 0.150 -33 Q 0.124 -34 Q 0.100 -35 L 0.081 -36 L 0.066 -37 P 0.054 -38 V 0.048 -39 L 0.051 -40 F 0.060 -41 L 0.064 -42 L 0.057 -43 Y 0.045 -44 L 0.038 -45 L 0.037 -46 M 0.039 -47 F 0.041 -48 L 0.043 -49 F 0.048 -50 T 0.054 -51 L 0.056 -52 L 0.058 -53 G 0.063 -54 N 0.068 -55 L 0.073 -56 L 0.075 -57 I 0.070 -58 M 0.060 -59 A 0.052 -60 T 0.047 -61 V 0.045 -62 W 0.045 -63 I 0.050 -64 E 0.057 -65 R 0.063 -66 R 0.067 -67 L 0.068 -68 H 0.064 -69 T 0.057 -70 P 0.047 -71 M 0.036 -72 Y 0.027 -73 L 0.022 -74 F 0.022 -75 L 0.029 -76 C 0.040 -77 A 0.049 -78 L 0.052 -79 S 0.051 -80 I 0.051 -81 S 0.053 -82 E 0.058 -83 I 0.060 -84 L 0.058 -85 F 0.054 -86 T 0.051 -87 V 0.050 -88 A 0.053 -89 I 0.056 -90 T 0.059 -91 P 0.058 -92 R 0.056 -93 M 0.055 -94 L 0.051 -95 A 0.045 -96 D 0.039 -97 L 0.038 -98 L 0.043 -99 F 0.054 -100 T 0.062 -101 H 0.062 -102 R 0.057 -103 S 0.051 -104 I 0.045 -105 T 0.038 -106 F 0.033 -107 V 0.031 -108 A 0.032 -109 C 0.032 -110 A 0.031 -111 I 0.030 -112 Q 0.030 -113 M 0.029 -114 F 0.028 -115 F 0.026 -116 S 0.025 -117 F 0.024 -118 M 0.024 -119 F 0.024 -120 G 0.026 -121 F 0.030 -122 T 0.035 -123 H 0.038 -124 S 0.038 -125 F 0.037 -126 L 0.035 -127 L 0.034 -128 M 0.032 -129 V 0.031 -130 M 0.030 -131 G 0.032 -132 Y 0.036 -133 D 0.040 -134 H 0.041 -135 Y 0.039 -136 V 0.038 -137 T 0.039 -138 I 0.044 -139 C 0.050 -140 H 0.055 -141 P 0.057 -142 L 0.055 -143 H 0.054 -144 Y 0.054 -145 N 0.057 -146 M 0.064 -147 L 0.073 -148 M 0.080 -149 S 0.082 -150 P 0.081 -151 R 0.076 -152 G 0.069 -153 C 0.065 -154 A 0.071 -155 H 0.079 -156 L 0.084 -157 V 0.084 -158 A 0.080 -159 W 0.073 -160 T 0.067 -161 W 0.066 -162 A 0.073 -163 G 0.080 -164 G 0.080 -165 S 0.075 -166 V 0.072 -167 M 0.072 -168 G 0.073 -169 M 0.072 -170 M 0.073 -171 V 0.075 -172 T 0.074 -173 M 0.070 -174 M 0.068 -175 V 0.069 -176 F 0.074 -177 H 0.084 -178 L 0.091 -179 T 0.094 -180 F 0.098 -181 C 0.107 -182 G 0.118 -183 S 0.128 -184 N 0.137 -185 V 0.144 -186 I 0.139 -187 H 0.117 -188 H 0.087 -189 F 0.065 -190 L 0.053 -191 C 0.051 -192 H 0.056 -193 V 0.065 -194 L 0.078 -195 S 0.091 -196 L 0.102 -197 L 0.109 -198 K 0.117 -199 L 0.123 -200 A 0.130 -201 C 0.142 -202 G 0.164 -203 S 0.186 -204 K 0.193 -205 T 0.180 -206 S 0.158 -207 S 0.139 -208 V 0.129 -209 I 0.127 -210 M 0.127 -211 G 0.125 -212 V 0.118 -213 M 0.104 -214 L 0.087 -215 V 0.073 -216 C 0.068 -217 V 0.068 -218 T 0.071 -219 A 0.074 -220 L 0.074 -221 I 0.072 -222 G 0.072 -223 C 0.071 -224 L 0.068 -225 F 0.066 -226 L 0.069 -227 I 0.071 -228 I 0.065 -229 L 0.056 -230 S 0.050 -231 F 0.045 -232 V 0.042 -233 F 0.046 -234 I 0.058 -235 V 0.074 -236 A 0.085 -237 A 0.086 -238 I 0.082 -239 L 0.085 -240 R 0.101 -241 I 0.125 -242 P 0.145 -243 S 0.151 -244 A 0.143 -245 E 0.127 -246 G 0.109 -247 R 0.095 -248 H 0.088 -249 K 0.084 -250 T 0.079 -251 F 0.076 -252 S 0.074 -253 T 0.072 -254 C 0.067 -255 V 0.064 -256 S 0.061 -257 H 0.057 -258 L 0.052 -259 T 0.050 -260 V 0.049 -261 V 0.045 -262 V 0.037 -263 M 0.029 -264 H 0.024 -265 Y 0.022 -266 S 0.023 -267 F 0.027 -268 A 0.032 -269 S 0.037 -270 L 0.042 -271 I 0.054 -272 Y 0.075 -273 L 0.109 -274 K 0.150 -275 P 0.187 -276 K 0.213 -277 G 0.225 -278 L 0.222 -279 H 0.200 -280 S 0.167 -281 M 0.134 -282 Y 0.114 -283 S 0.104 -284 D 0.098 -285 A 0.092 -286 L 0.087 -287 M 0.083 -288 A 0.078 -289 T 0.073 -290 T 0.073 -291 Y 0.079 -292 T 0.087 -293 V 0.095 -294 F 0.099 -295 T 0.098 -296 P 0.091 -297 F 0.083 -298 L 0.079 -299 S 0.077 -300 P 0.074 -301 I 0.074 -302 I 0.078 -303 F 0.082 -304 S 0.088 -305 L 0.101 -306 R 0.112 -307 N 0.108 -308 K 0.090 -309 E 0.074 -310 L 0.070 -311 K 0.076 -312 N 0.083 -313 A 0.084 -314 I 0.080 -315 N 0.079 -316 K 0.077 -317 N 0.076 -318 F 0.086 -319 C 0.114 -320 R 0.160 -321 R 0.223 -322 F 0.299 -323 C 0.375 -324 P 0.435 -325 L 0.461 -326 S 0.446 -327 S 0.419 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000172936.19_ENST00000650905.2_GN:MYD88_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000172936.19_ENST00000650905.2_GN:MYD88_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 5f4545941d23667760b14ebb4c051493972e43ac..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000172936.19_ENST00000650905.2_GN:MYD88_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,297 +0,0 @@ ->ENSG00000172936.19|ENST00000650905.2|GN:MYD88|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.413 -2 A 0.406 -3 A 0.422 -4 G 0.479 -5 G 0.552 -6 P 0.609 -7 G 0.643 -8 A 0.656 -9 G 0.651 -10 S 0.633 -11 A 0.615 -12 A 0.608 -13 P 0.607 -14 V 0.595 -15 S 0.551 -16 S 0.469 -17 T 0.364 -18 S 0.259 -19 S 0.177 -20 L 0.124 -21 P 0.089 -22 L 0.066 -23 A 0.053 -24 A 0.047 -25 L 0.044 -26 N 0.037 -27 M 0.029 -28 R 0.024 -29 V 0.023 -30 R 0.024 -31 R 0.027 -32 R 0.032 -33 L 0.038 -34 S 0.044 -35 L 0.053 -36 F 0.064 -37 L 0.077 -38 N 0.091 -39 V 0.110 -40 R 0.132 -41 T 0.150 -42 Q 0.158 -43 V 0.153 -44 A 0.137 -45 A 0.111 -46 D 0.082 -47 W 0.058 -48 T 0.047 -49 A 0.045 -50 L 0.046 -51 A 0.047 -52 E 0.045 -53 E 0.040 -54 M 0.037 -55 D 0.036 -56 F 0.037 -57 E 0.038 -58 Y 0.039 -59 L 0.040 -60 E 0.042 -61 I 0.046 -62 R 0.049 -63 Q 0.052 -64 L 0.057 -65 E 0.063 -66 T 0.068 -67 Q 0.070 -68 A 0.071 -69 D 0.067 -70 P 0.056 -71 T 0.044 -72 G 0.038 -73 R 0.039 -74 L 0.040 -75 L 0.039 -76 D 0.038 -77 A 0.038 -78 W 0.038 -79 Q 0.037 -80 G 0.037 -81 R 0.042 -82 P 0.049 -83 G 0.052 -84 A 0.050 -85 S 0.048 -86 V 0.047 -87 G 0.047 -88 R 0.046 -89 L 0.045 -90 L 0.045 -91 E 0.048 -92 L 0.054 -93 L 0.057 -94 T 0.060 -95 K 0.067 -96 L 0.077 -97 G 0.079 -98 R 0.069 -99 D 0.055 -100 D 0.045 -101 V 0.041 -102 L 0.039 -103 L 0.038 -104 E 0.040 -105 L 0.045 -106 G 0.048 -107 P 0.045 -108 S 0.042 -109 I 0.046 -110 E 0.056 -111 E 0.063 -112 D 0.067 -113 C 0.076 -114 Q 0.090 -115 K 0.096 -116 Y 0.092 -117 I 0.092 -118 L 0.100 -119 K 0.113 -120 Q 0.133 -121 Q 0.162 -122 Q 0.199 -123 E 0.247 -124 E 0.302 -125 A 0.353 -126 E 0.397 -127 K 0.442 -128 P 0.488 -129 L 0.536 -130 Q 0.581 -131 V 0.617 -132 A 0.631 -133 A 0.623 -134 V 0.600 -135 D 0.569 -136 S 0.538 -137 S 0.514 -138 V 0.499 -139 P 0.490 -140 R 0.486 -141 T 0.473 -142 A 0.439 -143 E 0.384 -144 L 0.329 -145 A 0.284 -146 G 0.247 -147 I 0.213 -148 T 0.193 -149 T 0.198 -150 L 0.222 -151 D 0.254 -152 D 0.280 -153 P 0.294 -154 L 0.299 -155 G 0.301 -156 H 0.291 -157 M 0.260 -158 P 0.211 -159 E 0.154 -160 R 0.105 -161 F 0.071 -162 D 0.048 -163 A 0.034 -164 F 0.028 -165 I 0.029 -166 C 0.032 -167 Y 0.032 -168 C 0.031 -169 P 0.029 -170 S 0.028 -171 D 0.027 -172 I 0.024 -173 Q 0.020 -174 F 0.017 -175 V 0.017 -176 Q 0.020 -177 E 0.027 -178 M 0.040 -179 I 0.057 -180 R 0.068 -181 Q 0.070 -182 L 0.068 -183 E 0.068 -184 Q 0.070 -185 T 0.074 -186 N 0.078 -187 Y 0.081 -188 R 0.077 -189 L 0.065 -190 K 0.051 -191 L 0.041 -192 C 0.037 -193 V 0.039 -194 S 0.046 -195 D 0.056 -196 R 0.068 -197 D 0.083 -198 V 0.104 -199 L 0.124 -200 P 0.133 -201 G 0.129 -202 T 0.114 -203 C 0.094 -204 V 0.076 -205 W 0.068 -206 S 0.067 -207 I 0.067 -208 A 0.065 -209 S 0.061 -210 E 0.056 -211 L 0.053 -212 I 0.058 -213 E 0.068 -214 K 0.074 -215 R 0.070 -216 C 0.060 -217 R 0.050 -218 R 0.041 -219 M 0.039 -220 V 0.044 -221 V 0.052 -222 V 0.057 -223 V 0.054 -224 S 0.049 -225 D 0.046 -226 D 0.048 -227 Y 0.050 -228 L 0.049 -229 Q 0.046 -230 S 0.044 -231 K 0.042 -232 E 0.040 -233 C 0.039 -234 D 0.038 -235 F 0.036 -236 Q 0.035 -237 T 0.037 -238 K 0.040 -239 F 0.043 -240 A 0.047 -241 L 0.059 -242 S 0.081 -243 L 0.112 -244 S 0.141 -245 P 0.161 -246 G 0.171 -247 A 0.169 -248 H 0.153 -249 Q 0.125 -250 K 0.093 -251 R 0.067 -252 L 0.055 -253 I 0.057 -254 P 0.069 -255 I 0.083 -256 K 0.090 -257 Y 0.088 -258 K 0.083 -259 A 0.083 -260 M 0.092 -261 K 0.102 -262 K 0.104 -263 E 0.098 -264 F 0.089 -265 P 0.080 -266 S 0.070 -267 I 0.063 -268 L 0.059 -269 R 0.061 -270 F 0.064 -271 I 0.065 -272 T 0.063 -273 V 0.063 -274 C 0.070 -275 D 0.081 -276 Y 0.093 -277 T 0.100 -278 N 0.103 -279 P 0.103 -280 C 0.100 -281 T 0.095 -282 K 0.084 -283 S 0.071 -284 W 0.058 -285 F 0.046 -286 W 0.038 -287 T 0.037 -288 R 0.041 -289 L 0.049 -290 A 0.055 -291 K 0.058 -292 A 0.063 -293 L 0.084 -294 S 0.130 -295 L 0.188 -296 P 0.231 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000172936.19_ENST00000650905.2_GN:MYD88_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000172936.19_ENST00000650905.2_GN:MYD88_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid deleted file mode 100644 index 59509c19cdcf81a462e9b150cd0ab065ff263da1..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000172936.19_ENST00000650905.2_GN:MYD88_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid +++ /dev/null @@ -1,310 +0,0 @@ ->ENSG00000172936.19|ENST00000650905.2|GN:MYD88|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:13 -1 M 0.441 -2 R 0.462 -3 P 0.489 -4 D 0.496 -5 R 0.471 -6 A 0.442 -7 E 0.447 -8 A 0.481 -9 P 0.511 -10 G 0.518 -11 P 0.495 -12 P 0.445 -13 A 0.402 -14 M 0.423 -15 A 0.508 -16 A 0.594 -17 G 0.640 -18 G 0.650 -19 P 0.630 -20 G 0.588 -21 A 0.561 -22 G 0.575 -23 S 0.607 -24 A 0.622 -25 A 0.625 -26 P 0.626 -27 V 0.613 -28 S 0.562 -29 S 0.472 -30 T 0.362 -31 S 0.256 -32 S 0.174 -33 L 0.120 -34 P 0.086 -35 L 0.063 -36 A 0.050 -37 A 0.046 -38 L 0.043 -39 N 0.037 -40 M 0.029 -41 R 0.024 -42 V 0.023 -43 R 0.024 -44 R 0.027 -45 R 0.033 -46 L 0.039 -47 S 0.045 -48 L 0.053 -49 F 0.065 -50 L 0.076 -51 N 0.090 -52 V 0.109 -53 R 0.131 -54 T 0.149 -55 Q 0.157 -56 V 0.152 -57 A 0.135 -58 A 0.109 -59 D 0.080 -60 W 0.057 -61 T 0.046 -62 A 0.044 -63 L 0.046 -64 A 0.046 -65 E 0.044 -66 E 0.039 -67 M 0.035 -68 D 0.034 -69 F 0.035 -70 E 0.036 -71 Y 0.037 -72 L 0.037 -73 E 0.040 -74 I 0.044 -75 R 0.046 -76 Q 0.049 -77 L 0.054 -78 E 0.061 -79 T 0.065 -80 Q 0.068 -81 A 0.068 -82 D 0.064 -83 P 0.054 -84 T 0.042 -85 G 0.037 -86 R 0.037 -87 L 0.039 -88 L 0.038 -89 D 0.036 -90 A 0.036 -91 W 0.037 -92 Q 0.036 -93 G 0.036 -94 R 0.041 -95 P 0.048 -96 G 0.051 -97 A 0.050 -98 S 0.047 -99 V 0.046 -100 G 0.045 -101 R 0.045 -102 L 0.044 -103 L 0.044 -104 E 0.047 -105 L 0.052 -106 L 0.056 -107 T 0.058 -108 K 0.065 -109 L 0.074 -110 G 0.077 -111 R 0.068 -112 D 0.054 -113 D 0.045 -114 V 0.041 -115 L 0.040 -116 L 0.039 -117 E 0.041 -118 L 0.046 -119 G 0.048 -120 P 0.045 -121 S 0.042 -122 I 0.045 -123 E 0.052 -124 E 0.055 -125 D 0.049 -126 C 0.041 -127 Q 0.039 -128 K 0.044 -129 Y 0.057 -130 I 0.075 -131 L 0.093 -132 K 0.109 -133 Q 0.129 -134 Q 0.158 -135 Q 0.195 -136 E 0.243 -137 E 0.299 -138 A 0.351 -139 E 0.397 -140 K 0.443 -141 P 0.493 -142 L 0.543 -143 Q 0.589 -144 V 0.622 -145 A 0.635 -146 A 0.627 -147 V 0.605 -148 D 0.574 -149 S 0.542 -150 S 0.518 -151 V 0.503 -152 P 0.495 -153 R 0.490 -154 T 0.477 -155 A 0.441 -156 E 0.385 -157 L 0.329 -158 A 0.284 -159 G 0.246 -160 I 0.212 -161 T 0.191 -162 T 0.195 -163 L 0.218 -164 D 0.249 -165 D 0.276 -166 P 0.290 -167 L 0.296 -168 G 0.298 -169 H 0.289 -170 M 0.260 -171 P 0.210 -172 E 0.154 -173 R 0.105 -174 F 0.070 -175 D 0.048 -176 A 0.033 -177 F 0.027 -178 I 0.028 -179 C 0.031 -180 Y 0.032 -181 C 0.030 -182 P 0.029 -183 S 0.028 -184 D 0.027 -185 I 0.023 -186 Q 0.019 -187 F 0.017 -188 V 0.017 -189 Q 0.020 -190 E 0.027 -191 M 0.040 -192 I 0.055 -193 R 0.065 -194 Q 0.067 -195 L 0.066 -196 E 0.067 -197 Q 0.069 -198 T 0.073 -199 N 0.077 -200 Y 0.080 -201 R 0.075 -202 L 0.063 -203 K 0.049 -204 L 0.040 -205 C 0.036 -206 V 0.038 -207 S 0.045 -208 D 0.055 -209 R 0.066 -210 D 0.082 -211 V 0.102 -212 L 0.122 -213 P 0.130 -214 G 0.125 -215 T 0.110 -216 C 0.091 -217 V 0.074 -218 W 0.067 -219 S 0.066 -220 I 0.067 -221 A 0.065 -222 S 0.062 -223 E 0.056 -224 L 0.053 -225 I 0.059 -226 E 0.068 -227 K 0.074 -228 R 0.070 -229 C 0.060 -230 R 0.049 -231 R 0.041 -232 M 0.040 -233 V 0.045 -234 V 0.052 -235 V 0.057 -236 V 0.055 -237 S 0.049 -238 D 0.046 -239 D 0.048 -240 Y 0.050 -241 L 0.049 -242 Q 0.046 -243 S 0.044 -244 K 0.041 -245 E 0.039 -246 C 0.038 -247 D 0.037 -248 F 0.035 -249 Q 0.035 -250 T 0.037 -251 K 0.039 -252 F 0.042 -253 A 0.047 -254 L 0.059 -255 S 0.082 -256 L 0.113 -257 S 0.142 -258 P 0.163 -259 G 0.173 -260 A 0.171 -261 H 0.154 -262 Q 0.126 -263 K 0.094 -264 R 0.067 -265 L 0.055 -266 I 0.058 -267 P 0.070 -268 I 0.083 -269 K 0.091 -270 Y 0.089 -271 K 0.083 -272 A 0.084 -273 M 0.093 -274 K 0.104 -275 K 0.106 -276 E 0.100 -277 F 0.091 -278 P 0.081 -279 S 0.071 -280 I 0.064 -281 L 0.060 -282 R 0.061 -283 F 0.064 -284 I 0.066 -285 T 0.064 -286 V 0.064 -287 C 0.070 -288 D 0.082 -289 Y 0.093 -290 T 0.100 -291 N 0.103 -292 P 0.104 -293 C 0.102 -294 T 0.096 -295 K 0.086 -296 S 0.072 -297 W 0.058 -298 F 0.046 -299 W 0.038 -300 T 0.037 -301 R 0.042 -302 L 0.049 -303 A 0.055 -304 K 0.058 -305 A 0.063 -306 L 0.084 -307 S 0.129 -308 L 0.188 -309 P 0.231 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000173535.16_ENST00000356864.4_GN:TNFRSF10C_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000173535.16_ENST00000356864.4_GN:TNFRSF10C_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index d9ce730d54b9549b3ae35a062cd574155fffe4b5..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000173535.16_ENST00000356864.4_GN:TNFRSF10C_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,260 +0,0 @@ ->ENSG00000173535.16|ENST00000356864.4|GN:TNFRSF10C|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.394 -2 A 0.390 -3 R 0.369 -4 I 0.325 -5 P 0.264 -6 K 0.210 -7 T 0.177 -8 L 0.158 -9 K 0.144 -10 F 0.133 -11 V 0.128 -12 V 0.133 -13 V 0.145 -14 I 0.160 -15 V 0.177 -16 A 0.192 -17 V 0.206 -18 L 0.229 -19 L 0.268 -20 P 0.314 -21 V 0.353 -22 L 0.386 -23 A 0.417 -24 Y 0.459 -25 S 0.519 -26 A 0.582 -27 T 0.630 -28 T 0.655 -29 A 0.659 -30 R 0.652 -31 Q 0.645 -32 E 0.646 -33 E 0.652 -34 V 0.657 -35 P 0.667 -36 Q 0.682 -37 Q 0.693 -38 T 0.692 -39 V 0.679 -40 A 0.665 -41 P 0.656 -42 Q 0.651 -43 Q 0.645 -44 Q 0.632 -45 R 0.605 -46 H 0.565 -47 S 0.519 -48 F 0.473 -49 K 0.424 -50 G 0.364 -51 E 0.296 -52 E 0.228 -53 C 0.176 -54 P 0.140 -55 A 0.113 -56 G 0.090 -57 S 0.078 -58 H 0.081 -59 R 0.094 -60 S 0.106 -61 E 0.112 -62 H 0.117 -63 T 0.128 -64 G 0.142 -65 A 0.153 -66 C 0.156 -67 N 0.146 -68 P 0.125 -69 C 0.103 -70 T 0.091 -71 E 0.093 -72 G 0.104 -73 V 0.115 -74 D 0.125 -75 Y 0.136 -76 T 0.152 -77 N 0.177 -78 A 0.198 -79 S 0.198 -80 N 0.180 -81 N 0.160 -82 E 0.147 -83 P 0.144 -84 S 0.149 -85 C 0.155 -86 F 0.158 -87 P 0.154 -88 C 0.140 -89 T 0.119 -90 V 0.098 -91 C 0.082 -92 K 0.074 -93 S 0.070 -94 D 0.068 -95 Q 0.073 -96 K 0.085 -97 H 0.101 -98 K 0.113 -99 S 0.120 -100 S 0.119 -101 C 0.109 -102 T 0.096 -103 M 0.090 -104 T 0.096 -105 R 0.110 -106 D 0.119 -107 T 0.114 -108 V 0.099 -109 C 0.082 -110 Q 0.074 -111 C 0.076 -112 K 0.084 -113 E 0.091 -114 G 0.091 -115 T 0.090 -116 F 0.092 -117 R 0.098 -118 N 0.107 -119 E 0.118 -120 N 0.125 -121 S 0.126 -122 P 0.123 -123 E 0.125 -124 M 0.133 -125 C 0.142 -126 R 0.143 -127 K 0.138 -128 C 0.132 -129 S 0.126 -130 R 0.127 -131 C 0.137 -132 P 0.150 -133 S 0.155 -134 G 0.149 -135 E 0.141 -136 V 0.138 -137 Q 0.145 -138 V 0.165 -139 S 0.193 -140 N 0.209 -141 C 0.198 -142 T 0.169 -143 S 0.144 -144 W 0.140 -145 D 0.153 -146 D 0.174 -147 I 0.193 -148 Q 0.206 -149 C 0.219 -150 V 0.264 -151 E 0.360 -152 E 0.482 -153 F 0.584 -154 G 0.651 -155 A 0.695 -156 N 0.724 -157 A 0.741 -158 T 0.746 -159 V 0.740 -160 E 0.730 -161 T 0.728 -162 P 0.737 -163 A 0.740 -164 A 0.713 -165 E 0.659 -166 E 0.628 -167 T 0.655 -168 M 0.705 -169 N 0.730 -170 T 0.730 -171 S 0.725 -172 P 0.723 -173 G 0.716 -174 T 0.708 -175 P 0.708 -176 A 0.717 -177 P 0.728 -178 A 0.724 -179 A 0.689 -180 E 0.634 -181 E 0.605 -182 T 0.633 -183 M 0.686 -184 N 0.721 -185 T 0.735 -186 S 0.744 -187 P 0.751 -188 G 0.753 -189 T 0.751 -190 P 0.754 -191 A 0.765 -192 P 0.782 -193 A 0.796 -194 A 0.802 -195 E 0.803 -196 E 0.798 -197 T 0.786 -198 M 0.771 -199 T 0.758 -200 T 0.754 -201 S 0.755 -202 P 0.757 -203 G 0.756 -204 T 0.752 -205 P 0.751 -206 A 0.757 -207 P 0.769 -208 A 0.782 -209 A 0.789 -210 E 0.790 -211 E 0.785 -212 T 0.775 -213 M 0.760 -214 T 0.744 -215 T 0.732 -216 S 0.725 -217 P 0.721 -218 G 0.717 -219 T 0.716 -220 P 0.720 -221 A 0.733 -222 P 0.748 -223 A 0.748 -224 A 0.714 -225 E 0.656 -226 E 0.627 -227 T 0.660 -228 M 0.719 -229 I 0.756 -230 T 0.768 -231 S 0.771 -232 P 0.770 -233 G 0.764 -234 T 0.755 -235 P 0.747 -236 A 0.730 -237 S 0.701 -238 S 0.662 -239 H 0.616 -240 Y 0.561 -241 L 0.505 -242 S 0.462 -243 C 0.427 -244 T 0.387 -245 I 0.347 -246 V 0.321 -247 G 0.310 -248 I 0.298 -249 I 0.283 -250 V 0.271 -251 L 0.258 -252 I 0.237 -253 V 0.211 -254 L 0.188 -255 L 0.175 -256 I 0.173 -257 V 0.179 -258 F 0.188 -259 V 0.194 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000173535.16_ENST00000356864.4_GN:TNFRSF10C_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:40.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000173535.16_ENST00000356864.4_GN:TNFRSF10C_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:40.caid deleted file mode 100644 index f44687c8f589f45562caa97ebf0e3f58a60236ca..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000173535.16_ENST00000356864.4_GN:TNFRSF10C_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:40.caid +++ /dev/null @@ -1,300 +0,0 @@ ->ENSG00000173535.16|ENST00000356864.4|GN:TNFRSF10C|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:40 -1 M 0.481 -2 Q 0.508 -3 G 0.536 -4 V 0.532 -5 K 0.496 -6 E 0.471 -7 R 0.493 -8 F 0.550 -9 L 0.609 -10 P 0.660 -11 L 0.702 -12 G 0.731 -13 N 0.743 -14 S 0.745 -15 G 0.738 -16 D 0.719 -17 R 0.689 -18 A 0.659 -19 P 0.636 -20 R 0.629 -21 P 0.639 -22 P 0.660 -23 D 0.679 -24 G 0.678 -25 R 0.644 -26 G 0.588 -27 R 0.553 -28 V 0.564 -29 R 0.583 -30 P 0.581 -31 R 0.590 -32 T 0.646 -33 Q 0.721 -34 D 0.770 -35 G 0.789 -36 V 0.789 -37 G 0.781 -38 N 0.773 -39 H 0.766 -40 T 0.757 -41 M 0.738 -42 A 0.696 -43 R 0.622 -44 I 0.515 -45 P 0.402 -46 K 0.321 -47 T 0.282 -48 L 0.256 -49 K 0.221 -50 F 0.191 -51 V 0.176 -52 V 0.174 -53 V 0.177 -54 I 0.187 -55 V 0.204 -56 A 0.221 -57 V 0.236 -58 L 0.260 -59 L 0.304 -60 P 0.362 -61 V 0.419 -62 L 0.466 -63 A 0.504 -64 Y 0.546 -65 S 0.601 -66 A 0.659 -67 T 0.703 -68 T 0.725 -69 A 0.730 -70 R 0.726 -71 Q 0.723 -72 E 0.725 -73 E 0.729 -74 V 0.730 -75 P 0.734 -76 Q 0.744 -77 Q 0.752 -78 T 0.751 -79 V 0.739 -80 A 0.724 -81 P 0.713 -82 Q 0.704 -83 Q 0.693 -84 Q 0.675 -85 R 0.645 -86 H 0.603 -87 S 0.555 -88 F 0.504 -89 K 0.446 -90 G 0.376 -91 E 0.297 -92 E 0.226 -93 C 0.174 -94 P 0.141 -95 A 0.114 -96 G 0.090 -97 S 0.076 -98 H 0.077 -99 R 0.088 -100 S 0.099 -101 E 0.103 -102 H 0.108 -103 T 0.117 -104 G 0.130 -105 A 0.141 -106 C 0.145 -107 N 0.137 -108 P 0.118 -109 C 0.098 -110 T 0.087 -111 E 0.090 -112 G 0.101 -113 V 0.112 -114 D 0.121 -115 Y 0.130 -116 T 0.144 -117 N 0.163 -118 A 0.179 -119 S 0.180 -120 N 0.166 -121 N 0.150 -122 E 0.142 -123 P 0.143 -124 S 0.150 -125 C 0.158 -126 F 0.161 -127 P 0.157 -128 C 0.145 -129 T 0.126 -130 V 0.106 -131 C 0.090 -132 K 0.081 -133 S 0.076 -134 D 0.074 -135 Q 0.079 -136 K 0.091 -137 H 0.107 -138 K 0.120 -139 S 0.129 -140 S 0.129 -141 C 0.119 -142 T 0.106 -143 M 0.101 -144 T 0.110 -145 R 0.127 -146 D 0.138 -147 T 0.131 -148 V 0.111 -149 C 0.091 -150 Q 0.080 -151 C 0.081 -152 K 0.090 -153 E 0.096 -154 G 0.096 -155 T 0.094 -156 F 0.097 -157 R 0.103 -158 N 0.113 -159 E 0.124 -160 N 0.130 -161 S 0.129 -162 P 0.126 -163 E 0.130 -164 M 0.140 -165 C 0.150 -166 R 0.151 -167 K 0.145 -168 C 0.139 -169 S 0.133 -170 R 0.134 -171 C 0.145 -172 P 0.158 -173 S 0.161 -174 G 0.153 -175 E 0.143 -176 V 0.137 -177 Q 0.143 -178 V 0.163 -179 S 0.191 -180 N 0.209 -181 C 0.200 -182 T 0.172 -183 S 0.146 -184 W 0.138 -185 D 0.148 -186 D 0.164 -187 I 0.181 -188 Q 0.193 -189 C 0.211 -190 V 0.264 -191 E 0.369 -192 E 0.496 -193 F 0.599 -194 G 0.664 -195 A 0.706 -196 N 0.733 -197 A 0.749 -198 T 0.755 -199 V 0.750 -200 E 0.739 -201 T 0.735 -202 P 0.742 -203 A 0.743 -204 A 0.715 -205 E 0.660 -206 E 0.630 -207 T 0.659 -208 M 0.710 -209 N 0.735 -210 T 0.734 -211 S 0.726 -212 P 0.720 -213 G 0.711 -214 T 0.701 -215 P 0.700 -216 A 0.709 -217 P 0.722 -218 A 0.720 -219 A 0.686 -220 E 0.631 -221 E 0.603 -222 T 0.631 -223 M 0.684 -224 N 0.719 -225 T 0.732 -226 S 0.740 -227 P 0.746 -228 G 0.746 -229 T 0.744 -230 P 0.747 -231 A 0.759 -232 P 0.777 -233 A 0.793 -234 A 0.801 -235 E 0.802 -236 E 0.797 -237 T 0.785 -238 M 0.770 -239 T 0.758 -240 T 0.754 -241 S 0.755 -242 P 0.756 -243 G 0.755 -244 T 0.750 -245 P 0.749 -246 A 0.754 -247 P 0.764 -248 A 0.762 -249 A 0.729 -250 E 0.673 -251 E 0.639 -252 T 0.660 -253 M 0.703 -254 T 0.728 -255 T 0.731 -256 S 0.726 -257 P 0.722 -258 G 0.720 -259 T 0.718 -260 P 0.723 -261 A 0.735 -262 P 0.749 -263 A 0.749 -264 A 0.714 -265 E 0.656 -266 E 0.627 -267 T 0.661 -268 M 0.721 -269 I 0.759 -270 T 0.772 -271 S 0.776 -272 P 0.775 -273 G 0.768 -274 T 0.761 -275 P 0.754 -276 A 0.742 -277 S 0.717 -278 S 0.682 -279 H 0.639 -280 Y 0.585 -281 L 0.527 -282 S 0.481 -283 C 0.441 -284 T 0.397 -285 I 0.351 -286 V 0.321 -287 G 0.307 -288 I 0.292 -289 I 0.273 -290 V 0.257 -291 L 0.244 -292 I 0.226 -293 V 0.203 -294 L 0.184 -295 L 0.173 -296 I 0.174 -297 V 0.181 -298 F 0.192 -299 V 0.200 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000173908.9_ENST00000306658.8_GN:KRT28_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000173908.9_ENST00000306658.8_GN:KRT28_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index de74ff1c2ecb1a01cd810cbbe502c8d533853260..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000173908.9_ENST00000306658.8_GN:KRT28_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,465 +0,0 @@ ->ENSG00000173908.9|ENST00000306658.8|GN:KRT28|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.453 -2 S 0.510 -3 L 0.583 -4 Q 0.633 -5 F 0.654 -6 S 0.664 -7 N 0.675 -8 G 0.690 -9 S 0.708 -10 R 0.727 -11 H 0.748 -12 V 0.763 -13 C 0.766 -14 L 0.760 -15 R 0.758 -16 S 0.765 -17 G 0.777 -18 A 0.787 -19 G 0.793 -20 S 0.792 -21 V 0.785 -22 R 0.783 -23 P 0.794 -24 L 0.814 -25 N 0.831 -26 G 0.841 -27 G 0.845 -28 A 0.846 -29 G 0.847 -30 F 0.849 -31 A 0.852 -32 G 0.854 -33 S 0.854 -34 S 0.853 -35 A 0.851 -36 C 0.849 -37 G 0.843 -38 G 0.837 -39 S 0.833 -40 V 0.831 -41 A 0.832 -42 G 0.833 -43 S 0.831 -44 E 0.827 -45 F 0.824 -46 S 0.827 -47 C 0.829 -48 A 0.829 -49 L 0.829 -50 G 0.832 -51 G 0.838 -52 G 0.841 -53 L 0.839 -54 G 0.834 -55 S 0.828 -56 V 0.824 -57 P 0.828 -58 G 0.838 -59 G 0.846 -60 S 0.847 -61 H 0.845 -62 A 0.843 -63 G 0.843 -64 G 0.842 -65 A 0.839 -66 L 0.837 -67 G 0.836 -68 N 0.835 -69 A 0.832 -70 A 0.828 -71 C 0.823 -72 I 0.815 -73 G 0.807 -74 F 0.804 -75 A 0.805 -76 G 0.807 -77 S 0.810 -78 E 0.811 -79 G 0.810 -80 G 0.804 -81 L 0.795 -82 L 0.788 -83 S 0.781 -84 G 0.769 -85 N 0.751 -86 E 0.731 -87 K 0.713 -88 V 0.693 -89 T 0.669 -90 M 0.657 -91 Q 0.664 -92 N 0.668 -93 L 0.659 -94 N 0.643 -95 D 0.621 -96 R 0.584 -97 L 0.543 -98 A 0.507 -99 S 0.459 -100 Y 0.403 -101 L 0.375 -102 D 0.382 -103 N 0.389 -104 V 0.392 -105 R 0.408 -106 A 0.422 -107 L 0.412 -108 E 0.396 -109 E 0.391 -110 A 0.381 -111 N 0.354 -112 A 0.321 -113 E 0.292 -114 L 0.261 -115 E 0.228 -116 R 0.204 -117 K 0.196 -118 I 0.196 -119 K 0.191 -120 G 0.173 -121 W 0.153 -122 Y 0.146 -123 E 0.160 -124 K 0.199 -125 Y 0.262 -126 G 0.346 -127 P 0.442 -128 G 0.528 -129 S 0.585 -130 C 0.614 -131 R 0.630 -132 G 0.640 -133 L 0.629 -134 D 0.583 -135 H 0.503 -136 D 0.405 -137 Y 0.319 -138 S 0.268 -139 R 0.252 -140 Y 0.257 -141 H 0.264 -142 L 0.272 -143 T 0.286 -144 I 0.306 -145 E 0.319 -146 D 0.311 -147 L 0.288 -148 K 0.268 -149 N 0.261 -150 K 0.267 -151 I 0.281 -152 I 0.302 -153 S 0.323 -154 S 0.338 -155 T 0.363 -156 T 0.400 -157 T 0.433 -158 N 0.455 -159 A 0.467 -160 N 0.458 -161 V 0.437 -162 I 0.434 -163 L 0.446 -164 Q 0.454 -165 I 0.456 -166 D 0.458 -167 N 0.439 -168 A 0.391 -169 R 0.346 -170 L 0.330 -171 A 0.329 -172 A 0.323 -173 D 0.310 -174 D 0.286 -175 F 0.254 -176 R 0.230 -177 L 0.218 -178 K 0.209 -179 Y 0.207 -180 E 0.217 -181 N 0.227 -182 E 0.233 -183 L 0.248 -184 T 0.269 -185 L 0.285 -186 H 0.298 -187 Q 0.309 -188 N 0.307 -189 V 0.303 -190 E 0.325 -191 A 0.361 -192 D 0.370 -193 I 0.345 -194 N 0.314 -195 G 0.290 -196 L 0.265 -197 R 0.238 -198 R 0.218 -199 V 0.210 -200 L 0.216 -201 D 0.228 -202 E 0.234 -203 L 0.234 -204 T 0.247 -205 L 0.272 -206 C 0.293 -207 R 0.308 -208 T 0.329 -209 D 0.351 -210 Q 0.372 -211 E 0.400 -212 L 0.416 -213 Q 0.394 -214 Y 0.352 -215 E 0.325 -216 S 0.306 -217 L 0.280 -218 S 0.263 -219 E 0.266 -220 E 0.268 -221 M 0.257 -222 T 0.244 -223 Y 0.242 -224 L 0.248 -225 K 0.253 -226 K 0.248 -227 N 0.236 -228 H 0.230 -229 E 0.242 -230 E 0.267 -231 E 0.293 -232 M 0.319 -233 K 0.346 -234 A 0.369 -235 L 0.392 -236 Q 0.428 -237 C 0.477 -238 A 0.527 -239 A 0.566 -240 G 0.595 -241 G 0.620 -242 N 0.639 -243 V 0.652 -244 N 0.659 -245 V 0.663 -246 E 0.669 -247 M 0.677 -248 N 0.682 -249 A 0.680 -250 A 0.674 -251 P 0.660 -252 G 0.624 -253 V 0.552 -254 D 0.456 -255 L 0.374 -256 A 0.343 -257 V 0.357 -258 L 0.384 -259 L 0.411 -260 N 0.440 -261 N 0.456 -262 M 0.432 -263 R 0.375 -264 A 0.326 -265 E 0.301 -266 Y 0.290 -267 E 0.285 -268 A 0.279 -269 L 0.271 -270 A 0.268 -271 E 0.273 -272 Q 0.280 -273 N 0.289 -274 R 0.303 -275 K 0.321 -276 D 0.329 -277 A 0.323 -278 E 0.304 -279 A 0.278 -280 W 0.255 -281 F 0.245 -282 N 0.248 -283 E 0.250 -284 K 0.244 -285 S 0.234 -286 A 0.229 -287 S 0.233 -288 L 0.237 -289 Q 0.237 -290 Q 0.236 -291 Q 0.240 -292 I 0.253 -293 S 0.273 -294 H 0.294 -295 D 0.311 -296 S 0.331 -297 G 0.348 -298 A 0.350 -299 A 0.343 -300 T 0.339 -301 F 0.335 -302 A 0.322 -303 R 0.310 -304 S 0.313 -305 Q 0.325 -306 L 0.333 -307 T 0.338 -308 E 0.334 -309 M 0.314 -310 R 0.286 -311 R 0.269 -312 T 0.269 -313 L 0.277 -314 Q 0.281 -315 T 0.271 -316 L 0.259 -317 E 0.263 -318 I 0.280 -319 Q 0.293 -320 L 0.308 -321 Q 0.333 -322 S 0.350 -323 L 0.360 -324 M 0.381 -325 A 0.407 -326 T 0.412 -327 K 0.404 -328 H 0.403 -329 S 0.399 -330 L 0.389 -331 E 0.390 -332 C 0.396 -333 S 0.376 -334 L 0.331 -335 T 0.292 -336 E 0.273 -337 T 0.264 -338 E 0.262 -339 S 0.258 -340 N 0.240 -341 Y 0.222 -342 C 0.226 -343 T 0.244 -344 Q 0.257 -345 L 0.270 -346 A 0.294 -347 Q 0.314 -348 I 0.315 -349 Q 0.307 -350 A 0.313 -351 Q 0.338 -352 I 0.370 -353 G 0.392 -354 A 0.383 -355 L 0.345 -356 E 0.302 -357 E 0.270 -358 Q 0.254 -359 L 0.255 -360 H 0.268 -361 Q 0.276 -362 V 0.279 -363 R 0.287 -364 T 0.301 -365 E 0.315 -366 T 0.339 -367 E 0.368 -368 G 0.372 -369 Q 0.344 -370 K 0.317 -371 L 0.299 -372 E 0.281 -373 Y 0.269 -374 E 0.269 -375 H 0.267 -376 L 0.263 -377 L 0.286 -378 D 0.328 -379 V 0.352 -380 K 0.346 -381 V 0.336 -382 H 0.341 -383 L 0.360 -384 E 0.379 -385 K 0.375 -386 E 0.340 -387 I 0.299 -388 E 0.268 -389 T 0.245 -390 Y 0.234 -391 C 0.242 -392 R 0.264 -393 L 0.295 -394 I 0.345 -395 D 0.421 -396 G 0.509 -397 D 0.587 -398 G 0.637 -399 N 0.658 -400 S 0.667 -401 C 0.677 -402 S 0.691 -403 K 0.708 -404 S 0.724 -405 K 0.739 -406 G 0.752 -407 F 0.762 -408 G 0.766 -409 S 0.760 -410 G 0.751 -411 S 0.750 -412 P 0.759 -413 G 0.770 -414 N 0.775 -415 S 0.774 -416 S 0.765 -417 K 0.751 -418 D 0.736 -419 L 0.724 -420 S 0.708 -421 K 0.681 -422 T 0.654 -423 T 0.638 -424 L 0.621 -425 V 0.587 -426 K 0.543 -427 T 0.507 -428 V 0.476 -429 V 0.442 -430 E 0.409 -431 E 0.386 -432 L 0.386 -433 D 0.424 -434 Q 0.479 -435 R 0.511 -436 G 0.497 -437 K 0.445 -438 V 0.393 -439 L 0.388 -440 S 0.441 -441 S 0.505 -442 R 0.538 -443 I 0.540 -444 H 0.535 -445 S 0.530 -446 I 0.521 -447 E 0.502 -448 E 0.479 -449 K 0.465 -450 T 0.473 -451 S 0.496 -452 K 0.507 -453 M 0.513 -454 T 0.542 -455 N 0.599 -456 G 0.659 -457 K 0.696 -458 T 0.709 -459 E 0.706 -460 Q 0.691 -461 R 0.665 -462 V 0.620 -463 P 0.558 -464 F 0.508 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000173908.9_ENST00000306658.8_GN:KRT28_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000173908.9_ENST00000306658.8_GN:KRT28_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid deleted file mode 100644 index 2762501fe3c1e37f04f96293c00a76ee4003a825..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000173908.9_ENST00000306658.8_GN:KRT28_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid +++ /dev/null @@ -1,487 +0,0 @@ ->ENSG00000173908.9|ENST00000306658.8|GN:KRT28|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:22 -1 M 0.333 -2 I 0.364 -3 F 0.414 -4 C 0.466 -5 S 0.507 -6 L 0.528 -7 G 0.524 -8 T 0.493 -9 L 0.445 -10 Q 0.409 -11 F 0.392 -12 C 0.366 -13 I 0.326 -14 D 0.306 -15 K 0.333 -16 V 0.393 -17 N 0.454 -18 I 0.499 -19 S 0.527 -20 Q 0.538 -21 N 0.532 -22 T 0.525 -23 M 0.526 -24 S 0.534 -25 L 0.543 -26 Q 0.554 -27 F 0.578 -28 S 0.625 -29 N 0.678 -30 G 0.715 -31 S 0.729 -32 R 0.735 -33 H 0.746 -34 V 0.764 -35 C 0.778 -36 L 0.781 -37 R 0.781 -38 S 0.787 -39 G 0.798 -40 A 0.808 -41 G 0.811 -42 S 0.803 -43 V 0.788 -44 R 0.781 -45 P 0.791 -46 L 0.811 -47 N 0.830 -48 G 0.843 -49 G 0.849 -50 A 0.853 -51 G 0.856 -52 F 0.860 -53 A 0.865 -54 G 0.867 -55 S 0.867 -56 S 0.866 -57 A 0.866 -58 C 0.866 -59 G 0.863 -60 G 0.859 -61 S 0.856 -62 V 0.855 -63 A 0.855 -64 G 0.855 -65 S 0.853 -66 E 0.849 -67 F 0.846 -68 S 0.847 -69 C 0.849 -70 A 0.850 -71 L 0.850 -72 G 0.854 -73 G 0.859 -74 G 0.861 -75 L 0.858 -76 G 0.853 -77 S 0.847 -78 V 0.843 -79 P 0.846 -80 G 0.854 -81 G 0.861 -82 S 0.862 -83 H 0.859 -84 A 0.856 -85 G 0.853 -86 G 0.850 -87 A 0.845 -88 L 0.840 -89 G 0.836 -90 N 0.831 -91 A 0.826 -92 A 0.822 -93 C 0.818 -94 I 0.811 -95 G 0.805 -96 F 0.803 -97 A 0.802 -98 G 0.803 -99 S 0.803 -100 E 0.804 -101 G 0.801 -102 G 0.794 -103 L 0.785 -104 L 0.776 -105 S 0.767 -106 G 0.754 -107 N 0.732 -108 E 0.706 -109 K 0.682 -110 V 0.658 -111 T 0.631 -112 M 0.615 -113 Q 0.618 -114 N 0.621 -115 L 0.609 -116 N 0.594 -117 D 0.573 -118 R 0.538 -119 L 0.496 -120 A 0.459 -121 S 0.415 -122 Y 0.364 -123 L 0.340 -124 D 0.348 -125 N 0.356 -126 V 0.360 -127 R 0.378 -128 A 0.398 -129 L 0.397 -130 E 0.393 -131 E 0.397 -132 A 0.393 -133 N 0.365 -134 A 0.329 -135 E 0.295 -136 L 0.260 -137 E 0.227 -138 R 0.202 -139 K 0.193 -140 I 0.193 -141 K 0.186 -142 G 0.169 -143 W 0.150 -144 Y 0.144 -145 E 0.160 -146 K 0.199 -147 Y 0.261 -148 G 0.346 -149 P 0.444 -150 G 0.533 -151 S 0.593 -152 C 0.623 -153 R 0.640 -154 G 0.647 -155 L 0.634 -156 D 0.588 -157 H 0.507 -158 D 0.408 -159 Y 0.320 -160 S 0.267 -161 R 0.251 -162 Y 0.254 -163 H 0.260 -164 L 0.266 -165 T 0.276 -166 I 0.292 -167 E 0.302 -168 D 0.295 -169 L 0.273 -170 K 0.253 -171 N 0.246 -172 K 0.250 -173 I 0.264 -174 I 0.289 -175 S 0.313 -176 S 0.332 -177 T 0.360 -178 T 0.400 -179 T 0.433 -180 N 0.455 -181 A 0.466 -182 N 0.456 -183 V 0.434 -184 I 0.429 -185 L 0.440 -186 Q 0.447 -187 I 0.450 -188 D 0.455 -189 N 0.440 -190 A 0.397 -191 R 0.355 -192 L 0.340 -193 A 0.341 -194 A 0.337 -195 D 0.325 -196 D 0.299 -197 F 0.263 -198 R 0.237 -199 L 0.226 -200 K 0.216 -201 Y 0.212 -202 E 0.220 -203 N 0.227 -204 E 0.229 -205 L 0.240 -206 T 0.259 -207 L 0.274 -208 H 0.286 -209 Q 0.298 -210 N 0.297 -211 V 0.294 -212 E 0.316 -213 A 0.350 -214 D 0.358 -215 I 0.332 -216 N 0.302 -217 G 0.281 -218 L 0.259 -219 R 0.235 -220 R 0.217 -221 V 0.211 -222 L 0.217 -223 D 0.230 -224 E 0.238 -225 L 0.238 -226 T 0.249 -227 L 0.272 -228 C 0.289 -229 R 0.303 -230 T 0.324 -231 D 0.347 -232 Q 0.368 -233 E 0.395 -234 L 0.410 -235 Q 0.387 -236 Y 0.346 -237 E 0.320 -238 S 0.301 -239 L 0.275 -240 S 0.258 -241 E 0.261 -242 E 0.264 -243 M 0.254 -244 T 0.241 -245 Y 0.239 -246 L 0.246 -247 K 0.252 -248 K 0.248 -249 N 0.235 -250 H 0.229 -251 E 0.242 -252 E 0.266 -253 E 0.291 -254 M 0.316 -255 K 0.342 -256 A 0.364 -257 L 0.386 -258 Q 0.420 -259 C 0.470 -260 A 0.521 -261 A 0.562 -262 G 0.595 -263 G 0.622 -264 N 0.644 -265 V 0.657 -266 N 0.662 -267 V 0.663 -268 E 0.667 -269 M 0.674 -270 N 0.677 -271 A 0.674 -272 A 0.669 -273 P 0.657 -274 G 0.625 -275 V 0.557 -276 D 0.463 -277 L 0.381 -278 A 0.348 -279 V 0.359 -280 L 0.384 -281 L 0.409 -282 N 0.438 -283 N 0.452 -284 M 0.426 -285 R 0.371 -286 A 0.325 -287 E 0.304 -288 Y 0.297 -289 E 0.295 -290 A 0.292 -291 L 0.285 -292 A 0.283 -293 E 0.288 -294 Q 0.297 -295 N 0.307 -296 R 0.323 -297 K 0.340 -298 D 0.348 -299 A 0.340 -300 E 0.319 -301 A 0.292 -302 W 0.269 -303 F 0.259 -304 N 0.260 -305 E 0.261 -306 K 0.254 -307 S 0.243 -308 A 0.239 -309 S 0.243 -310 L 0.247 -311 Q 0.246 -312 Q 0.243 -313 Q 0.246 -314 I 0.260 -315 S 0.283 -316 H 0.307 -317 D 0.328 -318 S 0.350 -319 G 0.369 -320 A 0.371 -321 A 0.361 -322 T 0.356 -323 F 0.351 -324 A 0.336 -325 R 0.322 -326 S 0.326 -327 Q 0.340 -328 L 0.351 -329 T 0.357 -330 E 0.353 -331 M 0.330 -332 R 0.299 -333 R 0.281 -334 T 0.283 -335 L 0.295 -336 Q 0.302 -337 T 0.292 -338 L 0.278 -339 E 0.282 -340 I 0.299 -341 Q 0.310 -342 L 0.324 -343 Q 0.348 -344 S 0.365 -345 L 0.374 -346 M 0.394 -347 A 0.418 -348 T 0.422 -349 K 0.415 -350 H 0.414 -351 S 0.410 -352 L 0.397 -353 E 0.396 -354 C 0.400 -355 S 0.380 -356 L 0.337 -357 T 0.300 -358 E 0.283 -359 T 0.277 -360 E 0.276 -361 S 0.273 -362 N 0.255 -363 Y 0.236 -364 C 0.239 -365 T 0.258 -366 Q 0.270 -367 L 0.282 -368 A 0.305 -369 Q 0.324 -370 I 0.325 -371 Q 0.316 -372 A 0.320 -373 Q 0.344 -374 I 0.379 -375 G 0.402 -376 A 0.394 -377 L 0.355 -378 E 0.310 -379 E 0.277 -380 Q 0.260 -381 L 0.262 -382 H 0.277 -383 Q 0.287 -384 V 0.289 -385 R 0.296 -386 T 0.308 -387 E 0.321 -388 T 0.345 -389 E 0.374 -390 G 0.377 -391 Q 0.350 -392 K 0.324 -393 L 0.309 -394 E 0.293 -395 Y 0.284 -396 E 0.286 -397 H 0.284 -398 L 0.280 -399 L 0.304 -400 D 0.348 -401 V 0.371 -402 K 0.366 -403 V 0.358 -404 H 0.364 -405 L 0.382 -406 E 0.400 -407 K 0.393 -408 E 0.355 -409 I 0.309 -410 E 0.275 -411 T 0.251 -412 Y 0.239 -413 C 0.248 -414 R 0.270 -415 L 0.302 -416 I 0.353 -417 D 0.428 -418 G 0.514 -419 D 0.590 -420 G 0.639 -421 N 0.662 -422 S 0.672 -423 C 0.681 -424 S 0.695 -425 K 0.710 -426 S 0.726 -427 K 0.740 -428 G 0.752 -429 F 0.762 -430 G 0.765 -431 S 0.761 -432 G 0.753 -433 S 0.752 -434 P 0.761 -435 G 0.772 -436 N 0.778 -437 S 0.777 -438 S 0.769 -439 K 0.756 -440 D 0.742 -441 L 0.731 -442 S 0.716 -443 K 0.691 -444 T 0.667 -445 T 0.654 -446 L 0.641 -447 V 0.609 -448 K 0.566 -449 T 0.526 -450 V 0.489 -451 V 0.453 -452 E 0.422 -453 E 0.399 -454 L 0.395 -455 D 0.429 -456 Q 0.483 -457 R 0.516 -458 G 0.505 -459 K 0.455 -460 V 0.403 -461 L 0.400 -462 S 0.456 -463 S 0.523 -464 R 0.558 -465 I 0.564 -466 H 0.564 -467 S 0.564 -468 I 0.558 -469 E 0.543 -470 E 0.522 -471 K 0.506 -472 T 0.512 -473 S 0.528 -474 K 0.534 -475 M 0.533 -476 T 0.557 -477 N 0.609 -478 G 0.664 -479 K 0.698 -480 T 0.709 -481 E 0.705 -482 Q 0.691 -483 R 0.664 -484 V 0.617 -485 P 0.553 -486 F 0.502 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000173976.16_ENST00000555633.3_GN:RAX2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000173976.16_ENST00000555633.3_GN:RAX2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index cd63a547947a0b8e4ceda0996738934412a23770..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000173976.16_ENST00000555633.3_GN:RAX2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,185 +0,0 @@ ->ENSG00000173976.16|ENST00000555633.3|GN:RAX2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.525 -2 F 0.556 -3 L 0.598 -4 S 0.639 -5 P 0.677 -6 G 0.711 -7 E 0.741 -8 G 0.767 -9 P 0.788 -10 A 0.802 -11 T 0.811 -12 E 0.816 -13 G 0.818 -14 G 0.815 -15 G 0.808 -16 L 0.799 -17 G 0.790 -18 P 0.782 -19 G 0.771 -20 E 0.757 -21 E 0.741 -22 A 0.730 -23 P 0.726 -24 K 0.725 -25 K 0.720 -26 K 0.706 -27 H 0.683 -28 R 0.648 -29 R 0.595 -30 N 0.511 -31 R 0.404 -32 T 0.304 -33 T 0.237 -34 F 0.193 -35 T 0.151 -36 T 0.107 -37 Y 0.071 -38 Q 0.053 -39 L 0.051 -40 H 0.060 -41 Q 0.070 -42 L 0.076 -43 E 0.074 -44 R 0.067 -45 A 0.060 -46 F 0.058 -47 E 0.059 -48 A 0.059 -49 S 0.057 -50 H 0.058 -51 Y 0.066 -52 P 0.075 -53 D 0.076 -54 V 0.067 -55 Y 0.054 -56 S 0.044 -57 R 0.041 -58 E 0.049 -59 E 0.067 -60 L 0.088 -61 A 0.101 -62 A 0.098 -63 K 0.083 -64 V 0.068 -65 H 0.060 -66 L 0.057 -67 P 0.055 -68 E 0.055 -69 V 0.058 -70 R 0.060 -71 V 0.057 -72 Q 0.050 -73 V 0.042 -74 W 0.035 -75 F 0.030 -76 Q 0.028 -77 N 0.028 -78 R 0.029 -79 R 0.032 -80 A 0.036 -81 K 0.042 -82 W 0.055 -83 R 0.079 -84 R 0.115 -85 Q 0.161 -86 E 0.215 -87 R 0.276 -88 L 0.348 -89 E 0.440 -90 S 0.545 -91 G 0.637 -92 S 0.695 -93 G 0.727 -94 A 0.742 -95 V 0.746 -96 A 0.737 -97 A 0.723 -98 P 0.712 -99 R 0.711 -100 L 0.716 -101 P 0.724 -102 E 0.731 -103 A 0.736 -104 P 0.738 -105 A 0.739 -106 L 0.741 -107 P 0.743 -108 F 0.746 -109 A 0.748 -110 R 0.751 -111 P 0.763 -112 P 0.785 -113 A 0.806 -114 M 0.815 -115 S 0.810 -116 L 0.798 -117 P 0.784 -118 L 0.774 -119 E 0.766 -120 P 0.755 -121 W 0.742 -122 L 0.731 -123 G 0.728 -124 P 0.733 -125 G 0.745 -126 P 0.758 -127 P 0.769 -128 A 0.776 -129 V 0.781 -130 P 0.785 -131 G 0.787 -132 L 0.791 -133 P 0.799 -134 R 0.807 -135 L 0.803 -136 L 0.788 -137 G 0.772 -138 P 0.769 -139 G 0.781 -140 P 0.804 -141 G 0.828 -142 L 0.842 -143 Q 0.843 -144 A 0.833 -145 S 0.813 -146 F 0.789 -147 G 0.776 -148 P 0.778 -149 H 0.790 -150 A 0.797 -151 F 0.792 -152 A 0.783 -153 P 0.782 -154 T 0.790 -155 F 0.798 -156 A 0.801 -157 D 0.799 -158 G 0.795 -159 F 0.788 -160 A 0.769 -161 L 0.727 -162 E 0.648 -163 E 0.537 -164 A 0.428 -165 S 0.351 -166 L 0.307 -167 R 0.287 -168 L 0.285 -169 L 0.289 -170 A 0.287 -171 K 0.288 -172 E 0.300 -173 H 0.316 -174 A 0.324 -175 Q 0.337 -176 A 0.370 -177 L 0.402 -178 D 0.412 -179 R 0.404 -180 A 0.397 -181 W 0.396 -182 P 0.400 -183 P 0.406 -184 A 0.408 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000173976.16_ENST00000555633.3_GN:RAX2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:46.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000173976.16_ENST00000555633.3_GN:RAX2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:46.caid deleted file mode 100644 index ad2444e4f170e5cb69b334c23dada038ec9979c9..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000173976.16_ENST00000555633.3_GN:RAX2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:46.caid +++ /dev/null @@ -1,231 +0,0 @@ ->ENSG00000173976.16|ENST00000555633.3|GN:RAX2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:46 -1 M 0.535 -2 P 0.578 -3 A 0.642 -4 P 0.705 -5 V 0.752 -6 E 0.779 -7 G 0.789 -8 T 0.786 -9 D 0.776 -10 F 0.770 -11 P 0.778 -12 G 0.796 -13 A 0.813 -14 G 0.820 -15 R 0.816 -16 Q 0.802 -17 A 0.781 -18 W 0.763 -19 G 0.761 -20 S 0.773 -21 P 0.790 -22 A 0.803 -23 L 0.808 -24 S 0.808 -25 L 0.809 -26 P 0.811 -27 V 0.812 -28 A 0.813 -29 P 0.818 -30 P 0.828 -31 A 0.835 -32 V 0.829 -33 S 0.814 -34 P 0.803 -35 P 0.804 -36 S 0.809 -37 V 0.808 -38 P 0.801 -39 L 0.795 -40 P 0.795 -41 S 0.799 -42 H 0.803 -43 Q 0.807 -44 V 0.812 -45 G 0.813 -46 A 0.806 -47 M 0.795 -48 F 0.786 -49 L 0.785 -50 S 0.792 -51 P 0.802 -52 G 0.813 -53 E 0.823 -54 G 0.832 -55 P 0.841 -56 A 0.849 -57 T 0.855 -58 E 0.857 -59 G 0.857 -60 G 0.856 -61 G 0.852 -62 L 0.847 -63 G 0.843 -64 P 0.841 -65 G 0.838 -66 E 0.830 -67 E 0.820 -68 A 0.810 -69 P 0.803 -70 K 0.795 -71 K 0.783 -72 K 0.764 -73 H 0.736 -74 R 0.698 -75 R 0.642 -76 N 0.554 -77 R 0.439 -78 T 0.330 -79 T 0.256 -80 F 0.209 -81 T 0.165 -82 T 0.119 -83 Y 0.080 -84 Q 0.058 -85 L 0.055 -86 H 0.062 -87 Q 0.072 -88 L 0.078 -89 E 0.076 -90 R 0.069 -91 A 0.062 -92 F 0.059 -93 E 0.059 -94 A 0.058 -95 S 0.054 -96 H 0.054 -97 Y 0.061 -98 P 0.070 -99 D 0.072 -100 V 0.064 -101 Y 0.052 -102 S 0.043 -103 R 0.041 -104 E 0.048 -105 E 0.065 -106 L 0.085 -107 A 0.097 -108 A 0.094 -109 K 0.078 -110 V 0.063 -111 H 0.054 -112 L 0.051 -113 P 0.050 -114 E 0.051 -115 V 0.054 -116 R 0.056 -117 V 0.054 -118 Q 0.048 -119 V 0.040 -120 W 0.033 -121 F 0.029 -122 Q 0.028 -123 N 0.027 -124 R 0.028 -125 R 0.031 -126 A 0.035 -127 K 0.040 -128 W 0.052 -129 R 0.074 -130 R 0.105 -131 Q 0.145 -132 E 0.193 -133 R 0.251 -134 L 0.322 -135 E 0.415 -136 S 0.523 -137 G 0.619 -138 S 0.684 -139 G 0.719 -140 A 0.737 -141 V 0.740 -142 A 0.730 -143 A 0.713 -144 P 0.701 -145 R 0.698 -146 L 0.703 -147 P 0.712 -148 E 0.722 -149 A 0.728 -150 P 0.731 -151 A 0.732 -152 L 0.734 -153 P 0.739 -154 F 0.745 -155 A 0.751 -156 R 0.757 -157 P 0.771 -158 P 0.795 -159 A 0.817 -160 M 0.827 -161 S 0.823 -162 L 0.811 -163 P 0.799 -164 L 0.792 -165 E 0.787 -166 P 0.781 -167 W 0.772 -168 L 0.764 -169 G 0.761 -170 P 0.764 -171 G 0.773 -172 P 0.783 -173 P 0.793 -174 A 0.799 -175 V 0.803 -176 P 0.805 -177 G 0.807 -178 L 0.811 -179 P 0.818 -180 R 0.823 -181 L 0.817 -182 L 0.802 -183 G 0.786 -184 P 0.783 -185 G 0.794 -186 P 0.816 -187 G 0.840 -188 L 0.854 -189 Q 0.856 -190 A 0.846 -191 S 0.826 -192 F 0.803 -193 G 0.790 -194 P 0.792 -195 H 0.802 -196 A 0.807 -197 F 0.801 -198 A 0.793 -199 P 0.793 -200 T 0.800 -201 F 0.807 -202 A 0.808 -203 D 0.805 -204 G 0.800 -205 F 0.793 -206 A 0.773 -207 L 0.729 -208 E 0.648 -209 E 0.539 -210 A 0.437 -211 S 0.367 -212 L 0.324 -213 R 0.301 -214 L 0.295 -215 L 0.296 -216 A 0.292 -217 K 0.291 -218 E 0.305 -219 H 0.325 -220 A 0.336 -221 Q 0.352 -222 A 0.384 -223 L 0.416 -224 D 0.425 -225 R 0.416 -226 A 0.406 -227 W 0.403 -228 P 0.407 -229 P 0.413 -230 A 0.415 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000174007.10_ENST00000409690.5_GN:CEP19_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000174007.10_ENST00000409690.5_GN:CEP19_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 626ebb903489f97bf9ed6bce5ac94df3bf1de792..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000174007.10_ENST00000409690.5_GN:CEP19_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,164 +0,0 @@ ->ENSG00000174007.10|ENST00000409690.5|GN:CEP19|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.322 -2 M 0.278 -3 C 0.212 -4 T 0.148 -5 A 0.100 -6 K 0.067 -7 K 0.046 -8 C 0.036 -9 G 0.033 -10 I 0.035 -11 R 0.040 -12 F 0.043 -13 Q 0.042 -14 P 0.036 -15 P 0.029 -16 A 0.023 -17 I 0.019 -18 I 0.017 -19 L 0.017 -20 I 0.022 -21 Y 0.033 -22 E 0.047 -23 S 0.063 -24 E 0.080 -25 I 0.100 -26 K 0.125 -27 G 0.146 -28 K 0.154 -29 I 0.145 -30 R 0.123 -31 Q 0.101 -32 R 0.083 -33 I 0.067 -34 M 0.058 -35 P 0.057 -36 V 0.063 -37 R 0.068 -38 N 0.066 -39 F 0.062 -40 S 0.062 -41 K 0.071 -42 F 0.080 -43 S 0.080 -44 D 0.070 -45 C 0.057 -46 T 0.048 -47 R 0.045 -48 A 0.043 -49 A 0.042 -50 E 0.045 -51 Q 0.051 -52 L 0.060 -53 K 0.066 -54 N 0.072 -55 N 0.076 -56 P 0.072 -57 R 0.061 -58 H 0.050 -59 K 0.044 -60 S 0.043 -61 Y 0.046 -62 L 0.053 -63 E 0.061 -64 Q 0.066 -65 V 0.065 -66 S 0.059 -67 L 0.049 -68 R 0.040 -69 Q 0.032 -70 L 0.028 -71 E 0.025 -72 K 0.023 -73 L 0.022 -74 F 0.021 -75 S 0.022 -76 F 0.024 -77 L 0.028 -78 R 0.034 -79 G 0.044 -80 Y 0.059 -81 L 0.081 -82 S 0.107 -83 G 0.122 -84 Q 0.118 -85 S 0.103 -86 L 0.090 -87 A 0.090 -88 E 0.097 -89 T 0.102 -90 M 0.107 -91 E 0.116 -92 Q 0.132 -93 I 0.153 -94 Q 0.180 -95 R 0.211 -96 E 0.244 -97 T 0.276 -98 T 0.304 -99 I 0.329 -100 D 0.352 -101 P 0.368 -102 E 0.369 -103 E 0.356 -104 D 0.343 -105 L 0.338 -106 N 0.333 -107 K 0.323 -108 L 0.310 -109 D 0.294 -110 D 0.268 -111 K 0.233 -112 E 0.202 -113 L 0.185 -114 A 0.179 -115 K 0.181 -116 R 0.187 -117 K 0.192 -118 S 0.196 -119 I 0.201 -120 M 0.204 -121 D 0.200 -122 E 0.189 -123 L 0.181 -124 F 0.181 -125 E 0.187 -126 K 0.196 -127 N 0.206 -128 Q 0.216 -129 K 0.238 -130 K 0.280 -131 K 0.325 -132 D 0.352 -133 D 0.364 -134 P 0.377 -135 N 0.394 -136 F 0.415 -137 V 0.445 -138 Y 0.480 -139 D 0.509 -140 I 0.518 -141 E 0.505 -142 V 0.490 -143 E 0.497 -144 F 0.534 -145 P 0.589 -146 Q 0.643 -147 D 0.676 -148 D 0.684 -149 Q 0.680 -150 L 0.681 -151 Q 0.688 -152 S 0.699 -153 C 0.712 -154 G 0.722 -155 W 0.730 -156 D 0.738 -157 T 0.745 -158 E 0.748 -159 S 0.740 -160 A 0.712 -161 D 0.659 -162 E 0.591 -163 F 0.538 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000174007.10_ENST00000409690.5_GN:CEP19_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000174007.10_ENST00000409690.5_GN:CEP19_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid deleted file mode 100644 index 00ede0e81e40a1b553cd969c13e5c04efbc8a696..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000174007.10_ENST00000409690.5_GN:CEP19_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid +++ /dev/null @@ -1,166 +0,0 @@ ->ENSG00000174007.10|ENST00000409690.5|GN:CEP19|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:2 -1 M 0.504 -2 G 0.488 -3 M 0.441 -4 M 0.354 -5 C 0.248 -6 T 0.158 -7 A 0.098 -8 K 0.062 -9 K 0.042 -10 C 0.033 -11 G 0.030 -12 I 0.032 -13 R 0.037 -14 F 0.040 -15 Q 0.039 -16 P 0.034 -17 P 0.028 -18 A 0.023 -19 I 0.019 -20 I 0.017 -21 L 0.017 -22 I 0.022 -23 Y 0.031 -24 E 0.044 -25 S 0.057 -26 E 0.073 -27 I 0.093 -28 K 0.117 -29 G 0.139 -30 K 0.149 -31 I 0.141 -32 R 0.121 -33 Q 0.101 -34 R 0.083 -35 I 0.068 -36 M 0.058 -37 P 0.057 -38 V 0.063 -39 R 0.067 -40 N 0.065 -41 F 0.061 -42 S 0.062 -43 K 0.071 -44 F 0.080 -45 S 0.080 -46 D 0.070 -47 C 0.057 -48 T 0.048 -49 R 0.045 -50 A 0.043 -51 A 0.042 -52 E 0.045 -53 Q 0.051 -54 L 0.059 -55 K 0.066 -56 N 0.071 -57 N 0.075 -58 P 0.072 -59 R 0.061 -60 H 0.049 -61 K 0.043 -62 S 0.042 -63 Y 0.045 -64 L 0.052 -65 E 0.060 -66 Q 0.065 -67 V 0.064 -68 S 0.058 -69 L 0.049 -70 R 0.039 -71 Q 0.032 -72 L 0.027 -73 E 0.025 -74 K 0.023 -75 L 0.022 -76 F 0.021 -77 S 0.022 -78 F 0.024 -79 L 0.027 -80 R 0.033 -81 G 0.043 -82 Y 0.058 -83 L 0.080 -84 S 0.105 -85 G 0.121 -86 Q 0.118 -87 S 0.102 -88 L 0.089 -89 A 0.088 -90 E 0.095 -91 T 0.100 -92 M 0.105 -93 E 0.113 -94 Q 0.128 -95 I 0.150 -96 Q 0.177 -97 R 0.207 -98 E 0.241 -99 T 0.274 -100 T 0.302 -101 I 0.327 -102 D 0.349 -103 P 0.365 -104 E 0.365 -105 E 0.352 -106 D 0.339 -107 L 0.334 -108 N 0.330 -109 K 0.320 -110 L 0.308 -111 D 0.291 -112 D 0.265 -113 K 0.231 -114 E 0.200 -115 L 0.183 -116 A 0.179 -117 K 0.181 -118 R 0.186 -119 K 0.192 -120 S 0.197 -121 I 0.201 -122 M 0.204 -123 D 0.199 -124 E 0.188 -125 L 0.180 -126 F 0.181 -127 E 0.186 -128 K 0.194 -129 N 0.203 -130 Q 0.212 -131 K 0.234 -132 K 0.276 -133 K 0.322 -134 D 0.348 -135 D 0.360 -136 P 0.373 -137 N 0.390 -138 F 0.411 -139 V 0.440 -140 Y 0.475 -141 D 0.504 -142 I 0.513 -143 E 0.500 -144 V 0.485 -145 E 0.493 -146 F 0.532 -147 P 0.588 -148 Q 0.642 -149 D 0.675 -150 D 0.681 -151 Q 0.677 -152 L 0.678 -153 Q 0.686 -154 S 0.699 -155 C 0.712 -156 G 0.723 -157 W 0.731 -158 D 0.738 -159 T 0.746 -160 E 0.748 -161 S 0.740 -162 A 0.711 -163 D 0.659 -164 E 0.590 -165 F 0.537 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000174804.4_ENST00000531380.2_GN:FZD4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000174804.4_ENST00000531380.2_GN:FZD4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index ccfb7e3beeac7f28c04b617ef719b7dda63da521..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000174804.4_ENST00000531380.2_GN:FZD4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,538 +0,0 @@ ->ENSG00000174804.4|ENST00000531380.2|GN:FZD4|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.308 -2 A 0.325 -3 W 0.350 -4 R 0.373 -5 G 0.388 -6 A 0.409 -7 G 0.450 -8 P 0.490 -9 S 0.509 -10 V 0.517 -11 P 0.527 -12 G 0.537 -13 A 0.541 -14 P 0.546 -15 G 0.551 -16 G 0.540 -17 V 0.490 -18 G 0.409 -19 L 0.322 -20 S 0.248 -21 L 0.190 -22 G 0.148 -23 L 0.123 -24 L 0.113 -25 L 0.112 -26 Q 0.112 -27 L 0.109 -28 L 0.107 -29 L 0.120 -30 L 0.160 -31 L 0.225 -32 G 0.300 -33 P 0.375 -34 A 0.442 -35 R 0.498 -36 G 0.541 -37 F 0.569 -38 G 0.582 -39 D 0.579 -40 E 0.549 -41 E 0.483 -42 E 0.386 -43 R 0.280 -44 R 0.192 -45 C 0.133 -46 D 0.099 -47 P 0.081 -48 I 0.072 -49 R 0.064 -50 I 0.058 -51 S 0.053 -52 M 0.054 -53 C 0.060 -54 Q 0.073 -55 N 0.087 -56 L 0.095 -57 G 0.095 -58 Y 0.089 -59 N 0.087 -60 V 0.090 -61 T 0.092 -62 K 0.085 -63 M 0.075 -64 P 0.077 -65 N 0.092 -66 L 0.113 -67 V 0.130 -68 G 0.137 -69 H 0.131 -70 E 0.121 -71 L 0.119 -72 Q 0.121 -73 T 0.123 -74 D 0.126 -75 A 0.129 -76 E 0.128 -77 L 0.120 -78 Q 0.108 -79 L 0.095 -80 T 0.084 -81 T 0.076 -82 F 0.071 -83 T 0.065 -84 P 0.059 -85 L 0.059 -86 I 0.064 -87 Q 0.075 -88 Y 0.084 -89 G 0.090 -90 C 0.090 -91 S 0.083 -92 S 0.074 -93 Q 0.065 -94 L 0.056 -95 Q 0.050 -96 F 0.048 -97 F 0.053 -98 L 0.060 -99 C 0.064 -100 S 0.064 -101 V 0.061 -102 Y 0.058 -103 V 0.056 -104 P 0.055 -105 M 0.057 -106 C 0.061 -107 T 0.067 -108 E 0.075 -109 K 0.086 -110 I 0.100 -111 N 0.119 -112 I 0.138 -113 P 0.150 -114 I 0.146 -115 G 0.128 -116 P 0.101 -117 C 0.076 -118 G 0.061 -119 G 0.054 -120 M 0.048 -121 C 0.043 -122 L 0.041 -123 S 0.043 -124 V 0.046 -125 K 0.045 -126 R 0.043 -127 R 0.040 -128 C 0.037 -129 E 0.037 -130 P 0.040 -131 V 0.046 -132 L 0.052 -133 K 0.055 -134 E 0.060 -135 F 0.075 -136 G 0.100 -137 F 0.124 -138 A 0.134 -139 W 0.127 -140 P 0.109 -141 E 0.091 -142 S 0.074 -143 L 0.061 -144 N 0.051 -145 C 0.046 -146 S 0.045 -147 K 0.051 -148 F 0.064 -149 P 0.083 -150 P 0.100 -151 Q 0.114 -152 N 0.128 -153 D 0.141 -154 H 0.144 -155 N 0.135 -156 H 0.121 -157 M 0.117 -158 C 0.132 -159 M 0.168 -160 E 0.228 -161 G 0.313 -162 P 0.417 -163 G 0.515 -164 D 0.582 -165 E 0.608 -166 E 0.605 -167 V 0.593 -168 P 0.585 -169 L 0.583 -170 P 0.579 -171 H 0.570 -172 K 0.558 -173 T 0.543 -174 P 0.524 -175 I 0.510 -176 Q 0.501 -177 P 0.477 -178 G 0.419 -179 E 0.338 -180 E 0.261 -181 C 0.208 -182 H 0.181 -183 S 0.179 -184 V 0.191 -185 G 0.204 -186 T 0.207 -187 N 0.195 -188 S 0.171 -189 D 0.145 -190 Q 0.123 -191 Y 0.105 -192 I 0.088 -193 W 0.075 -194 V 0.068 -195 K 0.071 -196 R 0.079 -197 S 0.089 -198 L 0.102 -199 N 0.120 -200 C 0.130 -201 V 0.124 -202 L 0.109 -203 K 0.104 -204 C 0.122 -205 G 0.162 -206 Y 0.209 -207 D 0.241 -208 A 0.245 -209 G 0.230 -210 L 0.214 -211 Y 0.201 -212 S 0.180 -213 R 0.153 -214 S 0.133 -215 A 0.123 -216 K 0.117 -217 E 0.110 -218 F 0.100 -219 T 0.091 -220 D 0.081 -221 I 0.070 -222 W 0.062 -223 M 0.059 -224 A 0.057 -225 V 0.053 -226 W 0.053 -227 A 0.058 -228 S 0.065 -229 L 0.069 -230 C 0.070 -231 F 0.069 -232 I 0.071 -233 S 0.077 -234 T 0.078 -235 A 0.072 -236 F 0.064 -237 T 0.057 -238 V 0.052 -239 L 0.048 -240 T 0.044 -241 F 0.043 -242 L 0.044 -243 I 0.047 -244 D 0.048 -245 S 0.046 -246 S 0.044 -247 R 0.042 -248 F 0.038 -249 S 0.033 -250 Y 0.028 -251 P 0.027 -252 E 0.029 -253 R 0.032 -254 P 0.034 -255 I 0.036 -256 I 0.041 -257 F 0.049 -258 L 0.058 -259 S 0.066 -260 M 0.071 -261 C 0.072 -262 Y 0.073 -263 N 0.072 -264 I 0.069 -265 Y 0.066 -266 S 0.064 -267 I 0.062 -268 A 0.064 -269 Y 0.070 -270 I 0.075 -271 V 0.079 -272 R 0.084 -273 L 0.089 -274 T 0.096 -275 V 0.110 -276 G 0.125 -277 R 0.134 -278 E 0.136 -279 R 0.134 -280 I 0.131 -281 S 0.127 -282 C 0.125 -283 D 0.132 -284 F 0.150 -285 E 0.175 -286 E 0.193 -287 A 0.197 -288 A 0.191 -289 E 0.184 -290 P 0.173 -291 V 0.157 -292 L 0.144 -293 I 0.140 -294 Q 0.147 -295 E 0.160 -296 G 0.175 -297 L 0.180 -298 K 0.173 -299 N 0.152 -300 T 0.125 -301 G 0.106 -302 C 0.099 -303 A 0.095 -304 I 0.092 -305 I 0.087 -306 F 0.077 -307 L 0.062 -308 L 0.047 -309 M 0.036 -310 Y 0.033 -311 F 0.036 -312 F 0.044 -313 G 0.058 -314 M 0.074 -315 A 0.083 -316 S 0.079 -317 S 0.066 -318 I 0.052 -319 W 0.042 -320 W 0.037 -321 V 0.037 -322 I 0.042 -323 L 0.048 -324 T 0.052 -325 L 0.053 -326 T 0.053 -327 W 0.052 -328 F 0.054 -329 L 0.060 -330 A 0.073 -331 A 0.089 -332 G 0.098 -333 L 0.098 -334 K 0.092 -335 W 0.090 -336 G 0.096 -337 H 0.107 -338 E 0.115 -339 A 0.114 -340 I 0.103 -341 E 0.087 -342 M 0.073 -343 H 0.061 -344 S 0.049 -345 S 0.039 -346 Y 0.033 -347 F 0.034 -348 H 0.038 -349 I 0.048 -350 A 0.059 -351 A 0.064 -352 W 0.060 -353 A 0.057 -354 I 0.059 -355 P 0.064 -356 A 0.067 -357 V 0.070 -358 K 0.074 -359 T 0.075 -360 I 0.073 -361 V 0.071 -362 I 0.073 -363 L 0.077 -364 I 0.085 -365 M 0.095 -366 R 0.106 -367 L 0.116 -368 V 0.122 -369 D 0.123 -370 A 0.128 -371 D 0.134 -372 E 0.137 -373 L 0.134 -374 T 0.126 -375 G 0.115 -376 L 0.106 -377 C 0.112 -378 Y 0.136 -379 V 0.166 -380 G 0.185 -381 N 0.188 -382 Q 0.177 -383 N 0.158 -384 L 0.140 -385 D 0.128 -386 A 0.119 -387 L 0.107 -388 T 0.096 -389 G 0.092 -390 F 0.090 -391 V 0.086 -392 V 0.082 -393 A 0.087 -394 P 0.095 -395 L 0.095 -396 F 0.083 -397 T 0.071 -398 Y 0.066 -399 L 0.070 -400 V 0.083 -401 I 0.104 -402 G 0.124 -403 T 0.132 -404 L 0.124 -405 F 0.110 -406 I 0.100 -407 A 0.093 -408 A 0.090 -409 G 0.094 -410 L 0.101 -411 V 0.102 -412 A 0.090 -413 L 0.074 -414 F 0.066 -415 K 0.071 -416 I 0.087 -417 R 0.110 -418 S 0.141 -419 N 0.179 -420 L 0.223 -421 Q 0.263 -422 K 0.296 -423 D 0.318 -424 G 0.327 -425 T 0.318 -426 K 0.291 -427 T 0.253 -428 D 0.210 -429 K 0.175 -430 L 0.149 -431 E 0.127 -432 R 0.103 -433 L 0.079 -434 M 0.063 -435 V 0.056 -436 K 0.056 -437 I 0.061 -438 G 0.063 -439 V 0.059 -440 F 0.056 -441 S 0.055 -442 V 0.054 -443 L 0.049 -444 Y 0.045 -445 T 0.043 -446 V 0.041 -447 P 0.044 -448 A 0.053 -449 T 0.060 -450 C 0.056 -451 V 0.047 -452 I 0.039 -453 A 0.038 -454 C 0.038 -455 Y 0.038 -456 F 0.040 -457 Y 0.043 -458 E 0.048 -459 I 0.052 -460 S 0.054 -461 N 0.057 -462 W 0.064 -463 A 0.076 -464 L 0.093 -465 F 0.117 -466 R 0.148 -467 Y 0.183 -468 S 0.217 -469 A 0.245 -470 D 0.267 -471 D 0.274 -472 S 0.254 -473 N 0.205 -474 M 0.147 -475 A 0.105 -476 V 0.088 -477 E 0.082 -478 M 0.078 -479 L 0.074 -480 K 0.072 -481 I 0.073 -482 F 0.076 -483 M 0.077 -484 S 0.078 -485 L 0.080 -486 L 0.082 -487 V 0.083 -488 G 0.081 -489 I 0.083 -490 T 0.090 -491 S 0.093 -492 G 0.089 -493 M 0.081 -494 W 0.075 -495 I 0.069 -496 W 0.064 -497 S 0.062 -498 A 0.064 -499 K 0.066 -500 T 0.067 -501 L 0.071 -502 H 0.072 -503 T 0.065 -504 W 0.057 -505 Q 0.057 -506 K 0.070 -507 C 0.093 -508 S 0.117 -509 N 0.137 -510 R 0.159 -511 L 0.194 -512 V 0.243 -513 N 0.304 -514 S 0.374 -515 G 0.445 -516 K 0.501 -517 V 0.528 -518 K 0.521 -519 R 0.492 -520 E 0.478 -521 K 0.507 -522 R 0.559 -523 G 0.598 -524 N 0.615 -525 G 0.615 -526 W 0.608 -527 V 0.607 -528 K 0.619 -529 P 0.648 -530 G 0.687 -531 K 0.725 -532 G 0.751 -533 S 0.765 -534 E 0.772 -535 T 0.774 -536 V 0.770 -537 V 0.765 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000174804.4_ENST00000531380.2_GN:FZD4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000174804.4_ENST00000531380.2_GN:FZD4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid deleted file mode 100644 index 91bef5b7c837d94034c23921d98a71fcf716fa84..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000174804.4_ENST00000531380.2_GN:FZD4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid +++ /dev/null @@ -1,541 +0,0 @@ ->ENSG00000174804.4|ENST00000531380.2|GN:FZD4|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 -1 M 0.200 -2 L 0.202 -3 A 0.217 -4 M 0.245 -5 A 0.271 -6 W 0.292 -7 R 0.325 -8 G 0.377 -9 A 0.427 -10 G 0.457 -11 P 0.470 -12 S 0.479 -13 V 0.491 -14 P 0.505 -15 G 0.520 -16 A 0.539 -17 P 0.558 -18 G 0.569 -19 G 0.556 -20 V 0.507 -21 G 0.428 -22 L 0.342 -23 S 0.265 -24 L 0.203 -25 G 0.158 -26 L 0.129 -27 L 0.115 -28 L 0.112 -29 Q 0.112 -30 L 0.108 -31 L 0.107 -32 L 0.122 -33 L 0.162 -34 L 0.227 -35 G 0.302 -36 P 0.377 -37 A 0.445 -38 R 0.502 -39 G 0.545 -40 F 0.573 -41 G 0.586 -42 D 0.581 -43 E 0.551 -44 E 0.484 -45 E 0.386 -46 R 0.280 -47 R 0.192 -48 C 0.133 -49 D 0.099 -50 P 0.081 -51 I 0.071 -52 R 0.064 -53 I 0.057 -54 S 0.053 -55 M 0.053 -56 C 0.060 -57 Q 0.072 -58 N 0.086 -59 L 0.095 -60 G 0.095 -61 Y 0.088 -62 N 0.085 -63 V 0.089 -64 T 0.091 -65 K 0.084 -66 M 0.075 -67 P 0.076 -68 N 0.091 -69 L 0.112 -70 V 0.130 -71 G 0.136 -72 H 0.130 -73 E 0.120 -74 L 0.117 -75 Q 0.119 -76 T 0.121 -77 D 0.124 -78 A 0.127 -79 E 0.126 -80 L 0.119 -81 Q 0.107 -82 L 0.094 -83 T 0.083 -84 T 0.075 -85 F 0.070 -86 T 0.064 -87 P 0.059 -88 L 0.058 -89 I 0.064 -90 Q 0.074 -91 Y 0.084 -92 G 0.090 -93 C 0.089 -94 S 0.082 -95 S 0.073 -96 Q 0.064 -97 L 0.055 -98 Q 0.049 -99 F 0.048 -100 F 0.053 -101 L 0.060 -102 C 0.064 -103 S 0.063 -104 V 0.061 -105 Y 0.058 -106 V 0.055 -107 P 0.055 -108 M 0.057 -109 C 0.061 -110 T 0.067 -111 E 0.075 -112 K 0.086 -113 I 0.100 -114 N 0.119 -115 I 0.138 -116 P 0.150 -117 I 0.146 -118 G 0.128 -119 P 0.101 -120 C 0.076 -121 G 0.061 -122 G 0.054 -123 M 0.048 -124 C 0.043 -125 L 0.041 -126 S 0.043 -127 V 0.045 -128 K 0.045 -129 R 0.042 -130 R 0.039 -131 C 0.037 -132 E 0.037 -133 P 0.040 -134 V 0.046 -135 L 0.051 -136 K 0.054 -137 E 0.059 -138 F 0.074 -139 G 0.099 -140 F 0.123 -141 A 0.133 -142 W 0.126 -143 P 0.108 -144 E 0.090 -145 S 0.074 -146 L 0.060 -147 N 0.051 -148 C 0.046 -149 S 0.045 -150 K 0.051 -151 F 0.064 -152 P 0.083 -153 P 0.100 -154 Q 0.114 -155 N 0.128 -156 D 0.141 -157 H 0.143 -158 N 0.134 -159 H 0.121 -160 M 0.117 -161 C 0.131 -162 M 0.167 -163 E 0.227 -164 G 0.312 -165 P 0.415 -166 G 0.514 -167 D 0.581 -168 E 0.607 -169 E 0.605 -170 V 0.593 -171 P 0.585 -172 L 0.582 -173 P 0.579 -174 H 0.569 -175 K 0.557 -176 T 0.541 -177 P 0.523 -178 I 0.508 -179 Q 0.498 -180 P 0.474 -181 G 0.416 -182 E 0.335 -183 E 0.259 -184 C 0.206 -185 H 0.180 -186 S 0.178 -187 V 0.191 -188 G 0.203 -189 T 0.206 -190 N 0.194 -191 S 0.170 -192 D 0.144 -193 Q 0.123 -194 Y 0.105 -195 I 0.088 -196 W 0.074 -197 V 0.068 -198 K 0.070 -199 R 0.078 -200 S 0.088 -201 L 0.102 -202 N 0.119 -203 C 0.130 -204 V 0.124 -205 L 0.109 -206 K 0.104 -207 C 0.121 -208 G 0.161 -209 Y 0.207 -210 D 0.239 -211 A 0.243 -212 G 0.229 -213 L 0.213 -214 Y 0.199 -215 S 0.179 -216 R 0.152 -217 S 0.132 -218 A 0.123 -219 K 0.117 -220 E 0.109 -221 F 0.100 -222 T 0.090 -223 D 0.080 -224 I 0.068 -225 W 0.061 -226 M 0.059 -227 A 0.056 -228 V 0.053 -229 W 0.053 -230 A 0.058 -231 S 0.065 -232 L 0.069 -233 C 0.069 -234 F 0.068 -235 I 0.071 -236 S 0.076 -237 T 0.077 -238 A 0.072 -239 F 0.064 -240 T 0.057 -241 V 0.051 -242 L 0.047 -243 T 0.044 -244 F 0.042 -245 L 0.043 -246 I 0.046 -247 D 0.047 -248 S 0.046 -249 S 0.044 -250 R 0.041 -251 F 0.038 -252 S 0.032 -253 Y 0.027 -254 P 0.027 -255 E 0.029 -256 R 0.032 -257 P 0.034 -258 I 0.036 -259 I 0.041 -260 F 0.048 -261 L 0.058 -262 S 0.066 -263 M 0.070 -264 C 0.072 -265 Y 0.073 -266 N 0.071 -267 I 0.069 -268 Y 0.066 -269 S 0.063 -270 I 0.062 -271 A 0.064 -272 Y 0.069 -273 I 0.074 -274 V 0.079 -275 R 0.084 -276 L 0.088 -277 T 0.096 -278 V 0.110 -279 G 0.125 -280 R 0.134 -281 E 0.136 -282 R 0.134 -283 I 0.131 -284 S 0.127 -285 C 0.125 -286 D 0.131 -287 F 0.149 -288 E 0.174 -289 E 0.192 -290 A 0.196 -291 A 0.191 -292 E 0.184 -293 P 0.173 -294 V 0.157 -295 L 0.143 -296 I 0.140 -297 Q 0.146 -298 E 0.160 -299 G 0.174 -300 L 0.180 -301 K 0.173 -302 N 0.152 -303 T 0.125 -304 G 0.106 -305 C 0.099 -306 A 0.095 -307 I 0.092 -308 I 0.087 -309 F 0.077 -310 L 0.062 -311 L 0.047 -312 M 0.036 -313 Y 0.033 -314 F 0.036 -315 F 0.044 -316 G 0.058 -317 M 0.074 -318 A 0.083 -319 S 0.079 -320 S 0.066 -321 I 0.052 -322 W 0.042 -323 W 0.037 -324 V 0.037 -325 I 0.043 -326 L 0.049 -327 T 0.052 -328 L 0.053 -329 T 0.053 -330 W 0.052 -331 F 0.053 -332 L 0.060 -333 A 0.073 -334 A 0.089 -335 G 0.098 -336 L 0.097 -337 K 0.092 -338 W 0.090 -339 G 0.096 -340 H 0.107 -341 E 0.115 -342 A 0.114 -343 I 0.103 -344 E 0.087 -345 M 0.073 -346 H 0.060 -347 S 0.049 -348 S 0.038 -349 Y 0.033 -350 F 0.033 -351 H 0.038 -352 I 0.048 -353 A 0.059 -354 A 0.063 -355 W 0.060 -356 A 0.057 -357 I 0.059 -358 P 0.064 -359 A 0.067 -360 V 0.070 -361 K 0.073 -362 T 0.075 -363 I 0.073 -364 V 0.071 -365 I 0.072 -366 L 0.077 -367 I 0.084 -368 M 0.095 -369 R 0.106 -370 L 0.116 -371 V 0.121 -372 D 0.123 -373 A 0.128 -374 D 0.134 -375 E 0.137 -376 L 0.134 -377 T 0.126 -378 G 0.115 -379 L 0.106 -380 C 0.112 -381 Y 0.136 -382 V 0.166 -383 G 0.185 -384 N 0.188 -385 Q 0.176 -386 N 0.158 -387 L 0.140 -388 D 0.128 -389 A 0.118 -390 L 0.107 -391 T 0.096 -392 G 0.091 -393 F 0.090 -394 V 0.086 -395 V 0.082 -396 A 0.086 -397 P 0.095 -398 L 0.095 -399 F 0.083 -400 T 0.071 -401 Y 0.066 -402 L 0.070 -403 V 0.083 -404 I 0.104 -405 G 0.124 -406 T 0.132 -407 L 0.124 -408 F 0.110 -409 I 0.100 -410 A 0.092 -411 A 0.089 -412 G 0.093 -413 L 0.101 -414 V 0.101 -415 A 0.090 -416 L 0.074 -417 F 0.066 -418 K 0.071 -419 I 0.087 -420 R 0.110 -421 S 0.141 -422 N 0.179 -423 L 0.223 -424 Q 0.264 -425 K 0.296 -426 D 0.318 -427 G 0.327 -428 T 0.318 -429 K 0.292 -430 T 0.253 -431 D 0.210 -432 K 0.175 -433 L 0.149 -434 E 0.127 -435 R 0.103 -436 L 0.079 -437 M 0.063 -438 V 0.055 -439 K 0.056 -440 I 0.061 -441 G 0.062 -442 V 0.059 -443 F 0.056 -444 S 0.055 -445 V 0.054 -446 L 0.049 -447 Y 0.045 -448 T 0.043 -449 V 0.041 -450 P 0.044 -451 A 0.053 -452 T 0.060 -453 C 0.056 -454 V 0.046 -455 I 0.039 -456 A 0.037 -457 C 0.038 -458 Y 0.038 -459 F 0.040 -460 Y 0.043 -461 E 0.048 -462 I 0.052 -463 S 0.054 -464 N 0.057 -465 W 0.064 -466 A 0.076 -467 L 0.093 -468 F 0.117 -469 R 0.149 -470 Y 0.183 -471 S 0.217 -472 A 0.245 -473 D 0.267 -474 D 0.274 -475 S 0.254 -476 N 0.205 -477 M 0.147 -478 A 0.105 -479 V 0.087 -480 E 0.082 -481 M 0.078 -482 L 0.073 -483 K 0.071 -484 I 0.073 -485 F 0.076 -486 M 0.077 -487 S 0.078 -488 L 0.080 -489 L 0.082 -490 V 0.082 -491 G 0.081 -492 I 0.083 -493 T 0.090 -494 S 0.093 -495 G 0.089 -496 M 0.081 -497 W 0.075 -498 I 0.069 -499 W 0.064 -500 S 0.062 -501 A 0.064 -502 K 0.066 -503 T 0.067 -504 L 0.070 -505 H 0.071 -506 T 0.065 -507 W 0.056 -508 Q 0.057 -509 K 0.070 -510 C 0.093 -511 S 0.118 -512 N 0.138 -513 R 0.160 -514 L 0.195 -515 V 0.244 -516 N 0.305 -517 S 0.375 -518 G 0.446 -519 K 0.502 -520 V 0.529 -521 K 0.522 -522 R 0.494 -523 E 0.480 -524 K 0.509 -525 R 0.560 -526 G 0.599 -527 N 0.615 -528 G 0.615 -529 W 0.609 -530 V 0.608 -531 K 0.620 -532 P 0.649 -533 G 0.688 -534 K 0.726 -535 G 0.752 -536 S 0.766 -537 E 0.773 -538 T 0.775 -539 V 0.771 -540 V 0.765 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000175336.11_ENST00000398189.4_GN:APOF_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000175336.11_ENST00000398189.4_GN:APOF_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 2d49611788a30282621d546635a865dac7ef0985..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000175336.11_ENST00000398189.4_GN:APOF_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,327 +0,0 @@ ->ENSG00000175336.11|ENST00000398189.4|GN:APOF|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.434 -2 T 0.465 -3 G 0.505 -4 L 0.521 -5 C 0.497 -6 G 0.469 -7 Y 0.483 -8 S 0.533 -9 A 0.573 -10 P 0.574 -11 D 0.544 -12 M 0.510 -13 R 0.506 -14 G 0.535 -15 L 0.549 -16 R 0.520 -17 L 0.479 -18 I 0.459 -19 M 0.437 -20 I 0.383 -21 P 0.311 -22 V 0.250 -23 E 0.210 -24 L 0.184 -25 L 0.171 -26 L 0.168 -27 C 0.166 -28 Y 0.161 -29 L 0.162 -30 L 0.185 -31 L 0.240 -32 H 0.319 -33 P 0.406 -34 V 0.488 -35 D 0.555 -36 A 0.600 -37 T 0.626 -38 S 0.642 -39 Y 0.660 -40 G 0.677 -41 K 0.689 -42 Q 0.696 -43 T 0.697 -44 N 0.687 -45 V 0.655 -46 L 0.600 -47 M 0.539 -48 H 0.505 -49 F 0.520 -50 P 0.568 -51 L 0.618 -52 S 0.654 -53 L 0.678 -54 E 0.687 -55 S 0.673 -56 Q 0.643 -57 T 0.611 -58 P 0.585 -59 S 0.559 -60 S 0.523 -61 D 0.474 -62 P 0.420 -63 L 0.376 -64 S 0.351 -65 C 0.342 -66 Q 0.336 -67 F 0.326 -68 L 0.314 -69 H 0.304 -70 P 0.292 -71 K 0.283 -72 S 0.285 -73 L 0.295 -74 P 0.296 -75 G 0.278 -76 F 0.249 -77 S 0.219 -78 H 0.193 -79 M 0.171 -80 A 0.152 -81 P 0.131 -82 L 0.105 -83 P 0.076 -84 K 0.055 -85 F 0.044 -86 L 0.039 -87 V 0.034 -88 S 0.031 -89 L 0.031 -90 A 0.033 -91 L 0.034 -92 R 0.035 -93 N 0.037 -94 A 0.040 -95 L 0.046 -96 E 0.057 -97 E 0.071 -98 A 0.082 -99 G 0.082 -100 C 0.073 -101 Q 0.060 -102 A 0.045 -103 D 0.033 -104 V 0.022 -105 W 0.016 -106 A 0.012 -107 L 0.011 -108 Q 0.012 -109 L 0.015 -110 Q 0.020 -111 L 0.025 -112 Y 0.031 -113 R 0.045 -114 Q 0.067 -115 G 0.086 -116 G 0.089 -117 V 0.075 -118 N 0.056 -119 A 0.041 -120 T 0.032 -121 Q 0.027 -122 V 0.025 -123 L 0.025 -124 I 0.027 -125 Q 0.031 -126 H 0.041 -127 L 0.058 -128 R 0.081 -129 G 0.105 -130 L 0.124 -131 Q 0.146 -132 K 0.176 -133 G 0.210 -134 R 0.236 -135 S 0.247 -136 T 0.240 -137 E 0.217 -138 R 0.191 -139 N 0.168 -140 V 0.140 -141 S 0.105 -142 V 0.071 -143 E 0.048 -144 A 0.040 -145 L 0.044 -146 A 0.054 -147 S 0.059 -148 A 0.053 -149 L 0.043 -150 Q 0.039 -151 L 0.043 -152 L 0.053 -153 A 0.069 -154 R 0.094 -155 E 0.124 -156 Q 0.162 -157 Q 0.211 -158 S 0.272 -159 T 0.331 -160 G 0.375 -161 R 0.403 -162 V 0.422 -163 G 0.429 -164 R 0.422 -165 S 0.405 -166 L 0.379 -167 P 0.343 -168 T 0.300 -169 E 0.258 -170 D 0.216 -171 C 0.178 -172 E 0.155 -173 N 0.150 -174 E 0.153 -175 K 0.154 -176 E 0.156 -177 Q 0.158 -178 A 0.153 -179 V 0.146 -180 H 0.145 -181 N 0.143 -182 V 0.132 -183 V 0.119 -184 Q 0.110 -185 L 0.103 -186 L 0.097 -187 P 0.097 -188 G 0.100 -189 V 0.104 -190 G 0.105 -191 T 0.098 -192 F 0.082 -193 Y 0.069 -194 N 0.062 -195 L 0.058 -196 G 0.051 -197 T 0.044 -198 A 0.038 -199 L 0.031 -200 Y 0.025 -201 Y 0.024 -202 A 0.031 -203 T 0.045 -204 Q 0.066 -205 N 0.087 -206 C 0.095 -207 L 0.088 -208 G 0.078 -209 K 0.070 -210 A 0.066 -211 R 0.068 -212 E 0.079 -213 R 0.101 -214 G 0.121 -215 R 0.125 -216 D 0.110 -217 G 0.085 -218 A 0.065 -219 I 0.055 -220 D 0.052 -221 L 0.050 -222 G 0.049 -223 Y 0.049 -224 D 0.048 -225 L 0.045 -226 L 0.043 -227 M 0.044 -228 T 0.048 -229 M 0.055 -230 A 0.064 -231 G 0.075 -232 M 0.089 -233 S 0.106 -234 G 0.128 -235 G 0.144 -236 P 0.143 -237 M 0.126 -238 G 0.105 -239 L 0.092 -240 A 0.088 -241 I 0.085 -242 S 0.080 -243 A 0.077 -244 A 0.079 -245 L 0.080 -246 K 0.075 -247 P 0.068 -248 A 0.062 -249 L 0.058 -250 R 0.056 -251 S 0.055 -252 G 0.051 -253 V 0.044 -254 Q 0.039 -255 Q 0.040 -256 L 0.048 -257 I 0.060 -258 Q 0.069 -259 Y 0.066 -260 Y 0.061 -261 Q 0.066 -262 D 0.086 -263 Q 0.120 -264 K 0.167 -265 D 0.225 -266 A 0.279 -267 N 0.317 -268 I 0.339 -269 S 0.352 -270 Q 0.355 -271 P 0.345 -272 E 0.329 -273 T 0.315 -274 T 0.297 -275 K 0.267 -276 E 0.232 -277 G 0.208 -278 L 0.204 -279 R 0.216 -280 A 0.237 -281 I 0.259 -282 S 0.285 -283 D 0.317 -284 V 0.347 -285 S 0.367 -286 D 0.370 -287 L 0.353 -288 E 0.323 -289 E 0.288 -290 T 0.244 -291 T 0.193 -292 T 0.145 -293 L 0.111 -294 A 0.093 -295 S 0.089 -296 F 0.088 -297 I 0.087 -298 S 0.086 -299 E 0.092 -300 V 0.102 -301 V 0.114 -302 S 0.128 -303 S 0.142 -304 A 0.144 -305 P 0.132 -306 Y 0.118 -307 W 0.109 -308 G 0.105 -309 W 0.106 -310 A 0.118 -311 I 0.136 -312 I 0.146 -313 K 0.149 -314 S 0.163 -315 Y 0.198 -316 D 0.247 -317 L 0.309 -318 D 0.380 -319 P 0.452 -320 G 0.515 -321 A 0.564 -322 G 0.592 -323 S 0.595 -324 L 0.571 -325 E 0.519 -326 I 0.470 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000175336.11_ENST00000398189.4_GN:APOF_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000175336.11_ENST00000398189.4_GN:APOF_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid deleted file mode 100644 index 262fbaf281693a55c4c0ff8d07044fdbacacd2fc..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000175336.11_ENST00000398189.4_GN:APOF_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid +++ /dev/null @@ -1,350 +0,0 @@ ->ENSG00000175336.11|ENST00000398189.4|GN:APOF|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:23 -1 M 0.393 -2 G 0.408 -3 H 0.430 -4 R 0.440 -5 T 0.416 -6 R 0.385 -7 Q 0.400 -8 N 0.454 -9 R 0.483 -10 I 0.466 -11 R 0.448 -12 K 0.452 -13 R 0.453 -14 S 0.448 -15 N 0.458 -16 L 0.464 -17 P 0.436 -18 R 0.405 -19 Q 0.433 -20 S 0.519 -21 H 0.602 -22 F 0.650 -23 S 0.678 -24 M 0.705 -25 T 0.728 -26 G 0.738 -27 L 0.733 -28 C 0.718 -29 G 0.700 -30 Y 0.684 -31 S 0.674 -32 A 0.671 -33 P 0.671 -34 D 0.672 -35 M 0.677 -36 R 0.687 -37 G 0.700 -38 L 0.706 -39 R 0.700 -40 L 0.677 -41 I 0.632 -42 M 0.564 -43 I 0.473 -44 P 0.382 -45 V 0.312 -46 E 0.269 -47 L 0.241 -48 L 0.227 -49 L 0.223 -50 C 0.217 -51 Y 0.205 -52 L 0.200 -53 L 0.219 -54 L 0.275 -55 H 0.362 -56 P 0.462 -57 V 0.553 -58 D 0.622 -59 A 0.666 -60 T 0.689 -61 S 0.703 -62 Y 0.719 -63 G 0.735 -64 K 0.746 -65 Q 0.749 -66 T 0.745 -67 N 0.730 -68 V 0.697 -69 L 0.643 -70 M 0.580 -71 H 0.543 -72 F 0.554 -73 P 0.600 -74 L 0.649 -75 S 0.686 -76 L 0.711 -77 E 0.719 -78 S 0.707 -79 Q 0.677 -80 T 0.643 -81 P 0.612 -82 S 0.580 -83 S 0.540 -84 D 0.490 -85 P 0.436 -86 L 0.393 -87 S 0.365 -88 C 0.349 -89 Q 0.336 -90 F 0.322 -91 L 0.307 -92 H 0.293 -93 P 0.280 -94 K 0.273 -95 S 0.277 -96 L 0.287 -97 P 0.285 -98 G 0.265 -99 F 0.236 -100 S 0.206 -101 H 0.182 -102 M 0.164 -103 A 0.149 -104 P 0.130 -105 L 0.104 -106 P 0.074 -107 K 0.052 -108 F 0.041 -109 L 0.037 -110 V 0.033 -111 S 0.029 -112 L 0.028 -113 A 0.029 -114 L 0.031 -115 R 0.032 -116 N 0.033 -117 A 0.036 -118 L 0.042 -119 E 0.052 -120 E 0.065 -121 A 0.076 -122 G 0.079 -123 C 0.073 -124 Q 0.062 -125 A 0.048 -126 D 0.035 -127 V 0.025 -128 W 0.017 -129 A 0.013 -130 L 0.011 -131 Q 0.012 -132 L 0.015 -133 Q 0.020 -134 L 0.025 -135 Y 0.031 -136 R 0.046 -137 Q 0.070 -138 G 0.092 -139 G 0.097 -140 V 0.082 -141 N 0.061 -142 A 0.044 -143 T 0.034 -144 Q 0.028 -145 V 0.024 -146 L 0.024 -147 I 0.025 -148 Q 0.029 -149 H 0.038 -150 L 0.057 -151 R 0.081 -152 G 0.105 -153 L 0.125 -154 Q 0.147 -155 K 0.180 -156 G 0.216 -157 R 0.245 -158 S 0.258 -159 T 0.248 -160 E 0.222 -161 R 0.193 -162 N 0.169 -163 V 0.142 -164 S 0.107 -165 V 0.072 -166 E 0.048 -167 A 0.036 -168 L 0.031 -169 A 0.028 -170 S 0.027 -171 A 0.027 -172 L 0.029 -173 Q 0.034 -174 L 0.041 -175 L 0.052 -176 A 0.067 -177 R 0.090 -178 E 0.118 -179 Q 0.152 -180 Q 0.200 -181 S 0.258 -182 T 0.315 -183 G 0.358 -184 R 0.386 -185 V 0.405 -186 G 0.413 -187 R 0.408 -188 S 0.394 -189 L 0.372 -190 P 0.337 -191 T 0.295 -192 E 0.253 -193 D 0.212 -194 C 0.175 -195 E 0.153 -196 N 0.150 -197 E 0.153 -198 K 0.154 -199 E 0.155 -200 Q 0.157 -201 A 0.153 -202 V 0.147 -203 H 0.146 -204 N 0.144 -205 V 0.132 -206 V 0.119 -207 Q 0.110 -208 L 0.103 -209 L 0.097 -210 P 0.095 -211 G 0.098 -212 V 0.102 -213 G 0.105 -214 T 0.098 -215 F 0.082 -216 Y 0.068 -217 N 0.062 -218 L 0.057 -219 G 0.051 -220 T 0.044 -221 A 0.038 -222 L 0.032 -223 Y 0.026 -224 Y 0.025 -225 A 0.031 -226 T 0.045 -227 Q 0.066 -228 N 0.086 -229 C 0.094 -230 L 0.088 -231 G 0.078 -232 K 0.072 -233 A 0.069 -234 R 0.070 -235 E 0.082 -236 R 0.104 -237 G 0.124 -238 R 0.127 -239 D 0.112 -240 G 0.087 -241 A 0.066 -242 I 0.056 -243 D 0.053 -244 L 0.051 -245 G 0.050 -246 Y 0.049 -247 D 0.048 -248 L 0.045 -249 L 0.043 -250 M 0.044 -251 T 0.048 -252 M 0.054 -253 A 0.063 -254 G 0.074 -255 M 0.088 -256 S 0.106 -257 G 0.129 -258 G 0.145 -259 P 0.144 -260 M 0.128 -261 G 0.106 -262 L 0.093 -263 A 0.089 -264 I 0.087 -265 S 0.081 -266 A 0.079 -267 A 0.081 -268 L 0.082 -269 K 0.077 -270 P 0.070 -271 A 0.064 -272 L 0.060 -273 R 0.059 -274 S 0.058 -275 G 0.054 -276 V 0.047 -277 Q 0.040 -278 Q 0.037 -279 L 0.036 -280 I 0.035 -281 Q 0.038 -282 Y 0.043 -283 Y 0.052 -284 Q 0.068 -285 D 0.094 -286 Q 0.131 -287 K 0.181 -288 D 0.242 -289 A 0.299 -290 N 0.338 -291 I 0.360 -292 S 0.373 -293 Q 0.377 -294 P 0.367 -295 E 0.351 -296 T 0.335 -297 T 0.315 -298 K 0.282 -299 E 0.244 -300 G 0.220 -301 L 0.215 -302 R 0.229 -303 A 0.251 -304 I 0.275 -305 S 0.303 -306 D 0.336 -307 V 0.366 -308 S 0.385 -309 D 0.385 -310 L 0.367 -311 E 0.335 -312 E 0.299 -313 T 0.254 -314 T 0.201 -315 T 0.152 -316 L 0.117 -317 A 0.100 -318 S 0.096 -319 F 0.096 -320 I 0.093 -321 S 0.092 -322 E 0.097 -323 V 0.107 -324 V 0.120 -325 S 0.135 -326 S 0.148 -327 A 0.149 -328 P 0.137 -329 Y 0.122 -330 W 0.113 -331 G 0.109 -332 W 0.111 -333 A 0.124 -334 I 0.144 -335 I 0.154 -336 K 0.157 -337 S 0.171 -338 Y 0.205 -339 D 0.254 -340 L 0.316 -341 D 0.388 -342 P 0.461 -343 G 0.526 -344 A 0.575 -345 G 0.603 -346 S 0.608 -347 L 0.582 -348 E 0.528 -349 I 0.478 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000176547.11_ENST00000319856.5_GN:OR4C3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000176547.11_ENST00000319856.5_GN:OR4C3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index eb5131121cf557c2547b976a923e2fe7e34bf087..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000176547.11_ENST00000319856.5_GN:OR4C3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,303 +0,0 @@ ->ENSG00000176547.11|ENST00000319856.5|GN:OR4C3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.428 -2 D 0.435 -3 I 0.437 -4 P 0.418 -5 Q 0.369 -6 N 0.300 -7 I 0.228 -8 T 0.172 -9 E 0.141 -10 F 0.131 -11 F 0.131 -12 M 0.135 -13 L 0.141 -14 G 0.151 -15 L 0.161 -16 S 0.169 -17 Q 0.168 -18 N 0.151 -19 S 0.120 -20 E 0.089 -21 V 0.068 -22 Q 0.059 -23 R 0.058 -24 V 0.061 -25 L 0.065 -26 F 0.071 -27 V 0.070 -28 V 0.059 -29 F 0.045 -30 L 0.039 -31 L 0.042 -32 I 0.047 -33 Y 0.048 -34 V 0.047 -35 V 0.048 -36 T 0.050 -37 V 0.051 -38 C 0.054 -39 G 0.061 -40 N 0.068 -41 M 0.072 -42 L 0.070 -43 I 0.065 -44 V 0.058 -45 V 0.056 -46 T 0.061 -47 I 0.072 -48 T 0.084 -49 S 0.093 -50 S 0.094 -51 P 0.091 -52 T 0.087 -53 L 0.084 -54 A 0.079 -55 S 0.067 -56 P 0.050 -57 V 0.035 -58 Y 0.026 -59 F 0.022 -60 F 0.022 -61 L 0.028 -62 A 0.037 -63 N 0.047 -64 L 0.053 -65 S 0.054 -66 F 0.053 -67 I 0.053 -68 D 0.056 -69 T 0.057 -70 F 0.055 -71 Y 0.052 -72 S 0.051 -73 S 0.054 -74 S 0.058 -75 M 0.063 -76 A 0.065 -77 P 0.063 -78 K 0.061 -79 L 0.060 -80 I 0.058 -81 A 0.053 -82 D 0.051 -83 S 0.055 -84 L 0.067 -85 Y 0.082 -86 E 0.093 -87 G 0.092 -88 R 0.080 -89 T 0.067 -90 I 0.056 -91 S 0.045 -92 Y 0.035 -93 E 0.030 -94 C 0.028 -95 C 0.027 -96 M 0.027 -97 A 0.029 -98 Q 0.032 -99 L 0.035 -100 F 0.038 -101 G 0.038 -102 A 0.034 -103 H 0.030 -104 F 0.028 -105 L 0.030 -106 G 0.033 -107 G 0.038 -108 V 0.045 -109 E 0.050 -110 I 0.051 -111 I 0.046 -112 L 0.040 -113 L 0.035 -114 T 0.033 -115 V 0.031 -116 M 0.030 -117 A 0.032 -118 Y 0.035 -119 D 0.039 -120 R 0.041 -121 Y 0.043 -122 V 0.046 -123 A 0.050 -124 I 0.056 -125 C 0.063 -126 K 0.072 -127 P 0.078 -128 L 0.079 -129 H 0.077 -130 N 0.074 -131 T 0.069 -132 T 0.066 -133 I 0.067 -134 M 0.069 -135 T 0.070 -136 R 0.070 -137 H 0.068 -138 L 0.061 -139 C 0.058 -140 A 0.064 -141 M 0.069 -142 L 0.065 -143 V 0.053 -144 G 0.046 -145 V 0.046 -146 A 0.051 -147 W 0.056 -148 L 0.065 -149 G 0.075 -150 G 0.080 -151 F 0.078 -152 L 0.076 -153 H 0.079 -154 S 0.082 -155 L 0.082 -156 V 0.083 -157 Q 0.085 -158 L 0.083 -159 L 0.078 -160 L 0.075 -161 V 0.072 -162 L 0.073 -163 W 0.083 -164 L 0.096 -165 P 0.102 -166 F 0.104 -167 C 0.108 -168 G 0.117 -169 P 0.125 -170 N 0.134 -171 V 0.141 -172 I 0.139 -173 N 0.120 -174 H 0.095 -175 F 0.076 -176 A 0.066 -177 C 0.066 -178 D 0.077 -179 L 0.097 -180 Y 0.118 -181 P 0.131 -182 L 0.136 -183 L 0.139 -184 E 0.141 -185 V 0.133 -186 A 0.117 -187 C 0.103 -188 T 0.100 -189 N 0.104 -190 T 0.107 -191 Y 0.104 -192 V 0.100 -193 I 0.099 -194 G 0.100 -195 L 0.099 -196 L 0.094 -197 V 0.087 -198 V 0.079 -199 A 0.075 -200 N 0.073 -201 S 0.070 -202 G 0.065 -203 L 0.060 -204 I 0.060 -205 C 0.060 -206 L 0.061 -207 L 0.068 -208 N 0.075 -209 F 0.075 -210 L 0.069 -211 M 0.068 -212 L 0.072 -213 A 0.072 -214 A 0.064 -215 S 0.051 -216 Y 0.041 -217 I 0.037 -218 V 0.040 -219 I 0.049 -220 L 0.063 -221 Y 0.075 -222 S 0.081 -223 L 0.085 -224 R 0.094 -225 S 0.111 -226 H 0.131 -227 S 0.147 -228 A 0.153 -229 D 0.145 -230 G 0.125 -231 R 0.103 -232 C 0.087 -233 K 0.079 -234 A 0.075 -235 L 0.075 -236 S 0.077 -237 T 0.077 -238 C 0.077 -239 G 0.078 -240 A 0.078 -241 H 0.072 -242 F 0.063 -243 I 0.056 -244 V 0.052 -245 V 0.046 -246 A 0.037 -247 L 0.029 -248 F 0.025 -249 F 0.025 -250 V 0.028 -251 P 0.031 -252 C 0.034 -253 I 0.034 -254 F 0.035 -255 T 0.041 -256 Y 0.059 -257 V 0.090 -258 H 0.124 -259 P 0.154 -260 F 0.176 -261 S 0.191 -262 T 0.197 -263 L 0.192 -264 P 0.178 -265 I 0.157 -266 D 0.134 -267 K 0.112 -268 N 0.092 -269 M 0.077 -270 A 0.068 -271 L 0.066 -272 F 0.076 -273 Y 0.094 -274 G 0.109 -275 I 0.118 -276 L 0.121 -277 T 0.118 -278 P 0.108 -279 M 0.093 -280 L 0.082 -281 N 0.075 -282 P 0.069 -283 L 0.066 -284 I 0.067 -285 Y 0.068 -286 T 0.075 -287 L 0.091 -288 R 0.102 -289 N 0.094 -290 E 0.076 -291 E 0.063 -292 V 0.061 -293 K 0.070 -294 N 0.078 -295 A 0.078 -296 M 0.073 -297 R 0.073 -298 K 0.085 -299 L 0.109 -300 F 0.139 -301 T 0.168 -302 W 0.188 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000176547.11_ENST00000319856.5_GN:OR4C3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000176547.11_ENST00000319856.5_GN:OR4C3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid deleted file mode 100644 index 9b5e3752e9416538bc6bd5f9e829486a1683b6c9..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000176547.11_ENST00000319856.5_GN:OR4C3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid +++ /dev/null @@ -1,330 +0,0 @@ ->ENSG00000176547.11|ENST00000319856.5|GN:OR4C3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:27 -1 M 0.097 -2 Q 0.082 -3 L 0.062 -4 V 0.048 -5 L 0.040 -6 L 0.035 -7 L 0.034 -8 M 0.035 -9 F 0.036 -10 L 0.038 -11 L 0.048 -12 V 0.072 -13 F 0.110 -14 I 0.161 -15 G 0.220 -16 N 0.279 -17 T 0.328 -18 A 0.359 -19 P 0.372 -20 A 0.377 -21 F 0.380 -22 S 0.382 -23 V 0.389 -24 T 0.405 -25 L 0.429 -26 E 0.450 -27 S 0.457 -28 M 0.450 -29 D 0.437 -30 I 0.420 -31 P 0.389 -32 Q 0.342 -33 N 0.284 -34 I 0.224 -35 T 0.176 -36 E 0.147 -37 F 0.136 -38 F 0.133 -39 M 0.131 -40 L 0.132 -41 G 0.139 -42 L 0.151 -43 S 0.162 -44 Q 0.164 -45 N 0.147 -46 S 0.117 -47 E 0.087 -48 V 0.065 -49 Q 0.051 -50 R 0.044 -51 V 0.043 -52 L 0.051 -53 F 0.064 -54 V 0.069 -55 V 0.060 -56 F 0.046 -57 L 0.040 -58 L 0.041 -59 I 0.045 -60 Y 0.046 -61 V 0.045 -62 V 0.044 -63 T 0.045 -64 V 0.045 -65 C 0.048 -66 G 0.055 -67 N 0.063 -68 M 0.067 -69 L 0.066 -70 I 0.061 -71 V 0.055 -72 V 0.051 -73 T 0.055 -74 I 0.063 -75 T 0.073 -76 S 0.080 -77 S 0.083 -78 P 0.080 -79 T 0.076 -80 L 0.074 -81 A 0.069 -82 S 0.059 -83 P 0.044 -84 V 0.031 -85 Y 0.023 -86 F 0.020 -87 F 0.020 -88 L 0.025 -89 A 0.034 -90 N 0.043 -91 L 0.051 -92 S 0.054 -93 F 0.053 -94 I 0.052 -95 D 0.054 -96 T 0.055 -97 F 0.051 -98 Y 0.048 -99 S 0.047 -100 S 0.049 -101 S 0.052 -102 M 0.055 -103 A 0.057 -104 P 0.055 -105 K 0.052 -106 L 0.051 -107 I 0.048 -108 A 0.044 -109 D 0.041 -110 S 0.045 -111 L 0.056 -112 Y 0.071 -113 E 0.083 -114 G 0.083 -115 R 0.073 -116 T 0.062 -117 I 0.053 -118 S 0.042 -119 Y 0.033 -120 E 0.027 -121 C 0.025 -122 C 0.025 -123 M 0.026 -124 A 0.028 -125 Q 0.031 -126 L 0.033 -127 F 0.036 -128 G 0.035 -129 A 0.031 -130 H 0.028 -131 F 0.027 -132 L 0.029 -133 G 0.032 -134 G 0.036 -135 V 0.042 -136 E 0.046 -137 I 0.045 -138 I 0.041 -139 L 0.036 -140 L 0.032 -141 T 0.030 -142 V 0.028 -143 M 0.028 -144 A 0.030 -145 Y 0.033 -146 D 0.037 -147 R 0.040 -148 Y 0.042 -149 V 0.045 -150 A 0.050 -151 I 0.055 -152 C 0.063 -153 K 0.072 -154 P 0.077 -155 L 0.078 -156 H 0.076 -157 N 0.072 -158 T 0.067 -159 T 0.064 -160 I 0.065 -161 M 0.067 -162 T 0.068 -163 R 0.068 -164 H 0.065 -165 L 0.058 -166 C 0.054 -167 A 0.061 -168 M 0.067 -169 L 0.062 -170 V 0.050 -171 G 0.042 -172 V 0.042 -173 A 0.046 -174 W 0.050 -175 L 0.056 -176 G 0.065 -177 G 0.073 -178 F 0.074 -179 L 0.074 -180 H 0.077 -181 S 0.079 -182 L 0.079 -183 V 0.078 -184 Q 0.080 -185 L 0.079 -186 L 0.075 -187 L 0.073 -188 V 0.071 -189 L 0.073 -190 W 0.082 -191 L 0.094 -192 P 0.100 -193 F 0.100 -194 C 0.103 -195 G 0.110 -196 P 0.118 -197 N 0.127 -198 V 0.134 -199 I 0.132 -200 N 0.113 -201 H 0.089 -202 F 0.071 -203 A 0.063 -204 C 0.064 -205 D 0.076 -206 L 0.095 -207 Y 0.114 -208 P 0.126 -209 L 0.132 -210 L 0.135 -211 E 0.137 -212 V 0.130 -213 A 0.112 -214 C 0.097 -215 T 0.092 -216 N 0.096 -217 T 0.099 -218 Y 0.097 -219 V 0.092 -220 I 0.091 -221 G 0.092 -222 L 0.090 -223 L 0.086 -224 V 0.080 -225 V 0.074 -226 A 0.069 -227 N 0.067 -228 S 0.065 -229 G 0.060 -230 L 0.055 -231 I 0.055 -232 C 0.055 -233 L 0.056 -234 L 0.062 -235 N 0.069 -236 F 0.070 -237 L 0.065 -238 M 0.065 -239 L 0.069 -240 A 0.069 -241 A 0.060 -242 S 0.049 -243 Y 0.039 -244 I 0.036 -245 V 0.038 -246 I 0.047 -247 L 0.060 -248 Y 0.072 -249 S 0.078 -250 L 0.082 -251 R 0.091 -252 S 0.108 -253 H 0.127 -254 S 0.144 -255 A 0.150 -256 D 0.143 -257 G 0.124 -258 R 0.102 -259 C 0.086 -260 K 0.078 -261 A 0.074 -262 L 0.074 -263 S 0.075 -264 T 0.076 -265 C 0.076 -266 G 0.077 -267 A 0.077 -268 H 0.072 -269 F 0.063 -270 I 0.057 -271 V 0.052 -272 V 0.045 -273 A 0.036 -274 L 0.028 -275 F 0.024 -276 F 0.024 -277 V 0.027 -278 P 0.030 -279 C 0.032 -280 I 0.033 -281 F 0.033 -282 T 0.039 -283 Y 0.057 -284 V 0.087 -285 H 0.122 -286 P 0.153 -287 F 0.177 -288 S 0.194 -289 T 0.201 -290 L 0.197 -291 P 0.184 -292 I 0.163 -293 D 0.138 -294 K 0.114 -295 N 0.093 -296 M 0.078 -297 A 0.069 -298 L 0.068 -299 F 0.079 -300 Y 0.096 -301 G 0.112 -302 I 0.119 -303 L 0.121 -304 T 0.118 -305 P 0.107 -306 M 0.092 -307 L 0.080 -308 N 0.073 -309 P 0.068 -310 L 0.066 -311 I 0.066 -312 Y 0.068 -313 T 0.075 -314 L 0.090 -315 R 0.101 -316 N 0.095 -317 E 0.076 -318 E 0.062 -319 V 0.060 -320 K 0.068 -321 N 0.076 -322 A 0.076 -323 M 0.070 -324 R 0.069 -325 K 0.081 -326 L 0.103 -327 F 0.133 -328 T 0.163 -329 W 0.183 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000178726.7_ENST00000377103.3_GN:THBD_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000178726.7_ENST00000377103.3_GN:THBD_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 8d523f1f2bd18a22188c8f40825c6e52d6605f4c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000178726.7_ENST00000377103.3_GN:THBD_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,576 +0,0 @@ ->ENSG00000178726.7|ENST00000377103.3|GN:THBD|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.287 -2 L 0.285 -3 G 0.281 -4 V 0.270 -5 L 0.253 -6 V 0.245 -7 L 0.263 -8 G 0.290 -9 A 0.300 -10 L 0.301 -11 A 0.322 -12 L 0.363 -13 A 0.400 -14 G 0.425 -15 L 0.441 -16 G 0.454 -17 F 0.473 -18 P 0.498 -19 A 0.523 -20 P 0.534 -21 A 0.528 -22 E 0.512 -23 P 0.496 -24 Q 0.474 -25 P 0.435 -26 G 0.370 -27 G 0.280 -28 S 0.184 -29 Q 0.114 -30 C 0.080 -31 V 0.065 -32 E 0.053 -33 H 0.041 -34 D 0.035 -35 C 0.033 -36 F 0.037 -37 A 0.048 -38 L 0.068 -39 Y 0.090 -40 P 0.103 -41 G 0.097 -42 P 0.078 -43 A 0.060 -44 T 0.046 -45 F 0.037 -46 L 0.034 -47 N 0.039 -48 A 0.050 -49 S 0.063 -50 Q 0.071 -51 I 0.069 -52 C 0.067 -53 D 0.074 -54 G 0.084 -55 L 0.089 -56 R 0.085 -57 G 0.077 -58 H 0.070 -59 L 0.070 -60 M 0.077 -61 T 0.090 -62 V 0.100 -63 R 0.100 -64 S 0.085 -65 S 0.063 -66 V 0.042 -67 A 0.030 -68 A 0.028 -69 D 0.030 -70 V 0.032 -71 I 0.032 -72 S 0.035 -73 L 0.046 -74 L 0.069 -75 L 0.107 -76 N 0.158 -77 G 0.208 -78 D 0.244 -79 G 0.257 -80 G 0.243 -81 V 0.207 -82 G 0.158 -83 R 0.110 -84 R 0.075 -85 R 0.051 -86 L 0.035 -87 W 0.026 -88 I 0.026 -89 G 0.034 -90 L 0.046 -91 Q 0.062 -92 L 0.080 -93 P 0.098 -94 P 0.114 -95 G 0.134 -96 C 0.158 -97 G 0.177 -98 D 0.182 -99 P 0.179 -100 K 0.178 -101 R 0.178 -102 L 0.178 -103 G 0.177 -104 P 0.172 -105 L 0.157 -106 R 0.132 -107 G 0.102 -108 F 0.075 -109 Q 0.055 -110 W 0.045 -111 V 0.046 -112 T 0.057 -113 G 0.073 -114 D 0.090 -115 N 0.104 -116 N 0.113 -117 T 0.111 -118 S 0.099 -119 Y 0.089 -120 S 0.086 -121 R 0.091 -122 W 0.103 -123 A 0.128 -124 R 0.166 -125 L 0.210 -126 D 0.245 -127 L 0.264 -128 N 0.272 -129 G 0.269 -130 A 0.248 -131 P 0.207 -132 L 0.157 -133 C 0.116 -134 G 0.091 -135 P 0.077 -136 L 0.068 -137 C 0.060 -138 V 0.053 -139 A 0.051 -140 V 0.059 -141 S 0.082 -142 A 0.121 -143 A 0.169 -144 E 0.219 -145 A 0.263 -146 T 0.293 -147 V 0.305 -148 P 0.296 -149 S 0.270 -150 E 0.230 -151 P 0.184 -152 I 0.141 -153 W 0.109 -154 E 0.089 -155 E 0.076 -156 Q 0.068 -157 Q 0.062 -158 C 0.061 -159 E 0.064 -160 V 0.069 -161 K 0.073 -162 A 0.072 -163 D 0.070 -164 G 0.064 -165 F 0.058 -166 L 0.052 -167 C 0.051 -168 E 0.056 -169 F 0.064 -170 H 0.074 -171 F 0.082 -172 P 0.082 -173 A 0.076 -174 T 0.071 -175 C 0.080 -176 R 0.107 -177 P 0.147 -178 L 0.191 -179 A 0.232 -180 V 0.263 -181 E 0.279 -182 P 0.276 -183 G 0.261 -184 A 0.244 -185 A 0.225 -186 A 0.198 -187 A 0.162 -188 A 0.128 -189 V 0.105 -190 S 0.092 -191 I 0.086 -192 T 0.088 -193 Y 0.098 -194 G 0.118 -195 T 0.140 -196 P 0.160 -197 F 0.184 -198 A 0.213 -199 A 0.242 -200 R 0.261 -201 G 0.260 -202 A 0.231 -203 D 0.184 -204 F 0.138 -205 Q 0.104 -206 A 0.084 -207 L 0.074 -208 P 0.070 -209 V 0.070 -210 G 0.072 -211 S 0.075 -212 S 0.077 -213 A 0.079 -214 A 0.085 -215 V 0.094 -216 A 0.106 -217 P 0.122 -218 L 0.138 -219 G 0.150 -220 L 0.151 -221 Q 0.140 -222 L 0.121 -223 M 0.109 -224 C 0.110 -225 T 0.126 -226 A 0.153 -227 P 0.178 -228 P 0.186 -229 G 0.173 -230 A 0.147 -231 V 0.127 -232 Q 0.122 -233 G 0.125 -234 H 0.127 -235 W 0.132 -236 A 0.153 -237 R 0.198 -238 E 0.253 -239 A 0.291 -240 P 0.298 -241 G 0.279 -242 A 0.242 -243 W 0.195 -244 D 0.154 -245 C 0.135 -246 S 0.135 -247 V 0.137 -248 E 0.134 -249 N 0.135 -250 G 0.143 -251 G 0.147 -252 C 0.140 -253 E 0.133 -254 H 0.142 -255 A 0.166 -256 C 0.186 -257 N 0.193 -258 A 0.196 -259 I 0.194 -260 P 0.182 -261 G 0.166 -262 A 0.149 -263 P 0.128 -264 R 0.109 -265 C 0.101 -266 Q 0.109 -267 C 0.129 -268 P 0.149 -269 A 0.156 -270 G 0.148 -271 A 0.136 -272 A 0.131 -273 L 0.133 -274 Q 0.134 -275 A 0.130 -276 D 0.122 -277 G 0.117 -278 R 0.121 -279 S 0.139 -280 C 0.179 -281 T 0.244 -282 A 0.314 -283 S 0.361 -284 A 0.369 -285 T 0.344 -286 Q 0.298 -287 S 0.248 -288 C 0.209 -289 N 0.187 -290 D 0.172 -291 L 0.150 -292 C 0.126 -293 E 0.111 -294 H 0.112 -295 F 0.132 -296 C 0.162 -297 V 0.190 -298 P 0.207 -299 N 0.207 -300 P 0.192 -301 D 0.179 -302 Q 0.180 -303 P 0.183 -304 G 0.170 -305 S 0.143 -306 Y 0.115 -307 S 0.099 -308 C 0.096 -309 M 0.103 -310 C 0.115 -311 E 0.126 -312 T 0.130 -313 G 0.127 -314 Y 0.128 -315 R 0.135 -316 L 0.139 -317 A 0.135 -318 A 0.125 -319 D 0.115 -320 Q 0.116 -321 H 0.128 -322 R 0.142 -323 C 0.149 -324 E 0.149 -325 D 0.149 -326 V 0.152 -327 D 0.157 -328 D 0.158 -329 C 0.151 -330 I 0.140 -331 L 0.131 -332 E 0.128 -333 P 0.132 -334 S 0.140 -335 P 0.145 -336 C 0.140 -337 P 0.125 -338 Q 0.112 -339 R 0.111 -340 C 0.122 -341 V 0.140 -342 N 0.163 -343 T 0.189 -344 Q 0.206 -345 G 0.202 -346 G 0.177 -347 F 0.145 -348 E 0.118 -349 C 0.101 -350 H 0.098 -351 C 0.112 -352 Y 0.141 -353 P 0.169 -354 N 0.183 -355 Y 0.187 -356 D 0.189 -357 L 0.191 -358 V 0.189 -359 D 0.187 -360 G 0.186 -361 E 0.188 -362 C 0.202 -363 V 0.240 -364 E 0.293 -365 P 0.324 -366 V 0.305 -367 D 0.243 -368 P 0.176 -369 C 0.135 -370 F 0.123 -371 R 0.125 -372 A 0.125 -373 N 0.119 -374 C 0.113 -375 E 0.110 -376 Y 0.114 -377 Q 0.129 -378 C 0.149 -379 Q 0.161 -380 P 0.159 -381 L 0.148 -382 N 0.137 -383 Q 0.132 -384 T 0.128 -385 S 0.121 -386 Y 0.109 -387 L 0.095 -388 C 0.089 -389 V 0.097 -390 C 0.118 -391 A 0.141 -392 E 0.150 -393 G 0.145 -394 F 0.138 -395 A 0.138 -396 P 0.143 -397 I 0.148 -398 P 0.147 -399 H 0.137 -400 E 0.123 -401 P 0.113 -402 H 0.112 -403 R 0.117 -404 C 0.126 -405 Q 0.138 -406 M 0.153 -407 F 0.163 -408 C 0.171 -409 N 0.185 -410 Q 0.205 -411 T 0.228 -412 A 0.247 -413 C 0.258 -414 P 0.265 -415 A 0.274 -416 D 0.280 -417 C 0.272 -418 D 0.250 -419 P 0.230 -420 N 0.221 -421 T 0.216 -422 Q 0.205 -423 A 0.188 -424 S 0.174 -425 C 0.173 -426 E 0.189 -427 C 0.215 -428 P 0.241 -429 E 0.251 -430 G 0.243 -431 Y 0.239 -432 I 0.250 -433 L 0.265 -434 D 0.261 -435 D 0.234 -436 G 0.200 -437 F 0.179 -438 I 0.171 -439 C 0.166 -440 T 0.157 -441 D 0.147 -442 I 0.140 -443 D 0.139 -444 E 0.146 -445 C 0.161 -446 E 0.185 -447 N 0.218 -448 G 0.244 -449 G 0.246 -450 F 0.224 -451 C 0.198 -452 S 0.186 -453 G 0.185 -454 V 0.189 -455 C 0.195 -456 H 0.207 -457 N 0.229 -458 L 0.257 -459 P 0.267 -460 G 0.248 -461 T 0.210 -462 F 0.174 -463 E 0.154 -464 C 0.155 -465 I 0.188 -466 C 0.253 -467 G 0.322 -468 P 0.364 -469 D 0.369 -470 S 0.357 -471 A 0.349 -472 L 0.355 -473 A 0.365 -474 R 0.371 -475 H 0.373 -476 I 0.380 -477 G 0.399 -478 T 0.438 -479 D 0.496 -480 C 0.562 -481 D 0.624 -482 S 0.672 -483 G 0.703 -484 K 0.721 -485 V 0.735 -486 D 0.747 -487 G 0.753 -488 G 0.754 -489 D 0.753 -490 S 0.747 -491 G 0.734 -492 S 0.711 -493 G 0.680 -494 E 0.648 -495 P 0.622 -496 P 0.610 -497 P 0.612 -498 S 0.628 -499 P 0.653 -500 T 0.687 -501 P 0.722 -502 G 0.745 -503 S 0.747 -504 T 0.733 -505 L 0.717 -506 T 0.715 -507 P 0.733 -508 P 0.761 -509 A 0.786 -510 V 0.800 -511 G 0.804 -512 L 0.802 -513 V 0.795 -514 H 0.787 -515 S 0.780 -516 G 0.775 -517 L 0.772 -518 L 0.768 -519 I 0.757 -520 G 0.731 -521 I 0.690 -522 S 0.641 -523 I 0.595 -524 A 0.563 -525 S 0.529 -526 L 0.479 -527 C 0.437 -528 L 0.424 -529 V 0.412 -530 V 0.373 -531 A 0.318 -532 L 0.273 -533 L 0.238 -534 A 0.206 -535 L 0.181 -536 L 0.167 -537 C 0.168 -538 H 0.182 -539 L 0.209 -540 R 0.243 -541 K 0.282 -542 K 0.335 -543 Q 0.399 -544 G 0.463 -545 A 0.509 -546 A 0.534 -547 R 0.547 -548 A 0.553 -549 K 0.554 -550 M 0.543 -551 E 0.522 -552 Y 0.503 -553 K 0.504 -554 C 0.528 -555 A 0.564 -556 A 0.598 -557 P 0.624 -558 S 0.639 -559 K 0.643 -560 E 0.632 -561 V 0.605 -562 V 0.563 -563 L 0.527 -564 Q 0.520 -565 H 0.535 -566 V 0.537 -567 R 0.522 -568 T 0.517 -569 E 0.526 -570 R 0.523 -571 T 0.493 -572 P 0.446 -573 Q 0.401 -574 R 0.368 -575 L 0.352 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000178726.7_ENST00000377103.3_GN:THBD_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:56.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000178726.7_ENST00000377103.3_GN:THBD_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:56.caid deleted file mode 100644 index 1d3f7b70cbb129407802f87d7804a1e704f4e62e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000178726.7_ENST00000377103.3_GN:THBD_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:56.caid +++ /dev/null @@ -1,632 +0,0 @@ ->ENSG00000178726.7|ENST00000377103.3|GN:THBD|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:56 -1 M 0.316 -2 S 0.322 -3 E 0.332 -4 A 0.340 -5 A 0.342 -6 S 0.343 -7 Q 0.355 -8 G 0.364 -9 L 0.342 -10 R 0.310 -11 A 0.309 -12 A 0.332 -13 A 0.347 -14 R 0.362 -15 S 0.401 -16 V 0.458 -17 W 0.516 -18 A 0.572 -19 G 0.614 -20 T 0.625 -21 D 0.605 -22 R 0.581 -23 R 0.581 -24 G 0.599 -25 C 0.606 -26 R 0.592 -27 H 0.569 -28 R 0.553 -29 R 0.557 -30 P 0.584 -31 V 0.625 -32 P 0.666 -33 L 0.695 -34 C 0.710 -35 S 0.711 -36 G 0.705 -37 T 0.694 -38 A 0.664 -39 L 0.606 -40 S 0.555 -41 Q 0.547 -42 C 0.567 -43 P 0.582 -44 R 0.587 -45 F 0.590 -46 P 0.577 -47 R 0.547 -48 R 0.535 -49 L 0.567 -50 H 0.615 -51 A 0.647 -52 A 0.665 -53 R 0.686 -54 L 0.706 -55 G 0.717 -56 N 0.714 -57 M 0.696 -58 L 0.669 -59 G 0.637 -60 V 0.591 -61 L 0.525 -62 V 0.461 -63 L 0.436 -64 G 0.450 -65 A 0.461 -66 L 0.454 -67 A 0.456 -68 L 0.479 -69 A 0.506 -70 G 0.522 -71 L 0.528 -72 G 0.529 -73 F 0.532 -74 P 0.543 -75 A 0.556 -76 P 0.559 -77 A 0.547 -78 E 0.529 -79 P 0.513 -80 Q 0.492 -81 P 0.452 -82 G 0.382 -83 G 0.285 -84 S 0.183 -85 Q 0.111 -86 C 0.076 -87 V 0.062 -88 E 0.050 -89 H 0.039 -90 D 0.034 -91 C 0.033 -92 F 0.037 -93 A 0.048 -94 L 0.067 -95 Y 0.089 -96 P 0.101 -97 G 0.094 -98 P 0.075 -99 A 0.056 -100 T 0.043 -101 F 0.034 -102 L 0.032 -103 N 0.037 -104 A 0.047 -105 S 0.060 -106 Q 0.067 -107 I 0.064 -108 C 0.060 -109 D 0.062 -110 G 0.069 -111 L 0.075 -112 R 0.075 -113 G 0.070 -114 H 0.066 -115 L 0.066 -116 M 0.073 -117 T 0.085 -118 V 0.093 -119 R 0.092 -120 S 0.078 -121 S 0.057 -122 V 0.037 -123 A 0.026 -124 A 0.024 -125 D 0.025 -126 V 0.026 -127 I 0.027 -128 S 0.030 -129 L 0.040 -130 L 0.062 -131 L 0.097 -132 N 0.144 -133 G 0.193 -134 D 0.231 -135 G 0.245 -136 G 0.232 -137 V 0.197 -138 G 0.151 -139 R 0.108 -140 R 0.075 -141 R 0.052 -142 L 0.036 -143 W 0.026 -144 I 0.026 -145 G 0.034 -146 L 0.045 -147 Q 0.060 -148 L 0.077 -149 P 0.094 -150 P 0.112 -151 G 0.136 -152 C 0.166 -153 G 0.190 -154 D 0.199 -155 P 0.198 -156 K 0.195 -157 R 0.193 -158 L 0.190 -159 G 0.186 -160 P 0.180 -161 L 0.166 -162 R 0.142 -163 G 0.112 -164 F 0.083 -165 Q 0.060 -166 W 0.050 -167 V 0.052 -168 T 0.065 -169 G 0.085 -170 D 0.106 -171 N 0.122 -172 N 0.131 -173 T 0.128 -174 S 0.114 -175 Y 0.101 -176 S 0.096 -177 R 0.098 -178 W 0.109 -179 A 0.132 -180 R 0.169 -181 L 0.211 -182 D 0.243 -183 L 0.262 -184 N 0.272 -185 G 0.273 -186 A 0.255 -187 P 0.213 -188 L 0.160 -189 C 0.114 -190 G 0.086 -191 P 0.071 -192 L 0.063 -193 C 0.057 -194 V 0.053 -195 A 0.052 -196 V 0.061 -197 S 0.085 -198 A 0.123 -199 A 0.170 -200 E 0.219 -201 A 0.262 -202 T 0.293 -203 V 0.305 -204 P 0.294 -205 S 0.265 -206 E 0.223 -207 P 0.175 -208 I 0.133 -209 W 0.104 -210 E 0.086 -211 E 0.073 -212 Q 0.064 -213 Q 0.057 -214 C 0.054 -215 E 0.057 -216 V 0.062 -217 K 0.066 -218 A 0.067 -219 D 0.066 -220 G 0.062 -221 F 0.056 -222 L 0.052 -223 C 0.051 -224 E 0.055 -225 F 0.062 -226 H 0.072 -227 F 0.079 -228 P 0.081 -229 A 0.076 -230 T 0.071 -231 C 0.079 -232 R 0.101 -233 P 0.135 -234 L 0.172 -235 A 0.207 -236 V 0.235 -237 E 0.249 -238 P 0.244 -239 G 0.225 -240 A 0.205 -241 A 0.189 -242 A 0.168 -243 A 0.140 -244 A 0.114 -245 V 0.095 -246 S 0.085 -247 I 0.081 -248 T 0.082 -249 Y 0.091 -250 G 0.106 -251 T 0.122 -252 P 0.138 -253 F 0.158 -254 A 0.182 -255 A 0.205 -256 R 0.222 -257 G 0.224 -258 A 0.203 -259 D 0.164 -260 F 0.124 -261 Q 0.094 -262 A 0.076 -263 L 0.068 -264 P 0.066 -265 V 0.068 -266 G 0.071 -267 S 0.074 -268 S 0.076 -269 A 0.076 -270 A 0.079 -271 V 0.086 -272 A 0.097 -273 P 0.114 -274 L 0.132 -275 G 0.146 -276 L 0.149 -277 Q 0.137 -278 L 0.118 -279 M 0.106 -280 C 0.109 -281 T 0.128 -282 A 0.156 -283 P 0.181 -284 P 0.188 -285 G 0.173 -286 A 0.147 -287 V 0.127 -288 Q 0.122 -289 G 0.126 -290 H 0.130 -291 W 0.138 -292 A 0.163 -293 R 0.211 -294 E 0.271 -295 A 0.316 -296 P 0.332 -297 G 0.321 -298 A 0.288 -299 W 0.238 -300 D 0.191 -301 C 0.164 -302 S 0.158 -303 V 0.158 -304 E 0.155 -305 N 0.156 -306 G 0.164 -307 G 0.167 -308 C 0.160 -309 E 0.154 -310 H 0.167 -311 A 0.193 -312 C 0.214 -313 N 0.224 -314 A 0.231 -315 I 0.233 -316 P 0.221 -317 G 0.201 -318 A 0.179 -319 P 0.153 -320 R 0.130 -321 C 0.121 -322 Q 0.132 -323 C 0.157 -324 P 0.183 -325 A 0.193 -326 G 0.184 -327 A 0.170 -328 A 0.164 -329 L 0.166 -330 Q 0.166 -331 A 0.159 -332 D 0.148 -333 G 0.140 -334 R 0.145 -335 S 0.166 -336 C 0.210 -337 T 0.278 -338 A 0.352 -339 S 0.401 -340 A 0.408 -341 T 0.379 -342 Q 0.332 -343 S 0.280 -344 C 0.240 -345 N 0.218 -346 D 0.200 -347 L 0.173 -348 C 0.143 -349 E 0.124 -350 H 0.126 -351 F 0.148 -352 C 0.181 -353 V 0.212 -354 P 0.231 -355 N 0.231 -356 P 0.214 -357 D 0.200 -358 Q 0.200 -359 P 0.200 -360 G 0.185 -361 S 0.156 -362 Y 0.128 -363 S 0.109 -364 C 0.104 -365 M 0.109 -366 C 0.124 -367 E 0.139 -368 T 0.144 -369 G 0.141 -370 Y 0.142 -371 R 0.149 -372 L 0.153 -373 A 0.148 -374 A 0.134 -375 D 0.123 -376 Q 0.124 -377 H 0.139 -378 R 0.155 -379 C 0.163 -380 E 0.162 -381 D 0.159 -382 V 0.159 -383 D 0.162 -384 D 0.160 -385 C 0.151 -386 I 0.138 -387 L 0.128 -388 E 0.122 -389 P 0.124 -390 S 0.130 -391 P 0.134 -392 C 0.131 -393 P 0.119 -394 Q 0.108 -395 R 0.110 -396 C 0.123 -397 V 0.141 -398 N 0.164 -399 T 0.190 -400 Q 0.207 -401 G 0.202 -402 G 0.176 -403 F 0.141 -404 E 0.110 -405 C 0.091 -406 H 0.086 -407 C 0.100 -408 Y 0.128 -409 P 0.155 -410 N 0.168 -411 Y 0.171 -412 D 0.172 -413 L 0.174 -414 V 0.173 -415 D 0.172 -416 G 0.172 -417 E 0.175 -418 C 0.191 -419 V 0.233 -420 E 0.289 -421 P 0.323 -422 V 0.305 -423 D 0.244 -424 P 0.178 -425 C 0.136 -426 F 0.123 -427 R 0.124 -428 A 0.124 -429 N 0.119 -430 C 0.112 -431 E 0.107 -432 Y 0.109 -433 Q 0.123 -434 C 0.144 -435 Q 0.159 -436 P 0.159 -437 L 0.150 -438 N 0.139 -439 Q 0.133 -440 T 0.130 -441 S 0.123 -442 Y 0.112 -443 L 0.100 -444 C 0.094 -445 V 0.102 -446 C 0.122 -447 A 0.145 -448 E 0.154 -449 G 0.149 -450 F 0.141 -451 A 0.139 -452 P 0.144 -453 I 0.148 -454 P 0.147 -455 H 0.138 -456 E 0.126 -457 P 0.118 -458 H 0.119 -459 R 0.125 -460 C 0.132 -461 Q 0.143 -462 M 0.156 -463 F 0.168 -464 C 0.177 -465 N 0.192 -466 Q 0.214 -467 T 0.237 -468 A 0.255 -469 C 0.268 -470 P 0.277 -471 A 0.287 -472 D 0.291 -473 C 0.280 -474 D 0.256 -475 P 0.236 -476 N 0.227 -477 T 0.222 -478 Q 0.212 -479 A 0.196 -480 S 0.186 -481 C 0.190 -482 E 0.208 -483 C 0.232 -484 P 0.253 -485 E 0.259 -486 G 0.251 -487 Y 0.253 -488 I 0.275 -489 L 0.297 -490 D 0.295 -491 D 0.266 -492 G 0.230 -493 F 0.205 -494 I 0.192 -495 C 0.183 -496 T 0.170 -497 D 0.156 -498 I 0.148 -499 D 0.146 -500 E 0.153 -501 C 0.168 -502 E 0.193 -503 N 0.228 -504 G 0.255 -505 G 0.256 -506 F 0.234 -507 C 0.209 -508 S 0.198 -509 G 0.197 -510 V 0.201 -511 C 0.209 -512 H 0.222 -513 N 0.248 -514 L 0.279 -515 P 0.291 -516 G 0.270 -517 T 0.227 -518 F 0.186 -519 E 0.161 -520 C 0.160 -521 I 0.191 -522 C 0.254 -523 G 0.323 -524 P 0.363 -525 D 0.365 -526 S 0.349 -527 A 0.340 -528 L 0.345 -529 A 0.355 -530 R 0.358 -531 H 0.355 -532 I 0.359 -533 G 0.380 -534 T 0.425 -535 D 0.488 -536 C 0.557 -537 D 0.620 -538 S 0.671 -539 G 0.702 -540 K 0.720 -541 V 0.734 -542 D 0.746 -543 G 0.752 -544 G 0.754 -545 D 0.753 -546 S 0.748 -547 G 0.735 -548 S 0.713 -549 G 0.685 -550 E 0.657 -551 P 0.636 -552 P 0.626 -553 P 0.628 -554 S 0.642 -555 P 0.666 -556 T 0.697 -557 P 0.730 -558 G 0.751 -559 S 0.752 -560 T 0.738 -561 L 0.722 -562 T 0.719 -563 P 0.735 -564 P 0.761 -565 A 0.784 -566 V 0.796 -567 G 0.799 -568 L 0.794 -569 V 0.785 -570 H 0.776 -571 S 0.768 -572 G 0.762 -573 L 0.758 -574 L 0.754 -575 I 0.743 -576 G 0.719 -577 I 0.681 -578 S 0.635 -579 I 0.593 -580 A 0.564 -581 S 0.531 -582 L 0.481 -583 C 0.436 -584 L 0.417 -585 V 0.403 -586 V 0.362 -587 A 0.308 -588 L 0.264 -589 L 0.231 -590 A 0.200 -591 L 0.176 -592 L 0.164 -593 C 0.164 -594 H 0.178 -595 L 0.204 -596 R 0.237 -597 K 0.279 -598 K 0.331 -599 Q 0.394 -600 G 0.455 -601 A 0.498 -602 A 0.519 -603 R 0.524 -604 A 0.517 -605 K 0.505 -606 M 0.489 -607 E 0.467 -608 Y 0.449 -609 K 0.453 -610 C 0.485 -611 A 0.531 -612 A 0.569 -613 P 0.591 -614 S 0.599 -615 K 0.595 -616 E 0.576 -617 V 0.539 -618 V 0.487 -619 L 0.446 -620 Q 0.436 -621 H 0.446 -622 V 0.439 -623 R 0.412 -624 T 0.396 -625 E 0.400 -626 R 0.403 -627 T 0.385 -628 P 0.351 -629 Q 0.315 -630 R 0.284 -631 L 0.267 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000179639.11_ENST00000693622.1_GN:FCER1A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000179639.11_ENST00000693622.1_GN:FCER1A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 0feec6480c6785a1b99ddcba8d07f02c070177e2..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000179639.11_ENST00000693622.1_GN:FCER1A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,258 +0,0 @@ ->ENSG00000179639.11|ENST00000693622.1|GN:FCER1A|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.448 -2 A 0.489 -3 P 0.547 -4 A 0.592 -5 M 0.615 -6 E 0.621 -7 S 0.613 -8 P 0.575 -9 T 0.500 -10 L 0.423 -11 L 0.382 -12 C 0.367 -13 V 0.345 -14 A 0.321 -15 L 0.324 -16 L 0.353 -17 F 0.396 -18 F 0.451 -19 A 0.521 -20 P 0.594 -21 D 0.651 -22 G 0.681 -23 V 0.684 -24 L 0.659 -25 A 0.605 -26 V 0.522 -27 P 0.417 -28 Q 0.310 -29 K 0.217 -30 P 0.147 -31 K 0.102 -32 V 0.078 -33 S 0.067 -34 L 0.060 -35 N 0.055 -36 P 0.055 -37 P 0.057 -38 W 0.055 -39 N 0.049 -40 R 0.043 -41 I 0.043 -42 F 0.049 -43 K 0.057 -44 G 0.059 -45 E 0.055 -46 N 0.049 -47 V 0.046 -48 T 0.043 -49 L 0.042 -50 T 0.045 -51 C 0.056 -52 N 0.078 -53 G 0.106 -54 N 0.133 -55 N 0.150 -56 F 0.156 -57 F 0.154 -58 E 0.148 -59 V 0.136 -60 S 0.114 -61 S 0.084 -62 T 0.058 -63 K 0.042 -64 W 0.038 -65 F 0.043 -66 H 0.054 -67 N 0.068 -68 G 0.081 -69 S 0.089 -70 L 0.089 -71 S 0.082 -72 E 0.072 -73 E 0.065 -74 T 0.060 -75 N 0.056 -76 S 0.053 -77 S 0.053 -78 L 0.058 -79 N 0.063 -80 I 0.068 -81 V 0.071 -82 N 0.071 -83 A 0.067 -84 K 0.063 -85 F 0.062 -86 E 0.067 -87 D 0.075 -88 S 0.082 -89 G 0.080 -90 E 0.065 -91 Y 0.045 -92 K 0.033 -93 C 0.033 -94 Q 0.039 -95 H 0.046 -96 Q 0.056 -97 Q 0.067 -98 V 0.075 -99 N 0.073 -100 E 0.066 -101 S 0.062 -102 E 0.062 -103 P 0.062 -104 V 0.059 -105 Y 0.058 -106 L 0.061 -107 E 0.067 -108 V 0.069 -109 F 0.065 -110 S 0.060 -111 D 0.055 -112 W 0.051 -113 L 0.050 -114 L 0.053 -115 L 0.059 -116 Q 0.064 -117 A 0.066 -118 S 0.071 -119 A 0.078 -120 E 0.081 -121 V 0.077 -122 V 0.070 -123 M 0.071 -124 E 0.080 -125 G 0.088 -126 Q 0.083 -127 P 0.067 -128 L 0.050 -129 F 0.039 -130 L 0.036 -131 R 0.039 -132 C 0.045 -133 H 0.053 -134 G 0.058 -135 W 0.060 -136 R 0.063 -137 N 0.072 -138 W 0.084 -139 D 0.092 -140 V 0.084 -141 Y 0.064 -142 K 0.042 -143 V 0.028 -144 I 0.023 -145 Y 0.026 -146 Y 0.036 -147 K 0.049 -148 D 0.062 -149 G 0.073 -150 E 0.077 -151 A 0.070 -152 L 0.056 -153 K 0.043 -154 Y 0.036 -155 W 0.036 -156 Y 0.038 -157 E 0.040 -158 N 0.041 -159 H 0.040 -160 N 0.037 -161 I 0.037 -162 S 0.041 -163 I 0.046 -164 T 0.051 -165 N 0.059 -166 A 0.067 -167 T 0.074 -168 V 0.077 -169 E 0.080 -170 D 0.086 -171 S 0.093 -172 G 0.090 -173 T 0.070 -174 Y 0.045 -175 Y 0.029 -176 C 0.024 -177 T 0.026 -178 G 0.030 -179 K 0.033 -180 V 0.037 -181 W 0.042 -182 Q 0.050 -183 L 0.061 -184 D 0.070 -185 Y 0.074 -186 E 0.072 -187 S 0.072 -188 E 0.074 -189 P 0.075 -190 L 0.074 -191 N 0.071 -192 I 0.071 -193 T 0.080 -194 V 0.106 -195 I 0.157 -196 K 0.234 -197 A 0.319 -198 P 0.382 -199 R 0.404 -200 E 0.388 -201 K 0.349 -202 Y 0.305 -203 W 0.271 -204 L 0.259 -205 Q 0.269 -206 F 0.286 -207 F 0.294 -208 I 0.282 -209 P 0.260 -210 L 0.244 -211 L 0.238 -212 V 0.231 -213 V 0.222 -214 I 0.224 -215 L 0.240 -216 F 0.258 -217 A 0.276 -218 V 0.294 -219 D 0.309 -220 T 0.313 -221 G 0.303 -222 L 0.276 -223 F 0.248 -224 I 0.233 -225 S 0.232 -226 T 0.231 -227 Q 0.226 -228 Q 0.226 -229 Q 0.232 -230 V 0.234 -231 T 0.224 -232 F 0.210 -233 L 0.207 -234 L 0.221 -235 K 0.246 -236 I 0.268 -237 K 0.282 -238 R 0.297 -239 T 0.327 -240 R 0.372 -241 K 0.433 -242 G 0.499 -243 F 0.546 -244 R 0.565 -245 L 0.561 -246 L 0.541 -247 N 0.520 -248 P 0.511 -249 H 0.518 -250 P 0.532 -251 K 0.550 -252 P 0.573 -253 N 0.603 -254 P 0.622 -255 K 0.611 -256 N 0.565 -257 N 0.520 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000179639.11_ENST00000693622.1_GN:FCER1A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000179639.11_ENST00000693622.1_GN:FCER1A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid deleted file mode 100644 index 3b7198961b216c1b459d89d1d1b0b8c4808eff23..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000179639.11_ENST00000693622.1_GN:FCER1A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid +++ /dev/null @@ -1,261 +0,0 @@ ->ENSG00000179639.11|ENST00000693622.1|GN:FCER1A|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 -1 M 0.393 -2 K 0.395 -3 K 0.423 -4 M 0.489 -5 A 0.568 -6 P 0.626 -7 A 0.655 -8 M 0.662 -9 E 0.656 -10 S 0.635 -11 P 0.579 -12 T 0.484 -13 L 0.386 -14 L 0.342 -15 C 0.345 -16 V 0.345 -17 A 0.330 -18 L 0.330 -19 L 0.357 -20 F 0.400 -21 F 0.456 -22 A 0.526 -23 P 0.598 -24 D 0.655 -25 G 0.685 -26 V 0.687 -27 L 0.660 -28 A 0.604 -29 V 0.520 -30 P 0.415 -31 Q 0.308 -32 K 0.215 -33 P 0.146 -34 K 0.101 -35 V 0.078 -36 S 0.067 -37 L 0.060 -38 N 0.055 -39 P 0.055 -40 P 0.057 -41 W 0.055 -42 N 0.049 -43 R 0.043 -44 I 0.042 -45 F 0.049 -46 K 0.057 -47 G 0.059 -48 E 0.054 -49 N 0.049 -50 V 0.046 -51 T 0.043 -52 L 0.042 -53 T 0.045 -54 C 0.056 -55 N 0.077 -56 G 0.106 -57 N 0.133 -58 N 0.150 -59 F 0.156 -60 F 0.154 -61 E 0.147 -62 V 0.135 -63 S 0.114 -64 S 0.084 -65 T 0.057 -66 K 0.041 -67 W 0.037 -68 F 0.043 -69 H 0.053 -70 N 0.067 -71 G 0.080 -72 S 0.088 -73 L 0.089 -74 S 0.082 -75 E 0.072 -76 E 0.065 -77 T 0.060 -78 N 0.056 -79 S 0.052 -80 S 0.053 -81 L 0.057 -82 N 0.063 -83 I 0.067 -84 V 0.070 -85 N 0.070 -86 A 0.067 -87 K 0.063 -88 F 0.063 -89 E 0.067 -90 D 0.075 -91 S 0.082 -92 G 0.080 -93 E 0.065 -94 Y 0.045 -95 K 0.033 -96 C 0.033 -97 Q 0.039 -98 H 0.046 -99 Q 0.056 -100 Q 0.068 -101 V 0.075 -102 N 0.073 -103 E 0.066 -104 S 0.062 -105 E 0.062 -106 P 0.061 -107 V 0.059 -108 Y 0.057 -109 L 0.060 -110 E 0.066 -111 V 0.068 -112 F 0.065 -113 S 0.061 -114 D 0.056 -115 W 0.051 -116 L 0.051 -117 L 0.054 -118 L 0.059 -119 Q 0.064 -120 A 0.067 -121 S 0.071 -122 A 0.078 -123 E 0.082 -124 V 0.077 -125 V 0.070 -126 M 0.071 -127 E 0.081 -128 G 0.088 -129 Q 0.084 -130 P 0.068 -131 L 0.050 -132 F 0.039 -133 L 0.037 -134 R 0.040 -135 C 0.046 -136 H 0.053 -137 G 0.058 -138 W 0.061 -139 R 0.064 -140 N 0.072 -141 W 0.085 -142 D 0.092 -143 V 0.085 -144 Y 0.064 -145 K 0.042 -146 V 0.028 -147 I 0.023 -148 Y 0.026 -149 Y 0.036 -150 K 0.049 -151 D 0.063 -152 G 0.073 -153 E 0.077 -154 A 0.070 -155 L 0.056 -156 K 0.043 -157 Y 0.036 -158 W 0.036 -159 Y 0.038 -160 E 0.041 -161 N 0.042 -162 H 0.040 -163 N 0.037 -164 I 0.037 -165 S 0.041 -166 I 0.046 -167 T 0.051 -168 N 0.059 -169 A 0.067 -170 T 0.074 -171 V 0.077 -172 E 0.080 -173 D 0.086 -174 S 0.093 -175 G 0.090 -176 T 0.070 -177 Y 0.045 -178 Y 0.029 -179 C 0.024 -180 T 0.026 -181 G 0.030 -182 K 0.033 -183 V 0.036 -184 W 0.041 -185 Q 0.049 -186 L 0.060 -187 D 0.069 -188 Y 0.073 -189 E 0.072 -190 S 0.071 -191 E 0.074 -192 P 0.075 -193 L 0.073 -194 N 0.071 -195 I 0.071 -196 T 0.080 -197 V 0.106 -198 I 0.157 -199 K 0.234 -200 A 0.318 -201 P 0.382 -202 R 0.405 -203 E 0.389 -204 K 0.349 -205 Y 0.305 -206 W 0.271 -207 L 0.259 -208 Q 0.269 -209 F 0.286 -210 F 0.294 -211 I 0.283 -212 P 0.261 -213 L 0.245 -214 L 0.240 -215 V 0.233 -216 V 0.223 -217 I 0.225 -218 L 0.241 -219 F 0.262 -220 A 0.282 -221 V 0.302 -222 D 0.317 -223 T 0.322 -224 G 0.311 -225 L 0.284 -226 F 0.255 -227 I 0.240 -228 S 0.237 -229 T 0.236 -230 Q 0.231 -231 Q 0.231 -232 Q 0.238 -233 V 0.240 -234 T 0.229 -235 F 0.216 -236 L 0.213 -237 L 0.226 -238 K 0.250 -239 I 0.272 -240 K 0.284 -241 R 0.299 -242 T 0.328 -243 R 0.373 -244 K 0.433 -245 G 0.498 -246 F 0.545 -247 R 0.564 -248 L 0.560 -249 L 0.540 -250 N 0.518 -251 P 0.509 -252 H 0.516 -253 P 0.531 -254 K 0.549 -255 P 0.574 -256 N 0.603 -257 P 0.622 -258 K 0.611 -259 N 0.566 -260 N 0.520 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180383.4_ENST00000317676.3_GN:DEFB124_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180383.4_ENST00000317676.3_GN:DEFB124_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index ba9b083ded721060be87f2c2147b14cff8c4d87f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180383.4_ENST00000317676.3_GN:DEFB124_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,72 +0,0 @@ ->ENSG00000180383.4|ENST00000317676.3|GN:DEFB124|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.225 -2 T 0.198 -3 Q 0.161 -4 L 0.134 -5 L 0.127 -6 L 0.134 -7 F 0.142 -8 L 0.144 -9 V 0.141 -10 A 0.139 -11 L 0.146 -12 L 0.172 -13 V 0.219 -14 L 0.281 -15 G 0.346 -16 H 0.406 -17 V 0.461 -18 P 0.511 -19 S 0.547 -20 G 0.553 -21 R 0.521 -22 S 0.455 -23 E 0.367 -24 F 0.270 -25 K 0.179 -26 R 0.112 -27 C 0.076 -28 W 0.071 -29 K 0.088 -30 G 0.108 -31 Q 0.118 -32 G 0.114 -33 A 0.102 -34 C 0.091 -35 Q 0.086 -36 T 0.089 -37 Y 0.098 -38 C 0.103 -39 T 0.101 -40 R 0.095 -41 Q 0.089 -42 E 0.086 -43 T 0.082 -44 Y 0.077 -45 M 0.070 -46 H 0.062 -47 L 0.060 -48 C 0.067 -49 P 0.078 -50 D 0.085 -51 A 0.086 -52 S 0.079 -53 L 0.071 -54 C 0.069 -55 C 0.083 -56 L 0.121 -57 S 0.191 -58 Y 0.286 -59 A 0.383 -60 L 0.454 -61 K 0.493 -62 P 0.519 -63 P 0.550 -64 P 0.585 -65 V 0.615 -66 P 0.634 -67 K 0.640 -68 H 0.633 -69 E 0.604 -70 Y 0.552 -71 E 0.506 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180383.4_ENST00000317676.3_GN:DEFB124_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180383.4_ENST00000317676.3_GN:DEFB124_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid deleted file mode 100644 index 09cbface61bb5356e2f391b62a788296ee26701e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180383.4_ENST00000317676.3_GN:DEFB124_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:17.caid +++ /dev/null @@ -1,89 +0,0 @@ ->ENSG00000180383.4|ENST00000317676.3|GN:DEFB124|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:17 -1 M 0.461 -2 A 0.492 -3 E 0.545 -4 K 0.605 -5 K 0.653 -6 N 0.680 -7 A 0.694 -8 P 0.700 -9 S 0.695 -10 S 0.671 -11 L 0.632 -12 P 0.588 -13 R 0.540 -14 S 0.477 -15 P 0.394 -16 V 0.310 -17 A 0.248 -18 M 0.208 -19 T 0.180 -20 Q 0.156 -21 L 0.138 -22 L 0.129 -23 L 0.131 -24 F 0.137 -25 L 0.141 -26 V 0.142 -27 A 0.138 -28 L 0.133 -29 L 0.144 -30 V 0.181 -31 L 0.241 -32 G 0.313 -33 H 0.386 -34 V 0.452 -35 P 0.505 -36 S 0.536 -37 G 0.534 -38 R 0.495 -39 S 0.428 -40 E 0.347 -41 F 0.258 -42 K 0.174 -43 R 0.108 -44 C 0.073 -45 W 0.068 -46 K 0.084 -47 G 0.104 -48 Q 0.113 -49 G 0.109 -50 A 0.099 -51 C 0.088 -52 Q 0.084 -53 T 0.088 -54 Y 0.097 -55 C 0.102 -56 T 0.101 -57 R 0.096 -58 Q 0.090 -59 E 0.086 -60 T 0.083 -61 Y 0.078 -62 M 0.070 -63 H 0.062 -64 L 0.058 -65 C 0.064 -66 P 0.075 -67 D 0.082 -68 A 0.083 -69 S 0.077 -70 L 0.069 -71 C 0.067 -72 C 0.081 -73 L 0.120 -74 S 0.193 -75 Y 0.293 -76 A 0.396 -77 L 0.469 -78 K 0.508 -79 P 0.533 -80 P 0.564 -81 P 0.598 -82 V 0.627 -83 P 0.643 -84 K 0.647 -85 H 0.638 -86 E 0.608 -87 Y 0.556 -88 E 0.510 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180433.6_ENST00000641861.1_GN:OR6K6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180433.6_ENST00000641861.1_GN:OR6K6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 4de259c43b4950f23e91f66363c5dcf55aefb6bf..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180433.6_ENST00000641861.1_GN:OR6K6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,320 +0,0 @@ ->ENSG00000180433.6|ENST00000641861.1|GN:OR6K6|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.338 -2 T 0.347 -3 Q 0.383 -4 L 0.450 -5 T 0.516 -6 A 0.555 -7 S 0.571 -8 G 0.574 -9 N 0.557 -10 Q 0.510 -11 T 0.436 -12 M 0.347 -13 V 0.259 -14 T 0.188 -15 E 0.140 -16 F 0.113 -17 L 0.103 -18 F 0.109 -19 S 0.134 -20 M 0.175 -21 F 0.222 -22 P 0.260 -23 H 0.285 -24 A 0.297 -25 H 0.290 -26 R 0.263 -27 G 0.218 -28 G 0.163 -29 L 0.112 -30 L 0.076 -31 F 0.058 -32 F 0.050 -33 I 0.046 -34 P 0.044 -35 L 0.042 -36 L 0.042 -37 L 0.045 -38 I 0.051 -39 Y 0.054 -40 G 0.055 -41 F 0.058 -42 I 0.060 -43 L 0.060 -44 T 0.058 -45 G 0.059 -46 N 0.062 -47 L 0.065 -48 I 0.065 -49 M 0.059 -50 F 0.050 -51 I 0.048 -52 V 0.051 -53 I 0.056 -54 Q 0.064 -55 V 0.074 -56 G 0.085 -57 M 0.092 -58 A 0.093 -59 L 0.086 -60 H 0.073 -61 T 0.058 -62 P 0.045 -63 L 0.033 -64 Y 0.025 -65 F 0.021 -66 F 0.021 -67 I 0.026 -68 S 0.035 -69 V 0.042 -70 L 0.046 -71 S 0.046 -72 F 0.046 -73 L 0.048 -74 E 0.053 -75 I 0.058 -76 C 0.060 -77 Y 0.057 -78 T 0.053 -79 T 0.050 -80 T 0.050 -81 T 0.051 -82 I 0.053 -83 P 0.053 -84 K 0.052 -85 M 0.052 -86 L 0.052 -87 S 0.050 -88 C 0.051 -89 L 0.057 -90 I 0.069 -91 S 0.083 -92 E 0.093 -93 Q 0.092 -94 K 0.081 -95 S 0.068 -96 I 0.057 -97 S 0.049 -98 V 0.044 -99 A 0.043 -100 G 0.042 -101 C 0.039 -102 L 0.034 -103 L 0.032 -104 Q 0.033 -105 M 0.034 -106 Y 0.033 -107 F 0.030 -108 F 0.028 -109 H 0.029 -110 S 0.032 -111 L 0.036 -112 G 0.040 -113 I 0.045 -114 T 0.047 -115 E 0.045 -116 S 0.039 -117 C 0.033 -118 V 0.031 -119 L 0.032 -120 T 0.033 -121 A 0.032 -122 M 0.032 -123 A 0.036 -124 I 0.041 -125 D 0.045 -126 R 0.046 -127 Y 0.044 -128 I 0.042 -129 A 0.042 -130 I 0.045 -131 C 0.051 -132 N 0.057 -133 P 0.059 -134 L 0.056 -135 R 0.052 -136 Y 0.051 -137 P 0.054 -138 T 0.058 -139 I 0.064 -140 M 0.069 -141 I 0.071 -142 P 0.069 -143 K 0.064 -144 L 0.054 -145 C 0.049 -146 I 0.054 -147 Q 0.061 -148 L 0.062 -149 T 0.058 -150 V 0.058 -151 G 0.061 -152 S 0.065 -153 C 0.069 -154 F 0.073 -155 C 0.077 -156 G 0.077 -157 F 0.074 -158 L 0.074 -159 L 0.078 -160 V 0.082 -161 L 0.082 -162 P 0.080 -163 E 0.078 -164 I 0.072 -165 A 0.067 -166 W 0.066 -167 I 0.072 -168 S 0.081 -169 T 0.095 -170 L 0.107 -171 P 0.112 -172 F 0.114 -173 C 0.119 -174 G 0.128 -175 S 0.135 -176 N 0.139 -177 Q 0.141 -178 I 0.135 -179 H 0.115 -180 Q 0.091 -181 I 0.071 -182 F 0.061 -183 C 0.061 -184 D 0.072 -185 F 0.092 -186 T 0.113 -187 P 0.125 -188 V 0.129 -189 L 0.130 -190 S 0.131 -191 L 0.125 -192 A 0.112 -193 C 0.101 -194 T 0.101 -195 D 0.106 -196 T 0.102 -197 F 0.090 -198 L 0.079 -199 V 0.078 -200 V 0.084 -201 I 0.091 -202 V 0.092 -203 D 0.085 -204 A 0.077 -205 I 0.074 -206 H 0.073 -207 A 0.070 -208 A 0.065 -209 E 0.062 -210 I 0.060 -211 V 0.060 -212 A 0.064 -213 S 0.067 -214 F 0.065 -215 L 0.060 -216 V 0.062 -217 I 0.063 -218 A 0.058 -219 L 0.048 -220 S 0.041 -221 Y 0.037 -222 I 0.037 -223 R 0.043 -224 I 0.053 -225 I 0.067 -226 I 0.078 -227 V 0.082 -228 I 0.084 -229 L 0.093 -230 G 0.112 -231 M 0.134 -232 H 0.154 -233 S 0.164 -234 A 0.162 -235 E 0.151 -236 G 0.135 -237 H 0.117 -238 H 0.100 -239 K 0.089 -240 A 0.082 -241 F 0.077 -242 S 0.073 -243 T 0.070 -244 C 0.067 -245 A 0.067 -246 A 0.068 -247 H 0.066 -248 L 0.061 -249 A 0.057 -250 V 0.051 -251 F 0.042 -252 L 0.031 -253 L 0.024 -254 F 0.022 -255 F 0.025 -256 G 0.028 -257 S 0.030 -258 V 0.030 -259 A 0.029 -260 V 0.027 -261 M 0.027 -262 Y 0.029 -263 L 0.039 -264 R 0.055 -265 F 0.078 -266 S 0.102 -267 A 0.122 -268 T 0.131 -269 Y 0.128 -270 S 0.113 -271 V 0.093 -272 F 0.076 -273 W 0.068 -274 D 0.066 -275 T 0.068 -276 A 0.070 -277 I 0.071 -278 A 0.068 -279 V 0.065 -280 T 0.067 -281 F 0.075 -282 V 0.083 -283 I 0.089 -284 L 0.093 -285 A 0.093 -286 P 0.086 -287 F 0.076 -288 F 0.069 -289 N 0.066 -290 P 0.065 -291 I 0.066 -292 I 0.070 -293 Y 0.072 -294 S 0.078 -295 L 0.092 -296 K 0.103 -297 N 0.096 -298 K 0.078 -299 D 0.063 -300 M 0.061 -301 K 0.069 -302 E 0.076 -303 A 0.074 -304 I 0.066 -305 G 0.061 -306 R 0.061 -307 L 0.069 -308 F 0.086 -309 H 0.114 -310 Y 0.150 -311 Q 0.188 -312 K 0.223 -313 R 0.265 -314 A 0.325 -315 G 0.393 -316 W 0.448 -317 A 0.472 -318 G 0.457 -319 K 0.431 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180433.6_ENST00000641861.1_GN:OR6K6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180433.6_ENST00000641861.1_GN:OR6K6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid deleted file mode 100644 index c35a6b82a130de3fcd1642b42781eca3adea676a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180433.6_ENST00000641861.1_GN:OR6K6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid +++ /dev/null @@ -1,344 +0,0 @@ ->ENSG00000180433.6|ENST00000641861.1|GN:OR6K6|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:24 -1 M 0.341 -2 K 0.347 -3 Q 0.364 -4 Y 0.394 -5 S 0.427 -6 V 0.452 -7 G 0.464 -8 N 0.466 -9 Q 0.453 -10 H 0.425 -11 S 0.394 -12 N 0.367 -13 Y 0.338 -14 R 0.302 -15 S 0.266 -16 L 0.236 -17 L 0.213 -18 F 0.190 -19 P 0.158 -20 F 0.125 -21 L 0.109 -22 C 0.119 -23 S 0.146 -24 Q 0.178 -25 M 0.208 -26 T 0.242 -27 Q 0.301 -28 L 0.385 -29 T 0.467 -30 A 0.523 -31 S 0.552 -32 G 0.560 -33 N 0.544 -34 Q 0.500 -35 T 0.430 -36 M 0.343 -37 V 0.257 -38 T 0.186 -39 E 0.139 -40 F 0.112 -41 L 0.102 -42 F 0.108 -43 S 0.133 -44 M 0.176 -45 F 0.225 -46 P 0.263 -47 H 0.287 -48 A 0.297 -49 H 0.292 -50 R 0.265 -51 G 0.218 -52 G 0.162 -53 L 0.112 -54 L 0.077 -55 F 0.059 -56 F 0.051 -57 I 0.047 -58 P 0.043 -59 L 0.042 -60 L 0.043 -61 L 0.047 -62 I 0.052 -63 Y 0.056 -64 G 0.057 -65 F 0.058 -66 I 0.060 -67 L 0.059 -68 T 0.057 -69 G 0.058 -70 N 0.061 -71 L 0.065 -72 I 0.065 -73 M 0.058 -74 F 0.049 -75 I 0.046 -76 V 0.048 -77 I 0.051 -78 Q 0.056 -79 V 0.066 -80 G 0.076 -81 M 0.084 -82 A 0.085 -83 L 0.078 -84 H 0.066 -85 T 0.053 -86 P 0.041 -87 L 0.031 -88 Y 0.024 -89 F 0.020 -90 F 0.021 -91 I 0.026 -92 S 0.035 -93 V 0.043 -94 L 0.047 -95 S 0.047 -96 F 0.046 -97 L 0.048 -98 E 0.053 -99 I 0.058 -100 C 0.060 -101 Y 0.057 -102 T 0.053 -103 T 0.049 -104 T 0.048 -105 T 0.049 -106 I 0.050 -107 P 0.048 -108 K 0.047 -109 M 0.046 -110 L 0.045 -111 S 0.044 -112 C 0.044 -113 L 0.050 -114 I 0.062 -115 S 0.077 -116 E 0.088 -117 Q 0.088 -118 K 0.078 -119 S 0.066 -120 I 0.055 -121 S 0.047 -122 V 0.042 -123 A 0.041 -124 G 0.041 -125 C 0.038 -126 L 0.034 -127 L 0.031 -128 Q 0.031 -129 M 0.033 -130 Y 0.032 -131 F 0.029 -132 F 0.027 -133 H 0.028 -134 S 0.031 -135 L 0.035 -136 G 0.040 -137 I 0.044 -138 T 0.046 -139 E 0.044 -140 S 0.038 -141 C 0.033 -142 V 0.031 -143 L 0.031 -144 T 0.031 -145 A 0.031 -146 M 0.031 -147 A 0.035 -148 I 0.041 -149 D 0.045 -150 R 0.046 -151 Y 0.044 -152 I 0.042 -153 A 0.041 -154 I 0.044 -155 C 0.050 -156 N 0.056 -157 P 0.058 -158 L 0.056 -159 R 0.052 -160 Y 0.052 -161 P 0.054 -162 T 0.059 -163 I 0.065 -164 M 0.070 -165 I 0.071 -166 P 0.069 -167 K 0.063 -168 L 0.053 -169 C 0.048 -170 I 0.053 -171 Q 0.060 -172 L 0.061 -173 T 0.057 -174 V 0.056 -175 G 0.059 -176 S 0.063 -177 C 0.066 -178 F 0.070 -179 C 0.075 -180 G 0.076 -181 F 0.074 -182 L 0.074 -183 L 0.078 -184 V 0.082 -185 L 0.082 -186 P 0.080 -187 E 0.077 -188 I 0.072 -189 A 0.066 -190 W 0.066 -191 I 0.071 -192 S 0.081 -193 T 0.095 -194 L 0.106 -195 P 0.111 -196 F 0.113 -197 C 0.118 -198 G 0.127 -199 S 0.134 -200 N 0.139 -201 Q 0.140 -202 I 0.132 -203 H 0.112 -204 Q 0.088 -205 I 0.069 -206 F 0.060 -207 C 0.061 -208 D 0.072 -209 F 0.091 -210 T 0.110 -211 P 0.122 -212 V 0.126 -213 L 0.127 -214 S 0.127 -215 L 0.121 -216 A 0.108 -217 C 0.096 -218 T 0.096 -219 D 0.100 -220 T 0.096 -221 F 0.085 -222 L 0.074 -223 V 0.070 -224 V 0.073 -225 I 0.078 -226 V 0.080 -227 D 0.078 -228 A 0.074 -229 I 0.073 -230 H 0.073 -231 A 0.069 -232 A 0.064 -233 E 0.061 -234 I 0.059 -235 V 0.060 -236 A 0.064 -237 S 0.067 -238 F 0.064 -239 L 0.059 -240 V 0.060 -241 I 0.062 -242 A 0.057 -243 L 0.047 -244 S 0.040 -245 Y 0.036 -246 I 0.037 -247 R 0.042 -248 I 0.052 -249 I 0.066 -250 I 0.076 -251 V 0.080 -252 I 0.082 -253 L 0.091 -254 G 0.109 -255 M 0.131 -256 H 0.151 -257 S 0.161 -258 A 0.160 -259 E 0.150 -260 G 0.135 -261 H 0.118 -262 H 0.101 -263 K 0.089 -264 A 0.082 -265 F 0.076 -266 S 0.073 -267 T 0.070 -268 C 0.067 -269 A 0.067 -270 A 0.068 -271 H 0.066 -272 L 0.061 -273 A 0.057 -274 V 0.051 -275 F 0.042 -276 L 0.032 -277 L 0.024 -278 F 0.022 -279 F 0.025 -280 G 0.028 -281 S 0.030 -282 V 0.030 -283 A 0.029 -284 V 0.027 -285 M 0.026 -286 Y 0.029 -287 L 0.038 -288 R 0.055 -289 F 0.078 -290 S 0.104 -291 A 0.124 -292 T 0.134 -293 Y 0.132 -294 S 0.118 -295 V 0.097 -296 F 0.080 -297 W 0.072 -298 D 0.070 -299 T 0.071 -300 A 0.074 -301 I 0.074 -302 A 0.071 -303 V 0.068 -304 T 0.071 -305 F 0.078 -306 V 0.087 -307 I 0.093 -308 L 0.096 -309 A 0.097 -310 P 0.090 -311 F 0.079 -312 F 0.071 -313 N 0.068 -314 P 0.067 -315 I 0.069 -316 I 0.072 -317 Y 0.075 -318 S 0.080 -319 L 0.094 -320 K 0.104 -321 N 0.097 -322 K 0.079 -323 D 0.063 -324 M 0.061 -325 K 0.068 -326 E 0.075 -327 A 0.074 -328 I 0.066 -329 G 0.060 -330 R 0.061 -331 L 0.069 -332 F 0.087 -333 H 0.115 -334 Y 0.151 -335 Q 0.189 -336 K 0.224 -337 R 0.267 -338 A 0.328 -339 G 0.398 -340 W 0.454 -341 A 0.479 -342 G 0.464 -343 K 0.437 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180872.7_ENST00000651554.2_GN:DEFB112_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180872.7_ENST00000651554.2_GN:DEFB112_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 5b869505acb42699cbddc3f286934c39bc937298..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180872.7_ENST00000651554.2_GN:DEFB112_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,95 +0,0 @@ ->ENSG00000180872.7|ENST00000651554.2|GN:DEFB112|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.198 -2 K 0.172 -3 I 0.141 -4 L 0.123 -5 L 0.125 -6 F 0.138 -7 F 0.147 -8 C 0.143 -9 I 0.130 -10 L 0.119 -11 L 0.128 -12 F 0.163 -13 F 0.219 -14 G 0.279 -15 V 0.327 -16 L 0.368 -17 I 0.421 -18 P 0.494 -19 P 0.574 -20 A 0.633 -21 R 0.660 -22 S 0.664 -23 E 0.654 -24 G 0.627 -25 H 0.581 -26 H 0.521 -27 I 0.457 -28 T 0.396 -29 F 0.342 -30 S 0.287 -31 R 0.221 -32 W 0.156 -33 K 0.108 -34 S 0.078 -35 C 0.063 -36 T 0.062 -37 A 0.073 -38 I 0.087 -39 G 0.092 -40 G 0.086 -41 R 0.077 -42 C 0.071 -43 K 0.068 -44 N 0.070 -45 Q 0.080 -46 C 0.095 -47 D 0.105 -48 D 0.103 -49 S 0.092 -50 E 0.084 -51 F 0.082 -52 R 0.081 -53 I 0.074 -54 S 0.063 -55 Y 0.053 -56 C 0.050 -57 A 0.054 -58 R 0.061 -59 P 0.065 -60 T 0.062 -61 T 0.056 -62 H 0.051 -63 C 0.051 -64 C 0.061 -65 V 0.092 -66 T 0.148 -67 E 0.213 -68 C 0.260 -69 D 0.281 -70 P 0.290 -71 T 0.302 -72 D 0.323 -73 P 0.350 -74 N 0.374 -75 N 0.402 -76 W 0.441 -77 I 0.486 -78 P 0.531 -79 K 0.576 -80 D 0.622 -81 S 0.658 -82 V 0.679 -83 G 0.681 -84 T 0.663 -85 Q 0.620 -86 E 0.557 -87 W 0.497 -88 Y 0.467 -89 P 0.475 -90 K 0.509 -91 D 0.538 -92 S 0.533 -93 R 0.493 -94 H 0.453 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180872.7_ENST00000651554.2_GN:DEFB112_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180872.7_ENST00000651554.2_GN:DEFB112_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid deleted file mode 100644 index 91c114a099ece799c3f28f24d692ad789b937185..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180872.7_ENST00000651554.2_GN:DEFB112_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid +++ /dev/null @@ -1,108 +0,0 @@ ->ENSG00000180872.7|ENST00000651554.2|GN:DEFB112|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:13 -1 M 0.295 -2 I 0.285 -3 C 0.275 -4 T 0.270 -5 L 0.268 -6 F 0.280 -7 Y 0.319 -8 T 0.373 -9 K 0.406 -10 K 0.401 -11 S 0.371 -12 F 0.331 -13 T 0.285 -14 M 0.232 -15 K 0.185 -16 I 0.156 -17 L 0.142 -18 L 0.136 -19 F 0.137 -20 F 0.140 -21 C 0.138 -22 I 0.126 -23 L 0.115 -24 L 0.118 -25 F 0.144 -26 F 0.192 -27 G 0.253 -28 V 0.310 -29 L 0.361 -30 I 0.419 -31 P 0.492 -32 P 0.569 -33 A 0.626 -34 R 0.654 -35 S 0.661 -36 E 0.657 -37 G 0.636 -38 H 0.596 -39 H 0.539 -40 I 0.474 -41 T 0.409 -42 F 0.351 -43 S 0.291 -44 R 0.224 -45 W 0.159 -46 K 0.109 -47 S 0.079 -48 C 0.064 -49 T 0.063 -50 A 0.075 -51 I 0.088 -52 G 0.091 -53 G 0.085 -54 R 0.076 -55 C 0.070 -56 K 0.067 -57 N 0.069 -58 Q 0.078 -59 C 0.091 -60 D 0.101 -61 D 0.100 -62 S 0.090 -63 E 0.082 -64 F 0.079 -65 R 0.077 -66 I 0.071 -67 S 0.060 -68 Y 0.050 -69 C 0.047 -70 A 0.051 -71 R 0.057 -72 P 0.061 -73 T 0.058 -74 T 0.053 -75 H 0.048 -76 C 0.048 -77 C 0.058 -78 V 0.088 -79 T 0.143 -80 E 0.207 -81 C 0.254 -82 D 0.275 -83 P 0.283 -84 T 0.296 -85 D 0.319 -86 P 0.347 -87 N 0.372 -88 N 0.400 -89 W 0.438 -90 I 0.482 -91 P 0.526 -92 K 0.572 -93 D 0.619 -94 S 0.657 -95 V 0.677 -96 G 0.680 -97 T 0.662 -98 Q 0.618 -99 E 0.555 -100 W 0.496 -101 Y 0.466 -102 P 0.476 -103 K 0.510 -104 D 0.539 -105 S 0.535 -106 R 0.495 -107 H 0.455 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180934.7_ENST00000641900.1_GN:OR56A1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180934.7_ENST00000641900.1_GN:OR56A1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 1a552e59d43b4b4ca7061a32a5e6a0a4893c6ef9..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180934.7_ENST00000641900.1_GN:OR56A1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,315 +0,0 @@ ->ENSG00000180934.7|ENST00000641900.1|GN:OR56A1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.381 -2 A 0.408 -3 S 0.453 -4 P 0.501 -5 S 0.535 -6 N 0.551 -7 S 0.553 -8 S 0.538 -9 T 0.495 -10 V 0.425 -11 P 0.342 -12 V 0.263 -13 S 0.199 -14 E 0.151 -15 F 0.120 -16 L 0.101 -17 L 0.095 -18 I 0.106 -19 C 0.133 -20 F 0.164 -21 P 0.180 -22 N 0.172 -23 F 0.149 -24 Q 0.121 -25 S 0.095 -26 W 0.072 -27 Q 0.056 -28 H 0.047 -29 W 0.044 -30 L 0.043 -31 S 0.043 -32 L 0.043 -33 P 0.046 -34 L 0.051 -35 S 0.053 -36 L 0.051 -37 L 0.047 -38 F 0.043 -39 L 0.042 -40 L 0.045 -41 A 0.050 -42 M 0.055 -43 G 0.060 -44 A 0.067 -45 N 0.072 -46 T 0.072 -47 T 0.068 -48 L 0.061 -49 L 0.056 -50 I 0.057 -51 T 0.059 -52 I 0.059 -53 Q 0.058 -54 L 0.060 -55 E 0.063 -56 A 0.066 -57 S 0.065 -58 L 0.062 -59 H 0.056 -60 Q 0.049 -61 P 0.041 -62 L 0.033 -63 Y 0.027 -64 Y 0.024 -65 L 0.024 -66 L 0.027 -67 S 0.033 -68 L 0.038 -69 L 0.041 -70 S 0.042 -71 L 0.043 -72 L 0.047 -73 D 0.052 -74 I 0.054 -75 V 0.050 -76 L 0.043 -77 C 0.038 -78 L 0.037 -79 T 0.039 -80 V 0.042 -81 I 0.043 -82 P 0.040 -83 K 0.036 -84 V 0.032 -85 L 0.029 -86 A 0.026 -87 I 0.025 -88 F 0.029 -89 W 0.038 -90 Y 0.048 -91 D 0.052 -92 L 0.050 -93 R 0.046 -94 S 0.044 -95 I 0.043 -96 S 0.040 -97 F 0.035 -98 P 0.031 -99 A 0.029 -100 C 0.027 -101 F 0.025 -102 L 0.026 -103 Q 0.030 -104 M 0.036 -105 F 0.040 -106 I 0.041 -107 M 0.038 -108 N 0.034 -109 S 0.031 -110 F 0.028 -111 L 0.029 -112 P 0.031 -113 M 0.034 -114 E 0.035 -115 S 0.035 -116 C 0.033 -117 T 0.029 -118 F 0.027 -119 M 0.027 -120 V 0.028 -121 M 0.029 -122 A 0.031 -123 Y 0.034 -124 D 0.037 -125 R 0.038 -126 Y 0.037 -127 V 0.036 -128 A 0.038 -129 I 0.042 -130 C 0.048 -131 H 0.053 -132 P 0.056 -133 L 0.054 -134 R 0.053 -135 Y 0.054 -136 P 0.056 -137 S 0.061 -138 I 0.069 -139 I 0.074 -140 T 0.074 -141 N 0.070 -142 Q 0.064 -143 F 0.052 -144 V 0.041 -145 A 0.039 -146 K 0.046 -147 A 0.061 -148 S 0.073 -149 V 0.076 -150 F 0.069 -151 I 0.059 -152 V 0.054 -153 V 0.054 -154 R 0.057 -155 N 0.058 -156 A 0.056 -157 L 0.058 -158 L 0.066 -159 T 0.076 -160 A 0.082 -161 P 0.086 -162 I 0.086 -163 P 0.083 -164 I 0.081 -165 L 0.083 -166 T 0.085 -167 S 0.089 -168 L 0.096 -169 L 0.101 -170 H 0.102 -171 Y 0.103 -172 C 0.109 -173 G 0.116 -174 E 0.123 -175 N 0.134 -176 V 0.146 -177 I 0.144 -178 E 0.121 -179 N 0.088 -180 C 0.063 -181 I 0.054 -182 C 0.058 -183 A 0.070 -184 N 0.086 -185 L 0.104 -186 S 0.119 -187 V 0.129 -188 S 0.133 -189 R 0.132 -190 L 0.123 -191 S 0.109 -192 C 0.099 -193 D 0.099 -194 N 0.103 -195 F 0.101 -196 T 0.091 -197 L 0.081 -198 N 0.078 -199 R 0.081 -200 I 0.083 -201 Y 0.077 -202 Q 0.066 -203 F 0.058 -204 V 0.054 -205 A 0.050 -206 G 0.044 -207 W 0.039 -208 T 0.039 -209 L 0.044 -210 L 0.051 -211 G 0.057 -212 S 0.061 -213 D 0.061 -214 L 0.057 -215 F 0.056 -216 L 0.059 -217 I 0.060 -218 F 0.053 -219 L 0.042 -220 S 0.035 -221 Y 0.030 -222 T 0.030 -223 F 0.035 -224 I 0.047 -225 L 0.063 -226 R 0.076 -227 A 0.077 -228 V 0.071 -229 L 0.070 -230 R 0.087 -231 F 0.119 -232 K 0.159 -233 A 0.189 -234 E 0.196 -235 G 0.180 -236 A 0.153 -237 A 0.124 -238 V 0.103 -239 K 0.092 -240 A 0.087 -241 L 0.086 -242 S 0.086 -243 T 0.086 -244 C 0.087 -245 G 0.086 -246 S 0.080 -247 H 0.068 -248 F 0.055 -249 I 0.047 -250 L 0.042 -251 I 0.035 -252 L 0.029 -253 F 0.025 -254 F 0.026 -255 S 0.028 -256 T 0.029 -257 I 0.030 -258 L 0.029 -259 L 0.026 -260 V 0.022 -261 V 0.019 -262 V 0.017 -263 L 0.019 -264 T 0.024 -265 N 0.033 -266 V 0.046 -267 A 0.064 -268 R 0.087 -269 K 0.113 -270 K 0.131 -271 V 0.131 -272 P 0.112 -273 M 0.085 -274 D 0.066 -275 I 0.055 -276 L 0.049 -277 I 0.046 -278 L 0.045 -279 L 0.044 -280 N 0.041 -281 V 0.040 -282 L 0.043 -283 H 0.051 -284 H 0.063 -285 L 0.075 -286 I 0.083 -287 P 0.082 -288 P 0.075 -289 A 0.067 -290 L 0.062 -291 N 0.058 -292 P 0.054 -293 I 0.053 -294 V 0.057 -295 Y 0.063 -296 G 0.072 -297 V 0.085 -298 R 0.091 -299 T 0.084 -300 K 0.068 -301 E 0.058 -302 I 0.060 -303 K 0.073 -304 Q 0.087 -305 G 0.095 -306 I 0.098 -307 Q 0.100 -308 K 0.103 -309 L 0.107 -310 L 0.120 -311 Q 0.152 -312 R 0.204 -313 G 0.253 -314 R 0.279 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180934.7_ENST00000641900.1_GN:OR56A1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180934.7_ENST00000641900.1_GN:OR56A1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid deleted file mode 100644 index a06a977e6e8eda1d3ad393b668e06447dc5d62f4..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000180934.7_ENST00000641900.1_GN:OR56A1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid +++ /dev/null @@ -1,330 +0,0 @@ ->ENSG00000180934.7|ENST00000641900.1|GN:OR56A1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:15 -1 M 0.366 -2 R 0.369 -3 R 0.374 -4 N 0.377 -5 H 0.376 -6 Q 0.392 -7 K 0.428 -8 P 0.449 -9 T 0.424 -10 Q 0.380 -11 L 0.360 -12 M 0.371 -13 I 0.395 -14 Q 0.420 -15 P 0.444 -16 M 0.463 -17 A 0.486 -18 S 0.519 -19 P 0.559 -20 S 0.589 -21 N 0.602 -22 S 0.598 -23 S 0.576 -24 T 0.528 -25 V 0.454 -26 P 0.366 -27 V 0.282 -28 S 0.210 -29 E 0.158 -30 F 0.124 -31 L 0.104 -32 L 0.097 -33 I 0.106 -34 C 0.133 -35 F 0.165 -36 P 0.181 -37 N 0.173 -38 F 0.148 -39 Q 0.119 -40 S 0.093 -41 W 0.071 -42 Q 0.055 -43 H 0.047 -44 W 0.043 -45 L 0.043 -46 S 0.043 -47 L 0.043 -48 P 0.046 -49 L 0.051 -50 S 0.054 -51 L 0.052 -52 L 0.048 -53 F 0.045 -54 L 0.043 -55 L 0.046 -56 A 0.052 -57 M 0.057 -58 G 0.062 -59 A 0.069 -60 N 0.074 -61 T 0.074 -62 T 0.070 -63 L 0.063 -64 L 0.057 -65 I 0.057 -66 T 0.059 -67 I 0.058 -68 Q 0.057 -69 L 0.058 -70 E 0.062 -71 A 0.064 -72 S 0.063 -73 L 0.059 -74 H 0.054 -75 Q 0.047 -76 P 0.040 -77 L 0.032 -78 Y 0.026 -79 Y 0.023 -80 L 0.023 -81 L 0.027 -82 S 0.033 -83 L 0.039 -84 L 0.042 -85 S 0.042 -86 L 0.043 -87 L 0.046 -88 D 0.051 -89 I 0.054 -90 V 0.050 -91 L 0.043 -92 C 0.038 -93 L 0.037 -94 T 0.038 -95 V 0.040 -96 I 0.040 -97 P 0.038 -98 K 0.034 -99 V 0.030 -100 L 0.027 -101 A 0.024 -102 I 0.023 -103 F 0.027 -104 W 0.036 -105 Y 0.045 -106 D 0.050 -107 L 0.048 -108 R 0.044 -109 S 0.043 -110 I 0.042 -111 S 0.039 -112 F 0.034 -113 P 0.030 -114 A 0.028 -115 C 0.026 -116 F 0.024 -117 L 0.025 -118 Q 0.029 -119 M 0.034 -120 F 0.038 -121 I 0.039 -122 M 0.037 -123 N 0.033 -124 S 0.030 -125 F 0.028 -126 L 0.029 -127 P 0.031 -128 M 0.033 -129 E 0.035 -130 S 0.035 -131 C 0.033 -132 T 0.029 -133 F 0.027 -134 M 0.027 -135 V 0.028 -136 M 0.030 -137 A 0.032 -138 Y 0.035 -139 D 0.038 -140 R 0.039 -141 Y 0.038 -142 V 0.037 -143 A 0.039 -144 I 0.043 -145 C 0.049 -146 H 0.054 -147 P 0.056 -148 L 0.055 -149 R 0.054 -150 Y 0.055 -151 P 0.057 -152 S 0.062 -153 I 0.070 -154 I 0.073 -155 T 0.065 -156 N 0.052 -157 Q 0.040 -158 F 0.033 -159 V 0.031 -160 A 0.034 -161 K 0.045 -162 A 0.060 -163 S 0.073 -164 V 0.075 -165 F 0.068 -166 I 0.058 -167 V 0.054 -168 V 0.054 -169 R 0.057 -170 N 0.057 -171 A 0.057 -172 L 0.059 -173 L 0.067 -174 T 0.076 -175 A 0.083 -176 P 0.085 -177 I 0.085 -178 P 0.083 -179 I 0.082 -180 L 0.083 -181 T 0.086 -182 S 0.089 -183 L 0.096 -184 L 0.101 -185 H 0.102 -186 Y 0.102 -187 C 0.107 -188 G 0.113 -189 E 0.121 -190 N 0.132 -191 V 0.144 -192 I 0.143 -193 E 0.120 -194 N 0.087 -195 C 0.063 -196 I 0.055 -197 C 0.058 -198 A 0.070 -199 N 0.086 -200 L 0.103 -201 S 0.118 -202 V 0.126 -203 S 0.131 -204 R 0.130 -205 L 0.121 -206 S 0.107 -207 C 0.097 -208 D 0.097 -209 N 0.101 -210 F 0.100 -211 T 0.090 -212 L 0.079 -213 N 0.074 -214 R 0.073 -215 I 0.072 -216 Y 0.068 -217 Q 0.062 -218 F 0.058 -219 V 0.054 -220 A 0.050 -221 G 0.043 -222 W 0.039 -223 T 0.039 -224 L 0.044 -225 L 0.051 -226 G 0.057 -227 S 0.061 -228 D 0.061 -229 L 0.057 -230 F 0.056 -231 L 0.059 -232 I 0.060 -233 F 0.053 -234 L 0.043 -235 S 0.036 -236 Y 0.031 -237 T 0.030 -238 F 0.035 -239 I 0.047 -240 L 0.063 -241 R 0.075 -242 A 0.077 -243 V 0.071 -244 L 0.070 -245 R 0.087 -246 F 0.120 -247 K 0.160 -248 A 0.190 -249 E 0.198 -250 G 0.183 -251 A 0.156 -252 A 0.127 -253 V 0.105 -254 K 0.093 -255 A 0.089 -256 L 0.087 -257 S 0.087 -258 T 0.087 -259 C 0.088 -260 G 0.087 -261 S 0.081 -262 H 0.069 -263 F 0.056 -264 I 0.048 -265 L 0.043 -266 I 0.036 -267 L 0.029 -268 F 0.026 -269 F 0.026 -270 S 0.028 -271 T 0.029 -272 I 0.030 -273 L 0.029 -274 L 0.026 -275 V 0.022 -276 V 0.019 -277 V 0.017 -278 L 0.019 -279 T 0.024 -280 N 0.033 -281 V 0.046 -282 A 0.065 -283 R 0.089 -284 K 0.116 -285 K 0.135 -286 V 0.135 -287 P 0.115 -288 M 0.088 -289 D 0.068 -290 I 0.057 -291 L 0.051 -292 I 0.048 -293 L 0.047 -294 L 0.045 -295 N 0.043 -296 V 0.041 -297 L 0.044 -298 H 0.052 -299 H 0.065 -300 L 0.077 -301 I 0.085 -302 P 0.084 -303 P 0.077 -304 A 0.069 -305 L 0.063 -306 N 0.059 -307 P 0.055 -308 I 0.055 -309 V 0.058 -310 Y 0.064 -311 G 0.074 -312 V 0.087 -313 R 0.094 -314 T 0.086 -315 K 0.070 -316 E 0.059 -317 I 0.061 -318 K 0.073 -319 Q 0.086 -320 G 0.090 -321 I 0.084 -322 Q 0.077 -323 K 0.079 -324 L 0.091 -325 L 0.113 -326 Q 0.151 -327 R 0.204 -328 G 0.254 -329 R 0.281 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181616.10_ENST00000322653.7_GN:OR52H1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181616.10_ENST00000322653.7_GN:OR52H1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index fcdd390fd4bb62188e312aa523928c4c835852ff..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181616.10_ENST00000322653.7_GN:OR52H1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,315 +0,0 @@ ->ENSG00000181616.10|ENST00000322653.7|GN:OR52H1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.259 -2 I 0.278 -3 I 0.311 -4 F 0.345 -5 N 0.372 -6 L 0.386 -7 S 0.388 -8 S 0.376 -9 Y 0.347 -10 N 0.303 -11 P 0.252 -12 G 0.202 -13 P 0.161 -14 F 0.137 -15 I 0.129 -16 L 0.134 -17 V 0.154 -18 G 0.191 -19 I 0.226 -20 P 0.238 -21 G 0.220 -22 L 0.186 -23 E 0.150 -24 Q 0.117 -25 F 0.088 -26 H 0.067 -27 V 0.056 -28 W 0.051 -29 I 0.051 -30 G 0.051 -31 I 0.048 -32 P 0.046 -33 F 0.050 -34 C 0.063 -35 I 0.078 -36 I 0.086 -37 Y 0.088 -38 I 0.083 -39 V 0.073 -40 A 0.060 -41 V 0.051 -42 V 0.049 -43 G 0.052 -44 N 0.056 -45 C 0.058 -46 I 0.057 -47 L 0.051 -48 L 0.045 -49 Y 0.042 -50 L 0.045 -51 I 0.051 -52 V 0.056 -53 V 0.058 -54 E 0.059 -55 H 0.060 -56 S 0.061 -57 L 0.060 -58 H 0.057 -59 E 0.050 -60 P 0.041 -61 M 0.031 -62 F 0.024 -63 F 0.021 -64 F 0.021 -65 L 0.026 -66 S 0.033 -67 M 0.040 -68 L 0.044 -69 A 0.047 -70 M 0.049 -71 T 0.052 -72 D 0.055 -73 L 0.055 -74 I 0.050 -75 L 0.045 -76 S 0.043 -77 T 0.045 -78 A 0.048 -79 G 0.050 -80 V 0.051 -81 P 0.050 -82 K 0.050 -83 A 0.048 -84 L 0.043 -85 S 0.036 -86 I 0.032 -87 F 0.034 -88 W 0.042 -89 L 0.053 -90 G 0.061 -91 A 0.061 -92 R 0.055 -93 E 0.048 -94 I 0.044 -95 T 0.040 -96 F 0.037 -97 P 0.035 -98 G 0.035 -99 C 0.034 -100 L 0.032 -101 T 0.033 -102 Q 0.035 -103 M 0.037 -104 F 0.037 -105 F 0.035 -106 L 0.033 -107 H 0.032 -108 Y 0.032 -109 N 0.031 -110 F 0.032 -111 V 0.036 -112 L 0.041 -113 D 0.044 -114 S 0.045 -115 A 0.043 -116 I 0.041 -117 L 0.038 -118 M 0.035 -119 A 0.033 -120 M 0.033 -121 A 0.035 -122 F 0.038 -123 D 0.041 -124 H 0.041 -125 Y 0.041 -126 V 0.042 -127 A 0.045 -128 I 0.049 -129 C 0.054 -130 S 0.058 -131 P 0.061 -132 L 0.061 -133 R 0.060 -134 Y 0.059 -135 T 0.061 -136 T 0.066 -137 I 0.075 -138 L 0.081 -139 T 0.082 -140 P 0.080 -141 K 0.074 -142 T 0.065 -143 I 0.059 -144 I 0.064 -145 K 0.073 -146 S 0.076 -147 A 0.071 -148 M 0.065 -149 G 0.064 -150 I 0.068 -151 S 0.074 -152 F 0.079 -153 R 0.080 -154 S 0.073 -155 F 0.064 -156 C 0.061 -157 I 0.068 -158 I 0.077 -159 L 0.080 -160 P 0.078 -161 D 0.074 -162 V 0.070 -163 F 0.069 -164 L 0.071 -165 L 0.075 -166 T 0.079 -167 C 0.086 -168 L 0.091 -169 P 0.089 -170 F 0.081 -171 C 0.077 -172 R 0.080 -173 T 0.089 -174 R 0.107 -175 I 0.129 -176 I 0.138 -177 P 0.124 -178 H 0.097 -179 T 0.075 -180 Y 0.061 -181 C 0.057 -182 E 0.063 -183 H 0.079 -184 I 0.100 -185 G 0.117 -186 V 0.125 -187 A 0.129 -188 Q 0.128 -189 L 0.122 -190 A 0.110 -191 C 0.101 -192 A 0.104 -193 D 0.111 -194 I 0.111 -195 S 0.099 -196 I 0.083 -197 N 0.068 -198 F 0.060 -199 W 0.060 -200 Y 0.066 -201 G 0.070 -202 F 0.068 -203 C 0.065 -204 V 0.062 -205 P 0.057 -206 I 0.050 -207 M 0.046 -208 T 0.047 -209 V 0.048 -210 I 0.051 -211 S 0.061 -212 D 0.076 -213 V 0.088 -214 I 0.094 -215 L 0.091 -216 I 0.081 -217 A 0.065 -218 V 0.050 -219 S 0.041 -220 Y 0.038 -221 A 0.041 -222 H 0.047 -223 I 0.048 -224 L 0.047 -225 C 0.051 -226 A 0.063 -227 V 0.078 -228 F 0.096 -229 G 0.118 -230 L 0.136 -231 P 0.144 -232 S 0.137 -233 Q 0.120 -234 D 0.100 -235 A 0.082 -236 C 0.069 -237 Q 0.064 -238 K 0.066 -239 A 0.070 -240 L 0.073 -241 G 0.076 -242 T 0.076 -243 C 0.075 -244 G 0.075 -245 S 0.073 -246 H 0.069 -247 V 0.063 -248 C 0.059 -249 V 0.056 -250 I 0.049 -251 L 0.037 -252 M 0.027 -253 F 0.021 -254 Y 0.022 -255 T 0.024 -256 P 0.025 -257 A 0.023 -258 F 0.020 -259 F 0.019 -260 S 0.018 -261 I 0.019 -262 L 0.022 -263 A 0.029 -264 H 0.041 -265 R 0.060 -266 F 0.084 -267 G 0.112 -268 H 0.135 -269 N 0.145 -270 V 0.135 -271 S 0.109 -272 R 0.081 -273 T 0.061 -274 F 0.051 -275 H 0.050 -276 I 0.050 -277 M 0.050 -278 F 0.050 -279 A 0.048 -280 N 0.049 -281 L 0.055 -282 Y 0.068 -283 I 0.081 -284 V 0.092 -285 I 0.098 -286 P 0.098 -287 P 0.091 -288 A 0.081 -289 L 0.075 -290 N 0.071 -291 P 0.068 -292 M 0.065 -293 V 0.064 -294 Y 0.069 -295 G 0.080 -296 V 0.097 -297 K 0.108 -298 T 0.100 -299 K 0.079 -300 Q 0.062 -301 I 0.058 -302 R 0.065 -303 D 0.073 -304 K 0.074 -305 V 0.071 -306 I 0.072 -307 L 0.081 -308 L 0.102 -309 F 0.144 -310 S 0.212 -311 K 0.295 -312 G 0.365 -313 T 0.393 -314 G 0.392 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181616.10_ENST00000322653.7_GN:OR52H1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181616.10_ENST00000322653.7_GN:OR52H1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid deleted file mode 100644 index 6a781f525b87f3ba81be3a579fe3b3b6a8740658..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181616.10_ENST00000322653.7_GN:OR52H1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid +++ /dev/null @@ -1,321 +0,0 @@ ->ENSG00000181616.10|ENST00000322653.7|GN:OR52H1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:6 -1 M 0.375 -2 P 0.388 -3 S 0.405 -4 A 0.414 -5 S 0.404 -6 A 0.379 -7 M 0.357 -8 I 0.352 -9 I 0.360 -10 F 0.372 -11 N 0.385 -12 L 0.391 -13 S 0.384 -14 S 0.363 -15 Y 0.329 -16 N 0.288 -17 P 0.242 -18 G 0.196 -19 P 0.157 -20 F 0.134 -21 I 0.126 -22 L 0.130 -23 V 0.150 -24 G 0.188 -25 I 0.225 -26 P 0.238 -27 G 0.222 -28 L 0.188 -29 E 0.150 -30 Q 0.116 -31 F 0.087 -32 H 0.067 -33 V 0.055 -34 W 0.050 -35 I 0.050 -36 G 0.050 -37 I 0.048 -38 P 0.046 -39 F 0.051 -40 C 0.063 -41 I 0.078 -42 I 0.086 -43 Y 0.088 -44 I 0.084 -45 V 0.073 -46 A 0.060 -47 V 0.051 -48 V 0.049 -49 G 0.052 -50 N 0.056 -51 C 0.058 -52 I 0.057 -53 L 0.052 -54 L 0.045 -55 Y 0.042 -56 L 0.045 -57 I 0.051 -58 V 0.055 -59 V 0.056 -60 E 0.057 -61 H 0.059 -62 S 0.059 -63 L 0.058 -64 H 0.055 -65 E 0.049 -66 P 0.040 -67 M 0.031 -68 F 0.024 -69 F 0.020 -70 F 0.021 -71 L 0.026 -72 S 0.033 -73 M 0.040 -74 L 0.044 -75 A 0.047 -76 M 0.049 -77 T 0.051 -78 D 0.054 -79 L 0.053 -80 I 0.049 -81 L 0.044 -82 S 0.042 -83 T 0.044 -84 A 0.047 -85 G 0.049 -86 V 0.050 -87 P 0.049 -88 K 0.049 -89 A 0.046 -90 L 0.041 -91 S 0.035 -92 I 0.031 -93 F 0.033 -94 W 0.041 -95 L 0.052 -96 G 0.059 -97 A 0.059 -98 R 0.054 -99 E 0.048 -100 I 0.044 -101 T 0.040 -102 F 0.037 -103 P 0.035 -104 G 0.035 -105 C 0.033 -106 L 0.032 -107 T 0.032 -108 Q 0.034 -109 M 0.036 -110 F 0.036 -111 F 0.034 -112 L 0.032 -113 H 0.032 -114 Y 0.031 -115 N 0.031 -116 F 0.032 -117 V 0.036 -118 L 0.041 -119 D 0.044 -120 S 0.045 -121 A 0.043 -122 I 0.041 -123 L 0.038 -124 M 0.035 -125 A 0.033 -126 M 0.033 -127 A 0.036 -128 F 0.039 -129 D 0.041 -130 H 0.042 -131 Y 0.041 -132 V 0.042 -133 A 0.045 -134 I 0.050 -135 C 0.054 -136 S 0.059 -137 P 0.062 -138 L 0.061 -139 R 0.060 -140 Y 0.060 -141 T 0.061 -142 T 0.066 -143 I 0.075 -144 L 0.082 -145 T 0.083 -146 P 0.080 -147 K 0.075 -148 T 0.066 -149 I 0.060 -150 I 0.064 -151 K 0.073 -152 S 0.076 -153 A 0.071 -154 M 0.065 -155 G 0.063 -156 I 0.068 -157 S 0.074 -158 F 0.079 -159 R 0.079 -160 S 0.073 -161 F 0.064 -162 C 0.062 -163 I 0.068 -164 I 0.077 -165 L 0.080 -166 P 0.079 -167 D 0.075 -168 V 0.070 -169 F 0.069 -170 L 0.071 -171 L 0.075 -172 T 0.079 -173 C 0.086 -174 L 0.092 -175 P 0.089 -176 F 0.082 -177 C 0.078 -178 R 0.080 -179 T 0.089 -180 R 0.107 -181 I 0.128 -182 I 0.136 -183 P 0.122 -184 H 0.096 -185 T 0.074 -186 Y 0.061 -187 C 0.057 -188 E 0.063 -189 H 0.079 -190 I 0.099 -191 G 0.116 -192 V 0.125 -193 A 0.128 -194 Q 0.128 -195 L 0.121 -196 A 0.109 -197 C 0.101 -198 A 0.103 -199 D 0.110 -200 I 0.110 -201 S 0.099 -202 I 0.082 -203 N 0.068 -204 F 0.060 -205 W 0.060 -206 Y 0.066 -207 G 0.070 -208 F 0.069 -209 C 0.065 -210 V 0.062 -211 P 0.057 -212 I 0.050 -213 M 0.046 -214 T 0.047 -215 V 0.048 -216 I 0.051 -217 S 0.061 -218 D 0.076 -219 V 0.089 -220 I 0.094 -221 L 0.091 -222 I 0.081 -223 A 0.066 -224 V 0.051 -225 S 0.041 -226 Y 0.038 -227 A 0.042 -228 H 0.047 -229 I 0.049 -230 L 0.047 -231 C 0.051 -232 A 0.063 -233 V 0.078 -234 F 0.096 -235 G 0.118 -236 L 0.137 -237 P 0.144 -238 S 0.137 -239 Q 0.120 -240 D 0.100 -241 A 0.083 -242 C 0.070 -243 Q 0.065 -244 K 0.066 -245 A 0.071 -246 L 0.074 -247 G 0.077 -248 T 0.077 -249 C 0.077 -250 G 0.076 -251 S 0.074 -252 H 0.069 -253 V 0.063 -254 C 0.059 -255 V 0.056 -256 I 0.049 -257 L 0.037 -258 M 0.027 -259 F 0.022 -260 Y 0.022 -261 T 0.024 -262 P 0.025 -263 A 0.023 -264 F 0.020 -265 F 0.019 -266 S 0.018 -267 I 0.019 -268 L 0.022 -269 A 0.029 -270 H 0.041 -271 R 0.060 -272 F 0.085 -273 G 0.113 -274 H 0.137 -275 N 0.147 -276 V 0.137 -277 S 0.111 -278 R 0.082 -279 T 0.061 -280 F 0.052 -281 H 0.050 -282 I 0.051 -283 M 0.051 -284 F 0.050 -285 A 0.049 -286 N 0.050 -287 L 0.056 -288 Y 0.069 -289 I 0.082 -290 V 0.093 -291 I 0.099 -292 P 0.099 -293 P 0.091 -294 A 0.081 -295 L 0.075 -296 N 0.071 -297 P 0.068 -298 M 0.065 -299 V 0.065 -300 Y 0.069 -301 G 0.080 -302 V 0.097 -303 K 0.108 -304 T 0.100 -305 K 0.079 -306 Q 0.062 -307 I 0.058 -308 R 0.065 -309 D 0.073 -310 K 0.074 -311 V 0.071 -312 I 0.071 -313 L 0.080 -314 L 0.101 -315 F 0.144 -316 S 0.212 -317 K 0.296 -318 G 0.366 -319 T 0.394 -320 G 0.393 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181638.21_ENST00000330701.7_GN:ZFP41_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181638.21_ENST00000330701.7_GN:ZFP41_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 11620c89768903419ea3d8d2d24864d030af371e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181638.21_ENST00000330701.7_GN:ZFP41_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,199 +0,0 @@ ->ENSG00000181638.21|ENST00000330701.7|GN:ZFP41|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.420 -2 E 0.447 -3 K 0.498 -4 P 0.558 -5 A 0.609 -6 G 0.639 -7 R 0.651 -8 K 0.645 -9 K 0.618 -10 K 0.580 -11 T 0.544 -12 P 0.522 -13 T 0.524 -14 P 0.554 -15 R 0.591 -16 E 0.609 -17 E 0.603 -18 A 0.583 -19 D 0.551 -20 V 0.500 -21 Q 0.432 -22 K 0.384 -23 S 0.399 -24 A 0.456 -25 L 0.499 -26 R 0.526 -27 E 0.574 -28 E 0.639 -29 K 0.684 -30 V 0.700 -31 S 0.695 -32 G 0.680 -33 D 0.658 -34 R 0.639 -35 K 0.627 -36 P 0.624 -37 P 0.629 -38 E 0.639 -39 R 0.644 -40 P 0.645 -41 T 0.653 -42 V 0.662 -43 P 0.667 -44 R 0.669 -45 K 0.670 -46 P 0.670 -47 R 0.671 -48 T 0.675 -49 E 0.679 -50 P 0.669 -51 C 0.640 -52 L 0.604 -53 S 0.585 -54 P 0.598 -55 E 0.628 -56 D 0.655 -57 E 0.673 -58 E 0.685 -59 H 0.695 -60 V 0.704 -61 F 0.712 -62 D 0.716 -63 A 0.712 -64 F 0.696 -65 D 0.676 -66 A 0.659 -67 S 0.651 -68 F 0.655 -69 K 0.672 -70 D 0.695 -71 D 0.713 -72 F 0.724 -73 E 0.732 -74 G 0.737 -75 V 0.740 -76 P 0.740 -77 V 0.736 -78 F 0.725 -79 I 0.710 -80 P 0.685 -81 F 0.638 -82 Q 0.564 -83 R 0.466 -84 K 0.354 -85 K 0.246 -86 P 0.160 -87 Y 0.104 -88 E 0.075 -89 C 0.065 -90 S 0.066 -91 E 0.074 -92 C 0.085 -93 G 0.095 -94 R 0.098 -95 I 0.096 -96 F 0.092 -97 K 0.088 -98 H 0.090 -99 K 0.103 -100 T 0.123 -101 D 0.141 -102 H 0.152 -103 I 0.153 -104 R 0.143 -105 H 0.132 -106 Q 0.133 -107 R 0.143 -108 V 0.160 -109 H 0.184 -110 T 0.209 -111 G 0.219 -112 E 0.203 -113 K 0.166 -114 P 0.124 -115 F 0.092 -116 K 0.075 -117 C 0.068 -118 A 0.067 -119 Q 0.070 -120 C 0.075 -121 G 0.080 -122 K 0.087 -123 A 0.095 -124 F 0.105 -125 R 0.110 -126 H 0.110 -127 S 0.106 -128 S 0.102 -129 D 0.099 -130 V 0.104 -131 T 0.117 -132 K 0.132 -133 H 0.144 -134 Q 0.159 -135 R 0.179 -136 T 0.202 -137 H 0.226 -138 T 0.250 -139 G 0.259 -140 E 0.243 -141 K 0.201 -142 P 0.151 -143 F 0.111 -144 K 0.087 -145 C 0.077 -146 G 0.077 -147 E 0.082 -148 C 0.087 -149 G 0.091 -150 K 0.093 -151 A 0.097 -152 F 0.104 -153 N 0.113 -154 C 0.118 -155 G 0.118 -156 S 0.115 -157 N 0.116 -158 L 0.122 -159 L 0.127 -160 K 0.129 -161 H 0.134 -162 Q 0.147 -163 K 0.163 -164 T 0.178 -165 H 0.197 -166 T 0.225 -167 G 0.246 -168 E 0.244 -169 K 0.213 -170 P 0.168 -171 Y 0.129 -172 E 0.101 -173 C 0.081 -174 T 0.071 -175 H 0.071 -176 C 0.076 -177 G 0.082 -178 K 0.083 -179 A 0.083 -180 F 0.080 -181 A 0.077 -182 Y 0.073 -183 S 0.069 -184 S 0.066 -185 C 0.067 -186 L 0.076 -187 I 0.086 -188 R 0.090 -189 H 0.087 -190 Q 0.089 -191 K 0.103 -192 R 0.139 -193 H 0.209 -194 P 0.308 -195 R 0.397 -196 K 0.438 -197 K 0.426 -198 P 0.399 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181638.21_ENST00000330701.7_GN:ZFP41_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181638.21_ENST00000330701.7_GN:ZFP41_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid deleted file mode 100644 index f15ab855acd3435f7d0e46795f8393b4ebe11092..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181638.21_ENST00000330701.7_GN:ZFP41_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid +++ /dev/null @@ -1,200 +0,0 @@ ->ENSG00000181638.21|ENST00000330701.7|GN:ZFP41|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:1 -1 M 0.409 -2 M 0.429 -3 E 0.464 -4 K 0.502 -5 P 0.532 -6 A 0.561 -7 G 0.602 -8 R 0.638 -9 K 0.646 -10 K 0.623 -11 K 0.587 -12 T 0.550 -13 P 0.521 -14 T 0.520 -15 P 0.554 -16 R 0.595 -17 E 0.612 -18 E 0.605 -19 A 0.587 -20 D 0.562 -21 V 0.525 -22 Q 0.479 -23 K 0.442 -24 S 0.443 -25 A 0.475 -26 L 0.501 -27 R 0.522 -28 E 0.569 -29 E 0.634 -30 K 0.682 -31 V 0.700 -32 S 0.696 -33 G 0.681 -34 D 0.659 -35 R 0.640 -36 K 0.628 -37 P 0.625 -38 P 0.631 -39 E 0.640 -40 R 0.644 -41 P 0.646 -42 T 0.653 -43 V 0.663 -44 P 0.668 -45 R 0.670 -46 K 0.672 -47 P 0.671 -48 R 0.672 -49 T 0.677 -50 E 0.680 -51 P 0.671 -52 C 0.642 -53 L 0.606 -54 S 0.587 -55 P 0.599 -56 E 0.630 -57 D 0.656 -58 E 0.674 -59 E 0.686 -60 H 0.696 -61 V 0.705 -62 F 0.713 -63 D 0.717 -64 A 0.712 -65 F 0.696 -66 D 0.676 -67 A 0.659 -68 S 0.651 -69 F 0.655 -70 K 0.672 -71 D 0.694 -72 D 0.712 -73 F 0.724 -74 E 0.732 -75 G 0.738 -76 V 0.741 -77 P 0.741 -78 V 0.736 -79 F 0.726 -80 I 0.711 -81 P 0.685 -82 F 0.638 -83 Q 0.564 -84 R 0.466 -85 K 0.354 -86 K 0.246 -87 P 0.160 -88 Y 0.104 -89 E 0.075 -90 C 0.065 -91 S 0.066 -92 E 0.074 -93 C 0.086 -94 G 0.095 -95 R 0.098 -96 I 0.096 -97 F 0.092 -98 K 0.088 -99 H 0.090 -100 K 0.102 -101 T 0.123 -102 D 0.141 -103 H 0.152 -104 I 0.152 -105 R 0.143 -106 H 0.132 -107 Q 0.132 -108 R 0.142 -109 V 0.159 -110 H 0.183 -111 T 0.207 -112 G 0.217 -113 E 0.203 -114 K 0.166 -115 P 0.124 -116 F 0.092 -117 K 0.076 -118 C 0.069 -119 A 0.067 -120 Q 0.070 -121 C 0.075 -122 G 0.081 -123 K 0.087 -124 A 0.096 -125 F 0.105 -126 R 0.110 -127 H 0.110 -128 S 0.106 -129 S 0.102 -130 D 0.099 -131 V 0.104 -132 T 0.117 -133 K 0.131 -134 H 0.143 -135 Q 0.158 -136 R 0.179 -137 T 0.202 -138 H 0.226 -139 T 0.250 -140 G 0.260 -141 E 0.243 -142 K 0.201 -143 P 0.151 -144 F 0.111 -145 K 0.087 -146 C 0.076 -147 G 0.076 -148 E 0.081 -149 C 0.087 -150 G 0.090 -151 K 0.092 -152 A 0.097 -153 F 0.104 -154 N 0.112 -155 C 0.118 -156 G 0.118 -157 S 0.115 -158 N 0.116 -159 L 0.122 -160 L 0.127 -161 K 0.129 -162 H 0.133 -163 Q 0.147 -164 K 0.163 -165 T 0.177 -166 H 0.197 -167 T 0.224 -168 G 0.246 -169 E 0.243 -170 K 0.212 -171 P 0.167 -172 Y 0.128 -173 E 0.100 -174 C 0.081 -175 T 0.071 -176 H 0.070 -177 C 0.076 -178 G 0.081 -179 K 0.083 -180 A 0.082 -181 F 0.080 -182 A 0.076 -183 Y 0.072 -184 S 0.068 -185 S 0.065 -186 C 0.067 -187 L 0.076 -188 I 0.086 -189 R 0.090 -190 H 0.087 -191 Q 0.088 -192 K 0.103 -193 R 0.139 -194 H 0.209 -195 P 0.307 -196 R 0.397 -197 K 0.438 -198 K 0.426 -199 P 0.400 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181718.7_ENST00000641661.1_GN:OR5T2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181718.7_ENST00000641661.1_GN:OR5T2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index dceaf8f402d5c2cffc546805add81eed5e01c930..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181718.7_ENST00000641661.1_GN:OR5T2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,319 +0,0 @@ ->ENSG00000181718.7|ENST00000641661.1|GN:OR5T2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.418 -2 K 0.425 -3 N 0.436 -4 V 0.436 -5 T 0.403 -6 E 0.335 -7 V 0.250 -8 T 0.177 -9 L 0.133 -10 F 0.118 -11 V 0.118 -12 L 0.120 -13 K 0.123 -14 G 0.128 -15 F 0.139 -16 T 0.156 -17 D 0.169 -18 N 0.161 -19 L 0.131 -20 E 0.095 -21 L 0.070 -22 Q 0.063 -23 T 0.067 -24 I 0.072 -25 F 0.073 -26 F 0.073 -27 F 0.068 -28 L 0.057 -29 F 0.044 -30 L 0.039 -31 A 0.042 -32 I 0.047 -33 Y 0.049 -34 L 0.047 -35 F 0.047 -36 T 0.050 -37 L 0.050 -38 M 0.051 -39 G 0.059 -40 N 0.074 -41 L 0.089 -42 G 0.096 -43 L 0.088 -44 I 0.073 -45 L 0.062 -46 V 0.058 -47 V 0.059 -48 I 0.062 -49 R 0.066 -50 D 0.070 -51 S 0.070 -52 Q 0.068 -53 L 0.063 -54 H 0.056 -55 K 0.047 -56 P 0.038 -57 M 0.031 -58 Y 0.028 -59 Y 0.027 -60 F 0.027 -61 L 0.032 -62 S 0.043 -63 M 0.054 -64 L 0.063 -65 S 0.068 -66 S 0.067 -67 V 0.066 -68 D 0.069 -69 A 0.074 -70 C 0.075 -71 Y 0.070 -72 S 0.066 -73 S 0.066 -74 V 0.073 -75 I 0.081 -76 T 0.086 -77 P 0.083 -78 N 0.077 -79 M 0.071 -80 L 0.065 -81 V 0.060 -82 D 0.057 -83 F 0.060 -84 T 0.070 -85 T 0.085 -86 K 0.095 -87 N 0.090 -88 K 0.075 -89 V 0.059 -90 I 0.047 -91 S 0.039 -92 F 0.034 -93 L 0.033 -94 G 0.034 -95 C 0.034 -96 V 0.033 -97 A 0.032 -98 Q 0.033 -99 V 0.033 -100 F 0.031 -101 L 0.028 -102 A 0.026 -103 C 0.026 -104 S 0.027 -105 F 0.031 -106 G 0.037 -107 T 0.044 -108 T 0.049 -109 E 0.048 -110 C 0.043 -111 F 0.036 -112 L 0.033 -113 L 0.033 -114 A 0.033 -115 A 0.032 -116 M 0.031 -117 A 0.032 -118 Y 0.035 -119 D 0.039 -120 R 0.041 -121 Y 0.041 -122 V 0.042 -123 A 0.045 -124 I 0.051 -125 Y 0.057 -126 N 0.059 -127 P 0.056 -128 L 0.051 -129 L 0.049 -130 Y 0.051 -131 S 0.055 -132 V 0.062 -133 S 0.071 -134 M 0.078 -135 S 0.074 -136 P 0.061 -137 R 0.048 -138 V 0.039 -139 Y 0.035 -140 M 0.035 -141 P 0.041 -142 L 0.053 -143 I 0.068 -144 N 0.080 -145 A 0.083 -146 S 0.084 -147 Y 0.088 -148 V 0.094 -149 A 0.095 -150 G 0.089 -151 I 0.081 -152 L 0.080 -153 H 0.087 -154 A 0.093 -155 T 0.091 -156 I 0.088 -157 H 0.088 -158 T 0.088 -159 V 0.087 -160 A 0.087 -161 T 0.087 -162 F 0.089 -163 S 0.097 -164 L 0.104 -165 S 0.105 -166 F 0.105 -167 C 0.109 -168 G 0.116 -169 A 0.126 -170 N 0.138 -171 E 0.149 -172 I 0.147 -173 R 0.125 -174 R 0.097 -175 V 0.075 -176 F 0.064 -177 C 0.065 -178 D 0.081 -179 I 0.110 -180 P 0.140 -181 P 0.158 -182 L 0.164 -183 L 0.168 -184 A 0.172 -185 I 0.170 -186 S 0.162 -187 Y 0.158 -188 S 0.162 -189 D 0.169 -190 T 0.165 -191 H 0.147 -192 T 0.127 -193 N 0.113 -194 Q 0.106 -195 L 0.104 -196 L 0.104 -197 L 0.100 -198 F 0.090 -199 Y 0.081 -200 F 0.075 -201 V 0.074 -202 G 0.073 -203 S 0.072 -204 I 0.071 -205 E 0.068 -206 L 0.067 -207 V 0.074 -208 T 0.087 -209 I 0.097 -210 L 0.098 -211 I 0.090 -212 V 0.077 -213 L 0.061 -214 I 0.050 -215 S 0.044 -216 Y 0.042 -217 G 0.043 -218 L 0.048 -219 I 0.057 -220 L 0.067 -221 L 0.074 -222 A 0.072 -223 I 0.064 -224 L 0.060 -225 K 0.065 -226 M 0.082 -227 Y 0.103 -228 S 0.119 -229 A 0.121 -230 E 0.111 -231 G 0.096 -232 R 0.082 -233 R 0.073 -234 K 0.068 -235 V 0.065 -236 F 0.065 -237 S 0.067 -238 T 0.069 -239 C 0.071 -240 G 0.074 -241 A 0.077 -242 H 0.075 -243 L 0.071 -244 T 0.072 -245 G 0.074 -246 V 0.067 -247 S 0.051 -248 I 0.037 -249 Y 0.029 -250 Y 0.030 -251 G 0.034 -252 T 0.039 -253 I 0.041 -254 L 0.041 -255 F 0.043 -256 M 0.055 -257 Y 0.077 -258 V 0.113 -259 R 0.161 -260 P 0.212 -261 S 0.253 -262 S 0.274 -263 S 0.276 -264 Y 0.262 -265 A 0.234 -266 S 0.200 -267 D 0.168 -268 H 0.145 -269 D 0.127 -270 M 0.112 -271 I 0.098 -272 V 0.087 -273 S 0.076 -274 I 0.069 -275 F 0.071 -276 Y 0.083 -277 T 0.098 -278 I 0.109 -279 V 0.115 -280 I 0.115 -281 P 0.104 -282 L 0.090 -283 L 0.078 -284 N 0.071 -285 P 0.067 -286 V 0.065 -287 I 0.066 -288 Y 0.068 -289 S 0.074 -290 L 0.087 -291 R 0.100 -292 N 0.099 -293 K 0.086 -294 D 0.074 -295 V 0.072 -296 K 0.078 -297 D 0.086 -298 S 0.088 -299 M 0.087 -300 K 0.087 -301 K 0.096 -302 M 0.123 -303 F 0.173 -304 G 0.240 -305 K 0.304 -306 N 0.348 -307 Q 0.367 -308 V 0.368 -309 I 0.353 -310 N 0.327 -311 K 0.306 -312 V 0.304 -313 Y 0.315 -314 F 0.332 -315 H 0.357 -316 T 0.377 -317 K 0.376 -318 K 0.362 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181718.7_ENST00000641661.1_GN:OR5T2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:41.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181718.7_ENST00000641661.1_GN:OR5T2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:41.caid deleted file mode 100644 index 7adeb6d7095af2b64b8c773e9e77af37b2a31864..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181718.7_ENST00000641661.1_GN:OR5T2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:41.caid +++ /dev/null @@ -1,360 +0,0 @@ ->ENSG00000181718.7|ENST00000641661.1|GN:OR5T2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:41 -1 M 0.258 -2 S 0.253 -3 Y 0.252 -4 S 0.258 -5 I 0.261 -6 Y 0.254 -7 K 0.253 -8 S 0.272 -9 T 0.305 -10 V 0.339 -11 N 0.369 -12 I 0.385 -13 P 0.374 -14 L 0.343 -15 S 0.306 -16 H 0.271 -17 G 0.238 -18 V 0.212 -19 V 0.199 -20 H 0.200 -21 S 0.205 -22 F 0.209 -23 C 0.215 -24 H 0.228 -25 N 0.248 -26 M 0.266 -27 N 0.277 -28 C 0.268 -29 N 0.230 -30 F 0.177 -31 M 0.135 -32 H 0.112 -33 I 0.101 -34 F 0.095 -35 K 0.094 -36 F 0.095 -37 V 0.100 -38 L 0.118 -39 D 0.153 -40 F 0.197 -41 N 0.241 -42 M 0.282 -43 K 0.323 -44 N 0.360 -45 V 0.377 -46 T 0.357 -47 E 0.300 -48 V 0.226 -49 T 0.161 -50 L 0.124 -51 F 0.113 -52 V 0.114 -53 L 0.114 -54 K 0.114 -55 G 0.117 -56 F 0.129 -57 T 0.147 -58 D 0.162 -59 N 0.155 -60 L 0.127 -61 E 0.092 -62 L 0.065 -63 Q 0.051 -64 T 0.043 -65 I 0.040 -66 F 0.040 -67 F 0.041 -68 F 0.038 -69 L 0.034 -70 F 0.032 -71 L 0.033 -72 A 0.038 -73 I 0.043 -74 Y 0.045 -75 L 0.044 -76 F 0.045 -77 T 0.047 -78 L 0.048 -79 M 0.049 -80 G 0.056 -81 N 0.071 -82 L 0.087 -83 G 0.093 -84 L 0.086 -85 I 0.071 -86 L 0.058 -87 V 0.053 -88 V 0.052 -89 I 0.054 -90 R 0.058 -91 D 0.061 -92 S 0.061 -93 Q 0.057 -94 L 0.052 -95 H 0.046 -96 K 0.038 -97 P 0.031 -98 M 0.026 -99 Y 0.024 -100 Y 0.023 -101 F 0.024 -102 L 0.030 -103 S 0.041 -104 M 0.052 -105 L 0.061 -106 S 0.065 -107 S 0.064 -108 V 0.063 -109 D 0.066 -110 A 0.071 -111 C 0.071 -112 Y 0.066 -113 S 0.061 -114 S 0.062 -115 V 0.067 -116 I 0.074 -117 T 0.076 -118 P 0.073 -119 N 0.067 -120 M 0.062 -121 L 0.056 -122 V 0.051 -123 D 0.047 -124 F 0.050 -125 T 0.060 -126 T 0.075 -127 K 0.085 -128 N 0.082 -129 K 0.069 -130 V 0.055 -131 I 0.044 -132 S 0.036 -133 F 0.031 -134 L 0.030 -135 G 0.031 -136 C 0.032 -137 V 0.031 -138 A 0.031 -139 Q 0.031 -140 V 0.031 -141 F 0.029 -142 L 0.027 -143 A 0.025 -144 C 0.025 -145 S 0.027 -146 F 0.030 -147 G 0.036 -148 T 0.043 -149 T 0.047 -150 E 0.046 -151 C 0.041 -152 F 0.035 -153 L 0.032 -154 L 0.032 -155 A 0.032 -156 A 0.031 -157 M 0.030 -158 A 0.031 -159 Y 0.034 -160 D 0.038 -161 R 0.040 -162 Y 0.041 -163 V 0.042 -164 A 0.046 -165 I 0.051 -166 Y 0.057 -167 N 0.059 -168 P 0.056 -169 L 0.051 -170 L 0.048 -171 Y 0.051 -172 S 0.056 -173 V 0.064 -174 S 0.074 -175 M 0.081 -176 S 0.077 -177 P 0.064 -178 R 0.049 -179 V 0.039 -180 Y 0.034 -181 M 0.033 -182 P 0.036 -183 L 0.041 -184 I 0.046 -185 N 0.052 -186 A 0.060 -187 S 0.070 -188 Y 0.081 -189 V 0.089 -190 A 0.092 -191 G 0.087 -192 I 0.079 -193 L 0.078 -194 H 0.086 -195 A 0.092 -196 T 0.090 -197 I 0.086 -198 H 0.086 -199 T 0.085 -200 V 0.083 -201 A 0.083 -202 T 0.084 -203 F 0.087 -204 S 0.095 -205 L 0.101 -206 S 0.101 -207 F 0.098 -208 C 0.100 -209 G 0.107 -210 A 0.117 -211 N 0.131 -212 E 0.142 -213 I 0.139 -214 R 0.118 -215 R 0.092 -216 V 0.072 -217 F 0.063 -218 C 0.065 -219 D 0.080 -220 I 0.106 -221 P 0.134 -222 P 0.150 -223 L 0.157 -224 L 0.161 -225 A 0.164 -226 I 0.162 -227 S 0.153 -228 Y 0.148 -229 S 0.151 -230 D 0.156 -231 T 0.151 -232 H 0.134 -233 T 0.115 -234 N 0.102 -235 Q 0.096 -236 L 0.095 -237 L 0.095 -238 L 0.092 -239 F 0.085 -240 Y 0.076 -241 F 0.071 -242 V 0.070 -243 G 0.070 -244 S 0.069 -245 I 0.069 -246 E 0.067 -247 L 0.066 -248 V 0.070 -249 T 0.074 -250 I 0.072 -251 L 0.067 -252 I 0.065 -253 V 0.064 -254 L 0.057 -255 I 0.048 -256 S 0.043 -257 Y 0.040 -258 G 0.041 -259 L 0.045 -260 I 0.054 -261 L 0.066 -262 L 0.073 -263 A 0.070 -264 I 0.062 -265 L 0.056 -266 K 0.061 -267 M 0.077 -268 Y 0.098 -269 S 0.113 -270 A 0.116 -271 E 0.108 -272 G 0.094 -273 R 0.081 -274 R 0.072 -275 K 0.066 -276 V 0.063 -277 F 0.062 -278 S 0.064 -279 T 0.067 -280 C 0.069 -281 G 0.073 -282 A 0.076 -283 H 0.074 -284 L 0.071 -285 T 0.073 -286 G 0.075 -287 V 0.067 -288 S 0.051 -289 I 0.037 -290 Y 0.029 -291 Y 0.029 -292 G 0.033 -293 T 0.038 -294 I 0.039 -295 L 0.039 -296 F 0.041 -297 M 0.050 -298 Y 0.071 -299 V 0.107 -300 R 0.158 -301 P 0.212 -302 S 0.256 -303 S 0.281 -304 S 0.285 -305 Y 0.273 -306 A 0.245 -307 S 0.209 -308 D 0.176 -309 H 0.152 -310 D 0.134 -311 M 0.118 -312 I 0.104 -313 V 0.093 -314 S 0.081 -315 I 0.074 -316 F 0.077 -317 Y 0.088 -318 T 0.102 -319 I 0.112 -320 V 0.118 -321 I 0.117 -322 P 0.107 -323 L 0.092 -324 L 0.081 -325 N 0.074 -326 P 0.069 -327 V 0.067 -328 I 0.068 -329 Y 0.070 -330 S 0.075 -331 L 0.088 -332 R 0.101 -333 N 0.101 -334 K 0.087 -335 D 0.074 -336 V 0.071 -337 K 0.077 -338 D 0.085 -339 S 0.088 -340 M 0.088 -341 K 0.089 -342 K 0.097 -343 M 0.123 -344 F 0.174 -345 G 0.243 -346 K 0.311 -347 N 0.359 -348 Q 0.383 -349 V 0.389 -350 I 0.376 -351 N 0.347 -352 K 0.323 -353 V 0.319 -354 Y 0.329 -355 F 0.346 -356 H 0.370 -357 T 0.390 -358 K 0.387 -359 K 0.371 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181785.3_ENST00000641320.1_GN:OR5AS1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181785.3_ENST00000641320.1_GN:OR5AS1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 191cc448620e1d7967781f8f68c8b7c6de7a54db..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181785.3_ENST00000641320.1_GN:OR5AS1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,325 +0,0 @@ ->ENSG00000181785.3|ENST00000641320.1|GN:OR5AS1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.417 -2 L 0.429 -3 E 0.443 -4 S 0.450 -5 N 0.444 -6 Y 0.418 -7 T 0.369 -8 M 0.305 -9 P 0.244 -10 T 0.192 -11 E 0.153 -12 F 0.127 -13 L 0.114 -14 F 0.112 -15 V 0.116 -16 G 0.124 -17 F 0.133 -18 T 0.142 -19 D 0.145 -20 Y 0.134 -21 L 0.110 -22 P 0.084 -23 L 0.065 -24 R 0.053 -25 V 0.047 -26 T 0.046 -27 L 0.055 -28 F 0.067 -29 L 0.072 -30 V 0.062 -31 F 0.048 -32 L 0.040 -33 L 0.042 -34 V 0.048 -35 Y 0.051 -36 T 0.052 -37 L 0.053 -38 T 0.057 -39 M 0.058 -40 V 0.060 -41 G 0.065 -42 N 0.071 -43 I 0.073 -44 L 0.071 -45 L 0.064 -46 I 0.056 -47 I 0.051 -48 L 0.052 -49 V 0.057 -50 N 0.065 -51 I 0.074 -52 N 0.080 -53 S 0.080 -54 S 0.076 -55 L 0.071 -56 Q 0.065 -57 I 0.054 -58 P 0.042 -59 M 0.032 -60 Y 0.026 -61 Y 0.024 -62 F 0.027 -63 L 0.035 -64 S 0.047 -65 N 0.056 -66 L 0.061 -67 S 0.061 -68 F 0.060 -69 L 0.062 -70 D 0.069 -71 I 0.075 -72 S 0.074 -73 C 0.068 -74 S 0.064 -75 T 0.066 -76 A 0.069 -77 I 0.070 -78 T 0.068 -79 P 0.066 -80 K 0.064 -81 M 0.063 -82 L 0.061 -83 A 0.057 -84 N 0.056 -85 F 0.062 -86 L 0.075 -87 A 0.089 -88 S 0.096 -89 R 0.091 -90 K 0.081 -91 S 0.071 -92 I 0.064 -93 S 0.059 -94 P 0.055 -95 Y 0.051 -96 G 0.047 -97 C 0.043 -98 A 0.039 -99 L 0.036 -100 Q 0.037 -101 M 0.037 -102 F 0.034 -103 F 0.030 -104 F 0.028 -105 A 0.029 -106 S 0.032 -107 F 0.037 -108 A 0.045 -109 D 0.054 -110 A 0.059 -111 E 0.059 -112 C 0.054 -113 L 0.049 -114 I 0.044 -115 L 0.041 -116 A 0.038 -117 A 0.034 -118 M 0.033 -119 A 0.034 -120 Y 0.038 -121 D 0.043 -122 R 0.047 -123 Y 0.048 -124 A 0.048 -125 A 0.049 -126 I 0.052 -127 C 0.058 -128 N 0.064 -129 P 0.064 -130 L 0.059 -131 L 0.055 -132 Y 0.053 -133 T 0.054 -134 T 0.060 -135 L 0.067 -136 M 0.073 -137 S 0.075 -138 R 0.074 -139 R 0.069 -140 V 0.061 -141 C 0.055 -142 V 0.057 -143 C 0.065 -144 F 0.070 -145 I 0.073 -146 V 0.074 -147 L 0.068 -148 A 0.061 -149 Y 0.058 -150 F 0.064 -151 S 0.077 -152 G 0.086 -153 S 0.086 -154 T 0.081 -155 T 0.079 -156 S 0.079 -157 L 0.078 -158 V 0.076 -159 H 0.075 -160 V 0.070 -161 C 0.066 -162 L 0.068 -163 T 0.073 -164 F 0.080 -165 R 0.091 -166 L 0.099 -167 S 0.101 -168 F 0.101 -169 C 0.108 -170 G 0.117 -171 S 0.127 -172 N 0.135 -173 I 0.141 -174 V 0.136 -175 N 0.116 -176 H 0.092 -177 F 0.074 -178 F 0.065 -179 C 0.066 -180 D 0.080 -181 I 0.105 -182 P 0.129 -183 P 0.142 -184 L 0.145 -185 L 0.147 -186 A 0.147 -187 L 0.138 -188 S 0.122 -189 C 0.112 -190 T 0.117 -191 D 0.131 -192 T 0.137 -193 Q 0.131 -194 I 0.118 -195 N 0.106 -196 Q 0.098 -197 L 0.096 -198 L 0.098 -199 L 0.099 -200 F 0.095 -201 A 0.089 -202 L 0.085 -203 C 0.082 -204 S 0.076 -205 F 0.068 -206 I 0.065 -207 Q 0.067 -208 T 0.072 -209 S 0.082 -210 T 0.087 -211 F 0.083 -212 V 0.077 -213 V 0.075 -214 I 0.073 -215 F 0.065 -216 I 0.056 -217 S 0.049 -218 Y 0.046 -219 F 0.046 -220 C 0.049 -221 I 0.053 -222 L 0.057 -223 I 0.060 -224 T 0.062 -225 V 0.065 -226 L 0.076 -227 S 0.100 -228 I 0.133 -229 K 0.168 -230 S 0.195 -231 S 0.208 -232 G 0.201 -233 G 0.175 -234 R 0.141 -235 S 0.116 -236 K 0.103 -237 T 0.094 -238 F 0.086 -239 S 0.080 -240 T 0.076 -241 C 0.072 -242 A 0.071 -243 S 0.071 -244 H 0.069 -245 L 0.064 -246 I 0.063 -247 A 0.063 -248 V 0.056 -249 T 0.044 -250 L 0.032 -251 F 0.027 -252 Y 0.029 -253 G 0.035 -254 A 0.041 -255 L 0.043 -256 L 0.042 -257 F 0.044 -258 M 0.053 -259 Y 0.073 -260 L 0.106 -261 Q 0.148 -262 P 0.190 -263 T 0.223 -264 T 0.239 -265 S 0.240 -266 Y 0.226 -267 S 0.204 -268 L 0.176 -269 D 0.147 -270 T 0.125 -271 D 0.114 -272 K 0.109 -273 V 0.105 -274 V 0.098 -275 A 0.085 -276 V 0.074 -277 F 0.073 -278 Y 0.084 -279 T 0.098 -280 V 0.106 -281 V 0.108 -282 F 0.106 -283 P 0.100 -284 M 0.091 -285 F 0.085 -286 N 0.080 -287 P 0.075 -288 I 0.073 -289 I 0.073 -290 Y 0.072 -291 S 0.076 -292 F 0.087 -293 R 0.097 -294 N 0.093 -295 K 0.077 -296 D 0.063 -297 V 0.061 -298 K 0.068 -299 N 0.077 -300 A 0.080 -301 L 0.081 -302 K 0.086 -303 K 0.090 -304 L 0.091 -305 L 0.093 -306 E 0.102 -307 R 0.122 -308 I 0.153 -309 G 0.190 -310 Y 0.222 -311 S 0.242 -312 N 0.244 -313 E 0.225 -314 W 0.199 -315 Y 0.181 -316 L 0.180 -317 N 0.196 -318 R 0.224 -319 L 0.256 -320 R 0.289 -321 I 0.315 -322 V 0.323 -323 N 0.312 -324 I 0.296 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181785.3_ENST00000641320.1_GN:OR5AS1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181785.3_ENST00000641320.1_GN:OR5AS1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid deleted file mode 100644 index 7bc96e96b643de29ecc9244f336f36c1eba9f71f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181785.3_ENST00000641320.1_GN:OR5AS1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid +++ /dev/null @@ -1,338 +0,0 @@ ->ENSG00000181785.3|ENST00000641320.1|GN:OR5AS1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:13 -1 M 0.320 -2 V 0.337 -3 L 0.363 -4 R 0.384 -5 S 0.394 -6 S 0.409 -7 G 0.436 -8 K 0.449 -9 N 0.428 -10 K 0.399 -11 K 0.387 -12 T 0.388 -13 K 0.401 -14 M 0.438 -15 L 0.483 -16 E 0.504 -17 S 0.492 -18 N 0.463 -19 Y 0.425 -20 T 0.374 -21 M 0.314 -22 P 0.255 -23 T 0.202 -24 E 0.159 -25 F 0.129 -26 L 0.114 -27 F 0.111 -28 V 0.115 -29 G 0.124 -30 F 0.134 -31 T 0.145 -32 D 0.150 -33 Y 0.139 -34 L 0.114 -35 P 0.086 -36 L 0.065 -37 R 0.053 -38 V 0.046 -39 T 0.045 -40 L 0.052 -41 F 0.062 -42 L 0.065 -43 V 0.057 -44 F 0.045 -45 L 0.039 -46 L 0.042 -47 V 0.048 -48 Y 0.052 -49 T 0.052 -50 L 0.054 -51 T 0.057 -52 M 0.059 -53 V 0.061 -54 G 0.066 -55 N 0.071 -56 I 0.074 -57 L 0.072 -58 L 0.066 -59 I 0.058 -60 I 0.053 -61 L 0.053 -62 V 0.058 -63 N 0.066 -64 I 0.075 -65 N 0.080 -66 S 0.080 -67 S 0.076 -68 L 0.071 -69 Q 0.064 -70 I 0.054 -71 P 0.042 -72 M 0.031 -73 Y 0.025 -74 Y 0.023 -75 F 0.026 -76 L 0.035 -77 S 0.048 -78 N 0.057 -79 L 0.062 -80 S 0.062 -81 F 0.060 -82 L 0.061 -83 D 0.068 -84 I 0.073 -85 S 0.073 -86 C 0.068 -87 S 0.065 -88 T 0.066 -89 A 0.069 -90 I 0.068 -91 T 0.066 -92 P 0.063 -93 K 0.062 -94 M 0.060 -95 L 0.058 -96 A 0.054 -97 N 0.053 -98 F 0.058 -99 L 0.070 -100 A 0.084 -101 S 0.091 -102 R 0.088 -103 K 0.079 -104 S 0.070 -105 I 0.063 -106 S 0.058 -107 P 0.054 -108 Y 0.050 -109 G 0.047 -110 C 0.043 -111 A 0.038 -112 L 0.035 -113 Q 0.036 -114 M 0.036 -115 F 0.034 -116 F 0.030 -117 F 0.028 -118 A 0.029 -119 S 0.032 -120 F 0.037 -121 A 0.045 -122 D 0.053 -123 A 0.058 -124 E 0.058 -125 C 0.054 -126 L 0.049 -127 I 0.044 -128 L 0.041 -129 A 0.038 -130 A 0.034 -131 M 0.033 -132 A 0.034 -133 Y 0.038 -134 D 0.043 -135 R 0.047 -136 Y 0.049 -137 A 0.049 -138 A 0.050 -139 I 0.053 -140 C 0.059 -141 N 0.065 -142 P 0.065 -143 L 0.061 -144 L 0.056 -145 Y 0.054 -146 T 0.056 -147 T 0.061 -148 L 0.070 -149 M 0.076 -150 S 0.076 -151 R 0.074 -152 R 0.069 -153 V 0.060 -154 C 0.054 -155 V 0.057 -156 C 0.064 -157 F 0.069 -158 I 0.071 -159 V 0.071 -160 L 0.067 -161 A 0.060 -162 Y 0.058 -163 F 0.065 -164 S 0.078 -165 G 0.088 -166 S 0.088 -167 T 0.082 -168 T 0.080 -169 S 0.080 -170 L 0.078 -171 V 0.076 -172 H 0.075 -173 V 0.070 -174 C 0.066 -175 L 0.067 -176 T 0.072 -177 F 0.081 -178 R 0.092 -179 L 0.101 -180 S 0.102 -181 F 0.102 -182 C 0.108 -183 G 0.118 -184 S 0.128 -185 N 0.137 -186 I 0.144 -187 V 0.138 -188 N 0.118 -189 H 0.093 -190 F 0.075 -191 F 0.066 -192 C 0.067 -193 D 0.081 -194 I 0.105 -195 P 0.129 -196 P 0.142 -197 L 0.145 -198 L 0.147 -199 A 0.147 -200 L 0.138 -201 S 0.122 -202 C 0.111 -203 T 0.116 -204 D 0.129 -205 T 0.135 -206 Q 0.129 -207 I 0.117 -208 N 0.106 -209 Q 0.098 -210 L 0.096 -211 L 0.098 -212 L 0.099 -213 F 0.095 -214 A 0.090 -215 L 0.086 -216 C 0.083 -217 S 0.077 -218 F 0.069 -219 I 0.066 -220 Q 0.068 -221 T 0.074 -222 S 0.083 -223 T 0.088 -224 F 0.084 -225 V 0.077 -226 V 0.075 -227 I 0.074 -228 F 0.066 -229 I 0.057 -230 S 0.050 -231 Y 0.047 -232 F 0.046 -233 C 0.047 -234 I 0.046 -235 L 0.043 -236 I 0.043 -237 T 0.048 -238 V 0.058 -239 L 0.074 -240 S 0.100 -241 I 0.133 -242 K 0.169 -243 S 0.196 -244 S 0.209 -245 G 0.203 -246 G 0.177 -247 R 0.143 -248 S 0.118 -249 K 0.104 -250 T 0.095 -251 F 0.087 -252 S 0.081 -253 T 0.077 -254 C 0.073 -255 A 0.072 -256 S 0.073 -257 H 0.070 -258 L 0.065 -259 I 0.064 -260 A 0.064 -261 V 0.057 -262 T 0.044 -263 L 0.033 -264 F 0.028 -265 Y 0.029 -266 G 0.035 -267 A 0.041 -268 L 0.043 -269 L 0.042 -270 F 0.043 -271 M 0.053 -272 Y 0.073 -273 L 0.106 -274 Q 0.149 -275 P 0.192 -276 T 0.225 -277 T 0.243 -278 S 0.244 -279 Y 0.231 -280 S 0.209 -281 L 0.181 -282 D 0.152 -283 T 0.129 -284 D 0.117 -285 K 0.112 -286 V 0.108 -287 V 0.101 -288 A 0.087 -289 V 0.076 -290 F 0.075 -291 Y 0.086 -292 T 0.100 -293 V 0.108 -294 V 0.110 -295 F 0.108 -296 P 0.101 -297 M 0.093 -298 F 0.086 -299 N 0.081 -300 P 0.076 -301 I 0.073 -302 I 0.074 -303 Y 0.074 -304 S 0.077 -305 F 0.089 -306 R 0.099 -307 N 0.095 -308 K 0.078 -309 D 0.064 -310 V 0.061 -311 K 0.068 -312 N 0.077 -313 A 0.080 -314 L 0.082 -315 K 0.086 -316 K 0.091 -317 L 0.092 -318 L 0.094 -319 E 0.103 -320 R 0.123 -321 I 0.155 -322 G 0.193 -323 Y 0.226 -324 S 0.247 -325 N 0.248 -326 E 0.229 -327 W 0.203 -328 Y 0.184 -329 L 0.182 -330 N 0.197 -331 R 0.225 -332 L 0.258 -333 R 0.292 -334 I 0.320 -335 V 0.329 -336 N 0.317 -337 I 0.300 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181982.21_ENST00000635206.3_GN:CCDC149_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181982.21_ENST00000635206.3_GN:CCDC149_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index c63282e57945010b936125cf04aabad37d03ccfa..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181982.21_ENST00000635206.3_GN:CCDC149_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,536 +0,0 @@ ->ENSG00000181982.21|ENST00000635206.3|GN:CCDC149|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.430 -2 N 0.464 -3 G 0.505 -4 D 0.517 -5 R 0.488 -6 T 0.443 -7 E 0.410 -8 S 0.385 -9 D 0.348 -10 W 0.300 -11 Q 0.257 -12 G 0.224 -13 L 0.194 -14 V 0.171 -15 S 0.158 -16 E 0.144 -17 Y 0.121 -18 L 0.103 -19 V 0.101 -20 C 0.112 -21 K 0.129 -22 R 0.144 -23 K 0.157 -24 L 0.177 -25 E 0.205 -26 S 0.228 -27 K 0.247 -28 K 0.275 -29 E 0.305 -30 A 0.308 -31 L 0.280 -32 L 0.249 -33 I 0.232 -34 L 0.226 -35 S 0.227 -36 K 0.231 -37 E 0.234 -38 L 0.237 -39 D 0.243 -40 T 0.243 -41 C 0.241 -42 Q 0.254 -43 Q 0.277 -44 E 0.280 -45 R 0.259 -46 D 0.239 -47 Q 0.225 -48 Y 0.212 -49 K 0.206 -50 L 0.206 -51 M 0.205 -52 A 0.206 -53 N 0.215 -54 Q 0.222 -55 L 0.224 -56 R 0.230 -57 E 0.238 -58 R 0.236 -59 H 0.223 -60 Q 0.215 -61 S 0.215 -62 L 0.216 -63 K 0.218 -64 K 0.222 -65 K 0.218 -66 Y 0.208 -67 R 0.205 -68 E 0.221 -69 L 0.253 -70 I 0.295 -71 D 0.341 -72 G 0.386 -73 D 0.415 -74 P 0.422 -75 S 0.415 -76 L 0.406 -77 P 0.399 -78 P 0.391 -79 E 0.385 -80 K 0.389 -81 R 0.414 -82 K 0.452 -83 Q 0.482 -84 A 0.485 -85 N 0.453 -86 L 0.398 -87 A 0.350 -88 Q 0.324 -89 L 0.302 -90 L 0.285 -91 R 0.286 -92 D 0.302 -93 S 0.322 -94 Q 0.353 -95 D 0.388 -96 R 0.401 -97 N 0.390 -98 K 0.381 -99 H 0.383 -100 L 0.393 -101 G 0.409 -102 E 0.410 -103 E 0.380 -104 I 0.331 -105 K 0.288 -106 E 0.259 -107 L 0.246 -108 Q 0.251 -109 Q 0.270 -110 R 0.294 -111 L 0.323 -112 G 0.350 -113 E 0.358 -114 V 0.350 -115 Q 0.352 -116 G 0.362 -117 D 0.350 -118 N 0.309 -119 K 0.262 -120 L 0.228 -121 L 0.210 -122 R 0.204 -123 M 0.204 -124 T 0.206 -125 I 0.212 -126 A 0.224 -127 K 0.241 -128 Q 0.272 -129 R 0.327 -130 L 0.396 -131 G 0.461 -132 D 0.513 -133 E 0.547 -134 A 0.566 -135 I 0.585 -136 G 0.607 -137 V 0.616 -138 R 0.600 -139 H 0.564 -140 F 0.512 -141 A 0.453 -142 A 0.416 -143 H 0.412 -144 E 0.417 -145 R 0.413 -146 E 0.405 -147 D 0.389 -148 L 0.360 -149 V 0.326 -150 Q 0.300 -151 Q 0.283 -152 L 0.268 -153 E 0.256 -154 R 0.250 -155 A 0.248 -156 K 0.247 -157 E 0.249 -158 Q 0.256 -159 I 0.269 -160 E 0.290 -161 S 0.319 -162 L 0.362 -163 E 0.411 -164 H 0.441 -165 D 0.441 -166 L 0.434 -167 Q 0.433 -168 A 0.419 -169 S 0.393 -170 V 0.388 -171 D 0.395 -172 E 0.378 -173 L 0.342 -174 Q 0.320 -175 D 0.307 -176 V 0.289 -177 K 0.284 -178 E 0.299 -179 E 0.310 -180 R 0.304 -181 S 0.288 -182 S 0.271 -183 Y 0.263 -184 Q 0.274 -185 D 0.289 -186 K 0.288 -187 V 0.276 -188 E 0.265 -189 R 0.259 -190 L 0.255 -191 N 0.258 -192 Q 0.267 -193 E 0.270 -194 L 0.267 -195 N 0.267 -196 H 0.276 -197 I 0.293 -198 L 0.319 -199 S 0.352 -200 G 0.385 -201 H 0.414 -202 E 0.439 -203 N 0.463 -204 R 0.485 -205 I 0.498 -206 I 0.480 -207 D 0.427 -208 V 0.368 -209 D 0.324 -210 A 0.293 -211 L 0.274 -212 C 0.282 -213 M 0.308 -214 E 0.317 -215 N 0.287 -216 R 0.241 -217 Y 0.209 -218 L 0.199 -219 Q 0.202 -220 E 0.203 -221 R 0.197 -222 L 0.188 -223 K 0.182 -224 Q 0.180 -225 L 0.183 -226 H 0.196 -227 E 0.213 -228 E 0.218 -229 V 0.213 -230 N 0.209 -231 L 0.208 -232 L 0.213 -233 K 0.224 -234 S 0.238 -235 N 0.241 -236 I 0.233 -237 A 0.217 -238 K 0.198 -239 Y 0.185 -240 K 0.184 -241 N 0.192 -242 A 0.205 -243 L 0.219 -244 E 0.238 -245 R 0.264 -246 R 0.304 -247 K 0.363 -248 N 0.429 -249 S 0.490 -250 K 0.543 -251 G 0.592 -252 Q 0.635 -253 G 0.666 -254 K 0.684 -255 S 0.694 -256 S 0.701 -257 S 0.703 -258 S 0.700 -259 A 0.696 -260 L 0.696 -261 T 0.698 -262 G 0.689 -263 V 0.652 -264 L 0.582 -265 S 0.504 -266 A 0.452 -267 K 0.439 -268 Q 0.454 -269 V 0.488 -270 Q 0.536 -271 D 0.583 -272 L 0.617 -273 L 0.643 -274 S 0.663 -275 E 0.679 -276 D 0.690 -277 H 0.696 -278 G 0.693 -279 C 0.684 -280 S 0.677 -281 L 0.675 -282 P 0.667 -283 A 0.644 -284 T 0.601 -285 P 0.543 -286 Q 0.476 -287 S 0.417 -288 I 0.385 -289 S 0.378 -290 D 0.375 -291 L 0.361 -292 K 0.344 -293 S 0.329 -294 L 0.315 -295 A 0.300 -296 T 0.281 -297 A 0.257 -298 L 0.236 -299 L 0.223 -300 E 0.210 -301 T 0.187 -302 I 0.166 -303 H 0.157 -304 E 0.158 -305 K 0.162 -306 N 0.170 -307 M 0.181 -308 V 0.187 -309 I 0.188 -310 Q 0.190 -311 H 0.198 -312 Q 0.216 -313 R 0.250 -314 Q 0.291 -315 T 0.319 -316 N 0.326 -317 K 0.319 -318 I 0.308 -319 L 0.308 -320 G 0.326 -321 N 0.343 -322 R 0.333 -323 V 0.296 -324 A 0.254 -325 E 0.225 -326 L 0.212 -327 E 0.210 -328 K 0.211 -329 K 0.215 -330 L 0.227 -331 R 0.252 -332 T 0.293 -333 L 0.346 -334 E 0.404 -335 V 0.463 -336 S 0.525 -337 G 0.586 -338 L 0.633 -339 W 0.659 -340 S 0.673 -341 L 0.688 -342 P 0.713 -343 G 0.740 -344 L 0.762 -345 S 0.779 -346 Y 0.796 -347 N 0.812 -348 V 0.823 -349 S 0.827 -350 V 0.825 -351 G 0.821 -352 F 0.819 -353 G 0.821 -354 R 0.827 -355 G 0.835 -356 K 0.842 -357 D 0.846 -358 T 0.848 -359 I 0.849 -360 L 0.846 -361 F 0.836 -362 S 0.820 -363 D 0.804 -364 P 0.792 -365 T 0.786 -366 L 0.793 -367 P 0.811 -368 S 0.833 -369 G 0.848 -370 Q 0.850 -371 R 0.839 -372 S 0.824 -373 R 0.815 -374 S 0.818 -375 P 0.831 -376 L 0.844 -377 L 0.851 -378 K 0.852 -379 F 0.847 -380 V 0.835 -381 E 0.821 -382 Q 0.813 -383 P 0.816 -384 T 0.825 -385 E 0.833 -386 N 0.832 -387 K 0.822 -388 A 0.809 -389 D 0.801 -390 P 0.803 -391 K 0.809 -392 D 0.814 -393 G 0.811 -394 E 0.788 -395 A 0.735 -396 Q 0.665 -397 K 0.631 -398 Q 0.666 -399 E 0.731 -400 E 0.778 -401 D 0.799 -402 E 0.805 -403 S 0.807 -404 C 0.811 -405 A 0.817 -406 A 0.821 -407 A 0.822 -408 E 0.820 -409 A 0.815 -410 L 0.806 -411 T 0.795 -412 A 0.790 -413 P 0.797 -414 E 0.812 -415 D 0.823 -416 A 0.822 -417 G 0.813 -418 R 0.806 -419 P 0.809 -420 A 0.814 -421 V 0.810 -422 N 0.797 -423 S 0.785 -424 P 0.773 -425 A 0.740 -426 N 0.683 -427 Q 0.650 -428 S 0.681 -429 R 0.747 -430 G 0.796 -431 N 0.813 -432 Q 0.808 -433 C 0.797 -434 K 0.785 -435 L 0.767 -436 F 0.744 -437 H 0.730 -438 P 0.731 -439 S 0.742 -440 L 0.750 -441 P 0.754 -442 Q 0.755 -443 L 0.749 -444 P 0.721 -445 S 0.667 -446 E 0.603 -447 E 0.558 -448 E 0.535 -449 V 0.516 -450 N 0.501 -451 S 0.494 -452 L 0.485 -453 G 0.467 -454 R 0.452 -455 E 0.435 -456 I 0.400 -457 I 0.363 -458 K 0.361 -459 L 0.393 -460 T 0.416 -461 K 0.414 -462 E 0.411 -463 Q 0.427 -464 A 0.469 -465 A 0.531 -466 A 0.584 -467 E 0.606 -468 L 0.602 -469 E 0.590 -470 E 0.580 -471 V 0.569 -472 R 0.556 -473 R 0.552 -474 E 0.567 -475 S 0.602 -476 P 0.655 -477 I 0.715 -478 E 0.767 -479 G 0.796 -480 Q 0.806 -481 R 0.806 -482 S 0.802 -483 E 0.793 -484 T 0.780 -485 G 0.766 -486 P 0.755 -487 A 0.756 -488 P 0.773 -489 P 0.802 -490 G 0.830 -491 L 0.847 -492 A 0.852 -493 I 0.850 -494 Q 0.845 -495 G 0.834 -496 E 0.820 -497 L 0.809 -498 P 0.807 -499 K 0.811 -500 S 0.814 -501 H 0.814 -502 L 0.815 -503 D 0.817 -504 S 0.814 -505 F 0.807 -506 E 0.796 -507 A 0.779 -508 S 0.764 -509 R 0.761 -510 P 0.777 -511 A 0.803 -512 A 0.822 -513 K 0.825 -514 A 0.815 -515 S 0.801 -516 T 0.794 -517 P 0.800 -518 E 0.813 -519 D 0.822 -520 G 0.822 -521 K 0.812 -522 G 0.800 -523 I 0.792 -524 P 0.793 -525 E 0.799 -526 G 0.805 -527 G 0.810 -528 G 0.814 -529 M 0.818 -530 R 0.819 -531 S 0.814 -532 T 0.797 -533 V 0.761 -534 K 0.712 -535 T 0.673 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181982.21_ENST00000635206.3_GN:CCDC149_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181982.21_ENST00000635206.3_GN:CCDC149_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid deleted file mode 100644 index 83f497f009cba643020ca6f92142547048807bd8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000181982.21_ENST00000635206.3_GN:CCDC149_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid +++ /dev/null @@ -1,541 +0,0 @@ ->ENSG00000181982.21|ENST00000635206.3|GN:CCDC149|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:5 -1 M 0.451 -2 E 0.489 -3 E 0.538 -4 E 0.575 -5 A 0.591 -6 M 0.594 -7 N 0.598 -8 G 0.601 -9 D 0.582 -10 R 0.538 -11 T 0.497 -12 E 0.474 -13 S 0.447 -14 D 0.396 -15 W 0.333 -16 Q 0.282 -17 G 0.243 -18 L 0.207 -19 V 0.180 -20 S 0.163 -21 E 0.146 -22 Y 0.124 -23 L 0.107 -24 V 0.105 -25 C 0.115 -26 K 0.130 -27 R 0.144 -28 K 0.157 -29 L 0.178 -30 E 0.207 -31 S 0.232 -32 K 0.253 -33 K 0.285 -34 E 0.318 -35 A 0.321 -36 L 0.293 -37 L 0.261 -38 I 0.242 -39 L 0.234 -40 S 0.234 -41 K 0.237 -42 E 0.241 -43 L 0.247 -44 D 0.256 -45 T 0.257 -46 C 0.254 -47 Q 0.268 -48 Q 0.292 -49 E 0.295 -50 R 0.271 -51 D 0.246 -52 Q 0.230 -53 Y 0.216 -54 K 0.208 -55 L 0.207 -56 M 0.205 -57 A 0.205 -58 N 0.213 -59 Q 0.218 -60 L 0.216 -61 R 0.217 -62 E 0.223 -63 R 0.222 -64 H 0.212 -65 Q 0.207 -66 S 0.208 -67 L 0.210 -68 K 0.212 -69 K 0.215 -70 K 0.211 -71 Y 0.202 -72 R 0.200 -73 E 0.216 -74 L 0.248 -75 I 0.289 -76 D 0.335 -77 G 0.380 -78 D 0.410 -79 P 0.417 -80 S 0.410 -81 L 0.401 -82 P 0.393 -83 P 0.383 -84 E 0.375 -85 K 0.379 -86 R 0.403 -87 K 0.440 -88 Q 0.468 -89 A 0.472 -90 N 0.441 -91 L 0.387 -92 A 0.341 -93 Q 0.317 -94 L 0.296 -95 L 0.276 -96 R 0.276 -97 D 0.291 -98 S 0.311 -99 Q 0.339 -100 D 0.371 -101 R 0.382 -102 N 0.372 -103 K 0.363 -104 H 0.366 -105 L 0.377 -106 G 0.393 -107 E 0.393 -108 E 0.365 -109 I 0.320 -110 K 0.281 -111 E 0.254 -112 L 0.243 -113 Q 0.249 -114 Q 0.266 -115 R 0.288 -116 L 0.316 -117 G 0.344 -118 E 0.354 -119 V 0.347 -120 Q 0.349 -121 G 0.359 -122 D 0.347 -123 N 0.307 -124 K 0.260 -125 L 0.227 -126 L 0.209 -127 R 0.203 -128 M 0.203 -129 T 0.205 -130 I 0.212 -131 A 0.224 -132 K 0.242 -133 Q 0.276 -134 R 0.333 -135 L 0.404 -136 G 0.472 -137 D 0.524 -138 E 0.557 -139 A 0.576 -140 I 0.594 -141 G 0.614 -142 V 0.622 -143 R 0.606 -144 H 0.570 -145 F 0.516 -146 A 0.455 -147 A 0.416 -148 H 0.410 -149 E 0.412 -150 R 0.406 -151 E 0.397 -152 D 0.382 -153 L 0.355 -154 V 0.322 -155 Q 0.298 -156 Q 0.281 -157 L 0.265 -158 E 0.253 -159 R 0.247 -160 A 0.245 -161 K 0.245 -162 E 0.249 -163 Q 0.256 -164 I 0.270 -165 E 0.291 -166 S 0.322 -167 L 0.364 -168 E 0.413 -169 H 0.443 -170 D 0.443 -171 L 0.435 -172 Q 0.434 -173 A 0.419 -174 S 0.393 -175 V 0.387 -176 D 0.394 -177 E 0.377 -178 L 0.340 -179 Q 0.317 -180 D 0.303 -181 V 0.285 -182 K 0.280 -183 E 0.296 -184 E 0.307 -185 R 0.302 -186 S 0.286 -187 S 0.270 -188 Y 0.262 -189 Q 0.272 -190 D 0.287 -191 K 0.286 -192 V 0.273 -193 E 0.263 -194 R 0.257 -195 L 0.252 -196 N 0.253 -197 Q 0.260 -198 E 0.262 -199 L 0.258 -200 N 0.258 -201 H 0.267 -202 I 0.285 -203 L 0.310 -204 S 0.342 -205 G 0.375 -206 H 0.404 -207 E 0.430 -208 N 0.453 -209 R 0.475 -210 I 0.488 -211 I 0.470 -212 D 0.418 -213 V 0.360 -214 D 0.318 -215 A 0.288 -216 L 0.270 -217 C 0.279 -218 M 0.306 -219 E 0.315 -220 N 0.286 -221 R 0.241 -222 Y 0.209 -223 L 0.200 -224 Q 0.203 -225 E 0.205 -226 R 0.198 -227 L 0.189 -228 K 0.183 -229 Q 0.180 -230 L 0.183 -231 H 0.196 -232 E 0.213 -233 E 0.218 -234 V 0.212 -235 N 0.208 -236 L 0.208 -237 L 0.212 -238 K 0.224 -239 S 0.238 -240 N 0.241 -241 I 0.233 -242 A 0.217 -243 K 0.198 -244 Y 0.184 -245 K 0.183 -246 N 0.191 -247 A 0.203 -248 L 0.218 -249 E 0.236 -250 R 0.262 -251 R 0.302 -252 K 0.360 -253 N 0.426 -254 S 0.487 -255 K 0.540 -256 G 0.589 -257 Q 0.633 -258 G 0.664 -259 K 0.683 -260 S 0.694 -261 S 0.700 -262 S 0.703 -263 S 0.700 -264 A 0.695 -265 L 0.695 -266 T 0.698 -267 G 0.690 -268 V 0.652 -269 L 0.583 -270 S 0.506 -271 A 0.454 -272 K 0.442 -273 Q 0.458 -274 V 0.492 -275 Q 0.540 -276 D 0.588 -277 L 0.622 -278 L 0.646 -279 S 0.665 -280 E 0.680 -281 D 0.691 -282 H 0.698 -283 G 0.696 -284 C 0.687 -285 S 0.681 -286 L 0.678 -287 P 0.671 -288 A 0.649 -289 T 0.607 -290 P 0.549 -291 Q 0.481 -292 S 0.422 -293 I 0.389 -294 S 0.382 -295 D 0.379 -296 L 0.366 -297 K 0.349 -298 S 0.334 -299 L 0.319 -300 A 0.303 -301 T 0.283 -302 A 0.259 -303 L 0.238 -304 L 0.224 -305 E 0.211 -306 T 0.188 -307 I 0.167 -308 H 0.158 -309 E 0.160 -310 K 0.163 -311 N 0.172 -312 M 0.183 -313 V 0.189 -314 I 0.190 -315 Q 0.193 -316 H 0.200 -317 Q 0.218 -318 R 0.252 -319 Q 0.293 -320 T 0.322 -321 N 0.330 -322 K 0.324 -323 I 0.313 -324 L 0.313 -325 G 0.331 -326 N 0.348 -327 R 0.337 -328 V 0.299 -329 A 0.258 -330 E 0.229 -331 L 0.216 -332 E 0.213 -333 K 0.213 -334 K 0.216 -335 L 0.228 -336 R 0.254 -337 T 0.295 -338 L 0.348 -339 E 0.407 -340 V 0.466 -341 S 0.527 -342 G 0.586 -343 L 0.632 -344 W 0.658 -345 S 0.671 -346 L 0.687 -347 P 0.712 -348 G 0.740 -349 L 0.762 -350 S 0.778 -351 Y 0.795 -352 N 0.811 -353 V 0.822 -354 S 0.826 -355 V 0.825 -356 G 0.821 -357 F 0.818 -358 G 0.820 -359 R 0.827 -360 G 0.835 -361 K 0.842 -362 D 0.846 -363 T 0.847 -364 I 0.849 -365 L 0.846 -366 F 0.836 -367 S 0.820 -368 D 0.804 -369 P 0.791 -370 T 0.785 -371 L 0.792 -372 P 0.810 -373 S 0.832 -374 G 0.848 -375 Q 0.849 -376 R 0.838 -377 S 0.823 -378 R 0.814 -379 S 0.818 -380 P 0.830 -381 L 0.843 -382 L 0.851 -383 K 0.851 -384 F 0.846 -385 V 0.834 -386 E 0.820 -387 Q 0.813 -388 P 0.815 -389 T 0.824 -390 E 0.832 -391 N 0.832 -392 K 0.822 -393 A 0.809 -394 D 0.801 -395 P 0.802 -396 K 0.809 -397 D 0.814 -398 G 0.810 -399 E 0.785 -400 A 0.730 -401 Q 0.658 -402 K 0.625 -403 Q 0.659 -404 E 0.722 -405 E 0.767 -406 D 0.790 -407 E 0.801 -408 S 0.805 -409 C 0.810 -410 A 0.816 -411 A 0.821 -412 A 0.821 -413 E 0.819 -414 A 0.814 -415 L 0.805 -416 T 0.793 -417 A 0.789 -418 P 0.796 -419 E 0.810 -420 D 0.821 -421 A 0.821 -422 G 0.811 -423 R 0.804 -424 P 0.807 -425 A 0.812 -426 V 0.808 -427 N 0.794 -428 S 0.782 -429 P 0.770 -430 A 0.738 -431 N 0.681 -432 Q 0.648 -433 S 0.679 -434 R 0.746 -435 G 0.795 -436 N 0.812 -437 Q 0.808 -438 C 0.798 -439 K 0.785 -440 L 0.767 -441 F 0.745 -442 H 0.730 -443 P 0.731 -444 S 0.742 -445 L 0.750 -446 P 0.753 -447 Q 0.755 -448 L 0.749 -449 P 0.722 -450 S 0.669 -451 E 0.606 -452 E 0.561 -453 E 0.538 -454 V 0.520 -455 N 0.504 -456 S 0.497 -457 L 0.488 -458 G 0.470 -459 R 0.455 -460 E 0.439 -461 I 0.404 -462 I 0.367 -463 K 0.365 -464 L 0.397 -465 T 0.420 -466 K 0.418 -467 E 0.415 -468 Q 0.430 -469 A 0.472 -470 A 0.532 -471 A 0.585 -472 E 0.607 -473 L 0.602 -474 E 0.590 -475 E 0.580 -476 V 0.569 -477 R 0.557 -478 R 0.553 -479 E 0.567 -480 S 0.602 -481 P 0.655 -482 I 0.715 -483 E 0.767 -484 G 0.796 -485 Q 0.805 -486 R 0.805 -487 S 0.801 -488 E 0.792 -489 T 0.779 -490 G 0.765 -491 P 0.754 -492 A 0.755 -493 P 0.772 -494 P 0.802 -495 G 0.830 -496 L 0.847 -497 A 0.852 -498 I 0.851 -499 Q 0.845 -500 G 0.834 -501 E 0.820 -502 L 0.809 -503 P 0.807 -504 K 0.811 -505 S 0.814 -506 H 0.814 -507 L 0.815 -508 D 0.817 -509 S 0.814 -510 F 0.807 -511 E 0.796 -512 A 0.779 -513 S 0.764 -514 R 0.761 -515 P 0.777 -516 A 0.803 -517 A 0.822 -518 K 0.825 -519 A 0.814 -520 S 0.800 -521 T 0.794 -522 P 0.800 -523 E 0.813 -524 D 0.822 -525 G 0.822 -526 K 0.812 -527 G 0.800 -528 I 0.792 -529 P 0.792 -530 E 0.798 -531 G 0.804 -532 G 0.809 -533 G 0.814 -534 M 0.818 -535 R 0.819 -536 S 0.814 -537 T 0.795 -538 V 0.758 -539 K 0.707 -540 T 0.666 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182287.16_ENST00000672987.1_GN:AP1S2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182287.16_ENST00000672987.1_GN:AP1S2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index b363b0c95503f8d396d0af766ec9a2d5db86ec49..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182287.16_ENST00000672987.1_GN:AP1S2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,161 +0,0 @@ ->ENSG00000182287.16|ENST00000672987.1|GN:AP1S2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.070 -2 Q 0.055 -3 F 0.035 -4 M 0.021 -5 L 0.014 -6 L 0.013 -7 F 0.015 -8 S 0.020 -9 R 0.030 -10 Q 0.043 -11 G 0.053 -12 K 0.057 -13 L 0.056 -14 R 0.052 -15 L 0.047 -16 Q 0.045 -17 K 0.047 -18 W 0.053 -19 Y 0.060 -20 V 0.065 -21 P 0.069 -22 L 0.070 -23 S 0.071 -24 D 0.072 -25 K 0.070 -26 E 0.064 -27 K 0.060 -28 K 0.062 -29 K 0.067 -30 I 0.066 -31 T 0.058 -32 R 0.048 -33 E 0.041 -34 L 0.039 -35 V 0.042 -36 Q 0.046 -37 T 0.050 -38 V 0.056 -39 L 0.064 -40 A 0.075 -41 R 0.090 -42 K 0.108 -43 P 0.126 -44 K 0.137 -45 M 0.136 -46 C 0.120 -47 S 0.093 -48 F 0.069 -49 L 0.056 -50 E 0.052 -51 W 0.050 -52 R 0.049 -53 D 0.050 -54 L 0.048 -55 K 0.042 -56 I 0.034 -57 V 0.026 -58 Y 0.023 -59 K 0.025 -60 R 0.032 -61 Y 0.038 -62 A 0.040 -63 S 0.037 -64 L 0.030 -65 Y 0.022 -66 F 0.016 -67 C 0.016 -68 C 0.024 -69 A 0.039 -70 I 0.058 -71 E 0.075 -72 D 0.090 -73 Q 0.100 -74 D 0.102 -75 N 0.098 -76 E 0.092 -77 L 0.089 -78 I 0.088 -79 T 0.088 -80 L 0.086 -81 E 0.085 -82 I 0.084 -83 I 0.082 -84 H 0.080 -85 R 0.078 -86 Y 0.078 -87 V 0.081 -88 E 0.083 -89 L 0.079 -90 L 0.071 -91 D 0.065 -92 K 0.064 -93 Y 0.066 -94 F 0.069 -95 G 0.067 -96 S 0.060 -97 V 0.053 -98 C 0.051 -99 E 0.057 -100 L 0.067 -101 D 0.074 -102 I 0.071 -103 I 0.060 -104 F 0.049 -105 N 0.043 -106 F 0.041 -107 E 0.044 -108 K 0.049 -109 A 0.052 -110 Y 0.055 -111 F 0.062 -112 I 0.068 -113 L 0.071 -114 D 0.071 -115 E 0.071 -116 F 0.072 -117 L 0.077 -118 L 0.086 -119 G 0.100 -120 G 0.115 -121 E 0.122 -122 V 0.119 -123 Q 0.114 -124 E 0.113 -125 T 0.115 -126 S 0.112 -127 K 0.099 -128 K 0.085 -129 N 0.080 -130 V 0.083 -131 L 0.089 -132 K 0.092 -133 A 0.089 -134 I 0.081 -135 E 0.077 -136 Q 0.083 -137 A 0.106 -138 D 0.142 -139 L 0.181 -140 L 0.216 -141 Q 0.249 -142 E 0.282 -143 D 0.310 -144 A 0.334 -145 K 0.361 -146 E 0.394 -147 A 0.426 -148 E 0.448 -149 T 0.456 -150 P 0.451 -151 R 0.442 -152 S 0.433 -153 V 0.412 -154 L 0.372 -155 E 0.337 -156 E 0.339 -157 I 0.372 -158 G 0.400 -159 L 0.402 -160 T 0.391 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182287.16_ENST00000672987.1_GN:AP1S2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:42.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182287.16_ENST00000672987.1_GN:AP1S2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:42.caid deleted file mode 100644 index 2e30e26c2d08784ccd4255df13ce1861b9e51a0d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182287.16_ENST00000672987.1_GN:AP1S2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:42.caid +++ /dev/null @@ -1,203 +0,0 @@ ->ENSG00000182287.16|ENST00000672987.1|GN:AP1S2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:42 -1 M 0.408 -2 P 0.440 -3 A 0.483 -4 G 0.513 -5 C 0.523 -6 P 0.521 -7 P 0.504 -8 H 0.468 -9 S 0.436 -10 T 0.427 -11 T 0.430 -12 A 0.440 -13 S 0.464 -14 L 0.480 -15 P 0.473 -16 Q 0.473 -17 H 0.512 -18 G 0.563 -19 D 0.589 -20 R 0.591 -21 G 0.586 -22 F 0.584 -23 P 0.586 -24 F 0.596 -25 A 0.618 -26 A 0.646 -27 A 0.671 -28 A 0.687 -29 A 0.694 -30 A 0.687 -31 G 0.663 -32 Q 0.627 -33 A 0.589 -34 P 0.560 -35 P 0.542 -36 R 0.529 -37 P 0.516 -38 R 0.491 -39 P 0.442 -40 A 0.360 -41 A 0.260 -42 A 0.166 -43 M 0.098 -44 Q 0.056 -45 F 0.032 -46 M 0.019 -47 L 0.013 -48 L 0.012 -49 F 0.014 -50 S 0.019 -51 R 0.028 -52 Q 0.041 -53 G 0.051 -54 K 0.055 -55 L 0.053 -56 R 0.048 -57 L 0.044 -58 Q 0.041 -59 K 0.043 -60 W 0.049 -61 Y 0.058 -62 V 0.065 -63 P 0.070 -64 L 0.071 -65 S 0.066 -66 D 0.060 -67 K 0.054 -68 E 0.049 -69 K 0.046 -70 K 0.047 -71 K 0.051 -72 I 0.054 -73 T 0.052 -74 R 0.047 -75 E 0.042 -76 L 0.041 -77 V 0.044 -78 Q 0.048 -79 T 0.053 -80 V 0.058 -81 L 0.066 -82 A 0.076 -83 R 0.090 -84 K 0.109 -85 P 0.126 -86 K 0.135 -87 M 0.131 -88 C 0.113 -89 S 0.087 -90 F 0.065 -91 L 0.054 -92 E 0.050 -93 W 0.048 -94 R 0.047 -95 D 0.047 -96 L 0.045 -97 K 0.039 -98 I 0.031 -99 V 0.024 -100 Y 0.021 -101 K 0.023 -102 R 0.029 -103 Y 0.036 -104 A 0.038 -105 S 0.035 -106 L 0.028 -107 Y 0.020 -108 F 0.015 -109 C 0.014 -110 C 0.019 -111 A 0.031 -112 I 0.047 -113 E 0.066 -114 D 0.086 -115 Q 0.099 -116 D 0.102 -117 N 0.096 -118 E 0.089 -119 L 0.085 -120 I 0.083 -121 T 0.082 -122 L 0.082 -123 E 0.081 -124 I 0.081 -125 I 0.079 -126 H 0.077 -127 R 0.075 -128 Y 0.076 -129 V 0.079 -130 E 0.081 -131 L 0.076 -132 L 0.069 -133 D 0.064 -134 K 0.063 -135 Y 0.067 -136 F 0.069 -137 G 0.068 -138 S 0.063 -139 V 0.056 -140 C 0.054 -141 E 0.060 -142 L 0.069 -143 D 0.075 -144 I 0.071 -145 I 0.060 -146 F 0.048 -147 N 0.042 -148 F 0.040 -149 E 0.043 -150 K 0.048 -151 A 0.051 -152 Y 0.054 -153 F 0.061 -154 I 0.068 -155 L 0.071 -156 D 0.071 -157 E 0.071 -158 F 0.072 -159 L 0.077 -160 L 0.086 -161 G 0.101 -162 G 0.116 -163 E 0.124 -164 V 0.122 -165 Q 0.116 -166 E 0.115 -167 T 0.117 -168 S 0.114 -169 K 0.102 -170 K 0.088 -171 N 0.083 -172 V 0.085 -173 L 0.090 -174 K 0.093 -175 A 0.091 -176 I 0.084 -177 E 0.082 -178 Q 0.090 -179 A 0.115 -180 D 0.154 -181 L 0.195 -182 L 0.232 -183 Q 0.267 -184 E 0.303 -185 D 0.331 -186 A 0.352 -187 K 0.377 -188 E 0.409 -189 A 0.440 -190 E 0.464 -191 T 0.477 -192 P 0.482 -193 R 0.483 -194 S 0.484 -195 V 0.478 -196 L 0.455 -197 E 0.425 -198 E 0.414 -199 I 0.426 -200 G 0.438 -201 L 0.431 -202 T 0.417 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182521.6_ENST00000247219.6_GN:TBPL2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182521.6_ENST00000247219.6_GN:TBPL2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index ba37714b926cdfb75e4720a54f64088a3f8b5357..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182521.6_ENST00000247219.6_GN:TBPL2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,344 +0,0 @@ ->ENSG00000182521.6|ENST00000247219.6|GN:TBPL2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.388 -2 E 0.395 -3 Q 0.401 -4 E 0.397 -5 E 0.375 -6 T 0.335 -7 Y 0.290 -8 L 0.253 -9 E 0.227 -10 L 0.214 -11 Y 0.219 -12 L 0.241 -13 D 0.273 -14 Q 0.316 -15 C 0.379 -16 A 0.450 -17 A 0.503 -18 Q 0.543 -19 D 0.587 -20 G 0.621 -21 L 0.628 -22 A 0.615 -23 P 0.601 -24 P 0.599 -25 R 0.605 -26 S 0.605 -27 P 0.591 -28 L 0.563 -29 F 0.535 -30 S 0.516 -31 P 0.507 -32 V 0.503 -33 V 0.498 -34 P 0.494 -35 Y 0.498 -36 D 0.511 -37 M 0.524 -38 Y 0.533 -39 I 0.548 -40 L 0.584 -41 N 0.622 -42 A 0.638 -43 S 0.637 -44 N 0.645 -45 P 0.674 -46 D 0.712 -47 T 0.741 -48 A 0.750 -49 F 0.744 -50 N 0.736 -51 S 0.732 -52 N 0.736 -53 P 0.747 -54 E 0.762 -55 V 0.776 -56 K 0.782 -57 E 0.781 -58 T 0.775 -59 S 0.764 -60 G 0.747 -61 D 0.728 -62 F 0.717 -63 S 0.711 -64 S 0.690 -65 V 0.640 -66 D 0.571 -67 L 0.507 -68 S 0.470 -69 F 0.475 -70 L 0.522 -71 P 0.591 -72 D 0.653 -73 E 0.691 -74 V 0.705 -75 T 0.709 -76 Q 0.715 -77 E 0.727 -78 N 0.737 -79 K 0.736 -80 D 0.730 -81 Q 0.726 -82 P 0.726 -83 V 0.715 -84 I 0.676 -85 S 0.616 -86 K 0.580 -87 H 0.597 -88 E 0.624 -89 T 0.618 -90 E 0.614 -91 E 0.656 -92 N 0.719 -93 S 0.754 -94 E 0.758 -95 S 0.749 -96 Q 0.740 -97 S 0.734 -98 P 0.732 -99 Q 0.731 -100 S 0.724 -101 R 0.707 -102 L 0.692 -103 P 0.687 -104 S 0.685 -105 P 0.661 -106 S 0.619 -107 E 0.603 -108 Q 0.642 -109 D 0.703 -110 V 0.738 -111 G 0.735 -112 L 0.694 -113 G 0.634 -114 L 0.598 -115 N 0.608 -116 S 0.620 -117 S 0.595 -118 S 0.572 -119 L 0.602 -120 S 0.667 -121 N 0.715 -122 S 0.731 -123 H 0.729 -124 S 0.720 -125 Q 0.712 -126 L 0.712 -127 H 0.727 -128 P 0.749 -129 G 0.768 -130 D 0.778 -131 T 0.777 -132 D 0.767 -133 S 0.751 -134 V 0.734 -135 Q 0.724 -136 P 0.722 -137 S 0.723 -138 P 0.724 -139 E 0.721 -140 K 0.709 -141 P 0.672 -142 N 0.621 -143 S 0.597 -144 D 0.629 -145 S 0.682 -146 L 0.716 -147 S 0.730 -148 L 0.736 -149 A 0.734 -150 S 0.722 -151 I 0.706 -152 T 0.695 -153 P 0.691 -154 M 0.689 -155 T 0.684 -156 P 0.676 -157 M 0.669 -158 T 0.667 -159 P 0.662 -160 I 0.644 -161 S 0.600 -162 E 0.528 -163 C 0.441 -164 C 0.356 -165 G 0.287 -166 I 0.229 -167 V 0.178 -168 P 0.133 -169 Q 0.098 -170 L 0.072 -171 Q 0.055 -172 N 0.043 -173 I 0.035 -174 V 0.029 -175 S 0.026 -176 T 0.028 -177 V 0.034 -178 N 0.042 -179 L 0.049 -180 A 0.053 -181 C 0.054 -182 K 0.051 -183 L 0.046 -184 D 0.041 -185 L 0.038 -186 K 0.038 -187 K 0.040 -188 I 0.046 -189 A 0.053 -190 L 0.056 -191 H 0.058 -192 A 0.060 -193 K 0.063 -194 N 0.066 -195 A 0.067 -196 E 0.066 -197 Y 0.063 -198 N 0.059 -199 P 0.056 -200 K 0.056 -201 R 0.057 -202 F 0.060 -203 A 0.064 -204 A 0.065 -205 V 0.063 -206 I 0.059 -207 M 0.057 -208 R 0.057 -209 I 0.056 -210 R 0.052 -211 E 0.049 -212 P 0.053 -213 R 0.059 -214 T 0.062 -215 T 0.058 -216 A 0.051 -217 L 0.046 -218 I 0.045 -219 F 0.051 -220 S 0.066 -221 S 0.082 -222 G 0.087 -223 K 0.079 -224 M 0.069 -225 V 0.064 -226 C 0.068 -227 T 0.081 -228 G 0.101 -229 A 0.110 -230 K 0.100 -231 S 0.083 -232 E 0.072 -233 E 0.073 -234 Q 0.075 -235 S 0.071 -236 R 0.064 -237 L 0.062 -238 A 0.063 -239 A 0.060 -240 R 0.053 -241 K 0.049 -242 Y 0.055 -243 A 0.068 -244 R 0.077 -245 V 0.074 -246 V 0.064 -247 Q 0.059 -248 K 0.062 -249 L 0.071 -250 G 0.081 -251 F 0.089 -252 P 0.087 -253 A 0.078 -254 R 0.066 -255 F 0.058 -256 L 0.052 -257 D 0.047 -258 F 0.041 -259 K 0.038 -260 I 0.039 -261 Q 0.040 -262 N 0.041 -263 M 0.039 -264 V 0.033 -265 G 0.028 -266 S 0.027 -267 C 0.032 -268 D 0.039 -269 V 0.043 -270 R 0.043 -271 F 0.043 -272 P 0.042 -273 I 0.042 -274 R 0.041 -275 L 0.042 -276 E 0.045 -277 G 0.050 -278 L 0.055 -279 V 0.061 -280 L 0.063 -281 T 0.059 -282 H 0.052 -283 Q 0.047 -284 Q 0.046 -285 F 0.049 -286 S 0.055 -287 S 0.062 -288 Y 0.066 -289 E 0.064 -290 P 0.063 -291 E 0.063 -292 L 0.064 -293 F 0.068 -294 P 0.076 -295 G 0.081 -296 L 0.077 -297 I 0.068 -298 Y 0.061 -299 R 0.059 -300 M 0.059 -301 V 0.056 -302 K 0.055 -303 P 0.061 -304 R 0.073 -305 I 0.081 -306 V 0.077 -307 L 0.067 -308 L 0.056 -309 I 0.051 -310 F 0.053 -311 V 0.066 -312 S 0.083 -313 G 0.091 -314 K 0.089 -315 V 0.084 -316 V 0.085 -317 L 0.091 -318 T 0.100 -319 G 0.109 -320 A 0.110 -321 K 0.100 -322 E 0.086 -323 R 0.076 -324 S 0.073 -325 E 0.072 -326 I 0.067 -327 Y 0.061 -328 E 0.057 -329 A 0.053 -330 F 0.049 -331 E 0.045 -332 N 0.043 -333 I 0.041 -334 Y 0.039 -335 P 0.039 -336 I 0.040 -337 L 0.044 -338 K 0.049 -339 G 0.056 -340 F 0.065 -341 K 0.080 -342 K 0.106 -343 A 0.129 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182521.6_ENST00000247219.6_GN:TBPL2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:32.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182521.6_ENST00000247219.6_GN:TBPL2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:32.caid deleted file mode 100644 index 477e368ff37a4cab501ccbb374e88c86d46d41d3..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182521.6_ENST00000247219.6_GN:TBPL2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:32.caid +++ /dev/null @@ -1,376 +0,0 @@ ->ENSG00000182521.6|ENST00000247219.6|GN:TBPL2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:32 -1 M 0.418 -2 A 0.442 -3 S 0.484 -4 A 0.528 -5 P 0.558 -6 W 0.579 -7 P 0.602 -8 E 0.624 -9 R 0.637 -10 V 0.643 -11 P 0.651 -12 R 0.662 -13 L 0.670 -14 L 0.671 -15 A 0.665 -16 P 0.652 -17 R 0.637 -18 L 0.619 -19 P 0.590 -20 S 0.546 -21 Y 0.499 -22 P 0.467 -23 P 0.467 -24 P 0.505 -25 P 0.574 -26 P 0.647 -27 T 0.699 -28 V 0.718 -29 G 0.703 -30 L 0.659 -31 R 0.603 -32 S 0.563 -33 M 0.555 -34 E 0.565 -35 Q 0.568 -36 E 0.556 -37 E 0.533 -38 T 0.493 -39 Y 0.431 -40 L 0.370 -41 E 0.332 -42 L 0.320 -43 Y 0.327 -44 L 0.348 -45 D 0.382 -46 Q 0.432 -47 C 0.507 -48 A 0.591 -49 A 0.651 -50 Q 0.686 -51 D 0.709 -52 G 0.720 -53 L 0.714 -54 A 0.694 -55 P 0.678 -56 P 0.676 -57 R 0.686 -58 S 0.696 -59 P 0.696 -60 L 0.685 -61 F 0.671 -62 S 0.660 -63 P 0.654 -64 V 0.648 -65 V 0.640 -66 P 0.636 -67 Y 0.641 -68 D 0.652 -69 M 0.659 -70 Y 0.661 -71 I 0.669 -72 L 0.692 -73 N 0.717 -74 A 0.725 -75 S 0.717 -76 N 0.716 -77 P 0.730 -78 D 0.755 -79 T 0.775 -80 A 0.780 -81 F 0.775 -82 N 0.769 -83 S 0.766 -84 N 0.769 -85 P 0.776 -86 E 0.788 -87 V 0.797 -88 K 0.801 -89 E 0.799 -90 T 0.793 -91 S 0.781 -92 G 0.763 -93 D 0.742 -94 F 0.728 -95 S 0.721 -96 S 0.701 -97 V 0.655 -98 D 0.593 -99 L 0.536 -100 S 0.504 -101 F 0.510 -102 L 0.557 -103 P 0.623 -104 D 0.680 -105 E 0.711 -106 V 0.719 -107 T 0.719 -108 Q 0.721 -109 E 0.725 -110 N 0.726 -111 K 0.717 -112 D 0.704 -113 Q 0.700 -114 P 0.704 -115 V 0.698 -116 I 0.662 -117 S 0.605 -118 K 0.571 -119 H 0.588 -120 E 0.612 -121 T 0.604 -122 E 0.595 -123 E 0.622 -124 N 0.662 -125 S 0.688 -126 E 0.707 -127 S 0.724 -128 Q 0.732 -129 S 0.731 -130 P 0.731 -131 Q 0.733 -132 S 0.729 -133 R 0.717 -134 L 0.702 -135 P 0.695 -136 S 0.690 -137 P 0.666 -138 S 0.624 -139 E 0.608 -140 Q 0.649 -141 D 0.712 -142 V 0.751 -143 G 0.749 -144 L 0.710 -145 G 0.649 -146 L 0.613 -147 N 0.624 -148 S 0.637 -149 S 0.610 -150 S 0.585 -151 L 0.616 -152 S 0.684 -153 N 0.736 -154 S 0.756 -155 H 0.757 -156 S 0.750 -157 Q 0.743 -158 L 0.741 -159 H 0.752 -160 P 0.770 -161 G 0.787 -162 D 0.795 -163 T 0.794 -164 D 0.784 -165 S 0.769 -166 V 0.753 -167 Q 0.742 -168 P 0.740 -169 S 0.740 -170 P 0.740 -171 E 0.737 -172 K 0.723 -173 P 0.686 -174 N 0.633 -175 S 0.608 -176 D 0.639 -177 S 0.693 -178 L 0.728 -179 S 0.744 -180 L 0.752 -181 A 0.752 -182 S 0.740 -183 I 0.723 -184 T 0.711 -185 P 0.707 -186 M 0.705 -187 T 0.700 -188 P 0.692 -189 M 0.686 -190 T 0.683 -191 P 0.679 -192 I 0.661 -193 S 0.618 -194 E 0.545 -195 C 0.454 -196 C 0.366 -197 G 0.292 -198 I 0.231 -199 V 0.177 -200 P 0.132 -201 Q 0.098 -202 L 0.073 -203 Q 0.056 -204 N 0.044 -205 I 0.036 -206 V 0.030 -207 S 0.027 -208 T 0.028 -209 V 0.034 -210 N 0.041 -211 L 0.048 -212 A 0.051 -213 C 0.052 -214 K 0.049 -215 L 0.045 -216 D 0.040 -217 L 0.037 -218 K 0.036 -219 K 0.039 -220 I 0.045 -221 A 0.051 -222 L 0.054 -223 H 0.055 -224 A 0.058 -225 K 0.061 -226 N 0.064 -227 A 0.066 -228 E 0.065 -229 Y 0.061 -230 N 0.057 -231 P 0.053 -232 K 0.053 -233 R 0.054 -234 F 0.057 -235 A 0.060 -236 A 0.062 -237 V 0.060 -238 I 0.057 -239 M 0.056 -240 R 0.056 -241 I 0.055 -242 R 0.051 -243 E 0.048 -244 P 0.051 -245 R 0.059 -246 T 0.062 -247 T 0.059 -248 A 0.052 -249 L 0.046 -250 I 0.045 -251 F 0.051 -252 S 0.065 -253 S 0.081 -254 G 0.087 -255 K 0.079 -256 M 0.069 -257 V 0.065 -258 C 0.069 -259 T 0.083 -260 G 0.102 -261 A 0.111 -262 K 0.101 -263 S 0.084 -264 E 0.074 -265 E 0.074 -266 Q 0.076 -267 S 0.072 -268 R 0.065 -269 L 0.063 -270 A 0.063 -271 A 0.061 -272 R 0.054 -273 K 0.050 -274 Y 0.056 -275 A 0.069 -276 R 0.078 -277 V 0.074 -278 V 0.064 -279 Q 0.059 -280 K 0.062 -281 L 0.071 -282 G 0.082 -283 F 0.091 -284 P 0.090 -285 A 0.081 -286 R 0.069 -287 F 0.060 -288 L 0.053 -289 D 0.047 -290 F 0.041 -291 K 0.039 -292 I 0.039 -293 Q 0.040 -294 N 0.041 -295 M 0.039 -296 V 0.033 -297 G 0.028 -298 S 0.028 -299 C 0.033 -300 D 0.041 -301 V 0.044 -302 R 0.044 -303 F 0.044 -304 P 0.043 -305 I 0.043 -306 R 0.043 -307 L 0.044 -308 E 0.047 -309 G 0.051 -310 L 0.057 -311 V 0.063 -312 L 0.065 -313 T 0.062 -314 H 0.055 -315 Q 0.049 -316 Q 0.048 -317 F 0.051 -318 S 0.057 -319 S 0.065 -320 Y 0.068 -321 E 0.067 -322 P 0.066 -323 E 0.066 -324 L 0.067 -325 F 0.071 -326 P 0.078 -327 G 0.084 -328 L 0.080 -329 I 0.070 -330 Y 0.063 -331 R 0.061 -332 M 0.060 -333 V 0.057 -334 K 0.056 -335 P 0.062 -336 R 0.075 -337 I 0.083 -338 V 0.081 -339 L 0.070 -340 L 0.059 -341 I 0.053 -342 F 0.055 -343 V 0.068 -344 S 0.085 -345 G 0.094 -346 K 0.091 -347 V 0.086 -348 V 0.086 -349 L 0.092 -350 T 0.101 -351 G 0.110 -352 A 0.111 -353 K 0.101 -354 E 0.087 -355 R 0.078 -356 S 0.075 -357 E 0.073 -358 I 0.068 -359 Y 0.062 -360 E 0.057 -361 A 0.053 -362 F 0.049 -363 E 0.045 -364 N 0.043 -365 I 0.042 -366 Y 0.040 -367 P 0.039 -368 I 0.041 -369 L 0.045 -370 K 0.050 -371 G 0.057 -372 F 0.066 -373 K 0.082 -374 K 0.108 -375 A 0.131 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182545.7_ENST00000430083.2_GN:RNASE10_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182545.7_ENST00000430083.2_GN:RNASE10_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 492c23222cfe97c4dd6dd5fba7eb8e3de83f4cd5..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182545.7_ENST00000430083.2_GN:RNASE10_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,217 +0,0 @@ ->ENSG00000182545.7|ENST00000430083.2|GN:RNASE10|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.341 -2 K 0.307 -3 L 0.249 -4 N 0.187 -5 L 0.137 -6 V 0.108 -7 Q 0.099 -8 I 0.107 -9 F 0.126 -10 F 0.148 -11 M 0.167 -12 L 0.180 -13 L 0.194 -14 M 0.219 -15 L 0.262 -16 L 0.320 -17 L 0.395 -18 G 0.483 -19 L 0.566 -20 G 0.624 -21 M 0.656 -22 G 0.669 -23 L 0.672 -24 G 0.670 -25 L 0.665 -26 G 0.656 -27 L 0.644 -28 H 0.640 -29 M 0.652 -30 A 0.672 -31 T 0.687 -32 A 0.694 -33 V 0.694 -34 L 0.687 -35 E 0.679 -36 E 0.664 -37 S 0.638 -38 D 0.611 -39 Q 0.602 -40 P 0.611 -41 L 0.627 -42 N 0.630 -43 E 0.609 -44 F 0.578 -45 W 0.573 -46 S 0.602 -47 S 0.630 -48 D 0.620 -49 S 0.581 -50 Q 0.568 -51 D 0.603 -52 K 0.635 -53 A 0.625 -54 E 0.612 -55 A 0.644 -56 T 0.700 -57 E 0.740 -58 E 0.760 -59 G 0.773 -60 D 0.782 -61 G 0.788 -62 T 0.793 -63 Q 0.797 -64 T 0.796 -65 T 0.792 -66 E 0.786 -67 T 0.776 -68 L 0.762 -69 V 0.752 -70 L 0.746 -71 S 0.736 -72 N 0.720 -73 K 0.701 -74 E 0.678 -75 V 0.649 -76 V 0.621 -77 Q 0.605 -78 P 0.592 -79 G 0.565 -80 W 0.530 -81 P 0.511 -82 E 0.525 -83 D 0.567 -84 P 0.622 -85 I 0.676 -86 L 0.714 -87 G 0.728 -88 E 0.723 -89 D 0.709 -90 E 0.695 -91 V 0.688 -92 G 0.684 -93 G 0.667 -94 N 0.622 -95 K 0.559 -96 M 0.497 -97 L 0.445 -98 R 0.398 -99 A 0.353 -100 S 0.312 -101 A 0.276 -102 L 0.243 -103 F 0.213 -104 Q 0.191 -105 S 0.174 -106 N 0.151 -107 K 0.120 -108 D 0.088 -109 Y 0.064 -110 L 0.050 -111 R 0.047 -112 L 0.051 -113 D 0.056 -114 Q 0.057 -115 T 0.051 -116 D 0.045 -117 R 0.039 -118 E 0.034 -119 C 0.029 -120 N 0.027 -121 D 0.028 -122 M 0.033 -123 M 0.042 -124 A 0.058 -125 H 0.081 -126 K 0.103 -127 M 0.122 -128 K 0.132 -129 E 0.135 -130 P 0.130 -131 S 0.117 -132 Q 0.101 -133 S 0.087 -134 C 0.074 -135 I 0.063 -136 A 0.055 -137 Q 0.049 -138 Y 0.043 -139 A 0.038 -140 F 0.038 -141 I 0.045 -142 H 0.057 -143 E 0.069 -144 D 0.072 -145 L 0.065 -146 N 0.055 -147 T 0.045 -148 V 0.038 -149 K 0.036 -150 A 0.036 -151 V 0.035 -152 C 0.038 -153 N 0.048 -154 S 0.060 -155 P 0.066 -156 V 0.064 -157 I 0.059 -158 A 0.055 -159 C 0.055 -160 E 0.062 -161 L 0.074 -162 K 0.085 -163 G 0.090 -164 G 0.084 -165 K 0.072 -166 C 0.062 -167 H 0.060 -168 K 0.067 -169 S 0.079 -170 S 0.090 -171 R 0.095 -172 P 0.092 -173 F 0.083 -174 D 0.076 -175 L 0.077 -176 T 0.081 -177 L 0.081 -178 C 0.082 -179 E 0.088 -180 L 0.102 -181 S 0.120 -182 Q 0.134 -183 P 0.139 -184 D 0.132 -185 Q 0.115 -186 V 0.098 -187 T 0.089 -188 P 0.088 -189 N 0.091 -190 C 0.094 -191 N 0.097 -192 Y 0.104 -193 L 0.112 -194 T 0.114 -195 S 0.112 -196 V 0.108 -197 I 0.104 -198 K 0.098 -199 K 0.095 -200 H 0.101 -201 I 0.111 -202 I 0.113 -203 I 0.101 -204 T 0.083 -205 C 0.073 -206 N 0.080 -207 D 0.098 -208 M 0.123 -209 K 0.154 -210 R 0.186 -211 Q 0.214 -212 L 0.239 -213 P 0.261 -214 T 0.274 -215 G 0.277 -216 Q 0.275 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182545.7_ENST00000430083.2_GN:RNASE10_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:28.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182545.7_ENST00000430083.2_GN:RNASE10_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:28.caid deleted file mode 100644 index 4f73b78302c32b15c700112b12aa5167a88c3c9a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182545.7_ENST00000430083.2_GN:RNASE10_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:28.caid +++ /dev/null @@ -1,245 +0,0 @@ ->ENSG00000182545.7|ENST00000430083.2|GN:RNASE10|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:28 -1 M 0.405 -2 W 0.429 -3 G 0.465 -4 A 0.495 -5 P 0.512 -6 L 0.525 -7 P 0.546 -8 R 0.569 -9 R 0.581 -10 P 0.578 -11 V 0.572 -12 W 0.575 -13 D 0.577 -14 V 0.568 -15 R 0.575 -16 S 0.624 -17 A 0.683 -18 S 0.715 -19 A 0.724 -20 G 0.729 -21 P 0.732 -22 Q 0.731 -23 P 0.728 -24 C 0.729 -25 L 0.742 -26 G 0.758 -27 G 0.763 -28 K 0.742 -29 M 0.686 -30 K 0.592 -31 L 0.475 -32 N 0.359 -33 L 0.264 -34 V 0.203 -35 Q 0.176 -36 I 0.171 -37 F 0.181 -38 F 0.202 -39 M 0.228 -40 L 0.251 -41 L 0.281 -42 M 0.330 -43 L 0.387 -44 L 0.439 -45 L 0.491 -46 G 0.553 -47 L 0.615 -48 G 0.660 -49 M 0.682 -50 G 0.690 -51 L 0.693 -52 G 0.696 -53 L 0.700 -54 G 0.699 -55 L 0.692 -56 H 0.688 -57 M 0.692 -58 A 0.699 -59 T 0.705 -60 A 0.712 -61 V 0.715 -62 L 0.714 -63 E 0.712 -64 E 0.703 -65 S 0.683 -66 D 0.660 -67 Q 0.650 -68 P 0.656 -69 L 0.670 -70 N 0.674 -71 E 0.657 -72 F 0.629 -73 W 0.622 -74 S 0.645 -75 S 0.666 -76 D 0.649 -77 S 0.603 -78 Q 0.584 -79 D 0.614 -80 K 0.645 -81 A 0.634 -82 E 0.623 -83 A 0.658 -84 T 0.714 -85 E 0.754 -86 E 0.774 -87 G 0.786 -88 D 0.794 -89 G 0.799 -90 T 0.805 -91 Q 0.810 -92 T 0.810 -93 T 0.806 -94 E 0.801 -95 T 0.793 -96 L 0.780 -97 V 0.769 -98 L 0.761 -99 S 0.751 -100 N 0.736 -101 K 0.720 -102 E 0.701 -103 V 0.676 -104 V 0.650 -105 Q 0.634 -106 P 0.623 -107 G 0.603 -108 W 0.576 -109 P 0.562 -110 E 0.572 -111 D 0.604 -112 P 0.646 -113 I 0.687 -114 L 0.717 -115 G 0.727 -116 E 0.719 -117 D 0.702 -118 E 0.686 -119 V 0.677 -120 G 0.669 -121 G 0.646 -122 N 0.594 -123 K 0.525 -124 M 0.457 -125 L 0.403 -126 R 0.359 -127 A 0.323 -128 S 0.293 -129 A 0.267 -130 L 0.240 -131 F 0.212 -132 Q 0.187 -133 S 0.165 -134 N 0.139 -135 K 0.109 -136 D 0.080 -137 Y 0.060 -138 L 0.048 -139 R 0.047 -140 L 0.052 -141 D 0.058 -142 Q 0.059 -143 T 0.053 -144 D 0.046 -145 R 0.040 -146 E 0.036 -147 C 0.030 -148 N 0.028 -149 D 0.030 -150 M 0.034 -151 M 0.042 -152 A 0.057 -153 H 0.078 -154 K 0.100 -155 M 0.118 -156 K 0.129 -157 E 0.133 -158 P 0.128 -159 S 0.116 -160 Q 0.099 -161 S 0.084 -162 C 0.072 -163 I 0.062 -164 A 0.056 -165 Q 0.051 -166 Y 0.045 -167 A 0.040 -168 F 0.039 -169 I 0.045 -170 H 0.057 -171 E 0.069 -172 D 0.072 -173 L 0.067 -174 N 0.057 -175 T 0.047 -176 V 0.040 -177 K 0.037 -178 A 0.037 -179 V 0.036 -180 C 0.039 -181 N 0.048 -182 S 0.060 -183 P 0.065 -184 V 0.064 -185 I 0.059 -186 A 0.055 -187 C 0.054 -188 E 0.061 -189 L 0.072 -190 K 0.083 -191 G 0.087 -192 G 0.081 -193 K 0.070 -194 C 0.061 -195 H 0.059 -196 K 0.067 -197 S 0.078 -198 S 0.090 -199 R 0.095 -200 P 0.091 -201 F 0.083 -202 D 0.076 -203 L 0.077 -204 T 0.081 -205 L 0.081 -206 C 0.081 -207 E 0.088 -208 L 0.101 -209 S 0.118 -210 Q 0.131 -211 P 0.136 -212 D 0.128 -213 Q 0.112 -214 V 0.095 -215 T 0.085 -216 P 0.085 -217 N 0.089 -218 C 0.091 -219 N 0.095 -220 Y 0.101 -221 L 0.108 -222 T 0.111 -223 S 0.109 -224 V 0.107 -225 I 0.103 -226 K 0.098 -227 K 0.095 -228 H 0.101 -229 I 0.111 -230 I 0.111 -231 I 0.098 -232 T 0.080 -233 C 0.070 -234 N 0.077 -235 D 0.094 -236 M 0.118 -237 K 0.146 -238 R 0.173 -239 Q 0.198 -240 L 0.223 -241 P 0.245 -242 T 0.260 -243 G 0.267 -244 Q 0.267 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182612.12_ENST00000611590.2_GN:TSPAN10_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182612.12_ENST00000611590.2_GN:TSPAN10_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 15b35135b2d424ed125ac4212317cf5dbe490292..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182612.12_ENST00000611590.2_GN:TSPAN10_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,356 +0,0 @@ ->ENSG00000182612.12|ENST00000611590.2|GN:TSPAN10|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.447 -2 E 0.475 -3 E 0.507 -4 G 0.513 -5 E 0.486 -6 R 0.461 -7 S 0.467 -8 P 0.480 -9 L 0.476 -10 L 0.484 -11 S 0.521 -12 Q 0.550 -13 E 0.536 -14 T 0.508 -15 A 0.496 -16 G 0.490 -17 Q 0.493 -18 K 0.519 -19 P 0.545 -20 L 0.541 -21 S 0.533 -22 V 0.556 -23 H 0.596 -24 R 0.630 -25 P 0.662 -26 P 0.696 -27 T 0.720 -28 S 0.719 -29 G 0.695 -30 C 0.668 -31 L 0.661 -32 G 0.675 -33 P 0.691 -34 V 0.698 -35 P 0.701 -36 R 0.709 -37 E 0.722 -38 D 0.730 -39 Q 0.725 -40 A 0.715 -41 E 0.707 -42 A 0.693 -43 W 0.666 -44 G 0.620 -45 C 0.560 -46 S 0.496 -47 C 0.448 -48 C 0.445 -49 P 0.496 -50 P 0.577 -51 E 0.649 -52 T 0.679 -53 K 0.655 -54 H 0.601 -55 Q 0.575 -56 A 0.607 -57 L 0.665 -58 S 0.702 -59 G 0.712 -60 T 0.708 -61 P 0.702 -62 K 0.697 -63 K 0.690 -64 G 0.678 -65 P 0.665 -66 A 0.654 -67 P 0.637 -68 S 0.602 -69 L 0.551 -70 S 0.495 -71 P 0.434 -72 G 0.359 -73 S 0.271 -74 S 0.190 -75 C 0.132 -76 V 0.097 -77 K 0.075 -78 Y 0.062 -79 L 0.054 -80 I 0.048 -81 F 0.044 -82 L 0.044 -83 S 0.047 -84 N 0.048 -85 F 0.042 -86 P 0.032 -87 F 0.024 -88 S 0.023 -89 L 0.029 -90 L 0.038 -91 G 0.046 -92 L 0.047 -93 L 0.045 -94 A 0.043 -95 L 0.044 -96 A 0.048 -97 I 0.052 -98 G 0.051 -99 L 0.048 -100 W 0.046 -101 G 0.048 -102 L 0.051 -103 A 0.060 -104 V 0.082 -105 K 0.122 -106 G 0.179 -107 S 0.247 -108 L 0.319 -109 G 0.384 -110 S 0.431 -111 D 0.456 -112 L 0.466 -113 G 0.460 -114 G 0.440 -115 P 0.409 -116 L 0.376 -117 P 0.341 -118 A 0.299 -119 D 0.245 -120 P 0.185 -121 M 0.133 -122 L 0.098 -123 G 0.078 -124 L 0.072 -125 A 0.079 -126 L 0.092 -127 G 0.101 -128 G 0.097 -129 L 0.083 -130 V 0.068 -131 V 0.057 -132 S 0.054 -133 A 0.056 -134 V 0.062 -135 S 0.063 -136 L 0.059 -137 A 0.054 -138 G 0.054 -139 Y 0.058 -140 L 0.067 -141 G 0.079 -142 A 0.089 -143 L 0.096 -144 C 0.101 -145 E 0.101 -146 N 0.093 -147 T 0.079 -148 C 0.067 -149 L 0.061 -150 L 0.057 -151 R 0.053 -152 G 0.052 -153 F 0.054 -154 S 0.055 -155 G 0.054 -156 G 0.053 -157 I 0.049 -158 L 0.044 -159 A 0.040 -160 F 0.044 -161 L 0.055 -162 V 0.063 -163 L 0.061 -164 E 0.054 -165 A 0.048 -166 V 0.046 -167 A 0.048 -168 G 0.049 -169 A 0.046 -170 L 0.041 -171 V 0.040 -172 V 0.043 -173 A 0.047 -174 L 0.051 -175 W 0.057 -176 G 0.067 -177 P 0.075 -178 L 0.079 -179 Q 0.083 -180 D 0.092 -181 S 0.103 -182 L 0.110 -183 E 0.113 -184 H 0.110 -185 T 0.103 -186 L 0.096 -187 R 0.090 -188 V 0.081 -189 A 0.069 -190 I 0.061 -191 A 0.061 -192 H 0.066 -193 Y 0.076 -194 Q 0.090 -195 D 0.107 -196 D 0.117 -197 P 0.111 -198 D 0.095 -199 L 0.079 -200 R 0.072 -201 F 0.074 -202 L 0.074 -203 L 0.069 -204 D 0.061 -205 Q 0.056 -206 V 0.053 -207 Q 0.056 -208 L 0.065 -209 G 0.070 -210 L 0.063 -211 R 0.049 -212 C 0.038 -213 C 0.041 -214 G 0.058 -215 A 0.078 -216 A 0.092 -217 S 0.102 -218 Y 0.114 -219 Q 0.129 -220 D 0.137 -221 W 0.132 -222 Q 0.119 -223 Q 0.107 -224 N 0.103 -225 L 0.105 -226 Y 0.109 -227 F 0.115 -228 N 0.124 -229 C 0.138 -230 S 0.158 -231 S 0.180 -232 P 0.197 -233 G 0.207 -234 V 0.212 -235 Q 0.218 -236 A 0.228 -237 C 0.236 -238 S 0.238 -239 L 0.227 -240 P 0.200 -241 A 0.167 -242 S 0.141 -243 C 0.135 -244 C 0.159 -245 I 0.219 -246 D 0.298 -247 P 0.362 -248 R 0.395 -249 E 0.405 -250 D 0.410 -251 G 0.414 -252 A 0.405 -253 S 0.370 -254 V 0.318 -255 N 0.271 -256 D 0.238 -257 Q 0.212 -258 C 0.185 -259 G 0.164 -260 F 0.158 -261 G 0.158 -262 V 0.154 -263 L 0.144 -264 R 0.134 -265 L 0.130 -266 D 0.131 -267 A 0.137 -268 D 0.142 -269 A 0.145 -270 A 0.147 -271 Q 0.153 -272 R 0.160 -273 V 0.161 -274 V 0.151 -275 Y 0.131 -276 L 0.113 -277 E 0.105 -278 G 0.103 -279 C 0.100 -280 G 0.094 -281 P 0.092 -282 P 0.099 -283 L 0.107 -284 R 0.112 -285 R 0.113 -286 W 0.107 -287 L 0.094 -288 R 0.078 -289 A 0.063 -290 N 0.053 -291 L 0.051 -292 A 0.063 -293 A 0.085 -294 S 0.102 -295 G 0.106 -296 G 0.103 -297 Y 0.100 -298 A 0.095 -299 I 0.085 -300 A 0.076 -301 V 0.072 -302 V 0.068 -303 L 0.062 -304 L 0.056 -305 Q 0.054 -306 G 0.052 -307 A 0.051 -308 E 0.054 -309 L 0.062 -310 L 0.064 -311 L 0.053 -312 A 0.038 -313 A 0.029 -314 R 0.028 -315 L 0.033 -316 L 0.040 -317 G 0.048 -318 A 0.061 -319 L 0.080 -320 A 0.105 -321 A 0.134 -322 R 0.171 -323 R 0.225 -324 G 0.288 -325 A 0.350 -326 A 0.407 -327 Y 0.465 -328 G 0.526 -329 P 0.587 -330 G 0.638 -331 A 0.667 -332 R 0.675 -333 G 0.670 -334 E 0.652 -335 D 0.616 -336 R 0.580 -337 A 0.563 -338 G 0.550 -339 P 0.526 -340 Q 0.515 -341 S 0.543 -342 P 0.592 -343 S 0.631 -344 P 0.651 -345 G 0.656 -346 A 0.655 -347 P 0.663 -348 P 0.683 -349 A 0.700 -350 A 0.701 -351 K 0.693 -352 P 0.683 -353 A 0.657 -354 R 0.603 -355 G 0.550 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182612.12_ENST00000611590.2_GN:TSPAN10_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:38.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182612.12_ENST00000611590.2_GN:TSPAN10_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:38.caid deleted file mode 100644 index ef29cadd1829035561a794adead16c0cc51714dd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000182612.12_ENST00000611590.2_GN:TSPAN10_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:38.caid +++ /dev/null @@ -1,394 +0,0 @@ ->ENSG00000182612.12|ENST00000611590.2|GN:TSPAN10|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:38 -1 M 0.391 -2 H 0.422 -3 R 0.460 -4 L 0.480 -5 A 0.481 -6 Q 0.499 -7 G 0.547 -8 R 0.578 -9 S 0.561 -10 Q 0.540 -11 D 0.560 -12 Q 0.599 -13 P 0.621 -14 S 0.635 -15 S 0.658 -16 P 0.681 -17 A 0.683 -18 T 0.665 -19 E 0.649 -20 E 0.648 -21 P 0.650 -22 A 0.631 -23 N 0.576 -24 L 0.489 -25 S 0.407 -26 R 0.358 -27 R 0.340 -28 L 0.335 -29 C 0.344 -30 W 0.380 -31 G 0.431 -32 L 0.482 -33 S 0.532 -34 V 0.588 -35 P 0.647 -36 A 0.699 -37 S 0.731 -38 R 0.745 -39 M 0.752 -40 E 0.757 -41 E 0.760 -42 G 0.755 -43 E 0.739 -44 R 0.717 -45 S 0.698 -46 P 0.693 -47 L 0.704 -48 L 0.724 -49 S 0.730 -50 Q 0.699 -51 E 0.641 -52 T 0.602 -53 A 0.611 -54 G 0.639 -55 Q 0.659 -56 K 0.679 -57 P 0.698 -58 L 0.703 -59 S 0.699 -60 V 0.702 -61 H 0.711 -62 R 0.723 -63 P 0.743 -64 P 0.770 -65 T 0.791 -66 S 0.796 -67 G 0.783 -68 C 0.763 -69 L 0.755 -70 G 0.760 -71 P 0.769 -72 V 0.773 -73 P 0.773 -74 R 0.777 -75 E 0.785 -76 D 0.788 -77 Q 0.781 -78 A 0.771 -79 E 0.762 -80 A 0.747 -81 W 0.719 -82 G 0.673 -83 C 0.611 -84 S 0.540 -85 C 0.488 -86 C 0.487 -87 P 0.542 -88 P 0.623 -89 E 0.687 -90 T 0.709 -91 K 0.679 -92 H 0.622 -93 Q 0.595 -94 A 0.628 -95 L 0.684 -96 S 0.719 -97 G 0.727 -98 T 0.722 -99 P 0.716 -100 K 0.707 -101 K 0.695 -102 G 0.678 -103 P 0.660 -104 A 0.645 -105 P 0.625 -106 S 0.588 -107 L 0.535 -108 S 0.478 -109 P 0.416 -110 G 0.342 -111 S 0.257 -112 S 0.178 -113 C 0.122 -114 V 0.090 -115 K 0.070 -116 Y 0.058 -117 L 0.050 -118 I 0.045 -119 F 0.042 -120 L 0.042 -121 S 0.045 -122 N 0.046 -123 F 0.040 -124 P 0.031 -125 F 0.024 -126 S 0.023 -127 L 0.028 -128 L 0.038 -129 G 0.046 -130 L 0.047 -131 L 0.045 -132 A 0.043 -133 L 0.043 -134 A 0.047 -135 I 0.050 -136 G 0.049 -137 L 0.046 -138 W 0.045 -139 G 0.048 -140 L 0.052 -141 A 0.063 -142 V 0.086 -143 K 0.129 -144 G 0.190 -145 S 0.260 -146 L 0.334 -147 G 0.400 -148 S 0.448 -149 D 0.474 -150 L 0.487 -151 G 0.486 -152 G 0.465 -153 P 0.430 -154 L 0.390 -155 P 0.352 -156 A 0.309 -157 D 0.254 -158 P 0.194 -159 M 0.139 -160 L 0.101 -161 G 0.080 -162 L 0.074 -163 A 0.079 -164 L 0.092 -165 G 0.101 -166 G 0.096 -167 L 0.082 -168 V 0.066 -169 V 0.056 -170 S 0.052 -171 A 0.055 -172 V 0.060 -173 S 0.062 -174 L 0.057 -175 A 0.052 -176 G 0.051 -177 Y 0.056 -178 L 0.064 -179 G 0.076 -180 A 0.086 -181 L 0.092 -182 C 0.096 -183 E 0.096 -184 N 0.089 -185 T 0.075 -186 C 0.062 -187 L 0.056 -188 L 0.052 -189 R 0.049 -190 G 0.048 -191 F 0.049 -192 S 0.051 -193 G 0.051 -194 G 0.051 -195 I 0.048 -196 L 0.044 -197 A 0.040 -198 F 0.044 -199 L 0.053 -200 V 0.060 -201 L 0.057 -202 E 0.051 -203 A 0.045 -204 V 0.044 -205 A 0.046 -206 G 0.047 -207 A 0.043 -208 L 0.039 -209 V 0.038 -210 V 0.040 -211 A 0.043 -212 L 0.047 -213 W 0.053 -214 G 0.062 -215 P 0.071 -216 L 0.075 -217 Q 0.079 -218 D 0.089 -219 S 0.101 -220 L 0.109 -221 E 0.112 -222 H 0.110 -223 T 0.103 -224 L 0.097 -225 R 0.091 -226 V 0.081 -227 A 0.069 -228 I 0.060 -229 A 0.059 -230 H 0.063 -231 Y 0.070 -232 Q 0.081 -233 D 0.095 -234 D 0.103 -235 P 0.100 -236 D 0.086 -237 L 0.072 -238 R 0.066 -239 F 0.068 -240 L 0.069 -241 L 0.064 -242 D 0.058 -243 Q 0.053 -244 V 0.051 -245 Q 0.054 -246 L 0.061 -247 G 0.066 -248 L 0.060 -249 R 0.046 -250 C 0.037 -251 C 0.040 -252 G 0.057 -253 A 0.076 -254 A 0.091 -255 S 0.101 -256 Y 0.113 -257 Q 0.127 -258 D 0.136 -259 W 0.130 -260 Q 0.116 -261 Q 0.104 -262 N 0.100 -263 L 0.103 -264 Y 0.110 -265 F 0.116 -266 N 0.126 -267 C 0.139 -268 S 0.158 -269 S 0.180 -270 P 0.198 -271 G 0.209 -272 V 0.214 -273 Q 0.220 -274 A 0.229 -275 C 0.236 -276 S 0.235 -277 L 0.222 -278 P 0.194 -279 A 0.161 -280 S 0.137 -281 C 0.132 -282 C 0.159 -283 I 0.223 -284 D 0.306 -285 P 0.372 -286 R 0.407 -287 E 0.417 -288 D 0.421 -289 G 0.424 -290 A 0.415 -291 S 0.379 -292 V 0.326 -293 N 0.277 -294 D 0.244 -295 Q 0.217 -296 C 0.190 -297 G 0.170 -298 F 0.164 -299 G 0.166 -300 V 0.162 -301 L 0.151 -302 R 0.140 -303 L 0.135 -304 D 0.136 -305 A 0.141 -306 D 0.147 -307 A 0.148 -308 A 0.149 -309 Q 0.154 -310 R 0.161 -311 V 0.162 -312 V 0.152 -313 Y 0.132 -314 L 0.115 -315 E 0.106 -316 G 0.105 -317 C 0.103 -318 G 0.096 -319 P 0.094 -320 P 0.101 -321 L 0.109 -322 R 0.114 -323 R 0.114 -324 W 0.109 -325 L 0.095 -326 R 0.079 -327 A 0.064 -328 N 0.053 -329 L 0.051 -330 A 0.062 -331 A 0.084 -332 S 0.102 -333 G 0.106 -334 G 0.102 -335 Y 0.098 -336 A 0.091 -337 I 0.080 -338 A 0.072 -339 V 0.070 -340 V 0.067 -341 L 0.061 -342 L 0.056 -343 Q 0.054 -344 G 0.052 -345 A 0.050 -346 E 0.054 -347 L 0.061 -348 L 0.063 -349 L 0.053 -350 A 0.038 -351 A 0.028 -352 R 0.027 -353 L 0.031 -354 L 0.038 -355 G 0.046 -356 A 0.058 -357 L 0.077 -358 A 0.102 -359 A 0.131 -360 R 0.169 -361 R 0.223 -362 G 0.288 -363 A 0.350 -364 A 0.407 -365 Y 0.465 -366 G 0.527 -367 P 0.588 -368 G 0.639 -369 A 0.667 -370 R 0.676 -371 G 0.676 -372 E 0.668 -373 D 0.648 -374 R 0.622 -375 A 0.600 -376 G 0.574 -377 P 0.541 -378 Q 0.526 -379 S 0.552 -380 P 0.600 -381 S 0.639 -382 P 0.659 -383 G 0.664 -384 A 0.664 -385 P 0.672 -386 P 0.691 -387 A 0.709 -388 A 0.711 -389 K 0.704 -390 P 0.695 -391 A 0.669 -392 R 0.616 -393 G 0.564 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000183560.10_ENST00000687084.1_GN:IZUMO1R_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000183560.10_ENST00000687084.1_GN:IZUMO1R_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 275309f0b798f42bface303026503ec063d66179..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000183560.10_ENST00000687084.1_GN:IZUMO1R_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,251 +0,0 @@ ->ENSG00000183560.10|ENST00000687084.1|GN:IZUMO1R|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.340 -2 A 0.346 -3 C 0.354 -4 W 0.356 -5 W 0.344 -6 P 0.322 -7 L 0.303 -8 L 0.294 -9 L 0.286 -10 E 0.276 -11 L 0.272 -12 W 0.278 -13 T 0.295 -14 V 0.325 -15 M 0.358 -16 P 0.384 -17 T 0.403 -18 W 0.413 -19 A 0.406 -20 G 0.374 -21 D 0.321 -22 E 0.256 -23 L 0.190 -24 L 0.136 -25 N 0.101 -26 I 0.083 -27 C 0.075 -28 M 0.073 -29 N 0.077 -30 A 0.087 -31 K 0.100 -32 H 0.114 -33 H 0.124 -34 K 0.128 -35 R 0.137 -36 V 0.158 -37 P 0.187 -38 S 0.214 -39 P 0.231 -40 E 0.233 -41 D 0.221 -42 K 0.202 -43 L 0.177 -44 Y 0.151 -45 E 0.130 -46 E 0.124 -47 C 0.133 -48 I 0.145 -49 P 0.147 -50 W 0.141 -51 K 0.131 -52 D 0.116 -53 N 0.099 -54 A 0.084 -55 C 0.084 -56 C 0.109 -57 T 0.146 -58 L 0.173 -59 T 0.176 -60 T 0.166 -61 S 0.160 -62 W 0.162 -63 E 0.167 -64 A 0.170 -65 H 0.172 -66 L 0.171 -67 D 0.170 -68 V 0.172 -69 S 0.177 -70 P 0.179 -71 L 0.178 -72 Y 0.179 -73 N 0.184 -74 F 0.188 -75 S 0.185 -76 L 0.170 -77 F 0.156 -78 H 0.153 -79 C 0.157 -80 G 0.159 -81 L 0.155 -82 L 0.140 -83 M 0.120 -84 P 0.101 -85 G 0.089 -86 C 0.083 -87 R 0.086 -88 K 0.095 -89 H 0.106 -90 F 0.111 -91 I 0.109 -92 Q 0.099 -93 A 0.086 -94 I 0.073 -95 C 0.060 -96 F 0.052 -97 Y 0.051 -98 E 0.056 -99 C 0.068 -100 S 0.088 -101 P 0.108 -102 N 0.120 -103 L 0.123 -104 G 0.120 -105 P 0.117 -106 W 0.123 -107 I 0.144 -108 Q 0.180 -109 P 0.225 -110 V 0.271 -111 G 0.302 -112 S 0.311 -113 L 0.300 -114 G 0.279 -115 W 0.257 -116 E 0.242 -117 V 0.240 -118 A 0.251 -119 P 0.268 -120 S 0.283 -121 G 0.287 -122 Q 0.275 -123 G 0.248 -124 E 0.217 -125 R 0.203 -126 V 0.209 -127 V 0.219 -128 N 0.217 -129 V 0.196 -130 P 0.162 -131 L 0.122 -132 C 0.090 -133 Q 0.076 -134 E 0.074 -135 D 0.075 -136 C 0.078 -137 E 0.085 -138 E 0.091 -139 W 0.090 -140 W 0.086 -141 E 0.085 -142 D 0.085 -143 C 0.084 -144 R 0.088 -145 M 0.102 -146 S 0.118 -147 Y 0.122 -148 T 0.111 -149 C 0.095 -150 K 0.086 -151 S 0.085 -152 N 0.085 -153 W 0.087 -154 R 0.100 -155 G 0.120 -156 G 0.134 -157 W 0.134 -158 D 0.128 -159 W 0.126 -160 S 0.133 -161 Q 0.147 -162 G 0.158 -163 K 0.161 -164 N 0.157 -165 R 0.153 -166 C 0.153 -167 P 0.156 -168 K 0.161 -169 G 0.163 -170 A 0.160 -171 Q 0.147 -172 C 0.126 -173 L 0.104 -174 P 0.086 -175 F 0.075 -176 S 0.074 -177 H 0.080 -178 Y 0.086 -179 F 0.086 -180 P 0.080 -181 T 0.078 -182 P 0.083 -183 A 0.090 -184 D 0.088 -185 L 0.075 -186 C 0.062 -187 E 0.057 -188 K 0.058 -189 T 0.065 -190 W 0.077 -191 S 0.091 -192 N 0.099 -193 S 0.097 -194 F 0.096 -195 K 0.105 -196 A 0.125 -197 S 0.144 -198 P 0.152 -199 E 0.152 -200 R 0.160 -201 R 0.183 -202 N 0.209 -203 S 0.219 -204 G 0.207 -205 R 0.182 -206 C 0.160 -207 L 0.144 -208 Q 0.132 -209 K 0.130 -210 W 0.138 -211 F 0.154 -212 E 0.178 -213 P 0.207 -214 A 0.234 -215 Q 0.246 -216 G 0.234 -217 N 0.202 -218 P 0.166 -219 N 0.144 -220 V 0.142 -221 A 0.148 -222 V 0.148 -223 A 0.147 -224 R 0.155 -225 L 0.175 -226 F 0.205 -227 A 0.250 -228 S 0.312 -229 S 0.378 -230 A 0.435 -231 P 0.471 -232 S 0.488 -233 W 0.491 -234 E 0.476 -235 L 0.439 -236 S 0.396 -237 Y 0.356 -238 T 0.320 -239 I 0.298 -240 M 0.308 -241 V 0.332 -242 C 0.336 -243 S 0.330 -244 L 0.340 -245 F 0.367 -246 L 0.394 -247 P 0.416 -248 F 0.422 -249 L 0.399 -250 S 0.371 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000183560.10_ENST00000687084.1_GN:IZUMO1R_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000183560.10_ENST00000687084.1_GN:IZUMO1R_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid deleted file mode 100644 index 6a1177b19ee9a19dbd885bda34dd876dcf43398e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000183560.10_ENST00000687084.1_GN:IZUMO1R_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid +++ /dev/null @@ -1,281 +0,0 @@ ->ENSG00000183560.10|ENST00000687084.1|GN:IZUMO1R|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:30 -1 M 0.391 -2 G 0.404 -3 G 0.420 -4 T 0.432 -5 W 0.437 -6 N 0.446 -7 S 0.467 -8 P 0.492 -9 Q 0.507 -10 P 0.506 -11 H 0.492 -12 S 0.468 -13 L 0.443 -14 R 0.435 -15 G 0.435 -16 R 0.404 -17 R 0.356 -18 E 0.345 -19 Q 0.377 -20 E 0.409 -21 H 0.433 -22 L 0.472 -23 K 0.522 -24 A 0.559 -25 P 0.574 -26 A 0.565 -27 L 0.523 -28 K 0.468 -29 Q 0.442 -30 A 0.446 -31 M 0.440 -32 A 0.406 -33 C 0.370 -34 W 0.350 -35 W 0.346 -36 P 0.350 -37 L 0.353 -38 L 0.346 -39 L 0.329 -40 E 0.308 -41 L 0.292 -42 W 0.291 -43 T 0.305 -44 V 0.326 -45 M 0.347 -46 P 0.367 -47 T 0.387 -48 W 0.402 -49 A 0.400 -50 G 0.369 -51 D 0.316 -52 E 0.251 -53 L 0.186 -54 L 0.132 -55 N 0.099 -56 I 0.083 -57 C 0.076 -58 M 0.075 -59 N 0.079 -60 A 0.088 -61 K 0.101 -62 H 0.114 -63 H 0.121 -64 K 0.124 -65 R 0.132 -66 V 0.153 -67 P 0.183 -68 S 0.211 -69 P 0.228 -70 E 0.229 -71 D 0.216 -72 K 0.195 -73 L 0.172 -74 Y 0.147 -75 E 0.128 -76 E 0.122 -77 C 0.131 -78 I 0.142 -79 P 0.142 -80 W 0.135 -81 K 0.123 -82 D 0.108 -83 N 0.091 -84 A 0.078 -85 C 0.080 -86 C 0.104 -87 T 0.141 -88 L 0.166 -89 T 0.169 -90 T 0.160 -91 S 0.153 -92 W 0.155 -93 E 0.161 -94 A 0.166 -95 H 0.168 -96 L 0.167 -97 D 0.165 -98 V 0.166 -99 S 0.169 -100 P 0.169 -101 L 0.168 -102 Y 0.170 -103 N 0.176 -104 F 0.182 -105 S 0.180 -106 L 0.165 -107 F 0.151 -108 H 0.148 -109 C 0.153 -110 G 0.158 -111 L 0.155 -112 L 0.142 -113 M 0.122 -114 P 0.103 -115 G 0.089 -116 C 0.082 -117 R 0.084 -118 K 0.092 -119 H 0.102 -120 F 0.107 -121 I 0.104 -122 Q 0.094 -123 A 0.081 -124 I 0.068 -125 C 0.056 -126 F 0.049 -127 Y 0.049 -128 E 0.054 -129 C 0.067 -130 S 0.087 -131 P 0.108 -132 N 0.120 -133 L 0.123 -134 G 0.120 -135 P 0.118 -136 W 0.125 -137 I 0.147 -138 Q 0.184 -139 P 0.231 -140 V 0.278 -141 G 0.310 -142 S 0.320 -143 L 0.310 -144 G 0.290 -145 W 0.268 -146 E 0.254 -147 V 0.250 -148 A 0.259 -149 P 0.275 -150 S 0.288 -151 G 0.292 -152 Q 0.281 -153 G 0.254 -154 E 0.223 -155 R 0.207 -156 V 0.212 -157 V 0.221 -158 N 0.216 -159 V 0.195 -160 P 0.160 -161 L 0.120 -162 C 0.089 -163 Q 0.076 -164 E 0.075 -165 D 0.076 -166 C 0.079 -167 E 0.086 -168 E 0.092 -169 W 0.091 -170 W 0.087 -171 E 0.086 -172 D 0.087 -173 C 0.086 -174 R 0.090 -175 M 0.104 -176 S 0.120 -177 Y 0.124 -178 T 0.112 -179 C 0.095 -180 K 0.086 -181 S 0.085 -182 N 0.085 -183 W 0.087 -184 R 0.100 -185 G 0.120 -186 G 0.134 -187 W 0.134 -188 D 0.128 -189 W 0.126 -190 S 0.134 -191 Q 0.148 -192 G 0.159 -193 K 0.161 -194 N 0.157 -195 R 0.152 -196 C 0.151 -197 P 0.154 -198 K 0.158 -199 G 0.161 -200 A 0.157 -201 Q 0.143 -202 C 0.123 -203 L 0.101 -204 P 0.084 -205 F 0.073 -206 S 0.072 -207 H 0.078 -208 Y 0.084 -209 F 0.084 -210 P 0.079 -211 T 0.077 -212 P 0.081 -213 A 0.088 -214 D 0.087 -215 L 0.074 -216 C 0.061 -217 E 0.056 -218 K 0.057 -219 T 0.064 -220 W 0.075 -221 S 0.089 -222 N 0.096 -223 S 0.095 -224 F 0.094 -225 K 0.103 -226 A 0.123 -227 S 0.142 -228 P 0.149 -229 E 0.147 -230 R 0.154 -231 R 0.176 -232 N 0.203 -233 S 0.215 -234 G 0.204 -235 R 0.181 -236 C 0.160 -237 L 0.143 -238 Q 0.132 -239 K 0.129 -240 W 0.137 -241 F 0.153 -242 E 0.177 -243 P 0.206 -244 A 0.234 -245 Q 0.247 -246 G 0.236 -247 N 0.204 -248 P 0.166 -249 N 0.142 -250 V 0.138 -251 A 0.143 -252 V 0.142 -253 A 0.139 -254 R 0.146 -255 L 0.164 -256 F 0.193 -257 A 0.240 -258 S 0.304 -259 S 0.374 -260 A 0.434 -261 P 0.473 -262 S 0.490 -263 W 0.493 -264 E 0.476 -265 L 0.439 -266 S 0.396 -267 Y 0.369 -268 T 0.359 -269 I 0.363 -270 M 0.371 -271 V 0.364 -272 C 0.338 -273 S 0.319 -274 L 0.331 -275 F 0.360 -276 L 0.387 -277 P 0.409 -278 F 0.415 -279 L 0.395 -280 S 0.368 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185245.9_ENST00000329125.6_GN:GP1BA_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185245.9_ENST00000329125.6_GN:GP1BA_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 843fbfe1b53b05edfb50199790e5546f2ae75656..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185245.9_ENST00000329125.6_GN:GP1BA_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,653 +0,0 @@ ->ENSG00000185245.9|ENST00000329125.6|GN:GP1BA|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.274 -2 P 0.257 -3 L 0.230 -4 L 0.204 -5 L 0.189 -6 L 0.188 -7 L 0.206 -8 L 0.238 -9 L 0.280 -10 L 0.333 -11 P 0.397 -12 S 0.458 -13 P 0.492 -14 L 0.493 -15 H 0.475 -16 P 0.437 -17 H 0.367 -18 P 0.267 -19 I 0.167 -20 C 0.098 -21 E 0.069 -22 V 0.069 -23 S 0.079 -24 K 0.088 -25 V 0.090 -26 A 0.087 -27 S 0.084 -28 H 0.082 -29 L 0.081 -30 E 0.083 -31 V 0.088 -32 N 0.095 -33 C 0.102 -34 D 0.109 -35 K 0.112 -36 R 0.113 -37 N 0.112 -38 L 0.110 -39 T 0.109 -40 A 0.113 -41 L 0.118 -42 P 0.114 -43 P 0.100 -44 D 0.083 -45 L 0.070 -46 P 0.063 -47 K 0.066 -48 D 0.076 -49 T 0.092 -50 T 0.114 -51 I 0.137 -52 L 0.152 -53 H 0.159 -54 L 0.160 -55 S 0.153 -56 E 0.135 -57 N 0.109 -58 L 0.086 -59 L 0.073 -60 Y 0.069 -61 T 0.072 -62 F 0.074 -63 S 0.072 -64 L 0.065 -65 A 0.058 -66 T 0.050 -67 L 0.045 -68 M 0.040 -69 P 0.035 -70 Y 0.035 -71 T 0.041 -72 R 0.051 -73 L 0.060 -74 T 0.072 -75 Q 0.085 -76 L 0.099 -77 N 0.111 -78 L 0.123 -79 D 0.125 -80 R 0.112 -81 C 0.092 -82 E 0.078 -83 L 0.074 -84 T 0.075 -85 K 0.079 -86 L 0.083 -87 Q 0.082 -88 V 0.080 -89 D 0.079 -90 G 0.079 -91 T 0.083 -92 L 0.088 -93 P 0.090 -94 V 0.089 -95 L 0.092 -96 G 0.106 -97 T 0.125 -98 L 0.140 -99 D 0.147 -100 L 0.147 -101 S 0.139 -102 H 0.124 -103 N 0.111 -104 Q 0.106 -105 L 0.109 -106 Q 0.115 -107 S 0.127 -108 L 0.142 -109 P 0.146 -110 L 0.135 -111 L 0.117 -112 G 0.100 -113 Q 0.086 -114 T 0.076 -115 L 0.074 -116 P 0.080 -117 A 0.087 -118 L 0.096 -119 T 0.110 -120 V 0.125 -121 L 0.133 -122 D 0.132 -123 V 0.130 -124 S 0.131 -125 F 0.129 -126 N 0.122 -127 R 0.117 -128 L 0.117 -129 T 0.126 -130 S 0.147 -131 L 0.173 -132 P 0.189 -133 L 0.186 -134 G 0.164 -135 A 0.137 -136 L 0.120 -137 R 0.116 -138 G 0.119 -139 L 0.124 -140 G 0.130 -141 E 0.133 -142 L 0.136 -143 Q 0.146 -144 E 0.158 -145 L 0.165 -146 Y 0.164 -147 L 0.159 -148 K 0.147 -149 G 0.126 -150 N 0.106 -151 E 0.100 -152 L 0.107 -153 K 0.123 -154 T 0.147 -155 L 0.171 -156 P 0.183 -157 P 0.179 -158 G 0.162 -159 L 0.138 -160 L 0.113 -161 T 0.091 -162 P 0.079 -163 T 0.081 -164 P 0.094 -165 K 0.109 -166 L 0.119 -167 E 0.124 -168 K 0.124 -169 L 0.124 -170 S 0.130 -171 L 0.141 -172 A 0.148 -173 N 0.141 -174 N 0.124 -175 N 0.111 -176 L 0.110 -177 T 0.124 -178 E 0.152 -179 L 0.179 -180 P 0.184 -181 A 0.172 -182 G 0.154 -183 L 0.132 -184 L 0.111 -185 N 0.099 -186 G 0.102 -187 L 0.119 -188 E 0.140 -189 N 0.154 -190 L 0.150 -191 D 0.140 -192 T 0.138 -193 L 0.140 -194 L 0.141 -195 L 0.143 -196 Q 0.143 -197 E 0.128 -198 N 0.099 -199 S 0.072 -200 L 0.062 -201 Y 0.070 -202 T 0.091 -203 I 0.113 -204 P 0.123 -205 K 0.119 -206 G 0.105 -207 F 0.090 -208 F 0.086 -209 G 0.095 -210 S 0.106 -211 H 0.111 -212 L 0.115 -213 L 0.125 -214 P 0.134 -215 F 0.138 -216 A 0.136 -217 F 0.133 -218 L 0.131 -219 H 0.129 -220 G 0.119 -221 N 0.099 -222 P 0.077 -223 W 0.061 -224 L 0.048 -225 C 0.038 -226 N 0.034 -227 C 0.035 -228 E 0.036 -229 I 0.035 -230 L 0.032 -231 Y 0.029 -232 F 0.027 -233 R 0.027 -234 R 0.029 -235 W 0.032 -236 L 0.035 -237 Q 0.036 -238 D 0.037 -239 N 0.037 -240 A 0.039 -241 E 0.042 -242 N 0.048 -243 V 0.060 -244 Y 0.082 -245 V 0.115 -246 W 0.153 -247 K 0.186 -248 Q 0.206 -249 G 0.210 -250 V 0.207 -251 D 0.205 -252 V 0.202 -253 K 0.195 -254 A 0.187 -255 M 0.184 -256 T 0.185 -257 S 0.188 -258 N 0.189 -259 V 0.184 -260 A 0.164 -261 S 0.134 -262 V 0.105 -263 Q 0.088 -264 C 0.085 -265 D 0.088 -266 N 0.094 -267 S 0.100 -268 D 0.107 -269 K 0.109 -270 F 0.105 -271 P 0.099 -272 V 0.094 -273 Y 0.096 -274 K 0.107 -275 Y 0.123 -276 P 0.136 -277 G 0.148 -278 K 0.168 -279 G 0.206 -280 C 0.276 -281 P 0.383 -282 T 0.507 -283 L 0.616 -284 G 0.683 -285 D 0.709 -286 E 0.712 -287 G 0.708 -288 D 0.701 -289 T 0.691 -290 D 0.676 -291 L 0.654 -292 Y 0.623 -293 D 0.584 -294 Y 0.558 -295 Y 0.569 -296 P 0.614 -297 E 0.667 -298 E 0.705 -299 D 0.720 -300 T 0.721 -301 E 0.723 -302 G 0.735 -303 D 0.750 -304 K 0.758 -305 V 0.758 -306 R 0.754 -307 A 0.748 -308 T 0.741 -309 R 0.736 -310 T 0.730 -311 V 0.718 -312 V 0.704 -313 K 0.703 -314 F 0.720 -315 P 0.746 -316 T 0.767 -317 K 0.774 -318 A 0.764 -319 H 0.740 -320 T 0.715 -321 T 0.694 -322 P 0.683 -323 W 0.686 -324 G 0.701 -325 L 0.716 -326 F 0.722 -327 Y 0.723 -328 S 0.722 -329 W 0.720 -330 S 0.724 -331 T 0.738 -332 A 0.755 -333 S 0.766 -334 L 0.771 -335 D 0.767 -336 S 0.751 -337 Q 0.728 -338 M 0.716 -339 P 0.727 -340 S 0.748 -341 S 0.761 -342 L 0.763 -343 H 0.763 -344 P 0.754 -345 T 0.717 -346 Q 0.655 -347 E 0.609 -348 S 0.599 -349 T 0.600 -350 K 0.607 -351 E 0.643 -352 Q 0.681 -353 T 0.681 -354 T 0.653 -355 F 0.634 -356 P 0.640 -357 P 0.654 -358 R 0.650 -359 W 0.637 -360 T 0.645 -361 P 0.673 -362 N 0.699 -363 F 0.711 -364 T 0.719 -365 L 0.730 -366 H 0.744 -367 M 0.756 -368 E 0.758 -369 S 0.746 -370 I 0.728 -371 T 0.715 -372 F 0.710 -373 S 0.711 -374 K 0.715 -375 T 0.727 -376 P 0.750 -377 K 0.775 -378 S 0.788 -379 T 0.781 -380 T 0.763 -381 E 0.745 -382 P 0.733 -383 T 0.728 -384 P 0.730 -385 S 0.734 -386 P 0.727 -387 T 0.679 -388 T 0.578 -389 S 0.475 -390 E 0.440 -391 P 0.460 -392 V 0.464 -393 P 0.448 -394 E 0.468 -395 P 0.523 -396 A 0.566 -397 P 0.598 -398 N 0.642 -399 M 0.669 -400 T 0.650 -401 T 0.631 -402 L 0.660 -403 E 0.715 -404 P 0.754 -405 T 0.769 -406 P 0.777 -407 S 0.786 -408 P 0.793 -409 T 0.795 -410 T 0.795 -411 P 0.796 -412 E 0.801 -413 P 0.804 -414 T 0.799 -415 S 0.788 -416 E 0.777 -417 P 0.771 -418 A 0.768 -419 P 0.767 -420 S 0.768 -421 P 0.767 -422 T 0.763 -423 T 0.760 -424 P 0.766 -425 E 0.777 -426 P 0.783 -427 T 0.780 -428 S 0.771 -429 E 0.762 -430 P 0.755 -431 A 0.751 -432 P 0.750 -433 S 0.751 -434 P 0.752 -435 T 0.750 -436 T 0.749 -437 P 0.754 -438 E 0.766 -439 P 0.776 -440 T 0.779 -441 S 0.778 -442 E 0.778 -443 P 0.780 -444 A 0.783 -445 P 0.786 -446 S 0.787 -447 P 0.782 -448 T 0.768 -449 T 0.753 -450 P 0.745 -451 E 0.741 -452 P 0.739 -453 T 0.738 -454 P 0.744 -455 I 0.760 -456 P 0.779 -457 T 0.793 -458 I 0.795 -459 A 0.787 -460 T 0.776 -461 S 0.773 -462 P 0.779 -463 T 0.786 -464 I 0.774 -465 L 0.730 -466 V 0.667 -467 S 0.637 -468 A 0.672 -469 T 0.733 -470 S 0.769 -471 L 0.772 -472 I 0.765 -473 T 0.768 -474 P 0.784 -475 K 0.803 -476 S 0.818 -477 T 0.824 -478 F 0.824 -479 L 0.821 -480 T 0.816 -481 T 0.808 -482 T 0.802 -483 K 0.806 -484 P 0.818 -485 V 0.832 -486 S 0.840 -487 L 0.840 -488 L 0.836 -489 E 0.831 -490 S 0.826 -491 T 0.821 -492 K 0.814 -493 K 0.806 -494 T 0.798 -495 I 0.794 -496 P 0.796 -497 E 0.797 -498 L 0.786 -499 D 0.762 -500 Q 0.741 -501 P 0.741 -502 P 0.762 -503 K 0.788 -504 L 0.805 -505 R 0.812 -506 G 0.811 -507 V 0.807 -508 L 0.802 -509 Q 0.800 -510 G 0.797 -511 H 0.793 -512 L 0.789 -513 E 0.787 -514 S 0.782 -515 S 0.772 -516 R 0.756 -517 N 0.736 -518 D 0.715 -519 P 0.692 -520 F 0.669 -521 L 0.658 -522 H 0.656 -523 P 0.642 -524 D 0.590 -525 F 0.508 -526 C 0.438 -527 C 0.417 -528 L 0.430 -529 L 0.434 -530 P 0.409 -531 L 0.368 -532 G 0.327 -533 F 0.296 -534 Y 0.280 -535 V 0.284 -536 L 0.308 -537 G 0.340 -538 L 0.359 -539 F 0.352 -540 W 0.323 -541 L 0.284 -542 L 0.247 -543 F 0.223 -544 A 0.212 -545 S 0.204 -546 V 0.192 -547 V 0.177 -548 L 0.159 -549 I 0.144 -550 L 0.140 -551 L 0.144 -552 L 0.157 -553 S 0.180 -554 W 0.217 -555 V 0.262 -556 G 0.305 -557 H 0.346 -558 V 0.397 -559 K 0.464 -560 P 0.539 -561 Q 0.609 -562 A 0.664 -563 L 0.700 -564 D 0.720 -565 S 0.735 -566 G 0.751 -567 Q 0.764 -568 G 0.773 -569 A 0.777 -570 A 0.779 -571 L 0.776 -572 T 0.767 -573 T 0.745 -574 A 0.700 -575 T 0.620 -576 Q 0.501 -577 T 0.368 -578 T 0.258 -579 H 0.193 -580 L 0.170 -581 E 0.181 -582 L 0.223 -583 Q 0.277 -584 R 0.311 -585 G 0.304 -586 R 0.271 -587 Q 0.236 -588 V 0.217 -589 T 0.220 -590 V 0.227 -591 P 0.215 -592 R 0.180 -593 A 0.144 -594 W 0.122 -595 L 0.113 -596 L 0.118 -597 F 0.135 -598 L 0.156 -599 R 0.175 -600 G 0.188 -601 S 0.195 -602 L 0.193 -603 P 0.183 -604 T 0.168 -605 F 0.149 -606 R 0.130 -607 S 0.111 -608 S 0.093 -609 L 0.076 -610 F 0.068 -611 L 0.071 -612 W 0.085 -613 V 0.109 -614 R 0.138 -615 P 0.165 -616 N 0.185 -617 G 0.197 -618 R 0.197 -619 V 0.190 -620 G 0.186 -621 P 0.190 -622 L 0.207 -623 V 0.245 -624 A 0.307 -625 G 0.382 -626 R 0.451 -627 R 0.506 -628 P 0.550 -629 S 0.586 -630 A 0.608 -631 L 0.616 -632 S 0.614 -633 Q 0.612 -634 G 0.612 -635 R 0.598 -636 G 0.553 -637 Q 0.485 -638 D 0.417 -639 L 0.362 -640 L 0.316 -641 S 0.267 -642 T 0.214 -643 V 0.163 -644 S 0.130 -645 I 0.119 -646 R 0.121 -647 Y 0.125 -648 S 0.131 -649 G 0.135 -650 H 0.135 -651 S 0.127 -652 L 0.118 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185245.9_ENST00000329125.6_GN:GP1BA_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:29.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185245.9_ENST00000329125.6_GN:GP1BA_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:29.caid deleted file mode 100644 index 74765d69b02c0da66184fc75c9f6dd7b18e59885..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185245.9_ENST00000329125.6_GN:GP1BA_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:29.caid +++ /dev/null @@ -1,682 +0,0 @@ ->ENSG00000185245.9|ENST00000329125.6|GN:GP1BA|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:29 -1 M 0.398 -2 G 0.412 -3 L 0.429 -4 E 0.428 -5 E 0.395 -6 R 0.357 -7 R 0.364 -8 T 0.411 -9 E 0.453 -10 S 0.489 -11 S 0.548 -12 G 0.615 -13 T 0.648 -14 L 0.643 -15 E 0.620 -16 D 0.578 -17 A 0.507 -18 L 0.436 -19 C 0.409 -20 L 0.430 -21 R 0.460 -22 R 0.471 -23 S 0.465 -24 F 0.454 -25 C 0.438 -26 L 0.410 -27 P 0.365 -28 V 0.314 -29 L 0.274 -30 M 0.247 -31 P 0.223 -32 L 0.197 -33 L 0.177 -34 L 0.171 -35 L 0.176 -36 L 0.187 -37 L 0.206 -38 L 0.241 -39 L 0.299 -40 P 0.374 -41 S 0.448 -42 P 0.497 -43 L 0.508 -44 H 0.490 -45 P 0.446 -46 H 0.374 -47 P 0.275 -48 I 0.174 -49 C 0.102 -50 E 0.071 -51 V 0.070 -52 S 0.080 -53 K 0.089 -54 V 0.090 -55 A 0.085 -56 S 0.079 -57 H 0.076 -58 L 0.077 -59 E 0.080 -60 V 0.086 -61 N 0.092 -62 C 0.099 -63 D 0.105 -64 K 0.107 -65 R 0.108 -66 N 0.107 -67 L 0.105 -68 T 0.103 -69 A 0.106 -70 L 0.109 -71 P 0.105 -72 P 0.092 -73 D 0.076 -74 L 0.063 -75 P 0.059 -76 K 0.062 -77 D 0.071 -78 T 0.085 -79 T 0.106 -80 I 0.127 -81 L 0.141 -82 H 0.145 -83 L 0.144 -84 S 0.137 -85 E 0.121 -86 N 0.097 -87 L 0.075 -88 L 0.062 -89 Y 0.059 -90 T 0.062 -91 F 0.064 -92 S 0.063 -93 L 0.058 -94 A 0.052 -95 T 0.045 -96 L 0.040 -97 M 0.036 -98 P 0.031 -99 Y 0.031 -100 T 0.037 -101 R 0.046 -102 L 0.056 -103 T 0.067 -104 Q 0.080 -105 L 0.093 -106 N 0.105 -107 L 0.117 -108 D 0.120 -109 R 0.108 -110 C 0.088 -111 E 0.073 -112 L 0.068 -113 T 0.070 -114 K 0.076 -115 L 0.080 -116 Q 0.080 -117 V 0.079 -118 D 0.079 -119 G 0.081 -120 T 0.086 -121 L 0.092 -122 P 0.095 -123 V 0.095 -124 L 0.100 -125 G 0.116 -126 T 0.138 -127 L 0.156 -128 D 0.166 -129 L 0.167 -130 S 0.159 -131 H 0.143 -132 N 0.126 -133 Q 0.120 -134 L 0.123 -135 Q 0.131 -136 S 0.145 -137 L 0.162 -138 P 0.166 -139 L 0.153 -140 L 0.132 -141 G 0.114 -142 Q 0.099 -143 T 0.087 -144 L 0.084 -145 P 0.089 -146 A 0.097 -147 L 0.105 -148 T 0.117 -149 V 0.131 -150 L 0.138 -151 D 0.136 -152 V 0.134 -153 S 0.134 -154 F 0.133 -155 N 0.127 -156 R 0.123 -157 L 0.124 -158 T 0.133 -159 S 0.154 -160 L 0.180 -161 P 0.194 -162 L 0.190 -163 G 0.168 -164 A 0.140 -165 L 0.121 -166 R 0.116 -167 G 0.118 -168 L 0.122 -169 G 0.126 -170 E 0.129 -171 L 0.133 -172 Q 0.144 -173 E 0.157 -174 L 0.163 -175 Y 0.161 -176 L 0.154 -177 K 0.141 -178 G 0.121 -179 N 0.104 -180 E 0.100 -181 L 0.107 -182 K 0.122 -183 T 0.146 -184 L 0.169 -185 P 0.179 -186 P 0.171 -187 G 0.152 -188 L 0.127 -189 L 0.103 -190 T 0.085 -191 P 0.074 -192 T 0.077 -193 P 0.090 -194 K 0.106 -195 L 0.118 -196 E 0.125 -197 K 0.126 -198 L 0.123 -199 S 0.125 -200 L 0.133 -201 A 0.139 -202 N 0.133 -203 N 0.118 -204 N 0.106 -205 L 0.105 -206 T 0.117 -207 E 0.142 -208 L 0.168 -209 P 0.174 -210 A 0.163 -211 G 0.145 -212 L 0.123 -213 L 0.102 -214 N 0.091 -215 G 0.093 -216 L 0.109 -217 E 0.131 -218 N 0.145 -219 L 0.142 -220 D 0.132 -221 T 0.131 -222 L 0.135 -223 L 0.138 -224 L 0.142 -225 Q 0.142 -226 E 0.128 -227 N 0.098 -228 S 0.071 -229 L 0.060 -230 Y 0.067 -231 T 0.087 -232 I 0.109 -233 P 0.120 -234 K 0.117 -235 G 0.103 -236 F 0.088 -237 F 0.084 -238 G 0.094 -239 S 0.105 -240 H 0.110 -241 L 0.115 -242 L 0.125 -243 P 0.133 -244 F 0.137 -245 A 0.136 -246 F 0.133 -247 L 0.132 -248 H 0.130 -249 G 0.120 -250 N 0.100 -251 P 0.079 -252 W 0.062 -253 L 0.050 -254 C 0.040 -255 N 0.035 -256 C 0.036 -257 E 0.037 -258 I 0.036 -259 L 0.032 -260 Y 0.030 -261 F 0.028 -262 R 0.028 -263 R 0.030 -264 W 0.033 -265 L 0.036 -266 Q 0.038 -267 D 0.038 -268 N 0.039 -269 A 0.041 -270 E 0.045 -271 N 0.052 -272 V 0.065 -273 Y 0.089 -274 V 0.125 -275 W 0.166 -276 K 0.203 -277 Q 0.226 -278 G 0.231 -279 V 0.226 -280 D 0.221 -281 V 0.216 -282 K 0.206 -283 A 0.196 -284 M 0.192 -285 T 0.193 -286 S 0.197 -287 N 0.199 -288 V 0.194 -289 A 0.173 -290 S 0.141 -291 V 0.111 -292 Q 0.093 -293 C 0.090 -294 D 0.094 -295 N 0.099 -296 S 0.106 -297 D 0.112 -298 K 0.115 -299 F 0.112 -300 P 0.105 -301 V 0.100 -302 Y 0.101 -303 K 0.112 -304 Y 0.128 -305 P 0.142 -306 G 0.157 -307 K 0.179 -308 G 0.219 -309 C 0.292 -310 P 0.401 -311 T 0.526 -312 L 0.632 -313 G 0.696 -314 D 0.719 -315 E 0.722 -316 G 0.718 -317 D 0.712 -318 T 0.703 -319 D 0.688 -320 L 0.666 -321 Y 0.634 -322 D 0.594 -323 Y 0.565 -324 Y 0.575 -325 P 0.621 -326 E 0.675 -327 E 0.713 -328 D 0.727 -329 T 0.728 -330 E 0.731 -331 G 0.744 -332 D 0.760 -333 K 0.769 -334 V 0.769 -335 R 0.765 -336 A 0.760 -337 T 0.754 -338 R 0.750 -339 T 0.744 -340 V 0.732 -341 V 0.719 -342 K 0.716 -343 F 0.729 -344 P 0.751 -345 T 0.770 -346 K 0.777 -347 A 0.768 -348 H 0.744 -349 T 0.718 -350 T 0.696 -351 P 0.685 -352 W 0.688 -353 G 0.704 -354 L 0.718 -355 F 0.724 -356 Y 0.725 -357 S 0.723 -358 W 0.717 -359 S 0.718 -360 T 0.730 -361 A 0.747 -362 S 0.761 -363 L 0.768 -364 D 0.766 -365 S 0.752 -366 Q 0.730 -367 M 0.720 -368 P 0.730 -369 S 0.750 -370 S 0.761 -371 L 0.763 -372 H 0.762 -373 P 0.754 -374 T 0.719 -375 Q 0.661 -376 E 0.631 -377 S 0.662 -378 T 0.721 -379 K 0.758 -380 E 0.762 -381 Q 0.739 -382 T 0.698 -383 T 0.655 -384 F 0.633 -385 P 0.640 -386 P 0.655 -387 R 0.653 -388 W 0.641 -389 T 0.648 -390 P 0.675 -391 N 0.699 -392 F 0.710 -393 T 0.717 -394 L 0.727 -395 H 0.741 -396 M 0.752 -397 E 0.753 -398 S 0.739 -399 I 0.718 -400 T 0.703 -401 F 0.699 -402 S 0.703 -403 K 0.710 -404 T 0.724 -405 P 0.747 -406 K 0.772 -407 S 0.785 -408 T 0.779 -409 T 0.762 -410 E 0.745 -411 P 0.734 -412 T 0.729 -413 P 0.731 -414 S 0.739 -415 P 0.747 -416 T 0.736 -417 T 0.689 -418 S 0.616 -419 E 0.565 -420 P 0.559 -421 V 0.560 -422 P 0.541 -423 E 0.534 -424 P 0.557 -425 A 0.588 -426 P 0.618 -427 N 0.658 -428 M 0.677 -429 T 0.654 -430 T 0.633 -431 L 0.660 -432 E 0.714 -433 P 0.752 -434 T 0.767 -435 P 0.774 -436 S 0.783 -437 P 0.790 -438 T 0.793 -439 T 0.793 -440 P 0.793 -441 E 0.797 -442 P 0.800 -443 T 0.796 -444 S 0.785 -445 E 0.774 -446 P 0.768 -447 A 0.765 -448 P 0.764 -449 S 0.767 -450 P 0.768 -451 T 0.766 -452 T 0.765 -453 P 0.771 -454 E 0.782 -455 P 0.788 -456 T 0.786 -457 S 0.778 -458 E 0.769 -459 P 0.762 -460 A 0.758 -461 P 0.757 -462 S 0.759 -463 P 0.760 -464 T 0.759 -465 T 0.758 -466 P 0.762 -467 E 0.773 -468 P 0.784 -469 T 0.788 -470 S 0.787 -471 E 0.787 -472 P 0.789 -473 A 0.792 -474 P 0.795 -475 S 0.796 -476 P 0.790 -477 T 0.777 -478 T 0.762 -479 P 0.753 -480 E 0.750 -481 P 0.747 -482 T 0.746 -483 P 0.752 -484 I 0.768 -485 P 0.788 -486 T 0.801 -487 I 0.803 -488 A 0.795 -489 T 0.785 -490 S 0.781 -491 P 0.787 -492 T 0.793 -493 I 0.781 -494 L 0.736 -495 V 0.672 -496 S 0.641 -497 A 0.676 -498 T 0.738 -499 S 0.773 -500 L 0.777 -501 I 0.771 -502 T 0.775 -503 P 0.791 -504 K 0.810 -505 S 0.823 -506 T 0.828 -507 F 0.827 -508 L 0.824 -509 T 0.819 -510 T 0.812 -511 T 0.806 -512 K 0.810 -513 P 0.822 -514 V 0.835 -515 S 0.841 -516 L 0.841 -517 L 0.837 -518 E 0.832 -519 S 0.828 -520 T 0.823 -521 K 0.816 -522 K 0.809 -523 T 0.802 -524 I 0.799 -525 P 0.801 -526 E 0.802 -527 L 0.789 -528 D 0.764 -529 Q 0.743 -530 P 0.743 -531 P 0.764 -532 K 0.790 -533 L 0.806 -534 R 0.812 -535 G 0.811 -536 V 0.805 -537 L 0.799 -538 Q 0.796 -539 G 0.794 -540 H 0.790 -541 L 0.786 -542 E 0.784 -543 S 0.778 -544 S 0.765 -545 R 0.745 -546 N 0.721 -547 D 0.697 -548 P 0.671 -549 F 0.645 -550 L 0.633 -551 H 0.633 -552 P 0.621 -553 D 0.570 -554 F 0.489 -555 C 0.422 -556 C 0.399 -557 L 0.404 -558 L 0.400 -559 P 0.373 -560 L 0.334 -561 G 0.296 -562 F 0.267 -563 Y 0.251 -564 V 0.256 -565 L 0.282 -566 G 0.316 -567 L 0.339 -568 F 0.337 -569 W 0.312 -570 L 0.274 -571 L 0.238 -572 F 0.214 -573 A 0.201 -574 S 0.190 -575 V 0.177 -576 V 0.163 -577 L 0.148 -578 I 0.136 -579 L 0.132 -580 L 0.137 -581 L 0.148 -582 S 0.172 -583 W 0.209 -584 V 0.255 -585 G 0.299 -586 H 0.340 -587 V 0.389 -588 K 0.455 -589 P 0.529 -590 Q 0.598 -591 A 0.654 -592 L 0.691 -593 D 0.714 -594 S 0.731 -595 G 0.749 -596 Q 0.764 -597 G 0.774 -598 A 0.779 -599 A 0.778 -600 L 0.774 -601 T 0.764 -602 T 0.743 -603 A 0.703 -604 T 0.627 -605 Q 0.511 -606 T 0.375 -607 T 0.262 -608 H 0.194 -609 L 0.169 -610 E 0.179 -611 L 0.220 -612 Q 0.276 -613 R 0.313 -614 G 0.311 -615 R 0.280 -616 Q 0.243 -617 V 0.223 -618 T 0.224 -619 V 0.231 -620 P 0.219 -621 R 0.182 -622 A 0.146 -623 W 0.123 -624 L 0.114 -625 L 0.118 -626 F 0.136 -627 L 0.157 -628 R 0.175 -629 G 0.190 -630 S 0.197 -631 L 0.195 -632 P 0.185 -633 T 0.170 -634 F 0.152 -635 R 0.133 -636 S 0.115 -637 S 0.095 -638 L 0.078 -639 F 0.068 -640 L 0.071 -641 W 0.085 -642 V 0.111 -643 R 0.141 -644 P 0.168 -645 N 0.189 -646 G 0.201 -647 R 0.201 -648 V 0.193 -649 G 0.189 -650 P 0.192 -651 L 0.208 -652 V 0.246 -653 A 0.311 -654 G 0.388 -655 R 0.458 -656 R 0.512 -657 P 0.552 -658 S 0.585 -659 A 0.606 -660 L 0.614 -661 S 0.612 -662 Q 0.610 -663 G 0.610 -664 R 0.596 -665 G 0.553 -666 Q 0.486 -667 D 0.419 -668 L 0.364 -669 L 0.317 -670 S 0.268 -671 T 0.213 -672 V 0.162 -673 S 0.130 -674 I 0.119 -675 R 0.121 -676 Y 0.126 -677 S 0.131 -678 G 0.136 -679 H 0.135 -680 S 0.128 -681 L 0.120 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185614.8_ENST00000333323.6_GN:INKA1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185614.8_ENST00000333323.6_GN:INKA1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 5e8e2838673481ac51ac43b8af4f7c907525d04e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185614.8_ENST00000333323.6_GN:INKA1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,286 +0,0 @@ ->ENSG00000185614.8|ENST00000333323.6|GN:INKA1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.402 -2 H 0.424 -3 S 0.452 -4 A 0.460 -5 R 0.425 -6 L 0.359 -7 D 0.297 -8 S 0.255 -9 F 0.225 -10 L 0.200 -11 S 0.187 -12 Q 0.189 -13 L 0.193 -14 R 0.194 -15 W 0.198 -16 E 0.214 -17 L 0.251 -18 L 0.327 -19 C 0.447 -20 G 0.580 -21 R 0.686 -22 D 0.746 -23 T 0.767 -24 G 0.768 -25 S 0.765 -26 P 0.762 -27 S 0.759 -28 M 0.757 -29 P 0.765 -30 G 0.782 -31 P 0.799 -32 L 0.809 -33 Q 0.814 -34 P 0.809 -35 T 0.774 -36 S 0.711 -37 Q 0.670 -38 T 0.696 -39 G 0.760 -40 P 0.811 -41 D 0.833 -42 V 0.838 -43 Q 0.839 -44 P 0.845 -45 S 0.856 -46 H 0.869 -47 Q 0.880 -48 L 0.889 -49 R 0.897 -50 A 0.902 -51 S 0.904 -52 G 0.904 -53 A 0.905 -54 L 0.905 -55 E 0.904 -56 E 0.901 -57 D 0.899 -58 S 0.898 -59 V 0.899 -60 C 0.899 -61 C 0.891 -62 V 0.866 -63 E 0.809 -64 E 0.735 -65 E 0.696 -66 E 0.725 -67 E 0.788 -68 E 0.835 -69 E 0.859 -70 E 0.873 -71 E 0.884 -72 A 0.890 -73 V 0.891 -74 V 0.886 -75 T 0.879 -76 E 0.873 -77 D 0.870 -78 R 0.869 -79 D 0.870 -80 A 0.868 -81 A 0.861 -82 L 0.846 -83 G 0.830 -84 G 0.824 -85 P 0.831 -86 R 0.842 -87 E 0.851 -88 H 0.851 -89 A 0.843 -90 L 0.828 -91 D 0.809 -92 W 0.794 -93 D 0.792 -94 S 0.801 -95 G 0.818 -96 F 0.836 -97 S 0.850 -98 E 0.858 -99 V 0.860 -100 S 0.860 -101 G 0.857 -102 S 0.854 -103 T 0.851 -104 W 0.850 -105 R 0.848 -106 E 0.844 -107 E 0.832 -108 E 0.816 -109 L 0.801 -110 P 0.800 -111 V 0.811 -112 S 0.818 -113 Q 0.813 -114 R 0.805 -115 P 0.808 -116 A 0.822 -117 P 0.837 -118 S 0.842 -119 A 0.836 -120 Q 0.830 -121 P 0.834 -122 L 0.847 -123 R 0.860 -124 R 0.869 -125 Q 0.876 -126 C 0.880 -127 L 0.879 -128 S 0.872 -129 V 0.863 -130 S 0.853 -131 G 0.841 -132 L 0.828 -133 P 0.821 -134 M 0.825 -135 P 0.837 -136 S 0.848 -137 R 0.854 -138 A 0.860 -139 P 0.869 -140 V 0.875 -141 A 0.870 -142 S 0.850 -143 V 0.829 -144 P 0.821 -145 P 0.826 -146 V 0.829 -147 H 0.820 -148 H 0.807 -149 P 0.803 -150 R 0.810 -151 P 0.822 -152 K 0.828 -153 S 0.823 -154 T 0.814 -155 P 0.809 -156 D 0.807 -157 A 0.800 -158 C 0.785 -159 L 0.766 -160 E 0.746 -161 H 0.733 -162 W 0.736 -163 Q 0.754 -164 G 0.773 -165 L 0.777 -166 E 0.759 -167 A 0.716 -168 E 0.648 -169 D 0.562 -170 W 0.479 -171 T 0.427 -172 A 0.422 -173 A 0.461 -174 L 0.514 -175 L 0.549 -176 N 0.571 -177 R 0.604 -178 G 0.643 -179 R 0.674 -180 S 0.699 -181 R 0.723 -182 Q 0.747 -183 P 0.763 -184 L 0.764 -185 V 0.750 -186 L 0.729 -187 G 0.709 -188 D 0.699 -189 N 0.685 -190 C 0.643 -191 F 0.573 -192 A 0.520 -193 D 0.514 -194 L 0.528 -195 V 0.528 -196 H 0.524 -197 N 0.537 -198 W 0.561 -199 M 0.585 -200 E 0.613 -201 L 0.656 -202 P 0.711 -203 E 0.764 -204 T 0.802 -205 G 0.820 -206 S 0.825 -207 E 0.824 -208 G 0.822 -209 G 0.821 -210 D 0.820 -211 G 0.820 -212 G 0.821 -213 G 0.822 -214 H 0.821 -215 R 0.816 -216 A 0.801 -217 R 0.774 -218 A 0.736 -219 R 0.697 -220 P 0.668 -221 P 0.656 -222 Q 0.654 -223 F 0.650 -224 L 0.640 -225 L 0.620 -226 G 0.583 -227 L 0.514 -228 S 0.410 -229 E 0.302 -230 Q 0.226 -231 L 0.190 -232 R 0.181 -233 R 0.190 -234 R 0.209 -235 L 0.231 -236 A 0.254 -237 R 0.281 -238 A 0.310 -239 R 0.344 -240 R 0.384 -241 T 0.431 -242 A 0.478 -243 M 0.526 -244 A 0.579 -245 G 0.639 -246 K 0.690 -247 R 0.717 -248 L 0.717 -249 S 0.696 -250 C 0.667 -251 P 0.651 -252 P 0.653 -253 R 0.666 -254 P 0.680 -255 E 0.691 -256 P 0.697 -257 E 0.696 -258 L 0.685 -259 P 0.664 -260 A 0.633 -261 D 0.591 -262 V 0.546 -263 S 0.509 -264 R 0.479 -265 F 0.448 -266 A 0.425 -267 A 0.439 -268 L 0.489 -269 M 0.545 -270 S 0.587 -271 C 0.621 -272 R 0.656 -273 S 0.687 -274 R 0.709 -275 Q 0.727 -276 P 0.743 -277 I 0.745 -278 I 0.729 -279 C 0.704 -280 N 0.683 -281 D 0.673 -282 V 0.670 -283 S 0.651 -284 Y 0.598 -285 L 0.541 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185614.8_ENST00000333323.6_GN:INKA1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185614.8_ENST00000333323.6_GN:INKA1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid deleted file mode 100644 index 5eb2295d6cb7b2167c9683c5867b86a3a8f1af2a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185614.8_ENST00000333323.6_GN:INKA1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid +++ /dev/null @@ -1,288 +0,0 @@ ->ENSG00000185614.8|ENST00000333323.6|GN:INKA1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:2 -1 M 0.420 -2 D 0.425 -3 M 0.429 -4 H 0.428 -5 S 0.421 -6 A 0.402 -7 R 0.365 -8 L 0.319 -9 D 0.281 -10 S 0.251 -11 F 0.221 -12 L 0.195 -13 S 0.185 -14 Q 0.189 -15 L 0.193 -16 R 0.191 -17 W 0.193 -18 E 0.208 -19 L 0.247 -20 L 0.325 -21 C 0.446 -22 G 0.580 -23 R 0.685 -24 D 0.745 -25 T 0.766 -26 G 0.767 -27 S 0.763 -28 P 0.760 -29 S 0.757 -30 M 0.756 -31 P 0.764 -32 G 0.781 -33 P 0.798 -34 L 0.809 -35 Q 0.813 -36 P 0.808 -37 T 0.774 -38 S 0.711 -39 Q 0.671 -40 T 0.697 -41 G 0.760 -42 P 0.811 -43 D 0.834 -44 V 0.839 -45 Q 0.840 -46 P 0.846 -47 S 0.857 -48 H 0.870 -49 Q 0.881 -50 L 0.890 -51 R 0.898 -52 A 0.904 -53 S 0.906 -54 G 0.906 -55 A 0.907 -56 L 0.908 -57 E 0.906 -58 E 0.903 -59 D 0.900 -60 S 0.900 -61 V 0.900 -62 C 0.900 -63 C 0.893 -64 V 0.868 -65 E 0.813 -66 E 0.741 -67 E 0.704 -68 E 0.732 -69 E 0.791 -70 E 0.836 -71 E 0.859 -72 E 0.872 -73 E 0.883 -74 A 0.889 -75 V 0.890 -76 V 0.885 -77 T 0.878 -78 E 0.873 -79 D 0.870 -80 R 0.869 -81 D 0.869 -82 A 0.868 -83 A 0.860 -84 L 0.845 -85 G 0.830 -86 G 0.824 -87 P 0.831 -88 R 0.843 -89 E 0.851 -90 H 0.851 -91 A 0.843 -92 L 0.828 -93 D 0.808 -94 W 0.793 -95 D 0.791 -96 S 0.800 -97 G 0.816 -98 F 0.834 -99 S 0.848 -100 E 0.856 -101 V 0.858 -102 S 0.857 -103 G 0.855 -104 S 0.852 -105 T 0.849 -106 W 0.848 -107 R 0.847 -108 E 0.843 -109 E 0.832 -110 E 0.815 -111 L 0.800 -112 P 0.799 -113 V 0.810 -114 S 0.818 -115 Q 0.812 -116 R 0.804 -117 P 0.808 -118 A 0.822 -119 P 0.837 -120 S 0.842 -121 A 0.836 -122 Q 0.830 -123 P 0.835 -124 L 0.848 -125 R 0.861 -126 R 0.870 -127 Q 0.877 -128 C 0.881 -129 L 0.880 -130 S 0.874 -131 V 0.864 -132 S 0.854 -133 G 0.842 -134 L 0.829 -135 P 0.821 -136 M 0.825 -137 P 0.837 -138 S 0.848 -139 R 0.855 -140 A 0.860 -141 P 0.869 -142 V 0.875 -143 A 0.869 -144 S 0.850 -145 V 0.829 -146 P 0.820 -147 P 0.826 -148 V 0.829 -149 H 0.820 -150 H 0.807 -151 P 0.802 -152 R 0.809 -153 P 0.821 -154 K 0.828 -155 S 0.823 -156 T 0.813 -157 P 0.809 -158 D 0.807 -159 A 0.800 -160 C 0.786 -161 L 0.767 -162 E 0.747 -163 H 0.733 -164 W 0.736 -165 Q 0.755 -166 G 0.774 -167 L 0.778 -168 E 0.760 -169 A 0.717 -170 E 0.648 -171 D 0.562 -172 W 0.479 -173 T 0.428 -174 A 0.423 -175 A 0.462 -176 L 0.516 -177 L 0.551 -178 N 0.574 -179 R 0.608 -180 G 0.648 -181 R 0.680 -182 S 0.704 -183 R 0.727 -184 Q 0.749 -185 P 0.764 -186 L 0.765 -187 V 0.751 -188 L 0.729 -189 G 0.709 -190 D 0.698 -191 N 0.684 -192 C 0.642 -193 F 0.572 -194 A 0.519 -195 D 0.514 -196 L 0.528 -197 V 0.528 -198 H 0.524 -199 N 0.537 -200 W 0.561 -201 M 0.584 -202 E 0.612 -203 L 0.655 -204 P 0.710 -205 E 0.763 -206 T 0.801 -207 G 0.820 -208 S 0.824 -209 E 0.824 -210 G 0.822 -211 G 0.821 -212 D 0.820 -213 G 0.820 -214 G 0.821 -215 G 0.822 -216 H 0.821 -217 R 0.816 -218 A 0.801 -219 R 0.773 -220 A 0.735 -221 R 0.696 -222 P 0.667 -223 P 0.655 -224 Q 0.653 -225 F 0.650 -226 L 0.638 -227 L 0.619 -228 G 0.582 -229 L 0.514 -230 S 0.410 -231 E 0.302 -232 Q 0.226 -233 L 0.190 -234 R 0.182 -235 R 0.191 -236 R 0.209 -237 L 0.231 -238 A 0.254 -239 R 0.281 -240 A 0.310 -241 R 0.344 -242 R 0.384 -243 T 0.431 -244 A 0.479 -245 M 0.525 -246 A 0.579 -247 G 0.640 -248 K 0.690 -249 R 0.717 -250 L 0.718 -251 S 0.696 -252 C 0.668 -253 P 0.652 -254 P 0.655 -255 R 0.668 -256 P 0.682 -257 E 0.693 -258 P 0.699 -259 E 0.699 -260 L 0.690 -261 P 0.670 -262 A 0.639 -263 D 0.598 -264 V 0.554 -265 S 0.518 -266 R 0.488 -267 F 0.456 -268 A 0.432 -269 A 0.445 -270 L 0.495 -271 M 0.550 -272 S 0.591 -273 C 0.625 -274 R 0.660 -275 S 0.692 -276 R 0.715 -277 Q 0.733 -278 P 0.748 -279 I 0.751 -280 I 0.736 -281 C 0.712 -282 N 0.692 -283 D 0.681 -284 V 0.676 -285 S 0.656 -286 Y 0.601 -287 L 0.543 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185674.11_ENST00000333017.7_GN:LYG2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185674.11_ENST00000333017.7_GN:LYG2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index e47253a14642492f55380e73cb9cfb9f382ca9d0..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185674.11_ENST00000333017.7_GN:LYG2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,213 +0,0 @@ ->ENSG00000185674.11|ENST00000333017.7|GN:LYG2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.363 -2 L 0.376 -3 S 0.394 -4 S 0.391 -5 V 0.354 -6 V 0.304 -7 F 0.285 -8 W 0.299 -9 G 0.309 -10 L 0.310 -11 I 0.339 -12 A 0.406 -13 L 0.472 -14 I 0.513 -15 G 0.539 -16 T 0.559 -17 S 0.570 -18 R 0.566 -19 G 0.546 -20 S 0.519 -21 Y 0.502 -22 P 0.499 -23 F 0.507 -24 S 0.514 -25 H 0.509 -26 S 0.493 -27 M 0.467 -28 K 0.435 -29 P 0.402 -30 H 0.374 -31 L 0.355 -32 H 0.336 -33 P 0.310 -34 R 0.273 -35 L 0.231 -36 Y 0.189 -37 H 0.153 -38 G 0.128 -39 C 0.112 -40 Y 0.103 -41 G 0.098 -42 D 0.093 -43 I 0.090 -44 M 0.091 -45 T 0.098 -46 M 0.114 -47 K 0.136 -48 T 0.162 -49 S 0.193 -50 G 0.220 -51 A 0.233 -52 T 0.228 -53 C 0.217 -54 D 0.216 -55 A 0.225 -56 N 0.230 -57 S 0.223 -58 V 0.208 -59 M 0.194 -60 N 0.186 -61 C 0.183 -62 G 0.178 -63 I 0.172 -64 R 0.164 -65 G 0.149 -66 S 0.133 -67 E 0.125 -68 M 0.120 -69 F 0.110 -70 A 0.096 -71 E 0.087 -72 M 0.084 -73 D 0.079 -74 L 0.071 -75 R 0.063 -76 A 0.060 -77 I 0.058 -78 K 0.055 -79 P 0.054 -80 Y 0.058 -81 Q 0.065 -82 T 0.065 -83 L 0.055 -84 I 0.045 -85 K 0.044 -86 E 0.050 -87 V 0.054 -88 G 0.055 -89 Q 0.054 -90 R 0.056 -91 H 0.060 -92 C 0.065 -93 V 0.066 -94 D 0.062 -95 P 0.057 -96 A 0.055 -97 V 0.058 -98 I 0.064 -99 A 0.067 -100 A 0.066 -101 I 0.062 -102 I 0.060 -103 S 0.056 -104 R 0.051 -105 E 0.055 -106 S 0.076 -107 H 0.108 -108 G 0.140 -109 G 0.156 -110 S 0.156 -111 V 0.149 -112 L 0.148 -113 Q 0.155 -114 D 0.161 -115 G 0.156 -116 W 0.141 -117 D 0.126 -118 H 0.118 -119 R 0.111 -120 G 0.100 -121 L 0.089 -122 K 0.080 -123 F 0.071 -124 G 0.061 -125 L 0.055 -126 M 0.054 -127 Q 0.053 -128 L 0.050 -129 D 0.047 -130 K 0.049 -131 Q 0.058 -132 T 0.075 -133 Y 0.092 -134 H 0.108 -135 P 0.126 -136 V 0.140 -137 G 0.143 -138 A 0.136 -139 W 0.127 -140 D 0.120 -141 S 0.112 -142 K 0.103 -143 E 0.098 -144 H 0.096 -145 L 0.095 -146 S 0.097 -147 Q 0.102 -148 A 0.101 -149 T 0.089 -150 G 0.072 -151 I 0.059 -152 L 0.049 -153 T 0.041 -154 E 0.036 -155 R 0.035 -156 I 0.036 -157 K 0.039 -158 A 0.042 -159 I 0.048 -160 Q 0.057 -161 K 0.064 -162 K 0.067 -163 F 0.065 -164 P 0.062 -165 T 0.056 -166 W 0.048 -167 S 0.042 -168 V 0.038 -169 A 0.035 -170 Q 0.036 -171 H 0.038 -172 L 0.043 -173 K 0.051 -174 G 0.062 -175 G 0.070 -176 L 0.072 -177 S 0.068 -178 A 0.061 -179 F 0.054 -180 K 0.053 -181 S 0.061 -182 G 0.076 -183 I 0.097 -184 E 0.119 -185 A 0.140 -186 I 0.151 -187 A 0.148 -188 T 0.140 -189 P 0.144 -190 S 0.163 -191 D 0.182 -192 I 0.180 -193 D 0.154 -194 N 0.118 -195 D 0.087 -196 F 0.068 -197 V 0.058 -198 N 0.053 -199 D 0.052 -200 I 0.051 -201 I 0.046 -202 A 0.039 -203 R 0.035 -204 A 0.035 -205 K 0.038 -206 F 0.042 -207 Y 0.048 -208 K 0.055 -209 R 0.067 -210 Q 0.089 -211 S 0.114 -212 F 0.132 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185674.11_ENST00000333017.7_GN:LYG2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:59.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185674.11_ENST00000333017.7_GN:LYG2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:59.caid deleted file mode 100644 index 9846c1cfd5e7a99bb67319ba7f71020df60853c6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185674.11_ENST00000333017.7_GN:LYG2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:59.caid +++ /dev/null @@ -1,272 +0,0 @@ ->ENSG00000185674.11|ENST00000333017.7|GN:LYG2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:59 -1 M 0.383 -2 G 0.391 -3 T 0.401 -4 K 0.402 -5 S 0.391 -6 R 0.392 -7 R 0.422 -8 P 0.462 -9 N 0.481 -10 I 0.484 -11 S 0.488 -12 A 0.490 -13 Y 0.484 -14 V 0.490 -15 T 0.517 -16 G 0.555 -17 Q 0.591 -18 R 0.615 -19 P 0.619 -20 S 0.594 -21 L 0.545 -22 C 0.491 -23 K 0.465 -24 S 0.481 -25 L 0.517 -26 K 0.541 -27 C 0.546 -28 S 0.542 -29 L 0.531 -30 L 0.512 -31 L 0.491 -32 S 0.485 -33 T 0.500 -34 E 0.515 -35 D 0.495 -36 L 0.435 -37 C 0.382 -38 K 0.391 -39 Q 0.467 -40 R 0.561 -41 G 0.629 -42 E 0.651 -43 I 0.624 -44 F 0.573 -45 S 0.552 -46 V 0.578 -47 R 0.602 -48 L 0.588 -49 Q 0.572 -50 T 0.598 -51 R 0.647 -52 S 0.686 -53 W 0.706 -54 K 0.711 -55 I 0.710 -56 R 0.713 -57 F 0.726 -58 P 0.749 -59 A 0.768 -60 M 0.765 -61 L 0.723 -62 S 0.656 -63 S 0.617 -64 V 0.634 -65 V 0.667 -66 F 0.675 -67 W 0.673 -68 G 0.686 -69 L 0.705 -70 I 0.712 -71 A 0.709 -72 L 0.705 -73 I 0.704 -74 G 0.709 -75 T 0.715 -76 S 0.715 -77 R 0.702 -78 G 0.671 -79 S 0.637 -80 Y 0.620 -81 P 0.626 -82 F 0.644 -83 S 0.657 -84 H 0.654 -85 S 0.634 -86 M 0.601 -87 K 0.561 -88 P 0.523 -89 H 0.491 -90 L 0.467 -91 H 0.444 -92 P 0.412 -93 R 0.363 -94 L 0.300 -95 Y 0.235 -96 H 0.182 -97 G 0.147 -98 C 0.126 -99 Y 0.112 -100 G 0.101 -101 D 0.092 -102 I 0.084 -103 M 0.081 -104 T 0.085 -105 M 0.096 -106 K 0.113 -107 T 0.134 -108 S 0.157 -109 G 0.178 -110 A 0.188 -111 T 0.184 -112 C 0.176 -113 D 0.175 -114 A 0.183 -115 N 0.191 -116 S 0.193 -117 V 0.187 -118 M 0.181 -119 N 0.180 -120 C 0.181 -121 G 0.181 -122 I 0.177 -123 R 0.170 -124 G 0.155 -125 S 0.137 -126 E 0.125 -127 M 0.118 -128 F 0.107 -129 A 0.092 -130 E 0.083 -131 M 0.080 -132 D 0.077 -133 L 0.069 -134 R 0.062 -135 A 0.060 -136 I 0.060 -137 K 0.057 -138 P 0.055 -139 Y 0.058 -140 Q 0.062 -141 T 0.060 -142 L 0.048 -143 I 0.035 -144 K 0.029 -145 E 0.031 -146 V 0.038 -147 G 0.044 -148 Q 0.048 -149 R 0.051 -150 H 0.056 -151 C 0.062 -152 V 0.064 -153 D 0.062 -154 P 0.058 -155 A 0.055 -156 V 0.058 -157 I 0.063 -158 A 0.067 -159 A 0.066 -160 I 0.063 -161 I 0.062 -162 S 0.058 -163 R 0.054 -164 E 0.059 -165 S 0.081 -166 H 0.115 -167 G 0.148 -168 G 0.165 -169 S 0.163 -170 V 0.156 -171 L 0.157 -172 Q 0.165 -173 D 0.173 -174 G 0.169 -175 W 0.152 -176 D 0.137 -177 H 0.128 -178 R 0.119 -179 G 0.106 -180 L 0.093 -181 K 0.083 -182 F 0.073 -183 G 0.063 -184 L 0.057 -185 M 0.056 -186 Q 0.055 -187 L 0.051 -188 D 0.048 -189 K 0.050 -190 Q 0.059 -191 T 0.075 -192 Y 0.092 -193 H 0.107 -194 P 0.123 -195 V 0.135 -196 G 0.138 -197 A 0.132 -198 W 0.123 -199 D 0.117 -200 S 0.111 -201 K 0.104 -202 E 0.099 -203 H 0.099 -204 L 0.099 -205 S 0.100 -206 Q 0.104 -207 A 0.102 -208 T 0.088 -209 G 0.071 -210 I 0.057 -211 L 0.047 -212 T 0.040 -213 E 0.035 -214 R 0.035 -215 I 0.036 -216 K 0.038 -217 A 0.039 -218 I 0.038 -219 Q 0.036 -220 K 0.038 -221 K 0.045 -222 F 0.052 -223 P 0.055 -224 T 0.051 -225 W 0.045 -226 S 0.040 -227 V 0.036 -228 A 0.035 -229 Q 0.035 -230 H 0.038 -231 L 0.042 -232 K 0.050 -233 G 0.059 -234 G 0.067 -235 L 0.069 -236 S 0.064 -237 A 0.056 -238 F 0.048 -239 K 0.046 -240 S 0.053 -241 G 0.069 -242 I 0.090 -243 E 0.114 -244 A 0.135 -245 I 0.146 -246 A 0.144 -247 T 0.138 -248 P 0.143 -249 S 0.162 -250 D 0.180 -251 I 0.179 -252 D 0.155 -253 N 0.120 -254 D 0.090 -255 F 0.071 -256 V 0.059 -257 N 0.053 -258 D 0.052 -259 I 0.050 -260 I 0.045 -261 A 0.039 -262 R 0.034 -263 A 0.034 -264 K 0.037 -265 F 0.042 -266 Y 0.047 -267 K 0.055 -268 R 0.067 -269 Q 0.089 -270 S 0.115 -271 F 0.132 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185860.15_ENST00000367912.7_GN:CCDC190_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185860.15_ENST00000367912.7_GN:CCDC190_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 51f8f4d635b0c69f9bad081fd7ba4126f28f2f90..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185860.15_ENST00000367912.7_GN:CCDC190_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,302 +0,0 @@ ->ENSG00000185860.15|ENST00000367912.7|GN:CCDC190|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.404 -2 E 0.403 -3 R 0.392 -4 H 0.376 -5 M 0.363 -6 V 0.349 -7 R 0.336 -8 G 0.326 -9 Q 0.311 -10 L 0.283 -11 Y 0.250 -12 K 0.226 -13 H 0.210 -14 F 0.191 -15 D 0.174 -16 L 0.167 -17 E 0.173 -18 R 0.187 -19 K 0.205 -20 N 0.224 -21 A 0.234 -22 K 0.235 -23 Q 0.238 -24 A 0.249 -25 E 0.254 -26 A 0.244 -27 R 0.227 -28 L 0.217 -29 D 0.213 -30 Q 0.208 -31 R 0.200 -32 L 0.195 -33 Q 0.193 -34 R 0.187 -35 L 0.172 -36 K 0.154 -37 V 0.142 -38 I 0.135 -39 C 0.129 -40 L 0.126 -41 Y 0.130 -42 H 0.140 -43 V 0.155 -44 K 0.175 -45 L 0.197 -46 L 0.211 -47 T 0.213 -48 W 0.213 -49 E 0.213 -50 Q 0.209 -51 R 0.204 -52 Q 0.203 -53 L 0.204 -54 Q 0.202 -55 K 0.196 -56 E 0.189 -57 L 0.189 -58 Q 0.195 -59 R 0.203 -60 L 0.215 -61 Q 0.230 -62 Q 0.243 -63 E 0.255 -64 T 0.273 -65 M 0.298 -66 K 0.329 -67 K 0.367 -68 K 0.413 -69 F 0.465 -70 S 0.514 -71 S 0.557 -72 Y 0.597 -73 L 0.635 -74 G 0.673 -75 N 0.704 -76 G 0.722 -77 F 0.721 -78 Q 0.711 -79 K 0.708 -80 R 0.718 -81 P 0.737 -82 E 0.761 -83 D 0.786 -84 V 0.806 -85 L 0.815 -86 V 0.810 -87 F 0.797 -88 S 0.789 -89 P 0.794 -90 Q 0.807 -91 G 0.819 -92 R 0.823 -93 Q 0.821 -94 K 0.814 -95 H 0.805 -96 R 0.794 -97 A 0.787 -98 P 0.786 -99 Q 0.788 -100 A 0.790 -101 K 0.789 -102 K 0.777 -103 M 0.736 -104 R 0.668 -105 A 0.622 -106 L 0.636 -107 A 0.688 -108 T 0.735 -109 R 0.761 -110 M 0.771 -111 A 0.771 -112 Q 0.770 -113 D 0.776 -114 T 0.786 -115 C 0.794 -116 K 0.800 -117 S 0.805 -118 K 0.803 -119 S 0.791 -120 Q 0.772 -121 V 0.757 -122 P 0.760 -123 P 0.782 -124 S 0.810 -125 H 0.830 -126 D 0.840 -127 A 0.840 -128 G 0.833 -129 L 0.821 -130 K 0.809 -131 D 0.795 -132 P 0.765 -133 M 0.720 -134 K 0.698 -135 S 0.724 -136 K 0.770 -137 K 0.799 -138 Q 0.810 -139 P 0.820 -140 L 0.832 -141 S 0.841 -142 Q 0.842 -143 N 0.839 -144 N 0.837 -145 R 0.841 -146 T 0.849 -147 A 0.855 -148 C 0.858 -149 F 0.858 -150 I 0.854 -151 K 0.847 -152 E 0.841 -153 Q 0.843 -154 P 0.852 -155 Q 0.865 -156 A 0.874 -157 Q 0.876 -158 E 0.875 -159 K 0.872 -160 D 0.866 -161 S 0.855 -162 V 0.843 -163 N 0.838 -164 P 0.841 -165 S 0.847 -166 K 0.848 -167 D 0.837 -168 V 0.817 -169 D 0.800 -170 P 0.798 -171 S 0.811 -172 K 0.829 -173 G 0.840 -174 I 0.840 -175 S 0.829 -176 V 0.806 -177 P 0.760 -178 C 0.695 -179 Q 0.653 -180 N 0.655 -181 Q 0.670 -182 E 0.691 -183 V 0.742 -184 S 0.806 -185 T 0.849 -186 N 0.866 -187 T 0.870 -188 I 0.869 -189 E 0.865 -190 Q 0.859 -191 G 0.855 -192 P 0.855 -193 S 0.859 -194 S 0.861 -195 S 0.861 -196 P 0.862 -197 A 0.866 -198 S 0.869 -199 D 0.871 -200 S 0.869 -201 G 0.865 -202 M 0.847 -203 A 0.798 -204 C 0.725 -205 A 0.680 -206 D 0.704 -207 E 0.763 -208 T 0.805 -209 R 0.822 -210 S 0.828 -211 K 0.833 -212 D 0.837 -213 V 0.835 -214 A 0.826 -215 L 0.813 -216 K 0.805 -217 P 0.810 -218 D 0.825 -219 G 0.840 -220 N 0.847 -221 T 0.846 -222 G 0.838 -223 K 0.823 -224 Q 0.805 -225 I 0.791 -226 P 0.793 -227 P 0.811 -228 K 0.833 -229 H 0.848 -230 M 0.855 -231 E 0.858 -232 C 0.857 -233 A 0.850 -234 G 0.837 -235 S 0.821 -236 F 0.809 -237 E 0.797 -238 G 0.778 -239 E 0.747 -240 F 0.701 -241 T 0.640 -242 K 0.570 -243 P 0.496 -244 T 0.419 -245 F 0.345 -246 L 0.294 -247 E 0.278 -248 L 0.288 -249 L 0.295 -250 S 0.289 -251 K 0.291 -252 A 0.318 -253 R 0.359 -254 N 0.385 -255 A 0.377 -256 H 0.342 -257 Y 0.312 -258 L 0.311 -259 R 0.341 -260 H 0.387 -261 R 0.440 -262 V 0.504 -263 P 0.575 -264 P 0.639 -265 E 0.683 -266 S 0.702 -267 E 0.707 -268 R 0.706 -269 L 0.695 -270 L 0.667 -271 S 0.629 -272 I 0.607 -273 G 0.619 -274 E 0.648 -275 I 0.674 -276 F 0.695 -277 G 0.722 -278 H 0.754 -279 G 0.783 -280 E 0.802 -281 S 0.812 -282 S 0.815 -283 S 0.814 -284 S 0.813 -285 R 0.816 -286 A 0.823 -287 G 0.828 -288 K 0.828 -289 E 0.825 -290 C 0.818 -291 E 0.807 -292 N 0.790 -293 R 0.771 -294 V 0.755 -295 P 0.747 -296 S 0.743 -297 K 0.735 -298 F 0.714 -299 L 0.672 -300 P 0.609 -301 L 0.558 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185860.15_ENST00000367912.7_GN:CCDC190_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185860.15_ENST00000367912.7_GN:CCDC190_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid deleted file mode 100644 index a015165b78e7db6907a773423696de0939953427..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000185860.15_ENST00000367912.7_GN:CCDC190_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid +++ /dev/null @@ -1,314 +0,0 @@ ->ENSG00000185860.15|ENST00000367912.7|GN:CCDC190|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:12 -1 M 0.518 -2 V 0.540 -3 K 0.550 -4 T 0.512 -5 L 0.422 -6 D 0.311 -7 L 0.222 -8 E 0.177 -9 T 0.165 -10 I 0.171 -11 K 0.187 -12 K 0.214 -13 M 0.250 -14 E 0.276 -15 R 0.279 -16 H 0.278 -17 M 0.297 -18 V 0.324 -19 R 0.335 -20 G 0.329 -21 Q 0.313 -22 L 0.285 -23 Y 0.248 -24 K 0.218 -25 H 0.199 -26 F 0.186 -27 D 0.180 -28 L 0.187 -29 E 0.199 -30 R 0.208 -31 K 0.215 -32 N 0.223 -33 A 0.228 -34 K 0.227 -35 Q 0.228 -36 A 0.236 -37 E 0.239 -38 A 0.229 -39 R 0.217 -40 L 0.212 -41 D 0.212 -42 Q 0.208 -43 R 0.203 -44 L 0.204 -45 Q 0.213 -46 R 0.220 -47 L 0.215 -48 K 0.201 -49 V 0.185 -50 I 0.171 -51 C 0.158 -52 L 0.151 -53 Y 0.153 -54 H 0.161 -55 V 0.174 -56 K 0.195 -57 L 0.218 -58 L 0.228 -59 T 0.220 -60 W 0.210 -61 E 0.203 -62 Q 0.196 -63 R 0.189 -64 Q 0.190 -65 L 0.193 -66 Q 0.193 -67 K 0.186 -68 E 0.179 -69 L 0.180 -70 Q 0.187 -71 R 0.197 -72 L 0.207 -73 Q 0.218 -74 Q 0.228 -75 E 0.241 -76 T 0.262 -77 M 0.290 -78 K 0.318 -79 K 0.350 -80 K 0.392 -81 F 0.440 -82 S 0.485 -83 S 0.526 -84 Y 0.566 -85 L 0.609 -86 G 0.650 -87 N 0.684 -88 G 0.704 -89 F 0.705 -90 Q 0.696 -91 K 0.693 -92 R 0.702 -93 P 0.721 -94 E 0.745 -95 D 0.769 -96 V 0.790 -97 L 0.800 -98 V 0.796 -99 F 0.784 -100 S 0.775 -101 P 0.779 -102 Q 0.792 -103 G 0.803 -104 R 0.807 -105 Q 0.803 -106 K 0.795 -107 H 0.783 -108 R 0.772 -109 A 0.764 -110 P 0.764 -111 Q 0.766 -112 A 0.767 -113 K 0.766 -114 K 0.753 -115 M 0.712 -116 R 0.646 -117 A 0.598 -118 L 0.607 -119 A 0.655 -120 T 0.704 -121 R 0.735 -122 M 0.750 -123 A 0.754 -124 Q 0.756 -125 D 0.765 -126 T 0.778 -127 C 0.788 -128 K 0.796 -129 S 0.801 -130 K 0.801 -131 S 0.791 -132 Q 0.773 -133 V 0.759 -134 P 0.762 -135 P 0.783 -136 S 0.812 -137 H 0.832 -138 D 0.842 -139 A 0.843 -140 G 0.836 -141 L 0.824 -142 K 0.811 -143 D 0.792 -144 P 0.751 -145 M 0.692 -146 K 0.662 -147 S 0.695 -148 K 0.756 -149 K 0.794 -150 Q 0.809 -151 P 0.820 -152 L 0.832 -153 S 0.840 -154 Q 0.841 -155 N 0.838 -156 N 0.837 -157 R 0.841 -158 T 0.849 -159 A 0.856 -160 C 0.858 -161 F 0.858 -162 I 0.854 -163 K 0.847 -164 E 0.841 -165 Q 0.842 -166 P 0.852 -167 Q 0.865 -168 A 0.873 -169 Q 0.875 -170 E 0.873 -171 K 0.870 -172 D 0.863 -173 S 0.852 -174 V 0.840 -175 N 0.834 -176 P 0.837 -177 S 0.844 -178 K 0.845 -179 D 0.834 -180 V 0.814 -181 D 0.797 -182 P 0.795 -183 S 0.808 -184 K 0.825 -185 G 0.836 -186 I 0.836 -187 S 0.826 -188 V 0.803 -189 P 0.757 -190 C 0.692 -191 Q 0.648 -192 N 0.644 -193 Q 0.650 -194 E 0.667 -195 V 0.721 -196 S 0.792 -197 T 0.840 -198 N 0.859 -199 T 0.864 -200 I 0.864 -201 E 0.860 -202 Q 0.854 -203 G 0.850 -204 P 0.850 -205 S 0.853 -206 S 0.855 -207 S 0.855 -208 P 0.857 -209 A 0.860 -210 S 0.864 -211 D 0.865 -212 S 0.864 -213 G 0.860 -214 M 0.842 -215 A 0.793 -216 C 0.720 -217 A 0.675 -218 D 0.699 -219 E 0.757 -220 T 0.798 -221 R 0.815 -222 S 0.822 -223 K 0.828 -224 D 0.831 -225 V 0.830 -226 A 0.821 -227 L 0.808 -228 K 0.801 -229 P 0.806 -230 D 0.822 -231 G 0.837 -232 N 0.844 -233 T 0.844 -234 G 0.836 -235 K 0.822 -236 Q 0.804 -237 I 0.790 -238 P 0.792 -239 P 0.810 -240 K 0.832 -241 H 0.847 -242 M 0.854 -243 E 0.857 -244 C 0.856 -245 A 0.849 -246 G 0.836 -247 S 0.820 -248 F 0.807 -249 E 0.795 -250 G 0.776 -251 E 0.745 -252 F 0.699 -253 T 0.638 -254 K 0.567 -255 P 0.491 -256 T 0.411 -257 F 0.335 -258 L 0.283 -259 E 0.264 -260 L 0.269 -261 L 0.273 -262 S 0.267 -263 K 0.271 -264 A 0.301 -265 R 0.347 -266 N 0.380 -267 A 0.379 -268 H 0.350 -269 Y 0.320 -270 L 0.320 -271 R 0.350 -272 H 0.397 -273 R 0.452 -274 V 0.515 -275 P 0.583 -276 P 0.644 -277 E 0.687 -278 S 0.707 -279 E 0.713 -280 R 0.713 -281 L 0.702 -282 L 0.673 -283 S 0.635 -284 I 0.615 -285 G 0.626 -286 E 0.655 -287 I 0.680 -288 F 0.702 -289 G 0.728 -290 H 0.759 -291 G 0.787 -292 E 0.805 -293 S 0.814 -294 S 0.816 -295 S 0.815 -296 S 0.814 -297 R 0.817 -298 A 0.824 -299 G 0.830 -300 K 0.830 -301 E 0.826 -302 C 0.819 -303 E 0.808 -304 N 0.792 -305 R 0.772 -306 V 0.755 -307 P 0.747 -308 S 0.742 -309 K 0.734 -310 F 0.714 -311 L 0.671 -312 P 0.608 -313 L 0.557 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186190.8_ENST00000375494.4_GN:BPIFB3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186190.8_ENST00000375494.4_GN:BPIFB3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 3499904e29f2e6de47a9f3cb4b2e233f8ce7bb78..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186190.8_ENST00000375494.4_GN:BPIFB3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,473 +0,0 @@ ->ENSG00000186190.8|ENST00000375494.4|GN:BPIFB3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.155 -2 L 0.142 -3 A 0.125 -4 L 0.114 -5 W 0.115 -6 S 0.121 -7 L 0.120 -8 L 0.115 -9 L 0.122 -10 L 0.146 -11 W 0.181 -12 G 0.213 -13 L 0.236 -14 A 0.256 -15 T 0.279 -16 P 0.297 -17 C 0.298 -18 Q 0.289 -19 E 0.284 -20 L 0.282 -21 L 0.274 -22 E 0.254 -23 T 0.222 -24 V 0.181 -25 G 0.137 -26 T 0.101 -27 L 0.079 -28 A 0.067 -29 R 0.058 -30 I 0.049 -31 D 0.039 -32 K 0.030 -33 D 0.027 -34 E 0.031 -35 L 0.041 -36 G 0.055 -37 K 0.064 -38 A 0.064 -39 I 0.059 -40 Q 0.057 -41 N 0.059 -42 S 0.066 -43 L 0.079 -44 V 0.098 -45 G 0.118 -46 E 0.127 -47 P 0.119 -48 I 0.099 -49 L 0.083 -50 Q 0.082 -51 N 0.096 -52 V 0.119 -53 L 0.145 -54 G 0.170 -55 S 0.187 -56 V 0.192 -57 T 0.195 -58 A 0.203 -59 V 0.220 -60 N 0.249 -61 R 0.291 -62 G 0.346 -63 L 0.411 -64 L 0.488 -65 G 0.566 -66 S 0.618 -67 G 0.633 -68 G 0.628 -69 L 0.624 -70 L 0.636 -71 G 0.657 -72 G 0.668 -73 G 0.660 -74 G 0.642 -75 L 0.629 -76 L 0.626 -77 G 0.623 -78 H 0.606 -79 G 0.571 -80 G 0.529 -81 V 0.494 -82 F 0.471 -83 G 0.440 -84 V 0.383 -85 V 0.307 -86 E 0.242 -87 E 0.205 -88 L 0.191 -89 S 0.188 -90 G 0.180 -91 L 0.158 -92 K 0.128 -93 I 0.102 -94 E 0.082 -95 E 0.069 -96 L 0.061 -97 T 0.057 -98 L 0.052 -99 P 0.045 -100 K 0.035 -101 V 0.026 -102 L 0.021 -103 L 0.023 -104 K 0.032 -105 L 0.046 -106 L 0.060 -107 P 0.071 -108 G 0.075 -109 F 0.072 -110 G 0.063 -111 V 0.054 -112 Q 0.048 -113 L 0.046 -114 S 0.046 -115 L 0.046 -116 H 0.045 -117 T 0.043 -118 K 0.040 -119 V 0.039 -120 G 0.040 -121 M 0.043 -122 H 0.047 -123 C 0.053 -124 S 0.065 -125 G 0.082 -126 P 0.101 -127 L 0.123 -128 G 0.143 -129 G 0.150 -130 L 0.144 -131 L 0.136 -132 Q 0.129 -133 L 0.119 -134 A 0.104 -135 A 0.089 -136 E 0.076 -137 V 0.065 -138 N 0.057 -139 V 0.051 -140 T 0.048 -141 S 0.045 -142 R 0.043 -143 V 0.045 -144 A 0.053 -145 L 0.065 -146 A 0.078 -147 V 0.090 -148 S 0.105 -149 S 0.122 -150 R 0.138 -151 G 0.143 -152 T 0.132 -153 P 0.110 -154 I 0.084 -155 L 0.062 -156 I 0.048 -157 L 0.039 -158 K 0.035 -159 R 0.035 -160 C 0.038 -161 S 0.040 -162 T 0.042 -163 L 0.045 -164 L 0.050 -165 G 0.055 -166 H 0.055 -167 I 0.053 -168 S 0.053 -169 L 0.061 -170 F 0.079 -171 S 0.106 -172 G 0.133 -173 L 0.156 -174 L 0.173 -175 P 0.184 -176 T 0.177 -177 P 0.147 -178 L 0.112 -179 F 0.088 -180 G 0.078 -181 V 0.074 -182 V 0.076 -183 E 0.083 -184 Q 0.090 -185 M 0.091 -186 L 0.089 -187 F 0.089 -188 K 0.091 -189 V 0.091 -190 L 0.084 -191 P 0.075 -192 G 0.068 -193 L 0.068 -194 L 0.070 -195 C 0.074 -196 P 0.081 -197 V 0.089 -198 V 0.092 -199 D 0.092 -200 S 0.092 -201 V 0.092 -202 L 0.090 -203 G 0.089 -204 V 0.088 -205 V 0.086 -206 N 0.084 -207 E 0.082 -208 L 0.073 -209 L 0.061 -210 G 0.053 -211 A 0.054 -212 V 0.057 -213 L 0.059 -214 G 0.060 -215 L 0.062 -216 V 0.067 -217 S 0.074 -218 L 0.083 -219 G 0.091 -220 A 0.093 -221 L 0.087 -222 G 0.078 -223 S 0.074 -224 V 0.074 -225 E 0.071 -226 F 0.069 -227 S 0.071 -228 L 0.078 -229 A 0.082 -230 T 0.081 -231 L 0.074 -232 P 0.067 -233 L 0.062 -234 I 0.061 -235 S 0.065 -236 N 0.068 -237 Q 0.065 -238 Y 0.054 -239 I 0.043 -240 E 0.035 -241 L 0.032 -242 D 0.033 -243 I 0.037 -244 N 0.044 -245 P 0.052 -246 I 0.056 -247 V 0.060 -248 K 0.069 -249 S 0.092 -250 V 0.120 -251 A 0.143 -252 G 0.153 -253 D 0.152 -254 I 0.149 -255 I 0.150 -256 D 0.156 -257 F 0.166 -258 P 0.176 -259 K 0.181 -260 S 0.182 -261 R 0.178 -262 A 0.169 -263 P 0.155 -264 A 0.143 -265 K 0.137 -266 V 0.133 -267 P 0.130 -268 P 0.124 -269 K 0.119 -270 K 0.119 -271 D 0.120 -272 H 0.116 -273 T 0.110 -274 S 0.104 -275 Q 0.100 -276 V 0.092 -277 M 0.079 -278 V 0.061 -279 P 0.046 -280 L 0.039 -281 Y 0.035 -282 L 0.032 -283 F 0.032 -284 N 0.037 -285 T 0.046 -286 T 0.054 -287 F 0.060 -288 G 0.066 -289 L 0.072 -290 L 0.080 -291 Q 0.088 -292 T 0.097 -293 N 0.102 -294 G 0.101 -295 A 0.095 -296 L 0.085 -297 D 0.076 -298 M 0.072 -299 D 0.071 -300 I 0.070 -301 T 0.071 -302 P 0.074 -303 E 0.082 -304 L 0.091 -305 V 0.102 -306 P 0.114 -307 S 0.125 -308 D 0.132 -309 V 0.128 -310 P 0.113 -311 L 0.094 -312 T 0.080 -313 T 0.074 -314 T 0.070 -315 D 0.066 -316 L 0.063 -317 A 0.070 -318 A 0.086 -319 L 0.105 -320 L 0.121 -321 P 0.130 -322 E 0.134 -323 A 0.137 -324 L 0.141 -325 G 0.146 -326 K 0.149 -327 L 0.147 -328 P 0.140 -329 L 0.134 -330 H 0.130 -331 Q 0.125 -332 Q 0.114 -333 L 0.097 -334 L 0.078 -335 L 0.064 -336 F 0.057 -337 L 0.061 -338 R 0.074 -339 V 0.096 -340 R 0.118 -341 E 0.126 -342 A 0.113 -343 P 0.088 -344 T 0.064 -345 V 0.051 -346 T 0.051 -347 L 0.062 -348 H 0.080 -349 N 0.093 -350 K 0.095 -351 K 0.087 -352 A 0.077 -353 L 0.069 -354 V 0.067 -355 S 0.068 -356 L 0.070 -357 P 0.065 -358 A 0.057 -359 N 0.048 -360 I 0.043 -361 H 0.040 -362 V 0.040 -363 L 0.044 -364 F 0.052 -365 Y 0.067 -366 V 0.087 -367 P 0.109 -368 K 0.128 -369 G 0.138 -370 T 0.136 -371 P 0.125 -372 E 0.114 -373 S 0.110 -374 L 0.112 -375 F 0.117 -376 E 0.122 -377 L 0.127 -378 N 0.126 -379 S 0.119 -380 V 0.111 -381 M 0.106 -382 T 0.103 -383 V 0.098 -384 R 0.088 -385 A 0.081 -386 Q 0.083 -387 L 0.094 -388 A 0.109 -389 P 0.116 -390 S 0.112 -391 A 0.100 -392 T 0.092 -393 K 0.090 -394 L 0.091 -395 H 0.089 -396 I 0.084 -397 S 0.075 -398 L 0.065 -399 S 0.058 -400 L 0.054 -401 E 0.049 -402 R 0.043 -403 L 0.039 -404 S 0.039 -405 V 0.045 -406 K 0.055 -407 V 0.066 -408 A 0.076 -409 S 0.083 -410 S 0.090 -411 F 0.104 -412 T 0.125 -413 H 0.146 -414 A 0.158 -415 F 0.162 -416 D 0.157 -417 G 0.143 -418 S 0.119 -419 R 0.094 -420 L 0.079 -421 E 0.077 -422 E 0.077 -423 W 0.070 -424 L 0.060 -425 S 0.054 -426 H 0.054 -427 V 0.060 -428 V 0.072 -429 G 0.083 -430 A 0.087 -431 V 0.083 -432 Y 0.080 -433 A 0.081 -434 P 0.084 -435 K 0.085 -436 L 0.089 -437 N 0.095 -438 V 0.099 -439 A 0.097 -440 L 0.095 -441 D 0.099 -442 V 0.103 -443 G 0.105 -444 I 0.106 -445 P 0.113 -446 L 0.124 -447 P 0.133 -448 K 0.134 -449 V 0.131 -450 L 0.128 -451 N 0.127 -452 I 0.125 -453 N 0.126 -454 F 0.135 -455 S 0.150 -456 N 0.155 -457 S 0.140 -458 V 0.114 -459 L 0.090 -460 E 0.076 -461 I 0.072 -462 V 0.070 -463 E 0.065 -464 N 0.060 -465 A 0.058 -466 V 0.058 -467 V 0.059 -468 L 0.062 -469 T 0.071 -470 V 0.092 -471 A 0.122 -472 S 0.145 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186190.8_ENST00000375494.4_GN:BPIFB3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:4.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186190.8_ENST00000375494.4_GN:BPIFB3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:4.caid deleted file mode 100644 index 1a412a08eef657617a6c616a98bde25dee2261c7..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186190.8_ENST00000375494.4_GN:BPIFB3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:4.caid +++ /dev/null @@ -1,477 +0,0 @@ ->ENSG00000186190.8|ENST00000375494.4|GN:BPIFB3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:4 -1 M 0.227 -2 Q 0.210 -3 P 0.181 -4 V 0.151 -5 M 0.132 -6 L 0.124 -7 A 0.114 -8 L 0.104 -9 W 0.104 -10 S 0.109 -11 L 0.107 -12 L 0.097 -13 L 0.094 -14 L 0.114 -15 W 0.155 -16 G 0.201 -17 L 0.236 -18 A 0.262 -19 T 0.287 -20 P 0.304 -21 C 0.305 -22 Q 0.293 -23 E 0.283 -24 L 0.276 -25 L 0.264 -26 E 0.243 -27 T 0.214 -28 V 0.176 -29 G 0.134 -30 T 0.101 -31 L 0.079 -32 A 0.068 -33 R 0.059 -34 I 0.050 -35 D 0.040 -36 K 0.031 -37 D 0.027 -38 E 0.031 -39 L 0.042 -40 G 0.055 -41 K 0.064 -42 A 0.063 -43 I 0.059 -44 Q 0.057 -45 N 0.059 -46 S 0.066 -47 L 0.079 -48 V 0.098 -49 G 0.118 -50 E 0.127 -51 P 0.119 -52 I 0.098 -53 L 0.083 -54 Q 0.082 -55 N 0.096 -56 V 0.119 -57 L 0.146 -58 G 0.170 -59 S 0.186 -60 V 0.191 -61 T 0.193 -62 A 0.201 -63 V 0.218 -64 N 0.246 -65 R 0.288 -66 G 0.343 -67 L 0.408 -68 L 0.484 -69 G 0.562 -70 S 0.615 -71 G 0.631 -72 G 0.627 -73 L 0.623 -74 L 0.634 -75 G 0.655 -76 G 0.666 -77 G 0.658 -78 G 0.641 -79 L 0.627 -80 L 0.623 -81 G 0.620 -82 H 0.603 -83 G 0.568 -84 G 0.526 -85 V 0.491 -86 F 0.467 -87 G 0.437 -88 V 0.379 -89 V 0.304 -90 E 0.241 -91 E 0.204 -92 L 0.190 -93 S 0.187 -94 G 0.179 -95 L 0.157 -96 K 0.127 -97 I 0.101 -98 E 0.082 -99 E 0.068 -100 L 0.060 -101 T 0.056 -102 L 0.052 -103 P 0.045 -104 K 0.035 -105 V 0.026 -106 L 0.021 -107 L 0.023 -108 K 0.032 -109 L 0.045 -110 L 0.060 -111 P 0.070 -112 G 0.075 -113 F 0.072 -114 G 0.064 -115 V 0.054 -116 Q 0.048 -117 L 0.046 -118 S 0.046 -119 L 0.046 -120 H 0.045 -121 T 0.043 -122 K 0.040 -123 V 0.039 -124 G 0.040 -125 M 0.043 -126 H 0.047 -127 C 0.053 -128 S 0.065 -129 G 0.082 -130 P 0.102 -131 L 0.124 -132 G 0.143 -133 G 0.150 -134 L 0.144 -135 L 0.136 -136 Q 0.129 -137 L 0.119 -138 A 0.104 -139 A 0.089 -140 E 0.076 -141 V 0.065 -142 N 0.057 -143 V 0.051 -144 T 0.048 -145 S 0.045 -146 R 0.043 -147 V 0.045 -148 A 0.053 -149 L 0.065 -150 A 0.078 -151 V 0.090 -152 S 0.105 -153 S 0.122 -154 R 0.138 -155 G 0.144 -156 T 0.133 -157 P 0.110 -158 I 0.084 -159 L 0.062 -160 I 0.048 -161 L 0.039 -162 K 0.035 -163 R 0.035 -164 C 0.038 -165 S 0.040 -166 T 0.042 -167 L 0.045 -168 L 0.050 -169 G 0.055 -170 H 0.055 -171 I 0.053 -172 S 0.053 -173 L 0.061 -174 F 0.079 -175 S 0.105 -176 G 0.132 -177 L 0.154 -178 L 0.172 -179 P 0.182 -180 T 0.175 -181 P 0.146 -182 L 0.111 -183 F 0.087 -184 G 0.077 -185 V 0.073 -186 V 0.075 -187 E 0.083 -188 Q 0.090 -189 M 0.090 -190 L 0.088 -191 F 0.088 -192 K 0.091 -193 V 0.091 -194 L 0.084 -195 P 0.074 -196 G 0.068 -197 L 0.068 -198 L 0.070 -199 C 0.074 -200 P 0.081 -201 V 0.088 -202 V 0.091 -203 D 0.091 -204 S 0.090 -205 V 0.089 -206 L 0.088 -207 G 0.087 -208 V 0.086 -209 V 0.084 -210 N 0.083 -211 E 0.081 -212 L 0.072 -213 L 0.060 -214 G 0.053 -215 A 0.054 -216 V 0.057 -217 L 0.059 -218 G 0.059 -219 L 0.062 -220 V 0.067 -221 S 0.074 -222 L 0.083 -223 G 0.091 -224 A 0.093 -225 L 0.086 -226 G 0.078 -227 S 0.074 -228 V 0.073 -229 E 0.071 -230 F 0.069 -231 S 0.071 -232 L 0.078 -233 A 0.083 -234 T 0.081 -235 L 0.074 -236 P 0.067 -237 L 0.062 -238 I 0.061 -239 S 0.065 -240 N 0.068 -241 Q 0.065 -242 Y 0.054 -243 I 0.043 -244 E 0.035 -245 L 0.032 -246 D 0.033 -247 I 0.037 -248 N 0.045 -249 P 0.053 -250 I 0.057 -251 V 0.060 -252 K 0.069 -253 S 0.091 -254 V 0.120 -255 A 0.143 -256 G 0.153 -257 D 0.153 -258 I 0.150 -259 I 0.150 -260 D 0.156 -261 F 0.166 -262 P 0.176 -263 K 0.182 -264 S 0.183 -265 R 0.179 -266 A 0.169 -267 P 0.156 -268 A 0.144 -269 K 0.137 -270 V 0.134 -271 P 0.130 -272 P 0.124 -273 K 0.120 -274 K 0.120 -275 D 0.121 -276 H 0.117 -277 T 0.110 -278 S 0.104 -279 Q 0.099 -280 V 0.092 -281 M 0.079 -282 V 0.061 -283 P 0.047 -284 L 0.039 -285 Y 0.035 -286 L 0.032 -287 F 0.032 -288 N 0.037 -289 T 0.046 -290 T 0.053 -291 F 0.060 -292 G 0.066 -293 L 0.072 -294 L 0.080 -295 Q 0.088 -296 T 0.097 -297 N 0.102 -298 G 0.101 -299 A 0.095 -300 L 0.085 -301 D 0.077 -302 M 0.072 -303 D 0.071 -304 I 0.071 -305 T 0.071 -306 P 0.075 -307 E 0.082 -308 L 0.092 -309 V 0.102 -310 P 0.114 -311 S 0.125 -312 D 0.132 -313 V 0.128 -314 P 0.113 -315 L 0.094 -316 T 0.080 -317 T 0.074 -318 T 0.070 -319 D 0.066 -320 L 0.063 -321 A 0.070 -322 A 0.086 -323 L 0.105 -324 L 0.121 -325 P 0.130 -326 E 0.134 -327 A 0.137 -328 L 0.141 -329 G 0.146 -330 K 0.149 -331 L 0.147 -332 P 0.141 -333 L 0.134 -334 H 0.130 -335 Q 0.126 -336 Q 0.115 -337 L 0.097 -338 L 0.078 -339 L 0.064 -340 F 0.058 -341 L 0.061 -342 R 0.074 -343 V 0.096 -344 R 0.118 -345 E 0.126 -346 A 0.114 -347 P 0.088 -348 T 0.064 -349 V 0.051 -350 T 0.051 -351 L 0.063 -352 H 0.080 -353 N 0.093 -354 K 0.095 -355 K 0.087 -356 A 0.077 -357 L 0.069 -358 V 0.066 -359 S 0.068 -360 L 0.069 -361 P 0.065 -362 A 0.057 -363 N 0.048 -364 I 0.043 -365 H 0.040 -366 V 0.040 -367 L 0.043 -368 F 0.052 -369 Y 0.067 -370 V 0.087 -371 P 0.109 -372 K 0.127 -373 G 0.138 -374 T 0.136 -375 P 0.124 -376 E 0.114 -377 S 0.110 -378 L 0.112 -379 F 0.117 -380 E 0.122 -381 L 0.127 -382 N 0.126 -383 S 0.119 -384 V 0.111 -385 M 0.106 -386 T 0.104 -387 V 0.098 -388 R 0.088 -389 A 0.081 -390 Q 0.083 -391 L 0.094 -392 A 0.109 -393 P 0.116 -394 S 0.112 -395 A 0.100 -396 T 0.092 -397 K 0.090 -398 L 0.091 -399 H 0.089 -400 I 0.084 -401 S 0.075 -402 L 0.065 -403 S 0.058 -404 L 0.054 -405 E 0.050 -406 R 0.044 -407 L 0.039 -408 S 0.039 -409 V 0.046 -410 K 0.055 -411 V 0.066 -412 A 0.076 -413 S 0.083 -414 S 0.090 -415 F 0.104 -416 T 0.125 -417 H 0.146 -418 A 0.158 -419 F 0.162 -420 D 0.158 -421 G 0.143 -422 S 0.119 -423 R 0.094 -424 L 0.079 -425 E 0.077 -426 E 0.077 -427 W 0.070 -428 L 0.060 -429 S 0.054 -430 H 0.054 -431 V 0.060 -432 V 0.072 -433 G 0.083 -434 A 0.087 -435 V 0.083 -436 Y 0.079 -437 A 0.081 -438 P 0.084 -439 K 0.085 -440 L 0.089 -441 N 0.095 -442 V 0.099 -443 A 0.097 -444 L 0.096 -445 D 0.099 -446 V 0.104 -447 G 0.105 -448 I 0.106 -449 P 0.113 -450 L 0.124 -451 P 0.133 -452 K 0.134 -453 V 0.131 -454 L 0.128 -455 N 0.127 -456 I 0.125 -457 N 0.126 -458 F 0.135 -459 S 0.150 -460 N 0.156 -461 S 0.141 -462 V 0.114 -463 L 0.090 -464 E 0.076 -465 I 0.072 -466 V 0.070 -467 E 0.065 -468 N 0.060 -469 A 0.058 -470 V 0.059 -471 V 0.059 -472 L 0.062 -473 T 0.071 -474 V 0.092 -475 A 0.122 -476 S 0.145 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186191.9_ENST00000375483.4_GN:BPIFB4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186191.9_ENST00000375483.4_GN:BPIFB4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index b481d02cf4a4e4dfce590c010587edbd3ab9017f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186191.9_ENST00000375483.4_GN:BPIFB4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,615 +0,0 @@ ->ENSG00000186191.9|ENST00000375483.4|GN:BPIFB4|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.154 -2 W 0.142 -3 M 0.123 -4 A 0.109 -5 W 0.108 -6 C 0.118 -7 V 0.124 -8 A 0.125 -9 A 0.130 -10 L 0.140 -11 S 0.151 -12 V 0.159 -13 V 0.170 -14 A 0.196 -15 V 0.235 -16 C 0.269 -17 G 0.287 -18 T 0.284 -19 S 0.264 -20 H 0.230 -21 E 0.183 -22 T 0.134 -23 N 0.095 -24 T 0.074 -25 V 0.065 -26 L 0.060 -27 R 0.053 -28 V 0.045 -29 T 0.037 -30 K 0.032 -31 D 0.031 -32 V 0.032 -33 L 0.034 -34 S 0.037 -35 N 0.044 -36 A 0.055 -37 I 0.064 -38 S 0.071 -39 G 0.077 -40 M 0.081 -41 L 0.088 -42 Q 0.103 -43 Q 0.125 -44 S 0.139 -45 D 0.135 -46 A 0.122 -47 L 0.115 -48 H 0.119 -49 S 0.130 -50 A 0.138 -51 L 0.140 -52 R 0.141 -53 E 0.151 -54 V 0.168 -55 P 0.193 -56 L 0.241 -57 G 0.320 -58 V 0.408 -59 G 0.468 -60 D 0.487 -61 I 0.491 -62 P 0.507 -63 Y 0.545 -64 N 0.586 -65 D 0.609 -66 F 0.609 -67 H 0.594 -68 V 0.558 -69 R 0.502 -70 G 0.457 -71 P 0.463 -72 P 0.527 -73 P 0.612 -74 V 0.674 -75 Y 0.702 -76 T 0.708 -77 N 0.713 -78 G 0.725 -79 K 0.742 -80 K 0.756 -81 L 0.761 -82 D 0.757 -83 G 0.745 -84 I 0.729 -85 Y 0.717 -86 Q 0.713 -87 Y 0.722 -88 G 0.740 -89 H 0.758 -90 I 0.762 -91 E 0.749 -92 T 0.734 -93 N 0.728 -94 D 0.727 -95 N 0.719 -96 T 0.707 -97 A 0.703 -98 Q 0.713 -99 L 0.727 -100 G 0.729 -101 G 0.719 -102 K 0.699 -103 Y 0.674 -104 R 0.656 -105 Y 0.664 -106 G 0.694 -107 E 0.711 -108 I 0.698 -109 L 0.666 -110 E 0.640 -111 S 0.634 -112 E 0.643 -113 G 0.653 -114 S 0.650 -115 I 0.640 -116 R 0.629 -117 D 0.615 -118 L 0.601 -119 R 0.597 -120 N 0.605 -121 S 0.614 -122 G 0.602 -123 Y 0.569 -124 R 0.550 -125 S 0.570 -126 A 0.607 -127 E 0.635 -128 N 0.649 -129 A 0.654 -130 Y 0.662 -131 G 0.674 -132 G 0.684 -133 H 0.686 -134 R 0.679 -135 G 0.655 -136 L 0.607 -137 G 0.546 -138 R 0.509 -139 Y 0.523 -140 R 0.558 -141 A 0.578 -142 A 0.586 -143 P 0.602 -144 V 0.624 -145 G 0.631 -146 R 0.614 -147 L 0.590 -148 H 0.576 -149 R 0.580 -150 R 0.596 -151 E 0.611 -152 L 0.615 -153 Q 0.620 -154 P 0.639 -155 G 0.664 -156 E 0.678 -157 I 0.681 -158 P 0.695 -159 P 0.729 -160 G 0.766 -161 V 0.788 -162 A 0.799 -163 T 0.809 -164 G 0.815 -165 A 0.807 -166 V 0.781 -167 G 0.752 -168 P 0.735 -169 G 0.736 -170 G 0.742 -171 L 0.734 -172 L 0.703 -173 G 0.659 -174 T 0.640 -175 G 0.670 -176 G 0.721 -177 M 0.754 -178 L 0.762 -179 A 0.760 -180 A 0.756 -181 D 0.755 -182 G 0.758 -183 I 0.762 -184 L 0.770 -185 A 0.778 -186 G 0.778 -187 Q 0.768 -188 G 0.755 -189 G 0.746 -190 L 0.749 -191 L 0.762 -192 G 0.776 -193 G 0.779 -194 G 0.767 -195 G 0.744 -196 L 0.724 -197 L 0.721 -198 G 0.735 -199 D 0.745 -200 G 0.740 -201 G 0.729 -202 L 0.723 -203 L 0.724 -204 G 0.726 -205 G 0.717 -206 G 0.686 -207 G 0.637 -208 V 0.592 -209 L 0.571 -210 G 0.566 -211 V 0.554 -212 L 0.541 -213 G 0.553 -214 E 0.576 -215 G 0.566 -216 G 0.505 -217 I 0.416 -218 L 0.337 -219 S 0.287 -220 T 0.268 -221 V 0.269 -222 Q 0.273 -223 G 0.267 -224 I 0.252 -225 T 0.232 -226 G 0.206 -227 L 0.169 -228 R 0.129 -229 I 0.096 -230 V 0.076 -231 E 0.066 -232 L 0.062 -233 T 0.057 -234 L 0.051 -235 P 0.043 -236 R 0.034 -237 V 0.026 -238 S 0.023 -239 V 0.028 -240 R 0.039 -241 L 0.056 -242 L 0.071 -243 P 0.082 -244 G 0.085 -245 V 0.079 -246 G 0.065 -247 V 0.051 -248 Y 0.044 -249 L 0.041 -250 S 0.039 -251 L 0.037 -252 Y 0.034 -253 T 0.031 -254 R 0.029 -255 V 0.029 -256 A 0.032 -257 I 0.036 -258 N 0.040 -259 G 0.043 -260 K 0.047 -261 S 0.052 -262 L 0.060 -263 I 0.069 -264 G 0.079 -265 F 0.087 -266 L 0.093 -267 D 0.097 -268 I 0.098 -269 A 0.097 -270 V 0.094 -271 E 0.088 -272 V 0.078 -273 N 0.065 -274 I 0.052 -275 T 0.044 -276 A 0.039 -277 K 0.039 -278 V 0.044 -279 R 0.054 -280 L 0.067 -281 T 0.081 -282 M 0.095 -283 D 0.113 -284 R 0.132 -285 T 0.145 -286 G 0.140 -287 Y 0.120 -288 P 0.094 -289 R 0.073 -290 L 0.058 -291 V 0.047 -292 I 0.041 -293 E 0.039 -294 R 0.041 -295 C 0.046 -296 D 0.051 -297 T 0.056 -298 L 0.066 -299 L 0.080 -300 G 0.092 -301 G 0.092 -302 I 0.082 -303 K 0.073 -304 V 0.069 -305 K 0.072 -306 L 0.080 -307 L 0.100 -308 R 0.128 -309 G 0.150 -310 L 0.157 -311 L 0.154 -312 P 0.145 -313 N 0.129 -314 L 0.110 -315 V 0.097 -316 D 0.090 -317 N 0.085 -318 L 0.082 -319 V 0.082 -320 N 0.084 -321 R 0.087 -322 V 0.093 -323 L 0.105 -324 A 0.119 -325 D 0.125 -326 V 0.118 -327 L 0.102 -328 P 0.084 -329 D 0.074 -330 L 0.073 -331 L 0.077 -332 C 0.083 -333 P 0.090 -334 I 0.095 -335 V 0.093 -336 D 0.089 -337 V 0.088 -338 V 0.089 -339 L 0.091 -340 G 0.096 -341 L 0.100 -342 V 0.096 -343 N 0.085 -344 D 0.074 -345 Q 0.069 -346 L 0.070 -347 G 0.075 -348 L 0.080 -349 V 0.079 -350 D 0.072 -351 S 0.066 -352 L 0.069 -353 I 0.079 -354 P 0.086 -355 L 0.087 -356 G 0.086 -357 I 0.084 -358 L 0.081 -359 G 0.077 -360 S 0.073 -361 V 0.069 -362 Q 0.065 -363 Y 0.062 -364 T 0.065 -365 F 0.072 -366 S 0.079 -367 S 0.079 -368 L 0.074 -369 P 0.069 -370 L 0.065 -371 V 0.065 -372 T 0.067 -373 G 0.070 -374 E 0.068 -375 F 0.060 -376 L 0.051 -377 E 0.043 -378 L 0.038 -379 D 0.033 -380 L 0.031 -381 N 0.034 -382 T 0.046 -383 L 0.068 -384 V 0.105 -385 G 0.162 -386 E 0.238 -387 A 0.314 -388 G 0.363 -389 G 0.372 -390 G 0.346 -391 L 0.307 -392 I 0.276 -393 D 0.264 -394 Y 0.264 -395 P 0.264 -396 L 0.255 -397 G 0.247 -398 W 0.247 -399 P 0.247 -400 A 0.238 -401 V 0.223 -402 S 0.209 -403 P 0.197 -404 K 0.183 -405 P 0.169 -406 M 0.158 -407 P 0.153 -408 E 0.156 -409 L 0.165 -410 P 0.179 -411 P 0.191 -412 M 0.194 -413 G 0.188 -414 D 0.170 -415 N 0.145 -416 T 0.121 -417 K 0.104 -418 S 0.095 -419 Q 0.091 -420 L 0.085 -421 A 0.074 -422 M 0.061 -423 S 0.050 -424 A 0.044 -425 N 0.041 -426 F 0.040 -427 L 0.042 -428 G 0.047 -429 S 0.053 -430 V 0.057 -431 L 0.060 -432 T 0.062 -433 L 0.066 -434 L 0.070 -435 Q 0.076 -436 K 0.081 -437 Q 0.084 -438 H 0.085 -439 A 0.084 -440 L 0.082 -441 D 0.078 -442 L 0.072 -443 D 0.068 -444 I 0.072 -445 T 0.086 -446 N 0.107 -447 G 0.121 -448 M 0.120 -449 F 0.111 -450 E 0.106 -451 E 0.108 -452 L 0.117 -453 P 0.125 -454 P 0.127 -455 L 0.120 -456 T 0.111 -457 T 0.103 -458 A 0.093 -459 T 0.081 -460 L 0.073 -461 G 0.078 -462 A 0.091 -463 L 0.101 -464 I 0.104 -465 P 0.103 -466 K 0.100 -467 V 0.099 -468 F 0.105 -469 Q 0.119 -470 Q 0.138 -471 Y 0.154 -472 P 0.160 -473 E 0.154 -474 S 0.143 -475 C 0.136 -476 P 0.132 -477 L 0.123 -478 I 0.108 -479 I 0.091 -480 R 0.079 -481 I 0.076 -482 Q 0.083 -483 V 0.099 -484 L 0.115 -485 N 0.120 -486 P 0.106 -487 P 0.083 -488 S 0.064 -489 V 0.060 -490 M 0.068 -491 L 0.086 -492 Q 0.105 -493 K 0.118 -494 D 0.117 -495 K 0.106 -496 A 0.091 -497 L 0.078 -498 V 0.070 -499 K 0.068 -500 V 0.067 -501 L 0.063 -502 A 0.055 -503 T 0.046 -504 A 0.041 -505 E 0.043 -506 V 0.051 -507 M 0.064 -508 V 0.082 -509 S 0.103 -510 Q 0.126 -511 P 0.145 -512 K 0.161 -513 D 0.170 -514 L 0.167 -515 E 0.151 -516 T 0.131 -517 T 0.118 -518 I 0.114 -519 C 0.117 -520 L 0.127 -521 I 0.137 -522 D 0.139 -523 V 0.132 -524 D 0.120 -525 T 0.105 -526 E 0.090 -527 F 0.078 -528 L 0.070 -529 A 0.066 -530 S 0.066 -531 F 0.072 -532 S 0.083 -533 T 0.096 -534 E 0.108 -535 G 0.118 -536 D 0.125 -537 K 0.127 -538 L 0.123 -539 M 0.114 -540 I 0.102 -541 D 0.087 -542 A 0.074 -543 K 0.066 -544 L 0.061 -545 E 0.058 -546 K 0.055 -547 T 0.053 -548 S 0.056 -549 L 0.063 -550 N 0.073 -551 L 0.082 -552 R 0.092 -553 T 0.105 -554 S 0.118 -555 N 0.132 -556 V 0.146 -557 G 0.159 -558 N 0.166 -559 F 0.158 -560 D 0.137 -561 I 0.113 -562 G 0.093 -563 L 0.080 -564 M 0.076 -565 E 0.079 -566 V 0.080 -567 L 0.072 -568 V 0.063 -569 E 0.059 -570 K 0.061 -571 I 0.069 -572 F 0.080 -573 D 0.088 -574 L 0.088 -575 A 0.086 -576 F 0.089 -577 M 0.099 -578 P 0.108 -579 A 0.110 -580 M 0.104 -581 N 0.099 -582 A 0.102 -583 V 0.111 -584 L 0.122 -585 G 0.134 -586 S 0.138 -587 G 0.134 -588 V 0.127 -589 P 0.128 -590 L 0.136 -591 P 0.142 -592 K 0.140 -593 I 0.130 -594 L 0.120 -595 N 0.115 -596 I 0.113 -597 D 0.113 -598 F 0.121 -599 S 0.141 -600 N 0.161 -601 A 0.165 -602 D 0.152 -603 I 0.132 -604 D 0.116 -605 V 0.111 -606 L 0.112 -607 E 0.108 -608 D 0.092 -609 L 0.074 -610 L 0.064 -611 V 0.068 -612 L 0.087 -613 S 0.115 -614 A 0.137 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186191.9_ENST00000375483.4_GN:BPIFB4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186191.9_ENST00000375483.4_GN:BPIFB4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid deleted file mode 100644 index 526c16c8b4e55b80ea7bb90cd95335f23d081749..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186191.9_ENST00000375483.4_GN:BPIFB4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid +++ /dev/null @@ -1,635 +0,0 @@ ->ENSG00000186191.9|ENST00000375483.4|GN:BPIFB4|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:20 -1 M 0.219 -2 R 0.204 -3 Y 0.187 -4 N 0.175 -5 L 0.163 -6 F 0.153 -7 V 0.151 -8 I 0.157 -9 W 0.164 -10 E 0.170 -11 Q 0.179 -12 K 0.197 -13 F 0.225 -14 K 0.268 -15 K 0.327 -16 G 0.383 -17 S 0.406 -18 S 0.383 -19 A 0.325 -20 S 0.256 -21 M 0.194 -22 W 0.148 -23 M 0.121 -24 A 0.112 -25 W 0.114 -26 C 0.117 -27 V 0.116 -28 A 0.113 -29 A 0.113 -30 L 0.118 -31 S 0.128 -32 V 0.138 -33 V 0.153 -34 A 0.181 -35 V 0.220 -36 C 0.257 -37 G 0.280 -38 T 0.283 -39 S 0.267 -40 H 0.231 -41 E 0.181 -42 T 0.130 -43 N 0.092 -44 T 0.072 -45 V 0.065 -46 L 0.061 -47 R 0.055 -48 V 0.046 -49 T 0.037 -50 K 0.033 -51 D 0.032 -52 V 0.032 -53 L 0.033 -54 S 0.036 -55 N 0.043 -56 A 0.054 -57 I 0.066 -58 S 0.077 -59 G 0.085 -60 M 0.089 -61 L 0.094 -62 Q 0.107 -63 Q 0.128 -64 S 0.141 -65 D 0.136 -66 A 0.122 -67 L 0.115 -68 H 0.118 -69 S 0.130 -70 A 0.141 -71 L 0.146 -72 R 0.150 -73 E 0.162 -74 V 0.183 -75 P 0.214 -76 L 0.270 -77 G 0.357 -78 V 0.450 -79 G 0.512 -80 D 0.531 -81 I 0.530 -82 P 0.541 -83 Y 0.573 -84 N 0.611 -85 D 0.632 -86 F 0.633 -87 H 0.620 -88 V 0.587 -89 R 0.534 -90 G 0.487 -91 P 0.487 -92 P 0.543 -93 P 0.621 -94 V 0.679 -95 Y 0.704 -96 T 0.711 -97 N 0.716 -98 G 0.727 -99 K 0.742 -100 K 0.753 -101 L 0.757 -102 D 0.751 -103 G 0.736 -104 I 0.716 -105 Y 0.699 -106 Q 0.693 -107 Y 0.703 -108 G 0.723 -109 H 0.743 -110 I 0.747 -111 E 0.737 -112 T 0.725 -113 N 0.725 -114 D 0.731 -115 N 0.730 -116 T 0.719 -117 A 0.710 -118 Q 0.713 -119 L 0.721 -120 G 0.724 -121 G 0.716 -122 K 0.699 -123 Y 0.679 -124 R 0.669 -125 Y 0.683 -126 G 0.714 -127 E 0.734 -128 I 0.723 -129 L 0.694 -130 E 0.669 -131 S 0.662 -132 E 0.669 -133 G 0.677 -134 S 0.673 -135 I 0.664 -136 R 0.654 -137 D 0.641 -138 L 0.625 -139 R 0.620 -140 N 0.627 -141 S 0.634 -142 G 0.620 -143 Y 0.585 -144 R 0.565 -145 S 0.588 -146 A 0.630 -147 E 0.659 -148 N 0.672 -149 A 0.676 -150 Y 0.682 -151 G 0.692 -152 G 0.698 -153 H 0.695 -154 R 0.685 -155 G 0.661 -156 L 0.614 -157 G 0.552 -158 R 0.516 -159 Y 0.531 -160 R 0.570 -161 A 0.594 -162 A 0.604 -163 P 0.620 -164 V 0.641 -165 G 0.647 -166 R 0.632 -167 L 0.609 -168 H 0.594 -169 R 0.596 -170 R 0.612 -171 E 0.627 -172 L 0.634 -173 Q 0.640 -174 P 0.658 -175 G 0.681 -176 E 0.692 -177 I 0.693 -178 P 0.708 -179 P 0.742 -180 G 0.779 -181 V 0.801 -182 A 0.811 -183 T 0.819 -184 G 0.824 -185 A 0.814 -186 V 0.790 -187 G 0.763 -188 P 0.749 -189 G 0.752 -190 G 0.756 -191 L 0.745 -192 L 0.707 -193 G 0.653 -194 T 0.628 -195 G 0.662 -196 G 0.723 -197 M 0.761 -198 L 0.772 -199 A 0.770 -200 A 0.768 -201 D 0.769 -202 G 0.772 -203 I 0.775 -204 L 0.781 -205 A 0.787 -206 G 0.786 -207 Q 0.776 -208 G 0.765 -209 G 0.761 -210 L 0.767 -211 L 0.779 -212 G 0.791 -213 G 0.794 -214 G 0.784 -215 G 0.765 -216 L 0.746 -217 L 0.741 -218 G 0.750 -219 D 0.757 -220 G 0.752 -221 G 0.741 -222 L 0.733 -223 L 0.732 -224 G 0.733 -225 G 0.721 -226 G 0.690 -227 G 0.642 -228 V 0.597 -229 L 0.575 -230 G 0.568 -231 V 0.553 -232 L 0.537 -233 G 0.546 -234 E 0.566 -235 G 0.556 -236 G 0.495 -237 I 0.406 -238 L 0.326 -239 S 0.277 -240 T 0.258 -241 V 0.258 -242 Q 0.260 -243 G 0.252 -244 I 0.237 -245 T 0.218 -246 G 0.193 -247 L 0.158 -248 R 0.121 -249 I 0.091 -250 V 0.073 -251 E 0.064 -252 L 0.060 -253 T 0.056 -254 L 0.050 -255 P 0.042 -256 R 0.033 -257 V 0.025 -258 S 0.022 -259 V 0.026 -260 R 0.038 -261 L 0.054 -262 L 0.070 -263 P 0.081 -264 G 0.085 -265 V 0.079 -266 G 0.064 -267 V 0.051 -268 Y 0.043 -269 L 0.040 -270 S 0.038 -271 L 0.036 -272 Y 0.034 -273 T 0.031 -274 R 0.029 -275 V 0.028 -276 A 0.030 -277 I 0.034 -278 N 0.038 -279 G 0.041 -280 K 0.045 -281 S 0.051 -282 L 0.059 -283 I 0.069 -284 G 0.079 -285 F 0.087 -286 L 0.093 -287 D 0.097 -288 I 0.097 -289 A 0.095 -290 V 0.092 -291 E 0.087 -292 V 0.077 -293 N 0.064 -294 I 0.052 -295 T 0.044 -296 A 0.039 -297 K 0.039 -298 V 0.044 -299 R 0.054 -300 L 0.067 -301 T 0.081 -302 M 0.096 -303 D 0.114 -304 R 0.134 -305 T 0.146 -306 G 0.141 -307 Y 0.121 -308 P 0.095 -309 R 0.073 -310 L 0.058 -311 V 0.048 -312 I 0.041 -313 E 0.039 -314 R 0.041 -315 C 0.046 -316 D 0.051 -317 T 0.057 -318 L 0.067 -319 L 0.082 -320 G 0.094 -321 G 0.094 -322 I 0.084 -323 K 0.074 -324 V 0.071 -325 K 0.073 -326 L 0.082 -327 L 0.103 -328 R 0.132 -329 G 0.154 -330 L 0.159 -331 L 0.156 -332 P 0.146 -333 N 0.130 -334 L 0.111 -335 V 0.098 -336 D 0.092 -337 N 0.087 -338 L 0.083 -339 V 0.083 -340 N 0.085 -341 R 0.088 -342 V 0.095 -343 L 0.108 -344 A 0.123 -345 D 0.129 -346 V 0.122 -347 L 0.105 -348 P 0.087 -349 D 0.076 -350 L 0.075 -351 L 0.078 -352 C 0.084 -353 P 0.090 -354 I 0.094 -355 V 0.093 -356 D 0.089 -357 V 0.087 -358 V 0.087 -359 L 0.088 -360 G 0.093 -361 L 0.097 -362 V 0.093 -363 N 0.083 -364 D 0.073 -365 Q 0.068 -366 L 0.070 -367 G 0.076 -368 L 0.080 -369 V 0.079 -370 D 0.072 -371 S 0.064 -372 L 0.067 -373 I 0.076 -374 P 0.084 -375 L 0.086 -376 G 0.085 -377 I 0.083 -378 L 0.080 -379 G 0.076 -380 S 0.073 -381 V 0.069 -382 Q 0.065 -383 Y 0.062 -384 T 0.065 -385 F 0.073 -386 S 0.079 -387 S 0.079 -388 L 0.075 -389 P 0.069 -390 L 0.065 -391 V 0.064 -392 T 0.066 -393 G 0.068 -394 E 0.066 -395 F 0.058 -396 L 0.049 -397 E 0.042 -398 L 0.037 -399 D 0.033 -400 L 0.031 -401 N 0.034 -402 T 0.047 -403 L 0.069 -404 V 0.107 -405 G 0.164 -406 E 0.240 -407 A 0.318 -408 G 0.369 -409 G 0.378 -410 G 0.352 -411 L 0.312 -412 I 0.280 -413 D 0.266 -414 Y 0.266 -415 P 0.265 -416 L 0.257 -417 G 0.249 -418 W 0.250 -419 P 0.251 -420 A 0.244 -421 V 0.229 -422 S 0.215 -423 P 0.202 -424 K 0.187 -425 P 0.171 -426 M 0.158 -427 P 0.152 -428 E 0.155 -429 L 0.165 -430 P 0.180 -431 P 0.192 -432 M 0.197 -433 G 0.191 -434 D 0.173 -435 N 0.147 -436 T 0.122 -437 K 0.105 -438 S 0.096 -439 Q 0.091 -440 L 0.085 -441 A 0.075 -442 M 0.061 -443 S 0.050 -444 A 0.044 -445 N 0.042 -446 F 0.041 -447 L 0.042 -448 G 0.047 -449 S 0.053 -450 V 0.057 -451 L 0.060 -452 T 0.063 -453 L 0.067 -454 L 0.071 -455 Q 0.076 -456 K 0.082 -457 Q 0.085 -458 H 0.085 -459 A 0.084 -460 L 0.083 -461 D 0.079 -462 L 0.073 -463 D 0.069 -464 I 0.073 -465 T 0.087 -466 N 0.109 -467 G 0.123 -468 M 0.122 -469 F 0.113 -470 E 0.107 -471 E 0.109 -472 L 0.118 -473 P 0.127 -474 P 0.128 -475 L 0.121 -476 T 0.112 -477 T 0.105 -478 A 0.095 -479 T 0.082 -480 L 0.074 -481 G 0.080 -482 A 0.093 -483 L 0.102 -484 I 0.105 -485 P 0.104 -486 K 0.101 -487 V 0.101 -488 F 0.107 -489 Q 0.121 -490 Q 0.140 -491 Y 0.157 -492 P 0.162 -493 E 0.157 -494 S 0.147 -495 C 0.140 -496 P 0.136 -497 L 0.127 -498 I 0.111 -499 I 0.093 -500 R 0.081 -501 I 0.077 -502 Q 0.084 -503 V 0.100 -504 L 0.117 -505 N 0.122 -506 P 0.109 -507 P 0.085 -508 S 0.066 -509 V 0.061 -510 M 0.070 -511 L 0.088 -512 Q 0.107 -513 K 0.119 -514 D 0.118 -515 K 0.106 -516 A 0.091 -517 L 0.078 -518 V 0.071 -519 K 0.068 -520 V 0.067 -521 L 0.064 -522 A 0.056 -523 T 0.047 -524 A 0.042 -525 E 0.044 -526 V 0.052 -527 M 0.065 -528 V 0.083 -529 S 0.106 -530 Q 0.128 -531 P 0.148 -532 K 0.164 -533 D 0.173 -534 L 0.170 -535 E 0.153 -536 T 0.134 -537 T 0.120 -538 I 0.116 -539 C 0.120 -540 L 0.130 -541 I 0.140 -542 D 0.142 -543 V 0.134 -544 D 0.121 -545 T 0.106 -546 E 0.091 -547 F 0.078 -548 L 0.070 -549 A 0.067 -550 S 0.067 -551 F 0.072 -552 S 0.083 -553 T 0.096 -554 E 0.109 -555 G 0.118 -556 D 0.125 -557 K 0.127 -558 L 0.123 -559 M 0.114 -560 I 0.102 -561 D 0.088 -562 A 0.075 -563 K 0.066 -564 L 0.062 -565 E 0.059 -566 K 0.056 -567 T 0.054 -568 S 0.057 -569 L 0.064 -570 N 0.073 -571 L 0.083 -572 R 0.094 -573 T 0.106 -574 S 0.120 -575 N 0.135 -576 V 0.149 -577 G 0.162 -578 N 0.169 -579 F 0.161 -580 D 0.140 -581 I 0.116 -582 G 0.095 -583 L 0.082 -584 M 0.078 -585 E 0.081 -586 V 0.081 -587 L 0.073 -588 V 0.064 -589 E 0.060 -590 K 0.062 -591 I 0.070 -592 F 0.082 -593 D 0.091 -594 L 0.091 -595 A 0.088 -596 F 0.091 -597 M 0.101 -598 P 0.110 -599 A 0.111 -600 M 0.105 -601 N 0.101 -602 A 0.103 -603 V 0.112 -604 L 0.124 -605 G 0.136 -606 S 0.141 -607 G 0.135 -608 V 0.129 -609 P 0.129 -610 L 0.137 -611 P 0.143 -612 K 0.140 -613 I 0.129 -614 L 0.119 -615 N 0.113 -616 I 0.111 -617 D 0.112 -618 F 0.120 -619 S 0.140 -620 N 0.160 -621 A 0.165 -622 D 0.153 -623 I 0.133 -624 D 0.118 -625 V 0.114 -626 L 0.115 -627 E 0.110 -628 D 0.094 -629 L 0.075 -630 L 0.064 -631 V 0.068 -632 L 0.086 -633 S 0.114 -634 A 0.135 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186407.9_ENST00000392619.2_GN:CD300E_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186407.9_ENST00000392619.2_GN:CD300E_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 6b1c76218765cb2862cb783f4fe9506875ff12cf..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186407.9_ENST00000392619.2_GN:CD300E_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,206 +0,0 @@ ->ENSG00000186407.9|ENST00000392619.2|GN:CD300E|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.300 -2 W 0.281 -3 L 0.257 -4 L 0.237 -5 P 0.219 -6 A 0.201 -7 L 0.190 -8 L 0.194 -9 L 0.211 -10 L 0.240 -11 C 0.276 -12 L 0.314 -13 S 0.342 -14 G 0.345 -15 C 0.308 -16 L 0.237 -17 S 0.165 -18 L 0.121 -19 K 0.107 -20 G 0.108 -21 P 0.111 -22 G 0.105 -23 S 0.093 -24 V 0.081 -25 T 0.074 -26 G 0.073 -27 T 0.078 -28 A 0.082 -29 G 0.078 -30 D 0.068 -31 S 0.056 -32 L 0.044 -33 T 0.034 -34 V 0.026 -35 W 0.023 -36 C 0.025 -37 Q 0.032 -38 Y 0.038 -39 E 0.042 -40 S 0.046 -41 M 0.051 -42 Y 0.056 -43 K 0.058 -44 G 0.057 -45 Y 0.052 -46 N 0.044 -47 K 0.033 -48 Y 0.028 -49 W 0.031 -50 C 0.042 -51 R 0.056 -52 G 0.070 -53 Q 0.081 -54 Y 0.089 -55 D 0.093 -56 T 0.095 -57 S 0.093 -58 C 0.084 -59 E 0.074 -60 S 0.069 -61 I 0.069 -62 V 0.069 -63 E 0.072 -64 T 0.085 -65 K 0.100 -66 G 0.105 -67 E 0.097 -68 E 0.082 -69 K 0.071 -70 V 0.068 -71 E 0.072 -72 R 0.079 -73 N 0.079 -74 G 0.066 -75 R 0.051 -76 V 0.044 -77 S 0.045 -78 I 0.047 -79 R 0.048 -80 D 0.049 -81 H 0.052 -82 P 0.055 -83 E 0.057 -84 A 0.053 -85 L 0.044 -86 A 0.032 -87 F 0.023 -88 T 0.020 -89 V 0.022 -90 T 0.029 -91 M 0.041 -92 Q 0.055 -93 N 0.064 -94 L 0.066 -95 N 0.065 -96 E 0.065 -97 D 0.071 -98 D 0.082 -99 A 0.089 -100 G 0.081 -101 S 0.058 -102 Y 0.034 -103 W 0.022 -104 C 0.024 -105 K 0.034 -106 I 0.050 -107 Q 0.070 -108 T 0.092 -109 V 0.114 -110 W 0.134 -111 V 0.152 -112 L 0.170 -113 D 0.187 -114 S 0.201 -115 W 0.212 -116 S 0.218 -117 R 0.212 -118 D 0.190 -119 P 0.158 -120 S 0.124 -121 D 0.094 -122 L 0.070 -123 V 0.051 -124 R 0.043 -125 V 0.048 -126 Y 0.071 -127 V 0.125 -128 S 0.217 -129 P 0.344 -130 A 0.472 -131 I 0.564 -132 T 0.610 -133 T 0.637 -134 P 0.664 -135 R 0.692 -136 R 0.709 -137 T 0.706 -138 T 0.689 -139 H 0.670 -140 P 0.656 -141 A 0.641 -142 T 0.628 -143 P 0.629 -144 P 0.649 -145 I 0.677 -146 F 0.701 -147 L 0.712 -148 V 0.710 -149 V 0.702 -150 N 0.701 -151 P 0.711 -152 G 0.725 -153 R 0.736 -154 N 0.743 -155 L 0.750 -156 S 0.760 -157 T 0.769 -158 G 0.774 -159 E 0.775 -160 V 0.776 -161 L 0.778 -162 T 0.779 -163 Q 0.777 -164 N 0.768 -165 S 0.752 -166 G 0.726 -167 F 0.694 -168 R 0.659 -169 L 0.621 -170 S 0.566 -171 S 0.489 -172 P 0.402 -173 H 0.323 -174 F 0.270 -175 L 0.245 -176 L 0.243 -177 V 0.254 -178 V 0.267 -179 L 0.278 -180 L 0.290 -181 K 0.298 -182 L 0.300 -183 P 0.296 -184 L 0.292 -185 L 0.288 -186 L 0.284 -187 S 0.276 -188 M 0.258 -189 L 0.232 -190 G 0.207 -191 A 0.189 -192 V 0.176 -193 F 0.175 -194 W 0.199 -195 V 0.250 -196 N 0.309 -197 R 0.363 -198 P 0.411 -199 Q 0.453 -200 W 0.483 -201 A 0.503 -202 P 0.523 -203 P 0.534 -204 G 0.521 -205 R 0.496 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186407.9_ENST00000392619.2_GN:CD300E_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186407.9_ENST00000392619.2_GN:CD300E_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid deleted file mode 100644 index 9c565c1d6e0ae06e504852f2da36e414c1b4232c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186407.9_ENST00000392619.2_GN:CD300E_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid +++ /dev/null @@ -1,233 +0,0 @@ ->ENSG00000186407.9|ENST00000392619.2|GN:CD300E|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:27 -1 M 0.422 -2 T 0.443 -3 Q 0.480 -4 A 0.513 -5 P 0.514 -6 L 0.487 -7 H 0.474 -8 I 0.504 -9 L 0.546 -10 G 0.566 -11 F 0.571 -12 Q 0.584 -13 L 0.610 -14 G 0.641 -15 P 0.663 -16 R 0.664 -17 F 0.636 -18 A 0.592 -19 E 0.577 -20 D 0.613 -21 G 0.666 -22 S 0.699 -23 Q 0.711 -24 G 0.709 -25 D 0.684 -26 R 0.631 -27 N 0.552 -28 M 0.458 -29 W 0.368 -30 L 0.304 -31 L 0.270 -32 P 0.249 -33 A 0.231 -34 L 0.222 -35 L 0.227 -36 L 0.242 -37 L 0.267 -38 C 0.300 -39 L 0.338 -40 S 0.369 -41 G 0.373 -42 C 0.330 -43 L 0.249 -44 S 0.166 -45 L 0.116 -46 K 0.101 -47 G 0.103 -48 P 0.107 -49 G 0.103 -50 S 0.092 -51 V 0.080 -52 T 0.072 -53 G 0.071 -54 T 0.076 -55 A 0.081 -56 G 0.077 -57 D 0.067 -58 S 0.054 -59 L 0.042 -60 T 0.032 -61 V 0.025 -62 W 0.023 -63 C 0.026 -64 Q 0.033 -65 Y 0.039 -66 E 0.042 -67 S 0.045 -68 M 0.050 -69 Y 0.055 -70 K 0.056 -71 G 0.055 -72 Y 0.051 -73 N 0.043 -74 K 0.032 -75 Y 0.027 -76 W 0.031 -77 C 0.041 -78 R 0.055 -79 G 0.068 -80 Q 0.078 -81 Y 0.085 -82 D 0.089 -83 T 0.091 -84 S 0.088 -85 C 0.079 -86 E 0.070 -87 S 0.065 -88 I 0.065 -89 V 0.066 -90 E 0.071 -91 T 0.084 -92 K 0.100 -93 G 0.105 -94 E 0.096 -95 E 0.082 -96 K 0.071 -97 V 0.068 -98 E 0.072 -99 R 0.078 -100 N 0.077 -101 G 0.064 -102 R 0.050 -103 V 0.044 -104 S 0.044 -105 I 0.046 -106 R 0.046 -107 D 0.047 -108 H 0.049 -109 P 0.053 -110 E 0.054 -111 A 0.051 -112 L 0.042 -113 A 0.031 -114 F 0.023 -115 T 0.019 -116 V 0.021 -117 T 0.029 -118 M 0.041 -119 Q 0.055 -120 N 0.064 -121 L 0.066 -122 N 0.065 -123 E 0.067 -124 D 0.073 -125 D 0.084 -126 A 0.092 -127 G 0.084 -128 S 0.060 -129 Y 0.035 -130 W 0.023 -131 C 0.024 -132 K 0.034 -133 I 0.050 -134 Q 0.071 -135 T 0.093 -136 V 0.116 -137 W 0.136 -138 V 0.154 -139 L 0.171 -140 D 0.186 -141 S 0.199 -142 W 0.209 -143 S 0.215 -144 R 0.210 -145 D 0.189 -146 P 0.156 -147 S 0.123 -148 D 0.093 -149 L 0.068 -150 V 0.051 -151 R 0.043 -152 V 0.048 -153 Y 0.072 -154 V 0.125 -155 S 0.218 -156 P 0.347 -157 A 0.479 -158 I 0.575 -159 T 0.623 -160 T 0.649 -161 P 0.675 -162 R 0.702 -163 R 0.719 -164 T 0.717 -165 T 0.700 -166 H 0.681 -167 P 0.665 -168 A 0.650 -169 T 0.636 -170 P 0.637 -171 P 0.658 -172 I 0.687 -173 F 0.711 -174 L 0.723 -175 V 0.719 -176 V 0.710 -177 N 0.709 -178 P 0.719 -179 G 0.734 -180 R 0.745 -181 N 0.753 -182 L 0.761 -183 S 0.771 -184 T 0.781 -185 G 0.786 -186 E 0.786 -187 V 0.786 -188 L 0.787 -189 T 0.787 -190 Q 0.783 -191 N 0.774 -192 S 0.756 -193 G 0.730 -194 F 0.696 -195 R 0.661 -196 L 0.623 -197 S 0.569 -198 S 0.492 -199 P 0.401 -200 H 0.320 -201 F 0.265 -202 L 0.241 -203 L 0.242 -204 V 0.256 -205 V 0.269 -206 L 0.279 -207 L 0.289 -208 K 0.297 -209 L 0.298 -210 P 0.295 -211 L 0.293 -212 L 0.292 -213 L 0.292 -214 S 0.285 -215 M 0.267 -216 L 0.239 -217 G 0.215 -218 A 0.198 -219 V 0.185 -220 F 0.183 -221 W 0.205 -222 V 0.253 -223 N 0.311 -224 R 0.363 -225 P 0.410 -226 Q 0.452 -227 W 0.482 -228 A 0.504 -229 P 0.525 -230 P 0.538 -231 G 0.526 -232 R 0.502 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186684.15_ENST00000664447.2_GN:CYP27C1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186684.15_ENST00000664447.2_GN:CYP27C1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index dce0ac3022612657caa122f3b69a92fe773cd12e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186684.15_ENST00000664447.2_GN:CYP27C1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,538 +0,0 @@ ->ENSG00000186684.15|ENST00000664447.2|GN:CYP27C1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.111 -2 A 0.100 -3 L 0.090 -4 L 0.092 -5 A 0.107 -6 R 0.130 -7 I 0.154 -8 L 0.180 -9 R 0.214 -10 A 0.253 -11 G 0.293 -12 L 0.328 -13 R 0.362 -14 P 0.395 -15 A 0.419 -16 P 0.433 -17 E 0.464 -18 R 0.532 -19 G 0.606 -20 G 0.645 -21 L 0.651 -22 L 0.654 -23 G 0.666 -24 G 0.667 -25 G 0.636 -26 A 0.573 -27 P 0.499 -28 R 0.455 -29 R 0.459 -30 P 0.492 -31 Q 0.534 -32 P 0.574 -33 A 0.587 -34 G 0.555 -35 A 0.504 -36 R 0.473 -37 L 0.462 -38 P 0.457 -39 A 0.466 -40 G 0.477 -41 A 0.451 -42 R 0.406 -43 A 0.409 -44 E 0.462 -45 D 0.508 -46 K 0.537 -47 G 0.579 -48 A 0.627 -49 G 0.655 -50 R 0.664 -51 P 0.662 -52 G 0.649 -53 S 0.637 -54 P 0.646 -55 P 0.678 -56 G 0.709 -57 G 0.717 -58 G 0.695 -59 R 0.648 -60 A 0.583 -61 E 0.509 -62 G 0.434 -63 P 0.364 -64 R 0.307 -65 S 0.268 -66 L 0.247 -67 A 0.231 -68 A 0.211 -69 M 0.184 -70 P 0.156 -71 G 0.136 -72 P 0.125 -73 R 0.114 -74 T 0.091 -75 L 0.065 -76 A 0.050 -77 N 0.044 -78 L 0.042 -79 A 0.047 -80 E 0.062 -81 F 0.084 -82 F 0.107 -83 C 0.125 -84 R 0.132 -85 D 0.128 -86 G 0.121 -87 F 0.114 -88 S 0.103 -89 R 0.087 -90 I 0.073 -91 H 0.066 -92 E 0.061 -93 I 0.053 -94 Q 0.044 -95 Q 0.038 -96 K 0.033 -97 H 0.030 -98 T 0.027 -99 R 0.029 -100 E 0.033 -101 Y 0.036 -102 G 0.034 -103 K 0.028 -104 I 0.024 -105 F 0.024 -106 K 0.026 -107 S 0.029 -108 H 0.033 -109 F 0.039 -110 G 0.049 -111 P 0.058 -112 Q 0.060 -113 F 0.055 -114 V 0.048 -115 V 0.046 -116 S 0.054 -117 I 0.067 -118 A 0.078 -119 D 0.078 -120 R 0.068 -121 D 0.058 -122 M 0.052 -123 V 0.052 -124 A 0.058 -125 Q 0.069 -126 V 0.083 -127 L 0.097 -128 R 0.110 -129 A 0.122 -130 E 0.129 -131 G 0.130 -132 A 0.124 -133 A 0.114 -134 P 0.107 -135 Q 0.105 -136 R 0.107 -137 A 0.109 -138 N 0.106 -139 M 0.096 -140 E 0.084 -141 S 0.073 -142 W 0.064 -143 R 0.058 -144 E 0.055 -145 Y 0.056 -146 R 0.062 -147 D 0.075 -148 L 0.096 -149 R 0.127 -150 G 0.164 -151 R 0.186 -152 A 0.180 -153 T 0.158 -154 G 0.141 -155 L 0.136 -156 I 0.135 -157 S 0.132 -158 A 0.127 -159 E 0.118 -160 G 0.107 -161 E 0.100 -162 Q 0.097 -163 W 0.092 -164 L 0.083 -165 K 0.077 -166 M 0.081 -167 R 0.089 -168 S 0.091 -169 V 0.084 -170 L 0.073 -171 R 0.067 -172 Q 0.066 -173 R 0.066 -174 I 0.066 -175 L 0.070 -176 K 0.080 -177 P 0.092 -178 K 0.098 -179 D 0.093 -180 V 0.084 -181 A 0.078 -182 I 0.077 -183 Y 0.076 -184 S 0.072 -185 G 0.067 -186 E 0.063 -187 V 0.064 -188 N 0.071 -189 Q 0.075 -190 V 0.070 -191 I 0.057 -192 A 0.044 -193 D 0.035 -194 L 0.033 -195 I 0.035 -196 K 0.038 -197 R 0.039 -198 I 0.037 -199 Y 0.037 -200 L 0.042 -201 L 0.056 -202 R 0.074 -203 S 0.095 -204 Q 0.113 -205 A 0.127 -206 E 0.134 -207 D 0.133 -208 G 0.120 -209 E 0.098 -210 T 0.079 -211 V 0.070 -212 T 0.067 -213 N 0.061 -214 V 0.055 -215 N 0.050 -216 D 0.048 -217 L 0.047 -218 F 0.047 -219 F 0.050 -220 K 0.061 -221 Y 0.072 -222 S 0.078 -223 M 0.083 -224 E 0.090 -225 G 0.091 -226 V 0.078 -227 A 0.059 -228 T 0.044 -229 I 0.036 -230 L 0.032 -231 Y 0.034 -232 E 0.045 -233 S 0.068 -234 R 0.098 -235 L 0.125 -236 G 0.135 -237 C 0.124 -238 L 0.104 -239 E 0.090 -240 N 0.084 -241 S 0.081 -242 I 0.073 -243 P 0.058 -244 Q 0.043 -245 L 0.033 -246 T 0.031 -247 V 0.032 -248 E 0.034 -249 Y 0.036 -250 I 0.035 -251 E 0.032 -252 A 0.028 -253 L 0.024 -254 E 0.022 -255 L 0.021 -256 M 0.021 -257 F 0.024 -258 S 0.028 -259 M 0.031 -260 F 0.031 -261 K 0.029 -262 T 0.026 -263 S 0.027 -264 M 0.029 -265 Y 0.033 -266 A 0.040 -267 G 0.049 -268 A 0.057 -269 I 0.061 -270 P 0.058 -271 R 0.049 -272 W 0.040 -273 L 0.039 -274 R 0.043 -275 P 0.052 -276 F 0.062 -277 I 0.069 -278 P 0.065 -279 K 0.053 -280 P 0.044 -281 W 0.042 -282 R 0.045 -283 E 0.050 -284 F 0.051 -285 C 0.050 -286 R 0.051 -287 S 0.054 -288 W 0.055 -289 D 0.055 -290 G 0.057 -291 L 0.057 -292 F 0.052 -293 K 0.043 -294 F 0.033 -295 S 0.025 -296 Q 0.020 -297 I 0.019 -298 H 0.021 -299 V 0.023 -300 D 0.025 -301 N 0.030 -302 K 0.040 -303 L 0.055 -304 R 0.068 -305 D 0.069 -306 I 0.060 -307 Q 0.052 -308 Y 0.052 -309 Q 0.062 -310 M 0.077 -311 D 0.097 -312 R 0.123 -313 G 0.149 -314 R 0.165 -315 R 0.164 -316 V 0.147 -317 S 0.120 -318 G 0.088 -319 G 0.061 -320 L 0.045 -321 L 0.040 -322 T 0.040 -323 Y 0.043 -324 L 0.047 -325 F 0.057 -326 L 0.070 -327 S 0.080 -328 Q 0.083 -329 A 0.077 -330 L 0.066 -331 T 0.056 -332 L 0.053 -333 Q 0.055 -334 E 0.057 -335 I 0.056 -336 Y 0.055 -337 A 0.063 -338 N 0.083 -339 V 0.101 -340 T 0.107 -341 E 0.109 -342 M 0.112 -343 L 0.115 -344 L 0.114 -345 A 0.117 -346 G 0.120 -347 V 0.119 -348 D 0.116 -349 T 0.113 -350 T 0.103 -351 S 0.086 -352 F 0.071 -353 T 0.061 -354 L 0.052 -355 S 0.042 -356 W 0.035 -357 T 0.032 -358 V 0.031 -359 Y 0.032 -360 L 0.034 -361 L 0.038 -362 A 0.042 -363 R 0.045 -364 H 0.043 -365 P 0.037 -366 E 0.029 -367 V 0.023 -368 Q 0.021 -369 Q 0.024 -370 T 0.033 -371 V 0.047 -372 Y 0.061 -373 R 0.066 -374 E 0.059 -375 I 0.047 -376 V 0.045 -377 K 0.055 -378 N 0.071 -379 L 0.084 -380 G 0.087 -381 E 0.079 -382 R 0.070 -383 H 0.069 -384 V 0.072 -385 P 0.071 -386 T 0.064 -387 A 0.060 -388 A 0.064 -389 D 0.071 -390 V 0.074 -391 P 0.073 -392 K 0.070 -393 V 0.065 -394 P 0.057 -395 L 0.049 -396 V 0.047 -397 R 0.054 -398 A 0.070 -399 L 0.087 -400 L 0.095 -401 K 0.096 -402 E 0.095 -403 T 0.093 -404 L 0.087 -405 R 0.077 -406 L 0.063 -407 F 0.050 -408 P 0.046 -409 V 0.052 -410 L 0.062 -411 P 0.065 -412 G 0.059 -413 N 0.050 -414 G 0.045 -415 R 0.047 -416 V 0.055 -417 T 0.065 -418 Q 0.071 -419 E 0.069 -420 D 0.063 -421 L 0.057 -422 V 0.053 -423 I 0.057 -424 G 0.067 -425 G 0.076 -426 Y 0.077 -427 L 0.072 -428 I 0.067 -429 P 0.069 -430 K 0.071 -431 G 0.067 -432 T 0.060 -433 Q 0.052 -434 L 0.044 -435 A 0.041 -436 L 0.045 -437 C 0.055 -438 H 0.066 -439 Y 0.070 -440 A 0.069 -441 T 0.067 -442 S 0.065 -443 Y 0.066 -444 Q 0.071 -445 D 0.081 -446 E 0.091 -447 N 0.098 -448 F 0.100 -449 P 0.098 -450 R 0.091 -451 A 0.085 -452 K 0.080 -453 E 0.075 -454 F 0.070 -455 R 0.063 -456 P 0.058 -457 E 0.058 -458 R 0.063 -459 W 0.072 -460 L 0.086 -461 R 0.113 -462 K 0.154 -463 G 0.197 -464 D 0.229 -465 L 0.244 -466 D 0.248 -467 R 0.248 -468 V 0.239 -469 D 0.214 -470 N 0.175 -471 F 0.140 -472 G 0.126 -473 S 0.132 -474 I 0.146 -475 P 0.154 -476 F 0.152 -477 G 0.142 -478 H 0.131 -479 G 0.123 -480 V 0.123 -481 R 0.137 -482 S 0.161 -483 C 0.179 -484 I 0.183 -485 G 0.174 -486 R 0.161 -487 R 0.162 -488 I 0.183 -489 A 0.196 -490 E 0.180 -491 L 0.153 -492 E 0.137 -493 I 0.121 -494 H 0.099 -495 L 0.078 -496 V 0.068 -497 V 0.064 -498 I 0.061 -499 Q 0.058 -500 L 0.057 -501 L 0.054 -502 Q 0.048 -503 H 0.042 -504 F 0.039 -505 E 0.042 -506 I 0.053 -507 K 0.071 -508 T 0.098 -509 S 0.132 -510 S 0.163 -511 Q 0.186 -512 T 0.196 -513 N 0.193 -514 A 0.178 -515 V 0.152 -516 H 0.125 -517 A 0.103 -518 K 0.085 -519 T 0.071 -520 H 0.065 -521 G 0.072 -522 L 0.087 -523 L 0.104 -524 T 0.119 -525 P 0.135 -526 G 0.147 -527 G 0.146 -528 P 0.128 -529 I 0.102 -530 H 0.082 -531 V 0.071 -532 R 0.069 -533 F 0.075 -534 V 0.096 -535 N 0.135 -536 R 0.180 -537 K 0.211 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186684.15_ENST00000664447.2_GN:CYP27C1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186684.15_ENST00000664447.2_GN:CYP27C1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid deleted file mode 100644 index 65c8afac75b4a42bf321d123cda7417e85ddc750..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000186684.15_ENST00000664447.2_GN:CYP27C1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid +++ /dev/null @@ -1,543 +0,0 @@ ->ENSG00000186684.15|ENST00000664447.2|GN:CYP27C1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:5 -1 M 0.218 -2 Q 0.209 -3 T 0.199 -4 S 0.186 -5 A 0.165 -6 M 0.140 -7 A 0.119 -8 L 0.103 -9 L 0.091 -10 A 0.088 -11 R 0.094 -12 I 0.108 -13 L 0.131 -14 R 0.167 -15 A 0.214 -16 G 0.262 -17 L 0.306 -18 R 0.352 -19 P 0.403 -20 A 0.459 -21 P 0.512 -22 E 0.564 -23 R 0.615 -24 G 0.653 -25 G 0.665 -26 L 0.660 -27 L 0.660 -28 G 0.670 -29 G 0.669 -30 G 0.637 -31 A 0.572 -32 P 0.498 -33 R 0.452 -34 R 0.454 -35 P 0.484 -36 Q 0.525 -37 P 0.567 -38 A 0.584 -39 G 0.554 -40 A 0.503 -41 R 0.473 -42 L 0.464 -43 P 0.460 -44 A 0.470 -45 G 0.481 -46 A 0.455 -47 R 0.410 -48 A 0.413 -49 E 0.468 -50 D 0.516 -51 K 0.548 -52 G 0.596 -53 A 0.649 -54 G 0.679 -55 R 0.686 -56 P 0.682 -57 G 0.667 -58 S 0.652 -59 P 0.659 -60 P 0.689 -61 G 0.718 -62 G 0.725 -63 G 0.701 -64 R 0.653 -65 A 0.586 -66 E 0.510 -67 G 0.433 -68 P 0.362 -69 R 0.303 -70 S 0.263 -71 L 0.242 -72 A 0.226 -73 A 0.206 -74 M 0.181 -75 P 0.153 -76 G 0.133 -77 P 0.123 -78 R 0.111 -79 T 0.088 -80 L 0.063 -81 A 0.048 -82 N 0.042 -83 L 0.040 -84 A 0.045 -85 E 0.059 -86 F 0.081 -87 F 0.103 -88 C 0.121 -89 R 0.128 -90 D 0.124 -91 G 0.117 -92 F 0.110 -93 S 0.100 -94 R 0.085 -95 I 0.072 -96 H 0.064 -97 E 0.059 -98 I 0.052 -99 Q 0.044 -100 Q 0.037 -101 K 0.033 -102 H 0.029 -103 T 0.027 -104 R 0.028 -105 E 0.032 -106 Y 0.035 -107 G 0.033 -108 K 0.028 -109 I 0.024 -110 F 0.023 -111 K 0.025 -112 S 0.028 -113 H 0.032 -114 F 0.038 -115 G 0.048 -116 P 0.057 -117 Q 0.060 -118 F 0.055 -119 V 0.048 -120 V 0.046 -121 S 0.054 -122 I 0.068 -123 A 0.079 -124 D 0.078 -125 R 0.069 -126 D 0.058 -127 M 0.052 -128 V 0.052 -129 A 0.058 -130 Q 0.068 -131 V 0.082 -132 L 0.097 -133 R 0.110 -134 A 0.122 -135 E 0.129 -136 G 0.130 -137 A 0.124 -138 A 0.115 -139 P 0.108 -140 Q 0.105 -141 R 0.107 -142 A 0.110 -143 N 0.106 -144 M 0.096 -145 E 0.084 -146 S 0.073 -147 W 0.064 -148 R 0.058 -149 E 0.055 -150 Y 0.056 -151 R 0.062 -152 D 0.074 -153 L 0.095 -154 R 0.127 -155 G 0.163 -156 R 0.185 -157 A 0.180 -158 T 0.157 -159 G 0.140 -160 L 0.135 -161 I 0.133 -162 S 0.131 -163 A 0.126 -164 E 0.117 -165 G 0.107 -166 E 0.100 -167 Q 0.097 -168 W 0.092 -169 L 0.083 -170 K 0.076 -171 M 0.079 -172 R 0.085 -173 S 0.087 -174 V 0.081 -175 L 0.072 -176 R 0.066 -177 Q 0.066 -178 R 0.066 -179 I 0.066 -180 L 0.070 -181 K 0.080 -182 P 0.092 -183 K 0.098 -184 D 0.093 -185 V 0.084 -186 A 0.078 -187 I 0.077 -188 Y 0.076 -189 S 0.072 -190 G 0.067 -191 E 0.063 -192 V 0.064 -193 N 0.071 -194 Q 0.075 -195 V 0.070 -196 I 0.057 -197 A 0.044 -198 D 0.034 -199 L 0.029 -200 I 0.028 -201 K 0.029 -202 R 0.031 -203 I 0.033 -204 Y 0.035 -205 L 0.042 -206 L 0.055 -207 R 0.073 -208 S 0.093 -209 Q 0.111 -210 A 0.125 -211 E 0.132 -212 D 0.131 -213 G 0.118 -214 E 0.096 -215 T 0.078 -216 V 0.069 -217 T 0.066 -218 N 0.061 -219 V 0.054 -220 N 0.049 -221 D 0.048 -222 L 0.047 -223 F 0.046 -224 F 0.050 -225 K 0.061 -226 Y 0.072 -227 S 0.077 -228 M 0.082 -229 E 0.089 -230 G 0.090 -231 V 0.077 -232 A 0.058 -233 T 0.043 -234 I 0.035 -235 L 0.031 -236 Y 0.033 -237 E 0.045 -238 S 0.067 -239 R 0.096 -240 L 0.123 -241 G 0.133 -242 C 0.123 -243 L 0.103 -244 E 0.088 -245 N 0.083 -246 S 0.080 -247 I 0.072 -248 P 0.057 -249 Q 0.042 -250 L 0.032 -251 T 0.030 -252 V 0.030 -253 E 0.032 -254 Y 0.034 -255 I 0.033 -256 E 0.030 -257 A 0.026 -258 L 0.023 -259 E 0.021 -260 L 0.020 -261 M 0.020 -262 F 0.023 -263 S 0.027 -264 M 0.031 -265 F 0.031 -266 K 0.029 -267 T 0.026 -268 S 0.027 -269 M 0.029 -270 Y 0.033 -271 A 0.040 -272 G 0.049 -273 A 0.057 -274 I 0.061 -275 P 0.058 -276 R 0.049 -277 W 0.040 -278 L 0.039 -279 R 0.043 -280 P 0.052 -281 F 0.062 -282 I 0.068 -283 P 0.064 -284 K 0.053 -285 P 0.044 -286 W 0.041 -287 R 0.045 -288 E 0.050 -289 F 0.051 -290 C 0.050 -291 R 0.051 -292 S 0.053 -293 W 0.055 -294 D 0.055 -295 G 0.056 -296 L 0.056 -297 F 0.050 -298 K 0.041 -299 F 0.032 -300 S 0.024 -301 Q 0.020 -302 I 0.019 -303 H 0.021 -304 V 0.023 -305 D 0.025 -306 N 0.030 -307 K 0.040 -308 L 0.055 -309 R 0.068 -310 D 0.069 -311 I 0.060 -312 Q 0.052 -313 Y 0.053 -314 Q 0.062 -315 M 0.077 -316 D 0.097 -317 R 0.123 -318 G 0.149 -319 R 0.165 -320 R 0.164 -321 V 0.148 -322 S 0.120 -323 G 0.089 -324 G 0.061 -325 L 0.045 -326 L 0.040 -327 T 0.040 -328 Y 0.042 -329 L 0.047 -330 F 0.057 -331 L 0.070 -332 S 0.080 -333 Q 0.083 -334 A 0.077 -335 L 0.066 -336 T 0.056 -337 L 0.053 -338 Q 0.055 -339 E 0.057 -340 I 0.056 -341 Y 0.055 -342 A 0.063 -343 N 0.083 -344 V 0.101 -345 T 0.108 -346 E 0.109 -347 M 0.112 -348 L 0.114 -349 L 0.114 -350 A 0.116 -351 G 0.119 -352 V 0.118 -353 D 0.115 -354 T 0.112 -355 T 0.102 -356 S 0.086 -357 F 0.071 -358 T 0.061 -359 L 0.052 -360 S 0.042 -361 W 0.035 -362 T 0.032 -363 V 0.031 -364 Y 0.032 -365 L 0.034 -366 L 0.038 -367 A 0.042 -368 R 0.045 -369 H 0.043 -370 P 0.036 -371 E 0.029 -372 V 0.023 -373 Q 0.021 -374 Q 0.024 -375 T 0.033 -376 V 0.046 -377 Y 0.060 -378 R 0.066 -379 E 0.058 -380 I 0.047 -381 V 0.045 -382 K 0.054 -383 N 0.071 -384 L 0.084 -385 G 0.087 -386 E 0.078 -387 R 0.069 -388 H 0.068 -389 V 0.072 -390 P 0.071 -391 T 0.064 -392 A 0.060 -393 A 0.064 -394 D 0.071 -395 V 0.074 -396 P 0.073 -397 K 0.070 -398 V 0.065 -399 P 0.057 -400 L 0.049 -401 V 0.047 -402 R 0.054 -403 A 0.070 -404 L 0.087 -405 L 0.096 -406 K 0.097 -407 E 0.095 -408 T 0.093 -409 L 0.088 -410 R 0.077 -411 L 0.063 -412 F 0.050 -413 P 0.046 -414 V 0.053 -415 L 0.062 -416 P 0.065 -417 G 0.059 -418 N 0.050 -419 G 0.045 -420 R 0.047 -421 V 0.055 -422 T 0.065 -423 Q 0.071 -424 E 0.070 -425 D 0.064 -426 L 0.057 -427 V 0.054 -428 I 0.057 -429 G 0.067 -430 G 0.076 -431 Y 0.077 -432 L 0.072 -433 I 0.067 -434 P 0.069 -435 K 0.071 -436 G 0.068 -437 T 0.060 -438 Q 0.052 -439 L 0.044 -440 A 0.041 -441 L 0.045 -442 C 0.056 -443 H 0.066 -444 Y 0.070 -445 A 0.070 -446 T 0.067 -447 S 0.065 -448 Y 0.066 -449 Q 0.072 -450 D 0.082 -451 E 0.092 -452 N 0.098 -453 F 0.101 -454 P 0.098 -455 R 0.091 -456 A 0.085 -457 K 0.080 -458 E 0.075 -459 F 0.070 -460 R 0.063 -461 P 0.058 -462 E 0.058 -463 R 0.063 -464 W 0.072 -465 L 0.086 -466 R 0.113 -467 K 0.154 -468 G 0.196 -469 D 0.228 -470 L 0.244 -471 D 0.248 -472 R 0.248 -473 V 0.239 -474 D 0.214 -475 N 0.175 -476 F 0.140 -477 G 0.126 -478 S 0.132 -479 I 0.146 -480 P 0.154 -481 F 0.152 -482 G 0.142 -483 H 0.131 -484 G 0.123 -485 V 0.123 -486 R 0.137 -487 S 0.162 -488 C 0.180 -489 I 0.184 -490 G 0.175 -491 R 0.162 -492 R 0.163 -493 I 0.184 -494 A 0.197 -495 E 0.181 -496 L 0.154 -497 E 0.137 -498 I 0.122 -499 H 0.099 -500 L 0.079 -501 V 0.069 -502 V 0.064 -503 I 0.061 -504 Q 0.059 -505 L 0.057 -506 L 0.054 -507 Q 0.048 -508 H 0.042 -509 F 0.039 -510 E 0.042 -511 I 0.053 -512 K 0.071 -513 T 0.098 -514 S 0.132 -515 S 0.164 -516 Q 0.186 -517 T 0.196 -518 N 0.193 -519 A 0.178 -520 V 0.152 -521 H 0.125 -522 A 0.103 -523 K 0.085 -524 T 0.071 -525 H 0.065 -526 G 0.072 -527 L 0.088 -528 L 0.104 -529 T 0.120 -530 P 0.135 -531 G 0.148 -532 G 0.147 -533 P 0.129 -534 I 0.103 -535 H 0.082 -536 V 0.072 -537 R 0.069 -538 F 0.075 -539 V 0.095 -540 N 0.133 -541 R 0.178 -542 K 0.209 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187080.10_ENST00000366480.5_GN:OR2AK2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187080.10_ENST00000366480.5_GN:OR2AK2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 1ddc3275b4744d7623e3146be7a0df7fb5478bba..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187080.10_ENST00000366480.5_GN:OR2AK2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,321 +0,0 @@ ->ENSG00000187080.10|ENST00000366480.5|GN:OR2AK2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.415 -2 K 0.430 -3 T 0.459 -4 G 0.492 -5 N 0.507 -6 Q 0.496 -7 S 0.461 -8 F 0.408 -9 G 0.340 -10 T 0.269 -11 D 0.210 -12 F 0.168 -13 L 0.142 -14 L 0.128 -15 V 0.125 -16 G 0.128 -17 L 0.133 -18 F 0.138 -19 Q 0.143 -20 Y 0.142 -21 G 0.127 -22 W 0.103 -23 I 0.078 -24 N 0.061 -25 S 0.051 -26 L 0.047 -27 L 0.049 -28 F 0.055 -29 V 0.058 -30 V 0.056 -31 I 0.053 -32 A 0.051 -33 T 0.049 -34 L 0.047 -35 F 0.044 -36 T 0.043 -37 V 0.044 -38 A 0.045 -39 L 0.046 -40 T 0.047 -41 G 0.052 -42 N 0.058 -43 I 0.061 -44 M 0.061 -45 L 0.057 -46 I 0.051 -47 H 0.046 -48 L 0.046 -49 I 0.048 -50 R 0.052 -51 L 0.058 -52 N 0.064 -53 T 0.066 -54 R 0.064 -55 L 0.061 -56 H 0.059 -57 T 0.055 -58 P 0.047 -59 M 0.038 -60 Y 0.032 -61 F 0.028 -62 L 0.029 -63 L 0.036 -64 S 0.045 -65 Q 0.053 -66 L 0.057 -67 S 0.058 -68 I 0.057 -69 V 0.056 -70 D 0.057 -71 L 0.058 -72 M 0.058 -73 Y 0.056 -74 I 0.054 -75 S 0.053 -76 T 0.057 -77 T 0.063 -78 V 0.066 -79 P 0.065 -80 K 0.061 -81 M 0.059 -82 A 0.056 -83 V 0.052 -84 S 0.051 -85 F 0.058 -86 L 0.072 -87 S 0.086 -88 Q 0.093 -89 S 0.091 -90 K 0.081 -91 T 0.067 -92 I 0.055 -93 R 0.044 -94 F 0.038 -95 L 0.038 -96 G 0.040 -97 C 0.042 -98 E 0.041 -99 I 0.040 -100 Q 0.040 -101 T 0.042 -102 Y 0.042 -103 V 0.040 -104 F 0.036 -105 L 0.034 -106 A 0.037 -107 L 0.040 -108 G 0.044 -109 G 0.048 -110 T 0.051 -111 E 0.050 -112 A 0.046 -113 L 0.040 -114 L 0.035 -115 L 0.032 -116 G 0.029 -117 F 0.028 -118 M 0.031 -119 S 0.035 -120 Y 0.040 -121 D 0.044 -122 R 0.045 -123 Y 0.042 -124 V 0.040 -125 A 0.040 -126 I 0.043 -127 C 0.049 -128 H 0.055 -129 P 0.056 -130 L 0.054 -131 H 0.052 -132 Y 0.051 -133 P 0.054 -134 M 0.059 -135 L 0.066 -136 M 0.070 -137 S 0.071 -138 K 0.071 -139 K 0.068 -140 I 0.060 -141 C 0.054 -142 C 0.060 -143 L 0.070 -144 M 0.076 -145 V 0.077 -146 A 0.076 -147 C 0.070 -148 A 0.061 -149 W 0.055 -150 A 0.057 -151 S 0.065 -152 G 0.072 -153 S 0.077 -154 I 0.081 -155 N 0.085 -156 A 0.087 -157 F 0.082 -158 I 0.078 -159 H 0.075 -160 T 0.069 -161 L 0.062 -162 Y 0.060 -163 V 0.063 -164 F 0.070 -165 Q 0.083 -166 L 0.092 -167 P 0.093 -168 F 0.089 -169 C 0.090 -170 R 0.097 -171 S 0.109 -172 R 0.124 -173 L 0.137 -174 I 0.137 -175 N 0.121 -176 H 0.098 -177 F 0.081 -178 F 0.071 -179 C 0.069 -180 E 0.077 -181 V 0.095 -182 P 0.112 -183 A 0.122 -184 L 0.125 -185 L 0.125 -186 S 0.122 -187 L 0.111 -188 V 0.097 -189 C 0.093 -190 Q 0.103 -191 D 0.118 -192 T 0.125 -193 S 0.123 -194 Q 0.118 -195 Y 0.112 -196 E 0.105 -197 Y 0.098 -198 T 0.095 -199 V 0.094 -200 L 0.094 -201 L 0.092 -202 S 0.088 -203 G 0.079 -204 L 0.065 -205 I 0.055 -206 I 0.052 -207 L 0.054 -208 L 0.059 -209 L 0.066 -210 P 0.068 -211 F 0.065 -212 L 0.064 -213 A 0.067 -214 I 0.068 -215 L 0.060 -216 A 0.049 -217 S 0.043 -218 Y 0.040 -219 A 0.041 -220 R 0.046 -221 V 0.054 -222 L 0.065 -223 I 0.073 -224 V 0.072 -225 V 0.066 -226 F 0.070 -227 Q 0.092 -228 M 0.131 -229 S 0.173 -230 S 0.201 -231 G 0.203 -232 K 0.181 -233 G 0.149 -234 Q 0.120 -235 A 0.101 -236 K 0.092 -237 A 0.088 -238 V 0.088 -239 S 0.089 -240 T 0.089 -241 C 0.085 -242 S 0.080 -243 S 0.075 -244 H 0.068 -245 L 0.062 -246 I 0.060 -247 V 0.063 -248 A 0.060 -249 S 0.049 -250 L 0.036 -251 F 0.027 -252 Y 0.025 -253 A 0.027 -254 T 0.032 -255 T 0.035 -256 L 0.038 -257 F 0.043 -258 T 0.055 -259 Y 0.077 -260 T 0.110 -261 R 0.146 -262 P 0.173 -263 H 0.185 -264 S 0.184 -265 L 0.176 -266 R 0.162 -267 S 0.145 -268 P 0.127 -269 S 0.115 -270 R 0.110 -271 D 0.107 -272 K 0.102 -273 A 0.097 -274 V 0.089 -275 A 0.079 -276 V 0.071 -277 F 0.071 -278 Y 0.079 -279 T 0.090 -280 I 0.099 -281 V 0.106 -282 T 0.108 -283 P 0.101 -284 L 0.089 -285 L 0.080 -286 N 0.074 -287 P 0.068 -288 F 0.063 -289 I 0.064 -290 Y 0.068 -291 S 0.078 -292 L 0.095 -293 R 0.106 -294 N 0.101 -295 K 0.084 -296 E 0.069 -297 V 0.061 -298 T 0.060 -299 G 0.064 -300 A 0.066 -301 V 0.065 -302 R 0.061 -303 R 0.062 -304 L 0.072 -305 L 0.090 -306 G 0.109 -307 Y 0.122 -308 W 0.133 -309 I 0.155 -310 C 0.197 -311 C 0.248 -312 R 0.293 -313 K 0.324 -314 Y 0.347 -315 D 0.360 -316 F 0.356 -317 R 0.343 -318 S 0.337 -319 L 0.331 -320 Y 0.323 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187080.10_ENST00000366480.5_GN:OR2AK2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187080.10_ENST00000366480.5_GN:OR2AK2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid deleted file mode 100644 index 5a2f1be8c3e1212879fd51a8842e3f72d6d3b171..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187080.10_ENST00000366480.5_GN:OR2AK2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid +++ /dev/null @@ -1,336 +0,0 @@ ->ENSG00000187080.10|ENST00000366480.5|GN:OR2AK2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:15 -1 M 0.250 -2 N 0.244 -3 I 0.245 -4 S 0.251 -5 D 0.251 -6 V 0.233 -7 I 0.204 -8 S 0.174 -9 F 0.149 -10 D 0.125 -11 I 0.107 -12 L 0.102 -13 V 0.119 -14 S 0.155 -15 A 0.201 -16 M 0.252 -17 K 0.307 -18 T 0.365 -19 G 0.413 -20 N 0.441 -21 Q 0.442 -22 S 0.413 -23 F 0.359 -24 G 0.294 -25 T 0.233 -26 D 0.185 -27 F 0.152 -28 L 0.130 -29 L 0.119 -30 V 0.115 -31 G 0.116 -32 L 0.120 -33 F 0.125 -34 Q 0.132 -35 Y 0.131 -36 G 0.118 -37 W 0.095 -38 I 0.072 -39 N 0.056 -40 S 0.047 -41 L 0.043 -42 L 0.042 -43 F 0.041 -44 V 0.041 -45 V 0.043 -46 I 0.046 -47 A 0.048 -48 T 0.047 -49 L 0.046 -50 F 0.044 -51 T 0.042 -52 V 0.043 -53 A 0.046 -54 L 0.046 -55 T 0.047 -56 G 0.052 -57 N 0.057 -58 I 0.061 -59 M 0.061 -60 L 0.057 -61 I 0.051 -62 H 0.045 -63 L 0.044 -64 I 0.046 -65 R 0.049 -66 L 0.055 -67 N 0.060 -68 T 0.062 -69 R 0.059 -70 L 0.057 -71 H 0.054 -72 T 0.051 -73 P 0.044 -74 M 0.036 -75 Y 0.030 -76 F 0.027 -77 L 0.029 -78 L 0.036 -79 S 0.046 -80 Q 0.054 -81 L 0.058 -82 S 0.059 -83 I 0.057 -84 V 0.055 -85 D 0.056 -86 L 0.058 -87 M 0.058 -88 Y 0.056 -89 I 0.053 -90 S 0.052 -91 T 0.054 -92 T 0.060 -93 V 0.063 -94 P 0.060 -95 K 0.056 -96 M 0.053 -97 A 0.050 -98 V 0.047 -99 S 0.045 -100 F 0.051 -101 L 0.064 -102 S 0.078 -103 Q 0.087 -104 S 0.086 -105 K 0.076 -106 T 0.064 -107 I 0.052 -108 R 0.042 -109 F 0.037 -110 L 0.036 -111 G 0.039 -112 C 0.040 -113 E 0.040 -114 I 0.039 -115 Q 0.039 -116 T 0.040 -117 Y 0.041 -118 V 0.039 -119 F 0.035 -120 L 0.034 -121 A 0.036 -122 L 0.040 -123 G 0.044 -124 G 0.048 -125 T 0.050 -126 E 0.049 -127 A 0.045 -128 L 0.040 -129 L 0.035 -130 L 0.032 -131 G 0.029 -132 F 0.028 -133 M 0.030 -134 S 0.035 -135 Y 0.040 -136 D 0.044 -137 R 0.045 -138 Y 0.042 -139 V 0.039 -140 A 0.040 -141 I 0.043 -142 C 0.049 -143 H 0.055 -144 P 0.056 -145 L 0.054 -146 H 0.052 -147 Y 0.052 -148 P 0.054 -149 M 0.060 -150 L 0.067 -151 M 0.071 -152 S 0.072 -153 K 0.071 -154 K 0.068 -155 I 0.060 -156 C 0.055 -157 C 0.061 -158 L 0.071 -159 M 0.076 -160 V 0.078 -161 A 0.076 -162 C 0.070 -163 A 0.061 -164 W 0.055 -165 A 0.057 -166 S 0.065 -167 G 0.073 -168 S 0.077 -169 I 0.081 -170 N 0.085 -171 A 0.087 -172 F 0.082 -173 I 0.077 -174 H 0.074 -175 T 0.068 -176 L 0.062 -177 Y 0.060 -178 V 0.063 -179 F 0.071 -180 Q 0.083 -181 L 0.092 -182 P 0.092 -183 F 0.087 -184 C 0.088 -185 R 0.095 -186 S 0.107 -187 R 0.121 -188 L 0.133 -189 I 0.133 -190 N 0.117 -191 H 0.095 -192 F 0.079 -193 F 0.069 -194 C 0.068 -195 E 0.076 -196 V 0.093 -197 P 0.110 -198 A 0.119 -199 L 0.122 -200 L 0.123 -201 S 0.120 -202 L 0.109 -203 V 0.096 -204 C 0.091 -205 Q 0.101 -206 D 0.116 -207 T 0.123 -208 S 0.121 -209 Q 0.116 -210 Y 0.110 -211 E 0.102 -212 Y 0.095 -213 T 0.092 -214 V 0.092 -215 L 0.091 -216 L 0.090 -217 S 0.087 -218 G 0.078 -219 L 0.065 -220 I 0.055 -221 I 0.052 -222 L 0.054 -223 L 0.059 -224 L 0.065 -225 P 0.068 -226 F 0.065 -227 L 0.063 -228 A 0.067 -229 I 0.068 -230 L 0.060 -231 A 0.049 -232 S 0.042 -233 Y 0.040 -234 A 0.041 -235 R 0.045 -236 V 0.054 -237 L 0.065 -238 I 0.073 -239 V 0.071 -240 V 0.066 -241 F 0.069 -242 Q 0.091 -243 M 0.128 -244 S 0.170 -245 S 0.197 -246 G 0.199 -247 K 0.178 -248 G 0.147 -249 Q 0.119 -250 A 0.101 -251 K 0.092 -252 A 0.088 -253 V 0.087 -254 S 0.088 -255 T 0.088 -256 C 0.084 -257 S 0.079 -258 S 0.075 -259 H 0.068 -260 L 0.062 -261 I 0.061 -262 V 0.063 -263 A 0.060 -264 S 0.049 -265 L 0.036 -266 F 0.027 -267 Y 0.025 -268 A 0.027 -269 T 0.031 -270 T 0.034 -271 L 0.037 -272 F 0.042 -273 T 0.053 -274 Y 0.075 -275 T 0.107 -276 R 0.144 -277 P 0.171 -278 H 0.184 -279 S 0.184 -280 L 0.177 -281 R 0.164 -282 S 0.146 -283 P 0.128 -284 S 0.116 -285 R 0.110 -286 D 0.107 -287 K 0.103 -288 A 0.098 -289 V 0.090 -290 A 0.080 -291 V 0.072 -292 F 0.073 -293 Y 0.081 -294 T 0.092 -295 I 0.101 -296 V 0.108 -297 T 0.109 -298 P 0.102 -299 L 0.091 -300 L 0.082 -301 N 0.076 -302 P 0.069 -303 F 0.065 -304 I 0.065 -305 Y 0.069 -306 S 0.079 -307 L 0.095 -308 R 0.107 -309 N 0.101 -310 K 0.084 -311 E 0.068 -312 V 0.060 -313 T 0.059 -314 G 0.063 -315 A 0.065 -316 V 0.064 -317 R 0.061 -318 R 0.062 -319 L 0.071 -320 L 0.089 -321 G 0.108 -322 Y 0.121 -323 W 0.133 -324 I 0.156 -325 C 0.199 -326 C 0.252 -327 R 0.297 -328 K 0.329 -329 Y 0.352 -330 D 0.364 -331 F 0.359 -332 R 0.346 -333 S 0.339 -334 L 0.334 -335 Y 0.325 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187170.6_ENST00000368777.2_GN:LCE4A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187170.6_ENST00000368777.2_GN:LCE4A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index a662261b3cd6c5b0324f655020e007e93cd07be5..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187170.6_ENST00000368777.2_GN:LCE4A_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,100 +0,0 @@ ->ENSG00000187170.6|ENST00000368777.2|GN:LCE4A|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.530 -2 S 0.556 -3 C 0.607 -4 Q 0.672 -5 Q 0.729 -6 N 0.759 -7 Q 0.763 -8 Q 0.744 -9 Q 0.701 -10 C 0.646 -11 Q 0.611 -12 P 0.617 -13 P 0.653 -14 P 0.684 -15 K 0.691 -16 C 0.680 -17 P 0.674 -18 I 0.673 -19 P 0.666 -20 K 0.651 -21 Y 0.649 -22 P 0.669 -23 P 0.694 -24 K 0.707 -25 C 0.713 -26 P 0.725 -27 S 0.737 -28 K 0.740 -29 C 0.744 -30 A 0.754 -31 S 0.753 -32 S 0.728 -33 C 0.698 -34 P 0.695 -35 P 0.726 -36 P 0.767 -37 I 0.791 -38 S 0.791 -39 S 0.777 -40 C 0.765 -41 C 0.770 -42 G 0.790 -43 S 0.808 -44 S 0.814 -45 S 0.809 -46 G 0.796 -47 G 0.782 -48 C 0.773 -49 G 0.774 -50 C 0.779 -51 C 0.785 -52 S 0.792 -53 S 0.800 -54 E 0.806 -55 G 0.809 -56 G 0.809 -57 G 0.804 -58 C 0.796 -59 C 0.795 -60 L 0.807 -61 S 0.819 -62 H 0.824 -63 H 0.824 -64 R 0.823 -65 H 0.819 -66 H 0.811 -67 R 0.794 -68 S 0.763 -69 H 0.722 -70 C 0.694 -71 H 0.700 -72 R 0.731 -73 P 0.767 -74 K 0.796 -75 S 0.810 -76 S 0.808 -77 N 0.798 -78 C 0.795 -79 Y 0.807 -80 G 0.829 -81 S 0.848 -82 G 0.859 -83 S 0.864 -84 G 0.863 -85 Q 0.859 -86 Q 0.850 -87 S 0.837 -88 G 0.826 -89 G 0.814 -90 S 0.795 -91 G 0.765 -92 C 0.732 -93 C 0.714 -94 S 0.711 -95 G 0.706 -96 G 0.674 -97 G 0.604 -98 C 0.511 -99 C 0.444 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187170.6_ENST00000368777.2_GN:LCE4A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:70.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187170.6_ENST00000368777.2_GN:LCE4A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:70.caid deleted file mode 100644 index 5435131021bdd4a6eceaf0d78b616de092324a75..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187170.6_ENST00000368777.2_GN:LCE4A_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:70.caid +++ /dev/null @@ -1,170 +0,0 @@ ->ENSG00000187170.6|ENST00000368777.2|GN:LCE4A|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:70 -1 M 0.482 -2 K 0.533 -3 P 0.597 -4 G 0.627 -5 G 0.618 -6 R 0.616 -7 R 0.665 -8 M 0.738 -9 S 0.786 -10 G 0.795 -11 M 0.783 -12 T 0.770 -13 P 0.767 -14 H 0.768 -15 L 0.766 -16 C 0.758 -17 N 0.743 -18 S 0.717 -19 H 0.678 -20 V 0.631 -21 L 0.588 -22 L 0.554 -23 L 0.518 -24 P 0.460 -25 L 0.392 -26 A 0.350 -27 W 0.352 -28 L 0.386 -29 I 0.432 -30 R 0.483 -31 G 0.542 -32 P 0.609 -33 A 0.671 -34 P 0.709 -35 G 0.709 -36 S 0.662 -37 I 0.588 -38 Q 0.525 -39 S 0.488 -40 V 0.460 -41 F 0.428 -42 L 0.404 -43 L 0.398 -44 L 0.400 -45 A 0.388 -46 S 0.359 -47 H 0.325 -48 L 0.293 -49 L 0.282 -50 C 0.313 -51 F 0.383 -52 L 0.474 -53 R 0.574 -54 D 0.669 -55 V 0.744 -56 S 0.794 -57 V 0.823 -58 A 0.832 -59 A 0.823 -60 S 0.809 -61 E 0.806 -62 P 0.817 -63 T 0.835 -64 V 0.843 -65 Y 0.837 -66 R 0.825 -67 N 0.818 -68 P 0.824 -69 T 0.834 -70 K 0.837 -71 M 0.829 -72 S 0.818 -73 C 0.815 -74 Q 0.830 -75 Q 0.850 -76 N 0.858 -77 Q 0.848 -78 Q 0.824 -79 Q 0.787 -80 C 0.746 -81 Q 0.719 -82 P 0.720 -83 P 0.742 -84 P 0.765 -85 K 0.774 -86 C 0.769 -87 P 0.761 -88 I 0.752 -89 P 0.743 -90 K 0.736 -91 Y 0.740 -92 P 0.752 -93 P 0.761 -94 K 0.761 -95 C 0.763 -96 P 0.778 -97 S 0.796 -98 K 0.803 -99 C 0.806 -100 A 0.810 -101 S 0.801 -102 S 0.772 -103 C 0.741 -104 P 0.738 -105 P 0.764 -106 P 0.800 -107 I 0.820 -108 S 0.820 -109 S 0.808 -110 C 0.797 -111 C 0.800 -112 G 0.814 -113 S 0.827 -114 S 0.831 -115 S 0.825 -116 G 0.815 -117 G 0.805 -118 C 0.801 -119 G 0.805 -120 C 0.809 -121 C 0.812 -122 S 0.815 -123 S 0.820 -124 E 0.824 -125 G 0.827 -126 G 0.829 -127 G 0.830 -128 C 0.827 -129 C 0.824 -130 L 0.825 -131 S 0.826 -132 H 0.824 -133 H 0.821 -134 R 0.820 -135 H 0.818 -136 H 0.813 -137 R 0.801 -138 S 0.779 -139 H 0.749 -140 C 0.728 -141 H 0.727 -142 R 0.745 -143 P 0.772 -144 K 0.799 -145 S 0.815 -146 S 0.816 -147 N 0.810 -148 C 0.809 -149 Y 0.821 -150 G 0.842 -151 S 0.860 -152 G 0.870 -153 S 0.874 -154 G 0.873 -155 Q 0.868 -156 Q 0.860 -157 S 0.850 -158 G 0.841 -159 G 0.833 -160 S 0.821 -161 G 0.799 -162 C 0.776 -163 C 0.761 -164 S 0.755 -165 G 0.744 -166 G 0.714 -167 G 0.658 -168 C 0.590 -169 C 0.543 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187475.6_ENST00000338379.6_GN:H1-6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187475.6_ENST00000338379.6_GN:H1-6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 1e51a3ade30e3568b1c8352f4de25f63ce42d307..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187475.6_ENST00000338379.6_GN:H1-6_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,208 +0,0 @@ ->ENSG00000187475.6|ENST00000338379.6|GN:H1-6|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.628 -2 S 0.642 -3 E 0.661 -4 T 0.666 -5 V 0.645 -6 P 0.610 -7 A 0.604 -8 A 0.643 -9 S 0.676 -10 A 0.662 -11 S 0.648 -12 A 0.673 -13 G 0.694 -14 V 0.670 -15 A 0.646 -16 A 0.671 -17 M 0.723 -18 E 0.756 -19 K 0.762 -20 L 0.758 -21 P 0.758 -22 T 0.764 -23 K 0.767 -24 K 0.765 -25 R 0.756 -26 G 0.746 -27 R 0.743 -28 K 0.751 -29 P 0.769 -30 A 0.789 -31 G 0.801 -32 L 0.801 -33 I 0.788 -34 S 0.765 -35 A 0.733 -36 S 0.691 -37 R 0.632 -38 K 0.551 -39 V 0.459 -40 P 0.369 -41 N 0.288 -42 L 0.213 -43 S 0.146 -44 V 0.093 -45 S 0.059 -46 K 0.044 -47 L 0.037 -48 I 0.033 -49 T 0.033 -50 E 0.037 -51 A 0.044 -52 L 0.054 -53 S 0.065 -54 V 0.073 -55 S 0.078 -56 Q 0.081 -57 E 0.084 -58 R 0.089 -59 V 0.093 -60 G 0.089 -61 M 0.076 -62 S 0.059 -63 L 0.045 -64 V 0.039 -65 A 0.041 -66 L 0.051 -67 K 0.062 -68 K 0.067 -69 A 0.062 -70 L 0.057 -71 A 0.060 -72 A 0.072 -73 A 0.086 -74 G 0.094 -75 Y 0.090 -76 D 0.075 -77 V 0.059 -78 E 0.045 -79 K 0.038 -80 N 0.036 -81 N 0.036 -82 S 0.036 -83 R 0.036 -84 I 0.038 -85 K 0.040 -86 L 0.040 -87 S 0.041 -88 L 0.042 -89 K 0.043 -90 S 0.045 -91 L 0.048 -92 V 0.053 -93 N 0.057 -94 K 0.061 -95 G 0.061 -96 I 0.062 -97 L 0.069 -98 V 0.085 -99 Q 0.107 -100 T 0.129 -101 R 0.145 -102 G 0.155 -103 T 0.159 -104 G 0.159 -105 A 0.158 -106 S 0.157 -107 G 0.148 -108 S 0.127 -109 F 0.113 -110 K 0.135 -111 L 0.211 -112 S 0.330 -113 K 0.450 -114 K 0.533 -115 V 0.579 -116 I 0.620 -117 P 0.676 -118 K 0.734 -119 S 0.774 -120 T 0.790 -121 R 0.793 -122 S 0.794 -123 K 0.797 -124 A 0.802 -125 K 0.806 -126 K 0.803 -127 S 0.785 -128 V 0.738 -129 S 0.669 -130 A 0.625 -131 K 0.643 -132 T 0.692 -133 K 0.729 -134 K 0.749 -135 L 0.764 -136 V 0.779 -137 L 0.791 -138 S 0.796 -139 R 0.796 -140 D 0.792 -141 S 0.783 -142 K 0.774 -143 S 0.773 -144 P 0.783 -145 K 0.803 -146 T 0.822 -147 A 0.833 -148 K 0.839 -149 T 0.843 -150 N 0.841 -151 K 0.836 -152 R 0.828 -153 A 0.819 -154 K 0.811 -155 K 0.813 -156 P 0.824 -157 R 0.837 -158 A 0.843 -159 T 0.841 -160 T 0.837 -161 P 0.840 -162 K 0.850 -163 T 0.861 -164 V 0.865 -165 R 0.865 -166 S 0.863 -167 G 0.860 -168 R 0.856 -169 K 0.853 -170 A 0.850 -171 K 0.846 -172 G 0.843 -173 A 0.842 -174 K 0.844 -175 G 0.848 -176 K 0.852 -177 Q 0.853 -178 Q 0.847 -179 Q 0.835 -180 K 0.820 -181 S 0.811 -182 P 0.814 -183 V 0.826 -184 K 0.836 -185 A 0.840 -186 R 0.839 -187 A 0.837 -188 S 0.835 -189 K 0.832 -190 S 0.829 -191 K 0.828 -192 L 0.826 -193 T 0.819 -194 Q 0.809 -195 H 0.797 -196 H 0.787 -197 E 0.781 -198 V 0.778 -199 N 0.773 -200 V 0.763 -201 R 0.750 -202 K 0.734 -203 A 0.709 -204 T 0.671 -205 S 0.625 -206 K 0.578 -207 K 0.544 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187475.6_ENST00000338379.6_GN:H1-6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187475.6_ENST00000338379.6_GN:H1-6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid deleted file mode 100644 index 302bc47bbbb379cc19d95a18e350619404876907..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187475.6_ENST00000338379.6_GN:H1-6_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid +++ /dev/null @@ -1,222 +0,0 @@ ->ENSG00000187475.6|ENST00000338379.6|GN:H1-6|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:14 -1 M 0.498 -2 L 0.530 -3 F 0.569 -4 A 0.583 -5 G 0.558 -6 Y 0.510 -7 Y 0.471 -8 I 0.443 -9 L 0.427 -10 R 0.450 -11 F 0.531 -12 S 0.637 -13 V 0.718 -14 V 0.762 -15 M 0.780 -16 S 0.787 -17 E 0.791 -18 T 0.793 -19 V 0.799 -20 P 0.811 -21 A 0.826 -22 A 0.839 -23 S 0.844 -24 A 0.844 -25 S 0.841 -26 A 0.825 -27 G 0.777 -28 V 0.706 -29 A 0.665 -30 A 0.691 -31 M 0.746 -32 E 0.779 -33 K 0.782 -34 L 0.776 -35 P 0.776 -36 T 0.782 -37 K 0.786 -38 K 0.782 -39 R 0.771 -40 G 0.759 -41 R 0.754 -42 K 0.762 -43 P 0.783 -44 A 0.805 -45 G 0.819 -46 L 0.819 -47 I 0.806 -48 S 0.780 -49 A 0.746 -50 S 0.702 -51 R 0.639 -52 K 0.553 -53 V 0.455 -54 P 0.363 -55 N 0.283 -56 L 0.211 -57 S 0.146 -58 V 0.093 -59 S 0.060 -60 K 0.044 -61 L 0.037 -62 I 0.033 -63 T 0.033 -64 E 0.037 -65 A 0.044 -66 L 0.054 -67 S 0.064 -68 V 0.072 -69 S 0.077 -70 Q 0.079 -71 E 0.081 -72 R 0.086 -73 V 0.090 -74 G 0.087 -75 M 0.074 -76 S 0.058 -77 L 0.044 -78 V 0.038 -79 A 0.041 -80 L 0.050 -81 K 0.062 -82 K 0.067 -83 A 0.062 -84 L 0.056 -85 A 0.059 -86 A 0.070 -87 A 0.084 -88 G 0.092 -89 Y 0.088 -90 D 0.074 -91 V 0.058 -92 E 0.045 -93 K 0.037 -94 N 0.035 -95 N 0.035 -96 S 0.035 -97 R 0.035 -98 I 0.037 -99 K 0.039 -100 L 0.039 -101 S 0.040 -102 L 0.042 -103 K 0.043 -104 S 0.044 -105 L 0.047 -106 V 0.051 -107 N 0.056 -108 K 0.060 -109 G 0.061 -110 I 0.062 -111 L 0.068 -112 V 0.084 -113 Q 0.106 -114 T 0.127 -115 R 0.144 -116 G 0.156 -117 T 0.161 -118 G 0.161 -119 A 0.160 -120 S 0.158 -121 G 0.148 -122 S 0.127 -123 F 0.113 -124 K 0.136 -125 L 0.213 -126 S 0.333 -127 K 0.456 -128 K 0.540 -129 V 0.587 -130 I 0.627 -131 P 0.681 -132 K 0.738 -133 S 0.777 -134 T 0.793 -135 R 0.796 -136 S 0.796 -137 K 0.800 -138 A 0.805 -139 K 0.808 -140 K 0.805 -141 S 0.787 -142 V 0.740 -143 S 0.669 -144 A 0.625 -145 K 0.642 -146 T 0.691 -147 K 0.729 -148 K 0.750 -149 L 0.766 -150 V 0.782 -151 L 0.794 -152 S 0.799 -153 R 0.799 -154 D 0.795 -155 S 0.787 -156 K 0.779 -157 S 0.778 -158 P 0.789 -159 K 0.808 -160 T 0.826 -161 A 0.837 -162 K 0.842 -163 T 0.845 -164 N 0.843 -165 K 0.838 -166 R 0.830 -167 A 0.821 -168 K 0.813 -169 K 0.815 -170 P 0.826 -171 R 0.839 -172 A 0.845 -173 T 0.843 -174 T 0.840 -175 P 0.843 -176 K 0.853 -177 T 0.863 -178 V 0.867 -179 R 0.866 -180 S 0.864 -181 G 0.861 -182 R 0.857 -183 K 0.854 -184 A 0.851 -185 K 0.847 -186 G 0.844 -187 A 0.843 -188 K 0.845 -189 G 0.849 -190 K 0.853 -191 Q 0.854 -192 Q 0.848 -193 Q 0.836 -194 K 0.822 -195 S 0.813 -196 P 0.816 -197 V 0.824 -198 K 0.822 -199 A 0.797 -200 R 0.754 -201 A 0.731 -202 S 0.751 -203 K 0.790 -204 S 0.818 -205 K 0.829 -206 L 0.830 -207 T 0.824 -208 Q 0.814 -209 H 0.802 -210 H 0.792 -211 E 0.787 -212 V 0.784 -213 N 0.779 -214 V 0.770 -215 R 0.759 -216 K 0.744 -217 A 0.719 -218 T 0.680 -219 S 0.632 -220 K 0.582 -221 K 0.546 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187855.6_ENST00000342331.5_GN:ASCL4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187855.6_ENST00000342331.5_GN:ASCL4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 6763f27d594c31a2cab1e1a3f28d87ec1748afa8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187855.6_ENST00000342331.5_GN:ASCL4_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,173 +0,0 @@ ->ENSG00000187855.6|ENST00000342331.5|GN:ASCL4|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.480 -2 E 0.508 -3 T 0.550 -4 R 0.592 -5 K 0.632 -6 P 0.667 -7 A 0.693 -8 E 0.707 -9 R 0.708 -10 L 0.700 -11 A 0.682 -12 L 0.659 -13 P 0.644 -14 Y 0.654 -15 S 0.685 -16 L 0.715 -17 R 0.731 -18 T 0.736 -19 A 0.745 -20 P 0.759 -21 L 0.775 -22 G 0.786 -23 V 0.791 -24 P 0.795 -25 G 0.793 -26 T 0.784 -27 L 0.772 -28 P 0.763 -29 G 0.754 -30 L 0.740 -31 P 0.721 -32 R 0.694 -33 R 0.654 -34 D 0.612 -35 P 0.591 -36 L 0.609 -37 R 0.659 -38 V 0.709 -39 A 0.726 -40 L 0.705 -41 R 0.657 -42 L 0.585 -43 D 0.492 -44 A 0.402 -45 A 0.343 -46 C 0.313 -47 W 0.296 -48 E 0.285 -49 W 0.289 -50 A 0.312 -51 R 0.358 -52 S 0.423 -53 G 0.491 -54 C 0.547 -55 A 0.587 -56 R 0.611 -57 G 0.624 -58 W 0.628 -59 Q 0.627 -60 Y 0.627 -61 L 0.637 -62 P 0.658 -63 V 0.683 -64 P 0.695 -65 L 0.683 -66 D 0.650 -67 S 0.602 -68 A 0.537 -69 F 0.450 -70 E 0.348 -71 P 0.260 -72 A 0.207 -73 F 0.187 -74 L 0.185 -75 R 0.187 -76 K 0.194 -77 R 0.201 -78 N 0.211 -79 E 0.225 -80 R 0.239 -81 E 0.243 -82 R 0.236 -83 Q 0.231 -84 R 0.231 -85 V 0.230 -86 R 0.225 -87 C 0.217 -88 V 0.199 -89 N 0.174 -90 E 0.152 -91 G 0.136 -92 Y 0.124 -93 A 0.113 -94 R 0.105 -95 L 0.101 -96 R 0.102 -97 D 0.110 -98 H 0.113 -99 L 0.103 -100 P 0.086 -101 R 0.074 -102 E 0.075 -103 L 0.087 -104 A 0.101 -105 D 0.112 -106 K 0.118 -107 R 0.116 -108 L 0.106 -109 S 0.088 -110 K 0.074 -111 V 0.069 -112 E 0.073 -113 T 0.081 -114 L 0.085 -115 R 0.089 -116 A 0.096 -117 A 0.098 -118 I 0.086 -119 D 0.072 -120 Y 0.069 -121 I 0.077 -122 K 0.085 -123 H 0.087 -124 L 0.089 -125 Q 0.096 -126 E 0.105 -127 L 0.111 -128 L 0.114 -129 E 0.122 -130 R 0.143 -131 Q 0.187 -132 A 0.258 -133 W 0.346 -134 G 0.436 -135 L 0.514 -136 E 0.576 -137 G 0.619 -138 A 0.645 -139 A 0.656 -140 G 0.654 -141 A 0.646 -142 V 0.639 -143 P 0.642 -144 Q 0.659 -145 R 0.682 -146 R 0.694 -147 A 0.689 -148 E 0.675 -149 C 0.667 -150 N 0.671 -151 S 0.679 -152 D 0.677 -153 G 0.651 -154 E 0.610 -155 S 0.593 -156 K 0.618 -157 A 0.636 -158 S 0.608 -159 S 0.576 -160 A 0.591 -161 P 0.643 -162 S 0.693 -163 P 0.725 -164 S 0.739 -165 S 0.740 -166 E 0.737 -167 P 0.740 -168 E 0.744 -169 E 0.737 -170 G 0.703 -171 G 0.646 -172 S 0.597 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187855.6_ENST00000342331.5_GN:ASCL4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187855.6_ENST00000342331.5_GN:ASCL4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid deleted file mode 100644 index 610a664125badd7cf7d43a1069c4b80ddf803555..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000187855.6_ENST00000342331.5_GN:ASCL4_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid +++ /dev/null @@ -1,174 +0,0 @@ ->ENSG00000187855.6|ENST00000342331.5|GN:ASCL4|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:1 -1 M 0.466 -2 M 0.494 -3 E 0.537 -4 T 0.580 -5 R 0.617 -6 K 0.648 -7 P 0.678 -8 A 0.702 -9 E 0.715 -10 R 0.715 -11 L 0.705 -12 A 0.687 -13 L 0.662 -14 P 0.645 -15 Y 0.652 -16 S 0.681 -17 L 0.710 -18 R 0.724 -19 T 0.731 -20 A 0.741 -21 P 0.758 -22 L 0.775 -23 G 0.786 -24 V 0.792 -25 P 0.794 -26 G 0.791 -27 T 0.782 -28 L 0.770 -29 P 0.761 -30 G 0.752 -31 L 0.739 -32 P 0.721 -33 R 0.694 -34 R 0.653 -35 D 0.609 -36 P 0.587 -37 L 0.604 -38 R 0.655 -39 V 0.706 -40 A 0.725 -41 L 0.704 -42 R 0.656 -43 L 0.584 -44 D 0.490 -45 A 0.399 -46 A 0.340 -47 C 0.311 -48 W 0.294 -49 E 0.285 -50 W 0.289 -51 A 0.312 -52 R 0.357 -53 S 0.420 -54 G 0.487 -55 C 0.543 -56 A 0.582 -57 R 0.606 -58 G 0.618 -59 W 0.622 -60 Q 0.621 -61 Y 0.621 -62 L 0.631 -63 P 0.653 -64 V 0.679 -65 P 0.691 -66 L 0.679 -67 D 0.644 -68 S 0.595 -69 A 0.531 -70 F 0.444 -71 E 0.344 -72 P 0.258 -73 A 0.205 -74 F 0.186 -75 L 0.183 -76 R 0.186 -77 K 0.192 -78 R 0.199 -79 N 0.209 -80 E 0.222 -81 R 0.236 -82 E 0.240 -83 R 0.235 -84 Q 0.230 -85 R 0.230 -86 V 0.228 -87 R 0.224 -88 C 0.215 -89 V 0.199 -90 N 0.174 -91 E 0.152 -92 G 0.136 -93 Y 0.124 -94 A 0.113 -95 R 0.106 -96 L 0.101 -97 R 0.102 -98 D 0.110 -99 H 0.113 -100 L 0.103 -101 P 0.086 -102 R 0.074 -103 E 0.075 -104 L 0.087 -105 A 0.102 -106 D 0.112 -107 K 0.118 -108 R 0.116 -109 L 0.106 -110 S 0.088 -111 K 0.074 -112 V 0.069 -113 E 0.073 -114 T 0.081 -115 L 0.085 -116 R 0.089 -117 A 0.096 -118 A 0.098 -119 I 0.086 -120 D 0.071 -121 Y 0.069 -122 I 0.077 -123 K 0.085 -124 H 0.087 -125 L 0.089 -126 Q 0.096 -127 E 0.105 -128 L 0.111 -129 L 0.114 -130 E 0.122 -131 R 0.143 -132 Q 0.188 -133 A 0.258 -134 W 0.346 -135 G 0.436 -136 L 0.514 -137 E 0.576 -138 G 0.619 -139 A 0.645 -140 A 0.655 -141 G 0.654 -142 A 0.645 -143 V 0.638 -144 P 0.641 -145 Q 0.658 -146 R 0.681 -147 R 0.694 -148 A 0.689 -149 E 0.675 -150 C 0.667 -151 N 0.671 -152 S 0.680 -153 D 0.677 -154 G 0.651 -155 E 0.609 -156 S 0.593 -157 K 0.618 -158 A 0.635 -159 S 0.608 -160 S 0.575 -161 A 0.590 -162 P 0.642 -163 S 0.692 -164 P 0.724 -165 S 0.738 -166 S 0.739 -167 E 0.736 -168 P 0.739 -169 E 0.744 -170 E 0.737 -171 G 0.703 -172 G 0.645 -173 S 0.596 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188124.4_ENST00000641124.1_GN:OR2AG2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188124.4_ENST00000641124.1_GN:OR2AG2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 260e61aa4f9220acc52df4e8e0c5e70f8ee6decd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188124.4_ENST00000641124.1_GN:OR2AG2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,317 +0,0 @@ ->ENSG00000188124.4|ENST00000641124.1|GN:OR2AG2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.392 -2 E 0.411 -3 L 0.441 -4 R 0.472 -5 N 0.492 -6 S 0.495 -7 T 0.481 -8 L 0.447 -9 G 0.390 -10 S 0.316 -11 G 0.244 -12 F 0.188 -13 I 0.155 -14 L 0.144 -15 V 0.150 -16 G 0.170 -17 I 0.200 -18 L 0.242 -19 N 0.291 -20 D 0.324 -21 S 0.322 -22 G 0.282 -23 S 0.218 -24 P 0.148 -25 E 0.092 -26 L 0.063 -27 L 0.059 -28 Y 0.066 -29 A 0.070 -30 T 0.062 -31 F 0.051 -32 T 0.045 -33 I 0.046 -34 L 0.048 -35 Y 0.049 -36 M 0.047 -37 L 0.047 -38 A 0.047 -39 L 0.047 -40 T 0.048 -41 S 0.054 -42 N 0.061 -43 G 0.064 -44 L 0.063 -45 L 0.058 -46 L 0.053 -47 L 0.052 -48 A 0.054 -49 I 0.057 -50 T 0.059 -51 I 0.062 -52 E 0.065 -53 A 0.066 -54 R 0.068 -55 L 0.068 -56 H 0.065 -57 M 0.059 -58 P 0.049 -59 M 0.038 -60 Y 0.029 -61 L 0.025 -62 L 0.027 -63 L 0.034 -64 G 0.044 -65 Q 0.050 -66 L 0.052 -67 S 0.051 -68 L 0.052 -69 M 0.056 -70 D 0.062 -71 L 0.066 -72 L 0.066 -73 F 0.064 -74 T 0.062 -75 S 0.060 -76 V 0.062 -77 V 0.069 -78 T 0.074 -79 P 0.072 -80 K 0.065 -81 A 0.059 -82 L 0.055 -83 A 0.051 -84 D 0.050 -85 F 0.053 -86 L 0.062 -87 R 0.075 -88 R 0.086 -89 E 0.089 -90 N 0.084 -91 T 0.074 -92 I 0.063 -93 S 0.053 -94 F 0.047 -95 G 0.046 -96 G 0.045 -97 C 0.042 -98 A 0.038 -99 L 0.036 -100 Q 0.037 -101 M 0.040 -102 F 0.041 -103 L 0.038 -104 A 0.033 -105 L 0.031 -106 T 0.031 -107 M 0.034 -108 G 0.039 -109 S 0.045 -110 A 0.049 -111 E 0.051 -112 D 0.051 -113 L 0.048 -114 L 0.042 -115 L 0.037 -116 A 0.032 -117 F 0.030 -118 M 0.031 -119 A 0.034 -120 Y 0.037 -121 D 0.039 -122 R 0.039 -123 Y 0.037 -124 V 0.036 -125 A 0.037 -126 I 0.040 -127 C 0.044 -128 H 0.048 -129 P 0.048 -130 L 0.046 -131 K 0.043 -132 Y 0.043 -133 M 0.047 -134 T 0.054 -135 L 0.064 -136 M 0.071 -137 S 0.072 -138 P 0.066 -139 R 0.059 -140 V 0.051 -141 C 0.049 -142 W 0.057 -143 I 0.067 -144 M 0.072 -145 V 0.073 -146 A 0.074 -147 T 0.073 -148 S 0.075 -149 W 0.080 -150 I 0.086 -151 L 0.090 -152 A 0.089 -153 S 0.082 -154 L 0.076 -155 I 0.077 -156 A 0.081 -157 I 0.084 -158 G 0.086 -159 H 0.088 -160 T 0.082 -161 M 0.072 -162 Y 0.067 -163 T 0.070 -164 M 0.082 -165 H 0.098 -166 L 0.109 -167 P 0.108 -168 F 0.100 -169 C 0.094 -170 V 0.095 -171 S 0.099 -172 W 0.110 -173 E 0.126 -174 I 0.134 -175 R 0.122 -176 H 0.098 -177 L 0.075 -178 L 0.062 -179 C 0.060 -180 E 0.072 -181 I 0.094 -182 P 0.116 -183 P 0.127 -184 L 0.129 -185 L 0.129 -186 K 0.128 -187 L 0.125 -188 A 0.118 -189 C 0.115 -190 A 0.121 -191 D 0.128 -192 T 0.126 -193 S 0.116 -194 R 0.107 -195 Y 0.103 -196 E 0.103 -197 L 0.103 -198 I 0.098 -199 I 0.089 -200 Y 0.079 -201 V 0.073 -202 T 0.069 -203 G 0.063 -204 V 0.056 -205 T 0.052 -206 F 0.054 -207 L 0.057 -208 L 0.063 -209 L 0.072 -210 P 0.078 -211 I 0.079 -212 S 0.080 -213 A 0.086 -214 I 0.087 -215 V 0.077 -216 A 0.063 -217 S 0.054 -218 Y 0.050 -219 T 0.049 -220 L 0.052 -221 V 0.059 -222 L 0.069 -223 F 0.077 -224 T 0.078 -225 V 0.079 -226 L 0.088 -227 R 0.107 -228 M 0.130 -229 P 0.146 -230 S 0.144 -231 N 0.130 -232 E 0.111 -233 G 0.092 -234 R 0.075 -235 K 0.066 -236 K 0.064 -237 A 0.065 -238 L 0.067 -239 V 0.073 -240 T 0.080 -241 C 0.085 -242 S 0.087 -243 S 0.084 -244 H 0.075 -245 L 0.066 -246 I 0.063 -247 V 0.064 -248 V 0.061 -249 G 0.050 -250 M 0.037 -251 F 0.030 -252 Y 0.030 -253 G 0.034 -254 A 0.038 -255 A 0.040 -256 T 0.040 -257 F 0.041 -258 M 0.048 -259 Y 0.062 -260 V 0.083 -261 L 0.106 -262 P 0.127 -263 S 0.142 -264 S 0.152 -265 F 0.159 -266 H 0.160 -267 S 0.152 -268 P 0.139 -269 K 0.129 -270 Q 0.123 -271 D 0.116 -272 N 0.107 -273 I 0.099 -274 I 0.090 -275 S 0.079 -276 V 0.070 -277 F 0.071 -278 Y 0.080 -279 T 0.090 -280 I 0.098 -281 V 0.105 -282 T 0.107 -283 P 0.100 -284 A 0.087 -285 L 0.077 -286 N 0.070 -287 P 0.063 -288 L 0.058 -289 I 0.058 -290 Y 0.061 -291 S 0.069 -292 L 0.081 -293 R 0.091 -294 N 0.086 -295 K 0.071 -296 E 0.059 -297 V 0.057 -298 M 0.065 -299 R 0.073 -300 A 0.072 -301 L 0.064 -302 R 0.056 -303 R 0.055 -304 V 0.063 -305 L 0.080 -306 G 0.104 -307 K 0.126 -308 Y 0.144 -309 I 0.163 -310 L 0.190 -311 L 0.225 -312 A 0.266 -313 H 0.305 -314 S 0.332 -315 T 0.341 -316 L 0.338 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188124.4_ENST00000641124.1_GN:OR2AG2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:33.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188124.4_ENST00000641124.1_GN:OR2AG2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:33.caid deleted file mode 100644 index 6979a2a761b561df70b433ae73cd4f345683dba8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188124.4_ENST00000641124.1_GN:OR2AG2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:33.caid +++ /dev/null @@ -1,350 +0,0 @@ ->ENSG00000188124.4|ENST00000641124.1|GN:OR2AG2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:33 -1 M 0.249 -2 H 0.237 -3 S 0.222 -4 D 0.205 -5 L 0.184 -6 E 0.164 -7 Q 0.150 -8 S 0.140 -9 K 0.136 -10 A 0.141 -11 R 0.147 -12 V 0.151 -13 N 0.154 -14 T 0.160 -15 F 0.170 -16 R 0.176 -17 K 0.178 -18 A 0.183 -19 S 0.192 -20 T 0.203 -21 D 0.220 -22 N 0.239 -23 I 0.252 -24 F 0.254 -25 G 0.243 -26 S 0.211 -27 R 0.166 -28 Q 0.129 -29 L 0.114 -30 K 0.117 -31 K 0.125 -32 H 0.130 -33 I 0.132 -34 M 0.142 -35 E 0.168 -36 L 0.208 -37 R 0.256 -38 N 0.305 -39 S 0.345 -40 T 0.367 -41 L 0.362 -42 G 0.330 -43 S 0.277 -44 G 0.220 -45 F 0.174 -46 I 0.148 -47 L 0.140 -48 V 0.149 -49 G 0.172 -50 I 0.205 -51 L 0.246 -52 N 0.290 -53 D 0.320 -54 S 0.317 -55 G 0.278 -56 S 0.215 -57 P 0.145 -58 E 0.089 -59 L 0.058 -60 L 0.046 -61 Y 0.043 -62 A 0.041 -63 T 0.039 -64 F 0.039 -65 T 0.040 -66 I 0.043 -67 L 0.046 -68 Y 0.047 -69 M 0.046 -70 L 0.047 -71 A 0.047 -72 L 0.046 -73 T 0.048 -74 S 0.054 -75 N 0.061 -76 G 0.065 -77 L 0.064 -78 L 0.059 -79 L 0.054 -80 L 0.052 -81 A 0.053 -82 I 0.053 -83 T 0.054 -84 I 0.055 -85 E 0.058 -86 A 0.060 -87 R 0.061 -88 L 0.062 -89 H 0.060 -90 M 0.055 -91 P 0.047 -92 M 0.036 -93 Y 0.027 -94 L 0.024 -95 L 0.026 -96 L 0.034 -97 G 0.043 -98 Q 0.050 -99 L 0.052 -100 S 0.051 -101 L 0.051 -102 M 0.055 -103 D 0.061 -104 L 0.065 -105 L 0.065 -106 F 0.062 -107 T 0.059 -108 S 0.056 -109 V 0.057 -110 V 0.061 -111 T 0.064 -112 P 0.062 -113 K 0.057 -114 A 0.051 -115 L 0.047 -116 A 0.043 -117 D 0.041 -118 F 0.045 -119 L 0.054 -120 R 0.067 -121 R 0.078 -122 E 0.083 -123 N 0.080 -124 T 0.071 -125 I 0.061 -126 S 0.051 -127 F 0.045 -128 G 0.043 -129 G 0.043 -130 C 0.040 -131 A 0.036 -132 L 0.034 -133 Q 0.035 -134 M 0.038 -135 F 0.039 -136 L 0.036 -137 A 0.031 -138 L 0.029 -139 T 0.029 -140 M 0.032 -141 G 0.038 -142 S 0.043 -143 A 0.047 -144 E 0.049 -145 D 0.049 -146 L 0.046 -147 L 0.041 -148 L 0.036 -149 A 0.031 -150 F 0.029 -151 M 0.030 -152 A 0.034 -153 Y 0.037 -154 D 0.039 -155 R 0.039 -156 Y 0.037 -157 V 0.036 -158 A 0.037 -159 I 0.040 -160 C 0.044 -161 H 0.047 -162 P 0.048 -163 L 0.045 -164 K 0.043 -165 Y 0.043 -166 M 0.046 -167 T 0.054 -168 L 0.064 -169 M 0.070 -170 S 0.065 -171 P 0.053 -172 R 0.041 -173 V 0.036 -174 C 0.041 -175 W 0.053 -176 I 0.062 -177 M 0.060 -178 V 0.051 -179 A 0.046 -180 T 0.048 -181 S 0.053 -182 W 0.056 -183 I 0.061 -184 L 0.070 -185 A 0.078 -186 S 0.077 -187 L 0.073 -188 I 0.075 -189 A 0.080 -190 I 0.084 -191 G 0.086 -192 H 0.087 -193 T 0.082 -194 M 0.071 -195 Y 0.066 -196 T 0.070 -197 M 0.082 -198 H 0.097 -199 L 0.108 -200 P 0.106 -201 F 0.096 -202 C 0.089 -203 V 0.089 -204 S 0.095 -205 W 0.107 -206 E 0.123 -207 I 0.130 -208 R 0.119 -209 H 0.095 -210 L 0.073 -211 L 0.060 -212 C 0.059 -213 E 0.072 -214 I 0.095 -215 P 0.116 -216 P 0.125 -217 L 0.125 -218 L 0.124 -219 K 0.123 -220 L 0.119 -221 A 0.111 -222 C 0.107 -223 A 0.113 -224 D 0.120 -225 T 0.120 -226 S 0.111 -227 R 0.101 -228 Y 0.093 -229 E 0.085 -230 L 0.080 -231 I 0.080 -232 I 0.079 -233 Y 0.075 -234 V 0.071 -235 T 0.067 -236 G 0.061 -237 V 0.055 -238 T 0.052 -239 F 0.054 -240 L 0.057 -241 L 0.063 -242 L 0.072 -243 P 0.078 -244 I 0.079 -245 S 0.080 -246 A 0.086 -247 I 0.088 -248 V 0.077 -249 A 0.063 -250 S 0.053 -251 Y 0.048 -252 T 0.046 -253 L 0.045 -254 V 0.044 -255 L 0.042 -256 F 0.043 -257 T 0.051 -258 V 0.065 -259 L 0.082 -260 R 0.104 -261 M 0.128 -262 P 0.143 -263 S 0.142 -264 N 0.128 -265 E 0.110 -266 G 0.091 -267 R 0.076 -268 K 0.066 -269 K 0.065 -270 A 0.066 -271 L 0.068 -272 V 0.074 -273 T 0.081 -274 C 0.087 -275 S 0.088 -276 S 0.084 -277 H 0.076 -278 L 0.067 -279 I 0.063 -280 V 0.065 -281 V 0.062 -282 G 0.051 -283 M 0.038 -284 F 0.031 -285 Y 0.030 -286 G 0.033 -287 A 0.037 -288 A 0.039 -289 T 0.039 -290 F 0.040 -291 M 0.046 -292 Y 0.060 -293 V 0.082 -294 L 0.108 -295 P 0.132 -296 S 0.149 -297 S 0.161 -298 F 0.169 -299 H 0.169 -300 S 0.160 -301 P 0.147 -302 K 0.137 -303 Q 0.131 -304 D 0.124 -305 N 0.113 -306 I 0.104 -307 I 0.095 -308 S 0.084 -309 V 0.074 -310 F 0.075 -311 Y 0.084 -312 T 0.094 -313 I 0.101 -314 V 0.108 -315 T 0.110 -316 P 0.103 -317 A 0.090 -318 L 0.080 -319 N 0.073 -320 P 0.066 -321 L 0.061 -322 I 0.060 -323 Y 0.063 -324 S 0.071 -325 L 0.084 -326 R 0.094 -327 N 0.089 -328 K 0.074 -329 E 0.061 -330 V 0.058 -331 M 0.066 -332 R 0.074 -333 A 0.074 -334 L 0.065 -335 R 0.057 -336 R 0.055 -337 V 0.063 -338 L 0.080 -339 G 0.103 -340 K 0.124 -341 Y 0.141 -342 I 0.159 -343 L 0.184 -344 L 0.220 -345 A 0.262 -346 H 0.303 -347 S 0.330 -348 T 0.338 -349 L 0.333 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188386.8_ENST00000374806.2_GN:PPP3R2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188386.8_ENST00000374806.2_GN:PPP3R2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 387cfc03f96bb5786a35c5fc8bf8469184d31af8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188386.8_ENST00000374806.2_GN:PPP3R2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,171 +0,0 @@ ->ENSG00000188386.8|ENST00000374806.2|GN:PPP3R2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.442 -2 G 0.454 -3 N 0.475 -4 E 0.485 -5 A 0.460 -6 S 0.401 -7 Y 0.334 -8 P 0.285 -9 A 0.258 -10 E 0.233 -11 M 0.200 -12 C 0.164 -13 S 0.136 -14 H 0.117 -15 F 0.100 -16 D 0.082 -17 N 0.067 -18 D 0.058 -19 E 0.053 -20 I 0.047 -21 K 0.041 -22 R 0.041 -23 L 0.051 -24 G 0.066 -25 R 0.073 -26 R 0.068 -27 F 0.059 -28 K 0.053 -29 K 0.054 -30 L 0.064 -31 D 0.086 -32 L 0.114 -33 D 0.134 -34 K 0.138 -35 S 0.135 -36 G 0.134 -37 S 0.131 -38 L 0.117 -39 S 0.095 -40 V 0.077 -41 E 0.073 -42 E 0.078 -43 F 0.083 -44 M 0.085 -45 S 0.088 -46 L 0.093 -47 P 0.098 -48 E 0.099 -49 L 0.101 -50 R 0.110 -51 H 0.123 -52 N 0.125 -53 P 0.110 -54 L 0.086 -55 V 0.069 -56 R 0.063 -57 R 0.062 -58 V 0.062 -59 I 0.062 -60 D 0.064 -61 V 0.069 -62 F 0.078 -63 D 0.101 -64 T 0.135 -65 D 0.168 -66 G 0.181 -67 D 0.174 -68 G 0.161 -69 E 0.145 -70 V 0.120 -71 D 0.091 -72 F 0.069 -73 K 0.063 -74 E 0.068 -75 F 0.071 -76 I 0.072 -77 L 0.076 -78 G 0.083 -79 T 0.083 -80 S 0.079 -81 Q 0.081 -82 F 0.098 -83 S 0.123 -84 V 0.143 -85 K 0.149 -86 G 0.140 -87 D 0.120 -88 E 0.097 -89 E 0.083 -90 Q 0.077 -91 K 0.072 -92 L 0.064 -93 R 0.060 -94 F 0.062 -95 A 0.068 -96 F 0.075 -97 S 0.082 -98 I 0.082 -99 Y 0.077 -100 D 0.077 -101 M 0.087 -102 D 0.099 -103 K 0.104 -104 D 0.107 -105 G 0.110 -106 Y 0.109 -107 I 0.098 -108 S 0.084 -109 N 0.078 -110 G 0.083 -111 E 0.088 -112 L 0.084 -113 F 0.076 -114 Q 0.071 -115 V 0.069 -116 L 0.067 -117 K 0.064 -118 M 0.069 -119 M 0.084 -120 V 0.106 -121 G 0.126 -122 N 0.134 -123 N 0.126 -124 L 0.111 -125 T 0.102 -126 D 0.102 -127 W 0.103 -128 Q 0.101 -129 L 0.097 -130 Q 0.095 -131 Q 0.092 -132 L 0.087 -133 V 0.078 -134 D 0.067 -135 K 0.059 -136 T 0.056 -137 I 0.056 -138 I 0.057 -139 I 0.061 -140 L 0.070 -141 D 0.087 -142 K 0.113 -143 D 0.141 -144 G 0.159 -145 D 0.164 -146 G 0.162 -147 K 0.152 -148 I 0.131 -149 S 0.107 -150 F 0.093 -151 E 0.087 -152 E 0.077 -153 F 0.061 -154 S 0.048 -155 A 0.045 -156 V 0.050 -157 V 0.066 -158 R 0.095 -159 D 0.131 -160 L 0.163 -161 E 0.182 -162 I 0.185 -163 H 0.181 -164 K 0.179 -165 K 0.177 -166 L 0.170 -167 V 0.168 -168 L 0.183 -169 I 0.206 -170 V 0.221 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188386.8_ENST00000374806.2_GN:PPP3R2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188386.8_ENST00000374806.2_GN:PPP3R2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid deleted file mode 100644 index 59362c6f08baab830d789b8bd911d8e0396b47fd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188386.8_ENST00000374806.2_GN:PPP3R2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid +++ /dev/null @@ -1,174 +0,0 @@ ->ENSG00000188386.8|ENST00000374806.2|GN:PPP3R2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 -1 M 0.426 -2 S 0.455 -3 T 0.506 -4 M 0.559 -5 G 0.592 -6 N 0.594 -7 E 0.564 -8 A 0.502 -9 S 0.421 -10 Y 0.344 -11 P 0.294 -12 A 0.265 -13 E 0.239 -14 M 0.203 -15 C 0.165 -16 S 0.137 -17 H 0.118 -18 F 0.101 -19 D 0.083 -20 N 0.069 -21 D 0.060 -22 E 0.055 -23 I 0.048 -24 K 0.041 -25 R 0.041 -26 L 0.051 -27 G 0.065 -28 R 0.072 -29 R 0.067 -30 F 0.058 -31 K 0.053 -32 K 0.053 -33 L 0.064 -34 D 0.085 -35 L 0.113 -36 D 0.132 -37 K 0.136 -38 S 0.133 -39 G 0.133 -40 S 0.130 -41 L 0.117 -42 S 0.095 -43 V 0.077 -44 E 0.073 -45 E 0.078 -46 F 0.083 -47 M 0.084 -48 S 0.087 -49 L 0.092 -50 P 0.097 -51 E 0.098 -52 L 0.100 -53 R 0.108 -54 H 0.121 -55 N 0.124 -56 P 0.109 -57 L 0.086 -58 V 0.069 -59 R 0.062 -60 R 0.061 -61 V 0.062 -62 I 0.062 -63 D 0.065 -64 V 0.069 -65 F 0.078 -66 D 0.100 -67 T 0.134 -68 D 0.166 -69 G 0.179 -70 D 0.173 -71 G 0.160 -72 E 0.144 -73 V 0.119 -74 D 0.090 -75 F 0.068 -76 K 0.063 -77 E 0.068 -78 F 0.071 -79 I 0.072 -80 L 0.076 -81 G 0.083 -82 T 0.083 -83 S 0.079 -84 Q 0.082 -85 F 0.098 -86 S 0.123 -87 V 0.142 -88 K 0.148 -89 G 0.140 -90 D 0.119 -91 E 0.097 -92 E 0.082 -93 Q 0.076 -94 K 0.071 -95 L 0.064 -96 R 0.060 -97 F 0.062 -98 A 0.068 -99 F 0.075 -100 S 0.082 -101 I 0.082 -102 Y 0.077 -103 D 0.077 -104 M 0.087 -105 D 0.099 -106 K 0.104 -107 D 0.107 -108 G 0.110 -109 Y 0.109 -110 I 0.098 -111 S 0.084 -112 N 0.078 -113 G 0.083 -114 E 0.089 -115 L 0.085 -116 F 0.076 -117 Q 0.071 -118 V 0.070 -119 L 0.067 -120 K 0.064 -121 M 0.069 -122 M 0.084 -123 V 0.106 -124 G 0.127 -125 N 0.135 -126 N 0.127 -127 L 0.112 -128 T 0.103 -129 D 0.102 -130 W 0.104 -131 Q 0.102 -132 L 0.097 -133 Q 0.095 -134 Q 0.092 -135 L 0.087 -136 V 0.078 -137 D 0.068 -138 K 0.059 -139 T 0.056 -140 I 0.056 -141 I 0.057 -142 I 0.062 -143 L 0.070 -144 D 0.087 -145 K 0.113 -146 D 0.142 -147 G 0.159 -148 D 0.164 -149 G 0.163 -150 K 0.153 -151 I 0.131 -152 S 0.107 -153 F 0.093 -154 E 0.087 -155 E 0.077 -156 F 0.061 -157 S 0.048 -158 A 0.045 -159 V 0.051 -160 V 0.067 -161 R 0.095 -162 D 0.132 -163 L 0.164 -164 E 0.182 -165 I 0.186 -166 H 0.181 -167 K 0.179 -168 K 0.177 -169 L 0.169 -170 V 0.167 -171 L 0.181 -172 I 0.204 -173 V 0.219 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188676.16_ENST00000502986.4_GN:IDO2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188676.16_ENST00000502986.4_GN:IDO2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 9756bb05d0f7309a2cb1faf2f5a0146b37c556a5..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188676.16_ENST00000502986.4_GN:IDO2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,408 +0,0 @@ ->ENSG00000188676.16|ENST00000502986.4|GN:IDO2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.421 -2 E 0.438 -3 P 0.460 -4 H 0.476 -5 R 0.482 -6 P 0.482 -7 N 0.478 -8 V 0.467 -9 K 0.440 -10 T 0.399 -11 A 0.346 -12 V 0.278 -13 P 0.204 -14 L 0.145 -15 S 0.115 -16 L 0.107 -17 E 0.104 -18 S 0.103 -19 Y 0.106 -20 H 0.109 -21 I 0.110 -22 S 0.105 -23 E 0.093 -24 E 0.081 -25 Y 0.077 -26 G 0.085 -27 F 0.102 -28 L 0.118 -29 L 0.124 -30 P 0.118 -31 D 0.107 -32 S 0.096 -33 L 0.084 -34 K 0.075 -35 E 0.070 -36 L 0.065 -37 P 0.059 -38 D 0.053 -39 H 0.046 -40 Y 0.040 -41 R 0.037 -42 P 0.039 -43 W 0.046 -44 M 0.058 -45 E 0.065 -46 I 0.063 -47 A 0.056 -48 N 0.052 -49 K 0.051 -50 L 0.055 -51 P 0.062 -52 Q 0.068 -53 L 0.071 -54 I 0.078 -55 D 0.090 -56 A 0.096 -57 H 0.090 -58 Q 0.084 -59 L 0.084 -60 Q 0.090 -61 A 0.099 -62 H 0.106 -63 V 0.111 -64 D 0.115 -65 K 0.121 -66 M 0.123 -67 P 0.113 -68 L 0.093 -69 L 0.075 -70 S 0.064 -71 C 0.059 -72 Q 0.060 -73 F 0.065 -74 L 0.071 -75 K 0.071 -76 G 0.066 -77 H 0.057 -78 R 0.049 -79 E 0.044 -80 Q 0.042 -81 R 0.043 -82 L 0.048 -83 A 0.053 -84 H 0.056 -85 L 0.060 -86 V 0.065 -87 L 0.067 -88 S 0.066 -89 F 0.068 -90 L 0.073 -91 T 0.075 -92 M 0.075 -93 G 0.078 -94 Y 0.082 -95 V 0.081 -96 W 0.078 -97 Q 0.086 -98 E 0.109 -99 G 0.136 -100 E 0.158 -101 A 0.169 -102 Q 0.166 -103 P 0.154 -104 A 0.141 -105 E 0.133 -106 V 0.130 -107 L 0.126 -108 P 0.116 -109 R 0.101 -110 N 0.083 -111 L 0.069 -112 A 0.063 -113 L 0.065 -114 P 0.068 -115 F 0.070 -116 V 0.072 -117 E 0.076 -118 V 0.086 -119 S 0.103 -120 R 0.129 -121 N 0.157 -122 L 0.177 -123 G 0.179 -124 L 0.161 -125 P 0.128 -126 P 0.100 -127 I 0.090 -128 L 0.102 -129 V 0.127 -130 H 0.150 -131 S 0.161 -132 D 0.160 -133 L 0.148 -134 V 0.129 -135 L 0.111 -136 T 0.100 -137 N 0.094 -138 W 0.089 -139 T 0.091 -140 K 0.107 -141 K 0.129 -142 D 0.150 -143 P 0.173 -144 D 0.194 -145 G 0.205 -146 F 0.197 -147 L 0.180 -148 E 0.168 -149 I 0.166 -150 G 0.164 -151 N 0.151 -152 L 0.131 -153 E 0.118 -154 T 0.112 -155 I 0.109 -156 I 0.110 -157 S 0.120 -158 F 0.140 -159 P 0.160 -160 G 0.173 -161 G 0.176 -162 E 0.170 -163 S 0.158 -164 L 0.146 -165 H 0.144 -166 G 0.147 -167 F 0.148 -168 I 0.146 -169 L 0.146 -170 V 0.153 -171 T 0.167 -172 A 0.187 -173 L 0.199 -174 V 0.191 -175 E 0.167 -176 K 0.143 -177 E 0.127 -178 A 0.115 -179 V 0.102 -180 P 0.086 -181 G 0.073 -182 I 0.062 -183 K 0.054 -184 A 0.049 -185 L 0.047 -186 V 0.047 -187 Q 0.048 -188 A 0.051 -189 T 0.057 -190 N 0.060 -191 A 0.057 -192 I 0.054 -193 L 0.053 -194 Q 0.056 -195 P 0.060 -196 N 0.060 -197 Q 0.056 -198 E 0.052 -199 A 0.054 -200 L 0.062 -201 L 0.071 -202 Q 0.075 -203 A 0.069 -204 L 0.059 -205 Q 0.057 -206 R 0.064 -207 L 0.075 -208 R 0.087 -209 L 0.097 -210 S 0.102 -211 I 0.100 -212 Q 0.097 -213 D 0.098 -214 I 0.099 -215 T 0.100 -216 K 0.099 -217 T 0.095 -218 L 0.090 -219 G 0.085 -220 Q 0.082 -221 M 0.079 -222 H 0.074 -223 D 0.074 -224 Y 0.078 -225 V 0.083 -226 D 0.083 -227 P 0.076 -228 D 0.065 -229 I 0.050 -230 F 0.040 -231 Y 0.037 -232 A 0.039 -233 G 0.040 -234 I 0.041 -235 R 0.044 -236 I 0.052 -237 F 0.067 -238 L 0.086 -239 S 0.109 -240 G 0.139 -241 W 0.172 -242 K 0.197 -243 D 0.206 -244 N 0.201 -245 P 0.192 -246 A 0.189 -247 M 0.195 -248 P 0.204 -249 A 0.202 -250 G 0.182 -251 L 0.152 -252 M 0.129 -253 Y 0.123 -254 E 0.128 -255 G 0.134 -256 V 0.136 -257 S 0.141 -258 Q 0.162 -259 E 0.198 -260 P 0.238 -261 L 0.269 -262 K 0.288 -263 Y 0.299 -264 S 0.314 -265 G 0.337 -266 G 0.360 -267 S 0.367 -268 A 0.349 -269 A 0.306 -270 Q 0.263 -271 S 0.244 -272 T 0.242 -273 V 0.244 -274 L 0.253 -275 H 0.262 -276 A 0.251 -277 F 0.216 -278 D 0.180 -279 E 0.158 -280 F 0.146 -281 L 0.141 -282 G 0.142 -283 I 0.146 -284 R 0.149 -285 H 0.148 -286 S 0.141 -287 K 0.130 -288 E 0.122 -289 S 0.118 -290 G 0.116 -291 D 0.113 -292 F 0.110 -293 L 0.107 -294 Y 0.109 -295 R 0.111 -296 M 0.106 -297 R 0.095 -298 D 0.082 -299 Y 0.073 -300 M 0.074 -301 P 0.082 -302 P 0.095 -303 S 0.105 -304 H 0.108 -305 K 0.105 -306 A 0.101 -307 F 0.095 -308 I 0.090 -309 E 0.089 -310 D 0.093 -311 I 0.101 -312 H 0.109 -313 S 0.111 -314 A 0.101 -315 P 0.078 -316 S 0.056 -317 L 0.044 -318 R 0.042 -319 D 0.044 -320 Y 0.049 -321 I 0.057 -322 L 0.068 -323 S 0.081 -324 S 0.091 -325 G 0.093 -326 Q 0.087 -327 D 0.078 -328 H 0.072 -329 L 0.073 -330 L 0.079 -331 T 0.080 -332 A 0.075 -333 Y 0.069 -334 N 0.065 -335 Q 0.064 -336 C 0.066 -337 V 0.073 -338 Q 0.080 -339 A 0.085 -340 L 0.085 -341 A 0.085 -342 E 0.086 -343 L 0.085 -344 R 0.081 -345 S 0.078 -346 Y 0.076 -347 H 0.071 -348 I 0.061 -349 T 0.050 -350 M 0.044 -351 V 0.041 -352 T 0.041 -353 K 0.042 -354 Y 0.048 -355 L 0.061 -356 I 0.078 -357 T 0.103 -358 A 0.140 -359 A 0.184 -360 A 0.228 -361 K 0.270 -362 A 0.317 -363 K 0.373 -364 H 0.427 -365 G 0.467 -366 K 0.482 -367 P 0.476 -368 N 0.455 -369 H 0.429 -370 L 0.403 -371 P 0.379 -372 G 0.361 -373 P 0.353 -374 P 0.347 -375 Q 0.332 -376 A 0.308 -377 L 0.284 -378 K 0.264 -379 D 0.250 -380 R 0.235 -381 G 0.212 -382 T 0.189 -383 G 0.178 -384 G 0.178 -385 T 0.172 -386 A 0.155 -387 V 0.133 -388 M 0.112 -389 S 0.098 -390 F 0.093 -391 L 0.093 -392 K 0.093 -393 S 0.092 -394 V 0.093 -395 R 0.099 -396 D 0.106 -397 K 0.110 -398 T 0.115 -399 L 0.122 -400 E 0.127 -401 S 0.136 -402 I 0.160 -403 L 0.209 -404 H 0.268 -405 P 0.309 -406 R 0.323 -407 G 0.320 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188676.16_ENST00000502986.4_GN:IDO2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188676.16_ENST00000502986.4_GN:IDO2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid deleted file mode 100644 index cf351117b479d70de612ac1ad9e166f636fc8711..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188676.16_ENST00000502986.4_GN:IDO2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid +++ /dev/null @@ -1,421 +0,0 @@ ->ENSG00000188676.16|ENST00000502986.4|GN:IDO2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:13 -1 M 0.279 -2 L 0.283 -3 H 0.296 -4 F 0.316 -5 H 0.336 -6 Y 0.350 -7 Y 0.358 -8 D 0.363 -9 T 0.364 -10 S 0.357 -11 N 0.347 -12 K 0.351 -13 I 0.378 -14 M 0.412 -15 E 0.437 -16 P 0.454 -17 H 0.461 -18 R 0.461 -19 P 0.460 -20 N 0.457 -21 V 0.442 -22 K 0.408 -23 T 0.362 -24 A 0.311 -25 V 0.250 -26 P 0.186 -27 L 0.137 -28 S 0.115 -29 L 0.108 -30 E 0.105 -31 S 0.102 -32 Y 0.104 -33 H 0.108 -34 I 0.110 -35 S 0.104 -36 E 0.092 -37 E 0.080 -38 Y 0.075 -39 G 0.083 -40 F 0.099 -41 L 0.116 -42 L 0.121 -43 P 0.115 -44 D 0.104 -45 S 0.093 -46 L 0.083 -47 K 0.074 -48 E 0.069 -49 L 0.065 -50 P 0.059 -51 D 0.053 -52 H 0.046 -53 Y 0.040 -54 R 0.037 -55 P 0.039 -56 W 0.046 -57 M 0.058 -58 E 0.065 -59 I 0.063 -60 A 0.056 -61 N 0.052 -62 K 0.051 -63 L 0.054 -64 P 0.061 -65 Q 0.067 -66 L 0.070 -67 I 0.077 -68 D 0.088 -69 A 0.093 -70 H 0.088 -71 Q 0.081 -72 L 0.082 -73 Q 0.088 -74 A 0.097 -75 H 0.104 -76 V 0.107 -77 D 0.111 -78 K 0.117 -79 M 0.118 -80 P 0.109 -81 L 0.091 -82 L 0.074 -83 S 0.063 -84 C 0.058 -85 Q 0.059 -86 F 0.065 -87 L 0.070 -88 K 0.071 -89 G 0.066 -90 H 0.057 -91 R 0.049 -92 E 0.044 -93 Q 0.041 -94 R 0.043 -95 L 0.047 -96 A 0.052 -97 H 0.055 -98 L 0.059 -99 V 0.063 -100 L 0.065 -101 S 0.064 -102 F 0.066 -103 L 0.072 -104 T 0.074 -105 M 0.073 -106 G 0.076 -107 Y 0.080 -108 V 0.079 -109 W 0.076 -110 Q 0.084 -111 E 0.106 -112 G 0.133 -113 E 0.156 -114 A 0.168 -115 Q 0.167 -116 P 0.156 -117 A 0.142 -118 E 0.134 -119 V 0.131 -120 L 0.127 -121 P 0.116 -122 R 0.101 -123 N 0.084 -124 L 0.069 -125 A 0.064 -126 L 0.066 -127 P 0.070 -128 F 0.071 -129 V 0.073 -130 E 0.077 -131 V 0.085 -132 S 0.102 -133 R 0.127 -134 N 0.154 -135 L 0.174 -136 G 0.177 -137 L 0.160 -138 P 0.129 -139 P 0.101 -140 I 0.091 -141 L 0.103 -142 V 0.127 -143 H 0.148 -144 S 0.159 -145 D 0.157 -146 L 0.146 -147 V 0.129 -148 L 0.112 -149 T 0.102 -150 N 0.095 -151 W 0.090 -152 T 0.092 -153 K 0.107 -154 K 0.129 -155 D 0.150 -156 P 0.172 -157 D 0.193 -158 G 0.203 -159 F 0.196 -160 L 0.180 -161 E 0.169 -162 I 0.168 -163 G 0.165 -164 N 0.151 -165 L 0.131 -166 E 0.118 -167 T 0.112 -168 I 0.109 -169 I 0.109 -170 S 0.119 -171 F 0.139 -172 P 0.160 -173 G 0.173 -174 G 0.177 -175 E 0.171 -176 S 0.158 -177 L 0.147 -178 H 0.144 -179 G 0.148 -180 F 0.149 -181 I 0.147 -182 L 0.146 -183 V 0.152 -184 T 0.166 -185 A 0.185 -186 L 0.197 -187 V 0.189 -188 E 0.165 -189 K 0.141 -190 E 0.125 -191 A 0.114 -192 V 0.101 -193 P 0.086 -194 G 0.072 -195 I 0.062 -196 K 0.054 -197 A 0.048 -198 L 0.047 -199 V 0.047 -200 Q 0.047 -201 A 0.051 -202 T 0.057 -203 N 0.059 -204 A 0.057 -205 I 0.053 -206 L 0.052 -207 Q 0.055 -208 P 0.058 -209 N 0.059 -210 Q 0.055 -211 E 0.051 -212 A 0.053 -213 L 0.061 -214 L 0.071 -215 Q 0.074 -216 A 0.068 -217 L 0.059 -218 Q 0.057 -219 R 0.063 -220 L 0.075 -221 R 0.087 -222 L 0.097 -223 S 0.101 -224 I 0.099 -225 Q 0.096 -226 D 0.096 -227 I 0.098 -228 T 0.099 -229 K 0.099 -230 T 0.095 -231 L 0.089 -232 G 0.084 -233 Q 0.081 -234 M 0.077 -235 H 0.073 -236 D 0.072 -237 Y 0.077 -238 V 0.082 -239 D 0.082 -240 P 0.076 -241 D 0.064 -242 I 0.050 -243 F 0.040 -244 Y 0.037 -245 A 0.038 -246 G 0.040 -247 I 0.040 -248 R 0.043 -249 I 0.052 -250 F 0.067 -251 L 0.086 -252 S 0.110 -253 G 0.140 -254 W 0.172 -255 K 0.198 -256 D 0.206 -257 N 0.201 -258 P 0.192 -259 A 0.189 -260 M 0.195 -261 P 0.204 -262 A 0.202 -263 G 0.182 -264 L 0.152 -265 M 0.128 -266 Y 0.121 -267 E 0.127 -268 G 0.134 -269 V 0.136 -270 S 0.142 -271 Q 0.162 -272 E 0.198 -273 P 0.236 -274 L 0.267 -275 K 0.285 -276 Y 0.297 -277 S 0.311 -278 G 0.335 -279 G 0.358 -280 S 0.366 -281 A 0.349 -282 A 0.307 -283 Q 0.265 -284 S 0.246 -285 T 0.244 -286 V 0.245 -287 L 0.252 -288 H 0.260 -289 A 0.249 -290 F 0.215 -291 D 0.180 -292 E 0.158 -293 F 0.146 -294 L 0.141 -295 G 0.142 -296 I 0.146 -297 R 0.150 -298 H 0.150 -299 S 0.144 -300 K 0.133 -301 E 0.124 -302 S 0.119 -303 G 0.115 -304 D 0.112 -305 F 0.109 -306 L 0.108 -307 Y 0.111 -308 R 0.113 -309 M 0.108 -310 R 0.097 -311 D 0.083 -312 Y 0.075 -313 M 0.075 -314 P 0.084 -315 P 0.097 -316 S 0.107 -317 H 0.110 -318 K 0.107 -319 A 0.102 -320 F 0.096 -321 I 0.091 -322 E 0.090 -323 D 0.095 -324 I 0.103 -325 H 0.111 -326 S 0.113 -327 A 0.102 -328 P 0.079 -329 S 0.057 -330 L 0.045 -331 R 0.043 -332 D 0.045 -333 Y 0.050 -334 I 0.058 -335 L 0.069 -336 S 0.082 -337 S 0.092 -338 G 0.094 -339 Q 0.087 -340 D 0.078 -341 H 0.072 -342 L 0.074 -343 L 0.079 -344 T 0.081 -345 A 0.076 -346 Y 0.070 -347 N 0.066 -348 Q 0.065 -349 C 0.067 -350 V 0.074 -351 Q 0.081 -352 A 0.086 -353 L 0.087 -354 A 0.087 -355 E 0.087 -356 L 0.086 -357 R 0.082 -358 S 0.079 -359 Y 0.077 -360 H 0.072 -361 I 0.061 -362 T 0.051 -363 M 0.045 -364 V 0.042 -365 T 0.041 -366 K 0.042 -367 Y 0.048 -368 L 0.060 -369 I 0.077 -370 T 0.102 -371 A 0.139 -372 A 0.183 -373 A 0.226 -374 K 0.267 -375 A 0.314 -376 K 0.370 -377 H 0.425 -378 G 0.465 -379 K 0.482 -380 P 0.476 -381 N 0.455 -382 H 0.430 -383 L 0.404 -384 P 0.380 -385 G 0.362 -386 P 0.355 -387 P 0.349 -388 Q 0.334 -389 A 0.310 -390 L 0.286 -391 K 0.266 -392 D 0.252 -393 R 0.237 -394 G 0.214 -395 T 0.190 -396 G 0.179 -397 G 0.179 -398 T 0.173 -399 A 0.156 -400 V 0.133 -401 M 0.112 -402 S 0.098 -403 F 0.093 -404 L 0.093 -405 K 0.094 -406 S 0.092 -407 V 0.094 -408 R 0.100 -409 D 0.106 -410 K 0.111 -411 T 0.116 -412 L 0.123 -413 E 0.128 -414 S 0.136 -415 I 0.161 -416 L 0.210 -417 H 0.268 -418 P 0.310 -419 R 0.323 -420 G 0.320 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188710.3_ENST00000623824.2_GN:QRFP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188710.3_ENST00000623824.2_GN:QRFP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index ce10a05bb30a6addbf87d3df675ac342499c3611..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188710.3_ENST00000623824.2_GN:QRFP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,137 +0,0 @@ ->ENSG00000188710.3|ENST00000623824.2|GN:QRFP|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.401 -2 V 0.418 -3 R 0.441 -4 P 0.459 -5 Y 0.455 -6 P 0.423 -7 L 0.388 -8 I 0.373 -9 Y 0.370 -10 F 0.377 -11 L 0.418 -12 F 0.495 -13 L 0.578 -14 P 0.639 -15 L 0.671 -16 G 0.672 -17 A 0.646 -18 C 0.620 -19 F 0.626 -20 P 0.658 -21 L 0.686 -22 L 0.698 -23 D 0.702 -24 R 0.706 -25 R 0.713 -26 E 0.726 -27 P 0.746 -28 T 0.770 -29 D 0.792 -30 A 0.806 -31 M 0.811 -32 G 0.812 -33 G 0.808 -34 L 0.795 -35 G 0.774 -36 A 0.746 -37 G 0.704 -38 E 0.654 -39 R 0.619 -40 W 0.616 -41 A 0.638 -42 D 0.662 -43 L 0.666 -44 A 0.642 -45 M 0.603 -46 G 0.583 -47 P 0.599 -48 R 0.635 -49 P 0.668 -50 H 0.692 -51 S 0.708 -52 V 0.709 -53 W 0.696 -54 G 0.686 -55 S 0.687 -56 S 0.685 -57 R 0.675 -58 W 0.669 -59 L 0.668 -60 R 0.665 -61 A 0.658 -62 S 0.656 -63 Q 0.659 -64 P 0.658 -65 Q 0.635 -66 A 0.589 -67 L 0.546 -68 L 0.527 -69 V 0.523 -70 I 0.510 -71 A 0.487 -72 R 0.470 -73 G 0.477 -74 L 0.511 -75 Q 0.552 -76 T 0.579 -77 S 0.578 -78 G 0.551 -79 R 0.502 -80 E 0.452 -81 H 0.420 -82 A 0.419 -83 G 0.438 -84 C 0.456 -85 R 0.462 -86 F 0.464 -87 R 0.474 -88 F 0.506 -89 G 0.565 -90 R 0.632 -91 Q 0.682 -92 D 0.714 -93 E 0.740 -94 G 0.761 -95 S 0.769 -96 E 0.762 -97 A 0.744 -98 T 0.727 -99 G 0.719 -100 F 0.721 -101 L 0.729 -102 P 0.742 -103 A 0.754 -104 A 0.753 -105 G 0.735 -106 E 0.705 -107 K 0.660 -108 T 0.597 -109 S 0.534 -110 G 0.495 -111 P 0.484 -112 L 0.493 -113 G 0.517 -114 N 0.535 -115 L 0.521 -116 A 0.479 -117 E 0.443 -118 E 0.429 -119 L 0.427 -120 N 0.427 -121 G 0.428 -122 Y 0.428 -123 S 0.423 -124 R 0.417 -125 K 0.428 -126 K 0.464 -127 G 0.510 -128 G 0.543 -129 F 0.551 -130 S 0.546 -131 F 0.540 -132 R 0.539 -133 F 0.534 -134 G 0.509 -135 R 0.461 -136 R 0.419 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188710.3_ENST00000623824.2_GN:QRFP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:33.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188710.3_ENST00000623824.2_GN:QRFP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:33.caid deleted file mode 100644 index e1233e22bd53ada2404d85da34121266044380e6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188710.3_ENST00000623824.2_GN:QRFP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:33.caid +++ /dev/null @@ -1,170 +0,0 @@ ->ENSG00000188710.3|ENST00000623824.2|GN:QRFP|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:33 -1 M 0.466 -2 P 0.521 -3 P 0.602 -4 G 0.674 -5 R 0.715 -6 G 0.719 -7 P 0.686 -8 R 0.635 -9 A 0.607 -10 A 0.621 -11 L 0.629 -12 P 0.602 -13 S 0.575 -14 P 0.582 -15 A 0.603 -16 P 0.631 -17 E 0.679 -18 P 0.732 -19 S 0.761 -20 D 0.772 -21 P 0.785 -22 P 0.809 -23 A 0.833 -24 S 0.845 -25 L 0.848 -26 P 0.851 -27 G 0.854 -28 S 0.852 -29 S 0.847 -30 P 0.847 -31 S 0.852 -32 H 0.854 -33 T 0.843 -34 M 0.813 -35 V 0.765 -36 R 0.709 -37 P 0.657 -38 Y 0.606 -39 P 0.545 -40 L 0.473 -41 I 0.415 -42 Y 0.390 -43 F 0.398 -44 L 0.432 -45 F 0.487 -46 L 0.550 -47 P 0.609 -48 L 0.659 -49 G 0.694 -50 A 0.705 -51 C 0.704 -52 F 0.718 -53 P 0.751 -54 L 0.784 -55 L 0.806 -56 D 0.814 -57 R 0.817 -58 R 0.820 -59 E 0.828 -60 P 0.843 -61 T 0.860 -62 D 0.875 -63 A 0.882 -64 M 0.883 -65 G 0.880 -66 G 0.878 -67 L 0.876 -68 G 0.870 -69 A 0.860 -70 G 0.846 -71 E 0.832 -72 R 0.823 -73 W 0.823 -74 A 0.830 -75 D 0.834 -76 L 0.829 -77 A 0.813 -78 M 0.793 -79 G 0.782 -80 P 0.788 -81 R 0.806 -82 P 0.824 -83 H 0.835 -84 S 0.837 -85 V 0.833 -86 W 0.826 -87 G 0.821 -88 S 0.814 -89 S 0.800 -90 R 0.789 -91 W 0.791 -92 L 0.804 -93 R 0.816 -94 A 0.810 -95 S 0.788 -96 Q 0.760 -97 P 0.734 -98 Q 0.705 -99 A 0.674 -100 L 0.658 -101 L 0.672 -102 V 0.705 -103 I 0.728 -104 A 0.729 -105 R 0.723 -106 G 0.727 -107 L 0.744 -108 Q 0.762 -109 T 0.773 -110 S 0.775 -111 G 0.765 -112 R 0.742 -113 E 0.714 -114 H 0.694 -115 A 0.694 -116 G 0.707 -117 C 0.719 -118 R 0.722 -119 F 0.722 -120 R 0.732 -121 F 0.751 -122 G 0.774 -123 R 0.795 -124 Q 0.809 -125 D 0.820 -126 E 0.828 -127 G 0.836 -128 S 0.842 -129 E 0.844 -130 A 0.841 -131 T 0.836 -132 G 0.832 -133 F 0.829 -134 L 0.832 -135 P 0.841 -136 A 0.853 -137 A 0.857 -138 G 0.848 -139 E 0.828 -140 K 0.795 -141 T 0.746 -142 S 0.698 -143 G 0.673 -144 P 0.673 -145 L 0.680 -146 G 0.685 -147 N 0.681 -148 L 0.655 -149 A 0.612 -150 E 0.578 -151 E 0.563 -152 L 0.563 -153 N 0.576 -154 G 0.602 -155 Y 0.631 -156 S 0.643 -157 R 0.633 -158 K 0.618 -159 K 0.620 -160 G 0.639 -161 G 0.663 -162 F 0.682 -163 S 0.693 -164 F 0.701 -165 R 0.705 -166 F 0.695 -167 G 0.650 -168 R 0.577 -169 R 0.517 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188784.4_ENST00000375116.3_GN:PLA2G2E_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188784.4_ENST00000375116.3_GN:PLA2G2E_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index e33551554f4150c6fc3411b41a18a8d29a45b04e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188784.4_ENST00000375116.3_GN:PLA2G2E_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,143 +0,0 @@ ->ENSG00000188784.4|ENST00000375116.3|GN:PLA2G2E|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.375 -2 K 0.373 -3 S 0.368 -4 P 0.352 -5 H 0.320 -6 V 0.283 -7 L 0.257 -8 V 0.250 -9 F 0.249 -10 L 0.248 -11 C 0.251 -12 L 0.266 -13 L 0.287 -14 V 0.303 -15 A 0.310 -16 L 0.312 -17 V 0.306 -18 T 0.285 -19 G 0.243 -20 N 0.187 -21 L 0.132 -22 V 0.095 -23 Q 0.082 -24 F 0.087 -25 G 0.097 -26 V 0.099 -27 M 0.089 -28 I 0.076 -29 E 0.070 -30 K 0.073 -31 M 0.080 -32 T 0.086 -33 G 0.087 -34 K 0.090 -35 S 0.098 -36 A 0.108 -37 L 0.117 -38 Q 0.126 -39 Y 0.134 -40 N 0.136 -41 D 0.126 -42 Y 0.106 -43 G 0.084 -44 C 0.073 -45 Y 0.080 -46 C 0.107 -47 G 0.148 -48 I 0.194 -49 G 0.229 -50 G 0.239 -51 S 0.230 -52 H 0.220 -53 W 0.217 -54 P 0.214 -55 V 0.204 -56 D 0.191 -57 Q 0.178 -58 T 0.169 -59 D 0.155 -60 W 0.128 -61 C 0.103 -62 C 0.096 -63 H 0.102 -64 A 0.105 -65 H 0.098 -66 D 0.085 -67 C 0.071 -68 C 0.064 -69 Y 0.067 -70 G 0.077 -71 R 0.088 -72 L 0.094 -73 E 0.094 -74 K 0.095 -75 L 0.102 -76 G 0.112 -77 C 0.117 -78 E 0.115 -79 P 0.112 -80 K 0.112 -81 L 0.115 -82 E 0.112 -83 K 0.102 -84 Y 0.088 -85 L 0.073 -86 F 0.061 -87 S 0.053 -88 V 0.051 -89 S 0.055 -90 E 0.063 -91 R 0.069 -92 G 0.071 -93 I 0.071 -94 F 0.076 -95 C 0.089 -96 A 0.103 -97 G 0.111 -98 R 0.109 -99 T 0.100 -100 T 0.092 -101 C 0.091 -102 Q 0.095 -103 R 0.098 -104 L 0.095 -105 T 0.086 -106 C 0.075 -107 E 0.072 -108 C 0.077 -109 D 0.082 -110 K 0.080 -111 R 0.074 -112 A 0.070 -113 A 0.068 -114 L 0.064 -115 C 0.061 -116 F 0.058 -117 R 0.058 -118 R 0.059 -119 N 0.062 -120 L 0.068 -121 G 0.075 -122 T 0.077 -123 Y 0.072 -124 N 0.067 -125 R 0.066 -126 K 0.070 -127 Y 0.077 -128 A 0.085 -129 H 0.093 -130 Y 0.098 -131 P 0.100 -132 N 0.100 -133 K 0.101 -134 L 0.102 -135 C 0.108 -136 T 0.124 -137 G 0.147 -138 P 0.166 -139 T 0.169 -140 P 0.159 -141 P 0.146 -142 C 0.140 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188784.4_ENST00000375116.3_GN:PLA2G2E_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188784.4_ENST00000375116.3_GN:PLA2G2E_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid deleted file mode 100644 index 15344deddfbcd9c84c2806996e01650eaeecd217..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188784.4_ENST00000375116.3_GN:PLA2G2E_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:12.caid +++ /dev/null @@ -1,155 +0,0 @@ ->ENSG00000188784.4|ENST00000375116.3|GN:PLA2G2E|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:12 -1 M 0.373 -2 L 0.395 -3 L 0.423 -4 V 0.444 -5 H 0.454 -6 L 0.464 -7 P 0.481 -8 S 0.507 -9 P 0.537 -10 Q 0.562 -11 P 0.573 -12 G 0.563 -13 M 0.531 -14 K 0.488 -15 S 0.443 -16 P 0.394 -17 H 0.341 -18 V 0.292 -19 L 0.255 -20 V 0.240 -21 F 0.244 -22 L 0.255 -23 C 0.264 -24 L 0.276 -25 L 0.291 -26 V 0.300 -27 A 0.303 -28 L 0.303 -29 V 0.297 -30 T 0.277 -31 G 0.238 -32 N 0.184 -33 L 0.130 -34 V 0.094 -35 Q 0.081 -36 F 0.085 -37 G 0.094 -38 V 0.096 -39 M 0.086 -40 I 0.074 -41 E 0.068 -42 K 0.071 -43 M 0.079 -44 T 0.085 -45 G 0.086 -46 K 0.089 -47 S 0.097 -48 A 0.107 -49 L 0.116 -50 Q 0.125 -51 Y 0.133 -52 N 0.135 -53 D 0.125 -54 Y 0.105 -55 G 0.084 -56 C 0.071 -57 Y 0.078 -58 C 0.104 -59 G 0.146 -60 I 0.191 -61 G 0.226 -62 G 0.236 -63 S 0.225 -64 H 0.214 -65 W 0.210 -66 P 0.207 -67 V 0.198 -68 D 0.186 -69 Q 0.174 -70 T 0.166 -71 D 0.152 -72 W 0.125 -73 C 0.100 -74 C 0.093 -75 H 0.100 -76 A 0.103 -77 H 0.096 -78 D 0.083 -79 C 0.070 -80 C 0.063 -81 Y 0.067 -82 G 0.077 -83 R 0.087 -84 L 0.093 -85 E 0.092 -86 K 0.093 -87 L 0.100 -88 G 0.110 -89 C 0.115 -90 E 0.113 -91 P 0.109 -92 K 0.110 -93 L 0.111 -94 E 0.109 -95 K 0.099 -96 Y 0.086 -97 L 0.072 -98 F 0.060 -99 S 0.052 -100 V 0.050 -101 S 0.054 -102 E 0.062 -103 R 0.069 -104 G 0.071 -105 I 0.071 -106 F 0.077 -107 C 0.089 -108 A 0.103 -109 G 0.111 -110 R 0.109 -111 T 0.100 -112 T 0.092 -113 C 0.092 -114 Q 0.096 -115 R 0.099 -116 L 0.097 -117 T 0.087 -118 C 0.076 -119 E 0.072 -120 C 0.077 -121 D 0.082 -122 K 0.080 -123 R 0.074 -124 A 0.070 -125 A 0.068 -126 L 0.065 -127 C 0.061 -128 F 0.059 -129 R 0.058 -130 R 0.059 -131 N 0.063 -132 L 0.069 -133 G 0.075 -134 T 0.077 -135 Y 0.072 -136 N 0.067 -137 R 0.066 -138 K 0.070 -139 Y 0.078 -140 A 0.086 -141 H 0.093 -142 Y 0.098 -143 P 0.099 -144 N 0.099 -145 K 0.100 -146 L 0.102 -147 C 0.108 -148 T 0.124 -149 G 0.149 -150 P 0.168 -151 T 0.172 -152 P 0.161 -153 P 0.148 -154 C 0.141 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188937.8_ENST00000378220.3_GN:NYX_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188937.8_ENST00000378220.3_GN:NYX_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index f24e25915148a9a60e71822f7c2072441df43395..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188937.8_ENST00000378220.3_GN:NYX_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,477 +0,0 @@ ->ENSG00000188937.8|ENST00000378220.3|GN:NYX|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.250 -2 L 0.245 -3 V 0.245 -4 L 0.252 -5 L 0.253 -6 L 0.251 -7 H 0.268 -8 A 0.306 -9 V 0.339 -10 V 0.356 -11 L 0.374 -12 G 0.407 -13 L 0.457 -14 P 0.512 -15 S 0.554 -16 A 0.573 -17 W 0.580 -18 A 0.585 -19 V 0.575 -20 G 0.537 -21 A 0.471 -22 C 0.392 -23 A 0.315 -24 R 0.245 -25 A 0.181 -26 C 0.127 -27 P 0.087 -28 A 0.062 -29 A 0.049 -30 C 0.046 -31 A 0.055 -32 C 0.071 -33 S 0.090 -34 T 0.107 -35 V 0.116 -36 E 0.114 -37 R 0.104 -38 G 0.090 -39 C 0.077 -40 S 0.069 -41 V 0.070 -42 R 0.078 -43 C 0.091 -44 D 0.105 -45 R 0.112 -46 A 0.112 -47 G 0.109 -48 L 0.106 -49 L 0.103 -50 R 0.101 -51 V 0.100 -52 P 0.101 -53 A 0.104 -54 E 0.102 -55 L 0.094 -56 P 0.084 -57 C 0.081 -58 E 0.084 -59 A 0.089 -60 V 0.098 -61 S 0.115 -62 I 0.138 -63 D 0.161 -64 L 0.174 -65 D 0.169 -66 R 0.148 -67 N 0.125 -68 G 0.112 -69 L 0.113 -70 R 0.129 -71 F 0.161 -72 L 0.193 -73 G 0.204 -74 E 0.190 -75 R 0.157 -76 A 0.124 -77 F 0.102 -78 G 0.089 -79 T 0.081 -80 L 0.075 -81 P 0.071 -82 S 0.070 -83 L 0.073 -84 R 0.083 -85 R 0.097 -86 L 0.113 -87 S 0.132 -88 L 0.149 -89 R 0.154 -90 H 0.140 -91 N 0.115 -92 N 0.100 -93 L 0.102 -94 S 0.123 -95 F 0.151 -96 I 0.172 -97 T 0.178 -98 P 0.172 -99 G 0.153 -100 A 0.121 -101 F 0.092 -102 K 0.075 -103 G 0.072 -104 L 0.078 -105 P 0.087 -106 R 0.093 -107 L 0.096 -108 A 0.105 -109 E 0.117 -110 L 0.129 -111 R 0.140 -112 L 0.149 -113 A 0.151 -114 H 0.142 -115 N 0.126 -116 G 0.113 -117 D 0.104 -118 L 0.098 -119 R 0.099 -120 Y 0.108 -121 L 0.116 -122 H 0.115 -123 A 0.107 -124 R 0.093 -125 T 0.077 -126 F 0.064 -127 A 0.057 -128 A 0.054 -129 L 0.057 -130 S 0.066 -131 R 0.074 -132 L 0.079 -133 R 0.086 -134 R 0.095 -135 L 0.104 -136 D 0.113 -137 L 0.125 -138 A 0.135 -139 A 0.134 -140 C 0.118 -141 R 0.101 -142 L 0.092 -143 F 0.098 -144 S 0.117 -145 V 0.136 -146 P 0.140 -147 E 0.131 -148 R 0.117 -149 L 0.101 -150 L 0.088 -151 A 0.079 -152 E 0.075 -153 L 0.074 -154 P 0.075 -155 A 0.074 -156 L 0.076 -157 R 0.087 -158 E 0.106 -159 L 0.124 -160 A 0.138 -161 A 0.145 -162 F 0.145 -163 D 0.133 -164 N 0.112 -165 L 0.092 -166 F 0.085 -167 R 0.088 -168 R 0.096 -169 V 0.105 -170 P 0.115 -171 G 0.124 -172 A 0.128 -173 L 0.125 -174 R 0.116 -175 G 0.108 -176 L 0.108 -177 A 0.114 -178 N 0.113 -179 L 0.104 -180 T 0.102 -181 H 0.115 -182 A 0.132 -183 H 0.146 -184 L 0.155 -185 E 0.156 -186 R 0.143 -187 G 0.124 -188 R 0.112 -189 I 0.112 -190 E 0.125 -191 A 0.140 -192 V 0.147 -193 A 0.140 -194 S 0.124 -195 S 0.104 -196 S 0.085 -197 L 0.078 -198 Q 0.081 -199 G 0.086 -200 L 0.092 -201 R 0.096 -202 R 0.096 -203 L 0.092 -204 R 0.091 -205 S 0.099 -206 L 0.113 -207 S 0.133 -208 L 0.154 -209 Q 0.161 -210 A 0.144 -211 N 0.116 -212 R 0.096 -213 V 0.096 -214 R 0.114 -215 A 0.142 -216 V 0.161 -217 H 0.165 -218 A 0.157 -219 G 0.139 -220 A 0.113 -221 F 0.088 -222 G 0.069 -223 D 0.058 -224 C 0.054 -225 G 0.057 -226 V 0.066 -227 L 0.085 -228 E 0.112 -229 H 0.135 -230 L 0.145 -231 L 0.144 -232 L 0.143 -233 N 0.142 -234 D 0.137 -235 N 0.125 -236 L 0.119 -237 L 0.122 -238 A 0.133 -239 E 0.152 -240 L 0.168 -241 P 0.167 -242 A 0.148 -243 D 0.123 -244 A 0.100 -245 F 0.086 -246 R 0.082 -247 G 0.085 -248 L 0.095 -249 R 0.109 -250 R 0.118 -251 L 0.118 -252 R 0.117 -253 T 0.123 -254 L 0.132 -255 N 0.140 -256 L 0.143 -257 G 0.137 -258 G 0.122 -259 N 0.102 -260 A 0.084 -261 L 0.076 -262 D 0.075 -263 R 0.077 -264 V 0.078 -265 A 0.080 -266 R 0.078 -267 A 0.068 -268 W 0.056 -269 F 0.051 -270 A 0.055 -271 D 0.063 -272 L 0.074 -273 A 0.089 -274 E 0.101 -275 L 0.110 -276 E 0.118 -277 L 0.126 -278 L 0.132 -279 Y 0.137 -280 L 0.140 -281 D 0.139 -282 R 0.129 -283 N 0.117 -284 S 0.113 -285 I 0.125 -286 A 0.151 -287 F 0.181 -288 V 0.197 -289 E 0.197 -290 E 0.189 -291 G 0.173 -292 A 0.149 -293 F 0.130 -294 Q 0.124 -295 N 0.128 -296 L 0.138 -297 S 0.151 -298 G 0.162 -299 L 0.164 -300 L 0.161 -301 A 0.161 -302 L 0.164 -303 H 0.167 -304 L 0.168 -305 N 0.160 -306 G 0.142 -307 N 0.120 -308 R 0.104 -309 L 0.100 -310 T 0.110 -311 V 0.126 -312 L 0.131 -313 A 0.117 -314 W 0.097 -315 V 0.084 -316 A 0.081 -317 F 0.092 -318 Q 0.112 -319 P 0.127 -320 G 0.125 -321 F 0.119 -322 F 0.126 -323 L 0.148 -324 G 0.174 -325 R 0.191 -326 L 0.199 -327 F 0.207 -328 L 0.215 -329 F 0.210 -330 R 0.180 -331 N 0.135 -332 P 0.094 -333 W 0.067 -334 C 0.055 -335 C 0.055 -336 D 0.063 -337 C 0.075 -338 R 0.080 -339 L 0.072 -340 E 0.057 -341 W 0.047 -342 L 0.049 -343 R 0.058 -344 D 0.067 -345 W 0.070 -346 M 0.075 -347 E 0.087 -348 G 0.101 -349 S 0.110 -350 G 0.109 -351 R 0.102 -352 V 0.093 -353 T 0.089 -354 D 0.090 -355 V 0.091 -356 P 0.086 -357 C 0.075 -358 A 0.065 -359 S 0.065 -360 P 0.077 -361 G 0.091 -362 S 0.097 -363 V 0.096 -364 A 0.094 -365 G 0.094 -366 L 0.095 -367 D 0.095 -368 L 0.093 -369 S 0.097 -370 Q 0.111 -371 V 0.139 -372 T 0.177 -373 F 0.228 -374 G 0.282 -375 R 0.319 -376 S 0.327 -377 S 0.313 -378 D 0.288 -379 G 0.262 -380 L 0.244 -381 C 0.246 -382 V 0.276 -383 D 0.330 -384 P 0.393 -385 E 0.453 -386 E 0.507 -387 L 0.555 -388 N 0.599 -389 L 0.638 -390 T 0.665 -391 T 0.672 -392 S 0.665 -393 S 0.657 -394 P 0.654 -395 G 0.652 -396 P 0.650 -397 S 0.650 -398 P 0.659 -399 E 0.678 -400 P 0.697 -401 A 0.704 -402 A 0.692 -403 T 0.665 -404 T 0.630 -405 V 0.588 -406 S 0.532 -407 R 0.463 -408 F 0.393 -409 S 0.334 -410 S 0.302 -411 L 0.300 -412 L 0.318 -413 S 0.338 -414 K 0.361 -415 L 0.402 -416 L 0.467 -417 A 0.542 -418 P 0.609 -419 R 0.658 -420 V 0.691 -421 P 0.708 -422 V 0.707 -423 E 0.691 -424 E 0.683 -425 A 0.705 -426 A 0.739 -427 N 0.762 -428 T 0.773 -429 T 0.781 -430 G 0.786 -431 G 0.783 -432 L 0.761 -433 A 0.711 -434 N 0.639 -435 A 0.578 -436 S 0.538 -437 L 0.486 -438 S 0.431 -439 D 0.430 -440 S 0.477 -441 L 0.516 -442 S 0.544 -443 S 0.598 -444 R 0.668 -445 G 0.718 -446 V 0.740 -447 G 0.746 -448 G 0.741 -449 A 0.726 -450 G 0.700 -451 R 0.670 -452 Q 0.648 -453 P 0.641 -454 W 0.649 -455 F 0.660 -456 L 0.657 -457 L 0.628 -458 A 0.580 -459 S 0.535 -460 C 0.516 -461 L 0.529 -462 L 0.557 -463 P 0.584 -464 S 0.593 -465 V 0.559 -466 A 0.488 -467 Q 0.436 -468 H 0.444 -469 V 0.489 -470 V 0.530 -471 F 0.557 -472 G 0.574 -473 L 0.573 -474 Q 0.544 -475 M 0.496 -476 D 0.456 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188937.8_ENST00000378220.3_GN:NYX_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188937.8_ENST00000378220.3_GN:NYX_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid deleted file mode 100644 index ad818b0671dadcf52b4c1f3a6049349146602d8d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000188937.8_ENST00000378220.3_GN:NYX_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid +++ /dev/null @@ -1,482 +0,0 @@ ->ENSG00000188937.8|ENST00000378220.3|GN:NYX|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:5 -1 M 0.377 -2 K 0.397 -3 G 0.425 -4 R 0.432 -5 G 0.392 -6 M 0.325 -7 L 0.273 -8 V 0.247 -9 L 0.235 -10 L 0.239 -11 L 0.268 -12 H 0.301 -13 A 0.320 -14 V 0.337 -15 V 0.364 -16 L 0.397 -17 G 0.437 -18 L 0.490 -19 P 0.546 -20 S 0.583 -21 A 0.594 -22 W 0.595 -23 A 0.593 -24 V 0.574 -25 G 0.528 -26 A 0.462 -27 C 0.388 -28 A 0.315 -29 R 0.244 -30 A 0.179 -31 C 0.126 -32 P 0.087 -33 A 0.062 -34 A 0.048 -35 C 0.047 -36 A 0.055 -37 C 0.072 -38 S 0.090 -39 T 0.107 -40 V 0.117 -41 E 0.115 -42 R 0.103 -43 G 0.088 -44 C 0.075 -45 S 0.068 -46 V 0.069 -47 R 0.076 -48 C 0.089 -49 D 0.102 -50 R 0.109 -51 A 0.109 -52 G 0.107 -53 L 0.104 -54 L 0.101 -55 R 0.099 -56 V 0.098 -57 P 0.099 -58 A 0.101 -59 E 0.100 -60 L 0.092 -61 P 0.082 -62 C 0.079 -63 E 0.082 -64 A 0.088 -65 V 0.097 -66 S 0.113 -67 I 0.134 -68 D 0.156 -69 L 0.169 -70 D 0.165 -71 R 0.144 -72 N 0.122 -73 G 0.110 -74 L 0.111 -75 R 0.127 -76 F 0.158 -77 L 0.190 -78 G 0.202 -79 E 0.187 -80 R 0.154 -81 A 0.121 -82 F 0.098 -83 G 0.086 -84 T 0.078 -85 L 0.072 -86 P 0.069 -87 S 0.068 -88 L 0.071 -89 R 0.082 -90 R 0.096 -91 L 0.113 -92 S 0.131 -93 L 0.149 -94 R 0.154 -95 H 0.139 -96 N 0.115 -97 N 0.099 -98 L 0.101 -99 S 0.122 -100 F 0.150 -101 I 0.170 -102 T 0.176 -103 P 0.170 -104 G 0.151 -105 A 0.120 -106 F 0.091 -107 K 0.076 -108 G 0.073 -109 L 0.079 -110 P 0.088 -111 R 0.095 -112 L 0.099 -113 A 0.107 -114 E 0.120 -115 L 0.132 -116 R 0.143 -117 L 0.153 -118 A 0.156 -119 H 0.147 -120 N 0.130 -121 G 0.117 -122 D 0.108 -123 L 0.102 -124 R 0.104 -125 Y 0.113 -126 L 0.121 -127 H 0.119 -128 A 0.111 -129 R 0.097 -130 T 0.080 -131 F 0.067 -132 A 0.059 -133 A 0.056 -134 L 0.059 -135 S 0.068 -136 R 0.076 -137 L 0.081 -138 R 0.086 -139 R 0.095 -140 L 0.104 -141 D 0.113 -142 L 0.124 -143 A 0.135 -144 A 0.133 -145 C 0.118 -146 R 0.101 -147 L 0.092 -148 F 0.099 -149 S 0.118 -150 V 0.137 -151 P 0.141 -152 E 0.131 -153 R 0.116 -154 L 0.100 -155 L 0.087 -156 A 0.079 -157 E 0.074 -158 L 0.074 -159 P 0.074 -160 A 0.074 -161 L 0.076 -162 R 0.087 -163 E 0.105 -164 L 0.123 -165 A 0.136 -166 A 0.143 -167 F 0.143 -168 D 0.132 -169 N 0.111 -170 L 0.092 -171 F 0.084 -172 R 0.087 -173 R 0.095 -174 V 0.104 -175 P 0.114 -176 G 0.123 -177 A 0.126 -178 L 0.123 -179 R 0.115 -180 G 0.107 -181 L 0.107 -182 A 0.113 -183 N 0.111 -184 L 0.102 -185 T 0.101 -186 H 0.114 -187 A 0.132 -188 H 0.146 -189 L 0.155 -190 E 0.155 -191 R 0.143 -192 G 0.124 -193 R 0.111 -194 I 0.111 -195 E 0.124 -196 A 0.140 -197 V 0.146 -198 A 0.140 -199 S 0.124 -200 S 0.102 -201 S 0.084 -202 L 0.077 -203 Q 0.079 -204 G 0.085 -205 L 0.091 -206 R 0.095 -207 R 0.095 -208 L 0.091 -209 R 0.090 -210 S 0.098 -211 L 0.112 -212 S 0.131 -213 L 0.153 -214 Q 0.160 -215 A 0.145 -216 N 0.116 -217 R 0.096 -218 V 0.095 -219 R 0.113 -220 A 0.140 -221 V 0.160 -222 H 0.164 -223 A 0.157 -224 G 0.139 -225 A 0.113 -226 F 0.087 -227 G 0.069 -228 D 0.057 -229 C 0.053 -230 G 0.057 -231 V 0.066 -232 L 0.085 -233 E 0.111 -234 H 0.134 -235 L 0.144 -236 L 0.144 -237 L 0.142 -238 N 0.142 -239 D 0.136 -240 N 0.125 -241 L 0.118 -242 L 0.121 -243 A 0.132 -244 E 0.151 -245 L 0.168 -246 P 0.167 -247 A 0.148 -248 D 0.123 -249 A 0.100 -250 F 0.087 -251 R 0.083 -252 G 0.086 -253 L 0.096 -254 R 0.110 -255 R 0.119 -256 L 0.119 -257 R 0.119 -258 T 0.124 -259 L 0.134 -260 N 0.142 -261 L 0.144 -262 G 0.138 -263 G 0.123 -264 N 0.103 -265 A 0.085 -266 L 0.077 -267 D 0.077 -268 R 0.079 -269 V 0.081 -270 A 0.082 -271 R 0.080 -272 A 0.071 -273 W 0.058 -274 F 0.054 -275 A 0.057 -276 D 0.065 -277 L 0.077 -278 A 0.092 -279 E 0.104 -280 L 0.113 -281 E 0.120 -282 L 0.128 -283 L 0.134 -284 Y 0.139 -285 L 0.142 -286 D 0.141 -287 R 0.131 -288 N 0.119 -289 S 0.116 -290 I 0.128 -291 A 0.154 -292 F 0.184 -293 V 0.201 -294 E 0.200 -295 E 0.191 -296 G 0.174 -297 A 0.151 -298 F 0.132 -299 Q 0.127 -300 N 0.131 -301 L 0.140 -302 S 0.153 -303 G 0.163 -304 L 0.166 -305 L 0.163 -306 A 0.163 -307 L 0.166 -308 H 0.169 -309 L 0.169 -310 N 0.161 -311 G 0.143 -312 N 0.121 -313 R 0.105 -314 L 0.101 -315 T 0.111 -316 V 0.127 -317 L 0.132 -318 A 0.118 -319 W 0.097 -320 V 0.084 -321 A 0.081 -322 F 0.091 -323 Q 0.112 -324 P 0.126 -325 G 0.125 -326 F 0.119 -327 F 0.125 -328 L 0.148 -329 G 0.173 -330 R 0.190 -331 L 0.199 -332 F 0.206 -333 L 0.214 -334 F 0.209 -335 R 0.179 -336 N 0.133 -337 P 0.092 -338 W 0.066 -339 C 0.054 -340 C 0.054 -341 D 0.063 -342 C 0.074 -343 R 0.079 -344 L 0.071 -345 E 0.056 -346 W 0.045 -347 L 0.043 -348 R 0.047 -349 D 0.052 -350 W 0.058 -351 M 0.069 -352 E 0.084 -353 G 0.100 -354 S 0.109 -355 G 0.108 -356 R 0.101 -357 V 0.093 -358 T 0.088 -359 D 0.089 -360 V 0.091 -361 P 0.085 -362 C 0.074 -363 A 0.065 -364 S 0.065 -365 P 0.077 -366 G 0.091 -367 S 0.097 -368 V 0.096 -369 A 0.094 -370 G 0.094 -371 L 0.096 -372 D 0.095 -373 L 0.094 -374 S 0.097 -375 Q 0.111 -376 V 0.138 -377 T 0.177 -378 F 0.228 -379 G 0.282 -380 R 0.319 -381 S 0.328 -382 S 0.313 -383 D 0.289 -384 G 0.263 -385 L 0.245 -386 C 0.247 -387 V 0.276 -388 D 0.330 -389 P 0.393 -390 E 0.453 -391 E 0.507 -392 L 0.555 -393 N 0.600 -394 L 0.639 -395 T 0.665 -396 T 0.672 -397 S 0.664 -398 S 0.657 -399 P 0.653 -400 G 0.652 -401 P 0.650 -402 S 0.650 -403 P 0.658 -404 E 0.676 -405 P 0.695 -406 A 0.701 -407 A 0.688 -408 T 0.660 -409 T 0.624 -410 V 0.581 -411 S 0.524 -412 R 0.455 -413 F 0.385 -414 S 0.328 -415 S 0.297 -416 L 0.297 -417 L 0.315 -418 S 0.337 -419 K 0.361 -420 L 0.402 -421 L 0.467 -422 A 0.542 -423 P 0.608 -424 R 0.658 -425 V 0.692 -426 P 0.719 -427 V 0.741 -428 E 0.758 -429 E 0.767 -430 A 0.772 -431 A 0.774 -432 N 0.774 -433 T 0.776 -434 T 0.781 -435 G 0.786 -436 G 0.782 -437 L 0.760 -438 A 0.711 -439 N 0.640 -440 A 0.581 -441 S 0.545 -442 L 0.505 -443 S 0.465 -444 D 0.471 -445 S 0.510 -446 L 0.533 -447 S 0.550 -448 S 0.600 -449 R 0.669 -450 G 0.719 -451 V 0.741 -452 G 0.746 -453 G 0.741 -454 A 0.727 -455 G 0.701 -456 R 0.671 -457 Q 0.650 -458 P 0.643 -459 W 0.650 -460 F 0.662 -461 L 0.659 -462 L 0.632 -463 A 0.586 -464 S 0.541 -465 C 0.521 -466 L 0.533 -467 L 0.560 -468 P 0.587 -469 S 0.595 -470 V 0.560 -471 A 0.488 -472 Q 0.436 -473 H 0.444 -474 V 0.491 -475 V 0.533 -476 F 0.561 -477 G 0.579 -478 L 0.578 -479 Q 0.548 -480 M 0.499 -481 D 0.460 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000196240.6_ENST00000641925.2_GN:OR2T2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000196240.6_ENST00000641925.2_GN:OR2T2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 8c3a6d94de8d10ef9f5e50a8dbaa6faf4b8d9a3a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000196240.6_ENST00000641925.2_GN:OR2T2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,325 +0,0 @@ ->ENSG00000196240.6|ENST00000641925.2|GN:OR2T2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.404 -2 G 0.419 -3 M 0.448 -4 E 0.482 -5 G 0.501 -6 L 0.498 -7 L 0.480 -8 Q 0.452 -9 N 0.405 -10 S 0.335 -11 T 0.255 -12 N 0.192 -13 F 0.158 -14 V 0.146 -15 L 0.144 -16 T 0.148 -17 G 0.157 -18 L 0.171 -19 I 0.191 -20 T 0.213 -21 H 0.221 -22 P 0.201 -23 A 0.161 -24 F 0.122 -25 P 0.092 -26 G 0.071 -27 L 0.056 -28 L 0.048 -29 F 0.044 -30 A 0.042 -31 I 0.042 -32 V 0.042 -33 F 0.042 -34 S 0.041 -35 I 0.041 -36 F 0.041 -37 V 0.043 -38 V 0.050 -39 A 0.055 -40 I 0.056 -41 T 0.056 -42 A 0.061 -43 N 0.067 -44 L 0.072 -45 V 0.073 -46 M 0.070 -47 I 0.063 -48 L 0.059 -49 L 0.059 -50 I 0.062 -51 H 0.066 -52 M 0.072 -53 D 0.078 -54 S 0.079 -55 R 0.074 -56 L 0.066 -57 H 0.059 -58 T 0.053 -59 P 0.045 -60 M 0.037 -61 Y 0.031 -62 F 0.028 -63 L 0.028 -64 L 0.032 -65 S 0.040 -66 Q 0.048 -67 L 0.053 -68 S 0.057 -69 I 0.060 -70 M 0.064 -71 D 0.072 -72 T 0.076 -73 I 0.071 -74 Y 0.060 -75 I 0.052 -76 C 0.048 -77 I 0.050 -78 T 0.055 -79 V 0.059 -80 P 0.058 -81 K 0.054 -82 M 0.052 -83 L 0.050 -84 Q 0.049 -85 D 0.050 -86 L 0.057 -87 L 0.071 -88 S 0.088 -89 K 0.099 -90 D 0.096 -91 K 0.082 -92 T 0.067 -93 I 0.055 -94 S 0.046 -95 F 0.041 -96 L 0.040 -97 G 0.041 -98 C 0.041 -99 A 0.038 -100 V 0.037 -101 Q 0.038 -102 I 0.040 -103 F 0.040 -104 L 0.038 -105 Y 0.034 -106 L 0.031 -107 T 0.031 -108 L 0.035 -109 I 0.039 -110 G 0.043 -111 G 0.045 -112 E 0.044 -113 F 0.040 -114 F 0.036 -115 L 0.034 -116 L 0.033 -117 G 0.033 -118 L 0.033 -119 M 0.033 -120 A 0.035 -121 Y 0.038 -122 D 0.043 -123 R 0.044 -124 Y 0.042 -125 V 0.040 -126 A 0.041 -127 V 0.046 -128 C 0.053 -129 N 0.059 -130 P 0.060 -131 L 0.057 -132 R 0.051 -133 Y 0.049 -134 P 0.050 -135 L 0.056 -136 L 0.063 -137 M 0.066 -138 N 0.066 -139 R 0.068 -140 R 0.067 -141 V 0.061 -142 C 0.057 -143 L 0.061 -144 F 0.068 -145 M 0.066 -146 V 0.058 -147 V 0.055 -148 G 0.059 -149 S 0.063 -150 W 0.065 -151 V 0.068 -152 G 0.074 -153 G 0.077 -154 S 0.078 -155 L 0.082 -156 D 0.086 -157 G 0.085 -158 F 0.082 -159 M 0.085 -160 L 0.094 -161 T 0.099 -162 P 0.098 -163 V 0.096 -164 T 0.094 -165 M 0.095 -166 S 0.101 -167 F 0.106 -168 P 0.106 -169 F 0.103 -170 C 0.105 -171 R 0.114 -172 S 0.127 -173 R 0.141 -174 E 0.151 -175 I 0.148 -176 N 0.129 -177 H 0.104 -178 F 0.082 -179 F 0.068 -180 C 0.064 -181 E 0.072 -182 I 0.090 -183 P 0.109 -184 A 0.121 -185 V 0.127 -186 L 0.132 -187 K 0.135 -188 L 0.132 -189 S 0.121 -190 C 0.113 -191 T 0.116 -192 D 0.121 -193 T 0.117 -194 S 0.105 -195 L 0.093 -196 Y 0.092 -197 E 0.098 -198 T 0.104 -199 L 0.104 -200 M 0.098 -201 Y 0.088 -202 A 0.078 -203 C 0.070 -204 C 0.062 -205 V 0.054 -206 L 0.050 -207 M 0.052 -208 L 0.058 -209 L 0.070 -210 I 0.080 -211 P 0.082 -212 L 0.077 -213 S 0.075 -214 V 0.081 -215 I 0.084 -216 S 0.077 -217 V 0.065 -218 S 0.055 -219 Y 0.050 -220 T 0.050 -221 H 0.055 -222 I 0.064 -223 L 0.073 -224 L 0.080 -225 T 0.080 -226 V 0.078 -227 H 0.081 -228 R 0.096 -229 M 0.119 -230 N 0.139 -231 S 0.144 -232 A 0.133 -233 E 0.113 -234 G 0.092 -235 R 0.076 -236 R 0.068 -237 K 0.069 -238 A 0.072 -239 F 0.074 -240 A 0.077 -241 T 0.081 -242 C 0.084 -243 S 0.086 -244 S 0.087 -245 H 0.084 -246 I 0.077 -247 M 0.070 -248 V 0.066 -249 V 0.059 -250 S 0.047 -251 V 0.035 -252 F 0.029 -253 Y 0.029 -254 G 0.032 -255 A 0.035 -256 A 0.037 -257 F 0.038 -258 Y 0.043 -259 T 0.054 -260 N 0.072 -261 V 0.095 -262 L 0.120 -263 P 0.141 -264 H 0.154 -265 S 0.159 -266 Y 0.160 -267 H 0.156 -268 T 0.142 -269 P 0.123 -270 E 0.109 -271 K 0.101 -272 D 0.096 -273 K 0.092 -274 V 0.088 -275 V 0.082 -276 S 0.074 -277 A 0.066 -278 F 0.066 -279 Y 0.074 -280 T 0.086 -281 I 0.096 -282 L 0.104 -283 T 0.107 -284 P 0.100 -285 M 0.089 -286 L 0.079 -287 N 0.072 -288 P 0.065 -289 L 0.061 -290 I 0.062 -291 Y 0.066 -292 S 0.075 -293 L 0.090 -294 R 0.102 -295 N 0.099 -296 K 0.084 -297 D 0.072 -298 V 0.071 -299 A 0.080 -300 A 0.090 -301 A 0.092 -302 L 0.086 -303 R 0.080 -304 K 0.085 -305 V 0.109 -306 L 0.160 -307 G 0.235 -308 R 0.325 -309 C 0.411 -310 G 0.473 -311 S 0.505 -312 S 0.519 -313 Q 0.523 -314 S 0.512 -315 I 0.487 -316 R 0.456 -317 V 0.421 -318 A 0.386 -319 T 0.376 -320 V 0.399 -321 I 0.421 -322 R 0.413 -323 K 0.389 -324 G 0.371 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000196240.6_ENST00000641925.2_GN:OR2T2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:31.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000196240.6_ENST00000641925.2_GN:OR2T2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:31.caid deleted file mode 100644 index 45f74cfeee7b73f5df9752dfb69edf7f82d64a5f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000196240.6_ENST00000641925.2_GN:OR2T2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:31.caid +++ /dev/null @@ -1,356 +0,0 @@ ->ENSG00000196240.6|ENST00000641925.2|GN:OR2T2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:31 -1 M 0.234 -2 N 0.217 -3 C 0.193 -4 S 0.175 -5 K 0.167 -6 L 0.169 -7 F 0.182 -8 S 0.213 -9 L 0.257 -10 V 0.299 -11 E 0.333 -12 E 0.353 -13 P 0.352 -14 V 0.329 -15 T 0.301 -16 S 0.282 -17 L 0.273 -18 G 0.268 -19 D 0.263 -20 L 0.259 -21 F 0.270 -22 N 0.300 -23 F 0.340 -24 R 0.370 -25 P 0.378 -26 R 0.369 -27 S 0.351 -28 L 0.333 -29 S 0.317 -30 W 0.311 -31 T 0.327 -32 M 0.364 -33 G 0.408 -34 M 0.446 -35 E 0.474 -36 G 0.489 -37 L 0.487 -38 L 0.471 -39 Q 0.442 -40 N 0.394 -41 S 0.324 -42 T 0.249 -43 N 0.189 -44 F 0.159 -45 V 0.149 -46 L 0.148 -47 T 0.152 -48 G 0.160 -49 L 0.174 -50 I 0.195 -51 T 0.218 -52 H 0.226 -53 P 0.205 -54 A 0.164 -55 F 0.123 -56 P 0.093 -57 G 0.071 -58 L 0.056 -59 L 0.047 -60 F 0.043 -61 A 0.041 -62 I 0.040 -63 V 0.041 -64 F 0.040 -65 S 0.040 -66 I 0.041 -67 F 0.041 -68 V 0.043 -69 V 0.050 -70 A 0.055 -71 I 0.055 -72 T 0.055 -73 A 0.059 -74 N 0.066 -75 L 0.070 -76 V 0.071 -77 M 0.068 -78 I 0.062 -79 L 0.057 -80 L 0.056 -81 I 0.058 -82 H 0.061 -83 M 0.067 -84 D 0.073 -85 S 0.073 -86 R 0.068 -87 L 0.060 -88 H 0.053 -89 T 0.048 -90 P 0.041 -91 M 0.034 -92 Y 0.029 -93 F 0.026 -94 L 0.026 -95 L 0.032 -96 S 0.041 -97 Q 0.049 -98 L 0.054 -99 S 0.058 -100 I 0.061 -101 M 0.064 -102 D 0.071 -103 T 0.076 -104 I 0.071 -105 Y 0.061 -106 I 0.051 -107 C 0.047 -108 I 0.047 -109 T 0.050 -110 V 0.053 -111 P 0.051 -112 K 0.047 -113 M 0.045 -114 L 0.043 -115 Q 0.041 -116 D 0.042 -117 L 0.048 -118 L 0.062 -119 S 0.079 -120 K 0.091 -121 D 0.090 -122 K 0.078 -123 T 0.064 -124 I 0.053 -125 S 0.044 -126 F 0.038 -127 L 0.038 -128 G 0.039 -129 C 0.040 -130 A 0.037 -131 V 0.035 -132 Q 0.036 -133 I 0.037 -134 F 0.038 -135 L 0.036 -136 Y 0.033 -137 L 0.030 -138 T 0.031 -139 L 0.034 -140 I 0.039 -141 G 0.042 -142 G 0.044 -143 E 0.043 -144 F 0.039 -145 F 0.035 -146 L 0.033 -147 L 0.032 -148 G 0.032 -149 L 0.031 -150 M 0.032 -151 A 0.033 -152 Y 0.037 -153 D 0.042 -154 R 0.044 -155 Y 0.042 -156 V 0.040 -157 A 0.041 -158 V 0.045 -159 C 0.052 -160 N 0.058 -161 P 0.060 -162 L 0.056 -163 R 0.051 -164 Y 0.049 -165 P 0.051 -166 L 0.057 -167 L 0.063 -168 M 0.067 -169 N 0.067 -170 R 0.068 -171 R 0.066 -172 V 0.060 -173 C 0.054 -174 L 0.058 -175 F 0.064 -176 M 0.063 -177 V 0.055 -178 V 0.052 -179 G 0.056 -180 S 0.060 -181 W 0.063 -182 V 0.066 -183 G 0.072 -184 G 0.076 -185 S 0.078 -186 L 0.082 -187 D 0.086 -188 G 0.085 -189 F 0.081 -190 M 0.083 -191 L 0.091 -192 T 0.097 -193 P 0.098 -194 V 0.095 -195 T 0.094 -196 M 0.095 -197 S 0.101 -198 F 0.107 -199 P 0.107 -200 F 0.103 -201 C 0.103 -202 R 0.111 -203 S 0.123 -204 R 0.137 -205 E 0.147 -206 I 0.144 -207 N 0.125 -208 H 0.100 -209 F 0.079 -210 F 0.066 -211 C 0.063 -212 E 0.072 -213 I 0.090 -214 P 0.108 -215 A 0.119 -216 V 0.124 -217 L 0.128 -218 K 0.131 -219 L 0.127 -220 S 0.116 -221 C 0.108 -222 T 0.110 -223 D 0.115 -224 T 0.112 -225 S 0.100 -226 L 0.088 -227 Y 0.086 -228 E 0.092 -229 T 0.099 -230 L 0.099 -231 M 0.091 -232 Y 0.081 -233 A 0.073 -234 C 0.066 -235 C 0.059 -236 V 0.052 -237 L 0.049 -238 M 0.051 -239 L 0.057 -240 L 0.067 -241 I 0.077 -242 P 0.079 -243 L 0.075 -244 S 0.073 -245 V 0.080 -246 I 0.084 -247 S 0.077 -248 V 0.064 -249 S 0.054 -250 Y 0.049 -251 T 0.049 -252 H 0.054 -253 I 0.062 -254 L 0.072 -255 L 0.079 -256 T 0.080 -257 V 0.077 -258 H 0.081 -259 R 0.095 -260 M 0.117 -261 N 0.137 -262 S 0.143 -263 A 0.132 -264 E 0.112 -265 G 0.092 -266 R 0.076 -267 R 0.069 -268 K 0.070 -269 A 0.072 -270 F 0.074 -271 A 0.077 -272 T 0.081 -273 C 0.083 -274 S 0.085 -275 S 0.086 -276 H 0.083 -277 I 0.077 -278 M 0.072 -279 V 0.067 -280 V 0.060 -281 S 0.047 -282 V 0.036 -283 F 0.029 -284 Y 0.029 -285 G 0.032 -286 A 0.035 -287 A 0.036 -288 F 0.037 -289 Y 0.041 -290 T 0.050 -291 N 0.066 -292 V 0.090 -293 L 0.119 -294 P 0.144 -295 H 0.160 -296 S 0.167 -297 Y 0.169 -298 H 0.163 -299 T 0.147 -300 P 0.128 -301 E 0.114 -302 K 0.107 -303 D 0.102 -304 K 0.097 -305 V 0.093 -306 V 0.088 -307 S 0.079 -308 A 0.071 -309 F 0.070 -310 Y 0.078 -311 T 0.089 -312 I 0.099 -313 L 0.107 -314 T 0.109 -315 P 0.103 -316 M 0.091 -317 L 0.081 -318 N 0.073 -319 P 0.066 -320 L 0.062 -321 I 0.064 -322 Y 0.067 -323 S 0.075 -324 L 0.089 -325 R 0.101 -326 N 0.099 -327 K 0.085 -328 D 0.072 -329 V 0.070 -330 A 0.079 -331 A 0.089 -332 A 0.091 -333 L 0.086 -334 R 0.081 -335 K 0.086 -336 V 0.110 -337 L 0.162 -338 G 0.238 -339 R 0.329 -340 C 0.417 -341 G 0.481 -342 S 0.516 -343 S 0.532 -344 Q 0.539 -345 S 0.532 -346 I 0.512 -347 R 0.484 -348 V 0.447 -349 A 0.409 -350 T 0.399 -351 V 0.423 -352 I 0.443 -353 R 0.430 -354 K 0.400 -355 G 0.378 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000196248.6_ENST00000641123.1_GN:OR10S1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000196248.6_ENST00000641123.1_GN:OR10S1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 7ffd85e759ac8846108a970ee6757d7b912779d6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000196248.6_ENST00000641123.1_GN:OR10S1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,323 +0,0 @@ ->ENSG00000196248.6|ENST00000641123.1|GN:OR10S1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.361 -2 T 0.374 -3 M 0.401 -4 T 0.436 -5 T 0.465 -6 E 0.484 -7 N 0.495 -8 P 0.495 -9 N 0.475 -10 Q 0.433 -11 T 0.375 -12 V 0.306 -13 V 0.233 -14 S 0.172 -15 H 0.134 -16 F 0.115 -17 F 0.111 -18 L 0.118 -19 E 0.136 -20 G 0.156 -21 L 0.165 -22 R 0.159 -23 Y 0.148 -24 T 0.144 -25 A 0.140 -26 K 0.128 -27 H 0.106 -28 S 0.082 -29 S 0.060 -30 L 0.049 -31 F 0.050 -32 F 0.060 -33 L 0.064 -34 L 0.057 -35 F 0.045 -36 L 0.039 -37 L 0.041 -38 I 0.046 -39 Y 0.050 -40 S 0.052 -41 I 0.054 -42 T 0.057 -43 V 0.057 -44 A 0.058 -45 G 0.062 -46 N 0.067 -47 L 0.069 -48 L 0.069 -49 I 0.065 -50 L 0.060 -51 L 0.061 -52 T 0.070 -53 V 0.085 -54 G 0.100 -55 S 0.108 -56 D 0.106 -57 S 0.098 -58 H 0.092 -59 L 0.087 -60 S 0.079 -61 L 0.067 -62 P 0.051 -63 M 0.038 -64 Y 0.029 -65 H 0.025 -66 F 0.024 -67 L 0.029 -68 G 0.037 -69 H 0.045 -70 L 0.051 -71 S 0.054 -72 F 0.055 -73 L 0.060 -74 D 0.069 -75 A 0.076 -76 C 0.073 -77 L 0.062 -78 S 0.053 -79 T 0.049 -80 V 0.049 -81 T 0.050 -82 V 0.051 -83 P 0.052 -84 K 0.052 -85 V 0.052 -86 M 0.052 -87 A 0.052 -88 G 0.055 -89 L 0.064 -90 L 0.079 -91 T 0.097 -92 L 0.115 -93 D 0.122 -94 G 0.115 -95 K 0.097 -96 V 0.076 -97 I 0.059 -98 S 0.048 -99 F 0.042 -100 E 0.040 -101 G 0.041 -102 C 0.039 -103 A 0.037 -104 V 0.035 -105 Q 0.035 -106 L 0.036 -107 Y 0.035 -108 C 0.033 -109 F 0.029 -110 H 0.026 -111 F 0.026 -112 L 0.029 -113 A 0.032 -114 S 0.036 -115 T 0.039 -116 E 0.039 -117 C 0.036 -118 F 0.031 -119 L 0.028 -120 Y 0.027 -121 T 0.028 -122 V 0.028 -123 M 0.029 -124 A 0.032 -125 Y 0.036 -126 D 0.041 -127 R 0.045 -128 Y 0.045 -129 L 0.045 -130 A 0.046 -131 I 0.051 -132 C 0.057 -133 Q 0.063 -134 P 0.065 -135 L 0.063 -136 H 0.061 -137 Y 0.060 -138 P 0.063 -139 V 0.069 -140 A 0.076 -141 M 0.078 -142 N 0.076 -143 R 0.074 -144 R 0.070 -145 M 0.062 -146 C 0.058 -147 A 0.064 -148 E 0.072 -149 M 0.071 -150 A 0.062 -151 G 0.055 -152 I 0.055 -153 T 0.061 -154 W 0.071 -155 A 0.078 -156 I 0.081 -157 G 0.080 -158 A 0.076 -159 T 0.075 -160 H 0.076 -161 A 0.077 -162 A 0.075 -163 I 0.073 -164 H 0.074 -165 T 0.074 -166 S 0.072 -167 L 0.072 -168 T 0.074 -169 F 0.080 -170 R 0.090 -171 L 0.097 -172 L 0.096 -173 Y 0.091 -174 C 0.091 -175 G 0.100 -176 P 0.114 -177 C 0.129 -178 H 0.140 -179 I 0.139 -180 A 0.121 -181 Y 0.095 -182 F 0.074 -183 F 0.064 -184 C 0.063 -185 D 0.075 -186 I 0.096 -187 P 0.117 -188 P 0.128 -189 V 0.128 -190 L 0.126 -191 K 0.125 -192 L 0.122 -193 A 0.114 -194 C 0.108 -195 T 0.112 -196 D 0.121 -197 T 0.123 -198 T 0.116 -199 I 0.107 -200 N 0.100 -201 E 0.094 -202 L 0.090 -203 V 0.088 -204 M 0.087 -205 L 0.086 -206 A 0.084 -207 S 0.081 -208 I 0.075 -209 G 0.069 -210 I 0.068 -211 V 0.071 -212 A 0.073 -213 A 0.075 -214 G 0.081 -215 C 0.091 -216 L 0.099 -217 I 0.099 -218 L 0.094 -219 I 0.083 -220 V 0.070 -221 I 0.057 -222 S 0.047 -223 Y 0.040 -224 I 0.038 -225 F 0.042 -226 I 0.053 -227 V 0.067 -228 A 0.077 -229 A 0.077 -230 V 0.070 -231 L 0.069 -232 R 0.078 -233 I 0.093 -234 R 0.107 -235 T 0.117 -236 A 0.124 -237 Q 0.125 -238 G 0.119 -239 R 0.109 -240 Q 0.105 -241 R 0.110 -242 A 0.119 -243 F 0.127 -244 S 0.127 -245 P 0.116 -246 C 0.099 -247 T 0.085 -248 A 0.076 -249 Q 0.070 -250 L 0.066 -251 T 0.067 -252 G 0.067 -253 V 0.057 -254 L 0.040 -255 L 0.027 -256 Y 0.023 -257 Y 0.028 -258 V 0.037 -259 P 0.042 -260 P 0.042 -261 V 0.040 -262 C 0.042 -263 I 0.054 -264 Y 0.078 -265 L 0.120 -266 Q 0.176 -267 P 0.233 -268 R 0.276 -269 S 0.300 -270 S 0.308 -271 E 0.301 -272 A 0.282 -273 G 0.255 -274 A 0.222 -275 G 0.186 -276 A 0.150 -277 P 0.117 -278 A 0.093 -279 V 0.080 -280 F 0.081 -281 Y 0.090 -282 T 0.102 -283 I 0.113 -284 V 0.120 -285 T 0.122 -286 P 0.114 -287 M 0.100 -288 L 0.090 -289 N 0.082 -290 P 0.074 -291 F 0.070 -292 I 0.069 -293 Y 0.069 -294 T 0.075 -295 L 0.090 -296 R 0.103 -297 N 0.099 -298 K 0.084 -299 E 0.070 -300 V 0.068 -301 K 0.076 -302 H 0.086 -303 A 0.088 -304 L 0.080 -305 Q 0.070 -306 R 0.064 -307 L 0.065 -308 L 0.080 -309 C 0.122 -310 S 0.190 -311 S 0.262 -312 F 0.317 -313 R 0.357 -314 E 0.390 -315 S 0.411 -316 T 0.412 -317 A 0.415 -318 G 0.434 -319 S 0.453 -320 P 0.446 -321 P 0.420 -322 P 0.398 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000196248.6_ENST00000641123.1_GN:OR10S1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000196248.6_ENST00000641123.1_GN:OR10S1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid deleted file mode 100644 index c8ce7c91d1e36e5e5439200466cc115abff66199..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000196248.6_ENST00000641123.1_GN:OR10S1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid +++ /dev/null @@ -1,353 +0,0 @@ ->ENSG00000196248.6|ENST00000641123.1|GN:OR10S1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:30 -1 M 0.251 -2 T 0.251 -3 S 0.261 -4 Q 0.280 -5 E 0.289 -6 R 0.282 -7 D 0.270 -8 T 0.262 -9 A 0.258 -10 I 0.252 -11 Y 0.245 -12 S 0.238 -13 I 0.228 -14 N 0.209 -15 V 0.187 -16 S 0.176 -17 F 0.183 -18 V 0.207 -19 A 0.246 -20 K 0.290 -21 G 0.322 -22 M 0.324 -23 T 0.302 -24 S 0.269 -25 R 0.239 -26 S 0.224 -27 V 0.222 -28 C 0.230 -29 E 0.246 -30 K 0.276 -31 M 0.312 -32 T 0.348 -33 M 0.385 -34 T 0.421 -35 T 0.449 -36 E 0.468 -37 N 0.480 -38 P 0.482 -39 N 0.469 -40 Q 0.436 -41 T 0.384 -42 V 0.313 -43 V 0.237 -44 S 0.175 -45 H 0.135 -46 F 0.117 -47 F 0.113 -48 L 0.120 -49 E 0.138 -50 G 0.158 -51 L 0.167 -52 R 0.161 -53 Y 0.151 -54 T 0.145 -55 A 0.142 -56 K 0.130 -57 H 0.107 -58 S 0.082 -59 S 0.060 -60 L 0.049 -61 F 0.051 -62 F 0.061 -63 L 0.065 -64 L 0.057 -65 F 0.045 -66 L 0.039 -67 L 0.040 -68 I 0.045 -69 Y 0.049 -70 S 0.050 -71 I 0.052 -72 T 0.055 -73 V 0.056 -74 A 0.057 -75 G 0.062 -76 N 0.067 -77 L 0.069 -78 L 0.068 -79 I 0.064 -80 L 0.059 -81 L 0.059 -82 T 0.066 -83 V 0.078 -84 G 0.091 -85 S 0.100 -86 D 0.099 -87 S 0.093 -88 H 0.086 -89 L 0.080 -90 S 0.072 -91 L 0.061 -92 P 0.047 -93 M 0.035 -94 Y 0.027 -95 H 0.023 -96 F 0.024 -97 L 0.029 -98 G 0.038 -99 H 0.047 -100 L 0.053 -101 S 0.055 -102 F 0.055 -103 L 0.060 -104 D 0.070 -105 A 0.078 -106 C 0.074 -107 L 0.063 -108 S 0.052 -109 T 0.048 -110 V 0.047 -111 T 0.047 -112 V 0.047 -113 P 0.046 -114 K 0.045 -115 V 0.045 -116 M 0.045 -117 A 0.045 -118 G 0.047 -119 L 0.055 -120 L 0.070 -121 T 0.090 -122 L 0.110 -123 D 0.120 -124 G 0.114 -125 K 0.096 -126 V 0.074 -127 I 0.058 -128 S 0.047 -129 F 0.040 -130 E 0.039 -131 G 0.039 -132 C 0.038 -133 A 0.036 -134 V 0.034 -135 Q 0.034 -136 L 0.035 -137 Y 0.035 -138 C 0.033 -139 F 0.028 -140 H 0.026 -141 F 0.026 -142 L 0.029 -143 A 0.032 -144 S 0.035 -145 T 0.038 -146 E 0.038 -147 C 0.035 -148 F 0.030 -149 L 0.027 -150 Y 0.027 -151 T 0.027 -152 V 0.028 -153 M 0.029 -154 A 0.031 -155 Y 0.036 -156 D 0.041 -157 R 0.045 -158 Y 0.045 -159 L 0.045 -160 A 0.046 -161 I 0.050 -162 C 0.057 -163 Q 0.063 -164 P 0.065 -165 L 0.063 -166 H 0.061 -167 Y 0.061 -168 P 0.064 -169 V 0.070 -170 A 0.077 -171 M 0.080 -172 N 0.078 -173 R 0.075 -174 R 0.070 -175 M 0.061 -176 C 0.057 -177 A 0.063 -178 E 0.071 -179 M 0.070 -180 A 0.061 -181 G 0.054 -182 I 0.051 -183 T 0.051 -184 W 0.053 -185 A 0.056 -186 I 0.063 -187 G 0.070 -188 A 0.073 -189 T 0.074 -190 H 0.076 -191 A 0.077 -192 A 0.075 -193 I 0.074 -194 H 0.075 -195 T 0.074 -196 S 0.073 -197 L 0.073 -198 T 0.074 -199 F 0.079 -200 R 0.088 -201 L 0.095 -202 L 0.092 -203 Y 0.085 -204 C 0.084 -205 G 0.092 -206 P 0.105 -207 C 0.119 -208 H 0.131 -209 I 0.131 -210 A 0.115 -211 Y 0.090 -212 F 0.071 -213 F 0.062 -214 C 0.063 -215 D 0.075 -216 I 0.095 -217 P 0.115 -218 P 0.125 -219 V 0.125 -220 L 0.123 -221 K 0.123 -222 L 0.119 -223 A 0.109 -224 C 0.101 -225 T 0.105 -226 D 0.114 -227 T 0.117 -228 T 0.111 -229 I 0.102 -230 N 0.094 -231 E 0.088 -232 L 0.084 -233 V 0.084 -234 M 0.084 -235 L 0.082 -236 A 0.081 -237 S 0.078 -238 I 0.073 -239 G 0.067 -240 I 0.067 -241 V 0.070 -242 A 0.072 -243 A 0.074 -244 G 0.080 -245 C 0.090 -246 L 0.097 -247 I 0.097 -248 L 0.092 -249 I 0.082 -250 V 0.070 -251 I 0.057 -252 S 0.047 -253 Y 0.040 -254 I 0.038 -255 F 0.042 -256 I 0.053 -257 V 0.067 -258 A 0.078 -259 A 0.077 -260 V 0.070 -261 L 0.069 -262 R 0.077 -263 I 0.091 -264 R 0.105 -265 T 0.116 -266 A 0.123 -267 Q 0.125 -268 G 0.119 -269 R 0.110 -270 Q 0.107 -271 R 0.112 -272 A 0.121 -273 F 0.128 -274 S 0.128 -275 P 0.117 -276 C 0.100 -277 T 0.085 -278 A 0.076 -279 Q 0.069 -280 L 0.065 -281 T 0.066 -282 G 0.066 -283 V 0.056 -284 L 0.040 -285 L 0.027 -286 Y 0.023 -287 Y 0.028 -288 V 0.036 -289 P 0.042 -290 P 0.042 -291 V 0.039 -292 C 0.041 -293 I 0.052 -294 Y 0.076 -295 L 0.119 -296 Q 0.177 -297 P 0.237 -298 R 0.282 -299 S 0.308 -300 S 0.316 -301 E 0.308 -302 A 0.289 -303 G 0.261 -304 A 0.228 -305 G 0.192 -306 A 0.155 -307 P 0.123 -308 A 0.098 -309 V 0.086 -310 F 0.086 -311 Y 0.095 -312 T 0.106 -313 I 0.116 -314 V 0.123 -315 T 0.125 -316 P 0.117 -317 M 0.103 -318 L 0.093 -319 N 0.085 -320 P 0.077 -321 F 0.073 -322 I 0.071 -323 Y 0.071 -324 T 0.077 -325 L 0.092 -326 R 0.105 -327 N 0.101 -328 K 0.085 -329 E 0.071 -330 V 0.069 -331 K 0.076 -332 H 0.086 -333 A 0.088 -334 L 0.080 -335 Q 0.070 -336 R 0.064 -337 L 0.065 -338 L 0.081 -339 C 0.123 -340 S 0.193 -341 S 0.268 -342 F 0.326 -343 R 0.368 -344 E 0.404 -345 S 0.425 -346 T 0.424 -347 A 0.425 -348 G 0.444 -349 S 0.462 -350 P 0.455 -351 P 0.427 -352 P 0.403 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000196666.7_ENST00000538490.3_GN:FAM180B_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000196666.7_ENST00000538490.3_GN:FAM180B_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index c8852dcba8091c3e8baf5d5a18d58866d19fd189..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000196666.7_ENST00000538490.3_GN:FAM180B_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,184 +0,0 @@ ->ENSG00000196666.7|ENST00000538490.3|GN:FAM180B|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.289 -2 A 0.283 -3 A 0.268 -4 T 0.241 -5 L 0.206 -6 Q 0.175 -7 F 0.151 -8 L 0.134 -9 V 0.124 -10 C 0.120 -11 L 0.119 -12 V 0.121 -13 V 0.125 -14 A 0.129 -15 I 0.133 -16 C 0.143 -17 L 0.175 -18 L 0.237 -19 S 0.323 -20 G 0.411 -21 V 0.489 -22 T 0.554 -23 T 0.598 -24 T 0.618 -25 Q 0.628 -26 P 0.646 -27 H 0.671 -28 A 0.689 -29 G 0.693 -30 Q 0.691 -31 P 0.697 -32 M 0.714 -33 D 0.732 -34 S 0.743 -35 T 0.751 -36 S 0.760 -37 V 0.770 -38 G 0.775 -39 G 0.769 -40 G 0.746 -41 L 0.702 -42 Q 0.643 -43 E 0.581 -44 P 0.523 -45 E 0.457 -46 A 0.372 -47 P 0.277 -48 E 0.196 -49 V 0.140 -50 M 0.105 -51 F 0.084 -52 E 0.070 -53 L 0.062 -54 L 0.056 -55 W 0.055 -56 A 0.059 -57 G 0.065 -58 L 0.069 -59 E 0.072 -60 L 0.078 -61 D 0.082 -62 V 0.082 -63 M 0.084 -64 G 0.091 -65 Q 0.098 -66 L 0.101 -67 H 0.102 -68 I 0.105 -69 Q 0.111 -70 D 0.116 -71 E 0.116 -72 E 0.113 -73 L 0.107 -74 A 0.098 -75 S 0.089 -76 T 0.083 -77 H 0.081 -78 P 0.080 -79 G 0.075 -80 R 0.066 -81 R 0.056 -82 L 0.051 -83 R 0.051 -84 L 0.053 -85 L 0.053 -86 L 0.052 -87 Q 0.055 -88 H 0.065 -89 H 0.079 -90 V 0.095 -91 P 0.105 -92 S 0.109 -93 D 0.111 -94 L 0.114 -95 E 0.112 -96 G 0.102 -97 T 0.086 -98 E 0.068 -99 Q 0.053 -100 W 0.046 -101 L 0.045 -102 Q 0.046 -103 Q 0.042 -104 L 0.039 -105 Q 0.042 -106 D 0.049 -107 L 0.055 -108 R 0.061 -109 K 0.071 -110 G 0.081 -111 P 0.087 -112 P 0.086 -113 L 0.078 -114 S 0.067 -115 T 0.057 -116 W 0.050 -117 D 0.046 -118 F 0.041 -119 E 0.036 -120 H 0.033 -121 L 0.033 -122 L 0.035 -123 L 0.035 -124 T 0.033 -125 G 0.029 -126 L 0.023 -127 S 0.018 -128 C 0.016 -129 V 0.018 -130 Y 0.023 -131 R 0.033 -132 L 0.045 -133 H 0.059 -134 A 0.076 -135 A 0.093 -136 S 0.104 -137 E 0.103 -138 A 0.094 -139 E 0.083 -140 E 0.076 -141 R 0.071 -142 G 0.065 -143 R 0.055 -144 W 0.045 -145 A 0.040 -146 Q 0.037 -147 V 0.032 -148 F 0.028 -149 A 0.028 -150 L 0.032 -151 L 0.038 -152 A 0.044 -153 Q 0.047 -154 E 0.047 -155 T 0.046 -156 L 0.044 -157 W 0.044 -158 D 0.045 -159 L 0.051 -160 C 0.063 -161 K 0.088 -162 G 0.127 -163 F 0.172 -164 C 0.211 -165 P 0.236 -166 Q 0.254 -167 D 0.272 -168 R 0.297 -169 P 0.326 -170 P 0.353 -171 S 0.370 -172 L 0.369 -173 G 0.350 -174 S 0.321 -175 W 0.296 -176 A 0.288 -177 S 0.292 -178 I 0.301 -179 L 0.313 -180 D 0.328 -181 P 0.337 -182 F 0.335 -183 P 0.328 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000196666.7_ENST00000538490.3_GN:FAM180B_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:18.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000196666.7_ENST00000538490.3_GN:FAM180B_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:18.caid deleted file mode 100644 index c10036c6b91a5854496abfdf84706f2738cb4478..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000196666.7_ENST00000538490.3_GN:FAM180B_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:18.caid +++ /dev/null @@ -1,202 +0,0 @@ ->ENSG00000196666.7|ENST00000538490.3|GN:FAM180B|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:18 -1 M 0.296 -2 R 0.296 -3 E 0.301 -4 Q 0.307 -5 R 0.303 -6 T 0.293 -7 A 0.295 -8 E 0.310 -9 Q 0.319 -10 S 0.311 -11 E 0.293 -12 T 0.275 -13 Q 0.258 -14 R 0.244 -15 T 0.237 -16 W 0.232 -17 L 0.231 -18 S 0.235 -19 M 0.235 -20 A 0.225 -21 A 0.212 -22 T 0.205 -23 L 0.204 -24 Q 0.199 -25 F 0.186 -26 L 0.169 -27 V 0.157 -28 C 0.154 -29 L 0.154 -30 V 0.149 -31 V 0.140 -32 A 0.131 -33 I 0.129 -34 C 0.140 -35 L 0.174 -36 L 0.240 -37 S 0.333 -38 G 0.431 -39 V 0.519 -40 T 0.590 -41 T 0.632 -42 T 0.645 -43 Q 0.649 -44 P 0.664 -45 H 0.689 -46 A 0.707 -47 G 0.710 -48 Q 0.708 -49 P 0.713 -50 M 0.728 -51 D 0.743 -52 S 0.754 -53 T 0.763 -54 S 0.774 -55 V 0.787 -56 G 0.793 -57 G 0.789 -58 G 0.768 -59 L 0.728 -60 Q 0.675 -61 E 0.620 -62 P 0.565 -63 E 0.497 -64 A 0.405 -65 P 0.302 -66 E 0.213 -67 V 0.153 -68 M 0.116 -69 F 0.091 -70 E 0.074 -71 L 0.063 -72 L 0.056 -73 W 0.054 -74 A 0.057 -75 G 0.062 -76 L 0.066 -77 E 0.070 -78 L 0.076 -79 D 0.080 -80 V 0.081 -81 M 0.082 -82 G 0.089 -83 Q 0.096 -84 L 0.100 -85 H 0.101 -86 I 0.103 -87 Q 0.108 -88 D 0.112 -89 E 0.112 -90 E 0.109 -91 L 0.105 -92 A 0.096 -93 S 0.086 -94 T 0.078 -95 H 0.074 -96 P 0.071 -97 G 0.066 -98 R 0.058 -99 R 0.050 -100 L 0.047 -101 R 0.048 -102 L 0.050 -103 L 0.049 -104 L 0.048 -105 Q 0.051 -106 H 0.061 -107 H 0.076 -108 V 0.092 -109 P 0.103 -110 S 0.107 -111 D 0.110 -112 L 0.114 -113 E 0.113 -114 G 0.104 -115 T 0.088 -116 E 0.069 -117 Q 0.055 -118 W 0.049 -119 L 0.051 -120 Q 0.052 -121 Q 0.046 -122 L 0.041 -123 Q 0.042 -124 D 0.049 -125 L 0.056 -126 R 0.062 -127 K 0.074 -128 G 0.086 -129 P 0.092 -130 P 0.091 -131 L 0.082 -132 S 0.070 -133 T 0.059 -134 W 0.053 -135 D 0.048 -136 F 0.042 -137 E 0.037 -138 H 0.034 -139 L 0.034 -140 L 0.035 -141 L 0.036 -142 T 0.033 -143 G 0.029 -144 L 0.022 -145 S 0.018 -146 C 0.016 -147 V 0.018 -148 Y 0.025 -149 R 0.036 -150 L 0.049 -151 H 0.065 -152 A 0.084 -153 A 0.103 -154 S 0.114 -155 E 0.112 -156 A 0.101 -157 E 0.090 -158 E 0.083 -159 R 0.077 -160 G 0.069 -161 R 0.058 -162 W 0.047 -163 A 0.041 -164 Q 0.037 -165 V 0.033 -166 F 0.029 -167 A 0.028 -168 L 0.032 -169 L 0.039 -170 A 0.046 -171 Q 0.050 -172 E 0.050 -173 T 0.049 -174 L 0.047 -175 W 0.047 -176 D 0.048 -177 L 0.054 -178 C 0.067 -179 K 0.093 -180 G 0.132 -181 F 0.176 -182 C 0.212 -183 P 0.234 -184 Q 0.249 -185 D 0.265 -186 R 0.287 -187 P 0.314 -188 P 0.339 -189 S 0.354 -190 L 0.353 -191 G 0.335 -192 S 0.309 -193 W 0.289 -194 A 0.285 -195 S 0.292 -196 I 0.300 -197 L 0.312 -198 D 0.327 -199 P 0.337 -200 F 0.336 -201 P 0.330 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000197125.3_ENST00000642064.1_GN:OR8B8_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000197125.3_ENST00000642064.1_GN:OR8B8_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index bbc476f1fe00f1762a7ea8ce8b9cff8f2ffb8c74..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000197125.3_ENST00000642064.1_GN:OR8B8_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,312 +0,0 @@ ->ENSG00000197125.3|ENST00000642064.1|GN:OR8B8|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.437 -2 A 0.458 -3 A 0.491 -4 E 0.517 -5 N 0.516 -6 S 0.477 -7 S 0.407 -8 F 0.324 -9 V 0.243 -10 T 0.177 -11 Q 0.137 -12 F 0.123 -13 I 0.123 -14 L 0.129 -15 A 0.138 -16 G 0.148 -17 L 0.161 -18 T 0.181 -19 D 0.200 -20 Q 0.200 -21 P 0.175 -22 G 0.138 -23 V 0.104 -24 Q 0.077 -25 I 0.060 -26 P 0.052 -27 L 0.049 -28 F 0.047 -29 F 0.042 -30 L 0.037 -31 F 0.036 -32 L 0.041 -33 G 0.047 -34 F 0.051 -35 Y 0.051 -36 V 0.048 -37 V 0.047 -38 T 0.047 -39 V 0.048 -40 V 0.050 -41 G 0.056 -42 N 0.065 -43 L 0.073 -44 G 0.076 -45 L 0.070 -46 I 0.058 -47 T 0.050 -48 L 0.048 -49 I 0.049 -50 R 0.050 -51 L 0.055 -52 N 0.061 -53 S 0.067 -54 H 0.071 -55 L 0.071 -56 H 0.066 -57 T 0.057 -58 P 0.046 -59 M 0.036 -60 Y 0.028 -61 F 0.024 -62 F 0.024 -63 L 0.030 -64 Y 0.039 -65 N 0.049 -66 L 0.054 -67 S 0.053 -68 F 0.050 -69 I 0.050 -70 D 0.055 -71 F 0.061 -72 C 0.065 -73 Y 0.066 -74 S 0.065 -75 S 0.066 -76 V 0.069 -77 I 0.073 -78 T 0.073 -79 P 0.068 -80 K 0.062 -81 M 0.058 -82 L 0.053 -83 M 0.049 -84 S 0.047 -85 F 0.051 -86 V 0.061 -87 L 0.071 -88 K 0.075 -89 K 0.070 -90 N 0.061 -91 S 0.053 -92 I 0.047 -93 S 0.042 -94 Y 0.038 -95 A 0.038 -96 G 0.038 -97 C 0.036 -98 M 0.034 -99 T 0.032 -100 Q 0.032 -101 L 0.032 -102 F 0.031 -103 F 0.029 -104 F 0.027 -105 L 0.026 -106 F 0.026 -107 F 0.028 -108 V 0.034 -109 V 0.043 -110 S 0.051 -111 E 0.052 -112 S 0.048 -113 F 0.041 -114 I 0.036 -115 L 0.034 -116 S 0.033 -117 A 0.031 -118 M 0.031 -119 A 0.034 -120 Y 0.038 -121 D 0.043 -122 R 0.045 -123 Y 0.045 -124 V 0.043 -125 A 0.045 -126 I 0.049 -127 C 0.055 -128 N 0.058 -129 P 0.056 -130 L 0.050 -131 L 0.047 -132 Y 0.047 -133 M 0.049 -134 V 0.054 -135 T 0.064 -136 M 0.075 -137 S 0.081 -138 P 0.082 -139 Q 0.078 -140 V 0.068 -141 C 0.061 -142 F 0.063 -143 L 0.068 -144 L 0.066 -145 L 0.060 -146 L 0.060 -147 G 0.067 -148 V 0.072 -149 Y 0.072 -150 G 0.072 -151 M 0.076 -152 G 0.079 -153 F 0.081 -154 A 0.082 -155 G 0.084 -156 A 0.084 -157 M 0.082 -158 A 0.083 -159 H 0.086 -160 T 0.086 -161 A 0.086 -162 C 0.089 -163 M 0.097 -164 M 0.107 -165 G 0.115 -166 V 0.114 -167 T 0.100 -168 F 0.085 -169 C 0.082 -170 A 0.091 -171 N 0.105 -172 N 0.122 -173 L 0.136 -174 V 0.137 -175 N 0.120 -176 H 0.094 -177 Y 0.074 -178 M 0.063 -179 C 0.063 -180 D 0.072 -181 I 0.087 -182 L 0.104 -183 P 0.115 -184 L 0.119 -185 L 0.124 -186 E 0.128 -187 C 0.127 -188 A 0.120 -189 C 0.117 -190 T 0.125 -191 S 0.135 -192 T 0.136 -193 Y 0.125 -194 V 0.112 -195 N 0.101 -196 E 0.097 -197 L 0.098 -198 V 0.098 -199 V 0.094 -200 F 0.085 -201 V 0.078 -202 V 0.073 -203 V 0.067 -204 G 0.062 -205 I 0.061 -206 D 0.067 -207 I 0.076 -208 G 0.085 -209 V 0.092 -210 P 0.093 -211 T 0.087 -212 V 0.079 -213 T 0.076 -214 I 0.072 -215 F 0.063 -216 I 0.053 -217 S 0.047 -218 Y 0.045 -219 A 0.046 -220 L 0.052 -221 I 0.062 -222 L 0.073 -223 S 0.081 -224 S 0.083 -225 I 0.082 -226 F 0.087 -227 H 0.106 -228 I 0.132 -229 D 0.153 -230 S 0.159 -231 T 0.148 -232 E 0.130 -233 G 0.111 -234 R 0.095 -235 S 0.087 -236 K 0.087 -237 A 0.086 -238 F 0.084 -239 S 0.082 -240 T 0.080 -241 C 0.078 -242 S 0.077 -243 S 0.079 -244 H 0.078 -245 I 0.075 -246 I 0.073 -247 A 0.072 -248 V 0.064 -249 S 0.050 -250 L 0.037 -251 F 0.032 -252 F 0.033 -253 G 0.037 -254 S 0.041 -255 G 0.042 -256 A 0.040 -257 F 0.037 -258 M 0.040 -259 Y 0.054 -260 L 0.081 -261 K 0.111 -262 P 0.135 -263 F 0.152 -264 S 0.165 -265 L 0.174 -266 L 0.177 -267 A 0.175 -268 M 0.170 -269 N 0.162 -270 Q 0.156 -271 G 0.151 -272 K 0.141 -273 V 0.127 -274 S 0.111 -275 S 0.095 -276 L 0.085 -277 F 0.086 -278 Y 0.094 -279 T 0.103 -280 T 0.112 -281 V 0.121 -282 V 0.124 -283 P 0.115 -284 M 0.099 -285 L 0.087 -286 N 0.079 -287 P 0.075 -288 L 0.074 -289 I 0.077 -290 Y 0.079 -291 S 0.085 -292 L 0.099 -293 R 0.111 -294 N 0.104 -295 K 0.084 -296 D 0.067 -297 V 0.064 -298 K 0.074 -299 V 0.085 -300 A 0.091 -301 L 0.093 -302 K 0.097 -303 K 0.105 -304 I 0.118 -305 L 0.145 -306 N 0.191 -307 K 0.253 -308 N 0.316 -309 A 0.353 -310 F 0.354 -311 S 0.338 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000197125.3_ENST00000642064.1_GN:OR8B8_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000197125.3_ENST00000642064.1_GN:OR8B8_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid deleted file mode 100644 index ed4c50430385e3a1252565d12907e7a475f9d068..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000197125.3_ENST00000642064.1_GN:OR8B8_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid +++ /dev/null @@ -1,314 +0,0 @@ ->ENSG00000197125.3|ENST00000642064.1|GN:OR8B8|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:2 -1 M 0.406 -2 T 0.430 -3 M 0.473 -4 A 0.519 -5 A 0.552 -6 E 0.562 -7 N 0.544 -8 S 0.494 -9 S 0.419 -10 F 0.330 -11 V 0.245 -12 T 0.177 -13 Q 0.136 -14 F 0.121 -15 I 0.122 -16 L 0.128 -17 A 0.137 -18 G 0.147 -19 L 0.161 -20 T 0.182 -21 D 0.202 -22 Q 0.202 -23 P 0.176 -24 G 0.139 -25 V 0.104 -26 Q 0.078 -27 I 0.061 -28 P 0.052 -29 L 0.049 -30 F 0.047 -31 F 0.042 -32 L 0.037 -33 F 0.036 -34 L 0.041 -35 G 0.047 -36 F 0.051 -37 Y 0.051 -38 V 0.048 -39 V 0.047 -40 T 0.048 -41 V 0.048 -42 V 0.050 -43 G 0.056 -44 N 0.065 -45 L 0.074 -46 G 0.077 -47 L 0.070 -48 I 0.058 -49 T 0.050 -50 L 0.048 -51 I 0.049 -52 R 0.050 -53 L 0.055 -54 N 0.061 -55 S 0.067 -56 H 0.071 -57 L 0.071 -58 H 0.066 -59 T 0.057 -60 P 0.046 -61 M 0.036 -62 Y 0.028 -63 F 0.024 -64 F 0.024 -65 L 0.029 -66 Y 0.039 -67 N 0.049 -68 L 0.054 -69 S 0.053 -70 F 0.050 -71 I 0.050 -72 D 0.055 -73 F 0.060 -74 C 0.064 -75 Y 0.066 -76 S 0.066 -77 S 0.066 -78 V 0.069 -79 I 0.072 -80 T 0.073 -81 P 0.068 -82 K 0.062 -83 M 0.057 -84 L 0.053 -85 M 0.048 -86 S 0.047 -87 F 0.051 -88 V 0.060 -89 L 0.070 -90 K 0.074 -91 K 0.069 -92 N 0.060 -93 S 0.052 -94 I 0.047 -95 S 0.042 -96 Y 0.038 -97 A 0.038 -98 G 0.038 -99 C 0.036 -100 M 0.034 -101 T 0.032 -102 Q 0.032 -103 L 0.032 -104 F 0.031 -105 F 0.029 -106 F 0.027 -107 L 0.026 -108 F 0.026 -109 F 0.028 -110 V 0.034 -111 V 0.043 -112 S 0.050 -113 E 0.052 -114 S 0.047 -115 F 0.041 -116 I 0.036 -117 L 0.034 -118 S 0.033 -119 A 0.031 -120 M 0.031 -121 A 0.034 -122 Y 0.038 -123 D 0.043 -124 R 0.045 -125 Y 0.045 -126 V 0.043 -127 A 0.045 -128 I 0.049 -129 C 0.055 -130 N 0.058 -131 P 0.056 -132 L 0.050 -133 L 0.047 -134 Y 0.047 -135 M 0.049 -136 V 0.055 -137 T 0.064 -138 M 0.075 -139 S 0.081 -140 P 0.082 -141 Q 0.078 -142 V 0.068 -143 C 0.061 -144 F 0.063 -145 L 0.068 -146 L 0.066 -147 L 0.060 -148 L 0.060 -149 G 0.066 -150 V 0.072 -151 Y 0.072 -152 G 0.072 -153 M 0.076 -154 G 0.080 -155 F 0.081 -156 A 0.082 -157 G 0.085 -158 A 0.085 -159 M 0.082 -160 A 0.083 -161 H 0.086 -162 T 0.086 -163 A 0.086 -164 C 0.089 -165 M 0.097 -166 M 0.107 -167 G 0.115 -168 V 0.114 -169 T 0.100 -170 F 0.085 -171 C 0.082 -172 A 0.091 -173 N 0.105 -174 N 0.122 -175 L 0.136 -176 V 0.138 -177 N 0.120 -178 H 0.094 -179 Y 0.074 -180 M 0.063 -181 C 0.063 -182 D 0.072 -183 I 0.088 -184 L 0.104 -185 P 0.115 -186 L 0.119 -187 L 0.124 -188 E 0.128 -189 C 0.127 -190 A 0.119 -191 C 0.116 -192 T 0.125 -193 S 0.135 -194 T 0.136 -195 Y 0.125 -196 V 0.111 -197 N 0.101 -198 E 0.097 -199 L 0.098 -200 V 0.099 -201 V 0.094 -202 F 0.085 -203 V 0.078 -204 V 0.073 -205 V 0.067 -206 G 0.062 -207 I 0.061 -208 D 0.067 -209 I 0.076 -210 G 0.085 -211 V 0.092 -212 P 0.093 -213 T 0.087 -214 V 0.079 -215 T 0.076 -216 I 0.073 -217 F 0.064 -218 I 0.054 -219 S 0.047 -220 Y 0.045 -221 A 0.046 -222 L 0.052 -223 I 0.062 -224 L 0.073 -225 S 0.081 -226 S 0.083 -227 I 0.082 -228 F 0.087 -229 H 0.106 -230 I 0.132 -231 D 0.153 -232 S 0.159 -233 T 0.148 -234 E 0.130 -235 G 0.111 -236 R 0.095 -237 S 0.088 -238 K 0.087 -239 A 0.087 -240 F 0.084 -241 S 0.082 -242 T 0.081 -243 C 0.078 -244 S 0.078 -245 S 0.079 -246 H 0.079 -247 I 0.076 -248 I 0.074 -249 A 0.072 -250 V 0.065 -251 S 0.051 -252 L 0.038 -253 F 0.032 -254 F 0.033 -255 G 0.037 -256 S 0.041 -257 G 0.042 -258 A 0.040 -259 F 0.037 -260 M 0.040 -261 Y 0.054 -262 L 0.081 -263 K 0.111 -264 P 0.135 -265 F 0.152 -266 S 0.166 -267 L 0.174 -268 L 0.177 -269 A 0.176 -270 M 0.170 -271 N 0.162 -272 Q 0.157 -273 G 0.152 -274 K 0.142 -275 V 0.128 -276 S 0.111 -277 S 0.096 -278 L 0.086 -279 F 0.087 -280 Y 0.095 -281 T 0.104 -282 T 0.113 -283 V 0.121 -284 V 0.124 -285 P 0.115 -286 M 0.099 -287 L 0.087 -288 N 0.080 -289 P 0.075 -290 L 0.075 -291 I 0.078 -292 Y 0.080 -293 S 0.085 -294 L 0.100 -295 R 0.111 -296 N 0.104 -297 K 0.084 -298 D 0.068 -299 V 0.064 -300 K 0.074 -301 V 0.085 -302 A 0.091 -303 L 0.093 -304 K 0.097 -305 K 0.105 -306 I 0.118 -307 L 0.145 -308 N 0.191 -309 K 0.253 -310 N 0.316 -311 A 0.353 -312 F 0.354 -313 S 0.339 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000198680.6_ENST00000358022.6_GN:TUSC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000198680.6_ENST00000358022.6_GN:TUSC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 02b97fc7032797f7abe3c0e5438fb939ee5c3001..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000198680.6_ENST00000358022.6_GN:TUSC1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,210 +0,0 @@ ->ENSG00000198680.6|ENST00000358022.6|GN:TUSC1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.449 -2 W 0.505 -3 R 0.586 -4 M 0.660 -5 R 0.709 -6 G 0.734 -7 G 0.735 -8 A 0.705 -9 T 0.655 -10 R 0.633 -11 R 0.674 -12 G 0.741 -13 S 0.786 -14 C 0.804 -15 C 0.813 -16 G 0.821 -17 G 0.828 -18 D 0.832 -19 G 0.831 -20 A 0.826 -21 A 0.818 -22 D 0.807 -23 G 0.795 -24 R 0.782 -25 G 0.777 -26 P 0.784 -27 G 0.799 -28 R 0.813 -29 S 0.820 -30 G 0.822 -31 R 0.823 -32 A 0.827 -33 R 0.833 -34 G 0.835 -35 G 0.832 -36 G 0.827 -37 S 0.825 -38 P 0.828 -39 S 0.832 -40 G 0.833 -41 G 0.828 -42 G 0.819 -43 G 0.805 -44 G 0.781 -45 V 0.741 -46 G 0.685 -47 W 0.636 -48 R 0.614 -49 G 0.615 -50 R 0.612 -51 A 0.600 -52 D 0.587 -53 G 0.573 -54 A 0.546 -55 R 0.508 -56 Q 0.470 -57 Q 0.431 -58 L 0.388 -59 E 0.353 -60 E 0.339 -61 R 0.344 -62 F 0.360 -63 A 0.380 -64 D 0.383 -65 L 0.360 -66 A 0.325 -67 A 0.293 -68 S 0.263 -69 H 0.234 -70 L 0.217 -71 E 0.211 -72 A 0.211 -73 I 0.215 -74 R 0.220 -75 A 0.218 -76 R 0.209 -77 D 0.207 -78 E 0.213 -79 W 0.220 -80 D 0.228 -81 R 0.233 -82 Q 0.229 -83 N 0.214 -84 A 0.196 -85 R 0.181 -86 L 0.176 -87 R 0.186 -88 Q 0.202 -89 E 0.204 -90 N 0.188 -91 A 0.169 -92 R 0.160 -93 L 0.162 -94 R 0.176 -95 L 0.199 -96 E 0.221 -97 N 0.232 -98 R 0.233 -99 R 0.240 -100 L 0.258 -101 K 0.281 -102 R 0.295 -103 E 0.287 -104 N 0.262 -105 R 0.234 -106 S 0.216 -107 L 0.211 -108 F 0.220 -109 R 0.238 -110 Q 0.262 -111 A 0.297 -112 L 0.344 -113 R 0.405 -114 L 0.484 -115 P 0.576 -116 G 0.662 -117 E 0.720 -118 G 0.747 -119 G 0.754 -120 N 0.752 -121 G 0.747 -122 T 0.743 -123 P 0.746 -124 A 0.755 -125 E 0.765 -126 A 0.769 -127 R 0.767 -128 R 0.762 -129 V 0.758 -130 P 0.760 -131 E 0.768 -132 E 0.773 -133 A 0.772 -134 S 0.771 -135 T 0.769 -136 N 0.767 -137 R 0.763 -138 R 0.761 -139 A 0.762 -140 R 0.763 -141 D 0.765 -142 S 0.761 -143 G 0.748 -144 R 0.724 -145 E 0.689 -146 D 0.648 -147 E 0.604 -148 P 0.560 -149 G 0.501 -150 S 0.417 -151 P 0.325 -152 R 0.258 -153 A 0.226 -154 L 0.213 -155 R 0.204 -156 A 0.198 -157 R 0.193 -158 L 0.187 -159 E 0.180 -160 K 0.173 -161 L 0.166 -162 E 0.162 -163 A 0.157 -164 M 0.148 -165 Y 0.133 -166 R 0.123 -167 R 0.124 -168 A 0.135 -169 L 0.148 -170 L 0.158 -171 Q 0.167 -172 L 0.180 -173 H 0.207 -174 L 0.248 -175 E 0.294 -176 Q 0.335 -177 R 0.376 -178 G 0.436 -179 P 0.522 -180 R 0.617 -181 P 0.694 -182 S 0.741 -183 G 0.762 -184 D 0.769 -185 K 0.766 -186 E 0.754 -187 E 0.739 -188 Q 0.732 -189 P 0.734 -190 L 0.736 -191 Q 0.733 -192 E 0.730 -193 P 0.732 -194 D 0.741 -195 S 0.755 -196 G 0.771 -197 L 0.785 -198 R 0.795 -199 S 0.799 -200 R 0.796 -201 D 0.783 -202 S 0.767 -203 E 0.756 -204 P 0.752 -205 S 0.751 -206 G 0.736 -207 P 0.689 -208 W 0.612 -209 L 0.545 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000198680.6_ENST00000358022.6_GN:TUSC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000198680.6_ENST00000358022.6_GN:TUSC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid deleted file mode 100644 index 7ac0823265a0279d267e1b35e6f8e4ba95c9b631..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000198680.6_ENST00000358022.6_GN:TUSC1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid +++ /dev/null @@ -1,213 +0,0 @@ ->ENSG00000198680.6|ENST00000358022.6|GN:TUSC1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 -1 M 0.459 -2 G 0.508 -3 P 0.578 -4 M 0.638 -5 W 0.680 -6 R 0.713 -7 M 0.743 -8 R 0.771 -9 G 0.791 -10 G 0.803 -11 A 0.809 -12 T 0.812 -13 R 0.815 -14 R 0.819 -15 G 0.822 -16 S 0.823 -17 C 0.824 -18 C 0.827 -19 G 0.834 -20 G 0.840 -21 D 0.845 -22 G 0.846 -23 A 0.843 -24 A 0.836 -25 D 0.824 -26 G 0.808 -27 R 0.794 -28 G 0.787 -29 P 0.793 -30 G 0.808 -31 R 0.821 -32 S 0.828 -33 G 0.828 -34 R 0.829 -35 A 0.833 -36 R 0.838 -37 G 0.840 -38 G 0.836 -39 G 0.830 -40 S 0.827 -41 P 0.829 -42 S 0.834 -43 G 0.835 -44 G 0.831 -45 G 0.823 -46 G 0.810 -47 G 0.788 -48 V 0.750 -49 G 0.698 -50 W 0.653 -51 R 0.635 -52 G 0.635 -53 R 0.631 -54 A 0.617 -55 D 0.604 -56 G 0.588 -57 A 0.559 -58 R 0.519 -59 Q 0.480 -60 Q 0.440 -61 L 0.396 -62 E 0.361 -63 E 0.346 -64 R 0.352 -65 F 0.369 -66 A 0.386 -67 D 0.387 -68 L 0.360 -69 A 0.323 -70 A 0.290 -71 S 0.258 -72 H 0.229 -73 L 0.213 -74 E 0.207 -75 A 0.207 -76 I 0.210 -77 R 0.215 -78 A 0.213 -79 R 0.205 -80 D 0.202 -81 E 0.209 -82 W 0.216 -83 D 0.223 -84 R 0.228 -85 Q 0.224 -86 N 0.210 -87 A 0.192 -88 R 0.177 -89 L 0.173 -90 R 0.183 -91 Q 0.197 -92 E 0.200 -93 N 0.185 -94 A 0.167 -95 R 0.159 -96 L 0.161 -97 R 0.173 -98 L 0.194 -99 E 0.215 -100 N 0.225 -101 R 0.227 -102 R 0.234 -103 L 0.252 -104 K 0.273 -105 R 0.286 -106 E 0.277 -107 N 0.253 -108 R 0.228 -109 S 0.211 -110 L 0.208 -111 F 0.217 -112 R 0.235 -113 Q 0.261 -114 A 0.297 -115 L 0.345 -116 R 0.406 -117 L 0.485 -118 P 0.577 -119 G 0.662 -120 E 0.720 -121 G 0.748 -122 G 0.755 -123 N 0.754 -124 G 0.749 -125 T 0.745 -126 P 0.747 -127 A 0.757 -128 E 0.766 -129 A 0.770 -130 R 0.769 -131 R 0.764 -132 V 0.760 -133 P 0.761 -134 E 0.769 -135 E 0.774 -136 A 0.774 -137 S 0.772 -138 T 0.771 -139 N 0.768 -140 R 0.765 -141 R 0.762 -142 A 0.763 -143 R 0.765 -144 D 0.766 -145 S 0.763 -146 G 0.750 -147 R 0.726 -148 E 0.691 -149 D 0.649 -150 E 0.606 -151 P 0.561 -152 G 0.502 -153 S 0.417 -154 P 0.324 -155 R 0.257 -156 A 0.225 -157 L 0.212 -158 R 0.204 -159 A 0.198 -160 R 0.193 -161 L 0.187 -162 E 0.179 -163 K 0.172 -164 L 0.166 -165 E 0.162 -166 A 0.157 -167 M 0.148 -168 Y 0.136 -169 R 0.129 -170 R 0.131 -171 A 0.140 -172 L 0.150 -173 L 0.158 -174 Q 0.165 -175 L 0.178 -176 H 0.204 -177 L 0.246 -178 E 0.291 -179 Q 0.331 -180 R 0.373 -181 G 0.434 -182 P 0.521 -183 R 0.616 -184 P 0.694 -185 S 0.740 -186 G 0.762 -187 D 0.769 -188 K 0.766 -189 E 0.755 -190 E 0.741 -191 Q 0.734 -192 P 0.736 -193 L 0.738 -194 Q 0.735 -195 E 0.731 -196 P 0.733 -197 D 0.741 -198 S 0.754 -199 G 0.770 -200 L 0.784 -201 R 0.794 -202 S 0.798 -203 R 0.795 -204 D 0.784 -205 S 0.768 -206 E 0.757 -207 P 0.753 -208 S 0.752 -209 G 0.737 -210 P 0.690 -211 W 0.612 -212 L 0.546 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000203857.10_ENST00000369413.8_GN:HSD3B1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000203857.10_ENST00000369413.8_GN:HSD3B1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 53d937068ee2033072d3fea32975345fb507da7e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000203857.10_ENST00000369413.8_GN:HSD3B1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,374 +0,0 @@ ->ENSG00000203857.10|ENST00000369413.8|GN:HSD3B1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.336 -2 T 0.290 -3 G 0.213 -4 W 0.132 -5 S 0.072 -6 C 0.040 -7 L 0.027 -8 V 0.027 -9 T 0.035 -10 G 0.049 -11 A 0.059 -12 G 0.058 -13 G 0.049 -14 F 0.043 -15 L 0.040 -16 G 0.036 -17 Q 0.034 -18 R 0.037 -19 I 0.041 -20 I 0.040 -21 R 0.036 -22 L 0.034 -23 L 0.036 -24 V 0.037 -25 K 0.038 -26 E 0.041 -27 K 0.046 -28 E 0.050 -29 L 0.051 -30 K 0.048 -31 E 0.042 -32 I 0.036 -33 R 0.034 -34 V 0.037 -35 L 0.042 -36 D 0.044 -37 K 0.043 -38 A 0.044 -39 F 0.049 -40 G 0.052 -41 P 0.048 -42 E 0.042 -43 L 0.044 -44 R 0.055 -45 E 0.064 -46 E 0.065 -47 F 0.063 -48 S 0.065 -49 K 0.072 -50 L 0.079 -51 Q 0.087 -52 N 0.092 -53 K 0.092 -54 T 0.083 -55 K 0.070 -56 L 0.060 -57 T 0.060 -58 V 0.066 -59 L 0.072 -60 E 0.072 -61 G 0.065 -62 D 0.057 -63 I 0.052 -64 L 0.050 -65 D 0.048 -66 E 0.041 -67 P 0.032 -68 F 0.025 -69 L 0.023 -70 K 0.026 -71 R 0.030 -72 A 0.038 -73 C 0.050 -74 Q 0.062 -75 D 0.065 -76 V 0.058 -77 S 0.050 -78 V 0.046 -79 I 0.047 -80 I 0.053 -81 H 0.064 -82 T 0.078 -83 A 0.090 -84 C 0.102 -85 I 0.115 -86 I 0.128 -87 D 0.135 -88 V 0.137 -89 F 0.137 -90 G 0.133 -91 V 0.124 -92 T 0.113 -93 H 0.102 -94 R 0.091 -95 E 0.078 -96 S 0.068 -97 I 0.063 -98 M 0.057 -99 N 0.053 -100 V 0.057 -101 N 0.063 -102 V 0.064 -103 K 0.062 -104 G 0.063 -105 T 0.064 -106 Q 0.059 -107 L 0.049 -108 L 0.042 -109 L 0.038 -110 E 0.034 -111 A 0.030 -112 C 0.031 -113 V 0.037 -114 Q 0.047 -115 A 0.054 -116 S 0.057 -117 V 0.056 -118 P 0.052 -119 V 0.048 -120 F 0.044 -121 I 0.044 -122 Y 0.048 -123 T 0.055 -124 S 0.063 -125 S 0.073 -126 I 0.094 -127 E 0.126 -128 V 0.158 -129 A 0.182 -130 G 0.200 -131 P 0.215 -132 N 0.220 -133 S 0.214 -134 Y 0.204 -135 K 0.193 -136 E 0.189 -137 I 0.195 -138 I 0.210 -139 Q 0.227 -140 N 0.234 -141 G 0.218 -142 H 0.180 -143 E 0.151 -144 E 0.149 -145 E 0.162 -146 P 0.167 -147 L 0.158 -148 E 0.151 -149 N 0.150 -150 T 0.150 -151 W 0.142 -152 P 0.125 -153 A 0.106 -154 P 0.098 -155 Y 0.099 -156 P 0.103 -157 H 0.110 -158 S 0.119 -159 K 0.121 -160 K 0.115 -161 L 0.112 -162 A 0.115 -163 E 0.117 -164 K 0.115 -165 A 0.112 -166 V 0.109 -167 L 0.105 -168 A 0.104 -169 A 0.105 -170 N 0.107 -171 G 0.107 -172 W 0.108 -173 N 0.110 -174 L 0.117 -175 K 0.133 -176 N 0.157 -177 G 0.173 -178 G 0.167 -179 T 0.138 -180 L 0.101 -181 Y 0.075 -182 T 0.063 -183 C 0.063 -184 A 0.077 -185 L 0.098 -186 R 0.112 -187 P 0.110 -188 M 0.101 -189 Y 0.095 -190 I 0.088 -191 Y 0.078 -192 G 0.073 -193 E 0.078 -194 G 0.087 -195 S 0.090 -196 R 0.087 -197 F 0.081 -198 L 0.078 -199 S 0.079 -200 A 0.084 -201 S 0.088 -202 I 0.085 -203 N 0.080 -204 E 0.076 -205 A 0.076 -206 L 0.084 -207 N 0.099 -208 N 0.118 -209 N 0.134 -210 G 0.147 -211 I 0.159 -212 L 0.166 -213 S 0.163 -214 S 0.156 -215 V 0.155 -216 G 0.156 -217 K 0.150 -218 F 0.138 -219 S 0.124 -220 T 0.109 -221 V 0.098 -222 N 0.092 -223 P 0.088 -224 V 0.082 -225 Y 0.079 -226 V 0.083 -227 G 0.090 -228 N 0.097 -229 V 0.101 -230 A 0.098 -231 W 0.091 -232 A 0.080 -233 H 0.067 -234 I 0.054 -235 L 0.047 -236 A 0.045 -237 L 0.047 -238 R 0.053 -239 A 0.061 -240 L 0.066 -241 Q 0.067 -242 D 0.067 -243 P 0.067 -244 K 0.066 -245 K 0.063 -246 A 0.064 -247 P 0.068 -248 S 0.075 -249 I 0.083 -250 R 0.090 -251 G 0.092 -252 Q 0.088 -253 F 0.080 -254 Y 0.072 -255 Y 0.068 -256 I 0.071 -257 S 0.080 -258 D 0.086 -259 D 0.088 -260 T 0.087 -261 P 0.086 -262 H 0.083 -263 Q 0.076 -264 S 0.069 -265 Y 0.062 -266 D 0.055 -267 N 0.048 -268 L 0.042 -269 N 0.038 -270 Y 0.036 -271 T 0.037 -272 L 0.038 -273 S 0.040 -274 K 0.045 -275 E 0.053 -276 F 0.066 -277 G 0.081 -278 L 0.095 -279 R 0.104 -280 L 0.111 -281 D 0.117 -282 S 0.123 -283 R 0.128 -284 W 0.128 -285 S 0.121 -286 F 0.109 -287 P 0.093 -288 L 0.076 -289 S 0.061 -290 L 0.055 -291 M 0.060 -292 Y 0.073 -293 W 0.085 -294 I 0.088 -295 G 0.084 -296 F 0.079 -297 L 0.075 -298 L 0.075 -299 E 0.076 -300 I 0.076 -301 V 0.076 -302 S 0.080 -303 F 0.086 -304 L 0.091 -305 L 0.101 -306 R 0.118 -307 P 0.139 -308 I 0.159 -309 Y 0.174 -310 T 0.183 -311 Y 0.188 -312 R 0.184 -313 P 0.168 -314 P 0.143 -315 F 0.118 -316 N 0.098 -317 R 0.086 -318 H 0.086 -319 I 0.094 -320 V 0.100 -321 T 0.099 -322 L 0.098 -323 S 0.103 -324 N 0.112 -325 S 0.123 -326 V 0.129 -327 F 0.127 -328 T 0.117 -329 F 0.105 -330 S 0.097 -331 Y 0.091 -332 K 0.082 -333 K 0.076 -334 A 0.077 -335 Q 0.085 -336 R 0.088 -337 D 0.082 -338 L 0.072 -339 A 0.067 -340 Y 0.069 -341 K 0.073 -342 P 0.075 -343 L 0.073 -344 Y 0.072 -345 S 0.070 -346 W 0.066 -347 E 0.061 -348 E 0.059 -349 A 0.058 -350 K 0.053 -351 Q 0.046 -352 K 0.045 -353 T 0.053 -354 V 0.065 -355 E 0.073 -356 W 0.070 -357 V 0.061 -358 G 0.053 -359 S 0.047 -360 L 0.045 -361 V 0.047 -362 D 0.052 -363 R 0.060 -364 H 0.074 -365 K 0.096 -366 E 0.127 -367 T 0.160 -368 L 0.194 -369 K 0.231 -370 S 0.271 -371 K 0.306 -372 T 0.325 -373 Q 0.328 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000203857.10_ENST00000369413.8_GN:HSD3B1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000203857.10_ENST00000369413.8_GN:HSD3B1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid deleted file mode 100644 index 8bcaf37b2a888416d924d7d1786257c2497a3806..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000203857.10_ENST00000369413.8_GN:HSD3B1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:2.caid +++ /dev/null @@ -1,376 +0,0 @@ ->ENSG00000203857.10|ENST00000369413.8|GN:HSD3B1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:2 -1 M 0.365 -2 A 0.361 -3 M 0.341 -4 T 0.289 -5 G 0.210 -6 W 0.130 -7 S 0.071 -8 C 0.040 -9 L 0.028 -10 V 0.027 -11 T 0.035 -12 G 0.049 -13 A 0.059 -14 G 0.058 -15 G 0.049 -16 F 0.043 -17 L 0.040 -18 G 0.036 -19 Q 0.034 -20 R 0.037 -21 I 0.041 -22 I 0.040 -23 R 0.035 -24 L 0.033 -25 L 0.035 -26 V 0.037 -27 K 0.038 -28 E 0.042 -29 K 0.047 -30 E 0.052 -31 L 0.053 -32 K 0.049 -33 E 0.042 -34 I 0.036 -35 R 0.034 -36 V 0.037 -37 L 0.042 -38 D 0.044 -39 K 0.043 -40 A 0.044 -41 F 0.049 -42 G 0.052 -43 P 0.048 -44 E 0.042 -45 L 0.044 -46 R 0.054 -47 E 0.064 -48 E 0.065 -49 F 0.063 -50 S 0.065 -51 K 0.071 -52 L 0.079 -53 Q 0.086 -54 N 0.091 -55 K 0.091 -56 T 0.082 -57 K 0.069 -58 L 0.059 -59 T 0.059 -60 V 0.066 -61 L 0.072 -62 E 0.072 -63 G 0.065 -64 D 0.056 -65 I 0.052 -66 L 0.050 -67 D 0.047 -68 E 0.041 -69 P 0.032 -70 F 0.025 -71 L 0.024 -72 K 0.026 -73 R 0.031 -74 A 0.038 -75 C 0.050 -76 Q 0.061 -77 D 0.064 -78 V 0.058 -79 S 0.050 -80 V 0.046 -81 I 0.047 -82 I 0.053 -83 H 0.064 -84 T 0.078 -85 A 0.090 -86 C 0.101 -87 I 0.115 -88 I 0.128 -89 D 0.135 -90 V 0.137 -91 F 0.137 -92 G 0.132 -93 V 0.123 -94 T 0.112 -95 H 0.102 -96 R 0.091 -97 E 0.078 -98 S 0.068 -99 I 0.063 -100 M 0.057 -101 N 0.053 -102 V 0.057 -103 N 0.063 -104 V 0.064 -105 K 0.062 -106 G 0.063 -107 T 0.065 -108 Q 0.059 -109 L 0.049 -110 L 0.042 -111 L 0.038 -112 E 0.034 -113 A 0.030 -114 C 0.031 -115 V 0.037 -116 Q 0.047 -117 A 0.054 -118 S 0.057 -119 V 0.056 -120 P 0.053 -121 V 0.048 -122 F 0.044 -123 I 0.044 -124 Y 0.048 -125 T 0.055 -126 S 0.063 -127 S 0.073 -128 I 0.094 -129 E 0.126 -130 V 0.158 -131 A 0.182 -132 G 0.201 -133 P 0.216 -134 N 0.221 -135 S 0.215 -136 Y 0.205 -137 K 0.194 -138 E 0.190 -139 I 0.196 -140 I 0.211 -141 Q 0.228 -142 N 0.235 -143 G 0.219 -144 H 0.181 -145 E 0.151 -146 E 0.150 -147 E 0.163 -148 P 0.167 -149 L 0.159 -150 E 0.151 -151 N 0.150 -152 T 0.150 -153 W 0.142 -154 P 0.124 -155 A 0.106 -156 P 0.098 -157 Y 0.099 -158 P 0.103 -159 H 0.110 -160 S 0.119 -161 K 0.121 -162 K 0.115 -163 L 0.112 -164 A 0.115 -165 E 0.118 -166 K 0.115 -167 A 0.112 -168 V 0.109 -169 L 0.106 -170 A 0.104 -171 A 0.106 -172 N 0.107 -173 G 0.107 -174 W 0.108 -175 N 0.110 -176 L 0.117 -177 K 0.133 -178 N 0.157 -179 G 0.173 -180 G 0.167 -181 T 0.137 -182 L 0.101 -183 Y 0.075 -184 T 0.063 -185 C 0.063 -186 A 0.077 -187 L 0.098 -188 R 0.112 -189 P 0.110 -190 M 0.101 -191 Y 0.095 -192 I 0.088 -193 Y 0.078 -194 G 0.073 -195 E 0.078 -196 G 0.087 -197 S 0.091 -198 R 0.087 -199 F 0.081 -200 L 0.078 -201 S 0.079 -202 A 0.084 -203 S 0.088 -204 I 0.086 -205 N 0.080 -206 E 0.076 -207 A 0.076 -208 L 0.084 -209 N 0.099 -210 N 0.117 -211 N 0.133 -212 G 0.147 -213 I 0.159 -214 L 0.166 -215 S 0.162 -216 S 0.156 -217 V 0.154 -218 G 0.155 -219 K 0.150 -220 F 0.138 -221 S 0.123 -222 T 0.109 -223 V 0.097 -224 N 0.092 -225 P 0.088 -226 V 0.082 -227 Y 0.079 -228 V 0.083 -229 G 0.090 -230 N 0.097 -231 V 0.101 -232 A 0.098 -233 W 0.091 -234 A 0.080 -235 H 0.067 -236 I 0.054 -237 L 0.046 -238 A 0.045 -239 L 0.048 -240 R 0.054 -241 A 0.062 -242 L 0.067 -243 Q 0.069 -244 D 0.068 -245 P 0.068 -246 K 0.065 -247 K 0.063 -248 A 0.063 -249 P 0.068 -250 S 0.075 -251 I 0.083 -252 R 0.090 -253 G 0.092 -254 Q 0.088 -255 F 0.080 -256 Y 0.072 -257 Y 0.068 -258 I 0.072 -259 S 0.080 -260 D 0.087 -261 D 0.088 -262 T 0.087 -263 P 0.086 -264 H 0.083 -265 Q 0.076 -266 S 0.069 -267 Y 0.062 -268 D 0.055 -269 N 0.048 -270 L 0.042 -271 N 0.038 -272 Y 0.036 -273 T 0.037 -274 L 0.038 -275 S 0.040 -276 K 0.045 -277 E 0.054 -278 F 0.066 -279 G 0.081 -280 L 0.095 -281 R 0.104 -282 L 0.111 -283 D 0.117 -284 S 0.123 -285 R 0.128 -286 W 0.128 -287 S 0.121 -288 F 0.109 -289 P 0.094 -290 L 0.076 -291 S 0.061 -292 L 0.055 -293 M 0.060 -294 Y 0.073 -295 W 0.085 -296 I 0.088 -297 G 0.085 -298 F 0.079 -299 L 0.075 -300 L 0.075 -301 E 0.076 -302 I 0.076 -303 V 0.076 -304 S 0.080 -305 F 0.086 -306 L 0.091 -307 L 0.101 -308 R 0.118 -309 P 0.140 -310 I 0.160 -311 Y 0.174 -312 T 0.184 -313 Y 0.188 -314 R 0.185 -315 P 0.168 -316 P 0.143 -317 F 0.119 -318 N 0.098 -319 R 0.086 -320 H 0.086 -321 I 0.095 -322 V 0.100 -323 T 0.099 -324 L 0.098 -325 S 0.103 -326 N 0.112 -327 S 0.123 -328 V 0.129 -329 F 0.128 -330 T 0.117 -331 F 0.105 -332 S 0.097 -333 Y 0.091 -334 K 0.083 -335 K 0.076 -336 A 0.077 -337 Q 0.085 -338 R 0.088 -339 D 0.082 -340 L 0.072 -341 A 0.067 -342 Y 0.069 -343 K 0.073 -344 P 0.075 -345 L 0.073 -346 Y 0.072 -347 S 0.070 -348 W 0.066 -349 E 0.061 -350 E 0.059 -351 A 0.058 -352 K 0.052 -353 Q 0.046 -354 K 0.045 -355 T 0.053 -356 V 0.065 -357 E 0.073 -358 W 0.070 -359 V 0.061 -360 G 0.053 -361 S 0.047 -362 L 0.045 -363 V 0.047 -364 D 0.052 -365 R 0.060 -366 H 0.074 -367 K 0.096 -368 E 0.127 -369 T 0.160 -370 L 0.194 -371 K 0.231 -372 S 0.271 -373 K 0.307 -374 T 0.326 -375 Q 0.329 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000204246.4_ENST00000641090.1_GN:OR13C3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000204246.4_ENST00000641090.1_GN:OR13C3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index a5ca0c3aa74b50df05de0d2e5667afe0b9980fb7..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000204246.4_ENST00000641090.1_GN:OR13C3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,318 +0,0 @@ ->ENSG00000204246.4|ENST00000641090.1|GN:OR13C3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.431 -2 G 0.446 -3 E 0.469 -4 I 0.484 -5 N 0.478 -6 Q 0.443 -7 T 0.382 -8 L 0.308 -9 V 0.237 -10 S 0.182 -11 E 0.149 -12 F 0.135 -13 L 0.130 -14 L 0.130 -15 L 0.139 -16 G 0.158 -17 L 0.180 -18 S 0.196 -19 G 0.197 -20 Y 0.180 -21 P 0.148 -22 K 0.112 -23 I 0.081 -24 E 0.059 -25 I 0.048 -26 V 0.047 -27 Y 0.055 -28 F 0.066 -29 A 0.070 -30 L 0.064 -31 I 0.054 -32 L 0.049 -33 V 0.051 -34 M 0.053 -35 Y 0.053 -36 L 0.050 -37 V 0.050 -38 I 0.052 -39 L 0.053 -40 I 0.056 -41 G 0.061 -42 N 0.065 -43 G 0.066 -44 V 0.064 -45 L 0.061 -46 I 0.058 -47 I 0.056 -48 A 0.056 -49 S 0.055 -50 I 0.057 -51 F 0.063 -52 D 0.070 -53 S 0.074 -54 H 0.074 -55 F 0.070 -56 H 0.065 -57 T 0.057 -58 P 0.044 -59 M 0.031 -60 Y 0.023 -61 F 0.020 -62 F 0.024 -63 L 0.033 -64 G 0.045 -65 N 0.054 -66 L 0.060 -67 S 0.061 -68 F 0.059 -69 L 0.057 -70 D 0.058 -71 I 0.060 -72 C 0.060 -73 Y 0.061 -74 T 0.061 -75 S 0.063 -76 S 0.064 -77 S 0.067 -78 V 0.070 -79 P 0.069 -80 S 0.063 -81 T 0.058 -82 L 0.054 -83 V 0.051 -84 S 0.051 -85 L 0.057 -86 I 0.066 -87 S 0.076 -88 K 0.081 -89 K 0.078 -90 R 0.070 -91 N 0.062 -92 I 0.054 -93 S 0.048 -94 F 0.043 -95 S 0.041 -96 G 0.041 -97 C 0.040 -98 A 0.037 -99 V 0.035 -100 Q 0.035 -101 M 0.036 -102 F 0.035 -103 F 0.031 -104 G 0.029 -105 F 0.029 -106 A 0.031 -107 M 0.035 -108 G 0.040 -109 S 0.046 -110 T 0.050 -111 E 0.050 -112 C 0.046 -113 L 0.041 -114 L 0.038 -115 L 0.035 -116 G 0.033 -117 M 0.032 -118 M 0.033 -119 A 0.035 -120 F 0.039 -121 D 0.043 -122 R 0.045 -123 Y 0.043 -124 V 0.041 -125 A 0.042 -126 I 0.046 -127 C 0.052 -128 N 0.058 -129 P 0.060 -130 L 0.057 -131 R 0.053 -132 Y 0.052 -133 P 0.053 -134 I 0.057 -135 I 0.061 -136 L 0.065 -137 S 0.066 -138 K 0.068 -139 V 0.068 -140 A 0.062 -141 Y 0.056 -142 V 0.060 -143 L 0.067 -144 M 0.067 -145 A 0.061 -146 S 0.055 -147 V 0.052 -148 S 0.052 -149 W 0.054 -150 L 0.060 -151 S 0.071 -152 G 0.082 -153 G 0.089 -154 I 0.095 -155 N 0.101 -156 S 0.101 -157 A 0.097 -158 V 0.095 -159 Q 0.094 -160 T 0.090 -161 L 0.084 -162 L 0.083 -163 A 0.088 -164 M 0.097 -165 R 0.110 -166 L 0.119 -167 P 0.119 -168 F 0.115 -169 C 0.116 -170 G 0.119 -171 N 0.124 -172 N 0.131 -173 I 0.140 -174 I 0.140 -175 N 0.124 -176 H 0.102 -177 F 0.085 -178 A 0.073 -179 C 0.069 -180 E 0.074 -181 I 0.085 -182 L 0.099 -183 A 0.112 -184 V 0.122 -185 L 0.127 -186 K 0.127 -187 L 0.121 -188 A 0.111 -189 C 0.106 -190 A 0.112 -191 D 0.121 -192 I 0.123 -193 S 0.118 -194 L 0.116 -195 N 0.122 -196 I 0.129 -197 I 0.132 -198 T 0.129 -199 M 0.121 -200 V 0.110 -201 I 0.098 -202 S 0.087 -203 N 0.077 -204 M 0.064 -205 A 0.055 -206 F 0.053 -207 L 0.056 -208 V 0.064 -209 L 0.073 -210 P 0.077 -211 L 0.072 -212 M 0.068 -213 V 0.069 -214 I 0.068 -215 F 0.059 -216 F 0.050 -217 S 0.044 -218 Y 0.040 -219 M 0.039 -220 F 0.043 -221 I 0.053 -222 L 0.067 -223 Y 0.077 -224 T 0.079 -225 I 0.077 -226 L 0.080 -227 Q 0.092 -228 M 0.113 -229 N 0.133 -230 S 0.141 -231 A 0.133 -232 T 0.113 -233 G 0.093 -234 R 0.079 -235 R 0.073 -236 K 0.075 -237 A 0.076 -238 F 0.076 -239 S 0.076 -240 T 0.078 -241 C 0.078 -242 S 0.078 -243 A 0.077 -244 H 0.073 -245 L 0.067 -246 T 0.064 -247 V 0.063 -248 V 0.057 -249 I 0.045 -250 I 0.034 -251 F 0.028 -252 Y 0.028 -253 G 0.031 -254 T 0.035 -255 I 0.036 -256 F 0.035 -257 F 0.039 -258 M 0.052 -259 Y 0.077 -260 A 0.114 -261 K 0.153 -262 P 0.186 -263 K 0.207 -264 S 0.220 -265 Q 0.229 -266 D 0.235 -267 L 0.235 -268 I 0.226 -269 G 0.207 -270 E 0.183 -271 E 0.165 -272 K 0.155 -273 L 0.145 -274 Q 0.128 -275 A 0.112 -276 L 0.104 -277 D 0.100 -278 K 0.094 -279 L 0.087 -280 I 0.079 -281 S 0.072 -282 L 0.071 -283 F 0.083 -284 Y 0.103 -285 G 0.117 -286 V 0.122 -287 V 0.123 -288 T 0.120 -289 P 0.109 -290 M 0.093 -291 L 0.081 -292 N 0.074 -293 P 0.068 -294 I 0.064 -295 L 0.065 -296 Y 0.069 -297 S 0.076 -298 L 0.087 -299 R 0.095 -300 N 0.091 -301 K 0.076 -302 D 0.064 -303 V 0.063 -304 K 0.073 -305 A 0.085 -306 A 0.088 -307 V 0.085 -308 K 0.083 -309 Y 0.090 -310 L 0.112 -311 L 0.151 -312 N 0.207 -313 K 0.275 -314 K 0.343 -315 P 0.386 -316 I 0.392 -317 H 0.380 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000204246.4_ENST00000641090.1_GN:OR13C3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000204246.4_ENST00000641090.1_GN:OR13C3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid deleted file mode 100644 index 237b53bbdd1f9d8ed9379235f65b19b4a0981e18..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000204246.4_ENST00000641090.1_GN:OR13C3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:30.caid +++ /dev/null @@ -1,348 +0,0 @@ ->ENSG00000204246.4|ENST00000641090.1|GN:OR13C3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:30 -1 M 0.097 -2 I 0.083 -3 V 0.065 -4 Q 0.053 -5 L 0.047 -6 I 0.043 -7 C 0.040 -8 T 0.038 -9 V 0.038 -10 C 0.039 -11 F 0.041 -12 L 0.045 -13 A 0.056 -14 V 0.074 -15 N 0.095 -16 T 0.118 -17 F 0.143 -18 H 0.165 -19 V 0.178 -20 R 0.188 -21 S 0.204 -22 S 0.225 -23 F 0.244 -24 D 0.257 -25 F 0.269 -26 L 0.287 -27 K 0.318 -28 A 0.363 -29 D 0.413 -30 D 0.456 -31 M 0.488 -32 G 0.512 -33 E 0.530 -34 I 0.539 -35 N 0.530 -36 Q 0.493 -37 T 0.426 -38 L 0.340 -39 V 0.258 -40 S 0.193 -41 E 0.152 -42 F 0.134 -43 L 0.126 -44 L 0.126 -45 L 0.134 -46 G 0.154 -47 L 0.179 -48 S 0.197 -49 G 0.199 -50 Y 0.180 -51 P 0.145 -52 K 0.108 -53 I 0.077 -54 E 0.058 -55 I 0.048 -56 V 0.047 -57 Y 0.055 -58 F 0.067 -59 A 0.071 -60 L 0.064 -61 I 0.053 -62 L 0.048 -63 V 0.049 -64 M 0.051 -65 Y 0.051 -66 L 0.047 -67 V 0.046 -68 I 0.047 -69 L 0.048 -70 I 0.051 -71 G 0.057 -72 N 0.061 -73 G 0.061 -74 V 0.059 -75 L 0.056 -76 I 0.054 -77 I 0.052 -78 A 0.050 -79 S 0.048 -80 I 0.048 -81 F 0.053 -82 D 0.060 -83 S 0.064 -84 H 0.064 -85 F 0.061 -86 H 0.056 -87 T 0.049 -88 P 0.038 -89 M 0.027 -90 Y 0.020 -91 F 0.017 -92 F 0.021 -93 L 0.029 -94 G 0.039 -95 N 0.048 -96 L 0.055 -97 S 0.057 -98 F 0.056 -99 L 0.054 -100 D 0.055 -101 I 0.057 -102 C 0.058 -103 Y 0.058 -104 T 0.059 -105 S 0.059 -106 S 0.059 -107 S 0.060 -108 V 0.060 -109 P 0.058 -110 S 0.053 -111 T 0.048 -112 L 0.044 -113 V 0.042 -114 S 0.042 -115 L 0.047 -116 I 0.056 -117 S 0.067 -118 K 0.074 -119 K 0.072 -120 R 0.066 -121 N 0.058 -122 I 0.051 -123 S 0.045 -124 F 0.039 -125 S 0.037 -126 G 0.037 -127 C 0.037 -128 A 0.035 -129 V 0.033 -130 Q 0.033 -131 M 0.034 -132 F 0.033 -133 F 0.030 -134 G 0.027 -135 F 0.027 -136 A 0.030 -137 M 0.033 -138 G 0.038 -139 S 0.044 -140 T 0.046 -141 E 0.046 -142 C 0.042 -143 L 0.037 -144 L 0.034 -145 L 0.032 -146 G 0.031 -147 M 0.030 -148 M 0.031 -149 A 0.033 -150 F 0.037 -151 D 0.042 -152 R 0.043 -153 Y 0.042 -154 V 0.040 -155 A 0.041 -156 I 0.045 -157 C 0.051 -158 N 0.057 -159 P 0.059 -160 L 0.056 -161 R 0.053 -162 Y 0.052 -163 P 0.053 -164 I 0.057 -165 I 0.063 -166 L 0.067 -167 S 0.068 -168 K 0.068 -169 V 0.065 -170 A 0.057 -171 Y 0.052 -172 V 0.057 -173 L 0.065 -174 M 0.065 -175 A 0.057 -176 S 0.050 -177 V 0.047 -178 S 0.048 -179 W 0.049 -180 L 0.053 -181 S 0.064 -182 G 0.076 -183 G 0.085 -184 I 0.090 -185 N 0.095 -186 S 0.096 -187 A 0.092 -188 V 0.089 -189 Q 0.089 -190 T 0.086 -191 L 0.081 -192 L 0.080 -193 A 0.085 -194 M 0.094 -195 R 0.107 -196 L 0.117 -197 P 0.118 -198 F 0.115 -199 C 0.115 -200 G 0.118 -201 N 0.120 -202 N 0.126 -203 I 0.134 -204 I 0.134 -205 N 0.119 -206 H 0.098 -207 F 0.082 -208 A 0.071 -209 C 0.069 -210 E 0.074 -211 I 0.084 -212 L 0.097 -213 A 0.108 -214 V 0.118 -215 L 0.123 -216 K 0.124 -217 L 0.117 -218 A 0.106 -219 C 0.100 -220 A 0.104 -221 D 0.113 -222 I 0.115 -223 S 0.111 -224 L 0.109 -225 N 0.114 -226 I 0.121 -227 I 0.124 -228 T 0.121 -229 M 0.113 -230 V 0.102 -231 I 0.091 -232 S 0.082 -233 N 0.072 -234 M 0.061 -235 A 0.053 -236 F 0.051 -237 L 0.055 -238 V 0.063 -239 L 0.072 -240 P 0.075 -241 L 0.069 -242 M 0.064 -243 V 0.066 -244 I 0.065 -245 F 0.058 -246 F 0.048 -247 S 0.041 -248 Y 0.038 -249 M 0.037 -250 F 0.041 -251 I 0.052 -252 L 0.065 -253 Y 0.075 -254 T 0.078 -255 I 0.075 -256 L 0.077 -257 Q 0.089 -258 M 0.109 -259 N 0.128 -260 S 0.137 -261 A 0.130 -262 T 0.112 -263 G 0.093 -264 R 0.080 -265 R 0.075 -266 K 0.076 -267 A 0.077 -268 F 0.075 -269 S 0.075 -270 T 0.076 -271 C 0.077 -272 S 0.076 -273 A 0.075 -274 H 0.072 -275 L 0.066 -276 T 0.063 -277 V 0.063 -278 V 0.057 -279 I 0.046 -280 I 0.034 -281 F 0.028 -282 Y 0.027 -283 G 0.030 -284 T 0.034 -285 I 0.035 -286 F 0.034 -287 F 0.036 -288 M 0.048 -289 Y 0.072 -290 A 0.109 -291 K 0.151 -292 P 0.187 -293 K 0.212 -294 S 0.227 -295 Q 0.239 -296 D 0.247 -297 L 0.249 -298 I 0.240 -299 G 0.219 -300 E 0.193 -301 E 0.172 -302 K 0.161 -303 L 0.150 -304 Q 0.133 -305 A 0.117 -306 L 0.109 -307 D 0.105 -308 K 0.099 -309 L 0.092 -310 I 0.084 -311 S 0.076 -312 L 0.075 -313 F 0.087 -314 Y 0.108 -315 G 0.122 -316 V 0.126 -317 V 0.125 -318 T 0.121 -319 P 0.109 -320 M 0.093 -321 L 0.081 -322 N 0.074 -323 P 0.068 -324 I 0.064 -325 L 0.065 -326 Y 0.069 -327 S 0.075 -328 L 0.086 -329 R 0.095 -330 N 0.090 -331 K 0.075 -332 D 0.063 -333 V 0.062 -334 K 0.071 -335 A 0.083 -336 A 0.086 -337 V 0.082 -338 K 0.080 -339 Y 0.086 -340 L 0.107 -341 L 0.145 -342 N 0.200 -343 K 0.267 -344 K 0.334 -345 P 0.377 -346 I 0.386 -347 H 0.375 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000204390.11_ENST00000375654.5_GN:HSPA1L_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000204390.11_ENST00000375654.5_GN:HSPA1L_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index a7bec3e0a9e2bb92a1091acdfbbf598cad0aff7d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000204390.11_ENST00000375654.5_GN:HSPA1L_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,642 +0,0 @@ ->ENSG00000204390.11|ENST00000375654.5|GN:HSPA1L|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.413 -2 A 0.404 -3 T 0.379 -4 A 0.330 -5 K 0.261 -6 G 0.186 -7 I 0.120 -8 A 0.071 -9 I 0.042 -10 G 0.028 -11 I 0.026 -12 D 0.031 -13 L 0.035 -14 G 0.038 -15 T 0.040 -16 T 0.040 -17 Y 0.038 -18 S 0.036 -19 C 0.035 -20 V 0.036 -21 G 0.037 -22 V 0.038 -23 F 0.043 -24 Q 0.049 -25 H 0.055 -26 G 0.061 -27 K 0.065 -28 V 0.069 -29 E 0.074 -30 I 0.084 -31 I 0.093 -32 A 0.100 -33 N 0.106 -34 D 0.116 -35 Q 0.126 -36 G 0.125 -37 N 0.109 -38 R 0.088 -39 T 0.077 -40 T 0.077 -41 P 0.080 -42 S 0.080 -43 Y 0.077 -44 V 0.077 -45 A 0.080 -46 F 0.081 -47 T 0.080 -48 D 0.079 -49 T 0.082 -50 E 0.089 -51 R 0.095 -52 L 0.095 -53 I 0.093 -54 G 0.093 -55 D 0.099 -56 A 0.105 -57 A 0.102 -58 K 0.089 -59 N 0.076 -60 Q 0.068 -61 V 0.066 -62 A 0.071 -63 M 0.083 -64 N 0.097 -65 P 0.108 -66 Q 0.114 -67 N 0.117 -68 T 0.120 -69 V 0.120 -70 F 0.119 -71 D 0.118 -72 A 0.116 -73 K 0.110 -74 R 0.102 -75 L 0.093 -76 I 0.082 -77 G 0.071 -78 R 0.064 -79 K 0.063 -80 F 0.061 -81 N 0.055 -82 D 0.048 -83 P 0.045 -84 V 0.045 -85 V 0.044 -86 Q 0.042 -87 A 0.042 -88 D 0.045 -89 M 0.045 -90 K 0.041 -91 L 0.035 -92 W 0.031 -93 P 0.031 -94 F 0.036 -95 Q 0.045 -96 V 0.055 -97 I 0.062 -98 N 0.070 -99 E 0.081 -100 G 0.093 -101 G 0.101 -102 K 0.100 -103 P 0.092 -104 K 0.080 -105 V 0.067 -106 L 0.057 -107 V 0.049 -108 S 0.046 -109 Y 0.053 -110 K 0.072 -111 G 0.093 -112 E 0.100 -113 N 0.090 -114 K 0.073 -115 A 0.059 -116 F 0.053 -117 Y 0.054 -118 P 0.062 -119 E 0.074 -120 E 0.085 -121 I 0.087 -122 S 0.079 -123 S 0.068 -124 M 0.064 -125 V 0.064 -126 L 0.062 -127 T 0.058 -128 K 0.056 -129 L 0.061 -130 K 0.070 -131 E 0.077 -132 T 0.076 -133 A 0.074 -134 E 0.079 -135 A 0.083 -136 F 0.081 -137 L 0.077 -138 G 0.082 -139 H 0.091 -140 P 0.092 -141 V 0.078 -142 T 0.058 -143 N 0.040 -144 A 0.026 -145 V 0.018 -146 I 0.017 -147 T 0.023 -148 V 0.033 -149 P 0.041 -150 A 0.045 -151 Y 0.044 -152 F 0.039 -153 N 0.033 -154 D 0.030 -155 S 0.031 -156 Q 0.034 -157 R 0.039 -158 Q 0.047 -159 A 0.054 -160 T 0.055 -161 K 0.055 -162 D 0.058 -163 A 0.059 -164 G 0.054 -165 V 0.050 -166 I 0.054 -167 A 0.062 -168 G 0.069 -169 L 0.072 -170 N 0.073 -171 V 0.067 -172 L 0.056 -173 R 0.045 -174 I 0.043 -175 I 0.049 -176 N 0.056 -177 E 0.060 -178 P 0.057 -179 T 0.051 -180 A 0.046 -181 A 0.041 -182 A 0.038 -183 I 0.037 -184 A 0.039 -185 Y 0.043 -186 G 0.051 -187 L 0.070 -188 D 0.103 -189 K 0.147 -190 G 0.187 -191 G 0.203 -192 Q 0.185 -193 G 0.143 -194 E 0.098 -195 R 0.066 -196 H 0.048 -197 V 0.038 -198 L 0.033 -199 I 0.031 -200 F 0.030 -201 D 0.029 -202 L 0.030 -203 G 0.032 -204 G 0.036 -205 G 0.040 -206 T 0.045 -207 F 0.049 -208 D 0.053 -209 V 0.053 -210 S 0.051 -211 I 0.048 -212 L 0.049 -213 T 0.056 -214 I 0.070 -215 D 0.091 -216 D 0.109 -217 G 0.112 -218 I 0.100 -219 F 0.084 -220 E 0.074 -221 V 0.071 -222 K 0.071 -223 A 0.072 -224 T 0.072 -225 A 0.069 -226 G 0.065 -227 D 0.065 -228 T 0.070 -229 H 0.079 -230 L 0.088 -231 G 0.096 -232 G 0.101 -233 E 0.103 -234 D 0.100 -235 F 0.091 -236 D 0.078 -237 N 0.067 -238 R 0.062 -239 L 0.063 -240 V 0.067 -241 S 0.066 -242 H 0.058 -243 F 0.053 -244 V 0.057 -245 E 0.061 -246 E 0.058 -247 F 0.056 -248 K 0.059 -249 R 0.063 -250 K 0.059 -251 H 0.053 -252 K 0.053 -253 K 0.059 -254 D 0.064 -255 I 0.063 -256 S 0.058 -257 Q 0.054 -258 N 0.051 -259 K 0.047 -260 R 0.042 -261 A 0.040 -262 V 0.040 -263 R 0.044 -264 R 0.052 -265 L 0.058 -266 R 0.059 -267 T 0.058 -268 A 0.058 -269 C 0.058 -270 E 0.056 -271 R 0.056 -272 A 0.057 -273 K 0.058 -274 R 0.059 -275 T 0.061 -276 L 0.063 -277 S 0.062 -278 S 0.060 -279 S 0.059 -280 T 0.058 -281 Q 0.055 -282 A 0.052 -283 N 0.050 -284 L 0.050 -285 E 0.049 -286 I 0.047 -287 D 0.045 -288 S 0.044 -289 L 0.043 -290 Y 0.043 -291 E 0.049 -292 G 0.056 -293 I 0.060 -294 D 0.058 -295 F 0.054 -296 Y 0.050 -297 T 0.048 -298 S 0.049 -299 I 0.054 -300 T 0.061 -301 R 0.069 -302 A 0.073 -303 R 0.072 -304 F 0.071 -305 E 0.076 -306 E 0.083 -307 L 0.081 -308 C 0.070 -309 A 0.062 -310 D 0.064 -311 L 0.071 -312 F 0.074 -313 R 0.072 -314 G 0.070 -315 T 0.065 -316 L 0.055 -317 E 0.047 -318 P 0.043 -319 V 0.043 -320 E 0.045 -321 K 0.050 -322 A 0.061 -323 L 0.073 -324 R 0.081 -325 D 0.080 -326 A 0.075 -327 K 0.071 -328 M 0.069 -329 D 0.068 -330 K 0.069 -331 A 0.077 -332 K 0.085 -333 I 0.083 -334 H 0.068 -335 D 0.048 -336 I 0.031 -337 V 0.023 -338 L 0.023 -339 V 0.029 -340 G 0.037 -341 G 0.045 -342 S 0.052 -343 T 0.056 -344 R 0.057 -345 I 0.059 -346 P 0.064 -347 K 0.072 -348 V 0.078 -349 Q 0.081 -350 R 0.079 -351 L 0.070 -352 L 0.058 -353 Q 0.052 -354 D 0.053 -355 Y 0.058 -356 F 0.068 -357 N 0.083 -358 G 0.102 -359 R 0.118 -360 D 0.125 -361 L 0.118 -362 N 0.103 -363 K 0.093 -364 S 0.092 -365 I 0.097 -366 N 0.098 -367 P 0.094 -368 D 0.089 -369 E 0.087 -370 A 0.088 -371 V 0.087 -372 A 0.081 -373 Y 0.074 -374 G 0.070 -375 A 0.070 -376 A 0.071 -377 V 0.077 -378 Q 0.088 -379 A 0.100 -380 A 0.109 -381 I 0.113 -382 L 0.116 -383 M 0.127 -384 G 0.152 -385 D 0.184 -386 K 0.209 -387 S 0.215 -388 E 0.205 -389 K 0.191 -390 V 0.184 -391 Q 0.184 -392 D 0.184 -393 L 0.178 -394 L 0.167 -395 L 0.154 -396 L 0.139 -397 D 0.124 -398 V 0.113 -399 A 0.104 -400 P 0.092 -401 L 0.081 -402 S 0.076 -403 L 0.073 -404 G 0.072 -405 L 0.081 -406 E 0.099 -407 T 0.120 -408 A 0.137 -409 G 0.147 -410 G 0.145 -411 V 0.130 -412 M 0.106 -413 T 0.088 -414 A 0.084 -415 L 0.092 -416 I 0.101 -417 K 0.101 -418 R 0.095 -419 N 0.090 -420 S 0.090 -421 T 0.092 -422 I 0.095 -423 P 0.100 -424 T 0.105 -425 K 0.105 -426 Q 0.100 -427 T 0.096 -428 Q 0.094 -429 I 0.091 -430 F 0.088 -431 T 0.087 -432 T 0.089 -433 Y 0.095 -434 S 0.105 -435 D 0.117 -436 N 0.128 -437 Q 0.136 -438 P 0.138 -439 G 0.135 -440 V 0.124 -441 L 0.110 -442 I 0.094 -443 Q 0.080 -444 V 0.069 -445 Y 0.061 -446 E 0.056 -447 G 0.052 -448 E 0.050 -449 R 0.051 -450 A 0.058 -451 M 0.071 -452 T 0.081 -453 K 0.086 -454 D 0.086 -455 N 0.085 -456 N 0.087 -457 L 0.092 -458 L 0.094 -459 G 0.093 -460 R 0.092 -461 F 0.096 -462 D 0.105 -463 L 0.119 -464 T 0.134 -465 G 0.153 -466 I 0.169 -467 P 0.174 -468 P 0.169 -469 A 0.165 -470 P 0.173 -471 R 0.186 -472 G 0.188 -473 V 0.173 -474 P 0.149 -475 Q 0.127 -476 I 0.108 -477 E 0.091 -478 V 0.077 -479 T 0.070 -480 F 0.071 -481 D 0.080 -482 I 0.095 -483 D 0.112 -484 A 0.126 -485 N 0.132 -486 G 0.128 -487 I 0.114 -488 L 0.095 -489 N 0.080 -490 V 0.071 -491 T 0.065 -492 A 0.061 -493 T 0.061 -494 D 0.065 -495 K 0.078 -496 S 0.098 -497 T 0.123 -498 G 0.141 -499 K 0.147 -500 V 0.145 -501 N 0.147 -502 K 0.158 -503 I 0.178 -504 T 0.203 -505 I 0.237 -506 T 0.282 -507 N 0.334 -508 D 0.379 -509 K 0.394 -510 G 0.371 -511 R 0.327 -512 L 0.287 -513 S 0.258 -514 K 0.235 -515 E 0.217 -516 E 0.204 -517 I 0.190 -518 E 0.181 -519 R 0.180 -520 M 0.184 -521 V 0.189 -522 L 0.195 -523 D 0.201 -524 A 0.198 -525 E 0.184 -526 K 0.171 -527 Y 0.171 -528 K 0.183 -529 A 0.198 -530 E 0.211 -531 D 0.221 -532 E 0.226 -533 V 0.221 -534 Q 0.210 -535 R 0.192 -536 E 0.172 -537 K 0.159 -538 I 0.155 -539 A 0.151 -540 A 0.143 -541 K 0.140 -542 N 0.143 -543 A 0.141 -544 L 0.130 -545 E 0.113 -546 S 0.096 -547 Y 0.082 -548 A 0.070 -549 F 0.064 -550 N 0.065 -551 M 0.068 -552 K 0.071 -553 S 0.078 -554 V 0.090 -555 V 0.109 -556 S 0.133 -557 D 0.154 -558 E 0.161 -559 G 0.154 -560 L 0.145 -561 K 0.139 -562 G 0.138 -563 K 0.133 -564 I 0.117 -565 S 0.092 -566 E 0.068 -567 S 0.054 -568 D 0.055 -569 K 0.066 -570 N 0.079 -571 K 0.087 -572 I 0.092 -573 L 0.096 -574 D 0.096 -575 K 0.089 -576 C 0.079 -577 N 0.073 -578 E 0.073 -579 L 0.082 -580 L 0.092 -581 S 0.091 -582 W 0.078 -583 L 0.067 -584 E 0.063 -585 V 0.064 -586 N 0.067 -587 Q 0.073 -588 L 0.081 -589 A 0.089 -590 E 0.093 -591 K 0.087 -592 D 0.075 -593 E 0.069 -594 F 0.072 -595 D 0.084 -596 H 0.096 -597 K 0.105 -598 R 0.111 -599 K 0.111 -600 E 0.106 -601 L 0.099 -602 E 0.094 -603 Q 0.090 -604 M 0.083 -605 C 0.073 -606 N 0.067 -607 P 0.071 -608 I 0.080 -609 I 0.087 -610 T 0.095 -611 K 0.116 -612 L 0.159 -613 Y 0.232 -614 Q 0.325 -615 G 0.416 -616 G 0.481 -617 C 0.518 -618 T 0.549 -619 G 0.586 -620 P 0.625 -621 A 0.654 -622 C 0.670 -623 G 0.670 -624 T 0.649 -625 G 0.609 -626 Y 0.578 -627 V 0.582 -628 P 0.611 -629 G 0.638 -630 R 0.654 -631 P 0.665 -632 A 0.674 -633 T 0.681 -634 G 0.688 -635 P 0.696 -636 T 0.699 -637 I 0.701 -638 E 0.702 -639 E 0.690 -640 V 0.658 -641 D 0.628 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000204390.11_ENST00000375654.5_GN:HSPA1L_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:64.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000204390.11_ENST00000375654.5_GN:HSPA1L_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:64.caid deleted file mode 100644 index 84bae074c2cf3c767886f4e8c7b3bced7f144295..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000204390.11_ENST00000375654.5_GN:HSPA1L_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:64.caid +++ /dev/null @@ -1,706 +0,0 @@ ->ENSG00000204390.11|ENST00000375654.5|GN:HSPA1L|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:64 -1 M 0.272 -2 G 0.273 -3 Q 0.277 -4 F 0.282 -5 G 0.281 -6 K 0.276 -7 R 0.275 -8 L 0.274 -9 L 0.267 -10 S 0.260 -11 W 0.262 -12 S 0.271 -13 R 0.282 -14 L 0.302 -15 K 0.341 -16 F 0.403 -17 A 0.474 -18 G 0.533 -19 R 0.576 -20 D 0.608 -21 G 0.630 -22 V 0.641 -23 G 0.646 -24 G 0.648 -25 G 0.640 -26 G 0.624 -27 T 0.606 -28 P 0.587 -29 V 0.566 -30 V 0.545 -31 Q 0.524 -32 F 0.502 -33 D 0.479 -34 I 0.466 -35 E 0.470 -36 G 0.493 -37 A 0.524 -38 P 0.553 -39 T 0.579 -40 Y 0.601 -41 S 0.615 -42 L 0.614 -43 G 0.601 -44 L 0.583 -45 R 0.562 -46 N 0.530 -47 L 0.481 -48 D 0.418 -49 V 0.358 -50 S 0.323 -51 K 0.321 -52 L 0.331 -53 K 0.336 -54 R 0.344 -55 R 0.370 -56 R 0.403 -57 R 0.430 -58 E 0.455 -59 T 0.480 -60 R 0.504 -61 P 0.534 -62 Q 0.572 -63 R 0.608 -64 T 0.626 -65 M 0.614 -66 A 0.569 -67 T 0.492 -68 A 0.397 -69 K 0.298 -70 G 0.208 -71 I 0.133 -72 A 0.080 -73 I 0.046 -74 G 0.030 -75 I 0.026 -76 D 0.029 -77 L 0.033 -78 G 0.036 -79 T 0.038 -80 T 0.040 -81 Y 0.038 -82 S 0.035 -83 C 0.034 -84 V 0.033 -85 G 0.032 -86 V 0.032 -87 F 0.036 -88 Q 0.042 -89 H 0.048 -90 G 0.053 -91 K 0.057 -92 V 0.060 -93 E 0.065 -94 I 0.073 -95 I 0.082 -96 A 0.089 -97 N 0.096 -98 D 0.106 -99 Q 0.116 -100 G 0.114 -101 N 0.098 -102 R 0.078 -103 T 0.069 -104 T 0.070 -105 P 0.074 -106 S 0.074 -107 Y 0.072 -108 V 0.070 -109 A 0.071 -110 F 0.072 -111 T 0.071 -112 D 0.071 -113 T 0.077 -114 E 0.084 -115 R 0.089 -116 L 0.089 -117 I 0.085 -118 G 0.085 -119 D 0.090 -120 A 0.096 -121 A 0.094 -122 K 0.082 -123 N 0.069 -124 Q 0.061 -125 V 0.058 -126 A 0.062 -127 M 0.073 -128 N 0.086 -129 P 0.098 -130 Q 0.105 -131 N 0.110 -132 T 0.113 -133 V 0.112 -134 F 0.109 -135 D 0.108 -136 A 0.106 -137 K 0.101 -138 R 0.094 -139 L 0.087 -140 I 0.075 -141 G 0.064 -142 R 0.058 -143 K 0.058 -144 F 0.056 -145 N 0.051 -146 D 0.046 -147 P 0.043 -148 V 0.043 -149 V 0.042 -150 Q 0.040 -151 A 0.040 -152 D 0.042 -153 M 0.042 -154 K 0.039 -155 L 0.033 -156 W 0.029 -157 P 0.029 -158 F 0.035 -159 Q 0.044 -160 V 0.053 -161 I 0.059 -162 N 0.065 -163 E 0.075 -164 G 0.087 -165 G 0.096 -166 K 0.096 -167 P 0.089 -168 K 0.077 -169 V 0.064 -170 L 0.054 -171 V 0.046 -172 S 0.044 -173 Y 0.050 -174 K 0.067 -175 G 0.086 -176 E 0.093 -177 N 0.085 -178 K 0.069 -179 A 0.056 -180 F 0.050 -181 Y 0.051 -182 P 0.059 -183 E 0.070 -184 E 0.081 -185 I 0.083 -186 S 0.076 -187 S 0.065 -188 M 0.061 -189 V 0.060 -190 L 0.058 -191 T 0.054 -192 K 0.052 -193 L 0.057 -194 K 0.066 -195 E 0.073 -196 T 0.072 -197 A 0.070 -198 E 0.074 -199 A 0.078 -200 F 0.074 -201 L 0.070 -202 G 0.074 -203 H 0.083 -204 P 0.084 -205 V 0.071 -206 T 0.052 -207 N 0.036 -208 A 0.023 -209 V 0.016 -210 I 0.015 -211 T 0.020 -212 V 0.028 -213 P 0.036 -214 A 0.039 -215 Y 0.038 -216 F 0.034 -217 N 0.028 -218 D 0.026 -219 S 0.027 -220 Q 0.030 -221 R 0.035 -222 Q 0.042 -223 A 0.048 -224 T 0.048 -225 K 0.048 -226 D 0.051 -227 A 0.052 -228 G 0.047 -229 V 0.043 -230 I 0.046 -231 A 0.053 -232 G 0.059 -233 L 0.063 -234 N 0.064 -235 V 0.060 -236 L 0.050 -237 R 0.041 -238 I 0.040 -239 I 0.045 -240 N 0.052 -241 E 0.056 -242 P 0.055 -243 T 0.049 -244 A 0.044 -245 A 0.040 -246 A 0.036 -247 I 0.036 -248 A 0.038 -249 Y 0.040 -250 G 0.048 -251 L 0.066 -252 D 0.098 -253 K 0.140 -254 G 0.179 -255 G 0.194 -256 Q 0.175 -257 G 0.135 -258 E 0.093 -259 R 0.063 -260 H 0.047 -261 V 0.038 -262 L 0.033 -263 I 0.031 -264 F 0.029 -265 D 0.029 -266 L 0.030 -267 G 0.032 -268 G 0.035 -269 G 0.039 -270 T 0.043 -271 F 0.048 -272 D 0.052 -273 V 0.052 -274 S 0.050 -275 I 0.048 -276 L 0.049 -277 T 0.055 -278 I 0.069 -279 D 0.090 -280 D 0.107 -281 G 0.110 -282 I 0.098 -283 F 0.082 -284 E 0.072 -285 V 0.069 -286 K 0.070 -287 A 0.072 -288 T 0.072 -289 A 0.069 -290 G 0.066 -291 D 0.065 -292 T 0.070 -293 H 0.080 -294 L 0.089 -295 G 0.097 -296 G 0.102 -297 E 0.103 -298 D 0.101 -299 F 0.092 -300 D 0.078 -301 N 0.066 -302 R 0.059 -303 L 0.055 -304 V 0.051 -305 S 0.046 -306 H 0.042 -307 F 0.045 -308 V 0.055 -309 E 0.061 -310 E 0.059 -311 F 0.056 -312 K 0.059 -313 R 0.063 -314 K 0.059 -315 H 0.054 -316 K 0.056 -317 K 0.062 -318 D 0.067 -319 I 0.066 -320 S 0.060 -321 Q 0.055 -322 N 0.052 -323 K 0.048 -324 R 0.043 -325 A 0.041 -326 V 0.041 -327 R 0.045 -328 R 0.053 -329 L 0.060 -330 R 0.061 -331 T 0.059 -332 A 0.059 -333 C 0.059 -334 E 0.057 -335 R 0.057 -336 A 0.058 -337 K 0.060 -338 R 0.061 -339 T 0.063 -340 L 0.064 -341 S 0.063 -342 S 0.061 -343 S 0.061 -344 T 0.060 -345 Q 0.057 -346 A 0.054 -347 N 0.052 -348 L 0.051 -349 E 0.050 -350 I 0.048 -351 D 0.046 -352 S 0.045 -353 L 0.043 -354 Y 0.044 -355 E 0.049 -356 G 0.057 -357 I 0.061 -358 D 0.060 -359 F 0.056 -360 Y 0.052 -361 T 0.050 -362 S 0.051 -363 I 0.056 -364 T 0.063 -365 R 0.070 -366 A 0.073 -367 R 0.072 -368 F 0.071 -369 E 0.076 -370 E 0.082 -371 L 0.080 -372 C 0.070 -373 A 0.063 -374 D 0.066 -375 L 0.073 -376 F 0.075 -377 R 0.073 -378 G 0.070 -379 T 0.065 -380 L 0.056 -381 E 0.048 -382 P 0.044 -383 V 0.044 -384 E 0.046 -385 K 0.051 -386 A 0.062 -387 L 0.073 -388 R 0.081 -389 D 0.080 -390 A 0.075 -391 K 0.071 -392 M 0.069 -393 D 0.067 -394 K 0.069 -395 A 0.076 -396 K 0.084 -397 I 0.081 -398 H 0.067 -399 D 0.048 -400 I 0.032 -401 V 0.023 -402 L 0.024 -403 V 0.029 -404 G 0.038 -405 G 0.046 -406 S 0.052 -407 T 0.056 -408 R 0.057 -409 I 0.058 -410 P 0.063 -411 K 0.071 -412 V 0.078 -413 Q 0.081 -414 R 0.079 -415 L 0.070 -416 L 0.058 -417 Q 0.051 -418 D 0.052 -419 Y 0.057 -420 F 0.065 -421 N 0.079 -422 G 0.097 -423 R 0.112 -424 D 0.120 -425 L 0.115 -426 N 0.101 -427 K 0.092 -428 S 0.092 -429 I 0.097 -430 N 0.099 -431 P 0.095 -432 D 0.091 -433 E 0.089 -434 A 0.090 -435 V 0.089 -436 A 0.082 -437 Y 0.075 -438 G 0.071 -439 A 0.070 -440 A 0.071 -441 V 0.077 -442 Q 0.088 -443 A 0.099 -444 A 0.107 -445 I 0.110 -446 L 0.113 -447 M 0.124 -448 G 0.150 -449 D 0.184 -450 K 0.211 -451 S 0.219 -452 E 0.211 -453 K 0.198 -454 V 0.191 -455 Q 0.191 -456 D 0.189 -457 L 0.182 -458 L 0.171 -459 L 0.159 -460 L 0.144 -461 D 0.130 -462 V 0.119 -463 A 0.110 -464 P 0.099 -465 L 0.088 -466 S 0.082 -467 L 0.079 -468 G 0.077 -469 L 0.085 -470 E 0.102 -471 T 0.123 -472 A 0.141 -473 G 0.151 -474 G 0.150 -475 V 0.134 -476 M 0.110 -477 T 0.092 -478 A 0.088 -479 L 0.096 -480 I 0.105 -481 K 0.106 -482 R 0.099 -483 N 0.093 -484 S 0.094 -485 T 0.096 -486 I 0.098 -487 P 0.103 -488 T 0.107 -489 K 0.106 -490 Q 0.101 -491 T 0.097 -492 Q 0.096 -493 I 0.094 -494 F 0.092 -495 T 0.091 -496 T 0.092 -497 Y 0.096 -498 S 0.106 -499 D 0.118 -500 N 0.130 -501 Q 0.138 -502 P 0.140 -503 G 0.137 -504 V 0.126 -505 L 0.111 -506 I 0.096 -507 Q 0.082 -508 V 0.071 -509 Y 0.063 -510 E 0.059 -511 G 0.055 -512 E 0.052 -513 R 0.053 -514 A 0.062 -515 M 0.074 -516 T 0.085 -517 K 0.089 -518 D 0.089 -519 N 0.088 -520 N 0.090 -521 L 0.094 -522 L 0.096 -523 G 0.095 -524 R 0.093 -525 F 0.097 -526 D 0.106 -527 L 0.119 -528 T 0.134 -529 G 0.152 -530 I 0.168 -531 P 0.174 -532 P 0.169 -533 A 0.168 -534 P 0.177 -535 R 0.191 -536 G 0.193 -537 V 0.176 -538 P 0.152 -539 Q 0.130 -540 I 0.111 -541 E 0.094 -542 V 0.080 -543 T 0.073 -544 F 0.074 -545 D 0.083 -546 I 0.098 -547 D 0.115 -548 A 0.129 -549 N 0.135 -550 G 0.130 -551 I 0.116 -552 L 0.098 -553 N 0.083 -554 V 0.074 -555 T 0.067 -556 A 0.063 -557 T 0.062 -558 D 0.067 -559 K 0.079 -560 S 0.099 -561 T 0.124 -562 G 0.142 -563 K 0.147 -564 V 0.146 -565 N 0.148 -566 K 0.160 -567 I 0.181 -568 T 0.207 -569 I 0.241 -570 T 0.285 -571 N 0.335 -572 D 0.378 -573 K 0.392 -574 G 0.368 -575 R 0.323 -576 L 0.283 -577 S 0.255 -578 K 0.233 -579 E 0.217 -580 E 0.205 -581 I 0.191 -582 E 0.181 -583 R 0.179 -584 M 0.183 -585 V 0.188 -586 L 0.195 -587 D 0.203 -588 A 0.201 -589 E 0.188 -590 K 0.174 -591 Y 0.175 -592 K 0.188 -593 A 0.204 -594 E 0.218 -595 D 0.229 -596 E 0.233 -597 V 0.229 -598 Q 0.217 -599 R 0.199 -600 E 0.179 -601 K 0.167 -602 I 0.162 -603 A 0.157 -604 A 0.149 -605 K 0.145 -606 N 0.146 -607 A 0.144 -608 L 0.131 -609 E 0.113 -610 S 0.096 -611 Y 0.082 -612 A 0.069 -613 F 0.063 -614 N 0.064 -615 M 0.067 -616 K 0.071 -617 S 0.077 -618 V 0.089 -619 V 0.108 -620 S 0.132 -621 D 0.152 -622 E 0.158 -623 G 0.152 -624 L 0.144 -625 K 0.139 -626 G 0.137 -627 K 0.132 -628 I 0.117 -629 S 0.093 -630 E 0.069 -631 S 0.056 -632 D 0.056 -633 K 0.066 -634 N 0.079 -635 K 0.086 -636 I 0.092 -637 L 0.097 -638 D 0.096 -639 K 0.089 -640 C 0.080 -641 N 0.074 -642 E 0.074 -643 L 0.081 -644 L 0.089 -645 S 0.087 -646 W 0.075 -647 L 0.065 -648 E 0.062 -649 V 0.064 -650 N 0.068 -651 Q 0.073 -652 L 0.082 -653 A 0.090 -654 E 0.093 -655 K 0.088 -656 D 0.077 -657 E 0.070 -658 F 0.074 -659 D 0.085 -660 H 0.097 -661 K 0.106 -662 R 0.112 -663 K 0.112 -664 E 0.106 -665 L 0.094 -666 E 0.083 -667 Q 0.075 -668 M 0.070 -669 C 0.066 -670 N 0.064 -671 P 0.070 -672 I 0.080 -673 I 0.087 -674 T 0.095 -675 K 0.116 -676 L 0.160 -677 Y 0.232 -678 Q 0.325 -679 G 0.417 -680 G 0.481 -681 C 0.516 -682 T 0.546 -683 G 0.583 -684 P 0.623 -685 A 0.652 -686 C 0.668 -687 G 0.666 -688 T 0.642 -689 G 0.598 -690 Y 0.563 -691 V 0.564 -692 P 0.592 -693 G 0.618 -694 R 0.630 -695 P 0.636 -696 A 0.636 -697 T 0.635 -698 G 0.636 -699 P 0.638 -700 T 0.638 -701 I 0.643 -702 E 0.648 -703 E 0.624 -704 V 0.565 -705 D 0.511 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000204710.3_ENST00000377185.3_GN:SPDYC_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000204710.3_ENST00000377185.3_GN:SPDYC_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index ef8d19fe9fbf7e7a4775c4ddebc8dc0b543b2cc7..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000204710.3_ENST00000377185.3_GN:SPDYC_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,275 +0,0 @@ ->ENSG00000204710.3|ENST00000377185.3|GN:SPDYC|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.449 -2 S 0.475 -3 D 0.509 -4 S 0.535 -5 Q 0.553 -6 D 0.567 -7 P 0.580 -8 T 0.589 -9 T 0.594 -10 S 0.603 -11 P 0.616 -12 V 0.632 -13 V 0.649 -14 T 0.663 -15 T 0.664 -16 Q 0.650 -17 V 0.639 -18 E 0.651 -19 L 0.680 -20 G 0.706 -21 G 0.721 -22 C 0.728 -23 S 0.731 -24 R 0.732 -25 Q 0.733 -26 G 0.733 -27 G 0.732 -28 G 0.719 -29 N 0.678 -30 G 0.598 -31 F 0.496 -32 L 0.402 -33 R 0.330 -34 F 0.272 -35 R 0.222 -36 Q 0.180 -37 H 0.140 -38 Q 0.105 -39 E 0.079 -40 V 0.065 -41 Q 0.058 -42 A 0.055 -43 F 0.055 -44 L 0.061 -45 S 0.068 -46 L 0.070 -47 L 0.068 -48 E 0.064 -49 D 0.059 -50 S 0.051 -51 F 0.044 -52 V 0.040 -53 Q 0.039 -54 E 0.041 -55 F 0.048 -56 L 0.060 -57 S 0.078 -58 K 0.094 -59 D 0.105 -60 P 0.110 -61 C 0.108 -62 F 0.100 -63 Q 0.092 -64 I 0.088 -65 S 0.086 -66 D 0.082 -67 K 0.076 -68 Y 0.069 -69 L 0.064 -70 L 0.062 -71 A 0.060 -72 M 0.057 -73 V 0.051 -74 L 0.044 -75 V 0.040 -76 Y 0.042 -77 F 0.047 -78 Q 0.055 -79 R 0.065 -80 A 0.074 -81 H 0.079 -82 L 0.081 -83 K 0.085 -84 L 0.092 -85 S 0.100 -86 E 0.109 -87 Y 0.113 -88 T 0.108 -89 H 0.093 -90 S 0.079 -91 S 0.071 -92 L 0.067 -93 F 0.066 -94 L 0.070 -95 A 0.072 -96 L 0.067 -97 Y 0.061 -98 L 0.058 -99 A 0.058 -100 N 0.057 -101 D 0.060 -102 M 0.067 -103 E 0.079 -104 E 0.094 -105 D 0.115 -106 L 0.140 -107 E 0.161 -108 G 0.165 -109 P 0.147 -110 K 0.123 -111 C 0.105 -112 E 0.095 -113 I 0.086 -114 F 0.077 -115 P 0.072 -116 W 0.073 -117 A 0.080 -118 L 0.088 -119 G 0.093 -120 K 0.094 -121 D 0.091 -122 W 0.084 -123 C 0.076 -124 L 0.072 -125 R 0.074 -126 V 0.078 -127 G 0.080 -128 K 0.076 -129 F 0.073 -130 L 0.073 -131 H 0.072 -132 Q 0.063 -133 R 0.050 -134 D 0.041 -135 K 0.040 -136 L 0.047 -137 W 0.058 -138 A 0.065 -139 R 0.064 -140 M 0.060 -141 G 0.061 -142 F 0.063 -143 R 0.066 -144 A 0.067 -145 V 0.069 -146 V 0.068 -147 S 0.064 -148 R 0.058 -149 Q 0.050 -150 C 0.040 -151 C 0.034 -152 E 0.032 -153 E 0.034 -154 V 0.037 -155 M 0.040 -156 A 0.045 -157 K 0.052 -158 E 0.061 -159 P 0.073 -160 F 0.085 -161 H 0.092 -162 W 0.094 -163 A 0.092 -164 W 0.091 -165 T 0.096 -166 R 0.112 -167 D 0.147 -168 R 0.209 -169 R 0.297 -170 P 0.398 -171 H 0.500 -172 H 0.586 -173 G 0.645 -174 G 0.672 -175 V 0.676 -176 Q 0.670 -177 R 0.659 -178 V 0.649 -179 C 0.649 -180 P 0.665 -181 Q 0.692 -182 V 0.720 -183 P 0.740 -184 V 0.748 -185 R 0.744 -186 L 0.734 -187 P 0.724 -188 R 0.722 -189 G 0.729 -190 P 0.740 -191 G 0.739 -192 L 0.719 -193 S 0.689 -194 P 0.670 -195 P 0.660 -196 H 0.639 -197 C 0.594 -198 S 0.540 -199 P 0.514 -200 C 0.542 -201 G 0.600 -202 L 0.648 -203 P 0.667 -204 Q 0.663 -205 H 0.643 -206 C 0.623 -207 S 0.621 -208 S 0.632 -209 H 0.652 -210 L 0.684 -211 L 0.717 -212 K 0.740 -213 P 0.752 -214 V 0.755 -215 S 0.749 -216 S 0.735 -217 K 0.720 -218 C 0.715 -219 P 0.730 -220 S 0.755 -221 L 0.772 -222 T 0.771 -223 S 0.752 -224 E 0.717 -225 C 0.673 -226 H 0.632 -227 R 0.607 -228 P 0.604 -229 P 0.617 -230 S 0.625 -231 Q 0.603 -232 N 0.550 -233 Y 0.498 -234 L 0.490 -235 S 0.529 -236 R 0.576 -237 V 0.605 -238 K 0.612 -239 N 0.604 -240 A 0.589 -241 W 0.581 -242 G 0.574 -243 G 0.551 -244 D 0.515 -245 F 0.494 -246 L 0.503 -247 I 0.522 -248 V 0.535 -249 L 0.548 -250 P 0.580 -251 P 0.624 -252 Q 0.649 -253 M 0.634 -254 Q 0.596 -255 L 0.562 -256 E 0.541 -257 P 0.525 -258 G 0.506 -259 T 0.491 -260 Y 0.487 -261 S 0.492 -262 L 0.497 -263 R 0.488 -264 I 0.461 -265 F 0.432 -266 P 0.425 -267 K 0.451 -268 P 0.502 -269 P 0.559 -270 A 0.607 -271 R 0.633 -272 P 0.625 -273 G 0.585 -274 H 0.542 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000204710.3_ENST00000377185.3_GN:SPDYC_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000204710.3_ENST00000377185.3_GN:SPDYC_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid deleted file mode 100644 index 9ddde56a1ace0c6f77c5b6b76a350b65dcb4bae6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000204710.3_ENST00000377185.3_GN:SPDYC_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:19.caid +++ /dev/null @@ -1,294 +0,0 @@ ->ENSG00000204710.3|ENST00000377185.3|GN:SPDYC|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:19 -1 M 0.341 -2 L 0.369 -3 W 0.411 -4 A 0.451 -5 I 0.480 -6 P 0.503 -7 E 0.527 -8 L 0.548 -9 G 0.551 -10 S 0.540 -11 P 0.532 -12 C 0.538 -13 P 0.545 -14 I 0.539 -15 S 0.525 -16 I 0.515 -17 S 0.519 -18 Y 0.546 -19 E 0.597 -20 M 0.653 -21 S 0.687 -22 D 0.690 -23 S 0.672 -24 Q 0.653 -25 D 0.649 -26 P 0.655 -27 T 0.662 -28 T 0.668 -29 S 0.679 -30 P 0.696 -31 V 0.714 -32 V 0.725 -33 T 0.726 -34 T 0.714 -35 Q 0.695 -36 V 0.684 -37 E 0.695 -38 L 0.720 -39 G 0.744 -40 G 0.757 -41 C 0.762 -42 S 0.766 -43 R 0.767 -44 Q 0.767 -45 G 0.765 -46 G 0.761 -47 G 0.747 -48 N 0.706 -49 G 0.628 -50 F 0.531 -51 L 0.444 -52 R 0.371 -53 F 0.305 -54 R 0.245 -55 Q 0.191 -56 H 0.145 -57 Q 0.106 -58 E 0.080 -59 V 0.066 -60 Q 0.059 -61 A 0.056 -62 F 0.057 -63 L 0.062 -64 S 0.069 -65 L 0.072 -66 L 0.070 -67 E 0.065 -68 D 0.059 -69 S 0.052 -70 F 0.044 -71 V 0.039 -72 Q 0.038 -73 E 0.040 -74 F 0.046 -75 L 0.058 -76 S 0.075 -77 K 0.091 -78 D 0.102 -79 P 0.108 -80 C 0.106 -81 F 0.098 -82 Q 0.090 -83 I 0.086 -84 S 0.084 -85 D 0.080 -86 K 0.073 -87 Y 0.066 -88 L 0.062 -89 L 0.060 -90 A 0.058 -91 M 0.055 -92 V 0.049 -93 L 0.042 -94 V 0.039 -95 Y 0.041 -96 F 0.046 -97 Q 0.054 -98 R 0.064 -99 A 0.073 -100 H 0.078 -101 L 0.080 -102 K 0.084 -103 L 0.090 -104 S 0.098 -105 E 0.108 -106 Y 0.113 -107 T 0.107 -108 H 0.093 -109 S 0.079 -110 S 0.070 -111 L 0.066 -112 F 0.066 -113 L 0.070 -114 A 0.072 -115 L 0.067 -116 Y 0.060 -117 L 0.058 -118 A 0.057 -119 N 0.057 -120 D 0.060 -121 M 0.068 -122 E 0.082 -123 E 0.099 -124 D 0.121 -125 L 0.148 -126 E 0.170 -127 G 0.172 -128 P 0.154 -129 K 0.127 -130 C 0.108 -131 E 0.098 -132 I 0.090 -133 F 0.081 -134 P 0.076 -135 W 0.078 -136 A 0.085 -137 L 0.094 -138 G 0.099 -139 K 0.099 -140 D 0.094 -141 W 0.086 -142 C 0.078 -143 L 0.073 -144 R 0.073 -145 V 0.077 -146 G 0.078 -147 K 0.075 -148 F 0.072 -149 L 0.073 -150 H 0.071 -151 Q 0.062 -152 R 0.050 -153 D 0.041 -154 K 0.040 -155 L 0.047 -156 W 0.058 -157 A 0.066 -158 R 0.064 -159 M 0.060 -160 G 0.060 -161 F 0.062 -162 R 0.064 -163 A 0.066 -164 V 0.067 -165 V 0.065 -166 S 0.060 -167 R 0.052 -168 Q 0.042 -169 C 0.035 -170 C 0.031 -171 E 0.032 -172 E 0.034 -173 V 0.037 -174 M 0.041 -175 A 0.045 -176 K 0.051 -177 E 0.059 -178 P 0.070 -179 F 0.082 -180 H 0.088 -181 W 0.090 -182 A 0.088 -183 W 0.087 -184 T 0.091 -185 R 0.105 -186 D 0.138 -187 R 0.196 -188 R 0.278 -189 P 0.376 -190 H 0.478 -191 H 0.568 -192 G 0.632 -193 G 0.663 -194 V 0.668 -195 Q 0.661 -196 R 0.650 -197 V 0.642 -198 C 0.644 -199 P 0.660 -200 Q 0.687 -201 V 0.716 -202 P 0.736 -203 V 0.744 -204 R 0.741 -205 L 0.731 -206 P 0.723 -207 R 0.721 -208 G 0.728 -209 P 0.739 -210 G 0.737 -211 L 0.715 -212 S 0.684 -213 P 0.663 -214 P 0.654 -215 H 0.635 -216 C 0.593 -217 S 0.541 -218 P 0.516 -219 C 0.542 -220 G 0.597 -221 L 0.642 -222 P 0.661 -223 Q 0.659 -224 H 0.642 -225 C 0.626 -226 S 0.627 -227 S 0.642 -228 H 0.663 -229 L 0.693 -230 L 0.724 -231 K 0.746 -232 P 0.758 -233 V 0.762 -234 S 0.756 -235 S 0.742 -236 K 0.726 -237 C 0.720 -238 P 0.734 -239 S 0.759 -240 L 0.777 -241 T 0.778 -242 S 0.761 -243 E 0.727 -244 C 0.684 -245 H 0.643 -246 R 0.617 -247 P 0.613 -248 P 0.625 -249 S 0.632 -250 Q 0.610 -251 N 0.558 -252 Y 0.507 -253 L 0.500 -254 S 0.538 -255 R 0.582 -256 V 0.607 -257 K 0.611 -258 N 0.600 -259 A 0.584 -260 W 0.575 -261 G 0.570 -262 G 0.546 -263 D 0.507 -264 F 0.484 -265 L 0.492 -266 I 0.513 -267 V 0.528 -268 L 0.544 -269 P 0.578 -270 P 0.624 -271 Q 0.650 -272 M 0.636 -273 Q 0.597 -274 L 0.562 -275 E 0.539 -276 P 0.518 -277 G 0.492 -278 T 0.473 -279 Y 0.469 -280 S 0.478 -281 L 0.486 -282 R 0.477 -283 I 0.449 -284 F 0.419 -285 P 0.413 -286 K 0.440 -287 P 0.493 -288 P 0.553 -289 A 0.603 -290 R 0.631 -291 P 0.626 -292 G 0.587 -293 H 0.545 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205045.13_ENST00000628453.4_GN:SLFN12L_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205045.13_ENST00000628453.4_GN:SLFN12L_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 086be2d7876cf6dada4407d4ee8becc52b6fc389..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205045.13_ENST00000628453.4_GN:SLFN12L_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,613 +0,0 @@ ->ENSG00000205045.13|ENST00000628453.4|GN:SLFN12L|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.229 -2 E 0.234 -3 K 0.240 -4 I 0.240 -5 R 0.231 -6 N 0.225 -7 V 0.224 -8 F 0.215 -9 H 0.192 -10 C 0.166 -11 E 0.143 -12 A 0.129 -13 H 0.127 -14 R 0.142 -15 I 0.165 -16 L 0.179 -17 Y 0.179 -18 I 0.171 -19 C 0.164 -20 E 0.156 -21 S 0.142 -22 Q 0.123 -23 F 0.110 -24 L 0.107 -25 R 0.105 -26 N 0.101 -27 F 0.097 -28 I 0.097 -29 R 0.104 -30 K 0.112 -31 E 0.116 -32 F 0.121 -33 L 0.136 -34 R 0.171 -35 G 0.222 -36 N 0.266 -37 G 0.279 -38 L 0.258 -39 A 0.225 -40 A 0.194 -41 G 0.165 -42 K 0.135 -43 M 0.110 -44 N 0.096 -45 I 0.087 -46 S 0.077 -47 I 0.065 -48 D 0.053 -49 L 0.044 -50 D 0.041 -51 T 0.042 -52 N 0.043 -53 Y 0.047 -54 A 0.053 -55 E 0.061 -56 L 0.068 -57 V 0.076 -58 L 0.085 -59 N 0.088 -60 V 0.084 -61 G 0.081 -62 R 0.085 -63 V 0.094 -64 T 0.101 -65 L 0.111 -66 G 0.133 -67 E 0.166 -68 N 0.199 -69 N 0.217 -70 R 0.216 -71 K 0.206 -72 K 0.193 -73 M 0.181 -74 K 0.169 -75 D 0.154 -76 C 0.132 -77 Q 0.111 -78 L 0.096 -79 R 0.086 -80 K 0.077 -81 Q 0.072 -82 Q 0.073 -83 N 0.072 -84 E 0.067 -85 N 0.060 -86 V 0.056 -87 S 0.056 -88 R 0.055 -89 A 0.054 -90 V 0.053 -91 C 0.054 -92 A 0.059 -93 L 0.070 -94 L 0.079 -95 N 0.081 -96 S 0.077 -97 G 0.074 -98 G 0.073 -99 G 0.075 -100 V 0.075 -101 I 0.072 -102 K 0.067 -103 A 0.063 -104 E 0.063 -105 V 0.069 -106 E 0.080 -107 N 0.093 -108 K 0.101 -109 G 0.103 -110 Y 0.099 -111 S 0.094 -112 Y 0.096 -113 K 0.104 -114 K 0.114 -115 D 0.123 -116 G 0.126 -117 I 0.118 -118 G 0.101 -119 L 0.082 -120 D 0.069 -121 L 0.066 -122 E 0.070 -123 N 0.072 -124 S 0.069 -125 F 0.065 -126 S 0.065 -127 N 0.065 -128 M 0.062 -129 L 0.057 -130 P 0.058 -131 F 0.068 -132 V 0.080 -133 P 0.079 -134 N 0.062 -135 F 0.041 -136 L 0.027 -137 D 0.021 -138 F 0.022 -139 M 0.026 -140 Q 0.031 -141 N 0.033 -142 G 0.031 -143 N 0.026 -144 Y 0.021 -145 F 0.019 -146 H 0.021 -147 I 0.027 -148 F 0.034 -149 V 0.043 -150 K 0.055 -151 S 0.070 -152 W 0.090 -153 S 0.111 -154 L 0.129 -155 E 0.141 -156 T 0.147 -157 S 0.147 -158 G 0.143 -159 P 0.136 -160 Q 0.130 -161 I 0.129 -162 A 0.130 -163 T 0.130 -164 L 0.126 -165 S 0.117 -166 S 0.105 -167 S 0.093 -168 L 0.082 -169 Y 0.078 -170 K 0.082 -171 R 0.090 -172 D 0.096 -173 V 0.101 -174 T 0.113 -175 S 0.130 -176 A 0.146 -177 K 0.153 -178 V 0.146 -179 M 0.125 -180 N 0.099 -181 A 0.077 -182 S 0.064 -183 A 0.060 -184 A 0.065 -185 L 0.077 -186 E 0.090 -187 F 0.098 -188 L 0.103 -189 K 0.108 -190 D 0.110 -191 M 0.113 -192 E 0.128 -193 K 0.162 -194 T 0.212 -195 G 0.259 -196 G 0.286 -197 R 0.288 -198 A 0.282 -199 Y 0.284 -200 L 0.291 -201 R 0.297 -202 P 0.301 -203 E 0.307 -204 F 0.319 -205 P 0.340 -206 A 0.365 -207 K 0.388 -208 R 0.413 -209 A 0.446 -210 C 0.475 -211 V 0.490 -212 D 0.495 -213 V 0.487 -214 Q 0.459 -215 E 0.420 -216 E 0.379 -217 S 0.329 -218 N 0.265 -219 M 0.202 -220 E 0.152 -221 A 0.114 -222 L 0.082 -223 A 0.063 -224 A 0.056 -225 D 0.057 -226 F 0.057 -227 F 0.056 -228 N 0.056 -229 R 0.059 -230 T 0.069 -231 E 0.083 -232 L 0.096 -233 G 0.102 -234 Y 0.101 -235 K 0.096 -236 E 0.093 -237 K 0.089 -238 L 0.084 -239 T 0.077 -240 F 0.072 -241 T 0.069 -242 E 0.065 -243 S 0.058 -244 T 0.051 -245 H 0.046 -246 V 0.049 -247 E 0.058 -248 I 0.071 -249 K 0.080 -250 N 0.081 -251 F 0.075 -252 S 0.066 -253 T 0.056 -254 E 0.047 -255 K 0.041 -256 L 0.039 -257 L 0.037 -258 Q 0.037 -259 R 0.039 -260 I 0.043 -261 T 0.046 -262 E 0.047 -263 I 0.045 -264 L 0.041 -265 P 0.037 -266 Q 0.037 -267 Y 0.039 -268 V 0.041 -269 S 0.044 -270 A 0.052 -271 F 0.064 -272 A 0.071 -273 N 0.070 -274 T 0.070 -275 D 0.074 -276 G 0.079 -277 G 0.079 -278 Y 0.074 -279 L 0.068 -280 F 0.070 -281 V 0.081 -282 G 0.092 -283 L 0.094 -284 N 0.085 -285 E 0.078 -286 D 0.078 -287 K 0.086 -288 E 0.093 -289 V 0.094 -290 I 0.088 -291 G 0.081 -292 F 0.075 -293 K 0.071 -294 A 0.066 -295 E 0.057 -296 K 0.049 -297 S 0.047 -298 Y 0.053 -299 L 0.063 -300 T 0.068 -301 K 0.067 -302 L 0.067 -303 E 0.074 -304 E 0.080 -305 V 0.080 -306 T 0.078 -307 K 0.080 -308 N 0.086 -309 S 0.101 -310 I 0.122 -311 G 0.145 -312 K 0.165 -313 L 0.177 -314 P 0.176 -315 V 0.167 -316 H 0.160 -317 H 0.160 -318 F 0.167 -319 C 0.177 -320 V 0.184 -321 E 0.189 -322 K 0.189 -323 G 0.178 -324 T 0.161 -325 I 0.138 -326 N 0.110 -327 Y 0.078 -328 L 0.051 -329 C 0.035 -330 K 0.031 -331 F 0.032 -332 L 0.037 -333 G 0.045 -334 V 0.056 -335 Y 0.067 -336 D 0.073 -337 K 0.077 -338 G 0.081 -339 R 0.086 -340 L 0.087 -341 C 0.080 -342 G 0.065 -343 Y 0.049 -344 V 0.037 -345 Y 0.030 -346 A 0.030 -347 L 0.036 -348 R 0.047 -349 V 0.054 -350 E 0.054 -351 R 0.051 -352 F 0.050 -353 C 0.054 -354 C 0.064 -355 A 0.077 -356 V 0.090 -357 F 0.095 -358 A 0.093 -359 K 0.086 -360 K 0.081 -361 P 0.081 -362 D 0.085 -363 S 0.090 -364 W 0.090 -365 H 0.085 -366 V 0.081 -367 K 0.081 -368 D 0.086 -369 N 0.095 -370 R 0.105 -371 V 0.108 -372 K 0.107 -373 Q 0.100 -374 L 0.086 -375 T 0.068 -376 E 0.053 -377 K 0.045 -378 E 0.044 -379 W 0.047 -380 I 0.056 -381 Q 0.072 -382 F 0.097 -383 M 0.129 -384 V 0.164 -385 D 0.200 -386 S 0.254 -387 E 0.335 -388 P 0.430 -389 V 0.508 -390 C 0.547 -391 E 0.546 -392 E 0.524 -393 L 0.507 -394 P 0.517 -395 S 0.551 -396 P 0.586 -397 A 0.593 -398 S 0.565 -399 T 0.527 -400 S 0.508 -401 S 0.512 -402 P 0.515 -403 V 0.492 -404 S 0.439 -405 Q 0.374 -406 S 0.316 -407 Y 0.281 -408 P 0.274 -409 L 0.280 -410 R 0.277 -411 E 0.256 -412 Y 0.229 -413 I 0.210 -414 N 0.197 -415 F 0.186 -416 K 0.180 -417 I 0.177 -418 Q 0.175 -419 P 0.170 -420 L 0.159 -421 R 0.148 -422 Y 0.148 -423 H 0.166 -424 L 0.202 -425 P 0.242 -426 G 0.266 -427 L 0.261 -428 S 0.233 -429 E 0.202 -430 K 0.177 -431 I 0.161 -432 T 0.150 -433 C 0.143 -434 A 0.138 -435 P 0.132 -436 K 0.123 -437 T 0.112 -438 F 0.106 -439 C 0.104 -440 R 0.101 -441 N 0.095 -442 L 0.092 -443 F 0.098 -444 S 0.111 -445 Q 0.125 -446 H 0.129 -447 E 0.121 -448 G 0.109 -449 L 0.100 -450 K 0.099 -451 Q 0.100 -452 L 0.098 -453 I 0.095 -454 C 0.098 -455 E 0.110 -456 E 0.126 -457 M 0.139 -458 G 0.143 -459 S 0.142 -460 V 0.143 -461 N 0.149 -462 K 0.155 -463 G 0.151 -464 S 0.134 -465 L 0.111 -466 I 0.090 -467 F 0.075 -468 S 0.063 -469 R 0.055 -470 S 0.050 -471 W 0.053 -472 S 0.065 -473 L 0.085 -474 D 0.108 -475 L 0.127 -476 G 0.136 -477 L 0.137 -478 Q 0.136 -479 E 0.133 -480 N 0.126 -481 H 0.115 -482 K 0.101 -483 V 0.086 -484 L 0.076 -485 C 0.073 -486 D 0.069 -487 A 0.060 -488 L 0.052 -489 L 0.049 -490 I 0.054 -491 S 0.063 -492 Q 0.076 -493 D 0.093 -494 K 0.110 -495 P 0.118 -496 P 0.110 -497 V 0.092 -498 L 0.075 -499 Y 0.066 -500 T 0.067 -501 F 0.078 -502 H 0.092 -503 M 0.099 -504 V 0.094 -505 Q 0.085 -506 D 0.082 -507 E 0.087 -508 E 0.097 -509 F 0.107 -510 K 0.110 -511 D 0.106 -512 Y 0.102 -513 S 0.101 -514 T 0.094 -515 Q 0.077 -516 T 0.061 -517 A 0.054 -518 Q 0.052 -519 T 0.052 -520 L 0.058 -521 K 0.069 -522 Q 0.075 -523 K 0.073 -524 L 0.069 -525 A 0.073 -526 K 0.085 -527 I 0.105 -528 G 0.127 -529 G 0.140 -530 Y 0.139 -531 T 0.130 -532 K 0.121 -533 K 0.112 -534 V 0.098 -535 C 0.081 -536 V 0.068 -537 M 0.059 -538 T 0.054 -539 K 0.052 -540 I 0.053 -541 F 0.060 -542 Y 0.077 -543 L 0.106 -544 S 0.140 -545 P 0.173 -546 E 0.201 -547 G 0.217 -548 K 0.216 -549 T 0.202 -550 S 0.187 -551 C 0.178 -552 Q 0.173 -553 Y 0.168 -554 D 0.160 -555 L 0.149 -556 N 0.136 -557 S 0.127 -558 Q 0.124 -559 V 0.127 -560 I 0.133 -561 Y 0.135 -562 P 0.132 -563 E 0.128 -564 S 0.125 -565 Y 0.122 -566 Y 0.119 -567 W 0.116 -568 T 0.116 -569 T 0.118 -570 A 0.120 -571 Q 0.119 -572 T 0.114 -573 M 0.107 -574 K 0.099 -575 D 0.095 -576 L 0.100 -577 E 0.112 -578 K 0.120 -579 A 0.124 -580 L 0.132 -581 S 0.144 -582 N 0.160 -583 I 0.179 -584 L 0.201 -585 P 0.222 -586 K 0.232 -587 E 0.226 -588 N 0.202 -589 Q 0.167 -590 I 0.136 -591 F 0.116 -592 L 0.104 -593 F 0.098 -594 V 0.100 -595 C 0.109 -596 L 0.119 -597 F 0.127 -598 R 0.133 -599 F 0.134 -600 C 0.128 -601 L 0.119 -602 F 0.113 -603 V 0.109 -604 C 0.101 -605 W 0.091 -606 F 0.083 -607 V 0.075 -608 C 0.069 -609 F 0.070 -610 F 0.086 -611 L 0.111 -612 R 0.131 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205045.13_ENST00000628453.4_GN:SLFN12L_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205045.13_ENST00000628453.4_GN:SLFN12L_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid deleted file mode 100644 index 93104b7e3d534b5923b56bd7c85df58711e7779a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205045.13_ENST00000628453.4_GN:SLFN12L_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid +++ /dev/null @@ -1,616 +0,0 @@ ->ENSG00000205045.13|ENST00000628453.4|GN:SLFN12L|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 -1 M 0.173 -2 K 0.157 -3 I 0.140 -4 M 0.131 -5 E 0.134 -6 K 0.144 -7 I 0.152 -8 R 0.160 -9 N 0.171 -10 V 0.179 -11 F 0.176 -12 H 0.163 -13 C 0.152 -14 E 0.144 -15 A 0.140 -16 H 0.141 -17 R 0.153 -18 I 0.171 -19 L 0.181 -20 Y 0.180 -21 I 0.171 -22 C 0.161 -23 E 0.151 -24 S 0.136 -25 Q 0.116 -26 F 0.101 -27 L 0.096 -28 R 0.093 -29 N 0.089 -30 F 0.086 -31 I 0.089 -32 R 0.096 -33 K 0.106 -34 E 0.111 -35 F 0.117 -36 L 0.133 -37 R 0.170 -38 G 0.221 -39 N 0.265 -40 G 0.279 -41 L 0.258 -42 A 0.224 -43 A 0.193 -44 G 0.165 -45 K 0.135 -46 M 0.110 -47 N 0.096 -48 I 0.086 -49 S 0.076 -50 I 0.065 -51 D 0.053 -52 L 0.044 -53 D 0.041 -54 T 0.041 -55 N 0.043 -56 Y 0.046 -57 A 0.053 -58 E 0.060 -59 L 0.067 -60 V 0.076 -61 L 0.084 -62 N 0.087 -63 V 0.083 -64 G 0.081 -65 R 0.085 -66 V 0.093 -67 T 0.100 -68 L 0.111 -69 G 0.133 -70 E 0.167 -71 N 0.200 -72 N 0.217 -73 R 0.216 -74 K 0.205 -75 K 0.192 -76 M 0.180 -77 K 0.168 -78 D 0.153 -79 C 0.131 -80 Q 0.110 -81 L 0.095 -82 R 0.085 -83 K 0.077 -84 Q 0.072 -85 Q 0.073 -86 N 0.072 -87 E 0.067 -88 N 0.060 -89 V 0.056 -90 S 0.055 -91 R 0.055 -92 A 0.054 -93 V 0.053 -94 C 0.053 -95 A 0.059 -96 L 0.070 -97 L 0.079 -98 N 0.080 -99 S 0.077 -100 G 0.073 -101 G 0.073 -102 G 0.074 -103 V 0.074 -104 I 0.072 -105 K 0.067 -106 A 0.063 -107 E 0.063 -108 V 0.069 -109 E 0.080 -110 N 0.093 -111 K 0.102 -112 G 0.104 -113 Y 0.100 -114 S 0.097 -115 Y 0.099 -116 K 0.107 -117 K 0.118 -118 D 0.126 -119 G 0.129 -120 I 0.121 -121 G 0.104 -122 L 0.084 -123 D 0.070 -124 L 0.066 -125 E 0.069 -126 N 0.072 -127 S 0.068 -128 F 0.065 -129 S 0.065 -130 N 0.065 -131 M 0.062 -132 L 0.057 -133 P 0.058 -134 F 0.069 -135 V 0.081 -136 P 0.080 -137 N 0.063 -138 F 0.041 -139 L 0.027 -140 D 0.021 -141 F 0.022 -142 M 0.026 -143 Q 0.031 -144 N 0.034 -145 G 0.031 -146 N 0.026 -147 Y 0.021 -148 F 0.019 -149 H 0.021 -150 I 0.026 -151 F 0.034 -152 V 0.043 -153 K 0.054 -154 S 0.070 -155 W 0.090 -156 S 0.111 -157 L 0.128 -158 E 0.140 -159 T 0.146 -160 S 0.146 -161 G 0.142 -162 P 0.135 -163 Q 0.130 -164 I 0.129 -165 A 0.130 -166 T 0.130 -167 L 0.125 -168 S 0.116 -169 S 0.105 -170 S 0.092 -171 L 0.082 -172 Y 0.078 -173 K 0.081 -174 R 0.088 -175 D 0.095 -176 V 0.101 -177 T 0.112 -178 S 0.129 -179 A 0.146 -180 K 0.153 -181 V 0.146 -182 M 0.125 -183 N 0.099 -184 A 0.077 -185 S 0.064 -186 A 0.060 -187 A 0.064 -188 L 0.077 -189 E 0.090 -190 F 0.098 -191 L 0.103 -192 K 0.108 -193 D 0.110 -194 M 0.113 -195 E 0.128 -196 K 0.163 -197 T 0.211 -198 G 0.259 -199 G 0.284 -200 R 0.286 -201 A 0.280 -202 Y 0.283 -203 L 0.291 -204 R 0.297 -205 P 0.301 -206 E 0.308 -207 F 0.321 -208 P 0.342 -209 A 0.367 -210 K 0.391 -211 R 0.416 -212 A 0.448 -213 C 0.476 -214 V 0.491 -215 D 0.496 -216 V 0.488 -217 Q 0.460 -218 E 0.421 -219 E 0.381 -220 S 0.330 -221 N 0.266 -222 M 0.201 -223 E 0.151 -224 A 0.113 -225 L 0.081 -226 A 0.061 -227 A 0.055 -228 D 0.055 -229 F 0.056 -230 F 0.055 -231 N 0.055 -232 R 0.059 -233 T 0.068 -234 E 0.082 -235 L 0.095 -236 G 0.102 -237 Y 0.101 -238 K 0.097 -239 E 0.093 -240 K 0.090 -241 L 0.084 -242 T 0.077 -243 F 0.072 -244 T 0.069 -245 E 0.064 -246 S 0.058 -247 T 0.050 -248 H 0.046 -249 V 0.048 -250 E 0.058 -251 I 0.070 -252 K 0.079 -253 N 0.080 -254 F 0.075 -255 S 0.066 -256 T 0.057 -257 E 0.048 -258 K 0.042 -259 L 0.039 -260 L 0.037 -261 Q 0.037 -262 R 0.039 -263 I 0.043 -264 T 0.046 -265 E 0.046 -266 I 0.045 -267 L 0.041 -268 P 0.037 -269 Q 0.037 -270 Y 0.039 -271 V 0.041 -272 S 0.044 -273 A 0.052 -274 F 0.064 -275 A 0.070 -276 N 0.070 -277 T 0.070 -278 D 0.074 -279 G 0.079 -280 G 0.078 -281 Y 0.073 -282 L 0.068 -283 F 0.070 -284 V 0.081 -285 G 0.092 -286 L 0.093 -287 N 0.085 -288 E 0.077 -289 D 0.078 -290 K 0.086 -291 E 0.093 -292 V 0.094 -293 I 0.089 -294 G 0.081 -295 F 0.076 -296 K 0.072 -297 A 0.066 -298 E 0.058 -299 K 0.049 -300 S 0.047 -301 Y 0.054 -302 L 0.064 -303 T 0.069 -304 K 0.067 -305 L 0.067 -306 E 0.074 -307 E 0.080 -308 V 0.080 -309 T 0.079 -310 K 0.081 -311 N 0.088 -312 S 0.102 -313 I 0.123 -314 G 0.146 -315 K 0.166 -316 L 0.177 -317 P 0.176 -318 V 0.167 -319 H 0.159 -320 H 0.159 -321 F 0.166 -322 C 0.174 -323 V 0.181 -324 E 0.186 -325 K 0.185 -326 G 0.176 -327 T 0.159 -328 I 0.138 -329 N 0.110 -330 Y 0.078 -331 L 0.051 -332 C 0.035 -333 K 0.031 -334 F 0.032 -335 L 0.037 -336 G 0.045 -337 V 0.056 -338 Y 0.067 -339 D 0.073 -340 K 0.076 -341 G 0.081 -342 R 0.086 -343 L 0.087 -344 C 0.079 -345 G 0.065 -346 Y 0.049 -347 V 0.037 -348 Y 0.030 -349 A 0.030 -350 L 0.036 -351 R 0.046 -352 V 0.054 -353 E 0.054 -354 R 0.051 -355 F 0.050 -356 C 0.054 -357 C 0.063 -358 A 0.077 -359 V 0.090 -360 F 0.095 -361 A 0.092 -362 K 0.086 -363 K 0.081 -364 P 0.080 -365 D 0.085 -366 S 0.089 -367 W 0.089 -368 H 0.084 -369 V 0.080 -370 K 0.080 -371 D 0.085 -372 N 0.094 -373 R 0.103 -374 V 0.107 -375 K 0.106 -376 Q 0.099 -377 L 0.085 -378 T 0.067 -379 E 0.053 -380 K 0.045 -381 E 0.044 -382 W 0.047 -383 I 0.056 -384 Q 0.071 -385 F 0.096 -386 M 0.128 -387 V 0.161 -388 D 0.198 -389 S 0.252 -390 E 0.332 -391 P 0.427 -392 V 0.506 -393 C 0.544 -394 E 0.543 -395 E 0.520 -396 L 0.503 -397 P 0.513 -398 S 0.548 -399 P 0.583 -400 A 0.590 -401 S 0.563 -402 T 0.524 -403 S 0.505 -404 S 0.508 -405 P 0.511 -406 V 0.487 -407 S 0.434 -408 Q 0.369 -409 S 0.312 -410 Y 0.277 -411 P 0.270 -412 L 0.276 -413 R 0.273 -414 E 0.252 -415 Y 0.225 -416 I 0.205 -417 N 0.192 -418 F 0.183 -419 K 0.178 -420 I 0.176 -421 Q 0.174 -422 P 0.169 -423 L 0.158 -424 R 0.147 -425 Y 0.146 -426 H 0.165 -427 L 0.201 -428 P 0.241 -429 G 0.265 -430 L 0.261 -431 S 0.234 -432 E 0.202 -433 K 0.177 -434 I 0.160 -435 T 0.150 -436 C 0.142 -437 A 0.138 -438 P 0.132 -439 K 0.123 -440 T 0.112 -441 F 0.106 -442 C 0.104 -443 R 0.101 -444 N 0.095 -445 L 0.092 -446 F 0.097 -447 S 0.111 -448 Q 0.125 -449 H 0.129 -450 E 0.120 -451 G 0.107 -452 L 0.095 -453 K 0.089 -454 Q 0.087 -455 L 0.088 -456 I 0.090 -457 C 0.097 -458 E 0.110 -459 E 0.126 -460 M 0.139 -461 G 0.143 -462 S 0.142 -463 V 0.143 -464 N 0.150 -465 K 0.155 -466 G 0.152 -467 S 0.135 -468 L 0.112 -469 I 0.091 -470 F 0.075 -471 S 0.064 -472 R 0.055 -473 S 0.050 -474 W 0.053 -475 S 0.065 -476 L 0.085 -477 D 0.109 -478 L 0.128 -479 G 0.137 -480 L 0.138 -481 Q 0.137 -482 E 0.133 -483 N 0.126 -484 H 0.115 -485 K 0.100 -486 V 0.085 -487 L 0.076 -488 C 0.073 -489 D 0.069 -490 A 0.060 -491 L 0.052 -492 L 0.050 -493 I 0.054 -494 S 0.063 -495 Q 0.076 -496 D 0.093 -497 K 0.110 -498 P 0.118 -499 P 0.110 -500 V 0.092 -501 L 0.075 -502 Y 0.066 -503 T 0.067 -504 F 0.078 -505 H 0.092 -506 M 0.099 -507 V 0.094 -508 Q 0.084 -509 D 0.082 -510 E 0.087 -511 E 0.097 -512 F 0.107 -513 K 0.110 -514 D 0.106 -515 Y 0.102 -516 S 0.101 -517 T 0.094 -518 Q 0.077 -519 T 0.061 -520 A 0.054 -521 Q 0.052 -522 T 0.052 -523 L 0.058 -524 K 0.068 -525 Q 0.075 -526 K 0.073 -527 L 0.069 -528 A 0.072 -529 K 0.084 -530 I 0.104 -531 G 0.126 -532 G 0.139 -533 Y 0.139 -534 T 0.130 -535 K 0.121 -536 K 0.112 -537 V 0.098 -538 C 0.081 -539 V 0.068 -540 M 0.059 -541 T 0.054 -542 K 0.052 -543 I 0.053 -544 F 0.060 -545 Y 0.077 -546 L 0.106 -547 S 0.141 -548 P 0.173 -549 E 0.200 -550 G 0.217 -551 K 0.216 -552 T 0.202 -553 S 0.187 -554 C 0.179 -555 Q 0.173 -556 Y 0.168 -557 D 0.160 -558 L 0.149 -559 N 0.137 -560 S 0.127 -561 Q 0.125 -562 V 0.128 -563 I 0.133 -564 Y 0.134 -565 P 0.131 -566 E 0.127 -567 S 0.125 -568 Y 0.123 -569 Y 0.120 -570 W 0.117 -571 T 0.116 -572 T 0.118 -573 A 0.120 -574 Q 0.119 -575 T 0.114 -576 M 0.107 -577 K 0.099 -578 D 0.095 -579 L 0.100 -580 E 0.111 -581 K 0.119 -582 A 0.123 -583 L 0.131 -584 S 0.143 -585 N 0.159 -586 I 0.178 -587 L 0.200 -588 P 0.220 -589 K 0.230 -590 E 0.224 -591 N 0.198 -592 Q 0.164 -593 I 0.133 -594 F 0.112 -595 L 0.100 -596 F 0.094 -597 V 0.096 -598 C 0.105 -599 L 0.116 -600 F 0.124 -601 R 0.130 -602 F 0.131 -603 C 0.125 -604 L 0.116 -605 F 0.110 -606 V 0.106 -607 C 0.099 -608 W 0.089 -609 F 0.081 -610 V 0.074 -611 C 0.068 -612 F 0.069 -613 F 0.084 -614 L 0.110 -615 R 0.130 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205186.4_ENST00000379071.4_GN:FABP9_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205186.4_ENST00000379071.4_GN:FABP9_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 41094b6589edb3a026d81b86ae0d8e4f0e996598..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205186.4_ENST00000379071.4_GN:FABP9_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,133 +0,0 @@ ->ENSG00000205186.4|ENST00000379071.4|GN:FABP9|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.215 -2 V 0.180 -3 E 0.130 -4 P 0.086 -5 F 0.057 -6 L 0.045 -7 G 0.045 -8 T 0.049 -9 W 0.050 -10 K 0.047 -11 L 0.043 -12 V 0.045 -13 S 0.055 -14 S 0.067 -15 E 0.074 -16 N 0.072 -17 F 0.065 -18 E 0.058 -19 D 0.052 -20 Y 0.048 -21 M 0.049 -22 K 0.058 -23 E 0.078 -24 L 0.109 -25 G 0.139 -26 V 0.151 -27 N 0.137 -28 F 0.114 -29 A 0.102 -30 A 0.104 -31 R 0.113 -32 N 0.121 -33 M 0.128 -34 A 0.136 -35 G 0.139 -36 L 0.131 -37 V 0.111 -38 K 0.083 -39 P 0.055 -40 T 0.037 -41 V 0.028 -42 T 0.025 -43 I 0.025 -44 S 0.028 -45 V 0.036 -46 D 0.047 -47 G 0.054 -48 K 0.054 -49 M 0.048 -50 M 0.041 -51 T 0.038 -52 I 0.038 -53 R 0.040 -54 T 0.045 -55 E 0.054 -56 S 0.065 -57 S 0.073 -58 F 0.078 -59 Q 0.080 -60 D 0.079 -61 T 0.077 -62 K 0.073 -63 I 0.065 -64 S 0.054 -65 F 0.043 -66 K 0.039 -67 L 0.043 -68 G 0.048 -69 E 0.050 -70 E 0.049 -71 F 0.051 -72 D 0.058 -73 E 0.067 -74 T 0.073 -75 T 0.073 -76 A 0.072 -77 D 0.075 -78 N 0.081 -79 R 0.089 -80 K 0.095 -81 V 0.094 -82 K 0.084 -83 S 0.069 -84 T 0.054 -85 I 0.042 -86 T 0.038 -87 L 0.042 -88 E 0.051 -89 N 0.055 -90 G 0.052 -91 S 0.044 -92 M 0.037 -93 I 0.033 -94 H 0.033 -95 V 0.033 -96 Q 0.034 -97 K 0.036 -98 W 0.041 -99 L 0.048 -100 G 0.052 -101 K 0.050 -102 E 0.045 -103 T 0.040 -104 T 0.037 -105 I 0.034 -106 K 0.030 -107 R 0.027 -108 K 0.028 -109 I 0.033 -110 V 0.037 -111 D 0.039 -112 E 0.039 -113 K 0.035 -114 M 0.031 -115 V 0.031 -116 V 0.032 -117 E 0.034 -118 C 0.035 -119 K 0.037 -120 M 0.042 -121 N 0.051 -122 N 0.061 -123 I 0.068 -124 V 0.069 -125 S 0.063 -126 T 0.055 -127 R 0.046 -128 I 0.040 -129 Y 0.038 -130 E 0.041 -131 K 0.048 -132 V 0.053 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205186.4_ENST00000379071.4_GN:FABP9_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205186.4_ENST00000379071.4_GN:FABP9_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid deleted file mode 100644 index b3f2c16cf02f7cface2b1bc74702d8bff5b35f94..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205186.4_ENST00000379071.4_GN:FABP9_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid +++ /dev/null @@ -1,134 +0,0 @@ ->ENSG00000205186.4|ENST00000379071.4|GN:FABP9|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:1 -1 M 0.289 -2 M 0.251 -3 V 0.191 -4 E 0.132 -5 P 0.086 -6 F 0.057 -7 L 0.044 -8 G 0.044 -9 T 0.048 -10 W 0.049 -11 K 0.046 -12 L 0.043 -13 V 0.045 -14 S 0.054 -15 S 0.066 -16 E 0.073 -17 N 0.071 -18 F 0.064 -19 E 0.058 -20 D 0.052 -21 Y 0.048 -22 M 0.049 -23 K 0.058 -24 E 0.078 -25 L 0.109 -26 G 0.140 -27 V 0.151 -28 N 0.137 -29 F 0.114 -30 A 0.102 -31 A 0.104 -32 R 0.112 -33 N 0.121 -34 M 0.128 -35 A 0.136 -36 G 0.139 -37 L 0.131 -38 V 0.110 -39 K 0.082 -40 P 0.055 -41 T 0.037 -42 V 0.028 -43 T 0.025 -44 I 0.024 -45 S 0.028 -46 V 0.036 -47 D 0.046 -48 G 0.053 -49 K 0.053 -50 M 0.047 -51 M 0.040 -52 T 0.037 -53 I 0.038 -54 R 0.040 -55 T 0.045 -56 E 0.054 -57 S 0.065 -58 S 0.073 -59 F 0.078 -60 Q 0.080 -61 D 0.080 -62 T 0.077 -63 K 0.072 -64 I 0.065 -65 S 0.053 -66 F 0.042 -67 K 0.039 -68 L 0.043 -69 G 0.048 -70 E 0.049 -71 E 0.049 -72 F 0.051 -73 D 0.058 -74 E 0.067 -75 T 0.073 -76 T 0.073 -77 A 0.072 -78 D 0.074 -79 N 0.081 -80 R 0.089 -81 K 0.095 -82 V 0.094 -83 K 0.084 -84 S 0.069 -85 T 0.053 -86 I 0.041 -87 T 0.036 -88 L 0.040 -89 E 0.048 -90 N 0.053 -91 G 0.050 -92 S 0.042 -93 M 0.036 -94 I 0.033 -95 H 0.032 -96 V 0.033 -97 Q 0.033 -98 K 0.035 -99 W 0.041 -100 L 0.048 -101 G 0.052 -102 K 0.050 -103 E 0.045 -104 T 0.040 -105 T 0.037 -106 I 0.034 -107 K 0.030 -108 R 0.027 -109 K 0.028 -110 I 0.033 -111 V 0.037 -112 D 0.039 -113 E 0.038 -114 K 0.035 -115 M 0.031 -116 V 0.031 -117 V 0.032 -118 E 0.034 -119 C 0.035 -120 K 0.037 -121 M 0.042 -122 N 0.051 -123 N 0.061 -124 I 0.068 -125 V 0.069 -126 S 0.063 -127 T 0.055 -128 R 0.046 -129 I 0.040 -130 Y 0.037 -131 E 0.041 -132 K 0.048 -133 V 0.053 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205209.8_ENST00000601241.6_GN:SCGB2B2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205209.8_ENST00000601241.6_GN:SCGB2B2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 2f88a0dc26604a1d29aa320f19b0026a778bd508..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205209.8_ENST00000601241.6_GN:SCGB2B2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,97 +0,0 @@ ->ENSG00000205209.8|ENST00000601241.6|GN:SCGB2B2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.347 -2 R 0.349 -3 V 0.351 -4 T 0.348 -5 S 0.329 -6 A 0.291 -7 T 0.246 -8 C 0.205 -9 A 0.174 -10 L 0.151 -11 L 0.134 -12 L 0.126 -13 A 0.125 -14 L 0.126 -15 I 0.133 -16 C 0.152 -17 S 0.186 -18 V 0.235 -19 Q 0.288 -20 L 0.328 -21 G 0.335 -22 D 0.303 -23 A 0.245 -24 C 0.180 -25 L 0.122 -26 D 0.080 -27 I 0.052 -28 D 0.037 -29 K 0.030 -30 L 0.030 -31 L 0.034 -32 A 0.040 -33 N 0.049 -34 V 0.056 -35 V 0.061 -36 F 0.067 -37 D 0.075 -38 V 0.079 -39 S 0.074 -40 Q 0.064 -41 D 0.054 -42 L 0.047 -43 L 0.044 -44 K 0.045 -45 E 0.050 -46 E 0.054 -47 L 0.059 -48 A 0.067 -49 R 0.078 -50 Y 0.092 -51 N 0.108 -52 P 0.127 -53 S 0.144 -54 P 0.154 -55 L 0.148 -56 T 0.131 -57 E 0.112 -58 E 0.102 -59 S 0.095 -60 F 0.087 -61 L 0.084 -62 N 0.086 -63 V 0.088 -64 Q 0.088 -65 Q 0.086 -66 C 0.079 -67 F 0.069 -68 A 0.065 -69 N 0.069 -70 V 0.070 -71 S 0.064 -72 V 0.059 -73 T 0.056 -74 E 0.052 -75 R 0.046 -76 F 0.043 -77 A 0.046 -78 H 0.053 -79 S 0.060 -80 V 0.065 -81 V 0.066 -82 I 0.062 -83 K 0.058 -84 K 0.057 -85 I 0.059 -86 L 0.063 -87 Q 0.071 -88 S 0.084 -89 N 0.095 -90 D 0.103 -91 C 0.117 -92 I 0.145 -93 E 0.182 -94 A 0.208 -95 A 0.209 -96 F 0.198 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205209.8_ENST00000601241.6_GN:SCGB2B2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205209.8_ENST00000601241.6_GN:SCGB2B2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid deleted file mode 100644 index d6bc2e81567d2b7091ca0c2fb9d0112f2bf18f35..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205209.8_ENST00000601241.6_GN:SCGB2B2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:27.caid +++ /dev/null @@ -1,124 +0,0 @@ ->ENSG00000205209.8|ENST00000601241.6|GN:SCGB2B2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:27 -1 M 0.182 -2 C 0.187 -3 L 0.199 -4 V 0.216 -5 Q 0.233 -6 I 0.243 -7 Y 0.254 -8 I 0.266 -9 K 0.277 -10 L 0.288 -11 T 0.307 -12 H 0.340 -13 R 0.392 -14 Q 0.459 -15 I 0.521 -16 P 0.557 -17 C 0.567 -18 L 0.564 -19 C 0.562 -20 L 0.565 -21 L 0.581 -22 G 0.615 -23 P 0.657 -24 D 0.691 -25 S 0.710 -26 A 0.711 -27 V 0.696 -28 M 0.675 -29 R 0.659 -30 V 0.643 -31 T 0.608 -32 S 0.540 -33 A 0.455 -34 T 0.375 -35 C 0.307 -36 A 0.250 -37 L 0.212 -38 L 0.194 -39 L 0.186 -40 A 0.176 -41 L 0.167 -42 I 0.169 -43 C 0.188 -44 S 0.223 -45 V 0.274 -46 Q 0.330 -47 L 0.369 -48 G 0.368 -49 D 0.323 -50 A 0.252 -51 C 0.178 -52 L 0.118 -53 D 0.076 -54 I 0.050 -55 D 0.037 -56 K 0.032 -57 L 0.033 -58 L 0.038 -59 A 0.045 -60 N 0.053 -61 V 0.061 -62 V 0.067 -63 F 0.074 -64 D 0.082 -65 V 0.085 -66 S 0.079 -67 Q 0.068 -68 D 0.058 -69 L 0.051 -70 L 0.047 -71 K 0.047 -72 E 0.051 -73 E 0.054 -74 L 0.057 -75 A 0.065 -76 R 0.077 -77 Y 0.091 -78 N 0.106 -79 P 0.123 -80 S 0.139 -81 P 0.148 -82 L 0.143 -83 T 0.126 -84 E 0.109 -85 E 0.097 -86 S 0.090 -87 F 0.084 -88 L 0.085 -89 N 0.090 -90 V 0.093 -91 Q 0.093 -92 Q 0.091 -93 C 0.082 -94 F 0.071 -95 A 0.068 -96 N 0.072 -97 V 0.072 -98 S 0.066 -99 V 0.061 -100 T 0.059 -101 E 0.055 -102 R 0.049 -103 F 0.046 -104 A 0.049 -105 H 0.055 -106 S 0.061 -107 V 0.064 -108 V 0.062 -109 I 0.057 -110 K 0.053 -111 K 0.053 -112 I 0.055 -113 L 0.060 -114 Q 0.069 -115 S 0.081 -116 N 0.092 -117 D 0.102 -118 C 0.119 -119 I 0.150 -120 E 0.192 -121 A 0.221 -122 A 0.224 -123 F 0.214 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205784.5_ENST00000650722.2_GN:ARRDC5_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205784.5_ENST00000650722.2_GN:ARRDC5_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 547fc1837e3b7e187fcfcf51123b34680e08b377..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205784.5_ENST00000650722.2_GN:ARRDC5_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,329 +0,0 @@ ->ENSG00000205784.5|ENST00000650722.2|GN:ARRDC5|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.246 -2 S 0.202 -3 V 0.141 -4 V 0.092 -5 K 0.064 -6 S 0.050 -7 I 0.044 -8 E 0.043 -9 L 0.046 -10 V 0.056 -11 L 0.069 -12 P 0.077 -13 E 0.077 -14 D 0.069 -15 R 0.055 -16 I 0.043 -17 Y 0.034 -18 L 0.029 -19 A 0.027 -20 G 0.028 -21 S 0.031 -22 S 0.035 -23 I 0.040 -24 K 0.044 -25 G 0.048 -26 Q 0.048 -27 V 0.046 -28 I 0.046 -29 L 0.051 -30 T 0.062 -31 L 0.072 -32 N 0.078 -33 S 0.077 -34 T 0.071 -35 L 0.066 -36 V 0.065 -37 D 0.063 -38 P 0.055 -39 I 0.043 -40 V 0.034 -41 K 0.030 -42 V 0.032 -43 E 0.036 -44 L 0.040 -45 V 0.044 -46 G 0.049 -47 R 0.056 -48 G 0.062 -49 Y 0.070 -50 V 0.080 -51 E 0.096 -52 W 0.124 -53 S 0.173 -54 E 0.244 -55 E 0.322 -56 A 0.388 -57 G 0.432 -58 A 0.451 -59 S 0.447 -60 C 0.434 -61 D 0.428 -62 Y 0.429 -63 S 0.420 -64 R 0.391 -65 N 0.350 -66 V 0.308 -67 I 0.268 -68 C 0.230 -69 N 0.193 -70 N 0.155 -71 K 0.120 -72 A 0.094 -73 D 0.079 -74 Y 0.071 -75 V 0.065 -76 H 0.059 -77 K 0.053 -78 T 0.047 -79 K 0.043 -80 T 0.043 -81 F 0.051 -82 P 0.066 -83 V 0.083 -84 E 0.091 -85 D 0.088 -86 N 0.080 -87 W 0.076 -88 L 0.079 -89 S 0.086 -90 A 0.089 -91 G 0.085 -92 S 0.075 -93 H 0.064 -94 T 0.053 -95 F 0.043 -96 D 0.036 -97 F 0.031 -98 H 0.031 -99 F 0.036 -100 N 0.047 -101 L 0.060 -102 P 0.070 -103 P 0.076 -104 R 0.082 -105 L 0.087 -106 P 0.087 -107 S 0.081 -108 T 0.074 -109 F 0.073 -110 T 0.080 -111 S 0.091 -112 K 0.098 -113 F 0.095 -114 G 0.086 -115 H 0.076 -116 V 0.069 -117 F 0.065 -118 Y 0.059 -119 F 0.048 -120 V 0.037 -121 Q 0.030 -122 A 0.028 -123 S 0.031 -124 C 0.037 -125 M 0.048 -126 G 0.062 -127 R 0.076 -128 E 0.086 -129 H 0.090 -130 I 0.089 -131 L 0.083 -132 A 0.071 -133 K 0.059 -134 K 0.048 -135 R 0.040 -136 M 0.033 -137 Y 0.029 -138 L 0.032 -139 L 0.045 -140 V 0.068 -141 Q 0.099 -142 G 0.133 -143 T 0.167 -144 S 0.195 -145 T 0.209 -146 F 0.209 -147 H 0.198 -148 K 0.183 -149 E 0.179 -150 T 0.195 -151 P 0.217 -152 F 0.221 -153 Q 0.200 -154 N 0.163 -155 P 0.126 -156 L 0.103 -157 F 0.096 -158 V 0.095 -159 E 0.087 -160 A 0.077 -161 E 0.076 -162 E 0.085 -163 K 0.096 -164 V 0.103 -165 S 0.105 -166 Y 0.101 -167 N 0.097 -168 C 0.098 -169 C 0.107 -170 R 0.115 -171 Q 0.112 -172 G 0.102 -173 T 0.090 -174 V 0.077 -175 C 0.062 -176 L 0.049 -177 Q 0.042 -178 I 0.041 -179 Q 0.045 -180 M 0.049 -181 E 0.051 -182 R 0.052 -183 N 0.053 -184 T 0.054 -185 F 0.053 -186 T 0.053 -187 P 0.054 -188 G 0.054 -189 E 0.053 -190 K 0.051 -191 V 0.050 -192 V 0.050 -193 F 0.049 -194 T 0.048 -195 T 0.049 -196 E 0.051 -197 I 0.054 -198 N 0.059 -199 N 0.065 -200 Q 0.070 -201 T 0.070 -202 S 0.063 -203 K 0.056 -204 C 0.052 -205 I 0.047 -206 K 0.039 -207 T 0.031 -208 V 0.025 -209 V 0.022 -210 F 0.020 -211 A 0.021 -212 L 0.025 -213 Y 0.031 -214 A 0.041 -215 H 0.051 -216 I 0.062 -217 Q 0.076 -218 Y 0.096 -219 E 0.118 -220 G 0.138 -221 F 0.158 -222 T 0.182 -223 P 0.210 -224 S 0.233 -225 A 0.246 -226 E 0.251 -227 R 0.253 -228 R 0.250 -229 S 0.233 -230 R 0.201 -231 L 0.165 -232 D 0.133 -233 S 0.109 -234 S 0.093 -235 E 0.083 -236 L 0.075 -237 L 0.067 -238 R 0.065 -239 Q 0.070 -240 E 0.076 -241 A 0.083 -242 N 0.093 -243 T 0.098 -244 P 0.096 -245 V 0.092 -246 T 0.093 -247 R 0.095 -248 F 0.092 -249 N 0.085 -250 T 0.077 -251 T 0.069 -252 K 0.064 -253 V 0.058 -254 V 0.051 -255 S 0.043 -256 T 0.040 -257 F 0.044 -258 N 0.058 -259 L 0.074 -260 P 0.083 -261 L 0.086 -262 L 0.090 -263 L 0.103 -264 S 0.126 -265 V 0.155 -266 S 0.188 -267 S 0.221 -268 S 0.241 -269 T 0.237 -270 Q 0.221 -271 D 0.201 -272 G 0.175 -273 E 0.140 -274 I 0.106 -275 M 0.085 -276 H 0.076 -277 T 0.074 -278 R 0.075 -279 Y 0.073 -280 E 0.060 -281 L 0.044 -282 V 0.032 -283 T 0.028 -284 T 0.031 -285 V 0.042 -286 H 0.059 -287 L 0.079 -288 P 0.092 -289 W 0.096 -290 S 0.095 -291 L 0.093 -292 T 0.090 -293 S 0.082 -294 L 0.071 -295 K 0.059 -296 A 0.051 -297 K 0.045 -298 V 0.040 -299 P 0.034 -300 I 0.031 -301 I 0.036 -302 I 0.054 -303 T 0.086 -304 S 0.133 -305 A 0.186 -306 S 0.234 -307 V 0.277 -308 D 0.318 -309 S 0.354 -310 A 0.382 -311 I 0.395 -312 C 0.398 -313 Q 0.402 -314 L 0.410 -315 S 0.411 -316 E 0.422 -317 D 0.458 -318 G 0.498 -319 V 0.519 -320 L 0.532 -321 P 0.548 -322 V 0.560 -323 N 0.561 -324 P 0.560 -325 D 0.556 -326 H 0.538 -327 Q 0.497 -328 N 0.460 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205784.5_ENST00000650722.2_GN:ARRDC5_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205784.5_ENST00000650722.2_GN:ARRDC5_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid deleted file mode 100644 index c2f23e1dfde5bc700aacb3bec3ae99eee0ccb2da..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000205784.5_ENST00000650722.2_GN:ARRDC5_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid +++ /dev/null @@ -1,343 +0,0 @@ ->ENSG00000205784.5|ENST00000650722.2|GN:ARRDC5|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:14 -1 M 0.440 -2 G 0.465 -3 D 0.490 -4 R 0.487 -5 E 0.457 -6 E 0.438 -7 C 0.450 -8 L 0.469 -9 S 0.471 -10 T 0.461 -11 P 0.458 -12 Q 0.465 -13 P 0.468 -14 P 0.444 -15 M 0.374 -16 S 0.269 -17 V 0.167 -18 V 0.097 -19 K 0.062 -20 S 0.047 -21 I 0.042 -22 E 0.041 -23 L 0.045 -24 V 0.054 -25 L 0.065 -26 P 0.074 -27 E 0.077 -28 D 0.070 -29 R 0.058 -30 I 0.044 -31 Y 0.035 -32 L 0.029 -33 A 0.027 -34 G 0.028 -35 S 0.031 -36 S 0.034 -37 I 0.038 -38 K 0.043 -39 G 0.046 -40 Q 0.046 -41 V 0.044 -42 I 0.044 -43 L 0.050 -44 T 0.061 -45 L 0.071 -46 N 0.078 -47 S 0.077 -48 T 0.071 -49 L 0.066 -50 V 0.064 -51 D 0.061 -52 P 0.053 -53 I 0.041 -54 V 0.032 -55 K 0.029 -56 V 0.031 -57 E 0.035 -58 L 0.039 -59 V 0.044 -60 G 0.049 -61 R 0.056 -62 G 0.062 -63 Y 0.069 -64 V 0.079 -65 E 0.094 -66 W 0.122 -67 S 0.170 -68 E 0.241 -69 E 0.320 -70 A 0.388 -71 G 0.434 -72 A 0.454 -73 S 0.449 -74 C 0.437 -75 D 0.433 -76 Y 0.436 -77 S 0.429 -78 R 0.400 -79 N 0.358 -80 V 0.315 -81 I 0.273 -82 C 0.233 -83 N 0.195 -84 N 0.157 -85 K 0.121 -86 A 0.095 -87 D 0.080 -88 Y 0.072 -89 V 0.066 -90 H 0.060 -91 K 0.053 -92 T 0.047 -93 K 0.043 -94 T 0.044 -95 F 0.052 -96 P 0.067 -97 V 0.083 -98 E 0.091 -99 D 0.087 -100 N 0.078 -101 W 0.073 -102 L 0.076 -103 S 0.083 -104 A 0.087 -105 G 0.083 -106 S 0.074 -107 H 0.063 -108 T 0.052 -109 F 0.043 -110 D 0.036 -111 F 0.031 -112 H 0.031 -113 F 0.036 -114 N 0.048 -115 L 0.060 -116 P 0.070 -117 P 0.076 -118 R 0.082 -119 L 0.087 -120 P 0.086 -121 S 0.081 -122 T 0.074 -123 F 0.072 -124 T 0.080 -125 S 0.091 -126 K 0.098 -127 F 0.096 -128 G 0.087 -129 H 0.077 -130 V 0.069 -131 F 0.065 -132 Y 0.059 -133 F 0.048 -134 V 0.037 -135 Q 0.029 -136 A 0.027 -137 S 0.030 -138 C 0.037 -139 M 0.047 -140 G 0.061 -141 R 0.075 -142 E 0.085 -143 H 0.089 -144 I 0.088 -145 L 0.081 -146 A 0.069 -147 K 0.056 -148 K 0.046 -149 R 0.038 -150 M 0.032 -151 Y 0.029 -152 L 0.032 -153 L 0.045 -154 V 0.068 -155 Q 0.099 -156 G 0.134 -157 T 0.168 -158 S 0.196 -159 T 0.212 -160 F 0.213 -161 H 0.201 -162 K 0.186 -163 E 0.182 -164 T 0.198 -165 P 0.221 -166 F 0.225 -167 Q 0.204 -168 N 0.167 -169 P 0.129 -170 L 0.105 -171 F 0.097 -172 V 0.095 -173 E 0.087 -174 A 0.078 -175 E 0.077 -176 E 0.086 -177 K 0.097 -178 V 0.105 -179 S 0.106 -180 Y 0.102 -181 N 0.096 -182 C 0.097 -183 C 0.106 -184 R 0.113 -185 Q 0.111 -186 G 0.102 -187 T 0.090 -188 V 0.077 -189 C 0.062 -190 L 0.049 -191 Q 0.042 -192 I 0.041 -193 Q 0.045 -194 M 0.049 -195 E 0.050 -196 R 0.051 -197 N 0.053 -198 T 0.054 -199 F 0.053 -200 T 0.053 -201 P 0.054 -202 G 0.054 -203 E 0.053 -204 K 0.051 -205 V 0.050 -206 V 0.049 -207 F 0.049 -208 T 0.048 -209 T 0.049 -210 E 0.051 -211 I 0.055 -212 N 0.059 -213 N 0.065 -214 Q 0.070 -215 T 0.070 -216 S 0.063 -217 K 0.056 -218 C 0.053 -219 I 0.047 -220 K 0.039 -221 T 0.031 -222 V 0.025 -223 V 0.022 -224 F 0.021 -225 A 0.022 -226 L 0.025 -227 Y 0.032 -228 A 0.041 -229 H 0.052 -230 I 0.063 -231 Q 0.077 -232 Y 0.097 -233 E 0.118 -234 G 0.138 -235 F 0.159 -236 T 0.184 -237 P 0.212 -238 S 0.236 -239 A 0.250 -240 E 0.255 -241 R 0.258 -242 R 0.255 -243 S 0.237 -244 R 0.204 -245 L 0.167 -246 D 0.135 -247 S 0.110 -248 S 0.094 -249 E 0.084 -250 L 0.075 -251 L 0.068 -252 R 0.066 -253 Q 0.070 -254 E 0.077 -255 A 0.084 -256 N 0.094 -257 T 0.099 -258 P 0.097 -259 V 0.093 -260 T 0.094 -261 R 0.096 -262 F 0.094 -263 N 0.087 -264 T 0.078 -265 T 0.071 -266 K 0.065 -267 V 0.059 -268 V 0.051 -269 S 0.044 -270 T 0.041 -271 F 0.045 -272 N 0.059 -273 L 0.075 -274 P 0.085 -275 L 0.088 -276 L 0.093 -277 L 0.106 -278 S 0.130 -279 V 0.160 -280 S 0.194 -281 S 0.228 -282 S 0.248 -283 T 0.244 -284 Q 0.226 -285 D 0.205 -286 G 0.179 -287 E 0.143 -288 I 0.109 -289 M 0.087 -290 H 0.078 -291 T 0.076 -292 R 0.077 -293 Y 0.074 -294 E 0.061 -295 L 0.045 -296 V 0.032 -297 T 0.028 -298 T 0.032 -299 V 0.042 -300 H 0.060 -301 L 0.079 -302 P 0.093 -303 W 0.097 -304 S 0.095 -305 L 0.094 -306 T 0.090 -307 S 0.082 -308 L 0.071 -309 K 0.060 -310 A 0.051 -311 K 0.045 -312 V 0.040 -313 P 0.035 -314 I 0.032 -315 I 0.037 -316 I 0.055 -317 T 0.088 -318 S 0.135 -319 A 0.188 -320 S 0.237 -321 V 0.281 -322 D 0.322 -323 S 0.360 -324 A 0.388 -325 I 0.401 -326 C 0.404 -327 Q 0.408 -328 L 0.417 -329 S 0.419 -330 E 0.430 -331 D 0.467 -332 G 0.507 -333 V 0.527 -334 L 0.540 -335 P 0.556 -336 V 0.569 -337 N 0.573 -338 P 0.574 -339 D 0.573 -340 H 0.558 -341 Q 0.518 -342 N 0.480 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000212127.6_ENST00000537503.2_GN:TAS2R14_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000212127.6_ENST00000537503.2_GN:TAS2R14_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 08db07a933fc2314849e14e60231a81785cd733f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000212127.6_ENST00000537503.2_GN:TAS2R14_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,318 +0,0 @@ ->ENSG00000212127.6|ENST00000537503.2|GN:TAS2R14|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.243 -2 G 0.225 -3 G 0.192 -4 V 0.158 -5 I 0.131 -6 K 0.112 -7 S 0.094 -8 I 0.079 -9 F 0.073 -10 T 0.073 -11 F 0.071 -12 V 0.059 -13 L 0.045 -14 I 0.034 -15 V 0.029 -16 E 0.027 -17 F 0.026 -18 I 0.029 -19 I 0.033 -20 G 0.036 -21 N 0.035 -22 L 0.034 -23 G 0.037 -24 N 0.041 -25 S 0.046 -26 F 0.049 -27 I 0.049 -28 A 0.046 -29 L 0.045 -30 V 0.046 -31 N 0.045 -32 C 0.045 -33 I 0.050 -34 D 0.059 -35 W 0.069 -36 V 0.080 -37 K 0.093 -38 G 0.108 -39 R 0.119 -40 K 0.117 -41 I 0.102 -42 S 0.079 -43 S 0.058 -44 V 0.043 -45 D 0.033 -46 R 0.028 -47 I 0.028 -48 L 0.033 -49 T 0.040 -50 A 0.043 -51 L 0.041 -52 A 0.041 -53 I 0.043 -54 S 0.044 -55 R 0.046 -56 I 0.046 -57 S 0.040 -58 L 0.031 -59 V 0.023 -60 W 0.019 -61 L 0.019 -62 I 0.023 -63 F 0.030 -64 G 0.034 -65 S 0.031 -66 W 0.025 -67 C 0.022 -68 V 0.024 -69 S 0.032 -70 V 0.045 -71 F 0.061 -72 F 0.075 -73 P 0.082 -74 A 0.085 -75 L 0.091 -76 F 0.102 -77 A 0.111 -78 T 0.109 -79 E 0.095 -80 K 0.077 -81 M 0.063 -82 F 0.056 -83 R 0.052 -84 M 0.048 -85 L 0.044 -86 T 0.043 -87 N 0.045 -88 I 0.043 -89 W 0.036 -90 T 0.029 -91 V 0.027 -92 I 0.027 -93 N 0.028 -94 H 0.030 -95 F 0.031 -96 S 0.030 -97 V 0.028 -98 W 0.025 -99 L 0.023 -100 A 0.023 -101 T 0.026 -102 G 0.029 -103 L 0.031 -104 G 0.034 -105 T 0.036 -106 F 0.037 -107 Y 0.038 -108 F 0.044 -109 L 0.054 -110 K 0.069 -111 I 0.089 -112 A 0.111 -113 N 0.129 -114 F 0.142 -115 S 0.148 -116 N 0.139 -117 S 0.116 -118 I 0.091 -119 F 0.074 -120 L 0.066 -121 Y 0.063 -122 L 0.062 -123 K 0.059 -124 W 0.053 -125 R 0.046 -126 V 0.042 -127 K 0.037 -128 K 0.034 -129 V 0.032 -130 V 0.030 -131 L 0.028 -132 V 0.028 -133 L 0.029 -134 L 0.029 -135 L 0.029 -136 V 0.031 -137 T 0.034 -138 S 0.033 -139 V 0.029 -140 F 0.025 -141 L 0.024 -142 F 0.027 -143 L 0.030 -144 N 0.034 -145 I 0.036 -146 A 0.038 -147 L 0.041 -148 I 0.046 -149 N 0.049 -150 I 0.051 -151 H 0.055 -152 I 0.060 -153 N 0.070 -154 A 0.088 -155 S 0.115 -156 I 0.156 -157 N 0.208 -158 G 0.261 -159 Y 0.301 -160 R 0.330 -161 R 0.357 -162 N 0.381 -163 K 0.394 -164 T 0.400 -165 C 0.413 -166 S 0.439 -167 S 0.462 -168 D 0.460 -169 S 0.427 -170 S 0.376 -171 N 0.326 -172 F 0.279 -173 T 0.235 -174 R 0.198 -175 F 0.167 -176 S 0.138 -177 S 0.114 -178 L 0.097 -179 I 0.085 -180 V 0.076 -181 L 0.070 -182 T 0.064 -183 S 0.057 -184 T 0.046 -185 V 0.036 -186 F 0.029 -187 I 0.028 -188 F 0.031 -189 I 0.034 -190 P 0.035 -191 F 0.034 -192 T 0.036 -193 L 0.041 -194 S 0.049 -195 L 0.059 -196 A 0.061 -197 M 0.052 -198 F 0.039 -199 L 0.030 -200 L 0.028 -201 L 0.028 -202 I 0.027 -203 F 0.028 -204 S 0.032 -205 M 0.037 -206 W 0.043 -207 K 0.052 -208 H 0.068 -209 R 0.091 -210 K 0.115 -211 K 0.138 -212 M 0.163 -213 Q 0.194 -214 H 0.231 -215 T 0.266 -216 V 0.292 -217 K 0.310 -218 I 0.323 -219 S 0.331 -220 G 0.333 -221 D 0.324 -222 A 0.303 -223 S 0.269 -224 T 0.231 -225 K 0.201 -226 A 0.180 -227 H 0.161 -228 R 0.136 -229 G 0.106 -230 V 0.082 -231 K 0.065 -232 S 0.051 -233 V 0.039 -234 I 0.030 -235 T 0.025 -236 F 0.022 -237 F 0.019 -238 L 0.017 -239 L 0.018 -240 Y 0.019 -241 A 0.019 -242 I 0.018 -243 F 0.017 -244 S 0.018 -245 L 0.020 -246 S 0.020 -247 F 0.020 -248 F 0.021 -249 I 0.024 -250 S 0.032 -251 V 0.047 -252 W 0.069 -253 T 0.095 -254 S 0.116 -255 E 0.126 -256 R 0.124 -257 L 0.111 -258 E 0.090 -259 E 0.069 -260 N 0.054 -261 L 0.046 -262 I 0.041 -263 I 0.037 -264 L 0.035 -265 S 0.035 -266 Q 0.036 -267 V 0.036 -268 M 0.037 -269 G 0.040 -270 M 0.045 -271 A 0.051 -272 Y 0.051 -273 P 0.046 -274 S 0.040 -275 C 0.039 -276 H 0.041 -277 S 0.043 -278 C 0.043 -279 V 0.041 -280 L 0.042 -281 I 0.046 -282 L 0.054 -283 G 0.061 -284 N 0.062 -285 K 0.056 -286 K 0.049 -287 L 0.043 -288 R 0.042 -289 Q 0.046 -290 A 0.052 -291 S 0.056 -292 L 0.058 -293 S 0.060 -294 V 0.063 -295 L 0.067 -296 L 0.077 -297 W 0.089 -298 L 0.100 -299 R 0.112 -300 Y 0.135 -301 M 0.174 -302 F 0.227 -303 K 0.297 -304 D 0.385 -305 G 0.471 -306 E 0.531 -307 P 0.562 -308 S 0.571 -309 G 0.550 -310 H 0.498 -311 K 0.452 -312 E 0.455 -313 F 0.488 -314 R 0.508 -315 E 0.495 -316 S 0.459 -317 S 0.427 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000212127.6_ENST00000537503.2_GN:TAS2R14_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000212127.6_ENST00000537503.2_GN:TAS2R14_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid deleted file mode 100644 index 06a64ee5778749b30f7d10635852338ecf6a91c2..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000212127.6_ENST00000537503.2_GN:TAS2R14_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:5.caid +++ /dev/null @@ -1,323 +0,0 @@ ->ENSG00000212127.6|ENST00000537503.2|GN:TAS2R14|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:5 -1 M 0.189 -2 L 0.175 -3 L 0.166 -4 Q 0.174 -5 A 0.190 -6 M 0.202 -7 G 0.197 -8 G 0.175 -9 V 0.147 -10 I 0.122 -11 K 0.101 -12 S 0.081 -13 I 0.068 -14 F 0.065 -15 T 0.068 -16 F 0.068 -17 V 0.058 -18 L 0.044 -19 I 0.035 -20 V 0.030 -21 E 0.028 -22 F 0.027 -23 I 0.029 -24 I 0.033 -25 G 0.035 -26 N 0.034 -27 L 0.034 -28 G 0.036 -29 N 0.041 -30 S 0.046 -31 F 0.049 -32 I 0.048 -33 A 0.045 -34 L 0.044 -35 V 0.045 -36 N 0.044 -37 C 0.045 -38 I 0.050 -39 D 0.059 -40 W 0.070 -41 V 0.081 -42 K 0.094 -43 G 0.109 -44 R 0.120 -45 K 0.119 -46 I 0.103 -47 S 0.080 -48 S 0.059 -49 V 0.044 -50 D 0.033 -51 R 0.028 -52 I 0.028 -53 L 0.033 -54 T 0.039 -55 A 0.042 -56 L 0.041 -57 A 0.040 -58 I 0.042 -59 S 0.044 -60 R 0.046 -61 I 0.045 -62 S 0.040 -63 L 0.031 -64 V 0.023 -65 W 0.018 -66 L 0.018 -67 I 0.022 -68 F 0.028 -69 G 0.032 -70 S 0.030 -71 W 0.024 -72 C 0.021 -73 V 0.023 -74 S 0.031 -75 V 0.044 -76 F 0.060 -77 F 0.073 -78 P 0.080 -79 A 0.082 -80 L 0.088 -81 F 0.100 -82 A 0.109 -83 T 0.107 -84 E 0.094 -85 K 0.076 -86 M 0.063 -87 F 0.056 -88 R 0.052 -89 M 0.047 -90 L 0.043 -91 T 0.043 -92 N 0.044 -93 I 0.043 -94 W 0.036 -95 T 0.029 -96 V 0.027 -97 I 0.027 -98 N 0.028 -99 H 0.030 -100 F 0.031 -101 S 0.030 -102 V 0.027 -103 W 0.025 -104 L 0.023 -105 A 0.023 -106 T 0.026 -107 G 0.029 -108 L 0.030 -109 G 0.033 -110 T 0.035 -111 F 0.036 -112 Y 0.037 -113 F 0.043 -114 L 0.054 -115 K 0.069 -116 I 0.089 -117 A 0.111 -118 N 0.129 -119 F 0.143 -120 S 0.149 -121 N 0.141 -122 S 0.118 -123 I 0.092 -124 F 0.075 -125 L 0.068 -126 Y 0.065 -127 L 0.063 -128 K 0.060 -129 W 0.054 -130 R 0.047 -131 V 0.042 -132 K 0.038 -133 K 0.035 -134 V 0.032 -135 V 0.030 -136 L 0.027 -137 V 0.027 -138 L 0.029 -139 L 0.029 -140 L 0.029 -141 V 0.031 -142 T 0.034 -143 S 0.033 -144 V 0.029 -145 F 0.025 -146 L 0.024 -147 F 0.027 -148 L 0.031 -149 N 0.034 -150 I 0.036 -151 A 0.038 -152 L 0.042 -153 I 0.046 -154 N 0.049 -155 I 0.051 -156 H 0.055 -157 I 0.060 -158 N 0.071 -159 A 0.088 -160 S 0.116 -161 I 0.157 -162 N 0.209 -163 G 0.261 -164 Y 0.301 -165 R 0.331 -166 R 0.358 -167 N 0.381 -168 K 0.394 -169 T 0.400 -170 C 0.414 -171 S 0.440 -172 S 0.464 -173 D 0.462 -174 S 0.428 -175 S 0.377 -176 N 0.326 -177 F 0.278 -178 T 0.234 -179 R 0.197 -180 F 0.165 -181 S 0.136 -182 S 0.113 -183 L 0.096 -184 I 0.085 -185 V 0.076 -186 L 0.070 -187 T 0.065 -188 S 0.057 -189 T 0.046 -190 V 0.036 -191 F 0.029 -192 I 0.028 -193 F 0.031 -194 I 0.034 -195 P 0.035 -196 F 0.035 -197 T 0.036 -198 L 0.041 -199 S 0.050 -200 L 0.059 -201 A 0.062 -202 M 0.053 -203 F 0.039 -204 L 0.030 -205 L 0.028 -206 L 0.028 -207 I 0.028 -208 F 0.028 -209 S 0.032 -210 M 0.037 -211 W 0.043 -212 K 0.052 -213 H 0.068 -214 R 0.091 -215 K 0.115 -216 K 0.137 -217 M 0.161 -218 Q 0.192 -219 H 0.229 -220 T 0.264 -221 V 0.290 -222 K 0.308 -223 I 0.321 -224 S 0.329 -225 G 0.331 -226 D 0.322 -227 A 0.301 -228 S 0.268 -229 T 0.230 -230 K 0.200 -231 A 0.179 -232 H 0.160 -233 R 0.135 -234 G 0.106 -235 V 0.081 -236 K 0.065 -237 S 0.051 -238 V 0.039 -239 I 0.030 -240 T 0.026 -241 F 0.022 -242 F 0.019 -243 L 0.017 -244 L 0.018 -245 Y 0.020 -246 A 0.020 -247 I 0.018 -248 F 0.017 -249 S 0.018 -250 L 0.020 -251 S 0.021 -252 F 0.020 -253 F 0.021 -254 I 0.024 -255 S 0.032 -256 V 0.047 -257 W 0.069 -258 T 0.095 -259 S 0.116 -260 E 0.125 -261 R 0.123 -262 L 0.110 -263 E 0.090 -264 E 0.069 -265 N 0.053 -266 L 0.045 -267 I 0.040 -268 I 0.037 -269 L 0.035 -270 S 0.035 -271 Q 0.036 -272 V 0.036 -273 M 0.037 -274 G 0.040 -275 M 0.046 -276 A 0.052 -277 Y 0.052 -278 P 0.047 -279 S 0.041 -280 C 0.039 -281 H 0.041 -282 S 0.043 -283 C 0.043 -284 V 0.042 -285 L 0.042 -286 I 0.046 -287 L 0.054 -288 G 0.061 -289 N 0.062 -290 K 0.056 -291 K 0.049 -292 L 0.043 -293 R 0.042 -294 Q 0.045 -295 A 0.051 -296 S 0.054 -297 L 0.057 -298 S 0.059 -299 V 0.062 -300 L 0.067 -301 L 0.077 -302 W 0.089 -303 L 0.101 -304 R 0.113 -305 Y 0.136 -306 M 0.174 -307 F 0.227 -308 K 0.298 -309 D 0.385 -310 G 0.471 -311 E 0.531 -312 P 0.563 -313 S 0.572 -314 G 0.549 -315 H 0.492 -316 K 0.441 -317 E 0.440 -318 F 0.478 -319 R 0.504 -320 E 0.496 -321 S 0.462 -322 S 0.430 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000212938.4_ENST00000391624.2_GN:KRTAP6-3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000212938.4_ENST00000391624.2_GN:KRTAP6-3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index d933fc4f98bdc099656387606357e58afd1740cb..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000212938.4_ENST00000391624.2_GN:KRTAP6-3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,104 +0,0 @@ ->ENSG00000212938.4|ENST00000391624.2|GN:KRTAP6-3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.378 -2 C 0.428 -3 G 0.490 -4 S 0.524 -5 Y 0.516 -6 Y 0.486 -7 R 0.459 -8 N 0.450 -9 Y 0.463 -10 N 0.489 -11 G 0.516 -12 G 0.533 -13 H 0.536 -14 G 0.541 -15 Y 0.553 -16 G 0.554 -17 C 0.531 -18 C 0.510 -19 G 0.532 -20 Y 0.589 -21 G 0.633 -22 G 0.626 -23 L 0.567 -24 G 0.485 -25 C 0.426 -26 G 0.413 -27 Y 0.429 -28 G 0.444 -29 G 0.449 -30 C 0.462 -31 G 0.493 -32 Y 0.522 -33 G 0.521 -34 C 0.491 -35 C 0.472 -36 G 0.500 -37 Y 0.558 -38 G 0.596 -39 G 0.581 -40 L 0.522 -41 G 0.463 -42 F 0.450 -43 G 0.496 -44 Y 0.574 -45 G 0.632 -46 G 0.635 -47 L 0.587 -48 D 0.524 -49 C 0.484 -50 G 0.492 -51 Y 0.540 -52 G 0.585 -53 G 0.586 -54 L 0.538 -55 G 0.478 -56 C 0.444 -57 G 0.437 -58 Y 0.424 -59 G 0.385 -60 S 0.332 -61 F 0.297 -62 C 0.300 -63 G 0.332 -64 C 0.373 -65 G 0.415 -66 Y 0.460 -67 R 0.501 -68 G 0.518 -69 L 0.497 -70 D 0.443 -71 C 0.382 -72 G 0.338 -73 Y 0.317 -74 G 0.309 -75 C 0.312 -76 G 0.326 -77 Y 0.343 -78 G 0.346 -79 Y 0.330 -80 V 0.307 -81 S 0.293 -82 H 0.295 -83 S 0.302 -84 F 0.308 -85 C 0.320 -86 G 0.349 -87 C 0.393 -88 G 0.430 -89 Y 0.447 -90 R 0.445 -91 C 0.437 -92 G 0.439 -93 S 0.466 -94 G 0.516 -95 Y 0.567 -96 G 0.600 -97 S 0.613 -98 S 0.612 -99 F 0.593 -100 G 0.549 -101 Y 0.479 -102 Y 0.397 -103 Y 0.340 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000212938.4_ENST00000391624.2_GN:KRTAP6-3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000212938.4_ENST00000391624.2_GN:KRTAP6-3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid deleted file mode 100644 index f30ccf845785df88e6ea7067911fae38a87a6915..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000212938.4_ENST00000391624.2_GN:KRTAP6-3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid +++ /dev/null @@ -1,111 +0,0 @@ ->ENSG00000212938.4|ENST00000391624.2|GN:KRTAP6-3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:7 -1 M 0.410 -2 T 0.439 -3 S 0.487 -4 T 0.529 -5 T 0.539 -6 N 0.506 -7 T 0.452 -8 M 0.416 -9 C 0.422 -10 G 0.453 -11 S 0.468 -12 Y 0.445 -13 Y 0.401 -14 R 0.363 -15 N 0.350 -16 Y 0.369 -17 N 0.415 -18 G 0.469 -19 G 0.509 -20 H 0.526 -21 G 0.531 -22 Y 0.533 -23 G 0.527 -24 C 0.509 -25 C 0.502 -26 G 0.533 -27 Y 0.591 -28 G 0.633 -29 G 0.625 -30 L 0.564 -31 G 0.481 -32 C 0.423 -33 G 0.411 -34 Y 0.426 -35 G 0.436 -36 G 0.437 -37 C 0.446 -38 G 0.473 -39 Y 0.499 -40 G 0.499 -41 C 0.474 -42 C 0.464 -43 G 0.498 -44 Y 0.558 -45 G 0.596 -46 G 0.584 -47 L 0.530 -48 G 0.477 -49 F 0.469 -50 G 0.517 -51 Y 0.593 -52 G 0.649 -53 G 0.651 -54 L 0.606 -55 D 0.545 -56 C 0.503 -57 G 0.506 -58 Y 0.547 -59 G 0.585 -60 G 0.579 -61 L 0.524 -62 G 0.459 -63 C 0.422 -64 G 0.412 -65 Y 0.398 -66 G 0.359 -67 S 0.308 -68 F 0.276 -69 C 0.281 -70 G 0.312 -71 C 0.350 -72 G 0.391 -73 Y 0.436 -74 R 0.478 -75 G 0.495 -76 L 0.476 -77 D 0.427 -78 C 0.373 -79 G 0.337 -80 Y 0.320 -81 G 0.311 -82 C 0.308 -83 G 0.313 -84 Y 0.318 -85 G 0.312 -86 Y 0.291 -87 V 0.271 -88 S 0.263 -89 H 0.266 -90 S 0.271 -91 F 0.279 -92 C 0.301 -93 G 0.342 -94 C 0.393 -95 G 0.432 -96 Y 0.448 -97 R 0.444 -98 C 0.432 -99 G 0.430 -100 S 0.454 -101 G 0.504 -102 Y 0.557 -103 G 0.593 -104 S 0.607 -105 S 0.606 -106 F 0.588 -107 G 0.547 -108 Y 0.482 -109 Y 0.404 -110 Y 0.347 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000214226.10_ENST00000397861.7_GN:C17orf67_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000214226.10_ENST00000397861.7_GN:C17orf67_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 1cd8135fe6872d75035cc68719d434666fb2db29..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000214226.10_ENST00000397861.7_GN:C17orf67_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,91 +0,0 @@ ->ENSG00000214226.10|ENST00000397861.7|GN:C17orf67|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.364 -2 K 0.358 -3 T 0.338 -4 L 0.304 -5 P 0.262 -6 V 0.226 -7 L 0.204 -8 V 0.204 -9 L 0.220 -10 S 0.241 -11 L 0.260 -12 T 0.271 -13 L 0.276 -14 L 0.295 -15 T 0.343 -16 V 0.407 -17 F 0.463 -18 S 0.510 -19 E 0.556 -20 T 0.595 -21 S 0.612 -22 P 0.594 -23 I 0.528 -24 L 0.421 -25 T 0.308 -26 E 0.225 -27 K 0.183 -28 Q 0.168 -29 A 0.166 -30 K 0.171 -31 Q 0.186 -32 L 0.207 -33 L 0.229 -34 R 0.253 -35 S 0.283 -36 R 0.321 -37 R 0.371 -38 Q 0.430 -39 D 0.484 -40 R 0.527 -41 P 0.561 -42 S 0.591 -43 K 0.617 -44 P 0.633 -45 G 0.630 -46 F 0.595 -47 P 0.533 -48 D 0.464 -49 E 0.407 -50 P 0.354 -51 M 0.291 -52 R 0.234 -53 E 0.203 -54 Y 0.195 -55 M 0.192 -56 H 0.198 -57 H 0.216 -58 L 0.237 -59 L 0.245 -60 A 0.250 -61 L 0.267 -62 E 0.287 -63 H 0.291 -64 R 0.288 -65 A 0.294 -66 E 0.307 -67 E 0.308 -68 Q 0.295 -69 F 0.274 -70 L 0.246 -71 E 0.220 -72 H 0.211 -73 W 0.226 -74 L 0.250 -75 N 0.269 -76 P 0.275 -77 H 0.263 -78 C 0.247 -79 K 0.249 -80 P 0.277 -81 H 0.317 -82 C 0.357 -83 D 0.404 -84 R 0.458 -85 N 0.502 -86 R 0.523 -87 I 0.528 -88 H 0.519 -89 P 0.492 -90 V 0.465 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000214226.10_ENST00000397861.7_GN:C17orf67_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000214226.10_ENST00000397861.7_GN:C17orf67_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid deleted file mode 100644 index c1010cbc7950ad7ae1873cd4723d11d4a01af987..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000214226.10_ENST00000397861.7_GN:C17orf67_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid +++ /dev/null @@ -1,115 +0,0 @@ ->ENSG00000214226.10|ENST00000397861.7|GN:C17orf67|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:24 -1 M 0.430 -2 A 0.456 -3 S 0.491 -4 F 0.524 -5 K 0.551 -6 L 0.570 -7 A 0.579 -8 D 0.575 -9 S 0.558 -10 V 0.535 -11 W 0.521 -12 E 0.511 -13 D 0.482 -14 S 0.433 -15 L 0.399 -16 S 0.414 -17 K 0.474 -18 R 0.554 -19 Q 0.624 -20 R 0.676 -21 N 0.709 -22 Q 0.727 -23 G 0.731 -24 R 0.715 -25 M 0.676 -26 K 0.611 -27 T 0.524 -28 L 0.431 -29 P 0.350 -30 V 0.294 -31 L 0.267 -32 V 0.270 -33 L 0.293 -34 S 0.316 -35 L 0.330 -36 T 0.332 -37 L 0.329 -38 L 0.332 -39 T 0.357 -40 V 0.400 -41 F 0.451 -42 S 0.507 -43 E 0.566 -44 T 0.614 -45 S 0.639 -46 P 0.632 -47 I 0.577 -48 L 0.475 -49 T 0.361 -50 E 0.275 -51 K 0.231 -52 Q 0.217 -53 A 0.218 -54 K 0.229 -55 Q 0.250 -56 L 0.274 -57 L 0.298 -58 R 0.326 -59 S 0.358 -60 R 0.396 -61 R 0.445 -62 Q 0.502 -63 D 0.551 -64 R 0.584 -65 P 0.608 -66 S 0.629 -67 K 0.650 -68 P 0.663 -69 G 0.656 -70 F 0.618 -71 P 0.553 -72 D 0.480 -73 E 0.418 -74 P 0.358 -75 M 0.290 -76 R 0.231 -77 E 0.201 -78 Y 0.192 -79 M 0.191 -80 H 0.199 -81 H 0.222 -82 L 0.243 -83 L 0.245 -84 A 0.244 -85 L 0.258 -86 E 0.278 -87 H 0.286 -88 R 0.287 -89 A 0.297 -90 E 0.311 -91 E 0.308 -92 Q 0.289 -93 F 0.264 -94 L 0.236 -95 E 0.210 -96 H 0.200 -97 W 0.210 -98 L 0.230 -99 N 0.245 -100 P 0.248 -101 H 0.235 -102 C 0.218 -103 K 0.219 -104 P 0.248 -105 H 0.292 -106 C 0.336 -107 D 0.385 -108 R 0.442 -109 N 0.493 -110 R 0.524 -111 I 0.538 -112 H 0.536 -113 P 0.511 -114 V 0.483 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000214336.5_ENST00000428390.3_GN:FOXI3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000214336.5_ENST00000428390.3_GN:FOXI3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 10e6c1f69aefe61735bc20617777eac053ecd154..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000214336.5_ENST00000428390.3_GN:FOXI3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,421 +0,0 @@ ->ENSG00000214336.5|ENST00000428390.3|GN:FOXI3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.511 -2 A 0.563 -3 L 0.626 -4 Y 0.671 -5 C 0.696 -6 G 0.708 -7 D 0.712 -8 N 0.716 -9 F 0.726 -10 G 0.740 -11 V 0.750 -12 Y 0.751 -13 S 0.745 -14 Q 0.739 -15 P 0.732 -16 G 0.724 -17 L 0.711 -18 P 0.694 -19 P 0.668 -20 P 0.638 -21 A 0.643 -22 A 0.705 -23 T 0.782 -24 A 0.822 -25 A 0.823 -26 A 0.807 -27 P 0.791 -28 G 0.779 -29 A 0.773 -30 P 0.778 -31 P 0.793 -32 A 0.806 -33 A 0.806 -34 R 0.792 -35 A 0.777 -36 P 0.772 -37 Y 0.778 -38 G 0.787 -39 L 0.793 -40 A 0.794 -41 D 0.790 -42 Y 0.782 -43 A 0.772 -44 A 0.768 -45 P 0.777 -46 P 0.801 -47 A 0.826 -48 A 0.835 -49 A 0.822 -50 A 0.793 -51 N 0.763 -52 P 0.744 -53 Y 0.743 -54 L 0.754 -55 W 0.768 -56 L 0.779 -57 N 0.788 -58 G 0.801 -59 P 0.821 -60 G 0.839 -61 V 0.843 -62 G 0.833 -63 G 0.819 -64 P 0.814 -65 P 0.819 -66 S 0.824 -67 A 0.810 -68 A 0.760 -69 A 0.690 -70 A 0.656 -71 A 0.692 -72 A 0.756 -73 A 0.795 -74 A 0.801 -75 Y 0.793 -76 L 0.780 -77 G 0.763 -78 A 0.742 -79 P 0.721 -80 P 0.709 -81 P 0.711 -82 P 0.726 -83 P 0.750 -84 P 0.780 -85 P 0.810 -86 G 0.835 -87 A 0.847 -88 A 0.847 -89 A 0.839 -90 G 0.829 -91 P 0.822 -92 F 0.818 -93 L 0.809 -94 Q 0.797 -95 P 0.791 -96 P 0.801 -97 P 0.822 -98 A 0.844 -99 A 0.855 -100 G 0.854 -101 T 0.847 -102 F 0.840 -103 G 0.832 -104 C 0.820 -105 S 0.803 -106 Q 0.787 -107 R 0.778 -108 P 0.776 -109 F 0.779 -110 A 0.784 -111 Q 0.785 -112 P 0.786 -113 A 0.789 -114 P 0.795 -115 A 0.799 -116 A 0.799 -117 P 0.797 -118 A 0.795 -119 S 0.793 -120 P 0.787 -121 A 0.776 -122 A 0.760 -123 P 0.739 -124 A 0.716 -125 G 0.688 -126 P 0.652 -127 G 0.595 -128 E 0.512 -129 L 0.418 -130 G 0.330 -131 W 0.259 -132 L 0.214 -133 S 0.195 -134 M 0.186 -135 A 0.174 -136 S 0.158 -137 R 0.142 -138 E 0.131 -139 D 0.126 -140 L 0.123 -141 M 0.123 -142 K 0.126 -143 M 0.129 -144 V 0.124 -145 R 0.115 -146 P 0.107 -147 P 0.096 -148 Y 0.079 -149 S 0.057 -150 Y 0.038 -151 S 0.026 -152 A 0.022 -153 L 0.023 -154 I 0.026 -155 A 0.032 -156 M 0.038 -157 A 0.043 -158 I 0.045 -159 Q 0.046 -160 S 0.047 -161 A 0.050 -162 P 0.053 -163 E 0.055 -164 R 0.056 -165 K 0.054 -166 L 0.047 -167 T 0.038 -168 L 0.033 -169 S 0.035 -170 H 0.039 -171 I 0.041 -172 Y 0.042 -173 Q 0.041 -174 F 0.040 -175 V 0.039 -176 A 0.042 -177 D 0.047 -178 S 0.051 -179 F 0.051 -180 P 0.052 -181 F 0.051 -182 Y 0.050 -183 Q 0.050 -184 R 0.052 -185 S 0.057 -186 K 0.060 -187 A 0.056 -188 G 0.049 -189 W 0.041 -190 Q 0.036 -191 N 0.036 -192 S 0.041 -193 I 0.050 -194 R 0.054 -195 H 0.056 -196 N 0.057 -197 L 0.060 -198 S 0.064 -199 L 0.069 -200 N 0.071 -201 D 0.069 -202 C 0.063 -203 F 0.061 -204 K 0.074 -205 K 0.104 -206 V 0.142 -207 P 0.174 -208 R 0.189 -209 D 0.191 -210 E 0.190 -211 D 0.201 -212 D 0.218 -213 P 0.226 -214 G 0.213 -215 K 0.181 -216 G 0.140 -217 N 0.101 -218 Y 0.073 -219 W 0.061 -220 T 0.062 -221 L 0.070 -222 D 0.074 -223 P 0.071 -224 N 0.067 -225 C 0.069 -226 E 0.078 -227 K 0.093 -228 M 0.111 -229 F 0.130 -230 D 0.147 -231 N 0.160 -232 G 0.165 -233 N 0.165 -234 F 0.168 -235 R 0.182 -236 R 0.211 -237 K 0.262 -238 R 0.345 -239 K 0.457 -240 R 0.569 -241 R 0.655 -242 S 0.706 -243 E 0.727 -244 A 0.733 -245 S 0.739 -246 N 0.749 -247 G 0.761 -248 S 0.773 -249 T 0.783 -250 V 0.788 -251 A 0.789 -252 A 0.784 -253 G 0.763 -254 T 0.716 -255 S 0.650 -256 K 0.615 -257 S 0.646 -258 E 0.712 -259 E 0.765 -260 G 0.791 -261 L 0.803 -262 S 0.811 -263 S 0.820 -264 G 0.829 -265 L 0.836 -266 G 0.842 -267 S 0.846 -268 G 0.848 -269 V 0.847 -270 G 0.842 -271 G 0.833 -272 K 0.825 -273 P 0.819 -274 E 0.817 -275 E 0.812 -276 E 0.805 -277 S 0.799 -278 P 0.799 -279 S 0.803 -280 T 0.805 -281 L 0.800 -282 L 0.794 -283 R 0.796 -284 P 0.805 -285 S 0.811 -286 H 0.805 -287 S 0.793 -288 P 0.781 -289 E 0.776 -290 P 0.783 -291 P 0.803 -292 E 0.829 -293 G 0.852 -294 T 0.866 -295 K 0.873 -296 S 0.872 -297 T 0.865 -298 A 0.851 -299 S 0.836 -300 S 0.827 -301 P 0.828 -302 G 0.839 -303 G 0.852 -304 P 0.862 -305 M 0.866 -306 L 0.862 -307 T 0.850 -308 S 0.832 -309 T 0.815 -310 P 0.803 -311 C 0.797 -312 L 0.793 -313 N 0.786 -314 T 0.770 -315 F 0.750 -316 F 0.738 -317 S 0.743 -318 S 0.759 -319 L 0.777 -320 S 0.795 -321 S 0.812 -322 L 0.827 -323 S 0.841 -324 V 0.850 -325 S 0.854 -326 S 0.856 -327 S 0.859 -328 V 0.862 -329 S 0.862 -330 T 0.858 -331 Q 0.848 -332 R 0.834 -333 A 0.819 -334 L 0.809 -335 P 0.811 -336 G 0.822 -337 S 0.833 -338 R 0.840 -339 H 0.844 -340 L 0.850 -341 G 0.857 -342 I 0.862 -343 Q 0.863 -344 G 0.859 -345 A 0.847 -346 Q 0.833 -347 L 0.826 -348 P 0.829 -349 S 0.836 -350 S 0.843 -351 G 0.845 -352 V 0.841 -353 F 0.834 -354 S 0.832 -355 P 0.841 -356 T 0.858 -357 S 0.871 -358 I 0.877 -359 S 0.874 -360 E 0.854 -361 A 0.804 -362 S 0.731 -363 A 0.689 -364 D 0.705 -365 T 0.724 -366 L 0.699 -367 Q 0.679 -368 L 0.720 -369 S 0.792 -370 N 0.842 -371 S 0.858 -372 T 0.857 -373 S 0.853 -374 N 0.848 -375 S 0.844 -376 T 0.840 -377 G 0.839 -378 Q 0.840 -379 R 0.838 -380 S 0.830 -381 S 0.811 -382 Y 0.784 -383 Y 0.758 -384 S 0.746 -385 P 0.754 -386 F 0.779 -387 P 0.811 -388 A 0.837 -389 S 0.850 -390 T 0.852 -391 S 0.851 -392 G 0.849 -393 G 0.843 -394 Q 0.831 -395 S 0.814 -396 S 0.797 -397 P 0.784 -398 F 0.774 -399 S 0.763 -400 S 0.753 -401 P 0.752 -402 F 0.764 -403 H 0.780 -404 N 0.790 -405 F 0.794 -406 S 0.797 -407 M 0.800 -408 V 0.795 -409 N 0.779 -410 S 0.756 -411 L 0.725 -412 I 0.689 -413 Y 0.665 -414 P 0.673 -415 R 0.712 -416 E 0.752 -417 G 0.767 -418 S 0.751 -419 E 0.712 -420 V 0.678 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000214336.5_ENST00000428390.3_GN:FOXI3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000214336.5_ENST00000428390.3_GN:FOXI3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid deleted file mode 100644 index 3f5a1a586193806dd3a7cf67c384490014e91873..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000214336.5_ENST00000428390.3_GN:FOXI3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid +++ /dev/null @@ -1,447 +0,0 @@ ->ENSG00000214336.5|ENST00000428390.3|GN:FOXI3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:26 -1 M 0.451 -2 L 0.481 -3 S 0.527 -4 P 0.567 -5 E 0.577 -6 R 0.555 -7 R 0.544 -8 D 0.578 -9 Q 0.635 -10 P 0.680 -11 R 0.711 -12 S 0.737 -13 P 0.763 -14 L 0.787 -15 A 0.799 -16 A 0.793 -17 A 0.769 -18 A 0.736 -19 P 0.707 -20 Q 0.686 -21 P 0.673 -22 P 0.667 -23 T 0.674 -24 A 0.692 -25 A 0.705 -26 D 0.706 -27 M 0.702 -28 A 0.698 -29 L 0.696 -30 Y 0.701 -31 C 0.715 -32 G 0.728 -33 D 0.733 -34 N 0.736 -35 F 0.745 -36 G 0.760 -37 V 0.771 -38 Y 0.772 -39 S 0.766 -40 Q 0.760 -41 P 0.756 -42 G 0.750 -43 L 0.745 -44 P 0.750 -45 P 0.772 -46 P 0.809 -47 A 0.845 -48 A 0.867 -49 T 0.872 -50 A 0.862 -51 A 0.843 -52 A 0.823 -53 P 0.807 -54 G 0.797 -55 A 0.794 -56 P 0.800 -57 P 0.816 -58 A 0.830 -59 A 0.831 -60 R 0.819 -61 A 0.807 -62 P 0.804 -63 Y 0.810 -64 G 0.818 -65 L 0.822 -66 A 0.821 -67 D 0.816 -68 Y 0.807 -69 A 0.798 -70 A 0.793 -71 P 0.800 -72 P 0.821 -73 A 0.844 -74 A 0.852 -75 A 0.839 -76 A 0.811 -77 N 0.779 -78 P 0.757 -79 Y 0.752 -80 L 0.759 -81 W 0.770 -82 L 0.779 -83 N 0.787 -84 G 0.799 -85 P 0.817 -86 G 0.834 -87 V 0.837 -88 G 0.826 -89 G 0.811 -90 P 0.805 -91 P 0.809 -92 S 0.811 -93 A 0.793 -94 A 0.741 -95 A 0.671 -96 A 0.638 -97 A 0.672 -98 A 0.734 -99 A 0.770 -100 A 0.775 -101 Y 0.766 -102 L 0.753 -103 G 0.737 -104 A 0.715 -105 P 0.693 -106 P 0.680 -107 P 0.682 -108 P 0.698 -109 P 0.724 -110 P 0.755 -111 P 0.787 -112 G 0.812 -113 A 0.824 -114 A 0.823 -115 A 0.813 -116 G 0.803 -117 P 0.797 -118 F 0.793 -119 L 0.784 -120 Q 0.771 -121 P 0.765 -122 P 0.776 -123 P 0.799 -124 A 0.823 -125 A 0.836 -126 G 0.835 -127 T 0.827 -128 F 0.819 -129 G 0.812 -130 C 0.801 -131 S 0.786 -132 Q 0.771 -133 R 0.763 -134 P 0.762 -135 F 0.768 -136 A 0.774 -137 Q 0.777 -138 P 0.779 -139 A 0.785 -140 P 0.793 -141 A 0.799 -142 A 0.800 -143 P 0.798 -144 A 0.797 -145 S 0.794 -146 P 0.788 -147 A 0.777 -148 A 0.761 -149 P 0.741 -150 A 0.716 -151 G 0.685 -152 P 0.644 -153 G 0.582 -154 E 0.498 -155 L 0.405 -156 G 0.317 -157 W 0.246 -158 L 0.200 -159 S 0.181 -160 M 0.173 -161 A 0.162 -162 S 0.147 -163 R 0.132 -164 E 0.122 -165 D 0.117 -166 L 0.116 -167 M 0.116 -168 K 0.119 -169 M 0.122 -170 V 0.118 -171 R 0.111 -172 P 0.106 -173 P 0.097 -174 Y 0.081 -175 S 0.059 -176 Y 0.039 -177 S 0.027 -178 A 0.023 -179 L 0.023 -180 I 0.026 -181 A 0.032 -182 M 0.038 -183 A 0.042 -184 I 0.044 -185 Q 0.045 -186 S 0.046 -187 A 0.048 -188 P 0.051 -189 E 0.054 -190 R 0.055 -191 K 0.053 -192 L 0.047 -193 T 0.039 -194 L 0.034 -195 S 0.034 -196 H 0.038 -197 I 0.041 -198 Y 0.041 -199 Q 0.041 -200 F 0.039 -201 V 0.038 -202 A 0.041 -203 D 0.045 -204 S 0.048 -205 F 0.049 -206 P 0.049 -207 F 0.049 -208 Y 0.048 -209 Q 0.047 -210 R 0.050 -211 S 0.055 -212 K 0.057 -213 A 0.053 -214 G 0.047 -215 W 0.040 -216 Q 0.035 -217 N 0.035 -218 S 0.041 -219 I 0.049 -220 R 0.054 -221 H 0.055 -222 N 0.056 -223 L 0.059 -224 S 0.064 -225 L 0.069 -226 N 0.070 -227 D 0.068 -228 C 0.062 -229 F 0.061 -230 K 0.074 -231 K 0.104 -232 V 0.142 -233 P 0.173 -234 R 0.188 -235 D 0.189 -236 E 0.188 -237 D 0.198 -238 D 0.216 -239 P 0.225 -240 G 0.212 -241 K 0.181 -242 G 0.140 -243 N 0.100 -244 Y 0.073 -245 W 0.061 -246 T 0.061 -247 L 0.068 -248 D 0.072 -249 P 0.070 -250 N 0.066 -251 C 0.068 -252 E 0.078 -253 K 0.094 -254 M 0.112 -255 F 0.130 -256 D 0.147 -257 N 0.160 -258 G 0.166 -259 N 0.167 -260 F 0.171 -261 R 0.185 -262 R 0.215 -263 K 0.269 -264 R 0.356 -265 K 0.470 -266 R 0.582 -267 R 0.667 -268 S 0.714 -269 E 0.734 -270 A 0.740 -271 S 0.746 -272 N 0.755 -273 G 0.767 -274 S 0.780 -275 T 0.790 -276 V 0.796 -277 A 0.796 -278 A 0.790 -279 G 0.769 -280 T 0.722 -281 S 0.656 -282 K 0.621 -283 S 0.653 -284 E 0.720 -285 E 0.773 -286 G 0.800 -287 L 0.812 -288 S 0.821 -289 S 0.829 -290 G 0.837 -291 L 0.844 -292 G 0.850 -293 S 0.854 -294 G 0.855 -295 V 0.853 -296 G 0.848 -297 G 0.839 -298 K 0.831 -299 P 0.826 -300 E 0.824 -301 E 0.820 -302 E 0.812 -303 S 0.806 -304 P 0.806 -305 S 0.811 -306 T 0.813 -307 L 0.808 -308 L 0.802 -309 R 0.802 -310 P 0.810 -311 S 0.816 -312 H 0.811 -313 S 0.799 -314 P 0.788 -315 E 0.783 -316 P 0.790 -317 P 0.810 -318 E 0.836 -319 G 0.857 -320 T 0.871 -321 K 0.877 -322 S 0.876 -323 T 0.869 -324 A 0.855 -325 S 0.840 -326 S 0.832 -327 P 0.833 -328 G 0.843 -329 G 0.855 -330 P 0.865 -331 M 0.868 -332 L 0.865 -333 T 0.853 -334 S 0.836 -335 T 0.820 -336 P 0.809 -337 C 0.803 -338 L 0.800 -339 N 0.793 -340 T 0.778 -341 F 0.758 -342 F 0.746 -343 S 0.750 -344 S 0.764 -345 L 0.782 -346 S 0.799 -347 S 0.815 -348 L 0.829 -349 S 0.841 -350 V 0.849 -351 S 0.853 -352 S 0.855 -353 S 0.858 -354 V 0.860 -355 S 0.860 -356 T 0.856 -357 Q 0.847 -358 R 0.832 -359 A 0.817 -360 L 0.808 -361 P 0.809 -362 G 0.820 -363 S 0.832 -364 R 0.839 -365 H 0.843 -366 L 0.849 -367 G 0.856 -368 I 0.861 -369 Q 0.862 -370 G 0.858 -371 A 0.846 -372 Q 0.832 -373 L 0.825 -374 P 0.828 -375 S 0.836 -376 S 0.842 -377 G 0.844 -378 V 0.840 -379 F 0.833 -380 S 0.831 -381 P 0.840 -382 T 0.857 -383 S 0.871 -384 I 0.877 -385 S 0.874 -386 E 0.855 -387 A 0.805 -388 S 0.732 -389 A 0.690 -390 D 0.705 -391 T 0.724 -392 L 0.699 -393 Q 0.679 -394 L 0.719 -395 S 0.792 -396 N 0.841 -397 S 0.857 -398 T 0.856 -399 S 0.851 -400 N 0.847 -401 S 0.842 -402 T 0.838 -403 G 0.837 -404 Q 0.837 -405 R 0.835 -406 S 0.827 -407 S 0.808 -408 Y 0.781 -409 Y 0.756 -410 S 0.744 -411 P 0.752 -412 F 0.778 -413 P 0.810 -414 A 0.836 -415 S 0.849 -416 T 0.851 -417 S 0.850 -418 G 0.848 -419 G 0.843 -420 Q 0.830 -421 S 0.813 -422 S 0.797 -423 P 0.784 -424 F 0.774 -425 S 0.764 -426 S 0.754 -427 P 0.753 -428 F 0.765 -429 H 0.782 -430 N 0.793 -431 F 0.797 -432 S 0.801 -433 M 0.804 -434 V 0.799 -435 N 0.784 -436 S 0.760 -437 L 0.730 -438 I 0.695 -439 Y 0.670 -440 P 0.677 -441 R 0.716 -442 E 0.756 -443 G 0.771 -444 S 0.756 -445 E 0.719 -446 V 0.686 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000215595.3_ENST00000400633.3_GN:C20orf202_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000215595.3_ENST00000400633.3_GN:C20orf202_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 8941cb6cf2b2670dd3f2af6cd7371f490406cf27..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000215595.3_ENST00000400633.3_GN:C20orf202_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,100 +0,0 @@ ->ENSG00000215595.3|ENST00000400633.3|GN:C20orf202|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.540 -2 K 0.572 -3 I 0.610 -4 A 0.624 -5 E 0.610 -6 E 0.583 -7 P 0.553 -8 S 0.513 -9 P 0.450 -10 S 0.365 -11 L 0.280 -12 G 0.216 -13 Q 0.176 -14 T 0.150 -15 L 0.130 -16 E 0.118 -17 W 0.116 -18 L 0.121 -19 R 0.132 -20 K 0.148 -21 E 0.165 -22 L 0.179 -23 S 0.199 -24 E 0.225 -25 M 0.247 -26 Q 0.263 -27 I 0.283 -28 Q 0.305 -29 D 0.309 -30 Q 0.284 -31 S 0.241 -32 L 0.196 -33 L 0.160 -34 L 0.139 -35 T 0.131 -36 L 0.128 -37 R 0.127 -38 H 0.130 -39 L 0.133 -40 H 0.133 -41 S 0.131 -42 V 0.128 -43 L 0.132 -44 E 0.144 -45 E 0.159 -46 L 0.174 -47 R 0.200 -48 A 0.247 -49 D 0.299 -50 S 0.338 -51 A 0.364 -52 H 0.386 -53 W 0.408 -54 E 0.440 -55 D 0.480 -56 A 0.521 -57 R 0.564 -58 S 0.615 -59 S 0.663 -60 G 0.696 -61 G 0.712 -62 T 0.718 -63 S 0.725 -64 P 0.742 -65 I 0.765 -66 R 0.784 -67 A 0.795 -68 R 0.801 -69 A 0.801 -70 G 0.797 -71 S 0.790 -72 E 0.781 -73 G 0.773 -74 R 0.765 -75 G 0.750 -76 C 0.731 -77 Q 0.714 -78 P 0.705 -79 V 0.699 -80 C 0.691 -81 S 0.683 -82 R 0.675 -83 G 0.653 -84 L 0.610 -85 A 0.573 -86 Q 0.573 -87 L 0.600 -88 L 0.626 -89 R 0.650 -90 G 0.678 -91 E 0.705 -92 D 0.721 -93 S 0.726 -94 R 0.724 -95 R 0.713 -96 S 0.683 -97 S 0.627 -98 L 0.556 -99 P 0.502 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000215595.3_ENST00000400633.3_GN:C20orf202_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000215595.3_ENST00000400633.3_GN:C20orf202_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid deleted file mode 100644 index 7155cfb69c05a01307e96d8326253d0f60d52e4d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000215595.3_ENST00000400633.3_GN:C20orf202_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid +++ /dev/null @@ -1,123 +0,0 @@ ->ENSG00000215595.3|ENST00000400633.3|GN:C20orf202|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:23 -1 M 0.475 -2 Y 0.523 -3 K 0.587 -4 S 0.637 -5 K 0.667 -6 I 0.690 -7 P 0.719 -8 R 0.751 -9 A 0.773 -10 Q 0.783 -11 N 0.789 -12 Q 0.799 -13 V 0.807 -14 S 0.809 -15 V 0.802 -16 K 0.788 -17 V 0.770 -18 T 0.761 -19 P 0.771 -20 K 0.793 -21 N 0.811 -22 T 0.819 -23 E 0.817 -24 M 0.812 -25 K 0.806 -26 I 0.789 -27 A 0.756 -28 E 0.709 -29 E 0.661 -30 P 0.623 -31 S 0.589 -32 P 0.544 -33 S 0.472 -34 L 0.380 -35 G 0.297 -36 Q 0.240 -37 T 0.203 -38 L 0.176 -39 E 0.160 -40 W 0.155 -41 L 0.156 -42 R 0.164 -43 K 0.183 -44 E 0.209 -45 L 0.237 -46 S 0.267 -47 E 0.295 -48 M 0.315 -49 Q 0.332 -50 I 0.355 -51 Q 0.379 -52 D 0.379 -53 Q 0.345 -54 S 0.292 -55 L 0.238 -56 L 0.196 -57 L 0.173 -58 T 0.163 -59 L 0.158 -60 R 0.153 -61 H 0.150 -62 L 0.146 -63 H 0.143 -64 S 0.142 -65 V 0.141 -66 L 0.145 -67 E 0.156 -68 E 0.168 -69 L 0.181 -70 R 0.207 -71 A 0.255 -72 D 0.307 -73 S 0.343 -74 A 0.363 -75 H 0.379 -76 W 0.401 -77 E 0.432 -78 D 0.469 -79 A 0.505 -80 R 0.547 -81 S 0.598 -82 S 0.647 -83 G 0.679 -84 G 0.695 -85 T 0.702 -86 S 0.711 -87 P 0.730 -88 I 0.755 -89 R 0.775 -90 A 0.787 -91 R 0.796 -92 A 0.799 -93 G 0.797 -94 S 0.791 -95 E 0.782 -96 G 0.774 -97 R 0.765 -98 G 0.751 -99 C 0.731 -100 Q 0.714 -101 P 0.705 -102 V 0.699 -103 C 0.686 -104 S 0.671 -105 R 0.659 -106 G 0.637 -107 L 0.593 -108 A 0.554 -109 Q 0.551 -110 L 0.578 -111 L 0.609 -112 R 0.640 -113 G 0.677 -114 E 0.710 -115 D 0.728 -116 S 0.733 -117 R 0.732 -118 R 0.726 -119 S 0.700 -120 S 0.644 -121 L 0.571 -122 P 0.515 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000215845.12_ENST00000423014.3_GN:TSTD1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000215845.12_ENST00000423014.3_GN:TSTD1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 1c8de78ab79b7a7a5f4c38b677c4feb6374119df..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000215845.12_ENST00000423014.3_GN:TSTD1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,116 +0,0 @@ ->ENSG00000215845.12|ENST00000423014.3|GN:TSTD1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.513 -2 A 0.484 -3 G 0.428 -4 A 0.342 -5 P 0.237 -6 T 0.144 -7 V 0.083 -8 S 0.052 -9 L 0.038 -10 P 0.033 -11 E 0.034 -12 L 0.041 -13 R 0.052 -14 S 0.061 -15 L 0.062 -16 L 0.063 -17 A 0.071 -18 S 0.081 -19 G 0.082 -20 R 0.072 -21 A 0.057 -22 R 0.046 -23 L 0.044 -24 F 0.052 -25 D 0.061 -26 V 0.066 -27 R 0.067 -28 S 0.068 -29 R 0.071 -30 E 0.076 -31 E 0.086 -32 A 0.095 -33 A 0.102 -34 A 0.108 -35 G 0.118 -36 T 0.126 -37 I 0.125 -38 P 0.116 -39 G 0.107 -40 A 0.099 -41 L 0.090 -42 N 0.081 -43 I 0.074 -44 P 0.066 -45 V 0.055 -46 S 0.046 -47 E 0.040 -48 L 0.038 -49 E 0.039 -50 S 0.043 -51 A 0.047 -52 L 0.050 -53 Q 0.052 -54 M 0.056 -55 E 0.061 -56 P 0.065 -57 A 0.063 -58 A 0.058 -59 F 0.053 -60 Q 0.051 -61 A 0.050 -62 L 0.054 -63 Y 0.065 -64 S 0.084 -65 A 0.106 -66 E 0.119 -67 K 0.116 -68 P 0.100 -69 K 0.085 -70 L 0.080 -71 E 0.083 -72 D 0.083 -73 E 0.074 -74 H 0.060 -75 L 0.047 -76 V 0.037 -77 F 0.031 -78 F 0.030 -79 C 0.035 -80 Q 0.048 -81 M 0.065 -82 G 0.076 -83 K 0.074 -84 R 0.063 -85 G 0.053 -86 L 0.051 -87 Q 0.052 -88 A 0.057 -89 T 0.062 -90 Q 0.066 -91 L 0.068 -92 A 0.071 -93 R 0.080 -94 S 0.087 -95 L 0.083 -96 G 0.072 -97 Y 0.062 -98 T 0.057 -99 G 0.059 -100 A 0.062 -101 R 0.061 -102 N 0.054 -103 Y 0.046 -104 A 0.042 -105 G 0.038 -106 A 0.034 -107 Y 0.031 -108 R 0.029 -109 E 0.032 -110 W 0.041 -111 L 0.057 -112 E 0.082 -113 K 0.120 -114 E 0.165 -115 S 0.199 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000215845.12_ENST00000423014.3_GN:TSTD1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000215845.12_ENST00000423014.3_GN:TSTD1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid deleted file mode 100644 index 778f71ecd671fd3717b79ab351d64980491c5aba..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000215845.12_ENST00000423014.3_GN:TSTD1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:22.caid +++ /dev/null @@ -1,138 +0,0 @@ ->ENSG00000215845.12|ENST00000423014.3|GN:TSTD1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:22 -1 M 0.481 -2 L 0.490 -3 Q 0.511 -4 A 0.540 -5 P 0.572 -6 R 0.596 -7 G 0.598 -8 R 0.560 -9 A 0.479 -10 R 0.401 -11 A 0.383 -12 A 0.415 -13 L 0.442 -14 R 0.459 -15 R 0.496 -16 L 0.552 -17 A 0.599 -18 V 0.627 -19 A 0.639 -20 T 0.637 -21 R 0.627 -22 T 0.612 -23 M 0.584 -24 A 0.535 -25 G 0.462 -26 A 0.366 -27 P 0.255 -28 T 0.156 -29 V 0.090 -30 S 0.055 -31 L 0.038 -32 P 0.031 -33 E 0.031 -34 L 0.037 -35 R 0.048 -36 S 0.057 -37 L 0.059 -38 L 0.060 -39 A 0.067 -40 S 0.076 -41 G 0.075 -42 R 0.066 -43 A 0.053 -44 R 0.044 -45 L 0.043 -46 F 0.051 -47 D 0.060 -48 V 0.064 -49 R 0.064 -50 S 0.064 -51 R 0.066 -52 E 0.072 -53 E 0.083 -54 A 0.094 -55 A 0.101 -56 A 0.107 -57 G 0.115 -58 T 0.122 -59 I 0.122 -60 P 0.114 -61 G 0.105 -62 A 0.097 -63 L 0.088 -64 N 0.079 -65 I 0.071 -66 P 0.063 -67 V 0.052 -68 S 0.042 -69 E 0.037 -70 L 0.035 -71 E 0.037 -72 S 0.041 -73 A 0.045 -74 L 0.048 -75 Q 0.050 -76 M 0.053 -77 E 0.059 -78 P 0.062 -79 A 0.060 -80 A 0.055 -81 F 0.050 -82 Q 0.046 -83 A 0.045 -84 L 0.048 -85 Y 0.058 -86 S 0.076 -87 A 0.098 -88 E 0.112 -89 K 0.111 -90 P 0.098 -91 K 0.084 -92 L 0.079 -93 E 0.082 -94 D 0.082 -95 E 0.074 -96 H 0.060 -97 L 0.047 -98 V 0.038 -99 F 0.031 -100 F 0.030 -101 C 0.034 -102 Q 0.045 -103 M 0.059 -104 G 0.068 -105 K 0.066 -106 R 0.056 -107 G 0.048 -108 L 0.046 -109 Q 0.047 -110 A 0.046 -111 T 0.045 -112 Q 0.045 -113 L 0.047 -114 A 0.051 -115 R 0.056 -116 S 0.059 -117 L 0.061 -118 G 0.060 -119 Y 0.057 -120 T 0.056 -121 G 0.059 -122 A 0.062 -123 R 0.061 -124 N 0.053 -125 Y 0.046 -126 A 0.041 -127 G 0.038 -128 A 0.033 -129 Y 0.030 -130 R 0.028 -131 E 0.030 -132 W 0.038 -133 L 0.054 -134 E 0.080 -135 K 0.119 -136 E 0.165 -137 S 0.198 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000221813.4_ENST00000641698.1_GN:OR6B1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000221813.4_ENST00000641698.1_GN:OR6B1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index b7347114a438c142958f6b070f715655861efefd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000221813.4_ENST00000641698.1_GN:OR6B1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,312 +0,0 @@ ->ENSG00000221813.4|ENST00000641698.1|GN:OR6B1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.429 -2 E 0.448 -3 L 0.476 -4 E 0.496 -5 N 0.495 -6 Q 0.465 -7 T 0.405 -8 R 0.327 -9 V 0.247 -10 T 0.184 -11 K 0.147 -12 F 0.132 -13 I 0.132 -14 L 0.137 -15 V 0.150 -16 G 0.171 -17 F 0.191 -18 P 0.200 -19 G 0.193 -20 S 0.169 -21 L 0.134 -22 S 0.100 -23 M 0.078 -24 R 0.069 -25 A 0.070 -26 A 0.074 -27 M 0.076 -28 F 0.077 -29 L 0.073 -30 I 0.060 -31 F 0.046 -32 L 0.039 -33 V 0.040 -34 A 0.043 -35 Y 0.045 -36 I 0.043 -37 L 0.044 -38 T 0.045 -39 V 0.045 -40 A 0.046 -41 E 0.051 -42 N 0.058 -43 V 0.063 -44 I 0.066 -45 I 0.063 -46 I 0.056 -47 L 0.050 -48 L 0.048 -49 V 0.050 -50 L 0.053 -51 Q 0.059 -52 N 0.066 -53 R 0.071 -54 P 0.073 -55 L 0.071 -56 H 0.065 -57 K 0.055 -58 P 0.044 -59 M 0.034 -60 Y 0.028 -61 F 0.025 -62 F 0.025 -63 L 0.031 -64 A 0.041 -65 N 0.050 -66 L 0.054 -67 S 0.055 -68 F 0.054 -69 L 0.058 -70 E 0.067 -71 T 0.074 -72 W 0.073 -73 Y 0.066 -74 I 0.059 -75 S 0.056 -76 V 0.058 -77 T 0.061 -78 V 0.063 -79 P 0.061 -80 K 0.056 -81 L 0.052 -82 L 0.046 -83 F 0.041 -84 S 0.039 -85 F 0.044 -86 W 0.057 -87 S 0.078 -88 V 0.094 -89 N 0.094 -90 N 0.081 -91 S 0.065 -92 I 0.053 -93 S 0.043 -94 F 0.035 -95 T 0.030 -96 L 0.029 -97 C 0.028 -98 M 0.028 -99 I 0.028 -100 Q 0.029 -101 L 0.032 -102 Y 0.033 -103 F 0.032 -104 F 0.031 -105 I 0.032 -106 A 0.034 -107 L 0.035 -108 M 0.038 -109 C 0.043 -110 T 0.046 -111 E 0.049 -112 C 0.049 -113 V 0.046 -114 L 0.042 -115 L 0.038 -116 A 0.035 -117 A 0.033 -118 M 0.033 -119 A 0.034 -120 Y 0.037 -121 D 0.040 -122 R 0.041 -123 Y 0.038 -124 V 0.037 -125 A 0.038 -126 I 0.042 -127 C 0.047 -128 R 0.054 -129 P 0.058 -130 L 0.058 -131 H 0.057 -132 Y 0.055 -133 P 0.055 -134 T 0.058 -135 I 0.061 -136 M 0.063 -137 S 0.058 -138 H 0.049 -139 G 0.040 -140 L 0.036 -141 C 0.041 -142 F 0.052 -143 R 0.061 -144 L 0.060 -145 A 0.056 -146 L 0.056 -147 G 0.060 -148 S 0.061 -149 W 0.058 -150 A 0.055 -151 I 0.057 -152 G 0.062 -153 F 0.065 -154 G 0.066 -155 I 0.067 -156 S 0.067 -157 L 0.066 -158 A 0.066 -159 K 0.067 -160 I 0.065 -161 Y 0.062 -162 F 0.064 -163 I 0.068 -164 S 0.074 -165 C 0.081 -166 L 0.086 -167 S 0.089 -168 F 0.093 -169 C 0.102 -170 G 0.114 -171 P 0.124 -172 N 0.132 -173 V 0.137 -174 I 0.132 -175 N 0.114 -176 H 0.091 -177 F 0.074 -178 F 0.066 -179 C 0.067 -180 D 0.080 -181 I 0.102 -182 S 0.126 -183 P 0.144 -184 V 0.152 -185 L 0.155 -186 N 0.154 -187 L 0.145 -188 S 0.131 -189 C 0.123 -190 T 0.126 -191 D 0.132 -192 M 0.130 -193 S 0.119 -194 I 0.107 -195 T 0.100 -196 E 0.100 -197 L 0.102 -198 V 0.104 -199 D 0.104 -200 F 0.101 -201 I 0.091 -202 L 0.077 -203 A 0.064 -204 L 0.054 -205 V 0.047 -206 I 0.045 -207 F 0.049 -208 L 0.059 -209 F 0.070 -210 P 0.073 -211 L 0.068 -212 F 0.064 -213 I 0.063 -214 T 0.062 -215 V 0.057 -216 L 0.052 -217 S 0.051 -218 Y 0.051 -219 G 0.055 -220 C 0.060 -221 I 0.067 -222 L 0.074 -223 A 0.079 -224 T 0.078 -225 I 0.074 -226 L 0.073 -227 C 0.083 -228 M 0.100 -229 P 0.114 -230 T 0.116 -231 G 0.108 -232 K 0.097 -233 Q 0.089 -234 K 0.085 -235 A 0.081 -236 F 0.077 -237 S 0.076 -238 T 0.077 -239 C 0.077 -240 A 0.077 -241 S 0.077 -242 H 0.073 -243 L 0.067 -244 V 0.064 -245 V 0.064 -246 V 0.060 -247 T 0.050 -248 I 0.037 -249 F 0.029 -250 Y 0.027 -251 S 0.029 -252 A 0.032 -253 I 0.034 -254 I 0.035 -255 F 0.040 -256 M 0.055 -257 Y 0.081 -258 A 0.114 -259 R 0.146 -260 P 0.167 -261 R 0.175 -262 V 0.178 -263 I 0.183 -264 H 0.188 -265 A 0.187 -266 F 0.173 -267 N 0.150 -268 M 0.129 -269 N 0.114 -270 K 0.102 -271 I 0.093 -272 I 0.082 -273 S 0.070 -274 I 0.062 -275 F 0.065 -276 Y 0.078 -277 A 0.093 -278 I 0.107 -279 V 0.119 -280 T 0.124 -281 P 0.118 -282 S 0.104 -283 L 0.091 -284 N 0.080 -285 P 0.071 -286 F 0.065 -287 I 0.064 -288 Y 0.065 -289 C 0.073 -290 L 0.089 -291 R 0.102 -292 N 0.097 -293 R 0.078 -294 E 0.063 -295 V 0.062 -296 K 0.072 -297 E 0.083 -298 A 0.084 -299 L 0.074 -300 K 0.063 -301 K 0.058 -302 L 0.065 -303 A 0.087 -304 Y 0.129 -305 C 0.190 -306 Q 0.259 -307 A 0.318 -308 S 0.359 -309 R 0.379 -310 S 0.379 -311 D 0.370 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000221813.4_ENST00000641698.1_GN:OR6B1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:100.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000221813.4_ENST00000641698.1_GN:OR6B1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:100.caid deleted file mode 100644 index f97bc0ae65f7981fee64a84b7df2c9dbc38f93ee..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000221813.4_ENST00000641698.1_GN:OR6B1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:100.caid +++ /dev/null @@ -1,412 +0,0 @@ ->ENSG00000221813.4|ENST00000641698.1|GN:OR6B1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:100 -1 M 0.358 -2 G 0.377 -3 T 0.407 -4 L 0.445 -5 V 0.487 -6 P 0.518 -7 G 0.522 -8 C 0.493 -9 W 0.446 -10 T 0.416 -11 K 0.425 -12 Q 0.453 -13 P 0.472 -14 R 0.499 -15 A 0.552 -16 T 0.608 -17 S 0.637 -18 D 0.643 -19 A 0.637 -20 D 0.612 -21 V 0.572 -22 V 0.534 -23 L 0.510 -24 V 0.479 -25 P 0.423 -26 R 0.357 -27 A 0.316 -28 L 0.309 -29 L 0.319 -30 S 0.340 -31 S 0.382 -32 Y 0.447 -33 P 0.524 -34 G 0.598 -35 F 0.653 -36 Q 0.677 -37 L 0.672 -38 E 0.654 -39 S 0.634 -40 S 0.616 -41 G 0.594 -42 A 0.564 -43 I 0.523 -44 C 0.476 -45 T 0.436 -46 Q 0.417 -47 S 0.410 -48 L 0.399 -49 F 0.396 -50 L 0.414 -51 G 0.438 -52 L 0.445 -53 E 0.438 -54 S 0.419 -55 G 0.377 -56 F 0.312 -57 L 0.250 -58 T 0.210 -59 S 0.186 -60 I 0.164 -61 Q 0.147 -62 Y 0.135 -63 L 0.128 -64 N 0.124 -65 L 0.121 -66 F 0.122 -67 L 0.131 -68 L 0.148 -69 H 0.162 -70 L 0.159 -71 P 0.133 -72 I 0.099 -73 L 0.076 -74 E 0.066 -75 L 0.063 -76 V 0.061 -77 K 0.062 -78 A 0.064 -79 L 0.067 -80 F 0.072 -81 S 0.085 -82 H 0.103 -83 F 0.124 -84 I 0.148 -85 L 0.182 -86 S 0.228 -87 E 0.277 -88 A 0.319 -89 A 0.349 -90 V 0.369 -91 P 0.382 -92 R 0.390 -93 R 0.393 -94 A 0.389 -95 K 0.377 -96 P 0.366 -97 C 0.369 -98 V 0.388 -99 S 0.414 -100 N 0.445 -101 M 0.476 -102 E 0.505 -103 L 0.523 -104 E 0.528 -105 N 0.514 -106 Q 0.476 -107 T 0.411 -108 R 0.331 -109 V 0.251 -110 T 0.188 -111 K 0.150 -112 F 0.135 -113 I 0.133 -114 L 0.134 -115 V 0.141 -116 G 0.156 -117 F 0.171 -118 P 0.177 -119 G 0.171 -120 S 0.150 -121 L 0.119 -122 S 0.088 -123 M 0.067 -124 R 0.056 -125 A 0.049 -126 A 0.048 -127 M 0.052 -128 F 0.059 -129 L 0.059 -130 I 0.051 -131 F 0.042 -132 L 0.038 -133 V 0.040 -134 A 0.044 -135 Y 0.045 -136 I 0.043 -137 L 0.041 -138 T 0.041 -139 V 0.040 -140 A 0.041 -141 E 0.046 -142 N 0.053 -143 V 0.058 -144 I 0.059 -145 I 0.056 -146 I 0.050 -147 L 0.045 -148 L 0.043 -149 V 0.044 -150 L 0.046 -151 Q 0.050 -152 N 0.057 -153 R 0.063 -154 P 0.066 -155 L 0.064 -156 H 0.057 -157 K 0.046 -158 P 0.036 -159 M 0.029 -160 Y 0.025 -161 F 0.022 -162 F 0.022 -163 L 0.027 -164 A 0.035 -165 N 0.042 -166 L 0.047 -167 S 0.049 -168 F 0.051 -169 L 0.055 -170 E 0.064 -171 T 0.071 -172 W 0.070 -173 Y 0.062 -174 I 0.055 -175 S 0.053 -176 V 0.055 -177 T 0.058 -178 V 0.060 -179 P 0.056 -180 K 0.051 -181 L 0.047 -182 L 0.042 -183 F 0.037 -184 S 0.035 -185 F 0.039 -186 W 0.052 -187 S 0.072 -188 V 0.088 -189 N 0.090 -190 N 0.078 -191 S 0.063 -192 I 0.050 -193 S 0.041 -194 F 0.033 -195 T 0.028 -196 L 0.026 -197 C 0.027 -198 M 0.028 -199 I 0.029 -200 Q 0.030 -201 L 0.031 -202 Y 0.032 -203 F 0.031 -204 F 0.030 -205 I 0.031 -206 A 0.033 -207 L 0.034 -208 M 0.038 -209 C 0.042 -210 T 0.045 -211 E 0.047 -212 C 0.046 -213 V 0.043 -214 L 0.039 -215 L 0.036 -216 A 0.035 -217 A 0.033 -218 M 0.033 -219 A 0.035 -220 Y 0.038 -221 D 0.041 -222 R 0.041 -223 Y 0.038 -224 V 0.035 -225 A 0.035 -226 I 0.038 -227 C 0.044 -228 R 0.049 -229 P 0.053 -230 L 0.054 -231 H 0.053 -232 Y 0.051 -233 P 0.051 -234 T 0.052 -235 I 0.056 -236 M 0.058 -237 S 0.054 -238 H 0.045 -239 G 0.036 -240 L 0.032 -241 C 0.037 -242 F 0.050 -243 R 0.059 -244 L 0.058 -245 A 0.052 -246 L 0.050 -247 G 0.051 -248 S 0.052 -249 W 0.050 -250 A 0.047 -251 I 0.050 -252 G 0.056 -253 F 0.059 -254 G 0.059 -255 I 0.059 -256 S 0.057 -257 L 0.056 -258 A 0.056 -259 K 0.057 -260 I 0.055 -261 Y 0.053 -262 F 0.055 -263 I 0.060 -264 S 0.067 -265 C 0.074 -266 L 0.080 -267 S 0.082 -268 F 0.084 -269 C 0.093 -270 G 0.104 -271 P 0.114 -272 N 0.122 -273 V 0.127 -274 I 0.122 -275 N 0.104 -276 H 0.084 -277 F 0.070 -278 F 0.064 -279 C 0.066 -280 D 0.079 -281 I 0.100 -282 S 0.124 -283 P 0.141 -284 V 0.150 -285 L 0.157 -286 N 0.157 -287 L 0.146 -288 S 0.130 -289 C 0.120 -290 T 0.123 -291 D 0.130 -292 M 0.129 -293 S 0.119 -294 I 0.107 -295 T 0.098 -296 E 0.093 -297 L 0.092 -298 V 0.094 -299 D 0.099 -300 F 0.098 -301 I 0.089 -302 L 0.076 -303 A 0.062 -304 L 0.051 -305 V 0.045 -306 I 0.044 -307 F 0.048 -308 L 0.055 -309 F 0.064 -310 P 0.067 -311 L 0.062 -312 F 0.058 -313 I 0.059 -314 T 0.060 -315 V 0.057 -316 L 0.051 -317 S 0.048 -318 Y 0.048 -319 G 0.049 -320 C 0.051 -321 I 0.052 -322 L 0.051 -323 A 0.052 -324 T 0.057 -325 I 0.064 -326 L 0.073 -327 C 0.087 -328 M 0.106 -329 P 0.121 -330 T 0.123 -331 G 0.113 -332 K 0.102 -333 Q 0.095 -334 K 0.091 -335 A 0.084 -336 F 0.079 -337 S 0.077 -338 T 0.079 -339 C 0.079 -340 A 0.078 -341 S 0.078 -342 H 0.074 -343 L 0.067 -344 V 0.065 -345 V 0.065 -346 V 0.062 -347 T 0.051 -348 I 0.038 -349 F 0.030 -350 Y 0.028 -351 S 0.031 -352 A 0.035 -353 I 0.036 -354 I 0.037 -355 F 0.041 -356 M 0.055 -357 Y 0.080 -358 A 0.114 -359 R 0.151 -360 P 0.177 -361 R 0.189 -362 V 0.193 -363 I 0.197 -364 H 0.201 -365 A 0.197 -366 F 0.181 -367 N 0.156 -368 M 0.133 -369 N 0.117 -370 K 0.106 -371 I 0.097 -372 I 0.087 -373 S 0.074 -374 I 0.066 -375 F 0.068 -376 Y 0.080 -377 A 0.095 -378 I 0.107 -379 V 0.118 -380 T 0.123 -381 P 0.117 -382 S 0.102 -383 L 0.090 -384 N 0.080 -385 P 0.071 -386 F 0.064 -387 I 0.062 -388 Y 0.062 -389 C 0.069 -390 L 0.085 -391 R 0.098 -392 N 0.093 -393 R 0.075 -394 E 0.061 -395 V 0.060 -396 K 0.070 -397 E 0.080 -398 A 0.080 -399 L 0.071 -400 K 0.059 -401 K 0.054 -402 L 0.060 -403 A 0.082 -404 Y 0.125 -405 C 0.190 -406 Q 0.262 -407 A 0.324 -408 S 0.366 -409 R 0.387 -410 S 0.388 -411 D 0.380 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000221888.4_ENST00000641256.1_GN:OR1C1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000221888.4_ENST00000641256.1_GN:OR1C1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index cac6efb88bee9bbdc3e33d130e904a4bfadfc4de..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000221888.4_ENST00000641256.1_GN:OR1C1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,315 +0,0 @@ ->ENSG00000221888.4|ENST00000641256.1|GN:OR1C1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.424 -2 E 0.441 -3 K 0.466 -4 R 0.483 -5 N 0.480 -6 L 0.450 -7 T 0.392 -8 V 0.319 -9 V 0.244 -10 R 0.182 -11 E 0.144 -12 F 0.129 -13 V 0.126 -14 L 0.132 -15 L 0.148 -16 G 0.171 -17 L 0.186 -18 P 0.187 -19 S 0.176 -20 S 0.159 -21 A 0.138 -22 E 0.115 -23 Q 0.093 -24 Q 0.076 -25 H 0.063 -26 L 0.060 -27 L 0.066 -28 S 0.076 -29 V 0.077 -30 L 0.066 -31 F 0.053 -32 L 0.048 -33 C 0.049 -34 M 0.052 -35 Y 0.053 -36 L 0.054 -37 A 0.058 -38 T 0.062 -39 T 0.063 -40 L 0.064 -41 G 0.068 -42 N 0.074 -43 M 0.075 -44 L 0.074 -45 I 0.071 -46 I 0.066 -47 A 0.063 -48 T 0.064 -49 I 0.070 -50 G 0.076 -51 F 0.081 -52 D 0.084 -53 S 0.084 -54 H 0.081 -55 L 0.077 -56 H 0.071 -57 S 0.061 -58 P 0.049 -59 M 0.038 -60 Y 0.030 -61 F 0.026 -62 F 0.027 -63 L 0.035 -64 S 0.046 -65 N 0.056 -66 L 0.060 -67 A 0.060 -68 F 0.057 -69 V 0.057 -70 D 0.061 -71 I 0.066 -72 C 0.068 -73 F 0.067 -74 T 0.065 -75 S 0.065 -76 T 0.066 -77 T 0.067 -78 V 0.068 -79 P 0.067 -80 Q 0.066 -81 M 0.065 -82 V 0.062 -83 V 0.059 -84 N 0.060 -85 I 0.066 -86 L 0.073 -87 T 0.078 -88 G 0.078 -89 T 0.071 -90 K 0.061 -91 T 0.054 -92 I 0.050 -93 S 0.046 -94 F 0.042 -95 A 0.041 -96 G 0.040 -97 C 0.038 -98 L 0.035 -99 T 0.033 -100 Q 0.032 -101 L 0.031 -102 F 0.029 -103 F 0.026 -104 F 0.024 -105 V 0.024 -106 S 0.027 -107 F 0.032 -108 V 0.039 -109 N 0.046 -110 M 0.051 -111 D 0.051 -112 S 0.049 -113 L 0.046 -114 L 0.041 -115 L 0.036 -116 C 0.034 -117 V 0.032 -118 M 0.032 -119 A 0.034 -120 Y 0.037 -121 D 0.040 -122 R 0.041 -123 Y 0.039 -124 V 0.037 -125 A 0.038 -126 I 0.042 -127 C 0.049 -128 H 0.056 -129 P 0.060 -130 L 0.060 -131 H 0.061 -132 Y 0.062 -133 T 0.065 -134 A 0.069 -135 R 0.072 -136 M 0.071 -137 N 0.062 -138 L 0.047 -139 C 0.035 -140 L 0.032 -141 C 0.040 -142 V 0.054 -143 Q 0.065 -144 L 0.067 -145 V 0.063 -146 A 0.062 -147 G 0.064 -148 L 0.066 -149 W 0.067 -150 L 0.069 -151 V 0.071 -152 T 0.073 -153 Y 0.071 -154 L 0.070 -155 H 0.071 -156 A 0.073 -157 L 0.074 -158 L 0.077 -159 H 0.081 -160 T 0.080 -161 V 0.078 -162 L 0.079 -163 I 0.083 -164 A 0.089 -165 Q 0.094 -166 L 0.095 -167 S 0.093 -168 F 0.092 -169 C 0.099 -170 A 0.110 -171 S 0.120 -172 N 0.130 -173 I 0.140 -174 I 0.139 -175 H 0.120 -176 H 0.094 -177 F 0.076 -178 F 0.068 -179 C 0.071 -180 D 0.084 -181 L 0.103 -182 N 0.123 -183 P 0.135 -184 L 0.138 -185 L 0.139 -186 Q 0.139 -187 L 0.133 -188 S 0.124 -189 C 0.121 -190 S 0.129 -191 D 0.141 -192 V 0.144 -193 S 0.137 -194 F 0.130 -195 N 0.126 -196 V 0.124 -197 M 0.121 -198 I 0.117 -199 I 0.113 -200 F 0.109 -201 A 0.110 -202 V 0.115 -203 G 0.114 -204 G 0.102 -205 L 0.085 -206 L 0.074 -207 A 0.072 -208 L 0.078 -209 T 0.086 -210 P 0.087 -211 L 0.082 -212 V 0.079 -213 C 0.083 -214 I 0.082 -215 L 0.071 -216 V 0.058 -217 S 0.051 -218 Y 0.049 -219 G 0.051 -220 L 0.057 -221 I 0.063 -222 F 0.070 -223 S 0.075 -224 T 0.075 -225 V 0.073 -226 L 0.079 -227 K 0.095 -228 I 0.114 -229 T 0.129 -230 S 0.136 -231 T 0.134 -232 Q 0.125 -233 G 0.112 -234 K 0.098 -235 Q 0.089 -236 R 0.088 -237 A 0.090 -238 V 0.092 -239 S 0.093 -240 T 0.092 -241 C 0.089 -242 S 0.085 -243 C 0.083 -244 H 0.079 -245 L 0.073 -246 S 0.068 -247 V 0.065 -248 V 0.056 -249 V 0.043 -250 L 0.031 -251 F 0.027 -252 Y 0.029 -253 G 0.033 -254 T 0.037 -255 A 0.039 -256 I 0.040 -257 A 0.045 -258 V 0.059 -259 Y 0.085 -260 F 0.128 -261 S 0.185 -262 P 0.248 -263 S 0.301 -264 S 0.331 -265 P 0.332 -266 H 0.315 -267 M 0.291 -268 P 0.264 -269 E 0.238 -270 S 0.212 -271 D 0.184 -272 T 0.154 -273 L 0.129 -274 S 0.112 -275 T 0.100 -276 I 0.094 -277 M 0.098 -278 Y 0.110 -279 S 0.121 -280 M 0.127 -281 V 0.131 -282 A 0.129 -283 P 0.120 -284 M 0.107 -285 L 0.099 -286 N 0.092 -287 P 0.084 -288 F 0.080 -289 I 0.080 -290 Y 0.080 -291 T 0.086 -292 L 0.103 -293 R 0.117 -294 N 0.110 -295 R 0.090 -296 D 0.074 -297 M 0.071 -298 K 0.080 -299 R 0.090 -300 G 0.093 -301 L 0.092 -302 Q 0.092 -303 K 0.091 -304 M 0.087 -305 L 0.087 -306 L 0.104 -307 K 0.141 -308 C 0.186 -309 T 0.228 -310 V 0.269 -311 F 0.309 -312 Q 0.335 -313 Q 0.341 -314 Q 0.335 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000221888.4_ENST00000641256.1_GN:OR1C1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:31.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000221888.4_ENST00000641256.1_GN:OR1C1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:31.caid deleted file mode 100644 index 296a006cc282f28fa2f14a4e8e0539ea490f122d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000221888.4_ENST00000641256.1_GN:OR1C1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:31.caid +++ /dev/null @@ -1,346 +0,0 @@ ->ENSG00000221888.4|ENST00000641256.1|GN:OR1C1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:31 -1 M 0.220 -2 H 0.217 -3 R 0.213 -4 S 0.206 -5 I 0.191 -6 Y 0.174 -7 A 0.170 -8 F 0.182 -9 V 0.208 -10 I 0.241 -11 G 0.272 -12 Y 0.299 -13 S 0.328 -14 G 0.361 -15 K 0.399 -16 R 0.439 -17 K 0.476 -18 V 0.508 -19 I 0.536 -20 G 0.560 -21 G 0.571 -22 K 0.568 -23 G 0.554 -24 L 0.522 -25 R 0.478 -26 K 0.452 -27 G 0.460 -28 F 0.486 -29 V 0.513 -30 G 0.533 -31 N 0.541 -32 M 0.541 -33 E 0.544 -34 K 0.550 -35 R 0.550 -36 N 0.536 -37 L 0.498 -38 T 0.431 -39 V 0.346 -40 V 0.261 -41 R 0.194 -42 E 0.151 -43 F 0.132 -44 V 0.126 -45 L 0.129 -46 L 0.142 -47 G 0.164 -48 L 0.181 -49 P 0.185 -50 S 0.178 -51 S 0.163 -52 A 0.143 -53 E 0.119 -54 Q 0.096 -55 Q 0.077 -56 H 0.064 -57 L 0.060 -58 L 0.066 -59 S 0.075 -60 V 0.075 -61 L 0.065 -62 F 0.054 -63 L 0.049 -64 C 0.050 -65 M 0.052 -66 Y 0.053 -67 L 0.053 -68 A 0.057 -69 T 0.062 -70 T 0.062 -71 L 0.063 -72 G 0.068 -73 N 0.074 -74 M 0.076 -75 L 0.075 -76 I 0.072 -77 I 0.067 -78 A 0.062 -79 T 0.061 -80 I 0.065 -81 G 0.069 -82 F 0.074 -83 D 0.077 -84 S 0.077 -85 H 0.074 -86 L 0.069 -87 H 0.063 -88 S 0.056 -89 P 0.045 -90 M 0.035 -91 Y 0.028 -92 F 0.024 -93 F 0.026 -94 L 0.035 -95 S 0.046 -96 N 0.056 -97 L 0.061 -98 A 0.060 -99 F 0.057 -100 V 0.056 -101 D 0.061 -102 I 0.066 -103 C 0.069 -104 F 0.068 -105 T 0.066 -106 S 0.065 -107 T 0.063 -108 T 0.062 -109 V 0.061 -110 P 0.060 -111 Q 0.059 -112 M 0.058 -113 V 0.055 -114 V 0.052 -115 N 0.052 -116 I 0.056 -117 L 0.063 -118 T 0.069 -119 G 0.070 -120 T 0.066 -121 K 0.058 -122 T 0.052 -123 I 0.047 -124 S 0.043 -125 F 0.039 -126 A 0.037 -127 G 0.037 -128 C 0.035 -129 L 0.033 -130 T 0.032 -131 Q 0.031 -132 L 0.030 -133 F 0.028 -134 F 0.025 -135 F 0.023 -136 V 0.023 -137 S 0.026 -138 F 0.031 -139 V 0.038 -140 N 0.045 -141 M 0.049 -142 D 0.050 -143 S 0.048 -144 L 0.045 -145 L 0.040 -146 L 0.035 -147 C 0.032 -148 V 0.031 -149 M 0.031 -150 A 0.033 -151 Y 0.037 -152 D 0.040 -153 R 0.041 -154 Y 0.039 -155 V 0.037 -156 A 0.038 -157 I 0.042 -158 C 0.049 -159 H 0.057 -160 P 0.060 -161 L 0.061 -162 H 0.061 -163 Y 0.063 -164 T 0.067 -165 A 0.071 -166 R 0.075 -167 M 0.075 -168 N 0.065 -169 L 0.049 -170 C 0.035 -171 L 0.032 -172 C 0.040 -173 V 0.054 -174 Q 0.065 -175 L 0.065 -176 V 0.059 -177 A 0.056 -178 G 0.057 -179 L 0.056 -180 W 0.053 -181 L 0.051 -182 V 0.057 -183 T 0.065 -184 Y 0.068 -185 L 0.069 -186 H 0.071 -187 A 0.073 -188 L 0.074 -189 L 0.077 -190 H 0.081 -191 T 0.080 -192 V 0.077 -193 L 0.078 -194 I 0.083 -195 A 0.088 -196 Q 0.094 -197 L 0.096 -198 S 0.094 -199 F 0.092 -200 C 0.097 -201 A 0.107 -202 S 0.116 -203 N 0.127 -204 I 0.137 -205 I 0.136 -206 H 0.118 -207 H 0.093 -208 F 0.074 -209 F 0.067 -210 C 0.071 -211 D 0.085 -212 L 0.105 -213 N 0.124 -214 P 0.134 -215 L 0.137 -216 L 0.138 -217 Q 0.137 -218 L 0.131 -219 S 0.120 -220 C 0.115 -221 S 0.122 -222 D 0.134 -223 V 0.138 -224 S 0.133 -225 F 0.126 -226 N 0.122 -227 V 0.120 -228 M 0.117 -229 I 0.114 -230 I 0.111 -231 F 0.108 -232 A 0.110 -233 V 0.114 -234 G 0.114 -235 G 0.102 -236 L 0.085 -237 L 0.074 -238 A 0.073 -239 L 0.080 -240 T 0.087 -241 P 0.088 -242 L 0.083 -243 V 0.080 -244 C 0.083 -245 I 0.084 -246 L 0.073 -247 V 0.060 -248 S 0.052 -249 Y 0.049 -250 G 0.051 -251 L 0.055 -252 I 0.062 -253 F 0.070 -254 S 0.076 -255 T 0.076 -256 V 0.074 -257 L 0.079 -258 K 0.094 -259 I 0.112 -260 T 0.127 -261 S 0.135 -262 T 0.133 -263 Q 0.126 -264 G 0.113 -265 K 0.100 -266 Q 0.091 -267 R 0.090 -268 A 0.092 -269 V 0.093 -270 S 0.094 -271 T 0.092 -272 C 0.089 -273 S 0.086 -274 C 0.084 -275 H 0.079 -276 L 0.074 -277 S 0.069 -278 V 0.066 -279 V 0.057 -280 V 0.044 -281 L 0.032 -282 F 0.027 -283 Y 0.029 -284 G 0.033 -285 T 0.037 -286 A 0.038 -287 I 0.039 -288 A 0.044 -289 V 0.057 -290 Y 0.083 -291 F 0.127 -292 S 0.187 -293 P 0.252 -294 S 0.308 -295 S 0.339 -296 P 0.341 -297 H 0.325 -298 M 0.301 -299 P 0.274 -300 E 0.248 -301 S 0.221 -302 D 0.192 -303 T 0.161 -304 L 0.135 -305 S 0.117 -306 T 0.105 -307 I 0.099 -308 M 0.104 -309 Y 0.116 -310 S 0.126 -311 M 0.132 -312 V 0.135 -313 A 0.133 -314 P 0.123 -315 M 0.111 -316 L 0.102 -317 N 0.094 -318 P 0.087 -319 F 0.083 -320 I 0.083 -321 Y 0.083 -322 T 0.089 -323 L 0.107 -324 R 0.120 -325 N 0.113 -326 R 0.092 -327 D 0.075 -328 M 0.072 -329 K 0.080 -330 R 0.090 -331 G 0.094 -332 L 0.094 -333 Q 0.094 -334 K 0.093 -335 M 0.088 -336 L 0.087 -337 L 0.104 -338 K 0.141 -339 C 0.188 -340 T 0.232 -341 V 0.274 -342 F 0.314 -343 Q 0.341 -344 Q 0.347 -345 Q 0.341 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000223611.7_ENST00000486479.3_GN:SUPT20HL2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000223611.7_ENST00000486479.3_GN:SUPT20HL2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 7d3eb8b72ada6e818882f1e1624ad264ff17acac..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000223611.7_ENST00000486479.3_GN:SUPT20HL2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,818 +0,0 @@ ->ENSG00000223611.7|ENST00000486479.3|GN:SUPT20HL2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.351 -2 D 0.347 -3 R 0.341 -4 D 0.335 -5 L 0.327 -6 E 0.313 -7 Q 0.307 -8 A 0.330 -9 L 0.377 -10 D 0.428 -11 R 0.472 -12 T 0.507 -13 E 0.525 -14 N 0.518 -15 I 0.481 -16 T 0.422 -17 E 0.373 -18 I 0.363 -19 A 0.379 -20 Q 0.399 -21 Q 0.419 -22 R 0.446 -23 R 0.478 -24 P 0.512 -25 R 0.548 -26 R 0.577 -27 R 0.589 -28 Y 0.584 -29 S 0.577 -30 P 0.577 -31 R 0.586 -32 A 0.585 -33 G 0.544 -34 K 0.461 -35 T 0.364 -36 L 0.284 -37 Q 0.231 -38 E 0.203 -39 K 0.187 -40 L 0.175 -41 Y 0.167 -42 D 0.165 -43 I 0.161 -44 Y 0.154 -45 V 0.159 -46 E 0.183 -47 E 0.226 -48 C 0.275 -49 G 0.314 -50 K 0.331 -51 E 0.332 -52 P 0.325 -53 E 0.309 -54 D 0.284 -55 P 0.250 -56 Q 0.217 -57 E 0.196 -58 L 0.189 -59 R 0.194 -60 S 0.208 -61 N 0.215 -62 V 0.201 -63 N 0.165 -64 L 0.123 -65 L 0.092 -66 E 0.078 -67 K 0.076 -68 L 0.080 -69 V 0.086 -70 R 0.095 -71 R 0.107 -72 E 0.119 -73 S 0.129 -74 L 0.129 -75 P 0.113 -76 C 0.087 -77 L 0.065 -78 L 0.054 -79 V 0.050 -80 N 0.051 -81 L 0.056 -82 Y 0.066 -83 P 0.081 -84 G 0.094 -85 N 0.101 -86 Q 0.099 -87 G 0.090 -88 Y 0.078 -89 S 0.070 -90 V 0.070 -91 M 0.080 -92 L 0.100 -93 Q 0.127 -94 R 0.152 -95 E 0.168 -96 D 0.176 -97 G 0.178 -98 S 0.179 -99 F 0.178 -100 A 0.176 -101 E 0.172 -102 T 0.161 -103 I 0.146 -104 R 0.132 -105 L 0.116 -106 P 0.102 -107 Y 0.090 -108 E 0.079 -109 E 0.067 -110 R 0.058 -111 A 0.057 -112 L 0.064 -113 L 0.073 -114 D 0.079 -115 Y 0.084 -116 L 0.091 -117 D 0.096 -118 A 0.094 -119 E 0.086 -120 E 0.077 -121 L 0.067 -122 P 0.057 -123 P 0.048 -124 A 0.042 -125 L 0.036 -126 G 0.032 -127 D 0.031 -128 V 0.031 -129 L 0.031 -130 D 0.029 -131 K 0.027 -132 A 0.027 -133 S 0.029 -134 V 0.033 -135 N 0.039 -136 I 0.045 -137 F 0.051 -138 H 0.061 -139 S 0.070 -140 G 0.074 -141 C 0.068 -142 V 0.058 -143 I 0.050 -144 V 0.045 -145 E 0.043 -146 V 0.044 -147 R 0.048 -148 D 0.056 -149 Y 0.074 -150 R 0.105 -151 Q 0.149 -152 S 0.191 -153 S 0.214 -154 N 0.213 -155 M 0.197 -156 Q 0.181 -157 P 0.172 -158 P 0.167 -159 G 0.157 -160 Y 0.136 -161 Q 0.107 -162 S 0.079 -163 R 0.059 -164 H 0.047 -165 I 0.042 -166 L 0.041 -167 L 0.046 -168 R 0.058 -169 P 0.073 -170 T 0.090 -171 M 0.111 -172 Q 0.138 -173 T 0.169 -174 L 0.199 -175 A 0.222 -176 P 0.240 -177 E 0.257 -178 V 0.277 -179 K 0.294 -180 T 0.298 -181 M 0.300 -182 T 0.308 -183 R 0.317 -184 D 0.322 -185 G 0.317 -186 E 0.295 -187 K 0.262 -188 W 0.238 -189 S 0.228 -190 Q 0.229 -191 E 0.239 -192 D 0.257 -193 K 0.273 -194 F 0.270 -195 P 0.244 -196 L 0.205 -197 E 0.170 -198 S 0.150 -199 Q 0.149 -200 L 0.156 -201 I 0.158 -202 L 0.156 -203 A 0.157 -204 T 0.158 -205 A 0.157 -206 E 0.160 -207 P 0.172 -208 L 0.189 -209 C 0.203 -210 L 0.211 -211 D 0.209 -212 P 0.202 -213 S 0.197 -214 V 0.201 -215 A 0.215 -216 V 0.221 -217 A 0.203 -218 C 0.173 -219 T 0.149 -220 A 0.131 -221 N 0.115 -222 R 0.108 -223 L 0.110 -224 L 0.117 -225 Y 0.129 -226 N 0.143 -227 K 0.152 -228 Q 0.161 -229 K 0.181 -230 M 0.209 -231 N 0.232 -232 T 0.246 -233 D 0.252 -234 P 0.253 -235 M 0.250 -236 E 0.245 -237 Q 0.240 -238 C 0.233 -239 L 0.219 -240 Q 0.202 -241 R 0.194 -242 Y 0.203 -243 S 0.240 -244 W 0.316 -245 P 0.418 -246 S 0.514 -247 V 0.586 -248 K 0.643 -249 P 0.694 -250 Q 0.736 -251 Q 0.758 -252 E 0.754 -253 Q 0.730 -254 S 0.694 -255 D 0.657 -256 C 0.624 -257 P 0.611 -258 P 0.631 -259 P 0.684 -260 P 0.747 -261 E 0.799 -262 L 0.827 -263 R 0.837 -264 V 0.838 -265 S 0.836 -266 T 0.833 -267 S 0.831 -268 G 0.829 -269 Q 0.827 -270 K 0.824 -271 E 0.820 -272 E 0.813 -273 R 0.807 -274 K 0.801 -275 V 0.796 -276 G 0.792 -277 Q 0.795 -278 P 0.806 -279 C 0.819 -280 E 0.829 -281 L 0.832 -282 N 0.825 -283 I 0.812 -284 T 0.805 -285 K 0.808 -286 A 0.815 -287 G 0.821 -288 S 0.820 -289 C 0.808 -290 V 0.773 -291 D 0.707 -292 T 0.630 -293 W 0.585 -294 K 0.596 -295 G 0.637 -296 R 0.671 -297 P 0.684 -298 C 0.687 -299 D 0.691 -300 L 0.699 -301 A 0.697 -302 V 0.685 -303 P 0.684 -304 S 0.696 -305 E 0.698 -306 V 0.658 -307 D 0.576 -308 V 0.475 -309 E 0.389 -310 K 0.345 -311 L 0.353 -312 A 0.399 -313 K 0.466 -314 G 0.546 -315 Y 0.628 -316 Q 0.689 -317 S 0.720 -318 V 0.723 -319 T 0.704 -320 A 0.669 -321 A 0.628 -322 D 0.594 -323 P 0.574 -324 Q 0.577 -325 L 0.607 -326 P 0.646 -327 V 0.673 -328 W 0.686 -329 P 0.707 -330 A 0.735 -331 Q 0.748 -332 E 0.727 -333 V 0.672 -334 E 0.597 -335 D 0.514 -336 P 0.444 -337 F 0.410 -338 R 0.412 -339 H 0.420 -340 A 0.415 -341 W 0.414 -342 E 0.442 -343 A 0.494 -344 G 0.543 -345 C 0.571 -346 Q 0.570 -347 A 0.540 -348 W 0.500 -349 D 0.478 -350 T 0.486 -351 K 0.523 -352 P 0.579 -353 N 0.632 -354 I 0.664 -355 M 0.676 -356 Q 0.680 -357 S 0.678 -358 F 0.668 -359 N 0.656 -360 D 0.644 -361 P 0.629 -362 L 0.621 -363 L 0.639 -364 C 0.679 -365 G 0.711 -366 K 0.716 -367 I 0.706 -368 R 0.704 -369 P 0.718 -370 R 0.740 -371 K 0.763 -372 K 0.782 -373 A 0.795 -374 R 0.799 -375 Q 0.795 -376 K 0.788 -377 S 0.777 -378 Q 0.764 -379 K 0.748 -380 S 0.731 -381 P 0.718 -382 W 0.717 -383 Q 0.731 -384 P 0.752 -385 F 0.775 -386 P 0.800 -387 D 0.819 -388 D 0.827 -389 H 0.826 -390 S 0.826 -391 A 0.829 -392 C 0.829 -393 L 0.828 -394 R 0.832 -395 P 0.843 -396 G 0.854 -397 S 0.859 -398 E 0.858 -399 T 0.852 -400 D 0.845 -401 A 0.841 -402 G 0.837 -403 R 0.834 -404 A 0.829 -405 V 0.819 -406 S 0.806 -407 Q 0.783 -408 A 0.735 -409 Q 0.672 -410 E 0.644 -411 S 0.681 -412 V 0.746 -413 Q 0.790 -414 S 0.808 -415 K 0.813 -416 V 0.810 -417 K 0.806 -418 G 0.810 -419 P 0.821 -420 G 0.835 -421 K 0.844 -422 M 0.845 -423 S 0.842 -424 H 0.837 -425 S 0.833 -426 S 0.832 -427 S 0.831 -428 G 0.831 -429 P 0.835 -430 A 0.838 -431 S 0.834 -432 V 0.824 -433 S 0.812 -434 Q 0.803 -435 L 0.794 -436 S 0.785 -437 S 0.776 -438 W 0.769 -439 K 0.768 -440 T 0.773 -441 P 0.778 -442 E 0.777 -443 Q 0.774 -444 P 0.776 -445 D 0.787 -446 P 0.799 -447 V 0.807 -448 W 0.813 -449 V 0.820 -450 Q 0.825 -451 S 0.826 -452 S 0.825 -453 V 0.826 -454 S 0.828 -455 G 0.832 -456 K 0.833 -457 G 0.827 -458 E 0.812 -459 K 0.789 -460 H 0.766 -461 P 0.755 -462 P 0.763 -463 P 0.781 -464 R 0.792 -465 T 0.784 -466 Q 0.754 -467 L 0.701 -468 P 0.641 -469 S 0.616 -470 S 0.644 -471 S 0.674 -472 G 0.661 -473 K 0.645 -474 I 0.678 -475 S 0.739 -476 S 0.782 -477 G 0.796 -478 N 0.788 -479 S 0.770 -480 F 0.757 -481 P 0.761 -482 P 0.778 -483 Q 0.796 -484 Q 0.806 -485 A 0.807 -486 G 0.801 -487 S 0.791 -488 P 0.783 -489 L 0.775 -490 K 0.767 -491 R 0.759 -492 P 0.760 -493 F 0.773 -494 P 0.793 -495 A 0.812 -496 A 0.822 -497 A 0.829 -498 P 0.837 -499 A 0.845 -500 V 0.850 -501 A 0.850 -502 A 0.843 -503 A 0.828 -504 A 0.813 -505 P 0.801 -506 A 0.796 -507 P 0.793 -508 A 0.789 -509 P 0.783 -510 A 0.767 -511 P 0.726 -512 A 0.661 -513 A 0.609 -514 A 0.593 -515 P 0.593 -516 A 0.605 -517 L 0.644 -518 A 0.672 -519 A 0.658 -520 A 0.647 -521 A 0.689 -522 V 0.759 -523 A 0.808 -524 A 0.826 -525 A 0.830 -526 A 0.829 -527 G 0.827 -528 G 0.822 -529 A 0.814 -530 A 0.809 -531 P 0.811 -532 S 0.818 -533 H 0.821 -534 S 0.816 -535 Q 0.812 -536 K 0.813 -537 P 0.820 -538 S 0.828 -539 V 0.839 -540 P 0.852 -541 L 0.864 -542 I 0.871 -543 K 0.871 -544 A 0.865 -545 S 0.855 -546 R 0.843 -547 R 0.833 -548 R 0.827 -549 P 0.827 -550 A 0.830 -551 A 0.829 -552 G 0.823 -553 R 0.819 -554 P 0.825 -555 T 0.837 -556 R 0.846 -557 F 0.845 -558 V 0.837 -559 K 0.825 -560 I 0.819 -561 A 0.824 -562 P 0.839 -563 A 0.857 -564 I 0.871 -565 Q 0.877 -566 V 0.879 -567 R 0.877 -568 T 0.873 -569 G 0.871 -570 S 0.873 -571 T 0.877 -572 G 0.882 -573 L 0.885 -574 K 0.885 -575 A 0.881 -576 T 0.875 -577 N 0.866 -578 V 0.855 -579 E 0.846 -580 G 0.841 -581 P 0.846 -582 V 0.858 -583 R 0.868 -584 G 0.869 -585 A 0.859 -586 Q 0.847 -587 V 0.839 -588 L 0.836 -589 G 0.830 -590 C 0.816 -591 S 0.800 -592 F 0.792 -593 K 0.797 -594 P 0.810 -595 V 0.820 -596 Q 0.823 -597 A 0.823 -598 P 0.828 -599 G 0.837 -600 S 0.843 -601 G 0.841 -602 A 0.833 -603 P 0.826 -604 A 0.828 -605 P 0.837 -606 A 0.845 -607 G 0.843 -608 I 0.821 -609 S 0.769 -610 G 0.702 -611 S 0.667 -612 G 0.698 -613 L 0.752 -614 Q 0.783 -615 S 0.791 -616 S 0.800 -617 G 0.811 -618 G 0.817 -619 P 0.815 -620 L 0.813 -621 P 0.813 -622 D 0.814 -623 A 0.814 -624 R 0.818 -625 P 0.830 -626 G 0.846 -627 A 0.855 -628 V 0.852 -629 Q 0.834 -630 A 0.802 -631 S 0.761 -632 S 0.719 -633 P 0.670 -634 A 0.603 -635 P 0.512 -636 L 0.415 -637 Q 0.335 -638 F 0.284 -639 F 0.268 -640 L 0.291 -641 N 0.334 -642 T 0.361 -643 P 0.357 -644 E 0.346 -645 G 0.345 -646 L 0.357 -647 R 0.374 -648 P 0.381 -649 L 0.376 -650 T 0.367 -651 L 0.358 -652 Q 0.356 -653 V 0.378 -654 P 0.425 -655 Q 0.464 -656 G 0.477 -657 W 0.492 -658 A 0.537 -659 V 0.594 -660 L 0.629 -661 T 0.642 -662 G 0.656 -663 P 0.678 -664 Q 0.691 -665 Q 0.681 -666 Q 0.648 -667 S 0.608 -668 H 0.568 -669 Q 0.524 -670 L 0.470 -671 V 0.426 -672 S 0.420 -673 L 0.452 -674 Q 0.495 -675 Q 0.530 -676 L 0.557 -677 Q 0.583 -678 Q 0.620 -679 P 0.670 -680 T 0.715 -681 A 0.736 -682 A 0.733 -683 H 0.724 -684 P 0.726 -685 P 0.739 -686 Q 0.756 -687 P 0.771 -688 G 0.786 -689 P 0.802 -690 Q 0.818 -691 G 0.832 -692 S 0.843 -693 T 0.852 -694 L 0.858 -695 G 0.855 -696 L 0.844 -697 S 0.830 -698 T 0.818 -699 Q 0.810 -700 G 0.802 -701 Q 0.790 -702 A 0.780 -703 F 0.779 -704 P 0.786 -705 A 0.798 -706 Q 0.809 -707 Q 0.817 -708 L 0.825 -709 L 0.830 -710 N 0.834 -711 V 0.835 -712 N 0.834 -713 L 0.834 -714 T 0.838 -715 G 0.844 -716 A 0.849 -717 G 0.849 -718 S 0.842 -719 G 0.827 -720 L 0.806 -721 Q 0.787 -722 P 0.780 -723 Q 0.787 -724 P 0.805 -725 Q 0.825 -726 A 0.838 -727 A 0.840 -728 V 0.830 -729 L 0.817 -730 S 0.809 -731 L 0.805 -732 L 0.805 -733 G 0.805 -734 S 0.804 -735 A 0.799 -736 Q 0.792 -737 V 0.787 -738 P 0.790 -739 Q 0.799 -740 Q 0.810 -741 G 0.817 -742 V 0.818 -743 Q 0.817 -744 L 0.819 -745 P 0.825 -746 F 0.830 -747 V 0.828 -748 L 0.817 -749 G 0.796 -750 Q 0.775 -751 Q 0.762 -752 P 0.765 -753 Q 0.785 -754 P 0.811 -755 L 0.827 -756 L 0.828 -757 L 0.814 -758 L 0.792 -759 Q 0.770 -760 P 0.755 -761 Q 0.752 -762 P 0.763 -763 Q 0.785 -764 P 0.809 -765 Q 0.828 -766 Q 0.838 -767 I 0.839 -768 Q 0.832 -769 L 0.821 -770 Q 0.809 -771 T 0.802 -772 Q 0.805 -773 P 0.814 -774 L 0.823 -775 R 0.825 -776 V 0.820 -777 L 0.813 -778 Q 0.809 -779 Q 0.812 -780 P 0.818 -781 V 0.820 -782 F 0.819 -783 L 0.820 -784 A 0.823 -785 T 0.825 -786 G 0.820 -787 A 0.811 -788 V 0.801 -789 Q 0.793 -790 I 0.782 -791 V 0.765 -792 Q 0.747 -793 P 0.738 -794 H 0.748 -795 P 0.775 -796 G 0.804 -797 V 0.824 -798 Q 0.835 -799 A 0.839 -800 G 0.840 -801 S 0.840 -802 Q 0.841 -803 L 0.842 -804 V 0.840 -805 G 0.830 -806 Q 0.816 -807 R 0.800 -808 K 0.788 -809 G 0.779 -810 G 0.770 -811 K 0.758 -812 P 0.745 -813 T 0.740 -814 P 0.748 -815 P 0.759 -816 A 0.762 -817 P 0.758 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000223611.7_ENST00000486479.3_GN:SUPT20HL2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000223611.7_ENST00000486479.3_GN:SUPT20HL2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid deleted file mode 100644 index 937cc9f6882149e9f45950458f44fa4bfcc7d386..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000223611.7_ENST00000486479.3_GN:SUPT20HL2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid +++ /dev/null @@ -1,844 +0,0 @@ ->ENSG00000223611.7|ENST00000486479.3|GN:SUPT20HL2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:26 -1 M 0.308 -2 T 0.319 -3 A 0.335 -4 V 0.342 -5 I 0.338 -6 P 0.337 -7 P 0.355 -8 C 0.384 -9 F 0.397 -10 T 0.379 -11 N 0.339 -12 A 0.293 -13 H 0.246 -14 A 0.206 -15 F 0.178 -16 S 0.166 -17 L 0.167 -18 L 0.173 -19 L 0.181 -20 G 0.191 -21 A 0.202 -22 L 0.219 -23 F 0.247 -24 S 0.281 -25 V 0.302 -26 T 0.300 -27 M 0.291 -28 D 0.288 -29 R 0.290 -30 D 0.290 -31 L 0.286 -32 E 0.276 -33 Q 0.275 -34 A 0.297 -35 L 0.345 -36 D 0.404 -37 R 0.457 -38 T 0.493 -39 E 0.506 -40 N 0.497 -41 I 0.462 -42 T 0.407 -43 E 0.361 -44 I 0.349 -45 A 0.361 -46 Q 0.378 -47 Q 0.399 -48 R 0.429 -49 R 0.468 -50 P 0.509 -51 R 0.550 -52 R 0.582 -53 R 0.594 -54 Y 0.591 -55 S 0.589 -56 P 0.594 -57 R 0.603 -58 A 0.599 -59 G 0.561 -60 K 0.487 -61 T 0.400 -62 L 0.321 -63 Q 0.262 -64 E 0.226 -65 K 0.203 -66 L 0.181 -67 Y 0.164 -68 D 0.156 -69 I 0.150 -70 Y 0.140 -71 V 0.138 -72 E 0.153 -73 E 0.185 -74 C 0.223 -75 G 0.256 -76 K 0.272 -77 E 0.275 -78 P 0.269 -79 E 0.256 -80 D 0.235 -81 P 0.207 -82 Q 0.180 -83 E 0.162 -84 L 0.155 -85 R 0.156 -86 S 0.162 -87 N 0.162 -88 V 0.149 -89 N 0.123 -90 L 0.093 -91 L 0.072 -92 E 0.063 -93 K 0.063 -94 L 0.067 -95 V 0.072 -96 R 0.081 -97 R 0.093 -98 E 0.106 -99 S 0.116 -100 L 0.115 -101 P 0.099 -102 C 0.075 -103 L 0.056 -104 L 0.048 -105 V 0.047 -106 N 0.048 -107 L 0.053 -108 Y 0.062 -109 P 0.072 -110 G 0.081 -111 N 0.087 -112 Q 0.086 -113 G 0.081 -114 Y 0.073 -115 S 0.066 -116 V 0.066 -117 M 0.074 -118 L 0.090 -119 Q 0.113 -120 R 0.134 -121 E 0.150 -122 D 0.160 -123 G 0.165 -124 S 0.167 -125 F 0.167 -126 A 0.168 -127 E 0.168 -128 T 0.161 -129 I 0.147 -130 R 0.132 -131 L 0.115 -132 P 0.099 -133 Y 0.084 -134 E 0.071 -135 E 0.060 -136 R 0.052 -137 A 0.053 -138 L 0.061 -139 L 0.070 -140 D 0.076 -141 Y 0.082 -142 L 0.090 -143 D 0.096 -144 A 0.094 -145 E 0.088 -146 E 0.080 -147 L 0.072 -148 P 0.061 -149 P 0.052 -150 A 0.045 -151 L 0.039 -152 G 0.034 -153 D 0.032 -154 V 0.032 -155 L 0.032 -156 D 0.030 -157 K 0.027 -158 A 0.027 -159 S 0.029 -160 V 0.033 -161 N 0.039 -162 I 0.044 -163 F 0.049 -164 H 0.057 -165 S 0.065 -166 G 0.070 -167 C 0.065 -168 V 0.055 -169 I 0.048 -170 V 0.044 -171 E 0.043 -172 V 0.045 -173 R 0.050 -174 D 0.060 -175 Y 0.078 -176 R 0.110 -177 Q 0.150 -178 S 0.186 -179 S 0.203 -180 N 0.200 -181 M 0.184 -182 Q 0.167 -183 P 0.156 -184 P 0.151 -185 G 0.143 -186 Y 0.125 -187 Q 0.100 -188 S 0.074 -189 R 0.056 -190 H 0.045 -191 I 0.040 -192 L 0.039 -193 L 0.044 -194 R 0.056 -195 P 0.070 -196 T 0.084 -197 M 0.103 -198 Q 0.132 -199 T 0.171 -200 L 0.212 -201 A 0.247 -202 P 0.271 -203 E 0.286 -204 V 0.300 -205 K 0.310 -206 T 0.311 -207 M 0.310 -208 T 0.312 -209 R 0.313 -210 D 0.308 -211 G 0.293 -212 E 0.264 -213 K 0.228 -214 W 0.203 -215 S 0.193 -216 Q 0.194 -217 E 0.201 -218 D 0.214 -219 K 0.224 -220 F 0.220 -221 P 0.199 -222 L 0.170 -223 E 0.141 -224 S 0.123 -225 Q 0.121 -226 L 0.127 -227 I 0.131 -228 L 0.131 -229 A 0.133 -230 T 0.134 -231 A 0.131 -232 E 0.128 -233 P 0.130 -234 L 0.138 -235 C 0.149 -236 L 0.158 -237 D 0.162 -238 P 0.161 -239 S 0.158 -240 V 0.163 -241 A 0.176 -242 V 0.179 -243 A 0.159 -244 C 0.130 -245 T 0.108 -246 A 0.091 -247 N 0.080 -248 R 0.076 -249 L 0.081 -250 L 0.091 -251 Y 0.105 -252 N 0.119 -253 K 0.127 -254 Q 0.135 -255 K 0.152 -256 M 0.179 -257 N 0.206 -258 T 0.222 -259 D 0.224 -260 P 0.216 -261 M 0.205 -262 E 0.196 -263 Q 0.191 -264 C 0.185 -265 L 0.174 -266 Q 0.161 -267 R 0.158 -268 Y 0.170 -269 S 0.209 -270 W 0.284 -271 P 0.382 -272 S 0.475 -273 V 0.548 -274 K 0.610 -275 P 0.669 -276 Q 0.717 -277 Q 0.742 -278 E 0.736 -279 Q 0.707 -280 S 0.667 -281 D 0.628 -282 C 0.595 -283 P 0.582 -284 P 0.604 -285 P 0.662 -286 P 0.732 -287 E 0.790 -288 L 0.822 -289 R 0.833 -290 V 0.834 -291 S 0.831 -292 T 0.828 -293 S 0.826 -294 G 0.825 -295 Q 0.823 -296 K 0.820 -297 E 0.815 -298 E 0.807 -299 R 0.798 -300 K 0.791 -301 V 0.785 -302 G 0.780 -303 Q 0.783 -304 P 0.796 -305 C 0.812 -306 E 0.825 -307 L 0.828 -308 N 0.819 -309 I 0.802 -310 T 0.790 -311 K 0.790 -312 A 0.798 -313 G 0.804 -314 S 0.802 -315 C 0.787 -316 V 0.747 -317 D 0.677 -318 T 0.597 -319 W 0.550 -320 K 0.559 -321 G 0.597 -322 R 0.626 -323 P 0.635 -324 C 0.633 -325 D 0.635 -326 L 0.641 -327 A 0.637 -328 V 0.621 -329 P 0.617 -330 S 0.630 -331 E 0.633 -332 V 0.592 -333 D 0.510 -334 V 0.415 -335 E 0.336 -336 K 0.297 -337 L 0.306 -338 A 0.350 -339 K 0.417 -340 G 0.501 -341 Y 0.589 -342 Q 0.658 -343 S 0.693 -344 V 0.693 -345 T 0.666 -346 A 0.621 -347 A 0.572 -348 D 0.529 -349 P 0.505 -350 Q 0.507 -351 L 0.541 -352 P 0.586 -353 V 0.616 -354 W 0.631 -355 P 0.653 -356 A 0.683 -357 Q 0.698 -358 E 0.675 -359 V 0.617 -360 E 0.539 -361 D 0.457 -362 P 0.388 -363 F 0.349 -364 R 0.343 -365 H 0.345 -366 A 0.340 -367 W 0.343 -368 E 0.373 -369 A 0.424 -370 G 0.467 -371 C 0.489 -372 Q 0.482 -373 A 0.451 -374 W 0.412 -375 D 0.394 -376 T 0.409 -377 K 0.455 -378 P 0.518 -379 N 0.573 -380 I 0.602 -381 M 0.615 -382 Q 0.624 -383 S 0.625 -384 F 0.616 -385 N 0.607 -386 D 0.598 -387 P 0.585 -388 L 0.575 -389 L 0.593 -390 C 0.639 -391 G 0.678 -392 K 0.688 -393 I 0.682 -394 R 0.684 -395 P 0.701 -396 R 0.726 -397 K 0.751 -398 K 0.772 -399 A 0.785 -400 R 0.788 -401 Q 0.785 -402 K 0.778 -403 S 0.768 -404 Q 0.755 -405 K 0.740 -406 S 0.723 -407 P 0.709 -408 W 0.707 -409 Q 0.720 -410 P 0.741 -411 F 0.765 -412 P 0.790 -413 D 0.811 -414 D 0.819 -415 H 0.818 -416 S 0.818 -417 A 0.820 -418 C 0.820 -419 L 0.820 -420 R 0.826 -421 P 0.839 -422 G 0.852 -423 S 0.858 -424 E 0.856 -425 T 0.850 -426 D 0.844 -427 A 0.839 -428 G 0.837 -429 R 0.834 -430 A 0.829 -431 V 0.821 -432 S 0.808 -433 Q 0.784 -434 A 0.736 -435 Q 0.672 -436 E 0.644 -437 S 0.682 -438 V 0.747 -439 Q 0.791 -440 S 0.809 -441 K 0.813 -442 V 0.810 -443 K 0.807 -444 G 0.810 -445 P 0.822 -446 G 0.836 -447 K 0.845 -448 M 0.846 -449 S 0.843 -450 H 0.839 -451 S 0.836 -452 S 0.834 -453 S 0.832 -454 G 0.832 -455 P 0.835 -456 A 0.838 -457 S 0.834 -458 V 0.823 -459 S 0.811 -460 Q 0.802 -461 L 0.793 -462 S 0.784 -463 S 0.774 -464 W 0.767 -465 K 0.766 -466 T 0.772 -467 P 0.777 -468 E 0.777 -469 Q 0.774 -470 P 0.776 -471 D 0.785 -472 P 0.796 -473 V 0.804 -474 W 0.810 -475 V 0.817 -476 Q 0.822 -477 S 0.823 -478 S 0.822 -479 V 0.823 -480 S 0.827 -481 G 0.832 -482 K 0.833 -483 G 0.828 -484 E 0.813 -485 K 0.790 -486 H 0.767 -487 P 0.757 -488 P 0.765 -489 P 0.782 -490 R 0.792 -491 T 0.784 -492 Q 0.754 -493 L 0.700 -494 P 0.640 -495 S 0.614 -496 S 0.642 -497 S 0.670 -498 G 0.652 -499 K 0.623 -500 I 0.622 -501 S 0.635 -502 S 0.655 -503 G 0.694 -504 N 0.735 -505 S 0.751 -506 F 0.752 -507 P 0.759 -508 P 0.777 -509 Q 0.796 -510 Q 0.806 -511 A 0.806 -512 G 0.799 -513 S 0.790 -514 P 0.781 -515 L 0.773 -516 K 0.764 -517 R 0.757 -518 P 0.757 -519 F 0.769 -520 P 0.789 -521 A 0.808 -522 A 0.818 -523 A 0.825 -524 P 0.833 -525 A 0.842 -526 V 0.847 -527 A 0.847 -528 A 0.840 -529 A 0.826 -530 A 0.810 -531 P 0.799 -532 A 0.793 -533 P 0.789 -534 A 0.785 -535 P 0.778 -536 A 0.763 -537 P 0.722 -538 A 0.658 -539 A 0.606 -540 A 0.590 -541 P 0.589 -542 A 0.602 -543 L 0.641 -544 A 0.669 -545 A 0.655 -546 A 0.645 -547 A 0.686 -548 V 0.755 -549 A 0.804 -550 A 0.822 -551 A 0.825 -552 A 0.824 -553 G 0.823 -554 G 0.818 -555 A 0.811 -556 A 0.805 -557 P 0.807 -558 S 0.814 -559 H 0.816 -560 S 0.813 -561 Q 0.808 -562 K 0.810 -563 P 0.817 -564 S 0.825 -565 V 0.835 -566 P 0.848 -567 L 0.860 -568 I 0.866 -569 K 0.867 -570 A 0.861 -571 S 0.851 -572 R 0.839 -573 R 0.830 -574 R 0.825 -575 P 0.825 -576 A 0.828 -577 A 0.827 -578 G 0.821 -579 R 0.818 -580 P 0.824 -581 T 0.836 -582 R 0.845 -583 F 0.844 -584 V 0.836 -585 K 0.824 -586 I 0.817 -587 A 0.822 -588 P 0.838 -589 A 0.856 -590 I 0.870 -591 Q 0.877 -592 V 0.878 -593 R 0.877 -594 T 0.874 -595 G 0.872 -596 S 0.874 -597 T 0.878 -598 G 0.883 -599 L 0.886 -600 K 0.886 -601 A 0.882 -602 T 0.875 -603 N 0.866 -604 V 0.855 -605 E 0.845 -606 G 0.841 -607 P 0.846 -608 V 0.858 -609 R 0.869 -610 G 0.870 -611 A 0.862 -612 Q 0.848 -613 V 0.839 -614 L 0.835 -615 G 0.829 -616 C 0.815 -617 S 0.800 -618 F 0.792 -619 K 0.798 -620 P 0.811 -621 V 0.822 -622 Q 0.825 -623 A 0.825 -624 P 0.830 -625 G 0.839 -626 S 0.845 -627 G 0.843 -628 A 0.835 -629 P 0.828 -630 A 0.829 -631 P 0.838 -632 A 0.845 -633 G 0.842 -634 I 0.820 -635 S 0.769 -636 G 0.702 -637 S 0.666 -638 G 0.691 -639 L 0.733 -640 Q 0.744 -641 S 0.742 -642 S 0.760 -643 G 0.790 -644 G 0.809 -645 P 0.813 -646 L 0.811 -647 P 0.811 -648 D 0.812 -649 A 0.812 -650 R 0.816 -651 P 0.828 -652 G 0.844 -653 A 0.854 -654 V 0.851 -655 Q 0.832 -656 A 0.801 -657 S 0.761 -658 S 0.719 -659 P 0.671 -660 A 0.604 -661 P 0.517 -662 L 0.423 -663 Q 0.345 -664 F 0.295 -665 F 0.280 -666 L 0.302 -667 N 0.344 -668 T 0.367 -669 P 0.362 -670 E 0.349 -671 G 0.348 -672 L 0.362 -673 R 0.382 -674 P 0.392 -675 L 0.389 -676 T 0.379 -677 L 0.369 -678 Q 0.365 -679 V 0.388 -680 P 0.435 -681 Q 0.474 -682 G 0.487 -683 W 0.501 -684 A 0.544 -685 V 0.598 -686 L 0.632 -687 T 0.645 -688 G 0.658 -689 P 0.680 -690 Q 0.694 -691 Q 0.684 -692 Q 0.654 -693 S 0.617 -694 H 0.580 -695 Q 0.537 -696 L 0.484 -697 V 0.440 -698 S 0.434 -699 L 0.464 -700 Q 0.505 -701 Q 0.539 -702 L 0.566 -703 Q 0.591 -704 Q 0.627 -705 P 0.675 -706 T 0.718 -707 A 0.738 -708 A 0.734 -709 H 0.725 -710 P 0.726 -711 P 0.739 -712 Q 0.755 -713 P 0.771 -714 G 0.786 -715 P 0.801 -716 Q 0.817 -717 G 0.832 -718 S 0.843 -719 T 0.852 -720 L 0.857 -721 G 0.855 -722 L 0.845 -723 S 0.831 -724 T 0.820 -725 Q 0.812 -726 G 0.803 -727 Q 0.792 -728 A 0.782 -729 F 0.781 -730 P 0.789 -731 A 0.800 -732 Q 0.811 -733 Q 0.820 -734 L 0.826 -735 L 0.831 -736 N 0.835 -737 V 0.836 -738 N 0.835 -739 L 0.835 -740 T 0.839 -741 G 0.845 -742 A 0.850 -743 G 0.850 -744 S 0.843 -745 G 0.829 -746 L 0.808 -747 Q 0.790 -748 P 0.782 -749 Q 0.789 -750 P 0.807 -751 Q 0.826 -752 A 0.840 -753 A 0.841 -754 V 0.831 -755 L 0.818 -756 S 0.809 -757 L 0.805 -758 L 0.805 -759 G 0.806 -760 S 0.807 -761 A 0.803 -762 Q 0.796 -763 V 0.792 -764 P 0.794 -765 Q 0.802 -766 Q 0.812 -767 G 0.819 -768 V 0.818 -769 Q 0.816 -770 L 0.819 -771 P 0.825 -772 F 0.830 -773 V 0.830 -774 L 0.819 -775 G 0.800 -776 Q 0.779 -777 Q 0.766 -778 P 0.769 -779 Q 0.787 -780 P 0.812 -781 L 0.828 -782 L 0.828 -783 L 0.815 -784 L 0.794 -785 Q 0.772 -786 P 0.757 -787 Q 0.754 -788 P 0.765 -789 Q 0.787 -790 P 0.812 -791 Q 0.830 -792 Q 0.841 -793 I 0.841 -794 Q 0.834 -795 L 0.822 -796 Q 0.810 -797 T 0.804 -798 Q 0.806 -799 P 0.816 -800 L 0.825 -801 R 0.828 -802 V 0.824 -803 L 0.817 -804 Q 0.814 -805 Q 0.816 -806 P 0.821 -807 V 0.823 -808 F 0.822 -809 L 0.823 -810 A 0.825 -811 T 0.826 -812 G 0.823 -813 A 0.816 -814 V 0.808 -815 Q 0.800 -816 I 0.788 -817 V 0.771 -818 Q 0.752 -819 P 0.743 -820 H 0.752 -821 P 0.778 -822 G 0.806 -823 V 0.826 -824 Q 0.835 -825 A 0.839 -826 G 0.839 -827 S 0.838 -828 Q 0.839 -829 L 0.840 -830 V 0.838 -831 G 0.830 -832 Q 0.816 -833 R 0.801 -834 K 0.789 -835 G 0.780 -836 G 0.772 -837 K 0.760 -838 P 0.747 -839 T 0.742 -840 P 0.750 -841 P 0.761 -842 A 0.763 -843 P 0.759 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000223731.4_ENST00000686983.1_GN:SUPT20HL1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000223731.4_ENST00000686983.1_GN:SUPT20HL1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 15637fb867a9c524fa58562add4a5f6442a15bcc..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000223731.4_ENST00000686983.1_GN:SUPT20HL1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,888 +0,0 @@ ->ENSG00000223731.4|ENST00000686983.1|GN:SUPT20HL1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.322 -2 D 0.309 -3 R 0.290 -4 D 0.273 -5 L 0.259 -6 E 0.244 -7 Q 0.232 -8 A 0.235 -9 L 0.253 -10 D 0.271 -11 R 0.288 -12 A 0.308 -13 E 0.331 -14 N 0.346 -15 I 0.345 -16 I 0.328 -17 E 0.312 -18 I 0.309 -19 A 0.318 -20 Q 0.330 -21 Q 0.351 -22 R 0.386 -23 P 0.433 -24 P 0.480 -25 R 0.519 -26 R 0.546 -27 R 0.557 -28 Y 0.556 -29 S 0.551 -30 P 0.551 -31 R 0.561 -32 A 0.563 -33 G 0.531 -34 K 0.461 -35 T 0.378 -36 L 0.307 -37 Q 0.255 -38 E 0.225 -39 K 0.208 -40 L 0.193 -41 Y 0.180 -42 D 0.172 -43 I 0.164 -44 Y 0.156 -45 V 0.157 -46 E 0.180 -47 E 0.221 -48 C 0.269 -49 G 0.306 -50 K 0.320 -51 E 0.320 -52 P 0.313 -53 E 0.300 -54 D 0.275 -55 P 0.240 -56 Q 0.204 -57 E 0.181 -58 L 0.175 -59 R 0.181 -60 S 0.196 -61 N 0.204 -62 V 0.191 -63 N 0.156 -64 L 0.117 -65 L 0.089 -66 E 0.076 -67 K 0.074 -68 L 0.078 -69 V 0.084 -70 R 0.094 -71 R 0.106 -72 E 0.117 -73 S 0.125 -74 L 0.124 -75 P 0.109 -76 C 0.085 -77 L 0.065 -78 L 0.054 -79 V 0.051 -80 N 0.052 -81 L 0.058 -82 Y 0.070 -83 P 0.086 -84 G 0.100 -85 N 0.108 -86 Q 0.106 -87 G 0.096 -88 Y 0.084 -89 S 0.074 -90 V 0.074 -91 M 0.083 -92 L 0.103 -93 Q 0.129 -94 R 0.154 -95 E 0.169 -96 D 0.176 -97 G 0.182 -98 S 0.188 -99 F 0.191 -100 A 0.189 -101 E 0.180 -102 T 0.167 -103 I 0.153 -104 R 0.141 -105 L 0.127 -106 P 0.113 -107 Y 0.100 -108 E 0.087 -109 E 0.071 -110 R 0.059 -111 A 0.056 -112 L 0.061 -113 L 0.069 -114 D 0.074 -115 Y 0.079 -116 L 0.086 -117 D 0.091 -118 A 0.089 -119 E 0.082 -120 E 0.074 -121 L 0.066 -122 P 0.058 -123 P 0.050 -124 A 0.043 -125 L 0.036 -126 G 0.031 -127 D 0.029 -128 V 0.029 -129 L 0.029 -130 D 0.027 -131 K 0.026 -132 A 0.026 -133 S 0.028 -134 V 0.032 -135 N 0.039 -136 I 0.046 -137 F 0.053 -138 H 0.061 -139 S 0.068 -140 G 0.070 -141 C 0.064 -142 V 0.054 -143 I 0.047 -144 V 0.044 -145 E 0.043 -146 V 0.044 -147 R 0.048 -148 D 0.055 -149 Y 0.073 -150 R 0.106 -151 Q 0.155 -152 S 0.203 -153 S 0.228 -154 N 0.221 -155 M 0.198 -156 Q 0.179 -157 P 0.173 -158 P 0.169 -159 G 0.155 -160 Y 0.131 -161 Q 0.100 -162 S 0.072 -163 R 0.053 -164 H 0.043 -165 I 0.038 -166 L 0.038 -167 L 0.045 -168 R 0.059 -169 P 0.073 -170 T 0.080 -171 M 0.083 -172 Q 0.086 -173 T 0.085 -174 L 0.082 -175 A 0.081 -176 H 0.085 -177 D 0.093 -178 V 0.101 -179 K 0.110 -180 M 0.125 -181 M 0.143 -182 T 0.157 -183 R 0.164 -184 D 0.173 -185 G 0.183 -186 Q 0.182 -187 K 0.162 -188 W 0.135 -189 S 0.115 -190 Q 0.107 -191 E 0.107 -192 D 0.107 -193 K 0.104 -194 L 0.101 -195 Q 0.099 -196 L 0.096 -197 E 0.091 -198 S 0.087 -199 Q 0.090 -200 L 0.100 -201 I 0.110 -202 L 0.121 -203 A 0.137 -204 T 0.160 -205 A 0.183 -206 E 0.203 -207 P 0.218 -208 L 0.228 -209 C 0.232 -210 L 0.225 -211 D 0.202 -212 P 0.171 -213 S 0.151 -214 V 0.148 -215 A 0.154 -216 V 0.159 -217 A 0.164 -218 C 0.171 -219 T 0.168 -220 A 0.150 -221 N 0.131 -222 R 0.128 -223 L 0.139 -224 L 0.151 -225 Y 0.158 -226 N 0.167 -227 K 0.177 -228 Q 0.192 -229 K 0.215 -230 M 0.241 -231 N 0.261 -232 T 0.277 -233 D 0.288 -234 P 0.294 -235 M 0.296 -236 K 0.303 -237 R 0.324 -238 C 0.349 -239 L 0.353 -240 Q 0.328 -241 R 0.297 -242 Y 0.286 -243 S 0.312 -244 W 0.387 -245 P 0.492 -246 S 0.588 -247 V 0.653 -248 K 0.694 -249 P 0.728 -250 Q 0.758 -251 Q 0.776 -252 E 0.777 -253 Q 0.763 -254 S 0.737 -255 D 0.703 -256 C 0.670 -257 P 0.653 -258 P 0.667 -259 P 0.710 -260 P 0.765 -261 E 0.812 -262 L 0.840 -263 R 0.849 -264 V 0.848 -265 S 0.843 -266 T 0.838 -267 S 0.836 -268 G 0.835 -269 Q 0.835 -270 K 0.834 -271 E 0.831 -272 E 0.827 -273 R 0.821 -274 K 0.817 -275 V 0.814 -276 G 0.811 -277 Q 0.813 -278 P 0.821 -279 C 0.833 -280 E 0.843 -281 L 0.848 -282 N 0.845 -283 I 0.836 -284 A 0.829 -285 K 0.829 -286 A 0.832 -287 G 0.835 -288 S 0.836 -289 C 0.833 -290 V 0.813 -291 D 0.766 -292 T 0.704 -293 W 0.667 -294 K 0.676 -295 G 0.712 -296 R 0.745 -297 P 0.765 -298 C 0.777 -299 D 0.785 -300 L 0.788 -301 A 0.781 -302 V 0.771 -303 P 0.769 -304 S 0.778 -305 E 0.778 -306 V 0.748 -307 D 0.680 -308 V 0.588 -309 E 0.499 -310 K 0.449 -311 L 0.455 -312 A 0.499 -313 K 0.561 -314 G 0.628 -315 Y 0.690 -316 Q 0.736 -317 S 0.761 -318 V 0.767 -319 T 0.757 -320 A 0.736 -321 A 0.708 -322 D 0.680 -323 P 0.660 -324 Q 0.659 -325 L 0.679 -326 P 0.710 -327 V 0.734 -328 W 0.752 -329 P 0.773 -330 A 0.796 -331 Q 0.807 -332 E 0.797 -333 V 0.770 -334 E 0.735 -335 D 0.702 -336 P 0.685 -337 F 0.700 -338 G 0.742 -339 F 0.787 -340 A 0.813 -341 L 0.820 -342 E 0.820 -343 A 0.821 -344 G 0.821 -345 C 0.814 -346 Q 0.797 -347 A 0.770 -348 W 0.739 -349 D 0.715 -350 T 0.708 -351 K 0.721 -352 P 0.746 -353 S 0.771 -354 I 0.783 -355 M 0.787 -356 Q 0.787 -357 S 0.782 -358 F 0.770 -359 N 0.755 -360 D 0.739 -361 P 0.720 -362 L 0.711 -363 L 0.724 -364 C 0.754 -365 G 0.777 -366 K 0.780 -367 I 0.769 -368 R 0.763 -369 P 0.768 -370 R 0.778 -371 K 0.792 -372 K 0.806 -373 A 0.816 -374 R 0.819 -375 Q 0.815 -376 K 0.806 -377 S 0.795 -378 Q 0.781 -379 K 0.764 -380 S 0.747 -381 P 0.734 -382 W 0.731 -383 Q 0.741 -384 P 0.759 -385 F 0.780 -386 P 0.803 -387 D 0.822 -388 D 0.832 -389 H 0.833 -390 S 0.833 -391 A 0.836 -392 C 0.836 -393 L 0.836 -394 R 0.840 -395 P 0.850 -396 G 0.861 -397 S 0.866 -398 E 0.864 -399 T 0.859 -400 D 0.854 -401 A 0.850 -402 G 0.847 -403 R 0.844 -404 A 0.837 -405 V 0.828 -406 S 0.815 -407 Q 0.791 -408 A 0.742 -409 Q 0.677 -410 E 0.646 -411 S 0.682 -412 V 0.745 -413 Q 0.789 -414 S 0.807 -415 K 0.811 -416 V 0.810 -417 K 0.808 -418 G 0.810 -419 P 0.820 -420 G 0.832 -421 K 0.839 -422 M 0.840 -423 S 0.837 -424 H 0.833 -425 S 0.830 -426 S 0.828 -427 S 0.828 -428 G 0.829 -429 P 0.833 -430 A 0.836 -431 S 0.833 -432 V 0.824 -433 S 0.812 -434 Q 0.803 -435 L 0.795 -436 S 0.787 -437 S 0.777 -438 W 0.770 -439 K 0.770 -440 T 0.775 -441 P 0.780 -442 E 0.781 -443 Q 0.779 -444 P 0.782 -445 D 0.791 -446 P 0.801 -447 V 0.808 -448 W 0.814 -449 V 0.820 -450 Q 0.825 -451 S 0.827 -452 S 0.826 -453 V 0.828 -454 S 0.832 -455 G 0.837 -456 K 0.838 -457 G 0.832 -458 E 0.817 -459 K 0.793 -460 H 0.768 -461 P 0.755 -462 P 0.760 -463 P 0.777 -464 R 0.787 -465 T 0.778 -466 Q 0.746 -467 L 0.692 -468 P 0.631 -469 S 0.608 -470 S 0.648 -471 S 0.717 -472 G 0.762 -473 K 0.764 -474 I 0.728 -475 S 0.673 -476 S 0.647 -477 G 0.678 -478 N 0.729 -479 S 0.756 -480 F 0.762 -481 P 0.773 -482 P 0.794 -483 Q 0.814 -484 Q 0.825 -485 A 0.825 -486 G 0.818 -487 S 0.808 -488 P 0.800 -489 L 0.796 -490 K 0.796 -491 R 0.799 -492 P 0.807 -493 F 0.817 -494 S 0.825 -495 A 0.829 -496 A 0.827 -497 A 0.820 -498 A 0.808 -499 I 0.791 -500 A 0.770 -501 A 0.742 -502 A 0.708 -503 A 0.660 -504 A 0.604 -505 A 0.578 -506 A 0.608 -507 A 0.665 -508 A 0.706 -509 A 0.730 -510 A 0.748 -511 A 0.762 -512 A 0.774 -513 A 0.781 -514 A 0.782 -515 A 0.775 -516 A 0.762 -517 A 0.754 -518 P 0.761 -519 A 0.783 -520 P 0.809 -521 A 0.829 -522 L 0.837 -523 A 0.834 -524 A 0.824 -525 A 0.809 -526 A 0.794 -527 A 0.785 -528 P 0.781 -529 A 0.772 -530 L 0.733 -531 A 0.669 -532 A 0.631 -533 A 0.657 -534 A 0.717 -535 A 0.767 -536 P 0.797 -537 A 0.817 -538 L 0.831 -539 A 0.840 -540 A 0.843 -541 A 0.837 -542 A 0.824 -543 A 0.811 -544 P 0.807 -545 A 0.813 -546 P 0.823 -547 A 0.834 -548 P 0.843 -549 A 0.847 -550 A 0.846 -551 A 0.842 -552 P 0.838 -553 A 0.822 -554 V 0.774 -555 A 0.701 -556 A 0.656 -557 A 0.683 -558 P 0.749 -559 A 0.801 -560 A 0.822 -561 A 0.826 -562 A 0.822 -563 S 0.814 -564 A 0.805 -565 A 0.799 -566 P 0.802 -567 S 0.811 -568 H 0.819 -569 S 0.820 -570 Q 0.819 -571 K 0.819 -572 P 0.823 -573 S 0.829 -574 V 0.840 -575 P 0.854 -576 L 0.866 -577 I 0.870 -578 Q 0.868 -579 A 0.859 -580 S 0.847 -581 R 0.837 -582 P 0.835 -583 C 0.841 -584 P 0.849 -585 A 0.848 -586 A 0.835 -587 Q 0.818 -588 P 0.813 -589 P 0.826 -590 T 0.843 -591 K 0.851 -592 F 0.848 -593 I 0.836 -594 K 0.823 -595 I 0.814 -596 A 0.816 -597 P 0.827 -598 A 0.841 -599 I 0.853 -600 Q 0.861 -601 L 0.865 -602 R 0.864 -603 T 0.861 -604 G 0.858 -605 S 0.854 -606 T 0.851 -607 G 0.850 -608 L 0.852 -609 K 0.854 -610 A 0.854 -611 I 0.851 -612 N 0.847 -613 V 0.842 -614 E 0.837 -615 G 0.835 -616 P 0.838 -617 V 0.847 -618 Q 0.859 -619 G 0.867 -620 A 0.866 -621 Q 0.858 -622 A 0.849 -623 L 0.841 -624 G 0.831 -625 S 0.819 -626 S 0.807 -627 F 0.804 -628 K 0.811 -629 P 0.822 -630 V 0.827 -631 Q 0.823 -632 A 0.817 -633 P 0.816 -634 G 0.822 -635 S 0.828 -636 G 0.827 -637 A 0.821 -638 P 0.816 -639 A 0.816 -640 P 0.823 -641 A 0.829 -642 G 0.827 -643 I 0.807 -644 S 0.757 -645 G 0.690 -646 S 0.655 -647 D 0.685 -648 L 0.744 -649 Q 0.782 -650 S 0.797 -651 S 0.807 -652 G 0.815 -653 G 0.819 -654 P 0.818 -655 L 0.817 -656 P 0.819 -657 D 0.822 -658 A 0.824 -659 R 0.828 -660 P 0.840 -661 G 0.856 -662 A 0.868 -663 V 0.868 -664 Q 0.854 -665 A 0.829 -666 S 0.799 -667 S 0.770 -668 P 0.746 -669 A 0.717 -670 P 0.668 -671 L 0.596 -672 Q 0.517 -673 F 0.458 -674 F 0.438 -675 L 0.464 -676 N 0.507 -677 T 0.528 -678 P 0.522 -679 E 0.505 -680 G 0.493 -681 L 0.493 -682 R 0.514 -683 P 0.551 -684 L 0.594 -685 T 0.631 -686 L 0.662 -687 L 0.686 -688 Q 0.704 -689 V 0.727 -690 P 0.764 -691 Q 0.805 -692 G 0.834 -693 S 0.844 -694 A 0.842 -695 V 0.835 -696 L 0.824 -697 T 0.812 -698 G 0.803 -699 P 0.802 -700 Q 0.804 -701 Q 0.800 -702 Q 0.785 -703 S 0.765 -704 H 0.744 -705 Q 0.717 -706 L 0.679 -707 V 0.647 -708 S 0.642 -709 L 0.661 -710 Q 0.681 -711 Q 0.693 -712 L 0.700 -713 Q 0.705 -714 Q 0.718 -715 P 0.743 -716 T 0.771 -717 A 0.784 -718 A 0.780 -719 H 0.770 -720 P 0.769 -721 P 0.778 -722 Q 0.791 -723 P 0.804 -724 G 0.817 -725 P 0.831 -726 Q 0.844 -727 G 0.856 -728 S 0.865 -729 A 0.872 -730 L 0.874 -731 G 0.869 -732 L 0.858 -733 S 0.846 -734 T 0.835 -735 Q 0.827 -736 G 0.818 -737 Q 0.807 -738 A 0.797 -739 F 0.796 -740 P 0.804 -741 A 0.817 -742 Q 0.829 -743 Q 0.833 -744 L 0.833 -745 L 0.829 -746 K 0.825 -747 V 0.822 -748 N 0.823 -749 P 0.829 -750 T 0.838 -751 R 0.848 -752 A 0.853 -753 R 0.852 -754 S 0.846 -755 G 0.835 -756 L 0.818 -757 Q 0.799 -758 P 0.785 -759 Q 0.780 -760 P 0.786 -761 Q 0.802 -762 P 0.822 -763 A 0.838 -764 V 0.841 -765 L 0.837 -766 S 0.831 -767 L 0.826 -768 L 0.823 -769 G 0.824 -770 S 0.824 -771 A 0.820 -772 Q 0.816 -773 V 0.815 -774 P 0.822 -775 Q 0.832 -776 Q 0.840 -777 G 0.840 -778 V 0.833 -779 Q 0.822 -780 L 0.816 -781 P 0.819 -782 S 0.828 -783 V 0.835 -784 L 0.834 -785 R 0.825 -786 Q 0.811 -787 Q 0.795 -788 Q 0.780 -789 P 0.769 -790 Q 0.765 -791 P 0.766 -792 Q 0.773 -793 P 0.785 -794 P 0.786 -795 K 0.753 -796 L 0.689 -797 Q 0.646 -798 L 0.664 -799 Q 0.712 -800 P 0.735 -801 Q 0.725 -802 W 0.708 -803 Q 0.708 -804 P 0.723 -805 K 0.745 -806 P 0.765 -807 R 0.776 -808 Q 0.779 -809 E 0.778 -810 Q 0.779 -811 P 0.787 -812 Q 0.798 -813 S 0.805 -814 Q 0.805 -815 Q 0.799 -816 Q 0.795 -817 Q 0.801 -818 P 0.813 -819 Q 0.824 -820 H 0.827 -821 I 0.822 -822 Q 0.811 -823 L 0.788 -824 Q 0.740 -825 T 0.674 -826 Q 0.640 -827 Q 0.671 -828 L 0.731 -829 R 0.771 -830 V 0.778 -831 L 0.769 -832 Q 0.757 -833 Q 0.756 -834 P 0.768 -835 Q 0.787 -836 H 0.802 -837 I 0.805 -838 Q 0.801 -839 L 0.795 -840 Q 0.788 -841 T 0.783 -842 Q 0.781 -843 Q 0.782 -844 L 0.783 -845 R 0.779 -846 V 0.769 -847 L 0.755 -848 Q 0.748 -849 Q 0.758 -850 P 0.777 -851 V 0.792 -852 F 0.802 -853 L 0.811 -854 A 0.818 -855 T 0.819 -856 G 0.815 -857 A 0.809 -858 V 0.803 -859 Q 0.794 -860 I 0.778 -861 V 0.757 -862 Q 0.737 -863 P 0.730 -864 H 0.744 -865 P 0.774 -866 G 0.805 -867 V 0.823 -868 Q 0.830 -869 V 0.831 -870 G 0.832 -871 S 0.831 -872 Q 0.828 -873 L 0.822 -874 V 0.810 -875 D 0.794 -876 Q 0.777 -877 R 0.763 -878 K 0.750 -879 E 0.742 -880 G 0.739 -881 K 0.739 -882 P 0.741 -883 T 0.747 -884 P 0.757 -885 P 0.763 -886 A 0.759 -887 P 0.751 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000223731.4_ENST00000686983.1_GN:SUPT20HL1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000223731.4_ENST00000686983.1_GN:SUPT20HL1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid deleted file mode 100644 index bb92ad63f42e06d0fa0e50c634d3fb296e900e6d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000223731.4_ENST00000686983.1_GN:SUPT20HL1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:26.caid +++ /dev/null @@ -1,914 +0,0 @@ ->ENSG00000223731.4|ENST00000686983.1|GN:SUPT20HL1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:26 -1 M 0.299 -2 T 0.306 -3 A 0.315 -4 V 0.318 -5 I 0.314 -6 P 0.315 -7 P 0.330 -8 C 0.352 -9 F 0.358 -10 T 0.334 -11 N 0.292 -12 A 0.242 -13 H 0.192 -14 A 0.149 -15 F 0.119 -16 S 0.104 -17 L 0.100 -18 L 0.103 -19 L 0.111 -20 G 0.121 -21 A 0.135 -22 L 0.152 -23 F 0.172 -24 S 0.196 -25 V 0.215 -26 T 0.220 -27 M 0.219 -28 D 0.214 -29 R 0.205 -30 D 0.196 -31 L 0.187 -32 E 0.172 -33 Q 0.158 -34 A 0.156 -35 L 0.167 -36 D 0.181 -37 R 0.190 -38 A 0.200 -39 E 0.216 -40 N 0.231 -41 I 0.235 -42 I 0.227 -43 E 0.216 -44 I 0.216 -45 A 0.227 -46 Q 0.249 -47 Q 0.284 -48 R 0.330 -49 P 0.378 -50 P 0.416 -51 R 0.444 -52 R 0.466 -53 R 0.482 -54 Y 0.493 -55 S 0.502 -56 P 0.510 -57 R 0.518 -58 A 0.517 -59 G 0.488 -60 K 0.426 -61 T 0.353 -62 L 0.289 -63 Q 0.241 -64 E 0.213 -65 K 0.196 -66 L 0.176 -67 Y 0.157 -68 D 0.144 -69 I 0.134 -70 Y 0.124 -71 V 0.124 -72 E 0.141 -73 E 0.172 -74 C 0.209 -75 G 0.239 -76 K 0.255 -77 E 0.257 -78 P 0.253 -79 E 0.241 -80 D 0.221 -81 P 0.192 -82 Q 0.162 -83 E 0.142 -84 L 0.135 -85 R 0.136 -86 S 0.143 -87 N 0.147 -88 V 0.137 -89 N 0.114 -90 L 0.088 -91 L 0.068 -92 E 0.061 -93 K 0.062 -94 L 0.067 -95 V 0.073 -96 R 0.082 -97 R 0.093 -98 E 0.105 -99 S 0.113 -100 L 0.111 -101 P 0.097 -102 C 0.074 -103 L 0.056 -104 L 0.048 -105 V 0.047 -106 N 0.049 -107 L 0.054 -108 Y 0.063 -109 P 0.073 -110 G 0.082 -111 N 0.087 -112 Q 0.087 -113 G 0.082 -114 Y 0.073 -115 S 0.067 -116 V 0.067 -117 M 0.076 -118 L 0.093 -119 Q 0.116 -120 R 0.137 -121 E 0.152 -122 D 0.162 -123 G 0.168 -124 S 0.170 -125 F 0.170 -126 A 0.169 -127 E 0.166 -128 T 0.158 -129 I 0.148 -130 R 0.136 -131 L 0.122 -132 P 0.106 -133 Y 0.091 -134 E 0.077 -135 E 0.063 -136 R 0.053 -137 A 0.052 -138 L 0.059 -139 L 0.067 -140 D 0.073 -141 Y 0.079 -142 L 0.086 -143 D 0.091 -144 A 0.089 -145 E 0.084 -146 E 0.078 -147 L 0.071 -148 P 0.062 -149 P 0.053 -150 A 0.046 -151 L 0.038 -152 G 0.033 -153 D 0.030 -154 V 0.030 -155 L 0.029 -156 D 0.027 -157 K 0.026 -158 A 0.026 -159 S 0.027 -160 V 0.031 -161 N 0.036 -162 I 0.043 -163 F 0.049 -164 H 0.055 -165 S 0.062 -166 G 0.065 -167 C 0.060 -168 V 0.051 -169 I 0.044 -170 V 0.041 -171 E 0.041 -172 V 0.043 -173 R 0.048 -174 D 0.056 -175 Y 0.074 -176 R 0.106 -177 Q 0.150 -178 S 0.193 -179 S 0.214 -180 N 0.208 -181 M 0.186 -182 Q 0.167 -183 P 0.159 -184 P 0.153 -185 G 0.141 -186 Y 0.118 -187 Q 0.090 -188 S 0.065 -189 R 0.048 -190 H 0.039 -191 I 0.036 -192 L 0.036 -193 L 0.042 -194 R 0.055 -195 P 0.066 -196 T 0.071 -197 M 0.072 -198 Q 0.075 -199 T 0.077 -200 L 0.074 -201 A 0.074 -202 H 0.078 -203 D 0.084 -204 V 0.091 -205 K 0.099 -206 M 0.111 -207 M 0.125 -208 T 0.134 -209 R 0.137 -210 D 0.141 -211 G 0.148 -212 Q 0.147 -213 K 0.131 -214 W 0.107 -215 S 0.090 -216 Q 0.083 -217 E 0.084 -218 D 0.084 -219 K 0.082 -220 L 0.081 -221 Q 0.080 -222 L 0.077 -223 E 0.071 -224 S 0.068 -225 Q 0.070 -226 L 0.077 -227 I 0.086 -228 L 0.095 -229 A 0.110 -230 T 0.133 -231 A 0.157 -232 E 0.177 -233 P 0.191 -234 L 0.198 -235 C 0.196 -236 L 0.189 -237 D 0.174 -238 P 0.154 -239 S 0.141 -240 V 0.139 -241 A 0.143 -242 V 0.144 -243 A 0.144 -244 C 0.147 -245 T 0.144 -246 A 0.130 -247 N 0.115 -248 R 0.113 -249 L 0.122 -250 L 0.132 -251 Y 0.142 -252 N 0.152 -253 K 0.163 -254 Q 0.175 -255 K 0.195 -256 M 0.221 -257 N 0.245 -258 T 0.264 -259 D 0.271 -260 P 0.265 -261 M 0.256 -262 K 0.259 -263 R 0.279 -264 C 0.304 -265 L 0.310 -266 Q 0.290 -267 R 0.265 -268 Y 0.258 -269 S 0.287 -270 W 0.363 -271 P 0.468 -272 S 0.565 -273 V 0.632 -274 K 0.678 -275 P 0.718 -276 Q 0.752 -277 Q 0.773 -278 E 0.773 -279 Q 0.756 -280 S 0.727 -281 D 0.692 -282 C 0.658 -283 P 0.641 -284 P 0.654 -285 P 0.699 -286 P 0.757 -287 E 0.808 -288 L 0.839 -289 R 0.850 -290 V 0.849 -291 S 0.844 -292 T 0.838 -293 S 0.836 -294 G 0.836 -295 Q 0.837 -296 K 0.836 -297 E 0.832 -298 E 0.826 -299 R 0.819 -300 K 0.814 -301 V 0.809 -302 G 0.806 -303 Q 0.808 -304 P 0.818 -305 C 0.831 -306 E 0.843 -307 L 0.847 -308 N 0.842 -309 I 0.831 -310 A 0.821 -311 K 0.819 -312 A 0.822 -313 G 0.824 -314 S 0.825 -315 C 0.820 -316 V 0.796 -317 D 0.741 -318 T 0.670 -319 W 0.627 -320 K 0.639 -321 G 0.681 -322 R 0.719 -323 P 0.740 -324 C 0.751 -325 D 0.759 -326 L 0.762 -327 A 0.753 -328 V 0.739 -329 P 0.735 -330 S 0.744 -331 E 0.745 -332 V 0.710 -333 D 0.633 -334 V 0.531 -335 E 0.440 -336 K 0.393 -337 L 0.401 -338 A 0.444 -339 K 0.503 -340 G 0.575 -341 Y 0.648 -342 Q 0.705 -343 S 0.737 -344 V 0.743 -345 T 0.729 -346 A 0.700 -347 A 0.663 -348 D 0.628 -349 P 0.604 -350 Q 0.602 -351 L 0.629 -352 P 0.668 -353 V 0.698 -354 W 0.717 -355 P 0.740 -356 A 0.767 -357 Q 0.781 -358 E 0.772 -359 V 0.743 -360 E 0.706 -361 D 0.672 -362 P 0.655 -363 F 0.671 -364 G 0.717 -365 F 0.767 -366 A 0.797 -367 L 0.804 -368 E 0.802 -369 A 0.799 -370 G 0.792 -371 C 0.778 -372 Q 0.757 -373 A 0.724 -374 W 0.685 -375 D 0.656 -376 T 0.651 -377 K 0.669 -378 P 0.702 -379 S 0.732 -380 I 0.747 -381 M 0.751 -382 Q 0.751 -383 S 0.746 -384 F 0.734 -385 N 0.721 -386 D 0.706 -387 P 0.685 -388 L 0.670 -389 L 0.680 -390 C 0.716 -391 G 0.747 -392 K 0.754 -393 I 0.745 -394 R 0.740 -395 P 0.747 -396 R 0.761 -397 K 0.778 -398 K 0.794 -399 A 0.805 -400 R 0.807 -401 Q 0.803 -402 K 0.794 -403 S 0.784 -404 Q 0.770 -405 K 0.755 -406 S 0.739 -407 P 0.725 -408 W 0.721 -409 Q 0.730 -410 P 0.748 -411 F 0.770 -412 P 0.794 -413 D 0.814 -414 D 0.824 -415 H 0.825 -416 S 0.826 -417 A 0.828 -418 C 0.828 -419 L 0.827 -420 R 0.833 -421 P 0.845 -422 G 0.858 -423 S 0.864 -424 E 0.862 -425 T 0.857 -426 D 0.852 -427 A 0.847 -428 G 0.841 -429 R 0.824 -430 A 0.786 -431 V 0.731 -432 S 0.695 -433 Q 0.695 -434 A 0.692 -435 Q 0.660 -436 E 0.643 -437 S 0.682 -438 V 0.747 -439 Q 0.790 -440 S 0.808 -441 K 0.813 -442 V 0.811 -443 K 0.809 -444 G 0.812 -445 P 0.822 -446 G 0.834 -447 K 0.842 -448 M 0.843 -449 S 0.840 -450 H 0.836 -451 S 0.833 -452 S 0.831 -453 S 0.830 -454 G 0.831 -455 P 0.834 -456 A 0.836 -457 S 0.832 -458 V 0.821 -459 S 0.809 -460 Q 0.800 -461 L 0.792 -462 S 0.784 -463 S 0.774 -464 W 0.768 -465 K 0.768 -466 T 0.774 -467 P 0.780 -468 E 0.782 -469 Q 0.781 -470 P 0.782 -471 D 0.789 -472 P 0.798 -473 V 0.804 -474 W 0.809 -475 V 0.817 -476 Q 0.823 -477 S 0.825 -478 S 0.825 -479 V 0.827 -480 S 0.832 -481 G 0.838 -482 K 0.840 -483 G 0.835 -484 E 0.819 -485 K 0.795 -486 H 0.770 -487 P 0.758 -488 P 0.763 -489 P 0.780 -490 R 0.789 -491 T 0.779 -492 Q 0.746 -493 L 0.691 -494 P 0.629 -495 S 0.605 -496 S 0.646 -497 S 0.715 -498 G 0.759 -499 K 0.761 -500 I 0.723 -501 S 0.666 -502 S 0.641 -503 G 0.674 -504 N 0.727 -505 S 0.755 -506 F 0.762 -507 P 0.774 -508 P 0.795 -509 Q 0.815 -510 Q 0.826 -511 A 0.825 -512 G 0.818 -513 S 0.807 -514 P 0.799 -515 L 0.794 -516 K 0.793 -517 R 0.797 -518 P 0.804 -519 F 0.814 -520 S 0.822 -521 A 0.825 -522 A 0.823 -523 A 0.815 -524 A 0.804 -525 I 0.790 -526 A 0.775 -527 A 0.757 -528 A 0.728 -529 A 0.676 -530 A 0.614 -531 A 0.583 -532 A 0.611 -533 A 0.667 -534 A 0.708 -535 A 0.731 -536 A 0.748 -537 A 0.761 -538 A 0.771 -539 A 0.777 -540 A 0.778 -541 A 0.771 -542 A 0.758 -543 A 0.750 -544 P 0.757 -545 A 0.779 -546 P 0.805 -547 A 0.825 -548 L 0.833 -549 A 0.831 -550 A 0.820 -551 A 0.805 -552 A 0.790 -553 A 0.779 -554 P 0.776 -555 A 0.767 -556 L 0.729 -557 A 0.666 -558 A 0.628 -559 A 0.654 -560 A 0.714 -561 A 0.763 -562 P 0.793 -563 A 0.813 -564 L 0.828 -565 A 0.837 -566 A 0.840 -567 A 0.835 -568 A 0.823 -569 A 0.809 -570 P 0.804 -571 A 0.810 -572 P 0.821 -573 A 0.832 -574 P 0.842 -575 A 0.847 -576 A 0.846 -577 A 0.843 -578 P 0.838 -579 A 0.823 -580 V 0.775 -581 A 0.702 -582 A 0.657 -583 A 0.683 -584 P 0.747 -585 A 0.796 -586 A 0.816 -587 A 0.821 -588 A 0.819 -589 S 0.812 -590 A 0.803 -591 A 0.797 -592 P 0.799 -593 S 0.808 -594 H 0.816 -595 S 0.818 -596 Q 0.817 -597 K 0.818 -598 P 0.821 -599 S 0.827 -600 V 0.838 -601 P 0.851 -602 L 0.863 -603 I 0.868 -604 Q 0.866 -605 A 0.857 -606 S 0.845 -607 R 0.835 -608 P 0.834 -609 C 0.840 -610 P 0.848 -611 A 0.847 -612 A 0.834 -613 Q 0.817 -614 P 0.813 -615 P 0.825 -616 T 0.842 -617 K 0.850 -618 F 0.846 -619 I 0.835 -620 K 0.821 -621 I 0.812 -622 A 0.813 -623 P 0.824 -624 A 0.839 -625 I 0.852 -626 Q 0.860 -627 L 0.863 -628 R 0.863 -629 T 0.860 -630 G 0.856 -631 S 0.852 -632 T 0.849 -633 G 0.848 -634 L 0.849 -635 K 0.852 -636 A 0.852 -637 I 0.849 -638 N 0.846 -639 V 0.841 -640 E 0.837 -641 G 0.834 -642 P 0.837 -643 V 0.846 -644 Q 0.858 -645 G 0.866 -646 A 0.864 -647 Q 0.856 -648 A 0.847 -649 L 0.839 -650 G 0.829 -651 S 0.817 -652 S 0.805 -653 F 0.800 -654 K 0.807 -655 P 0.818 -656 V 0.823 -657 Q 0.820 -658 A 0.814 -659 P 0.813 -660 G 0.820 -661 S 0.825 -662 G 0.825 -663 A 0.819 -664 P 0.813 -665 A 0.814 -666 P 0.821 -667 A 0.827 -668 G 0.825 -669 I 0.804 -670 S 0.754 -671 G 0.687 -672 S 0.653 -673 D 0.683 -674 L 0.741 -675 Q 0.779 -676 S 0.795 -677 S 0.804 -678 G 0.812 -679 G 0.816 -680 P 0.815 -681 L 0.813 -682 P 0.815 -683 D 0.819 -684 A 0.821 -685 R 0.825 -686 P 0.837 -687 G 0.853 -688 A 0.865 -689 V 0.865 -690 Q 0.852 -691 A 0.827 -692 S 0.797 -693 S 0.769 -694 P 0.746 -695 A 0.721 -696 P 0.676 -697 L 0.605 -698 Q 0.526 -699 F 0.465 -700 F 0.445 -701 L 0.469 -702 N 0.510 -703 T 0.530 -704 P 0.523 -705 E 0.506 -706 G 0.494 -707 L 0.495 -708 R 0.517 -709 P 0.555 -710 L 0.598 -711 T 0.636 -712 L 0.665 -713 L 0.687 -714 Q 0.705 -715 V 0.728 -716 P 0.766 -717 Q 0.807 -718 G 0.836 -719 S 0.847 -720 A 0.845 -721 V 0.837 -722 L 0.826 -723 T 0.814 -724 G 0.805 -725 P 0.803 -726 Q 0.806 -727 Q 0.802 -728 Q 0.788 -729 S 0.769 -730 H 0.748 -731 Q 0.722 -732 L 0.687 -733 V 0.657 -734 S 0.651 -735 L 0.668 -736 Q 0.687 -737 Q 0.697 -738 L 0.703 -739 Q 0.708 -740 Q 0.720 -741 P 0.745 -742 T 0.772 -743 A 0.784 -744 A 0.780 -745 H 0.771 -746 P 0.770 -747 P 0.779 -748 Q 0.792 -749 P 0.804 -750 G 0.817 -751 P 0.831 -752 Q 0.844 -753 G 0.856 -754 S 0.865 -755 A 0.871 -756 L 0.873 -757 G 0.868 -758 L 0.857 -759 S 0.845 -760 T 0.834 -761 Q 0.826 -762 G 0.816 -763 Q 0.805 -764 A 0.795 -765 F 0.794 -766 P 0.802 -767 A 0.816 -768 Q 0.827 -769 Q 0.832 -770 L 0.832 -771 L 0.828 -772 K 0.824 -773 V 0.821 -774 N 0.822 -775 P 0.828 -776 T 0.838 -777 R 0.847 -778 A 0.852 -779 R 0.852 -780 S 0.846 -781 G 0.835 -782 L 0.818 -783 Q 0.799 -784 P 0.785 -785 Q 0.781 -786 P 0.786 -787 Q 0.802 -788 P 0.822 -789 A 0.837 -790 V 0.840 -791 L 0.835 -792 S 0.829 -793 L 0.824 -794 L 0.821 -795 G 0.822 -796 S 0.822 -797 A 0.819 -798 Q 0.815 -799 V 0.814 -800 P 0.821 -801 Q 0.831 -802 Q 0.839 -803 G 0.839 -804 V 0.831 -805 Q 0.820 -806 L 0.814 -807 P 0.817 -808 S 0.825 -809 V 0.832 -810 L 0.831 -811 R 0.822 -812 Q 0.808 -813 Q 0.793 -814 Q 0.778 -815 P 0.768 -816 Q 0.764 -817 P 0.765 -818 Q 0.772 -819 P 0.784 -820 P 0.785 -821 K 0.751 -822 L 0.687 -823 Q 0.644 -824 L 0.661 -825 Q 0.707 -826 P 0.727 -827 Q 0.716 -828 W 0.700 -829 Q 0.701 -830 P 0.718 -831 K 0.742 -832 P 0.762 -833 R 0.773 -834 Q 0.776 -835 E 0.775 -836 Q 0.776 -837 P 0.784 -838 Q 0.796 -839 S 0.804 -840 Q 0.803 -841 Q 0.797 -842 Q 0.794 -843 Q 0.798 -844 P 0.810 -845 Q 0.822 -846 H 0.825 -847 I 0.820 -848 Q 0.809 -849 L 0.787 -850 Q 0.739 -851 T 0.673 -852 Q 0.639 -853 Q 0.670 -854 L 0.730 -855 R 0.770 -856 V 0.778 -857 L 0.768 -858 Q 0.757 -859 Q 0.756 -860 P 0.768 -861 Q 0.787 -862 H 0.800 -863 I 0.804 -864 Q 0.800 -865 L 0.794 -866 Q 0.787 -867 T 0.781 -868 Q 0.778 -869 Q 0.779 -870 L 0.780 -871 R 0.775 -872 V 0.764 -873 L 0.751 -874 Q 0.746 -875 Q 0.756 -876 P 0.775 -877 V 0.789 -878 F 0.799 -879 L 0.807 -880 A 0.814 -881 T 0.814 -882 G 0.810 -883 A 0.804 -884 V 0.798 -885 Q 0.788 -886 I 0.771 -887 V 0.750 -888 Q 0.730 -889 P 0.724 -890 H 0.738 -891 P 0.769 -892 G 0.801 -893 V 0.820 -894 Q 0.826 -895 V 0.827 -896 G 0.828 -897 S 0.828 -898 Q 0.827 -899 L 0.820 -900 V 0.808 -901 D 0.792 -902 Q 0.775 -903 R 0.759 -904 K 0.746 -905 E 0.738 -906 G 0.735 -907 K 0.736 -908 P 0.738 -909 T 0.744 -910 P 0.754 -911 P 0.761 -912 A 0.756 -913 P 0.747 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000226288.3_ENST00000641896.1_GN:OR52I2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000226288.3_ENST00000641896.1_GN:OR52I2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 66fcf5ac72317c00fa96933fac27f1637704b9a0..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000226288.3_ENST00000641896.1_GN:OR52I2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,325 +0,0 @@ ->ENSG00000226288.3|ENST00000641896.1|GN:OR52I2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.393 -2 L 0.412 -3 G 0.445 -4 P 0.479 -5 A 0.501 -6 Y 0.508 -7 N 0.508 -8 H 0.505 -9 T 0.493 -10 M 0.458 -11 E 0.400 -12 T 0.329 -13 P 0.258 -14 A 0.196 -15 S 0.153 -16 F 0.130 -17 L 0.121 -18 L 0.121 -19 V 0.138 -20 G 0.169 -21 I 0.205 -22 P 0.228 -23 G 0.230 -24 L 0.212 -25 Q 0.182 -26 S 0.145 -27 S 0.107 -28 H 0.074 -29 L 0.053 -30 W 0.046 -31 L 0.047 -32 A 0.051 -33 I 0.053 -34 S 0.055 -35 L 0.059 -36 S 0.063 -37 A 0.065 -38 M 0.067 -39 Y 0.071 -40 I 0.072 -41 I 0.067 -42 A 0.058 -43 L 0.050 -44 L 0.048 -45 G 0.054 -46 N 0.062 -47 T 0.066 -48 I 0.064 -49 I 0.055 -50 V 0.045 -51 T 0.039 -52 A 0.038 -53 I 0.039 -54 W 0.044 -55 M 0.055 -56 D 0.072 -57 S 0.089 -58 T 0.100 -59 R 0.100 -60 H 0.090 -61 E 0.073 -62 P 0.054 -63 M 0.040 -64 Y 0.030 -65 C 0.025 -66 F 0.024 -67 L 0.027 -68 C 0.034 -69 V 0.042 -70 L 0.048 -71 A 0.051 -72 A 0.051 -73 V 0.050 -74 D 0.050 -75 I 0.049 -76 V 0.047 -77 M 0.046 -78 A 0.048 -79 S 0.049 -80 S 0.050 -81 V 0.052 -82 V 0.053 -83 P 0.051 -84 K 0.048 -85 M 0.047 -86 V 0.048 -87 S 0.050 -88 I 0.054 -89 F 0.065 -90 C 0.084 -91 S 0.106 -92 G 0.119 -93 D 0.116 -94 S 0.100 -95 S 0.079 -96 I 0.062 -97 S 0.048 -98 F 0.038 -99 S 0.034 -100 A 0.032 -101 C 0.030 -102 F 0.028 -103 T 0.028 -104 Q 0.030 -105 M 0.030 -106 F 0.030 -107 F 0.028 -108 V 0.028 -109 H 0.028 -110 L 0.028 -111 A 0.028 -112 T 0.030 -113 A 0.033 -114 V 0.038 -115 E 0.043 -116 T 0.046 -117 G 0.045 -118 L 0.040 -119 L 0.036 -120 L 0.033 -121 T 0.032 -122 M 0.031 -123 A 0.033 -124 F 0.036 -125 D 0.039 -126 R 0.040 -127 Y 0.039 -128 V 0.038 -129 A 0.039 -130 I 0.043 -131 C 0.048 -132 K 0.053 -133 P 0.056 -134 L 0.057 -135 H 0.057 -136 Y 0.057 -137 K 0.056 -138 R 0.060 -139 I 0.070 -140 L 0.081 -141 T 0.082 -142 P 0.075 -143 Q 0.066 -144 V 0.055 -145 M 0.046 -146 L 0.046 -147 G 0.054 -148 M 0.068 -149 S 0.080 -150 M 0.084 -151 A 0.080 -152 I 0.073 -153 T 0.068 -154 I 0.067 -155 R 0.068 -156 A 0.067 -157 I 0.066 -158 I 0.072 -159 A 0.085 -160 I 0.096 -161 T 0.099 -162 P 0.097 -163 L 0.092 -164 S 0.086 -165 W 0.080 -166 M 0.077 -167 V 0.079 -168 S 0.088 -169 H 0.104 -170 L 0.116 -171 P 0.118 -172 F 0.113 -173 C 0.113 -174 G 0.120 -175 S 0.127 -176 N 0.134 -177 V 0.139 -178 V 0.131 -179 V 0.109 -180 H 0.085 -181 S 0.067 -182 Y 0.057 -183 C 0.053 -184 E 0.057 -185 H 0.069 -186 I 0.083 -187 A 0.096 -188 L 0.105 -189 A 0.112 -190 R 0.117 -191 L 0.117 -192 A 0.111 -193 C 0.111 -194 A 0.122 -195 D 0.136 -196 P 0.140 -197 V 0.130 -198 P 0.112 -199 S 0.097 -200 S 0.087 -201 L 0.081 -202 Y 0.077 -203 S 0.075 -204 L 0.075 -205 I 0.075 -206 G 0.073 -207 S 0.067 -208 S 0.059 -209 L 0.055 -210 M 0.058 -211 V 0.062 -212 G 0.065 -213 S 0.067 -214 D 0.069 -215 V 0.066 -216 A 0.065 -217 F 0.071 -218 I 0.081 -219 A 0.086 -220 A 0.080 -221 S 0.064 -222 Y 0.047 -223 I 0.038 -224 L 0.039 -225 I 0.049 -226 L 0.063 -227 K 0.074 -228 A 0.077 -229 V 0.077 -230 F 0.084 -231 G 0.100 -232 L 0.119 -233 S 0.128 -234 S 0.123 -235 K 0.108 -236 T 0.090 -237 A 0.076 -238 Q 0.065 -239 L 0.059 -240 K 0.058 -241 A 0.060 -242 L 0.063 -243 S 0.067 -244 T 0.072 -245 C 0.077 -246 G 0.081 -247 S 0.081 -248 H 0.077 -249 V 0.071 -250 G 0.066 -251 V 0.061 -252 M 0.052 -253 A 0.039 -254 L 0.028 -255 Y 0.022 -256 Y 0.021 -257 L 0.024 -258 P 0.028 -259 G 0.030 -260 M 0.030 -261 A 0.029 -262 S 0.026 -263 I 0.025 -264 Y 0.027 -265 A 0.032 -266 A 0.039 -267 W 0.053 -268 L 0.075 -269 G 0.105 -270 Q 0.131 -271 D 0.146 -272 V 0.146 -273 V 0.132 -274 P 0.110 -275 L 0.088 -276 H 0.070 -277 T 0.058 -278 Q 0.053 -279 V 0.054 -280 L 0.059 -281 L 0.061 -282 A 0.058 -283 D 0.052 -284 L 0.050 -285 Y 0.054 -286 V 0.063 -287 I 0.073 -288 I 0.078 -289 P 0.077 -290 A 0.072 -291 T 0.068 -292 L 0.067 -293 N 0.067 -294 P 0.067 -295 I 0.067 -296 I 0.068 -297 Y 0.067 -298 G 0.069 -299 M 0.077 -300 R 0.084 -301 T 0.080 -302 K 0.066 -303 Q 0.055 -304 L 0.053 -305 R 0.061 -306 E 0.068 -307 R 0.068 -308 I 0.067 -309 W 0.071 -310 S 0.076 -311 Y 0.074 -312 L 0.069 -313 M 0.072 -314 H 0.087 -315 V 0.110 -316 L 0.140 -317 F 0.182 -318 D 0.238 -319 H 0.303 -320 S 0.366 -321 N 0.420 -322 L 0.452 -323 G 0.450 -324 S 0.431 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000226288.3_ENST00000641896.1_GN:OR52I2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000226288.3_ENST00000641896.1_GN:OR52I2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid deleted file mode 100644 index 1d4f40c0247527b571784c8451e7a53176abb4be..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000226288.3_ENST00000641896.1_GN:OR52I2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid +++ /dev/null @@ -1,332 +0,0 @@ ->ENSG00000226288.3|ENST00000641896.1|GN:OR52I2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:7 -1 M 0.304 -2 K 0.313 -3 K 0.330 -4 V 0.348 -5 S 0.359 -6 L 0.365 -7 V 0.373 -8 M 0.383 -9 L 0.398 -10 G 0.419 -11 P 0.443 -12 A 0.464 -13 Y 0.474 -14 N 0.480 -15 H 0.483 -16 T 0.476 -17 M 0.447 -18 E 0.395 -19 T 0.331 -20 P 0.263 -21 A 0.201 -22 S 0.155 -23 F 0.129 -24 L 0.117 -25 L 0.116 -26 V 0.132 -27 G 0.165 -28 I 0.201 -29 P 0.224 -30 G 0.227 -31 L 0.209 -32 Q 0.180 -33 S 0.144 -34 S 0.105 -35 H 0.073 -36 L 0.052 -37 W 0.045 -38 L 0.047 -39 A 0.051 -40 I 0.053 -41 S 0.055 -42 L 0.059 -43 S 0.063 -44 A 0.065 -45 M 0.066 -46 Y 0.068 -47 I 0.069 -48 I 0.064 -49 A 0.057 -50 L 0.050 -51 L 0.049 -52 G 0.054 -53 N 0.062 -54 T 0.066 -55 I 0.064 -56 I 0.055 -57 V 0.045 -58 T 0.039 -59 A 0.037 -60 I 0.038 -61 W 0.043 -62 M 0.054 -63 D 0.070 -64 S 0.086 -65 T 0.097 -66 R 0.097 -67 H 0.087 -68 E 0.071 -69 P 0.053 -70 M 0.039 -71 Y 0.030 -72 C 0.025 -73 F 0.024 -74 L 0.026 -75 C 0.034 -76 V 0.042 -77 L 0.049 -78 A 0.051 -79 A 0.051 -80 V 0.050 -81 D 0.049 -82 I 0.048 -83 V 0.047 -84 M 0.046 -85 A 0.047 -86 S 0.049 -87 S 0.050 -88 V 0.051 -89 V 0.051 -90 P 0.049 -91 K 0.046 -92 M 0.045 -93 V 0.045 -94 S 0.047 -95 I 0.052 -96 F 0.062 -97 C 0.081 -98 S 0.103 -99 G 0.117 -100 D 0.114 -101 S 0.098 -102 S 0.078 -103 I 0.061 -104 S 0.047 -105 F 0.037 -106 S 0.033 -107 A 0.031 -108 C 0.030 -109 F 0.028 -110 T 0.028 -111 Q 0.030 -112 M 0.030 -113 F 0.030 -114 F 0.028 -115 V 0.028 -116 H 0.028 -117 L 0.028 -118 A 0.029 -119 T 0.030 -120 A 0.033 -121 V 0.038 -122 E 0.043 -123 T 0.046 -124 G 0.045 -125 L 0.040 -126 L 0.036 -127 L 0.033 -128 T 0.031 -129 M 0.031 -130 A 0.033 -131 F 0.036 -132 D 0.039 -133 R 0.040 -134 Y 0.039 -135 V 0.038 -136 A 0.039 -137 I 0.043 -138 C 0.048 -139 K 0.053 -140 P 0.057 -141 L 0.058 -142 H 0.058 -143 Y 0.057 -144 K 0.056 -145 R 0.060 -146 I 0.071 -147 L 0.082 -148 T 0.083 -149 P 0.077 -150 Q 0.068 -151 V 0.057 -152 M 0.047 -153 L 0.046 -154 G 0.055 -155 M 0.068 -156 S 0.080 -157 M 0.085 -158 A 0.080 -159 I 0.073 -160 T 0.068 -161 I 0.067 -162 R 0.068 -163 A 0.067 -164 I 0.067 -165 I 0.072 -166 A 0.085 -167 I 0.096 -168 T 0.099 -169 P 0.097 -170 L 0.093 -171 S 0.086 -172 W 0.080 -173 M 0.077 -174 V 0.079 -175 S 0.088 -176 H 0.103 -177 L 0.116 -178 P 0.118 -179 F 0.113 -180 C 0.113 -181 G 0.119 -182 S 0.126 -183 N 0.133 -184 V 0.137 -185 V 0.130 -186 V 0.109 -187 H 0.084 -188 S 0.067 -189 Y 0.057 -190 C 0.053 -191 E 0.058 -192 H 0.069 -193 I 0.083 -194 A 0.095 -195 L 0.104 -196 A 0.111 -197 R 0.116 -198 L 0.115 -199 A 0.110 -200 C 0.109 -201 A 0.120 -202 D 0.134 -203 P 0.138 -204 V 0.129 -205 P 0.111 -206 S 0.095 -207 S 0.083 -208 L 0.077 -209 Y 0.074 -210 S 0.073 -211 L 0.074 -212 I 0.075 -213 G 0.073 -214 S 0.068 -215 S 0.060 -216 L 0.056 -217 M 0.058 -218 V 0.062 -219 G 0.065 -220 S 0.068 -221 D 0.069 -222 V 0.067 -223 A 0.065 -224 F 0.072 -225 I 0.082 -226 A 0.086 -227 A 0.080 -228 S 0.064 -229 Y 0.047 -230 I 0.038 -231 L 0.039 -232 I 0.049 -233 L 0.063 -234 K 0.074 -235 A 0.078 -236 V 0.077 -237 F 0.083 -238 G 0.099 -239 L 0.117 -240 S 0.127 -241 S 0.122 -242 K 0.107 -243 T 0.090 -244 A 0.076 -245 Q 0.065 -246 L 0.059 -247 K 0.059 -248 A 0.061 -249 L 0.064 -250 S 0.067 -251 T 0.072 -252 C 0.077 -253 G 0.081 -254 S 0.081 -255 H 0.077 -256 V 0.071 -257 G 0.067 -258 V 0.062 -259 M 0.052 -260 A 0.040 -261 L 0.029 -262 Y 0.022 -263 Y 0.022 -264 L 0.024 -265 P 0.028 -266 G 0.030 -267 M 0.031 -268 A 0.029 -269 S 0.026 -270 I 0.025 -271 Y 0.027 -272 A 0.031 -273 A 0.038 -274 W 0.051 -275 L 0.075 -276 G 0.105 -277 Q 0.133 -278 D 0.148 -279 V 0.147 -280 V 0.133 -281 P 0.111 -282 L 0.089 -283 H 0.071 -284 T 0.059 -285 Q 0.053 -286 V 0.055 -287 L 0.060 -288 L 0.062 -289 A 0.059 -290 D 0.053 -291 L 0.051 -292 Y 0.055 -293 V 0.064 -294 I 0.074 -295 I 0.079 -296 P 0.078 -297 A 0.073 -298 T 0.069 -299 L 0.068 -300 N 0.068 -301 P 0.068 -302 I 0.068 -303 I 0.069 -304 Y 0.068 -305 G 0.069 -306 M 0.077 -307 R 0.084 -308 T 0.080 -309 K 0.067 -310 Q 0.055 -311 L 0.053 -312 R 0.060 -313 E 0.068 -314 R 0.068 -315 I 0.066 -316 W 0.071 -317 S 0.075 -318 Y 0.073 -319 L 0.069 -320 M 0.072 -321 H 0.087 -322 V 0.111 -323 L 0.142 -324 F 0.183 -325 D 0.240 -326 H 0.306 -327 S 0.370 -328 N 0.424 -329 L 0.456 -330 G 0.453 -331 S 0.434 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000228716.8_ENST00000439211.7_GN:DHFR_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000228716.8_ENST00000439211.7_GN:DHFR_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 9b80374a8883dd895a955af4e1543183f4f184e0..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000228716.8_ENST00000439211.7_GN:DHFR_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,188 +0,0 @@ ->ENSG00000228716.8|ENST00000439211.7|GN:DHFR|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.294 -2 V 0.261 -3 G 0.202 -4 S 0.137 -5 L 0.086 -6 N 0.059 -7 C 0.050 -8 I 0.049 -9 V 0.051 -10 A 0.053 -11 V 0.057 -12 S 0.067 -13 Q 0.090 -14 N 0.122 -15 M 0.157 -16 G 0.182 -17 I 0.188 -18 G 0.182 -19 K 0.179 -20 N 0.184 -21 G 0.190 -22 D 0.183 -23 L 0.162 -24 P 0.141 -25 W 0.132 -26 P 0.127 -27 P 0.112 -28 L 0.086 -29 R 0.060 -30 N 0.048 -31 E 0.052 -32 F 0.064 -33 R 0.073 -34 Y 0.071 -35 F 0.068 -36 Q 0.070 -37 R 0.076 -38 M 0.086 -39 T 0.098 -40 T 0.112 -41 T 0.128 -42 S 0.145 -43 S 0.161 -44 V 0.171 -45 E 0.176 -46 G 0.179 -47 K 0.175 -48 Q 0.160 -49 N 0.138 -50 L 0.120 -51 V 0.110 -52 I 0.104 -53 M 0.094 -54 G 0.085 -55 K 0.087 -56 K 0.099 -57 T 0.110 -58 W 0.110 -59 F 0.109 -60 S 0.117 -61 I 0.126 -62 P 0.124 -63 E 0.114 -64 K 0.104 -65 N 0.099 -66 R 0.101 -67 P 0.110 -68 L 0.122 -69 K 0.128 -70 G 0.126 -71 R 0.112 -72 I 0.092 -73 N 0.075 -74 L 0.068 -75 V 0.066 -76 L 0.063 -77 S 0.061 -78 R 0.062 -79 E 0.064 -80 L 0.070 -81 K 0.083 -82 E 0.099 -83 P 0.109 -84 P 0.105 -85 Q 0.094 -86 G 0.086 -87 A 0.081 -88 H 0.076 -89 F 0.069 -90 L 0.064 -91 S 0.059 -92 R 0.052 -93 S 0.044 -94 L 0.038 -95 D 0.036 -96 D 0.037 -97 A 0.045 -98 L 0.058 -99 K 0.068 -100 L 0.067 -101 T 0.061 -102 E 0.059 -103 Q 0.062 -104 P 0.065 -105 E 0.065 -106 L 0.062 -107 A 0.061 -108 N 0.064 -109 K 0.070 -110 V 0.073 -111 D 0.069 -112 M 0.061 -113 V 0.053 -114 W 0.046 -115 I 0.040 -116 V 0.037 -117 G 0.042 -118 G 0.056 -119 S 0.071 -120 S 0.078 -121 V 0.076 -122 Y 0.069 -123 K 0.064 -124 E 0.064 -125 A 0.067 -126 M 0.069 -127 N 0.074 -128 H 0.083 -129 P 0.091 -130 G 0.093 -131 H 0.084 -132 L 0.068 -133 K 0.051 -134 L 0.041 -135 F 0.037 -136 V 0.036 -137 T 0.036 -138 R 0.037 -139 I 0.040 -140 M 0.045 -141 Q 0.053 -142 D 0.059 -143 F 0.062 -144 E 0.061 -145 S 0.061 -146 D 0.065 -147 T 0.070 -148 F 0.075 -149 F 0.081 -150 P 0.087 -151 E 0.088 -152 I 0.082 -153 D 0.075 -154 L 0.072 -155 E 0.069 -156 K 0.062 -157 Y 0.055 -158 K 0.056 -159 L 0.065 -160 L 0.079 -161 P 0.093 -162 E 0.107 -163 Y 0.119 -164 P 0.132 -165 G 0.143 -166 V 0.145 -167 L 0.137 -168 S 0.121 -169 D 0.101 -170 V 0.084 -171 Q 0.072 -172 E 0.067 -173 E 0.070 -174 K 0.079 -175 G 0.090 -176 I 0.094 -177 K 0.085 -178 Y 0.069 -179 K 0.053 -180 F 0.044 -181 E 0.041 -182 V 0.042 -183 Y 0.049 -184 E 0.067 -185 K 0.098 -186 N 0.137 -187 D 0.164 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000228716.8_ENST00000439211.7_GN:DHFR_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:80.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000228716.8_ENST00000439211.7_GN:DHFR_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:80.caid deleted file mode 100644 index b96efc5e6aeb6e3b9887786c2e5ce4f6487032d2..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000228716.8_ENST00000439211.7_GN:DHFR_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:80.caid +++ /dev/null @@ -1,268 +0,0 @@ ->ENSG00000228716.8|ENST00000439211.7|GN:DHFR|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:80 -1 M 0.456 -2 A 0.484 -3 G 0.525 -4 Q 0.555 -5 G 0.555 -6 W 0.544 -7 Q 0.554 -8 P 0.585 -9 G 0.609 -10 G 0.604 -11 R 0.565 -12 A 0.506 -13 W 0.460 -14 R 0.463 -15 G 0.506 -16 A 0.530 -17 R 0.512 -18 A 0.499 -19 R 0.526 -20 G 0.556 -21 R 0.555 -22 S 0.556 -23 S 0.589 -24 Q 0.618 -25 A 0.607 -26 S 0.598 -27 A 0.634 -28 G 0.689 -29 A 0.714 -30 S 0.704 -31 T 0.683 -32 P 0.673 -33 R 0.676 -34 P 0.674 -35 C 0.648 -36 V 0.603 -37 R 0.586 -38 R 0.627 -39 G 0.695 -40 G 0.737 -41 G 0.741 -42 A 0.724 -43 G 0.705 -44 P 0.691 -45 R 0.683 -46 L 0.676 -47 H 0.673 -48 K 0.676 -49 W 0.687 -50 G 0.704 -51 R 0.720 -52 G 0.736 -53 G 0.748 -54 R 0.750 -55 G 0.743 -56 G 0.729 -57 H 0.707 -58 N 0.683 -59 F 0.668 -60 A 0.670 -61 P 0.684 -62 N 0.703 -63 L 0.726 -64 T 0.753 -65 A 0.777 -66 R 0.794 -67 S 0.807 -68 A 0.818 -69 V 0.821 -70 T 0.817 -71 S 0.808 -72 G 0.793 -73 L 0.766 -74 G 0.734 -75 G 0.712 -76 P 0.713 -77 P 0.727 -78 A 0.726 -79 A 0.683 -80 V 0.593 -81 M 0.469 -82 V 0.335 -83 G 0.216 -84 S 0.127 -85 L 0.074 -86 N 0.051 -87 C 0.045 -88 I 0.045 -89 V 0.047 -90 A 0.050 -91 V 0.054 -92 S 0.065 -93 Q 0.086 -94 N 0.120 -95 M 0.156 -96 G 0.181 -97 I 0.187 -98 G 0.180 -99 K 0.177 -100 N 0.182 -101 G 0.187 -102 D 0.177 -103 L 0.154 -104 P 0.131 -105 W 0.119 -106 P 0.114 -107 P 0.100 -108 L 0.076 -109 R 0.053 -110 N 0.041 -111 E 0.040 -112 F 0.044 -113 R 0.048 -114 Y 0.052 -115 F 0.057 -116 Q 0.066 -117 R 0.075 -118 M 0.085 -119 T 0.098 -120 T 0.114 -121 T 0.129 -122 S 0.141 -123 S 0.151 -124 V 0.157 -125 E 0.161 -126 G 0.165 -127 K 0.163 -128 Q 0.150 -129 N 0.130 -130 L 0.114 -131 V 0.107 -132 I 0.102 -133 M 0.094 -134 G 0.085 -135 K 0.085 -136 K 0.098 -137 T 0.111 -138 W 0.112 -139 F 0.109 -140 S 0.114 -141 I 0.122 -142 P 0.119 -143 E 0.110 -144 K 0.101 -145 N 0.099 -146 R 0.102 -147 P 0.109 -148 L 0.118 -149 K 0.125 -150 G 0.125 -151 R 0.114 -152 I 0.095 -153 N 0.077 -154 L 0.069 -155 V 0.067 -156 L 0.065 -157 S 0.063 -158 R 0.064 -159 E 0.068 -160 L 0.076 -161 K 0.090 -162 E 0.108 -163 P 0.118 -164 P 0.113 -165 Q 0.101 -166 G 0.094 -167 A 0.089 -168 H 0.082 -169 F 0.073 -170 L 0.067 -171 S 0.062 -172 R 0.054 -173 S 0.045 -174 L 0.038 -175 D 0.035 -176 D 0.037 -177 A 0.045 -178 L 0.057 -179 K 0.066 -180 L 0.064 -181 T 0.058 -182 E 0.056 -183 Q 0.059 -184 P 0.063 -185 E 0.064 -186 L 0.061 -187 A 0.060 -188 N 0.066 -189 K 0.076 -190 V 0.080 -191 D 0.074 -192 M 0.063 -193 V 0.054 -194 W 0.046 -195 I 0.039 -196 V 0.037 -197 G 0.042 -198 G 0.056 -199 S 0.072 -200 S 0.079 -201 V 0.077 -202 Y 0.069 -203 K 0.063 -204 E 0.061 -205 A 0.063 -206 M 0.065 -207 N 0.069 -208 H 0.075 -209 P 0.081 -210 G 0.081 -211 H 0.073 -212 L 0.059 -213 K 0.046 -214 L 0.039 -215 F 0.037 -216 V 0.036 -217 T 0.035 -218 R 0.035 -219 I 0.037 -220 M 0.041 -221 Q 0.046 -222 D 0.050 -223 F 0.052 -224 E 0.052 -225 S 0.053 -226 D 0.057 -227 T 0.063 -228 F 0.068 -229 F 0.074 -230 P 0.079 -231 E 0.079 -232 I 0.072 -233 D 0.062 -234 L 0.053 -235 E 0.048 -236 K 0.046 -237 Y 0.046 -238 K 0.051 -239 L 0.061 -240 L 0.073 -241 P 0.084 -242 E 0.094 -243 Y 0.105 -244 P 0.118 -245 G 0.129 -246 V 0.134 -247 L 0.128 -248 S 0.114 -249 D 0.097 -250 V 0.080 -251 Q 0.069 -252 E 0.064 -253 E 0.067 -254 K 0.077 -255 G 0.091 -256 I 0.097 -257 K 0.089 -258 Y 0.072 -259 K 0.056 -260 F 0.046 -261 E 0.042 -262 V 0.044 -263 Y 0.051 -264 E 0.068 -265 K 0.100 -266 N 0.140 -267 D 0.169 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000235387.6_ENST00000443779.3_GN:SPAAR_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000235387.6_ENST00000443779.3_GN:SPAAR_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index a2393bab3b719a1fbef5a095c9ecf8d0b74e1411..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000235387.6_ENST00000443779.3_GN:SPAAR_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,76 +0,0 @@ ->ENSG00000235387.6|ENST00000443779.3|GN:SPAAR|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.242 -2 E 0.218 -3 T 0.180 -4 A 0.143 -5 V 0.115 -6 I 0.097 -7 G 0.089 -8 V 0.091 -9 V 0.096 -10 V 0.100 -11 V 0.096 -12 L 0.088 -13 F 0.079 -14 V 0.073 -15 V 0.073 -16 T 0.080 -17 V 0.085 -18 A 0.085 -19 I 0.085 -20 T 0.084 -21 C 0.079 -22 V 0.075 -23 L 0.077 -24 C 0.090 -25 C 0.117 -26 F 0.166 -27 S 0.239 -28 C 0.327 -29 D 0.419 -30 S 0.505 -31 R 0.576 -32 A 0.627 -33 Q 0.657 -34 D 0.675 -35 P 0.690 -36 Q 0.701 -37 G 0.708 -38 G 0.715 -39 P 0.727 -40 G 0.738 -41 R 0.736 -42 S 0.721 -43 F 0.700 -44 T 0.673 -45 V 0.643 -46 A 0.626 -47 T 0.632 -48 F 0.648 -49 R 0.659 -50 Q 0.671 -51 E 0.683 -52 A 0.689 -53 S 0.688 -54 L 0.685 -55 F 0.682 -56 T 0.686 -57 G 0.701 -58 P 0.729 -59 V 0.758 -60 R 0.772 -61 H 0.765 -62 A 0.744 -63 Q 0.719 -64 P 0.703 -65 V 0.695 -66 P 0.681 -67 S 0.648 -68 A 0.601 -69 Q 0.550 -70 D 0.499 -71 F 0.447 -72 W 0.397 -73 T 0.356 -74 F 0.322 -75 M 0.300 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000235387.6_ENST00000443779.3_GN:SPAAR_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000235387.6_ENST00000443779.3_GN:SPAAR_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid deleted file mode 100644 index a760063826113d15ef72e35155038d466ac11508..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000235387.6_ENST00000443779.3_GN:SPAAR_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:15.caid +++ /dev/null @@ -1,91 +0,0 @@ ->ENSG00000235387.6|ENST00000443779.3|GN:SPAAR|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:15 -1 M 0.520 -2 G 0.547 -3 A 0.580 -4 K 0.600 -5 A 0.606 -6 P 0.606 -7 R 0.600 -8 G 0.576 -9 P 0.527 -10 K 0.460 -11 V 0.392 -12 A 0.336 -13 Q 0.292 -14 W 0.260 -15 A 0.241 -16 M 0.229 -17 E 0.209 -18 T 0.181 -19 A 0.154 -20 V 0.135 -21 I 0.125 -22 G 0.117 -23 V 0.105 -24 V 0.091 -25 V 0.083 -26 V 0.084 -27 L 0.088 -28 F 0.091 -29 V 0.091 -30 V 0.094 -31 T 0.098 -32 V 0.100 -33 A 0.099 -34 I 0.097 -35 T 0.092 -36 C 0.085 -37 V 0.079 -38 L 0.081 -39 C 0.093 -40 C 0.119 -41 F 0.168 -42 S 0.244 -43 C 0.336 -44 D 0.427 -45 S 0.508 -46 R 0.577 -47 A 0.627 -48 Q 0.658 -49 D 0.677 -50 P 0.692 -51 Q 0.703 -52 G 0.710 -53 G 0.717 -54 P 0.731 -55 G 0.744 -56 R 0.742 -57 S 0.727 -58 F 0.709 -59 T 0.688 -60 V 0.661 -61 A 0.641 -62 T 0.643 -63 F 0.653 -64 R 0.660 -65 Q 0.664 -66 E 0.669 -67 A 0.671 -68 S 0.670 -69 L 0.670 -70 F 0.673 -71 T 0.680 -72 G 0.697 -73 P 0.727 -74 V 0.757 -75 R 0.771 -76 H 0.765 -77 A 0.745 -78 Q 0.722 -79 P 0.706 -80 V 0.697 -81 P 0.679 -82 S 0.640 -83 A 0.584 -84 Q 0.527 -85 D 0.477 -86 F 0.431 -87 W 0.391 -88 T 0.359 -89 F 0.333 -90 M 0.315 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000237651.8_ENST00000432605.3_GN:C2orf74_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000237651.8_ENST00000432605.3_GN:C2orf74_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 7dd31ab22bc057f38f3e73d950c1c6e528d3c137..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000237651.8_ENST00000432605.3_GN:C2orf74_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,188 +0,0 @@ ->ENSG00000237651.8|ENST00000432605.3|GN:C2orf74|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.333 -2 S 0.311 -3 F 0.275 -4 E 0.232 -5 T 0.185 -6 T 0.144 -7 A 0.119 -8 I 0.112 -9 T 0.114 -10 F 0.118 -11 F 0.126 -12 I 0.133 -13 I 0.132 -14 L 0.120 -15 L 0.106 -16 I 0.100 -17 C 0.102 -18 L 0.111 -19 I 0.121 -20 C 0.130 -21 I 0.134 -22 L 0.133 -23 L 0.129 -24 L 0.121 -25 L 0.106 -26 V 0.087 -27 V 0.073 -28 F 0.068 -29 L 0.071 -30 Y 0.082 -31 K 0.101 -32 C 0.131 -33 F 0.177 -34 Q 0.240 -35 G 0.316 -36 R 0.401 -37 K 0.493 -38 G 0.578 -39 K 0.642 -40 E 0.680 -41 T 0.702 -42 K 0.716 -43 K 0.728 -44 V 0.742 -45 P 0.760 -46 C 0.778 -47 T 0.794 -48 D 0.804 -49 A 0.809 -50 N 0.812 -51 G 0.816 -52 G 0.818 -53 V 0.813 -54 D 0.803 -55 C 0.797 -56 A 0.802 -57 A 0.816 -58 A 0.831 -59 K 0.838 -60 V 0.831 -61 V 0.807 -62 T 0.761 -63 S 0.699 -64 N 0.635 -65 P 0.587 -66 E 0.572 -67 D 0.589 -68 H 0.618 -69 E 0.637 -70 R 0.649 -71 I 0.671 -72 L 0.691 -73 M 0.697 -74 Q 0.699 -75 V 0.704 -76 M 0.704 -77 N 0.697 -78 L 0.690 -79 N 0.692 -80 V 0.706 -81 P 0.730 -82 M 0.758 -83 R 0.787 -84 P 0.815 -85 G 0.839 -86 I 0.854 -87 L 0.857 -88 V 0.850 -89 Q 0.842 -90 R 0.836 -91 Q 0.835 -92 S 0.836 -93 K 0.841 -94 E 0.848 -95 V 0.850 -96 L 0.840 -97 A 0.820 -98 T 0.801 -99 P 0.794 -100 L 0.801 -101 E 0.810 -102 N 0.814 -103 R 0.810 -104 R 0.806 -105 D 0.803 -106 M 0.801 -107 E 0.792 -108 A 0.775 -109 E 0.764 -110 E 0.767 -111 E 0.775 -112 N 0.781 -113 Q 0.786 -114 I 0.793 -115 N 0.793 -116 E 0.782 -117 K 0.765 -118 Q 0.751 -119 E 0.751 -120 P 0.769 -121 E 0.797 -122 N 0.820 -123 A 0.832 -124 G 0.835 -125 E 0.838 -126 T 0.839 -127 G 0.837 -128 Q 0.830 -129 E 0.822 -130 E 0.814 -131 D 0.808 -132 D 0.805 -133 G 0.807 -134 L 0.814 -135 Q 0.824 -136 K 0.835 -137 I 0.842 -138 H 0.849 -139 T 0.857 -140 S 0.861 -141 V 0.856 -142 T 0.844 -143 R 0.830 -144 T 0.828 -145 P 0.841 -146 S 0.859 -147 V 0.871 -148 V 0.867 -149 E 0.850 -150 S 0.824 -151 Q 0.794 -152 K 0.768 -153 R 0.759 -154 P 0.773 -155 L 0.800 -156 K 0.823 -157 G 0.828 -158 V 0.822 -159 T 0.814 -160 F 0.802 -161 S 0.781 -162 R 0.761 -163 E 0.758 -164 V 0.770 -165 I 0.781 -166 V 0.778 -167 V 0.764 -168 D 0.748 -169 L 0.736 -170 G 0.729 -171 N 0.720 -172 E 0.706 -173 Y 0.686 -174 P 0.668 -175 T 0.671 -176 P 0.699 -177 R 0.736 -178 S 0.757 -179 Y 0.755 -180 T 0.741 -181 R 0.726 -182 E 0.713 -183 H 0.696 -184 K 0.665 -185 E 0.618 -186 R 0.560 -187 K 0.515 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000237651.8_ENST00000432605.3_GN:C2orf74_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000237651.8_ENST00000432605.3_GN:C2orf74_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid deleted file mode 100644 index f68f3d1686863e14e60e8ae001c9e9856b4507f0..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000237651.8_ENST00000432605.3_GN:C2orf74_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:7.caid +++ /dev/null @@ -1,195 +0,0 @@ ->ENSG00000237651.8|ENST00000432605.3|GN:C2orf74|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:7 -1 M 0.490 -2 S 0.518 -3 L 0.562 -4 L 0.600 -5 A 0.619 -6 K 0.616 -7 P 0.599 -8 M 0.563 -9 S 0.497 -10 F 0.407 -11 E 0.316 -12 T 0.241 -13 T 0.184 -14 A 0.144 -15 I 0.120 -16 T 0.111 -17 F 0.116 -18 F 0.127 -19 I 0.137 -20 I 0.134 -21 L 0.122 -22 L 0.109 -23 I 0.105 -24 C 0.109 -25 L 0.118 -26 I 0.129 -27 C 0.138 -28 I 0.141 -29 L 0.139 -30 L 0.133 -31 L 0.123 -32 L 0.106 -33 V 0.085 -34 V 0.070 -35 F 0.064 -36 L 0.067 -37 Y 0.079 -38 K 0.098 -39 C 0.128 -40 F 0.172 -41 Q 0.235 -42 G 0.311 -43 R 0.397 -44 K 0.490 -45 G 0.579 -46 K 0.645 -47 E 0.684 -48 T 0.706 -49 K 0.720 -50 K 0.732 -51 V 0.748 -52 P 0.767 -53 C 0.786 -54 T 0.803 -55 D 0.813 -56 A 0.818 -57 N 0.822 -58 G 0.826 -59 G 0.828 -60 V 0.823 -61 D 0.813 -62 C 0.807 -63 A 0.811 -64 A 0.825 -65 A 0.838 -66 K 0.845 -67 V 0.838 -68 V 0.813 -69 T 0.767 -70 S 0.707 -71 N 0.647 -72 P 0.603 -73 E 0.590 -74 D 0.606 -75 H 0.633 -76 E 0.649 -77 R 0.659 -78 I 0.679 -79 L 0.701 -80 M 0.710 -81 Q 0.714 -82 V 0.718 -83 M 0.716 -84 N 0.708 -85 L 0.702 -86 N 0.703 -87 V 0.717 -88 P 0.740 -89 M 0.767 -90 R 0.794 -91 P 0.822 -92 G 0.845 -93 I 0.858 -94 L 0.860 -95 V 0.854 -96 Q 0.845 -97 R 0.839 -98 Q 0.838 -99 S 0.839 -100 K 0.843 -101 E 0.849 -102 V 0.849 -103 L 0.838 -104 A 0.817 -105 T 0.797 -106 P 0.790 -107 L 0.797 -108 E 0.807 -109 N 0.811 -110 R 0.807 -111 R 0.802 -112 D 0.797 -113 M 0.781 -114 E 0.739 -115 A 0.676 -116 E 0.638 -117 E 0.649 -118 E 0.664 -119 N 0.647 -120 Q 0.637 -121 I 0.676 -122 N 0.734 -123 E 0.765 -124 K 0.764 -125 Q 0.755 -126 E 0.755 -127 P 0.773 -128 E 0.801 -129 N 0.824 -130 A 0.836 -131 G 0.839 -132 E 0.841 -133 T 0.843 -134 G 0.840 -135 Q 0.834 -136 E 0.827 -137 E 0.819 -138 D 0.813 -139 D 0.809 -140 G 0.811 -141 L 0.817 -142 Q 0.827 -143 K 0.838 -144 I 0.845 -145 H 0.852 -146 T 0.859 -147 S 0.862 -148 V 0.858 -149 T 0.845 -150 R 0.832 -151 T 0.829 -152 P 0.841 -153 S 0.860 -154 V 0.871 -155 V 0.868 -156 E 0.851 -157 S 0.825 -158 Q 0.795 -159 K 0.769 -160 R 0.760 -161 P 0.773 -162 L 0.800 -163 K 0.823 -164 G 0.828 -165 V 0.822 -166 T 0.814 -167 F 0.801 -168 S 0.779 -169 R 0.759 -170 E 0.756 -171 V 0.769 -172 I 0.779 -173 V 0.777 -174 V 0.763 -175 D 0.749 -176 L 0.739 -177 G 0.732 -178 N 0.724 -179 E 0.710 -180 Y 0.688 -181 P 0.669 -182 T 0.671 -183 P 0.700 -184 R 0.737 -185 S 0.758 -186 Y 0.757 -187 T 0.742 -188 R 0.727 -189 E 0.714 -190 H 0.698 -191 K 0.670 -192 E 0.626 -193 R 0.570 -194 K 0.526 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000241563.4_ENST00000377049.4_GN:CORT_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000241563.4_ENST00000377049.4_GN:CORT_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 9afcd7faeff76a67fa74725bb1de246e7d97f399..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000241563.4_ENST00000377049.4_GN:CORT_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,106 +0,0 @@ ->ENSG00000241563.4|ENST00000377049.4|GN:CORT|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.384 -2 P 0.368 -3 L 0.339 -4 S 0.304 -5 P 0.271 -6 G 0.237 -7 L 0.202 -8 L 0.178 -9 L 0.178 -10 L 0.211 -11 L 0.288 -12 L 0.407 -13 S 0.542 -14 G 0.655 -15 A 0.726 -16 T 0.759 -17 A 0.769 -18 T 0.770 -19 A 0.762 -20 A 0.748 -21 L 0.738 -22 P 0.744 -23 L 0.762 -24 E 0.773 -25 G 0.768 -26 G 0.760 -27 P 0.763 -28 T 0.775 -29 G 0.781 -30 R 0.775 -31 D 0.758 -32 S 0.739 -33 E 0.727 -34 H 0.728 -35 M 0.740 -36 Q 0.752 -37 E 0.757 -38 A 0.752 -39 A 0.740 -40 G 0.725 -41 I 0.704 -42 R 0.672 -43 K 0.624 -44 S 0.551 -45 S 0.450 -46 L 0.345 -47 L 0.279 -48 T 0.266 -49 F 0.273 -50 L 0.266 -51 A 0.245 -52 W 0.229 -53 W 0.223 -54 F 0.226 -55 E 0.247 -56 W 0.297 -57 T 0.378 -58 S 0.479 -59 Q 0.578 -60 A 0.653 -61 S 0.694 -62 A 0.706 -63 G 0.712 -64 P 0.725 -65 L 0.732 -66 I 0.718 -67 G 0.686 -68 E 0.646 -69 E 0.594 -70 A 0.541 -71 R 0.519 -72 E 0.536 -73 V 0.559 -74 A 0.564 -75 R 0.570 -76 R 0.601 -77 Q 0.649 -78 E 0.685 -79 G 0.694 -80 A 0.691 -81 P 0.695 -82 P 0.714 -83 Q 0.738 -84 Q 0.751 -85 S 0.738 -86 A 0.706 -87 R 0.676 -88 R 0.661 -89 D 0.652 -90 R 0.634 -91 M 0.605 -92 P 0.564 -93 C 0.511 -94 R 0.462 -95 N 0.439 -96 F 0.446 -97 F 0.451 -98 W 0.435 -99 K 0.420 -100 T 0.425 -101 F 0.437 -102 S 0.431 -103 S 0.395 -104 C 0.342 -105 K 0.303 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000241563.4_ENST00000377049.4_GN:CORT_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:50.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000241563.4_ENST00000377049.4_GN:CORT_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:50.caid deleted file mode 100644 index 03a2605b211f0c571d7b408584d47d4b3ed08e98..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000241563.4_ENST00000377049.4_GN:CORT_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:50.caid +++ /dev/null @@ -1,156 +0,0 @@ ->ENSG00000241563.4|ENST00000377049.4|GN:CORT|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:50 -1 M 0.455 -2 Y 0.493 -3 R 0.550 -4 H 0.607 -5 K 0.650 -6 N 0.672 -7 S 0.682 -8 W 0.698 -9 R 0.724 -10 L 0.747 -11 G 0.755 -12 L 0.746 -13 K 0.726 -14 Y 0.711 -15 P 0.720 -16 P 0.755 -17 S 0.796 -18 S 0.820 -19 K 0.826 -20 E 0.824 -21 E 0.820 -22 T 0.812 -23 Q 0.801 -24 V 0.798 -25 P 0.810 -26 K 0.832 -27 T 0.851 -28 L 0.861 -29 I 0.858 -30 S 0.846 -31 G 0.832 -32 L 0.823 -33 P 0.827 -34 G 0.841 -35 R 0.855 -36 K 0.861 -37 S 0.858 -38 S 0.852 -39 S 0.848 -40 R 0.850 -41 V 0.854 -42 G 0.855 -43 E 0.853 -44 K 0.853 -45 L 0.853 -46 Q 0.855 -47 S 0.852 -48 A 0.838 -49 H 0.809 -50 K 0.773 -51 M 0.738 -52 P 0.695 -53 L 0.639 -54 S 0.572 -55 P 0.513 -56 G 0.473 -57 L 0.451 -58 L 0.448 -59 L 0.470 -60 L 0.518 -61 L 0.586 -62 L 0.660 -63 S 0.725 -64 G 0.774 -65 A 0.806 -66 T 0.822 -67 A 0.827 -68 T 0.824 -69 A 0.812 -70 A 0.796 -71 L 0.787 -72 P 0.792 -73 L 0.808 -74 E 0.818 -75 G 0.815 -76 G 0.811 -77 P 0.815 -78 T 0.826 -79 G 0.832 -80 R 0.827 -81 D 0.812 -82 S 0.796 -83 E 0.788 -84 H 0.789 -85 M 0.797 -86 Q 0.803 -87 E 0.803 -88 A 0.794 -89 A 0.779 -90 G 0.760 -91 I 0.732 -92 R 0.691 -93 K 0.637 -94 S 0.563 -95 S 0.464 -96 L 0.359 -97 L 0.292 -98 T 0.284 -99 F 0.303 -100 L 0.303 -101 A 0.277 -102 W 0.247 -103 W 0.227 -104 F 0.221 -105 E 0.236 -106 W 0.278 -107 T 0.349 -108 S 0.439 -109 Q 0.533 -110 A 0.612 -111 S 0.663 -112 A 0.685 -113 G 0.696 -114 P 0.710 -115 L 0.716 -116 I 0.701 -117 G 0.671 -118 E 0.635 -119 E 0.589 -120 A 0.536 -121 R 0.509 -122 E 0.519 -123 V 0.538 -124 A 0.540 -125 R 0.544 -126 R 0.577 -127 Q 0.631 -128 E 0.675 -129 G 0.692 -130 A 0.694 -131 P 0.702 -132 P 0.725 -133 Q 0.752 -134 Q 0.767 -135 S 0.761 -136 A 0.738 -137 R 0.715 -138 R 0.702 -139 D 0.691 -140 R 0.671 -141 M 0.642 -142 P 0.606 -143 C 0.563 -144 R 0.523 -145 N 0.505 -146 F 0.510 -147 F 0.509 -148 W 0.489 -149 K 0.475 -150 T 0.485 -151 F 0.503 -152 S 0.499 -153 S 0.456 -154 C 0.389 -155 K 0.340 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000243130.8_ENST00000320078.12_GN:PSG11_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000243130.8_ENST00000320078.12_GN:PSG11_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 60e50705cf4115de095b9972109b56f3a64e46f6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000243130.8_ENST00000320078.12_GN:PSG11_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,336 +0,0 @@ ->ENSG00000243130.8|ENST00000320078.12|GN:PSG11|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.416 -2 G 0.433 -3 P 0.451 -4 L 0.449 -5 S 0.433 -6 A 0.436 -7 P 0.472 -8 P 0.502 -9 C 0.492 -10 T 0.473 -11 E 0.478 -12 H 0.489 -13 I 0.476 -14 K 0.453 -15 W 0.449 -16 K 0.456 -17 G 0.449 -18 L 0.427 -19 L 0.402 -20 L 0.363 -21 T 0.314 -22 A 0.289 -23 L 0.296 -24 L 0.308 -25 L 0.319 -26 N 0.341 -27 F 0.371 -28 W 0.397 -29 N 0.422 -30 L 0.452 -31 P 0.476 -32 T 0.469 -33 T 0.418 -34 A 0.327 -35 Q 0.226 -36 V 0.143 -37 M 0.092 -38 I 0.070 -39 E 0.062 -40 A 0.056 -41 Q 0.048 -42 P 0.040 -43 P 0.036 -44 K 0.034 -45 V 0.037 -46 S 0.044 -47 E 0.053 -48 G 0.057 -49 K 0.055 -50 D 0.051 -51 V 0.050 -52 L 0.050 -53 L 0.051 -54 L 0.054 -55 V 0.058 -56 H 0.062 -57 N 0.063 -58 L 0.062 -59 P 0.060 -60 Q 0.058 -61 N 0.053 -62 L 0.047 -63 T 0.039 -64 G 0.032 -65 Y 0.027 -66 I 0.026 -67 W 0.029 -68 Y 0.034 -69 K 0.039 -70 G 0.043 -71 Q 0.048 -72 I 0.053 -73 R 0.058 -74 D 0.065 -75 L 0.075 -76 Y 0.085 -77 H 0.090 -78 Y 0.089 -79 I 0.083 -80 T 0.072 -81 S 0.060 -82 Y 0.054 -83 V 0.057 -84 V 0.066 -85 D 0.079 -86 G 0.090 -87 Q 0.099 -88 I 0.107 -89 I 0.113 -90 I 0.115 -91 Y 0.112 -92 G 0.109 -93 P 0.109 -94 A 0.110 -95 Y 0.105 -96 S 0.093 -97 G 0.079 -98 R 0.072 -99 E 0.078 -100 T 0.093 -101 V 0.102 -102 Y 0.096 -103 S 0.079 -104 N 0.063 -105 A 0.055 -106 S 0.053 -107 L 0.055 -108 L 0.058 -109 I 0.062 -110 Q 0.069 -111 N 0.072 -112 V 0.070 -113 T 0.066 -114 R 0.066 -115 E 0.075 -116 D 0.088 -117 A 0.097 -118 G 0.088 -119 S 0.066 -120 Y 0.042 -121 T 0.030 -122 L 0.030 -123 H 0.036 -124 I 0.045 -125 I 0.058 -126 K 0.081 -127 R 0.117 -128 G 0.161 -129 D 0.201 -130 G 0.226 -131 T 0.233 -132 R 0.226 -133 G 0.208 -134 V 0.181 -135 T 0.144 -136 G 0.107 -137 Y 0.078 -138 F 0.060 -139 T 0.049 -140 F 0.041 -141 T 0.037 -142 L 0.040 -143 Y 0.058 -144 L 0.090 -145 E 0.121 -146 T 0.137 -147 P 0.132 -148 K 0.116 -149 P 0.096 -150 S 0.081 -151 I 0.072 -152 S 0.069 -153 S 0.065 -154 S 0.060 -155 N 0.056 -156 L 0.053 -157 N 0.050 -158 P 0.049 -159 R 0.051 -160 E 0.057 -161 A 0.063 -162 M 0.066 -163 E 0.063 -164 T 0.057 -165 V 0.052 -166 I 0.048 -167 L 0.043 -168 T 0.037 -169 C 0.033 -170 N 0.036 -171 P 0.050 -172 E 0.072 -173 T 0.092 -174 P 0.101 -175 D 0.096 -176 A 0.080 -177 S 0.059 -178 Y 0.041 -179 L 0.033 -180 W 0.035 -181 W 0.045 -182 M 0.061 -183 N 0.075 -184 G 0.088 -185 Q 0.100 -186 S 0.111 -187 L 0.120 -188 P 0.129 -189 M 0.134 -190 T 0.126 -191 H 0.104 -192 R 0.084 -193 M 0.078 -194 Q 0.082 -195 L 0.084 -196 S 0.081 -197 E 0.075 -198 T 0.067 -199 N 0.057 -200 R 0.048 -201 T 0.045 -202 L 0.044 -203 F 0.045 -204 L 0.049 -205 F 0.057 -206 G 0.064 -207 V 0.066 -208 T 0.061 -209 K 0.059 -210 Y 0.064 -211 T 0.074 -212 A 0.080 -213 G 0.076 -214 P 0.061 -215 Y 0.043 -216 E 0.032 -217 C 0.033 -218 E 0.040 -219 I 0.047 -220 W 0.052 -221 N 0.056 -222 S 0.060 -223 G 0.064 -224 S 0.068 -225 A 0.070 -226 S 0.069 -227 R 0.065 -228 S 0.063 -229 D 0.064 -230 P 0.063 -231 V 0.060 -232 T 0.056 -233 L 0.057 -234 N 0.066 -235 L 0.079 -236 L 0.091 -237 H 0.097 -238 G 0.099 -239 P 0.105 -240 D 0.110 -241 L 0.108 -242 P 0.098 -243 R 0.085 -244 I 0.077 -245 F 0.075 -246 P 0.077 -247 S 0.079 -248 V 0.076 -249 T 0.069 -250 S 0.063 -251 Y 0.062 -252 Y 0.069 -253 S 0.078 -254 G 0.083 -255 E 0.079 -256 N 0.070 -257 L 0.060 -258 D 0.054 -259 L 0.057 -260 S 0.067 -261 C 0.080 -262 F 0.090 -263 A 0.097 -264 N 0.097 -265 S 0.090 -266 N 0.084 -267 P 0.086 -268 P 0.093 -269 A 0.088 -270 Q 0.069 -271 Y 0.047 -272 S 0.033 -273 W 0.029 -274 T 0.034 -275 I 0.046 -276 N 0.059 -277 G 0.067 -278 K 0.069 -279 F 0.069 -280 Q 0.069 -281 L 0.071 -282 S 0.073 -283 G 0.073 -284 Q 0.070 -285 K 0.067 -286 L 0.068 -287 F 0.070 -288 I 0.071 -289 P 0.070 -290 Q 0.070 -291 I 0.070 -292 T 0.070 -293 P 0.069 -294 K 0.069 -295 H 0.073 -296 N 0.081 -297 G 0.082 -298 L 0.069 -299 Y 0.052 -300 A 0.040 -301 C 0.038 -302 S 0.040 -303 A 0.043 -304 R 0.047 -305 N 0.054 -306 S 0.065 -307 A 0.075 -308 T 0.082 -309 G 0.085 -310 E 0.083 -311 E 0.073 -312 S 0.062 -313 S 0.053 -314 T 0.050 -315 S 0.048 -316 L 0.047 -317 T 0.048 -318 I 0.058 -319 R 0.084 -320 V 0.135 -321 I 0.212 -322 A 0.312 -323 P 0.424 -324 P 0.528 -325 G 0.607 -326 L 0.656 -327 G 0.675 -328 T 0.675 -329 F 0.664 -330 A 0.648 -331 F 0.625 -332 N 0.595 -333 N 0.566 -334 P 0.533 -335 T 0.505 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000243130.8_ENST00000320078.12_GN:PSG11_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000243130.8_ENST00000320078.12_GN:PSG11_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid deleted file mode 100644 index c4488205d6e275f74eb834e4ed14ab4523955f2c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000243130.8_ENST00000320078.12_GN:PSG11_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:6.caid +++ /dev/null @@ -1,342 +0,0 @@ ->ENSG00000243130.8|ENST00000320078.12|GN:PSG11|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:6 -1 M 0.356 -2 H 0.360 -3 A 0.385 -4 A 0.419 -5 E 0.426 -6 I 0.409 -7 M 0.415 -8 G 0.441 -9 P 0.439 -10 L 0.412 -11 S 0.411 -12 A 0.452 -13 P 0.498 -14 P 0.508 -15 C 0.483 -16 T 0.465 -17 E 0.482 -18 H 0.509 -19 I 0.513 -20 K 0.501 -21 W 0.495 -22 K 0.492 -23 G 0.477 -24 L 0.457 -25 L 0.436 -26 L 0.393 -27 T 0.335 -28 A 0.305 -29 L 0.311 -30 L 0.321 -31 L 0.328 -32 N 0.347 -33 F 0.376 -34 W 0.401 -35 N 0.425 -36 L 0.455 -37 P 0.477 -38 T 0.470 -39 T 0.418 -40 A 0.327 -41 Q 0.225 -42 V 0.142 -43 M 0.092 -44 I 0.071 -45 E 0.063 -46 A 0.057 -47 Q 0.048 -48 P 0.040 -49 P 0.036 -50 K 0.034 -51 V 0.037 -52 S 0.044 -53 E 0.053 -54 G 0.057 -55 K 0.055 -56 D 0.051 -57 V 0.050 -58 L 0.050 -59 L 0.051 -60 L 0.053 -61 V 0.058 -62 H 0.061 -63 N 0.062 -64 L 0.061 -65 P 0.059 -66 Q 0.056 -67 N 0.052 -68 L 0.046 -69 T 0.038 -70 G 0.031 -71 Y 0.026 -72 I 0.025 -73 W 0.028 -74 Y 0.033 -75 K 0.038 -76 G 0.043 -77 Q 0.048 -78 I 0.052 -79 R 0.057 -80 D 0.063 -81 L 0.074 -82 Y 0.083 -83 H 0.088 -84 Y 0.087 -85 I 0.081 -86 T 0.071 -87 S 0.060 -88 Y 0.054 -89 V 0.056 -90 V 0.065 -91 D 0.078 -92 G 0.090 -93 Q 0.099 -94 I 0.108 -95 I 0.114 -96 I 0.116 -97 Y 0.113 -98 G 0.109 -99 P 0.109 -100 A 0.109 -101 Y 0.104 -102 S 0.092 -103 G 0.079 -104 R 0.072 -105 E 0.077 -106 T 0.091 -107 V 0.100 -108 Y 0.094 -109 S 0.078 -110 N 0.062 -111 A 0.054 -112 S 0.053 -113 L 0.054 -114 L 0.057 -115 I 0.062 -116 Q 0.068 -117 N 0.072 -118 V 0.070 -119 T 0.065 -120 R 0.066 -121 E 0.075 -122 D 0.089 -123 A 0.097 -124 G 0.089 -125 S 0.066 -126 Y 0.042 -127 T 0.030 -128 L 0.030 -129 H 0.036 -130 I 0.045 -131 I 0.058 -132 K 0.081 -133 R 0.118 -134 G 0.162 -135 D 0.201 -136 G 0.226 -137 T 0.234 -138 R 0.227 -139 G 0.209 -140 V 0.182 -141 T 0.145 -142 G 0.106 -143 Y 0.077 -144 F 0.060 -145 T 0.049 -146 F 0.041 -147 T 0.036 -148 L 0.040 -149 Y 0.057 -150 L 0.089 -151 E 0.121 -152 T 0.136 -153 P 0.132 -154 K 0.116 -155 P 0.096 -156 S 0.081 -157 I 0.072 -158 S 0.069 -159 S 0.065 -160 S 0.061 -161 N 0.056 -162 L 0.053 -163 N 0.050 -164 P 0.048 -165 R 0.051 -166 E 0.057 -167 A 0.064 -168 M 0.066 -169 E 0.063 -170 T 0.057 -171 V 0.052 -172 I 0.048 -173 L 0.043 -174 T 0.037 -175 C 0.032 -176 N 0.036 -177 P 0.050 -178 E 0.072 -179 T 0.092 -180 P 0.100 -181 D 0.095 -182 A 0.079 -183 S 0.058 -184 Y 0.041 -185 L 0.032 -186 W 0.034 -187 W 0.045 -188 M 0.060 -189 N 0.074 -190 G 0.087 -191 Q 0.098 -192 S 0.109 -193 L 0.118 -194 P 0.127 -195 M 0.133 -196 T 0.125 -197 H 0.103 -198 R 0.083 -199 M 0.077 -200 Q 0.081 -201 L 0.083 -202 S 0.080 -203 E 0.074 -204 T 0.066 -205 N 0.056 -206 R 0.048 -207 T 0.044 -208 L 0.043 -209 F 0.044 -210 L 0.048 -211 F 0.056 -212 G 0.063 -213 V 0.065 -214 T 0.060 -215 K 0.058 -216 Y 0.063 -217 T 0.073 -218 A 0.079 -219 G 0.075 -220 P 0.060 -221 Y 0.043 -222 E 0.032 -223 C 0.032 -224 E 0.039 -225 I 0.046 -226 W 0.051 -227 N 0.055 -228 S 0.059 -229 G 0.063 -230 S 0.067 -231 A 0.070 -232 S 0.069 -233 R 0.064 -234 S 0.062 -235 D 0.063 -236 P 0.063 -237 V 0.059 -238 T 0.055 -239 L 0.057 -240 N 0.065 -241 L 0.079 -242 L 0.092 -243 H 0.097 -244 G 0.099 -245 P 0.105 -246 D 0.110 -247 L 0.108 -248 P 0.098 -249 R 0.086 -250 I 0.077 -251 F 0.075 -252 P 0.077 -253 S 0.080 -254 V 0.077 -255 T 0.070 -256 S 0.063 -257 Y 0.063 -258 Y 0.069 -259 S 0.078 -260 G 0.083 -261 E 0.079 -262 N 0.070 -263 L 0.060 -264 D 0.055 -265 L 0.058 -266 S 0.068 -267 C 0.080 -268 F 0.091 -269 A 0.098 -270 N 0.098 -271 S 0.091 -272 N 0.084 -273 P 0.087 -274 P 0.093 -275 A 0.088 -276 Q 0.069 -277 Y 0.048 -278 S 0.034 -279 W 0.030 -280 T 0.034 -281 I 0.046 -282 N 0.060 -283 G 0.068 -284 K 0.069 -285 F 0.069 -286 Q 0.070 -287 L 0.071 -288 S 0.074 -289 G 0.074 -290 Q 0.071 -291 K 0.068 -292 L 0.069 -293 F 0.071 -294 I 0.072 -295 P 0.072 -296 Q 0.071 -297 I 0.071 -298 T 0.071 -299 P 0.070 -300 K 0.070 -301 H 0.074 -302 N 0.082 -303 G 0.083 -304 L 0.070 -305 Y 0.052 -306 A 0.041 -307 C 0.038 -308 S 0.041 -309 A 0.044 -310 R 0.048 -311 N 0.055 -312 S 0.065 -313 A 0.076 -314 T 0.083 -315 G 0.086 -316 E 0.083 -317 E 0.074 -318 S 0.063 -319 S 0.054 -320 T 0.050 -321 S 0.049 -322 L 0.048 -323 T 0.049 -324 I 0.058 -325 R 0.086 -326 V 0.137 -327 I 0.215 -328 A 0.315 -329 P 0.427 -330 P 0.530 -331 G 0.609 -332 L 0.657 -333 G 0.677 -334 T 0.677 -335 F 0.667 -336 A 0.651 -337 F 0.628 -338 N 0.599 -339 N 0.568 -340 P 0.535 -341 T 0.507 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000250298.6_ENST00000638719.4_GN:GIMD1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000250298.6_ENST00000638719.4_GN:GIMD1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 695da01f66f9a89700f01b0b7d7dab8d3cf4d177..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000250298.6_ENST00000638719.4_GN:GIMD1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,218 +0,0 @@ ->ENSG00000250298.6|ENST00000638719.4|GN:GIMD1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.378 -2 T 0.367 -3 D 0.350 -4 P 0.320 -5 N 0.269 -6 K 0.201 -7 M 0.132 -8 I 0.080 -9 I 0.049 -10 N 0.032 -11 L 0.024 -12 A 0.020 -13 L 0.020 -14 F 0.024 -15 G 0.035 -16 M 0.049 -17 T 0.058 -18 Q 0.059 -19 S 0.053 -20 G 0.050 -21 K 0.054 -22 S 0.061 -23 S 0.069 -24 A 0.080 -25 G 0.093 -26 N 0.104 -27 I 0.106 -28 L 0.103 -29 L 0.100 -30 G 0.104 -31 S 0.118 -32 T 0.141 -33 D 0.165 -34 F 0.187 -35 H 0.206 -36 S 0.226 -37 S 0.247 -38 F 0.265 -39 A 0.273 -40 P 0.267 -41 C 0.249 -42 S 0.223 -43 V 0.193 -44 T 0.162 -45 T 0.135 -46 C 0.119 -47 C 0.118 -48 S 0.123 -49 L 0.125 -50 G 0.115 -51 R 0.095 -52 S 0.075 -53 C 0.064 -54 H 0.064 -55 L 0.072 -56 H 0.089 -57 S 0.113 -58 F 0.141 -59 M 0.170 -60 R 0.196 -61 R 0.222 -62 G 0.247 -63 G 0.264 -64 L 0.266 -65 E 0.254 -66 V 0.226 -67 A 0.185 -68 L 0.140 -69 Q 0.098 -70 V 0.066 -71 Q 0.045 -72 V 0.034 -73 L 0.032 -74 D 0.038 -75 T 0.051 -76 P 0.066 -77 G 0.084 -78 Y 0.105 -79 P 0.133 -80 H 0.158 -81 S 0.168 -82 R 0.159 -83 L 0.137 -84 S 0.113 -85 K 0.099 -86 K 0.092 -87 Y 0.084 -88 V 0.072 -89 K 0.058 -90 Q 0.045 -91 E 0.037 -92 V 0.037 -93 K 0.043 -94 E 0.046 -95 A 0.041 -96 L 0.032 -97 A 0.029 -98 H 0.037 -99 H 0.054 -100 F 0.078 -101 G 0.106 -102 Q 0.130 -103 G 0.138 -104 G 0.125 -105 L 0.099 -106 H 0.072 -107 L 0.052 -108 A 0.041 -109 L 0.039 -110 L 0.043 -111 V 0.048 -112 Q 0.051 -113 R 0.057 -114 A 0.070 -115 D 0.090 -116 V 0.114 -117 P 0.138 -118 F 0.160 -119 C 0.176 -120 G 0.173 -121 Q 0.152 -122 E 0.131 -123 V 0.118 -124 T 0.106 -125 D 0.085 -126 P 0.066 -127 V 0.059 -128 Q 0.058 -129 M 0.049 -130 I 0.035 -131 Q 0.027 -132 E 0.027 -133 L 0.034 -134 L 0.040 -135 G 0.041 -136 H 0.039 -137 A 0.038 -138 W 0.041 -139 M 0.043 -140 N 0.039 -141 Y 0.031 -142 T 0.024 -143 A 0.020 -144 I 0.017 -145 L 0.016 -146 F 0.018 -147 T 0.024 -148 H 0.034 -149 A 0.047 -150 E 0.061 -151 K 0.074 -152 I 0.083 -153 E 0.090 -154 E 0.102 -155 A 0.116 -156 G 0.122 -157 L 0.115 -158 T 0.100 -159 E 0.083 -160 D 0.069 -161 K 0.064 -162 Y 0.068 -163 L 0.073 -164 H 0.073 -165 E 0.071 -166 A 0.069 -167 S 0.061 -168 D 0.050 -169 T 0.044 -170 L 0.047 -171 K 0.057 -172 T 0.063 -173 L 0.060 -174 L 0.051 -175 N 0.045 -176 S 0.040 -177 I 0.034 -178 Q 0.027 -179 H 0.022 -180 K 0.020 -181 Y 0.024 -182 V 0.034 -183 F 0.051 -184 Q 0.072 -185 Y 0.095 -186 K 0.117 -187 K 0.135 -188 G 0.145 -189 K 0.136 -190 S 0.109 -191 L 0.075 -192 N 0.051 -193 E 0.039 -194 Q 0.035 -195 R 0.034 -196 M 0.034 -197 K 0.035 -198 I 0.036 -199 L 0.036 -200 E 0.036 -201 R 0.039 -202 I 0.049 -203 M 0.061 -204 E 0.066 -205 F 0.061 -206 I 0.055 -207 K 0.055 -208 E 0.059 -209 N 0.068 -210 C 0.086 -211 Y 0.118 -212 Q 0.160 -213 V 0.196 -214 L 0.211 -215 T 0.209 -216 F 0.203 -217 K 0.201 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000250298.6_ENST00000638719.4_GN:GIMD1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000250298.6_ENST00000638719.4_GN:GIMD1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid deleted file mode 100644 index f206a3beb4b6eb6a78fb01413b907c24bb7257c6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000250298.6_ENST00000638719.4_GN:GIMD1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:23.caid +++ /dev/null @@ -1,241 +0,0 @@ ->ENSG00000250298.6|ENST00000638719.4|GN:GIMD1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:23 -1 M 0.341 -2 K 0.341 -3 E 0.348 -4 Q 0.362 -5 L 0.370 -6 C 0.372 -7 Q 0.385 -8 G 0.410 -9 E 0.421 -10 R 0.411 -11 R 0.411 -12 L 0.435 -13 C 0.458 -14 G 0.451 -15 E 0.421 -16 S 0.392 -17 I 0.376 -18 F 0.382 -19 K 0.409 -20 T 0.439 -21 G 0.446 -22 K 0.436 -23 A 0.422 -24 M 0.401 -25 T 0.369 -26 D 0.328 -27 P 0.283 -28 N 0.232 -29 K 0.176 -30 M 0.121 -31 I 0.077 -32 I 0.048 -33 N 0.032 -34 L 0.024 -35 A 0.020 -36 L 0.020 -37 F 0.024 -38 G 0.035 -39 M 0.049 -40 T 0.059 -41 Q 0.059 -42 S 0.054 -43 G 0.051 -44 K 0.054 -45 S 0.061 -46 S 0.070 -47 A 0.080 -48 G 0.093 -49 N 0.103 -50 I 0.105 -51 L 0.100 -52 L 0.097 -53 G 0.102 -54 S 0.116 -55 T 0.138 -56 D 0.163 -57 F 0.186 -58 H 0.206 -59 S 0.227 -60 S 0.248 -61 F 0.266 -62 A 0.274 -63 P 0.265 -64 C 0.244 -65 S 0.215 -66 V 0.185 -67 T 0.154 -68 T 0.129 -69 C 0.114 -70 C 0.114 -71 S 0.119 -72 L 0.120 -73 G 0.110 -74 R 0.091 -75 S 0.073 -76 C 0.064 -77 H 0.064 -78 L 0.070 -79 H 0.081 -80 S 0.097 -81 F 0.118 -82 M 0.142 -83 R 0.168 -84 R 0.196 -85 G 0.223 -86 G 0.242 -87 L 0.246 -88 E 0.238 -89 V 0.215 -90 A 0.176 -91 L 0.132 -92 Q 0.092 -93 V 0.062 -94 Q 0.043 -95 V 0.033 -96 L 0.031 -97 D 0.037 -98 T 0.050 -99 P 0.066 -100 G 0.083 -101 Y 0.104 -102 P 0.131 -103 H 0.155 -104 S 0.165 -105 R 0.156 -106 L 0.133 -107 S 0.111 -108 K 0.097 -109 K 0.091 -110 Y 0.084 -111 V 0.072 -112 K 0.056 -113 Q 0.042 -114 E 0.032 -115 V 0.026 -116 K 0.024 -117 E 0.023 -118 A 0.022 -119 L 0.022 -120 A 0.025 -121 H 0.034 -122 H 0.051 -123 F 0.075 -124 G 0.103 -125 Q 0.127 -126 G 0.137 -127 G 0.125 -128 L 0.100 -129 H 0.073 -130 L 0.053 -131 A 0.043 -132 L 0.041 -133 L 0.045 -134 V 0.049 -135 Q 0.053 -136 R 0.059 -137 A 0.072 -138 D 0.094 -139 V 0.119 -140 P 0.143 -141 F 0.165 -142 C 0.180 -143 G 0.178 -144 Q 0.159 -145 E 0.137 -146 V 0.125 -147 T 0.112 -148 D 0.089 -149 P 0.069 -150 V 0.061 -151 Q 0.059 -152 M 0.050 -153 I 0.036 -154 Q 0.028 -155 E 0.029 -156 L 0.036 -157 L 0.043 -158 G 0.044 -159 H 0.041 -160 A 0.040 -161 W 0.042 -162 M 0.044 -163 N 0.039 -164 Y 0.031 -165 T 0.024 -166 A 0.020 -167 I 0.018 -168 L 0.017 -169 F 0.018 -170 T 0.024 -171 H 0.035 -172 A 0.049 -173 E 0.064 -174 K 0.077 -175 I 0.087 -176 E 0.094 -177 E 0.105 -178 A 0.118 -179 G 0.124 -180 L 0.116 -181 T 0.100 -182 E 0.082 -183 D 0.069 -184 K 0.063 -185 Y 0.066 -186 L 0.071 -187 H 0.072 -188 E 0.071 -189 A 0.069 -190 S 0.061 -191 D 0.050 -192 T 0.043 -193 L 0.046 -194 K 0.055 -195 T 0.061 -196 L 0.057 -197 L 0.049 -198 N 0.043 -199 S 0.038 -200 I 0.033 -201 Q 0.026 -202 H 0.021 -203 K 0.020 -204 Y 0.024 -205 V 0.034 -206 F 0.050 -207 Q 0.071 -208 Y 0.093 -209 K 0.115 -210 K 0.134 -211 G 0.145 -212 K 0.137 -213 S 0.109 -214 L 0.075 -215 N 0.051 -216 E 0.039 -217 Q 0.035 -218 R 0.034 -219 M 0.034 -220 K 0.035 -221 I 0.036 -222 L 0.036 -223 E 0.036 -224 R 0.039 -225 I 0.049 -226 M 0.061 -227 E 0.066 -228 F 0.062 -229 I 0.056 -230 K 0.057 -231 E 0.062 -232 N 0.071 -233 C 0.089 -234 Y 0.121 -235 Q 0.162 -236 V 0.195 -237 L 0.208 -238 T 0.206 -239 F 0.201 -240 K 0.200 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000250506.10_ENST00000448471.3_GN:CDK3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000250506.10_ENST00000448471.3_GN:CDK3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index fcea5a975567a726f1e5a58bb1cd4a1a50b89b90..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000250506.10_ENST00000448471.3_GN:CDK3_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,306 +0,0 @@ ->ENSG00000250506.10|ENST00000448471.3|GN:CDK3|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.147 -2 D 0.121 -3 M 0.086 -4 F 0.057 -5 Q 0.040 -6 K 0.033 -7 V 0.030 -8 E 0.032 -9 K 0.034 -10 I 0.036 -11 G 0.039 -12 E 0.047 -13 G 0.057 -14 T 0.061 -15 Y 0.057 -16 G 0.049 -17 V 0.041 -18 V 0.034 -19 Y 0.030 -20 K 0.028 -21 A 0.029 -22 K 0.030 -23 N 0.033 -24 R 0.039 -25 E 0.052 -26 T 0.070 -27 G 0.087 -28 Q 0.096 -29 L 0.092 -30 V 0.080 -31 A 0.067 -32 L 0.059 -33 K 0.065 -34 K 0.088 -35 I 0.125 -36 R 0.168 -37 L 0.207 -38 D 0.230 -39 L 0.235 -40 E 0.230 -41 M 0.230 -42 E 0.237 -43 G 0.243 -44 V 0.229 -45 P 0.187 -46 S 0.133 -47 T 0.093 -48 A 0.075 -49 I 0.074 -50 R 0.083 -51 E 0.093 -52 I 0.097 -53 S 0.093 -54 L 0.081 -55 L 0.069 -56 K 0.060 -57 E 0.058 -58 L 0.060 -59 K 0.061 -60 H 0.060 -61 P 0.056 -62 N 0.049 -63 I 0.041 -64 V 0.033 -65 R 0.029 -66 L 0.027 -67 L 0.025 -68 D 0.023 -69 V 0.023 -70 V 0.027 -71 H 0.035 -72 N 0.043 -73 E 0.047 -74 R 0.045 -75 K 0.037 -76 L 0.027 -77 Y 0.020 -78 L 0.019 -79 V 0.021 -80 F 0.025 -81 E 0.027 -82 F 0.026 -83 L 0.021 -84 S 0.016 -85 Q 0.015 -86 D 0.018 -87 L 0.022 -88 K 0.026 -89 K 0.030 -90 Y 0.035 -91 M 0.043 -92 D 0.055 -93 S 0.072 -94 T 0.094 -95 P 0.111 -96 G 0.113 -97 S 0.103 -98 E 0.085 -99 L 0.066 -100 P 0.051 -101 L 0.043 -102 H 0.039 -103 L 0.036 -104 I 0.035 -105 K 0.037 -106 S 0.040 -107 Y 0.039 -108 L 0.035 -109 F 0.031 -110 Q 0.029 -111 L 0.031 -112 L 0.034 -113 Q 0.034 -114 G 0.031 -115 V 0.028 -116 S 0.030 -117 F 0.035 -118 C 0.043 -119 H 0.055 -120 S 0.063 -121 H 0.059 -122 R 0.047 -123 V 0.040 -124 I 0.039 -125 H 0.043 -126 R 0.048 -127 D 0.052 -128 L 0.049 -129 K 0.041 -130 P 0.036 -131 Q 0.037 -132 N 0.039 -133 L 0.038 -134 L 0.031 -135 I 0.025 -136 N 0.028 -137 E 0.042 -138 L 0.058 -139 G 0.064 -140 A 0.060 -141 I 0.057 -142 K 0.061 -143 L 0.071 -144 A 0.085 -145 D 0.105 -146 F 0.130 -147 G 0.154 -148 L 0.173 -149 A 0.186 -150 R 0.197 -151 A 0.213 -152 F 0.236 -153 G 0.257 -154 V 0.270 -155 P 0.274 -156 L 0.278 -157 R 0.289 -158 T 0.309 -159 Y 0.332 -160 T 0.353 -161 H 0.369 -162 E 0.375 -163 V 0.358 -164 V 0.313 -165 T 0.255 -166 L 0.205 -167 W 0.167 -168 Y 0.137 -169 R 0.112 -170 A 0.094 -171 P 0.086 -172 E 0.089 -173 I 0.093 -174 L 0.094 -175 L 0.094 -176 G 0.100 -177 S 0.111 -178 K 0.121 -179 F 0.124 -180 Y 0.114 -181 T 0.097 -182 T 0.089 -183 A 0.105 -184 V 0.131 -185 D 0.146 -186 I 0.141 -187 W 0.130 -188 S 0.123 -189 I 0.114 -190 G 0.104 -191 C 0.099 -192 I 0.097 -193 F 0.092 -194 A 0.083 -195 E 0.074 -196 M 0.066 -197 V 0.060 -198 T 0.059 -199 R 0.065 -200 K 0.079 -201 A 0.095 -202 L 0.107 -203 F 0.113 -204 P 0.117 -205 G 0.120 -206 D 0.120 -207 S 0.113 -208 E 0.102 -209 I 0.095 -210 D 0.093 -211 Q 0.093 -212 L 0.090 -213 F 0.091 -214 R 0.093 -215 I 0.093 -216 F 0.094 -217 R 0.104 -218 M 0.119 -219 L 0.131 -220 G 0.136 -221 T 0.134 -222 P 0.126 -223 S 0.112 -224 E 0.093 -225 D 0.075 -226 T 0.064 -227 W 0.065 -228 P 0.076 -229 G 0.083 -230 V 0.082 -231 T 0.077 -232 Q 0.076 -233 L 0.082 -234 P 0.091 -235 D 0.095 -236 Y 0.098 -237 K 0.101 -238 G 0.106 -239 S 0.112 -240 F 0.115 -241 P 0.115 -242 K 0.108 -243 W 0.100 -244 T 0.097 -245 R 0.099 -246 K 0.104 -247 G 0.104 -248 L 0.099 -249 E 0.093 -250 E 0.092 -251 I 0.097 -252 V 0.108 -253 P 0.118 -254 N 0.119 -255 L 0.112 -256 E 0.104 -257 P 0.098 -258 E 0.093 -259 G 0.090 -260 R 0.093 -261 D 0.099 -262 L 0.103 -263 L 0.101 -264 M 0.093 -265 Q 0.078 -266 L 0.063 -267 L 0.054 -268 Q 0.049 -269 Y 0.050 -270 D 0.054 -271 P 0.059 -272 S 0.066 -273 Q 0.074 -274 R 0.077 -275 I 0.071 -276 T 0.063 -277 A 0.060 -278 K 0.062 -279 T 0.066 -280 A 0.072 -281 L 0.080 -282 A 0.090 -283 H 0.096 -284 P 0.094 -285 Y 0.085 -286 F 0.075 -287 S 0.073 -288 S 0.087 -289 P 0.118 -290 E 0.157 -291 P 0.191 -292 S 0.211 -293 P 0.214 -294 A 0.195 -295 A 0.162 -296 R 0.131 -297 Q 0.118 -298 Y 0.117 -299 V 0.121 -300 L 0.130 -301 Q 0.145 -302 R 0.167 -303 F 0.195 -304 R 0.225 -305 H 0.244 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000250506.10_ENST00000448471.3_GN:CDK3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000250506.10_ENST00000448471.3_GN:CDK3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid deleted file mode 100644 index 3550961c526e292c2942eb57aa013af94bdeafe0..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000250506.10_ENST00000448471.3_GN:CDK3_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:20.caid +++ /dev/null @@ -1,326 +0,0 @@ ->ENSG00000250506.10|ENST00000448471.3|GN:CDK3|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:20 -1 M 0.354 -2 C 0.361 -3 T 0.386 -4 Q 0.438 -5 S 0.504 -6 L 0.560 -7 G 0.597 -8 L 0.624 -9 A 0.645 -10 G 0.652 -11 L 0.637 -12 G 0.606 -13 S 0.580 -14 D 0.575 -15 P 0.582 -16 G 0.574 -17 S 0.526 -18 S 0.440 -19 V 0.338 -20 A 0.242 -21 M 0.164 -22 D 0.107 -23 M 0.069 -24 F 0.046 -25 Q 0.034 -26 K 0.029 -27 V 0.028 -28 E 0.029 -29 K 0.031 -30 I 0.033 -31 G 0.037 -32 E 0.045 -33 G 0.054 -34 T 0.058 -35 Y 0.055 -36 G 0.048 -37 V 0.040 -38 V 0.033 -39 Y 0.028 -40 K 0.026 -41 A 0.027 -42 K 0.029 -43 N 0.031 -44 R 0.037 -45 E 0.049 -46 T 0.065 -47 G 0.082 -48 Q 0.090 -49 L 0.087 -50 V 0.077 -51 A 0.065 -52 L 0.059 -53 K 0.066 -54 K 0.089 -55 I 0.126 -56 R 0.168 -57 L 0.205 -58 D 0.229 -59 L 0.234 -60 E 0.229 -61 M 0.226 -62 E 0.233 -63 G 0.239 -64 V 0.226 -65 P 0.185 -66 S 0.132 -67 T 0.092 -68 A 0.074 -69 I 0.072 -70 R 0.079 -71 E 0.086 -72 I 0.090 -73 S 0.087 -74 L 0.078 -75 L 0.066 -76 K 0.058 -77 E 0.055 -78 L 0.057 -79 K 0.059 -80 H 0.057 -81 P 0.053 -82 N 0.046 -83 I 0.038 -84 V 0.031 -85 R 0.027 -86 L 0.025 -87 L 0.023 -88 D 0.021 -89 V 0.021 -90 V 0.024 -91 H 0.030 -92 N 0.038 -93 E 0.043 -94 R 0.041 -95 K 0.034 -96 L 0.025 -97 Y 0.019 -98 L 0.017 -99 V 0.020 -100 F 0.024 -101 E 0.026 -102 F 0.024 -103 L 0.019 -104 S 0.015 -105 Q 0.014 -106 D 0.017 -107 L 0.021 -108 K 0.024 -109 K 0.027 -110 Y 0.033 -111 M 0.041 -112 D 0.053 -113 S 0.071 -114 T 0.093 -115 P 0.110 -116 G 0.114 -117 S 0.104 -118 E 0.086 -119 L 0.067 -120 P 0.052 -121 L 0.043 -122 H 0.039 -123 L 0.037 -124 I 0.035 -125 K 0.038 -126 S 0.041 -127 Y 0.040 -128 L 0.035 -129 F 0.031 -130 Q 0.029 -131 L 0.031 -132 L 0.033 -133 Q 0.034 -134 G 0.031 -135 V 0.028 -136 S 0.029 -137 F 0.034 -138 C 0.042 -139 H 0.054 -140 S 0.063 -141 H 0.059 -142 R 0.047 -143 V 0.040 -144 I 0.039 -145 H 0.043 -146 R 0.049 -147 D 0.052 -148 L 0.049 -149 K 0.042 -150 P 0.037 -151 Q 0.037 -152 N 0.039 -153 L 0.038 -154 L 0.032 -155 I 0.026 -156 N 0.029 -157 E 0.042 -158 L 0.058 -159 G 0.064 -160 A 0.061 -161 I 0.057 -162 K 0.061 -163 L 0.070 -164 A 0.084 -165 D 0.104 -166 F 0.128 -167 G 0.152 -168 L 0.171 -169 A 0.184 -170 R 0.196 -171 A 0.213 -172 F 0.237 -173 G 0.259 -174 V 0.272 -175 P 0.278 -176 L 0.283 -177 R 0.295 -178 T 0.315 -179 Y 0.336 -180 T 0.355 -181 H 0.370 -182 E 0.376 -183 V 0.361 -184 V 0.317 -185 T 0.259 -186 L 0.209 -187 W 0.172 -188 Y 0.141 -189 R 0.115 -190 A 0.096 -191 P 0.088 -192 E 0.091 -193 I 0.096 -194 L 0.097 -195 L 0.097 -196 G 0.102 -197 S 0.112 -198 K 0.121 -199 F 0.124 -200 Y 0.114 -201 T 0.096 -202 T 0.088 -203 A 0.103 -204 V 0.130 -205 D 0.145 -206 I 0.140 -207 W 0.129 -208 S 0.121 -209 I 0.113 -210 G 0.103 -211 C 0.098 -212 I 0.097 -213 F 0.092 -214 A 0.082 -215 E 0.073 -216 M 0.065 -217 V 0.059 -218 T 0.058 -219 R 0.064 -220 K 0.077 -221 A 0.093 -222 L 0.105 -223 F 0.111 -224 P 0.116 -225 G 0.119 -226 D 0.119 -227 S 0.112 -228 E 0.101 -229 I 0.094 -230 D 0.093 -231 Q 0.093 -232 L 0.091 -233 F 0.091 -234 R 0.094 -235 I 0.094 -236 F 0.095 -237 R 0.105 -238 M 0.121 -239 L 0.133 -240 G 0.137 -241 T 0.135 -242 P 0.127 -243 S 0.112 -244 E 0.093 -245 D 0.075 -246 T 0.064 -247 W 0.066 -248 P 0.076 -249 G 0.083 -250 V 0.082 -251 T 0.077 -252 Q 0.076 -253 L 0.082 -254 P 0.091 -255 D 0.096 -256 Y 0.098 -257 K 0.101 -258 G 0.106 -259 S 0.111 -260 F 0.115 -261 P 0.115 -262 K 0.109 -263 W 0.101 -264 T 0.097 -265 R 0.100 -266 K 0.105 -267 G 0.105 -268 L 0.100 -269 E 0.094 -270 E 0.093 -271 I 0.098 -272 V 0.110 -273 P 0.121 -274 N 0.122 -275 L 0.115 -276 E 0.107 -277 P 0.100 -278 E 0.094 -279 G 0.091 -280 R 0.094 -281 D 0.100 -282 L 0.104 -283 L 0.103 -284 M 0.094 -285 Q 0.079 -286 L 0.065 -287 L 0.055 -288 Q 0.051 -289 Y 0.051 -290 D 0.055 -291 P 0.061 -292 S 0.068 -293 Q 0.076 -294 R 0.079 -295 I 0.073 -296 T 0.065 -297 A 0.061 -298 K 0.063 -299 T 0.067 -300 A 0.073 -301 L 0.082 -302 A 0.092 -303 H 0.098 -304 P 0.096 -305 Y 0.086 -306 F 0.076 -307 S 0.074 -308 S 0.086 -309 P 0.115 -310 E 0.152 -311 P 0.184 -312 S 0.204 -313 P 0.207 -314 A 0.189 -315 A 0.155 -316 R 0.126 -317 Q 0.113 -318 Y 0.113 -319 V 0.119 -320 L 0.128 -321 Q 0.143 -322 R 0.166 -323 F 0.195 -324 R 0.225 -325 H 0.245 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000251664.5_ENST00000398631.3_GN:PCDHA12_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000251664.5_ENST00000398631.3_GN:PCDHA12_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 6e9ec2074f0fdfbb1a2148d4e490396d79148949..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000251664.5_ENST00000398631.3_GN:PCDHA12_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,942 +0,0 @@ ->ENSG00000251664.5|ENST00000398631.3|GN:PCDHA12|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.306 -2 V 0.325 -3 I 0.352 -4 I 0.377 -5 G 0.391 -6 P 0.398 -7 R 0.415 -8 G 0.455 -9 P 0.491 -10 G 0.489 -11 S 0.431 -12 Q 0.339 -13 R 0.253 -14 L 0.201 -15 L 0.179 -16 L 0.173 -17 S 0.173 -18 L 0.176 -19 L 0.178 -20 L 0.181 -21 L 0.194 -22 A 0.221 -23 A 0.253 -24 W 0.287 -25 E 0.324 -26 V 0.357 -27 G 0.368 -28 S 0.341 -29 G 0.281 -30 Q 0.204 -31 L 0.133 -32 H 0.082 -33 Y 0.054 -34 S 0.041 -35 V 0.039 -36 Y 0.043 -37 E 0.054 -38 E 0.069 -39 A 0.079 -40 K 0.080 -41 H 0.075 -42 G 0.070 -43 T 0.066 -44 F 0.060 -45 V 0.055 -46 G 0.052 -47 R 0.053 -48 I 0.057 -49 A 0.066 -50 Q 0.077 -51 D 0.093 -52 L 0.112 -53 G 0.125 -54 L 0.127 -55 E 0.122 -56 L 0.118 -57 A 0.116 -58 E 0.118 -59 L 0.127 -60 V 0.139 -61 P 0.137 -62 R 0.114 -63 L 0.085 -64 F 0.069 -65 R 0.072 -66 V 0.086 -67 A 0.100 -68 S 0.108 -69 K 0.110 -70 R 0.114 -71 H 0.123 -72 G 0.128 -73 D 0.115 -74 L 0.090 -75 L 0.069 -76 E 0.059 -77 V 0.056 -78 N 0.054 -79 L 0.055 -80 Q 0.061 -81 N 0.070 -82 G 0.074 -83 I 0.070 -84 L 0.065 -85 F 0.067 -86 V 0.076 -87 N 0.084 -88 S 0.085 -89 R 0.077 -90 I 0.067 -91 D 0.061 -92 R 0.064 -93 E 0.075 -94 K 0.089 -95 L 0.101 -96 C 0.111 -97 G 0.122 -98 R 0.132 -99 S 0.135 -100 A 0.129 -101 E 0.115 -102 C 0.098 -103 S 0.085 -104 I 0.076 -105 H 0.069 -106 L 0.061 -107 E 0.054 -108 V 0.048 -109 I 0.046 -110 V 0.045 -111 D 0.045 -112 R 0.046 -113 P 0.051 -114 L 0.061 -115 Q 0.075 -116 V 0.087 -117 F 0.095 -118 H 0.096 -119 V 0.094 -120 D 0.096 -121 V 0.109 -122 E 0.134 -123 V 0.159 -124 K 0.173 -125 D 0.174 -126 I 0.168 -127 N 0.162 -128 D 0.158 -129 N 0.153 -130 P 0.147 -131 P 0.142 -132 V 0.143 -133 F 0.149 -134 R 0.151 -135 E 0.145 -136 R 0.131 -137 E 0.114 -138 Q 0.099 -139 K 0.089 -140 V 0.081 -141 P 0.074 -142 V 0.066 -143 S 0.064 -144 E 0.074 -145 S 0.090 -146 A 0.101 -147 P 0.100 -148 L 0.092 -149 D 0.088 -150 S 0.090 -151 H 0.092 -152 F 0.096 -153 P 0.102 -154 L 0.111 -155 E 0.120 -156 G 0.123 -157 A 0.121 -158 S 0.122 -159 D 0.128 -160 A 0.140 -161 D 0.150 -162 I 0.153 -163 G 0.154 -164 V 0.155 -165 N 0.152 -166 S 0.138 -167 L 0.117 -168 L 0.099 -169 T 0.088 -170 Y 0.085 -171 A 0.084 -172 L 0.082 -173 S 0.079 -174 L 0.076 -175 N 0.071 -176 E 0.062 -177 N 0.054 -178 F 0.049 -179 E 0.051 -180 L 0.058 -181 K 0.069 -182 I 0.082 -183 K 0.095 -184 T 0.109 -185 K 0.121 -186 K 0.125 -187 D 0.127 -188 K 0.130 -189 S 0.129 -190 I 0.117 -191 L 0.098 -192 P 0.079 -193 E 0.069 -194 L 0.070 -195 V 0.078 -196 L 0.089 -197 R 0.096 -198 K 0.096 -199 L 0.090 -200 L 0.079 -201 D 0.067 -202 R 0.066 -203 E 0.076 -204 Q 0.088 -205 T 0.091 -206 P 0.085 -207 K 0.079 -208 L 0.077 -209 N 0.077 -210 L 0.072 -211 L 0.062 -212 L 0.051 -213 M 0.047 -214 V 0.049 -215 I 0.057 -216 D 0.066 -217 G 0.072 -218 G 0.068 -219 K 0.058 -220 P 0.052 -221 E 0.053 -222 L 0.058 -223 T 0.065 -224 G 0.074 -225 S 0.083 -226 V 0.087 -227 Q 0.084 -228 I 0.077 -229 Q 0.072 -230 I 0.077 -231 T 0.096 -232 V 0.126 -233 L 0.155 -234 D 0.169 -235 V 0.167 -236 N 0.157 -237 D 0.145 -238 N 0.134 -239 G 0.122 -240 P 0.114 -241 A 0.107 -242 F 0.097 -243 D 0.088 -244 K 0.085 -245 P 0.082 -246 S 0.072 -247 Y 0.058 -248 K 0.046 -249 V 0.038 -250 V 0.033 -251 L 0.031 -252 S 0.036 -253 E 0.047 -254 N 0.062 -255 V 0.072 -256 Q 0.073 -257 N 0.066 -258 D 0.061 -259 T 0.061 -260 R 0.063 -261 V 0.066 -262 I 0.072 -263 Q 0.082 -264 L 0.092 -265 N 0.100 -266 A 0.106 -267 S 0.110 -268 D 0.116 -269 P 0.128 -270 D 0.143 -271 E 0.153 -272 G 0.155 -273 L 0.154 -274 N 0.151 -275 G 0.141 -276 E 0.121 -277 I 0.099 -278 S 0.083 -279 Y 0.081 -280 G 0.088 -281 I 0.094 -282 K 0.097 -283 M 0.099 -284 I 0.096 -285 L 0.090 -286 P 0.091 -287 V 0.104 -288 S 0.124 -289 E 0.139 -290 K 0.141 -291 C 0.125 -292 M 0.096 -293 F 0.072 -294 S 0.062 -295 I 0.063 -296 N 0.066 -297 P 0.067 -298 D 0.068 -299 T 0.070 -300 G 0.069 -301 E 0.066 -302 I 0.064 -303 R 0.069 -304 I 0.081 -305 Y 0.098 -306 G 0.109 -307 E 0.107 -308 L 0.092 -309 D 0.073 -310 F 0.065 -311 E 0.070 -312 E 0.079 -313 N 0.081 -314 N 0.078 -315 A 0.077 -316 Y 0.076 -317 E 0.070 -318 I 0.059 -319 Q 0.047 -320 V 0.039 -321 N 0.035 -322 A 0.036 -323 I 0.041 -324 D 0.047 -325 K 0.051 -326 G 0.053 -327 I 0.053 -328 P 0.059 -329 S 0.066 -330 M 0.068 -331 A 0.066 -332 G 0.064 -333 H 0.065 -334 S 0.069 -335 M 0.071 -336 V 0.072 -337 L 0.077 -338 V 0.090 -339 E 0.116 -340 V 0.146 -341 L 0.168 -342 D 0.173 -343 V 0.166 -344 N 0.156 -345 D 0.151 -346 N 0.147 -347 V 0.141 -348 P 0.134 -349 E 0.127 -350 V 0.124 -351 M 0.125 -352 V 0.131 -353 T 0.138 -354 S 0.144 -355 L 0.140 -356 S 0.122 -357 L 0.096 -358 P 0.074 -359 V 0.063 -360 Q 0.066 -361 E 0.085 -362 D 0.114 -363 A 0.136 -364 Q 0.141 -365 V 0.136 -366 G 0.133 -367 T 0.128 -368 V 0.115 -369 I 0.098 -370 A 0.083 -371 L 0.070 -372 I 0.063 -373 S 0.066 -374 V 0.076 -375 S 0.090 -376 D 0.107 -377 R 0.127 -378 D 0.147 -379 S 0.160 -380 G 0.164 -381 A 0.163 -382 N 0.158 -383 G 0.148 -384 Q 0.132 -385 V 0.112 -386 I 0.092 -387 C 0.084 -388 S 0.088 -389 L 0.100 -390 T 0.115 -391 P 0.126 -392 H 0.120 -393 V 0.098 -394 P 0.074 -395 F 0.066 -396 K 0.071 -397 L 0.076 -398 V 0.075 -399 S 0.072 -400 T 0.067 -401 Y 0.060 -402 K 0.050 -403 N 0.041 -404 Y 0.036 -405 Y 0.038 -406 S 0.046 -407 L 0.060 -408 V 0.077 -409 L 0.092 -410 D 0.101 -411 S 0.101 -412 A 0.092 -413 L 0.078 -414 D 0.065 -415 R 0.061 -416 E 0.065 -417 S 0.071 -418 V 0.075 -419 S 0.077 -420 A 0.081 -421 Y 0.080 -422 E 0.069 -423 L 0.054 -424 V 0.042 -425 V 0.037 -426 T 0.037 -427 A 0.042 -428 R 0.052 -429 D 0.063 -430 G 0.069 -431 G 0.066 -432 S 0.060 -433 P 0.057 -434 S 0.057 -435 L 0.056 -436 W 0.056 -437 A 0.061 -438 T 0.071 -439 A 0.081 -440 R 0.088 -441 V 0.093 -442 S 0.098 -443 V 0.110 -444 E 0.134 -445 V 0.164 -446 A 0.187 -447 D 0.192 -448 V 0.181 -449 N 0.164 -450 D 0.152 -451 N 0.144 -452 A 0.136 -453 P 0.129 -454 A 0.124 -455 F 0.120 -456 A 0.116 -457 Q 0.117 -458 P 0.119 -459 E 0.112 -460 Y 0.094 -461 T 0.073 -462 V 0.058 -463 F 0.049 -464 V 0.047 -465 K 0.052 -466 E 0.066 -467 N 0.091 -468 N 0.121 -469 P 0.143 -470 P 0.145 -471 G 0.131 -472 C 0.110 -473 H 0.091 -474 I 0.078 -475 F 0.076 -476 T 0.085 -477 V 0.100 -478 S 0.114 -479 A 0.122 -480 W 0.126 -481 D 0.130 -482 A 0.141 -483 D 0.155 -484 A 0.163 -485 Q 0.167 -486 K 0.171 -487 N 0.172 -488 A 0.163 -489 L 0.140 -490 V 0.113 -491 S 0.091 -492 Y 0.084 -493 S 0.089 -494 L 0.096 -495 V 0.104 -496 E 0.113 -497 R 0.125 -498 R 0.138 -499 V 0.153 -500 G 0.172 -501 E 0.187 -502 H 0.185 -503 A 0.167 -504 L 0.142 -505 S 0.115 -506 S 0.090 -507 Y 0.072 -508 V 0.064 -509 S 0.066 -510 V 0.071 -511 H 0.075 -512 A 0.077 -513 E 0.082 -514 S 0.087 -515 G 0.089 -516 K 0.085 -517 V 0.083 -518 Y 0.092 -519 A 0.112 -520 L 0.136 -521 Q 0.150 -522 P 0.148 -523 L 0.131 -524 D 0.109 -525 H 0.096 -526 E 0.097 -527 E 0.102 -528 L 0.098 -529 E 0.086 -530 L 0.074 -531 L 0.066 -532 Q 0.060 -533 F 0.054 -534 Q 0.049 -535 V 0.047 -536 S 0.047 -537 A 0.051 -538 R 0.058 -539 D 0.068 -540 A 0.075 -541 G 0.076 -542 V 0.071 -543 P 0.071 -544 P 0.078 -545 L 0.086 -546 G 0.091 -547 S 0.098 -548 N 0.109 -549 V 0.115 -550 T 0.110 -551 L 0.101 -552 Q 0.100 -553 V 0.113 -554 F 0.141 -555 V 0.172 -556 L 0.195 -557 D 0.202 -558 E 0.199 -559 N 0.193 -560 D 0.189 -561 N 0.184 -562 A 0.173 -563 P 0.157 -564 A 0.143 -565 L 0.141 -566 L 0.159 -567 A 0.201 -568 T 0.280 -569 P 0.400 -570 A 0.530 -571 G 0.623 -572 S 0.661 -573 A 0.659 -574 G 0.627 -575 G 0.561 -576 A 0.465 -577 V 0.355 -578 S 0.251 -579 E 0.171 -580 L 0.120 -581 V 0.099 -582 P 0.098 -583 R 0.108 -584 S 0.123 -585 V 0.141 -586 G 0.161 -587 A 0.169 -588 G 0.157 -589 H 0.133 -590 V 0.109 -591 V 0.095 -592 A 0.088 -593 K 0.087 -594 V 0.089 -595 R 0.098 -596 A 0.115 -597 V 0.135 -598 D 0.156 -599 A 0.177 -600 D 0.193 -601 S 0.198 -602 G 0.191 -603 Y 0.179 -604 N 0.161 -605 A 0.137 -606 W 0.111 -607 L 0.091 -608 S 0.084 -609 Y 0.095 -610 E 0.118 -611 L 0.152 -612 Q 0.202 -613 P 0.263 -614 A 0.319 -615 A 0.344 -616 V 0.334 -617 G 0.301 -618 A 0.260 -619 H 0.210 -620 I 0.153 -621 P 0.107 -622 F 0.088 -623 H 0.094 -624 V 0.112 -625 G 0.123 -626 L 0.119 -627 Y 0.107 -628 T 0.095 -629 G 0.086 -630 E 0.077 -631 I 0.074 -632 S 0.081 -633 T 0.098 -634 T 0.114 -635 R 0.123 -636 I 0.125 -637 L 0.126 -638 D 0.132 -639 E 0.144 -640 A 0.157 -641 D 0.158 -642 A 0.145 -643 P 0.128 -644 R 0.113 -645 H 0.101 -646 R 0.089 -647 L 0.076 -648 L 0.066 -649 V 0.063 -650 L 0.066 -651 V 0.072 -652 K 0.077 -653 D 0.081 -654 H 0.084 -655 G 0.082 -656 E 0.076 -657 P 0.074 -658 A 0.076 -659 L 0.076 -660 T 0.074 -661 S 0.078 -662 T 0.087 -663 A 0.095 -664 T 0.097 -665 V 0.093 -666 L 0.087 -667 V 0.085 -668 S 0.095 -669 L 0.122 -670 V 0.172 -671 E 0.252 -672 N 0.359 -673 G 0.467 -674 Q 0.550 -675 A 0.611 -676 P 0.665 -677 K 0.717 -678 T 0.753 -679 S 0.770 -680 S 0.775 -681 R 0.780 -682 A 0.790 -683 S 0.803 -684 V 0.809 -685 G 0.798 -686 A 0.776 -687 V 0.754 -688 D 0.737 -689 P 0.726 -690 E 0.720 -691 A 0.715 -692 A 0.706 -693 L 0.682 -694 V 0.638 -695 D 0.573 -696 I 0.488 -697 N 0.398 -698 V 0.322 -699 Y 0.280 -700 L 0.273 -701 I 0.292 -702 I 0.331 -703 A 0.379 -704 I 0.419 -705 C 0.446 -706 A 0.471 -707 V 0.495 -708 S 0.510 -709 S 0.508 -710 L 0.487 -711 L 0.448 -712 V 0.399 -713 L 0.350 -714 T 0.310 -715 L 0.284 -716 L 0.265 -717 L 0.246 -718 Y 0.234 -719 T 0.240 -720 A 0.265 -721 L 0.302 -722 R 0.345 -723 C 0.390 -724 S 0.434 -725 A 0.483 -726 P 0.546 -727 P 0.619 -728 T 0.681 -729 V 0.719 -730 S 0.735 -731 R 0.736 -732 C 0.733 -733 A 0.733 -734 P 0.737 -735 G 0.748 -736 K 0.763 -737 P 0.778 -738 T 0.790 -739 L 0.800 -740 V 0.804 -741 C 0.800 -742 S 0.792 -743 S 0.790 -744 A 0.797 -745 V 0.805 -746 G 0.805 -747 S 0.796 -748 W 0.782 -749 S 0.763 -750 Y 0.733 -751 S 0.685 -752 Q 0.626 -753 Q 0.600 -754 R 0.639 -755 R 0.711 -756 Q 0.766 -757 R 0.792 -758 V 0.800 -759 C 0.796 -760 S 0.786 -761 A 0.773 -762 E 0.759 -763 S 0.751 -764 P 0.756 -765 P 0.778 -766 K 0.804 -767 T 0.820 -768 D 0.823 -769 L 0.815 -770 M 0.799 -771 A 0.777 -772 F 0.758 -773 S 0.754 -774 P 0.766 -775 S 0.780 -776 L 0.787 -777 Q 0.784 -778 L 0.768 -779 S 0.726 -780 R 0.666 -781 E 0.638 -782 D 0.667 -783 C 0.715 -784 L 0.733 -785 N 0.727 -786 P 0.726 -787 P 0.741 -788 S 0.761 -789 E 0.776 -790 P 0.781 -791 R 0.776 -792 Q 0.766 -793 P 0.757 -794 N 0.752 -795 P 0.750 -796 D 0.750 -797 W 0.755 -798 R 0.765 -799 Y 0.777 -800 S 0.786 -801 A 0.792 -802 S 0.794 -803 L 0.797 -804 R 0.801 -805 A 0.806 -806 G 0.808 -807 M 0.811 -808 H 0.816 -809 S 0.822 -810 S 0.826 -811 V 0.826 -812 H 0.827 -813 L 0.831 -814 E 0.833 -815 E 0.833 -816 A 0.831 -817 G 0.830 -818 I 0.829 -819 L 0.823 -820 R 0.811 -821 A 0.797 -822 G 0.786 -823 P 0.783 -824 G 0.786 -825 G 0.791 -826 P 0.791 -827 D 0.784 -828 Q 0.769 -829 Q 0.753 -830 W 0.751 -831 P 0.765 -832 T 0.772 -833 V 0.743 -834 S 0.681 -835 S 0.634 -836 A 0.636 -837 T 0.649 -838 P 0.637 -839 E 0.637 -840 P 0.690 -841 E 0.764 -842 A 0.813 -843 G 0.827 -844 E 0.820 -845 V 0.803 -846 S 0.788 -847 P 0.790 -848 P 0.808 -849 V 0.829 -850 G 0.843 -851 A 0.845 -852 G 0.841 -853 V 0.833 -854 N 0.825 -855 S 0.817 -856 N 0.806 -857 S 0.793 -858 W 0.782 -859 T 0.774 -860 F 0.766 -861 K 0.758 -862 Y 0.756 -863 G 0.760 -864 P 0.769 -865 G 0.781 -866 N 0.794 -867 P 0.803 -868 K 0.804 -869 Q 0.800 -870 S 0.796 -871 G 0.797 -872 P 0.801 -873 G 0.802 -874 E 0.799 -875 L 0.797 -876 P 0.802 -877 D 0.810 -878 K 0.810 -879 F 0.800 -880 I 0.791 -881 I 0.791 -882 P 0.797 -883 G 0.806 -884 S 0.814 -885 P 0.826 -886 A 0.839 -887 I 0.845 -888 I 0.842 -889 S 0.833 -890 I 0.818 -891 R 0.800 -892 Q 0.785 -893 E 0.777 -894 P 0.777 -895 T 0.784 -896 N 0.795 -897 S 0.802 -898 Q 0.801 -899 I 0.794 -900 D 0.787 -901 K 0.784 -902 S 0.784 -903 D 0.786 -904 F 0.788 -905 I 0.789 -906 T 0.790 -907 F 0.790 -908 G 0.782 -909 K 0.764 -910 K 0.734 -911 E 0.685 -912 E 0.621 -913 T 0.584 -914 K 0.608 -915 K 0.662 -916 K 0.703 -917 K 0.722 -918 K 0.731 -919 K 0.736 -920 K 0.739 -921 K 0.741 -922 G 0.742 -923 N 0.728 -924 K 0.674 -925 T 0.572 -926 Q 0.475 -927 E 0.454 -928 K 0.499 -929 K 0.541 -930 E 0.572 -931 K 0.630 -932 G 0.702 -933 N 0.752 -934 S 0.773 -935 T 0.781 -936 T 0.789 -937 D 0.795 -938 N 0.794 -939 S 0.783 -940 D 0.768 -941 Q 0.756 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000251664.5_ENST00000398631.3_GN:PCDHA12_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:32.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000251664.5_ENST00000398631.3_GN:PCDHA12_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:32.caid deleted file mode 100644 index fc3d20c049ef21330287f47c3c2d9765643ddb80..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000251664.5_ENST00000398631.3_GN:PCDHA12_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:32.caid +++ /dev/null @@ -1,974 +0,0 @@ ->ENSG00000251664.5|ENST00000398631.3|GN:PCDHA12|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:32 -1 M 0.304 -2 Y 0.312 -3 L 0.323 -4 Q 0.330 -5 K 0.332 -6 R 0.342 -7 V 0.364 -8 T 0.379 -9 A 0.375 -10 H 0.371 -11 K 0.388 -12 I 0.407 -13 P 0.408 -14 Q 0.411 -15 A 0.444 -16 S 0.496 -17 D 0.540 -18 P 0.564 -19 L 0.570 -20 K 0.567 -21 L 0.561 -22 I 0.551 -23 V 0.532 -24 P 0.508 -25 T 0.492 -26 Q 0.497 -27 R 0.517 -28 P 0.532 -29 S 0.527 -30 F 0.514 -31 S 0.533 -32 A 0.597 -33 M 0.661 -34 V 0.675 -35 I 0.643 -36 I 0.592 -37 G 0.542 -38 P 0.504 -39 R 0.494 -40 G 0.523 -41 P 0.569 -42 G 0.592 -43 S 0.570 -44 Q 0.507 -45 R 0.429 -46 L 0.366 -47 L 0.324 -48 L 0.296 -49 S 0.280 -50 L 0.281 -51 L 0.286 -52 L 0.288 -53 L 0.292 -54 A 0.302 -55 A 0.314 -56 W 0.330 -57 E 0.354 -58 V 0.379 -59 G 0.386 -60 S 0.355 -61 G 0.289 -62 Q 0.208 -63 L 0.134 -64 H 0.083 -65 Y 0.055 -66 S 0.043 -67 V 0.040 -68 Y 0.044 -69 E 0.055 -70 E 0.070 -71 A 0.079 -72 K 0.080 -73 H 0.075 -74 G 0.070 -75 T 0.065 -76 F 0.059 -77 V 0.054 -78 G 0.051 -79 R 0.052 -80 I 0.056 -81 A 0.064 -82 Q 0.074 -83 D 0.087 -84 L 0.103 -85 G 0.115 -86 L 0.117 -87 E 0.113 -88 L 0.110 -89 A 0.110 -90 E 0.111 -91 L 0.119 -92 V 0.130 -93 P 0.128 -94 R 0.108 -95 L 0.082 -96 F 0.066 -97 R 0.067 -98 V 0.079 -99 A 0.091 -100 S 0.097 -101 K 0.100 -102 R 0.106 -103 H 0.118 -104 G 0.124 -105 D 0.112 -106 L 0.087 -107 L 0.066 -108 E 0.057 -109 V 0.053 -110 N 0.052 -111 L 0.053 -112 Q 0.060 -113 N 0.069 -114 G 0.073 -115 I 0.068 -116 L 0.062 -117 F 0.064 -118 V 0.073 -119 N 0.082 -120 S 0.084 -121 R 0.076 -122 I 0.066 -123 D 0.059 -124 R 0.061 -125 E 0.073 -126 K 0.087 -127 L 0.098 -128 C 0.107 -129 G 0.117 -130 R 0.127 -131 S 0.133 -132 A 0.131 -133 E 0.120 -134 C 0.104 -135 S 0.090 -136 I 0.080 -137 H 0.072 -138 L 0.063 -139 E 0.054 -140 V 0.049 -141 I 0.047 -142 V 0.047 -143 D 0.047 -144 R 0.047 -145 P 0.053 -146 L 0.064 -147 Q 0.078 -148 V 0.091 -149 F 0.098 -150 H 0.099 -151 V 0.096 -152 D 0.098 -153 V 0.112 -154 E 0.139 -155 V 0.165 -156 K 0.178 -157 D 0.179 -158 I 0.172 -159 N 0.165 -160 D 0.160 -161 N 0.154 -162 P 0.146 -163 P 0.141 -164 V 0.142 -165 F 0.149 -166 R 0.151 -167 E 0.145 -168 R 0.130 -169 E 0.113 -170 Q 0.098 -171 K 0.087 -172 V 0.079 -173 P 0.071 -174 V 0.063 -175 S 0.062 -176 E 0.071 -177 S 0.087 -178 A 0.098 -179 P 0.096 -180 L 0.088 -181 D 0.085 -182 S 0.087 -183 H 0.088 -184 F 0.090 -185 P 0.095 -186 L 0.104 -187 E 0.112 -188 G 0.116 -189 A 0.116 -190 S 0.116 -191 D 0.124 -192 A 0.136 -193 D 0.147 -194 I 0.151 -195 G 0.152 -196 V 0.152 -197 N 0.148 -198 S 0.133 -199 L 0.112 -200 L 0.093 -201 T 0.083 -202 Y 0.080 -203 A 0.080 -204 L 0.078 -205 S 0.074 -206 L 0.071 -207 N 0.066 -208 E 0.058 -209 N 0.050 -210 F 0.047 -211 E 0.048 -212 L 0.055 -213 K 0.065 -214 I 0.076 -215 K 0.088 -216 T 0.100 -217 K 0.111 -218 K 0.115 -219 D 0.118 -220 K 0.122 -221 S 0.122 -222 I 0.111 -223 L 0.092 -224 P 0.075 -225 E 0.066 -226 L 0.066 -227 V 0.074 -228 L 0.083 -229 R 0.089 -230 K 0.090 -231 L 0.084 -232 L 0.074 -233 D 0.064 -234 R 0.062 -235 E 0.072 -236 Q 0.083 -237 T 0.086 -238 P 0.080 -239 K 0.074 -240 L 0.072 -241 N 0.071 -242 L 0.067 -243 L 0.057 -244 L 0.048 -245 M 0.044 -246 V 0.046 -247 I 0.052 -248 D 0.061 -249 G 0.066 -250 G 0.063 -251 K 0.054 -252 P 0.049 -253 E 0.051 -254 L 0.056 -255 T 0.062 -256 G 0.070 -257 S 0.079 -258 V 0.083 -259 Q 0.080 -260 I 0.074 -261 Q 0.069 -262 I 0.074 -263 T 0.094 -264 V 0.124 -265 L 0.153 -266 D 0.167 -267 V 0.165 -268 N 0.155 -269 D 0.144 -270 N 0.132 -271 G 0.122 -272 P 0.114 -273 A 0.107 -274 F 0.097 -275 D 0.089 -276 K 0.086 -277 P 0.083 -278 S 0.074 -279 Y 0.059 -280 K 0.047 -281 V 0.039 -282 V 0.034 -283 L 0.032 -284 S 0.036 -285 E 0.048 -286 N 0.063 -287 V 0.075 -288 Q 0.076 -289 N 0.070 -290 D 0.065 -291 T 0.065 -292 R 0.066 -293 V 0.067 -294 I 0.073 -295 Q 0.084 -296 L 0.095 -297 N 0.104 -298 A 0.110 -299 S 0.115 -300 D 0.120 -301 P 0.132 -302 D 0.146 -303 E 0.156 -304 G 0.158 -305 L 0.157 -306 N 0.154 -307 G 0.144 -308 E 0.125 -309 I 0.102 -310 S 0.086 -311 Y 0.086 -312 G 0.094 -313 I 0.101 -314 K 0.104 -315 M 0.105 -316 I 0.102 -317 L 0.095 -318 P 0.096 -319 V 0.111 -320 S 0.132 -321 E 0.148 -322 K 0.149 -323 C 0.132 -324 M 0.102 -325 F 0.076 -326 S 0.065 -327 I 0.066 -328 N 0.069 -329 P 0.071 -330 D 0.072 -331 T 0.073 -332 G 0.072 -333 E 0.069 -334 I 0.067 -335 R 0.073 -336 I 0.086 -337 Y 0.104 -338 G 0.117 -339 E 0.115 -340 L 0.098 -341 D 0.078 -342 F 0.069 -343 E 0.075 -344 E 0.085 -345 N 0.087 -346 N 0.083 -347 A 0.081 -348 Y 0.079 -349 E 0.072 -350 I 0.060 -351 Q 0.048 -352 V 0.040 -353 N 0.036 -354 A 0.038 -355 I 0.043 -356 D 0.049 -357 K 0.054 -358 G 0.055 -359 I 0.056 -360 P 0.062 -361 S 0.069 -362 M 0.072 -363 A 0.069 -364 G 0.067 -365 H 0.069 -366 S 0.072 -367 M 0.075 -368 V 0.076 -369 L 0.081 -370 V 0.095 -371 E 0.120 -372 V 0.150 -373 L 0.171 -374 D 0.175 -375 V 0.168 -376 N 0.159 -377 D 0.155 -378 N 0.151 -379 V 0.145 -380 P 0.138 -381 E 0.130 -382 V 0.127 -383 M 0.128 -384 V 0.133 -385 T 0.138 -386 S 0.143 -387 L 0.139 -388 S 0.121 -389 L 0.095 -390 P 0.074 -391 V 0.064 -392 Q 0.068 -393 E 0.087 -394 D 0.115 -395 A 0.137 -396 Q 0.142 -397 V 0.137 -398 G 0.133 -399 T 0.127 -400 V 0.114 -401 I 0.098 -402 A 0.083 -403 L 0.071 -404 I 0.064 -405 S 0.067 -406 V 0.076 -407 S 0.089 -408 D 0.105 -409 R 0.125 -410 D 0.144 -411 S 0.155 -412 G 0.159 -413 A 0.157 -414 N 0.152 -415 G 0.143 -416 Q 0.129 -417 V 0.109 -418 I 0.091 -419 C 0.083 -420 S 0.087 -421 L 0.098 -422 T 0.113 -423 P 0.123 -424 H 0.118 -425 V 0.096 -426 P 0.073 -427 F 0.066 -428 K 0.071 -429 L 0.076 -430 V 0.075 -431 S 0.072 -432 T 0.067 -433 Y 0.059 -434 K 0.050 -435 N 0.041 -436 Y 0.036 -437 Y 0.038 -438 S 0.047 -439 L 0.061 -440 V 0.077 -441 L 0.092 -442 D 0.101 -443 S 0.100 -444 A 0.092 -445 L 0.078 -446 D 0.065 -447 R 0.060 -448 E 0.064 -449 S 0.071 -450 V 0.074 -451 S 0.078 -452 A 0.081 -453 Y 0.080 -454 E 0.069 -455 L 0.055 -456 V 0.044 -457 V 0.038 -458 T 0.038 -459 A 0.044 -460 R 0.053 -461 D 0.064 -462 G 0.069 -463 G 0.066 -464 S 0.060 -465 P 0.057 -466 S 0.058 -467 L 0.057 -468 W 0.057 -469 A 0.062 -470 T 0.072 -471 A 0.081 -472 R 0.087 -473 V 0.091 -474 S 0.096 -475 V 0.109 -476 E 0.133 -477 V 0.164 -478 A 0.189 -479 D 0.195 -480 V 0.184 -481 N 0.167 -482 D 0.155 -483 N 0.147 -484 A 0.140 -485 P 0.133 -486 A 0.129 -487 F 0.124 -488 A 0.121 -489 Q 0.121 -490 P 0.123 -491 E 0.115 -492 Y 0.096 -493 T 0.075 -494 V 0.059 -495 F 0.050 -496 V 0.048 -497 K 0.053 -498 E 0.067 -499 N 0.093 -500 N 0.125 -501 P 0.148 -502 P 0.152 -503 G 0.138 -504 C 0.118 -505 H 0.097 -506 I 0.083 -507 F 0.080 -508 T 0.089 -509 V 0.103 -510 S 0.117 -511 A 0.126 -512 W 0.130 -513 D 0.135 -514 A 0.147 -515 D 0.162 -516 A 0.171 -517 Q 0.175 -518 K 0.178 -519 N 0.179 -520 A 0.169 -521 L 0.146 -522 V 0.117 -523 S 0.094 -524 Y 0.086 -525 S 0.090 -526 L 0.098 -527 V 0.106 -528 E 0.115 -529 R 0.125 -530 R 0.137 -531 V 0.153 -532 G 0.173 -533 E 0.188 -534 H 0.185 -535 A 0.166 -536 L 0.140 -537 S 0.114 -538 S 0.089 -539 Y 0.071 -540 V 0.064 -541 S 0.065 -542 V 0.070 -543 H 0.074 -544 A 0.077 -545 E 0.082 -546 S 0.087 -547 G 0.089 -548 K 0.086 -549 V 0.084 -550 Y 0.092 -551 A 0.113 -552 L 0.136 -553 Q 0.150 -554 P 0.148 -555 L 0.131 -556 D 0.109 -557 H 0.095 -558 E 0.096 -559 E 0.100 -560 L 0.097 -561 E 0.084 -562 L 0.072 -563 L 0.065 -564 Q 0.059 -565 F 0.054 -566 Q 0.049 -567 V 0.047 -568 S 0.048 -569 A 0.052 -570 R 0.060 -571 D 0.068 -572 A 0.075 -573 G 0.075 -574 V 0.070 -575 P 0.070 -576 P 0.077 -577 L 0.085 -578 G 0.091 -579 S 0.098 -580 N 0.110 -581 V 0.117 -582 T 0.112 -583 L 0.102 -584 Q 0.101 -585 V 0.114 -586 F 0.142 -587 V 0.173 -588 L 0.196 -589 D 0.203 -590 E 0.199 -591 N 0.193 -592 D 0.189 -593 N 0.185 -594 A 0.176 -595 P 0.160 -596 A 0.146 -597 L 0.144 -598 L 0.162 -599 A 0.204 -600 T 0.283 -601 P 0.401 -602 A 0.529 -603 G 0.621 -604 S 0.658 -605 A 0.656 -606 G 0.626 -607 G 0.562 -608 A 0.468 -609 V 0.358 -610 S 0.254 -611 E 0.173 -612 L 0.121 -613 V 0.099 -614 P 0.098 -615 R 0.108 -616 S 0.124 -617 V 0.142 -618 G 0.162 -619 A 0.170 -620 G 0.159 -621 H 0.134 -622 V 0.111 -623 V 0.096 -624 A 0.090 -625 K 0.088 -626 V 0.090 -627 R 0.100 -628 A 0.117 -629 V 0.137 -630 D 0.157 -631 A 0.179 -632 D 0.196 -633 S 0.201 -634 G 0.194 -635 Y 0.182 -636 N 0.165 -637 A 0.141 -638 W 0.115 -639 L 0.094 -640 S 0.087 -641 Y 0.097 -642 E 0.120 -643 L 0.154 -644 Q 0.203 -645 P 0.265 -646 A 0.322 -647 A 0.349 -648 V 0.339 -649 G 0.306 -650 A 0.264 -651 H 0.213 -652 I 0.156 -653 P 0.109 -654 F 0.090 -655 H 0.096 -656 V 0.114 -657 G 0.125 -658 L 0.122 -659 Y 0.110 -660 T 0.098 -661 G 0.088 -662 E 0.079 -663 I 0.076 -664 S 0.083 -665 T 0.100 -666 T 0.117 -667 R 0.126 -668 I 0.128 -669 L 0.128 -670 D 0.134 -671 E 0.146 -672 A 0.158 -673 D 0.159 -674 A 0.147 -675 P 0.130 -676 R 0.115 -677 H 0.103 -678 R 0.090 -679 L 0.077 -680 L 0.068 -681 V 0.064 -682 L 0.067 -683 V 0.073 -684 K 0.078 -685 D 0.082 -686 H 0.085 -687 G 0.083 -688 E 0.077 -689 P 0.075 -690 A 0.077 -691 L 0.076 -692 T 0.075 -693 S 0.078 -694 T 0.087 -695 A 0.095 -696 T 0.098 -697 V 0.094 -698 L 0.088 -699 V 0.086 -700 S 0.096 -701 L 0.123 -702 V 0.173 -703 E 0.253 -704 N 0.360 -705 G 0.467 -706 Q 0.551 -707 A 0.611 -708 P 0.666 -709 K 0.718 -710 T 0.754 -711 S 0.772 -712 S 0.778 -713 R 0.783 -714 A 0.792 -715 S 0.805 -716 V 0.810 -717 G 0.800 -718 A 0.778 -719 V 0.756 -720 D 0.739 -721 P 0.729 -722 E 0.724 -723 A 0.720 -724 A 0.712 -725 L 0.689 -726 V 0.648 -727 D 0.584 -728 I 0.501 -729 N 0.409 -730 V 0.331 -731 Y 0.287 -732 L 0.279 -733 I 0.299 -734 I 0.339 -735 A 0.389 -736 I 0.431 -737 C 0.461 -738 A 0.488 -739 V 0.512 -740 S 0.525 -741 S 0.522 -742 L 0.498 -743 L 0.457 -744 V 0.406 -745 L 0.355 -746 T 0.314 -747 L 0.287 -748 L 0.269 -749 L 0.251 -750 Y 0.240 -751 T 0.247 -752 A 0.273 -753 L 0.309 -754 R 0.352 -755 C 0.395 -756 S 0.437 -757 A 0.485 -758 P 0.547 -759 P 0.619 -760 T 0.681 -761 V 0.720 -762 S 0.736 -763 R 0.738 -764 C 0.735 -765 A 0.734 -766 P 0.738 -767 G 0.749 -768 K 0.763 -769 P 0.778 -770 T 0.791 -771 L 0.800 -772 V 0.805 -773 C 0.802 -774 S 0.794 -775 S 0.791 -776 A 0.797 -777 V 0.803 -778 G 0.803 -779 S 0.794 -780 W 0.780 -781 S 0.761 -782 Y 0.731 -783 S 0.683 -784 Q 0.624 -785 Q 0.599 -786 R 0.638 -787 R 0.710 -788 Q 0.765 -789 R 0.791 -790 V 0.798 -791 C 0.794 -792 S 0.783 -793 A 0.770 -794 E 0.758 -795 S 0.750 -796 P 0.756 -797 P 0.777 -798 K 0.803 -799 T 0.819 -800 D 0.822 -801 L 0.814 -802 M 0.798 -803 A 0.776 -804 F 0.756 -805 S 0.752 -806 P 0.764 -807 S 0.779 -808 L 0.786 -809 Q 0.783 -810 L 0.767 -811 S 0.724 -812 R 0.665 -813 E 0.637 -814 D 0.667 -815 C 0.714 -816 L 0.733 -817 N 0.727 -818 P 0.726 -819 P 0.740 -820 S 0.761 -821 E 0.776 -822 P 0.781 -823 R 0.776 -824 Q 0.766 -825 P 0.758 -826 N 0.753 -827 P 0.751 -828 D 0.751 -829 W 0.756 -830 R 0.766 -831 Y 0.777 -832 S 0.786 -833 A 0.791 -834 S 0.794 -835 L 0.797 -836 R 0.801 -837 A 0.806 -838 G 0.809 -839 M 0.811 -840 H 0.817 -841 S 0.823 -842 S 0.826 -843 V 0.827 -844 H 0.828 -845 L 0.831 -846 E 0.834 -847 E 0.833 -848 A 0.831 -849 G 0.830 -850 I 0.830 -851 L 0.824 -852 R 0.811 -853 A 0.797 -854 G 0.787 -855 P 0.783 -856 G 0.787 -857 G 0.792 -858 P 0.793 -859 D 0.786 -860 Q 0.771 -861 Q 0.755 -862 W 0.753 -863 P 0.765 -864 T 0.772 -865 V 0.744 -866 S 0.681 -867 S 0.638 -868 A 0.655 -869 T 0.702 -870 P 0.740 -871 E 0.766 -872 P 0.793 -873 E 0.817 -874 A 0.830 -875 G 0.831 -876 E 0.821 -877 V 0.803 -878 S 0.788 -879 P 0.790 -880 P 0.808 -881 V 0.829 -882 G 0.842 -883 A 0.845 -884 G 0.840 -885 V 0.832 -886 N 0.824 -887 S 0.816 -888 N 0.805 -889 S 0.793 -890 W 0.782 -891 T 0.773 -892 F 0.764 -893 K 0.756 -894 Y 0.754 -895 G 0.758 -896 P 0.767 -897 G 0.779 -898 N 0.792 -899 P 0.801 -900 K 0.803 -901 Q 0.798 -902 S 0.794 -903 G 0.795 -904 P 0.799 -905 G 0.801 -906 E 0.798 -907 L 0.796 -908 P 0.801 -909 D 0.809 -910 K 0.809 -911 F 0.799 -912 I 0.790 -913 I 0.790 -914 P 0.797 -915 G 0.805 -916 S 0.814 -917 P 0.826 -918 A 0.838 -919 I 0.844 -920 I 0.841 -921 S 0.831 -922 I 0.816 -923 R 0.798 -924 Q 0.782 -925 E 0.774 -926 P 0.773 -927 T 0.780 -928 N 0.791 -929 S 0.799 -930 Q 0.798 -931 I 0.792 -932 D 0.786 -933 K 0.783 -934 S 0.782 -935 D 0.784 -936 F 0.786 -937 I 0.788 -938 T 0.789 -939 F 0.789 -940 G 0.780 -941 K 0.761 -942 K 0.731 -943 E 0.682 -944 E 0.618 -945 T 0.582 -946 K 0.606 -947 K 0.661 -948 K 0.701 -949 K 0.721 -950 K 0.731 -951 K 0.736 -952 K 0.738 -953 K 0.740 -954 G 0.741 -955 N 0.726 -956 K 0.672 -957 T 0.571 -958 Q 0.474 -959 E 0.453 -960 K 0.497 -961 K 0.539 -962 E 0.570 -963 K 0.628 -964 G 0.701 -965 N 0.750 -966 S 0.771 -967 T 0.779 -968 T 0.787 -969 D 0.793 -970 N 0.792 -971 S 0.782 -972 D 0.766 -973 Q 0.754 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000254997.4_ENST00000528743.4_GN:KRTAP5-9_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000254997.4_ENST00000528743.4_GN:KRTAP5-9_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 3a9ee41aaa7567ad5576159ead667dcc9c356359..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000254997.4_ENST00000528743.4_GN:KRTAP5-9_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,170 +0,0 @@ ->ENSG00000254997.4|ENST00000528743.4|GN:KRTAP5-9|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.478 -2 G 0.495 -3 C 0.529 -4 C 0.568 -5 G 0.601 -6 C 0.624 -7 S 0.645 -8 G 0.655 -9 G 0.645 -10 C 0.611 -11 G 0.568 -12 S 0.548 -13 S 0.570 -14 C 0.619 -15 G 0.661 -16 G 0.673 -17 C 0.646 -18 D 0.598 -19 S 0.573 -20 S 0.596 -21 C 0.644 -22 G 0.683 -23 S 0.701 -24 C 0.701 -25 G 0.696 -26 S 0.688 -27 G 0.676 -28 C 0.668 -29 R 0.668 -30 G 0.662 -31 C 0.646 -32 G 0.636 -33 P 0.648 -34 S 0.678 -35 C 0.704 -36 C 0.719 -37 A 0.724 -38 P 0.721 -39 V 0.712 -40 Y 0.700 -41 C 0.695 -42 C 0.703 -43 K 0.715 -44 P 0.717 -45 V 0.703 -46 C 0.674 -47 C 0.644 -48 C 0.630 -49 V 0.637 -50 P 0.649 -51 A 0.642 -52 C 0.613 -53 S 0.577 -54 C 0.554 -55 S 0.550 -56 S 0.565 -57 C 0.593 -58 G 0.628 -59 K 0.664 -60 R 0.688 -61 G 0.700 -62 C 0.713 -63 G 0.732 -64 S 0.747 -65 C 0.749 -66 G 0.737 -67 G 0.715 -68 S 0.692 -69 K 0.681 -70 G 0.681 -71 G 0.689 -72 C 0.698 -73 G 0.702 -74 S 0.692 -75 C 0.659 -76 G 0.610 -77 C 0.561 -78 S 0.518 -79 Q 0.477 -80 C 0.448 -81 S 0.450 -82 C 0.488 -83 C 0.537 -84 K 0.565 -85 P 0.545 -86 C 0.483 -87 C 0.422 -88 C 0.408 -89 S 0.446 -90 S 0.512 -91 G 0.580 -92 C 0.636 -93 G 0.657 -94 S 0.619 -95 S 0.519 -96 C 0.395 -97 C 0.300 -98 Q 0.252 -99 C 0.239 -100 S 0.245 -101 C 0.271 -102 C 0.315 -103 K 0.352 -104 P 0.349 -105 Y 0.304 -106 C 0.247 -107 S 0.209 -108 Q 0.198 -109 C 0.213 -110 S 0.252 -111 C 0.311 -112 C 0.379 -113 K 0.434 -114 P 0.443 -115 C 0.400 -116 C 0.338 -117 S 0.294 -118 S 0.276 -119 S 0.287 -120 G 0.326 -121 R 0.390 -122 G 0.457 -123 S 0.491 -124 S 0.470 -125 C 0.418 -126 C 0.377 -127 Q 0.366 -128 S 0.378 -129 S 0.405 -130 C 0.446 -131 C 0.488 -132 K 0.508 -133 P 0.485 -134 C 0.423 -135 C 0.356 -136 S 0.312 -137 S 0.301 -138 S 0.324 -139 G 0.382 -140 C 0.461 -141 G 0.530 -142 S 0.547 -143 S 0.496 -144 C 0.414 -145 C 0.348 -146 Q 0.313 -147 S 0.295 -148 S 0.289 -149 C 0.313 -150 C 0.363 -151 K 0.400 -152 P 0.383 -153 C 0.318 -154 C 0.249 -155 S 0.211 -156 Q 0.200 -157 S 0.202 -158 R 0.214 -159 C 0.246 -160 C 0.297 -161 V 0.351 -162 P 0.382 -163 V 0.373 -164 C 0.341 -165 Y 0.319 -166 Q 0.317 -167 C 0.318 -168 K 0.309 -169 I 0.297 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000254997.4_ENST00000528743.4_GN:KRTAP5-9_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:32.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000254997.4_ENST00000528743.4_GN:KRTAP5-9_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:32.caid deleted file mode 100644 index d1742b6effb7d66ba0963fb875ac6a12af7f6d27..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000254997.4_ENST00000528743.4_GN:KRTAP5-9_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:32.caid +++ /dev/null @@ -1,202 +0,0 @@ ->ENSG00000254997.4|ENST00000528743.4|GN:KRTAP5-9|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:32 -1 M 0.387 -2 W 0.422 -3 D 0.470 -4 I 0.491 -5 K 0.460 -6 S 0.422 -7 R 0.457 -8 G 0.565 -9 S 0.670 -10 G 0.720 -11 G 0.724 -12 S 0.702 -13 T 0.669 -14 P 0.637 -15 A 0.619 -16 P 0.615 -17 P 0.616 -18 S 0.607 -19 H 0.576 -20 L 0.524 -21 L 0.467 -22 L 0.428 -23 Y 0.420 -24 L 0.437 -25 L 0.472 -26 H 0.529 -27 P 0.605 -28 Q 0.680 -29 S 0.732 -30 T 0.755 -31 R 0.761 -32 T 0.765 -33 M 0.766 -34 G 0.761 -35 C 0.751 -36 C 0.739 -37 G 0.729 -38 C 0.728 -39 S 0.740 -40 G 0.756 -41 G 0.764 -42 C 0.766 -43 G 0.769 -44 S 0.771 -45 S 0.770 -46 C 0.771 -47 G 0.775 -48 G 0.766 -49 C 0.726 -50 D 0.664 -51 S 0.630 -52 S 0.658 -53 C 0.718 -54 G 0.763 -55 S 0.781 -56 C 0.783 -57 G 0.780 -58 S 0.772 -59 G 0.758 -60 C 0.746 -61 R 0.745 -62 G 0.744 -63 C 0.737 -64 G 0.734 -65 P 0.743 -66 S 0.760 -67 C 0.773 -68 C 0.778 -69 A 0.779 -70 P 0.775 -71 V 0.762 -72 Y 0.744 -73 C 0.732 -74 C 0.735 -75 K 0.747 -76 P 0.755 -77 V 0.745 -78 C 0.717 -79 C 0.687 -80 C 0.672 -81 V 0.677 -82 P 0.685 -83 A 0.672 -84 C 0.639 -85 S 0.602 -86 C 0.575 -87 S 0.565 -88 S 0.572 -89 C 0.592 -90 G 0.625 -91 K 0.662 -92 R 0.689 -93 G 0.703 -94 C 0.716 -95 G 0.731 -96 S 0.740 -97 C 0.734 -98 G 0.716 -99 G 0.689 -100 S 0.664 -101 K 0.652 -102 G 0.653 -103 G 0.659 -104 C 0.666 -105 G 0.669 -106 S 0.655 -107 C 0.618 -108 G 0.567 -109 C 0.518 -110 S 0.480 -111 Q 0.452 -112 C 0.439 -113 S 0.459 -114 C 0.507 -115 C 0.558 -116 K 0.583 -117 P 0.558 -118 C 0.492 -119 C 0.427 -120 C 0.411 -121 S 0.451 -122 S 0.524 -123 G 0.600 -124 C 0.659 -125 G 0.677 -126 S 0.636 -127 S 0.540 -128 C 0.428 -129 C 0.345 -130 Q 0.306 -131 C 0.298 -132 S 0.314 -133 C 0.353 -134 C 0.406 -135 K 0.442 -136 P 0.430 -137 Y 0.373 -138 C 0.311 -139 S 0.272 -140 Q 0.262 -141 C 0.276 -142 S 0.315 -143 C 0.378 -144 C 0.449 -145 K 0.500 -146 P 0.501 -147 C 0.452 -148 C 0.390 -149 S 0.347 -150 S 0.329 -151 S 0.336 -152 G 0.372 -153 R 0.436 -154 G 0.506 -155 S 0.539 -156 S 0.512 -157 C 0.453 -158 C 0.407 -159 Q 0.392 -160 S 0.399 -161 S 0.421 -162 C 0.461 -163 C 0.511 -164 K 0.538 -165 P 0.515 -166 C 0.450 -167 C 0.380 -168 S 0.337 -169 S 0.326 -170 S 0.346 -171 G 0.398 -172 C 0.473 -173 G 0.544 -174 S 0.565 -175 S 0.518 -176 C 0.436 -177 C 0.369 -178 Q 0.330 -179 S 0.305 -180 S 0.291 -181 C 0.308 -182 C 0.357 -183 K 0.397 -184 P 0.385 -185 C 0.321 -186 C 0.250 -187 S 0.209 -188 Q 0.198 -189 S 0.201 -190 R 0.216 -191 C 0.253 -192 C 0.312 -193 V 0.378 -194 P 0.419 -195 V 0.415 -196 C 0.385 -197 Y 0.364 -198 Q 0.364 -199 C 0.360 -200 K 0.342 -201 I 0.322 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000257017.11_ENST00000355906.10_GN:HP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000257017.11_ENST00000355906.10_GN:HP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index b95225c66227cd98ec3f0b3b91dde3b6a8d6b6a5..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000257017.11_ENST00000355906.10_GN:HP_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,407 +0,0 @@ ->ENSG00000257017.11|ENST00000355906.10|GN:HP|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.304 -2 S 0.299 -3 A 0.306 -4 L 0.323 -5 G 0.317 -6 A 0.279 -7 V 0.241 -8 I 0.225 -9 A 0.221 -10 L 0.222 -11 L 0.239 -12 L 0.272 -13 W 0.305 -14 G 0.328 -15 Q 0.348 -16 L 0.381 -17 F 0.434 -18 A 0.497 -19 V 0.553 -20 D 0.598 -21 S 0.630 -22 G 0.651 -23 N 0.668 -24 D 0.687 -25 V 0.704 -26 T 0.713 -27 D 0.708 -28 I 0.679 -29 A 0.619 -30 D 0.538 -31 D 0.459 -32 G 0.401 -33 C 0.376 -34 P 0.380 -35 K 0.394 -36 P 0.389 -37 P 0.350 -38 E 0.284 -39 I 0.215 -40 A 0.163 -41 H 0.135 -42 G 0.134 -43 Y 0.148 -44 V 0.157 -45 E 0.148 -46 H 0.139 -47 S 0.147 -48 V 0.165 -49 R 0.171 -50 Y 0.163 -51 Q 0.155 -52 C 0.163 -53 K 0.183 -54 N 0.196 -55 Y 0.190 -56 Y 0.179 -57 K 0.175 -58 L 0.175 -59 R 0.172 -60 T 0.167 -61 E 0.162 -62 G 0.151 -63 D 0.131 -64 G 0.109 -65 V 0.088 -66 Y 0.074 -67 T 0.067 -68 L 0.068 -69 N 0.074 -70 D 0.078 -71 K 0.076 -72 K 0.072 -73 Q 0.071 -74 W 0.073 -75 I 0.083 -76 N 0.106 -77 K 0.140 -78 A 0.174 -79 V 0.191 -80 G 0.192 -81 D 0.189 -82 K 0.185 -83 L 0.178 -84 P 0.171 -85 E 0.174 -86 C 0.187 -87 E 0.208 -88 A 0.234 -89 D 0.254 -90 D 0.262 -91 G 0.256 -92 C 0.241 -93 P 0.228 -94 K 0.221 -95 P 0.215 -96 P 0.199 -97 E 0.172 -98 I 0.140 -99 A 0.111 -100 H 0.092 -101 G 0.090 -102 Y 0.102 -103 V 0.110 -104 E 0.103 -105 H 0.093 -106 S 0.094 -107 V 0.104 -108 R 0.107 -109 Y 0.102 -110 Q 0.097 -111 C 0.099 -112 K 0.111 -113 N 0.120 -114 Y 0.118 -115 Y 0.108 -116 K 0.098 -117 L 0.091 -118 R 0.086 -119 T 0.086 -120 E 0.093 -121 G 0.098 -122 D 0.093 -123 G 0.079 -124 V 0.065 -125 Y 0.055 -126 T 0.050 -127 L 0.052 -128 N 0.056 -129 N 0.057 -130 E 0.055 -131 K 0.055 -132 Q 0.058 -133 W 0.065 -134 I 0.074 -135 N 0.089 -136 K 0.109 -137 A 0.130 -138 V 0.139 -139 G 0.133 -140 D 0.125 -141 K 0.122 -142 L 0.122 -143 P 0.121 -144 E 0.118 -145 C 0.115 -146 E 0.115 -147 A 0.113 -148 V 0.107 -149 C 0.100 -150 G 0.101 -151 K 0.114 -152 P 0.139 -153 K 0.179 -154 N 0.233 -155 P 0.289 -156 A 0.335 -157 N 0.363 -158 P 0.366 -159 V 0.343 -160 Q 0.308 -161 R 0.277 -162 I 0.255 -163 L 0.237 -164 G 0.216 -165 G 0.194 -166 H 0.182 -167 L 0.188 -168 D 0.201 -169 A 0.204 -170 K 0.187 -171 G 0.156 -172 S 0.118 -173 F 0.081 -174 P 0.052 -175 W 0.034 -176 Q 0.024 -177 A 0.020 -178 K 0.021 -179 M 0.026 -180 V 0.035 -181 S 0.046 -182 H 0.055 -183 H 0.059 -184 N 0.057 -185 L 0.049 -186 T 0.038 -187 T 0.026 -188 G 0.020 -189 A 0.021 -190 T 0.029 -191 L 0.039 -192 I 0.045 -193 N 0.045 -194 E 0.039 -195 Q 0.032 -196 W 0.026 -197 L 0.022 -198 L 0.020 -199 T 0.019 -200 T 0.023 -201 A 0.032 -202 K 0.046 -203 N 0.062 -204 L 0.078 -205 F 0.098 -206 L 0.120 -207 N 0.137 -208 H 0.141 -209 S 0.140 -210 E 0.142 -211 N 0.143 -212 A 0.134 -213 T 0.116 -214 A 0.103 -215 K 0.100 -216 D 0.102 -217 I 0.102 -218 A 0.092 -219 P 0.073 -220 T 0.050 -221 L 0.032 -222 T 0.021 -223 L 0.017 -224 Y 0.018 -225 V 0.022 -226 G 0.028 -227 K 0.033 -228 K 0.037 -229 Q 0.039 -230 L 0.039 -231 V 0.036 -232 E 0.031 -233 I 0.027 -234 E 0.024 -235 K 0.024 -236 V 0.029 -237 V 0.037 -238 L 0.045 -239 H 0.047 -240 P 0.044 -241 N 0.041 -242 Y 0.043 -243 S 0.049 -244 Q 0.054 -245 V 0.051 -246 D 0.039 -247 I 0.027 -248 G 0.019 -249 L 0.017 -250 I 0.019 -251 K 0.023 -252 L 0.029 -253 K 0.034 -254 Q 0.040 -255 K 0.050 -256 V 0.065 -257 S 0.082 -258 V 0.092 -259 N 0.089 -260 E 0.078 -261 R 0.065 -262 V 0.057 -263 M 0.053 -264 P 0.050 -265 I 0.049 -266 C 0.052 -267 L 0.061 -268 P 0.072 -269 S 0.080 -270 K 0.080 -271 D 0.074 -272 Y 0.064 -273 A 0.056 -274 E 0.053 -275 V 0.054 -276 G 0.054 -277 R 0.049 -278 V 0.039 -279 G 0.030 -280 Y 0.026 -281 V 0.027 -282 S 0.033 -283 G 0.043 -284 W 0.057 -285 G 0.071 -286 R 0.084 -287 N 0.098 -288 A 0.113 -289 N 0.127 -290 F 0.133 -291 K 0.128 -292 F 0.115 -293 T 0.100 -294 D 0.089 -295 H 0.084 -296 L 0.081 -297 K 0.077 -298 Y 0.073 -299 V 0.072 -300 M 0.073 -301 L 0.072 -302 P 0.069 -303 V 0.065 -304 A 0.060 -305 D 0.055 -306 Q 0.050 -307 D 0.045 -308 Q 0.042 -309 C 0.044 -310 I 0.054 -311 R 0.070 -312 H 0.093 -313 Y 0.125 -314 E 0.172 -315 G 0.238 -316 S 0.314 -317 T 0.384 -318 V 0.430 -319 P 0.450 -320 E 0.449 -321 K 0.438 -322 K 0.428 -323 T 0.426 -324 P 0.430 -325 K 0.440 -326 S 0.454 -327 P 0.469 -328 V 0.471 -329 G 0.451 -330 V 0.412 -331 Q 0.354 -332 P 0.283 -333 I 0.209 -334 L 0.148 -335 N 0.107 -336 E 0.081 -337 H 0.065 -338 T 0.052 -339 F 0.046 -340 C 0.049 -341 A 0.060 -342 G 0.077 -343 M 0.096 -344 S 0.112 -345 K 0.121 -346 Y 0.123 -347 Q 0.118 -348 E 0.110 -349 D 0.099 -350 T 0.088 -351 C 0.079 -352 Y 0.079 -353 G 0.084 -354 D 0.085 -355 A 0.079 -356 G 0.071 -357 S 0.067 -358 A 0.063 -359 F 0.057 -360 A 0.052 -361 V 0.053 -362 H 0.058 -363 D 0.063 -364 L 0.067 -365 E 0.072 -366 E 0.074 -367 D 0.069 -368 T 0.059 -369 W 0.047 -370 Y 0.038 -371 A 0.035 -372 T 0.038 -373 G 0.044 -374 I 0.050 -375 L 0.056 -376 S 0.060 -377 F 0.064 -378 D 0.067 -379 K 0.069 -380 S 0.071 -381 C 0.076 -382 A 0.082 -383 V 0.085 -384 A 0.078 -385 E 0.063 -386 Y 0.048 -387 G 0.041 -388 V 0.040 -389 Y 0.045 -390 V 0.053 -391 K 0.063 -392 V 0.071 -393 T 0.076 -394 S 0.077 -395 I 0.077 -396 Q 0.077 -397 D 0.075 -398 W 0.068 -399 V 0.068 -400 Q 0.077 -401 K 0.088 -402 T 0.094 -403 I 0.108 -404 A 0.133 -405 E 0.164 -406 N 0.185 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000257017.11_ENST00000355906.10_GN:HP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000257017.11_ENST00000355906.10_GN:HP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid deleted file mode 100644 index cda2c5e6cd948d9d62b9f299f99dc846d7d83ba4..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000257017.11_ENST00000355906.10_GN:HP_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:14.caid +++ /dev/null @@ -1,421 +0,0 @@ ->ENSG00000257017.11|ENST00000355906.10|GN:HP|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:14 -1 M 0.351 -2 P 0.347 -3 H 0.354 -4 S 0.373 -5 T 0.389 -6 A 0.406 -7 L 0.438 -8 P 0.465 -9 E 0.462 -10 A 0.448 -11 R 0.453 -12 P 0.462 -13 T 0.450 -14 K 0.433 -15 M 0.432 -16 S 0.429 -17 A 0.413 -18 L 0.401 -19 G 0.394 -20 A 0.362 -21 V 0.305 -22 I 0.266 -23 A 0.254 -24 L 0.253 -25 L 0.257 -26 L 0.280 -27 W 0.312 -28 G 0.340 -29 Q 0.364 -30 L 0.403 -31 F 0.464 -32 A 0.531 -33 V 0.588 -34 D 0.631 -35 S 0.658 -36 G 0.672 -37 N 0.684 -38 D 0.699 -39 V 0.713 -40 T 0.721 -41 D 0.716 -42 I 0.685 -43 A 0.623 -44 D 0.539 -45 D 0.456 -46 G 0.398 -47 C 0.377 -48 P 0.387 -49 K 0.402 -50 P 0.395 -51 P 0.353 -52 E 0.286 -53 I 0.217 -54 A 0.165 -55 H 0.136 -56 G 0.134 -57 Y 0.148 -58 V 0.155 -59 E 0.145 -60 H 0.134 -61 S 0.140 -62 V 0.155 -63 R 0.161 -64 Y 0.153 -65 Q 0.146 -66 C 0.153 -67 K 0.170 -68 N 0.181 -69 Y 0.177 -70 Y 0.167 -71 K 0.164 -72 L 0.165 -73 R 0.162 -74 T 0.157 -75 E 0.152 -76 G 0.141 -77 D 0.122 -78 G 0.100 -79 V 0.081 -80 Y 0.068 -81 T 0.061 -82 L 0.061 -83 N 0.065 -84 D 0.069 -85 K 0.069 -86 K 0.067 -87 Q 0.067 -88 W 0.071 -89 I 0.080 -90 N 0.101 -91 K 0.134 -92 A 0.167 -93 V 0.185 -94 G 0.188 -95 D 0.186 -96 K 0.182 -97 L 0.175 -98 P 0.170 -99 E 0.174 -100 C 0.186 -101 E 0.206 -102 A 0.230 -103 D 0.251 -104 D 0.262 -105 G 0.259 -106 C 0.247 -107 P 0.235 -108 K 0.231 -109 P 0.227 -110 P 0.213 -111 E 0.185 -112 I 0.151 -113 A 0.119 -114 H 0.097 -115 G 0.094 -116 Y 0.105 -117 V 0.112 -118 E 0.106 -119 H 0.095 -120 S 0.096 -121 V 0.106 -122 R 0.110 -123 Y 0.105 -124 Q 0.099 -125 C 0.101 -126 K 0.112 -127 N 0.121 -128 Y 0.120 -129 Y 0.110 -130 K 0.100 -131 L 0.093 -132 R 0.087 -133 T 0.087 -134 E 0.095 -135 G 0.102 -136 D 0.097 -137 G 0.084 -138 V 0.069 -139 Y 0.057 -140 T 0.052 -141 L 0.054 -142 N 0.057 -143 N 0.058 -144 E 0.055 -145 K 0.055 -146 Q 0.059 -147 W 0.067 -148 I 0.076 -149 N 0.090 -150 K 0.110 -151 A 0.131 -152 V 0.139 -153 G 0.133 -154 D 0.126 -155 K 0.123 -156 L 0.123 -157 P 0.121 -158 E 0.117 -159 C 0.114 -160 E 0.115 -161 A 0.114 -162 V 0.108 -163 C 0.101 -164 G 0.102 -165 K 0.114 -166 P 0.139 -167 K 0.179 -168 N 0.233 -169 P 0.289 -170 A 0.336 -171 N 0.364 -172 P 0.366 -173 V 0.342 -174 Q 0.306 -175 R 0.274 -176 I 0.253 -177 L 0.236 -178 G 0.216 -179 G 0.194 -180 H 0.183 -181 L 0.189 -182 D 0.202 -183 A 0.205 -184 K 0.188 -185 G 0.156 -186 S 0.118 -187 F 0.081 -188 P 0.052 -189 W 0.034 -190 Q 0.024 -191 A 0.020 -192 K 0.021 -193 M 0.026 -194 V 0.036 -195 S 0.047 -196 H 0.056 -197 H 0.059 -198 N 0.057 -199 L 0.049 -200 T 0.037 -201 T 0.026 -202 G 0.020 -203 A 0.021 -204 T 0.028 -205 L 0.038 -206 I 0.044 -207 N 0.044 -208 E 0.038 -209 Q 0.031 -210 W 0.025 -211 L 0.022 -212 L 0.020 -213 T 0.019 -214 T 0.023 -215 A 0.032 -216 K 0.046 -217 N 0.061 -218 L 0.076 -219 F 0.095 -220 L 0.117 -221 N 0.133 -222 H 0.137 -223 S 0.136 -224 E 0.138 -225 N 0.140 -226 A 0.131 -227 T 0.114 -228 A 0.101 -229 K 0.098 -230 D 0.101 -231 I 0.101 -232 A 0.092 -233 P 0.072 -234 T 0.050 -235 L 0.032 -236 T 0.021 -237 L 0.017 -238 Y 0.018 -239 V 0.022 -240 G 0.028 -241 K 0.033 -242 K 0.037 -243 Q 0.040 -244 L 0.040 -245 V 0.037 -246 E 0.032 -247 I 0.027 -248 E 0.024 -249 K 0.024 -250 V 0.029 -251 V 0.037 -252 L 0.045 -253 H 0.047 -254 P 0.044 -255 N 0.041 -256 Y 0.043 -257 S 0.049 -258 Q 0.054 -259 V 0.050 -260 D 0.039 -261 I 0.027 -262 G 0.019 -263 L 0.017 -264 I 0.019 -265 K 0.023 -266 L 0.029 -267 K 0.034 -268 Q 0.040 -269 K 0.051 -270 V 0.067 -271 S 0.084 -272 V 0.093 -273 N 0.091 -274 E 0.080 -275 R 0.066 -276 V 0.058 -277 M 0.054 -278 P 0.051 -279 I 0.050 -280 C 0.053 -281 L 0.063 -282 P 0.074 -283 S 0.082 -284 K 0.082 -285 D 0.076 -286 Y 0.066 -287 A 0.057 -288 E 0.054 -289 V 0.055 -290 G 0.055 -291 R 0.050 -292 V 0.041 -293 G 0.031 -294 Y 0.027 -295 V 0.028 -296 S 0.034 -297 G 0.044 -298 W 0.058 -299 G 0.072 -300 R 0.086 -301 N 0.100 -302 A 0.116 -303 N 0.129 -304 F 0.135 -305 K 0.131 -306 F 0.118 -307 T 0.102 -308 D 0.092 -309 H 0.087 -310 L 0.084 -311 K 0.079 -312 Y 0.075 -313 V 0.074 -314 M 0.075 -315 L 0.074 -316 P 0.071 -317 V 0.067 -318 A 0.062 -319 D 0.057 -320 Q 0.051 -321 D 0.046 -322 Q 0.043 -323 C 0.045 -324 I 0.055 -325 R 0.072 -326 H 0.095 -327 Y 0.128 -328 E 0.176 -329 G 0.241 -330 S 0.318 -331 T 0.387 -332 V 0.433 -333 P 0.452 -334 E 0.451 -335 K 0.440 -336 K 0.429 -337 T 0.426 -338 P 0.430 -339 K 0.440 -340 S 0.455 -341 P 0.471 -342 V 0.474 -343 G 0.454 -344 V 0.414 -345 Q 0.356 -346 P 0.284 -347 I 0.211 -348 L 0.150 -349 N 0.108 -350 E 0.083 -351 H 0.066 -352 T 0.053 -353 F 0.047 -354 C 0.050 -355 A 0.061 -356 G 0.078 -357 M 0.097 -358 S 0.114 -359 K 0.123 -360 Y 0.124 -361 Q 0.120 -362 E 0.110 -363 D 0.099 -364 T 0.087 -365 C 0.079 -366 Y 0.079 -367 G 0.084 -368 D 0.085 -369 A 0.079 -370 G 0.071 -371 S 0.067 -372 A 0.064 -373 F 0.057 -374 A 0.052 -375 V 0.054 -376 H 0.059 -377 D 0.063 -378 L 0.068 -379 E 0.072 -380 E 0.073 -381 D 0.069 -382 T 0.059 -383 W 0.047 -384 Y 0.038 -385 A 0.035 -386 T 0.038 -387 G 0.044 -388 I 0.051 -389 L 0.057 -390 S 0.061 -391 F 0.065 -392 D 0.068 -393 K 0.070 -394 S 0.072 -395 C 0.076 -396 A 0.083 -397 V 0.085 -398 A 0.078 -399 E 0.063 -400 Y 0.049 -401 G 0.041 -402 V 0.041 -403 Y 0.045 -404 V 0.053 -405 K 0.063 -406 V 0.072 -407 T 0.077 -408 S 0.078 -409 I 0.078 -410 Q 0.078 -411 D 0.075 -412 W 0.069 -413 V 0.068 -414 Q 0.078 -415 K 0.088 -416 T 0.095 -417 I 0.109 -418 A 0.134 -419 E 0.165 -420 N 0.186 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000258436.2_ENST00000696784.1_GN:RNASE12_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000258436.2_ENST00000696784.1_GN:RNASE12_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 87b022c2e280e8ee361a3cb51f2c22a101a05f63..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000258436.2_ENST00000696784.1_GN:RNASE12_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,148 +0,0 @@ ->ENSG00000258436.2|ENST00000696784.1|GN:RNASE12|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.239 -2 I 0.216 -3 I 0.188 -4 M 0.170 -5 V 0.163 -6 I 0.159 -7 I 0.155 -8 F 0.151 -9 L 0.147 -10 V 0.150 -11 L 0.166 -12 L 0.195 -13 F 0.233 -14 W 0.277 -15 E 0.323 -16 N 0.366 -17 E 0.394 -18 V 0.398 -19 N 0.376 -20 D 0.348 -21 E 0.328 -22 A 0.312 -23 V 0.278 -24 M 0.225 -25 S 0.171 -26 T 0.129 -27 L 0.099 -28 E 0.079 -29 H 0.069 -30 L 0.065 -31 H 0.062 -32 V 0.064 -33 D 0.073 -34 Y 0.084 -35 P 0.095 -36 Q 0.109 -37 N 0.125 -38 D 0.139 -39 V 0.144 -40 P 0.136 -41 V 0.118 -42 P 0.097 -43 A 0.080 -44 R 0.065 -45 Y 0.050 -46 C 0.037 -47 N 0.032 -48 H 0.032 -49 M 0.034 -50 I 0.038 -51 I 0.046 -52 Q 0.059 -53 R 0.074 -54 V 0.090 -55 I 0.104 -56 R 0.115 -57 E 0.118 -58 P 0.113 -59 D 0.105 -60 H 0.096 -61 T 0.085 -62 C 0.071 -63 K 0.059 -64 K 0.052 -65 E 0.049 -66 H 0.045 -67 V 0.041 -68 F 0.039 -69 I 0.043 -70 H 0.051 -71 E 0.060 -72 R 0.066 -73 P 0.069 -74 R 0.068 -75 K 0.064 -76 I 0.062 -77 N 0.060 -78 G 0.057 -79 I 0.050 -80 C 0.043 -81 I 0.041 -82 S 0.045 -83 P 0.050 -84 K 0.053 -85 K 0.056 -86 V 0.061 -87 A 0.068 -88 C 0.075 -89 Q 0.083 -90 N 0.093 -91 L 0.099 -92 S 0.097 -93 A 0.083 -94 I 0.064 -95 F 0.049 -96 C 0.043 -97 F 0.048 -98 Q 0.063 -99 S 0.080 -100 E 0.091 -101 T 0.093 -102 K 0.087 -103 F 0.076 -104 K 0.067 -105 M 0.062 -106 T 0.061 -107 V 0.058 -108 C 0.057 -109 Q 0.060 -110 L 0.067 -111 I 0.075 -112 E 0.079 -113 G 0.077 -114 T 0.069 -115 R 0.058 -116 Y 0.053 -117 P 0.057 -118 A 0.065 -119 C 0.072 -120 R 0.076 -121 Y 0.082 -122 H 0.090 -123 Y 0.098 -124 S 0.108 -125 P 0.120 -126 T 0.134 -127 E 0.144 -128 G 0.146 -129 F 0.141 -130 V 0.132 -131 L 0.118 -132 V 0.096 -133 T 0.074 -134 C 0.061 -135 D 0.059 -136 D 0.067 -137 L 0.080 -138 R 0.092 -139 P 0.095 -140 D 0.090 -141 S 0.081 -142 F 0.078 -143 L 0.087 -144 G 0.107 -145 Y 0.134 -146 V 0.159 -147 K 0.174 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000258436.2_ENST00000696784.1_GN:RNASE12_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000258436.2_ENST00000696784.1_GN:RNASE12_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid deleted file mode 100644 index 548f74861d3efa1eb253a34084097166240e2845..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000258436.2_ENST00000696784.1_GN:RNASE12_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid +++ /dev/null @@ -1,172 +0,0 @@ ->ENSG00000258436.2|ENST00000696784.1|GN:RNASE12|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:24 -1 M 0.382 -2 L 0.409 -3 P 0.460 -4 V 0.515 -5 T 0.551 -6 V 0.566 -7 T 0.580 -8 R 0.606 -9 K 0.642 -10 M 0.677 -11 T 0.702 -12 A 0.713 -13 V 0.706 -14 K 0.684 -15 A 0.658 -16 K 0.631 -17 D 0.601 -18 A 0.558 -19 K 0.500 -20 S 0.428 -21 L 0.344 -22 L 0.265 -23 P 0.211 -24 L 0.187 -25 M 0.179 -26 I 0.172 -27 I 0.166 -28 M 0.160 -29 V 0.157 -30 I 0.154 -31 I 0.146 -32 F 0.133 -33 L 0.119 -34 V 0.113 -35 L 0.121 -36 L 0.144 -37 F 0.179 -38 W 0.225 -39 E 0.281 -40 N 0.339 -41 E 0.384 -42 V 0.399 -43 N 0.382 -44 D 0.352 -45 E 0.329 -46 A 0.309 -47 V 0.274 -48 M 0.221 -49 S 0.169 -50 T 0.129 -51 L 0.100 -52 E 0.081 -53 H 0.072 -54 L 0.068 -55 H 0.065 -56 V 0.066 -57 D 0.074 -58 Y 0.084 -59 P 0.095 -60 Q 0.109 -61 N 0.125 -62 D 0.137 -63 V 0.139 -64 P 0.129 -65 V 0.111 -66 P 0.091 -67 A 0.075 -68 R 0.061 -69 Y 0.046 -70 C 0.034 -71 N 0.030 -72 H 0.030 -73 M 0.033 -74 I 0.036 -75 I 0.044 -76 Q 0.055 -77 R 0.068 -78 V 0.081 -79 I 0.094 -80 R 0.103 -81 E 0.108 -82 P 0.106 -83 D 0.099 -84 H 0.092 -85 T 0.082 -86 C 0.069 -87 K 0.057 -88 K 0.051 -89 E 0.050 -90 H 0.047 -91 V 0.044 -92 F 0.042 -93 I 0.046 -94 H 0.054 -95 E 0.062 -96 R 0.068 -97 P 0.069 -98 R 0.067 -99 K 0.064 -100 I 0.062 -101 N 0.060 -102 G 0.057 -103 I 0.050 -104 C 0.042 -105 I 0.041 -106 S 0.045 -107 P 0.050 -108 K 0.054 -109 K 0.059 -110 V 0.066 -111 A 0.073 -112 C 0.081 -113 Q 0.089 -114 N 0.098 -115 L 0.105 -116 S 0.102 -117 A 0.088 -118 I 0.069 -119 F 0.053 -120 C 0.046 -121 F 0.052 -122 Q 0.067 -123 S 0.085 -124 E 0.096 -125 T 0.098 -126 K 0.090 -127 F 0.079 -128 K 0.068 -129 M 0.063 -130 T 0.061 -131 V 0.059 -132 C 0.058 -133 Q 0.061 -134 L 0.069 -135 I 0.076 -136 E 0.080 -137 G 0.079 -138 T 0.071 -139 R 0.060 -140 Y 0.056 -141 P 0.061 -142 A 0.071 -143 C 0.077 -144 R 0.081 -145 Y 0.086 -146 H 0.093 -147 Y 0.101 -148 S 0.111 -149 P 0.123 -150 T 0.135 -151 E 0.144 -152 G 0.146 -153 F 0.141 -154 V 0.132 -155 L 0.118 -156 V 0.096 -157 T 0.074 -158 C 0.062 -159 D 0.060 -160 D 0.066 -161 L 0.076 -162 R 0.086 -163 P 0.088 -164 D 0.083 -165 S 0.075 -166 F 0.073 -167 L 0.082 -168 G 0.102 -169 Y 0.128 -170 V 0.152 -171 K 0.166 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000263956.9_ENST00000682118.1_GN:NBPF11_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000263956.9_ENST00000682118.1_GN:NBPF11_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 8665c7013c36cff1f8c1946ab46d94a3f0c4ffe4..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000263956.9_ENST00000682118.1_GN:NBPF11_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,866 +0,0 @@ ->ENSG00000263956.9|ENST00000682118.1|GN:NBPF11|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.377 -2 V 0.412 -3 V 0.459 -4 S 0.501 -5 A 0.535 -6 G 0.556 -7 P 0.564 -8 W 0.567 -9 S 0.562 -10 S 0.536 -11 E 0.492 -12 K 0.449 -13 A 0.410 -14 E 0.367 -15 M 0.321 -16 N 0.275 -17 I 0.228 -18 L 0.187 -19 E 0.162 -20 I 0.153 -21 N 0.147 -22 E 0.138 -23 K 0.127 -24 L 0.123 -25 R 0.125 -26 P 0.126 -27 Q 0.125 -28 L 0.124 -29 A 0.127 -30 E 0.126 -31 N 0.122 -32 K 0.127 -33 Q 0.141 -34 Q 0.152 -35 F 0.152 -36 R 0.151 -37 N 0.151 -38 L 0.150 -39 K 0.146 -40 E 0.138 -41 R 0.126 -42 C 0.113 -43 F 0.105 -44 L 0.101 -45 T 0.102 -46 Q 0.106 -47 L 0.106 -48 A 0.104 -49 G 0.109 -50 F 0.126 -51 L 0.143 -52 A 0.151 -53 N 0.148 -54 R 0.139 -55 Q 0.132 -56 K 0.134 -57 K 0.139 -58 Y 0.135 -59 K 0.121 -60 Y 0.106 -61 E 0.102 -62 E 0.105 -63 C 0.108 -64 K 0.107 -65 D 0.104 -66 L 0.095 -67 I 0.083 -68 K 0.071 -69 F 0.062 -70 M 0.056 -71 L 0.058 -72 R 0.065 -73 N 0.071 -74 E 0.074 -75 R 0.077 -76 Q 0.083 -77 F 0.091 -78 K 0.103 -79 E 0.118 -80 E 0.132 -81 K 0.146 -82 L 0.165 -83 A 0.183 -84 E 0.190 -85 Q 0.188 -86 L 0.188 -87 K 0.193 -88 Q 0.199 -89 A 0.200 -90 E 0.189 -91 E 0.166 -92 L 0.144 -93 R 0.130 -94 Q 0.121 -95 Y 0.115 -96 K 0.115 -97 V 0.120 -98 L 0.123 -99 V 0.124 -100 H 0.129 -101 S 0.141 -102 Q 0.154 -103 E 0.165 -104 R 0.168 -105 E 0.159 -106 L 0.142 -107 T 0.127 -108 Q 0.119 -109 L 0.118 -110 R 0.119 -111 E 0.118 -112 K 0.115 -113 L 0.120 -114 R 0.133 -115 E 0.145 -116 G 0.143 -117 R 0.130 -118 D 0.117 -119 A 0.117 -120 S 0.134 -121 R 0.152 -122 S 0.157 -123 L 0.153 -124 N 0.155 -125 E 0.167 -126 H 0.181 -127 L 0.196 -128 Q 0.219 -129 A 0.248 -130 L 0.276 -131 L 0.294 -132 T 0.308 -133 P 0.332 -134 D 0.374 -135 E 0.420 -136 P 0.444 -137 D 0.435 -138 K 0.407 -139 S 0.386 -140 Q 0.385 -141 G 0.394 -142 Q 0.386 -143 D 0.343 -144 L 0.275 -145 Q 0.210 -146 E 0.171 -147 Q 0.165 -148 L 0.185 -149 A 0.207 -150 E 0.205 -151 G 0.179 -152 C 0.151 -153 R 0.136 -154 L 0.133 -155 A 0.139 -156 Q 0.150 -157 H 0.157 -158 L 0.160 -159 V 0.173 -160 Q 0.208 -161 K 0.261 -162 L 0.323 -163 S 0.393 -164 P 0.477 -165 E 0.568 -166 N 0.639 -167 D 0.678 -168 E 0.692 -169 D 0.697 -170 E 0.701 -171 D 0.706 -172 E 0.711 -173 D 0.713 -174 V 0.709 -175 Q 0.692 -176 V 0.651 -177 E 0.596 -178 E 0.570 -179 D 0.604 -180 E 0.669 -181 K 0.718 -182 V 0.740 -183 L 0.742 -184 E 0.733 -185 S 0.720 -186 S 0.714 -187 A 0.724 -188 P 0.748 -189 R 0.776 -190 E 0.796 -191 V 0.805 -192 Q 0.808 -193 K 0.809 -194 A 0.807 -195 E 0.802 -196 E 0.797 -197 S 0.793 -198 K 0.789 -199 V 0.786 -200 P 0.788 -201 E 0.797 -202 D 0.805 -203 S 0.806 -204 L 0.805 -205 E 0.805 -206 E 0.811 -207 C 0.818 -208 A 0.821 -209 I 0.820 -210 T 0.815 -211 C 0.809 -212 S 0.804 -213 N 0.801 -214 S 0.797 -215 H 0.796 -216 G 0.800 -217 P 0.807 -218 C 0.809 -219 D 0.804 -220 S 0.789 -221 I 0.769 -222 Q 0.757 -223 P 0.762 -224 H 0.779 -225 K 0.798 -226 N 0.810 -227 I 0.812 -228 K 0.804 -229 I 0.793 -230 T 0.783 -231 F 0.781 -232 E 0.785 -233 E 0.789 -234 D 0.790 -235 K 0.788 -236 V 0.787 -237 N 0.788 -238 S 0.791 -239 S 0.794 -240 L 0.799 -241 V 0.804 -242 V 0.808 -243 D 0.806 -244 R 0.801 -245 E 0.795 -246 S 0.790 -247 S 0.787 -248 H 0.788 -249 D 0.796 -250 G 0.802 -251 C 0.803 -252 Q 0.800 -253 D 0.799 -254 A 0.796 -255 L 0.788 -256 N 0.774 -257 I 0.755 -258 L 0.735 -259 P 0.720 -260 V 0.720 -261 P 0.734 -262 G 0.756 -263 P 0.778 -264 T 0.794 -265 S 0.802 -266 S 0.805 -267 A 0.809 -268 T 0.815 -269 N 0.822 -270 V 0.826 -271 S 0.829 -272 M 0.828 -273 V 0.819 -274 V 0.800 -275 S 0.778 -276 A 0.763 -277 G 0.756 -278 P 0.754 -279 L 0.753 -280 S 0.746 -281 S 0.725 -282 E 0.697 -283 K 0.671 -284 A 0.637 -285 E 0.586 -286 M 0.534 -287 N 0.493 -288 I 0.447 -289 L 0.383 -290 E 0.309 -291 I 0.240 -292 N 0.185 -293 E 0.153 -294 K 0.143 -295 L 0.142 -296 C 0.140 -297 P 0.134 -298 Q 0.125 -299 L 0.115 -300 A 0.105 -301 E 0.097 -302 K 0.092 -303 K 0.098 -304 Q 0.115 -305 Q 0.130 -306 F 0.131 -307 R 0.122 -308 S 0.115 -309 L 0.115 -310 K 0.121 -311 E 0.129 -312 K 0.128 -313 C 0.119 -314 F 0.108 -315 V 0.098 -316 T 0.088 -317 Q 0.081 -318 V 0.079 -319 A 0.077 -320 C 0.079 -321 F 0.089 -322 L 0.103 -323 A 0.107 -324 K 0.099 -325 Q 0.088 -326 Q 0.085 -327 N 0.092 -328 K 0.102 -329 Y 0.104 -330 K 0.096 -331 Y 0.086 -332 E 0.084 -333 E 0.087 -334 C 0.084 -335 K 0.075 -336 D 0.067 -337 L 0.066 -338 I 0.066 -339 K 0.062 -340 S 0.057 -341 M 0.050 -342 L 0.045 -343 R 0.043 -344 N 0.042 -345 E 0.042 -346 R 0.046 -347 Q 0.050 -348 F 0.057 -349 K 0.067 -350 E 0.081 -351 E 0.095 -352 K 0.105 -353 L 0.118 -354 A 0.130 -355 E 0.137 -356 Q 0.142 -357 L 0.151 -358 K 0.161 -359 Q 0.169 -360 A 0.172 -361 E 0.163 -362 E 0.146 -363 L 0.131 -364 R 0.126 -365 Q 0.128 -366 Y 0.130 -367 K 0.132 -368 V 0.137 -369 L 0.142 -370 V 0.148 -371 H 0.158 -372 S 0.172 -373 Q 0.184 -374 E 0.187 -375 R 0.178 -376 E 0.157 -377 L 0.135 -378 T 0.121 -379 Q 0.117 -380 L 0.120 -381 R 0.123 -382 E 0.121 -383 K 0.116 -384 L 0.114 -385 R 0.119 -386 E 0.125 -387 G 0.123 -388 R 0.110 -389 D 0.099 -390 A 0.100 -391 S 0.112 -392 R 0.121 -393 S 0.120 -394 L 0.114 -395 N 0.113 -396 E 0.119 -397 H 0.129 -398 L 0.144 -399 Q 0.164 -400 A 0.185 -401 L 0.200 -402 L 0.201 -403 T 0.199 -404 P 0.208 -405 D 0.233 -406 E 0.258 -407 P 0.263 -408 D 0.250 -409 K 0.234 -410 S 0.230 -411 Q 0.238 -412 G 0.242 -413 Q 0.230 -414 D 0.204 -415 L 0.175 -416 Q 0.150 -417 E 0.133 -418 Q 0.132 -419 L 0.147 -420 A 0.166 -421 E 0.171 -422 G 0.161 -423 C 0.147 -424 R 0.139 -425 L 0.140 -426 A 0.151 -427 Q 0.162 -428 H 0.163 -429 L 0.159 -430 V 0.168 -431 Q 0.194 -432 K 0.233 -433 L 0.285 -434 S 0.358 -435 P 0.460 -436 E 0.572 -437 N 0.655 -438 D 0.694 -439 N 0.706 -440 D 0.711 -441 D 0.720 -442 D 0.732 -443 E 0.743 -444 D 0.750 -445 V 0.749 -446 Q 0.742 -447 V 0.732 -448 E 0.716 -449 V 0.690 -450 A 0.661 -451 E 0.641 -452 K 0.621 -453 V 0.593 -454 Q 0.581 -455 K 0.613 -456 S 0.663 -457 S 0.695 -458 S 0.717 -459 P 0.745 -460 R 0.778 -461 E 0.804 -462 M 0.818 -463 Q 0.825 -464 K 0.828 -465 A 0.826 -466 E 0.821 -467 E 0.815 -468 K 0.809 -469 E 0.804 -470 V 0.802 -471 P 0.808 -472 E 0.821 -473 D 0.832 -474 S 0.836 -475 L 0.838 -476 E 0.843 -477 E 0.853 -478 C 0.861 -479 A 0.866 -480 I 0.864 -481 T 0.858 -482 C 0.851 -483 S 0.846 -484 N 0.841 -485 S 0.835 -486 H 0.830 -487 G 0.830 -488 P 0.833 -489 Y 0.836 -490 D 0.836 -491 S 0.829 -492 N 0.819 -493 Q 0.816 -494 P 0.825 -495 H 0.844 -496 R 0.864 -497 K 0.877 -498 T 0.882 -499 K 0.880 -500 I 0.872 -501 T 0.863 -502 F 0.858 -503 E 0.857 -504 E 0.859 -505 D 0.861 -506 K 0.862 -507 V 0.863 -508 D 0.863 -509 S 0.863 -510 T 0.862 -511 L 0.862 -512 I 0.861 -513 G 0.859 -514 S 0.852 -515 S 0.842 -516 S 0.834 -517 H 0.829 -518 V 0.824 -519 E 0.818 -520 W 0.814 -521 E 0.817 -522 D 0.825 -523 A 0.828 -524 V 0.824 -525 H 0.817 -526 I 0.809 -527 I 0.806 -528 P 0.811 -529 E 0.821 -530 N 0.828 -531 E 0.828 -532 S 0.823 -533 D 0.819 -534 D 0.818 -535 E 0.820 -536 E 0.821 -537 E 0.821 -538 E 0.821 -539 E 0.821 -540 K 0.817 -541 G 0.811 -542 P 0.803 -543 V 0.793 -544 S 0.773 -545 P 0.730 -546 R 0.671 -547 N 0.640 -548 L 0.658 -549 Q 0.679 -550 E 0.658 -551 S 0.638 -552 E 0.670 -553 E 0.729 -554 E 0.768 -555 E 0.779 -556 V 0.782 -557 P 0.790 -558 Q 0.803 -559 E 0.812 -560 S 0.811 -561 W 0.808 -562 D 0.811 -563 E 0.818 -564 G 0.824 -565 Y 0.827 -566 S 0.828 -567 T 0.820 -568 L 0.800 -569 S 0.768 -570 I 0.740 -571 P 0.731 -572 P 0.746 -573 E 0.765 -574 R 0.771 -575 L 0.771 -576 A 0.776 -577 S 0.782 -578 Y 0.779 -579 Q 0.770 -580 S 0.756 -581 Y 0.745 -582 S 0.743 -583 S 0.748 -584 T 0.747 -585 F 0.738 -586 H 0.723 -587 S 0.697 -588 L 0.672 -589 E 0.666 -590 E 0.673 -591 Q 0.674 -592 Q 0.675 -593 V 0.688 -594 C 0.708 -595 M 0.722 -596 A 0.726 -597 V 0.715 -598 D 0.687 -599 I 0.651 -600 G 0.624 -601 R 0.604 -602 H 0.581 -603 R 0.545 -604 W 0.504 -605 D 0.484 -606 Q 0.490 -607 V 0.510 -608 K 0.539 -609 K 0.582 -610 E 0.626 -611 D 0.653 -612 Q 0.661 -613 E 0.662 -614 A 0.671 -615 T 0.693 -616 G 0.725 -617 P 0.757 -618 R 0.777 -619 L 0.782 -620 S 0.774 -621 R 0.761 -622 E 0.752 -623 L 0.750 -624 L 0.749 -625 D 0.740 -626 E 0.727 -627 K 0.721 -628 E 0.729 -629 P 0.747 -630 E 0.763 -631 V 0.769 -632 L 0.766 -633 Q 0.760 -634 D 0.756 -635 S 0.756 -636 L 0.760 -637 D 0.768 -638 R 0.774 -639 C 0.772 -640 Y 0.764 -641 S 0.762 -642 T 0.771 -643 P 0.785 -644 S 0.797 -645 V 0.806 -646 Y 0.815 -647 L 0.823 -648 G 0.824 -649 L 0.816 -650 T 0.802 -651 D 0.783 -652 S 0.760 -653 C 0.746 -654 Q 0.746 -655 P 0.751 -656 Y 0.750 -657 R 0.743 -658 S 0.729 -659 A 0.704 -660 F 0.667 -661 Y 0.622 -662 V 0.574 -663 L 0.544 -664 E 0.555 -665 Q 0.599 -666 Q 0.650 -667 R 0.690 -668 I 0.719 -669 G 0.738 -670 L 0.751 -671 A 0.755 -672 V 0.745 -673 D 0.720 -674 M 0.691 -675 D 0.665 -676 E 0.640 -677 I 0.612 -678 E 0.585 -679 K 0.561 -680 Y 0.548 -681 Q 0.556 -682 E 0.582 -683 V 0.617 -684 E 0.649 -685 E 0.665 -686 D 0.657 -687 Q 0.641 -688 D 0.638 -689 P 0.652 -690 S 0.679 -691 C 0.717 -692 P 0.755 -693 R 0.778 -694 L 0.771 -695 S 0.725 -696 R 0.656 -697 E 0.614 -698 L 0.633 -699 L 0.676 -700 A 0.696 -701 E 0.692 -702 K 0.690 -703 E 0.701 -704 P 0.720 -705 E 0.738 -706 V 0.747 -707 L 0.748 -708 Q 0.746 -709 D 0.747 -710 S 0.751 -711 L 0.756 -712 D 0.763 -713 R 0.768 -714 C 0.767 -715 Y 0.759 -716 S 0.756 -717 T 0.770 -718 P 0.793 -719 S 0.814 -720 G 0.824 -721 Y 0.822 -722 L 0.808 -723 E 0.789 -724 L 0.771 -725 P 0.751 -726 D 0.728 -727 L 0.705 -728 G 0.697 -729 Q 0.711 -730 P 0.733 -731 Y 0.749 -732 R 0.753 -733 S 0.747 -734 A 0.724 -735 V 0.687 -736 Y 0.642 -737 S 0.593 -738 L 0.554 -739 E 0.545 -740 E 0.560 -741 Q 0.579 -742 Y 0.593 -743 L 0.606 -744 G 0.618 -745 L 0.624 -746 A 0.621 -747 L 0.597 -748 D 0.548 -749 V 0.494 -750 D 0.461 -751 R 0.460 -752 I 0.482 -753 K 0.515 -754 K 0.549 -755 D 0.571 -756 Q 0.577 -757 E 0.575 -758 E 0.579 -759 E 0.594 -760 E 0.606 -761 D 0.600 -762 Q 0.584 -763 G 0.585 -764 P 0.617 -765 P 0.672 -766 C 0.729 -767 P 0.770 -768 R 0.790 -769 L 0.792 -770 S 0.786 -771 R 0.778 -772 E 0.766 -773 L 0.747 -774 L 0.714 -775 E 0.667 -776 V 0.618 -777 V 0.587 -778 E 0.590 -779 P 0.614 -780 E 0.634 -781 V 0.635 -782 L 0.623 -783 Q 0.614 -784 D 0.614 -785 S 0.605 -786 L 0.568 -787 D 0.503 -788 V 0.442 -789 I 0.407 -790 Q 0.399 -791 L 0.411 -792 L 0.440 -793 P 0.473 -794 V 0.490 -795 V 0.496 -796 L 0.513 -797 N 0.540 -798 S 0.551 -799 L 0.543 -800 T 0.535 -801 P 0.535 -802 A 0.534 -803 S 0.520 -804 P 0.496 -805 T 0.469 -806 E 0.439 -807 V 0.395 -808 P 0.330 -809 F 0.253 -810 M 0.187 -811 H 0.151 -812 W 0.137 -813 R 0.137 -814 K 0.143 -815 N 0.148 -816 M 0.145 -817 L 0.136 -818 A 0.123 -819 F 0.109 -820 L 0.098 -821 L 0.095 -822 T 0.099 -823 W 0.111 -824 E 0.133 -825 K 0.164 -826 L 0.203 -827 K 0.256 -828 R 0.330 -829 R 0.426 -830 G 0.527 -831 R 0.611 -832 G 0.664 -833 R 0.685 -834 K 0.683 -835 E 0.667 -836 G 0.644 -837 E 0.611 -838 E 0.551 -839 D 0.462 -840 Q 0.384 -841 R 0.373 -842 R 0.432 -843 K 0.508 -844 E 0.564 -845 E 0.601 -846 G 0.625 -847 E 0.635 -848 E 0.636 -849 K 0.637 -850 K 0.648 -851 G 0.667 -852 K 0.691 -853 K 0.708 -854 I 0.716 -855 K 0.714 -856 T 0.705 -857 H 0.697 -858 H 0.699 -859 A 0.715 -860 P 0.736 -861 G 0.741 -862 S 0.705 -863 A 0.615 -864 A 0.498 -865 C 0.415 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000263956.9_ENST00000682118.1_GN:NBPF11_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:54.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000263956.9_ENST00000682118.1_GN:NBPF11_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:54.caid deleted file mode 100644 index 8c3344d2cee42906942922d50ce1b3a5ce9a696e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000263956.9_ENST00000682118.1_GN:NBPF11_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:54.caid +++ /dev/null @@ -1,920 +0,0 @@ ->ENSG00000263956.9|ENST00000682118.1|GN:NBPF11|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:54 -1 M 0.389 -2 V 0.416 -3 K 0.459 -4 Q 0.509 -5 N 0.556 -6 N 0.593 -7 I 0.626 -8 I 0.661 -9 P 0.695 -10 G 0.714 -11 E 0.706 -12 T 0.674 -13 Q 0.636 -14 I 0.614 -15 L 0.608 -16 L 0.608 -17 R 0.604 -18 F 0.597 -19 T 0.588 -20 G 0.580 -21 W 0.584 -22 E 0.609 -23 S 0.644 -24 K 0.676 -25 V 0.699 -26 N 0.711 -27 A 0.710 -28 K 0.702 -29 K 0.698 -30 Q 0.708 -31 L 0.733 -32 P 0.767 -33 V 0.798 -34 G 0.810 -35 I 0.800 -36 K 0.779 -37 C 0.760 -38 E 0.752 -39 P 0.755 -40 M 0.760 -41 D 0.759 -42 Q 0.752 -43 V 0.749 -44 P 0.760 -45 D 0.781 -46 S 0.797 -47 T 0.801 -48 S 0.799 -49 S 0.799 -50 A 0.805 -51 T 0.815 -52 N 0.825 -53 V 0.833 -54 S 0.839 -55 M 0.840 -56 V 0.828 -57 V 0.800 -58 S 0.766 -59 A 0.740 -60 G 0.728 -61 P 0.728 -62 W 0.736 -63 S 0.748 -64 S 0.752 -65 E 0.745 -66 K 0.728 -67 A 0.701 -68 E 0.660 -69 M 0.615 -70 N 0.567 -71 I 0.511 -72 L 0.450 -73 E 0.391 -74 I 0.330 -75 N 0.266 -76 E 0.215 -77 K 0.187 -78 L 0.183 -79 R 0.189 -80 P 0.193 -81 Q 0.187 -82 L 0.176 -83 A 0.167 -84 E 0.161 -85 N 0.159 -86 K 0.169 -87 Q 0.188 -88 Q 0.198 -89 F 0.190 -90 R 0.175 -91 N 0.165 -92 L 0.162 -93 K 0.158 -94 E 0.150 -95 R 0.137 -96 C 0.122 -97 F 0.111 -98 L 0.103 -99 T 0.100 -100 Q 0.100 -101 L 0.098 -102 A 0.098 -103 G 0.107 -104 F 0.124 -105 L 0.140 -106 A 0.148 -107 N 0.145 -108 R 0.138 -109 Q 0.135 -110 K 0.140 -111 K 0.144 -112 Y 0.141 -113 K 0.128 -114 Y 0.116 -115 E 0.114 -116 E 0.117 -117 C 0.118 -118 K 0.112 -119 D 0.105 -120 L 0.099 -121 I 0.091 -122 K 0.080 -123 F 0.070 -124 M 0.069 -125 L 0.079 -126 R 0.091 -127 N 0.094 -128 E 0.091 -129 R 0.088 -130 Q 0.090 -131 F 0.096 -132 K 0.105 -133 E 0.117 -134 E 0.127 -135 K 0.139 -136 L 0.155 -137 A 0.171 -138 E 0.180 -139 Q 0.182 -140 L 0.187 -141 K 0.194 -142 Q 0.200 -143 A 0.200 -144 E 0.190 -145 E 0.172 -146 L 0.154 -147 R 0.143 -148 Q 0.139 -149 Y 0.136 -150 K 0.138 -151 V 0.143 -152 L 0.143 -153 V 0.140 -154 H 0.142 -155 S 0.150 -156 Q 0.162 -157 E 0.171 -158 R 0.172 -159 E 0.162 -160 L 0.145 -161 T 0.130 -162 Q 0.122 -163 L 0.121 -164 R 0.124 -165 E 0.126 -166 K 0.127 -167 L 0.133 -168 R 0.148 -169 E 0.164 -170 G 0.169 -171 R 0.161 -172 D 0.150 -173 A 0.149 -174 S 0.164 -175 R 0.182 -176 S 0.186 -177 L 0.178 -178 N 0.175 -179 E 0.183 -180 H 0.192 -181 L 0.205 -182 Q 0.233 -183 A 0.277 -184 L 0.317 -185 L 0.341 -186 T 0.357 -187 P 0.386 -188 D 0.435 -189 E 0.485 -190 P 0.511 -191 D 0.499 -192 K 0.459 -193 S 0.419 -194 Q 0.401 -195 G 0.406 -196 Q 0.407 -197 D 0.373 -198 L 0.301 -199 Q 0.227 -200 E 0.184 -201 Q 0.175 -202 L 0.193 -203 A 0.212 -204 E 0.210 -205 G 0.187 -206 C 0.162 -207 R 0.148 -208 L 0.145 -209 A 0.151 -210 Q 0.162 -211 H 0.173 -212 L 0.180 -213 V 0.195 -214 Q 0.233 -215 K 0.290 -216 L 0.352 -217 S 0.421 -218 P 0.505 -219 E 0.595 -220 N 0.664 -221 D 0.699 -222 E 0.709 -223 D 0.711 -224 E 0.714 -225 D 0.718 -226 E 0.722 -227 D 0.722 -228 V 0.717 -229 Q 0.700 -230 V 0.660 -231 E 0.603 -232 E 0.574 -233 D 0.605 -234 E 0.667 -235 K 0.715 -236 V 0.736 -237 L 0.740 -238 E 0.734 -239 S 0.724 -240 S 0.717 -241 A 0.724 -242 P 0.745 -243 R 0.770 -244 E 0.788 -245 V 0.797 -246 Q 0.801 -247 K 0.802 -248 A 0.800 -249 E 0.796 -250 E 0.792 -251 S 0.789 -252 K 0.785 -253 V 0.782 -254 P 0.785 -255 E 0.794 -256 D 0.802 -257 S 0.804 -258 L 0.803 -259 E 0.805 -260 E 0.810 -261 C 0.815 -262 A 0.818 -263 I 0.816 -264 T 0.809 -265 C 0.801 -266 S 0.796 -267 N 0.792 -268 S 0.788 -269 H 0.788 -270 G 0.794 -271 P 0.801 -272 C 0.805 -273 D 0.801 -274 S 0.785 -275 I 0.765 -276 Q 0.754 -277 P 0.760 -278 H 0.779 -279 K 0.800 -280 N 0.814 -281 I 0.818 -282 K 0.812 -283 I 0.801 -284 T 0.791 -285 F 0.787 -286 E 0.789 -287 E 0.793 -288 D 0.794 -289 K 0.792 -290 V 0.790 -291 N 0.788 -292 S 0.786 -293 S 0.786 -294 L 0.790 -295 V 0.796 -296 V 0.801 -297 D 0.802 -298 R 0.801 -299 E 0.800 -300 S 0.801 -301 S 0.803 -302 H 0.808 -303 D 0.817 -304 G 0.825 -305 C 0.826 -306 Q 0.824 -307 D 0.823 -308 A 0.820 -309 L 0.812 -310 N 0.797 -311 I 0.778 -312 L 0.759 -313 P 0.747 -314 V 0.750 -315 P 0.765 -316 G 0.785 -317 P 0.805 -318 T 0.821 -319 S 0.832 -320 S 0.838 -321 A 0.844 -322 T 0.850 -323 N 0.857 -324 V 0.862 -325 S 0.864 -326 M 0.860 -327 V 0.849 -328 V 0.828 -329 S 0.802 -330 A 0.786 -331 G 0.784 -332 P 0.789 -333 L 0.795 -334 S 0.795 -335 S 0.783 -336 E 0.761 -337 K 0.734 -338 A 0.696 -339 E 0.642 -340 M 0.586 -341 N 0.544 -342 I 0.506 -343 L 0.449 -344 E 0.372 -345 I 0.290 -346 N 0.225 -347 E 0.189 -348 K 0.175 -349 L 0.173 -350 C 0.171 -351 P 0.166 -352 Q 0.156 -353 L 0.143 -354 A 0.130 -355 E 0.117 -356 K 0.111 -357 K 0.116 -358 Q 0.130 -359 Q 0.141 -360 F 0.139 -361 R 0.130 -362 S 0.125 -363 L 0.128 -364 K 0.138 -365 E 0.146 -366 K 0.142 -367 C 0.126 -368 F 0.110 -369 V 0.098 -370 T 0.086 -371 Q 0.078 -372 V 0.073 -373 A 0.068 -374 C 0.066 -375 F 0.073 -376 L 0.085 -377 A 0.091 -378 K 0.086 -379 Q 0.079 -380 Q 0.078 -381 N 0.083 -382 K 0.089 -383 Y 0.089 -384 K 0.080 -385 Y 0.073 -386 E 0.072 -387 E 0.076 -388 C 0.075 -389 K 0.068 -390 D 0.063 -391 L 0.063 -392 I 0.064 -393 K 0.061 -394 S 0.054 -395 M 0.049 -396 L 0.046 -397 R 0.048 -398 N 0.051 -399 E 0.055 -400 R 0.059 -401 Q 0.064 -402 F 0.070 -403 K 0.082 -404 E 0.099 -405 E 0.116 -406 K 0.131 -407 L 0.145 -408 A 0.156 -409 E 0.160 -410 Q 0.158 -411 L 0.158 -412 K 0.161 -413 Q 0.165 -414 A 0.166 -415 E 0.159 -416 E 0.144 -417 L 0.133 -418 R 0.131 -419 Q 0.134 -420 Y 0.138 -421 K 0.141 -422 V 0.146 -423 L 0.151 -424 V 0.160 -425 H 0.173 -426 S 0.187 -427 Q 0.195 -428 E 0.196 -429 R 0.187 -430 E 0.165 -431 L 0.140 -432 T 0.122 -433 Q 0.117 -434 L 0.119 -435 R 0.125 -436 E 0.127 -437 K 0.125 -438 L 0.127 -439 R 0.139 -440 E 0.154 -441 G 0.156 -442 R 0.140 -443 D 0.121 -444 A 0.114 -445 S 0.121 -446 R 0.130 -447 S 0.132 -448 L 0.130 -449 N 0.132 -450 E 0.141 -451 H 0.152 -452 L 0.166 -453 Q 0.190 -454 A 0.219 -455 L 0.241 -456 L 0.248 -457 T 0.249 -458 P 0.264 -459 D 0.299 -460 E 0.331 -461 P 0.339 -462 D 0.320 -463 K 0.295 -464 S 0.283 -465 Q 0.292 -466 G 0.304 -467 Q 0.297 -468 D 0.267 -469 L 0.226 -470 Q 0.189 -471 E 0.166 -472 Q 0.164 -473 L 0.183 -474 A 0.205 -475 E 0.208 -476 G 0.190 -477 C 0.167 -478 R 0.154 -479 L 0.155 -480 A 0.169 -481 Q 0.185 -482 H 0.192 -483 L 0.194 -484 V 0.209 -485 Q 0.244 -486 K 0.289 -487 L 0.340 -488 S 0.408 -489 P 0.503 -490 E 0.608 -491 N 0.687 -492 D 0.725 -493 N 0.735 -494 D 0.739 -495 D 0.744 -496 D 0.753 -497 E 0.761 -498 D 0.766 -499 V 0.766 -500 Q 0.762 -501 V 0.756 -502 E 0.746 -503 V 0.732 -504 A 0.717 -505 E 0.701 -506 K 0.670 -507 V 0.622 -508 Q 0.597 -509 K 0.624 -510 S 0.673 -511 S 0.706 -512 S 0.727 -513 P 0.754 -514 R 0.786 -515 E 0.811 -516 M 0.825 -517 Q 0.831 -518 K 0.832 -519 A 0.830 -520 E 0.824 -521 E 0.819 -522 K 0.813 -523 E 0.807 -524 V 0.804 -525 P 0.808 -526 E 0.820 -527 D 0.831 -528 S 0.837 -529 L 0.839 -530 E 0.845 -531 E 0.853 -532 C 0.861 -533 A 0.864 -534 I 0.863 -535 T 0.857 -536 C 0.850 -537 S 0.844 -538 N 0.838 -539 S 0.832 -540 H 0.828 -541 G 0.827 -542 P 0.830 -543 Y 0.833 -544 D 0.833 -545 S 0.826 -546 N 0.816 -547 Q 0.812 -548 P 0.821 -549 H 0.840 -550 R 0.860 -551 K 0.874 -552 T 0.880 -553 K 0.876 -554 I 0.866 -555 T 0.856 -556 F 0.849 -557 E 0.849 -558 E 0.851 -559 D 0.853 -560 K 0.853 -561 V 0.853 -562 D 0.853 -563 S 0.852 -564 T 0.850 -565 L 0.850 -566 I 0.850 -567 G 0.849 -568 S 0.842 -569 S 0.833 -570 S 0.826 -571 H 0.821 -572 V 0.817 -573 E 0.811 -574 W 0.807 -575 E 0.811 -576 D 0.818 -577 A 0.819 -578 V 0.814 -579 H 0.806 -580 I 0.798 -581 I 0.795 -582 P 0.801 -583 E 0.813 -584 N 0.821 -585 E 0.822 -586 S 0.819 -587 D 0.816 -588 D 0.815 -589 E 0.817 -590 E 0.819 -591 E 0.820 -592 E 0.820 -593 E 0.819 -594 K 0.815 -595 G 0.808 -596 P 0.801 -597 V 0.791 -598 S 0.772 -599 P 0.730 -600 R 0.671 -601 N 0.639 -602 L 0.658 -603 Q 0.679 -604 E 0.659 -605 S 0.639 -606 E 0.670 -607 E 0.729 -608 E 0.768 -609 E 0.779 -610 V 0.781 -611 P 0.790 -612 Q 0.803 -613 E 0.813 -614 S 0.813 -615 W 0.811 -616 D 0.814 -617 E 0.822 -618 G 0.827 -619 Y 0.829 -620 S 0.829 -621 T 0.822 -622 L 0.803 -623 S 0.774 -624 I 0.748 -625 P 0.741 -626 P 0.755 -627 E 0.773 -628 R 0.782 -629 L 0.784 -630 A 0.788 -631 S 0.792 -632 Y 0.790 -633 Q 0.782 -634 S 0.768 -635 Y 0.756 -636 S 0.752 -637 S 0.753 -638 T 0.750 -639 F 0.742 -640 H 0.728 -641 S 0.706 -642 L 0.686 -643 E 0.685 -644 E 0.694 -645 Q 0.697 -646 Q 0.700 -647 V 0.711 -648 C 0.727 -649 M 0.740 -650 A 0.743 -651 V 0.731 -652 D 0.704 -653 I 0.673 -654 G 0.649 -655 R 0.631 -656 H 0.609 -657 R 0.575 -658 W 0.535 -659 D 0.514 -660 Q 0.518 -661 V 0.537 -662 K 0.565 -663 K 0.607 -664 E 0.650 -665 D 0.677 -666 Q 0.684 -667 E 0.684 -668 A 0.689 -669 T 0.705 -670 G 0.732 -671 P 0.759 -672 R 0.775 -673 L 0.772 -674 S 0.747 -675 R 0.709 -676 E 0.685 -677 L 0.695 -678 L 0.720 -679 D 0.730 -680 E 0.727 -681 K 0.724 -682 E 0.732 -683 P 0.749 -684 E 0.765 -685 V 0.772 -686 L 0.770 -687 Q 0.765 -688 D 0.762 -689 S 0.762 -690 L 0.765 -691 D 0.771 -692 R 0.776 -693 C 0.773 -694 Y 0.766 -695 S 0.764 -696 T 0.774 -697 P 0.790 -698 S 0.802 -699 V 0.811 -700 Y 0.819 -701 L 0.825 -702 G 0.825 -703 L 0.817 -704 T 0.803 -705 D 0.784 -706 S 0.763 -707 C 0.748 -708 Q 0.746 -709 P 0.750 -710 Y 0.750 -711 R 0.744 -712 S 0.732 -713 A 0.709 -714 F 0.676 -715 Y 0.635 -716 V 0.589 -717 L 0.559 -718 E 0.569 -719 Q 0.611 -720 Q 0.658 -721 R 0.695 -722 I 0.721 -723 G 0.738 -724 L 0.748 -725 A 0.752 -726 V 0.744 -727 D 0.722 -728 M 0.694 -729 D 0.668 -730 E 0.642 -731 I 0.615 -732 E 0.590 -733 K 0.569 -734 Y 0.557 -735 Q 0.564 -736 E 0.589 -737 V 0.623 -738 E 0.654 -739 E 0.670 -740 D 0.662 -741 Q 0.646 -742 D 0.643 -743 P 0.656 -744 S 0.682 -745 C 0.718 -746 P 0.754 -747 R 0.775 -748 L 0.768 -749 S 0.723 -750 R 0.655 -751 E 0.614 -752 L 0.633 -753 L 0.676 -754 A 0.697 -755 E 0.694 -756 K 0.692 -757 E 0.704 -758 P 0.724 -759 E 0.742 -760 V 0.752 -761 L 0.754 -762 Q 0.752 -763 D 0.752 -764 S 0.756 -765 L 0.761 -766 D 0.767 -767 R 0.773 -768 C 0.771 -769 Y 0.760 -770 S 0.756 -771 T 0.770 -772 P 0.794 -773 S 0.816 -774 G 0.825 -775 Y 0.822 -776 L 0.807 -777 E 0.787 -778 L 0.769 -779 P 0.751 -780 D 0.730 -781 L 0.710 -782 G 0.703 -783 Q 0.717 -784 P 0.741 -785 Y 0.758 -786 R 0.763 -787 S 0.758 -788 A 0.737 -789 V 0.702 -790 Y 0.659 -791 S 0.614 -792 L 0.576 -793 E 0.566 -794 E 0.577 -795 Q 0.591 -796 Y 0.602 -797 L 0.615 -798 G 0.628 -799 L 0.636 -800 A 0.634 -801 L 0.610 -802 D 0.561 -803 V 0.508 -804 D 0.478 -805 R 0.478 -806 I 0.501 -807 K 0.534 -808 K 0.566 -809 D 0.587 -810 Q 0.594 -811 E 0.594 -812 E 0.599 -813 E 0.612 -814 E 0.622 -815 D 0.614 -816 Q 0.597 -817 G 0.597 -818 P 0.627 -819 P 0.678 -820 C 0.731 -821 P 0.769 -822 R 0.787 -823 L 0.789 -824 S 0.783 -825 R 0.774 -826 E 0.761 -827 L 0.741 -828 L 0.709 -829 E 0.664 -830 V 0.616 -831 V 0.585 -832 E 0.585 -833 P 0.606 -834 E 0.623 -835 V 0.620 -836 L 0.606 -837 Q 0.595 -838 D 0.593 -839 S 0.585 -840 L 0.546 -841 D 0.478 -842 V 0.413 -843 I 0.378 -844 Q 0.374 -845 L 0.390 -846 L 0.419 -847 P 0.448 -848 V 0.461 -849 V 0.466 -850 L 0.484 -851 N 0.514 -852 S 0.529 -853 L 0.524 -854 T 0.519 -855 P 0.521 -856 A 0.521 -857 S 0.508 -858 P 0.485 -859 T 0.458 -860 E 0.428 -861 V 0.385 -862 P 0.321 -863 F 0.244 -864 M 0.179 -865 H 0.143 -866 W 0.131 -867 R 0.131 -868 K 0.137 -869 N 0.140 -870 M 0.137 -871 L 0.127 -872 A 0.114 -873 F 0.099 -874 L 0.089 -875 L 0.087 -876 T 0.091 -877 W 0.103 -878 E 0.126 -879 K 0.158 -880 L 0.198 -881 K 0.249 -882 R 0.321 -883 R 0.415 -884 G 0.515 -885 R 0.599 -886 G 0.653 -887 R 0.674 -888 K 0.669 -889 E 0.649 -890 G 0.624 -891 E 0.588 -892 E 0.528 -893 D 0.442 -894 Q 0.369 -895 R 0.361 -896 R 0.417 -897 K 0.489 -898 E 0.545 -899 E 0.585 -900 G 0.611 -901 E 0.623 -902 E 0.623 -903 K 0.623 -904 K 0.631 -905 G 0.648 -906 K 0.667 -907 K 0.678 -908 I 0.678 -909 K 0.669 -910 T 0.660 -911 H 0.655 -912 H 0.664 -913 A 0.685 -914 P 0.707 -915 G 0.706 -916 S 0.657 -917 A 0.551 -918 A 0.424 -919 C 0.339 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000267673.7_ENST00000393708.3_GN:FDX2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000267673.7_ENST00000393708.3_GN:FDX2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 2aad6f3c1c400de9199d7496a0cf3647cf04dab3..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000267673.7_ENST00000393708.3_GN:FDX2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,184 +0,0 @@ ->ENSG00000267673.7|ENST00000393708.3|GN:FDX2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.449 -2 A 0.443 -3 A 0.448 -4 S 0.461 -5 M 0.452 -6 A 0.429 -7 R 0.451 -8 G 0.525 -9 G 0.597 -10 V 0.625 -11 S 0.616 -12 A 0.596 -13 R 0.578 -14 V 0.561 -15 L 0.533 -16 L 0.497 -17 Q 0.487 -18 A 0.521 -19 A 0.572 -20 R 0.607 -21 G 0.615 -22 T 0.595 -23 W 0.562 -24 W 0.549 -25 N 0.571 -26 R 0.616 -27 P 0.667 -28 G 0.715 -29 G 0.752 -30 T 0.771 -31 S 0.774 -32 G 0.770 -33 S 0.766 -34 G 0.765 -35 E 0.762 -36 G 0.754 -37 V 0.744 -38 A 0.738 -39 L 0.733 -40 G 0.723 -41 T 0.697 -42 T 0.663 -43 R 0.641 -44 K 0.647 -45 F 0.676 -46 Q 0.712 -47 A 0.737 -48 T 0.744 -49 G 0.733 -50 S 0.713 -51 R 0.701 -52 P 0.707 -53 A 0.727 -54 G 0.745 -55 E 0.751 -56 E 0.749 -57 D 0.739 -58 A 0.716 -59 G 0.677 -60 G 0.629 -61 P 0.576 -62 E 0.515 -63 R 0.448 -64 P 0.376 -65 G 0.299 -66 D 0.219 -67 V 0.144 -68 V 0.085 -69 N 0.047 -70 V 0.029 -71 V 0.022 -72 F 0.023 -73 V 0.030 -74 D 0.041 -75 R 0.056 -76 S 0.071 -77 G 0.079 -78 Q 0.077 -79 R 0.069 -80 I 0.058 -81 P 0.047 -82 V 0.037 -83 S 0.031 -84 G 0.030 -85 R 0.035 -86 V 0.044 -87 G 0.052 -88 D 0.056 -89 N 0.059 -90 V 0.065 -91 L 0.070 -92 H 0.072 -93 L 0.071 -94 A 0.070 -95 Q 0.069 -96 R 0.068 -97 H 0.071 -98 G 0.080 -99 V 0.097 -100 D 0.122 -101 L 0.149 -102 E 0.165 -103 G 0.165 -104 A 0.152 -105 C 0.138 -106 E 0.132 -107 A 0.132 -108 S 0.133 -109 L 0.138 -110 A 0.148 -111 C 0.152 -112 S 0.144 -113 T 0.128 -114 C 0.109 -115 H 0.087 -116 V 0.069 -117 Y 0.064 -118 V 0.068 -119 S 0.073 -120 E 0.072 -121 D 0.066 -122 H 0.062 -123 L 0.063 -124 D 0.070 -125 L 0.082 -126 L 0.100 -127 P 0.120 -128 P 0.134 -129 P 0.132 -130 E 0.112 -131 E 0.090 -132 R 0.076 -133 E 0.072 -134 D 0.076 -135 D 0.084 -136 M 0.094 -137 L 0.102 -138 D 0.106 -139 M 0.110 -140 A 0.115 -141 P 0.119 -142 L 0.123 -143 L 0.123 -144 Q 0.112 -145 E 0.091 -146 N 0.072 -147 S 0.060 -148 R 0.053 -149 L 0.047 -150 G 0.042 -151 C 0.040 -152 Q 0.040 -153 I 0.041 -154 V 0.039 -155 L 0.037 -156 T 0.038 -157 P 0.044 -158 E 0.054 -159 L 0.063 -160 E 0.066 -161 G 0.063 -162 A 0.055 -163 E 0.049 -164 F 0.049 -165 T 0.061 -166 L 0.083 -167 P 0.110 -168 K 0.141 -169 I 0.174 -170 T 0.205 -171 R 0.242 -172 N 0.288 -173 F 0.339 -174 Y 0.384 -175 V 0.426 -176 D 0.468 -177 G 0.505 -178 H 0.525 -179 V 0.529 -180 P 0.522 -181 K 0.502 -182 P 0.468 -183 H 0.437 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000267673.7_ENST00000393708.3_GN:FDX2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000267673.7_ENST00000393708.3_GN:FDX2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid deleted file mode 100644 index e0d013328c6e5ba66f49f6244da9cdc0d26a721a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000267673.7_ENST00000393708.3_GN:FDX2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:3.caid +++ /dev/null @@ -1,187 +0,0 @@ ->ENSG00000267673.7|ENST00000393708.3|GN:FDX2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:3 -1 M 0.441 -2 H 0.476 -3 V 0.526 -4 M 0.556 -5 A 0.550 -6 A 0.542 -7 S 0.572 -8 M 0.622 -9 A 0.655 -10 R 0.666 -11 G 0.670 -12 G 0.669 -13 V 0.661 -14 S 0.646 -15 A 0.631 -16 R 0.619 -17 V 0.602 -18 L 0.568 -19 L 0.523 -20 Q 0.505 -21 A 0.536 -22 A 0.586 -23 R 0.620 -24 G 0.626 -25 T 0.604 -26 W 0.568 -27 W 0.551 -28 N 0.571 -29 R 0.616 -30 P 0.668 -31 G 0.717 -32 G 0.755 -33 T 0.775 -34 S 0.779 -35 G 0.774 -36 S 0.770 -37 G 0.768 -38 E 0.765 -39 G 0.758 -40 V 0.749 -41 A 0.744 -42 L 0.740 -43 G 0.730 -44 T 0.706 -45 T 0.674 -46 R 0.653 -47 K 0.657 -48 F 0.684 -49 Q 0.716 -50 A 0.740 -51 T 0.747 -52 G 0.736 -53 S 0.716 -54 R 0.703 -55 P 0.709 -56 A 0.730 -57 G 0.747 -58 E 0.754 -59 E 0.751 -60 D 0.741 -61 A 0.717 -62 G 0.678 -63 G 0.629 -64 P 0.573 -65 E 0.511 -66 R 0.443 -67 P 0.372 -68 G 0.296 -69 D 0.216 -70 V 0.142 -71 V 0.084 -72 N 0.047 -73 V 0.029 -74 V 0.022 -75 F 0.023 -76 V 0.029 -77 D 0.041 -78 R 0.056 -79 S 0.070 -80 G 0.078 -81 Q 0.077 -82 R 0.068 -83 I 0.057 -84 P 0.046 -85 V 0.037 -86 S 0.031 -87 G 0.030 -88 R 0.034 -89 V 0.043 -90 G 0.051 -91 D 0.055 -92 N 0.057 -93 V 0.063 -94 L 0.068 -95 H 0.070 -96 L 0.069 -97 A 0.069 -98 Q 0.067 -99 R 0.066 -100 H 0.070 -101 G 0.080 -102 V 0.097 -103 D 0.122 -104 L 0.148 -105 E 0.164 -106 G 0.164 -107 A 0.151 -108 C 0.137 -109 E 0.131 -110 A 0.131 -111 S 0.133 -112 L 0.138 -113 A 0.147 -114 C 0.151 -115 S 0.143 -116 T 0.128 -117 C 0.109 -118 H 0.086 -119 V 0.069 -120 Y 0.063 -121 V 0.067 -122 S 0.072 -123 E 0.071 -124 D 0.065 -125 H 0.061 -126 L 0.062 -127 D 0.070 -128 L 0.082 -129 L 0.099 -130 P 0.119 -131 P 0.134 -132 P 0.131 -133 E 0.112 -134 E 0.090 -135 R 0.076 -136 E 0.072 -137 D 0.076 -138 D 0.084 -139 M 0.094 -140 L 0.102 -141 D 0.106 -142 M 0.110 -143 A 0.115 -144 P 0.119 -145 L 0.123 -146 L 0.123 -147 Q 0.112 -148 E 0.091 -149 N 0.071 -150 S 0.060 -151 R 0.053 -152 L 0.047 -153 G 0.042 -154 C 0.039 -155 Q 0.040 -156 I 0.041 -157 V 0.039 -158 L 0.037 -159 T 0.038 -160 P 0.044 -161 E 0.054 -162 L 0.062 -163 E 0.066 -164 G 0.063 -165 A 0.055 -166 E 0.049 -167 F 0.049 -168 T 0.061 -169 L 0.083 -170 P 0.110 -171 K 0.141 -172 I 0.173 -173 T 0.204 -174 R 0.240 -175 N 0.286 -176 F 0.336 -177 Y 0.381 -178 V 0.422 -179 D 0.465 -180 G 0.502 -181 H 0.523 -182 V 0.527 -183 P 0.520 -184 K 0.500 -185 P 0.466 -186 H 0.436 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000280236.3_ENST00000642051.1_GN:OR12D2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000280236.3_ENST00000642051.1_GN:OR12D2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index b4befc483dfec4501e616cb0f600bcea49f0bf78..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000280236.3_ENST00000642051.1_GN:OR12D2_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,308 +0,0 @@ ->ENSG00000280236.3|ENST00000642051.1|GN:OR12D2|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.436 -2 L 0.446 -3 N 0.456 -4 T 0.448 -5 T 0.406 -6 S 0.336 -7 V 0.258 -8 T 0.194 -9 E 0.154 -10 F 0.136 -11 L 0.130 -12 L 0.129 -13 L 0.139 -14 G 0.157 -15 V 0.173 -16 T 0.181 -17 D 0.179 -18 I 0.167 -19 Q 0.147 -20 E 0.122 -21 L 0.097 -22 Q 0.076 -23 P 0.060 -24 F 0.055 -25 L 0.060 -26 F 0.071 -27 V 0.074 -28 V 0.063 -29 F 0.049 -30 L 0.042 -31 T 0.044 -32 I 0.049 -33 Y 0.050 -34 F 0.048 -35 I 0.047 -36 S 0.047 -37 V 0.049 -38 T 0.054 -39 G 0.064 -40 N 0.075 -41 G 0.083 -42 A 0.084 -43 V 0.076 -44 L 0.065 -45 M 0.059 -46 I 0.061 -47 V 0.068 -48 I 0.077 -49 S 0.087 -50 D 0.095 -51 P 0.094 -52 R 0.086 -53 L 0.078 -54 H 0.071 -55 S 0.061 -56 L 0.047 -57 M 0.034 -58 Y 0.026 -59 F 0.022 -60 F 0.024 -61 L 0.031 -62 G 0.043 -63 N 0.052 -64 L 0.056 -65 S 0.055 -66 Y 0.053 -67 L 0.054 -68 D 0.061 -69 I 0.068 -70 C 0.069 -71 Y 0.064 -72 S 0.058 -73 T 0.057 -74 V 0.060 -75 T 0.064 -76 L 0.067 -77 P 0.065 -78 K 0.061 -79 M 0.060 -80 L 0.058 -81 Q 0.055 -82 N 0.053 -83 F 0.058 -84 L 0.071 -85 S 0.088 -86 T 0.098 -87 H 0.094 -88 K 0.082 -89 A 0.069 -90 I 0.058 -91 S 0.048 -92 F 0.041 -93 L 0.038 -94 G 0.038 -95 C 0.038 -96 I 0.037 -97 S 0.038 -98 Q 0.039 -99 L 0.037 -100 H 0.034 -101 F 0.030 -102 F 0.027 -103 H 0.027 -104 S 0.029 -105 L 0.034 -106 G 0.040 -107 S 0.046 -108 T 0.052 -109 E 0.055 -110 S 0.053 -111 M 0.046 -112 L 0.038 -113 F 0.032 -114 A 0.030 -115 V 0.031 -116 M 0.037 -117 A 0.044 -118 F 0.049 -119 D 0.052 -120 L 0.050 -121 S 0.046 -122 V 0.042 -123 A 0.043 -124 I 0.047 -125 C 0.052 -126 K 0.057 -127 P 0.059 -128 L 0.056 -129 R 0.051 -130 Y 0.048 -131 T 0.049 -132 V 0.053 -133 I 0.061 -134 M 0.066 -135 N 0.068 -136 P 0.067 -137 Q 0.064 -138 L 0.057 -139 C 0.053 -140 T 0.060 -141 Q 0.070 -142 M 0.075 -143 A 0.077 -144 I 0.075 -145 T 0.067 -146 I 0.056 -147 W 0.048 -148 V 0.046 -149 I 0.051 -150 G 0.057 -151 F 0.062 -152 F 0.066 -153 H 0.072 -154 A 0.076 -155 L 0.076 -156 L 0.079 -157 H 0.084 -158 S 0.087 -159 V 0.087 -160 M 0.091 -161 T 0.098 -162 S 0.106 -163 R 0.115 -164 L 0.120 -165 N 0.119 -166 F 0.118 -167 C 0.122 -168 G 0.128 -169 S 0.133 -170 N 0.139 -171 R 0.143 -172 I 0.139 -173 H 0.119 -174 H 0.093 -175 F 0.073 -176 L 0.063 -177 C 0.065 -178 D 0.078 -179 I 0.100 -180 K 0.121 -181 P 0.132 -182 L 0.135 -183 L 0.136 -184 K 0.136 -185 L 0.133 -186 A 0.128 -187 C 0.127 -188 G 0.136 -189 N 0.146 -190 T 0.145 -191 E 0.130 -192 L 0.112 -193 N 0.099 -194 Q 0.094 -195 W 0.093 -196 L 0.095 -197 L 0.094 -198 S 0.092 -199 T 0.090 -200 V 0.090 -201 T 0.087 -202 G 0.079 -203 T 0.068 -204 I 0.060 -205 A 0.058 -206 M 0.064 -207 G 0.072 -208 P 0.075 -209 F 0.068 -210 F 0.058 -211 L 0.054 -212 T 0.052 -213 L 0.048 -214 L 0.042 -215 S 0.037 -216 Y 0.034 -217 F 0.032 -218 Y 0.035 -219 I 0.044 -220 I 0.055 -221 T 0.060 -222 Y 0.056 -223 L 0.049 -224 F 0.053 -225 F 0.069 -226 K 0.092 -227 T 0.116 -228 R 0.133 -229 S 0.137 -230 C 0.127 -231 S 0.109 -232 M 0.091 -233 L 0.075 -234 C 0.065 -235 K 0.062 -236 A 0.061 -237 L 0.061 -238 S 0.061 -239 T 0.059 -240 C 0.056 -241 A 0.056 -242 S 0.058 -243 H 0.056 -244 F 0.053 -245 M 0.052 -246 V 0.051 -247 V 0.045 -248 I 0.036 -249 L 0.028 -250 F 0.025 -251 Y 0.027 -252 A 0.033 -253 P 0.036 -254 V 0.034 -255 L 0.032 -256 F 0.033 -257 T 0.043 -258 Y 0.067 -259 I 0.104 -260 H 0.146 -261 P 0.176 -262 A 0.189 -263 L 0.190 -264 E 0.190 -265 S 0.192 -266 F 0.194 -267 M 0.188 -268 D 0.173 -269 Q 0.152 -270 D 0.132 -271 R 0.116 -272 I 0.105 -273 V 0.094 -274 A 0.084 -275 I 0.078 -276 M 0.084 -277 Y 0.099 -278 T 0.115 -279 V 0.124 -280 V 0.128 -281 T 0.124 -282 P 0.113 -283 V 0.099 -284 L 0.087 -285 N 0.078 -286 P 0.071 -287 L 0.068 -288 I 0.070 -289 Y 0.073 -290 T 0.081 -291 L 0.098 -292 R 0.112 -293 N 0.106 -294 K 0.088 -295 E 0.070 -296 V 0.060 -297 K 0.058 -298 G 0.061 -299 A 0.067 -300 L 0.074 -301 G 0.086 -302 R 0.097 -303 V 0.106 -304 I 0.118 -305 R 0.139 -306 R 0.164 -307 L 0.183 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000280236.3_ENST00000642051.1_GN:OR12D2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000280236.3_ENST00000642051.1_GN:OR12D2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid deleted file mode 100644 index e119ff1a341616733ed1e918b5c0f1a8ccbcd8b8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000280236.3_ENST00000642051.1_GN:OR12D2_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:1.caid +++ /dev/null @@ -1,309 +0,0 @@ ->ENSG00000280236.3|ENST00000642051.1|GN:OR12D2|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:1 -1 M 0.416 -2 M 0.434 -3 L 0.460 -4 N 0.474 -5 T 0.459 -6 T 0.409 -7 S 0.333 -8 V 0.255 -9 T 0.192 -10 E 0.153 -11 F 0.135 -12 L 0.129 -13 L 0.128 -14 L 0.138 -15 G 0.156 -16 V 0.172 -17 T 0.179 -18 D 0.178 -19 I 0.166 -20 Q 0.147 -21 E 0.122 -22 L 0.097 -23 Q 0.076 -24 P 0.060 -25 F 0.055 -26 L 0.060 -27 F 0.071 -28 V 0.074 -29 V 0.063 -30 F 0.049 -31 L 0.042 -32 T 0.044 -33 I 0.049 -34 Y 0.050 -35 F 0.048 -36 I 0.047 -37 S 0.047 -38 V 0.049 -39 T 0.054 -40 G 0.064 -41 N 0.075 -42 G 0.083 -43 A 0.084 -44 V 0.076 -45 L 0.065 -46 M 0.059 -47 I 0.061 -48 V 0.067 -49 I 0.076 -50 S 0.087 -51 D 0.094 -52 P 0.093 -53 R 0.086 -54 L 0.078 -55 H 0.070 -56 S 0.060 -57 L 0.047 -58 M 0.034 -59 Y 0.026 -60 F 0.022 -61 F 0.024 -62 L 0.031 -63 G 0.042 -64 N 0.052 -65 L 0.056 -66 S 0.055 -67 Y 0.053 -68 L 0.054 -69 D 0.061 -70 I 0.068 -71 C 0.069 -72 Y 0.064 -73 S 0.058 -74 T 0.056 -75 V 0.059 -76 T 0.064 -77 L 0.067 -78 P 0.064 -79 K 0.061 -80 M 0.060 -81 L 0.058 -82 Q 0.055 -83 N 0.053 -84 F 0.057 -85 L 0.071 -86 S 0.088 -87 T 0.097 -88 H 0.094 -89 K 0.081 -90 A 0.068 -91 I 0.057 -92 S 0.048 -93 F 0.041 -94 L 0.038 -95 G 0.038 -96 C 0.038 -97 I 0.037 -98 S 0.038 -99 Q 0.039 -100 L 0.037 -101 H 0.034 -102 F 0.030 -103 F 0.027 -104 H 0.027 -105 S 0.029 -106 L 0.034 -107 G 0.040 -108 S 0.046 -109 T 0.052 -110 E 0.054 -111 S 0.053 -112 M 0.046 -113 L 0.038 -114 F 0.032 -115 A 0.030 -116 V 0.031 -117 M 0.037 -118 A 0.044 -119 F 0.050 -120 D 0.052 -121 L 0.050 -122 S 0.046 -123 V 0.042 -124 A 0.042 -125 I 0.046 -126 C 0.052 -127 K 0.057 -128 P 0.059 -129 L 0.056 -130 R 0.051 -131 Y 0.048 -132 T 0.049 -133 V 0.053 -134 I 0.061 -135 M 0.066 -136 N 0.068 -137 P 0.067 -138 Q 0.064 -139 L 0.056 -140 C 0.053 -141 T 0.059 -142 Q 0.070 -143 M 0.075 -144 A 0.077 -145 I 0.075 -146 T 0.067 -147 I 0.056 -148 W 0.048 -149 V 0.046 -150 I 0.051 -151 G 0.057 -152 F 0.062 -153 F 0.066 -154 H 0.072 -155 A 0.076 -156 L 0.076 -157 L 0.079 -158 H 0.084 -159 S 0.087 -160 V 0.088 -161 M 0.091 -162 T 0.098 -163 S 0.106 -164 R 0.115 -165 L 0.119 -166 N 0.118 -167 F 0.117 -168 C 0.121 -169 G 0.127 -170 S 0.133 -171 N 0.138 -172 R 0.143 -173 I 0.139 -174 H 0.119 -175 H 0.093 -176 F 0.073 -177 L 0.063 -178 C 0.065 -179 D 0.078 -180 I 0.100 -181 K 0.121 -182 P 0.133 -183 L 0.135 -184 L 0.136 -185 K 0.136 -186 L 0.133 -187 A 0.127 -188 C 0.127 -189 G 0.136 -190 N 0.146 -191 T 0.145 -192 E 0.130 -193 L 0.112 -194 N 0.099 -195 Q 0.094 -196 W 0.093 -197 L 0.095 -198 L 0.094 -199 S 0.092 -200 T 0.090 -201 V 0.090 -202 T 0.087 -203 G 0.079 -204 T 0.068 -205 I 0.060 -206 A 0.058 -207 M 0.064 -208 G 0.073 -209 P 0.075 -210 F 0.068 -211 F 0.058 -212 L 0.054 -213 T 0.052 -214 L 0.048 -215 L 0.043 -216 S 0.038 -217 Y 0.034 -218 F 0.032 -219 Y 0.035 -220 I 0.044 -221 I 0.055 -222 T 0.060 -223 Y 0.055 -224 L 0.049 -225 F 0.053 -226 F 0.069 -227 K 0.092 -228 T 0.116 -229 R 0.133 -230 S 0.137 -231 C 0.127 -232 S 0.109 -233 M 0.091 -234 L 0.075 -235 C 0.065 -236 K 0.062 -237 A 0.061 -238 L 0.061 -239 S 0.061 -240 T 0.059 -241 C 0.056 -242 A 0.056 -243 S 0.058 -244 H 0.057 -245 F 0.053 -246 M 0.052 -247 V 0.051 -248 V 0.045 -249 I 0.036 -250 L 0.028 -251 F 0.025 -252 Y 0.027 -253 A 0.033 -254 P 0.036 -255 V 0.034 -256 L 0.032 -257 F 0.033 -258 T 0.043 -259 Y 0.067 -260 I 0.105 -261 H 0.146 -262 P 0.177 -263 A 0.189 -264 L 0.191 -265 E 0.190 -266 S 0.193 -267 F 0.194 -268 M 0.188 -269 D 0.173 -270 Q 0.152 -271 D 0.132 -272 R 0.116 -273 I 0.105 -274 V 0.095 -275 A 0.084 -276 I 0.078 -277 M 0.084 -278 Y 0.099 -279 T 0.115 -280 V 0.125 -281 V 0.128 -282 T 0.124 -283 P 0.113 -284 V 0.099 -285 L 0.087 -286 N 0.078 -287 P 0.071 -288 L 0.068 -289 I 0.070 -290 Y 0.073 -291 T 0.081 -292 L 0.099 -293 R 0.112 -294 N 0.106 -295 K 0.088 -296 E 0.070 -297 V 0.060 -298 K 0.058 -299 G 0.061 -300 A 0.067 -301 L 0.074 -302 G 0.086 -303 R 0.097 -304 V 0.106 -305 I 0.118 -306 R 0.139 -307 R 0.164 -308 L 0.183 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000283268.2_ENST00000636508.2_GN:TEX54_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000283268.2_ENST00000636508.2_GN:TEX54_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index eb8584e33bc565082a11fac688083487780cb830..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000283268.2_ENST00000636508.2_GN:TEX54_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,125 +0,0 @@ ->ENSG00000283268.2|ENST00000636508.2|GN:TEX54|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.617 -2 G 0.645 -3 C 0.685 -4 C 0.720 -5 Q 0.741 -6 D 0.751 -7 K 0.758 -8 D 0.766 -9 F 0.774 -10 E 0.785 -11 M 0.794 -12 S 0.797 -13 D 0.790 -14 E 0.772 -15 Q 0.732 -16 S 0.677 -17 K 0.651 -18 E 0.688 -19 E 0.752 -20 E 0.795 -21 S 0.811 -22 E 0.815 -23 D 0.818 -24 G 0.821 -25 R 0.824 -26 E 0.827 -27 D 0.830 -28 E 0.835 -29 T 0.838 -30 T 0.838 -31 D 0.831 -32 T 0.819 -33 Q 0.804 -34 R 0.796 -35 G 0.798 -36 P 0.808 -37 R 0.815 -38 E 0.813 -39 C 0.809 -40 E 0.807 -41 R 0.805 -42 G 0.800 -43 L 0.795 -44 P 0.795 -45 E 0.801 -46 G 0.808 -47 R 0.810 -48 G 0.809 -49 E 0.814 -50 L 0.828 -51 R 0.844 -52 G 0.852 -53 L 0.846 -54 V 0.829 -55 V 0.812 -56 P 0.806 -57 S 0.807 -58 G 0.806 -59 A 0.801 -60 E 0.792 -61 D 0.779 -62 I 0.760 -63 D 0.733 -64 L 0.691 -65 N 0.639 -66 S 0.594 -67 P 0.573 -68 D 0.576 -69 H 0.599 -70 P 0.637 -71 N 0.675 -72 H 0.707 -73 K 0.732 -74 S 0.748 -75 N 0.745 -76 E 0.727 -77 S 0.705 -78 L 0.678 -79 L 0.638 -80 I 0.585 -81 T 0.535 -82 V 0.493 -83 L 0.457 -84 W 0.434 -85 R 0.440 -86 R 0.475 -87 L 0.518 -88 S 0.558 -89 T 0.606 -90 F 0.664 -91 G 0.716 -92 R 0.751 -93 R 0.771 -94 G 0.782 -95 S 0.784 -96 S 0.778 -97 R 0.774 -98 P 0.777 -99 S 0.781 -100 K 0.778 -101 R 0.769 -102 Q 0.764 -103 P 0.772 -104 D 0.787 -105 Q 0.800 -106 I 0.807 -107 R 0.807 -108 K 0.800 -109 Q 0.785 -110 E 0.767 -111 S 0.755 -112 P 0.751 -113 I 0.736 -114 R 0.701 -115 E 0.681 -116 G 0.705 -117 N 0.747 -118 Q 0.766 -119 E 0.760 -120 E 0.745 -121 P 0.729 -122 E 0.704 -123 K 0.665 -124 G 0.631 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000283268.2_ENST00000636508.2_GN:TEX54_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000283268.2_ENST00000636508.2_GN:TEX54_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid deleted file mode 100644 index d68f3ad4104d71425de047ce33271c213bf93a39..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000283268.2_ENST00000636508.2_GN:TEX54_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:24.caid +++ /dev/null @@ -1,149 +0,0 @@ ->ENSG00000283268.2|ENST00000636508.2|GN:TEX54|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:24 -1 M 0.520 -2 S 0.557 -3 Q 0.613 -4 K 0.673 -5 P 0.723 -6 G 0.754 -7 L 0.767 -8 E 0.774 -9 A 0.781 -10 G 0.789 -11 R 0.793 -12 L 0.791 -13 A 0.787 -14 W 0.787 -15 V 0.791 -16 A 0.789 -17 R 0.780 -18 S 0.773 -19 P 0.778 -20 G 0.797 -21 P 0.826 -22 R 0.853 -23 G 0.869 -24 A 0.872 -25 M 0.866 -26 G 0.855 -27 C 0.846 -28 C 0.841 -29 Q 0.838 -30 D 0.838 -31 K 0.839 -32 D 0.842 -33 F 0.846 -34 E 0.851 -35 M 0.854 -36 S 0.854 -37 D 0.847 -38 E 0.828 -39 Q 0.780 -40 S 0.713 -41 K 0.677 -42 E 0.711 -43 E 0.776 -44 E 0.820 -45 S 0.836 -46 E 0.840 -47 D 0.843 -48 G 0.846 -49 R 0.849 -50 E 0.853 -51 D 0.857 -52 E 0.862 -53 T 0.865 -54 T 0.865 -55 D 0.861 -56 T 0.853 -57 Q 0.843 -58 R 0.837 -59 G 0.839 -60 P 0.846 -61 R 0.852 -62 E 0.853 -63 C 0.851 -64 E 0.848 -65 R 0.844 -66 G 0.836 -67 L 0.828 -68 P 0.827 -69 E 0.832 -70 G 0.838 -71 R 0.839 -72 G 0.838 -73 E 0.841 -74 L 0.850 -75 R 0.860 -76 G 0.862 -77 L 0.853 -78 V 0.835 -79 V 0.818 -80 P 0.813 -81 S 0.815 -82 G 0.815 -83 A 0.810 -84 E 0.801 -85 D 0.785 -86 I 0.759 -87 D 0.724 -88 L 0.682 -89 N 0.639 -90 S 0.606 -91 P 0.593 -92 D 0.598 -93 H 0.620 -94 P 0.654 -95 N 0.689 -96 H 0.716 -97 K 0.735 -98 S 0.744 -99 N 0.738 -100 E 0.722 -101 S 0.702 -102 L 0.675 -103 L 0.633 -104 I 0.576 -105 T 0.515 -106 V 0.458 -107 L 0.408 -108 W 0.376 -109 R 0.377 -110 R 0.409 -111 L 0.456 -112 S 0.507 -113 T 0.569 -114 F 0.641 -115 G 0.702 -116 R 0.742 -117 R 0.763 -118 G 0.776 -119 S 0.780 -120 S 0.776 -121 R 0.772 -122 P 0.775 -123 S 0.781 -124 K 0.779 -125 R 0.771 -126 Q 0.768 -127 P 0.777 -128 D 0.794 -129 Q 0.809 -130 I 0.817 -131 R 0.818 -132 K 0.814 -133 Q 0.802 -134 E 0.785 -135 S 0.773 -136 P 0.763 -137 I 0.736 -138 R 0.687 -139 E 0.660 -140 G 0.691 -141 N 0.746 -142 Q 0.774 -143 E 0.771 -144 E 0.757 -145 P 0.742 -146 E 0.721 -147 K 0.688 -148 G 0.659 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000284188.3_ENST00000640271.3_GN:C1orf202_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000284188.3_ENST00000640271.3_GN:C1orf202_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 8591fc044345a14f66e6c70830bdd8b033a65bc3..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000284188.3_ENST00000640271.3_GN:C1orf202_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,183 +0,0 @@ ->ENSG00000284188.3|ENST00000640271.3|GN:C1orf202|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.548 -2 A 0.577 -3 A 0.621 -4 P 0.668 -5 R 0.709 -6 F 0.734 -7 G 0.743 -8 G 0.745 -9 P 0.748 -10 R 0.753 -11 R 0.754 -12 G 0.747 -13 G 0.728 -14 A 0.692 -15 Q 0.635 -16 H 0.564 -17 E 0.496 -18 L 0.444 -19 L 0.412 -20 E 0.403 -21 K 0.416 -22 A 0.442 -23 A 0.474 -24 R 0.519 -25 L 0.561 -26 E 0.569 -27 R 0.549 -28 G 0.545 -29 P 0.586 -30 P 0.654 -31 P 0.718 -32 R 0.758 -33 G 0.770 -34 D 0.765 -35 P 0.760 -36 E 0.767 -37 A 0.785 -38 V 0.807 -39 G 0.823 -40 R 0.834 -41 R 0.846 -42 A 0.856 -43 V 0.861 -44 A 0.858 -45 G 0.853 -46 D 0.850 -47 G 0.846 -48 G 0.835 -49 S 0.815 -50 C 0.784 -51 S 0.739 -52 G 0.670 -53 C 0.580 -54 W 0.494 -55 C 0.440 -56 W 0.411 -57 R 0.391 -58 R 0.383 -59 L 0.401 -60 F 0.451 -61 R 0.522 -62 G 0.596 -63 P 0.663 -64 R 0.710 -65 R 0.736 -66 K 0.751 -67 K 0.752 -68 L 0.719 -69 R 0.659 -70 Q 0.627 -71 A 0.662 -72 H 0.729 -73 A 0.777 -74 R 0.798 -75 A 0.805 -76 G 0.803 -77 K 0.791 -78 E 0.774 -79 A 0.761 -80 P 0.759 -81 E 0.763 -82 R 0.758 -83 G 0.735 -84 L 0.696 -85 W 0.650 -86 G 0.603 -87 P 0.553 -88 S 0.486 -89 S 0.400 -90 L 0.317 -91 Q 0.264 -92 R 0.250 -93 L 0.252 -94 L 0.246 -95 Q 0.230 -96 R 0.211 -97 L 0.196 -98 A 0.189 -99 T 0.189 -100 W 0.186 -101 R 0.180 -102 R 0.175 -103 R 0.178 -104 Y 0.190 -105 L 0.215 -106 R 0.262 -107 R 0.337 -108 K 0.424 -109 E 0.500 -110 R 0.561 -111 P 0.618 -112 D 0.674 -113 R 0.717 -114 L 0.740 -115 E 0.744 -116 E 0.741 -117 I 0.738 -118 P 0.741 -119 L 0.757 -120 L 0.779 -121 V 0.791 -122 L 0.792 -123 D 0.786 -124 R 0.779 -125 A 0.778 -126 Q 0.785 -127 G 0.799 -128 G 0.819 -129 H 0.837 -130 E 0.848 -131 A 0.849 -132 A 0.839 -133 A 0.826 -134 G 0.820 -135 P 0.828 -136 Q 0.841 -137 S 0.847 -138 S 0.841 -139 V 0.830 -140 P 0.822 -141 G 0.816 -142 R 0.802 -143 P 0.764 -144 A 0.706 -145 Q 0.670 -146 A 0.679 -147 A 0.688 -148 P 0.661 -149 A 0.640 -150 R 0.671 -151 Q 0.733 -152 P 0.781 -153 R 0.810 -154 R 0.832 -155 R 0.849 -156 S 0.859 -157 A 0.862 -158 T 0.858 -159 R 0.847 -160 S 0.833 -161 R 0.820 -162 S 0.813 -163 P 0.811 -164 V 0.804 -165 A 0.792 -166 P 0.784 -167 P 0.790 -168 V 0.805 -169 H 0.813 -170 A 0.809 -171 Q 0.793 -172 D 0.771 -173 C 0.749 -174 F 0.737 -175 F 0.735 -176 L 0.737 -177 F 0.736 -178 G 0.730 -179 Q 0.714 -180 Q 0.676 -181 K 0.613 -182 Q 0.558 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000284188.3_ENST00000640271.3_GN:C1orf202_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000284188.3_ENST00000640271.3_GN:C1orf202_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid deleted file mode 100644 index f25d29611443fdec42f5d1c89ded4443a6f1c560..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000284188.3_ENST00000640271.3_GN:C1orf202_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:13.caid +++ /dev/null @@ -1,196 +0,0 @@ ->ENSG00000284188.3|ENST00000640271.3|GN:C1orf202|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:13 -1 M 0.483 -2 W 0.532 -3 A 0.602 -4 P 0.661 -5 R 0.697 -6 S 0.713 -7 E 0.718 -8 K 0.725 -9 R 0.743 -10 P 0.770 -11 A 0.801 -12 R 0.823 -13 A 0.830 -14 M 0.824 -15 A 0.812 -16 A 0.801 -17 P 0.796 -18 R 0.800 -19 F 0.803 -20 G 0.798 -21 G 0.789 -22 P 0.788 -23 R 0.793 -24 R 0.796 -25 G 0.789 -26 G 0.771 -27 A 0.741 -28 Q 0.698 -29 H 0.644 -30 E 0.590 -31 L 0.547 -32 L 0.514 -33 E 0.497 -34 K 0.500 -35 A 0.515 -36 A 0.536 -37 R 0.565 -38 L 0.594 -39 E 0.591 -40 R 0.562 -41 G 0.552 -42 P 0.592 -43 P 0.662 -44 P 0.727 -45 R 0.767 -46 G 0.778 -47 D 0.773 -48 P 0.770 -49 E 0.778 -50 A 0.798 -51 V 0.821 -52 G 0.839 -53 R 0.850 -54 R 0.861 -55 A 0.870 -56 V 0.872 -57 A 0.868 -58 G 0.862 -59 D 0.858 -60 G 0.854 -61 G 0.843 -62 S 0.822 -63 C 0.791 -64 S 0.745 -65 G 0.674 -66 C 0.582 -67 W 0.498 -68 C 0.444 -69 W 0.415 -70 R 0.392 -71 R 0.378 -72 L 0.392 -73 F 0.440 -74 R 0.509 -75 G 0.584 -76 P 0.651 -77 R 0.696 -78 R 0.719 -79 K 0.732 -80 K 0.733 -81 L 0.700 -82 R 0.641 -83 Q 0.609 -84 A 0.644 -85 H 0.712 -86 A 0.762 -87 R 0.786 -88 A 0.795 -89 G 0.793 -90 K 0.781 -91 E 0.763 -92 A 0.751 -93 P 0.751 -94 E 0.756 -95 R 0.753 -96 G 0.731 -97 L 0.691 -98 W 0.642 -99 G 0.592 -100 P 0.540 -101 S 0.473 -102 S 0.388 -103 L 0.304 -104 Q 0.248 -105 R 0.229 -106 L 0.226 -107 L 0.219 -108 Q 0.205 -109 R 0.190 -110 L 0.179 -111 A 0.175 -112 T 0.176 -113 W 0.176 -114 R 0.170 -115 R 0.166 -116 R 0.170 -117 Y 0.184 -118 L 0.210 -119 R 0.257 -120 R 0.330 -121 K 0.416 -122 E 0.493 -123 R 0.558 -124 P 0.618 -125 D 0.677 -126 R 0.724 -127 L 0.749 -128 E 0.755 -129 E 0.752 -130 I 0.749 -131 P 0.753 -132 L 0.769 -133 L 0.789 -134 V 0.800 -135 L 0.798 -136 D 0.790 -137 R 0.782 -138 A 0.779 -139 Q 0.786 -140 G 0.801 -141 G 0.821 -142 H 0.840 -143 E 0.851 -144 A 0.853 -145 A 0.845 -146 A 0.833 -147 G 0.827 -148 P 0.834 -149 Q 0.846 -150 S 0.852 -151 S 0.846 -152 V 0.834 -153 P 0.826 -154 G 0.819 -155 R 0.804 -156 P 0.763 -157 A 0.701 -158 Q 0.663 -159 A 0.674 -160 A 0.686 -161 P 0.660 -162 A 0.640 -163 R 0.673 -164 Q 0.736 -165 P 0.787 -166 R 0.817 -167 R 0.838 -168 R 0.853 -169 S 0.861 -170 A 0.864 -171 T 0.859 -172 R 0.848 -173 S 0.834 -174 R 0.820 -175 S 0.813 -176 P 0.811 -177 V 0.804 -178 A 0.791 -179 P 0.783 -180 P 0.789 -181 V 0.804 -182 H 0.813 -183 A 0.810 -184 Q 0.795 -185 D 0.774 -186 C 0.753 -187 F 0.741 -188 F 0.739 -189 L 0.740 -190 F 0.738 -191 G 0.730 -192 Q 0.714 -193 Q 0.676 -194 K 0.613 -195 Q 0.558 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000285480.2_ENST00000644661.2_GN:H2BK1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000285480.2_ENST00000644661.2_GN:H2BK1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 22a05b3c1dfdf2747f5b721f5d0a2988ed100f8b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000285480.2_ENST00000644661.2_GN:H2BK1_species:homo_sapiens_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,123 +0,0 @@ ->ENSG00000285480.2|ENST00000644661.2|GN:H2BK1|species:homo_sapiens|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.482 -2 S 0.516 -3 A 0.559 -4 E 0.583 -5 Y 0.573 -6 G 0.540 -7 Q 0.526 -8 R 0.557 -9 Q 0.611 -10 Q 0.655 -11 P 0.686 -12 G 0.709 -13 G 0.721 -14 R 0.726 -15 G 0.728 -16 G 0.726 -17 R 0.718 -18 S 0.712 -19 S 0.707 -20 G 0.701 -21 N 0.688 -22 K 0.672 -23 K 0.660 -24 S 0.654 -25 K 0.648 -26 K 0.637 -27 R 0.620 -28 C 0.591 -29 R 0.544 -30 R 0.477 -31 K 0.393 -32 E 0.297 -33 S 0.206 -34 Y 0.133 -35 S 0.083 -36 M 0.054 -37 Y 0.042 -38 I 0.040 -39 Y 0.048 -40 K 0.065 -41 V 0.084 -42 L 0.095 -43 K 0.101 -44 Q 0.112 -45 V 0.128 -46 H 0.144 -47 P 0.162 -48 D 0.186 -49 I 0.202 -50 G 0.196 -51 I 0.171 -52 S 0.142 -53 A 0.124 -54 K 0.121 -55 A 0.121 -56 M 0.117 -57 S 0.114 -58 I 0.114 -59 M 0.118 -60 N 0.128 -61 S 0.149 -62 F 0.171 -63 V 0.184 -64 N 0.181 -65 D 0.166 -66 V 0.146 -67 F 0.126 -68 E 0.107 -69 Q 0.093 -70 L 0.086 -71 A 0.083 -72 C 0.074 -73 E 0.063 -74 A 0.061 -75 A 0.068 -76 R 0.073 -77 L 0.070 -78 A 0.067 -79 Q 0.074 -80 Y 0.089 -81 S 0.102 -82 G 0.108 -83 R 0.111 -84 T 0.120 -85 T 0.132 -86 L 0.129 -87 T 0.107 -88 S 0.080 -89 R 0.063 -90 E 0.056 -91 V 0.054 -92 Q 0.054 -93 T 0.051 -94 A 0.046 -95 V 0.045 -96 R 0.053 -97 L 0.069 -98 L 0.090 -99 L 0.105 -100 P 0.107 -101 G 0.104 -102 E 0.101 -103 L 0.097 -104 A 0.089 -105 K 0.081 -106 H 0.082 -107 A 0.092 -108 V 0.109 -109 S 0.126 -110 E 0.137 -111 G 0.140 -112 T 0.141 -113 K 0.142 -114 A 0.141 -115 V 0.135 -116 T 0.126 -117 K 0.125 -118 Y 0.139 -119 T 0.173 -120 S 0.218 -121 S 0.254 -122 K 0.272 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000285480.2_ENST00000644661.2_GN:H2BK1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:29.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000285480.2_ENST00000644661.2_GN:H2BK1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:29.caid deleted file mode 100644 index e6f126c3254ccf9ae96b4985ca71302a420f09a8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSG00000285480.2_ENST00000644661.2_GN:H2BK1_species:homo_sapiens_type:n_terminal_n_term:29.caid +++ /dev/null @@ -1,152 +0,0 @@ ->ENSG00000285480.2|ENST00000644661.2|GN:H2BK1|species:homo_sapiens|type:n_terminal|n_term:29 -1 M 0.462 -2 S 0.496 -3 P 0.541 -4 A 0.579 -5 T 0.613 -6 P 0.643 -7 G 0.656 -8 G 0.640 -9 A 0.608 -10 A 0.590 -11 D 0.595 -12 L 0.612 -13 I 0.643 -14 K 0.686 -15 S 0.725 -16 S 0.744 -17 S 0.749 -18 K 0.750 -19 G 0.750 -20 V 0.749 -21 G 0.745 -22 E 0.735 -23 G 0.716 -24 Y 0.694 -25 S 0.674 -26 R 0.649 -27 S 0.605 -28 R 0.547 -29 R 0.519 -30 M 0.549 -31 S 0.611 -32 A 0.660 -33 E 0.687 -34 Y 0.707 -35 G 0.725 -36 Q 0.733 -37 R 0.731 -38 Q 0.727 -39 Q 0.728 -40 P 0.737 -41 G 0.751 -42 G 0.764 -43 R 0.772 -44 G 0.775 -45 G 0.774 -46 R 0.771 -47 S 0.769 -48 S 0.766 -49 G 0.758 -50 N 0.744 -51 K 0.726 -52 K 0.712 -53 S 0.704 -54 K 0.697 -55 K 0.685 -56 R 0.665 -57 C 0.630 -58 R 0.573 -59 R 0.494 -60 K 0.399 -61 E 0.298 -62 S 0.206 -63 Y 0.134 -64 S 0.084 -65 M 0.054 -66 Y 0.041 -67 I 0.039 -68 Y 0.048 -69 K 0.066 -70 V 0.087 -71 L 0.099 -72 K 0.105 -73 Q 0.115 -74 V 0.129 -75 H 0.142 -76 P 0.158 -77 D 0.180 -78 I 0.196 -79 G 0.191 -80 I 0.165 -81 S 0.137 -82 A 0.121 -83 K 0.120 -84 A 0.122 -85 M 0.118 -86 S 0.115 -87 I 0.116 -88 M 0.118 -89 N 0.127 -90 S 0.145 -91 F 0.166 -92 V 0.178 -93 N 0.176 -94 D 0.161 -95 V 0.142 -96 F 0.125 -97 E 0.107 -98 Q 0.092 -99 L 0.085 -100 A 0.082 -101 C 0.073 -102 E 0.062 -103 A 0.058 -104 A 0.063 -105 R 0.067 -106 L 0.065 -107 A 0.065 -108 Q 0.073 -109 Y 0.087 -110 S 0.100 -111 G 0.106 -112 R 0.109 -113 T 0.119 -114 T 0.131 -115 L 0.129 -116 T 0.106 -117 S 0.080 -118 R 0.063 -119 E 0.056 -120 V 0.054 -121 Q 0.053 -122 T 0.050 -123 A 0.046 -124 V 0.045 -125 R 0.052 -126 L 0.069 -127 L 0.090 -128 L 0.106 -129 P 0.109 -130 G 0.105 -131 E 0.101 -132 L 0.097 -133 A 0.089 -134 K 0.081 -135 H 0.082 -136 A 0.092 -137 V 0.109 -138 S 0.126 -139 E 0.137 -140 G 0.140 -141 T 0.140 -142 K 0.141 -143 A 0.137 -144 V 0.127 -145 T 0.116 -146 K 0.117 -147 Y 0.136 -148 T 0.174 -149 S 0.220 -150 S 0.256 -151 K 0.273 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000002033.15_ENSMUST00000002101.12_GN:Cd3g_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000002033.15_ENSMUST00000002101.12_GN:Cd3g_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index b5332c544e7979fc0956c610736cf3b4732b3540..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000002033.15_ENSMUST00000002101.12_GN:Cd3g_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,183 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000002033.15|ENSMUST00000002101.12|GN:Cd3g|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.448 -2 E 0.462 -3 Q 0.484 -4 R 0.511 -5 K 0.538 -6 G 0.552 -7 L 0.543 -8 A 0.515 -9 G 0.461 -10 L 0.383 -11 F 0.312 -12 L 0.279 -13 V 0.282 -14 I 0.301 -15 S 0.329 -16 L 0.377 -17 L 0.442 -18 Q 0.510 -19 G 0.566 -20 T 0.608 -21 V 0.638 -22 A 0.650 -23 Q 0.642 -24 T 0.613 -25 N 0.559 -26 K 0.478 -27 A 0.379 -28 K 0.276 -29 N 0.184 -30 L 0.120 -31 V 0.089 -32 Q 0.085 -33 V 0.096 -34 D 0.108 -35 G 0.115 -36 S 0.122 -37 R 0.130 -38 G 0.136 -39 D 0.133 -40 G 0.116 -41 S 0.090 -42 V 0.064 -43 L 0.047 -44 L 0.039 -45 T 0.037 -46 C 0.040 -47 G 0.046 -48 L 0.053 -49 T 0.063 -50 D 0.069 -51 K 0.067 -52 T 0.058 -53 I 0.046 -54 K 0.040 -55 W 0.042 -56 L 0.051 -57 K 0.060 -58 D 0.066 -59 G 0.066 -60 S 0.062 -61 I 0.055 -62 I 0.050 -63 S 0.050 -64 P 0.060 -65 L 0.073 -66 N 0.081 -67 A 0.079 -68 T 0.068 -69 K 0.054 -70 N 0.044 -71 T 0.043 -72 W 0.050 -73 N 0.061 -74 L 0.072 -75 G 0.082 -76 N 0.086 -77 N 0.084 -78 A 0.079 -79 K 0.077 -80 D 0.078 -81 P 0.082 -82 R 0.085 -83 G 0.078 -84 T 0.061 -85 Y 0.043 -86 Q 0.038 -87 C 0.048 -88 Q 0.066 -89 G 0.079 -90 A 0.081 -91 K 0.078 -92 E 0.072 -93 T 0.067 -94 S 0.063 -95 N 0.063 -96 P 0.062 -97 L 0.060 -98 Q 0.055 -99 V 0.052 -100 Y 0.060 -101 Y 0.086 -102 R 0.127 -103 M 0.176 -104 C 0.224 -105 E 0.267 -106 N 0.304 -107 C 0.336 -108 I 0.357 -109 E 0.351 -110 L 0.315 -111 N 0.266 -112 I 0.226 -113 G 0.205 -114 T 0.199 -115 I 0.200 -116 S 0.205 -117 G 0.216 -118 F 0.230 -119 I 0.240 -120 F 0.239 -121 A 0.229 -122 E 0.214 -123 V 0.199 -124 I 0.190 -125 S 0.183 -126 I 0.172 -127 F 0.154 -128 F 0.134 -129 L 0.120 -130 A 0.112 -131 L 0.114 -132 G 0.121 -133 V 0.125 -134 Y 0.131 -135 L 0.154 -136 I 0.197 -137 A 0.250 -138 G 0.306 -139 Q 0.366 -140 D 0.425 -141 G 0.462 -142 V 0.456 -143 R 0.424 -144 Q 0.407 -145 S 0.419 -146 R 0.440 -147 A 0.458 -148 S 0.474 -149 D 0.469 -150 K 0.440 -151 Q 0.421 -152 T 0.436 -153 L 0.468 -154 L 0.497 -155 Q 0.530 -156 N 0.559 -157 E 0.573 -158 Q 0.573 -159 L 0.572 -160 Y 0.576 -161 Q 0.589 -162 P 0.615 -163 L 0.643 -164 K 0.653 -165 D 0.639 -166 R 0.618 -167 E 0.610 -168 Y 0.611 -169 D 0.608 -170 Q 0.596 -171 Y 0.589 -172 S 0.603 -173 H 0.639 -174 L 0.680 -175 Q 0.714 -176 G 0.731 -177 N 0.732 -178 Q 0.717 -179 L 0.686 -180 R 0.629 -181 K 0.552 -182 K 0.491 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000002033.15_ENSMUST00000002101.12_GN:Cd3g_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:37.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000002033.15_ENSMUST00000002101.12_GN:Cd3g_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:37.caid deleted file mode 100644 index ab14242f87a99718bcaa09f985e15961071c7db6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000002033.15_ENSMUST00000002101.12_GN:Cd3g_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:37.caid +++ /dev/null @@ -1,220 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000002033.15|ENSMUST00000002101.12|GN:Cd3g|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:37 -1 M 0.428 -2 H 0.467 -3 A 0.522 -4 G 0.559 -5 W 0.568 -6 S 0.578 -7 Q 0.609 -8 A 0.643 -9 S 0.650 -10 C 0.638 -11 C 0.637 -12 T 0.656 -13 G 0.675 -14 C 0.685 -15 L 0.689 -16 G 0.691 -17 G 0.681 -18 W 0.657 -19 V 0.630 -20 A 0.612 -21 G 0.601 -22 W 0.588 -23 L 0.577 -24 R 0.575 -25 D 0.563 -26 S 0.522 -27 Q 0.464 -28 Y 0.418 -29 F 0.402 -30 Y 0.414 -31 W 0.445 -32 R 0.492 -33 S 0.547 -34 K 0.596 -35 E 0.629 -36 T 0.644 -37 D 0.643 -38 M 0.637 -39 E 0.635 -40 Q 0.640 -41 R 0.648 -42 K 0.657 -43 G 0.661 -44 L 0.650 -45 A 0.617 -46 G 0.553 -47 L 0.458 -48 F 0.361 -49 L 0.296 -50 V 0.276 -51 I 0.289 -52 S 0.326 -53 L 0.382 -54 L 0.455 -55 Q 0.530 -56 G 0.594 -57 T 0.638 -58 V 0.665 -59 A 0.675 -60 Q 0.664 -61 T 0.630 -62 N 0.565 -63 K 0.474 -64 A 0.369 -65 K 0.263 -66 N 0.173 -67 L 0.113 -68 V 0.086 -69 Q 0.082 -70 V 0.092 -71 D 0.104 -72 G 0.112 -73 S 0.118 -74 R 0.127 -75 G 0.133 -76 D 0.128 -77 G 0.110 -78 S 0.084 -79 V 0.060 -80 L 0.044 -81 L 0.037 -82 T 0.035 -83 C 0.037 -84 G 0.042 -85 L 0.049 -86 T 0.057 -87 D 0.062 -88 K 0.061 -89 T 0.052 -90 I 0.042 -91 K 0.037 -92 W 0.039 -93 L 0.048 -94 K 0.058 -95 D 0.063 -96 G 0.064 -97 S 0.060 -98 I 0.053 -99 I 0.048 -100 S 0.049 -101 P 0.059 -102 L 0.072 -103 N 0.082 -104 A 0.080 -105 T 0.069 -106 K 0.054 -107 N 0.043 -108 T 0.042 -109 W 0.048 -110 N 0.057 -111 L 0.068 -112 G 0.076 -113 N 0.080 -114 N 0.080 -115 A 0.077 -116 K 0.078 -117 D 0.081 -118 P 0.086 -119 R 0.088 -120 G 0.081 -121 T 0.062 -122 Y 0.043 -123 Q 0.037 -124 C 0.048 -125 Q 0.066 -126 G 0.079 -127 A 0.082 -128 K 0.078 -129 E 0.073 -130 T 0.067 -131 S 0.063 -132 N 0.062 -133 P 0.061 -134 L 0.058 -135 Q 0.054 -136 V 0.052 -137 Y 0.059 -138 Y 0.083 -139 R 0.123 -140 M 0.172 -141 C 0.223 -142 E 0.269 -143 N 0.310 -144 C 0.350 -145 I 0.376 -146 E 0.369 -147 L 0.326 -148 N 0.270 -149 I 0.226 -150 G 0.203 -151 T 0.196 -152 I 0.195 -153 S 0.201 -154 G 0.212 -155 F 0.226 -156 I 0.234 -157 F 0.232 -158 A 0.223 -159 E 0.210 -160 V 0.198 -161 I 0.190 -162 S 0.185 -163 I 0.174 -164 F 0.155 -165 F 0.133 -166 L 0.117 -167 A 0.110 -168 L 0.113 -169 G 0.121 -170 V 0.126 -171 Y 0.134 -172 L 0.160 -173 I 0.206 -174 A 0.262 -175 G 0.319 -176 Q 0.378 -177 D 0.437 -178 G 0.475 -179 V 0.469 -180 R 0.437 -181 Q 0.421 -182 S 0.435 -183 R 0.459 -184 A 0.480 -185 S 0.495 -186 D 0.488 -187 K 0.456 -188 Q 0.436 -189 T 0.454 -190 L 0.490 -191 L 0.523 -192 Q 0.554 -193 N 0.579 -194 E 0.587 -195 Q 0.584 -196 L 0.582 -197 Y 0.586 -198 Q 0.598 -199 P 0.622 -200 L 0.649 -201 K 0.660 -202 D 0.646 -203 R 0.625 -204 E 0.616 -205 Y 0.617 -206 D 0.616 -207 Q 0.605 -208 Y 0.597 -209 S 0.609 -210 H 0.642 -211 L 0.683 -212 Q 0.718 -213 G 0.735 -214 N 0.734 -215 Q 0.717 -216 L 0.685 -217 R 0.630 -218 K 0.555 -219 K 0.495 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000002064.11_ENSMUST00000002133.9_GN:Sdf2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000002064.11_ENSMUST00000002133.9_GN:Sdf2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index f43fb9fb472a249fe6ccfd7552ba21190bb6467d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000002064.11_ENSMUST00000002133.9_GN:Sdf2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,212 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000002064.11|ENSMUST00000002133.9|GN:Sdf2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.329 -2 A 0.326 -3 V 0.334 -4 L 0.350 -5 S 0.347 -6 L 0.330 -7 L 0.348 -8 L 0.416 -9 L 0.496 -10 G 0.550 -11 G 0.568 -12 L 0.556 -13 W 0.536 -14 S 0.536 -15 A 0.557 -16 V 0.579 -17 G 0.585 -18 A 0.571 -19 S 0.530 -20 N 0.456 -21 M 0.357 -22 A 0.251 -23 V 0.158 -24 V 0.094 -25 T 0.058 -26 C 0.041 -27 G 0.037 -28 S 0.040 -29 V 0.042 -30 V 0.044 -31 K 0.047 -32 L 0.056 -33 L 0.071 -34 N 0.081 -35 T 0.081 -36 R 0.077 -37 H 0.076 -38 N 0.078 -39 V 0.080 -40 R 0.082 -41 L 0.089 -42 H 0.102 -43 S 0.117 -44 H 0.129 -45 D 0.138 -46 V 0.146 -47 R 0.151 -48 Y 0.151 -49 G 0.150 -50 S 0.148 -51 G 0.153 -52 S 0.166 -53 G 0.179 -54 Q 0.181 -55 Q 0.174 -56 S 0.165 -57 V 0.154 -58 T 0.137 -59 G 0.117 -60 V 0.102 -61 T 0.092 -62 S 0.087 -63 V 0.087 -64 D 0.090 -65 D 0.094 -66 S 0.096 -67 N 0.089 -68 S 0.071 -69 Y 0.051 -70 W 0.040 -71 R 0.043 -72 I 0.060 -73 R 0.088 -74 G 0.120 -75 K 0.143 -76 T 0.148 -77 A 0.140 -78 T 0.128 -79 V 0.116 -80 C 0.101 -81 E 0.086 -82 R 0.077 -83 G 0.078 -84 T 0.085 -85 P 0.086 -86 I 0.079 -87 K 0.067 -88 C 0.060 -89 G 0.060 -90 Q 0.062 -91 P 0.064 -92 I 0.066 -93 R 0.072 -94 L 0.084 -95 T 0.097 -96 H 0.103 -97 I 0.098 -98 N 0.096 -99 T 0.102 -100 G 0.107 -101 R 0.102 -102 N 0.093 -103 L 0.090 -104 H 0.098 -105 S 0.110 -106 H 0.117 -107 H 0.119 -108 F 0.120 -109 T 0.121 -110 S 0.117 -111 P 0.107 -112 L 0.100 -113 S 0.102 -114 G 0.110 -115 N 0.116 -116 Q 0.118 -117 E 0.120 -118 V 0.120 -119 S 0.115 -120 A 0.111 -121 F 0.115 -122 G 0.124 -123 E 0.134 -124 E 0.146 -125 G 0.159 -126 E 0.168 -127 G 0.164 -128 D 0.147 -129 Y 0.124 -130 L 0.100 -131 D 0.074 -132 D 0.050 -133 W 0.036 -134 T 0.034 -135 V 0.041 -136 L 0.053 -137 C 0.064 -138 N 0.068 -139 G 0.062 -140 P 0.054 -141 Y 0.050 -142 W 0.049 -143 V 0.050 -144 R 0.053 -145 D 0.059 -146 G 0.065 -147 E 0.069 -148 V 0.069 -149 R 0.069 -150 F 0.076 -151 K 0.091 -152 H 0.103 -153 S 0.100 -154 S 0.087 -155 T 0.077 -156 D 0.072 -157 V 0.069 -158 L 0.065 -159 L 0.063 -160 S 0.067 -161 V 0.082 -162 T 0.107 -163 G 0.134 -164 E 0.152 -165 Q 0.153 -166 Y 0.145 -167 G 0.137 -168 R 0.135 -169 P 0.133 -170 I 0.129 -171 S 0.127 -172 G 0.126 -173 Q 0.123 -174 K 0.119 -175 E 0.119 -176 V 0.119 -177 H 0.111 -178 G 0.097 -179 M 0.090 -180 A 0.095 -181 Q 0.106 -182 P 0.112 -183 S 0.106 -184 Q 0.090 -185 N 0.071 -186 N 0.054 -187 Y 0.041 -188 W 0.034 -189 K 0.034 -190 A 0.042 -191 M 0.058 -192 E 0.079 -193 G 0.097 -194 I 0.111 -195 F 0.125 -196 M 0.147 -197 K 0.174 -198 P 0.196 -199 S 0.208 -200 E 0.217 -201 L 0.236 -202 L 0.271 -203 R 0.324 -204 A 0.389 -205 E 0.443 -206 V 0.470 -207 H 0.478 -208 H 0.483 -209 A 0.473 -210 E 0.439 -211 L 0.403 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000002064.11_ENSMUST00000002133.9_GN:Sdf2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000002064.11_ENSMUST00000002133.9_GN:Sdf2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid deleted file mode 100644 index 6b88945f9086ba475a7ef03fcbbd591add6a3554..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000002064.11_ENSMUST00000002133.9_GN:Sdf2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid +++ /dev/null @@ -1,220 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000002064.11|ENSMUST00000002133.9|GN:Sdf2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:8 -1 M 0.420 -2 I 0.435 -3 S 0.466 -4 S 0.503 -5 L 0.519 -6 G 0.505 -7 S 0.485 -8 R 0.471 -9 M 0.434 -10 A 0.377 -11 V 0.355 -12 L 0.374 -13 S 0.387 -14 L 0.384 -15 L 0.407 -16 L 0.466 -17 L 0.532 -18 G 0.578 -19 G 0.596 -20 L 0.589 -21 W 0.576 -22 S 0.578 -23 A 0.594 -24 V 0.606 -25 G 0.603 -26 A 0.583 -27 S 0.539 -28 N 0.461 -29 M 0.358 -30 A 0.249 -31 V 0.155 -32 V 0.091 -33 T 0.056 -34 C 0.041 -35 G 0.037 -36 S 0.040 -37 V 0.042 -38 V 0.044 -39 K 0.047 -40 L 0.056 -41 L 0.071 -42 N 0.081 -43 T 0.081 -44 R 0.076 -45 H 0.075 -46 N 0.077 -47 V 0.078 -48 R 0.081 -49 L 0.088 -50 H 0.101 -51 S 0.116 -52 H 0.128 -53 D 0.138 -54 V 0.146 -55 R 0.150 -56 Y 0.151 -57 G 0.149 -58 S 0.147 -59 G 0.151 -60 S 0.163 -61 G 0.176 -62 Q 0.178 -63 Q 0.171 -64 S 0.163 -65 V 0.151 -66 T 0.133 -67 G 0.113 -68 V 0.098 -69 T 0.088 -70 S 0.084 -71 V 0.083 -72 D 0.086 -73 D 0.091 -74 S 0.094 -75 N 0.087 -76 S 0.069 -77 Y 0.050 -78 W 0.039 -79 R 0.043 -80 I 0.059 -81 R 0.087 -82 G 0.119 -83 K 0.142 -84 T 0.147 -85 A 0.139 -86 T 0.127 -87 V 0.115 -88 C 0.100 -89 E 0.086 -90 R 0.077 -91 G 0.078 -92 T 0.084 -93 P 0.085 -94 I 0.078 -95 K 0.067 -96 C 0.060 -97 G 0.059 -98 Q 0.062 -99 P 0.063 -100 I 0.065 -101 R 0.070 -102 L 0.082 -103 T 0.096 -104 H 0.101 -105 I 0.097 -106 N 0.094 -107 T 0.101 -108 G 0.106 -109 R 0.102 -110 N 0.093 -111 L 0.092 -112 H 0.101 -113 S 0.113 -114 H 0.120 -115 H 0.121 -116 F 0.122 -117 T 0.123 -118 S 0.120 -119 P 0.110 -120 L 0.102 -121 S 0.104 -122 G 0.112 -123 N 0.118 -124 Q 0.121 -125 E 0.123 -126 V 0.123 -127 S 0.119 -128 A 0.115 -129 F 0.119 -130 G 0.128 -131 E 0.138 -132 E 0.150 -133 G 0.164 -134 E 0.173 -135 G 0.169 -136 D 0.151 -137 Y 0.127 -138 L 0.102 -139 D 0.076 -140 D 0.051 -141 W 0.037 -142 T 0.034 -143 V 0.041 -144 L 0.053 -145 C 0.064 -146 N 0.068 -147 G 0.062 -148 P 0.054 -149 Y 0.051 -150 W 0.050 -151 V 0.050 -152 R 0.053 -153 D 0.059 -154 G 0.065 -155 E 0.069 -156 V 0.070 -157 R 0.069 -158 F 0.076 -159 K 0.091 -160 H 0.103 -161 S 0.100 -162 S 0.087 -163 T 0.076 -164 D 0.071 -165 V 0.068 -166 L 0.065 -167 L 0.063 -168 S 0.067 -169 V 0.082 -170 T 0.107 -171 G 0.134 -172 E 0.152 -173 Q 0.154 -174 Y 0.145 -175 G 0.137 -176 R 0.134 -177 P 0.132 -178 I 0.129 -179 S 0.128 -180 G 0.127 -181 Q 0.124 -182 K 0.120 -183 E 0.120 -184 V 0.120 -185 H 0.111 -186 G 0.097 -187 M 0.089 -188 A 0.094 -189 Q 0.104 -190 P 0.109 -191 S 0.103 -192 Q 0.088 -193 N 0.069 -194 N 0.052 -195 Y 0.040 -196 W 0.033 -197 K 0.033 -198 A 0.042 -199 M 0.058 -200 E 0.078 -201 G 0.096 -202 I 0.109 -203 F 0.123 -204 M 0.144 -205 K 0.172 -206 P 0.194 -207 S 0.205 -208 E 0.214 -209 L 0.234 -210 L 0.271 -211 R 0.326 -212 A 0.392 -213 E 0.447 -214 V 0.474 -215 H 0.483 -216 H 0.488 -217 A 0.477 -218 E 0.441 -219 L 0.404 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000002550.17_ENSMUST00000002625.15_GN:Uck1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000002550.17_ENSMUST00000002625.15_GN:Uck1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 6a8582e5697dbaf827cb1ae07f4e4868da89d264..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000002550.17_ENSMUST00000002625.15_GN:Uck1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,284 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000002550.17|ENSMUST00000002625.15|GN:Uck1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.370 -2 S 0.396 -3 V 0.443 -4 A 0.500 -5 P 0.553 -6 D 0.587 -7 M 0.588 -8 A 0.551 -9 S 0.504 -10 A 0.504 -11 G 0.569 -12 G 0.649 -13 G 0.696 -14 G 0.705 -15 S 0.696 -16 E 0.683 -17 S 0.671 -18 A 0.658 -19 A 0.643 -20 P 0.630 -21 E 0.618 -22 A 0.596 -23 D 0.558 -24 R 0.510 -25 P 0.456 -26 Q 0.393 -27 P 0.315 -28 R 0.231 -29 P 0.157 -30 F 0.105 -31 L 0.081 -32 I 0.079 -33 G 0.087 -34 V 0.098 -35 S 0.109 -36 G 0.117 -37 G 0.116 -38 T 0.109 -39 A 0.101 -40 S 0.098 -41 G 0.094 -42 K 0.085 -43 S 0.075 -44 T 0.072 -45 V 0.078 -46 C 0.082 -47 E 0.082 -48 K 0.085 -49 I 0.092 -50 M 0.095 -51 E 0.092 -52 L 0.090 -53 L 0.095 -54 G 0.103 -55 Q 0.109 -56 N 0.113 -57 E 0.111 -58 V 0.102 -59 D 0.091 -60 R 0.084 -61 R 0.087 -62 Q 0.092 -63 R 0.088 -64 K 0.075 -65 L 0.063 -66 V 0.058 -67 I 0.058 -68 L 0.059 -69 S 0.061 -70 Q 0.064 -71 D 0.071 -72 C 0.078 -73 F 0.082 -74 Y 0.081 -75 K 0.082 -76 V 0.085 -77 L 0.085 -78 T 0.078 -79 A 0.068 -80 E 0.062 -81 Q 0.064 -82 K 0.076 -83 A 0.092 -84 K 0.107 -85 A 0.124 -86 L 0.140 -87 K 0.153 -88 G 0.161 -89 Q 0.165 -90 Y 0.161 -91 N 0.144 -92 F 0.119 -93 D 0.098 -94 H 0.091 -95 P 0.094 -96 D 0.099 -97 A 0.101 -98 F 0.094 -99 D 0.078 -100 N 0.060 -101 D 0.047 -102 L 0.043 -103 M 0.049 -104 H 0.061 -105 K 0.069 -106 T 0.066 -107 L 0.058 -108 K 0.053 -109 N 0.052 -110 I 0.055 -111 V 0.063 -112 E 0.077 -113 G 0.091 -114 K 0.096 -115 T 0.095 -116 V 0.095 -117 E 0.095 -118 V 0.093 -119 P 0.087 -120 T 0.072 -121 Y 0.054 -122 D 0.042 -123 F 0.040 -124 V 0.049 -125 T 0.061 -126 H 0.071 -127 S 0.080 -128 R 0.086 -129 L 0.093 -130 P 0.099 -131 E 0.105 -132 T 0.103 -133 T 0.093 -134 V 0.080 -135 V 0.070 -136 Y 0.065 -137 P 0.065 -138 A 0.070 -139 D 0.083 -140 V 0.096 -141 V 0.105 -142 L 0.111 -143 F 0.116 -144 E 0.116 -145 G 0.110 -146 I 0.103 -147 L 0.102 -148 V 0.098 -149 F 0.086 -150 Y 0.072 -151 T 0.062 -152 Q 0.056 -153 E 0.053 -154 I 0.051 -155 R 0.054 -156 D 0.063 -157 M 0.074 -158 F 0.078 -159 H 0.070 -160 L 0.059 -161 R 0.055 -162 L 0.060 -163 F 0.069 -164 V 0.078 -165 D 0.083 -166 T 0.084 -167 D 0.082 -168 S 0.078 -169 D 0.074 -170 V 0.071 -171 R 0.070 -172 L 0.072 -173 S 0.074 -174 R 0.074 -175 R 0.073 -176 V 0.070 -177 L 0.067 -178 R 0.063 -179 D 0.061 -180 V 0.063 -181 Q 0.073 -182 R 0.088 -183 G 0.099 -184 R 0.102 -185 D 0.098 -186 L 0.092 -187 E 0.089 -188 Q 0.089 -189 I 0.088 -190 L 0.085 -191 T 0.086 -192 Q 0.092 -193 Y 0.094 -194 T 0.089 -195 A 0.083 -196 F 0.083 -197 V 0.084 -198 K 0.078 -199 P 0.067 -200 A 0.059 -201 F 0.057 -202 E 0.057 -203 E 0.056 -204 F 0.054 -205 C 0.051 -206 L 0.051 -207 P 0.055 -208 T 0.063 -209 K 0.073 -210 K 0.085 -211 Y 0.097 -212 A 0.103 -213 D 0.105 -214 V 0.111 -215 I 0.120 -216 I 0.126 -217 P 0.120 -218 R 0.109 -219 G 0.103 -220 V 0.103 -221 D 0.103 -222 N 0.095 -223 M 0.081 -224 V 0.068 -225 A 0.061 -226 I 0.057 -227 N 0.054 -228 L 0.056 -229 I 0.062 -230 V 0.071 -231 Q 0.074 -232 H 0.066 -233 I 0.054 -234 Q 0.048 -235 D 0.052 -236 I 0.069 -237 L 0.107 -238 N 0.168 -239 G 0.236 -240 D 0.289 -241 L 0.322 -242 C 0.346 -243 K 0.374 -244 R 0.411 -245 H 0.452 -246 R 0.492 -247 G 0.526 -248 G 0.556 -249 P 0.585 -250 N 0.613 -251 G 0.631 -252 R 0.632 -253 N 0.620 -254 H 0.596 -255 K 0.565 -256 R 0.537 -257 T 0.522 -258 F 0.525 -259 P 0.543 -260 E 0.570 -261 P 0.594 -262 G 0.608 -263 D 0.617 -264 H 0.633 -265 P 0.660 -266 G 0.688 -267 V 0.706 -268 L 0.707 -269 A 0.694 -270 T 0.665 -271 G 0.607 -272 K 0.515 -273 R 0.435 -274 S 0.429 -275 H 0.481 -276 L 0.523 -277 E 0.540 -278 S 0.563 -279 S 0.581 -280 S 0.568 -281 R 0.532 -282 P 0.492 -283 H 0.465 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000002550.17_ENSMUST00000002625.15_GN:Uck1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:29.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000002550.17_ENSMUST00000002625.15_GN:Uck1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:29.caid deleted file mode 100644 index 77138a773fad1fbc34600b62c6c82fdacd3789ec..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000002550.17_ENSMUST00000002625.15_GN:Uck1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:29.caid +++ /dev/null @@ -1,313 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000002550.17|ENSMUST00000002625.15|GN:Uck1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:29 -1 M 0.411 -2 R 0.442 -3 A 0.488 -4 C 0.520 -5 A 0.526 -6 H 0.522 -7 V 0.534 -8 P 0.554 -9 G 0.555 -10 S 0.523 -11 D 0.463 -12 A 0.397 -13 H 0.355 -14 S 0.349 -15 I 0.363 -16 R 0.373 -17 H 0.370 -18 Y 0.363 -19 V 0.368 -20 Q 0.408 -21 A 0.489 -22 G 0.576 -23 A 0.633 -24 G 0.658 -25 R 0.661 -26 V 0.648 -27 G 0.625 -28 E 0.600 -29 C 0.580 -30 M 0.567 -31 S 0.562 -32 V 0.569 -33 A 0.592 -34 P 0.626 -35 D 0.660 -36 M 0.682 -37 A 0.693 -38 S 0.699 -39 A 0.709 -40 G 0.725 -41 G 0.742 -42 G 0.754 -43 G 0.754 -44 S 0.745 -45 E 0.729 -46 S 0.711 -47 A 0.691 -48 A 0.672 -49 P 0.659 -50 E 0.649 -51 A 0.626 -52 D 0.582 -53 R 0.526 -54 P 0.466 -55 Q 0.400 -56 P 0.322 -57 R 0.237 -58 P 0.162 -59 F 0.109 -60 L 0.085 -61 I 0.082 -62 G 0.089 -63 V 0.098 -64 S 0.108 -65 G 0.114 -66 G 0.113 -67 T 0.106 -68 A 0.099 -69 S 0.096 -70 G 0.093 -71 K 0.084 -72 S 0.074 -73 T 0.071 -74 V 0.076 -75 C 0.080 -76 E 0.081 -77 K 0.083 -78 I 0.089 -79 M 0.092 -80 E 0.087 -81 L 0.084 -82 L 0.087 -83 G 0.093 -84 Q 0.099 -85 N 0.102 -86 E 0.101 -87 V 0.094 -88 D 0.083 -89 R 0.078 -90 R 0.082 -91 Q 0.087 -92 R 0.084 -93 K 0.072 -94 L 0.061 -95 V 0.056 -96 I 0.055 -97 L 0.056 -98 S 0.058 -99 Q 0.063 -100 D 0.069 -101 C 0.076 -102 F 0.079 -103 Y 0.078 -104 K 0.078 -105 V 0.080 -106 L 0.081 -107 T 0.074 -108 A 0.065 -109 E 0.059 -110 Q 0.062 -111 K 0.074 -112 A 0.090 -113 K 0.105 -114 A 0.120 -115 L 0.135 -116 K 0.147 -117 G 0.155 -118 Q 0.159 -119 Y 0.156 -120 N 0.140 -121 F 0.116 -122 D 0.096 -123 H 0.090 -124 P 0.094 -125 D 0.100 -126 A 0.103 -127 F 0.095 -128 D 0.079 -129 N 0.060 -130 D 0.046 -131 L 0.042 -132 M 0.048 -133 H 0.060 -134 K 0.068 -135 T 0.065 -136 L 0.057 -137 K 0.052 -138 N 0.052 -139 I 0.054 -140 V 0.063 -141 E 0.078 -142 G 0.094 -143 K 0.100 -144 T 0.098 -145 V 0.096 -146 E 0.095 -147 V 0.093 -148 P 0.086 -149 T 0.071 -150 Y 0.053 -151 D 0.041 -152 F 0.041 -153 V 0.049 -154 T 0.062 -155 H 0.073 -156 S 0.082 -157 R 0.088 -158 L 0.093 -159 P 0.099 -160 E 0.105 -161 T 0.104 -162 T 0.094 -163 V 0.082 -164 V 0.072 -165 Y 0.067 -166 P 0.067 -167 A 0.072 -168 D 0.084 -169 V 0.097 -170 V 0.106 -171 L 0.112 -172 F 0.116 -173 E 0.117 -174 G 0.111 -175 I 0.105 -176 L 0.103 -177 V 0.099 -178 F 0.087 -179 Y 0.073 -180 T 0.062 -181 Q 0.056 -182 E 0.053 -183 I 0.051 -184 R 0.054 -185 D 0.063 -186 M 0.074 -187 F 0.078 -188 H 0.070 -189 L 0.058 -190 R 0.054 -191 L 0.059 -192 F 0.069 -193 V 0.077 -194 D 0.083 -195 T 0.083 -196 D 0.081 -197 S 0.077 -198 D 0.073 -199 V 0.071 -200 R 0.071 -201 L 0.072 -202 S 0.074 -203 R 0.074 -204 R 0.073 -205 V 0.070 -206 L 0.067 -207 R 0.063 -208 D 0.060 -209 V 0.062 -210 Q 0.071 -211 R 0.086 -212 G 0.097 -213 R 0.099 -214 D 0.095 -215 L 0.089 -216 E 0.087 -217 Q 0.087 -218 I 0.086 -219 L 0.083 -220 T 0.084 -221 Q 0.090 -222 Y 0.092 -223 T 0.087 -224 A 0.080 -225 F 0.080 -226 V 0.081 -227 K 0.075 -228 P 0.065 -229 A 0.058 -230 F 0.056 -231 E 0.056 -232 E 0.055 -233 F 0.053 -234 C 0.050 -235 L 0.050 -236 P 0.054 -237 T 0.062 -238 K 0.072 -239 K 0.084 -240 Y 0.096 -241 A 0.103 -242 D 0.105 -243 V 0.111 -244 I 0.122 -245 I 0.128 -246 P 0.122 -247 R 0.109 -248 G 0.102 -249 V 0.102 -250 D 0.102 -251 N 0.095 -252 M 0.081 -253 V 0.068 -254 A 0.061 -255 I 0.057 -256 N 0.054 -257 L 0.055 -258 I 0.062 -259 V 0.071 -260 Q 0.074 -261 H 0.066 -262 I 0.054 -263 Q 0.049 -264 D 0.054 -265 I 0.071 -266 L 0.109 -267 N 0.171 -268 G 0.240 -269 D 0.294 -270 L 0.327 -271 C 0.352 -272 K 0.379 -273 R 0.415 -274 H 0.457 -275 R 0.496 -276 G 0.530 -277 G 0.560 -278 P 0.590 -279 N 0.619 -280 G 0.638 -281 R 0.641 -282 N 0.630 -283 H 0.608 -284 K 0.579 -285 R 0.553 -286 T 0.538 -287 F 0.541 -288 P 0.558 -289 E 0.583 -290 P 0.606 -291 G 0.618 -292 D 0.626 -293 H 0.642 -294 P 0.668 -295 G 0.696 -296 V 0.713 -297 L 0.715 -298 A 0.704 -299 T 0.676 -300 G 0.617 -301 K 0.523 -302 R 0.440 -303 S 0.433 -304 H 0.486 -305 L 0.527 -306 E 0.545 -307 S 0.570 -308 S 0.589 -309 S 0.576 -310 R 0.539 -311 P 0.499 -312 H 0.472 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000004127.13_ENSMUST00000162864.8_GN:Trmt10a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000004127.13_ENSMUST00000162864.8_GN:Trmt10a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 36ea07d51656e3720fc056f0b2b880a835d7c307..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000004127.13_ENSMUST00000162864.8_GN:Trmt10a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,329 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000004127.13|ENSMUST00000162864.8|GN:Trmt10a|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.428 -2 S 0.454 -3 S 0.496 -4 E 0.539 -5 M 0.571 -6 L 0.599 -7 P 0.633 -8 A 0.666 -9 S 0.684 -10 I 0.687 -11 E 0.685 -12 S 0.683 -13 T 0.681 -14 N 0.678 -15 V 0.677 -16 E 0.680 -17 E 0.685 -18 K 0.693 -19 L 0.700 -20 G 0.705 -21 T 0.710 -22 S 0.718 -23 D 0.728 -24 G 0.733 -25 E 0.730 -26 E 0.721 -27 E 0.710 -28 R 0.700 -29 Q 0.699 -30 E 0.709 -31 P 0.725 -32 R 0.741 -33 V 0.751 -34 D 0.748 -35 A 0.725 -36 G 0.689 -37 A 0.649 -38 E 0.599 -39 P 0.524 -40 I 0.431 -41 S 0.344 -42 K 0.284 -43 R 0.256 -44 Q 0.258 -45 L 0.269 -46 K 0.274 -47 K 0.280 -48 L 0.293 -49 M 0.302 -50 K 0.297 -51 Q 0.284 -52 K 0.272 -53 Q 0.258 -54 W 0.227 -55 E 0.190 -56 E 0.163 -57 Q 0.152 -58 R 0.149 -59 E 0.150 -60 Q 0.150 -61 R 0.148 -62 K 0.145 -63 E 0.143 -64 K 0.139 -65 R 0.130 -66 K 0.124 -67 E 0.123 -68 K 0.120 -69 R 0.113 -70 K 0.109 -71 R 0.108 -72 K 0.104 -73 K 0.099 -74 L 0.102 -75 E 0.111 -76 R 0.122 -77 R 0.140 -78 Q 0.174 -79 L 0.232 -80 E 0.308 -81 S 0.386 -82 N 0.457 -83 S 0.520 -84 D 0.573 -85 G 0.599 -86 N 0.591 -87 D 0.564 -88 R 0.533 -89 K 0.507 -90 R 0.487 -91 V 0.474 -92 R 0.455 -93 R 0.422 -94 D 0.373 -95 V 0.316 -96 A 0.255 -97 R 0.194 -98 S 0.138 -99 S 0.093 -100 L 0.061 -101 R 0.041 -102 L 0.036 -103 V 0.046 -104 I 0.067 -105 D 0.090 -106 C 0.102 -107 S 0.101 -108 F 0.094 -109 D 0.090 -110 D 0.092 -111 L 0.096 -112 M 0.094 -113 V 0.083 -114 L 0.071 -115 K 0.065 -116 D 0.064 -117 I 0.061 -118 K 0.058 -119 K 0.059 -120 L 0.065 -121 H 0.069 -122 K 0.069 -123 Q 0.065 -124 I 0.059 -125 Q 0.053 -126 R 0.050 -127 C 0.050 -128 Y 0.052 -129 A 0.056 -130 E 0.062 -131 N 0.068 -132 R 0.075 -133 R 0.082 -134 A 0.090 -135 S 0.096 -136 H 0.098 -137 P 0.089 -138 V 0.070 -139 Q 0.048 -140 F 0.032 -141 Y 0.026 -142 L 0.032 -143 T 0.049 -144 S 0.070 -145 H 0.084 -146 G 0.083 -147 G 0.073 -148 Q 0.064 -149 L 0.065 -150 K 0.072 -151 K 0.076 -152 N 0.074 -153 M 0.069 -154 D 0.066 -155 E 0.068 -156 N 0.073 -157 D 0.075 -158 Q 0.069 -159 G 0.056 -160 W 0.044 -161 V 0.037 -162 N 0.033 -163 W 0.032 -164 K 0.033 -165 D 0.036 -166 I 0.042 -167 H 0.049 -168 I 0.056 -169 K 0.060 -170 S 0.059 -171 E 0.051 -172 H 0.039 -173 Y 0.030 -174 S 0.028 -175 E 0.035 -176 L 0.047 -177 I 0.057 -178 K 0.057 -179 K 0.051 -180 E 0.045 -181 D 0.039 -182 L 0.036 -183 V 0.036 -184 Y 0.040 -185 L 0.050 -186 T 0.068 -187 S 0.090 -188 D 0.111 -189 S 0.125 -190 P 0.132 -191 N 0.134 -192 V 0.128 -193 L 0.110 -194 K 0.092 -195 D 0.081 -196 L 0.076 -197 D 0.072 -198 E 0.071 -199 S 0.072 -200 K 0.068 -201 A 0.057 -202 Y 0.041 -203 V 0.029 -204 I 0.033 -205 G 0.063 -206 G 0.120 -207 L 0.186 -208 V 0.235 -209 D 0.243 -210 H 0.221 -211 N 0.198 -212 H 0.198 -213 H 0.215 -214 K 0.230 -215 G 0.219 -216 L 0.179 -217 T 0.132 -218 F 0.098 -219 K 0.079 -220 Q 0.070 -221 A 0.067 -222 T 0.068 -223 S 0.075 -224 Y 0.092 -225 G 0.112 -226 I 0.122 -227 E 0.117 -228 H 0.107 -229 A 0.107 -230 Q 0.118 -231 L 0.129 -232 P 0.126 -233 L 0.111 -234 A 0.097 -235 D 0.091 -236 F 0.097 -237 V 0.110 -238 K 0.124 -239 M 0.135 -240 N 0.144 -241 S 0.151 -242 R 0.158 -243 K 0.166 -244 V 0.169 -245 L 0.159 -246 A 0.136 -247 V 0.109 -248 N 0.090 -249 H 0.081 -250 V 0.077 -251 F 0.073 -252 E 0.067 -253 I 0.060 -254 I 0.053 -255 L 0.048 -256 E 0.045 -257 F 0.044 -258 L 0.044 -259 E 0.043 -260 T 0.044 -261 R 0.049 -262 D 0.055 -263 W 0.062 -264 Q 0.070 -265 E 0.077 -266 A 0.077 -267 F 0.070 -268 F 0.065 -269 T 0.072 -270 I 0.087 -271 L 0.105 -272 P 0.125 -273 Q 0.154 -274 R 0.195 -275 K 0.244 -276 G 0.299 -277 A 0.355 -278 V 0.412 -279 P 0.469 -280 A 0.527 -281 H 0.578 -282 K 0.617 -283 A 0.642 -284 C 0.652 -285 E 0.651 -286 S 0.644 -287 S 0.641 -288 P 0.648 -289 Q 0.662 -290 D 0.672 -291 H 0.664 -292 Q 0.638 -293 S 0.610 -294 L 0.600 -295 P 0.615 -296 E 0.632 -297 G 0.630 -298 W 0.615 -299 D 0.606 -300 S 0.610 -301 A 0.621 -302 S 0.638 -303 E 0.658 -304 G 0.669 -305 E 0.661 -306 S 0.621 -307 C 0.563 -308 R 0.532 -309 D 0.560 -310 N 0.617 -311 P 0.661 -312 V 0.674 -313 S 0.651 -314 P 0.603 -315 Q 0.564 -316 K 0.543 -317 D 0.504 -318 E 0.451 -319 Q 0.448 -320 G 0.495 -321 Q 0.531 -322 Q 0.549 -323 S 0.588 -324 S 0.641 -325 P 0.667 -326 V 0.645 -327 L 0.584 -328 Q 0.526 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000004127.13_ENSMUST00000162864.8_GN:Trmt10a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000004127.13_ENSMUST00000162864.8_GN:Trmt10a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid deleted file mode 100644 index 86c654b0c58f8bfc870a6f06391a10900e47888e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000004127.13_ENSMUST00000162864.8_GN:Trmt10a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid +++ /dev/null @@ -1,331 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000004127.13|ENSMUST00000162864.8|GN:Trmt10a|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:2 -1 M 0.438 -2 N 0.466 -3 M 0.509 -4 S 0.552 -5 S 0.581 -6 E 0.597 -7 M 0.611 -8 L 0.633 -9 P 0.662 -10 A 0.689 -11 S 0.703 -12 I 0.705 -13 E 0.702 -14 S 0.701 -15 T 0.701 -16 N 0.700 -17 V 0.698 -18 E 0.698 -19 E 0.704 -20 K 0.710 -21 L 0.714 -22 G 0.715 -23 T 0.717 -24 S 0.724 -25 D 0.731 -26 G 0.734 -27 E 0.730 -28 E 0.722 -29 E 0.711 -30 R 0.703 -31 Q 0.703 -32 E 0.714 -33 P 0.730 -34 R 0.745 -35 V 0.755 -36 D 0.752 -37 A 0.730 -38 G 0.694 -39 A 0.655 -40 E 0.604 -41 P 0.528 -42 I 0.435 -43 S 0.350 -44 K 0.290 -45 R 0.263 -46 Q 0.264 -47 L 0.275 -48 K 0.280 -49 K 0.286 -50 L 0.299 -51 M 0.308 -52 K 0.301 -53 Q 0.286 -54 K 0.274 -55 Q 0.258 -56 W 0.227 -57 E 0.189 -58 E 0.162 -59 Q 0.151 -60 R 0.148 -61 E 0.149 -62 Q 0.150 -63 R 0.147 -64 K 0.144 -65 E 0.142 -66 K 0.138 -67 R 0.129 -68 K 0.124 -69 E 0.123 -70 K 0.119 -71 R 0.112 -72 K 0.109 -73 R 0.107 -74 K 0.103 -75 K 0.099 -76 L 0.101 -77 E 0.110 -78 R 0.122 -79 R 0.139 -80 Q 0.173 -81 L 0.231 -82 E 0.307 -83 S 0.385 -84 N 0.456 -85 S 0.520 -86 D 0.572 -87 G 0.598 -88 N 0.591 -89 D 0.563 -90 R 0.532 -91 K 0.506 -92 R 0.487 -93 V 0.473 -94 R 0.455 -95 R 0.422 -96 D 0.373 -97 V 0.317 -98 A 0.255 -99 R 0.194 -100 S 0.138 -101 S 0.093 -102 L 0.061 -103 R 0.041 -104 L 0.036 -105 V 0.046 -106 I 0.067 -107 D 0.090 -108 C 0.102 -109 S 0.101 -110 F 0.094 -111 D 0.090 -112 D 0.092 -113 L 0.096 -114 M 0.094 -115 V 0.083 -116 L 0.071 -117 K 0.065 -118 D 0.064 -119 I 0.062 -120 K 0.058 -121 K 0.059 -122 L 0.065 -123 H 0.070 -124 K 0.069 -125 Q 0.065 -126 I 0.059 -127 Q 0.053 -128 R 0.050 -129 C 0.050 -130 Y 0.053 -131 A 0.057 -132 E 0.062 -133 N 0.068 -134 R 0.075 -135 R 0.083 -136 A 0.091 -137 S 0.097 -138 H 0.098 -139 P 0.090 -140 V 0.070 -141 Q 0.048 -142 F 0.032 -143 Y 0.026 -144 L 0.032 -145 T 0.049 -146 S 0.070 -147 H 0.084 -148 G 0.083 -149 G 0.073 -150 Q 0.065 -151 L 0.065 -152 K 0.072 -153 K 0.076 -154 N 0.074 -155 M 0.069 -156 D 0.066 -157 E 0.068 -158 N 0.073 -159 D 0.075 -160 Q 0.069 -161 G 0.056 -162 W 0.044 -163 V 0.037 -164 N 0.033 -165 W 0.032 -166 K 0.033 -167 D 0.036 -168 I 0.042 -169 H 0.049 -170 I 0.055 -171 K 0.059 -172 S 0.059 -173 E 0.051 -174 H 0.039 -175 Y 0.030 -176 S 0.028 -177 E 0.035 -178 L 0.047 -179 I 0.057 -180 K 0.057 -181 K 0.051 -182 E 0.045 -183 D 0.039 -184 L 0.036 -185 V 0.036 -186 Y 0.040 -187 L 0.050 -188 T 0.068 -189 S 0.090 -190 D 0.111 -191 S 0.124 -192 P 0.131 -193 N 0.134 -194 V 0.127 -195 L 0.110 -196 K 0.092 -197 D 0.081 -198 L 0.075 -199 D 0.072 -200 E 0.071 -201 S 0.071 -202 K 0.068 -203 A 0.057 -204 Y 0.041 -205 V 0.029 -206 I 0.033 -207 G 0.063 -208 G 0.119 -209 L 0.185 -210 V 0.233 -211 D 0.242 -212 H 0.219 -213 N 0.197 -214 H 0.197 -215 H 0.214 -216 K 0.229 -217 G 0.218 -218 L 0.178 -219 T 0.132 -220 F 0.098 -221 K 0.079 -222 Q 0.070 -223 A 0.067 -224 T 0.068 -225 S 0.075 -226 Y 0.092 -227 G 0.112 -228 I 0.122 -229 E 0.117 -230 H 0.107 -231 A 0.107 -232 Q 0.119 -233 L 0.129 -234 P 0.126 -235 L 0.111 -236 A 0.097 -237 D 0.092 -238 F 0.097 -239 V 0.110 -240 K 0.124 -241 M 0.135 -242 N 0.144 -243 S 0.151 -244 R 0.159 -245 K 0.166 -246 V 0.169 -247 L 0.160 -248 A 0.136 -249 V 0.109 -250 N 0.090 -251 H 0.081 -252 V 0.077 -253 F 0.073 -254 E 0.067 -255 I 0.060 -256 I 0.053 -257 L 0.048 -258 E 0.046 -259 F 0.045 -260 L 0.044 -261 E 0.043 -262 T 0.045 -263 R 0.049 -264 D 0.055 -265 W 0.062 -266 Q 0.070 -267 E 0.077 -268 A 0.077 -269 F 0.070 -270 F 0.066 -271 T 0.072 -272 I 0.088 -273 L 0.105 -274 P 0.125 -275 Q 0.154 -276 R 0.195 -277 K 0.244 -278 G 0.299 -279 A 0.355 -280 V 0.412 -281 P 0.469 -282 A 0.527 -283 H 0.578 -284 K 0.617 -285 A 0.642 -286 C 0.652 -287 E 0.651 -288 S 0.645 -289 S 0.641 -290 P 0.648 -291 Q 0.662 -292 D 0.672 -293 H 0.665 -294 Q 0.639 -295 S 0.611 -296 L 0.601 -297 P 0.615 -298 E 0.632 -299 G 0.630 -300 W 0.615 -301 D 0.607 -302 S 0.610 -303 A 0.622 -304 S 0.639 -305 E 0.658 -306 G 0.670 -307 E 0.661 -308 S 0.622 -309 C 0.564 -310 R 0.533 -311 D 0.560 -312 N 0.618 -313 P 0.662 -314 V 0.674 -315 S 0.651 -316 P 0.603 -317 Q 0.564 -318 K 0.544 -319 D 0.504 -320 E 0.452 -321 Q 0.449 -322 G 0.496 -323 Q 0.532 -324 Q 0.551 -325 S 0.590 -326 S 0.642 -327 P 0.668 -328 V 0.646 -329 L 0.584 -330 Q 0.527 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000005547.15_ENSMUST00000005685.15_GN:Cyp2a5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000005547.15_ENSMUST00000005685.15_GN:Cyp2a5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index fd2e9393c4e0a1fd792ac407682b267110eea9ed..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000005547.15_ENSMUST00000005685.15_GN:Cyp2a5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,495 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000005547.15|ENSMUST00000005685.15|GN:Cyp2a5|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.340 -2 L 0.333 -3 T 0.323 -4 S 0.306 -5 G 0.271 -6 L 0.219 -7 L 0.171 -8 L 0.144 -9 V 0.137 -10 A 0.141 -11 A 0.144 -12 V 0.142 -13 A 0.137 -14 F 0.134 -15 L 0.132 -16 S 0.129 -17 V 0.122 -18 L 0.115 -19 V 0.108 -20 L 0.104 -21 M 0.109 -22 S 0.119 -23 V 0.129 -24 W 0.146 -25 K 0.174 -26 Q 0.210 -27 R 0.248 -28 K 0.282 -29 L 0.300 -30 S 0.287 -31 G 0.247 -32 K 0.207 -33 L 0.186 -34 P 0.177 -35 P 0.166 -36 G 0.162 -37 P 0.172 -38 T 0.183 -39 P 0.173 -40 L 0.142 -41 P 0.104 -42 F 0.072 -43 I 0.054 -44 G 0.048 -45 N 0.048 -46 F 0.052 -47 L 0.061 -48 Q 0.076 -49 L 0.090 -50 N 0.099 -51 T 0.102 -52 E 0.096 -53 Q 0.084 -54 M 0.073 -55 Y 0.068 -56 N 0.062 -57 S 0.053 -58 L 0.045 -59 M 0.041 -60 K 0.040 -61 I 0.037 -62 S 0.034 -63 Q 0.035 -64 R 0.039 -65 Y 0.042 -66 G 0.039 -67 P 0.034 -68 V 0.030 -69 F 0.029 -70 T 0.032 -71 I 0.036 -72 Y 0.042 -73 L 0.049 -74 G 0.058 -75 P 0.066 -76 R 0.069 -77 R 0.064 -78 I 0.055 -79 V 0.052 -80 V 0.058 -81 L 0.070 -82 C 0.081 -83 G 0.083 -84 Q 0.074 -85 E 0.059 -86 A 0.047 -87 V 0.046 -88 K 0.050 -89 E 0.056 -90 A 0.067 -91 L 0.085 -92 V 0.099 -93 D 0.098 -94 Q 0.084 -95 A 0.068 -96 E 0.060 -97 E 0.060 -98 F 0.068 -99 S 0.084 -100 G 0.106 -101 R 0.129 -102 G 0.141 -103 E 0.138 -104 Q 0.122 -105 A 0.102 -106 T 0.084 -107 F 0.072 -108 D 0.071 -109 W 0.082 -110 L 0.104 -111 F 0.130 -112 K 0.151 -113 G 0.155 -114 Y 0.141 -115 G 0.119 -116 V 0.103 -117 A 0.103 -118 F 0.118 -119 S 0.134 -120 S 0.134 -121 G 0.119 -122 E 0.101 -123 R 0.089 -124 A 0.080 -125 K 0.074 -126 Q 0.077 -127 L 0.093 -128 R 0.108 -129 R 0.110 -130 F 0.102 -131 S 0.095 -132 I 0.094 -133 A 0.097 -134 T 0.098 -135 L 0.097 -136 R 0.093 -137 D 0.090 -138 F 0.092 -139 G 0.111 -140 V 0.144 -141 G 0.173 -142 K 0.181 -143 R 0.173 -144 G 0.154 -145 I 0.128 -146 E 0.101 -147 E 0.082 -148 R 0.073 -149 I 0.073 -150 Q 0.079 -151 E 0.083 -152 E 0.080 -153 A 0.074 -154 G 0.066 -155 F 0.057 -156 L 0.050 -157 I 0.046 -158 D 0.047 -159 S 0.049 -160 F 0.054 -161 R 0.059 -162 K 0.068 -163 T 0.080 -164 N 0.092 -165 G 0.100 -166 A 0.097 -167 F 0.091 -168 I 0.085 -169 D 0.079 -170 P 0.069 -171 T 0.060 -172 F 0.057 -173 Y 0.059 -174 L 0.060 -175 S 0.065 -176 R 0.082 -177 T 0.101 -178 V 0.113 -179 S 0.119 -180 N 0.125 -181 V 0.119 -182 I 0.096 -183 S 0.068 -184 S 0.051 -185 I 0.045 -186 V 0.047 -187 F 0.057 -188 G 0.075 -189 D 0.095 -190 R 0.103 -191 F 0.096 -192 D 0.080 -193 Y 0.067 -194 E 0.057 -195 D 0.049 -196 K 0.043 -197 E 0.040 -198 F 0.039 -199 L 0.040 -200 S 0.042 -201 L 0.043 -202 L 0.040 -203 R 0.037 -204 M 0.034 -205 M 0.035 -206 L 0.036 -207 G 0.037 -208 S 0.039 -209 F 0.043 -210 Q 0.048 -211 F 0.051 -212 T 0.054 -213 A 0.059 -214 T 0.064 -215 S 0.066 -216 M 0.064 -217 G 0.060 -218 Q 0.054 -219 L 0.049 -220 Y 0.045 -221 E 0.043 -222 M 0.043 -223 F 0.044 -224 S 0.045 -225 S 0.042 -226 V 0.038 -227 M 0.039 -228 K 0.051 -229 H 0.070 -230 L 0.088 -231 P 0.096 -232 G 0.098 -233 P 0.098 -234 Q 0.096 -235 Q 0.096 -236 Q 0.099 -237 A 0.103 -238 F 0.110 -239 K 0.118 -240 E 0.124 -241 L 0.122 -242 Q 0.114 -243 G 0.108 -244 L 0.105 -245 E 0.099 -246 D 0.087 -247 F 0.071 -248 I 0.061 -249 T 0.061 -250 K 0.063 -251 K 0.059 -252 V 0.051 -253 E 0.047 -254 H 0.048 -255 N 0.052 -256 Q 0.057 -257 R 0.066 -258 T 0.081 -259 L 0.098 -260 D 0.105 -261 P 0.103 -262 N 0.097 -263 S 0.091 -264 P 0.080 -265 R 0.062 -266 D 0.049 -267 F 0.047 -268 I 0.055 -269 D 0.060 -270 S 0.060 -271 F 0.060 -272 L 0.061 -273 I 0.057 -274 R 0.049 -275 M 0.042 -276 L 0.042 -277 E 0.048 -278 E 0.062 -279 K 0.085 -280 K 0.112 -281 N 0.135 -282 P 0.148 -283 N 0.147 -284 T 0.134 -285 E 0.114 -286 F 0.095 -287 Y 0.079 -288 M 0.069 -289 K 0.066 -290 N 0.068 -291 L 0.070 -292 V 0.070 -293 L 0.077 -294 T 0.091 -295 T 0.102 -296 L 0.101 -297 N 0.097 -298 L 0.098 -299 F 0.103 -300 F 0.115 -301 A 0.134 -302 G 0.145 -303 T 0.140 -304 E 0.128 -305 T 0.118 -306 V 0.105 -307 S 0.087 -308 T 0.072 -309 T 0.063 -310 L 0.053 -311 R 0.044 -312 Y 0.038 -313 G 0.036 -314 F 0.036 -315 L 0.039 -316 L 0.045 -317 L 0.049 -318 M 0.052 -319 K 0.053 -320 H 0.051 -321 P 0.048 -322 D 0.045 -323 I 0.048 -324 E 0.058 -325 A 0.067 -326 K 0.068 -327 V 0.068 -328 H 0.074 -329 E 0.080 -330 E 0.076 -331 I 0.065 -332 D 0.059 -333 R 0.064 -334 V 0.078 -335 I 0.091 -336 G 0.094 -337 R 0.089 -338 N 0.082 -339 R 0.082 -340 Q 0.084 -341 P 0.080 -342 K 0.070 -343 Y 0.062 -344 E 0.059 -345 D 0.058 -346 R 0.058 -347 M 0.061 -348 K 0.068 -349 M 0.072 -350 P 0.072 -351 Y 0.066 -352 T 0.059 -353 E 0.060 -354 A 0.069 -355 V 0.079 -356 I 0.082 -357 H 0.081 -358 E 0.080 -359 I 0.078 -360 Q 0.073 -361 R 0.066 -362 F 0.059 -363 A 0.055 -364 D 0.056 -365 M 0.062 -366 I 0.067 -367 P 0.070 -368 M 0.069 -369 G 0.065 -370 L 0.058 -371 A 0.050 -372 R 0.047 -373 R 0.049 -374 V 0.054 -375 T 0.056 -376 K 0.055 -377 D 0.052 -378 T 0.049 -379 K 0.045 -380 F 0.043 -381 R 0.045 -382 D 0.053 -383 F 0.063 -384 L 0.069 -385 L 0.072 -386 P 0.077 -387 K 0.079 -388 G 0.074 -389 T 0.064 -390 E 0.056 -391 V 0.053 -392 F 0.057 -393 P 0.068 -394 M 0.081 -395 L 0.087 -396 G 0.082 -397 S 0.075 -398 V 0.076 -399 L 0.083 -400 K 0.091 -401 D 0.093 -402 P 0.093 -403 K 0.092 -404 F 0.094 -405 F 0.099 -406 S 0.103 -407 N 0.104 -408 P 0.099 -409 K 0.093 -410 D 0.089 -411 F 0.087 -412 N 0.085 -413 P 0.085 -414 K 0.093 -415 H 0.109 -416 F 0.126 -417 L 0.135 -418 D 0.136 -419 D 0.136 -420 K 0.141 -421 G 0.154 -422 Q 0.171 -423 F 0.186 -424 K 0.189 -425 K 0.179 -426 N 0.162 -427 D 0.146 -428 A 0.140 -429 F 0.148 -430 V 0.163 -431 P 0.171 -432 F 0.163 -433 S 0.142 -434 I 0.124 -435 G 0.116 -436 K 0.116 -437 R 0.125 -438 Y 0.143 -439 C 0.162 -440 F 0.173 -441 G 0.174 -442 E 0.172 -443 G 0.184 -444 L 0.214 -445 A 0.227 -446 R 0.203 -447 M 0.171 -448 E 0.155 -449 L 0.141 -450 F 0.114 -451 L 0.087 -452 F 0.073 -453 L 0.069 -454 T 0.065 -455 N 0.062 -456 I 0.061 -457 M 0.062 -458 Q 0.062 -459 N 0.059 -460 F 0.054 -461 H 0.051 -462 F 0.053 -463 K 0.064 -464 S 0.084 -465 T 0.108 -466 Q 0.129 -467 A 0.141 -468 P 0.142 -469 Q 0.138 -470 D 0.135 -471 I 0.139 -472 D 0.151 -473 V 0.172 -474 S 0.190 -475 P 0.185 -476 R 0.155 -477 L 0.116 -478 V 0.089 -479 G 0.084 -480 F 0.098 -481 A 0.129 -482 T 0.173 -483 I 0.217 -484 P 0.239 -485 P 0.221 -486 T 0.174 -487 Y 0.128 -488 T 0.098 -489 M 0.082 -490 S 0.078 -491 F 0.087 -492 L 0.116 -493 S 0.162 -494 R 0.201 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000005547.15_ENSMUST00000005685.15_GN:Cyp2a5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000005547.15_ENSMUST00000005685.15_GN:Cyp2a5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid deleted file mode 100644 index a515d3db81096525d98c1940e67a379fff679bc0..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000005547.15_ENSMUST00000005685.15_GN:Cyp2a5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid +++ /dev/null @@ -1,514 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000005547.15|ENSMUST00000005685.15|GN:Cyp2a5|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:19 -1 M 0.375 -2 Y 0.383 -3 K 0.397 -4 S 0.412 -5 K 0.428 -6 L 0.445 -7 I 0.471 -8 Q 0.501 -9 P 0.521 -10 S 0.520 -11 L 0.507 -12 S 0.494 -13 V 0.483 -14 Y 0.481 -15 H 0.499 -16 P 0.524 -17 T 0.520 -18 A 0.474 -19 T 0.423 -20 M 0.398 -21 L 0.385 -22 T 0.366 -23 S 0.335 -24 G 0.289 -25 L 0.233 -26 L 0.188 -27 L 0.165 -28 V 0.158 -29 A 0.155 -30 A 0.155 -31 V 0.157 -32 A 0.158 -33 F 0.154 -34 L 0.148 -35 S 0.141 -36 V 0.133 -37 L 0.123 -38 V 0.112 -39 L 0.105 -40 M 0.105 -41 S 0.112 -42 V 0.123 -43 W 0.142 -44 K 0.173 -45 Q 0.213 -46 R 0.253 -47 K 0.287 -48 L 0.302 -49 S 0.287 -50 G 0.247 -51 K 0.208 -52 L 0.188 -53 P 0.178 -54 P 0.166 -55 G 0.160 -56 P 0.169 -57 T 0.179 -58 P 0.169 -59 L 0.138 -60 P 0.101 -61 F 0.070 -62 I 0.053 -63 G 0.048 -64 N 0.049 -65 F 0.052 -66 L 0.061 -67 Q 0.074 -68 L 0.087 -69 N 0.096 -70 T 0.099 -71 E 0.094 -72 Q 0.082 -73 M 0.071 -74 Y 0.066 -75 N 0.061 -76 S 0.052 -77 L 0.043 -78 M 0.039 -79 K 0.037 -80 I 0.034 -81 S 0.032 -82 Q 0.032 -83 R 0.036 -84 Y 0.039 -85 G 0.037 -86 P 0.032 -87 V 0.028 -88 F 0.028 -89 T 0.030 -90 I 0.035 -91 Y 0.040 -92 L 0.047 -93 G 0.056 -94 P 0.064 -95 R 0.066 -96 R 0.062 -97 I 0.054 -98 V 0.052 -99 V 0.058 -100 L 0.070 -101 C 0.080 -102 G 0.082 -103 Q 0.073 -104 E 0.058 -105 A 0.046 -106 V 0.045 -107 K 0.049 -108 E 0.055 -109 A 0.066 -110 L 0.083 -111 V 0.096 -112 D 0.095 -113 Q 0.082 -114 A 0.067 -115 E 0.060 -116 E 0.060 -117 F 0.068 -118 S 0.083 -119 G 0.105 -120 R 0.126 -121 G 0.138 -122 E 0.135 -123 Q 0.119 -124 A 0.099 -125 T 0.082 -126 F 0.071 -127 D 0.070 -128 W 0.082 -129 L 0.104 -130 F 0.131 -131 K 0.153 -132 G 0.157 -133 Y 0.143 -134 G 0.121 -135 V 0.105 -136 A 0.106 -137 F 0.122 -138 S 0.138 -139 S 0.139 -140 G 0.123 -141 E 0.104 -142 R 0.091 -143 A 0.081 -144 K 0.074 -145 Q 0.078 -146 L 0.093 -147 R 0.108 -148 R 0.110 -149 F 0.102 -150 S 0.095 -151 I 0.093 -152 A 0.096 -153 T 0.098 -154 L 0.096 -155 R 0.093 -156 D 0.090 -157 F 0.092 -158 G 0.111 -159 V 0.145 -160 G 0.175 -161 K 0.184 -162 R 0.176 -163 G 0.157 -164 I 0.130 -165 E 0.102 -166 E 0.082 -167 R 0.073 -168 I 0.073 -169 Q 0.078 -170 E 0.082 -171 E 0.080 -172 A 0.073 -173 G 0.064 -174 F 0.056 -175 L 0.049 -176 I 0.045 -177 D 0.045 -178 S 0.048 -179 F 0.052 -180 R 0.058 -181 K 0.066 -182 T 0.078 -183 N 0.090 -184 G 0.097 -185 A 0.095 -186 F 0.089 -187 I 0.084 -188 D 0.078 -189 P 0.069 -190 T 0.060 -191 F 0.058 -192 Y 0.060 -193 L 0.061 -194 S 0.066 -195 R 0.082 -196 T 0.102 -197 V 0.113 -198 S 0.119 -199 N 0.124 -200 V 0.119 -201 I 0.096 -202 S 0.068 -203 S 0.050 -204 I 0.044 -205 V 0.046 -206 F 0.056 -207 G 0.074 -208 D 0.093 -209 R 0.101 -210 F 0.093 -211 D 0.078 -212 Y 0.065 -213 E 0.055 -214 D 0.047 -215 K 0.042 -216 E 0.039 -217 F 0.039 -218 L 0.039 -219 S 0.041 -220 L 0.042 -221 L 0.040 -222 R 0.036 -223 M 0.034 -224 M 0.034 -225 L 0.036 -226 G 0.037 -227 S 0.039 -228 F 0.042 -229 Q 0.047 -230 F 0.050 -231 T 0.052 -232 A 0.057 -233 T 0.061 -234 S 0.063 -235 M 0.062 -236 G 0.058 -237 Q 0.053 -238 L 0.048 -239 Y 0.044 -240 E 0.042 -241 M 0.042 -242 F 0.043 -243 S 0.044 -244 S 0.041 -245 V 0.037 -246 M 0.039 -247 K 0.050 -248 H 0.069 -249 L 0.087 -250 P 0.095 -251 G 0.097 -252 P 0.098 -253 Q 0.097 -254 Q 0.097 -255 Q 0.099 -256 A 0.104 -257 F 0.110 -258 K 0.118 -259 E 0.124 -260 L 0.121 -261 Q 0.114 -262 G 0.108 -263 L 0.104 -264 E 0.099 -265 D 0.087 -266 F 0.071 -267 I 0.061 -268 T 0.061 -269 K 0.062 -270 K 0.058 -271 V 0.051 -272 E 0.047 -273 H 0.048 -274 N 0.052 -275 Q 0.057 -276 R 0.067 -277 T 0.083 -278 L 0.100 -279 D 0.108 -280 P 0.105 -281 N 0.099 -282 S 0.093 -283 P 0.081 -284 R 0.064 -285 D 0.050 -286 F 0.048 -287 I 0.056 -288 D 0.061 -289 S 0.062 -290 F 0.062 -291 L 0.063 -292 I 0.059 -293 R 0.050 -294 M 0.043 -295 L 0.043 -296 E 0.049 -297 E 0.064 -298 K 0.088 -299 K 0.115 -300 N 0.139 -301 P 0.151 -302 N 0.149 -303 T 0.136 -304 E 0.116 -305 F 0.096 -306 Y 0.081 -307 M 0.071 -308 K 0.067 -309 N 0.070 -310 L 0.072 -311 V 0.072 -312 L 0.078 -313 T 0.092 -314 T 0.103 -315 L 0.102 -316 N 0.098 -317 L 0.098 -318 F 0.103 -319 F 0.116 -320 A 0.134 -321 G 0.145 -322 T 0.141 -323 E 0.129 -324 T 0.119 -325 V 0.106 -326 S 0.089 -327 T 0.074 -328 T 0.064 -329 L 0.055 -330 R 0.045 -331 Y 0.039 -332 G 0.037 -333 F 0.037 -334 L 0.040 -335 L 0.045 -336 L 0.050 -337 M 0.053 -338 K 0.053 -339 H 0.052 -340 P 0.049 -341 D 0.046 -342 I 0.049 -343 E 0.058 -344 A 0.067 -345 K 0.069 -346 V 0.069 -347 H 0.074 -348 E 0.081 -349 E 0.077 -350 I 0.065 -351 D 0.058 -352 R 0.063 -353 V 0.077 -354 I 0.089 -355 G 0.091 -356 R 0.085 -357 N 0.078 -358 R 0.078 -359 Q 0.082 -360 P 0.079 -361 K 0.069 -362 Y 0.061 -363 E 0.058 -364 D 0.057 -365 R 0.057 -366 M 0.061 -367 K 0.067 -368 M 0.072 -369 P 0.072 -370 Y 0.066 -371 T 0.060 -372 E 0.061 -373 A 0.070 -374 V 0.080 -375 I 0.083 -376 H 0.082 -377 E 0.081 -378 I 0.079 -379 Q 0.074 -380 R 0.067 -381 F 0.060 -382 A 0.056 -383 D 0.057 -384 M 0.062 -385 I 0.068 -386 P 0.071 -387 M 0.070 -388 G 0.066 -389 L 0.058 -390 A 0.051 -391 R 0.047 -392 R 0.050 -393 V 0.054 -394 T 0.057 -395 K 0.056 -396 D 0.052 -397 T 0.049 -398 K 0.046 -399 F 0.043 -400 R 0.045 -401 D 0.054 -402 F 0.064 -403 L 0.070 -404 L 0.073 -405 P 0.077 -406 K 0.080 -407 G 0.075 -408 T 0.064 -409 E 0.056 -410 V 0.053 -411 F 0.058 -412 P 0.069 -413 M 0.082 -414 L 0.088 -415 G 0.083 -416 S 0.076 -417 V 0.076 -418 L 0.084 -419 K 0.091 -420 D 0.093 -421 P 0.093 -422 K 0.093 -423 F 0.095 -424 F 0.100 -425 S 0.104 -426 N 0.105 -427 P 0.100 -428 K 0.093 -429 D 0.090 -430 F 0.088 -431 N 0.086 -432 P 0.086 -433 K 0.093 -434 H 0.110 -435 F 0.127 -436 L 0.135 -437 D 0.136 -438 D 0.136 -439 K 0.141 -440 G 0.153 -441 Q 0.171 -442 F 0.187 -443 K 0.189 -444 K 0.179 -445 N 0.162 -446 D 0.146 -447 A 0.141 -448 F 0.148 -449 V 0.163 -450 P 0.172 -451 F 0.164 -452 S 0.144 -453 I 0.126 -454 G 0.117 -455 K 0.117 -456 R 0.126 -457 Y 0.144 -458 C 0.163 -459 F 0.174 -460 G 0.175 -461 E 0.173 -462 G 0.185 -463 L 0.215 -464 A 0.228 -465 R 0.204 -466 M 0.172 -467 E 0.157 -468 L 0.143 -469 F 0.115 -470 L 0.088 -471 F 0.074 -472 L 0.070 -473 T 0.066 -474 N 0.062 -475 I 0.061 -476 M 0.062 -477 Q 0.061 -478 N 0.058 -479 F 0.053 -480 H 0.050 -481 F 0.053 -482 K 0.064 -483 S 0.084 -484 T 0.107 -485 Q 0.128 -486 A 0.140 -487 P 0.140 -488 Q 0.135 -489 D 0.132 -490 I 0.136 -491 D 0.149 -492 V 0.170 -493 S 0.188 -494 P 0.184 -495 R 0.153 -496 L 0.115 -497 V 0.089 -498 G 0.084 -499 F 0.098 -500 A 0.129 -501 T 0.172 -502 I 0.216 -503 P 0.238 -504 P 0.219 -505 T 0.173 -506 Y 0.127 -507 T 0.098 -508 M 0.083 -509 S 0.079 -510 F 0.088 -511 L 0.113 -512 S 0.153 -513 R 0.187 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000005846.13_ENSMUST00000119953.2_GN:Rsl1d1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000005846.13_ENSMUST00000119953.2_GN:Rsl1d1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index db5054d3ebf3bba93be57407a4293ecadd8e0fde..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000005846.13_ENSMUST00000119953.2_GN:Rsl1d1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,453 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000005846.13|ENSMUST00000119953.2|GN:Rsl1d1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.463 -2 K 0.482 -3 G 0.505 -4 S 0.500 -5 A 0.451 -6 S 0.398 -7 E 0.404 -8 S 0.471 -9 P 0.532 -10 S 0.548 -11 A 0.561 -12 S 0.607 -13 V 0.663 -14 A 0.695 -15 E 0.705 -16 A 0.705 -17 T 0.699 -18 T 0.691 -19 T 0.688 -20 D 0.685 -21 V 0.672 -22 Q 0.651 -23 V 0.633 -24 T 0.620 -25 P 0.601 -26 T 0.556 -27 A 0.476 -28 L 0.372 -29 L 0.267 -30 Q 0.179 -31 L 0.116 -32 D 0.075 -33 R 0.052 -34 E 0.041 -35 Q 0.039 -36 I 0.039 -37 R 0.038 -38 K 0.036 -39 A 0.035 -40 V 0.033 -41 E 0.033 -42 V 0.039 -43 I 0.047 -44 S 0.055 -45 N 0.065 -46 R 0.081 -47 S 0.110 -48 K 0.158 -49 S 0.221 -50 K 0.288 -51 K 0.357 -52 N 0.422 -53 N 0.468 -54 N 0.484 -55 E 0.479 -56 L 0.473 -57 L 0.475 -58 L 0.475 -59 S 0.449 -60 G 0.379 -61 S 0.275 -62 E 0.173 -63 N 0.099 -64 L 0.057 -65 F 0.038 -66 L 0.032 -67 M 0.035 -68 V 0.043 -69 I 0.054 -70 L 0.063 -71 W 0.072 -72 K 0.082 -73 I 0.097 -74 P 0.117 -75 E 0.136 -76 K 0.145 -77 E 0.139 -78 L 0.126 -79 R 0.120 -80 V 0.122 -81 K 0.127 -82 V 0.130 -83 P 0.128 -84 L 0.122 -85 P 0.119 -86 H 0.120 -87 S 0.123 -88 I 0.128 -89 L 0.137 -90 S 0.146 -91 E 0.148 -92 S 0.136 -93 S 0.109 -94 D 0.075 -95 V 0.046 -96 C 0.029 -97 L 0.026 -98 F 0.034 -99 T 0.051 -100 K 0.072 -101 D 0.092 -102 E 0.104 -103 F 0.106 -104 D 0.101 -105 S 0.097 -106 P 0.093 -107 E 0.087 -108 Q 0.078 -109 T 0.068 -110 E 0.060 -111 G 0.052 -112 F 0.048 -113 Y 0.050 -114 K 0.058 -115 K 0.062 -116 L 0.056 -117 L 0.044 -118 K 0.038 -119 K 0.038 -120 H 0.042 -121 G 0.047 -122 V 0.050 -123 N 0.049 -124 T 0.045 -125 I 0.041 -126 S 0.037 -127 Q 0.035 -128 I 0.034 -129 I 0.035 -130 P 0.034 -131 F 0.034 -132 K 0.034 -133 T 0.036 -134 L 0.038 -135 K 0.041 -136 T 0.046 -137 E 0.052 -138 Y 0.056 -139 K 0.058 -140 A 0.057 -141 Y 0.057 -142 E 0.056 -143 A 0.052 -144 K 0.045 -145 L 0.041 -146 R 0.044 -147 L 0.051 -148 L 0.057 -149 G 0.061 -150 S 0.062 -151 F 0.061 -152 E 0.055 -153 V 0.044 -154 F 0.033 -155 I 0.030 -156 T 0.037 -157 D 0.048 -158 A 0.056 -159 R 0.060 -160 I 0.062 -161 R 0.062 -162 R 0.060 -163 H 0.060 -164 L 0.061 -165 P 0.062 -166 S 0.064 -167 H 0.065 -168 I 0.061 -169 G 0.059 -170 R 0.060 -171 H 0.063 -172 F 0.066 -173 Y 0.071 -174 Q 0.080 -175 R 0.092 -176 K 0.103 -177 K 0.107 -178 V 0.102 -179 P 0.092 -180 V 0.081 -181 S 0.075 -182 V 0.070 -183 N 0.065 -184 L 0.063 -185 L 0.067 -186 A 0.074 -187 K 0.077 -188 N 0.071 -189 L 0.061 -190 S 0.054 -191 K 0.052 -192 E 0.053 -193 I 0.060 -194 N 0.073 -195 R 0.091 -196 C 0.104 -197 I 0.105 -198 T 0.092 -199 G 0.075 -200 T 0.063 -201 V 0.062 -202 L 0.065 -203 N 0.068 -204 I 0.068 -205 S 0.070 -206 K 0.080 -207 R 0.093 -208 G 0.096 -209 S 0.083 -210 C 0.061 -211 S 0.045 -212 T 0.038 -213 I 0.037 -214 R 0.037 -215 I 0.039 -216 G 0.044 -217 H 0.052 -218 T 0.063 -219 G 0.071 -220 M 0.072 -221 E 0.067 -222 T 0.061 -223 E 0.059 -224 H 0.060 -225 I 0.061 -226 V 0.065 -227 D 0.072 -228 N 0.076 -229 I 0.072 -230 L 0.065 -231 A 0.061 -232 V 0.057 -233 S 0.051 -234 E 0.045 -235 M 0.042 -236 L 0.041 -237 S 0.041 -238 E 0.043 -239 K 0.048 -240 L 0.054 -241 P 0.059 -242 E 0.058 -243 K 0.053 -244 W 0.047 -245 Q 0.043 -246 S 0.039 -247 V 0.036 -248 K 0.032 -249 L 0.029 -250 L 0.028 -251 F 0.029 -252 L 0.034 -253 K 0.042 -254 T 0.053 -255 E 0.064 -256 K 0.072 -257 S 0.073 -258 V 0.066 -259 S 0.059 -260 L 0.054 -261 P 0.055 -262 I 0.064 -263 F 0.090 -264 S 0.139 -265 S 0.206 -266 F 0.283 -267 V 0.371 -268 T 0.466 -269 S 0.542 -270 Q 0.571 -271 D 0.553 -272 E 0.511 -273 N 0.458 -274 A 0.396 -275 V 0.332 -276 S 0.280 -277 L 0.245 -278 R 0.226 -279 S 0.220 -280 L 0.218 -281 R 0.214 -282 K 0.210 -283 Q 0.207 -284 E 0.205 -285 L 0.202 -286 K 0.199 -287 K 0.198 -288 R 0.197 -289 K 0.199 -290 R 0.206 -291 E 0.218 -292 N 0.227 -293 A 0.228 -294 K 0.229 -295 L 0.235 -296 K 0.245 -297 K 0.256 -298 E 0.266 -299 S 0.275 -300 K 0.281 -301 M 0.286 -302 L 0.301 -303 R 0.328 -304 K 0.369 -305 K 0.423 -306 S 0.481 -307 K 0.532 -308 K 0.577 -309 A 0.617 -310 T 0.645 -311 S 0.661 -312 L 0.671 -313 L 0.674 -314 T 0.671 -315 Q 0.675 -316 S 0.696 -317 G 0.727 -318 L 0.752 -319 A 0.765 -320 S 0.763 -321 S 0.753 -322 A 0.745 -323 P 0.746 -324 A 0.749 -325 K 0.750 -326 S 0.750 -327 P 0.753 -328 G 0.761 -329 A 0.765 -330 Q 0.763 -331 K 0.758 -332 K 0.753 -333 K 0.750 -334 T 0.746 -335 N 0.728 -336 K 0.684 -337 A 0.622 -338 H 0.593 -339 K 0.631 -340 K 0.704 -341 Q 0.764 -342 K 0.798 -343 V 0.817 -344 T 0.827 -345 E 0.832 -346 E 0.832 -347 C 0.827 -348 E 0.819 -349 E 0.809 -350 A 0.798 -351 I 0.792 -352 P 0.793 -353 Q 0.799 -354 L 0.806 -355 V 0.811 -356 P 0.815 -357 I 0.818 -358 G 0.814 -359 E 0.803 -360 T 0.791 -361 P 0.789 -362 D 0.794 -363 K 0.798 -364 E 0.784 -365 N 0.739 -366 V 0.673 -367 K 0.638 -368 M 0.673 -369 Q 0.739 -370 E 0.785 -371 N 0.799 -372 I 0.797 -373 T 0.788 -374 G 0.781 -375 K 0.778 -376 T 0.782 -377 P 0.791 -378 K 0.800 -379 S 0.805 -380 K 0.802 -381 S 0.793 -382 D 0.783 -383 P 0.775 -384 S 0.770 -385 T 0.772 -386 P 0.781 -387 K 0.789 -388 G 0.787 -389 K 0.764 -390 K 0.715 -391 R 0.654 -392 K 0.632 -393 A 0.678 -394 L 0.749 -395 L 0.794 -396 A 0.803 -397 T 0.794 -398 E 0.783 -399 T 0.782 -400 P 0.792 -401 E 0.805 -402 A 0.809 -403 S 0.803 -404 A 0.796 -405 P 0.798 -406 G 0.806 -407 T 0.815 -408 S 0.817 -409 G 0.813 -410 K 0.803 -411 K 0.784 -412 Q 0.738 -413 K 0.675 -414 K 0.646 -415 D 0.682 -416 V 0.740 -417 Q 0.769 -418 E 0.766 -419 F 0.751 -420 R 0.743 -421 K 0.748 -422 P 0.768 -423 E 0.789 -424 A 0.799 -425 S 0.791 -426 S 0.772 -427 F 0.753 -428 S 0.741 -429 T 0.741 -430 P 0.749 -431 R 0.760 -432 K 0.774 -433 S 0.786 -434 G 0.795 -435 K 0.797 -436 K 0.795 -437 A 0.787 -438 S 0.770 -439 N 0.748 -440 T 0.731 -441 P 0.726 -442 R 0.724 -443 D 0.713 -444 K 0.690 -445 K 0.651 -446 T 0.601 -447 K 0.575 -448 A 0.595 -449 A 0.629 -450 H 0.629 -451 S 0.593 -452 N 0.558 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000005846.13_ENSMUST00000119953.2_GN:Rsl1d1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:13.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000005846.13_ENSMUST00000119953.2_GN:Rsl1d1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:13.caid deleted file mode 100644 index 05124b36e8655a74905b331befd90c4b225c5849..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000005846.13_ENSMUST00000119953.2_GN:Rsl1d1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:13.caid +++ /dev/null @@ -1,466 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000005846.13|ENSMUST00000119953.2|GN:Rsl1d1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:13 -1 M 0.439 -2 S 0.456 -3 S 0.477 -4 D 0.487 -5 F 0.488 -6 Y 0.500 -7 R 0.538 -8 P 0.594 -9 S 0.649 -10 T 0.691 -11 R 0.715 -12 G 0.727 -13 D 0.729 -14 M 0.727 -15 K 0.727 -16 G 0.726 -17 S 0.717 -18 A 0.698 -19 S 0.673 -20 E 0.654 -21 S 0.643 -22 P 0.625 -23 S 0.596 -24 A 0.589 -25 S 0.631 -26 V 0.690 -27 A 0.727 -28 E 0.739 -29 A 0.739 -30 T 0.732 -31 T 0.723 -32 T 0.717 -33 D 0.708 -34 V 0.689 -35 Q 0.664 -36 V 0.642 -37 T 0.627 -38 P 0.607 -39 T 0.562 -40 A 0.483 -41 L 0.379 -42 L 0.271 -43 Q 0.181 -44 L 0.117 -45 D 0.075 -46 R 0.051 -47 E 0.040 -48 Q 0.038 -49 I 0.039 -50 R 0.038 -51 K 0.036 -52 A 0.035 -53 V 0.033 -54 E 0.034 -55 V 0.040 -56 I 0.050 -57 S 0.060 -58 N 0.070 -59 R 0.085 -60 S 0.114 -61 K 0.161 -62 S 0.223 -63 K 0.289 -64 K 0.358 -65 N 0.423 -66 N 0.467 -67 N 0.482 -68 E 0.478 -69 L 0.473 -70 L 0.475 -71 L 0.473 -72 S 0.445 -73 G 0.374 -74 S 0.270 -75 E 0.168 -76 N 0.095 -77 L 0.055 -78 F 0.036 -79 L 0.031 -80 M 0.034 -81 V 0.042 -82 I 0.052 -83 L 0.062 -84 W 0.070 -85 K 0.079 -86 I 0.094 -87 P 0.113 -88 E 0.131 -89 K 0.140 -90 E 0.134 -91 L 0.122 -92 R 0.116 -93 V 0.119 -94 K 0.125 -95 V 0.128 -96 P 0.125 -97 L 0.120 -98 P 0.117 -99 H 0.116 -100 S 0.118 -101 I 0.122 -102 L 0.129 -103 S 0.139 -104 E 0.142 -105 S 0.132 -106 S 0.106 -107 D 0.074 -108 V 0.046 -109 C 0.029 -110 L 0.025 -111 F 0.033 -112 T 0.049 -113 K 0.069 -114 D 0.089 -115 E 0.102 -116 F 0.104 -117 D 0.099 -118 S 0.095 -119 P 0.091 -120 E 0.085 -121 Q 0.076 -122 T 0.067 -123 E 0.059 -124 G 0.052 -125 F 0.047 -126 Y 0.050 -127 K 0.058 -128 K 0.062 -129 L 0.055 -130 L 0.044 -131 K 0.037 -132 K 0.037 -133 H 0.041 -134 G 0.046 -135 V 0.049 -136 N 0.048 -137 T 0.045 -138 I 0.041 -139 S 0.037 -140 Q 0.035 -141 I 0.034 -142 I 0.035 -143 P 0.034 -144 F 0.033 -145 K 0.034 -146 T 0.035 -147 L 0.037 -148 K 0.040 -149 T 0.045 -150 E 0.051 -151 Y 0.056 -152 K 0.057 -153 A 0.057 -154 Y 0.056 -155 E 0.055 -156 A 0.051 -157 K 0.045 -158 L 0.040 -159 R 0.043 -160 L 0.050 -161 L 0.056 -162 G 0.060 -163 S 0.061 -164 F 0.060 -165 E 0.054 -166 V 0.043 -167 F 0.032 -168 I 0.029 -169 T 0.036 -170 D 0.047 -171 A 0.055 -172 R 0.059 -173 I 0.060 -174 R 0.061 -175 R 0.060 -176 H 0.060 -177 L 0.060 -178 P 0.061 -179 S 0.064 -180 H 0.064 -181 I 0.061 -182 G 0.058 -183 R 0.059 -184 H 0.062 -185 F 0.065 -186 Y 0.069 -187 Q 0.078 -188 R 0.089 -189 K 0.100 -190 K 0.104 -191 V 0.099 -192 P 0.089 -193 V 0.079 -194 S 0.073 -195 V 0.069 -196 N 0.064 -197 L 0.062 -198 L 0.066 -199 A 0.073 -200 K 0.075 -201 N 0.069 -202 L 0.060 -203 S 0.052 -204 K 0.050 -205 E 0.052 -206 I 0.059 -207 N 0.072 -208 R 0.089 -209 C 0.103 -210 I 0.104 -211 T 0.092 -212 G 0.074 -213 T 0.063 -214 V 0.061 -215 L 0.064 -216 N 0.066 -217 I 0.067 -218 S 0.069 -219 K 0.078 -220 R 0.091 -221 G 0.094 -222 S 0.081 -223 C 0.060 -224 S 0.044 -225 T 0.038 -226 I 0.037 -227 R 0.037 -228 I 0.039 -229 G 0.043 -230 H 0.051 -231 T 0.061 -232 G 0.069 -233 M 0.071 -234 E 0.067 -235 T 0.061 -236 E 0.058 -237 H 0.059 -238 I 0.061 -239 V 0.065 -240 D 0.072 -241 N 0.076 -242 I 0.072 -243 L 0.065 -244 A 0.061 -245 V 0.057 -246 S 0.051 -247 E 0.045 -248 M 0.042 -249 L 0.041 -250 S 0.041 -251 E 0.042 -252 K 0.047 -253 L 0.054 -254 P 0.058 -255 E 0.058 -256 K 0.053 -257 W 0.047 -258 Q 0.043 -259 S 0.040 -260 V 0.036 -261 K 0.032 -262 L 0.029 -263 L 0.028 -264 F 0.029 -265 L 0.034 -266 K 0.042 -267 T 0.053 -268 E 0.065 -269 K 0.073 -270 S 0.073 -271 V 0.067 -272 S 0.059 -273 L 0.055 -274 P 0.056 -275 I 0.065 -276 F 0.091 -277 S 0.141 -278 S 0.209 -279 F 0.286 -280 V 0.374 -281 T 0.469 -282 S 0.543 -283 Q 0.570 -284 D 0.550 -285 E 0.507 -286 N 0.454 -287 A 0.393 -288 V 0.330 -289 S 0.279 -290 L 0.244 -291 R 0.225 -292 S 0.218 -293 L 0.216 -294 R 0.212 -295 K 0.208 -296 Q 0.205 -297 E 0.202 -298 L 0.199 -299 K 0.196 -300 K 0.194 -301 R 0.194 -302 K 0.196 -303 R 0.205 -304 E 0.217 -305 N 0.224 -306 A 0.225 -307 K 0.224 -308 L 0.230 -309 K 0.240 -310 K 0.252 -311 E 0.263 -312 S 0.273 -313 K 0.279 -314 M 0.285 -315 L 0.298 -316 R 0.324 -317 K 0.365 -318 K 0.420 -319 S 0.479 -320 K 0.529 -321 K 0.575 -322 A 0.617 -323 T 0.646 -324 S 0.663 -325 L 0.673 -326 L 0.676 -327 T 0.673 -328 Q 0.676 -329 S 0.698 -330 G 0.729 -331 L 0.755 -332 A 0.767 -333 S 0.766 -334 S 0.756 -335 A 0.748 -336 P 0.749 -337 A 0.752 -338 K 0.752 -339 S 0.752 -340 P 0.756 -341 G 0.763 -342 A 0.767 -343 Q 0.765 -344 K 0.760 -345 K 0.755 -346 K 0.752 -347 T 0.748 -348 N 0.730 -349 K 0.685 -350 A 0.624 -351 H 0.594 -352 K 0.632 -353 K 0.705 -354 Q 0.765 -355 K 0.799 -356 V 0.818 -357 T 0.828 -358 E 0.833 -359 E 0.833 -360 C 0.829 -361 E 0.821 -362 E 0.811 -363 A 0.800 -364 I 0.793 -365 P 0.794 -366 Q 0.801 -367 L 0.807 -368 V 0.812 -369 P 0.816 -370 I 0.819 -371 G 0.815 -372 E 0.803 -373 T 0.791 -374 P 0.788 -375 D 0.793 -376 K 0.796 -377 E 0.783 -378 N 0.738 -379 V 0.672 -380 K 0.638 -381 M 0.672 -382 Q 0.739 -383 E 0.784 -384 N 0.799 -385 I 0.796 -386 T 0.788 -387 G 0.780 -388 K 0.778 -389 T 0.782 -390 P 0.791 -391 K 0.801 -392 S 0.805 -393 K 0.802 -394 S 0.793 -395 D 0.783 -396 P 0.775 -397 S 0.770 -398 T 0.772 -399 P 0.780 -400 K 0.788 -401 G 0.786 -402 K 0.764 -403 K 0.715 -404 R 0.654 -405 K 0.632 -406 A 0.677 -407 L 0.749 -408 L 0.794 -409 A 0.803 -410 T 0.794 -411 E 0.784 -412 T 0.782 -413 P 0.792 -414 E 0.805 -415 A 0.809 -416 S 0.803 -417 A 0.796 -418 P 0.797 -419 G 0.805 -420 T 0.814 -421 S 0.817 -422 G 0.812 -423 K 0.803 -424 K 0.783 -425 Q 0.738 -426 K 0.675 -427 K 0.647 -428 D 0.682 -429 V 0.741 -430 Q 0.771 -431 E 0.768 -432 F 0.753 -433 R 0.744 -434 K 0.750 -435 P 0.769 -436 E 0.790 -437 A 0.800 -438 S 0.793 -439 S 0.774 -440 F 0.755 -441 S 0.743 -442 T 0.743 -443 P 0.750 -444 R 0.761 -445 K 0.774 -446 S 0.787 -447 G 0.796 -448 K 0.798 -449 K 0.795 -450 A 0.788 -451 S 0.771 -452 N 0.749 -453 T 0.732 -454 P 0.726 -455 R 0.723 -456 D 0.712 -457 K 0.689 -458 K 0.650 -459 T 0.601 -460 K 0.575 -461 A 0.595 -462 A 0.628 -463 H 0.629 -464 S 0.595 -465 N 0.559 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000006273.15_ENSMUST00000006435.8_GN:Atp6v1b2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000006273.15_ENSMUST00000006435.8_GN:Atp6v1b2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index f3f50c03404094bd5426784c3db425aa38fa52ce..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000006273.15_ENSMUST00000006435.8_GN:Atp6v1b2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,512 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000006273.15|ENSMUST00000006435.8|GN:Atp6v1b2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.270 -2 A 0.262 -3 L 0.261 -4 R 0.283 -5 A 0.324 -6 M 0.365 -7 R 0.412 -8 G 0.472 -9 I 0.521 -10 V 0.541 -11 N 0.542 -12 G 0.540 -13 A 0.534 -14 A 0.522 -15 P 0.514 -16 E 0.519 -17 L 0.534 -18 P 0.549 -19 V 0.558 -20 P 0.563 -21 T 0.561 -22 G 0.557 -23 G 0.559 -24 P 0.569 -25 M 0.570 -26 A 0.542 -27 G 0.480 -28 A 0.393 -29 R 0.309 -30 E 0.257 -31 Q 0.243 -32 A 0.242 -33 L 0.233 -34 A 0.225 -35 V 0.229 -36 S 0.245 -37 R 0.264 -38 N 0.280 -39 Y 0.291 -40 L 0.299 -41 S 0.303 -42 Q 0.299 -43 P 0.280 -44 R 0.241 -45 L 0.188 -46 T 0.131 -47 Y 0.085 -48 K 0.056 -49 T 0.044 -50 V 0.044 -51 S 0.051 -52 G 0.060 -53 V 0.066 -54 N 0.067 -55 G 0.059 -56 P 0.047 -57 L 0.035 -58 V 0.031 -59 I 0.035 -60 L 0.047 -61 D 0.062 -62 H 0.075 -63 V 0.082 -64 K 0.082 -65 F 0.078 -66 P 0.071 -67 R 0.065 -68 Y 0.061 -69 A 0.059 -70 E 0.055 -71 I 0.046 -72 V 0.038 -73 H 0.035 -74 L 0.038 -75 T 0.045 -76 L 0.056 -77 P 0.068 -78 D 0.077 -79 G 0.079 -80 T 0.073 -81 K 0.063 -82 R 0.053 -83 S 0.047 -84 G 0.045 -85 Q 0.047 -86 V 0.049 -87 L 0.052 -88 E 0.057 -89 V 0.064 -90 S 0.067 -91 G 0.064 -92 S 0.054 -93 K 0.041 -94 A 0.032 -95 V 0.031 -96 V 0.037 -97 Q 0.045 -98 V 0.051 -99 F 0.059 -100 E 0.071 -101 G 0.083 -102 T 0.092 -103 S 0.098 -104 G 0.102 -105 I 0.102 -106 D 0.096 -107 A 0.088 -108 K 0.081 -109 K 0.072 -110 T 0.064 -111 S 0.060 -112 C 0.069 -113 E 0.089 -114 F 0.114 -115 T 0.137 -116 G 0.154 -117 D 0.165 -118 I 0.171 -119 L 0.176 -120 R 0.189 -121 T 0.214 -122 P 0.233 -123 V 0.226 -124 S 0.192 -125 E 0.157 -126 D 0.144 -127 M 0.148 -128 L 0.158 -129 G 0.170 -130 R 0.183 -131 V 0.186 -132 F 0.172 -133 N 0.155 -134 G 0.154 -135 S 0.165 -136 G 0.171 -137 K 0.164 -138 P 0.152 -139 I 0.141 -140 D 0.135 -141 R 0.141 -142 G 0.163 -143 P 0.189 -144 V 0.202 -145 V 0.193 -146 L 0.169 -147 A 0.149 -148 E 0.145 -149 D 0.148 -150 F 0.152 -151 L 0.155 -152 D 0.157 -153 I 0.161 -154 M 0.183 -155 G 0.230 -156 Q 0.286 -157 P 0.326 -158 I 0.331 -159 N 0.301 -160 P 0.254 -161 Q 0.212 -162 C 0.183 -163 R 0.167 -164 I 0.161 -165 Y 0.159 -166 P 0.151 -167 E 0.138 -168 E 0.126 -169 M 0.118 -170 I 0.110 -171 Q 0.097 -172 T 0.084 -173 G 0.073 -174 I 0.068 -175 S 0.070 -176 A 0.076 -177 I 0.079 -178 D 0.078 -179 G 0.076 -180 M 0.078 -181 N 0.084 -182 S 0.091 -183 I 0.093 -184 A 0.092 -185 R 0.096 -186 G 0.106 -187 Q 0.120 -188 K 0.137 -189 I 0.151 -190 P 0.159 -191 I 0.163 -192 F 0.171 -193 S 0.183 -194 A 0.190 -195 A 0.180 -196 G 0.155 -197 L 0.126 -198 P 0.104 -199 H 0.097 -200 N 0.102 -201 E 0.113 -202 I 0.120 -203 A 0.120 -204 A 0.114 -205 Q 0.111 -206 I 0.109 -207 C 0.101 -208 R 0.089 -209 Q 0.082 -210 A 0.088 -211 G 0.099 -212 L 0.111 -213 V 0.132 -214 K 0.168 -215 K 0.212 -216 S 0.251 -217 K 0.277 -218 D 0.288 -219 V 0.284 -220 V 0.274 -221 D 0.263 -222 Y 0.251 -223 S 0.229 -224 E 0.190 -225 E 0.141 -226 N 0.099 -227 F 0.074 -228 A 0.069 -229 I 0.077 -230 V 0.086 -231 F 0.087 -232 A 0.082 -233 A 0.079 -234 M 0.083 -235 G 0.088 -236 V 0.085 -237 N 0.073 -238 M 0.063 -239 E 0.063 -240 T 0.070 -241 A 0.075 -242 R 0.075 -243 F 0.069 -244 F 0.064 -245 K 0.065 -246 S 0.066 -247 D 0.061 -248 F 0.055 -249 E 0.056 -250 E 0.060 -251 N 0.060 -252 G 0.054 -253 S 0.049 -254 M 0.047 -255 D 0.046 -256 N 0.043 -257 V 0.040 -258 C 0.042 -259 L 0.051 -260 F 0.066 -261 L 0.085 -262 N 0.104 -263 L 0.120 -264 A 0.126 -265 N 0.124 -266 D 0.118 -267 P 0.108 -268 T 0.096 -269 I 0.088 -270 E 0.086 -271 R 0.086 -272 I 0.086 -273 I 0.087 -274 T 0.090 -275 P 0.089 -276 R 0.081 -277 L 0.069 -278 A 0.061 -279 L 0.056 -280 T 0.050 -281 T 0.043 -282 A 0.037 -283 E 0.032 -284 F 0.028 -285 L 0.028 -286 A 0.032 -287 Y 0.040 -288 Q 0.049 -289 C 0.055 -290 E 0.059 -291 K 0.062 -292 H 0.069 -293 V 0.079 -294 L 0.088 -295 V 0.091 -296 I 0.088 -297 L 0.080 -298 T 0.074 -299 D 0.075 -300 M 0.084 -301 S 0.097 -302 S 0.108 -303 Y 0.114 -304 A 0.118 -305 E 0.120 -306 A 0.118 -307 L 0.110 -308 R 0.102 -309 E 0.098 -310 V 0.099 -311 S 0.108 -312 A 0.121 -313 A 0.136 -314 R 0.151 -315 E 0.172 -316 E 0.199 -317 V 0.227 -318 P 0.243 -319 G 0.241 -320 R 0.232 -321 R 0.227 -322 G 0.221 -323 F 0.204 -324 P 0.173 -325 G 0.142 -326 Y 0.117 -327 M 0.099 -328 Y 0.087 -329 T 0.083 -330 D 0.084 -331 L 0.083 -332 A 0.079 -333 T 0.075 -334 I 0.070 -335 Y 0.068 -336 E 0.067 -337 R 0.068 -338 A 0.074 -339 G 0.087 -340 R 0.101 -341 V 0.111 -342 E 0.113 -343 G 0.112 -344 R 0.111 -345 N 0.112 -346 G 0.116 -347 S 0.122 -348 I 0.129 -349 T 0.135 -350 Q 0.140 -351 I 0.138 -352 P 0.131 -353 I 0.127 -354 L 0.134 -355 T 0.155 -356 M 0.176 -357 P 0.185 -358 N 0.181 -359 D 0.176 -360 D 0.169 -361 I 0.155 -362 T 0.141 -363 H 0.137 -364 P 0.143 -365 I 0.152 -366 P 0.155 -367 D 0.157 -368 L 0.164 -369 T 0.170 -370 G 0.167 -371 Y 0.155 -372 I 0.140 -373 T 0.124 -374 E 0.109 -375 G 0.096 -376 Q 0.086 -377 I 0.082 -378 Y 0.082 -379 V 0.083 -380 D 0.084 -381 R 0.085 -382 Q 0.091 -383 L 0.104 -384 H 0.122 -385 N 0.143 -386 R 0.164 -387 Q 0.176 -388 I 0.167 -389 Y 0.148 -390 P 0.138 -391 P 0.143 -392 I 0.155 -393 N 0.169 -394 V 0.175 -395 L 0.169 -396 P 0.158 -397 S 0.150 -398 L 0.148 -399 S 0.149 -400 R 0.148 -401 L 0.145 -402 M 0.146 -403 K 0.154 -404 S 0.164 -405 A 0.172 -406 I 0.182 -407 G 0.199 -408 E 0.214 -409 G 0.213 -410 M 0.191 -411 T 0.161 -412 R 0.142 -413 K 0.140 -414 D 0.146 -415 H 0.149 -416 A 0.144 -417 D 0.134 -418 V 0.123 -419 S 0.117 -420 N 0.116 -421 Q 0.116 -422 L 0.113 -423 Y 0.105 -424 A 0.098 -425 C 0.097 -426 Y 0.101 -427 A 0.105 -428 I 0.108 -429 G 0.110 -430 K 0.115 -431 D 0.119 -432 V 0.117 -433 Q 0.114 -434 A 0.114 -435 M 0.115 -436 K 0.122 -437 A 0.139 -438 V 0.162 -439 V 0.180 -440 G 0.184 -441 E 0.178 -442 E 0.172 -443 A 0.167 -444 L 0.154 -445 T 0.134 -446 S 0.119 -447 D 0.118 -448 D 0.119 -449 L 0.113 -450 L 0.107 -451 Y 0.104 -452 L 0.097 -453 E 0.085 -454 F 0.081 -455 L 0.082 -456 Q 0.079 -457 K 0.070 -458 F 0.067 -459 E 0.075 -460 K 0.087 -461 N 0.095 -462 F 0.098 -463 I 0.105 -464 T 0.127 -465 Q 0.164 -466 G 0.199 -467 P 0.210 -468 Y 0.194 -469 E 0.169 -470 N 0.145 -471 R 0.124 -472 T 0.105 -473 V 0.092 -474 Y 0.084 -475 E 0.080 -476 T 0.082 -477 L 0.087 -478 D 0.092 -479 I 0.091 -480 G 0.086 -481 W 0.082 -482 Q 0.083 -483 L 0.086 -484 L 0.085 -485 R 0.080 -486 I 0.075 -487 F 0.071 -488 P 0.070 -489 K 0.074 -490 E 0.080 -491 M 0.086 -492 L 0.092 -493 K 0.098 -494 R 0.100 -495 I 0.097 -496 P 0.090 -497 Q 0.080 -498 S 0.071 -499 T 0.063 -500 L 0.057 -501 S 0.057 -502 E 0.065 -503 F 0.085 -504 Y 0.124 -505 P 0.183 -506 R 0.254 -507 D 0.320 -508 S 0.371 -509 A 0.404 -510 K 0.422 -511 H 0.429 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000006273.15_ENSMUST00000006435.8_GN:Atp6v1b2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:29.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000006273.15_ENSMUST00000006435.8_GN:Atp6v1b2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:29.caid deleted file mode 100644 index aac27a1988399a6946ec4578a260fb6764cd708a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000006273.15_ENSMUST00000006435.8_GN:Atp6v1b2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:29.caid +++ /dev/null @@ -1,541 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000006273.15|ENSMUST00000006435.8|GN:Atp6v1b2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:29 -1 M 0.396 -2 G 0.408 -3 G 0.421 -4 A 0.414 -5 G 0.378 -6 R 0.344 -7 T 0.361 -8 G 0.419 -9 L 0.459 -10 P 0.448 -11 A 0.417 -12 I 0.401 -13 C 0.397 -14 A 0.406 -15 P 0.438 -16 A 0.473 -17 P 0.484 -18 R 0.494 -19 C 0.524 -20 C 0.545 -21 G 0.528 -22 A 0.507 -23 S 0.525 -24 R 0.570 -25 D 0.609 -26 G 0.622 -27 G 0.593 -28 D 0.511 -29 K 0.408 -30 M 0.333 -31 A 0.297 -32 L 0.285 -33 R 0.295 -34 A 0.337 -35 M 0.395 -36 R 0.456 -37 G 0.513 -38 I 0.555 -39 V 0.576 -40 N 0.583 -41 G 0.578 -42 A 0.558 -43 A 0.533 -44 P 0.518 -45 E 0.520 -46 L 0.531 -47 P 0.538 -48 V 0.541 -49 P 0.545 -50 T 0.552 -51 G 0.562 -52 G 0.577 -53 P 0.595 -54 M 0.603 -55 A 0.587 -56 G 0.542 -57 A 0.471 -58 R 0.390 -59 E 0.332 -60 Q 0.306 -61 A 0.293 -62 L 0.271 -63 A 0.249 -64 V 0.244 -65 S 0.254 -66 R 0.265 -67 N 0.274 -68 Y 0.284 -69 L 0.297 -70 S 0.308 -71 Q 0.307 -72 P 0.284 -73 R 0.240 -74 L 0.183 -75 T 0.126 -76 Y 0.082 -77 K 0.054 -78 T 0.041 -79 V 0.040 -80 S 0.046 -81 G 0.054 -82 V 0.061 -83 N 0.062 -84 G 0.056 -85 P 0.044 -86 L 0.033 -87 V 0.030 -88 I 0.034 -89 L 0.045 -90 D 0.059 -91 H 0.071 -92 V 0.078 -93 K 0.078 -94 F 0.073 -95 P 0.067 -96 R 0.060 -97 Y 0.056 -98 A 0.054 -99 E 0.050 -100 I 0.043 -101 V 0.036 -102 H 0.033 -103 L 0.036 -104 T 0.042 -105 L 0.052 -106 P 0.063 -107 D 0.072 -108 G 0.075 -109 T 0.071 -110 K 0.062 -111 R 0.052 -112 S 0.045 -113 G 0.042 -114 Q 0.043 -115 V 0.046 -116 L 0.049 -117 E 0.055 -118 V 0.062 -119 S 0.067 -120 G 0.064 -121 S 0.054 -122 K 0.041 -123 A 0.032 -124 V 0.031 -125 V 0.037 -126 Q 0.044 -127 V 0.051 -128 F 0.059 -129 E 0.071 -130 G 0.084 -131 T 0.093 -132 S 0.100 -133 G 0.104 -134 I 0.104 -135 D 0.098 -136 A 0.091 -137 K 0.084 -138 K 0.075 -139 T 0.066 -140 S 0.062 -141 C 0.071 -142 E 0.092 -143 F 0.119 -144 T 0.143 -145 G 0.160 -146 D 0.171 -147 I 0.177 -148 L 0.182 -149 R 0.194 -150 T 0.217 -151 P 0.235 -152 V 0.226 -153 S 0.191 -154 E 0.157 -155 D 0.144 -156 M 0.148 -157 L 0.158 -158 G 0.171 -159 R 0.183 -160 V 0.185 -161 F 0.170 -162 N 0.153 -163 G 0.153 -164 S 0.166 -165 G 0.172 -166 K 0.165 -167 P 0.152 -168 I 0.140 -169 D 0.134 -170 R 0.140 -171 G 0.162 -172 P 0.190 -173 V 0.204 -174 V 0.194 -175 L 0.169 -176 A 0.147 -177 E 0.142 -178 D 0.146 -179 F 0.151 -180 L 0.155 -181 D 0.157 -182 I 0.163 -183 M 0.186 -184 G 0.235 -185 Q 0.292 -186 P 0.331 -187 I 0.334 -188 N 0.303 -189 P 0.256 -190 Q 0.214 -191 C 0.185 -192 R 0.169 -193 I 0.163 -194 Y 0.161 -195 P 0.153 -196 E 0.139 -197 E 0.127 -198 M 0.119 -199 I 0.110 -200 Q 0.098 -201 T 0.084 -202 G 0.073 -203 I 0.068 -204 S 0.070 -205 A 0.075 -206 I 0.078 -207 D 0.077 -208 G 0.075 -209 M 0.078 -210 N 0.085 -211 S 0.092 -212 I 0.094 -213 A 0.094 -214 R 0.097 -215 G 0.107 -216 Q 0.121 -217 K 0.137 -218 I 0.151 -219 P 0.159 -220 I 0.163 -221 F 0.171 -222 S 0.184 -223 A 0.190 -224 A 0.180 -225 G 0.154 -226 L 0.125 -227 P 0.103 -228 H 0.095 -229 N 0.101 -230 E 0.111 -231 I 0.119 -232 A 0.119 -233 A 0.114 -234 Q 0.110 -235 I 0.108 -236 C 0.100 -237 R 0.088 -238 Q 0.082 -239 A 0.088 -240 G 0.099 -241 L 0.112 -242 V 0.133 -243 K 0.169 -244 K 0.212 -245 S 0.252 -246 K 0.278 -247 D 0.288 -248 V 0.285 -249 V 0.275 -250 D 0.265 -251 Y 0.253 -252 S 0.230 -253 E 0.190 -254 E 0.142 -255 N 0.099 -256 F 0.074 -257 A 0.069 -258 I 0.077 -259 V 0.086 -260 F 0.086 -261 A 0.081 -262 A 0.078 -263 M 0.082 -264 G 0.086 -265 V 0.083 -266 N 0.071 -267 M 0.060 -268 E 0.059 -269 T 0.065 -270 A 0.071 -271 R 0.071 -272 F 0.066 -273 F 0.062 -274 K 0.065 -275 S 0.066 -276 D 0.059 -277 F 0.049 -278 E 0.045 -279 E 0.046 -280 N 0.048 -281 G 0.048 -282 S 0.047 -283 M 0.047 -284 D 0.046 -285 N 0.043 -286 V 0.040 -287 C 0.042 -288 L 0.050 -289 F 0.065 -290 L 0.084 -291 N 0.104 -292 L 0.120 -293 A 0.126 -294 N 0.124 -295 D 0.118 -296 P 0.107 -297 T 0.096 -298 I 0.088 -299 E 0.086 -300 R 0.087 -301 I 0.086 -302 I 0.087 -303 T 0.090 -304 P 0.089 -305 R 0.081 -306 L 0.070 -307 A 0.062 -308 L 0.057 -309 T 0.051 -310 T 0.044 -311 A 0.038 -312 E 0.033 -313 F 0.029 -314 L 0.029 -315 A 0.033 -316 Y 0.040 -317 Q 0.049 -318 C 0.056 -319 E 0.060 -320 K 0.064 -321 H 0.071 -322 V 0.081 -323 L 0.090 -324 V 0.093 -325 I 0.090 -326 L 0.082 -327 T 0.076 -328 D 0.076 -329 M 0.086 -330 S 0.099 -331 S 0.111 -332 Y 0.117 -333 A 0.120 -334 E 0.122 -335 A 0.120 -336 L 0.112 -337 R 0.104 -338 E 0.100 -339 V 0.100 -340 S 0.106 -341 A 0.119 -342 A 0.135 -343 R 0.152 -344 E 0.173 -345 E 0.201 -346 V 0.229 -347 P 0.246 -348 G 0.245 -349 R 0.236 -350 R 0.230 -351 G 0.224 -352 F 0.206 -353 P 0.175 -354 G 0.143 -355 Y 0.119 -356 M 0.100 -357 Y 0.089 -358 T 0.084 -359 D 0.085 -360 L 0.085 -361 A 0.081 -362 T 0.076 -363 I 0.072 -364 Y 0.070 -365 E 0.069 -366 R 0.070 -367 A 0.076 -368 G 0.089 -369 R 0.104 -370 V 0.113 -371 E 0.115 -372 G 0.114 -373 R 0.113 -374 N 0.114 -375 G 0.118 -376 S 0.123 -377 I 0.130 -378 T 0.136 -379 Q 0.141 -380 I 0.140 -381 P 0.133 -382 I 0.128 -383 L 0.134 -384 T 0.155 -385 M 0.176 -386 P 0.184 -387 N 0.180 -388 D 0.175 -389 D 0.168 -390 I 0.155 -391 T 0.141 -392 H 0.137 -393 P 0.143 -394 I 0.152 -395 P 0.155 -396 D 0.157 -397 L 0.165 -398 T 0.171 -399 G 0.168 -400 Y 0.156 -401 I 0.141 -402 T 0.125 -403 E 0.110 -404 G 0.097 -405 Q 0.087 -406 I 0.083 -407 Y 0.083 -408 V 0.084 -409 D 0.084 -410 R 0.085 -411 Q 0.092 -412 L 0.105 -413 H 0.122 -414 N 0.143 -415 R 0.164 -416 Q 0.176 -417 I 0.168 -418 Y 0.150 -419 P 0.140 -420 P 0.144 -421 I 0.157 -422 N 0.170 -423 V 0.175 -424 L 0.170 -425 P 0.159 -426 S 0.151 -427 L 0.150 -428 S 0.151 -429 R 0.150 -430 L 0.147 -431 M 0.148 -432 K 0.157 -433 S 0.166 -434 A 0.174 -435 I 0.183 -436 G 0.200 -437 E 0.217 -438 G 0.216 -439 M 0.194 -440 T 0.164 -441 R 0.144 -442 K 0.142 -443 D 0.148 -444 H 0.151 -445 A 0.147 -446 D 0.137 -447 V 0.125 -448 S 0.118 -449 N 0.117 -450 Q 0.118 -451 L 0.114 -452 Y 0.106 -453 A 0.099 -454 C 0.097 -455 Y 0.101 -456 A 0.106 -457 I 0.108 -458 G 0.110 -459 K 0.115 -460 D 0.119 -461 V 0.117 -462 Q 0.114 -463 A 0.114 -464 M 0.116 -465 K 0.124 -466 A 0.142 -467 V 0.165 -468 V 0.183 -469 G 0.187 -470 E 0.180 -471 E 0.174 -472 A 0.168 -473 L 0.155 -474 T 0.134 -475 S 0.120 -476 D 0.118 -477 D 0.119 -478 L 0.113 -479 L 0.108 -480 Y 0.105 -481 L 0.098 -482 E 0.086 -483 F 0.081 -484 L 0.082 -485 Q 0.079 -486 K 0.070 -487 F 0.067 -488 E 0.075 -489 K 0.088 -490 N 0.096 -491 F 0.099 -492 I 0.107 -493 T 0.130 -494 Q 0.167 -495 G 0.202 -496 P 0.212 -497 Y 0.196 -498 E 0.170 -499 N 0.146 -500 R 0.125 -501 T 0.107 -502 V 0.093 -503 Y 0.085 -504 E 0.082 -505 T 0.084 -506 L 0.089 -507 D 0.094 -508 I 0.093 -509 G 0.087 -510 W 0.082 -511 Q 0.083 -512 L 0.086 -513 L 0.085 -514 R 0.081 -515 I 0.075 -516 F 0.071 -517 P 0.069 -518 K 0.072 -519 E 0.079 -520 M 0.085 -521 L 0.092 -522 K 0.097 -523 R 0.100 -524 I 0.097 -525 P 0.090 -526 Q 0.080 -527 S 0.071 -528 T 0.063 -529 L 0.057 -530 S 0.057 -531 E 0.065 -532 F 0.084 -533 Y 0.121 -534 P 0.176 -535 R 0.241 -536 D 0.301 -537 S 0.347 -538 A 0.377 -539 K 0.394 -540 H 0.401 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000006538.13_ENSMUST00000164097.4_GN:Ihh_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000006538.13_ENSMUST00000164097.4_GN:Ihh_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 545b92566e4cb1f74c52b0b31d7e0a153341f41b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000006538.13_ENSMUST00000164097.4_GN:Ihh_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,412 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000006538.13|ENSMUST00000164097.4|GN:Ihh|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.365 -2 S 0.373 -3 P 0.385 -4 A 0.394 -5 W 0.392 -6 L 0.378 -7 R 0.360 -8 P 0.335 -9 R 0.297 -10 L 0.256 -11 R 0.230 -12 F 0.222 -13 C 0.216 -14 L 0.205 -15 F 0.201 -16 L 0.207 -17 L 0.215 -18 L 0.222 -19 L 0.238 -20 L 0.267 -21 L 0.311 -22 V 0.365 -23 P 0.421 -24 A 0.463 -25 A 0.487 -26 R 0.508 -27 G 0.539 -28 C 0.573 -29 G 0.604 -30 P 0.630 -31 G 0.651 -32 R 0.666 -33 V 0.673 -34 V 0.669 -35 G 0.653 -36 S 0.626 -37 R 0.590 -38 R 0.555 -39 R 0.531 -40 P 0.515 -41 P 0.489 -42 R 0.441 -43 K 0.380 -44 L 0.320 -45 V 0.267 -46 P 0.226 -47 L 0.198 -48 A 0.175 -49 Y 0.151 -50 K 0.131 -51 Q 0.117 -52 F 0.110 -53 S 0.108 -54 P 0.111 -55 N 0.117 -56 V 0.121 -57 P 0.121 -58 E 0.122 -59 K 0.129 -60 T 0.141 -61 L 0.153 -62 G 0.164 -63 A 0.174 -64 S 0.177 -65 G 0.171 -66 R 0.163 -67 Y 0.159 -68 E 0.162 -69 G 0.170 -70 K 0.173 -71 I 0.168 -72 A 0.160 -73 R 0.154 -74 S 0.150 -75 S 0.147 -76 E 0.145 -77 R 0.149 -78 F 0.157 -79 K 0.165 -80 E 0.172 -81 L 0.180 -82 T 0.190 -83 P 0.202 -84 N 0.212 -85 Y 0.210 -86 N 0.196 -87 P 0.178 -88 D 0.165 -89 I 0.161 -90 I 0.166 -91 F 0.177 -92 K 0.192 -93 D 0.209 -94 E 0.225 -95 E 0.239 -96 N 0.252 -97 T 0.267 -98 G 0.269 -99 A 0.249 -100 D 0.209 -101 R 0.168 -102 L 0.140 -103 M 0.122 -104 T 0.104 -105 Q 0.085 -106 R 0.072 -107 C 0.070 -108 K 0.078 -109 D 0.084 -110 R 0.083 -111 L 0.077 -112 N 0.073 -113 S 0.073 -114 L 0.077 -115 A 0.081 -116 I 0.080 -117 S 0.073 -118 V 0.065 -119 M 0.060 -120 N 0.057 -121 Q 0.059 -122 W 0.068 -123 P 0.082 -124 G 0.094 -125 V 0.104 -126 K 0.115 -127 L 0.129 -128 R 0.149 -129 V 0.172 -130 T 0.193 -131 E 0.210 -132 G 0.220 -133 W 0.220 -134 D 0.212 -135 E 0.203 -136 D 0.202 -137 G 0.208 -138 H 0.214 -139 H 0.219 -140 S 0.229 -141 E 0.247 -142 E 0.266 -143 S 0.268 -144 L 0.248 -145 H 0.225 -146 Y 0.212 -147 E 0.200 -148 G 0.174 -149 R 0.138 -150 A 0.105 -151 V 0.084 -152 D 0.074 -153 I 0.070 -154 T 0.071 -155 T 0.076 -156 S 0.084 -157 D 0.092 -158 R 0.101 -159 D 0.108 -160 R 0.107 -161 N 0.097 -162 K 0.083 -163 Y 0.074 -164 G 0.073 -165 L 0.076 -166 L 0.076 -167 A 0.074 -168 R 0.070 -169 L 0.068 -170 A 0.069 -171 V 0.074 -172 E 0.084 -173 A 0.097 -174 G 0.109 -175 F 0.113 -176 D 0.104 -177 W 0.089 -178 V 0.075 -179 Y 0.068 -180 Y 0.070 -181 E 0.075 -182 S 0.078 -183 K 0.074 -184 A 0.066 -185 H 0.058 -186 V 0.052 -187 H 0.051 -188 C 0.056 -189 S 0.069 -190 V 0.101 -191 K 0.159 -192 S 0.235 -193 E 0.308 -194 H 0.361 -195 S 0.391 -196 A 0.400 -197 A 0.389 -198 A 0.359 -199 K 0.309 -200 T 0.244 -201 G 0.177 -202 G 0.125 -203 C 0.093 -204 F 0.076 -205 P 0.067 -206 A 0.059 -207 G 0.051 -208 A 0.044 -209 Q 0.039 -210 V 0.036 -211 R 0.037 -212 L 0.042 -213 E 0.052 -214 N 0.065 -215 G 0.076 -216 E 0.080 -217 R 0.077 -218 V 0.071 -219 A 0.068 -220 L 0.073 -221 S 0.084 -222 A 0.094 -223 V 0.094 -224 K 0.084 -225 P 0.075 -226 G 0.074 -227 D 0.080 -228 R 0.089 -229 V 0.097 -230 L 0.104 -231 A 0.109 -232 M 0.114 -233 G 0.117 -234 E 0.115 -235 D 0.112 -236 G 0.109 -237 T 0.105 -238 P 0.094 -239 T 0.075 -240 F 0.056 -241 S 0.044 -242 D 0.040 -243 V 0.041 -244 L 0.043 -245 I 0.047 -246 F 0.054 -247 L 0.059 -248 D 0.062 -249 R 0.063 -250 E 0.062 -251 P 0.060 -252 N 0.059 -253 R 0.058 -254 L 0.054 -255 R 0.048 -256 A 0.042 -257 F 0.038 -258 Q 0.035 -259 V 0.036 -260 I 0.040 -261 E 0.046 -262 T 0.051 -263 Q 0.052 -264 D 0.052 -265 P 0.054 -266 P 0.059 -267 R 0.062 -268 R 0.059 -269 L 0.054 -270 A 0.052 -271 L 0.057 -272 T 0.065 -273 P 0.070 -274 A 0.067 -275 H 0.059 -276 L 0.051 -277 L 0.048 -278 F 0.054 -279 I 0.067 -280 A 0.083 -281 D 0.096 -282 N 0.100 -283 H 0.099 -284 T 0.098 -285 E 0.097 -286 P 0.094 -287 A 0.091 -288 A 0.090 -289 H 0.091 -290 F 0.088 -291 R 0.079 -292 A 0.066 -293 T 0.055 -294 F 0.054 -295 A 0.062 -296 S 0.075 -297 H 0.084 -298 V 0.082 -299 Q 0.071 -300 P 0.060 -301 G 0.055 -302 Q 0.057 -303 Y 0.062 -304 V 0.070 -305 L 0.079 -306 V 0.087 -307 S 0.093 -308 G 0.099 -309 V 0.103 -310 P 0.106 -311 G 0.108 -312 L 0.108 -313 Q 0.102 -314 P 0.089 -315 A 0.073 -316 R 0.060 -317 V 0.055 -318 A 0.056 -319 A 0.059 -320 V 0.063 -321 S 0.068 -322 T 0.074 -323 H 0.079 -324 V 0.083 -325 A 0.084 -326 L 0.083 -327 G 0.080 -328 S 0.076 -329 Y 0.074 -330 A 0.075 -331 P 0.077 -332 L 0.081 -333 T 0.095 -334 R 0.118 -335 H 0.137 -336 G 0.137 -337 T 0.123 -338 L 0.114 -339 V 0.111 -340 V 0.108 -341 E 0.100 -342 D 0.090 -343 V 0.080 -344 V 0.073 -345 A 0.071 -346 S 0.078 -347 C 0.093 -348 F 0.109 -349 A 0.120 -350 A 0.124 -351 V 0.120 -352 A 0.114 -353 D 0.107 -354 H 0.101 -355 H 0.099 -356 L 0.103 -357 A 0.111 -358 Q 0.124 -359 L 0.136 -360 A 0.144 -361 F 0.145 -362 W 0.139 -363 P 0.132 -364 L 0.126 -365 R 0.125 -366 L 0.136 -367 F 0.161 -368 P 0.199 -369 S 0.236 -370 L 0.266 -371 A 0.290 -372 W 0.314 -373 G 0.340 -374 S 0.363 -375 W 0.373 -376 T 0.369 -377 P 0.351 -378 S 0.328 -379 E 0.306 -380 G 0.289 -381 V 0.273 -382 H 0.249 -383 W 0.211 -384 Y 0.172 -385 P 0.146 -386 Q 0.131 -387 M 0.127 -388 L 0.130 -389 Y 0.134 -390 R 0.138 -391 L 0.142 -392 G 0.149 -393 R 0.158 -394 L 0.172 -395 L 0.202 -396 L 0.255 -397 E 0.321 -398 E 0.375 -399 S 0.404 -400 T 0.424 -401 F 0.454 -402 H 0.496 -403 P 0.539 -404 L 0.573 -405 G 0.602 -406 M 0.631 -407 S 0.658 -408 G 0.669 -409 A 0.650 -410 G 0.605 -411 S 0.564 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000006538.13_ENSMUST00000164097.4_GN:Ihh_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:38.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000006538.13_ENSMUST00000164097.4_GN:Ihh_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:38.caid deleted file mode 100644 index ee978cf2a4e5371669500c723119854daf461541..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000006538.13_ENSMUST00000164097.4_GN:Ihh_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:38.caid +++ /dev/null @@ -1,450 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000006538.13|ENSMUST00000164097.4|GN:Ihh|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:38 -1 M 0.375 -2 E 0.395 -3 S 0.426 -4 P 0.439 -5 R 0.409 -6 A 0.357 -7 T 0.336 -8 Q 0.358 -9 T 0.389 -10 P 0.419 -11 E 0.463 -12 S 0.508 -13 P 0.525 -14 K 0.508 -15 L 0.468 -16 S 0.428 -17 Q 0.421 -18 P 0.441 -19 R 0.449 -20 A 0.445 -21 H 0.454 -22 L 0.470 -23 S 0.471 -24 A 0.478 -25 H 0.516 -26 Q 0.565 -27 A 0.595 -28 P 0.602 -29 S 0.592 -30 P 0.569 -31 A 0.558 -32 A 0.585 -33 L 0.635 -34 P 0.677 -35 G 0.700 -36 Y 0.706 -37 P 0.694 -38 A 0.663 -39 M 0.618 -40 S 0.570 -41 P 0.525 -42 A 0.485 -43 W 0.454 -44 L 0.430 -45 R 0.402 -46 P 0.367 -47 R 0.328 -48 L 0.295 -49 R 0.275 -50 F 0.267 -51 C 0.259 -52 L 0.244 -53 F 0.231 -54 L 0.228 -55 L 0.229 -56 L 0.230 -57 L 0.240 -58 L 0.269 -59 L 0.318 -60 V 0.383 -61 P 0.450 -62 A 0.501 -63 A 0.533 -64 R 0.561 -65 G 0.594 -66 C 0.628 -67 G 0.658 -68 P 0.686 -69 G 0.710 -70 R 0.726 -71 V 0.732 -72 V 0.727 -73 G 0.708 -74 S 0.676 -75 R 0.633 -76 R 0.589 -77 R 0.557 -78 P 0.535 -79 P 0.504 -80 R 0.448 -81 K 0.380 -82 L 0.314 -83 V 0.259 -84 P 0.219 -85 L 0.192 -86 A 0.169 -87 Y 0.145 -88 K 0.125 -89 Q 0.111 -90 F 0.104 -91 S 0.102 -92 P 0.105 -93 N 0.112 -94 V 0.116 -95 P 0.116 -96 E 0.117 -97 K 0.124 -98 T 0.135 -99 L 0.147 -100 G 0.159 -101 A 0.169 -102 S 0.172 -103 G 0.167 -104 R 0.160 -105 Y 0.157 -106 E 0.162 -107 G 0.170 -108 K 0.173 -109 I 0.168 -110 A 0.159 -111 R 0.152 -112 S 0.147 -113 S 0.145 -114 E 0.145 -115 R 0.150 -116 F 0.159 -117 K 0.167 -118 E 0.173 -119 L 0.180 -120 T 0.192 -121 P 0.205 -122 N 0.214 -123 Y 0.212 -124 N 0.196 -125 P 0.178 -126 D 0.166 -127 I 0.163 -128 I 0.167 -129 F 0.175 -130 K 0.188 -131 D 0.203 -132 E 0.218 -133 E 0.233 -134 N 0.249 -135 T 0.265 -136 G 0.269 -137 A 0.251 -138 D 0.212 -139 R 0.171 -140 L 0.141 -141 M 0.121 -142 T 0.102 -143 Q 0.083 -144 R 0.070 -145 C 0.066 -146 K 0.069 -147 D 0.073 -148 R 0.074 -149 L 0.072 -150 N 0.071 -151 S 0.069 -152 L 0.068 -153 A 0.064 -154 I 0.059 -155 S 0.056 -156 V 0.056 -157 M 0.057 -158 N 0.057 -159 Q 0.060 -160 W 0.070 -161 P 0.085 -162 G 0.098 -163 V 0.108 -164 K 0.119 -165 L 0.134 -166 R 0.153 -167 V 0.176 -168 T 0.198 -169 E 0.214 -170 G 0.225 -171 W 0.227 -172 D 0.218 -173 E 0.209 -174 D 0.207 -175 G 0.212 -176 H 0.217 -177 H 0.221 -178 S 0.230 -179 E 0.249 -180 E 0.269 -181 S 0.271 -182 L 0.249 -183 H 0.222 -184 Y 0.207 -185 E 0.195 -186 G 0.170 -187 R 0.135 -188 A 0.104 -189 V 0.084 -190 D 0.074 -191 I 0.070 -192 T 0.070 -193 T 0.074 -194 S 0.081 -195 D 0.089 -196 R 0.098 -197 D 0.104 -198 R 0.103 -199 N 0.093 -200 K 0.080 -201 Y 0.072 -202 G 0.072 -203 L 0.075 -204 L 0.075 -205 A 0.072 -206 R 0.069 -207 L 0.067 -208 A 0.067 -209 V 0.071 -210 E 0.080 -211 A 0.093 -212 G 0.104 -213 F 0.108 -214 D 0.100 -215 W 0.086 -216 V 0.072 -217 Y 0.066 -218 Y 0.067 -219 E 0.071 -220 S 0.073 -221 K 0.069 -222 A 0.061 -223 H 0.053 -224 V 0.049 -225 H 0.048 -226 C 0.053 -227 S 0.066 -228 V 0.097 -229 K 0.155 -230 S 0.231 -231 E 0.305 -232 H 0.361 -233 S 0.395 -234 A 0.405 -235 A 0.394 -236 A 0.363 -237 K 0.313 -238 T 0.248 -239 G 0.180 -240 G 0.127 -241 C 0.094 -242 F 0.077 -243 P 0.067 -244 A 0.058 -245 G 0.050 -246 A 0.043 -247 Q 0.038 -248 V 0.035 -249 R 0.035 -250 L 0.039 -251 E 0.049 -252 N 0.061 -253 G 0.071 -254 E 0.075 -255 R 0.072 -256 V 0.067 -257 A 0.065 -258 L 0.070 -259 S 0.081 -260 A 0.090 -261 V 0.090 -262 K 0.083 -263 P 0.075 -264 G 0.073 -265 D 0.079 -266 R 0.086 -267 V 0.092 -268 L 0.098 -269 A 0.102 -270 M 0.106 -271 G 0.108 -272 E 0.106 -273 D 0.104 -274 G 0.102 -275 T 0.099 -276 P 0.090 -277 T 0.073 -278 F 0.054 -279 S 0.043 -280 D 0.040 -281 V 0.041 -282 L 0.043 -283 I 0.048 -284 F 0.055 -285 L 0.060 -286 D 0.062 -287 R 0.062 -288 E 0.061 -289 P 0.060 -290 N 0.059 -291 R 0.057 -292 L 0.053 -293 R 0.047 -294 A 0.041 -295 F 0.036 -296 Q 0.033 -297 V 0.034 -298 I 0.037 -299 E 0.043 -300 T 0.048 -301 Q 0.050 -302 D 0.051 -303 P 0.053 -304 P 0.058 -305 R 0.061 -306 R 0.058 -307 L 0.053 -308 A 0.052 -309 L 0.057 -310 T 0.065 -311 P 0.071 -312 A 0.068 -313 H 0.059 -314 L 0.051 -315 L 0.048 -316 F 0.052 -317 I 0.065 -318 A 0.081 -319 D 0.092 -320 N 0.095 -321 H 0.094 -322 T 0.093 -323 E 0.093 -324 P 0.091 -325 A 0.089 -326 A 0.089 -327 H 0.090 -328 F 0.087 -329 R 0.079 -330 A 0.066 -331 T 0.056 -332 F 0.054 -333 A 0.063 -334 S 0.076 -335 H 0.084 -336 V 0.082 -337 Q 0.071 -338 P 0.060 -339 G 0.055 -340 Q 0.057 -341 Y 0.063 -342 V 0.071 -343 L 0.080 -344 V 0.087 -345 S 0.094 -346 G 0.100 -347 V 0.103 -348 P 0.105 -349 G 0.107 -350 L 0.107 -351 Q 0.101 -352 P 0.088 -353 A 0.072 -354 R 0.060 -355 V 0.054 -356 A 0.055 -357 A 0.058 -358 V 0.063 -359 S 0.068 -360 T 0.074 -361 H 0.079 -362 V 0.082 -363 A 0.084 -364 L 0.084 -365 G 0.082 -366 S 0.078 -367 Y 0.076 -368 A 0.076 -369 P 0.078 -370 L 0.082 -371 T 0.095 -372 R 0.118 -373 H 0.137 -374 G 0.137 -375 T 0.124 -376 L 0.114 -377 V 0.112 -378 V 0.109 -379 E 0.100 -380 D 0.090 -381 V 0.081 -382 V 0.074 -383 A 0.072 -384 S 0.080 -385 C 0.095 -386 F 0.110 -387 A 0.120 -388 A 0.122 -389 V 0.118 -390 A 0.112 -391 D 0.104 -392 H 0.098 -393 H 0.096 -394 L 0.099 -395 A 0.108 -396 Q 0.121 -397 L 0.134 -398 A 0.142 -399 F 0.143 -400 W 0.138 -401 P 0.131 -402 L 0.126 -403 R 0.125 -404 L 0.135 -405 F 0.161 -406 P 0.198 -407 S 0.235 -408 L 0.264 -409 A 0.287 -410 W 0.312 -411 G 0.339 -412 S 0.363 -413 W 0.376 -414 T 0.372 -415 P 0.354 -416 S 0.330 -417 E 0.308 -418 G 0.291 -419 V 0.275 -420 H 0.252 -421 W 0.214 -422 Y 0.175 -423 P 0.148 -424 Q 0.134 -425 M 0.130 -426 L 0.133 -427 Y 0.137 -428 R 0.139 -429 L 0.143 -430 G 0.151 -431 R 0.163 -432 L 0.179 -433 L 0.209 -434 L 0.261 -435 E 0.325 -436 E 0.379 -437 S 0.408 -438 T 0.428 -439 F 0.458 -440 H 0.499 -441 P 0.541 -442 L 0.575 -443 G 0.605 -444 M 0.635 -445 S 0.662 -446 G 0.674 -447 A 0.658 -448 G 0.616 -449 S 0.577 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000007480.7_ENSMUST00000172148.5_GN:Mc5r_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000007480.7_ENSMUST00000172148.5_GN:Mc5r_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 645a474700c191725ff5019372241d982ff2b188..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000007480.7_ENSMUST00000172148.5_GN:Mc5r_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,326 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000007480.7|ENSMUST00000172148.5|GN:Mc5r|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.338 -2 N 0.332 -3 S 0.323 -4 S 0.309 -5 S 0.283 -6 T 0.253 -7 L 0.233 -8 T 0.234 -9 V 0.242 -10 L 0.246 -11 N 0.251 -12 L 0.269 -13 T 0.299 -14 L 0.332 -15 N 0.362 -16 A 0.389 -17 S 0.412 -18 E 0.434 -19 D 0.455 -20 G 0.468 -21 I 0.467 -22 L 0.462 -23 G 0.462 -24 S 0.461 -25 N 0.451 -26 V 0.431 -27 K 0.399 -28 N 0.361 -29 K 0.319 -30 S 0.272 -31 L 0.225 -32 A 0.186 -33 C 0.163 -34 E 0.155 -35 E 0.151 -36 M 0.135 -37 G 0.106 -38 I 0.076 -39 A 0.056 -40 V 0.043 -41 E 0.033 -42 V 0.025 -43 F 0.023 -44 L 0.024 -45 T 0.028 -46 L 0.033 -47 G 0.036 -48 L 0.041 -49 V 0.047 -50 S 0.052 -51 L 0.051 -52 L 0.049 -53 E 0.050 -54 N 0.051 -55 I 0.052 -56 L 0.052 -57 V 0.054 -58 I 0.056 -59 G 0.057 -60 A 0.056 -61 I 0.054 -62 V 0.054 -63 K 0.059 -64 N 0.064 -65 K 0.068 -66 N 0.069 -67 L 0.067 -68 H 0.065 -69 S 0.059 -70 P 0.049 -71 M 0.037 -72 Y 0.027 -73 F 0.023 -74 F 0.024 -75 V 0.030 -76 G 0.039 -77 S 0.045 -78 L 0.048 -79 A 0.048 -80 V 0.049 -81 A 0.048 -82 D 0.044 -83 M 0.037 -84 L 0.029 -85 V 0.024 -86 S 0.022 -87 M 0.022 -88 S 0.022 -89 N 0.022 -90 A 0.022 -91 W 0.022 -92 E 0.020 -93 T 0.019 -94 V 0.018 -95 T 0.020 -96 I 0.024 -97 Y 0.031 -98 L 0.041 -99 L 0.060 -100 N 0.089 -101 N 0.124 -102 K 0.152 -103 H 0.164 -104 L 0.161 -105 V 0.151 -106 I 0.137 -107 A 0.121 -108 D 0.101 -109 T 0.085 -110 F 0.077 -111 V 0.075 -112 R 0.073 -113 H 0.071 -114 I 0.066 -115 D 0.057 -116 N 0.046 -117 V 0.039 -118 F 0.035 -119 D 0.036 -120 S 0.038 -121 M 0.036 -122 I 0.033 -123 C 0.032 -124 I 0.034 -125 S 0.037 -126 V 0.038 -127 V 0.038 -128 A 0.038 -129 S 0.037 -130 M 0.034 -131 C 0.033 -132 S 0.034 -133 L 0.036 -134 L 0.035 -135 A 0.034 -136 I 0.035 -137 A 0.039 -138 V 0.046 -139 D 0.051 -140 R 0.051 -141 Y 0.047 -142 I 0.042 -143 T 0.040 -144 I 0.041 -145 F 0.045 -146 Y 0.048 -147 A 0.048 -148 L 0.047 -149 R 0.048 -150 Y 0.049 -151 H 0.049 -152 H 0.051 -153 I 0.054 -154 M 0.056 -155 T 0.050 -156 A 0.041 -157 R 0.035 -158 R 0.038 -159 S 0.048 -160 G 0.062 -161 V 0.071 -162 I 0.067 -163 I 0.057 -164 A 0.050 -165 C 0.047 -166 I 0.046 -167 W 0.043 -168 T 0.037 -169 F 0.032 -170 C 0.030 -171 I 0.031 -172 S 0.036 -173 C 0.043 -174 G 0.048 -175 I 0.046 -176 V 0.041 -177 F 0.039 -178 I 0.042 -179 I 0.045 -180 Y 0.047 -181 Y 0.052 -182 E 0.063 -183 S 0.070 -184 K 0.066 -185 Y 0.055 -186 V 0.045 -187 I 0.037 -188 I 0.033 -189 C 0.032 -190 L 0.035 -191 I 0.040 -192 S 0.044 -193 M 0.045 -194 F 0.041 -195 F 0.037 -196 T 0.036 -197 M 0.036 -198 L 0.036 -199 F 0.035 -200 F 0.036 -201 M 0.037 -202 V 0.036 -203 S 0.032 -204 L 0.029 -205 Y 0.027 -206 I 0.027 -207 H 0.027 -208 M 0.027 -209 F 0.026 -210 L 0.028 -211 L 0.034 -212 A 0.049 -213 R 0.068 -214 N 0.084 -215 H 0.095 -216 V 0.106 -217 K 0.127 -218 R 0.161 -219 I 0.201 -220 A 0.238 -221 A 0.265 -222 S 0.281 -223 P 0.289 -224 R 0.291 -225 Y 0.279 -226 N 0.256 -227 S 0.226 -228 V 0.197 -229 R 0.173 -230 Q 0.157 -231 R 0.146 -232 T 0.138 -233 S 0.133 -234 M 0.125 -235 K 0.107 -236 G 0.082 -237 A 0.064 -238 I 0.058 -239 T 0.057 -240 L 0.055 -241 T 0.052 -242 M 0.052 -243 L 0.053 -244 L 0.054 -245 G 0.051 -246 I 0.045 -247 F 0.038 -248 I 0.029 -249 V 0.026 -250 C 0.029 -251 W 0.038 -252 S 0.044 -253 P 0.040 -254 F 0.031 -255 F 0.025 -256 L 0.024 -257 H 0.026 -258 L 0.026 -259 I 0.025 -260 L 0.027 -261 M 0.036 -262 I 0.053 -263 S 0.079 -264 C 0.106 -265 P 0.121 -266 Q 0.121 -267 N 0.111 -268 V 0.098 -269 Y 0.084 -270 C 0.069 -271 S 0.060 -272 C 0.059 -273 F 0.061 -274 M 0.061 -275 S 0.057 -276 Y 0.052 -277 F 0.046 -278 N 0.040 -279 M 0.038 -280 Y 0.038 -281 L 0.040 -282 I 0.043 -283 L 0.049 -284 I 0.056 -285 M 0.063 -286 C 0.071 -287 N 0.075 -288 S 0.072 -289 V 0.066 -290 I 0.060 -291 D 0.056 -292 P 0.052 -293 L 0.048 -294 I 0.044 -295 Y 0.042 -296 A 0.042 -297 L 0.047 -298 R 0.052 -299 S 0.052 -300 Q 0.046 -301 E 0.041 -302 M 0.043 -303 R 0.052 -304 R 0.063 -305 T 0.066 -306 F 0.065 -307 K 0.068 -308 E 0.077 -309 I 0.088 -310 V 0.109 -311 C 0.147 -312 C 0.208 -313 H 0.279 -314 G 0.343 -315 F 0.392 -316 R 0.437 -317 R 0.486 -318 P 0.529 -319 C 0.556 -320 R 0.572 -321 L 0.587 -322 L 0.596 -323 G 0.581 -324 G 0.540 -325 Y 0.499 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000007480.7_ENSMUST00000172148.5_GN:Mc5r_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:47.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000007480.7_ENSMUST00000172148.5_GN:Mc5r_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:47.caid deleted file mode 100644 index b996b6be8b3ef90149a8770f8db2fd9d3e8dff8a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000007480.7_ENSMUST00000172148.5_GN:Mc5r_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:47.caid +++ /dev/null @@ -1,373 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000007480.7|ENSMUST00000172148.5|GN:Mc5r|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:47 -1 M 0.377 -2 Q 0.398 -3 D 0.430 -4 Q 0.461 -5 S 0.485 -6 P 0.499 -7 V 0.500 -8 N 0.482 -9 R 0.450 -10 R 0.434 -11 F 0.453 -12 N 0.475 -13 S 0.461 -14 Q 0.433 -15 K 0.442 -16 P 0.500 -17 P 0.576 -18 G 0.626 -19 T 0.632 -20 R 0.606 -21 E 0.573 -22 E 0.537 -23 S 0.494 -24 C 0.455 -25 L 0.436 -26 P 0.436 -27 L 0.444 -28 R 0.465 -29 G 0.487 -30 A 0.487 -31 E 0.472 -32 Q 0.480 -33 N 0.527 -34 G 0.566 -35 K 0.556 -36 S 0.511 -37 D 0.459 -38 A 0.420 -39 K 0.401 -40 K 0.405 -41 W 0.427 -42 G 0.454 -43 H 0.476 -44 S 0.498 -45 L 0.522 -46 P 0.541 -47 A 0.540 -48 M 0.521 -49 N 0.502 -50 S 0.487 -51 S 0.461 -52 S 0.417 -53 T 0.369 -54 L 0.344 -55 T 0.347 -56 V 0.361 -57 L 0.371 -58 N 0.384 -59 L 0.413 -60 T 0.460 -61 L 0.510 -62 N 0.547 -63 A 0.571 -64 S 0.588 -65 E 0.607 -66 D 0.626 -67 G 0.633 -68 I 0.624 -69 L 0.614 -70 G 0.617 -71 S 0.622 -72 N 0.612 -73 V 0.579 -74 K 0.528 -75 N 0.467 -76 K 0.398 -77 S 0.324 -78 L 0.257 -79 A 0.210 -80 C 0.184 -81 E 0.170 -82 E 0.156 -83 M 0.131 -84 G 0.099 -85 I 0.071 -86 A 0.053 -87 V 0.042 -88 E 0.033 -89 V 0.025 -90 F 0.022 -91 L 0.024 -92 T 0.028 -93 L 0.032 -94 G 0.035 -95 L 0.038 -96 V 0.044 -97 S 0.047 -98 L 0.047 -99 L 0.045 -100 E 0.047 -101 N 0.049 -102 I 0.050 -103 L 0.051 -104 V 0.053 -105 I 0.055 -106 G 0.055 -107 A 0.054 -108 I 0.051 -109 V 0.050 -110 K 0.052 -111 N 0.057 -112 K 0.061 -113 N 0.062 -114 L 0.061 -115 H 0.058 -116 S 0.053 -117 P 0.043 -118 M 0.032 -119 Y 0.025 -120 F 0.022 -121 F 0.024 -122 V 0.032 -123 G 0.041 -124 S 0.048 -125 L 0.049 -126 A 0.049 -127 V 0.049 -128 A 0.048 -129 D 0.045 -130 M 0.038 -131 L 0.030 -132 V 0.024 -133 S 0.022 -134 M 0.022 -135 S 0.022 -136 N 0.022 -137 A 0.023 -138 W 0.023 -139 E 0.021 -140 T 0.019 -141 V 0.019 -142 T 0.020 -143 I 0.024 -144 Y 0.030 -145 L 0.040 -146 L 0.058 -147 N 0.087 -148 N 0.124 -149 K 0.157 -150 H 0.176 -151 L 0.179 -152 V 0.171 -153 I 0.155 -154 A 0.134 -155 D 0.111 -156 T 0.094 -157 F 0.085 -158 V 0.081 -159 R 0.079 -160 H 0.076 -161 I 0.070 -162 D 0.059 -163 N 0.048 -164 V 0.039 -165 F 0.036 -166 D 0.037 -167 S 0.038 -168 M 0.037 -169 I 0.034 -170 C 0.032 -171 I 0.034 -172 S 0.037 -173 V 0.038 -174 V 0.038 -175 A 0.038 -176 S 0.036 -177 M 0.034 -178 C 0.032 -179 S 0.033 -180 L 0.034 -181 L 0.034 -182 A 0.033 -183 I 0.035 -184 A 0.041 -185 V 0.049 -186 D 0.054 -187 R 0.054 -188 Y 0.048 -189 I 0.042 -190 T 0.039 -191 I 0.039 -192 F 0.042 -193 Y 0.044 -194 A 0.045 -195 L 0.045 -196 R 0.045 -197 Y 0.046 -198 H 0.047 -199 H 0.048 -200 I 0.052 -201 M 0.053 -202 T 0.047 -203 A 0.038 -204 R 0.032 -205 R 0.035 -206 S 0.045 -207 G 0.059 -208 V 0.067 -209 I 0.063 -210 I 0.053 -211 A 0.045 -212 C 0.042 -213 I 0.042 -214 W 0.039 -215 T 0.034 -216 F 0.029 -217 C 0.027 -218 I 0.028 -219 S 0.032 -220 C 0.039 -221 G 0.043 -222 I 0.041 -223 V 0.036 -224 F 0.035 -225 I 0.037 -226 I 0.040 -227 Y 0.042 -228 Y 0.046 -229 E 0.055 -230 S 0.060 -231 K 0.057 -232 Y 0.047 -233 V 0.039 -234 I 0.033 -235 I 0.031 -236 C 0.031 -237 L 0.034 -238 I 0.039 -239 S 0.043 -240 M 0.043 -241 F 0.040 -242 F 0.037 -243 T 0.036 -244 M 0.037 -245 L 0.037 -246 F 0.037 -247 F 0.038 -248 M 0.039 -249 V 0.038 -250 S 0.033 -251 L 0.030 -252 Y 0.027 -253 I 0.027 -254 H 0.027 -255 M 0.027 -256 F 0.027 -257 L 0.028 -258 L 0.035 -259 A 0.049 -260 R 0.068 -261 N 0.085 -262 H 0.095 -263 V 0.107 -264 K 0.129 -265 R 0.163 -266 I 0.204 -267 A 0.242 -268 A 0.269 -269 S 0.284 -270 P 0.293 -271 R 0.294 -272 Y 0.283 -273 N 0.260 -274 S 0.230 -275 V 0.201 -276 R 0.177 -277 Q 0.162 -278 R 0.152 -279 T 0.143 -280 S 0.136 -281 M 0.129 -282 K 0.112 -283 G 0.087 -284 A 0.068 -285 I 0.061 -286 T 0.060 -287 L 0.058 -288 T 0.056 -289 M 0.056 -290 L 0.057 -291 L 0.057 -292 G 0.055 -293 I 0.049 -294 F 0.041 -295 I 0.032 -296 V 0.029 -297 C 0.032 -298 W 0.042 -299 S 0.048 -300 P 0.044 -301 F 0.034 -302 F 0.028 -303 L 0.028 -304 H 0.029 -305 L 0.029 -306 I 0.028 -307 L 0.031 -308 M 0.040 -309 I 0.059 -310 S 0.088 -311 C 0.117 -312 P 0.134 -313 Q 0.134 -314 N 0.126 -315 V 0.114 -316 Y 0.100 -317 C 0.084 -318 S 0.073 -319 C 0.072 -320 F 0.074 -321 M 0.072 -322 S 0.066 -323 Y 0.059 -324 F 0.051 -325 N 0.044 -326 M 0.041 -327 Y 0.041 -328 L 0.044 -329 I 0.048 -330 L 0.053 -331 I 0.061 -332 M 0.069 -333 C 0.077 -334 N 0.081 -335 S 0.078 -336 V 0.071 -337 I 0.065 -338 D 0.060 -339 P 0.055 -340 L 0.051 -341 I 0.047 -342 Y 0.044 -343 A 0.045 -344 L 0.050 -345 R 0.055 -346 S 0.054 -347 Q 0.047 -348 E 0.039 -349 M 0.033 -350 R 0.032 -351 R 0.037 -352 T 0.045 -353 F 0.055 -354 K 0.065 -355 E 0.076 -356 I 0.087 -357 V 0.106 -358 C 0.142 -359 C 0.202 -360 H 0.275 -361 G 0.342 -362 F 0.395 -363 R 0.442 -364 R 0.493 -365 P 0.539 -366 C 0.568 -367 R 0.585 -368 L 0.601 -369 L 0.609 -370 G 0.593 -371 G 0.550 -372 Y 0.509 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000014164.16_ENSMUST00000160860.9_GN:Klhl3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000014164.16_ENSMUST00000160860.9_GN:Klhl3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 4947e92721d6bf06f994e8bfef4d030293193200..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000014164.16_ENSMUST00000160860.9_GN:Klhl3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,588 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000014164.16|ENSMUST00000160860.9|GN:Klhl3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.415 -2 E 0.421 -3 G 0.423 -4 E 0.408 -5 S 0.366 -6 V 0.325 -7 K 0.327 -8 P 0.373 -9 S 0.429 -10 P 0.471 -11 Q 0.497 -12 P 0.495 -13 T 0.456 -14 A 0.412 -15 Q 0.403 -16 A 0.420 -17 E 0.432 -18 D 0.429 -19 E 0.423 -20 E 0.421 -21 K 0.423 -22 N 0.418 -23 R 0.399 -24 R 0.373 -25 T 0.352 -26 V 0.338 -27 T 0.320 -28 V 0.292 -29 N 0.257 -30 A 0.224 -31 A 0.196 -32 H 0.172 -33 M 0.147 -34 G 0.119 -35 K 0.095 -36 A 0.076 -37 F 0.064 -38 K 0.059 -39 V 0.060 -40 M 0.067 -41 N 0.080 -42 E 0.091 -43 L 0.092 -44 R 0.086 -45 S 0.081 -46 K 0.084 -47 R 0.094 -48 L 0.105 -49 L 0.104 -50 C 0.091 -51 D 0.072 -52 V 0.054 -53 M 0.044 -54 I 0.044 -55 V 0.052 -56 A 0.063 -57 E 0.072 -58 D 0.079 -59 V 0.083 -60 E 0.080 -61 V 0.073 -62 E 0.071 -63 A 0.075 -64 H 0.075 -65 R 0.067 -66 V 0.059 -67 V 0.058 -68 L 0.062 -69 A 0.066 -70 A 0.064 -71 C 0.056 -72 S 0.047 -73 P 0.040 -74 Y 0.039 -75 F 0.046 -76 C 0.060 -77 A 0.073 -78 M 0.084 -79 F 0.102 -80 T 0.129 -81 G 0.154 -82 D 0.161 -83 M 0.154 -84 S 0.147 -85 E 0.143 -86 S 0.136 -87 K 0.125 -88 A 0.115 -89 K 0.107 -90 K 0.105 -91 I 0.109 -92 E 0.117 -93 I 0.121 -94 K 0.118 -95 D 0.113 -96 V 0.109 -97 D 0.100 -98 G 0.083 -99 Q 0.066 -100 T 0.060 -101 L 0.061 -102 S 0.064 -103 K 0.064 -104 L 0.064 -105 I 0.066 -106 D 0.067 -107 Y 0.064 -108 I 0.061 -109 Y 0.060 -110 T 0.064 -111 A 0.071 -112 E 0.077 -113 I 0.080 -114 E 0.078 -115 V 0.072 -116 T 0.066 -117 E 0.062 -118 E 0.061 -119 N 0.060 -120 V 0.057 -121 Q 0.055 -122 V 0.055 -123 L 0.056 -124 L 0.053 -125 P 0.050 -126 A 0.050 -127 A 0.054 -128 S 0.057 -129 L 0.058 -130 L 0.059 -131 Q 0.059 -132 L 0.056 -133 M 0.052 -134 D 0.049 -135 V 0.049 -136 R 0.052 -137 Q 0.054 -138 N 0.059 -139 C 0.070 -140 C 0.083 -141 D 0.088 -142 F 0.082 -143 L 0.074 -144 Q 0.068 -145 S 0.066 -146 Q 0.068 -147 L 0.070 -148 H 0.070 -149 P 0.068 -150 T 0.062 -151 N 0.053 -152 C 0.046 -153 L 0.044 -154 G 0.045 -155 I 0.047 -156 R 0.048 -157 A 0.051 -158 F 0.059 -159 A 0.067 -160 D 0.070 -161 V 0.070 -162 H 0.069 -163 T 0.067 -164 C 0.063 -165 T 0.058 -166 D 0.058 -167 L 0.064 -168 L 0.075 -169 Q 0.081 -170 Q 0.081 -171 A 0.080 -172 N 0.082 -173 A 0.082 -174 Y 0.072 -175 A 0.061 -176 E 0.054 -177 Q 0.049 -178 H 0.042 -179 F 0.038 -180 P 0.041 -181 E 0.048 -182 V 0.052 -183 M 0.051 -184 L 0.050 -185 G 0.052 -186 E 0.053 -187 E 0.051 -188 F 0.045 -189 L 0.040 -190 S 0.037 -191 L 0.037 -192 S 0.037 -193 L 0.035 -194 D 0.033 -195 Q 0.031 -196 V 0.032 -197 C 0.038 -198 S 0.050 -199 L 0.064 -200 I 0.078 -201 S 0.093 -202 S 0.105 -203 D 0.106 -204 K 0.093 -205 L 0.072 -206 T 0.053 -207 V 0.040 -208 S 0.036 -209 S 0.041 -210 E 0.050 -211 E 0.059 -212 K 0.064 -213 V 0.066 -214 F 0.065 -215 E 0.062 -216 A 0.057 -217 V 0.052 -218 I 0.053 -219 S 0.060 -220 W 0.065 -221 I 0.064 -222 N 0.058 -223 Y 0.050 -224 E 0.043 -225 K 0.037 -226 E 0.034 -227 T 0.034 -228 R 0.035 -229 L 0.037 -230 D 0.041 -231 H 0.043 -232 M 0.044 -233 A 0.044 -234 K 0.044 -235 L 0.045 -236 M 0.048 -237 E 0.051 -238 H 0.052 -239 V 0.054 -240 R 0.056 -241 L 0.059 -242 P 0.061 -243 L 0.062 -244 L 0.062 -245 P 0.064 -246 R 0.067 -247 D 0.067 -248 Y 0.063 -249 L 0.060 -250 V 0.065 -251 Q 0.072 -252 T 0.073 -253 V 0.070 -254 E 0.062 -255 E 0.053 -256 E 0.046 -257 A 0.045 -258 L 0.047 -259 I 0.049 -260 K 0.049 -261 N 0.048 -262 N 0.046 -263 N 0.045 -264 T 0.046 -265 C 0.053 -266 K 0.065 -267 D 0.076 -268 F 0.080 -269 L 0.084 -270 I 0.086 -271 E 0.084 -272 A 0.075 -273 M 0.065 -274 K 0.057 -275 Y 0.054 -276 H 0.058 -277 L 0.070 -278 L 0.088 -279 P 0.106 -280 L 0.118 -281 D 0.124 -282 Q 0.130 -283 R 0.141 -284 L 0.163 -285 L 0.187 -286 I 0.198 -287 K 0.190 -288 N 0.169 -289 P 0.149 -290 R 0.143 -291 T 0.156 -292 K 0.179 -293 P 0.205 -294 R 0.233 -295 T 0.263 -296 P 0.287 -297 V 0.294 -298 S 0.280 -299 L 0.241 -300 P 0.182 -301 K 0.118 -302 V 0.067 -303 M 0.040 -304 I 0.034 -305 V 0.044 -306 V 0.066 -307 G 0.094 -308 G 0.118 -309 Q 0.124 -310 A 0.117 -311 P 0.117 -312 K 0.129 -313 A 0.138 -314 I 0.132 -315 R 0.116 -316 S 0.101 -317 V 0.088 -318 E 0.078 -319 C 0.068 -320 Y 0.062 -321 D 0.058 -322 F 0.059 -323 E 0.065 -324 E 0.075 -325 G 0.083 -326 R 0.085 -327 W 0.083 -328 D 0.084 -329 Q 0.086 -330 I 0.086 -331 A 0.083 -332 E 0.078 -333 L 0.072 -334 P 0.065 -335 S 0.063 -336 R 0.069 -337 R 0.081 -338 C 0.096 -339 R 0.104 -340 A 0.103 -341 G 0.095 -342 V 0.086 -343 V 0.080 -344 F 0.077 -345 M 0.074 -346 A 0.067 -347 G 0.053 -348 H 0.037 -349 V 0.025 -350 Y 0.024 -351 A 0.031 -352 V 0.043 -353 G 0.055 -354 G 0.066 -355 F 0.075 -356 N 0.080 -357 G 0.088 -358 S 0.101 -359 L 0.119 -360 R 0.130 -361 V 0.129 -362 R 0.122 -363 T 0.110 -364 V 0.093 -365 D 0.075 -366 V 0.063 -367 Y 0.060 -368 D 0.060 -369 G 0.060 -370 V 0.057 -371 K 0.057 -372 D 0.062 -373 Q 0.068 -374 W 0.070 -375 T 0.070 -376 S 0.073 -377 I 0.079 -378 A 0.086 -379 S 0.090 -380 M 0.088 -381 Q 0.086 -382 E 0.088 -383 R 0.093 -384 R 0.101 -385 S 0.110 -386 T 0.117 -387 L 0.118 -388 G 0.106 -389 A 0.087 -390 A 0.076 -391 V 0.076 -392 L 0.077 -393 N 0.068 -394 D 0.052 -395 L 0.035 -396 L 0.025 -397 Y 0.026 -398 A 0.036 -399 V 0.052 -400 G 0.070 -401 G 0.086 -402 F 0.096 -403 D 0.098 -404 G 0.097 -405 S 0.104 -406 T 0.119 -407 G 0.130 -408 L 0.133 -409 A 0.129 -410 S 0.120 -411 V 0.106 -412 E 0.090 -413 A 0.072 -414 Y 0.056 -415 S 0.044 -416 Y 0.039 -417 K 0.041 -418 T 0.050 -419 N 0.061 -420 E 0.070 -421 W 0.074 -422 F 0.079 -423 F 0.088 -424 V 0.097 -425 A 0.104 -426 P 0.106 -427 M 0.100 -428 N 0.092 -429 T 0.090 -430 R 0.093 -431 R 0.102 -432 S 0.118 -433 S 0.140 -434 V 0.154 -435 G 0.147 -436 V 0.128 -437 G 0.112 -438 V 0.107 -439 V 0.107 -440 E 0.099 -441 G 0.082 -442 K 0.059 -443 L 0.041 -444 Y 0.037 -445 A 0.048 -446 V 0.066 -447 G 0.089 -448 G 0.114 -449 Y 0.136 -450 D 0.145 -451 G 0.141 -452 A 0.131 -453 S 0.127 -454 R 0.133 -455 Q 0.144 -456 C 0.151 -457 L 0.149 -458 S 0.141 -459 T 0.128 -460 V 0.111 -461 E 0.094 -462 Q 0.079 -463 Y 0.071 -464 N 0.073 -465 P 0.084 -466 A 0.096 -467 T 0.102 -468 N 0.103 -469 E 0.103 -470 W 0.103 -471 I 0.105 -472 Y 0.109 -473 V 0.111 -474 A 0.111 -475 D 0.110 -476 M 0.107 -477 S 0.105 -478 T 0.109 -479 R 0.122 -480 R 0.141 -481 S 0.161 -482 G 0.173 -483 A 0.174 -484 G 0.165 -485 V 0.150 -486 G 0.136 -487 V 0.126 -488 L 0.120 -489 S 0.116 -490 G 0.106 -491 Q 0.085 -492 L 0.060 -493 Y 0.046 -494 A 0.051 -495 T 0.068 -496 G 0.092 -497 G 0.114 -498 H 0.125 -499 D 0.123 -500 G 0.116 -501 P 0.115 -502 L 0.123 -503 V 0.128 -504 R 0.128 -505 K 0.126 -506 S 0.121 -507 V 0.112 -508 E 0.099 -509 V 0.088 -510 Y 0.081 -511 D 0.080 -512 P 0.084 -513 G 0.090 -514 T 0.096 -515 N 0.100 -516 T 0.102 -517 W 0.102 -518 K 0.105 -519 Q 0.111 -520 V 0.116 -521 A 0.116 -522 D 0.111 -523 M 0.102 -524 N 0.093 -525 M 0.091 -526 C 0.104 -527 R 0.130 -528 R 0.156 -529 N 0.168 -530 A 0.164 -531 G 0.149 -532 V 0.130 -533 C 0.116 -534 A 0.109 -535 V 0.109 -536 N 0.110 -537 G 0.103 -538 L 0.082 -539 L 0.058 -540 Y 0.046 -541 V 0.052 -542 V 0.067 -543 G 0.083 -544 G 0.099 -545 D 0.113 -546 D 0.120 -547 G 0.121 -548 S 0.121 -549 C 0.125 -550 N 0.137 -551 L 0.152 -552 A 0.158 -553 S 0.146 -554 V 0.123 -555 E 0.096 -556 Y 0.075 -557 Y 0.065 -558 N 0.067 -559 P 0.077 -560 V 0.085 -561 T 0.086 -562 D 0.084 -563 K 0.083 -564 W 0.081 -565 T 0.081 -566 L 0.082 -567 L 0.084 -568 P 0.086 -569 T 0.087 -570 N 0.086 -571 M 0.085 -572 S 0.090 -573 T 0.102 -574 G 0.118 -575 R 0.133 -576 S 0.144 -577 Y 0.145 -578 A 0.134 -579 G 0.113 -580 V 0.092 -581 A 0.078 -582 V 0.070 -583 I 0.066 -584 H 0.067 -585 K 0.075 -586 S 0.088 -587 L 0.099 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000014164.16_ENSMUST00000160860.9_GN:Klhl3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000014164.16_ENSMUST00000160860.9_GN:Klhl3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid deleted file mode 100644 index 65917e41c908e837e1f8b9ca1c6a9255f2c23fc1..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000014164.16_ENSMUST00000160860.9_GN:Klhl3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid +++ /dev/null @@ -1,598 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000014164.16|ENSMUST00000160860.9|GN:Klhl3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:10 -1 M 0.342 -2 T 0.335 -3 T 0.341 -4 N 0.364 -5 P 0.386 -6 A 0.408 -7 G 0.441 -8 P 0.468 -9 P 0.461 -10 T 0.443 -11 M 0.447 -12 E 0.459 -13 G 0.446 -14 E 0.420 -15 S 0.411 -16 V 0.416 -17 K 0.422 -18 P 0.436 -19 S 0.459 -20 P 0.488 -21 Q 0.521 -22 P 0.550 -23 T 0.557 -24 A 0.539 -25 Q 0.514 -26 A 0.499 -27 E 0.489 -28 D 0.472 -29 E 0.452 -30 E 0.440 -31 K 0.438 -32 N 0.433 -33 R 0.414 -34 R 0.385 -35 T 0.363 -36 V 0.346 -37 T 0.323 -38 V 0.290 -39 N 0.253 -40 A 0.220 -41 A 0.194 -42 H 0.172 -43 M 0.149 -44 G 0.122 -45 K 0.098 -46 A 0.078 -47 F 0.066 -48 K 0.060 -49 V 0.060 -50 M 0.068 -51 N 0.080 -52 E 0.091 -53 L 0.092 -54 R 0.086 -55 S 0.081 -56 K 0.083 -57 R 0.093 -58 L 0.103 -59 L 0.102 -60 C 0.089 -61 D 0.070 -62 V 0.053 -63 M 0.043 -64 I 0.043 -65 V 0.051 -66 A 0.062 -67 E 0.071 -68 D 0.078 -69 V 0.081 -70 E 0.078 -71 V 0.071 -72 E 0.069 -73 A 0.073 -74 H 0.074 -75 R 0.066 -76 V 0.058 -77 V 0.057 -78 L 0.060 -79 A 0.063 -80 A 0.061 -81 C 0.054 -82 S 0.045 -83 P 0.038 -84 Y 0.035 -85 F 0.036 -86 C 0.041 -87 A 0.049 -88 M 0.065 -89 F 0.090 -90 T 0.123 -91 G 0.149 -92 D 0.157 -93 M 0.151 -94 S 0.145 -95 E 0.142 -96 S 0.135 -97 K 0.123 -98 A 0.113 -99 K 0.105 -100 K 0.104 -101 I 0.109 -102 E 0.117 -103 I 0.120 -104 K 0.117 -105 D 0.112 -106 V 0.108 -107 D 0.099 -108 G 0.082 -109 Q 0.066 -110 T 0.059 -111 L 0.061 -112 S 0.063 -113 K 0.063 -114 L 0.064 -115 I 0.066 -116 D 0.066 -117 Y 0.063 -118 I 0.060 -119 Y 0.060 -120 T 0.064 -121 A 0.071 -122 E 0.078 -123 I 0.080 -124 E 0.079 -125 V 0.073 -126 T 0.067 -127 E 0.064 -128 E 0.062 -129 N 0.061 -130 V 0.058 -131 Q 0.055 -132 V 0.056 -133 L 0.057 -134 L 0.054 -135 P 0.050 -136 A 0.051 -137 A 0.055 -138 S 0.058 -139 L 0.059 -140 L 0.060 -141 Q 0.060 -142 L 0.057 -143 M 0.052 -144 D 0.049 -145 V 0.049 -146 R 0.051 -147 Q 0.054 -148 N 0.059 -149 C 0.069 -150 C 0.082 -151 D 0.086 -152 F 0.081 -153 L 0.073 -154 Q 0.067 -155 S 0.065 -156 Q 0.067 -157 L 0.069 -158 H 0.069 -159 P 0.067 -160 T 0.061 -161 N 0.052 -162 C 0.045 -163 L 0.043 -164 G 0.044 -165 I 0.046 -166 R 0.047 -167 A 0.050 -168 F 0.057 -169 A 0.065 -170 D 0.069 -171 V 0.069 -172 H 0.067 -173 T 0.065 -174 C 0.062 -175 T 0.057 -176 D 0.056 -177 L 0.063 -178 L 0.074 -179 Q 0.081 -180 Q 0.080 -181 A 0.079 -182 N 0.081 -183 A 0.080 -184 Y 0.070 -185 A 0.060 -186 E 0.053 -187 Q 0.048 -188 H 0.042 -189 F 0.037 -190 P 0.040 -191 E 0.047 -192 V 0.051 -193 M 0.050 -194 L 0.049 -195 G 0.051 -196 E 0.052 -197 E 0.050 -198 F 0.045 -199 L 0.039 -200 S 0.037 -201 L 0.036 -202 S 0.036 -203 L 0.035 -204 D 0.032 -205 Q 0.030 -206 V 0.031 -207 C 0.038 -208 S 0.049 -209 L 0.063 -210 I 0.078 -211 S 0.093 -212 S 0.104 -213 D 0.105 -214 K 0.092 -215 L 0.071 -216 T 0.052 -217 V 0.039 -218 S 0.035 -219 S 0.040 -220 E 0.049 -221 E 0.058 -222 K 0.063 -223 V 0.065 -224 F 0.064 -225 E 0.061 -226 A 0.056 -227 V 0.051 -228 I 0.052 -229 S 0.059 -230 W 0.064 -231 I 0.063 -232 N 0.057 -233 Y 0.050 -234 E 0.042 -235 K 0.036 -236 E 0.034 -237 T 0.034 -238 R 0.034 -239 L 0.037 -240 D 0.041 -241 H 0.043 -242 M 0.044 -243 A 0.044 -244 K 0.044 -245 L 0.045 -246 M 0.048 -247 E 0.051 -248 H 0.052 -249 V 0.054 -250 R 0.057 -251 L 0.060 -252 P 0.062 -253 L 0.061 -254 L 0.059 -255 P 0.054 -256 R 0.048 -257 D 0.043 -258 Y 0.041 -259 L 0.041 -260 V 0.042 -261 Q 0.046 -262 T 0.053 -263 V 0.059 -264 E 0.059 -265 E 0.053 -266 E 0.047 -267 A 0.045 -268 L 0.048 -269 I 0.049 -270 K 0.049 -271 N 0.048 -272 N 0.047 -273 N 0.045 -274 T 0.047 -275 C 0.053 -276 K 0.064 -277 D 0.074 -278 F 0.079 -279 L 0.083 -280 I 0.087 -281 E 0.084 -282 A 0.076 -283 M 0.066 -284 K 0.058 -285 Y 0.055 -286 H 0.059 -287 L 0.070 -288 L 0.089 -289 P 0.107 -290 L 0.119 -291 D 0.125 -292 Q 0.131 -293 R 0.143 -294 L 0.165 -295 L 0.189 -296 I 0.200 -297 K 0.191 -298 N 0.170 -299 P 0.149 -300 R 0.143 -301 T 0.156 -302 K 0.179 -303 P 0.205 -304 R 0.233 -305 T 0.263 -306 P 0.286 -307 V 0.293 -308 S 0.277 -309 L 0.239 -310 P 0.181 -311 K 0.117 -312 V 0.067 -313 M 0.039 -314 I 0.033 -315 V 0.044 -316 V 0.066 -317 G 0.094 -318 G 0.118 -319 Q 0.124 -320 A 0.117 -321 P 0.116 -322 K 0.128 -323 A 0.137 -324 I 0.131 -325 R 0.116 -326 S 0.100 -327 V 0.088 -328 E 0.077 -329 C 0.068 -330 Y 0.061 -331 D 0.055 -332 F 0.054 -333 E 0.058 -334 E 0.069 -335 G 0.079 -336 R 0.083 -337 W 0.082 -338 D 0.082 -339 Q 0.084 -340 I 0.084 -341 A 0.082 -342 E 0.077 -343 L 0.070 -344 P 0.064 -345 S 0.062 -346 R 0.068 -347 R 0.081 -348 C 0.096 -349 R 0.105 -350 A 0.104 -351 G 0.096 -352 V 0.087 -353 V 0.080 -354 F 0.077 -355 M 0.074 -356 A 0.067 -357 G 0.052 -358 H 0.036 -359 V 0.025 -360 Y 0.023 -361 A 0.031 -362 V 0.042 -363 G 0.054 -364 G 0.064 -365 F 0.073 -366 N 0.078 -367 G 0.084 -368 S 0.098 -369 L 0.115 -370 R 0.126 -371 V 0.127 -372 R 0.121 -373 T 0.109 -374 V 0.092 -375 D 0.074 -376 V 0.062 -377 Y 0.058 -378 D 0.058 -379 G 0.058 -380 V 0.056 -381 K 0.056 -382 D 0.060 -383 Q 0.066 -384 W 0.068 -385 T 0.069 -386 S 0.072 -387 I 0.078 -388 A 0.085 -389 S 0.089 -390 M 0.088 -391 Q 0.085 -392 E 0.087 -393 R 0.092 -394 R 0.099 -395 S 0.108 -396 T 0.116 -397 L 0.117 -398 G 0.105 -399 A 0.087 -400 A 0.076 -401 V 0.075 -402 L 0.076 -403 N 0.068 -404 D 0.052 -405 L 0.035 -406 L 0.025 -407 Y 0.026 -408 A 0.036 -409 V 0.053 -410 G 0.070 -411 G 0.087 -412 F 0.097 -413 D 0.098 -414 G 0.097 -415 S 0.104 -416 T 0.118 -417 G 0.129 -418 L 0.132 -419 A 0.129 -420 S 0.120 -421 V 0.106 -422 E 0.090 -423 A 0.072 -424 Y 0.055 -425 S 0.044 -426 Y 0.039 -427 K 0.041 -428 T 0.049 -429 N 0.060 -430 E 0.069 -431 W 0.073 -432 F 0.078 -433 F 0.087 -434 V 0.097 -435 A 0.105 -436 P 0.106 -437 M 0.100 -438 N 0.093 -439 T 0.091 -440 R 0.093 -441 R 0.101 -442 S 0.118 -443 S 0.139 -444 V 0.153 -445 G 0.147 -446 V 0.127 -447 G 0.112 -448 V 0.107 -449 V 0.106 -450 E 0.099 -451 G 0.083 -452 K 0.060 -453 L 0.041 -454 Y 0.037 -455 A 0.048 -456 V 0.067 -457 G 0.089 -458 G 0.115 -459 Y 0.138 -460 D 0.149 -461 G 0.144 -462 A 0.134 -463 S 0.129 -464 R 0.135 -465 Q 0.147 -466 C 0.154 -467 L 0.152 -468 S 0.144 -469 T 0.130 -470 V 0.114 -471 E 0.096 -472 Q 0.080 -473 Y 0.069 -474 N 0.063 -475 P 0.064 -476 A 0.071 -477 T 0.082 -478 N 0.094 -479 E 0.101 -480 W 0.103 -481 I 0.106 -482 Y 0.109 -483 V 0.112 -484 A 0.112 -485 D 0.111 -486 M 0.108 -487 S 0.106 -488 T 0.110 -489 R 0.123 -490 R 0.143 -491 S 0.162 -492 G 0.175 -493 A 0.176 -494 G 0.167 -495 V 0.153 -496 G 0.138 -497 V 0.128 -498 L 0.122 -499 S 0.118 -500 G 0.108 -501 Q 0.086 -502 L 0.060 -503 Y 0.046 -504 A 0.051 -505 T 0.068 -506 G 0.091 -507 G 0.112 -508 H 0.123 -509 D 0.121 -510 G 0.114 -511 P 0.114 -512 L 0.121 -513 V 0.127 -514 R 0.128 -515 K 0.126 -516 S 0.122 -517 V 0.113 -518 E 0.100 -519 V 0.089 -520 Y 0.082 -521 D 0.082 -522 P 0.086 -523 G 0.091 -524 T 0.096 -525 N 0.100 -526 T 0.102 -527 W 0.102 -528 K 0.105 -529 Q 0.112 -530 V 0.117 -531 A 0.117 -532 D 0.111 -533 M 0.102 -534 N 0.093 -535 M 0.091 -536 C 0.104 -537 R 0.131 -538 R 0.157 -539 N 0.169 -540 A 0.165 -541 G 0.150 -542 V 0.131 -543 C 0.116 -544 A 0.110 -545 V 0.110 -546 N 0.111 -547 G 0.104 -548 L 0.083 -549 L 0.059 -550 Y 0.047 -551 V 0.052 -552 V 0.067 -553 G 0.084 -554 G 0.100 -555 D 0.113 -556 D 0.120 -557 G 0.121 -558 S 0.120 -559 C 0.125 -560 N 0.137 -561 L 0.152 -562 A 0.158 -563 S 0.146 -564 V 0.123 -565 E 0.097 -566 Y 0.076 -567 Y 0.063 -568 N 0.060 -569 P 0.062 -570 V 0.066 -571 T 0.071 -572 D 0.076 -573 K 0.080 -574 W 0.081 -575 T 0.081 -576 L 0.082 -577 L 0.084 -578 P 0.086 -579 T 0.087 -580 N 0.086 -581 M 0.086 -582 S 0.091 -583 T 0.103 -584 G 0.118 -585 R 0.134 -586 S 0.145 -587 Y 0.146 -588 A 0.134 -589 G 0.113 -590 V 0.092 -591 A 0.078 -592 V 0.070 -593 I 0.065 -594 H 0.066 -595 K 0.074 -596 S 0.087 -597 L 0.097 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000015672.5_ENSMUST00000220621.2_GN:Mrpl32_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000015672.5_ENSMUST00000220621.2_GN:Mrpl32_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 088eab673e5f64997179a8f7d94494efa1c6d46c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000015672.5_ENSMUST00000220621.2_GN:Mrpl32_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,188 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000015672.5|ENSMUST00000220621.2|GN:Mrpl32|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.431 -2 A 0.475 -3 P 0.526 -4 S 0.544 -5 L 0.521 -6 L 0.498 -7 L 0.510 -8 L 0.546 -9 S 0.573 -10 L 0.586 -11 P 0.598 -12 W 0.617 -13 P 0.633 -14 V 0.623 -15 R 0.581 -16 P 0.521 -17 G 0.464 -18 P 0.417 -19 L 0.375 -20 Q 0.332 -21 R 0.294 -22 C 0.274 -23 W 0.270 -24 E 0.270 -25 L 0.270 -26 L 0.276 -27 Q 0.286 -28 R 0.293 -29 Q 0.305 -30 L 0.327 -31 Q 0.349 -32 Q 0.359 -33 S 0.367 -34 W 0.391 -35 S 0.428 -36 R 0.462 -37 F 0.490 -38 V 0.518 -39 S 0.549 -40 P 0.584 -41 P 0.619 -42 W 0.653 -43 A 0.692 -44 P 0.731 -45 A 0.760 -46 L 0.771 -47 A 0.765 -48 V 0.750 -49 Q 0.735 -50 R 0.726 -51 P 0.728 -52 S 0.736 -53 I 0.742 -54 L 0.744 -55 T 0.745 -56 E 0.750 -57 L 0.757 -58 A 0.762 -59 H 0.768 -60 D 0.775 -61 T 0.777 -62 C 0.772 -63 E 0.763 -64 N 0.756 -65 K 0.748 -66 E 0.732 -67 N 0.696 -68 S 0.635 -69 S 0.554 -70 F 0.472 -71 L 0.409 -72 D 0.365 -73 S 0.322 -74 I 0.288 -75 F 0.296 -76 W 0.367 -77 M 0.475 -78 A 0.572 -79 A 0.613 -80 P 0.593 -81 K 0.552 -82 N 0.537 -83 R 0.545 -84 R 0.546 -85 T 0.535 -86 I 0.520 -87 E 0.498 -88 V 0.457 -89 N 0.405 -90 R 0.362 -91 C 0.338 -92 R 0.326 -93 R 0.318 -94 R 0.317 -95 N 0.324 -96 P 0.335 -97 Q 0.356 -98 K 0.384 -99 L 0.419 -100 I 0.461 -101 K 0.507 -102 I 0.539 -103 K 0.534 -104 N 0.478 -105 N 0.376 -106 I 0.265 -107 D 0.180 -108 I 0.131 -109 C 0.108 -110 P 0.098 -111 E 0.096 -112 C 0.103 -113 G 0.120 -114 H 0.141 -115 L 0.164 -116 K 0.199 -117 Q 0.249 -118 K 0.296 -119 H 0.310 -120 V 0.280 -121 L 0.222 -122 C 0.154 -123 G 0.101 -124 Y 0.078 -125 C 0.083 -126 Y 0.101 -127 E 0.120 -128 K 0.134 -129 V 0.141 -130 R 0.141 -131 Q 0.139 -132 E 0.137 -133 T 0.130 -134 T 0.114 -135 K 0.098 -136 I 0.092 -137 R 0.096 -138 Q 0.105 -139 Q 0.120 -140 I 0.146 -141 G 0.179 -142 A 0.209 -143 Q 0.236 -144 E 0.267 -145 G 0.297 -146 G 0.314 -147 P 0.316 -148 F 0.314 -149 R 0.314 -150 A 0.314 -151 P 0.311 -152 S 0.304 -153 V 0.287 -154 E 0.258 -155 T 0.223 -156 M 0.199 -157 V 0.192 -158 L 0.199 -159 Y 0.211 -160 T 0.224 -161 G 0.230 -162 E 0.229 -163 K 0.223 -164 P 0.211 -165 S 0.203 -166 E 0.207 -167 K 0.219 -168 D 0.230 -169 Q 0.231 -170 G 0.223 -171 K 0.212 -172 R 0.204 -173 I 0.198 -174 V 0.190 -175 E 0.178 -176 R 0.167 -177 N 0.166 -178 I 0.176 -179 K 0.186 -180 R 0.188 -181 P 0.184 -182 S 0.175 -183 W 0.167 -184 F 0.170 -185 T 0.190 -186 Q 0.221 -187 N 0.245 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000015672.5_ENSMUST00000220621.2_GN:Mrpl32_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:13.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000015672.5_ENSMUST00000220621.2_GN:Mrpl32_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:13.caid deleted file mode 100644 index 4ff884be26973ecc96756f448cc1662eec315904..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000015672.5_ENSMUST00000220621.2_GN:Mrpl32_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:13.caid +++ /dev/null @@ -1,201 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000015672.5|ENSMUST00000220621.2|GN:Mrpl32|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:13 -1 M 0.407 -2 R 0.433 -3 S 0.482 -4 A 0.537 -5 R 0.577 -6 V 0.595 -7 P 0.601 -8 L 0.599 -9 C 0.588 -10 L 0.575 -11 E 0.567 -12 K 0.568 -13 I 0.579 -14 M 0.607 -15 A 0.648 -16 P 0.681 -17 S 0.685 -18 L 0.666 -19 L 0.649 -20 L 0.644 -21 L 0.643 -22 S 0.639 -23 L 0.634 -24 P 0.641 -25 W 0.663 -26 P 0.683 -27 V 0.680 -28 R 0.647 -29 P 0.597 -30 G 0.548 -31 P 0.510 -32 L 0.479 -33 Q 0.454 -34 R 0.429 -35 C 0.402 -36 W 0.377 -37 E 0.355 -38 L 0.343 -39 L 0.345 -40 Q 0.351 -41 R 0.355 -42 Q 0.367 -43 L 0.396 -44 Q 0.428 -45 Q 0.446 -46 S 0.456 -47 W 0.479 -48 S 0.516 -49 R 0.550 -50 F 0.572 -51 V 0.583 -52 S 0.598 -53 P 0.623 -54 P 0.655 -55 W 0.688 -56 A 0.722 -57 P 0.757 -58 A 0.783 -59 L 0.793 -60 A 0.786 -61 V 0.771 -62 Q 0.754 -63 R 0.745 -64 P 0.745 -65 S 0.752 -66 I 0.757 -67 L 0.757 -68 T 0.756 -69 E 0.759 -70 L 0.765 -71 A 0.769 -72 H 0.773 -73 D 0.778 -74 T 0.780 -75 C 0.775 -76 E 0.766 -77 N 0.757 -78 K 0.748 -79 E 0.730 -80 N 0.692 -81 S 0.627 -82 S 0.542 -83 F 0.457 -84 L 0.395 -85 D 0.353 -86 S 0.315 -87 I 0.285 -88 F 0.296 -89 W 0.368 -90 M 0.478 -91 A 0.574 -92 A 0.613 -93 P 0.589 -94 K 0.545 -95 N 0.527 -96 R 0.533 -97 R 0.531 -98 T 0.515 -99 I 0.495 -100 E 0.472 -101 V 0.434 -102 N 0.385 -103 R 0.344 -104 C 0.321 -105 R 0.308 -106 R 0.300 -107 R 0.296 -108 N 0.301 -109 P 0.314 -110 Q 0.338 -111 K 0.369 -112 L 0.405 -113 I 0.448 -114 K 0.495 -115 I 0.531 -116 K 0.531 -117 N 0.480 -118 N 0.382 -119 I 0.270 -120 D 0.183 -121 I 0.133 -122 C 0.109 -123 P 0.099 -124 E 0.097 -125 C 0.105 -126 G 0.122 -127 H 0.143 -128 L 0.167 -129 K 0.203 -130 Q 0.255 -131 K 0.304 -132 H 0.318 -133 V 0.288 -134 L 0.228 -135 C 0.158 -136 G 0.103 -137 Y 0.079 -138 C 0.083 -139 Y 0.101 -140 E 0.120 -141 K 0.135 -142 V 0.143 -143 R 0.143 -144 Q 0.141 -145 E 0.139 -146 T 0.132 -147 T 0.117 -148 K 0.101 -149 I 0.094 -150 R 0.097 -151 Q 0.107 -152 Q 0.122 -153 I 0.148 -154 G 0.181 -155 A 0.211 -156 Q 0.238 -157 E 0.268 -158 G 0.296 -159 G 0.312 -160 P 0.315 -161 F 0.313 -162 R 0.314 -163 A 0.315 -164 P 0.313 -165 S 0.306 -166 V 0.291 -167 E 0.261 -168 T 0.226 -169 M 0.201 -170 V 0.192 -171 L 0.197 -172 Y 0.209 -173 T 0.221 -174 G 0.227 -175 E 0.226 -176 K 0.219 -177 P 0.208 -178 S 0.199 -179 E 0.202 -180 K 0.214 -181 D 0.224 -182 Q 0.223 -183 G 0.214 -184 K 0.203 -185 R 0.195 -186 I 0.190 -187 V 0.183 -188 E 0.171 -189 R 0.161 -190 N 0.160 -191 I 0.171 -192 K 0.182 -193 R 0.186 -194 P 0.182 -195 S 0.173 -196 W 0.164 -197 F 0.167 -198 T 0.188 -199 Q 0.220 -200 N 0.244 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000018567.15_ENSMUST00000018711.15_GN:Gabarap_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000018567.15_ENSMUST00000018711.15_GN:Gabarap_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 52a7d700c3668c7c3e1bd2e5e5c8b0873706b0d7..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000018567.15_ENSMUST00000018711.15_GN:Gabarap_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,118 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000018567.15|ENSMUST00000018711.15|GN:Gabarap|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.237 -2 K 0.195 -3 F 0.139 -4 V 0.098 -5 Y 0.080 -6 K 0.080 -7 E 0.089 -8 E 0.100 -9 H 0.105 -10 P 0.096 -11 F 0.078 -12 E 0.060 -13 K 0.050 -14 R 0.049 -15 R 0.055 -16 S 0.060 -17 E 0.058 -18 G 0.057 -19 E 0.064 -20 K 0.072 -21 I 0.073 -22 R 0.071 -23 K 0.070 -24 K 0.069 -25 Y 0.067 -26 P 0.063 -27 D 0.056 -28 R 0.047 -29 V 0.039 -30 P 0.034 -31 V 0.030 -32 I 0.033 -33 V 0.045 -34 E 0.069 -35 K 0.102 -36 A 0.137 -37 P 0.160 -38 K 0.166 -39 A 0.162 -40 R 0.159 -41 I 0.160 -42 G 0.162 -43 D 0.155 -44 L 0.135 -45 D 0.110 -46 K 0.090 -47 K 0.079 -48 K 0.080 -49 Y 0.093 -50 L 0.112 -51 V 0.122 -52 P 0.122 -53 S 0.117 -54 D 0.107 -55 L 0.090 -56 T 0.068 -57 V 0.051 -58 G 0.042 -59 Q 0.038 -60 F 0.034 -61 Y 0.029 -62 F 0.026 -63 L 0.025 -64 I 0.028 -65 R 0.034 -66 K 0.041 -67 R 0.050 -68 I 0.062 -69 H 0.076 -70 L 0.094 -71 R 0.109 -72 A 0.113 -73 E 0.106 -74 D 0.092 -75 A 0.075 -76 L 0.056 -77 F 0.039 -78 F 0.032 -79 F 0.037 -80 V 0.049 -81 N 0.063 -82 N 0.075 -83 V 0.084 -84 I 0.088 -85 P 0.089 -86 P 0.086 -87 T 0.077 -88 S 0.065 -89 A 0.052 -90 T 0.041 -91 M 0.036 -92 G 0.037 -93 Q 0.039 -94 L 0.037 -95 Y 0.032 -96 Q 0.029 -97 E 0.030 -98 H 0.034 -99 H 0.043 -100 E 0.057 -101 E 0.070 -102 D 0.076 -103 F 0.070 -104 F 0.057 -105 L 0.046 -106 Y 0.042 -107 I 0.045 -108 A 0.051 -109 Y 0.061 -110 S 0.077 -111 D 0.101 -112 E 0.133 -113 S 0.176 -114 V 0.227 -115 Y 0.276 -116 G 0.313 -117 L 0.329 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000018567.15_ENSMUST00000018711.15_GN:Gabarap_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:46.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000018567.15_ENSMUST00000018711.15_GN:Gabarap_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:46.caid deleted file mode 100644 index 73f48642b7eb90e2fe4bee0dabfb4d843d1ca379..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000018567.15_ENSMUST00000018711.15_GN:Gabarap_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:46.caid +++ /dev/null @@ -1,164 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000018567.15|ENSMUST00000018711.15|GN:Gabarap|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:46 -1 M 0.420 -2 N 0.433 -3 R 0.451 -4 E 0.453 -5 V 0.427 -6 A 0.393 -7 Q 0.394 -8 I 0.445 -9 R 0.510 -10 G 0.539 -11 S 0.517 -12 L 0.467 -13 R 0.422 -14 Q 0.418 -15 V 0.460 -16 C 0.519 -17 S 0.556 -18 S 0.557 -19 K 0.535 -20 P 0.511 -21 P 0.502 -22 P 0.506 -23 P 0.511 -24 P 0.519 -25 P 0.537 -26 P 0.565 -27 V 0.590 -28 P 0.606 -29 A 0.622 -30 P 0.644 -31 P 0.675 -32 L 0.705 -33 G 0.722 -34 S 0.721 -35 L 0.710 -36 S 0.705 -37 P 0.712 -38 A 0.717 -39 R 0.708 -40 S 0.683 -41 S 0.656 -42 P 0.635 -43 V 0.614 -44 L 0.573 -45 G 0.502 -46 R 0.407 -47 M 0.306 -48 K 0.215 -49 F 0.142 -50 V 0.097 -51 Y 0.080 -52 K 0.083 -53 E 0.094 -54 E 0.104 -55 H 0.106 -56 P 0.096 -57 F 0.077 -58 E 0.061 -59 K 0.053 -60 R 0.052 -61 R 0.057 -62 S 0.062 -63 E 0.061 -64 G 0.060 -65 E 0.067 -66 K 0.073 -67 I 0.069 -68 R 0.058 -69 K 0.051 -70 K 0.053 -71 Y 0.059 -72 P 0.060 -73 D 0.055 -74 R 0.046 -75 V 0.037 -76 P 0.031 -77 V 0.028 -78 I 0.030 -79 V 0.040 -80 E 0.062 -81 K 0.094 -82 A 0.128 -83 P 0.149 -84 K 0.155 -85 A 0.150 -86 R 0.146 -87 I 0.146 -88 G 0.148 -89 D 0.141 -90 L 0.123 -91 D 0.099 -92 K 0.078 -93 K 0.067 -94 K 0.067 -95 Y 0.082 -96 L 0.105 -97 V 0.121 -98 P 0.125 -99 S 0.119 -100 D 0.106 -101 L 0.086 -102 T 0.063 -103 V 0.047 -104 G 0.039 -105 Q 0.035 -106 F 0.032 -107 Y 0.027 -108 F 0.024 -109 L 0.023 -110 I 0.026 -111 R 0.031 -112 K 0.038 -113 R 0.047 -114 I 0.058 -115 H 0.072 -116 L 0.090 -117 R 0.106 -118 A 0.112 -119 E 0.107 -120 D 0.094 -121 A 0.077 -122 L 0.057 -123 F 0.040 -124 F 0.032 -125 F 0.036 -126 V 0.048 -127 N 0.061 -128 N 0.072 -129 V 0.080 -130 I 0.084 -131 P 0.085 -132 P 0.082 -133 T 0.075 -134 S 0.063 -135 A 0.050 -136 T 0.040 -137 M 0.035 -138 G 0.036 -139 Q 0.039 -140 L 0.037 -141 Y 0.033 -142 Q 0.031 -143 E 0.031 -144 H 0.036 -145 H 0.044 -146 E 0.058 -147 E 0.072 -148 D 0.078 -149 F 0.073 -150 F 0.059 -151 L 0.048 -152 Y 0.044 -153 I 0.046 -154 A 0.052 -155 Y 0.062 -156 S 0.078 -157 D 0.101 -158 E 0.131 -159 S 0.173 -160 V 0.223 -161 Y 0.276 -162 G 0.317 -163 L 0.337 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000018623.11_ENSMUST00000018767.9_GN:Mmp7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000018623.11_ENSMUST00000018767.9_GN:Mmp7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 125d528faf60dd91e2a92cd99470ba444998da02..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000018623.11_ENSMUST00000018767.9_GN:Mmp7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,265 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000018623.11|ENSMUST00000018767.9|GN:Mmp7|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.327 -2 Q 0.324 -3 L 0.330 -4 T 0.340 -5 L 0.340 -6 F 0.335 -7 C 0.350 -8 F 0.383 -9 V 0.407 -10 C 0.419 -11 L 0.431 -12 L 0.455 -13 P 0.485 -14 G 0.518 -15 H 0.550 -16 L 0.579 -17 A 0.601 -18 L 0.617 -19 P 0.627 -20 L 0.626 -21 S 0.609 -22 Q 0.581 -23 E 0.548 -24 A 0.502 -25 G 0.434 -26 D 0.345 -27 V 0.252 -28 S 0.174 -29 A 0.120 -30 H 0.085 -31 Q 0.062 -32 W 0.048 -33 E 0.041 -34 Q 0.038 -35 A 0.035 -36 Q 0.033 -37 N 0.033 -38 Y 0.034 -39 L 0.035 -40 R 0.037 -41 K 0.045 -42 F 0.070 -43 Y 0.118 -44 P 0.185 -45 H 0.250 -46 D 0.292 -47 S 0.308 -48 K 0.306 -49 T 0.298 -50 K 0.286 -51 K 0.263 -52 V 0.222 -53 N 0.167 -54 S 0.117 -55 L 0.085 -56 V 0.075 -57 D 0.077 -58 N 0.077 -59 L 0.072 -60 K 0.067 -61 E 0.065 -62 M 0.061 -63 Q 0.056 -64 K 0.058 -65 F 0.068 -66 F 0.087 -67 G 0.109 -68 L 0.124 -69 P 0.129 -70 M 0.126 -71 T 0.119 -72 G 0.112 -73 K 0.103 -74 L 0.087 -75 S 0.069 -76 P 0.056 -77 Y 0.053 -78 I 0.058 -79 M 0.066 -80 E 0.077 -81 I 0.086 -82 M 0.090 -83 Q 0.092 -84 K 0.093 -85 P 0.093 -86 R 0.094 -87 C 0.097 -88 G 0.107 -89 V 0.120 -90 P 0.132 -91 D 0.147 -92 V 0.169 -93 A 0.191 -94 E 0.209 -95 Y 0.229 -96 S 0.253 -97 L 0.270 -98 M 0.269 -99 P 0.252 -100 N 0.223 -101 S 0.178 -102 P 0.126 -103 K 0.081 -104 W 0.055 -105 H 0.046 -106 S 0.046 -107 R 0.049 -108 I 0.051 -109 V 0.048 -110 T 0.046 -111 Y 0.049 -112 R 0.059 -113 I 0.069 -114 V 0.072 -115 S 0.067 -116 Y 0.059 -117 T 0.055 -118 S 0.058 -119 D 0.063 -120 L 0.063 -121 P 0.059 -122 R 0.056 -123 I 0.057 -124 V 0.060 -125 V 0.065 -126 D 0.073 -127 Q 0.080 -128 I 0.076 -129 V 0.064 -130 K 0.054 -131 K 0.052 -132 A 0.058 -133 L 0.069 -134 R 0.074 -135 M 0.067 -136 W 0.054 -137 S 0.045 -138 M 0.043 -139 Q 0.042 -140 I 0.039 -141 P 0.035 -142 L 0.033 -143 N 0.032 -144 F 0.031 -145 K 0.032 -146 R 0.034 -147 V 0.039 -148 S 0.044 -149 W 0.049 -150 G 0.054 -151 T 0.057 -152 A 0.059 -153 D 0.060 -154 I 0.058 -155 I 0.056 -156 I 0.058 -157 G 0.067 -158 F 0.077 -159 A 0.086 -160 R 0.092 -161 R 0.096 -162 D 0.098 -163 H 0.096 -164 G 0.093 -165 D 0.093 -166 S 0.100 -167 F 0.113 -168 P 0.122 -169 F 0.123 -170 D 0.124 -171 G 0.130 -172 P 0.138 -173 G 0.144 -174 N 0.146 -175 T 0.146 -176 L 0.140 -177 G 0.131 -178 H 0.120 -179 A 0.113 -180 F 0.109 -181 A 0.111 -182 P 0.119 -183 G 0.131 -184 P 0.146 -185 G 0.164 -186 L 0.179 -187 G 0.182 -188 G 0.168 -189 D 0.148 -190 A 0.133 -191 H 0.131 -192 F 0.142 -193 D 0.156 -194 K 0.159 -195 D 0.149 -196 E 0.135 -197 Y 0.126 -198 W 0.129 -199 T 0.145 -200 D 0.170 -201 G 0.194 -202 E 0.208 -203 D 0.211 -204 A 0.202 -205 G 0.187 -206 V 0.171 -207 N 0.156 -208 F 0.146 -209 L 0.147 -210 F 0.162 -211 A 0.182 -212 A 0.188 -213 T 0.173 -214 H 0.156 -215 E 0.151 -216 F 0.146 -217 G 0.130 -218 H 0.112 -219 S 0.108 -220 L 0.115 -221 G 0.119 -222 L 0.114 -223 S 0.103 -224 H 0.099 -225 S 0.108 -226 S 0.128 -227 V 0.145 -228 P 0.154 -229 G 0.158 -230 T 0.161 -231 V 0.157 -232 M 0.140 -233 Y 0.118 -234 P 0.101 -235 T 0.094 -236 Y 0.091 -237 Q 0.096 -238 R 0.113 -239 D 0.138 -240 Y 0.157 -241 S 0.162 -242 E 0.153 -243 D 0.135 -244 F 0.116 -245 S 0.103 -246 L 0.095 -247 T 0.085 -248 K 0.075 -249 D 0.070 -250 D 0.073 -251 I 0.078 -252 A 0.081 -253 G 0.075 -254 I 0.064 -255 Q 0.059 -256 K 0.063 -257 L 0.077 -258 Y 0.103 -259 G 0.150 -260 K 0.219 -261 R 0.298 -262 N 0.360 -263 T 0.386 -264 L 0.387 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000018623.11_ENSMUST00000018767.9_GN:Mmp7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:3.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000018623.11_ENSMUST00000018767.9_GN:Mmp7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:3.caid deleted file mode 100644 index 1ba41fd51d820f20413e0f561a902143c748fbd4..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000018623.11_ENSMUST00000018767.9_GN:Mmp7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:3.caid +++ /dev/null @@ -1,268 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000018623.11|ENSMUST00000018767.9|GN:Mmp7|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:3 -1 M 0.353 -2 A 0.349 -3 A 0.354 -4 M 0.364 -5 Q 0.350 -6 L 0.313 -7 T 0.299 -8 L 0.322 -9 F 0.355 -10 C 0.377 -11 F 0.391 -12 V 0.401 -13 C 0.407 -14 L 0.418 -15 L 0.446 -16 P 0.490 -17 G 0.536 -18 H 0.573 -19 L 0.599 -20 A 0.616 -21 L 0.625 -22 P 0.629 -23 L 0.625 -24 S 0.607 -25 Q 0.579 -26 E 0.544 -27 A 0.496 -28 G 0.424 -29 D 0.335 -30 V 0.244 -31 S 0.170 -32 A 0.118 -33 H 0.084 -34 Q 0.062 -35 W 0.049 -36 E 0.042 -37 Q 0.038 -38 A 0.036 -39 Q 0.033 -40 N 0.033 -41 Y 0.034 -42 L 0.035 -43 R 0.037 -44 K 0.046 -45 F 0.069 -46 Y 0.117 -47 P 0.184 -48 H 0.250 -49 D 0.293 -50 S 0.308 -51 K 0.306 -52 T 0.297 -53 K 0.285 -54 K 0.261 -55 V 0.219 -56 N 0.165 -57 S 0.115 -58 L 0.084 -59 V 0.075 -60 D 0.076 -61 N 0.076 -62 L 0.071 -63 K 0.067 -64 E 0.064 -65 M 0.060 -66 Q 0.056 -67 K 0.057 -68 F 0.068 -69 F 0.087 -70 G 0.108 -71 L 0.123 -72 P 0.128 -73 M 0.125 -74 T 0.118 -75 G 0.111 -76 K 0.102 -77 L 0.087 -78 S 0.068 -79 P 0.056 -80 Y 0.053 -81 I 0.058 -82 M 0.066 -83 E 0.077 -84 I 0.086 -85 M 0.090 -86 Q 0.091 -87 K 0.092 -88 P 0.093 -89 R 0.093 -90 C 0.097 -91 G 0.106 -92 V 0.119 -93 P 0.131 -94 D 0.146 -95 V 0.168 -96 A 0.191 -97 E 0.209 -98 Y 0.229 -99 S 0.253 -100 L 0.270 -101 M 0.269 -102 P 0.252 -103 N 0.223 -104 S 0.179 -105 P 0.126 -106 K 0.081 -107 W 0.055 -108 H 0.046 -109 S 0.046 -110 R 0.049 -111 I 0.050 -112 V 0.048 -113 T 0.046 -114 Y 0.049 -115 R 0.059 -116 I 0.069 -117 V 0.072 -118 S 0.067 -119 Y 0.059 -120 T 0.056 -121 S 0.059 -122 D 0.063 -123 L 0.063 -124 P 0.059 -125 R 0.056 -126 I 0.057 -127 V 0.060 -128 V 0.065 -129 D 0.073 -130 Q 0.080 -131 I 0.076 -132 V 0.065 -133 K 0.054 -134 K 0.052 -135 A 0.058 -136 L 0.067 -137 R 0.072 -138 M 0.065 -139 W 0.053 -140 S 0.045 -141 M 0.043 -142 Q 0.042 -143 I 0.039 -144 P 0.035 -145 L 0.033 -146 N 0.032 -147 F 0.031 -148 K 0.031 -149 R 0.034 -150 V 0.039 -151 S 0.044 -152 W 0.049 -153 G 0.054 -154 T 0.057 -155 A 0.059 -156 D 0.060 -157 I 0.058 -158 I 0.056 -159 I 0.058 -160 G 0.067 -161 F 0.077 -162 A 0.086 -163 R 0.092 -164 R 0.096 -165 D 0.097 -166 H 0.096 -167 G 0.093 -168 D 0.093 -169 S 0.100 -170 F 0.113 -171 P 0.122 -172 F 0.123 -173 D 0.123 -174 G 0.129 -175 P 0.138 -176 G 0.143 -177 N 0.145 -178 T 0.145 -179 L 0.140 -180 G 0.131 -181 H 0.121 -182 A 0.113 -183 F 0.110 -184 A 0.111 -185 P 0.119 -186 G 0.131 -187 P 0.146 -188 G 0.163 -189 L 0.179 -190 G 0.182 -191 G 0.168 -192 D 0.148 -193 A 0.133 -194 H 0.131 -195 F 0.142 -196 D 0.156 -197 K 0.159 -198 D 0.149 -199 E 0.134 -200 Y 0.125 -201 W 0.129 -202 T 0.145 -203 D 0.170 -204 G 0.194 -205 E 0.209 -206 D 0.210 -207 A 0.202 -208 G 0.187 -209 V 0.171 -210 N 0.155 -211 F 0.146 -212 L 0.147 -213 F 0.162 -214 A 0.182 -215 A 0.187 -216 T 0.173 -217 H 0.156 -218 E 0.151 -219 F 0.146 -220 G 0.130 -221 H 0.112 -222 S 0.108 -223 L 0.114 -224 G 0.119 -225 L 0.114 -226 S 0.103 -227 H 0.099 -228 S 0.108 -229 S 0.128 -230 V 0.145 -231 P 0.154 -232 G 0.158 -233 T 0.161 -234 V 0.157 -235 M 0.140 -236 Y 0.118 -237 P 0.102 -238 T 0.094 -239 Y 0.092 -240 Q 0.096 -241 R 0.112 -242 D 0.137 -243 Y 0.156 -244 S 0.161 -245 E 0.152 -246 D 0.135 -247 F 0.116 -248 S 0.104 -249 L 0.095 -250 T 0.085 -251 K 0.075 -252 D 0.071 -253 D 0.073 -254 I 0.079 -255 A 0.081 -256 G 0.075 -257 I 0.065 -258 Q 0.059 -259 K 0.063 -260 L 0.077 -261 Y 0.103 -262 G 0.150 -263 K 0.219 -264 R 0.298 -265 N 0.359 -266 T 0.385 -267 L 0.386 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019232.15_ENSMUST00000072271.13_GN:Etnppl_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019232.15_ENSMUST00000072271.13_GN:Etnppl_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index c378d25621e082080e29852cf7beb48a70ae53bd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019232.15_ENSMUST00000072271.13_GN:Etnppl_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,500 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000019232.15|ENSMUST00000072271.13|GN:Etnppl|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.337 -2 C 0.323 -3 E 0.289 -4 L 0.233 -5 Y 0.170 -6 S 0.123 -7 K 0.103 -8 Q 0.105 -9 D 0.116 -10 T 0.127 -11 L 0.141 -12 A 0.163 -13 L 0.184 -14 R 0.186 -15 E 0.172 -16 R 0.163 -17 H 0.172 -18 I 0.192 -19 G 0.212 -20 P 0.230 -21 S 0.249 -22 C 0.262 -23 K 0.262 -24 I 0.241 -25 F 0.208 -26 F 0.180 -27 A 0.164 -28 A 0.149 -29 D 0.132 -30 P 0.120 -31 I 0.116 -32 K 0.115 -33 I 0.111 -34 M 0.109 -35 R 0.116 -36 A 0.127 -37 Q 0.132 -38 G 0.121 -39 Q 0.097 -40 Y 0.072 -41 M 0.054 -42 F 0.049 -43 D 0.055 -44 E 0.070 -45 K 0.094 -46 G 0.117 -47 E 0.135 -48 R 0.149 -49 Y 0.162 -50 L 0.175 -51 D 0.182 -52 C 0.180 -53 I 0.176 -54 N 0.178 -55 N 0.181 -56 V 0.177 -57 A 0.163 -58 H 0.146 -59 V 0.133 -60 G 0.125 -61 H 0.122 -62 C 0.120 -63 H 0.118 -64 P 0.117 -65 E 0.119 -66 V 0.124 -67 V 0.131 -68 K 0.141 -69 A 0.154 -70 A 0.167 -71 A 0.172 -72 K 0.169 -73 Q 0.160 -74 M 0.147 -75 E 0.131 -76 L 0.120 -77 L 0.123 -78 N 0.140 -79 T 0.165 -80 N 0.182 -81 S 0.184 -82 R 0.173 -83 F 0.150 -84 L 0.122 -85 H 0.096 -86 D 0.082 -87 N 0.079 -88 I 0.080 -89 I 0.081 -90 E 0.082 -91 F 0.084 -92 A 0.087 -93 K 0.085 -94 R 0.081 -95 L 0.078 -96 T 0.076 -97 A 0.073 -98 T 0.071 -99 L 0.069 -100 P 0.064 -101 Q 0.058 -102 E 0.054 -103 L 0.054 -104 S 0.056 -105 V 0.062 -106 C 0.072 -107 Y 0.088 -108 F 0.107 -109 T 0.131 -110 N 0.156 -111 S 0.169 -112 G 0.163 -113 S 0.148 -114 E 0.137 -115 A 0.129 -116 N 0.119 -117 D 0.109 -118 L 0.099 -119 A 0.088 -120 L 0.076 -121 R 0.066 -122 L 0.058 -123 A 0.051 -124 R 0.047 -125 Q 0.046 -126 F 0.048 -127 R 0.049 -128 G 0.047 -129 H 0.043 -130 Q 0.039 -131 D 0.040 -132 V 0.046 -133 I 0.059 -134 T 0.078 -135 L 0.100 -136 D 0.110 -137 H 0.100 -138 A 0.088 -139 Y 0.089 -140 H 0.101 -141 G 0.117 -142 H 0.129 -143 L 0.137 -144 S 0.149 -145 S 0.170 -146 L 0.191 -147 I 0.196 -148 E 0.181 -149 I 0.154 -150 S 0.126 -151 P 0.102 -152 Y 0.087 -153 K 0.087 -154 F 0.099 -155 Q 0.119 -156 K 0.146 -157 G 0.177 -158 K 0.207 -159 D 0.230 -160 V 0.235 -161 K 0.216 -162 R 0.176 -163 E 0.131 -164 T 0.097 -165 V 0.085 -166 H 0.094 -167 V 0.114 -168 A 0.131 -169 P 0.139 -170 A 0.135 -171 P 0.122 -172 D 0.106 -173 T 0.092 -174 Y 0.089 -175 R 0.099 -176 G 0.118 -177 K 0.134 -178 Y 0.141 -179 R 0.137 -180 E 0.131 -181 D 0.128 -182 H 0.124 -183 E 0.117 -184 D 0.112 -185 P 0.108 -186 S 0.096 -187 T 0.077 -188 A 0.062 -189 Y 0.057 -190 A 0.058 -191 D 0.059 -192 E 0.054 -193 V 0.052 -194 K 0.057 -195 K 0.062 -196 I 0.057 -197 I 0.048 -198 E 0.042 -199 E 0.045 -200 A 0.055 -201 H 0.066 -202 S 0.074 -203 S 0.080 -204 G 0.081 -205 R 0.075 -206 K 0.064 -207 I 0.053 -208 A 0.044 -209 A 0.041 -210 F 0.044 -211 I 0.054 -212 A 0.065 -213 E 0.071 -214 S 0.069 -215 M 0.063 -216 Q 0.057 -217 S 0.054 -218 C 0.055 -219 G 0.062 -220 G 0.075 -221 Q 0.091 -222 I 0.109 -223 I 0.126 -224 P 0.134 -225 P 0.129 -226 A 0.111 -227 G 0.087 -228 Y 0.064 -229 F 0.045 -230 Q 0.032 -231 K 0.027 -232 V 0.026 -233 A 0.026 -234 E 0.026 -235 H 0.027 -236 I 0.036 -237 H 0.052 -238 K 0.065 -239 A 0.068 -240 G 0.061 -241 G 0.050 -242 V 0.041 -243 F 0.041 -244 I 0.047 -245 A 0.055 -246 D 0.059 -247 E 0.056 -248 V 0.048 -249 Q 0.041 -250 V 0.037 -251 G 0.038 -252 F 0.039 -253 G 0.040 -254 R 0.040 -255 V 0.042 -256 G 0.044 -257 R 0.046 -258 Y 0.045 -259 F 0.041 -260 W 0.036 -261 S 0.036 -262 F 0.039 -263 Q 0.044 -264 M 0.050 -265 Y 0.059 -266 G 0.071 -267 E 0.080 -268 D 0.080 -269 F 0.070 -270 V 0.060 -271 P 0.052 -272 D 0.046 -273 I 0.042 -274 V 0.042 -275 T 0.046 -276 M 0.052 -277 G 0.057 -278 K 0.059 -279 P 0.060 -280 M 0.062 -281 G 0.064 -282 N 0.069 -283 G 0.082 -284 H 0.091 -285 P 0.089 -286 I 0.075 -287 S 0.061 -288 C 0.052 -289 V 0.049 -290 V 0.047 -291 T 0.049 -292 T 0.051 -293 K 0.050 -294 E 0.048 -295 I 0.049 -296 A 0.054 -297 E 0.067 -298 A 0.085 -299 F 0.106 -300 S 0.126 -301 S 0.141 -302 S 0.156 -303 G 0.172 -304 M 0.186 -305 E 0.193 -306 Y 0.186 -307 F 0.172 -308 N 0.164 -309 T 0.172 -310 Y 0.190 -311 G 0.204 -312 G 0.212 -313 N 0.224 -314 P 0.241 -315 V 0.248 -316 S 0.234 -317 C 0.218 -318 A 0.214 -319 V 0.210 -320 G 0.191 -321 L 0.164 -322 A 0.143 -323 V 0.130 -324 L 0.118 -325 D 0.108 -326 V 0.101 -327 I 0.096 -328 E 0.089 -329 K 0.082 -330 E 0.076 -331 N 0.075 -332 L 0.078 -333 Q 0.080 -334 G 0.078 -335 N 0.072 -336 A 0.063 -337 V 0.055 -338 R 0.053 -339 V 0.054 -340 G 0.054 -341 T 0.049 -342 Y 0.048 -343 L 0.055 -344 M 0.066 -345 E 0.072 -346 L 0.071 -347 L 0.073 -348 S 0.079 -349 E 0.081 -350 Q 0.072 -351 K 0.058 -352 A 0.046 -353 K 0.040 -354 H 0.039 -355 P 0.040 -356 L 0.042 -357 I 0.042 -358 G 0.041 -359 D 0.042 -360 I 0.046 -361 R 0.049 -362 G 0.049 -363 V 0.044 -364 G 0.039 -365 L 0.034 -366 F 0.032 -367 I 0.032 -368 G 0.034 -369 I 0.042 -370 D 0.055 -371 L 0.073 -372 V 0.092 -373 K 0.107 -374 D 0.114 -375 R 0.114 -376 E 0.116 -377 K 0.120 -378 R 0.126 -379 T 0.132 -380 P 0.128 -381 A 0.108 -382 T 0.082 -383 A 0.062 -384 E 0.054 -385 A 0.053 -386 Q 0.054 -387 H 0.055 -388 I 0.054 -389 I 0.052 -390 Y 0.049 -391 E 0.052 -392 M 0.058 -393 K 0.064 -394 G 0.067 -395 K 0.065 -396 G 0.061 -397 V 0.059 -398 L 0.060 -399 L 0.066 -400 S 0.072 -401 A 0.075 -402 D 0.077 -403 G 0.086 -404 P 0.098 -405 H 0.102 -406 R 0.092 -407 N 0.075 -408 V 0.057 -409 L 0.043 -410 K 0.037 -411 I 0.038 -412 K 0.047 -413 P 0.061 -414 P 0.074 -415 M 0.082 -416 C 0.083 -417 F 0.081 -418 T 0.078 -419 E 0.073 -420 D 0.070 -421 D 0.071 -422 A 0.072 -423 K 0.069 -424 F 0.068 -425 L 0.074 -426 V 0.085 -427 D 0.089 -428 H 0.081 -429 L 0.069 -430 D 0.058 -431 G 0.050 -432 I 0.044 -433 L 0.040 -434 T 0.037 -435 V 0.037 -436 L 0.043 -437 E 0.057 -438 E 0.084 -439 A 0.128 -440 M 0.187 -441 D 0.253 -442 S 0.317 -443 K 0.380 -444 S 0.444 -445 G 0.498 -446 T 0.524 -447 V 0.516 -448 F 0.490 -449 S 0.464 -450 E 0.444 -451 N 0.428 -452 T 0.411 -453 A 0.392 -454 Y 0.376 -455 R 0.369 -456 T 0.370 -457 K 0.374 -458 M 0.390 -459 P 0.426 -460 K 0.472 -461 E 0.502 -462 I 0.510 -463 Q 0.511 -464 V 0.518 -465 E 0.537 -466 L 0.566 -467 P 0.594 -468 N 0.610 -469 L 0.615 -470 S 0.619 -471 A 0.628 -472 T 0.638 -473 E 0.645 -474 A 0.641 -475 R 0.628 -476 E 0.615 -477 I 0.613 -478 P 0.630 -479 R 0.663 -480 G 0.693 -481 K 0.702 -482 R 0.699 -483 N 0.702 -484 G 0.706 -485 V 0.696 -486 C 0.665 -487 S 0.611 -488 D 0.537 -489 Q 0.451 -490 Q 0.375 -491 A 0.338 -492 L 0.344 -493 L 0.364 -494 S 0.374 -495 K 0.381 -496 R 0.400 -497 L 0.413 -498 K 0.403 -499 T 0.383 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019232.15_ENSMUST00000072271.13_GN:Etnppl_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:40.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019232.15_ENSMUST00000072271.13_GN:Etnppl_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:40.caid deleted file mode 100644 index b7a074059fae08faca3b0adb5da8dd26bb72456a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019232.15_ENSMUST00000072271.13_GN:Etnppl_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:40.caid +++ /dev/null @@ -1,540 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000019232.15|ENSMUST00000072271.13|GN:Etnppl|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:40 -1 M 0.392 -2 P 0.421 -3 L 0.463 -4 V 0.488 -5 T 0.478 -6 S 0.459 -7 D 0.451 -8 T 0.442 -9 Q 0.436 -10 G 0.444 -11 R 0.441 -12 R 0.402 -13 H 0.352 -14 R 0.342 -15 R 0.376 -16 G 0.409 -17 E 0.426 -18 K 0.454 -19 K 0.503 -20 S 0.558 -21 F 0.608 -22 A 0.646 -23 A 0.661 -24 S 0.653 -25 Q 0.632 -26 V 0.607 -27 T 0.585 -28 E 0.580 -29 G 0.595 -30 G 0.615 -31 T 0.622 -32 F 0.600 -33 I 0.552 -34 D 0.497 -35 L 0.465 -36 K 0.471 -37 G 0.498 -38 A 0.520 -39 A 0.524 -40 V 0.504 -41 M 0.464 -42 C 0.406 -43 E 0.334 -44 L 0.253 -45 Y 0.180 -46 S 0.131 -47 K 0.113 -48 Q 0.117 -49 D 0.130 -50 T 0.140 -51 L 0.153 -52 A 0.177 -53 L 0.201 -54 R 0.204 -55 E 0.187 -56 R 0.175 -57 H 0.185 -58 I 0.205 -59 G 0.223 -60 P 0.237 -61 S 0.253 -62 C 0.267 -63 K 0.268 -64 I 0.246 -65 F 0.210 -66 F 0.178 -67 A 0.159 -68 A 0.143 -69 D 0.125 -70 P 0.111 -71 I 0.105 -72 K 0.104 -73 I 0.105 -74 M 0.109 -75 R 0.118 -76 A 0.130 -77 Q 0.131 -78 G 0.117 -79 Q 0.093 -80 Y 0.068 -81 M 0.050 -82 F 0.045 -83 D 0.050 -84 E 0.065 -85 K 0.087 -86 G 0.111 -87 E 0.127 -88 R 0.139 -89 Y 0.150 -90 L 0.162 -91 D 0.169 -92 C 0.168 -93 I 0.167 -94 N 0.172 -95 N 0.177 -96 V 0.173 -97 A 0.158 -98 H 0.140 -99 V 0.126 -100 G 0.118 -101 H 0.114 -102 C 0.112 -103 H 0.110 -104 P 0.109 -105 E 0.111 -106 V 0.117 -107 V 0.126 -108 K 0.138 -109 A 0.152 -110 A 0.165 -111 A 0.170 -112 K 0.169 -113 Q 0.161 -114 M 0.147 -115 E 0.130 -116 L 0.119 -117 L 0.123 -118 N 0.141 -119 T 0.165 -120 N 0.180 -121 S 0.180 -122 R 0.168 -123 F 0.147 -124 L 0.122 -125 H 0.098 -126 D 0.084 -127 N 0.080 -128 I 0.080 -129 I 0.080 -130 E 0.080 -131 F 0.083 -132 A 0.085 -133 K 0.084 -134 R 0.080 -135 L 0.078 -136 T 0.077 -137 A 0.075 -138 T 0.074 -139 L 0.073 -140 P 0.067 -141 Q 0.061 -142 E 0.057 -143 L 0.058 -144 S 0.060 -145 V 0.065 -146 C 0.074 -147 Y 0.088 -148 F 0.107 -149 T 0.130 -150 N 0.156 -151 S 0.170 -152 G 0.163 -153 S 0.148 -154 E 0.137 -155 A 0.129 -156 N 0.119 -157 D 0.109 -158 L 0.100 -159 A 0.089 -160 L 0.076 -161 R 0.066 -162 L 0.057 -163 A 0.050 -164 R 0.046 -165 Q 0.046 -166 F 0.047 -167 R 0.049 -168 G 0.048 -169 H 0.044 -170 Q 0.041 -171 D 0.041 -172 V 0.048 -173 I 0.060 -174 T 0.080 -175 L 0.102 -176 D 0.111 -177 H 0.101 -178 A 0.089 -179 Y 0.091 -180 H 0.103 -181 G 0.119 -182 H 0.131 -183 L 0.140 -184 S 0.152 -185 S 0.173 -186 L 0.195 -187 I 0.201 -188 E 0.186 -189 I 0.159 -190 S 0.130 -191 P 0.106 -192 Y 0.091 -193 K 0.089 -194 F 0.100 -195 Q 0.119 -196 K 0.145 -197 G 0.176 -198 K 0.206 -199 D 0.227 -200 V 0.232 -201 K 0.213 -202 R 0.174 -203 E 0.129 -204 T 0.096 -205 V 0.084 -206 H 0.093 -207 V 0.114 -208 A 0.132 -209 P 0.140 -210 A 0.136 -211 P 0.123 -212 D 0.107 -213 T 0.093 -214 Y 0.089 -215 R 0.098 -216 G 0.115 -217 K 0.130 -218 Y 0.136 -219 R 0.131 -220 E 0.126 -221 D 0.124 -222 H 0.120 -223 E 0.115 -224 D 0.110 -225 P 0.107 -226 S 0.096 -227 T 0.077 -228 A 0.059 -229 Y 0.047 -230 A 0.040 -231 D 0.035 -232 E 0.035 -233 V 0.042 -234 K 0.054 -235 K 0.062 -236 I 0.057 -237 I 0.047 -238 E 0.041 -239 E 0.044 -240 A 0.053 -241 H 0.063 -242 S 0.071 -243 S 0.076 -244 G 0.078 -245 R 0.072 -246 K 0.061 -247 I 0.051 -248 A 0.043 -249 A 0.040 -250 F 0.044 -251 I 0.054 -252 A 0.066 -253 E 0.072 -254 S 0.069 -255 M 0.062 -256 Q 0.056 -257 S 0.053 -258 C 0.054 -259 G 0.061 -260 G 0.073 -261 Q 0.089 -262 I 0.107 -263 I 0.123 -264 P 0.131 -265 P 0.126 -266 A 0.109 -267 G 0.086 -268 Y 0.063 -269 F 0.045 -270 Q 0.033 -271 K 0.028 -272 V 0.027 -273 A 0.027 -274 E 0.027 -275 H 0.028 -276 I 0.036 -277 H 0.050 -278 K 0.063 -279 A 0.067 -280 G 0.061 -281 G 0.051 -282 V 0.043 -283 F 0.042 -284 I 0.048 -285 A 0.056 -286 D 0.060 -287 E 0.058 -288 V 0.050 -289 Q 0.042 -290 V 0.039 -291 G 0.039 -292 F 0.041 -293 G 0.041 -294 R 0.041 -295 V 0.042 -296 G 0.045 -297 R 0.047 -298 Y 0.046 -299 F 0.043 -300 W 0.038 -301 S 0.038 -302 F 0.042 -303 Q 0.048 -304 M 0.054 -305 Y 0.063 -306 G 0.076 -307 E 0.085 -308 D 0.085 -309 F 0.075 -310 V 0.064 -311 P 0.056 -312 D 0.049 -313 I 0.043 -314 V 0.042 -315 T 0.046 -316 M 0.052 -317 G 0.057 -318 K 0.059 -319 P 0.061 -320 M 0.063 -321 G 0.065 -322 N 0.072 -323 G 0.084 -324 H 0.094 -325 P 0.091 -326 I 0.076 -327 S 0.061 -328 C 0.052 -329 V 0.049 -330 V 0.048 -331 T 0.050 -332 T 0.053 -333 K 0.052 -334 E 0.050 -335 I 0.049 -336 A 0.055 -337 E 0.068 -338 A 0.087 -339 F 0.109 -340 S 0.129 -341 S 0.145 -342 S 0.159 -343 G 0.174 -344 M 0.188 -345 E 0.194 -346 Y 0.187 -347 F 0.172 -348 N 0.164 -349 T 0.172 -350 Y 0.191 -351 G 0.206 -352 G 0.216 -353 N 0.232 -354 P 0.254 -355 V 0.262 -356 S 0.247 -357 C 0.228 -358 A 0.222 -359 V 0.217 -360 G 0.196 -361 L 0.167 -362 A 0.146 -363 V 0.133 -364 L 0.122 -365 D 0.112 -366 V 0.104 -367 I 0.098 -368 E 0.091 -369 K 0.083 -370 E 0.076 -371 N 0.075 -372 L 0.079 -373 Q 0.082 -374 G 0.080 -375 N 0.073 -376 A 0.064 -377 V 0.056 -378 R 0.053 -379 V 0.055 -380 G 0.054 -381 T 0.050 -382 Y 0.049 -383 L 0.055 -384 M 0.066 -385 E 0.072 -386 L 0.072 -387 L 0.073 -388 S 0.079 -389 E 0.081 -390 Q 0.072 -391 K 0.057 -392 A 0.045 -393 K 0.039 -394 H 0.038 -395 P 0.040 -396 L 0.041 -397 I 0.041 -398 G 0.040 -399 D 0.042 -400 I 0.046 -401 R 0.049 -402 G 0.048 -403 V 0.044 -404 G 0.038 -405 L 0.034 -406 F 0.031 -407 I 0.031 -408 G 0.034 -409 I 0.042 -410 D 0.055 -411 L 0.074 -412 V 0.093 -413 K 0.108 -414 D 0.114 -415 R 0.115 -416 E 0.116 -417 K 0.120 -418 R 0.127 -419 T 0.132 -420 P 0.129 -421 A 0.109 -422 T 0.083 -423 A 0.063 -424 E 0.055 -425 A 0.055 -426 Q 0.056 -427 H 0.056 -428 I 0.055 -429 I 0.052 -430 Y 0.049 -431 E 0.051 -432 M 0.057 -433 K 0.064 -434 G 0.066 -435 K 0.064 -436 G 0.060 -437 V 0.058 -438 L 0.060 -439 L 0.067 -440 S 0.074 -441 A 0.077 -442 D 0.079 -443 G 0.088 -444 P 0.100 -445 H 0.105 -446 R 0.095 -447 N 0.076 -448 V 0.058 -449 L 0.043 -450 K 0.036 -451 I 0.037 -452 K 0.047 -453 P 0.061 -454 P 0.074 -455 M 0.082 -456 C 0.084 -457 F 0.082 -458 T 0.078 -459 E 0.074 -460 D 0.071 -461 D 0.073 -462 A 0.074 -463 K 0.071 -464 F 0.069 -465 L 0.075 -466 V 0.085 -467 D 0.088 -468 H 0.081 -469 L 0.071 -470 D 0.061 -471 G 0.054 -472 I 0.048 -473 L 0.043 -474 T 0.040 -475 V 0.041 -476 L 0.048 -477 E 0.064 -478 E 0.095 -479 A 0.143 -480 M 0.203 -481 D 0.268 -482 S 0.329 -483 K 0.384 -484 S 0.440 -485 G 0.487 -486 T 0.508 -487 V 0.496 -488 F 0.465 -489 S 0.434 -490 E 0.409 -491 N 0.387 -492 T 0.365 -493 A 0.344 -494 Y 0.327 -495 R 0.322 -496 T 0.327 -497 K 0.339 -498 M 0.363 -499 P 0.402 -500 K 0.439 -501 E 0.460 -502 I 0.469 -503 Q 0.477 -504 V 0.492 -505 E 0.520 -506 L 0.556 -507 P 0.589 -508 N 0.605 -509 L 0.610 -510 S 0.614 -511 A 0.624 -512 T 0.634 -513 E 0.637 -514 A 0.630 -515 R 0.614 -516 E 0.599 -517 I 0.595 -518 P 0.609 -519 R 0.638 -520 G 0.667 -521 K 0.680 -522 R 0.685 -523 N 0.697 -524 G 0.710 -525 V 0.707 -526 C 0.676 -527 S 0.611 -528 D 0.513 -529 Q 0.401 -530 Q 0.307 -531 A 0.253 -532 L 0.238 -533 L 0.245 -534 S 0.256 -535 K 0.258 -536 R 0.252 -537 L 0.249 -538 K 0.250 -539 T 0.251 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019432.16_ENSMUST00000173731.8_GN:Ddx39b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019432.16_ENSMUST00000173731.8_GN:Ddx39b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 4a01965d8598b51ddcd7d16ffc1e6f51b2298a6c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019432.16_ENSMUST00000173731.8_GN:Ddx39b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,429 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000019432.16|ENSMUST00000173731.8|GN:Ddx39b|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.438 -2 A 0.462 -3 E 0.502 -4 N 0.548 -5 D 0.583 -6 V 0.592 -7 D 0.579 -8 N 0.553 -9 E 0.522 -10 L 0.491 -11 L 0.468 -12 D 0.456 -13 Y 0.452 -14 E 0.457 -15 D 0.474 -16 D 0.491 -17 E 0.492 -18 V 0.488 -19 E 0.516 -20 T 0.587 -21 A 0.658 -22 A 0.693 -23 G 0.700 -24 A 0.698 -25 D 0.694 -26 G 0.683 -27 T 0.665 -28 E 0.647 -29 A 0.639 -30 P 0.642 -31 A 0.649 -32 K 0.650 -33 K 0.641 -34 D 0.623 -35 V 0.596 -36 K 0.560 -37 G 0.518 -38 S 0.479 -39 Y 0.452 -40 V 0.434 -41 S 0.415 -42 I 0.385 -43 H 0.338 -44 S 0.274 -45 S 0.201 -46 G 0.135 -47 F 0.090 -48 R 0.066 -49 D 0.056 -50 F 0.056 -51 L 0.060 -52 L 0.062 -53 K 0.061 -54 P 0.058 -55 E 0.057 -56 L 0.060 -57 L 0.064 -58 R 0.066 -59 A 0.062 -60 I 0.057 -61 V 0.055 -62 D 0.057 -63 C 0.063 -64 G 0.068 -65 F 0.069 -66 E 0.069 -67 H 0.068 -68 P 0.063 -69 S 0.056 -70 E 0.052 -71 V 0.053 -72 Q 0.056 -73 H 0.055 -74 E 0.051 -75 C 0.045 -76 I 0.040 -77 P 0.037 -78 Q 0.037 -79 A 0.045 -80 I 0.061 -81 L 0.080 -82 G 0.097 -83 M 0.107 -84 D 0.109 -85 V 0.103 -86 L 0.097 -87 C 0.096 -88 Q 0.102 -89 A 0.109 -90 K 0.111 -91 S 0.112 -92 G 0.118 -93 M 0.124 -94 G 0.121 -95 K 0.109 -96 T 0.095 -97 A 0.084 -98 V 0.075 -99 F 0.068 -100 V 0.066 -101 L 0.067 -102 A 0.068 -103 T 0.067 -104 L 0.065 -105 Q 0.064 -106 Q 0.066 -107 L 0.074 -108 E 0.086 -109 P 0.098 -110 V 0.105 -111 T 0.111 -112 G 0.115 -113 Q 0.111 -114 V 0.092 -115 S 0.063 -116 V 0.041 -117 L 0.034 -118 V 0.036 -119 M 0.038 -120 C 0.036 -121 H 0.031 -122 T 0.027 -123 R 0.027 -124 E 0.031 -125 L 0.033 -126 A 0.032 -127 F 0.031 -128 Q 0.038 -129 I 0.054 -130 S 0.072 -131 K 0.076 -132 E 0.066 -133 Y 0.051 -134 E 0.039 -135 R 0.031 -136 F 0.027 -137 S 0.027 -138 K 0.028 -139 Y 0.030 -140 M 0.032 -141 P 0.034 -142 N 0.034 -143 V 0.031 -144 K 0.028 -145 V 0.024 -146 A 0.020 -147 V 0.017 -148 F 0.016 -149 F 0.018 -150 G 0.024 -151 G 0.033 -152 L 0.041 -153 S 0.044 -154 I 0.041 -155 K 0.037 -156 K 0.038 -157 D 0.046 -158 E 0.059 -159 E 0.068 -160 V 0.068 -161 L 0.061 -162 K 0.057 -163 K 0.057 -164 N 0.057 -165 C 0.053 -166 P 0.048 -167 H 0.047 -168 I 0.051 -169 V 0.055 -170 V 0.056 -171 G 0.054 -172 T 0.054 -173 P 0.054 -174 G 0.053 -175 R 0.049 -176 I 0.044 -177 L 0.041 -178 A 0.046 -179 L 0.056 -180 A 0.065 -181 R 0.069 -182 N 0.069 -183 K 0.066 -184 S 0.061 -185 L 0.055 -186 N 0.051 -187 L 0.051 -188 K 0.052 -189 H 0.050 -190 I 0.045 -191 K 0.037 -192 H 0.028 -193 F 0.022 -194 I 0.019 -195 L 0.019 -196 D 0.021 -197 E 0.023 -198 C 0.027 -199 D 0.032 -200 K 0.042 -201 M 0.052 -202 L 0.059 -203 E 0.063 -204 Q 0.067 -205 L 0.066 -206 D 0.062 -207 M 0.060 -208 R 0.062 -209 R 0.062 -210 D 0.053 -211 V 0.041 -212 Q 0.035 -213 E 0.036 -214 I 0.043 -215 F 0.051 -216 R 0.055 -217 M 0.049 -218 T 0.040 -219 P 0.035 -220 H 0.036 -221 E 0.037 -222 K 0.036 -223 Q 0.033 -224 V 0.034 -225 M 0.039 -226 M 0.046 -227 F 0.055 -228 S 0.066 -229 A 0.075 -230 T 0.084 -231 L 0.088 -232 S 0.083 -233 K 0.069 -234 E 0.055 -235 I 0.047 -236 R 0.041 -237 P 0.038 -238 V 0.036 -239 C 0.037 -240 R 0.039 -241 K 0.042 -242 F 0.049 -243 M 0.062 -244 Q 0.076 -245 D 0.086 -246 P 0.087 -247 M 0.088 -248 E 0.100 -249 I 0.129 -250 F 0.172 -251 V 0.222 -252 D 0.270 -253 D 0.304 -254 E 0.319 -255 T 0.320 -256 K 0.318 -257 L 0.308 -258 T 0.279 -259 L 0.232 -260 H 0.176 -261 G 0.124 -262 L 0.084 -263 Q 0.058 -264 Q 0.043 -265 Y 0.036 -266 Y 0.036 -267 V 0.041 -268 K 0.044 -269 L 0.043 -270 K 0.041 -271 D 0.041 -272 N 0.042 -273 E 0.042 -274 K 0.041 -275 N 0.042 -276 R 0.043 -277 K 0.042 -278 L 0.041 -279 F 0.041 -280 D 0.042 -281 L 0.045 -282 L 0.049 -283 D 0.054 -284 V 0.059 -285 L 0.058 -286 E 0.051 -287 F 0.042 -288 N 0.033 -289 Q 0.028 -290 V 0.031 -291 V 0.041 -292 I 0.052 -293 F 0.058 -294 V 0.055 -295 K 0.046 -296 S 0.038 -297 V 0.035 -298 Q 0.038 -299 R 0.042 -300 C 0.046 -301 I 0.048 -302 A 0.051 -303 L 0.059 -304 A 0.070 -305 Q 0.075 -306 L 0.073 -307 L 0.074 -308 V 0.080 -309 E 0.085 -310 Q 0.080 -311 N 0.072 -312 F 0.063 -313 P 0.056 -314 A 0.049 -315 I 0.041 -316 A 0.034 -317 I 0.031 -318 H 0.037 -319 R 0.052 -320 G 0.070 -321 M 0.080 -322 P 0.077 -323 Q 0.065 -324 E 0.051 -325 E 0.043 -326 R 0.044 -327 L 0.053 -328 S 0.063 -329 R 0.066 -330 Y 0.067 -331 Q 0.066 -332 Q 0.062 -333 F 0.056 -334 K 0.053 -335 D 0.055 -336 F 0.058 -337 Q 0.060 -338 R 0.058 -339 R 0.055 -340 I 0.055 -341 L 0.057 -342 V 0.057 -343 A 0.058 -344 T 0.067 -345 N 0.088 -346 L 0.116 -347 F 0.141 -348 G 0.151 -349 R 0.145 -350 G 0.131 -351 M 0.119 -352 D 0.110 -353 I 0.099 -354 E 0.083 -355 R 0.067 -356 V 0.054 -357 N 0.048 -358 I 0.043 -359 A 0.037 -360 F 0.035 -361 N 0.042 -362 Y 0.056 -363 D 0.074 -364 M 0.089 -365 P 0.093 -366 E 0.087 -367 D 0.080 -368 S 0.073 -369 D 0.062 -370 T 0.051 -371 Y 0.044 -372 L 0.040 -373 H 0.040 -374 R 0.046 -375 V 0.057 -376 A 0.071 -377 R 0.087 -378 A 0.103 -379 G 0.118 -380 R 0.129 -381 F 0.137 -382 G 0.138 -383 T 0.133 -384 K 0.126 -385 G 0.121 -386 L 0.116 -387 A 0.110 -388 I 0.102 -389 T 0.095 -390 F 0.096 -391 V 0.102 -392 S 0.103 -393 D 0.096 -394 E 0.088 -395 N 0.085 -396 D 0.087 -397 A 0.095 -398 K 0.100 -399 I 0.095 -400 L 0.082 -401 N 0.073 -402 D 0.071 -403 V 0.076 -404 Q 0.084 -405 D 0.086 -406 R 0.079 -407 F 0.072 -408 E 0.069 -409 V 0.073 -410 N 0.076 -411 I 0.077 -412 S 0.074 -413 E 0.071 -414 L 0.072 -415 P 0.080 -416 D 0.090 -417 E 0.094 -418 I 0.086 -419 D 0.074 -420 I 0.065 -421 S 0.063 -422 S 0.069 -423 Y 0.090 -424 I 0.132 -425 E 0.195 -426 Q 0.260 -427 T 0.305 -428 R 0.324 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019432.16_ENSMUST00000173731.8_GN:Ddx39b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:55.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019432.16_ENSMUST00000173731.8_GN:Ddx39b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:55.caid deleted file mode 100644 index cfaed48b8c7306b1632243f25a9abcc7b93340d4..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019432.16_ENSMUST00000173731.8_GN:Ddx39b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:55.caid +++ /dev/null @@ -1,484 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000019432.16|ENSMUST00000173731.8|GN:Ddx39b|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:55 -1 M 0.330 -2 S 0.346 -3 F 0.380 -4 S 0.418 -5 G 0.439 -6 F 0.438 -7 F 0.439 -8 V 0.452 -9 V 0.470 -10 P 0.493 -11 S 0.515 -12 P 0.510 -13 S 0.458 -14 S 0.406 -15 S 0.417 -16 V 0.478 -17 G 0.522 -18 N 0.536 -19 W 0.550 -20 C 0.563 -21 L 0.564 -22 S 0.570 -23 P 0.583 -24 C 0.588 -25 C 0.577 -26 S 0.564 -27 S 0.563 -28 T 0.572 -29 P 0.581 -30 L 0.588 -31 F 0.601 -32 G 0.623 -33 P 0.644 -34 C 0.648 -35 F 0.624 -36 L 0.576 -37 T 0.545 -38 C 0.564 -39 S 0.615 -40 G 0.657 -41 T 0.680 -42 P 0.693 -43 N 0.704 -44 S 0.706 -45 R 0.694 -46 D 0.666 -47 L 0.629 -48 P 0.598 -49 S 0.581 -50 P 0.569 -51 P 0.556 -52 A 0.571 -53 G 0.630 -54 P 0.702 -55 I 0.748 -56 M 0.766 -57 A 0.772 -58 E 0.771 -59 N 0.763 -60 D 0.749 -61 V 0.731 -62 D 0.714 -63 N 0.696 -64 E 0.674 -65 L 0.647 -66 L 0.623 -67 D 0.606 -68 Y 0.601 -69 E 0.610 -70 D 0.624 -71 D 0.627 -72 E 0.607 -73 V 0.577 -74 E 0.581 -75 T 0.639 -76 A 0.708 -77 A 0.747 -78 G 0.756 -79 A 0.754 -80 D 0.748 -81 G 0.734 -82 T 0.713 -83 E 0.695 -84 A 0.689 -85 P 0.698 -86 A 0.711 -87 K 0.717 -88 K 0.712 -89 D 0.695 -90 V 0.668 -91 K 0.631 -92 G 0.587 -93 S 0.543 -94 Y 0.508 -95 V 0.482 -96 S 0.451 -97 I 0.407 -98 H 0.347 -99 S 0.275 -100 S 0.199 -101 G 0.133 -102 F 0.088 -103 R 0.064 -104 D 0.054 -105 F 0.053 -106 L 0.056 -107 L 0.058 -108 K 0.056 -109 P 0.052 -110 E 0.050 -111 L 0.049 -112 L 0.048 -113 R 0.047 -114 A 0.046 -115 I 0.046 -116 V 0.047 -117 D 0.052 -118 C 0.058 -119 G 0.062 -120 F 0.063 -121 E 0.062 -122 H 0.061 -123 P 0.056 -124 S 0.050 -125 E 0.047 -126 V 0.049 -127 Q 0.052 -128 H 0.052 -129 E 0.048 -130 C 0.043 -131 I 0.038 -132 P 0.035 -133 Q 0.035 -134 A 0.043 -135 I 0.058 -136 L 0.077 -137 G 0.095 -138 M 0.107 -139 D 0.111 -140 V 0.106 -141 L 0.099 -142 C 0.099 -143 Q 0.105 -144 A 0.111 -145 K 0.113 -146 S 0.116 -147 G 0.124 -148 M 0.132 -149 G 0.127 -150 K 0.113 -151 T 0.098 -152 A 0.087 -153 V 0.078 -154 F 0.070 -155 V 0.066 -156 L 0.067 -157 A 0.067 -158 T 0.065 -159 L 0.063 -160 Q 0.062 -161 Q 0.066 -162 L 0.074 -163 E 0.088 -164 P 0.100 -165 V 0.106 -166 T 0.110 -167 G 0.112 -168 Q 0.108 -169 V 0.089 -170 S 0.062 -171 V 0.041 -172 L 0.034 -173 V 0.036 -174 M 0.038 -175 C 0.036 -176 H 0.030 -177 T 0.025 -178 R 0.025 -179 E 0.029 -180 L 0.031 -181 A 0.030 -182 F 0.029 -183 Q 0.036 -184 I 0.051 -185 S 0.068 -186 K 0.073 -187 E 0.063 -188 Y 0.048 -189 E 0.035 -190 R 0.028 -191 F 0.024 -192 S 0.024 -193 K 0.026 -194 Y 0.027 -195 M 0.029 -196 P 0.030 -197 N 0.029 -198 V 0.027 -199 K 0.024 -200 V 0.020 -201 A 0.017 -202 V 0.015 -203 F 0.014 -204 F 0.016 -205 G 0.021 -206 G 0.030 -207 L 0.038 -208 S 0.040 -209 I 0.037 -210 K 0.033 -211 K 0.035 -212 D 0.043 -213 E 0.056 -214 E 0.066 -215 V 0.064 -216 L 0.057 -217 K 0.053 -218 K 0.053 -219 N 0.052 -220 C 0.048 -221 P 0.043 -222 H 0.043 -223 I 0.047 -224 V 0.052 -225 V 0.053 -226 G 0.051 -227 T 0.050 -228 P 0.052 -229 G 0.052 -230 R 0.048 -231 I 0.042 -232 L 0.039 -233 A 0.042 -234 L 0.051 -235 A 0.058 -236 R 0.061 -237 N 0.060 -238 K 0.056 -239 S 0.051 -240 L 0.045 -241 N 0.043 -242 L 0.044 -243 K 0.046 -244 H 0.044 -245 I 0.039 -246 K 0.031 -247 H 0.024 -248 F 0.019 -249 I 0.017 -250 L 0.018 -251 D 0.020 -252 E 0.023 -253 C 0.026 -254 D 0.032 -255 K 0.040 -256 M 0.049 -257 L 0.055 -258 E 0.058 -259 Q 0.060 -260 L 0.060 -261 D 0.057 -262 M 0.056 -263 R 0.059 -264 R 0.060 -265 D 0.052 -266 V 0.040 -267 Q 0.033 -268 E 0.032 -269 I 0.033 -270 F 0.033 -271 R 0.032 -272 M 0.031 -273 T 0.030 -274 P 0.032 -275 H 0.035 -276 E 0.037 -277 K 0.036 -278 Q 0.034 -279 V 0.036 -280 M 0.041 -281 M 0.049 -282 F 0.058 -283 S 0.069 -284 A 0.079 -285 T 0.089 -286 L 0.094 -287 S 0.088 -288 K 0.073 -289 E 0.059 -290 I 0.051 -291 R 0.046 -292 P 0.042 -293 V 0.040 -294 C 0.042 -295 R 0.045 -296 K 0.049 -297 F 0.056 -298 M 0.069 -299 Q 0.084 -300 D 0.094 -301 P 0.095 -302 M 0.094 -303 E 0.105 -304 I 0.135 -305 F 0.180 -306 V 0.232 -307 D 0.281 -308 D 0.315 -309 E 0.328 -310 T 0.331 -311 K 0.332 -312 L 0.324 -313 T 0.295 -314 L 0.245 -315 H 0.186 -316 G 0.132 -317 L 0.090 -318 Q 0.062 -319 Q 0.045 -320 Y 0.038 -321 Y 0.038 -322 V 0.043 -323 K 0.047 -324 L 0.047 -325 K 0.045 -326 D 0.044 -327 N 0.045 -328 E 0.045 -329 K 0.043 -330 N 0.043 -331 R 0.043 -332 K 0.043 -333 L 0.041 -334 F 0.041 -335 D 0.042 -336 L 0.046 -337 L 0.050 -338 D 0.056 -339 V 0.061 -340 L 0.060 -341 E 0.054 -342 F 0.044 -343 N 0.035 -344 Q 0.030 -345 V 0.034 -346 V 0.044 -347 I 0.056 -348 F 0.062 -349 V 0.057 -350 K 0.047 -351 S 0.038 -352 V 0.036 -353 Q 0.040 -354 R 0.045 -355 C 0.048 -356 I 0.050 -357 A 0.052 -358 L 0.060 -359 A 0.071 -360 Q 0.076 -361 L 0.074 -362 L 0.074 -363 V 0.081 -364 E 0.085 -365 Q 0.081 -366 N 0.071 -367 F 0.063 -368 P 0.055 -369 A 0.049 -370 I 0.041 -371 A 0.034 -372 I 0.031 -373 H 0.037 -374 R 0.052 -375 G 0.070 -376 M 0.080 -377 P 0.077 -378 Q 0.066 -379 E 0.053 -380 E 0.044 -381 R 0.045 -382 L 0.054 -383 S 0.063 -384 R 0.066 -385 Y 0.065 -386 Q 0.064 -387 Q 0.060 -388 F 0.055 -389 K 0.054 -390 D 0.055 -391 F 0.058 -392 Q 0.058 -393 R 0.056 -394 R 0.054 -395 I 0.056 -396 L 0.058 -397 V 0.058 -398 A 0.059 -399 T 0.067 -400 N 0.087 -401 L 0.114 -402 F 0.137 -403 G 0.146 -404 R 0.139 -405 G 0.124 -406 M 0.112 -407 D 0.104 -408 I 0.093 -409 E 0.080 -410 R 0.065 -411 V 0.055 -412 N 0.049 -413 I 0.045 -414 A 0.039 -415 F 0.037 -416 N 0.043 -417 Y 0.057 -418 D 0.075 -419 M 0.089 -420 P 0.092 -421 E 0.087 -422 D 0.080 -423 S 0.073 -424 D 0.063 -425 T 0.052 -426 Y 0.045 -427 L 0.042 -428 H 0.041 -429 R 0.047 -430 V 0.059 -431 A 0.073 -432 R 0.089 -433 A 0.104 -434 G 0.118 -435 R 0.129 -436 F 0.137 -437 G 0.140 -438 T 0.137 -439 K 0.132 -440 G 0.128 -441 L 0.123 -442 A 0.116 -443 I 0.106 -444 T 0.099 -445 F 0.100 -446 V 0.105 -447 S 0.107 -448 D 0.100 -449 E 0.092 -450 N 0.088 -451 D 0.090 -452 A 0.095 -453 K 0.099 -454 I 0.095 -455 L 0.084 -456 N 0.076 -457 D 0.075 -458 V 0.080 -459 Q 0.087 -460 D 0.089 -461 R 0.083 -462 F 0.075 -463 E 0.073 -464 V 0.075 -465 N 0.079 -466 I 0.079 -467 S 0.076 -468 E 0.073 -469 L 0.073 -470 P 0.082 -471 D 0.092 -472 E 0.096 -473 I 0.089 -474 D 0.076 -475 I 0.067 -476 S 0.065 -477 S 0.071 -478 Y 0.092 -479 I 0.135 -480 E 0.201 -481 Q 0.272 -482 T 0.322 -483 R 0.345 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019795.18_ENSMUST00000162606.8_GN:Pcmt1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019795.18_ENSMUST00000162606.8_GN:Pcmt1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 902227923f5636f2a27b7086dcc5a34aca8354a9..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019795.18_ENSMUST00000162606.8_GN:Pcmt1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,229 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000019795.18|ENSMUST00000162606.8|GN:Pcmt1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.309 -2 A 0.291 -3 W 0.268 -4 K 0.254 -5 S 0.246 -6 G 0.230 -7 G 0.204 -8 A 0.173 -9 S 0.141 -10 H 0.108 -11 S 0.083 -12 E 0.072 -13 L 0.072 -14 I 0.079 -15 H 0.086 -16 N 0.086 -17 L 0.084 -18 R 0.088 -19 K 0.100 -20 N 0.109 -21 G 0.107 -22 I 0.096 -23 I 0.081 -24 K 0.068 -25 T 0.056 -26 D 0.049 -27 K 0.049 -28 V 0.056 -29 F 0.068 -30 E 0.077 -31 V 0.078 -32 M 0.074 -33 L 0.072 -34 A 0.071 -35 T 0.067 -36 D 0.057 -37 R 0.048 -38 S 0.048 -39 H 0.056 -40 Y 0.065 -41 A 0.076 -42 K 0.092 -43 S 0.111 -44 N 0.128 -45 P 0.136 -46 Y 0.139 -47 M 0.148 -48 D 0.163 -49 S 0.172 -50 P 0.167 -51 Q 0.148 -52 S 0.126 -53 I 0.115 -54 G 0.118 -55 F 0.126 -56 Q 0.129 -57 A 0.128 -58 T 0.128 -59 I 0.135 -60 S 0.146 -61 A 0.151 -62 P 0.142 -63 H 0.125 -64 M 0.110 -65 H 0.100 -66 A 0.090 -67 Y 0.080 -68 A 0.071 -69 L 0.064 -70 E 0.057 -71 L 0.051 -72 L 0.045 -73 F 0.040 -74 D 0.037 -75 Q 0.039 -76 L 0.048 -77 H 0.063 -78 E 0.077 -79 G 0.078 -80 A 0.070 -81 K 0.061 -82 A 0.055 -83 L 0.052 -84 D 0.050 -85 V 0.046 -86 G 0.042 -87 S 0.043 -88 G 0.052 -89 S 0.065 -90 G 0.072 -91 I 0.070 -92 L 0.063 -93 T 0.056 -94 A 0.050 -95 C 0.046 -96 F 0.047 -97 A 0.050 -98 R 0.053 -99 M 0.056 -100 V 0.061 -101 G 0.073 -102 N 0.088 -103 S 0.093 -104 G 0.086 -105 K 0.075 -106 V 0.065 -107 I 0.056 -108 G 0.048 -109 I 0.046 -110 D 0.046 -111 H 0.043 -112 I 0.038 -113 K 0.036 -114 E 0.040 -115 L 0.051 -116 V 0.063 -117 D 0.071 -118 D 0.071 -119 S 0.070 -120 I 0.074 -121 T 0.077 -122 N 0.071 -123 V 0.060 -124 K 0.051 -125 K 0.048 -126 D 0.047 -127 D 0.045 -128 P 0.042 -129 M 0.044 -130 L 0.052 -131 L 0.063 -132 S 0.069 -133 S 0.067 -134 G 0.057 -135 R 0.046 -136 V 0.041 -137 R 0.047 -138 L 0.060 -139 V 0.074 -140 V 0.083 -141 G 0.084 -142 D 0.084 -143 G 0.086 -144 R 0.090 -145 M 0.091 -146 G 0.086 -147 Y 0.078 -148 A 0.070 -149 E 0.064 -150 E 0.057 -151 A 0.051 -152 P 0.047 -153 Y 0.046 -154 D 0.046 -155 A 0.045 -156 I 0.043 -157 H 0.043 -158 V 0.048 -159 G 0.059 -160 A 0.080 -161 A 0.105 -162 A 0.123 -163 P 0.125 -164 V 0.116 -165 V 0.103 -166 P 0.088 -167 Q 0.076 -168 A 0.069 -169 L 0.062 -170 I 0.056 -171 D 0.052 -172 Q 0.053 -173 L 0.061 -174 K 0.072 -175 P 0.079 -176 G 0.074 -177 G 0.064 -178 R 0.063 -179 L 0.073 -180 I 0.093 -181 L 0.124 -182 P 0.158 -183 V 0.185 -184 G 0.197 -185 P 0.202 -186 A 0.204 -187 G 0.205 -188 G 0.202 -189 N 0.188 -190 Q 0.165 -191 M 0.135 -192 L 0.107 -193 E 0.084 -194 Q 0.069 -195 Y 0.063 -196 D 0.063 -197 K 0.068 -198 L 0.078 -199 Q 0.091 -200 D 0.105 -201 G 0.112 -202 S 0.105 -203 V 0.089 -204 K 0.074 -205 M 0.070 -206 K 0.074 -207 P 0.081 -208 L 0.085 -209 M 0.088 -210 G 0.089 -211 V 0.088 -212 I 0.087 -213 Y 0.091 -214 V 0.100 -215 P 0.110 -216 L 0.120 -217 T 0.137 -218 D 0.170 -219 K 0.216 -220 E 0.261 -221 K 0.299 -222 Q 0.335 -223 W 0.374 -224 S 0.418 -225 R 0.464 -226 D 0.494 -227 E 0.491 -228 L 0.472 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019795.18_ENSMUST00000162606.8_GN:Pcmt1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:58.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019795.18_ENSMUST00000162606.8_GN:Pcmt1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:58.caid deleted file mode 100644 index 61809f7e5829e7535e3cbabdb0724bcde04a6e01..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019795.18_ENSMUST00000162606.8_GN:Pcmt1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:58.caid +++ /dev/null @@ -1,287 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000019795.18|ENSMUST00000162606.8|GN:Pcmt1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:58 -1 M 0.410 -2 P 0.438 -3 G 0.478 -4 A 0.505 -5 R 0.500 -6 I 0.473 -7 G 0.459 -8 G 0.458 -9 S 0.434 -10 G 0.397 -11 S 0.403 -12 D 0.450 -13 G 0.481 -14 S 0.494 -15 N 0.530 -16 S 0.583 -17 G 0.621 -18 R 0.637 -19 S 0.647 -20 S 0.658 -21 G 0.670 -22 D 0.680 -23 T 0.687 -24 S 0.687 -25 G 0.666 -26 A 0.603 -27 V 0.496 -28 T 0.376 -29 V 0.279 -30 W 0.222 -31 E 0.197 -32 V 0.178 -33 V 0.161 -34 S 0.155 -35 L 0.164 -36 L 0.183 -37 G 0.204 -38 K 0.227 -39 L 0.264 -40 L 0.321 -41 G 0.372 -42 T 0.377 -43 V 0.333 -44 A 0.272 -45 A 0.219 -46 L 0.180 -47 K 0.160 -48 V 0.154 -49 V 0.153 -50 L 0.149 -51 Y 0.144 -52 L 0.146 -53 L 0.158 -54 R 0.180 -55 V 0.212 -56 C 0.251 -57 F 0.287 -58 A 0.304 -59 M 0.293 -60 A 0.266 -61 W 0.238 -62 K 0.218 -63 S 0.205 -64 G 0.192 -65 G 0.174 -66 A 0.150 -67 S 0.123 -68 H 0.096 -69 S 0.075 -70 E 0.063 -71 L 0.055 -72 I 0.051 -73 H 0.052 -74 N 0.056 -75 L 0.059 -76 R 0.064 -77 K 0.076 -78 N 0.090 -79 G 0.093 -80 I 0.085 -81 I 0.072 -82 K 0.060 -83 T 0.050 -84 D 0.044 -85 K 0.041 -86 V 0.042 -87 F 0.043 -88 E 0.046 -89 V 0.051 -90 M 0.056 -91 L 0.060 -92 A 0.063 -93 T 0.060 -94 D 0.050 -95 R 0.042 -96 S 0.042 -97 H 0.048 -98 Y 0.056 -99 A 0.065 -100 K 0.079 -101 S 0.096 -102 N 0.110 -103 P 0.117 -104 Y 0.120 -105 M 0.126 -106 D 0.138 -107 S 0.148 -108 P 0.145 -109 Q 0.130 -110 S 0.111 -111 I 0.102 -112 G 0.106 -113 F 0.114 -114 Q 0.118 -115 A 0.117 -116 T 0.117 -117 I 0.124 -118 S 0.134 -119 A 0.138 -120 P 0.129 -121 H 0.114 -122 M 0.101 -123 H 0.092 -124 A 0.083 -125 Y 0.074 -126 A 0.066 -127 L 0.059 -128 E 0.053 -129 L 0.048 -130 L 0.043 -131 F 0.037 -132 D 0.035 -133 Q 0.037 -134 L 0.046 -135 H 0.060 -136 E 0.072 -137 G 0.075 -138 A 0.068 -139 K 0.060 -140 A 0.053 -141 L 0.050 -142 D 0.047 -143 V 0.044 -144 G 0.041 -145 S 0.043 -146 G 0.052 -147 S 0.064 -148 G 0.071 -149 I 0.069 -150 L 0.063 -151 T 0.055 -152 A 0.050 -153 C 0.046 -154 F 0.047 -155 A 0.051 -156 R 0.055 -157 M 0.058 -158 V 0.065 -159 G 0.078 -160 N 0.093 -161 S 0.099 -162 G 0.091 -163 K 0.078 -164 V 0.067 -165 I 0.056 -166 G 0.048 -167 I 0.046 -168 D 0.046 -169 H 0.044 -170 I 0.039 -171 K 0.038 -172 E 0.042 -173 L 0.051 -174 V 0.062 -175 D 0.069 -176 D 0.069 -177 S 0.069 -178 I 0.074 -179 T 0.076 -180 N 0.071 -181 V 0.059 -182 K 0.050 -183 K 0.046 -184 D 0.045 -185 D 0.043 -186 P 0.040 -187 M 0.042 -188 L 0.050 -189 L 0.061 -190 S 0.067 -191 S 0.065 -192 G 0.055 -193 R 0.044 -194 V 0.040 -195 R 0.046 -196 L 0.059 -197 V 0.074 -198 V 0.083 -199 G 0.085 -200 D 0.084 -201 G 0.086 -202 R 0.090 -203 M 0.090 -204 G 0.084 -205 Y 0.076 -206 A 0.068 -207 E 0.062 -208 E 0.056 -209 A 0.050 -210 P 0.047 -211 Y 0.047 -212 D 0.047 -213 A 0.046 -214 I 0.044 -215 H 0.045 -216 V 0.049 -217 G 0.061 -218 A 0.082 -219 A 0.106 -220 A 0.121 -221 P 0.122 -222 V 0.112 -223 V 0.099 -224 P 0.085 -225 Q 0.074 -226 A 0.068 -227 L 0.061 -228 I 0.054 -229 D 0.050 -230 Q 0.051 -231 L 0.058 -232 K 0.070 -233 P 0.077 -234 G 0.073 -235 G 0.065 -236 R 0.065 -237 L 0.076 -238 I 0.097 -239 L 0.127 -240 P 0.161 -241 V 0.185 -242 G 0.197 -243 P 0.200 -244 A 0.202 -245 G 0.203 -246 G 0.199 -247 N 0.187 -248 Q 0.164 -249 M 0.136 -250 L 0.108 -251 E 0.085 -252 Q 0.070 -253 Y 0.062 -254 D 0.061 -255 K 0.066 -256 L 0.076 -257 Q 0.090 -258 D 0.105 -259 G 0.112 -260 S 0.105 -261 V 0.089 -262 K 0.075 -263 M 0.071 -264 K 0.075 -265 P 0.082 -266 L 0.087 -267 M 0.089 -268 G 0.091 -269 V 0.091 -270 I 0.092 -271 Y 0.096 -272 V 0.106 -273 P 0.115 -274 L 0.124 -275 T 0.140 -276 D 0.173 -277 K 0.218 -278 E 0.264 -279 K 0.302 -280 Q 0.337 -281 W 0.374 -282 S 0.416 -283 R 0.459 -284 D 0.489 -285 E 0.487 -286 L 0.468 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019987.10_ENSMUST00000020161.10_GN:Arg1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019987.10_ENSMUST00000020161.10_GN:Arg1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 26d965725955d3b3a79509f9e9a02731dfbadebc..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019987.10_ENSMUST00000020161.10_GN:Arg1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,324 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000019987.10|ENSMUST00000020161.10|GN:Arg1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.374 -2 S 0.353 -3 S 0.313 -4 K 0.254 -5 P 0.183 -6 K 0.118 -7 S 0.076 -8 L 0.063 -9 E 0.073 -10 I 0.097 -11 I 0.125 -12 G 0.144 -13 A 0.149 -14 P 0.146 -15 F 0.144 -16 S 0.151 -17 K 0.162 -18 G 0.174 -19 Q 0.187 -20 P 0.208 -21 R 0.231 -22 G 0.246 -23 G 0.238 -24 V 0.212 -25 E 0.177 -26 K 0.144 -27 G 0.118 -28 P 0.099 -29 A 0.091 -30 A 0.093 -31 L 0.095 -32 R 0.088 -33 K 0.075 -34 A 0.065 -35 G 0.062 -36 L 0.064 -37 L 0.069 -38 E 0.071 -39 K 0.068 -40 L 0.062 -41 K 0.060 -42 E 0.063 -43 T 0.067 -44 E 0.067 -45 Y 0.065 -46 D 0.064 -47 V 0.067 -48 R 0.074 -49 D 0.085 -50 H 0.098 -51 G 0.110 -52 D 0.117 -53 L 0.113 -54 A 0.103 -55 F 0.097 -56 V 0.104 -57 D 0.124 -58 V 0.149 -59 P 0.173 -60 N 0.192 -61 D 0.210 -62 S 0.224 -63 S 0.226 -64 F 0.221 -65 Q 0.219 -66 I 0.226 -67 V 0.231 -68 K 0.223 -69 N 0.202 -70 P 0.180 -71 R 0.164 -72 S 0.155 -73 V 0.149 -74 G 0.137 -75 K 0.122 -76 A 0.111 -77 N 0.104 -78 E 0.093 -79 E 0.079 -80 L 0.067 -81 A 0.059 -82 G 0.054 -83 V 0.052 -84 V 0.056 -85 A 0.061 -86 E 0.062 -87 V 0.058 -88 Q 0.058 -89 K 0.070 -90 N 0.090 -91 G 0.107 -92 R 0.115 -93 V 0.115 -94 S 0.114 -95 V 0.117 -96 V 0.125 -97 L 0.130 -98 G 0.126 -99 G 0.119 -100 D 0.117 -101 H 0.119 -102 S 0.116 -103 L 0.105 -104 A 0.093 -105 V 0.081 -106 G 0.072 -107 S 0.067 -108 I 0.064 -109 S 0.063 -110 G 0.057 -111 H 0.049 -112 A 0.045 -113 R 0.047 -114 V 0.048 -115 H 0.047 -116 P 0.046 -117 D 0.048 -118 L 0.057 -119 C 0.077 -120 V 0.107 -121 I 0.136 -122 W 0.152 -123 V 0.149 -124 D 0.133 -125 A 0.115 -126 H 0.110 -127 T 0.114 -128 D 0.119 -129 I 0.117 -130 N 0.106 -131 T 0.097 -132 P 0.100 -133 L 0.114 -134 T 0.134 -135 T 0.152 -136 S 0.163 -137 S 0.166 -138 G 0.161 -139 N 0.155 -140 L 0.152 -141 H 0.154 -142 G 0.152 -143 Q 0.143 -144 P 0.130 -145 V 0.117 -146 S 0.109 -147 F 0.105 -148 L 0.104 -149 L 0.100 -150 K 0.096 -151 E 0.093 -152 L 0.095 -153 K 0.104 -154 G 0.121 -155 K 0.148 -156 F 0.174 -157 P 0.188 -158 D 0.186 -159 V 0.170 -160 P 0.143 -161 G 0.113 -162 F 0.089 -163 S 0.076 -164 W 0.074 -165 V 0.080 -166 T 0.082 -167 P 0.076 -168 C 0.067 -169 I 0.061 -170 S 0.059 -171 A 0.061 -172 K 0.066 -173 D 0.071 -174 I 0.079 -175 V 0.090 -176 Y 0.103 -177 I 0.113 -178 G 0.114 -179 L 0.112 -180 R 0.113 -181 D 0.119 -182 V 0.122 -183 D 0.116 -184 P 0.105 -185 G 0.094 -186 E 0.088 -187 H 0.086 -188 Y 0.084 -189 I 0.077 -190 I 0.065 -191 K 0.057 -192 T 0.058 -193 L 0.067 -194 G 0.077 -195 I 0.081 -196 K 0.074 -197 Y 0.065 -198 F 0.061 -199 S 0.065 -200 M 0.072 -201 T 0.076 -202 E 0.071 -203 V 0.062 -204 D 0.058 -205 K 0.058 -206 L 0.061 -207 G 0.059 -208 I 0.052 -209 G 0.044 -210 K 0.038 -211 V 0.034 -212 M 0.031 -213 E 0.030 -214 E 0.029 -215 T 0.027 -216 F 0.025 -217 S 0.024 -218 Y 0.026 -219 L 0.033 -220 L 0.045 -221 G 0.057 -222 R 0.065 -223 K 0.068 -224 K 0.073 -225 R 0.077 -226 P 0.078 -227 I 0.077 -228 H 0.084 -229 L 0.101 -230 S 0.126 -231 F 0.151 -232 D 0.163 -233 V 0.158 -234 D 0.145 -235 G 0.131 -236 L 0.116 -237 D 0.099 -238 P 0.086 -239 A 0.081 -240 F 0.082 -241 T 0.083 -242 P 0.085 -243 A 0.089 -244 T 0.098 -245 G 0.113 -246 T 0.134 -247 P 0.151 -248 V 0.158 -249 L 0.159 -250 G 0.156 -251 G 0.147 -252 L 0.129 -253 S 0.103 -254 Y 0.079 -255 R 0.067 -256 E 0.066 -257 G 0.068 -258 L 0.065 -259 Y 0.056 -260 I 0.047 -261 T 0.041 -262 E 0.038 -263 E 0.036 -264 I 0.034 -265 Y 0.034 -266 K 0.037 -267 T 0.041 -268 G 0.044 -269 L 0.046 -270 L 0.048 -271 S 0.050 -272 G 0.056 -273 L 0.068 -274 D 0.080 -275 I 0.086 -276 M 0.085 -277 E 0.085 -278 V 0.087 -279 N 0.092 -280 P 0.101 -281 T 0.114 -282 L 0.126 -283 G 0.127 -284 K 0.114 -285 T 0.096 -286 A 0.083 -287 E 0.079 -288 E 0.080 -289 V 0.079 -290 K 0.075 -291 S 0.072 -292 T 0.071 -293 V 0.069 -294 N 0.065 -295 T 0.061 -296 A 0.058 -297 V 0.056 -298 A 0.054 -299 L 0.050 -300 T 0.044 -301 L 0.038 -302 A 0.035 -303 C 0.038 -304 F 0.054 -305 G 0.089 -306 T 0.141 -307 Q 0.199 -308 R 0.251 -309 E 0.298 -310 G 0.342 -311 N 0.375 -312 H 0.390 -313 K 0.389 -314 P 0.379 -315 G 0.366 -316 T 0.354 -317 D 0.346 -318 Y 0.340 -319 L 0.336 -320 K 0.340 -321 P 0.347 -322 P 0.349 -323 K 0.345 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019987.10_ENSMUST00000020161.10_GN:Arg1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019987.10_ENSMUST00000020161.10_GN:Arg1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid deleted file mode 100644 index 203d3e241d72b3eb14013ba66d53cd069af05e26..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000019987.10_ENSMUST00000020161.10_GN:Arg1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid +++ /dev/null @@ -1,336 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000019987.10|ENSMUST00000020161.10|GN:Arg1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:12 -1 M 0.365 -2 Q 0.352 -3 Q 0.354 -4 Q 0.387 -5 Q 0.436 -6 P 0.476 -7 L 0.504 -8 E 0.526 -9 P 0.538 -10 R 0.539 -11 E 0.532 -12 S 0.514 -13 M 0.476 -14 S 0.418 -15 S 0.351 -16 K 0.277 -17 P 0.198 -18 K 0.128 -19 S 0.083 -20 L 0.070 -21 E 0.080 -22 I 0.104 -23 I 0.130 -24 G 0.149 -25 A 0.153 -26 P 0.148 -27 F 0.146 -28 S 0.152 -29 K 0.163 -30 G 0.175 -31 Q 0.190 -32 P 0.212 -33 R 0.238 -34 G 0.252 -35 G 0.245 -36 V 0.217 -37 E 0.182 -38 K 0.148 -39 G 0.120 -40 P 0.101 -41 A 0.093 -42 A 0.095 -43 L 0.097 -44 R 0.089 -45 K 0.075 -46 A 0.065 -47 G 0.062 -48 L 0.065 -49 L 0.070 -50 E 0.072 -51 K 0.068 -52 L 0.060 -53 K 0.056 -54 E 0.058 -55 T 0.063 -56 E 0.065 -57 Y 0.064 -58 D 0.064 -59 V 0.067 -60 R 0.074 -61 D 0.084 -62 H 0.097 -63 G 0.108 -64 D 0.114 -65 L 0.111 -66 A 0.101 -67 F 0.096 -68 V 0.103 -69 D 0.123 -70 V 0.149 -71 P 0.173 -72 N 0.194 -73 D 0.212 -74 S 0.226 -75 S 0.229 -76 F 0.223 -77 Q 0.221 -78 I 0.227 -79 V 0.232 -80 K 0.224 -81 N 0.204 -82 P 0.183 -83 R 0.167 -84 S 0.158 -85 V 0.151 -86 G 0.139 -87 K 0.124 -88 A 0.114 -89 N 0.106 -90 E 0.095 -91 E 0.080 -92 L 0.068 -93 A 0.060 -94 G 0.055 -95 V 0.053 -96 V 0.057 -97 A 0.062 -98 E 0.062 -99 V 0.058 -100 Q 0.057 -101 K 0.068 -102 N 0.087 -103 G 0.105 -104 R 0.115 -105 V 0.116 -106 S 0.116 -107 V 0.119 -108 V 0.127 -109 L 0.131 -110 G 0.127 -111 G 0.120 -112 D 0.118 -113 H 0.121 -114 S 0.118 -115 L 0.108 -116 A 0.095 -117 V 0.084 -118 G 0.075 -119 S 0.070 -120 I 0.067 -121 S 0.066 -122 G 0.060 -123 H 0.052 -124 A 0.047 -125 R 0.049 -126 V 0.051 -127 H 0.049 -128 P 0.048 -129 D 0.050 -130 L 0.059 -131 C 0.081 -132 V 0.111 -133 I 0.140 -134 W 0.156 -135 V 0.154 -136 D 0.137 -137 A 0.119 -138 H 0.112 -139 T 0.117 -140 D 0.121 -141 I 0.118 -142 N 0.108 -143 T 0.099 -144 P 0.102 -145 L 0.117 -146 T 0.136 -147 T 0.154 -148 S 0.165 -149 S 0.168 -150 G 0.164 -151 N 0.158 -152 L 0.155 -153 H 0.156 -154 G 0.155 -155 Q 0.147 -156 P 0.133 -157 V 0.121 -158 S 0.113 -159 F 0.109 -160 L 0.108 -161 L 0.104 -162 K 0.100 -163 E 0.098 -164 L 0.100 -165 K 0.109 -166 G 0.127 -167 K 0.154 -168 F 0.179 -169 P 0.192 -170 D 0.189 -171 V 0.173 -172 P 0.146 -173 G 0.115 -174 F 0.090 -175 S 0.077 -176 W 0.075 -177 V 0.081 -178 T 0.082 -179 P 0.077 -180 C 0.069 -181 I 0.063 -182 S 0.061 -183 A 0.063 -184 K 0.068 -185 D 0.073 -186 I 0.082 -187 V 0.093 -188 Y 0.106 -189 I 0.115 -190 G 0.116 -191 L 0.113 -192 R 0.114 -193 D 0.120 -194 V 0.124 -195 D 0.117 -196 P 0.106 -197 G 0.096 -198 E 0.089 -199 H 0.087 -200 Y 0.085 -201 I 0.078 -202 I 0.065 -203 K 0.056 -204 T 0.058 -205 L 0.067 -206 G 0.077 -207 I 0.081 -208 K 0.075 -209 Y 0.066 -210 F 0.063 -211 S 0.066 -212 M 0.073 -213 T 0.076 -214 E 0.071 -215 V 0.063 -216 D 0.058 -217 K 0.058 -218 L 0.060 -219 G 0.059 -220 I 0.052 -221 G 0.044 -222 K 0.039 -223 V 0.035 -224 M 0.033 -225 E 0.032 -226 E 0.031 -227 T 0.029 -228 F 0.026 -229 S 0.025 -230 Y 0.028 -231 L 0.035 -232 L 0.046 -233 G 0.058 -234 R 0.065 -235 K 0.068 -236 K 0.073 -237 R 0.078 -238 P 0.080 -239 I 0.080 -240 H 0.088 -241 L 0.106 -242 S 0.132 -243 F 0.157 -244 D 0.169 -245 V 0.163 -246 D 0.149 -247 G 0.135 -248 L 0.119 -249 D 0.101 -250 P 0.088 -251 A 0.083 -252 F 0.084 -253 T 0.085 -254 P 0.086 -255 A 0.090 -256 T 0.100 -257 G 0.116 -258 T 0.137 -259 P 0.154 -260 V 0.161 -261 L 0.162 -262 G 0.158 -263 G 0.150 -264 L 0.131 -265 S 0.106 -266 Y 0.082 -267 R 0.070 -268 E 0.069 -269 G 0.072 -270 L 0.068 -271 Y 0.059 -272 I 0.049 -273 T 0.043 -274 E 0.039 -275 E 0.037 -276 I 0.034 -277 Y 0.034 -278 K 0.038 -279 T 0.042 -280 G 0.046 -281 L 0.049 -282 L 0.050 -283 S 0.052 -284 G 0.059 -285 L 0.070 -286 D 0.082 -287 I 0.088 -288 M 0.088 -289 E 0.088 -290 V 0.090 -291 N 0.095 -292 P 0.104 -293 T 0.118 -294 L 0.131 -295 G 0.132 -296 K 0.118 -297 T 0.100 -298 A 0.087 -299 E 0.083 -300 E 0.083 -301 V 0.082 -302 K 0.078 -303 S 0.075 -304 T 0.074 -305 V 0.072 -306 N 0.068 -307 T 0.064 -308 A 0.061 -309 V 0.058 -310 A 0.056 -311 L 0.052 -312 T 0.046 -313 L 0.039 -314 A 0.036 -315 C 0.040 -316 F 0.055 -317 G 0.092 -318 T 0.148 -319 Q 0.210 -320 R 0.266 -321 E 0.315 -322 G 0.360 -323 N 0.393 -324 H 0.409 -325 K 0.409 -326 P 0.400 -327 G 0.386 -328 T 0.370 -329 D 0.358 -330 Y 0.349 -331 L 0.344 -332 K 0.348 -333 P 0.357 -334 P 0.360 -335 K 0.356 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020125.8_ENSMUST00000046091.7_GN:Elane_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020125.8_ENSMUST00000046091.7_GN:Elane_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 4dfe560f5e75cddb0c3d4dc8dba2b3e2594df689..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020125.8_ENSMUST00000046091.7_GN:Elane_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,266 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000020125.8|ENSMUST00000046091.7|GN:Elane|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.444 -2 A 0.465 -3 L 0.494 -4 G 0.505 -5 R 0.480 -6 L 0.433 -7 S 0.382 -8 S 0.332 -9 R 0.287 -10 T 0.266 -11 L 0.273 -12 A 0.289 -13 A 0.308 -14 M 0.335 -15 L 0.356 -16 L 0.358 -17 A 0.354 -18 L 0.365 -19 F 0.392 -20 L 0.426 -21 G 0.463 -22 G 0.497 -23 P 0.511 -24 A 0.493 -25 L 0.446 -26 A 0.387 -27 S 0.336 -28 E 0.301 -29 I 0.274 -30 V 0.240 -31 G 0.199 -32 G 0.162 -33 R 0.141 -34 P 0.137 -35 A 0.136 -36 R 0.130 -37 P 0.117 -38 H 0.101 -39 A 0.083 -40 W 0.064 -41 P 0.046 -42 F 0.034 -43 M 0.027 -44 A 0.028 -45 S 0.034 -46 L 0.047 -47 Q 0.063 -48 R 0.081 -49 R 0.099 -50 G 0.116 -51 G 0.118 -52 H 0.098 -53 F 0.065 -54 C 0.038 -55 G 0.026 -56 A 0.026 -57 T 0.032 -58 L 0.038 -59 I 0.040 -60 A 0.036 -61 R 0.031 -62 N 0.025 -63 F 0.021 -64 V 0.017 -65 M 0.015 -66 S 0.015 -67 A 0.018 -68 A 0.023 -69 H 0.029 -70 C 0.034 -71 V 0.040 -72 N 0.047 -73 G 0.054 -74 L 0.057 -75 N 0.054 -76 F 0.048 -77 R 0.041 -78 S 0.032 -79 V 0.025 -80 Q 0.021 -81 V 0.021 -82 V 0.025 -83 L 0.030 -84 G 0.038 -85 A 0.043 -86 H 0.043 -87 D 0.042 -88 L 0.045 -89 R 0.055 -90 R 0.070 -91 Q 0.081 -92 E 0.080 -93 R 0.070 -94 T 0.055 -95 R 0.044 -96 Q 0.037 -97 T 0.033 -98 F 0.029 -99 S 0.024 -100 V 0.021 -101 Q 0.019 -102 R 0.018 -103 I 0.019 -104 F 0.026 -105 E 0.041 -106 N 0.062 -107 G 0.082 -108 F 0.093 -109 D 0.091 -110 P 0.086 -111 S 0.089 -112 Q 0.103 -113 L 0.121 -114 L 0.124 -115 N 0.104 -116 D 0.071 -117 I 0.042 -118 V 0.024 -119 I 0.017 -120 I 0.017 -121 Q 0.021 -122 L 0.027 -123 N 0.035 -124 G 0.044 -125 S 0.055 -126 A 0.067 -127 T 0.077 -128 I 0.083 -129 N 0.084 -130 A 0.078 -131 N 0.066 -132 V 0.052 -133 Q 0.043 -134 V 0.044 -135 A 0.050 -136 Q 0.061 -137 L 0.080 -138 P 0.107 -139 A 0.133 -140 Q 0.149 -141 G 0.155 -142 Q 0.156 -143 G 0.148 -144 V 0.132 -145 G 0.114 -146 D 0.099 -147 R 0.087 -148 T 0.073 -149 P 0.056 -150 C 0.039 -151 L 0.029 -152 A 0.027 -153 M 0.030 -154 G 0.038 -155 W 0.050 -156 G 0.067 -157 R 0.083 -158 L 0.099 -159 G 0.118 -160 T 0.137 -161 N 0.148 -162 R 0.152 -163 P 0.150 -164 S 0.139 -165 P 0.120 -166 S 0.103 -167 V 0.092 -168 L 0.084 -169 Q 0.075 -170 E 0.065 -171 L 0.056 -172 N 0.048 -173 V 0.042 -174 T 0.040 -175 V 0.047 -176 V 0.059 -177 T 0.074 -178 N 0.085 -179 M 0.092 -180 C 0.097 -181 R 0.104 -182 R 0.109 -183 R 0.104 -184 V 0.086 -185 N 0.063 -186 V 0.047 -187 C 0.042 -188 T 0.047 -189 L 0.060 -190 V 0.081 -191 P 0.100 -192 R 0.112 -193 R 0.116 -194 Q 0.110 -195 A 0.098 -196 G 0.081 -197 I 0.067 -198 C 0.060 -199 F 0.061 -200 G 0.064 -201 D 0.066 -202 S 0.063 -203 G 0.060 -204 G 0.061 -205 P 0.064 -206 L 0.062 -207 V 0.055 -208 C 0.051 -209 N 0.050 -210 N 0.053 -211 L 0.055 -212 V 0.056 -213 Q 0.057 -214 G 0.057 -215 I 0.056 -216 D 0.053 -217 S 0.053 -218 F 0.060 -219 I 0.072 -220 R 0.081 -221 G 0.082 -222 G 0.081 -223 C 0.088 -224 G 0.103 -225 S 0.121 -226 G 0.133 -227 L 0.131 -228 Y 0.113 -229 P 0.087 -230 D 0.064 -231 A 0.053 -232 F 0.054 -233 A 0.063 -234 P 0.070 -235 V 0.072 -236 A 0.069 -237 E 0.067 -238 F 0.068 -239 A 0.072 -240 D 0.071 -241 W 0.060 -242 I 0.050 -243 N 0.046 -244 S 0.048 -245 I 0.056 -246 I 0.076 -247 R 0.112 -248 S 0.166 -249 H 0.228 -250 N 0.283 -251 D 0.317 -252 H 0.337 -253 L 0.354 -254 L 0.373 -255 T 0.395 -256 H 0.424 -257 P 0.456 -258 K 0.485 -259 D 0.510 -260 R 0.536 -261 E 0.560 -262 G 0.571 -263 R 0.553 -264 T 0.509 -265 N 0.467 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020125.8_ENSMUST00000046091.7_GN:Elane_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020125.8_ENSMUST00000046091.7_GN:Elane_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid deleted file mode 100644 index b28f7f83fa71c6abb263a0599924fbc790c57674..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020125.8_ENSMUST00000046091.7_GN:Elane_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid +++ /dev/null @@ -1,276 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000020125.8|ENSMUST00000046091.7|GN:Elane|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:10 -1 M 0.412 -2 W 0.437 -3 G 0.472 -4 A 0.481 -5 A 0.443 -6 R 0.399 -7 T 0.417 -8 Q 0.502 -9 P 0.589 -10 T 0.636 -11 M 0.655 -12 A 0.661 -13 L 0.647 -14 G 0.602 -15 R 0.532 -16 L 0.462 -17 S 0.412 -18 S 0.383 -19 R 0.369 -20 T 0.360 -21 L 0.344 -22 A 0.322 -23 A 0.316 -24 M 0.328 -25 L 0.334 -26 L 0.330 -27 A 0.336 -28 L 0.359 -29 F 0.389 -30 L 0.419 -31 G 0.453 -32 G 0.486 -33 P 0.501 -34 A 0.486 -35 L 0.440 -36 A 0.382 -37 S 0.331 -38 E 0.297 -39 I 0.272 -40 V 0.240 -41 G 0.200 -42 G 0.163 -43 R 0.143 -44 P 0.139 -45 A 0.139 -46 R 0.133 -47 P 0.119 -48 H 0.102 -49 A 0.083 -50 W 0.064 -51 P 0.046 -52 F 0.034 -53 M 0.027 -54 A 0.027 -55 S 0.034 -56 L 0.047 -57 Q 0.063 -58 R 0.081 -59 R 0.099 -60 G 0.115 -61 G 0.117 -62 H 0.097 -63 F 0.064 -64 C 0.037 -65 G 0.025 -66 A 0.025 -67 T 0.032 -68 L 0.037 -69 I 0.039 -70 A 0.036 -71 R 0.030 -72 N 0.025 -73 F 0.020 -74 V 0.017 -75 M 0.015 -76 S 0.014 -77 A 0.017 -78 A 0.022 -79 H 0.028 -80 C 0.033 -81 V 0.038 -82 N 0.045 -83 G 0.052 -84 L 0.055 -85 N 0.053 -86 F 0.047 -87 R 0.040 -88 S 0.031 -89 V 0.024 -90 Q 0.021 -91 V 0.021 -92 V 0.025 -93 L 0.030 -94 G 0.037 -95 A 0.042 -96 H 0.042 -97 D 0.041 -98 L 0.044 -99 R 0.053 -100 R 0.067 -101 Q 0.078 -102 E 0.078 -103 R 0.068 -104 T 0.055 -105 R 0.044 -106 Q 0.037 -107 T 0.033 -108 F 0.028 -109 S 0.024 -110 V 0.020 -111 Q 0.018 -112 R 0.017 -113 I 0.019 -114 F 0.026 -115 E 0.041 -116 N 0.063 -117 G 0.083 -118 F 0.094 -119 D 0.093 -120 P 0.087 -121 S 0.089 -122 Q 0.104 -123 L 0.122 -124 L 0.125 -125 N 0.106 -126 D 0.072 -127 I 0.043 -128 V 0.025 -129 I 0.017 -130 I 0.017 -131 Q 0.021 -132 L 0.027 -133 N 0.035 -134 G 0.044 -135 S 0.056 -136 A 0.068 -137 T 0.078 -138 I 0.084 -139 N 0.085 -140 A 0.079 -141 N 0.066 -142 V 0.052 -143 Q 0.044 -144 V 0.044 -145 A 0.050 -146 Q 0.061 -147 L 0.080 -148 P 0.107 -149 A 0.133 -150 Q 0.149 -151 G 0.156 -152 Q 0.156 -153 G 0.149 -154 V 0.133 -155 G 0.114 -156 D 0.099 -157 R 0.087 -158 T 0.072 -159 P 0.055 -160 C 0.039 -161 L 0.030 -162 A 0.027 -163 M 0.030 -164 G 0.038 -165 W 0.051 -166 G 0.067 -167 R 0.083 -168 L 0.099 -169 G 0.118 -170 T 0.136 -171 N 0.147 -172 R 0.151 -173 P 0.149 -174 S 0.139 -175 P 0.121 -176 S 0.103 -177 V 0.093 -178 L 0.085 -179 Q 0.076 -180 E 0.066 -181 L 0.057 -182 N 0.048 -183 V 0.042 -184 T 0.040 -185 V 0.046 -186 V 0.059 -187 T 0.073 -188 N 0.084 -189 M 0.091 -190 C 0.096 -191 R 0.103 -192 R 0.109 -193 R 0.105 -194 V 0.086 -195 N 0.063 -196 V 0.047 -197 C 0.042 -198 T 0.046 -199 L 0.059 -200 V 0.079 -201 P 0.099 -202 R 0.112 -203 R 0.115 -204 Q 0.109 -205 A 0.096 -206 G 0.079 -207 I 0.066 -208 C 0.059 -209 F 0.059 -210 G 0.063 -211 D 0.065 -212 S 0.062 -213 G 0.059 -214 G 0.061 -215 P 0.064 -216 L 0.061 -217 V 0.055 -218 C 0.050 -219 N 0.050 -220 N 0.052 -221 L 0.055 -222 V 0.055 -223 Q 0.056 -224 G 0.057 -225 I 0.056 -226 D 0.052 -227 S 0.053 -228 F 0.061 -229 I 0.073 -230 R 0.081 -231 G 0.082 -232 G 0.082 -233 C 0.088 -234 G 0.103 -235 S 0.122 -236 G 0.134 -237 L 0.132 -238 Y 0.114 -239 P 0.088 -240 D 0.065 -241 A 0.053 -242 F 0.054 -243 A 0.063 -244 P 0.070 -245 V 0.072 -246 A 0.069 -247 E 0.064 -248 F 0.058 -249 A 0.051 -250 D 0.044 -251 W 0.038 -252 I 0.037 -253 N 0.039 -254 S 0.043 -255 I 0.052 -256 I 0.074 -257 R 0.112 -258 S 0.166 -259 H 0.229 -260 N 0.284 -261 D 0.319 -262 H 0.339 -263 L 0.357 -264 L 0.375 -265 T 0.397 -266 H 0.426 -267 P 0.458 -268 K 0.488 -269 D 0.514 -270 R 0.541 -271 E 0.565 -272 G 0.576 -273 R 0.559 -274 T 0.515 -275 N 0.473 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020583.5_ENSMUST00000020899.5_GN:Matn3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020583.5_ENSMUST00000020899.5_GN:Matn3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 265a7535bbd0ddd445b1e86b0f11a43190f75e8c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020583.5_ENSMUST00000020899.5_GN:Matn3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,482 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000020583.5|ENSMUST00000020899.5|GN:Matn3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.396 -2 L 0.415 -3 L 0.448 -4 S 0.489 -5 A 0.524 -6 P 0.542 -7 L 0.548 -8 R 0.556 -9 H 0.572 -10 L 0.593 -11 P 0.610 -12 G 0.605 -13 L 0.566 -14 L 0.506 -15 L 0.450 -16 L 0.419 -17 L 0.416 -18 W 0.426 -19 P 0.432 -20 L 0.428 -21 L 0.427 -22 L 0.445 -23 L 0.488 -24 P 0.544 -25 S 0.593 -26 L 0.619 -27 A 0.626 -28 A 0.624 -29 P 0.606 -30 G 0.569 -31 R 0.540 -32 L 0.534 -33 A 0.535 -34 R 0.543 -35 A 0.571 -36 S 0.588 -37 V 0.568 -38 R 0.548 -39 R 0.567 -40 L 0.593 -41 G 0.581 -42 T 0.558 -43 R 0.572 -44 V 0.619 -45 P 0.662 -46 G 0.684 -47 G 0.689 -48 S 0.689 -49 P 0.695 -50 G 0.702 -51 H 0.690 -52 L 0.646 -53 S 0.585 -54 A 0.551 -55 L 0.554 -56 A 0.561 -57 T 0.563 -58 S 0.582 -59 T 0.615 -60 R 0.640 -61 A 0.656 -62 P 0.676 -63 Y 0.699 -64 S 0.721 -65 G 0.734 -66 G 0.736 -67 R 0.725 -68 G 0.700 -69 A 0.649 -70 G 0.561 -71 V 0.442 -72 C 0.319 -73 K 0.220 -74 S 0.157 -75 R 0.118 -76 P 0.088 -77 L 0.064 -78 D 0.048 -79 L 0.038 -80 V 0.033 -81 F 0.033 -82 I 0.038 -83 I 0.045 -84 D 0.055 -85 S 0.067 -86 S 0.078 -87 R 0.084 -88 S 0.085 -89 V 0.079 -90 R 0.069 -91 P 0.062 -92 L 0.059 -93 E 0.058 -94 F 0.056 -95 T 0.051 -96 K 0.047 -97 V 0.045 -98 K 0.047 -99 T 0.051 -100 F 0.052 -101 V 0.051 -102 S 0.048 -103 R 0.044 -104 I 0.040 -105 I 0.038 -106 D 0.040 -107 T 0.042 -108 L 0.044 -109 D 0.045 -110 I 0.048 -111 G 0.055 -112 A 0.062 -113 T 0.063 -114 D 0.056 -115 T 0.046 -116 R 0.037 -117 V 0.030 -118 A 0.025 -119 V 0.023 -120 V 0.025 -121 N 0.032 -122 Y 0.040 -123 A 0.049 -124 S 0.055 -125 T 0.059 -126 V 0.060 -127 K 0.057 -128 I 0.054 -129 E 0.055 -130 F 0.057 -131 Q 0.056 -132 L 0.053 -133 N 0.051 -134 T 0.052 -135 Y 0.053 -136 S 0.052 -137 D 0.050 -138 K 0.049 -139 Q 0.052 -140 A 0.058 -141 L 0.066 -142 K 0.076 -143 Q 0.084 -144 A 0.082 -145 V 0.078 -146 A 0.082 -147 R 0.095 -148 I 0.107 -149 T 0.107 -150 P 0.101 -151 L 0.099 -152 S 0.104 -153 T 0.111 -154 G 0.115 -155 T 0.112 -156 M 0.104 -157 S 0.095 -158 G 0.087 -159 L 0.079 -160 A 0.071 -161 I 0.064 -162 Q 0.060 -163 T 0.061 -164 A 0.067 -165 M 0.073 -166 E 0.077 -167 E 0.077 -168 A 0.075 -169 F 0.075 -170 T 0.082 -171 V 0.096 -172 E 0.111 -173 A 0.125 -174 G 0.141 -175 A 0.159 -176 R 0.177 -177 G 0.189 -178 P 0.191 -179 M 0.186 -180 S 0.181 -181 N 0.175 -182 I 0.159 -183 P 0.127 -184 K 0.091 -185 V 0.063 -186 A 0.046 -187 I 0.039 -188 I 0.039 -189 V 0.047 -190 T 0.069 -191 D 0.104 -192 G 0.138 -193 R 0.151 -194 P 0.144 -195 Q 0.134 -196 D 0.131 -197 Q 0.131 -198 V 0.125 -199 N 0.113 -200 E 0.098 -201 V 0.085 -202 A 0.081 -203 A 0.083 -204 R 0.086 -205 A 0.088 -206 R 0.089 -207 A 0.087 -208 S 0.081 -209 G 0.074 -210 I 0.065 -211 E 0.051 -212 L 0.038 -213 Y 0.031 -214 A 0.034 -215 V 0.041 -216 G 0.048 -217 V 0.054 -218 D 0.060 -219 R 0.066 -220 A 0.066 -221 D 0.060 -222 M 0.054 -223 E 0.051 -224 S 0.051 -225 L 0.050 -226 K 0.047 -227 M 0.046 -228 M 0.047 -229 A 0.048 -230 S 0.045 -231 K 0.041 -232 P 0.044 -233 L 0.052 -234 E 0.056 -235 E 0.054 -236 H 0.049 -237 V 0.048 -238 F 0.052 -239 Y 0.061 -240 V 0.074 -241 E 0.084 -242 T 0.089 -243 Y 0.087 -244 G 0.079 -245 V 0.069 -246 I 0.060 -247 E 0.055 -248 K 0.054 -249 L 0.055 -250 S 0.058 -251 A 0.058 -252 R 0.060 -253 F 0.067 -254 Q 0.079 -255 E 0.087 -256 T 0.089 -257 F 0.098 -258 C 0.125 -259 A 0.158 -260 L 0.171 -261 D 0.160 -262 Q 0.139 -263 C 0.126 -264 M 0.128 -265 L 0.138 -266 G 0.148 -267 T 0.146 -268 H 0.136 -269 Q 0.123 -270 C 0.112 -271 Q 0.107 -272 H 0.115 -273 V 0.138 -274 C 0.163 -275 V 0.175 -276 S 0.172 -277 D 0.169 -278 G 0.174 -279 D 0.184 -280 G 0.180 -281 K 0.155 -282 H 0.125 -283 H 0.107 -284 C 0.105 -285 E 0.113 -286 C 0.126 -287 S 0.137 -288 Q 0.139 -289 G 0.132 -290 Y 0.127 -291 T 0.130 -292 L 0.135 -293 N 0.137 -294 A 0.135 -295 D 0.132 -296 G 0.128 -297 K 0.126 -298 T 0.129 -299 C 0.140 -300 S 0.160 -301 A 0.185 -302 I 0.200 -303 D 0.196 -304 K 0.183 -305 C 0.178 -306 A 0.186 -307 L 0.197 -308 S 0.201 -309 T 0.198 -310 H 0.189 -311 G 0.176 -312 C 0.159 -313 E 0.146 -314 Q 0.151 -315 I 0.177 -316 C 0.205 -317 V 0.215 -318 N 0.204 -319 D 0.186 -320 R 0.176 -321 N 0.173 -322 G 0.165 -323 S 0.146 -324 Y 0.122 -325 H 0.106 -326 C 0.105 -327 E 0.113 -328 C 0.125 -329 Y 0.143 -330 G 0.162 -331 G 0.174 -332 Y 0.180 -333 A 0.183 -334 L 0.174 -335 N 0.154 -336 A 0.130 -337 D 0.111 -338 R 0.107 -339 R 0.121 -340 T 0.149 -341 C 0.186 -342 A 0.225 -343 A 0.255 -344 L 0.261 -345 D 0.241 -346 K 0.216 -347 C 0.208 -348 A 0.217 -349 S 0.228 -350 G 0.228 -351 T 0.216 -352 H 0.197 -353 G 0.176 -354 C 0.156 -355 Q 0.147 -356 H 0.163 -357 I 0.202 -358 C 0.236 -359 V 0.242 -360 N 0.226 -361 D 0.210 -362 G 0.207 -363 A 0.205 -364 G 0.192 -365 S 0.163 -366 H 0.132 -367 H 0.113 -368 C 0.110 -369 E 0.114 -370 C 0.120 -371 F 0.128 -372 E 0.133 -373 G 0.134 -374 Y 0.136 -375 T 0.141 -376 L 0.144 -377 N 0.140 -378 A 0.129 -379 D 0.114 -380 K 0.106 -381 K 0.111 -382 T 0.126 -383 C 0.146 -384 S 0.171 -385 V 0.196 -386 R 0.205 -387 N 0.192 -388 K 0.173 -389 C 0.170 -390 A 0.181 -391 L 0.189 -392 G 0.186 -393 T 0.174 -394 H 0.161 -395 G 0.150 -396 C 0.140 -397 Q 0.137 -398 H 0.153 -399 I 0.187 -400 C 0.215 -401 V 0.219 -402 S 0.205 -403 D 0.189 -404 G 0.173 -405 A 0.154 -406 V 0.130 -407 A 0.108 -408 Y 0.098 -409 H 0.099 -410 C 0.109 -411 D 0.122 -412 C 0.136 -413 F 0.152 -414 P 0.166 -415 G 0.172 -416 Y 0.171 -417 T 0.167 -418 L 0.158 -419 N 0.147 -420 D 0.135 -421 D 0.125 -422 K 0.123 -423 K 0.132 -424 T 0.149 -425 C 0.177 -426 S 0.225 -427 D 0.301 -428 I 0.389 -429 E 0.459 -430 E 0.497 -431 A 0.509 -432 R 0.516 -433 S 0.531 -434 L 0.556 -435 I 0.582 -436 S 0.608 -437 I 0.635 -438 E 0.652 -439 D 0.649 -440 A 0.634 -441 C 0.620 -442 G 0.618 -443 C 0.625 -444 G 0.629 -445 A 0.614 -446 T 0.575 -447 L 0.523 -448 A 0.473 -449 F 0.428 -450 Q 0.380 -451 E 0.337 -452 K 0.319 -453 V 0.317 -454 S 0.308 -455 S 0.298 -456 H 0.294 -457 L 0.289 -458 Q 0.286 -459 K 0.300 -460 L 0.322 -461 N 0.326 -462 T 0.312 -463 K 0.303 -464 L 0.302 -465 D 0.300 -466 N 0.297 -467 I 0.297 -468 L 0.295 -469 K 0.294 -470 K 0.305 -471 L 0.332 -472 K 0.369 -473 V 0.420 -474 T 0.478 -475 E 0.531 -476 Y 0.571 -477 G 0.598 -478 Q 0.605 -479 V 0.581 -480 H 0.530 -481 R 0.485 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020583.5_ENSMUST00000020899.5_GN:Matn3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:25.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020583.5_ENSMUST00000020899.5_GN:Matn3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:25.caid deleted file mode 100644 index 6b40f4a5c9678ea417ea7b75a7b4b33460889bdf..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020583.5_ENSMUST00000020899.5_GN:Matn3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:25.caid +++ /dev/null @@ -1,507 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000020583.5|ENSMUST00000020899.5|GN:Matn3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:25 -1 M 0.378 -2 A 0.393 -3 E 0.415 -4 T 0.438 -5 S 0.460 -6 D 0.482 -7 P 0.497 -8 V 0.501 -9 Y 0.484 -10 P 0.446 -11 S 0.406 -12 Y 0.376 -13 L 0.343 -14 A 0.312 -15 A 0.320 -16 H 0.373 -17 R 0.429 -18 P 0.459 -19 R 0.488 -20 Q 0.539 -21 V 0.589 -22 V 0.622 -23 K 0.651 -24 P 0.678 -25 I 0.691 -26 M 0.689 -27 L 0.677 -28 L 0.657 -29 S 0.636 -30 A 0.621 -31 P 0.616 -32 L 0.615 -33 R 0.615 -34 H 0.621 -35 L 0.640 -36 P 0.657 -37 G 0.653 -38 L 0.614 -39 L 0.544 -40 L 0.465 -41 L 0.414 -42 L 0.411 -43 W 0.433 -44 P 0.443 -45 L 0.436 -46 L 0.431 -47 L 0.448 -48 L 0.492 -49 P 0.551 -50 S 0.602 -51 L 0.633 -52 A 0.648 -53 A 0.665 -54 P 0.688 -55 G 0.712 -56 R 0.727 -57 L 0.734 -58 A 0.735 -59 R 0.733 -60 A 0.721 -61 S 0.682 -62 V 0.623 -63 R 0.591 -64 R 0.620 -65 L 0.675 -66 G 0.702 -67 T 0.700 -68 R 0.696 -69 V 0.702 -70 P 0.713 -71 G 0.722 -72 G 0.723 -73 S 0.721 -74 P 0.724 -75 G 0.728 -76 H 0.714 -77 L 0.669 -78 S 0.609 -79 A 0.581 -80 L 0.606 -81 A 0.643 -82 T 0.660 -83 S 0.663 -84 T 0.664 -85 R 0.664 -86 A 0.669 -87 P 0.684 -88 Y 0.705 -89 S 0.724 -90 G 0.736 -91 G 0.735 -92 R 0.723 -93 G 0.697 -94 A 0.646 -95 G 0.558 -96 V 0.439 -97 C 0.316 -98 K 0.217 -99 S 0.152 -100 R 0.112 -101 P 0.084 -102 L 0.061 -103 D 0.045 -104 L 0.035 -105 V 0.031 -106 F 0.032 -107 I 0.036 -108 I 0.044 -109 D 0.054 -110 S 0.065 -111 S 0.075 -112 R 0.081 -113 S 0.082 -114 V 0.078 -115 R 0.069 -116 P 0.062 -117 L 0.059 -118 E 0.057 -119 F 0.054 -120 T 0.050 -121 K 0.045 -122 V 0.044 -123 K 0.047 -124 T 0.050 -125 F 0.052 -126 V 0.051 -127 S 0.048 -128 R 0.044 -129 I 0.040 -130 I 0.039 -131 D 0.041 -132 T 0.044 -133 L 0.046 -134 D 0.047 -135 I 0.049 -136 G 0.057 -137 A 0.065 -138 T 0.066 -139 D 0.060 -140 T 0.049 -141 R 0.039 -142 V 0.031 -143 A 0.025 -144 V 0.022 -145 V 0.024 -146 N 0.031 -147 Y 0.040 -148 A 0.048 -149 S 0.054 -150 T 0.058 -151 V 0.058 -152 K 0.055 -153 I 0.052 -154 E 0.052 -155 F 0.053 -156 Q 0.053 -157 L 0.050 -158 N 0.050 -159 T 0.051 -160 Y 0.053 -161 S 0.052 -162 D 0.049 -163 K 0.047 -164 Q 0.049 -165 A 0.055 -166 L 0.063 -167 K 0.074 -168 Q 0.082 -169 A 0.081 -170 V 0.075 -171 A 0.078 -172 R 0.091 -173 I 0.102 -174 T 0.103 -175 P 0.098 -176 L 0.096 -177 S 0.101 -178 T 0.109 -179 G 0.113 -180 T 0.110 -181 M 0.103 -182 S 0.094 -183 G 0.085 -184 L 0.077 -185 A 0.069 -186 I 0.062 -187 Q 0.059 -188 T 0.060 -189 A 0.065 -190 M 0.071 -191 E 0.074 -192 E 0.074 -193 A 0.072 -194 F 0.072 -195 T 0.078 -196 V 0.092 -197 E 0.107 -198 A 0.121 -199 G 0.137 -200 A 0.155 -201 R 0.172 -202 G 0.184 -203 P 0.185 -204 M 0.178 -205 S 0.172 -206 N 0.166 -207 I 0.150 -208 P 0.121 -209 K 0.086 -210 V 0.060 -211 A 0.045 -212 I 0.038 -213 I 0.038 -214 V 0.045 -215 T 0.065 -216 D 0.097 -217 G 0.127 -218 R 0.139 -219 P 0.131 -220 Q 0.121 -221 D 0.118 -222 Q 0.119 -223 V 0.116 -224 N 0.108 -225 E 0.094 -226 V 0.082 -227 A 0.077 -228 A 0.079 -229 R 0.079 -230 A 0.077 -231 R 0.073 -232 A 0.068 -233 S 0.066 -234 G 0.065 -235 I 0.061 -236 E 0.049 -237 L 0.037 -238 Y 0.031 -239 A 0.033 -240 V 0.040 -241 G 0.047 -242 V 0.052 -243 D 0.057 -244 R 0.062 -245 A 0.062 -246 D 0.057 -247 M 0.051 -248 E 0.049 -249 S 0.049 -250 L 0.047 -251 K 0.045 -252 M 0.044 -253 M 0.046 -254 A 0.047 -255 S 0.043 -256 K 0.041 -257 P 0.044 -258 L 0.052 -259 E 0.056 -260 E 0.054 -261 H 0.050 -262 V 0.049 -263 F 0.053 -264 Y 0.063 -265 V 0.076 -266 E 0.086 -267 T 0.090 -268 Y 0.087 -269 G 0.079 -270 V 0.070 -271 I 0.062 -272 E 0.057 -273 K 0.055 -274 L 0.056 -275 S 0.058 -276 A 0.059 -277 R 0.061 -278 F 0.069 -279 Q 0.081 -280 E 0.090 -281 T 0.093 -282 F 0.103 -283 C 0.130 -284 A 0.164 -285 L 0.178 -286 D 0.168 -287 Q 0.147 -288 C 0.133 -289 M 0.135 -290 L 0.148 -291 G 0.160 -292 T 0.160 -293 H 0.149 -294 Q 0.134 -295 C 0.122 -296 Q 0.117 -297 H 0.126 -298 V 0.153 -299 C 0.181 -300 V 0.196 -301 S 0.193 -302 D 0.188 -303 G 0.191 -304 D 0.200 -305 G 0.194 -306 K 0.167 -307 H 0.134 -308 H 0.115 -309 C 0.114 -310 E 0.123 -311 C 0.135 -312 S 0.146 -313 Q 0.148 -314 G 0.142 -315 Y 0.137 -316 T 0.140 -317 L 0.146 -318 N 0.147 -319 A 0.144 -320 D 0.140 -321 G 0.136 -322 K 0.135 -323 T 0.139 -324 C 0.150 -325 S 0.170 -326 A 0.194 -327 I 0.209 -328 D 0.204 -329 K 0.190 -330 C 0.187 -331 A 0.198 -332 L 0.210 -333 S 0.211 -334 T 0.204 -335 H 0.194 -336 G 0.181 -337 C 0.164 -338 E 0.152 -339 Q 0.160 -340 I 0.192 -341 C 0.228 -342 V 0.241 -343 N 0.226 -344 D 0.203 -345 R 0.188 -346 N 0.181 -347 G 0.171 -348 S 0.151 -349 Y 0.125 -350 H 0.107 -351 C 0.104 -352 E 0.110 -353 C 0.121 -354 Y 0.139 -355 G 0.157 -356 G 0.169 -357 Y 0.176 -358 A 0.179 -359 L 0.171 -360 N 0.152 -361 A 0.128 -362 D 0.109 -363 R 0.104 -364 R 0.119 -365 T 0.148 -366 C 0.185 -367 A 0.223 -368 A 0.250 -369 L 0.253 -370 D 0.231 -371 K 0.206 -372 C 0.198 -373 A 0.205 -374 S 0.213 -375 G 0.210 -376 T 0.197 -377 H 0.181 -378 G 0.165 -379 C 0.148 -380 Q 0.138 -381 H 0.151 -382 I 0.186 -383 C 0.219 -384 V 0.226 -385 N 0.213 -386 D 0.200 -387 G 0.198 -388 A 0.199 -389 G 0.186 -390 S 0.159 -391 H 0.129 -392 H 0.111 -393 C 0.108 -394 E 0.113 -395 C 0.120 -396 F 0.129 -397 E 0.135 -398 G 0.137 -399 Y 0.139 -400 T 0.144 -401 L 0.148 -402 N 0.145 -403 A 0.134 -404 D 0.119 -405 K 0.111 -406 K 0.116 -407 T 0.130 -408 C 0.149 -409 S 0.173 -410 V 0.197 -411 R 0.208 -412 N 0.197 -413 K 0.180 -414 C 0.174 -415 A 0.179 -416 L 0.185 -417 G 0.183 -418 T 0.174 -419 H 0.162 -420 G 0.151 -421 C 0.139 -422 Q 0.134 -423 H 0.149 -424 I 0.184 -425 C 0.217 -426 V 0.225 -427 S 0.213 -428 D 0.197 -429 G 0.182 -430 A 0.164 -431 V 0.141 -432 A 0.120 -433 Y 0.109 -434 H 0.110 -435 C 0.120 -436 D 0.132 -437 C 0.145 -438 F 0.160 -439 P 0.174 -440 G 0.182 -441 Y 0.184 -442 T 0.181 -443 L 0.173 -444 N 0.160 -445 D 0.147 -446 D 0.137 -447 K 0.137 -448 K 0.148 -449 T 0.168 -450 C 0.199 -451 S 0.252 -452 D 0.332 -453 I 0.422 -454 E 0.492 -455 E 0.524 -456 A 0.528 -457 R 0.524 -458 S 0.529 -459 L 0.548 -460 I 0.574 -461 S 0.602 -462 I 0.629 -463 E 0.645 -464 D 0.640 -465 A 0.622 -466 C 0.605 -467 G 0.601 -468 C 0.606 -469 G 0.608 -470 A 0.595 -471 T 0.564 -472 L 0.521 -473 A 0.473 -474 F 0.424 -475 Q 0.372 -476 E 0.325 -477 K 0.300 -478 V 0.291 -479 S 0.283 -480 S 0.277 -481 H 0.278 -482 L 0.276 -483 Q 0.272 -484 K 0.277 -485 L 0.283 -486 N 0.277 -487 T 0.268 -488 K 0.269 -489 L 0.278 -490 D 0.282 -491 N 0.277 -492 I 0.266 -493 L 0.252 -494 K 0.244 -495 K 0.247 -496 L 0.258 -497 K 0.277 -498 V 0.314 -499 T 0.360 -500 E 0.394 -501 Y 0.417 -502 G 0.445 -503 Q 0.471 -504 V 0.477 -505 H 0.460 -506 R 0.442 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020585.6_ENSMUST00000020909.5_GN:Laptm4a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020585.6_ENSMUST00000020909.5_GN:Laptm4a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index a45f216c8ea299eb6b8c9911418e23cca68bcfd5..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020585.6_ENSMUST00000020909.5_GN:Laptm4a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,234 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000020585.6|ENSMUST00000020909.5|GN:Laptm4a|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.353 -2 V 0.370 -3 S 0.398 -4 M 0.430 -5 T 0.454 -6 F 0.466 -7 K 0.475 -8 R 0.490 -9 S 0.498 -10 R 0.482 -11 S 0.443 -12 D 0.393 -13 R 0.345 -14 F 0.304 -15 Y 0.270 -16 S 0.238 -17 T 0.202 -18 R 0.160 -19 C 0.121 -20 C 0.094 -21 G 0.080 -22 C 0.073 -23 C 0.068 -24 H 0.063 -25 V 0.057 -26 R 0.049 -27 T 0.041 -28 G 0.035 -29 T 0.030 -30 I 0.028 -31 I 0.030 -32 L 0.034 -33 G 0.036 -34 T 0.033 -35 W 0.028 -36 Y 0.027 -37 M 0.030 -38 V 0.033 -39 V 0.031 -40 N 0.029 -41 L 0.028 -42 L 0.030 -43 M 0.031 -44 A 0.034 -45 I 0.036 -46 L 0.041 -47 L 0.049 -48 T 0.056 -49 V 0.065 -50 E 0.078 -51 V 0.100 -52 T 0.135 -53 H 0.182 -54 P 0.230 -55 N 0.264 -56 S 0.282 -57 M 0.287 -58 P 0.280 -59 A 0.265 -60 V 0.247 -61 N 0.230 -62 I 0.211 -63 Q 0.195 -64 Y 0.188 -65 E 0.194 -66 V 0.209 -67 I 0.235 -68 G 0.272 -69 N 0.301 -70 Y 0.303 -71 Y 0.284 -72 S 0.258 -73 S 0.230 -74 E 0.201 -75 R 0.177 -76 M 0.163 -77 A 0.155 -78 D 0.142 -79 N 0.121 -80 A 0.101 -81 C 0.084 -82 V 0.074 -83 L 0.073 -84 F 0.077 -85 A 0.080 -86 V 0.079 -87 S 0.075 -88 V 0.067 -89 L 0.057 -90 M 0.048 -91 F 0.045 -92 I 0.049 -93 I 0.057 -94 S 0.058 -95 S 0.051 -96 M 0.043 -97 L 0.039 -98 V 0.039 -99 Y 0.043 -100 G 0.048 -101 A 0.053 -102 I 0.056 -103 S 0.057 -104 Y 0.057 -105 Q 0.055 -106 V 0.054 -107 G 0.054 -108 W 0.054 -109 L 0.050 -110 I 0.041 -111 P 0.031 -112 F 0.023 -113 F 0.019 -114 C 0.017 -115 Y 0.016 -116 R 0.018 -117 L 0.021 -118 F 0.027 -119 D 0.040 -120 F 0.053 -121 V 0.057 -122 L 0.050 -123 S 0.039 -124 C 0.031 -125 L 0.027 -126 V 0.027 -127 A 0.030 -128 I 0.035 -129 S 0.040 -130 S 0.045 -131 L 0.048 -132 T 0.049 -133 Y 0.052 -134 L 0.057 -135 P 0.060 -136 R 0.062 -137 I 0.068 -138 K 0.080 -139 E 0.089 -140 Y 0.092 -141 L 0.097 -142 D 0.114 -143 Q 0.146 -144 L 0.185 -145 P 0.219 -146 D 0.238 -147 F 0.236 -148 P 0.220 -149 Y 0.205 -150 K 0.202 -151 D 0.206 -152 D 0.207 -153 L 0.205 -154 L 0.202 -155 A 0.189 -156 L 0.160 -157 D 0.117 -158 S 0.080 -159 S 0.057 -160 C 0.048 -161 L 0.044 -162 L 0.041 -163 F 0.039 -164 I 0.036 -165 V 0.034 -166 L 0.031 -167 V 0.028 -168 F 0.027 -169 F 0.029 -170 V 0.032 -171 V 0.036 -172 F 0.040 -173 I 0.040 -174 I 0.036 -175 F 0.033 -176 K 0.033 -177 A 0.034 -178 Y 0.034 -179 L 0.034 -180 I 0.032 -181 N 0.029 -182 C 0.026 -183 V 0.025 -184 W 0.026 -185 N 0.028 -186 C 0.031 -187 Y 0.037 -188 K 0.045 -189 Y 0.057 -190 I 0.079 -191 N 0.113 -192 N 0.160 -193 R 0.225 -194 N 0.315 -195 V 0.424 -196 P 0.529 -197 E 0.606 -198 I 0.644 -199 A 0.647 -200 V 0.634 -201 Y 0.629 -202 P 0.638 -203 A 0.649 -204 F 0.646 -205 E 0.630 -206 T 0.618 -207 P 0.620 -208 P 0.630 -209 Q 0.633 -210 Y 0.627 -211 V 0.616 -212 L 0.598 -213 P 0.569 -214 T 0.532 -215 Y 0.507 -216 E 0.515 -217 M 0.548 -218 A 0.581 -219 V 0.598 -220 K 0.609 -221 I 0.630 -222 P 0.657 -223 E 0.673 -224 K 0.670 -225 E 0.655 -226 P 0.642 -227 P 0.645 -228 P 0.659 -229 P 0.669 -230 Y 0.654 -231 L 0.604 -232 P 0.532 -233 A 0.476 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020585.6_ENSMUST00000020909.5_GN:Laptm4a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:75.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020585.6_ENSMUST00000020909.5_GN:Laptm4a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:75.caid deleted file mode 100644 index c83dcff19d8981bd88cd7cc1345a39d30e98bbcb..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020585.6_ENSMUST00000020909.5_GN:Laptm4a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:75.caid +++ /dev/null @@ -1,309 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000020585.6|ENSMUST00000020909.5|GN:Laptm4a|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:75 -1 M 0.346 -2 W 0.389 -3 Q 0.467 -4 K 0.551 -5 A 0.612 -6 E 0.644 -7 G 0.659 -8 E 0.667 -9 I 0.671 -10 P 0.679 -11 S 0.693 -12 R 0.708 -13 R 0.721 -14 P 0.734 -15 A 0.743 -16 R 0.740 -17 A 0.728 -18 A 0.720 -19 P 0.726 -20 G 0.740 -21 A 0.745 -22 Q 0.733 -23 S 0.703 -24 A 0.652 -25 G 0.570 -26 A 0.469 -27 Q 0.391 -28 E 0.358 -29 L 0.354 -30 A 0.370 -31 R 0.424 -32 A 0.510 -33 R 0.589 -34 A 0.640 -35 E 0.672 -36 G 0.699 -37 G 0.729 -38 P 0.761 -39 E 0.791 -40 D 0.808 -41 A 0.803 -42 S 0.781 -43 F 0.754 -44 G 0.731 -45 C 0.721 -46 G 0.729 -47 H 0.746 -48 R 0.762 -49 R 0.770 -50 R 0.771 -51 V 0.767 -52 V 0.758 -53 W 0.742 -54 V 0.725 -55 E 0.715 -56 P 0.719 -57 L 0.732 -58 G 0.742 -59 R 0.743 -60 K 0.732 -61 L 0.718 -62 L 0.714 -63 S 0.726 -64 G 0.742 -65 A 0.751 -66 W 0.753 -67 A 0.751 -68 R 0.741 -69 T 0.727 -70 R 0.720 -71 P 0.728 -72 A 0.741 -73 R 0.743 -74 F 0.734 -75 R 0.728 -76 M 0.729 -77 V 0.726 -78 S 0.705 -79 M 0.679 -80 T 0.666 -81 F 0.661 -82 K 0.649 -83 R 0.627 -84 S 0.594 -85 R 0.545 -86 S 0.484 -87 D 0.422 -88 R 0.369 -89 F 0.328 -90 Y 0.293 -91 S 0.256 -92 T 0.211 -93 R 0.162 -94 C 0.118 -95 C 0.090 -96 G 0.075 -97 C 0.066 -98 C 0.059 -99 H 0.055 -100 V 0.051 -101 R 0.045 -102 T 0.039 -103 G 0.033 -104 T 0.029 -105 I 0.028 -106 I 0.030 -107 L 0.036 -108 G 0.039 -109 T 0.035 -110 W 0.028 -111 Y 0.021 -112 M 0.018 -113 V 0.016 -114 V 0.017 -115 N 0.021 -116 L 0.024 -117 L 0.026 -118 M 0.028 -119 A 0.030 -120 I 0.031 -121 L 0.035 -122 L 0.040 -123 T 0.045 -124 V 0.052 -125 E 0.062 -126 V 0.080 -127 T 0.110 -128 H 0.154 -129 P 0.202 -130 N 0.239 -131 S 0.261 -132 M 0.268 -133 P 0.259 -134 A 0.241 -135 V 0.222 -136 N 0.207 -137 I 0.193 -138 Q 0.181 -139 Y 0.179 -140 E 0.185 -141 V 0.197 -142 I 0.223 -143 G 0.260 -144 N 0.291 -145 Y 0.294 -146 Y 0.274 -147 S 0.245 -148 S 0.214 -149 E 0.184 -150 R 0.161 -151 M 0.151 -152 A 0.148 -153 D 0.139 -154 N 0.121 -155 A 0.101 -156 C 0.084 -157 V 0.072 -158 L 0.064 -159 F 0.058 -160 A 0.056 -161 V 0.059 -162 S 0.063 -163 V 0.062 -164 L 0.055 -165 M 0.048 -166 F 0.046 -167 I 0.050 -168 I 0.057 -169 S 0.059 -170 S 0.051 -171 M 0.043 -172 L 0.039 -173 V 0.040 -174 Y 0.044 -175 G 0.051 -176 A 0.057 -177 I 0.062 -178 S 0.063 -179 Y 0.062 -180 Q 0.059 -181 V 0.056 -182 G 0.055 -183 W 0.055 -184 L 0.052 -185 I 0.043 -186 P 0.033 -187 F 0.025 -188 F 0.020 -189 C 0.018 -190 Y 0.017 -191 R 0.018 -192 L 0.020 -193 F 0.024 -194 D 0.028 -195 F 0.029 -196 V 0.027 -197 L 0.025 -198 S 0.025 -199 C 0.025 -200 L 0.025 -201 V 0.026 -202 A 0.029 -203 I 0.034 -204 S 0.039 -205 S 0.043 -206 L 0.045 -207 T 0.046 -208 Y 0.049 -209 L 0.054 -210 P 0.058 -211 R 0.062 -212 I 0.068 -213 K 0.080 -214 E 0.088 -215 Y 0.089 -216 L 0.091 -217 D 0.105 -218 Q 0.134 -219 L 0.170 -220 P 0.200 -221 D 0.214 -222 F 0.209 -223 P 0.191 -224 Y 0.175 -225 K 0.171 -226 D 0.174 -227 D 0.175 -228 L 0.176 -229 L 0.175 -230 A 0.165 -231 L 0.138 -232 D 0.101 -233 S 0.069 -234 S 0.050 -235 C 0.043 -236 L 0.040 -237 L 0.038 -238 F 0.036 -239 I 0.033 -240 V 0.032 -241 L 0.030 -242 V 0.027 -243 F 0.027 -244 F 0.028 -245 V 0.032 -246 V 0.036 -247 F 0.039 -248 I 0.038 -249 I 0.035 -250 F 0.032 -251 K 0.032 -252 A 0.033 -253 Y 0.033 -254 L 0.033 -255 I 0.031 -256 N 0.028 -257 C 0.026 -258 V 0.025 -259 W 0.025 -260 N 0.026 -261 C 0.029 -262 Y 0.034 -263 K 0.041 -264 Y 0.053 -265 I 0.075 -266 N 0.110 -267 N 0.158 -268 R 0.224 -269 N 0.317 -270 V 0.430 -271 P 0.539 -272 E 0.620 -273 I 0.662 -274 A 0.668 -275 V 0.656 -276 Y 0.650 -277 P 0.660 -278 A 0.675 -279 F 0.675 -280 E 0.662 -281 T 0.650 -282 P 0.653 -283 P 0.664 -284 Q 0.670 -285 Y 0.666 -286 V 0.653 -287 L 0.633 -288 P 0.604 -289 T 0.568 -290 Y 0.546 -291 E 0.554 -292 M 0.589 -293 A 0.622 -294 V 0.637 -295 K 0.644 -296 I 0.659 -297 P 0.681 -298 E 0.695 -299 K 0.693 -300 E 0.678 -301 P 0.666 -302 P 0.669 -303 P 0.685 -304 P 0.697 -305 Y 0.686 -306 L 0.640 -307 P 0.569 -308 A 0.511 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020590.17_ENSMUST00000048519.17_GN:Snx13_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020590.17_ENSMUST00000048519.17_GN:Snx13_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 87cc03302c3903355c86d6a80d37f24a0133f958..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020590.17_ENSMUST00000048519.17_GN:Snx13_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,958 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000020590.17|ENSMUST00000048519.17|GN:Snx13|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.317 -2 L 0.339 -3 T 0.376 -4 E 0.411 -5 A 0.422 -6 S 0.399 -7 L 0.357 -8 S 0.315 -9 I 0.278 -10 W 0.247 -11 G 0.220 -12 W 0.199 -13 G 0.184 -14 S 0.174 -15 L 0.165 -16 G 0.157 -17 I 0.150 -18 V 0.136 -19 L 0.118 -20 F 0.104 -21 L 0.101 -22 I 0.109 -23 T 0.121 -24 F 0.128 -25 G 0.123 -26 P 0.107 -27 F 0.092 -28 V 0.082 -29 I 0.077 -30 F 0.077 -31 Y 0.086 -32 L 0.105 -33 A 0.126 -34 F 0.139 -35 Y 0.139 -36 I 0.131 -37 L 0.120 -38 C 0.115 -39 F 0.124 -40 V 0.150 -41 G 0.180 -42 G 0.195 -43 G 0.188 -44 L 0.170 -45 V 0.153 -46 V 0.139 -47 T 0.135 -48 L 0.149 -49 L 0.185 -50 Y 0.233 -51 G 0.271 -52 K 0.293 -53 T 0.309 -54 N 0.324 -55 S 0.322 -56 E 0.297 -57 K 0.267 -58 Y 0.249 -59 L 0.241 -60 E 0.240 -61 Q 0.249 -62 C 0.267 -63 E 0.285 -64 H 0.303 -65 S 0.323 -66 F 0.350 -67 L 0.385 -68 P 0.427 -69 P 0.465 -70 T 0.488 -71 S 0.493 -72 S 0.490 -73 G 0.484 -74 V 0.466 -75 P 0.427 -76 K 0.376 -77 C 0.328 -78 L 0.288 -79 E 0.262 -80 E 0.255 -81 M 0.258 -82 K 0.263 -83 R 0.274 -84 E 0.292 -85 A 0.309 -86 R 0.316 -87 T 0.309 -88 I 0.286 -89 K 0.250 -90 I 0.212 -91 D 0.178 -92 R 0.151 -93 R 0.134 -94 L 0.129 -95 T 0.134 -96 G 0.135 -97 A 0.122 -98 N 0.101 -99 I 0.083 -100 I 0.074 -101 D 0.070 -102 E 0.070 -103 P 0.068 -104 L 0.068 -105 Q 0.072 -106 Q 0.078 -107 V 0.084 -108 I 0.083 -109 Q 0.078 -110 F 0.074 -111 S 0.075 -112 L 0.078 -113 R 0.077 -114 D 0.071 -115 Y 0.063 -116 V 0.052 -117 Q 0.042 -118 Y 0.038 -119 W 0.041 -120 Y 0.053 -121 Y 0.074 -122 T 0.099 -123 L 0.121 -124 S 0.139 -125 D 0.154 -126 D 0.163 -127 E 0.158 -128 S 0.140 -129 F 0.122 -130 L 0.114 -131 L 0.116 -132 E 0.124 -133 I 0.127 -134 R 0.121 -135 Q 0.114 -136 T 0.111 -137 L 0.104 -138 Q 0.089 -139 N 0.074 -140 A 0.064 -141 L 0.059 -142 I 0.061 -143 Q 0.073 -144 F 0.086 -145 A 0.095 -146 T 0.110 -147 R 0.138 -148 S 0.166 -149 K 0.180 -150 E 0.175 -151 I 0.152 -152 D 0.116 -153 W 0.080 -154 Q 0.058 -155 P 0.051 -156 Y 0.051 -157 F 0.053 -158 T 0.058 -159 T 0.064 -160 R 0.068 -161 I 0.067 -162 V 0.065 -163 D 0.068 -164 D 0.074 -165 F 0.077 -166 G 0.080 -167 T 0.083 -168 H 0.083 -169 L 0.080 -170 R 0.072 -171 V 0.059 -172 F 0.046 -173 R 0.038 -174 K 0.038 -175 A 0.043 -176 Q 0.053 -177 Q 0.071 -178 R 0.102 -179 V 0.143 -180 T 0.188 -181 E 0.231 -182 K 0.268 -183 D 0.287 -184 D 0.284 -185 Q 0.270 -186 V 0.254 -187 K 0.234 -188 G 0.203 -189 T 0.170 -190 A 0.144 -191 E 0.125 -192 D 0.108 -193 L 0.097 -194 V 0.090 -195 E 0.081 -196 T 0.068 -197 F 0.058 -198 F 0.058 -199 E 0.068 -200 V 0.087 -201 E 0.105 -202 V 0.115 -203 E 0.116 -204 M 0.111 -205 E 0.103 -206 K 0.101 -207 D 0.110 -208 V 0.123 -209 C 0.131 -210 R 0.127 -211 D 0.114 -212 L 0.098 -213 V 0.088 -214 C 0.086 -215 T 0.089 -216 S 0.088 -217 P 0.079 -218 K 0.067 -219 D 0.057 -220 E 0.051 -221 E 0.048 -222 G 0.047 -223 F 0.044 -224 L 0.040 -225 R 0.037 -226 D 0.038 -227 L 0.040 -228 C 0.038 -229 E 0.038 -230 V 0.041 -231 L 0.046 -232 L 0.047 -233 Y 0.047 -234 L 0.048 -235 L 0.053 -236 L 0.063 -237 P 0.078 -238 P 0.091 -239 G 0.099 -240 D 0.102 -241 F 0.102 -242 Q 0.096 -243 S 0.087 -244 K 0.075 -245 I 0.064 -246 M 0.057 -247 R 0.056 -248 Y 0.065 -249 F 0.080 -250 V 0.090 -251 R 0.090 -252 E 0.092 -253 I 0.101 -254 L 0.111 -255 A 0.118 -256 R 0.129 -257 G 0.138 -258 I 0.137 -259 L 0.122 -260 L 0.103 -261 P 0.092 -262 L 0.094 -263 I 0.107 -264 N 0.125 -265 Q 0.141 -266 L 0.145 -267 S 0.136 -268 D 0.121 -269 P 0.107 -270 D 0.092 -271 Y 0.073 -272 I 0.055 -273 N 0.044 -274 Q 0.040 -275 Y 0.042 -276 V 0.045 -277 I 0.052 -278 W 0.064 -279 M 0.082 -280 I 0.104 -281 R 0.130 -282 D 0.155 -283 S 0.169 -284 N 0.167 -285 C 0.154 -286 N 0.136 -287 Y 0.117 -288 E 0.101 -289 A 0.094 -290 F 0.093 -291 M 0.094 -292 N 0.098 -293 I 0.106 -294 I 0.115 -295 K 0.119 -296 L 0.115 -297 S 0.104 -298 D 0.092 -299 N 0.081 -300 I 0.070 -301 G 0.061 -302 E 0.059 -303 L 0.067 -304 E 0.078 -305 A 0.081 -306 V 0.071 -307 R 0.058 -308 D 0.050 -309 K 0.050 -310 A 0.057 -311 A 0.071 -312 E 0.082 -313 E 0.084 -314 L 0.081 -315 Q 0.080 -316 Y 0.077 -317 L 0.078 -318 R 0.089 -319 S 0.114 -320 L 0.147 -321 D 0.178 -322 T 0.198 -323 A 0.207 -324 G 0.205 -325 D 0.192 -326 D 0.171 -327 I 0.147 -328 N 0.124 -329 T 0.109 -330 I 0.104 -331 K 0.105 -332 N 0.108 -333 Q 0.104 -334 I 0.092 -335 N 0.077 -336 S 0.066 -337 L 0.059 -338 L 0.052 -339 F 0.044 -340 V 0.037 -341 K 0.031 -342 K 0.028 -343 V 0.028 -344 C 0.031 -345 D 0.036 -346 S 0.039 -347 R 0.041 -348 I 0.043 -349 Q 0.046 -350 R 0.052 -351 L 0.065 -352 Q 0.090 -353 S 0.126 -354 G 0.163 -355 K 0.186 -356 E 0.187 -357 I 0.172 -358 N 0.154 -359 T 0.139 -360 V 0.126 -361 K 0.114 -362 L 0.103 -363 A 0.097 -364 A 0.100 -365 N 0.111 -366 F 0.122 -367 G 0.126 -368 K 0.121 -369 L 0.107 -370 C 0.087 -371 T 0.068 -372 V 0.052 -373 P 0.038 -374 L 0.032 -375 D 0.032 -376 S 0.035 -377 I 0.036 -378 L 0.035 -379 V 0.035 -380 D 0.036 -381 N 0.034 -382 V 0.031 -383 A 0.029 -384 L 0.027 -385 Q 0.029 -386 F 0.031 -387 F 0.033 -388 M 0.036 -389 D 0.043 -390 Y 0.052 -391 M 0.056 -392 Q 0.053 -393 Q 0.050 -394 T 0.054 -395 G 0.061 -396 G 0.065 -397 Q 0.065 -398 A 0.061 -399 H 0.053 -400 L 0.044 -401 F 0.036 -402 F 0.030 -403 W 0.027 -404 M 0.027 -405 T 0.028 -406 V 0.031 -407 E 0.034 -408 G 0.033 -409 Y 0.030 -410 R 0.027 -411 V 0.029 -412 T 0.038 -413 A 0.055 -414 Q 0.075 -415 Q 0.093 -416 Q 0.107 -417 L 0.125 -418 E 0.155 -419 V 0.199 -420 L 0.251 -421 S 0.301 -422 G 0.339 -423 R 0.362 -424 Q 0.372 -425 R 0.384 -426 D 0.404 -427 G 0.428 -428 K 0.442 -429 Q 0.432 -430 Q 0.396 -431 T 0.343 -432 N 0.293 -433 Q 0.256 -434 T 0.223 -435 K 0.182 -436 G 0.136 -437 L 0.097 -438 L 0.075 -439 R 0.064 -440 A 0.063 -441 A 0.067 -442 A 0.069 -443 V 0.067 -444 G 0.063 -445 I 0.060 -446 Y 0.056 -447 E 0.054 -448 Q 0.059 -449 Y 0.071 -450 L 0.088 -451 S 0.109 -452 E 0.124 -453 K 0.126 -454 A 0.114 -455 S 0.097 -456 P 0.084 -457 R 0.075 -458 V 0.068 -459 T 0.061 -460 V 0.058 -461 D 0.056 -462 D 0.052 -463 Y 0.047 -464 L 0.050 -465 V 0.061 -466 A 0.070 -467 K 0.070 -468 L 0.064 -469 A 0.059 -470 D 0.056 -471 T 0.055 -472 L 0.059 -473 N 0.069 -474 H 0.082 -475 E 0.098 -476 D 0.112 -477 P 0.120 -478 T 0.117 -479 P 0.110 -480 E 0.107 -481 I 0.104 -482 F 0.095 -483 D 0.079 -484 D 0.066 -485 I 0.058 -486 Q 0.054 -487 R 0.056 -488 K 0.065 -489 V 0.070 -490 Y 0.063 -491 E 0.050 -492 L 0.043 -493 M 0.042 -494 L 0.043 -495 R 0.046 -496 D 0.051 -497 E 0.051 -498 R 0.044 -499 F 0.036 -500 Y 0.031 -501 P 0.028 -502 S 0.027 -503 F 0.027 -504 R 0.025 -505 Q 0.022 -506 N 0.019 -507 A 0.018 -508 L 0.019 -509 Y 0.020 -510 V 0.021 -511 R 0.023 -512 M 0.030 -513 L 0.038 -514 A 0.048 -515 E 0.059 -516 L 0.076 -517 D 0.105 -518 M 0.146 -519 L 0.198 -520 K 0.257 -521 D 0.315 -522 P 0.366 -523 S 0.416 -524 F 0.480 -525 R 0.555 -526 G 0.619 -527 S 0.659 -528 D 0.679 -529 D 0.689 -530 G 0.685 -531 D 0.651 -532 G 0.591 -533 E 0.546 -534 S 0.554 -535 F 0.593 -536 N 0.621 -537 G 0.625 -538 S 0.623 -539 P 0.633 -540 T 0.656 -541 G 0.675 -542 S 0.676 -543 I 0.657 -544 N 0.619 -545 L 0.566 -546 S 0.520 -547 L 0.512 -548 D 0.538 -549 D 0.563 -550 L 0.570 -551 S 0.572 -552 S 0.573 -553 V 0.563 -554 T 0.537 -555 S 0.494 -556 D 0.434 -557 D 0.357 -558 S 0.273 -559 V 0.190 -560 Q 0.119 -561 L 0.067 -562 H 0.036 -563 A 0.023 -564 Y 0.023 -565 I 0.029 -566 S 0.035 -567 D 0.040 -568 T 0.047 -569 G 0.056 -570 V 0.068 -571 C 0.086 -572 N 0.107 -573 D 0.124 -574 H 0.126 -575 G 0.113 -576 K 0.089 -577 T 0.062 -578 Y 0.040 -579 A 0.026 -580 L 0.019 -581 Y 0.016 -582 A 0.015 -583 I 0.017 -584 T 0.021 -585 V 0.028 -586 H 0.037 -587 R 0.051 -588 R 0.071 -589 N 0.094 -590 L 0.111 -591 N 0.120 -592 T 0.122 -593 E 0.119 -594 E 0.106 -595 M 0.088 -596 W 0.070 -597 K 0.055 -598 T 0.046 -599 Y 0.040 -600 R 0.038 -601 R 0.039 -602 Y 0.040 -603 S 0.039 -604 D 0.037 -605 F 0.034 -606 H 0.033 -607 D 0.034 -608 F 0.040 -609 H 0.052 -610 M 0.060 -611 R 0.057 -612 I 0.047 -613 T 0.041 -614 E 0.042 -615 Q 0.050 -616 F 0.061 -617 E 0.070 -618 N 0.075 -619 L 0.080 -620 S 0.093 -621 S 0.113 -622 I 0.130 -623 L 0.138 -624 K 0.143 -625 L 0.154 -626 P 0.175 -627 G 0.197 -628 K 0.205 -629 K 0.193 -630 T 0.171 -631 F 0.151 -632 N 0.138 -633 N 0.128 -634 M 0.117 -635 D 0.106 -636 R 0.096 -637 D 0.088 -638 F 0.080 -639 L 0.074 -640 E 0.074 -641 K 0.080 -642 R 0.086 -643 K 0.084 -644 K 0.079 -645 D 0.078 -646 L 0.076 -647 N 0.066 -648 A 0.055 -649 Y 0.048 -650 L 0.045 -651 Q 0.046 -652 L 0.049 -653 L 0.053 -654 L 0.052 -655 T 0.048 -656 P 0.046 -657 E 0.048 -658 M 0.051 -659 M 0.056 -660 K 0.063 -661 A 0.069 -662 S 0.068 -663 P 0.060 -664 A 0.050 -665 L 0.041 -666 A 0.035 -667 H 0.034 -668 C 0.035 -669 V 0.034 -670 Y 0.030 -671 D 0.028 -672 F 0.033 -673 L 0.048 -674 E 0.075 -675 N 0.118 -676 K 0.176 -677 A 0.240 -678 Y 0.305 -679 S 0.367 -680 K 0.415 -681 G 0.433 -682 K 0.413 -683 G 0.366 -684 D 0.311 -685 F 0.266 -686 A 0.246 -687 R 0.250 -688 K 0.256 -689 M 0.250 -690 D 0.240 -691 T 0.233 -692 F 0.233 -693 V 0.240 -694 N 0.249 -695 P 0.249 -696 L 0.238 -697 R 0.227 -698 N 0.228 -699 S 0.245 -700 M 0.279 -701 R 0.319 -702 N 0.339 -703 V 0.319 -704 S 0.284 -705 N 0.275 -706 A 0.302 -707 V 0.339 -708 K 0.365 -709 S 0.379 -710 L 0.393 -711 P 0.420 -712 D 0.446 -713 S 0.434 -714 L 0.378 -715 A 0.314 -716 E 0.282 -717 G 0.286 -718 V 0.304 -719 T 0.315 -720 K 0.319 -721 M 0.331 -722 S 0.360 -723 D 0.392 -724 N 0.407 -725 V 0.398 -726 G 0.371 -727 R 0.340 -728 M 0.327 -729 S 0.342 -730 E 0.365 -731 R 0.363 -732 L 0.333 -733 G 0.311 -734 Q 0.322 -735 D 0.352 -736 I 0.366 -737 K 0.350 -738 Q 0.315 -739 S 0.286 -740 F 0.280 -741 F 0.303 -742 K 0.347 -743 V 0.405 -744 P 0.472 -745 P 0.540 -746 L 0.598 -747 I 0.639 -748 T 0.671 -749 K 0.698 -750 T 0.711 -751 D 0.702 -752 S 0.678 -753 D 0.656 -754 P 0.647 -755 E 0.647 -756 H 0.650 -757 C 0.654 -758 R 0.660 -759 V 0.667 -760 S 0.669 -761 A 0.657 -762 Q 0.631 -763 L 0.608 -764 D 0.591 -765 D 0.567 -766 N 0.522 -767 V 0.461 -768 D 0.403 -769 D 0.354 -770 N 0.297 -771 I 0.225 -772 P 0.158 -773 L 0.116 -774 R 0.097 -775 V 0.085 -776 M 0.075 -777 L 0.071 -778 L 0.074 -779 L 0.079 -780 M 0.088 -781 D 0.105 -782 E 0.132 -783 V 0.158 -784 F 0.177 -785 D 0.186 -786 L 0.189 -787 K 0.193 -788 E 0.204 -789 R 0.217 -790 N 0.213 -791 Q 0.182 -792 W 0.136 -793 L 0.097 -794 R 0.080 -795 R 0.082 -796 N 0.087 -797 I 0.089 -798 K 0.087 -799 N 0.087 -800 L 0.086 -801 L 0.083 -802 Q 0.082 -803 Q 0.088 -804 L 0.099 -805 I 0.108 -806 R 0.117 -807 A 0.129 -808 T 0.140 -809 Y 0.148 -810 G 0.151 -811 D 0.145 -812 T 0.133 -813 I 0.123 -814 N 0.119 -815 R 0.118 -816 K 0.120 -817 I 0.131 -818 V 0.149 -819 D 0.163 -820 H 0.172 -821 V 0.174 -822 D 0.168 -823 W 0.161 -824 M 0.163 -825 T 0.168 -826 S 0.167 -827 P 0.165 -828 E 0.164 -829 Q 0.157 -830 V 0.145 -831 A 0.134 -832 D 0.132 -833 S 0.135 -834 V 0.137 -835 K 0.135 -836 R 0.138 -837 F 0.149 -838 R 0.165 -839 D 0.183 -840 A 0.198 -841 F 0.208 -842 W 0.217 -843 P 0.229 -844 N 0.240 -845 G 0.245 -846 I 0.244 -847 L 0.243 -848 A 0.249 -849 E 0.259 -850 T 0.268 -851 V 0.268 -852 P 0.260 -853 C 0.240 -854 R 0.208 -855 D 0.172 -856 K 0.144 -857 A 0.129 -858 I 0.122 -859 R 0.116 -860 M 0.110 -861 R 0.104 -862 T 0.103 -863 R 0.108 -864 I 0.117 -865 A 0.125 -866 G 0.129 -867 K 0.125 -868 T 0.117 -869 K 0.109 -870 L 0.104 -871 F 0.104 -872 A 0.110 -873 I 0.118 -874 M 0.124 -875 P 0.127 -876 D 0.129 -877 E 0.132 -878 L 0.133 -879 K 0.137 -880 H 0.148 -881 I 0.162 -882 I 0.171 -883 G 0.167 -884 A 0.151 -885 E 0.128 -886 T 0.110 -887 T 0.102 -888 R 0.101 -889 K 0.099 -890 G 0.096 -891 I 0.090 -892 L 0.087 -893 R 0.090 -894 V 0.100 -895 F 0.110 -896 E 0.120 -897 M 0.131 -898 F 0.150 -899 Q 0.182 -900 H 0.221 -901 N 0.248 -902 Q 0.242 -903 L 0.200 -904 N 0.153 -905 R 0.132 -906 R 0.136 -907 M 0.148 -908 V 0.154 -909 Y 0.155 -910 V 0.157 -911 F 0.158 -912 L 0.156 -913 E 0.150 -914 G 0.144 -915 F 0.136 -916 L 0.129 -917 E 0.129 -918 T 0.136 -919 L 0.141 -920 F 0.143 -921 P 0.146 -922 Q 0.146 -923 Y 0.137 -924 K 0.119 -925 F 0.101 -926 R 0.094 -927 E 0.095 -928 L 0.099 -929 F 0.107 -930 N 0.120 -931 K 0.134 -932 L 0.147 -933 H 0.160 -934 S 0.174 -935 R 0.186 -936 S 0.192 -937 K 0.182 -938 Q 0.162 -939 M 0.146 -940 Q 0.141 -941 K 0.148 -942 Y 0.162 -943 K 0.182 -944 Q 0.206 -945 K 0.230 -946 L 0.249 -947 Q 0.270 -948 S 0.304 -949 T 0.356 -950 Q 0.415 -951 A 0.461 -952 P 0.467 -953 S 0.431 -954 L 0.380 -955 Q 0.348 -956 K 0.342 -957 R 0.347 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020590.17_ENSMUST00000048519.17_GN:Snx13_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020590.17_ENSMUST00000048519.17_GN:Snx13_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid deleted file mode 100644 index 0cd531f637c1cbc6e21b04fc6c803411e968749d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020590.17_ENSMUST00000048519.17_GN:Snx13_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid +++ /dev/null @@ -1,959 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000020590.17|ENSMUST00000048519.17|GN:Snx13|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:1 -1 M 0.316 -2 M 0.333 -3 L 0.363 -4 T 0.401 -5 E 0.429 -6 A 0.431 -7 S 0.405 -8 L 0.367 -9 S 0.327 -10 I 0.288 -11 W 0.252 -12 G 0.223 -13 W 0.199 -14 G 0.183 -15 S 0.173 -16 L 0.165 -17 G 0.158 -18 I 0.150 -19 V 0.136 -20 L 0.118 -21 F 0.104 -22 L 0.103 -23 I 0.110 -24 T 0.122 -25 F 0.128 -26 G 0.122 -27 P 0.107 -28 F 0.091 -29 V 0.082 -30 I 0.077 -31 F 0.077 -32 Y 0.087 -33 L 0.107 -34 A 0.128 -35 F 0.141 -36 Y 0.141 -37 I 0.132 -38 L 0.121 -39 C 0.115 -40 F 0.124 -41 V 0.150 -42 G 0.180 -43 G 0.194 -44 G 0.188 -45 L 0.170 -46 V 0.153 -47 V 0.139 -48 T 0.135 -49 L 0.149 -50 L 0.185 -51 Y 0.232 -52 G 0.270 -53 K 0.291 -54 T 0.308 -55 N 0.322 -56 S 0.320 -57 E 0.296 -58 K 0.266 -59 Y 0.248 -60 L 0.240 -61 E 0.239 -62 Q 0.248 -63 C 0.266 -64 E 0.285 -65 H 0.302 -66 S 0.322 -67 F 0.348 -68 L 0.384 -69 P 0.425 -70 P 0.463 -71 T 0.486 -72 S 0.492 -73 S 0.489 -74 G 0.483 -75 V 0.465 -76 P 0.427 -77 K 0.376 -78 C 0.328 -79 L 0.289 -80 E 0.263 -81 E 0.255 -82 M 0.258 -83 K 0.263 -84 R 0.274 -85 E 0.292 -86 A 0.310 -87 R 0.316 -88 T 0.309 -89 I 0.286 -90 K 0.250 -91 I 0.212 -92 D 0.179 -93 R 0.152 -94 R 0.134 -95 L 0.130 -96 T 0.134 -97 G 0.135 -98 A 0.122 -99 N 0.101 -100 I 0.083 -101 I 0.074 -102 D 0.071 -103 E 0.070 -104 P 0.069 -105 L 0.068 -106 Q 0.072 -107 Q 0.078 -108 V 0.083 -109 I 0.083 -110 Q 0.078 -111 F 0.074 -112 S 0.075 -113 L 0.078 -114 R 0.076 -115 D 0.071 -116 Y 0.063 -117 V 0.052 -118 Q 0.042 -119 Y 0.038 -120 W 0.041 -121 Y 0.053 -122 Y 0.074 -123 T 0.099 -124 L 0.121 -125 S 0.139 -126 D 0.155 -127 D 0.164 -128 E 0.159 -129 S 0.141 -130 F 0.122 -131 L 0.114 -132 L 0.116 -133 E 0.124 -134 I 0.127 -135 R 0.121 -136 Q 0.114 -137 T 0.112 -138 L 0.105 -139 Q 0.090 -140 N 0.074 -141 A 0.064 -142 L 0.059 -143 I 0.062 -144 Q 0.073 -145 F 0.086 -146 A 0.095 -147 T 0.110 -148 R 0.137 -149 S 0.166 -150 K 0.179 -151 E 0.174 -152 I 0.152 -153 D 0.116 -154 W 0.080 -155 Q 0.058 -156 P 0.051 -157 Y 0.051 -158 F 0.053 -159 T 0.058 -160 T 0.064 -161 R 0.068 -162 I 0.067 -163 V 0.065 -164 D 0.068 -165 D 0.074 -166 F 0.077 -167 G 0.080 -168 T 0.083 -169 H 0.083 -170 L 0.079 -171 R 0.071 -172 V 0.058 -173 F 0.045 -174 R 0.038 -175 K 0.037 -176 A 0.043 -177 Q 0.053 -178 Q 0.071 -179 R 0.102 -180 V 0.144 -181 T 0.188 -182 E 0.231 -183 K 0.268 -184 D 0.287 -185 D 0.284 -186 Q 0.270 -187 V 0.254 -188 K 0.234 -189 G 0.203 -190 T 0.170 -191 A 0.144 -192 E 0.124 -193 D 0.107 -194 L 0.096 -195 V 0.090 -196 E 0.080 -197 T 0.068 -198 F 0.058 -199 F 0.057 -200 E 0.068 -201 V 0.087 -202 E 0.105 -203 V 0.115 -204 E 0.116 -205 M 0.111 -206 E 0.103 -207 K 0.101 -208 D 0.110 -209 V 0.123 -210 C 0.130 -211 R 0.126 -212 D 0.114 -213 L 0.098 -214 V 0.087 -215 C 0.086 -216 T 0.089 -217 S 0.088 -218 P 0.079 -219 K 0.067 -220 D 0.057 -221 E 0.051 -222 E 0.049 -223 G 0.047 -224 F 0.044 -225 L 0.040 -226 R 0.037 -227 D 0.039 -228 L 0.040 -229 C 0.039 -230 E 0.038 -231 V 0.041 -232 L 0.046 -233 L 0.047 -234 Y 0.047 -235 L 0.048 -236 L 0.053 -237 L 0.063 -238 P 0.078 -239 P 0.091 -240 G 0.099 -241 D 0.102 -242 F 0.102 -243 Q 0.096 -244 S 0.087 -245 K 0.075 -246 I 0.064 -247 M 0.057 -248 R 0.056 -249 Y 0.065 -250 F 0.080 -251 V 0.090 -252 R 0.089 -253 E 0.091 -254 I 0.101 -255 L 0.111 -256 A 0.118 -257 R 0.129 -258 G 0.138 -259 I 0.137 -260 L 0.122 -261 L 0.103 -262 P 0.091 -263 L 0.094 -264 I 0.107 -265 N 0.125 -266 Q 0.141 -267 L 0.145 -268 S 0.136 -269 D 0.121 -270 P 0.107 -271 D 0.092 -272 Y 0.073 -273 I 0.055 -274 N 0.044 -275 Q 0.040 -276 Y 0.042 -277 V 0.045 -278 I 0.052 -279 W 0.064 -280 M 0.082 -281 I 0.104 -282 R 0.130 -283 D 0.155 -284 S 0.169 -285 N 0.167 -286 C 0.154 -287 N 0.136 -288 Y 0.116 -289 E 0.101 -290 A 0.094 -291 F 0.093 -292 M 0.094 -293 N 0.098 -294 I 0.105 -295 I 0.115 -296 K 0.119 -297 L 0.115 -298 S 0.104 -299 D 0.092 -300 N 0.081 -301 I 0.070 -302 G 0.061 -303 E 0.059 -304 L 0.067 -305 E 0.078 -306 A 0.081 -307 V 0.072 -308 R 0.058 -309 D 0.050 -310 K 0.050 -311 A 0.057 -312 A 0.071 -313 E 0.083 -314 E 0.084 -315 L 0.082 -316 Q 0.080 -317 Y 0.077 -318 L 0.078 -319 R 0.089 -320 S 0.114 -321 L 0.147 -322 D 0.178 -323 T 0.198 -324 A 0.207 -325 G 0.205 -326 D 0.192 -327 D 0.171 -328 I 0.147 -329 N 0.124 -330 T 0.109 -331 I 0.104 -332 K 0.105 -333 N 0.108 -334 Q 0.104 -335 I 0.092 -336 N 0.077 -337 S 0.066 -338 L 0.059 -339 L 0.052 -340 F 0.044 -341 V 0.037 -342 K 0.031 -343 K 0.028 -344 V 0.028 -345 C 0.031 -346 D 0.036 -347 S 0.039 -348 R 0.041 -349 I 0.043 -350 Q 0.046 -351 R 0.052 -352 L 0.065 -353 Q 0.090 -354 S 0.126 -355 G 0.163 -356 K 0.186 -357 E 0.187 -358 I 0.172 -359 N 0.154 -360 T 0.139 -361 V 0.126 -362 K 0.114 -363 L 0.103 -364 A 0.097 -365 A 0.100 -366 N 0.111 -367 F 0.122 -368 G 0.127 -369 K 0.121 -370 L 0.107 -371 C 0.088 -372 T 0.069 -373 V 0.052 -374 P 0.039 -375 L 0.032 -376 D 0.032 -377 S 0.035 -378 I 0.036 -379 L 0.035 -380 V 0.035 -381 D 0.036 -382 N 0.034 -383 V 0.031 -384 A 0.029 -385 L 0.027 -386 Q 0.029 -387 F 0.031 -388 F 0.033 -389 M 0.036 -390 D 0.043 -391 Y 0.052 -392 M 0.056 -393 Q 0.053 -394 Q 0.050 -395 T 0.054 -396 G 0.061 -397 G 0.065 -398 Q 0.065 -399 A 0.061 -400 H 0.053 -401 L 0.044 -402 F 0.036 -403 F 0.030 -404 W 0.027 -405 M 0.027 -406 T 0.028 -407 V 0.031 -408 E 0.034 -409 G 0.033 -410 Y 0.030 -411 R 0.027 -412 V 0.029 -413 T 0.038 -414 A 0.056 -415 Q 0.076 -416 Q 0.093 -417 Q 0.107 -418 L 0.125 -419 E 0.155 -420 V 0.199 -421 L 0.251 -422 S 0.301 -423 G 0.339 -424 R 0.361 -425 Q 0.372 -426 R 0.383 -427 D 0.403 -428 G 0.427 -429 K 0.441 -430 Q 0.432 -431 Q 0.396 -432 T 0.343 -433 N 0.293 -434 Q 0.256 -435 T 0.223 -436 K 0.182 -437 G 0.136 -438 L 0.097 -439 L 0.075 -440 R 0.064 -441 A 0.063 -442 A 0.067 -443 A 0.069 -444 V 0.067 -445 G 0.063 -446 I 0.060 -447 Y 0.056 -448 E 0.054 -449 Q 0.059 -450 Y 0.071 -451 L 0.088 -452 S 0.109 -453 E 0.124 -454 K 0.126 -455 A 0.114 -456 S 0.097 -457 P 0.084 -458 R 0.075 -459 V 0.068 -460 T 0.061 -461 V 0.058 -462 D 0.056 -463 D 0.052 -464 Y 0.047 -465 L 0.050 -466 V 0.061 -467 A 0.070 -468 K 0.070 -469 L 0.064 -470 A 0.059 -471 D 0.056 -472 T 0.055 -473 L 0.059 -474 N 0.069 -475 H 0.082 -476 E 0.098 -477 D 0.112 -478 P 0.120 -479 T 0.117 -480 P 0.110 -481 E 0.107 -482 I 0.104 -483 F 0.095 -484 D 0.079 -485 D 0.066 -486 I 0.058 -487 Q 0.054 -488 R 0.057 -489 K 0.065 -490 V 0.070 -491 Y 0.063 -492 E 0.050 -493 L 0.043 -494 M 0.042 -495 L 0.043 -496 R 0.046 -497 D 0.051 -498 E 0.051 -499 R 0.044 -500 F 0.036 -501 Y 0.031 -502 P 0.028 -503 S 0.027 -504 F 0.027 -505 R 0.025 -506 Q 0.022 -507 N 0.019 -508 A 0.018 -509 L 0.019 -510 Y 0.020 -511 V 0.021 -512 R 0.023 -513 M 0.030 -514 L 0.038 -515 A 0.048 -516 E 0.059 -517 L 0.076 -518 D 0.105 -519 M 0.146 -520 L 0.199 -521 K 0.257 -522 D 0.315 -523 P 0.366 -524 S 0.416 -525 F 0.480 -526 R 0.555 -527 G 0.619 -528 S 0.659 -529 D 0.679 -530 D 0.689 -531 G 0.685 -532 D 0.651 -533 G 0.591 -534 E 0.547 -535 S 0.554 -536 F 0.593 -537 N 0.621 -538 G 0.625 -539 S 0.623 -540 P 0.633 -541 T 0.656 -542 G 0.675 -543 S 0.676 -544 I 0.657 -545 N 0.619 -546 L 0.566 -547 S 0.521 -548 L 0.512 -549 D 0.538 -550 D 0.563 -551 L 0.570 -552 S 0.572 -553 S 0.573 -554 V 0.564 -555 T 0.537 -556 S 0.495 -557 D 0.434 -558 D 0.357 -559 S 0.273 -560 V 0.190 -561 Q 0.119 -562 L 0.067 -563 H 0.036 -564 A 0.023 -565 Y 0.023 -566 I 0.029 -567 S 0.035 -568 D 0.040 -569 T 0.047 -570 G 0.056 -571 V 0.068 -572 C 0.086 -573 N 0.108 -574 D 0.124 -575 H 0.127 -576 G 0.113 -577 K 0.089 -578 T 0.062 -579 Y 0.040 -580 A 0.026 -581 L 0.019 -582 Y 0.016 -583 A 0.015 -584 I 0.017 -585 T 0.021 -586 V 0.028 -587 H 0.037 -588 R 0.051 -589 R 0.072 -590 N 0.094 -591 L 0.111 -592 N 0.120 -593 T 0.122 -594 E 0.119 -595 E 0.106 -596 M 0.088 -597 W 0.070 -598 K 0.055 -599 T 0.046 -600 Y 0.040 -601 R 0.039 -602 R 0.039 -603 Y 0.040 -604 S 0.039 -605 D 0.037 -606 F 0.034 -607 H 0.033 -608 D 0.034 -609 F 0.040 -610 H 0.052 -611 M 0.060 -612 R 0.057 -613 I 0.047 -614 T 0.041 -615 E 0.042 -616 Q 0.050 -617 F 0.061 -618 E 0.070 -619 N 0.075 -620 L 0.080 -621 S 0.093 -622 S 0.113 -623 I 0.130 -624 L 0.138 -625 K 0.143 -626 L 0.154 -627 P 0.175 -628 G 0.197 -629 K 0.205 -630 K 0.193 -631 T 0.171 -632 F 0.151 -633 N 0.138 -634 N 0.128 -635 M 0.117 -636 D 0.106 -637 R 0.096 -638 D 0.088 -639 F 0.080 -640 L 0.074 -641 E 0.074 -642 K 0.080 -643 R 0.086 -644 K 0.084 -645 K 0.080 -646 D 0.079 -647 L 0.076 -648 N 0.067 -649 A 0.055 -650 Y 0.048 -651 L 0.045 -652 Q 0.046 -653 L 0.049 -654 L 0.053 -655 L 0.052 -656 T 0.048 -657 P 0.046 -658 E 0.048 -659 M 0.051 -660 M 0.056 -661 K 0.063 -662 A 0.069 -663 S 0.069 -664 P 0.060 -665 A 0.050 -666 L 0.041 -667 A 0.035 -668 H 0.034 -669 C 0.035 -670 V 0.034 -671 Y 0.030 -672 D 0.028 -673 F 0.033 -674 L 0.048 -675 E 0.075 -676 N 0.118 -677 K 0.176 -678 A 0.240 -679 Y 0.305 -680 S 0.367 -681 K 0.416 -682 G 0.434 -683 K 0.414 -684 G 0.366 -685 D 0.311 -686 F 0.267 -687 A 0.247 -688 R 0.250 -689 K 0.256 -690 M 0.251 -691 D 0.240 -692 T 0.234 -693 F 0.234 -694 V 0.240 -695 N 0.249 -696 P 0.250 -697 L 0.239 -698 R 0.228 -699 N 0.229 -700 S 0.246 -701 M 0.279 -702 R 0.320 -703 N 0.340 -704 V 0.321 -705 S 0.287 -706 N 0.279 -707 A 0.304 -708 V 0.340 -709 K 0.366 -710 S 0.379 -711 L 0.393 -712 P 0.420 -713 D 0.446 -714 S 0.435 -715 L 0.378 -716 A 0.314 -717 E 0.282 -718 G 0.286 -719 V 0.304 -720 T 0.315 -721 K 0.319 -722 M 0.331 -723 S 0.360 -724 D 0.392 -725 N 0.407 -726 V 0.398 -727 G 0.371 -728 R 0.340 -729 M 0.327 -730 S 0.343 -731 E 0.366 -732 R 0.364 -733 L 0.334 -734 G 0.312 -735 Q 0.323 -736 D 0.352 -737 I 0.366 -738 K 0.350 -739 Q 0.316 -740 S 0.286 -741 F 0.280 -742 F 0.303 -743 K 0.348 -744 V 0.405 -745 P 0.472 -746 P 0.541 -747 L 0.598 -748 I 0.639 -749 T 0.672 -750 K 0.699 -751 T 0.712 -752 D 0.702 -753 S 0.678 -754 D 0.657 -755 P 0.648 -756 E 0.648 -757 H 0.651 -758 C 0.654 -759 R 0.660 -760 V 0.667 -761 S 0.669 -762 A 0.657 -763 Q 0.632 -764 L 0.608 -765 D 0.591 -766 D 0.568 -767 N 0.523 -768 V 0.462 -769 D 0.404 -770 D 0.355 -771 N 0.298 -772 I 0.226 -773 P 0.158 -774 L 0.116 -775 R 0.097 -776 V 0.085 -777 M 0.075 -778 L 0.071 -779 L 0.074 -780 L 0.080 -781 M 0.088 -782 D 0.105 -783 E 0.132 -784 V 0.158 -785 F 0.177 -786 D 0.186 -787 L 0.189 -788 K 0.192 -789 E 0.204 -790 R 0.216 -791 N 0.212 -792 Q 0.182 -793 W 0.136 -794 L 0.097 -795 R 0.080 -796 R 0.081 -797 N 0.087 -798 I 0.089 -799 K 0.087 -800 N 0.087 -801 L 0.086 -802 L 0.083 -803 Q 0.082 -804 Q 0.088 -805 L 0.099 -806 I 0.108 -807 R 0.117 -808 A 0.129 -809 T 0.140 -810 Y 0.148 -811 G 0.151 -812 D 0.145 -813 T 0.132 -814 I 0.122 -815 N 0.119 -816 R 0.118 -817 K 0.120 -818 I 0.131 -819 V 0.148 -820 D 0.163 -821 H 0.172 -822 V 0.174 -823 D 0.168 -824 W 0.161 -825 M 0.163 -826 T 0.168 -827 S 0.167 -828 P 0.164 -829 E 0.163 -830 Q 0.157 -831 V 0.144 -832 A 0.134 -833 D 0.131 -834 S 0.135 -835 V 0.136 -836 K 0.135 -837 R 0.138 -838 F 0.149 -839 R 0.165 -840 D 0.182 -841 A 0.197 -842 F 0.208 -843 W 0.217 -844 P 0.228 -845 N 0.240 -846 G 0.245 -847 I 0.244 -848 L 0.243 -849 A 0.249 -850 E 0.259 -851 T 0.268 -852 V 0.268 -853 P 0.260 -854 C 0.241 -855 R 0.208 -856 D 0.172 -857 K 0.144 -858 A 0.129 -859 I 0.122 -860 R 0.116 -861 M 0.110 -862 R 0.105 -863 T 0.103 -864 R 0.108 -865 I 0.117 -866 A 0.126 -867 G 0.129 -868 K 0.125 -869 T 0.117 -870 K 0.109 -871 L 0.104 -872 F 0.104 -873 A 0.110 -874 I 0.118 -875 M 0.123 -876 P 0.127 -877 D 0.129 -878 E 0.132 -879 L 0.133 -880 K 0.137 -881 H 0.148 -882 I 0.162 -883 I 0.171 -884 G 0.168 -885 A 0.151 -886 E 0.128 -887 T 0.110 -888 T 0.102 -889 R 0.101 -890 K 0.099 -891 G 0.096 -892 I 0.090 -893 L 0.087 -894 R 0.090 -895 V 0.100 -896 F 0.110 -897 E 0.120 -898 M 0.131 -899 F 0.150 -900 Q 0.182 -901 H 0.221 -902 N 0.248 -903 Q 0.242 -904 L 0.200 -905 N 0.153 -906 R 0.132 -907 R 0.136 -908 M 0.148 -909 V 0.154 -910 Y 0.155 -911 V 0.157 -912 F 0.158 -913 L 0.156 -914 E 0.150 -915 G 0.144 -916 F 0.136 -917 L 0.129 -918 E 0.129 -919 T 0.136 -920 L 0.141 -921 F 0.143 -922 P 0.145 -923 Q 0.146 -924 Y 0.137 -925 K 0.118 -926 F 0.101 -927 R 0.094 -928 E 0.095 -929 L 0.099 -930 F 0.107 -931 N 0.120 -932 K 0.134 -933 L 0.147 -934 H 0.160 -935 S 0.174 -936 R 0.186 -937 S 0.192 -938 K 0.182 -939 Q 0.162 -940 M 0.146 -941 Q 0.141 -942 K 0.148 -943 Y 0.162 -944 K 0.182 -945 Q 0.206 -946 K 0.230 -947 L 0.249 -948 Q 0.270 -949 S 0.304 -950 T 0.356 -951 Q 0.415 -952 A 0.460 -953 P 0.467 -954 S 0.431 -955 L 0.380 -956 Q 0.348 -957 K 0.342 -958 R 0.346 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020708.13_ENSMUST00000021049.9_GN:Psmc5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020708.13_ENSMUST00000021049.9_GN:Psmc5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 5539cd75c8764fcfd98ea21525c4979c70fcdfa2..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020708.13_ENSMUST00000021049.9_GN:Psmc5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,407 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000020708.13|ENSMUST00000021049.9|GN:Psmc5|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.479 -2 A 0.499 -3 L 0.528 -4 D 0.554 -5 G 0.561 -6 P 0.543 -7 E 0.528 -8 Q 0.550 -9 M 0.596 -10 E 0.633 -11 L 0.653 -12 E 0.661 -13 E 0.659 -14 G 0.649 -15 K 0.637 -16 A 0.622 -17 G 0.589 -18 S 0.526 -19 G 0.438 -20 L 0.346 -21 R 0.272 -22 Q 0.223 -23 Y 0.196 -24 Y 0.186 -25 L 0.192 -26 S 0.209 -27 K 0.224 -28 I 0.227 -29 E 0.221 -30 E 0.225 -31 L 0.241 -32 Q 0.261 -33 L 0.279 -34 I 0.304 -35 V 0.328 -36 N 0.337 -37 D 0.325 -38 K 0.300 -39 S 0.278 -40 Q 0.268 -41 N 0.265 -42 L 0.259 -43 R 0.245 -44 R 0.238 -45 L 0.251 -46 Q 0.280 -47 A 0.306 -48 Q 0.315 -49 R 0.310 -50 N 0.298 -51 E 0.281 -52 L 0.262 -53 N 0.246 -54 A 0.241 -55 K 0.241 -56 V 0.237 -57 R 0.229 -58 L 0.228 -59 L 0.235 -60 R 0.249 -61 E 0.272 -62 E 0.301 -63 L 0.323 -64 Q 0.345 -65 L 0.372 -66 L 0.388 -67 Q 0.379 -68 E 0.349 -69 Q 0.309 -70 G 0.257 -71 S 0.192 -72 Y 0.127 -73 V 0.078 -74 G 0.049 -75 E 0.036 -76 V 0.033 -77 V 0.035 -78 R 0.039 -79 A 0.044 -80 M 0.049 -81 D 0.053 -82 K 0.053 -83 K 0.046 -84 K 0.035 -85 V 0.027 -86 L 0.024 -87 V 0.026 -88 K 0.032 -89 V 0.042 -90 H 0.055 -91 P 0.071 -92 E 0.082 -93 G 0.083 -94 K 0.075 -95 F 0.065 -96 V 0.057 -97 V 0.054 -98 D 0.058 -99 V 0.063 -100 D 0.066 -101 K 0.067 -102 N 0.068 -103 I 0.066 -104 D 0.059 -105 I 0.050 -106 N 0.046 -107 D 0.051 -108 V 0.062 -109 T 0.077 -110 P 0.091 -111 N 0.100 -112 C 0.100 -113 R 0.096 -114 V 0.092 -115 A 0.094 -116 L 0.100 -117 R 0.100 -118 N 0.093 -119 D 0.084 -120 S 0.079 -121 Y 0.078 -122 T 0.081 -123 L 0.086 -124 H 0.095 -125 K 0.115 -126 I 0.154 -127 L 0.211 -128 P 0.270 -129 N 0.313 -130 K 0.325 -131 V 0.302 -132 D 0.261 -133 P 0.224 -134 L 0.203 -135 V 0.195 -136 S 0.192 -137 L 0.195 -138 M 0.206 -139 M 0.222 -140 V 0.234 -141 E 0.244 -142 K 0.255 -143 V 0.252 -144 P 0.223 -145 D 0.181 -146 S 0.142 -147 T 0.111 -148 Y 0.088 -149 E 0.074 -150 M 0.067 -151 I 0.062 -152 G 0.060 -153 G 0.059 -154 L 0.056 -155 D 0.050 -156 K 0.048 -157 Q 0.054 -158 I 0.065 -159 K 0.074 -160 E 0.075 -161 I 0.067 -162 K 0.060 -163 E 0.056 -164 V 0.053 -165 I 0.050 -166 E 0.048 -167 L 0.047 -168 P 0.048 -169 V 0.052 -170 K 0.059 -171 H 0.067 -172 P 0.071 -173 E 0.074 -174 L 0.077 -175 F 0.085 -176 E 0.102 -177 A 0.128 -178 L 0.161 -179 G 0.194 -180 I 0.211 -181 A 0.202 -182 Q 0.170 -183 P 0.129 -184 K 0.094 -185 G 0.071 -186 V 0.060 -187 L 0.055 -188 L 0.053 -189 Y 0.055 -190 G 0.059 -191 P 0.062 -192 P 0.060 -193 G 0.058 -194 T 0.059 -195 G 0.064 -196 K 0.071 -197 T 0.083 -198 L 0.096 -199 L 0.103 -200 A 0.103 -201 R 0.100 -202 A 0.097 -203 V 0.091 -204 A 0.081 -205 H 0.072 -206 H 0.071 -207 T 0.078 -208 D 0.086 -209 C 0.085 -210 T 0.076 -211 F 0.065 -212 I 0.058 -213 R 0.056 -214 V 0.056 -215 S 0.058 -216 G 0.066 -217 S 0.084 -218 E 0.104 -219 L 0.115 -220 V 0.113 -221 Q 0.107 -222 K 0.105 -223 F 0.106 -224 I 0.102 -225 G 0.092 -226 E 0.081 -227 G 0.073 -228 A 0.067 -229 R 0.060 -230 M 0.053 -231 V 0.046 -232 R 0.040 -233 E 0.036 -234 L 0.033 -235 F 0.034 -236 V 0.036 -237 M 0.038 -238 A 0.039 -239 R 0.037 -240 E 0.033 -241 H 0.030 -242 A 0.029 -243 P 0.034 -244 S 0.042 -245 I 0.047 -246 I 0.046 -247 F 0.042 -248 M 0.041 -249 D 0.043 -250 E 0.047 -251 I 0.053 -252 D 0.066 -253 S 0.087 -254 I 0.113 -255 G 0.144 -256 S 0.188 -257 S 0.248 -258 R 0.314 -259 L 0.373 -260 E 0.411 -261 G 0.422 -262 G 0.407 -263 S 0.376 -264 G 0.337 -265 G 0.295 -266 D 0.249 -267 S 0.207 -268 E 0.176 -269 V 0.156 -270 Q 0.140 -271 R 0.121 -272 T 0.104 -273 M 0.091 -274 L 0.080 -275 E 0.073 -276 L 0.068 -277 L 0.065 -278 N 0.064 -279 Q 0.065 -280 L 0.070 -281 D 0.079 -282 G 0.097 -283 F 0.122 -284 E 0.144 -285 A 0.145 -286 T 0.125 -287 K 0.098 -288 N 0.076 -289 I 0.062 -290 K 0.055 -291 V 0.053 -292 I 0.055 -293 M 0.057 -294 A 0.059 -295 T 0.061 -296 N 0.065 -297 R 0.072 -298 I 0.081 -299 D 0.092 -300 I 0.101 -301 L 0.104 -302 D 0.100 -303 S 0.094 -304 A 0.092 -305 L 0.093 -306 L 0.099 -307 R 0.108 -308 P 0.114 -309 G 0.111 -310 R 0.103 -311 I 0.093 -312 D 0.082 -313 R 0.070 -314 K 0.063 -315 I 0.061 -316 E 0.071 -317 F 0.092 -318 P 0.115 -319 P 0.124 -320 P 0.116 -321 N 0.100 -322 E 0.087 -323 E 0.080 -324 A 0.071 -325 R 0.062 -326 L 0.057 -327 D 0.055 -328 I 0.054 -329 L 0.053 -330 K 0.053 -331 I 0.055 -332 H 0.057 -333 S 0.062 -334 R 0.068 -335 K 0.073 -336 M 0.075 -337 N 0.078 -338 L 0.084 -339 T 0.092 -340 R 0.101 -341 G 0.104 -342 I 0.095 -343 N 0.076 -344 L 0.058 -345 R 0.050 -346 K 0.055 -347 I 0.067 -348 A 0.078 -349 E 0.089 -350 L 0.103 -351 M 0.114 -352 P 0.115 -353 G 0.109 -354 A 0.101 -355 S 0.093 -356 G 0.084 -357 A 0.079 -358 E 0.080 -359 V 0.084 -360 K 0.087 -361 G 0.086 -362 V 0.084 -363 C 0.080 -364 T 0.074 -365 E 0.067 -366 A 0.064 -367 G 0.063 -368 M 0.064 -369 Y 0.068 -370 A 0.073 -371 L 0.077 -372 R 0.081 -373 E 0.085 -374 R 0.090 -375 R 0.098 -376 V 0.111 -377 H 0.123 -378 V 0.122 -379 T 0.108 -380 Q 0.091 -381 E 0.077 -382 D 0.068 -383 F 0.064 -384 E 0.068 -385 M 0.071 -386 A 0.065 -387 V 0.056 -388 A 0.057 -389 K 0.070 -390 V 0.086 -391 M 0.098 -392 Q 0.118 -393 K 0.161 -394 D 0.217 -395 S 0.265 -396 E 0.295 -397 K 0.316 -398 N 0.332 -399 M 0.342 -400 S 0.344 -401 I 0.338 -402 K 0.326 -403 K 0.311 -404 L 0.296 -405 W 0.283 -406 K 0.276 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020708.13_ENSMUST00000021049.9_GN:Psmc5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020708.13_ENSMUST00000021049.9_GN:Psmc5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid deleted file mode 100644 index 7f2faa00a994fe311b3b9636a4f16ab91b9d10a8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000020708.13_ENSMUST00000021049.9_GN:Psmc5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid +++ /dev/null @@ -1,417 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000020708.13|ENSMUST00000021049.9|GN:Psmc5|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:10 -1 M 0.432 -2 P 0.457 -3 A 0.498 -4 I 0.536 -5 P 0.546 -6 A 0.524 -7 E 0.507 -8 R 0.513 -9 G 0.519 -10 K 0.525 -11 M 0.560 -12 A 0.610 -13 L 0.641 -14 D 0.654 -15 G 0.672 -16 P 0.692 -17 E 0.702 -18 Q 0.701 -19 M 0.698 -20 E 0.698 -21 L 0.700 -22 E 0.698 -23 E 0.691 -24 G 0.680 -25 K 0.669 -26 A 0.655 -27 G 0.624 -28 S 0.563 -29 G 0.473 -30 L 0.375 -31 R 0.293 -32 Q 0.240 -33 Y 0.212 -34 Y 0.201 -35 L 0.205 -36 S 0.220 -37 K 0.237 -38 I 0.243 -39 E 0.245 -40 E 0.256 -41 L 0.276 -42 Q 0.295 -43 L 0.315 -44 I 0.341 -45 V 0.367 -46 N 0.377 -47 D 0.362 -48 K 0.336 -49 S 0.314 -50 Q 0.303 -51 N 0.295 -52 L 0.280 -53 R 0.259 -54 R 0.248 -55 L 0.259 -56 Q 0.288 -57 A 0.316 -58 Q 0.326 -59 R 0.318 -60 N 0.304 -61 E 0.285 -62 L 0.264 -63 N 0.249 -64 A 0.244 -65 K 0.243 -66 V 0.237 -67 R 0.228 -68 L 0.227 -69 L 0.234 -70 R 0.249 -71 E 0.274 -72 E 0.304 -73 L 0.326 -74 Q 0.347 -75 L 0.374 -76 L 0.390 -77 Q 0.380 -78 E 0.348 -79 Q 0.307 -80 G 0.254 -81 S 0.190 -82 Y 0.125 -83 V 0.077 -84 G 0.049 -85 E 0.035 -86 V 0.032 -87 V 0.034 -88 R 0.038 -89 A 0.042 -90 M 0.047 -91 D 0.051 -92 K 0.051 -93 K 0.045 -94 K 0.035 -95 V 0.026 -96 L 0.023 -97 V 0.025 -98 K 0.031 -99 V 0.040 -100 H 0.053 -101 P 0.069 -102 E 0.080 -103 G 0.082 -104 K 0.075 -105 F 0.065 -106 V 0.057 -107 V 0.054 -108 D 0.058 -109 V 0.063 -110 D 0.066 -111 K 0.067 -112 N 0.068 -113 I 0.067 -114 D 0.059 -115 I 0.050 -116 N 0.046 -117 D 0.051 -118 V 0.062 -119 T 0.076 -120 P 0.091 -121 N 0.100 -122 C 0.100 -123 R 0.095 -124 V 0.092 -125 A 0.095 -126 L 0.100 -127 R 0.100 -128 N 0.092 -129 D 0.084 -130 S 0.079 -131 Y 0.079 -132 T 0.082 -133 L 0.086 -134 H 0.095 -135 K 0.115 -136 I 0.155 -137 L 0.211 -138 P 0.271 -139 N 0.315 -140 K 0.327 -141 V 0.304 -142 D 0.262 -143 P 0.225 -144 L 0.203 -145 V 0.194 -146 S 0.192 -147 L 0.195 -148 M 0.206 -149 M 0.221 -150 V 0.233 -151 E 0.244 -152 K 0.254 -153 V 0.251 -154 P 0.222 -155 D 0.180 -156 S 0.142 -157 T 0.111 -158 Y 0.088 -159 E 0.074 -160 M 0.067 -161 I 0.063 -162 G 0.061 -163 G 0.060 -164 L 0.056 -165 D 0.051 -166 K 0.049 -167 Q 0.054 -168 I 0.065 -169 K 0.074 -170 E 0.075 -171 I 0.068 -172 K 0.061 -173 E 0.057 -174 V 0.054 -175 I 0.050 -176 E 0.048 -177 L 0.048 -178 P 0.048 -179 V 0.052 -180 K 0.060 -181 H 0.068 -182 P 0.074 -183 E 0.077 -184 L 0.079 -185 F 0.086 -186 E 0.103 -187 A 0.129 -188 L 0.162 -189 G 0.194 -190 I 0.212 -191 A 0.202 -192 Q 0.170 -193 P 0.129 -194 K 0.094 -195 G 0.072 -196 V 0.060 -197 L 0.055 -198 L 0.053 -199 Y 0.055 -200 G 0.059 -201 P 0.061 -202 P 0.060 -203 G 0.058 -204 T 0.059 -205 G 0.064 -206 K 0.071 -207 T 0.082 -208 L 0.095 -209 L 0.103 -210 A 0.102 -211 R 0.100 -212 A 0.097 -213 V 0.091 -214 A 0.081 -215 H 0.072 -216 H 0.071 -217 T 0.078 -218 D 0.086 -219 C 0.085 -220 T 0.075 -221 F 0.065 -222 I 0.058 -223 R 0.056 -224 V 0.056 -225 S 0.058 -226 G 0.066 -227 S 0.084 -228 E 0.104 -229 L 0.114 -230 V 0.113 -231 Q 0.107 -232 K 0.105 -233 F 0.106 -234 I 0.103 -235 G 0.093 -236 E 0.081 -237 G 0.073 -238 A 0.068 -239 R 0.061 -240 M 0.053 -241 V 0.046 -242 R 0.040 -243 E 0.036 -244 L 0.033 -245 F 0.034 -246 V 0.036 -247 M 0.038 -248 A 0.039 -249 R 0.037 -250 E 0.033 -251 H 0.030 -252 A 0.030 -253 P 0.034 -254 S 0.042 -255 I 0.047 -256 I 0.046 -257 F 0.042 -258 M 0.041 -259 D 0.043 -260 E 0.047 -261 I 0.053 -262 D 0.066 -263 S 0.088 -264 I 0.114 -265 G 0.146 -266 S 0.191 -267 S 0.251 -268 R 0.318 -269 L 0.377 -270 E 0.416 -271 G 0.426 -272 G 0.411 -273 S 0.380 -274 G 0.341 -275 G 0.298 -276 D 0.252 -277 S 0.210 -278 E 0.178 -279 V 0.158 -280 Q 0.142 -281 R 0.123 -282 T 0.105 -283 M 0.092 -284 L 0.081 -285 E 0.074 -286 L 0.069 -287 L 0.066 -288 N 0.065 -289 Q 0.066 -290 L 0.071 -291 D 0.080 -292 G 0.097 -293 F 0.123 -294 E 0.145 -295 A 0.146 -296 T 0.126 -297 K 0.099 -298 N 0.077 -299 I 0.062 -300 K 0.055 -301 V 0.054 -302 I 0.055 -303 M 0.057 -304 A 0.059 -305 T 0.062 -306 N 0.066 -307 R 0.073 -308 I 0.082 -309 D 0.094 -310 I 0.103 -311 L 0.105 -312 D 0.101 -313 S 0.095 -314 A 0.093 -315 L 0.094 -316 L 0.100 -317 R 0.109 -318 P 0.115 -319 G 0.112 -320 R 0.103 -321 I 0.093 -322 D 0.082 -323 R 0.071 -324 K 0.063 -325 I 0.062 -326 E 0.071 -327 F 0.092 -328 P 0.115 -329 P 0.125 -330 P 0.116 -331 N 0.100 -332 E 0.088 -333 E 0.080 -334 A 0.071 -335 R 0.062 -336 L 0.057 -337 D 0.055 -338 I 0.054 -339 L 0.053 -340 K 0.054 -341 I 0.055 -342 H 0.058 -343 S 0.062 -344 R 0.069 -345 K 0.073 -346 M 0.076 -347 N 0.079 -348 L 0.084 -349 T 0.092 -350 R 0.101 -351 G 0.104 -352 I 0.095 -353 N 0.076 -354 L 0.058 -355 R 0.050 -356 K 0.055 -357 I 0.067 -358 A 0.079 -359 E 0.090 -360 L 0.103 -361 M 0.115 -362 P 0.116 -363 G 0.110 -364 A 0.102 -365 S 0.094 -366 G 0.085 -367 A 0.080 -368 E 0.081 -369 V 0.085 -370 K 0.087 -371 G 0.086 -372 V 0.084 -373 C 0.080 -374 T 0.074 -375 E 0.067 -376 A 0.064 -377 G 0.063 -378 M 0.065 -379 Y 0.068 -380 A 0.073 -381 L 0.077 -382 R 0.081 -383 E 0.086 -384 R 0.090 -385 R 0.098 -386 V 0.111 -387 H 0.123 -388 V 0.122 -389 T 0.108 -390 Q 0.090 -391 E 0.076 -392 D 0.067 -393 F 0.064 -394 E 0.068 -395 M 0.071 -396 A 0.065 -397 V 0.056 -398 A 0.057 -399 K 0.070 -400 V 0.087 -401 M 0.099 -402 Q 0.120 -403 K 0.163 -404 D 0.220 -405 S 0.268 -406 E 0.298 -407 K 0.318 -408 N 0.334 -409 M 0.343 -410 S 0.345 -411 I 0.339 -412 K 0.327 -413 K 0.312 -414 L 0.297 -415 W 0.285 -416 K 0.277 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021130.9_ENSMUST00000219993.2_GN:Galnt16_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021130.9_ENSMUST00000219993.2_GN:Galnt16_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index c735b3acbfa95dd5d280c6bcef5e57d894562d61..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021130.9_ENSMUST00000219993.2_GN:Galnt16_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,559 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000021130.9|ENSMUST00000219993.2|GN:Galnt16|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.256 -2 R 0.251 -3 K 0.250 -4 I 0.254 -5 R 0.252 -6 A 0.243 -7 N 0.237 -8 A 0.232 -9 I 0.223 -10 A 0.220 -11 I 0.235 -12 L 0.266 -13 T 0.291 -14 V 0.294 -15 A 0.286 -16 W 0.279 -17 I 0.271 -18 L 0.260 -19 G 0.257 -20 T 0.252 -21 F 0.232 -22 Y 0.199 -23 Y 0.172 -24 L 0.166 -25 W 0.184 -26 Q 0.218 -27 D 0.251 -28 N 0.262 -29 R 0.260 -30 A 0.270 -31 H 0.305 -32 A 0.346 -33 A 0.379 -34 S 0.410 -35 S 0.449 -36 S 0.478 -37 G 0.482 -38 R 0.479 -39 G 0.485 -40 A 0.488 -41 Q 0.491 -42 R 0.520 -43 A 0.562 -44 G 0.589 -45 G 0.593 -46 R 0.588 -47 P 0.582 -48 E 0.573 -49 Q 0.556 -50 L 0.520 -51 R 0.466 -52 E 0.416 -53 D 0.397 -54 R 0.410 -55 T 0.438 -56 I 0.465 -57 P 0.477 -58 L 0.466 -59 I 0.439 -60 V 0.413 -61 T 0.401 -62 G 0.398 -63 T 0.398 -64 P 0.398 -65 S 0.395 -66 K 0.375 -67 G 0.326 -68 F 0.254 -69 D 0.183 -70 E 0.135 -71 K 0.116 -72 A 0.117 -73 Y 0.124 -74 L 0.133 -75 S 0.144 -76 A 0.154 -77 K 0.159 -78 Q 0.164 -79 L 0.172 -80 K 0.181 -81 P 0.193 -82 G 0.203 -83 E 0.206 -84 D 0.197 -85 P 0.175 -86 Y 0.149 -87 R 0.127 -88 Q 0.114 -89 H 0.118 -90 A 0.144 -91 F 0.180 -92 N 0.205 -93 Q 0.208 -94 L 0.198 -95 E 0.180 -96 S 0.162 -97 D 0.150 -98 K 0.147 -99 L 0.149 -100 S 0.147 -101 S 0.142 -102 D 0.140 -103 R 0.144 -104 P 0.150 -105 I 0.157 -106 R 0.164 -107 D 0.161 -108 T 0.147 -109 R 0.126 -110 H 0.107 -111 Y 0.095 -112 S 0.091 -113 C 0.092 -114 P 0.093 -115 S 0.097 -116 L 0.104 -117 S 0.110 -118 Y 0.108 -119 S 0.099 -120 S 0.093 -121 D 0.095 -122 L 0.096 -123 P 0.089 -124 A 0.072 -125 T 0.055 -126 S 0.046 -127 V 0.043 -128 I 0.044 -129 I 0.047 -130 T 0.054 -131 F 0.060 -132 H 0.063 -133 N 0.068 -134 E 0.075 -135 A 0.076 -136 R 0.069 -137 S 0.059 -138 T 0.053 -139 L 0.055 -140 L 0.059 -141 R 0.060 -142 T 0.057 -143 V 0.055 -144 K 0.054 -145 S 0.051 -146 V 0.047 -147 L 0.044 -148 N 0.044 -149 R 0.047 -150 T 0.048 -151 P 0.047 -152 A 0.045 -153 S 0.045 -154 L 0.046 -155 I 0.044 -156 Q 0.039 -157 E 0.032 -158 I 0.028 -159 I 0.025 -160 L 0.023 -161 V 0.024 -162 D 0.026 -163 D 0.030 -164 F 0.036 -165 S 0.042 -166 S 0.047 -167 D 0.049 -168 P 0.047 -169 E 0.043 -170 D 0.039 -171 C 0.037 -172 L 0.038 -173 L 0.044 -174 L 0.049 -175 T 0.053 -176 R 0.054 -177 I 0.054 -178 P 0.047 -179 K 0.040 -180 V 0.039 -181 K 0.045 -182 C 0.054 -183 L 0.060 -184 R 0.064 -185 N 0.065 -186 D 0.065 -187 K 0.063 -188 R 0.061 -189 E 0.058 -190 G 0.056 -191 L 0.051 -192 I 0.048 -193 R 0.048 -194 S 0.048 -195 R 0.046 -196 V 0.044 -197 R 0.045 -198 G 0.049 -199 A 0.052 -200 D 0.058 -201 V 0.069 -202 A 0.082 -203 G 0.086 -204 A 0.079 -205 T 0.068 -206 V 0.056 -207 L 0.049 -208 T 0.048 -209 F 0.054 -210 L 0.061 -211 D 0.063 -212 S 0.062 -213 H 0.062 -214 C 0.068 -215 E 0.077 -216 V 0.086 -217 N 0.091 -218 V 0.088 -219 E 0.077 -220 W 0.063 -221 L 0.050 -222 Q 0.039 -223 P 0.032 -224 M 0.028 -225 L 0.028 -226 Q 0.029 -227 R 0.030 -228 V 0.032 -229 M 0.034 -230 E 0.034 -231 D 0.033 -232 H 0.033 -233 T 0.038 -234 R 0.049 -235 V 0.061 -236 V 0.070 -237 S 0.074 -238 P 0.077 -239 I 0.079 -240 I 0.082 -241 D 0.086 -242 V 0.084 -243 I 0.075 -244 S 0.064 -245 L 0.058 -246 D 0.058 -247 N 0.063 -248 F 0.070 -249 A 0.079 -250 Y 0.093 -251 L 0.118 -252 A 0.150 -253 A 0.179 -254 S 0.196 -255 A 0.198 -256 D 0.188 -257 L 0.172 -258 R 0.153 -259 G 0.134 -260 G 0.114 -261 F 0.095 -262 D 0.082 -263 W 0.076 -264 S 0.076 -265 L 0.078 -266 H 0.083 -267 F 0.086 -268 K 0.092 -269 W 0.102 -270 E 0.115 -271 Q 0.126 -272 I 0.126 -273 P 0.113 -274 L 0.094 -275 E 0.082 -276 Q 0.078 -277 K 0.081 -278 M 0.087 -279 T 0.095 -280 R 0.105 -281 T 0.113 -282 D 0.120 -283 P 0.125 -284 T 0.130 -285 K 0.136 -286 P 0.144 -287 I 0.150 -288 R 0.149 -289 T 0.136 -290 P 0.124 -291 V 0.125 -292 I 0.141 -293 A 0.155 -294 G 0.151 -295 G 0.130 -296 I 0.103 -297 F 0.084 -298 V 0.074 -299 I 0.068 -300 D 0.060 -301 K 0.055 -302 S 0.054 -303 W 0.057 -304 F 0.060 -305 N 0.063 -306 H 0.067 -307 L 0.075 -308 G 0.084 -309 K 0.091 -310 Y 0.098 -311 D 0.103 -312 A 0.103 -313 Q 0.095 -314 M 0.080 -315 D 0.066 -316 I 0.058 -317 W 0.059 -318 G 0.069 -319 G 0.084 -320 E 0.096 -321 N 0.099 -322 F 0.094 -323 E 0.087 -324 L 0.076 -325 S 0.062 -326 F 0.049 -327 R 0.039 -328 V 0.032 -329 W 0.032 -330 M 0.044 -331 C 0.066 -332 G 0.090 -333 G 0.107 -334 S 0.114 -335 L 0.117 -336 E 0.121 -337 I 0.127 -338 V 0.128 -339 P 0.118 -340 C 0.106 -341 S 0.100 -342 R 0.100 -343 V 0.098 -344 G 0.092 -345 H 0.084 -346 V 0.076 -347 F 0.073 -348 R 0.074 -349 K 0.077 -350 R 0.078 -351 H 0.079 -352 P 0.088 -353 Y 0.104 -354 N 0.123 -355 F 0.136 -356 P 0.140 -357 E 0.140 -358 G 0.138 -359 N 0.130 -360 A 0.118 -361 L 0.111 -362 T 0.112 -363 Y 0.116 -364 I 0.123 -365 R 0.133 -366 N 0.136 -367 T 0.130 -368 K 0.122 -369 R 0.116 -370 T 0.104 -371 A 0.086 -372 E 0.070 -373 V 0.061 -374 W 0.057 -375 M 0.054 -376 D 0.052 -377 E 0.051 -378 Y 0.049 -379 K 0.046 -380 Q 0.044 -381 Y 0.043 -382 Y 0.043 -383 Y 0.046 -384 E 0.053 -385 A 0.067 -386 R 0.085 -387 P 0.101 -388 S 0.113 -389 A 0.121 -390 I 0.124 -391 G 0.127 -392 K 0.134 -393 A 0.138 -394 F 0.138 -395 G 0.136 -396 S 0.129 -397 V 0.111 -398 A 0.089 -399 T 0.073 -400 R 0.068 -401 I 0.074 -402 E 0.079 -403 Q 0.076 -404 R 0.072 -405 K 0.071 -406 K 0.075 -407 M 0.078 -408 D 0.079 -409 C 0.076 -410 K 0.071 -411 S 0.066 -412 F 0.068 -413 R 0.075 -414 W 0.080 -415 Y 0.084 -416 L 0.091 -417 E 0.099 -418 N 0.102 -419 V 0.097 -420 Y 0.092 -421 P 0.097 -422 E 0.111 -423 L 0.136 -424 T 0.172 -425 V 0.211 -426 P 0.232 -427 V 0.223 -428 K 0.193 -429 E 0.162 -430 V 0.138 -431 L 0.117 -432 P 0.099 -433 G 0.086 -434 V 0.075 -435 I 0.069 -436 K 0.067 -437 Q 0.064 -438 G 0.060 -439 V 0.054 -440 N 0.051 -441 C 0.054 -442 L 0.067 -443 E 0.095 -444 S 0.143 -445 Q 0.200 -446 G 0.254 -447 Q 0.292 -448 N 0.309 -449 T 0.304 -450 A 0.284 -451 G 0.259 -452 D 0.235 -453 L 0.213 -454 L 0.193 -455 L 0.176 -456 G 0.162 -457 M 0.151 -458 G 0.140 -459 I 0.128 -460 C 0.114 -461 R 0.102 -462 G 0.092 -463 S 0.086 -464 A 0.083 -465 K 0.093 -466 S 0.116 -467 P 0.137 -468 P 0.139 -469 P 0.121 -470 A 0.097 -471 Q 0.078 -472 A 0.066 -473 W 0.062 -474 L 0.064 -475 F 0.069 -476 S 0.071 -477 D 0.070 -478 H 0.070 -479 L 0.069 -480 I 0.064 -481 Q 0.057 -482 Q 0.052 -483 Q 0.054 -484 G 0.057 -485 K 0.056 -486 C 0.053 -487 L 0.057 -488 A 0.076 -489 A 0.109 -490 T 0.146 -491 S 0.175 -492 T 0.192 -493 L 0.202 -494 M 0.210 -495 S 0.220 -496 S 0.232 -497 P 0.240 -498 G 0.236 -499 S 0.218 -500 P 0.187 -501 V 0.146 -502 I 0.109 -503 L 0.087 -504 Q 0.078 -505 T 0.077 -506 C 0.080 -507 N 0.081 -508 P 0.081 -509 K 0.085 -510 E 0.094 -511 G 0.101 -512 K 0.099 -513 Q 0.088 -514 K 0.073 -515 W 0.063 -516 R 0.064 -517 R 0.072 -518 K 0.084 -519 G 0.093 -520 S 0.098 -521 F 0.099 -522 I 0.095 -523 Q 0.088 -524 H 0.082 -525 S 0.081 -526 V 0.087 -527 S 0.098 -528 G 0.106 -529 L 0.102 -530 C 0.089 -531 L 0.076 -532 E 0.072 -533 T 0.078 -534 K 0.088 -535 P 0.099 -536 A 0.111 -537 Q 0.121 -538 L 0.122 -539 V 0.116 -540 T 0.109 -541 S 0.108 -542 K 0.111 -543 C 0.116 -544 Q 0.125 -545 T 0.141 -546 D 0.159 -547 A 0.163 -548 Q 0.149 -549 A 0.123 -550 Q 0.098 -551 Q 0.076 -552 W 0.064 -553 Q 0.065 -554 L 0.078 -555 L 0.096 -556 P 0.110 -557 H 0.120 -558 T 0.126 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021130.9_ENSMUST00000219993.2_GN:Galnt16_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:145.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021130.9_ENSMUST00000219993.2_GN:Galnt16_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:145.caid deleted file mode 100644 index 16ffdfdf3e29ff3019bd914577b75da625caf3fd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021130.9_ENSMUST00000219993.2_GN:Galnt16_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:145.caid +++ /dev/null @@ -1,704 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000021130.9|ENSMUST00000219993.2|GN:Galnt16|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:145 -1 M 0.381 -2 K 0.411 -3 D 0.451 -4 V 0.472 -5 Q 0.466 -6 R 0.453 -7 S 0.465 -8 H 0.504 -9 P 0.540 -10 C 0.556 -11 A 0.564 -12 C 0.574 -13 I 0.577 -14 G 0.560 -15 C 0.522 -16 T 0.466 -17 A 0.402 -18 A 0.354 -19 Q 0.335 -20 L 0.322 -21 H 0.298 -22 L 0.276 -23 A 0.272 -24 L 0.282 -25 Q 0.306 -26 S 0.349 -27 V 0.399 -28 K 0.438 -29 C 0.459 -30 I 0.464 -31 S 0.463 -32 F 0.468 -33 Q 0.484 -34 L 0.510 -35 P 0.542 -36 T 0.578 -37 P 0.616 -38 S 0.653 -39 G 0.683 -40 H 0.704 -41 R 0.715 -42 G 0.715 -43 G 0.702 -44 W 0.683 -45 N 0.673 -46 P 0.672 -47 G 0.676 -48 S 0.684 -49 P 0.695 -50 R 0.706 -51 R 0.716 -52 I 0.724 -53 P 0.730 -54 V 0.734 -55 Q 0.740 -56 S 0.748 -57 Q 0.759 -58 D 0.767 -59 C 0.767 -60 L 0.758 -61 L 0.745 -62 A 0.736 -63 S 0.728 -64 L 0.720 -65 A 0.720 -66 P 0.736 -67 S 0.761 -68 E 0.780 -69 G 0.784 -70 L 0.775 -71 S 0.764 -72 E 0.757 -73 H 0.753 -74 R 0.746 -75 L 0.738 -76 N 0.732 -77 P 0.733 -78 A 0.741 -79 P 0.752 -80 E 0.754 -81 L 0.733 -82 S 0.676 -83 S 0.603 -84 Q 0.554 -85 R 0.544 -86 C 0.542 -87 R 0.554 -88 E 0.606 -89 L 0.674 -90 Q 0.721 -91 L 0.741 -92 G 0.751 -93 D 0.754 -94 S 0.755 -95 G 0.760 -96 Q 0.770 -97 G 0.777 -98 Q 0.778 -99 G 0.776 -100 S 0.770 -101 R 0.749 -102 V 0.701 -103 F 0.641 -104 A 0.617 -105 G 0.654 -106 D 0.714 -107 S 0.751 -108 G 0.757 -109 L 0.748 -110 S 0.742 -111 S 0.746 -112 P 0.758 -113 A 0.766 -114 Q 0.765 -115 A 0.755 -116 T 0.740 -117 T 0.721 -118 N 0.698 -119 G 0.662 -120 W 0.611 -121 G 0.557 -122 S 0.535 -123 K 0.564 -124 L 0.619 -125 P 0.665 -126 C 0.685 -127 S 0.668 -128 G 0.622 -129 S 0.595 -130 E 0.622 -131 S 0.677 -132 T 0.717 -133 P 0.737 -134 A 0.747 -135 S 0.754 -136 G 0.758 -137 P 0.759 -138 T 0.751 -139 R 0.733 -140 S 0.705 -141 A 0.675 -142 R 0.654 -143 P 0.650 -144 P 0.656 -145 T 0.649 -146 M 0.617 -147 R 0.575 -148 K 0.545 -149 I 0.526 -150 R 0.509 -151 A 0.497 -152 N 0.486 -153 A 0.462 -154 I 0.430 -155 A 0.409 -156 I 0.405 -157 L 0.412 -158 T 0.414 -159 V 0.394 -160 A 0.358 -161 W 0.320 -162 I 0.288 -163 L 0.268 -164 G 0.258 -165 T 0.241 -166 F 0.208 -167 Y 0.171 -168 Y 0.150 -169 L 0.152 -170 W 0.172 -171 Q 0.207 -172 D 0.250 -173 N 0.284 -174 R 0.306 -175 A 0.328 -176 H 0.361 -177 A 0.397 -178 A 0.433 -179 S 0.475 -180 S 0.526 -181 S 0.581 -182 G 0.625 -183 R 0.641 -184 G 0.621 -185 A 0.574 -186 Q 0.543 -187 R 0.562 -188 A 0.605 -189 G 0.629 -190 G 0.628 -191 R 0.619 -192 P 0.615 -193 E 0.614 -194 Q 0.600 -195 L 0.560 -196 R 0.501 -197 E 0.449 -198 D 0.428 -199 R 0.440 -200 T 0.469 -201 I 0.496 -202 P 0.504 -203 L 0.485 -204 I 0.450 -205 V 0.424 -206 T 0.418 -207 G 0.421 -208 T 0.420 -209 P 0.414 -210 S 0.406 -211 K 0.385 -212 G 0.336 -213 F 0.261 -214 D 0.186 -215 E 0.135 -216 K 0.114 -217 A 0.113 -218 Y 0.119 -219 L 0.127 -220 S 0.137 -221 A 0.145 -222 K 0.148 -223 Q 0.151 -224 L 0.158 -225 K 0.166 -226 P 0.176 -227 G 0.189 -228 E 0.196 -229 D 0.191 -230 P 0.170 -231 Y 0.142 -232 R 0.118 -233 Q 0.104 -234 H 0.108 -235 A 0.133 -236 F 0.168 -237 N 0.192 -238 Q 0.195 -239 L 0.183 -240 E 0.165 -241 S 0.147 -242 D 0.135 -243 K 0.131 -244 L 0.132 -245 S 0.131 -246 S 0.128 -247 D 0.129 -248 R 0.135 -249 P 0.142 -250 I 0.151 -251 R 0.157 -252 D 0.155 -253 T 0.140 -254 R 0.120 -255 H 0.102 -256 Y 0.091 -257 S 0.087 -258 C 0.087 -259 P 0.088 -260 S 0.091 -261 L 0.099 -262 S 0.106 -263 Y 0.104 -264 S 0.095 -265 S 0.089 -266 D 0.090 -267 L 0.093 -268 P 0.086 -269 A 0.069 -270 T 0.052 -271 S 0.042 -272 V 0.040 -273 I 0.040 -274 I 0.043 -275 T 0.049 -276 F 0.054 -277 H 0.057 -278 N 0.061 -279 E 0.067 -280 A 0.069 -281 R 0.063 -282 S 0.054 -283 T 0.049 -284 L 0.052 -285 L 0.056 -286 R 0.058 -287 T 0.056 -288 V 0.055 -289 K 0.054 -290 S 0.051 -291 V 0.045 -292 L 0.042 -293 N 0.042 -294 R 0.045 -295 T 0.047 -296 P 0.046 -297 A 0.043 -298 S 0.042 -299 L 0.043 -300 I 0.042 -301 Q 0.037 -302 E 0.031 -303 I 0.028 -304 I 0.026 -305 L 0.024 -306 V 0.024 -307 D 0.025 -308 D 0.028 -309 F 0.033 -310 S 0.040 -311 S 0.045 -312 D 0.048 -313 P 0.047 -314 E 0.043 -315 D 0.038 -316 C 0.036 -317 L 0.037 -318 L 0.042 -319 L 0.046 -320 T 0.048 -321 R 0.049 -322 I 0.048 -323 P 0.043 -324 K 0.038 -325 V 0.040 -326 K 0.047 -327 C 0.056 -328 L 0.062 -329 R 0.064 -330 N 0.065 -331 D 0.065 -332 K 0.063 -333 R 0.061 -334 E 0.060 -335 G 0.057 -336 L 0.053 -337 I 0.050 -338 R 0.050 -339 S 0.050 -340 R 0.048 -341 V 0.047 -342 R 0.049 -343 G 0.053 -344 A 0.056 -345 D 0.061 -346 V 0.073 -347 A 0.087 -348 G 0.092 -349 A 0.085 -350 T 0.073 -351 V 0.061 -352 L 0.053 -353 T 0.053 -354 F 0.060 -355 L 0.067 -356 D 0.069 -357 S 0.067 -358 H 0.066 -359 C 0.072 -360 E 0.082 -361 V 0.091 -362 N 0.096 -363 V 0.094 -364 E 0.083 -365 W 0.068 -366 L 0.054 -367 Q 0.043 -368 P 0.035 -369 M 0.032 -370 L 0.032 -371 Q 0.033 -372 R 0.034 -373 V 0.036 -374 M 0.038 -375 E 0.038 -376 D 0.038 -377 H 0.038 -378 T 0.043 -379 R 0.055 -380 V 0.069 -381 V 0.078 -382 S 0.082 -383 P 0.084 -384 I 0.086 -385 I 0.089 -386 D 0.092 -387 V 0.090 -388 I 0.078 -389 S 0.065 -390 L 0.058 -391 D 0.059 -392 N 0.065 -393 F 0.074 -394 A 0.086 -395 Y 0.103 -396 L 0.131 -397 A 0.166 -398 A 0.198 -399 S 0.215 -400 A 0.215 -401 D 0.202 -402 L 0.182 -403 R 0.161 -404 G 0.141 -405 G 0.120 -406 F 0.101 -407 D 0.088 -408 W 0.082 -409 S 0.082 -410 L 0.085 -411 H 0.090 -412 F 0.095 -413 K 0.101 -414 W 0.111 -415 E 0.124 -416 Q 0.135 -417 I 0.135 -418 P 0.122 -419 L 0.103 -420 E 0.089 -421 Q 0.085 -422 K 0.089 -423 M 0.097 -424 T 0.108 -425 R 0.120 -426 T 0.130 -427 D 0.137 -428 P 0.141 -429 T 0.145 -430 K 0.150 -431 P 0.158 -432 I 0.165 -433 R 0.162 -434 T 0.148 -435 P 0.134 -436 V 0.135 -437 I 0.152 -438 A 0.167 -439 G 0.164 -440 G 0.142 -441 I 0.113 -442 F 0.093 -443 V 0.083 -444 I 0.076 -445 D 0.068 -446 K 0.064 -447 S 0.064 -448 W 0.068 -449 F 0.071 -450 N 0.073 -451 H 0.075 -452 L 0.082 -453 G 0.090 -454 K 0.097 -455 Y 0.103 -456 D 0.108 -457 A 0.108 -458 Q 0.099 -459 M 0.084 -460 D 0.070 -461 I 0.063 -462 W 0.065 -463 G 0.077 -464 G 0.093 -465 E 0.106 -466 N 0.110 -467 F 0.106 -468 E 0.098 -469 L 0.086 -470 S 0.070 -471 F 0.054 -472 R 0.043 -473 V 0.035 -474 W 0.035 -475 M 0.047 -476 C 0.070 -477 G 0.096 -478 G 0.115 -479 S 0.124 -480 L 0.128 -481 E 0.134 -482 I 0.140 -483 V 0.140 -484 P 0.129 -485 C 0.116 -486 S 0.109 -487 R 0.108 -488 V 0.105 -489 G 0.098 -490 H 0.089 -491 V 0.081 -492 F 0.076 -493 R 0.077 -494 K 0.079 -495 R 0.081 -496 H 0.083 -497 P 0.091 -498 Y 0.108 -499 N 0.127 -500 F 0.141 -501 P 0.145 -502 E 0.145 -503 G 0.141 -504 N 0.132 -505 A 0.120 -506 L 0.115 -507 T 0.118 -508 Y 0.125 -509 I 0.134 -510 R 0.144 -511 N 0.148 -512 T 0.142 -513 K 0.133 -514 R 0.126 -515 T 0.113 -516 A 0.093 -517 E 0.075 -518 V 0.065 -519 W 0.060 -520 M 0.057 -521 D 0.056 -522 E 0.055 -523 Y 0.054 -524 K 0.050 -525 Q 0.048 -526 Y 0.047 -527 Y 0.047 -528 Y 0.049 -529 E 0.057 -530 A 0.071 -531 R 0.088 -532 P 0.104 -533 S 0.116 -534 A 0.123 -535 I 0.126 -536 G 0.130 -537 K 0.137 -538 A 0.142 -539 F 0.144 -540 G 0.144 -541 S 0.136 -542 V 0.118 -543 A 0.096 -544 T 0.078 -545 R 0.073 -546 I 0.078 -547 E 0.082 -548 Q 0.078 -549 R 0.070 -550 K 0.069 -551 K 0.074 -552 M 0.081 -553 D 0.084 -554 C 0.083 -555 K 0.078 -556 S 0.074 -557 F 0.076 -558 R 0.082 -559 W 0.087 -560 Y 0.091 -561 L 0.097 -562 E 0.104 -563 N 0.108 -564 V 0.105 -565 Y 0.101 -566 P 0.106 -567 E 0.123 -568 L 0.150 -569 T 0.188 -570 V 0.227 -571 P 0.246 -572 V 0.232 -573 K 0.197 -574 E 0.162 -575 V 0.137 -576 L 0.118 -577 P 0.103 -578 G 0.090 -579 V 0.078 -580 I 0.070 -581 K 0.065 -582 Q 0.063 -583 G 0.059 -584 V 0.055 -585 N 0.053 -586 C 0.057 -587 L 0.072 -588 E 0.103 -589 S 0.154 -590 Q 0.213 -591 G 0.268 -592 Q 0.306 -593 N 0.322 -594 T 0.316 -595 A 0.294 -596 G 0.266 -597 D 0.240 -598 L 0.217 -599 L 0.197 -600 L 0.181 -601 G 0.168 -602 M 0.157 -603 G 0.148 -604 I 0.137 -605 C 0.124 -606 R 0.110 -607 G 0.098 -608 S 0.089 -609 A 0.086 -610 K 0.096 -611 S 0.121 -612 P 0.145 -613 P 0.147 -614 P 0.126 -615 A 0.099 -616 Q 0.078 -617 A 0.064 -618 W 0.059 -619 L 0.061 -620 F 0.066 -621 S 0.069 -622 D 0.070 -623 H 0.072 -624 L 0.071 -625 I 0.066 -626 Q 0.057 -627 Q 0.053 -628 Q 0.056 -629 G 0.059 -630 K 0.059 -631 C 0.056 -632 L 0.060 -633 A 0.079 -634 A 0.113 -635 T 0.152 -636 S 0.184 -637 T 0.202 -638 L 0.211 -639 M 0.218 -640 S 0.227 -641 S 0.238 -642 P 0.245 -643 G 0.242 -644 S 0.226 -645 P 0.195 -646 V 0.153 -647 I 0.115 -648 L 0.091 -649 Q 0.083 -650 T 0.084 -651 C 0.088 -652 N 0.091 -653 P 0.092 -654 K 0.097 -655 E 0.106 -656 G 0.113 -657 K 0.109 -658 Q 0.095 -659 K 0.078 -660 W 0.066 -661 R 0.064 -662 R 0.071 -663 K 0.082 -664 G 0.090 -665 S 0.095 -666 F 0.095 -667 I 0.092 -668 Q 0.087 -669 H 0.084 -670 S 0.084 -671 V 0.091 -672 S 0.102 -673 G 0.109 -674 L 0.104 -675 C 0.090 -676 L 0.077 -677 E 0.074 -678 T 0.080 -679 K 0.090 -680 P 0.101 -681 A 0.112 -682 Q 0.120 -683 L 0.122 -684 V 0.116 -685 T 0.111 -686 S 0.111 -687 K 0.113 -688 C 0.116 -689 Q 0.124 -690 T 0.139 -691 D 0.156 -692 A 0.161 -693 Q 0.147 -694 A 0.121 -695 Q 0.094 -696 Q 0.071 -697 W 0.057 -698 Q 0.057 -699 L 0.067 -700 L 0.078 -701 P 0.087 -702 H 0.096 -703 T 0.103 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021339.5_ENSMUST00000021772.4_GN:Mrs2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021339.5_ENSMUST00000021772.4_GN:Mrs2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 6933e43bdb67ae4335bd5fe89e973fe43753ac26..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021339.5_ENSMUST00000021772.4_GN:Mrs2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,435 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000021339.5|ENSMUST00000021772.4|GN:Mrs2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.389 -2 E 0.406 -3 C 0.429 -4 L 0.452 -5 R 0.473 -6 C 0.501 -7 L 0.540 -8 P 0.575 -9 G 0.591 -10 L 0.584 -11 L 0.570 -12 P 0.561 -13 R 0.559 -14 A 0.555 -15 A 0.544 -16 Q 0.532 -17 P 0.512 -18 R 0.466 -19 R 0.394 -20 A 0.324 -21 L 0.282 -22 W 0.267 -23 T 0.268 -24 A 0.271 -25 V 0.267 -26 A 0.262 -27 R 0.280 -28 L 0.331 -29 S 0.402 -30 L 0.470 -31 A 0.528 -32 A 0.580 -33 C 0.627 -34 G 0.663 -35 G 0.681 -36 R 0.681 -37 A 0.668 -38 T 0.657 -39 P 0.655 -40 L 0.655 -41 R 0.648 -42 S 0.632 -43 R 0.618 -44 S 0.624 -45 P 0.651 -46 K 0.688 -47 A 0.720 -48 S 0.738 -49 S 0.748 -50 T 0.753 -51 A 0.751 -52 R 0.743 -53 A 0.736 -54 A 0.730 -55 G 0.717 -56 D 0.688 -57 V 0.648 -58 L 0.617 -59 R 0.608 -60 F 0.613 -61 R 0.615 -62 T 0.610 -63 S 0.610 -64 D 0.621 -65 A 0.626 -66 S 0.611 -67 Q 0.589 -68 A 0.582 -69 T 0.583 -70 L 0.572 -71 A 0.549 -72 S 0.514 -73 V 0.448 -74 A 0.343 -75 Q 0.223 -76 V 0.125 -77 F 0.066 -78 A 0.039 -79 V 0.029 -80 T 0.025 -81 K 0.024 -82 F 0.025 -83 D 0.030 -84 K 0.041 -85 E 0.056 -86 G 0.069 -87 N 0.075 -88 V 0.074 -89 T 0.070 -90 S 0.064 -91 F 0.056 -92 E 0.047 -93 R 0.037 -94 K 0.030 -95 K 0.026 -96 T 0.026 -97 E 0.028 -98 L 0.030 -99 Y 0.033 -100 H 0.036 -101 E 0.041 -102 L 0.051 -103 A 0.065 -104 L 0.079 -105 Q 0.091 -106 A 0.099 -107 R 0.105 -108 D 0.110 -109 L 0.118 -110 R 0.129 -111 F 0.136 -112 Q 0.131 -113 H 0.113 -114 V 0.087 -115 M 0.064 -116 S 0.050 -117 I 0.045 -118 T 0.045 -119 T 0.049 -120 R 0.051 -121 N 0.049 -122 N 0.042 -123 R 0.035 -124 I 0.032 -125 I 0.031 -126 M 0.033 -127 R 0.035 -128 M 0.037 -129 E 0.038 -130 Y 0.040 -131 L 0.040 -132 K 0.040 -133 A 0.038 -134 V 0.035 -135 I 0.037 -136 T 0.044 -137 P 0.051 -138 E 0.053 -139 C 0.049 -140 L 0.045 -141 L 0.046 -142 I 0.052 -143 L 0.060 -144 D 0.067 -145 Y 0.071 -146 R 0.071 -147 N 0.066 -148 L 0.055 -149 N 0.043 -150 L 0.035 -151 E 0.034 -152 H 0.038 -153 W 0.042 -154 L 0.050 -155 F 0.060 -156 R 0.066 -157 E 0.065 -158 L 0.058 -159 P 0.054 -160 S 0.058 -161 Q 0.078 -162 L 0.125 -163 A 0.209 -164 G 0.315 -165 E 0.401 -166 G 0.435 -167 Q 0.423 -168 L 0.393 -169 V 0.364 -170 T 0.336 -171 Y 0.303 -172 P 0.260 -173 L 0.207 -174 P 0.154 -175 F 0.113 -176 E 0.091 -177 F 0.086 -178 R 0.091 -179 A 0.097 -180 I 0.100 -181 E 0.102 -182 A 0.111 -183 L 0.118 -184 L 0.112 -185 Q 0.092 -186 Y 0.072 -187 W 0.063 -188 I 0.063 -189 S 0.068 -190 T 0.081 -191 L 0.096 -192 R 0.107 -193 G 0.113 -194 R 0.117 -195 L 0.115 -196 S 0.109 -197 V 0.103 -198 L 0.099 -199 Q 0.091 -200 P 0.077 -201 L 0.064 -202 I 0.056 -203 L 0.053 -204 E 0.052 -205 T 0.058 -206 L 0.071 -207 D 0.089 -208 A 0.108 -209 L 0.135 -210 V 0.171 -211 D 0.207 -212 P 0.231 -213 K 0.246 -214 H 0.252 -215 S 0.247 -216 S 0.228 -217 V 0.195 -218 D 0.150 -219 R 0.107 -220 S 0.077 -221 K 0.064 -222 L 0.062 -223 H 0.065 -224 V 0.069 -225 L 0.071 -226 L 0.073 -227 Q 0.080 -228 N 0.097 -229 G 0.119 -230 K 0.141 -231 S 0.154 -232 L 0.150 -233 S 0.129 -234 E 0.109 -235 L 0.099 -236 E 0.096 -237 T 0.092 -238 D 0.082 -239 I 0.068 -240 K 0.054 -241 I 0.044 -242 F 0.038 -243 K 0.035 -244 E 0.034 -245 S 0.036 -246 I 0.039 -247 L 0.043 -248 E 0.048 -249 L 0.054 -250 L 0.059 -251 D 0.058 -252 E 0.051 -253 E 0.043 -254 E 0.035 -255 M 0.031 -256 L 0.031 -257 E 0.034 -258 E 0.038 -259 L 0.043 -260 C 0.051 -261 L 0.066 -262 T 0.089 -263 K 0.115 -264 W 0.141 -265 S 0.169 -266 D 0.200 -267 P 0.229 -268 H 0.253 -269 V 0.275 -270 F 0.306 -271 E 0.347 -272 K 0.387 -273 S 0.418 -274 S 0.432 -275 T 0.421 -276 G 0.380 -277 I 0.319 -278 D 0.248 -279 H 0.182 -280 A 0.132 -281 E 0.100 -282 E 0.089 -283 M 0.090 -284 E 0.093 -285 L 0.091 -286 L 0.085 -287 L 0.079 -288 E 0.074 -289 N 0.072 -290 Y 0.077 -291 Y 0.088 -292 R 0.098 -293 L 0.102 -294 A 0.102 -295 E 0.105 -296 D 0.112 -297 L 0.120 -298 S 0.126 -299 N 0.131 -300 E 0.136 -301 A 0.138 -302 R 0.141 -303 E 0.146 -304 L 0.147 -305 R 0.140 -306 V 0.129 -307 L 0.121 -308 I 0.117 -309 D 0.117 -310 D 0.118 -311 S 0.116 -312 Q 0.110 -313 S 0.101 -314 I 0.093 -315 I 0.091 -316 F 0.096 -317 I 0.101 -318 N 0.110 -319 L 0.131 -320 D 0.160 -321 S 0.185 -322 H 0.198 -323 R 0.209 -324 N 0.217 -325 V 0.218 -326 M 0.214 -327 M 0.213 -328 R 0.216 -329 L 0.219 -330 N 0.218 -331 L 0.209 -332 Q 0.194 -333 L 0.181 -334 T 0.179 -335 M 0.188 -336 G 0.198 -337 T 0.197 -338 F 0.183 -339 S 0.169 -340 L 0.162 -341 S 0.157 -342 L 0.151 -343 F 0.146 -344 G 0.144 -345 L 0.149 -346 M 0.166 -347 G 0.194 -348 V 0.224 -349 A 0.253 -350 F 0.279 -351 G 0.291 -352 M 0.283 -353 N 0.270 -354 L 0.269 -355 E 0.280 -356 S 0.294 -357 S 0.302 -358 L 0.301 -359 E 0.293 -360 E 0.276 -361 D 0.243 -362 H 0.197 -363 R 0.151 -364 V 0.119 -365 F 0.099 -366 W 0.089 -367 L 0.094 -368 V 0.110 -369 T 0.124 -370 G 0.121 -371 I 0.111 -372 M 0.106 -373 F 0.109 -374 M 0.113 -375 G 0.112 -376 S 0.104 -377 G 0.092 -378 L 0.081 -379 I 0.072 -380 W 0.065 -381 R 0.059 -382 R 0.058 -383 L 0.067 -384 L 0.083 -385 S 0.105 -386 F 0.131 -387 L 0.161 -388 G 0.193 -389 R 0.231 -390 Q 0.276 -391 L 0.329 -392 E 0.383 -393 A 0.438 -394 P 0.489 -395 V 0.539 -396 P 0.590 -397 P 0.638 -398 V 0.669 -399 M 0.671 -400 T 0.653 -401 S 0.632 -402 L 0.616 -403 P 0.605 -404 K 0.597 -405 K 0.586 -406 T 0.558 -407 L 0.515 -408 L 0.483 -409 A 0.479 -410 N 0.487 -411 R 0.491 -412 R 0.509 -413 M 0.554 -414 D 0.601 -415 V 0.620 -416 K 0.614 -417 N 0.603 -418 S 0.594 -419 L 0.588 -420 R 0.595 -421 P 0.629 -422 E 0.679 -423 G 0.721 -424 L 0.743 -425 G 0.744 -426 A 0.724 -427 S 0.676 -428 R 0.613 -429 T 0.583 -430 I 0.609 -431 L 0.646 -432 A 0.634 -433 S 0.572 -434 R 0.512 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021339.5_ENSMUST00000021772.4_GN:Mrs2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:45.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021339.5_ENSMUST00000021772.4_GN:Mrs2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:45.caid deleted file mode 100644 index 4ce1badc8daae779b46c7a39a42791ac625c44d2..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021339.5_ENSMUST00000021772.4_GN:Mrs2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:45.caid +++ /dev/null @@ -1,480 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000021339.5|ENSMUST00000021772.4|GN:Mrs2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:45 -1 M 0.402 -2 R 0.416 -3 G 0.435 -4 R 0.442 -5 Q 0.437 -6 R 0.447 -7 A 0.503 -8 G 0.579 -9 A 0.622 -10 G 0.611 -11 R 0.565 -12 L 0.514 -13 A 0.477 -14 Q 0.458 -15 A 0.448 -16 R 0.440 -17 C 0.434 -18 A 0.429 -19 V 0.427 -20 V 0.428 -21 A 0.429 -22 V 0.427 -23 S 0.426 -24 R 0.436 -25 L 0.460 -26 T 0.498 -27 R 0.550 -28 V 0.605 -29 P 0.652 -30 A 0.681 -31 C 0.695 -32 R 0.704 -33 T 0.717 -34 G 0.736 -35 V 0.750 -36 L 0.749 -37 G 0.730 -38 R 0.699 -39 L 0.671 -40 P 0.660 -41 G 0.669 -42 C 0.687 -43 P 0.705 -44 R 0.717 -45 A 0.720 -46 M 0.715 -47 E 0.701 -48 C 0.674 -49 L 0.639 -50 R 0.618 -51 C 0.628 -52 L 0.658 -53 P 0.686 -54 G 0.701 -55 L 0.698 -56 L 0.688 -57 P 0.686 -58 R 0.694 -59 A 0.699 -60 A 0.696 -61 Q 0.687 -62 P 0.679 -63 R 0.669 -64 R 0.652 -65 A 0.616 -66 L 0.554 -67 W 0.488 -68 T 0.452 -69 A 0.445 -70 V 0.435 -71 A 0.421 -72 R 0.436 -73 L 0.499 -74 S 0.581 -75 L 0.645 -76 A 0.684 -77 A 0.708 -78 C 0.724 -79 G 0.735 -80 G 0.740 -81 R 0.735 -82 A 0.723 -83 T 0.714 -84 P 0.711 -85 L 0.711 -86 R 0.701 -87 S 0.683 -88 R 0.667 -89 S 0.669 -90 P 0.692 -91 K 0.726 -92 A 0.754 -93 S 0.769 -94 S 0.777 -95 T 0.777 -96 A 0.770 -97 R 0.759 -98 A 0.751 -99 A 0.743 -100 G 0.727 -101 D 0.691 -102 V 0.640 -103 L 0.596 -104 R 0.579 -105 F 0.582 -106 R 0.587 -107 T 0.584 -108 S 0.581 -109 D 0.582 -110 A 0.572 -111 S 0.541 -112 Q 0.506 -113 A 0.490 -114 T 0.485 -115 L 0.470 -116 A 0.447 -117 S 0.422 -118 V 0.375 -119 A 0.294 -120 Q 0.196 -121 V 0.113 -122 F 0.061 -123 A 0.036 -124 V 0.027 -125 T 0.024 -126 K 0.023 -127 F 0.024 -128 D 0.029 -129 K 0.039 -130 E 0.054 -131 G 0.069 -132 N 0.077 -133 V 0.079 -134 T 0.076 -135 S 0.071 -136 F 0.063 -137 E 0.052 -138 R 0.040 -139 K 0.031 -140 K 0.027 -141 T 0.027 -142 E 0.029 -143 L 0.031 -144 Y 0.034 -145 H 0.037 -146 E 0.044 -147 L 0.055 -148 A 0.070 -149 L 0.083 -150 Q 0.091 -151 A 0.096 -152 R 0.102 -153 D 0.108 -154 L 0.116 -155 R 0.128 -156 F 0.137 -157 Q 0.134 -158 H 0.116 -159 V 0.091 -160 M 0.067 -161 S 0.053 -162 I 0.048 -163 T 0.050 -164 T 0.055 -165 R 0.058 -166 N 0.056 -167 N 0.048 -168 R 0.040 -169 I 0.036 -170 I 0.035 -171 M 0.037 -172 R 0.039 -173 M 0.040 -174 E 0.041 -175 Y 0.043 -176 L 0.043 -177 K 0.043 -178 A 0.041 -179 V 0.038 -180 I 0.039 -181 T 0.045 -182 P 0.052 -183 E 0.053 -184 C 0.049 -185 L 0.044 -186 L 0.046 -187 I 0.051 -188 L 0.057 -189 D 0.062 -190 Y 0.064 -191 R 0.064 -192 N 0.059 -193 L 0.049 -194 N 0.038 -195 L 0.031 -196 E 0.030 -197 H 0.033 -198 W 0.037 -199 L 0.045 -200 F 0.055 -201 R 0.062 -202 E 0.061 -203 L 0.055 -204 P 0.051 -205 S 0.054 -206 Q 0.073 -207 L 0.119 -208 A 0.199 -209 G 0.297 -210 E 0.375 -211 G 0.403 -212 Q 0.387 -213 L 0.356 -214 V 0.330 -215 T 0.308 -216 Y 0.280 -217 P 0.240 -218 L 0.192 -219 P 0.143 -220 F 0.105 -221 E 0.085 -222 F 0.081 -223 R 0.086 -224 A 0.094 -225 I 0.097 -226 E 0.099 -227 A 0.106 -228 L 0.115 -229 L 0.110 -230 Q 0.091 -231 Y 0.071 -232 W 0.062 -233 I 0.062 -234 S 0.068 -235 T 0.081 -236 L 0.096 -237 R 0.106 -238 G 0.113 -239 R 0.117 -240 L 0.115 -241 S 0.108 -242 V 0.101 -243 L 0.095 -244 Q 0.086 -245 P 0.073 -246 L 0.060 -247 I 0.053 -248 L 0.050 -249 E 0.049 -250 T 0.054 -251 L 0.067 -252 D 0.084 -253 A 0.103 -254 L 0.128 -255 V 0.163 -256 D 0.198 -257 P 0.222 -258 K 0.236 -259 H 0.244 -260 S 0.242 -261 S 0.226 -262 V 0.196 -263 D 0.152 -264 R 0.108 -265 S 0.078 -266 K 0.064 -267 L 0.061 -268 H 0.063 -269 V 0.067 -270 L 0.070 -271 L 0.073 -272 Q 0.082 -273 N 0.098 -274 G 0.120 -275 K 0.142 -276 S 0.155 -277 L 0.151 -278 S 0.130 -279 E 0.109 -280 L 0.099 -281 E 0.096 -282 T 0.091 -283 D 0.082 -284 I 0.068 -285 K 0.054 -286 I 0.044 -287 F 0.038 -288 K 0.035 -289 E 0.034 -290 S 0.036 -291 I 0.039 -292 L 0.043 -293 E 0.049 -294 L 0.056 -295 L 0.062 -296 D 0.062 -297 E 0.056 -298 E 0.047 -299 E 0.038 -300 M 0.033 -301 L 0.033 -302 E 0.036 -303 E 0.039 -304 L 0.043 -305 C 0.050 -306 L 0.065 -307 T 0.088 -308 K 0.115 -309 W 0.144 -310 S 0.174 -311 D 0.205 -312 P 0.236 -313 H 0.260 -314 V 0.282 -315 F 0.313 -316 E 0.353 -317 K 0.395 -318 S 0.427 -319 S 0.441 -320 T 0.428 -321 G 0.385 -322 I 0.321 -323 D 0.250 -324 H 0.184 -325 A 0.134 -326 E 0.103 -327 E 0.089 -328 M 0.084 -329 E 0.081 -330 L 0.075 -331 L 0.072 -332 L 0.074 -333 E 0.075 -334 N 0.075 -335 Y 0.080 -336 Y 0.090 -337 R 0.100 -338 L 0.103 -339 A 0.104 -340 E 0.108 -341 D 0.116 -342 L 0.124 -343 S 0.130 -344 N 0.135 -345 E 0.141 -346 A 0.144 -347 R 0.147 -348 E 0.153 -349 L 0.154 -350 R 0.147 -351 V 0.136 -352 L 0.126 -353 I 0.122 -354 D 0.122 -355 D 0.124 -356 S 0.123 -357 Q 0.116 -358 S 0.106 -359 I 0.096 -360 I 0.093 -361 F 0.096 -362 I 0.102 -363 N 0.112 -364 L 0.133 -365 D 0.163 -366 S 0.188 -367 H 0.203 -368 R 0.214 -369 N 0.223 -370 V 0.223 -371 M 0.217 -372 M 0.215 -373 R 0.218 -374 L 0.221 -375 N 0.220 -376 L 0.212 -377 Q 0.198 -378 L 0.186 -379 T 0.185 -380 M 0.196 -381 G 0.207 -382 T 0.203 -383 F 0.188 -384 S 0.173 -385 L 0.166 -386 S 0.160 -387 L 0.153 -388 F 0.146 -389 G 0.143 -390 L 0.148 -391 M 0.165 -392 G 0.192 -393 V 0.221 -394 A 0.248 -395 F 0.271 -396 G 0.281 -397 M 0.271 -398 N 0.256 -399 L 0.253 -400 E 0.265 -401 S 0.279 -402 S 0.288 -403 L 0.288 -404 E 0.281 -405 E 0.264 -406 D 0.232 -407 H 0.187 -408 R 0.143 -409 V 0.112 -410 F 0.093 -411 W 0.084 -412 L 0.090 -413 V 0.107 -414 T 0.121 -415 G 0.119 -416 I 0.109 -417 M 0.106 -418 F 0.109 -419 M 0.113 -420 G 0.111 -421 S 0.103 -422 G 0.090 -423 L 0.078 -424 I 0.070 -425 W 0.063 -426 R 0.058 -427 R 0.058 -428 L 0.066 -429 L 0.082 -430 S 0.104 -431 F 0.129 -432 L 0.159 -433 G 0.193 -434 R 0.230 -435 Q 0.274 -436 L 0.326 -437 E 0.382 -438 A 0.439 -439 P 0.493 -440 V 0.545 -441 P 0.596 -442 P 0.643 -443 V 0.673 -444 M 0.675 -445 T 0.658 -446 S 0.639 -447 L 0.624 -448 P 0.615 -449 K 0.610 -450 K 0.603 -451 T 0.576 -452 L 0.533 -453 L 0.501 -454 A 0.498 -455 N 0.507 -456 R 0.514 -457 R 0.533 -458 M 0.578 -459 D 0.623 -460 V 0.644 -461 K 0.641 -462 N 0.633 -463 S 0.624 -464 L 0.614 -465 R 0.618 -466 P 0.649 -467 E 0.697 -468 G 0.737 -469 L 0.757 -470 G 0.758 -471 A 0.738 -472 S 0.690 -473 R 0.626 -474 T 0.594 -475 I 0.621 -476 L 0.658 -477 A 0.649 -478 S 0.588 -479 R 0.528 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021423.7_ENSMUST00000021860.7_GN:Ly86_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021423.7_ENSMUST00000021860.7_GN:Ly86_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index c9bb19d0e10c3078425363095c783a462f8c804d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021423.7_ENSMUST00000021860.7_GN:Ly86_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,163 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000021423.7|ENSMUST00000021860.7|GN:Ly86|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.420 -2 N 0.447 -3 G 0.473 -4 V 0.460 -5 A 0.397 -6 A 0.319 -7 A 0.274 -8 L 0.267 -9 L 0.270 -10 V 0.273 -11 W 0.287 -12 I 0.315 -13 L 0.352 -14 T 0.400 -15 S 0.463 -16 P 0.528 -17 S 0.575 -18 S 0.605 -19 S 0.634 -20 D 0.663 -21 H 0.680 -22 G 0.675 -23 S 0.646 -24 E 0.596 -25 N 0.529 -26 G 0.453 -27 W 0.375 -28 P 0.300 -29 K 0.229 -30 H 0.171 -31 T 0.134 -32 A 0.116 -33 C 0.113 -34 N 0.125 -35 S 0.144 -36 G 0.154 -37 G 0.148 -38 L 0.132 -39 E 0.115 -40 V 0.098 -41 V 0.084 -42 Y 0.074 -43 Q 0.074 -44 S 0.084 -45 C 0.100 -46 D 0.117 -47 P 0.130 -48 L 0.137 -49 Q 0.137 -50 D 0.125 -51 F 0.102 -52 G 0.078 -53 L 0.060 -54 S 0.053 -55 I 0.055 -56 D 0.060 -57 Q 0.064 -58 C 0.065 -59 S 0.064 -60 K 0.065 -61 Q 0.067 -62 I 0.067 -63 Q 0.062 -64 S 0.055 -65 N 0.048 -66 L 0.042 -67 N 0.038 -68 I 0.036 -69 R 0.033 -70 F 0.031 -71 G 0.032 -72 I 0.039 -73 I 0.051 -74 L 0.062 -75 R 0.065 -76 Q 0.058 -77 D 0.046 -78 I 0.034 -79 R 0.027 -80 K 0.023 -81 L 0.021 -82 F 0.021 -83 L 0.022 -84 D 0.023 -85 I 0.023 -86 T 0.024 -87 L 0.030 -88 M 0.041 -89 A 0.055 -90 K 0.065 -91 G 0.070 -92 S 0.070 -93 S 0.067 -94 I 0.061 -95 L 0.056 -96 N 0.054 -97 Y 0.053 -98 S 0.053 -99 Y 0.056 -100 P 0.063 -101 L 0.076 -102 C 0.096 -103 E 0.119 -104 E 0.140 -105 D 0.151 -106 Q 0.148 -107 P 0.137 -108 K 0.122 -109 F 0.109 -110 S 0.099 -111 F 0.093 -112 C 0.090 -113 G 0.089 -114 R 0.088 -115 R 0.091 -116 K 0.096 -117 G 0.098 -118 E 0.092 -119 Q 0.078 -120 I 0.059 -121 Y 0.047 -122 Y 0.045 -123 A 0.054 -124 G 0.066 -125 P 0.076 -126 V 0.090 -127 N 0.111 -128 N 0.138 -129 P 0.160 -130 G 0.174 -131 L 0.177 -132 D 0.171 -133 V 0.160 -134 P 0.151 -135 Q 0.138 -136 G 0.116 -137 E 0.089 -138 Y 0.064 -139 Q 0.046 -140 L 0.033 -141 L 0.024 -142 L 0.019 -143 E 0.016 -144 L 0.016 -145 Y 0.020 -146 N 0.027 -147 E 0.035 -148 N 0.040 -149 R 0.040 -150 A 0.035 -151 T 0.028 -152 V 0.022 -153 A 0.018 -154 C 0.017 -155 A 0.019 -156 N 0.021 -157 A 0.025 -158 T 0.033 -159 V 0.049 -160 T 0.074 -161 S 0.105 -162 S 0.127 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021423.7_ENSMUST00000021860.7_GN:Ly86_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:77.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021423.7_ENSMUST00000021860.7_GN:Ly86_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:77.caid deleted file mode 100644 index d15ee458361eefd92f0a4441d4490001c0d2c964..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021423.7_ENSMUST00000021860.7_GN:Ly86_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:77.caid +++ /dev/null @@ -1,240 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000021423.7|ENSMUST00000021860.7|GN:Ly86|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:77 -1 M 0.380 -2 R 0.404 -3 A 0.433 -4 R 0.443 -5 A 0.423 -6 H 0.395 -7 T 0.378 -8 H 0.357 -9 T 0.320 -10 C 0.282 -11 Y 0.260 -12 F 0.255 -13 K 0.260 -14 Y 0.278 -15 V 0.310 -16 K 0.357 -17 A 0.405 -18 P 0.440 -19 W 0.455 -20 N 0.461 -21 S 0.469 -22 I 0.481 -23 Q 0.495 -24 M 0.518 -25 P 0.550 -26 L 0.577 -27 P 0.586 -28 A 0.569 -29 V 0.520 -30 C 0.458 -31 L 0.408 -32 C 0.373 -33 L 0.342 -34 L 0.311 -35 T 0.287 -36 V 0.280 -37 Y 0.300 -38 F 0.340 -39 P 0.376 -40 E 0.385 -41 T 0.366 -42 S 0.343 -43 I 0.336 -44 R 0.358 -45 E 0.405 -46 V 0.454 -47 K 0.488 -48 L 0.517 -49 N 0.546 -50 I 0.559 -51 L 0.553 -52 L 0.546 -53 L 0.556 -54 Q 0.581 -55 G 0.601 -56 E 0.596 -57 D 0.562 -58 E 0.513 -59 L 0.464 -60 R 0.438 -61 R 0.452 -62 S 0.490 -63 F 0.520 -64 Y 0.538 -65 W 0.563 -66 A 0.599 -67 G 0.632 -68 L 0.655 -69 P 0.672 -70 L 0.680 -71 G 0.671 -72 T 0.651 -73 H 0.641 -74 N 0.652 -75 P 0.678 -76 L 0.705 -77 A 0.723 -78 M 0.730 -79 N 0.731 -80 G 0.720 -81 V 0.683 -82 A 0.612 -83 A 0.527 -84 A 0.470 -85 L 0.458 -86 L 0.458 -87 V 0.430 -88 W 0.386 -89 I 0.359 -90 L 0.364 -91 T 0.403 -92 S 0.475 -93 P 0.558 -94 S 0.628 -95 S 0.671 -96 S 0.698 -97 D 0.718 -98 H 0.726 -99 G 0.712 -100 S 0.676 -101 E 0.622 -102 N 0.553 -103 G 0.475 -104 W 0.395 -105 P 0.316 -106 K 0.242 -107 H 0.183 -108 T 0.146 -109 A 0.129 -110 C 0.125 -111 N 0.133 -112 S 0.148 -113 G 0.156 -114 G 0.147 -115 L 0.127 -116 E 0.106 -117 V 0.086 -118 V 0.071 -119 Y 0.063 -120 Q 0.063 -121 S 0.071 -122 C 0.084 -123 D 0.100 -124 P 0.115 -125 L 0.126 -126 Q 0.128 -127 D 0.117 -128 F 0.093 -129 G 0.068 -130 L 0.051 -131 S 0.044 -132 I 0.045 -133 D 0.050 -134 Q 0.056 -135 C 0.058 -136 S 0.059 -137 K 0.060 -138 Q 0.064 -139 I 0.066 -140 Q 0.064 -141 S 0.058 -142 N 0.052 -143 L 0.045 -144 N 0.040 -145 I 0.035 -146 R 0.032 -147 F 0.029 -148 G 0.030 -149 I 0.036 -150 I 0.046 -151 L 0.056 -152 R 0.060 -153 Q 0.055 -154 D 0.044 -155 I 0.034 -156 R 0.027 -157 K 0.024 -158 L 0.022 -159 F 0.021 -160 L 0.021 -161 D 0.022 -162 I 0.024 -163 T 0.026 -164 L 0.032 -165 M 0.043 -166 A 0.056 -167 K 0.064 -168 G 0.069 -169 S 0.070 -170 S 0.068 -171 I 0.064 -172 L 0.061 -173 N 0.060 -174 Y 0.059 -175 S 0.059 -176 Y 0.061 -177 P 0.069 -178 L 0.081 -179 C 0.100 -180 E 0.123 -181 E 0.143 -182 D 0.153 -183 Q 0.150 -184 P 0.138 -185 K 0.121 -186 F 0.106 -187 S 0.095 -188 F 0.090 -189 C 0.089 -190 G 0.089 -191 R 0.089 -192 R 0.092 -193 K 0.096 -194 G 0.097 -195 E 0.088 -196 Q 0.071 -197 I 0.054 -198 Y 0.043 -199 Y 0.043 -200 A 0.052 -201 G 0.064 -202 P 0.074 -203 V 0.088 -204 N 0.111 -205 N 0.137 -206 P 0.157 -207 G 0.168 -208 L 0.169 -209 D 0.160 -210 V 0.151 -211 P 0.143 -212 Q 0.134 -213 G 0.115 -214 E 0.089 -215 Y 0.065 -216 Q 0.046 -217 L 0.032 -218 L 0.023 -219 L 0.018 -220 E 0.015 -221 L 0.015 -222 Y 0.018 -223 N 0.025 -224 E 0.033 -225 N 0.037 -226 R 0.036 -227 A 0.031 -228 T 0.025 -229 V 0.020 -230 A 0.017 -231 C 0.017 -232 A 0.019 -233 N 0.021 -234 A 0.025 -235 T 0.032 -236 V 0.047 -237 T 0.072 -238 S 0.103 -239 S 0.125 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021595.19_ENSMUST00000109699.11_GN:Nsun2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021595.19_ENSMUST00000109699.11_GN:Nsun2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 3bc0c15ec14f43cadbe56f7cc3d6b37cd16a43f4..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021595.19_ENSMUST00000109699.11_GN:Nsun2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,758 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000021595.19|ENSMUST00000109699.11|GN:Nsun2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.359 -2 G 0.379 -3 R 0.408 -4 R 0.430 -5 A 0.439 -6 R 0.444 -7 G 0.454 -8 R 0.456 -9 R 0.430 -10 F 0.386 -11 Q 0.357 -12 Q 0.361 -13 P 0.385 -14 P 0.415 -15 Q 0.458 -16 P 0.516 -17 E 0.571 -18 G 0.611 -19 E 0.627 -20 E 0.610 -21 D 0.567 -22 A 0.540 -23 S 0.564 -24 D 0.620 -25 G 0.658 -26 G 0.665 -27 R 0.658 -28 K 0.655 -29 R 0.661 -30 G 0.669 -31 Q 0.667 -32 A 0.650 -33 G 0.619 -34 W 0.588 -35 E 0.565 -36 G 0.547 -37 G 0.528 -38 Y 0.503 -39 P 0.465 -40 E 0.412 -41 I 0.346 -42 V 0.278 -43 K 0.221 -44 E 0.174 -45 N 0.131 -46 K 0.092 -47 L 0.064 -48 F 0.048 -49 E 0.038 -50 H 0.031 -51 Y 0.028 -52 Y 0.030 -53 Q 0.038 -54 E 0.050 -55 L 0.067 -56 K 0.089 -57 I 0.111 -58 V 0.124 -59 P 0.124 -60 E 0.114 -61 G 0.099 -62 E 0.084 -63 W 0.075 -64 D 0.077 -65 Q 0.088 -66 F 0.101 -67 M 0.112 -68 E 0.118 -69 S 0.122 -70 L 0.131 -71 R 0.143 -72 E 0.147 -73 P 0.136 -74 L 0.115 -75 P 0.092 -76 A 0.075 -77 T 0.067 -78 L 0.069 -79 R 0.077 -80 I 0.089 -81 T 0.097 -82 G 0.093 -83 Y 0.080 -84 K 0.066 -85 S 0.057 -86 H 0.053 -87 A 0.051 -88 K 0.050 -89 E 0.050 -90 I 0.055 -91 L 0.065 -92 H 0.074 -93 C 0.076 -94 L 0.072 -95 K 0.064 -96 N 0.056 -97 K 0.048 -98 Y 0.042 -99 F 0.039 -100 K 0.042 -101 E 0.053 -102 L 0.068 -103 E 0.082 -104 D 0.092 -105 L 0.102 -106 E 0.114 -107 V 0.127 -108 D 0.141 -109 G 0.154 -110 Q 0.160 -111 K 0.149 -112 V 0.122 -113 E 0.094 -114 V 0.078 -115 P 0.071 -116 Q 0.068 -117 P 0.067 -118 L 0.064 -119 S 0.058 -120 W 0.055 -121 Y 0.056 -122 P 0.060 -123 E 0.059 -124 E 0.052 -125 L 0.041 -126 A 0.030 -127 W 0.024 -128 H 0.024 -129 T 0.031 -130 N 0.040 -131 L 0.047 -132 S 0.051 -133 R 0.054 -134 K 0.061 -135 I 0.072 -136 L 0.083 -137 R 0.091 -138 K 0.094 -139 S 0.088 -140 P 0.073 -141 L 0.057 -142 L 0.046 -143 A 0.043 -144 K 0.047 -145 F 0.058 -146 H 0.070 -147 Q 0.077 -148 F 0.076 -149 L 0.070 -150 V 0.064 -151 S 0.060 -152 E 0.057 -153 T 0.056 -154 E 0.057 -155 S 0.061 -156 G 0.066 -157 N 0.070 -158 I 0.074 -159 S 0.079 -160 R 0.084 -161 Q 0.088 -162 E 0.092 -163 A 0.097 -164 V 0.105 -165 S 0.112 -166 M 0.109 -167 I 0.095 -168 P 0.082 -169 P 0.076 -170 L 0.074 -171 L 0.070 -172 L 0.065 -173 N 0.064 -174 V 0.068 -175 E 0.074 -176 P 0.075 -177 H 0.073 -178 H 0.071 -179 K 0.070 -180 I 0.069 -181 L 0.065 -182 D 0.062 -183 M 0.060 -184 C 0.059 -185 A 0.056 -186 A 0.054 -187 P 0.057 -188 G 0.064 -189 S 0.070 -190 K 0.072 -191 T 0.073 -192 T 0.077 -193 Q 0.081 -194 L 0.080 -195 I 0.074 -196 E 0.071 -197 M 0.070 -198 L 0.069 -199 H 0.066 -200 A 0.067 -201 D 0.072 -202 M 0.078 -203 S 0.082 -204 V 0.084 -205 P 0.087 -206 F 0.090 -207 P 0.090 -208 E 0.086 -209 G 0.083 -210 F 0.082 -211 V 0.080 -212 I 0.075 -213 A 0.070 -214 N 0.071 -215 D 0.076 -216 V 0.075 -217 D 0.066 -218 N 0.057 -219 K 0.054 -220 R 0.056 -221 C 0.056 -222 Y 0.054 -223 L 0.056 -224 L 0.057 -225 V 0.055 -226 H 0.051 -227 Q 0.049 -228 A 0.047 -229 K 0.044 -230 R 0.043 -231 L 0.050 -232 S 0.061 -233 S 0.069 -234 P 0.067 -235 C 0.058 -236 I 0.052 -237 M 0.054 -238 V 0.060 -239 V 0.064 -240 N 0.065 -241 H 0.062 -242 D 0.062 -243 A 0.064 -244 S 0.067 -245 S 0.070 -246 I 0.073 -247 P 0.072 -248 R 0.069 -249 L 0.065 -250 T 0.067 -251 V 0.080 -252 D 0.106 -253 V 0.136 -254 D 0.155 -255 G 0.161 -256 R 0.156 -257 K 0.140 -258 E 0.116 -259 I 0.089 -260 L 0.063 -261 F 0.043 -262 Y 0.033 -263 D 0.030 -264 R 0.031 -265 I 0.036 -266 L 0.046 -267 C 0.059 -268 D 0.078 -269 V 0.103 -270 P 0.125 -271 C 0.139 -272 S 0.143 -273 G 0.138 -274 D 0.129 -275 G 0.124 -276 T 0.125 -277 M 0.127 -278 R 0.129 -279 K 0.132 -280 N 0.134 -281 I 0.135 -282 D 0.135 -283 V 0.130 -284 W 0.114 -285 K 0.098 -286 K 0.090 -287 W 0.089 -288 T 0.088 -289 T 0.090 -290 L 0.098 -291 N 0.108 -292 S 0.111 -293 L 0.107 -294 Q 0.107 -295 L 0.109 -296 H 0.103 -297 G 0.092 -298 L 0.082 -299 Q 0.075 -300 L 0.066 -301 R 0.058 -302 I 0.054 -303 A 0.051 -304 T 0.047 -305 R 0.046 -306 G 0.048 -307 A 0.051 -308 E 0.055 -309 Q 0.059 -310 L 0.065 -311 A 0.071 -312 E 0.074 -313 G 0.072 -314 G 0.071 -315 R 0.076 -316 M 0.084 -317 V 0.085 -318 Y 0.076 -319 S 0.066 -320 T 0.060 -321 C 0.060 -322 S 0.064 -323 L 0.067 -324 N 0.070 -325 P 0.075 -326 V 0.079 -327 E 0.075 -328 D 0.066 -329 E 0.062 -330 A 0.068 -331 V 0.073 -332 I 0.071 -333 A 0.063 -334 A 0.058 -335 L 0.057 -336 L 0.053 -337 E 0.049 -338 K 0.050 -339 S 0.059 -340 E 0.068 -341 G 0.068 -342 A 0.063 -343 L 0.061 -344 E 0.066 -345 L 0.071 -346 A 0.072 -347 D 0.068 -348 V 0.065 -349 S 0.067 -350 A 0.068 -351 E 0.066 -352 L 0.066 -353 P 0.074 -354 G 0.087 -355 L 0.101 -356 K 0.113 -357 W 0.128 -358 M 0.142 -359 P 0.148 -360 G 0.141 -361 V 0.128 -362 S 0.116 -363 Q 0.106 -364 W 0.092 -365 K 0.077 -366 V 0.063 -367 M 0.055 -368 T 0.054 -369 R 0.062 -370 D 0.078 -371 G 0.095 -372 Q 0.107 -373 W 0.111 -374 F 0.106 -375 A 0.096 -376 D 0.084 -377 W 0.077 -378 H 0.083 -379 E 0.101 -380 V 0.122 -381 P 0.139 -382 Q 0.147 -383 G 0.146 -384 R 0.139 -385 H 0.138 -386 T 0.145 -387 Q 0.154 -388 I 0.153 -389 R 0.141 -390 P 0.126 -391 T 0.115 -392 M 0.113 -393 F 0.119 -394 P 0.128 -395 P 0.127 -396 T 0.111 -397 D 0.088 -398 L 0.070 -399 E 0.060 -400 K 0.059 -401 L 0.066 -402 Q 0.077 -403 A 0.090 -404 M 0.098 -405 H 0.101 -406 L 0.102 -407 E 0.104 -408 R 0.104 -409 C 0.108 -410 L 0.115 -411 R 0.120 -412 I 0.114 -413 L 0.103 -414 P 0.099 -415 H 0.107 -416 H 0.118 -417 Q 0.122 -418 N 0.118 -419 T 0.113 -420 G 0.111 -421 G 0.111 -422 F 0.107 -423 F 0.098 -424 V 0.085 -425 A 0.074 -426 V 0.068 -427 L 0.069 -428 V 0.075 -429 K 0.086 -430 K 0.101 -431 A 0.114 -432 P 0.125 -433 M 0.140 -434 P 0.170 -435 W 0.222 -436 N 0.291 -437 K 0.363 -438 R 0.428 -439 Q 0.487 -440 P 0.544 -441 K 0.595 -442 V 0.633 -443 Q 0.656 -444 N 0.665 -445 K 0.661 -446 S 0.650 -447 A 0.637 -448 E 0.623 -449 A 0.605 -450 R 0.591 -451 E 0.591 -452 P 0.599 -453 R 0.604 -454 V 0.601 -455 S 0.597 -456 S 0.591 -457 H 0.569 -458 V 0.530 -459 A 0.511 -460 A 0.542 -461 T 0.600 -462 E 0.642 -463 G 0.659 -464 N 0.665 -465 P 0.672 -466 S 0.670 -467 D 0.640 -468 Q 0.576 -469 S 0.493 -470 E 0.432 -471 L 0.421 -472 E 0.436 -473 S 0.439 -474 Q 0.438 -475 M 0.467 -476 I 0.533 -477 T 0.610 -478 G 0.672 -479 A 0.707 -480 G 0.719 -481 D 0.714 -482 S 0.687 -483 E 0.631 -484 T 0.558 -485 A 0.504 -486 H 0.474 -487 N 0.436 -488 T 0.391 -489 E 0.388 -490 N 0.428 -491 T 0.464 -492 E 0.493 -493 S 0.543 -494 N 0.605 -495 E 0.652 -496 K 0.687 -497 K 0.719 -498 D 0.742 -499 G 0.744 -500 V 0.720 -501 C 0.683 -502 G 0.650 -503 P 0.635 -504 P 0.638 -505 P 0.648 -506 S 0.652 -507 K 0.648 -508 K 0.636 -509 M 0.617 -510 K 0.591 -511 L 0.559 -512 F 0.519 -513 G 0.471 -514 F 0.419 -515 K 0.367 -516 E 0.314 -517 D 0.266 -518 P 0.222 -519 F 0.181 -520 V 0.147 -521 F 0.128 -522 I 0.123 -523 P 0.121 -524 E 0.115 -525 D 0.104 -526 D 0.091 -527 P 0.078 -528 L 0.067 -529 F 0.059 -530 P 0.055 -531 P 0.055 -532 I 0.058 -533 E 0.065 -534 K 0.073 -535 F 0.079 -536 Y 0.080 -537 A 0.081 -538 L 0.086 -539 D 0.094 -540 P 0.101 -541 S 0.103 -542 F 0.096 -543 P 0.083 -544 R 0.072 -545 M 0.066 -546 N 0.060 -547 L 0.050 -548 L 0.042 -549 T 0.043 -550 R 0.053 -551 T 0.067 -552 T 0.085 -553 E 0.106 -554 G 0.125 -555 K 0.129 -556 K 0.121 -557 R 0.109 -558 Q 0.095 -559 L 0.079 -560 Y 0.067 -561 M 0.064 -562 V 0.067 -563 S 0.070 -564 K 0.064 -565 E 0.054 -566 L 0.047 -567 R 0.045 -568 N 0.048 -569 V 0.056 -570 L 0.072 -571 L 0.094 -572 N 0.113 -573 N 0.124 -574 S 0.134 -575 E 0.146 -576 K 0.157 -577 M 0.167 -578 K 0.178 -579 V 0.185 -580 I 0.180 -581 N 0.163 -582 T 0.140 -583 G 0.120 -584 I 0.109 -585 K 0.105 -586 V 0.107 -587 W 0.112 -588 C 0.124 -589 R 0.148 -590 N 0.183 -591 N 0.223 -592 S 0.256 -593 G 0.270 -594 E 0.259 -595 E 0.231 -596 F 0.198 -597 D 0.168 -598 C 0.139 -599 A 0.115 -600 F 0.100 -601 R 0.095 -602 L 0.099 -603 A 0.106 -604 Q 0.107 -605 E 0.096 -606 G 0.083 -607 I 0.075 -608 Y 0.072 -609 T 0.069 -610 L 0.066 -611 Y 0.065 -612 P 0.066 -613 F 0.068 -614 I 0.072 -615 N 0.078 -616 S 0.078 -617 R 0.070 -618 I 0.063 -619 I 0.062 -620 T 0.063 -621 V 0.058 -622 S 0.046 -623 M 0.037 -624 E 0.033 -625 D 0.033 -626 V 0.034 -627 K 0.035 -628 T 0.036 -629 L 0.039 -630 L 0.040 -631 T 0.040 -632 Q 0.042 -633 E 0.046 -634 N 0.050 -635 P 0.053 -636 F 0.055 -637 F 0.060 -638 R 0.067 -639 K 0.076 -640 L 0.081 -641 S 0.078 -642 S 0.068 -643 E 0.056 -644 A 0.046 -645 Y 0.042 -646 S 0.046 -647 Q 0.054 -648 V 0.065 -649 K 0.078 -650 D 0.089 -651 L 0.098 -652 A 0.103 -653 K 0.101 -654 G 0.094 -655 S 0.083 -656 V 0.071 -657 V 0.062 -658 L 0.060 -659 K 0.069 -660 Y 0.088 -661 E 0.114 -662 P 0.145 -663 D 0.177 -664 S 0.202 -665 A 0.217 -666 N 0.224 -667 P 0.228 -668 D 0.233 -669 T 0.238 -670 L 0.232 -671 Q 0.213 -672 C 0.187 -673 P 0.166 -674 I 0.151 -675 V 0.140 -676 L 0.125 -677 C 0.110 -678 G 0.101 -679 W 0.104 -680 R 0.117 -681 G 0.129 -682 K 0.132 -683 A 0.127 -684 S 0.116 -685 I 0.104 -686 R 0.096 -687 T 0.102 -688 F 0.119 -689 V 0.134 -690 P 0.135 -691 K 0.118 -692 N 0.096 -693 E 0.079 -694 R 0.074 -695 L 0.076 -696 H 0.079 -697 Y 0.084 -698 L 0.089 -699 R 0.093 -700 M 0.100 -701 M 0.113 -702 G 0.135 -703 L 0.169 -704 E 0.218 -705 V 0.275 -706 L 0.337 -707 G 0.408 -708 E 0.480 -709 K 0.542 -710 K 0.589 -711 K 0.624 -712 E 0.649 -713 G 0.659 -714 V 0.659 -715 I 0.663 -716 L 0.679 -717 T 0.700 -718 N 0.711 -719 E 0.709 -720 N 0.695 -721 A 0.670 -722 A 0.645 -723 S 0.634 -724 P 0.640 -725 E 0.655 -726 Q 0.673 -727 P 0.692 -728 G 0.706 -729 D 0.707 -730 E 0.688 -731 D 0.642 -732 A 0.579 -733 K 0.537 -734 Q 0.532 -735 T 0.533 -736 A 0.537 -737 Q 0.573 -738 D 0.630 -739 P 0.672 -740 C 0.693 -741 V 0.709 -742 P 0.726 -743 D 0.737 -744 S 0.740 -745 V 0.746 -746 P 0.763 -747 G 0.785 -748 C 0.801 -749 D 0.804 -750 A 0.793 -751 A 0.774 -752 A 0.751 -753 A 0.730 -754 E 0.715 -755 P 0.699 -756 S 0.675 -757 R 0.653 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021595.19_ENSMUST00000109699.11_GN:Nsun2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:25.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021595.19_ENSMUST00000109699.11_GN:Nsun2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:25.caid deleted file mode 100644 index e59f3fa3203ba932f2e835fe538e90b11e11b2da..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021595.19_ENSMUST00000109699.11_GN:Nsun2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:25.caid +++ /dev/null @@ -1,783 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000021595.19|ENSMUST00000109699.11|GN:Nsun2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:25 -1 M 0.272 -2 Q 0.273 -3 P 0.269 -4 E 0.252 -5 V 0.229 -6 Q 0.215 -7 R 0.229 -8 A 0.267 -9 C 0.304 -10 G 0.326 -11 L 0.337 -12 V 0.338 -13 G 0.327 -14 R 0.311 -15 C 0.295 -16 V 0.272 -17 R 0.243 -18 S 0.224 -19 A 0.219 -20 C 0.217 -21 A 0.214 -22 A 0.218 -23 A 0.228 -24 W 0.239 -25 A 0.259 -26 M 0.298 -27 G 0.341 -28 R 0.373 -29 R 0.400 -30 A 0.428 -31 R 0.447 -32 G 0.450 -33 R 0.434 -34 R 0.401 -35 F 0.362 -36 Q 0.339 -37 Q 0.350 -38 P 0.382 -39 P 0.417 -40 Q 0.460 -41 P 0.512 -42 E 0.567 -43 G 0.611 -44 E 0.633 -45 E 0.621 -46 D 0.580 -47 A 0.552 -48 S 0.576 -49 D 0.632 -50 G 0.675 -51 G 0.686 -52 R 0.683 -53 K 0.684 -54 R 0.694 -55 G 0.705 -56 Q 0.705 -57 A 0.691 -58 G 0.663 -59 W 0.633 -60 E 0.610 -61 G 0.588 -62 G 0.558 -63 Y 0.521 -64 P 0.474 -65 E 0.413 -66 I 0.340 -67 V 0.268 -68 K 0.208 -69 E 0.160 -70 N 0.119 -71 K 0.084 -72 L 0.059 -73 F 0.045 -74 E 0.036 -75 H 0.030 -76 Y 0.027 -77 Y 0.029 -78 Q 0.036 -79 E 0.047 -80 L 0.063 -81 K 0.083 -82 I 0.102 -83 V 0.113 -84 P 0.113 -85 E 0.103 -86 G 0.090 -87 E 0.078 -88 W 0.071 -89 D 0.074 -90 Q 0.087 -91 F 0.100 -92 M 0.109 -93 E 0.114 -94 S 0.117 -95 L 0.124 -96 R 0.134 -97 E 0.138 -98 P 0.129 -99 L 0.109 -100 P 0.088 -101 A 0.072 -102 T 0.065 -103 L 0.066 -104 R 0.074 -105 I 0.084 -106 T 0.090 -107 G 0.086 -108 Y 0.073 -109 K 0.060 -110 S 0.052 -111 H 0.048 -112 A 0.047 -113 K 0.045 -114 E 0.043 -115 I 0.042 -116 L 0.042 -117 H 0.047 -118 C 0.053 -119 L 0.058 -120 K 0.057 -121 N 0.052 -122 K 0.046 -123 Y 0.040 -124 F 0.038 -125 K 0.042 -126 E 0.053 -127 L 0.069 -128 E 0.084 -129 D 0.095 -130 L 0.106 -131 E 0.119 -132 V 0.132 -133 D 0.145 -134 G 0.158 -135 Q 0.165 -136 K 0.154 -137 V 0.127 -138 E 0.099 -139 V 0.081 -140 P 0.073 -141 Q 0.069 -142 P 0.067 -143 L 0.065 -144 S 0.059 -145 W 0.055 -146 Y 0.057 -147 P 0.061 -148 E 0.060 -149 E 0.053 -150 L 0.041 -151 A 0.030 -152 W 0.024 -153 H 0.024 -154 T 0.030 -155 N 0.039 -156 L 0.045 -157 S 0.049 -158 R 0.052 -159 K 0.059 -160 I 0.070 -161 L 0.081 -162 R 0.089 -163 K 0.092 -164 S 0.085 -165 P 0.071 -166 L 0.055 -167 L 0.044 -168 A 0.040 -169 K 0.041 -170 F 0.044 -171 H 0.045 -172 Q 0.046 -173 F 0.049 -174 L 0.052 -175 V 0.054 -176 S 0.054 -177 E 0.053 -178 T 0.052 -179 E 0.053 -180 S 0.058 -181 G 0.064 -182 N 0.068 -183 I 0.072 -184 S 0.077 -185 R 0.083 -186 Q 0.087 -187 E 0.091 -188 A 0.097 -189 V 0.104 -190 S 0.110 -191 M 0.107 -192 I 0.093 -193 P 0.080 -194 P 0.075 -195 L 0.073 -196 L 0.069 -197 L 0.064 -198 N 0.063 -199 V 0.067 -200 E 0.072 -201 P 0.073 -202 H 0.071 -203 H 0.070 -204 K 0.070 -205 I 0.068 -206 L 0.065 -207 D 0.061 -208 M 0.059 -209 C 0.057 -210 A 0.054 -211 A 0.052 -212 P 0.055 -213 G 0.062 -214 S 0.068 -215 K 0.070 -216 T 0.071 -217 T 0.074 -218 Q 0.078 -219 L 0.077 -220 I 0.072 -221 E 0.068 -222 M 0.067 -223 L 0.066 -224 H 0.063 -225 A 0.064 -226 D 0.070 -227 M 0.075 -228 S 0.079 -229 V 0.080 -230 P 0.082 -231 F 0.085 -232 P 0.085 -233 E 0.082 -234 G 0.079 -235 F 0.080 -236 V 0.079 -237 I 0.074 -238 A 0.069 -239 N 0.070 -240 D 0.075 -241 V 0.074 -242 D 0.065 -243 N 0.056 -244 K 0.053 -245 R 0.055 -246 C 0.055 -247 Y 0.053 -248 L 0.054 -249 L 0.054 -250 V 0.051 -251 H 0.047 -252 Q 0.046 -253 A 0.044 -254 K 0.042 -255 R 0.041 -256 L 0.047 -257 S 0.058 -258 S 0.067 -259 P 0.065 -260 C 0.057 -261 I 0.051 -262 M 0.052 -263 V 0.058 -264 V 0.063 -265 N 0.063 -266 H 0.061 -267 D 0.061 -268 A 0.063 -269 S 0.067 -270 S 0.070 -271 I 0.073 -272 P 0.073 -273 R 0.069 -274 L 0.065 -275 T 0.066 -276 V 0.079 -277 D 0.105 -278 V 0.135 -279 D 0.155 -280 G 0.162 -281 R 0.159 -282 K 0.143 -283 E 0.117 -284 I 0.090 -285 L 0.063 -286 F 0.044 -287 Y 0.034 -288 D 0.031 -289 R 0.031 -290 I 0.037 -291 L 0.046 -292 C 0.060 -293 D 0.080 -294 V 0.105 -295 P 0.128 -296 C 0.141 -297 S 0.145 -298 G 0.140 -299 D 0.130 -300 G 0.125 -301 T 0.127 -302 M 0.130 -303 R 0.133 -304 K 0.136 -305 N 0.138 -306 I 0.139 -307 D 0.139 -308 V 0.133 -309 W 0.117 -310 K 0.101 -311 K 0.093 -312 W 0.091 -313 T 0.091 -314 T 0.092 -315 L 0.100 -316 N 0.110 -317 S 0.113 -318 L 0.109 -319 Q 0.108 -320 L 0.110 -321 H 0.104 -322 G 0.093 -323 L 0.083 -324 Q 0.075 -325 L 0.066 -326 R 0.059 -327 I 0.055 -328 A 0.052 -329 T 0.049 -330 R 0.048 -331 G 0.050 -332 A 0.053 -333 E 0.057 -334 Q 0.061 -335 L 0.067 -336 A 0.073 -337 E 0.075 -338 G 0.072 -339 G 0.070 -340 R 0.076 -341 M 0.083 -342 V 0.084 -343 Y 0.076 -344 S 0.066 -345 T 0.060 -346 C 0.060 -347 S 0.063 -348 L 0.066 -349 N 0.070 -350 P 0.075 -351 V 0.080 -352 E 0.076 -353 D 0.067 -354 E 0.063 -355 A 0.068 -356 V 0.074 -357 I 0.071 -358 A 0.063 -359 A 0.058 -360 L 0.056 -361 L 0.052 -362 E 0.048 -363 K 0.049 -364 S 0.058 -365 E 0.066 -366 G 0.065 -367 A 0.060 -368 L 0.059 -369 E 0.064 -370 L 0.070 -371 A 0.070 -372 D 0.066 -373 V 0.063 -374 S 0.064 -375 A 0.064 -376 E 0.062 -377 L 0.062 -378 P 0.069 -379 G 0.082 -380 L 0.095 -381 K 0.109 -382 W 0.124 -383 M 0.140 -384 P 0.147 -385 G 0.140 -386 V 0.127 -387 S 0.115 -388 Q 0.105 -389 W 0.091 -390 K 0.075 -391 V 0.062 -392 M 0.054 -393 T 0.053 -394 R 0.060 -395 D 0.075 -396 G 0.091 -397 Q 0.103 -398 W 0.107 -399 F 0.104 -400 A 0.095 -401 D 0.083 -402 W 0.076 -403 H 0.081 -404 E 0.097 -405 V 0.118 -406 P 0.135 -407 Q 0.143 -408 G 0.142 -409 R 0.135 -410 H 0.134 -411 T 0.142 -412 Q 0.150 -413 I 0.149 -414 R 0.137 -415 P 0.123 -416 T 0.114 -417 M 0.112 -418 F 0.118 -419 P 0.127 -420 P 0.126 -421 T 0.110 -422 D 0.087 -423 L 0.069 -424 E 0.060 -425 K 0.059 -426 L 0.066 -427 Q 0.078 -428 A 0.090 -429 M 0.098 -430 H 0.102 -431 L 0.104 -432 E 0.105 -433 R 0.105 -434 C 0.109 -435 L 0.116 -436 R 0.121 -437 I 0.115 -438 L 0.104 -439 P 0.100 -440 H 0.109 -441 H 0.120 -442 Q 0.124 -443 N 0.120 -444 T 0.115 -445 G 0.113 -446 G 0.112 -447 F 0.109 -448 F 0.099 -449 V 0.086 -450 A 0.074 -451 V 0.069 -452 L 0.070 -453 V 0.075 -454 K 0.086 -455 K 0.101 -456 A 0.115 -457 P 0.126 -458 M 0.141 -459 P 0.171 -460 W 0.222 -461 N 0.291 -462 K 0.364 -463 R 0.429 -464 Q 0.488 -465 P 0.545 -466 K 0.595 -467 V 0.634 -468 Q 0.658 -469 N 0.668 -470 K 0.664 -471 S 0.654 -472 A 0.642 -473 E 0.628 -474 A 0.611 -475 R 0.598 -476 E 0.599 -477 P 0.609 -478 R 0.618 -479 V 0.619 -480 S 0.620 -481 S 0.621 -482 H 0.617 -483 V 0.603 -484 A 0.595 -485 A 0.610 -486 T 0.639 -487 E 0.661 -488 G 0.669 -489 N 0.673 -490 P 0.678 -491 S 0.676 -492 D 0.648 -493 Q 0.585 -494 S 0.502 -495 E 0.442 -496 L 0.431 -497 E 0.447 -498 S 0.451 -499 Q 0.450 -500 M 0.480 -501 I 0.547 -502 T 0.623 -503 G 0.683 -504 A 0.716 -505 G 0.727 -506 D 0.721 -507 S 0.693 -508 E 0.636 -509 T 0.563 -510 A 0.508 -511 H 0.479 -512 N 0.442 -513 T 0.398 -514 E 0.396 -515 N 0.436 -516 T 0.471 -517 E 0.499 -518 S 0.548 -519 N 0.610 -520 E 0.658 -521 K 0.691 -522 K 0.721 -523 D 0.743 -524 G 0.744 -525 V 0.722 -526 C 0.686 -527 G 0.654 -528 P 0.639 -529 P 0.641 -530 P 0.650 -531 S 0.655 -532 K 0.652 -533 K 0.641 -534 M 0.622 -535 K 0.597 -536 L 0.566 -537 F 0.526 -538 G 0.478 -539 F 0.425 -540 K 0.371 -541 E 0.317 -542 D 0.268 -543 P 0.223 -544 F 0.182 -545 V 0.148 -546 F 0.129 -547 I 0.124 -548 P 0.122 -549 E 0.116 -550 D 0.105 -551 D 0.092 -552 P 0.078 -553 L 0.067 -554 F 0.060 -555 P 0.056 -556 P 0.055 -557 I 0.059 -558 E 0.066 -559 K 0.074 -560 F 0.079 -561 Y 0.080 -562 A 0.081 -563 L 0.086 -564 D 0.094 -565 P 0.101 -566 S 0.103 -567 F 0.097 -568 P 0.084 -569 R 0.073 -570 M 0.067 -571 N 0.060 -572 L 0.050 -573 L 0.042 -574 T 0.044 -575 R 0.054 -576 T 0.068 -577 T 0.085 -578 E 0.107 -579 G 0.125 -580 K 0.130 -581 K 0.122 -582 R 0.109 -583 Q 0.096 -584 L 0.080 -585 Y 0.067 -586 M 0.064 -587 V 0.068 -588 S 0.070 -589 K 0.065 -590 E 0.055 -591 L 0.047 -592 R 0.045 -593 N 0.048 -594 V 0.056 -595 L 0.072 -596 L 0.094 -597 N 0.113 -598 N 0.124 -599 S 0.134 -600 E 0.145 -601 K 0.156 -602 M 0.166 -603 K 0.177 -604 V 0.185 -605 I 0.181 -606 N 0.164 -607 T 0.141 -608 G 0.121 -609 I 0.110 -610 K 0.106 -611 V 0.107 -612 W 0.113 -613 C 0.125 -614 R 0.148 -615 N 0.183 -616 N 0.223 -617 S 0.256 -618 G 0.270 -619 E 0.259 -620 E 0.231 -621 F 0.198 -622 D 0.168 -623 C 0.140 -624 A 0.115 -625 F 0.100 -626 R 0.096 -627 L 0.100 -628 A 0.107 -629 Q 0.107 -630 E 0.097 -631 G 0.083 -632 I 0.076 -633 Y 0.073 -634 T 0.070 -635 L 0.067 -636 Y 0.066 -637 P 0.067 -638 F 0.069 -639 I 0.073 -640 N 0.079 -641 S 0.080 -642 R 0.072 -643 I 0.064 -644 I 0.063 -645 T 0.064 -646 V 0.058 -647 S 0.047 -648 M 0.037 -649 E 0.033 -650 D 0.034 -651 V 0.035 -652 K 0.035 -653 T 0.036 -654 L 0.039 -655 L 0.040 -656 T 0.040 -657 Q 0.042 -658 E 0.046 -659 N 0.050 -660 P 0.053 -661 F 0.055 -662 F 0.060 -663 R 0.068 -664 K 0.076 -665 L 0.081 -666 S 0.079 -667 S 0.069 -668 E 0.057 -669 A 0.046 -670 Y 0.043 -671 S 0.046 -672 Q 0.054 -673 V 0.066 -674 K 0.078 -675 D 0.089 -676 L 0.098 -677 A 0.102 -678 K 0.101 -679 G 0.094 -680 S 0.083 -681 V 0.070 -682 V 0.061 -683 L 0.060 -684 K 0.069 -685 Y 0.088 -686 E 0.115 -687 P 0.146 -688 D 0.178 -689 S 0.204 -690 A 0.220 -691 N 0.227 -692 P 0.230 -693 D 0.236 -694 T 0.239 -695 L 0.234 -696 Q 0.215 -697 C 0.190 -698 P 0.168 -699 I 0.154 -700 V 0.142 -701 L 0.127 -702 C 0.111 -703 G 0.101 -704 W 0.105 -705 R 0.117 -706 G 0.130 -707 K 0.133 -708 A 0.128 -709 S 0.117 -710 I 0.104 -711 R 0.096 -712 T 0.102 -713 F 0.118 -714 V 0.133 -715 P 0.134 -716 K 0.118 -717 N 0.095 -718 E 0.079 -719 R 0.074 -720 L 0.075 -721 H 0.079 -722 Y 0.084 -723 L 0.089 -724 R 0.093 -725 M 0.100 -726 M 0.113 -727 G 0.135 -728 L 0.170 -729 E 0.218 -730 V 0.276 -731 L 0.339 -732 G 0.410 -733 E 0.482 -734 K 0.543 -735 K 0.589 -736 K 0.625 -737 E 0.650 -738 G 0.661 -739 V 0.660 -740 I 0.664 -741 L 0.680 -742 T 0.701 -743 N 0.712 -744 E 0.711 -745 N 0.697 -746 A 0.673 -747 A 0.648 -748 S 0.637 -749 P 0.643 -750 E 0.658 -751 Q 0.676 -752 P 0.695 -753 G 0.708 -754 D 0.710 -755 E 0.691 -756 D 0.645 -757 A 0.582 -758 K 0.541 -759 Q 0.536 -760 T 0.537 -761 A 0.542 -762 Q 0.578 -763 D 0.635 -764 P 0.676 -765 C 0.697 -766 V 0.713 -767 P 0.730 -768 D 0.741 -769 S 0.744 -770 V 0.750 -771 P 0.766 -772 G 0.788 -773 C 0.804 -774 D 0.807 -775 A 0.797 -776 A 0.777 -777 A 0.753 -778 A 0.732 -779 E 0.716 -780 P 0.698 -781 S 0.672 -782 R 0.649 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021732.15_ENSMUST00000022246.9_GN:Fgf10_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021732.15_ENSMUST00000022246.9_GN:Fgf10_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 35fcb1e678fefc8e6fbcb48b8b42d264bc1d6a6f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021732.15_ENSMUST00000022246.9_GN:Fgf10_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,210 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000021732.15|ENSMUST00000022246.9|GN:Fgf10|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.318 -2 W 0.317 -3 K 0.322 -4 W 0.334 -5 I 0.340 -6 L 0.334 -7 T 0.340 -8 H 0.369 -9 C 0.395 -10 A 0.400 -11 S 0.409 -12 A 0.446 -13 F 0.486 -14 P 0.508 -15 H 0.536 -16 L 0.588 -17 P 0.642 -18 G 0.670 -19 C 0.658 -20 C 0.608 -21 C 0.533 -22 C 0.460 -23 F 0.416 -24 L 0.404 -25 L 0.395 -26 L 0.386 -27 F 0.403 -28 L 0.440 -29 V 0.467 -30 S 0.478 -31 S 0.496 -32 F 0.544 -33 P 0.615 -34 V 0.682 -35 T 0.723 -36 C 0.737 -37 Q 0.736 -38 A 0.722 -39 L 0.684 -40 G 0.627 -41 Q 0.592 -42 D 0.611 -43 M 0.653 -44 V 0.678 -45 S 0.686 -46 Q 0.685 -47 E 0.676 -48 A 0.656 -49 T 0.626 -50 N 0.596 -51 C 0.591 -52 S 0.628 -53 S 0.680 -54 S 0.716 -55 S 0.730 -56 S 0.730 -57 S 0.721 -58 F 0.705 -59 S 0.692 -60 S 0.691 -61 P 0.704 -62 S 0.725 -63 S 0.743 -64 A 0.750 -65 G 0.746 -66 R 0.739 -67 H 0.736 -68 V 0.729 -69 R 0.711 -70 S 0.680 -71 Y 0.641 -72 N 0.600 -73 H 0.559 -74 L 0.513 -75 Q 0.452 -76 G 0.369 -77 D 0.269 -78 V 0.172 -79 R 0.099 -80 W 0.057 -81 R 0.038 -82 R 0.033 -83 L 0.037 -84 F 0.043 -85 S 0.049 -86 F 0.051 -87 T 0.049 -88 K 0.046 -89 Y 0.046 -90 F 0.045 -91 L 0.043 -92 T 0.043 -93 I 0.048 -94 E 0.060 -95 K 0.079 -96 N 0.104 -97 G 0.128 -98 K 0.139 -99 V 0.134 -100 S 0.118 -101 G 0.100 -102 T 0.083 -103 K 0.073 -104 N 0.070 -105 E 0.077 -106 D 0.088 -107 C 0.096 -108 P 0.097 -109 Y 0.093 -110 S 0.083 -111 V 0.069 -112 L 0.056 -113 E 0.050 -114 I 0.052 -115 T 0.060 -116 S 0.070 -117 V 0.081 -118 E 0.092 -119 I 0.098 -120 G 0.093 -121 V 0.081 -122 V 0.070 -123 A 0.065 -124 V 0.065 -125 K 0.067 -126 A 0.071 -127 I 0.074 -128 N 0.076 -129 S 0.075 -130 N 0.069 -131 Y 0.060 -132 Y 0.053 -133 L 0.049 -134 A 0.051 -135 M 0.058 -136 N 0.069 -137 K 0.084 -138 K 0.105 -139 G 0.126 -140 K 0.137 -141 L 0.132 -142 Y 0.117 -143 G 0.104 -144 S 0.099 -145 K 0.099 -146 E 0.096 -147 F 0.087 -148 N 0.073 -149 N 0.060 -150 D 0.054 -151 C 0.051 -152 K 0.050 -153 L 0.050 -154 K 0.054 -155 E 0.060 -156 R 0.068 -157 I 0.075 -158 E 0.081 -159 E 0.089 -160 N 0.097 -161 G 0.099 -162 Y 0.093 -163 N 0.082 -164 T 0.075 -165 Y 0.073 -166 A 0.076 -167 S 0.083 -168 F 0.092 -169 N 0.101 -170 W 0.106 -171 Q 0.109 -172 H 0.115 -173 N 0.127 -174 G 0.139 -175 R 0.139 -176 Q 0.124 -177 M 0.103 -178 Y 0.089 -179 V 0.089 -180 A 0.102 -181 L 0.121 -182 N 0.139 -183 G 0.152 -184 K 0.158 -185 G 0.157 -186 A 0.149 -187 P 0.135 -188 R 0.118 -189 R 0.104 -190 G 0.100 -191 Q 0.106 -192 K 0.119 -193 T 0.127 -194 R 0.120 -195 R 0.102 -196 K 0.088 -197 N 0.081 -198 T 0.075 -199 S 0.067 -200 A 0.058 -201 H 0.051 -202 F 0.048 -203 L 0.053 -204 P 0.065 -205 M 0.084 -206 T 0.112 -207 I 0.148 -208 Q 0.182 -209 T 0.202 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021732.15_ENSMUST00000022246.9_GN:Fgf10_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:51.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021732.15_ENSMUST00000022246.9_GN:Fgf10_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:51.caid deleted file mode 100644 index 4ca1f6d9e61fa60820cb1d324a796a3b1590b573..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021732.15_ENSMUST00000022246.9_GN:Fgf10_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:51.caid +++ /dev/null @@ -1,261 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000021732.15|ENSMUST00000022246.9|GN:Fgf10|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:51 -1 M 0.393 -2 L 0.422 -3 V 0.461 -4 H 0.490 -5 S 0.500 -6 L 0.503 -7 L 0.514 -8 A 0.529 -9 R 0.536 -10 S 0.543 -11 V 0.562 -12 P 0.592 -13 R 0.616 -14 G 0.627 -15 S 0.629 -16 Y 0.638 -17 P 0.656 -18 E 0.673 -19 A 0.674 -20 T 0.645 -21 T 0.586 -22 S 0.536 -23 S 0.530 -24 C 0.563 -25 L 0.606 -26 S 0.633 -27 A 0.631 -28 S 0.609 -29 Q 0.590 -30 Q 0.587 -31 V 0.596 -32 L 0.604 -33 P 0.599 -34 F 0.575 -35 Q 0.535 -36 Y 0.501 -37 V 0.501 -38 P 0.534 -39 S 0.582 -40 D 0.629 -41 E 0.667 -42 T 0.689 -43 I 0.694 -44 S 0.691 -45 S 0.686 -46 A 0.675 -47 E 0.649 -48 S 0.593 -49 F 0.509 -50 S 0.420 -51 T 0.357 -52 M 0.320 -53 W 0.290 -54 K 0.260 -55 W 0.238 -56 I 0.224 -57 L 0.215 -58 T 0.216 -59 H 0.231 -60 C 0.261 -61 A 0.307 -62 S 0.367 -63 A 0.424 -64 F 0.457 -65 P 0.466 -66 H 0.477 -67 L 0.504 -68 P 0.530 -69 G 0.531 -70 C 0.496 -71 C 0.430 -72 C 0.369 -73 C 0.344 -74 F 0.344 -75 L 0.335 -76 L 0.308 -77 L 0.290 -78 F 0.304 -79 L 0.334 -80 V 0.356 -81 S 0.369 -82 S 0.401 -83 F 0.472 -84 P 0.567 -85 V 0.652 -86 T 0.702 -87 C 0.723 -88 Q 0.732 -89 A 0.732 -90 L 0.705 -91 G 0.655 -92 Q 0.626 -93 D 0.649 -94 M 0.694 -95 V 0.722 -96 S 0.729 -97 Q 0.724 -98 E 0.709 -99 A 0.686 -100 T 0.654 -101 N 0.622 -102 C 0.616 -103 S 0.650 -104 S 0.702 -105 S 0.737 -106 S 0.749 -107 S 0.746 -108 S 0.735 -109 F 0.718 -110 S 0.704 -111 S 0.702 -112 P 0.712 -113 S 0.729 -114 S 0.739 -115 A 0.736 -116 G 0.723 -117 R 0.709 -118 H 0.700 -119 V 0.687 -120 R 0.661 -121 S 0.620 -122 Y 0.576 -123 N 0.540 -124 H 0.510 -125 L 0.478 -126 Q 0.431 -127 G 0.358 -128 D 0.263 -129 V 0.169 -130 R 0.097 -131 W 0.056 -132 R 0.037 -133 R 0.032 -134 L 0.035 -135 F 0.041 -136 S 0.047 -137 F 0.049 -138 T 0.049 -139 K 0.047 -140 Y 0.046 -141 F 0.045 -142 L 0.043 -143 T 0.044 -144 I 0.050 -145 E 0.062 -146 K 0.080 -147 N 0.104 -148 G 0.128 -149 K 0.141 -150 V 0.139 -151 S 0.126 -152 G 0.109 -153 T 0.093 -154 K 0.082 -155 N 0.080 -156 E 0.088 -157 D 0.101 -158 C 0.112 -159 P 0.113 -160 Y 0.107 -161 S 0.095 -162 V 0.078 -163 L 0.062 -164 E 0.056 -165 I 0.058 -166 T 0.067 -167 S 0.077 -168 V 0.086 -169 E 0.096 -170 I 0.101 -171 G 0.096 -172 V 0.083 -173 V 0.072 -174 A 0.068 -175 V 0.068 -176 K 0.071 -177 A 0.075 -178 I 0.079 -179 N 0.081 -180 S 0.078 -181 N 0.070 -182 Y 0.060 -183 Y 0.053 -184 L 0.049 -185 A 0.052 -186 M 0.059 -187 N 0.071 -188 K 0.087 -189 K 0.108 -190 G 0.128 -191 K 0.136 -192 L 0.129 -193 Y 0.112 -194 G 0.097 -195 S 0.089 -196 K 0.087 -197 E 0.083 -198 F 0.074 -199 N 0.062 -200 N 0.051 -201 D 0.044 -202 C 0.042 -203 K 0.042 -204 L 0.045 -205 K 0.050 -206 E 0.057 -207 R 0.064 -208 I 0.071 -209 E 0.077 -210 E 0.084 -211 N 0.092 -212 G 0.095 -213 Y 0.090 -214 N 0.082 -215 T 0.075 -216 Y 0.072 -217 A 0.073 -218 S 0.077 -219 F 0.084 -220 N 0.092 -221 W 0.097 -222 Q 0.100 -223 H 0.107 -224 N 0.119 -225 G 0.131 -226 R 0.132 -227 Q 0.118 -228 M 0.099 -229 Y 0.086 -230 V 0.085 -231 A 0.096 -232 L 0.114 -233 N 0.130 -234 G 0.142 -235 K 0.149 -236 G 0.149 -237 A 0.143 -238 P 0.131 -239 R 0.117 -240 R 0.104 -241 G 0.099 -242 Q 0.106 -243 K 0.120 -244 T 0.128 -245 R 0.120 -246 R 0.103 -247 K 0.089 -248 N 0.083 -249 T 0.078 -250 S 0.071 -251 A 0.062 -252 H 0.054 -253 F 0.050 -254 L 0.054 -255 P 0.065 -256 M 0.084 -257 T 0.111 -258 I 0.146 -259 Q 0.179 -260 T 0.199 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021750.17_ENSMUST00000120411.9_GN:Fam107a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021750.17_ENSMUST00000120411.9_GN:Fam107a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index c7ba0b8c78a2897f03cba4cf43550d1be9fb1bed..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021750.17_ENSMUST00000120411.9_GN:Fam107a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,173 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000021750.17|ENSMUST00000120411.9|GN:Fam107a|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.480 -2 A 0.519 -3 Q 0.575 -4 K 0.628 -5 L 0.665 -6 G 0.686 -7 E 0.696 -8 W 0.703 -9 A 0.711 -10 S 0.715 -11 A 0.720 -12 P 0.726 -13 A 0.730 -14 E 0.719 -15 A 0.693 -16 T 0.659 -17 G 0.621 -18 L 0.571 -19 Y 0.507 -20 R 0.446 -21 A 0.425 -22 V 0.453 -23 L 0.501 -24 L 0.538 -25 R 0.560 -26 S 0.563 -27 A 0.543 -28 S 0.510 -29 M 0.476 -30 Y 0.446 -31 S 0.426 -32 E 0.416 -33 I 0.404 -34 Q 0.399 -35 R 0.431 -36 E 0.502 -37 R 0.576 -38 A 0.619 -39 D 0.624 -40 I 0.607 -41 E 0.595 -42 G 0.603 -43 L 0.617 -44 M 0.615 -45 A 0.598 -46 R 0.593 -47 P 0.613 -48 E 0.641 -49 Y 0.654 -50 R 0.657 -51 E 0.665 -52 W 0.680 -53 N 0.691 -54 S 0.696 -55 E 0.701 -56 L 0.709 -57 I 0.721 -58 K 0.734 -59 P 0.747 -60 K 0.758 -61 K 0.763 -62 L 0.752 -63 L 0.718 -64 N 0.662 -65 P 0.586 -66 V 0.503 -67 K 0.442 -68 A 0.408 -69 S 0.384 -70 R 0.364 -71 S 0.356 -72 H 0.351 -73 Q 0.338 -74 E 0.323 -75 L 0.315 -76 H 0.318 -77 R 0.329 -78 E 0.332 -79 L 0.318 -80 L 0.307 -81 M 0.322 -82 N 0.355 -83 H 0.383 -84 K 0.393 -85 R 0.405 -86 G 0.441 -87 L 0.496 -88 G 0.532 -89 M 0.524 -90 D 0.476 -91 S 0.417 -92 K 0.366 -93 P 0.327 -94 E 0.296 -95 L 0.265 -96 Q 0.237 -97 R 0.214 -98 V 0.201 -99 L 0.200 -100 E 0.209 -101 H 0.216 -102 R 0.213 -103 R 0.213 -104 R 0.223 -105 N 0.235 -106 Q 0.242 -107 L 0.242 -108 I 0.232 -109 K 0.213 -110 K 0.196 -111 K 0.191 -112 E 0.195 -113 E 0.201 -114 E 0.207 -115 L 0.217 -116 E 0.230 -117 A 0.244 -118 K 0.258 -119 R 0.267 -120 M 0.269 -121 Q 0.259 -122 C 0.236 -123 P 0.203 -124 F 0.172 -125 K 0.154 -126 Q 0.149 -127 E 0.153 -128 L 0.158 -129 L 0.163 -130 R 0.170 -131 R 0.180 -132 Q 0.191 -133 Q 0.204 -134 R 0.219 -135 L 0.234 -136 N 0.248 -137 Q 0.274 -138 L 0.314 -139 E 0.358 -140 N 0.405 -141 P 0.462 -142 P 0.525 -143 Q 0.577 -144 R 0.600 -145 D 0.592 -146 E 0.563 -147 D 0.527 -148 H 0.488 -149 A 0.439 -150 P 0.381 -151 E 0.329 -152 F 0.294 -153 I 0.267 -154 K 0.237 -155 V 0.213 -156 R 0.202 -157 E 0.199 -158 N 0.198 -159 L 0.195 -160 R 0.191 -161 R 0.196 -162 I 0.217 -163 T 0.258 -164 T 0.314 -165 L 0.367 -166 T 0.400 -167 S 0.421 -168 E 0.448 -169 E 0.473 -170 R 0.472 -171 A 0.439 -172 L 0.405 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021750.17_ENSMUST00000120411.9_GN:Fam107a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:76.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021750.17_ENSMUST00000120411.9_GN:Fam107a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:76.caid deleted file mode 100644 index 86fc9923df20cfb471661e1f6803f1a2c077c7ea..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021750.17_ENSMUST00000120411.9_GN:Fam107a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:76.caid +++ /dev/null @@ -1,249 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000021750.17|ENSMUST00000120411.9|GN:Fam107a|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:76 -1 M 0.433 -2 L 0.487 -3 Q 0.562 -4 K 0.626 -5 C 0.667 -6 L 0.690 -7 D 0.702 -8 T 0.702 -9 L 0.692 -10 P 0.691 -11 L 0.716 -12 P 0.754 -13 G 0.780 -14 A 0.784 -15 Q 0.775 -16 R 0.766 -17 L 0.762 -18 P 0.766 -19 V 0.776 -20 P 0.783 -21 L 0.779 -22 G 0.767 -23 P 0.760 -24 P 0.761 -25 H 0.766 -26 T 0.772 -27 P 0.780 -28 R 0.791 -29 R 0.799 -30 S 0.790 -31 G 0.750 -32 K 0.689 -33 Q 0.660 -34 A 0.699 -35 G 0.768 -36 S 0.814 -37 R 0.828 -38 T 0.830 -39 Q 0.837 -40 P 0.851 -41 T 0.865 -42 V 0.867 -43 T 0.856 -44 R 0.839 -45 S 0.826 -46 P 0.824 -47 A 0.833 -48 G 0.845 -49 G 0.853 -50 A 0.859 -51 A 0.864 -52 G 0.867 -53 R 0.868 -54 V 0.863 -55 T 0.851 -56 I 0.834 -57 S 0.815 -58 E 0.801 -59 K 0.796 -60 L 0.797 -61 L 0.802 -62 K 0.812 -63 P 0.829 -64 S 0.844 -65 V 0.845 -66 Q 0.833 -67 A 0.821 -68 P 0.815 -69 R 0.817 -70 W 0.816 -71 G 0.804 -72 Y 0.778 -73 T 0.751 -74 A 0.734 -75 Q 0.724 -76 G 0.713 -77 M 0.684 -78 A 0.634 -79 Q 0.605 -80 K 0.636 -81 L 0.699 -82 G 0.743 -83 E 0.758 -84 W 0.764 -85 A 0.770 -86 S 0.773 -87 A 0.772 -88 P 0.772 -89 A 0.771 -90 E 0.758 -91 A 0.733 -92 T 0.703 -93 G 0.674 -94 L 0.635 -95 Y 0.588 -96 R 0.556 -97 A 0.553 -98 V 0.571 -99 L 0.591 -100 L 0.606 -101 R 0.613 -102 S 0.605 -103 A 0.584 -104 S 0.563 -105 M 0.538 -106 Y 0.507 -107 S 0.477 -108 E 0.452 -109 I 0.426 -110 Q 0.411 -111 R 0.441 -112 E 0.517 -113 R 0.594 -114 A 0.636 -115 D 0.636 -116 I 0.610 -117 E 0.586 -118 G 0.578 -119 L 0.576 -120 M 0.566 -121 A 0.554 -122 R 0.558 -123 P 0.583 -124 E 0.606 -125 Y 0.609 -126 R 0.605 -127 E 0.615 -128 W 0.637 -129 N 0.656 -130 S 0.666 -131 E 0.672 -132 L 0.683 -133 I 0.697 -134 K 0.713 -135 P 0.728 -136 K 0.742 -137 K 0.750 -138 L 0.742 -139 L 0.710 -140 N 0.652 -141 P 0.574 -142 V 0.492 -143 K 0.434 -144 A 0.405 -145 S 0.388 -146 R 0.374 -147 S 0.370 -148 H 0.365 -149 Q 0.349 -150 E 0.329 -151 L 0.316 -152 H 0.313 -153 R 0.321 -154 E 0.323 -155 L 0.311 -156 L 0.303 -157 M 0.322 -158 N 0.361 -159 H 0.393 -160 K 0.408 -161 R 0.431 -162 G 0.481 -163 L 0.542 -164 G 0.579 -165 M 0.568 -166 D 0.519 -167 S 0.456 -168 K 0.400 -169 P 0.356 -170 E 0.318 -171 L 0.282 -172 Q 0.249 -173 R 0.224 -174 V 0.208 -175 L 0.205 -176 E 0.214 -177 H 0.220 -178 R 0.220 -179 R 0.223 -180 R 0.238 -181 N 0.254 -182 Q 0.262 -183 L 0.262 -184 I 0.252 -185 K 0.232 -186 K 0.212 -187 K 0.205 -188 E 0.207 -189 E 0.211 -190 E 0.216 -191 L 0.223 -192 E 0.234 -193 A 0.247 -194 K 0.262 -195 R 0.272 -196 M 0.273 -197 Q 0.260 -198 C 0.236 -199 P 0.204 -200 F 0.174 -201 K 0.154 -202 Q 0.150 -203 E 0.157 -204 L 0.165 -205 L 0.170 -206 R 0.178 -207 R 0.190 -208 Q 0.201 -209 Q 0.213 -210 R 0.229 -211 L 0.245 -212 N 0.259 -213 Q 0.281 -214 L 0.318 -215 E 0.360 -216 N 0.405 -217 P 0.459 -218 P 0.520 -219 Q 0.571 -220 R 0.593 -221 D 0.583 -222 E 0.550 -223 D 0.508 -224 H 0.463 -225 A 0.411 -226 P 0.352 -227 E 0.302 -228 F 0.268 -229 I 0.243 -230 K 0.221 -231 V 0.207 -232 R 0.204 -233 E 0.206 -234 N 0.209 -235 L 0.209 -236 R 0.207 -237 R 0.209 -238 I 0.225 -239 T 0.259 -240 T 0.309 -241 L 0.356 -242 T 0.384 -243 S 0.406 -244 E 0.438 -245 E 0.469 -246 R 0.474 -247 A 0.447 -248 L 0.417 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021752.15_ENSMUST00000170111.3_GN:Kctd6_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021752.15_ENSMUST00000170111.3_GN:Kctd6_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 32e2a643cc0680ca288eff9a5bd67aa61f6509bb..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021752.15_ENSMUST00000170111.3_GN:Kctd6_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,238 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000021752.15|ENSMUST00000170111.3|GN:Kctd6|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.453 -2 D 0.459 -3 N 0.474 -4 G 0.489 -5 D 0.490 -6 W 0.481 -7 G 0.476 -8 Y 0.474 -9 M 0.453 -10 M 0.395 -11 S 0.309 -12 D 0.216 -13 P 0.136 -14 V 0.077 -15 T 0.045 -16 L 0.034 -17 N 0.037 -18 V 0.047 -19 G 0.062 -20 G 0.075 -21 H 0.079 -22 L 0.072 -23 Y 0.062 -24 T 0.052 -25 T 0.045 -26 S 0.038 -27 L 0.035 -28 T 0.036 -29 T 0.041 -30 L 0.047 -31 T 0.053 -32 R 0.058 -33 Y 0.064 -34 P 0.066 -35 D 0.062 -36 S 0.054 -37 M 0.050 -38 L 0.057 -39 G 0.074 -40 A 0.093 -41 M 0.114 -42 F 0.141 -43 G 0.170 -44 G 0.189 -45 D 0.198 -46 F 0.198 -47 P 0.185 -48 T 0.161 -49 A 0.141 -50 R 0.133 -51 D 0.136 -52 P 0.141 -53 Q 0.139 -54 G 0.126 -55 N 0.107 -56 Y 0.093 -57 F 0.089 -58 I 0.092 -59 D 0.095 -60 R 0.093 -61 D 0.088 -62 G 0.080 -63 P 0.070 -64 L 0.061 -65 F 0.057 -66 R 0.055 -67 Y 0.058 -68 V 0.064 -69 L 0.066 -70 N 0.065 -71 F 0.068 -72 L 0.075 -73 R 0.079 -74 T 0.076 -75 S 0.068 -76 E 0.063 -77 L 0.065 -78 T 0.078 -79 L 0.097 -80 P 0.110 -81 L 0.110 -82 D 0.101 -83 F 0.086 -84 K 0.068 -85 E 0.052 -86 F 0.042 -87 D 0.036 -88 L 0.036 -89 L 0.044 -90 R 0.057 -91 K 0.066 -92 E 0.066 -93 A 0.059 -94 D 0.049 -95 F 0.039 -96 Y 0.035 -97 Q 0.038 -98 I 0.043 -99 E 0.045 -100 P 0.048 -101 L 0.057 -102 I 0.072 -103 Q 0.084 -104 C 0.088 -105 L 0.096 -106 N 0.121 -107 D 0.166 -108 P 0.216 -109 R 0.251 -110 P 0.265 -111 L 0.272 -112 Y 0.288 -113 P 0.309 -114 M 0.311 -115 D 0.281 -116 T 0.228 -117 F 0.169 -118 E 0.115 -119 E 0.073 -120 V 0.049 -121 V 0.041 -122 E 0.040 -123 L 0.045 -124 S 0.057 -125 S 0.076 -126 T 0.105 -127 R 0.142 -128 K 0.180 -129 L 0.213 -130 S 0.239 -131 K 0.257 -132 Y 0.269 -133 S 0.274 -134 N 0.270 -135 P 0.257 -136 V 0.237 -137 A 0.210 -138 V 0.177 -139 I 0.140 -140 I 0.104 -141 T 0.076 -142 Q 0.060 -143 L 0.051 -144 T 0.046 -145 I 0.042 -146 T 0.040 -147 T 0.041 -148 K 0.045 -149 V 0.050 -150 H 0.054 -151 S 0.057 -152 L 0.061 -153 L 0.067 -154 E 0.072 -155 G 0.071 -156 I 0.065 -157 S 0.057 -158 N 0.050 -159 Y 0.046 -160 F 0.047 -161 T 0.051 -162 K 0.059 -163 W 0.071 -164 N 0.086 -165 K 0.101 -166 H 0.119 -167 M 0.143 -168 M 0.166 -169 D 0.180 -170 T 0.181 -171 R 0.171 -172 D 0.155 -173 C 0.139 -174 Q 0.123 -175 V 0.108 -176 S 0.098 -177 F 0.096 -178 T 0.105 -179 F 0.124 -180 G 0.150 -181 P 0.174 -182 C 0.186 -183 D 0.185 -184 Y 0.175 -185 H 0.159 -186 Q 0.137 -187 E 0.113 -188 V 0.091 -189 S 0.077 -190 L 0.066 -191 R 0.056 -192 V 0.049 -193 H 0.050 -194 L 0.059 -195 M 0.072 -196 E 0.080 -197 Y 0.078 -198 I 0.072 -199 T 0.072 -200 K 0.079 -201 Q 0.084 -202 G 0.081 -203 F 0.072 -204 T 0.064 -205 I 0.064 -206 R 0.069 -207 N 0.077 -208 T 0.090 -209 R 0.111 -210 V 0.140 -211 H 0.171 -212 H 0.196 -213 M 0.208 -214 S 0.206 -215 E 0.199 -216 R 0.197 -217 A 0.196 -218 N 0.193 -219 E 0.185 -220 N 0.170 -221 T 0.145 -222 V 0.116 -223 E 0.087 -224 H 0.061 -225 N 0.042 -226 W 0.031 -227 T 0.027 -228 F 0.030 -229 C 0.046 -230 R 0.083 -231 L 0.145 -232 A 0.224 -233 R 0.304 -234 K 0.374 -235 T 0.417 -236 D 0.420 -237 D 0.405 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021752.15_ENSMUST00000170111.3_GN:Kctd6_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:56.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021752.15_ENSMUST00000170111.3_GN:Kctd6_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:56.caid deleted file mode 100644 index c7d61d79e432c3b3d4fe509ac35c455251918191..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021752.15_ENSMUST00000170111.3_GN:Kctd6_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:56.caid +++ /dev/null @@ -1,294 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000021752.15|ENSMUST00000170111.3|GN:Kctd6|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:56 -1 M 0.338 -2 L 0.335 -3 S 0.352 -4 R 0.401 -5 S 0.462 -6 P 0.500 -7 E 0.500 -8 S 0.470 -9 S 0.433 -10 R 0.421 -11 V 0.445 -12 C 0.472 -13 L 0.470 -14 S 0.435 -15 L 0.396 -16 R 0.379 -17 T 0.385 -18 L 0.389 -19 D 0.380 -20 I 0.368 -21 I 0.368 -22 L 0.388 -23 P 0.423 -24 L 0.454 -25 V 0.471 -26 F 0.483 -27 L 0.506 -28 T 0.532 -29 A 0.544 -30 T 0.556 -31 A 0.595 -32 V 0.641 -33 G 0.668 -34 S 0.677 -35 P 0.688 -36 G 0.705 -37 K 0.719 -38 E 0.726 -39 G 0.726 -40 Q 0.718 -41 G 0.700 -42 R 0.673 -43 V 0.638 -44 P 0.601 -45 W 0.571 -46 L 0.552 -47 L 0.538 -48 S 0.525 -49 S 0.514 -50 E 0.505 -51 D 0.509 -52 A 0.531 -53 V 0.558 -54 L 0.581 -55 E 0.604 -56 Q 0.622 -57 M 0.626 -58 D 0.613 -59 N 0.593 -60 G 0.569 -61 D 0.538 -62 W 0.505 -63 G 0.480 -64 Y 0.460 -65 M 0.421 -66 M 0.348 -67 S 0.257 -68 D 0.171 -69 P 0.104 -70 V 0.059 -71 T 0.035 -72 L 0.028 -73 N 0.031 -74 V 0.041 -75 G 0.056 -76 G 0.068 -77 H 0.070 -78 L 0.061 -79 Y 0.050 -80 T 0.042 -81 T 0.036 -82 S 0.032 -83 L 0.030 -84 T 0.031 -85 T 0.036 -86 L 0.041 -87 T 0.046 -88 R 0.051 -89 Y 0.057 -90 P 0.060 -91 D 0.057 -92 S 0.050 -93 M 0.047 -94 L 0.053 -95 G 0.066 -96 A 0.082 -97 M 0.097 -98 F 0.118 -99 G 0.140 -100 G 0.155 -101 D 0.162 -102 F 0.163 -103 P 0.154 -104 T 0.136 -105 A 0.121 -106 R 0.116 -107 D 0.119 -108 P 0.124 -109 Q 0.123 -110 G 0.113 -111 N 0.098 -112 Y 0.085 -113 F 0.082 -114 I 0.085 -115 D 0.087 -116 R 0.084 -117 D 0.079 -118 G 0.071 -119 P 0.063 -120 L 0.057 -121 F 0.053 -122 R 0.052 -123 Y 0.055 -124 V 0.061 -125 L 0.063 -126 N 0.062 -127 F 0.063 -128 L 0.068 -129 R 0.071 -130 T 0.068 -131 S 0.063 -132 E 0.060 -133 L 0.064 -134 T 0.078 -135 L 0.097 -136 P 0.109 -137 L 0.109 -138 D 0.101 -139 F 0.086 -140 K 0.068 -141 E 0.053 -142 F 0.043 -143 D 0.037 -144 L 0.038 -145 L 0.046 -146 R 0.058 -147 K 0.067 -148 E 0.066 -149 A 0.058 -150 D 0.048 -151 F 0.039 -152 Y 0.036 -153 Q 0.040 -154 I 0.045 -155 E 0.047 -156 P 0.049 -157 L 0.057 -158 I 0.072 -159 Q 0.083 -160 C 0.088 -161 L 0.097 -162 N 0.126 -163 D 0.177 -164 P 0.234 -165 R 0.272 -166 P 0.284 -167 L 0.287 -168 Y 0.300 -169 P 0.318 -170 M 0.318 -171 D 0.287 -172 T 0.234 -173 F 0.175 -174 E 0.119 -175 E 0.075 -176 V 0.050 -177 V 0.042 -178 E 0.042 -179 L 0.047 -180 S 0.058 -181 S 0.078 -182 T 0.106 -183 R 0.140 -184 K 0.177 -185 L 0.208 -186 S 0.232 -187 K 0.249 -188 Y 0.261 -189 S 0.266 -190 N 0.263 -191 P 0.252 -192 V 0.234 -193 A 0.209 -194 V 0.177 -195 I 0.139 -196 I 0.104 -197 T 0.076 -198 Q 0.060 -199 L 0.051 -200 T 0.046 -201 I 0.042 -202 T 0.041 -203 T 0.042 -204 K 0.045 -205 V 0.050 -206 H 0.054 -207 S 0.058 -208 L 0.062 -209 L 0.067 -210 E 0.072 -211 G 0.070 -212 I 0.063 -213 S 0.055 -214 N 0.048 -215 Y 0.044 -216 F 0.044 -217 T 0.048 -218 K 0.055 -219 W 0.066 -220 N 0.079 -221 K 0.093 -222 H 0.112 -223 M 0.137 -224 M 0.162 -225 D 0.177 -226 T 0.178 -227 R 0.168 -228 D 0.152 -229 C 0.135 -230 Q 0.119 -231 V 0.106 -232 S 0.095 -233 F 0.092 -234 T 0.099 -235 F 0.116 -236 G 0.140 -237 P 0.162 -238 C 0.174 -239 D 0.175 -240 Y 0.166 -241 H 0.152 -242 Q 0.131 -243 E 0.108 -244 V 0.088 -245 S 0.075 -246 L 0.067 -247 R 0.058 -248 V 0.051 -249 H 0.052 -250 L 0.060 -251 M 0.073 -252 E 0.081 -253 Y 0.078 -254 I 0.072 -255 T 0.073 -256 K 0.081 -257 Q 0.087 -258 G 0.085 -259 F 0.076 -260 T 0.067 -261 I 0.066 -262 R 0.071 -263 N 0.080 -264 T 0.093 -265 R 0.113 -266 V 0.140 -267 H 0.170 -268 H 0.197 -269 M 0.211 -270 S 0.210 -271 E 0.203 -272 R 0.200 -273 A 0.199 -274 N 0.194 -275 E 0.186 -276 N 0.170 -277 T 0.145 -278 V 0.116 -279 E 0.087 -280 H 0.062 -281 N 0.043 -282 W 0.031 -283 T 0.027 -284 F 0.030 -285 C 0.046 -286 R 0.084 -287 L 0.148 -288 A 0.231 -289 R 0.318 -290 K 0.396 -291 T 0.441 -292 D 0.444 -293 D 0.426 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021832.9_ENSMUST00000022380.9_GN:Psmc6_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021832.9_ENSMUST00000022380.9_GN:Psmc6_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 1179b26aea9acb778b6f7482be51ce63a004ce42..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021832.9_ENSMUST00000022380.9_GN:Psmc6_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,390 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000021832.9|ENSMUST00000022380.9|GN:Psmc6|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.375 -2 A 0.356 -3 D 0.326 -4 P 0.292 -5 R 0.259 -6 D 0.227 -7 K 0.196 -8 A 0.172 -9 L 0.164 -10 Q 0.171 -11 D 0.182 -12 Y 0.182 -13 R 0.175 -14 K 0.177 -15 K 0.198 -16 L 0.241 -17 L 0.294 -18 E 0.334 -19 H 0.350 -20 K 0.354 -21 E 0.355 -22 I 0.354 -23 D 0.354 -24 G 0.349 -25 R 0.325 -26 L 0.282 -27 K 0.240 -28 E 0.218 -29 L 0.215 -30 R 0.216 -31 E 0.220 -32 Q 0.224 -33 L 0.218 -34 K 0.203 -35 E 0.191 -36 L 0.185 -37 T 0.180 -38 K 0.180 -39 Q 0.190 -40 Y 0.203 -41 E 0.212 -42 K 0.219 -43 S 0.231 -44 E 0.253 -45 N 0.283 -46 D 0.312 -47 L 0.333 -48 K 0.353 -49 A 0.382 -50 L 0.406 -51 Q 0.405 -52 S 0.384 -53 V 0.353 -54 G 0.304 -55 Q 0.232 -56 I 0.156 -57 V 0.096 -58 G 0.061 -59 E 0.045 -60 V 0.042 -61 L 0.044 -62 K 0.045 -63 Q 0.045 -64 L 0.046 -65 T 0.046 -66 E 0.044 -67 E 0.037 -68 K 0.029 -69 F 0.025 -70 I 0.026 -71 V 0.033 -72 K 0.045 -73 A 0.066 -74 T 0.095 -75 N 0.122 -76 G 0.136 -77 P 0.129 -78 R 0.109 -79 Y 0.089 -80 V 0.075 -81 V 0.068 -82 G 0.067 -83 C 0.068 -84 R 0.066 -85 R 0.064 -86 Q 0.065 -87 L 0.067 -88 D 0.064 -89 K 0.055 -90 S 0.051 -91 K 0.055 -92 L 0.068 -93 K 0.087 -94 P 0.107 -95 G 0.120 -96 T 0.120 -97 R 0.110 -98 V 0.101 -99 A 0.099 -100 L 0.097 -101 D 0.090 -102 M 0.078 -103 T 0.071 -104 T 0.071 -105 L 0.075 -106 T 0.083 -107 I 0.092 -108 M 0.100 -109 R 0.113 -110 Y 0.145 -111 L 0.197 -112 P 0.250 -113 R 0.289 -114 E 0.302 -115 V 0.285 -116 D 0.248 -117 P 0.214 -118 L 0.197 -119 V 0.195 -120 Y 0.198 -121 N 0.204 -122 M 0.216 -123 S 0.240 -124 H 0.274 -125 E 0.316 -126 D 0.351 -127 P 0.355 -128 G 0.319 -129 N 0.258 -130 V 0.190 -131 S 0.131 -132 Y 0.092 -133 S 0.073 -134 E 0.064 -135 I 0.058 -136 G 0.055 -137 G 0.053 -138 L 0.050 -139 S 0.048 -140 E 0.049 -141 Q 0.054 -142 I 0.063 -143 R 0.072 -144 E 0.074 -145 L 0.070 -146 R 0.064 -147 E 0.061 -148 V 0.058 -149 I 0.054 -150 E 0.051 -151 L 0.050 -152 P 0.050 -153 L 0.053 -154 T 0.060 -155 N 0.068 -156 P 0.075 -157 E 0.078 -158 L 0.079 -159 F 0.082 -160 Q 0.094 -161 R 0.116 -162 V 0.144 -163 G 0.173 -164 I 0.188 -165 I 0.179 -166 P 0.150 -167 P 0.113 -168 K 0.081 -169 G 0.062 -170 C 0.053 -171 L 0.050 -172 L 0.049 -173 Y 0.050 -174 G 0.052 -175 P 0.053 -176 P 0.051 -177 G 0.050 -178 T 0.053 -179 G 0.060 -180 K 0.069 -181 T 0.082 -182 L 0.097 -183 L 0.104 -184 A 0.103 -185 R 0.100 -186 A 0.098 -187 V 0.094 -188 A 0.086 -189 S 0.078 -190 Q 0.075 -191 L 0.082 -192 D 0.091 -193 C 0.092 -194 N 0.082 -195 F 0.068 -196 L 0.059 -197 K 0.054 -198 V 0.052 -199 V 0.052 -200 S 0.061 -201 S 0.081 -202 S 0.106 -203 I 0.124 -204 V 0.127 -205 D 0.123 -206 K 0.121 -207 Y 0.123 -208 I 0.120 -209 G 0.106 -210 E 0.088 -211 S 0.074 -212 A 0.064 -213 R 0.054 -214 L 0.045 -215 I 0.038 -216 R 0.034 -217 E 0.033 -218 M 0.035 -219 F 0.039 -220 N 0.043 -221 Y 0.043 -222 A 0.041 -223 R 0.037 -224 D 0.032 -225 H 0.028 -226 Q 0.026 -227 P 0.029 -228 C 0.037 -229 I 0.042 -230 I 0.042 -231 F 0.038 -232 M 0.039 -233 D 0.044 -234 E 0.051 -235 I 0.058 -236 D 0.069 -237 A 0.085 -238 I 0.106 -239 G 0.132 -240 G 0.164 -241 R 0.204 -242 R 0.246 -243 F 0.283 -244 S 0.307 -245 E 0.308 -246 G 0.283 -247 T 0.243 -248 S 0.205 -249 A 0.181 -250 D 0.166 -251 R 0.155 -252 E 0.149 -253 I 0.145 -254 Q 0.133 -255 R 0.113 -256 T 0.096 -257 L 0.085 -258 M 0.076 -259 E 0.068 -260 L 0.061 -261 L 0.058 -262 N 0.057 -263 Q 0.060 -264 M 0.067 -265 D 0.077 -266 G 0.093 -267 F 0.112 -268 D 0.127 -269 T 0.128 -270 L 0.114 -271 H 0.091 -272 R 0.069 -273 V 0.054 -274 K 0.048 -275 M 0.049 -276 I 0.053 -277 M 0.058 -278 A 0.063 -279 T 0.069 -280 N 0.077 -281 R 0.085 -282 P 0.091 -283 D 0.093 -284 T 0.096 -285 L 0.098 -286 D 0.096 -287 P 0.093 -288 A 0.091 -289 L 0.092 -290 L 0.097 -291 R 0.103 -292 P 0.106 -293 G 0.104 -294 R 0.099 -295 L 0.094 -296 D 0.086 -297 R 0.076 -298 K 0.068 -299 I 0.065 -300 H 0.069 -301 I 0.079 -302 D 0.089 -303 L 0.096 -304 P 0.099 -305 N 0.096 -306 E 0.092 -307 Q 0.087 -308 A 0.077 -309 R 0.064 -310 L 0.056 -311 D 0.053 -312 I 0.051 -313 L 0.049 -314 K 0.051 -315 I 0.056 -316 H 0.065 -317 A 0.081 -318 G 0.100 -319 P 0.112 -320 I 0.111 -321 T 0.103 -322 K 0.100 -323 H 0.102 -324 G 0.103 -325 E 0.098 -326 I 0.085 -327 D 0.068 -328 Y 0.052 -329 E 0.045 -330 A 0.048 -331 I 0.055 -332 V 0.060 -333 K 0.062 -334 L 0.065 -335 S 0.068 -336 D 0.070 -337 G 0.071 -338 F 0.070 -339 N 0.068 -340 G 0.068 -341 A 0.071 -342 D 0.077 -343 L 0.082 -344 R 0.081 -345 N 0.077 -346 V 0.074 -347 C 0.072 -348 T 0.068 -349 E 0.062 -350 A 0.058 -351 G 0.055 -352 M 0.055 -353 F 0.058 -354 A 0.065 -355 I 0.072 -356 R 0.080 -357 A 0.087 -358 D 0.093 -359 H 0.098 -360 D 0.105 -361 F 0.110 -362 V 0.107 -363 V 0.094 -364 Q 0.078 -365 E 0.064 -366 D 0.053 -367 F 0.046 -368 M 0.041 -369 K 0.040 -370 A 0.042 -371 V 0.045 -372 R 0.052 -373 K 0.067 -374 V 0.089 -375 A 0.116 -376 D 0.146 -377 S 0.181 -378 K 0.218 -379 K 0.260 -380 L 0.305 -381 E 0.346 -382 S 0.373 -383 K 0.384 -384 L 0.383 -385 D 0.379 -386 Y 0.375 -387 K 0.370 -388 P 0.361 -389 V 0.352 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021832.9_ENSMUST00000022380.9_GN:Psmc6_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021832.9_ENSMUST00000022380.9_GN:Psmc6_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid deleted file mode 100644 index b4017e7790a30ae808bed4d23631049503f52557..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021832.9_ENSMUST00000022380.9_GN:Psmc6_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid +++ /dev/null @@ -1,404 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000021832.9|ENSMUST00000022380.9|GN:Psmc6|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:14 -1 M 0.413 -2 A 0.442 -3 L 0.488 -4 P 0.530 -5 G 0.545 -6 I 0.529 -7 P 0.502 -8 Y 0.488 -9 E 0.489 -10 R 0.493 -11 R 0.501 -12 L 0.526 -13 L 0.557 -14 I 0.560 -15 M 0.519 -16 A 0.451 -17 D 0.383 -18 P 0.331 -19 R 0.297 -20 D 0.268 -21 K 0.235 -22 A 0.203 -23 L 0.185 -24 Q 0.184 -25 D 0.188 -26 Y 0.186 -27 R 0.180 -28 K 0.184 -29 K 0.209 -30 L 0.256 -31 L 0.309 -32 E 0.344 -33 H 0.354 -34 K 0.353 -35 E 0.354 -36 I 0.358 -37 D 0.362 -38 G 0.359 -39 R 0.336 -40 L 0.291 -41 K 0.247 -42 E 0.223 -43 L 0.221 -44 R 0.225 -45 E 0.231 -46 Q 0.234 -47 L 0.227 -48 K 0.210 -49 E 0.199 -50 L 0.195 -51 T 0.193 -52 K 0.194 -53 Q 0.202 -54 Y 0.213 -55 E 0.218 -56 K 0.221 -57 S 0.227 -58 E 0.242 -59 N 0.272 -60 D 0.309 -61 L 0.340 -62 K 0.364 -63 A 0.392 -64 L 0.414 -65 Q 0.411 -66 S 0.387 -67 V 0.354 -68 G 0.304 -69 Q 0.232 -70 I 0.155 -71 V 0.095 -72 G 0.059 -73 E 0.044 -74 V 0.041 -75 L 0.042 -76 K 0.043 -77 Q 0.043 -78 L 0.044 -79 T 0.045 -80 E 0.042 -81 E 0.036 -82 K 0.029 -83 F 0.024 -84 I 0.025 -85 V 0.032 -86 K 0.043 -87 A 0.063 -88 T 0.090 -89 N 0.117 -90 G 0.130 -91 P 0.124 -92 R 0.106 -93 Y 0.087 -94 V 0.073 -95 V 0.066 -96 G 0.065 -97 C 0.065 -98 R 0.063 -99 R 0.061 -100 Q 0.062 -101 L 0.064 -102 D 0.062 -103 K 0.054 -104 S 0.050 -105 K 0.054 -106 L 0.067 -107 K 0.086 -108 P 0.105 -109 G 0.117 -110 T 0.117 -111 R 0.107 -112 V 0.098 -113 A 0.095 -114 L 0.094 -115 D 0.086 -116 M 0.076 -117 T 0.069 -118 T 0.069 -119 L 0.074 -120 T 0.082 -121 I 0.091 -122 M 0.098 -123 R 0.111 -124 Y 0.143 -125 L 0.195 -126 P 0.250 -127 R 0.291 -128 E 0.305 -129 V 0.286 -130 D 0.248 -131 P 0.213 -132 L 0.196 -133 V 0.194 -134 Y 0.198 -135 N 0.203 -136 M 0.215 -137 S 0.239 -138 H 0.273 -139 E 0.316 -140 D 0.350 -141 P 0.354 -142 G 0.320 -143 N 0.259 -144 V 0.191 -145 S 0.132 -146 Y 0.093 -147 S 0.073 -148 E 0.065 -149 I 0.060 -150 G 0.056 -151 G 0.054 -152 L 0.051 -153 S 0.049 -154 E 0.050 -155 Q 0.056 -156 I 0.067 -157 R 0.076 -158 E 0.078 -159 L 0.072 -160 R 0.066 -161 E 0.061 -162 V 0.058 -163 I 0.055 -164 E 0.052 -165 L 0.050 -166 P 0.050 -167 L 0.054 -168 T 0.061 -169 N 0.070 -170 P 0.078 -171 E 0.081 -172 L 0.081 -173 F 0.083 -174 Q 0.095 -175 R 0.116 -176 V 0.145 -177 G 0.174 -178 I 0.189 -179 I 0.180 -180 P 0.151 -181 P 0.114 -182 K 0.082 -183 G 0.063 -184 C 0.054 -185 L 0.050 -186 L 0.050 -187 Y 0.051 -188 G 0.053 -189 P 0.053 -190 P 0.051 -191 G 0.050 -192 T 0.054 -193 G 0.060 -194 K 0.069 -195 T 0.082 -196 L 0.097 -197 L 0.104 -198 A 0.104 -199 R 0.101 -200 A 0.099 -201 V 0.095 -202 A 0.087 -203 S 0.079 -204 Q 0.076 -205 L 0.082 -206 D 0.091 -207 C 0.092 -208 N 0.081 -209 F 0.068 -210 L 0.059 -211 K 0.054 -212 V 0.052 -213 V 0.053 -214 S 0.062 -215 S 0.081 -216 S 0.106 -217 I 0.123 -218 V 0.126 -219 D 0.121 -220 K 0.119 -221 Y 0.121 -222 I 0.118 -223 G 0.105 -224 E 0.088 -225 S 0.074 -226 A 0.064 -227 R 0.055 -228 L 0.046 -229 I 0.039 -230 R 0.035 -231 E 0.035 -232 M 0.039 -233 F 0.047 -234 N 0.053 -235 Y 0.052 -236 A 0.045 -237 R 0.038 -238 D 0.033 -239 H 0.028 -240 Q 0.026 -241 P 0.030 -242 C 0.038 -243 I 0.043 -244 I 0.043 -245 F 0.039 -246 M 0.039 -247 D 0.045 -248 E 0.052 -249 I 0.059 -250 D 0.070 -251 A 0.086 -252 I 0.109 -253 G 0.135 -254 G 0.168 -255 R 0.209 -256 R 0.251 -257 F 0.288 -258 S 0.311 -259 E 0.312 -260 G 0.286 -261 T 0.245 -262 S 0.208 -263 A 0.184 -264 D 0.169 -265 R 0.157 -266 E 0.151 -267 I 0.147 -268 Q 0.135 -269 R 0.115 -270 T 0.097 -271 L 0.086 -272 M 0.078 -273 E 0.069 -274 L 0.063 -275 L 0.060 -276 N 0.059 -277 Q 0.062 -278 M 0.068 -279 D 0.079 -280 G 0.094 -281 F 0.114 -282 D 0.129 -283 T 0.130 -284 L 0.116 -285 H 0.093 -286 R 0.071 -287 V 0.056 -288 K 0.049 -289 M 0.050 -290 I 0.055 -291 M 0.059 -292 A 0.064 -293 T 0.070 -294 N 0.078 -295 R 0.087 -296 P 0.093 -297 D 0.096 -298 T 0.099 -299 L 0.101 -300 D 0.100 -301 P 0.096 -302 A 0.093 -303 L 0.095 -304 L 0.099 -305 R 0.105 -306 P 0.108 -307 G 0.106 -308 R 0.100 -309 L 0.095 -310 D 0.087 -311 R 0.077 -312 K 0.069 -313 I 0.066 -314 H 0.071 -315 I 0.080 -316 D 0.091 -317 L 0.098 -318 P 0.101 -319 N 0.098 -320 E 0.094 -321 Q 0.088 -322 A 0.078 -323 R 0.065 -324 L 0.057 -325 D 0.054 -326 I 0.052 -327 L 0.050 -328 K 0.052 -329 I 0.057 -330 H 0.066 -331 A 0.082 -332 G 0.101 -333 P 0.113 -334 I 0.112 -335 T 0.105 -336 K 0.101 -337 H 0.103 -338 G 0.103 -339 E 0.098 -340 I 0.086 -341 D 0.068 -342 Y 0.052 -343 E 0.046 -344 A 0.049 -345 I 0.056 -346 V 0.061 -347 K 0.063 -348 L 0.066 -349 S 0.069 -350 D 0.071 -351 G 0.071 -352 F 0.071 -353 N 0.069 -354 G 0.069 -355 A 0.072 -356 D 0.078 -357 L 0.082 -358 R 0.081 -359 N 0.078 -360 V 0.074 -361 C 0.072 -362 T 0.068 -363 E 0.063 -364 A 0.059 -365 G 0.056 -366 M 0.055 -367 F 0.058 -368 A 0.065 -369 I 0.072 -370 R 0.080 -371 A 0.088 -372 D 0.093 -373 H 0.098 -374 D 0.105 -375 F 0.110 -376 V 0.107 -377 V 0.094 -378 Q 0.078 -379 E 0.064 -380 D 0.054 -381 F 0.046 -382 M 0.041 -383 K 0.040 -384 A 0.042 -385 V 0.045 -386 R 0.052 -387 K 0.066 -388 V 0.088 -389 A 0.113 -390 D 0.143 -391 S 0.176 -392 K 0.212 -393 K 0.254 -394 L 0.300 -395 E 0.342 -396 S 0.371 -397 K 0.384 -398 L 0.386 -399 D 0.383 -400 Y 0.382 -401 K 0.378 -402 P 0.368 -403 V 0.359 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021890.7_ENSMUST00000022446.7_GN:Eaf1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021890.7_ENSMUST00000022446.7_GN:Eaf1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index d4dc702c290d26926c39138070cee08855a04a51..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021890.7_ENSMUST00000022446.7_GN:Eaf1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,269 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000021890.7|ENSMUST00000022446.7|GN:Eaf1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.595 -2 N 0.614 -3 G 0.640 -4 T 0.654 -5 A 0.653 -6 N 0.640 -7 P 0.623 -8 L 0.607 -9 L 0.581 -10 D 0.529 -11 R 0.448 -12 E 0.362 -13 E 0.292 -14 H 0.242 -15 C 0.205 -16 L 0.184 -17 R 0.181 -18 L 0.190 -19 G 0.201 -20 E 0.206 -21 S 0.201 -22 F 0.189 -23 E 0.181 -24 K 0.185 -25 R 0.200 -26 P 0.220 -27 R 0.235 -28 A 0.236 -29 S 0.223 -30 F 0.202 -31 H 0.181 -32 T 0.163 -33 I 0.151 -34 R 0.142 -35 Y 0.132 -36 D 0.123 -37 F 0.119 -38 K 0.120 -39 P 0.125 -40 A 0.134 -41 S 0.146 -42 I 0.156 -43 D 0.156 -44 T 0.149 -45 S 0.145 -46 C 0.150 -47 E 0.151 -48 G 0.143 -49 E 0.131 -50 L 0.127 -51 Q 0.132 -52 V 0.142 -53 G 0.152 -54 K 0.154 -55 G 0.144 -56 D 0.124 -57 E 0.099 -58 V 0.074 -59 T 0.058 -60 I 0.058 -61 T 0.075 -62 L 0.104 -63 P 0.135 -64 H 0.163 -65 I 0.187 -66 P 0.204 -67 G 0.206 -68 S 0.187 -69 T 0.158 -70 P 0.134 -71 P 0.117 -72 M 0.102 -73 T 0.086 -74 V 0.075 -75 F 0.068 -76 K 0.066 -77 G 0.070 -78 N 0.082 -79 K 0.098 -80 R 0.118 -81 P 0.141 -82 Y 0.167 -83 Q 0.193 -84 K 0.209 -85 D 0.207 -86 C 0.197 -87 V 0.201 -88 L 0.213 -89 I 0.205 -90 I 0.169 -91 N 0.128 -92 H 0.103 -93 D 0.101 -94 T 0.114 -95 G 0.132 -96 E 0.142 -97 Y 0.141 -98 V 0.128 -99 L 0.112 -100 E 0.103 -101 K 0.102 -102 L 0.103 -103 S 0.100 -104 S 0.096 -105 S 0.095 -106 I 0.095 -107 Q 0.092 -108 V 0.087 -109 K 0.092 -110 K 0.124 -111 T 0.201 -112 R 0.325 -113 A 0.462 -114 E 0.567 -115 G 0.619 -116 S 0.626 -117 S 0.606 -118 K 0.568 -119 I 0.519 -120 Q 0.466 -121 A 0.435 -122 R 0.451 -123 M 0.507 -124 E 0.569 -125 Q 0.612 -126 Q 0.636 -127 P 0.653 -128 A 0.667 -129 R 0.676 -130 P 0.685 -131 P 0.699 -132 Q 0.716 -133 P 0.724 -134 S 0.713 -135 Q 0.686 -136 P 0.656 -137 P 0.634 -138 P 0.622 -139 P 0.624 -140 P 0.639 -141 P 0.663 -142 P 0.692 -143 M 0.724 -144 P 0.753 -145 F 0.773 -146 R 0.783 -147 A 0.785 -148 P 0.783 -149 T 0.779 -150 K 0.779 -151 P 0.789 -152 P 0.807 -153 A 0.826 -154 G 0.838 -155 P 0.844 -156 K 0.846 -157 T 0.845 -158 S 0.844 -159 P 0.848 -160 L 0.853 -161 K 0.852 -162 D 0.841 -163 N 0.825 -164 P 0.809 -165 S 0.797 -166 P 0.785 -167 E 0.770 -168 P 0.737 -169 Q 0.676 -170 L 0.594 -171 D 0.521 -172 D 0.473 -173 I 0.436 -174 K 0.410 -175 R 0.416 -176 E 0.455 -177 L 0.502 -178 R 0.544 -179 A 0.590 -180 E 0.642 -181 V 0.683 -182 D 0.698 -183 I 0.688 -184 I 0.662 -185 E 0.641 -186 Q 0.645 -187 M 0.679 -188 S 0.727 -189 S 0.768 -190 S 0.794 -191 S 0.808 -192 G 0.816 -193 S 0.821 -194 S 0.822 -195 S 0.819 -196 S 0.813 -197 D 0.804 -198 S 0.784 -199 E 0.737 -200 S 0.669 -201 S 0.620 -202 S 0.607 -203 G 0.603 -204 S 0.606 -205 D 0.636 -206 D 0.658 -207 D 0.643 -208 S 0.633 -209 S 0.678 -210 S 0.752 -211 S 0.804 -212 A 0.824 -213 G 0.827 -214 E 0.823 -215 D 0.817 -216 N 0.811 -217 G 0.806 -218 P 0.801 -219 A 0.791 -220 S 0.766 -221 P 0.719 -222 P 0.662 -223 Q 0.639 -224 P 0.667 -225 S 0.690 -226 H 0.667 -227 Q 0.644 -228 Q 0.679 -229 P 0.749 -230 Y 0.801 -231 N 0.818 -232 S 0.815 -233 R 0.812 -234 P 0.820 -235 A 0.836 -236 V 0.850 -237 A 0.853 -238 N 0.848 -239 G 0.835 -240 T 0.817 -241 S 0.794 -242 R 0.775 -243 P 0.769 -244 Q 0.769 -245 G 0.752 -246 S 0.708 -247 S 0.650 -248 Q 0.603 -249 L 0.574 -250 M 0.554 -251 N 0.542 -252 T 0.538 -253 L 0.531 -254 R 0.521 -255 N 0.528 -256 D 0.558 -257 L 0.597 -258 Q 0.637 -259 L 0.678 -260 S 0.714 -261 E 0.739 -262 S 0.753 -263 G 0.757 -264 S 0.747 -265 D 0.721 -266 S 0.674 -267 D 0.611 -268 D 0.560 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021890.7_ENSMUST00000022446.7_GN:Eaf1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:87.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021890.7_ENSMUST00000022446.7_GN:Eaf1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:87.caid deleted file mode 100644 index 006e66e371a6c80b3ebafa53650380cdaba9ba63..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000021890.7_ENSMUST00000022446.7_GN:Eaf1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:87.caid +++ /dev/null @@ -1,356 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000021890.7|ENSMUST00000022446.7|GN:Eaf1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:87 -1 M 0.449 -2 A 0.480 -3 L 0.525 -4 P 0.571 -5 P 0.609 -6 L 0.639 -7 F 0.669 -8 P 0.703 -9 L 0.734 -10 G 0.742 -11 R 0.712 -12 R 0.655 -13 K 0.621 -14 S 0.642 -15 L 0.699 -16 P 0.752 -17 N 0.789 -18 A 0.810 -19 G 0.820 -20 S 0.822 -21 A 0.817 -22 A 0.808 -23 A 0.790 -24 L 0.755 -25 L 0.699 -26 P 0.635 -27 Q 0.605 -28 S 0.622 -29 L 0.636 -30 S 0.615 -31 R 0.603 -32 R 0.643 -33 G 0.702 -34 V 0.734 -35 D 0.733 -36 W 0.715 -37 F 0.703 -38 P 0.710 -39 A 0.736 -40 P 0.768 -41 G 0.794 -42 G 0.811 -43 R 0.820 -44 G 0.826 -45 L 0.831 -46 G 0.835 -47 S 0.835 -48 V 0.828 -49 R 0.815 -50 A 0.805 -51 P 0.801 -52 E 0.800 -53 R 0.795 -54 C 0.792 -55 P 0.795 -56 G 0.801 -57 S 0.802 -58 A 0.796 -59 V 0.789 -60 L 0.786 -61 R 0.787 -62 A 0.788 -63 A 0.787 -64 C 0.788 -65 A 0.794 -66 G 0.802 -67 I 0.809 -68 R 0.815 -69 G 0.820 -70 D 0.822 -71 C 0.819 -72 G 0.813 -73 R 0.806 -74 A 0.796 -75 R 0.784 -76 R 0.769 -77 A 0.755 -78 P 0.747 -79 I 0.745 -80 R 0.751 -81 V 0.766 -82 P 0.787 -83 G 0.803 -84 K 0.807 -85 C 0.801 -86 K 0.798 -87 A 0.802 -88 M 0.809 -89 N 0.807 -90 G 0.792 -91 T 0.768 -92 A 0.741 -93 N 0.715 -94 P 0.695 -95 L 0.678 -96 L 0.647 -97 D 0.584 -98 R 0.494 -99 E 0.398 -100 E 0.321 -101 H 0.263 -102 C 0.219 -103 L 0.192 -104 R 0.187 -105 L 0.201 -106 G 0.215 -107 E 0.213 -108 S 0.197 -109 F 0.178 -110 E 0.167 -111 K 0.170 -112 R 0.184 -113 P 0.203 -114 R 0.216 -115 A 0.216 -116 S 0.201 -117 F 0.180 -118 H 0.160 -119 T 0.144 -120 I 0.134 -121 R 0.125 -122 Y 0.117 -123 D 0.109 -124 F 0.105 -125 K 0.106 -126 P 0.110 -127 A 0.120 -128 S 0.133 -129 I 0.144 -130 D 0.146 -131 T 0.142 -132 S 0.144 -133 C 0.158 -134 E 0.165 -135 G 0.154 -136 E 0.134 -137 L 0.121 -138 Q 0.120 -139 V 0.127 -140 G 0.137 -141 K 0.143 -142 G 0.138 -143 D 0.121 -144 E 0.095 -145 V 0.070 -146 T 0.054 -147 I 0.053 -148 T 0.069 -149 L 0.097 -150 P 0.126 -151 H 0.152 -152 I 0.174 -153 P 0.190 -154 G 0.194 -155 S 0.180 -156 T 0.154 -157 P 0.130 -158 P 0.113 -159 M 0.097 -160 T 0.081 -161 V 0.070 -162 F 0.064 -163 K 0.062 -164 G 0.066 -165 N 0.078 -166 K 0.097 -167 R 0.119 -168 P 0.146 -169 Y 0.177 -170 Q 0.209 -171 K 0.231 -172 D 0.229 -173 C 0.216 -174 V 0.215 -175 L 0.226 -176 I 0.217 -177 I 0.178 -178 N 0.132 -179 H 0.103 -180 D 0.098 -181 T 0.111 -182 G 0.130 -183 E 0.142 -184 Y 0.143 -185 V 0.132 -186 L 0.116 -187 E 0.106 -188 K 0.106 -189 L 0.108 -190 S 0.105 -191 S 0.100 -192 S 0.097 -193 I 0.095 -194 Q 0.090 -195 V 0.085 -196 K 0.088 -197 K 0.116 -198 T 0.188 -199 R 0.310 -200 A 0.452 -201 E 0.567 -202 G 0.627 -203 S 0.639 -204 S 0.621 -205 K 0.585 -206 I 0.538 -207 Q 0.485 -208 A 0.451 -209 R 0.462 -210 M 0.513 -211 E 0.575 -212 Q 0.619 -213 Q 0.644 -214 P 0.661 -215 A 0.674 -216 R 0.683 -217 P 0.691 -218 P 0.706 -219 Q 0.724 -220 P 0.733 -221 S 0.723 -222 Q 0.696 -223 P 0.665 -224 P 0.642 -225 P 0.629 -226 P 0.629 -227 P 0.641 -228 P 0.664 -229 P 0.693 -230 M 0.726 -231 P 0.758 -232 F 0.781 -233 R 0.792 -234 A 0.795 -235 P 0.794 -236 T 0.791 -237 K 0.792 -238 P 0.801 -239 P 0.818 -240 A 0.836 -241 G 0.848 -242 P 0.854 -243 K 0.856 -244 T 0.855 -245 S 0.855 -246 P 0.858 -247 L 0.864 -248 K 0.863 -249 D 0.852 -250 N 0.837 -251 P 0.822 -252 S 0.811 -253 P 0.799 -254 E 0.782 -255 P 0.748 -256 Q 0.688 -257 L 0.609 -258 D 0.538 -259 D 0.489 -260 I 0.450 -261 K 0.421 -262 R 0.426 -263 E 0.465 -264 L 0.510 -265 R 0.551 -266 A 0.596 -267 E 0.645 -268 V 0.685 -269 D 0.700 -270 I 0.688 -271 I 0.661 -272 E 0.638 -273 Q 0.640 -274 M 0.673 -275 S 0.722 -276 S 0.766 -277 S 0.795 -278 S 0.811 -279 G 0.821 -280 S 0.827 -281 S 0.829 -282 S 0.828 -283 S 0.823 -284 D 0.816 -285 S 0.796 -286 E 0.749 -287 S 0.681 -288 S 0.631 -289 S 0.618 -290 G 0.614 -291 S 0.619 -292 D 0.649 -293 D 0.672 -294 D 0.656 -295 S 0.645 -296 S 0.691 -297 S 0.765 -298 S 0.818 -299 A 0.839 -300 G 0.840 -301 E 0.836 -302 D 0.830 -303 N 0.825 -304 G 0.823 -305 P 0.820 -306 A 0.816 -307 S 0.809 -308 P 0.803 -309 P 0.804 -310 Q 0.810 -311 P 0.808 -312 S 0.772 -313 H 0.707 -314 Q 0.666 -315 Q 0.697 -316 P 0.768 -317 Y 0.822 -318 N 0.840 -319 S 0.837 -320 R 0.832 -321 P 0.838 -322 A 0.853 -323 V 0.865 -324 A 0.869 -325 N 0.863 -326 G 0.851 -327 T 0.835 -328 S 0.815 -329 R 0.797 -330 P 0.791 -331 Q 0.790 -332 G 0.777 -333 S 0.742 -334 S 0.696 -335 Q 0.659 -336 L 0.636 -337 M 0.620 -338 N 0.611 -339 T 0.608 -340 L 0.602 -341 R 0.591 -342 N 0.593 -343 D 0.613 -344 L 0.641 -345 Q 0.671 -346 L 0.703 -347 S 0.732 -348 E 0.754 -349 S 0.768 -350 G 0.772 -351 S 0.763 -352 D 0.738 -353 S 0.693 -354 D 0.632 -355 D 0.583 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022061.9_ENSMUST00000022646.9_GN:Nkx3-1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022061.9_ENSMUST00000022646.9_GN:Nkx3-1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index f30f049fbfb776931657997115af6ea2c0f54e9b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022061.9_ENSMUST00000022646.9_GN:Nkx3-1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,238 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000022061.9|ENSMUST00000022646.9|GN:Nkx3-1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.539 -2 L 0.593 -3 R 0.659 -4 V 0.701 -5 A 0.713 -6 E 0.713 -7 P 0.719 -8 R 0.735 -9 E 0.759 -10 P 0.786 -11 R 0.809 -12 V 0.822 -13 E 0.825 -14 A 0.821 -15 G 0.813 -16 G 0.799 -17 R 0.776 -18 S 0.749 -19 P 0.726 -20 W 0.718 -21 A 0.728 -22 A 0.743 -23 P 0.763 -24 P 0.787 -25 T 0.809 -26 Q 0.821 -27 S 0.821 -28 K 0.813 -29 R 0.800 -30 L 0.782 -31 T 0.756 -32 S 0.721 -33 F 0.669 -34 L 0.593 -35 I 0.513 -36 Q 0.464 -37 D 0.444 -38 I 0.436 -39 L 0.450 -40 R 0.497 -41 D 0.556 -42 R 0.607 -43 A 0.652 -44 E 0.695 -45 R 0.730 -46 H 0.761 -47 G 0.788 -48 G 0.811 -49 H 0.826 -50 S 0.833 -51 G 0.831 -52 N 0.828 -53 P 0.825 -54 Q 0.821 -55 H 0.813 -56 S 0.801 -57 P 0.790 -58 D 0.788 -59 P 0.798 -60 R 0.817 -61 R 0.832 -62 D 0.836 -63 S 0.828 -64 A 0.816 -65 P 0.812 -66 E 0.821 -67 P 0.837 -68 D 0.852 -69 K 0.862 -70 A 0.866 -71 G 0.866 -72 G 0.866 -73 R 0.868 -74 G 0.865 -75 V 0.857 -76 A 0.844 -77 P 0.832 -78 E 0.824 -79 D 0.823 -80 P 0.830 -81 P 0.848 -82 S 0.867 -83 I 0.880 -84 R 0.882 -85 H 0.879 -86 S 0.878 -87 P 0.879 -88 A 0.879 -89 E 0.875 -90 T 0.869 -91 P 0.864 -92 T 0.861 -93 E 0.859 -94 P 0.860 -95 E 0.859 -96 S 0.851 -97 D 0.834 -98 A 0.811 -99 H 0.785 -100 F 0.761 -101 E 0.745 -102 T 0.733 -103 Y 0.723 -104 L 0.722 -105 L 0.732 -106 D 0.745 -107 C 0.751 -108 E 0.751 -109 H 0.749 -110 N 0.753 -111 P 0.771 -112 G 0.795 -113 D 0.813 -114 L 0.817 -115 A 0.811 -116 S 0.802 -117 A 0.798 -118 P 0.802 -119 Q 0.813 -120 V 0.818 -121 T 0.809 -122 K 0.786 -123 Q 0.762 -124 P 0.742 -125 Q 0.725 -126 K 0.701 -127 R 0.660 -128 S 0.590 -129 R 0.500 -130 A 0.407 -131 A 0.320 -132 F 0.241 -133 S 0.174 -134 H 0.120 -135 T 0.080 -136 Q 0.058 -137 V 0.053 -138 I 0.058 -139 E 0.065 -140 L 0.069 -141 E 0.069 -142 R 0.064 -143 K 0.055 -144 F 0.048 -145 S 0.045 -146 H 0.043 -147 Q 0.040 -148 K 0.038 -149 Y 0.041 -150 L 0.044 -151 S 0.046 -152 A 0.045 -153 P 0.043 -154 E 0.040 -155 R 0.039 -156 A 0.044 -157 H 0.059 -158 L 0.080 -159 A 0.096 -160 K 0.097 -161 N 0.086 -162 L 0.073 -163 K 0.064 -164 L 0.056 -165 T 0.051 -166 E 0.049 -167 T 0.051 -168 Q 0.053 -169 V 0.050 -170 K 0.042 -171 I 0.033 -172 W 0.027 -173 F 0.024 -174 Q 0.022 -175 N 0.022 -176 R 0.026 -177 R 0.033 -178 Y 0.043 -179 K 0.058 -180 T 0.085 -181 K 0.123 -182 R 0.166 -183 K 0.220 -184 Q 0.291 -185 L 0.362 -186 S 0.406 -187 E 0.438 -188 D 0.489 -189 L 0.558 -190 G 0.617 -191 V 0.654 -192 L 0.671 -193 E 0.671 -194 K 0.656 -195 N 0.638 -196 S 0.635 -197 P 0.650 -198 L 0.673 -199 S 0.695 -200 L 0.714 -201 P 0.734 -202 A 0.753 -203 L 0.764 -204 K 0.764 -205 D 0.754 -206 D 0.740 -207 S 0.731 -208 L 0.731 -209 P 0.743 -210 S 0.760 -211 T 0.773 -212 S 0.778 -213 L 0.778 -214 V 0.773 -215 S 0.757 -216 V 0.725 -217 Y 0.683 -218 T 0.642 -219 S 0.606 -220 Y 0.574 -221 P 0.547 -222 Y 0.530 -223 Y 0.534 -224 P 0.554 -225 Y 0.574 -226 L 0.591 -227 Y 0.618 -228 C 0.660 -229 L 0.699 -230 G 0.715 -231 S 0.704 -232 W 0.682 -233 H 0.665 -234 P 0.656 -235 S 0.629 -236 F 0.571 -237 W 0.515 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022061.9_ENSMUST00000022646.9_GN:Nkx3-1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022061.9_ENSMUST00000022646.9_GN:Nkx3-1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid deleted file mode 100644 index 6c35d49f7608227e1a3a16ee55f17e8af036b81c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022061.9_ENSMUST00000022646.9_GN:Nkx3-1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid +++ /dev/null @@ -1,257 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000022061.9|ENSMUST00000022646.9|GN:Nkx3-1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:19 -1 M 0.554 -2 A 0.602 -3 I 0.660 -4 S 0.700 -5 A 0.719 -6 R 0.729 -7 G 0.748 -8 P 0.781 -9 V 0.817 -10 I 0.842 -11 A 0.856 -12 K 0.859 -13 A 0.853 -14 A 0.842 -15 R 0.830 -16 S 0.825 -17 G 0.827 -18 G 0.835 -19 G 0.845 -20 M 0.854 -21 L 0.858 -22 R 0.857 -23 V 0.846 -24 A 0.828 -25 E 0.811 -26 P 0.803 -27 R 0.806 -28 E 0.819 -29 P 0.837 -30 R 0.854 -31 V 0.864 -32 E 0.866 -33 A 0.862 -34 G 0.852 -35 G 0.835 -36 R 0.811 -37 S 0.782 -38 P 0.760 -39 W 0.755 -40 A 0.763 -41 A 0.773 -42 P 0.785 -43 P 0.804 -44 T 0.824 -45 Q 0.836 -46 S 0.838 -47 K 0.833 -48 R 0.824 -49 L 0.811 -50 T 0.791 -51 S 0.761 -52 F 0.715 -53 L 0.650 -54 I 0.582 -55 Q 0.538 -56 D 0.517 -57 I 0.508 -58 L 0.524 -59 R 0.571 -60 D 0.624 -61 R 0.663 -62 A 0.695 -63 E 0.727 -64 R 0.757 -65 H 0.783 -66 G 0.807 -67 G 0.828 -68 H 0.843 -69 S 0.850 -70 G 0.849 -71 N 0.846 -72 P 0.842 -73 Q 0.837 -74 H 0.828 -75 S 0.814 -76 P 0.800 -77 D 0.796 -78 P 0.805 -79 R 0.822 -80 R 0.836 -81 D 0.840 -82 S 0.832 -83 A 0.820 -84 P 0.815 -85 E 0.822 -86 P 0.837 -87 D 0.852 -88 K 0.861 -89 A 0.865 -90 G 0.865 -91 G 0.866 -92 R 0.868 -93 G 0.867 -94 V 0.860 -95 A 0.848 -96 P 0.837 -97 E 0.828 -98 D 0.824 -99 P 0.830 -100 P 0.847 -101 S 0.866 -102 I 0.877 -103 R 0.878 -104 H 0.874 -105 S 0.871 -106 P 0.872 -107 A 0.872 -108 E 0.867 -109 T 0.860 -110 P 0.854 -111 T 0.850 -112 E 0.848 -113 P 0.848 -114 E 0.847 -115 S 0.839 -116 D 0.821 -117 A 0.796 -118 H 0.767 -119 F 0.741 -120 E 0.724 -121 T 0.712 -122 Y 0.701 -123 L 0.702 -124 L 0.716 -125 D 0.733 -126 C 0.743 -127 E 0.746 -128 H 0.745 -129 N 0.750 -130 P 0.768 -131 G 0.794 -132 D 0.814 -133 L 0.821 -134 A 0.816 -135 S 0.807 -136 A 0.802 -137 P 0.806 -138 Q 0.817 -139 V 0.822 -140 T 0.814 -141 K 0.792 -142 Q 0.769 -143 P 0.750 -144 Q 0.732 -145 K 0.708 -146 R 0.666 -147 S 0.596 -148 R 0.507 -149 A 0.413 -150 A 0.324 -151 F 0.243 -152 S 0.174 -153 H 0.120 -154 T 0.080 -155 Q 0.058 -156 V 0.053 -157 I 0.058 -158 E 0.065 -159 L 0.071 -160 E 0.072 -161 R 0.068 -162 K 0.059 -163 F 0.050 -164 S 0.046 -165 H 0.043 -166 Q 0.040 -167 K 0.039 -168 Y 0.041 -169 L 0.044 -170 S 0.046 -171 A 0.045 -172 P 0.042 -173 E 0.039 -174 R 0.038 -175 A 0.043 -176 H 0.059 -177 L 0.081 -178 A 0.098 -179 K 0.099 -180 N 0.088 -181 L 0.074 -182 K 0.063 -183 L 0.056 -184 T 0.051 -185 E 0.049 -186 T 0.051 -187 Q 0.053 -188 V 0.050 -189 K 0.042 -190 I 0.033 -191 W 0.027 -192 F 0.024 -193 Q 0.022 -194 N 0.022 -195 R 0.026 -196 R 0.034 -197 Y 0.043 -198 K 0.058 -199 T 0.084 -200 K 0.122 -201 R 0.166 -202 K 0.220 -203 Q 0.293 -204 L 0.364 -205 S 0.407 -206 E 0.437 -207 D 0.486 -208 L 0.554 -209 G 0.613 -210 V 0.651 -211 L 0.669 -212 E 0.669 -213 K 0.654 -214 N 0.637 -215 S 0.634 -216 P 0.651 -217 L 0.675 -218 S 0.696 -219 L 0.714 -220 P 0.734 -221 A 0.754 -222 L 0.767 -223 K 0.768 -224 D 0.759 -225 D 0.746 -226 S 0.737 -227 L 0.738 -228 P 0.748 -229 S 0.765 -230 T 0.777 -231 S 0.782 -232 L 0.782 -233 V 0.778 -234 S 0.762 -235 V 0.731 -236 Y 0.691 -237 T 0.650 -238 S 0.613 -239 Y 0.580 -240 P 0.554 -241 Y 0.539 -242 Y 0.545 -243 P 0.567 -244 Y 0.589 -245 L 0.608 -246 Y 0.634 -247 C 0.673 -248 L 0.709 -249 G 0.722 -250 S 0.711 -251 W 0.688 -252 H 0.671 -253 P 0.662 -254 S 0.636 -255 F 0.579 -256 W 0.524 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022109.7_ENSMUST00000022705.7_GN:Med4_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022109.7_ENSMUST00000022705.7_GN:Med4_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 1cabb2943ba58532d25a7a062221a2c9ea495ba3..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022109.7_ENSMUST00000022705.7_GN:Med4_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,271 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000022109.7|ENSMUST00000022705.7|GN:Med4|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.432 -2 A 0.474 -3 A 0.533 -4 S 0.583 -5 S 0.616 -6 S 0.636 -7 G 0.649 -8 E 0.653 -9 K 0.651 -10 E 0.652 -11 K 0.663 -12 E 0.679 -13 R 0.693 -14 M 0.705 -15 G 0.720 -16 G 0.732 -17 V 0.737 -18 S 0.733 -19 G 0.722 -20 M 0.708 -21 A 0.691 -22 G 0.662 -23 L 0.598 -24 G 0.488 -25 S 0.360 -26 T 0.260 -27 R 0.207 -28 E 0.189 -29 R 0.174 -30 L 0.151 -31 L 0.131 -32 S 0.121 -33 A 0.122 -34 L 0.138 -35 E 0.161 -36 D 0.172 -37 L 0.165 -38 E 0.150 -39 V 0.134 -40 L 0.118 -41 S 0.105 -42 R 0.093 -43 E 0.080 -44 L 0.070 -45 I 0.072 -46 E 0.086 -47 M 0.100 -48 L 0.112 -49 A 0.122 -50 I 0.134 -51 S 0.149 -52 R 0.160 -53 N 0.161 -54 Q 0.155 -55 K 0.148 -56 L 0.141 -57 L 0.134 -58 Q 0.133 -59 L 0.139 -60 E 0.145 -61 E 0.144 -62 E 0.136 -63 N 0.132 -64 Q 0.135 -65 V 0.144 -66 L 0.155 -67 E 0.162 -68 L 0.160 -69 L 0.157 -70 I 0.161 -71 H 0.180 -72 R 0.208 -73 D 0.229 -74 G 0.231 -75 D 0.220 -76 F 0.211 -77 Q 0.203 -78 E 0.186 -79 L 0.162 -80 M 0.142 -81 K 0.133 -82 L 0.133 -83 A 0.140 -84 L 0.152 -85 N 0.160 -86 Q 0.160 -87 G 0.154 -88 K 0.148 -89 V 0.151 -90 H 0.170 -91 H 0.199 -92 E 0.217 -93 M 0.216 -94 Q 0.208 -95 A 0.211 -96 L 0.228 -97 E 0.253 -98 K 0.278 -99 E 0.297 -100 V 0.305 -101 E 0.299 -102 K 0.279 -103 R 0.257 -104 D 0.252 -105 S 0.267 -106 D 0.279 -107 I 0.274 -108 Q 0.260 -109 Q 0.246 -110 L 0.235 -111 Q 0.232 -112 K 0.243 -113 Q 0.255 -114 L 0.260 -115 K 0.263 -116 E 0.260 -117 A 0.245 -118 E 0.229 -119 Q 0.221 -120 I 0.214 -121 L 0.205 -122 A 0.201 -123 T 0.202 -124 A 0.196 -125 V 0.184 -126 Y 0.180 -127 Q 0.183 -128 A 0.184 -129 K 0.180 -130 E 0.171 -131 K 0.160 -132 L 0.156 -133 K 0.162 -134 S 0.167 -135 I 0.166 -136 E 0.171 -137 K 0.190 -138 A 0.213 -139 R 0.236 -140 K 0.264 -141 G 0.297 -142 A 0.319 -143 I 0.311 -144 S 0.271 -145 S 0.221 -146 E 0.184 -147 E 0.166 -148 I 0.158 -149 I 0.154 -150 K 0.158 -151 Y 0.168 -152 A 0.170 -153 H 0.165 -154 R 0.166 -155 I 0.188 -156 S 0.222 -157 A 0.255 -158 S 0.283 -159 N 0.320 -160 A 0.370 -161 V 0.424 -162 C 0.471 -163 A 0.507 -164 P 0.527 -165 L 0.524 -166 T 0.496 -167 W 0.461 -168 V 0.444 -169 P 0.442 -170 G 0.427 -171 D 0.394 -172 P 0.358 -173 R 0.336 -174 R 0.346 -175 P 0.388 -176 Y 0.436 -177 P 0.454 -178 T 0.438 -179 D 0.412 -180 L 0.397 -181 E 0.387 -182 M 0.373 -183 R 0.358 -184 S 0.362 -185 G 0.391 -186 L 0.428 -187 L 0.464 -188 G 0.516 -189 Q 0.585 -190 M 0.643 -191 N 0.669 -192 N 0.678 -193 P 0.696 -194 S 0.726 -195 T 0.758 -196 S 0.781 -197 G 0.795 -198 V 0.800 -199 N 0.795 -200 G 0.782 -201 H 0.769 -202 L 0.770 -203 P 0.788 -204 G 0.815 -205 D 0.836 -206 A 0.843 -207 L 0.839 -208 A 0.831 -209 A 0.826 -210 G 0.819 -211 R 0.810 -212 L 0.804 -213 P 0.803 -214 D 0.802 -215 V 0.791 -216 L 0.766 -217 A 0.735 -218 P 0.710 -219 Q 0.696 -220 Y 0.696 -221 P 0.710 -222 W 0.736 -223 Q 0.768 -224 S 0.793 -225 N 0.809 -226 D 0.817 -227 M 0.824 -228 S 0.826 -229 V 0.821 -230 N 0.802 -231 M 0.774 -232 L 0.749 -233 P 0.745 -234 P 0.763 -235 N 0.790 -236 H 0.808 -237 S 0.813 -238 S 0.808 -239 D 0.799 -240 F 0.789 -241 L 0.773 -242 L 0.751 -243 E 0.728 -244 P 0.720 -245 P 0.733 -246 G 0.755 -247 H 0.772 -248 N 0.778 -249 K 0.777 -250 E 0.773 -251 N 0.770 -252 E 0.768 -253 D 0.763 -254 D 0.745 -255 V 0.700 -256 E 0.637 -257 V 0.593 -258 M 0.585 -259 S 0.585 -260 T 0.592 -261 D 0.622 -262 S 0.645 -263 S 0.630 -264 S 0.618 -265 S 0.653 -266 S 0.702 -267 S 0.714 -268 D 0.680 -269 S 0.621 -270 D 0.575 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022109.7_ENSMUST00000022705.7_GN:Med4_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022109.7_ENSMUST00000022705.7_GN:Med4_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid deleted file mode 100644 index 9f5889d46fdac6e74b751b5bcf1c12fe7077120b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022109.7_ENSMUST00000022705.7_GN:Med4_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid +++ /dev/null @@ -1,280 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000022109.7|ENSMUST00000022705.7|GN:Med4|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:9 -1 M 0.371 -2 R 0.408 -3 R 0.470 -4 L 0.539 -5 V 0.594 -6 V 0.632 -7 S 0.659 -8 G 0.676 -9 A 0.680 -10 M 0.682 -11 A 0.691 -12 A 0.702 -13 S 0.703 -14 S 0.700 -15 S 0.699 -16 G 0.697 -17 E 0.691 -18 K 0.687 -19 E 0.693 -20 K 0.706 -21 E 0.721 -22 R 0.734 -23 M 0.746 -24 G 0.755 -25 G 0.760 -26 V 0.758 -27 S 0.750 -28 G 0.735 -29 M 0.716 -30 A 0.698 -31 G 0.668 -32 L 0.602 -33 G 0.491 -34 S 0.365 -35 T 0.266 -36 R 0.212 -37 E 0.192 -38 R 0.177 -39 L 0.157 -40 L 0.140 -41 S 0.135 -42 A 0.143 -43 L 0.166 -44 E 0.193 -45 D 0.202 -46 L 0.191 -47 E 0.172 -48 V 0.152 -49 L 0.133 -50 S 0.117 -51 R 0.104 -52 E 0.088 -53 L 0.076 -54 I 0.076 -55 E 0.088 -56 M 0.100 -57 L 0.110 -58 A 0.118 -59 I 0.129 -60 S 0.143 -61 R 0.154 -62 N 0.155 -63 Q 0.150 -64 K 0.144 -65 L 0.138 -66 L 0.131 -67 Q 0.130 -68 L 0.138 -69 E 0.146 -70 E 0.145 -71 E 0.138 -72 N 0.134 -73 Q 0.137 -74 V 0.147 -75 L 0.160 -76 E 0.168 -77 L 0.168 -78 L 0.164 -79 I 0.166 -80 H 0.182 -81 R 0.209 -82 D 0.230 -83 G 0.232 -84 D 0.219 -85 F 0.208 -86 Q 0.199 -87 E 0.182 -88 L 0.158 -89 M 0.139 -90 K 0.130 -91 L 0.129 -92 A 0.136 -93 L 0.148 -94 N 0.156 -95 Q 0.156 -96 G 0.150 -97 K 0.145 -98 V 0.149 -99 H 0.168 -100 H 0.196 -101 E 0.213 -102 M 0.210 -103 Q 0.201 -104 A 0.203 -105 L 0.219 -106 E 0.242 -107 K 0.264 -108 E 0.279 -109 V 0.285 -110 E 0.279 -111 K 0.262 -112 R 0.243 -113 D 0.241 -114 S 0.257 -115 D 0.270 -116 I 0.267 -117 Q 0.255 -118 Q 0.243 -119 L 0.232 -120 Q 0.230 -121 K 0.241 -122 Q 0.255 -123 L 0.263 -124 K 0.266 -125 E 0.264 -126 A 0.248 -127 E 0.231 -128 Q 0.222 -129 I 0.216 -130 L 0.207 -131 A 0.203 -132 T 0.203 -133 A 0.196 -134 V 0.184 -135 Y 0.180 -136 Q 0.184 -137 A 0.185 -138 K 0.181 -139 E 0.172 -140 K 0.161 -141 L 0.157 -142 K 0.163 -143 S 0.169 -144 I 0.169 -145 E 0.175 -146 K 0.193 -147 A 0.217 -148 R 0.240 -149 K 0.268 -150 G 0.302 -151 A 0.325 -152 I 0.318 -153 S 0.279 -154 S 0.228 -155 E 0.190 -156 E 0.172 -157 I 0.162 -158 I 0.157 -159 K 0.161 -160 Y 0.170 -161 A 0.174 -162 H 0.169 -163 R 0.171 -164 I 0.193 -165 S 0.228 -166 A 0.260 -167 S 0.288 -168 N 0.324 -169 A 0.374 -170 V 0.427 -171 C 0.473 -172 A 0.508 -173 P 0.528 -174 L 0.525 -175 T 0.496 -176 W 0.461 -177 V 0.447 -178 P 0.445 -179 G 0.431 -180 D 0.397 -181 P 0.359 -182 R 0.335 -183 R 0.342 -184 P 0.384 -185 Y 0.432 -186 P 0.453 -187 T 0.438 -188 D 0.414 -189 L 0.399 -190 E 0.389 -191 M 0.374 -192 R 0.358 -193 S 0.361 -194 G 0.388 -195 L 0.424 -196 L 0.460 -197 G 0.511 -198 Q 0.580 -199 M 0.638 -200 N 0.665 -201 N 0.675 -202 P 0.693 -203 S 0.724 -204 T 0.756 -205 S 0.779 -206 G 0.793 -207 V 0.798 -208 N 0.794 -209 G 0.781 -210 H 0.768 -211 L 0.769 -212 P 0.786 -213 G 0.813 -214 D 0.834 -215 A 0.842 -216 L 0.837 -217 A 0.830 -218 A 0.824 -219 G 0.817 -220 R 0.808 -221 L 0.802 -222 P 0.802 -223 D 0.801 -224 V 0.791 -225 L 0.766 -226 A 0.736 -227 P 0.711 -228 Q 0.697 -229 Y 0.697 -230 P 0.711 -231 W 0.736 -232 Q 0.767 -233 S 0.793 -234 N 0.809 -235 D 0.818 -236 M 0.824 -237 S 0.827 -238 V 0.822 -239 N 0.803 -240 M 0.774 -241 L 0.749 -242 P 0.744 -243 P 0.763 -244 N 0.789 -245 H 0.808 -246 S 0.813 -247 S 0.808 -248 D 0.799 -249 F 0.789 -250 L 0.773 -251 L 0.751 -252 E 0.728 -253 P 0.720 -254 P 0.732 -255 G 0.754 -256 H 0.771 -257 N 0.778 -258 K 0.777 -259 E 0.773 -260 N 0.770 -261 E 0.768 -262 D 0.764 -263 D 0.747 -264 V 0.703 -265 E 0.640 -266 V 0.596 -267 M 0.587 -268 S 0.587 -269 T 0.594 -270 D 0.624 -271 S 0.647 -272 S 0.632 -273 S 0.620 -274 S 0.654 -275 S 0.704 -276 S 0.716 -277 D 0.682 -278 S 0.623 -279 D 0.577 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022516.11_ENSMUST00000230931.2_GN:Nudt16l1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022516.11_ENSMUST00000230931.2_GN:Nudt16l1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 9b8629e2422c8e785abaeca25ee44b2356b23b15..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022516.11_ENSMUST00000230931.2_GN:Nudt16l1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,212 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000022516.11|ENSMUST00000230931.2|GN:Nudt16l1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.392 -2 S 0.387 -3 T 0.382 -4 T 0.375 -5 T 0.355 -6 V 0.317 -7 P 0.264 -8 E 0.207 -9 L 0.157 -10 K 0.118 -11 Q 0.093 -12 I 0.080 -13 S 0.077 -14 R 0.080 -15 E 0.081 -16 E 0.074 -17 A 0.063 -18 M 0.060 -19 R 0.066 -20 L 0.078 -21 G 0.089 -22 P 0.094 -23 G 0.091 -24 W 0.079 -25 S 0.063 -26 H 0.048 -27 S 0.037 -28 C 0.029 -29 H 0.024 -30 A 0.021 -31 M 0.021 -32 L 0.025 -33 Y 0.035 -34 A 0.054 -35 A 0.077 -36 N 0.098 -37 P 0.114 -38 G 0.124 -39 Q 0.131 -40 L 0.139 -41 F 0.154 -42 G 0.172 -43 R 0.184 -44 I 0.178 -45 P 0.150 -46 M 0.108 -47 R 0.071 -48 F 0.049 -49 S 0.042 -50 V 0.043 -51 L 0.048 -52 M 0.055 -53 Q 0.065 -54 M 0.077 -55 R 0.088 -56 F 0.099 -57 D 0.109 -58 G 0.113 -59 L 0.107 -60 L 0.096 -61 G 0.088 -62 F 0.087 -63 P 0.086 -64 G 0.082 -65 G 0.077 -66 F 0.070 -67 V 0.063 -68 D 0.057 -69 R 0.059 -70 R 0.068 -71 F 0.076 -72 W 0.078 -73 S 0.075 -74 L 0.079 -75 E 0.091 -76 D 0.107 -77 G 0.118 -78 L 0.117 -79 N 0.109 -80 R 0.105 -81 V 0.106 -82 L 0.100 -83 G 0.088 -84 L 0.079 -85 G 0.081 -86 L 0.092 -87 G 0.103 -88 G 0.104 -89 L 0.096 -90 R 0.085 -91 L 0.070 -92 T 0.055 -93 E 0.045 -94 A 0.040 -95 D 0.035 -96 Y 0.028 -97 L 0.022 -98 S 0.019 -99 S 0.020 -100 H 0.025 -101 L 0.034 -102 T 0.048 -103 E 0.067 -104 G 0.086 -105 P 0.101 -106 H 0.106 -107 R 0.102 -108 V 0.088 -109 V 0.068 -110 A 0.048 -111 H 0.034 -112 L 0.026 -113 Y 0.023 -114 A 0.025 -115 R 0.029 -116 Q 0.033 -117 L 0.034 -118 T 0.033 -119 L 0.031 -120 E 0.031 -121 Q 0.037 -122 L 0.050 -123 H 0.067 -124 A 0.079 -125 V 0.081 -126 E 0.076 -127 I 0.071 -128 S 0.069 -129 A 0.069 -130 V 0.070 -131 H 0.071 -132 S 0.075 -133 R 0.082 -134 D 0.093 -135 H 0.105 -136 G 0.110 -137 L 0.104 -138 E 0.092 -139 V 0.082 -140 L 0.077 -141 G 0.072 -142 L 0.065 -143 V 0.058 -144 R 0.056 -145 V 0.056 -146 P 0.055 -147 L 0.054 -148 Y 0.058 -149 T 0.071 -150 Q 0.088 -151 K 0.103 -152 D 0.119 -153 R 0.136 -154 V 0.148 -155 G 0.147 -156 G 0.134 -157 F 0.115 -158 P 0.096 -159 N 0.082 -160 F 0.077 -161 L 0.078 -162 S 0.081 -163 N 0.081 -164 A 0.077 -165 F 0.070 -166 V 0.062 -167 S 0.060 -168 T 0.062 -169 A 0.061 -170 K 0.053 -171 Y 0.042 -172 Q 0.036 -173 L 0.032 -174 L 0.029 -175 F 0.027 -176 A 0.027 -177 L 0.030 -178 K 0.034 -179 V 0.039 -180 L 0.045 -181 N 0.053 -182 M 0.061 -183 M 0.071 -184 P 0.080 -185 S 0.083 -186 E 0.077 -187 K 0.069 -188 L 0.067 -189 A 0.073 -190 E 0.080 -191 A 0.084 -192 L 0.086 -193 A 0.094 -194 S 0.106 -195 A 0.113 -196 T 0.105 -197 E 0.089 -198 K 0.080 -199 Q 0.084 -200 K 0.096 -201 K 0.103 -202 A 0.102 -203 L 0.102 -204 E 0.107 -205 K 0.122 -206 L 0.152 -207 L 0.202 -208 P 0.265 -209 P 0.317 -210 S 0.339 -211 S 0.340 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022516.11_ENSMUST00000230931.2_GN:Nudt16l1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022516.11_ENSMUST00000230931.2_GN:Nudt16l1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid deleted file mode 100644 index 9956dba0bac8f43b97bec4eebe2272311eda6e71..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022516.11_ENSMUST00000230931.2_GN:Nudt16l1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid +++ /dev/null @@ -1,224 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000022516.11|ENSMUST00000230931.2|GN:Nudt16l1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:12 -1 M 0.304 -2 L 0.311 -3 V 0.326 -4 W 0.346 -5 A 0.361 -6 V 0.363 -7 G 0.354 -8 L 0.347 -9 E 0.349 -10 H 0.356 -11 I 0.361 -12 K 0.359 -13 M 0.355 -14 S 0.350 -15 T 0.346 -16 T 0.341 -17 T 0.328 -18 V 0.299 -19 P 0.253 -20 E 0.200 -21 L 0.153 -22 K 0.117 -23 Q 0.093 -24 I 0.080 -25 S 0.077 -26 R 0.079 -27 E 0.078 -28 E 0.070 -29 A 0.060 -30 M 0.058 -31 R 0.065 -32 L 0.076 -33 G 0.086 -34 P 0.089 -35 G 0.086 -36 W 0.076 -37 S 0.062 -38 H 0.049 -39 S 0.038 -40 C 0.031 -41 H 0.025 -42 A 0.022 -43 M 0.021 -44 L 0.025 -45 Y 0.036 -46 A 0.055 -47 A 0.078 -48 N 0.100 -49 P 0.116 -50 G 0.126 -51 Q 0.132 -52 L 0.140 -53 F 0.154 -54 G 0.172 -55 R 0.182 -56 I 0.174 -57 P 0.144 -58 M 0.103 -59 R 0.067 -60 F 0.047 -61 S 0.040 -62 V 0.041 -63 L 0.045 -64 M 0.051 -65 Q 0.059 -66 M 0.069 -67 R 0.079 -68 F 0.090 -69 D 0.101 -70 G 0.107 -71 L 0.102 -72 L 0.093 -73 G 0.087 -74 F 0.087 -75 P 0.086 -76 G 0.082 -77 G 0.076 -78 F 0.068 -79 V 0.060 -80 D 0.055 -81 R 0.057 -82 R 0.067 -83 F 0.076 -84 W 0.077 -85 S 0.075 -86 L 0.078 -87 E 0.091 -88 D 0.107 -89 G 0.117 -90 L 0.115 -91 N 0.107 -92 R 0.103 -93 V 0.104 -94 L 0.098 -95 G 0.086 -96 L 0.077 -97 G 0.080 -98 L 0.090 -99 G 0.101 -100 G 0.102 -101 L 0.096 -102 R 0.085 -103 L 0.071 -104 T 0.055 -105 E 0.044 -106 A 0.039 -107 D 0.034 -108 Y 0.028 -109 L 0.022 -110 S 0.019 -111 S 0.019 -112 H 0.024 -113 L 0.032 -114 T 0.045 -115 E 0.064 -116 G 0.084 -117 P 0.099 -118 H 0.105 -119 R 0.102 -120 V 0.089 -121 V 0.069 -122 A 0.049 -123 H 0.035 -124 L 0.026 -125 Y 0.023 -126 A 0.025 -127 R 0.029 -128 Q 0.033 -129 L 0.034 -130 T 0.033 -131 L 0.031 -132 E 0.031 -133 Q 0.037 -134 L 0.050 -135 H 0.067 -136 A 0.080 -137 V 0.082 -138 E 0.078 -139 I 0.074 -140 S 0.072 -141 A 0.071 -142 V 0.072 -143 H 0.074 -144 S 0.078 -145 R 0.085 -146 D 0.096 -147 H 0.108 -148 G 0.112 -149 L 0.106 -150 E 0.093 -151 V 0.083 -152 L 0.078 -153 G 0.073 -154 L 0.066 -155 V 0.059 -156 R 0.057 -157 V 0.058 -158 P 0.057 -159 L 0.056 -160 Y 0.061 -161 T 0.074 -162 Q 0.090 -163 K 0.106 -164 D 0.122 -165 R 0.138 -166 V 0.149 -167 G 0.148 -168 G 0.134 -169 F 0.114 -170 P 0.094 -171 N 0.080 -172 F 0.075 -173 L 0.077 -174 S 0.080 -175 N 0.081 -176 A 0.077 -177 F 0.070 -178 V 0.063 -179 S 0.060 -180 T 0.063 -181 A 0.062 -182 K 0.054 -183 Y 0.043 -184 Q 0.036 -185 L 0.032 -186 L 0.029 -187 F 0.027 -188 A 0.028 -189 L 0.031 -190 K 0.034 -191 V 0.038 -192 L 0.044 -193 N 0.052 -194 M 0.061 -195 M 0.071 -196 P 0.081 -197 S 0.084 -198 E 0.079 -199 K 0.070 -200 L 0.067 -201 A 0.072 -202 E 0.079 -203 A 0.082 -204 L 0.085 -205 A 0.093 -206 S 0.107 -207 A 0.115 -208 T 0.108 -209 E 0.092 -210 K 0.083 -211 Q 0.087 -212 K 0.099 -213 K 0.106 -214 A 0.105 -215 L 0.103 -216 E 0.109 -217 K 0.123 -218 L 0.153 -219 L 0.203 -220 P 0.266 -221 P 0.318 -222 S 0.341 -223 S 0.343 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022589.10_ENSMUST00000238900.3_GN:Cyp11b2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022589.10_ENSMUST00000238900.3_GN:Cyp11b2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 1c940e1627060b49b68d965dd602856129c2dace..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022589.10_ENSMUST00000238900.3_GN:Cyp11b2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,501 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000022589.10|ENSMUST00000238900.3|GN:Cyp11b2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.327 -2 A 0.341 -3 L 0.368 -4 R 0.396 -5 V 0.409 -6 T 0.406 -7 A 0.401 -8 D 0.395 -9 V 0.377 -10 W 0.354 -11 L 0.346 -12 A 0.356 -13 R 0.363 -14 P 0.348 -15 W 0.324 -16 Q 0.323 -17 C 0.349 -18 L 0.378 -19 H 0.405 -20 R 0.443 -21 T 0.489 -22 R 0.533 -23 A 0.579 -24 L 0.625 -25 G 0.660 -26 T 0.674 -27 T 0.669 -28 A 0.652 -29 T 0.628 -30 L 0.599 -31 A 0.563 -32 P 0.520 -33 K 0.467 -34 T 0.400 -35 L 0.329 -36 Q 0.267 -37 P 0.224 -38 F 0.193 -39 E 0.168 -40 A 0.150 -41 I 0.134 -42 P 0.118 -43 Q 0.107 -44 Y 0.105 -45 S 0.106 -46 R 0.102 -47 N 0.090 -48 K 0.072 -49 W 0.058 -50 L 0.049 -51 K 0.047 -52 M 0.048 -53 I 0.054 -54 Q 0.068 -55 I 0.086 -56 L 0.105 -57 R 0.126 -58 E 0.147 -59 Q 0.163 -60 G 0.174 -61 Q 0.177 -62 E 0.165 -63 N 0.137 -64 L 0.108 -65 H 0.088 -66 L 0.074 -67 E 0.062 -68 M 0.053 -69 H 0.048 -70 Q 0.042 -71 V 0.036 -72 F 0.030 -73 R 0.029 -74 E 0.032 -75 L 0.035 -76 G 0.033 -77 P 0.028 -78 I 0.023 -79 F 0.021 -80 R 0.021 -81 H 0.024 -82 S 0.031 -83 V 0.044 -84 G 0.061 -85 K 0.075 -86 T 0.077 -87 Q 0.069 -88 I 0.058 -89 V 0.053 -90 S 0.057 -91 V 0.066 -92 M 0.073 -93 L 0.073 -94 P 0.067 -95 E 0.059 -96 D 0.055 -97 A 0.056 -98 E 0.064 -99 K 0.076 -100 L 0.091 -101 H 0.104 -102 Q 0.112 -103 V 0.120 -104 E 0.127 -105 S 0.127 -106 M 0.118 -107 L 0.107 -108 P 0.100 -109 R 0.096 -110 R 0.097 -111 M 0.103 -112 H 0.107 -113 L 0.109 -114 E 0.105 -115 P 0.093 -116 W 0.080 -117 V 0.074 -118 A 0.074 -119 H 0.074 -120 R 0.077 -121 E 0.090 -122 L 0.116 -123 R 0.152 -124 G 0.186 -125 L 0.199 -126 R 0.184 -127 R 0.161 -128 G 0.151 -129 V 0.151 -130 F 0.148 -131 L 0.137 -132 L 0.122 -133 N 0.107 -134 G 0.097 -135 P 0.094 -136 E 0.096 -137 W 0.096 -138 R 0.088 -139 L 0.080 -140 N 0.077 -141 R 0.080 -142 L 0.082 -143 R 0.082 -144 L 0.080 -145 N 0.079 -146 R 0.082 -147 N 0.085 -148 V 0.084 -149 L 0.086 -150 S 0.091 -151 P 0.095 -152 K 0.092 -153 A 0.082 -154 V 0.070 -155 Q 0.060 -156 K 0.056 -157 F 0.053 -158 V 0.049 -159 P 0.044 -160 M 0.041 -161 V 0.045 -162 D 0.056 -163 M 0.063 -164 V 0.060 -165 A 0.049 -166 R 0.040 -167 D 0.037 -168 F 0.041 -169 L 0.052 -170 E 0.058 -171 T 0.053 -172 L 0.043 -173 K 0.037 -174 E 0.039 -175 K 0.049 -176 V 0.063 -177 L 0.074 -178 Q 0.086 -179 N 0.101 -180 A 0.116 -181 R 0.125 -182 G 0.117 -183 S 0.093 -184 L 0.067 -185 T 0.052 -186 M 0.047 -187 D 0.043 -188 V 0.038 -189 Q 0.035 -190 Q 0.038 -191 S 0.042 -192 L 0.045 -193 F 0.047 -194 N 0.054 -195 Y 0.062 -196 T 0.068 -197 I 0.074 -198 E 0.082 -199 A 0.083 -200 S 0.072 -201 N 0.057 -202 F 0.048 -203 A 0.043 -204 L 0.044 -205 F 0.052 -206 G 0.065 -207 E 0.082 -208 R 0.104 -209 L 0.129 -210 G 0.143 -211 L 0.140 -212 L 0.127 -213 G 0.114 -214 H 0.105 -215 D 0.096 -216 L 0.085 -217 S 0.071 -218 P 0.058 -219 G 0.047 -220 S 0.039 -221 L 0.035 -222 K 0.038 -223 F 0.049 -224 I 0.062 -225 H 0.066 -226 A 0.059 -227 L 0.046 -228 H 0.034 -229 S 0.027 -230 M 0.025 -231 F 0.029 -232 K 0.034 -233 S 0.038 -234 T 0.037 -235 S 0.032 -236 Q 0.028 -237 L 0.028 -238 L 0.030 -239 F 0.033 -240 L 0.037 -241 P 0.040 -242 K 0.040 -243 S 0.037 -244 L 0.035 -245 T 0.036 -246 R 0.039 -247 W 0.044 -248 T 0.053 -249 S 0.060 -250 T 0.059 -251 R 0.054 -252 V 0.052 -253 W 0.055 -254 K 0.058 -255 E 0.060 -256 H 0.061 -257 F 0.065 -258 D 0.071 -259 A 0.074 -260 W 0.071 -261 D 0.065 -262 V 0.063 -263 I 0.066 -264 S 0.069 -265 E 0.068 -266 Y 0.059 -267 A 0.051 -268 N 0.052 -269 R 0.055 -270 C 0.051 -271 I 0.042 -272 W 0.037 -273 K 0.041 -274 V 0.052 -275 H 0.068 -276 Q 0.084 -277 E 0.095 -278 L 0.102 -279 R 0.115 -280 L 0.141 -281 G 0.174 -282 S 0.197 -283 S 0.194 -284 Q 0.168 -285 T 0.132 -286 Y 0.096 -287 S 0.065 -288 G 0.045 -289 I 0.038 -290 V 0.040 -291 A 0.045 -292 E 0.048 -293 L 0.051 -294 I 0.060 -295 S 0.079 -296 Q 0.106 -297 G 0.128 -298 S 0.132 -299 L 0.116 -300 P 0.091 -301 L 0.071 -302 D 0.062 -303 A 0.060 -304 I 0.059 -305 K 0.061 -306 A 0.073 -307 N 0.095 -308 S 0.113 -309 M 0.120 -310 E 0.122 -311 L 0.128 -312 T 0.136 -313 A 0.140 -314 G 0.140 -315 S 0.132 -316 V 0.119 -317 D 0.112 -318 T 0.109 -319 T 0.100 -320 A 0.087 -321 I 0.076 -322 P 0.069 -323 L 0.062 -324 V 0.053 -325 M 0.046 -326 T 0.043 -327 L 0.043 -328 F 0.044 -329 E 0.047 -330 L 0.049 -331 A 0.052 -332 R 0.053 -333 N 0.051 -334 P 0.045 -335 D 0.041 -336 V 0.044 -337 Q 0.055 -338 K 0.067 -339 A 0.070 -340 L 0.069 -341 R 0.071 -342 Q 0.071 -343 E 0.063 -344 S 0.051 -345 L 0.046 -346 A 0.051 -347 A 0.056 -348 E 0.062 -349 A 0.071 -350 S 0.084 -351 I 0.094 -352 A 0.097 -353 A 0.094 -354 N 0.087 -355 P 0.081 -356 Q 0.085 -357 K 0.097 -358 A 0.108 -359 M 0.107 -360 S 0.101 -361 D 0.094 -362 L 0.085 -363 P 0.074 -364 L 0.063 -365 L 0.055 -366 R 0.054 -367 A 0.061 -368 A 0.072 -369 L 0.082 -370 K 0.087 -371 E 0.090 -372 T 0.088 -373 L 0.079 -374 R 0.065 -375 L 0.052 -376 Y 0.042 -377 P 0.038 -378 V 0.041 -379 G 0.045 -380 G 0.047 -381 F 0.045 -382 L 0.042 -383 E 0.040 -384 R 0.042 -385 I 0.048 -386 L 0.055 -387 S 0.058 -388 S 0.054 -389 D 0.046 -390 L 0.040 -391 V 0.036 -392 L 0.035 -393 Q 0.040 -394 N 0.047 -395 Y 0.053 -396 H 0.056 -397 V 0.058 -398 P 0.062 -399 A 0.062 -400 G 0.057 -401 T 0.049 -402 L 0.041 -403 V 0.034 -404 L 0.031 -405 L 0.034 -406 Y 0.043 -407 L 0.052 -408 Y 0.059 -409 S 0.064 -410 M 0.070 -411 G 0.078 -412 R 0.085 -413 N 0.090 -414 P 0.093 -415 A 0.092 -416 V 0.088 -417 F 0.084 -418 P 0.081 -419 R 0.081 -420 P 0.084 -421 E 0.085 -422 R 0.083 -423 Y 0.078 -424 M 0.070 -425 P 0.063 -426 Q 0.062 -427 R 0.066 -428 W 0.073 -429 L 0.084 -430 E 0.108 -431 R 0.149 -432 K 0.186 -433 R 0.200 -434 S 0.187 -435 F 0.166 -436 Q 0.155 -437 H 0.153 -438 L 0.155 -439 A 0.154 -440 F 0.147 -441 G 0.135 -442 F 0.123 -443 G 0.115 -444 V 0.111 -445 R 0.119 -446 Q 0.140 -447 C 0.161 -448 L 0.169 -449 G 0.164 -450 R 0.150 -451 R 0.146 -452 L 0.159 -453 A 0.167 -454 E 0.153 -455 V 0.132 -456 E 0.122 -457 M 0.110 -458 M 0.089 -459 L 0.070 -460 L 0.061 -461 L 0.058 -462 H 0.053 -463 H 0.049 -464 I 0.048 -465 L 0.049 -466 K 0.049 -467 T 0.046 -468 F 0.041 -469 Q 0.040 -470 V 0.043 -471 E 0.049 -472 T 0.058 -473 L 0.072 -474 R 0.095 -475 Q 0.127 -476 E 0.152 -477 D 0.155 -478 V 0.138 -479 Q 0.116 -480 M 0.101 -481 A 0.089 -482 Y 0.075 -483 R 0.063 -484 F 0.061 -485 V 0.070 -486 L 0.085 -487 M 0.102 -488 P 0.118 -489 S 0.131 -490 S 0.137 -491 S 0.130 -492 P 0.110 -493 V 0.086 -494 L 0.067 -495 T 0.058 -496 F 0.061 -497 R 0.082 -498 P 0.123 -499 V 0.178 -500 S 0.220 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022589.10_ENSMUST00000238900.3_GN:Cyp11b2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022589.10_ENSMUST00000238900.3_GN:Cyp11b2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid deleted file mode 100644 index 5bcab895fadca313f987ffd1a233a2931614fedf..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022589.10_ENSMUST00000238900.3_GN:Cyp11b2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid +++ /dev/null @@ -1,503 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000022589.10|ENSMUST00000238900.3|GN:Cyp11b2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:2 -1 M 0.268 -2 A 0.271 -3 M 0.282 -4 A 0.294 -5 L 0.297 -6 R 0.299 -7 V 0.312 -8 T 0.332 -9 A 0.349 -10 D 0.354 -11 V 0.343 -12 W 0.328 -13 L 0.326 -14 A 0.340 -15 R 0.351 -16 P 0.344 -17 W 0.325 -18 Q 0.325 -19 C 0.352 -20 L 0.382 -21 H 0.408 -22 R 0.444 -23 T 0.488 -24 R 0.530 -25 A 0.573 -26 L 0.617 -27 G 0.651 -28 T 0.668 -29 T 0.665 -30 A 0.649 -31 T 0.627 -32 L 0.599 -33 A 0.563 -34 P 0.520 -35 K 0.466 -36 T 0.399 -37 L 0.327 -38 Q 0.266 -39 P 0.223 -40 F 0.192 -41 E 0.167 -42 A 0.149 -43 I 0.133 -44 P 0.117 -45 Q 0.106 -46 Y 0.104 -47 S 0.105 -48 R 0.101 -49 N 0.089 -50 K 0.071 -51 W 0.057 -52 L 0.049 -53 K 0.046 -54 M 0.047 -55 I 0.054 -56 Q 0.067 -57 I 0.085 -58 L 0.104 -59 R 0.124 -60 E 0.145 -61 Q 0.161 -62 G 0.173 -63 Q 0.176 -64 E 0.164 -65 N 0.137 -66 L 0.107 -67 H 0.087 -68 L 0.073 -69 E 0.061 -70 M 0.052 -71 H 0.047 -72 Q 0.042 -73 V 0.035 -74 F 0.030 -75 R 0.029 -76 E 0.032 -77 L 0.034 -78 G 0.033 -79 P 0.028 -80 I 0.023 -81 F 0.020 -82 R 0.021 -83 H 0.024 -84 S 0.031 -85 V 0.043 -86 G 0.060 -87 K 0.074 -88 T 0.077 -89 Q 0.068 -90 I 0.057 -91 V 0.053 -92 S 0.057 -93 V 0.066 -94 M 0.073 -95 L 0.073 -96 P 0.067 -97 E 0.059 -98 D 0.055 -99 A 0.056 -100 E 0.064 -101 K 0.076 -102 L 0.092 -103 H 0.104 -104 Q 0.112 -105 V 0.120 -106 E 0.127 -107 S 0.127 -108 M 0.118 -109 L 0.107 -110 P 0.100 -111 R 0.096 -112 R 0.097 -113 M 0.102 -114 H 0.107 -115 L 0.109 -116 E 0.105 -117 P 0.093 -118 W 0.079 -119 V 0.071 -120 A 0.070 -121 H 0.070 -122 R 0.075 -123 E 0.090 -124 L 0.116 -125 R 0.152 -126 G 0.186 -127 L 0.199 -128 R 0.184 -129 R 0.161 -130 G 0.151 -131 V 0.151 -132 F 0.148 -133 L 0.137 -134 L 0.122 -135 N 0.107 -136 G 0.097 -137 P 0.094 -138 E 0.096 -139 W 0.096 -140 R 0.088 -141 L 0.079 -142 N 0.077 -143 R 0.079 -144 L 0.081 -145 R 0.081 -146 L 0.080 -147 N 0.079 -148 R 0.082 -149 N 0.085 -150 V 0.084 -151 L 0.086 -152 S 0.091 -153 P 0.095 -154 K 0.092 -155 A 0.082 -156 V 0.070 -157 Q 0.060 -158 K 0.056 -159 F 0.053 -160 V 0.049 -161 P 0.044 -162 M 0.041 -163 V 0.045 -164 D 0.055 -165 M 0.062 -166 V 0.059 -167 A 0.049 -168 R 0.040 -169 D 0.037 -170 F 0.041 -171 L 0.051 -172 E 0.058 -173 T 0.053 -174 L 0.043 -175 K 0.037 -176 E 0.039 -177 K 0.049 -178 V 0.062 -179 L 0.074 -180 Q 0.086 -181 N 0.100 -182 A 0.116 -183 R 0.124 -184 G 0.117 -185 S 0.092 -186 L 0.066 -187 T 0.052 -188 M 0.047 -189 D 0.043 -190 V 0.037 -191 Q 0.035 -192 Q 0.037 -193 S 0.042 -194 L 0.044 -195 F 0.047 -196 N 0.054 -197 Y 0.062 -198 T 0.068 -199 I 0.074 -200 E 0.081 -201 A 0.082 -202 S 0.072 -203 N 0.057 -204 F 0.047 -205 A 0.043 -206 L 0.044 -207 F 0.052 -208 G 0.064 -209 E 0.081 -210 R 0.104 -211 L 0.128 -212 G 0.143 -213 L 0.140 -214 L 0.127 -215 G 0.114 -216 H 0.105 -217 D 0.096 -218 L 0.084 -219 S 0.071 -220 P 0.057 -221 G 0.047 -222 S 0.038 -223 L 0.034 -224 K 0.037 -225 F 0.046 -226 I 0.055 -227 H 0.057 -228 A 0.052 -229 L 0.042 -230 H 0.032 -231 S 0.026 -232 M 0.025 -233 F 0.029 -234 K 0.034 -235 S 0.038 -236 T 0.037 -237 S 0.032 -238 Q 0.028 -239 L 0.028 -240 L 0.030 -241 F 0.033 -242 L 0.037 -243 P 0.040 -244 K 0.040 -245 S 0.037 -246 L 0.035 -247 T 0.036 -248 R 0.039 -249 W 0.044 -250 T 0.053 -251 S 0.060 -252 T 0.059 -253 R 0.054 -254 V 0.052 -255 W 0.055 -256 K 0.058 -257 E 0.060 -258 H 0.061 -259 F 0.065 -260 D 0.071 -261 A 0.074 -262 W 0.070 -263 D 0.065 -264 V 0.061 -265 I 0.060 -266 S 0.058 -267 E 0.054 -268 Y 0.047 -269 A 0.044 -270 N 0.047 -271 R 0.051 -272 C 0.048 -273 I 0.041 -274 W 0.037 -275 K 0.041 -276 V 0.052 -277 H 0.068 -278 Q 0.083 -279 E 0.094 -280 L 0.102 -281 R 0.115 -282 L 0.141 -283 G 0.175 -284 S 0.197 -285 S 0.194 -286 Q 0.169 -287 T 0.133 -288 Y 0.096 -289 S 0.065 -290 G 0.045 -291 I 0.038 -292 V 0.040 -293 A 0.045 -294 E 0.048 -295 L 0.052 -296 I 0.060 -297 S 0.079 -298 Q 0.106 -299 G 0.128 -300 S 0.133 -301 L 0.116 -302 P 0.091 -303 L 0.071 -304 D 0.062 -305 A 0.060 -306 I 0.059 -307 K 0.061 -308 A 0.073 -309 N 0.094 -310 S 0.113 -311 M 0.120 -312 E 0.122 -313 L 0.128 -314 T 0.135 -315 A 0.139 -316 G 0.139 -317 S 0.131 -318 V 0.118 -319 D 0.111 -320 T 0.108 -321 T 0.100 -322 A 0.086 -323 I 0.076 -324 P 0.069 -325 L 0.062 -326 V 0.053 -327 M 0.046 -328 T 0.043 -329 L 0.043 -330 F 0.044 -331 E 0.047 -332 L 0.049 -333 A 0.052 -334 R 0.053 -335 N 0.051 -336 P 0.045 -337 D 0.040 -338 V 0.043 -339 Q 0.053 -340 K 0.064 -341 A 0.068 -342 L 0.068 -343 R 0.070 -344 Q 0.071 -345 E 0.063 -346 S 0.050 -347 L 0.046 -348 A 0.050 -349 A 0.056 -350 E 0.061 -351 A 0.071 -352 S 0.084 -353 I 0.094 -354 A 0.097 -355 A 0.094 -356 N 0.087 -357 P 0.081 -358 Q 0.085 -359 K 0.097 -360 A 0.107 -361 M 0.107 -362 S 0.101 -363 D 0.094 -364 L 0.085 -365 P 0.074 -366 L 0.063 -367 L 0.055 -368 R 0.054 -369 A 0.061 -370 A 0.072 -371 L 0.082 -372 K 0.087 -373 E 0.090 -374 T 0.088 -375 L 0.079 -376 R 0.065 -377 L 0.052 -378 Y 0.042 -379 P 0.038 -380 V 0.041 -381 G 0.045 -382 G 0.046 -383 F 0.045 -384 L 0.042 -385 E 0.040 -386 R 0.041 -387 I 0.047 -388 L 0.055 -389 S 0.057 -390 S 0.053 -391 D 0.046 -392 L 0.040 -393 V 0.036 -394 L 0.035 -395 Q 0.039 -396 N 0.047 -397 Y 0.053 -398 H 0.056 -399 V 0.058 -400 P 0.061 -401 A 0.062 -402 G 0.057 -403 T 0.049 -404 L 0.040 -405 V 0.034 -406 L 0.031 -407 L 0.034 -408 Y 0.043 -409 L 0.052 -410 Y 0.058 -411 S 0.064 -412 M 0.071 -413 G 0.078 -414 R 0.085 -415 N 0.090 -416 P 0.093 -417 A 0.092 -418 V 0.088 -419 F 0.084 -420 P 0.081 -421 R 0.081 -422 P 0.084 -423 E 0.085 -424 R 0.083 -425 Y 0.078 -426 M 0.069 -427 P 0.063 -428 Q 0.062 -429 R 0.066 -430 W 0.072 -431 L 0.083 -432 E 0.108 -433 R 0.148 -434 K 0.185 -435 R 0.198 -436 S 0.186 -437 F 0.166 -438 Q 0.154 -439 H 0.153 -440 L 0.155 -441 A 0.154 -442 F 0.147 -443 G 0.135 -444 F 0.123 -445 G 0.114 -446 V 0.111 -447 R 0.120 -448 Q 0.141 -449 C 0.161 -450 L 0.169 -451 G 0.164 -452 R 0.150 -453 R 0.146 -454 L 0.159 -455 A 0.167 -456 E 0.153 -457 V 0.132 -458 E 0.122 -459 M 0.110 -460 M 0.089 -461 L 0.070 -462 L 0.061 -463 L 0.058 -464 H 0.053 -465 H 0.049 -466 I 0.048 -467 L 0.049 -468 K 0.049 -469 T 0.045 -470 F 0.041 -471 Q 0.039 -472 V 0.043 -473 E 0.049 -474 T 0.058 -475 L 0.071 -476 R 0.095 -477 Q 0.126 -478 E 0.152 -479 D 0.155 -480 V 0.137 -481 Q 0.116 -482 M 0.101 -483 A 0.089 -484 Y 0.075 -485 R 0.064 -486 F 0.061 -487 V 0.070 -488 L 0.086 -489 M 0.102 -490 P 0.118 -491 S 0.131 -492 S 0.136 -493 S 0.129 -494 P 0.109 -495 V 0.085 -496 L 0.067 -497 T 0.058 -498 F 0.061 -499 R 0.081 -500 P 0.121 -501 V 0.175 -502 S 0.216 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022774.14_ENSMUST00000023460.7_GN:Ncbp2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022774.14_ENSMUST00000023460.7_GN:Ncbp2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 8907c9ab594d2b07b430a5133c2f81f5a6174486..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022774.14_ENSMUST00000023460.7_GN:Ncbp2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,157 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000022774.14|ENSMUST00000023460.7|GN:Ncbp2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.450 -2 S 0.476 -3 G 0.516 -4 G 0.546 -5 L 0.551 -6 L 0.539 -7 K 0.529 -8 A 0.522 -9 L 0.505 -10 R 0.479 -11 S 0.458 -12 D 0.439 -13 S 0.412 -14 Y 0.370 -15 V 0.320 -16 E 0.274 -17 L 0.238 -18 S 0.209 -19 E 0.182 -20 Y 0.152 -21 R 0.125 -22 D 0.109 -23 Q 0.108 -24 H 0.114 -25 F 0.122 -26 R 0.132 -27 G 0.149 -28 D 0.166 -29 N 0.168 -30 E 0.154 -31 E 0.139 -32 Q 0.133 -33 E 0.131 -34 K 0.125 -35 L 0.118 -36 L 0.111 -37 K 0.101 -38 K 0.082 -39 S 0.060 -40 C 0.044 -41 T 0.038 -42 L 0.041 -43 Y 0.051 -44 V 0.064 -45 G 0.075 -46 N 0.080 -47 L 0.077 -48 S 0.066 -49 F 0.055 -50 Y 0.049 -51 T 0.045 -52 T 0.041 -53 E 0.038 -54 E 0.039 -55 Q 0.042 -56 I 0.050 -57 Y 0.062 -58 E 0.069 -59 L 0.065 -60 F 0.055 -61 S 0.049 -62 K 0.049 -63 S 0.055 -64 G 0.065 -65 D 0.074 -66 I 0.073 -67 K 0.066 -68 K 0.060 -69 I 0.063 -70 I 0.070 -71 M 0.078 -72 G 0.085 -73 L 0.091 -74 D 0.094 -75 K 0.094 -76 M 0.097 -77 K 0.105 -78 K 0.115 -79 T 0.122 -80 A 0.115 -81 C 0.094 -82 G 0.068 -83 F 0.048 -84 C 0.038 -85 F 0.039 -86 V 0.046 -87 E 0.057 -88 Y 0.064 -89 Y 0.065 -90 S 0.061 -91 R 0.058 -92 A 0.057 -93 D 0.055 -94 A 0.054 -95 E 0.057 -96 N 0.062 -97 A 0.066 -98 M 0.067 -99 R 0.067 -100 Y 0.065 -101 I 0.059 -102 N 0.054 -103 G 0.053 -104 T 0.057 -105 R 0.062 -106 L 0.069 -107 D 0.077 -108 D 0.086 -109 R 0.097 -110 I 0.108 -111 I 0.116 -112 R 0.119 -113 T 0.118 -114 D 0.116 -115 W 0.116 -116 D 0.120 -117 A 0.124 -118 G 0.128 -119 F 0.137 -120 K 0.158 -121 E 0.193 -122 G 0.232 -123 R 0.257 -124 Q 0.251 -125 Y 0.227 -126 G 0.213 -127 R 0.227 -128 G 0.261 -129 R 0.290 -130 S 0.298 -131 G 0.309 -132 G 0.352 -133 Q 0.413 -134 V 0.452 -135 R 0.456 -136 D 0.438 -137 E 0.411 -138 Y 0.391 -139 R 0.402 -140 E 0.443 -141 D 0.476 -142 Y 0.463 -143 D 0.408 -144 A 0.347 -145 G 0.305 -146 R 0.288 -147 G 0.285 -148 G 0.290 -149 Y 0.304 -150 G 0.329 -151 K 0.360 -152 L 0.388 -153 A 0.406 -154 Q 0.417 -155 K 0.422 -156 Q 0.422 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022774.14_ENSMUST00000023460.7_GN:Ncbp2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:38.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022774.14_ENSMUST00000023460.7_GN:Ncbp2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:38.caid deleted file mode 100644 index aa8ae831f1efd103ea702d853e1bfe3f29bc4a28..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022774.14_ENSMUST00000023460.7_GN:Ncbp2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:38.caid +++ /dev/null @@ -1,195 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000022774.14|ENSMUST00000023460.7|GN:Ncbp2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:38 -1 M 0.395 -2 T 0.413 -3 T 0.445 -4 R 0.479 -5 L 0.505 -6 A 0.519 -7 P 0.524 -8 W 0.516 -9 F 0.488 -10 W 0.447 -11 S 0.421 -12 T 0.427 -13 P 0.438 -14 P 0.433 -15 A 0.432 -16 F 0.451 -17 P 0.472 -18 F 0.480 -19 P 0.490 -20 P 0.511 -21 P 0.533 -22 A 0.551 -23 A 0.562 -24 W 0.558 -25 F 0.534 -26 S 0.503 -27 R 0.483 -28 P 0.481 -29 W 0.494 -30 P 0.511 -31 C 0.520 -32 R 0.515 -33 V 0.502 -34 W 0.488 -35 C 0.482 -36 F 0.490 -37 C 0.512 -38 I 0.544 -39 M 0.579 -40 S 0.610 -41 G 0.634 -42 G 0.647 -43 L 0.646 -44 L 0.635 -45 K 0.623 -46 A 0.605 -47 L 0.577 -48 R 0.547 -49 S 0.525 -50 D 0.502 -51 S 0.465 -52 Y 0.411 -53 V 0.350 -54 E 0.292 -55 L 0.245 -56 S 0.208 -57 E 0.176 -58 Y 0.146 -59 R 0.120 -60 D 0.105 -61 Q 0.104 -62 H 0.109 -63 F 0.116 -64 R 0.124 -65 G 0.139 -66 D 0.155 -67 N 0.159 -68 E 0.148 -69 E 0.135 -70 Q 0.130 -71 E 0.130 -72 K 0.125 -73 L 0.117 -74 L 0.110 -75 K 0.099 -76 K 0.080 -77 S 0.058 -78 C 0.042 -79 T 0.037 -80 L 0.041 -81 Y 0.052 -82 V 0.064 -83 G 0.074 -84 N 0.078 -85 L 0.074 -86 S 0.063 -87 F 0.052 -88 Y 0.047 -89 T 0.044 -90 T 0.041 -91 E 0.039 -92 E 0.040 -93 Q 0.043 -94 I 0.050 -95 Y 0.062 -96 E 0.069 -97 L 0.065 -98 F 0.055 -99 S 0.048 -100 K 0.048 -101 S 0.054 -102 G 0.063 -103 D 0.072 -104 I 0.073 -105 K 0.066 -106 K 0.061 -107 I 0.064 -108 I 0.071 -109 M 0.078 -110 G 0.084 -111 L 0.088 -112 D 0.090 -113 K 0.090 -114 M 0.093 -115 K 0.102 -116 K 0.114 -117 T 0.121 -118 A 0.115 -119 C 0.094 -120 G 0.068 -121 F 0.048 -122 C 0.039 -123 F 0.039 -124 V 0.046 -125 E 0.056 -126 Y 0.064 -127 Y 0.064 -128 S 0.060 -129 R 0.058 -130 A 0.056 -131 D 0.054 -132 A 0.054 -133 E 0.056 -134 N 0.062 -135 A 0.066 -136 M 0.067 -137 R 0.066 -138 Y 0.064 -139 I 0.060 -140 N 0.056 -141 G 0.056 -142 T 0.060 -143 R 0.066 -144 L 0.072 -145 D 0.079 -146 D 0.088 -147 R 0.098 -148 I 0.109 -149 I 0.116 -150 R 0.119 -151 T 0.119 -152 D 0.118 -153 W 0.118 -154 D 0.123 -155 A 0.128 -156 G 0.133 -157 F 0.142 -158 K 0.164 -159 E 0.199 -160 G 0.241 -161 R 0.267 -162 Q 0.260 -163 Y 0.233 -164 G 0.216 -165 R 0.229 -166 G 0.263 -167 R 0.292 -168 S 0.301 -169 G 0.314 -170 G 0.361 -171 Q 0.428 -172 V 0.472 -173 R 0.478 -174 D 0.459 -175 E 0.429 -176 Y 0.407 -177 R 0.417 -178 E 0.459 -179 D 0.490 -180 Y 0.476 -181 D 0.419 -182 A 0.356 -183 G 0.314 -184 R 0.296 -185 G 0.292 -186 G 0.297 -187 Y 0.312 -188 G 0.339 -189 K 0.372 -190 L 0.403 -191 A 0.425 -192 Q 0.437 -193 K 0.441 -194 Q 0.441 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022871.14_ENSMUST00000232097.2_GN:Fetub_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022871.14_ENSMUST00000232097.2_GN:Fetub_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index dfe33564c9ba3fd269e75f3c38ac6a1be1e17faf..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022871.14_ENSMUST00000232097.2_GN:Fetub_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,389 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000022871.14|ENSMUST00000232097.2|GN:Fetub|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.300 -2 G 0.284 -3 L 0.257 -4 L 0.229 -5 R 0.207 -6 L 0.193 -7 L 0.189 -8 V 0.193 -9 L 0.201 -10 C 0.213 -11 T 0.233 -12 L 0.254 -13 A 0.270 -14 A 0.284 -15 C 0.306 -16 C 0.336 -17 M 0.367 -18 A 0.391 -19 R 0.414 -20 S 0.445 -21 P 0.483 -22 P 0.517 -23 A 0.537 -24 P 0.551 -25 P 0.565 -26 L 0.574 -27 P 0.570 -28 Q 0.554 -29 R 0.530 -30 P 0.494 -31 L 0.443 -32 S 0.377 -33 P 0.305 -34 L 0.239 -35 H 0.187 -36 P 0.148 -37 L 0.117 -38 G 0.094 -39 C 0.079 -40 N 0.067 -41 D 0.056 -42 S 0.045 -43 E 0.036 -44 V 0.029 -45 L 0.025 -46 A 0.024 -47 V 0.025 -48 A 0.028 -49 G 0.029 -50 F 0.029 -51 A 0.030 -52 L 0.035 -53 Q 0.043 -54 N 0.055 -55 I 0.068 -56 N 0.074 -57 R 0.073 -58 D 0.072 -59 Q 0.074 -60 K 0.082 -61 D 0.095 -62 G 0.109 -63 Y 0.114 -64 M 0.103 -65 L 0.081 -66 S 0.057 -67 L 0.039 -68 N 0.031 -69 R 0.030 -70 V 0.033 -71 H 0.036 -72 D 0.034 -73 V 0.030 -74 R 0.026 -75 E 0.025 -76 H 0.028 -77 Y 0.036 -78 Q 0.048 -79 E 0.063 -80 D 0.077 -81 M 0.083 -82 G 0.075 -83 S 0.058 -84 L 0.046 -85 F 0.045 -86 Y 0.054 -87 L 0.069 -88 T 0.082 -89 L 0.089 -90 D 0.091 -91 V 0.092 -92 L 0.099 -93 E 0.108 -94 T 0.117 -95 D 0.121 -96 C 0.119 -97 H 0.114 -98 V 0.114 -99 L 0.124 -100 S 0.143 -101 R 0.164 -102 K 0.179 -103 A 0.179 -104 Q 0.160 -105 K 0.134 -106 D 0.116 -107 C 0.112 -108 K 0.117 -109 P 0.118 -110 R 0.112 -111 M 0.103 -112 F 0.095 -113 Y 0.091 -114 E 0.093 -115 S 0.099 -116 V 0.100 -117 Y 0.089 -118 G 0.073 -119 Q 0.061 -120 C 0.051 -121 K 0.043 -122 A 0.036 -123 M 0.032 -124 F 0.031 -125 H 0.032 -126 I 0.037 -127 N 0.044 -128 K 0.053 -129 P 0.059 -130 R 0.059 -131 R 0.055 -132 V 0.050 -133 L 0.047 -134 Y 0.048 -135 L 0.053 -136 P 0.057 -137 A 0.058 -138 Y 0.058 -139 N 0.060 -140 C 0.065 -141 T 0.072 -142 L 0.082 -143 R 0.098 -144 P 0.123 -145 V 0.154 -146 S 0.182 -147 K 0.205 -148 R 0.230 -149 K 0.256 -150 T 0.274 -151 H 0.279 -152 T 0.275 -153 T 0.262 -154 C 0.235 -155 P 0.201 -156 D 0.176 -157 C 0.164 -158 P 0.158 -159 S 0.146 -160 P 0.125 -161 I 0.101 -162 D 0.079 -163 L 0.065 -164 S 0.057 -165 N 0.052 -166 P 0.046 -167 S 0.039 -168 A 0.035 -169 L 0.033 -170 E 0.034 -171 A 0.034 -172 A 0.033 -173 T 0.031 -174 E 0.030 -175 S 0.030 -176 L 0.032 -177 A 0.035 -178 K 0.042 -179 F 0.052 -180 N 0.061 -181 S 0.064 -182 K 0.065 -183 S 0.067 -184 P 0.072 -185 S 0.080 -186 K 0.090 -187 K 0.094 -188 Y 0.086 -189 E 0.070 -190 L 0.052 -191 V 0.040 -192 K 0.035 -193 V 0.035 -194 T 0.035 -195 K 0.034 -196 A 0.032 -197 M 0.032 -198 N 0.034 -199 Q 0.036 -200 W 0.039 -201 V 0.042 -202 S 0.045 -203 G 0.046 -204 P 0.045 -205 A 0.044 -206 Y 0.046 -207 Y 0.053 -208 V 0.061 -209 E 0.068 -210 Y 0.071 -211 L 0.071 -212 I 0.070 -213 K 0.077 -214 E 0.093 -215 A 0.114 -216 P 0.135 -217 C 0.156 -218 T 0.176 -219 K 0.192 -220 S 0.205 -221 Q 0.218 -222 A 0.224 -223 S 0.223 -224 C 0.227 -225 S 0.245 -226 L 0.270 -227 Q 0.288 -228 H 0.297 -229 S 0.293 -230 D 0.267 -231 S 0.224 -232 E 0.178 -233 P 0.141 -234 V 0.112 -235 G 0.093 -236 I 0.082 -237 C 0.074 -238 Q 0.067 -239 G 0.062 -240 S 0.063 -241 T 0.075 -242 V 0.099 -243 Q 0.134 -244 S 0.172 -245 S 0.202 -246 L 0.220 -247 R 0.228 -248 H 0.231 -249 V 0.234 -250 P 0.243 -251 L 0.263 -252 I 0.290 -253 Q 0.312 -254 P 0.310 -255 V 0.272 -256 E 0.211 -257 K 0.152 -258 S 0.114 -259 V 0.096 -260 T 0.088 -261 V 0.082 -262 T 0.078 -263 C 0.081 -264 E 0.097 -265 F 0.136 -266 F 0.207 -267 E 0.309 -268 S 0.419 -269 Q 0.508 -270 A 0.561 -271 Q 0.589 -272 V 0.615 -273 P 0.646 -274 G 0.673 -275 D 0.684 -276 E 0.683 -277 N 0.680 -278 P 0.680 -279 A 0.672 -280 V 0.640 -281 T 0.586 -282 Q 0.550 -283 G 0.557 -284 P 0.567 -285 Q 0.545 -286 K 0.514 -287 L 0.496 -288 P 0.467 -289 Q 0.436 -290 K 0.463 -291 N 0.555 -292 T 0.644 -293 A 0.692 -294 P 0.713 -295 T 0.724 -296 S 0.733 -297 S 0.743 -298 P 0.755 -299 S 0.760 -300 V 0.756 -301 T 0.748 -302 A 0.745 -303 P 0.752 -304 R 0.760 -305 G 0.748 -306 S 0.695 -307 I 0.617 -308 Q 0.572 -309 H 0.585 -310 L 0.610 -311 P 0.610 -312 E 0.616 -313 L 0.661 -314 D 0.714 -315 D 0.732 -316 E 0.724 -317 K 0.722 -318 P 0.739 -319 E 0.763 -320 E 0.780 -321 S 0.786 -322 K 0.783 -323 G 0.773 -324 G 0.759 -325 S 0.744 -326 P 0.732 -327 E 0.721 -328 E 0.699 -329 A 0.673 -330 F 0.665 -331 P 0.690 -332 V 0.724 -333 Q 0.739 -334 L 0.733 -335 D 0.721 -336 L 0.714 -337 T 0.709 -338 T 0.704 -339 N 0.708 -340 P 0.723 -341 Q 0.744 -342 G 0.760 -343 D 0.758 -344 T 0.732 -345 L 0.690 -346 D 0.654 -347 V 0.634 -348 S 0.618 -349 F 0.594 -350 L 0.560 -351 Y 0.526 -352 L 0.500 -353 E 0.486 -354 P 0.485 -355 G 0.499 -356 D 0.518 -357 K 0.536 -358 K 0.557 -359 L 0.577 -360 V 0.574 -361 V 0.545 -362 L 0.517 -363 P 0.522 -364 F 0.563 -365 P 0.619 -366 G 0.662 -367 K 0.673 -368 E 0.647 -369 Q 0.589 -370 R 0.523 -371 S 0.474 -372 A 0.448 -373 E 0.440 -374 C 0.462 -375 P 0.521 -376 G 0.598 -377 P 0.662 -378 E 0.695 -379 K 0.698 -380 E 0.685 -381 N 0.670 -382 N 0.661 -383 P 0.659 -384 L 0.652 -385 V 0.626 -386 L 0.576 -387 P 0.514 -388 P 0.469 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022871.14_ENSMUST00000232097.2_GN:Fetub_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022871.14_ENSMUST00000232097.2_GN:Fetub_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid deleted file mode 100644 index e02bd2f49eb8a7ba7ceceb8889d5ce3efecfd355..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022871.14_ENSMUST00000232097.2_GN:Fetub_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid +++ /dev/null @@ -1,397 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000022871.14|ENSMUST00000232097.2|GN:Fetub|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:8 -1 M 0.340 -2 C 0.343 -3 V 0.341 -4 C 0.326 -5 H 0.298 -6 L 0.266 -7 W 0.247 -8 R 0.252 -9 M 0.268 -10 G 0.275 -11 L 0.263 -12 L 0.242 -13 R 0.225 -14 L 0.217 -15 L 0.222 -16 V 0.235 -17 L 0.249 -18 C 0.260 -19 T 0.266 -20 L 0.268 -21 A 0.275 -22 A 0.290 -23 C 0.315 -24 C 0.347 -25 M 0.378 -26 A 0.404 -27 R 0.430 -28 S 0.462 -29 P 0.499 -30 P 0.526 -31 A 0.541 -32 P 0.551 -33 P 0.564 -34 L 0.573 -35 P 0.569 -36 Q 0.553 -37 R 0.529 -38 P 0.493 -39 L 0.441 -40 S 0.376 -41 P 0.305 -42 L 0.240 -43 H 0.189 -44 P 0.150 -45 L 0.120 -46 G 0.098 -47 C 0.082 -48 N 0.069 -49 D 0.058 -50 S 0.047 -51 E 0.037 -52 V 0.030 -53 L 0.026 -54 A 0.024 -55 V 0.026 -56 A 0.028 -57 G 0.029 -58 F 0.029 -59 A 0.030 -60 L 0.035 -61 Q 0.043 -62 N 0.055 -63 I 0.067 -64 N 0.073 -65 R 0.073 -66 D 0.071 -67 Q 0.073 -68 K 0.080 -69 D 0.093 -70 G 0.106 -71 Y 0.110 -72 M 0.100 -73 L 0.078 -74 S 0.055 -75 L 0.038 -76 N 0.030 -77 R 0.030 -78 V 0.033 -79 H 0.035 -80 D 0.034 -81 V 0.029 -82 R 0.026 -83 E 0.025 -84 H 0.028 -85 Y 0.036 -86 Q 0.048 -87 E 0.063 -88 D 0.077 -89 M 0.083 -90 G 0.074 -91 S 0.059 -92 L 0.046 -93 F 0.045 -94 Y 0.055 -95 L 0.070 -96 T 0.083 -97 L 0.089 -98 D 0.090 -99 V 0.092 -100 L 0.098 -101 E 0.108 -102 T 0.117 -103 D 0.120 -104 C 0.118 -105 H 0.113 -106 V 0.113 -107 L 0.123 -108 S 0.143 -109 R 0.165 -110 K 0.181 -111 A 0.181 -112 Q 0.162 -113 K 0.135 -114 D 0.117 -115 C 0.113 -116 K 0.117 -117 P 0.118 -118 R 0.112 -119 M 0.102 -120 F 0.094 -121 Y 0.090 -122 E 0.093 -123 S 0.099 -124 V 0.100 -125 Y 0.089 -126 G 0.073 -127 Q 0.061 -128 C 0.052 -129 K 0.043 -130 A 0.036 -131 M 0.032 -132 F 0.031 -133 H 0.033 -134 I 0.037 -135 N 0.045 -136 K 0.054 -137 P 0.060 -138 R 0.060 -139 R 0.057 -140 V 0.052 -141 L 0.048 -142 Y 0.049 -143 L 0.054 -144 P 0.058 -145 A 0.059 -146 Y 0.058 -147 N 0.060 -148 C 0.065 -149 T 0.072 -150 L 0.082 -151 R 0.098 -152 P 0.124 -153 V 0.155 -154 S 0.184 -155 K 0.207 -156 R 0.232 -157 K 0.259 -158 T 0.278 -159 H 0.283 -160 T 0.279 -161 T 0.265 -162 C 0.237 -163 P 0.203 -164 D 0.177 -165 C 0.165 -166 P 0.159 -167 S 0.147 -168 P 0.126 -169 I 0.102 -170 D 0.080 -171 L 0.066 -172 S 0.057 -173 N 0.052 -174 P 0.046 -175 S 0.040 -176 A 0.035 -177 L 0.033 -178 E 0.034 -179 A 0.034 -180 A 0.033 -181 T 0.032 -182 E 0.031 -183 S 0.031 -184 L 0.032 -185 A 0.036 -186 K 0.042 -187 F 0.052 -188 N 0.061 -189 S 0.065 -190 K 0.065 -191 S 0.067 -192 P 0.071 -193 S 0.079 -194 K 0.089 -195 K 0.093 -196 Y 0.086 -197 E 0.070 -198 L 0.052 -199 V 0.040 -200 K 0.035 -201 V 0.035 -202 T 0.036 -203 K 0.034 -204 A 0.032 -205 M 0.032 -206 N 0.034 -207 Q 0.036 -208 W 0.039 -209 V 0.042 -210 S 0.045 -211 G 0.046 -212 P 0.045 -213 A 0.044 -214 Y 0.046 -215 Y 0.053 -216 V 0.061 -217 E 0.068 -218 Y 0.071 -219 L 0.071 -220 I 0.070 -221 K 0.076 -222 E 0.092 -223 A 0.113 -224 P 0.134 -225 C 0.156 -226 T 0.176 -227 K 0.192 -228 S 0.206 -229 Q 0.219 -230 A 0.226 -231 S 0.225 -232 C 0.229 -233 S 0.247 -234 L 0.271 -235 Q 0.290 -236 H 0.299 -237 S 0.295 -238 D 0.269 -239 S 0.225 -240 E 0.179 -241 P 0.141 -242 V 0.113 -243 G 0.093 -244 I 0.082 -245 C 0.075 -246 Q 0.067 -247 G 0.062 -248 S 0.064 -249 T 0.075 -250 V 0.098 -251 Q 0.133 -252 S 0.171 -253 S 0.201 -254 L 0.219 -255 R 0.228 -256 H 0.231 -257 V 0.234 -258 P 0.244 -259 L 0.264 -260 I 0.291 -261 Q 0.313 -262 P 0.312 -263 V 0.274 -264 E 0.212 -265 K 0.153 -266 S 0.115 -267 V 0.097 -268 T 0.089 -269 V 0.083 -270 T 0.079 -271 C 0.082 -272 E 0.098 -273 F 0.137 -274 F 0.208 -275 E 0.310 -276 S 0.420 -277 Q 0.510 -278 A 0.563 -279 Q 0.591 -280 V 0.617 -281 P 0.648 -282 G 0.674 -283 D 0.685 -284 E 0.684 -285 N 0.681 -286 P 0.681 -287 A 0.674 -288 V 0.641 -289 T 0.586 -290 Q 0.550 -291 G 0.557 -292 P 0.568 -293 Q 0.546 -294 K 0.516 -295 L 0.498 -296 P 0.468 -297 Q 0.433 -298 K 0.449 -299 N 0.509 -300 T 0.555 -301 A 0.580 -302 P 0.623 -303 T 0.678 -304 S 0.716 -305 S 0.737 -306 P 0.753 -307 S 0.760 -308 V 0.758 -309 T 0.750 -310 A 0.747 -311 P 0.754 -312 R 0.762 -313 G 0.750 -314 S 0.696 -315 I 0.619 -316 Q 0.574 -317 H 0.586 -318 L 0.611 -319 P 0.610 -320 E 0.615 -321 L 0.659 -322 D 0.707 -323 D 0.719 -324 E 0.707 -325 K 0.709 -326 P 0.734 -327 E 0.764 -328 E 0.783 -329 S 0.789 -330 K 0.786 -331 G 0.777 -332 G 0.763 -333 S 0.748 -334 P 0.736 -335 E 0.725 -336 E 0.705 -337 A 0.679 -338 F 0.672 -339 P 0.696 -340 V 0.730 -341 Q 0.745 -342 L 0.739 -343 D 0.727 -344 L 0.720 -345 T 0.715 -346 T 0.710 -347 N 0.714 -348 P 0.729 -349 Q 0.750 -350 G 0.766 -351 D 0.764 -352 T 0.739 -353 L 0.699 -354 D 0.664 -355 V 0.645 -356 S 0.630 -357 F 0.605 -358 L 0.570 -359 Y 0.535 -360 L 0.509 -361 E 0.496 -362 P 0.496 -363 G 0.510 -364 D 0.529 -365 K 0.545 -366 K 0.565 -367 L 0.583 -368 V 0.580 -369 V 0.553 -370 L 0.527 -371 P 0.532 -372 F 0.572 -373 P 0.627 -374 G 0.668 -375 K 0.678 -376 E 0.652 -377 Q 0.594 -378 R 0.528 -379 S 0.480 -380 A 0.453 -381 E 0.445 -382 C 0.468 -383 P 0.527 -384 G 0.605 -385 P 0.669 -386 E 0.702 -387 K 0.705 -388 E 0.691 -389 N 0.675 -390 N 0.667 -391 P 0.666 -392 L 0.660 -393 V 0.634 -394 L 0.584 -395 P 0.520 -396 P 0.474 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022974.13_ENSMUST00000118522.8_GN:Paxbp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022974.13_ENSMUST00000118522.8_GN:Paxbp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index eb727e404e9579909a707e0dfa28b6e28ab10c8a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022974.13_ENSMUST00000118522.8_GN:Paxbp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,920 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000022974.13|ENSMUST00000118522.8|GN:Paxbp1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.312 -2 F 0.330 -3 R 0.359 -4 K 0.386 -5 A 0.396 -6 R 0.399 -7 R 0.429 -8 V 0.497 -9 N 0.560 -10 V 0.590 -11 R 0.602 -12 K 0.615 -13 R 0.624 -14 N 0.620 -15 D 0.606 -16 S 0.583 -17 E 0.555 -18 E 0.532 -19 E 0.520 -20 E 0.523 -21 R 0.543 -22 E 0.573 -23 R 0.597 -24 D 0.603 -25 E 0.593 -26 E 0.571 -27 Q 0.548 -28 E 0.540 -29 P 0.558 -30 P 0.595 -31 P 0.631 -32 L 0.652 -33 L 0.659 -34 P 0.671 -35 P 0.699 -36 P 0.741 -37 A 0.777 -38 S 0.795 -39 G 0.792 -40 E 0.775 -41 E 0.760 -42 P 0.756 -43 G 0.765 -44 P 0.781 -45 G 0.799 -46 G 0.811 -47 G 0.812 -48 D 0.803 -49 R 0.793 -50 A 0.790 -51 P 0.799 -52 A 0.812 -53 G 0.820 -54 E 0.819 -55 S 0.811 -56 L 0.801 -57 L 0.794 -58 G 0.793 -59 P 0.792 -60 G 0.786 -61 P 0.775 -62 L 0.763 -63 P 0.756 -64 P 0.759 -65 P 0.771 -66 P 0.783 -67 S 0.782 -68 A 0.774 -69 H 0.774 -70 H 0.790 -71 P 0.812 -72 G 0.832 -73 L 0.843 -74 G 0.844 -75 A 0.841 -76 E 0.838 -77 A 0.838 -78 G 0.839 -79 G 0.841 -80 G 0.842 -81 I 0.842 -82 S 0.841 -83 G 0.841 -84 G 0.834 -85 A 0.823 -86 E 0.815 -87 P 0.817 -88 G 0.824 -89 N 0.823 -90 G 0.811 -91 L 0.794 -92 K 0.782 -93 P 0.775 -94 R 0.771 -95 K 0.771 -96 R 0.776 -97 P 0.782 -98 R 0.786 -99 E 0.788 -100 N 0.784 -101 K 0.775 -102 E 0.768 -103 V 0.770 -104 P 0.780 -105 R 0.788 -106 A 0.788 -107 S 0.782 -108 L 0.775 -109 L 0.775 -110 S 0.785 -111 F 0.797 -112 Q 0.806 -113 D 0.808 -114 E 0.802 -115 E 0.794 -116 E 0.786 -117 E 0.777 -118 N 0.761 -119 E 0.732 -120 E 0.695 -121 V 0.665 -122 F 0.652 -123 K 0.652 -124 V 0.648 -125 K 0.634 -126 K 0.607 -127 S 0.564 -128 S 0.509 -129 Y 0.447 -130 S 0.377 -131 K 0.311 -132 K 0.270 -133 I 0.255 -134 V 0.246 -135 K 0.235 -136 L 0.229 -137 L 0.226 -138 K 0.224 -139 K 0.227 -140 E 0.235 -141 Y 0.246 -142 K 0.257 -143 E 0.269 -144 D 0.280 -145 L 0.286 -146 E 0.296 -147 K 0.325 -148 S 0.378 -149 K 0.442 -150 I 0.504 -151 K 0.555 -152 T 0.590 -153 E 0.609 -154 L 0.628 -155 N 0.661 -156 T 0.695 -157 A 0.712 -158 A 0.712 -159 D 0.705 -160 S 0.695 -161 D 0.685 -162 Q 0.684 -163 P 0.686 -164 L 0.670 -165 D 0.633 -166 K 0.617 -167 T 0.653 -168 C 0.713 -169 H 0.755 -170 A 0.775 -171 K 0.781 -172 D 0.775 -173 T 0.765 -174 N 0.760 -175 P 0.768 -176 E 0.788 -177 D 0.811 -178 G 0.829 -179 V 0.834 -180 V 0.830 -181 I 0.822 -182 S 0.816 -183 E 0.814 -184 H 0.816 -185 G 0.823 -186 E 0.830 -187 D 0.834 -188 E 0.835 -189 M 0.832 -190 D 0.826 -191 M 0.818 -192 E 0.808 -193 S 0.797 -194 E 0.786 -195 K 0.773 -196 E 0.758 -197 E 0.742 -198 E 0.727 -199 K 0.723 -200 P 0.734 -201 K 0.757 -202 A 0.777 -203 G 0.784 -204 G 0.776 -205 A 0.759 -206 F 0.739 -207 S 0.705 -208 N 0.649 -209 A 0.589 -210 L 0.555 -211 S 0.551 -212 S 0.566 -213 L 0.591 -214 N 0.615 -215 V 0.628 -216 L 0.640 -217 R 0.664 -218 P 0.699 -219 G 0.726 -220 E 0.723 -221 I 0.675 -222 P 0.582 -223 D 0.465 -224 A 0.351 -225 A 0.267 -226 F 0.220 -227 I 0.199 -228 H 0.192 -229 A 0.194 -230 A 0.210 -231 R 0.235 -232 K 0.259 -233 K 0.273 -234 R 0.278 -235 Q 0.290 -236 L 0.316 -237 A 0.348 -238 R 0.381 -239 E 0.436 -240 L 0.515 -241 G 0.590 -242 D 0.638 -243 F 0.660 -244 T 0.679 -245 P 0.705 -246 H 0.728 -247 D 0.735 -248 S 0.727 -249 E 0.725 -250 P 0.742 -251 G 0.773 -252 K 0.803 -253 G 0.820 -254 R 0.825 -255 L 0.823 -256 V 0.816 -257 R 0.809 -258 E 0.804 -259 D 0.804 -260 E 0.807 -261 N 0.811 -262 D 0.814 -263 A 0.815 -264 S 0.814 -265 D 0.810 -266 D 0.802 -267 E 0.787 -268 D 0.766 -269 D 0.738 -270 D 0.704 -271 E 0.666 -272 K 0.638 -273 R 0.634 -274 R 0.648 -275 I 0.660 -276 V 0.659 -277 F 0.642 -278 S 0.620 -279 V 0.602 -280 K 0.579 -281 E 0.529 -282 K 0.456 -283 S 0.392 -284 Q 0.359 -285 R 0.352 -286 Q 0.361 -287 K 0.380 -288 I 0.402 -289 A 0.427 -290 E 0.460 -291 E 0.512 -292 I 0.588 -293 G 0.666 -294 I 0.725 -295 E 0.758 -296 G 0.772 -297 S 0.770 -298 D 0.760 -299 D 0.751 -300 D 0.749 -301 A 0.753 -302 L 0.758 -303 V 0.765 -304 T 0.769 -305 G 0.766 -306 E 0.749 -307 Q 0.708 -308 D 0.636 -309 E 0.544 -310 E 0.455 -311 L 0.378 -312 S 0.312 -313 R 0.262 -314 W 0.234 -315 E 0.220 -316 Q 0.218 -317 E 0.232 -318 Q 0.258 -319 I 0.285 -320 R 0.324 -321 K 0.409 -322 G 0.529 -323 I 0.634 -324 N 0.693 -325 I 0.722 -326 P 0.744 -327 Q 0.763 -328 V 0.770 -329 Q 0.762 -330 A 0.744 -331 S 0.733 -332 Q 0.738 -333 P 0.758 -334 S 0.781 -335 E 0.797 -336 V 0.799 -337 N 0.787 -338 V 0.767 -339 Y 0.748 -340 Y 0.742 -341 Q 0.751 -342 N 0.764 -343 T 0.771 -344 Y 0.770 -345 Q 0.766 -346 T 0.763 -347 M 0.766 -348 P 0.782 -349 Y 0.806 -350 G 0.824 -351 A 0.829 -352 S 0.823 -353 Y 0.813 -354 G 0.806 -355 I 0.805 -356 P 0.811 -357 Y 0.820 -358 S 0.826 -359 Y 0.825 -360 T 0.821 -361 A 0.819 -362 Y 0.824 -363 G 0.830 -364 S 0.831 -365 S 0.831 -366 D 0.831 -367 A 0.830 -368 K 0.825 -369 S 0.817 -370 Q 0.811 -371 K 0.804 -372 T 0.798 -373 D 0.794 -374 N 0.792 -375 T 0.788 -376 V 0.785 -377 P 0.784 -378 F 0.781 -379 K 0.772 -380 T 0.763 -381 P 0.761 -382 S 0.765 -383 N 0.767 -384 E 0.759 -385 M 0.743 -386 A 0.720 -387 P 0.676 -388 V 0.587 -389 T 0.455 -390 I 0.325 -391 D 0.249 -392 L 0.228 -393 V 0.227 -394 K 0.223 -395 R 0.225 -396 Q 0.238 -397 L 0.250 -398 K 0.247 -399 D 0.233 -400 R 0.219 -401 L 0.214 -402 D 0.219 -403 S 0.225 -404 M 0.222 -405 K 0.217 -406 E 0.221 -407 L 0.229 -408 H 0.228 -409 K 0.220 -410 T 0.215 -411 N 0.213 -412 Q 0.208 -413 Q 0.206 -414 Q 0.212 -415 H 0.218 -416 E 0.215 -417 K 0.208 -418 H 0.203 -419 L 0.211 -420 Q 0.231 -421 S 0.247 -422 R 0.242 -423 V 0.225 -424 D 0.213 -425 S 0.211 -426 T 0.215 -427 R 0.224 -428 A 0.234 -429 I 0.240 -430 E 0.245 -431 R 0.256 -432 L 0.276 -433 E 0.298 -434 G 0.311 -435 S 0.315 -436 S 0.315 -437 G 0.302 -438 G 0.261 -439 I 0.203 -440 G 0.152 -441 E 0.119 -442 R 0.104 -443 Y 0.102 -444 K 0.102 -445 F 0.100 -446 L 0.103 -447 Q 0.113 -448 E 0.127 -449 M 0.141 -450 R 0.151 -451 G 0.154 -452 Y 0.150 -453 V 0.145 -454 Q 0.145 -455 D 0.145 -456 L 0.137 -457 L 0.124 -458 E 0.113 -459 C 0.105 -460 F 0.101 -461 S 0.098 -462 E 0.093 -463 K 0.086 -464 V 0.080 -465 P 0.078 -466 L 0.078 -467 I 0.078 -468 N 0.081 -469 E 0.085 -470 L 0.082 -471 E 0.075 -472 S 0.069 -473 A 0.062 -474 I 0.052 -475 H 0.043 -476 Q 0.039 -477 L 0.038 -478 Y 0.036 -479 K 0.034 -480 Q 0.033 -481 R 0.036 -482 A 0.042 -483 S 0.047 -484 R 0.047 -485 L 0.047 -486 V 0.048 -487 Q 0.051 -488 R 0.056 -489 R 0.064 -490 Q 0.071 -491 D 0.077 -492 D 0.083 -493 I 0.091 -494 K 0.094 -495 D 0.095 -496 E 0.101 -497 S 0.118 -498 S 0.141 -499 E 0.173 -500 F 0.217 -501 S 0.273 -502 S 0.330 -503 H 0.374 -504 S 0.398 -505 N 0.406 -506 K 0.410 -507 A 0.421 -508 L 0.439 -509 M 0.464 -510 A 0.493 -511 P 0.514 -512 N 0.512 -513 L 0.492 -514 D 0.467 -515 S 0.443 -516 F 0.416 -517 G 0.383 -518 R 0.332 -519 D 0.261 -520 R 0.190 -521 A 0.143 -522 L 0.121 -523 Y 0.114 -524 Q 0.112 -525 E 0.114 -526 H 0.118 -527 A 0.119 -528 K 0.114 -529 R 0.109 -530 R 0.109 -531 I 0.112 -532 A 0.106 -533 E 0.092 -534 R 0.081 -535 E 0.079 -536 A 0.079 -537 R 0.078 -538 R 0.080 -539 T 0.083 -540 R 0.081 -541 R 0.082 -542 R 0.091 -543 Q 0.103 -544 A 0.111 -545 R 0.121 -546 E 0.144 -547 Q 0.178 -548 T 0.216 -549 G 0.247 -550 Q 0.269 -551 M 0.289 -552 A 0.312 -553 D 0.334 -554 H 0.341 -555 L 0.335 -556 E 0.321 -557 G 0.297 -558 L 0.260 -559 S 0.220 -560 S 0.189 -561 D 0.164 -562 D 0.142 -563 E 0.123 -564 E 0.111 -565 T 0.102 -566 S 0.093 -567 T 0.086 -568 D 0.084 -569 I 0.082 -570 T 0.078 -571 N 0.076 -572 F 0.082 -573 N 0.095 -574 L 0.104 -575 E 0.107 -576 K 0.106 -577 D 0.108 -578 R 0.110 -579 I 0.112 -580 L 0.112 -581 K 0.110 -582 E 0.106 -583 S 0.099 -584 S 0.091 -585 K 0.082 -586 V 0.074 -587 F 0.072 -588 E 0.076 -589 D 0.084 -590 V 0.086 -591 L 0.080 -592 E 0.067 -593 S 0.053 -594 F 0.045 -595 Y 0.047 -596 S 0.057 -597 I 0.071 -598 D 0.080 -599 C 0.078 -600 I 0.071 -601 K 0.064 -602 A 0.057 -603 Q 0.048 -604 F 0.041 -605 E 0.036 -606 A 0.033 -607 W 0.031 -608 R 0.029 -609 S 0.031 -610 K 0.035 -611 Y 0.039 -612 Y 0.044 -613 M 0.049 -614 S 0.054 -615 Y 0.060 -616 K 0.072 -617 D 0.088 -618 A 0.100 -619 Y 0.105 -620 I 0.108 -621 G 0.113 -622 L 0.119 -623 C 0.122 -624 L 0.119 -625 P 0.113 -626 K 0.110 -627 L 0.110 -628 F 0.108 -629 N 0.102 -630 P 0.098 -631 L 0.099 -632 I 0.102 -633 R 0.103 -634 L 0.101 -635 Q 0.099 -636 L 0.097 -637 L 0.094 -638 T 0.089 -639 W 0.086 -640 T 0.085 -641 P 0.088 -642 L 0.095 -643 E 0.105 -644 A 0.117 -645 K 0.129 -646 C 0.138 -647 R 0.136 -648 D 0.124 -649 F 0.107 -650 E 0.092 -651 T 0.080 -652 M 0.069 -653 L 0.060 -654 W 0.056 -655 F 0.056 -656 E 0.058 -657 S 0.064 -658 L 0.074 -659 L 0.088 -660 F 0.106 -661 Y 0.133 -662 G 0.172 -663 C 0.215 -664 E 0.251 -665 D 0.268 -666 R 0.272 -667 E 0.273 -668 Q 0.276 -669 E 0.276 -670 K 0.269 -671 D 0.256 -672 E 0.244 -673 A 0.240 -674 D 0.237 -675 V 0.221 -676 A 0.186 -677 L 0.149 -678 L 0.123 -679 P 0.112 -680 T 0.116 -681 I 0.129 -682 V 0.141 -683 E 0.147 -684 K 0.148 -685 V 0.147 -686 I 0.142 -687 L 0.130 -688 P 0.112 -689 K 0.096 -690 L 0.087 -691 T 0.084 -692 V 0.085 -693 I 0.088 -694 A 0.095 -695 E 0.103 -696 T 0.108 -697 M 0.111 -698 W 0.117 -699 D 0.124 -700 P 0.127 -701 F 0.124 -702 S 0.115 -703 T 0.103 -704 T 0.090 -705 Q 0.082 -706 T 0.075 -707 S 0.068 -708 R 0.063 -709 M 0.063 -710 V 0.063 -711 G 0.059 -712 I 0.053 -713 T 0.048 -714 M 0.045 -715 K 0.045 -716 L 0.051 -717 I 0.061 -718 N 0.071 -719 G 0.077 -720 Y 0.077 -721 P 0.076 -722 S 0.077 -723 V 0.086 -724 V 0.103 -725 N 0.123 -726 A 0.135 -727 D 0.132 -728 N 0.114 -729 K 0.092 -730 N 0.073 -731 T 0.060 -732 Q 0.053 -733 V 0.052 -734 Y 0.054 -735 L 0.058 -736 K 0.061 -737 A 0.065 -738 L 0.069 -739 L 0.073 -740 L 0.078 -741 R 0.088 -742 M 0.101 -743 R 0.111 -744 R 0.114 -745 T 0.118 -746 L 0.125 -747 D 0.134 -748 D 0.141 -749 D 0.141 -750 V 0.139 -751 F 0.141 -752 M 0.148 -753 P 0.152 -754 L 0.145 -755 Y 0.133 -756 P 0.123 -757 K 0.116 -758 N 0.111 -759 V 0.107 -760 L 0.107 -761 E 0.113 -762 N 0.124 -763 K 0.137 -764 N 0.145 -765 S 0.138 -766 G 0.121 -767 P 0.102 -768 Y 0.087 -769 L 0.077 -770 F 0.074 -771 F 0.077 -772 Q 0.080 -773 R 0.084 -774 Q 0.091 -775 F 0.097 -776 W 0.099 -777 S 0.100 -778 S 0.101 -779 V 0.098 -780 K 0.091 -781 L 0.084 -782 L 0.078 -783 G 0.071 -784 N 0.065 -785 F 0.065 -786 L 0.069 -787 Q 0.070 -788 W 0.068 -789 Y 0.069 -790 G 0.072 -791 I 0.074 -792 F 0.071 -793 S 0.067 -794 N 0.063 -795 K 0.061 -796 T 0.060 -797 L 0.062 -798 Q 0.065 -799 E 0.070 -800 L 0.076 -801 S 0.093 -802 I 0.127 -803 D 0.163 -804 G 0.173 -805 L 0.148 -806 L 0.110 -807 N 0.080 -808 R 0.062 -809 Y 0.053 -810 I 0.049 -811 L 0.048 -812 M 0.048 -813 A 0.053 -814 F 0.065 -815 Q 0.084 -816 N 0.101 -817 S 0.109 -818 E 0.109 -819 Y 0.105 -820 G 0.098 -821 D 0.088 -822 D 0.080 -823 S 0.079 -824 I 0.080 -825 R 0.076 -826 K 0.070 -827 A 0.069 -828 Q 0.068 -829 N 0.066 -830 V 0.064 -831 I 0.062 -832 N 0.056 -833 C 0.050 -834 F 0.047 -835 P 0.049 -836 K 0.053 -837 Q 0.059 -838 W 0.068 -839 F 0.085 -840 V 0.113 -841 N 0.147 -842 L 0.176 -843 K 0.195 -844 G 0.202 -845 E 0.197 -846 R 0.182 -847 T 0.157 -848 I 0.126 -849 S 0.101 -850 Q 0.087 -851 L 0.079 -852 E 0.069 -853 N 0.059 -854 F 0.053 -855 C 0.051 -856 R 0.049 -857 Y 0.047 -858 L 0.045 -859 V 0.045 -860 H 0.045 -861 L 0.047 -862 A 0.051 -863 D 0.055 -864 T 0.059 -865 I 0.065 -866 Y 0.075 -867 R 0.087 -868 N 0.103 -869 S 0.126 -870 I 0.154 -871 G 0.173 -872 C 0.166 -873 S 0.134 -874 D 0.100 -875 V 0.082 -876 E 0.081 -877 K 0.089 -878 R 0.094 -879 N 0.092 -880 A 0.085 -881 R 0.079 -882 E 0.074 -883 N 0.073 -884 I 0.070 -885 K 0.062 -886 Q 0.054 -887 I 0.049 -888 V 0.046 -889 K 0.044 -890 L 0.044 -891 L 0.046 -892 A 0.051 -893 S 0.060 -894 V 0.071 -895 R 0.080 -896 A 0.089 -897 L 0.095 -898 D 0.102 -899 H 0.110 -900 A 0.126 -901 I 0.151 -902 S 0.182 -903 V 0.209 -904 A 0.227 -905 S 0.236 -906 D 0.243 -907 H 0.247 -908 N 0.241 -909 V 0.224 -910 K 0.206 -911 E 0.190 -912 V 0.174 -913 K 0.153 -914 S 0.131 -915 L 0.116 -916 I 0.116 -917 E 0.131 -918 G 0.150 -919 K 0.162 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022974.13_ENSMUST00000118522.8_GN:Paxbp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:52.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022974.13_ENSMUST00000118522.8_GN:Paxbp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:52.caid deleted file mode 100644 index 1053c1d46655a1de09bffdc2cddf03aa9b526a81..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000022974.13_ENSMUST00000118522.8_GN:Paxbp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:52.caid +++ /dev/null @@ -1,972 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000022974.13|ENSMUST00000118522.8|GN:Paxbp1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:52 -1 M 0.406 -2 R 0.435 -3 N 0.484 -4 R 0.536 -5 G 0.563 -6 G 0.551 -7 A 0.532 -8 I 0.529 -9 A 0.527 -10 S 0.532 -11 Q 0.570 -12 S 0.622 -13 R 0.654 -14 D 0.666 -15 D 0.677 -16 P 0.693 -17 A 0.710 -18 G 0.725 -19 G 0.733 -20 G 0.728 -21 E 0.711 -22 L 0.696 -23 L 0.691 -24 R 0.698 -25 L 0.712 -26 R 0.724 -27 V 0.733 -28 R 0.744 -29 G 0.760 -30 G 0.774 -31 G 0.777 -32 L 0.768 -33 R 0.757 -34 A 0.753 -35 P 0.760 -36 S 0.772 -37 S 0.780 -38 S 0.785 -39 Q 0.789 -40 S 0.796 -41 A 0.804 -42 S 0.813 -43 G 0.820 -44 C 0.821 -45 E 0.820 -46 S 0.816 -47 A 0.806 -48 V 0.789 -49 T 0.769 -50 A 0.753 -51 A 0.742 -52 G 0.737 -53 M 0.732 -54 F 0.729 -55 R 0.729 -56 K 0.731 -57 A 0.734 -58 R 0.738 -59 R 0.746 -60 V 0.756 -61 N 0.761 -62 V 0.758 -63 R 0.755 -64 K 0.758 -65 R 0.761 -66 N 0.756 -67 D 0.745 -68 S 0.736 -69 E 0.729 -70 E 0.722 -71 E 0.715 -72 E 0.712 -73 R 0.714 -74 E 0.719 -75 R 0.723 -76 D 0.723 -77 E 0.712 -78 E 0.688 -79 Q 0.659 -80 E 0.638 -81 P 0.641 -82 P 0.667 -83 P 0.698 -84 L 0.716 -85 L 0.721 -86 P 0.727 -87 P 0.751 -88 P 0.786 -89 A 0.816 -90 S 0.830 -91 G 0.827 -92 E 0.814 -93 E 0.801 -94 P 0.796 -95 G 0.802 -96 P 0.813 -97 G 0.824 -98 G 0.831 -99 G 0.832 -100 D 0.826 -101 R 0.819 -102 A 0.818 -103 P 0.824 -104 A 0.833 -105 G 0.837 -106 E 0.833 -107 S 0.823 -108 L 0.811 -109 L 0.801 -110 G 0.795 -111 P 0.788 -112 G 0.779 -113 P 0.767 -114 L 0.755 -115 P 0.748 -116 P 0.747 -117 P 0.745 -118 P 0.720 -119 S 0.671 -120 A 0.640 -121 H 0.667 -122 H 0.729 -123 P 0.783 -124 G 0.815 -125 L 0.828 -126 G 0.829 -127 A 0.825 -128 E 0.821 -129 A 0.820 -130 G 0.822 -131 G 0.826 -132 G 0.829 -133 I 0.831 -134 S 0.833 -135 G 0.831 -136 G 0.823 -137 A 0.810 -138 E 0.800 -139 P 0.802 -140 G 0.810 -141 N 0.812 -142 G 0.805 -143 L 0.793 -144 K 0.784 -145 P 0.778 -146 R 0.774 -147 K 0.772 -148 R 0.773 -149 P 0.777 -150 R 0.783 -151 E 0.787 -152 N 0.785 -153 K 0.777 -154 E 0.769 -155 V 0.771 -156 P 0.782 -157 R 0.793 -158 A 0.797 -159 S 0.795 -160 L 0.792 -161 L 0.796 -162 S 0.806 -163 F 0.820 -164 Q 0.829 -165 D 0.830 -166 E 0.824 -167 E 0.815 -168 E 0.807 -169 E 0.797 -170 N 0.782 -171 E 0.758 -172 E 0.729 -173 V 0.706 -174 F 0.702 -175 K 0.709 -176 V 0.713 -177 K 0.702 -178 K 0.673 -179 S 0.626 -180 S 0.566 -181 Y 0.495 -182 S 0.411 -183 K 0.330 -184 K 0.280 -185 I 0.258 -186 V 0.241 -187 K 0.226 -188 L 0.223 -189 L 0.226 -190 K 0.228 -191 K 0.233 -192 E 0.242 -193 Y 0.253 -194 K 0.262 -195 E 0.273 -196 D 0.282 -197 L 0.287 -198 E 0.294 -199 K 0.321 -200 S 0.373 -201 K 0.437 -202 I 0.502 -203 K 0.560 -204 T 0.602 -205 E 0.624 -206 L 0.645 -207 N 0.676 -208 T 0.709 -209 A 0.726 -210 A 0.726 -211 D 0.719 -212 S 0.707 -213 D 0.698 -214 Q 0.700 -215 P 0.717 -216 L 0.741 -217 D 0.760 -218 K 0.772 -219 T 0.779 -220 C 0.783 -221 H 0.787 -222 A 0.792 -223 K 0.795 -224 D 0.790 -225 T 0.779 -226 N 0.772 -227 P 0.778 -228 E 0.796 -229 D 0.816 -230 G 0.832 -231 V 0.839 -232 V 0.836 -233 I 0.829 -234 S 0.822 -235 E 0.819 -236 H 0.822 -237 G 0.829 -238 E 0.836 -239 D 0.839 -240 E 0.838 -241 M 0.835 -242 D 0.831 -243 M 0.825 -244 E 0.817 -245 S 0.808 -246 E 0.798 -247 K 0.788 -248 E 0.776 -249 E 0.761 -250 E 0.746 -251 K 0.739 -252 P 0.747 -253 K 0.765 -254 A 0.781 -255 G 0.784 -256 G 0.773 -257 A 0.752 -258 F 0.729 -259 S 0.694 -260 N 0.636 -261 A 0.573 -262 L 0.536 -263 S 0.534 -264 S 0.551 -265 L 0.574 -266 N 0.592 -267 V 0.600 -268 L 0.610 -269 R 0.636 -270 P 0.676 -271 G 0.711 -272 E 0.715 -273 I 0.671 -274 P 0.582 -275 D 0.467 -276 A 0.356 -277 A 0.273 -278 F 0.225 -279 I 0.200 -280 H 0.187 -281 A 0.185 -282 A 0.196 -283 R 0.215 -284 K 0.235 -285 K 0.247 -286 R 0.253 -287 Q 0.266 -288 L 0.293 -289 A 0.324 -290 R 0.353 -291 E 0.401 -292 L 0.478 -293 G 0.562 -294 D 0.622 -295 F 0.655 -296 T 0.678 -297 P 0.705 -298 H 0.729 -299 D 0.738 -300 S 0.734 -301 E 0.732 -302 P 0.749 -303 G 0.779 -304 K 0.808 -305 G 0.824 -306 R 0.827 -307 L 0.823 -308 V 0.815 -309 R 0.807 -310 E 0.802 -311 D 0.804 -312 E 0.809 -313 N 0.813 -314 D 0.813 -315 A 0.811 -316 S 0.808 -317 D 0.805 -318 D 0.801 -319 E 0.791 -320 D 0.775 -321 D 0.747 -322 D 0.708 -323 E 0.666 -324 K 0.640 -325 R 0.644 -326 R 0.665 -327 I 0.683 -328 V 0.684 -329 F 0.672 -330 S 0.658 -331 V 0.647 -332 K 0.626 -333 E 0.571 -334 K 0.488 -335 S 0.413 -336 Q 0.371 -337 R 0.358 -338 Q 0.363 -339 K 0.379 -340 I 0.402 -341 A 0.430 -342 E 0.464 -343 E 0.517 -344 I 0.593 -345 G 0.674 -346 I 0.735 -347 E 0.768 -348 G 0.777 -349 S 0.770 -350 D 0.754 -351 D 0.741 -352 D 0.739 -353 A 0.746 -354 L 0.756 -355 V 0.766 -356 T 0.775 -357 G 0.775 -358 E 0.762 -359 Q 0.726 -360 D 0.662 -361 E 0.576 -362 E 0.485 -363 L 0.400 -364 S 0.327 -365 R 0.273 -366 W 0.242 -367 E 0.226 -368 Q 0.221 -369 E 0.234 -370 Q 0.261 -371 I 0.288 -372 R 0.324 -373 K 0.405 -374 G 0.526 -375 I 0.633 -376 N 0.694 -377 I 0.723 -378 P 0.745 -379 Q 0.762 -380 V 0.769 -381 Q 0.761 -382 A 0.744 -383 S 0.733 -384 Q 0.737 -385 P 0.755 -386 S 0.777 -387 E 0.792 -388 V 0.794 -389 N 0.781 -390 V 0.760 -391 Y 0.742 -392 Y 0.738 -393 Q 0.748 -394 N 0.761 -395 T 0.765 -396 Y 0.760 -397 Q 0.754 -398 T 0.751 -399 M 0.756 -400 P 0.774 -401 Y 0.798 -402 G 0.818 -403 A 0.825 -404 S 0.818 -405 Y 0.808 -406 G 0.801 -407 I 0.798 -408 P 0.802 -409 Y 0.809 -410 S 0.815 -411 Y 0.814 -412 T 0.809 -413 A 0.808 -414 Y 0.813 -415 G 0.820 -416 S 0.824 -417 S 0.825 -418 D 0.825 -419 A 0.824 -420 K 0.819 -421 S 0.813 -422 Q 0.808 -423 K 0.803 -424 T 0.799 -425 D 0.796 -426 N 0.792 -427 T 0.786 -428 V 0.781 -429 P 0.780 -430 F 0.778 -431 K 0.770 -432 T 0.762 -433 P 0.762 -434 S 0.767 -435 N 0.767 -436 E 0.757 -437 M 0.739 -438 A 0.715 -439 P 0.672 -440 V 0.588 -441 T 0.463 -442 I 0.339 -443 D 0.265 -444 L 0.244 -445 V 0.241 -446 K 0.235 -447 R 0.235 -448 Q 0.248 -449 L 0.261 -450 K 0.258 -451 D 0.244 -452 R 0.232 -453 L 0.230 -454 D 0.237 -455 S 0.243 -456 M 0.239 -457 K 0.232 -458 E 0.236 -459 L 0.247 -460 H 0.249 -461 K 0.244 -462 T 0.242 -463 N 0.241 -464 Q 0.237 -465 Q 0.236 -466 Q 0.243 -467 H 0.248 -468 E 0.244 -469 K 0.234 -470 H 0.228 -471 L 0.237 -472 Q 0.262 -473 S 0.282 -474 R 0.277 -475 V 0.255 -476 D 0.238 -477 S 0.232 -478 T 0.233 -479 R 0.240 -480 A 0.251 -481 I 0.260 -482 E 0.267 -483 R 0.279 -484 L 0.299 -485 E 0.320 -486 G 0.330 -487 S 0.331 -488 S 0.331 -489 G 0.318 -490 G 0.276 -491 I 0.218 -492 G 0.166 -493 E 0.132 -494 R 0.114 -495 Y 0.109 -496 K 0.107 -497 F 0.105 -498 L 0.110 -499 Q 0.122 -500 E 0.137 -501 M 0.151 -502 R 0.161 -503 G 0.163 -504 Y 0.157 -505 V 0.152 -506 Q 0.152 -507 D 0.151 -508 L 0.143 -509 L 0.128 -510 E 0.116 -511 C 0.109 -512 F 0.105 -513 S 0.103 -514 E 0.098 -515 K 0.090 -516 V 0.084 -517 P 0.082 -518 L 0.082 -519 I 0.083 -520 N 0.086 -521 E 0.089 -522 L 0.086 -523 E 0.078 -524 S 0.072 -525 A 0.065 -526 I 0.054 -527 H 0.045 -528 Q 0.041 -529 L 0.040 -530 Y 0.038 -531 K 0.036 -532 Q 0.035 -533 R 0.038 -534 A 0.045 -535 S 0.050 -536 R 0.051 -537 L 0.050 -538 V 0.051 -539 Q 0.055 -540 R 0.059 -541 R 0.066 -542 Q 0.073 -543 D 0.079 -544 D 0.085 -545 I 0.093 -546 K 0.096 -547 D 0.096 -548 E 0.102 -549 S 0.118 -550 S 0.142 -551 E 0.174 -552 F 0.219 -553 S 0.276 -554 S 0.335 -555 H 0.379 -556 S 0.404 -557 N 0.411 -558 K 0.415 -559 A 0.426 -560 L 0.445 -561 M 0.469 -562 A 0.496 -563 P 0.514 -564 N 0.510 -565 L 0.489 -566 D 0.462 -567 S 0.434 -568 F 0.404 -569 G 0.371 -570 R 0.324 -571 D 0.259 -572 R 0.193 -573 A 0.148 -574 L 0.128 -575 Y 0.121 -576 Q 0.119 -577 E 0.120 -578 H 0.124 -579 A 0.126 -580 K 0.122 -581 R 0.116 -582 R 0.115 -583 I 0.117 -584 A 0.111 -585 E 0.095 -586 R 0.083 -587 E 0.081 -588 A 0.081 -589 R 0.080 -590 R 0.082 -591 T 0.085 -592 R 0.082 -593 R 0.081 -594 R 0.088 -595 Q 0.099 -596 A 0.110 -597 R 0.124 -598 E 0.149 -599 Q 0.183 -600 T 0.221 -601 G 0.252 -602 Q 0.275 -603 M 0.294 -604 A 0.317 -605 D 0.337 -606 H 0.345 -607 L 0.340 -608 E 0.328 -609 G 0.306 -610 L 0.269 -611 S 0.229 -612 S 0.197 -613 D 0.173 -614 D 0.150 -615 E 0.131 -616 E 0.117 -617 T 0.107 -618 S 0.097 -619 T 0.089 -620 D 0.087 -621 I 0.086 -622 T 0.082 -623 N 0.079 -624 F 0.085 -625 N 0.097 -626 L 0.107 -627 E 0.109 -628 K 0.109 -629 D 0.110 -630 R 0.111 -631 I 0.109 -632 L 0.104 -633 K 0.099 -634 E 0.097 -635 S 0.095 -636 S 0.091 -637 K 0.083 -638 V 0.076 -639 F 0.073 -640 E 0.078 -641 D 0.085 -642 V 0.088 -643 L 0.081 -644 E 0.068 -645 S 0.054 -646 F 0.046 -647 Y 0.048 -648 S 0.058 -649 I 0.073 -650 D 0.082 -651 C 0.080 -652 I 0.072 -653 K 0.065 -654 A 0.058 -655 Q 0.050 -656 F 0.042 -657 E 0.038 -658 A 0.035 -659 W 0.032 -660 R 0.031 -661 S 0.032 -662 K 0.036 -663 Y 0.040 -664 Y 0.045 -665 M 0.050 -666 S 0.055 -667 Y 0.061 -668 K 0.073 -669 D 0.090 -670 A 0.103 -671 Y 0.107 -672 I 0.110 -673 G 0.116 -674 L 0.122 -675 C 0.125 -676 L 0.122 -677 P 0.115 -678 K 0.112 -679 L 0.113 -680 F 0.111 -681 N 0.105 -682 P 0.100 -683 L 0.101 -684 I 0.104 -685 R 0.105 -686 L 0.103 -687 Q 0.100 -688 L 0.099 -689 L 0.096 -690 T 0.092 -691 W 0.088 -692 T 0.087 -693 P 0.090 -694 L 0.098 -695 E 0.107 -696 A 0.119 -697 K 0.130 -698 C 0.139 -699 R 0.138 -700 D 0.126 -701 F 0.108 -702 E 0.093 -703 T 0.081 -704 M 0.070 -705 L 0.061 -706 W 0.057 -707 F 0.057 -708 E 0.059 -709 S 0.066 -710 L 0.076 -711 L 0.090 -712 F 0.108 -713 Y 0.136 -714 G 0.174 -715 C 0.218 -716 E 0.253 -717 D 0.271 -718 R 0.275 -719 E 0.276 -720 Q 0.279 -721 E 0.280 -722 K 0.273 -723 D 0.261 -724 E 0.250 -725 A 0.245 -726 D 0.242 -727 V 0.224 -728 A 0.188 -729 L 0.151 -730 L 0.125 -731 P 0.115 -732 T 0.119 -733 I 0.132 -734 V 0.144 -735 E 0.149 -736 K 0.150 -737 V 0.150 -738 I 0.146 -739 L 0.134 -740 P 0.115 -741 K 0.099 -742 L 0.089 -743 T 0.086 -744 V 0.087 -745 I 0.090 -746 A 0.097 -747 E 0.105 -748 T 0.111 -749 M 0.114 -750 W 0.119 -751 D 0.126 -752 P 0.129 -753 F 0.125 -754 S 0.117 -755 T 0.105 -756 T 0.094 -757 Q 0.085 -758 T 0.079 -759 S 0.071 -760 R 0.066 -761 M 0.065 -762 V 0.066 -763 G 0.061 -764 I 0.055 -765 T 0.050 -766 M 0.046 -767 K 0.045 -768 L 0.052 -769 I 0.063 -770 N 0.073 -771 G 0.079 -772 Y 0.079 -773 P 0.076 -774 S 0.078 -775 V 0.087 -776 V 0.104 -777 N 0.124 -778 A 0.136 -779 D 0.133 -780 N 0.115 -781 K 0.093 -782 N 0.074 -783 T 0.061 -784 Q 0.054 -785 V 0.052 -786 Y 0.055 -787 L 0.058 -788 K 0.062 -789 A 0.065 -790 L 0.069 -791 L 0.073 -792 L 0.078 -793 R 0.088 -794 M 0.102 -795 R 0.112 -796 R 0.116 -797 T 0.119 -798 L 0.125 -799 D 0.134 -800 D 0.140 -801 D 0.141 -802 V 0.139 -803 F 0.141 -804 M 0.149 -805 P 0.152 -806 L 0.145 -807 Y 0.133 -808 P 0.123 -809 K 0.116 -810 N 0.111 -811 V 0.107 -812 L 0.107 -813 E 0.113 -814 N 0.124 -815 K 0.137 -816 N 0.145 -817 S 0.139 -818 G 0.121 -819 P 0.102 -820 Y 0.087 -821 L 0.077 -822 F 0.075 -823 F 0.078 -824 Q 0.082 -825 R 0.086 -826 Q 0.093 -827 F 0.099 -828 W 0.101 -829 S 0.102 -830 S 0.104 -831 V 0.101 -832 K 0.094 -833 L 0.086 -834 L 0.080 -835 G 0.073 -836 N 0.067 -837 F 0.066 -838 L 0.070 -839 Q 0.071 -840 W 0.069 -841 Y 0.069 -842 G 0.073 -843 I 0.075 -844 F 0.072 -845 S 0.067 -846 N 0.064 -847 K 0.061 -848 T 0.061 -849 L 0.063 -850 Q 0.066 -851 E 0.070 -852 L 0.076 -853 S 0.093 -854 I 0.127 -855 D 0.162 -856 G 0.173 -857 L 0.148 -858 L 0.111 -859 N 0.081 -860 R 0.063 -861 Y 0.054 -862 I 0.050 -863 L 0.048 -864 M 0.049 -865 A 0.054 -866 F 0.067 -867 Q 0.085 -868 N 0.103 -869 S 0.111 -870 E 0.110 -871 Y 0.106 -872 G 0.099 -873 D 0.089 -874 D 0.081 -875 S 0.080 -876 I 0.081 -877 R 0.077 -878 K 0.072 -879 A 0.071 -880 Q 0.070 -881 N 0.067 -882 V 0.065 -883 I 0.063 -884 N 0.058 -885 C 0.052 -886 F 0.049 -887 P 0.050 -888 K 0.054 -889 Q 0.060 -890 W 0.068 -891 F 0.083 -892 V 0.109 -893 N 0.142 -894 L 0.171 -895 K 0.190 -896 G 0.197 -897 E 0.192 -898 R 0.176 -899 T 0.150 -900 I 0.120 -901 S 0.097 -902 Q 0.085 -903 L 0.079 -904 E 0.070 -905 N 0.060 -906 F 0.054 -907 C 0.052 -908 R 0.050 -909 Y 0.047 -910 L 0.046 -911 V 0.046 -912 H 0.046 -913 L 0.048 -914 A 0.052 -915 D 0.056 -916 T 0.059 -917 I 0.066 -918 Y 0.076 -919 R 0.088 -920 N 0.104 -921 S 0.127 -922 I 0.155 -923 G 0.175 -924 C 0.168 -925 S 0.137 -926 D 0.102 -927 V 0.082 -928 E 0.074 -929 K 0.073 -930 R 0.073 -931 N 0.075 -932 A 0.076 -933 R 0.076 -934 E 0.075 -935 N 0.075 -936 I 0.072 -937 K 0.064 -938 Q 0.055 -939 I 0.050 -940 V 0.047 -941 K 0.045 -942 L 0.043 -943 L 0.045 -944 A 0.049 -945 S 0.056 -946 V 0.066 -947 R 0.075 -948 A 0.083 -949 L 0.092 -950 D 0.102 -951 H 0.115 -952 A 0.134 -953 I 0.161 -954 S 0.192 -955 V 0.219 -956 A 0.237 -957 S 0.247 -958 D 0.254 -959 H 0.258 -960 N 0.252 -961 V 0.234 -962 K 0.214 -963 E 0.198 -964 V 0.180 -965 K 0.158 -966 S 0.135 -967 L 0.119 -968 I 0.118 -969 E 0.132 -970 G 0.151 -971 K 0.163 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000023064.5_ENSMUST00000023826.5_GN:Sncg_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000023064.5_ENSMUST00000023826.5_GN:Sncg_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 6f28172c83d253c3211cb7182ccb90c47ffa6db7..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000023064.5_ENSMUST00000023826.5_GN:Sncg_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,124 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000023064.5|ENSMUST00000023826.5|GN:Sncg|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.246 -2 D 0.236 -3 V 0.221 -4 F 0.214 -5 K 0.219 -6 K 0.233 -7 G 0.247 -8 F 0.260 -9 S 0.272 -10 I 0.274 -11 A 0.266 -12 K 0.263 -13 E 0.279 -14 G 0.305 -15 V 0.316 -16 V 0.310 -17 G 0.299 -18 A 0.288 -19 V 0.280 -20 E 0.289 -21 K 0.312 -22 T 0.328 -23 K 0.339 -24 Q 0.355 -25 G 0.370 -26 V 0.370 -27 T 0.359 -28 E 0.342 -29 A 0.321 -30 A 0.309 -31 E 0.314 -32 K 0.322 -33 T 0.313 -34 K 0.286 -35 E 0.258 -36 G 0.239 -37 V 0.230 -38 M 0.236 -39 Y 0.265 -40 V 0.306 -41 G 0.340 -42 T 0.365 -43 K 0.384 -44 T 0.386 -45 K 0.376 -46 E 0.377 -47 N 0.380 -48 V 0.358 -49 V 0.313 -50 Q 0.284 -51 S 0.286 -52 V 0.298 -53 T 0.303 -54 S 0.303 -55 V 0.300 -56 A 0.306 -57 E 0.324 -58 K 0.344 -59 T 0.354 -60 K 0.361 -61 E 0.379 -62 Q 0.408 -63 A 0.443 -64 N 0.487 -65 A 0.525 -66 V 0.526 -67 S 0.485 -68 E 0.434 -69 A 0.405 -70 V 0.390 -71 V 0.364 -72 S 0.339 -73 S 0.334 -74 V 0.341 -75 N 0.344 -76 T 0.350 -77 V 0.370 -78 A 0.403 -79 N 0.441 -80 K 0.468 -81 T 0.468 -82 V 0.446 -83 E 0.429 -84 E 0.430 -85 A 0.437 -86 E 0.442 -87 N 0.442 -88 I 0.432 -89 V 0.410 -90 V 0.391 -91 T 0.392 -92 T 0.408 -93 G 0.427 -94 V 0.442 -95 V 0.447 -96 R 0.451 -97 K 0.473 -98 E 0.508 -99 D 0.533 -100 L 0.539 -101 E 0.544 -102 P 0.570 -103 P 0.616 -104 A 0.661 -105 Q 0.683 -106 D 0.674 -107 Q 0.634 -108 E 0.580 -109 A 0.538 -110 K 0.510 -111 E 0.468 -112 Q 0.424 -113 E 0.439 -114 E 0.515 -115 N 0.590 -116 E 0.625 -117 E 0.635 -118 A 0.639 -119 K 0.641 -120 S 0.635 -121 G 0.608 -122 E 0.556 -123 D 0.510 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000023064.5_ENSMUST00000023826.5_GN:Sncg_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:61.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000023064.5_ENSMUST00000023826.5_GN:Sncg_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:61.caid deleted file mode 100644 index fb8b5cf28ddc389750c140773e5349e1b042ac6f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000023064.5_ENSMUST00000023826.5_GN:Sncg_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:61.caid +++ /dev/null @@ -1,185 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000023064.5|ENSMUST00000023826.5|GN:Sncg|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:61 -1 M 0.492 -2 P 0.535 -3 S 0.589 -4 L 0.629 -5 W 0.653 -6 P 0.671 -7 A 0.688 -8 L 0.703 -9 P 0.723 -10 A 0.750 -11 P 0.782 -12 T 0.807 -13 L 0.821 -14 A 0.824 -15 R 0.818 -16 A 0.807 -17 G 0.796 -18 W 0.792 -19 A 0.800 -20 P 0.819 -21 A 0.838 -22 S 0.851 -23 S 0.854 -24 H 0.851 -25 S 0.846 -26 I 0.842 -27 N 0.843 -28 I 0.848 -29 S 0.857 -30 S 0.862 -31 A 0.863 -32 S 0.862 -33 I 0.861 -34 R 0.862 -35 G 0.865 -36 S 0.865 -37 S 0.862 -38 S 0.856 -39 R 0.851 -40 D 0.847 -41 S 0.843 -42 G 0.838 -43 C 0.835 -44 G 0.832 -45 S 0.829 -46 T 0.828 -47 P 0.832 -48 V 0.840 -49 H 0.843 -50 S 0.835 -51 L 0.818 -52 Q 0.799 -53 Q 0.786 -54 P 0.784 -55 G 0.784 -56 S 0.777 -57 I 0.756 -58 L 0.727 -59 A 0.690 -60 N 0.636 -61 T 0.557 -62 M 0.474 -63 D 0.414 -64 V 0.381 -65 F 0.373 -66 K 0.388 -67 K 0.411 -68 G 0.423 -69 F 0.434 -70 S 0.450 -71 I 0.450 -72 A 0.424 -73 K 0.408 -74 E 0.436 -75 G 0.483 -76 V 0.506 -77 V 0.501 -78 G 0.491 -79 A 0.480 -80 V 0.474 -81 E 0.483 -82 K 0.495 -83 T 0.495 -84 K 0.492 -85 Q 0.494 -86 G 0.487 -87 V 0.469 -88 T 0.447 -89 E 0.423 -90 A 0.400 -91 A 0.394 -92 E 0.412 -93 K 0.423 -94 T 0.408 -95 K 0.374 -96 E 0.341 -97 G 0.314 -98 V 0.293 -99 M 0.287 -100 Y 0.301 -101 V 0.329 -102 G 0.358 -103 T 0.386 -104 K 0.412 -105 T 0.421 -106 K 0.420 -107 E 0.429 -108 N 0.436 -109 V 0.409 -110 V 0.354 -111 Q 0.316 -112 S 0.314 -113 V 0.331 -114 T 0.346 -115 S 0.354 -116 V 0.353 -117 A 0.351 -118 E 0.357 -119 K 0.363 -120 T 0.361 -121 K 0.361 -122 E 0.375 -123 Q 0.402 -124 A 0.441 -125 N 0.491 -126 A 0.528 -127 V 0.528 -128 S 0.492 -129 E 0.451 -130 A 0.426 -131 V 0.407 -132 V 0.379 -133 S 0.355 -134 S 0.353 -135 V 0.366 -136 N 0.381 -137 T 0.398 -138 V 0.424 -139 A 0.463 -140 N 0.506 -141 K 0.531 -142 T 0.526 -143 V 0.507 -144 E 0.495 -145 E 0.494 -146 A 0.502 -147 E 0.514 -148 N 0.523 -149 I 0.517 -150 V 0.499 -151 V 0.490 -152 T 0.505 -153 T 0.541 -154 G 0.584 -155 V 0.620 -156 V 0.641 -157 R 0.647 -158 K 0.648 -159 E 0.649 -160 D 0.644 -161 L 0.629 -162 E 0.618 -163 P 0.627 -164 P 0.663 -165 A 0.705 -166 Q 0.727 -167 D 0.717 -168 Q 0.672 -169 E 0.609 -170 A 0.562 -171 K 0.534 -172 E 0.492 -173 Q 0.447 -174 E 0.463 -175 E 0.546 -176 N 0.628 -177 E 0.667 -178 E 0.679 -179 A 0.684 -180 K 0.686 -181 S 0.676 -182 G 0.644 -183 E 0.586 -184 D 0.537 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000023067.15_ENSMUST00000233296.2_GN:Cdkn1a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000023067.15_ENSMUST00000233296.2_GN:Cdkn1a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index bf6871a05fb7576825eef62dfecc0308e4a40078..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000023067.15_ENSMUST00000233296.2_GN:Cdkn1a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,160 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000023067.15|ENSMUST00000233296.2|GN:Cdkn1a|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.519 -2 S 0.552 -3 N 0.607 -4 P 0.664 -5 G 0.703 -6 D 0.716 -7 V 0.709 -8 R 0.697 -9 P 0.691 -10 V 0.695 -11 P 0.705 -12 H 0.712 -13 R 0.714 -14 S 0.712 -15 K 0.712 -16 V 0.711 -17 C 0.702 -18 R 0.682 -19 C 0.652 -20 L 0.608 -21 F 0.565 -22 G 0.544 -23 P 0.549 -24 V 0.548 -25 D 0.511 -26 S 0.443 -27 E 0.373 -28 Q 0.325 -29 L 0.301 -30 R 0.298 -31 R 0.319 -32 D 0.347 -33 C 0.348 -34 D 0.322 -35 A 0.304 -36 L 0.311 -37 M 0.329 -38 A 0.347 -39 G 0.354 -40 C 0.336 -41 L 0.297 -42 Q 0.263 -43 E 0.241 -44 A 0.224 -45 R 0.214 -46 E 0.219 -47 R 0.233 -48 W 0.244 -49 N 0.247 -50 F 0.236 -51 D 0.212 -52 F 0.184 -53 V 0.172 -54 T 0.191 -55 E 0.237 -56 T 0.289 -57 P 0.324 -58 L 0.343 -59 E 0.364 -60 G 0.399 -61 N 0.434 -62 F 0.450 -63 V 0.453 -64 W 0.466 -65 E 0.493 -66 R 0.515 -67 V 0.515 -68 R 0.514 -69 S 0.540 -70 L 0.591 -71 G 0.644 -72 L 0.680 -73 P 0.695 -74 K 0.692 -75 V 0.682 -76 Y 0.677 -77 L 0.680 -78 S 0.697 -79 P 0.729 -80 G 0.763 -81 S 0.786 -82 R 0.797 -83 S 0.801 -84 R 0.800 -85 D 0.800 -86 D 0.800 -87 L 0.801 -88 G 0.801 -89 G 0.799 -90 D 0.796 -91 K 0.794 -92 R 0.797 -93 P 0.810 -94 S 0.830 -95 T 0.846 -96 S 0.850 -97 S 0.847 -98 A 0.841 -99 L 0.831 -100 L 0.816 -101 Q 0.797 -102 G 0.780 -103 P 0.771 -104 A 0.774 -105 P 0.788 -106 E 0.803 -107 D 0.815 -108 H 0.822 -109 V 0.825 -110 A 0.825 -111 L 0.822 -112 S 0.820 -113 L 0.819 -114 S 0.822 -115 C 0.831 -116 T 0.847 -117 L 0.860 -118 V 0.859 -119 S 0.841 -120 E 0.814 -121 R 0.793 -122 P 0.785 -123 E 0.785 -124 D 0.786 -125 S 0.784 -126 P 0.784 -127 G 0.790 -128 G 0.800 -129 P 0.814 -130 G 0.828 -131 T 0.837 -132 S 0.835 -133 Q 0.823 -134 G 0.806 -135 R 0.789 -136 K 0.776 -137 R 0.767 -138 R 0.753 -139 Q 0.723 -140 T 0.672 -141 S 0.598 -142 L 0.509 -143 T 0.428 -144 D 0.387 -145 F 0.382 -146 Y 0.399 -147 H 0.440 -148 S 0.511 -149 K 0.593 -150 R 0.658 -151 R 0.699 -152 L 0.720 -153 V 0.719 -154 F 0.697 -155 C 0.659 -156 K 0.610 -157 R 0.554 -158 K 0.497 -159 P 0.456 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000023067.15_ENSMUST00000233296.2_GN:Cdkn1a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:26.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000023067.15_ENSMUST00000233296.2_GN:Cdkn1a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:26.caid deleted file mode 100644 index 667c9d248c42320bc265451529155427961e6b14..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000023067.15_ENSMUST00000233296.2_GN:Cdkn1a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:26.caid +++ /dev/null @@ -1,186 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000023067.15|ENSMUST00000233296.2|GN:Cdkn1a|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:26 -1 M 0.494 -2 S 0.523 -3 G 0.564 -4 S 0.597 -5 P 0.608 -6 V 0.591 -7 C 0.557 -8 V 0.524 -9 Y 0.499 -10 V 0.481 -11 Y 0.471 -12 L 0.473 -13 C 0.501 -14 V 0.565 -15 P 0.650 -16 A 0.730 -17 R 0.782 -18 V 0.812 -19 T 0.829 -20 G 0.837 -21 V 0.829 -22 S 0.792 -23 A 0.736 -24 A 0.706 -25 G 0.733 -26 T 0.782 -27 M 0.808 -28 S 0.811 -29 N 0.810 -30 P 0.812 -31 G 0.814 -32 D 0.809 -33 V 0.795 -34 R 0.776 -35 P 0.763 -36 V 0.760 -37 P 0.763 -38 H 0.766 -39 R 0.765 -40 S 0.763 -41 K 0.763 -42 V 0.760 -43 C 0.749 -44 R 0.729 -45 C 0.701 -46 L 0.664 -47 F 0.624 -48 G 0.602 -49 P 0.601 -50 V 0.589 -51 D 0.544 -52 S 0.475 -53 E 0.412 -54 Q 0.373 -55 L 0.357 -56 R 0.354 -57 R 0.370 -58 D 0.395 -59 C 0.393 -60 D 0.362 -61 A 0.342 -62 L 0.347 -63 M 0.363 -64 A 0.376 -65 G 0.377 -66 C 0.349 -67 L 0.302 -68 Q 0.262 -69 E 0.236 -70 A 0.215 -71 R 0.202 -72 E 0.205 -73 R 0.218 -74 W 0.230 -75 N 0.235 -76 F 0.226 -77 D 0.202 -78 F 0.174 -79 V 0.161 -80 T 0.174 -81 E 0.209 -82 T 0.248 -83 P 0.274 -84 L 0.288 -85 E 0.309 -86 G 0.346 -87 N 0.387 -88 F 0.408 -89 V 0.413 -90 W 0.426 -91 E 0.456 -92 R 0.481 -93 V 0.486 -94 R 0.487 -95 S 0.510 -96 L 0.556 -97 G 0.610 -98 L 0.656 -99 P 0.682 -100 K 0.685 -101 V 0.675 -102 Y 0.668 -103 L 0.669 -104 S 0.685 -105 P 0.718 -106 G 0.755 -107 S 0.782 -108 R 0.794 -109 S 0.798 -110 R 0.797 -111 D 0.795 -112 D 0.794 -113 L 0.794 -114 G 0.794 -115 G 0.793 -116 D 0.790 -117 K 0.788 -118 R 0.791 -119 P 0.805 -120 S 0.825 -121 T 0.840 -122 S 0.844 -123 S 0.839 -124 A 0.831 -125 L 0.821 -126 L 0.807 -127 Q 0.789 -128 G 0.772 -129 P 0.765 -130 A 0.769 -131 P 0.784 -132 E 0.800 -133 D 0.813 -134 H 0.822 -135 V 0.826 -136 A 0.827 -137 L 0.825 -138 S 0.822 -139 L 0.823 -140 S 0.827 -141 C 0.838 -142 T 0.852 -143 L 0.863 -144 V 0.862 -145 S 0.846 -146 E 0.821 -147 R 0.800 -148 P 0.793 -149 E 0.794 -150 D 0.795 -151 S 0.793 -152 P 0.794 -153 G 0.798 -154 G 0.808 -155 P 0.821 -156 G 0.835 -157 T 0.844 -158 S 0.841 -159 Q 0.829 -160 G 0.811 -161 R 0.793 -162 K 0.781 -163 R 0.772 -164 R 0.760 -165 Q 0.731 -166 T 0.681 -167 S 0.607 -168 L 0.517 -169 T 0.435 -170 D 0.390 -171 F 0.383 -172 Y 0.398 -173 H 0.440 -174 S 0.512 -175 K 0.595 -176 R 0.661 -177 R 0.702 -178 L 0.722 -179 V 0.722 -180 F 0.702 -181 C 0.665 -182 K 0.616 -183 R 0.558 -184 K 0.497 -185 P 0.454 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000023802.5_ENSMUST00000115800.2_GN:Nox3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000023802.5_ENSMUST00000115800.2_GN:Nox3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 410c5aff4942f6999d767b05d60a3aaadd76ad11..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000023802.5_ENSMUST00000115800.2_GN:Nox3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,569 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000023802.5|ENSMUST00000115800.2|GN:Nox3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.273 -2 P 0.239 -3 V 0.195 -4 C 0.160 -5 W 0.138 -6 I 0.131 -7 L 0.137 -8 N 0.146 -9 E 0.142 -10 S 0.121 -11 G 0.094 -12 S 0.071 -13 F 0.057 -14 V 0.047 -15 V 0.041 -16 A 0.039 -17 L 0.039 -18 L 0.043 -19 W 0.053 -20 L 0.066 -21 A 0.075 -22 V 0.073 -23 N 0.065 -24 A 0.056 -25 Y 0.049 -26 L 0.045 -27 F 0.045 -28 I 0.045 -29 D 0.046 -30 T 0.047 -31 F 0.048 -32 F 0.050 -33 W 0.056 -34 Y 0.063 -35 T 0.069 -36 E 0.073 -37 E 0.074 -38 E 0.073 -39 A 0.068 -40 F 0.064 -41 F 0.064 -42 Y 0.068 -43 T 0.074 -44 R 0.085 -45 V 0.104 -46 I 0.121 -47 L 0.125 -48 G 0.114 -49 S 0.096 -50 A 0.079 -51 L 0.072 -52 A 0.071 -53 W 0.074 -54 A 0.086 -55 R 0.104 -56 A 0.115 -57 S 0.124 -58 A 0.142 -59 V 0.160 -60 C 0.156 -61 L 0.133 -62 N 0.110 -63 F 0.095 -64 N 0.086 -65 C 0.081 -66 M 0.079 -67 L 0.075 -68 I 0.069 -69 L 0.061 -70 L 0.054 -71 P 0.052 -72 V 0.051 -73 S 0.050 -74 R 0.046 -75 N 0.040 -76 F 0.035 -77 I 0.032 -78 S 0.033 -79 L 0.042 -80 V 0.058 -81 R 0.076 -82 G 0.089 -83 T 0.100 -84 S 0.103 -85 V 0.098 -86 C 0.093 -87 C 0.096 -88 R 0.104 -89 G 0.111 -90 P 0.115 -91 W 0.116 -92 R 0.112 -93 R 0.101 -94 Q 0.090 -95 L 0.082 -96 D 0.076 -97 K 0.071 -98 N 0.066 -99 L 0.057 -100 N 0.046 -101 F 0.037 -102 H 0.032 -103 K 0.035 -104 L 0.046 -105 V 0.061 -106 A 0.068 -107 Y 0.064 -108 G 0.056 -109 I 0.052 -110 A 0.049 -111 V 0.048 -112 N 0.050 -113 S 0.052 -114 V 0.048 -115 I 0.041 -116 H 0.039 -117 I 0.041 -118 V 0.046 -119 A 0.050 -120 H 0.052 -121 L 0.049 -122 F 0.045 -123 N 0.045 -124 L 0.045 -125 E 0.043 -126 R 0.041 -127 Y 0.043 -128 H 0.053 -129 L 0.070 -130 G 0.085 -131 Q 0.093 -132 A 0.093 -133 K 0.089 -134 D 0.086 -135 A 0.085 -136 E 0.081 -137 G 0.072 -138 L 0.064 -139 L 0.063 -140 A 0.068 -141 A 0.079 -142 L 0.099 -143 S 0.128 -144 K 0.163 -145 L 0.199 -146 G 0.231 -147 D 0.254 -148 A 0.265 -149 P 0.262 -150 N 0.259 -151 E 0.265 -152 S 0.275 -153 Y 0.279 -154 L 0.272 -155 N 0.256 -156 P 0.230 -157 V 0.202 -158 R 0.182 -159 T 0.178 -160 F 0.187 -161 D 0.202 -162 M 0.212 -163 G 0.206 -164 T 0.185 -165 T 0.164 -166 T 0.151 -167 E 0.140 -168 L 0.122 -169 L 0.100 -170 M 0.082 -171 T 0.074 -172 V 0.071 -173 S 0.069 -174 G 0.068 -175 I 0.070 -176 T 0.079 -177 G 0.092 -178 L 0.102 -179 G 0.106 -180 I 0.107 -181 S 0.106 -182 L 0.103 -183 A 0.099 -184 L 0.093 -185 V 0.085 -186 F 0.079 -187 I 0.076 -188 M 0.072 -189 T 0.070 -190 S 0.070 -191 S 0.069 -192 T 0.064 -193 E 0.060 -194 F 0.062 -195 I 0.064 -196 R 0.061 -197 R 0.054 -198 S 0.049 -199 S 0.046 -200 Y 0.041 -201 E 0.038 -202 L 0.037 -203 F 0.037 -204 W 0.036 -205 Y 0.036 -206 T 0.040 -207 H 0.045 -208 H 0.048 -209 I 0.049 -210 F 0.047 -211 V 0.041 -212 F 0.037 -213 F 0.039 -214 F 0.044 -215 I 0.051 -216 S 0.060 -217 L 0.067 -218 A 0.069 -219 I 0.066 -220 H 0.068 -221 G 0.081 -222 G 0.102 -223 G 0.120 -224 R 0.129 -225 I 0.135 -226 I 0.144 -227 R 0.155 -228 G 0.158 -229 Q 0.150 -230 T 0.139 -231 P 0.130 -232 E 0.117 -233 S 0.099 -234 L 0.083 -235 R 0.077 -236 L 0.080 -237 H 0.081 -238 N 0.074 -239 V 0.061 -240 T 0.051 -241 Y 0.044 -242 C 0.042 -243 R 0.045 -244 D 0.049 -245 H 0.052 -246 Y 0.055 -247 A 0.058 -248 E 0.061 -249 W 0.068 -250 Q 0.083 -251 A 0.105 -252 A 0.132 -253 A 0.160 -254 L 0.185 -255 C 0.208 -256 P 0.229 -257 V 0.243 -258 P 0.247 -259 Q 0.244 -260 F 0.241 -261 S 0.248 -262 G 0.260 -263 K 0.262 -264 E 0.236 -265 P 0.188 -266 S 0.140 -267 A 0.108 -268 W 0.088 -269 K 0.078 -270 W 0.078 -271 A 0.085 -272 L 0.090 -273 G 0.095 -274 P 0.103 -275 V 0.107 -276 V 0.099 -277 L 0.079 -278 Y 0.057 -279 A 0.043 -280 C 0.040 -281 E 0.047 -282 R 0.061 -283 I 0.076 -284 I 0.083 -285 R 0.083 -286 F 0.081 -287 W 0.086 -288 R 0.097 -289 S 0.101 -290 H 0.089 -291 Q 0.070 -292 E 0.055 -293 V 0.045 -294 V 0.038 -295 I 0.033 -296 T 0.031 -297 K 0.033 -298 V 0.039 -299 V 0.046 -300 S 0.055 -301 H 0.063 -302 P 0.066 -303 S 0.060 -304 A 0.046 -305 V 0.031 -306 L 0.021 -307 E 0.017 -308 L 0.017 -309 H 0.019 -310 M 0.023 -311 K 0.029 -312 K 0.039 -313 R 0.052 -314 D 0.064 -315 F 0.072 -316 K 0.076 -317 M 0.076 -318 A 0.071 -319 P 0.061 -320 G 0.050 -321 Q 0.043 -322 Y 0.039 -323 I 0.038 -324 F 0.040 -325 I 0.045 -326 Q 0.052 -327 C 0.058 -328 P 0.062 -329 S 0.065 -330 V 0.068 -331 S 0.069 -332 P 0.071 -333 L 0.069 -334 E 0.062 -335 W 0.051 -336 H 0.039 -337 P 0.029 -338 F 0.025 -339 T 0.027 -340 L 0.033 -341 T 0.041 -342 S 0.048 -343 A 0.055 -344 P 0.061 -345 Q 0.065 -346 E 0.063 -347 D 0.052 -348 F 0.036 -349 F 0.023 -350 S 0.017 -351 V 0.020 -352 H 0.031 -353 I 0.048 -354 R 0.066 -355 A 0.080 -356 S 0.084 -357 G 0.080 -358 D 0.072 -359 W 0.063 -360 T 0.058 -361 E 0.057 -362 A 0.059 -363 L 0.062 -364 L 0.066 -365 K 0.073 -366 A 0.083 -367 F 0.101 -368 R 0.137 -369 V 0.189 -370 E 0.245 -371 G 0.286 -372 Q 0.313 -373 A 0.329 -374 P 0.332 -375 S 0.325 -376 E 0.312 -377 L 0.290 -378 C 0.256 -379 S 0.211 -380 M 0.164 -381 P 0.123 -382 R 0.097 -383 L 0.089 -384 A 0.091 -385 V 0.094 -386 D 0.095 -387 G 0.097 -388 P 0.109 -389 F 0.133 -390 G 0.156 -391 G 0.163 -392 S 0.154 -393 L 0.138 -394 A 0.122 -395 D 0.105 -396 V 0.087 -397 F 0.076 -398 H 0.078 -399 Y 0.088 -400 P 0.095 -401 V 0.095 -402 S 0.091 -403 V 0.092 -404 C 0.096 -405 I 0.101 -406 A 0.103 -407 T 0.104 -408 G 0.108 -409 I 0.118 -410 G 0.125 -411 V 0.124 -412 T 0.112 -413 P 0.095 -414 F 0.078 -415 A 0.067 -416 S 0.061 -417 L 0.058 -418 L 0.056 -419 K 0.053 -420 S 0.047 -421 V 0.041 -422 W 0.039 -423 Y 0.041 -424 K 0.046 -425 C 0.054 -426 C 0.067 -427 E 0.084 -428 S 0.100 -429 Q 0.113 -430 S 0.122 -431 L 0.125 -432 P 0.119 -433 E 0.104 -434 L 0.086 -435 S 0.074 -436 K 0.070 -437 V 0.069 -438 Y 0.062 -439 F 0.052 -440 Y 0.048 -441 W 0.053 -442 I 0.064 -443 C 0.073 -444 R 0.078 -445 D 0.081 -446 A 0.085 -447 G 0.081 -448 A 0.068 -449 F 0.050 -450 E 0.038 -451 W 0.032 -452 F 0.032 -453 A 0.034 -454 D 0.035 -455 L 0.034 -456 L 0.033 -457 L 0.033 -458 S 0.037 -459 L 0.047 -460 E 0.061 -461 T 0.070 -462 R 0.069 -463 M 0.064 -464 S 0.062 -465 E 0.063 -466 Q 0.067 -467 G 0.076 -468 K 0.088 -469 A 0.090 -470 H 0.076 -471 L 0.053 -472 L 0.036 -473 S 0.030 -474 Y 0.032 -475 H 0.040 -476 I 0.052 -477 Y 0.064 -478 L 0.076 -479 T 0.085 -480 G 0.089 -481 W 0.093 -482 D 0.101 -483 E 0.118 -484 N 0.142 -485 Q 0.171 -486 A 0.202 -487 I 0.230 -488 H 0.248 -489 I 0.259 -490 A 0.265 -491 L 0.263 -492 H 0.252 -493 W 0.238 -494 D 0.226 -495 E 0.221 -496 S 0.227 -497 L 0.240 -498 D 0.241 -499 V 0.222 -500 I 0.197 -501 T 0.185 -502 G 0.182 -503 L 0.173 -504 K 0.160 -505 Q 0.150 -506 K 0.146 -507 A 0.147 -508 F 0.150 -509 Y 0.148 -510 G 0.138 -511 R 0.121 -512 P 0.100 -513 N 0.079 -514 W 0.068 -515 N 0.068 -516 D 0.068 -517 E 0.063 -518 F 0.061 -519 K 0.071 -520 Q 0.085 -521 I 0.092 -522 A 0.094 -523 Y 0.100 -524 N 0.112 -525 H 0.123 -526 P 0.123 -527 S 0.112 -528 S 0.098 -529 S 0.087 -530 I 0.080 -531 G 0.073 -532 V 0.064 -533 F 0.054 -534 F 0.047 -535 C 0.047 -536 G 0.052 -537 S 0.059 -538 K 0.062 -539 A 0.064 -540 M 0.072 -541 S 0.082 -542 K 0.088 -543 T 0.087 -544 L 0.086 -545 Q 0.091 -546 K 0.095 -547 M 0.093 -548 C 0.087 -549 R 0.082 -550 L 0.082 -551 Y 0.089 -552 S 0.106 -553 S 0.129 -554 V 0.152 -555 D 0.170 -556 P 0.181 -557 R 0.187 -558 G 0.182 -559 V 0.164 -560 H 0.134 -561 F 0.104 -562 Y 0.085 -563 Y 0.085 -564 N 0.100 -565 K 0.126 -566 E 0.157 -567 N 0.190 -568 F 0.212 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000023802.5_ENSMUST00000115800.2_GN:Nox3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:20.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000023802.5_ENSMUST00000115800.2_GN:Nox3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:20.caid deleted file mode 100644 index 2d02d7d33656caf42aaeff29eb7202bb8fa30016..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000023802.5_ENSMUST00000115800.2_GN:Nox3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:20.caid +++ /dev/null @@ -1,589 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000023802.5|ENSMUST00000115800.2|GN:Nox3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:20 -1 M 0.351 -2 Q 0.360 -3 R 0.378 -4 T 0.396 -5 G 0.403 -6 S 0.411 -7 N 0.434 -8 G 0.450 -9 R 0.437 -10 K 0.422 -11 G 0.429 -12 I 0.438 -13 T 0.423 -14 C 0.395 -15 W 0.373 -16 S 0.353 -17 K 0.325 -18 R 0.293 -19 S 0.261 -20 V 0.222 -21 M 0.177 -22 P 0.140 -23 V 0.120 -24 C 0.112 -25 W 0.107 -26 I 0.108 -27 L 0.117 -28 N 0.126 -29 E 0.123 -30 S 0.107 -31 G 0.086 -32 S 0.067 -33 F 0.052 -34 V 0.043 -35 V 0.037 -36 A 0.035 -37 L 0.036 -38 L 0.040 -39 W 0.050 -40 L 0.065 -41 A 0.074 -42 V 0.073 -43 N 0.066 -44 A 0.057 -45 Y 0.050 -46 L 0.047 -47 F 0.047 -48 I 0.047 -49 D 0.047 -50 T 0.048 -51 F 0.049 -52 F 0.052 -53 W 0.059 -54 Y 0.068 -55 T 0.074 -56 E 0.076 -57 E 0.077 -58 E 0.075 -59 A 0.070 -60 F 0.064 -61 F 0.064 -62 Y 0.067 -63 T 0.074 -64 R 0.085 -65 V 0.103 -66 I 0.118 -67 L 0.120 -68 G 0.107 -69 S 0.089 -70 A 0.074 -71 L 0.068 -72 A 0.068 -73 W 0.071 -74 A 0.083 -75 R 0.100 -76 A 0.111 -77 S 0.120 -78 A 0.137 -79 V 0.154 -80 C 0.151 -81 L 0.129 -82 N 0.106 -83 F 0.091 -84 N 0.082 -85 C 0.078 -86 M 0.075 -87 L 0.072 -88 I 0.066 -89 L 0.059 -90 L 0.052 -91 P 0.049 -92 V 0.049 -93 S 0.047 -94 R 0.043 -95 N 0.038 -96 F 0.034 -97 I 0.031 -98 S 0.032 -99 L 0.041 -100 V 0.056 -101 R 0.073 -102 G 0.086 -103 T 0.096 -104 S 0.100 -105 V 0.096 -106 C 0.091 -107 C 0.094 -108 R 0.102 -109 G 0.108 -110 P 0.112 -111 W 0.114 -112 R 0.111 -113 R 0.103 -114 Q 0.092 -115 L 0.084 -116 D 0.078 -117 K 0.072 -118 N 0.067 -119 L 0.057 -120 N 0.046 -121 F 0.037 -122 H 0.032 -123 K 0.035 -124 L 0.046 -125 V 0.060 -126 A 0.067 -127 Y 0.063 -128 G 0.056 -129 I 0.052 -130 A 0.049 -131 V 0.047 -132 N 0.050 -133 S 0.051 -134 V 0.048 -135 I 0.042 -136 H 0.039 -137 I 0.042 -138 V 0.047 -139 A 0.051 -140 H 0.052 -141 L 0.049 -142 F 0.045 -143 N 0.045 -144 L 0.045 -145 E 0.043 -146 R 0.041 -147 Y 0.043 -148 H 0.054 -149 L 0.072 -150 G 0.089 -151 Q 0.099 -152 A 0.099 -153 K 0.096 -154 D 0.093 -155 A 0.092 -156 E 0.086 -157 G 0.076 -158 L 0.067 -159 L 0.065 -160 A 0.069 -161 A 0.080 -162 L 0.100 -163 S 0.130 -164 K 0.164 -165 L 0.199 -166 G 0.229 -167 D 0.251 -168 A 0.259 -169 P 0.256 -170 N 0.252 -171 E 0.259 -172 S 0.271 -173 Y 0.275 -174 L 0.268 -175 N 0.251 -176 P 0.224 -177 V 0.196 -178 R 0.177 -179 T 0.173 -180 F 0.182 -181 D 0.197 -182 M 0.208 -183 G 0.203 -184 T 0.183 -185 T 0.161 -186 T 0.148 -187 E 0.137 -188 L 0.119 -189 L 0.097 -190 M 0.080 -191 T 0.072 -192 V 0.069 -193 S 0.068 -194 G 0.066 -195 I 0.069 -196 T 0.078 -197 G 0.091 -198 L 0.100 -199 G 0.104 -200 I 0.105 -201 S 0.104 -202 L 0.101 -203 A 0.097 -204 L 0.091 -205 V 0.084 -206 F 0.078 -207 I 0.074 -208 M 0.071 -209 T 0.067 -210 S 0.068 -211 S 0.067 -212 T 0.061 -213 E 0.057 -214 F 0.059 -215 I 0.061 -216 R 0.057 -217 R 0.050 -218 S 0.046 -219 S 0.042 -220 Y 0.038 -221 E 0.035 -222 L 0.035 -223 F 0.035 -224 W 0.035 -225 Y 0.036 -226 T 0.039 -227 H 0.044 -228 H 0.048 -229 I 0.049 -230 F 0.047 -231 V 0.041 -232 F 0.037 -233 F 0.039 -234 F 0.044 -235 I 0.051 -236 S 0.059 -237 L 0.067 -238 A 0.068 -239 I 0.065 -240 H 0.067 -241 G 0.080 -242 G 0.100 -243 G 0.117 -244 R 0.127 -245 I 0.132 -246 I 0.140 -247 R 0.151 -248 G 0.155 -249 Q 0.147 -250 T 0.136 -251 P 0.127 -252 E 0.114 -253 S 0.096 -254 L 0.080 -255 R 0.074 -256 L 0.077 -257 H 0.078 -258 N 0.072 -259 V 0.060 -260 T 0.050 -261 Y 0.043 -262 C 0.043 -263 R 0.046 -264 D 0.050 -265 H 0.054 -266 Y 0.057 -267 A 0.059 -268 E 0.062 -269 W 0.068 -270 Q 0.083 -271 A 0.105 -272 A 0.134 -273 A 0.163 -274 L 0.190 -275 C 0.215 -276 P 0.236 -277 V 0.250 -278 P 0.252 -279 Q 0.246 -280 F 0.242 -281 S 0.247 -282 G 0.259 -283 K 0.261 -284 E 0.235 -285 P 0.188 -286 S 0.141 -287 A 0.109 -288 W 0.089 -289 K 0.078 -290 W 0.078 -291 A 0.084 -292 L 0.090 -293 G 0.095 -294 P 0.103 -295 V 0.107 -296 V 0.099 -297 L 0.079 -298 Y 0.057 -299 A 0.043 -300 C 0.040 -301 E 0.047 -302 R 0.061 -303 I 0.076 -304 I 0.083 -305 R 0.083 -306 F 0.081 -307 W 0.086 -308 R 0.098 -309 S 0.101 -310 H 0.090 -311 Q 0.071 -312 E 0.056 -313 V 0.046 -314 V 0.038 -315 I 0.033 -316 T 0.031 -317 K 0.033 -318 V 0.039 -319 V 0.047 -320 S 0.055 -321 H 0.064 -322 P 0.067 -323 S 0.061 -324 A 0.046 -325 V 0.032 -326 L 0.022 -327 E 0.017 -328 L 0.017 -329 H 0.020 -330 M 0.024 -331 K 0.030 -332 K 0.040 -333 R 0.052 -334 D 0.065 -335 F 0.074 -336 K 0.078 -337 M 0.078 -338 A 0.072 -339 P 0.062 -340 G 0.051 -341 Q 0.043 -342 Y 0.040 -343 I 0.039 -344 F 0.041 -345 I 0.046 -346 Q 0.053 -347 C 0.059 -348 P 0.063 -349 S 0.066 -350 V 0.068 -351 S 0.070 -352 P 0.071 -353 L 0.069 -354 E 0.063 -355 W 0.051 -356 H 0.039 -357 P 0.029 -358 F 0.025 -359 T 0.027 -360 L 0.033 -361 T 0.041 -362 S 0.048 -363 A 0.055 -364 P 0.061 -365 Q 0.065 -366 E 0.063 -367 D 0.052 -368 F 0.035 -369 F 0.022 -370 S 0.017 -371 V 0.020 -372 H 0.031 -373 I 0.047 -374 R 0.065 -375 A 0.078 -376 S 0.083 -377 G 0.079 -378 D 0.071 -379 W 0.062 -380 T 0.057 -381 E 0.056 -382 A 0.057 -383 L 0.057 -384 L 0.057 -385 K 0.061 -386 A 0.072 -387 F 0.094 -388 R 0.132 -389 V 0.185 -390 E 0.240 -391 G 0.282 -392 Q 0.309 -393 A 0.325 -394 P 0.329 -395 S 0.322 -396 E 0.309 -397 L 0.287 -398 C 0.253 -399 S 0.208 -400 M 0.161 -401 P 0.122 -402 R 0.096 -403 L 0.088 -404 A 0.090 -405 V 0.093 -406 D 0.094 -407 G 0.097 -408 P 0.109 -409 F 0.131 -410 G 0.153 -411 G 0.160 -412 S 0.150 -413 L 0.134 -414 A 0.119 -415 D 0.102 -416 V 0.085 -417 F 0.075 -418 H 0.077 -419 Y 0.087 -420 P 0.095 -421 V 0.094 -422 S 0.091 -423 V 0.092 -424 C 0.097 -425 I 0.103 -426 A 0.105 -427 T 0.106 -428 G 0.110 -429 I 0.119 -430 G 0.126 -431 V 0.125 -432 T 0.113 -433 P 0.096 -434 F 0.079 -435 A 0.067 -436 S 0.060 -437 L 0.057 -438 L 0.056 -439 K 0.052 -440 S 0.046 -441 V 0.041 -442 W 0.039 -443 Y 0.041 -444 K 0.046 -445 C 0.054 -446 C 0.067 -447 E 0.084 -448 S 0.101 -449 Q 0.114 -450 S 0.122 -451 L 0.125 -452 P 0.119 -453 E 0.104 -454 L 0.086 -455 S 0.074 -456 K 0.070 -457 V 0.069 -458 Y 0.062 -459 F 0.052 -460 Y 0.048 -461 W 0.053 -462 I 0.064 -463 C 0.073 -464 R 0.078 -465 D 0.081 -466 A 0.085 -467 G 0.081 -468 A 0.067 -469 F 0.050 -470 E 0.038 -471 W 0.032 -472 F 0.032 -473 A 0.034 -474 D 0.035 -475 L 0.034 -476 L 0.033 -477 L 0.033 -478 S 0.037 -479 L 0.047 -480 E 0.061 -481 T 0.070 -482 R 0.069 -483 M 0.064 -484 S 0.061 -485 E 0.062 -486 Q 0.066 -487 G 0.076 -488 K 0.088 -489 A 0.090 -490 H 0.076 -491 L 0.054 -492 L 0.037 -493 S 0.030 -494 Y 0.032 -495 H 0.041 -496 I 0.052 -497 Y 0.063 -498 L 0.074 -499 T 0.081 -500 G 0.086 -501 W 0.089 -502 D 0.097 -503 E 0.113 -504 N 0.137 -505 Q 0.166 -506 A 0.197 -507 I 0.225 -508 H 0.242 -509 I 0.253 -510 A 0.259 -511 L 0.257 -512 H 0.246 -513 W 0.232 -514 D 0.220 -515 E 0.216 -516 S 0.224 -517 L 0.239 -518 D 0.242 -519 V 0.223 -520 I 0.199 -521 T 0.186 -522 G 0.182 -523 L 0.173 -524 K 0.159 -525 Q 0.148 -526 K 0.143 -527 A 0.144 -528 F 0.147 -529 Y 0.146 -530 G 0.137 -531 R 0.120 -532 P 0.099 -533 N 0.079 -534 W 0.068 -535 N 0.068 -536 D 0.068 -537 E 0.063 -538 F 0.061 -539 K 0.072 -540 Q 0.085 -541 I 0.092 -542 A 0.094 -543 Y 0.100 -544 N 0.112 -545 H 0.123 -546 P 0.123 -547 S 0.112 -548 S 0.098 -549 S 0.087 -550 I 0.080 -551 G 0.073 -552 V 0.064 -553 F 0.054 -554 F 0.047 -555 C 0.047 -556 G 0.052 -557 S 0.059 -558 K 0.062 -559 A 0.064 -560 M 0.072 -561 S 0.082 -562 K 0.088 -563 T 0.087 -564 L 0.086 -565 Q 0.091 -566 K 0.096 -567 M 0.093 -568 C 0.088 -569 R 0.083 -570 L 0.081 -571 Y 0.088 -572 S 0.104 -573 S 0.127 -574 V 0.150 -575 D 0.168 -576 P 0.180 -577 R 0.185 -578 G 0.181 -579 V 0.163 -580 H 0.134 -581 F 0.104 -582 Y 0.085 -583 Y 0.084 -584 N 0.099 -585 K 0.124 -586 E 0.155 -587 N 0.186 -588 F 0.209 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024006.18_ENSMUST00000119274.3_GN:Stk38_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024006.18_ENSMUST00000119274.3_GN:Stk38_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index b3f07e37fd2718d1242976a39dd6e2fa6d573eb6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024006.18_ENSMUST00000119274.3_GN:Stk38_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,466 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000024006.18|ENSMUST00000119274.3|GN:Stk38|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.408 -2 A 0.438 -3 M 0.485 -4 T 0.530 -5 G 0.559 -6 S 0.571 -7 T 0.579 -8 P 0.590 -9 C 0.592 -10 S 0.570 -11 S 0.514 -12 M 0.433 -13 S 0.352 -14 N 0.294 -15 H 0.259 -16 T 0.236 -17 K 0.224 -18 E 0.223 -19 R 0.233 -20 V 0.248 -21 T 0.265 -22 M 0.282 -23 T 0.296 -24 K 0.300 -25 V 0.296 -26 T 0.289 -27 L 0.285 -28 E 0.283 -29 N 0.279 -30 F 0.266 -31 Y 0.251 -32 S 0.246 -33 N 0.249 -34 L 0.245 -35 I 0.230 -36 A 0.213 -37 Q 0.196 -38 H 0.177 -39 E 0.158 -40 E 0.141 -41 R 0.129 -42 E 0.124 -43 M 0.123 -44 R 0.121 -45 Q 0.117 -46 K 0.109 -47 K 0.094 -48 L 0.083 -49 E 0.084 -50 K 0.093 -51 V 0.098 -52 M 0.102 -53 E 0.117 -54 E 0.152 -55 E 0.191 -56 G 0.208 -57 L 0.190 -58 K 0.152 -59 D 0.118 -60 E 0.097 -61 E 0.085 -62 K 0.081 -63 R 0.087 -64 L 0.099 -65 R 0.108 -66 R 0.113 -67 S 0.118 -68 A 0.130 -69 H 0.142 -70 A 0.140 -71 R 0.125 -72 K 0.110 -73 E 0.105 -74 T 0.107 -75 E 0.113 -76 F 0.120 -77 L 0.130 -78 R 0.145 -79 L 0.159 -80 K 0.161 -81 R 0.151 -82 T 0.134 -83 R 0.111 -84 L 0.086 -85 G 0.067 -86 L 0.058 -87 E 0.055 -88 D 0.053 -89 F 0.049 -90 E 0.044 -91 S 0.042 -92 L 0.042 -93 K 0.041 -94 V 0.039 -95 I 0.036 -96 G 0.037 -97 R 0.043 -98 G 0.053 -99 A 0.060 -100 F 0.062 -101 G 0.056 -102 E 0.048 -103 V 0.038 -104 R 0.032 -105 L 0.029 -106 V 0.029 -107 Q 0.030 -108 K 0.031 -109 K 0.033 -110 D 0.038 -111 T 0.042 -112 G 0.043 -113 H 0.040 -114 V 0.035 -115 Y 0.033 -116 A 0.031 -117 M 0.031 -118 K 0.032 -119 I 0.035 -120 L 0.036 -121 R 0.035 -122 K 0.037 -123 A 0.043 -124 D 0.048 -125 M 0.050 -126 L 0.052 -127 E 0.059 -128 K 0.069 -129 E 0.077 -130 Q 0.080 -131 V 0.077 -132 G 0.071 -133 H 0.063 -134 I 0.055 -135 R 0.052 -136 A 0.054 -137 E 0.053 -138 R 0.049 -139 D 0.044 -140 I 0.042 -141 L 0.041 -142 V 0.045 -143 E 0.056 -144 A 0.070 -145 D 0.075 -146 S 0.068 -147 L 0.054 -148 W 0.043 -149 V 0.036 -150 V 0.030 -151 K 0.023 -152 M 0.017 -153 F 0.015 -154 Y 0.015 -155 S 0.016 -156 F 0.019 -157 Q 0.023 -158 D 0.027 -159 K 0.029 -160 L 0.028 -161 N 0.023 -162 L 0.019 -163 Y 0.016 -164 L 0.015 -165 I 0.016 -166 M 0.018 -167 E 0.020 -168 F 0.026 -169 L 0.036 -170 P 0.048 -171 G 0.053 -172 G 0.051 -173 D 0.044 -174 M 0.037 -175 M 0.035 -176 T 0.037 -177 L 0.042 -178 L 0.047 -179 M 0.048 -180 K 0.045 -181 K 0.041 -182 D 0.040 -183 T 0.043 -184 L 0.045 -185 T 0.043 -186 E 0.042 -187 E 0.045 -188 E 0.050 -189 T 0.051 -190 Q 0.049 -191 F 0.049 -192 Y 0.052 -193 I 0.053 -194 A 0.054 -195 E 0.055 -196 T 0.053 -197 V 0.046 -198 L 0.038 -199 A 0.034 -200 I 0.031 -201 D 0.029 -202 S 0.027 -203 I 0.028 -204 H 0.030 -205 Q 0.034 -206 L 0.039 -207 G 0.043 -208 F 0.045 -209 I 0.046 -210 H 0.048 -211 R 0.052 -212 D 0.056 -213 I 0.056 -214 K 0.054 -215 P 0.052 -216 D 0.054 -217 N 0.054 -218 L 0.052 -219 L 0.047 -220 L 0.045 -221 D 0.048 -222 S 0.057 -223 K 0.067 -224 G 0.070 -225 H 0.069 -226 V 0.069 -227 K 0.075 -228 L 0.087 -229 S 0.104 -230 D 0.130 -231 F 0.168 -232 G 0.202 -233 L 0.216 -234 C 0.208 -235 T 0.200 -236 G 0.211 -237 L 0.239 -238 K 0.270 -239 K 0.298 -240 A 0.322 -241 H 0.339 -242 R 0.345 -243 T 0.342 -244 E 0.334 -245 F 0.327 -246 Y 0.327 -247 R 0.335 -248 N 0.342 -249 L 0.344 -250 N 0.342 -251 H 0.341 -252 S 0.341 -253 L 0.343 -254 P 0.356 -255 S 0.379 -256 D 0.398 -257 F 0.402 -258 T 0.402 -259 F 0.417 -260 Q 0.435 -261 N 0.420 -262 M 0.364 -263 N 0.301 -264 S 0.252 -265 K 0.215 -266 R 0.186 -267 K 0.171 -268 A 0.169 -269 E 0.171 -270 T 0.167 -271 W 0.157 -272 K 0.148 -273 R 0.149 -274 N 0.159 -275 R 0.175 -276 R 0.196 -277 Q 0.222 -278 L 0.250 -279 A 0.275 -280 F 0.296 -281 S 0.311 -282 T 0.318 -283 V 0.317 -284 G 0.317 -285 T 0.322 -286 P 0.328 -287 D 0.322 -288 Y 0.298 -289 I 0.254 -290 A 0.199 -291 P 0.153 -292 E 0.128 -293 V 0.116 -294 F 0.110 -295 M 0.113 -296 Q 0.121 -297 T 0.122 -298 G 0.112 -299 Y 0.093 -300 N 0.078 -301 K 0.082 -302 L 0.105 -303 C 0.133 -304 D 0.143 -305 W 0.139 -306 W 0.137 -307 S 0.141 -308 L 0.134 -309 G 0.116 -310 V 0.102 -311 I 0.095 -312 M 0.087 -313 Y 0.075 -314 E 0.067 -315 M 0.062 -316 L 0.060 -317 I 0.061 -318 G 0.066 -319 Y 0.075 -320 P 0.084 -321 P 0.091 -322 F 0.093 -323 C 0.092 -324 S 0.090 -325 E 0.091 -326 T 0.089 -327 P 0.082 -328 Q 0.074 -329 E 0.071 -330 T 0.076 -331 Y 0.081 -332 K 0.084 -333 K 0.087 -334 V 0.086 -335 M 0.078 -336 N 0.066 -337 W 0.059 -338 K 0.059 -339 E 0.064 -340 T 0.070 -341 L 0.079 -342 T 0.097 -343 F 0.118 -344 P 0.133 -345 P 0.138 -346 E 0.137 -347 V 0.132 -348 P 0.120 -349 V 0.103 -350 S 0.084 -351 E 0.071 -352 K 0.065 -353 A 0.066 -354 K 0.072 -355 G 0.081 -356 L 0.086 -357 I 0.082 -358 L 0.070 -359 R 0.058 -360 F 0.054 -361 C 0.060 -362 C 0.070 -363 E 0.080 -364 W 0.093 -365 E 0.108 -366 H 0.123 -367 R 0.136 -368 I 0.144 -369 G 0.140 -370 A 0.124 -371 P 0.104 -372 G 0.089 -373 V 0.079 -374 E 0.075 -375 E 0.078 -376 I 0.085 -377 K 0.091 -378 N 0.098 -379 N 0.102 -380 L 0.097 -381 F 0.088 -382 F 0.081 -383 E 0.079 -384 G 0.077 -385 V 0.073 -386 D 0.065 -387 W 0.057 -388 E 0.055 -389 H 0.058 -390 I 0.061 -391 R 0.065 -392 E 0.078 -393 R 0.097 -394 P 0.114 -395 A 0.123 -396 A 0.128 -397 I 0.133 -398 S 0.138 -399 I 0.143 -400 E 0.150 -401 I 0.160 -402 K 0.176 -403 S 0.191 -404 I 0.195 -405 D 0.186 -406 D 0.175 -407 T 0.168 -408 S 0.166 -409 N 0.173 -410 F 0.189 -411 D 0.209 -412 E 0.231 -413 F 0.261 -414 P 0.304 -415 E 0.363 -416 S 0.431 -417 D 0.485 -418 I 0.511 -419 L 0.519 -420 K 0.533 -421 P 0.560 -422 T 0.587 -423 V 0.603 -424 T 0.604 -425 T 0.593 -426 S 0.571 -427 S 0.545 -428 H 0.523 -429 P 0.502 -430 E 0.469 -431 T 0.423 -432 D 0.376 -433 Y 0.338 -434 K 0.312 -435 N 0.284 -436 K 0.247 -437 D 0.209 -438 W 0.191 -439 V 0.202 -440 F 0.224 -441 I 0.232 -442 N 0.213 -443 Y 0.180 -444 T 0.153 -445 Y 0.148 -446 K 0.172 -447 R 0.228 -448 F 0.313 -449 E 0.408 -450 G 0.487 -451 L 0.535 -452 T 0.556 -453 A 0.567 -454 R 0.577 -455 G 0.580 -456 A 0.556 -457 I 0.508 -458 P 0.462 -459 S 0.439 -460 Y 0.442 -461 M 0.461 -462 K 0.489 -463 A 0.502 -464 A 0.484 -465 K 0.453 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024006.18_ENSMUST00000119274.3_GN:Stk38_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:84.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024006.18_ENSMUST00000119274.3_GN:Stk38_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:84.caid deleted file mode 100644 index 1ca6e2c5070d0225a7cffca184ef0d6ac97b45b9..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024006.18_ENSMUST00000119274.3_GN:Stk38_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:84.caid +++ /dev/null @@ -1,550 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000024006.18|ENSMUST00000119274.3|GN:Stk38|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:84 -1 M 0.367 -2 R 0.379 -3 S 0.395 -4 L 0.405 -5 S 0.405 -6 R 0.419 -7 G 0.467 -8 G 0.527 -9 P 0.563 -10 S 0.582 -11 P 0.599 -12 Q 0.611 -13 S 0.614 -14 E 0.615 -15 G 0.623 -16 V 0.630 -17 P 0.627 -18 G 0.611 -19 E 0.583 -20 P 0.549 -21 W 0.528 -22 P 0.537 -23 L 0.568 -24 R 0.598 -25 A 0.606 -26 A 0.594 -27 V 0.581 -28 F 0.580 -29 S 0.585 -30 G 0.585 -31 S 0.577 -32 W 0.571 -33 G 0.571 -34 S 0.561 -35 S 0.543 -36 F 0.535 -37 C 0.548 -38 P 0.557 -39 V 0.544 -40 L 0.529 -41 S 0.549 -42 R 0.595 -43 I 0.619 -44 G 0.605 -45 S 0.596 -46 C 0.628 -47 A 0.669 -48 H 0.684 -49 S 0.686 -50 E 0.694 -51 S 0.712 -52 P 0.736 -53 A 0.759 -54 C 0.774 -55 R 0.779 -56 G 0.779 -57 R 0.778 -58 S 0.776 -59 G 0.771 -60 A 0.759 -61 A 0.733 -62 R 0.682 -63 T 0.613 -64 S 0.567 -65 R 0.564 -66 L 0.563 -67 R 0.536 -68 R 0.519 -69 L 0.543 -70 C 0.578 -71 S 0.594 -72 R 0.606 -73 R 0.633 -74 P 0.670 -75 R 0.699 -76 A 0.708 -77 S 0.698 -78 L 0.687 -79 P 0.700 -80 P 0.737 -81 G 0.772 -82 S 0.789 -83 A 0.791 -84 A 0.788 -85 M 0.785 -86 A 0.781 -87 M 0.774 -88 T 0.762 -89 G 0.743 -90 S 0.723 -91 T 0.712 -92 P 0.710 -93 C 0.700 -94 S 0.663 -95 S 0.593 -96 M 0.507 -97 S 0.437 -98 N 0.390 -99 H 0.352 -100 T 0.313 -101 K 0.287 -102 E 0.278 -103 R 0.278 -104 V 0.281 -105 T 0.290 -106 M 0.304 -107 T 0.313 -108 K 0.309 -109 V 0.300 -110 T 0.292 -111 L 0.285 -112 E 0.276 -113 N 0.265 -114 F 0.248 -115 Y 0.229 -116 S 0.223 -117 N 0.228 -118 L 0.228 -119 I 0.217 -120 A 0.203 -121 Q 0.189 -122 H 0.174 -123 E 0.159 -124 E 0.143 -125 R 0.130 -126 E 0.125 -127 M 0.123 -128 R 0.121 -129 Q 0.116 -130 K 0.106 -131 K 0.090 -132 L 0.078 -133 E 0.078 -134 K 0.084 -135 V 0.085 -136 M 0.084 -137 E 0.095 -138 E 0.123 -139 E 0.158 -140 G 0.174 -141 L 0.159 -142 K 0.127 -143 D 0.099 -144 E 0.083 -145 E 0.076 -146 K 0.075 -147 R 0.083 -148 L 0.096 -149 R 0.105 -150 R 0.108 -151 S 0.112 -152 A 0.123 -153 H 0.134 -154 A 0.130 -155 R 0.112 -156 K 0.096 -157 E 0.089 -158 T 0.091 -159 E 0.096 -160 F 0.102 -161 L 0.110 -162 R 0.124 -163 L 0.139 -164 K 0.146 -165 R 0.143 -166 T 0.130 -167 R 0.110 -168 L 0.086 -169 G 0.066 -170 L 0.056 -171 E 0.053 -172 D 0.050 -173 F 0.047 -174 E 0.044 -175 S 0.043 -176 L 0.043 -177 K 0.042 -178 V 0.040 -179 I 0.036 -180 G 0.036 -181 R 0.040 -182 G 0.048 -183 A 0.055 -184 F 0.057 -185 G 0.054 -186 E 0.047 -187 V 0.039 -188 R 0.032 -189 L 0.030 -190 V 0.029 -191 Q 0.029 -192 K 0.028 -193 K 0.029 -194 D 0.032 -195 T 0.035 -196 G 0.036 -197 H 0.033 -198 V 0.031 -199 Y 0.031 -200 A 0.031 -201 M 0.030 -202 K 0.032 -203 I 0.035 -204 L 0.036 -205 R 0.035 -206 K 0.036 -207 A 0.042 -208 D 0.047 -209 M 0.050 -210 L 0.053 -211 E 0.061 -212 K 0.072 -213 E 0.081 -214 Q 0.082 -215 V 0.079 -216 G 0.073 -217 H 0.065 -218 I 0.057 -219 R 0.054 -220 A 0.056 -221 E 0.055 -222 R 0.049 -223 D 0.043 -224 I 0.040 -225 L 0.038 -226 V 0.041 -227 E 0.051 -228 A 0.063 -229 D 0.066 -230 S 0.058 -231 L 0.046 -232 W 0.037 -233 V 0.032 -234 V 0.026 -235 K 0.019 -236 M 0.014 -237 F 0.013 -238 Y 0.013 -239 S 0.014 -240 F 0.016 -241 Q 0.020 -242 D 0.024 -243 K 0.027 -244 L 0.025 -245 N 0.022 -246 L 0.018 -247 Y 0.015 -248 L 0.014 -249 I 0.015 -250 M 0.016 -251 E 0.019 -252 F 0.024 -253 L 0.035 -254 P 0.047 -255 G 0.053 -256 G 0.051 -257 D 0.044 -258 M 0.038 -259 M 0.035 -260 T 0.037 -261 L 0.042 -262 L 0.046 -263 M 0.047 -264 K 0.043 -265 K 0.039 -266 D 0.038 -267 T 0.040 -268 L 0.042 -269 T 0.042 -270 E 0.042 -271 E 0.045 -272 E 0.050 -273 T 0.051 -274 Q 0.049 -275 F 0.049 -276 Y 0.052 -277 I 0.054 -278 A 0.054 -279 E 0.056 -280 T 0.054 -281 V 0.047 -282 L 0.039 -283 A 0.034 -284 I 0.030 -285 D 0.028 -286 S 0.026 -287 I 0.027 -288 H 0.030 -289 Q 0.034 -290 L 0.039 -291 G 0.043 -292 F 0.045 -293 I 0.047 -294 H 0.049 -295 R 0.054 -296 D 0.058 -297 I 0.058 -298 K 0.055 -299 P 0.053 -300 D 0.054 -301 N 0.054 -302 L 0.051 -303 L 0.047 -304 L 0.045 -305 D 0.050 -306 S 0.060 -307 K 0.070 -308 G 0.074 -309 H 0.072 -310 V 0.072 -311 K 0.079 -312 L 0.090 -313 S 0.107 -314 D 0.133 -315 F 0.169 -316 G 0.202 -317 L 0.217 -318 C 0.211 -319 T 0.205 -320 G 0.218 -321 L 0.248 -322 K 0.282 -323 K 0.313 -324 A 0.341 -325 H 0.362 -326 R 0.373 -327 T 0.373 -328 E 0.364 -329 F 0.352 -330 Y 0.348 -331 R 0.356 -332 N 0.366 -333 L 0.370 -334 N 0.367 -335 H 0.362 -336 S 0.358 -337 L 0.360 -338 P 0.372 -339 S 0.394 -340 D 0.412 -341 F 0.414 -342 T 0.411 -343 F 0.425 -344 Q 0.442 -345 N 0.427 -346 M 0.371 -347 N 0.307 -348 S 0.260 -349 K 0.226 -350 R 0.197 -351 K 0.179 -352 A 0.174 -353 E 0.174 -354 T 0.169 -355 W 0.158 -356 K 0.150 -357 R 0.153 -358 N 0.165 -359 R 0.181 -360 R 0.205 -361 Q 0.236 -362 L 0.265 -363 A 0.287 -364 F 0.301 -365 S 0.312 -366 T 0.319 -367 V 0.321 -368 G 0.325 -369 T 0.335 -370 P 0.342 -371 D 0.335 -372 Y 0.310 -373 I 0.266 -374 A 0.209 -375 P 0.161 -376 E 0.134 -377 V 0.121 -378 F 0.114 -379 M 0.117 -380 Q 0.124 -381 T 0.126 -382 G 0.115 -383 Y 0.097 -384 N 0.083 -385 K 0.087 -386 L 0.113 -387 C 0.143 -388 D 0.155 -389 W 0.150 -390 W 0.146 -391 S 0.148 -392 L 0.140 -393 G 0.122 -394 V 0.108 -395 I 0.101 -396 M 0.093 -397 Y 0.081 -398 E 0.072 -399 M 0.067 -400 L 0.065 -401 I 0.064 -402 G 0.068 -403 Y 0.076 -404 P 0.084 -405 P 0.090 -406 F 0.091 -407 C 0.090 -408 S 0.088 -409 E 0.088 -410 T 0.087 -411 P 0.081 -412 Q 0.072 -413 E 0.070 -414 T 0.075 -415 Y 0.080 -416 K 0.084 -417 K 0.088 -418 V 0.089 -419 M 0.080 -420 N 0.066 -421 W 0.057 -422 K 0.056 -423 E 0.060 -424 T 0.065 -425 L 0.074 -426 T 0.092 -427 F 0.113 -428 P 0.127 -429 P 0.131 -430 E 0.129 -431 V 0.124 -432 P 0.114 -433 V 0.098 -434 S 0.081 -435 E 0.069 -436 K 0.064 -437 A 0.065 -438 K 0.070 -439 G 0.078 -440 L 0.083 -441 I 0.081 -442 L 0.070 -443 R 0.058 -444 F 0.055 -445 C 0.062 -446 C 0.071 -447 E 0.082 -448 W 0.095 -449 E 0.111 -450 H 0.127 -451 R 0.143 -452 I 0.152 -453 G 0.148 -454 A 0.129 -455 P 0.108 -456 G 0.091 -457 V 0.080 -458 E 0.076 -459 E 0.080 -460 I 0.087 -461 K 0.094 -462 N 0.101 -463 N 0.104 -464 L 0.099 -465 F 0.089 -466 F 0.081 -467 E 0.077 -468 G 0.075 -469 V 0.071 -470 D 0.063 -471 W 0.055 -472 E 0.053 -473 H 0.056 -474 I 0.060 -475 R 0.065 -476 E 0.078 -477 R 0.098 -478 P 0.117 -479 A 0.127 -480 A 0.133 -481 I 0.139 -482 S 0.147 -483 I 0.154 -484 E 0.162 -485 I 0.173 -486 K 0.188 -487 S 0.201 -488 I 0.205 -489 D 0.196 -490 D 0.184 -491 T 0.175 -492 S 0.172 -493 N 0.177 -494 F 0.191 -495 D 0.210 -496 E 0.231 -497 F 0.259 -498 P 0.302 -499 E 0.362 -500 S 0.429 -501 D 0.483 -502 I 0.514 -503 L 0.532 -504 K 0.555 -505 P 0.584 -506 T 0.609 -507 V 0.622 -508 T 0.621 -509 T 0.611 -510 S 0.592 -511 S 0.569 -512 H 0.548 -513 P 0.524 -514 E 0.484 -515 T 0.427 -516 D 0.372 -517 Y 0.330 -518 K 0.302 -519 N 0.277 -520 K 0.245 -521 D 0.217 -522 W 0.208 -523 V 0.228 -524 F 0.258 -525 I 0.268 -526 N 0.246 -527 Y 0.206 -528 T 0.173 -529 Y 0.167 -530 K 0.193 -531 R 0.249 -532 F 0.328 -533 E 0.410 -534 G 0.480 -535 L 0.527 -536 T 0.547 -537 A 0.550 -538 R 0.551 -539 G 0.542 -540 A 0.509 -541 I 0.462 -542 P 0.424 -543 S 0.398 -544 Y 0.378 -545 M 0.377 -546 K 0.406 -547 A 0.443 -548 A 0.459 -549 K 0.457 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024018.19_ENSMUST00000128751.3_GN:Ccdc167_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024018.19_ENSMUST00000128751.3_GN:Ccdc167_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index dfca210ddbdd8a6ecef2b4bac40e3cbc6e07fe9f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024018.19_ENSMUST00000128751.3_GN:Ccdc167_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,98 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000024018.19|ENSMUST00000128751.3|GN:Ccdc167|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.349 -2 T 0.342 -3 K 0.346 -4 K 0.368 -5 K 0.391 -6 R 0.398 -7 E 0.387 -8 N 0.360 -9 L 0.321 -10 G 0.270 -11 V 0.219 -12 A 0.183 -13 Q 0.160 -14 E 0.143 -15 I 0.128 -16 D 0.119 -17 G 0.109 -18 L 0.099 -19 E 0.096 -20 E 0.097 -21 K 0.090 -22 L 0.074 -23 S 0.060 -24 R 0.054 -25 C 0.059 -26 R 0.071 -27 K 0.083 -28 D 0.081 -29 L 0.069 -30 E 0.058 -31 A 0.053 -32 V 0.056 -33 T 0.068 -34 S 0.084 -35 Q 0.094 -36 L 0.100 -37 Y 0.113 -38 R 0.137 -39 A 0.161 -40 E 0.169 -41 L 0.157 -42 S 0.136 -43 P 0.118 -44 E 0.104 -45 D 0.092 -46 R 0.081 -47 R 0.075 -48 S 0.079 -49 L 0.091 -50 E 0.105 -51 K 0.115 -52 E 0.112 -53 K 0.100 -54 H 0.088 -55 T 0.081 -56 L 0.081 -57 M 0.089 -58 N 0.095 -59 K 0.092 -60 A 0.082 -61 S 0.072 -62 K 0.069 -63 Y 0.079 -64 E 0.095 -65 K 0.101 -66 E 0.090 -67 L 0.074 -68 K 0.066 -69 L 0.069 -70 L 0.083 -71 R 0.105 -72 H 0.126 -73 E 0.141 -74 N 0.152 -75 R 0.161 -76 K 0.168 -77 N 0.169 -78 T 0.164 -79 L 0.155 -80 L 0.149 -81 S 0.148 -82 V 0.147 -83 A 0.145 -84 I 0.141 -85 F 0.134 -86 T 0.125 -87 V 0.117 -88 F 0.108 -89 A 0.098 -90 L 0.089 -91 L 0.082 -92 Y 0.078 -93 A 0.075 -94 Y 0.079 -95 W 0.098 -96 T 0.125 -97 M 0.145 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024018.19_ENSMUST00000128751.3_GN:Ccdc167_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024018.19_ENSMUST00000128751.3_GN:Ccdc167_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid deleted file mode 100644 index 18b8afd3dfd5a87cc64f2b6a50dc2d882a0194c0..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024018.19_ENSMUST00000128751.3_GN:Ccdc167_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid +++ /dev/null @@ -1,110 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000024018.19|ENSMUST00000128751.3|GN:Ccdc167|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:12 -1 M 0.438 -2 G 0.436 -3 W 0.429 -4 S 0.416 -5 S 0.398 -6 A 0.379 -7 E 0.361 -8 K 0.342 -9 T 0.324 -10 A 0.315 -11 S 0.317 -12 N 0.318 -13 M 0.311 -14 T 0.303 -15 K 0.305 -16 K 0.316 -17 K 0.330 -18 R 0.340 -19 E 0.344 -20 N 0.342 -21 L 0.327 -22 G 0.290 -23 V 0.243 -24 A 0.207 -25 Q 0.185 -26 E 0.164 -27 I 0.145 -28 D 0.130 -29 G 0.115 -30 L 0.098 -31 E 0.089 -32 E 0.088 -33 K 0.084 -34 L 0.073 -35 S 0.062 -36 R 0.057 -37 C 0.061 -38 R 0.073 -39 K 0.084 -40 D 0.082 -41 L 0.071 -42 E 0.061 -43 A 0.057 -44 V 0.060 -45 T 0.073 -46 S 0.089 -47 Q 0.098 -48 L 0.100 -49 Y 0.110 -50 R 0.132 -51 A 0.155 -52 E 0.164 -53 L 0.154 -54 S 0.134 -55 P 0.118 -56 E 0.106 -57 D 0.095 -58 R 0.083 -59 R 0.078 -60 S 0.081 -61 L 0.091 -62 E 0.104 -63 K 0.113 -64 E 0.110 -65 K 0.101 -66 H 0.091 -67 T 0.083 -68 L 0.082 -69 M 0.089 -70 N 0.097 -71 K 0.095 -72 A 0.085 -73 S 0.075 -74 K 0.071 -75 Y 0.080 -76 E 0.095 -77 K 0.102 -78 E 0.092 -79 L 0.077 -80 K 0.070 -81 L 0.073 -82 L 0.086 -83 R 0.106 -84 H 0.125 -85 E 0.139 -86 N 0.147 -87 R 0.152 -88 K 0.158 -89 N 0.161 -90 T 0.158 -91 L 0.152 -92 L 0.147 -93 S 0.147 -94 V 0.147 -95 A 0.143 -96 I 0.136 -97 F 0.127 -98 T 0.117 -99 V 0.107 -100 F 0.100 -101 A 0.091 -102 L 0.083 -103 L 0.077 -104 Y 0.073 -105 A 0.072 -106 Y 0.077 -107 W 0.096 -108 T 0.124 -109 M 0.145 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024182.19_ENSMUST00000074370.11_GN:Axin1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024182.19_ENSMUST00000074370.11_GN:Axin1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 246641daae1b2d27a5c5e03912a35c2d9eb1f140..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024182.19_ENSMUST00000074370.11_GN:Axin1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,864 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000024182.19|ENSMUST00000074370.11|GN:Axin1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.432 -2 N 0.468 -3 V 0.516 -4 Q 0.556 -5 E 0.584 -6 Q 0.605 -7 G 0.621 -8 F 0.638 -9 P 0.659 -10 L 0.680 -11 D 0.696 -12 L 0.710 -13 G 0.720 -14 A 0.722 -15 S 0.716 -16 F 0.712 -17 T 0.710 -18 E 0.705 -19 D 0.690 -20 A 0.666 -21 P 0.646 -22 R 0.647 -23 P 0.671 -24 P 0.706 -25 V 0.740 -26 P 0.769 -27 G 0.793 -28 E 0.807 -29 E 0.814 -30 G 0.815 -31 E 0.813 -32 L 0.807 -33 V 0.801 -34 S 0.794 -35 T 0.784 -36 D 0.767 -37 S 0.748 -38 R 0.738 -39 P 0.731 -40 V 0.704 -41 N 0.657 -42 H 0.632 -43 S 0.664 -44 F 0.726 -45 C 0.773 -46 S 0.799 -47 G 0.813 -48 K 0.821 -49 G 0.823 -50 T 0.820 -51 S 0.814 -52 I 0.809 -53 K 0.810 -54 S 0.815 -55 E 0.818 -56 T 0.816 -57 S 0.809 -58 T 0.795 -59 A 0.777 -60 T 0.764 -61 P 0.767 -62 R 0.782 -63 R 0.796 -64 S 0.798 -65 D 0.789 -66 L 0.778 -67 D 0.772 -68 L 0.766 -69 G 0.755 -70 Y 0.743 -71 E 0.741 -72 P 0.751 -73 E 0.758 -74 G 0.748 -75 S 0.711 -76 A 0.652 -77 S 0.579 -78 P 0.489 -79 T 0.381 -80 P 0.269 -81 P 0.176 -82 Y 0.115 -83 L 0.082 -84 R 0.066 -85 W 0.057 -86 A 0.048 -87 E 0.038 -88 S 0.032 -89 L 0.033 -90 H 0.039 -91 S 0.045 -92 L 0.044 -93 L 0.038 -94 D 0.033 -95 D 0.030 -96 Q 0.028 -97 D 0.028 -98 G 0.027 -99 I 0.025 -100 S 0.023 -101 L 0.024 -102 F 0.026 -103 R 0.032 -104 T 0.044 -105 F 0.061 -106 L 0.070 -107 K 0.064 -108 Q 0.051 -109 E 0.047 -110 G 0.054 -111 C 0.063 -112 A 0.066 -113 D 0.060 -114 L 0.049 -115 L 0.038 -116 D 0.031 -117 F 0.026 -118 W 0.023 -119 F 0.021 -120 A 0.022 -121 C 0.026 -122 S 0.031 -123 G 0.034 -124 F 0.034 -125 R 0.036 -126 K 0.044 -127 L 0.058 -128 E 0.076 -129 P 0.095 -130 C 0.111 -131 D 0.119 -132 S 0.118 -133 N 0.105 -134 E 0.083 -135 E 0.061 -136 K 0.049 -137 R 0.045 -138 L 0.043 -139 K 0.041 -140 L 0.039 -141 A 0.038 -142 R 0.035 -143 A 0.035 -144 I 0.036 -145 Y 0.036 -146 R 0.037 -147 K 0.043 -148 Y 0.052 -149 I 0.063 -150 L 0.084 -151 D 0.118 -152 S 0.152 -153 N 0.168 -154 G 0.165 -155 I 0.156 -156 V 0.147 -157 S 0.137 -158 R 0.126 -159 Q 0.117 -160 T 0.108 -161 K 0.093 -162 P 0.075 -163 A 0.062 -164 T 0.060 -165 K 0.068 -166 S 0.078 -167 F 0.079 -168 I 0.071 -169 K 0.063 -170 D 0.059 -171 C 0.060 -172 V 0.061 -173 M 0.064 -174 K 0.070 -175 Q 0.083 -176 Q 0.098 -177 I 0.107 -178 D 0.105 -179 P 0.102 -180 A 0.105 -181 M 0.112 -182 F 0.112 -183 D 0.099 -184 Q 0.089 -185 A 0.091 -186 Q 0.098 -187 T 0.108 -188 E 0.119 -189 I 0.124 -190 Q 0.118 -191 S 0.101 -192 T 0.082 -193 M 0.066 -194 E 0.050 -195 E 0.037 -196 N 0.030 -197 T 0.028 -198 Y 0.027 -199 P 0.026 -200 S 0.026 -201 F 0.028 -202 L 0.029 -203 K 0.029 -204 S 0.029 -205 D 0.029 -206 I 0.028 -207 Y 0.031 -208 L 0.039 -209 E 0.051 -210 Y 0.067 -211 T 0.095 -212 R 0.148 -213 T 0.232 -214 G 0.342 -215 S 0.458 -216 E 0.555 -217 S 0.622 -218 P 0.672 -219 K 0.719 -220 V 0.755 -221 C 0.773 -222 S 0.779 -223 D 0.781 -224 Q 0.785 -225 S 0.792 -226 S 0.802 -227 G 0.811 -228 S 0.818 -229 G 0.826 -230 T 0.832 -231 G 0.834 -232 K 0.831 -233 G 0.823 -234 M 0.811 -235 S 0.796 -236 G 0.776 -237 Y 0.760 -238 L 0.759 -239 P 0.775 -240 T 0.792 -241 L 0.798 -242 N 0.792 -243 E 0.779 -244 D 0.763 -245 E 0.748 -246 E 0.739 -247 W 0.745 -248 K 0.768 -249 C 0.795 -250 D 0.813 -251 Q 0.824 -252 D 0.830 -253 A 0.830 -254 D 0.824 -255 E 0.815 -256 D 0.807 -257 D 0.798 -258 G 0.785 -259 R 0.774 -260 D 0.763 -261 P 0.753 -262 L 0.744 -263 P 0.743 -264 P 0.748 -265 S 0.745 -266 R 0.726 -267 L 0.702 -268 T 0.686 -269 Q 0.688 -270 K 0.704 -271 L 0.721 -272 L 0.732 -273 L 0.742 -274 E 0.755 -275 T 0.765 -276 A 0.766 -277 A 0.765 -278 P 0.772 -279 R 0.787 -280 A 0.801 -281 P 0.809 -282 S 0.810 -283 S 0.806 -284 R 0.801 -285 R 0.795 -286 Y 0.795 -287 N 0.803 -288 E 0.813 -289 G 0.817 -290 R 0.810 -291 E 0.798 -292 L 0.784 -293 R 0.774 -294 Y 0.772 -295 G 0.775 -296 S 0.774 -297 W 0.767 -298 R 0.762 -299 E 0.757 -300 P 0.750 -301 V 0.739 -302 N 0.729 -303 P 0.728 -304 Y 0.743 -305 Y 0.769 -306 V 0.797 -307 N 0.816 -308 S 0.827 -309 G 0.835 -310 Y 0.844 -311 A 0.850 -312 L 0.850 -313 A 0.849 -314 P 0.853 -315 A 0.861 -316 T 0.867 -317 S 0.869 -318 A 0.866 -319 N 0.862 -320 D 0.856 -321 S 0.848 -322 E 0.840 -323 Q 0.837 -324 Q 0.838 -325 S 0.838 -326 L 0.835 -327 S 0.835 -328 S 0.837 -329 D 0.840 -330 A 0.840 -331 D 0.840 -332 T 0.840 -333 L 0.842 -334 S 0.845 -335 L 0.848 -336 T 0.851 -337 D 0.851 -338 S 0.848 -339 S 0.841 -340 V 0.832 -341 D 0.813 -342 G 0.775 -343 I 0.727 -344 P 0.694 -345 P 0.693 -346 Y 0.708 -347 R 0.718 -348 I 0.712 -349 R 0.692 -350 K 0.675 -351 Q 0.669 -352 H 0.666 -353 R 0.665 -354 R 0.681 -355 E 0.720 -356 M 0.761 -357 Q 0.787 -358 E 0.799 -359 S 0.798 -360 I 0.785 -361 Q 0.768 -362 V 0.759 -363 N 0.763 -364 G 0.772 -365 R 0.774 -366 V 0.768 -367 P 0.761 -368 L 0.759 -369 P 0.755 -370 H 0.742 -371 I 0.723 -372 P 0.708 -373 R 0.703 -374 T 0.706 -375 Y 0.702 -376 R 0.688 -377 M 0.678 -378 P 0.680 -379 K 0.683 -380 E 0.661 -381 I 0.607 -382 R 0.538 -383 V 0.468 -384 E 0.403 -385 P 0.355 -386 Q 0.330 -387 K 0.326 -388 F 0.331 -389 A 0.328 -390 E 0.312 -391 E 0.295 -392 L 0.276 -393 I 0.245 -394 H 0.207 -395 R 0.180 -396 L 0.163 -397 E 0.151 -398 A 0.144 -399 V 0.139 -400 Q 0.136 -401 R 0.140 -402 T 0.151 -403 R 0.167 -404 E 0.191 -405 A 0.222 -406 E 0.242 -407 E 0.246 -408 K 0.242 -409 L 0.238 -410 E 0.234 -411 E 0.230 -412 R 0.222 -413 L 0.215 -414 K 0.223 -415 R 0.248 -416 V 0.277 -417 R 0.304 -418 M 0.341 -419 E 0.406 -420 E 0.491 -421 E 0.575 -422 G 0.647 -423 E 0.704 -424 D 0.741 -425 G 0.756 -426 E 0.756 -427 M 0.754 -428 P 0.759 -429 S 0.772 -430 G 0.790 -431 P 0.805 -432 M 0.815 -433 A 0.816 -434 S 0.808 -435 H 0.797 -436 K 0.789 -437 L 0.788 -438 P 0.791 -439 S 0.792 -440 V 0.785 -441 P 0.772 -442 A 0.756 -443 W 0.740 -444 H 0.725 -445 H 0.715 -446 F 0.721 -447 P 0.748 -448 P 0.788 -449 R 0.822 -450 Y 0.838 -451 V 0.840 -452 D 0.836 -453 M 0.832 -454 G 0.830 -455 C 0.832 -456 S 0.838 -457 G 0.846 -458 L 0.852 -459 R 0.852 -460 D 0.844 -461 A 0.824 -462 H 0.796 -463 E 0.764 -464 E 0.736 -465 N 0.717 -466 P 0.718 -467 E 0.735 -468 S 0.750 -469 I 0.747 -470 L 0.717 -471 D 0.667 -472 E 0.610 -473 H 0.556 -474 V 0.517 -475 Q 0.512 -476 R 0.550 -477 V 0.604 -478 M 0.647 -479 R 0.679 -480 T 0.713 -481 P 0.753 -482 G 0.788 -483 C 0.806 -484 Q 0.806 -485 S 0.801 -486 P 0.802 -487 G 0.812 -488 P 0.825 -489 G 0.834 -490 H 0.834 -491 R 0.827 -492 S 0.821 -493 P 0.819 -494 D 0.820 -495 S 0.808 -496 G 0.764 -497 H 0.700 -498 V 0.669 -499 A 0.710 -500 K 0.783 -501 T 0.833 -502 A 0.852 -503 V 0.856 -504 L 0.857 -505 G 0.859 -506 G 0.861 -507 T 0.861 -508 A 0.860 -509 S 0.859 -510 G 0.857 -511 H 0.856 -512 G 0.855 -513 K 0.849 -514 H 0.839 -515 V 0.831 -516 P 0.833 -517 K 0.844 -518 L 0.855 -519 G 0.859 -520 L 0.858 -521 K 0.855 -522 L 0.852 -523 D 0.849 -524 T 0.844 -525 A 0.839 -526 G 0.833 -527 L 0.826 -528 H 0.823 -529 H 0.823 -530 H 0.826 -531 R 0.827 -532 H 0.826 -533 V 0.822 -534 H 0.820 -535 H 0.820 -536 H 0.818 -537 V 0.811 -538 H 0.804 -539 H 0.800 -540 N 0.796 -541 S 0.787 -542 A 0.776 -543 R 0.768 -544 P 0.772 -545 K 0.784 -546 E 0.790 -547 Q 0.778 -548 M 0.746 -549 E 0.699 -550 A 0.642 -551 E 0.577 -552 V 0.515 -553 A 0.481 -554 R 0.501 -555 R 0.567 -556 V 0.636 -557 Q 0.680 -558 S 0.700 -559 S 0.704 -560 F 0.704 -561 S 0.710 -562 W 0.727 -563 G 0.753 -564 P 0.784 -565 E 0.810 -566 T 0.827 -567 H 0.835 -568 G 0.837 -569 H 0.835 -570 A 0.831 -571 K 0.828 -572 P 0.828 -573 R 0.828 -574 S 0.826 -575 Y 0.823 -576 S 0.826 -577 E 0.840 -578 N 0.856 -579 A 0.866 -580 G 0.868 -581 T 0.866 -582 T 0.865 -583 L 0.867 -584 S 0.869 -585 A 0.871 -586 G 0.870 -587 D 0.866 -588 L 0.861 -589 A 0.854 -590 F 0.850 -591 G 0.850 -592 G 0.850 -593 K 0.848 -594 T 0.840 -595 S 0.823 -596 A 0.795 -597 P 0.748 -598 S 0.688 -599 K 0.648 -600 R 0.647 -601 N 0.656 -602 T 0.672 -603 K 0.720 -604 K 0.783 -605 A 0.822 -606 E 0.835 -607 S 0.840 -608 G 0.845 -609 K 0.849 -610 N 0.850 -611 A 0.846 -612 N 0.837 -613 A 0.823 -614 E 0.809 -615 V 0.798 -616 P 0.794 -617 S 0.793 -618 T 0.785 -619 T 0.764 -620 E 0.733 -621 D 0.692 -622 A 0.641 -623 E 0.589 -624 K 0.552 -625 N 0.533 -626 Q 0.514 -627 K 0.477 -628 I 0.423 -629 M 0.367 -630 Q 0.329 -631 W 0.316 -632 I 0.318 -633 I 0.332 -634 E 0.359 -635 G 0.395 -636 E 0.427 -637 K 0.447 -638 E 0.455 -639 I 0.466 -640 S 0.497 -641 R 0.552 -642 H 0.610 -643 R 0.657 -644 K 0.691 -645 A 0.716 -646 G 0.736 -647 H 0.756 -648 G 0.776 -649 S 0.791 -650 S 0.797 -651 G 0.798 -652 L 0.800 -653 R 0.802 -654 K 0.800 -655 Q 0.793 -656 Q 0.788 -657 A 0.789 -658 H 0.791 -659 E 0.789 -660 S 0.785 -661 S 0.783 -662 R 0.791 -663 P 0.808 -664 L 0.829 -665 S 0.842 -666 I 0.846 -667 E 0.844 -668 R 0.843 -669 P 0.845 -670 G 0.844 -671 A 0.830 -672 V 0.801 -673 H 0.769 -674 P 0.750 -675 W 0.753 -676 V 0.770 -677 S 0.785 -678 A 0.794 -679 Q 0.804 -680 L 0.818 -681 R 0.827 -682 N 0.824 -683 S 0.811 -684 V 0.799 -685 Q 0.796 -686 P 0.803 -687 S 0.813 -688 H 0.821 -689 L 0.828 -690 F 0.833 -691 I 0.833 -692 Q 0.826 -693 D 0.815 -694 P 0.798 -695 T 0.778 -696 M 0.763 -697 P 0.762 -698 P 0.774 -699 N 0.783 -700 P 0.777 -701 A 0.753 -702 P 0.721 -703 N 0.693 -704 P 0.674 -705 L 0.650 -706 T 0.602 -707 Q 0.520 -708 L 0.424 -709 E 0.349 -710 E 0.313 -711 A 0.303 -712 R 0.301 -713 R 0.302 -714 R 0.310 -715 L 0.318 -716 E 0.326 -717 E 0.346 -718 E 0.379 -719 E 0.409 -720 K 0.434 -721 R 0.465 -722 A 0.507 -723 N 0.551 -724 K 0.588 -725 L 0.618 -726 P 0.636 -727 S 0.640 -728 K 0.625 -729 Q 0.592 -730 R 0.560 -731 Y 0.552 -732 V 0.563 -733 Q 0.567 -734 A 0.558 -735 V 0.559 -736 M 0.587 -737 Q 0.637 -738 R 0.689 -739 G 0.733 -740 R 0.763 -741 T 0.781 -742 C 0.785 -743 V 0.782 -744 R 0.782 -745 P 0.788 -746 A 0.796 -747 C 0.801 -748 A 0.806 -749 P 0.814 -750 V 0.819 -751 L 0.820 -752 S 0.816 -753 V 0.809 -754 V 0.804 -755 P 0.808 -756 A 0.819 -757 V 0.829 -758 S 0.834 -759 D 0.835 -760 L 0.833 -761 E 0.831 -762 L 0.828 -763 S 0.825 -764 E 0.823 -765 T 0.820 -766 E 0.819 -767 T 0.818 -768 K 0.815 -769 S 0.811 -770 Q 0.807 -771 R 0.808 -772 K 0.811 -773 A 0.811 -774 G 0.802 -775 G 0.784 -776 G 0.756 -777 S 0.717 -778 A 0.670 -779 P 0.615 -780 P 0.540 -781 C 0.427 -782 D 0.289 -783 S 0.167 -784 I 0.085 -785 V 0.045 -786 V 0.031 -787 A 0.029 -788 Y 0.033 -789 Y 0.041 -790 F 0.052 -791 C 0.064 -792 G 0.073 -793 E 0.080 -794 P 0.085 -795 I 0.087 -796 P 0.083 -797 Y 0.073 -798 R 0.061 -799 T 0.056 -800 L 0.060 -801 V 0.072 -802 R 0.081 -803 G 0.082 -804 R 0.076 -805 A 0.067 -806 V 0.055 -807 T 0.044 -808 L 0.039 -809 G 0.038 -810 Q 0.040 -811 F 0.042 -812 K 0.046 -813 E 0.053 -814 L 0.063 -815 L 0.071 -816 T 0.078 -817 K 0.086 -818 K 0.097 -819 G 0.102 -820 S 0.095 -821 Y 0.080 -822 R 0.061 -823 Y 0.046 -824 Y 0.039 -825 F 0.041 -826 K 0.051 -827 K 0.070 -828 V 0.096 -829 S 0.126 -830 D 0.149 -831 E 0.168 -832 F 0.188 -833 D 0.209 -834 C 0.217 -835 G 0.204 -836 V 0.174 -837 V 0.140 -838 F 0.113 -839 E 0.097 -840 E 0.090 -841 V 0.089 -842 R 0.091 -843 E 0.094 -844 D 0.093 -845 E 0.088 -846 A 0.082 -847 V 0.077 -848 L 0.076 -849 P 0.078 -850 V 0.080 -851 F 0.081 -852 E 0.083 -853 E 0.087 -854 K 0.092 -855 I 0.093 -856 I 0.089 -857 G 0.082 -858 K 0.078 -859 V 0.079 -860 E 0.096 -861 K 0.137 -862 V 0.199 -863 D 0.248 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024182.19_ENSMUST00000074370.11_GN:Axin1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024182.19_ENSMUST00000074370.11_GN:Axin1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid deleted file mode 100644 index b6f1a562b590d71003d27fc0fa2b1091af59c78d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024182.19_ENSMUST00000074370.11_GN:Axin1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid +++ /dev/null @@ -1,869 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000024182.19|ENSMUST00000074370.11|GN:Axin1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:5 -1 M 0.395 -2 Q 0.425 -3 S 0.482 -4 P 0.556 -5 K 0.627 -6 M 0.678 -7 N 0.704 -8 V 0.708 -9 Q 0.701 -10 E 0.694 -11 Q 0.692 -12 G 0.689 -13 F 0.687 -14 P 0.692 -15 L 0.703 -16 D 0.716 -17 L 0.729 -18 G 0.738 -19 A 0.739 -20 S 0.733 -21 F 0.728 -22 T 0.726 -23 E 0.722 -24 D 0.708 -25 A 0.683 -26 P 0.661 -27 R 0.659 -28 P 0.679 -29 P 0.711 -30 V 0.742 -31 P 0.770 -32 G 0.794 -33 E 0.810 -34 E 0.820 -35 G 0.824 -36 E 0.824 -37 L 0.818 -38 V 0.810 -39 S 0.802 -40 T 0.792 -41 D 0.774 -42 S 0.755 -43 R 0.744 -44 P 0.736 -45 V 0.709 -46 N 0.663 -47 H 0.639 -48 S 0.672 -49 F 0.734 -50 C 0.781 -51 S 0.807 -52 G 0.821 -53 K 0.829 -54 G 0.832 -55 T 0.829 -56 S 0.823 -57 I 0.818 -58 K 0.819 -59 S 0.824 -60 E 0.828 -61 T 0.826 -62 S 0.818 -63 T 0.804 -64 A 0.785 -65 T 0.772 -66 P 0.773 -67 R 0.787 -68 R 0.800 -69 S 0.801 -70 D 0.791 -71 L 0.780 -72 D 0.773 -73 L 0.767 -74 G 0.756 -75 Y 0.744 -76 E 0.742 -77 P 0.752 -78 E 0.759 -79 G 0.748 -80 S 0.712 -81 A 0.653 -82 S 0.579 -83 P 0.489 -84 T 0.382 -85 P 0.270 -86 P 0.176 -87 Y 0.115 -88 L 0.082 -89 R 0.066 -90 W 0.057 -91 A 0.047 -92 E 0.037 -93 S 0.031 -94 L 0.032 -95 H 0.039 -96 S 0.045 -97 L 0.044 -98 L 0.038 -99 D 0.032 -100 D 0.030 -101 Q 0.028 -102 D 0.028 -103 G 0.027 -104 I 0.025 -105 S 0.023 -106 L 0.024 -107 F 0.026 -108 R 0.032 -109 T 0.044 -110 F 0.061 -111 L 0.070 -112 K 0.064 -113 Q 0.051 -114 E 0.048 -115 G 0.055 -116 C 0.064 -117 A 0.068 -118 D 0.061 -119 L 0.050 -120 L 0.038 -121 D 0.031 -122 F 0.026 -123 W 0.023 -124 F 0.021 -125 A 0.022 -126 C 0.026 -127 S 0.031 -128 G 0.034 -129 F 0.034 -130 R 0.036 -131 K 0.044 -132 L 0.059 -133 E 0.077 -134 P 0.095 -135 C 0.111 -136 D 0.119 -137 S 0.118 -138 N 0.105 -139 E 0.083 -140 E 0.061 -141 K 0.049 -142 R 0.045 -143 L 0.042 -144 K 0.040 -145 L 0.039 -146 A 0.037 -147 R 0.035 -148 A 0.035 -149 I 0.036 -150 Y 0.035 -151 R 0.037 -152 K 0.043 -153 Y 0.052 -154 I 0.063 -155 L 0.084 -156 D 0.118 -157 S 0.151 -158 N 0.167 -159 G 0.165 -160 I 0.156 -161 V 0.147 -162 S 0.137 -163 R 0.125 -164 Q 0.117 -165 T 0.107 -166 K 0.092 -167 P 0.074 -168 A 0.061 -169 T 0.059 -170 K 0.068 -171 S 0.078 -172 F 0.079 -173 I 0.071 -174 K 0.062 -175 D 0.058 -176 C 0.059 -177 V 0.061 -178 M 0.063 -179 K 0.070 -180 Q 0.082 -181 Q 0.098 -182 I 0.106 -183 D 0.105 -184 P 0.101 -185 A 0.104 -186 M 0.111 -187 F 0.110 -188 D 0.098 -189 Q 0.088 -190 A 0.089 -191 Q 0.096 -192 T 0.105 -193 E 0.116 -194 I 0.122 -195 Q 0.117 -196 S 0.101 -197 T 0.082 -198 M 0.065 -199 E 0.050 -200 E 0.037 -201 N 0.030 -202 T 0.028 -203 Y 0.027 -204 P 0.026 -205 S 0.026 -206 F 0.028 -207 L 0.029 -208 K 0.029 -209 S 0.029 -210 D 0.028 -211 I 0.028 -212 Y 0.031 -213 L 0.039 -214 E 0.051 -215 Y 0.067 -216 T 0.095 -217 R 0.148 -218 T 0.231 -219 G 0.341 -220 S 0.457 -221 E 0.554 -222 S 0.621 -223 P 0.672 -224 K 0.718 -225 V 0.754 -226 C 0.773 -227 S 0.778 -228 D 0.780 -229 Q 0.785 -230 S 0.792 -231 S 0.802 -232 G 0.810 -233 S 0.818 -234 G 0.826 -235 T 0.832 -236 G 0.834 -237 K 0.831 -238 G 0.822 -239 M 0.810 -240 S 0.795 -241 G 0.775 -242 Y 0.758 -243 L 0.758 -244 P 0.774 -245 T 0.791 -246 L 0.797 -247 N 0.791 -248 E 0.778 -249 D 0.761 -250 E 0.746 -251 E 0.737 -252 W 0.743 -253 K 0.767 -254 C 0.794 -255 D 0.813 -256 Q 0.823 -257 D 0.829 -258 A 0.830 -259 D 0.823 -260 E 0.815 -261 D 0.807 -262 D 0.798 -263 G 0.786 -264 R 0.774 -265 D 0.764 -266 P 0.754 -267 L 0.744 -268 P 0.743 -269 P 0.749 -270 S 0.747 -271 R 0.729 -272 L 0.705 -273 T 0.689 -274 Q 0.691 -275 K 0.706 -276 L 0.722 -277 L 0.732 -278 L 0.741 -279 E 0.755 -280 T 0.764 -281 A 0.765 -282 A 0.764 -283 P 0.771 -284 R 0.786 -285 A 0.800 -286 P 0.808 -287 S 0.810 -288 S 0.807 -289 R 0.801 -290 R 0.796 -291 Y 0.796 -292 N 0.804 -293 E 0.814 -294 G 0.818 -295 R 0.812 -296 E 0.799 -297 L 0.786 -298 R 0.775 -299 Y 0.774 -300 G 0.776 -301 S 0.774 -302 W 0.768 -303 R 0.763 -304 E 0.758 -305 P 0.750 -306 V 0.739 -307 N 0.730 -308 P 0.730 -309 Y 0.744 -310 Y 0.770 -311 V 0.798 -312 N 0.817 -313 S 0.828 -314 G 0.836 -315 Y 0.846 -316 A 0.852 -317 L 0.852 -318 A 0.851 -319 P 0.855 -320 A 0.863 -321 T 0.870 -322 S 0.871 -323 A 0.869 -324 N 0.864 -325 D 0.858 -326 S 0.851 -327 E 0.843 -328 Q 0.840 -329 Q 0.841 -330 S 0.840 -331 L 0.838 -332 S 0.837 -333 S 0.840 -334 D 0.842 -335 A 0.842 -336 D 0.842 -337 T 0.843 -338 L 0.844 -339 S 0.847 -340 L 0.851 -341 T 0.854 -342 D 0.854 -343 S 0.850 -344 S 0.844 -345 V 0.835 -346 D 0.815 -347 G 0.778 -348 I 0.730 -349 P 0.697 -350 P 0.697 -351 Y 0.713 -352 R 0.723 -353 I 0.718 -354 R 0.699 -355 K 0.682 -356 Q 0.675 -357 H 0.671 -358 R 0.668 -359 R 0.684 -360 E 0.721 -361 M 0.762 -362 Q 0.788 -363 E 0.799 -364 S 0.799 -365 I 0.787 -366 Q 0.770 -367 V 0.761 -368 N 0.764 -369 G 0.773 -370 R 0.774 -371 V 0.768 -372 P 0.761 -373 L 0.758 -374 P 0.754 -375 H 0.741 -376 I 0.722 -377 P 0.706 -378 R 0.701 -379 T 0.702 -380 Y 0.698 -381 R 0.685 -382 M 0.675 -383 P 0.677 -384 K 0.680 -385 E 0.660 -386 I 0.606 -387 R 0.536 -388 V 0.466 -389 E 0.402 -390 P 0.354 -391 Q 0.329 -392 K 0.326 -393 F 0.331 -394 A 0.327 -395 E 0.312 -396 E 0.294 -397 L 0.275 -398 I 0.244 -399 H 0.207 -400 R 0.179 -401 L 0.163 -402 E 0.151 -403 A 0.143 -404 V 0.138 -405 Q 0.136 -406 R 0.139 -407 T 0.150 -408 R 0.165 -409 E 0.190 -410 A 0.220 -411 E 0.240 -412 E 0.243 -413 K 0.239 -414 L 0.235 -415 E 0.232 -416 E 0.228 -417 R 0.220 -418 L 0.214 -419 K 0.221 -420 R 0.246 -421 V 0.275 -422 R 0.302 -423 M 0.339 -424 E 0.403 -425 E 0.487 -426 E 0.571 -427 G 0.643 -428 E 0.701 -429 D 0.739 -430 G 0.754 -431 E 0.755 -432 M 0.753 -433 P 0.758 -434 S 0.771 -435 G 0.789 -436 P 0.804 -437 M 0.814 -438 A 0.815 -439 S 0.807 -440 H 0.795 -441 K 0.787 -442 L 0.786 -443 P 0.790 -444 S 0.790 -445 V 0.783 -446 P 0.770 -447 A 0.754 -448 W 0.738 -449 H 0.723 -450 H 0.714 -451 F 0.720 -452 P 0.747 -453 P 0.787 -454 R 0.821 -455 Y 0.838 -456 V 0.840 -457 D 0.835 -458 M 0.832 -459 G 0.830 -460 C 0.832 -461 S 0.838 -462 G 0.846 -463 L 0.852 -464 R 0.852 -465 D 0.844 -466 A 0.824 -467 H 0.795 -468 E 0.764 -469 E 0.736 -470 N 0.717 -471 P 0.718 -472 E 0.735 -473 S 0.750 -474 I 0.746 -475 L 0.717 -476 D 0.668 -477 E 0.610 -478 H 0.557 -479 V 0.517 -480 Q 0.512 -481 R 0.551 -482 V 0.606 -483 M 0.649 -484 R 0.681 -485 T 0.716 -486 P 0.755 -487 G 0.790 -488 C 0.808 -489 Q 0.809 -490 S 0.803 -491 P 0.804 -492 G 0.814 -493 P 0.828 -494 G 0.836 -495 H 0.836 -496 R 0.829 -497 S 0.823 -498 P 0.821 -499 D 0.821 -500 S 0.809 -501 G 0.766 -502 H 0.701 -503 V 0.671 -504 A 0.711 -505 K 0.784 -506 T 0.834 -507 A 0.854 -508 V 0.858 -509 L 0.859 -510 G 0.861 -511 G 0.863 -512 T 0.863 -513 A 0.862 -514 S 0.861 -515 G 0.859 -516 H 0.858 -517 G 0.856 -518 K 0.851 -519 H 0.841 -520 V 0.832 -521 P 0.834 -522 K 0.845 -523 L 0.856 -524 G 0.860 -525 L 0.859 -526 K 0.856 -527 L 0.853 -528 D 0.850 -529 T 0.845 -530 A 0.840 -531 G 0.833 -532 L 0.827 -533 H 0.823 -534 H 0.823 -535 H 0.825 -536 R 0.826 -537 H 0.825 -538 V 0.822 -539 H 0.820 -540 H 0.819 -541 H 0.817 -542 V 0.811 -543 H 0.803 -544 H 0.799 -545 N 0.796 -546 S 0.787 -547 A 0.776 -548 R 0.769 -549 P 0.773 -550 K 0.784 -551 E 0.790 -552 Q 0.778 -553 M 0.746 -554 E 0.699 -555 A 0.642 -556 E 0.579 -557 V 0.517 -558 A 0.483 -559 R 0.502 -560 R 0.567 -561 V 0.636 -562 Q 0.680 -563 S 0.699 -564 S 0.704 -565 F 0.703 -566 S 0.709 -567 W 0.726 -568 G 0.753 -569 P 0.783 -570 E 0.810 -571 T 0.827 -572 H 0.835 -573 G 0.836 -574 H 0.834 -575 A 0.831 -576 K 0.828 -577 P 0.827 -578 R 0.828 -579 S 0.826 -580 Y 0.822 -581 S 0.826 -582 E 0.840 -583 N 0.856 -584 A 0.866 -585 G 0.868 -586 T 0.866 -587 T 0.865 -588 L 0.866 -589 S 0.869 -590 A 0.870 -591 G 0.869 -592 D 0.866 -593 L 0.860 -594 A 0.854 -595 F 0.850 -596 G 0.849 -597 G 0.850 -598 K 0.848 -599 T 0.840 -600 S 0.823 -601 A 0.795 -602 P 0.748 -603 S 0.687 -604 K 0.647 -605 R 0.642 -606 N 0.648 -607 T 0.663 -608 K 0.713 -609 K 0.779 -610 A 0.820 -611 E 0.834 -612 S 0.839 -613 G 0.844 -614 K 0.849 -615 N 0.850 -616 A 0.846 -617 N 0.837 -618 A 0.823 -619 E 0.809 -620 V 0.798 -621 P 0.794 -622 S 0.793 -623 T 0.785 -624 T 0.764 -625 E 0.733 -626 D 0.692 -627 A 0.641 -628 E 0.588 -629 K 0.551 -630 N 0.533 -631 Q 0.513 -632 K 0.476 -633 I 0.422 -634 M 0.366 -635 Q 0.329 -636 W 0.316 -637 I 0.318 -638 I 0.331 -639 E 0.359 -640 G 0.395 -641 E 0.427 -642 K 0.447 -643 E 0.456 -644 I 0.466 -645 S 0.498 -646 R 0.552 -647 H 0.611 -648 R 0.658 -649 K 0.692 -650 A 0.716 -651 G 0.736 -652 H 0.756 -653 G 0.777 -654 S 0.791 -655 S 0.797 -656 G 0.798 -657 L 0.800 -658 R 0.802 -659 K 0.798 -660 Q 0.789 -661 Q 0.783 -662 A 0.785 -663 H 0.789 -664 E 0.789 -665 S 0.785 -666 S 0.783 -667 R 0.791 -668 P 0.808 -669 L 0.829 -670 S 0.842 -671 I 0.846 -672 E 0.844 -673 R 0.843 -674 P 0.845 -675 G 0.844 -676 A 0.830 -677 V 0.801 -678 H 0.769 -679 P 0.750 -680 W 0.753 -681 V 0.770 -682 S 0.785 -683 A 0.794 -684 Q 0.804 -685 L 0.818 -686 R 0.827 -687 N 0.824 -688 S 0.811 -689 V 0.799 -690 Q 0.796 -691 P 0.803 -692 S 0.813 -693 H 0.821 -694 L 0.828 -695 F 0.833 -696 I 0.833 -697 Q 0.826 -698 D 0.814 -699 P 0.798 -700 T 0.778 -701 M 0.763 -702 P 0.762 -703 P 0.774 -704 N 0.783 -705 P 0.777 -706 A 0.753 -707 P 0.721 -708 N 0.693 -709 P 0.674 -710 L 0.650 -711 T 0.602 -712 Q 0.520 -713 L 0.424 -714 E 0.348 -715 E 0.312 -716 A 0.303 -717 R 0.300 -718 R 0.302 -719 R 0.310 -720 L 0.318 -721 E 0.326 -722 E 0.345 -723 E 0.378 -724 E 0.408 -725 K 0.433 -726 R 0.464 -727 A 0.506 -728 N 0.550 -729 K 0.588 -730 L 0.617 -731 P 0.636 -732 S 0.640 -733 K 0.625 -734 Q 0.592 -735 R 0.560 -736 Y 0.552 -737 V 0.563 -738 Q 0.568 -739 A 0.559 -740 V 0.559 -741 M 0.587 -742 Q 0.637 -743 R 0.689 -744 G 0.733 -745 R 0.763 -746 T 0.781 -747 C 0.785 -748 V 0.782 -749 R 0.782 -750 P 0.788 -751 A 0.796 -752 C 0.801 -753 A 0.807 -754 P 0.814 -755 V 0.819 -756 L 0.820 -757 S 0.816 -758 V 0.809 -759 V 0.804 -760 P 0.808 -761 A 0.819 -762 V 0.829 -763 S 0.834 -764 D 0.835 -765 L 0.833 -766 E 0.831 -767 L 0.828 -768 S 0.825 -769 E 0.823 -770 T 0.820 -771 E 0.819 -772 T 0.818 -773 K 0.815 -774 S 0.811 -775 Q 0.807 -776 R 0.808 -777 K 0.811 -778 A 0.811 -779 G 0.802 -780 G 0.784 -781 G 0.756 -782 S 0.717 -783 A 0.670 -784 P 0.615 -785 P 0.540 -786 C 0.427 -787 D 0.289 -788 S 0.167 -789 I 0.085 -790 V 0.045 -791 V 0.031 -792 A 0.029 -793 Y 0.033 -794 Y 0.041 -795 F 0.052 -796 C 0.064 -797 G 0.073 -798 E 0.080 -799 P 0.085 -800 I 0.087 -801 P 0.083 -802 Y 0.072 -803 R 0.061 -804 T 0.056 -805 L 0.060 -806 V 0.072 -807 R 0.081 -808 G 0.082 -809 R 0.076 -810 A 0.067 -811 V 0.055 -812 T 0.044 -813 L 0.039 -814 G 0.038 -815 Q 0.040 -816 F 0.042 -817 K 0.046 -818 E 0.053 -819 L 0.063 -820 L 0.071 -821 T 0.078 -822 K 0.086 -823 K 0.097 -824 G 0.102 -825 S 0.096 -826 Y 0.080 -827 R 0.061 -828 Y 0.046 -829 Y 0.039 -830 F 0.041 -831 K 0.051 -832 K 0.070 -833 V 0.097 -834 S 0.126 -835 D 0.149 -836 E 0.168 -837 F 0.188 -838 D 0.209 -839 C 0.217 -840 G 0.204 -841 V 0.174 -842 V 0.140 -843 F 0.113 -844 E 0.097 -845 E 0.090 -846 V 0.089 -847 R 0.091 -848 E 0.094 -849 D 0.093 -850 E 0.088 -851 A 0.082 -852 V 0.077 -853 L 0.076 -854 P 0.078 -855 V 0.080 -856 F 0.081 -857 E 0.083 -858 E 0.087 -859 K 0.092 -860 I 0.093 -861 I 0.089 -862 G 0.082 -863 K 0.078 -864 V 0.079 -865 E 0.096 -866 K 0.137 -867 V 0.197 -868 D 0.247 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024446.14_ENSMUST00000025319.7_GN:Rpp21_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024446.14_ENSMUST00000025319.7_GN:Rpp21_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index c691c5670448527cf7707e2f4ef5cc4e806fb7f0..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024446.14_ENSMUST00000025319.7_GN:Rpp21_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,151 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000024446.14|ENSMUST00000025319.7|GN:Rpp21|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.412 -2 A 0.403 -3 G 0.386 -4 P 0.355 -5 V 0.304 -6 K 0.237 -7 D 0.171 -8 R 0.124 -9 E 0.097 -10 A 0.083 -11 F 0.078 -12 Q 0.076 -13 R 0.072 -14 L 0.068 -15 S 0.063 -16 F 0.056 -17 L 0.053 -18 Y 0.058 -19 Q 0.069 -20 A 0.077 -21 A 0.081 -22 H 0.086 -23 C 0.096 -24 V 0.108 -25 L 0.114 -26 S 0.111 -27 Q 0.103 -28 N 0.096 -29 P 0.096 -30 E 0.099 -31 N 0.103 -32 Q 0.105 -33 A 0.108 -34 L 0.109 -35 A 0.103 -36 R 0.086 -37 F 0.068 -38 Y 0.058 -39 C 0.053 -40 H 0.051 -41 T 0.052 -42 E 0.060 -43 K 0.073 -44 T 0.082 -45 I 0.084 -46 A 0.079 -47 K 0.073 -48 R 0.073 -49 L 0.079 -50 V 0.093 -51 L 0.114 -52 R 0.136 -53 Q 0.145 -54 D 0.135 -55 P 0.117 -56 S 0.108 -57 V 0.108 -58 K 0.111 -59 R 0.110 -60 T 0.105 -61 L 0.095 -62 C 0.082 -63 R 0.074 -64 S 0.070 -65 C 0.070 -66 S 0.077 -67 S 0.090 -68 L 0.106 -69 L 0.119 -70 I 0.124 -71 P 0.128 -72 G 0.131 -73 L 0.125 -74 T 0.109 -75 C 0.095 -76 T 0.093 -77 Q 0.100 -78 R 0.110 -79 Q 0.117 -80 R 0.124 -81 R 0.134 -82 R 0.146 -83 K 0.152 -84 G 0.144 -85 Q 0.122 -86 R 0.095 -87 W 0.073 -88 T 0.060 -89 V 0.054 -90 Q 0.052 -91 T 0.052 -92 C 0.055 -93 L 0.060 -94 T 0.067 -95 C 0.076 -96 Q 0.084 -97 R 0.088 -98 S 0.092 -99 Q 0.102 -100 R 0.117 -101 F 0.139 -102 L 0.164 -103 N 0.186 -104 D 0.200 -105 P 0.208 -106 K 0.214 -107 H 0.224 -108 L 0.240 -109 L 0.263 -110 W 0.288 -111 G 0.306 -112 D 0.317 -113 R 0.336 -114 P 0.373 -115 E 0.418 -116 A 0.464 -117 Q 0.514 -118 L 0.568 -119 E 0.607 -120 N 0.622 -121 Q 0.621 -122 A 0.617 -123 D 0.608 -124 I 0.594 -125 N 0.580 -126 P 0.570 -127 S 0.566 -128 E 0.570 -129 P 0.580 -130 L 0.591 -131 P 0.599 -132 N 0.606 -133 I 0.613 -134 A 0.615 -135 D 0.615 -136 L 0.618 -137 P 0.630 -138 K 0.649 -139 E 0.661 -140 N 0.643 -141 I 0.598 -142 Q 0.575 -143 T 0.605 -144 Q 0.655 -145 A 0.678 -146 L 0.672 -147 N 0.651 -148 T 0.613 -149 S 0.556 -150 E 0.509 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024446.14_ENSMUST00000025319.7_GN:Rpp21_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:73.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024446.14_ENSMUST00000025319.7_GN:Rpp21_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:73.caid deleted file mode 100644 index d87820f0af8bd7c9ab44631ba18afa41652f6e91..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024446.14_ENSMUST00000025319.7_GN:Rpp21_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:73.caid +++ /dev/null @@ -1,224 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000024446.14|ENSMUST00000025319.7|GN:Rpp21|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:73 -1 M 0.221 -2 Y 0.213 -3 F 0.202 -4 K 0.190 -5 I 0.174 -6 L 0.154 -7 Y 0.138 -8 L 0.138 -9 F 0.149 -10 H 0.155 -11 V 0.150 -12 Y 0.152 -13 L 0.168 -14 I 0.193 -15 R 0.228 -16 E 0.279 -17 G 0.334 -18 Y 0.388 -19 Q 0.449 -20 T 0.519 -21 R 0.574 -22 A 0.594 -23 A 0.585 -24 C 0.569 -25 T 0.560 -26 Q 0.562 -27 K 0.571 -28 T 0.584 -29 C 0.596 -30 G 0.594 -31 V 0.569 -32 L 0.530 -33 W 0.501 -34 F 0.496 -35 L 0.516 -36 T 0.554 -37 E 0.603 -38 A 0.650 -39 G 0.685 -40 A 0.702 -41 G 0.699 -42 L 0.672 -43 R 0.626 -44 A 0.577 -45 P 0.552 -46 P 0.565 -47 P 0.607 -48 P 0.653 -49 A 0.676 -50 L 0.674 -51 Q 0.657 -52 F 0.638 -53 P 0.617 -54 A 0.589 -55 D 0.545 -56 V 0.496 -57 A 0.464 -58 H 0.448 -59 C 0.430 -60 A 0.412 -61 R 0.421 -62 L 0.465 -63 G 0.513 -64 R 0.537 -65 D 0.541 -66 I 0.540 -67 R 0.551 -68 K 0.587 -69 E 0.639 -70 G 0.684 -71 Q 0.706 -72 T 0.701 -73 L 0.669 -74 M 0.607 -75 A 0.527 -76 G 0.450 -77 P 0.384 -78 V 0.316 -79 K 0.238 -80 D 0.165 -81 R 0.116 -82 E 0.090 -83 A 0.082 -84 F 0.083 -85 Q 0.084 -86 R 0.082 -87 L 0.082 -88 S 0.079 -89 F 0.071 -90 L 0.063 -91 Y 0.065 -92 Q 0.076 -93 A 0.084 -94 A 0.088 -95 H 0.093 -96 C 0.104 -97 V 0.116 -98 L 0.119 -99 S 0.112 -100 Q 0.099 -101 N 0.089 -102 P 0.087 -103 E 0.090 -104 N 0.093 -105 Q 0.096 -106 A 0.101 -107 L 0.104 -108 A 0.099 -109 R 0.082 -110 F 0.064 -111 Y 0.053 -112 C 0.048 -113 H 0.046 -114 T 0.047 -115 E 0.055 -116 K 0.066 -117 T 0.074 -118 I 0.074 -119 A 0.069 -120 K 0.065 -121 R 0.065 -122 L 0.070 -123 V 0.081 -124 L 0.098 -125 R 0.116 -126 Q 0.123 -127 D 0.114 -128 P 0.100 -129 S 0.095 -130 V 0.098 -131 K 0.099 -132 R 0.099 -133 T 0.097 -134 L 0.091 -135 C 0.080 -136 R 0.071 -137 S 0.067 -138 C 0.068 -139 S 0.075 -140 S 0.086 -141 L 0.100 -142 L 0.111 -143 I 0.117 -144 P 0.122 -145 G 0.126 -146 L 0.122 -147 T 0.107 -148 C 0.093 -149 T 0.090 -150 Q 0.097 -151 R 0.107 -152 Q 0.116 -153 R 0.124 -154 R 0.134 -155 R 0.144 -156 K 0.148 -157 G 0.139 -158 Q 0.118 -159 R 0.092 -160 W 0.071 -161 T 0.059 -162 V 0.054 -163 Q 0.054 -164 T 0.055 -165 C 0.058 -166 L 0.063 -167 T 0.071 -168 C 0.082 -169 Q 0.090 -170 R 0.096 -171 S 0.102 -172 Q 0.112 -173 R 0.129 -174 F 0.151 -175 L 0.173 -176 N 0.193 -177 D 0.207 -178 P 0.215 -179 K 0.223 -180 H 0.234 -181 L 0.251 -182 L 0.274 -183 W 0.297 -184 G 0.312 -185 D 0.318 -186 R 0.330 -187 P 0.358 -188 E 0.394 -189 A 0.433 -190 Q 0.482 -191 L 0.542 -192 E 0.590 -193 N 0.610 -194 Q 0.612 -195 A 0.610 -196 D 0.607 -197 I 0.598 -198 N 0.587 -199 P 0.578 -200 S 0.574 -201 E 0.577 -202 P 0.586 -203 L 0.599 -204 P 0.613 -205 N 0.628 -206 I 0.638 -207 A 0.641 -208 D 0.638 -209 L 0.640 -210 P 0.653 -211 K 0.675 -212 E 0.688 -213 N 0.668 -214 I 0.620 -215 Q 0.595 -216 T 0.625 -217 Q 0.675 -218 A 0.701 -219 L 0.698 -220 N 0.678 -221 T 0.639 -222 S 0.582 -223 E 0.533 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024726.11_ENSMUST00000025632.11_GN:Carnmt1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024726.11_ENSMUST00000025632.11_GN:Carnmt1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 12820af9cd1d6facc0beed46f0a6c4e2a96e20d1..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024726.11_ENSMUST00000025632.11_GN:Carnmt1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,401 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000024726.11|ENSMUST00000025632.11|GN:Carnmt1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.354 -2 Q 0.361 -3 R 0.371 -4 R 0.373 -5 Q 0.361 -6 R 0.351 -7 A 0.365 -8 P 0.388 -9 P 0.391 -10 A 0.387 -11 S 0.406 -12 Q 0.430 -13 P 0.418 -14 A 0.392 -15 Q 0.420 -16 D 0.511 -17 G 0.605 -18 G 0.651 -19 R 0.653 -20 S 0.628 -21 E 0.585 -22 D 0.524 -23 V 0.456 -24 E 0.398 -25 V 0.361 -26 Q 0.351 -27 F 0.363 -28 S 0.387 -29 A 0.416 -30 G 0.448 -31 R 0.482 -32 L 0.513 -33 G 0.529 -34 S 0.519 -35 A 0.487 -36 A 0.454 -37 P 0.434 -38 A 0.433 -39 G 0.449 -40 P 0.475 -41 P 0.495 -42 A 0.487 -43 R 0.440 -44 G 0.372 -45 T 0.309 -46 A 0.261 -47 E 0.227 -48 D 0.204 -49 E 0.186 -50 E 0.165 -51 R 0.142 -52 L 0.121 -53 E 0.102 -54 R 0.082 -55 E 0.067 -56 H 0.059 -57 F 0.057 -58 W 0.058 -59 K 0.061 -60 V 0.062 -61 I 0.058 -62 N 0.053 -63 A 0.050 -64 F 0.046 -65 R 0.043 -66 Y 0.044 -67 Y 0.049 -68 G 0.056 -69 T 0.063 -70 S 0.073 -71 M 0.081 -72 H 0.086 -73 E 0.084 -74 R 0.077 -75 V 0.068 -76 N 0.063 -77 R 0.065 -78 T 0.074 -79 E 0.084 -80 R 0.091 -81 Q 0.089 -82 F 0.083 -83 R 0.082 -84 S 0.092 -85 L 0.107 -86 P 0.112 -87 E 0.102 -88 N 0.085 -89 Q 0.071 -90 Q 0.065 -91 K 0.068 -92 L 0.077 -93 L 0.087 -94 P 0.094 -95 Q 0.096 -96 F 0.093 -97 P 0.088 -98 L 0.083 -99 H 0.084 -100 L 0.091 -101 D 0.102 -102 K 0.119 -103 I 0.133 -104 R 0.134 -105 K 0.128 -106 C 0.125 -107 I 0.124 -108 D 0.122 -109 H 0.120 -110 N 0.119 -111 Q 0.113 -112 E 0.101 -113 I 0.088 -114 L 0.075 -115 L 0.063 -116 T 0.054 -117 I 0.048 -118 V 0.043 -119 N 0.039 -120 D 0.036 -121 C 0.034 -122 I 0.035 -123 H 0.043 -124 M 0.057 -125 F 0.073 -126 E 0.089 -127 N 0.108 -128 K 0.134 -129 E 0.173 -130 Y 0.220 -131 G 0.265 -132 E 0.292 -133 D 0.299 -134 A 0.296 -135 N 0.291 -136 G 0.287 -137 K 0.280 -138 I 0.262 -139 M 0.236 -140 P 0.207 -141 A 0.177 -142 S 0.150 -143 T 0.129 -144 F 0.114 -145 D 0.102 -146 M 0.093 -147 D 0.091 -148 K 0.097 -149 L 0.099 -150 K 0.093 -151 S 0.084 -152 T 0.078 -153 L 0.073 -154 K 0.065 -155 Q 0.056 -156 F 0.048 -157 V 0.044 -158 R 0.042 -159 D 0.043 -160 W 0.049 -161 S 0.060 -162 E 0.071 -163 T 0.078 -164 G 0.079 -165 K 0.074 -166 A 0.069 -167 E 0.065 -168 R 0.061 -169 D 0.059 -170 A 0.058 -171 C 0.053 -172 Y 0.046 -173 K 0.040 -174 P 0.039 -175 I 0.042 -176 I 0.051 -177 K 0.056 -178 E 0.052 -179 I 0.044 -180 I 0.042 -181 K 0.050 -182 N 0.064 -183 F 0.075 -184 P 0.077 -185 K 0.072 -186 E 0.069 -187 R 0.070 -188 W 0.071 -189 D 0.071 -190 P 0.069 -191 S 0.065 -192 K 0.061 -193 V 0.055 -194 N 0.048 -195 I 0.042 -196 L 0.040 -197 V 0.048 -198 P 0.064 -199 G 0.087 -200 A 0.112 -201 G 0.131 -202 L 0.139 -203 G 0.138 -204 R 0.130 -205 L 0.118 -206 A 0.102 -207 W 0.088 -208 E 0.081 -209 V 0.082 -210 A 0.087 -211 M 0.089 -212 L 0.092 -213 G 0.097 -214 Y 0.103 -215 A 0.108 -216 C 0.108 -217 Q 0.106 -218 G 0.108 -219 N 0.117 -220 E 0.123 -221 W 0.112 -222 S 0.088 -223 F 0.067 -224 F 0.056 -225 M 0.051 -226 L 0.049 -227 F 0.049 -228 S 0.054 -229 S 0.057 -230 N 0.054 -231 F 0.054 -232 V 0.062 -233 L 0.073 -234 N 0.078 -235 R 0.076 -236 C 0.074 -237 S 0.074 -238 E 0.076 -239 I 0.081 -240 N 0.085 -241 K 0.087 -242 Y 0.087 -243 K 0.085 -244 L 0.080 -245 Y 0.072 -246 P 0.066 -247 W 0.064 -248 I 0.066 -249 H 0.070 -250 Q 0.073 -251 F 0.079 -252 S 0.087 -253 N 0.095 -254 N 0.101 -255 R 0.108 -256 R 0.120 -257 S 0.137 -258 A 0.152 -259 D 0.158 -260 Q 0.160 -261 I 0.163 -262 R 0.163 -263 P 0.155 -264 I 0.140 -265 L 0.128 -266 F 0.124 -267 P 0.126 -268 D 0.129 -269 V 0.125 -270 D 0.113 -271 P 0.100 -272 H 0.097 -273 S 0.107 -274 L 0.128 -275 P 0.152 -276 P 0.167 -277 G 0.166 -278 S 0.148 -279 N 0.121 -280 F 0.102 -281 S 0.100 -282 M 0.109 -283 T 0.112 -284 A 0.107 -285 G 0.095 -286 D 0.079 -287 F 0.064 -288 Q 0.055 -289 E 0.052 -290 I 0.055 -291 Y 0.061 -292 S 0.065 -293 E 0.070 -294 C 0.075 -295 N 0.076 -296 A 0.068 -297 W 0.057 -298 D 0.049 -299 C 0.046 -300 I 0.046 -301 A 0.048 -302 T 0.054 -303 C 0.065 -304 F 0.081 -305 F 0.097 -306 I 0.109 -307 D 0.115 -308 T 0.120 -309 A 0.120 -310 H 0.110 -311 N 0.093 -312 V 0.075 -313 I 0.061 -314 D 0.050 -315 Y 0.043 -316 I 0.041 -317 D 0.044 -318 T 0.049 -319 I 0.052 -320 W 0.053 -321 R 0.055 -322 I 0.057 -323 L 0.063 -324 K 0.074 -325 P 0.082 -326 G 0.083 -327 G 0.081 -328 I 0.084 -329 W 0.099 -330 I 0.124 -331 N 0.150 -332 L 0.175 -333 G 0.193 -334 P 0.196 -335 L 0.181 -336 L 0.156 -337 Y 0.137 -338 H 0.135 -339 F 0.149 -340 E 0.177 -341 N 0.214 -342 L 0.254 -343 A 0.290 -344 N 0.311 -345 E 0.316 -346 L 0.307 -347 S 0.288 -348 I 0.266 -349 E 0.240 -350 L 0.206 -351 S 0.165 -352 Y 0.128 -353 E 0.107 -354 D 0.101 -355 I 0.104 -356 K 0.105 -357 N 0.100 -358 V 0.086 -359 V 0.071 -360 L 0.064 -361 Q 0.067 -362 Y 0.074 -363 G 0.080 -364 F 0.079 -365 Q 0.071 -366 L 0.061 -367 E 0.050 -368 V 0.043 -369 E 0.041 -370 K 0.045 -371 E 0.053 -372 S 0.062 -373 V 0.069 -374 L 0.071 -375 S 0.066 -376 T 0.060 -377 Y 0.056 -378 T 0.058 -379 V 0.064 -380 N 0.074 -381 D 0.086 -382 L 0.095 -383 S 0.103 -384 M 0.114 -385 M 0.128 -386 K 0.142 -387 Y 0.150 -388 Y 0.150 -389 Y 0.139 -390 E 0.118 -391 C 0.093 -392 V 0.071 -393 L 0.055 -394 F 0.047 -395 V 0.048 -396 V 0.057 -397 R 0.077 -398 K 0.108 -399 P 0.143 -400 Q 0.166 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024726.11_ENSMUST00000025632.11_GN:Carnmt1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:76.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024726.11_ENSMUST00000025632.11_GN:Carnmt1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:76.caid deleted file mode 100644 index cb2f3d0f512ca9fd0c14b23b43922e77a47fddab..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000024726.11_ENSMUST00000025632.11_GN:Carnmt1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:76.caid +++ /dev/null @@ -1,477 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000024726.11|ENSMUST00000025632.11|GN:Carnmt1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:76 -1 M 0.366 -2 N 0.382 -3 A 0.408 -4 G 0.428 -5 G 0.431 -6 R 0.425 -7 G 0.420 -8 L 0.413 -9 S 0.400 -10 L 0.392 -11 V 0.396 -12 V 0.404 -13 G 0.401 -14 A 0.388 -15 C 0.382 -16 A 0.401 -17 G 0.436 -18 P 0.467 -19 E 0.476 -20 T 0.463 -21 L 0.438 -22 A 0.417 -23 E 0.423 -24 R 0.473 -25 S 0.548 -26 A 0.616 -27 N 0.667 -28 G 0.699 -29 G 0.708 -30 L 0.703 -31 R 0.704 -32 A 0.716 -33 A 0.729 -34 G 0.734 -35 A 0.732 -36 G 0.723 -37 R 0.710 -38 A 0.701 -39 A 0.698 -40 S 0.694 -41 G 0.688 -42 G 0.678 -43 L 0.666 -44 G 0.650 -45 R 0.628 -46 G 0.592 -47 R 0.544 -48 R 0.516 -49 R 0.533 -50 L 0.571 -51 E 0.591 -52 E 0.588 -53 A 0.584 -54 R 0.599 -55 P 0.633 -56 F 0.670 -57 A 0.697 -58 T 0.708 -59 T 0.713 -60 H 0.723 -61 S 0.739 -62 G 0.751 -63 A 0.754 -64 G 0.745 -65 K 0.726 -66 R 0.703 -67 R 0.673 -68 R 0.630 -69 V 0.575 -70 T 0.513 -71 P 0.452 -72 W 0.403 -73 A 0.373 -74 A 0.352 -75 A 0.337 -76 A 0.334 -77 M 0.344 -78 Q 0.374 -79 R 0.430 -80 R 0.488 -81 Q 0.515 -82 R 0.522 -83 A 0.543 -84 P 0.588 -85 P 0.640 -86 A 0.681 -87 S 0.703 -88 Q 0.715 -89 P 0.728 -90 A 0.747 -91 Q 0.764 -92 D 0.774 -93 G 0.775 -94 G 0.767 -95 R 0.753 -96 S 0.734 -97 E 0.706 -98 D 0.662 -99 V 0.603 -100 E 0.541 -101 V 0.496 -102 Q 0.484 -103 F 0.503 -104 S 0.539 -105 A 0.578 -106 G 0.612 -107 R 0.636 -108 L 0.646 -109 G 0.640 -110 S 0.616 -111 A 0.579 -112 A 0.544 -113 P 0.522 -114 A 0.515 -115 G 0.522 -116 P 0.536 -117 P 0.543 -118 A 0.523 -119 R 0.465 -120 G 0.387 -121 T 0.315 -122 A 0.260 -123 E 0.220 -124 D 0.193 -125 E 0.174 -126 E 0.151 -127 R 0.127 -128 L 0.106 -129 E 0.088 -130 R 0.071 -131 E 0.059 -132 H 0.052 -133 F 0.049 -134 W 0.051 -135 K 0.054 -136 V 0.055 -137 I 0.052 -138 N 0.047 -139 A 0.043 -140 F 0.040 -141 R 0.037 -142 Y 0.038 -143 Y 0.043 -144 G 0.049 -145 T 0.056 -146 S 0.062 -147 M 0.065 -148 H 0.063 -149 E 0.058 -150 R 0.057 -151 V 0.056 -152 N 0.057 -153 R 0.062 -154 T 0.071 -155 E 0.082 -156 R 0.090 -157 Q 0.089 -158 F 0.085 -159 R 0.085 -160 S 0.096 -161 L 0.111 -162 P 0.116 -163 E 0.104 -164 N 0.085 -165 Q 0.070 -166 Q 0.065 -167 K 0.068 -168 L 0.078 -169 L 0.090 -170 P 0.099 -171 Q 0.102 -172 F 0.099 -173 P 0.091 -174 L 0.085 -175 H 0.086 -176 L 0.093 -177 D 0.105 -178 K 0.122 -179 I 0.137 -180 R 0.138 -181 K 0.132 -182 C 0.128 -183 I 0.127 -184 D 0.124 -185 H 0.122 -186 N 0.123 -187 Q 0.118 -188 E 0.106 -189 I 0.092 -190 L 0.079 -191 L 0.067 -192 T 0.059 -193 I 0.052 -194 V 0.046 -195 N 0.041 -196 D 0.038 -197 C 0.036 -198 I 0.038 -199 H 0.046 -200 M 0.058 -201 F 0.072 -202 E 0.085 -203 N 0.102 -204 K 0.128 -205 E 0.165 -206 Y 0.213 -207 G 0.257 -208 E 0.284 -209 D 0.289 -210 A 0.283 -211 N 0.276 -212 G 0.272 -213 K 0.266 -214 I 0.251 -215 M 0.226 -216 P 0.198 -217 A 0.170 -218 S 0.144 -219 T 0.124 -220 F 0.109 -221 D 0.098 -222 M 0.089 -223 D 0.087 -224 K 0.093 -225 L 0.096 -226 K 0.092 -227 S 0.085 -228 T 0.081 -229 L 0.077 -230 K 0.069 -231 Q 0.059 -232 F 0.050 -233 V 0.045 -234 R 0.042 -235 D 0.042 -236 W 0.048 -237 S 0.058 -238 E 0.068 -239 T 0.075 -240 G 0.075 -241 K 0.071 -242 A 0.066 -243 E 0.062 -244 R 0.058 -245 D 0.057 -246 A 0.057 -247 C 0.052 -248 Y 0.045 -249 K 0.038 -250 P 0.034 -251 I 0.032 -252 I 0.031 -253 K 0.031 -254 E 0.032 -255 I 0.033 -256 I 0.037 -257 K 0.047 -258 N 0.061 -259 F 0.071 -260 P 0.073 -261 K 0.069 -262 E 0.067 -263 R 0.069 -264 W 0.071 -265 D 0.070 -266 P 0.067 -267 S 0.063 -268 K 0.059 -269 V 0.053 -270 N 0.047 -271 I 0.041 -272 L 0.040 -273 V 0.048 -274 P 0.065 -275 G 0.088 -276 A 0.113 -277 G 0.132 -278 L 0.139 -279 G 0.137 -280 R 0.129 -281 L 0.116 -282 A 0.101 -283 W 0.087 -284 E 0.079 -285 V 0.081 -286 A 0.086 -287 M 0.088 -288 L 0.091 -289 G 0.098 -290 Y 0.105 -291 A 0.110 -292 C 0.110 -293 Q 0.107 -294 G 0.109 -295 N 0.119 -296 E 0.126 -297 W 0.115 -298 S 0.091 -299 F 0.068 -300 F 0.056 -301 M 0.051 -302 L 0.048 -303 F 0.049 -304 S 0.054 -305 S 0.057 -306 N 0.054 -307 F 0.054 -308 V 0.063 -309 L 0.074 -310 N 0.079 -311 R 0.078 -312 C 0.076 -313 S 0.077 -314 E 0.080 -315 I 0.085 -316 N 0.088 -317 K 0.090 -318 Y 0.089 -319 K 0.086 -320 L 0.080 -321 Y 0.073 -322 P 0.067 -323 W 0.065 -324 I 0.067 -325 H 0.071 -326 Q 0.074 -327 F 0.079 -328 S 0.087 -329 N 0.095 -330 N 0.101 -331 R 0.108 -332 R 0.121 -333 S 0.140 -334 A 0.156 -335 D 0.161 -336 Q 0.162 -337 I 0.165 -338 R 0.164 -339 P 0.155 -340 I 0.140 -341 L 0.127 -342 F 0.123 -343 P 0.125 -344 D 0.129 -345 V 0.126 -346 D 0.115 -347 P 0.102 -348 H 0.099 -349 S 0.109 -350 L 0.130 -351 P 0.153 -352 P 0.168 -353 G 0.166 -354 S 0.148 -355 N 0.120 -356 F 0.100 -357 S 0.097 -358 M 0.106 -359 T 0.110 -360 A 0.105 -361 G 0.093 -362 D 0.077 -363 F 0.062 -364 Q 0.054 -365 E 0.051 -366 I 0.055 -367 Y 0.061 -368 S 0.066 -369 E 0.071 -370 C 0.077 -371 N 0.077 -372 A 0.069 -373 W 0.058 -374 D 0.051 -375 C 0.049 -376 I 0.048 -377 A 0.051 -378 T 0.057 -379 C 0.068 -380 F 0.084 -381 F 0.101 -382 I 0.113 -383 D 0.120 -384 T 0.125 -385 A 0.126 -386 H 0.116 -387 N 0.097 -388 V 0.078 -389 I 0.063 -390 D 0.052 -391 Y 0.044 -392 I 0.043 -393 D 0.047 -394 T 0.051 -395 I 0.054 -396 W 0.056 -397 R 0.057 -398 I 0.059 -399 L 0.066 -400 K 0.077 -401 P 0.086 -402 G 0.088 -403 G 0.085 -404 I 0.088 -405 W 0.104 -406 I 0.129 -407 N 0.157 -408 L 0.181 -409 G 0.198 -410 P 0.198 -411 L 0.181 -412 L 0.154 -413 Y 0.134 -414 H 0.131 -415 F 0.145 -416 E 0.172 -417 N 0.207 -418 L 0.247 -419 A 0.281 -420 N 0.302 -421 E 0.308 -422 L 0.301 -423 S 0.283 -424 I 0.262 -425 E 0.238 -426 L 0.205 -427 S 0.164 -428 Y 0.128 -429 E 0.105 -430 D 0.100 -431 I 0.102 -432 K 0.105 -433 N 0.100 -434 V 0.087 -435 V 0.071 -436 L 0.064 -437 Q 0.067 -438 Y 0.075 -439 G 0.081 -440 F 0.079 -441 Q 0.071 -442 L 0.060 -443 E 0.050 -444 V 0.042 -445 E 0.041 -446 K 0.045 -447 E 0.052 -448 S 0.061 -449 V 0.069 -450 L 0.071 -451 S 0.066 -452 T 0.060 -453 Y 0.058 -454 T 0.060 -455 V 0.066 -456 N 0.077 -457 D 0.089 -458 L 0.099 -459 S 0.108 -460 M 0.119 -461 M 0.134 -462 K 0.148 -463 Y 0.157 -464 Y 0.157 -465 Y 0.146 -466 E 0.124 -467 C 0.097 -468 V 0.074 -469 L 0.057 -470 F 0.049 -471 V 0.050 -472 V 0.060 -473 R 0.082 -474 K 0.118 -475 P 0.160 -476 Q 0.189 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000025170.14_ENSMUST00000106107.3_GN:Rab40b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000025170.14_ENSMUST00000106107.3_GN:Rab40b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 59a68ad14b67c53e9be4335d9f20e57da0b95511..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000025170.14_ENSMUST00000106107.3_GN:Rab40b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,279 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000025170.14|ENSMUST00000106107.3|GN:Rab40b|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.506 -2 S 0.526 -3 S 0.551 -4 L 0.567 -5 G 0.569 -6 S 0.556 -7 P 0.523 -8 V 0.463 -9 R 0.379 -10 A 0.279 -11 Y 0.183 -12 D 0.109 -13 F 0.064 -14 L 0.039 -15 L 0.025 -16 K 0.019 -17 F 0.018 -18 L 0.022 -19 L 0.028 -20 V 0.037 -21 G 0.050 -22 D 0.067 -23 S 0.081 -24 D 0.087 -25 V 0.086 -26 G 0.087 -27 K 0.094 -28 G 0.106 -29 E 0.119 -30 I 0.130 -31 L 0.135 -32 A 0.137 -33 S 0.143 -34 L 0.164 -35 Q 0.208 -36 D 0.270 -37 G 0.328 -38 A 0.364 -39 A 0.374 -40 E 0.375 -41 S 0.375 -42 P 0.374 -43 Y 0.371 -44 G 0.370 -45 H 0.364 -46 P 0.343 -47 A 0.295 -48 G 0.224 -49 I 0.154 -50 D 0.102 -51 H 0.071 -52 K 0.052 -53 T 0.043 -54 T 0.040 -55 T 0.043 -56 I 0.048 -57 L 0.052 -58 L 0.056 -59 D 0.064 -60 G 0.074 -61 R 0.081 -62 R 0.081 -63 V 0.071 -64 K 0.055 -65 L 0.041 -66 Q 0.031 -67 L 0.030 -68 W 0.039 -69 D 0.065 -70 T 0.109 -71 S 0.163 -72 G 0.208 -73 Q 0.237 -74 G 0.246 -75 R 0.232 -76 F 0.203 -77 C 0.169 -78 T 0.137 -79 I 0.108 -80 F 0.084 -81 R 0.068 -82 S 0.060 -83 Y 0.059 -84 S 0.066 -85 R 0.077 -86 G 0.088 -87 A 0.091 -88 Q 0.082 -89 G 0.065 -90 V 0.049 -91 V 0.042 -92 L 0.040 -93 V 0.039 -94 Y 0.039 -95 D 0.040 -96 I 0.043 -97 A 0.043 -98 N 0.039 -99 R 0.034 -100 W 0.034 -101 S 0.038 -102 F 0.043 -103 D 0.046 -104 G 0.044 -105 I 0.036 -106 N 0.026 -107 R 0.021 -108 W 0.027 -109 I 0.040 -110 K 0.048 -111 E 0.041 -112 I 0.028 -113 D 0.021 -114 E 0.024 -115 H 0.033 -116 A 0.046 -117 P 0.058 -118 G 0.064 -119 V 0.062 -120 P 0.052 -121 K 0.040 -122 I 0.033 -123 L 0.033 -124 V 0.035 -125 G 0.035 -126 N 0.036 -127 R 0.040 -128 L 0.045 -129 H 0.047 -130 L 0.047 -131 A 0.047 -132 F 0.046 -133 K 0.047 -134 R 0.050 -135 Q 0.059 -136 V 0.070 -137 P 0.074 -138 T 0.068 -139 E 0.059 -140 Q 0.053 -141 A 0.056 -142 Q 0.065 -143 A 0.070 -144 Y 0.064 -145 A 0.051 -146 E 0.042 -147 R 0.041 -148 L 0.049 -149 G 0.058 -150 V 0.057 -151 T 0.046 -152 F 0.034 -153 F 0.031 -154 E 0.036 -155 V 0.047 -156 S 0.062 -157 P 0.076 -158 L 0.083 -159 C 0.082 -160 N 0.075 -161 F 0.065 -162 N 0.055 -163 I 0.048 -164 T 0.043 -165 E 0.040 -166 S 0.039 -167 F 0.036 -168 T 0.035 -169 E 0.035 -170 L 0.036 -171 A 0.035 -172 R 0.035 -173 I 0.036 -174 V 0.039 -175 L 0.045 -176 L 0.059 -177 R 0.086 -178 H 0.121 -179 G 0.155 -180 M 0.178 -181 D 0.190 -182 R 0.199 -183 L 0.212 -184 W 0.235 -185 R 0.266 -186 P 0.292 -187 S 0.306 -188 K 0.303 -189 V 0.276 -190 L 0.230 -191 S 0.183 -192 L 0.148 -193 Q 0.126 -194 E 0.116 -195 L 0.113 -196 C 0.112 -197 C 0.110 -198 R 0.110 -199 A 0.112 -200 V 0.113 -201 V 0.115 -202 S 0.128 -203 C 0.145 -204 T 0.149 -205 P 0.136 -206 G 0.119 -207 H 0.106 -208 L 0.099 -209 V 0.095 -210 D 0.099 -211 K 0.113 -212 L 0.129 -213 P 0.135 -214 L 0.129 -215 P 0.110 -216 V 0.086 -217 A 0.070 -218 L 0.066 -219 R 0.070 -220 S 0.070 -221 H 0.063 -222 L 0.055 -223 K 0.055 -224 S 0.066 -225 F 0.097 -226 S 0.155 -227 M 0.235 -228 A 0.324 -229 S 0.415 -230 G 0.495 -231 L 0.554 -232 N 0.589 -233 T 0.606 -234 R 0.615 -235 M 0.627 -236 M 0.649 -237 H 0.674 -238 G 0.694 -239 R 0.705 -240 S 0.711 -241 Y 0.714 -242 S 0.707 -243 L 0.671 -244 T 0.612 -245 A 0.575 -246 N 0.593 -247 S 0.633 -248 S 0.655 -249 H 0.663 -250 K 0.672 -251 R 0.682 -252 N 0.683 -253 S 0.668 -254 F 0.629 -255 R 0.578 -256 K 0.557 -257 V 0.591 -258 R 0.648 -259 T 0.678 -260 I 0.674 -261 R 0.658 -262 P 0.653 -263 P 0.658 -264 Q 0.661 -265 S 0.660 -266 P 0.665 -267 P 0.684 -268 R 0.707 -269 N 0.720 -270 C 0.721 -271 A 0.714 -272 R 0.704 -273 N 0.695 -274 S 0.687 -275 C 0.674 -276 K 0.645 -277 I 0.591 -278 S 0.541 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000025170.14_ENSMUST00000106107.3_GN:Rab40b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000025170.14_ENSMUST00000106107.3_GN:Rab40b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid deleted file mode 100644 index 12ef734425a3e8ab72767883cca7fd65bf13030b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000025170.14_ENSMUST00000106107.3_GN:Rab40b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid +++ /dev/null @@ -1,280 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000025170.14|ENSMUST00000106107.3|GN:Rab40b|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:1 -1 M 0.492 -2 M 0.520 -3 S 0.557 -4 S 0.582 -5 L 0.586 -6 G 0.578 -7 S 0.561 -8 P 0.529 -9 V 0.469 -10 R 0.381 -11 A 0.278 -12 Y 0.182 -13 D 0.110 -14 F 0.065 -15 L 0.040 -16 L 0.026 -17 K 0.019 -18 F 0.018 -19 L 0.021 -20 L 0.028 -21 V 0.037 -22 G 0.050 -23 D 0.067 -24 S 0.081 -25 D 0.086 -26 V 0.086 -27 G 0.087 -28 K 0.094 -29 G 0.105 -30 E 0.119 -31 I 0.129 -32 L 0.134 -33 A 0.137 -34 S 0.142 -35 L 0.163 -36 Q 0.208 -37 D 0.270 -38 G 0.329 -39 A 0.364 -40 A 0.374 -41 E 0.375 -42 S 0.375 -43 P 0.373 -44 Y 0.371 -45 G 0.369 -46 H 0.363 -47 P 0.341 -48 A 0.293 -49 G 0.223 -50 I 0.153 -51 D 0.102 -52 H 0.070 -53 K 0.052 -54 T 0.042 -55 T 0.040 -56 T 0.043 -57 I 0.047 -58 L 0.051 -59 L 0.056 -60 D 0.064 -61 G 0.073 -62 R 0.081 -63 R 0.081 -64 V 0.071 -65 K 0.055 -66 L 0.040 -67 Q 0.031 -68 L 0.029 -69 W 0.038 -70 D 0.064 -71 T 0.109 -72 S 0.162 -73 G 0.208 -74 Q 0.236 -75 G 0.244 -76 R 0.230 -77 F 0.201 -78 C 0.168 -79 T 0.136 -80 I 0.107 -81 F 0.083 -82 R 0.067 -83 S 0.059 -84 Y 0.058 -85 S 0.065 -86 R 0.077 -87 G 0.087 -88 A 0.091 -89 Q 0.082 -90 G 0.064 -91 V 0.049 -92 V 0.042 -93 L 0.039 -94 V 0.039 -95 Y 0.039 -96 D 0.040 -97 I 0.043 -98 A 0.043 -99 N 0.039 -100 R 0.034 -101 W 0.034 -102 S 0.038 -103 F 0.043 -104 D 0.046 -105 G 0.044 -106 I 0.036 -107 N 0.026 -108 R 0.021 -109 W 0.027 -110 I 0.040 -111 K 0.048 -112 E 0.041 -113 I 0.028 -114 D 0.021 -115 E 0.024 -116 H 0.033 -117 A 0.046 -118 P 0.058 -119 G 0.064 -120 V 0.062 -121 P 0.052 -122 K 0.040 -123 I 0.033 -124 L 0.033 -125 V 0.035 -126 G 0.035 -127 N 0.036 -128 R 0.039 -129 L 0.045 -130 H 0.047 -131 L 0.047 -132 A 0.047 -133 F 0.046 -134 K 0.047 -135 R 0.050 -136 Q 0.059 -137 V 0.070 -138 P 0.074 -139 T 0.068 -140 E 0.059 -141 Q 0.053 -142 A 0.056 -143 Q 0.066 -144 A 0.070 -145 Y 0.064 -146 A 0.051 -147 E 0.042 -148 R 0.041 -149 L 0.049 -150 G 0.058 -151 V 0.057 -152 T 0.046 -153 F 0.034 -154 F 0.031 -155 E 0.036 -156 V 0.047 -157 S 0.062 -158 P 0.076 -159 L 0.083 -160 C 0.082 -161 N 0.075 -162 F 0.065 -163 N 0.055 -164 I 0.048 -165 T 0.043 -166 E 0.040 -167 S 0.039 -168 F 0.036 -169 T 0.035 -170 E 0.035 -171 L 0.036 -172 A 0.035 -173 R 0.035 -174 I 0.036 -175 V 0.039 -176 L 0.045 -177 L 0.059 -178 R 0.086 -179 H 0.121 -180 G 0.154 -181 M 0.177 -182 D 0.190 -183 R 0.198 -184 L 0.211 -185 W 0.235 -186 R 0.265 -187 P 0.291 -188 S 0.305 -189 K 0.302 -190 V 0.275 -191 L 0.229 -192 S 0.182 -193 L 0.147 -194 Q 0.126 -195 E 0.115 -196 L 0.113 -197 C 0.111 -198 C 0.109 -199 R 0.110 -200 A 0.112 -201 V 0.112 -202 V 0.115 -203 S 0.128 -204 C 0.145 -205 T 0.149 -206 P 0.136 -207 G 0.118 -208 H 0.106 -209 L 0.099 -210 V 0.095 -211 D 0.099 -212 K 0.113 -213 L 0.128 -214 P 0.135 -215 L 0.129 -216 P 0.110 -217 V 0.086 -218 A 0.070 -219 L 0.066 -220 R 0.070 -221 S 0.070 -222 H 0.063 -223 L 0.055 -224 K 0.055 -225 S 0.066 -226 F 0.097 -227 S 0.154 -228 M 0.234 -229 A 0.323 -230 S 0.414 -231 G 0.495 -232 L 0.553 -233 N 0.588 -234 T 0.605 -235 R 0.614 -236 M 0.627 -237 M 0.648 -238 H 0.673 -239 G 0.693 -240 R 0.705 -241 S 0.711 -242 Y 0.714 -243 S 0.707 -244 L 0.671 -245 T 0.612 -246 A 0.576 -247 N 0.593 -248 S 0.632 -249 S 0.654 -250 H 0.660 -251 K 0.670 -252 R 0.682 -253 N 0.684 -254 S 0.668 -255 F 0.629 -256 R 0.579 -257 K 0.557 -258 V 0.592 -259 R 0.648 -260 T 0.678 -261 I 0.674 -262 R 0.658 -263 P 0.653 -264 P 0.658 -265 Q 0.661 -266 S 0.660 -267 P 0.665 -268 P 0.684 -269 R 0.707 -270 N 0.721 -271 C 0.721 -272 A 0.714 -273 R 0.704 -274 N 0.695 -275 S 0.687 -276 C 0.675 -277 K 0.645 -278 I 0.592 -279 S 0.542 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000025735.14_ENSMUST00000026831.14_GN:Rhbdl1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000025735.14_ENSMUST00000026831.14_GN:Rhbdl1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 2c70890a9af20b4da13dffbc8a7e6563a825bff4..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000025735.14_ENSMUST00000026831.14_GN:Rhbdl1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,374 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000025735.14|ENSMUST00000026831.14|GN:Rhbdl1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.145 -2 D 0.116 -3 R 0.083 -4 S 0.064 -5 S 0.056 -6 L 0.055 -7 L 0.060 -8 Q 0.065 -9 L 0.061 -10 I 0.053 -11 Q 0.051 -12 E 0.059 -13 Q 0.074 -14 Q 0.091 -15 L 0.112 -16 D 0.138 -17 P 0.163 -18 E 0.178 -19 N 0.173 -20 T 0.149 -21 G 0.120 -22 F 0.096 -23 I 0.075 -24 G 0.057 -25 A 0.043 -26 D 0.036 -27 T 0.035 -28 F 0.043 -29 A 0.056 -30 G 0.068 -31 L 0.071 -32 V 0.075 -33 H 0.088 -34 S 0.107 -35 H 0.124 -36 E 0.134 -37 L 0.136 -38 P 0.129 -39 L 0.113 -40 D 0.089 -41 P 0.065 -42 T 0.044 -43 K 0.031 -44 L 0.026 -45 D 0.026 -46 M 0.028 -47 L 0.030 -48 V 0.034 -49 A 0.041 -50 L 0.053 -51 A 0.071 -52 Q 0.093 -53 S 0.110 -54 N 0.116 -55 E 0.112 -56 R 0.105 -57 G 0.098 -58 Q 0.083 -59 V 0.061 -60 C 0.040 -61 Y 0.025 -62 Q 0.020 -63 E 0.020 -64 L 0.024 -65 V 0.032 -66 D 0.047 -67 L 0.069 -68 I 0.099 -69 S 0.137 -70 S 0.176 -71 K 0.206 -72 R 0.224 -73 S 0.231 -74 S 0.226 -75 S 0.207 -76 F 0.181 -77 K 0.166 -78 R 0.169 -79 A 0.186 -80 I 0.206 -81 A 0.235 -82 N 0.277 -83 G 0.321 -84 Q 0.348 -85 R 0.354 -86 A 0.350 -87 L 0.340 -88 P 0.322 -89 R 0.303 -90 D 0.290 -91 G 0.280 -92 L 0.271 -93 L 0.271 -94 D 0.283 -95 E 0.297 -96 P 0.293 -97 G 0.266 -98 L 0.221 -99 S 0.171 -100 V 0.124 -101 Y 0.091 -102 K 0.075 -103 R 0.070 -104 F 0.071 -105 V 0.072 -106 R 0.072 -107 Y 0.069 -108 V 0.064 -109 A 0.060 -110 Y 0.064 -111 E 0.073 -112 I 0.084 -113 L 0.091 -114 P 0.096 -115 C 0.097 -116 E 0.092 -117 V 0.081 -118 D 0.069 -119 R 0.059 -120 R 0.053 -121 W 0.050 -122 Y 0.049 -123 F 0.049 -124 Y 0.050 -125 R 0.049 -126 H 0.044 -127 R 0.038 -128 T 0.033 -129 C 0.035 -130 P 0.044 -131 P 0.052 -132 P 0.050 -133 V 0.041 -134 F 0.033 -135 M 0.031 -136 A 0.033 -137 S 0.041 -138 V 0.054 -139 T 0.068 -140 L 0.075 -141 A 0.070 -142 Q 0.059 -143 I 0.048 -144 I 0.039 -145 V 0.033 -146 F 0.030 -147 L 0.028 -148 C 0.030 -149 Y 0.037 -150 G 0.048 -151 A 0.061 -152 R 0.071 -153 L 0.075 -154 N 0.073 -155 K 0.068 -156 W 0.064 -157 V 0.063 -158 L 0.066 -159 Q 0.072 -160 T 0.079 -161 Y 0.084 -162 H 0.091 -163 P 0.102 -164 E 0.119 -165 Y 0.136 -166 M 0.142 -167 K 0.133 -168 S 0.116 -169 P 0.100 -170 L 0.089 -171 V 0.081 -172 Y 0.076 -173 H 0.073 -174 P 0.072 -175 G 0.072 -176 H 0.072 -177 R 0.072 -178 A 0.074 -179 R 0.077 -180 A 0.080 -181 W 0.087 -182 R 0.099 -183 F 0.110 -184 L 0.121 -185 T 0.132 -186 Y 0.138 -187 M 0.134 -188 F 0.127 -189 M 0.124 -190 H 0.132 -191 V 0.151 -192 G 0.172 -193 L 0.194 -194 E 0.221 -195 Q 0.236 -196 L 0.217 -197 G 0.187 -198 F 0.182 -199 N 0.189 -200 A 0.176 -201 L 0.142 -202 L 0.108 -203 Q 0.082 -204 L 0.061 -205 M 0.048 -206 I 0.046 -207 G 0.047 -208 V 0.045 -209 P 0.041 -210 L 0.037 -211 E 0.036 -212 M 0.035 -213 V 0.033 -214 H 0.032 -215 G 0.030 -216 V 0.027 -217 L 0.024 -218 R 0.023 -219 I 0.025 -220 S 0.026 -221 L 0.027 -222 L 0.030 -223 Y 0.035 -224 L 0.039 -225 A 0.042 -226 G 0.042 -227 V 0.040 -228 L 0.038 -229 A 0.037 -230 G 0.038 -231 S 0.040 -232 L 0.042 -233 T 0.044 -234 V 0.047 -235 S 0.051 -236 I 0.058 -237 T 0.069 -238 D 0.082 -239 M 0.099 -240 R 0.120 -241 A 0.136 -242 P 0.134 -243 V 0.118 -244 V 0.110 -245 G 0.120 -246 G 0.140 -247 S 0.155 -248 G 0.154 -249 G 0.138 -250 V 0.118 -251 Y 0.105 -252 A 0.095 -253 L 0.084 -254 C 0.071 -255 S 0.061 -256 A 0.055 -257 H 0.050 -258 L 0.047 -259 A 0.042 -260 N 0.037 -261 V 0.036 -262 V 0.040 -263 M 0.044 -264 N 0.046 -265 W 0.047 -266 A 0.048 -267 G 0.050 -268 M 0.054 -269 R 0.059 -270 C 0.061 -271 P 0.057 -272 Y 0.048 -273 K 0.037 -274 L 0.030 -275 L 0.029 -276 R 0.039 -277 M 0.054 -278 V 0.065 -279 L 0.063 -280 A 0.053 -281 L 0.046 -282 V 0.044 -283 C 0.047 -284 M 0.049 -285 S 0.047 -286 S 0.043 -287 E 0.042 -288 V 0.043 -289 G 0.047 -290 R 0.052 -291 A 0.055 -292 V 0.056 -293 W 0.062 -294 L 0.081 -295 R 0.112 -296 F 0.154 -297 S 0.205 -298 P 0.252 -299 P 0.281 -300 L 0.291 -301 P 0.283 -302 A 0.265 -303 S 0.248 -304 G 0.244 -305 P 0.248 -306 Q 0.246 -307 P 0.227 -308 S 0.192 -309 F 0.158 -310 M 0.140 -311 A 0.138 -312 H 0.134 -313 L 0.115 -314 A 0.091 -315 G 0.073 -316 A 0.063 -317 V 0.060 -318 V 0.057 -319 G 0.054 -320 V 0.052 -321 S 0.051 -322 M 0.049 -323 G 0.048 -324 L 0.050 -325 T 0.052 -326 I 0.056 -327 L 0.062 -328 R 0.075 -329 S 0.090 -330 Y 0.102 -331 E 0.108 -332 E 0.108 -333 R 0.109 -334 L 0.113 -335 R 0.119 -336 D 0.121 -337 Q 0.115 -338 C 0.107 -339 G 0.099 -340 W 0.093 -341 W 0.089 -342 V 0.088 -343 V 0.084 -344 L 0.075 -345 L 0.068 -346 A 0.067 -347 Y 0.067 -348 G 0.063 -349 T 0.059 -350 F 0.061 -351 L 0.067 -352 L 0.069 -353 F 0.059 -354 A 0.045 -355 I 0.034 -356 F 0.030 -357 W 0.032 -358 N 0.038 -359 V 0.048 -360 F 0.063 -361 A 0.082 -362 Y 0.104 -363 D 0.132 -364 L 0.170 -365 L 0.220 -366 G 0.272 -367 A 0.314 -368 D 0.336 -369 I 0.338 -370 P 0.327 -371 P 0.313 -372 P 0.304 -373 P 0.300 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000025735.14_ENSMUST00000026831.14_GN:Rhbdl1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:56.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000025735.14_ENSMUST00000026831.14_GN:Rhbdl1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:56.caid deleted file mode 100644 index b68ff05c083757e380c1e97506091d8bbaf4a1bf..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000025735.14_ENSMUST00000026831.14_GN:Rhbdl1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:56.caid +++ /dev/null @@ -1,430 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000025735.14|ENSMUST00000026831.14|GN:Rhbdl1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:56 -1 M 0.106 -2 R 0.096 -3 V 0.082 -4 L 0.070 -5 W 0.065 -6 L 0.070 -7 C 0.085 -8 A 0.102 -9 R 0.119 -10 W 0.141 -11 A 0.174 -12 G 0.206 -13 I 0.222 -14 S 0.217 -15 V 0.194 -16 T 0.166 -17 L 0.147 -18 S 0.142 -19 E 0.144 -20 L 0.148 -21 G 0.147 -22 E 0.140 -23 R 0.128 -24 R 0.118 -25 A 0.118 -26 E 0.128 -27 Q 0.141 -28 A 0.150 -29 E 0.165 -30 R 0.208 -31 A 0.283 -32 G 0.371 -33 R 0.453 -34 G 0.515 -35 G 0.535 -36 A 0.511 -37 E 0.483 -38 R 0.488 -39 S 0.505 -40 A 0.505 -41 E 0.497 -42 Q 0.504 -43 P 0.529 -44 L 0.566 -45 P 0.601 -46 A 0.620 -47 S 0.614 -48 A 0.593 -49 D 0.572 -50 P 0.560 -51 G 0.558 -52 P 0.564 -53 R 0.572 -54 P 0.559 -55 G 0.498 -56 S 0.391 -57 M 0.273 -58 D 0.175 -59 R 0.110 -60 S 0.075 -61 S 0.059 -62 L 0.055 -63 L 0.060 -64 Q 0.065 -65 L 0.061 -66 I 0.053 -67 Q 0.050 -68 E 0.058 -69 Q 0.072 -70 Q 0.088 -71 L 0.105 -72 D 0.128 -73 P 0.151 -74 E 0.165 -75 N 0.159 -76 T 0.136 -77 G 0.108 -78 F 0.085 -79 I 0.067 -80 G 0.051 -81 A 0.039 -82 D 0.031 -83 T 0.027 -84 F 0.028 -85 A 0.032 -86 G 0.038 -87 L 0.043 -88 V 0.053 -89 H 0.068 -90 S 0.085 -91 H 0.097 -92 E 0.103 -93 L 0.101 -94 P 0.094 -95 L 0.080 -96 D 0.064 -97 P 0.047 -98 T 0.033 -99 K 0.024 -100 L 0.020 -101 D 0.020 -102 M 0.021 -103 L 0.024 -104 V 0.027 -105 A 0.034 -106 L 0.045 -107 A 0.061 -108 Q 0.081 -109 S 0.097 -110 N 0.103 -111 E 0.100 -112 R 0.095 -113 G 0.090 -114 Q 0.076 -115 V 0.056 -116 C 0.035 -117 Y 0.021 -118 Q 0.016 -119 E 0.017 -120 L 0.020 -121 V 0.025 -122 D 0.035 -123 L 0.050 -124 I 0.071 -125 S 0.100 -126 S 0.130 -127 K 0.156 -128 R 0.175 -129 S 0.186 -130 S 0.185 -131 S 0.171 -132 F 0.152 -133 K 0.139 -134 R 0.138 -135 A 0.147 -136 I 0.163 -137 A 0.189 -138 N 0.230 -139 G 0.275 -140 Q 0.308 -141 R 0.324 -142 A 0.328 -143 L 0.321 -144 P 0.304 -145 R 0.288 -146 D 0.281 -147 G 0.278 -148 L 0.274 -149 L 0.275 -150 D 0.285 -151 E 0.295 -152 P 0.291 -153 G 0.266 -154 L 0.224 -155 S 0.175 -156 V 0.127 -157 Y 0.092 -158 K 0.073 -159 R 0.066 -160 F 0.066 -161 V 0.068 -162 R 0.069 -163 Y 0.067 -164 V 0.061 -165 A 0.058 -166 Y 0.061 -167 E 0.071 -168 I 0.082 -169 L 0.091 -170 P 0.098 -171 C 0.100 -172 E 0.095 -173 V 0.085 -174 D 0.072 -175 R 0.062 -176 R 0.056 -177 W 0.055 -178 Y 0.055 -179 F 0.055 -180 Y 0.056 -181 R 0.056 -182 H 0.050 -183 R 0.042 -184 T 0.036 -185 C 0.036 -186 P 0.043 -187 P 0.050 -188 P 0.048 -189 V 0.040 -190 F 0.033 -191 M 0.031 -192 A 0.033 -193 S 0.038 -194 V 0.045 -195 T 0.050 -196 L 0.050 -197 A 0.050 -198 Q 0.049 -199 I 0.046 -200 I 0.040 -201 V 0.035 -202 F 0.031 -203 L 0.029 -204 C 0.031 -205 Y 0.037 -206 G 0.047 -207 A 0.058 -208 R 0.067 -209 L 0.070 -210 N 0.068 -211 K 0.064 -212 W 0.061 -213 V 0.061 -214 L 0.063 -215 Q 0.068 -216 T 0.073 -217 Y 0.078 -218 H 0.082 -219 P 0.091 -220 E 0.105 -221 Y 0.119 -222 M 0.126 -223 K 0.120 -224 S 0.107 -225 P 0.095 -226 L 0.087 -227 V 0.081 -228 Y 0.077 -229 H 0.074 -230 P 0.073 -231 G 0.072 -232 H 0.071 -233 R 0.070 -234 A 0.072 -235 R 0.074 -236 A 0.077 -237 W 0.085 -238 R 0.097 -239 F 0.108 -240 L 0.119 -241 T 0.131 -242 Y 0.137 -243 M 0.134 -244 F 0.127 -245 M 0.124 -246 H 0.132 -247 V 0.150 -248 G 0.171 -249 L 0.194 -250 E 0.220 -251 Q 0.234 -252 L 0.214 -253 G 0.184 -254 F 0.180 -255 N 0.188 -256 A 0.175 -257 L 0.141 -258 L 0.107 -259 Q 0.081 -260 L 0.060 -261 M 0.047 -262 I 0.045 -263 G 0.047 -264 V 0.045 -265 P 0.041 -266 L 0.038 -267 E 0.037 -268 M 0.036 -269 V 0.035 -270 H 0.033 -271 G 0.032 -272 V 0.029 -273 L 0.026 -274 R 0.025 -275 I 0.026 -276 S 0.028 -277 L 0.029 -278 L 0.032 -279 Y 0.037 -280 L 0.041 -281 A 0.044 -282 G 0.044 -283 V 0.042 -284 L 0.040 -285 A 0.039 -286 G 0.040 -287 S 0.043 -288 L 0.045 -289 T 0.048 -290 V 0.051 -291 S 0.056 -292 I 0.063 -293 T 0.075 -294 D 0.090 -295 M 0.106 -296 R 0.127 -297 A 0.143 -298 P 0.141 -299 V 0.126 -300 V 0.117 -301 G 0.127 -302 G 0.147 -303 S 0.162 -304 G 0.161 -305 G 0.143 -306 V 0.121 -307 Y 0.105 -308 A 0.096 -309 L 0.084 -310 C 0.072 -311 S 0.062 -312 A 0.056 -313 H 0.052 -314 L 0.048 -315 A 0.043 -316 N 0.038 -317 V 0.037 -318 V 0.042 -319 M 0.047 -320 N 0.049 -321 W 0.050 -322 A 0.052 -323 G 0.055 -324 M 0.060 -325 R 0.066 -326 C 0.069 -327 P 0.063 -328 Y 0.052 -329 K 0.039 -330 L 0.031 -331 L 0.030 -332 R 0.039 -333 M 0.055 -334 V 0.065 -335 L 0.063 -336 A 0.053 -337 L 0.046 -338 V 0.044 -339 C 0.047 -340 M 0.050 -341 S 0.049 -342 S 0.046 -343 E 0.045 -344 V 0.046 -345 G 0.050 -346 R 0.055 -347 A 0.058 -348 V 0.059 -349 W 0.066 -350 L 0.084 -351 R 0.115 -352 F 0.156 -353 S 0.205 -354 P 0.250 -355 P 0.279 -356 L 0.289 -357 P 0.283 -358 A 0.265 -359 S 0.248 -360 G 0.242 -361 P 0.244 -362 Q 0.241 -363 P 0.223 -364 S 0.192 -365 F 0.161 -366 M 0.146 -367 A 0.147 -368 H 0.143 -369 L 0.123 -370 A 0.096 -371 G 0.076 -372 A 0.066 -373 V 0.062 -374 V 0.060 -375 G 0.057 -376 V 0.054 -377 S 0.053 -378 M 0.051 -379 G 0.050 -380 L 0.051 -381 T 0.054 -382 I 0.057 -383 L 0.064 -384 R 0.076 -385 S 0.091 -386 Y 0.102 -387 E 0.107 -388 E 0.107 -389 R 0.106 -390 L 0.109 -391 R 0.114 -392 D 0.115 -393 Q 0.109 -394 C 0.100 -395 G 0.094 -396 W 0.089 -397 W 0.087 -398 V 0.087 -399 V 0.084 -400 L 0.075 -401 L 0.068 -402 A 0.066 -403 Y 0.066 -404 G 0.062 -405 T 0.055 -406 F 0.049 -407 L 0.044 -408 L 0.040 -409 F 0.036 -410 A 0.032 -411 I 0.029 -412 F 0.029 -413 W 0.031 -414 N 0.037 -415 V 0.047 -416 F 0.061 -417 A 0.080 -418 Y 0.102 -419 D 0.130 -420 L 0.170 -421 L 0.221 -422 G 0.276 -423 A 0.319 -424 D 0.344 -425 I 0.347 -426 P 0.336 -427 P 0.321 -428 P 0.311 -429 P 0.306 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000025909.17_ENSMUST00000140295.8_GN:Sntg1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000025909.17_ENSMUST00000140295.8_GN:Sntg1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index b19cde4c552b0dfa6af02451c6bc46a1f7f1e227..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000025909.17_ENSMUST00000140295.8_GN:Sntg1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,518 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000025909.17|ENSMUST00000140295.8|GN:Sntg1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.303 -2 D 0.302 -3 F 0.316 -4 R 0.347 -5 T 0.377 -6 T 0.378 -7 C 0.339 -8 E 0.266 -9 E 0.184 -10 T 0.115 -11 K 0.071 -12 T 0.049 -13 G 0.042 -14 V 0.042 -15 C 0.049 -16 L 0.067 -17 L 0.096 -18 Q 0.132 -19 D 0.164 -20 G 0.182 -21 N 0.185 -22 Q 0.174 -23 E 0.150 -24 P 0.121 -25 F 0.096 -26 K 0.078 -27 V 0.063 -28 R 0.050 -29 L 0.045 -30 H 0.052 -31 L 0.064 -32 A 0.071 -33 R 0.070 -34 D 0.069 -35 L 0.076 -36 L 0.092 -37 M 0.113 -38 L 0.138 -39 Q 0.170 -40 E 0.217 -41 Q 0.290 -42 D 0.383 -43 V 0.465 -44 L 0.511 -45 C 0.519 -46 V 0.506 -47 S 0.480 -48 G 0.440 -49 E 0.386 -50 P 0.326 -51 F 0.259 -52 Y 0.194 -53 S 0.141 -54 G 0.105 -55 E 0.083 -56 R 0.075 -57 T 0.074 -58 V 0.075 -59 T 0.072 -60 I 0.067 -61 R 0.065 -62 R 0.072 -63 Q 0.090 -64 T 0.119 -65 V 0.149 -66 G 0.168 -67 G 0.168 -68 F 0.148 -69 G 0.122 -70 L 0.106 -71 S 0.104 -72 I 0.107 -73 K 0.107 -74 G 0.106 -75 G 0.114 -76 A 0.131 -77 E 0.150 -78 H 0.159 -79 N 0.151 -80 I 0.129 -81 P 0.100 -82 V 0.076 -83 V 0.065 -84 I 0.065 -85 S 0.070 -86 K 0.078 -87 I 0.086 -88 S 0.088 -89 K 0.081 -90 E 0.066 -91 Q 0.054 -92 R 0.050 -93 A 0.052 -94 E 0.056 -95 L 0.063 -96 S 0.070 -97 G 0.072 -98 L 0.070 -99 L 0.065 -100 F 0.062 -101 I 0.062 -102 G 0.063 -103 D 0.061 -104 A 0.054 -105 I 0.045 -106 L 0.040 -107 Q 0.041 -108 I 0.051 -109 N 0.066 -110 G 0.080 -111 I 0.086 -112 N 0.080 -113 V 0.068 -114 R 0.056 -115 K 0.050 -116 C 0.048 -117 R 0.048 -118 H 0.048 -119 E 0.046 -120 E 0.046 -121 V 0.050 -122 V 0.060 -123 Q 0.069 -124 V 0.068 -125 L 0.064 -126 R 0.065 -127 N 0.070 -128 A 0.072 -129 G 0.069 -130 E 0.064 -131 E 0.059 -132 V 0.055 -133 T 0.049 -134 L 0.044 -135 T 0.041 -136 V 0.041 -137 S 0.044 -138 F 0.055 -139 L 0.078 -140 K 0.114 -141 R 0.157 -142 A 0.200 -143 P 0.240 -144 A 0.275 -145 F 0.312 -146 L 0.355 -147 K 0.408 -148 L 0.473 -149 P 0.545 -150 V 0.609 -151 N 0.651 -152 E 0.658 -153 D 0.623 -154 C 0.562 -155 A 0.524 -156 C 0.529 -157 A 0.541 -158 P 0.528 -159 S 0.513 -160 D 0.516 -161 Q 0.514 -162 S 0.509 -163 S 0.524 -164 G 0.535 -165 T 0.520 -166 S 0.510 -167 S 0.542 -168 P 0.593 -169 L 0.627 -170 C 0.636 -171 D 0.631 -172 S 0.626 -173 G 0.630 -174 L 0.641 -175 H 0.648 -176 L 0.638 -177 N 0.608 -178 Y 0.582 -179 H 0.587 -180 P 0.624 -181 N 0.670 -182 N 0.705 -183 T 0.721 -184 D 0.725 -185 T 0.725 -186 L 0.721 -187 S 0.710 -188 C 0.691 -189 S 0.663 -190 S 0.630 -191 W 0.605 -192 P 0.596 -193 T 0.602 -194 S 0.615 -195 P 0.623 -196 G 0.613 -197 L 0.568 -198 R 0.490 -199 W 0.401 -200 E 0.328 -201 K 0.279 -202 R 0.244 -203 W 0.218 -204 C 0.196 -205 D 0.170 -206 L 0.139 -207 R 0.116 -208 L 0.105 -209 I 0.096 -210 P 0.079 -211 L 0.056 -212 L 0.038 -213 H 0.028 -214 A 0.024 -215 R 0.024 -216 F 0.031 -217 S 0.045 -218 Q 0.062 -219 Y 0.078 -220 V 0.088 -221 P 0.094 -222 G 0.095 -223 T 0.095 -224 D 0.099 -225 L 0.108 -226 S 0.116 -227 R 0.113 -228 Q 0.099 -229 N 0.079 -230 A 0.060 -231 F 0.049 -232 Q 0.045 -233 V 0.046 -234 V 0.049 -235 A 0.056 -236 V 0.065 -237 D 0.076 -238 G 0.084 -239 V 0.084 -240 C 0.081 -241 S 0.081 -242 G 0.084 -243 I 0.089 -244 L 0.093 -245 Q 0.099 -246 C 0.109 -247 L 0.118 -248 S 0.120 -249 A 0.111 -250 E 0.093 -251 D 0.075 -252 C 0.066 -253 M 0.063 -254 D 0.066 -255 W 0.073 -256 L 0.082 -257 Q 0.086 -258 A 0.085 -259 I 0.088 -260 A 0.098 -261 S 0.110 -262 N 0.119 -263 I 0.128 -264 S 0.133 -265 N 0.130 -266 L 0.125 -267 T 0.122 -268 K 0.121 -269 H 0.118 -270 N 0.111 -271 I 0.103 -272 K 0.100 -273 K 0.101 -274 I 0.105 -275 N 0.103 -276 R 0.093 -277 N 0.083 -278 F 0.081 -279 P 0.085 -280 V 0.088 -281 N 0.089 -282 Q 0.093 -283 Q 0.098 -284 I 0.096 -285 V 0.084 -286 Y 0.071 -287 M 0.060 -288 G 0.051 -289 W 0.041 -290 C 0.033 -291 E 0.033 -292 A 0.046 -293 R 0.073 -294 E 0.107 -295 Q 0.141 -296 E 0.172 -297 S 0.196 -298 L 0.211 -299 Q 0.210 -300 D 0.192 -301 R 0.163 -302 V 0.131 -303 Y 0.104 -304 T 0.086 -305 P 0.071 -306 V 0.055 -307 F 0.040 -308 L 0.034 -309 A 0.039 -310 L 0.047 -311 R 0.050 -312 G 0.047 -313 S 0.041 -314 C 0.036 -315 L 0.034 -316 Y 0.036 -317 R 0.043 -318 F 0.054 -319 L 0.066 -320 S 0.073 -321 P 0.076 -322 P 0.075 -323 V 0.075 -324 T 0.076 -325 T 0.078 -326 W 0.078 -327 D 0.077 -328 W 0.074 -329 T 0.074 -330 R 0.076 -331 A 0.077 -332 E 0.074 -333 K 0.067 -334 T 0.058 -335 F 0.047 -336 S 0.039 -337 V 0.034 -338 C 0.032 -339 E 0.031 -340 I 0.030 -341 M 0.031 -342 C 0.039 -343 K 0.056 -344 V 0.082 -345 L 0.107 -346 K 0.125 -347 D 0.133 -348 S 0.131 -349 D 0.122 -350 L 0.114 -351 L 0.112 -352 D 0.113 -353 R 0.111 -354 R 0.103 -355 K 0.085 -356 H 0.063 -357 C 0.045 -358 F 0.037 -359 T 0.039 -360 M 0.048 -361 Q 0.063 -362 S 0.079 -363 E 0.096 -364 C 0.113 -365 G 0.123 -366 E 0.117 -367 D 0.095 -368 L 0.070 -369 Y 0.053 -370 F 0.048 -371 S 0.053 -372 V 0.067 -373 E 0.083 -374 L 0.089 -375 E 0.084 -376 S 0.072 -377 D 0.062 -378 L 0.057 -379 A 0.055 -380 Q 0.055 -381 W 0.062 -382 E 0.073 -383 R 0.079 -384 A 0.077 -385 F 0.075 -386 Q 0.076 -387 T 0.075 -388 A 0.077 -389 T 0.085 -390 F 0.096 -391 L 0.103 -392 E 0.103 -393 V 0.098 -394 E 0.087 -395 R 0.073 -396 I 0.060 -397 Q 0.051 -398 C 0.046 -399 K 0.043 -400 T 0.043 -401 Y 0.041 -402 A 0.037 -403 C 0.033 -404 V 0.031 -405 L 0.035 -406 E 0.046 -407 S 0.062 -408 H 0.073 -409 L 0.072 -410 M 0.062 -411 G 0.053 -412 L 0.051 -413 T 0.052 -414 I 0.052 -415 D 0.051 -416 F 0.050 -417 S 0.052 -418 T 0.055 -419 G 0.055 -420 F 0.053 -421 I 0.052 -422 C 0.053 -423 F 0.055 -424 D 0.060 -425 A 0.066 -426 A 0.072 -427 T 0.076 -428 K 0.078 -429 A 0.081 -430 V 0.085 -431 L 0.082 -432 W 0.072 -433 R 0.058 -434 Y 0.044 -435 K 0.033 -436 F 0.026 -437 S 0.023 -438 Q 0.024 -439 L 0.031 -440 K 0.043 -441 G 0.055 -442 S 0.065 -443 S 0.075 -444 D 0.087 -445 D 0.098 -446 G 0.103 -447 K 0.098 -448 S 0.084 -449 K 0.066 -450 I 0.052 -451 K 0.046 -452 F 0.049 -453 L 0.060 -454 F 0.078 -455 Q 0.100 -456 N 0.118 -457 P 0.124 -458 D 0.124 -459 T 0.130 -460 K 0.139 -461 Q 0.143 -462 I 0.136 -463 E 0.121 -464 A 0.106 -465 K 0.095 -466 E 0.090 -467 L 0.087 -468 E 0.083 -469 F 0.078 -470 S 0.073 -471 N 0.071 -472 L 0.071 -473 F 0.070 -474 A 0.068 -475 V 0.066 -476 L 0.063 -477 H 0.060 -478 C 0.057 -479 I 0.057 -480 H 0.060 -481 S 0.064 -482 F 0.072 -483 F 0.086 -484 A 0.102 -485 A 0.115 -486 K 0.132 -487 V 0.162 -488 A 0.206 -489 C 0.256 -490 L 0.311 -491 D 0.367 -492 P 0.413 -493 L 0.447 -494 F 0.483 -495 L 0.528 -496 G 0.571 -497 N 0.600 -498 Q 0.612 -499 A 0.616 -500 A 0.611 -501 T 0.586 -502 T 0.541 -503 A 0.511 -504 A 0.518 -505 V 0.528 -506 S 0.507 -507 S 0.488 -508 A 0.508 -509 S 0.556 -510 T 0.601 -511 S 0.635 -512 K 0.663 -513 A 0.682 -514 K 0.691 -515 H 0.685 -516 L 0.663 -517 A 0.641 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000025909.17_ENSMUST00000140295.8_GN:Sntg1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:11.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000025909.17_ENSMUST00000140295.8_GN:Sntg1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:11.caid deleted file mode 100644 index 482eba54c0bcf43f849cad8ce39c3b24538872dd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000025909.17_ENSMUST00000140295.8_GN:Sntg1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:11.caid +++ /dev/null @@ -1,529 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000025909.17|ENSMUST00000140295.8|GN:Sntg1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:11 -1 M 0.319 -2 M 0.329 -3 T 0.351 -4 T 0.373 -5 S 0.384 -6 F 0.386 -7 T 0.396 -8 V 0.417 -9 P 0.433 -10 Q 0.425 -11 H 0.396 -12 M 0.359 -13 D 0.333 -14 F 0.332 -15 R 0.357 -16 T 0.385 -17 T 0.385 -18 C 0.342 -19 E 0.265 -20 E 0.182 -21 T 0.115 -22 K 0.073 -23 T 0.051 -24 G 0.043 -25 V 0.043 -26 C 0.050 -27 L 0.067 -28 L 0.097 -29 Q 0.133 -30 D 0.165 -31 G 0.183 -32 N 0.186 -33 Q 0.174 -34 E 0.149 -35 P 0.120 -36 F 0.094 -37 K 0.076 -38 V 0.061 -39 R 0.049 -40 L 0.045 -41 H 0.052 -42 L 0.064 -43 A 0.072 -44 R 0.071 -45 D 0.069 -46 L 0.077 -47 L 0.094 -48 M 0.116 -49 L 0.143 -50 Q 0.178 -51 E 0.229 -52 Q 0.308 -53 D 0.406 -54 V 0.490 -55 L 0.533 -56 C 0.536 -57 V 0.520 -58 S 0.492 -59 G 0.448 -60 E 0.390 -61 P 0.326 -62 F 0.257 -63 Y 0.191 -64 S 0.138 -65 G 0.103 -66 E 0.082 -67 R 0.074 -68 T 0.074 -69 V 0.075 -70 T 0.072 -71 I 0.067 -72 R 0.065 -73 R 0.071 -74 Q 0.088 -75 T 0.116 -76 V 0.146 -77 G 0.165 -78 G 0.165 -79 F 0.145 -80 G 0.119 -81 L 0.102 -82 S 0.100 -83 I 0.104 -84 K 0.104 -85 G 0.103 -86 G 0.111 -87 A 0.127 -88 E 0.145 -89 H 0.153 -90 N 0.146 -91 I 0.125 -92 P 0.097 -93 V 0.074 -94 V 0.064 -95 I 0.064 -96 S 0.068 -97 K 0.076 -98 I 0.084 -99 S 0.087 -100 K 0.080 -101 E 0.065 -102 Q 0.053 -103 R 0.049 -104 A 0.051 -105 E 0.056 -106 L 0.062 -107 S 0.069 -108 G 0.072 -109 L 0.070 -110 L 0.066 -111 F 0.063 -112 I 0.062 -113 G 0.063 -114 D 0.061 -115 A 0.055 -116 I 0.045 -117 L 0.040 -118 Q 0.041 -119 I 0.051 -120 N 0.066 -121 G 0.081 -122 I 0.087 -123 N 0.081 -124 V 0.069 -125 R 0.057 -126 K 0.050 -127 C 0.048 -128 R 0.048 -129 H 0.048 -130 E 0.046 -131 E 0.045 -132 V 0.050 -133 V 0.060 -134 Q 0.068 -135 V 0.068 -136 L 0.064 -137 R 0.065 -138 N 0.071 -139 A 0.073 -140 G 0.069 -141 E 0.064 -142 E 0.059 -143 V 0.054 -144 T 0.048 -145 L 0.043 -146 T 0.041 -147 V 0.041 -148 S 0.044 -149 F 0.055 -150 L 0.077 -151 K 0.112 -152 R 0.153 -153 A 0.195 -154 P 0.235 -155 A 0.271 -156 F 0.310 -157 L 0.353 -158 K 0.406 -159 L 0.471 -160 P 0.543 -161 V 0.608 -162 N 0.651 -163 E 0.659 -164 D 0.625 -165 C 0.564 -166 A 0.525 -167 C 0.530 -168 A 0.542 -169 P 0.528 -170 S 0.514 -171 D 0.517 -172 Q 0.516 -173 S 0.510 -174 S 0.524 -175 G 0.535 -176 T 0.520 -177 S 0.511 -178 S 0.544 -179 P 0.596 -180 L 0.629 -181 C 0.638 -182 D 0.634 -183 S 0.629 -184 G 0.632 -185 L 0.643 -186 H 0.651 -187 L 0.642 -188 N 0.614 -189 Y 0.589 -190 H 0.595 -191 P 0.631 -192 N 0.676 -193 N 0.710 -194 T 0.724 -195 D 0.728 -196 T 0.727 -197 L 0.722 -198 S 0.711 -199 C 0.692 -200 S 0.664 -201 S 0.631 -202 W 0.606 -203 P 0.598 -204 T 0.604 -205 S 0.617 -206 P 0.625 -207 G 0.614 -208 L 0.570 -209 R 0.492 -210 W 0.403 -211 E 0.329 -212 K 0.279 -213 R 0.244 -214 W 0.219 -215 C 0.198 -216 D 0.171 -217 L 0.140 -218 R 0.115 -219 L 0.104 -220 I 0.095 -221 P 0.078 -222 L 0.056 -223 L 0.038 -224 H 0.028 -225 A 0.024 -226 R 0.025 -227 F 0.032 -228 S 0.045 -229 Q 0.063 -230 Y 0.078 -231 V 0.088 -232 P 0.093 -233 G 0.095 -234 T 0.094 -235 D 0.098 -236 L 0.107 -237 S 0.114 -238 R 0.112 -239 Q 0.098 -240 N 0.078 -241 A 0.060 -242 F 0.048 -243 Q 0.045 -244 V 0.046 -245 V 0.049 -246 A 0.056 -247 V 0.065 -248 D 0.076 -249 G 0.084 -250 V 0.084 -251 C 0.080 -252 S 0.080 -253 G 0.084 -254 I 0.088 -255 L 0.092 -256 Q 0.098 -257 C 0.107 -258 L 0.117 -259 S 0.120 -260 A 0.110 -261 E 0.093 -262 D 0.075 -263 C 0.066 -264 M 0.063 -265 D 0.066 -266 W 0.073 -267 L 0.082 -268 Q 0.085 -269 A 0.084 -270 I 0.086 -271 A 0.097 -272 S 0.109 -273 N 0.118 -274 I 0.127 -275 S 0.132 -276 N 0.130 -277 L 0.125 -278 T 0.123 -279 K 0.122 -280 H 0.119 -281 N 0.112 -282 I 0.104 -283 K 0.100 -284 K 0.102 -285 I 0.106 -286 N 0.104 -287 R 0.095 -288 N 0.085 -289 F 0.082 -290 P 0.086 -291 V 0.089 -292 N 0.091 -293 Q 0.095 -294 Q 0.100 -295 I 0.098 -296 V 0.086 -297 Y 0.072 -298 M 0.061 -299 G 0.052 -300 W 0.042 -301 C 0.034 -302 E 0.034 -303 A 0.047 -304 R 0.074 -305 E 0.109 -306 Q 0.144 -307 E 0.174 -308 S 0.199 -309 L 0.214 -310 Q 0.213 -311 D 0.195 -312 R 0.166 -313 V 0.134 -314 Y 0.106 -315 T 0.088 -316 P 0.073 -317 V 0.056 -318 F 0.041 -319 L 0.035 -320 A 0.040 -321 L 0.048 -322 R 0.051 -323 G 0.048 -324 S 0.041 -325 C 0.037 -326 L 0.035 -327 Y 0.036 -328 R 0.043 -329 F 0.055 -330 L 0.066 -331 S 0.073 -332 P 0.075 -333 P 0.075 -334 V 0.074 -335 T 0.076 -336 T 0.077 -337 W 0.078 -338 D 0.076 -339 W 0.074 -340 T 0.074 -341 R 0.075 -342 A 0.076 -343 E 0.074 -344 K 0.067 -345 T 0.058 -346 F 0.048 -347 S 0.040 -348 V 0.034 -349 C 0.032 -350 E 0.031 -351 I 0.030 -352 M 0.031 -353 C 0.038 -354 K 0.055 -355 V 0.080 -356 L 0.106 -357 K 0.123 -358 D 0.130 -359 S 0.128 -360 D 0.120 -361 L 0.112 -362 L 0.110 -363 D 0.111 -364 R 0.109 -365 R 0.101 -366 K 0.084 -367 H 0.062 -368 C 0.045 -369 F 0.037 -370 T 0.038 -371 M 0.048 -372 Q 0.061 -373 S 0.077 -374 E 0.094 -375 C 0.111 -376 G 0.121 -377 E 0.115 -378 D 0.094 -379 L 0.069 -380 Y 0.052 -381 F 0.047 -382 S 0.053 -383 V 0.067 -384 E 0.082 -385 L 0.088 -386 E 0.083 -387 S 0.072 -388 D 0.062 -389 L 0.057 -390 A 0.054 -391 Q 0.055 -392 W 0.062 -393 E 0.073 -394 R 0.079 -395 A 0.078 -396 F 0.075 -397 Q 0.076 -398 T 0.075 -399 A 0.077 -400 T 0.086 -401 F 0.098 -402 L 0.104 -403 E 0.105 -404 V 0.099 -405 E 0.088 -406 R 0.074 -407 I 0.061 -408 Q 0.052 -409 C 0.046 -410 K 0.044 -411 T 0.043 -412 Y 0.041 -413 A 0.038 -414 C 0.033 -415 V 0.031 -416 L 0.036 -417 E 0.047 -418 S 0.062 -419 H 0.073 -420 L 0.072 -421 M 0.063 -422 G 0.054 -423 L 0.051 -424 T 0.052 -425 I 0.053 -426 D 0.051 -427 F 0.050 -428 S 0.053 -429 T 0.056 -430 G 0.056 -431 F 0.054 -432 I 0.053 -433 C 0.053 -434 F 0.056 -435 D 0.060 -436 A 0.066 -437 A 0.072 -438 T 0.076 -439 K 0.078 -440 A 0.082 -441 V 0.086 -442 L 0.083 -443 W 0.073 -444 R 0.058 -445 Y 0.045 -446 K 0.033 -447 F 0.026 -448 S 0.023 -449 Q 0.025 -450 L 0.032 -451 K 0.043 -452 G 0.055 -453 S 0.066 -454 S 0.076 -455 D 0.087 -456 D 0.099 -457 G 0.104 -458 K 0.099 -459 S 0.085 -460 K 0.067 -461 I 0.052 -462 K 0.046 -463 F 0.049 -464 L 0.061 -465 F 0.079 -466 Q 0.102 -467 N 0.119 -468 P 0.125 -469 D 0.126 -470 T 0.131 -471 K 0.140 -472 Q 0.144 -473 I 0.137 -474 E 0.123 -475 A 0.107 -476 K 0.096 -477 E 0.091 -478 L 0.089 -479 E 0.084 -480 F 0.079 -481 S 0.075 -482 N 0.072 -483 L 0.072 -484 F 0.071 -485 A 0.069 -486 V 0.066 -487 L 0.064 -488 H 0.061 -489 C 0.058 -490 I 0.058 -491 H 0.061 -492 S 0.065 -493 F 0.073 -494 F 0.087 -495 A 0.104 -496 A 0.117 -497 K 0.134 -498 V 0.164 -499 A 0.206 -500 C 0.256 -501 L 0.310 -502 D 0.365 -503 P 0.410 -504 L 0.445 -505 F 0.481 -506 L 0.526 -507 G 0.569 -508 N 0.598 -509 Q 0.611 -510 A 0.615 -511 A 0.610 -512 T 0.586 -513 T 0.541 -514 A 0.511 -515 A 0.519 -516 V 0.530 -517 S 0.510 -518 S 0.491 -519 A 0.512 -520 S 0.560 -521 T 0.605 -522 S 0.639 -523 K 0.666 -524 A 0.685 -525 K 0.693 -526 H 0.687 -527 L 0.664 -528 A 0.642 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026223.16_ENSMUST00000027425.16_GN:Itm2c_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026223.16_ENSMUST00000027425.16_GN:Itm2c_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 2835a754c8bddff9e22f2de4121b90e7d8e64d4b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026223.16_ENSMUST00000027425.16_GN:Itm2c_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,270 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000026223.16|ENSMUST00000027425.16|GN:Itm2c|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.278 -2 V 0.292 -3 K 0.309 -4 I 0.326 -5 S 0.348 -6 F 0.389 -7 Q 0.457 -8 P 0.539 -9 A 0.606 -10 V 0.653 -11 A 0.688 -12 G 0.713 -13 I 0.725 -14 K 0.732 -15 A 0.740 -16 D 0.742 -17 K 0.726 -18 A 0.682 -19 D 0.623 -20 K 0.582 -21 A 0.572 -22 A 0.566 -23 A 0.565 -24 S 0.601 -25 G 0.664 -26 P 0.717 -27 A 0.745 -28 S 0.751 -29 A 0.740 -30 S 0.721 -31 A 0.696 -32 P 0.649 -33 A 0.562 -34 A 0.476 -35 E 0.468 -36 I 0.542 -37 L 0.627 -38 L 0.676 -39 T 0.702 -40 P 0.723 -41 A 0.735 -42 R 0.733 -43 E 0.718 -44 E 0.693 -45 R 0.673 -46 P 0.675 -47 P 0.701 -48 R 0.733 -49 H 0.753 -50 R 0.759 -51 S 0.758 -52 R 0.758 -53 K 0.758 -54 G 0.757 -55 G 0.753 -56 S 0.748 -57 V 0.738 -58 G 0.712 -59 G 0.651 -60 V 0.549 -61 C 0.431 -62 Y 0.343 -63 L 0.315 -64 S 0.331 -65 M 0.355 -66 G 0.364 -67 M 0.350 -68 V 0.320 -69 V 0.293 -70 L 0.285 -71 L 0.293 -72 M 0.298 -73 G 0.288 -74 L 0.264 -75 V 0.231 -76 F 0.196 -77 A 0.166 -78 S 0.140 -79 V 0.113 -80 Y 0.088 -81 I 0.070 -82 Y 0.059 -83 R 0.054 -84 Y 0.059 -85 F 0.072 -86 F 0.091 -87 L 0.116 -88 A 0.153 -89 Q 0.200 -90 L 0.242 -91 A 0.258 -92 R 0.244 -93 D 0.208 -94 N 0.163 -95 F 0.123 -96 F 0.097 -97 H 0.085 -98 C 0.087 -99 G 0.099 -100 V 0.122 -101 L 0.153 -102 Y 0.192 -103 E 0.236 -104 D 0.277 -105 S 0.308 -106 L 0.326 -107 S 0.334 -108 S 0.331 -109 Q 0.324 -110 I 0.321 -111 R 0.322 -112 T 0.316 -113 R 0.294 -114 L 0.254 -115 E 0.202 -116 L 0.153 -117 E 0.117 -118 E 0.092 -119 D 0.073 -120 V 0.057 -121 K 0.047 -122 I 0.043 -123 Y 0.048 -124 L 0.058 -125 E 0.066 -126 E 0.067 -127 N 0.060 -128 Y 0.055 -129 E 0.057 -130 R 0.072 -131 I 0.098 -132 N 0.133 -133 V 0.173 -134 P 0.211 -135 V 0.241 -136 P 0.260 -137 Q 0.270 -138 F 0.268 -139 G 0.254 -140 G 0.241 -141 G 0.240 -142 D 0.239 -143 P 0.216 -144 A 0.168 -145 D 0.117 -146 I 0.085 -147 I 0.072 -148 H 0.070 -149 D 0.073 -150 F 0.077 -151 Q 0.079 -152 R 0.079 -153 G 0.070 -154 L 0.052 -155 T 0.035 -156 A 0.029 -157 Y 0.037 -158 H 0.054 -159 D 0.075 -160 I 0.092 -161 S 0.102 -162 L 0.102 -163 D 0.094 -164 K 0.082 -165 C 0.073 -166 Y 0.069 -167 V 0.070 -168 I 0.073 -169 E 0.074 -170 L 0.076 -171 N 0.078 -172 T 0.080 -173 T 0.081 -174 I 0.083 -175 V 0.085 -176 L 0.086 -177 P 0.083 -178 P 0.077 -179 R 0.070 -180 N 0.065 -181 F 0.067 -182 W 0.077 -183 E 0.086 -184 L 0.089 -185 L 0.089 -186 M 0.091 -187 N 0.098 -188 V 0.109 -189 K 0.122 -190 R 0.137 -191 G 0.152 -192 T 0.157 -193 Y 0.150 -194 L 0.139 -195 P 0.127 -196 Q 0.119 -197 T 0.121 -198 Y 0.131 -199 I 0.140 -200 I 0.142 -201 Q 0.135 -202 E 0.124 -203 E 0.116 -204 M 0.111 -205 V 0.103 -206 V 0.089 -207 T 0.075 -208 E 0.065 -209 H 0.057 -210 V 0.053 -211 R 0.052 -212 D 0.053 -213 K 0.058 -214 E 0.063 -215 A 0.066 -216 L 0.065 -217 G 0.062 -218 S 0.058 -219 F 0.055 -220 I 0.056 -221 Y 0.061 -222 H 0.063 -223 L 0.058 -224 C 0.057 -225 N 0.067 -226 G 0.080 -227 K 0.086 -228 D 0.080 -229 T 0.073 -230 Y 0.071 -231 R 0.075 -232 L 0.083 -233 R 0.098 -234 R 0.130 -235 R 0.180 -236 S 0.237 -237 T 0.282 -238 R 0.311 -239 R 0.329 -240 R 0.340 -241 I 0.348 -242 N 0.352 -243 K 0.354 -244 R 0.354 -245 G 0.345 -246 G 0.322 -247 K 0.284 -248 N 0.232 -249 C 0.181 -250 N 0.139 -251 A 0.109 -252 I 0.086 -253 R 0.068 -254 H 0.057 -255 F 0.055 -256 E 0.061 -257 N 0.072 -258 T 0.081 -259 F 0.087 -260 V 0.090 -261 V 0.090 -262 E 0.086 -263 T 0.082 -264 L 0.085 -265 I 0.104 -266 C 0.145 -267 G 0.194 -268 V 0.230 -269 V 0.243 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026223.16_ENSMUST00000027425.16_GN:Itm2c_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:82.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026223.16_ENSMUST00000027425.16_GN:Itm2c_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:82.caid deleted file mode 100644 index 2b9273405ecdebe622f8868b85a456b57d414458..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026223.16_ENSMUST00000027425.16_GN:Itm2c_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:82.caid +++ /dev/null @@ -1,352 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000026223.16|ENSMUST00000027425.16|GN:Itm2c|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:82 -1 M 0.277 -2 N 0.268 -3 I 0.256 -4 S 0.246 -5 K 0.236 -6 R 0.220 -7 W 0.204 -8 K 0.194 -9 E 0.189 -10 I 0.183 -11 S 0.183 -12 A 0.195 -13 F 0.211 -14 F 0.224 -15 S 0.233 -16 Y 0.240 -17 S 0.247 -18 A 0.261 -19 A 0.289 -20 R 0.332 -21 C 0.398 -22 S 0.492 -23 S 0.594 -24 A 0.672 -25 Q 0.709 -26 A 0.716 -27 S 0.712 -28 G 0.713 -29 P 0.724 -30 S 0.740 -31 L 0.754 -32 E 0.768 -33 G 0.776 -34 G 0.765 -35 A 0.721 -36 G 0.657 -37 R 0.627 -38 V 0.665 -39 R 0.737 -40 G 0.787 -41 G 0.806 -42 D 0.806 -43 R 0.802 -44 G 0.799 -45 E 0.800 -46 D 0.803 -47 S 0.801 -48 G 0.784 -49 A 0.736 -50 I 0.671 -51 Q 0.642 -52 T 0.683 -53 S 0.750 -54 G 0.788 -55 A 0.793 -56 C 0.793 -57 G 0.805 -58 A 0.822 -59 A 0.831 -60 R 0.829 -61 S 0.820 -62 R 0.808 -63 H 0.797 -64 C 0.792 -65 D 0.794 -66 R 0.791 -67 G 0.778 -68 C 0.767 -69 T 0.767 -70 G 0.777 -71 R 0.787 -72 G 0.789 -73 C 0.787 -74 R 0.785 -75 E 0.772 -76 Q 0.724 -77 A 0.651 -78 Q 0.606 -79 V 0.622 -80 N 0.663 -81 A 0.679 -82 A 0.669 -83 M 0.653 -84 V 0.644 -85 K 0.642 -86 I 0.641 -87 S 0.644 -88 F 0.658 -89 Q 0.691 -90 P 0.738 -91 A 0.782 -92 V 0.809 -93 A 0.821 -94 G 0.822 -95 I 0.817 -96 K 0.813 -97 A 0.813 -98 D 0.814 -99 K 0.815 -100 A 0.815 -101 D 0.816 -102 K 0.816 -103 A 0.812 -104 A 0.801 -105 A 0.786 -106 S 0.774 -107 G 0.771 -108 P 0.776 -109 A 0.784 -110 S 0.783 -111 A 0.771 -112 S 0.751 -113 A 0.726 -114 P 0.688 -115 A 0.636 -116 A 0.608 -117 E 0.633 -118 I 0.682 -119 L 0.711 -120 L 0.720 -121 T 0.729 -122 P 0.745 -123 A 0.760 -124 R 0.763 -125 E 0.752 -126 E 0.733 -127 R 0.717 -128 P 0.719 -129 P 0.742 -130 R 0.769 -131 H 0.785 -132 R 0.789 -133 S 0.786 -134 R 0.784 -135 K 0.781 -136 G 0.777 -137 G 0.768 -138 S 0.755 -139 V 0.735 -140 G 0.702 -141 G 0.637 -142 V 0.532 -143 C 0.408 -144 Y 0.312 -145 L 0.271 -146 S 0.274 -147 M 0.292 -148 G 0.302 -149 M 0.293 -150 V 0.271 -151 V 0.250 -152 L 0.241 -153 L 0.242 -154 M 0.240 -155 G 0.231 -156 L 0.213 -157 V 0.190 -158 F 0.165 -159 A 0.144 -160 S 0.125 -161 V 0.104 -162 Y 0.084 -163 I 0.067 -164 Y 0.055 -165 R 0.049 -166 Y 0.051 -167 F 0.063 -168 F 0.083 -169 L 0.112 -170 A 0.153 -171 Q 0.202 -172 L 0.243 -173 A 0.259 -174 R 0.244 -175 D 0.204 -176 N 0.156 -177 F 0.113 -178 F 0.086 -179 H 0.074 -180 C 0.075 -181 G 0.088 -182 V 0.111 -183 L 0.144 -184 Y 0.183 -185 E 0.226 -186 D 0.267 -187 S 0.298 -188 L 0.318 -189 S 0.327 -190 S 0.327 -191 Q 0.322 -192 I 0.320 -193 R 0.319 -194 T 0.307 -195 R 0.276 -196 L 0.229 -197 E 0.178 -198 L 0.134 -199 E 0.103 -200 E 0.083 -201 D 0.068 -202 V 0.055 -203 K 0.046 -204 I 0.044 -205 Y 0.049 -206 L 0.060 -207 E 0.068 -208 E 0.069 -209 N 0.062 -210 Y 0.055 -211 E 0.056 -212 R 0.068 -213 I 0.091 -214 N 0.123 -215 V 0.160 -216 P 0.197 -217 V 0.228 -218 P 0.250 -219 Q 0.264 -220 F 0.265 -221 G 0.251 -222 G 0.235 -223 G 0.232 -224 D 0.229 -225 P 0.208 -226 A 0.163 -227 D 0.116 -228 I 0.086 -229 I 0.073 -230 H 0.071 -231 D 0.073 -232 F 0.076 -233 Q 0.080 -234 R 0.079 -235 G 0.070 -236 L 0.052 -237 T 0.035 -238 A 0.029 -239 Y 0.036 -240 H 0.052 -241 D 0.072 -242 I 0.089 -243 S 0.098 -244 L 0.099 -245 D 0.091 -246 K 0.080 -247 C 0.071 -248 Y 0.068 -249 V 0.069 -250 I 0.071 -251 E 0.071 -252 L 0.072 -253 N 0.074 -254 T 0.075 -255 T 0.076 -256 I 0.078 -257 V 0.079 -258 L 0.078 -259 P 0.073 -260 P 0.066 -261 R 0.060 -262 N 0.055 -263 F 0.055 -264 W 0.061 -265 E 0.069 -266 L 0.074 -267 L 0.078 -268 M 0.083 -269 N 0.091 -270 V 0.101 -271 K 0.115 -272 R 0.135 -273 G 0.152 -274 T 0.158 -275 Y 0.154 -276 L 0.146 -277 P 0.139 -278 Q 0.135 -279 T 0.137 -280 Y 0.145 -281 I 0.152 -282 I 0.151 -283 Q 0.142 -284 E 0.129 -285 E 0.120 -286 M 0.115 -287 V 0.108 -288 V 0.096 -289 T 0.084 -290 E 0.075 -291 H 0.067 -292 V 0.062 -293 R 0.061 -294 D 0.064 -295 K 0.068 -296 E 0.073 -297 A 0.074 -298 L 0.073 -299 G 0.071 -300 S 0.067 -301 F 0.061 -302 I 0.053 -303 Y 0.046 -304 H 0.041 -305 L 0.042 -306 C 0.052 -307 N 0.071 -308 G 0.088 -309 K 0.095 -310 D 0.091 -311 T 0.084 -312 Y 0.084 -313 R 0.091 -314 L 0.101 -315 R 0.117 -316 R 0.151 -317 R 0.206 -318 S 0.264 -319 T 0.309 -320 R 0.336 -321 R 0.352 -322 R 0.363 -323 I 0.369 -324 N 0.372 -325 K 0.371 -326 R 0.367 -327 G 0.356 -328 G 0.333 -329 K 0.296 -330 N 0.245 -331 C 0.193 -332 N 0.150 -333 A 0.119 -334 I 0.096 -335 R 0.077 -336 H 0.065 -337 F 0.062 -338 E 0.070 -339 N 0.082 -340 T 0.091 -341 F 0.095 -342 V 0.095 -343 V 0.093 -344 E 0.088 -345 T 0.082 -346 L 0.084 -347 I 0.103 -348 C 0.146 -349 G 0.200 -350 V 0.239 -351 V 0.254 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026531.5_ENSMUST00000027816.5_GN:Mptx1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026531.5_ENSMUST00000027816.5_GN:Mptx1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 2c90837a2ad9402b22b934d2b00a2486f40037ed..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026531.5_ENSMUST00000027816.5_GN:Mptx1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,220 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000026531.5|ENSMUST00000027816.5|GN:Mptx1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.355 -2 E 0.341 -3 K 0.329 -4 L 0.329 -5 I 0.336 -6 V 0.341 -7 G 0.342 -8 I 0.327 -9 L 0.300 -10 F 0.291 -11 L 0.312 -12 S 0.340 -13 V 0.353 -14 L 0.370 -15 S 0.412 -16 G 0.466 -17 S 0.505 -18 V 0.523 -19 A 0.516 -20 E 0.476 -21 T 0.408 -22 D 0.329 -23 M 0.252 -24 K 0.183 -25 G 0.126 -26 K 0.087 -27 A 0.065 -28 F 0.060 -29 I 0.067 -30 F 0.080 -31 P 0.090 -32 Q 0.099 -33 E 0.110 -34 S 0.122 -35 S 0.125 -36 T 0.115 -37 A 0.099 -38 Y 0.085 -39 V 0.076 -40 S 0.070 -41 L 0.068 -42 I 0.071 -43 P 0.077 -44 K 0.085 -45 V 0.092 -46 R 0.094 -47 K 0.091 -48 S 0.081 -49 L 0.069 -50 Q 0.054 -51 N 0.040 -52 F 0.029 -53 T 0.022 -54 L 0.018 -55 C 0.018 -56 M 0.021 -57 K 0.024 -58 T 0.030 -59 F 0.037 -60 T 0.047 -61 D 0.055 -62 L 0.060 -63 T 0.060 -64 R 0.054 -65 P 0.045 -66 Y 0.037 -67 S 0.032 -68 I 0.030 -69 F 0.033 -70 S 0.042 -71 Y 0.054 -72 N 0.066 -73 T 0.073 -74 R 0.073 -75 N 0.069 -76 Q 0.065 -77 D 0.062 -78 N 0.061 -79 E 0.057 -80 I 0.048 -81 L 0.035 -82 L 0.027 -83 F 0.026 -84 V 0.032 -85 E 0.041 -86 N 0.052 -87 I 0.060 -88 G 0.061 -89 E 0.054 -90 Y 0.043 -91 M 0.036 -92 F 0.037 -93 Y 0.047 -94 V 0.062 -95 G 0.072 -96 N 0.076 -97 M 0.072 -98 V 0.065 -99 A 0.061 -100 T 0.063 -101 F 0.068 -102 K 0.075 -103 A 0.080 -104 P 0.081 -105 T 0.078 -106 N 0.072 -107 L 0.066 -108 P 0.056 -109 D 0.045 -110 P 0.035 -111 A 0.027 -112 R 0.020 -113 I 0.016 -114 C 0.015 -115 V 0.018 -116 N 0.022 -117 W 0.028 -118 E 0.039 -119 S 0.055 -120 G 0.071 -121 S 0.079 -122 G 0.075 -123 I 0.062 -124 A 0.046 -125 E 0.031 -126 F 0.022 -127 W 0.021 -128 L 0.027 -129 N 0.039 -130 G 0.053 -131 K 0.066 -132 P 0.076 -133 L 0.081 -134 G 0.082 -135 R 0.083 -136 K 0.085 -137 G 0.091 -138 L 0.099 -139 K 0.106 -140 K 0.110 -141 G 0.109 -142 Y 0.105 -143 T 0.101 -144 V 0.104 -145 G 0.116 -146 G 0.126 -147 D 0.120 -148 A 0.097 -149 M 0.074 -150 I 0.062 -151 T 0.063 -152 L 0.075 -153 G 0.090 -154 Q 0.102 -155 E 0.107 -156 Q 0.105 -157 D 0.103 -158 S 0.104 -159 Y 0.116 -160 G 0.135 -161 G 0.151 -162 N 0.155 -163 F 0.146 -164 D 0.132 -165 A 0.119 -166 K 0.105 -167 Q 0.093 -168 S 0.086 -169 F 0.084 -170 V 0.084 -171 G 0.080 -172 E 0.070 -173 I 0.058 -174 W 0.048 -175 D 0.043 -176 V 0.040 -177 S 0.039 -178 L 0.038 -179 W 0.036 -180 D 0.036 -181 H 0.039 -182 V 0.044 -183 V 0.049 -184 P 0.054 -185 L 0.062 -186 E 0.072 -187 K 0.080 -188 V 0.084 -189 S 0.085 -190 D 0.085 -191 S 0.084 -192 C 0.086 -193 N 0.091 -194 N 0.093 -195 G 0.088 -196 N 0.080 -197 L 0.073 -198 I 0.065 -199 N 0.056 -200 W 0.048 -201 Q 0.046 -202 A 0.050 -203 L 0.056 -204 N 0.062 -205 Y 0.071 -206 E 0.086 -207 D 0.102 -208 N 0.111 -209 G 0.106 -210 Y 0.094 -211 V 0.090 -212 V 0.101 -213 T 0.122 -214 K 0.147 -215 P 0.175 -216 K 0.202 -217 L 0.219 -218 W 0.223 -219 P 0.221 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026531.5_ENSMUST00000027816.5_GN:Mptx1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026531.5_ENSMUST00000027816.5_GN:Mptx1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid deleted file mode 100644 index ded13a4de06003d40d42072d356c85e097aed42e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026531.5_ENSMUST00000027816.5_GN:Mptx1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid +++ /dev/null @@ -1,236 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000026531.5|ENSMUST00000027816.5|GN:Mptx1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:16 -1 M 0.344 -2 R 0.366 -3 V 0.408 -4 A 0.459 -5 D 0.504 -6 L 0.526 -7 P 0.516 -8 L 0.473 -9 L 0.413 -10 E 0.367 -11 L 0.348 -12 S 0.342 -13 K 0.342 -14 K 0.365 -15 S 0.414 -16 T 0.467 -17 M 0.501 -18 E 0.499 -19 K 0.460 -20 L 0.406 -21 I 0.376 -22 V 0.379 -23 G 0.379 -24 I 0.356 -25 L 0.338 -26 F 0.349 -27 L 0.376 -28 S 0.404 -29 V 0.432 -30 L 0.463 -31 S 0.496 -32 G 0.525 -33 S 0.547 -34 V 0.555 -35 A 0.536 -36 E 0.484 -37 T 0.408 -38 D 0.326 -39 M 0.248 -40 K 0.176 -41 G 0.119 -42 K 0.081 -43 A 0.061 -44 F 0.057 -45 I 0.064 -46 F 0.076 -47 P 0.087 -48 Q 0.096 -49 E 0.108 -50 S 0.120 -51 S 0.123 -52 T 0.114 -53 A 0.098 -54 Y 0.084 -55 V 0.075 -56 S 0.070 -57 L 0.067 -58 I 0.069 -59 P 0.075 -60 K 0.083 -61 V 0.089 -62 R 0.091 -63 K 0.088 -64 S 0.080 -65 L 0.068 -66 Q 0.054 -67 N 0.040 -68 F 0.029 -69 T 0.022 -70 L 0.018 -71 C 0.018 -72 M 0.020 -73 K 0.023 -74 T 0.028 -75 F 0.036 -76 T 0.045 -77 D 0.052 -78 L 0.057 -79 T 0.056 -80 R 0.051 -81 P 0.043 -82 Y 0.035 -83 S 0.030 -84 I 0.029 -85 F 0.032 -86 S 0.040 -87 Y 0.052 -88 N 0.064 -89 T 0.070 -90 R 0.071 -91 N 0.067 -92 Q 0.063 -93 D 0.061 -94 N 0.059 -95 E 0.056 -96 I 0.046 -97 L 0.034 -98 L 0.026 -99 F 0.025 -100 V 0.030 -101 E 0.040 -102 N 0.050 -103 I 0.058 -104 G 0.059 -105 E 0.052 -106 Y 0.042 -107 M 0.034 -108 F 0.035 -109 Y 0.045 -110 V 0.059 -111 G 0.069 -112 N 0.073 -113 M 0.070 -114 V 0.063 -115 A 0.059 -116 T 0.061 -117 F 0.067 -118 K 0.074 -119 A 0.079 -120 P 0.081 -121 T 0.077 -122 N 0.072 -123 L 0.065 -124 P 0.057 -125 D 0.045 -126 P 0.035 -127 A 0.027 -128 R 0.020 -129 I 0.016 -130 C 0.015 -131 V 0.017 -132 N 0.022 -133 W 0.028 -134 E 0.039 -135 S 0.055 -136 G 0.072 -137 S 0.080 -138 G 0.075 -139 I 0.062 -140 A 0.046 -141 E 0.031 -142 F 0.022 -143 W 0.021 -144 L 0.027 -145 N 0.039 -146 G 0.054 -147 K 0.067 -148 P 0.077 -149 L 0.082 -150 G 0.083 -151 R 0.083 -152 K 0.086 -153 G 0.092 -154 L 0.100 -155 K 0.107 -156 K 0.111 -157 G 0.110 -158 Y 0.106 -159 T 0.102 -160 V 0.105 -161 G 0.117 -162 G 0.126 -163 D 0.119 -164 A 0.096 -165 M 0.073 -166 I 0.061 -167 T 0.063 -168 L 0.074 -169 G 0.089 -170 Q 0.102 -171 E 0.107 -172 Q 0.106 -173 D 0.103 -174 S 0.104 -175 Y 0.115 -176 G 0.134 -177 G 0.150 -178 N 0.153 -179 F 0.144 -180 D 0.131 -181 A 0.117 -182 K 0.104 -183 Q 0.093 -184 S 0.085 -185 F 0.083 -186 V 0.083 -187 G 0.079 -188 E 0.070 -189 I 0.057 -190 W 0.047 -191 D 0.042 -192 V 0.040 -193 S 0.039 -194 L 0.038 -195 W 0.036 -196 D 0.035 -197 H 0.038 -198 V 0.043 -199 V 0.046 -200 P 0.046 -201 L 0.049 -202 E 0.055 -203 K 0.065 -204 V 0.074 -205 S 0.079 -206 D 0.080 -207 S 0.080 -208 C 0.083 -209 N 0.088 -210 N 0.089 -211 G 0.084 -212 N 0.077 -213 L 0.070 -214 I 0.063 -215 N 0.054 -216 W 0.046 -217 Q 0.044 -218 A 0.047 -219 L 0.053 -220 N 0.059 -221 Y 0.068 -222 E 0.083 -223 D 0.099 -224 N 0.108 -225 G 0.104 -226 Y 0.092 -227 V 0.089 -228 V 0.100 -229 T 0.121 -230 K 0.147 -231 P 0.174 -232 K 0.201 -233 L 0.218 -234 W 0.223 -235 P 0.222 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026708.17_ENSMUST00000111618.8_GN:Cenpl_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026708.17_ENSMUST00000111618.8_GN:Cenpl_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 0d5a8a0309dcf9a8f3dab525ecf0eaa0ea4ce9c5..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026708.17_ENSMUST00000111618.8_GN:Cenpl_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,346 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000026708.17|ENSMUST00000111618.8|GN:Cenpl|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.466 -2 D 0.485 -3 S 0.509 -4 C 0.518 -5 D 0.501 -6 F 0.478 -7 R 0.487 -8 G 0.537 -9 L 0.584 -10 T 0.584 -11 S 0.547 -12 R 0.522 -13 R 0.543 -14 R 0.588 -15 T 0.619 -16 S 0.625 -17 N 0.611 -18 L 0.582 -19 K 0.554 -20 N 0.539 -21 Y 0.541 -22 F 0.556 -23 V 0.563 -24 G 0.532 -25 A 0.459 -26 T 0.368 -27 P 0.291 -28 L 0.241 -29 Q 0.210 -30 K 0.190 -31 R 0.180 -32 L 0.184 -33 E 0.201 -34 L 0.225 -35 V 0.250 -36 R 0.285 -37 R 0.341 -38 Q 0.411 -39 N 0.467 -40 S 0.494 -41 D 0.504 -42 F 0.515 -43 P 0.532 -44 S 0.554 -45 P 0.568 -46 S 0.571 -47 R 0.566 -48 R 0.560 -49 K 0.558 -50 I 0.562 -51 P 0.573 -52 Q 0.589 -53 C 0.591 -54 S 0.568 -55 Q 0.523 -56 L 0.468 -57 Q 0.404 -58 E 0.333 -59 D 0.261 -60 I 0.196 -61 D 0.144 -62 P 0.108 -63 Q 0.088 -64 K 0.076 -65 V 0.065 -66 A 0.057 -67 F 0.056 -68 L 0.060 -69 L 0.063 -70 H 0.061 -71 K 0.056 -72 Q 0.052 -73 W 0.050 -74 T 0.050 -75 I 0.049 -76 Y 0.048 -77 S 0.050 -78 L 0.053 -79 T 0.054 -80 P 0.051 -81 L 0.045 -82 Y 0.041 -83 K 0.038 -84 F 0.037 -85 S 0.038 -86 Y 0.038 -87 S 0.041 -88 N 0.044 -89 L 0.046 -90 K 0.045 -91 D 0.041 -92 Y 0.037 -93 S 0.034 -94 R 0.031 -95 L 0.029 -96 L 0.027 -97 S 0.026 -98 A 0.027 -99 F 0.030 -100 I 0.036 -101 V 0.043 -102 A 0.053 -103 E 0.063 -104 K 0.074 -105 Q 0.088 -106 K 0.109 -107 G 0.132 -108 V 0.147 -109 A 0.148 -110 V 0.140 -111 E 0.129 -112 V 0.121 -113 G 0.113 -114 E 0.101 -115 D 0.085 -116 F 0.067 -117 N 0.051 -118 I 0.039 -119 K 0.033 -120 V 0.031 -121 I 0.029 -122 F 0.029 -123 S 0.033 -124 T 0.042 -125 L 0.055 -126 L 0.068 -127 G 0.080 -128 V 0.087 -129 K 0.090 -130 G 0.089 -131 T 0.084 -132 Q 0.078 -133 R 0.074 -134 D 0.068 -135 H 0.060 -136 E 0.052 -137 A 0.046 -138 F 0.042 -139 L 0.041 -140 V 0.041 -141 Q 0.043 -142 I 0.047 -143 L 0.057 -144 S 0.071 -145 K 0.091 -146 S 0.114 -147 Q 0.142 -148 S 0.169 -149 S 0.184 -150 R 0.186 -151 E 0.181 -152 H 0.172 -153 R 0.155 -154 E 0.136 -155 D 0.116 -156 K 0.096 -157 V 0.076 -158 L 0.059 -159 W 0.048 -160 T 0.044 -161 G 0.039 -162 W 0.033 -163 F 0.028 -164 C 0.028 -165 C 0.034 -166 V 0.046 -167 F 0.064 -168 G 0.081 -169 E 0.096 -170 S 0.108 -171 L 0.120 -172 Q 0.130 -173 E 0.137 -174 T 0.139 -175 V 0.135 -176 S 0.126 -177 E 0.115 -178 D 0.104 -179 F 0.094 -180 T 0.089 -181 C 0.091 -182 L 0.090 -183 P 0.083 -184 L 0.076 -185 F 0.078 -186 L 0.092 -187 A 0.115 -188 N 0.145 -189 G 0.173 -190 A 0.189 -191 E 0.190 -192 S 0.179 -193 N 0.160 -194 T 0.132 -195 S 0.100 -196 L 0.077 -197 I 0.067 -198 R 0.070 -199 D 0.073 -200 W 0.065 -201 F 0.052 -202 Q 0.045 -203 K 0.046 -204 T 0.045 -205 F 0.041 -206 D 0.039 -207 C 0.042 -208 C 0.048 -209 F 0.052 -210 S 0.053 -211 P 0.054 -212 L 0.054 -213 A 0.052 -214 I 0.052 -215 S 0.057 -216 A 0.065 -217 F 0.068 -218 N 0.064 -219 L 0.053 -220 S 0.041 -221 W 0.031 -222 M 0.025 -223 A 0.023 -224 A 0.023 -225 M 0.023 -226 W 0.025 -227 T 0.029 -228 A 0.037 -229 C 0.045 -230 K 0.053 -231 M 0.061 -232 D 0.069 -233 R 0.076 -234 Y 0.085 -235 M 0.096 -236 A 0.110 -237 T 0.116 -238 T 0.109 -239 E 0.096 -240 F 0.087 -241 L 0.082 -242 W 0.084 -243 S 0.094 -244 V 0.110 -245 P 0.124 -246 C 0.131 -247 S 0.136 -248 P 0.138 -249 Q 0.140 -250 S 0.142 -251 L 0.143 -252 D 0.139 -253 I 0.129 -254 S 0.116 -255 Y 0.100 -256 A 0.082 -257 I 0.068 -258 H 0.059 -259 P 0.054 -260 E 0.050 -261 D 0.047 -262 A 0.045 -263 K 0.045 -264 A 0.047 -265 L 0.049 -266 W 0.052 -267 E 0.056 -268 S 0.064 -269 V 0.079 -270 H 0.097 -271 K 0.114 -272 T 0.129 -273 P 0.142 -274 G 0.149 -275 E 0.140 -276 V 0.119 -277 T 0.092 -278 Q 0.071 -279 E 0.059 -280 E 0.053 -281 V 0.049 -282 D 0.044 -283 L 0.040 -284 F 0.038 -285 M 0.036 -286 N 0.034 -287 C 0.034 -288 L 0.034 -289 Y 0.035 -290 S 0.038 -291 H 0.038 -292 F 0.037 -293 H 0.036 -294 R 0.038 -295 H 0.042 -296 F 0.048 -297 K 0.055 -298 I 0.062 -299 H 0.067 -300 L 0.072 -301 A 0.081 -302 A 0.093 -303 T 0.108 -304 R 0.126 -305 L 0.148 -306 V 0.169 -307 R 0.183 -308 V 0.191 -309 S 0.204 -310 T 0.224 -311 S 0.248 -312 V 0.266 -313 A 0.273 -314 S 0.268 -315 A 0.259 -316 H 0.254 -317 T 0.254 -318 D 0.255 -319 G 0.248 -320 K 0.233 -321 I 0.210 -322 K 0.186 -323 I 0.165 -324 L 0.148 -325 C 0.133 -326 H 0.116 -327 K 0.104 -328 Y 0.101 -329 L 0.105 -330 I 0.107 -331 G 0.104 -332 V 0.100 -333 L 0.096 -334 A 0.096 -335 Y 0.106 -336 M 0.124 -337 T 0.142 -338 E 0.158 -339 L 0.178 -340 A 0.205 -341 I 0.234 -342 F 0.257 -343 Q 0.273 -344 I 0.280 -345 E 0.281 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026708.17_ENSMUST00000111618.8_GN:Cenpl_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:39.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026708.17_ENSMUST00000111618.8_GN:Cenpl_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:39.caid deleted file mode 100644 index 015e4a0edec2bd16c810fac544d7c60d0633c66d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026708.17_ENSMUST00000111618.8_GN:Cenpl_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:39.caid +++ /dev/null @@ -1,385 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000026708.17|ENSMUST00000111618.8|GN:Cenpl|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:39 -1 M 0.391 -2 T 0.422 -3 V 0.469 -4 S 0.509 -5 L 0.519 -6 R 0.495 -7 H 0.473 -8 S 0.491 -9 F 0.534 -10 G 0.560 -11 D 0.555 -12 L 0.531 -13 P 0.492 -14 S 0.443 -15 I 0.405 -16 E 0.394 -17 N 0.389 -18 V 0.364 -19 V 0.335 -20 T 0.336 -21 T 0.356 -22 L 0.361 -23 L 0.356 -24 W 0.371 -25 H 0.417 -26 T 0.482 -27 T 0.555 -28 P 0.630 -29 V 0.692 -30 E 0.730 -31 E 0.746 -32 E 0.744 -33 I 0.724 -34 A 0.691 -35 T 0.669 -36 P 0.678 -37 P 0.716 -38 E 0.758 -39 T 0.784 -40 M 0.792 -41 D 0.787 -42 S 0.772 -43 C 0.750 -44 D 0.731 -45 F 0.728 -46 R 0.739 -47 G 0.749 -48 L 0.739 -49 T 0.698 -50 S 0.636 -51 R 0.603 -52 R 0.628 -53 R 0.678 -54 T 0.709 -55 S 0.717 -56 N 0.716 -57 L 0.711 -58 K 0.701 -59 N 0.692 -60 Y 0.689 -61 F 0.694 -62 V 0.690 -63 G 0.653 -64 A 0.579 -65 T 0.490 -66 P 0.410 -67 L 0.350 -68 Q 0.304 -69 K 0.272 -70 R 0.264 -71 L 0.284 -72 E 0.325 -73 L 0.367 -74 V 0.399 -75 R 0.432 -76 R 0.484 -77 Q 0.548 -78 N 0.593 -79 S 0.604 -80 D 0.595 -81 F 0.590 -82 P 0.599 -83 S 0.621 -84 P 0.642 -85 S 0.653 -86 R 0.651 -87 R 0.641 -88 K 0.632 -89 I 0.630 -90 P 0.638 -91 Q 0.648 -92 C 0.644 -93 S 0.618 -94 Q 0.573 -95 L 0.514 -96 Q 0.443 -97 E 0.361 -98 D 0.279 -99 I 0.205 -100 D 0.145 -101 P 0.103 -102 Q 0.078 -103 K 0.066 -104 V 0.058 -105 A 0.053 -106 F 0.052 -107 L 0.054 -108 L 0.054 -109 H 0.050 -110 K 0.045 -111 Q 0.041 -112 W 0.041 -113 T 0.043 -114 I 0.043 -115 Y 0.042 -116 S 0.045 -117 L 0.050 -118 T 0.052 -119 P 0.051 -120 L 0.046 -121 Y 0.042 -122 K 0.040 -123 F 0.040 -124 S 0.041 -125 Y 0.042 -126 S 0.043 -127 N 0.046 -128 L 0.047 -129 K 0.045 -130 D 0.040 -131 Y 0.034 -132 S 0.031 -133 R 0.028 -134 L 0.026 -135 L 0.024 -136 S 0.023 -137 A 0.023 -138 F 0.027 -139 I 0.032 -140 V 0.040 -141 A 0.049 -142 E 0.060 -143 K 0.071 -144 Q 0.087 -145 K 0.111 -146 G 0.137 -147 V 0.156 -148 A 0.159 -149 V 0.150 -150 E 0.138 -151 V 0.129 -152 G 0.120 -153 E 0.108 -154 D 0.090 -155 F 0.071 -156 N 0.054 -157 I 0.040 -158 K 0.034 -159 V 0.031 -160 I 0.029 -161 F 0.029 -162 S 0.033 -163 T 0.043 -164 L 0.056 -165 L 0.070 -166 G 0.081 -167 V 0.087 -168 K 0.089 -169 G 0.087 -170 T 0.081 -171 Q 0.073 -172 R 0.068 -173 D 0.062 -174 H 0.054 -175 E 0.047 -176 A 0.042 -177 F 0.039 -178 L 0.039 -179 V 0.040 -180 Q 0.043 -181 I 0.048 -182 L 0.057 -183 S 0.072 -184 K 0.089 -185 S 0.108 -186 Q 0.131 -187 S 0.153 -188 S 0.166 -189 R 0.167 -190 E 0.162 -191 H 0.152 -192 R 0.136 -193 E 0.118 -194 D 0.101 -195 K 0.084 -196 V 0.068 -197 L 0.053 -198 W 0.043 -199 T 0.039 -200 G 0.035 -201 W 0.029 -202 F 0.024 -203 C 0.023 -204 C 0.028 -205 V 0.039 -206 F 0.055 -207 G 0.072 -208 E 0.087 -209 S 0.099 -210 L 0.109 -211 Q 0.117 -212 E 0.124 -213 T 0.127 -214 V 0.125 -215 S 0.119 -216 E 0.111 -217 D 0.099 -218 F 0.087 -219 T 0.081 -220 C 0.081 -221 L 0.080 -222 P 0.073 -223 L 0.066 -224 F 0.068 -225 L 0.081 -226 A 0.104 -227 N 0.133 -228 G 0.161 -229 A 0.176 -230 E 0.177 -231 S 0.168 -232 N 0.152 -233 T 0.126 -234 S 0.096 -235 L 0.074 -236 I 0.066 -237 R 0.069 -238 D 0.071 -239 W 0.062 -240 F 0.049 -241 Q 0.042 -242 K 0.042 -243 T 0.041 -244 F 0.037 -245 D 0.036 -246 C 0.039 -247 C 0.044 -248 F 0.047 -249 S 0.049 -250 P 0.051 -251 L 0.050 -252 A 0.047 -253 I 0.046 -254 S 0.049 -255 A 0.055 -256 F 0.058 -257 N 0.055 -258 L 0.047 -259 S 0.036 -260 W 0.027 -261 M 0.021 -262 A 0.019 -263 A 0.019 -264 M 0.019 -265 W 0.021 -266 T 0.025 -267 A 0.033 -268 C 0.043 -269 K 0.053 -270 M 0.062 -271 D 0.071 -272 R 0.079 -273 Y 0.088 -274 M 0.102 -275 A 0.117 -276 T 0.124 -277 T 0.116 -278 E 0.101 -279 F 0.091 -280 L 0.087 -281 W 0.091 -282 S 0.107 -283 V 0.129 -284 P 0.144 -285 C 0.152 -286 S 0.155 -287 P 0.156 -288 Q 0.156 -289 S 0.157 -290 L 0.157 -291 D 0.151 -292 I 0.141 -293 S 0.128 -294 Y 0.111 -295 A 0.094 -296 I 0.080 -297 H 0.071 -298 P 0.065 -299 E 0.061 -300 D 0.056 -301 A 0.052 -302 K 0.052 -303 A 0.054 -304 L 0.057 -305 W 0.061 -306 E 0.066 -307 S 0.077 -308 V 0.093 -309 H 0.113 -310 K 0.132 -311 T 0.148 -312 P 0.159 -313 G 0.160 -314 E 0.147 -315 V 0.123 -316 T 0.097 -317 Q 0.077 -318 E 0.065 -319 E 0.059 -320 V 0.054 -321 D 0.049 -322 L 0.045 -323 F 0.041 -324 M 0.038 -325 N 0.037 -326 C 0.037 -327 L 0.038 -328 Y 0.039 -329 S 0.041 -330 H 0.043 -331 F 0.041 -332 H 0.040 -333 R 0.043 -334 H 0.048 -335 F 0.054 -336 K 0.061 -337 I 0.068 -338 H 0.073 -339 L 0.080 -340 A 0.089 -341 A 0.102 -342 T 0.115 -343 R 0.131 -344 L 0.152 -345 V 0.174 -346 R 0.187 -347 V 0.190 -348 S 0.195 -349 T 0.209 -350 S 0.228 -351 V 0.242 -352 A 0.247 -353 S 0.242 -354 A 0.234 -355 H 0.231 -356 T 0.233 -357 D 0.234 -358 G 0.228 -359 K 0.214 -360 I 0.193 -361 K 0.168 -362 I 0.147 -363 L 0.129 -364 C 0.114 -365 H 0.098 -366 K 0.086 -367 Y 0.083 -368 L 0.087 -369 I 0.088 -370 G 0.085 -371 V 0.081 -372 L 0.078 -373 A 0.079 -374 Y 0.089 -375 M 0.105 -376 T 0.124 -377 E 0.141 -378 L 0.161 -379 A 0.186 -380 I 0.213 -381 F 0.235 -382 Q 0.251 -383 I 0.260 -384 E 0.262 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026895.8_ENSMUST00000070112.6_GN:Ndufa8_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026895.8_ENSMUST00000070112.6_GN:Ndufa8_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 921d63f24e35b1e4f706c6039b846555e3363de4..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026895.8_ENSMUST00000070112.6_GN:Ndufa8_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,173 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000026895.8|ENSMUST00000070112.6|GN:Ndufa8|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.437 -2 P 0.455 -3 G 0.482 -4 I 0.504 -5 V 0.510 -6 E 0.501 -7 L 0.479 -8 P 0.431 -9 T 0.361 -10 L 0.295 -11 E 0.251 -12 E 0.226 -13 L 0.217 -14 K 0.222 -15 V 0.236 -16 E 0.248 -17 E 0.252 -18 V 0.258 -19 K 0.282 -20 V 0.321 -21 S 0.345 -22 S 0.323 -23 A 0.259 -24 V 0.187 -25 L 0.139 -26 K 0.119 -27 A 0.116 -28 A 0.118 -29 A 0.113 -30 H 0.100 -31 H 0.089 -32 Y 0.085 -33 G 0.085 -34 A 0.081 -35 Q 0.071 -36 C 0.064 -37 D 0.064 -38 K 0.071 -39 T 0.086 -40 N 0.108 -41 K 0.122 -42 E 0.119 -43 F 0.101 -44 M 0.083 -45 L 0.069 -46 C 0.060 -47 R 0.058 -48 W 0.062 -49 E 0.071 -50 E 0.083 -51 K 0.101 -52 D 0.120 -53 P 0.130 -54 R 0.123 -55 R 0.105 -56 C 0.092 -57 L 0.090 -58 K 0.099 -59 E 0.111 -60 G 0.122 -61 K 0.129 -62 L 0.130 -63 V 0.129 -64 N 0.124 -65 G 0.109 -66 C 0.087 -67 A 0.072 -68 L 0.071 -69 N 0.074 -70 F 0.074 -71 F 0.071 -72 R 0.069 -73 Q 0.070 -74 I 0.071 -75 K 0.069 -76 S 0.061 -77 H 0.052 -78 C 0.047 -79 A 0.047 -80 E 0.047 -81 P 0.051 -82 F 0.059 -83 T 0.068 -84 E 0.068 -85 Y 0.062 -86 W 0.054 -87 T 0.052 -88 C 0.055 -89 L 0.064 -90 D 0.075 -91 Y 0.085 -92 S 0.090 -93 N 0.088 -94 M 0.082 -95 Q 0.080 -96 L 0.084 -97 F 0.087 -98 R 0.084 -99 H 0.074 -100 C 0.063 -101 R 0.059 -102 Q 0.061 -103 Q 0.066 -104 Q 0.074 -105 A 0.079 -106 K 0.077 -107 F 0.071 -108 D 0.066 -109 Q 0.059 -110 C 0.050 -111 V 0.045 -112 L 0.047 -113 D 0.055 -114 K 0.068 -115 L 0.086 -116 G 0.108 -117 W 0.134 -118 V 0.163 -119 R 0.199 -120 P 0.243 -121 D 0.288 -122 L 0.323 -123 G 0.348 -124 Q 0.369 -125 L 0.382 -126 S 0.381 -127 K 0.369 -128 V 0.355 -129 T 0.345 -130 K 0.339 -131 V 0.334 -132 K 0.328 -133 T 0.333 -134 D 0.356 -135 R 0.394 -136 P 0.434 -137 L 0.470 -138 P 0.497 -139 E 0.509 -140 N 0.497 -141 P 0.468 -142 Y 0.451 -143 H 0.462 -144 S 0.493 -145 R 0.526 -146 A 0.547 -147 R 0.554 -148 P 0.556 -149 E 0.570 -150 P 0.600 -151 N 0.636 -152 P 0.664 -153 V 0.674 -154 I 0.675 -155 E 0.679 -156 G 0.692 -157 D 0.705 -158 L 0.710 -159 K 0.710 -160 P 0.710 -161 A 0.708 -162 K 0.706 -163 H 0.707 -164 G 0.696 -165 T 0.645 -166 R 0.555 -167 F 0.463 -168 F 0.406 -169 F 0.394 -170 W 0.407 -171 T 0.420 -172 V 0.424 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026895.8_ENSMUST00000070112.6_GN:Ndufa8_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:34.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026895.8_ENSMUST00000070112.6_GN:Ndufa8_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:34.caid deleted file mode 100644 index d4e1a79cb262b339e9b99094d5807ff9a14793e9..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000026895.8_ENSMUST00000070112.6_GN:Ndufa8_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:34.caid +++ /dev/null @@ -1,207 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000026895.8|ENSMUST00000070112.6|GN:Ndufa8|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:34 -1 M 0.249 -2 R 0.250 -3 R 0.251 -4 W 0.245 -5 Y 0.227 -6 R 0.207 -7 A 0.200 -8 V 0.211 -9 L 0.239 -10 A 0.292 -11 S 0.371 -12 Q 0.461 -13 R 0.545 -14 G 0.612 -15 L 0.655 -16 E 0.677 -17 G 0.686 -18 D 0.685 -19 G 0.677 -20 R 0.669 -21 H 0.669 -22 G 0.674 -23 R 0.680 -24 G 0.679 -25 H 0.669 -26 L 0.653 -27 V 0.637 -28 R 0.631 -29 V 0.643 -30 A 0.665 -31 A 0.681 -32 T 0.686 -33 A 0.678 -34 V 0.661 -35 M 0.654 -36 P 0.666 -37 G 0.684 -38 I 0.685 -39 V 0.666 -40 E 0.637 -41 L 0.597 -42 P 0.531 -43 T 0.442 -44 L 0.353 -45 E 0.286 -46 E 0.243 -47 L 0.222 -48 K 0.220 -49 V 0.227 -50 E 0.234 -51 E 0.241 -52 V 0.255 -53 K 0.289 -54 V 0.337 -55 S 0.367 -56 S 0.347 -57 A 0.279 -58 V 0.201 -59 L 0.147 -60 K 0.124 -61 A 0.122 -62 A 0.124 -63 A 0.118 -64 H 0.105 -65 H 0.093 -66 Y 0.088 -67 G 0.087 -68 A 0.082 -69 Q 0.072 -70 C 0.064 -71 D 0.064 -72 K 0.070 -73 T 0.085 -74 N 0.106 -75 K 0.119 -76 E 0.115 -77 F 0.099 -78 M 0.081 -79 L 0.067 -80 C 0.057 -81 R 0.054 -82 W 0.057 -83 E 0.063 -84 E 0.073 -85 K 0.088 -86 D 0.106 -87 P 0.116 -88 R 0.112 -89 R 0.097 -90 C 0.084 -91 L 0.083 -92 K 0.091 -93 E 0.103 -94 G 0.114 -95 K 0.120 -96 L 0.122 -97 V 0.122 -98 N 0.119 -99 G 0.104 -100 C 0.083 -101 A 0.069 -102 L 0.067 -103 N 0.070 -104 F 0.070 -105 F 0.067 -106 R 0.066 -107 Q 0.067 -108 I 0.069 -109 K 0.066 -110 S 0.059 -111 H 0.051 -112 C 0.046 -113 A 0.046 -114 E 0.046 -115 P 0.049 -116 F 0.056 -117 T 0.064 -118 E 0.064 -119 Y 0.057 -120 W 0.050 -121 T 0.048 -122 C 0.052 -123 L 0.061 -124 D 0.072 -125 Y 0.082 -126 S 0.087 -127 N 0.087 -128 M 0.084 -129 Q 0.084 -130 L 0.090 -131 F 0.095 -132 R 0.092 -133 H 0.080 -134 C 0.068 -135 R 0.062 -136 Q 0.064 -137 Q 0.069 -138 Q 0.077 -139 A 0.082 -140 K 0.081 -141 F 0.074 -142 D 0.068 -143 Q 0.061 -144 C 0.052 -145 V 0.046 -146 L 0.049 -147 D 0.058 -148 K 0.071 -149 L 0.090 -150 G 0.114 -151 W 0.142 -152 V 0.173 -153 R 0.211 -154 P 0.259 -155 D 0.307 -156 L 0.345 -157 G 0.372 -158 Q 0.392 -159 L 0.404 -160 S 0.402 -161 K 0.391 -162 V 0.377 -163 T 0.364 -164 K 0.356 -165 V 0.350 -166 K 0.344 -167 T 0.348 -168 D 0.372 -169 R 0.408 -170 P 0.446 -171 L 0.482 -172 P 0.509 -173 E 0.521 -174 N 0.509 -175 P 0.479 -176 Y 0.459 -177 H 0.467 -178 S 0.498 -179 R 0.531 -180 A 0.551 -181 R 0.556 -182 P 0.556 -183 E 0.567 -184 P 0.596 -185 N 0.632 -186 P 0.661 -187 V 0.672 -188 I 0.675 -189 E 0.681 -190 G 0.695 -191 D 0.707 -192 L 0.709 -193 K 0.710 -194 P 0.712 -195 A 0.715 -196 K 0.718 -197 H 0.721 -198 G 0.712 -199 T 0.664 -200 R 0.579 -201 F 0.490 -202 F 0.435 -203 F 0.424 -204 W 0.437 -205 T 0.445 -206 V 0.444 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000027347.20_ENSMUST00000102534.11_GN:Rasgrp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000027347.20_ENSMUST00000102534.11_GN:Rasgrp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 2b6166856ff3bad2e8929bfd608739eaaa07730f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000027347.20_ENSMUST00000102534.11_GN:Rasgrp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,796 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000027347.20|ENSMUST00000102534.11|GN:Rasgrp1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.367 -2 G 0.392 -3 T 0.426 -4 L 0.448 -5 G 0.446 -6 K 0.434 -7 A 0.424 -8 R 0.409 -9 E 0.396 -10 A 0.404 -11 P 0.418 -12 R 0.423 -13 K 0.440 -14 P 0.489 -15 C 0.545 -16 H 0.583 -17 G 0.599 -18 S 0.584 -19 R 0.541 -20 A 0.512 -21 G 0.523 -22 P 0.539 -23 K 0.524 -24 A 0.505 -25 R 0.531 -26 L 0.589 -27 E 0.630 -28 A 0.634 -29 K 0.617 -30 S 0.597 -31 T 0.581 -32 N 0.568 -33 S 0.564 -34 P 0.568 -35 L 0.579 -36 P 0.587 -37 A 0.585 -38 Q 0.565 -39 P 0.520 -40 S 0.455 -41 L 0.390 -42 A 0.345 -43 Q 0.318 -44 I 0.295 -45 T 0.275 -46 Q 0.269 -47 F 0.277 -48 R 0.288 -49 M 0.293 -50 M 0.292 -51 V 0.289 -52 S 0.288 -53 L 0.292 -54 G 0.305 -55 H 0.325 -56 L 0.341 -57 A 0.328 -58 K 0.276 -59 G 0.207 -60 A 0.148 -61 S 0.107 -62 L 0.079 -63 D 0.063 -64 D 0.054 -65 L 0.047 -66 I 0.043 -67 D 0.042 -68 S 0.043 -69 C 0.045 -70 I 0.049 -71 Q 0.058 -72 S 0.075 -73 F 0.099 -74 D 0.121 -75 A 0.134 -76 D 0.135 -77 G 0.129 -78 N 0.122 -79 L 0.119 -80 C 0.118 -81 R 0.113 -82 N 0.099 -83 N 0.078 -84 Q 0.058 -85 L 0.042 -86 L 0.033 -87 Q 0.033 -88 V 0.037 -89 M 0.037 -90 L 0.030 -91 T 0.023 -92 M 0.019 -93 H 0.019 -94 R 0.020 -95 I 0.022 -96 I 0.025 -97 I 0.031 -98 S 0.039 -99 S 0.047 -100 A 0.049 -101 E 0.045 -102 L 0.040 -103 L 0.038 -104 Q 0.036 -105 K 0.034 -106 V 0.037 -107 M 0.045 -108 N 0.051 -109 L 0.047 -110 Y 0.039 -111 K 0.036 -112 D 0.038 -113 A 0.046 -114 L 0.055 -115 E 0.065 -116 K 0.077 -117 N 0.088 -118 S 0.090 -119 P 0.079 -120 G 0.063 -121 V 0.051 -122 C 0.042 -123 L 0.034 -124 K 0.029 -125 I 0.029 -126 C 0.029 -127 Y 0.026 -128 F 0.024 -129 V 0.023 -130 R 0.023 -131 Y 0.023 -132 W 0.024 -133 I 0.026 -134 T 0.026 -135 E 0.024 -136 F 0.021 -137 W 0.020 -138 I 0.023 -139 M 0.028 -140 F 0.033 -141 K 0.040 -142 M 0.048 -143 D 0.053 -144 A 0.054 -145 S 0.053 -146 L 0.056 -147 T 0.065 -148 S 0.071 -149 T 0.069 -150 M 0.060 -151 E 0.052 -152 E 0.047 -153 F 0.048 -154 Q 0.056 -155 D 0.063 -156 L 0.061 -157 V 0.059 -158 K 0.064 -159 A 0.075 -160 N 0.086 -161 G 0.092 -162 E 0.092 -163 E 0.089 -164 T 0.084 -165 H 0.081 -166 C 0.078 -167 H 0.078 -168 L 0.084 -169 I 0.096 -170 D 0.110 -171 T 0.125 -172 T 0.139 -173 Q 0.153 -174 I 0.171 -175 N 0.191 -176 S 0.207 -177 R 0.208 -178 D 0.196 -179 W 0.184 -180 S 0.183 -181 R 0.194 -182 K 0.210 -183 L 0.227 -184 T 0.245 -185 Q 0.269 -186 R 0.295 -187 I 0.317 -188 K 0.331 -189 S 0.342 -190 N 0.349 -191 T 0.347 -192 S 0.334 -193 K 0.312 -194 K 0.282 -195 R 0.251 -196 K 0.223 -197 V 0.192 -198 S 0.152 -199 L 0.109 -200 L 0.077 -201 F 0.062 -202 D 0.060 -203 H 0.063 -204 L 0.063 -205 E 0.059 -206 P 0.054 -207 E 0.052 -208 E 0.052 -209 L 0.049 -210 S 0.045 -211 E 0.042 -212 H 0.040 -213 L 0.037 -214 T 0.037 -215 Y 0.040 -216 L 0.049 -217 E 0.058 -218 F 0.065 -219 K 0.067 -220 S 0.067 -221 F 0.069 -222 R 0.075 -223 R 0.081 -224 I 0.081 -225 S 0.072 -226 F 0.059 -227 S 0.048 -228 D 0.040 -229 Y 0.035 -230 Q 0.036 -231 N 0.039 -232 Y 0.047 -233 L 0.058 -234 V 0.066 -235 N 0.071 -236 S 0.076 -237 C 0.079 -238 V 0.082 -239 K 0.090 -240 E 0.103 -241 N 0.108 -242 P 0.102 -243 T 0.094 -244 M 0.090 -245 E 0.090 -246 R 0.095 -247 S 0.100 -248 I 0.101 -249 A 0.101 -250 L 0.100 -251 C 0.100 -252 N 0.101 -253 G 0.099 -254 I 0.090 -255 S 0.079 -256 Q 0.072 -257 W 0.066 -258 V 0.060 -259 Q 0.057 -260 L 0.058 -261 M 0.062 -262 V 0.065 -263 L 0.069 -264 S 0.078 -265 R 0.087 -266 P 0.092 -267 T 0.092 -268 P 0.087 -269 Q 0.079 -270 L 0.069 -271 R 0.062 -272 A 0.059 -273 E 0.058 -274 V 0.057 -275 F 0.053 -276 I 0.047 -277 K 0.041 -278 F 0.038 -279 I 0.038 -280 H 0.042 -281 V 0.048 -282 A 0.054 -283 Q 0.058 -284 K 0.064 -285 L 0.076 -286 H 0.095 -287 Q 0.117 -288 L 0.130 -289 Q 0.126 -290 N 0.111 -291 F 0.094 -292 N 0.081 -293 T 0.072 -294 L 0.062 -295 M 0.051 -296 A 0.039 -297 V 0.032 -298 I 0.034 -299 G 0.043 -300 G 0.056 -301 L 0.071 -302 C 0.084 -303 H 0.091 -304 S 0.091 -305 S 0.084 -306 I 0.076 -307 S 0.071 -308 R 0.073 -309 L 0.077 -310 K 0.081 -311 E 0.085 -312 T 0.089 -313 S 0.091 -314 S 0.091 -315 H 0.091 -316 V 0.089 -317 P 0.079 -318 H 0.067 -319 E 0.060 -320 I 0.062 -321 N 0.071 -322 K 0.080 -323 V 0.081 -324 L 0.080 -325 G 0.078 -326 E 0.074 -327 M 0.071 -328 T 0.072 -329 E 0.077 -330 L 0.086 -331 L 0.103 -332 S 0.127 -333 S 0.150 -334 C 0.158 -335 R 0.148 -336 N 0.130 -337 Y 0.112 -338 D 0.098 -339 N 0.090 -340 Y 0.089 -341 R 0.093 -342 R 0.102 -343 A 0.110 -344 Y 0.116 -345 G 0.120 -346 E 0.121 -347 C 0.120 -348 T 0.116 -349 H 0.113 -350 F 0.111 -351 K 0.106 -352 I 0.097 -353 P 0.086 -354 I 0.074 -355 L 0.065 -356 G 0.065 -357 V 0.068 -358 H 0.072 -359 L 0.080 -360 K 0.094 -361 D 0.107 -362 L 0.112 -363 I 0.115 -364 S 0.123 -365 L 0.133 -366 Y 0.141 -367 E 0.148 -368 A 0.158 -369 M 0.170 -370 P 0.182 -371 D 0.187 -372 Y 0.179 -373 L 0.163 -374 E 0.152 -375 D 0.159 -376 G 0.171 -377 K 0.173 -378 V 0.159 -379 N 0.136 -380 V 0.117 -381 Q 0.110 -382 K 0.110 -383 L 0.110 -384 L 0.110 -385 A 0.115 -386 L 0.119 -387 Y 0.122 -388 N 0.126 -389 H 0.130 -390 I 0.127 -391 N 0.122 -392 E 0.121 -393 L 0.125 -394 V 0.128 -395 Q 0.126 -396 L 0.122 -397 Q 0.118 -398 E 0.121 -399 M 0.129 -400 A 0.138 -401 P 0.147 -402 P 0.155 -403 L 0.158 -404 D 0.150 -405 A 0.132 -406 N 0.110 -407 K 0.088 -408 D 0.070 -409 L 0.058 -410 V 0.051 -411 H 0.052 -412 L 0.056 -413 L 0.060 -414 T 0.062 -415 L 0.065 -416 S 0.066 -417 L 0.065 -418 D 0.063 -419 L 0.064 -420 Y 0.068 -421 Y 0.079 -422 T 0.096 -423 E 0.114 -424 D 0.125 -425 E 0.124 -426 I 0.120 -427 Y 0.118 -428 E 0.119 -429 L 0.121 -430 S 0.123 -431 Y 0.128 -432 A 0.132 -433 R 0.133 -434 E 0.142 -435 P 0.173 -436 R 0.226 -437 N 0.284 -438 H 0.339 -439 R 0.389 -440 A 0.438 -441 P 0.486 -442 P 0.521 -443 L 0.531 -444 T 0.519 -445 P 0.495 -446 S 0.466 -447 K 0.437 -448 P 0.414 -449 P 0.399 -450 V 0.384 -451 V 0.362 -452 V 0.337 -453 D 0.312 -454 W 0.288 -455 A 0.273 -456 S 0.274 -457 G 0.285 -458 V 0.291 -459 S 0.291 -460 P 0.286 -461 K 0.267 -462 P 0.232 -463 D 0.194 -464 P 0.167 -465 K 0.155 -466 T 0.151 -467 I 0.152 -468 S 0.150 -469 K 0.137 -470 H 0.112 -471 V 0.085 -472 Q 0.066 -473 R 0.056 -474 M 0.050 -475 V 0.045 -476 D 0.042 -477 S 0.046 -478 V 0.051 -479 F 0.055 -480 K 0.058 -481 N 0.063 -482 Y 0.076 -483 D 0.100 -484 L 0.128 -485 D 0.144 -486 Q 0.142 -487 D 0.131 -488 G 0.121 -489 Y 0.111 -490 I 0.095 -491 S 0.078 -492 Q 0.068 -493 E 0.067 -494 E 0.070 -495 F 0.073 -496 E 0.076 -497 K 0.080 -498 I 0.090 -499 A 0.108 -500 A 0.127 -501 S 0.136 -502 F 0.130 -503 P 0.117 -504 F 0.110 -505 S 0.116 -506 F 0.128 -507 C 0.135 -508 V 0.137 -509 M 0.139 -510 D 0.146 -511 K 0.153 -512 D 0.155 -513 R 0.153 -514 E 0.146 -515 G 0.137 -516 L 0.123 -517 I 0.102 -518 S 0.081 -519 R 0.068 -520 D 0.065 -521 E 0.064 -522 I 0.061 -523 T 0.055 -524 A 0.052 -525 Y 0.049 -526 F 0.045 -527 M 0.047 -528 R 0.061 -529 A 0.087 -530 S 0.119 -531 S 0.154 -532 I 0.186 -533 Y 0.215 -534 S 0.252 -535 K 0.299 -536 L 0.351 -537 G 0.396 -538 L 0.412 -539 G 0.385 -540 F 0.325 -541 P 0.258 -542 H 0.206 -543 N 0.179 -544 F 0.171 -545 Q 0.171 -546 E 0.173 -547 T 0.173 -548 T 0.172 -549 Y 0.171 -550 L 0.171 -551 K 0.170 -552 P 0.168 -553 T 0.163 -554 F 0.146 -555 C 0.122 -556 D 0.109 -557 N 0.120 -558 C 0.154 -559 A 0.194 -560 G 0.224 -561 F 0.233 -562 L 0.225 -563 W 0.208 -564 G 0.191 -565 V 0.180 -566 I 0.180 -567 K 0.187 -568 Q 0.190 -569 G 0.179 -570 Y 0.161 -571 R 0.145 -572 C 0.137 -573 K 0.135 -574 D 0.141 -575 C 0.151 -576 G 0.155 -577 M 0.147 -578 N 0.131 -579 C 0.112 -580 H 0.095 -581 K 0.087 -582 Q 0.093 -583 C 0.108 -584 K 0.122 -585 D 0.130 -586 L 0.131 -587 V 0.128 -588 V 0.123 -589 F 0.119 -590 E 0.119 -591 C 0.125 -592 K 0.151 -593 K 0.213 -594 R 0.313 -595 I 0.429 -596 K 0.532 -597 S 0.608 -598 P 0.655 -599 A 0.679 -600 I 0.687 -601 S 0.687 -602 T 0.691 -603 E 0.697 -604 N 0.696 -605 I 0.683 -606 S 0.663 -607 S 0.645 -608 V 0.633 -609 V 0.630 -610 P 0.638 -611 M 0.654 -612 S 0.666 -613 T 0.664 -614 L 0.660 -615 C 0.671 -616 P 0.702 -617 L 0.739 -618 G 0.767 -619 T 0.779 -620 K 0.779 -621 D 0.771 -622 L 0.757 -623 L 0.737 -624 H 0.720 -625 A 0.716 -626 P 0.733 -627 E 0.765 -628 E 0.799 -629 G 0.821 -630 S 0.826 -631 F 0.817 -632 I 0.803 -633 F 0.797 -634 Q 0.802 -635 N 0.810 -636 G 0.808 -637 E 0.793 -638 I 0.777 -639 V 0.769 -640 D 0.764 -641 H 0.755 -642 S 0.749 -643 E 0.753 -644 E 0.764 -645 S 0.780 -646 K 0.796 -647 D 0.813 -648 R 0.829 -649 T 0.841 -650 I 0.844 -651 M 0.841 -652 L 0.834 -653 L 0.827 -654 G 0.819 -655 V 0.813 -656 S 0.807 -657 S 0.801 -658 Q 0.798 -659 K 0.800 -660 I 0.803 -661 S 0.804 -662 V 0.801 -663 R 0.795 -664 L 0.790 -665 K 0.788 -666 R 0.796 -667 T 0.810 -668 V 0.825 -669 A 0.837 -670 H 0.847 -671 K 0.853 -672 S 0.856 -673 T 0.856 -674 Q 0.855 -675 T 0.850 -676 E 0.841 -677 S 0.830 -678 F 0.823 -679 P 0.823 -680 W 0.828 -681 V 0.834 -682 G 0.834 -683 G 0.826 -684 E 0.813 -685 T 0.800 -686 T 0.798 -687 P 0.809 -688 G 0.826 -689 H 0.837 -690 F 0.840 -691 V 0.834 -692 L 0.822 -693 S 0.811 -694 S 0.808 -695 P 0.814 -696 R 0.825 -697 K 0.835 -698 S 0.843 -699 A 0.850 -700 Q 0.856 -701 G 0.862 -702 A 0.864 -703 L 0.860 -704 Y 0.851 -705 V 0.840 -706 H 0.827 -707 S 0.814 -708 P 0.805 -709 A 0.798 -710 S 0.791 -711 P 0.784 -712 C 0.782 -713 P 0.790 -714 S 0.803 -715 P 0.816 -716 A 0.824 -717 L 0.824 -718 V 0.816 -719 R 0.805 -720 K 0.798 -721 R 0.796 -722 A 0.796 -723 F 0.790 -724 V 0.776 -725 K 0.759 -726 W 0.747 -727 E 0.740 -728 N 0.736 -729 K 0.735 -730 E 0.735 -731 S 0.729 -732 L 0.714 -733 I 0.696 -734 K 0.689 -735 P 0.701 -736 K 0.730 -737 P 0.760 -738 E 0.777 -739 L 0.775 -740 H 0.761 -741 L 0.738 -742 R 0.696 -743 L 0.626 -744 R 0.544 -745 T 0.485 -746 Y 0.464 -747 Q 0.466 -748 E 0.461 -749 L 0.441 -750 E 0.414 -751 Q 0.383 -752 E 0.350 -753 I 0.317 -754 N 0.290 -755 T 0.278 -756 L 0.289 -757 K 0.317 -758 A 0.351 -759 D 0.382 -760 N 0.401 -761 D 0.401 -762 A 0.385 -763 L 0.362 -764 K 0.343 -765 I 0.329 -766 Q 0.315 -767 L 0.294 -768 K 0.268 -769 Y 0.246 -770 A 0.241 -771 Q 0.249 -772 K 0.262 -773 K 0.281 -774 I 0.311 -775 E 0.345 -776 S 0.371 -777 L 0.393 -778 Q 0.428 -779 L 0.484 -780 G 0.542 -781 K 0.584 -782 S 0.611 -783 N 0.634 -784 H 0.658 -785 V 0.677 -786 L 0.687 -787 A 0.690 -788 Q 0.690 -789 M 0.691 -790 D 0.695 -791 H 0.707 -792 G 0.724 -793 D 0.736 -794 S 0.734 -795 A 0.725 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000027347.20_ENSMUST00000102534.11_GN:Rasgrp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:82.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000027347.20_ENSMUST00000102534.11_GN:Rasgrp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:82.caid deleted file mode 100644 index 681ae0fd33b44b222762b1bed137f5d5cd9ae19c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000027347.20_ENSMUST00000102534.11_GN:Rasgrp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:82.caid +++ /dev/null @@ -1,878 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000027347.20|ENSMUST00000102534.11|GN:Rasgrp1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:82 -1 M 0.293 -2 I 0.296 -3 T 0.303 -4 S 0.315 -5 T 0.324 -6 P 0.315 -7 V 0.291 -8 R 0.264 -9 W 0.250 -10 L 0.257 -11 V 0.279 -12 R 0.302 -13 E 0.318 -14 S 0.333 -15 V 0.367 -16 C 0.430 -17 A 0.498 -18 R 0.551 -19 G 0.582 -20 S 0.592 -21 E 0.580 -22 R 0.559 -23 R 0.546 -24 E 0.544 -25 R 0.540 -26 A 0.531 -27 R 0.529 -28 T 0.542 -29 N 0.563 -30 F 0.583 -31 V 0.602 -32 P 0.624 -33 A 0.644 -34 G 0.661 -35 E 0.674 -36 P 0.685 -37 G 0.684 -38 S 0.652 -39 A 0.589 -40 R 0.538 -41 R 0.530 -42 A 0.537 -43 P 0.526 -44 R 0.517 -45 V 0.536 -46 V 0.554 -47 G 0.545 -48 S 0.528 -49 G 0.522 -50 L 0.519 -51 R 0.531 -52 G 0.572 -53 P 0.608 -54 A 0.604 -55 A 0.601 -56 A 0.644 -57 E 0.708 -58 G 0.747 -59 C 0.757 -60 A 0.760 -61 A 0.766 -62 P 0.773 -63 G 0.777 -64 R 0.773 -65 A 0.762 -66 D 0.753 -67 P 0.751 -68 T 0.759 -69 A 0.771 -70 L 0.780 -71 G 0.782 -72 E 0.776 -73 T 0.764 -74 A 0.756 -75 P 0.757 -76 G 0.762 -77 A 0.751 -78 Q 0.707 -79 R 0.641 -80 A 0.603 -81 A 0.627 -82 T 0.683 -83 M 0.727 -84 G 0.749 -85 T 0.758 -86 L 0.760 -87 G 0.762 -88 K 0.756 -89 A 0.737 -90 R 0.707 -91 E 0.686 -92 A 0.679 -93 P 0.680 -94 R 0.686 -95 K 0.698 -96 P 0.716 -97 C 0.731 -98 H 0.743 -99 G 0.751 -100 S 0.750 -101 R 0.739 -102 A 0.724 -103 G 0.707 -104 P 0.671 -105 K 0.615 -106 A 0.581 -107 R 0.605 -108 L 0.662 -109 E 0.702 -110 A 0.709 -111 K 0.696 -112 S 0.677 -113 T 0.658 -114 N 0.639 -115 S 0.624 -116 P 0.616 -117 L 0.617 -118 P 0.620 -119 A 0.617 -120 Q 0.595 -121 P 0.549 -122 S 0.483 -123 L 0.417 -124 A 0.369 -125 Q 0.337 -126 I 0.307 -127 T 0.281 -128 Q 0.270 -129 F 0.271 -130 R 0.271 -131 M 0.266 -132 M 0.260 -133 V 0.257 -134 S 0.258 -135 L 0.267 -136 G 0.284 -137 H 0.306 -138 L 0.322 -139 A 0.309 -140 K 0.260 -141 G 0.195 -142 A 0.140 -143 S 0.101 -144 L 0.075 -145 D 0.059 -146 D 0.050 -147 L 0.044 -148 I 0.038 -149 D 0.036 -150 S 0.037 -151 C 0.039 -152 I 0.043 -153 Q 0.053 -154 S 0.072 -155 F 0.096 -156 D 0.116 -157 A 0.127 -158 D 0.129 -159 G 0.128 -160 N 0.126 -161 L 0.123 -162 C 0.119 -163 R 0.112 -164 N 0.098 -165 N 0.079 -166 Q 0.060 -167 L 0.044 -168 L 0.034 -169 Q 0.033 -170 V 0.037 -171 M 0.037 -172 L 0.031 -173 T 0.023 -174 M 0.019 -175 H 0.019 -176 R 0.020 -177 I 0.023 -178 I 0.026 -179 I 0.031 -180 S 0.038 -181 S 0.043 -182 A 0.045 -183 E 0.041 -184 L 0.037 -185 L 0.035 -186 Q 0.033 -187 K 0.030 -188 V 0.027 -189 M 0.027 -190 N 0.028 -191 L 0.028 -192 Y 0.028 -193 K 0.030 -194 D 0.034 -195 A 0.040 -196 L 0.049 -197 E 0.060 -198 K 0.073 -199 N 0.085 -200 S 0.086 -201 P 0.074 -202 G 0.058 -203 V 0.045 -204 C 0.036 -205 L 0.030 -206 K 0.026 -207 I 0.025 -208 C 0.025 -209 Y 0.023 -210 F 0.021 -211 V 0.020 -212 R 0.020 -213 Y 0.020 -214 W 0.021 -215 I 0.023 -216 T 0.023 -217 E 0.021 -218 F 0.019 -219 W 0.019 -220 I 0.020 -221 M 0.024 -222 F 0.027 -223 K 0.033 -224 M 0.039 -225 D 0.043 -226 A 0.043 -227 S 0.041 -228 L 0.046 -229 T 0.056 -230 S 0.064 -231 T 0.061 -232 M 0.052 -233 E 0.044 -234 E 0.040 -235 F 0.043 -236 Q 0.052 -237 D 0.058 -238 L 0.055 -239 V 0.049 -240 K 0.050 -241 A 0.057 -242 N 0.065 -243 G 0.070 -244 E 0.069 -245 E 0.065 -246 T 0.062 -247 H 0.060 -248 C 0.060 -249 H 0.060 -250 L 0.064 -251 I 0.073 -252 D 0.084 -253 T 0.093 -254 T 0.103 -255 Q 0.114 -256 I 0.131 -257 N 0.151 -258 S 0.168 -259 R 0.173 -260 D 0.166 -261 W 0.159 -262 S 0.163 -263 R 0.178 -264 K 0.200 -265 L 0.223 -266 T 0.244 -267 Q 0.268 -268 R 0.293 -269 I 0.312 -270 K 0.322 -271 S 0.328 -272 N 0.332 -273 T 0.329 -274 S 0.313 -275 K 0.289 -276 K 0.260 -277 R 0.233 -278 K 0.210 -279 V 0.184 -280 S 0.148 -281 L 0.108 -282 L 0.079 -283 F 0.067 -284 D 0.066 -285 H 0.069 -286 L 0.067 -287 E 0.060 -288 P 0.054 -289 E 0.052 -290 E 0.051 -291 L 0.048 -292 S 0.044 -293 E 0.042 -294 H 0.040 -295 L 0.038 -296 T 0.038 -297 Y 0.042 -298 L 0.051 -299 E 0.061 -300 F 0.066 -301 K 0.068 -302 S 0.068 -303 F 0.071 -304 R 0.078 -305 R 0.084 -306 I 0.085 -307 S 0.076 -308 F 0.063 -309 S 0.052 -310 D 0.043 -311 Y 0.039 -312 Q 0.039 -313 N 0.042 -314 Y 0.050 -315 L 0.062 -316 V 0.072 -317 N 0.078 -318 S 0.085 -319 C 0.090 -320 V 0.093 -321 K 0.102 -322 E 0.115 -323 N 0.120 -324 P 0.114 -325 T 0.104 -326 M 0.097 -327 E 0.095 -328 R 0.098 -329 S 0.102 -330 I 0.102 -331 A 0.101 -332 L 0.099 -333 C 0.098 -334 N 0.099 -335 G 0.097 -336 I 0.088 -337 S 0.078 -338 Q 0.070 -339 W 0.064 -340 V 0.058 -341 Q 0.055 -342 L 0.058 -343 M 0.061 -344 V 0.065 -345 L 0.069 -346 S 0.079 -347 R 0.089 -348 P 0.096 -349 T 0.097 -350 P 0.093 -351 Q 0.084 -352 L 0.073 -353 R 0.065 -354 A 0.062 -355 E 0.061 -356 V 0.060 -357 F 0.056 -358 I 0.050 -359 K 0.044 -360 F 0.040 -361 I 0.041 -362 H 0.044 -363 V 0.051 -364 A 0.056 -365 Q 0.060 -366 K 0.067 -367 L 0.080 -368 H 0.100 -369 Q 0.122 -370 L 0.135 -371 Q 0.131 -372 N 0.115 -373 F 0.097 -374 N 0.084 -375 T 0.074 -376 L 0.064 -377 M 0.052 -378 A 0.040 -379 V 0.033 -380 I 0.035 -381 G 0.043 -382 G 0.055 -383 L 0.070 -384 C 0.083 -385 H 0.090 -386 S 0.090 -387 S 0.083 -388 I 0.075 -389 S 0.071 -390 R 0.073 -391 L 0.078 -392 K 0.082 -393 E 0.086 -394 T 0.089 -395 S 0.090 -396 S 0.089 -397 H 0.089 -398 V 0.086 -399 P 0.077 -400 H 0.066 -401 E 0.059 -402 I 0.062 -403 N 0.071 -404 K 0.079 -405 V 0.080 -406 L 0.079 -407 G 0.078 -408 E 0.075 -409 M 0.072 -410 T 0.072 -411 E 0.077 -412 L 0.086 -413 L 0.102 -414 S 0.127 -415 S 0.149 -416 C 0.157 -417 R 0.147 -418 N 0.128 -419 Y 0.110 -420 D 0.097 -421 N 0.089 -422 Y 0.089 -423 R 0.093 -424 R 0.102 -425 A 0.111 -426 Y 0.118 -427 G 0.122 -428 E 0.124 -429 C 0.123 -430 T 0.119 -431 H 0.116 -432 F 0.114 -433 K 0.109 -434 I 0.100 -435 P 0.088 -436 I 0.076 -437 L 0.067 -438 G 0.066 -439 V 0.070 -440 H 0.074 -441 L 0.083 -442 K 0.098 -443 D 0.111 -444 L 0.116 -445 I 0.119 -446 S 0.127 -447 L 0.138 -448 Y 0.147 -449 E 0.155 -450 A 0.165 -451 M 0.177 -452 P 0.188 -453 D 0.192 -454 Y 0.182 -455 L 0.163 -456 E 0.150 -457 D 0.156 -458 G 0.169 -459 K 0.173 -460 V 0.159 -461 N 0.137 -462 V 0.118 -463 Q 0.111 -464 K 0.112 -465 L 0.112 -466 L 0.113 -467 A 0.117 -468 L 0.120 -469 Y 0.119 -470 N 0.121 -471 H 0.127 -472 I 0.128 -473 N 0.125 -474 E 0.126 -475 L 0.130 -476 V 0.133 -477 Q 0.131 -478 L 0.127 -479 Q 0.123 -480 E 0.126 -481 M 0.133 -482 A 0.141 -483 P 0.148 -484 P 0.155 -485 L 0.158 -486 D 0.151 -487 A 0.135 -488 N 0.113 -489 K 0.092 -490 D 0.074 -491 L 0.060 -492 V 0.054 -493 H 0.055 -494 L 0.060 -495 L 0.064 -496 T 0.066 -497 L 0.068 -498 S 0.069 -499 L 0.067 -500 D 0.065 -501 L 0.064 -502 Y 0.068 -503 Y 0.078 -504 T 0.095 -505 E 0.114 -506 D 0.125 -507 E 0.126 -508 I 0.122 -509 Y 0.121 -510 E 0.123 -511 L 0.125 -512 S 0.128 -513 Y 0.134 -514 A 0.139 -515 R 0.141 -516 E 0.149 -517 P 0.182 -518 R 0.236 -519 N 0.296 -520 H 0.352 -521 R 0.401 -522 A 0.450 -523 P 0.497 -524 P 0.533 -525 L 0.546 -526 T 0.538 -527 P 0.519 -528 S 0.495 -529 K 0.470 -530 P 0.451 -531 P 0.436 -532 V 0.417 -533 V 0.389 -534 V 0.357 -535 D 0.324 -536 W 0.292 -537 A 0.273 -538 S 0.275 -539 G 0.287 -540 V 0.296 -541 S 0.301 -542 P 0.297 -543 K 0.277 -544 P 0.240 -545 D 0.201 -546 P 0.175 -547 K 0.163 -548 T 0.157 -549 I 0.154 -550 S 0.147 -551 K 0.132 -552 H 0.108 -553 V 0.083 -554 Q 0.066 -555 R 0.057 -556 M 0.051 -557 V 0.044 -558 D 0.042 -559 S 0.044 -560 V 0.050 -561 F 0.054 -562 K 0.057 -563 N 0.062 -564 Y 0.073 -565 D 0.096 -566 L 0.122 -567 D 0.138 -568 Q 0.135 -569 D 0.125 -570 G 0.117 -571 Y 0.107 -572 I 0.092 -573 S 0.075 -574 Q 0.064 -575 E 0.063 -576 E 0.065 -577 F 0.066 -578 E 0.068 -579 K 0.072 -580 I 0.081 -581 A 0.097 -582 A 0.116 -583 S 0.125 -584 F 0.120 -585 P 0.108 -586 F 0.100 -587 S 0.102 -588 F 0.109 -589 C 0.114 -590 V 0.117 -591 M 0.124 -592 D 0.134 -593 K 0.144 -594 D 0.148 -595 R 0.146 -596 E 0.139 -597 G 0.130 -598 L 0.116 -599 I 0.096 -600 S 0.077 -601 R 0.065 -602 D 0.063 -603 E 0.063 -604 I 0.059 -605 T 0.054 -606 A 0.050 -607 Y 0.046 -608 F 0.042 -609 M 0.043 -610 R 0.055 -611 A 0.078 -612 S 0.108 -613 S 0.142 -614 I 0.175 -615 Y 0.206 -616 S 0.243 -617 K 0.290 -618 L 0.340 -619 G 0.381 -620 L 0.395 -621 G 0.369 -622 F 0.311 -623 P 0.248 -624 H 0.200 -625 N 0.174 -626 F 0.167 -627 Q 0.168 -628 E 0.171 -629 T 0.172 -630 T 0.172 -631 Y 0.172 -632 L 0.172 -633 K 0.172 -634 P 0.171 -635 T 0.166 -636 F 0.149 -637 C 0.126 -638 D 0.113 -639 N 0.125 -640 C 0.159 -641 A 0.200 -642 G 0.230 -643 F 0.239 -644 L 0.230 -645 W 0.212 -646 G 0.196 -647 V 0.186 -648 I 0.187 -649 K 0.196 -650 Q 0.199 -651 G 0.187 -652 Y 0.166 -653 R 0.149 -654 C 0.140 -655 K 0.139 -656 D 0.146 -657 C 0.155 -658 G 0.158 -659 M 0.149 -660 N 0.132 -661 C 0.113 -662 H 0.096 -663 K 0.088 -664 Q 0.094 -665 C 0.109 -666 K 0.124 -667 D 0.131 -668 L 0.133 -669 V 0.129 -670 V 0.123 -671 F 0.119 -672 E 0.119 -673 C 0.126 -674 K 0.153 -675 K 0.217 -676 R 0.319 -677 I 0.436 -678 K 0.539 -679 S 0.613 -680 P 0.659 -681 A 0.682 -682 I 0.688 -683 S 0.688 -684 T 0.692 -685 E 0.699 -686 N 0.698 -687 I 0.684 -688 S 0.663 -689 S 0.644 -690 V 0.633 -691 V 0.631 -692 P 0.642 -693 M 0.659 -694 S 0.670 -695 T 0.667 -696 L 0.663 -697 C 0.674 -698 P 0.704 -699 L 0.740 -700 G 0.768 -701 T 0.780 -702 K 0.779 -703 D 0.771 -704 L 0.757 -705 L 0.737 -706 H 0.721 -707 A 0.718 -708 P 0.735 -709 E 0.767 -710 E 0.800 -711 G 0.821 -712 S 0.825 -713 F 0.816 -714 I 0.803 -715 F 0.798 -716 Q 0.804 -717 N 0.812 -718 G 0.808 -719 E 0.791 -720 I 0.773 -721 V 0.765 -722 D 0.760 -723 H 0.752 -724 S 0.746 -725 E 0.749 -726 E 0.762 -727 S 0.779 -728 K 0.795 -729 D 0.812 -730 R 0.828 -731 T 0.839 -732 I 0.843 -733 M 0.841 -734 L 0.836 -735 L 0.828 -736 G 0.820 -737 V 0.813 -738 S 0.806 -739 S 0.801 -740 Q 0.798 -741 K 0.799 -742 I 0.802 -743 S 0.802 -744 V 0.799 -745 R 0.794 -746 L 0.790 -747 K 0.790 -748 R 0.798 -749 T 0.811 -750 V 0.825 -751 A 0.838 -752 H 0.849 -753 K 0.856 -754 S 0.858 -755 T 0.857 -756 Q 0.855 -757 T 0.849 -758 E 0.839 -759 S 0.827 -760 F 0.821 -761 P 0.821 -762 W 0.828 -763 V 0.834 -764 G 0.835 -765 G 0.827 -766 E 0.814 -767 T 0.802 -768 T 0.800 -769 P 0.811 -770 G 0.827 -771 H 0.838 -772 F 0.840 -773 V 0.833 -774 L 0.820 -775 S 0.809 -776 S 0.807 -777 P 0.814 -778 R 0.825 -779 K 0.836 -780 S 0.843 -781 A 0.849 -782 Q 0.855 -783 G 0.861 -784 A 0.862 -785 L 0.858 -786 Y 0.849 -787 V 0.838 -788 H 0.825 -789 S 0.812 -790 P 0.804 -791 A 0.797 -792 S 0.790 -793 P 0.783 -794 C 0.782 -795 P 0.789 -796 S 0.802 -797 P 0.815 -798 A 0.823 -799 L 0.822 -800 V 0.814 -801 R 0.803 -802 K 0.795 -803 R 0.793 -804 A 0.792 -805 F 0.786 -806 V 0.774 -807 K 0.758 -808 W 0.746 -809 E 0.741 -810 N 0.740 -811 K 0.739 -812 E 0.737 -813 S 0.731 -814 L 0.716 -815 I 0.698 -816 K 0.690 -817 P 0.701 -818 K 0.728 -819 P 0.758 -820 E 0.773 -821 L 0.771 -822 H 0.756 -823 L 0.734 -824 R 0.692 -825 L 0.622 -826 R 0.538 -827 T 0.475 -828 Y 0.453 -829 Q 0.457 -830 E 0.454 -831 L 0.437 -832 E 0.410 -833 Q 0.379 -834 E 0.345 -835 I 0.313 -836 N 0.287 -837 T 0.276 -838 L 0.287 -839 K 0.314 -840 A 0.347 -841 D 0.375 -842 N 0.389 -843 D 0.384 -844 A 0.367 -845 L 0.349 -846 K 0.336 -847 I 0.326 -848 Q 0.312 -849 L 0.291 -850 K 0.263 -851 Y 0.241 -852 A 0.236 -853 Q 0.243 -854 K 0.256 -855 K 0.276 -856 I 0.304 -857 E 0.334 -858 S 0.360 -859 L 0.384 -860 Q 0.421 -861 L 0.478 -862 G 0.537 -863 K 0.578 -864 S 0.604 -865 N 0.626 -866 H 0.648 -867 V 0.664 -868 L 0.672 -869 A 0.675 -870 Q 0.678 -871 M 0.684 -872 D 0.691 -873 H 0.704 -874 G 0.722 -875 D 0.734 -876 S 0.731 -877 A 0.722 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000027536.7_ENSMUST00000029049.7_GN:Chmp4c_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000027536.7_ENSMUST00000029049.7_GN:Chmp4c_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 6ab4539bd9f91389f59f8177471d6d4ae27b3d5c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000027536.7_ENSMUST00000029049.7_GN:Chmp4c_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,233 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000027536.7|ENSMUST00000029049.7|GN:Chmp4c|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.466 -2 S 0.490 -3 K 0.528 -4 L 0.564 -5 G 0.584 -6 K 0.590 -7 F 0.598 -8 F 0.616 -9 K 0.643 -10 G 0.673 -11 T 0.698 -12 R 0.713 -13 S 0.719 -14 S 0.714 -15 R 0.701 -16 A 0.683 -17 R 0.659 -18 A 0.623 -19 A 0.559 -20 P 0.462 -21 S 0.343 -22 A 0.231 -23 Q 0.159 -24 E 0.131 -25 A 0.126 -26 L 0.125 -27 A 0.122 -28 R 0.115 -29 L 0.103 -30 R 0.095 -31 E 0.092 -32 T 0.088 -33 E 0.079 -34 E 0.073 -35 M 0.071 -36 L 0.073 -37 A 0.077 -38 K 0.076 -39 K 0.070 -40 Q 0.061 -41 E 0.054 -42 Y 0.052 -43 L 0.057 -44 E 0.068 -45 N 0.073 -46 R 0.066 -47 I 0.052 -48 Q 0.043 -49 R 0.041 -50 E 0.047 -51 L 0.060 -52 A 0.070 -53 L 0.068 -54 A 0.058 -55 K 0.051 -56 K 0.052 -57 H 0.060 -58 G 0.073 -59 S 0.089 -60 Q 0.100 -61 N 0.103 -62 K 0.096 -63 R 0.084 -64 A 0.076 -65 A 0.073 -66 L 0.072 -67 Q 0.073 -68 A 0.078 -69 L 0.084 -70 K 0.085 -71 R 0.080 -72 K 0.072 -73 K 0.064 -74 R 0.062 -75 F 0.069 -76 E 0.078 -77 K 0.082 -78 Q 0.081 -79 L 0.085 -80 T 0.096 -81 Q 0.117 -82 V 0.150 -83 D 0.188 -84 G 0.210 -85 T 0.207 -86 L 0.198 -87 S 0.193 -88 T 0.181 -89 I 0.167 -90 E 0.164 -91 F 0.163 -92 Q 0.159 -93 R 0.164 -94 E 0.176 -95 A 0.172 -96 L 0.161 -97 E 0.162 -98 N 0.172 -99 S 0.175 -100 H 0.174 -101 T 0.177 -102 N 0.184 -103 T 0.196 -104 E 0.210 -105 V 0.211 -106 L 0.199 -107 R 0.190 -108 N 0.196 -109 M 0.203 -110 G 0.204 -111 F 0.205 -112 A 0.207 -113 A 0.210 -114 K 0.223 -115 A 0.245 -116 M 0.262 -117 K 0.273 -118 A 0.286 -119 V 0.307 -120 H 0.331 -121 D 0.356 -122 N 0.380 -123 M 0.394 -124 D 0.390 -125 L 0.372 -126 N 0.357 -127 K 0.352 -128 I 0.349 -129 D 0.343 -130 D 0.337 -131 L 0.331 -132 M 0.333 -133 Q 0.353 -134 D 0.382 -135 I 0.399 -136 T 0.402 -137 E 0.403 -138 Q 0.409 -139 Q 0.427 -140 D 0.446 -141 I 0.433 -142 A 0.393 -143 Q 0.362 -144 E 0.347 -145 I 0.327 -146 S 0.305 -147 E 0.295 -148 A 0.296 -149 F 0.304 -150 S 0.321 -151 Q 0.345 -152 R 0.374 -153 V 0.402 -154 Q 0.428 -155 F 0.442 -156 A 0.440 -157 D 0.424 -158 G 0.396 -159 F 0.352 -160 D 0.292 -161 E 0.233 -162 A 0.195 -163 E 0.177 -164 L 0.167 -165 L 0.160 -166 A 0.159 -167 E 0.162 -168 L 0.162 -169 E 0.162 -170 E 0.164 -171 L 0.171 -172 E 0.178 -173 Q 0.185 -174 E 0.193 -175 E 0.207 -176 L 0.224 -177 N 0.244 -178 K 0.274 -179 K 0.321 -180 M 0.384 -181 T 0.457 -182 S 0.533 -183 L 0.598 -184 E 0.647 -185 L 0.683 -186 P 0.707 -187 N 0.720 -188 V 0.729 -189 P 0.739 -190 S 0.751 -191 S 0.757 -192 S 0.756 -193 L 0.752 -194 P 0.751 -195 A 0.753 -196 Q 0.757 -197 P 0.765 -198 S 0.776 -199 R 0.785 -200 K 0.788 -201 A 0.779 -202 S 0.766 -203 M 0.760 -204 P 0.767 -205 S 0.780 -206 S 0.787 -207 V 0.782 -208 H 0.766 -209 R 0.747 -210 S 0.734 -211 R 0.723 -212 A 0.711 -213 A 0.694 -214 S 0.671 -215 S 0.646 -216 R 0.624 -217 R 0.613 -218 A 0.613 -219 E 0.604 -220 E 0.567 -221 D 0.513 -222 D 0.468 -223 D 0.434 -224 F 0.404 -225 K 0.386 -226 Q 0.386 -227 L 0.392 -228 A 0.392 -229 A 0.390 -230 W 0.382 -231 A 0.355 -232 T 0.326 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000027536.7_ENSMUST00000029049.7_GN:Chmp4c_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:40.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000027536.7_ENSMUST00000029049.7_GN:Chmp4c_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:40.caid deleted file mode 100644 index e02cd1377cf16a1221f93e421c6fd67d30e501c0..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000027536.7_ENSMUST00000029049.7_GN:Chmp4c_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:40.caid +++ /dev/null @@ -1,273 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000027536.7|ENSMUST00000029049.7|GN:Chmp4c|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:40 -1 M 0.450 -2 P 0.481 -3 K 0.528 -4 S 0.571 -5 G 0.597 -6 C 0.605 -7 H 0.606 -8 L 0.612 -9 P 0.617 -10 K 0.619 -11 Q 0.616 -12 L 0.603 -13 V 0.571 -14 D 0.518 -15 S 0.450 -16 Q 0.379 -17 E 0.321 -18 L 0.285 -19 C 0.272 -20 R 0.269 -21 L 0.264 -22 R 0.257 -23 L 0.253 -24 W 0.256 -25 L 0.269 -26 T 0.297 -27 C 0.344 -28 L 0.404 -29 Q 0.471 -30 S 0.534 -31 A 0.586 -32 G 0.621 -33 T 0.642 -34 L 0.654 -35 V 0.669 -36 P 0.688 -37 H 0.701 -38 C 0.707 -39 S 0.707 -40 A 0.704 -41 M 0.704 -42 S 0.708 -43 K 0.712 -44 L 0.706 -45 G 0.691 -46 K 0.678 -47 F 0.674 -48 F 0.679 -49 K 0.694 -50 G 0.715 -51 T 0.736 -52 R 0.749 -53 S 0.754 -54 S 0.749 -55 R 0.737 -56 A 0.718 -57 R 0.694 -58 A 0.656 -59 A 0.590 -60 P 0.488 -61 S 0.363 -62 A 0.246 -63 Q 0.170 -64 E 0.140 -65 A 0.134 -66 L 0.132 -67 A 0.131 -68 R 0.127 -69 L 0.118 -70 R 0.113 -71 E 0.112 -72 T 0.107 -73 E 0.097 -74 E 0.088 -75 M 0.083 -76 L 0.083 -77 A 0.084 -78 K 0.082 -79 K 0.074 -80 Q 0.065 -81 E 0.058 -82 Y 0.054 -83 L 0.057 -84 E 0.066 -85 N 0.070 -86 R 0.061 -87 I 0.048 -88 Q 0.040 -89 R 0.038 -90 E 0.044 -91 L 0.057 -92 A 0.067 -93 L 0.065 -94 A 0.055 -95 K 0.047 -96 K 0.047 -97 H 0.053 -98 G 0.065 -99 S 0.078 -100 Q 0.087 -101 N 0.090 -102 K 0.084 -103 R 0.075 -104 A 0.070 -105 A 0.069 -106 L 0.067 -107 Q 0.066 -108 A 0.069 -109 L 0.074 -110 K 0.075 -111 R 0.072 -112 K 0.065 -113 K 0.058 -114 R 0.056 -115 F 0.062 -116 E 0.070 -117 K 0.073 -118 Q 0.072 -119 L 0.076 -120 T 0.087 -121 Q 0.108 -122 V 0.140 -123 D 0.175 -124 G 0.193 -125 T 0.191 -126 L 0.190 -127 S 0.194 -128 T 0.185 -129 I 0.168 -130 E 0.160 -131 F 0.155 -132 Q 0.148 -133 R 0.151 -134 E 0.162 -135 A 0.162 -136 L 0.155 -137 E 0.159 -138 N 0.172 -139 S 0.178 -140 H 0.181 -141 T 0.187 -142 N 0.198 -143 T 0.214 -144 E 0.230 -145 V 0.232 -146 L 0.219 -147 R 0.211 -148 N 0.218 -149 M 0.225 -150 G 0.225 -151 F 0.223 -152 A 0.223 -153 A 0.226 -154 K 0.241 -155 A 0.266 -156 M 0.285 -157 K 0.296 -158 A 0.309 -159 V 0.331 -160 H 0.356 -161 D 0.385 -162 N 0.412 -163 M 0.430 -164 D 0.430 -165 L 0.416 -166 N 0.407 -167 K 0.408 -168 I 0.408 -169 D 0.399 -170 D 0.386 -171 L 0.370 -172 M 0.363 -173 Q 0.380 -174 D 0.411 -175 I 0.430 -176 T 0.435 -177 E 0.436 -178 Q 0.441 -179 Q 0.457 -180 D 0.475 -181 I 0.461 -182 A 0.418 -183 Q 0.383 -184 E 0.366 -185 I 0.346 -186 S 0.322 -187 E 0.309 -188 A 0.307 -189 F 0.313 -190 S 0.328 -191 Q 0.352 -192 R 0.378 -193 V 0.405 -194 Q 0.428 -195 F 0.441 -196 A 0.439 -197 D 0.424 -198 G 0.395 -199 F 0.349 -200 D 0.289 -201 E 0.232 -202 A 0.195 -203 E 0.177 -204 L 0.169 -205 L 0.164 -206 A 0.163 -207 E 0.165 -208 L 0.165 -209 E 0.162 -210 E 0.164 -211 L 0.170 -212 E 0.178 -213 Q 0.184 -214 E 0.193 -215 E 0.205 -216 L 0.222 -217 N 0.242 -218 K 0.271 -219 K 0.316 -220 M 0.377 -221 T 0.448 -222 S 0.524 -223 L 0.591 -224 E 0.642 -225 L 0.679 -226 P 0.703 -227 N 0.717 -228 V 0.729 -229 P 0.742 -230 S 0.756 -231 S 0.763 -232 S 0.762 -233 L 0.759 -234 P 0.757 -235 A 0.759 -236 Q 0.763 -237 P 0.770 -238 S 0.781 -239 R 0.790 -240 K 0.794 -241 A 0.788 -242 S 0.776 -243 M 0.771 -244 P 0.777 -245 S 0.788 -246 S 0.795 -247 V 0.791 -248 H 0.775 -249 R 0.758 -250 S 0.745 -251 R 0.736 -252 A 0.724 -253 A 0.707 -254 S 0.684 -255 S 0.659 -256 R 0.635 -257 R 0.621 -258 A 0.618 -259 E 0.606 -260 E 0.567 -261 D 0.512 -262 D 0.467 -263 D 0.433 -264 F 0.405 -265 K 0.389 -266 Q 0.393 -267 L 0.403 -268 A 0.408 -269 A 0.411 -270 W 0.407 -271 A 0.382 -272 T 0.352 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000027861.14_ENSMUST00000165540.9_GN:Casq2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000027861.14_ENSMUST00000165540.9_GN:Casq2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 534e8cfc597ad5b5d1202aa673969504fda0c772..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000027861.14_ENSMUST00000165540.9_GN:Casq2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,419 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000027861.14|ENSMUST00000165540.9|GN:Casq2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.266 -2 K 0.251 -3 R 0.233 -4 I 0.222 -5 Y 0.211 -6 L 0.208 -7 L 0.221 -8 M 0.248 -9 V 0.272 -10 G 0.284 -11 V 0.280 -12 Y 0.265 -13 L 0.252 -14 L 0.263 -15 S 0.307 -16 L 0.368 -17 S 0.434 -18 G 0.498 -19 A 0.548 -20 E 0.563 -21 E 0.532 -22 G 0.467 -23 L 0.390 -24 N 0.320 -25 F 0.265 -26 P 0.221 -27 T 0.191 -28 Y 0.175 -29 D 0.169 -30 G 0.166 -31 K 0.159 -32 D 0.145 -33 R 0.129 -34 V 0.113 -35 V 0.097 -36 S 0.083 -37 L 0.076 -38 S 0.069 -39 E 0.058 -40 K 0.047 -41 N 0.041 -42 L 0.035 -43 K 0.031 -44 Q 0.031 -45 M 0.032 -46 L 0.034 -47 K 0.040 -48 R 0.046 -49 Y 0.047 -50 D 0.040 -51 L 0.031 -52 L 0.027 -53 C 0.028 -54 L 0.031 -55 Y 0.036 -56 Y 0.048 -57 H 0.071 -58 E 0.106 -59 P 0.143 -60 V 0.171 -61 S 0.183 -62 S 0.178 -63 D 0.161 -64 K 0.142 -65 V 0.127 -66 S 0.117 -67 Q 0.116 -68 K 0.124 -69 Q 0.135 -70 F 0.143 -71 Q 0.144 -72 L 0.136 -73 K 0.120 -74 E 0.108 -75 I 0.099 -76 V 0.087 -77 L 0.071 -78 E 0.058 -79 L 0.051 -80 V 0.046 -81 A 0.041 -82 Q 0.037 -83 V 0.034 -84 L 0.032 -85 E 0.032 -86 H 0.036 -87 K 0.041 -88 N 0.047 -89 I 0.047 -90 G 0.042 -91 F 0.036 -92 V 0.035 -93 M 0.039 -94 V 0.044 -95 D 0.047 -96 S 0.045 -97 R 0.041 -98 K 0.035 -99 E 0.029 -100 A 0.025 -101 K 0.025 -102 L 0.026 -103 A 0.028 -104 K 0.029 -105 R 0.031 -106 L 0.035 -107 G 0.042 -108 F 0.050 -109 S 0.056 -110 E 0.061 -111 E 0.063 -112 G 0.060 -113 S 0.052 -114 L 0.039 -115 Y 0.030 -116 V 0.028 -117 L 0.034 -118 K 0.043 -119 G 0.055 -120 D 0.068 -121 R 0.077 -122 T 0.081 -123 I 0.082 -124 E 0.083 -125 F 0.087 -126 D 0.095 -127 G 0.104 -128 E 0.109 -129 F 0.109 -130 A 0.106 -131 A 0.099 -132 D 0.090 -133 V 0.081 -134 L 0.076 -135 V 0.076 -136 E 0.080 -137 F 0.082 -138 L 0.083 -139 L 0.089 -140 D 0.105 -141 L 0.125 -142 I 0.142 -143 E 0.153 -144 D 0.153 -145 P 0.140 -146 V 0.122 -147 E 0.107 -148 I 0.099 -149 V 0.093 -150 N 0.085 -151 N 0.075 -152 K 0.065 -153 L 0.057 -154 E 0.051 -155 V 0.049 -156 Q 0.052 -157 A 0.056 -158 F 0.057 -159 E 0.055 -160 R 0.055 -161 I 0.059 -162 E 0.066 -163 D 0.069 -164 Q 0.062 -165 T 0.045 -166 K 0.029 -167 L 0.020 -168 L 0.017 -169 G 0.020 -170 F 0.028 -171 F 0.039 -172 K 0.047 -173 N 0.053 -174 E 0.056 -175 D 0.058 -176 S 0.055 -177 E 0.052 -178 Y 0.054 -179 Y 0.063 -180 K 0.069 -181 A 0.064 -182 F 0.051 -183 Q 0.042 -184 E 0.040 -185 A 0.040 -186 A 0.041 -187 E 0.038 -188 H 0.033 -189 F 0.030 -190 Q 0.029 -191 P 0.031 -192 Y 0.034 -193 I 0.037 -194 K 0.035 -195 F 0.032 -196 F 0.030 -197 A 0.032 -198 T 0.038 -199 F 0.043 -200 D 0.044 -201 K 0.039 -202 A 0.033 -203 V 0.028 -204 A 0.027 -205 K 0.029 -206 K 0.035 -207 L 0.045 -208 S 0.054 -209 L 0.061 -210 K 0.063 -211 M 0.062 -212 N 0.058 -213 E 0.052 -214 V 0.046 -215 G 0.043 -216 F 0.047 -217 Y 0.058 -218 E 0.067 -219 P 0.068 -220 F 0.064 -221 M 0.064 -222 D 0.073 -223 E 0.081 -224 P 0.079 -225 N 0.071 -226 V 0.066 -227 I 0.070 -228 P 0.075 -229 N 0.073 -230 K 0.065 -231 P 0.059 -232 Y 0.058 -233 T 0.057 -234 E 0.054 -235 E 0.050 -236 E 0.051 -237 L 0.058 -238 V 0.068 -239 E 0.076 -240 F 0.077 -241 V 0.076 -242 K 0.078 -243 E 0.084 -244 H 0.092 -245 Q 0.106 -246 R 0.122 -247 P 0.131 -248 T 0.132 -249 L 0.133 -250 R 0.136 -251 R 0.135 -252 L 0.129 -253 R 0.122 -254 P 0.120 -255 E 0.124 -256 D 0.128 -257 M 0.126 -258 F 0.122 -259 E 0.119 -260 T 0.118 -261 W 0.123 -262 T 0.142 -263 T 0.172 -264 G 0.200 -265 E 0.210 -266 D 0.201 -267 D 0.184 -268 L 0.164 -269 N 0.140 -270 G 0.110 -271 I 0.079 -272 H 0.053 -273 I 0.037 -274 V 0.031 -275 A 0.034 -276 F 0.041 -277 A 0.048 -278 E 0.053 -279 K 0.057 -280 S 0.059 -281 D 0.061 -282 P 0.062 -283 D 0.063 -284 G 0.065 -285 Y 0.068 -286 E 0.071 -287 F 0.071 -288 L 0.069 -289 E 0.065 -290 I 0.060 -291 L 0.051 -292 K 0.043 -293 Q 0.040 -294 V 0.041 -295 A 0.045 -296 R 0.048 -297 D 0.054 -298 N 0.063 -299 T 0.075 -300 D 0.086 -301 N 0.090 -302 P 0.085 -303 D 0.071 -304 L 0.056 -305 S 0.042 -306 I 0.032 -307 L 0.029 -308 W 0.035 -309 I 0.051 -310 D 0.069 -311 P 0.079 -312 D 0.080 -313 D 0.077 -314 F 0.070 -315 P 0.058 -316 L 0.045 -317 L 0.035 -318 V 0.029 -319 A 0.024 -320 Y 0.021 -321 W 0.022 -322 E 0.027 -323 K 0.035 -324 T 0.044 -325 F 0.050 -326 K 0.056 -327 I 0.059 -328 D 0.058 -329 L 0.050 -330 F 0.043 -331 K 0.039 -332 P 0.038 -333 Q 0.036 -334 I 0.035 -335 G 0.035 -336 V 0.038 -337 V 0.044 -338 N 0.052 -339 V 0.059 -340 T 0.066 -341 D 0.076 -342 A 0.088 -343 D 0.093 -344 S 0.086 -345 I 0.073 -346 W 0.070 -347 M 0.087 -348 E 0.121 -349 I 0.160 -350 P 0.196 -351 D 0.222 -352 D 0.230 -353 D 0.216 -354 D 0.189 -355 L 0.159 -356 P 0.129 -357 T 0.102 -358 A 0.081 -359 E 0.069 -360 E 0.065 -361 L 0.068 -362 E 0.074 -363 D 0.076 -364 W 0.071 -365 I 0.063 -366 E 0.058 -367 D 0.059 -368 V 0.070 -369 L 0.098 -370 S 0.140 -371 G 0.188 -372 K 0.236 -373 I 0.289 -374 N 0.357 -375 T 0.437 -376 E 0.515 -377 D 0.573 -378 D 0.606 -379 D 0.625 -380 N 0.640 -381 E 0.652 -382 D 0.663 -383 E 0.672 -384 D 0.678 -385 D 0.683 -386 D 0.684 -387 G 0.675 -388 D 0.640 -389 D 0.586 -390 N 0.552 -391 D 0.557 -392 D 0.561 -393 D 0.536 -394 D 0.512 -395 D 0.513 -396 D 0.517 -397 D 0.527 -398 D 0.565 -399 D 0.616 -400 N 0.650 -401 D 0.663 -402 N 0.660 -403 S 0.629 -404 D 0.574 -405 E 0.532 -406 D 0.522 -407 N 0.522 -408 E 0.531 -409 D 0.571 -410 S 0.629 -411 D 0.671 -412 D 0.687 -413 D 0.687 -414 D 0.678 -415 D 0.659 -416 D 0.623 -417 D 0.574 -418 E 0.534 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000027861.14_ENSMUST00000165540.9_GN:Casq2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000027861.14_ENSMUST00000165540.9_GN:Casq2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid deleted file mode 100644 index 7c2e02247f94c0dc72a6796a283e3cea9d6d5acb..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000027861.14_ENSMUST00000165540.9_GN:Casq2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid +++ /dev/null @@ -1,433 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000027861.14|ENSMUST00000165540.9|GN:Casq2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:14 -1 M 0.270 -2 I 0.274 -3 S 0.283 -4 I 0.287 -5 L 0.273 -6 E 0.254 -7 T 0.252 -8 E 0.265 -9 K 0.272 -10 Q 0.271 -11 D 0.265 -12 F 0.251 -13 S 0.232 -14 Q 0.215 -15 M 0.198 -16 K 0.182 -17 R 0.169 -18 I 0.161 -19 Y 0.154 -20 L 0.152 -21 L 0.158 -22 M 0.173 -23 V 0.189 -24 G 0.193 -25 V 0.184 -26 Y 0.173 -27 L 0.176 -28 L 0.203 -29 S 0.253 -30 L 0.316 -31 S 0.384 -32 G 0.449 -33 A 0.498 -34 E 0.515 -35 E 0.488 -36 G 0.429 -37 L 0.360 -38 N 0.298 -39 F 0.248 -40 P 0.210 -41 T 0.185 -42 Y 0.172 -43 D 0.168 -44 G 0.166 -45 K 0.158 -46 D 0.144 -47 R 0.129 -48 V 0.114 -49 V 0.097 -50 S 0.084 -51 L 0.077 -52 S 0.070 -53 E 0.058 -54 K 0.047 -55 N 0.040 -56 L 0.034 -57 K 0.030 -58 Q 0.030 -59 M 0.031 -60 L 0.033 -61 K 0.038 -62 R 0.045 -63 Y 0.046 -64 D 0.040 -65 L 0.031 -66 L 0.027 -67 C 0.028 -68 L 0.030 -69 Y 0.034 -70 Y 0.045 -71 H 0.068 -72 E 0.100 -73 P 0.135 -74 V 0.163 -75 S 0.176 -76 S 0.172 -77 D 0.156 -78 K 0.138 -79 V 0.124 -80 S 0.114 -81 Q 0.113 -82 K 0.120 -83 Q 0.130 -84 F 0.138 -85 Q 0.139 -86 L 0.130 -87 K 0.116 -88 E 0.104 -89 I 0.096 -90 V 0.084 -91 L 0.069 -92 E 0.056 -93 L 0.049 -94 V 0.045 -95 A 0.040 -96 Q 0.035 -97 V 0.032 -98 L 0.030 -99 E 0.031 -100 H 0.034 -101 K 0.040 -102 N 0.046 -103 I 0.047 -104 G 0.043 -105 F 0.036 -106 V 0.035 -107 M 0.039 -108 V 0.044 -109 D 0.046 -110 S 0.045 -111 R 0.040 -112 K 0.034 -113 E 0.029 -114 A 0.025 -115 K 0.024 -116 L 0.025 -117 A 0.027 -118 K 0.028 -119 R 0.030 -120 L 0.034 -121 G 0.042 -122 F 0.050 -123 S 0.057 -124 E 0.062 -125 E 0.064 -126 G 0.062 -127 S 0.053 -128 L 0.040 -129 Y 0.030 -130 V 0.029 -131 L 0.035 -132 K 0.044 -133 G 0.056 -134 D 0.069 -135 R 0.078 -136 T 0.082 -137 I 0.083 -138 E 0.084 -139 F 0.088 -140 D 0.097 -141 G 0.106 -142 E 0.111 -143 F 0.111 -144 A 0.107 -145 A 0.099 -146 D 0.090 -147 V 0.081 -148 L 0.074 -149 V 0.074 -150 E 0.079 -151 F 0.081 -152 L 0.082 -153 L 0.089 -154 D 0.106 -155 L 0.126 -156 I 0.143 -157 E 0.154 -158 D 0.153 -159 P 0.140 -160 V 0.122 -161 E 0.107 -162 I 0.099 -163 V 0.093 -164 N 0.085 -165 N 0.075 -166 K 0.065 -167 L 0.056 -168 E 0.049 -169 V 0.046 -170 Q 0.048 -171 A 0.053 -172 F 0.055 -173 E 0.054 -174 R 0.055 -175 I 0.059 -176 E 0.066 -177 D 0.070 -178 Q 0.062 -179 T 0.045 -180 K 0.030 -181 L 0.020 -182 L 0.017 -183 G 0.020 -184 F 0.028 -185 F 0.039 -186 K 0.047 -187 N 0.053 -188 E 0.056 -189 D 0.058 -190 S 0.055 -191 E 0.052 -192 Y 0.054 -193 Y 0.063 -194 K 0.069 -195 A 0.064 -196 F 0.051 -197 Q 0.042 -198 E 0.040 -199 A 0.040 -200 A 0.040 -201 E 0.038 -202 H 0.033 -203 F 0.029 -204 Q 0.028 -205 P 0.030 -206 Y 0.033 -207 I 0.036 -208 K 0.035 -209 F 0.031 -210 F 0.029 -211 A 0.032 -212 T 0.038 -213 F 0.042 -214 D 0.042 -215 K 0.038 -216 A 0.032 -217 V 0.027 -218 A 0.026 -219 K 0.028 -220 K 0.035 -221 L 0.044 -222 S 0.053 -223 L 0.060 -224 K 0.062 -225 M 0.061 -226 N 0.057 -227 E 0.051 -228 V 0.046 -229 G 0.043 -230 F 0.047 -231 Y 0.057 -232 E 0.067 -233 P 0.067 -234 F 0.063 -235 M 0.064 -236 D 0.072 -237 E 0.080 -238 P 0.079 -239 N 0.071 -240 V 0.066 -241 I 0.070 -242 P 0.075 -243 N 0.073 -244 K 0.066 -245 P 0.060 -246 Y 0.058 -247 T 0.058 -248 E 0.055 -249 E 0.051 -250 E 0.051 -251 L 0.058 -252 V 0.068 -253 E 0.076 -254 F 0.078 -255 V 0.077 -256 K 0.080 -257 E 0.085 -258 H 0.094 -259 Q 0.108 -260 R 0.124 -261 P 0.134 -262 T 0.134 -263 L 0.134 -264 R 0.137 -265 R 0.136 -266 L 0.131 -267 R 0.124 -268 P 0.121 -269 E 0.125 -270 D 0.130 -271 M 0.128 -272 F 0.123 -273 E 0.120 -274 T 0.119 -275 W 0.125 -276 T 0.145 -277 T 0.176 -278 G 0.204 -279 E 0.214 -280 D 0.205 -281 D 0.187 -282 L 0.167 -283 N 0.142 -284 G 0.111 -285 I 0.079 -286 H 0.053 -287 I 0.037 -288 V 0.031 -289 A 0.034 -290 F 0.042 -291 A 0.049 -292 E 0.055 -293 K 0.059 -294 S 0.061 -295 D 0.063 -296 P 0.064 -297 D 0.066 -298 G 0.067 -299 Y 0.070 -300 E 0.072 -301 F 0.072 -302 L 0.070 -303 E 0.066 -304 I 0.060 -305 L 0.052 -306 K 0.044 -307 Q 0.041 -308 V 0.042 -309 A 0.046 -310 R 0.050 -311 D 0.055 -312 N 0.065 -313 T 0.077 -314 D 0.088 -315 N 0.092 -316 P 0.087 -317 D 0.074 -318 L 0.058 -319 S 0.043 -320 I 0.033 -321 L 0.030 -322 W 0.036 -323 I 0.053 -324 D 0.071 -325 P 0.081 -326 D 0.082 -327 D 0.079 -328 F 0.072 -329 P 0.060 -330 L 0.046 -331 L 0.035 -332 V 0.029 -333 A 0.025 -334 Y 0.022 -335 W 0.022 -336 E 0.027 -337 K 0.036 -338 T 0.045 -339 F 0.051 -340 K 0.057 -341 I 0.061 -342 D 0.059 -343 L 0.052 -344 F 0.045 -345 K 0.041 -346 P 0.039 -347 Q 0.038 -348 I 0.036 -349 G 0.036 -350 V 0.039 -351 V 0.047 -352 N 0.055 -353 V 0.061 -354 T 0.067 -355 D 0.077 -356 A 0.089 -357 D 0.093 -358 S 0.086 -359 I 0.073 -360 W 0.069 -361 M 0.085 -362 E 0.119 -363 I 0.158 -364 P 0.193 -365 D 0.219 -366 D 0.227 -367 D 0.213 -368 D 0.186 -369 L 0.157 -370 P 0.128 -371 T 0.101 -372 A 0.080 -373 E 0.068 -374 E 0.065 -375 L 0.067 -376 E 0.073 -377 D 0.075 -378 W 0.070 -379 I 0.062 -380 E 0.057 -381 D 0.058 -382 V 0.069 -383 L 0.096 -384 S 0.138 -385 G 0.184 -386 K 0.231 -387 I 0.285 -388 N 0.354 -389 T 0.435 -390 E 0.514 -391 D 0.573 -392 D 0.606 -393 D 0.625 -394 N 0.639 -395 E 0.652 -396 D 0.662 -397 E 0.671 -398 D 0.678 -399 D 0.682 -400 D 0.684 -401 G 0.675 -402 D 0.640 -403 D 0.586 -404 N 0.551 -405 D 0.554 -406 D 0.555 -407 D 0.528 -408 D 0.507 -409 D 0.510 -410 D 0.515 -411 D 0.525 -412 D 0.564 -413 D 0.615 -414 N 0.650 -415 D 0.664 -416 N 0.661 -417 S 0.630 -418 D 0.574 -419 E 0.532 -420 D 0.523 -421 N 0.523 -422 E 0.531 -423 D 0.571 -424 S 0.629 -425 D 0.671 -426 D 0.687 -427 D 0.687 -428 D 0.679 -429 D 0.659 -430 D 0.623 -431 D 0.574 -432 E 0.535 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028042.16_ENSMUST00000107435.8_GN:Zbtb7b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028042.16_ENSMUST00000107435.8_GN:Zbtb7b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 10430ea206a55836206df4d5a7bd18cf217849e4..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028042.16_ENSMUST00000107435.8_GN:Zbtb7b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,545 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000028042.16|ENSMUST00000107435.8|GN:Zbtb7b|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.461 -2 G 0.484 -3 S 0.522 -4 P 0.556 -5 E 0.562 -6 D 0.527 -7 D 0.464 -8 L 0.404 -9 I 0.376 -10 G 0.381 -11 I 0.389 -12 P 0.373 -13 F 0.338 -14 P 0.303 -15 D 0.272 -16 H 0.232 -17 S 0.182 -18 S 0.138 -19 E 0.113 -20 L 0.100 -21 L 0.086 -22 S 0.071 -23 C 0.062 -24 L 0.063 -25 N 0.074 -26 E 0.083 -27 Q 0.083 -28 R 0.077 -29 Q 0.076 -30 L 0.083 -31 G 0.094 -32 H 0.098 -33 L 0.091 -34 C 0.074 -35 D 0.056 -36 L 0.042 -37 T 0.034 -38 I 0.032 -39 R 0.036 -40 T 0.042 -41 Q 0.047 -42 G 0.050 -43 L 0.052 -44 E 0.055 -45 Y 0.057 -46 R 0.062 -47 T 0.070 -48 H 0.072 -49 R 0.066 -50 A 0.058 -51 V 0.056 -52 L 0.059 -53 A 0.061 -54 A 0.059 -55 C 0.052 -56 S 0.040 -57 H 0.030 -58 Y 0.024 -59 F 0.024 -60 K 0.029 -61 K 0.040 -62 L 0.063 -63 F 0.106 -64 T 0.171 -65 E 0.254 -66 G 0.341 -67 G 0.418 -68 G 0.475 -69 G 0.510 -70 T 0.531 -71 V 0.554 -72 M 0.595 -73 G 0.648 -74 T 0.689 -75 G 0.711 -76 G 0.719 -77 G 0.722 -78 G 0.721 -79 T 0.715 -80 A 0.706 -81 S 0.696 -82 G 0.682 -83 G 0.661 -84 A 0.633 -85 G 0.592 -86 A 0.528 -87 G 0.432 -88 V 0.324 -89 C 0.237 -90 E 0.181 -91 L 0.146 -92 D 0.122 -93 F 0.106 -94 V 0.095 -95 G 0.081 -96 P 0.064 -97 E 0.052 -98 A 0.048 -99 L 0.051 -100 G 0.054 -101 A 0.056 -102 L 0.056 -103 L 0.054 -104 E 0.050 -105 F 0.046 -106 A 0.043 -107 Y 0.045 -108 T 0.047 -109 A 0.047 -110 T 0.045 -111 L 0.044 -112 T 0.045 -113 T 0.047 -114 S 0.049 -115 S 0.052 -116 A 0.053 -117 N 0.050 -118 M 0.044 -119 P 0.037 -120 A 0.032 -121 V 0.028 -122 L 0.027 -123 Q 0.030 -124 A 0.035 -125 A 0.037 -126 R 0.035 -127 L 0.032 -128 L 0.033 -129 E 0.036 -130 I 0.037 -131 P 0.036 -132 C 0.033 -133 V 0.032 -134 I 0.033 -135 A 0.037 -136 A 0.043 -137 C 0.050 -138 M 0.058 -139 E 0.067 -140 I 0.083 -141 L 0.118 -142 Q 0.178 -143 G 0.253 -144 S 0.326 -145 G 0.381 -146 L 0.417 -147 E 0.436 -148 A 0.442 -149 P 0.430 -150 S 0.400 -151 P 0.361 -152 D 0.322 -153 E 0.283 -154 D 0.235 -155 D 0.183 -156 C 0.140 -157 E 0.112 -158 R 0.096 -159 A 0.094 -160 R 0.102 -161 Q 0.113 -162 Y 0.118 -163 L 0.118 -164 E 0.124 -165 A 0.143 -166 F 0.178 -167 A 0.229 -168 T 0.300 -169 A 0.390 -170 T 0.488 -171 T 0.571 -172 T 0.626 -173 A 0.658 -174 S 0.679 -175 T 0.694 -176 S 0.703 -177 G 0.710 -178 M 0.721 -179 P 0.739 -180 N 0.758 -181 G 0.761 -182 E 0.741 -183 D 0.707 -184 S 0.680 -185 P 0.676 -186 P 0.689 -187 Q 0.704 -188 V 0.705 -189 P 0.691 -190 L 0.658 -191 L 0.614 -192 P 0.567 -193 P 0.528 -194 P 0.507 -195 P 0.514 -196 P 0.549 -197 P 0.604 -198 P 0.667 -199 R 0.725 -200 P 0.770 -201 V 0.798 -202 A 0.806 -203 R 0.799 -204 R 0.781 -205 S 0.759 -206 R 0.742 -207 K 0.740 -208 P 0.752 -209 R 0.770 -210 K 0.781 -211 A 0.769 -212 F 0.722 -213 L 0.659 -214 Q 0.632 -215 T 0.676 -216 K 0.751 -217 G 0.806 -218 A 0.828 -219 R 0.832 -220 A 0.826 -221 N 0.815 -222 H 0.799 -223 L 0.782 -224 V 0.769 -225 P 0.767 -226 E 0.771 -227 A 0.776 -228 P 0.782 -229 T 0.787 -230 V 0.786 -231 L 0.777 -232 T 0.764 -233 H 0.752 -234 P 0.747 -235 L 0.747 -236 T 0.750 -237 Y 0.751 -238 E 0.743 -239 E 0.723 -240 E 0.702 -241 E 0.695 -242 M 0.707 -243 V 0.729 -244 G 0.750 -245 R 0.766 -246 L 0.776 -247 G 0.783 -248 N 0.787 -249 S 0.788 -250 G 0.789 -251 G 0.792 -252 S 0.796 -253 G 0.798 -254 L 0.798 -255 G 0.796 -256 D 0.787 -257 S 0.764 -258 Y 0.734 -259 S 0.717 -260 P 0.727 -261 P 0.755 -262 T 0.784 -263 G 0.801 -264 A 0.802 -265 A 0.790 -266 S 0.775 -267 P 0.764 -268 A 0.758 -269 E 0.751 -270 G 0.743 -271 P 0.739 -272 L 0.741 -273 N 0.744 -274 Y 0.746 -275 E 0.747 -276 V 0.748 -277 F 0.752 -278 E 0.763 -279 G 0.773 -280 E 0.779 -281 E 0.780 -282 E 0.781 -283 E 0.783 -284 E 0.782 -285 E 0.770 -286 M 0.743 -287 A 0.708 -288 Y 0.682 -289 P 0.681 -290 P 0.704 -291 G 0.736 -292 Y 0.761 -293 G 0.776 -294 L 0.783 -295 A 0.783 -296 Q 0.780 -297 S 0.774 -298 N 0.768 -299 E 0.763 -300 P 0.759 -301 S 0.750 -302 L 0.738 -303 S 0.733 -304 P 0.743 -305 E 0.762 -306 E 0.780 -307 L 0.789 -308 G 0.785 -309 S 0.769 -310 D 0.744 -311 E 0.716 -312 D 0.682 -313 P 0.625 -314 I 0.535 -315 D 0.432 -316 P 0.352 -317 D 0.303 -318 L 0.268 -319 M 0.242 -320 A 0.232 -321 Y 0.234 -322 L 0.242 -323 S 0.262 -324 S 0.312 -325 L 0.395 -326 H 0.496 -327 Q 0.588 -328 D 0.658 -329 A 0.695 -330 L 0.709 -331 T 0.717 -332 P 0.733 -333 G 0.755 -334 L 0.773 -335 D 0.781 -336 G 0.779 -337 Q 0.771 -338 D 0.760 -339 K 0.745 -340 L 0.723 -341 V 0.695 -342 R 0.671 -343 K 0.658 -344 R 0.646 -345 R 0.617 -346 S 0.558 -347 Q 0.469 -348 M 0.360 -349 P 0.251 -350 Q 0.165 -351 E 0.112 -352 C 0.086 -353 P 0.073 -354 V 0.070 -355 C 0.074 -356 H 0.084 -357 K 0.094 -358 I 0.102 -359 I 0.115 -360 H 0.139 -361 G 0.173 -362 A 0.209 -363 G 0.234 -364 K 0.237 -365 L 0.220 -366 P 0.195 -367 R 0.173 -368 H 0.160 -369 M 0.162 -370 R 0.178 -371 T 0.204 -372 H 0.243 -373 T 0.281 -374 G 0.292 -375 E 0.261 -376 K 0.205 -377 P 0.152 -378 F 0.118 -379 A 0.098 -380 C 0.082 -381 E 0.069 -382 V 0.063 -383 C 0.066 -384 G 0.074 -385 V 0.082 -386 R 0.090 -387 F 0.100 -388 T 0.111 -389 R 0.120 -390 N 0.127 -391 D 0.132 -392 K 0.135 -393 L 0.131 -394 K 0.120 -395 I 0.107 -396 H 0.100 -397 M 0.105 -398 R 0.118 -399 K 0.134 -400 H 0.156 -401 T 0.181 -402 G 0.197 -403 E 0.189 -404 R 0.158 -405 P 0.123 -406 Y 0.099 -407 S 0.088 -408 C 0.083 -409 P 0.080 -410 H 0.076 -411 C 0.072 -412 P 0.073 -413 A 0.082 -414 R 0.093 -415 F 0.101 -416 L 0.105 -417 H 0.109 -418 S 0.118 -419 Y 0.131 -420 D 0.145 -421 L 0.152 -422 K 0.147 -423 N 0.133 -424 H 0.123 -425 M 0.130 -426 H 0.150 -427 L 0.169 -428 H 0.183 -429 T 0.202 -430 G 0.220 -431 D 0.220 -432 R 0.194 -433 P 0.155 -434 Y 0.120 -435 E 0.097 -436 C 0.082 -437 H 0.076 -438 L 0.081 -439 C 0.093 -440 H 0.104 -441 K 0.110 -442 A 0.116 -443 F 0.123 -444 A 0.126 -445 K 0.122 -446 E 0.111 -447 D 0.099 -448 H 0.091 -449 L 0.088 -450 Q 0.088 -451 R 0.094 -452 H 0.102 -453 L 0.115 -454 K 0.137 -455 G 0.165 -456 Q 0.193 -457 N 0.217 -458 C 0.251 -459 L 0.309 -460 E 0.390 -461 V 0.469 -462 R 0.525 -463 T 0.561 -464 R 0.590 -465 R 0.620 -466 R 0.650 -467 R 0.673 -468 K 0.686 -469 D 0.691 -470 D 0.690 -471 V 0.679 -472 A 0.658 -473 A 0.631 -474 P 0.601 -475 H 0.572 -476 Y 0.558 -477 P 0.575 -478 P 0.622 -479 P 0.681 -480 S 0.732 -481 T 0.760 -482 T 0.763 -483 T 0.748 -484 S 0.734 -485 S 0.736 -486 P 0.755 -487 A 0.776 -488 G 0.787 -489 L 0.781 -490 D 0.766 -491 L 0.752 -492 S 0.746 -493 N 0.744 -494 G 0.738 -495 H 0.726 -496 L 0.704 -497 D 0.662 -498 T 0.594 -499 F 0.515 -500 H 0.453 -501 L 0.410 -502 S 0.367 -503 L 0.322 -504 A 0.293 -505 R 0.291 -506 F 0.314 -507 W 0.358 -508 E 0.423 -509 Q 0.490 -510 S 0.534 -511 A 0.548 -512 T 0.545 -513 T 0.548 -514 G 0.572 -515 P 0.621 -516 P 0.678 -517 V 0.719 -518 T 0.728 -519 T 0.709 -520 Q 0.680 -521 G 0.652 -522 P 0.619 -523 P 0.581 -524 E 0.568 -525 E 0.594 -526 E 0.613 -527 E 0.594 -528 E 0.578 -529 E 0.603 -530 G 0.641 -531 T 0.660 -532 P 0.671 -533 T 0.686 -534 T 0.707 -535 P 0.734 -536 Q 0.762 -537 A 0.785 -538 E 0.802 -539 G 0.811 -540 A 0.809 -541 M 0.797 -542 E 0.775 -543 S 0.747 -544 S 0.726 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028042.16_ENSMUST00000107435.8_GN:Zbtb7b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:63.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028042.16_ENSMUST00000107435.8_GN:Zbtb7b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:63.caid deleted file mode 100644 index 52ec7f73e257194a95250f8859a5b4f808a196e0..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028042.16_ENSMUST00000107435.8_GN:Zbtb7b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:63.caid +++ /dev/null @@ -1,608 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000028042.16|ENSMUST00000107435.8|GN:Zbtb7b|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:63 -1 M 0.337 -2 L 0.345 -3 Q 0.373 -4 K 0.421 -5 E 0.457 -6 T 0.465 -7 T 0.476 -8 R 0.514 -9 G 0.553 -10 Q 0.560 -11 L 0.543 -12 W 0.524 -13 C 0.512 -14 P 0.501 -15 S 0.484 -16 V 0.465 -17 W 0.459 -18 S 0.474 -19 P 0.483 -20 C 0.457 -21 T 0.425 -22 R 0.458 -23 I 0.563 -24 G 0.672 -25 G 0.728 -26 L 0.731 -27 G 0.695 -28 G 0.634 -29 S 0.591 -30 L 0.605 -31 T 0.652 -32 P 0.690 -33 T 0.712 -34 A 0.728 -35 P 0.745 -36 G 0.760 -37 S 0.765 -38 N 0.754 -39 Q 0.727 -40 L 0.692 -41 P 0.655 -42 S 0.626 -43 P 0.617 -44 P 0.632 -45 S 0.662 -46 P 0.694 -47 F 0.719 -48 V 0.738 -49 A 0.749 -50 C 0.748 -51 G 0.732 -52 L 0.701 -53 S 0.662 -54 S 0.628 -55 P 0.610 -56 P 0.610 -57 R 0.635 -58 P 0.680 -59 P 0.727 -60 G 0.757 -61 S 0.767 -62 E 0.765 -63 K 0.759 -64 M 0.750 -65 G 0.738 -66 S 0.725 -67 P 0.713 -68 E 0.694 -69 D 0.650 -70 D 0.580 -71 L 0.506 -72 I 0.461 -73 G 0.450 -74 I 0.441 -75 P 0.407 -76 F 0.363 -77 P 0.334 -78 D 0.311 -79 H 0.271 -80 S 0.211 -81 S 0.157 -82 E 0.126 -83 L 0.109 -84 L 0.093 -85 S 0.076 -86 C 0.066 -87 L 0.067 -88 N 0.076 -89 E 0.084 -90 Q 0.083 -91 R 0.076 -92 Q 0.072 -93 L 0.076 -94 G 0.082 -95 H 0.083 -96 L 0.076 -97 C 0.062 -98 D 0.049 -99 L 0.037 -100 T 0.030 -101 I 0.028 -102 R 0.032 -103 T 0.038 -104 Q 0.042 -105 G 0.043 -106 L 0.044 -107 E 0.046 -108 Y 0.049 -109 R 0.056 -110 T 0.067 -111 H 0.072 -112 R 0.065 -113 A 0.056 -114 V 0.052 -115 L 0.052 -116 A 0.052 -117 A 0.049 -118 C 0.042 -119 S 0.032 -120 H 0.025 -121 Y 0.021 -122 F 0.022 -123 K 0.027 -124 K 0.037 -125 L 0.057 -126 F 0.095 -127 T 0.157 -128 E 0.242 -129 G 0.339 -130 G 0.428 -131 G 0.491 -132 G 0.525 -133 T 0.543 -134 V 0.563 -135 M 0.599 -136 G 0.646 -137 T 0.682 -138 G 0.701 -139 G 0.710 -140 G 0.713 -141 G 0.712 -142 T 0.706 -143 A 0.697 -144 S 0.688 -145 G 0.675 -146 G 0.655 -147 A 0.628 -148 G 0.592 -149 A 0.534 -150 G 0.442 -151 V 0.335 -152 C 0.247 -153 E 0.188 -154 L 0.149 -155 D 0.124 -156 F 0.109 -157 V 0.099 -158 G 0.086 -159 P 0.069 -160 E 0.055 -161 A 0.050 -162 L 0.052 -163 G 0.056 -164 A 0.057 -165 L 0.056 -166 L 0.054 -167 E 0.049 -168 F 0.045 -169 A 0.042 -170 Y 0.045 -171 T 0.047 -172 A 0.048 -173 T 0.047 -174 L 0.046 -175 T 0.046 -176 T 0.047 -177 S 0.049 -178 S 0.051 -179 A 0.052 -180 N 0.049 -181 M 0.043 -182 P 0.036 -183 A 0.032 -184 V 0.029 -185 L 0.027 -186 Q 0.029 -187 A 0.034 -188 A 0.036 -189 R 0.033 -190 L 0.031 -191 L 0.031 -192 E 0.034 -193 I 0.035 -194 P 0.033 -195 C 0.030 -196 V 0.028 -197 I 0.029 -198 A 0.033 -199 A 0.038 -200 C 0.045 -201 M 0.052 -202 E 0.063 -203 I 0.080 -204 L 0.115 -205 Q 0.176 -206 G 0.254 -207 S 0.332 -208 G 0.393 -209 L 0.431 -210 E 0.447 -211 A 0.446 -212 P 0.429 -213 S 0.397 -214 P 0.358 -215 D 0.322 -216 E 0.286 -217 D 0.238 -218 D 0.184 -219 C 0.140 -220 E 0.111 -221 R 0.094 -222 A 0.091 -223 R 0.100 -224 Q 0.111 -225 Y 0.116 -226 L 0.118 -227 E 0.127 -228 A 0.149 -229 F 0.187 -230 A 0.238 -231 T 0.306 -232 A 0.393 -233 T 0.489 -234 T 0.571 -235 T 0.626 -236 A 0.658 -237 S 0.676 -238 T 0.689 -239 S 0.697 -240 G 0.704 -241 M 0.715 -242 P 0.733 -243 N 0.751 -244 G 0.754 -245 E 0.735 -246 D 0.702 -247 S 0.674 -248 P 0.669 -249 P 0.683 -250 Q 0.699 -251 V 0.703 -252 P 0.693 -253 L 0.669 -254 L 0.636 -255 P 0.600 -256 P 0.569 -257 P 0.553 -258 P 0.560 -259 P 0.589 -260 P 0.634 -261 P 0.683 -262 R 0.729 -263 P 0.766 -264 V 0.788 -265 A 0.793 -266 R 0.786 -267 R 0.769 -268 S 0.748 -269 R 0.732 -270 K 0.731 -271 P 0.744 -272 R 0.761 -273 K 0.770 -274 A 0.755 -275 F 0.707 -276 L 0.644 -277 Q 0.620 -278 T 0.664 -279 K 0.739 -280 G 0.793 -281 A 0.815 -282 R 0.817 -283 A 0.810 -284 N 0.797 -285 H 0.779 -286 L 0.761 -287 V 0.750 -288 P 0.749 -289 E 0.753 -290 A 0.759 -291 P 0.766 -292 T 0.773 -293 V 0.773 -294 L 0.763 -295 T 0.748 -296 H 0.737 -297 P 0.734 -298 L 0.739 -299 T 0.745 -300 Y 0.744 -301 E 0.723 -302 E 0.673 -303 E 0.611 -304 E 0.583 -305 M 0.615 -306 V 0.678 -307 G 0.729 -308 R 0.756 -309 L 0.770 -310 G 0.779 -311 N 0.785 -312 S 0.788 -313 G 0.790 -314 G 0.794 -315 S 0.800 -316 G 0.805 -317 L 0.807 -318 G 0.807 -319 D 0.802 -320 S 0.783 -321 Y 0.757 -322 S 0.742 -323 P 0.750 -324 P 0.775 -325 T 0.803 -326 G 0.820 -327 A 0.821 -328 A 0.811 -329 S 0.797 -330 P 0.787 -331 A 0.780 -332 E 0.772 -333 G 0.763 -334 P 0.758 -335 L 0.758 -336 N 0.761 -337 Y 0.762 -338 E 0.763 -339 V 0.765 -340 F 0.772 -341 E 0.783 -342 G 0.795 -343 E 0.801 -344 E 0.804 -345 E 0.806 -346 E 0.809 -347 E 0.809 -348 E 0.798 -349 M 0.775 -350 A 0.745 -351 Y 0.722 -352 P 0.720 -353 P 0.740 -354 G 0.767 -355 Y 0.787 -356 G 0.798 -357 L 0.802 -358 A 0.800 -359 Q 0.794 -360 S 0.786 -361 N 0.778 -362 E 0.772 -363 P 0.768 -364 S 0.760 -365 L 0.748 -366 S 0.742 -367 P 0.751 -368 E 0.770 -369 E 0.789 -370 L 0.797 -371 G 0.793 -372 S 0.776 -373 D 0.750 -374 E 0.722 -375 D 0.688 -376 P 0.630 -377 I 0.539 -378 D 0.435 -379 P 0.357 -380 D 0.311 -381 L 0.279 -382 M 0.254 -383 A 0.244 -384 Y 0.247 -385 L 0.253 -386 S 0.269 -387 S 0.315 -388 L 0.397 -389 H 0.495 -390 Q 0.584 -391 D 0.652 -392 A 0.692 -393 L 0.709 -394 T 0.719 -395 P 0.735 -396 G 0.756 -397 L 0.773 -398 D 0.780 -399 G 0.775 -400 Q 0.765 -401 D 0.753 -402 K 0.738 -403 L 0.715 -404 V 0.687 -405 R 0.661 -406 K 0.647 -407 R 0.634 -408 R 0.603 -409 S 0.542 -410 Q 0.454 -411 M 0.349 -412 P 0.245 -413 Q 0.162 -414 E 0.111 -415 C 0.084 -416 P 0.070 -417 V 0.065 -418 C 0.067 -419 H 0.075 -420 K 0.082 -421 I 0.089 -422 I 0.102 -423 H 0.126 -424 G 0.160 -425 A 0.194 -426 G 0.216 -427 K 0.220 -428 L 0.207 -429 P 0.188 -430 R 0.170 -431 H 0.160 -432 M 0.161 -433 R 0.172 -434 T 0.193 -435 H 0.226 -436 T 0.262 -437 G 0.273 -438 E 0.246 -439 K 0.196 -440 P 0.148 -441 F 0.118 -442 A 0.099 -443 C 0.083 -444 E 0.070 -445 V 0.065 -446 C 0.070 -447 G 0.079 -448 V 0.088 -449 R 0.096 -450 F 0.105 -451 T 0.115 -452 R 0.125 -453 N 0.132 -454 D 0.138 -455 K 0.143 -456 L 0.140 -457 K 0.129 -458 I 0.113 -459 H 0.103 -460 M 0.107 -461 R 0.119 -462 K 0.136 -463 H 0.158 -464 T 0.185 -465 G 0.202 -466 E 0.195 -467 R 0.164 -468 P 0.129 -469 Y 0.104 -470 S 0.093 -471 C 0.087 -472 P 0.085 -473 H 0.083 -474 C 0.080 -475 P 0.082 -476 A 0.091 -477 R 0.103 -478 F 0.111 -479 L 0.115 -480 H 0.119 -481 S 0.127 -482 Y 0.140 -483 D 0.155 -484 L 0.164 -485 K 0.160 -486 N 0.145 -487 H 0.132 -488 M 0.138 -489 H 0.158 -490 L 0.179 -491 H 0.196 -492 T 0.218 -493 G 0.238 -494 D 0.238 -495 R 0.210 -496 P 0.169 -497 Y 0.133 -498 E 0.107 -499 C 0.090 -500 H 0.083 -501 L 0.088 -502 C 0.102 -503 H 0.115 -504 K 0.122 -505 A 0.126 -506 F 0.131 -507 A 0.132 -508 K 0.126 -509 E 0.114 -510 D 0.101 -511 H 0.094 -512 L 0.091 -513 Q 0.093 -514 R 0.099 -515 H 0.107 -516 L 0.120 -517 K 0.140 -518 G 0.167 -519 Q 0.193 -520 N 0.217 -521 C 0.252 -522 L 0.314 -523 E 0.397 -524 V 0.478 -525 R 0.536 -526 T 0.571 -527 R 0.599 -528 R 0.627 -529 R 0.654 -530 R 0.675 -531 K 0.688 -532 D 0.693 -533 D 0.692 -534 V 0.680 -535 A 0.658 -536 A 0.629 -537 P 0.598 -538 H 0.569 -539 Y 0.556 -540 P 0.574 -541 P 0.620 -542 P 0.679 -543 S 0.730 -544 T 0.761 -545 T 0.766 -546 T 0.753 -547 S 0.739 -548 S 0.740 -549 P 0.757 -550 A 0.777 -551 G 0.787 -552 L 0.780 -553 D 0.765 -554 L 0.751 -555 S 0.746 -556 N 0.745 -557 G 0.739 -558 H 0.723 -559 L 0.696 -560 D 0.648 -561 T 0.570 -562 F 0.481 -563 H 0.413 -564 L 0.371 -565 S 0.335 -566 L 0.296 -567 A 0.272 -568 R 0.273 -569 F 0.297 -570 W 0.344 -571 E 0.414 -572 Q 0.484 -573 S 0.530 -574 A 0.543 -575 T 0.539 -576 T 0.541 -577 G 0.565 -578 P 0.615 -579 P 0.674 -580 V 0.717 -581 T 0.726 -582 T 0.706 -583 Q 0.677 -584 G 0.650 -585 P 0.617 -586 P 0.580 -587 E 0.569 -588 E 0.595 -589 E 0.614 -590 E 0.595 -591 E 0.579 -592 E 0.605 -593 G 0.645 -594 T 0.668 -595 P 0.679 -596 T 0.693 -597 T 0.712 -598 P 0.737 -599 Q 0.765 -600 A 0.789 -601 E 0.806 -602 G 0.815 -603 A 0.815 -604 M 0.803 -605 E 0.778 -606 S 0.744 -607 S 0.718 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028057.15_ENSMUST00000029692.15_GN:Rit1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028057.15_ENSMUST00000029692.15_GN:Rit1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 64e4d30b0af229a087308ead4e1d42b0914b2331..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028057.15_ENSMUST00000029692.15_GN:Rit1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,220 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000028057.15|ENSMUST00000029692.15|GN:Rit1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.472 -2 E 0.501 -3 S 0.541 -4 G 0.572 -5 A 0.589 -6 R 0.605 -7 P 0.632 -8 I 0.662 -9 G 0.680 -10 S 0.677 -11 S 0.657 -12 C 0.632 -13 S 0.614 -14 S 0.610 -15 P 0.616 -16 A 0.609 -17 A 0.564 -18 L 0.469 -19 S 0.337 -20 R 0.206 -21 E 0.110 -22 Y 0.057 -23 K 0.034 -24 L 0.028 -25 V 0.030 -26 M 0.035 -27 L 0.042 -28 G 0.053 -29 A 0.070 -30 G 0.088 -31 G 0.098 -32 V 0.098 -33 G 0.094 -34 K 0.092 -35 S 0.094 -36 A 0.099 -37 M 0.107 -38 T 0.112 -39 M 0.109 -40 Q 0.102 -41 F 0.097 -42 I 0.092 -43 S 0.091 -44 H 0.094 -45 R 0.102 -46 F 0.112 -47 P 0.125 -48 E 0.148 -49 D 0.175 -50 H 0.194 -51 D 0.195 -52 P 0.181 -53 T 0.155 -54 I 0.122 -55 E 0.091 -56 D 0.071 -57 A 0.058 -58 Y 0.047 -59 K 0.040 -60 I 0.036 -61 R 0.038 -62 I 0.043 -63 R 0.049 -64 I 0.058 -65 D 0.070 -66 D 0.086 -67 E 0.096 -68 P 0.094 -69 A 0.079 -70 N 0.060 -71 L 0.045 -72 D 0.036 -73 I 0.036 -74 L 0.046 -75 D 0.069 -76 T 0.106 -77 A 0.143 -78 G 0.166 -79 Q 0.169 -80 A 0.158 -81 E 0.146 -82 F 0.134 -83 T 0.117 -84 A 0.098 -85 M 0.080 -86 R 0.062 -87 D 0.048 -88 Q 0.040 -89 Y 0.039 -90 M 0.044 -91 R 0.054 -92 A 0.063 -93 G 0.068 -94 E 0.066 -95 G 0.055 -96 F 0.043 -97 I 0.037 -98 I 0.035 -99 C 0.035 -100 Y 0.037 -101 S 0.040 -102 I 0.043 -103 T 0.044 -104 D 0.041 -105 R 0.038 -106 R 0.037 -107 S 0.038 -108 F 0.038 -109 H 0.036 -110 E 0.032 -111 V 0.028 -112 R 0.024 -113 E 0.023 -114 F 0.027 -115 K 0.037 -116 Q 0.043 -117 L 0.040 -118 I 0.033 -119 Y 0.031 -120 R 0.034 -121 V 0.037 -122 R 0.038 -123 R 0.043 -124 T 0.056 -125 D 0.072 -126 D 0.079 -127 T 0.071 -128 P 0.054 -129 V 0.040 -130 V 0.034 -131 L 0.034 -132 V 0.035 -133 G 0.034 -134 N 0.033 -135 K 0.037 -136 S 0.043 -137 D 0.047 -138 L 0.047 -139 K 0.047 -140 Q 0.048 -141 L 0.048 -142 R 0.047 -143 Q 0.050 -144 V 0.057 -145 S 0.066 -146 K 0.072 -147 E 0.072 -148 E 0.067 -149 G 0.065 -150 L 0.070 -151 S 0.073 -152 L 0.070 -153 A 0.064 -154 R 0.058 -155 E 0.051 -156 F 0.051 -157 S 0.059 -158 C 0.065 -159 P 0.060 -160 F 0.048 -161 F 0.041 -162 E 0.039 -163 T 0.039 -164 S 0.042 -165 A 0.047 -166 A 0.053 -167 Y 0.057 -168 R 0.058 -169 Y 0.058 -170 Y 0.056 -171 I 0.050 -172 D 0.042 -173 D 0.037 -174 V 0.035 -175 F 0.036 -176 H 0.038 -177 A 0.038 -178 L 0.036 -179 V 0.032 -180 R 0.031 -181 E 0.035 -182 I 0.045 -183 R 0.059 -184 K 0.070 -185 K 0.070 -186 E 0.067 -187 K 0.076 -188 E 0.100 -189 L 0.131 -190 V 0.158 -191 L 0.179 -192 A 0.202 -193 M 0.230 -194 E 0.262 -195 K 0.299 -196 K 0.342 -197 A 0.391 -198 K 0.439 -199 P 0.479 -200 K 0.502 -201 N 0.499 -202 S 0.472 -203 V 0.431 -204 W 0.393 -205 K 0.373 -206 R 0.373 -207 L 0.387 -208 K 0.414 -209 S 0.453 -210 P 0.497 -211 F 0.537 -212 R 0.572 -213 R 0.602 -214 K 0.626 -215 K 0.642 -216 D 0.646 -217 S 0.628 -218 V 0.584 -219 T 0.539 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028057.15_ENSMUST00000029692.15_GN:Rit1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:50.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028057.15_ENSMUST00000029692.15_GN:Rit1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:50.caid deleted file mode 100644 index 47baebe3f320c524068266fb0f9b00df555e9e81..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028057.15_ENSMUST00000029692.15_GN:Rit1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:50.caid +++ /dev/null @@ -1,270 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000028057.15|ENSMUST00000029692.15|GN:Rit1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:50 -1 M 0.389 -2 P 0.396 -3 R 0.405 -4 P 0.411 -5 P 0.417 -6 A 0.444 -7 P 0.498 -8 S 0.539 -9 S 0.537 -10 R 0.523 -11 T 0.538 -12 R 0.563 -13 A 0.564 -14 G 0.532 -15 P 0.473 -16 W 0.414 -17 A 0.397 -18 V 0.434 -19 G 0.481 -20 R 0.501 -21 S 0.502 -22 W 0.514 -23 E 0.543 -24 R 0.573 -25 N 0.590 -26 A 0.586 -27 G 0.561 -28 Y 0.534 -29 H 0.521 -30 P 0.522 -31 A 0.532 -32 S 0.552 -33 K 0.576 -34 L 0.590 -35 V 0.587 -36 S 0.578 -37 E 0.564 -38 E 0.537 -39 A 0.494 -40 F 0.454 -41 P 0.440 -42 R 0.466 -43 G 0.518 -44 P 0.565 -45 G 0.583 -46 L 0.573 -47 P 0.546 -48 R 0.522 -49 R 0.529 -50 T 0.582 -51 M 0.649 -52 E 0.697 -53 S 0.716 -54 G 0.713 -55 A 0.703 -56 R 0.706 -57 P 0.728 -58 I 0.758 -59 G 0.775 -60 S 0.773 -61 S 0.755 -62 C 0.728 -63 S 0.704 -64 S 0.691 -65 P 0.687 -66 A 0.673 -67 A 0.622 -68 L 0.517 -69 S 0.369 -70 R 0.223 -71 E 0.116 -72 Y 0.058 -73 K 0.034 -74 L 0.027 -75 V 0.029 -76 M 0.034 -77 L 0.041 -78 G 0.052 -79 A 0.068 -80 G 0.086 -81 G 0.095 -82 V 0.094 -83 G 0.089 -84 K 0.087 -85 S 0.088 -86 A 0.093 -87 M 0.102 -88 T 0.107 -89 M 0.104 -90 Q 0.096 -91 F 0.089 -92 I 0.083 -93 S 0.078 -94 H 0.077 -95 R 0.083 -96 F 0.091 -97 P 0.103 -98 E 0.121 -99 D 0.144 -100 H 0.160 -101 D 0.162 -102 P 0.151 -103 T 0.129 -104 I 0.101 -105 E 0.075 -106 D 0.058 -107 A 0.048 -108 Y 0.041 -109 K 0.036 -110 I 0.033 -111 R 0.033 -112 I 0.035 -113 R 0.039 -114 I 0.046 -115 D 0.059 -116 D 0.074 -117 E 0.085 -118 P 0.085 -119 A 0.072 -120 N 0.055 -121 L 0.041 -122 D 0.033 -123 I 0.033 -124 L 0.042 -125 D 0.063 -126 T 0.096 -127 A 0.132 -128 G 0.154 -129 Q 0.158 -130 A 0.150 -131 E 0.141 -132 F 0.130 -133 T 0.115 -134 A 0.096 -135 M 0.077 -136 R 0.059 -137 D 0.045 -138 Q 0.037 -139 Y 0.036 -140 M 0.041 -141 R 0.051 -142 A 0.061 -143 G 0.068 -144 E 0.066 -145 G 0.055 -146 F 0.043 -147 I 0.036 -148 I 0.034 -149 C 0.034 -150 Y 0.035 -151 S 0.037 -152 I 0.040 -153 T 0.041 -154 D 0.039 -155 R 0.037 -156 R 0.037 -157 S 0.038 -158 F 0.037 -159 H 0.035 -160 E 0.031 -161 V 0.027 -162 R 0.023 -163 E 0.019 -164 F 0.017 -165 K 0.016 -166 Q 0.017 -167 L 0.020 -168 I 0.024 -169 Y 0.030 -170 R 0.035 -171 V 0.039 -172 R 0.040 -173 R 0.044 -174 T 0.057 -175 D 0.073 -176 D 0.079 -177 T 0.071 -178 P 0.054 -179 V 0.040 -180 V 0.033 -181 L 0.033 -182 V 0.034 -183 G 0.033 -184 N 0.032 -185 K 0.035 -186 S 0.041 -187 D 0.045 -188 L 0.046 -189 K 0.046 -190 Q 0.047 -191 L 0.046 -192 R 0.046 -193 Q 0.047 -194 V 0.052 -195 S 0.055 -196 K 0.053 -197 E 0.048 -198 E 0.047 -199 G 0.053 -200 L 0.064 -201 S 0.067 -202 L 0.058 -203 A 0.043 -204 R 0.032 -205 E 0.029 -206 F 0.037 -207 S 0.049 -208 C 0.054 -209 P 0.049 -210 F 0.039 -211 F 0.035 -212 E 0.035 -213 T 0.036 -214 S 0.038 -215 A 0.043 -216 A 0.048 -217 Y 0.051 -218 R 0.052 -219 Y 0.051 -220 Y 0.050 -221 I 0.045 -222 D 0.039 -223 D 0.035 -224 V 0.034 -225 F 0.034 -226 H 0.035 -227 A 0.035 -228 L 0.034 -229 V 0.030 -230 R 0.030 -231 E 0.034 -232 I 0.044 -233 R 0.058 -234 K 0.069 -235 K 0.068 -236 E 0.065 -237 K 0.073 -238 E 0.098 -239 L 0.130 -240 V 0.158 -241 L 0.181 -242 A 0.207 -243 M 0.236 -244 E 0.269 -245 K 0.305 -246 K 0.348 -247 A 0.395 -248 K 0.442 -249 P 0.484 -250 K 0.509 -251 N 0.509 -252 S 0.483 -253 V 0.442 -254 W 0.405 -255 K 0.388 -256 R 0.390 -257 L 0.405 -258 K 0.433 -259 S 0.471 -260 P 0.514 -261 F 0.555 -262 R 0.590 -263 R 0.619 -264 K 0.643 -265 K 0.658 -266 D 0.661 -267 S 0.643 -268 V 0.598 -269 T 0.553 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028322.12_ENSMUST00000030003.10_GN:Exosc3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028322.12_ENSMUST00000030003.10_GN:Exosc3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index f5a371bcaad7dc765d1ee42715bf7bcd2577a310..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028322.12_ENSMUST00000030003.10_GN:Exosc3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,275 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000028322.12|ENSMUST00000030003.10|GN:Exosc3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.365 -2 A 0.388 -3 E 0.426 -4 V 0.466 -5 L 0.492 -6 S 0.501 -7 A 0.504 -8 G 0.510 -9 P 0.518 -10 E 0.528 -11 S 0.537 -12 V 0.542 -13 A 0.536 -14 G 0.515 -15 C 0.468 -16 R 0.395 -17 A 0.310 -18 R 0.229 -19 A 0.168 -20 V 0.126 -21 H 0.098 -22 K 0.080 -23 V 0.073 -24 L 0.074 -25 N 0.081 -26 Q 0.091 -27 V 0.100 -28 V 0.104 -29 L 0.102 -30 P 0.094 -31 G 0.087 -32 E 0.080 -33 E 0.076 -34 L 0.083 -35 V 0.111 -36 L 0.167 -37 P 0.245 -38 D 0.337 -39 H 0.434 -40 E 0.522 -41 D 0.592 -42 V 0.645 -43 D 0.683 -44 G 0.706 -45 L 0.719 -46 G 0.726 -47 G 0.723 -48 A 0.706 -49 G 0.678 -50 E 0.647 -51 Q 0.623 -52 P 0.616 -53 L 0.626 -54 R 0.643 -55 L 0.654 -56 N 0.646 -57 A 0.618 -58 G 0.581 -59 A 0.544 -60 R 0.512 -61 P 0.474 -62 R 0.415 -63 L 0.337 -64 R 0.261 -65 V 0.204 -66 V 0.165 -67 C 0.142 -68 G 0.131 -69 P 0.124 -70 G 0.114 -71 L 0.103 -72 R 0.094 -73 R 0.087 -74 C 0.078 -75 G 0.069 -76 D 0.062 -77 R 0.059 -78 L 0.059 -79 L 0.061 -80 V 0.066 -81 T 0.075 -82 K 0.088 -83 C 0.100 -84 G 0.106 -85 R 0.102 -86 L 0.096 -87 R 0.100 -88 H 0.120 -89 K 0.158 -90 E 0.209 -91 P 0.264 -92 S 0.314 -93 G 0.345 -94 G 0.348 -95 G 0.320 -96 G 0.269 -97 G 0.210 -98 V 0.163 -99 Y 0.143 -100 W 0.152 -101 V 0.177 -102 D 0.197 -103 S 0.202 -104 Q 0.195 -105 Q 0.183 -106 K 0.170 -107 R 0.154 -108 Y 0.139 -109 V 0.131 -110 P 0.130 -111 V 0.128 -112 K 0.124 -113 G 0.116 -114 D 0.104 -115 H 0.086 -116 V 0.069 -117 I 0.056 -118 G 0.048 -119 I 0.044 -120 V 0.045 -121 I 0.053 -122 A 0.066 -123 K 0.079 -124 S 0.082 -125 G 0.073 -126 D 0.055 -127 I 0.041 -128 F 0.035 -129 K 0.036 -130 V 0.041 -131 D 0.046 -132 V 0.052 -133 G 0.064 -134 G 0.078 -135 S 0.088 -136 E 0.087 -137 P 0.078 -138 A 0.068 -139 S 0.062 -140 L 0.062 -141 S 0.067 -142 Y 0.077 -143 L 0.097 -144 A 0.124 -145 F 0.147 -146 E 0.155 -147 G 0.156 -148 A 0.153 -149 T 0.146 -150 K 0.137 -151 R 0.135 -152 N 0.144 -153 R 0.155 -154 P 0.159 -155 N 0.153 -156 V 0.142 -157 Q 0.132 -158 V 0.130 -159 G 0.135 -160 D 0.134 -161 L 0.119 -162 I 0.095 -163 Y 0.072 -164 G 0.058 -165 Q 0.054 -166 C 0.057 -167 V 0.067 -168 V 0.086 -169 A 0.110 -170 N 0.126 -171 K 0.135 -172 D 0.144 -173 M 0.152 -174 E 0.150 -175 P 0.137 -176 E 0.122 -177 M 0.120 -178 V 0.137 -179 C 0.168 -180 I 0.199 -181 D 0.219 -182 S 0.227 -183 C 0.228 -184 G 0.227 -185 R 0.234 -186 A 0.250 -187 N 0.263 -188 G 0.268 -189 M 0.263 -190 G 0.245 -191 V 0.216 -192 I 0.189 -193 G 0.173 -194 Q 0.160 -195 D 0.142 -196 G 0.120 -197 L 0.099 -198 L 0.084 -199 F 0.076 -200 K 0.073 -201 V 0.066 -202 T 0.052 -203 L 0.039 -204 G 0.033 -205 L 0.035 -206 I 0.042 -207 R 0.051 -208 K 0.060 -209 L 0.072 -210 L 0.090 -211 A 0.112 -212 P 0.127 -213 D 0.122 -214 C 0.099 -215 E 0.073 -216 I 0.058 -217 V 0.057 -218 Q 0.060 -219 E 0.057 -220 L 0.051 -221 G 0.047 -222 K 0.048 -223 L 0.049 -224 Y 0.048 -225 P 0.044 -226 L 0.041 -227 E 0.040 -228 I 0.040 -229 V 0.039 -230 F 0.039 -231 G 0.042 -232 M 0.048 -233 N 0.057 -234 G 0.062 -235 R 0.062 -236 I 0.061 -237 W 0.062 -238 V 0.067 -239 K 0.072 -240 A 0.076 -241 K 0.076 -242 T 0.072 -243 I 0.063 -244 Q 0.054 -245 Q 0.048 -246 T 0.048 -247 L 0.053 -248 I 0.059 -249 L 0.064 -250 A 0.064 -251 N 0.062 -252 V 0.059 -253 L 0.058 -254 E 0.057 -255 A 0.058 -256 C 0.059 -257 E 0.060 -258 H 0.060 -259 M 0.061 -260 T 0.067 -261 T 0.077 -262 E 0.083 -263 Q 0.076 -264 R 0.068 -265 K 0.069 -266 Q 0.077 -267 I 0.084 -268 F 0.092 -269 A 0.102 -270 R 0.111 -271 L 0.123 -272 A 0.144 -273 E 0.171 -274 S 0.192 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028322.12_ENSMUST00000030003.10_GN:Exosc3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028322.12_ENSMUST00000030003.10_GN:Exosc3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid deleted file mode 100644 index 2098f75392736a9a8c1e52564ee4e1ffee65a4f4..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028322.12_ENSMUST00000030003.10_GN:Exosc3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid +++ /dev/null @@ -1,280 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000028322.12|ENSMUST00000030003.10|GN:Exosc3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:5 -1 M 0.318 -2 V 0.327 -3 T 0.347 -4 P 0.370 -5 A 0.372 -6 M 0.343 -7 A 0.310 -8 E 0.307 -9 V 0.338 -10 L 0.377 -11 S 0.404 -12 A 0.416 -13 G 0.420 -14 P 0.428 -15 E 0.444 -16 S 0.464 -17 V 0.475 -18 A 0.470 -19 G 0.446 -20 C 0.399 -21 R 0.334 -22 A 0.261 -23 R 0.194 -24 A 0.144 -25 V 0.109 -26 H 0.086 -27 K 0.071 -28 V 0.066 -29 L 0.068 -30 N 0.075 -31 Q 0.085 -32 V 0.095 -33 V 0.100 -34 L 0.099 -35 P 0.092 -36 G 0.085 -37 E 0.079 -38 E 0.076 -39 L 0.083 -40 V 0.113 -41 L 0.170 -42 P 0.247 -43 D 0.339 -44 H 0.434 -45 E 0.522 -46 D 0.592 -47 V 0.647 -48 D 0.686 -49 G 0.710 -50 L 0.724 -51 G 0.732 -52 G 0.729 -53 A 0.712 -54 G 0.684 -55 E 0.652 -56 Q 0.627 -57 P 0.619 -58 L 0.627 -59 R 0.644 -60 L 0.653 -61 N 0.642 -62 A 0.612 -63 G 0.572 -64 A 0.534 -65 R 0.501 -66 P 0.463 -67 R 0.404 -68 L 0.326 -69 R 0.251 -70 V 0.196 -71 V 0.160 -72 C 0.139 -73 G 0.128 -74 P 0.121 -75 G 0.111 -76 L 0.099 -77 R 0.090 -78 R 0.083 -79 C 0.076 -80 G 0.067 -81 D 0.060 -82 R 0.058 -83 L 0.058 -84 L 0.059 -85 V 0.064 -86 T 0.073 -87 K 0.085 -88 C 0.097 -89 G 0.102 -90 R 0.099 -91 L 0.093 -92 R 0.097 -93 H 0.117 -94 K 0.154 -95 E 0.203 -96 P 0.257 -97 S 0.305 -98 G 0.335 -99 G 0.339 -100 G 0.314 -101 G 0.265 -102 G 0.207 -103 V 0.160 -104 Y 0.140 -105 W 0.149 -106 V 0.174 -107 D 0.194 -108 S 0.199 -109 Q 0.193 -110 Q 0.183 -111 K 0.170 -112 R 0.155 -113 Y 0.140 -114 V 0.132 -115 P 0.130 -116 V 0.129 -117 K 0.124 -118 G 0.116 -119 D 0.104 -120 H 0.086 -121 V 0.068 -122 I 0.055 -123 G 0.048 -124 I 0.044 -125 V 0.045 -126 I 0.053 -127 A 0.066 -128 K 0.079 -129 S 0.083 -130 G 0.073 -131 D 0.056 -132 I 0.041 -133 F 0.035 -134 K 0.037 -135 V 0.042 -136 D 0.046 -137 V 0.053 -138 G 0.065 -139 G 0.079 -140 S 0.089 -141 E 0.088 -142 P 0.078 -143 A 0.067 -144 S 0.061 -145 L 0.061 -146 S 0.066 -147 Y 0.077 -148 L 0.097 -149 A 0.125 -150 F 0.147 -151 E 0.156 -152 G 0.157 -153 A 0.154 -154 T 0.147 -155 K 0.137 -156 R 0.136 -157 N 0.144 -158 R 0.155 -159 P 0.159 -160 N 0.154 -161 V 0.142 -162 Q 0.132 -163 V 0.130 -164 G 0.135 -165 D 0.135 -166 L 0.120 -167 I 0.095 -168 Y 0.072 -169 G 0.058 -170 Q 0.054 -171 C 0.057 -172 V 0.067 -173 V 0.087 -174 A 0.110 -175 N 0.126 -176 K 0.134 -177 D 0.143 -178 M 0.151 -179 E 0.149 -180 P 0.136 -181 E 0.122 -182 M 0.119 -183 V 0.136 -184 C 0.166 -185 I 0.197 -186 D 0.217 -187 S 0.225 -188 C 0.225 -189 G 0.225 -190 R 0.231 -191 A 0.245 -192 N 0.258 -193 G 0.262 -194 M 0.258 -195 G 0.241 -196 V 0.213 -197 I 0.186 -198 G 0.170 -199 Q 0.157 -200 D 0.140 -201 G 0.118 -202 L 0.097 -203 L 0.082 -204 F 0.075 -205 K 0.072 -206 V 0.065 -207 T 0.051 -208 L 0.039 -209 G 0.033 -210 L 0.035 -211 I 0.042 -212 R 0.050 -213 K 0.059 -214 L 0.070 -215 L 0.088 -216 A 0.111 -217 P 0.125 -218 D 0.121 -219 C 0.098 -220 E 0.072 -221 I 0.058 -222 V 0.058 -223 Q 0.061 -224 E 0.058 -225 L 0.051 -226 G 0.047 -227 K 0.047 -228 L 0.049 -229 Y 0.047 -230 P 0.044 -231 L 0.041 -232 E 0.040 -233 I 0.040 -234 V 0.040 -235 F 0.039 -236 G 0.042 -237 M 0.048 -238 N 0.056 -239 G 0.062 -240 R 0.062 -241 I 0.061 -242 W 0.063 -243 V 0.067 -244 K 0.072 -245 A 0.075 -246 K 0.075 -247 T 0.071 -248 I 0.062 -249 Q 0.053 -250 Q 0.048 -251 T 0.048 -252 L 0.052 -253 I 0.059 -254 L 0.063 -255 A 0.064 -256 N 0.062 -257 V 0.059 -258 L 0.058 -259 E 0.058 -260 A 0.058 -261 C 0.059 -262 E 0.060 -263 H 0.060 -264 M 0.061 -265 T 0.067 -266 T 0.077 -267 E 0.082 -268 Q 0.076 -269 R 0.068 -270 K 0.069 -271 Q 0.077 -272 I 0.084 -273 F 0.091 -274 A 0.101 -275 R 0.111 -276 L 0.123 -277 A 0.143 -278 E 0.171 -279 S 0.192 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028647.14_ENSMUST00000106202.4_GN:Mycbp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028647.14_ENSMUST00000106202.4_GN:Mycbp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 72e8d6af521ac322b957f3835e55333477d5e3a9..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028647.14_ENSMUST00000106202.4_GN:Mycbp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,147 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000028647.14|ENSMUST00000106202.4|GN:Mycbp|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.345 -2 A 0.352 -3 H 0.354 -4 Y 0.343 -5 K 0.317 -6 A 0.283 -7 A 0.249 -8 D 0.222 -9 S 0.194 -10 K 0.162 -11 R 0.134 -12 E 0.120 -13 Q 0.118 -14 F 0.124 -15 R 0.132 -16 R 0.134 -17 Y 0.131 -18 L 0.135 -19 E 0.149 -20 K 0.168 -21 S 0.183 -22 G 0.188 -23 V 0.179 -24 L 0.159 -25 D 0.140 -26 T 0.128 -27 L 0.117 -28 T 0.102 -29 K 0.086 -30 V 0.076 -31 L 0.071 -32 V 0.069 -33 A 0.071 -34 L 0.076 -35 Y 0.083 -36 E 0.091 -37 E 0.103 -38 P 0.118 -39 E 0.131 -40 K 0.137 -41 P 0.135 -42 T 0.130 -43 S 0.124 -44 A 0.115 -45 L 0.105 -46 D 0.095 -47 F 0.091 -48 L 0.093 -49 K 0.101 -50 H 0.118 -51 H 0.159 -52 L 0.238 -53 G 0.350 -54 A 0.463 -55 A 0.539 -56 T 0.560 -57 P 0.539 -58 E 0.490 -59 N 0.433 -60 P 0.382 -61 E 0.345 -62 I 0.325 -63 E 0.314 -64 L 0.299 -65 L 0.276 -66 R 0.264 -67 L 0.266 -68 E 0.262 -69 L 0.236 -70 A 0.208 -71 E 0.199 -72 M 0.207 -73 K 0.217 -74 E 0.224 -75 K 0.224 -76 Y 0.222 -77 E 0.225 -78 A 0.224 -79 T 0.217 -80 V 0.215 -81 E 0.222 -82 E 0.225 -83 N 0.220 -84 K 0.208 -85 K 0.198 -86 L 0.196 -87 K 0.201 -88 A 0.206 -89 K 0.210 -90 V 0.212 -91 N 0.213 -92 L 0.211 -93 K 0.210 -94 K 0.214 -95 K 0.219 -96 L 0.223 -97 K 0.231 -98 L 0.244 -99 K 0.263 -100 N 0.283 -101 N 0.298 -102 L 0.312 -103 V 0.329 -104 S 0.341 -105 N 0.337 -106 D 0.319 -107 Y 0.298 -108 L 0.277 -109 T 0.259 -110 K 0.254 -111 S 0.265 -112 L 0.285 -113 L 0.314 -114 Q 0.349 -115 A 0.367 -116 R 0.370 -117 D 0.383 -118 V 0.410 -119 C 0.431 -120 S 0.445 -121 S 0.454 -122 V 0.446 -123 V 0.420 -124 E 0.401 -125 H 0.408 -126 L 0.439 -127 S 0.486 -128 G 0.537 -129 M 0.575 -130 C 0.590 -131 K 0.593 -132 G 0.605 -133 P 0.637 -134 G 0.675 -135 S 0.702 -136 H 0.713 -137 L 0.716 -138 Q 0.718 -139 H 0.718 -140 D 0.716 -141 K 0.710 -142 T 0.700 -143 R 0.683 -144 V 0.640 -145 N 0.571 -146 N 0.511 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028647.14_ENSMUST00000106202.4_GN:Mycbp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028647.14_ENSMUST00000106202.4_GN:Mycbp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid deleted file mode 100644 index c562005410f147ffd88db4529f6602fb75305557..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028647.14_ENSMUST00000106202.4_GN:Mycbp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid +++ /dev/null @@ -1,170 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000028647.14|ENSMUST00000106202.4|GN:Mycbp|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:23 -1 M 0.472 -2 S 0.502 -3 S 0.543 -4 E 0.566 -5 A 0.555 -6 W 0.530 -7 S 0.530 -8 P 0.575 -9 P 0.640 -10 A 0.691 -11 R 0.713 -12 V 0.714 -13 S 0.703 -14 G 0.680 -15 A 0.634 -16 S 0.564 -17 Y 0.491 -18 A 0.447 -19 A 0.444 -20 V 0.463 -21 A 0.474 -22 V 0.459 -23 T 0.417 -24 M 0.369 -25 A 0.332 -26 H 0.303 -27 Y 0.276 -28 K 0.245 -29 A 0.211 -30 A 0.185 -31 D 0.169 -32 S 0.154 -33 K 0.135 -34 R 0.121 -35 E 0.112 -36 Q 0.110 -37 F 0.115 -38 R 0.123 -39 R 0.128 -40 Y 0.126 -41 L 0.129 -42 E 0.142 -43 K 0.159 -44 S 0.174 -45 G 0.181 -46 V 0.174 -47 L 0.157 -48 D 0.139 -49 T 0.128 -50 L 0.119 -51 T 0.104 -52 K 0.089 -53 V 0.078 -54 L 0.073 -55 V 0.071 -56 A 0.073 -57 L 0.078 -58 Y 0.085 -59 E 0.094 -60 E 0.105 -61 P 0.120 -62 E 0.132 -63 K 0.138 -64 P 0.135 -65 T 0.130 -66 S 0.122 -67 A 0.112 -68 L 0.101 -69 D 0.090 -70 F 0.085 -71 L 0.087 -72 K 0.095 -73 H 0.111 -74 H 0.151 -75 L 0.226 -76 G 0.336 -77 A 0.450 -78 A 0.528 -79 T 0.553 -80 P 0.531 -81 E 0.481 -82 N 0.422 -83 P 0.372 -84 E 0.336 -85 I 0.317 -86 E 0.308 -87 L 0.294 -88 L 0.272 -89 R 0.261 -90 L 0.265 -91 E 0.262 -92 L 0.237 -93 A 0.207 -94 E 0.196 -95 M 0.202 -96 K 0.210 -97 E 0.214 -98 K 0.211 -99 Y 0.205 -100 E 0.203 -101 A 0.199 -102 T 0.192 -103 V 0.192 -104 E 0.201 -105 E 0.207 -106 N 0.203 -107 K 0.194 -108 K 0.186 -109 L 0.184 -110 K 0.188 -111 A 0.193 -112 K 0.196 -113 V 0.199 -114 N 0.202 -115 L 0.203 -116 K 0.204 -117 K 0.211 -118 K 0.220 -119 L 0.229 -120 K 0.240 -121 L 0.257 -122 K 0.278 -123 N 0.297 -124 N 0.312 -125 L 0.326 -126 V 0.343 -127 S 0.354 -128 N 0.349 -129 D 0.330 -130 Y 0.308 -131 L 0.286 -132 T 0.268 -133 K 0.262 -134 S 0.270 -135 L 0.285 -136 L 0.311 -137 Q 0.346 -138 A 0.367 -139 R 0.373 -140 D 0.388 -141 V 0.414 -142 C 0.433 -143 S 0.445 -144 S 0.455 -145 V 0.450 -146 V 0.425 -147 E 0.405 -148 H 0.414 -149 L 0.448 -150 S 0.496 -151 G 0.548 -152 M 0.586 -153 C 0.601 -154 K 0.604 -155 G 0.615 -156 P 0.645 -157 G 0.683 -158 S 0.709 -159 H 0.720 -160 L 0.723 -161 Q 0.723 -162 H 0.722 -163 D 0.720 -164 K 0.713 -165 T 0.704 -166 R 0.685 -167 V 0.642 -168 N 0.572 -169 N 0.512 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028648.14_ENSMUST00000106207.8_GN:Ndufs5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028648.14_ENSMUST00000106207.8_GN:Ndufs5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 07df6ca30b6c20786de05b385e10673fbd31f009..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028648.14_ENSMUST00000106207.8_GN:Ndufs5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,107 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000028648.14|ENSMUST00000106207.8|GN:Ndufs5|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.345 -2 P 0.333 -3 F 0.315 -4 L 0.293 -5 D 0.262 -6 I 0.232 -7 Q 0.219 -8 K 0.230 -9 K 0.256 -10 L 0.283 -11 G 0.300 -12 I 0.297 -13 S 0.278 -14 L 0.252 -15 D 0.233 -16 R 0.233 -17 H 0.256 -18 F 0.295 -19 M 0.336 -20 F 0.364 -21 L 0.367 -22 S 0.344 -23 A 0.304 -24 E 0.267 -25 Q 0.240 -26 P 0.223 -27 Y 0.216 -28 K 0.224 -29 N 0.238 -30 A 0.236 -31 A 0.208 -32 R 0.166 -33 C 0.130 -34 H 0.107 -35 A 0.097 -36 F 0.098 -37 E 0.109 -38 K 0.115 -39 E 0.107 -40 W 0.092 -41 I 0.083 -42 E 0.080 -43 C 0.086 -44 A 0.106 -45 H 0.135 -46 G 0.160 -47 I 0.171 -48 G 0.165 -49 G 0.146 -50 T 0.120 -51 R 0.098 -52 A 0.083 -53 K 0.072 -54 K 0.062 -55 E 0.057 -56 C 0.058 -57 K 0.064 -58 I 0.074 -59 E 0.086 -60 F 0.097 -61 D 0.102 -62 D 0.097 -63 F 0.085 -64 E 0.075 -65 E 0.068 -66 C 0.062 -67 L 0.061 -68 L 0.066 -69 R 0.074 -70 Y 0.088 -71 K 0.109 -72 T 0.134 -73 M 0.156 -74 R 0.175 -75 R 0.190 -76 M 0.199 -77 H 0.202 -78 D 0.202 -79 I 0.197 -80 K 0.184 -81 K 0.168 -82 Q 0.153 -83 R 0.139 -84 E 0.131 -85 K 0.128 -86 L 0.125 -87 M 0.120 -88 K 0.119 -89 E 0.132 -90 G 0.161 -91 K 0.198 -92 Y 0.236 -93 T 0.279 -94 P 0.331 -95 P 0.387 -96 P 0.435 -97 H 0.472 -98 H 0.505 -99 S 0.529 -100 G 0.532 -101 R 0.512 -102 E 0.480 -103 E 0.444 -104 P 0.404 -105 R 0.365 -106 P 0.340 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028648.14_ENSMUST00000106207.8_GN:Ndufs5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:65.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028648.14_ENSMUST00000106207.8_GN:Ndufs5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:65.caid deleted file mode 100644 index 0fabfdd6c02fd9f6928a648bd2c5335c965db574..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028648.14_ENSMUST00000106207.8_GN:Ndufs5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:65.caid +++ /dev/null @@ -1,172 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000028648.14|ENSMUST00000106207.8|GN:Ndufs5|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:65 -1 M 0.377 -2 K 0.376 -3 K 0.377 -4 S 0.375 -5 R 0.362 -6 L 0.338 -7 F 0.308 -8 S 0.271 -9 L 0.227 -10 Q 0.186 -11 C 0.160 -12 D 0.144 -13 L 0.132 -14 K 0.124 -15 L 0.118 -16 A 0.111 -17 W 0.108 -18 A 0.110 -19 R 0.112 -20 W 0.109 -21 D 0.108 -22 A 0.111 -23 I 0.125 -24 W 0.161 -25 K 0.223 -26 N 0.296 -27 K 0.363 -28 K 0.421 -29 L 0.477 -30 G 0.525 -31 E 0.559 -32 K 0.585 -33 R 0.613 -34 F 0.646 -35 G 0.676 -36 A 0.693 -37 S 0.690 -38 G 0.659 -39 L 0.601 -40 A 0.537 -41 D 0.496 -42 E 0.481 -43 V 0.468 -44 P 0.447 -45 R 0.427 -46 F 0.410 -47 F 0.393 -48 S 0.370 -49 E 0.337 -50 A 0.296 -51 C 0.263 -52 H 0.251 -53 L 0.257 -54 I 0.273 -55 T 0.298 -56 L 0.332 -57 L 0.370 -58 S 0.413 -59 P 0.461 -60 G 0.500 -61 C 0.522 -62 S 0.531 -63 F 0.527 -64 T 0.502 -65 A 0.470 -66 M 0.453 -67 P 0.453 -68 F 0.444 -69 L 0.413 -70 D 0.376 -71 I 0.361 -72 Q 0.381 -73 K 0.429 -74 K 0.485 -75 L 0.532 -76 G 0.555 -77 I 0.547 -78 S 0.514 -79 L 0.463 -80 D 0.405 -81 R 0.363 -82 H 0.360 -83 F 0.383 -84 M 0.403 -85 F 0.402 -86 L 0.383 -87 S 0.353 -88 A 0.316 -89 E 0.283 -90 Q 0.258 -91 P 0.238 -92 Y 0.223 -93 K 0.222 -94 N 0.231 -95 A 0.230 -96 A 0.205 -97 R 0.164 -98 C 0.126 -99 H 0.102 -100 A 0.091 -101 F 0.094 -102 E 0.107 -103 K 0.113 -104 E 0.104 -105 W 0.088 -106 I 0.078 -107 E 0.077 -108 C 0.084 -109 A 0.104 -110 H 0.131 -111 G 0.153 -112 I 0.160 -113 G 0.151 -114 G 0.132 -115 T 0.109 -116 R 0.090 -117 A 0.079 -118 K 0.069 -119 K 0.059 -120 E 0.054 -121 C 0.055 -122 K 0.060 -123 I 0.069 -124 E 0.081 -125 F 0.092 -126 D 0.098 -127 D 0.093 -128 F 0.083 -129 E 0.074 -130 E 0.068 -131 C 0.063 -132 L 0.063 -133 L 0.068 -134 R 0.076 -135 Y 0.087 -136 K 0.103 -137 T 0.122 -138 M 0.142 -139 R 0.160 -140 R 0.171 -141 M 0.176 -142 H 0.179 -143 D 0.180 -144 I 0.176 -145 K 0.168 -146 K 0.160 -147 Q 0.151 -148 R 0.141 -149 E 0.135 -150 K 0.134 -151 L 0.133 -152 M 0.131 -153 K 0.132 -154 E 0.146 -155 G 0.178 -156 K 0.219 -157 Y 0.257 -158 T 0.294 -159 P 0.338 -160 P 0.388 -161 P 0.436 -162 H 0.478 -163 H 0.518 -164 S 0.548 -165 G 0.556 -166 R 0.540 -167 E 0.508 -168 E 0.469 -169 P 0.425 -170 R 0.382 -171 P 0.354 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028669.16_ENSMUST00000105851.9_GN:Pithd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028669.16_ENSMUST00000105851.9_GN:Pithd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index a36e8136b0d1dbdbb266c6acc7a41e028d763681..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028669.16_ENSMUST00000105851.9_GN:Pithd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,212 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000028669.16|ENSMUST00000105851.9|GN:Pithd1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.428 -2 S 0.437 -3 H 0.449 -4 G 0.449 -5 H 0.433 -6 S 0.439 -7 H 0.497 -8 G 0.578 -9 G 0.631 -10 G 0.636 -11 G 0.608 -12 C 0.569 -13 R 0.542 -14 C 0.537 -15 A 0.539 -16 A 0.527 -17 E 0.488 -18 R 0.430 -19 E 0.372 -20 E 0.333 -21 P 0.309 -22 P 0.286 -23 E 0.259 -24 Q 0.236 -25 R 0.213 -26 G 0.189 -27 L 0.163 -28 A 0.138 -29 Y 0.113 -30 G 0.090 -31 L 0.072 -32 Y 0.060 -33 L 0.051 -34 R 0.046 -35 I 0.041 -36 D 0.037 -37 L 0.033 -38 E 0.029 -39 R 0.026 -40 L 0.029 -41 Q 0.038 -42 C 0.051 -43 L 0.063 -44 N 0.070 -45 E 0.079 -46 S 0.093 -47 R 0.112 -48 E 0.128 -49 G 0.131 -50 S 0.119 -51 G 0.101 -52 R 0.090 -53 G 0.089 -54 V 0.087 -55 F 0.078 -56 K 0.069 -57 P 0.063 -58 W 0.060 -59 E 0.058 -60 E 0.059 -61 R 0.064 -62 T 0.079 -63 D 0.101 -64 R 0.125 -65 S 0.138 -66 K 0.133 -67 F 0.118 -68 V 0.107 -69 E 0.107 -70 S 0.115 -71 D 0.125 -72 A 0.128 -73 D 0.123 -74 E 0.108 -75 E 0.087 -76 L 0.066 -77 L 0.052 -78 F 0.049 -79 N 0.055 -80 I 0.065 -81 P 0.071 -82 F 0.076 -83 T 0.079 -84 G 0.078 -85 N 0.074 -86 V 0.068 -87 K 0.060 -88 L 0.050 -89 K 0.042 -90 G 0.038 -91 V 0.037 -92 I 0.037 -93 I 0.042 -94 M 0.052 -95 G 0.065 -96 E 0.073 -97 D 0.077 -98 D 0.078 -99 D 0.076 -100 S 0.069 -101 H 0.061 -102 P 0.053 -103 S 0.045 -104 E 0.039 -105 M 0.033 -106 R 0.031 -107 L 0.032 -108 Y 0.037 -109 K 0.043 -110 N 0.050 -111 I 0.058 -112 P 0.064 -113 Q 0.063 -114 M 0.060 -115 S 0.057 -116 F 0.056 -117 D 0.056 -118 D 0.057 -119 T 0.060 -120 E 0.065 -121 R 0.070 -122 E 0.073 -123 P 0.069 -124 E 0.062 -125 Q 0.058 -126 T 0.059 -127 F 0.064 -128 S 0.069 -129 L 0.075 -130 N 0.080 -131 R 0.088 -132 D 0.096 -133 I 0.101 -134 T 0.101 -135 G 0.094 -136 E 0.082 -137 L 0.066 -138 E 0.052 -139 Y 0.046 -140 A 0.045 -141 T 0.045 -142 K 0.044 -143 I 0.043 -144 S 0.043 -145 R 0.042 -146 F 0.039 -147 S 0.039 -148 N 0.042 -149 V 0.041 -150 Y 0.035 -151 H 0.029 -152 L 0.026 -153 S 0.029 -154 I 0.035 -155 H 0.045 -156 I 0.056 -157 S 0.066 -158 K 0.075 -159 N 0.083 -160 F 0.089 -161 G 0.092 -162 A 0.090 -163 D 0.083 -164 T 0.071 -165 T 0.058 -166 K 0.047 -167 I 0.039 -168 F 0.032 -169 Y 0.028 -170 I 0.026 -171 G 0.028 -172 L 0.034 -173 R 0.046 -174 G 0.062 -175 E 0.082 -176 W 0.110 -177 T 0.158 -178 E 0.228 -179 L 0.313 -180 R 0.399 -181 R 0.481 -182 H 0.550 -183 E 0.597 -184 V 0.619 -185 T 0.627 -186 I 0.636 -187 C 0.648 -188 N 0.665 -189 Y 0.688 -190 E 0.707 -191 A 0.712 -192 S 0.699 -193 A 0.676 -194 N 0.656 -195 P 0.649 -196 A 0.653 -197 D 0.663 -198 H 0.672 -199 R 0.670 -200 V 0.639 -201 H 0.583 -202 Q 0.543 -203 V 0.546 -204 T 0.557 -205 P 0.544 -206 Q 0.532 -207 T 0.552 -208 H 0.582 -209 F 0.577 -210 I 0.529 -211 S 0.481 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028669.16_ENSMUST00000105851.9_GN:Pithd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:43.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028669.16_ENSMUST00000105851.9_GN:Pithd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:43.caid deleted file mode 100644 index 7da5436cfeb4e19aa0a67ca489b9207f66588a68..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028669.16_ENSMUST00000105851.9_GN:Pithd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:43.caid +++ /dev/null @@ -1,255 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000028669.16|ENSMUST00000105851.9|GN:Pithd1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:43 -1 M 0.431 -2 R 0.445 -3 R 0.480 -4 A 0.529 -5 G 0.570 -6 A 0.588 -7 P 0.586 -8 F 0.573 -9 T 0.552 -10 T 0.526 -11 P 0.495 -12 R 0.460 -13 W 0.426 -14 R 0.401 -15 R 0.390 -16 L 0.390 -17 A 0.400 -18 V 0.418 -19 V 0.447 -20 A 0.488 -21 E 0.532 -22 P 0.569 -23 S 0.593 -24 E 0.607 -25 L 0.620 -26 R 0.644 -27 V 0.680 -28 S 0.721 -29 G 0.752 -30 G 0.762 -31 A 0.758 -32 E 0.754 -33 G 0.755 -34 V 0.753 -35 T 0.740 -36 G 0.708 -37 E 0.641 -38 P 0.540 -39 A 0.457 -40 G 0.452 -41 G 0.502 -42 V 0.537 -43 A 0.554 -44 M 0.596 -45 S 0.655 -46 H 0.692 -47 G 0.702 -48 H 0.702 -49 S 0.704 -50 H 0.714 -51 G 0.728 -52 G 0.736 -53 G 0.725 -54 G 0.695 -55 C 0.662 -56 R 0.646 -57 C 0.646 -58 A 0.643 -59 A 0.619 -60 E 0.569 -61 R 0.495 -62 E 0.416 -63 E 0.355 -64 P 0.314 -65 P 0.278 -66 E 0.242 -67 Q 0.212 -68 R 0.187 -69 G 0.164 -70 L 0.141 -71 A 0.121 -72 Y 0.102 -73 G 0.084 -74 L 0.070 -75 Y 0.059 -76 L 0.051 -77 R 0.045 -78 I 0.040 -79 D 0.034 -80 L 0.030 -81 E 0.026 -82 R 0.023 -83 L 0.025 -84 Q 0.034 -85 C 0.046 -86 L 0.057 -87 N 0.064 -88 E 0.072 -89 S 0.084 -90 R 0.100 -91 E 0.115 -92 G 0.119 -93 S 0.108 -94 G 0.092 -95 R 0.083 -96 G 0.082 -97 V 0.081 -98 F 0.072 -99 K 0.063 -100 P 0.057 -101 W 0.053 -102 E 0.052 -103 E 0.053 -104 R 0.059 -105 T 0.073 -106 D 0.095 -107 R 0.119 -108 S 0.133 -109 K 0.129 -110 F 0.114 -111 V 0.103 -112 E 0.101 -113 S 0.108 -114 D 0.117 -115 A 0.121 -116 D 0.116 -117 E 0.103 -118 E 0.083 -119 L 0.063 -120 L 0.049 -121 F 0.047 -122 N 0.054 -123 I 0.063 -124 P 0.069 -125 F 0.072 -126 T 0.075 -127 G 0.075 -128 N 0.071 -129 V 0.065 -130 K 0.057 -131 L 0.048 -132 K 0.040 -133 G 0.035 -134 V 0.034 -135 I 0.035 -136 I 0.040 -137 M 0.051 -138 G 0.064 -139 E 0.072 -140 D 0.076 -141 D 0.077 -142 D 0.074 -143 S 0.067 -144 H 0.059 -145 P 0.050 -146 S 0.043 -147 E 0.036 -148 M 0.031 -149 R 0.029 -150 L 0.030 -151 Y 0.035 -152 K 0.042 -153 N 0.050 -154 I 0.059 -155 P 0.064 -156 Q 0.063 -157 M 0.059 -158 S 0.056 -159 F 0.054 -160 D 0.053 -161 D 0.054 -162 T 0.057 -163 E 0.062 -164 R 0.068 -165 E 0.070 -166 P 0.067 -167 E 0.060 -168 Q 0.055 -169 T 0.055 -170 F 0.059 -171 S 0.064 -172 L 0.070 -173 N 0.077 -174 R 0.084 -175 D 0.092 -176 I 0.096 -177 T 0.095 -178 G 0.088 -179 E 0.076 -180 L 0.061 -181 E 0.048 -182 Y 0.042 -183 A 0.042 -184 T 0.042 -185 K 0.042 -186 I 0.042 -187 S 0.042 -188 R 0.040 -189 F 0.038 -190 S 0.038 -191 N 0.040 -192 V 0.040 -193 Y 0.034 -194 H 0.028 -195 L 0.026 -196 S 0.028 -197 I 0.034 -198 H 0.043 -199 I 0.053 -200 S 0.062 -201 K 0.071 -202 N 0.079 -203 F 0.086 -204 G 0.088 -205 A 0.087 -206 D 0.081 -207 T 0.069 -208 T 0.057 -209 K 0.047 -210 I 0.039 -211 F 0.032 -212 Y 0.027 -213 I 0.026 -214 G 0.028 -215 L 0.034 -216 R 0.046 -217 G 0.062 -218 E 0.082 -219 W 0.111 -220 T 0.159 -221 E 0.230 -222 L 0.314 -223 R 0.400 -224 R 0.481 -225 H 0.549 -226 E 0.595 -227 V 0.615 -228 T 0.624 -229 I 0.636 -230 C 0.653 -231 N 0.673 -232 Y 0.695 -233 E 0.712 -234 A 0.715 -235 S 0.702 -236 A 0.679 -237 N 0.660 -238 P 0.653 -239 A 0.658 -240 D 0.672 -241 H 0.685 -242 R 0.687 -243 V 0.658 -244 H 0.603 -245 Q 0.563 -246 V 0.567 -247 T 0.580 -248 P 0.568 -249 Q 0.559 -250 T 0.583 -251 H 0.615 -252 F 0.611 -253 I 0.562 -254 S 0.512 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028811.13_ENSMUST00000106054.4_GN:Yars1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028811.13_ENSMUST00000106054.4_GN:Yars1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index e3b1609f1326755f0b7163a5d7261f342693106c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028811.13_ENSMUST00000106054.4_GN:Yars1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,529 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000028811.13|ENSMUST00000106054.4|GN:Yars1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.400 -2 G 0.384 -3 D 0.352 -4 A 0.300 -5 P 0.227 -6 S 0.152 -7 P 0.097 -8 E 0.071 -9 E 0.062 -10 K 0.058 -11 L 0.056 -12 H 0.057 -13 L 0.058 -14 I 0.060 -15 T 0.062 -16 R 0.066 -17 N 0.071 -18 L 0.073 -19 Q 0.072 -20 E 0.073 -21 V 0.075 -22 L 0.071 -23 G 0.060 -24 E 0.048 -25 E 0.039 -26 K 0.036 -27 L 0.040 -28 K 0.050 -29 E 0.056 -30 I 0.052 -31 L 0.044 -32 K 0.039 -33 E 0.037 -34 R 0.038 -35 E 0.039 -36 L 0.040 -37 K 0.042 -38 V 0.045 -39 Y 0.051 -40 W 0.058 -41 G 0.066 -42 T 0.077 -43 A 0.089 -44 T 0.103 -45 T 0.115 -46 G 0.123 -47 K 0.122 -48 P 0.110 -49 H 0.087 -50 V 0.063 -51 A 0.048 -52 Y 0.039 -53 F 0.033 -54 V 0.029 -55 P 0.028 -56 M 0.028 -57 S 0.028 -58 K 0.029 -59 I 0.032 -60 A 0.036 -61 D 0.040 -62 F 0.047 -63 L 0.056 -64 K 0.069 -65 A 0.083 -66 G 0.089 -67 C 0.084 -68 E 0.070 -69 V 0.058 -70 T 0.054 -71 I 0.062 -72 L 0.077 -73 F 0.092 -74 A 0.099 -75 D 0.100 -76 L 0.098 -77 H 0.097 -78 A 0.097 -79 Y 0.100 -80 L 0.106 -81 D 0.107 -82 N 0.101 -83 M 0.099 -84 K 0.101 -85 A 0.100 -86 P 0.091 -87 W 0.080 -88 E 0.074 -89 L 0.073 -90 L 0.071 -91 E 0.067 -92 L 0.065 -93 R 0.065 -94 T 0.067 -95 S 0.066 -96 Y 0.056 -97 Y 0.042 -98 E 0.031 -99 N 0.026 -100 V 0.026 -101 I 0.027 -102 K 0.029 -103 A 0.031 -104 M 0.033 -105 L 0.036 -106 E 0.038 -107 S 0.042 -108 I 0.045 -109 G 0.049 -110 V 0.052 -111 P 0.054 -112 L 0.051 -113 E 0.044 -114 K 0.034 -115 L 0.028 -116 K 0.027 -117 F 0.030 -118 I 0.034 -119 K 0.034 -120 G 0.032 -121 T 0.028 -122 D 0.025 -123 Y 0.024 -124 Q 0.026 -125 L 0.028 -126 S 0.029 -127 K 0.031 -128 E 0.034 -129 Y 0.042 -130 T 0.055 -131 L 0.063 -132 D 0.062 -133 V 0.061 -134 Y 0.067 -135 R 0.077 -136 L 0.081 -137 S 0.078 -138 S 0.074 -139 V 0.076 -140 V 0.078 -141 T 0.075 -142 Q 0.068 -143 H 0.064 -144 D 0.066 -145 A 0.071 -146 K 0.079 -147 K 0.091 -148 A 0.103 -149 G 0.109 -150 A 0.114 -151 E 0.125 -152 V 0.143 -153 V 0.160 -154 K 0.170 -155 Q 0.176 -156 V 0.179 -157 E 0.183 -158 H 0.191 -159 P 0.197 -160 L 0.192 -161 L 0.187 -162 S 0.204 -163 G 0.248 -164 L 0.278 -165 L 0.262 -166 Y 0.219 -167 P 0.193 -168 G 0.188 -169 L 0.183 -170 Q 0.167 -171 A 0.141 -172 L 0.111 -173 D 0.083 -174 E 0.062 -175 E 0.050 -176 Y 0.046 -177 L 0.047 -178 K 0.052 -179 V 0.056 -180 D 0.055 -181 A 0.047 -182 Q 0.037 -183 F 0.033 -184 G 0.040 -185 G 0.057 -186 V 0.081 -187 D 0.100 -188 Q 0.104 -189 R 0.095 -190 K 0.085 -191 I 0.079 -192 F 0.072 -193 T 0.063 -194 F 0.055 -195 A 0.049 -196 E 0.043 -197 K 0.040 -198 Y 0.041 -199 L 0.045 -200 P 0.051 -201 A 0.058 -202 L 0.065 -203 G 0.073 -204 Y 0.082 -205 S 0.092 -206 K 0.099 -207 R 0.102 -208 V 0.107 -209 H 0.115 -210 L 0.126 -211 M 0.141 -212 N 0.159 -213 P 0.177 -214 M 0.187 -215 V 0.182 -216 P 0.168 -217 G 0.160 -218 L 0.162 -219 T 0.171 -220 G 0.190 -221 S 0.222 -222 K 0.259 -223 M 0.288 -224 S 0.304 -225 S 0.302 -226 S 0.281 -227 E 0.253 -228 E 0.229 -229 E 0.215 -230 S 0.204 -231 K 0.189 -232 I 0.165 -233 D 0.138 -234 L 0.113 -235 L 0.098 -236 D 0.088 -237 R 0.078 -238 K 0.069 -239 E 0.065 -240 D 0.070 -241 V 0.078 -242 K 0.092 -243 K 0.108 -244 K 0.118 -245 L 0.115 -246 K 0.105 -247 K 0.097 -248 A 0.088 -249 F 0.081 -250 C 0.080 -251 E 0.086 -252 P 0.090 -253 G 0.089 -254 N 0.088 -255 V 0.091 -256 E 0.094 -257 N 0.092 -258 N 0.084 -259 G 0.075 -260 V 0.066 -261 L 0.060 -262 S 0.056 -263 F 0.053 -264 I 0.050 -265 K 0.045 -266 H 0.040 -267 V 0.035 -268 L 0.034 -269 F 0.039 -270 P 0.046 -271 L 0.047 -272 K 0.041 -273 S 0.032 -274 E 0.027 -275 F 0.030 -276 V 0.040 -277 I 0.054 -278 L 0.068 -279 R 0.079 -280 D 0.090 -281 E 0.101 -282 K 0.115 -283 W 0.131 -284 G 0.142 -285 G 0.138 -286 N 0.120 -287 K 0.100 -288 T 0.087 -289 Y 0.077 -290 T 0.064 -291 V 0.051 -292 Y 0.042 -293 L 0.039 -294 E 0.041 -295 L 0.050 -296 E 0.065 -297 K 0.077 -298 D 0.084 -299 F 0.090 -300 A 0.099 -301 A 0.107 -302 E 0.110 -303 V 0.106 -304 V 0.097 -305 H 0.087 -306 P 0.084 -307 G 0.091 -308 D 0.104 -309 L 0.112 -310 K 0.111 -311 N 0.110 -312 S 0.116 -313 V 0.123 -314 E 0.124 -315 V 0.123 -316 A 0.118 -317 L 0.105 -318 N 0.087 -319 K 0.073 -320 L 0.064 -321 L 0.054 -322 D 0.047 -323 P 0.046 -324 I 0.053 -325 R 0.065 -326 E 0.071 -327 K 0.066 -328 F 0.057 -329 N 0.052 -330 T 0.053 -331 P 0.056 -332 A 0.057 -333 L 0.055 -334 K 0.056 -335 K 0.060 -336 L 0.063 -337 A 0.064 -338 S 0.067 -339 A 0.080 -340 A 0.110 -341 Y 0.164 -342 P 0.233 -343 D 0.295 -344 P 0.340 -345 S 0.382 -346 K 0.427 -347 Q 0.469 -348 K 0.496 -349 P 0.510 -350 P 0.506 -351 A 0.488 -352 K 0.487 -353 G 0.525 -354 P 0.579 -355 A 0.616 -356 K 0.625 -357 N 0.612 -358 S 0.588 -359 E 0.554 -360 P 0.502 -361 E 0.423 -362 E 0.327 -363 V 0.236 -364 I 0.168 -365 P 0.125 -366 S 0.101 -367 R 0.084 -368 L 0.069 -369 D 0.055 -370 I 0.045 -371 R 0.039 -372 V 0.037 -373 G 0.037 -374 K 0.038 -375 I 0.041 -376 L 0.045 -377 S 0.053 -378 V 0.061 -379 E 0.069 -380 K 0.077 -381 H 0.081 -382 P 0.081 -383 D 0.078 -384 A 0.075 -385 D 0.070 -386 S 0.061 -387 L 0.051 -388 Y 0.040 -389 V 0.033 -390 E 0.031 -391 K 0.032 -392 I 0.035 -393 D 0.038 -394 V 0.042 -395 G 0.045 -396 E 0.047 -397 A 0.047 -398 E 0.047 -399 P 0.046 -400 R 0.045 -401 T 0.043 -402 V 0.043 -403 V 0.045 -404 S 0.050 -405 G 0.053 -406 L 0.050 -407 V 0.045 -408 Q 0.041 -409 F 0.042 -410 V 0.044 -411 P 0.045 -412 K 0.045 -413 E 0.048 -414 E 0.055 -415 L 0.063 -416 Q 0.071 -417 D 0.077 -418 R 0.080 -419 L 0.082 -420 V 0.086 -421 V 0.093 -422 V 0.104 -423 L 0.111 -424 C 0.111 -425 N 0.109 -426 L 0.114 -427 K 0.126 -428 P 0.137 -429 Q 0.142 -430 K 0.143 -431 M 0.139 -432 R 0.138 -433 G 0.144 -434 V 0.156 -435 D 0.161 -436 S 0.151 -437 Q 0.130 -438 G 0.110 -439 M 0.096 -440 L 0.088 -441 L 0.084 -442 C 0.085 -443 A 0.092 -444 S 0.105 -445 V 0.124 -446 E 0.150 -447 G 0.175 -448 V 0.189 -449 S 0.189 -450 R 0.177 -451 Q 0.161 -452 V 0.148 -453 E 0.141 -454 P 0.144 -455 L 0.155 -456 D 0.170 -457 P 0.181 -458 P 0.180 -459 A 0.168 -460 G 0.155 -461 S 0.144 -462 A 0.133 -463 P 0.124 -464 G 0.121 -465 E 0.126 -466 R 0.132 -467 V 0.135 -468 F 0.137 -469 V 0.139 -470 Q 0.142 -471 G 0.145 -472 Y 0.148 -473 E 0.153 -474 K 0.165 -475 G 0.178 -476 Q 0.187 -477 P 0.188 -478 D 0.186 -479 E 0.188 -480 E 0.192 -481 L 0.193 -482 K 0.185 -483 P 0.172 -484 K 0.156 -485 K 0.142 -486 K 0.131 -487 V 0.120 -488 F 0.108 -489 E 0.097 -490 K 0.095 -491 L 0.099 -492 Q 0.100 -493 A 0.093 -494 D 0.084 -495 F 0.082 -496 K 0.087 -497 I 0.094 -498 S 0.101 -499 E 0.114 -500 E 0.131 -501 C 0.143 -502 I 0.142 -503 A 0.128 -504 Q 0.107 -505 W 0.088 -506 K 0.081 -507 Q 0.087 -508 T 0.094 -509 N 0.091 -510 F 0.083 -511 M 0.082 -512 T 0.088 -513 K 0.097 -514 L 0.107 -515 G 0.117 -516 F 0.123 -517 V 0.129 -518 S 0.136 -519 C 0.144 -520 K 0.150 -521 S 0.158 -522 L 0.174 -523 K 0.202 -524 G 0.237 -525 G 0.267 -526 N 0.282 -527 I 0.286 -528 S 0.287 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028811.13_ENSMUST00000106054.4_GN:Yars1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:36.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028811.13_ENSMUST00000106054.4_GN:Yars1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:36.caid deleted file mode 100644 index fbc2edbc2c9ce9a81e9b92d662e4c6e4560037e0..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000028811.13_ENSMUST00000106054.4_GN:Yars1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:36.caid +++ /dev/null @@ -1,565 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000028811.13|ENSMUST00000106054.4|GN:Yars1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:36 -1 M 0.381 -2 Q 0.401 -3 P 0.432 -4 D 0.454 -5 G 0.453 -6 T 0.445 -7 S 0.454 -8 V 0.478 -9 T 0.499 -10 V 0.510 -11 P 0.501 -12 G 0.460 -13 T 0.406 -14 R 0.363 -15 R 0.331 -16 R 0.309 -17 R 0.310 -18 R 0.327 -19 T 0.342 -20 R 0.363 -21 K 0.397 -22 G 0.431 -23 R 0.463 -24 G 0.502 -25 C 0.537 -26 R 0.553 -27 L 0.561 -28 S 0.571 -29 A 0.584 -30 G 0.594 -31 N 0.600 -32 R 0.611 -33 D 0.632 -34 S 0.649 -35 G 0.647 -36 A 0.620 -37 M 0.570 -38 G 0.503 -39 D 0.428 -40 A 0.344 -41 P 0.250 -42 S 0.162 -43 P 0.101 -44 E 0.073 -45 E 0.063 -46 K 0.059 -47 L 0.056 -48 H 0.056 -49 L 0.057 -50 I 0.058 -51 T 0.060 -52 R 0.064 -53 N 0.070 -54 L 0.073 -55 Q 0.075 -56 E 0.077 -57 V 0.079 -58 L 0.074 -59 G 0.062 -60 E 0.049 -61 E 0.039 -62 K 0.033 -63 L 0.031 -64 K 0.031 -65 E 0.032 -66 I 0.033 -67 L 0.034 -68 K 0.035 -69 E 0.035 -70 R 0.035 -71 E 0.036 -72 L 0.037 -73 K 0.039 -74 V 0.043 -75 Y 0.048 -76 W 0.055 -77 G 0.063 -78 T 0.073 -79 A 0.086 -80 T 0.100 -81 T 0.112 -82 G 0.120 -83 K 0.120 -84 P 0.108 -85 H 0.085 -86 V 0.062 -87 A 0.046 -88 Y 0.037 -89 F 0.031 -90 V 0.027 -91 P 0.026 -92 M 0.027 -93 S 0.027 -94 K 0.028 -95 I 0.030 -96 A 0.034 -97 D 0.039 -98 F 0.044 -99 L 0.052 -100 K 0.063 -101 A 0.075 -102 G 0.082 -103 C 0.077 -104 E 0.066 -105 V 0.055 -106 T 0.054 -107 I 0.063 -108 L 0.078 -109 F 0.092 -110 A 0.098 -111 D 0.097 -112 L 0.093 -113 H 0.092 -114 A 0.091 -115 Y 0.094 -116 L 0.099 -117 D 0.100 -118 N 0.097 -119 M 0.097 -120 K 0.101 -121 A 0.100 -122 P 0.090 -123 W 0.079 -124 E 0.075 -125 L 0.074 -126 L 0.072 -127 E 0.068 -128 L 0.064 -129 R 0.058 -130 T 0.051 -131 S 0.044 -132 Y 0.038 -133 Y 0.033 -134 E 0.028 -135 N 0.026 -136 V 0.026 -137 I 0.027 -138 K 0.029 -139 A 0.031 -140 M 0.034 -141 L 0.037 -142 E 0.040 -143 S 0.043 -144 I 0.048 -145 G 0.053 -146 V 0.057 -147 P 0.059 -148 L 0.055 -149 E 0.047 -150 K 0.037 -151 L 0.030 -152 K 0.028 -153 F 0.030 -154 I 0.034 -155 K 0.034 -156 G 0.031 -157 T 0.027 -158 D 0.025 -159 Y 0.024 -160 Q 0.025 -161 L 0.028 -162 S 0.030 -163 K 0.031 -164 E 0.033 -165 Y 0.038 -166 T 0.045 -167 L 0.051 -168 D 0.052 -169 V 0.054 -170 Y 0.063 -171 R 0.074 -172 L 0.079 -173 S 0.077 -174 S 0.075 -175 V 0.077 -176 V 0.080 -177 T 0.077 -178 Q 0.069 -179 H 0.064 -180 D 0.065 -181 A 0.070 -182 K 0.079 -183 K 0.091 -184 A 0.102 -185 G 0.108 -186 A 0.112 -187 E 0.124 -188 V 0.142 -189 V 0.158 -190 K 0.168 -191 Q 0.173 -192 V 0.175 -193 E 0.179 -194 H 0.187 -195 P 0.194 -196 L 0.191 -197 L 0.185 -198 S 0.201 -199 G 0.243 -200 L 0.272 -201 L 0.256 -202 Y 0.215 -203 P 0.189 -204 G 0.184 -205 L 0.181 -206 Q 0.167 -207 A 0.141 -208 L 0.110 -209 D 0.082 -210 E 0.061 -211 E 0.049 -212 Y 0.045 -213 L 0.046 -214 K 0.050 -215 V 0.054 -216 D 0.053 -217 A 0.046 -218 Q 0.036 -219 F 0.032 -220 G 0.038 -221 G 0.055 -222 V 0.078 -223 D 0.096 -224 Q 0.099 -225 R 0.091 -226 K 0.081 -227 I 0.074 -228 F 0.065 -229 T 0.056 -230 F 0.049 -231 A 0.046 -232 E 0.042 -233 K 0.039 -234 Y 0.040 -235 L 0.044 -236 P 0.049 -237 A 0.056 -238 L 0.063 -239 G 0.071 -240 Y 0.081 -241 S 0.091 -242 K 0.098 -243 R 0.101 -244 V 0.106 -245 H 0.114 -246 L 0.125 -247 M 0.140 -248 N 0.158 -249 P 0.176 -250 M 0.186 -251 V 0.181 -252 P 0.168 -253 G 0.160 -254 L 0.163 -255 T 0.173 -256 G 0.193 -257 S 0.228 -258 K 0.267 -259 M 0.297 -260 S 0.314 -261 S 0.311 -262 S 0.290 -263 E 0.262 -264 E 0.238 -265 E 0.222 -266 S 0.210 -267 K 0.193 -268 I 0.167 -269 D 0.138 -270 L 0.113 -271 L 0.098 -272 D 0.089 -273 R 0.079 -274 K 0.070 -275 E 0.067 -276 D 0.071 -277 V 0.079 -278 K 0.092 -279 K 0.109 -280 K 0.119 -281 L 0.117 -282 K 0.108 -283 K 0.100 -284 A 0.092 -285 F 0.084 -286 C 0.082 -287 E 0.088 -288 P 0.092 -289 G 0.091 -290 N 0.090 -291 V 0.093 -292 E 0.097 -293 N 0.095 -294 N 0.086 -295 G 0.075 -296 V 0.066 -297 L 0.060 -298 S 0.057 -299 F 0.054 -300 I 0.050 -301 K 0.045 -302 H 0.040 -303 V 0.036 -304 L 0.035 -305 F 0.040 -306 P 0.047 -307 L 0.049 -308 K 0.042 -309 S 0.033 -310 E 0.028 -311 F 0.031 -312 V 0.040 -313 I 0.054 -314 L 0.068 -315 R 0.080 -316 D 0.092 -317 E 0.104 -318 K 0.118 -319 W 0.135 -320 G 0.146 -321 G 0.142 -322 N 0.124 -323 K 0.103 -324 T 0.089 -325 Y 0.078 -326 T 0.066 -327 V 0.052 -328 Y 0.043 -329 L 0.040 -330 E 0.042 -331 L 0.051 -332 E 0.066 -333 K 0.078 -334 D 0.085 -335 F 0.091 -336 A 0.100 -337 A 0.107 -338 E 0.109 -339 V 0.105 -340 V 0.096 -341 H 0.086 -342 P 0.084 -343 G 0.093 -344 D 0.107 -345 L 0.115 -346 K 0.114 -347 N 0.112 -348 S 0.118 -349 V 0.125 -350 E 0.125 -351 V 0.123 -352 A 0.119 -353 L 0.106 -354 N 0.089 -355 K 0.075 -356 L 0.065 -357 L 0.056 -358 D 0.048 -359 P 0.047 -360 I 0.055 -361 R 0.066 -362 E 0.071 -363 K 0.066 -364 F 0.056 -365 N 0.051 -366 T 0.052 -367 P 0.055 -368 A 0.056 -369 L 0.054 -370 K 0.055 -371 K 0.059 -372 L 0.063 -373 A 0.064 -374 S 0.067 -375 A 0.080 -376 A 0.109 -377 Y 0.163 -378 P 0.233 -379 D 0.298 -380 P 0.346 -381 S 0.388 -382 K 0.432 -383 Q 0.471 -384 K 0.500 -385 P 0.525 -386 P 0.549 -387 A 0.570 -388 K 0.588 -389 G 0.607 -390 P 0.624 -391 A 0.636 -392 K 0.635 -393 N 0.621 -394 S 0.595 -395 E 0.560 -396 P 0.508 -397 E 0.428 -398 E 0.330 -399 V 0.239 -400 I 0.170 -401 P 0.127 -402 S 0.102 -403 R 0.085 -404 L 0.069 -405 D 0.055 -406 I 0.046 -407 R 0.040 -408 V 0.038 -409 G 0.038 -410 K 0.039 -411 I 0.041 -412 L 0.046 -413 S 0.053 -414 V 0.061 -415 E 0.069 -416 K 0.077 -417 H 0.082 -418 P 0.082 -419 D 0.079 -420 A 0.076 -421 D 0.070 -422 S 0.062 -423 L 0.052 -424 Y 0.041 -425 V 0.034 -426 E 0.032 -427 K 0.033 -428 I 0.036 -429 D 0.039 -430 V 0.043 -431 G 0.046 -432 E 0.047 -433 A 0.048 -434 E 0.047 -435 P 0.047 -436 R 0.046 -437 T 0.045 -438 V 0.044 -439 V 0.046 -440 S 0.051 -441 G 0.053 -442 L 0.051 -443 V 0.045 -444 Q 0.042 -445 F 0.042 -446 V 0.045 -447 P 0.045 -448 K 0.045 -449 E 0.048 -450 E 0.055 -451 L 0.064 -452 Q 0.073 -453 D 0.079 -454 R 0.083 -455 L 0.085 -456 V 0.088 -457 V 0.095 -458 V 0.106 -459 L 0.113 -460 C 0.112 -461 N 0.109 -462 L 0.115 -463 K 0.127 -464 P 0.138 -465 Q 0.144 -466 K 0.145 -467 M 0.142 -468 R 0.141 -469 G 0.147 -470 V 0.159 -471 D 0.164 -472 S 0.154 -473 Q 0.133 -474 G 0.112 -475 M 0.097 -476 L 0.088 -477 L 0.085 -478 C 0.086 -479 A 0.093 -480 S 0.107 -481 V 0.127 -482 E 0.154 -483 G 0.179 -484 V 0.194 -485 S 0.193 -486 R 0.180 -487 Q 0.163 -488 V 0.149 -489 E 0.143 -490 P 0.146 -491 L 0.157 -492 D 0.173 -493 P 0.184 -494 P 0.183 -495 A 0.171 -496 G 0.158 -497 S 0.147 -498 A 0.136 -499 P 0.127 -500 G 0.124 -501 E 0.129 -502 R 0.134 -503 V 0.137 -504 F 0.139 -505 V 0.142 -506 Q 0.145 -507 G 0.147 -508 Y 0.150 -509 E 0.155 -510 K 0.166 -511 G 0.180 -512 Q 0.189 -513 P 0.190 -514 D 0.189 -515 E 0.191 -516 E 0.197 -517 L 0.198 -518 K 0.191 -519 P 0.176 -520 K 0.160 -521 K 0.145 -522 K 0.133 -523 V 0.122 -524 F 0.108 -525 E 0.097 -526 K 0.095 -527 L 0.099 -528 Q 0.101 -529 A 0.095 -530 D 0.086 -531 F 0.082 -532 K 0.086 -533 I 0.093 -534 S 0.099 -535 E 0.111 -536 E 0.128 -537 C 0.141 -538 I 0.141 -539 A 0.128 -540 Q 0.108 -541 W 0.091 -542 K 0.085 -543 Q 0.092 -544 T 0.099 -545 N 0.096 -546 F 0.088 -547 M 0.087 -548 T 0.094 -549 K 0.102 -550 L 0.110 -551 G 0.117 -552 F 0.122 -553 V 0.127 -554 S 0.136 -555 C 0.146 -556 K 0.154 -557 S 0.163 -558 L 0.179 -559 K 0.205 -560 G 0.237 -561 G 0.265 -562 N 0.279 -563 I 0.284 -564 S 0.286 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029103.17_ENSMUST00000030986.15_GN:Lrpap1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029103.17_ENSMUST00000030986.15_GN:Lrpap1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index ef7f0991647f05d044cbf4dfcea8e50257b2289f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029103.17_ENSMUST00000030986.15_GN:Lrpap1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,361 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000029103.17|ENSMUST00000030986.15|GN:Lrpap1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.412 -2 A 0.437 -3 P 0.469 -4 R 0.482 -5 R 0.475 -6 E 0.483 -7 R 0.533 -8 V 0.596 -9 S 0.626 -10 T 0.621 -11 L 0.597 -12 P 0.559 -13 R 0.504 -14 L 0.455 -15 Q 0.420 -16 L 0.374 -17 L 0.313 -18 V 0.278 -19 L 0.293 -20 L 0.339 -21 L 0.393 -22 L 0.445 -23 P 0.481 -24 L 0.495 -25 M 0.496 -26 L 0.500 -27 V 0.517 -28 P 0.553 -29 Q 0.606 -30 P 0.661 -31 I 0.700 -32 A 0.715 -33 G 0.712 -34 H 0.703 -35 G 0.690 -36 G 0.670 -37 K 0.634 -38 Y 0.591 -39 S 0.562 -40 R 0.562 -41 E 0.574 -42 K 0.575 -43 N 0.566 -44 E 0.571 -45 P 0.601 -46 E 0.634 -47 M 0.643 -48 A 0.626 -49 A 0.596 -50 K 0.564 -51 R 0.533 -52 E 0.498 -53 S 0.447 -54 G 0.378 -55 E 0.300 -56 E 0.226 -57 F 0.167 -58 R 0.128 -59 M 0.107 -60 E 0.098 -61 K 0.092 -62 L 0.084 -63 N 0.075 -64 Q 0.067 -65 L 0.059 -66 W 0.053 -67 E 0.050 -68 K 0.050 -69 A 0.053 -70 K 0.060 -71 R 0.070 -72 L 0.081 -73 H 0.089 -74 L 0.091 -75 S 0.086 -76 P 0.077 -77 V 0.068 -78 R 0.064 -79 L 0.065 -80 A 0.069 -81 E 0.077 -82 L 0.090 -83 H 0.102 -84 S 0.106 -85 D 0.101 -86 L 0.091 -87 K 0.076 -88 I 0.059 -89 Q 0.046 -90 E 0.040 -91 R 0.037 -92 D 0.036 -93 E 0.037 -94 L 0.040 -95 N 0.044 -96 W 0.050 -97 K 0.060 -98 K 0.073 -99 L 0.085 -100 K 0.096 -101 V 0.108 -102 E 0.126 -103 G 0.147 -104 L 0.162 -105 D 0.164 -106 K 0.160 -107 D 0.160 -108 G 0.160 -109 E 0.153 -110 K 0.134 -111 E 0.111 -112 A 0.092 -113 K 0.086 -114 L 0.090 -115 I 0.097 -116 H 0.101 -117 N 0.103 -118 L 0.107 -119 N 0.112 -120 V 0.111 -121 I 0.104 -122 L 0.096 -123 A 0.086 -124 R 0.079 -125 Y 0.084 -126 G 0.117 -127 L 0.189 -128 D 0.287 -129 G 0.377 -130 R 0.436 -131 K 0.469 -132 D 0.490 -133 A 0.512 -134 Q 0.538 -135 M 0.570 -136 V 0.601 -137 H 0.622 -138 S 0.634 -139 N 0.641 -140 A 0.642 -141 L 0.635 -142 N 0.619 -143 E 0.596 -144 D 0.566 -145 T 0.531 -146 Q 0.484 -147 D 0.415 -148 E 0.325 -149 L 0.239 -150 G 0.184 -151 D 0.157 -152 P 0.138 -153 R 0.115 -154 L 0.092 -155 E 0.074 -156 K 0.061 -157 L 0.052 -158 W 0.046 -159 H 0.043 -160 K 0.047 -161 A 0.060 -162 K 0.084 -163 T 0.117 -164 S 0.147 -165 G 0.158 -166 K 0.148 -167 F 0.128 -168 S 0.111 -169 S 0.095 -170 E 0.080 -171 E 0.070 -172 L 0.067 -173 D 0.067 -174 K 0.068 -175 L 0.073 -176 W 0.080 -177 R 0.081 -178 E 0.073 -179 F 0.061 -180 L 0.053 -181 H 0.049 -182 Y 0.044 -183 K 0.037 -184 E 0.032 -185 K 0.031 -186 I 0.034 -187 Q 0.040 -188 E 0.045 -189 Y 0.048 -190 N 0.050 -191 V 0.050 -192 L 0.052 -193 L 0.058 -194 D 0.065 -195 T 0.070 -196 L 0.073 -197 S 0.081 -198 R 0.091 -199 A 0.107 -200 E 0.135 -201 E 0.174 -202 G 0.214 -203 Y 0.247 -204 E 0.272 -205 N 0.287 -206 L 0.293 -207 L 0.299 -208 S 0.314 -209 P 0.334 -210 S 0.344 -211 D 0.337 -212 M 0.319 -213 A 0.305 -214 H 0.297 -215 I 0.286 -216 K 0.263 -217 S 0.229 -218 D 0.192 -219 T 0.158 -220 L 0.133 -221 I 0.119 -222 S 0.115 -223 K 0.116 -224 H 0.116 -225 S 0.115 -226 E 0.111 -227 L 0.107 -228 K 0.104 -229 D 0.105 -230 R 0.102 -231 L 0.092 -232 R 0.082 -233 S 0.078 -234 I 0.079 -235 N 0.083 -236 Q 0.085 -237 G 0.080 -238 L 0.070 -239 D 0.062 -240 R 0.060 -241 L 0.066 -242 R 0.076 -243 K 0.086 -244 V 0.106 -245 S 0.146 -246 H 0.201 -247 Q 0.262 -248 G 0.318 -249 Y 0.358 -250 G 0.375 -251 S 0.366 -252 T 0.336 -253 T 0.288 -254 E 0.232 -255 F 0.182 -256 E 0.151 -257 E 0.137 -258 P 0.128 -259 R 0.116 -260 V 0.108 -261 I 0.107 -262 D 0.104 -263 L 0.093 -264 W 0.081 -265 D 0.074 -266 L 0.074 -267 A 0.086 -268 Q 0.107 -269 S 0.129 -270 A 0.137 -271 N 0.129 -272 F 0.113 -273 T 0.100 -274 E 0.088 -275 K 0.077 -276 E 0.071 -277 L 0.071 -278 E 0.074 -279 S 0.076 -280 F 0.081 -281 R 0.091 -282 E 0.098 -283 E 0.100 -284 L 0.096 -285 K 0.087 -286 H 0.075 -287 F 0.070 -288 E 0.071 -289 A 0.069 -290 K 0.060 -291 I 0.052 -292 E 0.050 -293 K 0.050 -294 H 0.049 -295 N 0.047 -296 H 0.047 -297 Y 0.052 -298 Q 0.063 -299 K 0.072 -300 Q 0.072 -301 L 0.063 -302 E 0.054 -303 I 0.048 -304 S 0.048 -305 H 0.056 -306 Q 0.070 -307 K 0.085 -308 L 0.100 -309 K 0.120 -310 H 0.147 -311 V 0.181 -312 E 0.218 -313 S 0.255 -314 I 0.282 -315 G 0.295 -316 D 0.294 -317 P 0.282 -318 E 0.262 -319 H 0.240 -320 I 0.217 -321 S 0.194 -322 R 0.174 -323 N 0.160 -324 K 0.151 -325 E 0.146 -326 K 0.143 -327 Y 0.138 -328 V 0.132 -329 L 0.127 -330 L 0.125 -331 E 0.127 -332 E 0.128 -333 K 0.116 -334 T 0.096 -335 K 0.082 -336 E 0.078 -337 L 0.079 -338 G 0.076 -339 Y 0.072 -340 K 0.071 -341 V 0.077 -342 K 0.085 -343 K 0.090 -344 H 0.087 -345 L 0.078 -346 Q 0.069 -347 D 0.064 -348 L 0.066 -349 S 0.069 -350 S 0.070 -351 R 0.068 -352 V 0.072 -353 S 0.082 -354 R 0.096 -355 A 0.118 -356 R 0.156 -357 H 0.209 -358 N 0.261 -359 E 0.294 -360 L 0.305 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029103.17_ENSMUST00000030986.15_GN:Lrpap1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:18.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029103.17_ENSMUST00000030986.15_GN:Lrpap1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:18.caid deleted file mode 100644 index 5b4293319b944ffcbb4213839b6d1e5972772348..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029103.17_ENSMUST00000030986.15_GN:Lrpap1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:18.caid +++ /dev/null @@ -1,379 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000029103.17|ENSMUST00000030986.15|GN:Lrpap1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:18 -1 M 0.416 -2 G 0.440 -3 G 0.472 -4 P 0.485 -5 T 0.471 -6 R 0.463 -7 P 0.494 -8 S 0.547 -9 P 0.582 -10 V 0.579 -11 S 0.538 -12 L 0.467 -13 L 0.397 -14 A 0.362 -15 L 0.369 -16 Q 0.391 -17 R 0.423 -18 K 0.478 -19 M 0.547 -20 A 0.608 -21 P 0.652 -22 R 0.685 -23 R 0.711 -24 E 0.730 -25 R 0.739 -26 V 0.736 -27 S 0.721 -28 T 0.696 -29 L 0.661 -30 P 0.611 -31 R 0.552 -32 L 0.512 -33 Q 0.489 -34 L 0.444 -35 L 0.376 -36 V 0.343 -37 L 0.368 -38 L 0.417 -39 L 0.464 -40 L 0.504 -41 P 0.533 -42 L 0.545 -43 M 0.544 -44 L 0.540 -45 V 0.547 -46 P 0.575 -47 Q 0.626 -48 P 0.681 -49 I 0.720 -50 A 0.736 -51 G 0.735 -52 H 0.727 -53 G 0.716 -54 G 0.697 -55 K 0.664 -56 Y 0.625 -57 S 0.603 -58 R 0.610 -59 E 0.628 -60 K 0.630 -61 N 0.619 -62 E 0.621 -63 P 0.645 -64 E 0.671 -65 M 0.675 -66 A 0.655 -67 A 0.624 -68 K 0.589 -69 R 0.553 -70 E 0.512 -71 S 0.456 -72 G 0.381 -73 E 0.297 -74 E 0.220 -75 F 0.159 -76 R 0.119 -77 M 0.098 -78 E 0.090 -79 K 0.085 -80 L 0.080 -81 N 0.073 -82 Q 0.065 -83 L 0.057 -84 W 0.051 -85 E 0.048 -86 K 0.049 -87 A 0.052 -88 K 0.058 -89 R 0.068 -90 L 0.079 -91 H 0.087 -92 L 0.088 -93 S 0.082 -94 P 0.074 -95 V 0.065 -96 R 0.062 -97 L 0.064 -98 A 0.068 -99 E 0.076 -100 L 0.089 -101 H 0.100 -102 S 0.103 -103 D 0.099 -104 L 0.090 -105 K 0.076 -106 I 0.059 -107 Q 0.045 -108 E 0.038 -109 R 0.035 -110 D 0.034 -111 E 0.035 -112 L 0.038 -113 N 0.043 -114 W 0.049 -115 K 0.059 -116 K 0.073 -117 L 0.086 -118 K 0.097 -119 V 0.110 -120 E 0.129 -121 G 0.153 -122 L 0.170 -123 D 0.173 -124 K 0.170 -125 D 0.171 -126 G 0.172 -127 E 0.164 -128 K 0.144 -129 E 0.119 -130 A 0.099 -131 K 0.091 -132 L 0.095 -133 I 0.101 -134 H 0.104 -135 N 0.104 -136 L 0.104 -137 N 0.103 -138 V 0.100 -139 I 0.096 -140 L 0.092 -141 A 0.086 -142 R 0.081 -143 Y 0.087 -144 G 0.121 -145 L 0.195 -146 D 0.295 -147 G 0.386 -148 R 0.443 -149 K 0.474 -150 D 0.497 -151 A 0.521 -152 Q 0.550 -153 M 0.581 -154 V 0.609 -155 H 0.628 -156 S 0.639 -157 N 0.647 -158 A 0.648 -159 L 0.642 -160 N 0.626 -161 E 0.603 -162 D 0.573 -163 T 0.537 -164 Q 0.489 -165 D 0.418 -166 E 0.326 -167 L 0.239 -168 G 0.183 -169 D 0.157 -170 P 0.138 -171 R 0.116 -172 L 0.092 -173 E 0.074 -174 K 0.062 -175 L 0.053 -176 W 0.047 -177 H 0.044 -178 K 0.048 -179 A 0.061 -180 K 0.085 -181 T 0.117 -182 S 0.145 -183 G 0.155 -184 K 0.144 -185 F 0.125 -186 S 0.108 -187 S 0.093 -188 E 0.079 -189 E 0.069 -190 L 0.066 -191 D 0.066 -192 K 0.068 -193 L 0.072 -194 W 0.079 -195 R 0.080 -196 E 0.072 -197 F 0.060 -198 L 0.053 -199 H 0.049 -200 Y 0.044 -201 K 0.037 -202 E 0.032 -203 K 0.030 -204 I 0.033 -205 Q 0.038 -206 E 0.044 -207 Y 0.047 -208 N 0.048 -209 V 0.048 -210 L 0.049 -211 L 0.054 -212 D 0.061 -213 T 0.065 -214 L 0.068 -215 S 0.075 -216 R 0.087 -217 A 0.103 -218 E 0.131 -219 E 0.169 -220 G 0.208 -221 Y 0.241 -222 E 0.265 -223 N 0.279 -224 L 0.284 -225 L 0.290 -226 S 0.305 -227 P 0.325 -228 S 0.335 -229 D 0.328 -230 M 0.311 -231 A 0.297 -232 H 0.289 -233 I 0.278 -234 K 0.257 -235 S 0.225 -236 D 0.189 -237 T 0.156 -238 L 0.133 -239 I 0.119 -240 S 0.116 -241 K 0.117 -242 H 0.117 -243 S 0.115 -244 E 0.111 -245 L 0.107 -246 K 0.105 -247 D 0.106 -248 R 0.103 -249 L 0.093 -250 R 0.083 -251 S 0.077 -252 I 0.075 -253 N 0.074 -254 Q 0.073 -255 G 0.071 -256 L 0.066 -257 D 0.061 -258 R 0.061 -259 L 0.068 -260 R 0.077 -261 K 0.088 -262 V 0.107 -263 S 0.146 -264 H 0.203 -265 Q 0.264 -266 G 0.320 -267 Y 0.362 -268 G 0.380 -269 S 0.372 -270 T 0.341 -271 T 0.293 -272 E 0.236 -273 F 0.186 -274 E 0.153 -275 E 0.138 -276 P 0.129 -277 R 0.117 -278 V 0.109 -279 I 0.108 -280 D 0.105 -281 L 0.094 -282 W 0.082 -283 D 0.075 -284 L 0.076 -285 A 0.088 -286 Q 0.111 -287 S 0.133 -288 A 0.141 -289 N 0.133 -290 F 0.118 -291 T 0.105 -292 E 0.094 -293 K 0.082 -294 E 0.076 -295 L 0.075 -296 E 0.078 -297 S 0.080 -298 F 0.085 -299 R 0.094 -300 E 0.101 -301 E 0.103 -302 L 0.099 -303 K 0.089 -304 H 0.077 -305 F 0.071 -306 E 0.072 -307 A 0.070 -308 K 0.061 -309 I 0.053 -310 E 0.051 -311 K 0.051 -312 H 0.050 -313 N 0.048 -314 H 0.048 -315 Y 0.054 -316 Q 0.065 -317 K 0.075 -318 Q 0.074 -319 L 0.065 -320 E 0.056 -321 I 0.051 -322 S 0.051 -323 H 0.058 -324 Q 0.072 -325 K 0.088 -326 L 0.103 -327 K 0.124 -328 H 0.152 -329 V 0.186 -330 E 0.223 -331 S 0.259 -332 I 0.285 -333 G 0.297 -334 D 0.296 -335 P 0.284 -336 E 0.264 -337 H 0.241 -338 I 0.218 -339 S 0.195 -340 R 0.175 -341 N 0.161 -342 K 0.152 -343 E 0.148 -344 K 0.144 -345 Y 0.139 -346 V 0.134 -347 L 0.128 -348 L 0.126 -349 E 0.129 -350 E 0.128 -351 K 0.117 -352 T 0.097 -353 K 0.083 -354 E 0.079 -355 L 0.080 -356 G 0.077 -357 Y 0.073 -358 K 0.072 -359 V 0.078 -360 K 0.086 -361 K 0.091 -362 H 0.087 -363 L 0.079 -364 Q 0.070 -365 D 0.065 -366 L 0.066 -367 S 0.070 -368 S 0.070 -369 R 0.069 -370 V 0.073 -371 S 0.083 -372 R 0.097 -373 A 0.118 -374 R 0.156 -375 H 0.208 -376 N 0.259 -377 E 0.292 -378 L 0.303 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029149.15_ENSMUST00000054829.13_GN:Krtcap3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029149.15_ENSMUST00000054829.13_GN:Krtcap3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 8ca526aa96aed2684bda96b40fda094af5fbe1ff..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029149.15_ENSMUST00000054829.13_GN:Krtcap3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,241 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000029149.15|ENSMUST00000054829.13|GN:Krtcap3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.312 -2 R 0.311 -3 C 0.313 -4 C 0.318 -5 G 0.317 -6 V 0.302 -7 C 0.284 -8 A 0.272 -9 F 0.260 -10 D 0.236 -11 A 0.205 -12 A 0.175 -13 R 0.149 -14 G 0.124 -15 P 0.097 -16 R 0.072 -17 R 0.054 -18 L 0.043 -19 M 0.037 -20 R 0.037 -21 V 0.043 -22 G 0.049 -23 L 0.049 -24 A 0.043 -25 L 0.034 -26 I 0.029 -27 L 0.031 -28 V 0.038 -29 G 0.043 -30 H 0.040 -31 V 0.034 -32 N 0.030 -33 L 0.028 -34 L 0.029 -35 V 0.031 -36 G 0.033 -37 A 0.035 -38 V 0.037 -39 L 0.041 -40 H 0.046 -41 G 0.052 -42 T 0.057 -43 V 0.061 -44 L 0.069 -45 R 0.085 -46 H 0.109 -47 V 0.139 -48 A 0.168 -49 N 0.196 -50 P 0.221 -51 R 0.246 -52 G 0.268 -53 A 0.283 -54 V 0.285 -55 T 0.278 -56 P 0.265 -57 E 0.243 -58 Y 0.216 -59 T 0.190 -60 T 0.168 -61 A 0.148 -62 N 0.126 -63 V 0.099 -64 I 0.075 -65 S 0.063 -66 V 0.062 -67 G 0.069 -68 S 0.074 -69 G 0.070 -70 L 0.055 -71 L 0.038 -72 S 0.029 -73 V 0.030 -74 S 0.038 -75 V 0.045 -76 G 0.046 -77 L 0.040 -78 V 0.034 -79 A 0.031 -80 L 0.033 -81 L 0.038 -82 A 0.047 -83 S 0.058 -84 R 0.068 -85 N 0.078 -86 L 0.085 -87 L 0.086 -88 R 0.079 -89 P 0.067 -90 R 0.056 -91 L 0.047 -92 H 0.042 -93 W 0.039 -94 A 0.040 -95 L 0.047 -96 L 0.057 -97 T 0.061 -98 L 0.055 -99 A 0.045 -100 L 0.038 -101 V 0.037 -102 N 0.035 -103 L 0.033 -104 L 0.030 -105 L 0.028 -106 S 0.027 -107 A 0.026 -108 A 0.027 -109 C 0.029 -110 S 0.033 -111 M 0.035 -112 G 0.034 -113 L 0.030 -114 L 0.026 -115 L 0.026 -116 A 0.026 -117 V 0.027 -118 S 0.028 -119 L 0.030 -120 T 0.035 -121 V 0.044 -122 A 0.062 -123 N 0.090 -124 G 0.125 -125 G 0.156 -126 R 0.179 -127 R 0.198 -128 L 0.212 -129 I 0.221 -130 A 0.226 -131 D 0.239 -132 C 0.268 -133 H 0.321 -134 P 0.397 -135 G 0.472 -136 L 0.515 -137 M 0.524 -138 D 0.521 -139 P 0.526 -140 S 0.544 -141 I 0.573 -142 P 0.604 -143 L 0.624 -144 D 0.621 -145 Q 0.609 -146 G 0.608 -147 P 0.619 -148 G 0.616 -149 H 0.579 -150 T 0.507 -151 D 0.420 -152 C 0.341 -153 S 0.277 -154 F 0.225 -155 D 0.180 -156 P 0.143 -157 T 0.117 -158 R 0.100 -159 I 0.090 -160 Y 0.084 -161 D 0.081 -162 T 0.081 -163 A 0.079 -164 L 0.073 -165 A 0.061 -166 L 0.050 -167 W 0.044 -168 I 0.044 -169 P 0.047 -170 S 0.050 -171 L 0.051 -172 F 0.049 -173 M 0.051 -174 S 0.055 -175 A 0.060 -176 A 0.061 -177 E 0.057 -178 A 0.049 -179 A 0.039 -180 L 0.034 -181 S 0.033 -182 G 0.030 -183 Y 0.026 -184 C 0.020 -185 C 0.019 -186 V 0.020 -187 A 0.024 -188 A 0.032 -189 L 0.046 -190 T 0.068 -191 L 0.103 -192 R 0.154 -193 G 0.217 -194 I 0.282 -195 G 0.346 -196 P 0.396 -197 C 0.419 -198 R 0.412 -199 K 0.392 -200 E 0.375 -201 G 0.358 -202 L 0.326 -203 Q 0.286 -204 E 0.258 -205 Q 0.247 -206 L 0.242 -207 Q 0.249 -208 E 0.271 -209 L 0.294 -210 T 0.310 -211 E 0.330 -212 L 0.360 -213 E 0.387 -214 L 0.401 -215 P 0.403 -216 E 0.400 -217 C 0.392 -218 K 0.382 -219 R 0.387 -220 Q 0.417 -221 E 0.455 -222 N 0.475 -223 V 0.469 -224 Q 0.449 -225 L 0.431 -226 L 0.426 -227 H 0.436 -228 G 0.444 -229 R 0.435 -230 Q 0.428 -231 D 0.435 -232 F 0.428 -233 Q 0.400 -234 A 0.384 -235 L 0.398 -236 Q 0.427 -237 K 0.459 -238 T 0.483 -239 W 0.477 -240 V 0.454 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029149.15_ENSMUST00000054829.13_GN:Krtcap3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029149.15_ENSMUST00000054829.13_GN:Krtcap3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid deleted file mode 100644 index 0c71db22afe84dadea620d9b6a17b5197f8623f2..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029149.15_ENSMUST00000054829.13_GN:Krtcap3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid +++ /dev/null @@ -1,250 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000029149.15|ENSMUST00000054829.13|GN:Krtcap3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:9 -1 M 0.434 -2 G 0.459 -3 G 0.502 -4 G 0.542 -5 S 0.568 -6 R 0.582 -7 A 0.589 -8 A 0.576 -9 T 0.527 -10 M 0.447 -11 R 0.366 -12 C 0.308 -13 C 0.276 -14 G 0.259 -15 V 0.245 -16 C 0.234 -17 A 0.228 -18 F 0.217 -19 D 0.196 -20 A 0.170 -21 A 0.147 -22 R 0.128 -23 G 0.109 -24 P 0.088 -25 R 0.067 -26 R 0.052 -27 L 0.042 -28 M 0.037 -29 R 0.037 -30 V 0.043 -31 G 0.049 -32 L 0.049 -33 A 0.042 -34 L 0.034 -35 I 0.029 -36 L 0.031 -37 V 0.039 -38 G 0.043 -39 H 0.040 -40 V 0.034 -41 N 0.030 -42 L 0.029 -43 L 0.030 -44 V 0.032 -45 G 0.034 -46 A 0.035 -47 V 0.038 -48 L 0.042 -49 H 0.047 -50 G 0.053 -51 T 0.057 -52 V 0.061 -53 L 0.069 -54 R 0.085 -55 H 0.109 -56 V 0.138 -57 A 0.167 -58 N 0.193 -59 P 0.218 -60 R 0.242 -61 G 0.265 -62 A 0.279 -63 V 0.281 -64 T 0.274 -65 P 0.260 -66 E 0.238 -67 Y 0.210 -68 T 0.185 -69 T 0.164 -70 A 0.145 -71 N 0.124 -72 V 0.098 -73 I 0.075 -74 S 0.063 -75 V 0.063 -76 G 0.069 -77 S 0.074 -78 G 0.069 -79 L 0.054 -80 L 0.037 -81 S 0.028 -82 V 0.030 -83 S 0.037 -84 V 0.044 -85 G 0.045 -86 L 0.039 -87 V 0.033 -88 A 0.031 -89 L 0.032 -90 L 0.037 -91 A 0.046 -92 S 0.056 -93 R 0.066 -94 N 0.076 -95 L 0.084 -96 L 0.085 -97 R 0.078 -98 P 0.067 -99 R 0.056 -100 L 0.048 -101 H 0.042 -102 W 0.039 -103 A 0.041 -104 L 0.048 -105 L 0.058 -106 T 0.062 -107 L 0.056 -108 A 0.045 -109 L 0.039 -110 V 0.037 -111 N 0.036 -112 L 0.033 -113 L 0.031 -114 L 0.029 -115 S 0.028 -116 A 0.027 -117 A 0.027 -118 C 0.030 -119 S 0.034 -120 M 0.036 -121 G 0.034 -122 L 0.030 -123 L 0.026 -124 L 0.026 -125 A 0.026 -126 V 0.027 -127 S 0.028 -128 L 0.031 -129 T 0.036 -130 V 0.045 -131 A 0.064 -132 N 0.093 -133 G 0.129 -134 G 0.159 -135 R 0.181 -136 R 0.198 -137 L 0.213 -138 I 0.222 -139 A 0.229 -140 D 0.243 -141 C 0.272 -142 H 0.326 -143 P 0.403 -144 G 0.479 -145 L 0.522 -146 M 0.531 -147 D 0.526 -148 P 0.530 -149 S 0.548 -150 I 0.578 -151 P 0.609 -152 L 0.628 -153 D 0.625 -154 Q 0.612 -155 G 0.611 -156 P 0.622 -157 G 0.619 -158 H 0.580 -159 T 0.508 -160 D 0.422 -161 C 0.342 -162 S 0.277 -163 F 0.224 -164 D 0.179 -165 P 0.142 -166 T 0.115 -167 R 0.099 -168 I 0.089 -169 Y 0.083 -170 D 0.081 -171 T 0.081 -172 A 0.079 -173 L 0.073 -174 A 0.061 -175 L 0.050 -176 W 0.044 -177 I 0.043 -178 P 0.047 -179 S 0.050 -180 L 0.051 -181 F 0.049 -182 M 0.051 -183 S 0.055 -184 A 0.060 -185 A 0.061 -186 E 0.057 -187 A 0.048 -188 A 0.039 -189 L 0.034 -190 S 0.032 -191 G 0.030 -192 Y 0.025 -193 C 0.020 -194 C 0.018 -195 V 0.020 -196 A 0.024 -197 A 0.031 -198 L 0.046 -199 T 0.068 -200 L 0.102 -201 R 0.153 -202 G 0.214 -203 I 0.280 -204 G 0.345 -205 P 0.399 -206 C 0.424 -207 R 0.419 -208 K 0.397 -209 E 0.379 -210 G 0.361 -211 L 0.329 -212 Q 0.289 -213 E 0.261 -214 Q 0.249 -215 L 0.243 -216 Q 0.249 -217 E 0.270 -218 L 0.294 -219 T 0.310 -220 E 0.330 -221 L 0.359 -222 E 0.386 -223 L 0.398 -224 P 0.399 -225 E 0.396 -226 C 0.388 -227 K 0.380 -228 R 0.386 -229 Q 0.415 -230 E 0.453 -231 N 0.473 -232 V 0.466 -233 Q 0.445 -234 L 0.425 -235 L 0.419 -236 H 0.430 -237 G 0.439 -238 R 0.430 -239 Q 0.423 -240 D 0.430 -241 F 0.422 -242 Q 0.393 -243 A 0.377 -244 L 0.393 -245 Q 0.424 -246 K 0.457 -247 T 0.481 -248 W 0.475 -249 V 0.452 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029161.9_ENSMUST00000031051.9_GN:Cgref1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029161.9_ENSMUST00000031051.9_GN:Cgref1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 2ef8d3cd1500f82f9cf2d8d4f068ac2316fe147c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029161.9_ENSMUST00000031051.9_GN:Cgref1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,281 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000029161.9|ENSMUST00000031051.9|GN:Cgref1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.244 -2 F 0.238 -3 Q 0.233 -4 W 0.235 -5 L 0.242 -6 M 0.253 -7 Q 0.281 -8 A 0.327 -9 L 0.370 -10 M 0.402 -11 L 0.426 -12 P 0.436 -13 L 0.424 -14 L 0.408 -15 L 0.412 -16 L 0.450 -17 P 0.517 -18 L 0.594 -19 G 0.655 -20 R 0.687 -21 A 0.693 -22 A 0.693 -23 P 0.705 -24 K 0.725 -25 D 0.736 -26 G 0.724 -27 V 0.685 -28 A 0.624 -29 R 0.547 -30 L 0.466 -31 D 0.398 -32 P 0.358 -33 E 0.347 -34 V 0.349 -35 Q 0.358 -36 Q 0.366 -37 Q 0.360 -38 L 0.332 -39 T 0.285 -40 P 0.231 -41 N 0.181 -42 P 0.142 -43 F 0.118 -44 Q 0.107 -45 P 0.097 -46 G 0.079 -47 P 0.057 -48 E 0.039 -49 Q 0.029 -50 L 0.025 -51 R 0.023 -52 H 0.021 -53 L 0.020 -54 Q 0.023 -55 N 0.031 -56 Y 0.046 -57 L 0.068 -58 K 0.090 -59 G 0.110 -60 L 0.132 -61 E 0.156 -62 K 0.180 -63 M 0.198 -64 E 0.209 -65 E 0.214 -66 D 0.216 -67 P 0.208 -68 E 0.188 -69 H 0.159 -70 M 0.127 -71 D 0.096 -72 R 0.072 -73 E 0.057 -74 Q 0.050 -75 V 0.047 -76 L 0.043 -77 L 0.040 -78 S 0.039 -79 L 0.038 -80 F 0.035 -81 A 0.031 -82 L 0.030 -83 H 0.036 -84 D 0.051 -85 Y 0.071 -86 D 0.088 -87 Q 0.099 -88 N 0.109 -89 G 0.121 -90 Q 0.128 -91 L 0.119 -92 D 0.094 -93 G 0.069 -94 L 0.052 -95 E 0.044 -96 L 0.039 -97 L 0.036 -98 S 0.034 -99 M 0.035 -100 L 0.037 -101 T 0.041 -102 A 0.054 -103 A 0.081 -104 L 0.120 -105 A 0.166 -106 P 0.207 -107 G 0.227 -108 A 0.219 -109 A 0.194 -110 H 0.172 -111 F 0.159 -112 P 0.145 -113 I 0.123 -114 N 0.099 -115 P 0.083 -116 V 0.070 -117 I 0.059 -118 L 0.053 -119 V 0.052 -120 V 0.053 -121 D 0.055 -122 S 0.060 -123 V 0.068 -124 L 0.073 -125 E 0.071 -126 T 0.067 -127 Q 0.072 -128 D 0.091 -129 L 0.122 -130 D 0.151 -131 G 0.166 -132 D 0.164 -133 G 0.153 -134 L 0.135 -135 M 0.108 -136 T 0.079 -137 P 0.059 -138 A 0.054 -139 E 0.055 -140 L 0.056 -141 I 0.062 -142 N 0.080 -143 F 0.111 -144 P 0.156 -145 E 0.224 -146 V 0.318 -147 P 0.419 -148 K 0.501 -149 H 0.554 -150 T 0.586 -151 E 0.602 -152 S 0.603 -153 L 0.605 -154 P 0.628 -155 P 0.668 -156 A 0.696 -157 L 0.699 -158 Q 0.694 -159 E 0.696 -160 P 0.709 -161 Q 0.734 -162 P 0.766 -163 A 0.792 -164 G 0.799 -165 S 0.792 -166 Q 0.787 -167 P 0.796 -168 L 0.814 -169 L 0.825 -170 A 0.821 -171 N 0.809 -172 S 0.806 -173 P 0.817 -174 L 0.833 -175 Q 0.843 -176 S 0.846 -177 E 0.843 -178 T 0.835 -179 Q 0.826 -180 Q 0.815 -181 S 0.805 -182 L 0.795 -183 G 0.783 -184 T 0.765 -185 K 0.741 -186 E 0.700 -187 I 0.631 -188 R 0.548 -189 S 0.490 -190 Q 0.469 -191 V 0.460 -192 E 0.457 -193 A 0.485 -194 K 0.557 -195 R 0.637 -196 A 0.690 -197 S 0.709 -198 L 0.712 -199 E 0.718 -200 P 0.738 -201 E 0.769 -202 Q 0.796 -203 E 0.809 -204 A 0.796 -205 G 0.749 -206 H 0.684 -207 Q 0.654 -208 T 0.694 -209 E 0.763 -210 G 0.810 -211 K 0.824 -212 V 0.820 -213 D 0.807 -214 T 0.785 -215 L 0.759 -216 S 0.741 -217 P 0.739 -218 E 0.749 -219 E 0.761 -220 E 0.772 -221 A 0.783 -222 R 0.794 -223 G 0.806 -224 Q 0.816 -225 A 0.821 -226 E 0.823 -227 S 0.821 -228 E 0.816 -229 G 0.806 -230 D 0.794 -231 V 0.783 -232 P 0.781 -233 G 0.792 -234 P 0.809 -235 R 0.823 -236 E 0.831 -237 G 0.832 -238 A 0.827 -239 E 0.823 -240 E 0.824 -241 Q 0.829 -242 V 0.830 -243 E 0.822 -244 I 0.810 -245 K 0.794 -246 D 0.775 -247 N 0.750 -248 E 0.722 -249 G 0.695 -250 E 0.654 -251 A 0.591 -252 K 0.530 -253 E 0.514 -254 L 0.547 -255 L 0.581 -256 V 0.582 -257 E 0.573 -258 T 0.582 -259 L 0.604 -260 E 0.625 -261 S 0.638 -262 L 0.641 -263 N 0.640 -264 T 0.651 -265 P 0.678 -266 N 0.712 -267 E 0.738 -268 A 0.750 -269 E 0.752 -270 A 0.752 -271 H 0.757 -272 S 0.764 -273 I 0.765 -274 Q 0.760 -275 L 0.746 -276 E 0.723 -277 N 0.689 -278 D 0.640 -279 E 0.575 -280 I 0.524 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029161.9_ENSMUST00000031051.9_GN:Cgref1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:45.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029161.9_ENSMUST00000031051.9_GN:Cgref1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:45.caid deleted file mode 100644 index 102aca7ef9a1ab69cd008812fca9d6197d0f9dd9..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029161.9_ENSMUST00000031051.9_GN:Cgref1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:45.caid +++ /dev/null @@ -1,326 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000029161.9|ENSMUST00000031051.9|GN:Cgref1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:45 -1 M 0.433 -2 A 0.481 -3 T 0.541 -4 W 0.587 -5 S 0.617 -6 R 0.645 -7 P 0.680 -8 G 0.721 -9 E 0.752 -10 G 0.755 -11 R 0.719 -12 L 0.659 -13 R 0.625 -14 A 0.640 -15 A 0.654 -16 G 0.626 -17 R 0.599 -18 E 0.624 -19 R 0.683 -20 R 0.730 -21 G 0.742 -22 A 0.714 -23 Y 0.662 -24 R 0.637 -25 V 0.672 -26 H 0.734 -27 E 0.778 -28 A 0.793 -29 G 0.793 -30 A 0.795 -31 P 0.807 -32 V 0.823 -33 A 0.836 -34 H 0.842 -35 S 0.841 -36 A 0.836 -37 A 0.824 -38 A 0.803 -39 A 0.776 -40 A 0.747 -41 P 0.722 -42 V 0.694 -43 S 0.646 -44 S 0.568 -45 R 0.484 -46 M 0.419 -47 F 0.375 -48 Q 0.351 -49 W 0.350 -50 L 0.358 -51 M 0.365 -52 Q 0.390 -53 A 0.433 -54 L 0.470 -55 M 0.487 -56 L 0.495 -57 P 0.497 -58 L 0.486 -59 L 0.470 -60 L 0.471 -61 L 0.505 -62 P 0.572 -63 L 0.649 -64 G 0.708 -65 R 0.736 -66 A 0.740 -67 A 0.740 -68 P 0.748 -69 K 0.765 -70 D 0.774 -71 G 0.760 -72 V 0.720 -73 A 0.659 -74 R 0.583 -75 L 0.503 -76 D 0.436 -77 P 0.402 -78 E 0.397 -79 V 0.402 -80 Q 0.409 -81 Q 0.414 -82 Q 0.401 -83 L 0.360 -84 T 0.298 -85 P 0.232 -86 N 0.174 -87 P 0.133 -88 F 0.109 -89 Q 0.098 -90 P 0.087 -91 G 0.070 -92 P 0.049 -93 E 0.034 -94 Q 0.026 -95 L 0.022 -96 R 0.020 -97 H 0.018 -98 L 0.017 -99 Q 0.019 -100 N 0.025 -101 Y 0.038 -102 L 0.055 -103 K 0.071 -104 G 0.087 -105 L 0.105 -106 E 0.127 -107 K 0.149 -108 M 0.168 -109 E 0.183 -110 E 0.196 -111 D 0.206 -112 P 0.205 -113 E 0.187 -114 H 0.156 -115 M 0.122 -116 D 0.090 -117 R 0.068 -118 E 0.055 -119 Q 0.050 -120 V 0.046 -121 L 0.042 -122 L 0.039 -123 S 0.037 -124 L 0.036 -125 F 0.035 -126 A 0.031 -127 L 0.031 -128 H 0.039 -129 D 0.056 -130 Y 0.078 -131 D 0.097 -132 Q 0.110 -133 N 0.121 -134 G 0.133 -135 Q 0.137 -136 L 0.125 -137 D 0.099 -138 G 0.074 -139 L 0.058 -140 E 0.049 -141 L 0.042 -142 L 0.036 -143 S 0.033 -144 M 0.034 -145 L 0.035 -146 T 0.040 -147 A 0.053 -148 A 0.081 -149 L 0.123 -150 A 0.174 -151 P 0.221 -152 G 0.247 -153 A 0.244 -154 A 0.222 -155 H 0.200 -156 F 0.185 -157 P 0.167 -158 I 0.141 -159 N 0.116 -160 P 0.096 -161 V 0.081 -162 I 0.069 -163 L 0.064 -164 V 0.063 -165 V 0.064 -166 D 0.066 -167 S 0.070 -168 V 0.077 -169 L 0.080 -170 E 0.076 -171 T 0.071 -172 Q 0.076 -173 D 0.095 -174 L 0.127 -175 D 0.158 -176 G 0.173 -177 D 0.171 -178 G 0.159 -179 L 0.140 -180 M 0.112 -181 T 0.081 -182 P 0.059 -183 A 0.052 -184 E 0.053 -185 L 0.053 -186 I 0.057 -187 N 0.071 -188 F 0.097 -189 P 0.139 -190 E 0.205 -191 V 0.296 -192 P 0.394 -193 K 0.472 -194 H 0.523 -195 T 0.555 -196 E 0.574 -197 S 0.579 -198 L 0.585 -199 P 0.613 -200 P 0.660 -201 A 0.694 -202 L 0.701 -203 Q 0.696 -204 E 0.698 -205 P 0.712 -206 Q 0.738 -207 P 0.770 -208 A 0.796 -209 G 0.805 -210 S 0.800 -211 Q 0.798 -212 P 0.808 -213 L 0.824 -214 L 0.832 -215 A 0.825 -216 N 0.810 -217 S 0.806 -218 P 0.816 -219 L 0.831 -220 Q 0.842 -221 S 0.845 -222 E 0.841 -223 T 0.834 -224 Q 0.825 -225 Q 0.815 -226 S 0.806 -227 L 0.799 -228 G 0.790 -229 T 0.776 -230 K 0.756 -231 E 0.722 -232 I 0.661 -233 R 0.583 -234 S 0.525 -235 Q 0.506 -236 V 0.497 -237 E 0.487 -238 A 0.508 -239 K 0.576 -240 R 0.655 -241 A 0.704 -242 S 0.719 -243 L 0.719 -244 E 0.723 -245 P 0.742 -246 E 0.771 -247 Q 0.796 -248 E 0.808 -249 A 0.796 -250 G 0.751 -251 H 0.688 -252 Q 0.660 -253 T 0.698 -254 E 0.767 -255 G 0.813 -256 K 0.829 -257 V 0.825 -258 D 0.812 -259 T 0.791 -260 L 0.767 -261 S 0.751 -262 P 0.749 -263 E 0.757 -264 E 0.767 -265 E 0.776 -266 A 0.786 -267 R 0.798 -268 G 0.810 -269 Q 0.818 -270 A 0.823 -271 E 0.824 -272 S 0.822 -273 E 0.817 -274 G 0.807 -275 D 0.794 -276 V 0.782 -277 P 0.779 -278 G 0.789 -279 P 0.806 -280 R 0.821 -281 E 0.825 -282 G 0.815 -283 A 0.795 -284 E 0.783 -285 E 0.794 -286 Q 0.816 -287 V 0.828 -288 E 0.825 -289 I 0.813 -290 K 0.798 -291 D 0.779 -292 N 0.755 -293 E 0.730 -294 G 0.704 -295 E 0.665 -296 A 0.603 -297 K 0.542 -298 E 0.528 -299 L 0.572 -300 L 0.635 -301 V 0.679 -302 E 0.694 -303 T 0.686 -304 L 0.670 -305 E 0.663 -306 S 0.665 -307 L 0.666 -308 N 0.664 -309 T 0.674 -310 P 0.701 -311 N 0.733 -312 E 0.758 -313 A 0.767 -314 E 0.768 -315 A 0.767 -316 H 0.770 -317 S 0.776 -318 I 0.778 -319 Q 0.773 -320 L 0.759 -321 E 0.737 -322 N 0.703 -323 D 0.655 -324 E 0.592 -325 I 0.542 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029389.18_ENSMUST00000071057.14_GN:Ddx55_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029389.18_ENSMUST00000071057.14_GN:Ddx55_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index e44b56808cf3f84e8a364d3a44f09c94d8fe657c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029389.18_ENSMUST00000071057.14_GN:Ddx55_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,601 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000029389.18|ENSMUST00000071057.14|GN:Ddx55|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.253 -2 E 0.235 -3 H 0.214 -4 V 0.197 -5 T 0.183 -6 E 0.163 -7 G 0.134 -8 A 0.101 -9 W 0.074 -10 E 0.062 -11 S 0.063 -12 L 0.069 -13 Q 0.073 -14 V 0.072 -15 P 0.068 -16 L 0.061 -17 H 0.053 -18 P 0.048 -19 R 0.047 -20 V 0.047 -21 L 0.048 -22 G 0.049 -23 A 0.046 -24 L 0.043 -25 R 0.041 -26 E 0.044 -27 L 0.050 -28 G 0.055 -29 F 0.056 -30 P 0.053 -31 H 0.048 -32 M 0.043 -33 T 0.040 -34 P 0.041 -35 V 0.045 -36 Q 0.047 -37 S 0.046 -38 A 0.043 -39 T 0.038 -40 I 0.033 -41 P 0.029 -42 L 0.029 -43 F 0.035 -44 M 0.047 -45 K 0.062 -46 N 0.078 -47 K 0.092 -48 D 0.099 -49 V 0.101 -50 A 0.102 -51 A 0.107 -52 E 0.115 -53 A 0.118 -54 V 0.116 -55 T 0.116 -56 G 0.121 -57 S 0.126 -58 G 0.124 -59 K 0.112 -60 T 0.094 -61 L 0.077 -62 A 0.065 -63 F 0.058 -64 V 0.055 -65 I 0.052 -66 P 0.048 -67 I 0.043 -68 L 0.039 -69 E 0.037 -70 I 0.038 -71 L 0.040 -72 L 0.041 -73 R 0.044 -74 R 0.054 -75 E 0.072 -76 E 0.095 -77 K 0.114 -78 L 0.121 -79 K 0.120 -80 K 0.117 -81 N 0.110 -82 Q 0.095 -83 V 0.074 -84 G 0.054 -85 A 0.041 -86 I 0.040 -87 V 0.043 -88 I 0.042 -89 T 0.037 -90 P 0.031 -91 T 0.029 -92 R 0.030 -93 E 0.035 -94 L 0.039 -95 A 0.038 -96 I 0.038 -97 Q 0.044 -98 I 0.058 -99 D 0.072 -100 E 0.075 -101 V 0.066 -102 L 0.052 -103 S 0.040 -104 H 0.032 -105 F 0.027 -106 T 0.025 -107 K 0.024 -108 H 0.024 -109 F 0.023 -110 P 0.022 -111 Q 0.020 -112 F 0.020 -113 S 0.021 -114 Q 0.024 -115 I 0.026 -116 L 0.026 -117 W 0.025 -118 I 0.025 -119 G 0.029 -120 G 0.036 -121 R 0.042 -122 N 0.043 -123 P 0.042 -124 G 0.039 -125 E 0.038 -126 D 0.044 -127 V 0.056 -128 E 0.065 -129 R 0.063 -130 F 0.055 -131 K 0.052 -132 Q 0.057 -133 H 0.062 -134 G 0.058 -135 G 0.050 -136 N 0.045 -137 I 0.046 -138 I 0.047 -139 V 0.047 -140 A 0.046 -141 T 0.045 -142 P 0.044 -143 G 0.041 -144 R 0.037 -145 L 0.033 -146 E 0.031 -147 D 0.033 -148 M 0.037 -149 F 0.044 -150 R 0.054 -151 R 0.071 -152 K 0.095 -153 A 0.118 -154 E 0.132 -155 G 0.136 -156 L 0.128 -157 D 0.107 -158 L 0.078 -159 A 0.054 -160 S 0.042 -161 C 0.042 -162 V 0.046 -163 K 0.046 -164 S 0.040 -165 L 0.032 -166 D 0.025 -167 V 0.022 -168 L 0.022 -169 V 0.022 -170 L 0.022 -171 D 0.024 -172 E 0.029 -173 A 0.034 -174 D 0.040 -175 R 0.047 -176 L 0.053 -177 L 0.055 -178 D 0.053 -179 M 0.052 -180 G 0.053 -181 F 0.053 -182 E 0.048 -183 A 0.043 -184 S 0.040 -185 I 0.039 -186 N 0.039 -187 T 0.039 -188 I 0.037 -189 L 0.036 -190 E 0.035 -191 F 0.035 -192 L 0.034 -193 P 0.035 -194 K 0.037 -195 Q 0.038 -196 R 0.037 -197 R 0.034 -198 T 0.033 -199 G 0.034 -200 L 0.039 -201 F 0.049 -202 S 0.065 -203 A 0.082 -204 T 0.094 -205 Q 0.095 -206 T 0.084 -207 Q 0.069 -208 E 0.058 -209 V 0.052 -210 E 0.052 -211 N 0.055 -212 L 0.061 -213 V 0.067 -214 R 0.071 -215 A 0.075 -216 G 0.079 -217 L 0.089 -218 R 0.103 -219 N 0.109 -220 P 0.101 -221 V 0.085 -222 R 0.079 -223 I 0.092 -224 S 0.126 -225 V 0.184 -226 K 0.264 -227 E 0.353 -228 K 0.429 -229 G 0.478 -230 V 0.502 -231 A 0.508 -232 A 0.498 -233 S 0.465 -234 S 0.411 -235 T 0.348 -236 Q 0.297 -237 K 0.270 -238 T 0.256 -239 P 0.231 -240 S 0.188 -241 R 0.139 -242 L 0.097 -243 E 0.067 -244 N 0.048 -245 H 0.036 -246 Y 0.033 -247 M 0.036 -248 I 0.042 -249 C 0.043 -250 K 0.041 -251 A 0.040 -252 D 0.043 -253 E 0.046 -254 K 0.043 -255 F 0.038 -256 N 0.035 -257 Q 0.032 -258 L 0.028 -259 V 0.025 -260 H 0.024 -261 F 0.025 -262 L 0.028 -263 R 0.029 -264 S 0.030 -265 R 0.032 -266 Q 0.034 -267 Q 0.036 -268 E 0.036 -269 K 0.033 -270 H 0.030 -271 L 0.030 -272 V 0.034 -273 F 0.038 -274 F 0.037 -275 S 0.032 -276 T 0.027 -277 C 0.024 -278 A 0.025 -279 C 0.025 -280 V 0.025 -281 E 0.025 -282 Y 0.025 -283 Y 0.026 -284 G 0.027 -285 K 0.029 -286 A 0.030 -287 L 0.031 -288 E 0.031 -289 A 0.030 -290 L 0.030 -291 L 0.032 -292 K 0.036 -293 K 0.041 -294 V 0.045 -295 K 0.047 -296 I 0.044 -297 L 0.036 -298 C 0.029 -299 I 0.026 -300 H 0.031 -301 G 0.042 -302 K 0.053 -303 M 0.059 -304 K 0.057 -305 Y 0.049 -306 K 0.043 -307 R 0.044 -308 N 0.053 -309 K 0.062 -310 I 0.066 -311 F 0.067 -312 M 0.066 -313 E 0.058 -314 F 0.045 -315 R 0.036 -316 K 0.034 -317 L 0.037 -318 Q 0.046 -319 S 0.056 -320 G 0.065 -321 I 0.068 -322 L 0.068 -323 V 0.063 -324 C 0.057 -325 T 0.056 -326 D 0.065 -327 V 0.079 -328 M 0.089 -329 A 0.092 -330 R 0.088 -331 G 0.084 -332 I 0.084 -333 D 0.087 -334 I 0.089 -335 P 0.085 -336 E 0.074 -337 V 0.059 -338 N 0.046 -339 W 0.037 -340 V 0.030 -341 L 0.029 -342 Q 0.033 -343 Y 0.046 -344 D 0.067 -345 P 0.088 -346 P 0.098 -347 S 0.096 -348 N 0.088 -349 A 0.080 -350 S 0.071 -351 A 0.062 -352 F 0.058 -353 V 0.057 -354 H 0.058 -355 R 0.062 -356 C 0.067 -357 G 0.075 -358 R 0.089 -359 T 0.110 -360 A 0.130 -361 R 0.140 -362 I 0.148 -363 G 0.161 -364 H 0.176 -365 G 0.180 -366 G 0.169 -367 S 0.146 -368 A 0.123 -369 L 0.109 -370 V 0.101 -371 F 0.095 -372 L 0.090 -373 L 0.082 -374 P 0.072 -375 M 0.062 -376 E 0.053 -377 E 0.046 -378 A 0.043 -379 Y 0.050 -380 I 0.064 -381 N 0.073 -382 F 0.072 -383 L 0.069 -384 A 0.072 -385 I 0.083 -386 N 0.095 -387 Q 0.106 -388 K 0.114 -389 C 0.120 -390 P 0.117 -391 L 0.102 -392 Q 0.084 -393 E 0.070 -394 M 0.063 -395 S 0.066 -396 L 0.079 -397 Q 0.095 -398 R 0.104 -399 N 0.103 -400 T 0.100 -401 I 0.099 -402 D 0.098 -403 L 0.093 -404 L 0.084 -405 P 0.074 -406 K 0.069 -407 L 0.074 -408 R 0.089 -409 A 0.105 -410 M 0.116 -411 A 0.125 -412 L 0.132 -413 A 0.134 -414 D 0.127 -415 R 0.115 -416 A 0.103 -417 V 0.089 -418 F 0.074 -419 E 0.064 -420 K 0.061 -421 G 0.060 -422 M 0.059 -423 K 0.059 -424 A 0.059 -425 F 0.054 -426 V 0.044 -427 S 0.036 -428 F 0.031 -429 V 0.029 -430 Q 0.031 -431 A 0.040 -432 Y 0.057 -433 A 0.076 -434 K 0.092 -435 H 0.102 -436 E 0.102 -437 C 0.096 -438 S 0.090 -439 L 0.089 -440 I 0.093 -441 F 0.097 -442 R 0.100 -443 L 0.101 -444 K 0.104 -445 D 0.103 -446 L 0.096 -447 D 0.081 -448 F 0.066 -449 A 0.056 -450 G 0.053 -451 L 0.054 -452 A 0.056 -453 R 0.057 -454 G 0.058 -455 F 0.066 -456 A 0.079 -457 L 0.090 -458 L 0.095 -459 R 0.096 -460 M 0.095 -461 P 0.094 -462 R 0.094 -463 M 0.100 -464 P 0.107 -465 E 0.113 -466 L 0.118 -467 R 0.124 -468 G 0.131 -469 K 0.136 -470 Q 0.142 -471 F 0.152 -472 P 0.162 -473 D 0.166 -474 F 0.165 -475 V 0.166 -476 P 0.176 -477 V 0.201 -478 D 0.234 -479 I 0.255 -480 D 0.252 -481 T 0.232 -482 D 0.212 -483 T 0.199 -484 I 0.192 -485 P 0.190 -486 F 0.192 -487 K 0.194 -488 D 0.188 -489 K 0.172 -490 I 0.156 -491 R 0.152 -492 E 0.159 -493 K 0.176 -494 Q 0.196 -495 R 0.211 -496 Q 0.216 -497 K 0.215 -498 L 0.213 -499 L 0.215 -500 E 0.224 -501 Q 0.239 -502 K 0.254 -503 R 0.261 -504 K 0.268 -505 E 0.285 -506 R 0.308 -507 S 0.328 -508 E 0.344 -509 N 0.359 -510 E 0.369 -511 G 0.374 -512 R 0.375 -513 K 0.380 -514 K 0.390 -515 F 0.400 -516 I 0.405 -517 K 0.400 -518 N 0.387 -519 K 0.365 -520 A 0.340 -521 W 0.318 -522 S 0.304 -523 K 0.296 -524 Q 0.291 -525 K 0.289 -526 A 0.291 -527 K 0.288 -528 K 0.276 -529 E 0.261 -530 R 0.255 -531 K 0.248 -532 K 0.242 -533 K 0.250 -534 M 0.278 -535 N 0.306 -536 A 0.322 -537 K 0.330 -538 R 0.345 -539 K 0.372 -540 K 0.407 -541 D 0.442 -542 E 0.470 -543 G 0.489 -544 S 0.497 -545 D 0.491 -546 I 0.476 -547 D 0.462 -548 D 0.449 -549 E 0.428 -550 D 0.398 -551 M 0.367 -552 E 0.340 -553 E 0.318 -554 L 0.299 -555 L 0.278 -556 N 0.249 -557 D 0.216 -558 T 0.183 -559 R 0.157 -560 L 0.143 -561 L 0.137 -562 K 0.133 -563 K 0.132 -564 F 0.143 -565 K 0.171 -566 K 0.206 -567 G 0.226 -568 K 0.214 -569 I 0.181 -570 T 0.154 -571 E 0.146 -572 E 0.147 -573 E 0.152 -574 F 0.161 -575 E 0.170 -576 K 0.178 -577 G 0.188 -578 L 0.203 -579 L 0.220 -580 T 0.245 -581 S 0.282 -582 A 0.325 -583 K 0.369 -584 R 0.418 -585 T 0.468 -586 V 0.503 -587 Q 0.519 -588 L 0.530 -589 T 0.542 -590 D 0.561 -591 L 0.587 -592 G 0.620 -593 V 0.650 -594 S 0.673 -595 D 0.687 -596 L 0.697 -597 E 0.700 -598 E 0.690 -599 D 0.667 -600 S 0.644 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029389.18_ENSMUST00000071057.14_GN:Ddx55_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:18.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029389.18_ENSMUST00000071057.14_GN:Ddx55_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:18.caid deleted file mode 100644 index 44502df6029fbae336a735ca65d1429f2739c604..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000029389.18_ENSMUST00000071057.14_GN:Ddx55_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:18.caid +++ /dev/null @@ -1,619 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000029389.18|ENSMUST00000071057.14|GN:Ddx55|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:18 -1 M 0.248 -2 L 0.242 -3 L 0.244 -4 Q 0.271 -5 R 0.320 -6 C 0.368 -7 G 0.396 -8 R 0.411 -9 L 0.421 -10 K 0.430 -11 P 0.444 -12 A 0.464 -13 E 0.484 -14 N 0.500 -15 R 0.508 -16 G 0.502 -17 R 0.478 -18 A 0.436 -19 M 0.376 -20 E 0.311 -21 H 0.254 -22 V 0.212 -23 T 0.180 -24 E 0.150 -25 G 0.120 -26 A 0.090 -27 W 0.067 -28 E 0.058 -29 S 0.060 -30 L 0.067 -31 Q 0.072 -32 V 0.073 -33 P 0.070 -34 L 0.062 -35 H 0.054 -36 P 0.049 -37 R 0.047 -38 V 0.047 -39 L 0.048 -40 G 0.048 -41 A 0.045 -42 L 0.042 -43 R 0.040 -44 E 0.042 -45 L 0.047 -46 G 0.052 -47 F 0.052 -48 P 0.050 -49 H 0.045 -50 M 0.040 -51 T 0.037 -52 P 0.038 -53 V 0.043 -54 Q 0.045 -55 S 0.044 -56 A 0.041 -57 T 0.036 -58 I 0.032 -59 P 0.028 -60 L 0.027 -61 F 0.033 -62 M 0.045 -63 K 0.060 -64 N 0.075 -65 K 0.088 -66 D 0.095 -67 V 0.095 -68 A 0.095 -69 A 0.099 -70 E 0.105 -71 A 0.108 -72 V 0.107 -73 T 0.107 -74 G 0.113 -75 S 0.118 -76 G 0.116 -77 K 0.105 -78 T 0.088 -79 L 0.072 -80 A 0.061 -81 F 0.054 -82 V 0.051 -83 I 0.048 -84 P 0.045 -85 I 0.040 -86 L 0.036 -87 E 0.034 -88 I 0.036 -89 L 0.038 -90 L 0.039 -91 R 0.042 -92 R 0.052 -93 E 0.070 -94 E 0.093 -95 K 0.112 -96 L 0.119 -97 K 0.117 -98 K 0.114 -99 N 0.107 -100 Q 0.093 -101 V 0.072 -102 G 0.053 -103 A 0.041 -104 I 0.040 -105 V 0.043 -106 I 0.043 -107 T 0.037 -108 P 0.031 -109 T 0.028 -110 R 0.029 -111 E 0.033 -112 L 0.037 -113 A 0.037 -114 I 0.036 -115 Q 0.043 -116 I 0.057 -117 D 0.071 -118 E 0.074 -119 V 0.064 -120 L 0.051 -121 S 0.039 -122 H 0.031 -123 F 0.026 -124 T 0.024 -125 K 0.024 -126 H 0.024 -127 F 0.023 -128 P 0.022 -129 Q 0.021 -130 F 0.021 -131 S 0.022 -132 Q 0.025 -133 I 0.027 -134 L 0.027 -135 W 0.026 -136 I 0.026 -137 G 0.030 -138 G 0.036 -139 R 0.042 -140 N 0.044 -141 P 0.042 -142 G 0.039 -143 E 0.038 -144 D 0.044 -145 V 0.056 -146 E 0.065 -147 R 0.062 -148 F 0.055 -149 K 0.053 -150 Q 0.059 -151 H 0.063 -152 G 0.059 -153 G 0.050 -154 N 0.045 -155 I 0.045 -156 I 0.046 -157 V 0.046 -158 A 0.045 -159 T 0.044 -160 P 0.043 -161 G 0.040 -162 R 0.036 -163 L 0.032 -164 E 0.030 -165 D 0.032 -166 M 0.037 -167 F 0.043 -168 R 0.054 -169 R 0.071 -170 K 0.095 -171 A 0.118 -172 E 0.131 -173 G 0.134 -174 L 0.126 -175 D 0.106 -176 L 0.078 -177 A 0.054 -178 S 0.043 -179 C 0.042 -180 V 0.047 -181 K 0.047 -182 S 0.041 -183 L 0.032 -184 D 0.026 -185 V 0.023 -186 L 0.022 -187 V 0.022 -188 L 0.022 -189 D 0.024 -190 E 0.029 -191 A 0.034 -192 D 0.040 -193 R 0.047 -194 L 0.053 -195 L 0.054 -196 D 0.053 -197 M 0.052 -198 G 0.053 -199 F 0.052 -200 E 0.048 -201 A 0.043 -202 S 0.039 -203 I 0.038 -204 N 0.038 -205 T 0.037 -206 I 0.036 -207 L 0.034 -208 E 0.034 -209 F 0.033 -210 L 0.033 -211 P 0.034 -212 K 0.036 -213 Q 0.038 -214 R 0.036 -215 R 0.034 -216 T 0.033 -217 G 0.034 -218 L 0.038 -219 F 0.048 -220 S 0.062 -221 A 0.078 -222 T 0.090 -223 Q 0.091 -224 T 0.081 -225 Q 0.066 -226 E 0.056 -227 V 0.050 -228 E 0.050 -229 N 0.053 -230 L 0.059 -231 V 0.065 -232 R 0.069 -233 A 0.073 -234 G 0.077 -235 L 0.087 -236 R 0.100 -237 N 0.107 -238 P 0.099 -239 V 0.084 -240 R 0.078 -241 I 0.091 -242 S 0.125 -243 V 0.181 -244 K 0.260 -245 E 0.347 -246 K 0.422 -247 G 0.470 -248 V 0.493 -249 A 0.499 -250 A 0.490 -251 S 0.459 -252 S 0.407 -253 T 0.346 -254 Q 0.296 -255 K 0.269 -256 T 0.254 -257 P 0.229 -258 S 0.186 -259 R 0.138 -260 L 0.097 -261 E 0.068 -262 N 0.049 -263 H 0.037 -264 Y 0.034 -265 M 0.037 -266 I 0.043 -267 C 0.045 -268 K 0.042 -269 A 0.041 -270 D 0.044 -271 E 0.046 -272 K 0.043 -273 F 0.039 -274 N 0.035 -275 Q 0.032 -276 L 0.028 -277 V 0.025 -278 H 0.024 -279 F 0.026 -280 L 0.029 -281 R 0.031 -282 S 0.032 -283 R 0.034 -284 Q 0.036 -285 Q 0.038 -286 E 0.038 -287 K 0.035 -288 H 0.031 -289 L 0.032 -290 V 0.036 -291 F 0.039 -292 F 0.039 -293 S 0.034 -294 T 0.028 -295 C 0.025 -296 A 0.025 -297 C 0.026 -298 V 0.026 -299 E 0.026 -300 Y 0.026 -301 Y 0.027 -302 G 0.028 -303 K 0.029 -304 A 0.031 -305 L 0.031 -306 E 0.032 -307 A 0.031 -308 L 0.032 -309 L 0.034 -310 K 0.038 -311 K 0.043 -312 V 0.047 -313 K 0.049 -314 I 0.045 -315 L 0.037 -316 C 0.029 -317 I 0.026 -318 H 0.032 -319 G 0.043 -320 K 0.054 -321 M 0.060 -322 K 0.058 -323 Y 0.051 -324 K 0.044 -325 R 0.044 -326 N 0.053 -327 K 0.063 -328 I 0.066 -329 F 0.067 -330 M 0.066 -331 E 0.058 -332 F 0.046 -333 R 0.037 -334 K 0.035 -335 L 0.038 -336 Q 0.047 -337 S 0.058 -338 G 0.066 -339 I 0.070 -340 L 0.069 -341 V 0.063 -342 C 0.057 -343 T 0.056 -344 D 0.064 -345 V 0.077 -346 M 0.088 -347 A 0.090 -348 R 0.086 -349 G 0.082 -350 I 0.082 -351 D 0.085 -352 I 0.086 -353 P 0.083 -354 E 0.072 -355 V 0.058 -356 N 0.046 -357 W 0.037 -358 V 0.031 -359 L 0.029 -360 Q 0.033 -361 Y 0.046 -362 D 0.066 -363 P 0.087 -364 P 0.098 -365 S 0.096 -366 N 0.089 -367 A 0.081 -368 S 0.071 -369 A 0.062 -370 F 0.058 -371 V 0.057 -372 H 0.058 -373 R 0.062 -374 C 0.067 -375 G 0.074 -376 R 0.088 -377 T 0.109 -378 A 0.127 -379 R 0.137 -380 I 0.144 -381 G 0.158 -382 H 0.174 -383 G 0.179 -384 G 0.169 -385 S 0.147 -386 A 0.125 -387 L 0.110 -388 V 0.101 -389 F 0.096 -390 L 0.090 -391 L 0.082 -392 P 0.072 -393 M 0.062 -394 E 0.053 -395 E 0.046 -396 A 0.043 -397 Y 0.050 -398 I 0.064 -399 N 0.073 -400 F 0.072 -401 L 0.069 -402 A 0.072 -403 I 0.082 -404 N 0.095 -405 Q 0.106 -406 K 0.115 -407 C 0.121 -408 P 0.117 -409 L 0.103 -410 Q 0.084 -411 E 0.070 -412 M 0.063 -413 S 0.066 -414 L 0.079 -415 Q 0.095 -416 R 0.104 -417 N 0.103 -418 T 0.099 -419 I 0.098 -420 D 0.097 -421 L 0.092 -422 L 0.083 -423 P 0.073 -424 K 0.068 -425 L 0.074 -426 R 0.088 -427 A 0.105 -428 M 0.116 -429 A 0.124 -430 L 0.132 -431 A 0.133 -432 D 0.126 -433 R 0.114 -434 A 0.102 -435 V 0.089 -436 F 0.074 -437 E 0.064 -438 K 0.061 -439 G 0.060 -440 M 0.059 -441 K 0.059 -442 A 0.059 -443 F 0.054 -444 V 0.045 -445 S 0.036 -446 F 0.031 -447 V 0.029 -448 Q 0.031 -449 A 0.040 -450 Y 0.057 -451 A 0.077 -452 K 0.094 -453 H 0.103 -454 E 0.104 -455 C 0.098 -456 S 0.092 -457 L 0.091 -458 I 0.095 -459 F 0.099 -460 R 0.101 -461 L 0.102 -462 K 0.104 -463 D 0.104 -464 L 0.096 -465 D 0.081 -466 F 0.066 -467 A 0.057 -468 G 0.054 -469 L 0.055 -470 A 0.057 -471 R 0.058 -472 G 0.059 -473 F 0.067 -474 A 0.080 -475 L 0.090 -476 L 0.095 -477 R 0.096 -478 M 0.095 -479 P 0.093 -480 R 0.095 -481 M 0.100 -482 P 0.107 -483 E 0.113 -484 L 0.118 -485 R 0.124 -486 G 0.131 -487 K 0.136 -488 Q 0.142 -489 F 0.152 -490 P 0.162 -491 D 0.166 -492 F 0.165 -493 V 0.165 -494 P 0.176 -495 V 0.201 -496 D 0.234 -497 I 0.255 -498 D 0.253 -499 T 0.233 -500 D 0.213 -501 T 0.200 -502 I 0.193 -503 P 0.191 -504 F 0.193 -505 K 0.195 -506 D 0.189 -507 K 0.173 -508 I 0.157 -509 R 0.152 -510 E 0.159 -511 K 0.176 -512 Q 0.196 -513 R 0.212 -514 Q 0.217 -515 K 0.216 -516 L 0.214 -517 L 0.216 -518 E 0.225 -519 Q 0.240 -520 K 0.255 -521 R 0.262 -522 K 0.269 -523 E 0.286 -524 R 0.308 -525 S 0.327 -526 E 0.342 -527 N 0.357 -528 E 0.368 -529 G 0.372 -530 R 0.373 -531 K 0.378 -532 K 0.387 -533 F 0.398 -534 I 0.402 -535 K 0.398 -536 N 0.384 -537 K 0.362 -538 A 0.337 -539 W 0.315 -540 S 0.301 -541 K 0.295 -542 Q 0.291 -543 K 0.289 -544 A 0.291 -545 K 0.289 -546 K 0.276 -547 E 0.262 -548 R 0.257 -549 K 0.252 -550 K 0.246 -551 K 0.254 -552 M 0.281 -553 N 0.309 -554 A 0.323 -555 K 0.331 -556 R 0.346 -557 K 0.373 -558 K 0.408 -559 D 0.442 -560 E 0.470 -561 G 0.488 -562 S 0.495 -563 D 0.489 -564 I 0.475 -565 D 0.461 -566 D 0.449 -567 E 0.427 -568 D 0.396 -569 M 0.365 -570 E 0.338 -571 E 0.315 -572 L 0.297 -573 L 0.275 -574 N 0.248 -575 D 0.216 -576 T 0.184 -577 R 0.160 -578 L 0.145 -579 L 0.140 -580 K 0.136 -581 K 0.135 -582 F 0.145 -583 K 0.173 -584 K 0.209 -585 G 0.229 -586 K 0.217 -587 I 0.184 -588 T 0.156 -589 E 0.148 -590 E 0.149 -591 E 0.155 -592 F 0.164 -593 E 0.173 -594 K 0.180 -595 G 0.190 -596 L 0.205 -597 L 0.222 -598 T 0.245 -599 S 0.282 -600 A 0.325 -601 K 0.369 -602 R 0.417 -603 T 0.467 -604 V 0.502 -605 Q 0.518 -606 L 0.530 -607 T 0.542 -608 D 0.560 -609 L 0.586 -610 G 0.618 -611 V 0.647 -612 S 0.670 -613 D 0.685 -614 L 0.695 -615 E 0.698 -616 E 0.687 -617 D 0.661 -618 S 0.636 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030034.13_ENSMUST00000113935.9_GN:Ino80b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030034.13_ENSMUST00000113935.9_GN:Ino80b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 0724f7c4137afd340e5ca60167d8f58da4497edd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030034.13_ENSMUST00000113935.9_GN:Ino80b_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,359 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030034.13|ENSMUST00000113935.9|GN:Ino80b|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.452 -2 S 0.489 -3 K 0.540 -4 L 0.587 -5 W 0.629 -6 R 0.675 -7 R 0.723 -8 G 0.763 -9 S 0.789 -10 T 0.806 -11 S 0.817 -12 G 0.821 -13 A 0.815 -14 M 0.799 -15 E 0.782 -16 A 0.768 -17 P 0.767 -18 E 0.783 -19 P 0.809 -20 G 0.834 -21 E 0.847 -22 T 0.852 -23 L 0.852 -24 E 0.848 -25 L 0.843 -26 S 0.840 -27 L 0.841 -28 A 0.844 -29 G 0.844 -30 A 0.839 -31 H 0.834 -32 G 0.830 -33 H 0.828 -34 G 0.823 -35 V 0.812 -36 H 0.794 -37 K 0.774 -38 K 0.747 -39 K 0.700 -40 H 0.638 -41 K 0.599 -42 K 0.611 -43 H 0.631 -44 K 0.618 -45 K 0.603 -46 K 0.623 -47 H 0.645 -48 K 0.632 -49 K 0.625 -50 K 0.671 -51 H 0.742 -52 H 0.791 -53 Q 0.811 -54 E 0.818 -55 E 0.817 -56 E 0.812 -57 A 0.808 -58 G 0.813 -59 P 0.826 -60 T 0.836 -61 L 0.835 -62 Q 0.823 -63 T 0.811 -64 P 0.807 -65 A 0.811 -66 K 0.818 -67 P 0.824 -68 Q 0.830 -69 L 0.836 -70 K 0.838 -71 L 0.834 -72 K 0.829 -73 I 0.825 -74 K 0.824 -75 L 0.824 -76 G 0.819 -77 G 0.803 -78 Q 0.777 -79 V 0.759 -80 L 0.760 -81 G 0.769 -82 T 0.775 -83 K 0.780 -84 S 0.789 -85 V 0.804 -86 P 0.825 -87 T 0.847 -88 F 0.861 -89 T 0.863 -90 V 0.857 -91 I 0.848 -92 P 0.842 -93 E 0.839 -94 G 0.839 -95 P 0.837 -96 R 0.831 -97 S 0.825 -98 P 0.826 -99 S 0.837 -100 P 0.856 -101 L 0.873 -102 M 0.882 -103 V 0.882 -104 V 0.874 -105 D 0.860 -106 N 0.840 -107 E 0.818 -108 E 0.800 -109 E 0.790 -110 P 0.790 -111 M 0.794 -112 E 0.788 -113 G 0.753 -114 V 0.682 -115 P 0.590 -116 L 0.505 -117 E 0.446 -118 Q 0.420 -119 Y 0.419 -120 R 0.440 -121 A 0.489 -122 W 0.558 -123 L 0.625 -124 D 0.671 -125 E 0.698 -126 D 0.711 -127 S 0.716 -128 N 0.714 -129 L 0.711 -130 S 0.716 -131 P 0.729 -132 S 0.747 -133 P 0.762 -134 L 0.770 -135 R 0.769 -136 D 0.763 -137 L 0.761 -138 P 0.766 -139 G 0.774 -140 D 0.771 -141 L 0.754 -142 E 0.728 -143 G 0.688 -144 Q 0.630 -145 E 0.558 -146 E 0.480 -147 E 0.400 -148 E 0.336 -149 E 0.297 -150 Q 0.274 -151 R 0.260 -152 W 0.254 -153 L 0.249 -154 D 0.247 -155 A 0.258 -156 L 0.287 -157 E 0.331 -158 K 0.397 -159 G 0.474 -160 E 0.531 -161 L 0.552 -162 D 0.541 -163 D 0.509 -164 N 0.470 -165 G 0.438 -166 D 0.416 -167 L 0.401 -168 K 0.395 -169 K 0.390 -170 E 0.362 -171 I 0.307 -172 N 0.254 -173 E 0.233 -174 R 0.245 -175 L 0.264 -176 L 0.260 -177 T 0.227 -178 A 0.183 -179 R 0.148 -180 Q 0.133 -181 R 0.141 -182 A 0.168 -183 L 0.193 -184 L 0.210 -185 Q 0.236 -186 K 0.285 -187 A 0.350 -188 R 0.416 -189 S 0.483 -190 Q 0.555 -191 P 0.629 -192 S 0.693 -193 P 0.736 -194 T 0.756 -195 L 0.764 -196 P 0.772 -197 L 0.787 -198 P 0.806 -199 V 0.823 -200 G 0.828 -201 G 0.820 -202 G 0.802 -203 C 0.779 -204 P 0.760 -205 A 0.747 -206 P 0.730 -207 A 0.694 -208 L 0.635 -209 T 0.563 -210 E 0.487 -211 E 0.412 -212 M 0.355 -213 L 0.328 -214 L 0.313 -215 K 0.289 -216 R 0.257 -217 E 0.229 -218 E 0.216 -219 R 0.216 -220 A 0.218 -221 R 0.215 -222 K 0.211 -223 R 0.214 -224 R 0.217 -225 L 0.220 -226 Q 0.230 -227 A 0.244 -228 A 0.255 -229 R 0.262 -230 R 0.274 -231 A 0.292 -232 E 0.308 -233 E 0.318 -234 H 0.326 -235 K 0.334 -236 N 0.341 -237 Q 0.349 -238 T 0.361 -239 I 0.362 -240 E 0.339 -241 R 0.310 -242 L 0.303 -243 T 0.333 -244 K 0.407 -245 T 0.508 -246 A 0.600 -247 A 0.663 -248 P 0.707 -249 S 0.740 -250 G 0.764 -251 R 0.777 -252 G 0.783 -253 G 0.785 -254 R 0.788 -255 G 0.791 -256 A 0.792 -257 A 0.791 -258 R 0.788 -259 G 0.784 -260 E 0.781 -261 R 0.779 -262 R 0.783 -263 G 0.791 -264 G 0.796 -265 R 0.791 -266 A 0.773 -267 A 0.748 -268 A 0.722 -269 P 0.702 -270 A 0.695 -271 P 0.700 -272 A 0.710 -273 P 0.705 -274 M 0.671 -275 V 0.624 -276 R 0.599 -277 Y 0.597 -278 C 0.600 -279 S 0.599 -280 G 0.597 -281 A 0.592 -282 Q 0.582 -283 G 0.567 -284 S 0.544 -285 T 0.510 -286 L 0.483 -287 S 0.489 -288 F 0.532 -289 P 0.578 -290 P 0.605 -291 G 0.616 -292 V 0.620 -293 P 0.630 -294 T 0.656 -295 P 0.696 -296 T 0.728 -297 A 0.737 -298 V 0.715 -299 A 0.677 -300 Q 0.650 -301 R 0.651 -302 P 0.668 -303 A 0.674 -304 P 0.652 -305 S 0.607 -306 G 0.545 -307 P 0.462 -308 A 0.359 -309 P 0.256 -310 R 0.176 -311 C 0.130 -312 S 0.114 -313 V 0.114 -314 P 0.112 -315 G 0.104 -316 C 0.098 -317 P 0.109 -318 H 0.132 -319 P 0.153 -320 R 0.164 -321 R 0.169 -322 Y 0.166 -323 A 0.150 -324 C 0.130 -325 S 0.117 -326 R 0.119 -327 T 0.133 -328 G 0.148 -329 Q 0.150 -330 A 0.141 -331 L 0.127 -332 C 0.108 -333 S 0.086 -334 L 0.070 -335 Q 0.062 -336 C 0.060 -337 Y 0.060 -338 R 0.058 -339 I 0.056 -340 N 0.056 -341 L 0.063 -342 Q 0.083 -343 L 0.129 -344 R 0.209 -345 L 0.316 -346 G 0.429 -347 G 0.523 -348 P 0.589 -349 E 0.627 -350 G 0.646 -351 P 0.657 -352 G 0.668 -353 S 0.682 -354 P 0.696 -355 L 0.702 -356 L 0.676 -357 A 0.614 -358 T 0.556 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030034.13_ENSMUST00000113935.9_GN:Ino80b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:17.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030034.13_ENSMUST00000113935.9_GN:Ino80b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:17.caid deleted file mode 100644 index 80d992314645d94d309c54ba75db7ba1b4237af2..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030034.13_ENSMUST00000113935.9_GN:Ino80b_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:17.caid +++ /dev/null @@ -1,376 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030034.13|ENSMUST00000113935.9|GN:Ino80b|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:17 -1 M 0.496 -2 S 0.549 -3 A 0.620 -4 C 0.676 -5 V 0.710 -6 P 0.732 -7 T 0.745 -8 V 0.748 -9 S 0.742 -10 S 0.739 -11 P 0.749 -12 L 0.769 -13 P 0.781 -14 L 0.773 -15 Q 0.749 -16 D 0.720 -17 P 0.694 -18 M 0.678 -19 S 0.669 -20 K 0.666 -21 L 0.672 -22 W 0.697 -23 R 0.739 -24 R 0.782 -25 G 0.813 -26 S 0.830 -27 T 0.840 -28 S 0.847 -29 G 0.848 -30 A 0.841 -31 M 0.825 -32 E 0.805 -33 A 0.789 -34 P 0.786 -35 E 0.801 -36 P 0.826 -37 G 0.848 -38 E 0.860 -39 T 0.865 -40 L 0.867 -41 E 0.867 -42 L 0.865 -43 S 0.863 -44 L 0.863 -45 A 0.863 -46 G 0.861 -47 A 0.856 -48 H 0.850 -49 G 0.847 -50 H 0.845 -51 G 0.842 -52 V 0.834 -53 H 0.823 -54 K 0.811 -55 K 0.801 -56 K 0.781 -57 H 0.735 -58 K 0.670 -59 K 0.624 -60 H 0.613 -61 K 0.610 -62 K 0.614 -63 K 0.645 -64 H 0.668 -65 K 0.653 -66 K 0.643 -67 K 0.687 -68 H 0.757 -69 H 0.806 -70 Q 0.826 -71 E 0.831 -72 E 0.829 -73 E 0.823 -74 A 0.818 -75 G 0.821 -76 P 0.831 -77 T 0.840 -78 L 0.838 -79 Q 0.825 -80 T 0.812 -81 P 0.806 -82 A 0.808 -83 K 0.813 -84 P 0.818 -85 Q 0.824 -86 L 0.829 -87 K 0.830 -88 L 0.825 -89 K 0.817 -90 I 0.813 -91 K 0.814 -92 L 0.817 -93 G 0.814 -94 G 0.800 -95 Q 0.775 -96 V 0.757 -97 L 0.758 -98 G 0.767 -99 T 0.774 -100 K 0.780 -101 S 0.788 -102 V 0.800 -103 P 0.820 -104 T 0.841 -105 F 0.854 -106 T 0.855 -107 V 0.846 -108 I 0.836 -109 P 0.828 -110 E 0.826 -111 G 0.825 -112 P 0.822 -113 R 0.816 -114 S 0.809 -115 P 0.811 -116 S 0.824 -117 P 0.845 -118 L 0.863 -119 M 0.874 -120 V 0.875 -121 V 0.868 -122 D 0.854 -123 N 0.835 -124 E 0.814 -125 E 0.796 -126 E 0.788 -127 P 0.789 -128 M 0.795 -129 E 0.791 -130 G 0.759 -131 V 0.692 -132 P 0.602 -133 L 0.516 -134 E 0.455 -135 Q 0.426 -136 Y 0.425 -137 R 0.448 -138 A 0.499 -139 W 0.569 -140 L 0.635 -141 D 0.680 -142 E 0.705 -143 D 0.718 -144 S 0.723 -145 N 0.723 -146 L 0.722 -147 S 0.728 -148 P 0.742 -149 S 0.759 -150 P 0.772 -151 L 0.779 -152 R 0.778 -153 D 0.772 -154 L 0.769 -155 P 0.775 -156 G 0.782 -157 D 0.779 -158 L 0.763 -159 E 0.737 -160 G 0.696 -161 Q 0.635 -162 E 0.561 -163 E 0.481 -164 E 0.402 -165 E 0.340 -166 E 0.304 -167 Q 0.282 -168 R 0.267 -169 W 0.261 -170 L 0.256 -171 D 0.255 -172 A 0.268 -173 L 0.297 -174 E 0.339 -175 K 0.402 -176 G 0.478 -177 E 0.534 -178 L 0.554 -179 D 0.543 -180 D 0.509 -181 N 0.466 -182 G 0.429 -183 D 0.405 -184 L 0.392 -185 K 0.389 -186 K 0.384 -187 E 0.355 -188 I 0.300 -189 N 0.247 -190 E 0.225 -191 R 0.236 -192 L 0.255 -193 L 0.253 -194 T 0.222 -195 A 0.179 -196 R 0.145 -197 Q 0.131 -198 R 0.141 -199 A 0.169 -200 L 0.195 -201 L 0.213 -202 Q 0.241 -203 K 0.292 -204 A 0.358 -205 R 0.421 -206 S 0.484 -207 Q 0.554 -208 P 0.628 -209 S 0.692 -210 P 0.734 -211 T 0.754 -212 L 0.762 -213 P 0.770 -214 L 0.785 -215 P 0.804 -216 V 0.820 -217 G 0.825 -218 G 0.817 -219 G 0.798 -220 C 0.775 -221 P 0.757 -222 A 0.744 -223 P 0.728 -224 A 0.693 -225 L 0.635 -226 T 0.565 -227 E 0.491 -228 E 0.418 -229 M 0.362 -230 L 0.335 -231 L 0.320 -232 K 0.295 -233 R 0.261 -234 E 0.233 -235 E 0.218 -236 R 0.218 -237 A 0.220 -238 R 0.217 -239 K 0.214 -240 R 0.216 -241 R 0.219 -242 L 0.222 -243 Q 0.230 -244 A 0.242 -245 A 0.250 -246 R 0.256 -247 R 0.269 -248 A 0.289 -249 E 0.306 -250 E 0.317 -251 H 0.325 -252 K 0.334 -253 N 0.341 -254 Q 0.348 -255 T 0.358 -256 I 0.357 -257 E 0.334 -258 R 0.307 -259 L 0.303 -260 T 0.336 -261 K 0.412 -262 T 0.514 -263 A 0.605 -264 A 0.665 -265 P 0.707 -266 S 0.738 -267 G 0.761 -268 R 0.774 -269 G 0.779 -270 G 0.782 -271 R 0.785 -272 G 0.788 -273 A 0.790 -274 A 0.788 -275 R 0.785 -276 G 0.782 -277 E 0.779 -278 R 0.778 -279 R 0.783 -280 G 0.792 -281 G 0.797 -282 R 0.792 -283 A 0.776 -284 A 0.752 -285 A 0.727 -286 P 0.709 -287 A 0.703 -288 P 0.709 -289 A 0.721 -290 P 0.717 -291 M 0.684 -292 V 0.641 -293 R 0.621 -294 Y 0.623 -295 C 0.628 -296 S 0.626 -297 G 0.620 -298 A 0.611 -299 Q 0.599 -300 G 0.583 -301 S 0.560 -302 T 0.528 -303 L 0.502 -304 S 0.510 -305 F 0.551 -306 P 0.595 -307 P 0.619 -308 G 0.626 -309 V 0.626 -310 P 0.633 -311 T 0.659 -312 P 0.699 -313 T 0.732 -314 A 0.741 -315 V 0.722 -316 A 0.686 -317 Q 0.660 -318 R 0.660 -319 P 0.676 -320 A 0.681 -321 P 0.659 -322 S 0.614 -323 G 0.553 -324 P 0.470 -325 A 0.366 -326 P 0.261 -327 R 0.179 -328 C 0.132 -329 S 0.116 -330 V 0.115 -331 P 0.113 -332 G 0.104 -333 C 0.099 -334 P 0.109 -335 H 0.132 -336 P 0.153 -337 R 0.165 -338 R 0.171 -339 Y 0.168 -340 A 0.152 -341 C 0.132 -342 S 0.119 -343 R 0.120 -344 T 0.133 -345 G 0.148 -346 Q 0.150 -347 A 0.141 -348 L 0.127 -349 C 0.109 -350 S 0.088 -351 L 0.071 -352 Q 0.063 -353 C 0.061 -354 Y 0.061 -355 R 0.059 -356 I 0.057 -357 N 0.057 -358 L 0.064 -359 Q 0.085 -360 L 0.130 -361 R 0.210 -362 L 0.317 -363 G 0.430 -364 G 0.525 -365 P 0.591 -366 E 0.629 -367 G 0.648 -368 P 0.659 -369 G 0.671 -370 S 0.685 -371 P 0.700 -372 L 0.705 -373 L 0.679 -374 A 0.618 -375 T 0.561 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030050.5_ENSMUST00000032129.3_GN:Gkn1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030050.5_ENSMUST00000032129.3_GN:Gkn1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 60078aa5199fe0db84de792911006e1e8a248e6a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030050.5_ENSMUST00000032129.3_GN:Gkn1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,185 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030050.5|ENSMUST00000032129.3|GN:Gkn1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.336 -2 K 0.333 -3 L 0.332 -4 T 0.328 -5 M 0.306 -6 F 0.279 -7 V 0.280 -8 V 0.311 -9 G 0.345 -10 L 0.376 -11 L 0.420 -12 G 0.468 -13 L 0.496 -14 L 0.509 -15 A 0.522 -16 A 0.526 -17 P 0.502 -18 G 0.439 -19 F 0.350 -20 A 0.263 -21 Y 0.203 -22 T 0.180 -23 V 0.191 -24 N 0.227 -25 I 0.280 -26 N 0.339 -27 G 0.391 -28 N 0.432 -29 D 0.452 -30 G 0.444 -31 N 0.425 -32 V 0.416 -33 D 0.420 -34 G 0.406 -35 S 0.357 -36 G 0.282 -37 Q 0.208 -38 Q 0.149 -39 S 0.111 -40 V 0.090 -41 S 0.084 -42 I 0.087 -43 N 0.093 -44 G 0.095 -45 V 0.093 -46 H 0.087 -47 N 0.082 -48 V 0.082 -49 A 0.091 -50 N 0.109 -51 I 0.133 -52 D 0.160 -53 N 0.186 -54 N 0.208 -55 N 0.216 -56 G 0.205 -57 W 0.177 -58 D 0.144 -59 S 0.115 -60 W 0.087 -61 N 0.064 -62 S 0.051 -63 L 0.047 -64 W 0.051 -65 D 0.058 -66 Y 0.063 -67 E 0.065 -68 N 0.060 -69 S 0.050 -70 F 0.036 -71 A 0.025 -72 A 0.022 -73 T 0.026 -74 R 0.033 -75 L 0.042 -76 F 0.052 -77 S 0.064 -78 K 0.071 -79 K 0.072 -80 S 0.069 -81 C 0.068 -82 I 0.070 -83 V 0.071 -84 H 0.070 -85 R 0.069 -86 M 0.068 -87 N 0.067 -88 K 0.070 -89 D 0.077 -90 A 0.086 -91 M 0.092 -92 P 0.091 -93 S 0.084 -94 L 0.077 -95 Q 0.072 -96 D 0.071 -97 L 0.076 -98 D 0.086 -99 T 0.095 -100 M 0.097 -101 V 0.094 -102 K 0.097 -103 E 0.113 -104 Q 0.146 -105 K 0.189 -106 G 0.224 -107 K 0.243 -108 G 0.255 -109 P 0.266 -110 G 0.274 -111 G 0.274 -112 A 0.260 -113 P 0.233 -114 P 0.200 -115 K 0.171 -116 D 0.147 -117 L 0.123 -118 M 0.103 -119 Y 0.095 -120 S 0.100 -121 V 0.103 -122 N 0.094 -123 P 0.080 -124 T 0.070 -125 R 0.065 -126 V 0.063 -127 E 0.062 -128 D 0.060 -129 L 0.058 -130 N 0.055 -131 T 0.054 -132 F 0.058 -133 G 0.064 -134 P 0.063 -135 K 0.056 -136 I 0.048 -137 A 0.043 -138 G 0.040 -139 M 0.041 -140 C 0.050 -141 R 0.074 -142 G 0.106 -143 I 0.124 -144 P 0.114 -145 T 0.090 -146 Y 0.072 -147 V 0.066 -148 A 0.069 -149 E 0.084 -150 E 0.114 -151 I 0.156 -152 P 0.198 -153 G 0.227 -154 P 0.241 -155 N 0.241 -156 Q 0.234 -157 P 0.224 -158 L 0.214 -159 Y 0.196 -160 S 0.168 -161 K 0.133 -162 K 0.100 -163 C 0.077 -164 Y 0.064 -165 T 0.057 -166 A 0.051 -167 D 0.046 -168 I 0.044 -169 L 0.049 -170 W 0.058 -171 I 0.067 -172 L 0.073 -173 R 0.074 -174 M 0.072 -175 S 0.073 -176 F 0.091 -177 C 0.140 -178 G 0.219 -179 T 0.306 -180 S 0.375 -181 V 0.411 -182 E 0.409 -183 T 0.372 -184 Y 0.334 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030050.5_ENSMUST00000032129.3_GN:Gkn1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:17.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030050.5_ENSMUST00000032129.3_GN:Gkn1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:17.caid deleted file mode 100644 index 16d74cf0921da27b6148275ca5b0a38e523328a7..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030050.5_ENSMUST00000032129.3_GN:Gkn1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:17.caid +++ /dev/null @@ -1,202 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030050.5|ENSMUST00000032129.3|GN:Gkn1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:17 -1 M 0.332 -2 S 0.331 -3 V 0.350 -4 S 0.398 -5 T 0.459 -6 P 0.516 -7 P 0.568 -8 D 0.610 -9 P 0.631 -10 L 0.633 -11 L 0.623 -12 H 0.611 -13 H 0.602 -14 T 0.608 -15 P 0.634 -16 A 0.663 -17 A 0.664 -18 M 0.627 -19 K 0.572 -20 L 0.517 -21 T 0.460 -22 M 0.406 -23 F 0.386 -24 V 0.409 -25 V 0.453 -26 G 0.494 -27 L 0.525 -28 L 0.544 -29 G 0.548 -30 L 0.541 -31 L 0.535 -32 A 0.536 -33 A 0.531 -34 P 0.500 -35 G 0.436 -36 F 0.347 -37 A 0.259 -38 Y 0.197 -39 T 0.174 -40 V 0.185 -41 N 0.224 -42 I 0.284 -43 N 0.349 -44 G 0.408 -45 N 0.457 -46 D 0.485 -47 G 0.481 -48 N 0.459 -49 V 0.446 -50 D 0.442 -51 G 0.422 -52 S 0.366 -53 G 0.287 -54 Q 0.211 -55 Q 0.151 -56 S 0.111 -57 V 0.090 -58 S 0.084 -59 I 0.087 -60 N 0.094 -61 G 0.097 -62 V 0.095 -63 H 0.091 -64 N 0.085 -65 V 0.084 -66 A 0.092 -67 N 0.109 -68 I 0.131 -69 D 0.157 -70 N 0.182 -71 N 0.202 -72 N 0.211 -73 G 0.199 -74 W 0.172 -75 D 0.140 -76 S 0.111 -77 W 0.085 -78 N 0.063 -79 S 0.050 -80 L 0.047 -81 W 0.050 -82 D 0.057 -83 Y 0.063 -84 E 0.064 -85 N 0.060 -86 S 0.050 -87 F 0.036 -88 A 0.025 -89 A 0.022 -90 T 0.026 -91 R 0.033 -92 L 0.041 -93 F 0.052 -94 S 0.063 -95 K 0.070 -96 K 0.071 -97 S 0.068 -98 C 0.068 -99 I 0.070 -100 V 0.071 -101 H 0.071 -102 R 0.070 -103 M 0.069 -104 N 0.068 -105 K 0.070 -106 D 0.078 -107 A 0.088 -108 M 0.094 -109 P 0.092 -110 S 0.084 -111 L 0.075 -112 Q 0.070 -113 D 0.068 -114 L 0.072 -115 D 0.082 -116 T 0.091 -117 M 0.093 -118 V 0.090 -119 K 0.093 -120 E 0.110 -121 Q 0.144 -122 K 0.188 -123 G 0.224 -124 K 0.244 -125 G 0.258 -126 P 0.272 -127 G 0.281 -128 G 0.280 -129 A 0.264 -130 P 0.235 -131 P 0.202 -132 K 0.173 -133 D 0.149 -134 L 0.125 -135 M 0.105 -136 Y 0.097 -137 S 0.102 -138 V 0.106 -139 N 0.097 -140 P 0.083 -141 T 0.072 -142 R 0.068 -143 V 0.066 -144 E 0.064 -145 D 0.061 -146 L 0.059 -147 N 0.057 -148 T 0.056 -149 F 0.060 -150 G 0.065 -151 P 0.064 -152 K 0.057 -153 I 0.049 -154 A 0.043 -155 G 0.041 -156 M 0.041 -157 C 0.050 -158 R 0.073 -159 G 0.105 -160 I 0.124 -161 P 0.115 -162 T 0.091 -163 Y 0.074 -164 V 0.068 -165 A 0.071 -166 E 0.084 -167 E 0.113 -168 I 0.154 -169 P 0.195 -170 G 0.224 -171 P 0.238 -172 N 0.238 -173 Q 0.231 -174 P 0.221 -175 L 0.211 -176 Y 0.194 -177 S 0.166 -178 K 0.131 -179 K 0.098 -180 C 0.075 -181 Y 0.062 -182 T 0.055 -183 A 0.050 -184 D 0.045 -185 I 0.044 -186 L 0.050 -187 W 0.059 -188 I 0.067 -189 L 0.073 -190 R 0.075 -191 M 0.073 -192 S 0.074 -193 F 0.093 -194 C 0.144 -195 G 0.225 -196 T 0.312 -197 S 0.378 -198 V 0.412 -199 E 0.409 -200 T 0.373 -201 Y 0.335 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030173.16_ENSMUST00000118060.8_GN:Klra5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030173.16_ENSMUST00000118060.8_GN:Klra5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index e375da9560c190eb30d53175d21ef3e77dadd91b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030173.16_ENSMUST00000118060.8_GN:Klra5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,267 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030173.16|ENSMUST00000118060.8|GN:Klra5|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.460 -2 S 0.486 -3 E 0.529 -4 P 0.571 -5 E 0.588 -6 V 0.578 -7 T 0.556 -8 Y 0.540 -9 S 0.545 -10 T 0.566 -11 V 0.586 -12 R 0.596 -13 L 0.609 -14 H 0.636 -15 K 0.671 -16 S 0.700 -17 S 0.719 -18 G 0.732 -19 L 0.737 -20 Q 0.735 -21 R 0.728 -22 L 0.726 -23 V 0.729 -24 S 0.734 -25 H 0.743 -26 E 0.757 -27 E 0.766 -28 I 0.763 -29 Q 0.760 -30 G 0.767 -31 P 0.786 -32 G 0.806 -33 E 0.817 -34 A 0.817 -35 G 0.808 -36 Y 0.792 -37 R 0.772 -38 K 0.747 -39 C 0.710 -40 S 0.656 -41 V 0.582 -42 P 0.495 -43 W 0.420 -44 Q 0.371 -45 L 0.338 -46 T 0.301 -47 V 0.259 -48 R 0.234 -49 S 0.233 -50 L 0.242 -51 G 0.242 -52 I 0.229 -53 F 0.212 -54 C 0.198 -55 F 0.192 -56 L 0.193 -57 L 0.195 -58 L 0.192 -59 V 0.186 -60 T 0.177 -61 V 0.167 -62 A 0.156 -63 V 0.145 -64 L 0.136 -65 A 0.135 -66 V 0.139 -67 K 0.144 -68 I 0.151 -69 F 0.166 -70 Q 0.191 -71 Y 0.218 -72 S 0.245 -73 Q 0.272 -74 H 0.301 -75 K 0.330 -76 Q 0.362 -77 E 0.399 -78 I 0.431 -79 H 0.443 -80 E 0.437 -81 T 0.428 -82 L 0.431 -83 N 0.445 -84 H 0.461 -85 N 0.470 -86 H 0.472 -87 N 0.470 -88 C 0.466 -89 S 0.464 -90 N 0.460 -91 M 0.437 -92 Q 0.395 -93 S 0.364 -94 D 0.349 -95 I 0.329 -96 K 0.299 -97 L 0.281 -98 K 0.285 -99 E 0.299 -100 E 0.309 -101 M 0.319 -102 L 0.339 -103 R 0.375 -104 N 0.425 -105 K 0.476 -106 S 0.507 -107 I 0.505 -108 D 0.478 -109 C 0.462 -110 S 0.474 -111 P 0.493 -112 G 0.478 -113 E 0.423 -114 E 0.357 -115 L 0.305 -116 L 0.264 -117 E 0.233 -118 S 0.214 -119 L 0.204 -120 N 0.202 -121 R 0.208 -122 E 0.218 -123 Q 0.222 -124 N 0.217 -125 R 0.211 -126 W 0.208 -127 Y 0.215 -128 S 0.243 -129 E 0.293 -130 T 0.357 -131 K 0.425 -132 T 0.499 -133 D 0.575 -134 L 0.637 -135 D 0.674 -136 S 0.688 -137 S 0.690 -138 Q 0.692 -139 D 0.696 -140 T 0.697 -141 G 0.683 -142 T 0.640 -143 G 0.553 -144 V 0.426 -145 K 0.290 -146 H 0.180 -147 W 0.110 -148 F 0.070 -149 C 0.050 -150 Y 0.040 -151 G 0.035 -152 T 0.032 -153 K 0.029 -154 C 0.027 -155 F 0.027 -156 Y 0.032 -157 F 0.044 -158 I 0.060 -159 M 0.072 -160 S 0.072 -161 K 0.059 -162 N 0.043 -163 T 0.032 -164 W 0.028 -165 S 0.030 -166 G 0.035 -167 C 0.040 -168 K 0.043 -169 Q 0.044 -170 T 0.042 -171 C 0.043 -172 Q 0.048 -173 H 0.054 -174 Y 0.058 -175 S 0.062 -176 L 0.065 -177 P 0.063 -178 L 0.059 -179 V 0.061 -180 K 0.070 -181 I 0.077 -182 E 0.073 -183 D 0.060 -184 E 0.045 -185 D 0.033 -186 E 0.025 -187 L 0.022 -188 K 0.022 -189 F 0.023 -190 L 0.024 -191 Q 0.025 -192 F 0.028 -193 Q 0.031 -194 V 0.033 -195 I 0.033 -196 S 0.032 -197 D 0.029 -198 S 0.023 -199 Y 0.017 -200 W 0.013 -201 I 0.014 -202 G 0.018 -203 L 0.022 -204 S 0.025 -205 Y 0.027 -206 D 0.030 -207 K 0.034 -208 K 0.038 -209 K 0.041 -210 K 0.043 -211 Q 0.044 -212 W 0.041 -213 A 0.036 -214 W 0.035 -215 I 0.047 -216 D 0.075 -217 N 0.113 -218 G 0.148 -219 P 0.166 -220 S 0.167 -221 K 0.164 -222 L 0.172 -223 D 0.193 -224 M 0.220 -225 K 0.248 -226 T 0.271 -227 R 0.280 -228 K 0.271 -229 M 0.249 -230 N 0.219 -231 F 0.184 -232 K 0.148 -233 P 0.116 -234 G 0.093 -235 G 0.077 -236 C 0.066 -237 I 0.056 -238 F 0.049 -239 L 0.047 -240 S 0.050 -241 K 0.057 -242 T 0.070 -243 R 0.084 -244 L 0.093 -245 E 0.092 -246 D 0.087 -247 T 0.082 -248 N 0.081 -249 C 0.081 -250 N 0.081 -251 N 0.077 -252 S 0.069 -253 Y 0.058 -254 F 0.046 -255 C 0.035 -256 I 0.027 -257 C 0.025 -258 G 0.030 -259 K 0.047 -260 K 0.081 -261 L 0.136 -262 D 0.208 -263 H 0.277 -264 F 0.323 -265 P 0.344 -266 G 0.350 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030173.16_ENSMUST00000118060.8_GN:Klra5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:44.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030173.16_ENSMUST00000118060.8_GN:Klra5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:44.caid deleted file mode 100644 index 61c524d26ce935e38d78f6bbad82506f7c491a45..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030173.16_ENSMUST00000118060.8_GN:Klra5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:44.caid +++ /dev/null @@ -1,311 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030173.16|ENSMUST00000118060.8|GN:Klra5|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:44 -1 M 0.485 -2 I 0.529 -3 A 0.582 -4 L 0.616 -5 Q 0.628 -6 S 0.639 -7 K 0.669 -8 G 0.710 -9 L 0.743 -10 T 0.763 -11 G 0.771 -12 R 0.766 -13 G 0.747 -14 Y 0.729 -15 R 0.726 -16 P 0.738 -17 E 0.750 -18 N 0.748 -19 A 0.728 -20 N 0.698 -21 F 0.674 -22 S 0.670 -23 P 0.674 -24 N 0.655 -25 F 0.612 -26 S 0.591 -27 L 0.625 -28 H 0.688 -29 Q 0.740 -30 N 0.770 -31 H 0.787 -32 S 0.799 -33 G 0.811 -34 R 0.821 -35 D 0.827 -36 T 0.829 -37 E 0.827 -38 H 0.825 -39 T 0.820 -40 S 0.810 -41 C 0.799 -42 T 0.797 -43 P 0.804 -44 T 0.808 -45 M 0.800 -46 S 0.786 -47 E 0.777 -48 P 0.775 -49 E 0.771 -50 V 0.762 -51 T 0.753 -52 Y 0.751 -53 S 0.759 -54 T 0.768 -55 V 0.773 -56 R 0.772 -57 L 0.773 -58 H 0.779 -59 K 0.789 -60 S 0.797 -61 S 0.804 -62 G 0.811 -63 L 0.816 -64 Q 0.818 -65 R 0.817 -66 L 0.815 -67 V 0.813 -68 S 0.813 -69 H 0.818 -70 E 0.826 -71 E 0.829 -72 I 0.825 -73 Q 0.819 -74 G 0.823 -75 P 0.835 -76 G 0.849 -77 E 0.857 -78 A 0.857 -79 G 0.849 -80 Y 0.835 -81 R 0.816 -82 K 0.791 -83 C 0.751 -84 S 0.690 -85 V 0.606 -86 P 0.510 -87 W 0.428 -88 Q 0.378 -89 L 0.345 -90 T 0.308 -91 V 0.267 -92 R 0.242 -93 S 0.241 -94 L 0.250 -95 G 0.248 -96 I 0.234 -97 F 0.216 -98 C 0.203 -99 F 0.199 -100 L 0.200 -101 L 0.200 -102 L 0.196 -103 V 0.190 -104 T 0.183 -105 V 0.176 -106 A 0.167 -107 V 0.156 -108 L 0.148 -109 A 0.146 -110 V 0.147 -111 K 0.148 -112 I 0.153 -113 F 0.164 -114 Q 0.183 -115 Y 0.207 -116 S 0.233 -117 Q 0.260 -118 H 0.288 -119 K 0.316 -120 Q 0.345 -121 E 0.376 -122 I 0.399 -123 H 0.408 -124 E 0.404 -125 T 0.399 -126 L 0.400 -127 N 0.407 -128 H 0.416 -129 N 0.424 -130 H 0.432 -131 N 0.434 -132 C 0.432 -133 S 0.435 -134 N 0.438 -135 M 0.419 -136 Q 0.378 -137 S 0.345 -138 D 0.332 -139 I 0.316 -140 K 0.288 -141 L 0.266 -142 K 0.262 -143 E 0.272 -144 E 0.286 -145 M 0.303 -146 L 0.330 -147 R 0.371 -148 N 0.421 -149 K 0.471 -150 S 0.506 -151 I 0.516 -152 D 0.506 -153 C 0.500 -154 S 0.513 -155 P 0.523 -156 G 0.499 -157 E 0.435 -158 E 0.359 -159 L 0.296 -160 L 0.248 -161 E 0.214 -162 S 0.194 -163 L 0.182 -164 N 0.180 -165 R 0.186 -166 E 0.195 -167 Q 0.197 -168 N 0.194 -169 R 0.191 -170 W 0.191 -171 Y 0.200 -172 S 0.229 -173 E 0.280 -174 T 0.345 -175 K 0.418 -176 T 0.499 -177 D 0.582 -178 L 0.650 -179 D 0.690 -180 S 0.705 -181 S 0.706 -182 Q 0.706 -183 D 0.708 -184 T 0.705 -185 G 0.687 -186 T 0.640 -187 G 0.552 -188 V 0.425 -189 K 0.288 -190 H 0.177 -191 W 0.107 -192 F 0.069 -193 C 0.050 -194 Y 0.041 -195 G 0.036 -196 T 0.033 -197 K 0.030 -198 C 0.027 -199 F 0.027 -200 Y 0.031 -201 F 0.043 -202 I 0.058 -203 M 0.071 -204 S 0.071 -205 K 0.058 -206 N 0.043 -207 T 0.031 -208 W 0.026 -209 S 0.028 -210 G 0.035 -211 C 0.044 -212 K 0.054 -213 Q 0.059 -214 T 0.054 -215 C 0.047 -216 Q 0.047 -217 H 0.050 -218 Y 0.053 -219 S 0.055 -220 L 0.058 -221 P 0.056 -222 L 0.052 -223 V 0.055 -224 K 0.064 -225 I 0.071 -226 E 0.068 -227 D 0.056 -228 E 0.042 -229 D 0.031 -230 E 0.024 -231 L 0.022 -232 K 0.022 -233 F 0.022 -234 L 0.023 -235 Q 0.024 -236 F 0.026 -237 Q 0.029 -238 V 0.031 -239 I 0.032 -240 S 0.032 -241 D 0.029 -242 S 0.023 -243 Y 0.017 -244 W 0.013 -245 I 0.014 -246 G 0.018 -247 L 0.022 -248 S 0.025 -249 Y 0.027 -250 D 0.030 -251 K 0.034 -252 K 0.038 -253 K 0.042 -254 K 0.045 -255 Q 0.046 -256 W 0.043 -257 A 0.038 -258 W 0.036 -259 I 0.048 -260 D 0.077 -261 N 0.115 -262 G 0.149 -263 P 0.166 -264 S 0.166 -265 K 0.163 -266 L 0.171 -267 D 0.192 -268 M 0.219 -269 K 0.248 -270 T 0.271 -271 R 0.280 -272 K 0.272 -273 M 0.252 -274 N 0.224 -275 F 0.191 -276 K 0.155 -277 P 0.123 -278 G 0.099 -279 G 0.082 -280 C 0.070 -281 I 0.059 -282 F 0.052 -283 L 0.050 -284 S 0.053 -285 K 0.061 -286 T 0.075 -287 R 0.090 -288 L 0.100 -289 E 0.099 -290 D 0.092 -291 T 0.087 -292 N 0.085 -293 C 0.086 -294 N 0.086 -295 N 0.082 -296 S 0.074 -297 Y 0.063 -298 F 0.050 -299 C 0.038 -300 I 0.029 -301 C 0.026 -302 G 0.032 -303 K 0.050 -304 K 0.085 -305 L 0.143 -306 D 0.218 -307 H 0.289 -308 F 0.336 -309 P 0.357 -310 G 0.361 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030235.18_ENSMUST00000032362.12_GN:Slco1c1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030235.18_ENSMUST00000032362.12_GN:Slco1c1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index bb99145bca9625a5e839808d435344d802a8f63a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030235.18_ENSMUST00000032362.12_GN:Slco1c1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,716 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030235.18|ENSMUST00000032362.12|GN:Slco1c1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.328 -2 D 0.333 -3 T 0.339 -4 S 0.336 -5 S 0.314 -6 K 0.289 -7 E 0.287 -8 N 0.301 -9 A 0.304 -10 H 0.301 -11 L 0.314 -12 F 0.339 -13 H 0.362 -14 K 0.397 -15 N 0.449 -16 S 0.493 -17 A 0.516 -18 Q 0.537 -19 P 0.568 -20 A 0.598 -21 G 0.614 -22 G 0.620 -23 P 0.619 -24 S 0.609 -25 F 0.595 -26 T 0.582 -27 V 0.572 -28 G 0.569 -29 Y 0.588 -30 P 0.625 -31 S 0.656 -32 T 0.662 -33 E 0.642 -34 E 0.599 -35 A 0.531 -36 R 0.438 -37 P 0.332 -38 C 0.239 -39 C 0.177 -40 G 0.141 -41 K 0.115 -42 L 0.089 -43 K 0.067 -44 V 0.056 -45 F 0.053 -46 L 0.054 -47 G 0.054 -48 A 0.053 -49 L 0.051 -50 S 0.049 -51 F 0.047 -52 V 0.044 -53 Y 0.042 -54 F 0.041 -55 A 0.040 -56 K 0.038 -57 A 0.040 -58 L 0.049 -59 A 0.061 -60 E 0.079 -61 G 0.100 -62 Y 0.119 -63 L 0.129 -64 K 0.130 -65 S 0.123 -66 T 0.108 -67 V 0.090 -68 T 0.077 -69 Q 0.072 -70 I 0.073 -71 E 0.081 -72 R 0.096 -73 R 0.117 -74 F 0.134 -75 E 0.140 -76 I 0.130 -77 P 0.108 -78 S 0.087 -79 S 0.075 -80 L 0.070 -81 V 0.066 -82 G 0.062 -83 I 0.061 -84 I 0.067 -85 D 0.076 -86 G 0.080 -87 S 0.079 -88 F 0.083 -89 E 0.095 -90 I 0.101 -91 G 0.089 -92 N 0.071 -93 L 0.057 -94 L 0.052 -95 V 0.050 -96 I 0.046 -97 T 0.039 -98 F 0.037 -99 V 0.041 -100 S 0.046 -101 Y 0.050 -102 F 0.058 -103 G 0.070 -104 A 0.077 -105 K 0.073 -106 L 0.063 -107 H 0.054 -108 R 0.047 -109 P 0.043 -110 K 0.043 -111 I 0.050 -112 I 0.059 -113 G 0.067 -114 A 0.069 -115 G 0.066 -116 C 0.057 -117 L 0.050 -118 V 0.051 -119 M 0.059 -120 G 0.069 -121 F 0.074 -122 G 0.074 -123 T 0.068 -124 M 0.064 -125 L 0.067 -126 I 0.076 -127 A 0.082 -128 V 0.083 -129 P 0.084 -130 Q 0.091 -131 F 0.104 -132 F 0.120 -133 M 0.135 -134 E 0.145 -135 K 0.151 -136 Y 0.160 -137 S 0.178 -138 Y 0.208 -139 E 0.247 -140 K 0.286 -141 Y 0.324 -142 E 0.358 -143 R 0.391 -144 Y 0.429 -145 S 0.479 -146 P 0.527 -147 S 0.555 -148 S 0.552 -149 N 0.528 -150 V 0.501 -151 T 0.475 -152 P 0.446 -153 S 0.407 -154 I 0.359 -155 S 0.318 -156 P 0.294 -157 C 0.295 -158 Y 0.326 -159 L 0.384 -160 E 0.447 -161 S 0.485 -162 S 0.494 -163 S 0.497 -164 P 0.517 -165 S 0.558 -166 P 0.608 -167 S 0.650 -168 S 0.675 -169 I 0.691 -170 L 0.703 -171 G 0.711 -172 K 0.713 -173 S 0.711 -174 Q 0.710 -175 N 0.710 -176 K 0.706 -177 I 0.695 -178 S 0.677 -179 H 0.646 -180 E 0.600 -181 C 0.557 -182 V 0.540 -183 G 0.535 -184 D 0.502 -185 S 0.433 -186 S 0.353 -187 S 0.281 -188 S 0.213 -189 M 0.144 -190 W 0.088 -191 V 0.058 -192 Y 0.051 -193 V 0.059 -194 F 0.073 -195 L 0.090 -196 G 0.101 -197 N 0.098 -198 L 0.088 -199 L 0.085 -200 R 0.096 -201 G 0.113 -202 L 0.128 -203 G 0.139 -204 E 0.147 -205 T 0.146 -206 P 0.127 -207 I 0.097 -208 Q 0.075 -209 P 0.070 -210 L 0.071 -211 G 0.068 -212 I 0.062 -213 A 0.058 -214 Y 0.059 -215 L 0.060 -216 D 0.060 -217 D 0.062 -218 F 0.067 -219 A 0.071 -220 S 0.071 -221 E 0.068 -222 D 0.064 -223 N 0.059 -224 A 0.054 -225 A 0.047 -226 F 0.042 -227 Y 0.042 -228 I 0.046 -229 G 0.053 -230 C 0.062 -231 V 0.075 -232 Q 0.084 -233 T 0.085 -234 V 0.079 -235 A 0.073 -236 I 0.069 -237 I 0.069 -238 G 0.073 -239 P 0.076 -240 I 0.078 -241 F 0.081 -242 G 0.086 -243 F 0.091 -244 L 0.100 -245 L 0.113 -246 G 0.123 -247 S 0.130 -248 L 0.142 -249 C 0.159 -250 A 0.168 -251 K 0.167 -252 L 0.165 -253 Y 0.175 -254 V 0.196 -255 D 0.222 -256 I 0.245 -257 G 0.251 -258 F 0.237 -259 V 0.210 -260 N 0.190 -261 L 0.190 -262 D 0.209 -263 H 0.232 -264 I 0.238 -265 T 0.222 -266 I 0.195 -267 T 0.168 -268 P 0.150 -269 K 0.144 -270 D 0.145 -271 P 0.144 -272 Q 0.139 -273 W 0.134 -274 V 0.130 -275 G 0.125 -276 A 0.111 -277 W 0.091 -278 W 0.078 -279 L 0.077 -280 G 0.079 -281 Y 0.076 -282 L 0.077 -283 I 0.088 -284 A 0.103 -285 G 0.109 -286 F 0.101 -287 L 0.084 -288 S 0.069 -289 L 0.062 -290 L 0.064 -291 A 0.070 -292 A 0.073 -293 V 0.069 -294 P 0.063 -295 F 0.061 -296 W 0.068 -297 C 0.080 -298 L 0.093 -299 P 0.098 -300 K 0.096 -301 T 0.101 -302 L 0.122 -303 P 0.158 -304 R 0.204 -305 S 0.259 -306 Q 0.317 -307 S 0.372 -308 R 0.416 -309 E 0.454 -310 N 0.490 -311 S 0.525 -312 G 0.549 -313 S 0.554 -314 T 0.542 -315 S 0.530 -316 E 0.523 -317 K 0.511 -318 S 0.489 -319 K 0.473 -320 F 0.464 -321 I 0.455 -322 D 0.445 -323 D 0.445 -324 P 0.453 -325 I 0.465 -326 H 0.479 -327 Y 0.491 -328 Q 0.496 -329 M 0.508 -330 A 0.539 -331 P 0.578 -332 G 0.599 -333 D 0.586 -334 D 0.536 -335 K 0.464 -336 M 0.388 -337 K 0.319 -338 I 0.263 -339 M 0.228 -340 E 0.209 -341 M 0.191 -342 A 0.170 -343 K 0.156 -344 D 0.143 -345 F 0.122 -346 L 0.097 -347 P 0.081 -348 S 0.075 -349 L 0.077 -350 K 0.081 -351 T 0.080 -352 L 0.076 -353 F 0.073 -354 R 0.072 -355 N 0.070 -356 P 0.064 -357 V 0.059 -358 Y 0.055 -359 I 0.050 -360 L 0.045 -361 Y 0.046 -362 L 0.052 -363 C 0.056 -364 A 0.054 -365 S 0.049 -366 T 0.046 -367 V 0.044 -368 Q 0.044 -369 F 0.046 -370 N 0.052 -371 S 0.057 -372 L 0.064 -373 F 0.076 -374 G 0.088 -375 M 0.090 -376 V 0.086 -377 T 0.082 -378 Y 0.080 -379 K 0.078 -380 P 0.074 -381 K 0.072 -382 Y 0.069 -383 I 0.065 -384 E 0.065 -385 Q 0.075 -386 Q 0.096 -387 Y 0.117 -388 G 0.129 -389 Q 0.123 -390 S 0.104 -391 S 0.080 -392 S 0.064 -393 K 0.059 -394 A 0.057 -395 N 0.053 -396 F 0.051 -397 V 0.055 -398 I 0.060 -399 G 0.060 -400 L 0.059 -401 I 0.063 -402 N 0.071 -403 I 0.074 -404 P 0.073 -405 A 0.072 -406 V 0.074 -407 A 0.076 -408 L 0.078 -409 G 0.082 -410 I 0.084 -411 F 0.084 -412 S 0.087 -413 G 0.089 -414 G 0.085 -415 I 0.079 -416 V 0.076 -417 M 0.074 -418 K 0.069 -419 K 0.065 -420 F 0.063 -421 R 0.063 -422 L 0.058 -423 G 0.051 -424 I 0.043 -425 C 0.036 -426 E 0.033 -427 A 0.033 -428 T 0.033 -429 K 0.032 -430 L 0.030 -431 Y 0.029 -432 L 0.032 -433 G 0.036 -434 S 0.037 -435 S 0.036 -436 V 0.037 -437 F 0.037 -438 G 0.037 -439 Y 0.036 -440 L 0.039 -441 L 0.045 -442 F 0.056 -443 L 0.071 -444 S 0.087 -445 L 0.096 -446 F 0.097 -447 A 0.098 -448 L 0.104 -449 G 0.115 -450 C 0.128 -451 E 0.140 -452 N 0.146 -453 S 0.149 -454 S 0.158 -455 V 0.177 -456 A 0.200 -457 G 0.214 -458 L 0.213 -459 T 0.205 -460 V 0.197 -461 S 0.192 -462 Y 0.199 -463 Q 0.225 -464 G 0.268 -465 T 0.315 -466 K 0.352 -467 P 0.364 -468 V 0.353 -469 S 0.332 -470 Y 0.319 -471 H 0.318 -472 E 0.316 -473 R 0.302 -474 A 0.281 -475 L 0.268 -476 F 0.271 -477 S 0.271 -478 D 0.246 -479 C 0.203 -480 N 0.167 -481 S 0.147 -482 R 0.133 -483 C 0.128 -484 K 0.135 -485 C 0.154 -486 S 0.176 -487 D 0.189 -488 S 0.185 -489 K 0.171 -490 W 0.153 -491 E 0.136 -492 P 0.119 -493 M 0.101 -494 C 0.086 -495 G 0.083 -496 D 0.096 -497 N 0.122 -498 G 0.146 -499 I 0.153 -500 T 0.143 -501 Y 0.127 -502 V 0.114 -503 S 0.110 -504 A 0.111 -505 C 0.111 -506 L 0.110 -507 A 0.110 -508 G 0.111 -509 C 0.110 -510 Q 0.109 -511 S 0.109 -512 S 0.110 -513 S 0.115 -514 R 0.122 -515 S 0.132 -516 G 0.141 -517 K 0.141 -518 N 0.131 -519 I 0.117 -520 I 0.107 -521 F 0.100 -522 S 0.092 -523 N 0.081 -524 C 0.072 -525 T 0.073 -526 C 0.090 -527 V 0.126 -528 G 0.179 -529 F 0.240 -530 A 0.297 -531 A 0.339 -532 P 0.362 -533 K 0.367 -534 S 0.355 -535 G 0.327 -536 N 0.281 -537 W 0.228 -538 S 0.184 -539 G 0.157 -540 M 0.146 -541 M 0.147 -542 G 0.154 -543 R 0.164 -544 C 0.184 -545 Q 0.218 -546 K 0.252 -547 D 0.262 -548 N 0.239 -549 G 0.194 -550 C 0.147 -551 S 0.111 -552 Q 0.089 -553 M 0.079 -554 F 0.074 -555 L 0.071 -556 Y 0.071 -557 F 0.075 -558 L 0.077 -559 V 0.076 -560 I 0.074 -561 S 0.073 -562 V 0.070 -563 I 0.067 -564 T 0.070 -565 S 0.079 -566 Y 0.088 -567 T 0.096 -568 L 0.102 -569 S 0.104 -570 L 0.103 -571 G 0.107 -572 G 0.113 -573 I 0.110 -574 P 0.096 -575 G 0.085 -576 Y 0.084 -577 I 0.092 -578 L 0.097 -579 L 0.094 -580 L 0.082 -581 R 0.072 -582 C 0.070 -583 I 0.076 -584 Q 0.084 -585 P 0.089 -586 Q 0.090 -587 L 0.085 -588 K 0.075 -589 S 0.066 -590 F 0.065 -591 A 0.069 -592 L 0.072 -593 G 0.076 -594 I 0.084 -595 Y 0.090 -596 T 0.087 -597 L 0.080 -598 A 0.078 -599 V 0.076 -600 R 0.071 -601 V 0.069 -602 L 0.077 -603 A 0.089 -604 G 0.096 -605 I 0.095 -606 P 0.096 -607 A 0.100 -608 P 0.101 -609 V 0.102 -610 Y 0.114 -611 F 0.132 -612 G 0.146 -613 V 0.156 -614 L 0.173 -615 I 0.191 -616 D 0.196 -617 T 0.187 -618 S 0.177 -619 C 0.180 -620 L 0.204 -621 K 0.240 -622 W 0.272 -623 G 0.283 -624 F 0.273 -625 K 0.256 -626 K 0.243 -627 C 0.241 -628 G 0.253 -629 S 0.271 -630 R 0.276 -631 G 0.261 -632 S 0.237 -633 C 0.219 -634 R 0.216 -635 L 0.222 -636 Y 0.217 -637 D 0.190 -638 S 0.157 -639 H 0.136 -640 A 0.121 -641 F 0.101 -642 R 0.082 -643 H 0.076 -644 I 0.082 -645 Y 0.090 -646 L 0.094 -647 G 0.093 -648 L 0.091 -649 T 0.086 -650 T 0.078 -651 L 0.069 -652 L 0.065 -653 G 0.065 -654 T 0.064 -655 V 0.061 -656 S 0.062 -657 V 0.066 -658 F 0.067 -659 L 0.059 -660 S 0.049 -661 M 0.044 -662 A 0.045 -663 V 0.046 -664 L 0.047 -665 F 0.050 -666 V 0.059 -667 L 0.073 -668 K 0.091 -669 K 0.115 -670 K 0.152 -671 Y 0.205 -672 V 0.268 -673 S 0.327 -674 K 0.369 -675 H 0.393 -676 S 0.408 -677 S 0.422 -678 L 0.433 -679 I 0.435 -680 T 0.436 -681 T 0.446 -682 R 0.459 -683 E 0.466 -684 K 0.471 -685 I 0.475 -686 G 0.469 -687 M 0.453 -688 S 0.439 -689 S 0.432 -690 S 0.428 -691 I 0.422 -692 K 0.415 -693 K 0.408 -694 E 0.402 -695 T 0.387 -696 C 0.366 -697 A 0.353 -698 A 0.354 -699 R 0.357 -700 D 0.354 -701 R 0.351 -702 G 0.347 -703 L 0.329 -704 Q 0.298 -705 P 0.259 -706 K 0.225 -707 Y 0.203 -708 W 0.198 -709 P 0.205 -710 G 0.211 -711 K 0.209 -712 E 0.194 -713 T 0.175 -714 R 0.164 -715 L 0.162 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030235.18_ENSMUST00000032362.12_GN:Slco1c1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030235.18_ENSMUST00000032362.12_GN:Slco1c1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid deleted file mode 100644 index e822b6bc8504ced293eeff6f0e90a0619fe96ce9..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030235.18_ENSMUST00000032362.12_GN:Slco1c1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid +++ /dev/null @@ -1,717 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030235.18|ENSMUST00000032362.12|GN:Slco1c1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:1 -1 M 0.314 -2 M 0.332 -3 D 0.357 -4 T 0.374 -5 S 0.371 -6 S 0.350 -7 K 0.336 -8 E 0.344 -9 N 0.349 -10 A 0.330 -11 H 0.312 -12 L 0.319 -13 F 0.339 -14 H 0.360 -15 K 0.398 -16 N 0.454 -17 S 0.500 -18 A 0.522 -19 Q 0.542 -20 P 0.572 -21 A 0.599 -22 G 0.613 -23 G 0.619 -24 P 0.618 -25 S 0.608 -26 F 0.593 -27 T 0.580 -28 V 0.570 -29 G 0.568 -30 Y 0.587 -31 P 0.625 -32 S 0.657 -33 T 0.663 -34 E 0.642 -35 E 0.599 -36 A 0.531 -37 R 0.436 -38 P 0.330 -39 C 0.237 -40 C 0.176 -41 G 0.141 -42 K 0.115 -43 L 0.089 -44 K 0.067 -45 V 0.056 -46 F 0.053 -47 L 0.054 -48 G 0.055 -49 A 0.053 -50 L 0.051 -51 S 0.049 -52 F 0.047 -53 V 0.044 -54 Y 0.042 -55 F 0.041 -56 A 0.040 -57 K 0.038 -58 A 0.040 -59 L 0.049 -60 A 0.061 -61 E 0.078 -62 G 0.100 -63 Y 0.119 -64 L 0.128 -65 K 0.129 -66 S 0.122 -67 T 0.107 -68 V 0.090 -69 T 0.077 -70 Q 0.072 -71 I 0.073 -72 E 0.080 -73 R 0.096 -74 R 0.116 -75 F 0.134 -76 E 0.140 -77 I 0.129 -78 P 0.108 -79 S 0.087 -80 S 0.075 -81 L 0.069 -82 V 0.066 -83 G 0.062 -84 I 0.061 -85 I 0.067 -86 D 0.076 -87 G 0.080 -88 S 0.079 -89 F 0.083 -90 E 0.095 -91 I 0.101 -92 G 0.090 -93 N 0.070 -94 L 0.057 -95 L 0.052 -96 V 0.050 -97 I 0.046 -98 T 0.039 -99 F 0.037 -100 V 0.041 -101 S 0.046 -102 Y 0.050 -103 F 0.057 -104 G 0.070 -105 A 0.077 -106 K 0.073 -107 L 0.063 -108 H 0.054 -109 R 0.047 -110 P 0.043 -111 K 0.043 -112 I 0.050 -113 I 0.059 -114 G 0.067 -115 A 0.069 -116 G 0.066 -117 C 0.057 -118 L 0.050 -119 V 0.050 -120 M 0.059 -121 G 0.069 -122 F 0.074 -123 G 0.074 -124 T 0.068 -125 M 0.064 -126 L 0.067 -127 I 0.076 -128 A 0.082 -129 V 0.083 -130 P 0.084 -131 Q 0.091 -132 F 0.105 -133 F 0.121 -134 M 0.136 -135 E 0.145 -136 K 0.151 -137 Y 0.160 -138 S 0.178 -139 Y 0.208 -140 E 0.247 -141 K 0.287 -142 Y 0.324 -143 E 0.359 -144 R 0.391 -145 Y 0.430 -146 S 0.479 -147 P 0.528 -148 S 0.556 -149 S 0.553 -150 N 0.530 -151 V 0.502 -152 T 0.476 -153 P 0.447 -154 S 0.408 -155 I 0.360 -156 S 0.318 -157 P 0.294 -158 C 0.295 -159 Y 0.326 -160 L 0.384 -161 E 0.447 -162 S 0.486 -163 S 0.495 -164 S 0.498 -165 P 0.518 -166 S 0.559 -167 P 0.608 -168 S 0.650 -169 S 0.675 -170 I 0.691 -171 L 0.703 -172 G 0.711 -173 K 0.713 -174 S 0.711 -175 Q 0.710 -176 N 0.710 -177 K 0.706 -178 I 0.695 -179 S 0.676 -180 H 0.646 -181 E 0.600 -182 C 0.557 -183 V 0.540 -184 G 0.535 -185 D 0.502 -186 S 0.433 -187 S 0.353 -188 S 0.281 -189 S 0.213 -190 M 0.144 -191 W 0.088 -192 V 0.058 -193 Y 0.051 -194 V 0.059 -195 F 0.073 -196 L 0.090 -197 G 0.101 -198 N 0.098 -199 L 0.088 -200 L 0.085 -201 R 0.096 -202 G 0.113 -203 L 0.128 -204 G 0.138 -205 E 0.146 -206 T 0.146 -207 P 0.127 -208 I 0.097 -209 Q 0.075 -210 P 0.070 -211 L 0.071 -212 G 0.068 -213 I 0.062 -214 A 0.058 -215 Y 0.058 -216 L 0.059 -217 D 0.059 -218 D 0.062 -219 F 0.066 -220 A 0.071 -221 S 0.071 -222 E 0.068 -223 D 0.064 -224 N 0.059 -225 A 0.054 -226 A 0.047 -227 F 0.042 -228 Y 0.042 -229 I 0.046 -230 G 0.053 -231 C 0.062 -232 V 0.075 -233 Q 0.084 -234 T 0.084 -235 V 0.079 -236 A 0.073 -237 I 0.069 -238 I 0.069 -239 G 0.073 -240 P 0.076 -241 I 0.077 -242 F 0.081 -243 G 0.086 -244 F 0.091 -245 L 0.100 -246 L 0.113 -247 G 0.123 -248 S 0.130 -249 L 0.141 -250 C 0.159 -251 A 0.168 -252 K 0.167 -253 L 0.165 -254 Y 0.175 -255 V 0.195 -256 D 0.222 -257 I 0.245 -258 G 0.251 -259 F 0.237 -260 V 0.210 -261 N 0.190 -262 L 0.189 -263 D 0.209 -264 H 0.232 -265 I 0.238 -266 T 0.222 -267 I 0.195 -268 T 0.168 -269 P 0.150 -270 K 0.144 -271 D 0.145 -272 P 0.144 -273 Q 0.139 -274 W 0.134 -275 V 0.129 -276 G 0.124 -277 A 0.110 -278 W 0.091 -279 W 0.078 -280 L 0.077 -281 G 0.078 -282 Y 0.076 -283 L 0.077 -284 I 0.088 -285 A 0.103 -286 G 0.109 -287 F 0.101 -288 L 0.085 -289 S 0.069 -290 L 0.062 -291 L 0.064 -292 A 0.070 -293 A 0.074 -294 V 0.069 -295 P 0.063 -296 F 0.062 -297 W 0.068 -298 C 0.080 -299 L 0.093 -300 P 0.098 -301 K 0.096 -302 T 0.101 -303 L 0.121 -304 P 0.157 -305 R 0.203 -306 S 0.257 -307 Q 0.316 -308 S 0.371 -309 R 0.415 -310 E 0.453 -311 N 0.489 -312 S 0.524 -313 G 0.549 -314 S 0.553 -315 T 0.542 -316 S 0.530 -317 E 0.523 -318 K 0.510 -319 S 0.489 -320 K 0.473 -321 F 0.464 -322 I 0.455 -323 D 0.445 -324 D 0.445 -325 P 0.453 -326 I 0.465 -327 H 0.479 -328 Y 0.490 -329 Q 0.496 -330 M 0.508 -331 A 0.539 -332 P 0.578 -333 G 0.599 -334 D 0.586 -335 D 0.536 -336 K 0.463 -337 M 0.388 -338 K 0.319 -339 I 0.263 -340 M 0.228 -341 E 0.209 -342 M 0.191 -343 A 0.170 -344 K 0.156 -345 D 0.143 -346 F 0.122 -347 L 0.098 -348 P 0.081 -349 S 0.076 -350 L 0.080 -351 K 0.084 -352 T 0.082 -353 L 0.077 -354 F 0.073 -355 R 0.072 -356 N 0.070 -357 P 0.065 -358 V 0.059 -359 Y 0.055 -360 I 0.050 -361 L 0.045 -362 Y 0.046 -363 L 0.052 -364 C 0.056 -365 A 0.054 -366 S 0.049 -367 T 0.046 -368 V 0.044 -369 Q 0.044 -370 F 0.046 -371 N 0.052 -372 S 0.057 -373 L 0.064 -374 F 0.076 -375 G 0.088 -376 M 0.090 -377 V 0.086 -378 T 0.082 -379 Y 0.080 -380 K 0.078 -381 P 0.074 -382 K 0.072 -383 Y 0.069 -384 I 0.064 -385 E 0.065 -386 Q 0.075 -387 Q 0.096 -388 Y 0.117 -389 G 0.128 -390 Q 0.123 -391 S 0.104 -392 S 0.080 -393 S 0.064 -394 K 0.059 -395 A 0.057 -396 N 0.053 -397 F 0.051 -398 V 0.055 -399 I 0.060 -400 G 0.060 -401 L 0.059 -402 I 0.063 -403 N 0.071 -404 I 0.074 -405 P 0.073 -406 A 0.072 -407 V 0.074 -408 A 0.076 -409 L 0.078 -410 G 0.082 -411 I 0.083 -412 F 0.084 -413 S 0.087 -414 G 0.089 -415 G 0.084 -416 I 0.079 -417 V 0.076 -418 M 0.074 -419 K 0.069 -420 K 0.065 -421 F 0.063 -422 R 0.063 -423 L 0.058 -424 G 0.051 -425 I 0.043 -426 C 0.036 -427 E 0.033 -428 A 0.033 -429 T 0.033 -430 K 0.032 -431 L 0.030 -432 Y 0.029 -433 L 0.032 -434 G 0.036 -435 S 0.037 -436 S 0.037 -437 V 0.037 -438 F 0.037 -439 G 0.037 -440 Y 0.037 -441 L 0.039 -442 L 0.045 -443 F 0.056 -444 L 0.071 -445 S 0.087 -446 L 0.096 -447 F 0.097 -448 A 0.098 -449 L 0.104 -450 G 0.115 -451 C 0.128 -452 E 0.140 -453 N 0.146 -454 S 0.149 -455 S 0.157 -456 V 0.177 -457 A 0.200 -458 G 0.214 -459 L 0.213 -460 T 0.205 -461 V 0.197 -462 S 0.192 -463 Y 0.199 -464 Q 0.225 -465 G 0.267 -466 T 0.315 -467 K 0.351 -468 P 0.364 -469 V 0.353 -470 S 0.332 -471 Y 0.319 -472 H 0.318 -473 E 0.316 -474 R 0.302 -475 A 0.280 -476 L 0.268 -477 F 0.270 -478 S 0.271 -479 D 0.246 -480 C 0.203 -481 N 0.167 -482 S 0.146 -483 R 0.133 -484 C 0.127 -485 K 0.135 -486 C 0.154 -487 S 0.176 -488 D 0.188 -489 S 0.185 -490 K 0.171 -491 W 0.153 -492 E 0.136 -493 P 0.118 -494 M 0.100 -495 C 0.086 -496 G 0.082 -497 D 0.095 -498 N 0.121 -499 G 0.146 -500 I 0.153 -501 T 0.143 -502 Y 0.127 -503 V 0.114 -504 S 0.109 -505 A 0.111 -506 C 0.111 -507 L 0.110 -508 A 0.110 -509 G 0.111 -510 C 0.110 -511 Q 0.109 -512 S 0.109 -513 S 0.110 -514 S 0.115 -515 R 0.122 -516 S 0.132 -517 G 0.141 -518 K 0.141 -519 N 0.131 -520 I 0.117 -521 I 0.107 -522 F 0.100 -523 S 0.092 -524 N 0.080 -525 C 0.072 -526 T 0.073 -527 C 0.089 -528 V 0.126 -529 G 0.179 -530 F 0.240 -531 A 0.297 -532 A 0.339 -533 P 0.362 -534 K 0.367 -535 S 0.355 -536 G 0.327 -537 N 0.281 -538 W 0.228 -539 S 0.184 -540 G 0.157 -541 M 0.146 -542 M 0.147 -543 G 0.154 -544 R 0.164 -545 C 0.184 -546 Q 0.218 -547 K 0.252 -548 D 0.262 -549 N 0.239 -550 G 0.194 -551 C 0.147 -552 S 0.111 -553 Q 0.089 -554 M 0.079 -555 F 0.074 -556 L 0.071 -557 Y 0.073 -558 F 0.081 -559 L 0.090 -560 V 0.093 -561 I 0.087 -562 S 0.080 -563 V 0.072 -564 I 0.067 -565 T 0.070 -566 S 0.079 -567 Y 0.088 -568 T 0.095 -569 L 0.102 -570 S 0.103 -571 L 0.103 -572 G 0.107 -573 G 0.112 -574 I 0.109 -575 P 0.096 -576 G 0.085 -577 Y 0.084 -578 I 0.092 -579 L 0.097 -580 L 0.094 -581 L 0.082 -582 R 0.072 -583 C 0.070 -584 I 0.076 -585 Q 0.084 -586 P 0.089 -587 Q 0.090 -588 L 0.085 -589 K 0.075 -590 S 0.066 -591 F 0.065 -592 A 0.069 -593 L 0.072 -594 G 0.076 -595 I 0.084 -596 Y 0.090 -597 T 0.087 -598 L 0.080 -599 A 0.078 -600 V 0.076 -601 R 0.071 -602 V 0.069 -603 L 0.077 -604 A 0.089 -605 G 0.096 -606 I 0.095 -607 P 0.096 -608 A 0.100 -609 P 0.101 -610 V 0.102 -611 Y 0.114 -612 F 0.132 -613 G 0.146 -614 V 0.156 -615 L 0.173 -616 I 0.191 -617 D 0.196 -618 T 0.187 -619 S 0.177 -620 C 0.180 -621 L 0.203 -622 K 0.240 -623 W 0.271 -624 G 0.282 -625 F 0.272 -626 K 0.255 -627 K 0.243 -628 C 0.241 -629 G 0.253 -630 S 0.271 -631 R 0.276 -632 G 0.262 -633 S 0.237 -634 C 0.219 -635 R 0.216 -636 L 0.222 -637 Y 0.217 -638 D 0.190 -639 S 0.157 -640 H 0.136 -641 A 0.121 -642 F 0.101 -643 R 0.082 -644 H 0.076 -645 I 0.082 -646 Y 0.090 -647 L 0.094 -648 G 0.093 -649 L 0.091 -650 T 0.087 -651 T 0.078 -652 L 0.070 -653 L 0.066 -654 G 0.065 -655 T 0.063 -656 V 0.061 -657 S 0.062 -658 V 0.066 -659 F 0.067 -660 L 0.059 -661 S 0.049 -662 M 0.044 -663 A 0.045 -664 V 0.047 -665 L 0.047 -666 F 0.050 -667 V 0.059 -668 L 0.073 -669 K 0.091 -670 K 0.115 -671 K 0.152 -672 Y 0.205 -673 V 0.268 -674 S 0.327 -675 K 0.369 -676 H 0.393 -677 S 0.409 -678 S 0.423 -679 L 0.433 -680 I 0.435 -681 T 0.436 -682 T 0.446 -683 R 0.459 -684 E 0.466 -685 K 0.471 -686 I 0.475 -687 G 0.469 -688 M 0.453 -689 S 0.439 -690 S 0.432 -691 S 0.428 -692 I 0.422 -693 K 0.415 -694 K 0.408 -695 E 0.402 -696 T 0.388 -697 C 0.367 -698 A 0.353 -699 A 0.354 -700 R 0.358 -701 D 0.355 -702 R 0.352 -703 G 0.348 -704 L 0.330 -705 Q 0.299 -706 P 0.260 -707 K 0.226 -708 Y 0.204 -709 W 0.199 -710 P 0.206 -711 G 0.212 -712 K 0.210 -713 E 0.195 -714 T 0.176 -715 R 0.165 -716 L 0.163 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030292.11_ENSMUST00000032433.9_GN:Smco2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030292.11_ENSMUST00000032433.9_GN:Smco2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index bc74c212c89ea1ca85ee890fbd66c92deb1964c1..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030292.11_ENSMUST00000032433.9_GN:Smco2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,348 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030292.11|ENSMUST00000032433.9|GN:Smco2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.522 -2 M 0.563 -3 S 0.618 -4 L 0.663 -5 Q 0.690 -6 L 0.705 -7 G 0.712 -8 T 0.715 -9 A 0.706 -10 G 0.678 -11 K 0.622 -12 E 0.551 -13 R 0.502 -14 Q 0.495 -15 L 0.500 -16 A 0.487 -17 E 0.484 -18 K 0.521 -19 S 0.578 -20 R 0.627 -21 D 0.666 -22 L 0.702 -23 Q 0.738 -24 N 0.769 -25 V 0.787 -26 S 0.793 -27 M 0.793 -28 T 0.794 -29 E 0.799 -30 G 0.804 -31 S 0.806 -32 E 0.807 -33 E 0.810 -34 V 0.812 -35 S 0.810 -36 E 0.791 -37 M 0.746 -38 D 0.683 -39 H 0.652 -40 I 0.683 -41 S 0.741 -42 D 0.777 -43 R 0.790 -44 P 0.798 -45 D 0.807 -46 E 0.812 -47 K 0.808 -48 D 0.800 -49 K 0.797 -50 P 0.807 -51 S 0.823 -52 E 0.835 -53 N 0.839 -54 L 0.837 -55 Q 0.832 -56 T 0.823 -57 D 0.810 -58 S 0.796 -59 L 0.787 -60 Y 0.788 -61 K 0.793 -62 M 0.797 -63 D 0.795 -64 T 0.788 -65 E 0.782 -66 K 0.780 -67 W 0.789 -68 D 0.805 -69 G 0.808 -70 L 0.774 -71 E 0.711 -72 Q 0.678 -73 E 0.714 -74 S 0.780 -75 E 0.824 -76 H 0.834 -77 S 0.822 -78 Q 0.803 -79 D 0.789 -80 P 0.789 -81 P 0.799 -82 S 0.812 -83 K 0.823 -84 P 0.831 -85 D 0.835 -86 E 0.839 -87 Q 0.841 -88 E 0.844 -89 V 0.845 -90 T 0.846 -91 L 0.841 -92 V 0.829 -93 C 0.814 -94 E 0.803 -95 G 0.803 -96 P 0.814 -97 Q 0.828 -98 V 0.836 -99 S 0.834 -100 Q 0.824 -101 L 0.815 -102 S 0.814 -103 P 0.821 -104 S 0.827 -105 T 0.823 -106 D 0.805 -107 E 0.773 -108 S 0.732 -109 T 0.696 -110 P 0.669 -111 I 0.635 -112 P 0.581 -113 E 0.508 -114 S 0.428 -115 L 0.346 -116 T 0.278 -117 H 0.241 -118 K 0.230 -119 L 0.222 -120 N 0.203 -121 Y 0.178 -122 W 0.159 -123 H 0.155 -124 A 0.166 -125 K 0.191 -126 M 0.226 -127 G 0.260 -128 L 0.281 -129 Q 0.292 -130 M 0.306 -131 K 0.327 -132 E 0.362 -133 L 0.402 -134 G 0.422 -135 A 0.416 -136 D 0.401 -137 H 0.378 -138 G 0.333 -139 D 0.264 -140 W 0.192 -141 L 0.139 -142 E 0.113 -143 R 0.101 -144 I 0.092 -145 N 0.082 -146 N 0.074 -147 I 0.068 -148 I 0.063 -149 Q 0.059 -150 N 0.055 -151 I 0.053 -152 N 0.053 -153 N 0.053 -154 T 0.053 -155 E 0.055 -156 S 0.056 -157 T 0.055 -158 V 0.055 -159 K 0.057 -160 S 0.061 -161 L 0.063 -162 L 0.066 -163 T 0.069 -164 E 0.067 -165 V 0.063 -166 I 0.064 -167 S 0.073 -168 L 0.087 -169 E 0.102 -170 N 0.117 -171 Q 0.131 -172 S 0.148 -173 K 0.177 -174 N 0.212 -175 L 0.249 -176 E 0.289 -177 D 0.319 -178 S 0.315 -179 D 0.276 -180 Q 0.228 -181 E 0.194 -182 A 0.170 -183 D 0.148 -184 I 0.127 -185 E 0.106 -186 E 0.087 -187 K 0.073 -188 I 0.065 -189 T 0.065 -190 E 0.070 -191 I 0.078 -192 R 0.083 -193 R 0.082 -194 Q 0.071 -195 L 0.057 -196 K 0.049 -197 E 0.049 -198 V 0.052 -199 N 0.057 -200 I 0.061 -201 K 0.064 -202 L 0.069 -203 T 0.079 -204 Q 0.093 -205 V 0.107 -206 D 0.116 -207 A 0.118 -208 C 0.112 -209 E 0.103 -210 E 0.095 -211 A 0.086 -212 R 0.077 -213 E 0.071 -214 L 0.068 -215 K 0.067 -216 E 0.065 -217 K 0.066 -218 L 0.072 -219 V 0.081 -220 E 0.084 -221 Q 0.075 -222 I 0.061 -223 E 0.053 -224 S 0.053 -225 F 0.063 -226 H 0.080 -227 K 0.094 -228 E 0.097 -229 M 0.093 -230 N 0.086 -231 V 0.079 -232 L 0.081 -233 N 0.090 -234 S 0.098 -235 K 0.101 -236 L 0.108 -237 E 0.126 -238 M 0.145 -239 Y 0.166 -240 Y 0.201 -241 T 0.262 -242 Q 0.356 -243 G 0.473 -244 S 0.582 -245 D 0.656 -246 A 0.693 -247 D 0.708 -248 S 0.716 -249 H 0.725 -250 N 0.733 -251 S 0.739 -252 E 0.739 -253 D 0.739 -254 V 0.738 -255 D 0.735 -256 T 0.725 -257 E 0.711 -258 Q 0.699 -259 E 0.693 -260 E 0.698 -261 P 0.710 -262 L 0.720 -263 V 0.729 -264 P 0.739 -265 E 0.748 -266 A 0.752 -267 S 0.757 -268 P 0.767 -269 S 0.781 -270 L 0.790 -271 S 0.783 -272 A 0.758 -273 S 0.724 -274 P 0.690 -275 T 0.662 -276 P 0.638 -277 P 0.609 -278 C 0.564 -279 S 0.499 -280 A 0.424 -281 V 0.353 -282 W 0.295 -283 K 0.257 -284 N 0.236 -285 A 0.221 -286 L 0.204 -287 K 0.187 -288 L 0.179 -289 F 0.176 -290 V 0.172 -291 I 0.172 -292 V 0.174 -293 Y 0.172 -294 V 0.161 -295 V 0.150 -296 T 0.149 -297 I 0.153 -298 T 0.154 -299 G 0.150 -300 L 0.147 -301 S 0.144 -302 C 0.137 -303 Y 0.126 -304 I 0.117 -305 L 0.120 -306 F 0.139 -307 V 0.167 -308 D 0.186 -309 A 0.186 -310 T 0.174 -311 F 0.164 -312 L 0.168 -313 F 0.190 -314 E 0.227 -315 R 0.262 -316 V 0.286 -317 L 0.301 -318 P 0.319 -319 S 0.339 -320 V 0.360 -321 L 0.388 -322 G 0.423 -323 H 0.440 -324 R 0.416 -325 T 0.364 -326 M 0.323 -327 W 0.316 -328 D 0.321 -329 L 0.312 -330 R 0.294 -331 E 0.290 -332 M 0.307 -333 M 0.337 -334 A 0.369 -335 P 0.404 -336 F 0.455 -337 L 0.517 -338 N 0.572 -339 L 0.614 -340 E 0.643 -341 A 0.657 -342 E 0.658 -343 D 0.648 -344 L 0.622 -345 L 0.578 -346 P 0.524 -347 S 0.484 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030292.11_ENSMUST00000032433.9_GN:Smco2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:56.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030292.11_ENSMUST00000032433.9_GN:Smco2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:56.caid deleted file mode 100644 index 7ddfed803debc4140dc8afbec434352e8581fd0e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030292.11_ENSMUST00000032433.9_GN:Smco2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:56.caid +++ /dev/null @@ -1,404 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030292.11|ENSMUST00000032433.9|GN:Smco2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:56 -1 M 0.528 -2 S 0.576 -3 E 0.639 -4 R 0.689 -5 A 0.720 -6 G 0.742 -7 P 0.760 -8 T 0.769 -9 A 0.763 -10 S 0.740 -11 F 0.714 -12 P 0.699 -13 P 0.696 -14 Q 0.691 -15 V 0.678 -16 W 0.674 -17 N 0.692 -18 N 0.722 -19 L 0.750 -20 Q 0.773 -21 G 0.790 -22 L 0.796 -23 S 0.795 -24 S 0.797 -25 P 0.810 -26 G 0.828 -27 A 0.844 -28 R 0.852 -29 T 0.855 -30 G 0.855 -31 S 0.855 -32 A 0.854 -33 T 0.852 -34 S 0.848 -35 Q 0.847 -36 K 0.852 -37 S 0.859 -38 Q 0.866 -39 G 0.870 -40 T 0.873 -41 L 0.874 -42 S 0.873 -43 T 0.872 -44 E 0.871 -45 V 0.868 -46 A 0.855 -47 A 0.831 -48 L 0.804 -49 T 0.788 -50 P 0.790 -51 A 0.796 -52 A 0.786 -53 L 0.742 -54 S 0.678 -55 K 0.646 -56 D 0.681 -57 M 0.749 -58 M 0.800 -59 S 0.824 -60 L 0.833 -61 Q 0.835 -62 L 0.836 -63 G 0.836 -64 T 0.837 -65 A 0.834 -66 G 0.828 -67 K 0.822 -68 E 0.819 -69 R 0.817 -70 Q 0.814 -71 L 0.808 -72 A 0.803 -73 E 0.799 -74 K 0.798 -75 S 0.798 -76 R 0.798 -77 D 0.800 -78 L 0.805 -79 Q 0.816 -80 N 0.828 -81 V 0.835 -82 S 0.835 -83 M 0.830 -84 T 0.826 -85 E 0.826 -86 G 0.828 -87 S 0.828 -88 E 0.826 -89 E 0.823 -90 V 0.821 -91 S 0.814 -92 E 0.794 -93 M 0.747 -94 D 0.684 -95 H 0.652 -96 I 0.685 -97 S 0.744 -98 D 0.782 -99 R 0.795 -100 P 0.803 -101 D 0.811 -102 E 0.815 -103 K 0.813 -104 D 0.808 -105 K 0.806 -106 P 0.814 -107 S 0.826 -108 E 0.836 -109 N 0.839 -110 L 0.836 -111 Q 0.830 -112 T 0.820 -113 D 0.803 -114 S 0.773 -115 L 0.721 -116 Y 0.660 -117 K 0.632 -118 M 0.662 -119 D 0.713 -120 T 0.743 -121 E 0.748 -122 K 0.747 -123 W 0.756 -124 D 0.774 -125 G 0.780 -126 L 0.747 -127 E 0.685 -128 Q 0.652 -129 E 0.686 -130 S 0.752 -131 E 0.796 -132 H 0.806 -133 S 0.795 -134 Q 0.776 -135 D 0.761 -136 P 0.760 -137 P 0.770 -138 S 0.785 -139 K 0.797 -140 P 0.807 -141 D 0.814 -142 E 0.821 -143 Q 0.827 -144 E 0.832 -145 V 0.835 -146 T 0.836 -147 L 0.831 -148 V 0.819 -149 C 0.803 -150 E 0.792 -151 G 0.793 -152 P 0.805 -153 Q 0.820 -154 V 0.831 -155 S 0.831 -156 Q 0.822 -157 L 0.814 -158 S 0.814 -159 P 0.823 -160 S 0.830 -161 T 0.829 -162 D 0.813 -163 E 0.785 -164 S 0.749 -165 T 0.718 -166 P 0.693 -167 I 0.663 -168 P 0.612 -169 E 0.542 -170 S 0.460 -171 L 0.372 -172 T 0.291 -173 H 0.243 -174 K 0.228 -175 L 0.222 -176 N 0.207 -177 Y 0.185 -178 W 0.169 -179 H 0.166 -180 A 0.177 -181 K 0.200 -182 M 0.234 -183 G 0.268 -184 L 0.290 -185 Q 0.303 -186 M 0.317 -187 K 0.338 -188 E 0.371 -189 L 0.409 -190 G 0.430 -191 A 0.429 -192 D 0.418 -193 H 0.398 -194 G 0.353 -195 D 0.283 -196 W 0.206 -197 L 0.150 -198 E 0.121 -199 R 0.108 -200 I 0.099 -201 N 0.090 -202 N 0.082 -203 I 0.077 -204 I 0.072 -205 Q 0.066 -206 N 0.062 -207 I 0.059 -208 N 0.057 -209 N 0.054 -210 T 0.053 -211 E 0.053 -212 S 0.054 -213 T 0.053 -214 V 0.053 -215 K 0.055 -216 S 0.059 -217 L 0.062 -218 L 0.065 -219 T 0.067 -220 E 0.066 -221 V 0.062 -222 I 0.064 -223 S 0.075 -224 L 0.089 -225 E 0.104 -226 N 0.115 -227 Q 0.123 -228 S 0.136 -229 K 0.159 -230 N 0.186 -231 L 0.215 -232 E 0.249 -233 D 0.277 -234 S 0.277 -235 D 0.246 -236 Q 0.205 -237 E 0.176 -238 A 0.157 -239 D 0.139 -240 I 0.122 -241 E 0.104 -242 E 0.089 -243 K 0.078 -244 I 0.071 -245 T 0.069 -246 E 0.073 -247 I 0.080 -248 R 0.087 -249 R 0.086 -250 Q 0.076 -251 L 0.062 -252 K 0.053 -253 E 0.052 -254 V 0.056 -255 N 0.062 -256 I 0.066 -257 K 0.070 -258 L 0.075 -259 T 0.083 -260 Q 0.094 -261 V 0.108 -262 D 0.119 -263 A 0.124 -264 C 0.119 -265 E 0.110 -266 E 0.101 -267 A 0.092 -268 R 0.082 -269 E 0.076 -270 L 0.073 -271 K 0.072 -272 E 0.071 -273 K 0.072 -274 L 0.077 -275 V 0.086 -276 E 0.089 -277 Q 0.080 -278 I 0.067 -279 E 0.059 -280 S 0.059 -281 F 0.069 -282 H 0.084 -283 K 0.096 -284 E 0.099 -285 M 0.097 -286 N 0.092 -287 V 0.086 -288 L 0.087 -289 N 0.096 -290 S 0.103 -291 K 0.107 -292 L 0.120 -293 E 0.143 -294 M 0.168 -295 Y 0.194 -296 Y 0.234 -297 T 0.300 -298 Q 0.395 -299 G 0.509 -300 S 0.612 -301 D 0.681 -302 A 0.714 -303 D 0.727 -304 S 0.734 -305 H 0.742 -306 N 0.750 -307 S 0.755 -308 E 0.755 -309 D 0.755 -310 V 0.755 -311 D 0.753 -312 T 0.745 -313 E 0.731 -314 Q 0.717 -315 E 0.709 -316 E 0.713 -317 P 0.724 -318 L 0.737 -319 V 0.748 -320 P 0.758 -321 E 0.767 -322 A 0.772 -323 S 0.777 -324 P 0.786 -325 S 0.800 -326 L 0.809 -327 S 0.802 -328 A 0.778 -329 S 0.744 -330 P 0.711 -331 T 0.684 -332 P 0.662 -333 P 0.635 -334 C 0.592 -335 S 0.530 -336 A 0.456 -337 V 0.385 -338 W 0.327 -339 K 0.288 -340 N 0.270 -341 A 0.257 -342 L 0.239 -343 K 0.221 -344 L 0.211 -345 F 0.206 -346 V 0.199 -347 I 0.195 -348 V 0.197 -349 Y 0.195 -350 V 0.183 -351 V 0.170 -352 T 0.165 -353 I 0.168 -354 T 0.168 -355 G 0.163 -356 L 0.159 -357 S 0.156 -358 C 0.146 -359 Y 0.132 -360 I 0.121 -361 L 0.122 -362 F 0.140 -363 V 0.166 -364 D 0.182 -365 A 0.180 -366 T 0.166 -367 F 0.155 -368 L 0.158 -369 F 0.181 -370 E 0.218 -371 R 0.255 -372 V 0.281 -373 L 0.298 -374 P 0.315 -375 S 0.332 -376 V 0.351 -377 L 0.376 -378 G 0.408 -379 H 0.426 -380 R 0.406 -381 T 0.358 -382 M 0.320 -383 W 0.314 -384 D 0.320 -385 L 0.313 -386 R 0.298 -387 E 0.295 -388 M 0.312 -389 M 0.339 -390 A 0.369 -391 P 0.406 -392 F 0.461 -393 L 0.527 -394 N 0.582 -395 L 0.621 -396 E 0.645 -397 A 0.658 -398 E 0.661 -399 D 0.652 -400 L 0.627 -401 L 0.584 -402 P 0.530 -403 S 0.491 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030325.17_ENSMUST00000174404.8_GN:Klrb1c_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030325.17_ENSMUST00000174404.8_GN:Klrb1c_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index f751c078242c55b8e820a4675476a13e07c20c4b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030325.17_ENSMUST00000174404.8_GN:Klrb1c_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,224 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030325.17|ENSMUST00000174404.8|GN:Klrb1c|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.467 -2 D 0.499 -3 T 0.548 -4 A 0.589 -5 S 0.606 -6 I 0.600 -7 Y 0.586 -8 L 0.578 -9 G 0.572 -10 L 0.568 -11 K 0.573 -12 P 0.591 -13 P 0.615 -14 R 0.643 -15 T 0.678 -16 L 0.707 -17 G 0.714 -18 A 0.696 -19 W 0.664 -20 H 0.633 -21 E 0.622 -22 S 0.640 -23 P 0.674 -24 P 0.704 -25 S 0.719 -26 L 0.725 -27 P 0.734 -28 P 0.752 -29 D 0.766 -30 A 0.761 -31 C 0.731 -32 R 0.687 -33 C 0.645 -34 P 0.615 -35 R 0.601 -36 S 0.592 -37 H 0.575 -38 R 0.559 -39 L 0.568 -40 A 0.598 -41 L 0.614 -42 K 0.604 -43 L 0.578 -44 S 0.533 -45 C 0.467 -46 A 0.408 -47 G 0.374 -48 L 0.351 -49 I 0.329 -50 L 0.315 -51 L 0.303 -52 V 0.282 -53 L 0.266 -54 T 0.269 -55 L 0.292 -56 I 0.323 -57 G 0.343 -58 M 0.333 -59 S 0.295 -60 V 0.256 -61 L 0.234 -62 V 0.232 -63 R 0.242 -64 V 0.261 -65 L 0.287 -66 V 0.320 -67 Q 0.358 -68 K 0.404 -69 P 0.452 -70 S 0.481 -71 R 0.474 -72 E 0.440 -73 K 0.399 -74 C 0.372 -75 C 0.384 -76 V 0.438 -77 F 0.497 -78 I 0.523 -79 Q 0.521 -80 E 0.520 -81 N 0.532 -82 L 0.537 -83 N 0.530 -84 K 0.532 -85 T 0.551 -86 T 0.574 -87 D 0.581 -88 C 0.564 -89 S 0.520 -90 V 0.449 -91 N 0.354 -92 L 0.252 -93 E 0.164 -94 C 0.107 -95 P 0.078 -96 Q 0.063 -97 D 0.052 -98 W 0.045 -99 L 0.042 -100 L 0.041 -101 H 0.038 -102 R 0.036 -103 D 0.035 -104 K 0.033 -105 C 0.030 -106 F 0.029 -107 H 0.033 -108 V 0.045 -109 S 0.059 -110 Q 0.070 -111 V 0.071 -112 S 0.061 -113 N 0.047 -114 T 0.037 -115 W 0.032 -116 E 0.032 -117 E 0.035 -118 G 0.036 -119 Q 0.037 -120 A 0.039 -121 D 0.041 -122 C 0.043 -123 G 0.049 -124 R 0.057 -125 K 0.066 -126 G 0.068 -127 A 0.062 -128 T 0.051 -129 L 0.046 -130 L 0.050 -131 L 0.058 -132 I 0.063 -133 Q 0.059 -134 D 0.048 -135 Q 0.037 -136 E 0.027 -137 E 0.021 -138 L 0.018 -139 R 0.016 -140 F 0.015 -141 L 0.016 -142 L 0.018 -143 D 0.021 -144 S 0.026 -145 I 0.030 -146 K 0.033 -147 E 0.033 -148 K 0.030 -149 Y 0.026 -150 N 0.023 -151 S 0.019 -152 F 0.015 -153 W 0.012 -154 I 0.013 -155 G 0.017 -156 L 0.021 -157 R 0.024 -158 F 0.027 -159 T 0.031 -160 L 0.036 -161 P 0.041 -162 D 0.047 -163 M 0.053 -164 N 0.053 -165 W 0.046 -166 K 0.035 -167 W 0.030 -168 I 0.034 -169 N 0.045 -170 G 0.057 -171 T 0.068 -172 T 0.075 -173 F 0.080 -174 N 0.087 -175 S 0.097 -176 D 0.108 -177 V 0.122 -178 L 0.142 -179 K 0.162 -180 I 0.178 -181 T 0.189 -182 G 0.194 -183 V 0.185 -184 T 0.160 -185 E 0.131 -186 N 0.106 -187 G 0.086 -188 S 0.067 -189 C 0.052 -190 A 0.043 -191 S 0.042 -192 I 0.046 -193 L 0.052 -194 G 0.063 -195 D 0.077 -196 K 0.092 -197 V 0.102 -198 T 0.107 -199 P 0.105 -200 E 0.099 -201 S 0.095 -202 C 0.095 -203 A 0.099 -204 S 0.102 -205 D 0.098 -206 N 0.083 -207 R 0.062 -208 W 0.045 -209 I 0.037 -210 C 0.037 -211 Q 0.046 -212 K 0.071 -213 E 0.123 -214 L 0.209 -215 N 0.320 -216 H 0.433 -217 E 0.520 -218 T 0.576 -219 P 0.612 -220 S 0.630 -221 N 0.613 -222 D 0.559 -223 S 0.508 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030325.17_ENSMUST00000174404.8_GN:Klrb1c_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:48.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030325.17_ENSMUST00000174404.8_GN:Klrb1c_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:48.caid deleted file mode 100644 index 6846dc1aba5b6a347038bc5f031b05fe2acc4ab1..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030325.17_ENSMUST00000174404.8_GN:Klrb1c_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:48.caid +++ /dev/null @@ -1,272 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030325.17|ENSMUST00000174404.8|GN:Klrb1c|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:48 -1 M 0.435 -2 E 0.464 -3 K 0.503 -4 P 0.526 -5 S 0.525 -6 E 0.540 -7 T 0.600 -8 G 0.675 -9 I 0.718 -10 S 0.731 -11 G 0.737 -12 C 0.741 -13 G 0.740 -14 N 0.734 -15 R 0.720 -16 A 0.699 -17 E 0.678 -18 H 0.667 -19 S 0.662 -20 Q 0.657 -21 R 0.652 -22 T 0.649 -23 F 0.639 -24 F 0.618 -25 C 0.585 -26 L 0.559 -27 F 0.558 -28 H 0.588 -29 L 0.633 -30 K 0.682 -31 G 0.727 -32 L 0.755 -33 G 0.760 -34 V 0.748 -35 C 0.725 -36 P 0.686 -37 F 0.638 -38 S 0.608 -39 P 0.623 -40 P 0.678 -41 V 0.740 -42 K 0.780 -43 C 0.795 -44 C 0.793 -45 I 0.783 -46 S 0.774 -47 C 0.771 -48 E 0.769 -49 M 0.767 -50 D 0.770 -51 T 0.778 -52 A 0.784 -53 S 0.781 -54 I 0.775 -55 Y 0.770 -56 L 0.766 -57 G 0.758 -58 L 0.745 -59 K 0.737 -60 P 0.743 -61 P 0.767 -62 R 0.800 -63 T 0.825 -64 L 0.835 -65 G 0.830 -66 A 0.813 -67 W 0.792 -68 H 0.771 -69 E 0.756 -70 S 0.750 -71 P 0.758 -72 P 0.772 -73 S 0.783 -74 L 0.786 -75 P 0.793 -76 P 0.806 -77 D 0.814 -78 A 0.804 -79 C 0.775 -80 R 0.740 -81 C 0.710 -82 P 0.688 -83 R 0.669 -84 S 0.651 -85 H 0.631 -86 R 0.618 -87 L 0.629 -88 A 0.655 -89 L 0.667 -90 K 0.652 -91 L 0.613 -92 S 0.550 -93 C 0.476 -94 A 0.423 -95 G 0.400 -96 L 0.379 -97 I 0.352 -98 L 0.330 -99 L 0.305 -100 V 0.273 -101 L 0.248 -102 T 0.242 -103 L 0.253 -104 I 0.271 -105 G 0.284 -106 M 0.277 -107 S 0.250 -108 V 0.221 -109 L 0.205 -110 V 0.201 -111 R 0.206 -112 V 0.218 -113 L 0.240 -114 V 0.272 -115 Q 0.315 -116 K 0.369 -117 P 0.429 -118 S 0.470 -119 R 0.473 -120 E 0.447 -121 K 0.411 -122 C 0.386 -123 C 0.390 -124 V 0.431 -125 F 0.477 -126 I 0.493 -127 Q 0.481 -128 E 0.476 -129 N 0.492 -130 L 0.511 -131 N 0.519 -132 K 0.530 -133 T 0.554 -134 T 0.579 -135 D 0.588 -136 C 0.569 -137 S 0.519 -138 V 0.446 -139 N 0.355 -140 L 0.260 -141 E 0.178 -142 C 0.123 -143 P 0.093 -144 Q 0.075 -145 D 0.061 -146 W 0.050 -147 L 0.045 -148 L 0.042 -149 H 0.039 -150 R 0.036 -151 D 0.036 -152 K 0.034 -153 C 0.032 -154 F 0.030 -155 H 0.033 -156 V 0.044 -157 S 0.059 -158 Q 0.071 -159 V 0.073 -160 S 0.064 -161 N 0.051 -162 T 0.039 -163 W 0.033 -164 E 0.034 -165 E 0.036 -166 G 0.038 -167 Q 0.039 -168 A 0.041 -169 D 0.043 -170 C 0.045 -171 G 0.051 -172 R 0.060 -173 K 0.069 -174 G 0.070 -175 A 0.062 -176 T 0.051 -177 L 0.045 -178 L 0.049 -179 L 0.057 -180 I 0.062 -181 Q 0.059 -182 D 0.049 -183 Q 0.038 -184 E 0.028 -185 E 0.022 -186 L 0.018 -187 R 0.017 -188 F 0.016 -189 L 0.017 -190 L 0.018 -191 D 0.021 -192 S 0.026 -193 I 0.029 -194 K 0.032 -195 E 0.032 -196 K 0.029 -197 Y 0.025 -198 N 0.021 -199 S 0.018 -200 F 0.014 -201 W 0.011 -202 I 0.012 -203 G 0.016 -204 L 0.020 -205 R 0.023 -206 F 0.026 -207 T 0.029 -208 L 0.034 -209 P 0.038 -210 D 0.043 -211 M 0.047 -212 N 0.046 -213 W 0.039 -214 K 0.031 -215 W 0.026 -216 I 0.029 -217 N 0.038 -218 G 0.049 -219 T 0.058 -220 T 0.065 -221 F 0.070 -222 N 0.077 -223 S 0.087 -224 D 0.098 -225 V 0.111 -226 L 0.130 -227 K 0.151 -228 I 0.170 -229 T 0.183 -230 G 0.187 -231 V 0.177 -232 T 0.151 -233 E 0.123 -234 N 0.101 -235 G 0.082 -236 S 0.064 -237 C 0.050 -238 A 0.042 -239 S 0.041 -240 I 0.043 -241 L 0.049 -242 G 0.060 -243 D 0.076 -244 K 0.093 -245 V 0.105 -246 T 0.110 -247 P 0.108 -248 E 0.101 -249 S 0.096 -250 C 0.096 -251 A 0.099 -252 S 0.102 -253 D 0.098 -254 N 0.083 -255 R 0.063 -256 W 0.046 -257 I 0.038 -258 C 0.038 -259 Q 0.048 -260 K 0.074 -261 E 0.129 -262 L 0.217 -263 N 0.332 -264 H 0.448 -265 E 0.537 -266 T 0.592 -267 P 0.627 -268 S 0.643 -269 N 0.626 -270 D 0.572 -271 S 0.521 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030340.17_ENSMUST00000081440.14_GN:Scnn1a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030340.17_ENSMUST00000081440.14_GN:Scnn1a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index fa830d4d5a5e606db6ae6998cf07f1b7fa3ebea3..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030340.17_ENSMUST00000081440.14_GN:Scnn1a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,700 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030340.17|ENSMUST00000081440.14|GN:Scnn1a|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.321 -2 L 0.341 -3 D 0.373 -4 H 0.405 -5 T 0.430 -6 R 0.456 -7 A 0.485 -8 P 0.504 -9 E 0.501 -10 L 0.486 -11 N 0.475 -12 L 0.475 -13 D 0.482 -14 L 0.493 -15 D 0.509 -16 L 0.532 -17 D 0.557 -18 V 0.569 -19 S 0.567 -20 N 0.567 -21 S 0.587 -22 P 0.628 -23 K 0.674 -24 G 0.705 -25 S 0.715 -26 M 0.714 -27 K 0.714 -28 G 0.714 -29 N 0.701 -30 N 0.672 -31 F 0.640 -32 K 0.620 -33 E 0.610 -34 Q 0.596 -35 D 0.566 -36 L 0.523 -37 C 0.491 -38 P 0.492 -39 P 0.528 -40 L 0.570 -41 P 0.584 -42 M 0.567 -43 Q 0.566 -44 G 0.611 -45 L 0.664 -46 G 0.686 -47 K 0.675 -48 G 0.640 -49 D 0.586 -50 K 0.547 -51 R 0.551 -52 E 0.564 -53 E 0.548 -54 Q 0.531 -55 A 0.549 -56 L 0.580 -57 G 0.593 -58 P 0.594 -59 E 0.594 -60 P 0.590 -61 S 0.580 -62 E 0.567 -63 P 0.545 -64 R 0.515 -65 Q 0.477 -66 P 0.426 -67 T 0.362 -68 E 0.302 -69 E 0.262 -70 E 0.238 -71 E 0.220 -72 A 0.204 -73 L 0.192 -74 I 0.185 -75 E 0.178 -76 F 0.162 -77 H 0.134 -78 R 0.108 -79 S 0.089 -80 Y 0.074 -81 R 0.063 -82 E 0.060 -83 L 0.062 -84 F 0.064 -85 Q 0.065 -86 F 0.069 -87 F 0.077 -88 C 0.088 -89 N 0.101 -90 N 0.113 -91 T 0.114 -92 T 0.106 -93 I 0.098 -94 H 0.097 -95 G 0.103 -96 A 0.109 -97 I 0.107 -98 R 0.103 -99 L 0.105 -100 V 0.112 -101 C 0.121 -102 S 0.128 -103 K 0.131 -104 H 0.125 -105 N 0.107 -106 R 0.082 -107 M 0.062 -108 K 0.055 -109 T 0.055 -110 A 0.056 -111 F 0.058 -112 W 0.063 -113 A 0.070 -114 V 0.075 -115 L 0.078 -116 W 0.077 -117 L 0.073 -118 C 0.073 -119 T 0.077 -120 F 0.081 -121 G 0.081 -122 M 0.080 -123 M 0.081 -124 Y 0.085 -125 W 0.089 -126 Q 0.093 -127 F 0.098 -128 A 0.103 -129 L 0.104 -130 L 0.099 -131 F 0.101 -132 E 0.111 -133 E 0.118 -134 Y 0.113 -135 F 0.105 -136 S 0.102 -137 Y 0.104 -138 P 0.110 -139 V 0.121 -140 S 0.133 -141 L 0.147 -142 N 0.160 -143 I 0.167 -144 N 0.167 -145 L 0.165 -146 N 0.161 -147 S 0.153 -148 D 0.138 -149 K 0.123 -150 L 0.115 -151 V 0.111 -152 F 0.108 -153 P 0.102 -154 A 0.092 -155 V 0.081 -156 T 0.079 -157 V 0.091 -158 C 0.112 -159 T 0.126 -160 L 0.125 -161 N 0.118 -162 P 0.110 -163 Y 0.101 -164 R 0.088 -165 Y 0.078 -166 T 0.074 -167 E 0.069 -168 I 0.060 -169 K 0.050 -170 E 0.046 -171 D 0.050 -172 L 0.058 -173 E 0.068 -174 E 0.077 -175 L 0.085 -176 D 0.090 -177 R 0.092 -178 I 0.089 -179 T 0.080 -180 E 0.071 -181 Q 0.067 -182 T 0.068 -183 L 0.074 -184 F 0.083 -185 D 0.090 -186 L 0.096 -187 Y 0.109 -188 K 0.139 -189 Y 0.188 -190 N 0.246 -191 S 0.296 -192 S 0.332 -193 Y 0.368 -194 T 0.416 -195 R 0.474 -196 Q 0.532 -197 A 0.583 -198 G 0.619 -199 G 0.635 -200 R 0.631 -201 R 0.615 -202 R 0.597 -203 S 0.589 -204 T 0.591 -205 R 0.599 -206 D 0.607 -207 L 0.611 -208 R 0.606 -209 G 0.578 -210 A 0.527 -211 L 0.481 -212 P 0.459 -213 H 0.450 -214 P 0.436 -215 L 0.426 -216 Q 0.429 -217 R 0.431 -218 L 0.414 -219 R 0.385 -220 T 0.361 -221 P 0.353 -222 P 0.371 -223 P 0.420 -224 P 0.487 -225 N 0.548 -226 P 0.585 -227 A 0.605 -228 R 0.626 -229 S 0.651 -230 A 0.671 -231 R 0.684 -232 S 0.693 -233 A 0.692 -234 S 0.684 -235 S 0.675 -236 S 0.670 -237 V 0.660 -238 R 0.642 -239 D 0.615 -240 N 0.583 -241 N 0.550 -242 P 0.517 -243 Q 0.473 -244 V 0.411 -245 D 0.337 -246 R 0.268 -247 K 0.217 -248 D 0.182 -249 W 0.158 -250 K 0.141 -251 I 0.125 -252 G 0.109 -253 F 0.095 -254 Q 0.080 -255 L 0.067 -256 C 0.060 -257 N 0.060 -258 Q 0.067 -259 N 0.077 -260 K 0.088 -261 S 0.096 -262 D 0.101 -263 C 0.102 -264 F 0.099 -265 Y 0.092 -266 Q 0.081 -267 T 0.074 -268 Y 0.072 -269 S 0.074 -270 S 0.080 -271 G 0.086 -272 V 0.085 -273 D 0.074 -274 A 0.063 -275 V 0.057 -276 R 0.051 -277 E 0.044 -278 W 0.038 -279 Y 0.032 -280 R 0.029 -281 F 0.029 -282 H 0.035 -283 Y 0.049 -284 I 0.066 -285 N 0.078 -286 I 0.079 -287 L 0.077 -288 S 0.082 -289 R 0.098 -290 L 0.121 -291 P 0.149 -292 D 0.180 -293 T 0.209 -294 S 0.218 -295 P 0.205 -296 A 0.184 -297 L 0.170 -298 E 0.162 -299 E 0.151 -300 E 0.133 -301 A 0.113 -302 L 0.095 -303 G 0.076 -304 S 0.058 -305 F 0.042 -306 I 0.030 -307 F 0.024 -308 T 0.021 -309 C 0.022 -310 R 0.025 -311 F 0.031 -312 N 0.039 -313 Q 0.051 -314 A 0.063 -315 P 0.070 -316 C 0.066 -317 N 0.056 -318 Q 0.047 -319 A 0.042 -320 N 0.039 -321 Y 0.040 -322 S 0.044 -323 Q 0.051 -324 F 0.058 -325 H 0.061 -326 H 0.058 -327 P 0.049 -328 M 0.039 -329 Y 0.031 -330 G 0.027 -331 N 0.025 -332 C 0.026 -333 Y 0.031 -334 T 0.042 -335 F 0.057 -336 N 0.077 -337 N 0.103 -338 K 0.136 -339 N 0.163 -340 N 0.171 -341 S 0.156 -342 N 0.134 -343 L 0.115 -344 W 0.102 -345 M 0.096 -346 S 0.098 -347 S 0.110 -348 M 0.131 -349 P 0.156 -350 G 0.168 -351 V 0.156 -352 N 0.131 -353 N 0.108 -354 G 0.092 -355 L 0.081 -356 S 0.073 -357 L 0.068 -358 T 0.067 -359 L 0.070 -360 R 0.081 -361 T 0.095 -362 E 0.107 -363 Q 0.113 -364 N 0.113 -365 D 0.107 -366 F 0.099 -367 I 0.092 -368 P 0.090 -369 L 0.099 -370 L 0.119 -371 S 0.139 -372 T 0.146 -373 V 0.142 -374 T 0.135 -375 G 0.128 -376 A 0.121 -377 R 0.115 -378 V 0.111 -379 M 0.108 -380 V 0.109 -381 H 0.115 -382 G 0.121 -383 Q 0.124 -384 D 0.124 -385 E 0.123 -386 P 0.121 -387 A 0.119 -388 F 0.122 -389 M 0.128 -390 D 0.129 -391 D 0.122 -392 G 0.109 -393 G 0.098 -394 F 0.096 -395 N 0.102 -396 V 0.116 -397 R 0.136 -398 P 0.160 -399 G 0.182 -400 V 0.199 -401 E 0.210 -402 T 0.214 -403 S 0.206 -404 I 0.187 -405 S 0.165 -406 M 0.149 -407 R 0.139 -408 K 0.137 -409 E 0.138 -410 A 0.145 -411 L 0.156 -412 D 0.168 -413 S 0.180 -414 L 0.192 -415 G 0.210 -416 G 0.224 -417 N 0.223 -418 Y 0.209 -419 G 0.196 -420 D 0.195 -421 C 0.207 -422 T 0.226 -423 E 0.247 -424 N 0.267 -425 G 0.282 -426 S 0.287 -427 D 0.282 -428 V 0.273 -429 P 0.267 -430 V 0.262 -431 K 0.254 -432 N 0.233 -433 L 0.197 -434 Y 0.155 -435 P 0.126 -436 S 0.116 -437 K 0.117 -438 Y 0.118 -439 T 0.115 -440 Q 0.107 -441 Q 0.100 -442 V 0.098 -443 C 0.104 -444 I 0.112 -445 H 0.117 -446 S 0.122 -447 C 0.128 -448 F 0.133 -449 Q 0.134 -450 E 0.127 -451 N 0.116 -452 M 0.103 -453 I 0.093 -454 K 0.085 -455 K 0.083 -456 C 0.090 -457 G 0.103 -458 C 0.118 -459 A 0.128 -460 Y 0.124 -461 I 0.110 -462 F 0.097 -463 Y 0.095 -464 P 0.105 -465 K 0.119 -466 P 0.132 -467 K 0.139 -468 G 0.144 -469 V 0.143 -470 E 0.133 -471 F 0.118 -472 C 0.101 -473 D 0.087 -474 Y 0.076 -475 L 0.071 -476 K 0.068 -477 Q 0.065 -478 S 0.064 -479 S 0.062 -480 W 0.057 -481 G 0.050 -482 Y 0.044 -483 C 0.044 -484 Y 0.047 -485 Y 0.054 -486 K 0.065 -487 L 0.079 -488 Q 0.091 -489 A 0.103 -490 A 0.119 -491 F 0.132 -492 S 0.139 -493 L 0.143 -494 D 0.148 -495 S 0.146 -496 L 0.133 -497 G 0.114 -498 C 0.104 -499 F 0.105 -500 S 0.107 -501 K 0.107 -502 C 0.112 -503 R 0.125 -504 K 0.140 -505 P 0.156 -506 C 0.175 -507 S 0.195 -508 V 0.211 -509 T 0.218 -510 N 0.219 -511 Y 0.214 -512 K 0.203 -513 L 0.187 -514 S 0.169 -515 A 0.154 -516 G 0.145 -517 Y 0.140 -518 S 0.135 -519 R 0.127 -520 W 0.117 -521 P 0.114 -522 S 0.115 -523 V 0.109 -524 K 0.095 -525 S 0.078 -526 Q 0.065 -527 D 0.058 -528 W 0.056 -529 I 0.057 -530 F 0.060 -531 E 0.069 -532 M 0.082 -533 L 0.096 -534 S 0.109 -535 L 0.127 -536 Q 0.149 -537 N 0.171 -538 N 0.188 -539 Y 0.202 -540 T 0.214 -541 I 0.229 -542 N 0.242 -543 N 0.242 -544 K 0.220 -545 R 0.184 -546 N 0.145 -547 G 0.113 -548 V 0.095 -549 A 0.089 -550 K 0.089 -551 L 0.092 -552 N 0.093 -553 I 0.096 -554 F 0.106 -555 F 0.123 -556 K 0.143 -557 E 0.167 -558 L 0.198 -559 N 0.234 -560 Y 0.271 -561 K 0.305 -562 T 0.327 -563 N 0.326 -564 S 0.310 -565 E 0.292 -566 S 0.277 -567 P 0.257 -568 S 0.227 -569 V 0.192 -570 T 0.158 -571 M 0.132 -572 V 0.124 -573 S 0.132 -574 L 0.146 -575 L 0.158 -576 S 0.173 -577 N 0.196 -578 L 0.217 -579 G 0.221 -580 S 0.204 -581 Q 0.177 -582 W 0.150 -583 S 0.129 -584 L 0.117 -585 W 0.114 -586 F 0.123 -587 G 0.139 -588 S 0.146 -589 S 0.135 -590 V 0.114 -591 L 0.098 -592 S 0.091 -593 V 0.083 -594 V 0.073 -595 E 0.064 -596 M 0.059 -597 A 0.056 -598 E 0.052 -599 L 0.048 -600 I 0.045 -601 F 0.046 -602 D 0.049 -603 L 0.051 -604 L 0.054 -605 V 0.058 -606 I 0.063 -607 T 0.068 -608 L 0.071 -609 I 0.073 -610 M 0.077 -611 L 0.089 -612 L 0.110 -613 H 0.139 -614 R 0.171 -615 F 0.202 -616 R 0.233 -617 S 0.269 -618 R 0.313 -619 Y 0.362 -620 W 0.416 -621 S 0.479 -622 P 0.551 -623 G 0.614 -624 R 0.658 -625 G 0.682 -626 A 0.694 -627 R 0.697 -628 G 0.687 -629 A 0.648 -630 R 0.593 -631 E 0.564 -632 V 0.586 -633 A 0.619 -634 S 0.628 -635 T 0.623 -636 P 0.626 -637 A 0.630 -638 S 0.624 -639 S 0.614 -640 F 0.617 -641 P 0.636 -642 S 0.656 -643 R 0.665 -644 F 0.663 -645 C 0.663 -646 P 0.670 -647 H 0.678 -648 P 0.673 -649 T 0.652 -650 S 0.633 -651 P 0.633 -652 P 0.655 -653 P 0.683 -654 S 0.695 -655 L 0.675 -656 P 0.629 -657 Q 0.605 -658 Q 0.630 -659 G 0.668 -660 T 0.682 -661 T 0.683 -662 P 0.694 -663 P 0.712 -664 L 0.726 -665 A 0.721 -666 L 0.689 -667 T 0.636 -668 A 0.592 -669 P 0.587 -670 P 0.619 -671 P 0.659 -672 A 0.677 -673 Y 0.657 -674 A 0.610 -675 T 0.580 -676 L 0.599 -677 G 0.645 -678 P 0.678 -679 S 0.693 -680 A 0.703 -681 S 0.714 -682 P 0.727 -683 L 0.742 -684 D 0.748 -685 S 0.740 -686 A 0.729 -687 V 0.730 -688 P 0.745 -689 G 0.763 -690 S 0.764 -691 S 0.743 -692 A 0.708 -693 C 0.673 -694 A 0.645 -695 P 0.619 -696 A 0.583 -697 M 0.524 -698 A 0.447 -699 L 0.387 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030340.17_ENSMUST00000081440.14_GN:Scnn1a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030340.17_ENSMUST00000081440.14_GN:Scnn1a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid deleted file mode 100644 index 08b6469c9a1848fe05432dacf41658f8a1bc5169..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030340.17_ENSMUST00000081440.14_GN:Scnn1a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid +++ /dev/null @@ -1,701 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030340.17|ENSMUST00000081440.14|GN:Scnn1a|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:1 -1 M 0.308 -2 M 0.326 -3 L 0.360 -4 D 0.396 -5 H 0.420 -6 T 0.432 -7 R 0.445 -8 A 0.452 -9 P 0.435 -10 E 0.415 -11 L 0.421 -12 N 0.447 -13 L 0.466 -14 D 0.478 -15 L 0.490 -16 D 0.507 -17 L 0.530 -18 D 0.557 -19 V 0.572 -20 S 0.571 -21 N 0.570 -22 S 0.590 -23 P 0.631 -24 K 0.676 -25 G 0.706 -26 S 0.716 -27 M 0.715 -28 K 0.715 -29 G 0.715 -30 N 0.703 -31 N 0.674 -32 F 0.642 -33 K 0.622 -34 E 0.612 -35 Q 0.598 -36 D 0.568 -37 L 0.525 -38 C 0.492 -39 P 0.494 -40 P 0.530 -41 L 0.572 -42 P 0.586 -43 M 0.569 -44 Q 0.568 -45 G 0.613 -46 L 0.668 -47 G 0.691 -48 K 0.682 -49 G 0.646 -50 D 0.591 -51 K 0.551 -52 R 0.554 -53 E 0.567 -54 E 0.551 -55 Q 0.534 -56 A 0.551 -57 L 0.582 -58 G 0.595 -59 P 0.596 -60 E 0.596 -61 P 0.592 -62 S 0.582 -63 E 0.568 -64 P 0.545 -65 R 0.515 -66 Q 0.477 -67 P 0.426 -68 T 0.362 -69 E 0.303 -70 E 0.263 -71 E 0.238 -72 E 0.220 -73 A 0.204 -74 L 0.192 -75 I 0.185 -76 E 0.178 -77 F 0.162 -78 H 0.134 -79 R 0.107 -80 S 0.089 -81 Y 0.074 -82 R 0.063 -83 E 0.060 -84 L 0.062 -85 F 0.064 -86 Q 0.065 -87 F 0.069 -88 F 0.077 -89 C 0.087 -90 N 0.101 -91 N 0.113 -92 T 0.114 -93 T 0.106 -94 I 0.097 -95 H 0.096 -96 G 0.103 -97 A 0.109 -98 I 0.107 -99 R 0.103 -100 L 0.105 -101 V 0.112 -102 C 0.121 -103 S 0.128 -104 K 0.131 -105 H 0.124 -106 N 0.106 -107 R 0.082 -108 M 0.062 -109 K 0.055 -110 T 0.056 -111 A 0.056 -112 F 0.058 -113 W 0.063 -114 A 0.070 -115 V 0.075 -116 L 0.078 -117 W 0.077 -118 L 0.073 -119 C 0.073 -120 T 0.077 -121 F 0.080 -122 G 0.081 -123 M 0.080 -124 M 0.081 -125 Y 0.085 -126 W 0.089 -127 Q 0.090 -128 F 0.093 -129 A 0.098 -130 L 0.099 -131 L 0.097 -132 F 0.100 -133 E 0.111 -134 E 0.117 -135 Y 0.113 -136 F 0.105 -137 S 0.101 -138 Y 0.103 -139 P 0.110 -140 V 0.121 -141 S 0.133 -142 L 0.147 -143 N 0.160 -144 I 0.167 -145 N 0.167 -146 L 0.165 -147 N 0.161 -148 S 0.153 -149 D 0.138 -150 K 0.123 -151 L 0.115 -152 V 0.111 -153 F 0.108 -154 P 0.102 -155 A 0.092 -156 V 0.081 -157 T 0.079 -158 V 0.091 -159 C 0.112 -160 T 0.126 -161 L 0.125 -162 N 0.117 -163 P 0.110 -164 Y 0.101 -165 R 0.088 -166 Y 0.078 -167 T 0.073 -168 E 0.069 -169 I 0.060 -170 K 0.049 -171 E 0.046 -172 D 0.049 -173 L 0.057 -174 E 0.067 -175 E 0.077 -176 L 0.085 -177 D 0.090 -178 R 0.092 -179 I 0.089 -180 T 0.079 -181 E 0.071 -182 Q 0.067 -183 T 0.068 -184 L 0.074 -185 F 0.083 -186 D 0.090 -187 L 0.096 -188 Y 0.109 -189 K 0.139 -190 Y 0.189 -191 N 0.247 -192 S 0.296 -193 S 0.333 -194 Y 0.369 -195 T 0.416 -196 R 0.474 -197 Q 0.533 -198 A 0.583 -199 G 0.619 -200 G 0.635 -201 R 0.631 -202 R 0.615 -203 R 0.597 -204 S 0.588 -205 T 0.591 -206 R 0.599 -207 D 0.607 -208 L 0.612 -209 R 0.606 -210 G 0.578 -211 A 0.528 -212 L 0.481 -213 P 0.459 -214 H 0.450 -215 P 0.437 -216 L 0.426 -217 Q 0.430 -218 R 0.431 -219 L 0.414 -220 R 0.385 -221 T 0.361 -222 P 0.354 -223 P 0.372 -224 P 0.420 -225 P 0.488 -226 N 0.549 -227 P 0.586 -228 A 0.605 -229 R 0.627 -230 S 0.652 -231 A 0.672 -232 R 0.685 -233 S 0.693 -234 A 0.693 -235 S 0.685 -236 S 0.676 -237 S 0.671 -238 V 0.661 -239 R 0.643 -240 D 0.615 -241 N 0.584 -242 N 0.551 -243 P 0.517 -244 Q 0.474 -245 V 0.412 -246 D 0.337 -247 R 0.268 -248 K 0.217 -249 D 0.182 -250 W 0.158 -251 K 0.140 -252 I 0.125 -253 G 0.109 -254 F 0.095 -255 Q 0.080 -256 L 0.067 -257 C 0.060 -258 N 0.060 -259 Q 0.067 -260 N 0.077 -261 K 0.088 -262 S 0.096 -263 D 0.101 -264 C 0.102 -265 F 0.100 -266 Y 0.091 -267 Q 0.081 -268 T 0.074 -269 Y 0.072 -270 S 0.074 -271 S 0.080 -272 G 0.086 -273 V 0.085 -274 D 0.074 -275 A 0.063 -276 V 0.057 -277 R 0.051 -278 E 0.044 -279 W 0.038 -280 Y 0.032 -281 R 0.029 -282 F 0.029 -283 H 0.035 -284 Y 0.049 -285 I 0.066 -286 N 0.078 -287 I 0.079 -288 L 0.077 -289 S 0.082 -290 R 0.098 -291 L 0.121 -292 P 0.149 -293 D 0.181 -294 T 0.209 -295 S 0.219 -296 P 0.205 -297 A 0.184 -298 L 0.170 -299 E 0.163 -300 E 0.151 -301 E 0.133 -302 A 0.114 -303 L 0.095 -304 G 0.076 -305 S 0.058 -306 F 0.042 -307 I 0.030 -308 F 0.024 -309 T 0.021 -310 C 0.022 -311 R 0.025 -312 F 0.031 -313 N 0.039 -314 Q 0.051 -315 A 0.063 -316 P 0.069 -317 C 0.066 -318 N 0.056 -319 Q 0.047 -320 A 0.042 -321 N 0.039 -322 Y 0.040 -323 S 0.044 -324 Q 0.051 -325 F 0.058 -326 H 0.061 -327 H 0.058 -328 P 0.049 -329 M 0.039 -330 Y 0.031 -331 G 0.027 -332 N 0.025 -333 C 0.026 -334 Y 0.031 -335 T 0.042 -336 F 0.057 -337 N 0.077 -338 N 0.103 -339 K 0.136 -340 N 0.163 -341 N 0.171 -342 S 0.156 -343 N 0.134 -344 L 0.115 -345 W 0.102 -346 M 0.096 -347 S 0.098 -348 S 0.110 -349 M 0.131 -350 P 0.156 -351 G 0.168 -352 V 0.156 -353 N 0.131 -354 N 0.108 -355 G 0.092 -356 L 0.081 -357 S 0.073 -358 L 0.068 -359 T 0.067 -360 L 0.070 -361 R 0.081 -362 T 0.095 -363 E 0.106 -364 Q 0.113 -365 N 0.113 -366 D 0.107 -367 F 0.099 -368 I 0.092 -369 P 0.090 -370 L 0.099 -371 L 0.119 -372 S 0.139 -373 T 0.146 -374 V 0.142 -375 T 0.135 -376 G 0.128 -377 A 0.121 -378 R 0.115 -379 V 0.111 -380 M 0.108 -381 V 0.109 -382 H 0.115 -383 G 0.121 -384 Q 0.124 -385 D 0.124 -386 E 0.123 -387 P 0.121 -388 A 0.119 -389 F 0.122 -390 M 0.128 -391 D 0.129 -392 D 0.122 -393 G 0.109 -394 G 0.098 -395 F 0.096 -396 N 0.102 -397 V 0.115 -398 R 0.136 -399 P 0.160 -400 G 0.182 -401 V 0.199 -402 E 0.210 -403 T 0.214 -404 S 0.205 -405 I 0.187 -406 S 0.165 -407 M 0.149 -408 R 0.139 -409 K 0.137 -410 E 0.138 -411 A 0.144 -412 L 0.155 -413 D 0.168 -414 S 0.179 -415 L 0.192 -416 G 0.210 -417 G 0.224 -418 N 0.223 -419 Y 0.209 -420 G 0.196 -421 D 0.195 -422 C 0.207 -423 T 0.226 -424 E 0.247 -425 N 0.267 -426 G 0.282 -427 S 0.287 -428 D 0.282 -429 V 0.273 -430 P 0.267 -431 V 0.262 -432 K 0.254 -433 N 0.233 -434 L 0.197 -435 Y 0.155 -436 P 0.126 -437 S 0.116 -438 K 0.117 -439 Y 0.118 -440 T 0.114 -441 Q 0.107 -442 Q 0.100 -443 V 0.098 -444 C 0.104 -445 I 0.112 -446 H 0.117 -447 S 0.122 -448 C 0.128 -449 F 0.133 -450 Q 0.134 -451 E 0.127 -452 N 0.116 -453 M 0.104 -454 I 0.093 -455 K 0.085 -456 K 0.083 -457 C 0.090 -458 G 0.103 -459 C 0.118 -460 A 0.128 -461 Y 0.125 -462 I 0.110 -463 F 0.097 -464 Y 0.095 -465 P 0.105 -466 K 0.120 -467 P 0.132 -468 K 0.139 -469 G 0.144 -470 V 0.143 -471 E 0.134 -472 F 0.118 -473 C 0.101 -474 D 0.086 -475 Y 0.076 -476 L 0.071 -477 K 0.068 -478 Q 0.065 -479 S 0.064 -480 S 0.062 -481 W 0.057 -482 G 0.050 -483 Y 0.044 -484 C 0.044 -485 Y 0.047 -486 Y 0.054 -487 K 0.066 -488 L 0.079 -489 Q 0.091 -490 A 0.103 -491 A 0.119 -492 F 0.132 -493 S 0.139 -494 L 0.143 -495 D 0.148 -496 S 0.146 -497 L 0.133 -498 G 0.114 -499 C 0.104 -500 F 0.105 -501 S 0.107 -502 K 0.107 -503 C 0.112 -504 R 0.125 -505 K 0.140 -506 P 0.156 -507 C 0.175 -508 S 0.195 -509 V 0.211 -510 T 0.218 -511 N 0.219 -512 Y 0.214 -513 K 0.203 -514 L 0.187 -515 S 0.169 -516 A 0.155 -517 G 0.145 -518 Y 0.140 -519 S 0.135 -520 R 0.127 -521 W 0.117 -522 P 0.114 -523 S 0.115 -524 V 0.109 -525 K 0.095 -526 S 0.078 -527 Q 0.065 -528 D 0.058 -529 W 0.056 -530 I 0.057 -531 F 0.060 -532 E 0.069 -533 M 0.082 -534 L 0.096 -535 S 0.109 -536 L 0.127 -537 Q 0.149 -538 N 0.172 -539 N 0.189 -540 Y 0.202 -541 T 0.215 -542 I 0.229 -543 N 0.242 -544 N 0.242 -545 K 0.221 -546 R 0.184 -547 N 0.145 -548 G 0.114 -549 V 0.095 -550 A 0.089 -551 K 0.089 -552 L 0.092 -553 N 0.093 -554 I 0.096 -555 F 0.106 -556 F 0.123 -557 K 0.143 -558 E 0.167 -559 L 0.198 -560 N 0.234 -561 Y 0.271 -562 K 0.305 -563 T 0.326 -564 N 0.326 -565 S 0.310 -566 E 0.292 -567 S 0.277 -568 P 0.257 -569 S 0.227 -570 V 0.192 -571 T 0.157 -572 M 0.132 -573 V 0.124 -574 S 0.132 -575 L 0.146 -576 L 0.158 -577 S 0.173 -578 N 0.196 -579 L 0.217 -580 G 0.221 -581 S 0.204 -582 Q 0.177 -583 W 0.150 -584 S 0.129 -585 L 0.117 -586 W 0.114 -587 F 0.123 -588 G 0.139 -589 S 0.146 -590 S 0.135 -591 V 0.114 -592 L 0.098 -593 S 0.091 -594 V 0.083 -595 V 0.073 -596 E 0.064 -597 M 0.059 -598 A 0.056 -599 E 0.052 -600 L 0.048 -601 I 0.045 -602 F 0.046 -603 D 0.049 -604 L 0.051 -605 L 0.054 -606 V 0.058 -607 I 0.063 -608 T 0.068 -609 L 0.071 -610 I 0.073 -611 M 0.078 -612 L 0.090 -613 L 0.110 -614 H 0.139 -615 R 0.171 -616 F 0.202 -617 R 0.233 -618 S 0.269 -619 R 0.313 -620 Y 0.362 -621 W 0.415 -622 S 0.479 -623 P 0.550 -624 G 0.614 -625 R 0.658 -626 G 0.682 -627 A 0.694 -628 R 0.698 -629 G 0.687 -630 A 0.648 -631 R 0.593 -632 E 0.564 -633 V 0.586 -634 A 0.619 -635 S 0.628 -636 T 0.623 -637 P 0.626 -638 A 0.630 -639 S 0.624 -640 S 0.614 -641 F 0.617 -642 P 0.636 -643 S 0.656 -644 R 0.665 -645 F 0.663 -646 C 0.663 -647 P 0.670 -648 H 0.678 -649 P 0.672 -650 T 0.652 -651 S 0.632 -652 P 0.633 -653 P 0.655 -654 P 0.683 -655 S 0.695 -656 L 0.675 -657 P 0.629 -658 Q 0.605 -659 Q 0.630 -660 G 0.668 -661 T 0.682 -662 T 0.683 -663 P 0.694 -664 P 0.713 -665 L 0.727 -666 A 0.723 -667 L 0.690 -668 T 0.636 -669 A 0.592 -670 P 0.587 -671 P 0.619 -672 P 0.660 -673 A 0.680 -674 Y 0.667 -675 A 0.631 -676 T 0.606 -677 L 0.619 -678 G 0.655 -679 P 0.682 -680 S 0.694 -681 A 0.703 -682 S 0.714 -683 P 0.727 -684 L 0.742 -685 D 0.748 -686 S 0.740 -687 A 0.729 -688 V 0.729 -689 P 0.745 -690 G 0.762 -691 S 0.764 -692 S 0.743 -693 A 0.707 -694 C 0.671 -695 A 0.643 -696 P 0.617 -697 A 0.580 -698 M 0.521 -699 A 0.444 -700 L 0.385 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030432.13_ENSMUST00000032597.12_GN:Rpl28_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030432.13_ENSMUST00000032597.12_GN:Rpl28_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 2c3183976f808c915e1f493056a057c2339b708b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030432.13_ENSMUST00000032597.12_GN:Rpl28_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,138 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030432.13|ENSMUST00000032597.12|GN:Rpl28|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.237 -2 S 0.218 -3 A 0.193 -4 H 0.176 -5 L 0.167 -6 Q 0.154 -7 W 0.132 -8 M 0.114 -9 V 0.110 -10 V 0.112 -11 R 0.116 -12 N 0.127 -13 C 0.146 -14 S 0.164 -15 S 0.176 -16 F 0.179 -17 L 0.174 -18 I 0.163 -19 K 0.148 -20 R 0.138 -21 N 0.140 -22 K 0.152 -23 Q 0.167 -24 T 0.181 -25 Y 0.201 -26 S 0.234 -27 T 0.278 -28 E 0.309 -29 P 0.305 -30 N 0.282 -31 N 0.276 -32 L 0.298 -33 K 0.330 -34 A 0.344 -35 R 0.333 -36 N 0.308 -37 S 0.292 -38 F 0.306 -39 R 0.350 -40 Y 0.402 -41 N 0.435 -42 G 0.436 -43 L 0.409 -44 I 0.362 -45 H 0.303 -46 R 0.239 -47 K 0.179 -48 T 0.128 -49 V 0.095 -50 G 0.082 -51 V 0.086 -52 E 0.096 -53 P 0.103 -54 A 0.105 -55 A 0.109 -56 D 0.116 -57 G 0.120 -58 K 0.116 -59 G 0.102 -60 V 0.085 -61 V 0.072 -62 V 0.069 -63 V 0.073 -64 M 0.083 -65 K 0.097 -66 R 0.116 -67 R 0.139 -68 S 0.164 -69 G 0.185 -70 Q 0.190 -71 R 0.180 -72 K 0.173 -73 P 0.178 -74 A 0.184 -75 T 0.177 -76 S 0.158 -77 Y 0.135 -78 V 0.118 -79 R 0.109 -80 T 0.106 -81 T 0.102 -82 I 0.096 -83 N 0.088 -84 K 0.081 -85 N 0.079 -86 A 0.078 -87 R 0.077 -88 A 0.076 -89 T 0.079 -90 L 0.086 -91 S 0.092 -92 S 0.093 -93 I 0.091 -94 R 0.088 -95 H 0.084 -96 M 0.078 -97 I 0.075 -98 R 0.080 -99 K 0.088 -100 N 0.090 -101 K 0.086 -102 Y 0.079 -103 R 0.070 -104 P 0.063 -105 D 0.062 -106 L 0.061 -107 R 0.056 -108 M 0.050 -109 A 0.051 -110 A 0.059 -111 I 0.070 -112 R 0.077 -113 R 0.075 -114 A 0.072 -115 S 0.072 -116 A 0.074 -117 I 0.078 -118 L 0.088 -119 R 0.107 -120 S 0.139 -121 Q 0.193 -122 K 0.266 -123 P 0.336 -124 V 0.384 -125 V 0.408 -126 V 0.420 -127 K 0.428 -128 R 0.440 -129 K 0.458 -130 R 0.480 -131 T 0.504 -132 R 0.534 -133 P 0.567 -134 T 0.587 -135 K 0.576 -136 S 0.536 -137 S 0.497 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030432.13_ENSMUST00000032597.12_GN:Rpl28_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:28.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030432.13_ENSMUST00000032597.12_GN:Rpl28_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:28.caid deleted file mode 100644 index 62ac1fe2afe7072ed8238ccc8b8473ea2f149a2a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030432.13_ENSMUST00000032597.12_GN:Rpl28_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:28.caid +++ /dev/null @@ -1,166 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030432.13|ENSMUST00000032597.12|GN:Rpl28|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:28 -1 M 0.377 -2 R 0.386 -3 C 0.396 -4 H 0.400 -5 F 0.403 -6 K 0.428 -7 G 0.482 -8 V 0.532 -9 V 0.559 -10 P 0.571 -11 P 0.572 -12 L 0.546 -13 V 0.493 -14 S 0.447 -15 L 0.447 -16 F 0.488 -17 P 0.539 -18 S 0.589 -19 P 0.635 -20 A 0.669 -21 A 0.683 -22 I 0.681 -23 G 0.675 -24 R 0.672 -25 G 0.664 -26 A 0.634 -27 A 0.569 -28 A 0.472 -29 M 0.365 -30 S 0.273 -31 A 0.209 -32 H 0.173 -33 L 0.158 -34 Q 0.145 -35 W 0.127 -36 M 0.114 -37 V 0.114 -38 V 0.118 -39 R 0.123 -40 N 0.134 -41 C 0.153 -42 S 0.170 -43 S 0.179 -44 F 0.180 -45 L 0.174 -46 I 0.164 -47 K 0.150 -48 R 0.138 -49 N 0.136 -50 K 0.147 -51 Q 0.162 -52 T 0.178 -53 Y 0.200 -54 S 0.236 -55 T 0.282 -56 E 0.314 -57 P 0.311 -58 N 0.289 -59 N 0.284 -60 L 0.310 -61 K 0.344 -62 A 0.360 -63 R 0.350 -64 N 0.326 -65 S 0.311 -66 F 0.322 -67 R 0.360 -68 Y 0.404 -69 N 0.428 -70 G 0.424 -71 L 0.396 -72 I 0.352 -73 H 0.299 -74 R 0.240 -75 K 0.182 -76 T 0.131 -77 V 0.097 -78 G 0.082 -79 V 0.085 -80 E 0.095 -81 P 0.101 -82 A 0.103 -83 A 0.107 -84 D 0.115 -85 G 0.120 -86 K 0.116 -87 G 0.102 -88 V 0.084 -89 V 0.072 -90 V 0.069 -91 V 0.075 -92 M 0.084 -93 K 0.098 -94 R 0.115 -95 R 0.137 -96 S 0.161 -97 G 0.181 -98 Q 0.186 -99 R 0.175 -100 K 0.166 -101 P 0.170 -102 A 0.177 -103 T 0.172 -104 S 0.156 -105 Y 0.138 -106 V 0.123 -107 R 0.114 -108 T 0.109 -109 T 0.103 -110 I 0.095 -111 N 0.087 -112 K 0.080 -113 N 0.078 -114 A 0.078 -115 R 0.076 -116 A 0.075 -117 T 0.078 -118 L 0.085 -119 S 0.091 -120 S 0.092 -121 I 0.089 -122 R 0.087 -123 H 0.084 -124 M 0.079 -125 I 0.077 -126 R 0.082 -127 K 0.089 -128 N 0.092 -129 K 0.088 -130 Y 0.080 -131 R 0.070 -132 P 0.064 -133 D 0.063 -134 L 0.062 -135 R 0.057 -136 M 0.051 -137 A 0.051 -138 A 0.059 -139 I 0.071 -140 R 0.077 -141 R 0.076 -142 A 0.072 -143 S 0.072 -144 A 0.074 -145 I 0.078 -146 L 0.089 -147 R 0.107 -148 S 0.139 -149 Q 0.194 -150 K 0.267 -151 P 0.337 -152 V 0.385 -153 V 0.410 -154 V 0.421 -155 K 0.430 -156 R 0.444 -157 K 0.464 -158 R 0.488 -159 T 0.512 -160 R 0.542 -161 P 0.575 -162 T 0.595 -163 K 0.585 -164 S 0.545 -165 S 0.505 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030681.19_ENSMUST00000165096.10_GN:Mvp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030681.19_ENSMUST00000165096.10_GN:Mvp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 5e9bf2cfed13ab5f43b40cdd6ef326b718805885..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030681.19_ENSMUST00000165096.10_GN:Mvp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,862 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030681.19|ENSMUST00000165096.10|GN:Mvp|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.395 -2 A 0.394 -3 T 0.378 -4 E 0.336 -5 E 0.271 -6 A 0.206 -7 I 0.168 -8 I 0.165 -9 R 0.181 -10 I 0.194 -11 P 0.190 -12 P 0.168 -13 Y 0.135 -14 H 0.107 -15 Y 0.093 -16 I 0.096 -17 H 0.111 -18 V 0.123 -19 L 0.126 -20 D 0.121 -21 Q 0.119 -22 N 0.122 -23 S 0.124 -24 N 0.124 -25 V 0.124 -26 S 0.124 -27 R 0.124 -28 V 0.125 -29 E 0.126 -30 V 0.122 -31 G 0.111 -32 P 0.097 -33 K 0.091 -34 T 0.097 -35 Y 0.113 -36 I 0.129 -37 R 0.138 -38 Q 0.139 -39 D 0.132 -40 N 0.120 -41 E 0.106 -42 R 0.096 -43 V 0.097 -44 L 0.111 -45 F 0.132 -46 A 0.153 -47 P 0.167 -48 V 0.178 -49 R 0.187 -50 M 0.193 -51 V 0.196 -52 T 0.199 -53 V 0.199 -54 P 0.188 -55 P 0.168 -56 R 0.145 -57 H 0.131 -58 Y 0.131 -59 C 0.149 -60 I 0.184 -61 V 0.228 -62 A 0.266 -63 N 0.285 -64 P 0.285 -65 V 0.277 -66 S 0.273 -67 R 0.275 -68 D 0.278 -69 A 0.279 -70 Q 0.281 -71 S 0.291 -72 S 0.310 -73 V 0.328 -74 L 0.342 -75 F 0.355 -76 D 0.361 -77 V 0.352 -78 T 0.338 -79 G 0.339 -80 Q 0.352 -81 V 0.353 -82 R 0.331 -83 L 0.292 -84 R 0.254 -85 H 0.225 -86 A 0.206 -87 D 0.195 -88 Q 0.184 -89 E 0.171 -90 I 0.158 -91 R 0.150 -92 L 0.146 -93 A 0.139 -94 Q 0.128 -95 D 0.118 -96 P 0.115 -97 F 0.120 -98 P 0.133 -99 L 0.145 -100 Y 0.154 -101 P 0.157 -102 G 0.151 -103 E 0.138 -104 L 0.122 -105 L 0.111 -106 E 0.114 -107 K 0.130 -108 D 0.147 -109 I 0.157 -110 T 0.159 -111 P 0.158 -112 L 0.158 -113 Q 0.160 -114 V 0.167 -115 V 0.174 -116 L 0.176 -117 P 0.173 -118 N 0.161 -119 T 0.143 -120 A 0.125 -121 L 0.115 -122 H 0.116 -123 L 0.127 -124 K 0.143 -125 A 0.158 -126 L 0.167 -127 L 0.168 -128 D 0.162 -129 F 0.159 -130 E 0.162 -131 D 0.171 -132 K 0.189 -133 N 0.218 -134 G 0.248 -135 D 0.263 -136 K 0.256 -137 V 0.237 -138 M 0.219 -139 A 0.210 -140 G 0.207 -141 D 0.201 -142 E 0.186 -143 W 0.163 -144 L 0.143 -145 F 0.138 -146 E 0.142 -147 G 0.144 -148 P 0.147 -149 G 0.155 -150 T 0.161 -151 Y 0.162 -152 I 0.161 -153 P 0.157 -154 Q 0.145 -155 K 0.125 -156 E 0.104 -157 V 0.091 -158 E 0.091 -159 V 0.103 -160 V 0.122 -161 E 0.145 -162 I 0.167 -163 I 0.185 -164 Q 0.191 -165 A 0.185 -166 T 0.173 -167 V 0.160 -168 I 0.149 -169 K 0.139 -170 Q 0.129 -171 N 0.118 -172 Q 0.108 -173 A 0.098 -174 L 0.091 -175 R 0.090 -176 L 0.100 -177 R 0.118 -178 A 0.137 -179 R 0.148 -180 K 0.149 -181 E 0.145 -182 C 0.141 -183 F 0.138 -184 D 0.138 -185 R 0.146 -186 D 0.165 -187 G 0.188 -188 K 0.201 -189 E 0.197 -190 R 0.186 -191 V 0.178 -192 T 0.175 -193 G 0.174 -194 E 0.171 -195 E 0.161 -196 W 0.145 -197 L 0.129 -198 V 0.122 -199 R 0.122 -200 S 0.127 -201 V 0.137 -202 G 0.147 -203 A 0.150 -204 Y 0.148 -205 L 0.149 -206 P 0.149 -207 A 0.140 -208 V 0.119 -209 F 0.096 -210 E 0.086 -211 E 0.092 -212 V 0.111 -213 L 0.137 -214 D 0.160 -215 L 0.174 -216 V 0.177 -217 D 0.171 -218 A 0.158 -219 V 0.143 -220 I 0.130 -221 L 0.118 -222 T 0.105 -223 E 0.092 -224 K 0.085 -225 T 0.084 -226 A 0.084 -227 L 0.086 -228 H 0.091 -229 L 0.101 -230 R 0.116 -231 A 0.130 -232 R 0.136 -233 Q 0.132 -234 N 0.123 -235 F 0.114 -236 K 0.110 -237 D 0.113 -238 L 0.125 -239 R 0.144 -240 G 0.164 -241 V 0.173 -242 A 0.166 -243 H 0.152 -244 R 0.145 -245 T 0.146 -246 G 0.151 -247 E 0.151 -248 E 0.144 -249 W 0.129 -250 L 0.112 -251 V 0.100 -252 T 0.093 -253 V 0.093 -254 Q 0.098 -255 D 0.108 -256 T 0.120 -257 E 0.132 -258 A 0.141 -259 H 0.146 -260 V 0.149 -261 P 0.145 -262 D 0.130 -263 V 0.106 -264 Y 0.087 -265 E 0.078 -266 E 0.081 -267 V 0.091 -268 L 0.103 -269 G 0.112 -270 V 0.116 -271 V 0.118 -272 P 0.120 -273 I 0.126 -274 T 0.138 -275 T 0.156 -276 L 0.177 -277 G 0.183 -278 P 0.164 -279 R 0.131 -280 H 0.101 -281 Y 0.090 -282 C 0.102 -283 V 0.130 -284 I 0.163 -285 L 0.191 -286 D 0.210 -287 P 0.224 -288 M 0.226 -289 G 0.215 -290 P 0.200 -291 D 0.199 -292 G 0.214 -293 K 0.231 -294 N 0.232 -295 Q 0.218 -296 L 0.202 -297 G 0.189 -298 Q 0.177 -299 K 0.163 -300 R 0.148 -301 V 0.139 -302 V 0.137 -303 K 0.134 -304 G 0.123 -305 E 0.111 -306 K 0.108 -307 S 0.113 -308 F 0.119 -309 F 0.125 -310 L 0.130 -311 Q 0.132 -312 P 0.130 -313 G 0.126 -314 E 0.121 -315 R 0.116 -316 L 0.110 -317 E 0.107 -318 R 0.112 -319 G 0.122 -320 I 0.135 -321 Q 0.147 -322 D 0.154 -323 V 0.154 -324 Y 0.151 -325 V 0.152 -326 L 0.155 -327 S 0.153 -328 E 0.143 -329 Q 0.127 -330 Q 0.111 -331 G 0.099 -332 L 0.093 -333 L 0.097 -334 L 0.112 -335 K 0.136 -336 A 0.162 -337 L 0.189 -338 Q 0.211 -339 P 0.226 -340 L 0.242 -341 E 0.280 -342 E 0.335 -343 G 0.383 -344 E 0.403 -345 G 0.400 -346 E 0.391 -347 E 0.375 -348 K 0.351 -349 V 0.322 -350 A 0.290 -351 H 0.257 -352 Q 0.230 -353 A 0.217 -354 G 0.217 -355 D 0.217 -356 R 0.204 -357 W 0.183 -358 L 0.168 -359 I 0.162 -360 R 0.150 -361 G 0.131 -362 P 0.121 -363 L 0.129 -364 E 0.146 -365 Y 0.156 -366 V 0.159 -367 P 0.157 -368 S 0.149 -369 A 0.132 -370 K 0.109 -371 V 0.090 -372 E 0.084 -373 V 0.093 -374 V 0.112 -375 E 0.134 -376 E 0.158 -377 R 0.184 -378 Q 0.209 -379 A 0.226 -380 I 0.232 -381 P 0.226 -382 L 0.209 -383 D 0.187 -384 Q 0.166 -385 N 0.147 -386 E 0.133 -387 G 0.123 -388 I 0.119 -389 Y 0.121 -390 V 0.126 -391 Q 0.123 -392 D 0.113 -393 V 0.104 -394 K 0.107 -395 T 0.119 -396 G 0.132 -397 K 0.139 -398 V 0.138 -399 R 0.137 -400 A 0.140 -401 V 0.143 -402 I 0.141 -403 G 0.134 -404 S 0.129 -405 T 0.130 -406 Y 0.134 -407 M 0.135 -408 L 0.129 -409 T 0.120 -410 Q 0.109 -411 D 0.101 -412 E 0.094 -413 V 0.090 -414 L 0.091 -415 W 0.101 -416 E 0.119 -417 K 0.137 -418 E 0.146 -419 L 0.142 -420 P 0.133 -421 S 0.121 -422 G 0.110 -423 V 0.102 -424 E 0.103 -425 E 0.115 -426 L 0.141 -427 L 0.180 -428 N 0.229 -429 L 0.282 -430 G 0.331 -431 H 0.365 -432 D 0.385 -433 P 0.410 -434 L 0.449 -435 A 0.491 -436 D 0.519 -437 R 0.534 -438 G 0.546 -439 Q 0.562 -440 K 0.577 -441 G 0.588 -442 T 0.587 -443 A 0.578 -444 K 0.562 -445 V 0.545 -446 L 0.534 -447 Q 0.532 -448 P 0.539 -449 S 0.536 -450 A 0.503 -451 A 0.435 -452 R 0.355 -453 N 0.286 -454 K 0.240 -455 T 0.226 -456 R 0.247 -457 V 0.273 -458 V 0.270 -459 S 0.236 -460 Y 0.205 -461 R 0.196 -462 V 0.203 -463 P 0.211 -464 H 0.210 -465 N 0.198 -466 A 0.181 -467 A 0.171 -468 V 0.174 -469 Q 0.183 -470 V 0.185 -471 Y 0.170 -472 D 0.145 -473 Y 0.127 -474 R 0.124 -475 A 0.136 -476 K 0.155 -477 R 0.172 -478 A 0.180 -479 R 0.183 -480 V 0.184 -481 V 0.177 -482 F 0.159 -483 G 0.139 -484 P 0.135 -485 E 0.150 -486 L 0.171 -487 V 0.180 -488 S 0.175 -489 L 0.166 -490 D 0.159 -491 P 0.151 -492 E 0.142 -493 E 0.132 -494 Q 0.124 -495 F 0.117 -496 T 0.113 -497 V 0.113 -498 L 0.114 -499 S 0.121 -500 L 0.137 -501 S 0.153 -502 A 0.156 -503 G 0.146 -504 R 0.139 -505 P 0.148 -506 K 0.168 -507 R 0.186 -508 P 0.192 -509 H 0.192 -510 A 0.199 -511 R 0.219 -512 R 0.243 -513 A 0.258 -514 L 0.260 -515 C 0.261 -516 L 0.261 -517 L 0.249 -518 L 0.224 -519 G 0.204 -520 P 0.197 -521 D 0.193 -522 F 0.180 -523 F 0.159 -524 T 0.137 -525 D 0.117 -526 V 0.099 -527 I 0.083 -528 T 0.074 -529 I 0.074 -530 E 0.088 -531 T 0.108 -532 A 0.126 -533 D 0.132 -534 H 0.131 -535 A 0.125 -536 R 0.116 -537 L 0.106 -538 Q 0.096 -539 L 0.088 -540 Q 0.081 -541 L 0.074 -542 A 0.068 -543 Y 0.064 -544 N 0.062 -545 W 0.066 -546 H 0.076 -547 F 0.093 -548 E 0.115 -549 L 0.137 -550 K 0.158 -551 N 0.176 -552 R 0.192 -553 N 0.203 -554 D 0.209 -555 P 0.206 -556 E 0.198 -557 E 0.192 -558 T 0.187 -559 A 0.175 -560 K 0.162 -561 L 0.158 -562 F 0.158 -563 S 0.156 -564 V 0.149 -565 P 0.139 -566 D 0.125 -567 F 0.109 -568 V 0.097 -569 G 0.091 -570 D 0.090 -571 A 0.089 -572 C 0.085 -573 K 0.082 -574 A 0.082 -575 I 0.083 -576 A 0.083 -577 S 0.082 -578 R 0.086 -579 V 0.097 -580 R 0.110 -581 G 0.118 -582 A 0.121 -583 V 0.124 -584 A 0.126 -585 S 0.120 -586 V 0.105 -587 T 0.086 -588 F 0.070 -589 D 0.058 -590 D 0.051 -591 F 0.047 -592 H 0.044 -593 K 0.043 -594 N 0.045 -595 S 0.047 -596 A 0.049 -597 R 0.050 -598 I 0.052 -599 I 0.055 -600 R 0.062 -601 M 0.075 -602 A 0.098 -603 V 0.131 -604 F 0.178 -605 G 0.239 -606 F 0.301 -607 E 0.347 -608 M 0.371 -609 S 0.385 -610 E 0.401 -611 D 0.415 -612 A 0.417 -613 G 0.409 -614 P 0.406 -615 D 0.409 -616 G 0.405 -617 A 0.394 -618 L 0.381 -619 L 0.369 -620 P 0.356 -621 R 0.337 -622 A 0.311 -623 R 0.279 -624 D 0.248 -625 R 0.219 -626 A 0.193 -627 V 0.169 -628 F 0.154 -629 P 0.146 -630 Q 0.141 -631 N 0.135 -632 G 0.130 -633 L 0.127 -634 V 0.127 -635 V 0.129 -636 S 0.132 -637 S 0.132 -638 V 0.129 -639 D 0.123 -640 V 0.117 -641 Q 0.117 -642 S 0.121 -643 V 0.130 -644 E 0.139 -645 P 0.146 -646 V 0.148 -647 D 0.151 -648 Q 0.161 -649 R 0.175 -650 T 0.187 -651 R 0.197 -652 D 0.213 -653 A 0.233 -654 L 0.246 -655 Q 0.256 -656 R 0.274 -657 S 0.311 -658 V 0.361 -659 Q 0.400 -660 L 0.409 -661 A 0.394 -662 I 0.374 -663 E 0.369 -664 I 0.377 -665 T 0.390 -666 T 0.408 -667 N 0.429 -668 S 0.444 -669 Q 0.443 -670 E 0.438 -671 A 0.440 -672 A 0.443 -673 A 0.437 -674 K 0.428 -675 H 0.426 -676 E 0.424 -677 A 0.406 -678 Q 0.384 -679 R 0.380 -680 L 0.382 -681 E 0.374 -682 Q 0.375 -683 E 0.400 -684 A 0.434 -685 R 0.456 -686 G 0.459 -687 R 0.432 -688 L 0.386 -689 E 0.356 -690 R 0.364 -691 Q 0.390 -692 K 0.406 -693 I 0.407 -694 L 0.397 -695 D 0.383 -696 Q 0.378 -697 S 0.389 -698 E 0.408 -699 A 0.418 -700 E 0.420 -701 K 0.429 -702 A 0.442 -703 R 0.444 -704 K 0.443 -705 E 0.466 -706 L 0.498 -707 L 0.504 -708 E 0.490 -709 L 0.477 -710 E 0.475 -711 A 0.476 -712 M 0.479 -713 S 0.482 -714 M 0.481 -715 A 0.472 -716 V 0.459 -717 E 0.454 -718 S 0.458 -719 T 0.474 -720 G 0.507 -721 N 0.549 -722 A 0.578 -723 K 0.581 -724 A 0.567 -725 E 0.544 -726 A 0.512 -727 E 0.475 -728 S 0.454 -729 R 0.451 -730 A 0.449 -731 E 0.455 -732 A 0.487 -733 A 0.528 -734 R 0.559 -735 I 0.578 -736 E 0.588 -737 G 0.594 -738 E 0.596 -739 G 0.586 -740 S 0.553 -741 V 0.506 -742 L 0.472 -743 Q 0.463 -744 A 0.462 -745 K 0.456 -746 L 0.447 -747 K 0.436 -748 A 0.426 -749 Q 0.441 -750 A 0.493 -751 L 0.549 -752 A 0.569 -753 I 0.550 -754 E 0.516 -755 T 0.486 -756 E 0.463 -757 A 0.440 -758 E 0.409 -759 L 0.370 -760 E 0.335 -761 R 0.314 -762 V 0.310 -763 K 0.318 -764 K 0.334 -765 V 0.348 -766 R 0.361 -767 E 0.375 -768 M 0.384 -769 E 0.374 -770 L 0.352 -771 I 0.336 -772 Y 0.336 -773 S 0.343 -774 R 0.347 -775 A 0.350 -776 Q 0.358 -777 L 0.360 -778 E 0.349 -779 L 0.331 -780 E 0.309 -781 V 0.286 -782 S 0.286 -783 K 0.323 -784 A 0.381 -785 Q 0.429 -786 Q 0.453 -787 L 0.452 -788 A 0.439 -789 D 0.424 -790 V 0.410 -791 E 0.383 -792 A 0.348 -793 K 0.331 -794 K 0.345 -795 F 0.370 -796 K 0.384 -797 E 0.387 -798 M 0.383 -799 T 0.378 -800 E 0.386 -801 A 0.398 -802 L 0.393 -803 G 0.371 -804 P 0.358 -805 G 0.364 -806 T 0.386 -807 I 0.415 -808 R 0.438 -809 D 0.446 -810 L 0.444 -811 A 0.431 -812 V 0.401 -813 A 0.366 -814 G 0.350 -815 P 0.351 -816 E 0.351 -817 M 0.338 -818 Q 0.313 -819 V 0.286 -820 K 0.279 -821 L 0.298 -822 L 0.325 -823 Q 0.349 -824 S 0.378 -825 L 0.413 -826 G 0.436 -827 L 0.443 -828 K 0.454 -829 S 0.473 -830 T 0.493 -831 L 0.519 -832 I 0.558 -833 T 0.603 -834 D 0.634 -835 G 0.643 -836 S 0.632 -837 S 0.608 -838 P 0.577 -839 I 0.536 -840 N 0.479 -841 L 0.404 -842 F 0.333 -843 N 0.287 -844 T 0.268 -845 A 0.272 -846 F 0.303 -847 G 0.365 -848 L 0.446 -849 L 0.533 -850 G 0.610 -851 L 0.667 -852 G 0.699 -853 S 0.707 -854 D 0.702 -855 G 0.689 -856 Q 0.681 -857 P 0.687 -858 P 0.707 -859 V 0.724 -860 Q 0.730 -861 K 0.729 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030681.19_ENSMUST00000165096.10_GN:Mvp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030681.19_ENSMUST00000165096.10_GN:Mvp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid deleted file mode 100644 index 91e69c12212025b80defce6a5936707f93e997b0..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030681.19_ENSMUST00000165096.10_GN:Mvp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid +++ /dev/null @@ -1,871 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030681.19|ENSMUST00000165096.10|GN:Mvp|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:9 -1 M 0.364 -2 L 0.363 -3 G 0.361 -4 R 0.365 -5 G 0.372 -6 L 0.373 -7 G 0.380 -8 F 0.409 -9 T 0.441 -10 M 0.455 -11 A 0.448 -12 T 0.418 -13 E 0.357 -14 E 0.276 -15 A 0.205 -16 I 0.170 -17 I 0.170 -18 R 0.184 -19 I 0.194 -20 P 0.187 -21 P 0.164 -22 Y 0.133 -23 H 0.106 -24 Y 0.092 -25 I 0.095 -26 H 0.107 -27 V 0.118 -28 L 0.120 -29 D 0.116 -30 Q 0.116 -31 N 0.121 -32 S 0.125 -33 N 0.125 -34 V 0.125 -35 S 0.125 -36 R 0.124 -37 V 0.124 -38 E 0.124 -39 V 0.120 -40 G 0.109 -41 P 0.096 -42 K 0.091 -43 T 0.098 -44 Y 0.115 -45 I 0.132 -46 R 0.141 -47 Q 0.142 -48 D 0.135 -49 N 0.120 -50 E 0.105 -51 R 0.095 -52 V 0.096 -53 L 0.108 -54 F 0.128 -55 A 0.146 -56 P 0.160 -57 V 0.171 -58 R 0.181 -59 M 0.189 -60 V 0.193 -61 T 0.198 -62 V 0.198 -63 P 0.187 -64 P 0.166 -65 R 0.143 -66 H 0.129 -67 Y 0.128 -68 C 0.146 -69 I 0.179 -70 V 0.221 -71 A 0.256 -72 N 0.274 -73 P 0.275 -74 V 0.268 -75 S 0.264 -76 R 0.265 -77 D 0.267 -78 A 0.268 -79 Q 0.271 -80 S 0.283 -81 S 0.304 -82 V 0.323 -83 L 0.337 -84 F 0.350 -85 D 0.355 -86 V 0.344 -87 T 0.329 -88 G 0.327 -89 Q 0.338 -90 V 0.340 -91 R 0.321 -92 L 0.286 -93 R 0.250 -94 H 0.223 -95 A 0.206 -96 D 0.195 -97 Q 0.184 -98 E 0.169 -99 I 0.154 -100 R 0.147 -101 L 0.144 -102 A 0.137 -103 Q 0.128 -104 D 0.120 -105 P 0.117 -106 F 0.121 -107 P 0.133 -108 L 0.145 -109 Y 0.153 -110 P 0.156 -111 G 0.152 -112 E 0.140 -113 L 0.125 -114 L 0.115 -115 E 0.117 -116 K 0.132 -117 D 0.150 -118 I 0.161 -119 T 0.164 -120 P 0.163 -121 L 0.163 -122 Q 0.166 -123 V 0.173 -124 V 0.179 -125 L 0.180 -126 P 0.175 -127 N 0.162 -128 T 0.143 -129 A 0.124 -130 L 0.113 -131 H 0.113 -132 L 0.124 -133 K 0.141 -134 A 0.158 -135 L 0.168 -136 L 0.170 -137 D 0.165 -138 F 0.161 -139 E 0.164 -140 D 0.172 -141 K 0.189 -142 N 0.218 -143 G 0.248 -144 D 0.264 -145 K 0.257 -146 V 0.237 -147 M 0.219 -148 A 0.210 -149 G 0.207 -150 D 0.202 -151 E 0.187 -152 W 0.162 -153 L 0.142 -154 F 0.137 -155 E 0.142 -156 G 0.145 -157 P 0.149 -158 G 0.157 -159 T 0.163 -160 Y 0.164 -161 I 0.162 -162 P 0.158 -163 Q 0.145 -164 K 0.124 -165 E 0.103 -166 V 0.089 -167 E 0.089 -168 V 0.101 -169 V 0.119 -170 E 0.140 -171 I 0.163 -172 I 0.181 -173 Q 0.187 -174 A 0.181 -175 T 0.170 -176 V 0.158 -177 I 0.147 -178 K 0.137 -179 Q 0.126 -180 N 0.116 -181 Q 0.106 -182 A 0.096 -183 L 0.089 -184 R 0.090 -185 L 0.100 -186 R 0.118 -187 A 0.137 -188 R 0.148 -189 K 0.149 -190 E 0.144 -191 C 0.139 -192 F 0.136 -193 D 0.137 -194 R 0.144 -195 D 0.163 -196 G 0.185 -197 K 0.197 -198 E 0.193 -199 R 0.181 -200 V 0.173 -201 T 0.171 -202 G 0.171 -203 E 0.167 -204 E 0.158 -205 W 0.141 -206 L 0.125 -207 V 0.117 -208 R 0.116 -209 S 0.122 -210 V 0.132 -211 G 0.142 -212 A 0.145 -213 Y 0.143 -214 L 0.143 -215 P 0.144 -216 A 0.135 -217 V 0.114 -218 F 0.092 -219 E 0.082 -220 E 0.089 -221 V 0.108 -222 L 0.134 -223 D 0.157 -224 L 0.170 -225 V 0.173 -226 D 0.167 -227 A 0.154 -228 V 0.139 -229 I 0.127 -230 L 0.115 -231 T 0.102 -232 E 0.091 -233 K 0.084 -234 T 0.083 -235 A 0.084 -236 L 0.086 -237 H 0.090 -238 L 0.100 -239 R 0.115 -240 A 0.129 -241 R 0.135 -242 Q 0.131 -243 N 0.122 -244 F 0.114 -245 K 0.111 -246 D 0.114 -247 L 0.126 -248 R 0.145 -249 G 0.164 -250 V 0.173 -251 A 0.167 -252 H 0.153 -253 R 0.146 -254 T 0.147 -255 G 0.151 -256 E 0.152 -257 E 0.145 -258 W 0.129 -259 L 0.112 -260 V 0.099 -261 T 0.093 -262 V 0.093 -263 Q 0.098 -264 D 0.108 -265 T 0.121 -266 E 0.133 -267 A 0.142 -268 H 0.147 -269 V 0.150 -270 P 0.147 -271 D 0.132 -272 V 0.108 -273 Y 0.088 -274 E 0.080 -275 E 0.082 -276 V 0.092 -277 L 0.104 -278 G 0.113 -279 V 0.119 -280 V 0.122 -281 P 0.125 -282 I 0.131 -283 T 0.143 -284 T 0.162 -285 L 0.183 -286 G 0.190 -287 P 0.171 -288 R 0.136 -289 H 0.105 -290 Y 0.092 -291 C 0.102 -292 V 0.130 -293 I 0.165 -294 L 0.194 -295 D 0.216 -296 P 0.231 -297 M 0.235 -298 G 0.224 -299 P 0.209 -300 D 0.207 -301 G 0.224 -302 K 0.242 -303 N 0.244 -304 Q 0.229 -305 L 0.211 -306 G 0.196 -307 Q 0.184 -308 K 0.170 -309 R 0.155 -310 V 0.145 -311 V 0.143 -312 K 0.139 -313 G 0.128 -314 E 0.116 -315 K 0.113 -316 S 0.118 -317 F 0.124 -318 F 0.129 -319 L 0.135 -320 Q 0.138 -321 P 0.136 -322 G 0.131 -323 E 0.125 -324 R 0.119 -325 L 0.113 -326 E 0.110 -327 R 0.113 -328 G 0.123 -329 I 0.136 -330 Q 0.149 -331 D 0.156 -332 V 0.156 -333 Y 0.153 -334 V 0.154 -335 L 0.156 -336 S 0.154 -337 E 0.143 -338 Q 0.128 -339 Q 0.113 -340 G 0.101 -341 L 0.095 -342 L 0.099 -343 L 0.114 -344 K 0.138 -345 A 0.165 -346 L 0.191 -347 Q 0.213 -348 P 0.227 -349 L 0.243 -350 E 0.279 -351 E 0.334 -352 G 0.382 -353 E 0.401 -354 G 0.399 -355 E 0.390 -356 E 0.374 -357 K 0.349 -358 V 0.319 -359 A 0.288 -360 H 0.254 -361 Q 0.226 -362 A 0.213 -363 G 0.212 -364 D 0.212 -365 R 0.200 -366 W 0.180 -367 L 0.167 -368 I 0.161 -369 R 0.149 -370 G 0.130 -371 P 0.119 -372 L 0.127 -373 E 0.143 -374 Y 0.153 -375 V 0.156 -376 P 0.154 -377 S 0.148 -378 A 0.131 -379 K 0.108 -380 V 0.089 -381 E 0.083 -382 V 0.093 -383 V 0.111 -384 E 0.133 -385 E 0.157 -386 R 0.183 -387 Q 0.208 -388 A 0.225 -389 I 0.231 -390 P 0.225 -391 L 0.208 -392 D 0.187 -393 Q 0.166 -394 N 0.148 -395 E 0.134 -396 G 0.124 -397 I 0.120 -398 Y 0.123 -399 V 0.128 -400 Q 0.125 -401 D 0.114 -402 V 0.106 -403 K 0.108 -404 T 0.120 -405 G 0.134 -406 K 0.140 -407 V 0.138 -408 R 0.136 -409 A 0.139 -410 V 0.142 -411 I 0.141 -412 G 0.134 -413 S 0.128 -414 T 0.129 -415 Y 0.133 -416 M 0.134 -417 L 0.129 -418 T 0.119 -419 Q 0.109 -420 D 0.101 -421 E 0.095 -422 V 0.090 -423 L 0.091 -424 W 0.101 -425 E 0.120 -426 K 0.138 -427 E 0.146 -428 L 0.143 -429 P 0.133 -430 S 0.121 -431 G 0.110 -432 V 0.102 -433 E 0.102 -434 E 0.115 -435 L 0.141 -436 L 0.181 -437 N 0.230 -438 L 0.284 -439 G 0.334 -440 H 0.367 -441 D 0.388 -442 P 0.412 -443 L 0.450 -444 A 0.493 -445 D 0.522 -446 R 0.537 -447 G 0.549 -448 Q 0.563 -449 K 0.579 -450 G 0.588 -451 T 0.588 -452 A 0.578 -453 K 0.563 -454 V 0.547 -455 L 0.536 -456 Q 0.535 -457 P 0.542 -458 S 0.540 -459 A 0.506 -460 A 0.439 -461 R 0.360 -462 N 0.291 -463 K 0.245 -464 T 0.231 -465 R 0.251 -466 V 0.277 -467 V 0.273 -468 S 0.239 -469 Y 0.208 -470 R 0.198 -471 V 0.204 -472 P 0.212 -473 H 0.210 -474 N 0.198 -475 A 0.182 -476 A 0.172 -477 V 0.175 -478 Q 0.185 -479 V 0.187 -480 Y 0.171 -481 D 0.146 -482 Y 0.128 -483 R 0.125 -484 A 0.137 -485 K 0.157 -486 R 0.174 -487 A 0.182 -488 R 0.186 -489 V 0.187 -490 V 0.179 -491 F 0.161 -492 G 0.141 -493 P 0.136 -494 E 0.153 -495 L 0.174 -496 V 0.183 -497 S 0.178 -498 L 0.169 -499 D 0.161 -500 P 0.153 -501 E 0.143 -502 E 0.134 -503 Q 0.126 -504 F 0.119 -505 T 0.115 -506 V 0.115 -507 L 0.116 -508 S 0.123 -509 L 0.139 -510 S 0.155 -511 A 0.157 -512 G 0.147 -513 R 0.140 -514 P 0.148 -515 K 0.168 -516 R 0.186 -517 P 0.192 -518 H 0.192 -519 A 0.199 -520 R 0.220 -521 R 0.245 -522 A 0.261 -523 L 0.264 -524 C 0.265 -525 L 0.265 -526 L 0.251 -527 L 0.226 -528 G 0.205 -529 P 0.197 -530 D 0.194 -531 F 0.181 -532 F 0.160 -533 T 0.138 -534 D 0.118 -535 V 0.100 -536 I 0.084 -537 T 0.075 -538 I 0.075 -539 E 0.088 -540 T 0.109 -541 A 0.126 -542 D 0.133 -543 H 0.131 -544 A 0.125 -545 R 0.117 -546 L 0.106 -547 Q 0.096 -548 L 0.088 -549 Q 0.082 -550 L 0.075 -551 A 0.069 -552 Y 0.064 -553 N 0.063 -554 W 0.066 -555 H 0.076 -556 F 0.093 -557 E 0.115 -558 L 0.138 -559 K 0.159 -560 N 0.177 -561 R 0.192 -562 N 0.204 -563 D 0.209 -564 P 0.206 -565 E 0.197 -566 E 0.192 -567 T 0.187 -568 A 0.175 -569 K 0.162 -570 L 0.158 -571 F 0.158 -572 S 0.156 -573 V 0.149 -574 P 0.139 -575 D 0.126 -576 F 0.110 -577 V 0.097 -578 G 0.092 -579 D 0.090 -580 A 0.089 -581 C 0.086 -582 K 0.083 -583 A 0.083 -584 I 0.084 -585 A 0.083 -586 S 0.083 -587 R 0.087 -588 V 0.098 -589 R 0.110 -590 G 0.119 -591 A 0.122 -592 V 0.125 -593 A 0.126 -594 S 0.121 -595 V 0.106 -596 T 0.087 -597 F 0.070 -598 D 0.059 -599 D 0.052 -600 F 0.047 -601 H 0.044 -602 K 0.044 -603 N 0.046 -604 S 0.048 -605 A 0.049 -606 R 0.050 -607 I 0.052 -608 I 0.055 -609 R 0.062 -610 M 0.076 -611 A 0.099 -612 V 0.132 -613 F 0.180 -614 G 0.241 -615 F 0.303 -616 E 0.349 -617 M 0.372 -618 S 0.386 -619 E 0.402 -620 D 0.416 -621 A 0.418 -622 G 0.410 -623 P 0.407 -624 D 0.410 -625 G 0.406 -626 A 0.394 -627 L 0.381 -628 L 0.370 -629 P 0.357 -630 R 0.339 -631 A 0.312 -632 R 0.281 -633 D 0.249 -634 R 0.221 -635 A 0.194 -636 V 0.170 -637 F 0.155 -638 P 0.147 -639 Q 0.142 -640 N 0.136 -641 G 0.131 -642 L 0.128 -643 V 0.128 -644 V 0.130 -645 S 0.133 -646 S 0.133 -647 V 0.130 -648 D 0.123 -649 V 0.118 -650 Q 0.117 -651 S 0.122 -652 V 0.130 -653 E 0.140 -654 P 0.146 -655 V 0.149 -656 D 0.152 -657 Q 0.162 -658 R 0.177 -659 T 0.188 -660 R 0.198 -661 D 0.214 -662 A 0.234 -663 L 0.248 -664 Q 0.257 -665 R 0.275 -666 S 0.312 -667 V 0.362 -668 Q 0.402 -669 L 0.412 -670 A 0.396 -671 I 0.377 -672 E 0.371 -673 I 0.379 -674 T 0.392 -675 T 0.409 -676 N 0.430 -677 S 0.445 -678 Q 0.444 -679 E 0.439 -680 A 0.441 -681 A 0.445 -682 A 0.439 -683 K 0.430 -684 H 0.428 -685 E 0.426 -686 A 0.407 -687 Q 0.384 -688 R 0.380 -689 L 0.383 -690 E 0.375 -691 Q 0.376 -692 E 0.401 -693 A 0.435 -694 R 0.458 -695 G 0.460 -696 R 0.433 -697 L 0.387 -698 E 0.357 -699 R 0.364 -700 Q 0.390 -701 K 0.407 -702 I 0.407 -703 L 0.397 -704 D 0.384 -705 Q 0.378 -706 S 0.390 -707 E 0.409 -708 A 0.419 -709 E 0.421 -710 K 0.430 -711 A 0.444 -712 R 0.445 -713 K 0.445 -714 E 0.468 -715 L 0.500 -716 L 0.508 -717 E 0.493 -718 L 0.481 -719 E 0.477 -720 A 0.478 -721 M 0.480 -722 S 0.482 -723 M 0.481 -724 A 0.472 -725 V 0.460 -726 E 0.455 -727 S 0.460 -728 T 0.476 -729 G 0.509 -730 N 0.550 -731 A 0.579 -732 K 0.582 -733 A 0.567 -734 E 0.544 -735 A 0.512 -736 E 0.475 -737 S 0.454 -738 R 0.451 -739 A 0.449 -740 E 0.455 -741 A 0.487 -742 A 0.529 -743 R 0.560 -744 I 0.579 -745 E 0.589 -746 G 0.595 -747 E 0.597 -748 G 0.588 -749 S 0.556 -750 V 0.509 -751 L 0.476 -752 Q 0.466 -753 A 0.465 -754 K 0.459 -755 L 0.449 -756 K 0.438 -757 A 0.427 -758 Q 0.441 -759 A 0.493 -760 L 0.549 -761 A 0.569 -762 I 0.549 -763 E 0.515 -764 T 0.484 -765 E 0.462 -766 A 0.440 -767 E 0.409 -768 L 0.370 -769 E 0.335 -770 R 0.315 -771 V 0.311 -772 K 0.320 -773 K 0.336 -774 V 0.350 -775 R 0.362 -776 E 0.377 -777 M 0.385 -778 E 0.375 -779 L 0.353 -780 I 0.336 -781 Y 0.336 -782 S 0.344 -783 R 0.348 -784 A 0.352 -785 Q 0.361 -786 L 0.363 -787 E 0.351 -788 L 0.333 -789 E 0.310 -790 V 0.287 -791 S 0.286 -792 K 0.323 -793 A 0.382 -794 Q 0.431 -795 Q 0.455 -796 L 0.454 -797 A 0.440 -798 D 0.426 -799 V 0.411 -800 E 0.384 -801 A 0.349 -802 K 0.331 -803 K 0.345 -804 F 0.370 -805 K 0.384 -806 E 0.387 -807 M 0.383 -808 T 0.379 -809 E 0.386 -810 A 0.399 -811 L 0.394 -812 G 0.372 -813 P 0.358 -814 G 0.364 -815 T 0.385 -816 I 0.414 -817 R 0.437 -818 D 0.447 -819 L 0.445 -820 A 0.433 -821 V 0.403 -822 A 0.368 -823 G 0.351 -824 P 0.352 -825 E 0.352 -826 M 0.339 -827 Q 0.313 -828 V 0.287 -829 K 0.279 -830 L 0.298 -831 L 0.325 -832 Q 0.349 -833 S 0.378 -834 L 0.413 -835 G 0.436 -836 L 0.443 -837 K 0.454 -838 S 0.474 -839 T 0.494 -840 L 0.520 -841 I 0.560 -842 T 0.605 -843 D 0.637 -844 G 0.645 -845 S 0.634 -846 S 0.610 -847 P 0.578 -848 I 0.538 -849 N 0.480 -850 L 0.405 -851 F 0.334 -852 N 0.288 -853 T 0.269 -854 A 0.273 -855 F 0.305 -856 G 0.366 -857 L 0.448 -858 L 0.534 -859 G 0.612 -860 L 0.669 -861 G 0.700 -862 S 0.708 -863 D 0.703 -864 G 0.690 -865 Q 0.682 -866 P 0.688 -867 P 0.707 -868 V 0.725 -869 Q 0.731 -870 K 0.729 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030750.14_ENSMUST00000033006.15_GN:Nsmce1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030750.14_ENSMUST00000033006.15_GN:Nsmce1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 0eb15116cfad6adb98a1df3fb0197b370e96ed25..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030750.14_ENSMUST00000033006.15_GN:Nsmce1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,267 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030750.14|ENSMUST00000033006.15|GN:Nsmce1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.502 -2 Q 0.521 -3 G 0.553 -4 S 0.584 -5 T 0.599 -6 R 0.596 -7 R 0.576 -8 A 0.526 -9 G 0.437 -10 A 0.320 -11 M 0.205 -12 T 0.116 -13 D 0.062 -14 V 0.036 -15 H 0.026 -16 R 0.022 -17 R 0.021 -18 F 0.023 -19 L 0.027 -20 Q 0.032 -21 L 0.038 -22 L 0.046 -23 M 0.053 -24 T 0.054 -25 H 0.051 -26 G 0.046 -27 V 0.041 -28 L 0.036 -29 E 0.030 -30 E 0.026 -31 W 0.026 -32 E 0.032 -33 V 0.043 -34 R 0.058 -35 R 0.067 -36 L 0.063 -37 Q 0.050 -38 N 0.040 -39 H 0.038 -40 C 0.040 -41 Y 0.045 -42 Q 0.053 -43 V 0.068 -44 H 0.087 -45 D 0.107 -46 R 0.125 -47 N 0.136 -48 A 0.140 -49 T 0.135 -50 V 0.119 -51 D 0.091 -52 K 0.062 -53 L 0.042 -54 E 0.034 -55 D 0.037 -56 F 0.048 -57 I 0.063 -58 N 0.076 -59 N 0.082 -60 I 0.087 -61 N 0.092 -62 S 0.092 -63 V 0.084 -64 L 0.077 -65 E 0.075 -66 S 0.074 -67 L 0.069 -68 Y 0.061 -69 I 0.053 -70 E 0.049 -71 I 0.051 -72 K 0.060 -73 K 0.077 -74 G 0.093 -75 V 0.103 -76 T 0.106 -77 E 0.102 -78 D 0.096 -79 D 0.091 -80 G 0.090 -81 R 0.085 -82 P 0.074 -83 I 0.058 -84 Y 0.049 -85 A 0.052 -86 L 0.069 -87 V 0.096 -88 N 0.128 -89 L 0.156 -90 A 0.173 -91 T 0.181 -92 T 0.184 -93 S 0.184 -94 V 0.180 -95 S 0.172 -96 K 0.163 -97 M 0.149 -98 A 0.132 -99 T 0.115 -100 D 0.101 -101 F 0.093 -102 A 0.084 -103 E 0.073 -104 N 0.061 -105 E 0.052 -106 L 0.047 -107 D 0.042 -108 L 0.037 -109 F 0.033 -110 R 0.031 -111 K 0.032 -112 A 0.035 -113 L 0.038 -114 E 0.042 -115 L 0.048 -116 I 0.055 -117 V 0.060 -118 D 0.062 -119 S 0.065 -120 E 0.069 -121 T 0.072 -122 G 0.069 -123 F 0.058 -124 A 0.046 -125 S 0.036 -126 S 0.030 -127 T 0.028 -128 N 0.030 -129 I 0.033 -130 L 0.036 -131 N 0.041 -132 L 0.049 -133 V 0.058 -134 D 0.070 -135 Q 0.091 -136 L 0.120 -137 K 0.145 -138 G 0.156 -139 K 0.153 -140 K 0.139 -141 M 0.116 -142 R 0.097 -143 K 0.088 -144 K 0.087 -145 E 0.082 -146 A 0.072 -147 E 0.061 -148 Q 0.055 -149 V 0.056 -150 L 0.060 -151 Q 0.064 -152 K 0.066 -153 F 0.067 -154 V 0.066 -155 Q 0.059 -156 S 0.049 -157 K 0.042 -158 W 0.039 -159 L 0.042 -160 I 0.050 -161 E 0.057 -162 K 0.061 -163 E 0.061 -164 G 0.056 -165 E 0.047 -166 F 0.038 -167 T 0.033 -168 L 0.033 -169 H 0.034 -170 G 0.035 -171 R 0.033 -172 A 0.030 -173 I 0.030 -174 L 0.033 -175 E 0.037 -176 M 0.037 -177 E 0.033 -178 Q 0.030 -179 F 0.029 -180 I 0.028 -181 R 0.030 -182 E 0.037 -183 S 0.044 -184 Y 0.048 -185 P 0.044 -186 D 0.038 -187 S 0.034 -188 V 0.031 -189 K 0.027 -190 M 0.025 -191 C 0.025 -192 N 0.028 -193 I 0.034 -194 C 0.044 -195 H 0.056 -196 G 0.067 -197 L 0.070 -198 L 0.068 -199 I 0.063 -200 Q 0.065 -201 G 0.070 -202 Q 0.074 -203 S 0.072 -204 C 0.068 -205 E 0.067 -206 T 0.068 -207 C 0.071 -208 G 0.076 -209 I 0.076 -210 R 0.069 -211 M 0.061 -212 H 0.055 -213 L 0.054 -214 P 0.056 -215 C 0.056 -216 V 0.052 -217 A 0.045 -218 K 0.041 -219 Y 0.041 -220 F 0.044 -221 Q 0.051 -222 S 0.063 -223 I 0.076 -224 P 0.087 -225 E 0.092 -226 P 0.090 -227 H 0.083 -228 C 0.073 -229 P 0.063 -230 H 0.057 -231 C 0.055 -232 N 0.056 -233 D 0.058 -234 Y 0.058 -235 W 0.060 -236 P 0.068 -237 H 0.084 -238 D 0.101 -239 I 0.111 -240 P 0.112 -241 E 0.113 -242 V 0.118 -243 Y 0.126 -244 N 0.134 -245 P 0.145 -246 E 0.156 -247 K 0.169 -248 E 0.188 -249 R 0.221 -250 E 0.273 -251 A 0.338 -252 G 0.398 -253 I 0.438 -254 S 0.466 -255 K 0.491 -256 S 0.505 -257 S 0.493 -258 R 0.464 -259 K 0.457 -260 S 0.487 -261 L 0.521 -262 R 0.533 -263 T 0.529 -264 R 0.515 -265 Q 0.484 -266 H 0.452 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030750.14_ENSMUST00000033006.15_GN:Nsmce1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030750.14_ENSMUST00000033006.15_GN:Nsmce1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid deleted file mode 100644 index e0b7532bd10f334b6a5247769460671235e5b206..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030750.14_ENSMUST00000033006.15_GN:Nsmce1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid +++ /dev/null @@ -1,281 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030750.14|ENSMUST00000033006.15|GN:Nsmce1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:14 -1 M 0.360 -2 A 0.364 -3 S 0.393 -4 G 0.443 -5 V 0.475 -6 I 0.474 -7 S 0.468 -8 L 0.480 -9 V 0.501 -10 C 0.524 -11 A 0.556 -12 P 0.594 -13 S 0.626 -14 N 0.647 -15 M 0.665 -16 Q 0.682 -17 G 0.692 -18 S 0.685 -19 T 0.665 -20 R 0.639 -21 R 0.604 -22 A 0.547 -23 G 0.456 -24 A 0.339 -25 M 0.222 -26 T 0.128 -27 D 0.068 -28 V 0.038 -29 H 0.026 -30 R 0.022 -31 R 0.021 -32 F 0.023 -33 L 0.027 -34 Q 0.032 -35 L 0.038 -36 L 0.046 -37 M 0.052 -38 T 0.054 -39 H 0.050 -40 G 0.046 -41 V 0.041 -42 L 0.036 -43 E 0.030 -44 E 0.026 -45 W 0.026 -46 E 0.032 -47 V 0.043 -48 R 0.058 -49 R 0.067 -50 L 0.064 -51 Q 0.051 -52 N 0.041 -53 H 0.039 -54 C 0.041 -55 Y 0.045 -56 Q 0.052 -57 V 0.065 -58 H 0.084 -59 D 0.103 -60 R 0.120 -61 N 0.131 -62 A 0.133 -63 T 0.127 -64 V 0.111 -65 D 0.085 -66 K 0.058 -67 L 0.038 -68 E 0.031 -69 D 0.034 -70 F 0.045 -71 I 0.060 -72 N 0.073 -73 N 0.079 -74 I 0.084 -75 N 0.089 -76 S 0.089 -77 V 0.081 -78 L 0.075 -79 E 0.073 -80 S 0.073 -81 L 0.069 -82 Y 0.060 -83 I 0.052 -84 E 0.047 -85 I 0.048 -86 K 0.057 -87 K 0.073 -88 G 0.089 -89 V 0.099 -90 T 0.102 -91 E 0.099 -92 D 0.093 -93 D 0.089 -94 G 0.087 -95 R 0.083 -96 P 0.072 -97 I 0.057 -98 Y 0.048 -99 A 0.051 -100 L 0.066 -101 V 0.092 -102 N 0.122 -103 L 0.150 -104 A 0.170 -105 T 0.180 -106 T 0.185 -107 S 0.186 -108 V 0.182 -109 S 0.173 -110 K 0.163 -111 M 0.148 -112 A 0.130 -113 T 0.113 -114 D 0.101 -115 F 0.092 -116 A 0.084 -117 E 0.072 -118 N 0.060 -119 E 0.052 -120 L 0.047 -121 D 0.042 -122 L 0.036 -123 F 0.032 -124 R 0.030 -125 K 0.030 -126 A 0.034 -127 L 0.037 -128 E 0.041 -129 L 0.048 -130 I 0.055 -131 V 0.059 -132 D 0.062 -133 S 0.065 -134 E 0.070 -135 T 0.073 -136 G 0.070 -137 F 0.059 -138 A 0.047 -139 S 0.036 -140 S 0.030 -141 T 0.029 -142 N 0.030 -143 I 0.033 -144 L 0.036 -145 N 0.042 -146 L 0.049 -147 V 0.058 -148 D 0.070 -149 Q 0.092 -150 L 0.122 -151 K 0.146 -152 G 0.158 -153 K 0.155 -154 K 0.140 -155 M 0.118 -156 R 0.098 -157 K 0.089 -158 K 0.087 -159 E 0.082 -160 A 0.072 -161 E 0.061 -162 Q 0.055 -163 V 0.056 -164 L 0.061 -165 Q 0.064 -166 K 0.066 -167 F 0.068 -168 V 0.066 -169 Q 0.059 -170 S 0.050 -171 K 0.043 -172 W 0.040 -173 L 0.043 -174 I 0.050 -175 E 0.057 -176 K 0.061 -177 E 0.061 -178 G 0.056 -179 E 0.047 -180 F 0.038 -181 T 0.033 -182 L 0.033 -183 H 0.034 -184 G 0.035 -185 R 0.033 -186 A 0.030 -187 I 0.029 -188 L 0.033 -189 E 0.036 -190 M 0.036 -191 E 0.033 -192 Q 0.030 -193 F 0.028 -194 I 0.028 -195 R 0.030 -196 E 0.037 -197 S 0.045 -198 Y 0.048 -199 P 0.044 -200 D 0.038 -201 S 0.033 -202 V 0.030 -203 K 0.027 -204 M 0.025 -205 C 0.025 -206 N 0.028 -207 I 0.034 -208 C 0.043 -209 H 0.055 -210 G 0.064 -211 L 0.068 -212 L 0.066 -213 I 0.063 -214 Q 0.064 -215 G 0.070 -216 Q 0.074 -217 S 0.072 -218 C 0.069 -219 E 0.067 -220 T 0.067 -221 C 0.071 -222 G 0.075 -223 I 0.074 -224 R 0.068 -225 M 0.060 -226 H 0.055 -227 L 0.054 -228 P 0.056 -229 C 0.057 -230 V 0.052 -231 A 0.046 -232 K 0.042 -233 Y 0.042 -234 F 0.045 -235 Q 0.052 -236 S 0.063 -237 I 0.077 -238 P 0.087 -239 E 0.092 -240 P 0.091 -241 H 0.084 -242 C 0.074 -243 P 0.064 -244 H 0.058 -245 C 0.056 -246 N 0.057 -247 D 0.059 -248 Y 0.059 -249 W 0.061 -250 P 0.069 -251 H 0.084 -252 D 0.101 -253 I 0.110 -254 P 0.111 -255 E 0.112 -256 V 0.116 -257 Y 0.123 -258 N 0.131 -259 P 0.141 -260 E 0.152 -261 K 0.164 -262 E 0.183 -263 R 0.216 -264 E 0.269 -265 A 0.335 -266 G 0.397 -267 I 0.439 -268 S 0.468 -269 K 0.492 -270 S 0.506 -271 S 0.494 -272 R 0.465 -273 K 0.458 -274 S 0.490 -275 L 0.526 -276 R 0.540 -277 T 0.537 -278 R 0.522 -279 Q 0.489 -280 H 0.456 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030781.14_ENSMUST00000118169.8_GN:Slc5a2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030781.14_ENSMUST00000118169.8_GN:Slc5a2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 0869f8c7bb363bafbf17eba94ad7ef46ebb3c5c8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030781.14_ENSMUST00000118169.8_GN:Slc5a2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,671 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030781.14|ENSMUST00000118169.8|GN:Slc5a2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.316 -2 E 0.311 -3 Q 0.311 -4 H 0.322 -5 V 0.339 -6 E 0.370 -7 A 0.421 -8 G 0.475 -9 S 0.506 -10 E 0.517 -11 L 0.520 -12 G 0.518 -13 E 0.502 -14 Q 0.466 -15 K 0.415 -16 V 0.357 -17 L 0.302 -18 I 0.248 -19 D 0.197 -20 N 0.152 -21 P 0.123 -22 A 0.115 -23 D 0.112 -24 I 0.101 -25 L 0.086 -26 V 0.075 -27 I 0.070 -28 A 0.070 -29 A 0.069 -30 Y 0.064 -31 F 0.056 -32 L 0.049 -33 L 0.048 -34 V 0.051 -35 I 0.052 -36 G 0.053 -37 V 0.053 -38 G 0.049 -39 L 0.045 -40 W 0.045 -41 S 0.052 -42 M 0.067 -43 F 0.097 -44 R 0.148 -45 T 0.207 -46 N 0.245 -47 R 0.250 -48 G 0.232 -49 T 0.211 -50 V 0.194 -51 G 0.183 -52 G 0.175 -53 Y 0.165 -54 F 0.155 -55 L 0.154 -56 A 0.158 -57 G 0.153 -58 R 0.137 -59 S 0.116 -60 M 0.098 -61 V 0.084 -62 W 0.074 -63 W 0.070 -64 P 0.071 -65 V 0.073 -66 G 0.079 -67 A 0.096 -68 S 0.126 -69 L 0.161 -70 F 0.186 -71 A 0.195 -72 S 0.194 -73 N 0.187 -74 I 0.174 -75 G 0.163 -76 S 0.162 -77 G 0.168 -78 H 0.171 -79 F 0.168 -80 V 0.164 -81 G 0.165 -82 L 0.167 -83 A 0.164 -84 G 0.156 -85 T 0.148 -86 G 0.144 -87 A 0.141 -88 A 0.141 -89 S 0.148 -90 G 0.159 -91 L 0.172 -92 A 0.181 -93 V 0.179 -94 A 0.168 -95 G 0.156 -96 F 0.150 -97 E 0.144 -98 W 0.137 -99 N 0.132 -100 A 0.127 -101 L 0.116 -102 F 0.102 -103 V 0.093 -104 V 0.085 -105 L 0.071 -106 L 0.059 -107 L 0.051 -108 G 0.043 -109 W 0.035 -110 L 0.030 -111 F 0.029 -112 V 0.031 -113 P 0.033 -114 V 0.035 -115 Y 0.040 -116 L 0.051 -117 T 0.073 -118 A 0.097 -119 G 0.108 -120 V 0.100 -121 I 0.082 -122 T 0.070 -123 M 0.069 -124 P 0.074 -125 Q 0.077 -126 Y 0.077 -127 L 0.076 -128 R 0.073 -129 K 0.070 -130 R 0.071 -131 F 0.077 -132 G 0.081 -133 G 0.080 -134 H 0.071 -135 R 0.063 -136 I 0.059 -137 R 0.058 -138 L 0.059 -139 Y 0.063 -140 L 0.070 -141 S 0.072 -142 V 0.070 -143 L 0.068 -144 S 0.071 -145 L 0.068 -146 F 0.057 -147 L 0.046 -148 Y 0.039 -149 I 0.038 -150 F 0.042 -151 T 0.050 -152 K 0.063 -153 I 0.075 -154 S 0.086 -155 V 0.098 -156 D 0.108 -157 M 0.114 -158 F 0.116 -159 S 0.112 -160 G 0.104 -161 A 0.093 -162 V 0.084 -163 F 0.079 -164 I 0.072 -165 Q 0.063 -166 Q 0.057 -167 A 0.059 -168 L 0.064 -169 G 0.067 -170 W 0.063 -171 N 0.056 -172 I 0.050 -173 Y 0.051 -174 A 0.058 -175 S 0.068 -176 V 0.074 -177 I 0.077 -178 A 0.084 -179 L 0.091 -180 L 0.087 -181 G 0.076 -182 I 0.068 -183 T 0.062 -184 M 0.057 -185 I 0.052 -186 Y 0.050 -187 T 0.052 -188 V 0.059 -189 T 0.074 -190 G 0.091 -191 G 0.105 -192 L 0.118 -193 A 0.136 -194 A 0.153 -195 L 0.159 -196 M 0.157 -197 Y 0.162 -198 T 0.170 -199 D 0.166 -200 T 0.151 -201 V 0.144 -202 Q 0.150 -203 T 0.155 -204 F 0.149 -205 V 0.140 -206 I 0.129 -207 L 0.115 -208 A 0.100 -209 G 0.093 -210 A 0.086 -211 F 0.080 -212 I 0.076 -213 L 0.075 -214 T 0.071 -215 G 0.067 -216 Y 0.065 -217 A 0.063 -218 F 0.060 -219 H 0.065 -220 E 0.079 -221 V 0.097 -222 G 0.105 -223 G 0.100 -224 Y 0.091 -225 S 0.086 -226 G 0.084 -227 L 0.083 -228 F 0.081 -229 D 0.082 -230 K 0.081 -231 Y 0.084 -232 L 0.092 -233 G 0.101 -234 A 0.112 -235 M 0.128 -236 T 0.150 -237 S 0.179 -238 L 0.214 -239 T 0.252 -240 V 0.291 -241 S 0.328 -242 K 0.357 -243 D 0.375 -244 P 0.383 -245 S 0.386 -246 V 0.381 -247 G 0.367 -248 N 0.347 -249 I 0.326 -250 S 0.302 -251 S 0.274 -252 T 0.248 -253 C 0.234 -254 Y 0.240 -255 Q 0.260 -256 P 0.272 -257 R 0.268 -258 P 0.249 -259 D 0.217 -260 S 0.182 -261 Y 0.158 -262 H 0.159 -263 L 0.189 -264 L 0.239 -265 R 0.286 -266 D 0.305 -267 P 0.289 -268 V 0.256 -269 T 0.230 -270 G 0.210 -271 D 0.190 -272 L 0.166 -273 P 0.138 -274 W 0.110 -275 P 0.091 -276 A 0.085 -277 L 0.086 -278 L 0.084 -279 L 0.085 -280 G 0.093 -281 L 0.101 -282 T 0.103 -283 I 0.106 -284 V 0.121 -285 S 0.138 -286 G 0.139 -287 W 0.125 -288 Y 0.111 -289 W 0.105 -290 C 0.109 -291 S 0.122 -292 D 0.135 -293 Q 0.138 -294 V 0.132 -295 I 0.124 -296 V 0.120 -297 Q 0.123 -298 R 0.131 -299 C 0.139 -300 L 0.140 -301 A 0.135 -302 G 0.123 -303 K 0.105 -304 N 0.086 -305 L 0.074 -306 T 0.070 -307 H 0.071 -308 I 0.073 -309 K 0.077 -310 A 0.087 -311 G 0.103 -312 C 0.117 -313 I 0.122 -314 L 0.126 -315 C 0.125 -316 G 0.119 -317 Y 0.117 -318 L 0.126 -319 K 0.129 -320 L 0.114 -321 M 0.093 -322 P 0.079 -323 M 0.069 -324 F 0.059 -325 L 0.051 -326 M 0.049 -327 V 0.056 -328 M 0.066 -329 P 0.075 -330 G 0.082 -331 M 0.091 -332 I 0.099 -333 S 0.098 -334 R 0.090 -335 I 0.080 -336 L 0.075 -337 Y 0.077 -338 P 0.085 -339 D 0.102 -340 E 0.123 -341 V 0.141 -342 A 0.149 -343 C 0.152 -344 V 0.158 -345 V 0.163 -346 P 0.157 -347 E 0.141 -348 V 0.120 -349 C 0.107 -350 K 0.109 -351 R 0.120 -352 V 0.129 -353 C 0.131 -354 G 0.131 -355 T 0.135 -356 E 0.144 -357 V 0.154 -358 G 0.159 -359 C 0.157 -360 S 0.155 -361 N 0.154 -362 I 0.149 -363 A 0.133 -364 Y 0.106 -365 P 0.083 -366 R 0.073 -367 L 0.073 -368 V 0.074 -369 V 0.076 -370 K 0.083 -371 L 0.096 -372 M 0.109 -373 P 0.117 -374 N 0.116 -375 G 0.108 -376 L 0.099 -377 R 0.096 -378 G 0.100 -379 L 0.106 -380 M 0.114 -381 L 0.124 -382 A 0.135 -383 V 0.148 -384 M 0.161 -385 L 0.166 -386 A 0.166 -387 A 0.167 -388 L 0.172 -389 M 0.180 -390 S 0.192 -391 S 0.202 -392 L 0.206 -393 A 0.204 -394 S 0.199 -395 I 0.192 -396 F 0.183 -397 N 0.182 -398 S 0.188 -399 S 0.188 -400 S 0.175 -401 T 0.153 -402 L 0.130 -403 F 0.109 -404 T 0.096 -405 M 0.086 -406 D 0.075 -407 I 0.062 -408 Y 0.050 -409 T 0.045 -410 R 0.048 -411 L 0.061 -412 R 0.083 -413 P 0.107 -414 R 0.124 -415 A 0.126 -416 G 0.112 -417 D 0.093 -418 K 0.080 -419 E 0.075 -420 L 0.074 -421 L 0.078 -422 L 0.083 -423 V 0.086 -424 G 0.089 -425 R 0.096 -426 L 0.104 -427 W 0.105 -428 V 0.098 -429 V 0.091 -430 F 0.093 -431 I 0.102 -432 V 0.106 -433 A 0.100 -434 V 0.087 -435 S 0.073 -436 V 0.062 -437 A 0.059 -438 W 0.063 -439 L 0.069 -440 P 0.074 -441 V 0.077 -442 V 0.084 -443 Q 0.100 -444 A 0.120 -445 A 0.138 -446 Q 0.147 -447 G 0.148 -448 G 0.143 -449 Q 0.131 -450 L 0.116 -451 F 0.104 -452 D 0.105 -453 Y 0.118 -454 I 0.136 -455 Q 0.152 -456 S 0.166 -457 V 0.166 -458 S 0.148 -459 S 0.124 -460 Y 0.112 -461 L 0.111 -462 A 0.116 -463 P 0.118 -464 P 0.117 -465 V 0.118 -466 S 0.122 -467 A 0.121 -468 V 0.107 -469 F 0.086 -470 V 0.068 -471 L 0.057 -472 A 0.049 -473 L 0.047 -474 F 0.055 -475 V 0.075 -476 P 0.099 -477 R 0.112 -478 V 0.106 -479 N 0.087 -480 E 0.069 -481 K 0.059 -482 G 0.057 -483 A 0.057 -484 F 0.055 -485 W 0.058 -486 G 0.065 -487 L 0.074 -488 V 0.078 -489 G 0.082 -490 G 0.085 -491 L 0.086 -492 L 0.087 -493 M 0.093 -494 G 0.105 -495 L 0.115 -496 A 0.122 -497 R 0.127 -498 L 0.127 -499 I 0.123 -500 P 0.125 -501 E 0.132 -502 F 0.147 -503 F 0.178 -504 F 0.226 -505 G 0.275 -506 S 0.304 -507 G 0.303 -508 S 0.276 -509 C 0.244 -510 V 0.227 -511 R 0.230 -512 P 0.238 -513 S 0.238 -514 A 0.223 -515 C 0.200 -516 P 0.171 -517 A 0.139 -518 L 0.119 -519 F 0.124 -520 C 0.146 -521 R 0.162 -522 V 0.157 -523 H 0.135 -524 Y 0.111 -525 L 0.095 -526 Y 0.088 -527 F 0.090 -528 A 0.094 -529 I 0.095 -530 I 0.097 -531 L 0.100 -532 F 0.100 -533 I 0.099 -534 C 0.103 -535 S 0.108 -536 G 0.105 -537 I 0.096 -538 L 0.091 -539 T 0.091 -540 L 0.095 -541 G 0.104 -542 I 0.116 -543 S 0.120 -544 L 0.116 -545 C 0.115 -546 T 0.126 -547 A 0.148 -548 P 0.169 -549 I 0.181 -550 P 0.187 -551 Q 0.190 -552 K 0.189 -553 H 0.180 -554 L 0.169 -555 H 0.160 -556 R 0.149 -557 L 0.131 -558 V 0.116 -559 F 0.117 -560 S 0.133 -561 L 0.152 -562 R 0.169 -563 H 0.193 -564 S 0.229 -565 K 0.272 -566 E 0.310 -567 E 0.341 -568 R 0.373 -569 E 0.406 -570 D 0.437 -571 L 0.462 -572 D 0.479 -573 A 0.490 -574 D 0.500 -575 E 0.508 -576 L 0.513 -577 E 0.516 -578 G 0.526 -579 P 0.548 -580 A 0.584 -581 P 0.622 -582 A 0.649 -583 P 0.645 -584 V 0.612 -585 Q 0.594 -586 N 0.616 -587 G 0.635 -588 G 0.614 -589 Q 0.589 -590 E 0.609 -591 C 0.657 -592 A 0.692 -593 M 0.706 -594 E 0.709 -595 M 0.709 -596 E 0.707 -597 E 0.695 -598 V 0.669 -599 Q 0.631 -600 S 0.593 -601 P 0.557 -602 A 0.519 -603 P 0.469 -604 G 0.400 -605 L 0.320 -606 L 0.253 -607 R 0.213 -608 R 0.193 -609 C 0.184 -610 L 0.185 -611 L 0.188 -612 W 0.187 -613 F 0.198 -614 C 0.241 -615 G 0.317 -616 M 0.414 -617 S 0.510 -618 K 0.587 -619 S 0.632 -620 G 0.650 -621 S 0.642 -622 G 0.612 -623 S 0.570 -624 P 0.533 -625 P 0.505 -626 P 0.484 -627 T 0.464 -628 T 0.442 -629 E 0.418 -630 E 0.393 -631 V 0.369 -632 A 0.351 -633 A 0.343 -634 T 0.343 -635 T 0.342 -636 R 0.329 -637 R 0.308 -638 L 0.288 -639 E 0.275 -640 D 0.266 -641 I 0.258 -642 S 0.244 -643 E 0.221 -644 D 0.189 -645 P 0.152 -646 R 0.122 -647 W 0.108 -648 A 0.108 -649 R 0.111 -650 V 0.112 -651 V 0.114 -652 N 0.117 -653 L 0.121 -654 N 0.130 -655 A 0.140 -656 L 0.147 -657 L 0.157 -658 M 0.168 -659 M 0.168 -660 T 0.155 -661 V 0.139 -662 A 0.122 -663 V 0.102 -664 F 0.086 -665 L 0.080 -666 W 0.081 -667 G 0.087 -668 F 0.102 -669 Y 0.126 -670 A 0.145 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030781.14_ENSMUST00000118169.8_GN:Slc5a2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:4.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030781.14_ENSMUST00000118169.8_GN:Slc5a2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:4.caid deleted file mode 100644 index 3ab06815657ef0915dbb88392fa7b0e46652195f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030781.14_ENSMUST00000118169.8_GN:Slc5a2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:4.caid +++ /dev/null @@ -1,675 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030781.14|ENSMUST00000118169.8|GN:Slc5a2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:4 -1 M 0.178 -2 L 0.175 -3 E 0.178 -4 R 0.191 -5 M 0.208 -6 E 0.224 -7 Q 0.245 -8 H 0.279 -9 V 0.318 -10 E 0.358 -11 A 0.397 -12 G 0.429 -13 S 0.453 -14 E 0.470 -15 L 0.486 -16 G 0.497 -17 E 0.491 -18 Q 0.462 -19 K 0.416 -20 V 0.362 -21 L 0.308 -22 I 0.254 -23 D 0.201 -24 N 0.154 -25 P 0.124 -26 A 0.112 -27 D 0.103 -28 I 0.085 -29 L 0.066 -30 V 0.059 -31 I 0.062 -32 A 0.067 -33 A 0.068 -34 Y 0.064 -35 F 0.056 -36 L 0.049 -37 L 0.048 -38 V 0.051 -39 I 0.052 -40 G 0.053 -41 V 0.053 -42 G 0.049 -43 L 0.045 -44 W 0.045 -45 S 0.052 -46 M 0.067 -47 F 0.097 -48 R 0.147 -49 T 0.205 -50 N 0.244 -51 R 0.249 -52 G 0.233 -53 T 0.212 -54 V 0.194 -55 G 0.182 -56 G 0.174 -57 Y 0.163 -58 F 0.154 -59 L 0.153 -60 A 0.156 -61 G 0.152 -62 R 0.136 -63 S 0.115 -64 M 0.098 -65 V 0.084 -66 W 0.074 -67 W 0.070 -68 P 0.071 -69 V 0.073 -70 G 0.078 -71 A 0.096 -72 S 0.126 -73 L 0.160 -74 F 0.184 -75 A 0.194 -76 S 0.193 -77 N 0.186 -78 I 0.173 -79 G 0.162 -80 S 0.161 -81 G 0.167 -82 H 0.170 -83 F 0.167 -84 V 0.164 -85 G 0.165 -86 L 0.167 -87 A 0.164 -88 G 0.156 -89 T 0.148 -90 G 0.143 -91 A 0.140 -92 A 0.140 -93 S 0.146 -94 G 0.158 -95 L 0.171 -96 A 0.181 -97 V 0.179 -98 A 0.168 -99 G 0.156 -100 F 0.149 -101 E 0.143 -102 W 0.136 -103 N 0.131 -104 A 0.126 -105 L 0.115 -106 F 0.102 -107 V 0.093 -108 V 0.085 -109 L 0.072 -110 L 0.059 -111 L 0.051 -112 G 0.043 -113 W 0.035 -114 L 0.030 -115 F 0.029 -116 V 0.031 -117 P 0.033 -118 V 0.036 -119 Y 0.040 -120 L 0.051 -121 T 0.073 -122 A 0.097 -123 G 0.108 -124 V 0.100 -125 I 0.082 -126 T 0.070 -127 M 0.070 -128 P 0.074 -129 Q 0.077 -130 Y 0.077 -131 L 0.076 -132 R 0.073 -133 K 0.071 -134 R 0.071 -135 F 0.077 -136 G 0.082 -137 G 0.080 -138 H 0.072 -139 R 0.063 -140 I 0.060 -141 R 0.059 -142 L 0.059 -143 Y 0.063 -144 L 0.070 -145 S 0.072 -146 V 0.070 -147 L 0.068 -148 S 0.070 -149 L 0.067 -150 F 0.057 -151 L 0.045 -152 Y 0.039 -153 I 0.038 -154 F 0.041 -155 T 0.050 -156 K 0.063 -157 I 0.075 -158 S 0.086 -159 V 0.097 -160 D 0.108 -161 M 0.114 -162 F 0.115 -163 S 0.112 -164 G 0.103 -165 A 0.092 -166 V 0.084 -167 F 0.079 -168 I 0.072 -169 Q 0.063 -170 Q 0.058 -171 A 0.059 -172 L 0.064 -173 G 0.067 -174 W 0.063 -175 N 0.056 -176 I 0.050 -177 Y 0.050 -178 A 0.058 -179 S 0.068 -180 V 0.073 -181 I 0.076 -182 A 0.084 -183 L 0.090 -184 L 0.086 -185 G 0.076 -186 I 0.068 -187 T 0.062 -188 M 0.057 -189 I 0.052 -190 Y 0.050 -191 T 0.051 -192 V 0.059 -193 T 0.073 -194 G 0.090 -195 G 0.105 -196 L 0.118 -197 A 0.136 -198 A 0.153 -199 L 0.159 -200 M 0.157 -201 Y 0.161 -202 T 0.170 -203 D 0.166 -204 T 0.151 -205 V 0.144 -206 Q 0.150 -207 T 0.155 -208 F 0.149 -209 V 0.140 -210 I 0.129 -211 L 0.114 -212 A 0.100 -213 G 0.092 -214 A 0.086 -215 F 0.079 -216 I 0.075 -217 L 0.074 -218 T 0.071 -219 G 0.067 -220 Y 0.065 -221 A 0.063 -222 F 0.060 -223 H 0.064 -224 E 0.078 -225 V 0.096 -226 G 0.104 -227 G 0.099 -228 Y 0.090 -229 S 0.085 -230 G 0.084 -231 L 0.082 -232 F 0.081 -233 D 0.081 -234 K 0.081 -235 Y 0.084 -236 L 0.092 -237 G 0.101 -238 A 0.112 -239 M 0.128 -240 T 0.150 -241 S 0.178 -242 L 0.213 -243 T 0.251 -244 V 0.291 -245 S 0.327 -246 K 0.357 -247 D 0.374 -248 P 0.382 -249 S 0.385 -250 V 0.381 -251 G 0.366 -252 N 0.347 -253 I 0.326 -254 S 0.302 -255 S 0.274 -256 T 0.248 -257 C 0.234 -258 Y 0.241 -259 Q 0.260 -260 P 0.272 -261 R 0.268 -262 P 0.249 -263 D 0.217 -264 S 0.182 -265 Y 0.158 -266 H 0.159 -267 L 0.190 -268 L 0.240 -269 R 0.288 -270 D 0.306 -271 P 0.290 -272 V 0.257 -273 T 0.230 -274 G 0.210 -275 D 0.190 -276 L 0.166 -277 P 0.138 -278 W 0.110 -279 P 0.091 -280 A 0.085 -281 L 0.086 -282 L 0.085 -283 L 0.085 -284 G 0.093 -285 L 0.101 -286 T 0.103 -287 I 0.106 -288 V 0.121 -289 S 0.138 -290 G 0.139 -291 W 0.126 -292 Y 0.111 -293 W 0.105 -294 C 0.109 -295 S 0.123 -296 D 0.135 -297 Q 0.139 -298 V 0.133 -299 I 0.125 -300 V 0.120 -301 Q 0.123 -302 R 0.132 -303 C 0.139 -304 L 0.140 -305 A 0.135 -306 G 0.124 -307 K 0.105 -308 N 0.086 -309 L 0.074 -310 T 0.071 -311 H 0.072 -312 I 0.074 -313 K 0.077 -314 A 0.087 -315 G 0.104 -316 C 0.117 -317 I 0.123 -318 L 0.126 -319 C 0.125 -320 G 0.119 -321 Y 0.117 -322 L 0.126 -323 K 0.129 -324 L 0.114 -325 M 0.093 -326 P 0.079 -327 M 0.069 -328 F 0.059 -329 L 0.051 -330 M 0.049 -331 V 0.056 -332 M 0.066 -333 P 0.075 -334 G 0.082 -335 M 0.092 -336 I 0.100 -337 S 0.099 -338 R 0.090 -339 I 0.080 -340 L 0.075 -341 Y 0.077 -342 P 0.085 -343 D 0.102 -344 E 0.123 -345 V 0.140 -346 A 0.148 -347 C 0.152 -348 V 0.157 -349 V 0.163 -350 P 0.157 -351 E 0.141 -352 V 0.120 -353 C 0.106 -354 K 0.108 -355 R 0.119 -356 V 0.127 -357 C 0.129 -358 G 0.130 -359 T 0.134 -360 E 0.143 -361 V 0.153 -362 G 0.158 -363 C 0.156 -364 S 0.154 -365 N 0.154 -366 I 0.149 -367 A 0.132 -368 Y 0.106 -369 P 0.082 -370 R 0.073 -371 L 0.073 -372 V 0.074 -373 V 0.075 -374 K 0.082 -375 L 0.096 -376 M 0.108 -377 P 0.116 -378 N 0.115 -379 G 0.107 -380 L 0.098 -381 R 0.095 -382 G 0.099 -383 L 0.106 -384 M 0.114 -385 L 0.123 -386 A 0.134 -387 V 0.148 -388 M 0.160 -389 L 0.165 -390 A 0.165 -391 A 0.166 -392 L 0.171 -393 M 0.179 -394 S 0.191 -395 S 0.202 -396 L 0.205 -397 A 0.203 -398 S 0.199 -399 I 0.192 -400 F 0.183 -401 N 0.182 -402 S 0.188 -403 S 0.188 -404 S 0.175 -405 T 0.153 -406 L 0.129 -407 F 0.109 -408 T 0.095 -409 M 0.086 -410 D 0.075 -411 I 0.062 -412 Y 0.050 -413 T 0.045 -414 R 0.048 -415 L 0.061 -416 R 0.083 -417 P 0.107 -418 R 0.124 -419 A 0.125 -420 G 0.111 -421 D 0.093 -422 K 0.080 -423 E 0.075 -424 L 0.074 -425 L 0.077 -426 L 0.082 -427 V 0.084 -428 G 0.088 -429 R 0.096 -430 L 0.104 -431 W 0.105 -432 V 0.098 -433 V 0.091 -434 F 0.093 -435 I 0.102 -436 V 0.106 -437 A 0.100 -438 V 0.087 -439 S 0.073 -440 V 0.062 -441 A 0.059 -442 W 0.063 -443 L 0.069 -444 P 0.073 -445 V 0.076 -446 V 0.084 -447 Q 0.100 -448 A 0.120 -449 A 0.138 -450 Q 0.147 -451 G 0.148 -452 G 0.143 -453 Q 0.131 -454 L 0.116 -455 F 0.104 -456 D 0.105 -457 Y 0.118 -458 I 0.136 -459 Q 0.152 -460 S 0.166 -461 V 0.166 -462 S 0.148 -463 S 0.124 -464 Y 0.111 -465 L 0.111 -466 A 0.116 -467 P 0.118 -468 P 0.117 -469 V 0.118 -470 S 0.122 -471 A 0.121 -472 V 0.107 -473 F 0.086 -474 V 0.068 -475 L 0.057 -476 A 0.050 -477 L 0.048 -478 F 0.056 -479 V 0.075 -480 P 0.099 -481 R 0.113 -482 V 0.107 -483 N 0.087 -484 E 0.069 -485 K 0.060 -486 G 0.058 -487 A 0.057 -488 F 0.056 -489 W 0.058 -490 G 0.066 -491 L 0.074 -492 V 0.078 -493 G 0.082 -494 G 0.085 -495 L 0.086 -496 L 0.087 -497 M 0.093 -498 G 0.105 -499 L 0.115 -500 A 0.122 -501 R 0.127 -502 L 0.127 -503 I 0.124 -504 P 0.125 -505 E 0.133 -506 F 0.147 -507 F 0.178 -508 F 0.226 -509 G 0.275 -510 S 0.303 -511 G 0.302 -512 S 0.275 -513 C 0.243 -514 V 0.226 -515 R 0.228 -516 P 0.237 -517 S 0.236 -518 A 0.222 -519 C 0.200 -520 P 0.171 -521 A 0.139 -522 L 0.119 -523 F 0.124 -524 C 0.146 -525 R 0.162 -526 V 0.157 -527 H 0.134 -528 Y 0.110 -529 L 0.095 -530 Y 0.089 -531 F 0.090 -532 A 0.094 -533 I 0.095 -534 I 0.097 -535 L 0.100 -536 F 0.100 -537 I 0.098 -538 C 0.103 -539 S 0.108 -540 G 0.104 -541 I 0.096 -542 L 0.090 -543 T 0.090 -544 L 0.095 -545 G 0.104 -546 I 0.116 -547 S 0.120 -548 L 0.116 -549 C 0.114 -550 T 0.126 -551 A 0.148 -552 P 0.169 -553 I 0.181 -554 P 0.187 -555 Q 0.190 -556 K 0.188 -557 H 0.179 -558 L 0.168 -559 H 0.159 -560 R 0.148 -561 L 0.130 -562 V 0.116 -563 F 0.117 -564 S 0.133 -565 L 0.152 -566 R 0.170 -567 H 0.193 -568 S 0.230 -569 K 0.273 -570 E 0.310 -571 E 0.342 -572 R 0.374 -573 E 0.407 -574 D 0.439 -575 L 0.464 -576 D 0.481 -577 A 0.493 -578 D 0.503 -579 E 0.511 -580 L 0.516 -581 E 0.519 -582 G 0.528 -583 P 0.550 -584 A 0.585 -585 P 0.623 -586 A 0.650 -587 P 0.645 -588 V 0.612 -589 Q 0.594 -590 N 0.616 -591 G 0.635 -592 G 0.614 -593 Q 0.590 -594 E 0.610 -595 C 0.657 -596 A 0.692 -597 M 0.706 -598 E 0.709 -599 M 0.709 -600 E 0.707 -601 E 0.696 -602 V 0.669 -603 Q 0.632 -604 S 0.594 -605 P 0.558 -606 A 0.520 -607 P 0.469 -608 G 0.400 -609 L 0.320 -610 L 0.253 -611 R 0.213 -612 R 0.193 -613 C 0.184 -614 L 0.185 -615 L 0.188 -616 W 0.187 -617 F 0.198 -618 C 0.241 -619 G 0.317 -620 M 0.414 -621 S 0.511 -622 K 0.587 -623 S 0.633 -624 G 0.650 -625 S 0.643 -626 G 0.613 -627 S 0.571 -628 P 0.534 -629 P 0.506 -630 P 0.485 -631 T 0.465 -632 T 0.443 -633 E 0.420 -634 E 0.395 -635 V 0.370 -636 A 0.352 -637 A 0.344 -638 T 0.344 -639 T 0.342 -640 R 0.329 -641 R 0.308 -642 L 0.289 -643 E 0.275 -644 D 0.266 -645 I 0.258 -646 S 0.244 -647 E 0.221 -648 D 0.189 -649 P 0.153 -650 R 0.123 -651 W 0.109 -652 A 0.109 -653 R 0.111 -654 V 0.112 -655 V 0.114 -656 N 0.117 -657 L 0.121 -658 N 0.130 -659 A 0.140 -660 L 0.147 -661 L 0.157 -662 M 0.168 -663 M 0.167 -664 T 0.154 -665 V 0.138 -666 A 0.121 -667 V 0.101 -668 F 0.085 -669 L 0.079 -670 W 0.080 -671 G 0.086 -672 F 0.101 -673 Y 0.124 -674 A 0.144 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030968.4_ENSMUST00000033267.4_GN:Pdilt_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030968.4_ENSMUST00000033267.4_GN:Pdilt_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 581332ac55a7826bd73398b61e629558d8f378bb..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030968.4_ENSMUST00000033267.4_GN:Pdilt_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,589 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030968.4|ENSMUST00000033267.4|GN:Pdilt|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.316 -2 E 0.309 -3 L 0.292 -4 L 0.268 -5 W 0.242 -6 T 0.218 -7 P 0.197 -8 L 0.182 -9 L 0.179 -10 L 0.189 -11 V 0.202 -12 A 0.210 -13 A 0.218 -14 C 0.233 -15 L 0.255 -16 S 0.288 -17 E 0.336 -18 V 0.390 -19 L 0.440 -20 G 0.481 -21 S 0.512 -22 P 0.534 -23 E 0.550 -24 I 0.564 -25 D 0.577 -26 T 0.575 -27 G 0.549 -28 I 0.510 -29 N 0.472 -30 I 0.432 -31 S 0.388 -32 Q 0.346 -33 P 0.307 -34 L 0.272 -35 H 0.241 -36 I 0.220 -37 L 0.203 -38 E 0.185 -39 D 0.164 -40 H 0.145 -41 N 0.129 -42 L 0.113 -43 M 0.097 -44 V 0.085 -45 L 0.074 -46 T 0.064 -47 P 0.055 -48 A 0.048 -49 G 0.046 -50 L 0.050 -51 T 0.059 -52 Q 0.065 -53 T 0.062 -54 L 0.054 -55 N 0.053 -56 E 0.057 -57 T 0.057 -58 R 0.046 -59 F 0.034 -60 L 0.028 -61 M 0.028 -62 V 0.030 -63 I 0.032 -64 F 0.035 -65 H 0.040 -66 N 0.046 -67 P 0.051 -68 S 0.053 -69 L 0.054 -70 K 0.054 -71 Q 0.055 -72 S 0.057 -73 R 0.063 -74 K 0.074 -75 L 0.082 -76 A 0.081 -77 K 0.070 -78 E 0.058 -79 L 0.048 -80 G 0.041 -81 K 0.036 -82 A 0.034 -83 A 0.032 -84 E 0.032 -85 I 0.041 -86 F 0.061 -87 G 0.091 -88 K 0.126 -89 G 0.150 -90 K 0.154 -91 N 0.138 -92 G 0.111 -93 L 0.083 -94 G 0.061 -95 F 0.046 -96 G 0.039 -97 K 0.038 -98 V 0.043 -99 D 0.046 -100 I 0.046 -101 T 0.043 -102 K 0.040 -103 E 0.037 -104 T 0.034 -105 E 0.033 -106 L 0.038 -107 Q 0.048 -108 Q 0.055 -109 E 0.053 -110 F 0.049 -111 D 0.051 -112 I 0.055 -113 T 0.054 -114 H 0.053 -115 A 0.053 -116 P 0.053 -117 E 0.048 -118 L 0.040 -119 K 0.032 -120 L 0.027 -121 F 0.027 -122 F 0.032 -123 E 0.040 -124 G 0.051 -125 N 0.059 -126 R 0.062 -127 L 0.062 -128 K 0.060 -129 P 0.058 -130 I 0.058 -131 S 0.063 -132 C 0.078 -133 K 0.098 -134 D 0.111 -135 V 0.112 -136 V 0.102 -137 E 0.087 -138 S 0.071 -139 T 0.057 -140 A 0.049 -141 L 0.047 -142 V 0.046 -143 V 0.046 -144 W 0.048 -145 L 0.051 -146 R 0.058 -147 R 0.071 -148 Q 0.090 -149 I 0.112 -150 S 0.134 -151 K 0.149 -152 K 0.149 -153 A 0.133 -154 L 0.109 -155 L 0.086 -156 F 0.071 -157 N 0.063 -158 N 0.058 -159 S 0.052 -160 D 0.045 -161 E 0.040 -162 V 0.042 -163 A 0.051 -164 D 0.058 -165 F 0.053 -166 V 0.041 -167 K 0.033 -168 S 0.029 -169 R 0.027 -170 P 0.023 -171 L 0.020 -172 V 0.020 -173 I 0.021 -174 V 0.023 -175 G 0.028 -176 F 0.037 -177 F 0.047 -178 Q 0.053 -179 D 0.056 -180 L 0.060 -181 E 0.061 -182 E 0.059 -183 E 0.052 -184 V 0.045 -185 A 0.039 -186 E 0.036 -187 L 0.035 -188 F 0.033 -189 Y 0.029 -190 D 0.027 -191 T 0.027 -192 I 0.029 -193 K 0.031 -194 D 0.035 -195 F 0.038 -196 P 0.038 -197 E 0.034 -198 L 0.030 -199 T 0.028 -200 F 0.028 -201 G 0.032 -202 A 0.038 -203 I 0.047 -204 Q 0.058 -205 I 0.070 -206 K 0.082 -207 N 0.089 -208 S 0.084 -209 F 0.073 -210 G 0.066 -211 R 0.063 -212 F 0.060 -213 H 0.059 -214 V 0.057 -215 I 0.054 -216 L 0.051 -217 D 0.046 -218 S 0.038 -219 V 0.029 -220 L 0.022 -221 V 0.020 -222 F 0.023 -223 K 0.029 -224 K 0.035 -225 G 0.040 -226 K 0.041 -227 I 0.040 -228 V 0.042 -229 K 0.049 -230 R 0.064 -231 Q 0.085 -232 E 0.108 -233 L 0.131 -234 I 0.153 -235 N 0.170 -236 D 0.175 -237 S 0.162 -238 T 0.137 -239 N 0.107 -240 K 0.081 -241 D 0.063 -242 H 0.056 -243 L 0.057 -244 N 0.063 -245 Q 0.066 -246 V 0.064 -247 I 0.060 -248 K 0.059 -249 Q 0.060 -250 Q 0.065 -251 L 0.074 -252 T 0.085 -253 G 0.096 -254 F 0.103 -255 V 0.105 -256 I 0.100 -257 E 0.093 -258 L 0.088 -259 N 0.086 -260 P 0.085 -261 E 0.082 -262 N 0.075 -263 K 0.066 -264 D 0.062 -265 L 0.060 -266 I 0.059 -267 Y 0.061 -268 E 0.070 -269 L 0.077 -270 N 0.077 -271 I 0.067 -272 L 0.052 -273 N 0.039 -274 H 0.030 -275 M 0.026 -276 L 0.027 -277 L 0.034 -278 F 0.044 -279 I 0.052 -280 S 0.057 -281 K 0.062 -282 S 0.063 -283 S 0.060 -284 E 0.056 -285 P 0.056 -286 Y 0.057 -287 S 0.056 -288 T 0.054 -289 I 0.052 -290 S 0.049 -291 R 0.044 -292 H 0.040 -293 Y 0.036 -294 R 0.032 -295 Q 0.030 -296 I 0.030 -297 A 0.031 -298 K 0.030 -299 E 0.029 -300 F 0.032 -301 Q 0.038 -302 N 0.044 -303 K 0.047 -304 I 0.046 -305 L 0.043 -306 F 0.040 -307 V 0.042 -308 L 0.051 -309 V 0.064 -310 N 0.073 -311 A 0.076 -312 D 0.078 -313 E 0.081 -314 P 0.082 -315 K 0.074 -316 N 0.059 -317 K 0.046 -318 R 0.038 -319 I 0.034 -320 F 0.034 -321 E 0.037 -322 Y 0.042 -323 F 0.049 -324 Q 0.058 -325 I 0.063 -326 S 0.064 -327 R 0.063 -328 V 0.059 -329 N 0.052 -330 V 0.043 -331 P 0.034 -332 S 0.029 -333 V 0.027 -334 Q 0.029 -335 I 0.035 -336 L 0.047 -337 N 0.064 -338 L 0.081 -339 S 0.095 -340 S 0.109 -341 D 0.118 -342 G 0.114 -343 R 0.096 -344 Y 0.078 -345 K 0.068 -346 M 0.068 -347 P 0.074 -348 T 0.081 -349 D 0.084 -350 D 0.082 -351 I 0.075 -352 N 0.068 -353 F 0.061 -354 E 0.055 -355 S 0.051 -356 L 0.049 -357 K 0.047 -358 K 0.046 -359 F 0.048 -360 C 0.050 -361 N 0.053 -362 S 0.058 -363 F 0.066 -364 L 0.077 -365 S 0.093 -366 K 0.119 -367 T 0.152 -368 A 0.189 -369 K 0.227 -370 K 0.264 -371 H 0.301 -372 K 0.335 -373 A 0.363 -374 S 0.375 -375 E 0.359 -376 E 0.321 -377 I 0.278 -378 P 0.242 -379 K 0.213 -380 Y 0.192 -381 W 0.179 -382 D 0.172 -383 Q 0.169 -384 G 0.164 -385 P 0.159 -386 V 0.153 -387 K 0.148 -388 K 0.143 -389 L 0.138 -390 V 0.134 -391 G 0.129 -392 K 0.118 -393 N 0.099 -394 F 0.078 -395 N 0.065 -396 V 0.062 -397 V 0.065 -398 V 0.071 -399 L 0.080 -400 D 0.090 -401 K 0.097 -402 E 0.098 -403 K 0.094 -404 D 0.087 -405 V 0.076 -406 F 0.063 -407 V 0.052 -408 M 0.047 -409 F 0.047 -410 Y 0.051 -411 A 0.056 -412 P 0.062 -413 W 0.064 -414 S 0.065 -415 E 0.065 -416 K 0.066 -417 C 0.069 -418 R 0.074 -419 V 0.079 -420 L 0.083 -421 L 0.081 -422 P 0.073 -423 L 0.063 -424 L 0.054 -425 E 0.049 -426 E 0.046 -427 L 0.047 -428 G 0.053 -429 I 0.057 -430 K 0.058 -431 Y 0.057 -432 Q 0.058 -433 N 0.062 -434 H 0.064 -435 S 0.061 -436 T 0.056 -437 V 0.055 -438 I 0.057 -439 I 0.062 -440 A 0.068 -441 K 0.075 -442 I 0.082 -443 D 0.086 -444 I 0.086 -445 T 0.084 -446 A 0.083 -447 N 0.083 -448 D 0.086 -449 I 0.091 -450 Q 0.101 -451 L 0.121 -452 A 0.150 -453 N 0.176 -454 P 0.183 -455 E 0.167 -456 Q 0.137 -457 Y 0.109 -458 P 0.086 -459 F 0.068 -460 F 0.060 -461 R 0.065 -462 L 0.084 -463 F 0.109 -464 P 0.127 -465 T 0.130 -466 D 0.126 -467 S 0.123 -468 Q 0.119 -469 E 0.113 -470 A 0.109 -471 V 0.108 -472 M 0.110 -473 Y 0.112 -474 K 0.113 -475 G 0.112 -476 E 0.104 -477 H 0.092 -478 T 0.083 -479 M 0.081 -480 K 0.081 -481 G 0.079 -482 F 0.073 -483 C 0.067 -484 D 0.065 -485 F 0.064 -486 L 0.063 -487 E 0.065 -488 S 0.070 -489 H 0.076 -490 V 0.085 -491 K 0.106 -492 V 0.145 -493 R 0.194 -494 I 0.246 -495 E 0.300 -496 E 0.348 -497 E 0.375 -498 D 0.379 -499 E 0.376 -500 L 0.382 -501 L 0.396 -502 Y 0.415 -503 I 0.443 -504 E 0.471 -505 Q 0.492 -506 N 0.509 -507 E 0.530 -508 E 0.558 -509 E 0.587 -510 E 0.607 -511 V 0.609 -512 L 0.596 -513 A 0.584 -514 E 0.582 -515 P 0.579 -516 E 0.555 -517 I 0.514 -518 Q 0.494 -519 L 0.516 -520 I 0.554 -521 E 0.572 -522 K 0.570 -523 L 0.567 -524 P 0.576 -525 E 0.599 -526 N 0.623 -527 P 0.638 -528 L 0.657 -529 L 0.686 -530 K 0.716 -531 I 0.737 -532 E 0.749 -533 D 0.752 -534 T 0.744 -535 S 0.731 -536 K 0.721 -537 Q 0.717 -538 D 0.716 -539 R 0.718 -540 P 0.727 -541 V 0.737 -542 K 0.737 -543 E 0.725 -544 S 0.715 -545 P 0.715 -546 V 0.721 -547 L 0.725 -548 D 0.720 -549 S 0.702 -550 I 0.681 -551 R 0.669 -552 K 0.672 -553 P 0.679 -554 E 0.681 -555 E 0.680 -556 P 0.679 -557 E 0.669 -558 R 0.631 -559 R 0.568 -560 K 0.521 -561 E 0.513 -562 T 0.509 -563 A 0.487 -564 E 0.480 -565 R 0.514 -566 E 0.566 -567 A 0.604 -568 A 0.621 -569 A 0.620 -570 A 0.612 -571 Q 0.614 -572 P 0.630 -573 K 0.644 -574 E 0.643 -575 Q 0.634 -576 P 0.631 -577 K 0.642 -578 P 0.660 -579 E 0.671 -580 R 0.665 -581 K 0.642 -582 L 0.618 -583 E 0.603 -584 V 0.585 -585 K 0.545 -586 E 0.475 -587 E 0.396 -588 L 0.343 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030968.4_ENSMUST00000033267.4_GN:Pdilt_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030968.4_ENSMUST00000033267.4_GN:Pdilt_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid deleted file mode 100644 index 6735d7362c9e8cb6cc033cafff0766bbca8f80c1..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030968.4_ENSMUST00000033267.4_GN:Pdilt_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid +++ /dev/null @@ -1,605 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030968.4|ENSMUST00000033267.4|GN:Pdilt|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:16 -1 M 0.370 -2 W 0.394 -3 P 0.429 -4 D 0.460 -5 S 0.469 -6 P 0.454 -7 E 0.445 -8 S 0.471 -9 N 0.506 -10 P 0.511 -11 A 0.505 -12 A 0.523 -13 C 0.559 -14 R 0.587 -15 P 0.597 -16 S 0.573 -17 M 0.514 -18 E 0.449 -19 L 0.403 -20 L 0.366 -21 W 0.327 -22 T 0.298 -23 P 0.280 -24 L 0.261 -25 L 0.246 -26 L 0.250 -27 V 0.265 -28 A 0.268 -29 A 0.267 -30 C 0.276 -31 L 0.300 -32 S 0.338 -33 E 0.386 -34 V 0.433 -35 L 0.470 -36 G 0.499 -37 S 0.523 -38 P 0.544 -39 E 0.563 -40 I 0.583 -41 D 0.600 -42 T 0.603 -43 G 0.582 -44 I 0.547 -45 N 0.511 -46 I 0.470 -47 S 0.418 -48 Q 0.366 -49 P 0.321 -50 L 0.283 -51 H 0.252 -52 I 0.232 -53 L 0.216 -54 E 0.197 -55 D 0.175 -56 H 0.154 -57 N 0.134 -58 L 0.115 -59 M 0.098 -60 V 0.085 -61 L 0.074 -62 T 0.065 -63 P 0.055 -64 A 0.048 -65 G 0.045 -66 L 0.048 -67 T 0.057 -68 Q 0.064 -69 T 0.061 -70 L 0.053 -71 N 0.052 -72 E 0.057 -73 T 0.057 -74 R 0.047 -75 F 0.034 -76 L 0.028 -77 M 0.028 -78 V 0.030 -79 I 0.031 -80 F 0.034 -81 H 0.039 -82 N 0.044 -83 P 0.048 -84 S 0.050 -85 L 0.051 -86 K 0.052 -87 Q 0.052 -88 S 0.055 -89 R 0.062 -90 K 0.072 -91 L 0.080 -92 A 0.078 -93 K 0.067 -94 E 0.055 -95 L 0.045 -96 G 0.039 -97 K 0.035 -98 A 0.032 -99 A 0.030 -100 E 0.031 -101 I 0.039 -102 F 0.058 -103 G 0.087 -104 K 0.119 -105 G 0.143 -106 K 0.148 -107 N 0.134 -108 G 0.109 -109 L 0.083 -110 G 0.062 -111 F 0.047 -112 G 0.039 -113 K 0.039 -114 V 0.043 -115 D 0.047 -116 I 0.047 -117 T 0.043 -118 K 0.040 -119 E 0.037 -120 T 0.033 -121 E 0.032 -122 L 0.037 -123 Q 0.047 -124 Q 0.054 -125 E 0.052 -126 F 0.049 -127 D 0.052 -128 I 0.055 -129 T 0.055 -130 H 0.054 -131 A 0.055 -132 P 0.054 -133 E 0.049 -134 L 0.041 -135 K 0.033 -136 L 0.028 -137 F 0.028 -138 F 0.033 -139 E 0.042 -140 G 0.053 -141 N 0.061 -142 R 0.064 -143 L 0.063 -144 K 0.061 -145 P 0.059 -146 I 0.058 -147 S 0.065 -148 C 0.082 -149 K 0.102 -150 D 0.116 -151 V 0.117 -152 V 0.106 -153 E 0.090 -154 S 0.072 -155 T 0.058 -156 A 0.050 -157 L 0.047 -158 V 0.046 -159 V 0.047 -160 W 0.048 -161 L 0.051 -162 R 0.058 -163 R 0.071 -164 Q 0.090 -165 I 0.113 -166 S 0.135 -167 K 0.150 -168 K 0.149 -169 A 0.133 -170 L 0.109 -171 L 0.086 -172 F 0.071 -173 N 0.063 -174 N 0.058 -175 S 0.052 -176 D 0.045 -177 E 0.039 -178 V 0.038 -179 A 0.044 -180 D 0.048 -181 F 0.045 -182 V 0.037 -183 K 0.032 -184 S 0.030 -185 R 0.027 -186 P 0.023 -187 L 0.020 -188 V 0.020 -189 I 0.021 -190 V 0.023 -191 G 0.029 -192 F 0.038 -193 F 0.048 -194 Q 0.053 -195 D 0.057 -196 L 0.060 -197 E 0.062 -198 E 0.059 -199 E 0.052 -200 V 0.045 -201 A 0.039 -202 E 0.036 -203 L 0.035 -204 F 0.033 -205 Y 0.029 -206 D 0.027 -207 T 0.027 -208 I 0.029 -209 K 0.031 -210 D 0.034 -211 F 0.037 -212 P 0.037 -213 E 0.033 -214 L 0.029 -215 T 0.027 -216 F 0.028 -217 G 0.031 -218 A 0.038 -219 I 0.046 -220 Q 0.056 -221 I 0.068 -222 K 0.080 -223 N 0.085 -224 S 0.080 -225 F 0.070 -226 G 0.063 -227 R 0.060 -228 F 0.059 -229 H 0.057 -230 V 0.055 -231 I 0.052 -232 L 0.050 -233 D 0.045 -234 S 0.037 -235 V 0.028 -236 L 0.022 -237 V 0.020 -238 F 0.023 -239 K 0.029 -240 K 0.035 -241 G 0.039 -242 K 0.040 -243 I 0.040 -244 V 0.042 -245 K 0.049 -246 R 0.064 -247 Q 0.084 -248 E 0.107 -249 L 0.129 -250 I 0.152 -251 N 0.169 -252 D 0.174 -253 S 0.162 -254 T 0.136 -255 N 0.107 -256 K 0.081 -257 D 0.063 -258 H 0.054 -259 L 0.050 -260 N 0.048 -261 Q 0.047 -262 V 0.049 -263 I 0.053 -264 K 0.057 -265 Q 0.060 -266 Q 0.066 -267 L 0.075 -268 T 0.087 -269 G 0.097 -270 F 0.104 -271 V 0.106 -272 I 0.102 -273 E 0.095 -274 L 0.091 -275 N 0.089 -276 P 0.087 -277 E 0.084 -278 N 0.076 -279 K 0.067 -280 D 0.062 -281 L 0.061 -282 I 0.060 -283 Y 0.063 -284 E 0.071 -285 L 0.079 -286 N 0.079 -287 I 0.069 -288 L 0.054 -289 N 0.040 -290 H 0.031 -291 M 0.026 -292 L 0.028 -293 L 0.035 -294 F 0.045 -295 I 0.054 -296 S 0.059 -297 K 0.064 -298 S 0.066 -299 S 0.063 -300 E 0.059 -301 P 0.058 -302 Y 0.059 -303 S 0.058 -304 T 0.056 -305 I 0.054 -306 S 0.051 -307 R 0.046 -308 H 0.041 -309 Y 0.036 -310 R 0.033 -311 Q 0.031 -312 I 0.031 -313 A 0.032 -314 K 0.031 -315 E 0.030 -316 F 0.033 -317 Q 0.039 -318 N 0.045 -319 K 0.049 -320 I 0.048 -321 L 0.044 -322 F 0.041 -323 V 0.043 -324 L 0.053 -325 V 0.065 -326 N 0.075 -327 A 0.078 -328 D 0.080 -329 E 0.083 -330 P 0.084 -331 K 0.076 -332 N 0.061 -333 K 0.048 -334 R 0.039 -335 I 0.035 -336 F 0.035 -337 E 0.038 -338 Y 0.043 -339 F 0.050 -340 Q 0.059 -341 I 0.064 -342 S 0.065 -343 R 0.063 -344 V 0.060 -345 N 0.053 -346 V 0.043 -347 P 0.035 -348 S 0.030 -349 V 0.028 -350 Q 0.030 -351 I 0.037 -352 L 0.050 -353 N 0.067 -354 L 0.084 -355 S 0.098 -356 S 0.111 -357 D 0.119 -358 G 0.115 -359 R 0.098 -360 Y 0.078 -361 K 0.068 -362 M 0.068 -363 P 0.074 -364 T 0.080 -365 D 0.084 -366 D 0.081 -367 I 0.075 -368 N 0.068 -369 F 0.062 -370 E 0.056 -371 S 0.052 -372 L 0.049 -373 K 0.047 -374 K 0.047 -375 F 0.048 -376 C 0.051 -377 N 0.054 -378 S 0.059 -379 F 0.066 -380 L 0.077 -381 S 0.093 -382 K 0.119 -383 T 0.151 -384 A 0.188 -385 K 0.226 -386 K 0.265 -387 H 0.302 -388 K 0.338 -389 A 0.367 -390 S 0.378 -391 E 0.361 -392 E 0.322 -393 I 0.278 -394 P 0.242 -395 K 0.213 -396 Y 0.193 -397 W 0.180 -398 D 0.173 -399 Q 0.169 -400 G 0.164 -401 P 0.159 -402 V 0.153 -403 K 0.148 -404 K 0.144 -405 L 0.139 -406 V 0.135 -407 G 0.130 -408 K 0.118 -409 N 0.099 -410 F 0.078 -411 N 0.065 -412 V 0.063 -413 V 0.065 -414 V 0.072 -415 L 0.081 -416 D 0.091 -417 K 0.098 -418 E 0.099 -419 K 0.095 -420 D 0.087 -421 V 0.076 -422 F 0.063 -423 V 0.053 -424 M 0.048 -425 F 0.048 -426 Y 0.052 -427 A 0.057 -428 P 0.062 -429 W 0.065 -430 S 0.065 -431 E 0.065 -432 K 0.067 -433 C 0.070 -434 R 0.075 -435 V 0.080 -436 L 0.084 -437 L 0.082 -438 P 0.074 -439 L 0.063 -440 L 0.055 -441 E 0.050 -442 E 0.047 -443 L 0.048 -444 G 0.053 -445 I 0.058 -446 K 0.058 -447 Y 0.057 -448 Q 0.059 -449 N 0.063 -450 H 0.064 -451 S 0.061 -452 T 0.057 -453 V 0.055 -454 I 0.058 -455 I 0.063 -456 A 0.069 -457 K 0.076 -458 I 0.083 -459 D 0.087 -460 I 0.087 -461 T 0.086 -462 A 0.084 -463 N 0.084 -464 D 0.087 -465 I 0.092 -466 Q 0.103 -467 L 0.124 -468 A 0.153 -469 N 0.179 -470 P 0.187 -471 E 0.170 -472 Q 0.140 -473 Y 0.111 -474 P 0.087 -475 F 0.069 -476 F 0.061 -477 R 0.066 -478 L 0.085 -479 F 0.111 -480 P 0.130 -481 T 0.133 -482 D 0.128 -483 S 0.125 -484 Q 0.120 -485 E 0.114 -486 A 0.110 -487 V 0.110 -488 M 0.111 -489 Y 0.113 -490 K 0.114 -491 G 0.113 -492 E 0.105 -493 H 0.093 -494 T 0.084 -495 M 0.081 -496 K 0.082 -497 G 0.080 -498 F 0.073 -499 C 0.067 -500 D 0.065 -501 F 0.064 -502 L 0.064 -503 E 0.066 -504 S 0.071 -505 H 0.076 -506 V 0.085 -507 K 0.106 -508 V 0.144 -509 R 0.193 -510 I 0.245 -511 E 0.299 -512 E 0.349 -513 E 0.377 -514 D 0.381 -515 E 0.378 -516 L 0.384 -517 L 0.397 -518 Y 0.416 -519 I 0.444 -520 E 0.472 -521 Q 0.495 -522 N 0.514 -523 E 0.536 -524 E 0.563 -525 E 0.591 -526 E 0.611 -527 V 0.612 -528 L 0.598 -529 A 0.585 -530 E 0.583 -531 P 0.581 -532 E 0.557 -533 I 0.515 -534 Q 0.495 -535 L 0.519 -536 I 0.557 -537 E 0.576 -538 K 0.574 -539 L 0.570 -540 P 0.580 -541 E 0.603 -542 N 0.626 -543 P 0.641 -544 L 0.658 -545 L 0.687 -546 K 0.717 -547 I 0.738 -548 E 0.750 -549 D 0.754 -550 T 0.746 -551 S 0.733 -552 K 0.724 -553 Q 0.720 -554 D 0.718 -555 R 0.720 -556 P 0.729 -557 V 0.739 -558 K 0.738 -559 E 0.726 -560 S 0.716 -561 P 0.716 -562 V 0.723 -563 L 0.728 -564 D 0.723 -565 S 0.707 -566 I 0.686 -567 R 0.675 -568 K 0.677 -569 P 0.683 -570 E 0.684 -571 E 0.683 -572 P 0.682 -573 E 0.672 -574 R 0.634 -575 R 0.571 -576 K 0.525 -577 E 0.517 -578 T 0.514 -579 A 0.493 -580 E 0.486 -581 R 0.521 -582 E 0.574 -583 A 0.612 -584 A 0.630 -585 A 0.629 -586 A 0.620 -587 Q 0.621 -588 P 0.636 -589 K 0.649 -590 E 0.649 -591 Q 0.640 -592 P 0.637 -593 K 0.648 -594 P 0.666 -595 E 0.679 -596 R 0.676 -597 K 0.656 -598 L 0.634 -599 E 0.621 -600 V 0.605 -601 K 0.565 -602 E 0.495 -603 E 0.413 -604 L 0.358 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030980.19_ENSMUST00000106550.12_GN:Knop1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030980.19_ENSMUST00000106550.12_GN:Knop1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 35c879c204afe160c0990aa51a69a0e2b2046b58..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030980.19_ENSMUST00000106550.12_GN:Knop1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,481 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030980.19|ENSMUST00000106550.12|GN:Knop1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.525 -2 V 0.575 -3 S 0.643 -4 K 0.699 -5 T 0.737 -6 Q 0.765 -7 K 0.790 -8 A 0.807 -9 D 0.809 -10 L 0.801 -11 G 0.791 -12 P 0.787 -13 Q 0.787 -14 L 0.788 -15 P 0.793 -16 E 0.800 -17 K 0.803 -18 K 0.803 -19 K 0.802 -20 K 0.803 -21 K 0.806 -22 K 0.812 -23 K 0.823 -24 K 0.836 -25 K 0.849 -26 R 0.859 -27 V 0.866 -28 V 0.867 -29 A 0.862 -30 N 0.849 -31 V 0.830 -32 S 0.812 -33 E 0.804 -34 P 0.808 -35 E 0.820 -36 T 0.831 -37 Q 0.840 -38 Y 0.845 -39 S 0.846 -40 V 0.843 -41 L 0.835 -42 N 0.827 -43 S 0.820 -44 N 0.817 -45 D 0.819 -46 Y 0.827 -47 F 0.837 -48 I 0.840 -49 D 0.828 -50 A 0.804 -51 S 0.788 -52 P 0.796 -53 P 0.827 -54 R 0.859 -55 A 0.874 -56 T 0.871 -57 S 0.865 -58 P 0.867 -59 S 0.877 -60 N 0.890 -61 N 0.899 -62 V 0.902 -63 D 0.901 -64 E 0.894 -65 V 0.882 -66 Q 0.869 -67 I 0.862 -68 P 0.865 -69 E 0.871 -70 I 0.874 -71 S 0.871 -72 L 0.865 -73 S 0.860 -74 K 0.856 -75 R 0.851 -76 K 0.848 -77 K 0.848 -78 K 0.852 -79 K 0.855 -80 K 0.856 -81 S 0.856 -82 C 0.855 -83 S 0.856 -84 T 0.857 -85 H 0.860 -86 L 0.863 -87 E 0.864 -88 E 0.864 -89 C 0.863 -90 L 0.860 -91 G 0.854 -92 A 0.848 -93 E 0.844 -94 P 0.846 -95 T 0.851 -96 R 0.856 -97 A 0.853 -98 R 0.842 -99 Q 0.825 -100 K 0.802 -101 K 0.772 -102 S 0.738 -103 P 0.715 -104 S 0.711 -105 P 0.717 -106 R 0.726 -107 R 0.734 -108 Q 0.743 -109 A 0.751 -110 L 0.751 -111 E 0.741 -112 Q 0.728 -113 S 0.718 -114 A 0.711 -115 E 0.703 -116 G 0.692 -117 L 0.671 -118 I 0.641 -119 R 0.611 -120 E 0.597 -121 K 0.605 -122 K 0.631 -123 K 0.666 -124 K 0.698 -125 R 0.722 -126 R 0.737 -127 K 0.750 -128 S 0.762 -129 L 0.770 -130 S 0.775 -131 K 0.776 -132 A 0.776 -133 A 0.772 -134 S 0.772 -135 Q 0.780 -136 G 0.795 -137 S 0.811 -138 G 0.821 -139 L 0.823 -140 K 0.817 -141 T 0.801 -142 S 0.779 -143 P 0.761 -144 D 0.754 -145 P 0.756 -146 K 0.751 -147 H 0.719 -148 A 0.666 -149 K 0.641 -150 E 0.678 -151 V 0.743 -152 S 0.787 -153 K 0.803 -154 A 0.811 -155 G 0.818 -156 R 0.825 -157 K 0.829 -158 S 0.830 -159 K 0.830 -160 K 0.832 -161 Q 0.835 -162 R 0.837 -163 K 0.837 -164 E 0.834 -165 K 0.830 -166 K 0.829 -167 V 0.831 -168 P 0.838 -169 D 0.847 -170 T 0.850 -171 E 0.842 -172 A 0.825 -173 L 0.806 -174 P 0.795 -175 P 0.795 -176 Q 0.796 -177 D 0.791 -178 A 0.784 -179 W 0.785 -180 L 0.797 -181 Y 0.812 -182 E 0.825 -183 A 0.833 -184 G 0.835 -185 D 0.835 -186 S 0.833 -187 L 0.829 -188 H 0.826 -189 S 0.829 -190 C 0.835 -191 L 0.843 -192 E 0.850 -193 G 0.855 -194 A 0.855 -195 E 0.847 -196 A 0.834 -197 E 0.818 -198 E 0.795 -199 Q 0.771 -200 A 0.759 -201 A 0.765 -202 L 0.781 -203 G 0.795 -204 Q 0.804 -205 K 0.808 -206 R 0.809 -207 K 0.806 -208 Q 0.796 -209 G 0.782 -210 S 0.774 -211 P 0.774 -212 R 0.783 -213 D 0.793 -214 H 0.798 -215 N 0.800 -216 M 0.801 -217 K 0.805 -218 K 0.811 -219 K 0.819 -220 K 0.825 -221 K 0.828 -222 K 0.829 -223 T 0.828 -224 H 0.831 -225 Q 0.837 -226 E 0.846 -227 G 0.855 -228 D 0.863 -229 I 0.868 -230 L 0.872 -231 L 0.872 -232 V 0.871 -233 N 0.870 -234 S 0.872 -235 R 0.875 -236 V 0.878 -237 S 0.877 -238 V 0.871 -239 E 0.861 -240 N 0.849 -241 S 0.837 -242 L 0.826 -243 K 0.819 -244 K 0.821 -245 G 0.830 -246 S 0.842 -247 K 0.851 -248 K 0.858 -249 S 0.860 -250 V 0.858 -251 K 0.853 -252 S 0.848 -253 E 0.845 -254 A 0.842 -255 L 0.836 -256 E 0.828 -257 F 0.823 -258 V 0.822 -259 P 0.825 -260 I 0.828 -261 D 0.824 -262 S 0.815 -263 P 0.807 -264 K 0.807 -265 A 0.814 -266 P 0.827 -267 G 0.844 -268 K 0.859 -269 K 0.870 -270 K 0.874 -271 V 0.876 -272 K 0.876 -273 S 0.876 -274 K 0.877 -275 K 0.878 -276 K 0.875 -277 V 0.867 -278 E 0.854 -279 Q 0.845 -280 P 0.845 -281 V 0.851 -282 G 0.858 -283 E 0.863 -284 G 0.865 -285 L 0.866 -286 A 0.864 -287 V 0.859 -288 K 0.851 -289 R 0.843 -290 K 0.835 -291 K 0.815 -292 K 0.766 -293 K 0.698 -294 K 0.664 -295 K 0.698 -296 K 0.762 -297 R 0.808 -298 K 0.827 -299 E 0.836 -300 N 0.841 -301 G 0.840 -302 V 0.831 -303 K 0.816 -304 E 0.799 -305 D 0.787 -306 P 0.785 -307 W 0.796 -308 Q 0.815 -309 E 0.835 -310 E 0.849 -311 K 0.857 -312 E 0.863 -313 E 0.867 -314 S 0.869 -315 D 0.869 -316 T 0.871 -317 D 0.873 -318 L 0.874 -319 E 0.875 -320 V 0.875 -321 V 0.871 -322 L 0.865 -323 E 0.858 -324 K 0.853 -325 K 0.851 -326 G 0.849 -327 N 0.844 -328 M 0.830 -329 D 0.805 -330 E 0.772 -331 T 0.742 -332 C 0.710 -333 I 0.660 -334 D 0.592 -335 Q 0.530 -336 V 0.485 -337 R 0.446 -338 R 0.409 -339 K 0.402 -340 A 0.436 -341 L 0.470 -342 Q 0.471 -343 E 0.463 -344 E 0.477 -345 I 0.506 -346 D 0.534 -347 R 0.574 -348 E 0.632 -349 S 0.691 -350 G 0.736 -351 K 0.768 -352 T 0.790 -353 E 0.799 -354 A 0.792 -355 S 0.780 -356 E 0.776 -357 P 0.786 -358 K 0.804 -359 K 0.821 -360 W 0.834 -361 T 0.846 -362 V 0.857 -363 G 0.862 -364 L 0.861 -365 S 0.857 -366 V 0.852 -367 K 0.847 -368 T 0.839 -369 E 0.823 -370 A 0.796 -371 S 0.764 -372 E 0.742 -373 P 0.735 -374 K 0.734 -375 K 0.728 -376 W 0.718 -377 T 0.708 -378 G 0.691 -379 T 0.643 -380 Q 0.558 -381 F 0.456 -382 G 0.369 -383 Q 0.311 -384 W 0.281 -385 D 0.281 -386 T 0.310 -387 A 0.353 -388 G 0.370 -389 F 0.337 -390 E 0.272 -391 N 0.214 -392 E 0.180 -393 E 0.167 -394 Q 0.159 -395 K 0.154 -396 L 0.165 -397 K 0.193 -398 F 0.216 -399 L 0.229 -400 K 0.252 -401 L 0.292 -402 M 0.327 -403 G 0.337 -404 G 0.343 -405 F 0.367 -406 K 0.412 -407 H 0.467 -408 L 0.523 -409 S 0.573 -410 P 0.608 -411 S 0.625 -412 F 0.629 -413 S 0.633 -414 R 0.649 -415 P 0.678 -416 P 0.711 -417 S 0.734 -418 M 0.738 -419 T 0.722 -420 I 0.693 -421 R 0.661 -422 S 0.633 -423 N 0.605 -424 M 0.568 -425 A 0.521 -426 L 0.470 -427 D 0.417 -428 K 0.369 -429 K 0.336 -430 S 0.327 -431 S 0.351 -432 E 0.390 -433 M 0.411 -434 L 0.400 -435 Q 0.376 -436 Q 0.370 -437 S 0.387 -438 L 0.408 -439 Q 0.409 -440 Q 0.385 -441 D 0.351 -442 Y 0.326 -443 D 0.307 -444 R 0.285 -445 A 0.264 -446 M 0.255 -447 S 0.256 -448 W 0.258 -449 K 0.265 -450 Y 0.294 -451 S 0.360 -452 H 0.462 -453 G 0.572 -454 A 0.662 -455 G 0.716 -456 L 0.735 -457 G 0.721 -458 F 0.687 -459 N 0.646 -460 S 0.608 -461 E 0.572 -462 A 0.533 -463 R 0.502 -464 K 0.503 -465 V 0.550 -466 F 0.620 -467 Y 0.679 -468 I 0.708 -469 D 0.712 -470 R 0.705 -471 N 0.700 -472 A 0.705 -473 S 0.720 -474 K 0.739 -475 S 0.752 -476 I 0.754 -477 K 0.743 -478 L 0.711 -479 Q 0.658 -480 D 0.611 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030980.19_ENSMUST00000106550.12_GN:Knop1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:52.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030980.19_ENSMUST00000106550.12_GN:Knop1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:52.caid deleted file mode 100644 index ded3d5c082adfde4a9c227e693b4bf2aed6144a7..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030980.19_ENSMUST00000106550.12_GN:Knop1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:52.caid +++ /dev/null @@ -1,533 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030980.19|ENSMUST00000106550.12|GN:Knop1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:52 -1 M 0.528 -2 D 0.578 -3 A 0.629 -4 V 0.637 -5 S 0.608 -6 T 0.597 -7 A 0.642 -8 T 0.713 -9 Q 0.763 -10 G 0.781 -11 T 0.779 -12 G 0.763 -13 R 0.745 -14 P 0.738 -15 R 0.748 -16 P 0.765 -17 G 0.779 -18 R 0.786 -19 R 0.788 -20 R 0.789 -21 I 0.790 -22 S 0.792 -23 R 0.795 -24 G 0.798 -25 R 0.802 -26 A 0.807 -27 R 0.813 -28 K 0.820 -29 S 0.827 -30 K 0.832 -31 L 0.834 -32 T 0.835 -33 S 0.838 -34 G 0.843 -35 S 0.847 -36 R 0.850 -37 L 0.853 -38 R 0.857 -39 G 0.860 -40 C 0.860 -41 S 0.857 -42 R 0.854 -43 G 0.849 -44 D 0.839 -45 A 0.825 -46 W 0.814 -47 P 0.813 -48 A 0.820 -49 S 0.827 -50 E 0.837 -51 P 0.850 -52 V 0.861 -53 M 0.866 -54 V 0.868 -55 S 0.869 -56 K 0.871 -57 T 0.873 -58 Q 0.876 -59 K 0.876 -60 A 0.873 -61 D 0.864 -62 L 0.851 -63 G 0.838 -64 P 0.831 -65 Q 0.829 -66 L 0.831 -67 P 0.839 -68 E 0.851 -69 K 0.861 -70 K 0.864 -71 K 0.864 -72 K 0.863 -73 K 0.863 -74 K 0.863 -75 K 0.866 -76 K 0.872 -77 K 0.880 -78 R 0.888 -79 V 0.893 -80 V 0.894 -81 A 0.890 -82 N 0.877 -83 V 0.859 -84 S 0.841 -85 E 0.830 -86 P 0.830 -87 E 0.835 -88 T 0.843 -89 Q 0.849 -90 Y 0.851 -91 S 0.849 -92 V 0.843 -93 L 0.834 -94 N 0.826 -95 S 0.821 -96 N 0.821 -97 D 0.825 -98 Y 0.832 -99 F 0.842 -100 I 0.845 -101 D 0.833 -102 A 0.809 -103 S 0.789 -104 P 0.792 -105 P 0.817 -106 R 0.845 -107 A 0.856 -108 T 0.852 -109 S 0.842 -110 P 0.840 -111 S 0.848 -112 N 0.860 -113 N 0.868 -114 V 0.870 -115 D 0.867 -116 E 0.859 -117 V 0.845 -118 Q 0.830 -119 I 0.821 -120 P 0.823 -121 E 0.829 -122 I 0.830 -123 S 0.826 -124 L 0.820 -125 S 0.816 -126 K 0.814 -127 R 0.812 -128 K 0.813 -129 K 0.816 -130 K 0.820 -131 K 0.824 -132 K 0.826 -133 S 0.827 -134 C 0.826 -135 S 0.827 -136 T 0.832 -137 H 0.837 -138 L 0.842 -139 E 0.845 -140 E 0.847 -141 C 0.849 -142 L 0.848 -143 G 0.844 -144 A 0.838 -145 E 0.834 -146 P 0.834 -147 T 0.840 -148 R 0.845 -149 A 0.844 -150 R 0.835 -151 Q 0.820 -152 K 0.802 -153 K 0.777 -154 S 0.749 -155 P 0.728 -156 S 0.720 -157 P 0.723 -158 R 0.731 -159 R 0.743 -160 Q 0.757 -161 A 0.765 -162 L 0.763 -163 E 0.754 -164 Q 0.744 -165 S 0.732 -166 A 0.718 -167 E 0.704 -168 G 0.691 -169 L 0.669 -170 I 0.635 -171 R 0.603 -172 E 0.586 -173 K 0.588 -174 K 0.608 -175 K 0.640 -176 K 0.675 -177 R 0.705 -178 R 0.728 -179 K 0.746 -180 S 0.762 -181 L 0.772 -182 S 0.777 -183 K 0.780 -184 A 0.782 -185 A 0.781 -186 S 0.781 -187 Q 0.787 -188 G 0.799 -189 S 0.813 -190 G 0.821 -191 L 0.823 -192 K 0.817 -193 T 0.801 -194 S 0.779 -195 P 0.759 -196 D 0.752 -197 P 0.753 -198 K 0.748 -199 H 0.718 -200 A 0.667 -201 K 0.644 -202 E 0.682 -203 V 0.747 -204 S 0.789 -205 K 0.804 -206 A 0.808 -207 G 0.812 -208 R 0.816 -209 K 0.818 -210 S 0.817 -211 K 0.816 -212 K 0.818 -213 Q 0.821 -214 R 0.823 -215 K 0.823 -216 E 0.821 -217 K 0.819 -218 K 0.819 -219 V 0.821 -220 P 0.827 -221 D 0.834 -222 T 0.835 -223 E 0.827 -224 A 0.811 -225 L 0.793 -226 P 0.781 -227 P 0.779 -228 Q 0.778 -229 D 0.771 -230 A 0.760 -231 W 0.759 -232 L 0.771 -233 Y 0.789 -234 E 0.805 -235 A 0.813 -236 G 0.816 -237 D 0.815 -238 S 0.814 -239 L 0.809 -240 H 0.806 -241 S 0.807 -242 C 0.812 -243 L 0.819 -244 E 0.827 -245 G 0.835 -246 A 0.835 -247 E 0.827 -248 A 0.814 -249 E 0.795 -250 E 0.767 -251 Q 0.737 -252 A 0.719 -253 A 0.722 -254 L 0.739 -255 G 0.759 -256 Q 0.773 -257 K 0.779 -258 R 0.780 -259 K 0.776 -260 Q 0.765 -261 G 0.752 -262 S 0.744 -263 P 0.747 -264 R 0.757 -265 D 0.767 -266 H 0.772 -267 N 0.772 -268 M 0.774 -269 K 0.780 -270 K 0.789 -271 K 0.797 -272 K 0.803 -273 K 0.806 -274 K 0.807 -275 T 0.806 -276 H 0.808 -277 Q 0.816 -278 E 0.827 -279 G 0.838 -280 D 0.846 -281 I 0.851 -282 L 0.852 -283 L 0.852 -284 V 0.851 -285 N 0.851 -286 S 0.853 -287 R 0.858 -288 V 0.863 -289 S 0.864 -290 V 0.861 -291 E 0.854 -292 N 0.845 -293 S 0.833 -294 L 0.821 -295 K 0.813 -296 K 0.814 -297 G 0.822 -298 S 0.831 -299 K 0.840 -300 K 0.847 -301 S 0.851 -302 V 0.850 -303 K 0.845 -304 S 0.840 -305 E 0.834 -306 A 0.829 -307 L 0.823 -308 E 0.818 -309 F 0.816 -310 V 0.816 -311 P 0.820 -312 I 0.823 -313 D 0.820 -314 S 0.812 -315 P 0.806 -316 K 0.807 -317 A 0.815 -318 P 0.828 -319 G 0.844 -320 K 0.860 -321 K 0.871 -322 K 0.876 -323 V 0.877 -324 K 0.878 -325 S 0.879 -326 K 0.879 -327 K 0.880 -328 K 0.879 -329 V 0.872 -330 E 0.861 -331 Q 0.853 -332 P 0.852 -333 V 0.857 -334 G 0.863 -335 E 0.866 -336 G 0.866 -337 L 0.864 -338 A 0.857 -339 V 0.835 -340 K 0.783 -341 R 0.713 -342 K 0.672 -343 K 0.683 -344 K 0.697 -345 K 0.674 -346 K 0.658 -347 K 0.697 -348 K 0.764 -349 R 0.810 -350 K 0.830 -351 E 0.838 -352 N 0.842 -353 G 0.839 -354 V 0.828 -355 K 0.812 -356 E 0.795 -357 D 0.780 -358 P 0.773 -359 W 0.779 -360 Q 0.798 -361 E 0.819 -362 E 0.835 -363 K 0.845 -364 E 0.852 -365 E 0.856 -366 S 0.857 -367 D 0.857 -368 T 0.859 -369 D 0.861 -370 L 0.864 -371 E 0.867 -372 V 0.868 -373 V 0.865 -374 L 0.859 -375 E 0.851 -376 K 0.845 -377 K 0.841 -378 G 0.838 -379 N 0.832 -380 M 0.816 -381 D 0.784 -382 E 0.743 -383 T 0.701 -384 C 0.658 -385 I 0.600 -386 D 0.529 -387 Q 0.468 -388 V 0.426 -389 R 0.386 -390 R 0.347 -391 K 0.336 -392 A 0.366 -393 L 0.405 -394 Q 0.418 -395 E 0.415 -396 E 0.428 -397 I 0.454 -398 D 0.486 -399 R 0.532 -400 E 0.597 -401 S 0.661 -402 G 0.708 -403 K 0.740 -404 T 0.760 -405 E 0.767 -406 A 0.758 -407 S 0.747 -408 E 0.747 -409 P 0.762 -410 K 0.784 -411 K 0.802 -412 W 0.816 -413 T 0.829 -414 V 0.841 -415 G 0.846 -416 L 0.844 -417 S 0.838 -418 V 0.831 -419 K 0.825 -420 T 0.816 -421 E 0.800 -422 A 0.773 -423 S 0.742 -424 E 0.722 -425 P 0.717 -426 K 0.719 -427 K 0.718 -428 W 0.713 -429 T 0.707 -430 G 0.689 -431 T 0.639 -432 Q 0.556 -433 F 0.462 -434 G 0.383 -435 Q 0.327 -436 W 0.296 -437 D 0.294 -438 T 0.323 -439 A 0.365 -440 G 0.382 -441 F 0.349 -442 E 0.283 -443 N 0.222 -444 E 0.186 -445 E 0.170 -446 Q 0.160 -447 K 0.155 -448 L 0.168 -449 K 0.196 -450 F 0.222 -451 L 0.242 -452 K 0.272 -453 L 0.317 -454 M 0.354 -455 G 0.369 -456 G 0.379 -457 F 0.407 -458 K 0.452 -459 H 0.501 -460 L 0.548 -461 S 0.589 -462 P 0.619 -463 S 0.634 -464 F 0.638 -465 S 0.640 -466 R 0.653 -467 P 0.682 -468 P 0.718 -469 S 0.745 -470 M 0.753 -471 T 0.741 -472 I 0.714 -473 R 0.684 -474 S 0.660 -475 N 0.638 -476 M 0.606 -477 A 0.562 -478 L 0.513 -479 D 0.461 -480 K 0.409 -481 K 0.366 -482 S 0.348 -483 S 0.367 -484 E 0.404 -485 M 0.424 -486 L 0.409 -487 Q 0.377 -488 Q 0.361 -489 S 0.376 -490 L 0.403 -491 Q 0.413 -492 Q 0.390 -493 D 0.354 -494 Y 0.332 -495 D 0.324 -496 R 0.310 -497 A 0.291 -498 M 0.281 -499 S 0.279 -500 W 0.278 -501 K 0.281 -502 Y 0.306 -503 S 0.367 -504 H 0.464 -505 G 0.569 -506 A 0.653 -507 G 0.703 -508 L 0.717 -509 G 0.699 -510 F 0.660 -511 N 0.612 -512 S 0.560 -513 E 0.513 -514 A 0.476 -515 R 0.457 -516 K 0.472 -517 V 0.527 -518 F 0.602 -519 Y 0.666 -520 I 0.696 -521 D 0.690 -522 R 0.668 -523 N 0.654 -524 A 0.667 -525 S 0.699 -526 K 0.727 -527 S 0.738 -528 I 0.735 -529 K 0.728 -530 L 0.723 -531 Q 0.712 -532 D 0.698 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030986.14_ENSMUST00000033290.12_GN:Dhx32_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030986.14_ENSMUST00000033290.12_GN:Dhx32_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 37370e303bd03c72e18afc3956b8da52a5aeecb6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030986.14_ENSMUST00000033290.12_GN:Dhx32_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,745 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030986.14|ENSMUST00000033290.12|GN:Dhx32|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.370 -2 D 0.363 -3 E 0.370 -4 E 0.402 -5 E 0.437 -6 L 0.458 -7 D 0.473 -8 H 0.493 -9 P 0.509 -10 N 0.513 -11 A 0.504 -12 S 0.488 -13 P 0.469 -14 E 0.453 -15 K 0.438 -16 R 0.419 -17 Y 0.398 -18 F 0.380 -19 P 0.374 -20 E 0.403 -21 S 0.466 -22 L 0.535 -23 D 0.583 -24 S 0.610 -25 S 0.623 -26 D 0.627 -27 G 0.623 -28 D 0.613 -29 E 0.597 -30 E 0.575 -31 G 0.541 -32 V 0.498 -33 L 0.456 -34 A 0.425 -35 C 0.401 -36 E 0.368 -37 D 0.325 -38 L 0.279 -39 E 0.241 -40 L 0.212 -41 N 0.190 -42 P 0.170 -43 F 0.163 -44 D 0.176 -45 G 0.203 -46 L 0.223 -47 P 0.221 -48 Y 0.193 -49 S 0.154 -50 S 0.121 -51 R 0.103 -52 Y 0.096 -53 Y 0.095 -54 K 0.099 -55 L 0.103 -56 L 0.106 -57 K 0.106 -58 E 0.102 -59 R 0.093 -60 E 0.083 -61 E 0.078 -62 L 0.075 -63 P 0.070 -64 I 0.062 -65 W 0.056 -66 K 0.050 -67 E 0.042 -68 K 0.033 -69 Y 0.027 -70 S 0.026 -71 F 0.035 -72 M 0.050 -73 E 0.060 -74 S 0.057 -75 L 0.047 -76 L 0.042 -77 Q 0.042 -78 N 0.046 -79 Q 0.052 -80 V 0.062 -81 V 0.075 -82 V 0.086 -83 V 0.092 -84 S 0.094 -85 G 0.097 -86 D 0.107 -87 S 0.118 -88 K 0.122 -89 C 0.119 -90 G 0.114 -91 K 0.111 -92 S 0.107 -93 S 0.099 -94 Q 0.088 -95 V 0.076 -96 P 0.063 -97 Q 0.051 -98 W 0.042 -99 C 0.037 -100 A 0.035 -101 E 0.033 -102 Y 0.034 -103 C 0.037 -104 L 0.042 -105 S 0.045 -106 I 0.048 -107 H 0.053 -108 Y 0.061 -109 Q 0.071 -110 H 0.075 -111 G 0.071 -112 G 0.064 -113 V 0.058 -114 I 0.059 -115 C 0.066 -116 T 0.079 -117 Q 0.089 -118 A 0.085 -119 H 0.070 -120 K 0.055 -121 Q 0.045 -122 T 0.039 -123 A 0.037 -124 V 0.039 -125 Q 0.045 -126 L 0.052 -127 A 0.057 -128 L 0.063 -129 R 0.070 -130 V 0.075 -131 A 0.076 -132 D 0.074 -133 E 0.070 -134 M 0.067 -135 D 0.066 -136 V 0.068 -137 N 0.068 -138 I 0.066 -139 G 0.060 -140 H 0.057 -141 E 0.056 -142 V 0.057 -143 G 0.055 -144 Y 0.051 -145 V 0.050 -146 I 0.050 -147 P 0.052 -148 F 0.057 -149 E 0.067 -150 N 0.075 -151 C 0.078 -152 C 0.077 -153 T 0.075 -154 T 0.074 -155 E 0.074 -156 T 0.072 -157 I 0.071 -158 L 0.073 -159 R 0.075 -160 Y 0.074 -161 C 0.070 -162 T 0.064 -163 D 0.056 -164 D 0.049 -165 M 0.045 -166 L 0.042 -167 Q 0.038 -168 R 0.034 -169 E 0.032 -170 M 0.031 -171 M 0.029 -172 S 0.027 -173 N 0.025 -174 P 0.024 -175 F 0.024 -176 L 0.026 -177 G 0.029 -178 S 0.031 -179 Y 0.033 -180 G 0.034 -181 V 0.036 -182 I 0.040 -183 I 0.041 -184 L 0.040 -185 D 0.037 -186 D 0.034 -187 V 0.031 -188 H 0.029 -189 E 0.028 -190 R 0.031 -191 S 0.036 -192 L 0.042 -193 A 0.047 -194 T 0.048 -195 D 0.047 -196 V 0.044 -197 L 0.041 -198 L 0.036 -199 G 0.032 -200 L 0.029 -201 L 0.025 -202 K 0.023 -203 D 0.023 -204 V 0.025 -205 L 0.028 -206 L 0.031 -207 A 0.034 -208 R 0.035 -209 P 0.034 -210 E 0.031 -211 L 0.028 -212 K 0.030 -213 L 0.036 -214 I 0.044 -215 V 0.050 -216 N 0.054 -217 C 0.060 -218 S 0.065 -219 P 0.066 -220 L 0.064 -221 L 0.061 -222 T 0.057 -223 S 0.054 -224 K 0.053 -225 L 0.054 -226 S 0.057 -227 S 0.060 -228 Y 0.062 -229 Y 0.069 -230 G 0.081 -231 D 0.092 -232 V 0.092 -233 P 0.082 -234 V 0.075 -235 I 0.078 -236 E 0.088 -237 V 0.104 -238 R 0.130 -239 N 0.162 -240 K 0.186 -241 H 0.192 -242 P 0.179 -243 V 0.157 -244 E 0.135 -245 V 0.121 -246 V 0.117 -247 Y 0.122 -248 L 0.130 -249 S 0.139 -250 G 0.147 -251 A 0.151 -252 Q 0.145 -253 K 0.126 -254 D 0.101 -255 S 0.079 -256 F 0.063 -257 E 0.054 -258 S 0.049 -259 V 0.045 -260 I 0.042 -261 R 0.041 -262 L 0.041 -263 I 0.041 -264 F 0.041 -265 E 0.041 -266 I 0.045 -267 H 0.052 -268 R 0.060 -269 S 0.066 -270 G 0.066 -271 E 0.060 -272 K 0.054 -273 G 0.051 -274 D 0.052 -275 V 0.056 -276 V 0.060 -277 V 0.061 -278 F 0.058 -279 L 0.052 -280 A 0.047 -281 C 0.050 -282 E 0.061 -283 Q 0.069 -284 D 0.063 -285 I 0.049 -286 E 0.038 -287 K 0.038 -288 T 0.049 -289 Y 0.062 -290 E 0.067 -291 L 0.061 -292 V 0.056 -293 C 0.062 -294 Q 0.072 -295 E 0.081 -296 G 0.089 -297 S 0.099 -298 N 0.107 -299 L 0.109 -300 N 0.108 -301 P 0.106 -302 D 0.109 -303 V 0.113 -304 G 0.108 -305 D 0.093 -306 L 0.073 -307 V 0.059 -308 V 0.053 -309 I 0.049 -310 P 0.044 -311 L 0.041 -312 Y 0.044 -313 P 0.058 -314 K 0.081 -315 E 0.104 -316 K 0.125 -317 C 0.148 -318 S 0.176 -319 L 0.202 -320 F 0.226 -321 R 0.260 -322 P 0.302 -323 V 0.333 -324 D 0.342 -325 E 0.340 -326 T 0.336 -327 E 0.327 -328 K 0.310 -329 R 0.290 -330 C 0.271 -331 Q 0.253 -332 V 0.234 -333 Y 0.208 -334 Q 0.174 -335 R 0.142 -336 R 0.124 -337 V 0.115 -338 V 0.105 -339 L 0.092 -340 T 0.078 -341 T 0.070 -342 S 0.074 -343 C 0.085 -344 G 0.093 -345 E 0.092 -346 S 0.083 -347 L 0.075 -348 I 0.068 -349 W 0.064 -350 S 0.064 -351 H 0.063 -352 T 0.058 -353 V 0.048 -354 K 0.038 -355 F 0.032 -356 V 0.035 -357 I 0.046 -358 D 0.062 -359 V 0.076 -360 G 0.085 -361 L 0.092 -362 E 0.099 -363 R 0.103 -364 R 0.103 -365 Q 0.098 -366 V 0.093 -367 Y 0.089 -368 N 0.088 -369 P 0.089 -370 R 0.092 -371 I 0.100 -372 R 0.111 -373 A 0.118 -374 N 0.121 -375 S 0.123 -376 L 0.131 -377 V 0.141 -378 L 0.149 -379 Q 0.150 -380 P 0.137 -381 I 0.112 -382 S 0.086 -383 Q 0.068 -384 S 0.057 -385 Q 0.052 -386 A 0.051 -387 E 0.051 -388 I 0.052 -389 R 0.056 -390 K 0.061 -391 Q 0.068 -392 L 0.083 -393 L 0.107 -394 G 0.134 -395 S 0.153 -396 S 0.166 -397 P 0.172 -398 S 0.176 -399 G 0.178 -400 K 0.176 -401 L 0.167 -402 F 0.149 -403 C 0.129 -404 L 0.111 -405 Y 0.098 -406 T 0.095 -407 E 0.102 -408 E 0.111 -409 F 0.117 -410 A 0.125 -411 S 0.134 -412 K 0.140 -413 D 0.136 -414 M 0.125 -415 R 0.120 -416 P 0.130 -417 L 0.154 -418 K 0.187 -419 P 0.219 -420 A 0.239 -421 E 0.241 -422 M 0.224 -423 Q 0.193 -424 E 0.160 -425 A 0.137 -426 N 0.123 -427 L 0.109 -428 T 0.091 -429 S 0.071 -430 M 0.056 -431 V 0.049 -432 L 0.047 -433 F 0.046 -434 M 0.046 -435 K 0.045 -436 R 0.045 -437 V 0.051 -438 D 0.063 -439 I 0.081 -440 A 0.103 -441 G 0.129 -442 L 0.154 -443 G 0.168 -444 R 0.165 -445 C 0.148 -446 D 0.123 -447 F 0.101 -448 M 0.089 -449 N 0.090 -450 R 0.099 -451 P 0.106 -452 A 0.105 -453 P 0.098 -454 E 0.090 -455 S 0.084 -456 L 0.078 -457 M 0.074 -458 Q 0.077 -459 A 0.084 -460 L 0.086 -461 E 0.084 -462 D 0.085 -463 L 0.086 -464 D 0.084 -465 Y 0.079 -466 L 0.076 -467 A 0.081 -468 A 0.091 -469 L 0.099 -470 D 0.103 -471 N 0.103 -472 D 0.105 -473 G 0.107 -474 N 0.102 -475 L 0.090 -476 S 0.072 -477 E 0.059 -478 F 0.056 -479 G 0.061 -480 I 0.068 -481 I 0.073 -482 M 0.076 -483 S 0.077 -484 E 0.077 -485 F 0.081 -486 P 0.089 -487 L 0.097 -488 D 0.097 -489 P 0.087 -490 Q 0.073 -491 L 0.067 -492 S 0.068 -493 K 0.069 -494 S 0.072 -495 I 0.078 -496 L 0.083 -497 A 0.080 -498 S 0.071 -499 C 0.065 -500 E 0.066 -501 F 0.070 -502 D 0.073 -503 C 0.071 -504 V 0.066 -505 D 0.068 -506 E 0.077 -507 M 0.089 -508 L 0.097 -509 T 0.107 -510 I 0.120 -511 A 0.126 -512 A 0.118 -513 M 0.103 -514 V 0.096 -515 T 0.100 -516 A 0.111 -517 P 0.123 -518 S 0.138 -519 C 0.152 -520 F 0.157 -521 L 0.157 -522 H 0.163 -523 V 0.178 -524 P 0.193 -525 H 0.196 -526 G 0.183 -527 A 0.156 -528 E 0.125 -529 E 0.103 -530 A 0.092 -531 A 0.085 -532 V 0.078 -533 T 0.074 -534 C 0.072 -535 W 0.067 -536 K 0.063 -537 T 0.063 -538 F 0.072 -539 L 0.089 -540 H 0.107 -541 P 0.120 -542 E 0.123 -543 G 0.120 -544 D 0.113 -545 H 0.104 -546 F 0.098 -547 T 0.094 -548 L 0.089 -549 I 0.081 -550 N 0.072 -551 V 0.065 -552 Y 0.058 -553 N 0.050 -554 A 0.043 -555 Y 0.042 -556 Q 0.047 -557 D 0.056 -558 T 0.065 -559 V 0.077 -560 L 0.094 -561 N 0.113 -562 S 0.125 -563 A 0.128 -564 N 0.126 -565 E 0.120 -566 H 0.109 -567 C 0.096 -568 V 0.088 -569 E 0.085 -570 M 0.084 -571 W 0.078 -572 C 0.073 -573 H 0.072 -574 D 0.075 -575 C 0.077 -576 F 0.075 -577 L 0.072 -578 S 0.069 -579 C 0.070 -580 S 0.078 -581 A 0.087 -582 L 0.092 -583 R 0.095 -584 M 0.101 -585 A 0.109 -586 D 0.114 -587 V 0.117 -588 I 0.116 -589 R 0.110 -590 A 0.101 -591 E 0.093 -592 L 0.091 -593 L 0.092 -594 E 0.090 -595 I 0.081 -596 I 0.067 -597 K 0.057 -598 R 0.056 -599 I 0.063 -600 E 0.075 -601 L 0.085 -602 P 0.091 -603 Y 0.098 -604 A 0.116 -605 E 0.147 -606 P 0.180 -607 A 0.207 -608 F 0.228 -609 G 0.235 -610 S 0.217 -611 K 0.178 -612 E 0.137 -613 N 0.108 -614 G 0.089 -615 L 0.076 -616 N 0.067 -617 I 0.066 -618 K 0.069 -619 K 0.074 -620 A 0.076 -621 L 0.071 -622 L 0.065 -623 S 0.063 -624 G 0.062 -625 Y 0.059 -626 F 0.055 -627 M 0.055 -628 Q 0.058 -629 I 0.059 -630 A 0.059 -631 R 0.064 -632 D 0.077 -633 V 0.097 -634 D 0.121 -635 G 0.142 -636 S 0.148 -637 G 0.132 -638 N 0.100 -639 Y 0.068 -640 L 0.050 -641 M 0.046 -642 L 0.050 -643 T 0.057 -644 H 0.064 -645 K 0.075 -646 Q 0.085 -647 V 0.087 -648 A 0.082 -649 Q 0.076 -650 L 0.076 -651 H 0.076 -652 P 0.073 -653 L 0.072 -654 S 0.081 -655 S 0.099 -656 Y 0.119 -657 S 0.132 -658 I 0.134 -659 T 0.127 -660 K 0.119 -661 K 0.117 -662 M 0.116 -663 P 0.113 -664 E 0.106 -665 W 0.101 -666 V 0.097 -667 L 0.091 -668 F 0.084 -669 H 0.083 -670 Q 0.088 -671 F 0.096 -672 S 0.100 -673 I 0.098 -674 S 0.095 -675 E 0.097 -676 N 0.103 -677 N 0.105 -678 Y 0.098 -679 I 0.086 -680 R 0.076 -681 V 0.072 -682 A 0.073 -683 S 0.078 -684 A 0.082 -685 V 0.084 -686 S 0.081 -687 P 0.076 -688 E 0.069 -689 L 0.062 -690 F 0.058 -691 M 0.058 -692 Q 0.064 -693 L 0.072 -694 V 0.078 -695 P 0.077 -696 Q 0.075 -697 Y 0.078 -698 Y 0.087 -699 F 0.099 -700 S 0.117 -701 N 0.138 -702 L 0.159 -703 P 0.173 -704 P 0.175 -705 S 0.165 -706 E 0.151 -707 S 0.146 -708 K 0.156 -709 D 0.173 -710 I 0.189 -711 L 0.203 -712 Q 0.220 -713 Q 0.244 -714 A 0.281 -715 A 0.330 -716 G 0.381 -717 H 0.434 -718 L 0.488 -719 P 0.540 -720 T 0.580 -721 E 0.600 -722 T 0.597 -723 V 0.581 -724 N 0.570 -725 K 0.571 -726 D 0.567 -727 Q 0.544 -728 D 0.504 -729 V 0.463 -730 C 0.433 -731 D 0.416 -732 K 0.420 -733 C 0.452 -734 P 0.503 -735 D 0.553 -736 A 0.585 -737 T 0.595 -738 E 0.590 -739 Q 0.570 -740 R 0.531 -741 C 0.481 -742 T 0.436 -743 I 0.406 -744 Q 0.394 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030986.14_ENSMUST00000033290.12_GN:Dhx32_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030986.14_ENSMUST00000033290.12_GN:Dhx32_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid deleted file mode 100644 index 8e1ba8ff6e713a0c8df958a94f922ba2cfedc595..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000030986.14_ENSMUST00000033290.12_GN:Dhx32_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid +++ /dev/null @@ -1,752 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000030986.14|ENSMUST00000033290.12|GN:Dhx32|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:7 -1 M 0.312 -2 S 0.322 -3 S 0.338 -4 L 0.346 -5 R 0.329 -6 E 0.305 -7 E 0.314 -8 M 0.351 -9 D 0.377 -10 E 0.386 -11 E 0.403 -12 E 0.425 -13 L 0.438 -14 D 0.451 -15 H 0.479 -16 P 0.512 -17 N 0.532 -18 A 0.529 -19 S 0.510 -20 P 0.487 -21 E 0.468 -22 K 0.449 -23 R 0.429 -24 Y 0.413 -25 F 0.411 -26 P 0.432 -27 E 0.469 -28 S 0.511 -29 L 0.547 -30 D 0.579 -31 S 0.606 -32 S 0.625 -33 D 0.635 -34 G 0.637 -35 D 0.631 -36 E 0.616 -37 E 0.592 -38 G 0.558 -39 V 0.516 -40 L 0.478 -41 A 0.449 -42 C 0.422 -43 E 0.385 -44 D 0.337 -45 L 0.287 -46 E 0.245 -47 L 0.214 -48 N 0.191 -49 P 0.171 -50 F 0.165 -51 D 0.178 -52 G 0.205 -53 L 0.226 -54 P 0.223 -55 Y 0.194 -56 S 0.155 -57 S 0.123 -58 R 0.105 -59 Y 0.097 -60 Y 0.096 -61 K 0.100 -62 L 0.103 -63 L 0.105 -64 K 0.104 -65 E 0.100 -66 R 0.093 -67 E 0.083 -68 E 0.077 -69 L 0.074 -70 P 0.069 -71 I 0.061 -72 W 0.054 -73 K 0.049 -74 E 0.041 -75 K 0.032 -76 Y 0.026 -77 S 0.026 -78 F 0.035 -79 M 0.049 -80 E 0.059 -81 S 0.056 -82 L 0.047 -83 L 0.041 -84 Q 0.042 -85 N 0.046 -86 Q 0.052 -87 V 0.062 -88 V 0.075 -89 V 0.086 -90 V 0.092 -91 S 0.093 -92 G 0.096 -93 D 0.105 -94 S 0.116 -95 K 0.121 -96 C 0.118 -97 G 0.112 -98 K 0.109 -99 S 0.105 -100 S 0.098 -101 Q 0.087 -102 V 0.074 -103 P 0.062 -104 Q 0.050 -105 W 0.041 -106 C 0.036 -107 A 0.034 -108 E 0.033 -109 Y 0.033 -110 C 0.036 -111 L 0.041 -112 S 0.044 -113 I 0.047 -114 H 0.052 -115 Y 0.061 -116 Q 0.070 -117 H 0.075 -118 G 0.071 -119 G 0.063 -120 V 0.058 -121 I 0.059 -122 C 0.066 -123 T 0.079 -124 Q 0.089 -125 A 0.085 -126 H 0.070 -127 K 0.055 -128 Q 0.044 -129 T 0.039 -130 A 0.037 -131 V 0.039 -132 Q 0.045 -133 L 0.052 -134 A 0.057 -135 L 0.062 -136 R 0.069 -137 V 0.074 -138 A 0.076 -139 D 0.073 -140 E 0.070 -141 M 0.067 -142 D 0.066 -143 V 0.067 -144 N 0.068 -145 I 0.065 -146 G 0.060 -147 H 0.056 -148 E 0.056 -149 V 0.057 -150 G 0.054 -151 Y 0.050 -152 V 0.049 -153 I 0.049 -154 P 0.051 -155 F 0.057 -156 E 0.066 -157 N 0.074 -158 C 0.077 -159 C 0.076 -160 T 0.074 -161 T 0.073 -162 E 0.073 -163 T 0.071 -164 I 0.070 -165 L 0.072 -166 R 0.074 -167 Y 0.073 -168 C 0.069 -169 T 0.063 -170 D 0.055 -171 D 0.048 -172 M 0.044 -173 L 0.041 -174 Q 0.037 -175 R 0.034 -176 E 0.031 -177 M 0.030 -178 M 0.028 -179 S 0.027 -180 N 0.025 -181 P 0.023 -182 F 0.023 -183 L 0.025 -184 G 0.028 -185 S 0.030 -186 Y 0.032 -187 G 0.033 -188 V 0.036 -189 I 0.039 -190 I 0.040 -191 L 0.039 -192 D 0.036 -193 D 0.033 -194 V 0.030 -195 H 0.028 -196 E 0.027 -197 R 0.030 -198 S 0.035 -199 L 0.041 -200 A 0.046 -201 T 0.047 -202 D 0.046 -203 V 0.043 -204 L 0.039 -205 L 0.035 -206 G 0.031 -207 L 0.028 -208 L 0.024 -209 K 0.022 -210 D 0.022 -211 V 0.024 -212 L 0.027 -213 L 0.030 -214 A 0.033 -215 R 0.034 -216 P 0.033 -217 E 0.030 -218 L 0.027 -219 K 0.029 -220 L 0.036 -221 I 0.044 -222 V 0.049 -223 N 0.053 -224 C 0.058 -225 S 0.063 -226 P 0.065 -227 L 0.063 -228 L 0.059 -229 T 0.055 -230 S 0.053 -231 K 0.052 -232 L 0.053 -233 S 0.056 -234 S 0.059 -235 Y 0.061 -236 Y 0.067 -237 G 0.079 -238 D 0.090 -239 V 0.090 -240 P 0.081 -241 V 0.074 -242 I 0.077 -243 E 0.087 -244 V 0.103 -245 R 0.129 -246 N 0.161 -247 K 0.185 -248 H 0.191 -249 P 0.179 -250 V 0.157 -251 E 0.135 -252 V 0.120 -253 V 0.117 -254 Y 0.122 -255 L 0.130 -256 S 0.138 -257 G 0.146 -258 A 0.150 -259 Q 0.144 -260 K 0.126 -261 D 0.100 -262 S 0.078 -263 F 0.063 -264 E 0.054 -265 S 0.049 -266 V 0.045 -267 I 0.042 -268 R 0.040 -269 L 0.040 -270 I 0.041 -271 F 0.041 -272 E 0.041 -273 I 0.045 -274 H 0.052 -275 R 0.060 -276 S 0.066 -277 G 0.066 -278 E 0.060 -279 K 0.054 -280 G 0.051 -281 D 0.052 -282 V 0.056 -283 V 0.060 -284 V 0.062 -285 F 0.059 -286 L 0.052 -287 A 0.047 -288 C 0.049 -289 E 0.059 -290 Q 0.066 -291 D 0.061 -292 I 0.048 -293 E 0.038 -294 K 0.038 -295 T 0.049 -296 Y 0.062 -297 E 0.067 -298 L 0.061 -299 V 0.056 -300 C 0.061 -301 Q 0.072 -302 E 0.081 -303 G 0.089 -304 S 0.098 -305 N 0.106 -306 L 0.109 -307 N 0.108 -308 P 0.106 -309 D 0.109 -310 V 0.113 -311 G 0.108 -312 D 0.093 -313 L 0.073 -314 V 0.059 -315 V 0.052 -316 I 0.048 -317 P 0.043 -318 L 0.041 -319 Y 0.045 -320 P 0.059 -321 K 0.082 -322 E 0.106 -323 K 0.126 -324 C 0.149 -325 S 0.177 -326 L 0.203 -327 F 0.227 -328 R 0.262 -329 P 0.304 -330 V 0.334 -331 D 0.343 -332 E 0.341 -333 T 0.338 -334 E 0.328 -335 K 0.311 -336 R 0.291 -337 C 0.272 -338 Q 0.253 -339 V 0.234 -340 Y 0.208 -341 Q 0.175 -342 R 0.143 -343 R 0.125 -344 V 0.115 -345 V 0.105 -346 L 0.092 -347 T 0.078 -348 T 0.071 -349 S 0.074 -350 C 0.085 -351 G 0.093 -352 E 0.091 -353 S 0.083 -354 L 0.074 -355 I 0.067 -356 W 0.063 -357 S 0.063 -358 H 0.063 -359 T 0.058 -360 V 0.048 -361 K 0.038 -362 F 0.032 -363 V 0.035 -364 I 0.046 -365 D 0.062 -366 V 0.076 -367 G 0.085 -368 L 0.093 -369 E 0.099 -370 R 0.103 -371 R 0.103 -372 Q 0.099 -373 V 0.093 -374 Y 0.089 -375 N 0.088 -376 P 0.089 -377 R 0.092 -378 I 0.100 -379 R 0.110 -380 A 0.118 -381 N 0.120 -382 S 0.123 -383 L 0.130 -384 V 0.140 -385 L 0.149 -386 Q 0.149 -387 P 0.136 -388 I 0.112 -389 S 0.086 -390 Q 0.068 -391 S 0.057 -392 Q 0.052 -393 A 0.051 -394 E 0.051 -395 I 0.052 -396 R 0.056 -397 K 0.060 -398 Q 0.067 -399 L 0.082 -400 L 0.106 -401 G 0.133 -402 S 0.153 -403 S 0.165 -404 P 0.172 -405 S 0.176 -406 G 0.178 -407 K 0.177 -408 L 0.168 -409 F 0.150 -410 C 0.129 -411 L 0.110 -412 Y 0.096 -413 T 0.088 -414 E 0.089 -415 E 0.094 -416 F 0.104 -417 A 0.118 -418 S 0.132 -419 K 0.140 -420 D 0.136 -421 M 0.125 -422 R 0.120 -423 P 0.129 -424 L 0.153 -425 K 0.187 -426 P 0.219 -427 A 0.239 -428 E 0.241 -429 M 0.224 -430 Q 0.194 -431 E 0.161 -432 A 0.138 -433 N 0.123 -434 L 0.110 -435 T 0.092 -436 S 0.072 -437 M 0.057 -438 V 0.049 -439 L 0.047 -440 F 0.046 -441 M 0.046 -442 K 0.045 -443 R 0.045 -444 V 0.051 -445 D 0.063 -446 I 0.081 -447 A 0.103 -448 G 0.129 -449 L 0.154 -450 G 0.168 -451 R 0.166 -452 C 0.148 -453 D 0.123 -454 F 0.101 -455 M 0.089 -456 N 0.090 -457 R 0.099 -458 P 0.107 -459 A 0.105 -460 P 0.098 -461 E 0.091 -462 S 0.085 -463 L 0.079 -464 M 0.074 -465 Q 0.078 -466 A 0.085 -467 L 0.088 -468 E 0.086 -469 D 0.086 -470 L 0.087 -471 D 0.085 -472 Y 0.079 -473 L 0.077 -474 A 0.082 -475 A 0.091 -476 L 0.100 -477 D 0.103 -478 N 0.104 -479 D 0.106 -480 G 0.107 -481 N 0.103 -482 L 0.090 -483 S 0.072 -484 E 0.059 -485 F 0.057 -486 G 0.062 -487 I 0.068 -488 I 0.073 -489 M 0.077 -490 S 0.077 -491 E 0.077 -492 F 0.081 -493 P 0.090 -494 L 0.098 -495 D 0.098 -496 P 0.087 -497 Q 0.074 -498 L 0.067 -499 S 0.068 -500 K 0.069 -501 S 0.072 -502 I 0.078 -503 L 0.083 -504 A 0.080 -505 S 0.072 -506 C 0.066 -507 E 0.066 -508 F 0.070 -509 D 0.073 -510 C 0.071 -511 V 0.066 -512 D 0.068 -513 E 0.077 -514 M 0.089 -515 L 0.098 -516 T 0.107 -517 I 0.120 -518 A 0.126 -519 A 0.118 -520 M 0.103 -521 V 0.096 -522 T 0.100 -523 A 0.111 -524 P 0.123 -525 S 0.138 -526 C 0.152 -527 F 0.157 -528 L 0.157 -529 H 0.163 -530 V 0.178 -531 P 0.192 -532 H 0.196 -533 G 0.183 -534 A 0.156 -535 E 0.125 -536 E 0.103 -537 A 0.092 -538 A 0.084 -539 V 0.077 -540 T 0.074 -541 C 0.072 -542 W 0.067 -543 K 0.063 -544 T 0.063 -545 F 0.072 -546 L 0.089 -547 H 0.107 -548 P 0.120 -549 E 0.123 -550 G 0.120 -551 D 0.113 -552 H 0.104 -553 F 0.098 -554 T 0.094 -555 L 0.089 -556 I 0.081 -557 N 0.072 -558 V 0.065 -559 Y 0.058 -560 N 0.050 -561 A 0.043 -562 Y 0.042 -563 Q 0.047 -564 D 0.056 -565 T 0.065 -566 V 0.077 -567 L 0.094 -568 N 0.113 -569 S 0.125 -570 A 0.128 -571 N 0.126 -572 E 0.120 -573 H 0.109 -574 C 0.096 -575 V 0.088 -576 E 0.085 -577 M 0.083 -578 W 0.078 -579 C 0.073 -580 H 0.072 -581 D 0.075 -582 C 0.077 -583 F 0.075 -584 L 0.072 -585 S 0.069 -586 C 0.070 -587 S 0.078 -588 A 0.087 -589 L 0.092 -590 R 0.095 -591 M 0.102 -592 A 0.109 -593 D 0.114 -594 V 0.117 -595 I 0.116 -596 R 0.110 -597 A 0.100 -598 E 0.093 -599 L 0.090 -600 L 0.092 -601 E 0.090 -602 I 0.081 -603 I 0.067 -604 K 0.057 -605 R 0.056 -606 I 0.063 -607 E 0.075 -608 L 0.085 -609 P 0.091 -610 Y 0.098 -611 A 0.116 -612 E 0.147 -613 P 0.180 -614 A 0.207 -615 F 0.228 -616 G 0.235 -617 S 0.217 -618 K 0.178 -619 E 0.137 -620 N 0.108 -621 G 0.090 -622 L 0.076 -623 N 0.068 -624 I 0.066 -625 K 0.069 -626 K 0.074 -627 A 0.076 -628 L 0.072 -629 L 0.065 -630 S 0.063 -631 G 0.063 -632 Y 0.059 -633 F 0.055 -634 M 0.055 -635 Q 0.058 -636 I 0.059 -637 A 0.059 -638 R 0.064 -639 D 0.077 -640 V 0.097 -641 D 0.121 -642 G 0.142 -643 S 0.149 -644 G 0.132 -645 N 0.100 -646 Y 0.068 -647 L 0.050 -648 M 0.046 -649 L 0.050 -650 T 0.057 -651 H 0.064 -652 K 0.074 -653 Q 0.085 -654 V 0.087 -655 A 0.082 -656 Q 0.076 -657 L 0.076 -658 H 0.076 -659 P 0.073 -660 L 0.072 -661 S 0.081 -662 S 0.099 -663 Y 0.119 -664 S 0.132 -665 I 0.133 -666 T 0.126 -667 K 0.119 -668 K 0.117 -669 M 0.117 -670 P 0.113 -671 E 0.106 -672 W 0.101 -673 V 0.097 -674 L 0.091 -675 F 0.084 -676 H 0.082 -677 Q 0.088 -678 F 0.096 -679 S 0.100 -680 I 0.098 -681 S 0.095 -682 E 0.097 -683 N 0.103 -684 N 0.105 -685 Y 0.098 -686 I 0.086 -687 R 0.076 -688 V 0.072 -689 A 0.073 -690 S 0.078 -691 A 0.082 -692 V 0.084 -693 S 0.082 -694 P 0.076 -695 E 0.069 -696 L 0.062 -697 F 0.058 -698 M 0.058 -699 Q 0.063 -700 L 0.072 -701 V 0.078 -702 P 0.076 -703 Q 0.074 -704 Y 0.078 -705 Y 0.087 -706 F 0.099 -707 S 0.116 -708 N 0.138 -709 L 0.159 -710 P 0.173 -711 P 0.175 -712 S 0.165 -713 E 0.151 -714 S 0.146 -715 K 0.156 -716 D 0.173 -717 I 0.189 -718 L 0.203 -719 Q 0.219 -720 Q 0.243 -721 A 0.280 -722 A 0.328 -723 G 0.380 -724 H 0.433 -725 L 0.487 -726 P 0.539 -727 T 0.578 -728 E 0.598 -729 T 0.595 -730 V 0.579 -731 N 0.568 -732 K 0.568 -733 D 0.563 -734 Q 0.539 -735 D 0.497 -736 V 0.456 -737 C 0.424 -738 D 0.408 -739 K 0.412 -740 C 0.444 -741 P 0.496 -742 D 0.547 -743 A 0.577 -744 T 0.586 -745 E 0.580 -746 Q 0.560 -747 R 0.522 -748 C 0.472 -749 T 0.428 -750 I 0.399 -751 Q 0.387 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031221.8_ENSMUST00000033570.6_GN:Igbp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031221.8_ENSMUST00000033570.6_GN:Igbp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index fee574c3b0255212e157da6788bb956b757e9048..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031221.8_ENSMUST00000033570.6_GN:Igbp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,341 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000031221.8|ENSMUST00000033570.6|GN:Igbp1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.483 -2 A 0.505 -3 A 0.538 -4 S 0.563 -5 E 0.569 -6 D 0.556 -7 E 0.526 -8 L 0.479 -9 L 0.415 -10 L 0.335 -11 P 0.246 -12 R 0.161 -13 L 0.096 -14 P 0.057 -15 E 0.038 -16 L 0.032 -17 F 0.031 -18 E 0.032 -19 T 0.036 -20 S 0.045 -21 K 0.056 -22 K 0.060 -23 L 0.053 -24 L 0.042 -25 E 0.038 -26 D 0.043 -27 V 0.057 -28 E 0.078 -29 V 0.101 -30 A 0.122 -31 T 0.135 -32 E 0.143 -33 P 0.146 -34 T 0.143 -35 G 0.132 -36 S 0.115 -37 R 0.096 -38 T 0.082 -39 I 0.074 -40 Q 0.066 -41 D 0.059 -42 K 0.057 -43 V 0.063 -44 S 0.071 -45 K 0.075 -46 G 0.072 -47 L 0.061 -48 E 0.049 -49 L 0.042 -50 L 0.038 -51 E 0.035 -52 K 0.036 -53 A 0.041 -54 A 0.049 -55 G 0.056 -56 M 0.059 -57 L 0.060 -58 S 0.062 -59 Q 0.065 -60 L 0.070 -61 D 0.078 -62 L 0.089 -63 F 0.098 -64 S 0.101 -65 R 0.101 -66 N 0.099 -67 E 0.094 -68 D 0.086 -69 L 0.080 -70 E 0.077 -71 E 0.078 -72 I 0.077 -73 A 0.071 -74 S 0.064 -75 T 0.058 -76 D 0.053 -77 L 0.045 -78 K 0.038 -79 Y 0.033 -80 L 0.032 -81 M 0.035 -82 V 0.039 -83 P 0.044 -84 A 0.051 -85 L 0.060 -86 Q 0.070 -87 G 0.078 -88 A 0.086 -89 L 0.094 -90 T 0.104 -91 M 0.116 -92 K 0.125 -93 Q 0.129 -94 V 0.130 -95 N 0.128 -96 P 0.117 -97 S 0.101 -98 K 0.088 -99 R 0.081 -100 L 0.076 -101 D 0.073 -102 H 0.077 -103 L 0.084 -104 Q 0.088 -105 R 0.087 -106 A 0.082 -107 R 0.072 -108 E 0.063 -109 H 0.060 -110 F 0.059 -111 V 0.054 -112 H 0.049 -113 F 0.047 -114 L 0.047 -115 T 0.047 -116 Q 0.048 -117 C 0.052 -118 H 0.056 -119 C 0.059 -120 Y 0.063 -121 H 0.071 -122 V 0.082 -123 A 0.097 -124 E 0.116 -125 F 0.147 -126 Q 0.200 -127 L 0.275 -128 P 0.354 -129 Q 0.421 -130 T 0.478 -131 K 0.529 -132 T 0.571 -133 N 0.598 -134 S 0.613 -135 A 0.624 -136 E 0.638 -137 N 0.652 -138 N 0.659 -139 T 0.656 -140 A 0.647 -141 S 0.632 -142 S 0.607 -143 S 0.570 -144 M 0.526 -145 A 0.477 -146 Y 0.422 -147 P 0.355 -148 N 0.278 -149 L 0.208 -150 V 0.163 -151 A 0.145 -152 M 0.141 -153 A 0.142 -154 S 0.142 -155 Q 0.136 -156 R 0.125 -157 Q 0.118 -158 A 0.117 -159 K 0.110 -160 I 0.097 -161 E 0.085 -162 R 0.076 -163 Y 0.073 -164 K 0.076 -165 Q 0.077 -166 K 0.071 -167 K 0.062 -168 E 0.056 -169 V 0.059 -170 E 0.067 -171 H 0.071 -172 R 0.062 -173 L 0.048 -174 S 0.039 -175 A 0.038 -176 L 0.041 -177 K 0.047 -178 S 0.059 -179 A 0.075 -180 V 0.095 -181 E 0.118 -182 S 0.143 -183 G 0.163 -184 Q 0.168 -185 A 0.153 -186 D 0.119 -187 D 0.084 -188 E 0.061 -189 R 0.051 -190 V 0.048 -191 R 0.049 -192 E 0.050 -193 Y 0.050 -194 H 0.048 -195 L 0.049 -196 L 0.055 -197 H 0.061 -198 L 0.061 -199 R 0.055 -200 R 0.049 -201 W 0.049 -202 I 0.052 -203 A 0.056 -204 V 0.058 -205 S 0.060 -206 L 0.063 -207 E 0.069 -208 E 0.074 -209 L 0.072 -210 E 0.064 -211 S 0.057 -212 I 0.055 -213 D 0.059 -214 Q 0.065 -215 E 0.073 -216 I 0.082 -217 K 0.089 -218 I 0.090 -219 L 0.092 -220 K 0.107 -221 E 0.144 -222 K 0.204 -223 D 0.285 -224 S 0.378 -225 P 0.469 -226 R 0.546 -227 E 0.600 -228 E 0.625 -229 T 0.633 -230 A 0.642 -231 C 0.660 -232 H 0.677 -233 S 0.684 -234 S 0.680 -235 L 0.669 -236 P 0.655 -237 E 0.639 -238 K 0.630 -239 P 0.632 -240 P 0.649 -241 M 0.671 -242 K 0.690 -243 P 0.703 -244 F 0.711 -245 I 0.710 -246 L 0.698 -247 T 0.686 -248 R 0.685 -249 N 0.684 -250 K 0.672 -251 A 0.657 -252 Q 0.648 -253 A 0.643 -254 K 0.636 -255 V 0.634 -256 F 0.651 -257 G 0.683 -258 T 0.709 -259 G 0.721 -260 Y 0.729 -261 P 0.740 -262 S 0.750 -263 L 0.745 -264 A 0.709 -265 T 0.639 -266 M 0.558 -267 T 0.485 -268 V 0.407 -269 S 0.329 -270 D 0.277 -271 W 0.249 -272 Y 0.225 -273 E 0.204 -274 Q 0.204 -275 H 0.233 -276 Q 0.286 -277 K 0.360 -278 Y 0.462 -279 G 0.569 -280 V 0.645 -281 L 0.682 -282 P 0.698 -283 D 0.707 -284 R 0.713 -285 G 0.714 -286 I 0.708 -287 A 0.694 -288 K 0.674 -289 P 0.650 -290 A 0.615 -291 S 0.562 -292 A 0.494 -293 D 0.420 -294 F 0.351 -295 Q 0.299 -296 R 0.281 -297 A 0.291 -298 A 0.309 -299 Q 0.331 -300 Q 0.364 -301 Q 0.387 -302 E 0.380 -303 D 0.359 -304 Q 0.346 -305 E 0.335 -306 Q 0.326 -307 K 0.329 -308 D 0.331 -309 E 0.314 -310 E 0.288 -311 S 0.277 -312 E 0.286 -313 E 0.305 -314 K 0.327 -315 A 0.350 -316 L 0.370 -317 H 0.386 -318 R 0.395 -319 M 0.385 -320 R 0.357 -321 E 0.322 -322 W 0.294 -323 D 0.280 -324 D 0.277 -325 W 0.282 -326 K 0.293 -327 D 0.312 -328 T 0.344 -329 H 0.398 -330 P 0.471 -331 R 0.544 -332 G 0.601 -333 Y 0.636 -334 G 0.646 -335 N 0.639 -336 R 0.636 -337 Q 0.642 -338 N 0.636 -339 M 0.600 -340 G 0.561 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031221.8_ENSMUST00000033570.6_GN:Igbp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031221.8_ENSMUST00000033570.6_GN:Igbp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid deleted file mode 100644 index afec95ae033a2325058af40b769fba48e051ddaf..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031221.8_ENSMUST00000033570.6_GN:Igbp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid +++ /dev/null @@ -1,360 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000031221.8|ENSMUST00000033570.6|GN:Igbp1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:19 -1 M 0.352 -2 E 0.356 -3 F 0.365 -4 T 0.380 -5 F 0.406 -6 D 0.445 -7 F 0.494 -8 G 0.539 -9 R 0.573 -10 N 0.593 -11 S 0.600 -12 S 0.590 -13 G 0.564 -14 F 0.529 -15 L 0.497 -16 S 0.480 -17 F 0.480 -18 H 0.499 -19 K 0.530 -20 M 0.566 -21 A 0.597 -22 A 0.618 -23 S 0.627 -24 E 0.622 -25 D 0.604 -26 E 0.567 -27 L 0.508 -28 L 0.427 -29 L 0.334 -30 P 0.239 -31 R 0.155 -32 L 0.094 -33 P 0.057 -34 E 0.039 -35 L 0.033 -36 F 0.032 -37 E 0.033 -38 T 0.036 -39 S 0.044 -40 K 0.055 -41 K 0.060 -42 L 0.053 -43 L 0.043 -44 E 0.039 -45 D 0.043 -46 V 0.056 -47 E 0.076 -48 V 0.098 -49 A 0.117 -50 T 0.131 -51 E 0.140 -52 P 0.145 -53 T 0.144 -54 G 0.133 -55 S 0.115 -56 R 0.096 -57 T 0.082 -58 I 0.074 -59 Q 0.067 -60 D 0.060 -61 K 0.059 -62 V 0.065 -63 S 0.073 -64 K 0.077 -65 G 0.073 -66 L 0.062 -67 E 0.050 -68 L 0.043 -69 L 0.039 -70 E 0.036 -71 K 0.036 -72 A 0.042 -73 A 0.052 -74 G 0.059 -75 M 0.061 -76 L 0.062 -77 S 0.064 -78 Q 0.066 -79 L 0.070 -80 D 0.077 -81 L 0.087 -82 F 0.096 -83 S 0.099 -84 R 0.100 -85 N 0.098 -86 E 0.094 -87 D 0.086 -88 L 0.079 -89 E 0.076 -90 E 0.077 -91 I 0.075 -92 A 0.069 -93 S 0.061 -94 T 0.056 -95 D 0.050 -96 L 0.043 -97 K 0.036 -98 Y 0.032 -99 L 0.031 -100 M 0.034 -101 V 0.038 -102 P 0.042 -103 A 0.049 -104 L 0.057 -105 Q 0.065 -106 G 0.072 -107 A 0.079 -108 L 0.088 -109 T 0.100 -110 M 0.113 -111 K 0.122 -112 Q 0.127 -113 V 0.130 -114 N 0.127 -115 P 0.116 -116 S 0.100 -117 K 0.088 -118 R 0.081 -119 L 0.076 -120 D 0.073 -121 H 0.077 -122 L 0.084 -123 Q 0.088 -124 R 0.087 -125 A 0.082 -126 R 0.071 -127 E 0.062 -128 H 0.059 -129 F 0.058 -130 V 0.053 -131 H 0.048 -132 F 0.047 -133 L 0.047 -134 T 0.047 -135 Q 0.049 -136 C 0.053 -137 H 0.057 -138 C 0.060 -139 Y 0.064 -140 H 0.072 -141 V 0.083 -142 A 0.098 -143 E 0.119 -144 F 0.151 -145 Q 0.204 -146 L 0.278 -147 P 0.354 -148 Q 0.419 -149 T 0.474 -150 K 0.526 -151 T 0.570 -152 N 0.600 -153 S 0.616 -154 A 0.628 -155 E 0.643 -156 N 0.657 -157 N 0.665 -158 T 0.663 -159 A 0.654 -160 S 0.639 -161 S 0.613 -162 S 0.576 -163 M 0.531 -164 A 0.481 -165 Y 0.425 -166 P 0.359 -167 N 0.282 -168 L 0.212 -169 V 0.167 -170 A 0.149 -171 M 0.145 -172 A 0.146 -173 S 0.146 -174 Q 0.138 -175 R 0.126 -176 Q 0.120 -177 A 0.118 -178 K 0.111 -179 I 0.099 -180 E 0.086 -181 R 0.077 -182 Y 0.073 -183 K 0.075 -184 Q 0.077 -185 K 0.071 -186 K 0.062 -187 E 0.057 -188 V 0.059 -189 E 0.067 -190 H 0.071 -191 R 0.062 -192 L 0.048 -193 S 0.040 -194 A 0.039 -195 L 0.041 -196 K 0.048 -197 S 0.060 -198 A 0.077 -199 V 0.096 -200 E 0.118 -201 S 0.142 -202 G 0.162 -203 Q 0.167 -204 A 0.152 -205 D 0.118 -206 D 0.083 -207 E 0.060 -208 R 0.050 -209 V 0.048 -210 R 0.049 -211 E 0.050 -212 Y 0.049 -213 H 0.048 -214 L 0.048 -215 L 0.053 -216 H 0.059 -217 L 0.059 -218 R 0.053 -219 R 0.048 -220 W 0.047 -221 I 0.050 -222 A 0.054 -223 V 0.057 -224 S 0.059 -225 L 0.062 -226 E 0.068 -227 E 0.073 -228 L 0.072 -229 E 0.063 -230 S 0.056 -231 I 0.055 -232 D 0.058 -233 Q 0.065 -234 E 0.073 -235 I 0.082 -236 K 0.089 -237 I 0.091 -238 L 0.093 -239 K 0.108 -240 E 0.144 -241 K 0.204 -242 D 0.285 -243 S 0.378 -244 P 0.470 -245 R 0.548 -246 E 0.602 -247 E 0.628 -248 T 0.635 -249 A 0.645 -250 C 0.663 -251 H 0.680 -252 S 0.688 -253 S 0.684 -254 L 0.673 -255 P 0.659 -256 E 0.644 -257 K 0.634 -258 P 0.637 -259 P 0.654 -260 M 0.677 -261 K 0.697 -262 P 0.710 -263 F 0.718 -264 I 0.716 -265 L 0.703 -266 T 0.690 -267 R 0.690 -268 N 0.690 -269 K 0.681 -270 A 0.668 -271 Q 0.661 -272 A 0.657 -273 K 0.650 -274 V 0.649 -275 F 0.666 -276 G 0.696 -277 T 0.720 -278 G 0.730 -279 Y 0.737 -280 P 0.748 -281 S 0.757 -282 L 0.752 -283 A 0.717 -284 T 0.647 -285 M 0.567 -286 T 0.494 -287 V 0.415 -288 S 0.337 -289 D 0.283 -290 W 0.253 -291 Y 0.228 -292 E 0.207 -293 Q 0.209 -294 H 0.241 -295 Q 0.295 -296 K 0.371 -297 Y 0.474 -298 G 0.582 -299 V 0.657 -300 L 0.694 -301 P 0.708 -302 D 0.716 -303 R 0.720 -304 G 0.721 -305 I 0.715 -306 A 0.700 -307 K 0.681 -308 P 0.657 -309 A 0.624 -310 S 0.572 -311 A 0.503 -312 D 0.427 -313 F 0.355 -314 Q 0.302 -315 R 0.284 -316 A 0.295 -317 A 0.312 -318 Q 0.335 -319 Q 0.369 -320 Q 0.394 -321 E 0.389 -322 D 0.368 -323 Q 0.352 -324 E 0.338 -325 Q 0.326 -326 K 0.327 -327 D 0.329 -328 E 0.313 -329 E 0.287 -330 S 0.277 -331 E 0.287 -332 E 0.308 -333 K 0.331 -334 A 0.354 -335 L 0.375 -336 H 0.392 -337 R 0.401 -338 M 0.391 -339 R 0.362 -340 E 0.326 -341 W 0.297 -342 D 0.283 -343 D 0.281 -344 W 0.285 -345 K 0.297 -346 D 0.317 -347 T 0.348 -348 H 0.403 -349 P 0.477 -350 R 0.549 -351 G 0.604 -352 Y 0.639 -353 G 0.649 -354 N 0.642 -355 R 0.639 -356 Q 0.645 -357 N 0.639 -358 M 0.604 -359 G 0.566 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031250.9_ENSMUST00000033602.9_GN:Tnmd_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031250.9_ENSMUST00000033602.9_GN:Tnmd_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 37f959c9a836ef1270a4f5e317c44b13cc998bf6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031250.9_ENSMUST00000033602.9_GN:Tnmd_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,318 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000031250.9|ENSMUST00000033602.9|GN:Tnmd|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.405 -2 A 0.423 -3 K 0.455 -4 N 0.497 -5 P 0.543 -6 P 0.583 -7 E 0.603 -8 N 0.599 -9 C 0.583 -10 E 0.567 -11 G 0.548 -12 C 0.511 -13 H 0.471 -14 I 0.457 -15 L 0.465 -16 N 0.460 -17 A 0.437 -18 E 0.424 -19 A 0.434 -20 L 0.457 -21 K 0.475 -22 S 0.477 -23 K 0.471 -24 K 0.478 -25 I 0.482 -26 C 0.461 -27 K 0.423 -28 S 0.386 -29 L 0.346 -30 K 0.300 -31 I 0.266 -32 C 0.254 -33 G 0.250 -34 L 0.242 -35 V 0.235 -36 F 0.232 -37 G 0.233 -38 I 0.241 -39 L 0.251 -40 A 0.253 -41 L 0.243 -42 T 0.228 -43 L 0.208 -44 I 0.182 -45 V 0.158 -46 L 0.150 -47 F 0.167 -48 W 0.205 -49 G 0.252 -50 S 0.289 -51 K 0.312 -52 H 0.332 -53 F 0.364 -54 W 0.412 -55 P 0.468 -56 E 0.503 -57 V 0.487 -58 S 0.424 -59 K 0.340 -60 K 0.260 -61 T 0.196 -62 Y 0.148 -63 D 0.115 -64 M 0.095 -65 E 0.085 -66 H 0.081 -67 T 0.083 -68 F 0.094 -69 Y 0.112 -70 S 0.131 -71 N 0.142 -72 G 0.147 -73 E 0.147 -74 K 0.140 -75 K 0.123 -76 K 0.098 -77 I 0.074 -78 Y 0.056 -79 M 0.050 -80 E 0.054 -81 I 0.064 -82 D 0.071 -83 P 0.070 -84 I 0.064 -85 T 0.059 -86 R 0.058 -87 T 0.059 -88 E 0.058 -89 I 0.056 -90 F 0.058 -91 R 0.069 -92 S 0.092 -93 G 0.125 -94 N 0.157 -95 G 0.172 -96 T 0.164 -97 D 0.143 -98 E 0.118 -99 T 0.092 -100 L 0.072 -101 E 0.061 -102 V 0.060 -103 H 0.062 -104 D 0.067 -105 F 0.073 -106 K 0.080 -107 N 0.084 -108 G 0.077 -109 Y 0.058 -110 T 0.037 -111 G 0.027 -112 I 0.027 -113 Y 0.033 -114 F 0.043 -115 V 0.057 -116 G 0.071 -117 L 0.079 -118 Q 0.079 -119 K 0.073 -120 C 0.067 -121 F 0.064 -122 I 0.062 -123 K 0.062 -124 T 0.064 -125 Q 0.072 -126 I 0.087 -127 K 0.115 -128 V 0.156 -129 I 0.205 -130 P 0.252 -131 E 0.303 -132 F 0.371 -133 S 0.456 -134 E 0.537 -135 P 0.594 -136 E 0.618 -137 E 0.603 -138 E 0.557 -139 I 0.505 -140 D 0.461 -141 E 0.423 -142 N 0.391 -143 E 0.363 -144 E 0.331 -145 I 0.290 -146 T 0.249 -147 T 0.214 -148 T 0.188 -149 F 0.173 -150 F 0.166 -151 E 0.162 -152 Q 0.156 -153 S 0.148 -154 V 0.134 -155 I 0.114 -156 W 0.095 -157 V 0.082 -158 P 0.073 -159 A 0.067 -160 E 0.066 -161 K 0.067 -162 P 0.068 -163 I 0.069 -164 E 0.071 -165 N 0.073 -166 R 0.071 -167 D 0.066 -168 F 0.064 -169 L 0.070 -170 K 0.083 -171 N 0.093 -172 S 0.089 -173 K 0.072 -174 I 0.054 -175 L 0.042 -176 E 0.037 -177 I 0.038 -178 C 0.048 -179 D 0.064 -180 N 0.080 -181 V 0.085 -182 T 0.075 -183 M 0.058 -184 Y 0.044 -185 W 0.037 -186 I 0.038 -187 N 0.046 -188 P 0.059 -189 T 0.076 -190 L 0.096 -191 I 0.118 -192 A 0.141 -193 V 0.168 -194 S 0.200 -195 E 0.237 -196 L 0.274 -197 Q 0.314 -198 D 0.357 -199 F 0.403 -200 E 0.447 -201 E 0.486 -202 D 0.513 -203 G 0.519 -204 E 0.499 -205 D 0.462 -206 L 0.430 -207 H 0.424 -208 F 0.454 -209 P 0.501 -210 T 0.543 -211 S 0.570 -212 E 0.588 -213 K 0.604 -214 K 0.620 -215 G 0.625 -216 I 0.615 -217 D 0.597 -218 Q 0.565 -219 N 0.516 -220 E 0.465 -221 Q 0.438 -222 W 0.453 -223 V 0.498 -224 V 0.551 -225 P 0.594 -226 Q 0.616 -227 V 0.619 -228 K 0.615 -229 V 0.616 -230 E 0.617 -231 K 0.608 -232 T 0.591 -233 R 0.584 -234 H 0.597 -235 T 0.620 -236 R 0.641 -237 Q 0.649 -238 A 0.638 -239 S 0.611 -240 E 0.583 -241 E 0.560 -242 D 0.547 -243 L 0.553 -244 P 0.588 -245 I 0.631 -246 N 0.646 -247 D 0.616 -248 Y 0.561 -249 T 0.520 -250 E 0.503 -251 N 0.494 -252 G 0.476 -253 I 0.444 -254 E 0.396 -255 F 0.341 -256 D 0.301 -257 P 0.283 -258 M 0.278 -259 L 0.266 -260 D 0.243 -261 E 0.215 -262 R 0.183 -263 G 0.146 -264 Y 0.108 -265 C 0.075 -266 C 0.054 -267 I 0.050 -268 Y 0.060 -269 C 0.081 -270 R 0.109 -271 R 0.140 -272 G 0.160 -273 N 0.163 -274 R 0.154 -275 Y 0.144 -276 C 0.146 -277 R 0.159 -278 R 0.167 -279 V 0.163 -280 C 0.161 -281 E 0.176 -282 P 0.197 -283 L 0.208 -284 L 0.200 -285 G 0.175 -286 Y 0.143 -287 Y 0.116 -288 P 0.095 -289 Y 0.083 -290 P 0.080 -291 Y 0.084 -292 C 0.091 -293 Y 0.106 -294 Q 0.136 -295 G 0.173 -296 G 0.195 -297 R 0.189 -298 V 0.163 -299 I 0.131 -300 C 0.107 -301 R 0.096 -302 V 0.094 -303 I 0.096 -304 M 0.097 -305 P 0.097 -306 C 0.100 -307 N 0.107 -308 W 0.117 -309 W 0.129 -310 V 0.143 -311 A 0.153 -312 R 0.166 -313 M 0.192 -314 L 0.229 -315 G 0.261 -316 R 0.278 -317 V 0.282 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031250.9_ENSMUST00000033602.9_GN:Tnmd_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:44.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031250.9_ENSMUST00000033602.9_GN:Tnmd_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:44.caid deleted file mode 100644 index acf27a9dcf061e41240a95a216666d9759fc86d2..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031250.9_ENSMUST00000033602.9_GN:Tnmd_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:44.caid +++ /dev/null @@ -1,362 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000031250.9|ENSMUST00000033602.9|GN:Tnmd|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:44 -1 M 0.336 -2 T 0.363 -3 Y 0.409 -4 L 0.451 -5 S 0.470 -6 H 0.481 -7 I 0.497 -8 N 0.493 -9 S 0.470 -10 A 0.469 -11 S 0.511 -12 P 0.579 -13 P 0.652 -14 A 0.708 -15 S 0.740 -16 G 0.755 -17 S 0.758 -18 R 0.752 -19 L 0.737 -20 T 0.718 -21 C 0.702 -22 N 0.701 -23 S 0.713 -24 T 0.726 -25 S 0.734 -26 A 0.737 -27 V 0.731 -28 V 0.711 -29 L 0.685 -30 S 0.659 -31 V 0.630 -32 L 0.598 -33 S 0.587 -34 K 0.610 -35 Q 0.653 -36 G 0.689 -37 K 0.707 -38 S 0.709 -39 T 0.696 -40 V 0.669 -41 C 0.646 -42 W 0.641 -43 E 0.641 -44 T 0.620 -45 M 0.577 -46 A 0.530 -47 K 0.498 -48 N 0.497 -49 P 0.539 -50 P 0.606 -51 E 0.660 -52 N 0.678 -53 C 0.671 -54 E 0.657 -55 G 0.641 -56 C 0.635 -57 H 0.659 -58 I 0.698 -59 L 0.716 -60 N 0.698 -61 A 0.658 -62 E 0.616 -63 A 0.585 -64 L 0.575 -65 K 0.575 -66 S 0.568 -67 K 0.555 -68 K 0.548 -69 I 0.537 -70 C 0.505 -71 K 0.462 -72 S 0.424 -73 L 0.382 -74 K 0.333 -75 I 0.295 -76 C 0.279 -77 G 0.271 -78 L 0.257 -79 V 0.243 -80 F 0.234 -81 G 0.231 -82 I 0.234 -83 L 0.239 -84 A 0.238 -85 L 0.227 -86 T 0.211 -87 L 0.192 -88 I 0.167 -89 V 0.145 -90 L 0.138 -91 F 0.155 -92 W 0.194 -93 G 0.240 -94 S 0.273 -95 K 0.286 -96 H 0.297 -97 F 0.324 -98 W 0.374 -99 P 0.434 -100 E 0.475 -101 V 0.467 -102 S 0.410 -103 K 0.329 -104 K 0.249 -105 T 0.184 -106 Y 0.135 -107 D 0.102 -108 M 0.083 -109 E 0.073 -110 H 0.069 -111 T 0.070 -112 F 0.078 -113 Y 0.095 -114 S 0.113 -115 N 0.127 -116 G 0.136 -117 E 0.141 -118 K 0.137 -119 K 0.121 -120 K 0.096 -121 I 0.071 -122 Y 0.053 -123 M 0.046 -124 E 0.047 -125 I 0.054 -126 D 0.060 -127 P 0.060 -128 I 0.056 -129 T 0.053 -130 R 0.053 -131 T 0.054 -132 E 0.054 -133 I 0.053 -134 F 0.056 -135 R 0.068 -136 S 0.091 -137 G 0.125 -138 N 0.159 -139 G 0.177 -140 T 0.171 -141 D 0.151 -142 E 0.125 -143 T 0.097 -144 L 0.074 -145 E 0.062 -146 V 0.059 -147 H 0.062 -148 D 0.067 -149 F 0.074 -150 K 0.081 -151 N 0.083 -152 G 0.075 -153 Y 0.055 -154 T 0.035 -155 G 0.025 -156 I 0.025 -157 Y 0.032 -158 F 0.044 -159 V 0.059 -160 G 0.073 -161 L 0.080 -162 Q 0.080 -163 K 0.074 -164 C 0.068 -165 F 0.065 -166 I 0.066 -167 K 0.068 -168 T 0.073 -169 Q 0.083 -170 I 0.101 -171 K 0.131 -172 V 0.173 -173 I 0.220 -174 P 0.268 -175 E 0.320 -176 F 0.386 -177 S 0.464 -178 E 0.538 -179 P 0.592 -180 E 0.615 -181 E 0.599 -182 E 0.553 -183 I 0.499 -184 D 0.449 -185 E 0.404 -186 N 0.366 -187 E 0.333 -188 E 0.296 -189 I 0.252 -190 T 0.210 -191 T 0.179 -192 T 0.159 -193 F 0.150 -194 F 0.148 -195 E 0.149 -196 Q 0.147 -197 S 0.141 -198 V 0.129 -199 I 0.111 -200 W 0.092 -201 V 0.078 -202 P 0.068 -203 A 0.061 -204 E 0.059 -205 K 0.059 -206 P 0.059 -207 I 0.060 -208 E 0.061 -209 N 0.062 -210 R 0.061 -211 D 0.057 -212 F 0.055 -213 L 0.060 -214 K 0.071 -215 N 0.079 -216 S 0.075 -217 K 0.062 -218 I 0.048 -219 L 0.039 -220 E 0.035 -221 I 0.037 -222 C 0.046 -223 D 0.062 -224 N 0.078 -225 V 0.083 -226 T 0.072 -227 M 0.054 -228 Y 0.041 -229 W 0.035 -230 I 0.036 -231 N 0.043 -232 P 0.056 -233 T 0.072 -234 L 0.093 -235 I 0.116 -236 A 0.141 -237 V 0.168 -238 S 0.200 -239 E 0.236 -240 L 0.272 -241 Q 0.309 -242 D 0.350 -243 F 0.395 -244 E 0.441 -245 E 0.481 -246 D 0.507 -247 G 0.511 -248 E 0.490 -249 D 0.453 -250 L 0.421 -251 H 0.418 -252 F 0.452 -253 P 0.504 -254 T 0.545 -255 S 0.569 -256 E 0.580 -257 K 0.591 -258 K 0.603 -259 G 0.606 -260 I 0.596 -261 D 0.577 -262 Q 0.545 -263 N 0.498 -264 E 0.450 -265 Q 0.427 -266 W 0.441 -267 V 0.483 -268 V 0.533 -269 P 0.572 -270 Q 0.592 -271 V 0.592 -272 K 0.587 -273 V 0.589 -274 E 0.596 -275 K 0.593 -276 T 0.581 -277 R 0.578 -278 H 0.594 -279 T 0.619 -280 R 0.641 -281 Q 0.652 -282 A 0.644 -283 S 0.623 -284 E 0.600 -285 E 0.581 -286 D 0.568 -287 L 0.573 -288 P 0.604 -289 I 0.640 -290 N 0.651 -291 D 0.621 -292 Y 0.570 -293 T 0.532 -294 E 0.514 -295 N 0.504 -296 G 0.489 -297 I 0.459 -298 E 0.413 -299 F 0.360 -300 D 0.322 -301 P 0.307 -302 M 0.300 -303 L 0.284 -304 D 0.257 -305 E 0.223 -306 R 0.186 -307 G 0.147 -308 Y 0.108 -309 C 0.074 -310 C 0.054 -311 I 0.051 -312 Y 0.062 -313 C 0.084 -314 R 0.115 -315 R 0.148 -316 G 0.170 -317 N 0.173 -318 R 0.165 -319 Y 0.156 -320 C 0.160 -321 R 0.177 -322 R 0.188 -323 V 0.182 -324 C 0.174 -325 E 0.187 -326 P 0.210 -327 L 0.224 -328 L 0.217 -329 G 0.190 -330 Y 0.155 -331 Y 0.124 -332 P 0.101 -333 Y 0.087 -334 P 0.082 -335 Y 0.084 -336 C 0.091 -337 Y 0.107 -338 Q 0.139 -339 G 0.178 -340 G 0.201 -341 R 0.197 -342 V 0.170 -343 I 0.138 -344 C 0.113 -345 R 0.102 -346 V 0.099 -347 I 0.100 -348 M 0.100 -349 P 0.099 -350 C 0.101 -351 N 0.107 -352 W 0.116 -353 W 0.131 -354 V 0.146 -355 A 0.155 -356 R 0.166 -357 M 0.190 -358 L 0.224 -359 G 0.252 -360 R 0.265 -361 V 0.267 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031495.9_ENSMUST00000011445.8_GN:Cd209d_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031495.9_ENSMUST00000011445.8_GN:Cd209d_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index c3b417b44c5d50044ce227dccea339d808937a5d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031495.9_ENSMUST00000011445.8_GN:Cd209d_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,238 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000031495.9|ENSMUST00000011445.8|GN:Cd209d|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.431 -2 S 0.456 -3 D 0.489 -4 S 0.506 -5 M 0.491 -6 E 0.454 -7 S 0.432 -8 K 0.438 -9 T 0.449 -10 Q 0.460 -11 Q 0.487 -12 V 0.520 -13 V 0.539 -14 I 0.549 -15 P 0.561 -16 E 0.575 -17 D 0.582 -18 E 0.578 -19 E 0.560 -20 C 0.543 -21 L 0.546 -22 M 0.565 -23 S 0.577 -24 G 0.562 -25 T 0.515 -26 R 0.456 -27 Y 0.409 -28 S 0.387 -29 D 0.382 -30 I 0.376 -31 S 0.365 -32 S 0.360 -33 R 0.374 -34 L 0.409 -35 Q 0.450 -36 T 0.480 -37 K 0.505 -38 F 0.534 -39 G 0.558 -40 I 0.552 -41 K 0.517 -42 S 0.477 -43 L 0.460 -44 A 0.473 -45 E 0.497 -46 Y 0.514 -47 T 0.521 -48 K 0.528 -49 Q 0.528 -50 S 0.512 -51 R 0.480 -52 N 0.431 -53 P 0.368 -54 L 0.308 -55 V 0.269 -56 L 0.249 -57 Q 0.238 -58 L 0.233 -59 L 0.242 -60 S 0.259 -61 F 0.263 -62 L 0.252 -63 F 0.243 -64 L 0.247 -65 A 0.258 -66 G 0.257 -67 L 0.238 -68 L 0.211 -69 L 0.192 -70 I 0.180 -71 I 0.167 -72 L 0.157 -73 I 0.161 -74 L 0.189 -75 V 0.235 -76 S 0.289 -77 K 0.337 -78 V 0.366 -79 P 0.369 -80 S 0.351 -81 S 0.325 -82 E 0.304 -83 V 0.283 -84 Q 0.254 -85 N 0.225 -86 K 0.208 -87 I 0.200 -88 Y 0.195 -89 Q 0.191 -90 E 0.185 -91 L 0.172 -92 M 0.167 -93 Q 0.181 -94 L 0.206 -95 K 0.228 -96 A 0.251 -97 E 0.282 -98 V 0.314 -99 H 0.342 -100 D 0.361 -101 G 0.363 -102 L 0.337 -103 C 0.283 -104 Q 0.215 -105 P 0.151 -106 C 0.103 -107 A 0.074 -108 R 0.057 -109 D 0.044 -110 W 0.037 -111 T 0.033 -112 F 0.032 -113 F 0.032 -114 N 0.034 -115 G 0.036 -116 S 0.035 -117 C 0.033 -118 Y 0.031 -119 F 0.035 -120 F 0.044 -121 S 0.055 -122 K 0.064 -123 S 0.064 -124 Q 0.055 -125 R 0.041 -126 N 0.031 -127 W 0.027 -128 H 0.031 -129 N 0.038 -130 S 0.047 -131 T 0.057 -132 T 0.061 -133 A 0.056 -134 C 0.046 -135 Q 0.043 -136 E 0.050 -137 L 0.060 -138 G 0.065 -139 A 0.060 -140 Q 0.050 -141 L 0.045 -142 V 0.049 -143 I 0.058 -144 I 0.063 -145 E 0.059 -146 T 0.051 -147 D 0.041 -148 E 0.034 -149 E 0.036 -150 Q 0.044 -151 T 0.049 -152 F 0.042 -153 L 0.029 -154 Q 0.021 -155 Q 0.019 -156 T 0.023 -157 S 0.029 -158 K 0.036 -159 A 0.040 -160 R 0.041 -161 G 0.039 -162 P 0.033 -163 T 0.026 -164 W 0.021 -165 M 0.021 -166 G 0.026 -167 L 0.035 -168 S 0.046 -169 D 0.059 -170 M 0.072 -171 H 0.081 -172 N 0.087 -173 E 0.089 -174 A 0.087 -175 T 0.076 -176 W 0.058 -177 H 0.040 -178 W 0.033 -179 V 0.039 -180 D 0.054 -181 G 0.071 -182 S 0.086 -183 P 0.097 -184 L 0.106 -185 S 0.113 -186 P 0.116 -187 S 0.109 -188 F 0.095 -189 T 0.086 -190 R 0.084 -191 Y 0.087 -192 W 0.097 -193 N 0.116 -194 R 0.135 -195 G 0.142 -196 E 0.136 -197 P 0.128 -198 N 0.129 -199 N 0.139 -200 V 0.155 -201 G 0.167 -202 D 0.168 -203 E 0.152 -204 D 0.124 -205 C 0.094 -206 A 0.072 -207 E 0.061 -208 F 0.062 -209 S 0.075 -210 G 0.097 -211 D 0.113 -212 G 0.112 -213 W 0.098 -214 N 0.084 -215 D 0.080 -216 L 0.082 -217 S 0.085 -218 C 0.084 -219 D 0.081 -220 K 0.080 -221 L 0.078 -222 L 0.070 -223 F 0.057 -224 W 0.044 -225 I 0.036 -226 C 0.034 -227 K 0.037 -228 K 0.050 -229 V 0.078 -230 S 0.129 -231 T 0.201 -232 S 0.276 -233 S 0.331 -234 C 0.362 -235 T 0.376 -236 T 0.373 -237 K 0.361 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031495.9_ENSMUST00000011445.8_GN:Cd209d_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031495.9_ENSMUST00000011445.8_GN:Cd209d_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid deleted file mode 100644 index 5303d2b6b076464deaa87578f7b6f9a6630f7fdf..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031495.9_ENSMUST00000011445.8_GN:Cd209d_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid +++ /dev/null @@ -1,261 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000031495.9|ENSMUST00000011445.8|GN:Cd209d|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:23 -1 M 0.404 -2 S 0.424 -3 R 0.463 -4 K 0.511 -5 W 0.559 -6 A 0.595 -7 L 0.618 -8 G 0.634 -9 D 0.640 -10 N 0.635 -11 R 0.632 -12 S 0.635 -13 C 0.632 -14 A 0.611 -15 L 0.583 -16 S 0.551 -17 K 0.506 -18 S 0.468 -19 Q 0.485 -20 A 0.562 -21 L 0.645 -22 V 0.690 -23 T 0.702 -24 M 0.706 -25 S 0.709 -26 D 0.707 -27 S 0.701 -28 M 0.696 -29 E 0.694 -30 S 0.695 -31 K 0.699 -32 T 0.708 -33 Q 0.719 -34 Q 0.724 -35 V 0.717 -36 V 0.699 -37 I 0.679 -38 P 0.666 -39 E 0.666 -40 D 0.679 -41 E 0.692 -42 E 0.692 -43 C 0.682 -44 L 0.675 -45 M 0.676 -46 S 0.671 -47 G 0.648 -48 T 0.606 -49 R 0.557 -50 Y 0.515 -51 S 0.492 -52 D 0.477 -53 I 0.461 -54 S 0.449 -55 S 0.458 -56 R 0.486 -57 L 0.523 -58 Q 0.557 -59 T 0.583 -60 K 0.604 -61 F 0.628 -62 G 0.644 -63 I 0.633 -64 K 0.597 -65 S 0.560 -66 L 0.548 -67 A 0.562 -68 E 0.577 -69 Y 0.575 -70 T 0.564 -71 K 0.558 -72 Q 0.548 -73 S 0.524 -74 R 0.484 -75 N 0.429 -76 P 0.361 -77 L 0.297 -78 V 0.257 -79 L 0.239 -80 Q 0.231 -81 L 0.232 -82 L 0.247 -83 S 0.267 -84 F 0.274 -85 L 0.261 -86 F 0.247 -87 L 0.245 -88 A 0.250 -89 G 0.248 -90 L 0.231 -91 L 0.208 -92 L 0.192 -93 I 0.182 -94 I 0.169 -95 L 0.157 -96 I 0.159 -97 L 0.184 -98 V 0.228 -99 S 0.280 -100 K 0.328 -101 V 0.358 -102 P 0.362 -103 S 0.343 -104 S 0.317 -105 E 0.296 -106 V 0.277 -107 Q 0.251 -108 N 0.223 -109 K 0.206 -110 I 0.197 -111 Y 0.190 -112 Q 0.185 -113 E 0.178 -114 L 0.165 -115 M 0.159 -116 Q 0.172 -117 L 0.194 -118 K 0.216 -119 A 0.240 -120 E 0.270 -121 V 0.301 -122 H 0.328 -123 D 0.349 -124 G 0.355 -125 L 0.337 -126 C 0.291 -127 Q 0.227 -128 P 0.163 -129 C 0.114 -130 A 0.083 -131 R 0.064 -132 D 0.049 -133 W 0.040 -134 T 0.035 -135 F 0.034 -136 F 0.034 -137 N 0.036 -138 G 0.038 -139 S 0.037 -140 C 0.034 -141 Y 0.032 -142 F 0.035 -143 F 0.044 -144 S 0.055 -145 K 0.064 -146 S 0.065 -147 Q 0.056 -148 R 0.043 -149 N 0.032 -150 W 0.028 -151 H 0.032 -152 N 0.039 -153 S 0.048 -154 T 0.056 -155 T 0.061 -156 A 0.055 -157 C 0.046 -158 Q 0.044 -159 E 0.051 -160 L 0.062 -161 G 0.066 -162 A 0.060 -163 Q 0.050 -164 L 0.044 -165 V 0.048 -166 I 0.057 -167 I 0.063 -168 E 0.060 -169 T 0.052 -170 D 0.041 -171 E 0.035 -172 E 0.037 -173 Q 0.045 -174 T 0.050 -175 F 0.043 -176 L 0.030 -177 Q 0.021 -178 Q 0.019 -179 T 0.023 -180 S 0.030 -181 K 0.037 -182 A 0.041 -183 R 0.042 -184 G 0.040 -185 P 0.034 -186 T 0.026 -187 W 0.021 -188 M 0.021 -189 G 0.026 -190 L 0.035 -191 S 0.046 -192 D 0.059 -193 M 0.071 -194 H 0.080 -195 N 0.084 -196 E 0.086 -197 A 0.084 -198 T 0.073 -199 W 0.056 -200 H 0.039 -201 W 0.031 -202 V 0.036 -203 D 0.050 -204 G 0.067 -205 S 0.082 -206 P 0.094 -207 L 0.103 -208 S 0.112 -209 P 0.114 -210 S 0.106 -211 F 0.092 -212 T 0.083 -213 R 0.081 -214 Y 0.085 -215 W 0.095 -216 N 0.114 -217 R 0.134 -218 G 0.140 -219 E 0.134 -220 P 0.127 -221 N 0.127 -222 N 0.137 -223 V 0.153 -224 G 0.165 -225 D 0.166 -226 E 0.150 -227 D 0.123 -228 C 0.093 -229 A 0.072 -230 E 0.061 -231 F 0.062 -232 S 0.075 -233 G 0.097 -234 D 0.114 -235 G 0.113 -236 W 0.099 -237 N 0.085 -238 D 0.080 -239 L 0.083 -240 S 0.086 -241 C 0.084 -242 D 0.082 -243 K 0.080 -244 L 0.078 -245 L 0.070 -246 F 0.057 -247 W 0.044 -248 I 0.036 -249 C 0.034 -250 K 0.038 -251 K 0.051 -252 V 0.080 -253 S 0.132 -254 T 0.207 -255 S 0.285 -256 S 0.342 -257 C 0.373 -258 T 0.385 -259 T 0.379 -260 K 0.366 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031751.15_ENSMUST00000053766.14_GN:Amfr_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031751.15_ENSMUST00000053766.14_GN:Amfr_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index fc937066c3c200bd076fa0cbf51301d04ed3e83a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031751.15_ENSMUST00000053766.14_GN:Amfr_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,640 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000031751.15|ENSMUST00000053766.14|GN:Amfr|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.307 -2 P 0.290 -3 L 0.269 -4 L 0.258 -5 F 0.265 -6 L 0.285 -7 E 0.302 -8 R 0.297 -9 F 0.266 -10 P 0.222 -11 W 0.183 -12 P 0.152 -13 S 0.121 -14 L 0.087 -15 R 0.059 -16 T 0.043 -17 Y 0.039 -18 T 0.041 -19 G 0.050 -20 L 0.061 -21 S 0.071 -22 G 0.073 -23 L 0.070 -24 A 0.064 -25 L 0.059 -26 L 0.057 -27 G 0.059 -28 T 0.065 -29 I 0.071 -30 V 0.073 -31 S 0.068 -32 A 0.063 -33 Y 0.068 -34 R 0.090 -35 A 0.131 -36 L 0.193 -37 S 0.273 -38 Q 0.370 -39 P 0.475 -40 E 0.573 -41 D 0.640 -42 G 0.666 -43 S 0.660 -44 G 0.639 -45 E 0.618 -46 P 0.608 -47 E 0.609 -48 P 0.613 -49 L 0.611 -50 T 0.600 -51 A 0.582 -52 P 0.567 -53 L 0.563 -54 Q 0.579 -55 P 0.610 -56 E 0.638 -57 A 0.653 -58 R 0.657 -59 L 0.660 -60 T 0.659 -61 A 0.643 -62 G 0.603 -63 G 0.536 -64 P 0.444 -65 R 0.339 -66 A 0.241 -67 R 0.172 -68 D 0.140 -69 V 0.134 -70 A 0.135 -71 Q 0.131 -72 Y 0.121 -73 L 0.112 -74 L 0.105 -75 S 0.098 -76 D 0.085 -77 S 0.069 -78 L 0.057 -79 F 0.053 -80 V 0.056 -81 W 0.061 -82 V 0.063 -83 L 0.060 -84 V 0.058 -85 N 0.059 -86 T 0.062 -87 A 0.065 -88 C 0.065 -89 C 0.065 -90 V 0.068 -91 L 0.069 -92 M 0.064 -93 L 0.059 -94 V 0.058 -95 A 0.059 -96 K 0.058 -97 L 0.055 -98 I 0.053 -99 Q 0.052 -100 C 0.053 -101 I 0.060 -102 V 0.068 -103 F 0.077 -104 G 0.085 -105 P 0.089 -106 L 0.083 -107 R 0.068 -108 V 0.051 -109 S 0.041 -110 E 0.037 -111 R 0.035 -112 Q 0.036 -113 H 0.037 -114 L 0.040 -115 K 0.042 -116 D 0.042 -117 K 0.039 -118 F 0.034 -119 W 0.029 -120 N 0.025 -121 F 0.022 -122 I 0.020 -123 F 0.018 -124 Y 0.016 -125 K 0.017 -126 F 0.019 -127 I 0.023 -128 F 0.030 -129 I 0.045 -130 F 0.067 -131 G 0.091 -132 V 0.109 -133 L 0.118 -134 N 0.122 -135 V 0.125 -136 Q 0.126 -137 T 0.117 -138 V 0.095 -139 E 0.071 -140 E 0.056 -141 V 0.048 -142 V 0.045 -143 M 0.045 -144 W 0.045 -145 C 0.042 -146 L 0.039 -147 W 0.042 -148 F 0.052 -149 A 0.065 -150 G 0.074 -151 L 0.077 -152 V 0.074 -153 F 0.071 -154 L 0.073 -155 H 0.078 -156 L 0.079 -157 M 0.074 -158 V 0.068 -159 Q 0.066 -160 L 0.065 -161 C 0.061 -162 K 0.057 -163 D 0.054 -164 R 0.052 -165 F 0.052 -166 E 0.054 -167 Y 0.059 -168 L 0.068 -169 S 0.079 -170 F 0.094 -171 S 0.113 -172 P 0.130 -173 T 0.138 -174 T 0.127 -175 P 0.101 -176 M 0.071 -177 S 0.052 -178 S 0.043 -179 H 0.038 -180 G 0.036 -181 R 0.035 -182 V 0.033 -183 L 0.031 -184 S 0.030 -185 L 0.031 -186 L 0.031 -187 I 0.032 -188 A 0.034 -189 M 0.035 -190 L 0.038 -191 L 0.041 -192 S 0.047 -193 C 0.054 -194 C 0.061 -195 G 0.063 -196 L 0.060 -197 A 0.055 -198 V 0.051 -199 V 0.047 -200 C 0.044 -201 C 0.043 -202 V 0.045 -203 T 0.049 -204 G 0.053 -205 Y 0.057 -206 T 0.062 -207 H 0.066 -208 G 0.065 -209 M 0.058 -210 H 0.050 -211 T 0.044 -212 L 0.038 -213 A 0.032 -214 F 0.028 -215 M 0.029 -216 A 0.032 -217 A 0.038 -218 E 0.045 -219 S 0.049 -220 L 0.049 -221 L 0.046 -222 V 0.042 -223 T 0.039 -224 V 0.039 -225 R 0.039 -226 T 0.039 -227 A 0.037 -228 H 0.035 -229 V 0.032 -230 I 0.029 -231 L 0.027 -232 R 0.026 -233 Y 0.025 -234 V 0.023 -235 I 0.024 -236 H 0.028 -237 L 0.037 -238 W 0.051 -239 D 0.071 -240 L 0.095 -241 N 0.115 -242 H 0.131 -243 E 0.141 -244 G 0.141 -245 T 0.131 -246 W 0.116 -247 E 0.099 -248 G 0.083 -249 K 0.069 -250 G 0.058 -251 T 0.050 -252 Y 0.046 -253 V 0.042 -254 Y 0.042 -255 Y 0.045 -256 T 0.049 -257 D 0.050 -258 F 0.048 -259 V 0.051 -260 M 0.059 -261 E 0.065 -262 L 0.064 -263 A 0.059 -264 L 0.054 -265 L 0.051 -266 S 0.052 -267 L 0.053 -268 D 0.050 -269 L 0.045 -270 M 0.039 -271 H 0.037 -272 H 0.038 -273 I 0.040 -274 H 0.045 -275 M 0.054 -276 L 0.066 -277 L 0.083 -278 F 0.097 -279 G 0.098 -280 N 0.086 -281 I 0.077 -282 W 0.083 -283 L 0.096 -284 S 0.101 -285 M 0.092 -286 A 0.079 -287 S 0.068 -288 L 0.059 -289 V 0.054 -290 I 0.053 -291 F 0.055 -292 M 0.057 -293 Q 0.057 -294 L 0.052 -295 R 0.043 -296 Y 0.035 -297 L 0.032 -298 F 0.035 -299 H 0.044 -300 E 0.061 -301 V 0.075 -302 Q 0.079 -303 R 0.073 -304 R 0.070 -305 I 0.081 -306 R 0.100 -307 R 0.109 -308 H 0.101 -309 K 0.090 -310 N 0.085 -311 Y 0.083 -312 L 0.078 -313 R 0.073 -314 V 0.069 -315 V 0.067 -316 G 0.066 -317 N 0.067 -318 M 0.069 -319 E 0.070 -320 A 0.070 -321 R 0.073 -322 F 0.079 -323 A 0.081 -324 V 0.077 -325 A 0.071 -326 T 0.068 -327 P 0.072 -328 E 0.078 -329 E 0.079 -330 L 0.075 -331 A 0.076 -332 V 0.083 -333 N 0.096 -334 N 0.103 -335 D 0.098 -336 D 0.082 -337 C 0.064 -338 A 0.051 -339 I 0.050 -340 C 0.060 -341 W 0.078 -342 D 0.097 -343 S 0.105 -344 M 0.096 -345 Q 0.080 -346 A 0.067 -347 A 0.060 -348 R 0.058 -349 K 0.057 -350 L 0.052 -351 P 0.047 -352 C 0.049 -353 G 0.058 -354 H 0.066 -355 L 0.065 -356 F 0.056 -357 H 0.045 -358 N 0.039 -359 S 0.041 -360 C 0.047 -361 L 0.052 -362 R 0.052 -363 S 0.050 -364 W 0.050 -365 L 0.052 -366 E 0.053 -367 Q 0.055 -368 D 0.058 -369 T 0.062 -370 S 0.063 -371 C 0.060 -372 P 0.058 -373 T 0.065 -374 C 0.083 -375 R 0.108 -376 M 0.139 -377 S 0.179 -378 L 0.233 -379 N 0.298 -380 I 0.366 -381 A 0.429 -382 D 0.482 -383 G 0.531 -384 S 0.577 -385 R 0.608 -386 A 0.615 -387 R 0.604 -388 E 0.590 -389 D 0.584 -390 H 0.590 -391 Q 0.610 -392 G 0.638 -393 E 0.663 -394 N 0.671 -395 L 0.656 -396 D 0.625 -397 E 0.590 -398 N 0.567 -399 L 0.565 -400 V 0.593 -401 P 0.647 -402 V 0.700 -403 A 0.725 -404 A 0.719 -405 A 0.696 -406 E 0.673 -407 G 0.661 -408 R 0.665 -409 P 0.682 -410 R 0.696 -411 L 0.688 -412 N 0.653 -413 Q 0.599 -414 H 0.540 -415 N 0.477 -416 H 0.404 -417 F 0.323 -418 F 0.248 -419 H 0.196 -420 F 0.174 -421 D 0.175 -422 G 0.185 -423 S 0.190 -424 R 0.183 -425 I 0.169 -426 A 0.160 -427 S 0.168 -428 W 0.197 -429 L 0.242 -430 P 0.286 -431 S 0.315 -432 F 0.335 -433 S 0.365 -434 V 0.407 -435 E 0.446 -436 V 0.476 -437 M 0.504 -438 H 0.540 -439 T 0.587 -440 T 0.636 -441 N 0.669 -442 I 0.681 -443 L 0.672 -444 G 0.643 -445 I 0.593 -446 T 0.530 -447 Q 0.458 -448 A 0.383 -449 S 0.315 -450 N 0.259 -451 S 0.209 -452 Q 0.162 -453 L 0.120 -454 N 0.088 -455 A 0.069 -456 M 0.062 -457 A 0.061 -458 H 0.064 -459 Q 0.069 -460 I 0.073 -461 Q 0.070 -462 E 0.065 -463 M 0.063 -464 F 0.066 -465 P 0.074 -466 Q 0.080 -467 V 0.082 -468 P 0.076 -469 Y 0.068 -470 H 0.060 -471 L 0.054 -472 V 0.050 -473 L 0.053 -474 Q 0.064 -475 D 0.076 -476 L 0.079 -477 Q 0.072 -478 M 0.063 -479 T 0.060 -480 R 0.064 -481 S 0.070 -482 V 0.073 -483 E 0.070 -484 I 0.068 -485 T 0.073 -486 T 0.083 -487 D 0.091 -488 N 0.091 -489 I 0.089 -490 L 0.099 -491 E 0.125 -492 G 0.157 -493 R 0.182 -494 I 0.204 -495 Q 0.235 -496 V 0.287 -497 P 0.362 -498 F 0.453 -499 P 0.544 -500 T 0.619 -501 Q 0.666 -502 R 0.687 -503 S 0.689 -504 D 0.680 -505 S 0.666 -506 L 0.658 -507 R 0.665 -508 P 0.687 -509 A 0.707 -510 L 0.713 -511 N 0.708 -512 S 0.693 -513 P 0.659 -514 V 0.606 -515 E 0.575 -516 R 0.599 -517 P 0.655 -518 S 0.706 -519 P 0.743 -520 D 0.756 -521 L 0.730 -522 E 0.673 -523 E 0.638 -524 G 0.653 -525 E 0.667 -526 A 0.644 -527 S 0.624 -528 V 0.646 -529 Q 0.667 -530 T 0.646 -531 E 0.626 -532 R 0.654 -533 V 0.713 -534 P 0.758 -535 L 0.771 -536 D 0.762 -537 L 0.744 -538 S 0.738 -539 P 0.750 -540 R 0.771 -541 L 0.781 -542 E 0.777 -543 E 0.760 -544 T 0.729 -545 L 0.688 -546 D 0.658 -547 F 0.657 -548 S 0.682 -549 E 0.711 -550 V 0.726 -551 E 0.733 -552 L 0.738 -553 E 0.744 -554 P 0.749 -555 I 0.750 -556 E 0.749 -557 V 0.746 -558 E 0.739 -559 D 0.724 -560 F 0.703 -561 E 0.685 -562 A 0.677 -563 R 0.679 -564 G 0.675 -565 S 0.647 -566 R 0.594 -567 F 0.530 -568 S 0.477 -569 K 0.444 -570 S 0.418 -571 A 0.388 -572 D 0.359 -573 E 0.345 -574 R 0.344 -575 Q 0.341 -576 R 0.342 -577 M 0.367 -578 L 0.398 -579 V 0.397 -580 Q 0.372 -581 R 0.361 -582 K 0.373 -583 D 0.388 -584 D 0.387 -585 L 0.364 -586 L 0.328 -587 Q 0.295 -588 Q 0.271 -589 A 0.257 -590 R 0.254 -591 K 0.270 -592 R 0.310 -593 F 0.365 -594 L 0.427 -595 N 0.496 -596 K 0.565 -597 S 0.611 -598 S 0.626 -599 E 0.632 -600 D 0.650 -601 D 0.677 -602 G 0.695 -603 A 0.701 -604 S 0.699 -605 E 0.691 -606 R 0.679 -607 L 0.672 -608 L 0.678 -609 P 0.698 -610 S 0.724 -611 E 0.736 -612 G 0.718 -613 T 0.664 -614 S 0.593 -615 S 0.530 -616 D 0.480 -617 P 0.433 -618 V 0.385 -619 T 0.343 -620 L 0.318 -621 R 0.303 -622 R 0.289 -623 R 0.280 -624 M 0.279 -625 L 0.276 -626 A 0.270 -627 A 0.266 -628 A 0.269 -629 A 0.272 -630 E 0.276 -631 R 0.285 -632 R 0.298 -633 L 0.316 -634 Q 0.339 -635 R 0.372 -636 Q 0.416 -637 R 0.465 -638 T 0.509 -639 T 0.537 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031751.15_ENSMUST00000053766.14_GN:Amfr_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:121.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031751.15_ENSMUST00000053766.14_GN:Amfr_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:121.caid deleted file mode 100644 index 302499a5a48841580e64df8098cb19448a98c0bc..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031751.15_ENSMUST00000053766.14_GN:Amfr_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:121.caid +++ /dev/null @@ -1,761 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000031751.15|ENSMUST00000053766.14|GN:Amfr|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:121 -1 M 0.344 -2 L 0.382 -3 Q 0.444 -4 G 0.500 -5 A 0.516 -6 G 0.490 -7 T 0.469 -8 R 0.487 -9 G 0.525 -10 P 0.552 -11 R 0.574 -12 P 0.599 -13 G 0.621 -14 P 0.625 -15 V 0.615 -16 L 0.607 -17 S 0.609 -18 G 0.601 -19 L 0.567 -20 Q 0.522 -21 S 0.509 -22 A 0.553 -23 G 0.624 -24 C 0.679 -25 G 0.710 -26 R 0.725 -27 G 0.727 -28 T 0.715 -29 K 0.688 -30 A 0.647 -31 A 0.600 -32 P 0.564 -33 P 0.547 -34 R 0.533 -35 P 0.509 -36 S 0.502 -37 R 0.543 -38 P 0.613 -39 R 0.677 -40 P 0.722 -41 A 0.754 -42 R 0.770 -43 G 0.768 -44 G 0.753 -45 G 0.732 -46 P 0.718 -47 P 0.712 -48 R 0.704 -49 V 0.675 -50 R 0.628 -51 R 0.605 -52 G 0.638 -53 S 0.691 -54 S 0.723 -55 A 0.738 -56 P 0.752 -57 A 0.770 -58 G 0.781 -59 A 0.783 -60 A 0.776 -61 A 0.766 -62 G 0.756 -63 A 0.746 -64 A 0.728 -65 R 0.707 -66 G 0.698 -67 G 0.700 -68 A 0.680 -69 A 0.632 -70 R 0.604 -71 A 0.634 -72 A 0.686 -73 R 0.719 -74 S 0.733 -75 G 0.742 -76 P 0.753 -77 A 0.765 -78 R 0.776 -79 P 0.787 -80 G 0.794 -81 A 0.791 -82 A 0.771 -83 A 0.722 -84 A 0.657 -85 A 0.628 -86 A 0.665 -87 A 0.726 -88 A 0.754 -89 A 0.741 -90 A 0.707 -91 T 0.679 -92 P 0.677 -93 E 0.699 -94 P 0.722 -95 V 0.728 -96 G 0.714 -97 A 0.680 -98 F 0.623 -99 R 0.561 -100 K 0.532 -101 A 0.557 -102 A 0.604 -103 A 0.629 -104 G 0.627 -105 A 0.608 -106 W 0.594 -107 P 0.604 -108 Q 0.638 -109 R 0.669 -110 G 0.679 -111 K 0.672 -112 P 0.668 -113 R 0.675 -114 G 0.688 -115 P 0.701 -116 E 0.714 -117 P 0.723 -118 V 0.722 -119 A 0.708 -120 A 0.680 -121 A 0.637 -122 M 0.573 -123 P 0.491 -124 L 0.411 -125 L 0.349 -126 F 0.317 -127 L 0.310 -128 E 0.312 -129 R 0.306 -130 F 0.283 -131 P 0.248 -132 W 0.212 -133 P 0.181 -134 S 0.148 -135 L 0.110 -136 R 0.077 -137 T 0.056 -138 Y 0.047 -139 T 0.047 -140 G 0.055 -141 L 0.066 -142 S 0.076 -143 G 0.080 -144 L 0.077 -145 A 0.072 -146 L 0.066 -147 L 0.063 -148 G 0.059 -149 T 0.054 -150 I 0.046 -151 V 0.039 -152 S 0.038 -153 A 0.043 -154 Y 0.055 -155 R 0.077 -156 A 0.118 -157 L 0.180 -158 S 0.264 -159 Q 0.367 -160 P 0.481 -161 E 0.585 -162 D 0.655 -163 G 0.683 -164 S 0.678 -165 G 0.658 -166 E 0.638 -167 P 0.629 -168 E 0.631 -169 P 0.638 -170 L 0.638 -171 T 0.630 -172 A 0.614 -173 P 0.598 -174 L 0.591 -175 Q 0.601 -176 P 0.623 -177 E 0.643 -178 A 0.649 -179 R 0.648 -180 L 0.649 -181 T 0.650 -182 A 0.635 -183 G 0.596 -184 G 0.529 -185 P 0.437 -186 R 0.331 -187 A 0.234 -188 R 0.168 -189 D 0.139 -190 V 0.133 -191 A 0.133 -192 Q 0.126 -193 Y 0.115 -194 L 0.106 -195 L 0.100 -196 S 0.093 -197 D 0.080 -198 S 0.066 -199 L 0.054 -200 F 0.050 -201 V 0.052 -202 W 0.056 -203 V 0.058 -204 L 0.055 -205 V 0.052 -206 N 0.053 -207 T 0.057 -208 A 0.060 -209 C 0.061 -210 C 0.063 -211 V 0.066 -212 L 0.067 -213 M 0.063 -214 L 0.058 -215 V 0.057 -216 A 0.058 -217 K 0.056 -218 L 0.054 -219 I 0.051 -220 Q 0.050 -221 C 0.053 -222 I 0.059 -223 V 0.066 -224 F 0.073 -225 G 0.081 -226 P 0.086 -227 L 0.082 -228 R 0.067 -229 V 0.051 -230 S 0.039 -231 E 0.034 -232 R 0.032 -233 Q 0.032 -234 H 0.034 -235 L 0.037 -236 K 0.040 -237 D 0.040 -238 K 0.037 -239 F 0.032 -240 W 0.027 -241 N 0.023 -242 F 0.021 -243 I 0.018 -244 F 0.016 -245 Y 0.015 -246 K 0.016 -247 F 0.017 -248 I 0.021 -249 F 0.027 -250 I 0.040 -251 F 0.060 -252 G 0.081 -253 V 0.096 -254 L 0.103 -255 N 0.105 -256 V 0.108 -257 Q 0.110 -258 T 0.104 -259 V 0.085 -260 E 0.063 -261 E 0.049 -262 V 0.042 -263 V 0.039 -264 M 0.039 -265 W 0.040 -266 C 0.038 -267 L 0.036 -268 W 0.039 -269 F 0.049 -270 A 0.062 -271 G 0.071 -272 L 0.074 -273 V 0.071 -274 F 0.068 -275 L 0.072 -276 H 0.078 -277 L 0.080 -278 M 0.075 -279 V 0.071 -280 Q 0.070 -281 L 0.068 -282 C 0.064 -283 K 0.059 -284 D 0.056 -285 R 0.055 -286 F 0.053 -287 E 0.054 -288 Y 0.057 -289 L 0.065 -290 S 0.076 -291 F 0.091 -292 S 0.110 -293 P 0.129 -294 T 0.138 -295 T 0.127 -296 P 0.101 -297 M 0.072 -298 S 0.052 -299 S 0.043 -300 H 0.038 -301 G 0.035 -302 R 0.034 -303 V 0.032 -304 L 0.029 -305 S 0.029 -306 L 0.030 -307 L 0.031 -308 I 0.033 -309 A 0.034 -310 M 0.037 -311 L 0.040 -312 L 0.044 -313 S 0.051 -314 C 0.059 -315 C 0.067 -316 G 0.069 -317 L 0.065 -318 A 0.059 -319 V 0.054 -320 V 0.050 -321 C 0.047 -322 C 0.046 -323 V 0.049 -324 T 0.054 -325 G 0.058 -326 Y 0.062 -327 T 0.067 -328 H 0.071 -329 G 0.069 -330 M 0.062 -331 H 0.054 -332 T 0.048 -333 L 0.042 -334 A 0.036 -335 F 0.031 -336 M 0.030 -337 A 0.033 -338 A 0.038 -339 E 0.045 -340 S 0.051 -341 L 0.052 -342 L 0.049 -343 V 0.045 -344 T 0.042 -345 V 0.041 -346 R 0.041 -347 T 0.041 -348 A 0.040 -349 H 0.038 -350 V 0.035 -351 I 0.031 -352 L 0.029 -353 R 0.028 -354 Y 0.027 -355 V 0.025 -356 I 0.027 -357 H 0.032 -358 L 0.041 -359 W 0.056 -360 D 0.078 -361 L 0.103 -362 N 0.124 -363 H 0.139 -364 E 0.147 -365 G 0.147 -366 T 0.137 -367 W 0.121 -368 E 0.103 -369 G 0.086 -370 K 0.072 -371 G 0.062 -372 T 0.056 -373 Y 0.051 -374 V 0.048 -375 Y 0.047 -376 Y 0.050 -377 T 0.054 -378 D 0.055 -379 F 0.053 -380 V 0.057 -381 M 0.065 -382 E 0.072 -383 L 0.071 -384 A 0.065 -385 L 0.059 -386 L 0.055 -387 S 0.055 -388 L 0.056 -389 D 0.054 -390 L 0.048 -391 M 0.042 -392 H 0.039 -393 H 0.039 -394 I 0.041 -395 H 0.046 -396 M 0.054 -397 L 0.067 -398 L 0.084 -399 F 0.097 -400 G 0.096 -401 N 0.082 -402 I 0.072 -403 W 0.076 -404 L 0.090 -405 S 0.096 -406 M 0.088 -407 A 0.077 -408 S 0.067 -409 L 0.059 -410 V 0.054 -411 I 0.054 -412 F 0.057 -413 M 0.060 -414 Q 0.060 -415 L 0.053 -416 R 0.043 -417 Y 0.036 -418 L 0.033 -419 F 0.035 -420 H 0.045 -421 E 0.061 -422 V 0.074 -423 Q 0.077 -424 R 0.069 -425 R 0.057 -426 I 0.057 -427 R 0.070 -428 R 0.085 -429 H 0.088 -430 K 0.085 -431 N 0.083 -432 Y 0.083 -433 L 0.079 -434 R 0.074 -435 V 0.070 -436 V 0.069 -437 G 0.069 -438 N 0.071 -439 M 0.075 -440 E 0.077 -441 A 0.077 -442 R 0.079 -443 F 0.084 -444 A 0.085 -445 V 0.080 -446 A 0.072 -447 T 0.068 -448 P 0.072 -449 E 0.078 -450 E 0.079 -451 L 0.076 -452 A 0.076 -453 V 0.084 -454 N 0.095 -455 N 0.102 -456 D 0.097 -457 D 0.082 -458 C 0.064 -459 A 0.051 -460 I 0.050 -461 C 0.060 -462 W 0.077 -463 D 0.096 -464 S 0.104 -465 M 0.095 -466 Q 0.080 -467 A 0.068 -468 A 0.061 -469 R 0.059 -470 K 0.058 -471 L 0.054 -472 P 0.049 -473 C 0.051 -474 G 0.060 -475 H 0.069 -476 L 0.069 -477 F 0.059 -478 H 0.047 -479 N 0.040 -480 S 0.041 -481 C 0.049 -482 L 0.054 -483 R 0.054 -484 S 0.051 -485 W 0.051 -486 L 0.052 -487 E 0.054 -488 Q 0.057 -489 D 0.062 -490 T 0.066 -491 S 0.066 -492 C 0.062 -493 P 0.061 -494 T 0.068 -495 C 0.088 -496 R 0.113 -497 M 0.143 -498 S 0.180 -499 L 0.229 -500 N 0.289 -501 I 0.352 -502 A 0.411 -503 D 0.464 -504 G 0.515 -505 S 0.564 -506 R 0.598 -507 A 0.608 -508 R 0.601 -509 E 0.593 -510 D 0.591 -511 H 0.597 -512 Q 0.614 -513 G 0.639 -514 E 0.661 -515 N 0.667 -516 L 0.651 -517 D 0.620 -518 E 0.586 -519 N 0.562 -520 L 0.561 -521 V 0.591 -522 P 0.646 -523 V 0.701 -524 A 0.725 -525 A 0.717 -526 A 0.694 -527 E 0.673 -528 G 0.663 -529 R 0.670 -530 P 0.690 -531 R 0.706 -532 L 0.701 -533 N 0.667 -534 Q 0.614 -535 H 0.555 -536 N 0.492 -537 H 0.417 -538 F 0.331 -539 F 0.253 -540 H 0.200 -541 F 0.181 -542 D 0.186 -543 G 0.198 -544 S 0.201 -545 R 0.190 -546 I 0.173 -547 A 0.166 -548 S 0.175 -549 W 0.205 -550 L 0.253 -551 P 0.302 -552 S 0.333 -553 F 0.351 -554 S 0.379 -555 V 0.420 -556 E 0.464 -557 V 0.501 -558 M 0.533 -559 H 0.568 -560 T 0.612 -561 T 0.656 -562 N 0.684 -563 I 0.692 -564 L 0.681 -565 G 0.650 -566 I 0.600 -567 T 0.536 -568 Q 0.465 -569 A 0.394 -570 S 0.331 -571 N 0.277 -572 S 0.224 -573 Q 0.171 -574 L 0.126 -575 N 0.092 -576 A 0.073 -577 M 0.065 -578 A 0.064 -579 H 0.067 -580 Q 0.072 -581 I 0.075 -582 Q 0.072 -583 E 0.066 -584 M 0.063 -585 F 0.066 -586 P 0.074 -587 Q 0.080 -588 V 0.082 -589 P 0.077 -590 Y 0.069 -591 H 0.061 -592 L 0.055 -593 V 0.050 -594 L 0.053 -595 Q 0.064 -596 D 0.077 -597 L 0.081 -598 Q 0.074 -599 M 0.064 -600 T 0.059 -601 R 0.061 -602 S 0.067 -603 V 0.069 -604 E 0.067 -605 I 0.064 -606 T 0.069 -607 T 0.079 -608 D 0.086 -609 N 0.085 -610 I 0.083 -611 L 0.093 -612 E 0.119 -613 G 0.150 -614 R 0.175 -615 I 0.196 -616 Q 0.227 -617 V 0.279 -618 P 0.354 -619 F 0.445 -620 P 0.537 -621 T 0.613 -622 Q 0.662 -623 R 0.685 -624 S 0.689 -625 D 0.681 -626 S 0.669 -627 L 0.660 -628 R 0.666 -629 P 0.685 -630 A 0.704 -631 L 0.710 -632 N 0.705 -633 S 0.693 -634 P 0.668 -635 V 0.631 -636 E 0.609 -637 R 0.627 -638 P 0.668 -639 S 0.710 -640 P 0.747 -641 D 0.775 -642 L 0.791 -643 E 0.795 -644 E 0.792 -645 G 0.779 -646 E 0.743 -647 A 0.691 -648 S 0.666 -649 V 0.696 -650 Q 0.748 -651 T 0.783 -652 E 0.790 -653 R 0.783 -654 V 0.777 -655 P 0.776 -656 L 0.772 -657 D 0.758 -658 L 0.741 -659 S 0.735 -660 P 0.748 -661 R 0.768 -662 L 0.778 -663 E 0.772 -664 E 0.754 -665 T 0.722 -666 L 0.681 -667 D 0.649 -668 F 0.645 -669 S 0.667 -670 E 0.691 -671 V 0.704 -672 E 0.710 -673 L 0.717 -674 E 0.725 -675 P 0.730 -676 I 0.730 -677 E 0.726 -678 V 0.721 -679 E 0.712 -680 D 0.695 -681 F 0.674 -682 E 0.658 -683 A 0.655 -684 R 0.662 -685 G 0.661 -686 S 0.632 -687 R 0.573 -688 F 0.507 -689 S 0.456 -690 K 0.428 -691 S 0.408 -692 A 0.381 -693 D 0.354 -694 E 0.338 -695 R 0.333 -696 Q 0.330 -697 R 0.332 -698 M 0.356 -699 L 0.384 -700 V 0.382 -701 Q 0.361 -702 R 0.358 -703 K 0.380 -704 D 0.403 -705 D 0.402 -706 L 0.375 -707 L 0.337 -708 Q 0.305 -709 Q 0.285 -710 A 0.272 -711 R 0.268 -712 K 0.283 -713 R 0.322 -714 F 0.380 -715 L 0.448 -716 N 0.520 -717 K 0.585 -718 S 0.626 -719 S 0.639 -720 E 0.644 -721 D 0.660 -722 D 0.682 -723 G 0.697 -724 A 0.700 -725 S 0.697 -726 E 0.688 -727 R 0.677 -728 L 0.671 -729 L 0.677 -730 P 0.698 -731 S 0.725 -732 E 0.740 -733 G 0.724 -734 T 0.674 -735 S 0.607 -736 S 0.546 -737 D 0.499 -738 P 0.456 -739 V 0.409 -740 T 0.367 -741 L 0.339 -742 R 0.321 -743 R 0.304 -744 R 0.289 -745 M 0.282 -746 L 0.275 -747 A 0.266 -748 A 0.262 -749 A 0.265 -750 A 0.271 -751 E 0.282 -752 R 0.300 -753 R 0.324 -754 L 0.351 -755 Q 0.382 -756 R 0.421 -757 Q 0.465 -758 R 0.508 -759 T 0.543 -760 T 0.565 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031913.10_ENSMUST00000034388.10_GN:Vps4a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031913.10_ENSMUST00000034388.10_GN:Vps4a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index f262edfc2ac9ee9a08cef0b7aec259241c89984e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031913.10_ENSMUST00000034388.10_GN:Vps4a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,438 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000031913.10|ENSMUST00000034388.10|GN:Vps4a|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.365 -2 T 0.325 -3 T 0.257 -4 S 0.183 -5 T 0.123 -6 L 0.085 -7 Q 0.067 -8 K 0.062 -9 A 0.065 -10 I 0.071 -11 D 0.075 -12 L 0.075 -13 V 0.077 -14 T 0.082 -15 K 0.083 -16 A 0.081 -17 T 0.079 -18 E 0.078 -19 E 0.074 -20 D 0.075 -21 K 0.084 -22 A 0.098 -23 K 0.104 -24 N 0.096 -25 Y 0.078 -26 E 0.061 -27 E 0.055 -28 A 0.055 -29 L 0.054 -30 R 0.051 -31 L 0.048 -32 Y 0.049 -33 Q 0.050 -34 H 0.050 -35 A 0.045 -36 V 0.039 -37 E 0.033 -38 Y 0.031 -39 F 0.031 -40 L 0.035 -41 H 0.042 -42 A 0.051 -43 I 0.063 -44 K 0.080 -45 Y 0.106 -46 E 0.137 -47 A 0.165 -48 H 0.177 -49 S 0.172 -50 D 0.153 -51 K 0.129 -52 A 0.111 -53 K 0.101 -54 E 0.093 -55 S 0.086 -56 I 0.083 -57 R 0.087 -58 A 0.090 -59 K 0.087 -60 C 0.075 -61 M 0.062 -62 Q 0.054 -63 Y 0.057 -64 L 0.068 -65 D 0.074 -66 R 0.071 -67 A 0.064 -68 E 0.061 -69 K 0.062 -70 L 0.066 -71 K 0.074 -72 D 0.078 -73 Y 0.076 -74 L 0.079 -75 R 0.097 -76 N 0.128 -77 K 0.169 -78 E 0.222 -79 K 0.296 -80 H 0.386 -81 G 0.471 -82 K 0.532 -83 K 0.559 -84 P 0.553 -85 V 0.526 -86 K 0.515 -87 E 0.537 -88 N 0.555 -89 Q 0.542 -90 S 0.536 -91 E 0.576 -92 G 0.637 -93 K 0.678 -94 G 0.694 -95 S 0.697 -96 D 0.694 -97 S 0.685 -98 D 0.671 -99 S 0.652 -100 E 0.622 -101 G 0.571 -102 D 0.502 -103 N 0.424 -104 P 0.349 -105 E 0.293 -106 K 0.261 -107 K 0.234 -108 K 0.205 -109 L 0.179 -110 Q 0.161 -111 E 0.149 -112 Q 0.143 -113 L 0.143 -114 M 0.146 -115 G 0.149 -116 A 0.153 -117 V 0.163 -118 V 0.177 -119 M 0.197 -120 E 0.218 -121 K 0.225 -122 P 0.204 -123 N 0.160 -124 I 0.110 -125 R 0.072 -126 W 0.051 -127 N 0.044 -128 D 0.043 -129 V 0.042 -130 A 0.043 -131 G 0.046 -132 L 0.048 -133 E 0.049 -134 G 0.052 -135 A 0.056 -136 K 0.063 -137 E 0.077 -138 A 0.091 -139 L 0.099 -140 K 0.099 -141 E 0.093 -142 A 0.083 -143 V 0.070 -144 I 0.061 -145 L 0.057 -146 P 0.056 -147 I 0.055 -148 K 0.056 -149 F 0.059 -150 P 0.066 -151 H 0.074 -152 L 0.087 -153 F 0.104 -154 T 0.127 -155 G 0.159 -156 K 0.193 -157 R 0.213 -158 T 0.206 -159 P 0.173 -160 W 0.125 -161 R 0.084 -162 G 0.061 -163 I 0.053 -164 L 0.050 -165 L 0.050 -166 F 0.053 -167 G 0.058 -168 P 0.061 -169 P 0.061 -170 G 0.062 -171 T 0.066 -172 G 0.070 -173 K 0.069 -174 S 0.068 -175 Y 0.072 -176 L 0.082 -177 A 0.091 -178 K 0.098 -179 A 0.104 -180 V 0.106 -181 A 0.101 -182 T 0.093 -183 E 0.088 -184 A 0.090 -185 N 0.099 -186 N 0.107 -187 S 0.104 -188 T 0.086 -189 F 0.064 -190 F 0.049 -191 S 0.044 -192 V 0.043 -193 S 0.044 -194 S 0.048 -195 S 0.057 -196 D 0.067 -197 L 0.074 -198 M 0.075 -199 S 0.076 -200 K 0.081 -201 W 0.087 -202 L 0.089 -203 G 0.087 -204 E 0.081 -205 S 0.073 -206 E 0.062 -207 K 0.049 -208 L 0.039 -209 V 0.032 -210 K 0.029 -211 N 0.027 -212 L 0.026 -213 F 0.026 -214 E 0.027 -215 L 0.030 -216 A 0.035 -217 R 0.036 -218 Q 0.033 -219 H 0.029 -220 K 0.029 -221 P 0.037 -222 S 0.047 -223 I 0.053 -224 I 0.049 -225 F 0.041 -226 I 0.037 -227 D 0.037 -228 E 0.039 -229 V 0.042 -230 D 0.050 -231 S 0.065 -232 L 0.089 -233 C 0.120 -234 G 0.154 -235 S 0.183 -236 R 0.199 -237 N 0.199 -238 E 0.191 -239 N 0.179 -240 E 0.160 -241 S 0.134 -242 E 0.107 -243 A 0.087 -244 A 0.075 -245 R 0.070 -246 R 0.071 -247 I 0.073 -248 K 0.071 -249 T 0.063 -250 E 0.053 -251 F 0.045 -252 L 0.042 -253 V 0.046 -254 Q 0.059 -255 M 0.085 -256 Q 0.125 -257 G 0.171 -258 V 0.211 -259 G 0.236 -260 N 0.240 -261 N 0.221 -262 N 0.184 -263 D 0.140 -264 G 0.101 -265 T 0.074 -266 L 0.058 -267 V 0.051 -268 L 0.047 -269 G 0.047 -270 A 0.051 -271 T 0.060 -272 N 0.076 -273 I 0.093 -274 P 0.103 -275 W 0.101 -276 V 0.098 -277 L 0.098 -278 D 0.094 -279 S 0.085 -280 A 0.074 -281 I 0.068 -282 R 0.068 -283 R 0.071 -284 R 0.073 -285 F 0.073 -286 E 0.065 -287 K 0.053 -288 R 0.044 -289 I 0.044 -290 Y 0.050 -291 I 0.060 -292 P 0.068 -293 L 0.073 -294 P 0.072 -295 E 0.067 -296 E 0.060 -297 A 0.053 -298 A 0.047 -299 R 0.044 -300 A 0.045 -301 Q 0.047 -302 M 0.046 -303 F 0.045 -304 R 0.047 -305 L 0.052 -306 H 0.062 -307 L 0.076 -308 G 0.091 -309 S 0.100 -310 T 0.099 -311 P 0.090 -312 H 0.079 -313 N 0.071 -314 L 0.066 -315 T 0.061 -316 D 0.055 -317 A 0.050 -318 N 0.047 -319 I 0.044 -320 H 0.045 -321 E 0.054 -322 L 0.071 -323 A 0.084 -324 R 0.089 -325 K 0.088 -326 T 0.088 -327 E 0.089 -328 G 0.091 -329 Y 0.093 -330 S 0.093 -331 G 0.093 -332 A 0.094 -333 D 0.096 -334 I 0.093 -335 S 0.091 -336 I 0.096 -337 I 0.108 -338 V 0.115 -339 R 0.114 -340 D 0.112 -341 S 0.117 -342 L 0.123 -343 M 0.126 -344 Q 0.130 -345 P 0.138 -346 V 0.149 -347 R 0.159 -348 K 0.164 -349 V 0.161 -350 Q 0.154 -351 S 0.148 -352 A 0.145 -353 T 0.139 -354 H 0.129 -355 F 0.121 -356 K 0.122 -357 K 0.136 -358 V 0.163 -359 C 0.195 -360 G 0.217 -361 P 0.223 -362 S 0.222 -363 R 0.223 -364 T 0.233 -365 N 0.249 -366 P 0.263 -367 S 0.272 -368 V 0.273 -369 M 0.263 -370 I 0.242 -371 D 0.217 -372 D 0.193 -373 L 0.171 -374 L 0.160 -375 T 0.160 -376 P 0.168 -377 C 0.178 -378 S 0.183 -379 P 0.187 -380 G 0.194 -381 D 0.203 -382 P 0.206 -383 G 0.205 -384 A 0.208 -385 I 0.215 -386 E 0.218 -387 M 0.212 -388 T 0.198 -389 W 0.179 -390 M 0.167 -391 D 0.175 -392 V 0.200 -393 P 0.224 -394 G 0.226 -395 D 0.206 -396 K 0.180 -397 L 0.169 -398 L 0.179 -399 E 0.197 -400 P 0.205 -401 V 0.198 -402 V 0.173 -403 C 0.138 -404 M 0.107 -405 S 0.092 -406 D 0.088 -407 M 0.090 -408 L 0.097 -409 R 0.107 -410 S 0.114 -411 L 0.117 -412 A 0.122 -413 T 0.133 -414 T 0.143 -415 R 0.144 -416 P 0.142 -417 T 0.145 -418 V 0.143 -419 N 0.129 -420 A 0.110 -421 D 0.095 -422 D 0.089 -423 L 0.091 -424 L 0.090 -425 K 0.086 -426 V 0.086 -427 K 0.092 -428 K 0.095 -429 F 0.092 -430 S 0.091 -431 E 0.095 -432 D 0.105 -433 F 0.126 -434 G 0.163 -435 Q 0.219 -436 E 0.276 -437 S 0.312 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031913.10_ENSMUST00000034388.10_GN:Vps4a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:73.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031913.10_ENSMUST00000034388.10_GN:Vps4a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:73.caid deleted file mode 100644 index b2bbda6fdf99d17372d3866b460f3c5c1c50e349..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031913.10_ENSMUST00000034388.10_GN:Vps4a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:73.caid +++ /dev/null @@ -1,511 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000031913.10|ENSMUST00000034388.10|GN:Vps4a|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:73 -1 M 0.391 -2 A 0.410 -3 T 0.442 -4 G 0.473 -5 R 0.496 -6 Q 0.517 -7 P 0.547 -8 R 0.576 -9 D 0.588 -10 S 0.577 -11 G 0.553 -12 W 0.537 -13 A 0.535 -14 A 0.528 -15 L 0.498 -16 G 0.456 -17 R 0.436 -18 A 0.446 -19 P 0.460 -20 R 0.479 -21 S 0.530 -22 P 0.605 -23 S 0.666 -24 D 0.694 -25 S 0.698 -26 A 0.695 -27 P 0.700 -28 T 0.713 -29 A 0.725 -30 S 0.728 -31 G 0.723 -32 S 0.706 -33 S 0.665 -34 A 0.603 -35 R 0.556 -36 A 0.543 -37 E 0.538 -38 S 0.542 -39 R 0.585 -40 P 0.656 -41 A 0.712 -42 G 0.730 -43 L 0.722 -44 L 0.707 -45 S 0.700 -46 G 0.696 -47 G 0.691 -48 P 0.683 -49 T 0.673 -50 T 0.657 -51 S 0.633 -52 A 0.615 -53 P 0.620 -54 P 0.637 -55 S 0.631 -56 R 0.598 -57 T 0.588 -58 E 0.637 -59 A 0.706 -60 A 0.748 -61 S 0.764 -62 S 0.773 -63 T 0.781 -64 A 0.783 -65 G 0.777 -66 C 0.761 -67 G 0.737 -68 A 0.712 -69 D 0.693 -70 P 0.677 -71 G 0.653 -72 Y 0.607 -73 E 0.530 -74 M 0.429 -75 T 0.321 -76 T 0.224 -77 S 0.149 -78 T 0.101 -79 L 0.075 -80 Q 0.065 -81 K 0.065 -82 A 0.069 -83 I 0.073 -84 D 0.071 -85 L 0.063 -86 V 0.055 -87 T 0.058 -88 K 0.066 -89 A 0.074 -90 T 0.078 -91 E 0.077 -92 E 0.072 -93 D 0.072 -94 K 0.079 -95 A 0.089 -96 K 0.093 -97 N 0.084 -98 Y 0.068 -99 E 0.055 -100 E 0.052 -101 A 0.053 -102 L 0.052 -103 R 0.048 -104 L 0.046 -105 Y 0.048 -106 Q 0.049 -107 H 0.047 -108 A 0.042 -109 V 0.035 -110 E 0.030 -111 Y 0.027 -112 F 0.028 -113 L 0.031 -114 H 0.036 -115 A 0.043 -116 I 0.054 -117 K 0.069 -118 Y 0.091 -119 E 0.116 -120 A 0.137 -121 H 0.145 -122 S 0.141 -123 D 0.128 -124 K 0.112 -125 A 0.099 -126 K 0.091 -127 E 0.084 -128 S 0.077 -129 I 0.075 -130 R 0.082 -131 A 0.087 -132 K 0.084 -133 C 0.073 -134 M 0.059 -135 Q 0.049 -136 Y 0.051 -137 L 0.062 -138 D 0.069 -139 R 0.065 -140 A 0.057 -141 E 0.051 -142 K 0.051 -143 L 0.058 -144 K 0.068 -145 D 0.074 -146 Y 0.071 -147 L 0.072 -148 R 0.086 -149 N 0.112 -150 K 0.150 -151 E 0.201 -152 K 0.273 -153 H 0.360 -154 G 0.446 -155 K 0.514 -156 K 0.563 -157 P 0.599 -158 V 0.626 -159 K 0.642 -160 E 0.638 -161 N 0.606 -162 Q 0.557 -163 S 0.538 -164 E 0.574 -165 G 0.634 -166 K 0.675 -167 G 0.692 -168 S 0.696 -169 D 0.692 -170 S 0.683 -171 D 0.668 -172 S 0.650 -173 E 0.621 -174 G 0.572 -175 D 0.503 -176 N 0.422 -177 P 0.343 -178 E 0.284 -179 K 0.250 -180 K 0.225 -181 K 0.199 -182 L 0.175 -183 Q 0.160 -184 E 0.149 -185 Q 0.143 -186 L 0.143 -187 M 0.147 -188 G 0.151 -189 A 0.157 -190 V 0.167 -191 V 0.181 -192 M 0.201 -193 E 0.220 -194 K 0.224 -195 P 0.202 -196 N 0.156 -197 I 0.106 -198 R 0.069 -199 W 0.049 -200 N 0.044 -201 D 0.042 -202 V 0.041 -203 A 0.041 -204 G 0.043 -205 L 0.045 -206 E 0.047 -207 G 0.049 -208 A 0.052 -209 K 0.060 -210 E 0.074 -211 A 0.091 -212 L 0.101 -213 K 0.102 -214 E 0.096 -215 A 0.085 -216 V 0.071 -217 I 0.061 -218 L 0.057 -219 P 0.056 -220 I 0.055 -221 K 0.056 -222 F 0.060 -223 P 0.064 -224 H 0.070 -225 L 0.081 -226 F 0.096 -227 T 0.117 -228 G 0.147 -229 K 0.180 -230 R 0.200 -231 T 0.195 -232 P 0.164 -233 W 0.119 -234 R 0.081 -235 G 0.059 -236 I 0.050 -237 L 0.047 -238 L 0.045 -239 F 0.047 -240 G 0.052 -241 P 0.055 -242 P 0.056 -243 G 0.058 -244 T 0.063 -245 G 0.067 -246 K 0.066 -247 S 0.064 -248 Y 0.068 -249 L 0.077 -250 A 0.086 -251 K 0.092 -252 A 0.096 -253 V 0.097 -254 A 0.092 -255 T 0.085 -256 E 0.080 -257 A 0.082 -258 N 0.092 -259 N 0.101 -260 S 0.099 -261 T 0.083 -262 F 0.062 -263 F 0.049 -264 S 0.045 -265 V 0.044 -266 S 0.045 -267 S 0.049 -268 S 0.058 -269 D 0.068 -270 L 0.075 -271 M 0.075 -272 S 0.075 -273 K 0.079 -274 W 0.085 -275 L 0.088 -276 G 0.086 -277 E 0.081 -278 S 0.074 -279 E 0.064 -280 K 0.051 -281 L 0.041 -282 V 0.034 -283 K 0.030 -284 N 0.027 -285 L 0.026 -286 F 0.027 -287 E 0.028 -288 L 0.032 -289 A 0.037 -290 R 0.039 -291 Q 0.036 -292 H 0.032 -293 K 0.032 -294 P 0.039 -295 S 0.050 -296 I 0.055 -297 I 0.051 -298 F 0.043 -299 I 0.039 -300 D 0.038 -301 E 0.041 -302 V 0.044 -303 D 0.052 -304 S 0.068 -305 L 0.095 -306 C 0.128 -307 G 0.165 -308 S 0.197 -309 R 0.214 -310 N 0.216 -311 E 0.209 -312 N 0.198 -313 E 0.180 -314 S 0.153 -315 E 0.123 -316 A 0.100 -317 A 0.087 -318 R 0.082 -319 R 0.082 -320 I 0.083 -321 K 0.079 -322 T 0.069 -323 E 0.058 -324 F 0.050 -325 L 0.047 -326 V 0.051 -327 Q 0.065 -328 M 0.092 -329 Q 0.135 -330 G 0.185 -331 V 0.227 -332 G 0.251 -333 N 0.255 -334 N 0.236 -335 N 0.198 -336 D 0.152 -337 G 0.109 -338 T 0.078 -339 L 0.060 -340 V 0.052 -341 L 0.049 -342 G 0.049 -343 A 0.054 -344 T 0.064 -345 N 0.080 -346 I 0.098 -347 P 0.108 -348 W 0.109 -349 V 0.110 -350 L 0.111 -351 D 0.106 -352 S 0.092 -353 A 0.078 -354 I 0.070 -355 R 0.070 -356 R 0.073 -357 R 0.076 -358 F 0.075 -359 E 0.066 -360 K 0.053 -361 R 0.044 -362 I 0.043 -363 Y 0.050 -364 I 0.060 -365 P 0.068 -366 L 0.073 -367 P 0.073 -368 E 0.068 -369 E 0.060 -370 A 0.054 -371 A 0.048 -372 R 0.045 -373 A 0.046 -374 Q 0.048 -375 M 0.047 -376 F 0.045 -377 R 0.046 -378 L 0.052 -379 H 0.062 -380 L 0.076 -381 G 0.091 -382 S 0.099 -383 T 0.098 -384 P 0.088 -385 H 0.077 -386 N 0.070 -387 L 0.065 -388 T 0.059 -389 D 0.053 -390 A 0.048 -391 N 0.045 -392 I 0.043 -393 H 0.045 -394 E 0.055 -395 L 0.072 -396 A 0.086 -397 R 0.091 -398 K 0.090 -399 T 0.090 -400 E 0.091 -401 G 0.093 -402 Y 0.096 -403 S 0.097 -404 G 0.098 -405 A 0.099 -406 D 0.100 -407 I 0.097 -408 S 0.094 -409 I 0.099 -410 I 0.110 -411 V 0.117 -412 R 0.115 -413 D 0.114 -414 S 0.120 -415 L 0.128 -416 M 0.132 -417 Q 0.136 -418 P 0.145 -419 V 0.156 -420 R 0.166 -421 K 0.171 -422 V 0.167 -423 Q 0.160 -424 S 0.154 -425 A 0.152 -426 T 0.146 -427 H 0.135 -428 F 0.126 -429 K 0.126 -430 K 0.138 -431 V 0.164 -432 C 0.195 -433 G 0.218 -434 P 0.226 -435 S 0.225 -436 R 0.226 -437 T 0.236 -438 N 0.253 -439 P 0.267 -440 S 0.277 -441 V 0.280 -442 M 0.271 -443 I 0.251 -444 D 0.226 -445 D 0.201 -446 L 0.180 -447 L 0.167 -448 T 0.166 -449 P 0.175 -450 C 0.186 -451 S 0.193 -452 P 0.198 -453 G 0.203 -454 D 0.209 -455 P 0.210 -456 G 0.209 -457 A 0.212 -458 I 0.222 -459 E 0.228 -460 M 0.224 -461 T 0.211 -462 W 0.192 -463 M 0.179 -464 D 0.186 -465 V 0.211 -466 P 0.234 -467 G 0.235 -468 D 0.213 -469 K 0.188 -470 L 0.182 -471 L 0.197 -472 E 0.217 -473 P 0.226 -474 V 0.216 -475 V 0.186 -476 C 0.147 -477 M 0.114 -478 S 0.097 -479 D 0.091 -480 M 0.087 -481 L 0.087 -482 R 0.095 -483 S 0.106 -484 L 0.115 -485 A 0.124 -486 T 0.136 -487 T 0.146 -488 R 0.146 -489 P 0.144 -490 T 0.146 -491 V 0.144 -492 N 0.129 -493 A 0.109 -494 D 0.093 -495 D 0.088 -496 L 0.089 -497 L 0.089 -498 K 0.085 -499 V 0.084 -500 K 0.088 -501 K 0.091 -502 F 0.089 -503 S 0.088 -504 E 0.095 -505 D 0.109 -506 F 0.135 -507 G 0.184 -508 Q 0.263 -509 E 0.361 -510 S 0.432 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031970.18_ENSMUST00000176155.3_GN:Dbndd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031970.18_ENSMUST00000176155.3_GN:Dbndd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 57d1446836df75b0f88d32be5ad057e6a0a409a8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031970.18_ENSMUST00000176155.3_GN:Dbndd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,161 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000031970.18|ENSMUST00000176155.3|GN:Dbndd1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.627 -2 E 0.641 -3 S 0.669 -4 P 0.706 -5 E 0.742 -6 G 0.765 -7 A 0.779 -8 G 0.793 -9 P 0.813 -10 G 0.832 -11 E 0.843 -12 I 0.844 -13 V 0.839 -14 K 0.830 -15 D 0.821 -16 V 0.814 -17 K 0.810 -18 V 0.811 -19 P 0.818 -20 Q 0.833 -21 A 0.848 -22 A 0.858 -23 L 0.863 -24 N 0.863 -25 V 0.862 -26 S 0.857 -27 A 0.849 -28 H 0.841 -29 E 0.836 -30 T 0.832 -31 G 0.829 -32 D 0.827 -33 M 0.824 -34 C 0.818 -35 R 0.813 -36 T 0.816 -37 P 0.826 -38 V 0.837 -39 A 0.844 -40 E 0.844 -41 E 0.841 -42 E 0.835 -43 E 0.831 -44 E 0.832 -45 V 0.837 -46 G 0.842 -47 I 0.842 -48 P 0.839 -49 I 0.838 -50 P 0.841 -51 A 0.850 -52 P 0.863 -53 G 0.874 -54 F 0.879 -55 L 0.875 -56 Q 0.864 -57 V 0.851 -58 T 0.835 -59 E 0.820 -60 R 0.807 -61 R 0.804 -62 Q 0.810 -63 P 0.825 -64 L 0.840 -65 S 0.851 -66 S 0.857 -67 V 0.857 -68 S 0.852 -69 S 0.846 -70 L 0.836 -71 E 0.817 -72 V 0.793 -73 H 0.770 -74 F 0.757 -75 D 0.746 -76 L 0.721 -77 L 0.672 -78 D 0.613 -79 L 0.573 -80 T 0.566 -81 E 0.588 -82 L 0.617 -83 T 0.620 -84 D 0.590 -85 M 0.549 -86 S 0.516 -87 D 0.491 -88 Q 0.485 -89 E 0.502 -90 L 0.506 -91 A 0.489 -92 E 0.499 -93 V 0.563 -94 F 0.645 -95 A 0.706 -96 D 0.742 -97 S 0.760 -98 D 0.767 -99 D 0.770 -100 E 0.777 -101 N 0.786 -102 L 0.789 -103 A 0.780 -104 T 0.764 -105 E 0.751 -106 S 0.749 -107 P 0.762 -108 A 0.779 -109 G 0.787 -110 L 0.780 -111 H 0.769 -112 P 0.770 -113 L 0.780 -114 S 0.785 -115 R 0.779 -116 A 0.766 -117 S 0.757 -118 C 0.755 -119 L 0.752 -120 R 0.742 -121 S 0.726 -122 P 0.711 -123 S 0.701 -124 W 0.700 -125 T 0.703 -126 K 0.699 -127 T 0.688 -128 R 0.689 -129 A 0.707 -130 E 0.731 -131 Q 0.747 -132 N 0.751 -133 R 0.746 -134 E 0.731 -135 K 0.708 -136 Q 0.691 -137 P 0.696 -138 P 0.717 -139 S 0.732 -140 D 0.733 -141 P 0.733 -142 E 0.743 -143 R 0.767 -144 Q 0.796 -145 G 0.819 -146 T 0.827 -147 I 0.821 -148 V 0.811 -149 D 0.804 -150 T 0.803 -151 F 0.803 -152 L 0.800 -153 T 0.790 -154 V 0.772 -155 E 0.743 -156 E 0.713 -157 P 0.688 -158 K 0.658 -159 E 0.610 -160 D 0.567 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031970.18_ENSMUST00000176155.3_GN:Dbndd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:34.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031970.18_ENSMUST00000176155.3_GN:Dbndd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:34.caid deleted file mode 100644 index 722afe92de6fb19d80286fe5d2f5213e7e372362..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000031970.18_ENSMUST00000176155.3_GN:Dbndd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:34.caid +++ /dev/null @@ -1,195 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000031970.18|ENSMUST00000176155.3|GN:Dbndd1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:34 -1 M 0.606 -2 R 0.653 -3 C 0.711 -4 A 0.747 -5 R 0.760 -6 S 0.769 -7 P 0.786 -8 D 0.812 -9 S 0.837 -10 V 0.856 -11 V 0.867 -12 T 0.873 -13 R 0.878 -14 A 0.879 -15 V 0.873 -16 G 0.863 -17 A 0.855 -18 P 0.852 -19 G 0.847 -20 L 0.830 -21 S 0.807 -22 P 0.793 -23 P 0.796 -24 L 0.807 -25 P 0.813 -26 T 0.812 -27 P 0.814 -28 P 0.822 -29 A 0.832 -30 D 0.841 -31 P 0.853 -32 I 0.866 -33 G 0.874 -34 R 0.871 -35 M 0.859 -36 E 0.844 -37 S 0.835 -38 P 0.836 -39 E 0.844 -40 G 0.848 -41 A 0.846 -42 G 0.846 -43 P 0.854 -44 G 0.867 -45 E 0.875 -46 I 0.876 -47 V 0.873 -48 K 0.868 -49 D 0.862 -50 V 0.856 -51 K 0.850 -52 V 0.847 -53 P 0.851 -54 Q 0.864 -55 A 0.878 -56 A 0.888 -57 L 0.892 -58 N 0.892 -59 V 0.890 -60 S 0.885 -61 A 0.876 -62 H 0.867 -63 E 0.861 -64 T 0.856 -65 G 0.851 -66 D 0.846 -67 M 0.839 -68 C 0.829 -69 R 0.821 -70 T 0.823 -71 P 0.835 -72 V 0.849 -73 A 0.857 -74 E 0.858 -75 E 0.854 -76 E 0.848 -77 E 0.844 -78 E 0.845 -79 V 0.849 -80 G 0.851 -81 I 0.847 -82 P 0.842 -83 I 0.840 -84 P 0.843 -85 A 0.849 -86 P 0.859 -87 G 0.870 -88 F 0.874 -89 L 0.868 -90 Q 0.855 -91 V 0.841 -92 T 0.825 -93 E 0.810 -94 R 0.799 -95 R 0.796 -96 Q 0.804 -97 P 0.818 -98 L 0.832 -99 S 0.842 -100 S 0.847 -101 V 0.847 -102 S 0.842 -103 S 0.835 -104 L 0.823 -105 E 0.799 -106 V 0.768 -107 H 0.742 -108 F 0.732 -109 D 0.727 -110 L 0.708 -111 L 0.662 -112 D 0.604 -113 L 0.562 -114 T 0.552 -115 E 0.574 -116 L 0.604 -117 T 0.610 -118 D 0.579 -119 M 0.531 -120 S 0.488 -121 D 0.457 -122 Q 0.451 -123 E 0.468 -124 L 0.473 -125 A 0.459 -126 E 0.477 -127 V 0.549 -128 F 0.637 -129 A 0.699 -130 D 0.735 -131 S 0.753 -132 D 0.760 -133 D 0.765 -134 E 0.775 -135 N 0.789 -136 L 0.795 -137 A 0.788 -138 T 0.773 -139 E 0.760 -140 S 0.757 -141 P 0.769 -142 A 0.787 -143 G 0.795 -144 L 0.789 -145 H 0.780 -146 P 0.783 -147 L 0.796 -148 S 0.802 -149 R 0.798 -150 A 0.787 -151 S 0.778 -152 C 0.776 -153 L 0.772 -154 R 0.761 -155 S 0.745 -156 P 0.732 -157 S 0.725 -158 W 0.727 -159 T 0.731 -160 K 0.725 -161 T 0.710 -162 R 0.703 -163 A 0.714 -164 E 0.734 -165 Q 0.751 -166 N 0.758 -167 R 0.754 -168 E 0.739 -169 K 0.716 -170 Q 0.699 -171 P 0.705 -172 P 0.727 -173 S 0.742 -174 D 0.742 -175 P 0.741 -176 E 0.751 -177 R 0.775 -178 Q 0.804 -179 G 0.826 -180 T 0.834 -181 I 0.829 -182 V 0.819 -183 D 0.812 -184 T 0.810 -185 F 0.808 -186 L 0.804 -187 T 0.794 -188 V 0.776 -189 E 0.749 -190 E 0.721 -191 P 0.698 -192 K 0.672 -193 E 0.631 -194 D 0.592 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032116.19_ENSMUST00000120381.9_GN:Stt3a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032116.19_ENSMUST00000120381.9_GN:Stt3a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 77802cefef1afefcfdbf617a2ef0dac6738bf917..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032116.19_ENSMUST00000120381.9_GN:Stt3a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,706 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000032116.19|ENSMUST00000120381.9|GN:Stt3a|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.336 -2 T 0.335 -3 K 0.332 -4 L 0.328 -5 G 0.326 -6 F 0.324 -7 L 0.315 -8 R 0.291 -9 L 0.254 -10 S 0.215 -11 Y 0.182 -12 E 0.159 -13 K 0.146 -14 Q 0.135 -15 D 0.119 -16 T 0.100 -17 L 0.089 -18 L 0.086 -19 K 0.084 -20 L 0.083 -21 L 0.084 -22 I 0.088 -23 L 0.091 -24 S 0.090 -25 M 0.088 -26 A 0.088 -27 A 0.093 -28 V 0.099 -29 L 0.103 -30 S 0.104 -31 F 0.103 -32 S 0.105 -33 T 0.106 -34 R 0.096 -35 L 0.079 -36 F 0.067 -37 A 0.066 -38 V 0.074 -39 L 0.091 -40 R 0.114 -41 F 0.132 -42 E 0.140 -43 S 0.141 -44 V 0.139 -45 I 0.132 -46 H 0.125 -47 E 0.124 -48 F 0.129 -49 D 0.125 -50 P 0.106 -51 Y 0.083 -52 F 0.069 -53 N 0.063 -54 Y 0.059 -55 R 0.055 -56 T 0.055 -57 T 0.055 -58 R 0.055 -59 F 0.054 -60 L 0.058 -61 A 0.065 -62 E 0.076 -63 E 0.089 -64 G 0.097 -65 F 0.093 -66 Y 0.087 -67 K 0.089 -68 F 0.099 -69 H 0.109 -70 N 0.118 -71 W 0.129 -72 F 0.137 -73 D 0.134 -74 D 0.120 -75 R 0.099 -76 A 0.077 -77 W 0.061 -78 Y 0.058 -79 P 0.073 -80 L 0.102 -81 G 0.131 -82 R 0.148 -83 I 0.157 -84 I 0.168 -85 G 0.183 -86 G 0.194 -87 T 0.193 -88 I 0.184 -89 Y 0.173 -90 P 0.163 -91 G 0.156 -92 L 0.156 -93 M 0.153 -94 I 0.137 -95 T 0.118 -96 S 0.109 -97 A 0.109 -98 A 0.109 -99 I 0.105 -100 Y 0.101 -101 H 0.097 -102 V 0.094 -103 L 0.095 -104 H 0.101 -105 F 0.112 -106 F 0.125 -107 H 0.139 -108 I 0.145 -109 T 0.135 -110 I 0.114 -111 D 0.094 -112 I 0.085 -113 R 0.085 -114 N 0.090 -115 V 0.092 -116 C 0.092 -117 V 0.097 -118 F 0.109 -119 L 0.124 -120 A 0.136 -121 P 0.140 -122 L 0.138 -123 F 0.135 -124 S 0.134 -125 S 0.129 -126 F 0.118 -127 T 0.105 -128 T 0.090 -129 I 0.075 -130 V 0.066 -131 T 0.062 -132 Y 0.063 -133 H 0.067 -134 L 0.070 -135 T 0.070 -136 K 0.069 -137 E 0.070 -138 L 0.068 -139 K 0.062 -140 D 0.057 -141 A 0.060 -142 G 0.067 -143 A 0.070 -144 G 0.068 -145 L 0.070 -146 L 0.084 -147 A 0.105 -148 A 0.120 -149 A 0.125 -150 M 0.129 -151 I 0.131 -152 A 0.120 -153 V 0.100 -154 V 0.089 -155 P 0.092 -156 G 0.099 -157 Y 0.100 -158 I 0.097 -159 S 0.094 -160 R 0.097 -161 S 0.105 -162 V 0.116 -163 A 0.129 -164 G 0.147 -165 S 0.166 -166 Y 0.179 -167 D 0.190 -168 N 0.205 -169 E 0.209 -170 G 0.190 -171 I 0.163 -172 A 0.148 -173 I 0.141 -174 F 0.128 -175 C 0.107 -176 M 0.093 -177 L 0.086 -178 L 0.078 -179 T 0.066 -180 Y 0.056 -181 Y 0.049 -182 M 0.044 -183 W 0.043 -184 I 0.048 -185 K 0.054 -186 A 0.058 -187 V 0.064 -188 K 0.072 -189 T 0.082 -190 G 0.088 -191 S 0.083 -192 I 0.069 -193 Y 0.058 -194 W 0.055 -195 A 0.057 -196 A 0.061 -197 K 0.070 -198 C 0.084 -199 A 0.094 -200 L 0.097 -201 A 0.100 -202 Y 0.101 -203 F 0.096 -204 Y 0.089 -205 M 0.089 -206 V 0.095 -207 S 0.101 -208 S 0.101 -209 W 0.100 -210 G 0.103 -211 G 0.104 -212 Y 0.093 -213 V 0.076 -214 F 0.063 -215 L 0.060 -216 I 0.063 -217 N 0.063 -218 L 0.058 -219 I 0.051 -220 P 0.045 -221 L 0.040 -222 H 0.036 -223 V 0.033 -224 L 0.032 -225 V 0.035 -226 L 0.039 -227 M 0.043 -228 L 0.049 -229 T 0.058 -230 G 0.068 -231 R 0.075 -232 F 0.074 -233 S 0.064 -234 H 0.054 -235 R 0.048 -236 I 0.042 -237 Y 0.038 -238 V 0.036 -239 A 0.036 -240 Y 0.035 -241 C 0.034 -242 T 0.034 -243 V 0.034 -244 Y 0.037 -245 C 0.041 -246 L 0.047 -247 G 0.053 -248 T 0.057 -249 I 0.062 -250 L 0.067 -251 S 0.068 -252 M 0.065 -253 Q 0.063 -254 I 0.066 -255 S 0.067 -256 F 0.067 -257 V 0.066 -258 G 0.067 -259 F 0.067 -260 Q 0.067 -261 P 0.068 -262 V 0.070 -263 L 0.073 -264 S 0.076 -265 S 0.075 -266 E 0.070 -267 H 0.063 -268 M 0.059 -269 A 0.061 -270 A 0.067 -271 F 0.072 -272 G 0.074 -273 V 0.072 -274 F 0.070 -275 G 0.069 -276 L 0.065 -277 C 0.061 -278 Q 0.060 -279 I 0.059 -280 H 0.054 -281 A 0.049 -282 F 0.047 -283 V 0.048 -284 D 0.051 -285 Y 0.055 -286 L 0.062 -287 R 0.070 -288 S 0.082 -289 K 0.095 -290 L 0.103 -291 N 0.102 -292 P 0.096 -293 Q 0.089 -294 Q 0.078 -295 F 0.070 -296 E 0.069 -297 V 0.070 -298 L 0.069 -299 F 0.071 -300 R 0.073 -301 S 0.071 -302 V 0.066 -303 I 0.065 -304 S 0.071 -305 L 0.081 -306 V 0.093 -307 G 0.100 -308 F 0.102 -309 V 0.100 -310 L 0.098 -311 L 0.099 -312 T 0.107 -313 V 0.117 -314 G 0.124 -315 A 0.125 -316 L 0.123 -317 L 0.126 -318 M 0.134 -319 L 0.147 -320 T 0.164 -321 G 0.181 -322 K 0.190 -323 I 0.192 -324 S 0.186 -325 P 0.173 -326 W 0.158 -327 T 0.146 -328 G 0.138 -329 R 0.134 -330 F 0.135 -331 Y 0.138 -332 S 0.140 -333 L 0.146 -334 L 0.161 -335 D 0.179 -336 P 0.193 -337 S 0.196 -338 Y 0.187 -339 A 0.175 -340 K 0.173 -341 N 0.180 -342 N 0.188 -343 I 0.191 -344 P 0.194 -345 I 0.209 -346 I 0.238 -347 A 0.269 -348 S 0.285 -349 V 0.287 -350 S 0.286 -351 E 0.288 -352 H 0.286 -353 Q 0.273 -354 P 0.243 -355 T 0.198 -356 T 0.147 -357 W 0.105 -358 S 0.077 -359 S 0.062 -360 Y 0.053 -361 Y 0.049 -362 F 0.051 -363 D 0.055 -364 L 0.055 -365 Q 0.051 -366 L 0.046 -367 L 0.045 -368 V 0.045 -369 F 0.044 -370 M 0.044 -371 F 0.045 -372 P 0.048 -373 V 0.048 -374 G 0.045 -375 L 0.040 -376 Y 0.036 -377 Y 0.037 -378 C 0.043 -379 F 0.054 -380 S 0.068 -381 N 0.079 -382 L 0.082 -383 S 0.074 -384 D 0.061 -385 A 0.051 -386 R 0.048 -387 I 0.049 -388 F 0.052 -389 I 0.055 -390 I 0.060 -391 M 0.063 -392 Y 0.066 -393 G 0.068 -394 V 0.068 -395 T 0.068 -396 S 0.073 -397 M 0.079 -398 Y 0.082 -399 F 0.083 -400 S 0.089 -401 A 0.099 -402 V 0.117 -403 M 0.147 -404 V 0.182 -405 R 0.203 -406 L 0.196 -407 M 0.167 -408 L 0.139 -409 V 0.122 -410 L 0.115 -411 A 0.110 -412 P 0.102 -413 V 0.093 -414 M 0.083 -415 C 0.070 -416 I 0.058 -417 L 0.049 -418 S 0.044 -419 G 0.042 -420 I 0.045 -421 G 0.048 -422 V 0.050 -423 S 0.050 -424 Q 0.052 -425 V 0.056 -426 L 0.057 -427 S 0.057 -428 T 0.061 -429 Y 0.073 -430 M 0.092 -431 K 0.122 -432 N 0.163 -433 L 0.214 -434 D 0.266 -435 I 0.312 -436 S 0.353 -437 R 0.391 -438 P 0.423 -439 D 0.452 -440 K 0.475 -441 K 0.489 -442 S 0.499 -443 K 0.514 -444 K 0.533 -445 Q 0.547 -446 Q 0.546 -447 D 0.524 -448 S 0.480 -449 T 0.423 -450 Y 0.366 -451 P 0.310 -452 I 0.256 -453 K 0.207 -454 N 0.171 -455 E 0.149 -456 V 0.137 -457 A 0.131 -458 S 0.125 -459 G 0.120 -460 M 0.117 -461 I 0.119 -462 L 0.119 -463 V 0.115 -464 M 0.112 -465 A 0.110 -466 F 0.108 -467 F 0.102 -468 L 0.094 -469 I 0.087 -470 T 0.085 -471 Y 0.090 -472 T 0.097 -473 F 0.099 -474 H 0.099 -475 S 0.102 -476 T 0.107 -477 W 0.111 -478 V 0.115 -479 T 0.123 -480 S 0.140 -481 E 0.167 -482 A 0.197 -483 Y 0.222 -484 S 0.241 -485 S 0.260 -486 P 0.278 -487 S 0.294 -488 I 0.314 -489 V 0.339 -490 L 0.363 -491 S 0.385 -492 A 0.408 -493 R 0.429 -494 G 0.436 -495 G 0.421 -496 D 0.390 -497 G 0.360 -498 S 0.338 -499 R 0.327 -500 I 0.320 -501 I 0.305 -502 F 0.272 -503 D 0.223 -504 D 0.171 -505 F 0.129 -506 R 0.096 -507 E 0.074 -508 A 0.067 -509 Y 0.071 -510 Y 0.074 -511 W 0.070 -512 L 0.067 -513 R 0.070 -514 H 0.082 -515 N 0.098 -516 T 0.110 -517 P 0.114 -518 E 0.111 -519 D 0.105 -520 A 0.098 -521 K 0.093 -522 V 0.091 -523 M 0.096 -524 S 0.108 -525 W 0.124 -526 W 0.129 -527 D 0.117 -528 Y 0.096 -529 G 0.077 -530 Y 0.067 -531 Q 0.064 -532 I 0.063 -533 T 0.064 -534 A 0.068 -535 M 0.078 -536 A 0.089 -537 N 0.104 -538 R 0.117 -539 T 0.126 -540 I 0.129 -541 L 0.136 -542 V 0.150 -543 D 0.167 -544 N 0.176 -545 N 0.175 -546 T 0.168 -547 W 0.159 -548 N 0.149 -549 N 0.138 -550 T 0.128 -551 H 0.121 -552 I 0.116 -553 S 0.115 -554 R 0.119 -555 V 0.129 -556 G 0.137 -557 Q 0.135 -558 A 0.124 -559 M 0.116 -560 A 0.111 -561 S 0.107 -562 T 0.099 -563 E 0.086 -564 E 0.073 -565 K 0.063 -566 A 0.063 -567 Y 0.071 -568 E 0.077 -569 I 0.071 -570 M 0.059 -571 R 0.054 -572 E 0.060 -573 L 0.072 -574 D 0.077 -575 V 0.075 -576 S 0.070 -577 Y 0.068 -578 V 0.070 -579 L 0.075 -580 V 0.081 -581 I 0.090 -582 F 0.100 -583 G 0.112 -584 G 0.124 -585 L 0.133 -586 T 0.139 -587 G 0.146 -588 Y 0.158 -589 S 0.164 -590 S 0.153 -591 D 0.128 -592 D 0.101 -593 I 0.081 -594 N 0.072 -595 K 0.071 -596 F 0.072 -597 L 0.069 -598 W 0.065 -599 M 0.064 -600 V 0.068 -601 R 0.076 -602 I 0.088 -603 G 0.100 -604 G 0.108 -605 S 0.115 -606 T 0.128 -607 E 0.146 -608 T 0.163 -609 G 0.177 -610 R 0.184 -611 H 0.184 -612 I 0.175 -613 K 0.161 -614 E 0.150 -615 N 0.147 -616 D 0.145 -617 Y 0.139 -618 Y 0.131 -619 T 0.127 -620 P 0.133 -621 T 0.147 -622 G 0.165 -623 E 0.177 -624 F 0.178 -625 R 0.170 -626 V 0.164 -627 D 0.172 -628 R 0.192 -629 E 0.211 -630 G 0.219 -631 S 0.217 -632 P 0.216 -633 V 0.216 -634 L 0.212 -635 L 0.201 -636 N 0.183 -637 C 0.165 -638 L 0.153 -639 M 0.145 -640 Y 0.142 -641 K 0.145 -642 M 0.149 -643 C 0.149 -644 Y 0.148 -645 Y 0.156 -646 R 0.178 -647 F 0.206 -648 G 0.230 -649 Q 0.247 -650 V 0.261 -651 Y 0.271 -652 T 0.275 -653 E 0.272 -654 A 0.264 -655 K 0.258 -656 R 0.265 -657 P 0.291 -658 P 0.319 -659 G 0.318 -660 F 0.285 -661 D 0.239 -662 R 0.198 -663 V 0.174 -664 R 0.170 -665 N 0.184 -666 A 0.204 -667 E 0.217 -668 I 0.217 -669 G 0.209 -670 N 0.203 -671 K 0.198 -672 D 0.192 -673 F 0.183 -674 E 0.170 -675 L 0.153 -676 D 0.134 -677 V 0.115 -678 L 0.101 -679 E 0.092 -680 E 0.086 -681 A 0.081 -682 Y 0.077 -683 T 0.078 -684 T 0.085 -685 E 0.091 -686 H 0.091 -687 W 0.088 -688 L 0.083 -689 V 0.079 -690 R 0.078 -691 I 0.078 -692 Y 0.079 -693 K 0.083 -694 V 0.100 -695 K 0.133 -696 D 0.178 -697 L 0.229 -698 D 0.281 -699 N 0.333 -700 R 0.385 -701 G 0.426 -702 L 0.441 -703 S 0.430 -704 R 0.410 -705 T 0.398 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032116.19_ENSMUST00000120381.9_GN:Stt3a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:48.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032116.19_ENSMUST00000120381.9_GN:Stt3a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:48.caid deleted file mode 100644 index b6754f6aa895ba1edb46b464fae0360853b6c01b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032116.19_ENSMUST00000120381.9_GN:Stt3a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:48.caid +++ /dev/null @@ -1,754 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000032116.19|ENSMUST00000120381.9|GN:Stt3a|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:48 -1 M 0.338 -2 R 0.346 -3 S 0.369 -4 G 0.404 -5 Q 0.439 -6 G 0.471 -7 G 0.500 -8 G 0.511 -9 P 0.487 -10 W 0.437 -11 L 0.385 -12 L 0.355 -13 S 0.354 -14 G 0.369 -15 L 0.370 -16 S 0.360 -17 A 0.374 -18 P 0.418 -19 L 0.465 -20 N 0.494 -21 G 0.502 -22 W 0.492 -23 Q 0.481 -24 G 0.476 -25 E 0.458 -26 Q 0.412 -27 S 0.351 -28 G 0.289 -29 F 0.234 -30 L 0.195 -31 R 0.172 -32 S 0.158 -33 I 0.147 -34 R 0.141 -35 E 0.139 -36 V 0.146 -37 F 0.166 -38 E 0.197 -39 Y 0.233 -40 H 0.272 -41 Q 0.317 -42 L 0.365 -43 P 0.408 -44 P 0.432 -45 I 0.429 -46 D 0.410 -47 V 0.394 -48 K 0.382 -49 M 0.367 -50 T 0.346 -51 K 0.323 -52 L 0.307 -53 G 0.297 -54 F 0.287 -55 L 0.271 -56 R 0.244 -57 L 0.209 -58 S 0.176 -59 Y 0.149 -60 E 0.129 -61 K 0.122 -62 Q 0.122 -63 D 0.119 -64 T 0.111 -65 L 0.106 -66 L 0.106 -67 K 0.106 -68 L 0.103 -69 L 0.101 -70 I 0.101 -71 L 0.102 -72 S 0.101 -73 M 0.098 -74 A 0.097 -75 A 0.100 -76 V 0.104 -77 L 0.106 -78 S 0.105 -79 F 0.104 -80 S 0.105 -81 T 0.106 -82 R 0.096 -83 L 0.078 -84 F 0.065 -85 A 0.063 -86 V 0.070 -87 L 0.086 -88 R 0.107 -89 F 0.125 -90 E 0.132 -91 S 0.131 -92 V 0.128 -93 I 0.121 -94 H 0.114 -95 E 0.114 -96 F 0.121 -97 D 0.118 -98 P 0.100 -99 Y 0.079 -100 F 0.066 -101 N 0.060 -102 Y 0.056 -103 R 0.052 -104 T 0.052 -105 T 0.053 -106 R 0.052 -107 F 0.051 -108 L 0.054 -109 A 0.060 -110 E 0.070 -111 E 0.082 -112 G 0.088 -113 F 0.084 -114 Y 0.079 -115 K 0.082 -116 F 0.093 -117 H 0.103 -118 N 0.112 -119 W 0.123 -120 F 0.131 -121 D 0.129 -122 D 0.115 -123 R 0.095 -124 A 0.074 -125 W 0.059 -126 Y 0.056 -127 P 0.072 -128 L 0.102 -129 G 0.131 -130 R 0.148 -131 I 0.157 -132 I 0.168 -133 G 0.183 -134 G 0.194 -135 T 0.194 -136 I 0.186 -137 Y 0.174 -138 P 0.162 -139 G 0.153 -140 L 0.153 -141 M 0.152 -142 I 0.136 -143 T 0.118 -144 S 0.110 -145 A 0.111 -146 A 0.108 -147 I 0.097 -148 Y 0.084 -149 H 0.075 -150 V 0.073 -151 L 0.075 -152 H 0.079 -153 F 0.087 -154 F 0.106 -155 H 0.130 -156 I 0.144 -157 T 0.136 -158 I 0.114 -159 D 0.094 -160 I 0.086 -161 R 0.087 -162 N 0.092 -163 V 0.093 -164 C 0.092 -165 V 0.095 -166 F 0.107 -167 L 0.121 -168 A 0.132 -169 P 0.135 -170 L 0.133 -171 F 0.130 -172 S 0.129 -173 S 0.124 -174 F 0.112 -175 T 0.098 -176 T 0.084 -177 I 0.070 -178 V 0.060 -179 T 0.057 -180 Y 0.058 -181 H 0.062 -182 L 0.065 -183 T 0.066 -184 K 0.065 -185 E 0.066 -186 L 0.065 -187 K 0.059 -188 D 0.054 -189 A 0.058 -190 G 0.065 -191 A 0.068 -192 G 0.066 -193 L 0.068 -194 L 0.083 -195 A 0.105 -196 A 0.120 -197 A 0.124 -198 M 0.128 -199 I 0.130 -200 A 0.118 -201 V 0.099 -202 V 0.089 -203 P 0.092 -204 G 0.099 -205 Y 0.100 -206 I 0.096 -207 S 0.091 -208 R 0.093 -209 S 0.100 -210 V 0.109 -211 A 0.123 -212 G 0.142 -213 S 0.162 -214 Y 0.177 -215 D 0.189 -216 N 0.204 -217 E 0.208 -218 G 0.190 -219 I 0.163 -220 A 0.149 -221 I 0.145 -222 F 0.132 -223 C 0.111 -224 M 0.097 -225 L 0.090 -226 L 0.081 -227 T 0.068 -228 Y 0.057 -229 Y 0.049 -230 M 0.044 -231 W 0.044 -232 I 0.048 -233 K 0.054 -234 A 0.059 -235 V 0.064 -236 K 0.074 -237 T 0.083 -238 G 0.088 -239 S 0.082 -240 I 0.068 -241 Y 0.056 -242 W 0.054 -243 A 0.056 -244 A 0.060 -245 K 0.069 -246 C 0.083 -247 A 0.093 -248 L 0.096 -249 A 0.098 -250 Y 0.099 -251 F 0.094 -252 Y 0.086 -253 M 0.086 -254 V 0.091 -255 S 0.096 -256 S 0.096 -257 W 0.095 -258 G 0.098 -259 G 0.099 -260 Y 0.090 -261 V 0.073 -262 F 0.061 -263 L 0.059 -264 I 0.062 -265 N 0.062 -266 L 0.058 -267 I 0.051 -268 P 0.045 -269 L 0.040 -270 H 0.036 -271 V 0.032 -272 L 0.032 -273 V 0.034 -274 L 0.037 -275 M 0.041 -276 L 0.046 -277 T 0.054 -278 G 0.065 -279 R 0.072 -280 F 0.072 -281 S 0.063 -282 H 0.053 -283 R 0.047 -284 I 0.042 -285 Y 0.038 -286 V 0.036 -287 A 0.035 -288 Y 0.035 -289 C 0.034 -290 T 0.034 -291 V 0.035 -292 Y 0.037 -293 C 0.042 -294 L 0.047 -295 G 0.052 -296 T 0.056 -297 I 0.061 -298 L 0.065 -299 S 0.066 -300 M 0.063 -301 Q 0.062 -302 I 0.064 -303 S 0.067 -304 F 0.067 -305 V 0.068 -306 G 0.070 -307 F 0.071 -308 Q 0.071 -309 P 0.070 -310 V 0.070 -311 L 0.072 -312 S 0.074 -313 S 0.073 -314 E 0.069 -315 H 0.062 -316 M 0.057 -317 A 0.059 -318 A 0.065 -319 F 0.071 -320 G 0.073 -321 V 0.071 -322 F 0.070 -323 G 0.068 -324 L 0.064 -325 C 0.060 -326 Q 0.059 -327 I 0.057 -328 H 0.053 -329 A 0.048 -330 F 0.047 -331 V 0.048 -332 D 0.051 -333 Y 0.055 -334 L 0.062 -335 R 0.071 -336 S 0.083 -337 K 0.098 -338 L 0.106 -339 N 0.105 -340 P 0.098 -341 Q 0.089 -342 Q 0.077 -343 F 0.069 -344 E 0.068 -345 V 0.069 -346 L 0.068 -347 F 0.070 -348 R 0.073 -349 S 0.071 -350 V 0.066 -351 I 0.065 -352 S 0.071 -353 L 0.082 -354 V 0.093 -355 G 0.101 -356 F 0.104 -357 V 0.102 -358 L 0.100 -359 L 0.102 -360 T 0.109 -361 V 0.117 -362 G 0.121 -363 A 0.118 -364 L 0.117 -365 L 0.122 -366 M 0.132 -367 L 0.144 -368 T 0.161 -369 G 0.178 -370 K 0.188 -371 I 0.190 -372 S 0.184 -373 P 0.170 -374 W 0.155 -375 T 0.144 -376 G 0.137 -377 R 0.135 -378 F 0.137 -379 Y 0.140 -380 S 0.142 -381 L 0.148 -382 L 0.163 -383 D 0.181 -384 P 0.194 -385 S 0.195 -386 Y 0.184 -387 A 0.172 -388 K 0.170 -389 N 0.178 -390 N 0.185 -391 I 0.188 -392 P 0.192 -393 I 0.207 -394 I 0.235 -395 A 0.265 -396 S 0.283 -397 V 0.286 -398 S 0.287 -399 E 0.290 -400 H 0.289 -401 Q 0.276 -402 P 0.245 -403 T 0.199 -404 T 0.148 -405 W 0.104 -406 S 0.076 -407 S 0.061 -408 Y 0.052 -409 Y 0.048 -410 F 0.050 -411 D 0.054 -412 L 0.054 -413 Q 0.050 -414 L 0.046 -415 L 0.045 -416 V 0.045 -417 F 0.044 -418 M 0.044 -419 F 0.046 -420 P 0.048 -421 V 0.048 -422 G 0.046 -423 L 0.040 -424 Y 0.036 -425 Y 0.037 -426 C 0.043 -427 F 0.053 -428 S 0.066 -429 N 0.076 -430 L 0.080 -431 S 0.073 -432 D 0.060 -433 A 0.051 -434 R 0.049 -435 I 0.050 -436 F 0.052 -437 I 0.056 -438 I 0.061 -439 M 0.065 -440 Y 0.069 -441 G 0.071 -442 V 0.070 -443 T 0.070 -444 S 0.075 -445 M 0.081 -446 Y 0.084 -447 F 0.086 -448 S 0.091 -449 A 0.101 -450 V 0.119 -451 M 0.150 -452 V 0.185 -453 R 0.207 -454 L 0.199 -455 M 0.171 -456 L 0.142 -457 V 0.125 -458 L 0.118 -459 A 0.113 -460 P 0.105 -461 V 0.095 -462 M 0.084 -463 C 0.071 -464 I 0.058 -465 L 0.049 -466 S 0.043 -467 G 0.042 -468 I 0.044 -469 G 0.048 -470 V 0.049 -471 S 0.048 -472 Q 0.051 -473 V 0.055 -474 L 0.056 -475 S 0.056 -476 T 0.061 -477 Y 0.073 -478 M 0.094 -479 K 0.124 -480 N 0.166 -481 L 0.219 -482 D 0.272 -483 I 0.318 -484 S 0.359 -485 R 0.396 -486 P 0.428 -487 D 0.458 -488 K 0.481 -489 K 0.497 -490 S 0.508 -491 K 0.522 -492 K 0.540 -493 Q 0.551 -494 Q 0.548 -495 D 0.525 -496 S 0.480 -497 T 0.422 -498 Y 0.364 -499 P 0.310 -500 I 0.256 -501 K 0.208 -502 N 0.172 -503 E 0.150 -504 V 0.138 -505 A 0.131 -506 S 0.124 -507 G 0.116 -508 M 0.109 -509 I 0.103 -510 L 0.099 -511 V 0.100 -512 M 0.105 -513 A 0.110 -514 F 0.109 -515 F 0.104 -516 L 0.096 -517 I 0.089 -518 T 0.085 -519 Y 0.084 -520 T 0.082 -521 F 0.080 -522 H 0.082 -523 S 0.084 -524 T 0.083 -525 W 0.084 -526 V 0.094 -527 T 0.113 -528 S 0.138 -529 E 0.167 -530 A 0.198 -531 Y 0.223 -532 S 0.243 -533 S 0.262 -534 P 0.282 -535 S 0.300 -536 I 0.320 -537 V 0.345 -538 L 0.369 -539 S 0.392 -540 A 0.416 -541 R 0.436 -542 G 0.442 -543 G 0.425 -544 D 0.392 -545 G 0.360 -546 S 0.339 -547 R 0.330 -548 I 0.324 -549 I 0.310 -550 F 0.277 -551 D 0.227 -552 D 0.175 -553 F 0.131 -554 R 0.097 -555 E 0.073 -556 A 0.059 -557 Y 0.056 -558 Y 0.055 -559 W 0.055 -560 L 0.059 -561 R 0.068 -562 H 0.082 -563 N 0.099 -564 T 0.111 -565 P 0.115 -566 E 0.112 -567 D 0.106 -568 A 0.099 -569 K 0.093 -570 V 0.092 -571 M 0.097 -572 S 0.110 -573 W 0.126 -574 W 0.130 -575 D 0.118 -576 Y 0.097 -577 G 0.078 -578 Y 0.067 -579 Q 0.064 -580 I 0.063 -581 T 0.064 -582 A 0.069 -583 M 0.078 -584 A 0.090 -585 N 0.104 -586 R 0.118 -587 T 0.126 -588 I 0.130 -589 L 0.137 -590 V 0.152 -591 D 0.169 -592 N 0.178 -593 N 0.178 -594 T 0.170 -595 W 0.161 -596 N 0.152 -597 N 0.141 -598 T 0.131 -599 H 0.124 -600 I 0.119 -601 S 0.117 -602 R 0.121 -603 V 0.132 -604 G 0.139 -605 Q 0.137 -606 A 0.126 -607 M 0.117 -608 A 0.113 -609 S 0.109 -610 T 0.100 -611 E 0.088 -612 E 0.073 -613 K 0.064 -614 A 0.064 -615 Y 0.072 -616 E 0.078 -617 I 0.072 -618 M 0.059 -619 R 0.054 -620 E 0.061 -621 L 0.072 -622 D 0.077 -623 V 0.075 -624 S 0.070 -625 Y 0.068 -626 V 0.070 -627 L 0.075 -628 V 0.081 -629 I 0.090 -630 F 0.100 -631 G 0.112 -632 G 0.124 -633 L 0.134 -634 T 0.139 -635 G 0.147 -636 Y 0.159 -637 S 0.165 -638 S 0.154 -639 D 0.129 -640 D 0.102 -641 I 0.082 -642 N 0.073 -643 K 0.072 -644 F 0.073 -645 L 0.070 -646 W 0.065 -647 M 0.065 -648 V 0.069 -649 R 0.077 -650 I 0.089 -651 G 0.101 -652 G 0.109 -653 S 0.116 -654 T 0.129 -655 E 0.147 -656 T 0.165 -657 G 0.179 -658 R 0.186 -659 H 0.185 -660 I 0.176 -661 K 0.162 -662 E 0.151 -663 N 0.148 -664 D 0.147 -665 Y 0.140 -666 Y 0.132 -667 T 0.128 -668 P 0.133 -669 T 0.148 -670 G 0.166 -671 E 0.178 -672 F 0.180 -673 R 0.172 -674 V 0.166 -675 D 0.174 -676 R 0.195 -677 E 0.215 -678 G 0.223 -679 S 0.221 -680 P 0.220 -681 V 0.220 -682 L 0.216 -683 L 0.204 -684 N 0.186 -685 C 0.168 -686 L 0.156 -687 M 0.147 -688 Y 0.144 -689 K 0.146 -690 M 0.149 -691 C 0.148 -692 Y 0.147 -693 Y 0.154 -694 R 0.176 -695 F 0.205 -696 G 0.229 -697 Q 0.247 -698 V 0.261 -699 Y 0.271 -700 T 0.275 -701 E 0.272 -702 A 0.264 -703 K 0.258 -704 R 0.265 -705 P 0.291 -706 P 0.320 -707 G 0.320 -708 F 0.287 -709 D 0.240 -710 R 0.200 -711 V 0.175 -712 R 0.171 -713 N 0.186 -714 A 0.206 -715 E 0.219 -716 I 0.218 -717 G 0.210 -718 N 0.203 -719 K 0.198 -720 D 0.190 -721 F 0.180 -722 E 0.167 -723 L 0.152 -724 D 0.133 -725 V 0.116 -726 L 0.102 -727 E 0.092 -728 E 0.085 -729 A 0.080 -730 Y 0.076 -731 T 0.077 -732 T 0.084 -733 E 0.090 -734 H 0.090 -735 W 0.086 -736 L 0.082 -737 V 0.078 -738 R 0.077 -739 I 0.077 -740 Y 0.078 -741 K 0.083 -742 V 0.099 -743 K 0.130 -744 D 0.173 -745 L 0.221 -746 D 0.270 -747 N 0.319 -748 R 0.366 -749 G 0.402 -750 L 0.413 -751 S 0.401 -752 R 0.383 -753 T 0.372 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032251.13_ENSMUST00000113245.9_GN:Irak1bp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032251.13_ENSMUST00000113245.9_GN:Irak1bp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index fe26e8de655f22db54588f017aab0a96ab29a7eb..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032251.13_ENSMUST00000113245.9_GN:Irak1bp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,260 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000032251.13|ENSMUST00000113245.9|GN:Irak1bp1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.405 -2 S 0.420 -3 L 0.449 -4 Q 0.487 -5 P 0.527 -6 A 0.563 -7 P 0.579 -8 A 0.558 -9 S 0.501 -10 R 0.450 -11 V 0.441 -12 F 0.463 -13 M 0.483 -14 E 0.491 -15 L 0.487 -16 V 0.472 -17 P 0.456 -18 W 0.466 -19 A 0.513 -20 D 0.574 -21 R 0.625 -22 G 0.659 -23 R 0.673 -24 E 0.670 -25 N 0.660 -26 H 0.658 -27 P 0.671 -28 I 0.692 -29 S 0.708 -30 A 0.711 -31 A 0.701 -32 E 0.684 -33 A 0.667 -34 Q 0.663 -35 P 0.675 -36 I 0.691 -37 G 0.697 -38 R 0.690 -39 R 0.687 -40 P 0.695 -41 H 0.710 -42 V 0.718 -43 A 0.706 -44 E 0.674 -45 A 0.632 -46 H 0.592 -47 P 0.550 -48 G 0.488 -49 A 0.399 -50 R 0.300 -51 E 0.227 -52 V 0.183 -53 H 0.147 -54 V 0.113 -55 S 0.092 -56 G 0.087 -57 A 0.093 -58 A 0.101 -59 E 0.102 -60 V 0.100 -61 S 0.105 -62 A 0.119 -63 S 0.127 -64 P 0.115 -65 D 0.085 -66 R 0.055 -67 A 0.036 -68 L 0.028 -69 V 0.027 -70 T 0.031 -71 V 0.035 -72 R 0.038 -73 V 0.040 -74 S 0.043 -75 S 0.049 -76 T 0.055 -77 K 0.060 -78 E 0.066 -79 V 0.070 -80 S 0.070 -81 A 0.067 -82 E 0.066 -83 A 0.072 -84 K 0.083 -85 K 0.090 -86 S 0.089 -87 V 0.085 -88 C 0.082 -89 R 0.077 -90 R 0.065 -91 L 0.050 -92 D 0.041 -93 Y 0.041 -94 I 0.049 -95 T 0.062 -96 Q 0.068 -97 S 0.061 -98 L 0.051 -99 Q 0.046 -100 Q 0.046 -101 Q 0.049 -102 G 0.053 -103 F 0.056 -104 Q 0.059 -105 A 0.057 -106 E 0.048 -107 N 0.037 -108 V 0.032 -109 T 0.037 -110 V 0.047 -111 T 0.059 -112 K 0.068 -113 N 0.071 -114 I 0.070 -115 R 0.069 -116 R 0.072 -117 V 0.077 -118 E 0.082 -119 N 0.083 -120 A 0.079 -121 Y 0.070 -122 H 0.057 -123 M 0.042 -124 E 0.030 -125 A 0.022 -126 E 0.019 -127 V 0.018 -128 C 0.017 -129 I 0.015 -130 T 0.015 -131 F 0.018 -132 T 0.023 -133 E 0.028 -134 F 0.033 -135 G 0.035 -136 K 0.035 -137 M 0.033 -138 Q 0.031 -139 N 0.030 -140 I 0.032 -141 C 0.036 -142 N 0.038 -143 F 0.040 -144 L 0.045 -145 V 0.049 -146 E 0.052 -147 K 0.054 -148 L 0.053 -149 D 0.050 -150 S 0.046 -151 S 0.043 -152 V 0.047 -153 V 0.059 -154 I 0.077 -155 S 0.091 -156 P 0.095 -157 P 0.091 -158 E 0.089 -159 F 0.093 -160 Y 0.101 -161 H 0.107 -162 T 0.112 -163 P 0.117 -164 G 0.117 -165 S 0.111 -166 V 0.101 -167 E 0.094 -168 N 0.096 -169 L 0.100 -170 R 0.100 -171 R 0.095 -172 Q 0.093 -173 A 0.095 -174 C 0.098 -175 L 0.099 -176 V 0.099 -177 A 0.097 -178 V 0.093 -179 E 0.089 -180 N 0.089 -181 A 0.094 -182 W 0.100 -183 R 0.102 -184 K 0.099 -185 A 0.093 -186 Q 0.088 -187 E 0.087 -188 V 0.087 -189 C 0.086 -190 D 0.088 -191 L 0.098 -192 V 0.113 -193 G 0.127 -194 Q 0.133 -195 T 0.131 -196 L 0.124 -197 G 0.120 -198 K 0.121 -199 P 0.119 -200 L 0.112 -201 L 0.107 -202 I 0.107 -203 K 0.114 -204 E 0.135 -205 E 0.180 -206 E 0.245 -207 T 0.316 -208 K 0.376 -209 D 0.421 -210 W 0.465 -211 E 0.517 -212 G 0.568 -213 Q 0.603 -214 T 0.624 -215 D 0.638 -216 D 0.650 -217 H 0.658 -218 Q 0.662 -219 L 0.661 -220 S 0.652 -221 R 0.640 -222 L 0.633 -223 P 0.634 -224 G 0.632 -225 T 0.607 -226 L 0.550 -227 T 0.482 -228 V 0.431 -229 Q 0.408 -230 Q 0.403 -231 K 0.402 -232 I 0.401 -233 K 0.397 -234 S 0.376 -235 A 0.328 -236 T 0.261 -237 I 0.196 -238 H 0.143 -239 A 0.103 -240 A 0.077 -241 S 0.063 -242 K 0.057 -243 V 0.053 -244 F 0.050 -245 I 0.048 -246 T 0.049 -247 F 0.059 -248 E 0.089 -249 V 0.150 -250 K 0.246 -251 G 0.361 -252 K 0.467 -253 E 0.541 -254 K 0.580 -255 K 0.591 -256 K 0.583 -257 K 0.553 -258 H 0.500 -259 L 0.453 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032251.13_ENSMUST00000113245.9_GN:Irak1bp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:53.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032251.13_ENSMUST00000113245.9_GN:Irak1bp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:53.caid deleted file mode 100644 index df879691da83b11866180d0a6acf16cadc0580d7..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032251.13_ENSMUST00000113245.9_GN:Irak1bp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:53.caid +++ /dev/null @@ -1,313 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000032251.13|ENSMUST00000113245.9|GN:Irak1bp1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:53 -1 M 0.458 -2 C 0.507 -3 A 0.569 -4 G 0.608 -5 L 0.616 -6 L 0.608 -7 P 0.605 -8 W 0.613 -9 G 0.617 -10 K 0.603 -11 T 0.588 -12 R 0.591 -13 S 0.586 -14 P 0.559 -15 R 0.545 -16 C 0.572 -17 S 0.602 -18 G 0.593 -19 A 0.575 -20 S 0.587 -21 I 0.600 -22 P 0.584 -23 A 0.565 -24 S 0.567 -25 S 0.571 -26 A 0.575 -27 R 0.601 -28 T 0.623 -29 S 0.610 -30 K 0.601 -31 R 0.638 -32 A 0.697 -33 A 0.732 -34 A 0.737 -35 K 0.726 -36 R 0.707 -37 H 0.682 -38 S 0.665 -39 P 0.667 -40 P 0.685 -41 S 0.701 -42 T 0.701 -43 W 0.691 -44 R 0.688 -45 C 0.699 -46 Y 0.721 -47 G 0.746 -48 N 0.765 -49 T 0.772 -50 A 0.769 -51 A 0.769 -52 P 0.777 -53 A 0.787 -54 M 0.789 -55 S 0.778 -56 L 0.759 -57 Q 0.745 -58 P 0.741 -59 A 0.751 -60 P 0.763 -61 A 0.769 -62 S 0.766 -63 R 0.757 -64 V 0.744 -65 F 0.734 -66 M 0.726 -67 E 0.713 -68 L 0.684 -69 V 0.640 -70 P 0.601 -71 W 0.601 -72 A 0.649 -73 D 0.709 -74 R 0.752 -75 G 0.772 -76 R 0.775 -77 E 0.764 -78 N 0.747 -79 H 0.740 -80 P 0.748 -81 I 0.767 -82 S 0.783 -83 A 0.788 -84 A 0.780 -85 E 0.764 -86 A 0.750 -87 Q 0.746 -88 P 0.755 -89 I 0.766 -90 G 0.764 -91 R 0.750 -92 R 0.740 -93 P 0.742 -94 H 0.753 -95 V 0.756 -96 A 0.740 -97 E 0.702 -98 A 0.654 -99 H 0.607 -100 P 0.557 -101 G 0.491 -102 A 0.398 -103 R 0.297 -104 E 0.221 -105 V 0.175 -106 H 0.139 -107 V 0.108 -108 S 0.088 -109 G 0.083 -110 A 0.088 -111 A 0.094 -112 E 0.094 -113 V 0.091 -114 S 0.096 -115 A 0.109 -116 S 0.117 -117 P 0.107 -118 D 0.080 -119 R 0.052 -120 A 0.034 -121 L 0.027 -122 V 0.026 -123 T 0.029 -124 V 0.033 -125 R 0.036 -126 V 0.039 -127 S 0.043 -128 S 0.048 -129 T 0.054 -130 K 0.061 -131 E 0.067 -132 V 0.072 -133 S 0.072 -134 A 0.067 -135 E 0.065 -136 A 0.065 -137 K 0.067 -138 K 0.070 -139 S 0.073 -140 V 0.072 -141 C 0.068 -142 R 0.060 -143 R 0.050 -144 L 0.041 -145 D 0.037 -146 Y 0.038 -147 I 0.047 -148 T 0.060 -149 Q 0.067 -150 S 0.060 -151 L 0.050 -152 Q 0.045 -153 Q 0.047 -154 Q 0.051 -155 G 0.057 -156 F 0.061 -157 Q 0.062 -158 A 0.058 -159 E 0.048 -160 N 0.037 -161 V 0.033 -162 T 0.037 -163 V 0.046 -164 T 0.057 -165 K 0.065 -166 N 0.068 -167 I 0.067 -168 R 0.067 -169 R 0.070 -170 V 0.075 -171 E 0.080 -172 N 0.081 -173 A 0.078 -174 Y 0.070 -175 H 0.057 -176 M 0.042 -177 E 0.029 -178 A 0.022 -179 E 0.018 -180 V 0.017 -181 C 0.016 -182 I 0.015 -183 T 0.014 -184 F 0.017 -185 T 0.022 -186 E 0.027 -187 F 0.032 -188 G 0.034 -189 K 0.033 -190 M 0.031 -191 Q 0.029 -192 N 0.028 -193 I 0.029 -194 C 0.031 -195 N 0.033 -196 F 0.035 -197 L 0.039 -198 V 0.043 -199 E 0.046 -200 K 0.047 -201 L 0.046 -202 D 0.043 -203 S 0.039 -204 S 0.037 -205 V 0.041 -206 V 0.054 -207 I 0.071 -208 S 0.086 -209 P 0.090 -210 P 0.086 -211 E 0.084 -212 F 0.086 -213 Y 0.092 -214 H 0.096 -215 T 0.100 -216 P 0.103 -217 G 0.105 -218 S 0.100 -219 V 0.092 -220 E 0.088 -221 N 0.091 -222 L 0.097 -223 R 0.098 -224 R 0.093 -225 Q 0.091 -226 A 0.094 -227 C 0.098 -228 L 0.099 -229 V 0.100 -230 A 0.098 -231 V 0.092 -232 E 0.088 -233 N 0.088 -234 A 0.093 -235 W 0.099 -236 R 0.101 -237 K 0.098 -238 A 0.091 -239 Q 0.085 -240 E 0.084 -241 V 0.084 -242 C 0.083 -243 D 0.085 -244 L 0.095 -245 V 0.110 -246 G 0.124 -247 Q 0.130 -248 T 0.126 -249 L 0.120 -250 G 0.117 -251 K 0.118 -252 P 0.116 -253 L 0.110 -254 L 0.104 -255 I 0.104 -256 K 0.111 -257 E 0.133 -258 E 0.179 -259 E 0.247 -260 T 0.320 -261 K 0.380 -262 D 0.423 -263 W 0.464 -264 E 0.515 -265 G 0.567 -266 Q 0.605 -267 T 0.626 -268 D 0.640 -269 D 0.650 -270 H 0.659 -271 Q 0.664 -272 L 0.663 -273 S 0.656 -274 R 0.647 -275 L 0.644 -276 P 0.648 -277 G 0.649 -278 T 0.627 -279 L 0.572 -280 T 0.505 -281 V 0.451 -282 Q 0.423 -283 Q 0.412 -284 K 0.407 -285 I 0.402 -286 K 0.394 -287 S 0.372 -288 A 0.324 -289 T 0.261 -290 I 0.198 -291 H 0.145 -292 A 0.105 -293 A 0.078 -294 S 0.064 -295 K 0.057 -296 V 0.054 -297 F 0.051 -298 I 0.050 -299 T 0.051 -300 F 0.063 -301 E 0.095 -302 V 0.159 -303 K 0.259 -304 G 0.379 -305 K 0.488 -306 E 0.565 -307 K 0.605 -308 K 0.616 -309 K 0.607 -310 K 0.575 -311 H 0.520 -312 L 0.472 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032316.9_ENSMUST00000065330.8_GN:Clk3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032316.9_ENSMUST00000065330.8_GN:Clk3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 2ece8d007b3e54cd2506d970864cf9bc407f8ed3..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032316.9_ENSMUST00000065330.8_GN:Clk3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,491 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000032316.9|ENSMUST00000065330.8|GN:Clk3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.375 -2 H 0.386 -3 H 0.405 -4 C 0.422 -5 K 0.424 -6 R 0.411 -7 Y 0.394 -8 R 0.383 -9 S 0.385 -10 P 0.394 -11 E 0.398 -12 P 0.384 -13 D 0.348 -14 P 0.300 -15 Y 0.265 -16 L 0.257 -17 S 0.262 -18 Y 0.261 -19 R 0.253 -20 W 0.250 -21 K 0.267 -22 R 0.298 -23 R 0.326 -24 R 0.353 -25 S 0.399 -26 Y 0.460 -27 S 0.517 -28 R 0.568 -29 E 0.617 -30 H 0.657 -31 E 0.677 -32 G 0.670 -33 R 0.645 -34 L 0.620 -35 R 0.612 -36 Y 0.624 -37 P 0.646 -38 S 0.660 -39 R 0.651 -40 R 0.619 -41 E 0.578 -42 P 0.558 -43 P 0.584 -44 P 0.648 -45 R 0.711 -46 R 0.749 -47 S 0.763 -48 R 0.764 -49 S 0.756 -50 R 0.743 -51 S 0.731 -52 H 0.716 -53 D 0.689 -54 R 0.647 -55 I 0.604 -56 P 0.576 -57 Y 0.568 -58 Q 0.573 -59 R 0.576 -60 R 0.573 -61 Y 0.579 -62 R 0.610 -63 E 0.661 -64 H 0.710 -65 R 0.742 -66 D 0.753 -67 S 0.751 -68 D 0.744 -69 T 0.735 -70 Y 0.727 -71 R 0.725 -72 C 0.729 -73 E 0.736 -74 E 0.738 -75 R 0.733 -76 S 0.729 -77 P 0.734 -78 S 0.748 -79 F 0.766 -80 G 0.780 -81 E 0.784 -82 D 0.776 -83 C 0.760 -84 Y 0.746 -85 G 0.736 -86 S 0.720 -87 S 0.679 -88 R 0.620 -89 S 0.584 -90 R 0.596 -91 H 0.614 -92 R 0.598 -93 R 0.585 -94 R 0.618 -95 S 0.675 -96 R 0.713 -97 E 0.721 -98 R 0.713 -99 A 0.703 -100 P 0.700 -101 Y 0.707 -102 R 0.714 -103 T 0.714 -104 R 0.704 -105 K 0.680 -106 H 0.629 -107 A 0.557 -108 H 0.509 -109 H 0.515 -110 C 0.539 -111 H 0.540 -112 K 0.541 -113 R 0.571 -114 R 0.594 -115 T 0.582 -116 R 0.573 -117 S 0.607 -118 C 0.660 -119 S 0.693 -120 S 0.701 -121 A 0.697 -122 S 0.687 -123 S 0.677 -124 R 0.672 -125 S 0.673 -126 Q 0.673 -127 Q 0.671 -128 S 0.669 -129 S 0.662 -130 K 0.649 -131 R 0.636 -132 S 0.627 -133 S 0.614 -134 R 0.591 -135 S 0.561 -136 V 0.524 -137 E 0.477 -138 D 0.419 -139 D 0.353 -140 K 0.289 -141 E 0.241 -142 G 0.212 -143 H 0.190 -144 L 0.166 -145 V 0.137 -146 C 0.109 -147 R 0.086 -148 I 0.073 -149 G 0.074 -150 D 0.084 -151 W 0.087 -152 L 0.077 -153 Q 0.064 -154 E 0.060 -155 R 0.063 -156 Y 0.067 -157 E 0.070 -158 I 0.070 -159 V 0.069 -160 G 0.068 -161 N 0.066 -162 L 0.064 -163 G 0.062 -164 E 0.061 -165 G 0.062 -166 T 0.062 -167 F 0.058 -168 G 0.053 -169 K 0.045 -170 V 0.038 -171 V 0.033 -172 E 0.033 -173 C 0.040 -174 L 0.051 -175 D 0.059 -176 H 0.061 -177 A 0.062 -178 R 0.065 -179 G 0.070 -180 K 0.072 -181 S 0.072 -182 Q 0.069 -183 V 0.063 -184 A 0.054 -185 L 0.048 -186 K 0.049 -187 I 0.057 -188 I 0.066 -189 R 0.072 -190 N 0.072 -191 V 0.069 -192 G 0.066 -193 K 0.064 -194 Y 0.062 -195 R 0.057 -196 E 0.052 -197 A 0.052 -198 A 0.053 -199 R 0.056 -200 L 0.061 -201 E 0.069 -202 I 0.076 -203 N 0.077 -204 V 0.067 -205 L 0.053 -206 K 0.043 -207 K 0.040 -208 I 0.042 -209 K 0.046 -210 E 0.052 -211 K 0.060 -212 D 0.071 -213 K 0.083 -214 E 0.093 -215 N 0.097 -216 K 0.092 -217 F 0.078 -218 L 0.059 -219 C 0.040 -220 V 0.026 -221 L 0.018 -222 M 0.014 -223 S 0.013 -224 D 0.012 -225 W 0.012 -226 F 0.016 -227 N 0.022 -228 F 0.032 -229 H 0.042 -230 G 0.049 -231 H 0.047 -232 M 0.038 -233 C 0.028 -234 I 0.025 -235 A 0.029 -236 F 0.038 -237 E 0.047 -238 L 0.054 -239 L 0.057 -240 G 0.055 -241 K 0.048 -242 N 0.041 -243 T 0.038 -244 F 0.040 -245 E 0.045 -246 F 0.050 -247 L 0.055 -248 K 0.060 -249 E 0.069 -250 N 0.076 -251 N 0.076 -252 F 0.069 -253 Q 0.059 -254 P 0.052 -255 Y 0.045 -256 P 0.039 -257 L 0.033 -258 P 0.028 -259 H 0.024 -260 V 0.022 -261 R 0.024 -262 H 0.030 -263 M 0.036 -264 A 0.038 -265 Y 0.036 -266 Q 0.034 -267 L 0.034 -268 C 0.032 -269 H 0.032 -270 A 0.032 -271 L 0.030 -272 R 0.028 -273 F 0.027 -274 L 0.028 -275 H 0.030 -276 E 0.033 -277 N 0.034 -278 Q 0.034 -279 L 0.032 -280 T 0.032 -281 H 0.036 -282 T 0.046 -283 D 0.059 -284 L 0.067 -285 K 0.068 -286 P 0.069 -287 E 0.071 -288 N 0.069 -289 I 0.062 -290 L 0.053 -291 F 0.048 -292 V 0.050 -293 N 0.058 -294 S 0.071 -295 E 0.086 -296 F 0.103 -297 E 0.124 -298 T 0.148 -299 L 0.170 -300 Y 0.186 -301 N 0.194 -302 E 0.195 -303 H 0.190 -304 K 0.189 -305 S 0.197 -306 C 0.208 -307 E 0.207 -308 E 0.195 -309 K 0.176 -310 S 0.155 -311 V 0.132 -312 K 0.111 -313 N 0.093 -314 T 0.078 -315 S 0.065 -316 I 0.056 -317 R 0.051 -318 V 0.054 -319 A 0.065 -320 D 0.084 -321 F 0.103 -322 G 0.115 -323 S 0.117 -324 A 0.111 -325 T 0.103 -326 F 0.102 -327 D 0.110 -328 H 0.125 -329 E 0.146 -330 H 0.167 -331 H 0.177 -332 T 0.172 -333 T 0.160 -334 I 0.152 -335 V 0.153 -336 A 0.156 -337 T 0.158 -338 R 0.162 -339 H 0.170 -340 Y 0.171 -341 R 0.160 -342 P 0.145 -343 P 0.139 -344 E 0.144 -345 V 0.147 -346 I 0.137 -347 L 0.124 -348 E 0.118 -349 L 0.120 -350 G 0.118 -351 W 0.111 -352 A 0.105 -353 Q 0.107 -354 P 0.125 -355 C 0.155 -356 D 0.175 -357 V 0.173 -358 W 0.164 -359 S 0.160 -360 I 0.152 -361 G 0.137 -362 C 0.124 -363 I 0.117 -364 L 0.107 -365 F 0.094 -366 E 0.082 -367 Y 0.073 -368 Y 0.070 -369 R 0.075 -370 G 0.085 -371 F 0.095 -372 T 0.103 -373 L 0.109 -374 F 0.109 -375 Q 0.105 -376 T 0.100 -377 H 0.097 -378 E 0.102 -379 N 0.115 -380 R 0.127 -381 E 0.125 -382 H 0.111 -383 L 0.100 -384 V 0.100 -385 M 0.106 -386 M 0.109 -387 E 0.108 -388 K 0.109 -389 I 0.112 -390 L 0.120 -391 G 0.133 -392 P 0.140 -393 I 0.132 -394 P 0.107 -395 S 0.081 -396 H 0.065 -397 M 0.059 -398 I 0.058 -399 H 0.059 -400 R 0.061 -401 T 0.064 -402 R 0.064 -403 K 0.063 -404 Q 0.064 -405 K 0.066 -406 Y 0.066 -407 F 0.068 -408 Y 0.079 -409 K 0.103 -410 G 0.133 -411 G 0.152 -412 L 0.152 -413 V 0.141 -414 W 0.136 -415 D 0.142 -416 E 0.154 -417 N 0.162 -418 S 0.168 -419 S 0.175 -420 D 0.183 -421 G 0.188 -422 R 0.188 -423 Y 0.190 -424 V 0.196 -425 K 0.206 -426 E 0.210 -427 N 0.202 -428 C 0.182 -429 K 0.157 -430 P 0.136 -431 L 0.121 -432 K 0.113 -433 S 0.112 -434 Y 0.116 -435 M 0.122 -436 L 0.129 -437 Q 0.139 -438 D 0.147 -439 S 0.144 -440 L 0.128 -441 E 0.112 -442 H 0.107 -443 V 0.109 -444 Q 0.107 -445 L 0.103 -446 F 0.100 -447 D 0.100 -448 L 0.101 -449 M 0.101 -450 R 0.095 -451 R 0.085 -452 M 0.078 -453 L 0.080 -454 E 0.088 -455 F 0.094 -456 D 0.097 -457 P 0.096 -458 A 0.096 -459 Q 0.097 -460 R 0.095 -461 I 0.082 -462 T 0.065 -463 L 0.053 -464 A 0.051 -465 E 0.055 -466 A 0.060 -467 L 0.063 -468 L 0.066 -469 H 0.068 -470 P 0.067 -471 F 0.069 -472 F 0.082 -473 A 0.107 -474 G 0.134 -475 L 0.154 -476 T 0.172 -477 P 0.193 -478 E 0.215 -479 E 0.239 -480 R 0.267 -481 S 0.306 -482 F 0.352 -483 H 0.396 -484 S 0.429 -485 S 0.451 -486 R 0.475 -487 N 0.500 -488 P 0.511 -489 S 0.497 -490 R 0.477 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032316.9_ENSMUST00000065330.8_GN:Clk3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:148.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032316.9_ENSMUST00000065330.8_GN:Clk3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:148.caid deleted file mode 100644 index aedfa34835749a01d556a022b30722756c52a935..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032316.9_ENSMUST00000065330.8_GN:Clk3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:148.caid +++ /dev/null @@ -1,639 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000032316.9|ENSMUST00000065330.8|GN:Clk3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:148 -1 M 0.387 -2 P 0.405 -3 V 0.429 -4 L 0.442 -5 S 0.436 -6 A 0.431 -7 R 0.451 -8 R 0.479 -9 K 0.483 -10 R 0.479 -11 L 0.484 -12 A 0.484 -13 S 0.481 -14 T 0.506 -15 A 0.556 -16 G 0.598 -17 P 0.624 -18 R 0.643 -19 R 0.661 -20 G 0.672 -21 S 0.676 -22 G 0.676 -23 P 0.672 -24 S 0.656 -25 L 0.628 -26 A 0.591 -27 V 0.549 -28 R 0.505 -29 W 0.473 -30 V 0.472 -31 P 0.500 -32 P 0.543 -33 L 0.586 -34 G 0.625 -35 P 0.659 -36 E 0.692 -37 P 0.720 -38 S 0.741 -39 S 0.753 -40 D 0.759 -41 R 0.757 -42 G 0.751 -43 R 0.741 -44 A 0.731 -45 P 0.723 -46 M 0.719 -47 R 0.723 -48 P 0.734 -49 R 0.748 -50 G 0.759 -51 P 0.756 -52 T 0.722 -53 C 0.664 -54 S 0.633 -55 T 0.663 -56 T 0.723 -57 R 0.763 -58 R 0.779 -59 G 0.784 -60 A 0.783 -61 G 0.778 -62 R 0.771 -63 G 0.766 -64 P 0.761 -65 R 0.754 -66 L 0.745 -67 L 0.737 -68 P 0.735 -69 G 0.741 -70 P 0.755 -71 P 0.776 -72 G 0.794 -73 R 0.802 -74 D 0.800 -75 L 0.791 -76 H 0.784 -77 R 0.782 -78 C 0.778 -79 R 0.771 -80 P 0.770 -81 D 0.781 -82 P 0.796 -83 G 0.808 -84 G 0.814 -85 A 0.812 -86 G 0.800 -87 Q 0.786 -88 S 0.778 -89 P 0.779 -90 R 0.780 -91 V 0.775 -92 C 0.767 -93 E 0.761 -94 F 0.763 -95 G 0.768 -96 A 0.769 -97 R 0.761 -98 A 0.750 -99 V 0.743 -100 R 0.746 -101 P 0.762 -102 L 0.781 -103 G 0.793 -104 R 0.791 -105 V 0.777 -106 E 0.758 -107 P 0.742 -108 G 0.735 -109 P 0.741 -110 P 0.758 -111 T 0.778 -112 A 0.791 -113 A 0.794 -114 S 0.789 -115 R 0.786 -116 E 0.784 -117 G 0.779 -118 A 0.761 -119 V 0.726 -120 L 0.673 -121 P 0.616 -122 R 0.596 -123 A 0.639 -124 E 0.704 -125 A 0.746 -126 R 0.760 -127 A 0.767 -128 G 0.773 -129 S 0.778 -130 G 0.782 -131 R 0.786 -132 G 0.788 -133 A 0.786 -134 R 0.781 -135 S 0.777 -136 G 0.774 -137 E 0.770 -138 W 0.764 -139 G 0.759 -140 L 0.753 -141 A 0.746 -142 A 0.742 -143 A 0.734 -144 G 0.706 -145 A 0.664 -146 W 0.636 -147 E 0.628 -148 T 0.622 -149 M 0.611 -150 H 0.608 -151 H 0.621 -152 C 0.640 -153 K 0.654 -154 R 0.657 -155 Y 0.642 -156 R 0.621 -157 S 0.613 -158 P 0.619 -159 E 0.621 -160 P 0.594 -161 D 0.530 -162 P 0.449 -163 Y 0.391 -164 L 0.377 -165 S 0.391 -166 Y 0.409 -167 R 0.430 -168 W 0.467 -169 K 0.523 -170 R 0.580 -171 R 0.621 -172 R 0.642 -173 S 0.661 -174 Y 0.686 -175 S 0.713 -176 R 0.735 -177 E 0.750 -178 H 0.762 -179 E 0.767 -180 G 0.762 -181 R 0.749 -182 L 0.735 -183 R 0.727 -184 Y 0.730 -185 P 0.741 -186 S 0.753 -187 R 0.751 -188 R 0.732 -189 E 0.703 -190 P 0.685 -191 P 0.697 -192 P 0.734 -193 R 0.773 -194 R 0.797 -195 S 0.807 -196 R 0.808 -197 S 0.804 -198 R 0.795 -199 S 0.783 -200 H 0.768 -201 D 0.745 -202 R 0.713 -203 I 0.680 -204 P 0.657 -205 Y 0.651 -206 Q 0.660 -207 R 0.674 -208 R 0.685 -209 Y 0.698 -210 R 0.723 -211 E 0.752 -212 H 0.774 -213 R 0.783 -214 D 0.780 -215 S 0.772 -216 D 0.766 -217 T 0.764 -218 Y 0.765 -219 R 0.768 -220 C 0.771 -221 E 0.772 -222 E 0.767 -223 R 0.758 -224 S 0.751 -225 P 0.756 -226 S 0.770 -227 F 0.786 -228 G 0.799 -229 E 0.802 -230 D 0.795 -231 C 0.781 -232 Y 0.767 -233 G 0.760 -234 S 0.758 -235 S 0.756 -236 R 0.751 -237 S 0.743 -238 R 0.726 -239 H 0.686 -240 R 0.629 -241 R 0.602 -242 R 0.636 -243 S 0.699 -244 R 0.743 -245 E 0.756 -246 R 0.751 -247 A 0.743 -248 P 0.742 -249 Y 0.750 -250 R 0.760 -251 T 0.764 -252 R 0.762 -253 K 0.756 -254 H 0.745 -255 A 0.731 -256 H 0.718 -257 H 0.700 -258 C 0.664 -259 H 0.617 -260 K 0.601 -261 R 0.644 -262 R 0.711 -263 T 0.755 -264 R 0.773 -265 S 0.777 -266 C 0.772 -267 S 0.762 -268 S 0.753 -269 A 0.744 -270 S 0.732 -271 S 0.719 -272 R 0.711 -273 S 0.707 -274 Q 0.703 -275 Q 0.699 -276 S 0.696 -277 S 0.688 -278 K 0.675 -279 R 0.661 -280 S 0.652 -281 S 0.639 -282 R 0.616 -283 S 0.583 -284 V 0.543 -285 E 0.494 -286 D 0.433 -287 D 0.364 -288 K 0.295 -289 E 0.241 -290 G 0.206 -291 H 0.181 -292 L 0.157 -293 V 0.131 -294 C 0.106 -295 R 0.085 -296 I 0.073 -297 G 0.074 -298 D 0.084 -299 W 0.088 -300 L 0.077 -301 Q 0.063 -302 E 0.058 -303 R 0.060 -304 Y 0.063 -305 E 0.066 -306 I 0.067 -307 V 0.068 -308 G 0.068 -309 N 0.066 -310 L 0.063 -311 G 0.061 -312 E 0.061 -313 G 0.062 -314 T 0.062 -315 F 0.058 -316 G 0.052 -317 K 0.045 -318 V 0.038 -319 V 0.033 -320 E 0.033 -321 C 0.039 -322 L 0.048 -323 D 0.055 -324 H 0.055 -325 A 0.054 -326 R 0.057 -327 G 0.061 -328 K 0.065 -329 S 0.067 -330 Q 0.066 -331 V 0.062 -332 A 0.053 -333 L 0.047 -334 K 0.048 -335 I 0.056 -336 I 0.065 -337 R 0.071 -338 N 0.071 -339 V 0.069 -340 G 0.065 -341 K 0.064 -342 Y 0.062 -343 R 0.057 -344 E 0.053 -345 A 0.052 -346 A 0.054 -347 R 0.057 -348 L 0.062 -349 E 0.069 -350 I 0.077 -351 N 0.078 -352 V 0.068 -353 L 0.054 -354 K 0.045 -355 K 0.042 -356 I 0.043 -357 K 0.047 -358 E 0.052 -359 K 0.061 -360 D 0.072 -361 K 0.084 -362 E 0.094 -363 N 0.098 -364 K 0.092 -365 F 0.077 -366 L 0.058 -367 C 0.040 -368 V 0.026 -369 L 0.019 -370 M 0.015 -371 S 0.014 -372 D 0.012 -373 W 0.012 -374 F 0.016 -375 N 0.022 -376 F 0.032 -377 H 0.041 -378 G 0.048 -379 H 0.046 -380 M 0.037 -381 C 0.029 -382 I 0.026 -383 A 0.031 -384 F 0.041 -385 E 0.052 -386 L 0.059 -387 L 0.063 -388 G 0.062 -389 K 0.055 -390 N 0.046 -391 T 0.043 -392 F 0.045 -393 E 0.050 -394 F 0.056 -395 L 0.060 -396 K 0.064 -397 E 0.072 -398 N 0.079 -399 N 0.080 -400 F 0.073 -401 Q 0.065 -402 P 0.057 -403 Y 0.050 -404 P 0.043 -405 L 0.036 -406 P 0.030 -407 H 0.026 -408 V 0.024 -409 R 0.026 -410 H 0.032 -411 M 0.039 -412 A 0.041 -413 Y 0.039 -414 Q 0.038 -415 L 0.038 -416 C 0.037 -417 H 0.036 -418 A 0.036 -419 L 0.035 -420 R 0.032 -421 F 0.031 -422 L 0.033 -423 H 0.035 -424 E 0.038 -425 N 0.038 -426 Q 0.038 -427 L 0.036 -428 T 0.035 -429 H 0.039 -430 T 0.051 -431 D 0.065 -432 L 0.075 -433 K 0.079 -434 P 0.081 -435 E 0.082 -436 N 0.079 -437 I 0.069 -438 L 0.058 -439 F 0.052 -440 V 0.054 -441 N 0.062 -442 S 0.074 -443 E 0.089 -444 F 0.107 -445 E 0.129 -446 T 0.155 -447 L 0.177 -448 Y 0.189 -449 N 0.194 -450 E 0.192 -451 H 0.189 -452 K 0.191 -453 S 0.203 -454 C 0.215 -455 E 0.216 -456 E 0.203 -457 K 0.181 -458 S 0.156 -459 V 0.129 -460 K 0.105 -461 N 0.086 -462 T 0.072 -463 S 0.062 -464 I 0.056 -465 R 0.053 -466 V 0.057 -467 A 0.069 -468 D 0.088 -469 F 0.109 -470 G 0.122 -471 S 0.125 -472 A 0.118 -473 T 0.109 -474 F 0.105 -475 D 0.110 -476 H 0.123 -477 E 0.141 -478 H 0.161 -479 H 0.172 -480 T 0.169 -481 T 0.160 -482 I 0.156 -483 V 0.159 -484 A 0.163 -485 T 0.166 -486 R 0.173 -487 H 0.184 -488 Y 0.187 -489 R 0.178 -490 P 0.163 -491 P 0.158 -492 E 0.164 -493 V 0.167 -494 I 0.155 -495 L 0.137 -496 E 0.129 -497 L 0.128 -498 G 0.127 -499 W 0.121 -500 A 0.116 -501 Q 0.120 -502 P 0.141 -503 C 0.175 -504 D 0.197 -505 V 0.197 -506 W 0.192 -507 S 0.189 -508 I 0.179 -509 G 0.159 -510 C 0.144 -511 I 0.134 -512 L 0.123 -513 F 0.108 -514 E 0.094 -515 Y 0.084 -516 Y 0.080 -517 R 0.082 -518 G 0.090 -519 F 0.098 -520 T 0.108 -521 L 0.115 -522 F 0.117 -523 Q 0.114 -524 T 0.109 -525 H 0.107 -526 E 0.115 -527 N 0.131 -528 R 0.145 -529 E 0.143 -530 H 0.127 -531 L 0.113 -532 V 0.112 -533 M 0.118 -534 M 0.120 -535 E 0.118 -536 K 0.117 -537 I 0.121 -538 L 0.132 -539 G 0.147 -540 P 0.155 -541 I 0.146 -542 P 0.119 -543 S 0.091 -544 H 0.074 -545 M 0.069 -546 I 0.068 -547 H 0.069 -548 R 0.072 -549 T 0.074 -550 R 0.074 -551 K 0.072 -552 Q 0.073 -553 K 0.075 -554 Y 0.075 -555 F 0.076 -556 Y 0.087 -557 K 0.113 -558 G 0.145 -559 G 0.165 -560 L 0.164 -561 V 0.152 -562 W 0.147 -563 D 0.155 -564 E 0.165 -565 N 0.172 -566 S 0.176 -567 S 0.184 -568 D 0.195 -569 G 0.204 -570 R 0.208 -571 Y 0.212 -572 V 0.219 -573 K 0.227 -574 E 0.229 -575 N 0.218 -576 C 0.195 -577 K 0.170 -578 P 0.148 -579 L 0.132 -580 K 0.123 -581 S 0.122 -582 Y 0.124 -583 M 0.127 -584 L 0.132 -585 Q 0.142 -586 D 0.152 -587 S 0.151 -588 L 0.136 -589 E 0.122 -590 H 0.118 -591 V 0.122 -592 Q 0.122 -593 L 0.118 -594 F 0.117 -595 D 0.118 -596 L 0.120 -597 M 0.120 -598 R 0.114 -599 R 0.101 -600 M 0.094 -601 L 0.098 -602 E 0.108 -603 F 0.115 -604 D 0.118 -605 P 0.116 -606 A 0.114 -607 Q 0.114 -608 R 0.109 -609 I 0.094 -610 T 0.076 -611 L 0.064 -612 A 0.061 -613 E 0.065 -614 A 0.067 -615 L 0.068 -616 L 0.070 -617 H 0.072 -618 P 0.072 -619 F 0.071 -620 F 0.080 -621 A 0.101 -622 G 0.126 -623 L 0.146 -624 T 0.166 -625 P 0.189 -626 E 0.210 -627 E 0.231 -628 R 0.263 -629 S 0.312 -630 F 0.370 -631 H 0.423 -632 S 0.462 -633 S 0.483 -634 R 0.496 -635 N 0.506 -636 P 0.506 -637 S 0.491 -638 R 0.475 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032320.8_ENSMUST00000114276.3_GN:Rcn2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032320.8_ENSMUST00000114276.3_GN:Rcn2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 7eb74065c27933ac331a43deed5a128be5e092f8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032320.8_ENSMUST00000114276.3_GN:Rcn2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,321 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000032320.8|ENSMUST00000114276.3|GN:Rcn2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.359 -2 R 0.379 -3 L 0.414 -4 G 0.453 -5 P 0.486 -6 R 0.518 -7 P 0.550 -8 A 0.557 -9 A 0.526 -10 L 0.486 -11 G 0.469 -12 L 0.457 -13 L 0.435 -14 L 0.411 -15 P 0.386 -16 L 0.356 -17 L 0.338 -18 L 0.352 -19 Y 0.392 -20 A 0.442 -21 A 0.495 -22 V 0.545 -23 A 0.582 -24 G 0.597 -25 A 0.589 -26 S 0.569 -27 K 0.546 -28 A 0.515 -29 E 0.468 -30 E 0.410 -31 L 0.352 -32 H 0.306 -33 Y 0.276 -34 P 0.265 -35 Q 0.272 -36 G 0.291 -37 E 0.307 -38 H 0.302 -39 R 0.281 -40 A 0.277 -41 D 0.302 -42 Y 0.320 -43 D 0.296 -44 R 0.247 -45 E 0.212 -46 A 0.201 -47 L 0.207 -48 L 0.232 -49 G 0.272 -50 V 0.305 -51 Q 0.303 -52 E 0.266 -53 D 0.220 -54 V 0.182 -55 D 0.153 -56 E 0.128 -57 Y 0.109 -58 V 0.100 -59 K 0.103 -60 L 0.112 -61 G 0.117 -62 H 0.110 -63 E 0.092 -64 E 0.076 -65 Q 0.073 -66 Q 0.080 -67 R 0.084 -68 R 0.081 -69 L 0.071 -70 Q 0.061 -71 S 0.056 -72 I 0.055 -73 I 0.052 -74 K 0.048 -75 K 0.049 -76 I 0.059 -77 D 0.079 -78 S 0.106 -79 D 0.129 -80 S 0.139 -81 D 0.143 -82 G 0.150 -83 F 0.153 -84 L 0.143 -85 T 0.118 -86 E 0.090 -87 N 0.072 -88 E 0.064 -89 L 0.060 -90 S 0.057 -91 Q 0.057 -92 W 0.057 -93 I 0.056 -94 Q 0.054 -95 M 0.055 -96 S 0.062 -97 F 0.071 -98 K 0.077 -99 H 0.079 -100 Y 0.083 -101 A 0.089 -102 M 0.091 -103 Q 0.084 -104 E 0.071 -105 A 0.061 -106 K 0.065 -107 Q 0.075 -108 Q 0.078 -109 F 0.072 -110 V 0.061 -111 E 0.056 -112 Y 0.062 -113 D 0.076 -114 K 0.095 -115 N 0.109 -116 S 0.113 -117 D 0.112 -118 G 0.112 -119 A 0.106 -120 V 0.088 -121 T 0.065 -122 W 0.051 -123 D 0.048 -124 E 0.048 -125 Y 0.044 -126 N 0.037 -127 I 0.035 -128 Q 0.043 -129 M 0.061 -130 Y 0.088 -131 D 0.120 -132 R 0.155 -133 V 0.190 -134 I 0.221 -135 D 0.247 -136 F 0.266 -137 D 0.279 -138 E 0.296 -139 N 0.326 -140 T 0.363 -141 A 0.393 -142 L 0.402 -143 D 0.388 -144 D 0.359 -145 T 0.326 -146 E 0.296 -147 E 0.267 -148 G 0.232 -149 S 0.187 -150 F 0.138 -151 R 0.100 -152 Q 0.081 -153 L 0.078 -154 H 0.083 -155 L 0.088 -156 K 0.091 -157 D 0.088 -158 K 0.082 -159 K 0.074 -160 R 0.066 -161 F 0.059 -162 E 0.057 -163 K 0.060 -164 A 0.065 -165 N 0.075 -166 Q 0.093 -167 D 0.118 -168 S 0.137 -169 G 0.144 -170 P 0.141 -171 G 0.137 -172 L 0.129 -173 S 0.112 -174 L 0.090 -175 E 0.077 -176 E 0.074 -177 F 0.074 -178 I 0.078 -179 A 0.086 -180 F 0.094 -181 E 0.098 -182 H 0.101 -183 P 0.106 -184 E 0.112 -185 E 0.116 -186 V 0.114 -187 D 0.109 -188 Y 0.103 -189 M 0.095 -190 T 0.090 -191 E 0.094 -192 F 0.102 -193 V 0.100 -194 I 0.093 -195 Q 0.094 -196 E 0.102 -197 A 0.102 -198 L 0.092 -199 E 0.083 -200 E 0.082 -201 H 0.091 -202 D 0.110 -203 K 0.140 -204 N 0.167 -205 G 0.176 -206 D 0.166 -207 G 0.150 -208 F 0.131 -209 V 0.107 -210 S 0.085 -211 L 0.078 -212 E 0.088 -213 E 0.101 -214 F 0.109 -215 L 0.117 -216 G 0.131 -217 D 0.145 -218 Y 0.158 -219 R 0.174 -220 R 0.193 -221 D 0.206 -222 P 0.207 -223 T 0.200 -224 A 0.194 -225 N 0.186 -226 E 0.173 -227 D 0.153 -228 P 0.128 -229 E 0.106 -230 W 0.091 -231 I 0.082 -232 L 0.083 -233 V 0.091 -234 E 0.100 -235 K 0.101 -236 D 0.094 -237 R 0.081 -238 F 0.073 -239 V 0.075 -240 N 0.079 -241 D 0.076 -242 Y 0.074 -243 D 0.085 -244 K 0.105 -245 D 0.122 -246 N 0.130 -247 D 0.135 -248 G 0.145 -249 R 0.152 -250 L 0.143 -251 D 0.116 -252 P 0.089 -253 Q 0.077 -254 E 0.078 -255 L 0.079 -256 L 0.079 -257 S 0.084 -258 W 0.098 -259 V 0.117 -260 V 0.142 -261 P 0.169 -262 N 0.188 -263 N 0.194 -264 Q 0.188 -265 G 0.173 -266 I 0.147 -267 A 0.120 -268 Q 0.110 -269 E 0.117 -270 E 0.121 -271 A 0.117 -272 L 0.116 -273 H 0.126 -274 L 0.130 -275 I 0.118 -276 D 0.099 -277 E 0.087 -278 M 0.084 -279 D 0.090 -280 L 0.100 -281 N 0.110 -282 S 0.121 -283 D 0.137 -284 K 0.157 -285 K 0.168 -286 L 0.158 -287 S 0.133 -288 E 0.112 -289 E 0.101 -290 E 0.090 -291 I 0.076 -292 L 0.069 -293 E 0.069 -294 N 0.070 -295 Q 0.067 -296 D 0.067 -297 L 0.067 -298 F 0.069 -299 L 0.077 -300 T 0.093 -301 S 0.106 -302 E 0.109 -303 A 0.111 -304 T 0.124 -305 D 0.147 -306 Y 0.172 -307 G 0.193 -308 R 0.219 -309 Q 0.253 -310 L 0.291 -311 H 0.326 -312 D 0.356 -313 D 0.377 -314 Y 0.391 -315 F 0.401 -316 Y 0.420 -317 H 0.452 -318 D 0.481 -319 E 0.484 -320 L 0.471 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032320.8_ENSMUST00000114276.3_GN:Rcn2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:35.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032320.8_ENSMUST00000114276.3_GN:Rcn2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:35.caid deleted file mode 100644 index a14782a79185bb3f9845bdfb0acff6cee4d79f52..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032320.8_ENSMUST00000114276.3_GN:Rcn2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:35.caid +++ /dev/null @@ -1,356 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000032320.8|ENSMUST00000114276.3|GN:Rcn2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:35 -1 M 0.362 -2 Q 0.373 -3 R 0.392 -4 R 0.407 -5 P 0.408 -6 S 0.401 -7 V 0.400 -8 A 0.401 -9 A 0.391 -10 R 0.376 -11 E 0.371 -12 A 0.368 -13 R 0.365 -14 L 0.376 -15 P 0.412 -16 S 0.465 -17 P 0.521 -18 G 0.560 -19 S 0.561 -20 A 0.519 -21 C 0.460 -22 L 0.422 -23 P 0.410 -24 P 0.413 -25 R 0.424 -26 G 0.438 -27 F 0.434 -28 L 0.415 -29 R 0.411 -30 P 0.424 -31 R 0.419 -32 R 0.408 -33 A 0.451 -34 G 0.551 -35 A 0.637 -36 M 0.668 -37 R 0.660 -38 L 0.646 -39 G 0.645 -40 P 0.660 -41 R 0.687 -42 P 0.714 -43 A 0.724 -44 A 0.711 -45 L 0.680 -46 G 0.635 -47 L 0.585 -48 L 0.542 -49 L 0.504 -50 P 0.462 -51 L 0.439 -52 L 0.454 -53 L 0.488 -54 Y 0.512 -55 A 0.539 -56 A 0.585 -57 V 0.627 -58 A 0.642 -59 G 0.627 -60 A 0.592 -61 S 0.553 -62 K 0.524 -63 A 0.494 -64 E 0.446 -65 E 0.384 -66 L 0.325 -67 H 0.283 -68 Y 0.262 -69 P 0.258 -70 Q 0.269 -71 G 0.289 -72 E 0.307 -73 H 0.304 -74 R 0.285 -75 A 0.284 -76 D 0.318 -77 Y 0.348 -78 D 0.330 -79 R 0.275 -80 E 0.230 -81 A 0.211 -82 L 0.212 -83 L 0.227 -84 G 0.251 -85 V 0.264 -86 Q 0.253 -87 E 0.219 -88 D 0.180 -89 V 0.148 -90 D 0.123 -91 E 0.103 -92 Y 0.088 -93 V 0.082 -94 K 0.085 -95 L 0.093 -96 G 0.098 -97 H 0.091 -98 E 0.075 -99 E 0.063 -100 Q 0.063 -101 Q 0.071 -102 R 0.077 -103 R 0.073 -104 L 0.062 -105 Q 0.052 -106 S 0.046 -107 I 0.044 -108 I 0.043 -109 K 0.041 -110 K 0.044 -111 I 0.056 -112 D 0.077 -113 S 0.104 -114 D 0.126 -115 S 0.136 -116 D 0.140 -117 G 0.146 -118 F 0.148 -119 L 0.137 -120 T 0.113 -121 E 0.087 -122 N 0.071 -123 E 0.065 -124 L 0.060 -125 S 0.056 -126 Q 0.053 -127 W 0.052 -128 I 0.051 -129 Q 0.050 -130 M 0.052 -131 S 0.060 -132 F 0.069 -133 K 0.075 -134 H 0.079 -135 Y 0.084 -136 A 0.090 -137 M 0.091 -138 Q 0.083 -139 E 0.068 -140 A 0.054 -141 K 0.050 -142 Q 0.057 -143 Q 0.065 -144 F 0.067 -145 V 0.062 -146 E 0.060 -147 Y 0.065 -148 D 0.080 -149 K 0.099 -150 N 0.115 -151 S 0.122 -152 D 0.123 -153 G 0.121 -154 A 0.114 -155 V 0.094 -156 T 0.069 -157 W 0.054 -158 D 0.051 -159 E 0.052 -160 Y 0.047 -161 N 0.039 -162 I 0.037 -163 Q 0.047 -164 M 0.069 -165 Y 0.099 -166 D 0.136 -167 R 0.176 -168 V 0.212 -169 I 0.242 -170 D 0.264 -171 F 0.278 -172 D 0.289 -173 E 0.306 -174 N 0.339 -175 T 0.381 -176 A 0.414 -177 L 0.425 -178 D 0.409 -179 D 0.376 -180 T 0.338 -181 E 0.302 -182 E 0.268 -183 G 0.232 -184 S 0.187 -185 F 0.138 -186 R 0.098 -187 Q 0.079 -188 L 0.076 -189 H 0.081 -190 L 0.087 -191 K 0.090 -192 D 0.089 -193 K 0.084 -194 K 0.076 -195 R 0.067 -196 F 0.060 -197 E 0.058 -198 K 0.060 -199 A 0.064 -200 N 0.073 -201 Q 0.090 -202 D 0.112 -203 S 0.130 -204 G 0.136 -205 P 0.134 -206 G 0.132 -207 L 0.127 -208 S 0.110 -209 L 0.089 -210 E 0.075 -211 E 0.072 -212 F 0.074 -213 I 0.078 -214 A 0.085 -215 F 0.091 -216 E 0.094 -217 H 0.097 -218 P 0.102 -219 E 0.107 -220 E 0.110 -221 V 0.105 -222 D 0.097 -223 Y 0.090 -224 M 0.083 -225 T 0.079 -226 E 0.083 -227 F 0.090 -228 V 0.090 -229 I 0.085 -230 Q 0.087 -231 E 0.094 -232 A 0.094 -233 L 0.084 -234 E 0.075 -235 E 0.075 -236 H 0.084 -237 D 0.103 -238 K 0.132 -239 N 0.158 -240 G 0.167 -241 D 0.157 -242 G 0.141 -243 F 0.123 -244 V 0.101 -245 S 0.081 -246 L 0.075 -247 E 0.083 -248 E 0.096 -249 F 0.102 -250 L 0.108 -251 G 0.120 -252 D 0.134 -253 Y 0.149 -254 R 0.168 -255 R 0.190 -256 D 0.205 -257 P 0.206 -258 T 0.200 -259 A 0.194 -260 N 0.187 -261 E 0.173 -262 D 0.152 -263 P 0.127 -264 E 0.105 -265 W 0.089 -266 I 0.081 -267 L 0.081 -268 V 0.088 -269 E 0.097 -270 K 0.099 -271 D 0.093 -272 R 0.082 -273 F 0.075 -274 V 0.076 -275 N 0.079 -276 D 0.076 -277 Y 0.075 -278 D 0.087 -279 K 0.109 -280 D 0.128 -281 N 0.136 -282 D 0.141 -283 G 0.150 -284 R 0.155 -285 L 0.145 -286 D 0.118 -287 P 0.090 -288 Q 0.079 -289 E 0.080 -290 L 0.081 -291 L 0.080 -292 S 0.085 -293 W 0.098 -294 V 0.118 -295 V 0.143 -296 P 0.171 -297 N 0.192 -298 N 0.200 -299 Q 0.196 -300 G 0.180 -301 I 0.152 -302 A 0.124 -303 Q 0.114 -304 E 0.119 -305 E 0.122 -306 A 0.117 -307 L 0.116 -308 H 0.126 -309 L 0.132 -310 I 0.121 -311 D 0.103 -312 E 0.090 -313 M 0.088 -314 D 0.094 -315 L 0.106 -316 N 0.118 -317 S 0.130 -318 D 0.148 -319 K 0.171 -320 K 0.183 -321 L 0.171 -322 S 0.138 -323 E 0.105 -324 E 0.086 -325 E 0.078 -326 I 0.072 -327 L 0.070 -328 E 0.073 -329 N 0.073 -330 Q 0.072 -331 D 0.072 -332 L 0.073 -333 F 0.075 -334 L 0.083 -335 T 0.100 -336 S 0.113 -337 E 0.117 -338 A 0.117 -339 T 0.129 -340 D 0.152 -341 Y 0.177 -342 G 0.200 -343 R 0.228 -344 Q 0.263 -345 L 0.301 -346 H 0.336 -347 D 0.364 -348 D 0.386 -349 Y 0.399 -350 F 0.409 -351 Y 0.427 -352 H 0.458 -353 D 0.486 -354 E 0.489 -355 L 0.474 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032400.19_ENSMUST00000122091.8_GN:Zwilch_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032400.19_ENSMUST00000122091.8_GN:Zwilch_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index e38aa52f4279f1d585764e8d0a173f5a44faf6e6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032400.19_ENSMUST00000122091.8_GN:Zwilch_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,590 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000032400.19|ENSMUST00000122091.8|GN:Zwilch|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.106 -2 W 0.097 -3 S 0.089 -4 R 0.087 -5 M 0.093 -6 N 0.097 -7 R 0.091 -8 A 0.076 -9 A 0.065 -10 E 0.066 -11 E 0.072 -12 F 0.073 -13 Y 0.072 -14 A 0.072 -15 R 0.069 -16 L 0.070 -17 R 0.086 -18 Q 0.113 -19 E 0.143 -20 F 0.172 -21 N 0.197 -22 E 0.218 -23 E 0.243 -24 K 0.275 -25 K 0.309 -26 G 0.334 -27 A 0.341 -28 S 0.328 -29 K 0.298 -30 D 0.261 -31 P 0.223 -32 F 0.192 -33 I 0.166 -34 Y 0.147 -35 E 0.132 -36 A 0.120 -37 D 0.112 -38 V 0.111 -39 Q 0.113 -40 V 0.118 -41 Q 0.127 -42 L 0.138 -43 I 0.146 -44 S 0.152 -45 K 0.164 -46 G 0.182 -47 Q 0.190 -48 P 0.177 -49 S 0.155 -50 L 0.138 -51 L 0.131 -52 K 0.131 -53 T 0.134 -54 I 0.136 -55 L 0.139 -56 N 0.144 -57 E 0.148 -58 N 0.149 -59 D 0.145 -60 S 0.139 -61 V 0.138 -62 F 0.149 -63 L 0.173 -64 V 0.200 -65 E 0.222 -66 K 0.239 -67 V 0.264 -68 V 0.309 -69 L 0.371 -70 E 0.435 -71 K 0.484 -72 E 0.518 -73 E 0.550 -74 T 0.585 -75 S 0.608 -76 Q 0.598 -77 V 0.559 -78 E 0.527 -79 E 0.520 -80 L 0.520 -81 Q 0.529 -82 S 0.566 -83 E 0.611 -84 E 0.638 -85 T 0.655 -86 A 0.673 -87 I 0.687 -88 S 0.692 -89 D 0.688 -90 L 0.676 -91 S 0.659 -92 A 0.635 -93 G 0.592 -94 E 0.521 -95 N 0.428 -96 I 0.335 -97 R 0.261 -98 P 0.204 -99 L 0.162 -100 A 0.136 -101 L 0.126 -102 P 0.123 -103 V 0.119 -104 G 0.112 -105 R 0.102 -106 A 0.091 -107 R 0.082 -108 Q 0.076 -109 L 0.077 -110 I 0.083 -111 G 0.089 -112 L 0.091 -113 Y 0.091 -114 T 0.095 -115 M 0.106 -116 A 0.126 -117 H 0.152 -118 N 0.171 -119 P 0.177 -120 N 0.172 -121 M 0.165 -122 T 0.157 -123 H 0.153 -124 L 0.157 -125 K 0.162 -126 I 0.164 -127 K 0.162 -128 Q 0.157 -129 P 0.151 -130 V 0.147 -131 T 0.145 -132 A 0.143 -133 L 0.135 -134 P 0.123 -135 P 0.112 -136 L 0.109 -137 W 0.117 -138 V 0.138 -139 R 0.176 -140 C 0.228 -141 D 0.282 -142 G 0.315 -143 S 0.317 -144 D 0.293 -145 P 0.255 -146 E 0.214 -147 G 0.177 -148 T 0.147 -149 C 0.127 -150 W 0.115 -151 L 0.109 -152 G 0.104 -153 A 0.097 -154 E 0.085 -155 L 0.072 -156 I 0.063 -157 T 0.061 -158 T 0.066 -159 N 0.072 -160 D 0.072 -161 I 0.069 -162 I 0.064 -163 A 0.062 -164 G 0.061 -165 V 0.060 -166 I 0.056 -167 L 0.053 -168 Y 0.052 -169 V 0.055 -170 L 0.063 -171 T 0.078 -172 C 0.099 -173 K 0.123 -174 A 0.148 -175 D 0.174 -176 K 0.205 -177 N 0.235 -178 Y 0.255 -179 S 0.256 -180 E 0.246 -181 D 0.233 -182 L 0.226 -183 E 0.230 -184 N 0.241 -185 L 0.254 -186 K 0.271 -187 T 0.292 -188 S 0.304 -189 H 0.296 -190 K 0.276 -191 K 0.253 -192 R 0.236 -193 H 0.225 -194 H 0.217 -195 V 0.206 -196 S 0.191 -197 A 0.176 -198 V 0.164 -199 T 0.161 -200 A 0.164 -201 R 0.171 -202 G 0.176 -203 F 0.176 -204 A 0.171 -205 Q 0.165 -206 Y 0.171 -207 E 0.194 -208 L 0.233 -209 F 0.293 -210 K 0.377 -211 S 0.471 -212 D 0.551 -213 D 0.602 -214 L 0.620 -215 D 0.614 -216 D 0.596 -217 T 0.578 -218 V 0.571 -219 A 0.575 -220 P 0.570 -221 S 0.532 -222 Q 0.454 -223 T 0.367 -224 T 0.305 -225 V 0.279 -226 T 0.265 -227 L 0.240 -228 D 0.202 -229 L 0.163 -230 S 0.136 -231 W 0.133 -232 S 0.156 -233 P 0.195 -234 V 0.231 -235 D 0.252 -236 E 0.257 -237 M 0.250 -238 L 0.239 -239 Q 0.236 -240 T 0.250 -241 P 0.284 -242 P 0.332 -243 L 0.388 -244 S 0.436 -245 S 0.445 -246 T 0.414 -247 A 0.376 -248 A 0.357 -249 L 0.349 -250 N 0.330 -251 I 0.299 -252 R 0.278 -253 V 0.280 -254 Q 0.294 -255 S 0.307 -256 G 0.317 -257 E 0.317 -258 S 0.297 -259 R 0.260 -260 G 0.222 -261 C 0.187 -262 L 0.152 -263 S 0.119 -264 H 0.094 -265 L 0.079 -266 H 0.067 -267 R 0.058 -268 E 0.050 -269 L 0.045 -270 K 0.039 -271 F 0.033 -272 L 0.027 -273 L 0.025 -274 V 0.028 -275 L 0.034 -276 A 0.043 -277 D 0.053 -278 G 0.064 -279 I 0.073 -280 R 0.083 -281 T 0.095 -282 G 0.102 -283 V 0.099 -284 T 0.090 -285 E 0.084 -286 W 0.086 -287 L 0.092 -288 E 0.099 -289 P 0.101 -290 L 0.102 -291 E 0.106 -292 T 0.107 -293 K 0.097 -294 S 0.080 -295 A 0.070 -296 L 0.071 -297 E 0.072 -298 F 0.064 -299 V 0.052 -300 Q 0.045 -301 E 0.046 -302 F 0.057 -303 L 0.076 -304 N 0.097 -305 D 0.118 -306 L 0.143 -307 N 0.178 -308 K 0.221 -309 L 0.272 -310 D 0.331 -311 E 0.392 -312 F 0.443 -313 D 0.473 -314 D 0.479 -315 S 0.469 -316 T 0.465 -317 K 0.483 -318 K 0.511 -319 D 0.536 -320 K 0.551 -321 Q 0.553 -322 K 0.534 -323 E 0.495 -324 A 0.449 -325 V 0.400 -326 N 0.337 -327 H 0.259 -328 D 0.181 -329 A 0.119 -330 A 0.080 -331 A 0.059 -332 V 0.048 -333 V 0.044 -334 R 0.043 -335 S 0.042 -336 M 0.043 -337 L 0.048 -338 L 0.058 -339 T 0.071 -340 V 0.091 -341 R 0.113 -342 G 0.126 -343 D 0.119 -344 L 0.095 -345 D 0.067 -346 F 0.045 -347 A 0.032 -348 E 0.026 -349 Q 0.022 -350 L 0.022 -351 W 0.025 -352 C 0.032 -353 R 0.041 -354 M 0.051 -355 S 0.061 -356 S 0.067 -357 S 0.065 -358 V 0.057 -359 V 0.047 -360 S 0.038 -361 Y 0.031 -362 Q 0.026 -363 D 0.022 -364 L 0.021 -365 V 0.020 -366 K 0.019 -367 C 0.017 -368 F 0.017 -369 T 0.018 -370 L 0.022 -371 I 0.033 -372 L 0.049 -373 Q 0.061 -374 S 0.062 -375 L 0.060 -376 Q 0.067 -377 R 0.084 -378 G 0.100 -379 D 0.107 -380 I 0.105 -381 Q 0.102 -382 P 0.103 -383 W 0.110 -384 L 0.126 -385 H 0.154 -386 S 0.192 -387 G 0.225 -388 S 0.235 -389 N 0.216 -390 S 0.175 -391 L 0.128 -392 L 0.092 -393 S 0.074 -394 K 0.074 -395 L 0.084 -396 I 0.100 -397 H 0.117 -398 Q 0.136 -399 S 0.168 -400 Y 0.217 -401 H 0.276 -402 G 0.325 -403 A 0.345 -404 M 0.341 -405 D 0.331 -406 S 0.328 -407 V 0.329 -408 P 0.321 -409 L 0.302 -410 S 0.276 -411 G 0.241 -412 T 0.193 -413 T 0.141 -414 P 0.100 -415 L 0.073 -416 Q 0.057 -417 M 0.049 -418 L 0.045 -419 L 0.046 -420 E 0.050 -421 I 0.053 -422 G 0.054 -423 L 0.054 -424 D 0.052 -425 K 0.048 -426 L 0.045 -427 K 0.044 -428 K 0.041 -429 D 0.036 -430 Y 0.032 -431 I 0.033 -432 S 0.040 -433 F 0.050 -434 F 0.060 -435 V 0.072 -436 S 0.086 -437 Q 0.102 -438 E 0.114 -439 L 0.123 -440 A 0.133 -441 S 0.144 -442 L 0.143 -443 N 0.133 -444 H 0.124 -445 L 0.123 -446 E 0.130 -447 Y 0.143 -448 F 0.167 -449 I 0.200 -450 S 0.232 -451 P 0.253 -452 S 0.254 -453 V 0.237 -454 S 0.209 -455 T 0.181 -456 Q 0.159 -457 E 0.144 -458 Q 0.131 -459 V 0.117 -460 C 0.107 -461 R 0.103 -462 V 0.100 -463 Q 0.092 -464 K 0.083 -465 L 0.072 -466 H 0.061 -467 H 0.050 -468 I 0.042 -469 L 0.036 -470 E 0.031 -471 I 0.027 -472 L 0.024 -473 V 0.022 -474 I 0.024 -475 C 0.028 -476 M 0.033 -477 L 0.040 -478 F 0.047 -479 I 0.055 -480 K 0.063 -481 P 0.068 -482 Q 0.069 -483 H 0.064 -484 E 0.056 -485 L 0.051 -486 L 0.049 -487 F 0.050 -488 S 0.051 -489 L 0.049 -490 T 0.047 -491 Q 0.046 -492 S 0.048 -493 C 0.057 -494 I 0.072 -495 K 0.086 -496 Y 0.092 -497 Y 0.097 -498 K 0.116 -499 Q 0.152 -500 N 0.191 -501 P 0.216 -502 L 0.221 -503 D 0.218 -504 E 0.214 -505 Q 0.209 -506 H 0.209 -507 I 0.216 -508 F 0.226 -509 Q 0.240 -510 L 0.262 -511 P 0.287 -512 V 0.317 -513 R 0.357 -514 P 0.408 -515 A 0.457 -516 A 0.495 -517 V 0.527 -518 K 0.549 -519 N 0.548 -520 L 0.521 -521 Y 0.486 -522 Q 0.466 -523 S 0.464 -524 E 0.475 -525 K 0.493 -526 P 0.513 -527 Q 0.527 -528 K 0.536 -529 W 0.551 -530 R 0.582 -531 V 0.624 -532 E 0.654 -533 L 0.654 -534 S 0.639 -535 N 0.632 -536 S 0.635 -537 Q 0.638 -538 K 0.636 -539 R 0.630 -540 V 0.615 -541 K 0.584 -542 T 0.543 -543 V 0.513 -544 W 0.508 -545 Q 0.527 -546 L 0.553 -547 S 0.570 -548 D 0.570 -549 S 0.567 -550 S 0.577 -551 P 0.599 -552 V 0.616 -553 D 0.619 -554 H 0.611 -555 S 0.590 -556 S 0.551 -557 F 0.499 -558 H 0.454 -559 R 0.424 -560 P 0.413 -561 E 0.418 -562 F 0.427 -563 P 0.420 -564 E 0.386 -565 L 0.340 -566 T 0.305 -567 L 0.291 -568 N 0.297 -569 G 0.308 -570 S 0.300 -571 L 0.268 -572 E 0.224 -573 E 0.185 -574 R 0.159 -575 T 0.145 -576 A 0.137 -577 F 0.135 -578 V 0.139 -579 N 0.147 -580 M 0.156 -581 L 0.160 -582 T 0.160 -583 C 0.157 -584 S 0.148 -585 Q 0.134 -586 V 0.122 -587 H 0.120 -588 F 0.126 -589 K 0.132 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032400.19_ENSMUST00000122091.8_GN:Zwilch_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032400.19_ENSMUST00000122091.8_GN:Zwilch_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid deleted file mode 100644 index f9210a0022f6da3f864f1f865831a576b6b8b243..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032400.19_ENSMUST00000122091.8_GN:Zwilch_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid +++ /dev/null @@ -1,597 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000032400.19|ENSMUST00000122091.8|GN:Zwilch|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:7 -1 M 0.393 -2 D 0.411 -3 G 0.435 -4 G 0.452 -5 H 0.449 -6 G 0.416 -7 G 0.346 -8 M 0.255 -9 W 0.177 -10 S 0.130 -11 R 0.106 -12 M 0.098 -13 N 0.097 -14 R 0.092 -15 A 0.078 -16 A 0.068 -17 E 0.069 -18 E 0.075 -19 F 0.075 -20 Y 0.074 -21 A 0.074 -22 R 0.071 -23 L 0.073 -24 R 0.088 -25 Q 0.115 -26 E 0.144 -27 F 0.172 -28 N 0.196 -29 E 0.216 -30 E 0.241 -31 K 0.272 -32 K 0.304 -33 G 0.325 -34 A 0.327 -35 S 0.309 -36 K 0.276 -37 D 0.237 -38 P 0.201 -39 F 0.172 -40 I 0.150 -41 Y 0.134 -42 E 0.121 -43 A 0.110 -44 D 0.103 -45 V 0.103 -46 Q 0.106 -47 V 0.113 -48 Q 0.124 -49 L 0.136 -50 I 0.146 -51 S 0.154 -52 K 0.169 -53 G 0.187 -54 Q 0.193 -55 P 0.177 -56 S 0.151 -57 L 0.131 -58 L 0.122 -59 K 0.121 -60 T 0.125 -61 I 0.128 -62 L 0.132 -63 N 0.137 -64 E 0.140 -65 N 0.138 -66 D 0.131 -67 S 0.120 -68 V 0.114 -69 F 0.121 -70 L 0.139 -71 V 0.162 -72 E 0.184 -73 K 0.203 -74 V 0.231 -75 V 0.279 -76 L 0.346 -77 E 0.417 -78 K 0.476 -79 E 0.517 -80 E 0.554 -81 T 0.592 -82 S 0.615 -83 Q 0.604 -84 V 0.565 -85 E 0.539 -86 E 0.549 -87 L 0.572 -88 Q 0.593 -89 S 0.618 -90 E 0.638 -91 E 0.649 -92 T 0.658 -93 A 0.673 -94 I 0.685 -95 S 0.689 -96 D 0.684 -97 L 0.673 -98 S 0.659 -99 A 0.638 -100 G 0.598 -101 E 0.528 -102 N 0.435 -103 I 0.342 -104 R 0.266 -105 P 0.208 -106 L 0.165 -107 A 0.137 -108 L 0.125 -109 P 0.121 -110 V 0.117 -111 G 0.110 -112 R 0.101 -113 A 0.091 -114 R 0.081 -115 Q 0.075 -116 L 0.074 -117 I 0.080 -118 G 0.085 -119 L 0.087 -120 Y 0.087 -121 T 0.091 -122 M 0.102 -123 A 0.123 -124 H 0.150 -125 N 0.170 -126 P 0.176 -127 N 0.172 -128 M 0.164 -129 T 0.156 -130 H 0.150 -131 L 0.153 -132 K 0.158 -133 I 0.160 -134 K 0.158 -135 Q 0.153 -136 P 0.146 -137 V 0.141 -138 T 0.138 -139 A 0.135 -140 L 0.127 -141 P 0.114 -142 P 0.104 -143 L 0.101 -144 W 0.110 -145 V 0.132 -146 R 0.169 -147 C 0.219 -148 D 0.270 -149 G 0.303 -150 S 0.305 -151 D 0.281 -152 P 0.243 -153 E 0.202 -154 G 0.166 -155 T 0.136 -156 C 0.115 -157 W 0.103 -158 L 0.097 -159 G 0.092 -160 A 0.085 -161 E 0.075 -162 L 0.065 -163 I 0.057 -164 T 0.056 -165 T 0.060 -166 N 0.065 -167 D 0.066 -168 I 0.063 -169 I 0.059 -170 A 0.057 -171 G 0.057 -172 V 0.056 -173 I 0.053 -174 L 0.050 -175 Y 0.050 -176 V 0.052 -177 L 0.060 -178 T 0.073 -179 C 0.094 -180 K 0.118 -181 A 0.142 -182 D 0.166 -183 K 0.195 -184 N 0.224 -185 Y 0.243 -186 S 0.245 -187 E 0.236 -188 D 0.225 -189 L 0.219 -190 E 0.224 -191 N 0.236 -192 L 0.250 -193 K 0.268 -194 T 0.289 -195 S 0.301 -196 H 0.292 -197 K 0.270 -198 K 0.245 -199 R 0.226 -200 H 0.214 -201 H 0.204 -202 V 0.193 -203 S 0.179 -204 A 0.164 -205 V 0.154 -206 T 0.150 -207 A 0.152 -208 R 0.157 -209 G 0.161 -210 F 0.160 -211 A 0.153 -212 Q 0.148 -213 Y 0.154 -214 E 0.176 -215 L 0.214 -216 F 0.272 -217 K 0.356 -218 S 0.452 -219 D 0.532 -220 D 0.582 -221 L 0.600 -222 D 0.593 -223 D 0.572 -224 T 0.552 -225 V 0.545 -226 A 0.549 -227 P 0.543 -228 S 0.500 -229 Q 0.417 -230 T 0.328 -231 T 0.267 -232 V 0.241 -233 T 0.228 -234 L 0.207 -235 D 0.175 -236 L 0.143 -237 S 0.122 -238 W 0.121 -239 S 0.145 -240 P 0.183 -241 V 0.219 -242 D 0.241 -243 E 0.248 -244 M 0.242 -245 L 0.232 -246 Q 0.228 -247 T 0.242 -248 P 0.274 -249 P 0.319 -250 L 0.370 -251 S 0.412 -252 S 0.418 -253 T 0.385 -254 A 0.345 -255 A 0.324 -256 L 0.314 -257 N 0.296 -258 I 0.269 -259 R 0.251 -260 V 0.255 -261 Q 0.272 -262 S 0.290 -263 G 0.304 -264 E 0.307 -265 S 0.289 -266 R 0.255 -267 G 0.218 -268 C 0.183 -269 L 0.148 -270 S 0.115 -271 H 0.091 -272 L 0.076 -273 H 0.065 -274 R 0.056 -275 E 0.049 -276 L 0.044 -277 K 0.038 -278 F 0.032 -279 L 0.027 -280 L 0.025 -281 V 0.028 -282 L 0.034 -283 A 0.043 -284 D 0.054 -285 G 0.065 -286 I 0.075 -287 R 0.085 -288 T 0.098 -289 G 0.105 -290 V 0.102 -291 T 0.093 -292 E 0.088 -293 W 0.090 -294 L 0.096 -295 E 0.102 -296 P 0.104 -297 L 0.105 -298 E 0.109 -299 T 0.110 -300 K 0.100 -301 S 0.082 -302 A 0.071 -303 L 0.071 -304 E 0.072 -305 F 0.064 -306 V 0.052 -307 Q 0.045 -308 E 0.046 -309 F 0.057 -310 L 0.076 -311 N 0.097 -312 D 0.117 -313 L 0.143 -314 N 0.178 -315 K 0.221 -316 L 0.272 -317 D 0.331 -318 E 0.392 -319 F 0.443 -320 D 0.474 -321 D 0.479 -322 S 0.468 -323 T 0.464 -324 K 0.482 -325 K 0.511 -326 D 0.535 -327 K 0.550 -328 Q 0.552 -329 K 0.532 -330 E 0.492 -331 A 0.447 -332 V 0.397 -333 N 0.335 -334 H 0.258 -335 D 0.181 -336 A 0.119 -337 A 0.079 -338 A 0.059 -339 V 0.048 -340 V 0.044 -341 R 0.043 -342 S 0.043 -343 M 0.044 -344 L 0.049 -345 L 0.059 -346 T 0.073 -347 V 0.093 -348 R 0.115 -349 G 0.127 -350 D 0.120 -351 L 0.095 -352 D 0.067 -353 F 0.045 -354 A 0.032 -355 E 0.026 -356 Q 0.023 -357 L 0.023 -358 W 0.026 -359 C 0.032 -360 R 0.041 -361 M 0.052 -362 S 0.062 -363 S 0.067 -364 S 0.066 -365 V 0.058 -366 V 0.047 -367 S 0.038 -368 Y 0.031 -369 Q 0.026 -370 D 0.022 -371 L 0.021 -372 V 0.020 -373 K 0.018 -374 C 0.017 -375 F 0.016 -376 T 0.018 -377 L 0.022 -378 I 0.033 -379 L 0.049 -380 Q 0.060 -381 S 0.061 -382 L 0.059 -383 Q 0.067 -384 R 0.084 -385 G 0.101 -386 D 0.107 -387 I 0.105 -388 Q 0.103 -389 P 0.104 -390 W 0.111 -391 L 0.128 -392 H 0.156 -393 S 0.194 -394 G 0.227 -395 S 0.237 -396 N 0.217 -397 S 0.176 -398 L 0.129 -399 L 0.092 -400 S 0.075 -401 K 0.075 -402 L 0.086 -403 I 0.102 -404 H 0.120 -405 Q 0.140 -406 S 0.173 -407 Y 0.223 -408 H 0.285 -409 G 0.335 -410 A 0.357 -411 M 0.352 -412 D 0.342 -413 S 0.338 -414 V 0.338 -415 P 0.329 -416 L 0.310 -417 S 0.284 -418 G 0.247 -419 T 0.198 -420 T 0.144 -421 P 0.101 -422 L 0.074 -423 Q 0.058 -424 M 0.049 -425 L 0.045 -426 L 0.046 -427 E 0.050 -428 I 0.052 -429 G 0.053 -430 L 0.053 -431 D 0.051 -432 K 0.047 -433 L 0.044 -434 K 0.043 -435 K 0.041 -436 D 0.035 -437 Y 0.031 -438 I 0.032 -439 S 0.039 -440 F 0.050 -441 F 0.061 -442 V 0.072 -443 S 0.086 -444 Q 0.102 -445 E 0.115 -446 L 0.124 -447 A 0.135 -448 S 0.146 -449 L 0.146 -450 N 0.135 -451 H 0.126 -452 L 0.126 -453 E 0.132 -454 Y 0.145 -455 F 0.169 -456 I 0.202 -457 S 0.235 -458 P 0.256 -459 S 0.259 -460 V 0.241 -461 S 0.213 -462 T 0.184 -463 Q 0.162 -464 E 0.145 -465 Q 0.131 -466 V 0.117 -467 C 0.106 -468 R 0.102 -469 V 0.099 -470 Q 0.092 -471 K 0.082 -472 L 0.072 -473 H 0.060 -474 H 0.049 -475 I 0.041 -476 L 0.036 -477 E 0.031 -478 I 0.026 -479 L 0.023 -480 V 0.022 -481 I 0.024 -482 C 0.028 -483 M 0.033 -484 L 0.040 -485 F 0.047 -486 I 0.055 -487 K 0.063 -488 P 0.068 -489 Q 0.069 -490 H 0.063 -491 E 0.056 -492 L 0.050 -493 L 0.049 -494 F 0.050 -495 S 0.051 -496 L 0.049 -497 T 0.047 -498 Q 0.046 -499 S 0.048 -500 C 0.056 -501 I 0.072 -502 K 0.085 -503 Y 0.091 -504 Y 0.097 -505 K 0.116 -506 Q 0.152 -507 N 0.192 -508 P 0.216 -509 L 0.222 -510 D 0.219 -511 E 0.214 -512 Q 0.209 -513 H 0.209 -514 I 0.216 -515 F 0.226 -516 Q 0.241 -517 L 0.263 -518 P 0.289 -519 V 0.320 -520 R 0.359 -521 P 0.409 -522 A 0.456 -523 A 0.493 -524 V 0.524 -525 K 0.545 -526 N 0.543 -527 L 0.516 -528 Y 0.483 -529 Q 0.464 -530 S 0.464 -531 E 0.476 -532 K 0.493 -533 P 0.511 -534 Q 0.523 -535 K 0.532 -536 W 0.546 -537 R 0.578 -538 V 0.621 -539 E 0.652 -540 L 0.652 -541 S 0.638 -542 N 0.631 -543 S 0.634 -544 Q 0.636 -545 K 0.634 -546 R 0.627 -547 V 0.611 -548 K 0.580 -549 T 0.539 -550 V 0.508 -551 W 0.504 -552 Q 0.523 -553 L 0.550 -554 S 0.568 -555 D 0.570 -556 S 0.568 -557 S 0.578 -558 P 0.599 -559 V 0.616 -560 D 0.619 -561 H 0.611 -562 S 0.590 -563 S 0.550 -564 F 0.498 -565 H 0.452 -566 R 0.422 -567 P 0.412 -568 E 0.417 -569 F 0.426 -570 P 0.418 -571 E 0.385 -572 L 0.339 -573 T 0.305 -574 L 0.292 -575 N 0.297 -576 G 0.307 -577 S 0.298 -578 L 0.266 -579 E 0.222 -580 E 0.184 -581 R 0.158 -582 T 0.143 -583 A 0.135 -584 F 0.132 -585 V 0.136 -586 N 0.145 -587 M 0.154 -588 L 0.158 -589 T 0.158 -590 C 0.155 -591 S 0.146 -592 Q 0.132 -593 V 0.121 -594 H 0.119 -595 F 0.125 -596 K 0.131 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032482.10_ENSMUST00000035058.10_GN:Cspg5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032482.10_ENSMUST00000035058.10_GN:Cspg5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 2af839537ba823f3c1f39eb91eb29a5b9f66abbd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032482.10_ENSMUST00000035058.10_GN:Cspg5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,567 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000032482.10|ENSMUST00000035058.10|GN:Cspg5|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.439 -2 G 0.482 -3 R 0.543 -4 A 0.599 -5 G 0.641 -6 G 0.668 -7 G 0.682 -8 G 0.681 -9 P 0.659 -10 D 0.622 -11 W 0.588 -12 G 0.572 -13 P 0.576 -14 P 0.586 -15 P 0.570 -16 V 0.510 -17 L 0.428 -18 L 0.373 -19 L 0.374 -20 L 0.421 -21 G 0.470 -22 V 0.493 -23 T 0.497 -24 L 0.497 -25 V 0.508 -26 L 0.541 -27 T 0.599 -28 A 0.660 -29 G 0.698 -30 A 0.712 -31 V 0.722 -32 P 0.738 -33 A 0.758 -34 R 0.773 -35 E 0.783 -36 T 0.791 -37 G 0.795 -38 S 0.793 -39 A 0.783 -40 I 0.771 -41 E 0.755 -42 A 0.724 -43 E 0.670 -44 E 0.601 -45 L 0.532 -46 V 0.482 -47 R 0.476 -48 S 0.517 -49 S 0.564 -50 L 0.583 -51 A 0.589 -52 W 0.607 -53 E 0.637 -54 S 0.662 -55 R 0.679 -56 A 0.694 -57 N 0.713 -58 D 0.737 -59 T 0.756 -60 R 0.764 -61 E 0.766 -62 E 0.766 -63 A 0.763 -64 G 0.758 -65 L 0.755 -66 P 0.759 -67 A 0.774 -68 A 0.794 -69 G 0.808 -70 E 0.811 -71 D 0.805 -72 E 0.797 -73 T 0.785 -74 S 0.760 -75 W 0.712 -76 T 0.654 -77 E 0.632 -78 R 0.672 -79 G 0.742 -80 S 0.792 -81 E 0.818 -82 M 0.833 -83 A 0.839 -84 A 0.836 -85 V 0.824 -86 G 0.816 -87 P 0.816 -88 G 0.822 -89 V 0.823 -90 G 0.822 -91 P 0.822 -92 E 0.826 -93 E 0.829 -94 A 0.829 -95 L 0.829 -96 E 0.832 -97 A 0.837 -98 S 0.837 -99 A 0.833 -100 A 0.830 -101 V 0.830 -102 T 0.830 -103 G 0.829 -104 T 0.824 -105 A 0.818 -106 W 0.814 -107 L 0.816 -108 E 0.820 -109 A 0.817 -110 D 0.807 -111 G 0.799 -112 P 0.805 -113 G 0.822 -114 L 0.840 -115 G 0.855 -116 G 0.865 -117 V 0.867 -118 T 0.864 -119 A 0.859 -120 E 0.854 -121 A 0.849 -122 G 0.844 -123 S 0.836 -124 G 0.814 -125 D 0.763 -126 A 0.690 -127 Q 0.642 -128 T 0.660 -129 L 0.716 -130 P 0.762 -131 A 0.771 -132 T 0.736 -133 L 0.674 -134 Q 0.641 -135 A 0.677 -136 P 0.747 -137 D 0.800 -138 E 0.827 -139 A 0.837 -140 L 0.838 -141 G 0.834 -142 S 0.826 -143 S 0.810 -144 T 0.788 -145 M 0.771 -146 P 0.770 -147 P 0.779 -148 A 0.786 -149 I 0.792 -150 P 0.803 -151 E 0.815 -152 A 0.821 -153 T 0.821 -154 E 0.819 -155 T 0.816 -156 S 0.808 -157 G 0.799 -158 P 0.796 -159 P 0.801 -160 S 0.814 -161 P 0.828 -162 A 0.837 -163 V 0.838 -164 H 0.834 -165 D 0.828 -166 K 0.824 -167 P 0.825 -168 S 0.830 -169 V 0.833 -170 G 0.830 -171 P 0.821 -172 E 0.814 -173 L 0.810 -174 P 0.811 -175 K 0.810 -176 E 0.803 -177 I 0.798 -178 P 0.802 -179 L 0.812 -180 E 0.819 -181 V 0.821 -182 R 0.820 -183 L 0.821 -184 N 0.826 -185 L 0.833 -186 G 0.837 -187 G 0.830 -188 S 0.813 -189 T 0.798 -190 P 0.796 -191 E 0.802 -192 P 0.805 -193 T 0.804 -194 F 0.806 -195 P 0.820 -196 L 0.841 -197 Q 0.859 -198 G 0.867 -199 T 0.863 -200 L 0.852 -201 E 0.842 -202 T 0.835 -203 Q 0.830 -204 P 0.829 -205 A 0.829 -206 S 0.827 -207 D 0.820 -208 I 0.812 -209 I 0.806 -210 D 0.799 -211 I 0.789 -212 D 0.774 -213 Y 0.764 -214 F 0.768 -215 E 0.785 -216 G 0.802 -217 L 0.810 -218 D 0.811 -219 S 0.811 -220 E 0.813 -221 G 0.820 -222 R 0.829 -223 G 0.836 -224 A 0.837 -225 D 0.832 -226 M 0.823 -227 G 0.811 -228 S 0.799 -229 F 0.793 -230 P 0.799 -231 G 0.810 -232 S 0.823 -233 P 0.834 -234 G 0.840 -235 T 0.837 -236 S 0.829 -237 E 0.817 -238 N 0.804 -239 H 0.799 -240 P 0.805 -241 D 0.819 -242 T 0.828 -243 E 0.827 -244 G 0.815 -245 E 0.795 -246 T 0.773 -247 P 0.751 -248 S 0.728 -249 W 0.705 -250 S 0.686 -251 L 0.674 -252 L 0.672 -253 D 0.679 -254 L 0.686 -255 Y 0.695 -256 D 0.702 -257 D 0.701 -258 F 0.696 -259 T 0.702 -260 P 0.718 -261 F 0.730 -262 D 0.732 -263 E 0.723 -264 S 0.709 -265 D 0.693 -266 F 0.683 -267 Y 0.688 -268 P 0.707 -269 T 0.725 -270 T 0.727 -271 S 0.717 -272 F 0.709 -273 Y 0.714 -274 D 0.723 -275 D 0.716 -276 L 0.678 -277 E 0.623 -278 E 0.600 -279 E 0.636 -280 E 0.696 -281 E 0.735 -282 E 0.752 -283 E 0.762 -284 E 0.774 -285 D 0.785 -286 K 0.791 -287 D 0.795 -288 T 0.798 -289 V 0.802 -290 G 0.807 -291 G 0.811 -292 G 0.811 -293 D 0.805 -294 L 0.796 -295 E 0.790 -296 D 0.785 -297 E 0.779 -298 N 0.771 -299 D 0.760 -300 L 0.749 -301 L 0.746 -302 L 0.756 -303 P 0.773 -304 S 0.787 -305 Q 0.797 -306 K 0.811 -307 P 0.828 -308 G 0.840 -309 V 0.844 -310 G 0.844 -311 P 0.843 -312 G 0.841 -313 T 0.834 -314 G 0.823 -315 Q 0.813 -316 P 0.812 -317 T 0.815 -318 N 0.810 -319 R 0.793 -320 W 0.775 -321 H 0.760 -322 A 0.744 -323 V 0.726 -324 P 0.723 -325 P 0.737 -326 Q 0.759 -327 H 0.781 -328 T 0.803 -329 L 0.818 -330 G 0.815 -331 M 0.798 -332 V 0.781 -333 P 0.772 -334 G 0.763 -335 S 0.743 -336 S 0.715 -337 I 0.693 -338 S 0.681 -339 L 0.668 -340 R 0.652 -341 P 0.644 -342 R 0.656 -343 P 0.680 -344 G 0.702 -345 D 0.714 -346 P 0.725 -347 G 0.744 -348 K 0.771 -349 D 0.791 -350 L 0.797 -351 A 0.788 -352 S 0.768 -353 G 0.735 -354 E 0.679 -355 N 0.592 -356 G 0.478 -357 T 0.360 -358 E 0.267 -359 C 0.208 -360 R 0.174 -361 V 0.151 -362 G 0.136 -363 F 0.130 -364 V 0.130 -365 R 0.131 -366 H 0.130 -367 N 0.131 -368 G 0.133 -369 S 0.130 -370 C 0.114 -371 R 0.090 -372 S 0.069 -373 V 0.062 -374 C 0.067 -375 D 0.077 -376 L 0.085 -377 F 0.088 -378 P 0.088 -379 S 0.085 -380 Y 0.079 -381 C 0.078 -382 H 0.087 -383 N 0.102 -384 G 0.112 -385 G 0.112 -386 Q 0.107 -387 C 0.101 -388 Y 0.092 -389 L 0.080 -390 V 0.072 -391 E 0.073 -392 N 0.078 -393 I 0.076 -394 G 0.068 -395 A 0.061 -396 F 0.061 -397 C 0.071 -398 R 0.089 -399 C 0.109 -400 N 0.127 -401 T 0.141 -402 Q 0.152 -403 D 0.162 -404 Y 0.171 -405 I 0.180 -406 W 0.186 -407 H 0.184 -408 K 0.169 -409 G 0.152 -410 M 0.146 -411 R 0.157 -412 C 0.180 -413 E 0.216 -414 S 0.261 -415 I 0.299 -416 I 0.313 -417 T 0.305 -418 D 0.287 -419 F 0.263 -420 Q 0.238 -421 V 0.215 -422 M 0.196 -423 C 0.186 -424 V 0.188 -425 A 0.202 -426 V 0.221 -427 G 0.239 -428 S 0.251 -429 A 0.248 -430 A 0.229 -431 L 0.206 -432 V 0.192 -433 L 0.186 -434 L 0.179 -435 L 0.163 -436 L 0.143 -437 F 0.126 -438 M 0.113 -439 M 0.097 -440 T 0.078 -441 V 0.065 -442 F 0.064 -443 F 0.077 -444 A 0.098 -445 K 0.120 -446 K 0.139 -447 L 0.155 -448 Y 0.174 -449 L 0.203 -450 L 0.241 -451 K 0.278 -452 T 0.314 -453 E 0.344 -454 N 0.357 -455 T 0.357 -456 K 0.360 -457 L 0.375 -458 R 0.397 -459 R 0.427 -460 T 0.470 -461 N 0.517 -462 K 0.554 -463 F 0.581 -464 R 0.608 -465 T 0.642 -466 P 0.680 -467 S 0.716 -468 E 0.742 -469 L 0.756 -470 H 0.761 -471 N 0.765 -472 D 0.766 -473 N 0.762 -474 F 0.756 -475 S 0.761 -476 L 0.781 -477 S 0.807 -478 T 0.828 -479 I 0.839 -480 A 0.840 -481 E 0.830 -482 G 0.812 -483 S 0.793 -484 H 0.787 -485 P 0.800 -486 N 0.819 -487 V 0.833 -488 R 0.839 -489 K 0.839 -490 F 0.836 -491 C 0.830 -492 D 0.823 -493 T 0.820 -494 P 0.822 -495 R 0.825 -496 V 0.821 -497 S 0.805 -498 S 0.788 -499 P 0.781 -500 H 0.785 -501 A 0.787 -502 R 0.773 -503 A 0.753 -504 L 0.748 -505 A 0.757 -506 H 0.762 -507 Y 0.766 -508 D 0.773 -509 N 0.779 -510 I 0.779 -511 V 0.779 -512 C 0.784 -513 Q 0.783 -514 D 0.771 -515 D 0.752 -516 P 0.736 -517 S 0.736 -518 A 0.751 -519 P 0.775 -520 H 0.798 -521 K 0.810 -522 I 0.804 -523 Q 0.781 -524 D 0.752 -525 P 0.729 -526 L 0.726 -527 K 0.741 -528 S 0.761 -529 R 0.775 -530 L 0.783 -531 K 0.788 -532 E 0.789 -533 E 0.784 -534 E 0.777 -535 S 0.775 -536 F 0.780 -537 N 0.788 -538 I 0.794 -539 Q 0.794 -540 N 0.786 -541 S 0.765 -542 M 0.744 -543 S 0.741 -544 P 0.759 -545 K 0.782 -546 L 0.799 -547 E 0.807 -548 G 0.812 -549 G 0.818 -550 K 0.823 -551 G 0.825 -552 D 0.823 -553 Q 0.818 -554 D 0.811 -555 D 0.804 -556 L 0.799 -557 G 0.796 -558 V 0.794 -559 N 0.788 -560 C 0.776 -561 L 0.763 -562 Q 0.744 -563 N 0.698 -564 N 0.601 -565 L 0.472 -566 T 0.376 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032482.10_ENSMUST00000035058.10_GN:Cspg5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:223.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032482.10_ENSMUST00000035058.10_GN:Cspg5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:223.caid deleted file mode 100644 index 7ecdfe7402388add10d600d491a01ab5ebf6bf38..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032482.10_ENSMUST00000035058.10_GN:Cspg5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:223.caid +++ /dev/null @@ -1,790 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000032482.10|ENSMUST00000035058.10|GN:Cspg5|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:223 -1 M 0.391 -2 F 0.430 -3 S 0.480 -4 L 0.522 -5 L 0.557 -6 S 0.596 -7 G 0.635 -8 R 0.662 -9 R 0.675 -10 L 0.683 -11 R 0.697 -12 V 0.702 -13 G 0.684 -14 L 0.655 -15 E 0.638 -16 N 0.629 -17 L 0.615 -18 L 0.611 -19 D 0.628 -20 T 0.648 -21 E 0.656 -22 F 0.660 -23 W 0.676 -24 I 0.705 -25 G 0.737 -26 T 0.756 -27 G 0.760 -28 Q 0.757 -29 S 0.750 -30 V 0.744 -31 P 0.743 -32 R 0.748 -33 A 0.753 -34 P 0.753 -35 L 0.752 -36 S 0.753 -37 P 0.755 -38 H 0.759 -39 W 0.772 -40 G 0.790 -41 R 0.797 -42 G 0.782 -43 L 0.757 -44 P 0.746 -45 P 0.760 -46 P 0.786 -47 V 0.800 -48 A 0.794 -49 L 0.776 -50 P 0.760 -51 S 0.751 -52 P 0.739 -53 A 0.706 -54 P 0.656 -55 S 0.636 -56 L 0.680 -57 R 0.754 -58 V 0.802 -59 S 0.819 -60 E 0.825 -61 P 0.829 -62 A 0.822 -63 T 0.803 -64 S 0.778 -65 P 0.768 -66 P 0.781 -67 P 0.807 -68 L 0.832 -69 R 0.848 -70 A 0.853 -71 R 0.850 -72 G 0.839 -73 G 0.822 -74 W 0.806 -75 V 0.797 -76 P 0.797 -77 R 0.799 -78 R 0.801 -79 S 0.799 -80 A 0.794 -81 A 0.783 -82 Q 0.757 -83 R 0.704 -84 A 0.629 -85 Q 0.578 -86 H 0.589 -87 W 0.642 -88 K 0.692 -89 R 0.721 -90 K 0.733 -91 R 0.742 -92 A 0.755 -93 P 0.775 -94 W 0.799 -95 A 0.820 -96 A 0.830 -97 A 0.826 -98 G 0.815 -99 A 0.808 -100 P 0.805 -101 V 0.802 -102 G 0.793 -103 F 0.782 -104 P 0.772 -105 Q 0.764 -106 W 0.755 -107 L 0.747 -108 C 0.737 -109 C 0.732 -110 R 0.737 -111 P 0.747 -112 C 0.758 -113 A 0.766 -114 P 0.775 -115 R 0.783 -116 L 0.787 -117 H 0.785 -118 R 0.780 -119 S 0.776 -120 P 0.778 -121 R 0.784 -122 P 0.792 -123 V 0.800 -124 P 0.809 -125 E 0.819 -126 G 0.823 -127 S 0.819 -128 D 0.808 -129 C 0.797 -130 P 0.794 -131 L 0.800 -132 A 0.807 -133 R 0.806 -134 K 0.798 -135 T 0.786 -136 E 0.773 -137 R 0.755 -138 G 0.719 -139 R 0.671 -140 R 0.647 -141 Q 0.673 -142 R 0.723 -143 D 0.759 -144 V 0.773 -145 L 0.777 -146 R 0.783 -147 G 0.792 -148 G 0.802 -149 R 0.811 -150 S 0.818 -151 G 0.824 -152 G 0.826 -153 G 0.824 -154 A 0.818 -155 E 0.810 -156 R 0.800 -157 G 0.786 -158 S 0.760 -159 G 0.709 -160 K 0.641 -161 R 0.598 -162 Q 0.605 -163 R 0.618 -164 R 0.603 -165 R 0.599 -166 G 0.648 -167 R 0.726 -168 R 0.785 -169 G 0.815 -170 G 0.827 -171 A 0.831 -172 A 0.831 -173 L 0.831 -174 G 0.833 -175 G 0.836 -176 Q 0.841 -177 R 0.846 -178 L 0.851 -179 T 0.855 -180 A 0.856 -181 A 0.856 -182 C 0.853 -183 G 0.849 -184 G 0.841 -185 S 0.824 -186 C 0.799 -187 C 0.777 -188 P 0.767 -189 P 0.772 -190 W 0.788 -191 A 0.806 -192 E 0.817 -193 A 0.817 -194 A 0.811 -195 A 0.808 -196 H 0.811 -197 G 0.816 -198 R 0.818 -199 Q 0.813 -200 A 0.800 -201 Q 0.782 -202 R 0.770 -203 P 0.770 -204 G 0.780 -205 K 0.792 -206 P 0.801 -207 R 0.805 -208 A 0.804 -209 Q 0.801 -210 P 0.802 -211 S 0.804 -212 R 0.792 -213 A 0.747 -214 H 0.678 -215 R 0.638 -216 A 0.654 -217 Q 0.686 -218 R 0.690 -219 Q 0.688 -220 G 0.711 -221 L 0.748 -222 R 0.776 -223 A 0.793 -224 M 0.804 -225 G 0.812 -226 R 0.819 -227 A 0.822 -228 G 0.823 -229 G 0.820 -230 G 0.813 -231 G 0.799 -232 P 0.781 -233 D 0.760 -234 W 0.737 -235 G 0.718 -236 P 0.712 -237 P 0.723 -238 P 0.735 -239 V 0.732 -240 L 0.715 -241 L 0.704 -242 L 0.708 -243 L 0.720 -244 G 0.722 -245 V 0.711 -246 T 0.695 -247 L 0.677 -248 V 0.660 -249 L 0.657 -250 T 0.678 -251 A 0.713 -252 G 0.741 -253 A 0.758 -254 V 0.771 -255 P 0.788 -256 A 0.807 -257 R 0.821 -258 E 0.826 -259 T 0.826 -260 G 0.824 -261 S 0.821 -262 A 0.817 -263 I 0.809 -264 E 0.793 -265 A 0.764 -266 E 0.717 -267 E 0.658 -268 L 0.603 -269 V 0.568 -270 R 0.560 -271 S 0.572 -272 S 0.585 -273 L 0.588 -274 A 0.586 -275 W 0.598 -276 E 0.623 -277 S 0.647 -278 R 0.665 -279 A 0.682 -280 N 0.704 -281 D 0.724 -282 T 0.735 -283 R 0.738 -284 E 0.738 -285 E 0.740 -286 A 0.737 -287 G 0.731 -288 L 0.728 -289 P 0.736 -290 A 0.756 -291 A 0.780 -292 G 0.797 -293 E 0.799 -294 D 0.793 -295 E 0.782 -296 T 0.769 -297 S 0.744 -298 W 0.697 -299 T 0.641 -300 E 0.621 -301 R 0.663 -302 G 0.733 -303 S 0.785 -304 E 0.811 -305 M 0.826 -306 A 0.834 -307 A 0.832 -308 V 0.822 -309 G 0.815 -310 P 0.818 -311 G 0.825 -312 V 0.826 -313 G 0.825 -314 P 0.826 -315 E 0.831 -316 E 0.836 -317 A 0.835 -318 L 0.831 -319 E 0.831 -320 A 0.834 -321 S 0.834 -322 A 0.832 -323 A 0.831 -324 V 0.834 -325 T 0.836 -326 G 0.835 -327 T 0.833 -328 A 0.830 -329 W 0.829 -330 L 0.835 -331 E 0.844 -332 A 0.847 -333 D 0.841 -334 G 0.836 -335 P 0.841 -336 G 0.854 -337 L 0.869 -338 G 0.880 -339 G 0.888 -340 V 0.889 -341 T 0.886 -342 A 0.880 -343 E 0.874 -344 A 0.870 -345 G 0.865 -346 S 0.856 -347 G 0.837 -348 D 0.791 -349 A 0.723 -350 Q 0.679 -351 T 0.692 -352 L 0.742 -353 P 0.784 -354 A 0.792 -355 T 0.755 -356 L 0.689 -357 Q 0.654 -358 A 0.691 -359 P 0.764 -360 D 0.820 -361 E 0.847 -362 A 0.858 -363 L 0.859 -364 G 0.856 -365 S 0.848 -366 S 0.834 -367 T 0.815 -368 M 0.799 -369 P 0.796 -370 P 0.800 -371 A 0.804 -372 I 0.805 -373 P 0.810 -374 E 0.818 -375 A 0.820 -376 T 0.819 -377 E 0.818 -378 T 0.815 -379 S 0.809 -380 G 0.802 -381 P 0.800 -382 P 0.805 -383 S 0.814 -384 P 0.824 -385 A 0.831 -386 V 0.831 -387 H 0.827 -388 D 0.821 -389 K 0.818 -390 P 0.821 -391 S 0.826 -392 V 0.829 -393 G 0.827 -394 P 0.821 -395 E 0.814 -396 L 0.810 -397 P 0.809 -398 K 0.807 -399 E 0.801 -400 I 0.796 -401 P 0.800 -402 L 0.807 -403 E 0.811 -404 V 0.808 -405 R 0.805 -406 L 0.805 -407 N 0.812 -408 L 0.822 -409 G 0.830 -410 G 0.829 -411 S 0.817 -412 T 0.806 -413 P 0.805 -414 E 0.811 -415 P 0.812 -416 T 0.808 -417 F 0.807 -418 P 0.816 -419 L 0.833 -420 Q 0.850 -421 G 0.857 -422 T 0.852 -423 L 0.842 -424 E 0.834 -425 T 0.829 -426 Q 0.828 -427 P 0.830 -428 A 0.832 -429 S 0.828 -430 D 0.819 -431 I 0.809 -432 I 0.801 -433 D 0.792 -434 I 0.777 -435 D 0.756 -436 Y 0.740 -437 F 0.742 -438 E 0.760 -439 G 0.779 -440 L 0.789 -441 D 0.793 -442 S 0.795 -443 E 0.799 -444 G 0.805 -445 R 0.815 -446 G 0.824 -447 A 0.828 -448 D 0.824 -449 M 0.815 -450 G 0.804 -451 S 0.792 -452 F 0.788 -453 P 0.796 -454 G 0.810 -455 S 0.823 -456 P 0.833 -457 G 0.838 -458 T 0.837 -459 S 0.830 -460 E 0.821 -461 N 0.811 -462 H 0.807 -463 P 0.814 -464 D 0.827 -465 T 0.835 -466 E 0.834 -467 G 0.823 -468 E 0.805 -469 T 0.785 -470 P 0.765 -471 S 0.744 -472 W 0.725 -473 S 0.710 -474 L 0.700 -475 L 0.696 -476 D 0.697 -477 L 0.698 -478 Y 0.703 -479 D 0.709 -480 D 0.707 -481 F 0.703 -482 T 0.713 -483 P 0.734 -484 F 0.751 -485 D 0.755 -486 E 0.746 -487 S 0.730 -488 D 0.712 -489 F 0.700 -490 Y 0.706 -491 P 0.727 -492 T 0.747 -493 T 0.748 -494 S 0.734 -495 F 0.721 -496 Y 0.723 -497 D 0.732 -498 D 0.725 -499 L 0.687 -500 E 0.633 -501 E 0.612 -502 E 0.647 -503 E 0.702 -504 E 0.737 -505 E 0.753 -506 E 0.766 -507 E 0.782 -508 D 0.796 -509 K 0.806 -510 D 0.812 -511 T 0.815 -512 V 0.817 -513 G 0.819 -514 G 0.821 -515 G 0.820 -516 D 0.815 -517 L 0.807 -518 E 0.801 -519 D 0.796 -520 E 0.791 -521 N 0.784 -522 D 0.772 -523 L 0.759 -524 L 0.753 -525 L 0.763 -526 P 0.782 -527 S 0.799 -528 Q 0.810 -529 K 0.824 -530 P 0.841 -531 G 0.854 -532 V 0.859 -533 G 0.857 -534 P 0.857 -535 G 0.855 -536 T 0.849 -537 G 0.838 -538 Q 0.828 -539 P 0.827 -540 T 0.832 -541 N 0.829 -542 R 0.816 -543 W 0.801 -544 H 0.789 -545 A 0.774 -546 V 0.758 -547 P 0.757 -548 P 0.776 -549 Q 0.801 -550 H 0.821 -551 T 0.836 -552 L 0.844 -553 G 0.839 -554 M 0.823 -555 V 0.810 -556 P 0.805 -557 G 0.800 -558 S 0.784 -559 S 0.756 -560 I 0.729 -561 S 0.712 -562 L 0.698 -563 R 0.683 -564 P 0.677 -565 R 0.689 -566 P 0.708 -567 G 0.720 -568 D 0.721 -569 P 0.723 -570 G 0.738 -571 K 0.767 -572 D 0.792 -573 L 0.801 -574 A 0.796 -575 S 0.780 -576 G 0.754 -577 E 0.710 -578 N 0.634 -579 G 0.522 -580 T 0.396 -581 E 0.290 -582 C 0.221 -583 R 0.183 -584 V 0.161 -585 G 0.147 -586 F 0.140 -587 V 0.140 -588 R 0.141 -589 H 0.140 -590 N 0.139 -591 G 0.140 -592 S 0.136 -593 C 0.122 -594 R 0.098 -595 S 0.077 -596 V 0.070 -597 C 0.076 -598 D 0.086 -599 L 0.093 -600 F 0.095 -601 P 0.096 -602 S 0.094 -603 Y 0.089 -604 C 0.088 -605 H 0.097 -606 N 0.114 -607 G 0.126 -608 G 0.125 -609 Q 0.119 -610 C 0.112 -611 Y 0.101 -612 L 0.089 -613 V 0.084 -614 E 0.089 -615 N 0.098 -616 I 0.097 -617 G 0.087 -618 A 0.077 -619 F 0.076 -620 C 0.084 -621 R 0.100 -622 C 0.120 -623 N 0.136 -624 T 0.148 -625 Q 0.159 -626 D 0.168 -627 Y 0.179 -628 I 0.191 -629 W 0.201 -630 H 0.204 -631 K 0.192 -632 G 0.176 -633 M 0.173 -634 R 0.189 -635 C 0.219 -636 E 0.263 -637 S 0.315 -638 I 0.353 -639 I 0.364 -640 T 0.350 -641 D 0.324 -642 F 0.289 -643 Q 0.255 -644 V 0.228 -645 M 0.211 -646 C 0.206 -647 V 0.214 -648 A 0.233 -649 V 0.258 -650 G 0.285 -651 S 0.304 -652 A 0.301 -653 A 0.274 -654 L 0.239 -655 V 0.211 -656 L 0.191 -657 L 0.174 -658 L 0.158 -659 L 0.143 -660 F 0.132 -661 M 0.120 -662 M 0.105 -663 T 0.087 -664 V 0.074 -665 F 0.076 -666 F 0.094 -667 A 0.121 -668 K 0.146 -669 K 0.163 -670 L 0.176 -671 Y 0.196 -672 L 0.229 -673 L 0.272 -674 K 0.313 -675 T 0.351 -676 E 0.379 -677 N 0.388 -678 T 0.383 -679 K 0.381 -680 L 0.391 -681 R 0.413 -682 R 0.445 -683 T 0.485 -684 N 0.525 -685 K 0.552 -686 F 0.573 -687 R 0.599 -688 T 0.636 -689 P 0.678 -690 S 0.717 -691 E 0.745 -692 L 0.759 -693 H 0.765 -694 N 0.768 -695 D 0.766 -696 N 0.756 -697 F 0.747 -698 S 0.752 -699 L 0.776 -700 S 0.805 -701 T 0.826 -702 I 0.837 -703 A 0.838 -704 E 0.829 -705 G 0.810 -706 S 0.787 -707 H 0.778 -708 P 0.788 -709 N 0.807 -710 V 0.820 -711 R 0.824 -712 K 0.824 -713 F 0.821 -714 C 0.815 -715 D 0.809 -716 T 0.804 -717 P 0.807 -718 R 0.811 -719 V 0.808 -720 S 0.795 -721 S 0.779 -722 P 0.772 -723 H 0.778 -724 A 0.784 -725 R 0.779 -726 A 0.765 -727 L 0.757 -728 A 0.755 -729 H 0.752 -730 Y 0.750 -731 D 0.755 -732 N 0.758 -733 I 0.757 -734 V 0.758 -735 C 0.766 -736 Q 0.771 -737 D 0.764 -738 D 0.748 -739 P 0.733 -740 S 0.731 -741 A 0.745 -742 P 0.768 -743 H 0.790 -744 K 0.800 -745 I 0.793 -746 Q 0.769 -747 D 0.739 -748 P 0.717 -749 L 0.716 -750 K 0.733 -751 S 0.755 -752 R 0.769 -753 L 0.775 -754 K 0.778 -755 E 0.777 -756 E 0.773 -757 E 0.767 -758 S 0.766 -759 F 0.771 -760 N 0.780 -761 I 0.787 -762 Q 0.789 -763 N 0.781 -764 S 0.761 -765 M 0.740 -766 S 0.736 -767 P 0.752 -768 K 0.774 -769 L 0.788 -770 E 0.796 -771 G 0.801 -772 G 0.806 -773 K 0.810 -774 G 0.811 -775 D 0.808 -776 Q 0.803 -777 D 0.794 -778 D 0.784 -779 L 0.771 -780 G 0.759 -781 V 0.742 -782 N 0.718 -783 C 0.691 -784 L 0.668 -785 Q 0.645 -786 N 0.607 -787 N 0.537 -788 L 0.443 -789 T 0.372 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032484.9_ENSMUST00000035061.9_GN:Ngp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032484.9_ENSMUST00000035061.9_GN:Ngp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index b12a0b9cef0f116762985a5c1b2fcb71d089593e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032484.9_ENSMUST00000035061.9_GN:Ngp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,168 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000032484.9|ENSMUST00000035061.9|GN:Ngp|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.331 -2 A 0.324 -3 G 0.304 -4 L 0.270 -5 W 0.232 -6 K 0.205 -7 T 0.194 -8 F 0.194 -9 V 0.200 -10 L 0.216 -11 V 0.243 -12 V 0.270 -13 A 0.285 -14 L 0.295 -15 A 0.304 -16 V 0.306 -17 V 0.303 -18 S 0.301 -19 C 0.301 -20 E 0.299 -21 A 0.292 -22 L 0.275 -23 R 0.240 -24 Q 0.188 -25 L 0.128 -26 R 0.078 -27 Y 0.050 -28 E 0.036 -29 E 0.028 -30 I 0.023 -31 V 0.020 -32 D 0.018 -33 R 0.018 -34 A 0.018 -35 I 0.021 -36 E 0.025 -37 A 0.035 -38 Y 0.047 -39 N 0.057 -40 Q 0.063 -41 G 0.069 -42 R 0.078 -43 Q 0.085 -44 G 0.089 -45 R 0.092 -46 P 0.092 -47 L 0.082 -48 F 0.064 -49 R 0.048 -50 L 0.041 -51 L 0.040 -52 S 0.049 -53 A 0.069 -54 T 0.102 -55 P 0.141 -56 P 0.174 -57 S 0.190 -58 S 0.183 -59 Q 0.163 -60 N 0.141 -61 P 0.123 -62 A 0.113 -63 T 0.107 -64 N 0.099 -65 I 0.084 -66 P 0.067 -67 L 0.056 -68 Q 0.057 -69 F 0.062 -70 R 0.066 -71 I 0.070 -72 K 0.076 -73 E 0.084 -74 T 0.092 -75 E 0.098 -76 C 0.104 -77 T 0.108 -78 S 0.109 -79 T 0.111 -80 Q 0.118 -81 E 0.125 -82 R 0.125 -83 Q 0.120 -84 P 0.108 -85 K 0.092 -86 D 0.081 -87 C 0.077 -88 D 0.078 -89 F 0.081 -90 L 0.086 -91 E 0.095 -92 D 0.106 -93 G 0.111 -94 E 0.100 -95 E 0.077 -96 R 0.058 -97 N 0.047 -98 C 0.041 -99 T 0.036 -100 G 0.031 -101 K 0.029 -102 F 0.029 -103 F 0.033 -104 R 0.043 -105 R 0.054 -106 R 0.063 -107 Q 0.070 -108 S 0.075 -109 T 0.076 -110 S 0.073 -111 L 0.068 -112 T 0.063 -113 L 0.059 -114 T 0.060 -115 C 0.074 -116 D 0.109 -117 R 0.170 -118 D 0.252 -119 C 0.345 -120 S 0.438 -121 R 0.519 -122 E 0.582 -123 D 0.626 -124 T 0.654 -125 Q 0.670 -126 E 0.679 -127 T 0.681 -128 S 0.677 -129 F 0.672 -130 N 0.667 -131 D 0.661 -132 K 0.653 -133 Q 0.644 -134 D 0.633 -135 V 0.618 -136 S 0.602 -137 E 0.586 -138 K 0.566 -139 E 0.533 -140 K 0.485 -141 F 0.438 -142 E 0.406 -143 D 0.383 -144 V 0.360 -145 P 0.337 -146 P 0.318 -147 H 0.303 -148 I 0.293 -149 R 0.293 -150 N 0.297 -151 I 0.287 -152 Y 0.265 -153 E 0.255 -154 D 0.263 -155 A 0.278 -156 K 0.293 -157 Y 0.316 -158 D 0.343 -159 I 0.355 -160 I 0.352 -161 G 0.349 -162 N 0.347 -163 I 0.335 -164 L 0.317 -165 K 0.308 -166 N 0.308 -167 F 0.309 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032484.9_ENSMUST00000035061.9_GN:Ngp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:27.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032484.9_ENSMUST00000035061.9_GN:Ngp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:27.caid deleted file mode 100644 index 775f50f0902e32fc083d345ef61ddccd47ac24d4..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032484.9_ENSMUST00000035061.9_GN:Ngp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:27.caid +++ /dev/null @@ -1,195 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000032484.9|ENSMUST00000035061.9|GN:Ngp|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:27 -1 M 0.395 -2 S 0.439 -3 P 0.507 -4 A 0.570 -5 V 0.610 -6 L 0.631 -7 G 0.646 -8 Q 0.651 -9 G 0.631 -10 S 0.589 -11 L 0.542 -12 N 0.500 -13 I 0.470 -14 I 0.465 -15 Y 0.497 -16 I 0.553 -17 K 0.608 -18 G 0.651 -19 A 0.679 -20 K 0.696 -21 S 0.708 -22 G 0.715 -23 S 0.703 -24 V 0.658 -25 S 0.588 -26 E 0.536 -27 T 0.525 -28 M 0.526 -29 A 0.503 -30 G 0.447 -31 L 0.372 -32 W 0.310 -33 K 0.282 -34 T 0.281 -35 F 0.284 -36 V 0.288 -37 L 0.311 -38 V 0.346 -39 V 0.362 -40 A 0.349 -41 L 0.334 -42 A 0.330 -43 V 0.327 -44 V 0.320 -45 S 0.317 -46 C 0.315 -47 E 0.309 -48 A 0.294 -49 L 0.268 -50 R 0.227 -51 Q 0.173 -52 L 0.117 -53 R 0.073 -54 Y 0.047 -55 E 0.035 -56 E 0.027 -57 I 0.022 -58 V 0.019 -59 D 0.018 -60 R 0.017 -61 A 0.018 -62 I 0.020 -63 E 0.025 -64 A 0.035 -65 Y 0.047 -66 N 0.057 -67 Q 0.062 -68 G 0.067 -69 R 0.074 -70 Q 0.080 -71 G 0.083 -72 R 0.086 -73 P 0.086 -74 L 0.076 -75 F 0.060 -76 R 0.045 -77 L 0.037 -78 L 0.037 -79 S 0.044 -80 A 0.061 -81 T 0.091 -82 P 0.126 -83 P 0.158 -84 S 0.173 -85 S 0.169 -86 Q 0.151 -87 N 0.132 -88 P 0.116 -89 A 0.107 -90 T 0.103 -91 N 0.096 -92 I 0.082 -93 P 0.065 -94 L 0.055 -95 Q 0.056 -96 F 0.061 -97 R 0.064 -98 I 0.068 -99 K 0.074 -100 E 0.082 -101 T 0.089 -102 E 0.094 -103 C 0.098 -104 T 0.100 -105 S 0.100 -106 T 0.103 -107 Q 0.110 -108 E 0.118 -109 R 0.119 -110 Q 0.114 -111 P 0.104 -112 K 0.090 -113 D 0.080 -114 C 0.076 -115 D 0.076 -116 F 0.077 -117 L 0.081 -118 E 0.091 -119 D 0.104 -120 G 0.110 -121 E 0.099 -122 E 0.075 -123 R 0.055 -124 N 0.044 -125 C 0.039 -126 T 0.034 -127 G 0.030 -128 K 0.027 -129 F 0.028 -130 F 0.032 -131 R 0.040 -132 R 0.051 -133 R 0.060 -134 Q 0.067 -135 S 0.074 -136 T 0.079 -137 S 0.079 -138 L 0.074 -139 T 0.068 -140 L 0.061 -141 T 0.060 -142 C 0.073 -143 D 0.110 -144 R 0.173 -145 D 0.257 -146 C 0.350 -147 S 0.442 -148 R 0.523 -149 E 0.587 -150 D 0.633 -151 T 0.662 -152 Q 0.679 -153 E 0.688 -154 T 0.690 -155 S 0.685 -156 F 0.678 -157 N 0.672 -158 D 0.665 -159 K 0.657 -160 Q 0.648 -161 D 0.638 -162 V 0.624 -163 S 0.608 -164 E 0.593 -165 K 0.574 -166 E 0.542 -167 K 0.495 -168 F 0.449 -169 E 0.415 -170 D 0.389 -171 V 0.361 -172 P 0.336 -173 P 0.317 -174 H 0.303 -175 I 0.292 -176 R 0.291 -177 N 0.294 -178 I 0.285 -179 Y 0.265 -180 E 0.257 -181 D 0.267 -182 A 0.282 -183 K 0.298 -184 Y 0.321 -185 D 0.348 -186 I 0.362 -187 I 0.362 -188 G 0.362 -189 N 0.361 -190 I 0.347 -191 L 0.326 -192 K 0.313 -193 N 0.311 -194 F 0.311 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032515.9_ENSMUST00000215916.2_GN:Csrnp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032515.9_ENSMUST00000215916.2_GN:Csrnp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 1ec932c54040ab5e6883fcbe0199672b8b16a7e2..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032515.9_ENSMUST00000215916.2_GN:Csrnp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,584 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000032515.9|ENSMUST00000215916.2|GN:Csrnp1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.321 -2 T 0.333 -3 G 0.342 -4 L 0.333 -5 L 0.306 -6 K 0.281 -7 R 0.281 -8 K 0.305 -9 F 0.330 -10 D 0.341 -11 Q 0.349 -12 L 0.368 -13 E 0.397 -14 E 0.443 -15 D 0.500 -16 D 0.531 -17 S 0.518 -18 S 0.508 -19 S 0.537 -20 S 0.581 -21 S 0.606 -22 S 0.612 -23 S 0.607 -24 S 0.593 -25 F 0.582 -26 S 0.581 -27 S 0.580 -28 R 0.563 -29 L 0.538 -30 S 0.521 -31 L 0.514 -32 S 0.511 -33 S 0.521 -34 F 0.561 -35 P 0.624 -36 A 0.682 -37 S 0.713 -38 S 0.714 -39 A 0.702 -40 S 0.694 -41 P 0.699 -42 A 0.708 -43 W 0.715 -44 N 0.724 -45 S 0.731 -46 D 0.732 -47 E 0.728 -48 E 0.727 -49 G 0.732 -50 P 0.746 -51 G 0.760 -52 G 0.761 -53 Q 0.738 -54 A 0.688 -55 P 0.630 -56 Q 0.611 -57 S 0.656 -58 D 0.724 -59 Q 0.766 -60 D 0.776 -61 S 0.774 -62 C 0.772 -63 G 0.773 -64 L 0.767 -65 Q 0.744 -66 S 0.700 -67 F 0.650 -68 T 0.628 -69 P 0.648 -70 P 0.690 -71 S 0.720 -72 I 0.728 -73 L 0.717 -74 K 0.695 -75 R 0.675 -76 A 0.666 -77 P 0.664 -78 R 0.662 -79 E 0.662 -80 R 0.668 -81 P 0.669 -82 G 0.650 -83 H 0.615 -84 V 0.589 -85 A 0.574 -86 F 0.543 -87 N 0.491 -88 G 0.462 -89 I 0.471 -90 T 0.480 -91 V 0.457 -92 Y 0.407 -93 Y 0.352 -94 F 0.304 -95 P 0.266 -96 R 0.242 -97 C 0.241 -98 Q 0.252 -99 G 0.248 -100 F 0.223 -101 T 0.198 -102 S 0.184 -103 V 0.182 -104 P 0.190 -105 S 0.208 -106 R 0.234 -107 G 0.254 -108 G 0.261 -109 C 0.266 -110 T 0.283 -111 L 0.306 -112 G 0.311 -113 M 0.284 -114 A 0.239 -115 S 0.195 -116 R 0.166 -117 H 0.154 -118 S 0.152 -119 T 0.156 -120 C 0.170 -121 R 0.190 -122 L 0.200 -123 F 0.190 -124 S 0.162 -125 L 0.132 -126 A 0.108 -127 E 0.090 -128 F 0.079 -129 T 0.072 -130 Q 0.067 -131 E 0.067 -132 Q 0.073 -133 V 0.082 -134 R 0.091 -135 A 0.095 -136 R 0.092 -137 R 0.083 -138 E 0.075 -139 K 0.076 -140 L 0.084 -141 R 0.090 -142 R 0.088 -143 R 0.081 -144 L 0.075 -145 K 0.074 -146 E 0.075 -147 E 0.075 -148 K 0.070 -149 L 0.062 -150 E 0.053 -151 M 0.048 -152 L 0.047 -153 R 0.049 -154 W 0.056 -155 K 0.072 -156 F 0.099 -157 S 0.141 -158 V 0.198 -159 A 0.266 -160 G 0.335 -161 V 0.397 -162 P 0.445 -163 E 0.470 -164 S 0.470 -165 G 0.450 -166 A 0.428 -167 G 0.418 -168 V 0.412 -169 P 0.392 -170 L 0.353 -171 T 0.313 -172 A 0.294 -173 D 0.298 -174 A 0.313 -175 I 0.319 -176 D 0.302 -177 D 0.272 -178 A 0.238 -179 S 0.199 -180 V 0.156 -181 E 0.119 -182 E 0.096 -183 D 0.083 -184 L 0.075 -185 A 0.071 -186 V 0.072 -187 A 0.079 -188 V 0.089 -189 A 0.106 -190 N 0.128 -191 G 0.147 -192 R 0.157 -193 L 0.156 -194 E 0.152 -195 E 0.151 -196 A 0.153 -197 N 0.156 -198 F 0.161 -199 L 0.173 -200 Q 0.188 -201 P 0.196 -202 H 0.188 -203 P 0.163 -204 P 0.128 -205 R 0.101 -206 Q 0.090 -207 R 0.093 -208 R 0.105 -209 A 0.118 -210 L 0.125 -211 L 0.123 -212 R 0.116 -213 A 0.113 -214 S 0.116 -215 G 0.120 -216 V 0.123 -217 R 0.129 -218 R 0.138 -219 I 0.137 -220 D 0.123 -221 R 0.106 -222 E 0.094 -223 E 0.087 -224 K 0.088 -225 R 0.097 -226 E 0.108 -227 L 0.119 -228 Q 0.132 -229 V 0.150 -230 L 0.173 -231 R 0.199 -232 Q 0.221 -233 S 0.232 -234 R 0.231 -235 E 0.221 -236 D 0.202 -237 C 0.171 -238 G 0.134 -239 C 0.108 -240 H 0.101 -241 C 0.111 -242 D 0.129 -243 G 0.143 -244 V 0.147 -245 C 0.142 -246 D 0.135 -247 P 0.130 -248 E 0.122 -249 T 0.108 -250 C 0.098 -251 S 0.101 -252 C 0.114 -253 S 0.126 -254 L 0.141 -255 A 0.163 -256 G 0.184 -257 I 0.186 -258 K 0.168 -259 C 0.149 -260 Q 0.157 -261 M 0.187 -262 D 0.213 -263 H 0.219 -264 T 0.209 -265 S 0.194 -266 F 0.172 -267 P 0.145 -268 C 0.121 -269 G 0.107 -270 C 0.106 -271 C 0.120 -272 R 0.148 -273 E 0.175 -274 G 0.184 -275 C 0.178 -276 E 0.170 -277 N 0.169 -278 P 0.175 -279 N 0.186 -280 G 0.198 -281 R 0.208 -282 V 0.212 -283 E 0.206 -284 F 0.188 -285 N 0.161 -286 Q 0.135 -287 T 0.118 -288 R 0.109 -289 V 0.105 -290 Q 0.104 -291 T 0.108 -292 H 0.116 -293 F 0.119 -294 I 0.116 -295 H 0.115 -296 T 0.122 -297 L 0.132 -298 T 0.143 -299 R 0.160 -300 L 0.181 -301 Q 0.200 -302 M 0.226 -303 E 0.282 -304 Q 0.375 -305 G 0.476 -306 A 0.555 -307 E 0.606 -308 S 0.640 -309 L 0.661 -310 G 0.671 -311 D 0.666 -312 L 0.647 -313 E 0.623 -314 S 0.609 -315 P 0.613 -316 V 0.625 -317 E 0.630 -318 D 0.627 -319 T 0.629 -320 P 0.644 -321 V 0.666 -322 E 0.682 -323 Q 0.681 -324 A 0.657 -325 A 0.615 -326 L 0.577 -327 S 0.560 -328 P 0.557 -329 F 0.566 -330 P 0.593 -331 P 0.635 -332 S 0.672 -333 K 0.699 -334 P 0.726 -335 P 0.757 -336 V 0.784 -337 S 0.799 -338 S 0.804 -339 E 0.803 -340 L 0.801 -341 G 0.801 -342 D 0.796 -343 S 0.779 -344 S 0.744 -345 C 0.685 -346 S 0.616 -347 S 0.573 -348 D 0.567 -349 M 0.569 -350 T 0.576 -351 D 0.600 -352 S 0.609 -353 S 0.582 -354 T 0.565 -355 T 0.603 -356 L 0.671 -357 S 0.725 -358 S 0.753 -359 G 0.763 -360 S 0.762 -361 S 0.750 -362 E 0.738 -363 P 0.735 -364 P 0.744 -365 N 0.756 -366 H 0.764 -367 P 0.766 -368 A 0.766 -369 H 0.762 -370 P 0.756 -371 S 0.749 -372 L 0.748 -373 P 0.754 -374 G 0.764 -375 P 0.769 -376 S 0.770 -377 F 0.771 -378 R 0.774 -379 S 0.775 -380 G 0.763 -381 V 0.735 -382 D 0.701 -383 E 0.669 -384 D 0.636 -385 S 0.600 -386 L 0.570 -387 E 0.549 -388 Q 0.524 -389 I 0.501 -390 L 0.504 -391 N 0.540 -392 F 0.591 -393 S 0.633 -394 D 0.660 -395 S 0.677 -396 D 0.689 -397 L 0.702 -398 G 0.719 -399 I 0.736 -400 E 0.746 -401 E 0.747 -402 E 0.745 -403 E 0.745 -404 E 0.748 -405 E 0.755 -406 G 0.766 -407 G 0.779 -408 G 0.789 -409 V 0.792 -410 G 0.785 -411 N 0.771 -412 L 0.755 -413 D 0.737 -414 N 0.711 -415 L 0.678 -416 S 0.651 -417 C 0.632 -418 F 0.617 -419 H 0.607 -420 L 0.607 -421 A 0.608 -422 D 0.599 -423 I 0.589 -424 F 0.602 -425 G 0.645 -426 T 0.694 -427 G 0.724 -428 D 0.734 -429 P 0.734 -430 G 0.737 -431 S 0.742 -432 L 0.747 -433 A 0.748 -434 S 0.745 -435 W 0.746 -436 T 0.751 -437 H 0.758 -438 S 0.763 -439 Q 0.769 -440 S 0.778 -441 G 0.785 -442 S 0.793 -443 S 0.799 -444 L 0.803 -445 A 0.806 -446 S 0.808 -447 G 0.809 -448 I 0.804 -449 L 0.798 -450 D 0.793 -451 E 0.785 -452 N 0.772 -453 A 0.760 -454 N 0.749 -455 L 0.735 -456 D 0.715 -457 A 0.694 -458 S 0.681 -459 C 0.681 -460 F 0.691 -461 L 0.710 -462 N 0.730 -463 S 0.741 -464 G 0.748 -465 L 0.759 -466 G 0.778 -467 G 0.795 -468 L 0.805 -469 R 0.808 -470 E 0.807 -471 G 0.797 -472 S 0.782 -473 L 0.777 -474 P 0.789 -475 G 0.807 -476 S 0.816 -477 S 0.814 -478 G 0.810 -479 S 0.810 -480 P 0.818 -481 E 0.829 -482 G 0.839 -483 D 0.839 -484 A 0.830 -485 V 0.814 -486 Q 0.797 -487 S 0.780 -488 S 0.762 -489 S 0.743 -490 W 0.731 -491 D 0.728 -492 L 0.726 -493 S 0.725 -494 L 0.728 -495 S 0.736 -496 S 0.740 -497 C 0.734 -498 D 0.719 -499 S 0.698 -500 F 0.674 -501 E 0.649 -502 L 0.623 -503 L 0.607 -504 Q 0.606 -505 A 0.613 -506 L 0.617 -507 P 0.619 -508 D 0.622 -509 Y 0.626 -510 S 0.627 -511 L 0.636 -512 G 0.663 -513 P 0.693 -514 H 0.706 -515 Y 0.709 -516 T 0.722 -517 S 0.748 -518 R 0.769 -519 R 0.774 -520 V 0.766 -521 S 0.751 -522 G 0.737 -523 S 0.732 -524 P 0.740 -525 D 0.752 -526 S 0.754 -527 L 0.741 -528 E 0.714 -529 T 0.676 -530 F 0.635 -531 H 0.605 -532 P 0.592 -533 L 0.595 -534 P 0.599 -535 S 0.585 -536 F 0.556 -537 S 0.536 -538 P 0.533 -539 P 0.520 -540 R 0.481 -541 D 0.441 -542 A 0.431 -543 S 0.439 -544 T 0.440 -545 C 0.423 -546 F 0.381 -547 L 0.329 -548 E 0.296 -549 S 0.289 -550 L 0.304 -551 V 0.339 -552 G 0.382 -553 L 0.411 -554 S 0.416 -555 E 0.401 -556 P 0.361 -557 V 0.306 -558 T 0.257 -559 E 0.225 -560 V 0.203 -561 L 0.189 -562 A 0.185 -563 P 0.185 -564 L 0.181 -565 L 0.180 -566 E 0.185 -567 S 0.197 -568 Q 0.217 -569 F 0.245 -570 E 0.276 -571 D 0.296 -572 A 0.296 -573 A 0.287 -574 L 0.288 -575 A 0.300 -576 P 0.303 -577 L 0.294 -578 L 0.282 -579 E 0.272 -580 P 0.263 -581 V 0.250 -582 P 0.230 -583 V 0.213 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032515.9_ENSMUST00000215916.2_GN:Csrnp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:30.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032515.9_ENSMUST00000215916.2_GN:Csrnp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:30.caid deleted file mode 100644 index 871c66e797f3569756925105d96c5c97a72752df..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032515.9_ENSMUST00000215916.2_GN:Csrnp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:30.caid +++ /dev/null @@ -1,614 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000032515.9|ENSMUST00000215916.2|GN:Csrnp1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:30 -1 M 0.325 -2 A 0.352 -3 R 0.404 -4 Q 0.471 -5 G 0.529 -6 A 0.551 -7 Y 0.541 -8 L 0.520 -9 L 0.500 -10 I 0.488 -11 V 0.483 -12 P 0.479 -13 L 0.477 -14 S 0.494 -15 S 0.535 -16 S 0.587 -17 Q 0.635 -18 A 0.662 -19 S 0.667 -20 V 0.661 -21 L 0.651 -22 G 0.629 -23 C 0.589 -24 W 0.546 -25 N 0.515 -26 P 0.496 -27 L 0.487 -28 H 0.488 -29 S 0.491 -30 T 0.486 -31 M 0.480 -32 T 0.472 -33 G 0.440 -34 L 0.378 -35 L 0.310 -36 K 0.265 -37 R 0.258 -38 K 0.281 -39 F 0.322 -40 D 0.368 -41 Q 0.413 -42 L 0.450 -43 E 0.482 -44 E 0.525 -45 D 0.581 -46 D 0.628 -47 S 0.654 -48 S 0.667 -49 S 0.677 -50 S 0.685 -51 S 0.690 -52 S 0.690 -53 S 0.672 -54 S 0.624 -55 F 0.567 -56 S 0.552 -57 S 0.591 -58 R 0.640 -59 L 0.659 -60 S 0.653 -61 L 0.639 -62 S 0.623 -63 S 0.620 -64 F 0.648 -65 P 0.699 -66 A 0.746 -67 S 0.770 -68 S 0.770 -69 A 0.759 -70 S 0.751 -71 P 0.754 -72 A 0.760 -73 W 0.764 -74 N 0.769 -75 S 0.773 -76 D 0.774 -77 E 0.772 -78 E 0.771 -79 G 0.777 -80 P 0.788 -81 G 0.797 -82 G 0.795 -83 Q 0.770 -84 A 0.718 -85 P 0.654 -86 Q 0.627 -87 S 0.662 -88 D 0.722 -89 Q 0.760 -90 D 0.773 -91 S 0.777 -92 C 0.779 -93 G 0.780 -94 L 0.775 -95 Q 0.753 -96 S 0.712 -97 F 0.665 -98 T 0.643 -99 P 0.660 -100 P 0.696 -101 S 0.719 -102 I 0.718 -103 L 0.701 -104 K 0.677 -105 R 0.657 -106 A 0.648 -107 P 0.646 -108 R 0.645 -109 E 0.647 -110 R 0.654 -111 P 0.658 -112 G 0.641 -113 H 0.606 -114 V 0.577 -115 A 0.557 -116 F 0.518 -117 N 0.460 -118 G 0.425 -119 I 0.432 -120 T 0.441 -121 V 0.422 -122 Y 0.378 -123 Y 0.327 -124 F 0.281 -125 P 0.245 -126 R 0.223 -127 C 0.223 -128 Q 0.233 -129 G 0.228 -130 F 0.206 -131 T 0.185 -132 S 0.177 -133 V 0.183 -134 P 0.197 -135 S 0.222 -136 R 0.253 -137 G 0.280 -138 G 0.297 -139 C 0.313 -140 T 0.338 -141 L 0.364 -142 G 0.367 -143 M 0.338 -144 A 0.289 -145 S 0.240 -146 R 0.204 -147 H 0.187 -148 S 0.179 -149 T 0.177 -150 C 0.186 -151 R 0.199 -152 L 0.196 -153 F 0.175 -154 S 0.150 -155 L 0.132 -156 A 0.118 -157 E 0.105 -158 F 0.091 -159 T 0.077 -160 Q 0.066 -161 E 0.064 -162 Q 0.068 -163 V 0.075 -164 R 0.083 -165 A 0.086 -166 R 0.081 -167 R 0.071 -168 E 0.065 -169 K 0.067 -170 L 0.076 -171 R 0.082 -172 R 0.081 -173 R 0.077 -174 L 0.073 -175 K 0.072 -176 E 0.074 -177 E 0.074 -178 K 0.069 -179 L 0.060 -180 E 0.050 -181 M 0.045 -182 L 0.045 -183 R 0.048 -184 W 0.057 -185 K 0.073 -186 F 0.101 -187 S 0.143 -188 V 0.198 -189 A 0.263 -190 G 0.328 -191 V 0.388 -192 P 0.435 -193 E 0.460 -194 S 0.456 -195 G 0.431 -196 A 0.403 -197 G 0.385 -198 V 0.371 -199 P 0.343 -200 L 0.300 -201 T 0.260 -202 A 0.239 -203 D 0.240 -204 A 0.253 -205 I 0.257 -206 D 0.241 -207 D 0.212 -208 A 0.184 -209 S 0.156 -210 V 0.125 -211 E 0.097 -212 E 0.079 -213 D 0.070 -214 L 0.064 -215 A 0.062 -216 V 0.065 -217 A 0.071 -218 V 0.081 -219 A 0.097 -220 N 0.117 -221 G 0.133 -222 R 0.141 -223 L 0.141 -224 E 0.139 -225 E 0.140 -226 A 0.143 -227 N 0.147 -228 F 0.154 -229 L 0.167 -230 Q 0.180 -231 P 0.185 -232 H 0.176 -233 P 0.152 -234 P 0.120 -235 R 0.096 -236 Q 0.086 -237 R 0.089 -238 R 0.101 -239 A 0.116 -240 L 0.124 -241 L 0.123 -242 R 0.118 -243 A 0.115 -244 S 0.117 -245 G 0.120 -246 V 0.123 -247 R 0.129 -248 R 0.138 -249 I 0.138 -250 D 0.125 -251 R 0.109 -252 E 0.097 -253 E 0.089 -254 K 0.089 -255 R 0.098 -256 E 0.111 -257 L 0.121 -258 Q 0.133 -259 V 0.153 -260 L 0.177 -261 R 0.205 -262 Q 0.230 -263 S 0.242 -264 R 0.242 -265 E 0.232 -266 D 0.213 -267 C 0.179 -268 G 0.140 -269 C 0.113 -270 H 0.107 -271 C 0.119 -272 D 0.139 -273 G 0.154 -274 V 0.160 -275 C 0.157 -276 D 0.151 -277 P 0.144 -278 E 0.134 -279 T 0.119 -280 C 0.109 -281 S 0.113 -282 C 0.127 -283 S 0.141 -284 L 0.155 -285 A 0.177 -286 G 0.200 -287 I 0.204 -288 K 0.184 -289 C 0.164 -290 Q 0.170 -291 M 0.203 -292 D 0.234 -293 H 0.244 -294 T 0.236 -295 S 0.220 -296 F 0.197 -297 P 0.167 -298 C 0.140 -299 G 0.124 -300 C 0.121 -301 C 0.136 -302 R 0.166 -303 E 0.194 -304 G 0.205 -305 C 0.199 -306 E 0.193 -307 N 0.194 -308 P 0.204 -309 N 0.221 -310 G 0.239 -311 R 0.254 -312 V 0.262 -313 E 0.255 -314 F 0.228 -315 N 0.190 -316 Q 0.154 -317 T 0.131 -318 R 0.120 -319 V 0.115 -320 Q 0.114 -321 T 0.118 -322 H 0.126 -323 F 0.127 -324 I 0.122 -325 H 0.121 -326 T 0.128 -327 L 0.138 -328 T 0.149 -329 R 0.165 -330 L 0.185 -331 Q 0.203 -332 M 0.230 -333 E 0.287 -334 Q 0.379 -335 G 0.479 -336 A 0.558 -337 E 0.611 -338 S 0.646 -339 L 0.668 -340 G 0.677 -341 D 0.671 -342 L 0.650 -343 E 0.623 -344 S 0.605 -345 P 0.606 -346 V 0.617 -347 E 0.621 -348 D 0.619 -349 T 0.623 -350 P 0.640 -351 V 0.662 -352 E 0.669 -353 Q 0.641 -354 A 0.576 -355 A 0.513 -356 L 0.498 -357 S 0.525 -358 P 0.556 -359 F 0.579 -360 P 0.610 -361 P 0.652 -362 S 0.689 -363 K 0.715 -364 P 0.740 -365 P 0.769 -366 V 0.795 -367 S 0.808 -368 S 0.811 -369 E 0.808 -370 L 0.806 -371 G 0.805 -372 D 0.799 -373 S 0.781 -374 S 0.743 -375 C 0.683 -376 S 0.613 -377 S 0.569 -378 D 0.561 -379 M 0.563 -380 T 0.568 -381 D 0.588 -382 S 0.595 -383 S 0.566 -384 T 0.549 -385 T 0.588 -386 L 0.660 -387 S 0.719 -388 S 0.751 -389 G 0.766 -390 S 0.766 -391 S 0.755 -392 E 0.742 -393 P 0.738 -394 P 0.746 -395 N 0.758 -396 H 0.766 -397 P 0.767 -398 A 0.765 -399 H 0.759 -400 P 0.750 -401 S 0.740 -402 L 0.736 -403 P 0.742 -404 G 0.752 -405 P 0.756 -406 S 0.754 -407 F 0.753 -408 R 0.757 -409 S 0.761 -410 G 0.752 -411 V 0.726 -412 D 0.694 -413 E 0.664 -414 D 0.630 -415 S 0.595 -416 L 0.566 -417 E 0.544 -418 Q 0.517 -419 I 0.488 -420 L 0.483 -421 N 0.511 -422 F 0.556 -423 S 0.599 -424 D 0.628 -425 S 0.646 -426 D 0.659 -427 L 0.673 -428 G 0.692 -429 I 0.709 -430 E 0.720 -431 E 0.721 -432 E 0.719 -433 E 0.720 -434 E 0.724 -435 E 0.733 -436 G 0.746 -437 G 0.761 -438 G 0.773 -439 V 0.777 -440 G 0.771 -441 N 0.757 -442 L 0.742 -443 D 0.724 -444 N 0.695 -445 L 0.659 -446 S 0.628 -447 C 0.605 -448 F 0.587 -449 H 0.577 -450 L 0.577 -451 A 0.581 -452 D 0.573 -453 I 0.564 -454 F 0.581 -455 G 0.629 -456 T 0.683 -457 G 0.716 -458 D 0.725 -459 P 0.726 -460 G 0.730 -461 S 0.738 -462 L 0.745 -463 A 0.747 -464 S 0.744 -465 W 0.742 -466 T 0.746 -467 H 0.752 -468 S 0.757 -469 Q 0.764 -470 S 0.773 -471 G 0.783 -472 S 0.792 -473 S 0.801 -474 L 0.808 -475 A 0.813 -476 S 0.817 -477 G 0.818 -478 I 0.813 -479 L 0.807 -480 D 0.801 -481 E 0.793 -482 N 0.781 -483 A 0.769 -484 N 0.759 -485 L 0.747 -486 D 0.729 -487 A 0.710 -488 S 0.699 -489 C 0.697 -490 F 0.705 -491 L 0.722 -492 N 0.739 -493 S 0.751 -494 G 0.759 -495 L 0.771 -496 G 0.791 -497 G 0.809 -498 L 0.819 -499 R 0.823 -500 E 0.822 -501 G 0.811 -502 S 0.797 -503 L 0.792 -504 P 0.803 -505 G 0.820 -506 S 0.829 -507 S 0.827 -508 G 0.822 -509 S 0.822 -510 P 0.830 -511 E 0.841 -512 G 0.847 -513 D 0.832 -514 A 0.783 -515 V 0.712 -516 Q 0.668 -517 S 0.680 -518 S 0.718 -519 S 0.739 -520 W 0.743 -521 D 0.742 -522 L 0.739 -523 S 0.735 -524 L 0.738 -525 S 0.747 -526 S 0.752 -527 C 0.748 -528 D 0.737 -529 S 0.720 -530 F 0.700 -531 E 0.678 -532 L 0.655 -533 L 0.638 -534 Q 0.633 -535 A 0.634 -536 L 0.634 -537 P 0.630 -538 D 0.630 -539 Y 0.634 -540 S 0.638 -541 L 0.648 -542 G 0.674 -543 P 0.702 -544 H 0.713 -545 Y 0.714 -546 T 0.727 -547 S 0.753 -548 R 0.773 -549 R 0.778 -550 V 0.770 -551 S 0.755 -552 G 0.741 -553 S 0.736 -554 P 0.743 -555 D 0.754 -556 S 0.753 -557 L 0.738 -558 E 0.710 -559 T 0.670 -560 F 0.628 -561 H 0.597 -562 P 0.586 -563 L 0.592 -564 P 0.597 -565 S 0.583 -566 F 0.550 -567 S 0.528 -568 P 0.528 -569 P 0.525 -570 R 0.496 -571 D 0.465 -572 A 0.460 -573 S 0.470 -574 T 0.471 -575 C 0.451 -576 F 0.406 -577 L 0.351 -578 E 0.318 -579 S 0.317 -580 L 0.337 -581 V 0.368 -582 G 0.398 -583 L 0.412 -584 S 0.410 -585 E 0.394 -586 P 0.361 -587 V 0.311 -588 T 0.263 -589 E 0.229 -590 V 0.205 -591 L 0.192 -592 A 0.188 -593 P 0.186 -594 L 0.179 -595 L 0.177 -596 E 0.185 -597 S 0.201 -598 Q 0.223 -599 F 0.250 -600 E 0.281 -601 D 0.303 -602 A 0.305 -603 A 0.297 -604 L 0.299 -605 A 0.309 -606 P 0.308 -607 L 0.295 -608 L 0.281 -609 E 0.272 -610 P 0.264 -611 V 0.251 -612 P 0.228 -613 V 0.207 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032667.18_ENSMUST00000057792.9_GN:Pon2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032667.18_ENSMUST00000057792.9_GN:Pon2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 32b516c9a0ee0b5beb09251d2761099fae05c1af..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032667.18_ENSMUST00000057792.9_GN:Pon2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,355 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000032667.18|ENSMUST00000057792.9|GN:Pon2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.291 -2 G 0.274 -3 R 0.256 -4 M 0.245 -5 V 0.232 -6 A 0.217 -7 L 0.210 -8 S 0.212 -9 L 0.213 -10 L 0.210 -11 G 0.209 -12 I 0.206 -13 G 0.197 -14 L 0.182 -15 A 0.167 -16 L 0.155 -17 L 0.142 -18 G 0.127 -19 E 0.110 -20 R 0.091 -21 F 0.075 -22 L 0.067 -23 A 0.065 -24 L 0.066 -25 R 0.068 -26 S 0.075 -27 R 0.087 -28 L 0.109 -29 K 0.147 -30 A 0.197 -31 S 0.241 -32 R 0.263 -33 E 0.268 -34 V 0.263 -35 E 0.251 -36 S 0.232 -37 V 0.208 -38 D 0.180 -39 L 0.150 -40 P 0.117 -41 N 0.088 -42 C 0.070 -43 H 0.070 -44 L 0.079 -45 I 0.087 -46 K 0.086 -47 G 0.078 -48 I 0.069 -49 E 0.061 -50 T 0.059 -51 G 0.063 -52 A 0.075 -53 E 0.087 -54 D 0.091 -55 I 0.083 -56 D 0.073 -57 I 0.066 -58 L 0.063 -59 P 0.062 -60 N 0.058 -61 G 0.050 -62 L 0.041 -63 A 0.035 -64 F 0.036 -65 F 0.048 -66 S 0.067 -67 V 0.085 -68 G 0.099 -69 L 0.109 -70 K 0.117 -71 F 0.123 -72 P 0.127 -73 G 0.125 -74 L 0.114 -75 H 0.100 -76 S 0.094 -77 F 0.101 -78 A 0.115 -79 P 0.132 -80 D 0.149 -81 K 0.161 -82 P 0.158 -83 G 0.135 -84 G 0.104 -85 I 0.077 -86 L 0.060 -87 M 0.055 -88 M 0.057 -89 D 0.061 -90 L 0.066 -91 K 0.074 -92 D 0.087 -93 E 0.099 -94 R 0.102 -95 P 0.097 -96 R 0.089 -97 A 0.083 -98 L 0.081 -99 E 0.081 -100 L 0.083 -101 R 0.084 -102 V 0.086 -103 S 0.086 -104 W 0.088 -105 G 0.089 -106 F 0.088 -107 D 0.083 -108 L 0.077 -109 A 0.076 -110 S 0.083 -111 F 0.091 -112 N 0.094 -113 P 0.097 -114 H 0.097 -115 G 0.088 -116 I 0.072 -117 S 0.055 -118 T 0.045 -119 F 0.048 -120 I 0.064 -121 D 0.085 -122 D 0.103 -123 D 0.110 -124 D 0.106 -125 T 0.091 -126 V 0.068 -127 Y 0.046 -128 L 0.033 -129 F 0.029 -130 V 0.032 -131 V 0.039 -132 N 0.047 -133 H 0.053 -134 P 0.055 -135 Q 0.053 -136 F 0.053 -137 K 0.054 -138 S 0.053 -139 T 0.048 -140 V 0.041 -141 E 0.035 -142 I 0.032 -143 F 0.033 -144 K 0.039 -145 F 0.045 -146 Q 0.049 -147 E 0.052 -148 E 0.059 -149 E 0.068 -150 N 0.075 -151 S 0.078 -152 L 0.077 -153 L 0.069 -154 H 0.058 -155 L 0.051 -156 K 0.052 -157 T 0.057 -158 I 0.061 -159 K 0.060 -160 H 0.056 -161 E 0.052 -162 L 0.052 -163 L 0.055 -164 P 0.059 -165 S 0.066 -166 V 0.075 -167 N 0.086 -168 D 0.089 -169 I 0.081 -170 I 0.071 -171 A 0.064 -172 V 0.060 -173 G 0.055 -174 P 0.047 -175 T 0.037 -176 H 0.030 -177 F 0.027 -178 Y 0.032 -179 A 0.047 -180 T 0.071 -181 N 0.100 -182 D 0.123 -183 H 0.133 -184 Y 0.131 -185 F 0.124 -186 S 0.119 -187 D 0.109 -188 P 0.092 -189 F 0.077 -190 L 0.073 -191 K 0.075 -192 Y 0.077 -193 L 0.080 -194 E 0.088 -195 T 0.098 -196 Y 0.106 -197 L 0.114 -198 N 0.122 -199 L 0.124 -200 H 0.118 -201 W 0.107 -202 A 0.093 -203 N 0.075 -204 V 0.056 -205 V 0.041 -206 Y 0.036 -207 Y 0.037 -208 S 0.042 -209 P 0.046 -210 E 0.052 -211 E 0.059 -212 V 0.066 -213 K 0.074 -214 L 0.084 -215 V 0.094 -216 A 0.102 -217 E 0.108 -218 G 0.110 -219 F 0.107 -220 D 0.102 -221 S 0.099 -222 A 0.098 -223 N 0.094 -224 G 0.084 -225 I 0.069 -226 N 0.058 -227 I 0.053 -228 S 0.051 -229 P 0.047 -230 D 0.041 -231 K 0.034 -232 K 0.030 -233 Y 0.029 -234 V 0.031 -235 Y 0.038 -236 V 0.052 -237 A 0.072 -238 D 0.090 -239 I 0.101 -240 L 0.103 -241 A 0.096 -242 H 0.078 -243 E 0.058 -244 I 0.045 -245 H 0.041 -246 V 0.041 -247 L 0.043 -248 E 0.046 -249 K 0.050 -250 Q 0.056 -251 P 0.060 -252 N 0.062 -253 M 0.066 -254 N 0.069 -255 L 0.068 -256 T 0.063 -257 Q 0.061 -258 L 0.064 -259 K 0.070 -260 V 0.075 -261 L 0.079 -262 Q 0.079 -263 L 0.076 -264 G 0.070 -265 T 0.063 -266 L 0.062 -267 V 0.070 -268 D 0.083 -269 N 0.090 -270 L 0.085 -271 S 0.076 -272 I 0.072 -273 D 0.074 -274 P 0.074 -275 S 0.070 -276 S 0.064 -277 G 0.058 -278 D 0.051 -279 I 0.043 -280 W 0.038 -281 V 0.042 -282 G 0.060 -283 C 0.088 -284 H 0.115 -285 P 0.129 -286 N 0.129 -287 G 0.121 -288 Q 0.112 -289 R 0.103 -290 L 0.094 -291 F 0.086 -292 V 0.083 -293 Y 0.087 -294 H 0.099 -295 P 0.121 -296 N 0.148 -297 H 0.170 -298 P 0.171 -299 P 0.149 -300 A 0.116 -301 S 0.085 -302 E 0.063 -303 V 0.047 -304 L 0.040 -305 R 0.041 -306 I 0.046 -307 Q 0.050 -308 N 0.053 -309 I 0.058 -310 L 0.069 -311 S 0.087 -312 E 0.105 -313 K 0.113 -314 P 0.105 -315 S 0.092 -316 V 0.083 -317 T 0.080 -318 T 0.078 -319 V 0.076 -320 Y 0.078 -321 I 0.085 -322 N 0.097 -323 N 0.112 -324 G 0.119 -325 S 0.115 -326 V 0.105 -327 L 0.100 -328 Q 0.101 -329 G 0.102 -330 S 0.098 -331 S 0.091 -332 V 0.082 -333 A 0.072 -334 T 0.064 -335 I 0.062 -336 Y 0.063 -337 D 0.065 -338 R 0.066 -339 K 0.064 -340 L 0.057 -341 L 0.048 -342 V 0.042 -343 G 0.045 -344 T 0.053 -345 L 0.061 -346 Y 0.065 -347 Q 0.062 -348 K 0.054 -349 A 0.044 -350 L 0.039 -351 Y 0.041 -352 C 0.051 -353 E 0.064 -354 L 0.075 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032667.18_ENSMUST00000057792.9_GN:Pon2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:55.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032667.18_ENSMUST00000057792.9_GN:Pon2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:55.caid deleted file mode 100644 index b8285b15dacd317d6cd4b155237657f34d67f95a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000032667.18_ENSMUST00000057792.9_GN:Pon2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:55.caid +++ /dev/null @@ -1,410 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000032667.18|ENSMUST00000057792.9|GN:Pon2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:55 -1 M 0.338 -2 C 0.361 -3 G 0.394 -4 C 0.421 -5 A 0.424 -6 P 0.407 -7 R 0.390 -8 T 0.379 -9 R 0.354 -10 R 0.326 -11 R 0.343 -12 A 0.417 -13 E 0.505 -14 P 0.553 -15 G 0.532 -16 L 0.454 -17 Q 0.381 -18 S 0.370 -19 R 0.411 -20 R 0.454 -21 S 0.497 -22 G 0.553 -23 R 0.590 -24 G 0.582 -25 S 0.567 -26 G 0.589 -27 A 0.627 -28 A 0.648 -29 P 0.651 -30 R 0.645 -31 S 0.621 -32 G 0.581 -33 R 0.559 -34 G 0.585 -35 A 0.633 -36 G 0.664 -37 P 0.666 -38 A 0.637 -39 S 0.589 -40 G 0.562 -41 A 0.572 -42 A 0.580 -43 R 0.559 -44 S 0.550 -45 G 0.590 -46 P 0.648 -47 S 0.682 -48 Q 0.691 -49 T 0.689 -50 A 0.680 -51 G 0.661 -52 R 0.630 -53 S 0.591 -54 R 0.554 -55 T 0.529 -56 M 0.509 -57 G 0.471 -58 R 0.417 -59 M 0.371 -60 V 0.344 -61 A 0.329 -62 L 0.320 -63 S 0.315 -64 L 0.307 -65 L 0.298 -66 G 0.292 -67 I 0.284 -68 G 0.264 -69 L 0.231 -70 A 0.195 -71 L 0.167 -72 L 0.151 -73 G 0.139 -74 E 0.125 -75 R 0.107 -76 F 0.089 -77 L 0.077 -78 A 0.072 -79 L 0.071 -80 R 0.070 -81 S 0.072 -82 R 0.079 -83 L 0.094 -84 K 0.126 -85 A 0.172 -86 S 0.213 -87 R 0.234 -88 E 0.237 -89 V 0.231 -90 E 0.219 -91 S 0.203 -92 V 0.183 -93 D 0.159 -94 L 0.134 -95 P 0.107 -96 N 0.081 -97 C 0.066 -98 H 0.065 -99 L 0.073 -100 I 0.080 -101 K 0.078 -102 G 0.071 -103 I 0.063 -104 E 0.057 -105 T 0.056 -106 G 0.060 -107 A 0.071 -108 E 0.083 -109 D 0.087 -110 I 0.081 -111 D 0.071 -112 I 0.064 -113 L 0.061 -114 P 0.060 -115 N 0.058 -116 G 0.051 -117 L 0.043 -118 A 0.036 -119 F 0.036 -120 F 0.047 -121 S 0.066 -122 V 0.086 -123 G 0.101 -124 L 0.111 -125 K 0.116 -126 F 0.119 -127 P 0.121 -128 G 0.118 -129 L 0.110 -130 H 0.100 -131 S 0.099 -132 F 0.109 -133 A 0.125 -134 P 0.142 -135 D 0.159 -136 K 0.173 -137 P 0.170 -138 G 0.149 -139 G 0.117 -140 I 0.086 -141 L 0.067 -142 M 0.059 -143 M 0.060 -144 D 0.065 -145 L 0.070 -146 K 0.078 -147 D 0.093 -148 E 0.108 -149 R 0.115 -150 P 0.113 -151 R 0.105 -152 A 0.099 -153 L 0.095 -154 E 0.095 -155 L 0.095 -156 R 0.094 -157 V 0.092 -158 S 0.091 -159 W 0.092 -160 G 0.095 -161 F 0.095 -162 D 0.089 -163 L 0.081 -164 A 0.080 -165 S 0.087 -166 F 0.095 -167 N 0.099 -168 P 0.102 -169 H 0.101 -170 G 0.093 -171 I 0.077 -172 S 0.059 -173 T 0.049 -174 F 0.050 -175 I 0.065 -176 D 0.086 -177 D 0.105 -178 D 0.113 -179 D 0.108 -180 T 0.091 -181 V 0.067 -182 Y 0.044 -183 L 0.030 -184 F 0.027 -185 V 0.031 -186 V 0.040 -187 N 0.049 -188 H 0.056 -189 P 0.057 -190 Q 0.054 -191 F 0.052 -192 K 0.052 -193 S 0.051 -194 T 0.046 -195 V 0.039 -196 E 0.034 -197 I 0.031 -198 F 0.033 -199 K 0.038 -200 F 0.044 -201 Q 0.046 -202 E 0.047 -203 E 0.053 -204 E 0.061 -205 N 0.068 -206 S 0.071 -207 L 0.069 -208 L 0.061 -209 H 0.052 -210 L 0.045 -211 K 0.046 -212 T 0.052 -213 I 0.056 -214 K 0.055 -215 H 0.050 -216 E 0.046 -217 L 0.044 -218 L 0.046 -219 P 0.051 -220 S 0.058 -221 V 0.069 -222 N 0.080 -223 D 0.083 -224 I 0.076 -225 I 0.064 -226 A 0.056 -227 V 0.051 -228 G 0.045 -229 P 0.038 -230 T 0.029 -231 H 0.024 -232 F 0.024 -233 Y 0.030 -234 A 0.045 -235 T 0.068 -236 N 0.094 -237 D 0.113 -238 H 0.118 -239 Y 0.111 -240 F 0.102 -241 S 0.097 -242 D 0.089 -243 P 0.076 -244 F 0.066 -245 L 0.064 -246 K 0.068 -247 Y 0.070 -248 L 0.074 -249 E 0.081 -250 T 0.089 -251 Y 0.096 -252 L 0.103 -253 N 0.108 -254 L 0.109 -255 H 0.104 -256 W 0.096 -257 A 0.085 -258 N 0.070 -259 V 0.052 -260 V 0.039 -261 Y 0.033 -262 Y 0.034 -263 S 0.038 -264 P 0.042 -265 E 0.049 -266 E 0.057 -267 V 0.065 -268 K 0.073 -269 L 0.084 -270 V 0.094 -271 A 0.100 -272 E 0.104 -273 G 0.105 -274 F 0.102 -275 D 0.097 -276 S 0.094 -277 A 0.093 -278 N 0.091 -279 G 0.081 -280 I 0.067 -281 N 0.055 -282 I 0.050 -283 S 0.049 -284 P 0.046 -285 D 0.040 -286 K 0.034 -287 K 0.029 -288 Y 0.028 -289 V 0.029 -290 Y 0.035 -291 V 0.049 -292 A 0.069 -293 D 0.086 -294 I 0.097 -295 L 0.100 -296 A 0.095 -297 H 0.078 -298 E 0.058 -299 I 0.044 -300 H 0.040 -301 V 0.041 -302 L 0.043 -303 E 0.045 -304 K 0.050 -305 Q 0.056 -306 P 0.059 -307 N 0.062 -308 M 0.066 -309 N 0.070 -310 L 0.068 -311 T 0.062 -312 Q 0.060 -313 L 0.063 -314 K 0.068 -315 V 0.073 -316 L 0.077 -317 Q 0.078 -318 L 0.076 -319 G 0.071 -320 T 0.065 -321 L 0.065 -322 V 0.074 -323 D 0.086 -324 N 0.092 -325 L 0.086 -326 S 0.077 -327 I 0.075 -328 D 0.079 -329 P 0.080 -330 S 0.076 -331 S 0.070 -332 G 0.063 -333 D 0.054 -334 I 0.043 -335 W 0.037 -336 V 0.042 -337 G 0.060 -338 C 0.090 -339 H 0.120 -340 P 0.137 -341 N 0.140 -342 G 0.134 -343 Q 0.123 -344 R 0.112 -345 L 0.101 -346 F 0.092 -347 V 0.087 -348 Y 0.090 -349 H 0.102 -350 P 0.124 -351 N 0.151 -352 H 0.173 -353 P 0.177 -354 P 0.157 -355 A 0.123 -356 S 0.090 -357 E 0.065 -358 V 0.049 -359 L 0.040 -360 R 0.040 -361 I 0.046 -362 Q 0.051 -363 N 0.055 -364 I 0.061 -365 L 0.072 -366 S 0.088 -367 E 0.103 -368 K 0.107 -369 P 0.098 -370 S 0.086 -371 V 0.078 -372 T 0.076 -373 T 0.075 -374 V 0.074 -375 Y 0.076 -376 I 0.083 -377 N 0.094 -378 N 0.107 -379 G 0.114 -380 S 0.110 -381 V 0.100 -382 L 0.097 -383 Q 0.101 -384 G 0.104 -385 S 0.102 -386 S 0.097 -387 V 0.088 -388 A 0.076 -389 T 0.067 -390 I 0.063 -391 Y 0.065 -392 D 0.067 -393 R 0.068 -394 K 0.066 -395 L 0.059 -396 L 0.050 -397 V 0.045 -398 G 0.047 -399 T 0.055 -400 L 0.063 -401 Y 0.066 -402 Q 0.062 -403 K 0.053 -404 A 0.044 -405 L 0.040 -406 Y 0.043 -407 C 0.053 -408 E 0.068 -409 L 0.079 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033006.11_ENSMUST00000230532.2_GN:Sox10_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033006.11_ENSMUST00000230532.2_GN:Sox10_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 1862fdb73768a28aca7a592ded5f84e50f1a63ae..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033006.11_ENSMUST00000230532.2_GN:Sox10_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,467 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000033006.11|ENSMUST00000230532.2|GN:Sox10|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.517 -2 A 0.562 -3 E 0.617 -4 E 0.657 -5 Q 0.679 -6 D 0.691 -7 L 0.701 -8 S 0.715 -9 E 0.728 -10 V 0.737 -11 E 0.740 -12 L 0.744 -13 S 0.754 -14 P 0.771 -15 V 0.784 -16 G 0.782 -17 S 0.765 -18 E 0.745 -19 E 0.739 -20 P 0.749 -21 R 0.762 -22 C 0.767 -23 L 0.765 -24 S 0.770 -25 P 0.783 -26 G 0.794 -27 S 0.783 -28 A 0.736 -29 P 0.671 -30 S 0.640 -31 L 0.678 -32 G 0.746 -33 P 0.795 -34 D 0.819 -35 G 0.829 -36 G 0.833 -37 G 0.835 -38 G 0.837 -39 G 0.840 -40 S 0.842 -41 G 0.841 -42 L 0.835 -43 R 0.822 -44 A 0.805 -45 S 0.787 -46 P 0.777 -47 G 0.780 -48 P 0.789 -49 G 0.796 -50 E 0.800 -51 L 0.803 -52 G 0.803 -53 K 0.784 -54 V 0.734 -55 K 0.667 -56 K 0.637 -57 E 0.675 -58 Q 0.745 -59 Q 0.793 -60 D 0.807 -61 G 0.799 -62 E 0.769 -63 A 0.706 -64 D 0.609 -65 D 0.493 -66 D 0.385 -67 K 0.296 -68 F 0.225 -69 P 0.168 -70 V 0.125 -71 C 0.096 -72 I 0.078 -73 R 0.067 -74 E 0.064 -75 A 0.067 -76 V 0.072 -77 S 0.079 -78 Q 0.086 -79 V 0.096 -80 L 0.106 -81 S 0.112 -82 G 0.113 -83 Y 0.106 -84 D 0.093 -85 W 0.084 -86 T 0.090 -87 L 0.110 -88 V 0.146 -89 P 0.204 -90 M 0.291 -91 P 0.395 -92 V 0.492 -93 R 0.573 -94 V 0.642 -95 N 0.693 -96 G 0.715 -97 A 0.702 -98 S 0.657 -99 K 0.593 -100 S 0.531 -101 K 0.484 -102 P 0.448 -103 H 0.416 -104 V 0.385 -105 K 0.353 -106 R 0.319 -107 P 0.272 -108 M 0.208 -109 N 0.139 -110 A 0.087 -111 F 0.062 -112 M 0.054 -113 V 0.051 -114 W 0.045 -115 A 0.038 -116 Q 0.037 -117 A 0.040 -118 A 0.043 -119 R 0.040 -120 R 0.037 -121 K 0.039 -122 L 0.045 -123 A 0.051 -124 D 0.055 -125 Q 0.061 -126 Y 0.072 -127 P 0.081 -128 H 0.083 -129 L 0.082 -130 H 0.078 -131 N 0.071 -132 A 0.065 -133 E 0.063 -134 L 0.061 -135 S 0.054 -136 K 0.044 -137 T 0.037 -138 L 0.034 -139 G 0.033 -140 K 0.032 -141 L 0.032 -142 W 0.033 -143 R 0.035 -144 L 0.038 -145 L 0.039 -146 N 0.039 -147 E 0.038 -148 S 0.040 -149 D 0.042 -150 K 0.041 -151 R 0.037 -152 P 0.035 -153 F 0.036 -154 I 0.040 -155 E 0.042 -156 E 0.042 -157 A 0.040 -158 E 0.040 -159 R 0.044 -160 L 0.052 -161 R 0.063 -162 M 0.068 -163 Q 0.066 -164 H 0.061 -165 K 0.063 -166 K 0.071 -167 D 0.084 -168 H 0.098 -169 P 0.108 -170 D 0.114 -171 Y 0.120 -172 K 0.135 -173 Y 0.169 -174 Q 0.223 -175 P 0.285 -176 R 0.354 -177 R 0.440 -178 R 0.542 -179 K 0.640 -180 N 0.712 -181 G 0.758 -182 K 0.787 -183 A 0.806 -184 A 0.817 -185 Q 0.823 -186 G 0.826 -187 E 0.823 -188 A 0.814 -189 E 0.805 -190 C 0.803 -191 P 0.811 -192 G 0.824 -193 G 0.831 -194 E 0.829 -195 A 0.820 -196 E 0.812 -197 Q 0.805 -198 G 0.795 -199 G 0.775 -200 A 0.750 -201 A 0.725 -202 A 0.690 -203 I 0.630 -204 Q 0.557 -205 A 0.518 -206 H 0.542 -207 Y 0.604 -208 K 0.669 -209 S 0.716 -210 A 0.741 -211 H 0.754 -212 L 0.767 -213 D 0.778 -214 H 0.781 -215 R 0.777 -216 H 0.779 -217 P 0.794 -218 E 0.816 -219 E 0.834 -220 G 0.840 -221 S 0.840 -222 P 0.844 -223 M 0.854 -224 S 0.862 -225 D 0.856 -226 G 0.828 -227 N 0.767 -228 P 0.689 -229 E 0.652 -230 H 0.693 -231 P 0.773 -232 S 0.834 -233 G 0.856 -234 Q 0.852 -235 S 0.837 -236 H 0.815 -237 G 0.793 -238 P 0.775 -239 P 0.762 -240 T 0.758 -241 P 0.766 -242 P 0.778 -243 T 0.784 -244 T 0.772 -245 P 0.732 -246 K 0.676 -247 T 0.653 -248 E 0.698 -249 L 0.773 -250 Q 0.826 -251 S 0.847 -252 G 0.851 -253 K 0.845 -254 A 0.834 -255 D 0.825 -256 P 0.822 -257 K 0.826 -258 R 0.834 -259 D 0.842 -260 G 0.847 -261 R 0.848 -262 S 0.847 -263 L 0.844 -264 G 0.839 -265 E 0.834 -266 G 0.827 -267 G 0.819 -268 K 0.813 -269 P 0.810 -270 H 0.804 -271 I 0.794 -272 D 0.784 -273 F 0.784 -274 G 0.793 -275 N 0.801 -276 V 0.803 -277 D 0.798 -278 I 0.791 -279 G 0.783 -280 E 0.769 -281 I 0.749 -282 S 0.731 -283 H 0.720 -284 E 0.710 -285 V 0.703 -286 M 0.710 -287 S 0.729 -288 N 0.749 -289 M 0.761 -290 E 0.765 -291 T 0.764 -292 F 0.757 -293 D 0.744 -294 V 0.731 -295 T 0.723 -296 E 0.719 -297 L 0.708 -298 D 0.682 -299 Q 0.648 -300 Y 0.622 -301 L 0.620 -302 P 0.653 -303 P 0.709 -304 N 0.759 -305 G 0.783 -306 H 0.791 -307 P 0.803 -308 G 0.823 -309 H 0.844 -310 V 0.859 -311 G 0.865 -312 S 0.863 -313 Y 0.857 -314 S 0.851 -315 A 0.845 -316 A 0.839 -317 G 0.834 -318 Y 0.832 -319 G 0.836 -320 L 0.843 -321 G 0.851 -322 S 0.857 -323 A 0.863 -324 L 0.868 -325 A 0.873 -326 V 0.873 -327 A 0.868 -328 S 0.859 -329 G 0.853 -330 H 0.853 -331 S 0.858 -332 A 0.861 -333 W 0.860 -334 I 0.851 -335 S 0.835 -336 K 0.820 -337 P 0.820 -338 P 0.839 -339 G 0.863 -340 V 0.878 -341 A 0.883 -342 L 0.883 -343 P 0.883 -344 T 0.879 -345 V 0.866 -346 S 0.850 -347 P 0.843 -348 P 0.850 -349 G 0.863 -350 V 0.870 -351 D 0.870 -352 A 0.868 -353 K 0.870 -354 A 0.875 -355 Q 0.882 -356 V 0.887 -357 K 0.889 -358 T 0.890 -359 E 0.886 -360 T 0.876 -361 T 0.861 -362 G 0.848 -363 P 0.839 -364 Q 0.834 -365 G 0.833 -366 P 0.839 -367 P 0.852 -368 H 0.867 -369 Y 0.876 -370 T 0.877 -371 D 0.872 -372 Q 0.869 -373 P 0.872 -374 S 0.880 -375 T 0.889 -376 S 0.894 -377 Q 0.895 -378 I 0.895 -379 A 0.893 -380 Y 0.892 -381 T 0.889 -382 S 0.881 -383 L 0.869 -384 S 0.854 -385 L 0.842 -386 P 0.838 -387 H 0.843 -388 Y 0.851 -389 G 0.858 -390 S 0.859 -391 A 0.855 -392 F 0.851 -393 P 0.852 -394 S 0.856 -395 I 0.856 -396 S 0.854 -397 R 0.852 -398 P 0.852 -399 Q 0.853 -400 F 0.854 -401 D 0.852 -402 Y 0.850 -403 S 0.847 -404 D 0.839 -405 H 0.829 -406 Q 0.821 -407 P 0.820 -408 S 0.822 -409 G 0.825 -410 P 0.830 -411 Y 0.839 -412 Y 0.849 -413 G 0.858 -414 H 0.864 -415 A 0.868 -416 G 0.870 -417 Q 0.869 -418 A 0.867 -419 S 0.864 -420 G 0.860 -421 L 0.855 -422 Y 0.852 -423 S 0.849 -424 A 0.841 -425 F 0.829 -426 S 0.818 -427 Y 0.808 -428 M 0.801 -429 G 0.801 -430 P 0.809 -431 S 0.818 -432 Q 0.825 -433 R 0.834 -434 P 0.849 -435 L 0.867 -436 Y 0.883 -437 T 0.893 -438 A 0.894 -439 I 0.882 -440 S 0.862 -441 D 0.842 -442 P 0.828 -443 S 0.826 -444 P 0.832 -445 S 0.841 -446 G 0.849 -447 P 0.856 -448 Q 0.858 -449 S 0.854 -450 H 0.843 -451 S 0.831 -452 P 0.822 -453 T 0.814 -454 H 0.805 -455 W 0.794 -456 E 0.788 -457 Q 0.793 -458 P 0.808 -459 V 0.827 -460 Y 0.839 -461 T 0.839 -462 T 0.826 -463 L 0.794 -464 S 0.743 -465 R 0.683 -466 P 0.639 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033006.11_ENSMUST00000230532.2_GN:Sox10_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:103.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033006.11_ENSMUST00000230532.2_GN:Sox10_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:103.caid deleted file mode 100644 index 80d8f4485a71f0ad5e5f11387a178f2041e2d3eb..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033006.11_ENSMUST00000230532.2_GN:Sox10_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:103.caid +++ /dev/null @@ -1,570 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000033006.11|ENSMUST00000230532.2|GN:Sox10|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:103 -1 M 0.484 -2 E 0.525 -3 P 0.588 -4 S 0.652 -5 A 0.703 -6 A 0.737 -7 A 0.759 -8 Q 0.779 -9 S 0.796 -10 V 0.801 -11 S 0.792 -12 A 0.771 -13 V 0.751 -14 Q 0.745 -15 P 0.758 -16 G 0.774 -17 C 0.781 -18 L 0.776 -19 V 0.772 -20 V 0.774 -21 R 0.777 -22 I 0.773 -23 Q 0.763 -24 A 0.757 -25 P 0.759 -26 S 0.769 -27 R 0.782 -28 Q 0.796 -29 G 0.807 -30 S 0.814 -31 G 0.816 -32 L 0.816 -33 R 0.812 -34 L 0.799 -35 R 0.778 -36 A 0.754 -37 P 0.734 -38 Q 0.723 -39 P 0.715 -40 L 0.711 -41 P 0.716 -42 P 0.739 -43 S 0.774 -44 P 0.807 -45 S 0.825 -46 A 0.825 -47 S 0.809 -48 L 0.791 -49 P 0.782 -50 S 0.786 -51 P 0.796 -52 E 0.802 -53 L 0.793 -54 D 0.765 -55 R 0.719 -56 T 0.669 -57 P 0.629 -58 W 0.611 -59 D 0.616 -60 T 0.624 -61 V 0.602 -62 F 0.559 -63 H 0.535 -64 F 0.552 -65 L 0.582 -66 R 0.604 -67 T 0.629 -68 S 0.667 -69 P 0.714 -70 R 0.760 -71 L 0.795 -72 E 0.816 -73 E 0.826 -74 R 0.828 -75 S 0.828 -76 E 0.828 -77 E 0.831 -78 V 0.836 -79 G 0.840 -80 V 0.842 -81 G 0.840 -82 L 0.832 -83 F 0.818 -84 T 0.800 -85 R 0.781 -86 T 0.772 -87 P 0.776 -88 A 0.784 -89 A 0.790 -90 G 0.794 -91 P 0.804 -92 G 0.815 -93 E 0.808 -94 A 0.764 -95 A 0.693 -96 E 0.649 -97 A 0.663 -98 A 0.684 -99 A 0.669 -100 A 0.657 -101 G 0.694 -102 S 0.754 -103 D 0.792 -104 M 0.802 -105 A 0.796 -106 E 0.782 -107 E 0.769 -108 Q 0.760 -109 D 0.755 -110 L 0.755 -111 S 0.762 -112 E 0.772 -113 V 0.779 -114 E 0.777 -115 L 0.771 -116 S 0.769 -117 P 0.777 -118 V 0.788 -119 G 0.793 -120 S 0.787 -121 E 0.776 -122 E 0.768 -123 P 0.768 -124 R 0.773 -125 C 0.773 -126 L 0.767 -127 S 0.763 -128 P 0.763 -129 G 0.760 -130 S 0.738 -131 A 0.690 -132 P 0.629 -133 S 0.603 -134 L 0.643 -135 G 0.714 -136 P 0.768 -137 D 0.793 -138 G 0.802 -139 G 0.803 -140 G 0.801 -141 G 0.800 -142 G 0.800 -143 S 0.800 -144 G 0.799 -145 L 0.794 -146 R 0.785 -147 A 0.772 -148 S 0.761 -149 P 0.757 -150 G 0.765 -151 P 0.778 -152 G 0.786 -153 E 0.790 -154 L 0.790 -155 G 0.787 -156 K 0.769 -157 V 0.720 -158 K 0.652 -159 K 0.619 -160 E 0.653 -161 Q 0.716 -162 Q 0.759 -163 D 0.770 -164 G 0.755 -165 E 0.716 -166 A 0.645 -167 D 0.544 -168 D 0.434 -169 D 0.335 -170 K 0.255 -171 F 0.191 -172 P 0.139 -173 V 0.100 -174 C 0.075 -175 I 0.060 -176 R 0.050 -177 E 0.047 -178 A 0.049 -179 V 0.053 -180 S 0.057 -181 Q 0.062 -182 V 0.070 -183 L 0.080 -184 S 0.090 -185 G 0.096 -186 Y 0.094 -187 D 0.084 -188 W 0.077 -189 T 0.082 -190 L 0.102 -191 V 0.136 -192 P 0.194 -193 M 0.281 -194 P 0.385 -195 V 0.485 -196 R 0.574 -197 V 0.650 -198 N 0.705 -199 G 0.726 -200 A 0.710 -201 S 0.662 -202 K 0.595 -203 S 0.532 -204 K 0.487 -205 P 0.455 -206 H 0.429 -207 V 0.400 -208 K 0.367 -209 R 0.330 -210 P 0.281 -211 M 0.213 -212 N 0.141 -213 A 0.087 -214 F 0.061 -215 M 0.054 -216 V 0.051 -217 W 0.044 -218 A 0.037 -219 Q 0.035 -220 A 0.038 -221 A 0.040 -222 R 0.038 -223 R 0.036 -224 K 0.038 -225 L 0.043 -226 A 0.047 -227 D 0.051 -228 Q 0.057 -229 Y 0.066 -230 P 0.074 -231 H 0.075 -232 L 0.073 -233 H 0.070 -234 N 0.063 -235 A 0.056 -236 E 0.053 -237 L 0.053 -238 S 0.047 -239 K 0.039 -240 T 0.034 -241 L 0.032 -242 G 0.031 -243 K 0.029 -244 L 0.028 -245 W 0.028 -246 R 0.029 -247 L 0.031 -248 L 0.033 -249 N 0.033 -250 E 0.033 -251 S 0.035 -252 D 0.037 -253 K 0.037 -254 R 0.034 -255 P 0.031 -256 F 0.030 -257 I 0.029 -258 E 0.030 -259 E 0.031 -260 A 0.031 -261 E 0.031 -262 R 0.032 -263 L 0.038 -264 R 0.045 -265 M 0.050 -266 Q 0.051 -267 H 0.054 -268 K 0.059 -269 K 0.067 -270 D 0.079 -271 H 0.093 -272 P 0.104 -273 D 0.111 -274 Y 0.119 -275 K 0.135 -276 Y 0.169 -277 Q 0.222 -278 P 0.284 -279 R 0.351 -280 R 0.434 -281 R 0.531 -282 K 0.624 -283 N 0.692 -284 G 0.734 -285 K 0.757 -286 A 0.770 -287 A 0.777 -288 Q 0.782 -289 G 0.785 -290 E 0.784 -291 A 0.777 -292 E 0.769 -293 C 0.768 -294 P 0.778 -295 G 0.792 -296 G 0.802 -297 E 0.801 -298 A 0.793 -299 E 0.785 -300 Q 0.779 -301 G 0.768 -302 G 0.745 -303 A 0.715 -304 A 0.683 -305 A 0.640 -306 I 0.572 -307 Q 0.499 -308 A 0.460 -309 H 0.477 -310 Y 0.529 -311 K 0.589 -312 S 0.638 -313 A 0.670 -314 H 0.688 -315 L 0.708 -316 D 0.726 -317 H 0.734 -318 R 0.732 -319 H 0.736 -320 P 0.754 -321 E 0.782 -322 E 0.804 -323 G 0.811 -324 S 0.811 -325 P 0.814 -326 M 0.825 -327 S 0.834 -328 D 0.831 -329 G 0.804 -330 N 0.744 -331 P 0.668 -332 E 0.630 -333 H 0.670 -334 P 0.750 -335 S 0.812 -336 G 0.836 -337 Q 0.835 -338 S 0.821 -339 H 0.803 -340 G 0.783 -341 P 0.763 -342 P 0.746 -343 T 0.737 -344 P 0.741 -345 P 0.751 -346 T 0.756 -347 T 0.744 -348 P 0.707 -349 K 0.656 -350 T 0.637 -351 E 0.681 -352 L 0.754 -353 Q 0.807 -354 S 0.829 -355 G 0.835 -356 K 0.832 -357 A 0.826 -358 D 0.819 -359 P 0.818 -360 K 0.823 -361 R 0.831 -362 D 0.839 -363 G 0.844 -364 R 0.845 -365 S 0.843 -366 L 0.838 -367 G 0.833 -368 E 0.828 -369 G 0.821 -370 G 0.814 -371 K 0.810 -372 P 0.809 -373 H 0.805 -374 I 0.796 -375 D 0.785 -376 F 0.780 -377 G 0.785 -378 N 0.790 -379 V 0.789 -380 D 0.782 -381 I 0.773 -382 G 0.763 -383 E 0.745 -384 I 0.722 -385 S 0.705 -386 H 0.695 -387 E 0.681 -388 V 0.668 -389 M 0.671 -390 S 0.695 -391 N 0.720 -392 M 0.734 -393 E 0.739 -394 T 0.738 -395 F 0.730 -396 D 0.715 -397 V 0.699 -398 T 0.690 -399 E 0.687 -400 L 0.678 -401 D 0.654 -402 Q 0.619 -403 Y 0.586 -404 L 0.581 -405 P 0.617 -406 P 0.681 -407 N 0.736 -408 G 0.761 -409 H 0.768 -410 P 0.781 -411 G 0.801 -412 H 0.821 -413 V 0.833 -414 G 0.837 -415 S 0.834 -416 Y 0.828 -417 S 0.821 -418 A 0.814 -419 A 0.805 -420 G 0.796 -421 Y 0.791 -422 G 0.792 -423 L 0.798 -424 G 0.806 -425 S 0.813 -426 A 0.818 -427 L 0.823 -428 A 0.827 -429 V 0.825 -430 A 0.819 -431 S 0.811 -432 G 0.806 -433 H 0.805 -434 S 0.809 -435 A 0.810 -436 W 0.805 -437 I 0.794 -438 S 0.778 -439 K 0.764 -440 P 0.766 -441 P 0.787 -442 G 0.813 -443 V 0.827 -444 A 0.830 -445 L 0.831 -446 P 0.835 -447 T 0.833 -448 V 0.820 -449 S 0.803 -450 P 0.796 -451 P 0.803 -452 G 0.816 -453 V 0.823 -454 D 0.823 -455 A 0.821 -456 K 0.820 -457 A 0.823 -458 Q 0.828 -459 V 0.834 -460 K 0.839 -461 T 0.842 -462 E 0.838 -463 T 0.825 -464 T 0.807 -465 G 0.795 -466 P 0.790 -467 Q 0.789 -468 G 0.790 -469 P 0.796 -470 P 0.811 -471 H 0.828 -472 Y 0.839 -473 T 0.842 -474 D 0.838 -475 Q 0.834 -476 P 0.837 -477 S 0.845 -478 T 0.851 -479 S 0.853 -480 Q 0.853 -481 I 0.854 -482 A 0.855 -483 Y 0.853 -484 T 0.846 -485 S 0.834 -486 L 0.817 -487 S 0.800 -488 L 0.791 -489 P 0.791 -490 H 0.800 -491 Y 0.812 -492 G 0.823 -493 S 0.827 -494 A 0.822 -495 F 0.817 -496 P 0.817 -497 S 0.819 -498 I 0.819 -499 S 0.817 -500 R 0.816 -501 P 0.818 -502 Q 0.821 -503 F 0.822 -504 D 0.820 -505 Y 0.817 -506 S 0.814 -507 D 0.807 -508 H 0.797 -509 Q 0.789 -510 P 0.787 -511 S 0.790 -512 G 0.796 -513 P 0.804 -514 Y 0.816 -515 Y 0.828 -516 G 0.838 -517 H 0.845 -518 A 0.849 -519 G 0.850 -520 Q 0.848 -521 A 0.844 -522 S 0.840 -523 G 0.833 -524 L 0.826 -525 Y 0.821 -526 S 0.817 -527 A 0.809 -528 F 0.798 -529 S 0.786 -530 Y 0.772 -531 M 0.763 -532 G 0.766 -533 P 0.779 -534 S 0.794 -535 Q 0.806 -536 R 0.821 -537 P 0.839 -538 L 0.853 -539 Y 0.864 -540 T 0.870 -541 A 0.867 -542 I 0.853 -543 S 0.834 -544 D 0.817 -545 P 0.805 -546 S 0.803 -547 P 0.808 -548 S 0.818 -549 G 0.828 -550 P 0.837 -551 Q 0.844 -552 S 0.843 -553 H 0.834 -554 S 0.823 -555 P 0.814 -556 T 0.808 -557 H 0.800 -558 W 0.794 -559 E 0.792 -560 Q 0.799 -561 P 0.812 -562 V 0.824 -563 Y 0.830 -564 T 0.829 -565 T 0.820 -566 L 0.806 -567 S 0.783 -568 R 0.753 -569 P 0.729 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033420.13_ENSMUST00000042025.12_GN:Antxr1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033420.13_ENSMUST00000042025.12_GN:Antxr1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 6b6ecd3c2a649557009bf04aad00782c11a192c3..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033420.13_ENSMUST00000042025.12_GN:Antxr1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,563 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000033420.13|ENSMUST00000042025.12|GN:Antxr1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.365 -2 D 0.371 -3 R 0.383 -4 A 0.394 -5 G 0.395 -6 R 0.400 -7 L 0.432 -8 G 0.476 -9 A 0.502 -10 G 0.501 -11 L 0.481 -12 R 0.447 -13 G 0.398 -14 L 0.347 -15 C 0.310 -16 V 0.282 -17 A 0.259 -18 A 0.249 -19 L 0.248 -20 V 0.252 -21 L 0.267 -22 V 0.300 -23 C 0.343 -24 A 0.384 -25 G 0.423 -26 H 0.469 -27 G 0.515 -28 G 0.546 -29 R 0.554 -30 R 0.549 -31 E 0.540 -32 D 0.521 -33 G 0.484 -34 G 0.422 -35 P 0.343 -36 A 0.260 -37 C 0.189 -38 Y 0.139 -39 G 0.108 -40 G 0.083 -41 F 0.062 -42 D 0.046 -43 L 0.035 -44 Y 0.027 -45 F 0.025 -46 I 0.027 -47 L 0.034 -48 D 0.047 -49 K 0.064 -50 S 0.080 -51 G 0.086 -52 S 0.080 -53 V 0.068 -54 L 0.057 -55 H 0.052 -56 H 0.050 -57 W 0.046 -58 N 0.040 -59 E 0.035 -60 I 0.032 -61 Y 0.031 -62 Y 0.031 -63 F 0.029 -64 V 0.027 -65 E 0.024 -66 Q 0.023 -67 L 0.022 -68 A 0.024 -69 H 0.028 -70 R 0.036 -71 F 0.046 -72 I 0.056 -73 S 0.061 -74 P 0.057 -75 Q 0.048 -76 L 0.040 -77 R 0.032 -78 M 0.025 -79 S 0.019 -80 F 0.018 -81 I 0.022 -82 V 0.030 -83 F 0.039 -84 S 0.050 -85 T 0.060 -86 R 0.065 -87 G 0.063 -88 T 0.057 -89 T 0.055 -90 L 0.058 -91 M 0.059 -92 K 0.054 -93 L 0.047 -94 T 0.042 -95 E 0.040 -96 D 0.038 -97 R 0.036 -98 E 0.034 -99 Q 0.035 -100 I 0.044 -101 R 0.060 -102 Q 0.073 -103 G 0.072 -104 L 0.064 -105 E 0.060 -106 E 0.060 -107 L 0.057 -108 Q 0.051 -109 K 0.051 -110 V 0.062 -111 L 0.086 -112 P 0.119 -113 G 0.146 -114 G 0.149 -115 D 0.129 -116 T 0.104 -117 Y 0.085 -118 M 0.073 -119 H 0.064 -120 E 0.055 -121 G 0.048 -122 F 0.043 -123 E 0.043 -124 R 0.047 -125 A 0.052 -126 S 0.056 -127 E 0.055 -128 Q 0.050 -129 I 0.046 -130 Y 0.049 -131 Y 0.060 -132 E 0.077 -133 N 0.094 -134 S 0.105 -135 Q 0.113 -136 G 0.120 -137 Y 0.124 -138 R 0.118 -139 T 0.099 -140 A 0.075 -141 S 0.055 -142 V 0.042 -143 I 0.033 -144 I 0.027 -145 A 0.025 -146 L 0.032 -147 T 0.053 -148 D 0.085 -149 G 0.116 -150 E 0.130 -151 L 0.123 -152 H 0.105 -153 E 0.089 -154 D 0.080 -155 L 0.078 -156 F 0.074 -157 F 0.066 -158 Y 0.061 -159 S 0.065 -160 E 0.073 -161 R 0.075 -162 E 0.066 -163 A 0.052 -164 N 0.042 -165 R 0.038 -166 S 0.037 -167 R 0.037 -168 D 0.041 -169 L 0.049 -170 G 0.056 -171 A 0.056 -172 I 0.048 -173 V 0.038 -174 Y 0.035 -175 C 0.041 -176 V 0.052 -177 G 0.060 -178 V 0.064 -179 K 0.072 -180 D 0.084 -181 F 0.091 -182 N 0.088 -183 E 0.083 -184 T 0.078 -185 Q 0.071 -186 L 0.062 -187 A 0.056 -188 R 0.054 -189 I 0.056 -190 A 0.061 -191 D 0.069 -192 S 0.078 -193 K 0.081 -194 D 0.076 -195 H 0.070 -196 V 0.073 -197 F 0.086 -198 P 0.104 -199 V 0.116 -200 N 0.119 -201 D 0.114 -202 G 0.107 -203 F 0.096 -204 Q 0.083 -205 A 0.069 -206 L 0.058 -207 Q 0.051 -208 G 0.047 -209 I 0.045 -210 I 0.045 -211 H 0.047 -212 S 0.051 -213 I 0.056 -214 L 0.061 -215 K 0.063 -216 K 0.059 -217 S 0.053 -218 C 0.049 -219 I 0.048 -220 E 0.045 -221 I 0.042 -222 L 0.040 -223 A 0.041 -224 A 0.043 -225 E 0.045 -226 P 0.048 -227 S 0.050 -228 T 0.049 -229 I 0.043 -230 C 0.039 -231 A 0.040 -232 G 0.042 -233 E 0.040 -234 S 0.034 -235 F 0.028 -236 Q 0.023 -237 V 0.020 -238 V 0.018 -239 V 0.019 -240 R 0.024 -241 G 0.033 -242 N 0.043 -243 G 0.051 -244 F 0.055 -245 R 0.057 -246 H 0.061 -247 A 0.066 -248 R 0.068 -249 N 0.070 -250 V 0.069 -251 D 0.060 -252 R 0.045 -253 V 0.030 -254 L 0.021 -255 C 0.018 -256 S 0.021 -257 F 0.029 -258 K 0.041 -259 I 0.052 -260 N 0.057 -261 D 0.059 -262 S 0.062 -263 V 0.065 -264 T 0.067 -265 L 0.068 -266 N 0.067 -267 E 0.065 -268 K 0.059 -269 P 0.051 -270 F 0.045 -271 A 0.043 -272 V 0.043 -273 E 0.041 -274 D 0.035 -275 T 0.026 -276 Y 0.020 -277 L 0.017 -278 L 0.021 -279 C 0.030 -280 P 0.041 -281 A 0.052 -282 P 0.061 -283 I 0.069 -284 L 0.074 -285 K 0.079 -286 E 0.087 -287 V 0.098 -288 G 0.102 -289 M 0.093 -290 K 0.077 -291 A 0.060 -292 A 0.047 -293 L 0.038 -294 Q 0.033 -295 V 0.029 -296 S 0.027 -297 M 0.030 -298 N 0.038 -299 D 0.049 -300 G 0.056 -301 L 0.058 -302 S 0.059 -303 F 0.062 -304 I 0.066 -305 S 0.072 -306 S 0.076 -307 S 0.076 -308 V 0.070 -309 I 0.060 -310 I 0.054 -311 T 0.054 -312 T 0.064 -313 T 0.091 -314 H 0.151 -315 C 0.249 -316 S 0.364 -317 D 0.447 -318 G 0.460 -319 S 0.409 -320 I 0.330 -321 L 0.265 -322 A 0.229 -323 I 0.217 -324 A 0.221 -325 L 0.234 -326 L 0.243 -327 V 0.241 -328 L 0.236 -329 F 0.235 -330 L 0.231 -331 L 0.225 -332 L 0.226 -333 A 0.231 -334 L 0.223 -335 A 0.203 -336 L 0.184 -337 L 0.170 -338 W 0.158 -339 W 0.148 -340 F 0.149 -341 W 0.167 -342 P 0.196 -343 L 0.228 -344 C 0.261 -345 C 0.310 -346 T 0.388 -347 V 0.480 -348 I 0.549 -349 I 0.578 -350 K 0.580 -351 E 0.569 -352 V 0.551 -353 P 0.544 -354 P 0.571 -355 P 0.635 -356 P 0.708 -357 V 0.762 -358 E 0.792 -359 E 0.806 -360 S 0.811 -361 E 0.810 -362 E 0.803 -363 E 0.792 -364 D 0.779 -365 D 0.763 -366 D 0.742 -367 G 0.724 -368 L 0.714 -369 P 0.717 -370 K 0.728 -371 K 0.738 -372 K 0.746 -373 W 0.755 -374 P 0.759 -375 T 0.749 -376 V 0.717 -377 D 0.675 -378 A 0.642 -379 S 0.637 -380 Y 0.662 -381 Y 0.710 -382 G 0.764 -383 G 0.803 -384 R 0.824 -385 G 0.832 -386 V 0.832 -387 G 0.829 -388 G 0.825 -389 I 0.820 -390 K 0.814 -391 R 0.809 -392 M 0.806 -393 E 0.801 -394 V 0.793 -395 R 0.787 -396 W 0.785 -397 G 0.787 -398 E 0.791 -399 K 0.796 -400 G 0.792 -401 S 0.763 -402 T 0.708 -403 E 0.652 -404 E 0.621 -405 G 0.623 -406 A 0.639 -407 K 0.645 -408 L 0.634 -409 E 0.623 -410 K 0.630 -411 A 0.650 -412 K 0.674 -413 N 0.700 -414 A 0.727 -415 R 0.744 -416 V 0.745 -417 K 0.742 -418 M 0.746 -419 P 0.755 -420 E 0.759 -421 Q 0.753 -422 E 0.735 -423 Y 0.710 -424 E 0.688 -425 F 0.681 -426 P 0.694 -427 E 0.718 -428 P 0.745 -429 R 0.771 -430 N 0.791 -431 L 0.802 -432 N 0.807 -433 N 0.804 -434 N 0.793 -435 M 0.774 -436 R 0.756 -437 R 0.742 -438 P 0.736 -439 S 0.733 -440 S 0.733 -441 P 0.732 -442 R 0.725 -443 K 0.712 -444 W 0.695 -445 Y 0.675 -446 S 0.653 -447 P 0.639 -448 I 0.640 -449 K 0.651 -450 G 0.647 -451 K 0.605 -452 L 0.537 -453 D 0.474 -454 A 0.423 -455 L 0.381 -456 W 0.355 -457 V 0.357 -458 L 0.369 -459 L 0.376 -460 R 0.396 -461 K 0.453 -462 G 0.529 -463 Y 0.583 -464 D 0.607 -465 R 0.621 -466 V 0.642 -467 S 0.674 -468 V 0.704 -469 M 0.710 -470 R 0.690 -471 P 0.668 -472 Q 0.671 -473 P 0.699 -474 G 0.732 -475 D 0.761 -476 T 0.783 -477 G 0.794 -478 R 0.793 -479 C 0.783 -480 I 0.772 -481 N 0.766 -482 F 0.766 -483 T 0.766 -484 R 0.766 -485 V 0.770 -486 K 0.777 -487 N 0.780 -488 S 0.776 -489 Q 0.776 -490 P 0.783 -491 A 0.791 -492 K 0.794 -493 Y 0.798 -494 P 0.809 -495 L 0.827 -496 N 0.840 -497 N 0.840 -498 T 0.827 -499 Y 0.810 -500 H 0.800 -501 P 0.794 -502 S 0.781 -503 S 0.764 -504 P 0.756 -505 P 0.764 -506 P 0.785 -507 A 0.804 -508 P 0.809 -509 I 0.796 -510 Y 0.771 -511 T 0.737 -512 P 0.689 -513 P 0.635 -514 P 0.619 -515 P 0.668 -516 A 0.742 -517 P 0.789 -518 H 0.798 -519 C 0.790 -520 P 0.784 -521 P 0.789 -522 P 0.804 -523 A 0.821 -524 P 0.830 -525 S 0.829 -526 A 0.820 -527 P 0.808 -528 T 0.798 -529 P 0.794 -530 P 0.796 -531 I 0.798 -532 P 0.794 -533 S 0.777 -534 P 0.735 -535 P 0.671 -536 S 0.628 -537 T 0.629 -538 L 0.633 -539 P 0.609 -540 P 0.601 -541 P 0.648 -542 P 0.716 -543 Q 0.753 -544 A 0.754 -545 P 0.745 -546 P 0.748 -547 P 0.761 -548 N 0.768 -549 R 0.759 -550 A 0.740 -551 P 0.726 -552 P 0.728 -553 P 0.737 -554 S 0.741 -555 R 0.737 -556 P 0.733 -557 P 0.740 -558 P 0.757 -559 R 0.777 -560 P 0.786 -561 S 0.779 -562 V 0.765 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033420.13_ENSMUST00000042025.12_GN:Antxr1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033420.13_ENSMUST00000042025.12_GN:Antxr1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid deleted file mode 100644 index 950d4df5c347c8bf6d2fff2004e82db32917e296..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033420.13_ENSMUST00000042025.12_GN:Antxr1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid +++ /dev/null @@ -1,577 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000033420.13|ENSMUST00000042025.12|GN:Antxr1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:14 -1 M 0.335 -2 S 0.339 -3 H 0.358 -4 G 0.380 -5 R 0.375 -6 Q 0.346 -7 R 0.332 -8 G 0.335 -9 Q 0.344 -10 R 0.390 -11 S 0.487 -12 G 0.582 -13 C 0.628 -14 S 0.633 -15 M 0.624 -16 D 0.609 -17 R 0.580 -18 A 0.537 -19 G 0.493 -20 R 0.480 -21 L 0.514 -22 G 0.564 -23 A 0.597 -24 G 0.605 -25 L 0.593 -26 R 0.565 -27 G 0.527 -28 L 0.482 -29 C 0.432 -30 V 0.374 -31 A 0.324 -32 A 0.299 -33 L 0.293 -34 V 0.291 -35 L 0.297 -36 V 0.320 -37 C 0.353 -38 A 0.386 -39 G 0.422 -40 H 0.470 -41 G 0.523 -42 G 0.560 -43 R 0.572 -44 R 0.569 -45 E 0.560 -46 D 0.538 -47 G 0.496 -48 G 0.430 -49 P 0.349 -50 A 0.264 -51 C 0.192 -52 Y 0.142 -53 G 0.110 -54 G 0.085 -55 F 0.063 -56 D 0.047 -57 L 0.035 -58 Y 0.028 -59 F 0.025 -60 I 0.027 -61 L 0.035 -62 D 0.047 -63 K 0.065 -64 S 0.080 -65 G 0.086 -66 S 0.079 -67 V 0.067 -68 L 0.056 -69 H 0.051 -70 H 0.050 -71 W 0.046 -72 N 0.040 -73 E 0.035 -74 I 0.032 -75 Y 0.031 -76 Y 0.030 -77 F 0.029 -78 V 0.026 -79 E 0.023 -80 Q 0.022 -81 L 0.021 -82 A 0.023 -83 H 0.026 -84 R 0.034 -85 F 0.044 -86 I 0.054 -87 S 0.058 -88 P 0.054 -89 Q 0.046 -90 L 0.038 -91 R 0.031 -92 M 0.024 -93 S 0.019 -94 F 0.018 -95 I 0.022 -96 V 0.029 -97 F 0.038 -98 S 0.048 -99 T 0.058 -100 R 0.064 -101 G 0.062 -102 T 0.057 -103 T 0.055 -104 L 0.057 -105 M 0.059 -106 K 0.054 -107 L 0.047 -108 T 0.042 -109 E 0.040 -110 D 0.038 -111 R 0.036 -112 E 0.033 -113 Q 0.035 -114 I 0.044 -115 R 0.060 -116 Q 0.073 -117 G 0.072 -118 L 0.064 -119 E 0.060 -120 E 0.060 -121 L 0.057 -122 Q 0.051 -123 K 0.051 -124 V 0.063 -125 L 0.087 -126 P 0.120 -127 G 0.147 -128 G 0.150 -129 D 0.130 -130 T 0.105 -131 Y 0.086 -132 M 0.074 -133 H 0.065 -134 E 0.056 -135 G 0.048 -136 F 0.043 -137 E 0.043 -138 R 0.045 -139 A 0.046 -140 S 0.044 -141 E 0.040 -142 Q 0.038 -143 I 0.041 -144 Y 0.048 -145 Y 0.061 -146 E 0.079 -147 N 0.096 -148 S 0.108 -149 Q 0.116 -150 G 0.123 -151 Y 0.127 -152 R 0.120 -153 T 0.100 -154 A 0.076 -155 S 0.055 -156 V 0.041 -157 I 0.032 -158 I 0.026 -159 A 0.024 -160 L 0.031 -161 T 0.052 -162 D 0.084 -163 G 0.115 -164 E 0.130 -165 L 0.123 -166 H 0.106 -167 E 0.089 -168 D 0.081 -169 L 0.078 -170 F 0.073 -171 F 0.066 -172 Y 0.061 -173 S 0.064 -174 E 0.072 -175 R 0.074 -176 E 0.064 -177 A 0.050 -178 N 0.042 -179 R 0.038 -180 S 0.037 -181 R 0.038 -182 D 0.042 -183 L 0.049 -184 G 0.055 -185 A 0.055 -186 I 0.047 -187 V 0.038 -188 Y 0.034 -189 C 0.040 -190 V 0.051 -191 G 0.059 -192 V 0.063 -193 K 0.070 -194 D 0.081 -195 F 0.085 -196 N 0.075 -197 E 0.059 -198 T 0.049 -199 Q 0.047 -200 L 0.049 -201 A 0.050 -202 R 0.051 -203 I 0.054 -204 A 0.059 -205 D 0.066 -206 S 0.075 -207 K 0.079 -208 D 0.074 -209 H 0.068 -210 V 0.070 -211 F 0.083 -212 P 0.100 -213 V 0.111 -214 N 0.114 -215 D 0.110 -216 G 0.102 -217 F 0.093 -218 Q 0.080 -219 A 0.067 -220 L 0.056 -221 Q 0.049 -222 G 0.045 -223 I 0.044 -224 I 0.044 -225 H 0.046 -226 S 0.049 -227 I 0.055 -228 L 0.060 -229 K 0.062 -230 K 0.058 -231 S 0.052 -232 C 0.048 -233 I 0.047 -234 E 0.045 -235 I 0.042 -236 L 0.041 -237 A 0.042 -238 A 0.044 -239 E 0.046 -240 P 0.049 -241 S 0.051 -242 T 0.049 -243 I 0.044 -244 C 0.040 -245 A 0.041 -246 G 0.043 -247 E 0.041 -248 S 0.035 -249 F 0.028 -250 Q 0.023 -251 V 0.020 -252 V 0.018 -253 V 0.019 -254 R 0.024 -255 G 0.033 -256 N 0.044 -257 G 0.052 -258 F 0.055 -259 R 0.058 -260 H 0.062 -261 A 0.066 -262 R 0.069 -263 N 0.071 -264 V 0.070 -265 D 0.061 -266 R 0.046 -267 V 0.031 -268 L 0.021 -269 C 0.018 -270 S 0.021 -271 F 0.029 -272 K 0.041 -273 I 0.052 -274 N 0.058 -275 D 0.061 -276 S 0.064 -277 V 0.067 -278 T 0.069 -279 L 0.070 -280 N 0.069 -281 E 0.066 -282 K 0.060 -283 P 0.052 -284 F 0.046 -285 A 0.044 -286 V 0.044 -287 E 0.042 -288 D 0.035 -289 T 0.027 -290 Y 0.020 -291 L 0.017 -292 L 0.021 -293 C 0.030 -294 P 0.042 -295 A 0.054 -296 P 0.063 -297 I 0.070 -298 L 0.076 -299 K 0.081 -300 E 0.089 -301 V 0.100 -302 G 0.104 -303 M 0.095 -304 K 0.079 -305 A 0.062 -306 A 0.048 -307 L 0.039 -308 Q 0.033 -309 V 0.029 -310 S 0.028 -311 M 0.031 -312 N 0.040 -313 D 0.051 -314 G 0.058 -315 L 0.060 -316 S 0.060 -317 F 0.063 -318 I 0.068 -319 S 0.073 -320 S 0.078 -321 S 0.077 -322 V 0.071 -323 I 0.061 -324 I 0.054 -325 T 0.054 -326 T 0.063 -327 T 0.092 -328 H 0.153 -329 C 0.253 -330 S 0.372 -331 D 0.456 -332 G 0.469 -333 S 0.417 -334 I 0.336 -335 L 0.268 -336 A 0.231 -337 I 0.218 -338 A 0.222 -339 L 0.236 -340 L 0.246 -341 V 0.244 -342 L 0.241 -343 F 0.241 -344 L 0.238 -345 L 0.233 -346 L 0.235 -347 A 0.237 -348 L 0.227 -349 A 0.206 -350 L 0.187 -351 L 0.173 -352 W 0.161 -353 W 0.151 -354 F 0.152 -355 W 0.169 -356 P 0.198 -357 L 0.230 -358 C 0.263 -359 C 0.311 -360 T 0.388 -361 V 0.478 -362 I 0.548 -363 I 0.579 -364 K 0.582 -365 E 0.571 -366 V 0.551 -367 P 0.543 -368 P 0.569 -369 P 0.632 -370 P 0.705 -371 V 0.759 -372 E 0.788 -373 E 0.803 -374 S 0.808 -375 E 0.807 -376 E 0.800 -377 E 0.791 -378 D 0.779 -379 D 0.763 -380 D 0.743 -381 G 0.724 -382 L 0.715 -383 P 0.718 -384 K 0.729 -385 K 0.740 -386 K 0.747 -387 W 0.754 -388 P 0.757 -389 T 0.746 -390 V 0.714 -391 D 0.672 -392 A 0.639 -393 S 0.632 -394 Y 0.656 -395 Y 0.705 -396 G 0.759 -397 G 0.799 -398 R 0.820 -399 G 0.828 -400 V 0.828 -401 G 0.825 -402 G 0.820 -403 I 0.814 -404 K 0.806 -405 R 0.800 -406 M 0.796 -407 E 0.792 -408 V 0.785 -409 R 0.780 -410 W 0.779 -411 G 0.782 -412 E 0.786 -413 K 0.791 -414 G 0.788 -415 S 0.760 -416 T 0.706 -417 E 0.649 -418 E 0.619 -419 G 0.620 -420 A 0.635 -421 K 0.641 -422 L 0.631 -423 E 0.622 -424 K 0.629 -425 A 0.647 -426 K 0.667 -427 N 0.692 -428 A 0.721 -429 R 0.739 -430 V 0.741 -431 K 0.739 -432 M 0.745 -433 P 0.754 -434 E 0.758 -435 Q 0.751 -436 E 0.733 -437 Y 0.708 -438 E 0.687 -439 F 0.680 -440 P 0.692 -441 E 0.716 -442 P 0.743 -443 R 0.768 -444 N 0.788 -445 L 0.800 -446 N 0.804 -447 N 0.801 -448 N 0.790 -449 M 0.772 -450 R 0.753 -451 R 0.741 -452 P 0.734 -453 S 0.731 -454 S 0.731 -455 P 0.730 -456 R 0.722 -457 K 0.709 -458 W 0.695 -459 Y 0.677 -460 S 0.656 -461 P 0.640 -462 I 0.640 -463 K 0.650 -464 G 0.646 -465 K 0.603 -466 L 0.534 -467 D 0.469 -468 A 0.418 -469 L 0.376 -470 W 0.352 -471 V 0.355 -472 L 0.369 -473 L 0.377 -474 R 0.399 -475 K 0.458 -476 G 0.535 -477 Y 0.592 -478 D 0.616 -479 R 0.629 -480 V 0.648 -481 S 0.679 -482 V 0.708 -483 M 0.714 -484 R 0.695 -485 P 0.674 -486 Q 0.677 -487 P 0.704 -488 G 0.737 -489 D 0.765 -490 T 0.785 -491 G 0.795 -492 R 0.794 -493 C 0.784 -494 I 0.773 -495 N 0.767 -496 F 0.767 -497 T 0.767 -498 R 0.767 -499 V 0.772 -500 K 0.779 -501 N 0.782 -502 S 0.778 -503 Q 0.777 -504 P 0.784 -505 A 0.793 -506 K 0.796 -507 Y 0.800 -508 P 0.811 -509 L 0.828 -510 N 0.842 -511 N 0.842 -512 T 0.828 -513 Y 0.812 -514 H 0.801 -515 P 0.794 -516 S 0.782 -517 S 0.764 -518 P 0.756 -519 P 0.764 -520 P 0.785 -521 A 0.804 -522 P 0.810 -523 I 0.797 -524 Y 0.773 -525 T 0.741 -526 P 0.694 -527 P 0.642 -528 P 0.626 -529 P 0.673 -530 A 0.745 -531 P 0.790 -532 H 0.799 -533 C 0.791 -534 P 0.784 -535 P 0.789 -536 P 0.804 -537 A 0.820 -538 P 0.830 -539 S 0.829 -540 A 0.821 -541 P 0.809 -542 T 0.799 -543 P 0.794 -544 P 0.795 -545 I 0.797 -546 P 0.793 -547 S 0.777 -548 P 0.735 -549 P 0.673 -550 S 0.630 -551 T 0.630 -552 L 0.634 -553 P 0.610 -554 P 0.602 -555 P 0.650 -556 P 0.718 -557 Q 0.755 -558 A 0.756 -559 P 0.748 -560 P 0.751 -561 P 0.764 -562 N 0.771 -563 R 0.762 -564 A 0.743 -565 P 0.729 -566 P 0.731 -567 P 0.740 -568 S 0.744 -569 R 0.740 -570 P 0.735 -571 P 0.741 -572 P 0.759 -573 R 0.778 -574 P 0.787 -575 S 0.777 -576 V 0.763 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033508.9_ENSMUST00000043400.9_GN:Asprv1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033508.9_ENSMUST00000043400.9_GN:Asprv1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 93a3d6d396115b9ade70e48601efef0a6a6157c2..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033508.9_ENSMUST00000043400.9_GN:Asprv1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,257 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000033508.9|ENSMUST00000043400.9|GN:Asprv1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.415 -2 A 0.417 -3 T 0.451 -4 S 0.528 -5 G 0.612 -6 V 0.663 -7 R 0.680 -8 S 0.682 -9 K 0.680 -10 E 0.673 -11 G 0.658 -12 R 0.633 -13 R 0.597 -14 E 0.541 -15 H 0.457 -16 A 0.350 -17 F 0.248 -18 V 0.175 -19 P 0.135 -20 E 0.113 -21 P 0.097 -22 F 0.086 -23 T 0.085 -24 G 0.091 -25 T 0.094 -26 N 0.092 -27 L 0.087 -28 A 0.081 -29 P 0.070 -30 S 0.057 -31 L 0.047 -32 W 0.047 -33 L 0.056 -34 H 0.062 -35 R 0.058 -36 F 0.051 -37 E 0.049 -38 V 0.054 -39 I 0.062 -40 D 0.076 -41 D 0.098 -42 L 0.116 -43 N 0.117 -44 H 0.103 -45 W 0.087 -46 D 0.074 -47 H 0.061 -48 A 0.048 -49 T 0.038 -50 K 0.034 -51 L 0.037 -52 R 0.049 -53 F 0.067 -54 L 0.077 -55 K 0.073 -56 E 0.063 -57 S 0.056 -58 L 0.054 -59 K 0.054 -60 G 0.051 -61 D 0.046 -62 A 0.041 -63 L 0.038 -64 D 0.039 -65 V 0.042 -66 Y 0.050 -67 N 0.061 -68 G 0.076 -69 L 0.086 -70 S 0.087 -71 S 0.078 -72 Q 0.067 -73 A 0.060 -74 Q 0.054 -75 G 0.048 -76 D 0.038 -77 F 0.028 -78 S 0.023 -79 F 0.025 -80 V 0.035 -81 K 0.051 -82 Q 0.063 -83 A 0.061 -84 L 0.052 -85 L 0.049 -86 R 0.056 -87 A 0.078 -88 F 0.124 -89 G 0.211 -90 A 0.333 -91 P 0.458 -92 G 0.545 -93 E 0.580 -94 A 0.572 -95 F 0.547 -96 S 0.530 -97 E 0.522 -98 P 0.505 -99 E 0.467 -100 E 0.423 -101 I 0.382 -102 L 0.340 -103 F 0.305 -104 A 0.288 -105 N 0.288 -106 S 0.293 -107 M 0.287 -108 G 0.257 -109 K 0.202 -110 G 0.139 -111 Y 0.084 -112 Y 0.049 -113 L 0.033 -114 K 0.027 -115 G 0.027 -116 K 0.035 -117 V 0.051 -118 G 0.073 -119 H 0.093 -120 V 0.097 -121 P 0.082 -122 V 0.057 -123 R 0.035 -124 F 0.025 -125 L 0.027 -126 V 0.038 -127 D 0.056 -128 S 0.075 -129 G 0.087 -130 A 0.090 -131 Q 0.083 -132 V 0.073 -133 S 0.066 -134 V 0.058 -135 V 0.050 -136 H 0.045 -137 P 0.043 -138 A 0.043 -139 L 0.042 -140 W 0.042 -141 E 0.045 -142 E 0.053 -143 V 0.070 -144 T 0.100 -145 D 0.133 -146 G 0.155 -147 D 0.162 -148 L 0.158 -149 D 0.149 -150 T 0.141 -151 L 0.141 -152 R 0.141 -153 P 0.135 -154 F 0.123 -155 N 0.115 -156 N 0.112 -157 V 0.109 -158 V 0.105 -159 K 0.104 -160 V 0.111 -161 A 0.127 -162 N 0.141 -163 G 0.147 -164 A 0.143 -165 E 0.133 -166 M 0.119 -167 K 0.108 -168 I 0.099 -169 L 0.090 -170 G 0.078 -171 V 0.063 -172 W 0.048 -173 D 0.038 -174 T 0.031 -175 E 0.029 -176 I 0.030 -177 S 0.037 -178 L 0.045 -179 G 0.054 -180 K 0.060 -181 T 0.062 -182 K 0.061 -183 L 0.055 -184 K 0.048 -185 A 0.040 -186 E 0.033 -187 F 0.030 -188 L 0.033 -189 V 0.044 -190 A 0.061 -191 N 0.081 -192 A 0.095 -193 S 0.098 -194 A 0.092 -195 E 0.081 -196 E 0.070 -197 A 0.058 -198 I 0.047 -199 I 0.040 -200 G 0.038 -201 T 0.040 -202 D 0.042 -203 V 0.043 -204 L 0.043 -205 Q 0.045 -206 D 0.046 -207 H 0.047 -208 N 0.050 -209 A 0.057 -210 V 0.063 -211 L 0.064 -212 D 0.065 -213 F 0.068 -214 E 0.067 -215 H 0.056 -216 R 0.041 -217 T 0.031 -218 C 0.028 -219 T 0.028 -220 L 0.030 -221 K 0.034 -222 G 0.038 -223 K 0.040 -224 K 0.040 -225 F 0.042 -226 R 0.049 -227 L 0.067 -228 L 0.100 -229 P 0.149 -230 V 0.219 -231 G 0.303 -232 S 0.380 -233 S 0.428 -234 L 0.444 -235 E 0.445 -236 D 0.440 -237 E 0.430 -238 F 0.416 -239 D 0.408 -240 L 0.414 -241 E 0.441 -242 L 0.480 -243 I 0.520 -244 E 0.560 -245 E 0.598 -246 E 0.630 -247 E 0.654 -248 G 0.665 -249 S 0.661 -250 S 0.647 -251 A 0.635 -252 P 0.633 -253 E 0.631 -254 G 0.609 -255 S 0.562 -256 H 0.520 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033508.9_ENSMUST00000043400.9_GN:Asprv1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:83.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033508.9_ENSMUST00000043400.9_GN:Asprv1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:83.caid deleted file mode 100644 index 7d2e72e4aabbcf0169951a464d82b06e178e26bc..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033508.9_ENSMUST00000043400.9_GN:Asprv1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:83.caid +++ /dev/null @@ -1,340 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000033508.9|ENSMUST00000043400.9|GN:Asprv1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:83 -1 M 0.407 -2 R 0.430 -3 N 0.472 -4 P 0.521 -5 G 0.562 -6 G 0.588 -7 P 0.592 -8 G 0.562 -9 W 0.504 -10 A 0.460 -11 S 0.460 -12 K 0.484 -13 R 0.501 -14 P 0.485 -15 L 0.434 -16 Q 0.386 -17 K 0.403 -18 K 0.485 -19 Q 0.572 -20 N 0.620 -21 T 0.631 -22 A 0.622 -23 C 0.606 -24 L 0.598 -25 C 0.599 -26 A 0.602 -27 Q 0.602 -28 Q 0.605 -29 P 0.617 -30 A 0.628 -31 R 0.626 -32 H 0.603 -33 F 0.573 -34 V 0.564 -35 P 0.589 -36 A 0.631 -37 P 0.666 -38 F 0.684 -39 N 0.680 -40 S 0.636 -41 S 0.545 -42 R 0.466 -43 Q 0.478 -44 G 0.582 -45 K 0.693 -46 N 0.750 -47 T 0.758 -48 A 0.746 -49 Q 0.732 -50 P 0.723 -51 T 0.721 -52 E 0.723 -53 P 0.725 -54 S 0.726 -55 L 0.727 -56 S 0.730 -57 S 0.731 -58 V 0.728 -59 I 0.717 -60 A 0.704 -61 P 0.686 -62 T 0.653 -63 L 0.604 -64 F 0.546 -65 C 0.479 -66 A 0.404 -67 F 0.342 -68 L 0.315 -69 Y 0.327 -70 L 0.363 -71 A 0.416 -72 C 0.486 -73 V 0.557 -74 T 0.610 -75 A 0.640 -76 E 0.648 -77 L 0.643 -78 P 0.637 -79 E 0.628 -80 V 0.601 -81 S 0.562 -82 R 0.552 -83 R 0.600 -84 M 0.675 -85 A 0.734 -86 T 0.768 -87 S 0.788 -88 G 0.798 -89 V 0.795 -90 R 0.784 -91 S 0.773 -92 K 0.762 -93 E 0.746 -94 G 0.719 -95 R 0.683 -96 R 0.640 -97 E 0.580 -98 H 0.487 -99 A 0.369 -100 F 0.254 -101 V 0.172 -102 P 0.127 -103 E 0.103 -104 P 0.087 -105 F 0.077 -106 T 0.076 -107 G 0.081 -108 T 0.083 -109 N 0.080 -110 L 0.076 -111 A 0.071 -112 P 0.062 -113 S 0.050 -114 L 0.040 -115 W 0.035 -116 L 0.034 -117 H 0.035 -118 R 0.036 -119 F 0.038 -120 E 0.042 -121 V 0.047 -122 I 0.053 -123 D 0.064 -124 D 0.081 -125 L 0.095 -126 N 0.095 -127 H 0.085 -128 W 0.074 -129 D 0.064 -130 H 0.053 -131 A 0.042 -132 T 0.034 -133 K 0.031 -134 L 0.034 -135 R 0.045 -136 F 0.060 -137 L 0.069 -138 K 0.066 -139 E 0.056 -140 S 0.049 -141 L 0.048 -142 K 0.048 -143 G 0.046 -144 D 0.041 -145 A 0.036 -146 L 0.033 -147 D 0.034 -148 V 0.038 -149 Y 0.044 -150 N 0.053 -151 G 0.064 -152 L 0.072 -153 S 0.074 -154 S 0.069 -155 Q 0.062 -156 A 0.058 -157 Q 0.054 -158 G 0.047 -159 D 0.036 -160 F 0.026 -161 S 0.021 -162 F 0.023 -163 V 0.033 -164 K 0.048 -165 Q 0.059 -166 A 0.056 -167 L 0.046 -168 L 0.042 -169 R 0.047 -170 A 0.067 -171 F 0.111 -172 G 0.195 -173 A 0.315 -174 P 0.439 -175 G 0.526 -176 E 0.562 -177 A 0.557 -178 F 0.534 -179 S 0.517 -180 E 0.508 -181 P 0.490 -182 E 0.458 -183 E 0.422 -184 I 0.389 -185 L 0.352 -186 F 0.317 -187 A 0.296 -188 N 0.290 -189 S 0.289 -190 M 0.279 -191 G 0.246 -192 K 0.192 -193 G 0.129 -194 Y 0.077 -195 Y 0.045 -196 L 0.030 -197 K 0.025 -198 G 0.027 -199 K 0.035 -200 V 0.050 -201 G 0.072 -202 H 0.091 -203 V 0.094 -204 P 0.079 -205 V 0.055 -206 R 0.035 -207 F 0.025 -208 L 0.026 -209 V 0.037 -210 D 0.053 -211 S 0.069 -212 G 0.081 -213 A 0.083 -214 Q 0.079 -215 V 0.072 -216 S 0.065 -217 V 0.058 -218 V 0.049 -219 H 0.044 -220 P 0.042 -221 A 0.042 -222 L 0.040 -223 W 0.038 -224 E 0.039 -225 E 0.046 -226 V 0.061 -227 T 0.087 -228 D 0.116 -229 G 0.135 -230 D 0.141 -231 L 0.137 -232 D 0.128 -233 T 0.123 -234 L 0.124 -235 R 0.127 -236 P 0.121 -237 F 0.111 -238 N 0.103 -239 N 0.099 -240 V 0.095 -241 V 0.090 -242 K 0.090 -243 V 0.097 -244 A 0.111 -245 N 0.123 -246 G 0.128 -247 A 0.125 -248 E 0.117 -249 M 0.107 -250 K 0.097 -251 I 0.090 -252 L 0.082 -253 G 0.070 -254 V 0.056 -255 W 0.044 -256 D 0.034 -257 T 0.028 -258 E 0.026 -259 I 0.028 -260 S 0.034 -261 L 0.043 -262 G 0.052 -263 K 0.059 -264 T 0.061 -265 K 0.059 -266 L 0.053 -267 K 0.046 -268 A 0.038 -269 E 0.032 -270 F 0.028 -271 L 0.031 -272 V 0.042 -273 A 0.058 -274 N 0.078 -275 A 0.093 -276 S 0.097 -277 A 0.092 -278 E 0.082 -279 E 0.072 -280 A 0.061 -281 I 0.050 -282 I 0.042 -283 G 0.040 -284 T 0.042 -285 D 0.045 -286 V 0.046 -287 L 0.046 -288 Q 0.047 -289 D 0.049 -290 H 0.051 -291 N 0.055 -292 A 0.062 -293 V 0.067 -294 L 0.065 -295 D 0.059 -296 F 0.051 -297 E 0.044 -298 H 0.037 -299 R 0.033 -300 T 0.030 -301 C 0.030 -302 T 0.032 -303 L 0.035 -304 K 0.040 -305 G 0.044 -306 K 0.046 -307 K 0.046 -308 F 0.047 -309 R 0.053 -310 L 0.070 -311 L 0.102 -312 P 0.152 -313 V 0.226 -314 G 0.318 -315 S 0.406 -316 S 0.463 -317 L 0.485 -318 E 0.488 -319 D 0.482 -320 E 0.470 -321 F 0.454 -322 D 0.442 -323 L 0.445 -324 E 0.468 -325 L 0.506 -326 I 0.551 -327 E 0.595 -328 E 0.633 -329 E 0.663 -330 E 0.683 -331 G 0.690 -332 S 0.685 -333 S 0.670 -334 A 0.658 -335 P 0.657 -336 E 0.657 -337 G 0.634 -338 S 0.583 -339 H 0.536 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033726.9_ENSMUST00000045942.9_GN:Emx1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033726.9_ENSMUST00000045942.9_GN:Emx1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 138d6e9cd06e09093fb321a72b6b05aeb3425d50..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033726.9_ENSMUST00000045942.9_GN:Emx1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,258 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000033726.9|ENSMUST00000045942.9|GN:Emx1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.527 -2 F 0.566 -3 Q 0.623 -4 P 0.677 -5 A 0.713 -6 A 0.727 -7 K 0.726 -8 R 0.715 -9 G 0.683 -10 F 0.618 -11 T 0.538 -12 I 0.489 -13 E 0.499 -14 S 0.552 -15 L 0.612 -16 V 0.665 -17 A 0.719 -18 K 0.766 -19 D 0.797 -20 G 0.813 -21 G 0.821 -22 T 0.824 -23 G 0.820 -24 G 0.808 -25 S 0.784 -26 P 0.739 -27 G 0.680 -28 S 0.655 -29 G 0.695 -30 G 0.764 -31 A 0.805 -32 G 0.807 -33 S 0.794 -34 H 0.789 -35 P 0.802 -36 L 0.828 -37 A 0.851 -38 V 0.864 -39 A 0.862 -40 A 0.846 -41 S 0.825 -42 E 0.807 -43 E 0.802 -44 P 0.810 -45 L 0.824 -46 R 0.838 -47 P 0.850 -48 T 0.857 -49 A 0.853 -50 L 0.832 -51 N 0.804 -52 Y 0.781 -53 P 0.773 -54 H 0.783 -55 P 0.804 -56 S 0.828 -57 A 0.847 -58 A 0.860 -59 E 0.867 -60 T 0.869 -61 A 0.865 -62 F 0.860 -63 V 0.854 -64 S 0.847 -65 G 0.836 -66 F 0.830 -67 P 0.836 -68 A 0.851 -69 A 0.863 -70 A 0.868 -71 A 0.870 -72 A 0.872 -73 G 0.875 -74 A 0.877 -75 G 0.874 -76 R 0.865 -77 S 0.852 -78 L 0.838 -79 Y 0.828 -80 G 0.824 -81 G 0.827 -82 P 0.836 -83 E 0.844 -84 L 0.843 -85 V 0.834 -86 F 0.826 -87 P 0.829 -88 E 0.837 -89 A 0.839 -90 M 0.831 -91 N 0.820 -92 H 0.818 -93 P 0.830 -94 A 0.846 -95 L 0.854 -96 T 0.850 -97 V 0.841 -98 H 0.834 -99 P 0.835 -100 A 0.843 -101 H 0.853 -102 Q 0.860 -103 L 0.865 -104 G 0.869 -105 S 0.867 -106 S 0.854 -107 S 0.829 -108 L 0.798 -109 Q 0.777 -110 P 0.778 -111 P 0.795 -112 H 0.814 -113 S 0.820 -114 F 0.817 -115 F 0.814 -116 S 0.813 -117 A 0.807 -118 Q 0.791 -119 H 0.770 -120 R 0.744 -121 D 0.713 -122 P 0.678 -123 L 0.645 -124 H 0.617 -125 F 0.583 -126 Y 0.533 -127 P 0.482 -128 W 0.454 -129 V 0.461 -130 L 0.494 -131 R 0.533 -132 N 0.561 -133 R 0.581 -134 F 0.607 -135 F 0.650 -136 G 0.700 -137 H 0.740 -138 R 0.764 -139 F 0.779 -140 Q 0.792 -141 A 0.801 -142 S 0.801 -143 D 0.791 -144 V 0.781 -145 P 0.786 -146 Q 0.808 -147 D 0.833 -148 G 0.844 -149 L 0.838 -150 L 0.818 -151 L 0.792 -152 H 0.766 -153 G 0.752 -154 P 0.748 -155 F 0.745 -156 A 0.729 -157 R 0.707 -158 K 0.685 -159 P 0.666 -160 K 0.637 -161 R 0.587 -162 I 0.501 -163 R 0.389 -164 T 0.289 -165 A 0.227 -166 F 0.188 -167 S 0.151 -168 P 0.110 -169 S 0.073 -170 Q 0.049 -171 L 0.040 -172 L 0.044 -173 R 0.054 -174 L 0.064 -175 E 0.072 -176 R 0.072 -177 A 0.063 -178 F 0.051 -179 E 0.043 -180 K 0.040 -181 N 0.039 -182 H 0.038 -183 Y 0.039 -184 V 0.041 -185 V 0.042 -186 G 0.043 -187 A 0.043 -188 E 0.041 -189 R 0.040 -190 K 0.044 -191 Q 0.055 -192 L 0.069 -193 A 0.076 -194 G 0.072 -195 S 0.065 -196 L 0.062 -197 S 0.061 -198 L 0.058 -199 S 0.052 -200 E 0.048 -201 T 0.047 -202 Q 0.047 -203 V 0.045 -204 K 0.038 -205 V 0.031 -206 W 0.026 -207 F 0.023 -208 Q 0.021 -209 N 0.021 -210 R 0.021 -211 R 0.024 -212 T 0.028 -213 K 0.036 -214 Y 0.052 -215 K 0.077 -216 R 0.109 -217 Q 0.148 -218 K 0.194 -219 L 0.244 -220 E 0.288 -221 E 0.329 -222 E 0.380 -223 G 0.449 -224 P 0.526 -225 E 0.586 -226 S 0.610 -227 E 0.600 -228 Q 0.573 -229 K 0.545 -230 K 0.525 -231 K 0.511 -232 G 0.493 -233 S 0.461 -234 H 0.413 -235 H 0.360 -236 I 0.318 -237 N 0.290 -238 R 0.274 -239 W 0.270 -240 R 0.285 -241 I 0.320 -242 A 0.380 -243 T 0.465 -244 K 0.556 -245 Q 0.620 -246 A 0.650 -247 N 0.664 -248 G 0.681 -249 E 0.703 -250 D 0.727 -251 I 0.744 -252 D 0.750 -253 V 0.743 -254 T 0.719 -255 S 0.668 -256 N 0.593 -257 D 0.531 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033726.9_ENSMUST00000045942.9_GN:Emx1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033726.9_ENSMUST00000045942.9_GN:Emx1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid deleted file mode 100644 index ccfc54d9aaf206f29fdab1e6123a9318d697e864..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000033726.9_ENSMUST00000045942.9_GN:Emx1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid +++ /dev/null @@ -1,291 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000033726.9|ENSMUST00000045942.9|GN:Emx1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:33 -1 M 0.488 -2 C 0.534 -3 Q 0.592 -4 A 0.625 -5 W 0.615 -6 C 0.578 -7 T 0.557 -8 P 0.570 -9 R 0.591 -10 T 0.616 -11 A 0.669 -12 A 0.730 -13 A 0.765 -14 P 0.775 -15 G 0.765 -16 H 0.725 -17 R 0.660 -18 A 0.619 -19 F 0.643 -20 P 0.705 -21 R 0.753 -22 A 0.774 -23 P 0.784 -24 L 0.799 -25 P 0.820 -26 H 0.838 -27 S 0.848 -28 A 0.852 -29 S 0.854 -30 A 0.856 -31 A 0.857 -32 A 0.851 -33 T 0.838 -34 M 0.817 -35 F 0.798 -36 Q 0.790 -37 P 0.797 -38 A 0.808 -39 A 0.809 -40 K 0.801 -41 R 0.786 -42 G 0.760 -43 F 0.714 -44 T 0.658 -45 I 0.622 -46 E 0.627 -47 S 0.665 -48 L 0.710 -49 V 0.747 -50 A 0.781 -51 K 0.810 -52 D 0.830 -53 G 0.843 -54 G 0.851 -55 T 0.856 -56 G 0.854 -57 G 0.849 -58 S 0.846 -59 P 0.850 -60 G 0.861 -61 S 0.869 -62 G 0.873 -63 G 0.873 -64 A 0.867 -65 G 0.853 -66 S 0.838 -67 H 0.832 -68 P 0.845 -69 L 0.867 -70 A 0.887 -71 V 0.897 -72 A 0.896 -73 A 0.882 -74 S 0.863 -75 E 0.845 -76 E 0.838 -77 P 0.841 -78 L 0.849 -79 R 0.858 -80 P 0.867 -81 T 0.872 -82 A 0.867 -83 L 0.848 -84 N 0.820 -85 Y 0.795 -86 P 0.786 -87 H 0.793 -88 P 0.812 -89 S 0.834 -90 A 0.852 -91 A 0.863 -92 E 0.868 -93 T 0.868 -94 A 0.863 -95 F 0.857 -96 V 0.851 -97 S 0.841 -98 G 0.829 -99 F 0.821 -100 P 0.828 -101 A 0.843 -102 A 0.856 -103 A 0.862 -104 A 0.861 -105 A 0.862 -106 G 0.863 -107 A 0.864 -108 G 0.859 -109 R 0.849 -110 S 0.835 -111 L 0.820 -112 Y 0.810 -113 G 0.806 -114 G 0.810 -115 P 0.821 -116 E 0.831 -117 L 0.831 -118 V 0.821 -119 F 0.811 -120 P 0.812 -121 E 0.820 -122 A 0.822 -123 M 0.814 -124 N 0.802 -125 H 0.800 -126 P 0.812 -127 A 0.831 -128 L 0.841 -129 T 0.838 -130 V 0.827 -131 H 0.819 -132 P 0.822 -133 A 0.835 -134 H 0.848 -135 Q 0.858 -136 L 0.865 -137 G 0.870 -138 S 0.869 -139 S 0.857 -140 S 0.834 -141 L 0.804 -142 Q 0.784 -143 P 0.785 -144 P 0.804 -145 H 0.824 -146 S 0.833 -147 F 0.831 -148 F 0.829 -149 S 0.828 -150 A 0.822 -151 Q 0.809 -152 H 0.789 -153 R 0.764 -154 D 0.734 -155 P 0.702 -156 L 0.674 -157 H 0.648 -158 F 0.611 -159 Y 0.557 -160 P 0.504 -161 W 0.477 -162 V 0.488 -163 L 0.522 -164 R 0.561 -165 N 0.592 -166 R 0.613 -167 F 0.637 -168 F 0.674 -169 G 0.717 -170 H 0.754 -171 R 0.777 -172 F 0.792 -173 Q 0.804 -174 A 0.813 -175 S 0.812 -176 D 0.801 -177 V 0.790 -178 P 0.794 -179 Q 0.816 -180 D 0.841 -181 G 0.853 -182 L 0.847 -183 L 0.827 -184 L 0.800 -185 H 0.773 -186 G 0.757 -187 P 0.753 -188 F 0.749 -189 A 0.733 -190 R 0.709 -191 K 0.688 -192 P 0.669 -193 K 0.643 -194 R 0.593 -195 I 0.506 -196 R 0.392 -197 T 0.291 -198 A 0.227 -199 F 0.189 -200 S 0.152 -201 P 0.112 -202 S 0.074 -203 Q 0.050 -204 L 0.041 -205 L 0.044 -206 R 0.054 -207 L 0.065 -208 E 0.072 -209 R 0.072 -210 A 0.063 -211 F 0.051 -212 E 0.043 -213 K 0.039 -214 N 0.037 -215 H 0.036 -216 Y 0.037 -217 V 0.039 -218 V 0.040 -219 G 0.042 -220 A 0.042 -221 E 0.040 -222 R 0.039 -223 K 0.043 -224 Q 0.054 -225 L 0.068 -226 A 0.075 -227 G 0.071 -228 S 0.064 -229 L 0.060 -230 S 0.058 -231 L 0.055 -232 S 0.050 -233 E 0.047 -234 T 0.046 -235 Q 0.047 -236 V 0.044 -237 K 0.038 -238 V 0.031 -239 W 0.026 -240 F 0.023 -241 Q 0.021 -242 N 0.021 -243 R 0.022 -244 R 0.025 -245 T 0.030 -246 K 0.038 -247 Y 0.054 -248 K 0.080 -249 R 0.113 -250 Q 0.153 -251 K 0.201 -252 L 0.251 -253 E 0.295 -254 E 0.335 -255 E 0.386 -256 G 0.455 -257 P 0.532 -258 E 0.592 -259 S 0.616 -260 E 0.604 -261 Q 0.574 -262 K 0.545 -263 K 0.525 -264 K 0.511 -265 G 0.493 -266 S 0.459 -267 H 0.409 -268 H 0.357 -269 I 0.316 -270 N 0.288 -271 R 0.271 -272 W 0.267 -273 R 0.283 -274 I 0.319 -275 A 0.380 -276 T 0.465 -277 K 0.557 -278 Q 0.622 -279 A 0.655 -280 N 0.672 -281 G 0.688 -282 E 0.709 -283 D 0.730 -284 I 0.744 -285 D 0.747 -286 V 0.739 -287 T 0.717 -288 S 0.669 -289 N 0.597 -290 D 0.537 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000034245.11_ENSMUST00000041736.11_GN:Hdac11_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000034245.11_ENSMUST00000041736.11_GN:Hdac11_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 6319b3cca5a87d8fa62cc0c90b7ec8dc63d001ce..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000034245.11_ENSMUST00000041736.11_GN:Hdac11_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,348 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000034245.11|ENSMUST00000041736.11|GN:Hdac11|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.339 -2 P 0.316 -3 H 0.282 -4 A 0.246 -5 T 0.208 -6 Q 0.167 -7 L 0.129 -8 Y 0.104 -9 Q 0.096 -10 H 0.098 -11 V 0.101 -12 P 0.098 -13 E 0.092 -14 K 0.087 -15 R 0.082 -16 W 0.074 -17 P 0.067 -18 I 0.066 -19 V 0.072 -20 Y 0.083 -21 S 0.096 -22 P 0.103 -23 R 0.103 -24 Y 0.098 -25 N 0.091 -26 I 0.084 -27 T 0.084 -28 F 0.098 -29 M 0.124 -30 G 0.149 -31 L 0.163 -32 E 0.171 -33 K 0.179 -34 L 0.184 -35 H 0.181 -36 P 0.172 -37 F 0.160 -38 D 0.147 -39 A 0.134 -40 G 0.117 -41 K 0.096 -42 W 0.077 -43 G 0.066 -44 K 0.065 -45 V 0.071 -46 I 0.080 -47 N 0.086 -48 F 0.087 -49 L 0.086 -50 K 0.089 -51 E 0.089 -52 E 0.083 -53 K 0.075 -54 L 0.074 -55 L 0.082 -56 S 0.093 -57 D 0.099 -58 G 0.095 -59 M 0.088 -60 L 0.090 -61 V 0.102 -62 E 0.114 -63 A 0.118 -64 R 0.112 -65 E 0.098 -66 A 0.082 -67 S 0.067 -68 E 0.058 -69 E 0.055 -70 D 0.056 -71 L 0.057 -72 L 0.059 -73 V 0.062 -74 V 0.064 -75 H 0.061 -76 T 0.053 -77 R 0.048 -78 R 0.047 -79 Y 0.048 -80 L 0.047 -81 N 0.046 -82 E 0.048 -83 L 0.051 -84 K 0.053 -85 W 0.053 -86 S 0.057 -87 F 0.065 -88 V 0.073 -89 V 0.082 -90 A 0.093 -91 T 0.108 -92 I 0.124 -93 T 0.139 -94 E 0.154 -95 I 0.166 -96 P 0.167 -97 P 0.155 -98 V 0.140 -99 I 0.125 -100 F 0.109 -101 L 0.093 -102 P 0.077 -103 N 0.061 -104 F 0.052 -105 L 0.049 -106 V 0.049 -107 Q 0.054 -108 R 0.066 -109 K 0.081 -110 V 0.094 -111 L 0.104 -112 R 0.120 -113 P 0.143 -114 L 0.152 -115 R 0.138 -116 T 0.119 -117 Q 0.109 -118 T 0.100 -119 G 0.087 -120 G 0.075 -121 T 0.065 -122 I 0.054 -123 M 0.043 -124 A 0.037 -125 G 0.034 -126 K 0.034 -127 L 0.035 -128 A 0.037 -129 V 0.037 -130 E 0.037 -131 R 0.042 -132 G 0.053 -133 W 0.072 -134 A 0.097 -135 I 0.127 -136 N 0.161 -137 V 0.191 -138 G 0.208 -139 G 0.211 -140 G 0.205 -141 F 0.195 -142 H 0.182 -143 H 0.167 -144 C 0.150 -145 S 0.135 -146 S 0.136 -147 D 0.160 -148 R 0.195 -149 G 0.221 -150 G 0.230 -151 G 0.228 -152 F 0.221 -153 C 0.208 -154 A 0.186 -155 Y 0.160 -156 A 0.140 -157 D 0.122 -158 I 0.102 -159 T 0.086 -160 L 0.077 -161 A 0.068 -162 I 0.058 -163 K 0.048 -164 F 0.041 -165 L 0.037 -166 F 0.036 -167 E 0.042 -168 R 0.053 -169 V 0.066 -170 E 0.077 -171 G 0.079 -172 I 0.071 -173 S 0.060 -174 R 0.058 -175 A 0.071 -176 T 0.097 -177 I 0.130 -178 I 0.156 -179 D 0.160 -180 L 0.140 -181 D 0.113 -182 A 0.102 -183 H 0.110 -184 Q 0.124 -185 G 0.132 -186 N 0.133 -187 G 0.131 -188 H 0.123 -189 E 0.111 -190 R 0.099 -191 D 0.092 -192 F 0.090 -193 M 0.090 -194 G 0.087 -195 D 0.078 -196 K 0.064 -197 R 0.053 -198 V 0.053 -199 Y 0.065 -200 I 0.081 -201 M 0.095 -202 D 0.102 -203 V 0.100 -204 Y 0.091 -205 N 0.082 -206 R 0.076 -207 H 0.073 -208 I 0.070 -209 Y 0.070 -210 P 0.080 -211 G 0.096 -212 D 0.112 -213 R 0.125 -214 F 0.136 -215 A 0.141 -216 K 0.137 -217 E 0.129 -218 A 0.119 -219 I 0.108 -220 R 0.101 -221 R 0.108 -222 K 0.128 -223 V 0.150 -224 E 0.166 -225 L 0.175 -226 E 0.180 -227 W 0.180 -228 G 0.169 -229 T 0.149 -230 E 0.125 -231 D 0.102 -232 E 0.083 -233 E 0.072 -234 Y 0.071 -235 L 0.075 -236 E 0.074 -237 K 0.067 -238 V 0.060 -239 E 0.062 -240 R 0.063 -241 N 0.059 -242 V 0.054 -243 R 0.056 -244 R 0.060 -245 S 0.055 -246 L 0.044 -247 Q 0.039 -248 E 0.041 -249 H 0.047 -250 L 0.050 -251 P 0.052 -252 D 0.056 -253 V 0.063 -254 V 0.075 -255 V 0.093 -256 Y 0.113 -257 N 0.125 -258 A 0.125 -259 G 0.118 -260 T 0.116 -261 D 0.122 -262 V 0.124 -263 L 0.119 -264 E 0.112 -265 G 0.115 -266 D 0.127 -267 R 0.141 -268 L 0.153 -269 G 0.161 -270 G 0.161 -271 L 0.151 -272 S 0.141 -273 I 0.136 -274 S 0.132 -275 P 0.124 -276 A 0.116 -277 G 0.111 -278 I 0.104 -279 V 0.092 -280 K 0.078 -281 R 0.069 -282 D 0.065 -283 E 0.058 -284 V 0.048 -285 V 0.038 -286 F 0.031 -287 R 0.029 -288 V 0.030 -289 V 0.031 -290 R 0.034 -291 A 0.041 -292 H 0.054 -293 D 0.066 -294 I 0.071 -295 P 0.068 -296 I 0.069 -297 L 0.078 -298 M 0.088 -299 V 0.093 -300 T 0.091 -301 S 0.093 -302 G 0.101 -303 G 0.114 -304 Y 0.122 -305 Q 0.119 -306 K 0.108 -307 R 0.094 -308 T 0.081 -309 A 0.074 -310 R 0.076 -311 I 0.081 -312 I 0.078 -313 A 0.068 -314 D 0.057 -315 S 0.052 -316 I 0.051 -317 L 0.054 -318 N 0.059 -319 L 0.064 -320 H 0.068 -321 D 0.076 -322 L 0.086 -323 G 0.093 -324 L 0.101 -325 I 0.121 -326 G 0.159 -327 P 0.208 -328 E 0.262 -329 F 0.320 -330 P 0.381 -331 C 0.443 -332 V 0.497 -333 S 0.528 -334 A 0.529 -335 Q 0.513 -336 N 0.502 -337 S 0.505 -338 G 0.517 -339 I 0.528 -340 P 0.532 -341 L 0.528 -342 L 0.524 -343 S 0.528 -344 C 0.529 -345 A 0.503 -346 V 0.454 -347 P 0.415 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000034245.11_ENSMUST00000041736.11_GN:Hdac11_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000034245.11_ENSMUST00000041736.11_GN:Hdac11_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid deleted file mode 100644 index caae6b187d075a6ceb75b73abb110d390e84cc4b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000034245.11_ENSMUST00000041736.11_GN:Hdac11_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid +++ /dev/null @@ -1,380 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000034245.11|ENSMUST00000041736.11|GN:Hdac11|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:32 -1 M 0.363 -2 E 0.362 -3 A 0.369 -4 C 0.384 -5 V 0.387 -6 L 0.377 -7 R 0.383 -8 R 0.420 -9 P 0.453 -10 C 0.448 -11 L 0.422 -12 L 0.412 -13 H 0.420 -14 P 0.429 -15 S 0.438 -16 H 0.446 -17 P 0.448 -18 S 0.467 -19 R 0.526 -20 C 0.598 -21 G 0.640 -22 V 0.643 -23 A 0.626 -24 S 0.603 -25 R 0.592 -26 A 0.601 -27 G 0.618 -28 R 0.630 -29 A 0.636 -30 G 0.634 -31 C 0.609 -32 G 0.553 -33 M 0.480 -34 P 0.409 -35 H 0.349 -36 A 0.293 -37 T 0.235 -38 Q 0.176 -39 L 0.130 -40 Y 0.102 -41 Q 0.091 -42 H 0.091 -43 V 0.093 -44 P 0.092 -45 E 0.088 -46 K 0.085 -47 R 0.080 -48 W 0.073 -49 P 0.067 -50 I 0.065 -51 V 0.072 -52 Y 0.084 -53 S 0.098 -54 P 0.106 -55 R 0.108 -56 Y 0.103 -57 N 0.097 -58 I 0.091 -59 T 0.090 -60 F 0.103 -61 M 0.128 -62 G 0.152 -63 L 0.166 -64 E 0.177 -65 K 0.188 -66 L 0.196 -67 H 0.192 -68 P 0.178 -69 F 0.162 -70 D 0.146 -71 A 0.131 -72 G 0.115 -73 K 0.095 -74 W 0.078 -75 G 0.067 -76 K 0.066 -77 V 0.072 -78 I 0.080 -79 N 0.086 -80 F 0.086 -81 L 0.084 -82 K 0.085 -83 E 0.085 -84 E 0.078 -85 K 0.069 -86 L 0.067 -87 L 0.074 -88 S 0.085 -89 D 0.092 -90 G 0.091 -91 M 0.086 -92 L 0.090 -93 V 0.104 -94 E 0.118 -95 A 0.122 -96 R 0.115 -97 E 0.100 -98 A 0.082 -99 S 0.066 -100 E 0.056 -101 E 0.052 -102 D 0.053 -103 L 0.054 -104 L 0.056 -105 V 0.059 -106 V 0.062 -107 H 0.059 -108 T 0.052 -109 R 0.045 -110 R 0.045 -111 Y 0.046 -112 L 0.045 -113 N 0.044 -114 E 0.046 -115 L 0.049 -116 K 0.050 -117 W 0.051 -118 S 0.055 -119 F 0.062 -120 V 0.070 -121 V 0.078 -122 A 0.088 -123 T 0.102 -124 I 0.117 -125 T 0.132 -126 E 0.148 -127 I 0.163 -128 P 0.167 -129 P 0.158 -130 V 0.144 -131 I 0.128 -132 F 0.111 -133 L 0.093 -134 P 0.076 -135 N 0.061 -136 F 0.052 -137 L 0.049 -138 V 0.050 -139 Q 0.055 -140 R 0.067 -141 K 0.082 -142 V 0.095 -143 L 0.106 -144 R 0.123 -145 P 0.146 -146 L 0.154 -147 R 0.141 -148 T 0.122 -149 Q 0.111 -150 T 0.102 -151 G 0.088 -152 G 0.077 -153 T 0.067 -154 I 0.056 -155 M 0.045 -156 A 0.038 -157 G 0.035 -158 K 0.034 -159 L 0.036 -160 A 0.038 -161 V 0.038 -162 E 0.038 -163 R 0.044 -164 G 0.055 -165 W 0.074 -166 A 0.100 -167 I 0.131 -168 N 0.165 -169 V 0.196 -170 G 0.214 -171 G 0.216 -172 G 0.209 -173 F 0.197 -174 H 0.184 -175 H 0.168 -176 C 0.151 -177 S 0.136 -178 S 0.138 -179 D 0.163 -180 R 0.198 -181 G 0.222 -182 G 0.230 -183 G 0.227 -184 F 0.220 -185 C 0.207 -186 A 0.186 -187 Y 0.163 -188 A 0.144 -189 D 0.126 -190 I 0.105 -191 T 0.089 -192 L 0.080 -193 A 0.072 -194 I 0.061 -195 K 0.051 -196 F 0.044 -197 L 0.039 -198 F 0.039 -199 E 0.044 -200 R 0.054 -201 V 0.067 -202 E 0.077 -203 G 0.078 -204 I 0.069 -205 S 0.059 -206 R 0.058 -207 A 0.072 -208 T 0.100 -209 I 0.134 -210 I 0.160 -211 D 0.164 -212 L 0.143 -213 D 0.115 -214 A 0.102 -215 H 0.108 -216 Q 0.121 -217 G 0.129 -218 N 0.131 -219 G 0.129 -220 H 0.122 -221 E 0.110 -222 R 0.098 -223 D 0.091 -224 F 0.089 -225 M 0.090 -226 G 0.087 -227 D 0.077 -228 K 0.063 -229 R 0.052 -230 V 0.052 -231 Y 0.064 -232 I 0.081 -233 M 0.095 -234 D 0.102 -235 V 0.100 -236 Y 0.092 -237 N 0.081 -238 R 0.075 -239 H 0.071 -240 I 0.068 -241 Y 0.068 -242 P 0.078 -243 G 0.093 -244 D 0.109 -245 R 0.122 -246 F 0.133 -247 A 0.139 -248 K 0.137 -249 E 0.130 -250 A 0.121 -251 I 0.110 -252 R 0.103 -253 R 0.109 -254 K 0.129 -255 V 0.151 -256 E 0.166 -257 L 0.176 -258 E 0.180 -259 W 0.179 -260 G 0.168 -261 T 0.148 -262 E 0.124 -263 D 0.101 -264 E 0.082 -265 E 0.072 -266 Y 0.072 -267 L 0.075 -268 E 0.075 -269 K 0.067 -270 V 0.061 -271 E 0.062 -272 R 0.064 -273 N 0.058 -274 V 0.051 -275 R 0.050 -276 R 0.052 -277 S 0.049 -278 L 0.042 -279 Q 0.038 -280 E 0.042 -281 H 0.047 -282 L 0.049 -283 P 0.052 -284 D 0.056 -285 V 0.064 -286 V 0.077 -287 V 0.097 -288 Y 0.117 -289 N 0.130 -290 A 0.128 -291 G 0.120 -292 T 0.118 -293 D 0.124 -294 V 0.126 -295 L 0.120 -296 E 0.114 -297 G 0.116 -298 D 0.128 -299 R 0.143 -300 L 0.155 -301 G 0.164 -302 G 0.163 -303 L 0.154 -304 S 0.144 -305 I 0.139 -306 S 0.135 -307 P 0.127 -308 A 0.119 -309 G 0.114 -310 I 0.108 -311 V 0.095 -312 K 0.081 -313 R 0.073 -314 D 0.068 -315 E 0.061 -316 V 0.050 -317 V 0.039 -318 F 0.033 -319 R 0.031 -320 V 0.031 -321 V 0.033 -322 R 0.036 -323 A 0.043 -324 H 0.056 -325 D 0.069 -326 I 0.073 -327 P 0.071 -328 I 0.072 -329 L 0.081 -330 M 0.092 -331 V 0.096 -332 T 0.095 -333 S 0.096 -334 G 0.104 -335 G 0.117 -336 Y 0.124 -337 Q 0.121 -338 K 0.110 -339 R 0.095 -340 T 0.083 -341 A 0.076 -342 R 0.079 -343 I 0.084 -344 I 0.081 -345 A 0.070 -346 D 0.060 -347 S 0.054 -348 I 0.053 -349 L 0.055 -350 N 0.061 -351 L 0.065 -352 H 0.070 -353 D 0.078 -354 L 0.088 -355 G 0.095 -356 L 0.104 -357 I 0.126 -358 G 0.166 -359 P 0.218 -360 E 0.275 -361 F 0.335 -362 P 0.399 -363 C 0.464 -364 V 0.519 -365 S 0.551 -366 A 0.552 -367 Q 0.538 -368 N 0.526 -369 S 0.528 -370 G 0.539 -371 I 0.550 -372 P 0.556 -373 L 0.554 -374 L 0.551 -375 S 0.553 -376 C 0.550 -377 A 0.520 -378 V 0.467 -379 P 0.425 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000034634.8_ENSMUST00000040404.8_GN:Ly6d_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000034634.8_ENSMUST00000040404.8_GN:Ly6d_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 7777cc07e5032b30dc83b0001d0b183c3475c32b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000034634.8_ENSMUST00000040404.8_GN:Ly6d_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,128 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000034634.8|ENSMUST00000040404.8|GN:Ly6d|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.206 -2 K 0.195 -3 T 0.181 -4 A 0.170 -5 L 0.163 -6 L 0.159 -7 V 0.160 -8 L 0.165 -9 L 0.177 -10 V 0.202 -11 L 0.243 -12 A 0.296 -13 V 0.337 -14 A 0.353 -15 T 0.355 -16 S 0.363 -17 P 0.375 -18 A 0.364 -19 W 0.309 -20 A 0.220 -21 L 0.133 -22 R 0.072 -23 C 0.043 -24 H 0.037 -25 V 0.042 -26 C 0.049 -27 T 0.054 -28 N 0.059 -29 S 0.065 -30 A 0.072 -31 N 0.075 -32 C 0.076 -33 K 0.075 -34 N 0.074 -35 P 0.072 -36 Q 0.069 -37 V 0.068 -38 C 0.066 -39 P 0.063 -40 S 0.056 -41 N 0.049 -42 F 0.042 -43 Y 0.034 -44 F 0.025 -45 C 0.020 -46 K 0.022 -47 T 0.031 -48 V 0.045 -49 T 0.063 -50 S 0.082 -51 V 0.100 -52 E 0.114 -53 P 0.119 -54 L 0.119 -55 N 0.117 -56 G 0.116 -57 N 0.111 -58 L 0.101 -59 V 0.081 -60 R 0.059 -61 K 0.045 -62 E 0.045 -63 C 0.053 -64 A 0.064 -65 N 0.073 -66 S 0.082 -67 C 0.100 -68 T 0.132 -69 S 0.182 -70 D 0.245 -71 Y 0.315 -72 S 0.379 -73 Q 0.426 -74 Q 0.450 -75 G 0.446 -76 H 0.417 -77 V 0.370 -78 S 0.321 -79 S 0.278 -80 G 0.241 -81 S 0.199 -82 E 0.152 -83 V 0.107 -84 T 0.072 -85 Q 0.051 -86 C 0.045 -87 C 0.049 -88 Q 0.061 -89 T 0.079 -90 D 0.098 -91 L 0.110 -92 C 0.114 -93 N 0.118 -94 E 0.136 -95 R 0.184 -96 L 0.261 -97 V 0.360 -98 S 0.467 -99 A 0.558 -100 A 0.616 -101 P 0.649 -102 G 0.671 -103 H 0.681 -104 A 0.678 -105 L 0.667 -106 L 0.660 -107 S 0.661 -108 S 0.662 -109 V 0.656 -110 T 0.652 -111 L 0.656 -112 G 0.658 -113 L 0.639 -114 A 0.604 -115 T 0.563 -116 S 0.515 -117 L 0.459 -118 S 0.407 -119 L 0.364 -120 L 0.323 -121 T 0.285 -122 V 0.258 -123 M 0.248 -124 A 0.250 -125 L 0.258 -126 C 0.262 -127 L 0.261 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000034634.8_ENSMUST00000040404.8_GN:Ly6d_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:4.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000034634.8_ENSMUST00000040404.8_GN:Ly6d_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:4.caid deleted file mode 100644 index b15cf7095d346fd14c8f896441509cb6c8caf2a8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000034634.8_ENSMUST00000040404.8_GN:Ly6d_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:4.caid +++ /dev/null @@ -1,132 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000034634.8|ENSMUST00000040404.8|GN:Ly6d|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:4 -1 M 0.273 -2 M 0.259 -3 F 0.241 -4 R 0.225 -5 M 0.205 -6 K 0.181 -7 T 0.161 -8 A 0.150 -9 L 0.148 -10 L 0.153 -11 V 0.162 -12 L 0.172 -13 L 0.184 -14 V 0.204 -15 L 0.237 -16 A 0.282 -17 V 0.318 -18 A 0.333 -19 T 0.338 -20 S 0.353 -21 P 0.371 -22 A 0.364 -23 W 0.309 -24 A 0.221 -25 L 0.133 -26 R 0.072 -27 C 0.043 -28 H 0.036 -29 V 0.041 -30 C 0.049 -31 T 0.054 -32 N 0.059 -33 S 0.065 -34 A 0.072 -35 N 0.075 -36 C 0.075 -37 K 0.075 -38 N 0.073 -39 P 0.071 -40 Q 0.068 -41 V 0.067 -42 C 0.065 -43 P 0.062 -44 S 0.056 -45 N 0.049 -46 F 0.042 -47 Y 0.034 -48 F 0.026 -49 C 0.020 -50 K 0.022 -51 T 0.031 -52 V 0.045 -53 T 0.063 -54 S 0.082 -55 V 0.100 -56 E 0.114 -57 P 0.119 -58 L 0.118 -59 N 0.117 -60 G 0.115 -61 N 0.110 -62 L 0.099 -63 V 0.080 -64 R 0.058 -65 K 0.045 -66 E 0.044 -67 C 0.053 -68 A 0.064 -69 N 0.073 -70 S 0.082 -71 C 0.100 -72 T 0.133 -73 S 0.184 -74 D 0.248 -75 Y 0.317 -76 S 0.381 -77 Q 0.427 -78 Q 0.451 -79 G 0.447 -80 H 0.417 -81 V 0.370 -82 S 0.320 -83 S 0.278 -84 G 0.241 -85 S 0.199 -86 E 0.152 -87 V 0.107 -88 T 0.071 -89 Q 0.051 -90 C 0.045 -91 C 0.049 -92 Q 0.061 -93 T 0.079 -94 D 0.097 -95 L 0.110 -96 C 0.114 -97 N 0.117 -98 E 0.136 -99 R 0.184 -100 L 0.260 -101 V 0.359 -102 S 0.465 -103 A 0.555 -104 A 0.613 -105 P 0.648 -106 G 0.670 -107 H 0.680 -108 A 0.675 -109 L 0.663 -110 L 0.656 -111 S 0.657 -112 S 0.657 -113 V 0.649 -114 T 0.643 -115 L 0.648 -116 G 0.649 -117 L 0.629 -118 A 0.591 -119 T 0.549 -120 S 0.502 -121 L 0.449 -122 S 0.399 -123 L 0.355 -124 L 0.312 -125 T 0.273 -126 V 0.248 -127 M 0.238 -128 A 0.242 -129 L 0.253 -130 C 0.259 -131 L 0.259 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000035234.19_ENSMUST00000055245.13_GN:Abraxas1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000035234.19_ENSMUST00000055245.13_GN:Abraxas1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 19b7d28b6f6445e17eb7aef205cf4150490860f5..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000035234.19_ENSMUST00000055245.13_GN:Abraxas1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,408 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000035234.19|ENSMUST00000055245.13|GN:Abraxas1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.408 -2 E 0.395 -3 G 0.359 -4 E 0.297 -5 S 0.223 -6 T 0.158 -7 L 0.116 -8 G 0.095 -9 V 0.085 -10 L 0.080 -11 S 0.072 -12 G 0.062 -13 F 0.053 -14 V 0.047 -15 L 0.045 -16 G 0.044 -17 A 0.043 -18 L 0.043 -19 T 0.042 -20 F 0.042 -21 H 0.043 -22 H 0.048 -23 L 0.060 -24 N 0.073 -25 T 0.080 -26 D 0.079 -27 S 0.072 -28 D 0.064 -29 T 0.057 -30 E 0.049 -31 G 0.042 -32 F 0.040 -33 L 0.041 -34 L 0.045 -35 G 0.051 -36 E 0.064 -37 M 0.086 -38 K 0.119 -39 G 0.159 -40 E 0.204 -41 A 0.254 -42 K 0.312 -43 N 0.380 -44 S 0.445 -45 I 0.488 -46 T 0.496 -47 D 0.481 -48 S 0.464 -49 Q 0.456 -50 M 0.454 -51 D 0.446 -52 N 0.430 -53 V 0.406 -54 K 0.369 -55 V 0.312 -56 V 0.236 -57 Y 0.159 -58 T 0.102 -59 I 0.070 -60 D 0.058 -61 I 0.057 -62 Q 0.058 -63 K 0.058 -64 Y 0.055 -65 I 0.054 -66 P 0.054 -67 C 0.057 -68 Y 0.062 -69 R 0.068 -70 L 0.075 -71 F 0.081 -72 S 0.084 -73 F 0.088 -74 Y 0.098 -75 N 0.113 -76 S 0.130 -77 L 0.138 -78 G 0.134 -79 E 0.120 -80 V 0.099 -81 N 0.078 -82 E 0.064 -83 H 0.057 -84 A 0.051 -85 L 0.049 -86 K 0.052 -87 K 0.054 -88 V 0.049 -89 L 0.042 -90 S 0.040 -91 N 0.041 -92 V 0.043 -93 R 0.044 -94 K 0.047 -95 T 0.051 -96 V 0.053 -97 V 0.051 -98 G 0.047 -99 W 0.047 -100 Y 0.054 -101 K 0.062 -102 F 0.069 -103 R 0.075 -104 R 0.081 -105 H 0.087 -106 S 0.091 -107 D 0.090 -108 Q 0.084 -109 I 0.072 -110 M 0.059 -111 T 0.048 -112 F 0.041 -113 R 0.036 -114 E 0.033 -115 Q 0.030 -116 L 0.028 -117 L 0.027 -118 H 0.027 -119 R 0.027 -120 N 0.028 -121 L 0.028 -122 Q 0.027 -123 T 0.027 -124 H 0.031 -125 L 0.040 -126 S 0.055 -127 S 0.066 -128 P 0.067 -129 E 0.059 -130 L 0.048 -131 V 0.039 -132 F 0.033 -133 L 0.035 -134 L 0.045 -135 L 0.063 -136 T 0.085 -137 P 0.108 -138 S 0.127 -139 I 0.141 -140 T 0.151 -141 T 0.166 -142 E 0.195 -143 S 0.230 -144 C 0.251 -145 S 0.242 -146 T 0.209 -147 H 0.165 -148 C 0.126 -149 L 0.098 -150 E 0.079 -151 H 0.065 -152 A 0.053 -153 L 0.044 -154 Y 0.040 -155 K 0.043 -156 P 0.053 -157 Q 0.066 -158 R 0.075 -159 G 0.077 -160 L 0.074 -161 F 0.072 -162 H 0.072 -163 R 0.073 -164 V 0.070 -165 P 0.065 -166 L 0.062 -167 V 0.070 -168 V 0.098 -169 T 0.147 -170 N 0.209 -171 L 0.268 -172 G 0.306 -173 M 0.318 -174 S 0.313 -175 D 0.307 -176 Q 0.306 -177 L 0.307 -178 G 0.308 -179 Y 0.316 -180 K 0.343 -181 T 0.378 -182 E 0.403 -183 P 0.408 -184 A 0.395 -185 S 0.370 -186 C 0.344 -187 T 0.324 -188 S 0.299 -189 T 0.256 -190 V 0.208 -191 F 0.174 -192 S 0.163 -193 R 0.175 -194 A 0.197 -195 V 0.212 -196 R 0.217 -197 T 0.219 -198 H 0.220 -199 S 0.223 -200 S 0.230 -201 Q 0.242 -202 F 0.254 -203 F 0.274 -204 N 0.304 -205 E 0.340 -206 D 0.369 -207 G 0.382 -208 S 0.370 -209 L 0.331 -210 K 0.278 -211 E 0.233 -212 V 0.206 -213 H 0.191 -214 K 0.177 -215 I 0.161 -216 N 0.151 -217 E 0.151 -218 M 0.157 -219 Y 0.168 -220 A 0.184 -221 A 0.198 -222 V 0.202 -223 Q 0.201 -224 E 0.207 -225 E 0.216 -226 L 0.217 -227 K 0.214 -228 S 0.219 -229 I 0.224 -230 C 0.224 -231 Q 0.227 -232 K 0.239 -233 V 0.247 -234 E 0.243 -235 Q 0.232 -236 S 0.221 -237 E 0.215 -238 R 0.213 -239 E 0.212 -240 V 0.207 -241 E 0.197 -242 K 0.184 -243 L 0.173 -244 L 0.165 -245 M 0.162 -246 D 0.160 -247 V 0.158 -248 N 0.158 -249 Q 0.161 -250 L 0.165 -251 K 0.166 -252 E 0.166 -253 V 0.165 -254 R 0.168 -255 R 0.184 -256 T 0.217 -257 Q 0.257 -258 Q 0.290 -259 A 0.314 -260 R 0.344 -261 A 0.395 -262 T 0.458 -263 G 0.518 -264 A 0.566 -265 G 0.599 -266 E 0.615 -267 K 0.605 -268 N 0.570 -269 V 0.521 -270 Q 0.472 -271 R 0.431 -272 N 0.396 -273 P 0.366 -274 Q 0.343 -275 E 0.323 -276 N 0.289 -277 I 0.238 -278 L 0.189 -279 L 0.156 -280 C 0.134 -281 Q 0.121 -282 A 0.113 -283 L 0.108 -284 R 0.107 -285 T 0.118 -286 F 0.137 -287 F 0.159 -288 P 0.179 -289 E 0.198 -290 S 0.201 -291 E 0.180 -292 V 0.147 -293 L 0.124 -294 H 0.111 -295 S 0.103 -296 C 0.099 -297 V 0.103 -298 I 0.119 -299 S 0.144 -300 L 0.171 -301 K 0.201 -302 N 0.238 -303 R 0.279 -304 H 0.322 -305 I 0.372 -306 S 0.428 -307 P 0.484 -308 S 0.538 -309 G 0.581 -310 C 0.605 -311 N 0.610 -312 V 0.598 -313 N 0.567 -314 H 0.519 -315 H 0.460 -316 V 0.399 -317 D 0.345 -318 V 0.307 -319 V 0.276 -320 D 0.241 -321 Q 0.205 -322 L 0.178 -323 T 0.166 -324 L 0.162 -325 M 0.162 -326 V 0.158 -327 E 0.156 -328 Y 0.171 -329 V 0.214 -330 Y 0.291 -331 S 0.398 -332 P 0.510 -333 E 0.591 -334 A 0.627 -335 S 0.636 -336 P 0.647 -337 V 0.670 -338 P 0.698 -339 T 0.719 -340 A 0.724 -341 Q 0.714 -342 L 0.697 -343 R 0.678 -344 K 0.647 -345 R 0.609 -346 K 0.602 -347 A 0.652 -348 L 0.720 -349 D 0.760 -350 T 0.772 -351 H 0.776 -352 D 0.783 -353 Q 0.789 -354 G 0.786 -355 S 0.771 -356 V 0.750 -357 K 0.735 -358 R 0.737 -359 P 0.756 -360 R 0.779 -361 L 0.795 -362 L 0.801 -363 E 0.798 -364 T 0.790 -365 E 0.779 -366 S 0.770 -367 R 0.772 -368 P 0.785 -369 S 0.788 -370 V 0.756 -371 A 0.691 -372 A 0.645 -373 S 0.651 -374 R 0.664 -375 S 0.643 -376 R 0.631 -377 H 0.673 -378 Q 0.743 -379 D 0.792 -380 K 0.809 -381 A 0.809 -382 S 0.801 -383 S 0.791 -384 S 0.782 -385 S 0.772 -386 L 0.762 -387 D 0.755 -388 I 0.749 -389 D 0.736 -390 I 0.718 -391 E 0.706 -392 M 0.711 -393 G 0.727 -394 S 0.744 -395 P 0.757 -396 E 0.764 -397 D 0.759 -398 D 0.740 -399 A 0.710 -400 D 0.679 -401 Y 0.658 -402 P 0.648 -403 R 0.650 -404 S 0.652 -405 P 0.630 -406 T 0.574 -407 F 0.518 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000035234.19_ENSMUST00000055245.13_GN:Abraxas1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:15.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000035234.19_ENSMUST00000055245.13_GN:Abraxas1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:15.caid deleted file mode 100644 index 97085d26ccfee44f5e4821176863a967073fc2c4..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000035234.19_ENSMUST00000055245.13_GN:Abraxas1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:15.caid +++ /dev/null @@ -1,423 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000035234.19|ENSMUST00000055245.13|GN:Abraxas1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:15 -1 M 0.379 -2 L 0.416 -3 R 0.477 -4 D 0.543 -5 S 0.598 -6 G 0.638 -7 C 0.667 -8 G 0.689 -9 G 0.700 -10 S 0.700 -11 D 0.701 -12 R 0.704 -13 G 0.702 -14 G 0.687 -15 S 0.660 -16 M 0.626 -17 E 0.574 -18 G 0.490 -19 E 0.377 -20 S 0.265 -21 T 0.179 -22 L 0.128 -23 G 0.103 -24 V 0.092 -25 L 0.084 -26 S 0.076 -27 G 0.065 -28 F 0.055 -29 V 0.049 -30 L 0.047 -31 G 0.046 -32 A 0.044 -33 L 0.043 -34 T 0.042 -35 F 0.041 -36 H 0.042 -37 H 0.048 -38 L 0.060 -39 N 0.073 -40 T 0.080 -41 D 0.077 -42 S 0.070 -43 D 0.063 -44 T 0.056 -45 E 0.048 -46 G 0.042 -47 F 0.040 -48 L 0.042 -49 L 0.046 -50 G 0.053 -51 E 0.067 -52 M 0.091 -53 K 0.125 -54 G 0.165 -55 E 0.210 -56 A 0.262 -57 K 0.323 -58 N 0.389 -59 S 0.453 -60 I 0.494 -61 T 0.502 -62 D 0.487 -63 S 0.468 -64 Q 0.459 -65 M 0.454 -66 D 0.444 -67 N 0.425 -68 V 0.397 -69 K 0.358 -70 V 0.302 -71 V 0.229 -72 Y 0.154 -73 T 0.099 -74 I 0.068 -75 D 0.056 -76 I 0.054 -77 Q 0.056 -78 K 0.055 -79 Y 0.053 -80 I 0.051 -81 P 0.051 -82 C 0.054 -83 Y 0.059 -84 R 0.064 -85 L 0.070 -86 F 0.076 -87 S 0.080 -88 F 0.085 -89 Y 0.096 -90 N 0.112 -91 S 0.127 -92 L 0.135 -93 G 0.131 -94 E 0.117 -95 V 0.097 -96 N 0.074 -97 E 0.056 -98 H 0.047 -99 A 0.044 -100 L 0.045 -101 K 0.051 -102 K 0.054 -103 V 0.049 -104 L 0.041 -105 S 0.039 -106 N 0.040 -107 V 0.041 -108 R 0.043 -109 K 0.046 -110 T 0.050 -111 V 0.052 -112 V 0.050 -113 G 0.046 -114 W 0.047 -115 Y 0.053 -116 K 0.062 -117 F 0.068 -118 R 0.074 -119 R 0.081 -120 H 0.088 -121 S 0.092 -122 D 0.092 -123 Q 0.086 -124 I 0.075 -125 M 0.061 -126 T 0.050 -127 F 0.042 -128 R 0.038 -129 E 0.034 -130 Q 0.031 -131 L 0.029 -132 L 0.028 -133 H 0.028 -134 R 0.028 -135 N 0.029 -136 L 0.029 -137 Q 0.028 -138 T 0.028 -139 H 0.032 -140 L 0.042 -141 S 0.057 -142 S 0.068 -143 P 0.069 -144 E 0.060 -145 L 0.049 -146 V 0.039 -147 F 0.033 -148 L 0.034 -149 L 0.044 -150 L 0.062 -151 T 0.085 -152 P 0.108 -153 S 0.127 -154 I 0.140 -155 T 0.149 -156 T 0.163 -157 E 0.191 -158 S 0.227 -159 C 0.248 -160 S 0.240 -161 T 0.209 -162 H 0.167 -163 C 0.127 -164 L 0.099 -165 E 0.080 -166 H 0.066 -167 A 0.054 -168 L 0.045 -169 Y 0.040 -170 K 0.043 -171 P 0.054 -172 Q 0.067 -173 R 0.076 -174 G 0.078 -175 L 0.076 -176 F 0.074 -177 H 0.074 -178 R 0.073 -179 V 0.071 -180 P 0.065 -181 L 0.062 -182 V 0.070 -183 V 0.098 -184 T 0.146 -185 N 0.207 -186 L 0.263 -187 G 0.299 -188 M 0.310 -189 S 0.306 -190 D 0.300 -191 Q 0.298 -192 L 0.297 -193 G 0.297 -194 Y 0.306 -195 K 0.333 -196 T 0.368 -197 E 0.392 -198 P 0.396 -199 A 0.383 -200 S 0.358 -201 C 0.333 -202 T 0.314 -203 S 0.290 -204 T 0.249 -205 V 0.202 -206 F 0.169 -207 S 0.160 -208 R 0.173 -209 A 0.195 -210 V 0.208 -211 R 0.212 -212 T 0.214 -213 H 0.215 -214 S 0.218 -215 S 0.226 -216 Q 0.238 -217 F 0.250 -218 F 0.269 -219 N 0.297 -220 E 0.330 -221 D 0.354 -222 G 0.364 -223 S 0.352 -224 L 0.315 -225 K 0.264 -226 E 0.222 -227 V 0.196 -228 H 0.182 -229 K 0.170 -230 I 0.157 -231 N 0.149 -232 E 0.149 -233 M 0.157 -234 Y 0.168 -235 A 0.184 -236 A 0.197 -237 V 0.201 -238 Q 0.200 -239 E 0.207 -240 E 0.216 -241 L 0.217 -242 K 0.216 -243 S 0.221 -244 I 0.226 -245 C 0.225 -246 Q 0.228 -247 K 0.240 -248 V 0.249 -249 E 0.245 -250 Q 0.233 -251 S 0.223 -252 E 0.216 -253 R 0.215 -254 E 0.214 -255 V 0.210 -256 E 0.199 -257 K 0.185 -258 L 0.173 -259 L 0.164 -260 M 0.161 -261 D 0.159 -262 V 0.157 -263 N 0.157 -264 Q 0.161 -265 L 0.166 -266 K 0.168 -267 E 0.168 -268 V 0.167 -269 R 0.171 -270 R 0.186 -271 T 0.218 -272 Q 0.258 -273 Q 0.292 -274 A 0.317 -275 R 0.348 -276 A 0.398 -277 T 0.460 -278 G 0.518 -279 A 0.564 -280 G 0.597 -281 E 0.612 -282 K 0.603 -283 N 0.569 -284 V 0.520 -285 Q 0.470 -286 R 0.428 -287 N 0.392 -288 P 0.362 -289 Q 0.339 -290 E 0.317 -291 N 0.282 -292 I 0.232 -293 L 0.185 -294 L 0.153 -295 C 0.135 -296 Q 0.123 -297 A 0.117 -298 L 0.112 -299 R 0.111 -300 T 0.121 -301 F 0.141 -302 F 0.163 -303 P 0.186 -304 E 0.206 -305 S 0.211 -306 E 0.187 -307 V 0.151 -308 L 0.124 -309 H 0.111 -310 S 0.103 -311 C 0.098 -312 V 0.102 -313 I 0.118 -314 S 0.143 -315 L 0.170 -316 K 0.200 -317 N 0.236 -318 R 0.277 -319 H 0.321 -320 I 0.371 -321 S 0.429 -322 P 0.486 -323 S 0.540 -324 G 0.582 -325 C 0.604 -326 N 0.608 -327 V 0.596 -328 N 0.567 -329 H 0.520 -330 H 0.461 -331 V 0.401 -332 D 0.347 -333 V 0.308 -334 V 0.278 -335 D 0.243 -336 Q 0.206 -337 L 0.178 -338 T 0.165 -339 L 0.160 -340 M 0.159 -341 V 0.154 -342 E 0.153 -343 Y 0.168 -344 V 0.211 -345 Y 0.288 -346 S 0.395 -347 P 0.507 -348 E 0.589 -349 A 0.625 -350 S 0.635 -351 P 0.647 -352 V 0.670 -353 P 0.698 -354 T 0.719 -355 A 0.724 -356 Q 0.714 -357 L 0.697 -358 R 0.678 -359 K 0.647 -360 R 0.610 -361 K 0.603 -362 A 0.652 -363 L 0.720 -364 D 0.761 -365 T 0.773 -366 H 0.777 -367 D 0.784 -368 Q 0.789 -369 G 0.786 -370 S 0.772 -371 V 0.752 -372 K 0.737 -373 R 0.739 -374 P 0.757 -375 R 0.779 -376 L 0.795 -377 L 0.800 -378 E 0.797 -379 T 0.789 -380 E 0.778 -381 S 0.769 -382 R 0.772 -383 P 0.784 -384 S 0.788 -385 V 0.756 -386 A 0.690 -387 A 0.645 -388 S 0.651 -389 R 0.664 -390 S 0.642 -391 R 0.629 -392 H 0.672 -393 Q 0.743 -394 D 0.793 -395 K 0.812 -396 A 0.811 -397 S 0.802 -398 S 0.793 -399 S 0.784 -400 S 0.773 -401 L 0.763 -402 D 0.757 -403 I 0.751 -404 D 0.738 -405 I 0.719 -406 E 0.707 -407 M 0.712 -408 G 0.729 -409 S 0.746 -410 P 0.759 -411 E 0.766 -412 D 0.762 -413 D 0.742 -414 A 0.712 -415 D 0.682 -416 Y 0.661 -417 P 0.653 -418 R 0.656 -419 S 0.658 -420 P 0.635 -421 T 0.577 -422 F 0.522 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000035686.9_ENSMUST00000043077.8_GN:Thrsp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000035686.9_ENSMUST00000043077.8_GN:Thrsp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index defa98958c9ae5a883f2953018e9b62aea61661f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000035686.9_ENSMUST00000043077.8_GN:Thrsp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,151 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000035686.9|ENSMUST00000043077.8|GN:Thrsp|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.290 -2 Q 0.276 -3 V 0.249 -4 L 0.216 -5 T 0.190 -6 K 0.176 -7 R 0.172 -8 Y 0.170 -9 P 0.158 -10 K 0.136 -11 N 0.113 -12 C 0.093 -13 L 0.075 -14 L 0.059 -15 T 0.048 -16 V 0.044 -17 M 0.043 -18 D 0.045 -19 R 0.048 -20 Y 0.050 -21 S 0.048 -22 A 0.045 -23 V 0.045 -24 V 0.052 -25 R 0.063 -26 N 0.072 -27 M 0.074 -28 E 0.077 -29 Q 0.087 -30 V 0.104 -31 V 0.120 -32 M 0.136 -33 I 0.142 -34 P 0.133 -35 S 0.120 -36 L 0.117 -37 L 0.133 -38 R 0.174 -39 D 0.241 -40 V 0.322 -41 Q 0.395 -42 L 0.448 -43 S 0.495 -44 G 0.547 -45 P 0.610 -46 G 0.670 -47 G 0.706 -48 S 0.707 -49 V 0.675 -50 Q 0.615 -51 D 0.537 -52 G 0.456 -53 A 0.373 -54 P 0.285 -55 D 0.203 -56 L 0.140 -57 Y 0.096 -58 T 0.065 -59 Y 0.049 -60 F 0.046 -61 T 0.054 -62 M 0.063 -63 L 0.065 -64 K 0.062 -65 S 0.060 -66 I 0.057 -67 C 0.056 -68 V 0.062 -69 E 0.074 -70 V 0.087 -71 D 0.100 -72 H 0.120 -73 G 0.146 -74 L 0.168 -75 L 0.177 -76 P 0.169 -77 R 0.151 -78 E 0.133 -79 E 0.123 -80 W 0.130 -81 Q 0.156 -82 A 0.201 -83 K 0.265 -84 V 0.353 -85 A 0.462 -86 G 0.563 -87 N 0.628 -88 E 0.659 -89 T 0.670 -90 S 0.672 -91 E 0.669 -92 A 0.669 -93 E 0.672 -94 N 0.664 -95 D 0.627 -96 A 0.572 -97 A 0.537 -98 E 0.548 -99 T 0.575 -100 E 0.584 -101 E 0.566 -102 A 0.531 -103 E 0.493 -104 E 0.468 -105 D 0.467 -106 R 0.474 -107 I 0.466 -108 S 0.436 -109 E 0.394 -110 E 0.345 -111 L 0.286 -112 D 0.217 -113 L 0.157 -114 E 0.118 -115 A 0.099 -116 Q 0.090 -117 F 0.085 -118 H 0.081 -119 L 0.078 -120 H 0.078 -121 F 0.079 -122 C 0.082 -123 S 0.088 -124 L 0.090 -125 H 0.083 -126 H 0.074 -127 I 0.072 -128 L 0.074 -129 T 0.075 -130 H 0.077 -131 L 0.082 -132 T 0.088 -133 R 0.088 -134 K 0.082 -135 A 0.075 -136 Q 0.070 -137 E 0.069 -138 V 0.073 -139 T 0.081 -140 R 0.085 -141 K 0.082 -142 Y 0.082 -143 Q 0.092 -144 E 0.116 -145 M 0.157 -146 T 0.209 -147 G 0.255 -148 Q 0.277 -149 V 0.271 -150 L 0.257 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000035686.9_ENSMUST00000043077.8_GN:Thrsp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000035686.9_ENSMUST00000043077.8_GN:Thrsp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid deleted file mode 100644 index 12f86576af314c493b6eae686e98e15381f81eda..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000035686.9_ENSMUST00000043077.8_GN:Thrsp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid +++ /dev/null @@ -1,183 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000035686.9|ENSMUST00000043077.8|GN:Thrsp|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:32 -1 M 0.440 -2 V 0.466 -3 G 0.489 -4 L 0.485 -5 W 0.466 -6 H 0.454 -7 P 0.452 -8 V 0.443 -9 N 0.424 -10 L 0.408 -11 L 0.403 -12 S 0.403 -13 A 0.403 -14 Q 0.412 -15 K 0.438 -16 P 0.482 -17 R 0.527 -18 N 0.542 -19 S 0.507 -20 A 0.434 -21 G 0.354 -22 A 0.286 -23 V 0.232 -24 C 0.193 -25 R 0.172 -26 T 0.169 -27 L 0.170 -28 R 0.162 -29 K 0.155 -30 E 0.161 -31 A 0.175 -32 T 0.182 -33 M 0.176 -34 Q 0.161 -35 V 0.140 -36 L 0.116 -37 T 0.099 -38 K 0.096 -39 R 0.107 -40 Y 0.120 -41 P 0.122 -42 K 0.109 -43 N 0.090 -44 C 0.072 -45 L 0.057 -46 L 0.045 -47 T 0.039 -48 V 0.038 -49 M 0.039 -50 D 0.040 -51 R 0.041 -52 Y 0.044 -53 S 0.047 -54 A 0.049 -55 V 0.050 -56 V 0.054 -57 R 0.061 -58 N 0.068 -59 M 0.070 -60 E 0.072 -61 Q 0.080 -62 V 0.090 -63 V 0.101 -64 M 0.113 -65 I 0.120 -66 P 0.118 -67 S 0.114 -68 L 0.117 -69 L 0.133 -70 R 0.169 -71 D 0.226 -72 V 0.292 -73 Q 0.354 -74 L 0.410 -75 S 0.465 -76 G 0.524 -77 P 0.587 -78 G 0.646 -79 G 0.683 -80 S 0.686 -81 V 0.651 -82 Q 0.586 -83 D 0.508 -84 G 0.432 -85 A 0.354 -86 P 0.272 -87 D 0.196 -88 L 0.139 -89 Y 0.098 -90 T 0.067 -91 Y 0.048 -92 F 0.045 -93 T 0.051 -94 M 0.057 -95 L 0.056 -96 K 0.052 -97 S 0.050 -98 I 0.046 -99 C 0.044 -100 V 0.047 -101 E 0.058 -102 V 0.072 -103 D 0.091 -104 H 0.121 -105 G 0.155 -106 L 0.181 -107 L 0.187 -108 P 0.176 -109 R 0.158 -110 E 0.141 -111 E 0.134 -112 W 0.142 -113 Q 0.170 -114 A 0.220 -115 K 0.288 -116 V 0.373 -117 A 0.471 -118 G 0.562 -119 N 0.620 -120 E 0.649 -121 T 0.661 -122 S 0.663 -123 E 0.659 -124 A 0.657 -125 E 0.662 -126 N 0.665 -127 D 0.659 -128 A 0.648 -129 A 0.638 -130 E 0.623 -131 T 0.597 -132 E 0.558 -133 E 0.514 -134 A 0.470 -135 E 0.430 -136 E 0.408 -137 D 0.408 -138 R 0.419 -139 I 0.421 -140 S 0.402 -141 E 0.363 -142 E 0.313 -143 L 0.255 -144 D 0.197 -145 L 0.148 -146 E 0.117 -147 A 0.099 -148 Q 0.088 -149 F 0.082 -150 H 0.080 -151 L 0.080 -152 H 0.081 -153 F 0.085 -154 C 0.092 -155 S 0.099 -156 L 0.099 -157 H 0.089 -158 H 0.079 -159 I 0.077 -160 L 0.078 -161 T 0.077 -162 H 0.078 -163 L 0.084 -164 T 0.090 -165 R 0.088 -166 K 0.077 -167 A 0.064 -168 Q 0.054 -169 E 0.050 -170 V 0.053 -171 T 0.063 -172 R 0.070 -173 K 0.069 -174 Y 0.067 -175 Q 0.076 -176 E 0.100 -177 M 0.140 -178 T 0.191 -179 G 0.234 -180 Q 0.252 -181 V 0.246 -182 L 0.233 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036256.14_ENSMUST00000163898.6_GN:Igfbp7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036256.14_ENSMUST00000163898.6_GN:Igfbp7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 1472979f472c9fa4903d3288d20f53b69990be61..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036256.14_ENSMUST00000163898.6_GN:Igfbp7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,313 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000036256.14|ENSMUST00000163898.6|GN:Igfbp7|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.441 -2 E 0.456 -3 R 0.474 -4 P 0.469 -5 P 0.431 -6 R 0.393 -7 A 0.409 -8 L 0.466 -9 L 0.505 -10 L 0.527 -11 G 0.562 -12 A 0.582 -13 A 0.550 -14 G 0.495 -15 L 0.461 -16 L 0.440 -17 L 0.413 -18 L 0.399 -19 L 0.426 -20 L 0.485 -21 P 0.548 -22 L 0.602 -23 S 0.638 -24 S 0.659 -25 S 0.667 -26 S 0.667 -27 S 0.655 -28 S 0.628 -29 D 0.574 -30 A 0.491 -31 C 0.398 -32 G 0.320 -33 P 0.263 -34 C 0.218 -35 V 0.186 -36 P 0.170 -37 A 0.168 -38 S 0.175 -39 C 0.186 -40 P 0.200 -41 A 0.213 -42 L 0.220 -43 P 0.217 -44 R 0.205 -45 L 0.192 -46 G 0.183 -47 C 0.178 -48 P 0.179 -49 L 0.188 -50 G 0.204 -51 E 0.226 -52 T 0.255 -53 R 0.290 -54 D 0.308 -55 A 0.286 -56 C 0.241 -57 G 0.197 -58 C 0.163 -59 C 0.146 -60 P 0.146 -61 V 0.155 -62 C 0.167 -63 A 0.180 -64 R 0.192 -65 G 0.192 -66 E 0.180 -67 G 0.175 -68 E 0.184 -69 P 0.198 -70 C 0.212 -71 G 0.237 -72 G 0.273 -73 G 0.309 -74 A 0.326 -75 A 0.314 -76 G 0.278 -77 R 0.234 -78 G 0.200 -79 H 0.190 -80 C 0.201 -81 A 0.206 -82 P 0.188 -83 G 0.160 -84 M 0.143 -85 E 0.143 -86 C 0.162 -87 V 0.207 -88 K 0.279 -89 S 0.364 -90 R 0.438 -91 K 0.497 -92 R 0.544 -93 R 0.585 -94 K 0.619 -95 G 0.649 -96 K 0.674 -97 A 0.692 -98 G 0.699 -99 A 0.696 -100 A 0.686 -101 A 0.663 -102 G 0.627 -103 G 0.578 -104 P 0.510 -105 A 0.419 -106 T 0.311 -107 L 0.212 -108 A 0.143 -109 V 0.108 -110 C 0.093 -111 V 0.091 -112 C 0.097 -113 K 0.105 -114 S 0.108 -115 R 0.106 -116 Y 0.100 -117 P 0.092 -118 V 0.082 -119 C 0.068 -120 G 0.058 -121 S 0.060 -122 N 0.079 -123 G 0.107 -124 I 0.127 -125 T 0.130 -126 Y 0.120 -127 P 0.104 -128 S 0.090 -129 G 0.082 -130 C 0.078 -131 Q 0.072 -132 L 0.068 -133 R 0.068 -134 A 0.070 -135 A 0.073 -136 S 0.080 -137 L 0.090 -138 R 0.103 -139 A 0.115 -140 E 0.124 -141 S 0.136 -142 R 0.155 -143 G 0.177 -144 E 0.189 -145 K 0.184 -146 A 0.162 -147 I 0.130 -148 T 0.098 -149 Q 0.079 -150 V 0.078 -151 S 0.091 -152 K 0.111 -153 G 0.137 -154 T 0.181 -155 C 0.262 -156 E 0.378 -157 Q 0.494 -158 G 0.575 -159 S 0.618 -160 L 0.638 -161 I 0.650 -162 W 0.658 -163 D 0.659 -164 T 0.654 -165 Q 0.651 -166 P 0.661 -167 A 0.679 -168 Q 0.689 -169 R 0.679 -170 S 0.653 -171 H 0.616 -172 N 0.570 -173 P 0.517 -174 Q 0.485 -175 V 0.492 -176 E 0.508 -177 N 0.496 -178 R 0.463 -179 C 0.432 -180 F 0.413 -181 R 0.404 -182 D 0.402 -183 K 0.399 -184 H 0.393 -185 S 0.382 -186 R 0.355 -187 E 0.307 -188 Q 0.246 -189 G 0.191 -190 P 0.153 -191 S 0.129 -192 I 0.113 -193 V 0.103 -194 T 0.097 -195 P 0.094 -196 P 0.093 -197 K 0.092 -198 D 0.085 -199 I 0.070 -200 W 0.053 -201 N 0.043 -202 V 0.041 -203 T 0.046 -204 G 0.054 -205 A 0.060 -206 K 0.061 -207 V 0.058 -208 F 0.051 -209 L 0.047 -210 S 0.045 -211 C 0.045 -212 E 0.046 -213 V 0.052 -214 I 0.062 -215 G 0.068 -216 I 0.063 -217 P 0.056 -218 T 0.053 -219 P 0.050 -220 V 0.044 -221 L 0.035 -222 I 0.027 -223 W 0.024 -224 N 0.028 -225 K 0.039 -226 V 0.057 -227 K 0.082 -228 R 0.113 -229 D 0.147 -230 H 0.178 -231 S 0.195 -232 G 0.195 -233 V 0.182 -234 Q 0.158 -235 R 0.131 -236 T 0.109 -237 E 0.095 -238 L 0.094 -239 L 0.109 -240 P 0.138 -241 G 0.159 -242 D 0.153 -243 R 0.124 -244 E 0.091 -245 N 0.068 -246 L 0.060 -247 A 0.062 -248 I 0.066 -249 Q 0.072 -250 T 0.084 -251 R 0.105 -252 G 0.128 -253 G 0.143 -254 P 0.140 -255 E 0.122 -256 K 0.096 -257 H 0.072 -258 E 0.058 -259 V 0.050 -260 T 0.042 -261 G 0.036 -262 W 0.034 -263 V 0.034 -264 L 0.033 -265 V 0.030 -266 S 0.028 -267 P 0.034 -268 L 0.044 -269 S 0.054 -270 K 0.063 -271 E 0.073 -272 D 0.087 -273 A 0.096 -274 G 0.089 -275 E 0.068 -276 Y 0.046 -277 E 0.031 -278 C 0.027 -279 H 0.027 -280 A 0.029 -281 S 0.033 -282 N 0.042 -283 S 0.056 -284 Q 0.067 -285 G 0.072 -286 Q 0.072 -287 A 0.069 -288 S 0.063 -289 A 0.057 -290 A 0.053 -291 A 0.049 -292 K 0.045 -293 I 0.046 -294 T 0.059 -295 V 0.096 -296 V 0.162 -297 D 0.252 -298 A 0.347 -299 L 0.429 -300 H 0.493 -301 E 0.545 -302 I 0.587 -303 P 0.618 -304 L 0.641 -305 K 0.660 -306 K 0.675 -307 G 0.689 -308 E 0.703 -309 G 0.705 -310 A 0.677 -311 Q 0.616 -312 L 0.560 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036256.14_ENSMUST00000163898.6_GN:Igfbp7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036256.14_ENSMUST00000163898.6_GN:Igfbp7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid deleted file mode 100644 index 5cdda8c14c512fcd69899ee60ba8a780b5af1137..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036256.14_ENSMUST00000163898.6_GN:Igfbp7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid +++ /dev/null @@ -1,314 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000036256.14|ENSMUST00000163898.6|GN:Igfbp7|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:1 -1 M 0.439 -2 M 0.460 -3 E 0.491 -4 R 0.515 -5 P 0.519 -6 P 0.507 -7 R 0.515 -8 A 0.552 -9 L 0.574 -10 L 0.552 -11 L 0.526 -12 G 0.515 -13 A 0.481 -14 A 0.419 -15 G 0.383 -16 L 0.380 -17 L 0.362 -18 L 0.331 -19 L 0.337 -20 L 0.397 -21 L 0.477 -22 P 0.547 -23 L 0.601 -24 S 0.638 -25 S 0.658 -26 S 0.665 -27 S 0.665 -28 S 0.654 -29 S 0.627 -30 D 0.573 -31 A 0.491 -32 C 0.400 -33 G 0.322 -34 P 0.263 -35 C 0.218 -36 V 0.185 -37 P 0.169 -38 A 0.168 -39 S 0.175 -40 C 0.186 -41 P 0.200 -42 A 0.213 -43 L 0.220 -44 P 0.216 -45 R 0.204 -46 L 0.192 -47 G 0.183 -48 C 0.178 -49 P 0.179 -50 L 0.188 -51 G 0.204 -52 E 0.225 -53 T 0.254 -54 R 0.290 -55 D 0.308 -56 A 0.286 -57 C 0.241 -58 G 0.196 -59 C 0.162 -60 C 0.145 -61 P 0.145 -62 V 0.154 -63 C 0.166 -64 A 0.179 -65 R 0.191 -66 G 0.191 -67 E 0.180 -68 G 0.174 -69 E 0.183 -70 P 0.197 -71 C 0.212 -72 G 0.237 -73 G 0.273 -74 G 0.308 -75 A 0.325 -76 A 0.314 -77 G 0.278 -78 R 0.233 -79 G 0.199 -80 H 0.189 -81 C 0.200 -82 A 0.205 -83 P 0.187 -84 G 0.159 -85 M 0.142 -86 E 0.142 -87 C 0.162 -88 V 0.206 -89 K 0.279 -90 S 0.363 -91 R 0.437 -92 K 0.495 -93 R 0.543 -94 R 0.584 -95 K 0.618 -96 G 0.648 -97 K 0.673 -98 A 0.691 -99 G 0.698 -100 A 0.696 -101 A 0.685 -102 A 0.663 -103 G 0.626 -104 G 0.576 -105 P 0.508 -106 A 0.417 -107 T 0.310 -108 L 0.211 -109 A 0.143 -110 V 0.107 -111 C 0.093 -112 V 0.091 -113 C 0.097 -114 K 0.105 -115 S 0.108 -116 R 0.106 -117 Y 0.100 -118 P 0.092 -119 V 0.082 -120 C 0.069 -121 G 0.058 -122 S 0.060 -123 N 0.079 -124 G 0.107 -125 I 0.127 -126 T 0.131 -127 Y 0.120 -128 P 0.104 -129 S 0.089 -130 G 0.082 -131 C 0.078 -132 Q 0.072 -133 L 0.068 -134 R 0.068 -135 A 0.070 -136 A 0.073 -137 S 0.079 -138 L 0.090 -139 R 0.103 -140 A 0.115 -141 E 0.124 -142 S 0.135 -143 R 0.155 -144 G 0.177 -145 E 0.189 -146 K 0.184 -147 A 0.162 -148 I 0.130 -149 T 0.097 -150 Q 0.079 -151 V 0.078 -152 S 0.091 -153 K 0.111 -154 G 0.137 -155 T 0.181 -156 C 0.262 -157 E 0.378 -158 Q 0.494 -159 G 0.575 -160 S 0.618 -161 L 0.638 -162 I 0.649 -163 W 0.658 -164 D 0.659 -165 T 0.654 -166 Q 0.651 -167 P 0.661 -168 A 0.679 -169 Q 0.689 -170 R 0.679 -171 S 0.653 -172 H 0.616 -173 N 0.570 -174 P 0.517 -175 Q 0.485 -176 V 0.492 -177 E 0.508 -178 N 0.496 -179 R 0.462 -180 C 0.432 -181 F 0.413 -182 R 0.404 -183 D 0.402 -184 K 0.398 -185 H 0.392 -186 S 0.380 -187 R 0.354 -188 E 0.306 -189 Q 0.246 -190 G 0.191 -191 P 0.153 -192 S 0.129 -193 I 0.113 -194 V 0.103 -195 T 0.098 -196 P 0.094 -197 P 0.093 -198 K 0.092 -199 D 0.085 -200 I 0.070 -201 W 0.053 -202 N 0.042 -203 V 0.041 -204 T 0.046 -205 G 0.054 -206 A 0.060 -207 K 0.061 -208 V 0.057 -209 F 0.051 -210 L 0.047 -211 S 0.045 -212 C 0.045 -213 E 0.046 -214 V 0.052 -215 I 0.062 -216 G 0.067 -217 I 0.063 -218 P 0.056 -219 T 0.053 -220 P 0.050 -221 V 0.044 -222 L 0.035 -223 I 0.027 -224 W 0.024 -225 N 0.028 -226 K 0.039 -227 V 0.057 -228 K 0.082 -229 R 0.112 -230 D 0.147 -231 H 0.178 -232 S 0.195 -233 G 0.195 -234 V 0.181 -235 Q 0.158 -236 R 0.131 -237 T 0.108 -238 E 0.095 -239 L 0.094 -240 L 0.110 -241 P 0.138 -242 G 0.159 -243 D 0.153 -244 R 0.124 -245 E 0.091 -246 N 0.068 -247 L 0.060 -248 A 0.061 -249 I 0.066 -250 Q 0.072 -251 T 0.084 -252 R 0.105 -253 G 0.128 -254 G 0.142 -255 P 0.140 -256 E 0.122 -257 K 0.095 -258 H 0.072 -259 E 0.058 -260 V 0.050 -261 T 0.042 -262 G 0.036 -263 W 0.034 -264 V 0.034 -265 L 0.033 -266 V 0.030 -267 S 0.028 -268 P 0.034 -269 L 0.044 -270 S 0.054 -271 K 0.063 -272 E 0.073 -273 D 0.087 -274 A 0.096 -275 G 0.089 -276 E 0.068 -277 Y 0.046 -278 E 0.031 -279 C 0.027 -280 H 0.027 -281 A 0.029 -282 S 0.033 -283 N 0.042 -284 S 0.056 -285 Q 0.067 -286 G 0.072 -287 Q 0.072 -288 A 0.069 -289 S 0.063 -290 A 0.058 -291 A 0.053 -292 A 0.049 -293 K 0.045 -294 I 0.046 -295 T 0.059 -296 V 0.096 -297 V 0.162 -298 D 0.252 -299 A 0.348 -300 L 0.430 -301 H 0.493 -302 E 0.545 -303 I 0.587 -304 P 0.618 -305 L 0.641 -306 K 0.659 -307 K 0.674 -308 G 0.689 -309 E 0.702 -310 G 0.705 -311 A 0.676 -312 Q 0.616 -313 L 0.560 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036309.15_ENSMUST00000109072.2_GN:Skp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036309.15_ENSMUST00000109072.2_GN:Skp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 7dba4b019af6890f75683be4ee0c42848465e4bd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036309.15_ENSMUST00000109072.2_GN:Skp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,164 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000036309.15|ENSMUST00000109072.2|GN:Skp1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.223 -2 P 0.176 -3 T 0.115 -4 I 0.067 -5 K 0.040 -6 L 0.029 -7 Q 0.030 -8 S 0.041 -9 S 0.061 -10 D 0.082 -11 G 0.089 -12 E 0.078 -13 I 0.059 -14 F 0.045 -15 E 0.039 -16 V 0.036 -17 D 0.032 -18 V 0.028 -19 E 0.028 -20 I 0.031 -21 A 0.032 -22 K 0.031 -23 Q 0.030 -24 S 0.030 -25 V 0.031 -26 T 0.036 -27 I 0.050 -28 K 0.067 -29 T 0.077 -30 M 0.077 -31 L 0.079 -32 E 0.093 -33 D 0.128 -34 L 0.186 -35 G 0.255 -36 M 0.313 -37 D 0.352 -38 D 0.373 -39 E 0.379 -40 G 0.368 -41 D 0.338 -42 D 0.293 -43 D 0.238 -44 P 0.184 -45 V 0.144 -46 P 0.123 -47 L 0.116 -48 P 0.111 -49 N 0.103 -50 V 0.096 -51 N 0.086 -52 A 0.073 -53 A 0.059 -54 I 0.052 -55 L 0.050 -56 K 0.047 -57 K 0.045 -58 V 0.045 -59 I 0.043 -60 Q 0.038 -61 W 0.035 -62 C 0.035 -63 T 0.037 -64 H 0.045 -65 H 0.063 -66 K 0.090 -67 D 0.130 -68 D 0.187 -69 P 0.260 -70 P 0.340 -71 P 0.413 -72 P 0.472 -73 E 0.515 -74 D 0.540 -75 D 0.538 -76 E 0.520 -77 N 0.506 -78 K 0.504 -79 E 0.507 -80 K 0.507 -81 R 0.485 -82 T 0.426 -83 D 0.335 -84 D 0.243 -85 I 0.169 -86 P 0.113 -87 V 0.071 -88 W 0.049 -89 D 0.047 -90 Q 0.056 -91 E 0.064 -92 F 0.065 -93 L 0.064 -94 K 0.065 -95 V 0.066 -96 D 0.064 -97 Q 0.058 -98 G 0.054 -99 T 0.052 -100 L 0.050 -101 F 0.049 -102 E 0.049 -103 L 0.049 -104 I 0.047 -105 L 0.045 -106 A 0.045 -107 A 0.046 -108 N 0.048 -109 Y 0.054 -110 L 0.065 -111 D 0.074 -112 I 0.077 -113 K 0.074 -114 G 0.069 -115 L 0.067 -116 L 0.067 -117 D 0.068 -118 V 0.072 -119 T 0.080 -120 C 0.085 -121 K 0.082 -122 T 0.079 -123 V 0.084 -124 A 0.091 -125 N 0.098 -126 M 0.110 -127 I 0.126 -128 K 0.136 -129 G 0.138 -130 K 0.144 -131 T 0.152 -132 P 0.151 -133 E 0.137 -134 E 0.127 -135 I 0.126 -136 R 0.127 -137 K 0.132 -138 T 0.146 -139 F 0.167 -140 N 0.188 -141 I 0.204 -142 K 0.211 -143 N 0.206 -144 D 0.192 -145 F 0.174 -146 T 0.160 -147 E 0.154 -148 E 0.161 -149 E 0.174 -150 E 0.188 -151 A 0.202 -152 Q 0.219 -153 V 0.232 -154 R 0.237 -155 K 0.242 -156 E 0.253 -157 N 0.264 -158 Q 0.277 -159 W 0.302 -160 C 0.336 -161 E 0.359 -162 E 0.363 -163 K 0.357 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036309.15_ENSMUST00000109072.2_GN:Skp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036309.15_ENSMUST00000109072.2_GN:Skp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid deleted file mode 100644 index 639f64a53719f1c0964a238bcf9a1942345c8145..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036309.15_ENSMUST00000109072.2_GN:Skp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid +++ /dev/null @@ -1,166 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000036309.15|ENSMUST00000109072.2|GN:Skp1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:2 -1 M 0.399 -2 Q 0.367 -3 M 0.301 -4 P 0.215 -5 T 0.132 -6 I 0.072 -7 K 0.040 -8 L 0.028 -9 Q 0.028 -10 S 0.040 -11 S 0.059 -12 D 0.080 -13 G 0.087 -14 E 0.076 -15 I 0.058 -16 F 0.044 -17 E 0.037 -18 V 0.033 -19 D 0.028 -20 V 0.026 -21 E 0.027 -22 I 0.030 -23 A 0.031 -24 K 0.030 -25 Q 0.030 -26 S 0.030 -27 V 0.031 -28 T 0.036 -29 I 0.049 -30 K 0.066 -31 T 0.076 -32 M 0.077 -33 L 0.079 -34 E 0.094 -35 D 0.130 -36 L 0.190 -37 G 0.259 -38 M 0.319 -39 D 0.358 -40 D 0.380 -41 E 0.385 -42 G 0.373 -43 D 0.343 -44 D 0.296 -45 D 0.239 -46 P 0.184 -47 V 0.143 -48 P 0.122 -49 L 0.115 -50 P 0.110 -51 N 0.103 -52 V 0.095 -53 N 0.086 -54 A 0.072 -55 A 0.059 -56 I 0.052 -57 L 0.049 -58 K 0.047 -59 K 0.045 -60 V 0.045 -61 I 0.043 -62 Q 0.039 -63 W 0.035 -64 C 0.035 -65 T 0.037 -66 H 0.045 -67 H 0.062 -68 K 0.090 -69 D 0.129 -70 D 0.187 -71 P 0.261 -72 P 0.341 -73 P 0.414 -74 P 0.473 -75 E 0.517 -76 D 0.541 -77 D 0.539 -78 E 0.520 -79 N 0.506 -80 K 0.503 -81 E 0.507 -82 K 0.506 -83 R 0.484 -84 T 0.425 -85 D 0.335 -86 D 0.243 -87 I 0.170 -88 P 0.114 -89 V 0.072 -90 W 0.049 -91 D 0.047 -92 Q 0.056 -93 E 0.064 -94 F 0.065 -95 L 0.064 -96 K 0.065 -97 V 0.067 -98 D 0.064 -99 Q 0.058 -100 G 0.054 -101 T 0.052 -102 L 0.050 -103 F 0.049 -104 E 0.049 -105 L 0.049 -106 I 0.047 -107 L 0.045 -108 A 0.045 -109 A 0.046 -110 N 0.048 -111 Y 0.055 -112 L 0.065 -113 D 0.074 -114 I 0.077 -115 K 0.074 -116 G 0.069 -117 L 0.067 -118 L 0.067 -119 D 0.068 -120 V 0.072 -121 T 0.080 -122 C 0.085 -123 K 0.082 -124 T 0.079 -125 V 0.084 -126 A 0.091 -127 N 0.098 -128 M 0.110 -129 I 0.127 -130 K 0.137 -131 G 0.139 -132 K 0.144 -133 T 0.153 -134 P 0.151 -135 E 0.138 -136 E 0.128 -137 I 0.127 -138 R 0.128 -139 K 0.133 -140 T 0.147 -141 F 0.168 -142 N 0.189 -143 I 0.205 -144 K 0.212 -145 N 0.206 -146 D 0.192 -147 F 0.175 -148 T 0.160 -149 E 0.155 -150 E 0.162 -151 E 0.175 -152 E 0.188 -153 A 0.202 -154 Q 0.219 -155 V 0.232 -156 R 0.237 -157 K 0.242 -158 E 0.253 -159 N 0.265 -160 Q 0.278 -161 W 0.302 -162 C 0.336 -163 E 0.359 -164 E 0.362 -165 K 0.356 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036372.15_ENSMUST00000040372.14_GN:Tmem258_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036372.15_ENSMUST00000040372.14_GN:Tmem258_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index e8b335939fcb7cd311365b08f4284953bfb93c54..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036372.15_ENSMUST00000040372.14_GN:Tmem258_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,80 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000036372.15|ENSMUST00000040372.14|GN:Tmem258|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.471 -2 E 0.462 -3 L 0.458 -4 E 0.464 -5 A 0.463 -6 M 0.445 -7 S 0.416 -8 R 0.391 -9 Y 0.371 -10 T 0.349 -11 S 0.320 -12 P 0.282 -13 V 0.239 -14 N 0.195 -15 P 0.150 -16 A 0.110 -17 V 0.079 -18 F 0.059 -19 P 0.048 -20 H 0.044 -21 L 0.045 -22 T 0.049 -23 V 0.051 -24 V 0.055 -25 L 0.066 -26 L 0.080 -27 A 0.086 -28 I 0.079 -29 G 0.067 -30 M 0.056 -31 F 0.048 -32 F 0.046 -33 T 0.047 -34 A 0.045 -35 W 0.043 -36 F 0.044 -37 F 0.051 -38 V 0.063 -39 Y 0.080 -40 E 0.101 -41 V 0.124 -42 T 0.151 -43 S 0.181 -44 T 0.202 -45 K 0.207 -46 Y 0.199 -47 T 0.184 -48 R 0.158 -49 D 0.124 -50 I 0.092 -51 Y 0.075 -52 K 0.069 -53 E 0.066 -54 L 0.062 -55 L 0.065 -56 I 0.076 -57 S 0.086 -58 L 0.089 -59 V 0.093 -60 A 0.094 -61 S 0.086 -62 L 0.071 -63 F 0.064 -64 M 0.068 -65 G 0.078 -66 F 0.090 -67 G 0.104 -68 V 0.117 -69 L 0.122 -70 F 0.124 -71 L 0.125 -72 L 0.125 -73 L 0.124 -74 W 0.125 -75 V 0.131 -76 G 0.142 -77 I 0.156 -78 Y 0.169 -79 V 0.176 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036372.15_ENSMUST00000040372.14_GN:Tmem258_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:42.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036372.15_ENSMUST00000040372.14_GN:Tmem258_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:42.caid deleted file mode 100644 index 4d2b31267e3101523487863d8bff52cbdf84fb69..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036372.15_ENSMUST00000040372.14_GN:Tmem258_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:42.caid +++ /dev/null @@ -1,122 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000036372.15|ENSMUST00000040372.14|GN:Tmem258|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:42 -1 M 0.448 -2 G 0.474 -3 L 0.514 -4 Q 0.548 -5 V 0.554 -6 P 0.533 -7 Q 0.518 -8 C 0.525 -9 H 0.537 -10 A 0.553 -11 Q 0.600 -12 G 0.661 -13 T 0.696 -14 T 0.696 -15 S 0.680 -16 F 0.660 -17 S 0.632 -18 C 0.600 -19 C 0.567 -20 S 0.531 -21 V 0.492 -22 R 0.464 -23 L 0.469 -24 L 0.512 -25 L 0.582 -26 P 0.653 -27 T 0.704 -28 C 0.727 -29 S 0.734 -30 S 0.741 -31 G 0.750 -32 G 0.761 -33 G 0.766 -34 S 0.761 -35 V 0.741 -36 V 0.711 -37 Y 0.689 -38 P 0.689 -39 V 0.708 -40 R 0.722 -41 G 0.717 -42 K 0.695 -43 M 0.670 -44 E 0.650 -45 L 0.634 -46 E 0.622 -47 A 0.612 -48 M 0.593 -49 S 0.562 -50 R 0.520 -51 Y 0.474 -52 T 0.429 -53 S 0.384 -54 P 0.339 -55 V 0.294 -56 N 0.245 -57 P 0.191 -58 A 0.139 -59 V 0.097 -60 F 0.071 -61 P 0.058 -62 H 0.054 -63 L 0.055 -64 T 0.059 -65 V 0.061 -66 V 0.061 -67 L 0.065 -68 L 0.071 -69 A 0.074 -70 I 0.072 -71 G 0.068 -72 M 0.063 -73 F 0.058 -74 F 0.056 -75 T 0.057 -76 A 0.056 -77 W 0.054 -78 F 0.058 -79 F 0.069 -80 V 0.083 -81 Y 0.100 -82 E 0.121 -83 V 0.144 -84 T 0.171 -85 S 0.200 -86 T 0.219 -87 K 0.223 -88 Y 0.215 -89 T 0.197 -90 R 0.168 -91 D 0.131 -92 I 0.099 -93 Y 0.082 -94 K 0.077 -95 E 0.075 -96 L 0.072 -97 L 0.076 -98 I 0.089 -99 S 0.100 -100 L 0.102 -101 V 0.102 -102 A 0.103 -103 S 0.094 -104 L 0.079 -105 F 0.072 -106 M 0.077 -107 G 0.086 -108 F 0.096 -109 G 0.109 -110 V 0.119 -111 L 0.124 -112 F 0.126 -113 L 0.128 -114 L 0.129 -115 L 0.129 -116 W 0.134 -117 V 0.145 -118 G 0.163 -119 I 0.183 -120 Y 0.200 -121 V 0.209 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036647.6_ENSMUST00000040983.6_GN:Or6b9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036647.6_ENSMUST00000040983.6_GN:Or6b9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 7e4375bddeb4fccbdc654ed66a2028344e832017..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036647.6_ENSMUST00000040983.6_GN:Or6b9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,317 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000036647.6|ENSMUST00000040983.6|GN:Or6b9|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.446 -2 E 0.457 -3 N 0.466 -4 I 0.454 -5 T 0.407 -6 N 0.333 -7 I 0.254 -8 S 0.189 -9 E 0.148 -10 F 0.131 -11 I 0.127 -12 L 0.128 -13 M 0.137 -14 G 0.152 -15 F 0.165 -16 P 0.166 -17 T 0.151 -18 A 0.123 -19 P 0.089 -20 W 0.062 -21 L 0.050 -22 Q 0.053 -23 I 0.064 -24 L 0.070 -25 L 0.064 -26 F 0.052 -27 S 0.041 -28 I 0.033 -29 F 0.031 -30 F 0.033 -31 I 0.037 -32 T 0.042 -33 Y 0.044 -34 V 0.044 -35 F 0.047 -36 V 0.052 -37 L 0.054 -38 L 0.055 -39 E 0.058 -40 N 0.064 -41 L 0.070 -42 V 0.072 -43 I 0.069 -44 I 0.059 -45 L 0.050 -46 T 0.045 -47 V 0.046 -48 W 0.055 -49 V 0.070 -50 T 0.082 -51 G 0.087 -52 S 0.085 -53 L 0.078 -54 H 0.068 -55 K 0.057 -56 P 0.045 -57 M 0.035 -58 Y 0.029 -59 Y 0.025 -60 F 0.025 -61 L 0.030 -62 S 0.038 -63 T 0.045 -64 M 0.050 -65 S 0.051 -66 F 0.051 -67 L 0.053 -68 E 0.061 -69 A 0.066 -70 W 0.063 -71 Y 0.057 -72 I 0.051 -73 S 0.050 -74 V 0.053 -75 T 0.058 -76 V 0.061 -77 P 0.061 -78 K 0.059 -79 M 0.058 -80 L 0.056 -81 A 0.051 -82 G 0.047 -83 F 0.044 -84 L 0.045 -85 F 0.050 -86 H 0.058 -87 P 0.064 -88 N 0.064 -89 T 0.060 -90 I 0.053 -91 S 0.046 -92 F 0.040 -93 L 0.038 -94 G 0.038 -95 C 0.037 -96 M 0.034 -97 T 0.033 -98 Q 0.033 -99 L 0.033 -100 Y 0.033 -101 F 0.030 -102 F 0.029 -103 M 0.029 -104 S 0.032 -105 L 0.035 -106 A 0.038 -107 C 0.043 -108 T 0.046 -109 E 0.048 -110 C 0.048 -111 V 0.045 -112 L 0.041 -113 L 0.036 -114 A 0.033 -115 A 0.031 -116 M 0.031 -117 A 0.033 -118 Y 0.036 -119 D 0.040 -120 R 0.041 -121 Y 0.039 -122 V 0.036 -123 A 0.035 -124 I 0.036 -125 C 0.040 -126 W 0.044 -127 P 0.047 -128 L 0.046 -129 R 0.045 -130 Y 0.046 -131 P 0.049 -132 V 0.053 -133 M 0.057 -134 M 0.057 -135 T 0.053 -136 T 0.045 -137 G 0.039 -138 F 0.037 -139 C 0.042 -140 V 0.054 -141 Q 0.067 -142 L 0.073 -143 T 0.076 -144 I 0.076 -145 S 0.071 -146 S 0.061 -147 W 0.052 -148 V 0.050 -149 S 0.054 -150 G 0.060 -151 F 0.061 -152 T 0.062 -153 I 0.064 -154 S 0.065 -155 M 0.064 -156 A 0.064 -157 K 0.066 -158 V 0.065 -159 Y 0.064 -160 F 0.068 -161 L 0.077 -162 S 0.089 -163 R 0.103 -164 V 0.110 -165 A 0.107 -166 F 0.103 -167 C 0.105 -168 G 0.111 -169 N 0.117 -170 N 0.125 -171 V 0.133 -172 L 0.132 -173 N 0.115 -174 H 0.093 -175 F 0.075 -176 F 0.065 -177 C 0.063 -178 D 0.071 -179 V 0.088 -180 S 0.106 -181 P 0.117 -182 I 0.118 -183 L 0.116 -184 K 0.115 -185 L 0.111 -186 A 0.103 -187 C 0.099 -188 M 0.106 -189 N 0.117 -190 L 0.123 -191 S 0.120 -192 M 0.113 -193 A 0.105 -194 E 0.099 -195 T 0.095 -196 V 0.095 -197 D 0.098 -198 F 0.098 -199 A 0.092 -200 L 0.083 -201 A 0.072 -202 I 0.061 -203 V 0.054 -204 I 0.051 -205 L 0.054 -206 I 0.060 -207 F 0.068 -208 P 0.071 -209 L 0.069 -210 S 0.068 -211 A 0.071 -212 T 0.071 -213 V 0.064 -214 L 0.055 -215 S 0.051 -216 Y 0.049 -217 G 0.050 -218 F 0.055 -219 I 0.065 -220 V 0.077 -221 S 0.087 -222 T 0.090 -223 V 0.091 -224 L 0.098 -225 Q 0.117 -226 I 0.140 -227 P 0.155 -228 S 0.155 -229 A 0.141 -230 T 0.121 -231 G 0.102 -232 Q 0.088 -233 R 0.081 -234 K 0.080 -235 A 0.081 -236 F 0.080 -237 S 0.080 -238 T 0.078 -239 C 0.075 -240 A 0.074 -241 S 0.073 -242 H 0.070 -243 L 0.064 -244 T 0.060 -245 V 0.058 -246 V 0.053 -247 V 0.042 -248 I 0.031 -249 F 0.025 -250 Y 0.023 -251 T 0.025 -252 A 0.028 -253 V 0.030 -254 I 0.032 -255 F 0.037 -256 M 0.049 -257 Y 0.071 -258 V 0.100 -259 R 0.129 -260 P 0.150 -261 R 0.163 -262 A 0.177 -263 I 0.190 -264 A 0.198 -265 S 0.197 -266 F 0.188 -267 N 0.174 -268 S 0.159 -269 N 0.142 -270 K 0.124 -271 L 0.108 -272 I 0.095 -273 S 0.081 -274 A 0.071 -275 I 0.072 -276 Y 0.082 -277 A 0.095 -278 V 0.105 -279 F 0.110 -280 T 0.109 -281 P 0.100 -282 M 0.089 -283 L 0.080 -284 N 0.073 -285 P 0.068 -286 I 0.066 -287 I 0.068 -288 Y 0.069 -289 C 0.074 -290 L 0.087 -291 R 0.098 -292 N 0.094 -293 K 0.077 -294 E 0.064 -295 V 0.063 -296 K 0.073 -297 D 0.082 -298 A 0.083 -299 I 0.078 -300 R 0.079 -301 K 0.089 -302 T 0.115 -303 I 0.171 -304 A 0.261 -305 G 0.367 -306 G 0.458 -307 R 0.521 -308 A 0.563 -309 P 0.595 -310 A 0.611 -311 L 0.596 -312 G 0.556 -313 E 0.520 -314 S 0.500 -315 I 0.472 -316 S 0.440 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036647.6_ENSMUST00000040983.6_GN:Or6b9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:27.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036647.6_ENSMUST00000040983.6_GN:Or6b9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:27.caid deleted file mode 100644 index 95fd017bffbf3eb8cbaa8075eb9ae190f692e1e3..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036647.6_ENSMUST00000040983.6_GN:Or6b9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:27.caid +++ /dev/null @@ -1,344 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000036647.6|ENSMUST00000040983.6|GN:Or6b9|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:27 -1 M 0.109 -2 V 0.093 -3 L 0.075 -4 S 0.065 -5 W 0.058 -6 I 0.050 -7 L 0.043 -8 F 0.041 -9 L 0.043 -10 N 0.046 -11 F 0.046 -12 L 0.045 -13 I 0.046 -14 L 0.056 -15 A 0.076 -16 S 0.102 -17 N 0.130 -18 L 0.163 -19 L 0.206 -20 S 0.255 -21 F 0.300 -22 G 0.332 -23 D 0.341 -24 P 0.332 -25 T 0.323 -26 L 0.331 -27 W 0.358 -28 M 0.391 -29 E 0.420 -30 N 0.436 -31 I 0.427 -32 T 0.384 -33 N 0.317 -34 I 0.245 -35 S 0.185 -36 E 0.148 -37 F 0.132 -38 I 0.127 -39 L 0.127 -40 M 0.134 -41 G 0.149 -42 F 0.164 -43 P 0.167 -44 T 0.153 -45 A 0.125 -46 P 0.091 -47 W 0.063 -48 L 0.050 -49 Q 0.052 -50 I 0.061 -51 L 0.066 -52 L 0.062 -53 F 0.052 -54 S 0.043 -55 I 0.035 -56 F 0.032 -57 F 0.032 -58 I 0.036 -59 T 0.041 -60 Y 0.044 -61 V 0.045 -62 F 0.047 -63 V 0.051 -64 L 0.052 -65 L 0.053 -66 E 0.056 -67 N 0.062 -68 L 0.067 -69 V 0.068 -70 I 0.064 -71 I 0.055 -72 L 0.045 -73 T 0.039 -74 V 0.039 -75 W 0.045 -76 V 0.058 -77 T 0.069 -78 G 0.073 -79 S 0.071 -80 L 0.065 -81 H 0.058 -82 K 0.049 -83 P 0.039 -84 M 0.030 -85 Y 0.025 -86 Y 0.022 -87 F 0.022 -88 L 0.027 -89 S 0.035 -90 T 0.042 -91 M 0.047 -92 S 0.049 -93 F 0.050 -94 L 0.053 -95 E 0.059 -96 A 0.064 -97 W 0.061 -98 Y 0.054 -99 I 0.048 -100 S 0.046 -101 V 0.047 -102 T 0.050 -103 V 0.053 -104 P 0.052 -105 K 0.050 -106 M 0.049 -107 L 0.046 -108 A 0.042 -109 G 0.037 -110 F 0.035 -111 L 0.037 -112 F 0.043 -113 H 0.050 -114 P 0.056 -115 N 0.058 -116 T 0.054 -117 I 0.049 -118 S 0.043 -119 F 0.037 -120 L 0.034 -121 G 0.034 -122 C 0.034 -123 M 0.032 -124 T 0.031 -125 Q 0.031 -126 L 0.032 -127 Y 0.031 -128 F 0.029 -129 F 0.027 -130 M 0.028 -131 S 0.031 -132 L 0.034 -133 A 0.037 -134 C 0.040 -135 T 0.043 -136 E 0.043 -137 C 0.042 -138 V 0.039 -139 L 0.035 -140 L 0.033 -141 A 0.031 -142 A 0.030 -143 M 0.030 -144 A 0.032 -145 Y 0.035 -146 D 0.039 -147 R 0.040 -148 Y 0.038 -149 V 0.035 -150 A 0.034 -151 I 0.036 -152 C 0.039 -153 W 0.043 -154 P 0.046 -155 L 0.046 -156 R 0.045 -157 Y 0.046 -158 P 0.050 -159 V 0.054 -160 M 0.057 -161 M 0.058 -162 T 0.053 -163 T 0.044 -164 G 0.037 -165 F 0.034 -166 C 0.039 -167 V 0.052 -168 Q 0.062 -169 L 0.061 -170 T 0.052 -171 I 0.045 -172 S 0.043 -173 S 0.043 -174 W 0.042 -175 V 0.042 -176 S 0.048 -177 G 0.055 -178 F 0.059 -179 T 0.058 -180 I 0.058 -181 S 0.059 -182 M 0.058 -183 A 0.058 -184 K 0.061 -185 V 0.061 -186 Y 0.061 -187 F 0.064 -188 L 0.072 -189 S 0.085 -190 R 0.098 -191 V 0.106 -192 A 0.104 -193 F 0.100 -194 C 0.101 -195 G 0.106 -196 N 0.112 -197 N 0.119 -198 V 0.126 -199 L 0.124 -200 N 0.107 -201 H 0.086 -202 F 0.070 -203 F 0.061 -204 C 0.060 -205 D 0.069 -206 V 0.086 -207 S 0.103 -208 P 0.113 -209 I 0.114 -210 L 0.113 -211 K 0.112 -212 L 0.107 -213 A 0.098 -214 C 0.092 -215 M 0.097 -216 N 0.108 -217 L 0.113 -218 S 0.110 -219 M 0.103 -220 A 0.098 -221 E 0.094 -222 T 0.090 -223 V 0.089 -224 D 0.091 -225 F 0.091 -226 A 0.086 -227 L 0.077 -228 A 0.067 -229 I 0.056 -230 V 0.049 -231 I 0.047 -232 L 0.049 -233 I 0.056 -234 F 0.063 -235 P 0.066 -236 L 0.065 -237 S 0.065 -238 A 0.070 -239 T 0.072 -240 V 0.065 -241 L 0.056 -242 S 0.050 -243 Y 0.048 -244 G 0.048 -245 F 0.054 -246 I 0.063 -247 V 0.075 -248 S 0.085 -249 T 0.088 -250 V 0.088 -251 L 0.094 -252 Q 0.111 -253 I 0.132 -254 P 0.146 -255 S 0.145 -256 A 0.132 -257 T 0.115 -258 G 0.099 -259 Q 0.086 -260 R 0.080 -261 K 0.080 -262 A 0.080 -263 F 0.077 -264 S 0.076 -265 T 0.075 -266 C 0.074 -267 A 0.073 -268 S 0.072 -269 H 0.069 -270 L 0.063 -271 T 0.060 -272 V 0.059 -273 V 0.054 -274 V 0.043 -275 I 0.032 -276 F 0.025 -277 Y 0.023 -278 T 0.025 -279 A 0.027 -280 V 0.029 -281 I 0.030 -282 F 0.035 -283 M 0.046 -284 Y 0.066 -285 V 0.094 -286 R 0.125 -287 P 0.149 -288 R 0.165 -289 A 0.181 -290 I 0.198 -291 A 0.207 -292 S 0.206 -293 F 0.195 -294 N 0.178 -295 S 0.161 -296 N 0.143 -297 K 0.126 -298 L 0.110 -299 I 0.097 -300 S 0.084 -301 A 0.075 -302 I 0.076 -303 Y 0.087 -304 A 0.099 -305 V 0.108 -306 F 0.111 -307 T 0.109 -308 P 0.100 -309 M 0.088 -310 L 0.079 -311 N 0.073 -312 P 0.068 -313 I 0.066 -314 I 0.068 -315 Y 0.068 -316 C 0.073 -317 L 0.086 -318 R 0.097 -319 N 0.093 -320 K 0.077 -321 E 0.063 -322 V 0.062 -323 K 0.071 -324 D 0.080 -325 A 0.080 -326 I 0.075 -327 R 0.075 -328 K 0.085 -329 T 0.111 -330 I 0.166 -331 A 0.257 -332 G 0.363 -333 G 0.455 -334 R 0.519 -335 A 0.562 -336 P 0.594 -337 A 0.608 -338 L 0.588 -339 G 0.538 -340 E 0.499 -341 S 0.484 -342 I 0.467 -343 S 0.441 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036814.14_ENSMUST00000040960.13_GN:Slc6a20a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036814.14_ENSMUST00000040960.13_GN:Slc6a20a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index ef0111625a431bb633b788febe11a72b368efcdd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036814.14_ENSMUST00000040960.13_GN:Slc6a20a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,593 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000036814.14|ENSMUST00000040960.13|GN:Slc6a20a|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.390 -2 E 0.374 -3 K 0.343 -4 A 0.297 -5 R 0.247 -6 P 0.202 -7 Q 0.166 -8 W 0.137 -9 G 0.110 -10 H 0.085 -11 P 0.069 -12 L 0.061 -13 Q 0.058 -14 F 0.055 -15 V 0.052 -16 F 0.056 -17 A 0.065 -18 C 0.076 -19 I 0.090 -20 S 0.109 -21 Y 0.124 -22 A 0.124 -23 V 0.110 -24 G 0.099 -25 L 0.102 -26 G 0.114 -27 N 0.119 -28 V 0.112 -29 W 0.102 -30 R 0.102 -31 F 0.109 -32 P 0.109 -33 Y 0.101 -34 L 0.091 -35 C 0.085 -36 Q 0.083 -37 M 0.087 -38 Y 0.099 -39 G 0.106 -40 G 0.100 -41 G 0.084 -42 S 0.068 -43 F 0.058 -44 L 0.053 -45 V 0.054 -46 P 0.058 -47 Y 0.060 -48 I 0.057 -49 I 0.053 -50 M 0.051 -51 L 0.048 -52 I 0.045 -53 V 0.049 -54 E 0.058 -55 G 0.067 -56 M 0.069 -57 P 0.067 -58 L 0.065 -59 L 0.062 -60 Y 0.059 -61 L 0.059 -62 E 0.065 -63 L 0.070 -64 A 0.074 -65 V 0.076 -66 G 0.078 -67 Q 0.084 -68 R 0.096 -69 M 0.108 -70 R 0.113 -71 Q 0.113 -72 G 0.114 -73 S 0.115 -74 I 0.111 -75 G 0.098 -76 A 0.081 -77 W 0.067 -78 R 0.059 -79 T 0.057 -80 I 0.056 -81 S 0.057 -82 P 0.061 -83 Y 0.069 -84 L 0.080 -85 S 0.093 -86 G 0.106 -87 V 0.115 -88 G 0.116 -89 V 0.110 -90 A 0.103 -91 S 0.098 -92 V 0.094 -93 V 0.087 -94 V 0.080 -95 S 0.074 -96 F 0.070 -97 F 0.068 -98 L 0.071 -99 S 0.072 -100 M 0.067 -101 Y 0.062 -102 Y 0.062 -103 N 0.063 -104 V 0.064 -105 I 0.063 -106 N 0.061 -107 A 0.057 -108 W 0.056 -109 G 0.058 -110 F 0.063 -111 W 0.070 -112 Y 0.075 -113 L 0.075 -114 F 0.074 -115 H 0.077 -116 S 0.081 -117 F 0.081 -118 Q 0.074 -119 D 0.072 -120 P 0.079 -121 L 0.091 -122 P 0.102 -123 W 0.108 -124 S 0.117 -125 V 0.138 -126 C 0.174 -127 P 0.215 -128 L 0.254 -129 N 0.287 -130 S 0.308 -131 N 0.310 -132 H 0.295 -133 T 0.279 -134 G 0.265 -135 Y 0.241 -136 D 0.205 -137 E 0.174 -138 E 0.157 -139 C 0.147 -140 E 0.141 -141 K 0.142 -142 A 0.145 -143 S 0.142 -144 S 0.131 -145 T 0.121 -146 Q 0.118 -147 Y 0.120 -148 F 0.122 -149 W 0.122 -150 Y 0.132 -151 R 0.157 -152 K 0.181 -153 T 0.194 -154 L 0.196 -155 N 0.193 -156 I 0.191 -157 S 0.189 -158 P 0.187 -159 S 0.184 -160 I 0.184 -161 Q 0.187 -162 E 0.190 -163 N 0.193 -164 G 0.194 -165 G 0.185 -166 V 0.160 -167 Q 0.127 -168 W 0.104 -169 E 0.099 -170 P 0.104 -171 A 0.112 -172 L 0.130 -173 C 0.157 -174 L 0.177 -175 T 0.177 -176 L 0.171 -177 A 0.168 -178 W 0.162 -179 L 0.146 -180 M 0.127 -181 V 0.112 -182 Y 0.102 -183 L 0.096 -184 C 0.094 -185 I 0.096 -186 L 0.100 -187 R 0.104 -188 G 0.102 -189 T 0.097 -190 E 0.097 -191 S 0.104 -192 T 0.113 -193 G 0.125 -194 K 0.140 -195 V 0.147 -196 V 0.132 -197 Y 0.101 -198 F 0.077 -199 T 0.070 -200 A 0.071 -201 S 0.071 -202 M 0.072 -203 P 0.077 -204 Y 0.085 -205 C 0.091 -206 V 0.089 -207 L 0.078 -208 I 0.062 -209 I 0.052 -210 Y 0.055 -211 L 0.067 -212 V 0.074 -213 R 0.073 -214 G 0.069 -215 L 0.068 -216 T 0.072 -217 L 0.081 -218 H 0.090 -219 G 0.091 -220 A 0.085 -221 T 0.077 -222 N 0.068 -223 G 0.061 -224 L 0.056 -225 M 0.052 -226 Y 0.047 -227 M 0.042 -228 F 0.041 -229 T 0.042 -230 P 0.044 -231 K 0.045 -232 M 0.046 -233 E 0.048 -234 Q 0.051 -235 L 0.053 -236 A 0.054 -237 N 0.054 -238 P 0.053 -239 K 0.051 -240 A 0.051 -241 W 0.052 -242 I 0.057 -243 N 0.066 -244 A 0.076 -245 A 0.081 -246 T 0.089 -247 Q 0.098 -248 I 0.098 -249 F 0.092 -250 F 0.093 -251 S 0.105 -252 L 0.122 -253 G 0.137 -254 L 0.149 -255 G 0.160 -256 F 0.172 -257 G 0.183 -258 S 0.184 -259 L 0.173 -260 I 0.159 -261 A 0.147 -262 F 0.139 -263 A 0.130 -264 S 0.119 -265 Y 0.107 -266 N 0.097 -267 E 0.089 -268 P 0.084 -269 S 0.081 -270 N 0.080 -271 N 0.078 -272 C 0.078 -273 Q 0.082 -274 K 0.089 -275 H 0.093 -276 A 0.090 -277 I 0.088 -278 I 0.096 -279 V 0.112 -280 S 0.117 -281 I 0.110 -282 I 0.109 -283 N 0.117 -284 S 0.123 -285 S 0.127 -286 T 0.137 -287 S 0.147 -288 I 0.149 -289 F 0.147 -290 A 0.144 -291 S 0.140 -292 I 0.139 -293 V 0.138 -294 T 0.134 -295 F 0.126 -296 S 0.119 -297 I 0.117 -298 Y 0.117 -299 G 0.116 -300 F 0.110 -301 K 0.102 -302 A 0.101 -303 T 0.106 -304 F 0.117 -305 N 0.128 -306 Y 0.132 -307 E 0.126 -308 N 0.115 -309 C 0.103 -310 L 0.092 -311 N 0.087 -312 K 0.084 -313 V 0.075 -314 I 0.061 -315 L 0.053 -316 L 0.054 -317 L 0.062 -318 T 0.077 -319 N 0.096 -320 S 0.115 -321 F 0.128 -322 D 0.142 -323 L 0.163 -324 E 0.188 -325 D 0.207 -326 G 0.215 -327 F 0.209 -328 L 0.190 -329 T 0.161 -330 V 0.131 -331 S 0.105 -332 N 0.084 -333 L 0.067 -334 E 0.055 -335 E 0.050 -336 V 0.054 -337 K 0.066 -338 N 0.076 -339 Y 0.078 -340 L 0.081 -341 A 0.088 -342 S 0.096 -343 T 0.098 -344 Y 0.097 -345 P 0.092 -346 N 0.082 -347 K 0.070 -348 Y 0.065 -349 S 0.068 -350 E 0.079 -351 V 0.099 -352 F 0.124 -353 P 0.148 -354 H 0.162 -355 I 0.163 -356 R 0.156 -357 N 0.146 -358 C 0.133 -359 S 0.118 -360 L 0.110 -361 E 0.113 -362 S 0.125 -363 E 0.139 -364 L 0.150 -365 D 0.161 -366 T 0.175 -367 A 0.184 -368 V 0.177 -369 Q 0.161 -370 G 0.148 -371 T 0.144 -372 G 0.140 -373 L 0.128 -374 A 0.109 -375 F 0.094 -376 I 0.090 -377 V 0.087 -378 Y 0.077 -379 T 0.066 -380 E 0.063 -381 A 0.065 -382 I 0.069 -383 K 0.072 -384 N 0.078 -385 M 0.082 -386 E 0.077 -387 V 0.067 -388 S 0.055 -389 Q 0.046 -390 L 0.041 -391 W 0.042 -392 S 0.046 -393 V 0.050 -394 L 0.056 -395 Y 0.065 -396 F 0.075 -397 F 0.084 -398 M 0.089 -399 L 0.089 -400 L 0.086 -401 M 0.085 -402 L 0.092 -403 G 0.103 -404 I 0.118 -405 G 0.138 -406 S 0.160 -407 M 0.167 -408 L 0.153 -409 G 0.135 -410 N 0.121 -411 T 0.108 -412 A 0.093 -413 A 0.083 -414 I 0.077 -415 L 0.074 -416 T 0.071 -417 P 0.067 -418 L 0.064 -419 T 0.066 -420 D 0.073 -421 S 0.079 -422 K 0.074 -423 V 0.062 -424 I 0.053 -425 S 0.052 -426 S 0.056 -427 Y 0.059 -428 L 0.056 -429 P 0.047 -430 K 0.038 -431 E 0.033 -432 A 0.033 -433 I 0.038 -434 S 0.043 -435 G 0.046 -436 L 0.048 -437 V 0.052 -438 C 0.053 -439 L 0.051 -440 I 0.049 -441 N 0.050 -442 C 0.054 -443 A 0.060 -444 V 0.068 -445 G 0.074 -446 M 0.076 -447 V 0.074 -448 F 0.071 -449 T 0.071 -450 M 0.071 -451 E 0.074 -452 A 0.076 -453 G 0.076 -454 N 0.075 -455 Y 0.075 -456 W 0.080 -457 F 0.090 -458 D 0.103 -459 I 0.115 -460 F 0.121 -461 N 0.118 -462 D 0.110 -463 Y 0.098 -464 A 0.088 -465 A 0.081 -466 T 0.075 -467 L 0.071 -468 S 0.068 -469 L 0.067 -470 L 0.068 -471 L 0.070 -472 I 0.072 -473 V 0.068 -474 L 0.058 -475 V 0.048 -476 E 0.043 -477 T 0.040 -478 I 0.036 -479 A 0.036 -480 V 0.042 -481 C 0.049 -482 Y 0.052 -483 V 0.049 -484 Y 0.048 -485 G 0.047 -486 L 0.045 -487 K 0.041 -488 R 0.041 -489 F 0.051 -490 E 0.066 -491 S 0.078 -492 D 0.080 -493 L 0.075 -494 R 0.071 -495 A 0.070 -496 M 0.072 -497 T 0.077 -498 G 0.081 -499 R 0.087 -500 T 0.087 -501 L 0.078 -502 S 0.061 -503 W 0.044 -504 Y 0.035 -505 W 0.035 -506 K 0.037 -507 V 0.039 -508 M 0.043 -509 W 0.051 -510 A 0.057 -511 F 0.059 -512 V 0.058 -513 S 0.058 -514 P 0.055 -515 L 0.053 -516 L 0.054 -517 I 0.055 -518 V 0.052 -519 G 0.049 -520 L 0.050 -521 F 0.052 -522 I 0.053 -523 F 0.054 -524 Y 0.057 -525 L 0.058 -526 S 0.060 -527 D 0.063 -528 Y 0.067 -529 I 0.076 -530 L 0.097 -531 T 0.127 -532 G 0.153 -533 T 0.166 -534 L 0.172 -535 Q 0.177 -536 Y 0.183 -537 Q 0.185 -538 A 0.184 -539 W 0.185 -540 D 0.192 -541 A 0.205 -542 T 0.220 -543 Q 0.232 -544 G 0.235 -545 Q 0.228 -546 L 0.215 -547 V 0.201 -548 T 0.190 -549 K 0.181 -550 D 0.171 -551 Y 0.156 -552 P 0.135 -553 P 0.115 -554 H 0.100 -555 A 0.093 -556 L 0.091 -557 A 0.099 -558 V 0.121 -559 I 0.148 -560 G 0.167 -561 L 0.176 -562 L 0.183 -563 V 0.189 -564 A 0.191 -565 S 0.188 -566 S 0.178 -567 T 0.157 -568 M 0.131 -569 C 0.114 -570 I 0.107 -571 P 0.097 -572 L 0.084 -573 V 0.071 -574 A 0.062 -575 L 0.056 -576 G 0.054 -577 T 0.055 -578 F 0.057 -579 I 0.059 -580 R 0.064 -581 N 0.072 -582 R 0.085 -583 L 0.115 -584 K 0.177 -585 R 0.267 -586 G 0.364 -587 G 0.438 -588 S 0.470 -589 A 0.461 -590 P 0.427 -591 V 0.389 -592 A 0.364 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036814.14_ENSMUST00000040960.13_GN:Slc6a20a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:26.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036814.14_ENSMUST00000040960.13_GN:Slc6a20a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:26.caid deleted file mode 100644 index 106efc8f5f7eb779d881385e78b4f25365a9a557..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036814.14_ENSMUST00000040960.13_GN:Slc6a20a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:26.caid +++ /dev/null @@ -1,619 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000036814.14|ENSMUST00000040960.13|GN:Slc6a20a|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:26 -1 M 0.239 -2 R 0.241 -3 L 0.248 -4 A 0.258 -5 I 0.257 -6 K 0.253 -7 R 0.271 -8 R 0.309 -9 A 0.343 -10 S 0.372 -11 G 0.410 -12 G 0.438 -13 G 0.437 -14 Q 0.425 -15 R 0.424 -16 P 0.418 -17 G 0.391 -18 P 0.353 -19 D 0.316 -20 G 0.278 -21 E 0.243 -22 Q 0.226 -23 R 0.233 -24 A 0.251 -25 R 0.270 -26 D 0.293 -27 M 0.318 -28 E 0.333 -29 K 0.324 -30 A 0.289 -31 R 0.238 -32 P 0.191 -33 Q 0.155 -34 W 0.128 -35 G 0.104 -36 H 0.081 -37 P 0.066 -38 L 0.059 -39 Q 0.056 -40 F 0.053 -41 V 0.050 -42 F 0.053 -43 A 0.062 -44 C 0.073 -45 I 0.087 -46 S 0.106 -47 Y 0.121 -48 A 0.121 -49 V 0.109 -50 G 0.100 -51 L 0.105 -52 G 0.119 -53 N 0.124 -54 V 0.115 -55 W 0.105 -56 R 0.105 -57 F 0.112 -58 P 0.112 -59 Y 0.104 -60 L 0.094 -61 C 0.087 -62 Q 0.084 -63 M 0.088 -64 Y 0.098 -65 G 0.104 -66 G 0.098 -67 G 0.082 -68 S 0.067 -69 F 0.057 -70 L 0.052 -71 V 0.053 -72 P 0.057 -73 Y 0.058 -74 I 0.055 -75 I 0.052 -76 M 0.050 -77 L 0.047 -78 I 0.044 -79 V 0.047 -80 E 0.056 -81 G 0.064 -82 M 0.065 -83 P 0.063 -84 L 0.062 -85 L 0.059 -86 Y 0.057 -87 L 0.058 -88 E 0.063 -89 L 0.068 -90 A 0.071 -91 V 0.073 -92 G 0.075 -93 Q 0.080 -94 R 0.090 -95 M 0.100 -96 R 0.105 -97 Q 0.106 -98 G 0.109 -99 S 0.112 -100 I 0.110 -101 G 0.098 -102 A 0.082 -103 W 0.068 -104 R 0.060 -105 T 0.056 -106 I 0.055 -107 S 0.056 -108 P 0.060 -109 Y 0.068 -110 L 0.081 -111 S 0.094 -112 G 0.107 -113 V 0.116 -114 G 0.116 -115 V 0.109 -116 A 0.100 -117 S 0.095 -118 V 0.090 -119 V 0.083 -120 V 0.076 -121 S 0.071 -122 F 0.067 -123 F 0.066 -124 L 0.069 -125 S 0.070 -126 M 0.065 -127 Y 0.061 -128 Y 0.061 -129 N 0.062 -130 V 0.062 -131 I 0.062 -132 N 0.060 -133 A 0.057 -134 W 0.056 -135 G 0.058 -136 F 0.063 -137 W 0.069 -138 Y 0.074 -139 L 0.075 -140 F 0.074 -141 H 0.078 -142 S 0.083 -143 F 0.082 -144 Q 0.076 -145 D 0.073 -146 P 0.080 -147 L 0.093 -148 P 0.103 -149 W 0.108 -150 S 0.116 -151 V 0.138 -152 C 0.175 -153 P 0.217 -154 L 0.257 -155 N 0.291 -156 S 0.313 -157 N 0.314 -158 H 0.300 -159 T 0.285 -160 G 0.272 -161 Y 0.248 -162 D 0.211 -163 E 0.178 -164 E 0.159 -165 C 0.149 -166 E 0.143 -167 K 0.144 -168 A 0.148 -169 S 0.144 -170 S 0.132 -171 T 0.121 -172 Q 0.118 -173 Y 0.121 -174 F 0.123 -175 W 0.123 -176 Y 0.134 -177 R 0.158 -178 K 0.183 -179 T 0.195 -180 L 0.196 -181 N 0.192 -182 I 0.188 -183 S 0.187 -184 P 0.184 -185 S 0.181 -186 I 0.181 -187 Q 0.186 -188 E 0.190 -189 N 0.193 -190 G 0.194 -191 G 0.185 -192 V 0.160 -193 Q 0.127 -194 W 0.104 -195 E 0.100 -196 P 0.105 -197 A 0.114 -198 L 0.132 -199 C 0.160 -200 L 0.180 -201 T 0.181 -202 L 0.173 -203 A 0.166 -204 W 0.153 -205 L 0.134 -206 M 0.117 -207 V 0.107 -208 Y 0.100 -209 L 0.095 -210 C 0.092 -211 I 0.093 -212 L 0.097 -213 R 0.100 -214 G 0.098 -215 T 0.094 -216 E 0.095 -217 S 0.103 -218 T 0.113 -219 G 0.124 -220 K 0.138 -221 V 0.146 -222 V 0.131 -223 Y 0.101 -224 F 0.077 -225 T 0.070 -226 A 0.070 -227 S 0.069 -228 M 0.070 -229 P 0.076 -230 Y 0.084 -231 C 0.090 -232 V 0.088 -233 L 0.076 -234 I 0.060 -235 I 0.050 -236 Y 0.052 -237 L 0.062 -238 V 0.069 -239 R 0.069 -240 G 0.066 -241 L 0.066 -242 T 0.071 -243 L 0.079 -244 H 0.087 -245 G 0.089 -246 A 0.083 -247 T 0.075 -248 N 0.067 -249 G 0.060 -250 L 0.055 -251 M 0.050 -252 Y 0.046 -253 M 0.041 -254 F 0.040 -255 T 0.041 -256 P 0.042 -257 K 0.043 -258 M 0.044 -259 E 0.046 -260 Q 0.050 -261 L 0.053 -262 A 0.054 -263 N 0.055 -264 P 0.053 -265 K 0.052 -266 A 0.051 -267 W 0.052 -268 I 0.057 -269 N 0.066 -270 A 0.076 -271 A 0.081 -272 T 0.089 -273 Q 0.097 -274 I 0.098 -275 F 0.092 -276 F 0.093 -277 S 0.106 -278 L 0.122 -279 G 0.137 -280 L 0.149 -281 G 0.160 -282 F 0.172 -283 G 0.183 -284 S 0.185 -285 L 0.175 -286 I 0.160 -287 A 0.149 -288 F 0.141 -289 A 0.131 -290 S 0.119 -291 Y 0.107 -292 N 0.097 -293 E 0.090 -294 P 0.085 -295 S 0.083 -296 N 0.081 -297 N 0.077 -298 C 0.069 -299 Q 0.062 -300 K 0.063 -301 H 0.072 -302 A 0.081 -303 I 0.085 -304 I 0.095 -305 V 0.111 -306 S 0.116 -307 I 0.110 -308 I 0.109 -309 N 0.117 -310 S 0.123 -311 S 0.128 -312 T 0.138 -313 S 0.148 -314 I 0.150 -315 F 0.148 -316 A 0.145 -317 S 0.141 -318 I 0.140 -319 V 0.140 -320 T 0.136 -321 F 0.128 -322 S 0.121 -323 I 0.119 -324 Y 0.120 -325 G 0.119 -326 F 0.112 -327 K 0.104 -328 A 0.102 -329 T 0.108 -330 F 0.118 -331 N 0.129 -332 Y 0.134 -333 E 0.128 -334 N 0.116 -335 C 0.104 -336 L 0.093 -337 N 0.088 -338 K 0.085 -339 V 0.076 -340 I 0.063 -341 L 0.054 -342 L 0.054 -343 L 0.062 -344 T 0.077 -345 N 0.096 -346 S 0.115 -347 F 0.128 -348 D 0.141 -349 L 0.161 -350 E 0.186 -351 D 0.204 -352 G 0.210 -353 F 0.203 -354 L 0.184 -355 T 0.156 -356 V 0.128 -357 S 0.103 -358 N 0.083 -359 L 0.066 -360 E 0.055 -361 E 0.050 -362 V 0.054 -363 K 0.065 -364 N 0.075 -365 Y 0.076 -366 L 0.073 -367 A 0.074 -368 S 0.079 -369 T 0.084 -370 Y 0.089 -371 P 0.088 -372 N 0.080 -373 K 0.068 -374 Y 0.062 -375 S 0.066 -376 E 0.078 -377 V 0.097 -378 F 0.122 -379 P 0.146 -380 H 0.160 -381 I 0.161 -382 R 0.154 -383 N 0.145 -384 C 0.132 -385 S 0.118 -386 L 0.109 -387 E 0.112 -388 S 0.125 -389 E 0.139 -390 L 0.150 -391 D 0.160 -392 T 0.173 -393 A 0.181 -394 V 0.174 -395 Q 0.159 -396 G 0.147 -397 T 0.143 -398 G 0.140 -399 L 0.128 -400 A 0.109 -401 F 0.094 -402 I 0.089 -403 V 0.086 -404 Y 0.077 -405 T 0.066 -406 E 0.063 -407 A 0.066 -408 I 0.069 -409 K 0.073 -410 N 0.079 -411 M 0.082 -412 E 0.077 -413 V 0.067 -414 S 0.055 -415 Q 0.046 -416 L 0.042 -417 W 0.042 -418 S 0.046 -419 V 0.050 -420 L 0.056 -421 Y 0.065 -422 F 0.075 -423 F 0.085 -424 M 0.090 -425 L 0.090 -426 L 0.086 -427 M 0.085 -428 L 0.091 -429 G 0.102 -430 I 0.116 -431 G 0.136 -432 S 0.157 -433 M 0.164 -434 L 0.152 -435 G 0.134 -436 N 0.121 -437 T 0.108 -438 A 0.093 -439 A 0.083 -440 I 0.077 -441 L 0.074 -442 T 0.071 -443 P 0.067 -444 L 0.064 -445 T 0.066 -446 D 0.074 -447 S 0.079 -448 K 0.075 -449 V 0.063 -450 I 0.054 -451 S 0.053 -452 S 0.057 -453 Y 0.060 -454 L 0.057 -455 P 0.048 -456 K 0.039 -457 E 0.034 -458 A 0.034 -459 I 0.039 -460 S 0.044 -461 G 0.047 -462 L 0.049 -463 V 0.052 -464 C 0.053 -465 L 0.052 -466 I 0.050 -467 N 0.051 -468 C 0.055 -469 A 0.061 -470 V 0.069 -471 G 0.075 -472 M 0.077 -473 V 0.075 -474 F 0.073 -475 T 0.072 -476 M 0.073 -477 E 0.075 -478 A 0.077 -479 G 0.077 -480 N 0.076 -481 Y 0.077 -482 W 0.082 -483 F 0.092 -484 D 0.106 -485 I 0.118 -486 F 0.123 -487 N 0.121 -488 D 0.112 -489 Y 0.100 -490 A 0.089 -491 A 0.082 -492 T 0.076 -493 L 0.072 -494 S 0.069 -495 L 0.068 -496 L 0.069 -497 L 0.072 -498 I 0.073 -499 V 0.069 -500 L 0.059 -501 V 0.049 -502 E 0.044 -503 T 0.040 -504 I 0.036 -505 A 0.036 -506 V 0.042 -507 C 0.050 -508 Y 0.052 -509 V 0.050 -510 Y 0.049 -511 G 0.048 -512 L 0.046 -513 K 0.042 -514 R 0.039 -515 F 0.041 -516 E 0.045 -517 S 0.051 -518 D 0.058 -519 L 0.065 -520 R 0.068 -521 A 0.070 -522 M 0.073 -523 T 0.077 -524 G 0.082 -525 R 0.087 -526 T 0.088 -527 L 0.078 -528 S 0.061 -529 W 0.044 -530 Y 0.036 -531 W 0.035 -532 K 0.038 -533 V 0.039 -534 M 0.043 -535 W 0.051 -536 A 0.058 -537 F 0.059 -538 V 0.058 -539 S 0.058 -540 P 0.055 -541 L 0.053 -542 L 0.054 -543 I 0.055 -544 V 0.052 -545 G 0.049 -546 L 0.049 -547 F 0.050 -548 I 0.050 -549 F 0.051 -550 Y 0.055 -551 L 0.058 -552 S 0.060 -553 D 0.062 -554 Y 0.067 -555 I 0.076 -556 L 0.097 -557 T 0.127 -558 G 0.153 -559 T 0.165 -560 L 0.171 -561 Q 0.176 -562 Y 0.182 -563 Q 0.184 -564 A 0.183 -565 W 0.184 -566 D 0.192 -567 A 0.205 -568 T 0.219 -569 Q 0.231 -570 G 0.234 -571 Q 0.228 -572 L 0.215 -573 V 0.201 -574 T 0.190 -575 K 0.181 -576 D 0.171 -577 Y 0.156 -578 P 0.135 -579 P 0.115 -580 H 0.100 -581 A 0.093 -582 L 0.092 -583 A 0.101 -584 V 0.122 -585 I 0.147 -586 G 0.163 -587 L 0.170 -588 L 0.177 -589 V 0.187 -590 A 0.191 -591 S 0.188 -592 S 0.177 -593 T 0.156 -594 M 0.130 -595 C 0.114 -596 I 0.106 -597 P 0.097 -598 L 0.083 -599 V 0.070 -600 A 0.062 -601 L 0.056 -602 G 0.053 -603 T 0.054 -604 F 0.056 -605 I 0.058 -606 R 0.063 -607 N 0.071 -608 R 0.084 -609 L 0.113 -610 K 0.174 -611 R 0.262 -612 G 0.355 -613 G 0.424 -614 S 0.451 -615 A 0.437 -616 P 0.400 -617 V 0.363 -618 A 0.340 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036858.9_ENSMUST00000041012.10_GN:Ptcra_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036858.9_ENSMUST00000041012.10_GN:Ptcra_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index f3398c454c7b2402b8ef41c30830833b3e515f77..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036858.9_ENSMUST00000041012.10_GN:Ptcra_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,200 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000036858.9|ENSMUST00000041012.10|GN:Ptcra|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.345 -2 A 0.342 -3 R 0.327 -4 T 0.297 -5 W 0.257 -6 L 0.224 -7 L 0.215 -8 L 0.236 -9 L 0.281 -10 L 0.338 -11 G 0.389 -12 V 0.420 -13 R 0.437 -14 C 0.462 -15 Q 0.507 -16 A 0.559 -17 L 0.605 -18 P 0.639 -19 S 0.661 -20 G 0.659 -21 I 0.619 -22 A 0.535 -23 G 0.425 -24 T 0.312 -25 P 0.214 -26 F 0.143 -27 P 0.102 -28 S 0.087 -29 L 0.088 -30 A 0.093 -31 P 0.094 -32 P 0.089 -33 I 0.083 -34 T 0.082 -35 L 0.090 -36 L 0.105 -37 V 0.116 -38 D 0.118 -39 G 0.113 -40 R 0.098 -41 Q 0.076 -42 H 0.054 -43 M 0.038 -44 L 0.028 -45 V 0.022 -46 V 0.021 -47 C 0.024 -48 L 0.032 -49 V 0.044 -50 L 0.056 -51 D 0.068 -52 A 0.078 -53 A 0.087 -54 P 0.105 -55 P 0.132 -56 G 0.156 -57 L 0.158 -58 D 0.136 -59 N 0.103 -60 P 0.071 -61 V 0.048 -62 W 0.043 -63 F 0.060 -64 S 0.096 -65 A 0.140 -66 G 0.177 -67 N 0.195 -68 G 0.192 -69 S 0.176 -70 A 0.152 -71 L 0.124 -72 D 0.098 -73 A 0.077 -74 F 0.066 -75 T 0.061 -76 Y 0.061 -77 G 0.064 -78 P 0.068 -79 S 0.074 -80 L 0.081 -81 A 0.088 -82 P 0.091 -83 D 0.090 -84 G 0.083 -85 T 0.069 -86 W 0.051 -87 T 0.035 -88 S 0.026 -89 L 0.022 -90 A 0.023 -91 Q 0.026 -92 L 0.031 -93 S 0.039 -94 L 0.047 -95 P 0.056 -96 S 0.064 -97 E 0.068 -98 E 0.067 -99 L 0.066 -100 E 0.070 -101 A 0.074 -102 W 0.070 -103 E 0.058 -104 P 0.045 -105 L 0.033 -106 V 0.027 -107 C 0.030 -108 H 0.046 -109 T 0.081 -110 R 0.134 -111 P 0.202 -112 G 0.272 -113 A 0.328 -114 G 0.354 -115 G 0.352 -116 Q 0.330 -117 N 0.292 -118 R 0.244 -119 S 0.197 -120 T 0.168 -121 H 0.158 -122 P 0.165 -123 L 0.190 -124 Q 0.244 -125 L 0.331 -126 S 0.443 -127 G 0.550 -128 E 0.628 -129 S 0.670 -130 S 0.686 -131 T 0.688 -132 A 0.679 -133 R 0.664 -134 S 0.647 -135 C 0.633 -136 F 0.624 -137 P 0.627 -138 E 0.637 -139 P 0.644 -140 L 0.637 -141 G 0.609 -142 G 0.556 -143 T 0.477 -144 Q 0.383 -145 R 0.297 -146 Q 0.234 -147 V 0.196 -148 L 0.175 -149 W 0.166 -150 L 0.170 -151 S 0.175 -152 L 0.174 -153 L 0.173 -154 R 0.173 -155 L 0.166 -156 L 0.150 -157 L 0.139 -158 F 0.136 -159 K 0.131 -160 L 0.118 -161 L 0.105 -162 L 0.103 -163 L 0.111 -164 D 0.119 -165 V 0.118 -166 L 0.114 -167 L 0.119 -168 T 0.137 -169 C 0.161 -170 S 0.182 -171 H 0.189 -172 L 0.185 -173 R 0.184 -174 L 0.194 -175 H 0.209 -176 V 0.226 -177 L 0.252 -178 A 0.290 -179 G 0.336 -180 Q 0.378 -181 H 0.409 -182 L 0.434 -183 Q 0.462 -184 P 0.502 -185 P 0.553 -186 P 0.608 -187 S 0.649 -188 R 0.665 -189 K 0.659 -190 S 0.641 -191 L 0.625 -192 P 0.626 -193 P 0.648 -194 T 0.677 -195 H 0.696 -196 R 0.689 -197 I 0.645 -198 W 0.568 -199 T 0.501 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036858.9_ENSMUST00000041012.10_GN:Ptcra_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036858.9_ENSMUST00000041012.10_GN:Ptcra_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid deleted file mode 100644 index 0e2a78fb8fe518628353c2b024d919a6347c3723..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036858.9_ENSMUST00000041012.10_GN:Ptcra_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid +++ /dev/null @@ -1,207 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000036858.9|ENSMUST00000041012.10|GN:Ptcra|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:7 -1 M 0.297 -2 L 0.285 -3 L 0.275 -4 H 0.273 -5 E 0.266 -6 W 0.248 -7 A 0.235 -8 M 0.239 -9 A 0.243 -10 R 0.232 -11 T 0.212 -12 W 0.194 -13 L 0.182 -14 L 0.179 -15 L 0.194 -16 L 0.228 -17 L 0.270 -18 G 0.304 -19 V 0.326 -20 R 0.357 -21 C 0.411 -22 Q 0.479 -23 A 0.543 -24 L 0.590 -25 P 0.621 -26 S 0.639 -27 G 0.635 -28 I 0.595 -29 A 0.514 -30 G 0.407 -31 T 0.298 -32 P 0.204 -33 F 0.135 -34 P 0.097 -35 S 0.084 -36 L 0.086 -37 A 0.093 -38 P 0.094 -39 P 0.090 -40 I 0.085 -41 T 0.084 -42 L 0.093 -43 L 0.107 -44 V 0.119 -45 D 0.121 -46 G 0.116 -47 R 0.101 -48 Q 0.078 -49 H 0.055 -50 M 0.038 -51 L 0.028 -52 V 0.022 -53 V 0.021 -54 C 0.024 -55 L 0.032 -56 V 0.042 -57 L 0.055 -58 D 0.067 -59 A 0.076 -60 A 0.085 -61 P 0.103 -62 P 0.130 -63 G 0.154 -64 L 0.156 -65 D 0.134 -66 N 0.101 -67 P 0.069 -68 V 0.047 -69 W 0.043 -70 F 0.061 -71 S 0.097 -72 A 0.140 -73 G 0.176 -74 N 0.194 -75 G 0.193 -76 S 0.177 -77 A 0.153 -78 L 0.124 -79 D 0.098 -80 A 0.078 -81 F 0.066 -82 T 0.061 -83 Y 0.062 -84 G 0.064 -85 P 0.068 -86 S 0.073 -87 L 0.080 -88 A 0.085 -89 P 0.088 -90 D 0.087 -91 G 0.080 -92 T 0.067 -93 W 0.049 -94 T 0.034 -95 S 0.025 -96 L 0.021 -97 A 0.022 -98 Q 0.025 -99 L 0.030 -100 S 0.037 -101 L 0.043 -102 P 0.046 -103 S 0.045 -104 E 0.045 -105 E 0.048 -106 L 0.056 -107 E 0.067 -108 A 0.073 -109 W 0.070 -110 E 0.058 -111 P 0.045 -112 L 0.034 -113 V 0.027 -114 C 0.030 -115 H 0.046 -116 T 0.081 -117 R 0.134 -118 P 0.201 -119 G 0.271 -120 A 0.326 -121 G 0.353 -122 G 0.350 -123 Q 0.325 -124 N 0.286 -125 R 0.236 -126 S 0.191 -127 T 0.162 -128 H 0.155 -129 P 0.165 -130 L 0.193 -131 Q 0.247 -132 L 0.334 -133 S 0.445 -134 G 0.553 -135 E 0.630 -136 S 0.671 -137 S 0.688 -138 T 0.690 -139 A 0.682 -140 R 0.668 -141 S 0.651 -142 C 0.636 -143 F 0.626 -144 P 0.628 -145 E 0.637 -146 P 0.643 -147 L 0.636 -148 G 0.608 -149 G 0.555 -150 T 0.476 -151 Q 0.383 -152 R 0.298 -153 Q 0.236 -154 V 0.198 -155 L 0.176 -156 W 0.167 -157 L 0.171 -158 S 0.177 -159 L 0.176 -160 L 0.175 -161 R 0.175 -162 L 0.168 -163 L 0.152 -164 L 0.140 -165 F 0.138 -166 K 0.133 -167 L 0.119 -168 L 0.107 -169 L 0.105 -170 L 0.114 -171 D 0.121 -172 V 0.121 -173 L 0.117 -174 L 0.121 -175 T 0.138 -176 C 0.161 -177 S 0.181 -178 H 0.186 -179 L 0.180 -180 R 0.177 -181 L 0.185 -182 H 0.200 -183 V 0.217 -184 L 0.244 -185 A 0.283 -186 G 0.329 -187 Q 0.370 -188 H 0.402 -189 L 0.429 -190 Q 0.460 -191 P 0.501 -192 P 0.554 -193 P 0.609 -194 S 0.651 -195 R 0.669 -196 K 0.663 -197 S 0.646 -198 L 0.630 -199 P 0.630 -200 P 0.652 -201 T 0.682 -202 H 0.700 -203 R 0.693 -204 I 0.649 -205 W 0.573 -206 T 0.508 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036890.14_ENSMUST00000112810.8_GN:Gtdc1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036890.14_ENSMUST00000112810.8_GN:Gtdc1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 3f6e42aedd2c87e1839840420804e411e8cd8299..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036890.14_ENSMUST00000112810.8_GN:Gtdc1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,446 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000036890.14|ENSMUST00000112810.8|GN:Gtdc1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.151 -2 S 0.122 -3 I 0.088 -4 V 0.071 -5 I 0.074 -6 I 0.090 -7 E 0.107 -8 A 0.119 -9 F 0.128 -10 Y 0.133 -11 G 0.127 -12 G 0.109 -13 S 0.088 -14 H 0.072 -15 R 0.063 -16 Q 0.064 -17 L 0.073 -18 V 0.082 -19 E 0.086 -20 L 0.081 -21 L 0.071 -22 R 0.060 -23 E 0.053 -24 E 0.051 -25 L 0.055 -26 D 0.064 -27 D 0.070 -28 C 0.070 -29 V 0.066 -30 L 0.066 -31 Y 0.075 -32 T 0.091 -33 L 0.109 -34 P 0.121 -35 A 0.122 -36 K 0.109 -37 K 0.086 -38 W 0.062 -39 H 0.046 -40 W 0.039 -41 R 0.040 -42 A 0.043 -43 R 0.042 -44 T 0.036 -45 A 0.031 -46 A 0.028 -47 L 0.028 -48 Y 0.028 -49 F 0.030 -50 S 0.035 -51 Q 0.045 -52 N 0.060 -53 I 0.078 -54 P 0.092 -55 S 0.103 -56 S 0.109 -57 E 0.104 -58 H 0.087 -59 Y 0.066 -60 R 0.053 -61 T 0.051 -62 L 0.055 -63 F 0.060 -64 A 0.065 -65 S 0.071 -66 S 0.078 -67 V 0.082 -68 L 0.080 -69 N 0.072 -70 L 0.060 -71 T 0.050 -72 E 0.043 -73 L 0.039 -74 A 0.040 -75 A 0.044 -76 L 0.048 -77 R 0.049 -78 P 0.047 -79 D 0.046 -80 L 0.048 -81 G 0.053 -82 K 0.058 -83 L 0.061 -84 K 0.067 -85 K 0.079 -86 I 0.097 -87 L 0.121 -88 Y 0.146 -89 F 0.164 -90 H 0.160 -91 E 0.142 -92 N 0.130 -93 Q 0.128 -94 L 0.130 -95 V 0.136 -96 Y 0.152 -97 P 0.171 -98 V 0.180 -99 K 0.178 -100 K 0.171 -101 Y 0.166 -102 Q 0.164 -103 E 0.164 -104 R 0.158 -105 D 0.140 -106 F 0.116 -107 Q 0.098 -108 Y 0.095 -109 G 0.097 -110 Y 0.093 -111 N 0.083 -112 Q 0.077 -113 I 0.076 -114 L 0.071 -115 S 0.066 -116 C 0.069 -117 L 0.086 -118 V 0.108 -119 A 0.122 -120 D 0.117 -121 V 0.106 -122 V 0.102 -123 V 0.104 -124 F 0.103 -125 N 0.098 -126 S 0.088 -127 S 0.074 -128 F 0.063 -129 N 0.057 -130 M 0.054 -131 E 0.053 -132 S 0.055 -133 F 0.055 -134 L 0.053 -135 T 0.052 -136 S 0.057 -137 I 0.063 -138 G 0.066 -139 K 0.069 -140 F 0.075 -141 L 0.082 -142 K 0.089 -143 L 0.096 -144 I 0.105 -145 P 0.115 -146 D 0.124 -147 H 0.130 -148 R 0.133 -149 P 0.132 -150 K 0.125 -151 D 0.112 -152 L 0.094 -153 E 0.074 -154 S 0.060 -155 I 0.054 -156 I 0.057 -157 R 0.059 -158 P 0.056 -159 K 0.056 -160 C 0.062 -161 Q 0.073 -162 V 0.079 -163 I 0.078 -164 Y 0.075 -165 F 0.077 -166 P 0.082 -167 I 0.090 -168 R 0.105 -169 F 0.123 -170 P 0.138 -171 D 0.142 -172 V 0.143 -173 S 0.151 -174 R 0.166 -175 F 0.179 -176 M 0.179 -177 P 0.169 -178 K 0.153 -179 H 0.136 -180 K 0.121 -181 I 0.109 -182 A 0.105 -183 H 0.104 -184 L 0.103 -185 R 0.104 -186 R 0.111 -187 M 0.130 -188 L 0.166 -189 S 0.215 -190 L 0.271 -191 I 0.338 -192 G 0.416 -193 D 0.483 -194 A 0.525 -195 A 0.552 -196 A 0.584 -197 S 0.616 -198 Q 0.637 -199 S 0.639 -200 V 0.627 -201 A 0.613 -202 P 0.604 -203 C 0.607 -204 P 0.621 -205 Q 0.632 -206 P 0.622 -207 G 0.592 -208 Q 0.577 -209 R 0.598 -210 V 0.612 -211 S 0.584 -212 E 0.554 -213 K 0.562 -214 S 0.580 -215 P 0.571 -216 E 0.557 -217 N 0.561 -218 C 0.564 -219 E 0.575 -220 S 0.616 -221 K 0.667 -222 S 0.688 -223 D 0.681 -224 E 0.673 -225 H 0.673 -226 P 0.676 -227 D 0.673 -228 L 0.663 -229 D 0.644 -230 A 0.619 -231 E 0.597 -232 Q 0.586 -233 E 0.588 -234 A 0.594 -235 L 0.603 -236 D 0.618 -237 N 0.640 -238 P 0.665 -239 S 0.686 -240 V 0.700 -241 H 0.704 -242 K 0.702 -243 S 0.694 -244 G 0.678 -245 S 0.661 -246 L 0.647 -247 P 0.636 -248 V 0.622 -249 S 0.603 -250 K 0.578 -251 E 0.545 -252 N 0.507 -253 L 0.467 -254 P 0.420 -255 L 0.362 -256 D 0.305 -257 P 0.277 -258 S 0.293 -259 T 0.343 -260 L 0.398 -261 L 0.442 -262 C 0.468 -263 G 0.467 -264 A 0.433 -265 E 0.383 -266 D 0.332 -267 P 0.288 -268 Q 0.258 -269 R 0.234 -270 P 0.197 -271 L 0.149 -272 H 0.109 -273 I 0.088 -274 T 0.083 -275 W 0.090 -276 P 0.102 -277 H 0.110 -278 R 0.111 -279 W 0.108 -280 E 0.100 -281 H 0.093 -282 D 0.091 -283 K 0.090 -284 D 0.083 -285 P 0.070 -286 E 0.057 -287 T 0.049 -288 F 0.044 -289 L 0.042 -290 K 0.044 -291 I 0.046 -292 L 0.043 -293 M 0.039 -294 S 0.041 -295 L 0.051 -296 K 0.066 -297 Q 0.078 -298 L 0.080 -299 N 0.074 -300 L 0.068 -301 N 0.061 -302 F 0.051 -303 H 0.041 -304 V 0.036 -305 S 0.037 -306 V 0.044 -307 L 0.055 -308 G 0.065 -309 E 0.069 -310 T 0.068 -311 F 0.070 -312 T 0.081 -313 D 0.094 -314 T 0.097 -315 P 0.089 -316 D 0.075 -317 I 0.065 -318 F 0.061 -319 S 0.062 -320 E 0.066 -321 A 0.071 -322 K 0.078 -323 K 0.084 -324 A 0.084 -325 L 0.078 -326 G 0.073 -327 S 0.066 -328 S 0.058 -329 V 0.050 -330 L 0.047 -331 H 0.052 -332 W 0.064 -333 G 0.074 -334 Y 0.074 -335 L 0.068 -336 P 0.062 -337 R 0.053 -338 K 0.042 -339 E 0.034 -340 D 0.030 -341 Y 0.033 -342 F 0.035 -343 R 0.034 -344 V 0.032 -345 L 0.032 -346 C 0.035 -347 M 0.040 -348 A 0.045 -349 D 0.046 -350 V 0.045 -351 V 0.046 -352 I 0.052 -353 S 0.060 -354 T 0.066 -355 A 0.067 -356 K 0.063 -357 H 0.055 -358 E 0.049 -359 F 0.048 -360 F 0.052 -361 G 0.056 -362 V 0.058 -363 A 0.060 -364 M 0.062 -365 L 0.061 -366 E 0.056 -367 A 0.049 -368 V 0.044 -369 Y 0.045 -370 C 0.055 -371 G 0.066 -372 C 0.074 -373 Y 0.082 -374 P 0.090 -375 L 0.096 -376 C 0.101 -377 P 0.101 -378 K 0.096 -379 A 0.086 -380 L 0.077 -381 V 0.070 -382 Y 0.064 -383 P 0.060 -384 E 0.060 -385 I 0.064 -386 F 0.066 -387 P 0.066 -388 A 0.065 -389 E 0.062 -390 Y 0.057 -391 L 0.052 -392 Y 0.050 -393 S 0.050 -394 T 0.050 -395 P 0.047 -396 E 0.044 -397 Q 0.045 -398 L 0.053 -399 S 0.063 -400 K 0.069 -401 R 0.064 -402 L 0.054 -403 K 0.047 -404 S 0.044 -405 F 0.047 -406 C 0.055 -407 K 0.066 -408 R 0.077 -409 P 0.085 -410 D 0.091 -411 I 0.092 -412 I 0.089 -413 R 0.088 -414 K 0.095 -415 H 0.106 -416 L 0.119 -417 Y 0.135 -418 K 0.154 -419 G 0.165 -420 E 0.159 -421 V 0.139 -422 A 0.116 -423 P 0.097 -424 F 0.084 -425 S 0.073 -426 W 0.065 -427 A 0.062 -428 A 0.061 -429 L 0.058 -430 H 0.054 -431 G 0.051 -432 K 0.051 -433 F 0.052 -434 R 0.055 -435 S 0.061 -436 L 0.075 -437 L 0.109 -438 T 0.171 -439 T 0.255 -440 E 0.341 -441 P 0.415 -442 R 0.472 -443 E 0.502 -444 D 0.493 -445 L 0.467 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036890.14_ENSMUST00000112810.8_GN:Gtdc1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:20.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036890.14_ENSMUST00000112810.8_GN:Gtdc1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:20.caid deleted file mode 100644 index 5cd9f77469fa852f73cc55cff1945220988f38d3..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036890.14_ENSMUST00000112810.8_GN:Gtdc1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:20.caid +++ /dev/null @@ -1,466 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000036890.14|ENSMUST00000112810.8|GN:Gtdc1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:20 -1 M 0.282 -2 W 0.300 -3 K 0.334 -4 C 0.371 -5 T 0.400 -6 R 0.426 -7 L 0.458 -8 D 0.483 -9 I 0.484 -10 S 0.485 -11 S 0.522 -12 S 0.580 -13 G 0.622 -14 S 0.636 -15 E 0.636 -16 G 0.625 -17 L 0.590 -18 N 0.526 -19 R 0.439 -20 P 0.334 -21 M 0.226 -22 S 0.139 -23 I 0.086 -24 V 0.067 -25 I 0.070 -26 I 0.083 -27 E 0.097 -28 A 0.108 -29 F 0.119 -30 Y 0.127 -31 G 0.124 -32 G 0.109 -33 S 0.090 -34 H 0.074 -35 R 0.066 -36 Q 0.066 -37 L 0.074 -38 V 0.083 -39 E 0.086 -40 L 0.081 -41 L 0.070 -42 R 0.059 -43 E 0.051 -44 E 0.049 -45 L 0.052 -46 D 0.058 -47 D 0.063 -48 C 0.063 -49 V 0.061 -50 L 0.062 -51 Y 0.070 -52 T 0.086 -53 L 0.104 -54 P 0.117 -55 A 0.120 -56 K 0.107 -57 K 0.085 -58 W 0.062 -59 H 0.047 -60 W 0.041 -61 R 0.041 -62 A 0.044 -63 R 0.043 -64 T 0.037 -65 A 0.032 -66 A 0.029 -67 L 0.028 -68 Y 0.028 -69 F 0.029 -70 S 0.034 -71 Q 0.043 -72 N 0.058 -73 I 0.074 -74 P 0.086 -75 S 0.096 -76 S 0.102 -77 E 0.098 -78 H 0.081 -79 Y 0.061 -80 R 0.049 -81 T 0.047 -82 L 0.051 -83 F 0.056 -84 A 0.061 -85 S 0.067 -86 S 0.074 -87 V 0.079 -88 L 0.078 -89 N 0.070 -90 L 0.059 -91 T 0.049 -92 E 0.042 -93 L 0.038 -94 A 0.038 -95 A 0.041 -96 L 0.045 -97 R 0.047 -98 P 0.045 -99 D 0.044 -100 L 0.046 -101 G 0.052 -102 K 0.056 -103 L 0.060 -104 K 0.066 -105 K 0.078 -106 I 0.096 -107 L 0.119 -108 Y 0.145 -109 F 0.162 -110 H 0.158 -111 E 0.140 -112 N 0.129 -113 Q 0.128 -114 L 0.130 -115 V 0.136 -116 Y 0.153 -117 P 0.172 -118 V 0.182 -119 K 0.180 -120 K 0.174 -121 Y 0.170 -122 Q 0.169 -123 E 0.170 -124 R 0.164 -125 D 0.144 -126 F 0.117 -127 Q 0.097 -128 Y 0.093 -129 G 0.096 -130 Y 0.094 -131 N 0.085 -132 Q 0.080 -133 I 0.078 -134 L 0.073 -135 S 0.068 -136 C 0.071 -137 L 0.088 -138 V 0.112 -139 A 0.126 -140 D 0.119 -141 V 0.106 -142 V 0.102 -143 V 0.104 -144 F 0.105 -145 N 0.100 -146 S 0.090 -147 S 0.076 -148 F 0.066 -149 N 0.060 -150 M 0.056 -151 E 0.055 -152 S 0.056 -153 F 0.056 -154 L 0.053 -155 T 0.052 -156 S 0.057 -157 I 0.062 -158 G 0.065 -159 K 0.068 -160 F 0.074 -161 L 0.081 -162 K 0.089 -163 L 0.097 -164 I 0.105 -165 P 0.115 -166 D 0.123 -167 H 0.128 -168 R 0.130 -169 P 0.128 -170 K 0.122 -171 D 0.110 -172 L 0.093 -173 E 0.074 -174 S 0.060 -175 I 0.055 -176 I 0.057 -177 R 0.058 -178 P 0.056 -179 K 0.055 -180 C 0.063 -181 Q 0.074 -182 V 0.080 -183 I 0.079 -184 Y 0.076 -185 F 0.077 -186 P 0.081 -187 I 0.089 -188 R 0.103 -189 F 0.122 -190 P 0.135 -191 D 0.139 -192 V 0.140 -193 S 0.147 -194 R 0.162 -195 F 0.174 -196 M 0.175 -197 P 0.165 -198 K 0.150 -199 H 0.133 -200 K 0.117 -201 I 0.107 -202 A 0.104 -203 H 0.104 -204 L 0.104 -205 R 0.105 -206 R 0.113 -207 M 0.134 -208 L 0.170 -209 S 0.219 -210 L 0.275 -211 I 0.344 -212 G 0.422 -213 D 0.490 -214 A 0.530 -215 A 0.557 -216 A 0.590 -217 S 0.623 -218 Q 0.644 -219 S 0.646 -220 V 0.634 -221 A 0.619 -222 P 0.609 -223 C 0.612 -224 P 0.625 -225 Q 0.635 -226 P 0.624 -227 G 0.593 -228 Q 0.578 -229 R 0.598 -230 V 0.612 -231 S 0.586 -232 E 0.557 -233 K 0.567 -234 S 0.584 -235 P 0.574 -236 E 0.559 -237 N 0.561 -238 C 0.565 -239 E 0.576 -240 S 0.618 -241 K 0.670 -242 S 0.692 -243 D 0.686 -244 E 0.677 -245 H 0.677 -246 P 0.680 -247 D 0.678 -248 L 0.669 -249 D 0.650 -250 A 0.624 -251 E 0.596 -252 Q 0.575 -253 E 0.569 -254 A 0.583 -255 L 0.605 -256 D 0.627 -257 N 0.650 -258 P 0.673 -259 S 0.692 -260 V 0.704 -261 H 0.707 -262 K 0.705 -263 S 0.695 -264 G 0.679 -265 S 0.662 -266 L 0.649 -267 P 0.639 -268 V 0.626 -269 S 0.608 -270 K 0.586 -271 E 0.557 -272 N 0.523 -273 L 0.485 -274 P 0.439 -275 L 0.380 -276 D 0.320 -277 P 0.289 -278 S 0.305 -279 T 0.355 -280 L 0.413 -281 L 0.458 -282 C 0.485 -283 G 0.482 -284 A 0.447 -285 E 0.393 -286 D 0.339 -287 P 0.293 -288 Q 0.262 -289 R 0.237 -290 P 0.200 -291 L 0.152 -292 H 0.112 -293 I 0.091 -294 T 0.086 -295 W 0.093 -296 P 0.105 -297 H 0.112 -298 R 0.113 -299 W 0.109 -300 E 0.102 -301 H 0.095 -302 D 0.093 -303 K 0.093 -304 D 0.086 -305 P 0.072 -306 E 0.059 -307 T 0.051 -308 F 0.045 -309 L 0.044 -310 K 0.045 -311 I 0.047 -312 L 0.045 -313 M 0.041 -314 S 0.042 -315 L 0.052 -316 K 0.067 -317 Q 0.079 -318 L 0.081 -319 N 0.076 -320 L 0.071 -321 N 0.064 -322 F 0.054 -323 H 0.043 -324 V 0.037 -325 S 0.038 -326 V 0.045 -327 L 0.056 -328 G 0.066 -329 E 0.070 -330 T 0.069 -331 F 0.071 -332 T 0.082 -333 D 0.094 -334 T 0.098 -335 P 0.090 -336 D 0.076 -337 I 0.065 -338 F 0.061 -339 S 0.063 -340 E 0.066 -341 A 0.070 -342 K 0.076 -343 K 0.082 -344 A 0.081 -345 L 0.076 -346 G 0.072 -347 S 0.066 -348 S 0.058 -349 V 0.050 -350 L 0.047 -351 H 0.052 -352 W 0.063 -353 G 0.073 -354 Y 0.073 -355 L 0.068 -356 P 0.061 -357 R 0.052 -358 K 0.042 -359 E 0.033 -360 D 0.030 -361 Y 0.033 -362 F 0.035 -363 R 0.034 -364 V 0.032 -365 L 0.032 -366 C 0.035 -367 M 0.040 -368 A 0.045 -369 D 0.047 -370 V 0.046 -371 V 0.048 -372 I 0.054 -373 S 0.062 -374 T 0.068 -375 A 0.069 -376 K 0.064 -377 H 0.056 -378 E 0.050 -379 F 0.049 -380 F 0.053 -381 G 0.056 -382 V 0.058 -383 A 0.061 -384 M 0.063 -385 L 0.062 -386 E 0.057 -387 A 0.050 -388 V 0.044 -389 Y 0.045 -390 C 0.054 -391 G 0.065 -392 C 0.074 -393 Y 0.082 -394 P 0.091 -395 L 0.098 -396 C 0.102 -397 P 0.103 -398 K 0.097 -399 A 0.087 -400 L 0.078 -401 V 0.070 -402 Y 0.064 -403 P 0.061 -404 E 0.061 -405 I 0.065 -406 F 0.067 -407 P 0.067 -408 A 0.066 -409 E 0.063 -410 Y 0.058 -411 L 0.054 -412 Y 0.052 -413 S 0.052 -414 T 0.052 -415 P 0.048 -416 E 0.045 -417 Q 0.046 -418 L 0.053 -419 S 0.063 -420 K 0.068 -421 R 0.063 -422 L 0.053 -423 K 0.046 -424 S 0.044 -425 F 0.047 -426 C 0.055 -427 K 0.067 -428 R 0.079 -429 P 0.087 -430 D 0.094 -431 I 0.097 -432 I 0.095 -433 R 0.094 -434 K 0.101 -435 H 0.114 -436 L 0.127 -437 Y 0.142 -438 K 0.160 -439 G 0.170 -440 E 0.162 -441 V 0.141 -442 A 0.117 -443 P 0.098 -444 F 0.085 -445 S 0.074 -446 W 0.066 -447 A 0.063 -448 A 0.062 -449 L 0.058 -450 H 0.053 -451 G 0.051 -452 K 0.051 -453 F 0.052 -454 R 0.054 -455 S 0.059 -456 L 0.073 -457 L 0.105 -458 T 0.167 -459 T 0.249 -460 E 0.333 -461 P 0.407 -462 R 0.465 -463 E 0.497 -464 D 0.490 -465 L 0.466 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036908.18_ENSMUST00000162708.7_GN:Unc93b1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036908.18_ENSMUST00000162708.7_GN:Unc93b1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 67e4a094557c8af3a992b2ffccf2162762097123..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036908.18_ENSMUST00000162708.7_GN:Unc93b1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,599 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000036908.18|ENSMUST00000162708.7|GN:Unc93b1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.353 -2 E 0.372 -3 V 0.396 -4 E 0.414 -5 P 0.421 -6 P 0.430 -7 L 0.463 -8 Y 0.520 -9 P 0.573 -10 V 0.593 -11 A 0.573 -12 G 0.526 -13 A 0.483 -14 A 0.456 -15 G 0.428 -16 P 0.404 -17 Q 0.429 -18 G 0.491 -19 D 0.531 -20 E 0.549 -21 D 0.583 -22 R 0.630 -23 H 0.663 -24 G 0.679 -25 V 0.683 -26 P 0.682 -27 D 0.681 -28 G 0.680 -29 P 0.676 -30 E 0.672 -31 A 0.666 -32 P 0.658 -33 L 0.648 -34 D 0.640 -35 E 0.633 -36 L 0.622 -37 V 0.601 -38 G 0.575 -39 A 0.557 -40 Y 0.549 -41 P 0.532 -42 N 0.488 -43 Y 0.417 -44 N 0.332 -45 E 0.257 -46 E 0.202 -47 E 0.165 -48 E 0.138 -49 E 0.117 -50 R 0.101 -51 R 0.091 -52 Y 0.086 -53 Y 0.084 -54 R 0.087 -55 R 0.093 -56 K 0.091 -57 R 0.081 -58 L 0.070 -59 G 0.063 -60 V 0.057 -61 V 0.051 -62 K 0.046 -63 N 0.041 -64 V 0.036 -65 L 0.031 -66 A 0.029 -67 A 0.031 -68 S 0.036 -69 T 0.038 -70 G 0.035 -71 V 0.029 -72 T 0.025 -73 L 0.023 -74 T 0.022 -75 Y 0.023 -76 G 0.026 -77 V 0.028 -78 Y 0.029 -79 L 0.030 -80 G 0.032 -81 L 0.033 -82 L 0.035 -83 Q 0.038 -84 M 0.039 -85 Q 0.036 -86 L 0.034 -87 I 0.038 -88 L 0.044 -89 H 0.051 -90 Y 0.057 -91 D 0.062 -92 E 0.067 -93 T 0.068 -94 Y 0.067 -95 R 0.073 -96 E 0.091 -97 V 0.123 -98 K 0.165 -99 Y 0.215 -100 G 0.269 -101 N 0.311 -102 M 0.328 -103 G 0.320 -104 L 0.291 -105 P 0.247 -106 D 0.196 -107 I 0.152 -108 D 0.121 -109 S 0.103 -110 K 0.096 -111 M 0.096 -112 L 0.093 -113 M 0.082 -114 G 0.069 -115 I 0.063 -116 N 0.061 -117 V 0.063 -118 T 0.066 -119 P 0.065 -120 I 0.062 -121 A 0.058 -122 A 0.053 -123 L 0.046 -124 L 0.038 -125 Y 0.034 -126 T 0.033 -127 P 0.031 -128 V 0.027 -129 L 0.026 -130 I 0.026 -131 R 0.024 -132 F 0.024 -133 F 0.026 -134 G 0.027 -135 T 0.025 -136 K 0.023 -137 W 0.022 -138 M 0.023 -139 M 0.024 -140 F 0.025 -141 L 0.027 -142 A 0.029 -143 V 0.030 -144 G 0.028 -145 I 0.024 -146 Y 0.020 -147 A 0.019 -148 L 0.020 -149 F 0.022 -150 V 0.025 -151 S 0.030 -152 T 0.035 -153 N 0.040 -154 Y 0.043 -155 W 0.046 -156 E 0.048 -157 R 0.046 -158 Y 0.040 -159 Y 0.035 -160 T 0.035 -161 L 0.039 -162 V 0.042 -163 P 0.046 -164 S 0.054 -165 A 0.064 -166 V 0.072 -167 A 0.077 -168 L 0.080 -169 G 0.083 -170 M 0.086 -171 A 0.087 -172 I 0.087 -173 V 0.086 -174 P 0.081 -175 L 0.071 -176 W 0.065 -177 A 0.068 -178 S 0.074 -179 M 0.071 -180 G 0.061 -181 N 0.050 -182 Y 0.044 -183 I 0.042 -184 T 0.040 -185 R 0.038 -186 M 0.036 -187 S 0.036 -188 Q 0.037 -189 K 0.039 -190 Y 0.043 -191 Y 0.048 -192 E 0.054 -193 Y 0.068 -194 S 0.093 -195 H 0.127 -196 Y 0.165 -197 K 0.209 -198 E 0.256 -199 Q 0.297 -200 D 0.321 -201 E 0.331 -202 Q 0.336 -203 G 0.348 -204 P 0.366 -205 Q 0.388 -206 Q 0.408 -207 R 0.420 -208 P 0.421 -209 P 0.410 -210 R 0.390 -211 G 0.361 -212 S 0.324 -213 H 0.277 -214 A 0.224 -215 P 0.174 -216 Y 0.139 -217 L 0.117 -218 L 0.099 -219 V 0.082 -220 F 0.073 -221 Q 0.069 -222 A 0.065 -223 I 0.060 -224 F 0.059 -225 Y 0.058 -226 S 0.055 -227 F 0.050 -228 F 0.049 -229 H 0.049 -230 L 0.046 -231 S 0.041 -232 F 0.037 -233 A 0.036 -234 C 0.039 -235 A 0.044 -236 Q 0.047 -237 L 0.048 -238 P 0.047 -239 M 0.046 -240 I 0.045 -241 Y 0.045 -242 F 0.051 -243 L 0.066 -244 N 0.084 -245 N 0.102 -246 Y 0.120 -247 L 0.142 -248 Y 0.170 -249 D 0.198 -250 L 0.221 -251 N 0.235 -252 H 0.245 -253 T 0.249 -254 L 0.242 -255 I 0.226 -256 N 0.208 -257 V 0.192 -258 Q 0.173 -259 S 0.157 -260 C 0.159 -261 G 0.192 -262 T 0.241 -263 K 0.288 -264 S 0.327 -265 Q 0.367 -266 G 0.410 -267 I 0.452 -268 L 0.489 -269 N 0.512 -270 G 0.508 -271 F 0.475 -272 N 0.426 -273 K 0.382 -274 T 0.361 -275 V 0.353 -276 L 0.335 -277 R 0.297 -278 T 0.257 -279 L 0.231 -280 P 0.210 -281 R 0.181 -282 S 0.145 -283 K 0.110 -284 N 0.086 -285 L 0.070 -286 I 0.063 -287 V 0.065 -288 V 0.072 -289 E 0.080 -290 S 0.083 -291 V 0.083 -292 L 0.085 -293 M 0.088 -294 A 0.087 -295 V 0.080 -296 A 0.068 -297 F 0.056 -298 L 0.049 -299 A 0.048 -300 M 0.047 -301 L 0.047 -302 M 0.051 -303 V 0.058 -304 L 0.061 -305 G 0.062 -306 L 0.067 -307 C 0.080 -308 G 0.097 -309 A 0.112 -310 A 0.120 -311 Y 0.121 -312 R 0.128 -313 P 0.147 -314 T 0.174 -315 E 0.202 -316 E 0.220 -317 I 0.223 -318 D 0.213 -319 L 0.194 -320 R 0.171 -321 S 0.149 -322 V 0.128 -323 G 0.110 -324 W 0.097 -325 G 0.091 -326 N 0.087 -327 I 0.079 -328 F 0.068 -329 Q 0.058 -330 L 0.049 -331 P 0.041 -332 F 0.036 -333 K 0.038 -334 H 0.044 -335 V 0.048 -336 R 0.049 -337 D 0.049 -338 F 0.048 -339 R 0.047 -340 L 0.046 -341 R 0.048 -342 H 0.055 -343 L 0.062 -344 V 0.063 -345 P 0.056 -346 F 0.047 -347 F 0.042 -348 I 0.039 -349 Y 0.036 -350 S 0.035 -351 G 0.035 -352 F 0.034 -353 E 0.032 -354 V 0.031 -355 L 0.034 -356 F 0.039 -357 A 0.044 -358 C 0.053 -359 T 0.065 -360 G 0.075 -361 F 0.075 -362 A 0.068 -363 L 0.065 -364 G 0.066 -365 Y 0.069 -366 G 0.070 -367 V 0.077 -368 C 0.092 -369 S 0.104 -370 M 0.104 -371 G 0.092 -372 L 0.075 -373 E 0.061 -374 R 0.057 -375 L 0.059 -376 A 0.063 -377 Y 0.070 -378 L 0.078 -379 L 0.079 -380 I 0.069 -381 A 0.059 -382 Y 0.056 -383 S 0.060 -384 L 0.063 -385 G 0.063 -386 A 0.060 -387 S 0.056 -388 A 0.053 -389 S 0.051 -390 S 0.047 -391 V 0.044 -392 L 0.045 -393 G 0.047 -394 L 0.046 -395 L 0.047 -396 G 0.052 -397 L 0.055 -398 W 0.055 -399 L 0.053 -400 P 0.050 -401 R 0.046 -402 S 0.043 -403 V 0.040 -404 P 0.038 -405 L 0.038 -406 V 0.042 -407 A 0.046 -408 G 0.047 -409 A 0.045 -410 G 0.042 -411 L 0.038 -412 H 0.035 -413 L 0.032 -414 L 0.032 -415 L 0.033 -416 T 0.033 -417 L 0.031 -418 S 0.029 -419 L 0.029 -420 F 0.030 -421 F 0.033 -422 W 0.042 -423 A 0.053 -424 P 0.064 -425 A 0.073 -426 P 0.080 -427 R 0.084 -428 V 0.089 -429 L 0.094 -430 Q 0.095 -431 H 0.086 -432 S 0.069 -433 W 0.053 -434 I 0.044 -435 F 0.041 -436 Y 0.040 -437 F 0.040 -438 V 0.040 -439 A 0.040 -440 A 0.042 -441 L 0.050 -442 W 0.066 -443 G 0.088 -444 V 0.107 -445 G 0.121 -446 S 0.128 -447 A 0.125 -448 L 0.111 -449 N 0.097 -450 K 0.089 -451 T 0.087 -452 G 0.089 -453 L 0.089 -454 S 0.083 -455 T 0.075 -456 L 0.072 -457 L 0.070 -458 G 0.065 -459 I 0.060 -460 L 0.057 -461 Y 0.058 -462 E 0.061 -463 D 0.064 -464 K 0.064 -465 E 0.060 -466 R 0.056 -467 Q 0.053 -468 D 0.052 -469 F 0.051 -470 I 0.049 -471 F 0.047 -472 T 0.048 -473 I 0.053 -474 Y 0.057 -475 H 0.058 -476 W 0.052 -477 W 0.045 -478 Q 0.040 -479 A 0.037 -480 V 0.036 -481 A 0.035 -482 I 0.033 -483 F 0.030 -484 V 0.030 -485 V 0.034 -486 Y 0.044 -487 L 0.061 -488 G 0.081 -489 S 0.095 -490 S 0.099 -491 L 0.094 -492 P 0.082 -493 M 0.068 -494 K 0.055 -495 A 0.048 -496 K 0.050 -497 L 0.056 -498 A 0.062 -499 V 0.065 -500 L 0.064 -501 L 0.060 -502 V 0.053 -503 T 0.047 -504 L 0.043 -505 V 0.042 -506 A 0.046 -507 A 0.055 -508 A 0.065 -509 A 0.067 -510 S 0.058 -511 Y 0.045 -512 L 0.038 -513 W 0.040 -514 M 0.051 -515 E 0.070 -516 Q 0.086 -517 K 0.096 -518 L 0.106 -519 Q 0.125 -520 Q 0.156 -521 G 0.199 -522 L 0.252 -523 V 0.310 -524 P 0.361 -525 R 0.400 -526 Q 0.429 -527 P 0.450 -528 R 0.464 -529 I 0.479 -530 P 0.498 -531 K 0.525 -532 P 0.557 -533 Q 0.584 -534 H 0.599 -535 K 0.606 -536 V 0.609 -537 R 0.611 -538 G 0.611 -539 Y 0.614 -540 R 0.621 -541 Y 0.633 -542 L 0.648 -543 E 0.663 -544 E 0.678 -545 D 0.691 -546 N 0.702 -547 S 0.712 -548 D 0.721 -549 E 0.727 -550 S 0.731 -551 D 0.729 -552 M 0.714 -553 E 0.664 -554 G 0.571 -555 E 0.488 -556 Q 0.495 -557 G 0.593 -558 Q 0.702 -559 G 0.763 -560 D 0.767 -561 C 0.723 -562 A 0.655 -563 E 0.616 -564 D 0.637 -565 E 0.684 -566 A 0.716 -567 P 0.732 -568 Q 0.742 -569 A 0.746 -570 G 0.746 -571 P 0.745 -572 L 0.743 -573 G 0.736 -574 A 0.721 -575 E 0.708 -576 P 0.703 -577 A 0.701 -578 G 0.698 -579 P 0.690 -580 C 0.676 -581 R 0.651 -582 K 0.620 -583 P 0.597 -584 C 0.592 -585 P 0.607 -586 Y 0.639 -587 E 0.676 -588 Q 0.704 -589 A 0.716 -590 L 0.720 -591 G 0.721 -592 G 0.722 -593 D 0.722 -594 G 0.722 -595 P 0.718 -596 E 0.702 -597 E 0.671 -598 Q 0.645 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036908.18_ENSMUST00000162708.7_GN:Unc93b1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:21.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036908.18_ENSMUST00000162708.7_GN:Unc93b1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:21.caid deleted file mode 100644 index 70b193a1cd4785307c6f7d7f6a5951e4693e365f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036908.18_ENSMUST00000162708.7_GN:Unc93b1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:21.caid +++ /dev/null @@ -1,620 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000036908.18|ENSMUST00000162708.7|GN:Unc93b1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:21 -1 M 0.372 -2 K 0.387 -3 E 0.405 -4 V 0.413 -5 P 0.403 -6 T 0.385 -7 S 0.369 -8 C 0.362 -9 W 0.368 -10 C 0.382 -11 P 0.394 -12 E 0.394 -13 L 0.384 -14 Q 0.377 -15 A 0.392 -16 L 0.429 -17 D 0.461 -18 L 0.475 -19 D 0.480 -20 L 0.482 -21 V 0.479 -22 M 0.477 -23 E 0.479 -24 V 0.481 -25 E 0.484 -26 P 0.499 -27 P 0.529 -28 L 0.571 -29 Y 0.621 -30 P 0.670 -31 V 0.699 -32 A 0.685 -33 G 0.631 -34 A 0.579 -35 A 0.560 -36 G 0.559 -37 P 0.570 -38 Q 0.602 -39 G 0.626 -40 D 0.607 -41 E 0.578 -42 D 0.570 -43 R 0.571 -44 H 0.581 -45 G 0.620 -46 V 0.672 -47 P 0.703 -48 D 0.713 -49 G 0.711 -50 P 0.706 -51 E 0.700 -52 A 0.696 -53 P 0.695 -54 L 0.697 -55 D 0.701 -56 E 0.700 -57 L 0.690 -58 V 0.667 -59 G 0.641 -60 A 0.623 -61 Y 0.610 -62 P 0.584 -63 N 0.529 -64 Y 0.444 -65 N 0.348 -66 E 0.265 -67 E 0.205 -68 E 0.163 -69 E 0.132 -70 E 0.110 -71 R 0.094 -72 R 0.086 -73 Y 0.082 -74 Y 0.081 -75 R 0.084 -76 R 0.088 -77 K 0.085 -78 R 0.075 -79 L 0.064 -80 G 0.057 -81 V 0.053 -82 V 0.048 -83 K 0.043 -84 N 0.039 -85 V 0.034 -86 L 0.030 -87 A 0.028 -88 A 0.030 -89 S 0.035 -90 T 0.038 -91 G 0.035 -92 V 0.029 -93 T 0.024 -94 L 0.023 -95 T 0.022 -96 Y 0.023 -97 G 0.026 -98 V 0.027 -99 Y 0.028 -100 L 0.029 -101 G 0.031 -102 L 0.032 -103 L 0.033 -104 Q 0.035 -105 M 0.035 -106 Q 0.032 -107 L 0.030 -108 I 0.034 -109 L 0.041 -110 H 0.048 -111 Y 0.054 -112 D 0.060 -113 E 0.065 -114 T 0.067 -115 Y 0.069 -116 R 0.075 -117 E 0.095 -118 V 0.129 -119 K 0.172 -120 Y 0.225 -121 G 0.281 -122 N 0.325 -123 M 0.343 -124 G 0.334 -125 L 0.305 -126 P 0.260 -127 D 0.206 -128 I 0.159 -129 D 0.126 -130 S 0.105 -131 K 0.096 -132 M 0.096 -133 L 0.094 -134 M 0.083 -135 G 0.070 -136 I 0.063 -137 N 0.060 -138 V 0.062 -139 T 0.064 -140 P 0.063 -141 I 0.060 -142 A 0.056 -143 A 0.052 -144 L 0.045 -145 L 0.037 -146 Y 0.033 -147 T 0.033 -148 P 0.030 -149 V 0.027 -150 L 0.026 -151 I 0.026 -152 R 0.024 -153 F 0.024 -154 F 0.026 -155 G 0.027 -156 T 0.025 -157 K 0.022 -158 W 0.021 -159 M 0.022 -160 M 0.022 -161 F 0.023 -162 L 0.026 -163 A 0.028 -164 V 0.029 -165 G 0.027 -166 I 0.023 -167 Y 0.019 -168 A 0.019 -169 L 0.020 -170 F 0.021 -171 V 0.025 -172 S 0.030 -173 T 0.035 -174 N 0.039 -175 Y 0.042 -176 W 0.045 -177 E 0.047 -178 R 0.045 -179 Y 0.039 -180 Y 0.033 -181 T 0.033 -182 L 0.036 -183 V 0.040 -184 P 0.044 -185 S 0.052 -186 A 0.062 -187 V 0.070 -188 A 0.075 -189 L 0.077 -190 G 0.080 -191 M 0.084 -192 A 0.085 -193 I 0.084 -194 V 0.083 -195 P 0.078 -196 L 0.069 -197 W 0.063 -198 A 0.066 -199 S 0.072 -200 M 0.069 -201 G 0.059 -202 N 0.049 -203 Y 0.043 -204 I 0.041 -205 T 0.039 -206 R 0.036 -207 M 0.034 -208 S 0.033 -209 Q 0.034 -210 K 0.036 -211 Y 0.040 -212 Y 0.044 -213 E 0.050 -214 Y 0.062 -215 S 0.084 -216 H 0.116 -217 Y 0.154 -218 K 0.197 -219 E 0.244 -220 Q 0.286 -221 D 0.311 -222 E 0.322 -223 Q 0.330 -224 G 0.343 -225 P 0.361 -226 Q 0.382 -227 Q 0.401 -228 R 0.413 -229 P 0.416 -230 P 0.407 -231 R 0.388 -232 G 0.359 -233 S 0.320 -234 H 0.271 -235 A 0.215 -236 P 0.164 -237 Y 0.129 -238 L 0.109 -239 L 0.093 -240 V 0.079 -241 F 0.070 -242 Q 0.067 -243 A 0.064 -244 I 0.059 -245 F 0.058 -246 Y 0.058 -247 S 0.055 -248 F 0.050 -249 F 0.048 -250 H 0.047 -251 L 0.044 -252 S 0.039 -253 F 0.034 -254 A 0.034 -255 C 0.036 -256 A 0.041 -257 Q 0.044 -258 L 0.045 -259 P 0.045 -260 M 0.044 -261 I 0.042 -262 Y 0.042 -263 F 0.049 -264 L 0.064 -265 N 0.082 -266 N 0.101 -267 Y 0.119 -268 L 0.141 -269 Y 0.168 -270 D 0.197 -271 L 0.221 -272 N 0.237 -273 H 0.247 -274 T 0.251 -275 L 0.244 -276 I 0.226 -277 N 0.206 -278 V 0.188 -279 Q 0.170 -280 S 0.154 -281 C 0.157 -282 G 0.190 -283 T 0.240 -284 K 0.288 -285 S 0.327 -286 Q 0.367 -287 G 0.409 -288 I 0.452 -289 L 0.490 -290 N 0.514 -291 G 0.510 -292 F 0.475 -293 N 0.425 -294 K 0.383 -295 T 0.363 -296 V 0.357 -297 L 0.339 -298 R 0.301 -299 T 0.260 -300 L 0.232 -301 P 0.210 -302 R 0.180 -303 S 0.143 -304 K 0.109 -305 N 0.084 -306 L 0.069 -307 I 0.062 -308 V 0.064 -309 V 0.071 -310 E 0.079 -311 S 0.082 -312 V 0.083 -313 L 0.085 -314 M 0.088 -315 A 0.088 -316 V 0.080 -317 A 0.068 -318 F 0.056 -319 L 0.049 -320 A 0.048 -321 M 0.046 -322 L 0.046 -323 M 0.051 -324 V 0.057 -325 L 0.060 -326 G 0.062 -327 L 0.068 -328 C 0.081 -329 G 0.099 -330 A 0.114 -331 A 0.122 -332 Y 0.123 -333 R 0.130 -334 P 0.149 -335 T 0.175 -336 E 0.202 -337 E 0.220 -338 I 0.224 -339 D 0.214 -340 L 0.196 -341 R 0.172 -342 S 0.148 -343 V 0.126 -344 G 0.107 -345 W 0.094 -346 G 0.087 -347 N 0.082 -348 I 0.074 -349 F 0.064 -350 Q 0.054 -351 L 0.046 -352 P 0.038 -353 F 0.034 -354 K 0.036 -355 H 0.041 -356 V 0.045 -357 R 0.047 -358 D 0.047 -359 F 0.046 -360 R 0.045 -361 L 0.044 -362 R 0.046 -363 H 0.053 -364 L 0.061 -365 V 0.062 -366 P 0.055 -367 F 0.046 -368 F 0.040 -369 I 0.038 -370 Y 0.035 -371 S 0.034 -372 G 0.034 -373 F 0.033 -374 E 0.031 -375 V 0.030 -376 L 0.033 -377 F 0.037 -378 A 0.043 -379 C 0.052 -380 T 0.064 -381 G 0.075 -382 F 0.075 -383 A 0.069 -384 L 0.066 -385 G 0.067 -386 Y 0.070 -387 G 0.071 -388 V 0.078 -389 C 0.092 -390 S 0.104 -391 M 0.103 -392 G 0.090 -393 L 0.073 -394 E 0.060 -395 R 0.056 -396 L 0.058 -397 A 0.062 -398 Y 0.068 -399 L 0.076 -400 L 0.077 -401 I 0.067 -402 A 0.057 -403 Y 0.055 -404 S 0.058 -405 L 0.061 -406 G 0.061 -407 A 0.059 -408 S 0.056 -409 A 0.053 -410 S 0.050 -411 S 0.046 -412 V 0.043 -413 L 0.043 -414 G 0.043 -415 L 0.043 -416 L 0.044 -417 G 0.049 -418 L 0.052 -419 W 0.053 -420 L 0.052 -421 P 0.049 -422 R 0.046 -423 S 0.042 -424 V 0.040 -425 P 0.037 -426 L 0.038 -427 V 0.041 -428 A 0.045 -429 G 0.046 -430 A 0.044 -431 G 0.041 -432 L 0.037 -433 H 0.034 -434 L 0.032 -435 L 0.032 -436 L 0.033 -437 T 0.033 -438 L 0.031 -439 S 0.030 -440 L 0.030 -441 F 0.031 -442 F 0.035 -443 W 0.043 -444 A 0.055 -445 P 0.066 -446 A 0.075 -447 P 0.082 -448 R 0.086 -449 V 0.092 -450 L 0.098 -451 Q 0.098 -452 H 0.089 -453 S 0.071 -454 W 0.054 -455 I 0.045 -456 F 0.042 -457 Y 0.041 -458 F 0.041 -459 V 0.042 -460 A 0.042 -461 A 0.044 -462 L 0.052 -463 W 0.069 -464 G 0.092 -465 V 0.112 -466 G 0.126 -467 S 0.133 -468 A 0.130 -469 L 0.116 -470 N 0.102 -471 K 0.093 -472 T 0.091 -473 G 0.093 -474 L 0.092 -475 S 0.086 -476 T 0.078 -477 L 0.074 -478 L 0.072 -479 G 0.068 -480 I 0.063 -481 L 0.060 -482 Y 0.061 -483 E 0.064 -484 D 0.067 -485 K 0.067 -486 E 0.063 -487 R 0.058 -488 Q 0.055 -489 D 0.054 -490 F 0.053 -491 I 0.051 -492 F 0.049 -493 T 0.050 -494 I 0.054 -495 Y 0.059 -496 H 0.059 -497 W 0.053 -498 W 0.046 -499 Q 0.041 -500 A 0.038 -501 V 0.037 -502 A 0.036 -503 I 0.033 -504 F 0.030 -505 V 0.030 -506 V 0.034 -507 Y 0.045 -508 L 0.062 -509 G 0.083 -510 S 0.098 -511 S 0.102 -512 L 0.096 -513 P 0.084 -514 M 0.070 -515 K 0.057 -516 A 0.050 -517 K 0.051 -518 L 0.057 -519 A 0.063 -520 V 0.066 -521 L 0.066 -522 L 0.062 -523 V 0.054 -524 T 0.048 -525 L 0.044 -526 V 0.043 -527 A 0.047 -528 A 0.056 -529 A 0.066 -530 A 0.068 -531 S 0.059 -532 Y 0.046 -533 L 0.039 -534 W 0.040 -535 M 0.051 -536 E 0.070 -537 Q 0.087 -538 K 0.097 -539 L 0.107 -540 Q 0.127 -541 Q 0.159 -542 G 0.202 -543 L 0.255 -544 V 0.314 -545 P 0.365 -546 R 0.403 -547 Q 0.432 -548 P 0.452 -549 R 0.466 -550 I 0.480 -551 P 0.499 -552 K 0.526 -553 P 0.559 -554 Q 0.586 -555 H 0.600 -556 K 0.606 -557 V 0.610 -558 R 0.612 -559 G 0.612 -560 Y 0.613 -561 R 0.619 -562 Y 0.630 -563 L 0.644 -564 E 0.660 -565 E 0.676 -566 D 0.689 -567 N 0.700 -568 S 0.710 -569 D 0.719 -570 E 0.725 -571 S 0.727 -572 D 0.726 -573 M 0.711 -574 E 0.661 -575 G 0.568 -576 E 0.485 -577 Q 0.492 -578 G 0.591 -579 Q 0.701 -580 G 0.762 -581 D 0.767 -582 C 0.722 -583 A 0.654 -584 E 0.615 -585 D 0.637 -586 E 0.684 -587 A 0.716 -588 P 0.731 -589 Q 0.741 -590 A 0.746 -591 G 0.745 -592 P 0.745 -593 L 0.743 -594 G 0.735 -595 A 0.721 -596 E 0.708 -597 P 0.702 -598 A 0.700 -599 G 0.697 -600 P 0.690 -601 C 0.675 -602 R 0.651 -603 K 0.620 -604 P 0.598 -605 C 0.593 -606 P 0.608 -607 Y 0.639 -608 E 0.676 -609 Q 0.704 -610 A 0.717 -611 L 0.721 -612 G 0.723 -613 G 0.724 -614 D 0.724 -615 G 0.722 -616 P 0.717 -617 E 0.698 -618 E 0.664 -619 Q 0.636 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036949.17_ENSMUST00000082290.8_GN:Slc39a12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036949.17_ENSMUST00000082290.8_GN:Slc39a12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 1c06703c00e4e10f7fd65fca51c2e2a35897bc12..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036949.17_ENSMUST00000082290.8_GN:Slc39a12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,690 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000036949.17|ENSMUST00000082290.8|GN:Slc39a12|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.162 -2 C 0.139 -3 F 0.109 -4 W 0.090 -5 T 0.085 -6 N 0.087 -7 L 0.087 -8 S 0.089 -9 V 0.089 -10 W 0.086 -11 M 0.082 -12 I 0.081 -13 L 0.083 -14 L 0.093 -15 S 0.111 -16 H 0.129 -17 S 0.141 -18 L 0.157 -19 S 0.189 -20 L 0.234 -21 V 0.276 -22 S 0.302 -23 S 0.321 -24 T 0.348 -25 E 0.390 -26 T 0.436 -27 G 0.461 -28 K 0.460 -29 T 0.456 -30 L 0.459 -31 T 0.462 -32 Q 0.462 -33 N 0.462 -34 N 0.450 -35 S 0.420 -36 R 0.374 -37 A 0.323 -38 G 0.267 -39 S 0.203 -40 Q 0.139 -41 G 0.089 -42 L 0.055 -43 L 0.034 -44 E 0.023 -45 V 0.018 -46 L 0.017 -47 R 0.019 -48 V 0.024 -49 L 0.034 -50 S 0.050 -51 A 0.064 -52 G 0.072 -53 D 0.070 -54 H 0.064 -55 W 0.064 -56 S 0.069 -57 L 0.074 -58 N 0.077 -59 H 0.075 -60 P 0.065 -61 Q 0.052 -62 S 0.042 -63 L 0.038 -64 I 0.040 -65 K 0.042 -66 I 0.042 -67 L 0.042 -68 L 0.042 -69 E 0.047 -70 R 0.060 -71 T 0.087 -72 G 0.125 -73 C 0.161 -74 P 0.184 -75 Q 0.196 -76 R 0.201 -77 T 0.201 -78 D 0.197 -79 W 0.198 -80 T 0.207 -81 Q 0.217 -82 G 0.217 -83 D 0.201 -84 C 0.174 -85 K 0.143 -86 L 0.117 -87 C 0.096 -88 L 0.080 -89 E 0.068 -90 A 0.060 -91 D 0.058 -92 A 0.062 -93 L 0.074 -94 L 0.088 -95 L 0.102 -96 T 0.120 -97 A 0.145 -98 G 0.175 -99 G 0.198 -100 N 0.198 -101 L 0.172 -102 E 0.135 -103 D 0.106 -104 E 0.090 -105 L 0.080 -106 R 0.065 -107 E 0.050 -108 E 0.041 -109 V 0.037 -110 V 0.035 -111 Q 0.035 -112 R 0.037 -113 V 0.039 -114 S 0.038 -115 L 0.037 -116 L 0.034 -117 L 0.028 -118 L 0.021 -119 Y 0.016 -120 Y 0.014 -121 I 0.014 -122 I 0.015 -123 H 0.018 -124 Q 0.023 -125 E 0.030 -126 E 0.040 -127 I 0.051 -128 C 0.061 -129 S 0.064 -130 S 0.063 -131 K 0.063 -132 L 0.063 -133 N 0.062 -134 M 0.059 -135 S 0.054 -136 N 0.047 -137 R 0.038 -138 E 0.031 -139 Y 0.027 -140 E 0.024 -141 F 0.022 -142 Y 0.023 -143 L 0.027 -144 H 0.030 -145 S 0.037 -146 L 0.052 -147 L 0.075 -148 G 0.102 -149 L 0.124 -150 R 0.137 -151 Q 0.143 -152 D 0.144 -153 E 0.138 -154 D 0.123 -155 S 0.113 -156 Y 0.115 -157 F 0.121 -158 L 0.117 -159 S 0.099 -160 E 0.075 -161 K 0.058 -162 E 0.050 -163 T 0.049 -164 D 0.047 -165 D 0.041 -166 I 0.035 -167 L 0.031 -168 A 0.030 -169 F 0.029 -170 T 0.028 -171 R 0.031 -172 K 0.041 -173 Y 0.060 -174 F 0.092 -175 G 0.135 -176 T 0.178 -177 S 0.206 -178 S 0.207 -179 S 0.187 -180 Q 0.159 -181 C 0.136 -182 M 0.120 -183 E 0.103 -184 T 0.084 -185 K 0.070 -186 I 0.067 -187 L 0.072 -188 Q 0.082 -189 R 0.093 -190 E 0.114 -191 S 0.146 -192 G 0.187 -193 I 0.226 -194 Q 0.255 -195 G 0.266 -196 S 0.259 -197 N 0.247 -198 G 0.231 -199 A 0.204 -200 D 0.160 -201 E 0.114 -202 K 0.083 -203 T 0.066 -204 L 0.056 -205 P 0.048 -206 Q 0.042 -207 L 0.040 -208 A 0.037 -209 A 0.034 -210 T 0.031 -211 I 0.029 -212 I 0.028 -213 A 0.027 -214 L 0.028 -215 S 0.031 -216 L 0.040 -217 Q 0.059 -218 G 0.085 -219 V 0.109 -220 C 0.122 -221 L 0.125 -222 G 0.121 -223 R 0.114 -224 K 0.106 -225 A 0.099 -226 L 0.092 -227 P 0.085 -228 S 0.075 -229 P 0.062 -230 D 0.048 -231 D 0.035 -232 F 0.025 -233 T 0.020 -234 E 0.020 -235 Y 0.024 -236 I 0.026 -237 F 0.027 -238 S 0.027 -239 F 0.029 -240 L 0.033 -241 N 0.038 -242 S 0.042 -243 T 0.046 -244 N 0.055 -245 T 0.068 -246 L 0.073 -247 H 0.062 -248 L 0.046 -249 S 0.037 -250 E 0.038 -251 I 0.042 -252 E 0.045 -253 Q 0.048 -254 L 0.050 -255 L 0.050 -256 N 0.052 -257 M 0.057 -258 L 0.067 -259 T 0.080 -260 T 0.094 -261 R 0.110 -262 R 0.126 -263 T 0.141 -264 C 0.159 -265 A 0.184 -266 K 0.211 -267 E 0.223 -268 D 0.212 -269 K 0.187 -270 Y 0.168 -271 L 0.167 -272 H 0.177 -273 Q 0.187 -274 Y 0.192 -275 Q 0.206 -276 R 0.240 -277 K 0.295 -278 Q 0.349 -279 N 0.385 -280 T 0.421 -281 E 0.477 -282 E 0.538 -283 H 0.578 -284 S 0.594 -285 L 0.596 -286 R 0.596 -287 D 0.603 -288 P 0.611 -289 K 0.606 -290 T 0.578 -291 S 0.540 -292 T 0.529 -293 A 0.569 -294 M 0.629 -295 D 0.667 -296 K 0.673 -297 E 0.662 -298 S 0.648 -299 D 0.637 -300 D 0.622 -301 H 0.601 -302 S 0.580 -303 P 0.564 -304 S 0.545 -305 W 0.518 -306 D 0.480 -307 Q 0.419 -308 A 0.328 -309 C 0.227 -310 F 0.143 -311 S 0.088 -312 A 0.057 -313 R 0.043 -314 Q 0.039 -315 L 0.038 -316 V 0.036 -317 E 0.035 -318 I 0.038 -319 F 0.047 -320 L 0.065 -321 Q 0.093 -322 N 0.118 -323 H 0.126 -324 S 0.117 -325 S 0.099 -326 L 0.084 -327 S 0.077 -328 I 0.070 -329 S 0.060 -330 K 0.051 -331 E 0.046 -332 D 0.045 -333 F 0.043 -334 K 0.041 -335 Q 0.043 -336 L 0.047 -337 S 0.048 -338 P 0.047 -339 G 0.044 -340 I 0.041 -341 I 0.037 -342 Q 0.036 -343 Q 0.042 -344 L 0.059 -345 L 0.087 -346 S 0.122 -347 C 0.160 -348 S 0.200 -349 C 0.246 -350 Q 0.303 -351 M 0.371 -352 P 0.438 -353 K 0.491 -354 D 0.518 -355 Q 0.519 -356 Q 0.502 -357 A 0.478 -358 K 0.454 -359 P 0.425 -360 P 0.381 -361 P 0.317 -362 T 0.248 -363 T 0.190 -364 L 0.149 -365 E 0.119 -366 K 0.096 -367 Y 0.080 -368 G 0.074 -369 Y 0.077 -370 S 0.083 -371 T 0.087 -372 V 0.092 -373 A 0.098 -374 V 0.102 -375 T 0.103 -376 L 0.104 -377 L 0.106 -378 T 0.102 -379 L 0.096 -380 G 0.094 -381 S 0.089 -382 M 0.079 -383 L 0.069 -384 G 0.064 -385 T 0.063 -386 A 0.061 -387 L 0.059 -388 V 0.061 -389 L 0.076 -390 F 0.107 -391 H 0.140 -392 S 0.157 -393 C 0.152 -394 E 0.136 -395 E 0.122 -396 N 0.106 -397 Y 0.088 -398 S 0.071 -399 L 0.062 -400 I 0.056 -401 L 0.051 -402 Q 0.045 -403 L 0.040 -404 F 0.040 -405 V 0.044 -406 G 0.049 -407 L 0.055 -408 A 0.061 -409 V 0.064 -410 G 0.070 -411 T 0.086 -412 L 0.108 -413 S 0.120 -414 G 0.120 -415 D 0.117 -416 A 0.114 -417 L 0.110 -418 L 0.110 -419 H 0.117 -420 L 0.126 -421 I 0.139 -422 P 0.164 -423 Q 0.195 -424 V 0.217 -425 L 0.239 -426 G 0.281 -427 L 0.347 -428 H 0.419 -429 K 0.477 -430 Q 0.519 -431 E 0.548 -432 A 0.566 -433 E 0.573 -434 F 0.573 -435 G 0.565 -436 H 0.554 -437 F 0.544 -438 H 0.535 -439 E 0.516 -440 S 0.470 -441 Q 0.393 -442 S 0.295 -443 P 0.200 -444 I 0.133 -445 W 0.104 -446 K 0.101 -447 L 0.099 -448 L 0.090 -449 G 0.079 -450 L 0.072 -451 L 0.070 -452 G 0.069 -453 G 0.066 -454 I 0.065 -455 H 0.067 -456 G 0.069 -457 F 0.066 -458 F 0.061 -459 L 0.065 -460 I 0.076 -461 E 0.082 -462 K 0.081 -463 C 0.084 -464 F 0.099 -465 I 0.121 -466 L 0.151 -467 L 0.199 -468 V 0.274 -469 S 0.366 -470 P 0.455 -471 N 0.527 -472 T 0.579 -473 K 0.616 -474 G 0.641 -475 L 0.655 -476 P 0.663 -477 L 0.670 -478 V 0.674 -479 N 0.673 -480 E 0.661 -481 H 0.646 -482 V 0.637 -483 G 0.636 -484 H 0.641 -485 T 0.649 -486 H 0.662 -487 H 0.682 -488 L 0.705 -489 G 0.720 -490 L 0.726 -491 N 0.732 -492 P 0.745 -493 E 0.760 -494 L 0.770 -495 N 0.774 -496 D 0.773 -497 Q 0.768 -498 S 0.764 -499 S 0.764 -500 G 0.767 -501 G 0.774 -502 K 0.778 -503 S 0.769 -504 I 0.733 -505 S 0.673 -506 T 0.639 -507 I 0.664 -508 Q 0.716 -509 L 0.746 -510 K 0.751 -511 G 0.752 -512 P 0.761 -513 E 0.777 -514 D 0.792 -515 S 0.801 -516 Q 0.806 -517 T 0.805 -518 T 0.794 -519 V 0.776 -520 L 0.764 -521 P 0.763 -522 I 0.772 -523 G 0.779 -524 N 0.777 -525 V 0.768 -526 P 0.764 -527 A 0.763 -528 S 0.755 -529 N 0.733 -530 R 0.704 -531 N 0.670 -532 G 0.622 -533 K 0.550 -534 T 0.450 -535 I 0.337 -536 S 0.233 -537 L 0.159 -538 L 0.118 -539 A 0.102 -540 I 0.096 -541 M 0.098 -542 I 0.109 -543 L 0.128 -544 V 0.143 -545 G 0.150 -546 D 0.153 -547 S 0.148 -548 L 0.134 -549 H 0.116 -550 N 0.105 -551 F 0.103 -552 A 0.101 -553 D 0.095 -554 G 0.089 -555 L 0.088 -556 V 0.089 -557 I 0.083 -558 G 0.073 -559 T 0.066 -560 A 0.066 -561 F 0.070 -562 S 0.076 -563 S 0.080 -564 S 0.078 -565 L 0.071 -566 E 0.065 -567 S 0.064 -568 G 0.064 -569 V 0.066 -570 T 0.072 -571 T 0.080 -572 T 0.087 -573 I 0.097 -574 A 0.111 -575 I 0.121 -576 L 0.116 -577 C 0.104 -578 H 0.103 -579 E 0.113 -580 I 0.118 -581 P 0.112 -582 H 0.105 -583 E 0.100 -584 M 0.094 -585 G 0.087 -586 D 0.079 -587 F 0.070 -588 A 0.063 -589 V 0.059 -590 L 0.058 -591 L 0.059 -592 S 0.063 -593 S 0.068 -594 G 0.069 -595 L 0.061 -596 S 0.049 -597 V 0.038 -598 R 0.033 -599 T 0.036 -600 A 0.041 -601 I 0.044 -602 L 0.048 -603 M 0.058 -604 N 0.070 -605 F 0.080 -606 L 0.088 -607 S 0.093 -608 A 0.088 -609 L 0.074 -610 T 0.062 -611 A 0.056 -612 F 0.052 -613 A 0.052 -614 G 0.055 -615 L 0.057 -616 Y 0.058 -617 I 0.064 -618 G 0.074 -619 L 0.083 -620 S 0.093 -621 V 0.112 -622 S 0.138 -623 A 0.157 -624 D 0.156 -625 P 0.138 -626 R 0.112 -627 V 0.089 -628 Q 0.076 -629 D 0.070 -630 W 0.069 -631 I 0.072 -632 L 0.080 -633 T 0.090 -634 V 0.101 -635 T 0.113 -636 A 0.119 -637 G 0.114 -638 M 0.103 -639 F 0.094 -640 L 0.089 -641 Y 0.084 -642 L 0.083 -643 S 0.083 -644 L 0.085 -645 V 0.090 -646 G 0.095 -647 M 0.096 -648 L 0.101 -649 P 0.114 -650 E 0.128 -651 M 0.135 -652 T 0.141 -653 H 0.154 -654 V 0.168 -655 Q 0.168 -656 T 0.154 -657 Q 0.132 -658 R 0.106 -659 P 0.078 -660 W 0.056 -661 M 0.046 -662 T 0.043 -663 F 0.040 -664 L 0.036 -665 L 0.037 -666 Q 0.043 -667 N 0.053 -668 V 0.062 -669 G 0.066 -670 L 0.065 -671 V 0.061 -672 L 0.060 -673 G 0.062 -674 W 0.064 -675 F 0.067 -676 S 0.071 -677 L 0.072 -678 L 0.073 -679 L 0.080 -680 L 0.094 -681 A 0.105 -682 V 0.115 -683 Y 0.134 -684 E 0.160 -685 Q 0.181 -686 N 0.203 -687 I 0.230 -688 K 0.253 -689 I 0.262 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036949.17_ENSMUST00000082290.8_GN:Slc39a12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036949.17_ENSMUST00000082290.8_GN:Slc39a12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid deleted file mode 100644 index 7b8e671194cda17aae302fd500a28fe41185f7f0..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000036949.17_ENSMUST00000082290.8_GN:Slc39a12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid +++ /dev/null @@ -1,706 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000036949.17|ENSMUST00000082290.8|GN:Slc39a12|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:16 -1 M 0.325 -2 K 0.347 -3 P 0.377 -4 P 0.394 -5 I 0.393 -6 H 0.391 -7 P 0.402 -8 Q 0.416 -9 H 0.428 -10 N 0.447 -11 P 0.472 -12 S 0.490 -13 P 0.490 -14 R 0.470 -15 V 0.427 -16 D 0.365 -17 M 0.298 -18 C 0.238 -19 F 0.189 -20 W 0.158 -21 T 0.146 -22 N 0.143 -23 L 0.139 -24 S 0.133 -25 V 0.124 -26 W 0.111 -27 M 0.099 -28 I 0.092 -29 L 0.089 -30 L 0.095 -31 S 0.111 -32 H 0.130 -33 S 0.147 -34 L 0.171 -35 S 0.207 -36 L 0.252 -37 V 0.292 -38 S 0.318 -39 S 0.336 -40 T 0.362 -41 E 0.407 -42 T 0.456 -43 G 0.483 -44 K 0.480 -45 T 0.472 -46 L 0.476 -47 T 0.483 -48 Q 0.489 -49 N 0.492 -50 N 0.481 -51 S 0.451 -52 R 0.406 -53 A 0.353 -54 G 0.293 -55 S 0.224 -56 Q 0.156 -57 G 0.100 -58 L 0.062 -59 L 0.038 -60 E 0.024 -61 V 0.018 -62 L 0.017 -63 R 0.018 -64 V 0.022 -65 L 0.031 -66 S 0.045 -67 A 0.057 -68 G 0.063 -69 D 0.061 -70 H 0.058 -71 W 0.059 -72 S 0.065 -73 L 0.070 -74 N 0.072 -75 H 0.069 -76 P 0.061 -77 Q 0.050 -78 S 0.041 -79 L 0.037 -80 I 0.039 -81 K 0.041 -82 I 0.041 -83 L 0.040 -84 L 0.041 -85 E 0.046 -86 R 0.061 -87 T 0.089 -88 G 0.127 -89 C 0.163 -90 P 0.186 -91 Q 0.198 -92 R 0.202 -93 T 0.202 -94 D 0.199 -95 W 0.199 -96 T 0.208 -97 Q 0.218 -98 G 0.219 -99 D 0.204 -100 C 0.178 -101 K 0.147 -102 L 0.120 -103 C 0.099 -104 L 0.083 -105 E 0.071 -106 A 0.062 -107 D 0.059 -108 A 0.063 -109 L 0.075 -110 L 0.089 -111 L 0.103 -112 T 0.121 -113 A 0.148 -114 G 0.182 -115 G 0.206 -116 N 0.206 -117 L 0.179 -118 E 0.140 -119 D 0.111 -120 E 0.096 -121 L 0.085 -122 R 0.070 -123 E 0.054 -124 E 0.044 -125 V 0.040 -126 V 0.037 -127 Q 0.036 -128 R 0.039 -129 V 0.041 -130 S 0.041 -131 L 0.039 -132 L 0.036 -133 L 0.029 -134 L 0.021 -135 Y 0.016 -136 Y 0.014 -137 I 0.013 -138 I 0.014 -139 H 0.018 -140 Q 0.023 -141 E 0.031 -142 E 0.042 -143 I 0.054 -144 C 0.063 -145 S 0.066 -146 S 0.065 -147 K 0.065 -148 L 0.066 -149 N 0.064 -150 M 0.060 -151 S 0.054 -152 N 0.046 -153 R 0.038 -154 E 0.032 -155 Y 0.028 -156 E 0.025 -157 F 0.023 -158 Y 0.024 -159 L 0.028 -160 H 0.031 -161 S 0.038 -162 L 0.053 -163 L 0.076 -164 G 0.103 -165 L 0.124 -166 R 0.137 -167 Q 0.144 -168 D 0.145 -169 E 0.138 -170 D 0.123 -171 S 0.112 -172 Y 0.113 -173 F 0.120 -174 L 0.116 -175 S 0.097 -176 E 0.074 -177 K 0.056 -178 E 0.048 -179 T 0.048 -180 D 0.046 -181 D 0.041 -182 I 0.035 -183 L 0.031 -184 A 0.029 -185 F 0.028 -186 T 0.027 -187 R 0.030 -188 K 0.040 -189 Y 0.059 -190 F 0.090 -191 G 0.132 -192 T 0.174 -193 S 0.201 -194 S 0.202 -195 S 0.181 -196 Q 0.153 -197 C 0.130 -198 M 0.114 -199 E 0.097 -200 T 0.078 -201 K 0.065 -202 I 0.062 -203 L 0.068 -204 Q 0.078 -205 R 0.090 -206 E 0.110 -207 S 0.141 -208 G 0.180 -209 I 0.218 -210 Q 0.246 -211 G 0.256 -212 S 0.250 -213 N 0.237 -214 G 0.222 -215 A 0.196 -216 D 0.155 -217 E 0.111 -218 K 0.081 -219 T 0.065 -220 L 0.054 -221 P 0.045 -222 Q 0.039 -223 L 0.037 -224 A 0.034 -225 A 0.031 -226 T 0.028 -227 I 0.027 -228 I 0.026 -229 A 0.026 -230 L 0.027 -231 S 0.030 -232 L 0.039 -233 Q 0.057 -234 G 0.081 -235 V 0.104 -236 C 0.118 -237 L 0.121 -238 G 0.118 -239 R 0.113 -240 K 0.106 -241 A 0.099 -242 L 0.093 -243 P 0.085 -244 S 0.075 -245 P 0.063 -246 D 0.049 -247 D 0.035 -248 F 0.025 -249 T 0.021 -250 E 0.021 -251 Y 0.024 -252 I 0.027 -253 F 0.027 -254 S 0.027 -255 F 0.029 -256 L 0.033 -257 N 0.038 -258 S 0.042 -259 T 0.046 -260 N 0.055 -261 T 0.068 -262 L 0.073 -263 H 0.062 -264 L 0.045 -265 S 0.037 -266 E 0.037 -267 I 0.041 -268 E 0.044 -269 Q 0.047 -270 L 0.049 -271 L 0.049 -272 N 0.050 -273 M 0.056 -274 L 0.067 -275 T 0.080 -276 T 0.094 -277 R 0.110 -278 R 0.126 -279 T 0.141 -280 C 0.159 -281 A 0.185 -282 K 0.213 -283 E 0.226 -284 D 0.215 -285 K 0.189 -286 Y 0.170 -287 L 0.168 -288 H 0.177 -289 Q 0.187 -290 Y 0.194 -291 Q 0.209 -292 R 0.244 -293 K 0.296 -294 Q 0.345 -295 N 0.380 -296 T 0.416 -297 E 0.473 -298 E 0.533 -299 H 0.573 -300 S 0.589 -301 L 0.590 -302 R 0.590 -303 D 0.597 -304 P 0.605 -305 K 0.602 -306 T 0.577 -307 S 0.540 -308 T 0.529 -309 A 0.568 -310 M 0.627 -311 D 0.665 -312 K 0.672 -313 E 0.660 -314 S 0.647 -315 D 0.637 -316 D 0.623 -317 H 0.602 -318 S 0.582 -319 P 0.566 -320 S 0.547 -321 W 0.520 -322 D 0.481 -323 Q 0.416 -324 A 0.323 -325 C 0.222 -326 F 0.140 -327 S 0.087 -328 A 0.057 -329 R 0.043 -330 Q 0.039 -331 L 0.039 -332 V 0.037 -333 E 0.036 -334 I 0.038 -335 F 0.047 -336 L 0.066 -337 Q 0.094 -338 N 0.119 -339 H 0.128 -340 S 0.117 -341 S 0.099 -342 L 0.085 -343 S 0.078 -344 I 0.072 -345 S 0.062 -346 K 0.052 -347 E 0.047 -348 D 0.045 -349 F 0.043 -350 K 0.041 -351 Q 0.043 -352 L 0.048 -353 S 0.050 -354 P 0.048 -355 G 0.045 -356 I 0.041 -357 I 0.037 -358 Q 0.037 -359 Q 0.043 -360 L 0.061 -361 L 0.089 -362 S 0.124 -363 C 0.162 -364 S 0.202 -365 C 0.248 -366 Q 0.304 -367 M 0.369 -368 P 0.435 -369 K 0.488 -370 D 0.515 -371 Q 0.516 -372 Q 0.499 -373 A 0.476 -374 K 0.451 -375 P 0.423 -376 P 0.379 -377 P 0.316 -378 T 0.247 -379 T 0.189 -380 L 0.147 -381 E 0.118 -382 K 0.096 -383 Y 0.080 -384 G 0.074 -385 Y 0.077 -386 S 0.083 -387 T 0.088 -388 V 0.093 -389 A 0.099 -390 V 0.103 -391 T 0.103 -392 L 0.104 -393 L 0.106 -394 T 0.102 -395 L 0.097 -396 G 0.094 -397 S 0.089 -398 M 0.079 -399 L 0.068 -400 G 0.063 -401 T 0.062 -402 A 0.060 -403 L 0.057 -404 V 0.059 -405 L 0.073 -406 F 0.103 -407 H 0.136 -408 S 0.153 -409 C 0.148 -410 E 0.132 -411 E 0.117 -412 N 0.102 -413 Y 0.084 -414 S 0.068 -415 L 0.059 -416 I 0.054 -417 L 0.050 -418 Q 0.044 -419 L 0.040 -420 F 0.039 -421 V 0.043 -422 G 0.048 -423 L 0.054 -424 A 0.060 -425 V 0.063 -426 G 0.069 -427 T 0.086 -428 L 0.107 -429 S 0.119 -430 G 0.119 -431 D 0.116 -432 A 0.112 -433 L 0.108 -434 L 0.109 -435 H 0.115 -436 L 0.124 -437 I 0.137 -438 P 0.161 -439 Q 0.191 -440 V 0.214 -441 L 0.235 -442 G 0.277 -443 L 0.343 -444 H 0.414 -445 K 0.472 -446 Q 0.512 -447 E 0.540 -448 A 0.558 -449 E 0.566 -450 F 0.567 -451 G 0.560 -452 H 0.550 -453 F 0.540 -454 H 0.531 -455 E 0.512 -456 S 0.466 -457 Q 0.389 -458 S 0.293 -459 P 0.199 -460 I 0.132 -461 W 0.103 -462 K 0.098 -463 L 0.097 -464 L 0.088 -465 G 0.077 -466 L 0.071 -467 L 0.069 -468 G 0.068 -469 G 0.065 -470 I 0.063 -471 H 0.065 -472 G 0.068 -473 F 0.064 -474 F 0.060 -475 L 0.064 -476 I 0.075 -477 E 0.081 -478 K 0.081 -479 C 0.084 -480 F 0.098 -481 I 0.120 -482 L 0.150 -483 L 0.199 -484 V 0.274 -485 S 0.366 -486 P 0.455 -487 N 0.526 -488 T 0.578 -489 K 0.615 -490 G 0.640 -491 L 0.655 -492 P 0.663 -493 L 0.669 -494 V 0.674 -495 N 0.672 -496 E 0.660 -497 H 0.645 -498 V 0.636 -499 G 0.635 -500 H 0.641 -501 T 0.649 -502 H 0.663 -503 H 0.683 -504 L 0.705 -505 G 0.720 -506 L 0.726 -507 N 0.733 -508 P 0.746 -509 E 0.761 -510 L 0.771 -511 N 0.776 -512 D 0.775 -513 Q 0.771 -514 S 0.768 -515 S 0.767 -516 G 0.772 -517 G 0.779 -518 K 0.783 -519 S 0.774 -520 I 0.735 -521 S 0.675 -522 T 0.640 -523 I 0.665 -524 Q 0.718 -525 L 0.749 -526 K 0.755 -527 G 0.756 -528 P 0.765 -529 E 0.781 -530 D 0.795 -531 S 0.803 -532 Q 0.808 -533 T 0.807 -534 T 0.796 -535 V 0.778 -536 L 0.765 -537 P 0.765 -538 I 0.774 -539 G 0.781 -540 N 0.779 -541 V 0.770 -542 P 0.766 -543 A 0.765 -544 S 0.756 -545 N 0.734 -546 R 0.705 -547 N 0.671 -548 G 0.624 -549 K 0.552 -550 T 0.452 -551 I 0.338 -552 S 0.234 -553 L 0.160 -554 L 0.119 -555 A 0.102 -556 I 0.097 -557 M 0.099 -558 I 0.110 -559 L 0.129 -560 V 0.144 -561 G 0.152 -562 D 0.154 -563 S 0.150 -564 L 0.136 -565 H 0.118 -566 N 0.106 -567 F 0.104 -568 A 0.103 -569 D 0.096 -570 G 0.090 -571 L 0.089 -572 V 0.089 -573 I 0.084 -574 G 0.074 -575 T 0.067 -576 A 0.066 -577 F 0.070 -578 S 0.076 -579 S 0.080 -580 S 0.078 -581 L 0.071 -582 E 0.066 -583 S 0.065 -584 G 0.065 -585 V 0.067 -586 T 0.072 -587 T 0.081 -588 T 0.088 -589 I 0.098 -590 A 0.112 -591 I 0.122 -592 L 0.117 -593 C 0.105 -594 H 0.104 -595 E 0.114 -596 I 0.119 -597 P 0.114 -598 H 0.107 -599 E 0.102 -600 M 0.096 -601 G 0.088 -602 D 0.080 -603 F 0.071 -604 A 0.064 -605 V 0.060 -606 L 0.059 -607 L 0.060 -608 S 0.063 -609 S 0.069 -610 G 0.069 -611 L 0.061 -612 S 0.049 -613 V 0.038 -614 R 0.033 -615 T 0.036 -616 A 0.041 -617 I 0.044 -618 L 0.048 -619 M 0.058 -620 N 0.070 -621 F 0.080 -622 L 0.089 -623 S 0.094 -624 A 0.089 -625 L 0.075 -626 T 0.063 -627 A 0.056 -628 F 0.053 -629 A 0.053 -630 G 0.056 -631 L 0.057 -632 Y 0.058 -633 I 0.064 -634 G 0.075 -635 L 0.084 -636 S 0.094 -637 V 0.113 -638 S 0.138 -639 A 0.157 -640 D 0.157 -641 P 0.139 -642 R 0.113 -643 V 0.090 -644 Q 0.077 -645 D 0.071 -646 W 0.070 -647 I 0.073 -648 L 0.081 -649 T 0.092 -650 V 0.103 -651 T 0.115 -652 A 0.121 -653 G 0.116 -654 M 0.104 -655 F 0.095 -656 L 0.090 -657 Y 0.086 -658 L 0.084 -659 S 0.084 -660 L 0.086 -661 V 0.091 -662 G 0.096 -663 M 0.097 -664 L 0.102 -665 P 0.114 -666 E 0.128 -667 M 0.135 -668 T 0.140 -669 H 0.152 -670 V 0.165 -671 Q 0.166 -672 T 0.152 -673 Q 0.131 -674 R 0.105 -675 P 0.078 -676 W 0.056 -677 M 0.046 -678 T 0.043 -679 F 0.040 -680 L 0.036 -681 L 0.037 -682 Q 0.044 -683 N 0.054 -684 V 0.063 -685 G 0.067 -686 L 0.066 -687 V 0.062 -688 L 0.060 -689 G 0.060 -690 W 0.060 -691 F 0.061 -692 S 0.066 -693 L 0.069 -694 L 0.072 -695 L 0.080 -696 L 0.093 -697 A 0.103 -698 V 0.113 -699 Y 0.132 -700 E 0.157 -701 Q 0.177 -702 N 0.198 -703 I 0.225 -704 K 0.247 -705 I 0.256 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000037167.6_ENSMUST00000040437.6_GN:Spaca5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000037167.6_ENSMUST00000040437.6_GN:Spaca5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 52d6953fe03770fa024c85b69d6b84e532378268..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000037167.6_ENSMUST00000040437.6_GN:Spaca5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,161 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000037167.6|ENSMUST00000040437.6|GN:Spaca5|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.298 -2 K 0.291 -3 V 0.284 -4 C 0.273 -5 S 0.250 -6 I 0.220 -7 V 0.197 -8 V 0.190 -9 V 0.195 -10 I 0.211 -11 L 0.239 -12 A 0.268 -13 V 0.285 -14 L 0.294 -15 L 0.309 -16 I 0.331 -17 A 0.348 -18 K 0.350 -19 L 0.329 -20 D 0.286 -21 A 0.228 -22 K 0.167 -23 I 0.116 -24 Y 0.080 -25 E 0.058 -26 R 0.045 -27 C 0.037 -28 E 0.032 -29 L 0.030 -30 A 0.030 -31 K 0.030 -32 K 0.030 -33 L 0.032 -34 E 0.038 -35 E 0.047 -36 A 0.058 -37 G 0.065 -38 L 0.072 -39 D 0.081 -40 G 0.089 -41 F 0.096 -42 K 0.102 -43 G 0.108 -44 Y 0.107 -45 T 0.098 -46 V 0.087 -47 G 0.075 -48 D 0.064 -49 W 0.055 -50 L 0.051 -51 C 0.052 -52 V 0.056 -53 A 0.060 -54 H 0.060 -55 Y 0.061 -56 E 0.073 -57 S 0.100 -58 G 0.129 -59 F 0.147 -60 D 0.152 -61 T 0.149 -62 S 0.141 -63 F 0.131 -64 V 0.122 -65 D 0.118 -66 H 0.121 -67 N 0.130 -68 P 0.143 -69 D 0.156 -70 G 0.160 -71 S 0.144 -72 S 0.114 -73 E 0.085 -74 Y 0.067 -75 G 0.063 -76 I 0.071 -77 F 0.084 -78 Q 0.092 -79 L 0.093 -80 N 0.088 -81 S 0.086 -82 A 0.086 -83 W 0.088 -84 W 0.094 -85 C 0.111 -86 N 0.139 -87 N 0.172 -88 G 0.196 -89 I 0.207 -90 T 0.210 -91 P 0.210 -92 T 0.209 -93 Q 0.200 -94 N 0.180 -95 L 0.153 -96 C 0.133 -97 N 0.128 -98 I 0.134 -99 D 0.139 -100 C 0.143 -101 N 0.149 -102 D 0.153 -103 L 0.149 -104 L 0.140 -105 N 0.129 -106 R 0.117 -107 H 0.108 -108 I 0.103 -109 L 0.098 -110 D 0.091 -111 D 0.080 -112 I 0.070 -113 I 0.066 -114 C 0.067 -115 A 0.068 -116 K 0.067 -117 R 0.067 -118 V 0.069 -119 A 0.069 -120 S 0.070 -121 S 0.073 -122 H 0.075 -123 K 0.074 -124 S 0.074 -125 M 0.079 -126 K 0.083 -127 A 0.081 -128 W 0.070 -129 D 0.055 -130 S 0.041 -131 W 0.033 -132 T 0.030 -133 Q 0.032 -134 H 0.036 -135 C 0.042 -136 A 0.052 -137 G 0.064 -138 H 0.072 -139 D 0.070 -140 L 0.060 -141 S 0.051 -142 E 0.047 -143 W 0.047 -144 L 0.048 -145 K 0.049 -146 G 0.051 -147 C 0.060 -148 S 0.084 -149 V 0.126 -150 R 0.184 -151 L 0.242 -152 K 0.292 -153 T 0.328 -154 D 0.352 -155 S 0.365 -156 S 0.371 -157 Y 0.372 -158 N 0.364 -159 N 0.346 -160 W 0.330 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000037167.6_ENSMUST00000040437.6_GN:Spaca5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:22.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000037167.6_ENSMUST00000040437.6_GN:Spaca5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:22.caid deleted file mode 100644 index 934ec04d1e493aa1c6aa5ae77c34ae48ba6e3bf6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000037167.6_ENSMUST00000040437.6_GN:Spaca5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:22.caid +++ /dev/null @@ -1,183 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000037167.6|ENSMUST00000040437.6|GN:Spaca5|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:22 -1 M 0.352 -2 S 0.358 -3 L 0.367 -4 F 0.374 -5 L 0.378 -6 I 0.379 -7 I 0.376 -8 S 0.370 -9 G 0.361 -10 S 0.353 -11 E 0.343 -12 A 0.319 -13 R 0.283 -14 D 0.253 -15 H 0.238 -16 I 0.232 -17 E 0.228 -18 G 0.218 -19 L 0.200 -20 L 0.183 -21 A 0.182 -22 V 0.190 -23 M 0.194 -24 K 0.191 -25 V 0.185 -26 C 0.180 -27 S 0.175 -28 I 0.171 -29 V 0.167 -30 V 0.166 -31 V 0.166 -32 I 0.170 -33 L 0.181 -34 A 0.194 -35 V 0.199 -36 L 0.203 -37 L 0.222 -38 I 0.253 -39 A 0.282 -40 K 0.296 -41 L 0.287 -42 D 0.255 -43 A 0.207 -44 K 0.154 -45 I 0.108 -46 Y 0.074 -47 E 0.053 -48 R 0.042 -49 C 0.035 -50 E 0.031 -51 L 0.029 -52 A 0.028 -53 K 0.028 -54 K 0.029 -55 L 0.031 -56 E 0.037 -57 E 0.046 -58 A 0.055 -59 G 0.061 -60 L 0.068 -61 D 0.076 -62 G 0.084 -63 F 0.092 -64 K 0.098 -65 G 0.104 -66 Y 0.102 -67 T 0.093 -68 V 0.083 -69 G 0.072 -70 D 0.061 -71 W 0.052 -72 L 0.049 -73 C 0.049 -74 V 0.053 -75 A 0.056 -76 H 0.057 -77 Y 0.058 -78 E 0.070 -79 S 0.096 -80 G 0.125 -81 F 0.144 -82 D 0.149 -83 T 0.145 -84 S 0.138 -85 F 0.127 -86 V 0.117 -87 D 0.112 -88 H 0.114 -89 N 0.123 -90 P 0.137 -91 D 0.151 -92 G 0.155 -93 S 0.139 -94 S 0.110 -95 E 0.083 -96 Y 0.065 -97 G 0.062 -98 I 0.070 -99 F 0.083 -100 Q 0.090 -101 L 0.089 -102 N 0.085 -103 S 0.083 -104 A 0.084 -105 W 0.087 -106 W 0.095 -107 C 0.111 -108 N 0.139 -109 N 0.170 -110 G 0.195 -111 I 0.207 -112 T 0.210 -113 P 0.212 -114 T 0.211 -115 Q 0.202 -116 N 0.182 -117 L 0.153 -118 C 0.131 -119 N 0.127 -120 I 0.133 -121 D 0.138 -122 C 0.143 -123 N 0.150 -124 D 0.154 -125 L 0.150 -126 L 0.141 -127 N 0.129 -128 R 0.118 -129 H 0.109 -130 I 0.103 -131 L 0.099 -132 D 0.092 -133 D 0.081 -134 I 0.071 -135 I 0.066 -136 C 0.067 -137 A 0.067 -138 K 0.066 -139 R 0.067 -140 V 0.069 -141 A 0.070 -142 S 0.072 -143 S 0.076 -144 H 0.079 -145 K 0.079 -146 S 0.079 -147 M 0.082 -148 K 0.085 -149 A 0.082 -150 W 0.070 -151 D 0.055 -152 S 0.041 -153 W 0.033 -154 T 0.030 -155 Q 0.031 -156 H 0.036 -157 C 0.042 -158 A 0.052 -159 G 0.065 -160 H 0.073 -161 D 0.070 -162 L 0.060 -163 S 0.050 -164 E 0.046 -165 W 0.046 -166 L 0.048 -167 K 0.049 -168 G 0.052 -169 C 0.061 -170 S 0.085 -171 V 0.129 -172 R 0.188 -173 L 0.250 -174 K 0.303 -175 T 0.342 -176 D 0.367 -177 S 0.380 -178 S 0.383 -179 Y 0.381 -180 N 0.371 -181 N 0.352 -182 W 0.335 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000037254.19_ENSMUST00000042290.14_GN:Itih2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000037254.19_ENSMUST00000042290.14_GN:Itih2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 78efb7643f399795e85d45054a34f74fb47d7b5c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000037254.19_ENSMUST00000042290.14_GN:Itih2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,947 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000037254.19|ENSMUST00000042290.14|GN:Itih2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.263 -2 Q 0.258 -3 R 0.250 -4 P 0.237 -5 V 0.216 -6 C 0.193 -7 L 0.180 -8 L 0.177 -9 I 0.176 -10 W 0.174 -11 L 0.173 -12 F 0.176 -13 L 0.187 -14 L 0.219 -15 E 0.269 -16 A 0.319 -17 Q 0.355 -18 A 0.382 -19 F 0.411 -20 E 0.452 -21 I 0.503 -22 P 0.553 -23 I 0.597 -24 N 0.629 -25 G 0.641 -26 N 0.630 -27 S 0.603 -28 E 0.573 -29 F 0.545 -30 A 0.524 -31 E 0.510 -32 Y 0.502 -33 S 0.496 -34 D 0.486 -35 L 0.467 -36 V 0.437 -37 E 0.403 -38 L 0.376 -39 A 0.360 -40 P 0.360 -41 D 0.376 -42 K 0.407 -43 L 0.449 -44 P 0.497 -45 F 0.536 -46 V 0.549 -47 Q 0.540 -48 E 0.532 -49 N 0.530 -50 G 0.519 -51 R 0.497 -52 H 0.477 -53 Q 0.466 -54 R 0.469 -55 S 0.490 -56 L 0.525 -57 P 0.569 -58 E 0.614 -59 E 0.650 -60 S 0.668 -61 G 0.669 -62 E 0.665 -63 E 0.661 -64 T 0.653 -65 D 0.624 -66 T 0.561 -67 V 0.463 -68 D 0.347 -69 P 0.240 -70 V 0.159 -71 T 0.102 -72 L 0.068 -73 Y 0.052 -74 S 0.045 -75 Y 0.044 -76 K 0.045 -77 V 0.044 -78 Q 0.043 -79 S 0.043 -80 T 0.048 -81 I 0.058 -82 T 0.067 -83 S 0.067 -84 R 0.057 -85 V 0.047 -86 A 0.040 -87 T 0.038 -88 T 0.037 -89 T 0.037 -90 I 0.036 -91 Q 0.034 -92 S 0.032 -93 K 0.033 -94 L 0.040 -95 V 0.054 -96 N 0.075 -97 N 0.094 -98 S 0.106 -99 P 0.106 -100 L 0.097 -101 P 0.083 -102 Q 0.069 -103 S 0.059 -104 V 0.050 -105 V 0.043 -106 F 0.043 -107 D 0.055 -108 V 0.074 -109 Q 0.089 -110 I 0.098 -111 P 0.098 -112 K 0.088 -113 G 0.072 -114 A 0.057 -115 F 0.048 -116 I 0.046 -117 S 0.047 -118 N 0.046 -119 F 0.042 -120 T 0.038 -121 M 0.039 -122 T 0.047 -123 V 0.062 -124 N 0.077 -125 G 0.087 -126 M 0.092 -127 T 0.098 -128 F 0.109 -129 T 0.121 -130 S 0.122 -131 S 0.110 -132 I 0.092 -133 K 0.080 -134 E 0.078 -135 K 0.083 -136 T 0.085 -137 V 0.082 -138 G 0.077 -139 R 0.078 -140 A 0.078 -141 L 0.072 -142 Y 0.071 -143 S 0.081 -144 Q 0.097 -145 A 0.112 -146 R 0.130 -147 A 0.158 -148 K 0.193 -149 G 0.219 -150 K 0.223 -151 T 0.210 -152 A 0.192 -153 G 0.182 -154 W 0.185 -155 V 0.198 -156 R 0.212 -157 S 0.221 -158 R 0.223 -159 T 0.216 -160 L 0.196 -161 D 0.164 -162 M 0.127 -163 E 0.096 -164 N 0.075 -165 F 0.063 -166 N 0.056 -167 T 0.055 -168 E 0.061 -169 V 0.068 -170 N 0.071 -171 I 0.072 -172 P 0.074 -173 P 0.075 -174 G 0.076 -175 A 0.077 -176 K 0.077 -177 V 0.075 -178 Q 0.069 -179 F 0.061 -180 E 0.056 -181 L 0.051 -182 H 0.045 -183 Y 0.039 -184 Q 0.038 -185 E 0.043 -186 V 0.050 -187 K 0.056 -188 W 0.062 -189 R 0.072 -190 K 0.087 -191 L 0.098 -192 G 0.098 -193 S 0.087 -194 Y 0.070 -195 E 0.055 -196 H 0.050 -197 K 0.052 -198 I 0.057 -199 H 0.064 -200 L 0.069 -201 Q 0.072 -202 P 0.074 -203 G 0.075 -204 K 0.077 -205 L 0.078 -206 A 0.076 -207 K 0.073 -208 H 0.070 -209 L 0.068 -210 E 0.066 -211 V 0.064 -212 N 0.059 -213 V 0.054 -214 W 0.050 -215 I 0.053 -216 I 0.064 -217 E 0.080 -218 P 0.096 -219 Q 0.102 -220 G 0.097 -221 M 0.086 -222 R 0.072 -223 F 0.065 -224 L 0.069 -225 H 0.083 -226 V 0.106 -227 P 0.127 -228 D 0.137 -229 T 0.136 -230 F 0.135 -231 E 0.141 -232 G 0.148 -233 H 0.150 -234 F 0.149 -235 Q 0.144 -236 G 0.135 -237 V 0.116 -238 P 0.090 -239 V 0.068 -240 I 0.058 -241 S 0.060 -242 K 0.065 -243 G 0.066 -244 Q 0.063 -245 Q 0.056 -246 K 0.050 -247 A 0.046 -248 H 0.042 -249 V 0.039 -250 S 0.036 -251 F 0.038 -252 K 0.045 -253 P 0.053 -254 T 0.060 -255 V 0.068 -256 A 0.079 -257 Q 0.093 -258 Q 0.108 -259 R 0.130 -260 K 0.161 -261 C 0.189 -262 P 0.201 -263 N 0.193 -264 C 0.174 -265 T 0.150 -266 E 0.131 -267 T 0.121 -268 A 0.117 -269 V 0.113 -270 N 0.108 -271 G 0.098 -272 E 0.082 -273 L 0.066 -274 V 0.055 -275 V 0.049 -276 M 0.046 -277 Y 0.048 -278 D 0.059 -279 V 0.076 -280 N 0.099 -281 R 0.124 -282 E 0.145 -283 E 0.157 -284 K 0.158 -285 A 0.150 -286 G 0.134 -287 E 0.112 -288 L 0.091 -289 E 0.078 -290 V 0.073 -291 F 0.074 -292 N 0.078 -293 G 0.079 -294 Y 0.079 -295 F 0.080 -296 V 0.083 -297 H 0.084 -298 F 0.085 -299 F 0.095 -300 A 0.120 -301 P 0.157 -302 E 0.191 -303 N 0.212 -304 L 0.218 -305 D 0.213 -306 P 0.200 -307 I 0.176 -308 P 0.143 -309 K 0.115 -310 N 0.100 -311 I 0.092 -312 L 0.085 -313 F 0.082 -314 V 0.084 -315 I 0.088 -316 D 0.093 -317 V 0.100 -318 S 0.107 -319 G 0.108 -320 S 0.105 -321 M 0.098 -322 W 0.089 -323 G 0.079 -324 I 0.072 -325 K 0.067 -326 M 0.064 -327 K 0.063 -328 Q 0.063 -329 T 0.059 -330 V 0.054 -331 E 0.054 -332 A 0.058 -333 M 0.059 -334 K 0.056 -335 T 0.053 -336 I 0.054 -337 L 0.055 -338 D 0.056 -339 D 0.057 -340 L 0.057 -341 R 0.057 -342 T 0.056 -343 D 0.055 -344 D 0.049 -345 Q 0.038 -346 F 0.025 -347 S 0.018 -348 V 0.016 -349 V 0.018 -350 D 0.022 -351 F 0.027 -352 N 0.035 -353 H 0.046 -354 N 0.056 -355 V 0.058 -356 R 0.055 -357 T 0.051 -358 W 0.049 -359 R 0.051 -360 N 0.054 -361 D 0.055 -362 L 0.055 -363 V 0.055 -364 S 0.056 -365 A 0.054 -366 T 0.050 -367 K 0.045 -368 T 0.043 -369 Q 0.049 -370 I 0.064 -371 A 0.081 -372 D 0.090 -373 A 0.094 -374 K 0.095 -375 R 0.092 -376 Y 0.080 -377 I 0.067 -378 E 0.064 -379 K 0.074 -380 I 0.089 -381 Q 0.103 -382 P 0.117 -383 S 0.130 -384 G 0.135 -385 G 0.127 -386 T 0.112 -387 N 0.093 -388 I 0.074 -389 N 0.061 -390 E 0.053 -391 A 0.049 -392 L 0.046 -393 L 0.043 -394 R 0.042 -395 A 0.042 -396 I 0.043 -397 F 0.045 -398 I 0.048 -399 L 0.054 -400 N 0.063 -401 E 0.075 -402 A 0.085 -403 S 0.093 -404 N 0.106 -405 M 0.124 -406 G 0.140 -407 L 0.144 -408 L 0.137 -409 N 0.122 -410 P 0.107 -411 D 0.094 -412 S 0.082 -413 V 0.065 -414 S 0.048 -415 L 0.037 -416 I 0.032 -417 I 0.033 -418 L 0.041 -419 V 0.056 -420 S 0.080 -421 D 0.110 -422 G 0.138 -423 D 0.149 -424 P 0.140 -425 T 0.124 -426 V 0.116 -427 G 0.118 -428 E 0.125 -429 L 0.129 -430 K 0.121 -431 L 0.104 -432 S 0.086 -433 K 0.078 -434 I 0.077 -435 Q 0.074 -436 K 0.069 -437 N 0.065 -438 V 0.065 -439 K 0.067 -440 Q 0.069 -441 S 0.071 -442 I 0.071 -443 Q 0.071 -444 D 0.070 -445 N 0.065 -446 I 0.057 -447 S 0.046 -448 L 0.036 -449 F 0.032 -450 S 0.034 -451 L 0.042 -452 G 0.053 -453 I 0.063 -454 G 0.072 -455 F 0.079 -456 D 0.079 -457 V 0.068 -458 D 0.052 -459 Y 0.041 -460 D 0.038 -461 F 0.040 -462 L 0.044 -463 K 0.050 -464 R 0.056 -465 L 0.060 -466 S 0.061 -467 N 0.063 -468 E 0.069 -469 N 0.080 -470 R 0.090 -471 G 0.089 -472 I 0.081 -473 A 0.074 -474 Q 0.079 -475 R 0.098 -476 I 0.127 -477 Y 0.155 -478 G 0.173 -479 N 0.176 -480 Q 0.165 -481 D 0.145 -482 T 0.120 -483 S 0.095 -484 S 0.080 -485 Q 0.075 -486 L 0.074 -487 K 0.071 -488 K 0.067 -489 F 0.070 -490 Y 0.077 -491 N 0.078 -492 Q 0.076 -493 V 0.076 -494 S 0.079 -495 T 0.079 -496 P 0.074 -497 L 0.071 -498 L 0.072 -499 R 0.073 -500 N 0.070 -501 V 0.062 -502 Q 0.056 -503 F 0.057 -504 N 0.065 -505 Y 0.073 -506 P 0.074 -507 Q 0.070 -508 A 0.069 -509 S 0.075 -510 V 0.086 -511 T 0.092 -512 D 0.092 -513 V 0.086 -514 T 0.079 -515 Q 0.075 -516 N 0.074 -517 N 0.073 -518 F 0.066 -519 H 0.054 -520 N 0.046 -521 Y 0.047 -522 F 0.059 -523 G 0.073 -524 G 0.081 -525 S 0.082 -526 E 0.077 -527 I 0.070 -528 V 0.063 -529 V 0.055 -530 A 0.046 -531 G 0.041 -532 K 0.045 -533 F 0.055 -534 D 0.066 -535 P 0.077 -536 S 0.090 -537 K 0.103 -538 L 0.108 -539 T 0.104 -540 E 0.095 -541 V 0.084 -542 Q 0.070 -543 S 0.057 -544 I 0.048 -545 I 0.045 -546 T 0.047 -547 A 0.053 -548 T 0.061 -549 S 0.069 -550 A 0.074 -551 N 0.078 -552 T 0.083 -553 E 0.088 -554 L 0.091 -555 V 0.090 -556 L 0.088 -557 E 0.083 -558 T 0.076 -559 L 0.076 -560 S 0.086 -561 Q 0.103 -562 M 0.121 -563 D 0.135 -564 D 0.139 -565 L 0.138 -566 E 0.145 -567 E 0.168 -568 F 0.197 -569 L 0.222 -570 S 0.243 -571 K 0.270 -572 D 0.299 -573 K 0.316 -574 H 0.313 -575 A 0.293 -576 D 0.260 -577 P 0.219 -578 D 0.175 -579 F 0.134 -580 T 0.103 -581 K 0.081 -582 K 0.067 -583 L 0.062 -584 W 0.067 -585 A 0.076 -586 Y 0.085 -587 L 0.093 -588 T 0.094 -589 I 0.089 -590 N 0.084 -591 Q 0.083 -592 L 0.082 -593 L 0.083 -594 A 0.086 -595 E 0.089 -596 R 0.095 -597 S 0.104 -598 L 0.108 -599 A 0.105 -600 P 0.099 -601 T 0.091 -602 A 0.083 -603 A 0.076 -604 I 0.073 -605 K 0.071 -606 R 0.069 -607 K 0.068 -608 I 0.071 -609 T 0.071 -610 K 0.068 -611 T 0.070 -612 I 0.080 -613 L 0.091 -614 Q 0.095 -615 M 0.092 -616 S 0.092 -617 L 0.095 -618 D 0.098 -619 H 0.104 -620 H 0.118 -621 I 0.143 -622 V 0.176 -623 T 0.211 -624 P 0.236 -625 L 0.243 -626 T 0.242 -627 A 0.248 -628 M 0.264 -629 V 0.283 -630 I 0.303 -631 E 0.328 -632 N 0.352 -633 D 0.366 -634 A 0.370 -635 G 0.380 -636 D 0.403 -637 E 0.430 -638 R 0.451 -639 M 0.465 -640 L 0.467 -641 A 0.455 -642 D 0.438 -643 S 0.422 -644 P 0.408 -645 P 0.397 -646 Q 0.389 -647 D 0.382 -648 H 0.375 -649 S 0.373 -650 C 0.394 -651 C 0.449 -652 S 0.526 -653 G 0.587 -654 A 0.608 -655 L 0.595 -656 Y 0.572 -657 Y 0.565 -658 G 0.577 -659 T 0.595 -660 K 0.609 -661 V 0.615 -662 A 0.609 -663 S 0.594 -664 G 0.574 -665 P 0.551 -666 I 0.532 -667 P 0.525 -668 S 0.526 -669 W 0.523 -670 A 0.518 -671 N 0.514 -672 P 0.514 -673 S 0.523 -674 P 0.542 -675 T 0.557 -676 P 0.540 -677 M 0.477 -678 S 0.411 -679 A 0.401 -680 M 0.441 -681 L 0.471 -682 A 0.486 -683 V 0.517 -684 G 0.561 -685 A 0.589 -686 K 0.602 -687 P 0.612 -688 L 0.614 -689 E 0.599 -690 S 0.572 -691 T 0.546 -692 P 0.524 -693 P 0.498 -694 T 0.464 -695 H 0.421 -696 L 0.373 -697 N 0.325 -698 Q 0.287 -699 V 0.259 -700 E 0.227 -701 N 0.192 -702 D 0.168 -703 P 0.161 -704 H 0.159 -705 F 0.151 -706 I 0.142 -707 I 0.140 -708 Y 0.144 -709 L 0.148 -710 P 0.150 -711 K 0.149 -712 S 0.142 -713 K 0.129 -714 R 0.113 -715 N 0.095 -716 I 0.080 -717 C 0.071 -718 F 0.071 -719 N 0.080 -720 I 0.095 -721 D 0.114 -722 S 0.130 -723 E 0.135 -724 P 0.128 -725 G 0.116 -726 K 0.103 -727 I 0.091 -728 L 0.077 -729 S 0.068 -730 L 0.069 -731 V 0.081 -732 S 0.098 -733 D 0.114 -734 P 0.128 -735 E 0.137 -736 S 0.137 -737 G 0.126 -738 I 0.111 -739 V 0.102 -740 V 0.102 -741 N 0.108 -742 G 0.116 -743 Q 0.119 -744 L 0.118 -745 I 0.121 -746 G 0.131 -747 A 0.142 -748 K 0.146 -749 R 0.146 -750 A 0.152 -751 E 0.165 -752 N 0.178 -753 G 0.181 -754 K 0.169 -755 L 0.143 -756 S 0.112 -757 T 0.086 -758 Y 0.068 -759 F 0.057 -760 G 0.050 -761 K 0.044 -762 L 0.037 -763 G 0.030 -764 F 0.026 -765 Y 0.027 -766 F 0.032 -767 Q 0.043 -768 K 0.057 -769 E 0.068 -770 G 0.072 -771 M 0.068 -772 K 0.059 -773 I 0.051 -774 E 0.045 -775 I 0.044 -776 S 0.047 -777 T 0.052 -778 E 0.055 -779 T 0.056 -780 I 0.058 -781 T 0.062 -782 L 0.071 -783 S 0.083 -784 S 0.093 -785 G 0.097 -786 S 0.094 -787 S 0.089 -788 T 0.086 -789 S 0.090 -790 R 0.096 -791 L 0.098 -792 S 0.096 -793 W 0.093 -794 S 0.090 -795 D 0.086 -796 T 0.085 -797 A 0.094 -798 H 0.111 -799 L 0.129 -800 G 0.138 -801 N 0.130 -802 S 0.109 -803 R 0.086 -804 V 0.072 -805 L 0.067 -806 I 0.066 -807 S 0.068 -808 V 0.069 -809 K 0.069 -810 K 0.071 -811 E 0.073 -812 K 0.072 -813 S 0.067 -814 V 0.062 -815 T 0.060 -816 L 0.062 -817 T 0.065 -818 L 0.065 -819 N 0.066 -820 K 0.069 -821 E 0.071 -822 L 0.069 -823 F 0.065 -824 F 0.064 -825 S 0.071 -826 V 0.079 -827 L 0.083 -828 L 0.084 -829 H 0.087 -830 R 0.091 -831 V 0.095 -832 W 0.098 -833 R 0.103 -834 K 0.113 -835 H 0.128 -836 P 0.140 -837 V 0.143 -838 N 0.135 -839 V 0.118 -840 D 0.101 -841 F 0.090 -842 L 0.087 -843 G 0.087 -844 I 0.089 -845 Y 0.094 -846 A 0.103 -847 P 0.110 -848 P 0.115 -849 I 0.116 -850 D 0.112 -851 K 0.105 -852 F 0.104 -853 S 0.114 -854 P 0.126 -855 R 0.127 -856 V 0.117 -857 H 0.106 -858 G 0.099 -859 L 0.101 -860 L 0.113 -861 G 0.132 -862 Q 0.142 -863 F 0.136 -864 M 0.127 -865 Q 0.134 -866 E 0.158 -867 P 0.178 -868 A 0.179 -869 I 0.164 -870 H 0.153 -871 I 0.157 -872 F 0.180 -873 N 0.217 -874 E 0.262 -875 R 0.303 -876 P 0.324 -877 G 0.322 -878 K 0.307 -879 E 0.295 -880 P 0.288 -881 G 0.281 -882 K 0.268 -883 P 0.242 -884 E 0.209 -885 A 0.179 -886 S 0.159 -887 M 0.149 -888 E 0.147 -889 V 0.155 -890 K 0.176 -891 G 0.203 -892 H 0.227 -893 K 0.239 -894 L 0.238 -895 T 0.228 -896 V 0.219 -897 T 0.223 -898 R 0.245 -899 G 0.263 -900 L 0.254 -901 Q 0.220 -902 K 0.185 -903 D 0.164 -904 Y 0.156 -905 R 0.153 -906 T 0.156 -907 D 0.165 -908 I 0.172 -909 V 0.174 -910 F 0.183 -911 G 0.202 -912 T 0.219 -913 D 0.220 -914 V 0.201 -915 P 0.173 -916 C 0.150 -917 W 0.141 -918 F 0.147 -919 V 0.168 -920 H 0.206 -921 N 0.259 -922 S 0.311 -923 G 0.337 -924 K 0.323 -925 G 0.281 -926 F 0.246 -927 I 0.236 -928 D 0.246 -929 G 0.248 -930 H 0.228 -931 Y 0.197 -932 K 0.170 -933 D 0.149 -934 Y 0.133 -935 F 0.124 -936 V 0.123 -937 P 0.119 -938 Q 0.109 -939 L 0.094 -940 Y 0.086 -941 S 0.091 -942 F 0.111 -943 L 0.145 -944 K 0.197 -945 R 0.261 -946 P 0.309 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000037254.19_ENSMUST00000042290.14_GN:Itih2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:4.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000037254.19_ENSMUST00000042290.14_GN:Itih2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:4.caid deleted file mode 100644 index f2eeaaef865e00f3843cdfc5fa5c317d0fd330da..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000037254.19_ENSMUST00000042290.14_GN:Itih2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:4.caid +++ /dev/null @@ -1,951 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000037254.19|ENSMUST00000042290.14|GN:Itih2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:4 -1 M 0.276 -2 S 0.272 -3 S 0.273 -4 K 0.285 -5 M 0.291 -6 Q 0.282 -7 R 0.268 -8 P 0.254 -9 V 0.235 -10 C 0.209 -11 L 0.191 -12 L 0.186 -13 I 0.182 -14 W 0.177 -15 L 0.174 -16 F 0.176 -17 L 0.188 -18 L 0.220 -19 E 0.272 -20 A 0.325 -21 Q 0.363 -22 A 0.390 -23 F 0.416 -24 E 0.451 -25 I 0.495 -26 P 0.543 -27 I 0.587 -28 N 0.622 -29 G 0.637 -30 N 0.628 -31 S 0.604 -32 E 0.576 -33 F 0.551 -34 A 0.532 -35 E 0.521 -36 Y 0.516 -37 S 0.511 -38 D 0.502 -39 L 0.483 -40 V 0.453 -41 E 0.418 -42 L 0.389 -43 A 0.372 -44 P 0.369 -45 D 0.383 -46 K 0.413 -47 L 0.455 -48 P 0.504 -49 F 0.545 -50 V 0.560 -51 Q 0.554 -52 E 0.547 -53 N 0.543 -54 G 0.528 -55 R 0.504 -56 H 0.481 -57 Q 0.469 -58 R 0.471 -59 S 0.491 -60 L 0.527 -61 P 0.572 -62 E 0.617 -63 E 0.653 -64 S 0.671 -65 G 0.672 -66 E 0.667 -67 E 0.663 -68 T 0.655 -69 D 0.625 -70 T 0.561 -71 V 0.462 -72 D 0.346 -73 P 0.240 -74 V 0.159 -75 T 0.102 -76 L 0.068 -77 Y 0.051 -78 S 0.045 -79 Y 0.044 -80 K 0.044 -81 V 0.044 -82 Q 0.042 -83 S 0.043 -84 T 0.047 -85 I 0.057 -86 T 0.066 -87 S 0.066 -88 R 0.057 -89 V 0.046 -90 A 0.040 -91 T 0.037 -92 T 0.037 -93 T 0.036 -94 I 0.035 -95 Q 0.033 -96 S 0.032 -97 K 0.033 -98 L 0.039 -99 V 0.054 -100 N 0.074 -101 N 0.093 -102 S 0.104 -103 P 0.105 -104 L 0.096 -105 P 0.082 -106 Q 0.068 -107 S 0.058 -108 V 0.050 -109 V 0.043 -110 F 0.043 -111 D 0.055 -112 V 0.073 -113 Q 0.089 -114 I 0.097 -115 P 0.097 -116 K 0.087 -117 G 0.071 -118 A 0.057 -119 F 0.048 -120 I 0.046 -121 S 0.047 -122 N 0.046 -123 F 0.042 -124 T 0.038 -125 M 0.039 -126 T 0.047 -127 V 0.062 -128 N 0.076 -129 G 0.086 -130 M 0.092 -131 T 0.098 -132 F 0.109 -133 T 0.121 -134 S 0.122 -135 S 0.110 -136 I 0.092 -137 K 0.079 -138 E 0.074 -139 K 0.074 -140 T 0.074 -141 V 0.073 -142 G 0.072 -143 R 0.076 -144 A 0.077 -145 L 0.072 -146 Y 0.070 -147 S 0.080 -148 Q 0.096 -149 A 0.111 -150 R 0.129 -151 A 0.157 -152 K 0.192 -153 G 0.217 -154 K 0.221 -155 T 0.209 -156 A 0.192 -157 G 0.182 -158 W 0.185 -159 V 0.199 -160 R 0.213 -161 S 0.222 -162 R 0.224 -163 T 0.216 -164 L 0.196 -165 D 0.165 -166 M 0.128 -167 E 0.096 -168 N 0.075 -169 F 0.063 -170 N 0.055 -171 T 0.054 -172 E 0.060 -173 V 0.067 -174 N 0.070 -175 I 0.071 -176 P 0.073 -177 P 0.074 -178 G 0.076 -179 A 0.077 -180 K 0.077 -181 V 0.074 -182 Q 0.068 -183 F 0.061 -184 E 0.056 -185 L 0.051 -186 H 0.044 -187 Y 0.039 -188 Q 0.038 -189 E 0.042 -190 V 0.050 -191 K 0.056 -192 W 0.062 -193 R 0.072 -194 K 0.087 -195 L 0.097 -196 G 0.098 -197 S 0.087 -198 Y 0.069 -199 E 0.055 -200 H 0.050 -201 K 0.052 -202 I 0.057 -203 H 0.063 -204 L 0.069 -205 Q 0.072 -206 P 0.073 -207 G 0.075 -208 K 0.077 -209 L 0.078 -210 A 0.076 -211 K 0.073 -212 H 0.070 -213 L 0.068 -214 E 0.066 -215 V 0.064 -216 N 0.060 -217 V 0.054 -218 W 0.050 -219 I 0.053 -220 I 0.064 -221 E 0.080 -222 P 0.095 -223 Q 0.101 -224 G 0.097 -225 M 0.085 -226 R 0.072 -227 F 0.064 -228 L 0.068 -229 H 0.083 -230 V 0.105 -231 P 0.127 -232 D 0.137 -233 T 0.136 -234 F 0.135 -235 E 0.141 -236 G 0.147 -237 H 0.149 -238 F 0.148 -239 Q 0.144 -240 G 0.134 -241 V 0.116 -242 P 0.090 -243 V 0.068 -244 I 0.058 -245 S 0.060 -246 K 0.064 -247 G 0.066 -248 Q 0.062 -249 Q 0.056 -250 K 0.050 -251 A 0.045 -252 H 0.042 -253 V 0.038 -254 S 0.036 -255 F 0.038 -256 K 0.045 -257 P 0.053 -258 T 0.060 -259 V 0.067 -260 A 0.079 -261 Q 0.092 -262 Q 0.107 -263 R 0.130 -264 K 0.161 -265 C 0.189 -266 P 0.201 -267 N 0.193 -268 C 0.174 -269 T 0.151 -270 E 0.132 -271 T 0.121 -272 A 0.117 -273 V 0.114 -274 N 0.108 -275 G 0.099 -276 E 0.083 -277 L 0.066 -278 V 0.055 -279 V 0.049 -280 M 0.046 -281 Y 0.048 -282 D 0.059 -283 V 0.076 -284 N 0.099 -285 R 0.124 -286 E 0.145 -287 E 0.158 -288 K 0.159 -289 A 0.151 -290 G 0.134 -291 E 0.112 -292 L 0.092 -293 E 0.078 -294 V 0.073 -295 F 0.074 -296 N 0.078 -297 G 0.079 -298 Y 0.079 -299 F 0.080 -300 V 0.083 -301 H 0.084 -302 F 0.085 -303 F 0.095 -304 A 0.120 -305 P 0.157 -306 E 0.191 -307 N 0.212 -308 L 0.219 -309 D 0.214 -310 P 0.200 -311 I 0.176 -312 P 0.144 -313 K 0.116 -314 N 0.100 -315 I 0.092 -316 L 0.085 -317 F 0.082 -318 V 0.084 -319 I 0.088 -320 D 0.093 -321 V 0.100 -322 S 0.107 -323 G 0.108 -324 S 0.105 -325 M 0.098 -326 W 0.089 -327 G 0.079 -328 I 0.072 -329 K 0.067 -330 M 0.064 -331 K 0.063 -332 Q 0.063 -333 T 0.059 -334 V 0.054 -335 E 0.054 -336 A 0.058 -337 M 0.059 -338 K 0.056 -339 T 0.053 -340 I 0.054 -341 L 0.055 -342 D 0.056 -343 D 0.057 -344 L 0.057 -345 R 0.057 -346 T 0.056 -347 D 0.055 -348 D 0.049 -349 Q 0.038 -350 F 0.025 -351 S 0.018 -352 V 0.016 -353 V 0.018 -354 D 0.022 -355 F 0.027 -356 N 0.035 -357 H 0.046 -358 N 0.056 -359 V 0.058 -360 R 0.055 -361 T 0.051 -362 W 0.049 -363 R 0.051 -364 N 0.054 -365 D 0.055 -366 L 0.055 -367 V 0.055 -368 S 0.056 -369 A 0.054 -370 T 0.050 -371 K 0.045 -372 T 0.043 -373 Q 0.049 -374 I 0.064 -375 A 0.080 -376 D 0.090 -377 A 0.094 -378 K 0.095 -379 R 0.092 -380 Y 0.080 -381 I 0.067 -382 E 0.064 -383 K 0.074 -384 I 0.089 -385 Q 0.103 -386 P 0.117 -387 S 0.130 -388 G 0.135 -389 G 0.127 -390 T 0.112 -391 N 0.093 -392 I 0.074 -393 N 0.061 -394 E 0.053 -395 A 0.049 -396 L 0.045 -397 L 0.043 -398 R 0.042 -399 A 0.042 -400 I 0.042 -401 F 0.044 -402 I 0.048 -403 L 0.053 -404 N 0.063 -405 E 0.075 -406 A 0.085 -407 S 0.093 -408 N 0.106 -409 M 0.125 -410 G 0.140 -411 L 0.144 -412 L 0.137 -413 N 0.123 -414 P 0.107 -415 D 0.094 -416 S 0.082 -417 V 0.065 -418 S 0.048 -419 L 0.037 -420 I 0.032 -421 I 0.033 -422 L 0.041 -423 V 0.056 -424 S 0.080 -425 D 0.110 -426 G 0.138 -427 D 0.149 -428 P 0.140 -429 T 0.124 -430 V 0.116 -431 G 0.118 -432 E 0.125 -433 L 0.129 -434 K 0.122 -435 L 0.104 -436 S 0.087 -437 K 0.079 -438 I 0.077 -439 Q 0.074 -440 K 0.069 -441 N 0.065 -442 V 0.065 -443 K 0.068 -444 Q 0.069 -445 S 0.071 -446 I 0.071 -447 Q 0.071 -448 D 0.070 -449 N 0.066 -450 I 0.057 -451 S 0.046 -452 L 0.037 -453 F 0.032 -454 S 0.034 -455 L 0.042 -456 G 0.053 -457 I 0.063 -458 G 0.072 -459 F 0.079 -460 D 0.079 -461 V 0.068 -462 D 0.052 -463 Y 0.041 -464 D 0.038 -465 F 0.040 -466 L 0.044 -467 K 0.050 -468 R 0.056 -469 L 0.060 -470 S 0.061 -471 N 0.063 -472 E 0.069 -473 N 0.080 -474 R 0.090 -475 G 0.090 -476 I 0.081 -477 A 0.074 -478 Q 0.079 -479 R 0.098 -480 I 0.127 -481 Y 0.156 -482 G 0.174 -483 N 0.176 -484 Q 0.166 -485 D 0.145 -486 T 0.120 -487 S 0.095 -488 S 0.080 -489 Q 0.075 -490 L 0.074 -491 K 0.071 -492 K 0.067 -493 F 0.070 -494 Y 0.077 -495 N 0.079 -496 Q 0.076 -497 V 0.076 -498 S 0.080 -499 T 0.079 -500 P 0.074 -501 L 0.071 -502 L 0.072 -503 R 0.074 -504 N 0.070 -505 V 0.062 -506 Q 0.056 -507 F 0.057 -508 N 0.065 -509 Y 0.073 -510 P 0.074 -511 Q 0.070 -512 A 0.069 -513 S 0.076 -514 V 0.086 -515 T 0.093 -516 D 0.092 -517 V 0.086 -518 T 0.079 -519 Q 0.075 -520 N 0.075 -521 N 0.073 -522 F 0.066 -523 H 0.055 -524 N 0.046 -525 Y 0.048 -526 F 0.059 -527 G 0.073 -528 G 0.081 -529 S 0.082 -530 E 0.077 -531 I 0.070 -532 V 0.063 -533 V 0.055 -534 A 0.046 -535 G 0.041 -536 K 0.045 -537 F 0.055 -538 D 0.067 -539 P 0.077 -540 S 0.090 -541 K 0.103 -542 L 0.108 -543 T 0.104 -544 E 0.095 -545 V 0.084 -546 Q 0.070 -547 S 0.057 -548 I 0.048 -549 I 0.045 -550 T 0.047 -551 A 0.053 -552 T 0.061 -553 S 0.069 -554 A 0.074 -555 N 0.078 -556 T 0.083 -557 E 0.088 -558 L 0.090 -559 V 0.090 -560 L 0.088 -561 E 0.083 -562 T 0.076 -563 L 0.076 -564 S 0.087 -565 Q 0.104 -566 M 0.122 -567 D 0.135 -568 D 0.139 -569 L 0.138 -570 E 0.145 -571 E 0.168 -572 F 0.197 -573 L 0.222 -574 S 0.243 -575 K 0.270 -576 D 0.299 -577 K 0.316 -578 H 0.313 -579 A 0.293 -580 D 0.260 -581 P 0.219 -582 D 0.175 -583 F 0.135 -584 T 0.103 -585 K 0.082 -586 K 0.067 -587 L 0.062 -588 W 0.067 -589 A 0.076 -590 Y 0.086 -591 L 0.093 -592 T 0.094 -593 I 0.089 -594 N 0.084 -595 Q 0.083 -596 L 0.082 -597 L 0.083 -598 A 0.086 -599 E 0.090 -600 R 0.096 -601 S 0.104 -602 L 0.108 -603 A 0.105 -604 P 0.099 -605 T 0.091 -606 A 0.083 -607 A 0.076 -608 I 0.073 -609 K 0.071 -610 R 0.069 -611 K 0.069 -612 I 0.071 -613 T 0.071 -614 K 0.068 -615 T 0.070 -616 I 0.080 -617 L 0.091 -618 Q 0.095 -619 M 0.093 -620 S 0.092 -621 L 0.095 -622 D 0.099 -623 H 0.104 -624 H 0.118 -625 I 0.143 -626 V 0.177 -627 T 0.211 -628 P 0.236 -629 L 0.243 -630 T 0.242 -631 A 0.248 -632 M 0.264 -633 V 0.283 -634 I 0.304 -635 E 0.328 -636 N 0.353 -637 D 0.366 -638 A 0.370 -639 G 0.381 -640 D 0.403 -641 E 0.430 -642 R 0.452 -643 M 0.466 -644 L 0.467 -645 A 0.456 -646 D 0.438 -647 S 0.422 -648 P 0.408 -649 P 0.397 -650 Q 0.389 -651 D 0.381 -652 H 0.375 -653 S 0.373 -654 C 0.394 -655 C 0.449 -656 S 0.526 -657 G 0.587 -658 A 0.608 -659 L 0.595 -660 Y 0.573 -661 Y 0.565 -662 G 0.577 -663 T 0.595 -664 K 0.609 -665 V 0.614 -666 A 0.609 -667 S 0.594 -668 G 0.574 -669 P 0.551 -670 I 0.531 -671 P 0.524 -672 S 0.525 -673 W 0.523 -674 A 0.518 -675 N 0.514 -676 P 0.515 -677 S 0.524 -678 P 0.542 -679 T 0.558 -680 P 0.541 -681 M 0.479 -682 S 0.413 -683 A 0.403 -684 M 0.442 -685 L 0.472 -686 A 0.487 -687 V 0.518 -688 G 0.561 -689 A 0.589 -690 K 0.602 -691 P 0.612 -692 L 0.614 -693 E 0.599 -694 S 0.573 -695 T 0.547 -696 P 0.524 -697 P 0.498 -698 T 0.464 -699 H 0.421 -700 L 0.373 -701 N 0.325 -702 Q 0.288 -703 V 0.259 -704 E 0.227 -705 N 0.192 -706 D 0.168 -707 P 0.161 -708 H 0.159 -709 F 0.151 -710 I 0.142 -711 I 0.140 -712 Y 0.144 -713 L 0.148 -714 P 0.150 -715 K 0.149 -716 S 0.142 -717 K 0.129 -718 R 0.112 -719 N 0.095 -720 I 0.080 -721 C 0.071 -722 F 0.071 -723 N 0.080 -724 I 0.095 -725 D 0.114 -726 S 0.130 -727 E 0.135 -728 P 0.128 -729 G 0.116 -730 K 0.103 -731 I 0.091 -732 L 0.077 -733 S 0.068 -734 L 0.069 -735 V 0.081 -736 S 0.098 -737 D 0.114 -738 P 0.127 -739 E 0.137 -740 S 0.137 -741 G 0.126 -742 I 0.111 -743 V 0.102 -744 V 0.102 -745 N 0.109 -746 G 0.117 -747 Q 0.120 -748 L 0.118 -749 I 0.121 -750 G 0.131 -751 A 0.142 -752 K 0.146 -753 R 0.146 -754 A 0.152 -755 E 0.165 -756 N 0.178 -757 G 0.182 -758 K 0.169 -759 L 0.143 -760 S 0.112 -761 T 0.086 -762 Y 0.068 -763 F 0.057 -764 G 0.050 -765 K 0.044 -766 L 0.037 -767 G 0.030 -768 F 0.026 -769 Y 0.027 -770 F 0.032 -771 Q 0.043 -772 K 0.057 -773 E 0.068 -774 G 0.072 -775 M 0.068 -776 K 0.060 -777 I 0.051 -778 E 0.045 -779 I 0.044 -780 S 0.047 -781 T 0.052 -782 E 0.055 -783 T 0.056 -784 I 0.058 -785 T 0.062 -786 L 0.071 -787 S 0.083 -788 S 0.093 -789 G 0.096 -790 S 0.094 -791 S 0.089 -792 T 0.086 -793 S 0.089 -794 R 0.095 -795 L 0.098 -796 S 0.096 -797 W 0.093 -798 S 0.090 -799 D 0.086 -800 T 0.086 -801 A 0.095 -802 H 0.111 -803 L 0.129 -804 G 0.138 -805 N 0.131 -806 S 0.109 -807 R 0.087 -808 V 0.072 -809 L 0.067 -810 I 0.066 -811 S 0.068 -812 V 0.069 -813 K 0.069 -814 K 0.071 -815 E 0.073 -816 K 0.072 -817 S 0.067 -818 V 0.062 -819 T 0.060 -820 L 0.062 -821 T 0.065 -822 L 0.065 -823 N 0.066 -824 K 0.069 -825 E 0.072 -826 L 0.070 -827 F 0.065 -828 F 0.064 -829 S 0.071 -830 V 0.079 -831 L 0.083 -832 L 0.084 -833 H 0.087 -834 R 0.091 -835 V 0.095 -836 W 0.098 -837 R 0.104 -838 K 0.114 -839 H 0.128 -840 P 0.140 -841 V 0.143 -842 N 0.135 -843 V 0.118 -844 D 0.101 -845 F 0.090 -846 L 0.087 -847 G 0.087 -848 I 0.089 -849 Y 0.094 -850 A 0.103 -851 P 0.110 -852 P 0.115 -853 I 0.116 -854 D 0.112 -855 K 0.105 -856 F 0.104 -857 S 0.114 -858 P 0.126 -859 R 0.127 -860 V 0.117 -861 H 0.106 -862 G 0.099 -863 L 0.100 -864 L 0.113 -865 G 0.132 -866 Q 0.142 -867 F 0.136 -868 M 0.127 -869 Q 0.134 -870 E 0.158 -871 P 0.178 -872 A 0.178 -873 I 0.164 -874 H 0.153 -875 I 0.157 -876 F 0.179 -877 N 0.217 -878 E 0.262 -879 R 0.303 -880 P 0.324 -881 G 0.322 -882 K 0.308 -883 E 0.295 -884 P 0.288 -885 G 0.282 -886 K 0.268 -887 P 0.242 -888 E 0.209 -889 A 0.179 -890 S 0.159 -891 M 0.149 -892 E 0.147 -893 V 0.156 -894 K 0.176 -895 G 0.204 -896 H 0.227 -897 K 0.239 -898 L 0.238 -899 T 0.228 -900 V 0.218 -901 T 0.223 -902 R 0.246 -903 G 0.265 -904 L 0.255 -905 Q 0.220 -906 K 0.185 -907 D 0.164 -908 Y 0.155 -909 R 0.153 -910 T 0.155 -911 D 0.164 -912 I 0.171 -913 V 0.173 -914 F 0.182 -915 G 0.201 -916 T 0.218 -917 D 0.219 -918 V 0.200 -919 P 0.172 -920 C 0.150 -921 W 0.141 -922 F 0.147 -923 V 0.169 -924 H 0.207 -925 N 0.260 -926 S 0.312 -927 G 0.338 -928 K 0.324 -929 G 0.283 -930 F 0.247 -931 I 0.238 -932 D 0.248 -933 G 0.250 -934 H 0.230 -935 Y 0.198 -936 K 0.171 -937 D 0.149 -938 Y 0.133 -939 F 0.124 -940 V 0.122 -941 P 0.119 -942 Q 0.109 -943 L 0.094 -944 Y 0.085 -945 S 0.091 -946 F 0.110 -947 L 0.144 -948 K 0.196 -949 R 0.260 -950 P 0.308 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000037260.9_ENSMUST00000037609.8_GN:Hgsnat_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000037260.9_ENSMUST00000037609.8_GN:Hgsnat_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index fae392cd133727047bc759fb351171a532baa004..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000037260.9_ENSMUST00000037609.8_GN:Hgsnat_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,625 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000037260.9|ENSMUST00000037609.8|GN:Hgsnat|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.274 -2 G 0.270 -3 A 0.266 -4 G 0.254 -5 P 0.224 -6 A 0.184 -7 L 0.149 -8 A 0.126 -9 A 0.110 -10 L 0.100 -11 L 0.100 -12 L 0.111 -13 A 0.126 -14 G 0.140 -15 S 0.155 -16 V 0.169 -17 L 0.182 -18 S 0.194 -19 A 0.208 -20 T 0.230 -21 L 0.264 -22 L 0.308 -23 A 0.361 -24 P 0.411 -25 G 0.438 -26 R 0.434 -27 R 0.414 -28 A 0.402 -29 E 0.402 -30 P 0.400 -31 D 0.383 -32 L 0.348 -33 D 0.309 -34 E 0.282 -35 K 0.268 -36 R 0.268 -37 N 0.276 -38 V 0.277 -39 E 0.256 -40 L 0.214 -41 K 0.165 -42 M 0.121 -43 D 0.085 -44 Q 0.059 -45 A 0.042 -46 L 0.035 -47 L 0.033 -48 L 0.035 -49 I 0.039 -50 H 0.044 -51 N 0.050 -52 E 0.057 -53 L 0.067 -54 L 0.081 -55 G 0.089 -56 T 0.082 -57 S 0.063 -58 L 0.043 -59 T 0.031 -60 V 0.026 -61 Y 0.028 -62 W 0.035 -63 K 0.047 -64 S 0.062 -65 D 0.075 -66 D 0.078 -67 C 0.070 -68 Y 0.058 -69 Q 0.047 -70 C 0.043 -71 T 0.043 -72 F 0.046 -73 Q 0.050 -74 P 0.056 -75 L 0.060 -76 A 0.065 -77 N 0.074 -78 V 0.093 -79 S 0.127 -80 H 0.181 -81 G 0.243 -82 G 0.281 -83 K 0.278 -84 P 0.241 -85 A 0.194 -86 K 0.158 -87 P 0.139 -88 S 0.132 -89 V 0.124 -90 A 0.106 -91 P 0.081 -92 V 0.058 -93 S 0.042 -94 V 0.034 -95 S 0.030 -96 T 0.029 -97 Q 0.031 -98 H 0.037 -99 G 0.045 -100 S 0.052 -101 I 0.053 -102 L 0.053 -103 Q 0.056 -104 V 0.062 -105 N 0.073 -106 S 0.084 -107 T 0.094 -108 S 0.101 -109 E 0.104 -110 E 0.105 -111 R 0.101 -112 A 0.092 -113 A 0.079 -114 C 0.065 -115 R 0.053 -116 L 0.045 -117 E 0.040 -118 Y 0.038 -119 K 0.040 -120 F 0.050 -121 G 0.072 -122 E 0.105 -123 F 0.138 -124 G 0.153 -125 N 0.140 -126 Y 0.112 -127 S 0.090 -128 L 0.080 -129 L 0.084 -130 V 0.103 -131 Q 0.135 -132 H 0.175 -133 A 0.214 -134 S 0.246 -135 S 0.264 -136 G 0.270 -137 A 0.262 -138 N 0.239 -139 K 0.204 -140 I 0.164 -141 A 0.131 -142 C 0.112 -143 D 0.103 -144 I 0.098 -145 I 0.099 -146 V 0.113 -147 N 0.140 -148 E 0.172 -149 N 0.202 -150 P 0.218 -151 V 0.213 -152 D 0.192 -153 S 0.163 -154 N 0.139 -155 L 0.121 -156 P 0.104 -157 V 0.089 -158 S 0.080 -159 I 0.080 -160 A 0.089 -161 F 0.105 -162 L 0.122 -163 V 0.137 -164 G 0.146 -165 L 0.143 -166 A 0.130 -167 L 0.115 -168 I 0.099 -169 V 0.084 -170 A 0.073 -171 V 0.067 -172 S 0.065 -173 L 0.065 -174 L 0.070 -175 R 0.080 -176 L 0.097 -177 L 0.120 -178 L 0.147 -179 S 0.172 -180 L 0.190 -181 D 0.203 -182 D 0.209 -183 V 0.207 -184 N 0.196 -185 N 0.181 -186 W 0.172 -187 I 0.167 -188 S 0.164 -189 K 0.163 -190 T 0.172 -191 I 0.192 -192 A 0.212 -193 S 0.229 -194 R 0.247 -195 E 0.265 -196 T 0.278 -197 D 0.285 -198 R 0.287 -199 L 0.287 -200 I 0.291 -201 N 0.310 -202 S 0.344 -203 E 0.384 -204 L 0.426 -205 G 0.471 -206 S 0.511 -207 P 0.528 -208 S 0.520 -209 R 0.516 -210 A 0.547 -211 D 0.600 -212 P 0.644 -213 L 0.670 -214 S 0.683 -215 A 0.678 -216 D 0.653 -217 Y 0.623 -218 Q 0.612 -219 P 0.625 -220 E 0.649 -221 T 0.665 -222 R 0.666 -223 R 0.655 -224 S 0.629 -225 S 0.577 -226 A 0.488 -227 N 0.374 -228 R 0.259 -229 L 0.166 -230 R 0.103 -231 C 0.067 -232 V 0.052 -233 D 0.050 -234 T 0.058 -235 F 0.068 -236 R 0.075 -237 G 0.077 -238 L 0.077 -239 A 0.079 -240 L 0.081 -241 V 0.079 -242 L 0.074 -243 M 0.072 -244 V 0.075 -245 F 0.084 -246 V 0.100 -247 N 0.120 -248 Y 0.142 -249 G 0.166 -250 G 0.191 -251 G 0.205 -252 K 0.201 -253 Y 0.188 -254 W 0.178 -255 Y 0.178 -256 F 0.182 -257 K 0.180 -258 H 0.165 -259 S 0.142 -260 S 0.117 -261 W 0.095 -262 N 0.080 -263 G 0.072 -264 L 0.072 -265 T 0.082 -266 V 0.105 -267 A 0.141 -268 D 0.179 -269 L 0.205 -270 V 0.203 -271 F 0.177 -272 P 0.153 -273 W 0.147 -274 F 0.142 -275 V 0.121 -276 F 0.097 -277 I 0.087 -278 M 0.088 -279 G 0.088 -280 T 0.086 -281 S 0.080 -282 I 0.071 -283 F 0.061 -284 L 0.054 -285 S 0.052 -286 M 0.053 -287 T 0.059 -288 S 0.068 -289 I 0.078 -290 L 0.090 -291 Q 0.109 -292 R 0.132 -293 G 0.142 -294 C 0.128 -295 S 0.096 -296 K 0.064 -297 L 0.047 -298 K 0.043 -299 L 0.043 -300 L 0.040 -301 G 0.038 -302 K 0.039 -303 I 0.045 -304 V 0.056 -305 W 0.074 -306 R 0.092 -307 S 0.098 -308 F 0.090 -309 L 0.080 -310 L 0.078 -311 I 0.078 -312 C 0.076 -313 I 0.078 -314 G 0.089 -315 V 0.106 -316 I 0.125 -317 I 0.149 -318 V 0.182 -319 N 0.218 -320 P 0.248 -321 N 0.267 -322 Y 0.278 -323 C 0.285 -324 L 0.290 -325 G 0.291 -326 P 0.280 -327 L 0.255 -328 S 0.223 -329 W 0.196 -330 D 0.178 -331 K 0.163 -332 V 0.147 -333 R 0.134 -334 I 0.121 -335 P 0.108 -336 G 0.100 -337 V 0.105 -338 L 0.123 -339 Q 0.147 -340 R 0.169 -341 L 0.178 -342 G 0.168 -343 V 0.144 -344 T 0.119 -345 Y 0.095 -346 F 0.076 -347 V 0.063 -348 V 0.056 -349 A 0.053 -350 V 0.050 -351 L 0.047 -352 E 0.046 -353 F 0.046 -354 F 0.050 -355 F 0.062 -356 W 0.088 -357 K 0.127 -358 P 0.175 -359 V 0.226 -360 P 0.274 -361 D 0.315 -362 S 0.338 -363 C 0.342 -364 T 0.339 -365 L 0.336 -366 E 0.331 -367 S 0.316 -368 S 0.293 -369 C 0.266 -370 F 0.233 -371 S 0.191 -372 L 0.148 -373 R 0.118 -374 D 0.102 -375 I 0.095 -376 T 0.094 -377 S 0.093 -378 S 0.084 -379 W 0.070 -380 P 0.062 -381 Q 0.064 -382 W 0.074 -383 L 0.085 -384 T 0.087 -385 I 0.081 -386 L 0.072 -387 T 0.067 -388 L 0.067 -389 E 0.070 -390 S 0.070 -391 I 0.067 -392 W 0.064 -393 L 0.061 -394 A 0.065 -395 L 0.074 -396 T 0.083 -397 F 0.093 -398 F 0.110 -399 L 0.136 -400 P 0.162 -401 V 0.180 -402 P 0.192 -403 G 0.199 -404 C 0.209 -405 P 0.226 -406 T 0.247 -407 G 0.261 -408 Y 0.264 -409 L 0.263 -410 G 0.265 -411 P 0.272 -412 G 0.283 -413 G 0.285 -414 I 0.275 -415 G 0.260 -416 D 0.248 -417 L 0.241 -418 G 0.238 -419 K 0.237 -420 Y 0.232 -421 P 0.226 -422 H 0.230 -423 C 0.247 -424 T 0.273 -425 G 0.295 -426 G 0.295 -427 A 0.270 -428 A 0.238 -429 G 0.220 -430 Y 0.211 -431 I 0.195 -432 D 0.169 -433 R 0.150 -434 L 0.149 -435 L 0.165 -436 L 0.181 -437 G 0.186 -438 D 0.178 -439 N 0.162 -440 H 0.148 -441 L 0.144 -442 Y 0.157 -443 Q 0.180 -444 H 0.196 -445 P 0.197 -446 S 0.184 -447 S 0.167 -448 T 0.149 -449 V 0.132 -450 L 0.121 -451 Y 0.116 -452 H 0.119 -453 T 0.131 -454 E 0.153 -455 V 0.183 -456 A 0.210 -457 Y 0.227 -458 D 0.236 -459 P 0.246 -460 E 0.261 -461 G 0.273 -462 V 0.279 -463 L 0.287 -464 G 0.304 -465 T 0.317 -466 I 0.312 -467 N 0.292 -468 S 0.262 -469 I 0.226 -470 V 0.195 -471 M 0.168 -472 A 0.138 -473 F 0.113 -474 L 0.097 -475 G 0.089 -476 V 0.086 -477 Q 0.088 -478 A 0.090 -479 G 0.087 -480 K 0.081 -481 I 0.076 -482 L 0.073 -483 V 0.070 -484 Y 0.070 -485 Y 0.073 -486 K 0.077 -487 D 0.081 -488 Q 0.079 -489 T 0.068 -490 K 0.055 -491 A 0.045 -492 I 0.038 -493 L 0.033 -494 T 0.031 -495 R 0.033 -496 F 0.043 -497 A 0.056 -498 A 0.063 -499 W 0.057 -500 C 0.049 -501 C 0.046 -502 I 0.052 -503 L 0.066 -504 G 0.083 -505 L 0.092 -506 I 0.090 -507 S 0.083 -508 I 0.082 -509 V 0.092 -510 L 0.110 -511 T 0.125 -512 K 0.131 -513 V 0.138 -514 S 0.151 -515 A 0.167 -516 N 0.187 -517 E 0.209 -518 G 0.224 -519 F 0.231 -520 I 0.231 -521 P 0.221 -522 I 0.198 -523 N 0.168 -524 K 0.146 -525 N 0.144 -526 L 0.155 -527 W 0.170 -528 S 0.180 -529 I 0.187 -530 S 0.202 -531 Y 0.228 -532 V 0.242 -533 T 0.231 -534 T 0.213 -535 L 0.202 -536 S 0.184 -537 C 0.156 -538 F 0.129 -539 A 0.110 -540 F 0.097 -541 F 0.092 -542 I 0.091 -543 L 0.088 -544 L 0.081 -545 I 0.071 -546 L 0.063 -547 Y 0.058 -548 P 0.057 -549 V 0.063 -550 V 0.079 -551 D 0.097 -552 V 0.109 -553 K 0.112 -554 G 0.107 -555 L 0.099 -556 W 0.092 -557 T 0.091 -558 G 0.090 -559 T 0.086 -560 P 0.080 -561 F 0.082 -562 F 0.096 -563 Y 0.118 -564 P 0.144 -565 G 0.160 -566 M 0.158 -567 N 0.145 -568 S 0.127 -569 I 0.107 -570 L 0.088 -571 V 0.076 -572 Y 0.070 -573 V 0.065 -574 G 0.064 -575 H 0.066 -576 E 0.067 -577 V 0.067 -578 L 0.070 -579 E 0.078 -580 N 0.087 -581 Y 0.092 -582 F 0.095 -583 P 0.103 -584 F 0.118 -585 Q 0.141 -586 W 0.168 -587 K 0.197 -588 L 0.233 -589 A 0.268 -590 D 0.282 -591 E 0.265 -592 Q 0.225 -593 S 0.178 -594 H 0.137 -595 K 0.110 -596 E 0.099 -597 H 0.096 -598 L 0.098 -599 I 0.109 -600 Q 0.127 -601 N 0.137 -602 I 0.135 -603 V 0.130 -604 A 0.129 -605 T 0.121 -606 A 0.105 -607 L 0.089 -608 W 0.084 -609 V 0.087 -610 L 0.088 -611 I 0.081 -612 A 0.066 -613 Y 0.052 -614 V 0.047 -615 L 0.052 -616 Y 0.061 -617 K 0.070 -618 K 0.078 -619 K 0.084 -620 L 0.087 -621 F 0.093 -622 W 0.112 -623 K 0.146 -624 I 0.176 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000037260.9_ENSMUST00000037609.8_GN:Hgsnat_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000037260.9_ENSMUST00000037609.8_GN:Hgsnat_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid deleted file mode 100644 index d69dc13fc7d0db77c97905993387f78fcf734f2f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000037260.9_ENSMUST00000037609.8_GN:Hgsnat_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid +++ /dev/null @@ -1,657 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000037260.9|ENSMUST00000037609.8|GN:Hgsnat|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:32 -1 M 0.343 -2 T 0.357 -3 G 0.376 -4 G 0.377 -5 S 0.343 -6 S 0.292 -7 S 0.262 -8 R 0.257 -9 R 0.251 -10 R 0.235 -11 R 0.225 -12 A 0.222 -13 E 0.222 -14 E 0.232 -15 R 0.247 -16 S 0.253 -17 S 0.256 -18 A 0.280 -19 A 0.322 -20 G 0.347 -21 T 0.350 -22 E 0.344 -23 R 0.332 -24 N 0.309 -25 S 0.292 -26 R 0.291 -27 R 0.305 -28 E 0.340 -29 A 0.398 -30 V 0.454 -31 G 0.481 -32 G 0.471 -33 M 0.434 -34 G 0.388 -35 A 0.344 -36 G 0.303 -37 P 0.261 -38 A 0.219 -39 L 0.184 -40 A 0.162 -41 A 0.146 -42 L 0.135 -43 L 0.132 -44 L 0.141 -45 A 0.158 -46 G 0.174 -47 S 0.186 -48 V 0.196 -49 L 0.207 -50 S 0.222 -51 A 0.238 -52 T 0.256 -53 L 0.285 -54 L 0.330 -55 A 0.389 -56 P 0.448 -57 G 0.484 -58 R 0.482 -59 R 0.456 -60 A 0.433 -61 E 0.424 -62 P 0.421 -63 D 0.405 -64 L 0.371 -65 D 0.332 -66 E 0.302 -67 K 0.283 -68 R 0.276 -69 N 0.278 -70 V 0.273 -71 E 0.249 -72 L 0.206 -73 K 0.158 -74 M 0.116 -75 D 0.083 -76 Q 0.058 -77 A 0.042 -78 L 0.034 -79 L 0.032 -80 L 0.033 -81 I 0.036 -82 H 0.040 -83 N 0.045 -84 E 0.050 -85 L 0.061 -86 L 0.075 -87 G 0.084 -88 T 0.078 -89 S 0.060 -90 L 0.041 -91 T 0.029 -92 V 0.025 -93 Y 0.026 -94 W 0.032 -95 K 0.043 -96 S 0.056 -97 D 0.065 -98 D 0.067 -99 C 0.061 -100 Y 0.051 -101 Q 0.043 -102 C 0.040 -103 T 0.041 -104 F 0.043 -105 Q 0.048 -106 P 0.053 -107 L 0.057 -108 A 0.061 -109 N 0.070 -110 V 0.087 -111 S 0.117 -112 H 0.165 -113 G 0.221 -114 G 0.257 -115 K 0.255 -116 P 0.223 -117 A 0.184 -118 K 0.154 -119 P 0.140 -120 S 0.135 -121 V 0.126 -122 A 0.107 -123 P 0.081 -124 V 0.057 -125 S 0.041 -126 V 0.033 -127 S 0.030 -128 T 0.029 -129 Q 0.031 -130 H 0.038 -131 G 0.047 -132 S 0.054 -133 I 0.056 -134 L 0.056 -135 Q 0.058 -136 V 0.064 -137 N 0.072 -138 S 0.083 -139 T 0.094 -140 S 0.103 -141 E 0.109 -142 E 0.111 -143 R 0.107 -144 A 0.096 -145 A 0.080 -146 C 0.064 -147 R 0.052 -148 L 0.045 -149 E 0.041 -150 Y 0.040 -151 K 0.043 -152 F 0.054 -153 G 0.075 -154 E 0.107 -155 F 0.137 -156 G 0.149 -157 N 0.135 -158 Y 0.107 -159 S 0.085 -160 L 0.075 -161 L 0.078 -162 V 0.094 -163 Q 0.125 -164 H 0.164 -165 A 0.204 -166 S 0.236 -167 S 0.256 -168 G 0.262 -169 A 0.252 -170 N 0.228 -171 K 0.191 -172 I 0.151 -173 A 0.119 -174 C 0.100 -175 D 0.092 -176 I 0.088 -177 I 0.091 -178 V 0.107 -179 N 0.134 -180 E 0.167 -181 N 0.196 -182 P 0.212 -183 V 0.208 -184 D 0.186 -185 S 0.158 -186 N 0.134 -187 L 0.116 -188 P 0.100 -189 V 0.087 -190 S 0.079 -191 I 0.079 -192 A 0.090 -193 F 0.108 -194 L 0.128 -195 V 0.144 -196 G 0.154 -197 L 0.153 -198 A 0.140 -199 L 0.122 -200 I 0.104 -201 V 0.087 -202 A 0.074 -203 V 0.066 -204 S 0.064 -205 L 0.065 -206 L 0.069 -207 R 0.079 -208 L 0.095 -209 L 0.117 -210 L 0.141 -211 S 0.163 -212 L 0.180 -213 D 0.193 -214 D 0.200 -215 V 0.200 -216 N 0.191 -217 N 0.179 -218 W 0.170 -219 I 0.166 -220 S 0.163 -221 K 0.162 -222 T 0.171 -223 I 0.190 -224 A 0.211 -225 S 0.228 -226 R 0.245 -227 E 0.262 -228 T 0.275 -229 D 0.281 -230 R 0.282 -231 L 0.282 -232 I 0.287 -233 N 0.308 -234 S 0.344 -235 E 0.386 -236 L 0.430 -237 G 0.480 -238 S 0.536 -239 P 0.591 -240 S 0.632 -241 R 0.652 -242 A 0.657 -243 D 0.660 -244 P 0.667 -245 L 0.679 -246 S 0.689 -247 A 0.684 -248 D 0.659 -249 Y 0.628 -250 Q 0.617 -251 P 0.631 -252 E 0.655 -253 T 0.671 -254 R 0.673 -255 R 0.662 -256 S 0.636 -257 S 0.582 -258 A 0.493 -259 N 0.377 -260 R 0.262 -261 L 0.167 -262 R 0.103 -263 C 0.067 -264 V 0.052 -265 D 0.051 -266 T 0.058 -267 F 0.068 -268 R 0.075 -269 G 0.077 -270 L 0.077 -271 A 0.080 -272 L 0.082 -273 V 0.080 -274 L 0.075 -275 M 0.074 -276 V 0.076 -277 F 0.085 -278 V 0.101 -279 N 0.121 -280 Y 0.143 -281 G 0.168 -282 G 0.193 -283 G 0.207 -284 K 0.204 -285 Y 0.191 -286 W 0.182 -287 Y 0.183 -288 F 0.187 -289 K 0.184 -290 H 0.169 -291 S 0.144 -292 S 0.118 -293 W 0.096 -294 N 0.080 -295 G 0.073 -296 L 0.073 -297 T 0.083 -298 V 0.106 -299 A 0.142 -300 D 0.181 -301 L 0.208 -302 V 0.206 -303 F 0.179 -304 P 0.155 -305 W 0.149 -306 F 0.145 -307 V 0.123 -308 F 0.098 -309 I 0.087 -310 M 0.087 -311 G 0.088 -312 T 0.085 -313 S 0.079 -314 I 0.070 -315 F 0.060 -316 L 0.054 -317 S 0.052 -318 M 0.053 -319 T 0.059 -320 S 0.069 -321 I 0.078 -322 L 0.090 -323 Q 0.109 -324 R 0.131 -325 G 0.142 -326 C 0.128 -327 S 0.096 -328 K 0.064 -329 L 0.047 -330 K 0.043 -331 L 0.042 -332 L 0.040 -333 G 0.038 -334 K 0.039 -335 I 0.045 -336 V 0.057 -337 W 0.074 -338 R 0.093 -339 S 0.099 -340 F 0.090 -341 L 0.081 -342 L 0.079 -343 I 0.078 -344 C 0.076 -345 I 0.078 -346 G 0.089 -347 V 0.105 -348 I 0.124 -349 I 0.149 -350 V 0.181 -351 N 0.217 -352 P 0.246 -353 N 0.266 -354 Y 0.278 -355 C 0.284 -356 L 0.289 -357 G 0.291 -358 P 0.280 -359 L 0.256 -360 S 0.225 -361 W 0.198 -362 D 0.178 -363 K 0.163 -364 V 0.147 -365 R 0.134 -366 I 0.122 -367 P 0.109 -368 G 0.101 -369 V 0.106 -370 L 0.125 -371 Q 0.150 -372 R 0.173 -373 L 0.182 -374 G 0.170 -375 V 0.146 -376 T 0.119 -377 Y 0.096 -378 F 0.077 -379 V 0.063 -380 V 0.056 -381 A 0.053 -382 V 0.050 -383 L 0.048 -384 E 0.046 -385 F 0.046 -386 F 0.050 -387 F 0.062 -388 W 0.087 -389 K 0.126 -390 P 0.174 -391 V 0.224 -392 P 0.272 -393 D 0.311 -394 S 0.334 -395 C 0.338 -396 T 0.336 -397 L 0.334 -398 E 0.330 -399 S 0.315 -400 S 0.292 -401 C 0.265 -402 F 0.233 -403 S 0.191 -404 L 0.148 -405 R 0.118 -406 D 0.102 -407 I 0.095 -408 T 0.093 -409 S 0.092 -410 S 0.083 -411 W 0.069 -412 P 0.058 -413 Q 0.054 -414 W 0.055 -415 L 0.061 -416 T 0.068 -417 I 0.071 -418 L 0.069 -419 T 0.066 -420 L 0.067 -421 E 0.069 -422 S 0.070 -423 I 0.068 -424 W 0.064 -425 L 0.062 -426 A 0.065 -427 L 0.074 -428 T 0.083 -429 F 0.093 -430 F 0.110 -431 L 0.137 -432 P 0.163 -433 V 0.182 -434 P 0.193 -435 G 0.201 -436 C 0.210 -437 P 0.228 -438 T 0.250 -439 G 0.264 -440 Y 0.267 -441 L 0.266 -442 G 0.267 -443 P 0.274 -444 G 0.283 -445 G 0.285 -446 I 0.274 -447 G 0.258 -448 D 0.246 -449 L 0.239 -450 G 0.236 -451 K 0.236 -452 Y 0.232 -453 P 0.227 -454 H 0.231 -455 C 0.249 -456 T 0.276 -457 G 0.298 -458 G 0.300 -459 A 0.275 -460 A 0.243 -461 G 0.226 -462 Y 0.217 -463 I 0.200 -464 D 0.174 -465 R 0.153 -466 L 0.152 -467 L 0.167 -468 L 0.183 -469 G 0.187 -470 D 0.179 -471 N 0.164 -472 H 0.149 -473 L 0.146 -474 Y 0.160 -475 Q 0.183 -476 H 0.200 -477 P 0.201 -478 S 0.189 -479 S 0.172 -480 T 0.153 -481 V 0.136 -482 L 0.124 -483 Y 0.119 -484 H 0.122 -485 T 0.133 -486 E 0.155 -487 V 0.185 -488 A 0.212 -489 Y 0.229 -490 D 0.238 -491 P 0.249 -492 E 0.264 -493 G 0.276 -494 V 0.282 -495 L 0.292 -496 G 0.309 -497 T 0.322 -498 I 0.319 -499 N 0.300 -500 S 0.270 -501 I 0.234 -502 V 0.201 -503 M 0.172 -504 A 0.141 -505 F 0.114 -506 L 0.098 -507 G 0.089 -508 V 0.086 -509 Q 0.088 -510 A 0.091 -511 G 0.088 -512 K 0.082 -513 I 0.077 -514 L 0.073 -515 V 0.071 -516 Y 0.071 -517 Y 0.074 -518 K 0.079 -519 D 0.082 -520 Q 0.079 -521 T 0.069 -522 K 0.055 -523 A 0.045 -524 I 0.037 -525 L 0.032 -526 T 0.029 -527 R 0.029 -528 F 0.031 -529 A 0.035 -530 A 0.037 -531 W 0.037 -532 C 0.038 -533 C 0.042 -534 I 0.049 -535 L 0.058 -536 G 0.067 -537 L 0.072 -538 I 0.073 -539 S 0.075 -540 I 0.080 -541 V 0.092 -542 L 0.111 -543 T 0.126 -544 K 0.133 -545 V 0.139 -546 S 0.152 -547 A 0.168 -548 N 0.188 -549 E 0.210 -550 G 0.226 -551 F 0.233 -552 I 0.233 -553 P 0.223 -554 I 0.200 -555 N 0.169 -556 K 0.148 -557 N 0.146 -558 L 0.157 -559 W 0.173 -560 S 0.183 -561 I 0.190 -562 S 0.205 -563 Y 0.231 -564 V 0.245 -565 T 0.234 -566 T 0.216 -567 L 0.204 -568 S 0.186 -569 C 0.158 -570 F 0.131 -571 A 0.111 -572 F 0.099 -573 F 0.093 -574 I 0.092 -575 L 0.089 -576 L 0.082 -577 I 0.073 -578 L 0.064 -579 Y 0.059 -580 P 0.058 -581 V 0.063 -582 V 0.079 -583 D 0.097 -584 V 0.110 -585 K 0.112 -586 G 0.107 -587 L 0.099 -588 W 0.092 -589 T 0.090 -590 G 0.090 -591 T 0.086 -592 P 0.080 -593 F 0.082 -594 F 0.095 -595 Y 0.118 -596 P 0.144 -597 G 0.160 -598 M 0.158 -599 N 0.146 -600 S 0.129 -601 I 0.109 -602 L 0.090 -603 V 0.078 -604 Y 0.071 -605 V 0.066 -606 G 0.065 -607 H 0.067 -608 E 0.067 -609 V 0.067 -610 L 0.070 -611 E 0.078 -612 N 0.086 -613 Y 0.091 -614 F 0.094 -615 P 0.102 -616 F 0.118 -617 Q 0.142 -618 W 0.169 -619 K 0.199 -620 L 0.235 -621 A 0.270 -622 D 0.284 -623 E 0.266 -624 Q 0.226 -625 S 0.180 -626 H 0.139 -627 K 0.112 -628 E 0.100 -629 H 0.097 -630 L 0.098 -631 I 0.110 -632 Q 0.127 -633 N 0.138 -634 I 0.135 -635 V 0.131 -636 A 0.129 -637 T 0.121 -638 A 0.105 -639 L 0.089 -640 W 0.084 -641 V 0.087 -642 L 0.088 -643 I 0.081 -644 A 0.066 -645 Y 0.052 -646 V 0.048 -647 L 0.052 -648 Y 0.061 -649 K 0.070 -650 K 0.078 -651 K 0.083 -652 L 0.086 -653 F 0.093 -654 W 0.112 -655 K 0.145 -656 I 0.173 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000038286.12_ENSMUST00000040656.8_GN:Bphl_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000038286.12_ENSMUST00000040656.8_GN:Bphl_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index d47cd70627c454c5e75115af297171c24c5c9ac5..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000038286.12_ENSMUST00000040656.8_GN:Bphl_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,292 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000038286.12|ENSMUST00000040656.8|GN:Bphl|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.363 -2 A 0.362 -3 T 0.381 -4 A 0.424 -5 T 0.464 -6 V 0.483 -7 R 0.486 -8 P 0.478 -9 A 0.452 -10 A 0.413 -11 Q 0.393 -12 R 0.405 -13 L 0.425 -14 R 0.434 -15 L 0.436 -16 L 0.439 -17 L 0.447 -18 S 0.466 -19 P 0.491 -20 L 0.507 -21 K 0.508 -22 S 0.507 -23 R 0.514 -24 I 0.526 -25 C 0.542 -26 V 0.560 -27 P 0.579 -28 Q 0.594 -29 A 0.604 -30 E 0.607 -31 P 0.604 -32 V 0.590 -33 A 0.560 -34 T 0.523 -35 F 0.485 -36 G 0.441 -37 T 0.377 -38 A 0.292 -39 V 0.202 -40 T 0.129 -41 S 0.081 -42 A 0.055 -43 K 0.041 -44 V 0.035 -45 A 0.036 -46 V 0.041 -47 N 0.049 -48 G 0.056 -49 V 0.056 -50 H 0.049 -51 L 0.039 -52 H 0.032 -53 Y 0.031 -54 Q 0.038 -55 R 0.051 -56 V 0.071 -57 G 0.090 -58 E 0.101 -59 G 0.098 -60 E 0.088 -61 H 0.085 -62 A 0.094 -63 I 0.108 -64 L 0.121 -65 L 0.129 -66 L 0.129 -67 P 0.121 -68 G 0.110 -69 M 0.100 -70 L 0.092 -71 G 0.082 -72 S 0.071 -73 G 0.067 -74 K 0.073 -75 T 0.082 -76 D 0.085 -77 F 0.080 -78 A 0.072 -79 P 0.066 -80 Q 0.063 -81 L 0.063 -82 Q 0.065 -83 S 0.067 -84 L 0.067 -85 N 0.064 -86 K 0.059 -87 K 0.056 -88 R 0.051 -89 F 0.045 -90 T 0.038 -91 L 0.033 -92 V 0.031 -93 A 0.037 -94 W 0.051 -95 D 0.071 -96 P 0.084 -97 R 0.084 -98 G 0.076 -99 Y 0.068 -100 G 0.065 -101 Y 0.061 -102 S 0.054 -103 R 0.052 -104 P 0.065 -105 P 0.095 -106 D 0.128 -107 R 0.150 -108 D 0.156 -109 F 0.151 -110 P 0.140 -111 R 0.122 -112 D 0.095 -113 F 0.068 -114 F 0.048 -115 E 0.037 -116 R 0.034 -117 D 0.036 -118 A 0.039 -119 K 0.041 -120 D 0.041 -121 A 0.041 -122 V 0.041 -123 D 0.039 -124 L 0.035 -125 M 0.031 -126 K 0.031 -127 A 0.034 -128 L 0.038 -129 Q 0.041 -130 F 0.042 -131 K 0.040 -132 Q 0.038 -133 V 0.039 -134 S 0.041 -135 L 0.044 -136 L 0.044 -137 G 0.044 -138 W 0.048 -139 S 0.059 -140 D 0.070 -141 G 0.073 -142 G 0.073 -143 I 0.072 -144 T 0.070 -145 A 0.066 -146 L 0.062 -147 I 0.058 -148 A 0.055 -149 A 0.048 -150 A 0.039 -151 K 0.030 -152 Y 0.026 -153 P 0.026 -154 S 0.029 -155 Y 0.035 -156 I 0.041 -157 R 0.047 -158 K 0.053 -159 M 0.059 -160 V 0.062 -161 I 0.060 -162 W 0.062 -163 G 0.073 -164 A 0.089 -165 N 0.098 -166 A 0.101 -167 Y 0.098 -168 V 0.088 -169 T 0.076 -170 E 0.069 -171 E 0.069 -172 D 0.074 -173 S 0.084 -174 R 0.092 -175 I 0.093 -176 Y 0.089 -177 Q 0.084 -178 G 0.077 -179 I 0.067 -180 R 0.059 -181 D 0.058 -182 V 0.063 -183 S 0.073 -184 K 0.084 -185 W 0.086 -186 S 0.075 -187 E 0.058 -188 K 0.043 -189 A 0.035 -190 R 0.033 -191 K 0.035 -192 P 0.039 -193 L 0.043 -194 E 0.046 -195 A 0.050 -196 L 0.055 -197 Y 0.063 -198 G 0.066 -199 Y 0.059 -200 D 0.048 -201 Y 0.043 -202 L 0.044 -203 A 0.046 -204 K 0.049 -205 T 0.053 -206 C 0.059 -207 E 0.062 -208 D 0.063 -209 W 0.066 -210 V 0.070 -211 D 0.073 -212 G 0.075 -213 I 0.076 -214 S 0.072 -215 Q 0.062 -216 F 0.052 -217 K 0.049 -218 Q 0.050 -219 L 0.054 -220 P 0.061 -221 E 0.072 -222 G 0.081 -223 N 0.084 -224 I 0.078 -225 C 0.069 -226 R 0.061 -227 H 0.055 -228 L 0.051 -229 L 0.049 -230 P 0.050 -231 L 0.052 -232 V 0.056 -233 Q 0.062 -234 C 0.072 -235 P 0.083 -236 T 0.090 -237 L 0.093 -238 I 0.092 -239 V 0.088 -240 H 0.081 -241 G 0.076 -242 E 0.076 -243 K 0.080 -244 D 0.082 -245 P 0.077 -246 L 0.066 -247 V 0.056 -248 P 0.048 -249 R 0.041 -250 F 0.037 -251 H 0.038 -252 A 0.042 -253 D 0.046 -254 F 0.052 -255 L 0.064 -256 L 0.079 -257 Q 0.086 -258 H 0.082 -259 V 0.075 -260 K 0.075 -261 G 0.080 -262 S 0.082 -263 R 0.077 -264 L 0.074 -265 H 0.080 -266 L 0.092 -267 M 0.102 -268 P 0.102 -269 E 0.090 -270 G 0.072 -271 K 0.061 -272 H 0.061 -273 N 0.065 -274 L 0.065 -275 H 0.059 -276 L 0.052 -277 R 0.045 -278 F 0.039 -279 A 0.035 -280 D 0.033 -281 E 0.034 -282 F 0.041 -283 N 0.053 -284 R 0.060 -285 L 0.056 -286 V 0.046 -287 E 0.041 -288 D 0.041 -289 F 0.047 -290 L 0.061 -291 Q 0.075 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000038286.12_ENSMUST00000040656.8_GN:Bphl_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000038286.12_ENSMUST00000040656.8_GN:Bphl_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid deleted file mode 100644 index 32cc075efffdfbd8377de8878098ef925c1dcb3e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000038286.12_ENSMUST00000040656.8_GN:Bphl_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid +++ /dev/null @@ -1,300 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000038286.12|ENSMUST00000040656.8|GN:Bphl|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:8 -1 M 0.407 -2 E 0.423 -3 L 0.449 -4 V 0.482 -5 R 0.522 -6 P 0.566 -7 G 0.608 -8 A 0.631 -9 M 0.614 -10 A 0.563 -11 T 0.523 -12 A 0.519 -13 T 0.526 -14 V 0.517 -15 R 0.502 -16 P 0.491 -17 A 0.474 -18 A 0.446 -19 Q 0.435 -20 R 0.457 -21 L 0.487 -22 R 0.502 -23 L 0.501 -24 L 0.491 -25 L 0.483 -26 S 0.489 -27 P 0.504 -28 L 0.512 -29 K 0.510 -30 S 0.510 -31 R 0.521 -32 I 0.536 -33 C 0.553 -34 V 0.570 -35 P 0.588 -36 Q 0.601 -37 A 0.610 -38 E 0.614 -39 P 0.613 -40 V 0.601 -41 A 0.574 -42 T 0.535 -43 F 0.493 -44 G 0.447 -45 T 0.381 -46 A 0.295 -47 V 0.204 -48 T 0.130 -49 S 0.082 -50 A 0.054 -51 K 0.040 -52 V 0.034 -53 A 0.035 -54 V 0.040 -55 N 0.048 -56 G 0.055 -57 V 0.055 -58 H 0.048 -59 L 0.038 -60 H 0.031 -61 Y 0.031 -62 Q 0.038 -63 R 0.051 -64 V 0.070 -65 G 0.090 -66 E 0.101 -67 G 0.097 -68 E 0.087 -69 H 0.083 -70 A 0.092 -71 I 0.106 -72 L 0.118 -73 L 0.126 -74 L 0.127 -75 P 0.119 -76 G 0.108 -77 M 0.098 -78 L 0.090 -79 G 0.079 -80 S 0.068 -81 G 0.065 -82 K 0.071 -83 T 0.080 -84 D 0.083 -85 F 0.078 -86 A 0.070 -87 P 0.064 -88 Q 0.062 -89 L 0.062 -90 Q 0.064 -91 S 0.066 -92 L 0.067 -93 N 0.064 -94 K 0.059 -95 K 0.055 -96 R 0.051 -97 F 0.045 -98 T 0.038 -99 L 0.033 -100 V 0.031 -101 A 0.036 -102 W 0.051 -103 D 0.070 -104 P 0.083 -105 R 0.083 -106 G 0.074 -107 Y 0.067 -108 G 0.063 -109 Y 0.060 -110 S 0.053 -111 R 0.051 -112 P 0.064 -113 P 0.094 -114 D 0.127 -115 R 0.149 -116 D 0.156 -117 F 0.151 -118 P 0.140 -119 R 0.122 -120 D 0.095 -121 F 0.067 -122 F 0.047 -123 E 0.037 -124 R 0.034 -125 D 0.035 -126 A 0.039 -127 K 0.041 -128 D 0.041 -129 A 0.041 -130 V 0.041 -131 D 0.039 -132 L 0.035 -133 M 0.031 -134 K 0.031 -135 A 0.033 -136 L 0.038 -137 Q 0.041 -138 F 0.042 -139 K 0.040 -140 Q 0.039 -141 V 0.040 -142 S 0.042 -143 L 0.044 -144 L 0.044 -145 G 0.044 -146 W 0.049 -147 S 0.060 -148 D 0.070 -149 G 0.074 -150 G 0.073 -151 I 0.072 -152 T 0.070 -153 A 0.066 -154 L 0.062 -155 I 0.058 -156 A 0.055 -157 A 0.048 -158 A 0.038 -159 K 0.030 -160 Y 0.026 -161 P 0.026 -162 S 0.029 -163 Y 0.035 -164 I 0.041 -165 R 0.047 -166 K 0.053 -167 M 0.059 -168 V 0.062 -169 I 0.060 -170 W 0.062 -171 G 0.073 -172 A 0.089 -173 N 0.099 -174 A 0.102 -175 Y 0.098 -176 V 0.088 -177 T 0.076 -178 E 0.069 -179 E 0.069 -180 D 0.075 -181 S 0.085 -182 R 0.093 -183 I 0.094 -184 Y 0.089 -185 Q 0.084 -186 G 0.078 -187 I 0.068 -188 R 0.060 -189 D 0.058 -190 V 0.063 -191 S 0.073 -192 K 0.084 -193 W 0.086 -194 S 0.075 -195 E 0.057 -196 K 0.043 -197 A 0.035 -198 R 0.033 -199 K 0.035 -200 P 0.038 -201 L 0.042 -202 E 0.045 -203 A 0.049 -204 L 0.054 -205 Y 0.062 -206 G 0.064 -207 Y 0.058 -208 D 0.048 -209 Y 0.043 -210 L 0.044 -211 A 0.046 -212 K 0.048 -213 T 0.053 -214 C 0.059 -215 E 0.062 -216 D 0.063 -217 W 0.066 -218 V 0.070 -219 D 0.072 -220 G 0.074 -221 I 0.075 -222 S 0.071 -223 Q 0.061 -224 F 0.052 -225 K 0.049 -226 Q 0.050 -227 L 0.054 -228 P 0.061 -229 E 0.072 -230 G 0.081 -231 N 0.083 -232 I 0.077 -233 C 0.068 -234 R 0.060 -235 H 0.054 -236 L 0.050 -237 L 0.049 -238 P 0.050 -239 L 0.052 -240 V 0.055 -241 Q 0.062 -242 C 0.072 -243 P 0.083 -244 T 0.090 -245 L 0.093 -246 I 0.093 -247 V 0.088 -248 H 0.081 -249 G 0.076 -250 E 0.076 -251 K 0.080 -252 D 0.082 -253 P 0.077 -254 L 0.066 -255 V 0.056 -256 P 0.048 -257 R 0.041 -258 F 0.037 -259 H 0.038 -260 A 0.042 -261 D 0.046 -262 F 0.052 -263 L 0.065 -264 L 0.079 -265 Q 0.087 -266 H 0.082 -267 V 0.075 -268 K 0.075 -269 G 0.081 -270 S 0.082 -271 R 0.077 -272 L 0.074 -273 H 0.080 -274 L 0.092 -275 M 0.103 -276 P 0.103 -277 E 0.091 -278 G 0.073 -279 K 0.062 -280 H 0.062 -281 N 0.066 -282 L 0.065 -283 H 0.060 -284 L 0.052 -285 R 0.045 -286 F 0.039 -287 A 0.035 -288 D 0.033 -289 E 0.034 -290 F 0.041 -291 N 0.053 -292 R 0.061 -293 L 0.056 -294 V 0.047 -295 E 0.041 -296 D 0.041 -297 F 0.048 -298 L 0.061 -299 Q 0.075 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000038642.11_ENSMUST00000015667.9_GN:Ctss_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000038642.11_ENSMUST00000015667.9_GN:Ctss_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 4763269201b928a71074f92d68d3a0dbb7a9bd4b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000038642.11_ENSMUST00000015667.9_GN:Ctss_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,342 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000038642.11|ENSMUST00000015667.9|GN:Ctss|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.396 -2 R 0.415 -3 A 0.444 -4 P 0.453 -5 G 0.420 -6 H 0.373 -7 A 0.368 -8 A 0.393 -9 I 0.387 -10 R 0.343 -11 R 0.312 -12 W 0.314 -13 L 0.322 -14 F 0.330 -15 W 0.355 -16 M 0.387 -17 P 0.406 -18 L 0.424 -19 V 0.462 -20 C 0.504 -21 S 0.529 -22 V 0.535 -23 A 0.528 -24 M 0.502 -25 E 0.453 -26 Q 0.389 -27 L 0.322 -28 Q 0.260 -29 R 0.204 -30 D 0.152 -31 P 0.105 -32 T 0.068 -33 L 0.045 -34 D 0.033 -35 Y 0.027 -36 H 0.024 -37 W 0.022 -38 D 0.021 -39 L 0.021 -40 W 0.022 -41 K 0.024 -42 K 0.028 -43 T 0.032 -44 H 0.038 -45 E 0.047 -46 K 0.061 -47 E 0.077 -48 Y 0.090 -49 K 0.095 -50 D 0.097 -51 K 0.099 -52 N 0.099 -53 E 0.094 -54 E 0.083 -55 E 0.072 -56 V 0.066 -57 R 0.065 -58 R 0.066 -59 L 0.072 -60 I 0.082 -61 W 0.088 -62 E 0.081 -63 K 0.071 -64 N 0.064 -65 L 0.060 -66 K 0.058 -67 F 0.057 -68 I 0.058 -69 M 0.058 -70 I 0.061 -71 H 0.063 -72 N 0.065 -73 L 0.067 -74 E 0.071 -75 Y 0.078 -76 S 0.086 -77 M 0.096 -78 G 0.104 -79 M 0.106 -80 H 0.100 -81 T 0.091 -82 Y 0.089 -83 Q 0.095 -84 V 0.104 -85 G 0.110 -86 M 0.109 -87 N 0.103 -88 D 0.097 -89 M 0.093 -90 G 0.089 -91 D 0.085 -92 M 0.081 -93 T 0.078 -94 N 0.074 -95 E 0.070 -96 E 0.064 -97 I 0.059 -98 L 0.057 -99 C 0.064 -100 R 0.080 -101 M 0.105 -102 G 0.134 -103 A 0.159 -104 L 0.176 -105 R 0.192 -106 I 0.212 -107 P 0.232 -108 R 0.248 -109 Q 0.259 -110 S 0.263 -111 P 0.251 -112 K 0.229 -113 T 0.208 -114 V 0.191 -115 T 0.179 -116 F 0.169 -117 R 0.162 -118 S 0.157 -119 Y 0.153 -120 S 0.150 -121 N 0.144 -122 R 0.135 -123 T 0.125 -124 L 0.116 -125 P 0.108 -126 D 0.099 -127 T 0.090 -128 V 0.080 -129 D 0.069 -130 W 0.066 -131 R 0.073 -132 E 0.085 -133 K 0.092 -134 G 0.099 -135 C 0.110 -136 V 0.120 -137 T 0.122 -138 E 0.120 -139 V 0.116 -140 K 0.110 -141 Y 0.107 -142 Q 0.110 -143 G 0.116 -144 S 0.121 -145 C 0.119 -146 G 0.113 -147 A 0.111 -148 C 0.120 -149 W 0.132 -150 A 0.138 -151 F 0.138 -152 S 0.135 -153 A 0.130 -154 V 0.120 -155 G 0.107 -156 A 0.094 -157 L 0.081 -158 E 0.071 -159 G 0.064 -160 Q 0.060 -161 L 0.057 -162 K 0.055 -163 L 0.054 -164 K 0.057 -165 T 0.065 -166 G 0.075 -167 K 0.082 -168 L 0.083 -169 I 0.078 -170 S 0.074 -171 L 0.073 -172 S 0.070 -173 A 0.063 -174 Q 0.057 -175 N 0.055 -176 L 0.058 -177 V 0.058 -178 D 0.059 -179 C 0.064 -180 S 0.078 -181 N 0.103 -182 E 0.131 -183 E 0.154 -184 K 0.172 -185 Y 0.189 -186 G 0.203 -187 N 0.204 -188 K 0.192 -189 G 0.178 -190 C 0.172 -191 G 0.169 -192 G 0.162 -193 G 0.149 -194 Y 0.129 -195 M 0.109 -196 T 0.094 -197 E 0.085 -198 A 0.076 -199 F 0.068 -200 Q 0.062 -201 Y 0.060 -202 I 0.061 -203 I 0.067 -204 D 0.084 -205 N 0.111 -206 G 0.138 -207 G 0.150 -208 I 0.144 -209 E 0.125 -210 A 0.102 -211 D 0.082 -212 A 0.070 -213 S 0.063 -214 Y 0.060 -215 P 0.060 -216 Y 0.061 -217 K 0.066 -218 A 0.073 -219 T 0.082 -220 D 0.090 -221 E 0.096 -222 K 0.099 -223 C 0.099 -224 H 0.101 -225 Y 0.104 -226 N 0.104 -227 S 0.104 -228 K 0.106 -229 N 0.109 -230 R 0.110 -231 A 0.106 -232 A 0.099 -233 T 0.089 -234 C 0.077 -235 S 0.065 -236 R 0.057 -237 Y 0.056 -238 I 0.065 -239 Q 0.082 -240 L 0.105 -241 P 0.126 -242 F 0.134 -243 G 0.126 -244 D 0.107 -245 E 0.088 -246 D 0.073 -247 A 0.064 -248 L 0.057 -249 K 0.052 -250 E 0.048 -251 A 0.045 -252 V 0.042 -253 A 0.040 -254 T 0.039 -255 K 0.040 -256 G 0.042 -257 P 0.043 -258 V 0.043 -259 S 0.044 -260 V 0.047 -261 G 0.054 -262 I 0.061 -263 D 0.064 -264 A 0.064 -265 S 0.064 -266 H 0.063 -267 S 0.061 -268 S 0.057 -269 F 0.052 -270 F 0.049 -271 F 0.046 -272 Y 0.047 -273 K 0.056 -274 S 0.074 -275 G 0.092 -276 V 0.101 -277 Y 0.101 -278 D 0.100 -279 D 0.099 -280 P 0.097 -281 S 0.098 -282 C 0.104 -283 T 0.112 -284 G 0.116 -285 N 0.108 -286 V 0.089 -287 N 0.068 -288 H 0.053 -289 G 0.046 -290 V 0.045 -291 L 0.044 -292 V 0.044 -293 V 0.046 -294 G 0.049 -295 Y 0.053 -296 G 0.055 -297 T 0.056 -298 L 0.061 -299 D 0.070 -300 G 0.075 -301 K 0.068 -302 D 0.051 -303 Y 0.035 -304 W 0.028 -305 L 0.029 -306 V 0.032 -307 K 0.037 -308 N 0.043 -309 S 0.050 -310 W 0.058 -311 G 0.068 -312 L 0.079 -313 N 0.088 -314 F 0.090 -315 G 0.090 -316 D 0.090 -317 Q 0.090 -318 G 0.084 -319 Y 0.074 -320 I 0.069 -321 R 0.073 -322 M 0.087 -323 A 0.103 -324 R 0.116 -325 N 0.127 -326 N 0.136 -327 K 0.136 -328 N 0.129 -329 H 0.123 -330 C 0.129 -331 G 0.138 -332 I 0.139 -333 A 0.126 -334 S 0.111 -335 Y 0.097 -336 C 0.086 -337 S 0.076 -338 Y 0.070 -339 P 0.072 -340 E 0.080 -341 I 0.088 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000038642.11_ENSMUST00000015667.9_GN:Ctss_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000038642.11_ENSMUST00000015667.9_GN:Ctss_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid deleted file mode 100644 index 46b1d7e8e3319f61aa6993a70ca5286387296419..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000038642.11_ENSMUST00000015667.9_GN:Ctss_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid +++ /dev/null @@ -1,344 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000038642.11|ENSMUST00000015667.9|GN:Ctss|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:2 -1 M 0.389 -2 T 0.399 -3 M 0.422 -4 R 0.461 -5 A 0.505 -6 P 0.534 -7 G 0.528 -8 H 0.492 -9 A 0.456 -10 A 0.432 -11 I 0.394 -12 R 0.337 -13 R 0.305 -14 W 0.308 -15 L 0.317 -16 F 0.326 -17 W 0.352 -18 M 0.387 -19 P 0.409 -20 L 0.428 -21 V 0.464 -22 C 0.505 -23 S 0.527 -24 V 0.530 -25 A 0.520 -26 M 0.494 -27 E 0.446 -28 Q 0.384 -29 L 0.319 -30 Q 0.257 -31 R 0.202 -32 D 0.151 -33 P 0.104 -34 T 0.068 -35 L 0.044 -36 D 0.032 -37 Y 0.027 -38 H 0.023 -39 W 0.022 -40 D 0.021 -41 L 0.021 -42 W 0.022 -43 K 0.024 -44 K 0.028 -45 T 0.032 -46 H 0.038 -47 E 0.047 -48 K 0.061 -49 E 0.076 -50 Y 0.089 -51 K 0.095 -52 D 0.097 -53 K 0.098 -54 N 0.099 -55 E 0.094 -56 E 0.083 -57 E 0.072 -58 V 0.066 -59 R 0.064 -60 R 0.065 -61 L 0.071 -62 I 0.082 -63 W 0.087 -64 E 0.081 -65 K 0.070 -66 N 0.063 -67 L 0.060 -68 K 0.057 -69 F 0.057 -70 I 0.057 -71 M 0.058 -72 I 0.060 -73 H 0.063 -74 N 0.065 -75 L 0.067 -76 E 0.070 -77 Y 0.077 -78 S 0.086 -79 M 0.095 -80 G 0.103 -81 M 0.106 -82 H 0.100 -83 T 0.091 -84 Y 0.089 -85 Q 0.095 -86 V 0.104 -87 G 0.110 -88 M 0.109 -89 N 0.103 -90 D 0.097 -91 M 0.093 -92 G 0.089 -93 D 0.085 -94 M 0.081 -95 T 0.077 -96 N 0.074 -97 E 0.070 -98 E 0.064 -99 I 0.059 -100 L 0.057 -101 C 0.064 -102 R 0.079 -103 M 0.105 -104 G 0.134 -105 A 0.158 -106 L 0.175 -107 R 0.191 -108 I 0.211 -109 P 0.232 -110 R 0.248 -111 Q 0.259 -112 S 0.263 -113 P 0.251 -114 K 0.229 -115 T 0.208 -116 V 0.191 -117 T 0.179 -118 F 0.169 -119 R 0.162 -120 S 0.157 -121 Y 0.153 -122 S 0.150 -123 N 0.144 -124 R 0.135 -125 T 0.125 -126 L 0.116 -127 P 0.108 -128 D 0.099 -129 T 0.090 -130 V 0.079 -131 D 0.069 -132 W 0.066 -133 R 0.073 -134 E 0.085 -135 K 0.092 -136 G 0.099 -137 C 0.110 -138 V 0.120 -139 T 0.122 -140 E 0.120 -141 V 0.116 -142 K 0.110 -143 Y 0.107 -144 Q 0.110 -145 G 0.116 -146 S 0.121 -147 C 0.119 -148 G 0.113 -149 A 0.111 -150 C 0.120 -151 W 0.132 -152 A 0.138 -153 F 0.137 -154 S 0.135 -155 A 0.130 -156 V 0.120 -157 G 0.107 -158 A 0.094 -159 L 0.081 -160 E 0.071 -161 G 0.064 -162 Q 0.060 -163 L 0.057 -164 K 0.055 -165 L 0.054 -166 K 0.057 -167 T 0.065 -168 G 0.075 -169 K 0.082 -170 L 0.083 -171 I 0.078 -172 S 0.074 -173 L 0.073 -174 S 0.071 -175 A 0.063 -176 Q 0.057 -177 N 0.055 -178 L 0.058 -179 V 0.058 -180 D 0.059 -181 C 0.064 -182 S 0.078 -183 N 0.103 -184 E 0.131 -185 E 0.154 -186 K 0.172 -187 Y 0.189 -188 G 0.203 -189 N 0.204 -190 K 0.192 -191 G 0.178 -192 C 0.172 -193 G 0.169 -194 G 0.162 -195 G 0.148 -196 Y 0.129 -197 M 0.109 -198 T 0.094 -199 E 0.085 -200 A 0.076 -201 F 0.068 -202 Q 0.062 -203 Y 0.060 -204 I 0.061 -205 I 0.067 -206 D 0.084 -207 N 0.111 -208 G 0.138 -209 G 0.150 -210 I 0.144 -211 E 0.125 -212 A 0.102 -213 D 0.082 -214 A 0.070 -215 S 0.063 -216 Y 0.060 -217 P 0.060 -218 Y 0.061 -219 K 0.065 -220 A 0.073 -221 T 0.082 -222 D 0.090 -223 E 0.096 -224 K 0.099 -225 C 0.099 -226 H 0.101 -227 Y 0.103 -228 N 0.104 -229 S 0.104 -230 K 0.106 -231 N 0.109 -232 R 0.110 -233 A 0.106 -234 A 0.099 -235 T 0.089 -236 C 0.077 -237 S 0.065 -238 R 0.057 -239 Y 0.056 -240 I 0.065 -241 Q 0.082 -242 L 0.105 -243 P 0.126 -244 F 0.134 -245 G 0.126 -246 D 0.107 -247 E 0.088 -248 D 0.073 -249 A 0.064 -250 L 0.057 -251 K 0.052 -252 E 0.048 -253 A 0.045 -254 V 0.042 -255 A 0.040 -256 T 0.039 -257 K 0.040 -258 G 0.042 -259 P 0.043 -260 V 0.044 -261 S 0.044 -262 V 0.047 -263 G 0.054 -264 I 0.061 -265 D 0.065 -266 A 0.064 -267 S 0.064 -268 H 0.063 -269 S 0.061 -270 S 0.057 -271 F 0.052 -272 F 0.049 -273 F 0.046 -274 Y 0.047 -275 K 0.056 -276 S 0.074 -277 G 0.092 -278 V 0.101 -279 Y 0.101 -280 D 0.100 -281 D 0.099 -282 P 0.097 -283 S 0.098 -284 C 0.104 -285 T 0.112 -286 G 0.116 -287 N 0.108 -288 V 0.089 -289 N 0.068 -290 H 0.053 -291 G 0.046 -292 V 0.045 -293 L 0.044 -294 V 0.044 -295 V 0.046 -296 G 0.049 -297 Y 0.053 -298 G 0.055 -299 T 0.056 -300 L 0.061 -301 D 0.070 -302 G 0.075 -303 K 0.068 -304 D 0.051 -305 Y 0.035 -306 W 0.028 -307 L 0.029 -308 V 0.032 -309 K 0.037 -310 N 0.043 -311 S 0.050 -312 W 0.058 -313 G 0.068 -314 L 0.079 -315 N 0.088 -316 F 0.090 -317 G 0.090 -318 D 0.091 -319 Q 0.090 -320 G 0.084 -321 Y 0.074 -322 I 0.069 -323 R 0.073 -324 M 0.087 -325 A 0.103 -326 R 0.117 -327 N 0.128 -328 N 0.136 -329 K 0.136 -330 N 0.129 -331 H 0.123 -332 C 0.129 -333 G 0.139 -334 I 0.139 -335 A 0.127 -336 S 0.111 -337 Y 0.098 -338 C 0.086 -339 S 0.076 -340 Y 0.070 -341 P 0.072 -342 E 0.080 -343 I 0.088 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039041.16_ENSMUST00000061437.5_GN:Adrm1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039041.16_ENSMUST00000061437.5_GN:Adrm1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 0fd779a076c11009e3e5c1de0b5a806e4c2bfd18..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039041.16_ENSMUST00000061437.5_GN:Adrm1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,408 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000039041.16|ENSMUST00000061437.5|GN:Adrm1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.524 -2 T 0.549 -3 T 0.590 -4 S 0.631 -5 G 0.654 -6 A 0.655 -7 L 0.651 -8 F 0.661 -9 P 0.682 -10 S 0.696 -11 L 0.698 -12 V 0.698 -13 P 0.706 -14 G 0.714 -15 S 0.709 -16 R 0.684 -17 G 0.630 -18 S 0.539 -19 S 0.408 -20 T 0.265 -21 K 0.149 -22 Y 0.079 -23 L 0.048 -24 V 0.035 -25 E 0.031 -26 F 0.032 -27 R 0.036 -28 A 0.043 -29 G 0.051 -30 K 0.062 -31 M 0.075 -32 S 0.090 -33 L 0.102 -34 K 0.113 -35 G 0.119 -36 T 0.123 -37 T 0.127 -38 V 0.135 -39 T 0.146 -40 P 0.153 -41 D 0.148 -42 K 0.131 -43 R 0.109 -44 K 0.084 -45 G 0.060 -46 L 0.040 -47 V 0.028 -48 Y 0.023 -49 I 0.026 -50 Q 0.035 -51 Q 0.049 -52 T 0.065 -53 D 0.078 -54 D 0.084 -55 S 0.081 -56 L 0.069 -57 I 0.051 -58 H 0.034 -59 F 0.025 -60 C 0.023 -61 W 0.027 -62 K 0.033 -63 D 0.040 -64 R 0.047 -65 T 0.055 -66 S 0.065 -67 G 0.076 -68 T 0.082 -69 V 0.083 -70 E 0.080 -71 D 0.076 -72 D 0.070 -73 L 0.062 -74 I 0.052 -75 I 0.046 -76 F 0.047 -77 P 0.051 -78 D 0.048 -79 D 0.037 -80 C 0.025 -81 E 0.019 -82 F 0.020 -83 K 0.027 -84 R 0.035 -85 V 0.043 -86 P 0.052 -87 Q 0.063 -88 C 0.078 -89 P 0.090 -90 S 0.093 -91 G 0.084 -92 R 0.065 -93 V 0.044 -94 Y 0.031 -95 V 0.028 -96 L 0.032 -97 K 0.039 -98 F 0.048 -99 K 0.060 -100 A 0.075 -101 G 0.088 -102 S 0.094 -103 K 0.091 -104 R 0.079 -105 L 0.061 -106 F 0.042 -107 F 0.031 -108 W 0.032 -109 M 0.045 -110 Q 0.068 -111 E 0.093 -112 P 0.109 -113 K 0.113 -114 T 0.105 -115 D 0.092 -116 Q 0.078 -117 D 0.066 -118 E 0.058 -119 E 0.053 -120 H 0.048 -121 C 0.046 -122 R 0.047 -123 K 0.048 -124 V 0.049 -125 N 0.049 -126 E 0.053 -127 C 0.063 -128 L 0.085 -129 N 0.116 -130 N 0.155 -131 P 0.211 -132 P 0.299 -133 M 0.415 -134 P 0.533 -135 G 0.626 -136 S 0.682 -137 L 0.712 -138 G 0.729 -139 A 0.736 -140 S 0.736 -141 G 0.733 -142 S 0.729 -143 S 0.723 -144 G 0.713 -145 H 0.704 -146 E 0.699 -147 L 0.696 -148 S 0.696 -149 A 0.697 -150 L 0.699 -151 G 0.706 -152 G 0.717 -153 E 0.724 -154 G 0.710 -155 G 0.664 -156 L 0.599 -157 Q 0.546 -158 S 0.524 -159 L 0.533 -160 L 0.561 -161 G 0.590 -162 N 0.597 -163 M 0.585 -164 S 0.572 -165 H 0.557 -166 S 0.535 -167 Q 0.520 -168 L 0.516 -169 M 0.515 -170 Q 0.514 -171 L 0.523 -172 I 0.551 -173 G 0.601 -174 P 0.662 -175 A 0.712 -176 G 0.741 -177 L 0.757 -178 G 0.769 -179 G 0.779 -180 L 0.784 -181 G 0.789 -182 G 0.792 -183 L 0.791 -184 G 0.784 -185 A 0.769 -186 L 0.746 -187 T 0.726 -188 G 0.718 -189 P 0.718 -190 G 0.719 -191 L 0.716 -192 A 0.715 -193 S 0.719 -194 L 0.728 -195 L 0.744 -196 G 0.761 -197 S 0.767 -198 S 0.760 -199 G 0.753 -200 P 0.759 -201 P 0.776 -202 A 0.795 -203 S 0.806 -204 S 0.804 -205 S 0.784 -206 S 0.736 -207 S 0.669 -208 S 0.631 -209 S 0.645 -210 R 0.663 -211 S 0.646 -212 Q 0.636 -213 S 0.680 -214 A 0.746 -215 A 0.785 -216 V 0.795 -217 T 0.800 -218 P 0.809 -219 S 0.821 -220 S 0.831 -221 S 0.837 -222 T 0.840 -223 S 0.842 -224 S 0.843 -225 A 0.842 -226 R 0.833 -227 A 0.819 -228 T 0.804 -229 P 0.794 -230 A 0.790 -231 P 0.785 -232 S 0.764 -233 A 0.701 -234 P 0.593 -235 A 0.496 -236 A 0.484 -237 A 0.539 -238 S 0.579 -239 A 0.596 -240 T 0.636 -241 S 0.694 -242 P 0.737 -243 S 0.761 -244 P 0.778 -245 A 0.796 -246 P 0.812 -247 S 0.823 -248 S 0.829 -249 G 0.833 -250 N 0.837 -251 G 0.839 -252 T 0.836 -253 S 0.829 -254 T 0.820 -255 A 0.804 -256 A 0.783 -257 S 0.758 -258 P 0.735 -259 T 0.714 -260 Q 0.693 -261 P 0.656 -262 I 0.586 -263 Q 0.483 -264 L 0.383 -265 S 0.320 -266 D 0.289 -267 L 0.265 -268 Q 0.242 -269 S 0.234 -270 I 0.244 -271 L 0.266 -272 A 0.302 -273 T 0.355 -274 M 0.423 -275 N 0.497 -276 V 0.562 -277 P 0.607 -278 A 0.633 -279 G 0.654 -280 P 0.673 -281 G 0.677 -282 G 0.654 -283 S 0.601 -284 Q 0.526 -285 Q 0.437 -286 V 0.343 -287 D 0.261 -288 L 0.219 -289 A 0.222 -290 S 0.235 -291 V 0.214 -292 L 0.161 -293 T 0.115 -294 P 0.095 -295 E 0.093 -296 I 0.092 -297 M 0.087 -298 A 0.090 -299 P 0.106 -300 I 0.123 -301 L 0.130 -302 A 0.131 -303 N 0.130 -304 A 0.124 -305 D 0.111 -306 V 0.096 -307 Q 0.086 -308 E 0.089 -309 R 0.098 -310 L 0.106 -311 L 0.118 -312 P 0.145 -313 Y 0.183 -314 L 0.225 -315 P 0.266 -316 S 0.302 -317 G 0.321 -318 E 0.314 -319 S 0.291 -320 L 0.263 -321 P 0.230 -322 Q 0.188 -323 T 0.146 -324 A 0.119 -325 D 0.110 -326 E 0.117 -327 I 0.129 -328 Q 0.140 -329 N 0.149 -330 T 0.151 -331 L 0.141 -332 T 0.123 -333 S 0.107 -334 P 0.099 -335 Q 0.097 -336 F 0.099 -337 Q 0.100 -338 Q 0.105 -339 A 0.112 -340 L 0.115 -341 G 0.113 -342 M 0.108 -343 F 0.102 -344 S 0.099 -345 A 0.106 -346 A 0.124 -347 L 0.148 -348 A 0.171 -349 S 0.183 -350 G 0.179 -351 Q 0.163 -352 L 0.143 -353 G 0.132 -354 P 0.130 -355 L 0.127 -356 M 0.117 -357 C 0.109 -358 Q 0.112 -359 F 0.121 -360 G 0.127 -361 L 0.122 -362 P 0.108 -363 A 0.092 -364 E 0.081 -365 A 0.078 -366 V 0.079 -367 E 0.080 -368 A 0.081 -369 A 0.087 -370 N 0.100 -371 K 0.118 -372 G 0.132 -373 D 0.130 -374 V 0.113 -375 E 0.095 -376 A 0.089 -377 F 0.095 -378 A 0.109 -379 K 0.121 -380 A 0.131 -381 M 0.145 -382 Q 0.171 -383 N 0.215 -384 N 0.286 -385 A 0.374 -386 K 0.461 -387 S 0.533 -388 D 0.591 -389 P 0.637 -390 K 0.673 -391 E 0.698 -392 G 0.710 -393 D 0.711 -394 T 0.705 -395 K 0.690 -396 D 0.653 -397 K 0.600 -398 K 0.573 -399 D 0.596 -400 E 0.639 -401 E 0.667 -402 E 0.682 -403 D 0.689 -404 M 0.681 -405 S 0.645 -406 L 0.587 -407 D 0.539 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039041.16_ENSMUST00000061437.5_GN:Adrm1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:63.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039041.16_ENSMUST00000061437.5_GN:Adrm1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:63.caid deleted file mode 100644 index 687f50a665d8847c8a055ee65adeb88e6be011b0..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039041.16_ENSMUST00000061437.5_GN:Adrm1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:63.caid +++ /dev/null @@ -1,471 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000039041.16|ENSMUST00000061437.5|GN:Adrm1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:63 -1 M 0.322 -2 R 0.328 -3 W 0.344 -4 T 0.366 -5 V 0.384 -6 T 0.397 -7 R 0.420 -8 A 0.451 -9 N 0.469 -10 R 0.483 -11 D 0.523 -12 L 0.585 -13 V 0.648 -14 G 0.698 -15 A 0.731 -16 G 0.745 -17 R 0.746 -18 A 0.745 -19 A 0.745 -20 D 0.743 -21 G 0.735 -22 T 0.716 -23 Q 0.693 -24 S 0.666 -25 A 0.624 -26 A 0.557 -27 R 0.492 -28 A 0.479 -29 A 0.530 -30 A 0.599 -31 G 0.644 -32 R 0.660 -33 A 0.665 -34 K 0.671 -35 H 0.680 -36 G 0.688 -37 L 0.692 -38 P 0.698 -39 A 0.704 -40 R 0.701 -41 P 0.675 -42 G 0.632 -43 R 0.610 -44 R 0.642 -45 R 0.706 -46 G 0.760 -47 G 0.784 -48 R 0.782 -49 A 0.766 -50 S 0.758 -51 P 0.762 -52 D 0.768 -53 G 0.762 -54 A 0.745 -55 P 0.732 -56 R 0.733 -57 P 0.747 -58 S 0.765 -59 V 0.780 -60 S 0.794 -61 T 0.807 -62 A 0.817 -63 R 0.821 -64 M 0.822 -65 T 0.823 -66 T 0.822 -67 S 0.815 -68 G 0.799 -69 A 0.778 -70 L 0.763 -71 F 0.763 -72 P 0.773 -73 S 0.779 -74 L 0.775 -75 V 0.771 -76 P 0.772 -77 G 0.774 -78 S 0.764 -79 R 0.737 -80 G 0.681 -81 S 0.582 -82 S 0.437 -83 T 0.277 -84 K 0.149 -85 Y 0.076 -86 L 0.046 -87 V 0.034 -88 E 0.030 -89 F 0.031 -90 R 0.036 -91 A 0.042 -92 G 0.050 -93 K 0.061 -94 M 0.073 -95 S 0.086 -96 L 0.097 -97 K 0.106 -98 G 0.112 -99 T 0.115 -100 T 0.119 -101 V 0.126 -102 T 0.136 -103 P 0.142 -104 D 0.137 -105 K 0.121 -106 R 0.099 -107 K 0.076 -108 G 0.054 -109 L 0.035 -110 V 0.024 -111 Y 0.020 -112 I 0.022 -113 Q 0.029 -114 Q 0.040 -115 T 0.052 -116 D 0.063 -117 D 0.071 -118 S 0.070 -119 L 0.061 -120 I 0.045 -121 H 0.031 -122 F 0.022 -123 C 0.021 -124 W 0.024 -125 K 0.030 -126 D 0.035 -127 R 0.041 -128 T 0.048 -129 S 0.058 -130 G 0.069 -131 T 0.076 -132 V 0.077 -133 E 0.074 -134 D 0.070 -135 D 0.066 -136 L 0.059 -137 I 0.050 -138 I 0.043 -139 F 0.043 -140 P 0.046 -141 D 0.043 -142 D 0.033 -143 C 0.022 -144 E 0.017 -145 F 0.018 -146 K 0.023 -147 R 0.030 -148 V 0.037 -149 P 0.045 -150 Q 0.056 -151 C 0.069 -152 P 0.081 -153 S 0.085 -154 G 0.077 -155 R 0.060 -156 V 0.040 -157 Y 0.027 -158 V 0.025 -159 L 0.029 -160 K 0.035 -161 F 0.044 -162 K 0.057 -163 A 0.072 -164 G 0.085 -165 S 0.091 -166 K 0.088 -167 R 0.076 -168 L 0.058 -169 F 0.041 -170 F 0.030 -171 W 0.031 -172 M 0.045 -173 Q 0.069 -174 E 0.094 -175 P 0.111 -176 K 0.114 -177 T 0.106 -178 D 0.092 -179 Q 0.077 -180 D 0.063 -181 E 0.052 -182 E 0.045 -183 H 0.042 -184 C 0.042 -185 R 0.045 -186 K 0.046 -187 V 0.047 -188 N 0.047 -189 E 0.051 -190 C 0.062 -191 L 0.085 -192 N 0.118 -193 N 0.157 -194 P 0.213 -195 P 0.303 -196 M 0.421 -197 P 0.540 -198 G 0.632 -199 S 0.688 -200 L 0.720 -201 G 0.739 -202 A 0.749 -203 S 0.750 -204 G 0.748 -205 S 0.745 -206 S 0.738 -207 G 0.727 -208 H 0.718 -209 E 0.712 -210 L 0.707 -211 S 0.704 -212 A 0.703 -213 L 0.704 -214 G 0.710 -215 G 0.722 -216 E 0.729 -217 G 0.712 -218 G 0.660 -219 L 0.590 -220 Q 0.534 -221 S 0.514 -222 L 0.527 -223 L 0.561 -224 G 0.594 -225 N 0.600 -226 M 0.586 -227 S 0.569 -228 H 0.549 -229 S 0.527 -230 Q 0.513 -231 L 0.510 -232 M 0.508 -233 Q 0.509 -234 L 0.520 -235 I 0.551 -236 G 0.602 -237 P 0.663 -238 A 0.713 -239 G 0.742 -240 L 0.757 -241 G 0.769 -242 G 0.779 -243 L 0.785 -244 G 0.789 -245 G 0.791 -246 L 0.789 -247 G 0.781 -248 A 0.766 -249 L 0.744 -250 T 0.726 -251 G 0.718 -252 P 0.716 -253 G 0.713 -254 L 0.707 -255 A 0.703 -256 S 0.706 -257 L 0.715 -258 L 0.734 -259 G 0.756 -260 S 0.766 -261 S 0.761 -262 G 0.754 -263 P 0.759 -264 P 0.777 -265 A 0.798 -266 S 0.810 -267 S 0.809 -268 S 0.792 -269 S 0.747 -270 S 0.683 -271 S 0.646 -272 S 0.658 -273 R 0.672 -274 S 0.651 -275 Q 0.640 -276 S 0.684 -277 A 0.750 -278 A 0.789 -279 V 0.799 -280 T 0.803 -281 P 0.813 -282 S 0.826 -283 S 0.837 -284 S 0.843 -285 T 0.846 -286 S 0.848 -287 S 0.849 -288 A 0.847 -289 R 0.838 -290 A 0.824 -291 T 0.810 -292 P 0.799 -293 A 0.795 -294 P 0.790 -295 S 0.769 -296 A 0.706 -297 P 0.596 -298 A 0.499 -299 A 0.487 -300 A 0.542 -301 S 0.582 -302 A 0.599 -303 T 0.638 -304 S 0.695 -305 P 0.737 -306 S 0.759 -307 P 0.775 -308 A 0.793 -309 P 0.810 -310 S 0.822 -311 S 0.830 -312 G 0.835 -313 N 0.840 -314 G 0.842 -315 T 0.839 -316 S 0.833 -317 T 0.822 -318 A 0.806 -319 A 0.784 -320 S 0.760 -321 P 0.738 -322 T 0.720 -323 Q 0.702 -324 P 0.669 -325 I 0.602 -326 Q 0.502 -327 L 0.403 -328 S 0.341 -329 D 0.310 -330 L 0.283 -331 Q 0.259 -332 S 0.250 -333 I 0.261 -334 L 0.284 -335 A 0.321 -336 T 0.377 -337 M 0.449 -338 N 0.525 -339 V 0.588 -340 P 0.628 -341 A 0.651 -342 G 0.669 -343 P 0.685 -344 G 0.689 -345 G 0.666 -346 S 0.613 -347 Q 0.538 -348 Q 0.447 -349 V 0.351 -350 D 0.269 -351 L 0.228 -352 A 0.237 -353 S 0.254 -354 V 0.231 -355 L 0.173 -356 T 0.121 -357 P 0.100 -358 E 0.097 -359 I 0.094 -360 M 0.089 -361 A 0.093 -362 P 0.110 -363 I 0.127 -364 L 0.135 -365 A 0.137 -366 N 0.137 -367 A 0.131 -368 D 0.117 -369 V 0.100 -370 Q 0.091 -371 E 0.094 -372 R 0.103 -373 L 0.109 -374 L 0.120 -375 P 0.145 -376 Y 0.182 -377 L 0.223 -378 P 0.263 -379 S 0.298 -380 G 0.316 -381 E 0.306 -382 S 0.281 -383 L 0.252 -384 P 0.221 -385 Q 0.181 -386 T 0.142 -387 A 0.115 -388 D 0.107 -389 E 0.113 -390 I 0.125 -391 Q 0.136 -392 N 0.147 -393 T 0.151 -394 L 0.143 -395 T 0.127 -396 S 0.111 -397 P 0.102 -398 Q 0.100 -399 F 0.101 -400 Q 0.102 -401 Q 0.107 -402 A 0.114 -403 L 0.117 -404 G 0.114 -405 M 0.109 -406 F 0.103 -407 S 0.101 -408 A 0.109 -409 A 0.128 -410 L 0.151 -411 A 0.173 -412 S 0.184 -413 G 0.178 -414 Q 0.160 -415 L 0.140 -416 G 0.129 -417 P 0.127 -418 L 0.123 -419 M 0.114 -420 C 0.109 -421 Q 0.113 -422 F 0.122 -423 G 0.127 -424 L 0.122 -425 P 0.108 -426 A 0.092 -427 E 0.082 -428 A 0.080 -429 V 0.081 -430 E 0.081 -431 A 0.081 -432 A 0.087 -433 N 0.100 -434 K 0.117 -435 G 0.130 -436 D 0.128 -437 V 0.112 -438 E 0.095 -439 A 0.089 -440 F 0.097 -441 A 0.110 -442 K 0.122 -443 A 0.131 -444 M 0.144 -445 Q 0.170 -446 N 0.215 -447 N 0.286 -448 A 0.377 -449 K 0.467 -450 S 0.540 -451 D 0.598 -452 P 0.644 -453 K 0.680 -454 E 0.706 -455 G 0.719 -456 D 0.721 -457 T 0.720 -458 K 0.718 -459 D 0.715 -460 K 0.710 -461 K 0.709 -462 D 0.712 -463 E 0.716 -464 E 0.720 -465 E 0.724 -466 D 0.725 -467 M 0.710 -468 S 0.671 -469 L 0.615 -470 D 0.568 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039109.18_ENSMUST00000037491.11_GN:F13a1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039109.18_ENSMUST00000037491.11_GN:F13a1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 677c69430d8998f8cde81b1535c983a8814c024d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039109.18_ENSMUST00000037491.11_GN:F13a1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,733 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000039109.18|ENSMUST00000037491.11|GN:F13a1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.334 -2 S 0.327 -3 D 0.332 -4 T 0.346 -5 P 0.345 -6 A 0.334 -7 S 0.348 -8 T 0.396 -9 F 0.445 -10 G 0.480 -11 G 0.491 -12 R 0.465 -13 R 0.410 -14 A 0.365 -15 V 0.361 -16 P 0.389 -17 P 0.428 -18 N 0.470 -19 N 0.504 -20 S 0.519 -21 N 0.509 -22 A 0.480 -23 A 0.446 -24 E 0.416 -25 V 0.384 -26 D 0.345 -27 L 0.305 -28 P 0.271 -29 T 0.242 -30 E 0.218 -31 E 0.201 -32 L 0.194 -33 Q 0.200 -34 G 0.217 -35 L 0.235 -36 V 0.255 -37 P 0.284 -38 R 0.315 -39 G 0.328 -40 V 0.304 -41 N 0.256 -42 L 0.208 -43 K 0.170 -44 D 0.137 -45 Y 0.104 -46 L 0.074 -47 N 0.049 -48 V 0.034 -49 T 0.027 -50 A 0.025 -51 V 0.026 -52 H 0.031 -53 L 0.039 -54 F 0.048 -55 K 0.056 -56 E 0.061 -57 R 0.065 -58 W 0.069 -59 D 0.071 -60 S 0.071 -61 N 0.075 -62 K 0.089 -63 I 0.109 -64 D 0.121 -65 H 0.122 -66 H 0.119 -67 T 0.120 -68 D 0.121 -69 K 0.119 -70 Y 0.116 -71 D 0.116 -72 N 0.115 -73 N 0.108 -74 K 0.095 -75 L 0.076 -76 I 0.056 -77 V 0.040 -78 R 0.030 -79 R 0.026 -80 G 0.027 -81 Q 0.029 -82 T 0.029 -83 F 0.028 -84 Y 0.028 -85 I 0.029 -86 Q 0.028 -87 I 0.026 -88 D 0.026 -89 F 0.030 -90 N 0.037 -91 R 0.045 -92 P 0.049 -93 Y 0.051 -94 D 0.052 -95 P 0.052 -96 R 0.051 -97 K 0.050 -98 D 0.045 -99 L 0.035 -100 F 0.026 -101 R 0.019 -102 V 0.017 -103 E 0.019 -104 Y 0.023 -105 V 0.029 -106 I 0.037 -107 G 0.047 -108 R 0.058 -109 Y 0.067 -110 P 0.072 -111 Q 0.078 -112 E 0.091 -113 N 0.106 -114 K 0.111 -115 G 0.101 -116 T 0.081 -117 Y 0.065 -118 I 0.058 -119 P 0.060 -120 V 0.063 -121 P 0.065 -122 V 0.065 -123 V 0.065 -124 K 0.066 -125 E 0.071 -126 L 0.082 -127 Q 0.092 -128 S 0.092 -129 G 0.079 -130 K 0.061 -131 W 0.046 -132 G 0.038 -133 A 0.035 -134 K 0.035 -135 V 0.036 -136 I 0.037 -137 M 0.040 -138 N 0.044 -139 E 0.045 -140 D 0.040 -141 R 0.030 -142 S 0.022 -143 V 0.018 -144 R 0.017 -145 L 0.020 -146 S 0.027 -147 V 0.039 -148 Q 0.058 -149 S 0.078 -150 S 0.091 -151 P 0.094 -152 E 0.094 -153 C 0.095 -154 I 0.096 -155 V 0.098 -156 G 0.100 -157 K 0.099 -158 F 0.087 -159 R 0.066 -160 M 0.043 -161 Y 0.026 -162 V 0.018 -163 A 0.016 -164 V 0.019 -165 W 0.026 -166 T 0.034 -167 P 0.042 -168 Y 0.047 -169 G 0.049 -170 I 0.046 -171 L 0.043 -172 R 0.044 -173 T 0.052 -174 R 0.068 -175 R 0.090 -176 D 0.106 -177 P 0.107 -178 E 0.092 -179 T 0.070 -180 D 0.049 -181 T 0.036 -182 Y 0.034 -183 I 0.044 -184 L 0.064 -185 F 0.086 -186 N 0.105 -187 P 0.117 -188 W 0.124 -189 C 0.133 -190 E 0.143 -191 E 0.146 -192 D 0.138 -193 A 0.125 -194 V 0.113 -195 Y 0.106 -196 L 0.108 -197 D 0.113 -198 D 0.112 -199 E 0.101 -200 K 0.087 -201 E 0.074 -202 R 0.066 -203 E 0.066 -204 E 0.075 -205 Y 0.089 -206 V 0.102 -207 L 0.111 -208 N 0.115 -209 D 0.117 -210 I 0.119 -211 G 0.121 -212 V 0.120 -213 I 0.116 -214 F 0.114 -215 Y 0.121 -216 G 0.131 -217 D 0.135 -218 F 0.128 -219 K 0.119 -220 D 0.113 -221 I 0.110 -222 K 0.112 -223 S 0.117 -224 R 0.124 -225 S 0.131 -226 W 0.135 -227 S 0.131 -228 Y 0.121 -229 G 0.109 -230 Q 0.101 -231 F 0.102 -232 E 0.108 -233 D 0.114 -234 G 0.115 -235 I 0.113 -236 L 0.109 -237 D 0.101 -238 T 0.086 -239 C 0.070 -240 L 0.061 -241 Y 0.059 -242 V 0.062 -243 M 0.067 -244 D 0.074 -245 K 0.082 -246 A 0.090 -247 E 0.096 -248 M 0.098 -249 D 0.096 -250 L 0.094 -251 S 0.093 -252 G 0.093 -253 R 0.093 -254 G 0.096 -255 N 0.098 -256 P 0.093 -257 I 0.085 -258 K 0.081 -259 V 0.083 -260 S 0.089 -261 R 0.098 -262 V 0.104 -263 G 0.103 -264 S 0.098 -265 A 0.095 -266 M 0.096 -267 V 0.096 -268 N 0.096 -269 A 0.106 -270 K 0.131 -271 D 0.165 -272 D 0.196 -273 E 0.213 -274 G 0.215 -275 V 0.204 -276 L 0.185 -277 V 0.167 -278 G 0.155 -279 S 0.148 -280 W 0.141 -281 D 0.133 -282 N 0.128 -283 V 0.127 -284 Y 0.133 -285 A 0.144 -286 Y 0.157 -287 G 0.165 -288 I 0.166 -289 P 0.163 -290 P 0.158 -291 S 0.153 -292 A 0.148 -293 W 0.139 -294 T 0.125 -295 G 0.113 -296 S 0.109 -297 V 0.107 -298 D 0.104 -299 I 0.095 -300 L 0.083 -301 L 0.072 -302 E 0.066 -303 Y 0.063 -304 R 0.064 -305 S 0.074 -306 S 0.097 -307 E 0.132 -308 T 0.172 -309 P 0.207 -310 V 0.224 -311 R 0.222 -312 Y 0.209 -313 G 0.190 -314 Q 0.168 -315 C 0.154 -316 W 0.162 -317 V 0.184 -318 F 0.199 -319 A 0.197 -320 G 0.185 -321 V 0.171 -322 F 0.155 -323 N 0.140 -324 T 0.131 -325 F 0.125 -326 L 0.115 -327 R 0.107 -328 C 0.112 -329 L 0.129 -330 G 0.149 -331 I 0.158 -332 P 0.151 -333 A 0.134 -334 R 0.121 -335 V 0.115 -336 I 0.110 -337 T 0.100 -338 N 0.087 -339 Y 0.078 -340 F 0.074 -341 S 0.074 -342 A 0.076 -343 H 0.079 -344 D 0.084 -345 N 0.094 -346 D 0.106 -347 A 0.117 -348 N 0.125 -349 L 0.131 -350 Q 0.140 -351 M 0.150 -352 D 0.157 -353 I 0.159 -354 F 0.154 -355 L 0.148 -356 E 0.144 -357 E 0.142 -358 D 0.140 -359 G 0.138 -360 N 0.134 -361 V 0.133 -362 S 0.137 -363 S 0.151 -364 K 0.173 -365 L 0.192 -366 T 0.198 -367 K 0.198 -368 D 0.197 -369 S 0.190 -370 V 0.171 -371 W 0.144 -372 N 0.119 -373 Y 0.106 -374 H 0.101 -375 C 0.099 -376 W 0.097 -377 N 0.098 -378 E 0.097 -379 A 0.092 -380 W 0.090 -381 M 0.097 -382 T 0.112 -383 R 0.129 -384 P 0.143 -385 D 0.150 -386 L 0.156 -387 P 0.165 -388 V 0.177 -389 G 0.184 -390 F 0.179 -391 G 0.162 -392 G 0.139 -393 W 0.117 -394 Q 0.105 -395 A 0.106 -396 V 0.116 -397 D 0.126 -398 S 0.131 -399 T 0.134 -400 P 0.138 -401 Q 0.148 -402 E 0.160 -403 N 0.169 -404 S 0.167 -405 D 0.161 -406 G 0.155 -407 M 0.145 -408 Y 0.130 -409 R 0.112 -410 C 0.095 -411 G 0.082 -412 P 0.077 -413 A 0.076 -414 S 0.073 -415 V 0.068 -416 Q 0.067 -417 A 0.070 -418 V 0.076 -419 K 0.087 -420 H 0.101 -421 G 0.115 -422 H 0.122 -423 V 0.116 -424 C 0.102 -425 F 0.089 -426 Q 0.088 -427 F 0.101 -428 D 0.123 -429 A 0.143 -430 P 0.156 -431 F 0.159 -432 V 0.151 -433 F 0.139 -434 A 0.134 -435 E 0.136 -436 V 0.137 -437 N 0.136 -438 S 0.134 -439 D 0.125 -440 L 0.108 -441 V 0.090 -442 Y 0.080 -443 I 0.079 -444 T 0.083 -445 A 0.091 -446 K 0.102 -447 Q 0.110 -448 D 0.117 -449 G 0.126 -450 T 0.132 -451 H 0.132 -452 V 0.123 -453 V 0.110 -454 E 0.098 -455 A 0.090 -456 V 0.083 -457 D 0.079 -458 A 0.082 -459 T 0.091 -460 H 0.100 -461 I 0.108 -462 G 0.120 -463 K 0.131 -464 L 0.136 -465 I 0.132 -466 V 0.130 -467 T 0.141 -468 K 0.159 -469 Q 0.176 -470 I 0.188 -471 G 0.197 -472 G 0.198 -473 D 0.187 -474 G 0.171 -475 M 0.158 -476 Q 0.152 -477 D 0.148 -478 I 0.140 -479 T 0.131 -480 D 0.122 -481 T 0.110 -482 Y 0.099 -483 K 0.096 -484 F 0.107 -485 Q 0.128 -486 E 0.148 -487 G 0.158 -488 Q 0.156 -489 E 0.143 -490 E 0.126 -491 E 0.111 -492 R 0.104 -493 L 0.101 -494 A 0.100 -495 L 0.103 -496 E 0.107 -497 T 0.111 -498 A 0.116 -499 L 0.126 -500 M 0.140 -501 Y 0.162 -502 G 0.193 -503 A 0.229 -504 K 0.267 -505 K 0.308 -506 T 0.358 -507 L 0.414 -508 N 0.465 -509 T 0.498 -510 E 0.501 -511 G 0.479 -512 V 0.453 -513 V 0.430 -514 K 0.400 -515 S 0.352 -516 R 0.285 -517 S 0.211 -518 D 0.145 -519 V 0.099 -520 T 0.073 -521 M 0.059 -522 N 0.056 -523 F 0.061 -524 D 0.071 -525 V 0.078 -526 E 0.079 -527 N 0.071 -528 A 0.059 -529 V 0.049 -530 L 0.044 -531 G 0.042 -532 K 0.039 -533 D 0.034 -534 F 0.032 -535 K 0.036 -536 V 0.040 -537 T 0.042 -538 I 0.041 -539 T 0.041 -540 F 0.046 -541 Q 0.057 -542 N 0.070 -543 N 0.082 -544 S 0.089 -545 S 0.086 -546 N 0.074 -547 L 0.060 -548 Y 0.048 -549 T 0.038 -550 I 0.031 -551 L 0.025 -552 A 0.023 -553 Y 0.025 -554 L 0.032 -555 S 0.044 -556 G 0.056 -557 N 0.066 -558 I 0.070 -559 T 0.066 -560 F 0.062 -561 Y 0.067 -562 T 0.081 -563 G 0.095 -564 V 0.100 -565 S 0.097 -566 K 0.088 -567 K 0.080 -568 E 0.073 -569 F 0.065 -570 K 0.059 -571 K 0.058 -572 E 0.060 -573 S 0.059 -574 F 0.056 -575 E 0.054 -576 E 0.053 -577 T 0.053 -578 L 0.054 -579 D 0.059 -580 P 0.062 -581 F 0.060 -582 S 0.054 -583 S 0.047 -584 K 0.041 -585 K 0.037 -586 K 0.036 -587 E 0.036 -588 V 0.039 -589 L 0.044 -590 V 0.047 -591 R 0.043 -592 A 0.038 -593 G 0.033 -594 E 0.029 -595 Y 0.027 -596 M 0.029 -597 S 0.037 -598 H 0.048 -599 L 0.057 -600 L 0.066 -601 E 0.075 -602 Q 0.081 -603 G 0.079 -604 F 0.068 -605 L 0.056 -606 H 0.048 -607 F 0.044 -608 F 0.041 -609 V 0.037 -610 T 0.033 -611 A 0.031 -612 R 0.035 -613 I 0.046 -614 N 0.060 -615 E 0.071 -616 S 0.079 -617 R 0.086 -618 D 0.090 -619 V 0.089 -620 L 0.081 -621 A 0.069 -622 K 0.060 -623 Q 0.054 -624 K 0.049 -625 S 0.046 -626 I 0.047 -627 I 0.055 -628 L 0.070 -629 T 0.089 -630 I 0.105 -631 P 0.113 -632 K 0.109 -633 I 0.100 -634 T 0.092 -635 I 0.092 -636 K 0.101 -637 V 0.118 -638 R 0.133 -639 G 0.137 -640 A 0.126 -641 A 0.108 -642 M 0.093 -643 V 0.086 -644 G 0.084 -645 S 0.080 -646 D 0.071 -647 M 0.064 -648 V 0.061 -649 V 0.060 -650 T 0.061 -651 V 0.062 -652 E 0.066 -653 F 0.075 -654 T 0.087 -655 N 0.100 -656 P 0.111 -657 L 0.118 -658 K 0.119 -659 E 0.113 -660 T 0.105 -661 L 0.097 -662 Q 0.090 -663 N 0.081 -664 V 0.069 -665 W 0.060 -666 I 0.059 -667 H 0.067 -668 L 0.081 -669 D 0.098 -670 G 0.116 -671 P 0.126 -672 G 0.119 -673 V 0.101 -674 M 0.089 -675 R 0.088 -676 P 0.090 -677 K 0.087 -678 R 0.080 -679 K 0.072 -680 V 0.067 -681 F 0.067 -682 R 0.069 -683 E 0.076 -684 I 0.088 -685 R 0.102 -686 P 0.104 -687 N 0.093 -688 T 0.075 -689 T 0.061 -690 V 0.051 -691 Q 0.046 -692 W 0.045 -693 E 0.047 -694 E 0.053 -695 V 0.063 -696 C 0.082 -697 R 0.106 -698 P 0.129 -699 W 0.147 -700 V 0.162 -701 S 0.171 -702 G 0.167 -703 H 0.147 -704 R 0.124 -705 K 0.103 -706 L 0.085 -707 I 0.069 -708 A 0.059 -709 S 0.055 -710 M 0.057 -711 T 0.062 -712 S 0.069 -713 D 0.077 -714 S 0.085 -715 L 0.095 -716 R 0.108 -717 H 0.121 -718 V 0.126 -719 Y 0.118 -720 G 0.104 -721 E 0.088 -722 L 0.074 -723 D 0.064 -724 L 0.061 -725 Q 0.065 -726 I 0.075 -727 Q 0.093 -728 R 0.117 -729 R 0.143 -730 P 0.161 -731 T 0.168 -732 M 0.170 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039109.18_ENSMUST00000037491.11_GN:F13a1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:51.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039109.18_ENSMUST00000037491.11_GN:F13a1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:51.caid deleted file mode 100644 index 828ca618d7a3477a9da809d597d177f1bab60c02..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039109.18_ENSMUST00000037491.11_GN:F13a1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:51.caid +++ /dev/null @@ -1,784 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000039109.18|ENSMUST00000037491.11|GN:F13a1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:51 -1 M 0.297 -2 G 0.291 -3 R 0.281 -4 R 0.267 -5 V 0.245 -6 G 0.220 -7 A 0.198 -8 V 0.180 -9 R 0.167 -10 K 0.163 -11 L 0.169 -12 F 0.175 -13 K 0.174 -14 S 0.171 -15 Q 0.179 -16 L 0.203 -17 S 0.227 -18 G 0.230 -19 H 0.213 -20 F 0.189 -21 A 0.172 -22 R 0.165 -23 V 0.167 -24 L 0.175 -25 L 0.188 -26 R 0.209 -27 K 0.241 -28 Y 0.277 -29 P 0.305 -30 E 0.323 -31 A 0.330 -32 H 0.322 -33 R 0.316 -34 E 0.328 -35 T 0.351 -36 T 0.367 -37 R 0.387 -38 A 0.419 -39 P 0.433 -40 S 0.410 -41 Q 0.377 -42 E 0.359 -43 H 0.350 -44 K 0.352 -45 Q 0.385 -46 D 0.435 -47 P 0.465 -48 V 0.471 -49 K 0.475 -50 L 0.488 -51 R 0.502 -52 M 0.513 -53 S 0.527 -54 D 0.544 -55 T 0.564 -56 P 0.579 -57 A 0.592 -58 S 0.606 -59 T 0.619 -60 F 0.631 -61 G 0.645 -62 G 0.649 -63 R 0.626 -64 R 0.578 -65 A 0.526 -66 V 0.498 -67 P 0.504 -68 P 0.537 -69 N 0.585 -70 N 0.625 -71 S 0.643 -72 N 0.635 -73 A 0.604 -74 A 0.562 -75 E 0.515 -76 V 0.455 -77 D 0.380 -78 L 0.311 -79 P 0.262 -80 T 0.234 -81 E 0.214 -82 E 0.201 -83 L 0.198 -84 Q 0.209 -85 G 0.229 -86 L 0.248 -87 V 0.268 -88 P 0.300 -89 R 0.333 -90 G 0.341 -91 V 0.308 -92 N 0.252 -93 L 0.201 -94 K 0.162 -95 D 0.128 -96 Y 0.096 -97 L 0.066 -98 N 0.043 -99 V 0.030 -100 T 0.023 -101 A 0.022 -102 V 0.024 -103 H 0.029 -104 L 0.036 -105 F 0.045 -106 K 0.052 -107 E 0.056 -108 R 0.060 -109 W 0.063 -110 D 0.066 -111 S 0.066 -112 N 0.069 -113 K 0.082 -114 I 0.101 -115 D 0.113 -116 H 0.115 -117 H 0.114 -118 T 0.114 -119 D 0.114 -120 K 0.111 -121 Y 0.109 -122 D 0.109 -123 N 0.109 -124 N 0.103 -125 K 0.091 -126 L 0.073 -127 I 0.054 -128 V 0.038 -129 R 0.029 -130 R 0.025 -131 G 0.026 -132 Q 0.029 -133 T 0.029 -134 F 0.029 -135 Y 0.029 -136 I 0.029 -137 Q 0.028 -138 I 0.026 -139 D 0.025 -140 F 0.029 -141 N 0.036 -142 R 0.044 -143 P 0.049 -144 Y 0.051 -145 D 0.052 -146 P 0.051 -147 R 0.050 -148 K 0.049 -149 D 0.044 -150 L 0.035 -151 F 0.025 -152 R 0.019 -153 V 0.017 -154 E 0.020 -155 Y 0.025 -156 V 0.031 -157 I 0.040 -158 G 0.050 -159 R 0.062 -160 Y 0.071 -161 P 0.076 -162 Q 0.081 -163 E 0.092 -164 N 0.107 -165 K 0.113 -166 G 0.104 -167 T 0.085 -168 Y 0.069 -169 I 0.062 -170 P 0.063 -171 V 0.066 -172 P 0.067 -173 V 0.067 -174 V 0.067 -175 K 0.068 -176 E 0.073 -177 L 0.083 -178 Q 0.091 -179 S 0.089 -180 G 0.076 -181 K 0.058 -182 W 0.044 -183 G 0.036 -184 A 0.033 -185 K 0.032 -186 V 0.033 -187 I 0.033 -188 M 0.037 -189 N 0.041 -190 E 0.042 -191 D 0.038 -192 R 0.029 -193 S 0.021 -194 V 0.017 -195 R 0.017 -196 L 0.019 -197 S 0.026 -198 V 0.038 -199 Q 0.055 -200 S 0.074 -201 S 0.086 -202 P 0.089 -203 E 0.090 -204 C 0.091 -205 I 0.092 -206 V 0.094 -207 G 0.097 -208 K 0.096 -209 F 0.085 -210 R 0.064 -211 M 0.041 -212 Y 0.025 -213 V 0.017 -214 A 0.015 -215 V 0.017 -216 W 0.022 -217 T 0.030 -218 P 0.037 -219 Y 0.042 -220 G 0.044 -221 I 0.041 -222 L 0.038 -223 R 0.038 -224 T 0.046 -225 R 0.061 -226 R 0.082 -227 D 0.097 -228 P 0.098 -229 E 0.084 -230 T 0.063 -231 D 0.044 -232 T 0.032 -233 Y 0.031 -234 I 0.041 -235 L 0.059 -236 F 0.081 -237 N 0.100 -238 P 0.112 -239 W 0.119 -240 C 0.128 -241 E 0.140 -242 E 0.144 -243 D 0.137 -244 A 0.124 -245 V 0.111 -246 Y 0.104 -247 L 0.105 -248 D 0.110 -249 D 0.108 -250 E 0.097 -251 K 0.083 -252 E 0.071 -253 R 0.062 -254 E 0.062 -255 E 0.072 -256 Y 0.085 -257 V 0.098 -258 L 0.106 -259 N 0.110 -260 D 0.114 -261 I 0.118 -262 G 0.121 -263 V 0.121 -264 I 0.116 -265 F 0.114 -266 Y 0.121 -267 G 0.132 -268 D 0.135 -269 F 0.128 -270 K 0.118 -271 D 0.112 -272 I 0.110 -273 K 0.112 -274 S 0.117 -275 R 0.125 -276 S 0.131 -277 W 0.134 -278 S 0.130 -279 Y 0.120 -280 G 0.109 -281 Q 0.101 -282 F 0.102 -283 E 0.108 -284 D 0.114 -285 G 0.114 -286 I 0.105 -287 L 0.090 -288 D 0.077 -289 T 0.066 -290 C 0.058 -291 L 0.055 -292 Y 0.056 -293 V 0.060 -294 M 0.065 -295 D 0.072 -296 K 0.081 -297 A 0.090 -298 E 0.096 -299 M 0.098 -300 D 0.096 -301 L 0.093 -302 S 0.092 -303 G 0.092 -304 R 0.093 -305 G 0.097 -306 N 0.099 -307 P 0.094 -308 I 0.086 -309 K 0.083 -310 V 0.085 -311 S 0.091 -312 R 0.100 -313 V 0.106 -314 G 0.105 -315 S 0.099 -316 A 0.096 -317 M 0.096 -318 V 0.096 -319 N 0.096 -320 A 0.106 -321 K 0.131 -322 D 0.166 -323 D 0.197 -324 E 0.214 -325 G 0.217 -326 V 0.205 -327 L 0.185 -328 V 0.167 -329 G 0.155 -330 S 0.148 -331 W 0.140 -332 D 0.132 -333 N 0.128 -334 V 0.127 -335 Y 0.133 -336 A 0.145 -337 Y 0.158 -338 G 0.165 -339 I 0.165 -340 P 0.162 -341 P 0.157 -342 S 0.152 -343 A 0.148 -344 W 0.139 -345 T 0.125 -346 G 0.113 -347 S 0.108 -348 V 0.106 -349 D 0.102 -350 I 0.093 -351 L 0.081 -352 L 0.071 -353 E 0.065 -354 Y 0.062 -355 R 0.064 -356 S 0.074 -357 S 0.097 -358 E 0.133 -359 T 0.175 -360 P 0.209 -361 V 0.226 -362 R 0.223 -363 Y 0.210 -364 G 0.191 -365 Q 0.168 -366 C 0.155 -367 W 0.164 -368 V 0.186 -369 F 0.201 -370 A 0.198 -371 G 0.185 -372 V 0.171 -373 F 0.155 -374 N 0.140 -375 T 0.131 -376 F 0.125 -377 L 0.116 -378 R 0.108 -379 C 0.112 -380 L 0.129 -381 G 0.149 -382 I 0.159 -383 P 0.153 -384 A 0.137 -385 R 0.124 -386 V 0.118 -387 I 0.113 -388 T 0.103 -389 N 0.090 -390 Y 0.080 -391 F 0.076 -392 S 0.075 -393 A 0.077 -394 H 0.079 -395 D 0.084 -396 N 0.093 -397 D 0.105 -398 A 0.117 -399 N 0.125 -400 L 0.133 -401 Q 0.142 -402 M 0.151 -403 D 0.159 -404 I 0.161 -405 F 0.156 -406 L 0.149 -407 E 0.144 -408 E 0.141 -409 D 0.139 -410 G 0.136 -411 N 0.132 -412 V 0.131 -413 S 0.135 -414 S 0.149 -415 K 0.172 -416 L 0.191 -417 T 0.198 -418 K 0.199 -419 D 0.198 -420 S 0.192 -421 V 0.173 -422 W 0.146 -423 N 0.121 -424 Y 0.108 -425 H 0.105 -426 C 0.103 -427 W 0.103 -428 N 0.104 -429 E 0.103 -430 A 0.097 -431 W 0.093 -432 M 0.099 -433 T 0.113 -434 R 0.130 -435 P 0.143 -436 D 0.151 -437 L 0.156 -438 P 0.165 -439 V 0.178 -440 G 0.185 -441 F 0.180 -442 G 0.164 -443 G 0.141 -444 W 0.119 -445 Q 0.107 -446 A 0.109 -447 V 0.119 -448 D 0.129 -449 S 0.135 -450 T 0.137 -451 P 0.141 -452 Q 0.151 -453 E 0.163 -454 N 0.171 -455 S 0.170 -456 D 0.164 -457 G 0.157 -458 M 0.149 -459 Y 0.134 -460 R 0.115 -461 C 0.097 -462 G 0.085 -463 P 0.079 -464 A 0.077 -465 S 0.073 -466 V 0.068 -467 Q 0.066 -468 A 0.069 -469 V 0.076 -470 K 0.087 -471 H 0.102 -472 G 0.116 -473 H 0.124 -474 V 0.118 -475 C 0.103 -476 F 0.091 -477 Q 0.090 -478 F 0.102 -479 D 0.123 -480 A 0.144 -481 P 0.157 -482 F 0.159 -483 V 0.151 -484 F 0.139 -485 A 0.135 -486 E 0.138 -487 V 0.140 -488 N 0.140 -489 S 0.138 -490 D 0.129 -491 L 0.112 -492 V 0.093 -493 Y 0.082 -494 I 0.081 -495 T 0.085 -496 A 0.093 -497 K 0.103 -498 Q 0.112 -499 D 0.118 -500 G 0.126 -501 T 0.133 -502 H 0.134 -503 V 0.125 -504 V 0.112 -505 E 0.099 -506 A 0.090 -507 V 0.083 -508 D 0.079 -509 A 0.082 -510 T 0.092 -511 H 0.101 -512 I 0.110 -513 G 0.122 -514 K 0.134 -515 L 0.138 -516 I 0.134 -517 V 0.133 -518 T 0.143 -519 K 0.161 -520 Q 0.176 -521 I 0.188 -522 G 0.197 -523 G 0.197 -524 D 0.186 -525 G 0.170 -526 M 0.157 -527 Q 0.150 -528 D 0.145 -529 I 0.138 -530 T 0.129 -531 D 0.121 -532 T 0.110 -533 Y 0.099 -534 K 0.096 -535 F 0.106 -536 Q 0.127 -537 E 0.147 -538 G 0.156 -539 Q 0.153 -540 E 0.140 -541 E 0.122 -542 E 0.108 -543 R 0.100 -544 L 0.097 -545 A 0.097 -546 L 0.101 -547 E 0.105 -548 T 0.109 -549 A 0.114 -550 L 0.123 -551 M 0.136 -552 Y 0.158 -553 G 0.189 -554 A 0.226 -555 K 0.263 -556 K 0.305 -557 T 0.355 -558 L 0.410 -559 N 0.462 -560 T 0.497 -561 E 0.501 -562 G 0.481 -563 V 0.455 -564 V 0.432 -565 K 0.401 -566 S 0.353 -567 R 0.286 -568 S 0.212 -569 D 0.147 -570 V 0.101 -571 T 0.074 -572 M 0.060 -573 N 0.056 -574 F 0.060 -575 D 0.069 -576 V 0.077 -577 E 0.077 -578 N 0.069 -579 A 0.058 -580 V 0.048 -581 L 0.044 -582 G 0.042 -583 K 0.039 -584 D 0.034 -585 F 0.032 -586 K 0.036 -587 V 0.040 -588 T 0.041 -589 I 0.040 -590 T 0.041 -591 F 0.046 -592 Q 0.056 -593 N 0.070 -594 N 0.083 -595 S 0.089 -596 S 0.087 -597 N 0.075 -598 L 0.061 -599 Y 0.048 -600 T 0.038 -601 I 0.031 -602 L 0.025 -603 A 0.023 -604 Y 0.025 -605 L 0.033 -606 S 0.044 -607 G 0.057 -608 N 0.067 -609 I 0.070 -610 T 0.066 -611 F 0.062 -612 Y 0.067 -613 T 0.080 -614 G 0.094 -615 V 0.100 -616 S 0.097 -617 K 0.089 -618 K 0.081 -619 E 0.073 -620 F 0.065 -621 K 0.059 -622 K 0.058 -623 E 0.060 -624 S 0.059 -625 F 0.056 -626 E 0.054 -627 E 0.053 -628 T 0.053 -629 L 0.054 -630 D 0.059 -631 P 0.063 -632 F 0.061 -633 S 0.054 -634 S 0.047 -635 K 0.041 -636 K 0.037 -637 K 0.036 -638 E 0.036 -639 V 0.039 -640 L 0.044 -641 V 0.046 -642 R 0.042 -643 A 0.036 -644 G 0.031 -645 E 0.027 -646 Y 0.026 -647 M 0.029 -648 S 0.037 -649 H 0.048 -650 L 0.057 -651 L 0.067 -652 E 0.076 -653 Q 0.082 -654 G 0.079 -655 F 0.068 -656 L 0.057 -657 H 0.049 -658 F 0.044 -659 F 0.041 -660 V 0.038 -661 T 0.034 -662 A 0.031 -663 R 0.035 -664 I 0.046 -665 N 0.060 -666 E 0.072 -667 S 0.081 -668 R 0.088 -669 D 0.092 -670 V 0.091 -671 L 0.082 -672 A 0.071 -673 K 0.061 -674 Q 0.055 -675 K 0.050 -676 S 0.047 -677 I 0.048 -678 I 0.057 -679 L 0.072 -680 T 0.091 -681 I 0.107 -682 P 0.114 -683 K 0.110 -684 I 0.101 -685 T 0.094 -686 I 0.093 -687 K 0.102 -688 V 0.119 -689 R 0.133 -690 G 0.137 -691 A 0.127 -692 A 0.108 -693 M 0.092 -694 V 0.085 -695 G 0.083 -696 S 0.079 -697 D 0.071 -698 M 0.064 -699 V 0.061 -700 V 0.061 -701 T 0.061 -702 V 0.063 -703 E 0.067 -704 F 0.076 -705 T 0.088 -706 N 0.101 -707 P 0.111 -708 L 0.118 -709 K 0.119 -710 E 0.113 -711 T 0.105 -712 L 0.097 -713 Q 0.090 -714 N 0.081 -715 V 0.069 -716 W 0.060 -717 I 0.058 -718 H 0.067 -719 L 0.081 -720 D 0.099 -721 G 0.117 -722 P 0.126 -723 G 0.119 -724 V 0.100 -725 M 0.088 -726 R 0.087 -727 P 0.090 -728 K 0.087 -729 R 0.080 -730 K 0.072 -731 V 0.068 -732 F 0.067 -733 R 0.070 -734 E 0.076 -735 I 0.089 -736 R 0.103 -737 P 0.106 -738 N 0.094 -739 T 0.076 -740 T 0.061 -741 V 0.051 -742 Q 0.046 -743 W 0.045 -744 E 0.047 -745 E 0.053 -746 V 0.064 -747 C 0.083 -748 R 0.108 -749 P 0.130 -750 W 0.147 -751 V 0.162 -752 S 0.172 -753 G 0.168 -754 H 0.149 -755 R 0.125 -756 K 0.104 -757 L 0.087 -758 I 0.071 -759 A 0.060 -760 S 0.056 -761 M 0.058 -762 T 0.062 -763 S 0.069 -764 D 0.077 -765 S 0.085 -766 L 0.095 -767 R 0.108 -768 H 0.122 -769 V 0.126 -770 Y 0.119 -771 G 0.104 -772 E 0.088 -773 L 0.074 -774 D 0.065 -775 L 0.062 -776 Q 0.065 -777 I 0.076 -778 Q 0.093 -779 R 0.115 -780 R 0.140 -781 P 0.157 -782 T 0.163 -783 M 0.164 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039156.20_ENSMUST00000117661.9_GN:Stim2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039156.20_ENSMUST00000117661.9_GN:Stim2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index bfbb79748d1730431a5dade93d2f677b038dc0dd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039156.20_ENSMUST00000117661.9_GN:Stim2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,747 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000039156.20|ENSMUST00000117661.9|GN:Stim2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.156 -2 L 0.157 -3 L 0.168 -4 F 0.188 -5 G 0.202 -6 L 0.204 -7 L 0.214 -8 V 0.251 -9 A 0.309 -10 G 0.363 -11 V 0.397 -12 A 0.419 -13 D 0.443 -14 G 0.463 -15 C 0.463 -16 D 0.440 -17 L 0.404 -18 V 0.374 -19 P 0.359 -20 R 0.359 -21 H 0.377 -22 L 0.420 -23 R 0.486 -24 G 0.555 -25 R 0.593 -26 R 0.582 -27 A 0.544 -28 S 0.525 -29 G 0.538 -30 S 0.551 -31 A 0.565 -32 G 0.601 -33 A 0.639 -34 A 0.651 -35 A 0.647 -36 S 0.651 -37 P 0.662 -38 S 0.664 -39 A 0.651 -40 A 0.623 -41 A 0.593 -42 A 0.580 -43 G 0.584 -44 E 0.575 -45 R 0.542 -46 Q 0.502 -47 A 0.472 -48 L 0.446 -49 L 0.410 -50 T 0.360 -51 D 0.305 -52 P 0.258 -53 C 0.225 -54 M 0.207 -55 S 0.198 -56 L 0.188 -57 S 0.176 -58 P 0.171 -59 P 0.170 -60 C 0.159 -61 F 0.140 -62 T 0.123 -63 E 0.114 -64 E 0.106 -65 D 0.094 -66 R 0.082 -67 F 0.077 -68 S 0.074 -69 L 0.071 -70 E 0.068 -71 A 0.062 -72 L 0.053 -73 Q 0.046 -74 T 0.043 -75 I 0.044 -76 H 0.048 -77 K 0.056 -78 Q 0.068 -79 M 0.082 -80 D 0.102 -81 D 0.127 -82 D 0.147 -83 K 0.154 -84 D 0.153 -85 G 0.149 -86 G 0.141 -87 I 0.123 -88 E 0.100 -89 V 0.085 -90 D 0.081 -91 E 0.080 -92 S 0.074 -93 D 0.062 -94 E 0.054 -95 F 0.056 -96 I 0.069 -97 R 0.092 -98 E 0.114 -99 D 0.118 -100 M 0.103 -101 K 0.084 -102 Y 0.075 -103 K 0.076 -104 D 0.080 -105 A 0.081 -106 T 0.080 -107 N 0.079 -108 K 0.077 -109 H 0.076 -110 S 0.080 -111 H 0.089 -112 L 0.097 -113 H 0.099 -114 R 0.098 -115 E 0.097 -116 D 0.097 -117 K 0.098 -118 H 0.094 -119 I 0.082 -120 T 0.066 -121 V 0.058 -122 E 0.065 -123 D 0.076 -124 L 0.078 -125 W 0.072 -126 K 0.071 -127 Q 0.075 -128 W 0.077 -129 K 0.078 -130 T 0.078 -131 S 0.074 -132 E 0.068 -133 V 0.062 -134 H 0.059 -135 N 0.058 -136 W 0.056 -137 T 0.053 -138 L 0.047 -139 E 0.041 -140 D 0.036 -141 T 0.033 -142 L 0.032 -143 Q 0.031 -144 W 0.031 -145 L 0.032 -146 I 0.036 -147 E 0.044 -148 F 0.049 -149 V 0.051 -150 E 0.051 -151 L 0.052 -152 P 0.051 -153 Q 0.047 -154 Y 0.042 -155 E 0.040 -156 K 0.041 -157 N 0.045 -158 F 0.051 -159 R 0.055 -160 D 0.059 -161 N 0.065 -162 N 0.068 -163 V 0.064 -164 K 0.058 -165 G 0.055 -166 T 0.056 -167 T 0.058 -168 L 0.060 -169 P 0.063 -170 R 0.068 -171 I 0.076 -172 A 0.089 -173 V 0.101 -174 H 0.109 -175 E 0.109 -176 T 0.100 -177 S 0.080 -178 F 0.059 -179 M 0.047 -180 I 0.047 -181 S 0.053 -182 Q 0.058 -183 L 0.062 -184 K 0.069 -185 I 0.080 -186 S 0.091 -187 D 0.096 -188 R 0.094 -189 S 0.087 -190 H 0.079 -191 R 0.074 -192 Q 0.072 -193 K 0.073 -194 L 0.071 -195 Q 0.067 -196 L 0.063 -197 K 0.060 -198 A 0.057 -199 L 0.054 -200 D 0.055 -201 V 0.061 -202 V 0.072 -203 L 0.084 -204 F 0.103 -205 G 0.135 -206 P 0.184 -207 L 0.247 -208 T 0.319 -209 R 0.389 -210 P 0.432 -211 P 0.428 -212 H 0.384 -213 N 0.323 -214 W 0.272 -215 M 0.252 -216 K 0.263 -217 D 0.291 -218 F 0.322 -219 I 0.356 -220 L 0.396 -221 T 0.430 -222 I 0.448 -223 S 0.458 -224 I 0.461 -225 V 0.445 -226 I 0.409 -227 G 0.366 -228 V 0.328 -229 G 0.292 -230 G 0.255 -231 C 0.216 -232 W 0.188 -233 F 0.179 -234 A 0.183 -235 Y 0.197 -236 T 0.223 -237 Q 0.257 -238 N 0.285 -239 K 0.302 -240 T 0.312 -241 S 0.319 -242 K 0.322 -243 E 0.315 -244 H 0.303 -245 V 0.295 -246 A 0.288 -247 K 0.270 -248 M 0.242 -249 M 0.223 -250 K 0.225 -251 D 0.246 -252 L 0.277 -253 E 0.306 -254 S 0.321 -255 L 0.319 -256 Q 0.315 -257 T 0.320 -258 A 0.332 -259 E 0.343 -260 Q 0.351 -261 S 0.354 -262 L 0.352 -263 M 0.349 -264 D 0.341 -265 L 0.320 -266 Q 0.286 -267 E 0.253 -268 R 0.231 -269 L 0.222 -270 E 0.218 -271 K 0.217 -272 A 0.221 -273 Q 0.232 -274 E 0.244 -275 E 0.245 -276 N 0.235 -277 R 0.228 -278 T 0.229 -279 V 0.240 -280 A 0.255 -281 V 0.268 -282 E 0.267 -283 K 0.258 -284 Q 0.251 -285 N 0.244 -286 L 0.234 -287 E 0.222 -288 R 0.214 -289 K 0.209 -290 M 0.212 -291 M 0.227 -292 D 0.249 -293 E 0.261 -294 I 0.258 -295 N 0.252 -296 Y 0.255 -297 A 0.267 -298 K 0.283 -299 E 0.294 -300 E 0.292 -301 A 0.284 -302 C 0.278 -303 R 0.273 -304 L 0.259 -305 R 0.242 -306 E 0.233 -307 L 0.238 -308 R 0.255 -309 E 0.276 -310 G 0.288 -311 A 0.287 -312 E 0.280 -313 C 0.274 -314 E 0.275 -315 L 0.287 -316 S 0.305 -317 R 0.310 -318 R 0.299 -319 Q 0.287 -320 Y 0.283 -321 A 0.282 -322 E 0.285 -323 Q 0.298 -324 E 0.309 -325 L 0.308 -326 E 0.299 -327 Q 0.294 -328 V 0.289 -329 R 0.284 -330 M 0.284 -331 A 0.283 -332 L 0.278 -333 K 0.278 -334 K 0.287 -335 A 0.301 -336 E 0.310 -337 K 0.308 -338 E 0.295 -339 F 0.284 -340 E 0.287 -341 L 0.295 -342 R 0.296 -343 S 0.284 -344 S 0.260 -345 W 0.229 -346 S 0.195 -347 V 0.163 -348 P 0.138 -349 D 0.126 -350 A 0.124 -351 L 0.120 -352 Q 0.115 -353 K 0.111 -354 W 0.108 -355 L 0.106 -356 Q 0.103 -357 L 0.096 -358 T 0.084 -359 H 0.072 -360 E 0.064 -361 V 0.058 -362 E 0.050 -363 V 0.043 -364 Q 0.037 -365 Y 0.035 -366 Y 0.039 -367 N 0.047 -368 I 0.055 -369 K 0.065 -370 R 0.080 -371 Q 0.098 -372 N 0.111 -373 A 0.122 -374 E 0.133 -375 M 0.138 -376 Q 0.136 -377 L 0.139 -378 A 0.144 -379 I 0.140 -380 A 0.132 -381 K 0.131 -382 D 0.131 -383 E 0.127 -384 A 0.125 -385 E 0.128 -386 K 0.133 -387 I 0.143 -388 K 0.159 -389 K 0.180 -390 K 0.207 -391 R 0.246 -392 S 0.290 -393 T 0.319 -394 V 0.325 -395 F 0.319 -396 G 0.311 -397 T 0.307 -398 L 0.316 -399 H 0.343 -400 V 0.371 -401 A 0.381 -402 H 0.374 -403 S 0.361 -404 S 0.345 -405 S 0.335 -406 L 0.341 -407 D 0.353 -408 E 0.342 -409 V 0.300 -410 D 0.241 -411 H 0.184 -412 K 0.144 -413 I 0.129 -414 L 0.133 -415 E 0.134 -416 A 0.125 -417 K 0.114 -418 K 0.108 -419 A 0.103 -420 L 0.098 -421 S 0.094 -422 E 0.093 -423 L 0.094 -424 T 0.097 -425 T 0.098 -426 C 0.095 -427 L 0.089 -428 R 0.081 -429 E 0.070 -430 R 0.066 -431 L 0.071 -432 F 0.076 -433 R 0.072 -434 W 0.064 -435 Q 0.060 -436 Q 0.058 -437 I 0.056 -438 E 0.057 -439 K 0.063 -440 I 0.070 -441 C 0.077 -442 G 0.081 -443 F 0.084 -444 Q 0.085 -445 I 0.087 -446 A 0.094 -447 H 0.107 -448 N 0.125 -449 S 0.150 -450 G 0.184 -451 L 0.222 -452 P 0.245 -453 S 0.248 -454 L 0.248 -455 T 0.267 -456 S 0.301 -457 S 0.330 -458 L 0.357 -459 Y 0.394 -460 S 0.430 -461 D 0.443 -462 H 0.435 -463 S 0.435 -464 W 0.463 -465 V 0.511 -466 V 0.561 -467 M 0.606 -468 P 0.650 -469 R 0.684 -470 V 0.692 -471 S 0.672 -472 I 0.647 -473 P 0.647 -474 P 0.676 -475 Y 0.719 -476 P 0.763 -477 I 0.798 -478 A 0.821 -479 G 0.834 -480 G 0.842 -481 V 0.846 -482 D 0.844 -483 D 0.837 -484 L 0.826 -485 D 0.811 -486 E 0.788 -487 D 0.762 -488 T 0.747 -489 P 0.756 -490 P 0.780 -491 I 0.802 -492 V 0.811 -493 P 0.811 -494 Q 0.813 -495 F 0.824 -496 P 0.844 -497 G 0.859 -498 T 0.860 -499 V 0.849 -500 A 0.834 -501 K 0.827 -502 P 0.832 -503 A 0.845 -504 G 0.854 -505 S 0.856 -506 L 0.853 -507 A 0.848 -508 R 0.845 -509 S 0.842 -510 S 0.837 -511 S 0.832 -512 L 0.827 -513 C 0.827 -514 R 0.832 -515 S 0.839 -516 R 0.844 -517 R 0.846 -518 S 0.842 -519 I 0.833 -520 V 0.823 -521 P 0.816 -522 S 0.814 -523 S 0.816 -524 P 0.823 -525 Q 0.835 -526 S 0.845 -527 Q 0.848 -528 R 0.841 -529 A 0.826 -530 Q 0.807 -531 L 0.793 -532 P 0.790 -533 A 0.793 -534 H 0.797 -535 A 0.803 -536 P 0.812 -537 L 0.820 -538 A 0.821 -539 A 0.814 -540 H 0.807 -541 P 0.806 -542 R 0.811 -543 H 0.817 -544 P 0.820 -545 H 0.820 -546 H 0.820 -547 P 0.821 -548 Q 0.822 -549 H 0.828 -550 P 0.837 -551 Q 0.843 -552 H 0.841 -553 S 0.831 -554 L 0.817 -555 P 0.805 -556 S 0.804 -557 P 0.814 -558 D 0.829 -559 P 0.844 -560 D 0.855 -561 I 0.860 -562 L 0.860 -563 S 0.855 -564 V 0.847 -565 S 0.836 -566 S 0.829 -567 C 0.830 -568 P 0.839 -569 A 0.850 -570 L 0.853 -571 Y 0.850 -572 R 0.846 -573 N 0.842 -574 E 0.837 -575 E 0.833 -576 E 0.831 -577 E 0.830 -578 E 0.829 -579 A 0.826 -580 I 0.820 -581 Y 0.814 -582 F 0.807 -583 T 0.801 -584 A 0.799 -585 E 0.798 -586 K 0.796 -587 Q 0.791 -588 W 0.789 -589 E 0.791 -590 V 0.800 -591 P 0.815 -592 D 0.833 -593 T 0.846 -594 A 0.851 -595 S 0.851 -596 E 0.851 -597 C 0.852 -598 D 0.849 -599 S 0.843 -600 L 0.834 -601 N 0.826 -602 S 0.821 -603 S 0.818 -604 S 0.815 -605 G 0.810 -606 R 0.802 -607 K 0.793 -608 P 0.785 -609 S 0.781 -610 P 0.786 -611 P 0.796 -612 S 0.803 -613 S 0.802 -614 L 0.796 -615 E 0.787 -616 M 0.774 -617 Y 0.762 -618 Q 0.756 -619 T 0.757 -620 L 0.759 -621 S 0.761 -622 S 0.765 -623 R 0.772 -624 K 0.781 -625 I 0.791 -626 S 0.798 -627 R 0.802 -628 D 0.804 -629 E 0.803 -630 L 0.801 -631 S 0.803 -632 L 0.808 -633 E 0.814 -634 D 0.819 -635 S 0.821 -636 S 0.820 -637 R 0.813 -638 G 0.806 -639 E 0.800 -640 S 0.797 -641 P 0.789 -642 V 0.756 -643 T 0.700 -644 A 0.671 -645 D 0.705 -646 V 0.769 -647 S 0.812 -648 R 0.824 -649 G 0.823 -650 S 0.823 -651 P 0.829 -652 E 0.842 -653 C 0.856 -654 V 0.864 -655 G 0.866 -656 L 0.864 -657 T 0.863 -658 E 0.862 -659 T 0.860 -660 K 0.856 -661 S 0.850 -662 M 0.842 -663 I 0.833 -664 F 0.825 -665 S 0.824 -666 P 0.830 -667 A 0.843 -668 S 0.855 -669 R 0.862 -670 V 0.864 -671 Y 0.864 -672 N 0.863 -673 G 0.857 -674 I 0.847 -675 L 0.837 -676 E 0.830 -677 K 0.825 -678 S 0.817 -679 C 0.809 -680 S 0.806 -681 M 0.810 -682 H 0.817 -683 Q 0.819 -684 L 0.817 -685 S 0.812 -686 S 0.805 -687 G 0.793 -688 I 0.781 -689 P 0.773 -690 V 0.771 -691 P 0.776 -692 H 0.789 -693 P 0.807 -694 R 0.823 -695 H 0.834 -696 T 0.840 -697 S 0.842 -698 C 0.842 -699 S 0.843 -700 S 0.844 -701 A 0.842 -702 G 0.837 -703 N 0.829 -704 D 0.820 -705 S 0.813 -706 K 0.813 -707 P 0.823 -708 V 0.837 -709 Q 0.845 -710 E 0.845 -711 A 0.842 -712 S 0.839 -713 N 0.840 -714 V 0.842 -715 S 0.845 -716 R 0.845 -717 V 0.839 -718 S 0.827 -719 S 0.814 -720 I 0.809 -721 P 0.815 -722 H 0.827 -723 D 0.834 -724 L 0.835 -725 C 0.833 -726 H 0.832 -727 N 0.831 -728 G 0.827 -729 E 0.820 -730 K 0.807 -731 S 0.791 -732 K 0.777 -733 K 0.769 -734 P 0.770 -735 S 0.775 -736 K 0.774 -737 I 0.759 -738 K 0.736 -739 S 0.713 -740 L 0.696 -741 F 0.686 -742 K 0.683 -743 K 0.688 -744 K 0.696 -745 S 0.702 -746 K 0.704 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039156.20_ENSMUST00000117661.9_GN:Stim2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:66.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039156.20_ENSMUST00000117661.9_GN:Stim2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:66.caid deleted file mode 100644 index bfacab292b09a3fbc422a1d028cf60c2f55291cd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039156.20_ENSMUST00000117661.9_GN:Stim2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:66.caid +++ /dev/null @@ -1,813 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000039156.20|ENSMUST00000117661.9|GN:Stim2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:66 -1 M 0.308 -2 N 0.328 -3 A 0.352 -4 A 0.360 -5 A 0.340 -6 S 0.316 -7 R 0.328 -8 A 0.369 -9 S 0.404 -10 R 0.430 -11 A 0.466 -12 A 0.494 -13 G 0.496 -14 E 0.496 -15 G 0.508 -16 S 0.512 -17 G 0.512 -18 S 0.545 -19 A 0.605 -20 P 0.656 -21 G 0.682 -22 G 0.687 -23 S 0.680 -24 P 0.671 -25 L 0.672 -26 P 0.681 -27 R 0.686 -28 R 0.684 -29 P 0.690 -30 G 0.709 -31 P 0.733 -32 G 0.750 -33 Q 0.755 -34 L 0.752 -35 A 0.740 -36 V 0.718 -37 S 0.691 -38 E 0.659 -39 W 0.617 -40 P 0.572 -41 A 0.557 -42 A 0.587 -43 P 0.612 -44 V 0.594 -45 S 0.572 -46 A 0.601 -47 P 0.666 -48 P 0.722 -49 A 0.752 -50 V 0.763 -51 A 0.766 -52 P 0.770 -53 G 0.774 -54 R 0.770 -55 A 0.754 -56 S 0.733 -57 G 0.715 -58 R 0.702 -59 P 0.695 -60 L 0.686 -61 R 0.669 -62 R 0.636 -63 R 0.588 -64 W 0.540 -65 A 0.506 -66 A 0.482 -67 M 0.463 -68 L 0.457 -69 L 0.465 -70 F 0.463 -71 G 0.436 -72 L 0.402 -73 L 0.393 -74 V 0.428 -75 A 0.497 -76 G 0.569 -77 V 0.615 -78 A 0.635 -79 D 0.647 -80 G 0.652 -81 C 0.646 -82 D 0.626 -83 L 0.592 -84 V 0.553 -85 P 0.530 -86 R 0.534 -87 H 0.558 -88 L 0.589 -89 R 0.626 -90 G 0.665 -91 R 0.689 -92 R 0.684 -93 A 0.665 -94 S 0.664 -95 G 0.695 -96 S 0.736 -97 A 0.759 -98 G 0.760 -99 A 0.740 -100 A 0.710 -101 A 0.688 -102 S 0.686 -103 P 0.694 -104 S 0.697 -105 A 0.687 -106 A 0.664 -107 A 0.639 -108 A 0.626 -109 G 0.620 -110 E 0.599 -111 R 0.552 -112 Q 0.500 -113 A 0.460 -114 L 0.430 -115 L 0.398 -116 T 0.355 -117 D 0.306 -118 P 0.258 -119 C 0.218 -120 M 0.193 -121 S 0.182 -122 L 0.176 -123 S 0.174 -124 P 0.179 -125 P 0.184 -126 C 0.174 -127 F 0.150 -128 T 0.126 -129 E 0.111 -130 E 0.100 -131 D 0.089 -132 R 0.080 -133 F 0.076 -134 S 0.074 -135 L 0.070 -136 E 0.065 -137 A 0.059 -138 L 0.051 -139 Q 0.044 -140 T 0.042 -141 I 0.043 -142 H 0.048 -143 K 0.058 -144 Q 0.072 -145 M 0.089 -146 D 0.111 -147 D 0.137 -148 D 0.157 -149 K 0.164 -150 D 0.162 -151 G 0.160 -152 G 0.153 -153 I 0.135 -154 E 0.110 -155 V 0.094 -156 D 0.089 -157 E 0.089 -158 S 0.082 -159 D 0.070 -160 E 0.062 -161 F 0.064 -162 I 0.078 -163 R 0.101 -164 E 0.122 -165 D 0.127 -166 M 0.112 -167 K 0.095 -168 Y 0.089 -169 K 0.093 -170 D 0.097 -171 A 0.095 -172 T 0.091 -173 N 0.088 -174 K 0.085 -175 H 0.084 -176 S 0.087 -177 H 0.098 -178 L 0.109 -179 H 0.112 -180 R 0.109 -181 E 0.105 -182 D 0.104 -183 K 0.104 -184 H 0.101 -185 I 0.089 -186 T 0.072 -187 V 0.064 -188 E 0.071 -189 D 0.083 -190 L 0.083 -191 W 0.076 -192 K 0.074 -193 Q 0.077 -194 W 0.079 -195 K 0.079 -196 T 0.077 -197 S 0.073 -198 E 0.065 -199 V 0.058 -200 H 0.055 -201 N 0.054 -202 W 0.052 -203 T 0.048 -204 L 0.043 -205 E 0.038 -206 D 0.033 -207 T 0.030 -208 L 0.029 -209 Q 0.029 -210 W 0.029 -211 L 0.030 -212 I 0.034 -213 E 0.041 -214 F 0.047 -215 V 0.049 -216 E 0.048 -217 L 0.049 -218 P 0.048 -219 Q 0.044 -220 Y 0.040 -221 E 0.038 -222 K 0.039 -223 N 0.044 -224 F 0.049 -225 R 0.052 -226 D 0.055 -227 N 0.060 -228 N 0.062 -229 V 0.059 -230 K 0.054 -231 G 0.052 -232 T 0.053 -233 T 0.055 -234 L 0.057 -235 P 0.059 -236 R 0.062 -237 I 0.069 -238 A 0.078 -239 V 0.086 -240 H 0.090 -241 E 0.089 -242 T 0.081 -243 S 0.066 -244 F 0.049 -245 M 0.041 -246 I 0.042 -247 S 0.047 -248 Q 0.052 -249 L 0.056 -250 K 0.062 -251 I 0.072 -252 S 0.082 -253 D 0.086 -254 R 0.085 -255 S 0.079 -256 H 0.073 -257 R 0.069 -258 Q 0.068 -259 K 0.068 -260 L 0.066 -261 Q 0.062 -262 L 0.058 -263 K 0.056 -264 A 0.052 -265 L 0.049 -266 D 0.049 -267 V 0.054 -268 V 0.063 -269 L 0.075 -270 F 0.094 -271 G 0.125 -272 P 0.172 -273 L 0.233 -274 T 0.304 -275 R 0.373 -276 P 0.416 -277 P 0.415 -278 H 0.375 -279 N 0.318 -280 W 0.271 -281 M 0.253 -282 K 0.265 -283 D 0.292 -284 F 0.319 -285 I 0.350 -286 L 0.389 -287 T 0.422 -288 I 0.437 -289 S 0.443 -290 I 0.448 -291 V 0.437 -292 I 0.401 -293 G 0.356 -294 V 0.316 -295 G 0.282 -296 G 0.246 -297 C 0.211 -298 W 0.188 -299 F 0.184 -300 A 0.191 -301 Y 0.205 -302 T 0.232 -303 Q 0.265 -304 N 0.293 -305 K 0.312 -306 T 0.325 -307 S 0.333 -308 K 0.336 -309 E 0.329 -310 H 0.315 -311 V 0.304 -312 A 0.295 -313 K 0.276 -314 M 0.245 -315 M 0.223 -316 K 0.224 -317 D 0.245 -318 L 0.278 -319 E 0.312 -320 S 0.330 -321 L 0.330 -322 Q 0.328 -323 T 0.335 -324 A 0.348 -325 E 0.361 -326 Q 0.374 -327 S 0.379 -328 L 0.376 -329 M 0.370 -330 D 0.361 -331 L 0.338 -332 Q 0.303 -333 E 0.269 -334 R 0.250 -335 L 0.248 -336 E 0.257 -337 K 0.263 -338 A 0.264 -339 Q 0.270 -340 E 0.282 -341 E 0.284 -342 N 0.274 -343 R 0.265 -344 T 0.266 -345 V 0.277 -346 A 0.294 -347 V 0.308 -348 E 0.306 -349 K 0.291 -350 Q 0.278 -351 N 0.269 -352 L 0.257 -353 E 0.244 -354 R 0.235 -355 K 0.231 -356 M 0.235 -357 M 0.252 -358 D 0.276 -359 E 0.289 -360 I 0.286 -361 N 0.281 -362 Y 0.286 -363 A 0.302 -364 K 0.321 -365 E 0.333 -366 E 0.330 -367 A 0.321 -368 C 0.316 -369 R 0.312 -370 L 0.302 -371 R 0.290 -372 E 0.281 -373 L 0.277 -374 R 0.282 -375 E 0.296 -376 G 0.305 -377 A 0.304 -378 E 0.297 -379 C 0.291 -380 E 0.292 -381 L 0.305 -382 S 0.324 -383 R 0.328 -384 R 0.313 -385 Q 0.297 -386 Y 0.290 -387 A 0.286 -388 E 0.290 -389 Q 0.307 -390 E 0.324 -391 L 0.324 -392 E 0.315 -393 Q 0.307 -394 V 0.298 -395 R 0.288 -396 M 0.285 -397 A 0.282 -398 L 0.276 -399 K 0.273 -400 K 0.281 -401 A 0.295 -402 E 0.304 -403 K 0.300 -404 E 0.285 -405 F 0.273 -406 E 0.275 -407 L 0.282 -408 R 0.284 -409 S 0.276 -410 S 0.256 -411 W 0.226 -412 S 0.192 -413 V 0.157 -414 P 0.132 -415 D 0.121 -416 A 0.120 -417 L 0.117 -418 Q 0.110 -419 K 0.105 -420 W 0.103 -421 L 0.101 -422 Q 0.099 -423 L 0.091 -424 T 0.078 -425 H 0.067 -426 E 0.061 -427 V 0.056 -428 E 0.050 -429 V 0.044 -430 Q 0.038 -431 Y 0.036 -432 Y 0.041 -433 N 0.050 -434 I 0.060 -435 K 0.071 -436 R 0.089 -437 Q 0.107 -438 N 0.119 -439 A 0.129 -440 E 0.140 -441 M 0.145 -442 Q 0.143 -443 L 0.146 -444 A 0.151 -445 I 0.144 -446 A 0.133 -447 K 0.129 -448 D 0.129 -449 E 0.126 -450 A 0.125 -451 E 0.128 -452 K 0.133 -453 I 0.144 -454 K 0.163 -455 K 0.186 -456 K 0.214 -457 R 0.252 -458 S 0.294 -459 T 0.323 -460 V 0.330 -461 F 0.325 -462 G 0.317 -463 T 0.313 -464 L 0.324 -465 H 0.352 -466 V 0.382 -467 A 0.394 -468 H 0.389 -469 S 0.380 -470 S 0.368 -471 S 0.359 -472 L 0.366 -473 D 0.380 -474 E 0.368 -475 V 0.322 -476 D 0.257 -477 H 0.195 -478 K 0.153 -479 I 0.141 -480 L 0.149 -481 E 0.152 -482 A 0.143 -483 K 0.130 -484 K 0.121 -485 A 0.113 -486 L 0.106 -487 S 0.102 -488 E 0.100 -489 L 0.100 -490 T 0.102 -491 T 0.103 -492 C 0.103 -493 L 0.100 -494 R 0.093 -495 E 0.081 -496 R 0.072 -497 L 0.072 -498 F 0.074 -499 R 0.071 -500 W 0.068 -501 Q 0.068 -502 Q 0.067 -503 I 0.064 -504 E 0.064 -505 K 0.069 -506 I 0.077 -507 C 0.084 -508 G 0.089 -509 F 0.091 -510 Q 0.091 -511 I 0.092 -512 A 0.098 -513 H 0.112 -514 N 0.133 -515 S 0.160 -516 G 0.194 -517 L 0.230 -518 P 0.249 -519 S 0.245 -520 L 0.239 -521 T 0.253 -522 S 0.283 -523 S 0.310 -524 L 0.339 -525 Y 0.380 -526 S 0.419 -527 D 0.430 -528 H 0.416 -529 S 0.409 -530 W 0.434 -531 V 0.487 -532 V 0.546 -533 M 0.597 -534 P 0.642 -535 R 0.676 -536 V 0.684 -537 S 0.666 -538 I 0.643 -539 P 0.646 -540 P 0.677 -541 Y 0.720 -542 P 0.763 -543 I 0.797 -544 A 0.819 -545 G 0.832 -546 G 0.841 -547 V 0.845 -548 D 0.844 -549 D 0.837 -550 L 0.826 -551 D 0.810 -552 E 0.786 -553 D 0.759 -554 T 0.745 -555 P 0.755 -556 P 0.780 -557 I 0.802 -558 V 0.811 -559 P 0.810 -560 Q 0.810 -561 F 0.821 -562 P 0.841 -563 G 0.856 -564 T 0.858 -565 V 0.848 -566 A 0.834 -567 K 0.827 -568 P 0.832 -569 A 0.843 -570 G 0.851 -571 S 0.851 -572 L 0.847 -573 A 0.843 -574 R 0.839 -575 S 0.835 -576 S 0.829 -577 S 0.823 -578 L 0.819 -579 C 0.819 -580 R 0.824 -581 S 0.831 -582 R 0.836 -583 R 0.837 -584 S 0.833 -585 I 0.825 -586 V 0.816 -587 P 0.811 -588 S 0.809 -589 S 0.811 -590 P 0.817 -591 Q 0.828 -592 S 0.837 -593 Q 0.839 -594 R 0.833 -595 A 0.817 -596 Q 0.798 -597 L 0.785 -598 P 0.782 -599 A 0.786 -600 H 0.789 -601 A 0.794 -602 P 0.803 -603 L 0.810 -604 A 0.811 -605 A 0.804 -606 H 0.798 -607 P 0.797 -608 R 0.803 -609 H 0.809 -610 P 0.813 -611 H 0.815 -612 H 0.815 -613 P 0.815 -614 Q 0.816 -615 H 0.821 -616 P 0.830 -617 Q 0.836 -618 H 0.835 -619 S 0.825 -620 L 0.811 -621 P 0.801 -622 S 0.801 -623 P 0.810 -624 D 0.825 -625 P 0.840 -626 D 0.851 -627 I 0.855 -628 L 0.854 -629 S 0.850 -630 V 0.842 -631 S 0.831 -632 S 0.823 -633 C 0.825 -634 P 0.835 -635 A 0.846 -636 L 0.850 -637 Y 0.847 -638 R 0.843 -639 N 0.840 -640 E 0.836 -641 E 0.832 -642 E 0.830 -643 E 0.829 -644 E 0.828 -645 A 0.824 -646 I 0.819 -647 Y 0.812 -648 F 0.806 -649 T 0.800 -650 A 0.798 -651 E 0.798 -652 K 0.796 -653 Q 0.793 -654 W 0.790 -655 E 0.793 -656 V 0.801 -657 P 0.816 -658 D 0.834 -659 T 0.847 -660 A 0.851 -661 S 0.851 -662 E 0.851 -663 C 0.851 -664 D 0.848 -665 S 0.842 -666 L 0.834 -667 N 0.826 -668 S 0.820 -669 S 0.817 -670 S 0.815 -671 G 0.810 -672 R 0.804 -673 K 0.796 -674 P 0.789 -675 S 0.786 -676 P 0.791 -677 P 0.801 -678 S 0.808 -679 S 0.807 -680 L 0.801 -681 E 0.791 -682 M 0.778 -683 Y 0.765 -684 Q 0.758 -685 T 0.757 -686 L 0.758 -687 S 0.760 -688 S 0.764 -689 R 0.771 -690 K 0.782 -691 I 0.793 -692 S 0.800 -693 R 0.804 -694 D 0.805 -695 E 0.804 -696 L 0.802 -697 S 0.803 -698 L 0.808 -699 E 0.814 -700 D 0.820 -701 S 0.822 -702 S 0.821 -703 R 0.815 -704 G 0.808 -705 E 0.802 -706 S 0.799 -707 P 0.791 -708 V 0.759 -709 T 0.704 -710 A 0.676 -711 D 0.710 -712 V 0.773 -713 S 0.814 -714 R 0.826 -715 G 0.825 -716 S 0.825 -717 P 0.831 -718 E 0.844 -719 C 0.857 -720 V 0.865 -721 G 0.866 -722 L 0.865 -723 T 0.864 -724 E 0.864 -725 T 0.862 -726 K 0.859 -727 S 0.853 -728 M 0.844 -729 I 0.834 -730 F 0.826 -731 S 0.825 -732 P 0.831 -733 A 0.844 -734 S 0.856 -735 R 0.862 -736 V 0.863 -737 Y 0.863 -738 N 0.862 -739 G 0.856 -740 I 0.846 -741 L 0.835 -742 E 0.828 -743 K 0.822 -744 S 0.815 -745 C 0.805 -746 S 0.801 -747 M 0.804 -748 H 0.812 -749 Q 0.815 -750 L 0.814 -751 S 0.810 -752 S 0.803 -753 G 0.792 -754 I 0.781 -755 P 0.773 -756 V 0.770 -757 P 0.775 -758 H 0.787 -759 P 0.805 -760 R 0.820 -761 H 0.831 -762 T 0.838 -763 S 0.840 -764 C 0.840 -765 S 0.841 -766 S 0.843 -767 A 0.842 -768 G 0.837 -769 N 0.830 -770 D 0.821 -771 S 0.814 -772 K 0.814 -773 P 0.825 -774 V 0.838 -775 Q 0.845 -776 E 0.845 -777 A 0.841 -778 S 0.838 -779 N 0.839 -780 V 0.841 -781 S 0.842 -782 R 0.843 -783 V 0.837 -784 S 0.825 -785 S 0.811 -786 I 0.807 -787 P 0.814 -788 H 0.826 -789 D 0.834 -790 L 0.835 -791 C 0.833 -792 H 0.832 -793 N 0.831 -794 G 0.828 -795 E 0.820 -796 K 0.808 -797 S 0.791 -798 K 0.776 -799 K 0.769 -800 P 0.771 -801 S 0.777 -802 K 0.776 -803 I 0.763 -804 K 0.741 -805 S 0.719 -806 L 0.704 -807 F 0.696 -808 K 0.695 -809 K 0.699 -810 K 0.704 -811 S 0.707 -812 K 0.707 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039917.11_ENSMUST00000043707.7_GN:Rhbdd2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039917.11_ENSMUST00000043707.7_GN:Rhbdd2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 0e22c40db35134065d807bb32719d352ace4fd60..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039917.11_ENSMUST00000043707.7_GN:Rhbdd2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,362 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000039917.11|ENSMUST00000043707.7|GN:Rhbdd2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.385 -2 A 0.399 -3 A 0.417 -4 P 0.430 -5 G 0.435 -6 P 0.436 -7 A 0.432 -8 S 0.414 -9 R 0.370 -10 F 0.303 -11 W 0.246 -12 C 0.227 -13 S 0.237 -14 C 0.249 -15 P 0.249 -16 E 0.236 -17 V 0.206 -18 P 0.159 -19 S 0.109 -20 A 0.072 -21 T 0.052 -22 F 0.045 -23 F 0.045 -24 T 0.047 -25 A 0.047 -26 L 0.047 -27 L 0.048 -28 S 0.046 -29 L 0.040 -30 L 0.035 -31 V 0.042 -32 S 0.060 -33 G 0.079 -34 P 0.089 -35 R 0.092 -36 L 0.098 -37 F 0.112 -38 L 0.129 -39 L 0.148 -40 Q 0.175 -41 P 0.210 -42 P 0.248 -43 L 0.282 -44 A 0.308 -45 P 0.316 -46 S 0.300 -47 G 0.260 -48 L 0.203 -49 S 0.147 -50 L 0.109 -51 R 0.090 -52 S 0.079 -53 E 0.071 -54 A 0.069 -55 L 0.074 -56 R 0.082 -57 N 0.087 -58 W 0.087 -59 Q 0.085 -60 V 0.085 -61 Y 0.091 -62 R 0.101 -63 L 0.114 -64 V 0.130 -65 T 0.146 -66 Y 0.147 -67 I 0.128 -68 F 0.105 -69 V 0.094 -70 Y 0.100 -71 E 0.117 -72 N 0.129 -73 P 0.129 -74 V 0.121 -75 S 0.113 -76 L 0.104 -77 L 0.095 -78 C 0.092 -79 G 0.090 -80 A 0.081 -81 I 0.069 -82 I 0.060 -83 I 0.055 -84 W 0.048 -85 R 0.038 -86 F 0.030 -87 A 0.027 -88 G 0.025 -89 N 0.025 -90 F 0.027 -91 E 0.031 -92 R 0.036 -93 T 0.042 -94 V 0.050 -95 G 0.054 -96 T 0.049 -97 V 0.038 -98 R 0.028 -99 H 0.022 -100 C 0.020 -101 F 0.021 -102 F 0.024 -103 T 0.026 -104 L 0.026 -105 I 0.025 -106 F 0.025 -107 T 0.025 -108 V 0.024 -109 F 0.024 -110 S 0.027 -111 A 0.031 -112 I 0.034 -113 I 0.035 -114 Y 0.038 -115 L 0.040 -116 S 0.040 -117 F 0.044 -118 E 0.054 -119 S 0.069 -120 V 0.091 -121 S 0.117 -122 S 0.144 -123 L 0.173 -124 S 0.209 -125 K 0.250 -126 L 0.285 -127 G 0.306 -128 E 0.309 -129 V 0.287 -130 E 0.241 -131 D 0.183 -132 A 0.133 -133 R 0.107 -134 G 0.103 -135 F 0.109 -136 T 0.117 -137 P 0.120 -138 V 0.112 -139 A 0.095 -140 F 0.079 -141 A 0.069 -142 M 0.064 -143 L 0.057 -144 G 0.051 -145 V 0.051 -146 T 0.059 -147 S 0.067 -148 V 0.072 -149 R 0.078 -150 S 0.086 -151 R 0.092 -152 M 0.091 -153 R 0.086 -154 R 0.080 -155 A 0.076 -156 L 0.077 -157 V 0.086 -158 F 0.105 -159 G 0.127 -160 V 0.140 -161 V 0.133 -162 V 0.110 -163 P 0.085 -164 S 0.070 -165 V 0.062 -166 L 0.058 -167 V 0.055 -168 P 0.052 -169 W 0.050 -170 L 0.053 -171 L 0.057 -172 L 0.056 -173 C 0.053 -174 A 0.054 -175 S 0.061 -176 W 0.072 -177 L 0.087 -178 I 0.101 -179 P 0.110 -180 Q 0.113 -181 T 0.115 -182 S 0.113 -183 F 0.106 -184 L 0.104 -185 S 0.112 -186 N 0.115 -187 V 0.102 -188 S 0.078 -189 G 0.057 -190 L 0.045 -191 L 0.041 -192 I 0.040 -193 G 0.037 -194 L 0.033 -195 S 0.029 -196 Y 0.028 -197 G 0.027 -198 L 0.029 -199 T 0.033 -200 Y 0.043 -201 C 0.059 -202 Y 0.081 -203 S 0.104 -204 L 0.116 -205 D 0.112 -206 L 0.098 -207 S 0.083 -208 E 0.069 -209 R 0.058 -210 V 0.052 -211 A 0.053 -212 L 0.059 -213 K 0.065 -214 L 0.070 -215 D 0.071 -216 Q 0.069 -217 K 0.071 -218 F 0.076 -219 P 0.078 -220 F 0.073 -221 S 0.068 -222 L 0.067 -223 M 0.070 -224 R 0.080 -225 R 0.095 -226 I 0.104 -227 P 0.098 -228 L 0.082 -229 F 0.070 -230 K 0.073 -231 Y 0.090 -232 I 0.125 -233 S 0.172 -234 G 0.213 -235 S 0.235 -236 S 0.235 -237 A 0.220 -238 E 0.205 -239 R 0.201 -240 R 0.213 -241 A 0.238 -242 A 0.271 -243 Q 0.307 -244 S 0.345 -245 R 0.390 -246 R 0.448 -247 L 0.510 -248 N 0.564 -249 P 0.610 -250 A 0.657 -251 P 0.698 -252 G 0.724 -253 S 0.733 -254 Y 0.738 -255 P 0.748 -256 T 0.762 -257 Q 0.769 -258 S 0.763 -259 C 0.749 -260 H 0.739 -261 P 0.739 -262 H 0.742 -263 L 0.737 -264 T 0.729 -265 P 0.724 -266 S 0.726 -267 Y 0.735 -268 P 0.741 -269 V 0.720 -270 T 0.672 -271 Q 0.645 -272 M 0.680 -273 Q 0.745 -274 H 0.790 -275 A 0.805 -276 S 0.804 -277 G 0.801 -278 Q 0.802 -279 K 0.804 -280 L 0.795 -281 A 0.766 -282 S 0.723 -283 W 0.687 -284 P 0.688 -285 P 0.720 -286 G 0.754 -287 H 0.768 -288 M 0.768 -289 P 0.765 -290 S 0.762 -291 L 0.758 -292 P 0.754 -293 P 0.751 -294 Y 0.749 -295 Q 0.756 -296 P 0.770 -297 A 0.782 -298 S 0.786 -299 G 0.784 -300 L 0.781 -301 C 0.784 -302 Y 0.789 -303 V 0.790 -304 Q 0.782 -305 N 0.767 -306 H 0.748 -307 F 0.733 -308 G 0.730 -309 P 0.737 -310 N 0.752 -311 P 0.771 -312 N 0.793 -313 A 0.813 -314 S 0.823 -315 S 0.820 -316 V 0.811 -317 Y 0.810 -318 P 0.822 -319 A 0.842 -320 S 0.856 -321 A 0.860 -322 G 0.855 -323 T 0.848 -324 S 0.840 -325 Q 0.830 -326 G 0.811 -327 V 0.783 -328 Q 0.754 -329 P 0.738 -330 P 0.740 -331 S 0.753 -332 P 0.761 -333 I 0.757 -334 S 0.749 -335 C 0.752 -336 P 0.766 -337 G 0.778 -338 T 0.769 -339 V 0.723 -340 Y 0.658 -341 S 0.630 -342 G 0.669 -343 A 0.733 -344 L 0.771 -345 G 0.779 -346 T 0.781 -347 P 0.788 -348 G 0.791 -349 A 0.771 -350 T 0.705 -351 G 0.594 -352 S 0.493 -353 K 0.477 -354 E 0.528 -355 S 0.571 -356 S 0.595 -357 K 0.632 -358 V 0.654 -359 A 0.617 -360 M 0.535 -361 P 0.468 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039917.11_ENSMUST00000043707.7_GN:Rhbdd2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:41.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039917.11_ENSMUST00000043707.7_GN:Rhbdd2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:41.caid deleted file mode 100644 index 2fc7bad17fcd3a715b09f4a5adb7cba0aee905a1..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000039917.11_ENSMUST00000043707.7_GN:Rhbdd2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:41.caid +++ /dev/null @@ -1,403 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000039917.11|ENSMUST00000043707.7|GN:Rhbdd2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:41 -1 M 0.375 -2 G 0.405 -3 R 0.447 -4 C 0.477 -5 L 0.480 -6 R 0.469 -7 R 0.484 -8 G 0.535 -9 Q 0.582 -10 S 0.595 -11 S 0.595 -12 A 0.596 -13 V 0.577 -14 A 0.535 -15 R 0.501 -16 G 0.485 -17 D 0.447 -18 R 0.392 -19 R 0.376 -20 K 0.408 -21 E 0.447 -22 A 0.486 -23 E 0.545 -24 I 0.605 -25 E 0.641 -26 E 0.661 -27 G 0.680 -28 G 0.693 -29 G 0.693 -30 E 0.682 -31 Y 0.669 -32 R 0.655 -33 G 0.631 -34 R 0.583 -35 T 0.517 -36 L 0.455 -37 E 0.424 -38 G 0.424 -39 L 0.431 -40 A 0.444 -41 A 0.474 -42 M 0.513 -43 A 0.536 -44 A 0.529 -45 P 0.506 -46 G 0.487 -47 P 0.475 -48 A 0.460 -49 S 0.434 -50 R 0.382 -51 F 0.309 -52 W 0.246 -53 C 0.221 -54 S 0.228 -55 C 0.239 -56 P 0.237 -57 E 0.223 -58 V 0.195 -59 P 0.151 -60 S 0.104 -61 A 0.068 -62 T 0.049 -63 F 0.041 -64 F 0.041 -65 T 0.044 -66 A 0.044 -67 L 0.043 -68 L 0.044 -69 S 0.043 -70 L 0.037 -71 L 0.032 -72 V 0.036 -73 S 0.052 -74 G 0.068 -75 P 0.076 -76 R 0.078 -77 L 0.082 -78 F 0.092 -79 L 0.108 -80 L 0.127 -81 Q 0.154 -82 P 0.190 -83 P 0.227 -84 L 0.260 -85 A 0.286 -86 P 0.295 -87 S 0.278 -88 G 0.239 -89 L 0.185 -90 S 0.133 -91 L 0.097 -92 R 0.078 -93 S 0.068 -94 E 0.062 -95 A 0.060 -96 L 0.064 -97 R 0.071 -98 N 0.076 -99 W 0.076 -100 Q 0.075 -101 V 0.076 -102 Y 0.082 -103 R 0.093 -104 L 0.104 -105 V 0.121 -106 T 0.137 -107 Y 0.138 -108 I 0.121 -109 F 0.099 -110 V 0.087 -111 Y 0.091 -112 E 0.104 -113 N 0.116 -114 P 0.117 -115 V 0.113 -116 S 0.107 -117 L 0.098 -118 L 0.090 -119 C 0.088 -120 G 0.088 -121 A 0.079 -122 I 0.066 -123 I 0.057 -124 I 0.051 -125 W 0.044 -126 R 0.035 -127 F 0.028 -128 A 0.025 -129 G 0.023 -130 N 0.024 -131 F 0.026 -132 E 0.030 -133 R 0.034 -134 T 0.040 -135 V 0.048 -136 G 0.053 -137 T 0.048 -138 V 0.037 -139 R 0.028 -140 H 0.023 -141 C 0.021 -142 F 0.021 -143 F 0.024 -144 T 0.026 -145 L 0.026 -146 I 0.025 -147 F 0.025 -148 T 0.025 -149 V 0.024 -150 F 0.025 -151 S 0.029 -152 A 0.033 -153 I 0.035 -154 I 0.037 -155 Y 0.039 -156 L 0.040 -157 S 0.041 -158 F 0.045 -159 E 0.055 -160 S 0.071 -161 V 0.094 -162 S 0.123 -163 S 0.153 -164 L 0.183 -165 S 0.222 -166 K 0.264 -167 L 0.299 -168 G 0.320 -169 E 0.321 -170 V 0.297 -171 E 0.249 -172 D 0.188 -173 A 0.136 -174 R 0.109 -175 G 0.104 -176 F 0.110 -177 T 0.118 -178 P 0.121 -179 V 0.113 -180 A 0.095 -181 F 0.078 -182 A 0.069 -183 M 0.063 -184 L 0.057 -185 G 0.050 -186 V 0.051 -187 T 0.058 -188 S 0.067 -189 V 0.074 -190 R 0.081 -191 S 0.091 -192 R 0.097 -193 M 0.095 -194 R 0.088 -195 R 0.081 -196 A 0.076 -197 L 0.076 -198 V 0.085 -199 F 0.102 -200 G 0.121 -201 V 0.131 -202 V 0.124 -203 V 0.103 -204 P 0.080 -205 S 0.066 -206 V 0.058 -207 L 0.054 -208 V 0.051 -209 P 0.048 -210 W 0.047 -211 L 0.050 -212 L 0.054 -213 L 0.053 -214 C 0.050 -215 A 0.050 -216 S 0.055 -217 W 0.064 -218 L 0.078 -219 I 0.092 -220 P 0.100 -221 Q 0.103 -222 T 0.105 -223 S 0.103 -224 F 0.098 -225 L 0.099 -226 S 0.108 -227 N 0.112 -228 V 0.100 -229 S 0.076 -230 G 0.054 -231 L 0.042 -232 L 0.039 -233 I 0.038 -234 G 0.035 -235 L 0.031 -236 S 0.028 -237 Y 0.026 -238 G 0.026 -239 L 0.027 -240 T 0.031 -241 Y 0.040 -242 C 0.056 -243 Y 0.078 -244 S 0.100 -245 L 0.113 -246 D 0.110 -247 L 0.097 -248 S 0.082 -249 E 0.068 -250 R 0.057 -251 V 0.051 -252 A 0.053 -253 L 0.058 -254 K 0.063 -255 L 0.068 -256 D 0.070 -257 Q 0.070 -258 K 0.072 -259 F 0.077 -260 P 0.078 -261 F 0.073 -262 S 0.068 -263 L 0.067 -264 M 0.070 -265 R 0.079 -266 R 0.093 -267 I 0.102 -268 P 0.096 -269 L 0.080 -270 F 0.069 -271 K 0.072 -272 Y 0.089 -273 I 0.124 -274 S 0.171 -275 G 0.213 -276 S 0.235 -277 S 0.235 -278 A 0.222 -279 E 0.207 -280 R 0.203 -281 R 0.215 -282 A 0.240 -283 A 0.272 -284 Q 0.308 -285 S 0.348 -286 R 0.394 -287 R 0.453 -288 L 0.515 -289 N 0.570 -290 P 0.617 -291 A 0.664 -292 P 0.706 -293 G 0.731 -294 S 0.740 -295 Y 0.745 -296 P 0.755 -297 T 0.770 -298 Q 0.777 -299 S 0.772 -300 C 0.758 -301 H 0.748 -302 P 0.748 -303 H 0.752 -304 L 0.750 -305 T 0.742 -306 P 0.737 -307 S 0.739 -308 Y 0.748 -309 P 0.753 -310 V 0.732 -311 T 0.684 -312 Q 0.658 -313 M 0.693 -314 Q 0.759 -315 H 0.805 -316 A 0.820 -317 S 0.820 -318 G 0.818 -319 Q 0.819 -320 K 0.821 -321 L 0.814 -322 A 0.789 -323 S 0.750 -324 W 0.717 -325 P 0.716 -326 P 0.746 -327 G 0.778 -328 H 0.790 -329 M 0.789 -330 P 0.785 -331 S 0.781 -332 L 0.776 -333 P 0.772 -334 P 0.769 -335 Y 0.767 -336 Q 0.773 -337 P 0.786 -338 A 0.797 -339 S 0.800 -340 G 0.797 -341 L 0.795 -342 C 0.797 -343 Y 0.802 -344 V 0.803 -345 Q 0.795 -346 N 0.781 -347 H 0.763 -348 F 0.749 -349 G 0.745 -350 P 0.750 -351 N 0.763 -352 P 0.782 -353 N 0.803 -354 A 0.822 -355 S 0.832 -356 S 0.830 -357 V 0.822 -358 Y 0.821 -359 P 0.834 -360 A 0.852 -361 S 0.864 -362 A 0.868 -363 G 0.864 -364 T 0.857 -365 S 0.850 -366 Q 0.840 -367 G 0.822 -368 V 0.796 -369 Q 0.770 -370 P 0.755 -371 P 0.757 -372 S 0.768 -373 P 0.774 -374 I 0.770 -375 S 0.762 -376 C 0.762 -377 P 0.774 -378 G 0.784 -379 T 0.774 -380 V 0.727 -381 Y 0.660 -382 S 0.632 -383 G 0.671 -384 A 0.736 -385 L 0.775 -386 G 0.785 -387 T 0.789 -388 P 0.796 -389 G 0.800 -390 A 0.784 -391 T 0.734 -392 G 0.664 -393 S 0.623 -394 K 0.637 -395 E 0.657 -396 S 0.640 -397 S 0.623 -398 K 0.644 -399 V 0.665 -400 A 0.631 -401 M 0.551 -402 P 0.485 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040133.3_ENSMUST00000039160.3_GN:Gpr176_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040133.3_ENSMUST00000039160.3_GN:Gpr176_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 658f67c0acb0b768edfa2071cce91ff6d5215d07..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040133.3_ENSMUST00000039160.3_GN:Gpr176_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,516 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000040133.3|ENSMUST00000039160.3|GN:Gpr176|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.366 -2 G 0.389 -3 H 0.417 -4 N 0.426 -5 S 0.406 -6 S 0.385 -7 W 0.397 -8 V 0.439 -9 S 0.484 -10 P 0.505 -11 N 0.490 -12 T 0.453 -13 S 0.437 -14 H 0.476 -15 P 0.548 -16 R 0.610 -17 N 0.641 -18 T 0.644 -19 S 0.618 -20 G 0.570 -21 A 0.535 -22 E 0.545 -23 A 0.579 -24 G 0.593 -25 A 0.568 -26 N 0.518 -27 L 0.469 -28 S 0.441 -29 A 0.430 -30 F 0.418 -31 G 0.392 -32 E 0.344 -33 L 0.280 -34 S 0.216 -35 E 0.162 -36 A 0.122 -37 Q 0.094 -38 L 0.080 -39 Y 0.072 -40 R 0.062 -41 Q 0.050 -42 F 0.042 -43 T 0.040 -44 T 0.040 -45 T 0.039 -46 V 0.037 -47 Q 0.035 -48 V 0.033 -49 V 0.032 -50 I 0.034 -51 F 0.037 -52 I 0.042 -53 G 0.047 -54 S 0.048 -55 L 0.044 -56 L 0.041 -57 G 0.039 -58 N 0.039 -59 F 0.040 -60 M 0.042 -61 V 0.040 -62 L 0.036 -63 W 0.033 -64 S 0.033 -65 T 0.034 -66 C 0.038 -67 R 0.045 -68 T 0.051 -69 T 0.056 -70 V 0.061 -71 F 0.064 -72 K 0.065 -73 S 0.062 -74 V 0.054 -75 T 0.041 -76 N 0.029 -77 R 0.024 -78 F 0.024 -79 I 0.028 -80 K 0.033 -81 N 0.036 -82 L 0.038 -83 A 0.039 -84 C 0.039 -85 S 0.038 -86 G 0.038 -87 I 0.038 -88 C 0.035 -89 A 0.030 -90 S 0.026 -91 V 0.025 -92 V 0.026 -93 C 0.029 -94 V 0.033 -95 P 0.034 -96 F 0.033 -97 D 0.031 -98 I 0.032 -99 I 0.040 -100 L 0.058 -101 S 0.087 -102 S 0.122 -103 S 0.148 -104 P 0.153 -105 H 0.138 -106 C 0.116 -107 C 0.095 -108 W 0.078 -109 W 0.064 -110 I 0.054 -111 Y 0.047 -112 T 0.042 -113 M 0.038 -114 L 0.033 -115 F 0.028 -116 C 0.026 -117 K 0.026 -118 V 0.028 -119 L 0.031 -120 K 0.034 -121 F 0.036 -122 L 0.035 -123 H 0.032 -124 K 0.028 -125 V 0.026 -126 F 0.027 -127 C 0.031 -128 S 0.035 -129 V 0.036 -130 T 0.035 -131 V 0.035 -132 L 0.035 -133 S 0.032 -134 F 0.028 -135 P 0.024 -136 A 0.023 -137 I 0.024 -138 A 0.028 -139 L 0.033 -140 D 0.037 -141 R 0.039 -142 Y 0.038 -143 Y 0.041 -144 S 0.051 -145 V 0.069 -146 L 0.091 -147 Y 0.110 -148 P 0.119 -149 L 0.118 -150 E 0.115 -151 R 0.114 -152 K 0.110 -153 I 0.099 -154 S 0.085 -155 D 0.075 -156 A 0.067 -157 K 0.060 -158 S 0.058 -159 R 0.064 -160 E 0.068 -161 L 0.063 -162 V 0.052 -163 M 0.043 -164 Y 0.042 -165 I 0.044 -166 W 0.044 -167 A 0.043 -168 H 0.044 -169 A 0.047 -170 V 0.052 -171 V 0.061 -172 A 0.070 -173 S 0.074 -174 V 0.069 -175 P 0.061 -176 V 0.057 -177 F 0.056 -178 A 0.055 -179 V 0.053 -180 T 0.049 -181 N 0.047 -182 V 0.051 -183 A 0.058 -184 D 0.065 -185 I 0.071 -186 Y 0.079 -187 A 0.090 -188 M 0.095 -189 S 0.088 -190 T 0.076 -191 C 0.068 -192 T 0.071 -193 E 0.080 -194 V 0.094 -195 W 0.110 -196 S 0.122 -197 N 0.120 -198 S 0.103 -199 L 0.082 -200 G 0.066 -201 H 0.056 -202 L 0.048 -203 V 0.041 -204 Y 0.035 -205 V 0.032 -206 L 0.033 -207 I 0.036 -208 Y 0.038 -209 N 0.035 -210 V 0.031 -211 T 0.030 -212 T 0.032 -213 V 0.034 -214 I 0.035 -215 V 0.037 -216 P 0.036 -217 V 0.032 -218 A 0.030 -219 V 0.030 -220 V 0.029 -221 F 0.025 -222 L 0.024 -223 F 0.031 -224 L 0.043 -225 I 0.051 -226 L 0.047 -227 I 0.036 -228 R 0.030 -229 R 0.032 -230 A 0.037 -231 L 0.046 -232 S 0.059 -233 A 0.076 -234 S 0.091 -235 Q 0.101 -236 K 0.110 -237 K 0.125 -238 K 0.144 -239 V 0.164 -240 I 0.185 -241 I 0.210 -242 A 0.237 -243 A 0.261 -244 L 0.281 -245 R 0.301 -246 T 0.327 -247 P 0.353 -248 Q 0.373 -249 N 0.386 -250 T 0.395 -251 I 0.399 -252 S 0.393 -253 I 0.368 -254 P 0.322 -255 Y 0.271 -256 A 0.229 -257 S 0.196 -258 Q 0.166 -259 R 0.136 -260 E 0.114 -261 A 0.099 -262 E 0.085 -263 L 0.072 -264 H 0.062 -265 A 0.057 -266 T 0.053 -267 L 0.048 -268 L 0.045 -269 S 0.045 -270 M 0.045 -271 V 0.043 -272 T 0.040 -273 V 0.037 -274 F 0.033 -275 I 0.027 -276 L 0.023 -277 C 0.022 -278 S 0.025 -279 V 0.028 -280 P 0.029 -281 Y 0.027 -282 A 0.024 -283 T 0.021 -284 L 0.020 -285 V 0.019 -286 V 0.019 -287 Y 0.019 -288 Q 0.021 -289 T 0.027 -290 V 0.037 -291 L 0.053 -292 N 0.077 -293 V 0.103 -294 P 0.126 -295 N 0.139 -296 T 0.135 -297 S 0.110 -298 V 0.077 -299 F 0.052 -300 L 0.040 -301 L 0.037 -302 L 0.037 -303 T 0.039 -304 A 0.040 -305 I 0.041 -306 W 0.045 -307 L 0.052 -308 P 0.058 -309 K 0.063 -310 V 0.068 -311 S 0.070 -312 L 0.068 -313 L 0.063 -314 A 0.058 -315 N 0.054 -316 P 0.050 -317 V 0.046 -318 L 0.042 -319 F 0.038 -320 L 0.037 -321 T 0.042 -322 V 0.049 -323 N 0.049 -324 K 0.044 -325 S 0.036 -326 V 0.030 -327 R 0.027 -328 K 0.029 -329 C 0.034 -330 L 0.040 -331 V 0.049 -332 G 0.061 -333 T 0.074 -334 L 0.087 -335 V 0.100 -336 Q 0.115 -337 L 0.128 -338 H 0.140 -339 H 0.157 -340 R 0.188 -341 Y 0.231 -342 S 0.283 -343 R 0.348 -344 R 0.439 -345 N 0.544 -346 V 0.627 -347 V 0.674 -348 S 0.700 -349 T 0.718 -350 G 0.732 -351 S 0.742 -352 G 0.747 -353 V 0.746 -354 A 0.740 -355 E 0.735 -356 P 0.731 -357 S 0.726 -358 L 0.721 -359 E 0.717 -360 P 0.714 -361 S 0.706 -362 M 0.693 -363 R 0.678 -364 S 0.654 -365 G 0.618 -366 S 0.578 -367 Q 0.544 -368 L 0.501 -369 L 0.438 -370 E 0.382 -371 M 0.363 -372 F 0.387 -373 H 0.442 -374 I 0.514 -375 G 0.571 -376 Q 0.592 -377 Q 0.590 -378 Q 0.585 -379 I 0.582 -380 F 0.585 -381 K 0.605 -382 P 0.641 -383 S 0.679 -384 E 0.706 -385 D 0.714 -386 E 0.709 -387 E 0.703 -388 E 0.702 -389 S 0.700 -390 E 0.688 -391 A 0.671 -392 K 0.663 -393 Y 0.674 -394 L 0.699 -395 G 0.722 -396 S 0.734 -397 A 0.734 -398 D 0.729 -399 F 0.726 -400 Q 0.730 -401 A 0.738 -402 K 0.746 -403 E 0.751 -404 V 0.755 -405 L 0.753 -406 T 0.745 -407 S 0.734 -408 C 0.731 -409 P 0.744 -410 E 0.767 -411 G 0.784 -412 E 0.780 -413 Q 0.764 -414 E 0.752 -415 P 0.753 -416 P 0.764 -417 Q 0.771 -418 L 0.758 -419 A 0.711 -420 P 0.638 -421 S 0.586 -422 V 0.581 -423 P 0.591 -424 P 0.588 -425 P 0.606 -426 G 0.674 -427 T 0.752 -428 V 0.795 -429 D 0.801 -430 S 0.792 -431 E 0.787 -432 P 0.788 -433 R 0.788 -434 V 0.786 -435 S 0.785 -436 P 0.789 -437 V 0.797 -438 A 0.805 -439 P 0.811 -440 M 0.815 -441 E 0.816 -442 S 0.809 -443 G 0.789 -444 I 0.763 -445 F 0.745 -446 P 0.737 -447 D 0.727 -448 K 0.710 -449 Y 0.695 -450 S 0.681 -451 L 0.667 -452 Q 0.659 -453 F 0.651 -454 G 0.630 -455 F 0.601 -456 G 0.585 -457 P 0.586 -458 F 0.598 -459 E 0.609 -460 L 0.606 -461 P 0.591 -462 P 0.575 -463 Q 0.567 -464 W 0.579 -465 L 0.618 -466 S 0.672 -467 E 0.719 -468 T 0.750 -469 R 0.761 -470 N 0.757 -471 S 0.748 -472 K 0.743 -473 K 0.741 -474 R 0.738 -475 L 0.730 -476 L 0.724 -477 P 0.728 -478 P 0.742 -479 L 0.754 -480 G 0.755 -481 N 0.744 -482 T 0.732 -483 P 0.733 -484 E 0.747 -485 E 0.759 -486 L 0.754 -487 I 0.735 -488 Q 0.713 -489 T 0.697 -490 K 0.689 -491 V 0.691 -492 P 0.706 -493 R 0.719 -494 V 0.703 -495 N 0.656 -496 R 0.626 -497 V 0.651 -498 E 0.702 -499 R 0.729 -500 K 0.730 -501 M 0.723 -502 S 0.716 -503 R 0.715 -504 N 0.717 -505 N 0.707 -506 K 0.675 -507 V 0.637 -508 S 0.619 -509 I 0.625 -510 F 0.645 -511 P 0.669 -512 K 0.673 -513 V 0.640 -514 D 0.584 -515 S 0.539 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040133.3_ENSMUST00000039160.3_GN:Gpr176_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:49.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040133.3_ENSMUST00000039160.3_GN:Gpr176_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:49.caid deleted file mode 100644 index a0bf81911fc29d9dd1a4d3c09d5e1dcef045de2a..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040133.3_ENSMUST00000039160.3_GN:Gpr176_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:49.caid +++ /dev/null @@ -1,565 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000040133.3|ENSMUST00000039160.3|GN:Gpr176|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:49 -1 M 0.345 -2 S 0.373 -3 R 0.416 -4 R 0.461 -5 E 0.490 -6 G 0.490 -7 L 0.472 -8 A 0.461 -9 G 0.461 -10 W 0.456 -11 P 0.439 -12 A 0.409 -13 L 0.380 -14 Q 0.377 -15 D 0.393 -16 A 0.394 -17 A 0.376 -18 W 0.375 -19 L 0.412 -20 P 0.469 -21 S 0.518 -22 V 0.552 -23 G 0.578 -24 P 0.600 -25 S 0.619 -26 T 0.640 -27 P 0.663 -28 G 0.677 -29 A 0.669 -30 G 0.634 -31 A 0.583 -32 A 0.531 -33 V 0.482 -34 R 0.440 -35 W 0.407 -36 A 0.388 -37 Q 0.401 -38 R 0.460 -39 P 0.550 -40 G 0.627 -41 G 0.648 -42 R 0.598 -43 A 0.514 -44 Q 0.464 -45 T 0.482 -46 P 0.529 -47 G 0.548 -48 F 0.533 -49 A 0.519 -50 M 0.534 -51 G 0.564 -52 H 0.576 -53 N 0.543 -54 S 0.478 -55 S 0.429 -56 W 0.435 -57 V 0.488 -58 S 0.551 -59 P 0.593 -60 N 0.591 -61 T 0.553 -62 S 0.528 -63 H 0.563 -64 P 0.637 -65 R 0.703 -66 N 0.739 -67 T 0.752 -68 S 0.749 -69 G 0.739 -70 A 0.729 -71 E 0.723 -72 A 0.718 -73 G 0.703 -74 A 0.668 -75 N 0.615 -76 L 0.561 -77 S 0.527 -78 A 0.508 -79 F 0.488 -80 G 0.450 -81 E 0.387 -82 L 0.308 -83 S 0.232 -84 E 0.172 -85 A 0.129 -86 Q 0.099 -87 L 0.084 -88 Y 0.075 -89 R 0.064 -90 Q 0.050 -91 F 0.041 -92 T 0.038 -93 T 0.038 -94 T 0.037 -95 V 0.035 -96 Q 0.034 -97 V 0.033 -98 V 0.032 -99 I 0.034 -100 F 0.038 -101 I 0.042 -102 G 0.045 -103 S 0.045 -104 L 0.041 -105 L 0.038 -106 G 0.037 -107 N 0.037 -108 F 0.038 -109 M 0.038 -110 V 0.036 -111 L 0.032 -112 W 0.029 -113 S 0.028 -114 T 0.029 -115 C 0.032 -116 R 0.038 -117 T 0.044 -118 T 0.049 -119 V 0.054 -120 F 0.057 -121 K 0.057 -122 S 0.054 -123 V 0.047 -124 T 0.036 -125 N 0.026 -126 R 0.022 -127 F 0.023 -128 I 0.028 -129 K 0.033 -130 N 0.037 -131 L 0.040 -132 A 0.040 -133 C 0.040 -134 S 0.040 -135 G 0.041 -136 I 0.040 -137 C 0.037 -138 A 0.031 -139 S 0.027 -140 V 0.025 -141 V 0.026 -142 C 0.029 -143 V 0.033 -144 P 0.034 -145 F 0.032 -146 D 0.030 -147 I 0.032 -148 I 0.040 -149 L 0.058 -150 S 0.087 -151 S 0.123 -152 S 0.150 -153 P 0.156 -154 H 0.144 -155 C 0.125 -156 C 0.108 -157 W 0.091 -158 W 0.075 -159 I 0.063 -160 Y 0.053 -161 T 0.045 -162 M 0.039 -163 L 0.034 -164 F 0.029 -165 C 0.027 -166 K 0.027 -167 V 0.029 -168 L 0.032 -169 K 0.034 -170 F 0.035 -171 L 0.034 -172 H 0.031 -173 K 0.027 -174 V 0.025 -175 F 0.027 -176 C 0.030 -177 S 0.034 -178 V 0.035 -179 T 0.034 -180 V 0.033 -181 L 0.033 -182 S 0.031 -183 F 0.027 -184 P 0.023 -185 A 0.022 -186 I 0.024 -187 A 0.028 -188 L 0.033 -189 D 0.038 -190 R 0.040 -191 Y 0.039 -192 Y 0.041 -193 S 0.051 -194 V 0.068 -195 L 0.089 -196 Y 0.108 -197 P 0.116 -198 L 0.113 -199 E 0.108 -200 R 0.104 -201 K 0.099 -202 I 0.086 -203 S 0.069 -204 D 0.053 -205 A 0.042 -206 K 0.037 -207 S 0.035 -208 R 0.036 -209 E 0.037 -210 L 0.037 -211 V 0.037 -212 M 0.036 -213 Y 0.038 -214 I 0.040 -215 W 0.041 -216 A 0.039 -217 H 0.040 -218 A 0.044 -219 V 0.049 -220 V 0.057 -221 A 0.066 -222 S 0.069 -223 V 0.064 -224 P 0.056 -225 V 0.051 -226 F 0.048 -227 A 0.047 -228 V 0.044 -229 T 0.041 -230 N 0.039 -231 V 0.042 -232 A 0.047 -233 D 0.052 -234 I 0.057 -235 Y 0.064 -236 A 0.074 -237 M 0.079 -238 S 0.074 -239 T 0.065 -240 C 0.060 -241 T 0.063 -242 E 0.070 -243 V 0.081 -244 W 0.095 -245 S 0.106 -246 N 0.105 -247 S 0.092 -248 L 0.074 -249 G 0.059 -250 H 0.051 -251 L 0.044 -252 V 0.037 -253 Y 0.032 -254 V 0.030 -255 L 0.030 -256 I 0.033 -257 Y 0.035 -258 N 0.032 -259 V 0.029 -260 T 0.028 -261 T 0.030 -262 V 0.032 -263 I 0.033 -264 V 0.035 -265 P 0.033 -266 V 0.030 -267 A 0.028 -268 V 0.029 -269 V 0.029 -270 F 0.025 -271 L 0.024 -272 F 0.031 -273 L 0.044 -274 I 0.051 -275 L 0.046 -276 I 0.035 -277 R 0.029 -278 R 0.030 -279 A 0.035 -280 L 0.044 -281 S 0.057 -282 A 0.075 -283 S 0.091 -284 Q 0.102 -285 K 0.113 -286 K 0.130 -287 K 0.152 -288 V 0.173 -289 I 0.196 -290 I 0.223 -291 A 0.253 -292 A 0.278 -293 L 0.298 -294 R 0.317 -295 T 0.341 -296 P 0.365 -297 Q 0.385 -298 N 0.402 -299 T 0.415 -300 I 0.421 -301 S 0.416 -302 I 0.389 -303 P 0.341 -304 Y 0.285 -305 A 0.239 -306 S 0.204 -307 Q 0.171 -308 R 0.139 -309 E 0.116 -310 A 0.101 -311 E 0.088 -312 L 0.074 -313 H 0.064 -314 A 0.058 -315 T 0.053 -316 L 0.048 -317 L 0.046 -318 S 0.046 -319 M 0.045 -320 V 0.043 -321 T 0.040 -322 V 0.038 -323 F 0.033 -324 I 0.028 -325 L 0.024 -326 C 0.024 -327 S 0.026 -328 V 0.030 -329 P 0.031 -330 Y 0.028 -331 A 0.024 -332 T 0.022 -333 L 0.021 -334 V 0.021 -335 V 0.020 -336 Y 0.020 -337 Q 0.023 -338 T 0.028 -339 V 0.039 -340 L 0.056 -341 N 0.080 -342 V 0.107 -343 P 0.130 -344 N 0.142 -345 T 0.137 -346 S 0.111 -347 V 0.077 -348 F 0.051 -349 L 0.040 -350 L 0.036 -351 L 0.036 -352 T 0.038 -353 A 0.039 -354 I 0.040 -355 W 0.044 -356 L 0.052 -357 P 0.058 -358 K 0.063 -359 V 0.068 -360 S 0.072 -361 L 0.069 -362 L 0.064 -363 A 0.059 -364 N 0.055 -365 P 0.050 -366 V 0.046 -367 L 0.041 -368 F 0.037 -369 L 0.036 -370 T 0.041 -371 V 0.047 -372 N 0.048 -373 K 0.042 -374 S 0.035 -375 V 0.029 -376 R 0.027 -377 K 0.028 -378 C 0.033 -379 L 0.039 -380 V 0.047 -381 G 0.059 -382 T 0.073 -383 L 0.085 -384 V 0.098 -385 Q 0.112 -386 L 0.124 -387 H 0.137 -388 H 0.156 -389 R 0.189 -390 Y 0.235 -391 S 0.288 -392 R 0.355 -393 R 0.445 -394 N 0.547 -395 V 0.627 -396 V 0.672 -397 S 0.696 -398 T 0.714 -399 G 0.727 -400 S 0.736 -401 G 0.739 -402 V 0.735 -403 A 0.728 -404 E 0.723 -405 P 0.720 -406 S 0.716 -407 L 0.711 -408 E 0.707 -409 P 0.703 -410 S 0.696 -411 M 0.685 -412 R 0.674 -413 S 0.658 -414 G 0.630 -415 S 0.597 -416 Q 0.564 -417 L 0.520 -418 L 0.456 -419 E 0.398 -420 M 0.380 -421 F 0.407 -422 H 0.466 -423 I 0.535 -424 G 0.585 -425 Q 0.597 -426 Q 0.587 -427 Q 0.577 -428 I 0.574 -429 F 0.580 -430 K 0.601 -431 P 0.634 -432 S 0.670 -433 E 0.695 -434 D 0.704 -435 E 0.701 -436 E 0.698 -437 E 0.702 -438 S 0.706 -439 E 0.700 -440 A 0.687 -441 K 0.680 -442 Y 0.690 -443 L 0.711 -444 G 0.731 -445 S 0.741 -446 A 0.741 -447 D 0.735 -448 F 0.733 -449 Q 0.738 -450 A 0.749 -451 K 0.761 -452 E 0.769 -453 V 0.770 -454 L 0.764 -455 T 0.752 -456 S 0.740 -457 C 0.735 -458 P 0.746 -459 E 0.767 -460 G 0.781 -461 E 0.776 -462 Q 0.760 -463 E 0.748 -464 P 0.750 -465 P 0.760 -466 Q 0.766 -467 L 0.752 -468 A 0.705 -469 P 0.634 -470 S 0.581 -471 V 0.577 -472 P 0.587 -473 P 0.584 -474 P 0.603 -475 G 0.669 -476 T 0.747 -477 V 0.789 -478 D 0.795 -479 S 0.786 -480 E 0.781 -481 P 0.781 -482 R 0.781 -483 V 0.778 -484 S 0.777 -485 P 0.783 -486 V 0.792 -487 A 0.801 -488 P 0.808 -489 M 0.812 -490 E 0.813 -491 S 0.805 -492 G 0.783 -493 I 0.756 -494 F 0.738 -495 P 0.730 -496 D 0.718 -497 K 0.701 -498 Y 0.691 -499 S 0.687 -500 L 0.684 -501 Q 0.681 -502 F 0.673 -503 G 0.650 -504 F 0.619 -505 G 0.600 -506 P 0.598 -507 F 0.606 -508 E 0.614 -509 L 0.615 -510 P 0.607 -511 P 0.596 -512 Q 0.590 -513 W 0.600 -514 L 0.635 -515 S 0.684 -516 E 0.726 -517 T 0.752 -518 R 0.761 -519 N 0.755 -520 S 0.745 -521 K 0.739 -522 K 0.736 -523 R 0.731 -524 L 0.724 -525 L 0.720 -526 P 0.725 -527 P 0.739 -528 L 0.750 -529 G 0.748 -530 N 0.733 -531 T 0.719 -532 P 0.722 -533 E 0.740 -534 E 0.755 -535 L 0.753 -536 I 0.736 -537 Q 0.716 -538 T 0.701 -539 K 0.692 -540 V 0.695 -541 P 0.710 -542 R 0.735 -543 V 0.752 -544 N 0.752 -545 R 0.745 -546 V 0.743 -547 E 0.744 -548 R 0.740 -549 K 0.730 -550 M 0.722 -551 S 0.715 -552 R 0.713 -553 N 0.711 -554 N 0.691 -555 K 0.646 -556 V 0.597 -557 S 0.573 -558 I 0.581 -559 F 0.608 -560 P 0.638 -561 K 0.644 -562 V 0.612 -563 D 0.554 -564 S 0.508 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040205.9_ENSMUST00000046611.9_GN:Cuzd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040205.9_ENSMUST00000046611.9_GN:Cuzd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 649512486e51c23a5d53a00fe156e03c69aca6cc..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040205.9_ENSMUST00000046611.9_GN:Cuzd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,608 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000040205.9|ENSMUST00000046611.9|GN:Cuzd1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.275 -2 E 0.271 -3 V 0.268 -4 T 0.265 -5 G 0.255 -6 R 0.238 -7 L 0.226 -8 F 0.220 -9 I 0.208 -10 W 0.196 -11 A 0.194 -12 I 0.199 -13 L 0.200 -14 A 0.206 -15 V 0.229 -16 S 0.274 -17 C 0.332 -18 G 0.388 -19 A 0.434 -20 Q 0.467 -21 L 0.487 -22 N 0.498 -23 S 0.511 -24 T 0.524 -25 E 0.526 -26 A 0.515 -27 E 0.493 -28 G 0.451 -29 K 0.379 -30 S 0.284 -31 R 0.194 -32 C 0.133 -33 T 0.108 -34 A 0.111 -35 S 0.129 -36 L 0.150 -37 G 0.167 -38 G 0.180 -39 A 0.185 -40 N 0.178 -41 L 0.157 -42 G 0.131 -43 E 0.109 -44 T 0.097 -45 H 0.096 -46 K 0.102 -47 A 0.111 -48 L 0.119 -49 V 0.123 -50 L 0.124 -51 Q 0.119 -52 L 0.110 -53 S 0.104 -54 A 0.103 -55 N 0.100 -56 E 0.089 -57 N 0.072 -58 C 0.057 -59 T 0.049 -60 W 0.051 -61 T 0.059 -62 I 0.065 -63 E 0.066 -64 R 0.066 -65 P 0.068 -66 E 0.071 -67 N 0.072 -68 R 0.069 -69 S 0.065 -70 I 0.064 -71 R 0.066 -72 I 0.066 -73 I 0.058 -74 F 0.044 -75 S 0.033 -76 Y 0.029 -77 I 0.033 -78 K 0.046 -79 L 0.068 -80 D 0.092 -81 P 0.111 -82 G 0.116 -83 S 0.111 -84 R 0.102 -85 C 0.094 -86 E 0.083 -87 T 0.066 -88 E 0.048 -89 N 0.036 -90 I 0.030 -91 K 0.032 -92 V 0.037 -93 F 0.044 -94 D 0.050 -95 G 0.056 -96 S 0.062 -97 S 0.067 -98 T 0.069 -99 S 0.071 -100 G 0.077 -101 P 0.084 -102 L 0.088 -103 L 0.084 -104 G 0.075 -105 K 0.066 -106 A 0.061 -107 C 0.060 -108 S 0.065 -109 R 0.076 -110 N 0.084 -111 D 0.085 -112 F 0.080 -113 V 0.068 -114 P 0.053 -115 V 0.040 -116 F 0.036 -117 E 0.039 -118 S 0.044 -119 S 0.045 -120 S 0.043 -121 N 0.040 -122 S 0.039 -123 M 0.039 -124 T 0.039 -125 F 0.040 -126 Q 0.042 -127 I 0.046 -128 V 0.057 -129 T 0.078 -130 G 0.103 -131 L 0.121 -132 T 0.129 -133 K 0.130 -134 F 0.127 -135 P 0.116 -136 R 0.100 -137 S 0.082 -138 V 0.064 -139 F 0.048 -140 I 0.035 -141 F 0.026 -142 Y 0.024 -143 Y 0.033 -144 F 0.058 -145 F 0.100 -146 S 0.152 -147 A 0.200 -148 A 0.238 -149 T 0.266 -150 V 0.278 -151 I 0.262 -152 P 0.218 -153 N 0.162 -154 C 0.119 -155 G 0.100 -156 G 0.098 -157 D 0.098 -158 L 0.088 -159 R 0.072 -160 A 0.062 -161 L 0.064 -162 E 0.076 -163 G 0.088 -164 S 0.095 -165 F 0.096 -166 S 0.094 -167 S 0.092 -168 P 0.086 -169 N 0.076 -170 Y 0.067 -171 P 0.067 -172 K 0.077 -173 P 0.088 -174 H 0.094 -175 P 0.094 -176 E 0.089 -177 L 0.085 -178 A 0.080 -179 Y 0.072 -180 C 0.061 -181 V 0.053 -182 W 0.051 -183 H 0.053 -184 I 0.056 -185 Q 0.060 -186 V 0.069 -187 G 0.078 -188 K 0.082 -189 G 0.077 -190 Y 0.069 -191 K 0.065 -192 I 0.066 -193 Q 0.069 -194 L 0.068 -195 K 0.063 -196 F 0.053 -197 T 0.041 -198 D 0.030 -199 L 0.022 -200 L 0.019 -201 L 0.020 -202 E 0.024 -203 M 0.029 -204 D 0.034 -205 E 0.040 -206 N 0.046 -207 C 0.049 -208 K 0.047 -209 F 0.039 -210 D 0.030 -211 F 0.023 -212 I 0.021 -213 A 0.022 -214 V 0.025 -215 Y 0.027 -216 D 0.030 -217 G 0.036 -218 P 0.042 -219 S 0.047 -220 T 0.047 -221 T 0.049 -222 A 0.057 -223 G 0.067 -224 L 0.072 -225 L 0.065 -226 K 0.052 -227 Q 0.041 -228 L 0.035 -229 C 0.037 -230 G 0.045 -231 R 0.057 -232 G 0.064 -233 K 0.060 -234 P 0.048 -235 T 0.038 -236 L 0.034 -237 E 0.035 -238 S 0.036 -239 S 0.036 -240 S 0.034 -241 D 0.034 -242 A 0.035 -243 M 0.037 -244 T 0.040 -245 V 0.042 -246 V 0.042 -247 L 0.041 -248 S 0.040 -249 T 0.042 -250 D 0.050 -251 Y 0.063 -252 A 0.077 -253 N 0.083 -254 S 0.078 -255 Y 0.067 -256 K 0.057 -257 G 0.049 -258 F 0.039 -259 S 0.031 -260 A 0.026 -261 S 0.024 -262 Y 0.027 -263 T 0.037 -264 S 0.058 -265 I 0.092 -266 Y 0.141 -267 I 0.198 -268 H 0.250 -269 D 0.279 -270 V 0.278 -271 N 0.243 -272 T 0.184 -273 T 0.119 -274 S 0.068 -275 L 0.038 -276 S 0.025 -277 C 0.021 -278 V 0.020 -279 S 0.018 -280 D 0.017 -281 K 0.017 -282 M 0.017 -283 R 0.018 -284 V 0.019 -285 I 0.020 -286 I 0.021 -287 S 0.024 -288 K 0.029 -289 S 0.038 -290 Y 0.049 -291 L 0.060 -292 P 0.069 -293 A 0.077 -294 L 0.086 -295 N 0.095 -296 Y 0.100 -297 N 0.097 -298 E 0.090 -299 S 0.081 -300 N 0.073 -301 L 0.070 -302 Q 0.071 -303 L 0.071 -304 N 0.069 -305 D 0.066 -306 P 0.061 -307 T 0.058 -308 C 0.062 -309 R 0.076 -310 P 0.091 -311 N 0.099 -312 V 0.094 -313 S 0.077 -314 N 0.058 -315 V 0.045 -316 I 0.037 -317 E 0.034 -318 F 0.036 -319 S 0.041 -320 I 0.044 -321 P 0.044 -322 L 0.043 -323 H 0.046 -324 E 0.051 -325 C 0.055 -326 G 0.057 -327 T 0.057 -328 V 0.059 -329 K 0.067 -330 K 0.084 -331 I 0.104 -332 E 0.114 -333 D 0.107 -334 H 0.090 -335 A 0.074 -336 I 0.066 -337 S 0.064 -338 Y 0.064 -339 T 0.065 -340 N 0.065 -341 R 0.065 -342 I 0.068 -343 T 0.081 -344 F 0.110 -345 I 0.161 -346 E 0.225 -347 S 0.285 -348 P 0.330 -349 V 0.358 -350 S 0.367 -351 A 0.358 -352 V 0.337 -353 I 0.319 -354 T 0.306 -355 R 0.290 -356 Q 0.261 -357 K 0.217 -358 L 0.167 -359 L 0.125 -360 Q 0.101 -361 I 0.090 -362 V 0.080 -363 V 0.069 -364 T 0.058 -365 C 0.055 -366 E 0.066 -367 M 0.090 -368 E 0.128 -369 Y 0.183 -370 N 0.244 -371 S 0.292 -372 T 0.313 -373 V 0.312 -374 E 0.301 -375 I 0.287 -376 M 0.266 -377 Y 0.241 -378 I 0.224 -379 T 0.227 -380 E 0.255 -381 D 0.303 -382 D 0.354 -383 I 0.387 -384 I 0.392 -385 Q 0.379 -386 N 0.360 -387 Q 0.342 -388 S 0.328 -389 V 0.315 -390 L 0.297 -391 G 0.266 -392 K 0.225 -393 Y 0.183 -394 N 0.144 -395 T 0.109 -396 S 0.079 -397 L 0.062 -398 A 0.060 -399 L 0.070 -400 Y 0.082 -401 E 0.089 -402 S 0.094 -403 D 0.098 -404 S 0.100 -405 F 0.100 -406 E 0.110 -407 N 0.130 -408 L 0.145 -409 V 0.145 -410 Q 0.132 -411 E 0.115 -412 S 0.100 -413 P 0.090 -414 Y 0.087 -415 Y 0.085 -416 V 0.088 -417 D 0.098 -418 L 0.114 -419 N 0.124 -420 Q 0.118 -421 T 0.100 -422 L 0.080 -423 F 0.068 -424 V 0.062 -425 Q 0.056 -426 A 0.049 -427 T 0.047 -428 L 0.052 -429 H 0.068 -430 T 0.093 -431 S 0.120 -432 D 0.137 -433 P 0.137 -434 S 0.122 -435 L 0.099 -436 V 0.075 -437 V 0.056 -438 F 0.043 -439 L 0.034 -440 D 0.027 -441 T 0.025 -442 C 0.029 -443 R 0.036 -444 A 0.044 -445 S 0.052 -446 P 0.058 -447 T 0.063 -448 S 0.067 -449 D 0.069 -450 F 0.068 -451 A 0.066 -452 S 0.064 -453 P 0.062 -454 T 0.059 -455 Y 0.059 -456 D 0.066 -457 L 0.080 -458 I 0.096 -459 S 0.107 -460 S 0.111 -461 G 0.111 -462 C 0.113 -463 C 0.117 -464 Q 0.121 -465 D 0.118 -466 E 0.110 -467 T 0.105 -468 C 0.108 -469 K 0.118 -470 V 0.128 -471 Y 0.135 -472 P 0.132 -473 L 0.117 -474 F 0.095 -475 G 0.075 -476 H 0.059 -477 Y 0.049 -478 G 0.042 -479 R 0.038 -480 F 0.037 -481 Q 0.040 -482 F 0.047 -483 N 0.056 -484 A 0.062 -485 F 0.064 -486 K 0.069 -487 F 0.081 -488 L 0.095 -489 K 0.101 -490 H 0.100 -491 L 0.097 -492 N 0.096 -493 S 0.093 -494 V 0.090 -495 Y 0.089 -496 L 0.095 -497 K 0.103 -498 C 0.105 -499 K 0.095 -500 I 0.078 -501 L 0.065 -502 I 0.064 -503 C 0.079 -504 D 0.105 -505 N 0.133 -506 N 0.153 -507 D 0.166 -508 Q 0.176 -509 T 0.184 -510 S 0.190 -511 R 0.196 -512 C 0.205 -513 N 0.212 -514 Q 0.212 -515 G 0.214 -516 C 0.233 -517 V 0.280 -518 P 0.339 -519 R 0.380 -520 R 0.392 -521 K 0.390 -522 R 0.393 -523 D 0.406 -524 I 0.411 -525 P 0.396 -526 S 0.361 -527 Y 0.314 -528 K 0.260 -529 W 0.206 -530 K 0.158 -531 T 0.123 -532 D 0.100 -533 S 0.087 -534 V 0.078 -535 I 0.068 -536 G 0.059 -537 P 0.058 -538 I 0.070 -539 R 0.101 -540 L 0.161 -541 K 0.258 -542 R 0.380 -543 D 0.501 -544 R 0.592 -545 S 0.649 -546 A 0.682 -547 S 0.700 -548 R 0.709 -549 D 0.712 -550 S 0.703 -551 G 0.683 -552 L 0.653 -553 L 0.612 -554 P 0.566 -555 Q 0.538 -556 I 0.537 -557 H 0.542 -558 E 0.558 -559 A 0.606 -560 E 0.660 -561 I 0.682 -562 S 0.672 -563 N 0.649 -564 Q 0.625 -565 P 0.605 -566 L 0.583 -567 S 0.548 -568 R 0.492 -569 L 0.422 -570 Y 0.364 -571 L 0.350 -572 F 0.375 -573 S 0.398 -574 F 0.395 -575 M 0.378 -576 V 0.367 -577 L 0.353 -578 A 0.335 -579 L 0.334 -580 N 0.346 -581 V 0.342 -582 V 0.317 -583 I 0.286 -584 V 0.255 -585 A 0.221 -586 I 0.185 -587 T 0.159 -588 T 0.152 -589 V 0.158 -590 K 0.158 -591 H 0.148 -592 F 0.139 -593 L 0.145 -594 N 0.155 -595 R 0.158 -596 W 0.153 -597 M 0.151 -598 D 0.159 -599 H 0.174 -600 R 0.192 -601 Y 0.211 -602 Q 0.228 -603 K 0.240 -604 L 0.250 -605 Q 0.260 -606 V 0.273 -607 Y 0.282 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040205.9_ENSMUST00000046611.9_GN:Cuzd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040205.9_ENSMUST00000046611.9_GN:Cuzd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid deleted file mode 100644 index 6b459f493e5caabfa36bee77f894a2cd3aa4826e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040205.9_ENSMUST00000046611.9_GN:Cuzd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid +++ /dev/null @@ -1,641 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000040205.9|ENSMUST00000046611.9|GN:Cuzd1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:33 -1 M 0.324 -2 A 0.331 -3 K 0.340 -4 L 0.348 -5 T 0.355 -6 R 0.369 -7 F 0.395 -8 P 0.410 -9 R 0.386 -10 Y 0.332 -11 Q 0.285 -12 E 0.263 -13 A 0.252 -14 Y 0.247 -15 K 0.259 -16 T 0.276 -17 R 0.281 -18 R 0.280 -19 I 0.282 -20 I 0.278 -21 R 0.270 -22 S 0.283 -23 L 0.313 -24 R 0.330 -25 V 0.329 -26 R 0.334 -27 A 0.348 -28 L 0.364 -29 R 0.388 -30 H 0.430 -31 P 0.476 -32 A 0.509 -33 K 0.532 -34 M 0.552 -35 E 0.564 -36 V 0.561 -37 T 0.541 -38 G 0.505 -39 R 0.458 -40 L 0.422 -41 F 0.406 -42 I 0.381 -43 W 0.334 -44 A 0.288 -45 I 0.266 -46 L 0.263 -47 A 0.268 -48 V 0.283 -49 S 0.319 -50 C 0.378 -51 G 0.443 -52 A 0.492 -53 Q 0.517 -54 L 0.523 -55 N 0.527 -56 S 0.546 -57 T 0.570 -58 E 0.580 -59 A 0.570 -60 E 0.543 -61 G 0.489 -62 K 0.401 -63 S 0.291 -64 R 0.192 -65 C 0.127 -66 T 0.102 -67 A 0.108 -68 S 0.129 -69 L 0.152 -70 G 0.172 -71 G 0.186 -72 A 0.191 -73 N 0.183 -74 L 0.160 -75 G 0.131 -76 E 0.107 -77 T 0.094 -78 H 0.091 -79 K 0.096 -80 A 0.103 -81 L 0.109 -82 V 0.113 -83 L 0.113 -84 Q 0.108 -85 L 0.100 -86 S 0.094 -87 A 0.093 -88 N 0.089 -89 E 0.080 -90 N 0.065 -91 C 0.052 -92 T 0.045 -93 W 0.046 -94 T 0.052 -95 I 0.057 -96 E 0.058 -97 R 0.058 -98 P 0.059 -99 E 0.062 -100 N 0.065 -101 R 0.064 -102 S 0.061 -103 I 0.060 -104 R 0.063 -105 I 0.063 -106 I 0.055 -107 F 0.042 -108 S 0.031 -109 Y 0.027 -110 I 0.031 -111 K 0.045 -112 L 0.066 -113 D 0.090 -114 P 0.108 -115 G 0.114 -116 S 0.109 -117 R 0.101 -118 C 0.093 -119 E 0.082 -120 T 0.065 -121 E 0.049 -122 N 0.037 -123 I 0.032 -124 K 0.033 -125 V 0.040 -126 F 0.047 -127 D 0.054 -128 G 0.060 -129 S 0.067 -130 S 0.071 -131 T 0.073 -132 S 0.075 -133 G 0.080 -134 P 0.086 -135 L 0.088 -136 L 0.084 -137 G 0.075 -138 K 0.067 -139 A 0.063 -140 C 0.063 -141 S 0.069 -142 R 0.080 -143 N 0.087 -144 D 0.088 -145 F 0.083 -146 V 0.071 -147 P 0.055 -148 V 0.041 -149 F 0.037 -150 E 0.039 -151 S 0.044 -152 S 0.046 -153 S 0.044 -154 N 0.041 -155 S 0.040 -156 M 0.040 -157 T 0.040 -158 F 0.040 -159 Q 0.043 -160 I 0.047 -161 V 0.057 -162 T 0.078 -163 G 0.102 -164 L 0.118 -165 T 0.124 -166 K 0.126 -167 F 0.123 -168 P 0.114 -169 R 0.100 -170 S 0.083 -171 V 0.066 -172 F 0.049 -173 I 0.036 -174 F 0.026 -175 Y 0.024 -176 Y 0.032 -177 F 0.056 -178 F 0.097 -179 S 0.145 -180 A 0.190 -181 A 0.226 -182 T 0.253 -183 V 0.264 -184 I 0.248 -185 P 0.205 -186 N 0.152 -187 C 0.111 -188 G 0.095 -189 G 0.094 -190 D 0.094 -191 L 0.084 -192 R 0.069 -193 A 0.059 -194 L 0.062 -195 E 0.074 -196 G 0.087 -197 S 0.093 -198 F 0.094 -199 S 0.092 -200 S 0.089 -201 P 0.083 -202 N 0.073 -203 Y 0.065 -204 P 0.065 -205 K 0.074 -206 P 0.085 -207 H 0.090 -208 P 0.089 -209 E 0.085 -210 L 0.081 -211 A 0.077 -212 Y 0.069 -213 C 0.059 -214 V 0.052 -215 W 0.051 -216 H 0.053 -217 I 0.056 -218 Q 0.060 -219 V 0.067 -220 G 0.077 -221 K 0.081 -222 G 0.076 -223 Y 0.070 -224 K 0.066 -225 I 0.067 -226 Q 0.070 -227 L 0.069 -228 K 0.063 -229 F 0.052 -230 T 0.040 -231 D 0.029 -232 L 0.021 -233 L 0.018 -234 L 0.019 -235 E 0.022 -236 M 0.027 -237 D 0.032 -238 E 0.038 -239 N 0.044 -240 C 0.047 -241 K 0.045 -242 F 0.037 -243 D 0.028 -244 F 0.022 -245 I 0.020 -246 A 0.022 -247 V 0.024 -248 Y 0.026 -249 D 0.029 -250 G 0.033 -251 P 0.039 -252 S 0.042 -253 T 0.043 -254 T 0.045 -255 A 0.054 -256 G 0.065 -257 L 0.070 -258 L 0.064 -259 K 0.052 -260 Q 0.041 -261 L 0.035 -262 C 0.037 -263 G 0.045 -264 R 0.057 -265 G 0.064 -266 K 0.060 -267 P 0.048 -268 T 0.038 -269 L 0.034 -270 E 0.035 -271 S 0.036 -272 S 0.036 -273 S 0.035 -274 D 0.034 -275 A 0.035 -276 M 0.037 -277 T 0.040 -278 V 0.042 -279 V 0.041 -280 L 0.040 -281 S 0.040 -282 T 0.042 -283 D 0.050 -284 Y 0.063 -285 A 0.078 -286 N 0.084 -287 S 0.079 -288 Y 0.068 -289 K 0.058 -290 G 0.049 -291 F 0.039 -292 S 0.031 -293 A 0.026 -294 S 0.024 -295 Y 0.027 -296 T 0.038 -297 S 0.059 -298 I 0.095 -299 Y 0.146 -300 I 0.207 -301 H 0.260 -302 D 0.291 -303 V 0.289 -304 N 0.254 -305 T 0.193 -306 T 0.125 -307 S 0.072 -308 L 0.040 -309 S 0.026 -310 C 0.022 -311 V 0.021 -312 S 0.020 -313 D 0.018 -314 K 0.017 -315 M 0.018 -316 R 0.018 -317 V 0.019 -318 I 0.021 -319 I 0.022 -320 S 0.025 -321 K 0.031 -322 S 0.041 -323 Y 0.054 -324 L 0.066 -325 P 0.075 -326 A 0.084 -327 L 0.094 -328 N 0.105 -329 Y 0.111 -330 N 0.109 -331 E 0.100 -332 S 0.089 -333 N 0.078 -334 L 0.073 -335 Q 0.073 -336 L 0.074 -337 N 0.072 -338 D 0.068 -339 P 0.063 -340 T 0.060 -341 C 0.065 -342 R 0.079 -343 P 0.095 -344 N 0.103 -345 V 0.097 -346 S 0.080 -347 N 0.061 -348 V 0.048 -349 I 0.040 -350 E 0.037 -351 F 0.038 -352 S 0.042 -353 I 0.046 -354 P 0.045 -355 L 0.044 -356 H 0.046 -357 E 0.051 -358 C 0.055 -359 G 0.057 -360 T 0.058 -361 V 0.058 -362 K 0.065 -363 K 0.081 -364 I 0.099 -365 E 0.109 -366 D 0.101 -367 H 0.085 -368 A 0.071 -369 I 0.064 -370 S 0.063 -371 Y 0.064 -372 T 0.065 -373 N 0.065 -374 R 0.065 -375 I 0.067 -376 T 0.078 -377 F 0.105 -378 I 0.152 -379 E 0.211 -380 S 0.267 -381 P 0.307 -382 V 0.330 -383 S 0.338 -384 A 0.329 -385 V 0.311 -386 I 0.295 -387 T 0.284 -388 R 0.268 -389 Q 0.242 -390 K 0.202 -391 L 0.155 -392 L 0.116 -393 Q 0.094 -394 I 0.083 -395 V 0.075 -396 V 0.064 -397 T 0.054 -398 C 0.051 -399 E 0.061 -400 M 0.085 -401 E 0.122 -402 Y 0.175 -403 N 0.233 -404 S 0.277 -405 T 0.295 -406 V 0.293 -407 E 0.283 -408 I 0.269 -409 M 0.250 -410 Y 0.227 -411 I 0.213 -412 T 0.218 -413 E 0.245 -414 D 0.290 -415 D 0.335 -416 I 0.364 -417 I 0.370 -418 Q 0.360 -419 N 0.345 -420 Q 0.330 -421 S 0.319 -422 V 0.309 -423 L 0.291 -424 G 0.261 -425 K 0.219 -426 Y 0.177 -427 N 0.139 -428 T 0.105 -429 S 0.076 -430 L 0.060 -431 A 0.059 -432 L 0.069 -433 Y 0.081 -434 E 0.087 -435 S 0.091 -436 D 0.096 -437 S 0.097 -438 F 0.098 -439 E 0.109 -440 N 0.129 -441 L 0.146 -442 V 0.146 -443 Q 0.134 -444 E 0.116 -445 S 0.100 -446 P 0.090 -447 Y 0.086 -448 Y 0.084 -449 V 0.086 -450 D 0.096 -451 L 0.113 -452 N 0.123 -453 Q 0.117 -454 T 0.099 -455 L 0.080 -456 F 0.068 -457 V 0.061 -458 Q 0.055 -459 A 0.049 -460 T 0.047 -461 L 0.053 -462 H 0.069 -463 T 0.094 -464 S 0.121 -465 D 0.139 -466 P 0.139 -467 S 0.124 -468 L 0.100 -469 V 0.076 -470 V 0.056 -471 F 0.043 -472 L 0.034 -473 D 0.028 -474 T 0.026 -475 C 0.029 -476 R 0.036 -477 A 0.045 -478 S 0.053 -479 P 0.059 -480 T 0.064 -481 S 0.068 -482 D 0.070 -483 F 0.069 -484 A 0.067 -485 S 0.065 -486 P 0.063 -487 T 0.060 -488 Y 0.060 -489 D 0.068 -490 L 0.083 -491 I 0.100 -492 S 0.111 -493 S 0.115 -494 G 0.115 -495 C 0.117 -496 C 0.121 -497 Q 0.124 -498 D 0.121 -499 E 0.113 -500 T 0.107 -501 C 0.110 -502 K 0.120 -503 V 0.131 -504 Y 0.137 -505 P 0.135 -506 L 0.121 -507 F 0.099 -508 G 0.078 -509 H 0.062 -510 Y 0.051 -511 G 0.043 -512 R 0.039 -513 F 0.038 -514 Q 0.041 -515 F 0.048 -516 N 0.056 -517 A 0.062 -518 F 0.064 -519 K 0.069 -520 F 0.082 -521 L 0.096 -522 K 0.102 -523 H 0.101 -524 L 0.098 -525 N 0.097 -526 S 0.095 -527 V 0.091 -528 Y 0.091 -529 L 0.096 -530 K 0.104 -531 C 0.105 -532 K 0.096 -533 I 0.079 -534 L 0.066 -535 I 0.064 -536 C 0.079 -537 D 0.106 -538 N 0.134 -539 N 0.154 -540 D 0.167 -541 Q 0.176 -542 T 0.183 -543 S 0.188 -544 R 0.195 -545 C 0.204 -546 N 0.211 -547 Q 0.211 -548 G 0.212 -549 C 0.232 -550 V 0.280 -551 P 0.339 -552 R 0.380 -553 R 0.392 -554 K 0.389 -555 R 0.393 -556 D 0.406 -557 I 0.411 -558 P 0.396 -559 S 0.361 -560 Y 0.314 -561 K 0.260 -562 W 0.206 -563 K 0.160 -564 T 0.125 -565 D 0.103 -566 S 0.090 -567 V 0.080 -568 I 0.069 -569 G 0.061 -570 P 0.059 -571 I 0.071 -572 R 0.102 -573 L 0.162 -574 K 0.258 -575 R 0.381 -576 D 0.500 -577 R 0.591 -578 S 0.648 -579 A 0.681 -580 S 0.699 -581 R 0.709 -582 D 0.712 -583 S 0.703 -584 G 0.683 -585 L 0.653 -586 L 0.612 -587 P 0.566 -588 Q 0.539 -589 I 0.538 -590 H 0.543 -591 E 0.560 -592 A 0.607 -593 E 0.660 -594 I 0.683 -595 S 0.673 -596 N 0.648 -597 Q 0.624 -598 P 0.603 -599 L 0.580 -600 S 0.542 -601 R 0.482 -602 L 0.409 -603 Y 0.350 -604 L 0.331 -605 F 0.351 -606 S 0.374 -607 F 0.376 -608 M 0.366 -609 V 0.359 -610 L 0.348 -611 A 0.332 -612 L 0.332 -613 N 0.343 -614 V 0.339 -615 V 0.313 -616 I 0.280 -617 V 0.246 -618 A 0.211 -619 I 0.176 -620 T 0.151 -621 T 0.144 -622 V 0.149 -623 K 0.150 -624 H 0.139 -625 F 0.130 -626 L 0.135 -627 N 0.146 -628 R 0.148 -629 W 0.143 -630 M 0.141 -631 D 0.149 -632 H 0.163 -633 R 0.179 -634 Y 0.196 -635 Q 0.210 -636 K 0.220 -637 L 0.228 -638 Q 0.236 -639 V 0.245 -640 Y 0.252 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040302.18_ENSMUST00000042753.14_GN:Rbm48_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040302.18_ENSMUST00000042753.14_GN:Rbm48_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 10b14a4b7a9927b6a9767f32b32ca00dd47e1b74..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040302.18_ENSMUST00000042753.14_GN:Rbm48_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,372 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000040302.18|ENSMUST00000042753.14|GN:Rbm48|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.462 -2 A 0.493 -3 S 0.541 -4 S 0.585 -5 D 0.615 -6 G 0.630 -7 K 0.643 -8 P 0.656 -9 G 0.660 -10 G 0.639 -11 V 0.586 -12 F 0.507 -13 D 0.430 -14 H 0.379 -15 H 0.355 -16 V 0.342 -17 Q 0.326 -18 T 0.307 -19 A 0.291 -20 V 0.282 -21 C 0.277 -22 D 0.272 -23 S 0.264 -24 R 0.255 -25 A 0.253 -26 K 0.263 -27 Y 0.276 -28 R 0.291 -29 E 0.318 -30 G 0.367 -31 R 0.430 -32 R 0.491 -33 P 0.541 -34 R 0.583 -35 A 0.614 -36 V 0.622 -37 K 0.603 -38 V 0.566 -39 Y 0.511 -40 T 0.437 -41 I 0.357 -42 N 0.286 -43 L 0.223 -44 E 0.163 -45 S 0.108 -46 Q 0.067 -47 Y 0.042 -48 L 0.032 -49 L 0.033 -50 I 0.041 -51 Q 0.053 -52 G 0.063 -53 V 0.067 -54 P 0.066 -55 A 0.067 -56 V 0.072 -57 G 0.071 -58 A 0.059 -59 M 0.043 -60 K 0.030 -61 E 0.026 -62 L 0.033 -63 V 0.046 -64 E 0.056 -65 R 0.052 -66 F 0.043 -67 A 0.036 -68 L 0.035 -69 Y 0.036 -70 G 0.040 -71 A 0.042 -72 I 0.038 -73 E 0.030 -74 Q 0.023 -75 Y 0.024 -76 N 0.035 -77 A 0.054 -78 L 0.077 -79 D 0.099 -80 E 0.117 -81 Y 0.131 -82 P 0.144 -83 A 0.156 -84 E 0.161 -85 D 0.148 -86 F 0.118 -87 T 0.082 -88 E 0.050 -89 V 0.028 -90 Y 0.017 -91 L 0.016 -92 I 0.023 -93 K 0.033 -94 F 0.043 -95 V 0.046 -96 K 0.045 -97 L 0.045 -98 Q 0.044 -99 S 0.042 -100 A 0.040 -101 R 0.041 -102 V 0.046 -103 A 0.052 -104 K 0.055 -105 K 0.052 -106 K 0.048 -107 M 0.046 -108 D 0.044 -109 E 0.042 -110 Q 0.041 -111 S 0.042 -112 F 0.047 -113 F 0.060 -114 G 0.079 -115 G 0.092 -116 L 0.092 -117 L 0.081 -118 H 0.067 -119 V 0.060 -120 C 0.066 -121 Y 0.087 -122 A 0.113 -123 P 0.128 -124 E 0.125 -125 F 0.108 -126 E 0.089 -127 T 0.076 -128 V 0.071 -129 E 0.071 -130 E 0.074 -131 T 0.080 -132 R 0.090 -133 K 0.101 -134 K 0.107 -135 L 0.112 -136 Q 0.116 -137 E 0.122 -138 R 0.129 -139 K 0.133 -140 A 0.131 -141 Y 0.124 -142 I 0.123 -143 T 0.135 -144 R 0.155 -145 V 0.181 -146 T 0.213 -147 K 0.255 -148 N 0.300 -149 Q 0.341 -150 D 0.374 -151 C 0.397 -152 Y 0.416 -153 M 0.441 -154 A 0.471 -155 K 0.498 -156 K 0.522 -157 K 0.554 -158 P 0.595 -159 V 0.640 -160 P 0.685 -161 E 0.724 -162 Q 0.757 -163 K 0.780 -164 G 0.794 -165 T 0.800 -166 K 0.800 -167 D 0.797 -168 S 0.793 -169 R 0.785 -170 Q 0.771 -171 G 0.748 -172 F 0.722 -173 H 0.705 -174 P 0.709 -175 P 0.731 -176 M 0.764 -177 P 0.796 -178 G 0.818 -179 F 0.818 -180 G 0.780 -181 T 0.718 -182 A 0.687 -183 A 0.725 -184 L 0.791 -185 N 0.830 -186 T 0.835 -187 S 0.827 -188 P 0.817 -189 E 0.808 -190 S 0.801 -191 P 0.803 -192 P 0.818 -193 E 0.839 -194 N 0.854 -195 S 0.857 -196 S 0.850 -197 S 0.839 -198 C 0.828 -199 L 0.822 -200 P 0.822 -201 Y 0.822 -202 S 0.813 -203 C 0.797 -204 E 0.781 -205 F 0.773 -206 P 0.775 -207 L 0.783 -208 S 0.794 -209 C 0.809 -210 F 0.824 -211 A 0.835 -212 S 0.842 -213 K 0.846 -214 S 0.846 -215 T 0.845 -216 C 0.843 -217 S 0.843 -218 R 0.844 -219 G 0.845 -220 E 0.848 -221 H 0.851 -222 V 0.851 -223 D 0.850 -224 R 0.850 -225 V 0.848 -226 S 0.843 -227 D 0.834 -228 S 0.812 -229 C 0.762 -230 N 0.694 -231 S 0.660 -232 A 0.694 -233 R 0.759 -234 N 0.803 -235 H 0.818 -236 G 0.822 -237 E 0.824 -238 L 0.822 -239 S 0.819 -240 R 0.816 -241 H 0.813 -242 R 0.809 -243 D 0.805 -244 H 0.799 -245 S 0.790 -246 A 0.778 -247 F 0.767 -248 S 0.768 -249 P 0.783 -250 K 0.806 -251 L 0.827 -252 Q 0.836 -253 M 0.835 -254 N 0.824 -255 T 0.809 -256 Y 0.795 -257 K 0.784 -258 N 0.774 -259 S 0.768 -260 V 0.768 -261 P 0.769 -262 C 0.772 -263 S 0.774 -264 S 0.770 -265 V 0.753 -266 Q 0.733 -267 E 0.728 -268 A 0.740 -269 I 0.753 -270 A 0.762 -271 T 0.772 -272 S 0.778 -273 Q 0.778 -274 A 0.774 -275 V 0.769 -276 G 0.760 -277 R 0.739 -278 F 0.706 -279 M 0.671 -280 P 0.648 -281 R 0.633 -282 T 0.609 -283 T 0.567 -284 Q 0.522 -285 L 0.496 -286 Q 0.490 -287 E 0.493 -288 R 0.508 -289 K 0.544 -290 R 0.590 -291 R 0.622 -292 R 0.633 -293 D 0.631 -294 C 0.620 -295 D 0.600 -296 R 0.586 -297 E 0.596 -298 L 0.635 -299 G 0.687 -300 T 0.725 -301 L 0.733 -302 L 0.720 -303 E 0.703 -304 T 0.695 -305 H 0.698 -306 T 0.710 -307 S 0.726 -308 S 0.745 -309 N 0.764 -310 E 0.780 -311 V 0.784 -312 L 0.775 -313 I 0.758 -314 G 0.744 -315 P 0.740 -316 K 0.747 -317 L 0.760 -318 P 0.775 -319 G 0.789 -320 I 0.798 -321 P 0.805 -322 T 0.812 -323 V 0.816 -324 D 0.812 -325 L 0.800 -326 Q 0.785 -327 D 0.769 -328 D 0.756 -329 S 0.740 -330 L 0.705 -331 N 0.645 -332 T 0.572 -333 T 0.503 -334 A 0.448 -335 T 0.410 -336 L 0.389 -337 I 0.369 -338 R 0.340 -339 R 0.327 -340 K 0.356 -341 L 0.407 -342 K 0.454 -343 E 0.501 -344 V 0.545 -345 I 0.569 -346 S 0.569 -347 S 0.569 -348 V 0.579 -349 P 0.603 -350 K 0.639 -351 P 0.680 -352 P 0.721 -353 E 0.758 -354 D 0.784 -355 N 0.797 -356 I 0.802 -357 K 0.804 -358 D 0.803 -359 V 0.795 -360 C 0.775 -361 T 0.748 -362 S 0.724 -363 H 0.717 -364 P 0.731 -365 G 0.754 -366 K 0.769 -367 Q 0.770 -368 R 0.753 -369 R 0.716 -370 R 0.658 -371 I 0.609 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040302.18_ENSMUST00000042753.14_GN:Rbm48_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:42.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040302.18_ENSMUST00000042753.14_GN:Rbm48_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:42.caid deleted file mode 100644 index e76424c0e9ecd0a3b5ba2a7c5bacf582399105a8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040302.18_ENSMUST00000042753.14_GN:Rbm48_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:42.caid +++ /dev/null @@ -1,414 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000040302.18|ENSMUST00000042753.14|GN:Rbm48|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:42 -1 M 0.434 -2 I 0.483 -3 V 0.552 -4 D 0.608 -5 G 0.630 -6 V 0.620 -7 D 0.585 -8 P 0.541 -9 S 0.524 -10 A 0.547 -11 N 0.571 -12 P 0.559 -13 S 0.545 -14 T 0.575 -15 P 0.638 -16 G 0.697 -17 P 0.735 -18 S 0.751 -19 C 0.754 -20 S 0.753 -21 L 0.753 -22 I 0.752 -23 G 0.746 -24 L 0.736 -25 R 0.725 -26 G 0.706 -27 A 0.674 -28 R 0.646 -29 L 0.638 -30 A 0.652 -31 D 0.673 -32 V 0.687 -33 V 0.694 -34 L 0.701 -35 A 0.715 -36 R 0.733 -37 G 0.749 -38 T 0.761 -39 R 0.773 -40 A 0.788 -41 G 0.800 -42 K 0.803 -43 M 0.800 -44 A 0.793 -45 S 0.784 -46 S 0.771 -47 D 0.755 -48 G 0.742 -49 K 0.738 -50 P 0.744 -51 G 0.753 -52 G 0.749 -53 V 0.721 -54 F 0.670 -55 D 0.616 -56 H 0.577 -57 H 0.554 -58 V 0.540 -59 Q 0.527 -60 T 0.503 -61 A 0.469 -62 V 0.438 -63 C 0.414 -64 D 0.393 -65 S 0.371 -66 R 0.353 -67 A 0.346 -68 K 0.353 -69 Y 0.364 -70 R 0.379 -71 E 0.406 -72 G 0.455 -73 R 0.516 -74 R 0.576 -75 P 0.623 -76 R 0.660 -77 A 0.681 -78 V 0.677 -79 K 0.648 -80 V 0.600 -81 Y 0.535 -82 T 0.453 -83 I 0.367 -84 N 0.291 -85 L 0.224 -86 E 0.162 -87 S 0.106 -88 Q 0.065 -89 Y 0.041 -90 L 0.033 -91 L 0.034 -92 I 0.042 -93 Q 0.053 -94 G 0.062 -95 V 0.065 -96 P 0.063 -97 A 0.063 -98 V 0.067 -99 G 0.066 -100 A 0.055 -101 M 0.040 -102 K 0.028 -103 E 0.025 -104 L 0.032 -105 V 0.045 -106 E 0.054 -107 R 0.051 -108 F 0.041 -109 A 0.034 -110 L 0.032 -111 Y 0.034 -112 G 0.037 -113 A 0.039 -114 I 0.036 -115 E 0.029 -116 Q 0.023 -117 Y 0.024 -118 N 0.034 -119 A 0.053 -120 L 0.076 -121 D 0.098 -122 E 0.117 -123 Y 0.131 -124 P 0.143 -125 A 0.153 -126 E 0.156 -127 D 0.143 -128 F 0.115 -129 T 0.082 -130 E 0.051 -131 V 0.028 -132 Y 0.017 -133 L 0.016 -134 I 0.023 -135 K 0.034 -136 F 0.044 -137 V 0.047 -138 K 0.046 -139 L 0.045 -140 Q 0.044 -141 S 0.042 -142 A 0.040 -143 R 0.040 -144 V 0.045 -145 A 0.051 -146 K 0.053 -147 K 0.051 -148 K 0.047 -149 M 0.046 -150 D 0.044 -151 E 0.043 -152 Q 0.042 -153 S 0.043 -154 F 0.048 -155 F 0.061 -156 G 0.080 -157 G 0.093 -158 L 0.093 -159 L 0.081 -160 H 0.066 -161 V 0.060 -162 C 0.067 -163 Y 0.089 -164 A 0.115 -165 P 0.131 -166 E 0.128 -167 F 0.112 -168 E 0.093 -169 T 0.079 -170 V 0.074 -171 E 0.074 -172 E 0.076 -173 T 0.082 -174 R 0.092 -175 K 0.103 -176 K 0.109 -177 L 0.113 -178 Q 0.117 -179 E 0.122 -180 R 0.128 -181 K 0.132 -182 A 0.129 -183 Y 0.123 -184 I 0.124 -185 T 0.136 -186 R 0.157 -187 V 0.184 -188 T 0.218 -189 K 0.258 -190 N 0.298 -191 Q 0.336 -192 D 0.366 -193 C 0.389 -194 Y 0.407 -195 M 0.430 -196 A 0.458 -197 K 0.487 -198 K 0.516 -199 K 0.553 -200 P 0.597 -201 V 0.646 -202 P 0.692 -203 E 0.731 -204 Q 0.763 -205 K 0.786 -206 G 0.800 -207 T 0.805 -208 K 0.805 -209 D 0.802 -210 S 0.798 -211 R 0.790 -212 Q 0.776 -213 G 0.754 -214 F 0.730 -215 H 0.715 -216 P 0.719 -217 P 0.741 -218 M 0.772 -219 P 0.802 -220 G 0.822 -221 F 0.821 -222 G 0.783 -223 T 0.720 -224 A 0.688 -225 A 0.725 -226 L 0.792 -227 N 0.832 -228 T 0.838 -229 S 0.829 -230 P 0.819 -231 E 0.809 -232 S 0.803 -233 P 0.804 -234 P 0.817 -235 E 0.838 -236 N 0.853 -237 S 0.856 -238 S 0.849 -239 S 0.837 -240 C 0.827 -241 L 0.823 -242 P 0.823 -243 Y 0.822 -244 S 0.813 -245 C 0.796 -246 E 0.780 -247 F 0.773 -248 P 0.774 -249 L 0.781 -250 S 0.790 -251 C 0.802 -252 F 0.816 -253 A 0.828 -254 S 0.835 -255 K 0.839 -256 S 0.840 -257 T 0.839 -258 C 0.839 -259 S 0.840 -260 R 0.842 -261 G 0.843 -262 E 0.846 -263 H 0.849 -264 V 0.850 -265 D 0.849 -266 R 0.848 -267 V 0.846 -268 S 0.841 -269 D 0.832 -270 S 0.810 -271 C 0.760 -272 N 0.692 -273 S 0.657 -274 A 0.691 -275 R 0.755 -276 N 0.800 -277 H 0.816 -278 G 0.820 -279 E 0.820 -280 L 0.819 -281 S 0.816 -282 R 0.813 -283 H 0.810 -284 R 0.808 -285 D 0.805 -286 H 0.800 -287 S 0.792 -288 A 0.780 -289 F 0.770 -290 S 0.771 -291 P 0.785 -292 K 0.809 -293 L 0.830 -294 Q 0.841 -295 M 0.842 -296 N 0.834 -297 T 0.821 -298 Y 0.808 -299 K 0.797 -300 N 0.790 -301 S 0.786 -302 V 0.787 -303 P 0.791 -304 C 0.797 -305 S 0.799 -306 S 0.793 -307 V 0.775 -308 Q 0.756 -309 E 0.752 -310 A 0.765 -311 I 0.781 -312 A 0.792 -313 T 0.800 -314 S 0.803 -315 Q 0.798 -316 A 0.792 -317 V 0.788 -318 G 0.781 -319 R 0.764 -320 F 0.736 -321 M 0.707 -322 P 0.686 -323 R 0.670 -324 T 0.645 -325 T 0.601 -326 Q 0.552 -327 L 0.520 -328 Q 0.509 -329 E 0.508 -330 R 0.519 -331 K 0.550 -332 R 0.595 -333 R 0.630 -334 R 0.646 -335 D 0.652 -336 C 0.649 -337 D 0.635 -338 R 0.624 -339 E 0.635 -340 L 0.671 -341 G 0.717 -342 T 0.748 -343 L 0.753 -344 L 0.740 -345 E 0.724 -346 T 0.715 -347 H 0.718 -348 T 0.728 -349 S 0.743 -350 S 0.760 -351 N 0.778 -352 E 0.793 -353 V 0.797 -354 L 0.789 -355 I 0.773 -356 G 0.760 -357 P 0.756 -358 K 0.761 -359 L 0.772 -360 P 0.785 -361 G 0.796 -362 I 0.802 -363 P 0.807 -364 T 0.813 -365 V 0.817 -366 D 0.815 -367 L 0.805 -368 Q 0.790 -369 D 0.774 -370 D 0.760 -371 S 0.741 -372 L 0.704 -373 N 0.644 -374 T 0.574 -375 T 0.508 -376 A 0.451 -377 T 0.410 -378 L 0.389 -379 I 0.373 -380 R 0.348 -381 R 0.338 -382 K 0.370 -383 L 0.424 -384 K 0.472 -385 E 0.516 -386 V 0.557 -387 I 0.580 -388 S 0.581 -389 S 0.581 -390 V 0.590 -391 P 0.612 -392 K 0.646 -393 P 0.687 -394 P 0.728 -395 E 0.763 -396 D 0.788 -397 N 0.801 -398 I 0.805 -399 K 0.807 -400 D 0.805 -401 V 0.796 -402 C 0.776 -403 T 0.747 -404 S 0.723 -405 H 0.715 -406 P 0.729 -407 G 0.752 -408 K 0.767 -409 Q 0.768 -410 R 0.751 -411 R 0.713 -412 R 0.656 -413 I 0.608 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040521.12_ENSMUST00000040560.11_GN:Tsfm_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040521.12_ENSMUST00000040560.11_GN:Tsfm_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index fcb6968dc5fdb8b152947ae462bcffb73f3aca87..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040521.12_ENSMUST00000040560.11_GN:Tsfm_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,325 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000040521.12|ENSMUST00000040560.11|GN:Tsfm|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.391 -2 S 0.404 -3 L 0.420 -4 L 0.420 -5 R 0.397 -6 S 0.376 -7 L 0.386 -8 R 0.421 -9 F 0.464 -10 F 0.504 -11 P 0.526 -12 V 0.519 -13 A 0.512 -14 C 0.540 -15 T 0.585 -16 G 0.616 -17 R 0.623 -18 S 0.606 -19 A 0.571 -20 R 0.554 -21 A 0.581 -22 V 0.623 -23 L 0.639 -24 L 0.630 -25 Q 0.618 -26 P 0.608 -27 S 0.600 -28 Q 0.597 -29 P 0.598 -30 W 0.593 -31 L 0.583 -32 T 0.574 -33 F 0.574 -34 H 0.585 -35 A 0.604 -36 G 0.630 -37 P 0.655 -38 S 0.671 -39 L 0.669 -40 S 0.648 -41 S 0.612 -42 A 0.559 -43 A 0.479 -44 S 0.364 -45 S 0.236 -46 K 0.132 -47 E 0.072 -48 L 0.047 -49 L 0.038 -50 M 0.038 -51 K 0.047 -52 L 0.059 -53 R 0.066 -54 R 0.070 -55 K 0.076 -56 T 0.085 -57 G 0.088 -58 Y 0.078 -59 S 0.060 -60 F 0.047 -61 V 0.044 -62 N 0.046 -63 C 0.047 -64 K 0.045 -65 K 0.048 -66 A 0.057 -67 L 0.063 -68 E 0.063 -69 T 0.065 -70 C 0.078 -71 G 0.091 -72 G 0.092 -73 D 0.080 -74 L 0.064 -75 K 0.052 -76 Q 0.048 -77 A 0.054 -78 E 0.069 -79 D 0.082 -80 W 0.090 -81 L 0.097 -82 H 0.106 -83 K 0.116 -84 Q 0.126 -85 A 0.139 -86 Q 0.148 -87 K 0.149 -88 E 0.146 -89 G 0.145 -90 W 0.142 -91 S 0.135 -92 K 0.127 -93 A 0.122 -94 A 0.124 -95 K 0.132 -96 L 0.138 -97 H 0.131 -98 G 0.116 -99 R 0.101 -100 K 0.090 -101 T 0.078 -102 K 0.066 -103 E 0.058 -104 G 0.053 -105 L 0.049 -106 I 0.043 -107 G 0.040 -108 L 0.038 -109 L 0.039 -110 Q 0.041 -111 E 0.043 -112 G 0.044 -113 N 0.046 -114 T 0.047 -115 A 0.046 -116 V 0.042 -117 L 0.036 -118 V 0.031 -119 E 0.030 -120 V 0.035 -121 N 0.046 -122 C 0.061 -123 E 0.071 -124 T 0.073 -125 D 0.070 -126 F 0.069 -127 V 0.068 -128 S 0.063 -129 R 0.057 -130 N 0.052 -131 L 0.050 -132 K 0.051 -133 F 0.051 -134 Q 0.050 -135 Q 0.048 -136 L 0.048 -137 V 0.047 -138 Q 0.048 -139 Q 0.051 -140 V 0.053 -141 A 0.053 -142 L 0.050 -143 G 0.047 -144 T 0.043 -145 M 0.039 -146 A 0.036 -147 H 0.035 -148 C 0.037 -149 Q 0.045 -150 N 0.059 -151 L 0.077 -152 T 0.093 -153 D 0.099 -154 R 0.099 -155 L 0.095 -156 S 0.089 -157 T 0.083 -158 Y 0.080 -159 S 0.078 -160 K 0.079 -161 G 0.080 -162 F 0.076 -163 L 0.068 -164 N 0.059 -165 S 0.054 -166 S 0.054 -167 E 0.060 -168 L 0.069 -169 S 0.078 -170 E 0.087 -171 L 0.093 -172 A 0.095 -173 A 0.095 -174 G 0.101 -175 P 0.116 -176 D 0.132 -177 R 0.136 -178 E 0.125 -179 G 0.105 -180 S 0.084 -181 L 0.065 -182 K 0.053 -183 D 0.053 -184 Q 0.059 -185 L 0.064 -186 A 0.062 -187 L 0.055 -188 A 0.049 -189 I 0.047 -190 G 0.049 -191 K 0.054 -192 L 0.060 -193 G 0.066 -194 E 0.068 -195 N 0.066 -196 M 0.060 -197 I 0.052 -198 L 0.045 -199 K 0.038 -200 R 0.032 -201 A 0.028 -202 A 0.028 -203 W 0.030 -204 V 0.034 -205 K 0.041 -206 V 0.048 -207 P 0.053 -208 S 0.053 -209 G 0.049 -210 F 0.044 -211 Y 0.042 -212 V 0.043 -213 G 0.046 -214 S 0.052 -215 Y 0.063 -216 V 0.080 -217 H 0.100 -218 G 0.118 -219 V 0.132 -220 T 0.139 -221 Q 0.142 -222 S 0.140 -223 P 0.130 -224 S 0.118 -225 L 0.110 -226 Q 0.106 -227 N 0.101 -228 L 0.090 -229 V 0.077 -230 L 0.068 -231 G 0.065 -232 K 0.060 -233 Y 0.053 -234 G 0.048 -235 A 0.048 -236 L 0.051 -237 V 0.055 -238 I 0.060 -239 C 0.065 -240 E 0.072 -241 T 0.082 -242 P 0.097 -243 E 0.112 -244 Q 0.120 -245 I 0.118 -246 A 0.108 -247 N 0.094 -248 L 0.078 -249 E 0.066 -250 E 0.058 -251 V 0.056 -252 G 0.061 -253 R 0.071 -254 R 0.078 -255 L 0.078 -256 G 0.074 -257 Q 0.072 -258 H 0.076 -259 V 0.083 -260 V 0.090 -261 G 0.096 -262 M 0.102 -263 A 0.110 -264 P 0.119 -265 L 0.133 -266 S 0.154 -267 V 0.175 -268 G 0.192 -269 S 0.208 -270 L 0.230 -271 D 0.256 -272 D 0.283 -273 E 0.311 -274 P 0.339 -275 G 0.365 -276 G 0.378 -277 E 0.362 -278 T 0.316 -279 E 0.262 -280 T 0.222 -281 R 0.202 -282 M 0.196 -283 L 0.195 -284 P 0.188 -285 Q 0.170 -286 P 0.144 -287 Y 0.117 -288 L 0.095 -289 L 0.081 -290 D 0.076 -291 P 0.075 -292 S 0.073 -293 I 0.070 -294 T 0.068 -295 L 0.068 -296 G 0.067 -297 Q 0.068 -298 Y 0.067 -299 V 0.064 -300 Q 0.060 -301 P 0.061 -302 Q 0.062 -303 G 0.062 -304 V 0.062 -305 T 0.070 -306 V 0.087 -307 V 0.104 -308 D 0.110 -309 F 0.104 -310 V 0.097 -311 R 0.095 -312 F 0.101 -313 E 0.119 -314 C 0.154 -315 G 0.211 -316 E 0.286 -317 D 0.370 -318 E 0.453 -319 Q 0.526 -320 V 0.584 -321 A 0.617 -322 E 0.617 -323 A 0.584 -324 E 0.550 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040521.12_ENSMUST00000040560.11_GN:Tsfm_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040521.12_ENSMUST00000040560.11_GN:Tsfm_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid deleted file mode 100644 index 7eb93d6656911729cac314957674743988387dcc..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040521.12_ENSMUST00000040560.11_GN:Tsfm_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid +++ /dev/null @@ -1,332 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000040521.12|ENSMUST00000040560.11|GN:Tsfm|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:7 -1 M 0.449 -2 G 0.464 -3 G 0.484 -4 R 0.491 -5 A 0.479 -6 R 0.479 -7 G 0.510 -8 M 0.550 -9 S 0.566 -10 L 0.550 -11 L 0.503 -12 R 0.438 -13 S 0.391 -14 L 0.388 -15 R 0.417 -16 F 0.462 -17 F 0.522 -18 P 0.585 -19 V 0.631 -20 A 0.654 -21 C 0.663 -22 T 0.668 -23 G 0.672 -24 R 0.667 -25 S 0.640 -26 A 0.593 -27 R 0.563 -28 A 0.583 -29 V 0.621 -30 L 0.638 -31 L 0.632 -32 Q 0.621 -33 P 0.613 -34 S 0.607 -35 Q 0.605 -36 P 0.609 -37 W 0.609 -38 L 0.601 -39 T 0.592 -40 F 0.590 -41 H 0.597 -42 A 0.612 -43 G 0.635 -44 P 0.660 -45 S 0.676 -46 L 0.675 -47 S 0.655 -48 S 0.620 -49 A 0.568 -50 A 0.486 -51 S 0.369 -52 S 0.239 -53 K 0.133 -54 E 0.073 -55 L 0.048 -56 L 0.039 -57 M 0.039 -58 K 0.048 -59 L 0.060 -60 R 0.067 -61 R 0.070 -62 K 0.075 -63 T 0.084 -64 G 0.087 -65 Y 0.077 -66 S 0.059 -67 F 0.046 -68 V 0.043 -69 N 0.045 -70 C 0.045 -71 K 0.044 -72 K 0.047 -73 A 0.056 -74 L 0.063 -75 E 0.062 -76 T 0.064 -77 C 0.076 -78 G 0.089 -79 G 0.090 -80 D 0.078 -81 L 0.063 -82 K 0.051 -83 Q 0.047 -84 A 0.054 -85 E 0.068 -86 D 0.081 -87 W 0.089 -88 L 0.096 -89 H 0.105 -90 K 0.114 -91 Q 0.124 -92 A 0.136 -93 Q 0.144 -94 K 0.145 -95 E 0.142 -96 G 0.141 -97 W 0.137 -98 S 0.131 -99 K 0.124 -100 A 0.120 -101 A 0.122 -102 K 0.129 -103 L 0.135 -104 H 0.129 -105 G 0.114 -106 R 0.100 -107 K 0.090 -108 T 0.078 -109 K 0.066 -110 E 0.058 -111 G 0.053 -112 L 0.048 -113 I 0.043 -114 G 0.039 -115 L 0.038 -116 L 0.040 -117 Q 0.041 -118 E 0.043 -119 G 0.044 -120 N 0.046 -121 T 0.047 -122 A 0.046 -123 V 0.042 -124 L 0.036 -125 V 0.031 -126 E 0.030 -127 V 0.035 -128 N 0.046 -129 C 0.061 -130 E 0.072 -131 T 0.073 -132 D 0.071 -133 F 0.069 -134 V 0.068 -135 S 0.064 -136 R 0.057 -137 N 0.052 -138 L 0.050 -139 K 0.051 -140 F 0.051 -141 Q 0.050 -142 Q 0.048 -143 L 0.047 -144 V 0.047 -145 Q 0.048 -146 Q 0.051 -147 V 0.053 -148 A 0.052 -149 L 0.049 -150 G 0.046 -151 T 0.043 -152 M 0.039 -153 A 0.035 -154 H 0.034 -155 C 0.037 -156 Q 0.045 -157 N 0.059 -158 L 0.077 -159 T 0.093 -160 D 0.099 -161 R 0.098 -162 L 0.094 -163 S 0.088 -164 T 0.082 -165 Y 0.078 -166 S 0.077 -167 K 0.078 -168 G 0.079 -169 F 0.076 -170 L 0.068 -171 N 0.059 -172 S 0.053 -173 S 0.053 -174 E 0.059 -175 L 0.068 -176 S 0.077 -177 E 0.086 -178 L 0.092 -179 A 0.094 -180 A 0.094 -181 G 0.100 -182 P 0.116 -183 D 0.131 -184 R 0.135 -185 E 0.123 -186 G 0.103 -187 S 0.082 -188 L 0.064 -189 K 0.053 -190 D 0.052 -191 Q 0.059 -192 L 0.064 -193 A 0.061 -194 L 0.055 -195 A 0.049 -196 I 0.047 -197 G 0.049 -198 K 0.054 -199 L 0.060 -200 G 0.065 -201 E 0.067 -202 N 0.065 -203 M 0.059 -204 I 0.051 -205 L 0.044 -206 K 0.037 -207 R 0.031 -208 A 0.028 -209 A 0.027 -210 W 0.029 -211 V 0.034 -212 K 0.040 -213 V 0.047 -214 P 0.052 -215 S 0.053 -216 G 0.049 -217 F 0.044 -218 Y 0.041 -219 V 0.042 -220 G 0.045 -221 S 0.051 -222 Y 0.062 -223 V 0.079 -224 H 0.099 -225 G 0.117 -226 V 0.130 -227 T 0.138 -228 Q 0.141 -229 S 0.138 -230 P 0.128 -231 S 0.115 -232 L 0.107 -233 Q 0.104 -234 N 0.099 -235 L 0.088 -236 V 0.075 -237 L 0.067 -238 G 0.063 -239 K 0.059 -240 Y 0.052 -241 G 0.047 -242 A 0.047 -243 L 0.051 -244 V 0.055 -245 I 0.059 -246 C 0.064 -247 E 0.071 -248 T 0.082 -249 P 0.097 -250 E 0.112 -251 Q 0.121 -252 I 0.119 -253 A 0.108 -254 N 0.094 -255 L 0.078 -256 E 0.066 -257 E 0.058 -258 V 0.056 -259 G 0.061 -260 R 0.070 -261 R 0.078 -262 L 0.078 -263 G 0.073 -264 Q 0.072 -265 H 0.075 -266 V 0.082 -267 V 0.089 -268 G 0.096 -269 M 0.102 -270 A 0.110 -271 P 0.119 -272 L 0.134 -273 S 0.154 -274 V 0.176 -275 G 0.192 -276 S 0.209 -277 L 0.231 -278 D 0.258 -279 D 0.286 -280 E 0.314 -281 P 0.342 -282 G 0.368 -283 G 0.382 -284 E 0.366 -285 T 0.319 -286 E 0.264 -287 T 0.223 -288 R 0.203 -289 M 0.197 -290 L 0.196 -291 P 0.188 -292 Q 0.170 -293 P 0.145 -294 Y 0.118 -295 L 0.095 -296 L 0.081 -297 D 0.076 -298 P 0.075 -299 S 0.073 -300 I 0.070 -301 T 0.069 -302 L 0.068 -303 G 0.068 -304 Q 0.068 -305 Y 0.067 -306 V 0.064 -307 Q 0.061 -308 P 0.061 -309 Q 0.063 -310 G 0.062 -311 V 0.062 -312 T 0.070 -313 V 0.087 -314 V 0.103 -315 D 0.109 -316 F 0.104 -317 V 0.096 -318 R 0.095 -319 F 0.101 -320 E 0.119 -321 C 0.155 -322 G 0.212 -323 E 0.286 -324 D 0.370 -325 E 0.454 -326 Q 0.528 -327 V 0.586 -328 A 0.619 -329 E 0.619 -330 A 0.587 -331 E 0.553 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040596.17_ENSMUST00000131487.9_GN:Pogk_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040596.17_ENSMUST00000131487.9_GN:Pogk_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 968d3d88467ca6f0c8f8bb9fe02bcf1982df24a6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040596.17_ENSMUST00000131487.9_GN:Pogk_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,608 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000040596.17|ENSMUST00000131487.9|GN:Pogk|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.348 -2 E 0.356 -3 S 0.372 -4 R 0.398 -5 A 0.431 -6 Y 0.467 -7 P 0.497 -8 L 0.510 -9 N 0.500 -10 L 0.471 -11 T 0.422 -12 L 0.354 -13 K 0.293 -14 E 0.267 -15 E 0.273 -16 Q 0.287 -17 K 0.310 -18 E 0.354 -19 E 0.411 -20 E 0.463 -21 V 0.499 -22 E 0.507 -23 I 0.486 -24 Q 0.464 -25 E 0.470 -26 L 0.488 -27 E 0.492 -28 D 0.491 -29 G 0.500 -30 P 0.508 -31 I 0.496 -32 D 0.477 -33 M 0.481 -34 Q 0.524 -35 K 0.589 -36 V 0.641 -37 Q 0.665 -38 I 0.664 -39 C 0.650 -40 S 0.627 -41 E 0.595 -42 G 0.546 -43 A 0.473 -44 W 0.388 -45 V 0.320 -46 P 0.275 -47 A 0.235 -48 L 0.195 -49 F 0.169 -50 D 0.169 -51 E 0.183 -52 V 0.189 -53 A 0.177 -54 I 0.154 -55 Y 0.136 -56 F 0.131 -57 S 0.136 -58 D 0.146 -59 E 0.156 -60 E 0.153 -61 W 0.140 -62 E 0.138 -63 V 0.151 -64 L 0.159 -65 T 0.143 -66 E 0.118 -67 Q 0.101 -68 Q 0.094 -69 K 0.093 -70 A 0.101 -71 L 0.116 -72 Y 0.125 -73 R 0.124 -74 E 0.127 -75 V 0.138 -76 M 0.140 -77 R 0.122 -78 M 0.098 -79 N 0.084 -80 Y 0.076 -81 E 0.071 -82 T 0.072 -83 V 0.077 -84 L 0.088 -85 S 0.102 -86 L 0.112 -87 E 0.114 -88 F 0.115 -89 P 0.120 -90 F 0.130 -91 P 0.135 -92 K 0.129 -93 P 0.115 -94 D 0.101 -95 M 0.092 -96 I 0.091 -97 N 0.098 -98 R 0.115 -99 L 0.140 -100 E 0.170 -101 R 0.204 -102 D 0.241 -103 E 0.279 -104 E 0.316 -105 C 0.348 -106 P 0.373 -107 N 0.390 -108 S 0.395 -109 D 0.389 -110 E 0.382 -111 W 0.391 -112 R 0.431 -113 L 0.498 -114 Q 0.566 -115 G 0.614 -116 V 0.641 -117 T 0.658 -118 F 0.677 -119 A 0.696 -120 E 0.709 -121 N 0.715 -122 E 0.712 -123 E 0.703 -124 S 0.689 -125 D 0.671 -126 F 0.650 -127 R 0.632 -128 T 0.624 -129 P 0.625 -130 D 0.626 -131 W 0.628 -132 A 0.641 -133 S 0.665 -134 P 0.695 -135 T 0.725 -136 N 0.748 -137 A 0.748 -138 T 0.724 -139 S 0.687 -140 H 0.650 -141 F 0.623 -142 P 0.614 -143 Q 0.622 -144 P 0.642 -145 Q 0.668 -146 P 0.691 -147 F 0.704 -148 N 0.703 -149 S 0.690 -150 F 0.677 -151 G 0.671 -152 L 0.664 -153 R 0.642 -154 L 0.604 -155 P 0.561 -156 Q 0.538 -157 D 0.543 -158 I 0.559 -159 T 0.572 -160 E 0.585 -161 L 0.597 -162 P 0.590 -163 E 0.559 -164 W 0.529 -165 T 0.527 -166 E 0.549 -167 G 0.568 -168 Y 0.570 -169 P 0.557 -170 F 0.543 -171 Y 0.541 -172 M 0.550 -173 A 0.553 -174 M 0.541 -175 G 0.531 -176 F 0.548 -177 P 0.582 -178 G 0.606 -179 Y 0.589 -180 D 0.527 -181 L 0.442 -182 S 0.374 -183 A 0.350 -184 D 0.354 -185 D 0.348 -186 L 0.317 -187 A 0.283 -188 S 0.272 -189 K 0.287 -190 F 0.319 -191 Q 0.360 -192 F 0.400 -193 S 0.426 -194 R 0.426 -195 G 0.398 -196 M 0.344 -197 R 0.273 -198 R 0.201 -199 S 0.141 -200 Y 0.097 -201 D 0.071 -202 A 0.058 -203 G 0.050 -204 F 0.040 -205 K 0.033 -206 L 0.030 -207 M 0.032 -208 V 0.035 -209 V 0.035 -210 E 0.033 -211 Y 0.030 -212 A 0.029 -213 E 0.031 -214 S 0.034 -215 T 0.038 -216 N 0.040 -217 N 0.042 -218 C 0.047 -219 Q 0.060 -220 A 0.079 -221 A 0.093 -222 K 0.093 -223 Q 0.084 -224 F 0.077 -225 G 0.070 -226 V 0.058 -227 L 0.042 -228 E 0.028 -229 K 0.020 -230 N 0.016 -231 V 0.016 -232 R 0.016 -233 D 0.018 -234 W 0.020 -235 R 0.023 -236 K 0.024 -237 V 0.026 -238 K 0.030 -239 P 0.039 -240 Q 0.051 -241 L 0.066 -242 Q 0.087 -243 N 0.115 -244 A 0.140 -245 H 0.149 -246 A 0.143 -247 M 0.138 -248 R 0.147 -249 R 0.170 -250 A 0.207 -251 F 0.253 -252 R 0.308 -253 G 0.359 -254 P 0.381 -255 K 0.360 -256 N 0.308 -257 G 0.246 -258 R 0.187 -259 F 0.139 -260 A 0.103 -261 L 0.078 -262 V 0.063 -263 D 0.054 -264 Q 0.045 -265 R 0.036 -266 V 0.030 -267 A 0.027 -268 E 0.025 -269 Y 0.024 -270 V 0.024 -271 R 0.026 -272 Y 0.030 -273 M 0.039 -274 Q 0.052 -275 A 0.069 -276 K 0.089 -277 G 0.104 -278 D 0.107 -279 P 0.096 -280 I 0.075 -281 T 0.053 -282 R 0.039 -283 E 0.032 -284 A 0.033 -285 M 0.041 -286 Q 0.052 -287 L 0.057 -288 K 0.054 -289 A 0.053 -290 L 0.061 -291 E 0.066 -292 I 0.062 -293 A 0.054 -294 Q 0.050 -295 E 0.052 -296 M 0.064 -297 N 0.085 -298 I 0.105 -299 P 0.113 -300 E 0.107 -301 K 0.095 -302 G 0.085 -303 F 0.079 -304 K 0.071 -305 A 0.059 -306 S 0.047 -307 L 0.039 -308 G 0.036 -309 W 0.033 -310 C 0.027 -311 R 0.022 -312 R 0.022 -313 M 0.026 -314 M 0.032 -315 R 0.039 -316 R 0.051 -317 Y 0.077 -318 D 0.120 -319 L 0.178 -320 S 0.242 -321 L 0.303 -322 R 0.353 -323 H 0.385 -324 K 0.387 -325 V 0.362 -326 P 0.326 -327 V 0.295 -328 P 0.274 -329 Q 0.255 -330 H 0.232 -331 L 0.205 -332 A 0.172 -333 E 0.136 -334 D 0.104 -335 L 0.084 -336 T 0.070 -337 E 0.061 -338 K 0.056 -339 L 0.054 -340 V 0.051 -341 T 0.049 -342 Y 0.052 -343 Q 0.059 -344 Q 0.062 -345 S 0.058 -346 V 0.054 -347 L 0.061 -348 A 0.068 -349 L 0.065 -350 R 0.057 -351 R 0.056 -352 T 0.065 -353 H 0.075 -354 D 0.077 -355 Y 0.073 -356 E 0.065 -357 V 0.058 -358 A 0.052 -359 Q 0.044 -360 M 0.036 -361 G 0.029 -362 N 0.028 -363 A 0.036 -364 D 0.055 -365 E 0.084 -366 T 0.109 -367 P 0.123 -368 I 0.133 -369 C 0.156 -370 L 0.209 -371 E 0.294 -372 V 0.396 -373 P 0.487 -374 S 0.551 -375 R 0.597 -376 V 0.636 -377 T 0.664 -378 V 0.676 -379 D 0.677 -380 N 0.677 -381 Q 0.665 -382 G 0.631 -383 E 0.592 -384 K 0.573 -385 P 0.568 -386 I 0.552 -387 L 0.512 -388 V 0.454 -389 K 0.397 -390 T 0.356 -391 P 0.330 -392 G 0.309 -393 R 0.285 -394 E 0.249 -395 K 0.202 -396 L 0.154 -397 R 0.118 -398 I 0.093 -399 T 0.076 -400 A 0.063 -401 M 0.054 -402 L 0.048 -403 G 0.044 -404 V 0.047 -405 L 0.060 -406 A 0.081 -407 D 0.100 -408 G 0.108 -409 R 0.102 -410 K 0.094 -411 L 0.090 -412 P 0.084 -413 P 0.071 -414 Y 0.059 -415 I 0.056 -416 I 0.061 -417 L 0.067 -418 R 0.073 -419 G 0.081 -420 T 0.094 -421 Y 0.111 -422 I 0.126 -423 P 0.138 -424 P 0.151 -425 G 0.164 -426 K 0.169 -427 F 0.161 -428 P 0.142 -429 S 0.118 -430 G 0.100 -431 M 0.090 -432 E 0.085 -433 I 0.081 -434 R 0.081 -435 C 0.082 -436 H 0.078 -437 R 0.070 -438 Y 0.064 -439 G 0.063 -440 W 0.065 -441 M 0.063 -442 T 0.060 -443 E 0.056 -444 D 0.053 -445 L 0.051 -446 M 0.048 -447 Q 0.044 -448 D 0.042 -449 W 0.041 -450 L 0.042 -451 E 0.045 -452 V 0.046 -453 V 0.043 -454 W 0.037 -455 R 0.037 -456 R 0.048 -457 R 0.070 -458 T 0.103 -459 G 0.139 -460 A 0.170 -461 V 0.181 -462 P 0.169 -463 R 0.140 -464 Q 0.108 -465 R 0.080 -466 G 0.059 -467 M 0.045 -468 L 0.039 -469 I 0.040 -470 L 0.047 -471 N 0.060 -472 G 0.076 -473 F 0.085 -474 R 0.086 -475 C 0.085 -476 H 0.083 -477 A 0.077 -478 T 0.069 -479 D 0.064 -480 S 0.067 -481 V 0.078 -482 K 0.090 -483 S 0.095 -484 S 0.089 -485 M 0.083 -486 E 0.082 -487 N 0.085 -488 M 0.087 -489 N 0.089 -490 T 0.087 -491 D 0.081 -492 M 0.079 -493 V 0.086 -494 I 0.099 -495 I 0.114 -496 P 0.123 -497 G 0.126 -498 G 0.125 -499 L 0.123 -500 T 0.119 -501 S 0.109 -502 Q 0.093 -503 L 0.080 -504 Q 0.079 -505 V 0.086 -506 L 0.094 -507 D 0.098 -508 V 0.101 -509 V 0.102 -510 V 0.093 -511 Y 0.079 -512 K 0.071 -513 P 0.068 -514 L 0.067 -515 N 0.064 -516 D 0.060 -517 S 0.059 -518 V 0.063 -519 R 0.068 -520 A 0.069 -521 Q 0.070 -522 Y 0.074 -523 S 0.080 -524 N 0.081 -525 W 0.080 -526 L 0.084 -527 L 0.097 -528 A 0.123 -529 G 0.155 -530 N 0.184 -531 L 0.205 -532 A 0.221 -533 L 0.237 -534 S 0.254 -535 P 0.269 -536 T 0.281 -537 G 0.286 -538 N 0.282 -539 A 0.266 -540 K 0.241 -541 K 0.215 -542 P 0.188 -543 P 0.155 -544 L 0.123 -545 G 0.104 -546 L 0.094 -547 F 0.086 -548 L 0.076 -549 E 0.068 -550 W 0.067 -551 I 0.067 -552 M 0.067 -553 V 0.067 -554 A 0.071 -555 W 0.078 -556 N 0.091 -557 S 0.106 -558 I 0.114 -559 S 0.108 -560 S 0.098 -561 E 0.092 -562 S 0.089 -563 I 0.087 -564 V 0.087 -565 Q 0.089 -566 G 0.092 -567 F 0.093 -568 R 0.092 -569 K 0.088 -570 C 0.083 -571 H 0.082 -572 I 0.093 -573 S 0.122 -574 S 0.161 -575 N 0.200 -576 L 0.242 -577 E 0.298 -578 D 0.367 -579 E 0.423 -580 G 0.449 -581 D 0.453 -582 V 0.444 -583 L 0.424 -584 W 0.405 -585 E 0.407 -586 I 0.424 -587 E 0.435 -588 G 0.428 -589 E 0.417 -590 L 0.422 -591 P 0.444 -592 K 0.471 -593 E 0.496 -594 P 0.524 -595 P 0.559 -596 K 0.599 -597 E 0.634 -598 C 0.656 -599 G 0.677 -600 P 0.706 -601 E 0.736 -602 S 0.753 -603 V 0.752 -604 A 0.734 -605 E 0.697 -606 G 0.646 -607 D 0.604 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040596.17_ENSMUST00000131487.9_GN:Pogk_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040596.17_ENSMUST00000131487.9_GN:Pogk_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid deleted file mode 100644 index c728a02fc9f34bcae52290e30ab24bfc54fe142d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000040596.17_ENSMUST00000131487.9_GN:Pogk_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid +++ /dev/null @@ -1,615 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000040596.17|ENSMUST00000131487.9|GN:Pogk|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:7 -1 M 0.365 -2 N 0.381 -3 L 0.408 -4 E 0.438 -5 N 0.464 -6 P 0.475 -7 E 0.475 -8 M 0.471 -9 E 0.462 -10 S 0.454 -11 R 0.460 -12 A 0.480 -13 Y 0.506 -14 P 0.530 -15 L 0.542 -16 N 0.539 -17 L 0.514 -18 T 0.464 -19 L 0.396 -20 K 0.342 -21 E 0.322 -22 E 0.322 -23 Q 0.325 -24 K 0.344 -25 E 0.394 -26 E 0.458 -27 E 0.506 -28 V 0.528 -29 E 0.518 -30 I 0.482 -31 Q 0.453 -32 E 0.457 -33 L 0.474 -34 E 0.480 -35 D 0.486 -36 G 0.504 -37 P 0.518 -38 I 0.513 -39 D 0.505 -40 M 0.521 -41 Q 0.574 -42 K 0.640 -43 V 0.688 -44 Q 0.705 -45 I 0.700 -46 C 0.682 -47 S 0.657 -48 E 0.623 -49 G 0.571 -50 A 0.492 -51 W 0.402 -52 V 0.330 -53 P 0.282 -54 A 0.241 -55 L 0.199 -56 F 0.173 -57 D 0.172 -58 E 0.184 -59 V 0.189 -60 A 0.175 -61 I 0.151 -62 Y 0.133 -63 F 0.128 -64 S 0.134 -65 D 0.145 -66 E 0.155 -67 E 0.152 -68 W 0.139 -69 E 0.137 -70 V 0.150 -71 L 0.158 -72 T 0.141 -73 E 0.116 -74 Q 0.099 -75 Q 0.093 -76 K 0.094 -77 A 0.103 -78 L 0.116 -79 Y 0.123 -80 R 0.122 -81 E 0.123 -82 V 0.134 -83 M 0.137 -84 R 0.120 -85 M 0.097 -86 N 0.082 -87 Y 0.074 -88 E 0.070 -89 T 0.070 -90 V 0.076 -91 L 0.087 -92 S 0.100 -93 L 0.110 -94 E 0.113 -95 F 0.113 -96 P 0.119 -97 F 0.129 -98 P 0.135 -99 K 0.129 -100 P 0.115 -101 D 0.100 -102 M 0.091 -103 I 0.090 -104 N 0.097 -105 R 0.113 -106 L 0.138 -107 E 0.167 -108 R 0.200 -109 D 0.236 -110 E 0.273 -111 E 0.309 -112 C 0.339 -113 P 0.363 -114 N 0.380 -115 S 0.386 -116 D 0.381 -117 E 0.374 -118 W 0.383 -119 R 0.423 -120 L 0.490 -121 Q 0.560 -122 G 0.611 -123 V 0.640 -124 T 0.658 -125 F 0.678 -126 A 0.697 -127 E 0.710 -128 N 0.715 -129 E 0.712 -130 E 0.703 -131 S 0.690 -132 D 0.673 -133 F 0.652 -134 R 0.635 -135 T 0.628 -136 P 0.629 -137 D 0.630 -138 W 0.632 -139 A 0.646 -140 S 0.671 -141 P 0.700 -142 T 0.731 -143 N 0.753 -144 A 0.753 -145 T 0.728 -146 S 0.691 -147 H 0.654 -148 F 0.627 -149 P 0.618 -150 Q 0.627 -151 P 0.647 -152 Q 0.672 -153 P 0.695 -154 F 0.708 -155 N 0.706 -156 S 0.693 -157 F 0.680 -158 G 0.675 -159 L 0.667 -160 R 0.646 -161 L 0.607 -162 P 0.564 -163 Q 0.539 -164 D 0.543 -165 I 0.558 -166 T 0.571 -167 E 0.585 -168 L 0.596 -169 P 0.589 -170 E 0.557 -171 W 0.526 -172 T 0.524 -173 E 0.546 -174 G 0.567 -175 Y 0.569 -176 P 0.556 -177 F 0.542 -178 Y 0.540 -179 M 0.550 -180 A 0.554 -181 M 0.543 -182 G 0.534 -183 F 0.550 -184 P 0.585 -185 G 0.607 -186 Y 0.589 -187 D 0.526 -188 L 0.439 -189 S 0.370 -190 A 0.346 -191 D 0.350 -192 D 0.345 -193 L 0.316 -194 A 0.283 -195 S 0.271 -196 K 0.287 -197 F 0.318 -198 Q 0.358 -199 F 0.399 -200 S 0.425 -201 R 0.424 -202 G 0.396 -203 M 0.342 -204 R 0.270 -205 R 0.199 -206 S 0.140 -207 Y 0.096 -208 D 0.071 -209 A 0.059 -210 G 0.050 -211 F 0.040 -212 K 0.033 -213 L 0.030 -214 M 0.032 -215 V 0.035 -216 V 0.035 -217 E 0.033 -218 Y 0.030 -219 A 0.029 -220 E 0.031 -221 S 0.034 -222 T 0.037 -223 N 0.039 -224 N 0.041 -225 C 0.047 -226 Q 0.060 -227 A 0.079 -228 A 0.093 -229 K 0.093 -230 Q 0.084 -231 F 0.076 -232 G 0.070 -233 V 0.058 -234 L 0.041 -235 E 0.027 -236 K 0.019 -237 N 0.016 -238 V 0.016 -239 R 0.016 -240 D 0.018 -241 W 0.020 -242 R 0.023 -243 K 0.024 -244 V 0.025 -245 K 0.030 -246 P 0.039 -247 Q 0.051 -248 L 0.066 -249 Q 0.087 -250 N 0.114 -251 A 0.139 -252 H 0.148 -253 A 0.143 -254 M 0.138 -255 R 0.147 -256 R 0.170 -257 A 0.207 -258 F 0.255 -259 R 0.310 -260 G 0.361 -261 P 0.382 -262 K 0.361 -263 N 0.309 -264 G 0.247 -265 R 0.188 -266 F 0.140 -267 A 0.104 -268 L 0.079 -269 V 0.063 -270 D 0.054 -271 Q 0.045 -272 R 0.036 -273 V 0.030 -274 A 0.027 -275 E 0.025 -276 Y 0.024 -277 V 0.025 -278 R 0.026 -279 Y 0.030 -280 M 0.039 -281 Q 0.052 -282 A 0.069 -283 K 0.090 -284 G 0.106 -285 D 0.109 -286 P 0.097 -287 I 0.076 -288 T 0.054 -289 R 0.039 -290 E 0.033 -291 A 0.034 -292 M 0.042 -293 Q 0.053 -294 L 0.058 -295 K 0.054 -296 A 0.054 -297 L 0.061 -298 E 0.067 -299 I 0.063 -300 A 0.055 -301 Q 0.051 -302 E 0.053 -303 M 0.065 -304 N 0.087 -305 I 0.108 -306 P 0.115 -307 E 0.109 -308 K 0.096 -309 G 0.086 -310 F 0.079 -311 K 0.071 -312 A 0.060 -313 S 0.047 -314 L 0.039 -315 G 0.036 -316 W 0.033 -317 C 0.027 -318 R 0.023 -319 R 0.022 -320 M 0.027 -321 M 0.033 -322 R 0.039 -323 R 0.052 -324 Y 0.077 -325 D 0.121 -326 L 0.178 -327 S 0.242 -328 L 0.303 -329 R 0.354 -330 H 0.385 -331 K 0.387 -332 V 0.362 -333 P 0.326 -334 V 0.295 -335 P 0.275 -336 Q 0.256 -337 H 0.233 -338 L 0.205 -339 A 0.173 -340 E 0.136 -341 D 0.105 -342 L 0.084 -343 T 0.071 -344 E 0.061 -345 K 0.056 -346 L 0.054 -347 V 0.051 -348 T 0.049 -349 Y 0.052 -350 Q 0.059 -351 Q 0.062 -352 S 0.058 -353 V 0.055 -354 L 0.061 -355 A 0.069 -356 L 0.066 -357 R 0.057 -358 R 0.056 -359 T 0.065 -360 H 0.075 -361 D 0.077 -362 Y 0.073 -363 E 0.065 -364 V 0.058 -365 A 0.052 -366 Q 0.044 -367 M 0.036 -368 G 0.030 -369 N 0.028 -370 A 0.036 -371 D 0.055 -372 E 0.084 -373 T 0.109 -374 P 0.123 -375 I 0.132 -376 C 0.156 -377 L 0.209 -378 E 0.293 -379 V 0.395 -380 P 0.486 -381 S 0.550 -382 R 0.596 -383 V 0.635 -384 T 0.663 -385 V 0.674 -386 D 0.675 -387 N 0.675 -388 Q 0.664 -389 G 0.630 -390 E 0.591 -391 K 0.571 -392 P 0.567 -393 I 0.551 -394 L 0.511 -395 V 0.453 -396 K 0.396 -397 T 0.355 -398 P 0.329 -399 G 0.309 -400 R 0.284 -401 E 0.249 -402 K 0.201 -403 L 0.154 -404 R 0.118 -405 I 0.094 -406 T 0.076 -407 A 0.063 -408 M 0.054 -409 L 0.048 -410 G 0.044 -411 V 0.047 -412 L 0.060 -413 A 0.081 -414 D 0.100 -415 G 0.108 -416 R 0.102 -417 K 0.094 -418 L 0.090 -419 P 0.084 -420 P 0.071 -421 Y 0.059 -422 I 0.056 -423 I 0.061 -424 L 0.067 -425 R 0.073 -426 G 0.081 -427 T 0.094 -428 Y 0.111 -429 I 0.125 -430 P 0.138 -431 P 0.151 -432 G 0.163 -433 K 0.168 -434 F 0.161 -435 P 0.142 -436 S 0.118 -437 G 0.100 -438 M 0.091 -439 E 0.085 -440 I 0.081 -441 R 0.081 -442 C 0.082 -443 H 0.078 -444 R 0.070 -445 Y 0.064 -446 G 0.064 -447 W 0.065 -448 M 0.063 -449 T 0.060 -450 E 0.056 -451 D 0.053 -452 L 0.051 -453 M 0.048 -454 Q 0.044 -455 D 0.042 -456 W 0.041 -457 L 0.042 -458 E 0.045 -459 V 0.046 -460 V 0.042 -461 W 0.037 -462 R 0.037 -463 R 0.048 -464 R 0.070 -465 T 0.103 -466 G 0.140 -467 A 0.170 -468 V 0.182 -469 P 0.169 -470 R 0.141 -471 Q 0.108 -472 R 0.081 -473 G 0.059 -474 M 0.045 -475 L 0.039 -476 I 0.040 -477 L 0.047 -478 N 0.060 -479 G 0.076 -480 F 0.085 -481 R 0.087 -482 C 0.086 -483 H 0.083 -484 A 0.077 -485 T 0.069 -486 D 0.064 -487 S 0.067 -488 V 0.078 -489 K 0.090 -490 S 0.095 -491 S 0.089 -492 M 0.083 -493 E 0.082 -494 N 0.085 -495 M 0.088 -496 N 0.089 -497 T 0.087 -498 D 0.081 -499 M 0.079 -500 V 0.086 -501 I 0.099 -502 I 0.114 -503 P 0.124 -504 G 0.126 -505 G 0.125 -506 L 0.123 -507 T 0.120 -508 S 0.109 -509 Q 0.093 -510 L 0.080 -511 Q 0.079 -512 V 0.087 -513 L 0.094 -514 D 0.098 -515 V 0.102 -516 V 0.102 -517 V 0.093 -518 Y 0.080 -519 K 0.071 -520 P 0.068 -521 L 0.067 -522 N 0.064 -523 D 0.060 -524 S 0.059 -525 V 0.065 -526 R 0.072 -527 A 0.074 -528 Q 0.074 -529 Y 0.076 -530 S 0.080 -531 N 0.082 -532 W 0.080 -533 L 0.083 -534 L 0.097 -535 A 0.123 -536 G 0.155 -537 N 0.183 -538 L 0.204 -539 A 0.221 -540 L 0.237 -541 S 0.253 -542 P 0.269 -543 T 0.281 -544 G 0.286 -545 N 0.282 -546 A 0.266 -547 K 0.241 -548 K 0.215 -549 P 0.188 -550 P 0.155 -551 L 0.123 -552 G 0.104 -553 L 0.095 -554 F 0.086 -555 L 0.076 -556 E 0.068 -557 W 0.067 -558 I 0.068 -559 M 0.067 -560 V 0.067 -561 A 0.071 -562 W 0.078 -563 N 0.091 -564 S 0.106 -565 I 0.114 -566 S 0.108 -567 S 0.098 -568 E 0.092 -569 S 0.089 -570 I 0.087 -571 V 0.087 -572 Q 0.089 -573 G 0.092 -574 F 0.093 -575 R 0.092 -576 K 0.088 -577 C 0.083 -578 H 0.082 -579 I 0.093 -580 S 0.122 -581 S 0.161 -582 N 0.201 -583 L 0.243 -584 E 0.299 -585 D 0.368 -586 E 0.425 -587 G 0.451 -588 D 0.455 -589 V 0.446 -590 L 0.425 -591 W 0.406 -592 E 0.407 -593 I 0.424 -594 E 0.434 -595 G 0.427 -596 E 0.416 -597 L 0.422 -598 P 0.444 -599 K 0.471 -600 E 0.496 -601 P 0.523 -602 P 0.558 -603 K 0.598 -604 E 0.632 -605 C 0.655 -606 G 0.675 -607 P 0.704 -608 E 0.735 -609 S 0.753 -610 V 0.751 -611 A 0.732 -612 E 0.695 -613 G 0.642 -614 D 0.600 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000041536.14_ENSMUST00000185595.7_GN:Serpina3a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000041536.14_ENSMUST00000185595.7_GN:Serpina3a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index c98ba415e883457be6ad8d1d92e8ed9365448843..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000041536.14_ENSMUST00000185595.7_GN:Serpina3a_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,423 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000041536.14|ENSMUST00000185595.7|GN:Serpina3a|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.267 -2 A 0.273 -3 F 0.284 -4 I 0.288 -5 A 0.279 -6 A 0.270 -7 L 0.286 -8 G 0.321 -9 L 0.349 -10 L 0.364 -11 M 0.383 -12 A 0.407 -13 G 0.424 -14 I 0.430 -15 C 0.421 -16 P 0.391 -17 A 0.346 -18 I 0.305 -19 T 0.284 -20 Y 0.278 -21 W 0.284 -22 A 0.307 -23 T 0.350 -24 A 0.410 -25 D 0.471 -26 G 0.519 -27 Q 0.554 -28 L 0.581 -29 G 0.594 -30 R 0.586 -31 H 0.563 -32 T 0.536 -33 E 0.507 -34 V 0.473 -35 Q 0.444 -36 K 0.429 -37 D 0.424 -38 R 0.424 -39 D 0.429 -40 H 0.440 -41 E 0.442 -42 I 0.415 -43 Q 0.353 -44 L 0.274 -45 D 0.199 -46 S 0.140 -47 V 0.099 -48 T 0.075 -49 L 0.064 -50 A 0.059 -51 S 0.057 -52 I 0.053 -53 N 0.049 -54 T 0.044 -55 D 0.040 -56 F 0.037 -57 A 0.034 -58 F 0.033 -59 S 0.035 -60 L 0.036 -61 Y 0.035 -62 K 0.034 -63 K 0.035 -64 L 0.040 -65 A 0.048 -66 L 0.057 -67 K 0.067 -68 N 0.075 -69 P 0.078 -70 H 0.077 -71 K 0.075 -72 N 0.075 -73 I 0.074 -74 V 0.072 -75 F 0.069 -76 S 0.067 -77 P 0.063 -78 L 0.059 -79 S 0.056 -80 I 0.052 -81 S 0.051 -82 A 0.051 -83 A 0.052 -84 L 0.056 -85 A 0.064 -86 L 0.072 -87 M 0.074 -88 S 0.075 -89 L 0.081 -90 G 0.095 -91 A 0.109 -92 K 0.113 -93 D 0.109 -94 N 0.105 -95 T 0.103 -96 L 0.102 -97 E 0.098 -98 E 0.089 -99 I 0.079 -100 L 0.070 -101 E 0.062 -102 G 0.054 -103 L 0.048 -104 K 0.049 -105 F 0.059 -106 N 0.071 -107 L 0.080 -108 T 0.085 -109 E 0.089 -110 T 0.089 -111 P 0.086 -112 E 0.079 -113 A 0.072 -114 D 0.065 -115 I 0.056 -116 H 0.048 -117 Q 0.042 -118 N 0.039 -119 F 0.037 -120 G 0.035 -121 H 0.032 -122 L 0.030 -123 L 0.031 -124 Q 0.033 -125 M 0.040 -126 L 0.054 -127 I 0.078 -128 Q 0.109 -129 P 0.141 -130 E 0.161 -131 N 0.159 -132 Q 0.139 -133 V 0.114 -134 Q 0.092 -135 I 0.075 -136 N 0.059 -137 A 0.046 -138 G 0.036 -139 N 0.030 -140 A 0.028 -141 L 0.028 -142 F 0.032 -143 I 0.037 -144 D 0.042 -145 K 0.048 -146 H 0.054 -147 L 0.057 -148 Q 0.057 -149 I 0.051 -150 L 0.043 -151 T 0.035 -152 E 0.033 -153 F 0.038 -154 K 0.049 -155 E 0.057 -156 K 0.054 -157 A 0.048 -158 R 0.046 -159 A 0.048 -160 L 0.048 -161 Y 0.044 -162 K 0.039 -163 A 0.037 -164 E 0.038 -165 A 0.043 -166 F 0.051 -167 T 0.059 -168 A 0.064 -169 D 0.063 -170 F 0.062 -171 Q 0.063 -172 L 0.065 -173 P 0.065 -174 R 0.062 -175 E 0.058 -176 A 0.055 -177 T 0.054 -178 K 0.052 -179 L 0.055 -180 I 0.066 -181 N 0.080 -182 D 0.084 -183 Y 0.078 -184 V 0.072 -185 R 0.073 -186 K 0.076 -187 Q 0.075 -188 T 0.080 -189 Q 0.096 -190 G 0.114 -191 K 0.126 -192 I 0.132 -193 K 0.135 -194 E 0.136 -195 L 0.134 -196 V 0.130 -197 S 0.124 -198 D 0.122 -199 L 0.125 -200 H 0.130 -201 R 0.136 -202 N 0.140 -203 T 0.132 -204 S 0.113 -205 M 0.095 -206 A 0.083 -207 L 0.078 -208 V 0.082 -209 N 0.092 -210 F 0.100 -211 L 0.107 -212 N 0.114 -213 F 0.115 -214 Q 0.106 -215 G 0.092 -216 F 0.082 -217 W 0.078 -218 N 0.078 -219 V 0.085 -220 T 0.103 -221 F 0.121 -222 D 0.123 -223 P 0.107 -224 E 0.087 -225 D 0.073 -226 T 0.067 -227 F 0.066 -228 L 0.066 -229 G 0.063 -230 N 0.054 -231 F 0.045 -232 T 0.039 -233 L 0.040 -234 D 0.044 -235 R 0.048 -236 K 0.051 -237 R 0.060 -238 T 0.072 -239 V 0.083 -240 N 0.088 -241 V 0.087 -242 P 0.080 -243 M 0.072 -244 M 0.069 -245 K 0.069 -246 T 0.067 -247 E 0.060 -248 E 0.051 -249 L 0.045 -250 T 0.041 -251 T 0.036 -252 N 0.031 -253 Y 0.027 -254 F 0.027 -255 R 0.031 -256 D 0.037 -257 E 0.042 -258 E 0.044 -259 M 0.042 -260 Q 0.037 -261 S 0.031 -262 T 0.026 -263 V 0.023 -264 M 0.023 -265 E 0.025 -266 L 0.027 -267 N 0.028 -268 Y 0.030 -269 I 0.032 -270 G 0.034 -271 N 0.034 -272 A 0.034 -273 S 0.033 -274 F 0.034 -275 L 0.037 -276 F 0.045 -277 I 0.057 -278 L 0.071 -279 P 0.081 -280 D 0.081 -281 Q 0.074 -282 G 0.065 -283 R 0.057 -284 I 0.051 -285 Q 0.049 -286 H 0.051 -287 V 0.053 -288 E 0.056 -289 D 0.062 -290 S 0.067 -291 L 0.068 -292 Q 0.060 -293 P 0.048 -294 Q 0.036 -295 S 0.028 -296 L 0.024 -297 R 0.024 -298 K 0.030 -299 W 0.037 -300 R 0.045 -301 K 0.054 -302 S 0.063 -303 L 0.071 -304 R 0.074 -305 P 0.070 -306 R 0.067 -307 M 0.067 -308 L 0.068 -309 D 0.065 -310 E 0.063 -311 L 0.067 -312 S 0.077 -313 L 0.088 -314 P 0.097 -315 K 0.100 -316 F 0.101 -317 S 0.102 -318 L 0.101 -319 S 0.096 -320 Q 0.088 -321 D 0.079 -322 Y 0.070 -323 N 0.063 -324 L 0.059 -325 N 0.058 -326 D 0.058 -327 I 0.059 -328 L 0.059 -329 P 0.058 -330 E 0.060 -331 L 0.068 -332 G 0.080 -333 I 0.093 -334 K 0.105 -335 E 0.115 -336 V 0.126 -337 F 0.138 -338 S 0.146 -339 T 0.144 -340 Q 0.130 -341 A 0.107 -342 D 0.089 -343 L 0.080 -344 S 0.077 -345 G 0.075 -346 I 0.072 -347 T 0.073 -348 G 0.086 -349 A 0.106 -350 K 0.123 -351 N 0.129 -352 I 0.120 -353 R 0.106 -354 V 0.094 -355 S 0.092 -356 Q 0.099 -357 M 0.113 -358 I 0.127 -359 H 0.136 -360 Q 0.139 -361 A 0.138 -362 A 0.140 -363 L 0.152 -364 D 0.174 -365 V 0.205 -366 T 0.242 -367 E 0.282 -368 T 0.321 -369 H 0.360 -370 T 0.399 -371 E 0.437 -372 A 0.468 -373 D 0.480 -374 V 0.473 -375 I 0.467 -376 T 0.474 -377 I 0.485 -378 A 0.480 -379 R 0.461 -380 Y 0.448 -381 N 0.452 -382 F 0.475 -383 Q 0.507 -384 S 0.528 -385 A 0.521 -386 K 0.484 -387 I 0.433 -388 K 0.372 -389 A 0.301 -390 K 0.235 -391 I 0.190 -392 V 0.164 -393 K 0.144 -394 V 0.121 -395 D 0.097 -396 R 0.077 -397 E 0.063 -398 F 0.052 -399 L 0.046 -400 Y 0.044 -401 L 0.047 -402 I 0.053 -403 L 0.062 -404 D 0.070 -405 P 0.071 -406 M 0.064 -407 F 0.058 -408 K 0.057 -409 S 0.060 -410 I 0.062 -411 S 0.065 -412 V 0.068 -413 M 0.069 -414 G 0.067 -415 K 0.068 -416 V 0.077 -417 I 0.093 -418 N 0.113 -419 P 0.135 -420 L 0.161 -421 T 0.191 -422 N 0.214 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000041536.14_ENSMUST00000185595.7_GN:Serpina3a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000041536.14_ENSMUST00000185595.7_GN:Serpina3a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid deleted file mode 100644 index 153d3066140b7c7dae00fc6c80891a0ffce417e8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000041536.14_ENSMUST00000185595.7_GN:Serpina3a_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid +++ /dev/null @@ -1,424 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000041536.14|ENSMUST00000185595.7|GN:Serpina3a|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:1 -1 M 0.240 -2 M 0.235 -3 A 0.231 -4 F 0.228 -5 I 0.221 -6 A 0.215 -7 A 0.230 -8 L 0.262 -9 G 0.290 -10 L 0.306 -11 L 0.326 -12 M 0.358 -13 A 0.388 -14 G 0.408 -15 I 0.417 -16 C 0.409 -17 P 0.379 -18 A 0.335 -19 I 0.297 -20 T 0.278 -21 Y 0.275 -22 W 0.282 -23 A 0.304 -24 T 0.345 -25 A 0.403 -26 D 0.465 -27 G 0.516 -28 Q 0.552 -29 L 0.578 -30 G 0.591 -31 R 0.583 -32 H 0.559 -33 T 0.531 -34 E 0.502 -35 V 0.469 -36 Q 0.441 -37 K 0.426 -38 D 0.422 -39 R 0.422 -40 D 0.429 -41 H 0.440 -42 E 0.443 -43 I 0.415 -44 Q 0.354 -45 L 0.275 -46 D 0.200 -47 S 0.141 -48 V 0.100 -49 T 0.076 -50 L 0.064 -51 A 0.059 -52 S 0.057 -53 I 0.054 -54 N 0.049 -55 T 0.044 -56 D 0.040 -57 F 0.037 -58 A 0.034 -59 F 0.033 -60 S 0.035 -61 L 0.036 -62 Y 0.035 -63 K 0.034 -64 K 0.035 -65 L 0.041 -66 A 0.049 -67 L 0.057 -68 K 0.067 -69 N 0.075 -70 P 0.078 -71 H 0.077 -72 K 0.076 -73 N 0.075 -74 I 0.074 -75 V 0.072 -76 F 0.070 -77 S 0.067 -78 P 0.063 -79 L 0.059 -80 S 0.056 -81 I 0.052 -82 S 0.051 -83 A 0.051 -84 A 0.052 -85 L 0.056 -86 A 0.064 -87 L 0.072 -88 M 0.075 -89 S 0.075 -90 L 0.081 -91 G 0.095 -92 A 0.109 -93 K 0.113 -94 D 0.109 -95 N 0.105 -96 T 0.103 -97 L 0.102 -98 E 0.098 -99 E 0.089 -100 I 0.078 -101 L 0.069 -102 E 0.062 -103 G 0.054 -104 L 0.048 -105 K 0.049 -106 F 0.059 -107 N 0.071 -108 L 0.080 -109 T 0.085 -110 E 0.089 -111 T 0.089 -112 P 0.085 -113 E 0.079 -114 A 0.072 -115 D 0.065 -116 I 0.056 -117 H 0.048 -118 Q 0.042 -119 N 0.039 -120 F 0.037 -121 G 0.035 -122 H 0.032 -123 L 0.030 -124 L 0.031 -125 Q 0.033 -126 M 0.040 -127 L 0.055 -128 I 0.078 -129 Q 0.110 -130 P 0.142 -131 E 0.162 -132 N 0.160 -133 Q 0.139 -134 V 0.114 -135 Q 0.093 -136 I 0.075 -137 N 0.059 -138 A 0.046 -139 G 0.036 -140 N 0.030 -141 A 0.028 -142 L 0.029 -143 F 0.032 -144 I 0.037 -145 D 0.043 -146 K 0.048 -147 H 0.054 -148 L 0.057 -149 Q 0.057 -150 I 0.051 -151 L 0.043 -152 T 0.035 -153 E 0.033 -154 F 0.038 -155 K 0.049 -156 E 0.056 -157 K 0.054 -158 A 0.048 -159 R 0.046 -160 A 0.048 -161 L 0.048 -162 Y 0.044 -163 K 0.039 -164 A 0.037 -165 E 0.038 -166 A 0.043 -167 F 0.051 -168 T 0.059 -169 A 0.064 -170 D 0.063 -171 F 0.062 -172 Q 0.063 -173 L 0.065 -174 P 0.065 -175 R 0.062 -176 E 0.058 -177 A 0.055 -178 T 0.053 -179 K 0.052 -180 L 0.054 -181 I 0.065 -182 N 0.079 -183 D 0.084 -184 Y 0.078 -185 V 0.072 -186 R 0.073 -187 K 0.075 -188 Q 0.075 -189 T 0.080 -190 Q 0.096 -191 G 0.114 -192 K 0.126 -193 I 0.132 -194 K 0.135 -195 E 0.136 -196 L 0.134 -197 V 0.130 -198 S 0.124 -199 D 0.123 -200 L 0.126 -201 H 0.131 -202 R 0.137 -203 N 0.140 -204 T 0.132 -205 S 0.114 -206 M 0.095 -207 A 0.083 -208 L 0.078 -209 V 0.083 -210 N 0.092 -211 F 0.101 -212 L 0.108 -213 N 0.114 -214 F 0.115 -215 Q 0.106 -216 G 0.092 -217 F 0.082 -218 W 0.078 -219 N 0.078 -220 V 0.085 -221 T 0.103 -222 F 0.121 -223 D 0.123 -224 P 0.107 -225 E 0.087 -226 D 0.073 -227 T 0.067 -228 F 0.066 -229 L 0.066 -230 G 0.063 -231 N 0.054 -232 F 0.045 -233 T 0.039 -234 L 0.040 -235 D 0.044 -236 R 0.048 -237 K 0.052 -238 R 0.060 -239 T 0.072 -240 V 0.083 -241 N 0.089 -242 V 0.087 -243 P 0.080 -244 M 0.072 -245 M 0.069 -246 K 0.069 -247 T 0.067 -248 E 0.060 -249 E 0.052 -250 L 0.046 -251 T 0.041 -252 T 0.036 -253 N 0.031 -254 Y 0.027 -255 F 0.027 -256 R 0.031 -257 D 0.037 -258 E 0.042 -259 E 0.044 -260 M 0.042 -261 Q 0.037 -262 S 0.031 -263 T 0.026 -264 V 0.023 -265 M 0.024 -266 E 0.026 -267 L 0.027 -268 N 0.028 -269 Y 0.030 -270 I 0.032 -271 G 0.034 -272 N 0.034 -273 A 0.034 -274 S 0.033 -275 F 0.034 -276 L 0.038 -277 F 0.045 -278 I 0.057 -279 L 0.071 -280 P 0.081 -281 D 0.081 -282 Q 0.074 -283 G 0.066 -284 R 0.057 -285 I 0.051 -286 Q 0.049 -287 H 0.051 -288 V 0.053 -289 E 0.056 -290 D 0.062 -291 S 0.068 -292 L 0.068 -293 Q 0.061 -294 P 0.048 -295 Q 0.036 -296 S 0.028 -297 L 0.024 -298 R 0.024 -299 K 0.030 -300 W 0.037 -301 R 0.045 -302 K 0.054 -303 S 0.063 -304 L 0.072 -305 R 0.074 -306 P 0.070 -307 R 0.067 -308 M 0.067 -309 L 0.068 -310 D 0.065 -311 E 0.064 -312 L 0.068 -313 S 0.077 -314 L 0.089 -315 P 0.097 -316 K 0.101 -317 F 0.102 -318 S 0.102 -319 L 0.101 -320 S 0.096 -321 Q 0.089 -322 D 0.079 -323 Y 0.070 -324 N 0.063 -325 L 0.059 -326 N 0.057 -327 D 0.058 -328 I 0.059 -329 L 0.059 -330 P 0.059 -331 E 0.060 -332 L 0.068 -333 G 0.080 -334 I 0.093 -335 K 0.105 -336 E 0.115 -337 V 0.126 -338 F 0.138 -339 S 0.146 -340 T 0.144 -341 Q 0.130 -342 A 0.107 -343 D 0.089 -344 L 0.080 -345 S 0.077 -346 G 0.075 -347 I 0.072 -348 T 0.073 -349 G 0.086 -350 A 0.106 -351 K 0.123 -352 N 0.129 -353 I 0.121 -354 R 0.106 -355 V 0.094 -356 S 0.092 -357 Q 0.099 -358 M 0.113 -359 I 0.127 -360 H 0.136 -361 Q 0.139 -362 A 0.138 -363 A 0.141 -364 L 0.153 -365 D 0.175 -366 V 0.206 -367 T 0.243 -368 E 0.282 -369 T 0.322 -370 H 0.360 -371 T 0.399 -372 E 0.437 -373 A 0.469 -374 D 0.481 -375 V 0.475 -376 I 0.468 -377 T 0.475 -378 I 0.485 -379 A 0.481 -380 R 0.461 -381 Y 0.447 -382 N 0.452 -383 F 0.475 -384 Q 0.507 -385 S 0.528 -386 A 0.520 -387 K 0.484 -388 I 0.433 -389 K 0.372 -390 A 0.301 -391 K 0.236 -392 I 0.190 -393 V 0.164 -394 K 0.144 -395 V 0.121 -396 D 0.097 -397 R 0.077 -398 E 0.063 -399 F 0.053 -400 L 0.046 -401 Y 0.044 -402 L 0.047 -403 I 0.053 -404 L 0.062 -405 D 0.070 -406 P 0.071 -407 M 0.065 -408 F 0.058 -409 K 0.057 -410 S 0.060 -411 I 0.063 -412 S 0.065 -413 V 0.068 -414 M 0.069 -415 G 0.067 -416 K 0.068 -417 V 0.077 -418 I 0.094 -419 N 0.113 -420 P 0.135 -421 L 0.161 -422 T 0.192 -423 N 0.214 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000041605.17_ENSMUST00000120339.8_GN:Inava_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000041605.17_ENSMUST00000120339.8_GN:Inava_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 6c0c0284ea026d2a34a3c35ba203ddf769c7aea8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000041605.17_ENSMUST00000120339.8_GN:Inava_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,664 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000041605.17|ENSMUST00000120339.8|GN:Inava|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.338 -2 L 0.372 -3 Q 0.431 -4 M 0.497 -5 P 0.552 -6 K 0.590 -7 L 0.618 -8 N 0.639 -9 E 0.644 -10 I 0.638 -11 P 0.645 -12 P 0.677 -13 G 0.715 -14 R 0.735 -15 G 0.739 -16 G 0.735 -17 P 0.728 -18 G 0.721 -19 E 0.712 -20 P 0.703 -21 W 0.701 -22 G 0.701 -23 E 0.679 -24 G 0.627 -25 R 0.592 -26 W 0.617 -27 A 0.678 -28 G 0.725 -29 P 0.746 -30 T 0.754 -31 G 0.760 -32 P 0.769 -33 E 0.779 -34 A 0.783 -35 A 0.775 -36 R 0.756 -37 P 0.718 -38 A 0.670 -39 R 0.652 -40 G 0.696 -41 A 0.761 -42 R 0.801 -43 G 0.812 -44 Q 0.811 -45 A 0.806 -46 R 0.798 -47 G 0.774 -48 A 0.719 -49 R 0.643 -50 A 0.594 -51 R 0.605 -52 W 0.646 -53 D 0.669 -54 S 0.664 -55 W 0.659 -56 E 0.675 -57 H 0.700 -58 S 0.713 -59 R 0.712 -60 L 0.710 -61 P 0.715 -62 T 0.724 -63 H 0.733 -64 P 0.743 -65 G 0.760 -66 P 0.779 -67 G 0.789 -68 W 0.788 -69 D 0.780 -70 Q 0.768 -71 C 0.755 -72 S 0.750 -73 P 0.758 -74 S 0.771 -75 F 0.778 -76 L 0.776 -77 C 0.772 -78 A 0.771 -79 P 0.774 -80 S 0.780 -81 S 0.785 -82 Q 0.790 -83 K 0.797 -84 L 0.803 -85 I 0.804 -86 M 0.801 -87 E 0.797 -88 S 0.795 -89 K 0.796 -90 D 0.799 -91 E 0.804 -92 V 0.808 -93 S 0.807 -94 D 0.800 -95 S 0.789 -96 D 0.779 -97 S 0.777 -98 G 0.783 -99 I 0.788 -100 I 0.783 -101 L 0.765 -102 Q 0.743 -103 S 0.727 -104 G 0.721 -105 P 0.715 -106 D 0.707 -107 S 0.696 -108 P 0.682 -109 V 0.661 -110 S 0.622 -111 P 0.558 -112 M 0.477 -113 K 0.400 -114 E 0.343 -115 L 0.304 -116 T 0.270 -117 N 0.235 -118 A 0.202 -119 V 0.177 -120 R 0.169 -121 K 0.177 -122 Q 0.189 -123 Q 0.188 -124 R 0.177 -125 A 0.169 -126 L 0.170 -127 E 0.176 -128 A 0.183 -129 R 0.188 -130 L 0.185 -131 E 0.176 -132 A 0.167 -133 C 0.166 -134 L 0.167 -135 E 0.165 -136 E 0.156 -137 L 0.140 -138 R 0.121 -139 R 0.111 -140 L 0.113 -141 C 0.122 -142 L 0.129 -143 R 0.136 -144 E 0.146 -145 A 0.157 -146 E 0.163 -147 L 0.169 -148 T 0.182 -149 G 0.195 -150 T 0.198 -151 L 0.187 -152 P 0.169 -153 A 0.163 -154 E 0.176 -155 Y 0.195 -156 P 0.203 -157 L 0.207 -158 K 0.221 -159 P 0.254 -160 G 0.305 -161 E 0.372 -162 K 0.440 -163 A 0.488 -164 P 0.507 -165 K 0.509 -166 V 0.504 -167 R 0.498 -168 R 0.496 -169 R 0.504 -170 I 0.516 -171 G 0.520 -172 A 0.511 -173 A 0.493 -174 Y 0.471 -175 K 0.447 -176 L 0.412 -177 D 0.358 -178 E 0.300 -179 W 0.264 -180 A 0.256 -181 L 0.266 -182 H 0.271 -183 R 0.254 -184 E 0.221 -185 D 0.184 -186 P 0.149 -187 L 0.116 -188 S 0.091 -189 S 0.075 -190 L 0.064 -191 E 0.060 -192 R 0.063 -193 Q 0.066 -194 L 0.065 -195 A 0.062 -196 L 0.056 -197 Q 0.051 -198 L 0.049 -199 Q 0.048 -200 I 0.042 -201 T 0.036 -202 E 0.035 -203 A 0.038 -204 A 0.047 -205 R 0.062 -206 R 0.073 -207 L 0.076 -208 C 0.083 -209 A 0.102 -210 E 0.125 -211 E 0.140 -212 N 0.144 -213 L 0.135 -214 S 0.114 -215 R 0.091 -216 Q 0.075 -217 A 0.063 -218 R 0.054 -219 R 0.048 -220 Q 0.048 -221 R 0.056 -222 K 0.071 -223 H 0.084 -224 A 0.085 -225 A 0.076 -226 L 0.069 -227 Q 0.068 -228 E 0.068 -229 E 0.066 -230 K 0.060 -231 K 0.053 -232 L 0.050 -233 R 0.050 -234 D 0.049 -235 L 0.047 -236 Q 0.048 -237 R 0.055 -238 C 0.071 -239 L 0.099 -240 G 0.131 -241 D 0.149 -242 R 0.158 -243 R 0.179 -244 R 0.224 -245 N 0.281 -246 S 0.337 -247 E 0.396 -248 P 0.466 -249 P 0.545 -250 P 0.621 -251 T 0.675 -252 T 0.702 -253 V 0.710 -254 P 0.718 -255 S 0.731 -256 L 0.745 -257 G 0.754 -258 R 0.758 -259 E 0.761 -260 L 0.766 -261 S 0.770 -262 A 0.771 -263 S 0.769 -264 D 0.766 -265 D 0.762 -266 S 0.755 -267 S 0.744 -268 L 0.738 -269 S 0.744 -270 D 0.756 -271 G 0.768 -272 L 0.777 -273 L 0.785 -274 L 0.794 -275 E 0.801 -276 E 0.804 -277 E 0.802 -278 D 0.790 -279 S 0.770 -280 Q 0.748 -281 A 0.731 -282 P 0.719 -283 K 0.714 -284 P 0.717 -285 P 0.729 -286 P 0.742 -287 E 0.749 -288 S 0.743 -289 P 0.730 -290 A 0.720 -291 P 0.717 -292 P 0.718 -293 S 0.714 -294 R 0.704 -295 P 0.692 -296 L 0.676 -297 P 0.649 -298 P 0.611 -299 Q 0.600 -300 S 0.645 -301 L 0.716 -302 E 0.769 -303 G 0.792 -304 L 0.794 -305 Q 0.793 -306 P 0.797 -307 T 0.804 -308 G 0.812 -309 P 0.821 -310 E 0.829 -311 S 0.838 -312 G 0.843 -313 G 0.842 -314 Q 0.838 -315 E 0.830 -316 R 0.817 -317 A 0.791 -318 P 0.741 -319 I 0.671 -320 Q 0.628 -321 N 0.645 -322 S 0.694 -323 P 0.732 -324 W 0.759 -325 K 0.784 -326 E 0.804 -327 T 0.810 -328 S 0.802 -329 L 0.786 -330 D 0.766 -331 H 0.748 -332 P 0.736 -333 Y 0.734 -334 E 0.743 -335 K 0.761 -336 P 0.780 -337 R 0.798 -338 K 0.812 -339 S 0.819 -340 S 0.822 -341 E 0.825 -342 L 0.831 -343 S 0.837 -344 S 0.840 -345 E 0.836 -346 S 0.829 -347 S 0.822 -348 S 0.820 -349 P 0.823 -350 A 0.827 -351 T 0.826 -352 T 0.818 -353 P 0.808 -354 Q 0.794 -355 D 0.771 -356 Q 0.738 -357 P 0.700 -358 N 0.662 -359 P 0.623 -360 S 0.588 -361 S 0.566 -362 L 0.563 -363 W 0.575 -364 V 0.586 -365 L 0.570 -366 D 0.513 -367 A 0.431 -368 A 0.353 -369 S 0.307 -370 Y 0.302 -371 H 0.332 -372 V 0.391 -373 V 0.470 -374 P 0.559 -375 I 0.644 -376 R 0.708 -377 N 0.743 -378 V 0.762 -379 P 0.784 -380 G 0.813 -381 Q 0.838 -382 R 0.852 -383 Q 0.858 -384 G 0.862 -385 R 0.860 -386 T 0.852 -387 S 0.838 -388 A 0.826 -389 P 0.818 -390 A 0.811 -391 T 0.808 -392 P 0.815 -393 E 0.828 -394 M 0.837 -395 Q 0.839 -396 G 0.838 -397 R 0.836 -398 R 0.836 -399 G 0.836 -400 Q 0.832 -401 S 0.827 -402 Q 0.823 -403 S 0.822 -404 L 0.822 -405 R 0.822 -406 V 0.822 -407 D 0.820 -408 S 0.817 -409 F 0.819 -410 R 0.828 -411 A 0.839 -412 G 0.846 -413 A 0.847 -414 E 0.845 -415 G 0.842 -416 R 0.838 -417 G 0.830 -418 R 0.814 -419 S 0.789 -420 A 0.760 -421 F 0.741 -422 P 0.739 -423 R 0.747 -424 R 0.752 -425 R 0.753 -426 P 0.752 -427 T 0.748 -428 H 0.738 -429 Y 0.719 -430 T 0.694 -431 V 0.678 -432 T 0.679 -433 V 0.692 -434 P 0.707 -435 D 0.721 -436 S 0.722 -437 C 0.708 -438 F 0.695 -439 T 0.703 -440 P 0.729 -441 G 0.748 -442 K 0.747 -443 P 0.742 -444 P 0.747 -445 L 0.760 -446 P 0.774 -447 H 0.787 -448 P 0.802 -449 A 0.817 -450 C 0.827 -451 H 0.835 -452 S 0.840 -453 C 0.842 -454 S 0.844 -455 E 0.845 -456 D 0.843 -457 S 0.840 -458 G 0.838 -459 S 0.837 -460 D 0.822 -461 V 0.777 -462 S 0.709 -463 S 0.665 -464 I 0.684 -465 S 0.736 -466 H 0.778 -467 P 0.802 -468 T 0.818 -469 S 0.829 -470 P 0.838 -471 G 0.841 -472 S 0.833 -473 S 0.815 -474 S 0.792 -475 P 0.764 -476 D 0.724 -477 I 0.669 -478 S 0.612 -479 F 0.578 -480 L 0.578 -481 R 0.591 -482 P 0.592 -483 L 0.575 -484 C 0.549 -485 L 0.530 -486 P 0.527 -487 E 0.537 -488 P 0.564 -489 P 0.612 -490 R 0.664 -491 H 0.701 -492 R 0.717 -493 G 0.711 -494 A 0.678 -495 W 0.635 -496 G 0.613 -497 P 0.624 -498 A 0.648 -499 C 0.659 -500 G 0.646 -501 R 0.614 -502 E 0.571 -503 L 0.517 -504 A 0.450 -505 P 0.368 -506 H 0.285 -507 Y 0.224 -508 S 0.199 -509 K 0.215 -510 L 0.267 -511 L 0.332 -512 L 0.383 -513 P 0.409 -514 A 0.404 -515 G 0.367 -516 Y 0.316 -517 F 0.283 -518 P 0.273 -519 T 0.265 -520 G 0.247 -521 R 0.225 -522 Y 0.211 -523 V 0.214 -524 M 0.231 -525 V 0.256 -526 A 0.281 -527 E 0.295 -528 G 0.294 -529 H 0.291 -530 L 0.314 -531 P 0.369 -532 P 0.426 -533 G 0.435 -534 E 0.383 -535 W 0.313 -536 E 0.272 -537 L 0.262 -538 C 0.272 -539 R 0.303 -540 A 0.362 -541 A 0.437 -542 V 0.496 -543 G 0.524 -544 A 0.519 -545 A 0.493 -546 Y 0.461 -547 D 0.437 -548 E 0.418 -549 E 0.406 -550 G 0.409 -551 A 0.427 -552 P 0.455 -553 L 0.479 -554 R 0.490 -555 Y 0.490 -556 Q 0.491 -557 R 0.493 -558 L 0.503 -559 V 0.535 -560 P 0.583 -561 S 0.627 -562 H 0.656 -563 S 0.675 -564 R 0.689 -565 I 0.699 -566 V 0.709 -567 R 0.719 -568 T 0.726 -569 P 0.736 -570 S 0.748 -571 L 0.753 -572 K 0.749 -573 D 0.738 -574 S 0.731 -575 P 0.737 -576 A 0.754 -577 G 0.770 -578 R 0.775 -579 G 0.762 -580 L 0.727 -581 S 0.680 -582 K 0.637 -583 A 0.603 -584 A 0.560 -585 V 0.497 -586 S 0.421 -587 E 0.339 -588 E 0.259 -589 L 0.197 -590 K 0.159 -591 W 0.141 -592 W 0.139 -593 H 0.149 -594 E 0.167 -595 R 0.195 -596 A 0.240 -597 R 0.305 -598 L 0.381 -599 R 0.454 -600 S 0.508 -601 S 0.540 -602 R 0.564 -603 P 0.594 -604 H 0.621 -605 S 0.630 -606 L 0.632 -607 D 0.650 -608 R 0.678 -609 Q 0.687 -610 G 0.667 -611 A 0.638 -612 F 0.623 -613 R 0.624 -614 V 0.629 -615 R 0.632 -616 S 0.631 -617 L 0.637 -618 P 0.665 -619 P 0.714 -620 G 0.762 -621 R 0.791 -622 E 0.802 -623 S 0.801 -624 F 0.800 -625 G 0.799 -626 R 0.793 -627 A 0.779 -628 S 0.761 -629 G 0.746 -630 P 0.735 -631 R 0.717 -632 T 0.674 -633 Q 0.599 -634 V 0.502 -635 P 0.394 -636 P 0.287 -637 V 0.205 -638 Y 0.164 -639 V 0.164 -640 L 0.185 -641 R 0.204 -642 R 0.220 -643 S 0.241 -644 T 0.267 -645 D 0.286 -646 G 0.294 -647 A 0.275 -648 P 0.229 -649 V 0.180 -650 Q 0.151 -651 V 0.139 -652 F 0.142 -653 V 0.163 -654 P 0.191 -655 E 0.203 -656 N 0.198 -657 G 0.186 -658 E 0.171 -659 I 0.151 -660 I 0.137 -661 S 0.138 -662 Q 0.146 -663 V 0.152 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000041605.17_ENSMUST00000120339.8_GN:Inava_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000041605.17_ENSMUST00000120339.8_GN:Inava_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid deleted file mode 100644 index 368ab5aac7ff3a739c5e0ef1886c8db86de508f5..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000041605.17_ENSMUST00000120339.8_GN:Inava_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid +++ /dev/null @@ -1,678 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000041605.17|ENSMUST00000120339.8|GN:Inava|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:14 -1 M 0.436 -2 P 0.480 -3 Q 0.551 -4 G 0.623 -5 T 0.671 -6 D 0.686 -7 V 0.679 -8 L 0.671 -9 G 0.665 -10 S 0.652 -11 L 0.635 -12 T 0.628 -13 F 0.624 -14 G 0.607 -15 M 0.572 -16 L 0.537 -17 Q 0.533 -18 M 0.566 -19 P 0.619 -20 K 0.666 -21 L 0.700 -22 N 0.716 -23 E 0.713 -24 I 0.701 -25 P 0.704 -26 P 0.730 -27 G 0.764 -28 R 0.784 -29 G 0.786 -30 G 0.779 -31 P 0.770 -32 G 0.763 -33 E 0.755 -34 P 0.745 -35 W 0.742 -36 G 0.738 -37 E 0.709 -38 G 0.651 -39 R 0.612 -40 W 0.637 -41 A 0.701 -42 G 0.750 -43 P 0.770 -44 T 0.775 -45 G 0.780 -46 P 0.789 -47 E 0.799 -48 A 0.802 -49 A 0.798 -50 R 0.795 -51 P 0.801 -52 A 0.814 -53 R 0.829 -54 G 0.840 -55 A 0.846 -56 R 0.846 -57 G 0.843 -58 Q 0.841 -59 A 0.838 -60 R 0.831 -61 G 0.807 -62 A 0.752 -63 R 0.675 -64 A 0.625 -65 R 0.638 -66 W 0.682 -67 D 0.707 -68 S 0.702 -69 W 0.695 -70 E 0.706 -71 H 0.724 -72 S 0.732 -73 R 0.729 -74 L 0.726 -75 P 0.730 -76 T 0.737 -77 H 0.743 -78 P 0.751 -79 G 0.765 -80 P 0.781 -81 G 0.789 -82 W 0.786 -83 D 0.777 -84 Q 0.765 -85 C 0.753 -86 S 0.750 -87 P 0.759 -88 S 0.773 -89 F 0.779 -90 L 0.776 -91 C 0.771 -92 A 0.769 -93 P 0.774 -94 S 0.781 -95 S 0.785 -96 Q 0.789 -97 K 0.796 -98 L 0.803 -99 I 0.803 -100 M 0.796 -101 E 0.790 -102 S 0.786 -103 K 0.786 -104 D 0.789 -105 E 0.794 -106 V 0.797 -107 S 0.795 -108 D 0.786 -109 S 0.773 -110 D 0.763 -111 S 0.762 -112 G 0.770 -113 I 0.777 -114 I 0.773 -115 L 0.757 -116 Q 0.737 -117 S 0.723 -118 G 0.717 -119 P 0.712 -120 D 0.703 -121 S 0.692 -122 P 0.679 -123 V 0.658 -124 S 0.619 -125 P 0.554 -126 M 0.473 -127 K 0.399 -128 E 0.345 -129 L 0.307 -130 T 0.271 -131 N 0.234 -132 A 0.201 -133 V 0.176 -134 R 0.166 -135 K 0.174 -136 Q 0.185 -137 Q 0.182 -138 R 0.170 -139 A 0.162 -140 L 0.164 -141 E 0.171 -142 A 0.179 -143 R 0.183 -144 L 0.181 -145 E 0.172 -146 A 0.164 -147 C 0.163 -148 L 0.164 -149 E 0.161 -150 E 0.152 -151 L 0.136 -152 R 0.118 -153 R 0.108 -154 L 0.110 -155 C 0.119 -156 L 0.127 -157 R 0.133 -158 E 0.143 -159 A 0.154 -160 E 0.159 -161 L 0.166 -162 T 0.180 -163 G 0.194 -164 T 0.199 -165 L 0.189 -166 P 0.170 -167 A 0.162 -168 E 0.174 -169 Y 0.192 -170 P 0.200 -171 L 0.203 -172 K 0.217 -173 P 0.247 -174 G 0.296 -175 E 0.360 -176 K 0.426 -177 A 0.476 -178 P 0.498 -179 K 0.502 -180 V 0.500 -181 R 0.496 -182 R 0.496 -183 R 0.503 -184 I 0.513 -185 G 0.515 -186 A 0.506 -187 A 0.490 -188 Y 0.470 -189 K 0.445 -190 L 0.408 -191 D 0.351 -192 E 0.292 -193 W 0.255 -194 A 0.247 -195 L 0.257 -196 H 0.263 -197 R 0.248 -198 E 0.217 -199 D 0.181 -200 P 0.147 -201 L 0.115 -202 S 0.090 -203 S 0.073 -204 L 0.063 -205 E 0.059 -206 R 0.061 -207 Q 0.065 -208 L 0.064 -209 A 0.060 -210 L 0.054 -211 Q 0.049 -212 L 0.047 -213 Q 0.045 -214 I 0.040 -215 T 0.035 -216 E 0.034 -217 A 0.038 -218 A 0.047 -219 R 0.061 -220 R 0.072 -221 L 0.075 -222 C 0.081 -223 A 0.098 -224 E 0.120 -225 E 0.134 -226 N 0.137 -227 L 0.127 -228 S 0.107 -229 R 0.086 -230 Q 0.071 -231 A 0.060 -232 R 0.052 -233 R 0.046 -234 Q 0.046 -235 R 0.054 -236 K 0.069 -237 H 0.082 -238 A 0.083 -239 A 0.074 -240 L 0.068 -241 Q 0.066 -242 E 0.067 -243 E 0.065 -244 K 0.059 -245 K 0.053 -246 L 0.049 -247 R 0.049 -248 D 0.049 -249 L 0.047 -250 Q 0.047 -251 R 0.054 -252 C 0.070 -253 L 0.098 -254 G 0.130 -255 D 0.148 -256 R 0.157 -257 R 0.178 -258 R 0.223 -259 N 0.280 -260 S 0.337 -261 E 0.397 -262 P 0.467 -263 P 0.546 -264 P 0.621 -265 T 0.676 -266 T 0.702 -267 V 0.710 -268 P 0.717 -269 S 0.729 -270 L 0.742 -271 G 0.751 -272 R 0.754 -273 E 0.757 -274 L 0.761 -275 S 0.766 -276 A 0.767 -277 S 0.764 -278 D 0.761 -279 D 0.757 -280 S 0.749 -281 S 0.737 -282 L 0.731 -283 S 0.737 -284 D 0.750 -285 G 0.763 -286 L 0.772 -287 L 0.780 -288 L 0.789 -289 E 0.796 -290 E 0.800 -291 E 0.799 -292 D 0.788 -293 S 0.769 -294 Q 0.747 -295 A 0.731 -296 P 0.719 -297 K 0.715 -298 P 0.719 -299 P 0.730 -300 P 0.744 -301 E 0.751 -302 S 0.745 -303 P 0.732 -304 A 0.721 -305 P 0.719 -306 P 0.720 -307 S 0.717 -308 R 0.708 -309 P 0.696 -310 L 0.681 -311 P 0.653 -312 P 0.615 -313 Q 0.604 -314 S 0.648 -315 L 0.719 -316 E 0.773 -317 G 0.796 -318 L 0.799 -319 Q 0.798 -320 P 0.802 -321 T 0.810 -322 G 0.819 -323 P 0.827 -324 E 0.836 -325 S 0.843 -326 G 0.848 -327 G 0.846 -328 Q 0.841 -329 E 0.833 -330 R 0.820 -331 A 0.795 -332 P 0.744 -333 I 0.674 -334 Q 0.631 -335 N 0.649 -336 S 0.699 -337 P 0.738 -338 W 0.765 -339 K 0.789 -340 E 0.807 -341 T 0.812 -342 S 0.805 -343 L 0.790 -344 D 0.771 -345 H 0.754 -346 P 0.741 -347 Y 0.739 -348 E 0.747 -349 K 0.764 -350 P 0.783 -351 R 0.800 -352 K 0.813 -353 S 0.820 -354 S 0.822 -355 E 0.825 -356 L 0.832 -357 S 0.838 -358 S 0.841 -359 E 0.837 -360 S 0.830 -361 S 0.823 -362 S 0.820 -363 P 0.823 -364 A 0.826 -365 T 0.824 -366 T 0.816 -367 P 0.806 -368 Q 0.792 -369 D 0.768 -370 Q 0.735 -371 P 0.698 -372 N 0.659 -373 P 0.618 -374 S 0.582 -375 S 0.559 -376 L 0.554 -377 W 0.566 -378 V 0.576 -379 L 0.561 -380 D 0.508 -381 A 0.430 -382 A 0.355 -383 S 0.308 -384 Y 0.299 -385 H 0.326 -386 V 0.383 -387 V 0.461 -388 P 0.550 -389 I 0.637 -390 R 0.702 -391 N 0.737 -392 V 0.756 -393 P 0.778 -394 G 0.808 -395 Q 0.833 -396 R 0.847 -397 Q 0.854 -398 G 0.858 -399 R 0.857 -400 T 0.848 -401 S 0.835 -402 A 0.823 -403 P 0.815 -404 A 0.808 -405 T 0.805 -406 P 0.812 -407 E 0.825 -408 M 0.835 -409 Q 0.837 -410 G 0.836 -411 R 0.835 -412 R 0.836 -413 G 0.835 -414 Q 0.831 -415 S 0.826 -416 Q 0.822 -417 S 0.821 -418 L 0.821 -419 R 0.821 -420 V 0.821 -421 D 0.818 -422 S 0.815 -423 F 0.817 -424 R 0.826 -425 A 0.838 -426 G 0.845 -427 A 0.846 -428 E 0.844 -429 G 0.841 -430 R 0.836 -431 G 0.827 -432 R 0.810 -433 S 0.783 -434 A 0.753 -435 F 0.733 -436 P 0.731 -437 R 0.739 -438 R 0.743 -439 R 0.742 -440 P 0.739 -441 T 0.733 -442 H 0.720 -443 Y 0.698 -444 T 0.672 -445 V 0.657 -446 T 0.662 -447 V 0.678 -448 P 0.698 -449 D 0.716 -450 S 0.721 -451 C 0.709 -452 F 0.697 -453 T 0.706 -454 P 0.732 -455 G 0.752 -456 K 0.752 -457 P 0.748 -458 P 0.754 -459 L 0.767 -460 P 0.780 -461 H 0.793 -462 P 0.807 -463 A 0.822 -464 C 0.832 -465 H 0.840 -466 S 0.845 -467 C 0.847 -468 S 0.849 -469 E 0.850 -470 D 0.848 -471 S 0.845 -472 G 0.843 -473 S 0.842 -474 D 0.827 -475 V 0.780 -476 S 0.708 -477 S 0.664 -478 I 0.684 -479 S 0.739 -480 H 0.783 -481 P 0.807 -482 T 0.822 -483 S 0.833 -484 P 0.842 -485 G 0.845 -486 S 0.837 -487 S 0.819 -488 S 0.796 -489 P 0.769 -490 D 0.731 -491 I 0.679 -492 S 0.626 -493 F 0.594 -494 L 0.593 -495 R 0.605 -496 P 0.606 -497 L 0.589 -498 C 0.563 -499 L 0.542 -500 P 0.535 -501 E 0.543 -502 P 0.570 -503 P 0.618 -504 R 0.670 -505 H 0.706 -506 R 0.721 -507 G 0.713 -508 A 0.679 -509 W 0.637 -510 G 0.614 -511 P 0.623 -512 A 0.644 -513 C 0.653 -514 G 0.640 -515 R 0.610 -516 E 0.568 -517 L 0.515 -518 A 0.449 -519 P 0.368 -520 H 0.286 -521 Y 0.225 -522 S 0.200 -523 K 0.215 -524 L 0.267 -525 L 0.332 -526 L 0.383 -527 P 0.408 -528 A 0.403 -529 G 0.364 -530 Y 0.312 -531 F 0.279 -532 P 0.269 -533 T 0.262 -534 G 0.243 -535 R 0.221 -536 Y 0.207 -537 V 0.209 -538 M 0.226 -539 V 0.250 -540 A 0.273 -541 E 0.286 -542 G 0.286 -543 H 0.285 -544 L 0.308 -545 P 0.363 -546 P 0.420 -547 G 0.429 -548 E 0.376 -549 W 0.306 -550 E 0.264 -551 L 0.252 -552 C 0.260 -553 R 0.289 -554 A 0.346 -555 A 0.418 -556 V 0.477 -557 G 0.506 -558 A 0.502 -559 A 0.477 -560 Y 0.446 -561 D 0.423 -562 E 0.406 -563 E 0.395 -564 G 0.399 -565 A 0.418 -566 P 0.446 -567 L 0.469 -568 R 0.479 -569 Y 0.478 -570 Q 0.478 -571 R 0.481 -572 L 0.493 -573 V 0.526 -574 P 0.573 -575 S 0.617 -576 H 0.646 -577 S 0.667 -578 R 0.682 -579 I 0.693 -580 V 0.704 -581 R 0.714 -582 T 0.723 -583 P 0.734 -584 S 0.746 -585 L 0.752 -586 K 0.748 -587 D 0.737 -588 S 0.731 -589 P 0.737 -590 A 0.754 -591 G 0.771 -592 R 0.776 -593 G 0.763 -594 L 0.729 -595 S 0.681 -596 K 0.637 -597 A 0.601 -598 A 0.557 -599 V 0.492 -600 S 0.414 -601 E 0.330 -602 E 0.249 -603 L 0.185 -604 K 0.146 -605 W 0.129 -606 W 0.129 -607 H 0.142 -608 E 0.160 -609 R 0.183 -610 A 0.221 -611 R 0.279 -612 L 0.354 -613 R 0.433 -614 S 0.494 -615 S 0.531 -616 R 0.556 -617 P 0.585 -618 H 0.611 -619 S 0.615 -620 L 0.612 -621 D 0.628 -622 R 0.656 -623 Q 0.663 -624 G 0.636 -625 A 0.602 -626 F 0.588 -627 R 0.592 -628 V 0.599 -629 R 0.606 -630 S 0.612 -631 L 0.624 -632 P 0.658 -633 P 0.710 -634 G 0.760 -635 R 0.790 -636 E 0.801 -637 S 0.801 -638 F 0.800 -639 G 0.799 -640 R 0.794 -641 A 0.780 -642 S 0.763 -643 G 0.749 -644 P 0.739 -645 R 0.720 -646 T 0.676 -647 Q 0.599 -648 V 0.499 -649 P 0.389 -650 P 0.282 -651 V 0.202 -652 Y 0.165 -653 V 0.167 -654 L 0.188 -655 R 0.207 -656 R 0.222 -657 S 0.243 -658 T 0.267 -659 D 0.286 -660 G 0.292 -661 A 0.272 -662 P 0.226 -663 V 0.178 -664 Q 0.149 -665 V 0.137 -666 F 0.140 -667 V 0.160 -668 P 0.187 -669 E 0.198 -670 N 0.194 -671 G 0.185 -672 E 0.171 -673 I 0.151 -674 I 0.137 -675 S 0.138 -676 Q 0.146 -677 V 0.152 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000041697.10_ENSMUST00000040154.10_GN:Cox6a1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000041697.10_ENSMUST00000040154.10_GN:Cox6a1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 7845a72cff5e1ead9ad286ce80d4813eda12e81d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000041697.10_ENSMUST00000040154.10_GN:Cox6a1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,112 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000041697.10|ENSMUST00000040154.10|GN:Cox6a1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.469 -2 A 0.504 -3 S 0.545 -4 A 0.559 -5 V 0.543 -6 L 0.533 -7 S 0.556 -8 A 0.579 -9 S 0.566 -10 R 0.550 -11 V 0.571 -12 S 0.612 -13 R 0.644 -14 P 0.668 -15 L 0.686 -16 G 0.690 -17 R 0.682 -18 A 0.677 -19 L 0.685 -20 P 0.702 -21 G 0.714 -22 L 0.712 -23 R 0.702 -24 R 0.708 -25 P 0.737 -26 M 0.769 -27 S 0.785 -28 S 0.781 -29 G 0.768 -30 A 0.751 -31 H 0.730 -32 G 0.700 -33 E 0.659 -34 E 0.604 -35 G 0.528 -36 S 0.431 -37 A 0.330 -38 R 0.250 -39 M 0.196 -40 W 0.159 -41 K 0.136 -42 A 0.123 -43 L 0.114 -44 T 0.105 -45 Y 0.103 -46 F 0.110 -47 V 0.123 -48 A 0.139 -49 L 0.160 -50 P 0.189 -51 G 0.212 -52 V 0.215 -53 G 0.203 -54 V 0.190 -55 S 0.185 -56 M 0.183 -57 L 0.179 -58 N 0.172 -59 V 0.158 -60 F 0.143 -61 L 0.139 -62 K 0.155 -63 S 0.185 -64 R 0.219 -65 H 0.251 -66 E 0.284 -67 E 0.316 -68 H 0.338 -69 E 0.345 -70 R 0.341 -71 P 0.329 -72 P 0.316 -73 F 0.304 -74 V 0.293 -75 A 0.283 -76 Y 0.278 -77 P 0.282 -78 H 0.289 -79 L 0.290 -80 R 0.287 -81 I 0.294 -82 R 0.320 -83 T 0.358 -84 K 0.405 -85 P 0.464 -86 F 0.521 -87 P 0.547 -88 W 0.535 -89 G 0.502 -90 D 0.468 -91 G 0.442 -92 N 0.447 -93 H 0.490 -94 T 0.543 -95 L 0.571 -96 F 0.569 -97 H 0.550 -98 N 0.513 -99 P 0.460 -100 H 0.419 -101 V 0.411 -102 N 0.423 -103 P 0.434 -104 L 0.436 -105 P 0.425 -106 T 0.416 -107 G 0.425 -108 Y 0.449 -109 E 0.468 -110 D 0.469 -111 E 0.462 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000041697.10_ENSMUST00000040154.10_GN:Cox6a1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000041697.10_ENSMUST00000040154.10_GN:Cox6a1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid deleted file mode 100644 index 2e56383b964c7430abf2565b5fbbbe0e82363fbf..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000041697.10_ENSMUST00000040154.10_GN:Cox6a1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid +++ /dev/null @@ -1,113 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000041697.10|ENSMUST00000040154.10|GN:Cox6a1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:1 -1 M 0.480 -2 M 0.514 -3 A 0.561 -4 S 0.595 -5 A 0.596 -6 V 0.568 -7 L 0.556 -8 S 0.591 -9 A 0.640 -10 S 0.663 -11 R 0.662 -12 V 0.657 -13 S 0.652 -14 R 0.652 -15 P 0.666 -16 L 0.684 -17 G 0.689 -18 R 0.683 -19 A 0.679 -20 L 0.687 -21 P 0.703 -22 G 0.715 -23 L 0.712 -24 R 0.703 -25 R 0.709 -26 P 0.736 -27 M 0.768 -28 S 0.784 -29 S 0.781 -30 G 0.768 -31 A 0.752 -32 H 0.731 -33 G 0.701 -34 E 0.661 -35 E 0.607 -36 G 0.531 -37 S 0.433 -38 A 0.332 -39 R 0.252 -40 M 0.197 -41 W 0.160 -42 K 0.136 -43 A 0.124 -44 L 0.115 -45 T 0.106 -46 Y 0.103 -47 F 0.110 -48 V 0.122 -49 A 0.138 -50 L 0.160 -51 P 0.188 -52 G 0.211 -53 V 0.214 -54 G 0.202 -55 V 0.190 -56 S 0.184 -57 M 0.182 -58 L 0.178 -59 N 0.171 -60 V 0.157 -61 F 0.142 -62 L 0.139 -63 K 0.155 -64 S 0.186 -65 R 0.220 -66 H 0.252 -67 E 0.285 -68 E 0.317 -69 H 0.339 -70 E 0.346 -71 R 0.341 -72 P 0.329 -73 P 0.315 -74 F 0.303 -75 V 0.292 -76 A 0.282 -77 Y 0.278 -78 P 0.282 -79 H 0.289 -80 L 0.291 -81 R 0.287 -82 I 0.295 -83 R 0.320 -84 T 0.358 -85 K 0.404 -86 P 0.463 -87 F 0.520 -88 P 0.547 -89 W 0.534 -90 G 0.502 -91 D 0.468 -92 G 0.442 -93 N 0.447 -94 H 0.489 -95 T 0.543 -96 L 0.570 -97 F 0.569 -98 H 0.551 -99 N 0.514 -100 P 0.461 -101 H 0.421 -102 V 0.413 -103 N 0.424 -104 P 0.436 -105 L 0.437 -106 P 0.426 -107 T 0.418 -108 G 0.428 -109 Y 0.453 -110 E 0.471 -111 D 0.472 -112 E 0.464 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000042082.8_ENSMUST00000091403.6_GN:Arsb_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000042082.8_ENSMUST00000091403.6_GN:Arsb_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index b859701aa77418913b0f104a583aaa6b18ff770c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000042082.8_ENSMUST00000091403.6_GN:Arsb_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,535 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000042082.8|ENSMUST00000091403.6|GN:Arsb|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.333 -2 G 0.329 -3 K 0.332 -4 L 0.343 -5 S 0.348 -6 P 0.353 -7 C 0.379 -8 T 0.411 -9 G 0.418 -10 R 0.414 -11 S 0.435 -12 R 0.478 -13 P 0.513 -14 G 0.537 -15 G 0.560 -16 P 0.581 -17 G 0.586 -18 P 0.567 -19 Q 0.515 -20 L 0.435 -21 P 0.345 -22 L 0.266 -23 L 0.212 -24 L 0.182 -25 L 0.169 -26 L 0.166 -27 L 0.167 -28 Q 0.170 -29 L 0.171 -30 L 0.166 -31 L 0.166 -32 L 0.188 -33 L 0.237 -34 L 0.305 -35 S 0.377 -36 P 0.443 -37 A 0.494 -38 R 0.524 -39 A 0.537 -40 S 0.538 -41 G 0.522 -42 A 0.478 -43 T 0.404 -44 Q 0.314 -45 P 0.228 -46 P 0.164 -47 H 0.131 -48 V 0.121 -49 V 0.116 -50 F 0.108 -51 V 0.099 -52 L 0.092 -53 A 0.089 -54 D 0.090 -55 D 0.091 -56 L 0.084 -57 G 0.072 -58 W 0.068 -59 N 0.077 -60 D 0.093 -61 L 0.107 -62 G 0.123 -63 F 0.143 -64 H 0.162 -65 G 0.169 -66 S 0.162 -67 V 0.152 -68 I 0.144 -69 R 0.135 -70 T 0.124 -71 P 0.116 -72 H 0.114 -73 L 0.113 -74 D 0.110 -75 A 0.108 -76 L 0.116 -77 A 0.130 -78 A 0.141 -79 G 0.141 -80 G 0.132 -81 V 0.123 -82 V 0.116 -83 L 0.107 -84 D 0.095 -85 N 0.085 -86 Y 0.078 -87 Y 0.074 -88 V 0.072 -89 Q 0.072 -90 P 0.079 -91 L 0.089 -92 C 0.099 -93 T 0.115 -94 P 0.138 -95 S 0.158 -96 R 0.165 -97 S 0.162 -98 Q 0.158 -99 L 0.157 -100 L 0.158 -101 T 0.157 -102 G 0.153 -103 R 0.149 -104 Y 0.144 -105 Q 0.140 -106 I 0.144 -107 H 0.160 -108 L 0.179 -109 G 0.186 -110 L 0.180 -111 Q 0.174 -112 H 0.183 -113 Y 0.212 -114 L 0.242 -115 I 0.253 -116 M 0.240 -117 T 0.212 -118 C 0.181 -119 Q 0.155 -120 P 0.142 -121 S 0.140 -122 C 0.140 -123 V 0.134 -124 P 0.118 -125 L 0.101 -126 D 0.090 -127 E 0.082 -128 K 0.076 -129 L 0.073 -130 L 0.074 -131 P 0.077 -132 Q 0.077 -133 L 0.073 -134 L 0.066 -135 K 0.063 -136 E 0.068 -137 A 0.081 -138 G 0.095 -139 Y 0.103 -140 A 0.103 -141 T 0.104 -142 H 0.114 -143 M 0.132 -144 V 0.146 -145 G 0.148 -146 K 0.143 -147 W 0.137 -148 H 0.129 -149 L 0.117 -150 G 0.103 -151 M 0.090 -152 Y 0.082 -153 R 0.081 -154 K 0.084 -155 E 0.088 -156 C 0.088 -157 L 0.081 -158 P 0.074 -159 T 0.076 -160 R 0.090 -161 R 0.113 -162 G 0.132 -163 F 0.136 -164 D 0.128 -165 T 0.125 -166 Y 0.133 -167 F 0.146 -168 G 0.154 -169 Y 0.150 -170 L 0.139 -171 L 0.127 -172 G 0.125 -173 S 0.129 -174 E 0.131 -175 D 0.131 -176 Y 0.136 -177 Y 0.148 -178 T 0.160 -179 H 0.164 -180 E 0.163 -181 A 0.159 -182 C 0.158 -183 A 0.159 -184 P 0.157 -185 I 0.152 -186 E 0.147 -187 S 0.145 -188 L 0.144 -189 N 0.143 -190 G 0.143 -191 T 0.147 -192 R 0.151 -193 C 0.150 -194 A 0.147 -195 L 0.147 -196 D 0.149 -197 L 0.144 -198 R 0.133 -199 D 0.122 -200 G 0.121 -201 E 0.132 -202 E 0.151 -203 P 0.160 -204 A 0.151 -205 K 0.134 -206 E 0.125 -207 Y 0.126 -208 N 0.126 -209 N 0.118 -210 I 0.106 -211 Y 0.100 -212 S 0.099 -213 T 0.093 -214 N 0.084 -215 I 0.080 -216 F 0.086 -217 T 0.094 -218 K 0.097 -219 R 0.095 -220 A 0.093 -221 T 0.093 -222 T 0.091 -223 V 0.085 -224 I 0.080 -225 A 0.081 -226 N 0.087 -227 H 0.091 -228 P 0.088 -229 P 0.087 -230 E 0.096 -231 K 0.113 -232 P 0.132 -233 L 0.155 -234 F 0.177 -235 L 0.187 -236 Y 0.178 -237 L 0.160 -238 A 0.139 -239 F 0.121 -240 Q 0.113 -241 S 0.114 -242 V 0.113 -243 H 0.106 -244 D 0.101 -245 P 0.108 -246 L 0.120 -247 Q 0.128 -248 V 0.124 -249 P 0.108 -250 E 0.086 -251 E 0.069 -252 Y 0.059 -253 M 0.053 -254 E 0.051 -255 P 0.056 -256 Y 0.066 -257 G 0.075 -258 F 0.082 -259 I 0.087 -260 Q 0.092 -261 D 0.097 -262 K 0.104 -263 H 0.113 -264 R 0.122 -265 R 0.135 -266 I 0.159 -267 Y 0.186 -268 A 0.204 -269 G 0.213 -270 M 0.211 -271 V 0.199 -272 S 0.187 -273 L 0.176 -274 M 0.163 -275 D 0.141 -276 E 0.115 -277 A 0.092 -278 V 0.076 -279 G 0.065 -280 N 0.060 -281 V 0.062 -282 T 0.069 -283 K 0.072 -284 A 0.065 -285 L 0.052 -286 K 0.042 -287 S 0.038 -288 H 0.035 -289 G 0.033 -290 L 0.033 -291 W 0.035 -292 N 0.039 -293 N 0.045 -294 T 0.053 -295 V 0.058 -296 F 0.059 -297 I 0.056 -298 F 0.054 -299 S 0.056 -300 T 0.060 -301 D 0.068 -302 N 0.080 -303 G 0.093 -304 G 0.100 -305 Q 0.100 -306 T 0.105 -307 R 0.120 -308 S 0.137 -309 G 0.147 -310 G 0.143 -311 N 0.133 -312 N 0.124 -313 W 0.121 -314 P 0.127 -315 L 0.133 -316 R 0.130 -317 G 0.124 -318 R 0.118 -319 K 0.113 -320 G 0.107 -321 T 0.101 -322 L 0.100 -323 W 0.103 -324 E 0.109 -325 G 0.117 -326 G 0.126 -327 I 0.135 -328 R 0.141 -329 G 0.139 -330 T 0.125 -331 G 0.100 -332 F 0.076 -333 V 0.062 -334 A 0.064 -335 S 0.079 -336 P 0.098 -337 L 0.113 -338 L 0.122 -339 K 0.129 -340 Q 0.146 -341 K 0.170 -342 G 0.188 -343 V 0.190 -344 K 0.183 -345 S 0.178 -346 R 0.183 -347 E 0.197 -348 L 0.207 -349 M 0.197 -350 H 0.172 -351 I 0.152 -352 T 0.150 -353 D 0.155 -354 W 0.149 -355 L 0.131 -356 P 0.112 -357 T 0.096 -358 L 0.083 -359 V 0.071 -360 D 0.065 -361 L 0.070 -362 A 0.086 -363 G 0.109 -364 G 0.131 -365 S 0.150 -366 T 0.175 -367 N 0.205 -368 G 0.229 -369 T 0.236 -370 K 0.218 -371 P 0.182 -372 L 0.145 -373 D 0.125 -374 G 0.121 -375 F 0.120 -376 N 0.112 -377 M 0.097 -378 W 0.080 -379 K 0.070 -380 T 0.067 -381 I 0.070 -382 S 0.075 -383 E 0.084 -384 G 0.098 -385 H 0.114 -386 P 0.124 -387 S 0.125 -388 P 0.119 -389 R 0.115 -390 V 0.116 -391 E 0.120 -392 L 0.119 -393 L 0.108 -394 H 0.097 -395 N 0.097 -396 I 0.111 -397 D 0.136 -398 Q 0.167 -399 D 0.197 -400 F 0.215 -401 F 0.226 -402 D 0.236 -403 G 0.248 -404 L 0.264 -405 P 0.288 -406 C 0.325 -407 P 0.370 -408 G 0.406 -409 K 0.415 -410 N 0.402 -411 M 0.388 -412 T 0.389 -413 P 0.394 -414 A 0.387 -415 K 0.373 -416 D 0.362 -417 D 0.359 -418 S 0.361 -419 F 0.363 -420 P 0.369 -421 L 0.387 -422 E 0.415 -423 H 0.440 -424 S 0.434 -425 A 0.386 -426 F 0.316 -427 N 0.251 -428 T 0.204 -429 S 0.172 -430 I 0.145 -431 H 0.120 -432 A 0.099 -433 G 0.085 -434 I 0.076 -435 R 0.071 -436 Y 0.066 -437 K 0.064 -438 N 0.071 -439 W 0.082 -440 K 0.092 -441 L 0.099 -442 L 0.110 -443 T 0.136 -444 G 0.175 -445 H 0.213 -446 P 0.238 -447 G 0.249 -448 C 0.251 -449 G 0.240 -450 Y 0.218 -451 W 0.197 -452 F 0.194 -453 P 0.220 -454 P 0.273 -455 P 0.332 -456 S 0.379 -457 Q 0.408 -458 S 0.426 -459 N 0.437 -460 V 0.435 -461 S 0.421 -462 E 0.410 -463 I 0.408 -464 P 0.408 -465 P 0.398 -466 V 0.377 -467 D 0.353 -468 P 0.330 -469 P 0.299 -470 T 0.252 -471 K 0.198 -472 T 0.152 -473 L 0.126 -474 W 0.126 -475 L 0.142 -476 F 0.163 -477 D 0.172 -478 I 0.166 -479 N 0.154 -480 Q 0.144 -481 D 0.137 -482 P 0.131 -483 E 0.128 -484 E 0.127 -485 R 0.128 -486 H 0.127 -487 D 0.120 -488 V 0.104 -489 S 0.085 -490 R 0.070 -491 E 0.062 -492 H 0.058 -493 P 0.054 -494 H 0.050 -495 I 0.049 -496 V 0.051 -497 Q 0.057 -498 N 0.068 -499 L 0.082 -500 L 0.093 -501 S 0.099 -502 R 0.099 -503 L 0.093 -504 Q 0.087 -505 Y 0.090 -506 Y 0.104 -507 H 0.123 -508 E 0.140 -509 H 0.155 -510 S 0.167 -511 V 0.175 -512 P 0.184 -513 S 0.194 -514 H 0.200 -515 F 0.202 -516 P 0.203 -517 P 0.205 -518 L 0.208 -519 D 0.215 -520 P 0.226 -521 R 0.240 -522 C 0.250 -523 D 0.246 -524 P 0.228 -525 K 0.212 -526 S 0.210 -527 T 0.222 -528 G 0.236 -529 V 0.244 -530 W 0.248 -531 S 0.255 -532 P 0.271 -533 W 0.291 -534 M 0.307 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000042082.8_ENSMUST00000091403.6_GN:Arsb_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:28.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000042082.8_ENSMUST00000091403.6_GN:Arsb_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:28.caid deleted file mode 100644 index 73e2bde98e36e610aa427c94871a4452bd4e21dd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000042082.8_ENSMUST00000091403.6_GN:Arsb_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:28.caid +++ /dev/null @@ -1,563 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000042082.8|ENSMUST00000091403.6|GN:Arsb|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:28 -1 M 0.309 -2 K 0.306 -3 S 0.314 -4 C 0.334 -5 W 0.350 -6 G 0.365 -7 A 0.399 -8 R 0.436 -9 P 0.441 -10 L 0.422 -11 S 0.411 -12 S 0.409 -13 R 0.423 -14 F 0.466 -15 C 0.519 -16 R 0.551 -17 G 0.563 -18 C 0.567 -19 P 0.566 -20 Q 0.562 -21 H 0.567 -22 G 0.577 -23 L 0.565 -24 C 0.523 -25 R 0.476 -26 L 0.448 -27 L 0.435 -28 R 0.448 -29 M 0.500 -30 G 0.562 -31 K 0.599 -32 L 0.618 -33 S 0.640 -34 P 0.659 -35 C 0.658 -36 T 0.624 -37 G 0.566 -38 R 0.523 -39 S 0.536 -40 R 0.589 -41 P 0.636 -42 G 0.656 -43 G 0.657 -44 P 0.648 -45 G 0.633 -46 P 0.606 -47 Q 0.559 -48 L 0.492 -49 P 0.410 -50 L 0.323 -51 L 0.252 -52 L 0.208 -53 L 0.193 -54 L 0.194 -55 L 0.198 -56 Q 0.202 -57 L 0.204 -58 L 0.202 -59 L 0.203 -60 L 0.224 -61 L 0.270 -62 L 0.334 -63 S 0.407 -64 P 0.478 -65 A 0.533 -66 R 0.563 -67 A 0.574 -68 S 0.572 -69 G 0.551 -70 A 0.501 -71 T 0.419 -72 Q 0.323 -73 P 0.233 -74 P 0.166 -75 H 0.131 -76 V 0.120 -77 V 0.113 -78 F 0.104 -79 V 0.095 -80 L 0.088 -81 A 0.086 -82 D 0.088 -83 D 0.089 -84 L 0.082 -85 G 0.070 -86 W 0.065 -87 N 0.072 -88 D 0.087 -89 L 0.100 -90 G 0.116 -91 F 0.137 -92 H 0.156 -93 G 0.163 -94 S 0.157 -95 V 0.147 -96 I 0.139 -97 R 0.130 -98 T 0.118 -99 P 0.111 -100 H 0.109 -101 L 0.108 -102 D 0.104 -103 A 0.102 -104 L 0.109 -105 A 0.123 -106 A 0.135 -107 G 0.135 -108 G 0.127 -109 V 0.118 -110 V 0.111 -111 L 0.101 -112 D 0.090 -113 N 0.081 -114 Y 0.076 -115 Y 0.073 -116 V 0.070 -117 Q 0.071 -118 P 0.077 -119 L 0.087 -120 C 0.097 -121 T 0.112 -122 P 0.134 -123 S 0.155 -124 R 0.163 -125 S 0.161 -126 Q 0.158 -127 L 0.157 -128 L 0.158 -129 T 0.157 -130 G 0.154 -131 R 0.150 -132 Y 0.147 -133 Q 0.144 -134 I 0.148 -135 H 0.164 -136 L 0.184 -137 G 0.194 -138 L 0.190 -139 Q 0.186 -140 H 0.197 -141 Y 0.227 -142 L 0.259 -143 I 0.268 -144 M 0.251 -145 T 0.219 -146 C 0.187 -147 Q 0.161 -148 P 0.148 -149 S 0.147 -150 C 0.148 -151 V 0.140 -152 P 0.123 -153 L 0.105 -154 D 0.093 -155 E 0.086 -156 K 0.078 -157 L 0.074 -158 L 0.075 -159 P 0.077 -160 Q 0.077 -161 L 0.072 -162 L 0.066 -163 K 0.063 -164 E 0.068 -165 A 0.081 -166 G 0.095 -167 Y 0.103 -168 A 0.103 -169 T 0.103 -170 H 0.113 -171 M 0.131 -172 V 0.146 -173 G 0.148 -174 K 0.142 -175 W 0.136 -176 H 0.129 -177 L 0.117 -178 G 0.102 -179 M 0.089 -180 Y 0.081 -181 R 0.079 -182 K 0.082 -183 E 0.086 -184 C 0.086 -185 L 0.079 -186 P 0.072 -187 T 0.074 -188 R 0.087 -189 R 0.110 -190 G 0.130 -191 F 0.134 -192 D 0.126 -193 T 0.123 -194 Y 0.133 -195 F 0.147 -196 G 0.154 -197 Y 0.150 -198 L 0.138 -199 L 0.127 -200 G 0.125 -201 S 0.130 -202 E 0.133 -203 D 0.132 -204 Y 0.138 -205 Y 0.150 -206 T 0.160 -207 H 0.164 -208 E 0.161 -209 A 0.157 -210 C 0.155 -211 A 0.155 -212 P 0.153 -213 I 0.148 -214 E 0.143 -215 S 0.141 -216 L 0.140 -217 N 0.139 -218 G 0.139 -219 T 0.143 -220 R 0.147 -221 C 0.147 -222 A 0.143 -223 L 0.142 -224 D 0.144 -225 L 0.140 -226 R 0.129 -227 D 0.118 -228 G 0.115 -229 E 0.126 -230 E 0.145 -231 P 0.156 -232 A 0.148 -233 K 0.131 -234 E 0.122 -235 Y 0.122 -236 N 0.122 -237 N 0.114 -238 I 0.102 -239 Y 0.097 -240 S 0.097 -241 T 0.092 -242 N 0.083 -243 I 0.080 -244 F 0.086 -245 T 0.094 -246 K 0.097 -247 R 0.095 -248 A 0.093 -249 T 0.093 -250 T 0.091 -251 V 0.085 -252 I 0.080 -253 A 0.082 -254 N 0.088 -255 H 0.091 -256 P 0.088 -257 P 0.088 -258 E 0.097 -259 K 0.114 -260 P 0.134 -261 L 0.157 -262 F 0.180 -263 L 0.189 -264 Y 0.181 -265 L 0.163 -266 A 0.142 -267 F 0.124 -268 Q 0.116 -269 S 0.118 -270 V 0.117 -271 H 0.109 -272 D 0.104 -273 P 0.111 -274 L 0.125 -275 Q 0.133 -276 V 0.129 -277 P 0.112 -278 E 0.089 -279 E 0.071 -280 Y 0.061 -281 M 0.055 -282 E 0.054 -283 P 0.058 -284 Y 0.069 -285 G 0.079 -286 F 0.086 -287 I 0.091 -288 Q 0.095 -289 D 0.100 -290 K 0.107 -291 H 0.116 -292 R 0.124 -293 R 0.137 -294 I 0.161 -295 Y 0.188 -296 A 0.207 -297 G 0.216 -298 M 0.214 -299 V 0.204 -300 S 0.191 -301 L 0.181 -302 M 0.166 -303 D 0.144 -304 E 0.117 -305 A 0.094 -306 V 0.078 -307 G 0.067 -308 N 0.061 -309 V 0.063 -310 T 0.070 -311 K 0.074 -312 A 0.066 -313 L 0.053 -314 K 0.044 -315 S 0.039 -316 H 0.037 -317 G 0.035 -318 L 0.035 -319 W 0.038 -320 N 0.042 -321 N 0.048 -322 T 0.055 -323 V 0.060 -324 F 0.060 -325 I 0.057 -326 F 0.056 -327 S 0.057 -328 T 0.062 -329 D 0.070 -330 N 0.083 -331 G 0.096 -332 G 0.103 -333 Q 0.103 -334 T 0.108 -335 R 0.124 -336 S 0.142 -337 G 0.152 -338 G 0.148 -339 N 0.137 -340 N 0.127 -341 W 0.124 -342 P 0.130 -343 L 0.136 -344 R 0.133 -345 G 0.127 -346 R 0.121 -347 K 0.116 -348 G 0.110 -349 T 0.105 -350 L 0.104 -351 W 0.107 -352 E 0.113 -353 G 0.120 -354 G 0.129 -355 I 0.137 -356 R 0.142 -357 G 0.140 -358 T 0.125 -359 G 0.101 -360 F 0.077 -361 V 0.064 -362 A 0.066 -363 S 0.081 -364 P 0.099 -365 L 0.114 -366 L 0.121 -367 K 0.128 -368 Q 0.143 -369 K 0.166 -370 G 0.183 -371 V 0.186 -372 K 0.180 -373 S 0.175 -374 R 0.180 -375 E 0.194 -376 L 0.204 -377 M 0.195 -378 H 0.171 -379 I 0.152 -380 T 0.150 -381 D 0.154 -382 W 0.148 -383 L 0.130 -384 P 0.111 -385 T 0.095 -386 L 0.082 -387 V 0.070 -388 D 0.064 -389 L 0.068 -390 A 0.083 -391 G 0.105 -392 G 0.127 -393 S 0.146 -394 T 0.170 -395 N 0.199 -396 G 0.224 -397 T 0.231 -398 K 0.213 -399 P 0.178 -400 L 0.142 -401 D 0.122 -402 G 0.119 -403 F 0.118 -404 N 0.111 -405 M 0.096 -406 W 0.079 -407 K 0.069 -408 T 0.066 -409 I 0.068 -410 S 0.073 -411 E 0.082 -412 G 0.096 -413 H 0.113 -414 P 0.123 -415 S 0.124 -416 P 0.119 -417 R 0.115 -418 V 0.116 -419 E 0.119 -420 L 0.117 -421 L 0.107 -422 H 0.096 -423 N 0.096 -424 I 0.110 -425 D 0.136 -426 Q 0.169 -427 D 0.199 -428 F 0.218 -429 F 0.230 -430 D 0.240 -431 G 0.253 -432 L 0.269 -433 P 0.293 -434 C 0.329 -435 P 0.373 -436 G 0.409 -437 K 0.418 -438 N 0.404 -439 M 0.391 -440 T 0.391 -441 P 0.396 -442 A 0.389 -443 K 0.374 -444 D 0.364 -445 D 0.362 -446 S 0.363 -447 F 0.366 -448 P 0.372 -449 L 0.389 -450 E 0.416 -451 H 0.439 -452 S 0.432 -453 A 0.384 -454 F 0.314 -455 N 0.250 -456 T 0.205 -457 S 0.173 -458 I 0.147 -459 H 0.122 -460 A 0.100 -461 G 0.085 -462 I 0.077 -463 R 0.072 -464 Y 0.067 -465 K 0.066 -466 N 0.072 -467 W 0.084 -468 K 0.093 -469 L 0.100 -470 L 0.111 -471 T 0.137 -472 G 0.177 -473 H 0.215 -474 P 0.239 -475 G 0.251 -476 C 0.252 -477 G 0.242 -478 Y 0.220 -479 W 0.198 -480 F 0.196 -481 P 0.223 -482 P 0.275 -483 P 0.335 -484 S 0.381 -485 Q 0.408 -486 S 0.426 -487 N 0.437 -488 V 0.435 -489 S 0.422 -490 E 0.411 -491 I 0.411 -492 P 0.412 -493 P 0.403 -494 V 0.381 -495 D 0.356 -496 P 0.332 -497 P 0.300 -498 T 0.254 -499 K 0.199 -500 T 0.153 -501 L 0.128 -502 W 0.127 -503 L 0.145 -504 F 0.167 -505 D 0.177 -506 I 0.171 -507 N 0.158 -508 Q 0.147 -509 D 0.139 -510 P 0.132 -511 E 0.129 -512 E 0.129 -513 R 0.129 -514 H 0.128 -515 D 0.121 -516 V 0.105 -517 S 0.086 -518 R 0.070 -519 E 0.062 -520 H 0.058 -521 P 0.054 -522 H 0.051 -523 I 0.050 -524 V 0.051 -525 Q 0.058 -526 N 0.069 -527 L 0.083 -528 L 0.094 -529 S 0.100 -530 R 0.100 -531 L 0.095 -532 Q 0.088 -533 Y 0.091 -534 Y 0.105 -535 H 0.124 -536 E 0.142 -537 H 0.156 -538 S 0.167 -539 V 0.176 -540 P 0.185 -541 S 0.194 -542 H 0.200 -543 F 0.202 -544 P 0.203 -545 P 0.205 -546 L 0.208 -547 D 0.214 -548 P 0.223 -549 R 0.236 -550 C 0.247 -551 D 0.245 -552 P 0.228 -553 K 0.213 -554 S 0.213 -555 T 0.227 -556 G 0.243 -557 V 0.253 -558 W 0.256 -559 S 0.261 -560 P 0.272 -561 W 0.286 -562 M 0.296 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000042312.12_ENSMUST00000250017.1_GN:S100a13_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000042312.12_ENSMUST00000250017.1_GN:S100a13_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 5521755e0d0b33f61d9dcf0fcd2df5d0e37dd1cd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000042312.12_ENSMUST00000250017.1_GN:S100a13_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,99 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000042312.12|ENSMUST00000250017.1|GN:S100a13|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.462 -2 A 0.478 -3 A 0.484 -4 E 0.458 -5 T 0.404 -6 L 0.335 -7 T 0.265 -8 E 0.207 -9 L 0.172 -10 E 0.159 -11 A 0.159 -12 A 0.159 -13 I 0.152 -14 E 0.136 -15 T 0.110 -16 V 0.082 -17 V 0.063 -18 S 0.053 -19 T 0.047 -20 F 0.045 -21 F 0.049 -22 T 0.057 -23 F 0.069 -24 A 0.088 -25 G 0.112 -26 R 0.136 -27 E 0.153 -28 G 0.159 -29 R 0.157 -30 K 0.152 -31 G 0.149 -32 S 0.142 -33 L 0.124 -34 N 0.097 -35 I 0.075 -36 N 0.064 -37 E 0.059 -38 F 0.053 -39 K 0.051 -40 E 0.054 -41 L 0.060 -42 A 0.068 -43 T 0.078 -44 Q 0.090 -45 Q 0.097 -46 L 0.095 -47 P 0.088 -48 H 0.085 -49 L 0.095 -50 L 0.116 -51 K 0.138 -52 D 0.149 -53 V 0.141 -54 G 0.120 -55 S 0.094 -56 L 0.073 -57 D 0.063 -58 E 0.060 -59 K 0.060 -60 M 0.061 -61 K 0.061 -62 T 0.066 -63 L 0.077 -64 D 0.097 -65 V 0.118 -66 N 0.128 -67 Q 0.124 -68 D 0.116 -69 S 0.115 -70 E 0.118 -71 L 0.113 -72 R 0.094 -73 F 0.074 -74 S 0.063 -75 E 0.063 -76 Y 0.063 -77 W 0.060 -78 R 0.058 -79 L 0.057 -80 I 0.056 -81 G 0.057 -82 E 0.063 -83 L 0.075 -84 A 0.090 -85 K 0.102 -86 E 0.106 -87 V 0.108 -88 R 0.120 -89 K 0.144 -90 E 0.175 -91 K 0.211 -92 A 0.253 -93 L 0.301 -94 G 0.345 -95 I 0.374 -96 R 0.378 -97 K 0.361 -98 K 0.341 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000042312.12_ENSMUST00000250017.1_GN:S100a13_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:62.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000042312.12_ENSMUST00000250017.1_GN:S100a13_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:62.caid deleted file mode 100644 index 20216114c2459b4e0511da163d7f8abeea0ea47b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000042312.12_ENSMUST00000250017.1_GN:S100a13_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:62.caid +++ /dev/null @@ -1,161 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000042312.12|ENSMUST00000250017.1|GN:S100a13|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:62 -1 M 0.381 -2 A 0.388 -3 S 0.414 -4 D 0.451 -5 S 0.477 -6 R 0.502 -7 G 0.552 -8 G 0.608 -9 P 0.623 -10 L 0.597 -11 S 0.582 -12 G 0.615 -13 G 0.660 -14 G 0.676 -15 N 0.663 -16 L 0.641 -17 T 0.616 -18 L 0.584 -19 Q 0.539 -20 T 0.480 -21 W 0.424 -22 E 0.389 -23 W 0.375 -24 L 0.374 -25 S 0.376 -26 P 0.369 -27 C 0.350 -28 L 0.331 -29 V 0.328 -30 L 0.343 -31 I 0.368 -32 N 0.396 -33 F 0.417 -34 S 0.426 -35 L 0.429 -36 R 0.442 -37 A 0.482 -38 P 0.547 -39 D 0.609 -40 R 0.647 -41 L 0.662 -42 A 0.664 -43 A 0.653 -44 S 0.634 -45 H 0.620 -46 L 0.622 -47 L 0.635 -48 S 0.645 -49 R 0.649 -50 S 0.645 -51 I 0.627 -52 C 0.594 -53 V 0.554 -54 D 0.510 -55 I 0.469 -56 S 0.451 -57 S 0.464 -58 C 0.496 -59 F 0.540 -60 G 0.591 -61 I 0.627 -62 L 0.638 -63 M 0.636 -64 A 0.630 -65 A 0.605 -66 E 0.554 -67 T 0.484 -68 L 0.406 -69 T 0.326 -70 E 0.258 -71 L 0.217 -72 E 0.206 -73 A 0.212 -74 A 0.214 -75 I 0.203 -76 E 0.178 -77 T 0.142 -78 V 0.106 -79 V 0.082 -80 S 0.067 -81 T 0.056 -82 F 0.049 -83 F 0.050 -84 T 0.056 -85 F 0.066 -86 A 0.082 -87 G 0.103 -88 R 0.122 -89 E 0.134 -90 G 0.137 -91 R 0.133 -92 K 0.130 -93 G 0.129 -94 S 0.126 -95 L 0.113 -96 N 0.090 -97 I 0.071 -98 N 0.063 -99 E 0.058 -100 F 0.051 -101 K 0.047 -102 E 0.049 -103 L 0.053 -104 A 0.059 -105 T 0.065 -106 Q 0.074 -107 Q 0.079 -108 L 0.077 -109 P 0.071 -110 H 0.070 -111 L 0.080 -112 L 0.100 -113 K 0.119 -114 D 0.129 -115 V 0.125 -116 G 0.109 -117 S 0.088 -118 L 0.069 -119 D 0.058 -120 E 0.055 -121 K 0.055 -122 M 0.056 -123 K 0.058 -124 T 0.064 -125 L 0.077 -126 D 0.097 -127 V 0.116 -128 N 0.125 -129 Q 0.122 -130 D 0.115 -131 S 0.112 -132 E 0.113 -133 L 0.107 -134 R 0.088 -135 F 0.067 -136 S 0.057 -137 E 0.056 -138 Y 0.056 -139 W 0.052 -140 R 0.049 -141 L 0.048 -142 I 0.047 -143 G 0.048 -144 E 0.055 -145 L 0.069 -146 A 0.088 -147 K 0.103 -148 E 0.109 -149 V 0.111 -150 R 0.123 -151 K 0.149 -152 E 0.184 -153 K 0.221 -154 A 0.266 -155 L 0.316 -156 G 0.362 -157 I 0.391 -158 R 0.395 -159 K 0.378 -160 K 0.360 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000043017.10_ENSMUST00000144408.2_GN:Ptgir_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000043017.10_ENSMUST00000144408.2_GN:Ptgir_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 0dfd6d58373e0a6a75bd2f6d5c1fe61e4945d837..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000043017.10_ENSMUST00000144408.2_GN:Ptgir_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,416 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000043017.10|ENSMUST00000144408.2|GN:Ptgir|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.333 -2 M 0.355 -3 A 0.396 -4 S 0.449 -5 D 0.494 -6 G 0.517 -7 H 0.523 -8 P 0.524 -9 G 0.528 -10 P 0.538 -11 P 0.549 -12 S 0.553 -13 V 0.549 -14 T 0.551 -15 P 0.569 -16 G 0.596 -17 S 0.623 -18 P 0.641 -19 L 0.650 -20 S 0.653 -21 A 0.653 -22 G 0.642 -23 G 0.611 -24 R 0.561 -25 E 0.511 -26 W 0.478 -27 Q 0.461 -28 G 0.449 -29 M 0.429 -30 A 0.385 -31 G 0.312 -32 S 0.223 -33 C 0.146 -34 W 0.099 -35 N 0.081 -36 I 0.080 -37 T 0.087 -38 Y 0.096 -39 V 0.102 -40 Q 0.102 -41 D 0.096 -42 S 0.088 -43 V 0.079 -44 G 0.069 -45 P 0.058 -46 A 0.048 -47 T 0.043 -48 S 0.043 -49 T 0.041 -50 L 0.038 -51 M 0.037 -52 F 0.037 -53 V 0.038 -54 A 0.040 -55 G 0.039 -56 V 0.038 -57 V 0.040 -58 G 0.044 -59 N 0.048 -60 G 0.049 -61 L 0.048 -62 A 0.046 -63 L 0.047 -64 G 0.053 -65 I 0.060 -66 L 0.066 -67 G 0.073 -68 A 0.082 -69 R 0.094 -70 R 0.109 -71 R 0.130 -72 S 0.149 -73 H 0.155 -74 P 0.143 -75 S 0.119 -76 A 0.092 -77 F 0.067 -78 A 0.046 -79 V 0.036 -80 L 0.035 -81 V 0.041 -82 T 0.050 -83 G 0.054 -84 L 0.050 -85 A 0.043 -86 V 0.040 -87 T 0.040 -88 D 0.041 -89 L 0.039 -90 L 0.034 -91 G 0.028 -92 T 0.023 -93 C 0.021 -94 F 0.021 -95 L 0.023 -96 S 0.025 -97 P 0.025 -98 A 0.023 -99 V 0.021 -100 F 0.020 -101 V 0.021 -102 A 0.024 -103 Y 0.032 -104 A 0.043 -105 R 0.054 -106 N 0.063 -107 S 0.073 -108 S 0.084 -109 L 0.098 -110 L 0.112 -111 G 0.122 -112 L 0.128 -113 A 0.137 -114 H 0.153 -115 G 0.164 -116 G 0.151 -117 T 0.114 -118 M 0.074 -119 L 0.049 -120 C 0.037 -121 D 0.032 -122 T 0.031 -123 F 0.033 -124 A 0.037 -125 F 0.039 -126 A 0.036 -127 M 0.032 -128 T 0.028 -129 F 0.027 -130 F 0.028 -131 G 0.032 -132 L 0.036 -133 A 0.038 -134 S 0.038 -135 T 0.035 -136 L 0.033 -137 I 0.032 -138 L 0.030 -139 F 0.028 -140 A 0.028 -141 M 0.032 -142 A 0.037 -143 V 0.043 -144 E 0.047 -145 R 0.048 -146 C 0.047 -147 L 0.049 -148 A 0.056 -149 L 0.064 -150 S 0.065 -151 H 0.059 -152 P 0.050 -153 Y 0.044 -154 L 0.046 -155 Y 0.052 -156 A 0.061 -157 Q 0.070 -158 L 0.077 -159 D 0.075 -160 G 0.062 -161 P 0.046 -162 R 0.034 -163 C 0.031 -164 A 0.033 -165 R 0.037 -166 F 0.045 -167 A 0.055 -168 L 0.060 -169 P 0.059 -170 S 0.057 -171 I 0.057 -172 Y 0.054 -173 A 0.048 -174 F 0.044 -175 C 0.042 -176 C 0.041 -177 L 0.045 -178 F 0.054 -179 C 0.067 -180 S 0.079 -181 L 0.088 -182 P 0.095 -183 L 0.102 -184 L 0.113 -185 G 0.125 -186 L 0.135 -187 G 0.136 -188 E 0.128 -189 H 0.118 -190 Q 0.112 -191 Q 0.109 -192 Y 0.106 -193 C 0.103 -194 P 0.096 -195 G 0.081 -196 S 0.062 -197 W 0.049 -198 C 0.049 -199 F 0.062 -200 I 0.079 -201 R 0.095 -202 M 0.110 -203 R 0.132 -204 S 0.159 -205 A 0.183 -206 Q 0.197 -207 P 0.200 -208 G 0.188 -209 G 0.158 -210 C 0.119 -211 A 0.085 -212 F 0.064 -213 S 0.057 -214 L 0.058 -215 A 0.062 -216 Y 0.064 -217 A 0.064 -218 S 0.065 -219 L 0.067 -220 M 0.067 -221 A 0.061 -222 L 0.054 -223 L 0.051 -224 V 0.056 -225 T 0.063 -226 S 0.068 -227 I 0.063 -228 F 0.051 -229 F 0.042 -230 C 0.040 -231 N 0.044 -232 G 0.048 -233 S 0.053 -234 V 0.060 -235 T 0.069 -236 L 0.073 -237 S 0.069 -238 L 0.063 -239 Y 0.064 -240 H 0.068 -241 M 0.066 -242 Y 0.063 -243 R 0.068 -244 Q 0.084 -245 Q 0.105 -246 R 0.134 -247 R 0.174 -248 H 0.230 -249 H 0.289 -250 G 0.330 -251 S 0.347 -252 F 0.350 -253 V 0.351 -254 P 0.343 -255 T 0.315 -256 S 0.274 -257 R 0.234 -258 A 0.200 -259 R 0.165 -260 E 0.129 -261 D 0.099 -262 E 0.080 -263 V 0.069 -264 Y 0.058 -265 H 0.047 -266 L 0.041 -267 I 0.038 -268 L 0.036 -269 L 0.034 -270 A 0.031 -271 L 0.031 -272 M 0.033 -273 T 0.035 -274 V 0.037 -275 I 0.038 -276 M 0.035 -277 A 0.031 -278 V 0.027 -279 C 0.028 -280 S 0.031 -281 L 0.034 -282 P 0.034 -283 L 0.031 -284 M 0.027 -285 I 0.027 -286 R 0.028 -287 G 0.027 -288 F 0.025 -289 T 0.026 -290 Q 0.036 -291 A 0.058 -292 I 0.090 -293 A 0.124 -294 P 0.152 -295 D 0.174 -296 S 0.181 -297 R 0.165 -298 E 0.140 -299 M 0.121 -300 G 0.104 -301 D 0.081 -302 L 0.059 -303 L 0.048 -304 A 0.048 -305 F 0.052 -306 R 0.058 -307 F 0.066 -308 N 0.072 -309 A 0.076 -310 F 0.082 -311 N 0.086 -312 P 0.081 -313 I 0.068 -314 L 0.054 -315 D 0.044 -316 P 0.037 -317 W 0.034 -318 V 0.030 -319 F 0.025 -320 I 0.021 -321 L 0.019 -322 F 0.021 -323 R 0.025 -324 K 0.032 -325 A 0.042 -326 V 0.052 -327 F 0.063 -328 Q 0.075 -329 R 0.088 -330 L 0.095 -331 K 0.094 -332 F 0.086 -333 W 0.075 -334 L 0.067 -335 C 0.074 -336 C 0.106 -337 L 0.161 -338 C 0.228 -339 A 0.308 -340 R 0.406 -341 S 0.508 -342 V 0.585 -343 H 0.626 -344 G 0.641 -345 D 0.638 -346 L 0.625 -347 Q 0.615 -348 A 0.619 -349 P 0.631 -350 L 0.644 -351 S 0.656 -352 R 0.675 -353 P 0.703 -354 A 0.730 -355 S 0.749 -356 G 0.752 -357 R 0.736 -358 R 0.708 -359 D 0.685 -360 P 0.681 -361 P 0.699 -362 A 0.732 -363 P 0.765 -364 T 0.776 -365 S 0.744 -366 L 0.680 -367 Q 0.642 -368 A 0.671 -369 K 0.732 -370 E 0.770 -371 G 0.770 -372 S 0.749 -373 W 0.724 -374 V 0.710 -375 P 0.711 -376 L 0.722 -377 S 0.733 -378 S 0.738 -379 W 0.747 -380 G 0.766 -381 T 0.786 -382 G 0.794 -383 Q 0.790 -384 V 0.777 -385 A 0.768 -386 P 0.769 -387 L 0.776 -388 T 0.782 -389 A 0.785 -390 V 0.785 -391 P 0.787 -392 L 0.792 -393 T 0.797 -394 G 0.799 -395 G 0.799 -396 D 0.793 -397 G 0.782 -398 C 0.769 -399 S 0.761 -400 V 0.752 -401 G 0.731 -402 M 0.698 -403 P 0.659 -404 S 0.615 -405 K 0.572 -406 S 0.549 -407 E 0.544 -408 A 0.524 -409 I 0.475 -410 A 0.424 -411 A 0.396 -412 C 0.374 -413 S 0.337 -414 L 0.303 -415 C 0.285 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000043017.10_ENSMUST00000144408.2_GN:Ptgir_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000043017.10_ENSMUST00000144408.2_GN:Ptgir_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid deleted file mode 100644 index 66e0c967a75234c4f58db13e636b7cc028538690..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000043017.10_ENSMUST00000144408.2_GN:Ptgir_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid +++ /dev/null @@ -1,418 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000043017.10|ENSMUST00000144408.2|GN:Ptgir|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:2 -1 M 0.323 -2 K 0.344 -3 M 0.372 -4 M 0.391 -5 A 0.395 -6 S 0.408 -7 D 0.446 -8 G 0.488 -9 H 0.510 -10 P 0.518 -11 G 0.520 -12 P 0.509 -13 P 0.482 -14 S 0.466 -15 V 0.490 -16 T 0.539 -17 P 0.585 -18 G 0.620 -19 S 0.645 -20 P 0.662 -21 L 0.670 -22 S 0.671 -23 A 0.670 -24 G 0.658 -25 G 0.627 -26 R 0.578 -27 E 0.531 -28 W 0.498 -29 Q 0.480 -30 G 0.467 -31 M 0.443 -32 A 0.397 -33 G 0.320 -34 S 0.228 -35 C 0.149 -36 W 0.101 -37 N 0.084 -38 I 0.084 -39 T 0.090 -40 Y 0.098 -41 V 0.103 -42 Q 0.103 -43 D 0.097 -44 S 0.088 -45 V 0.079 -46 G 0.069 -47 P 0.058 -48 A 0.048 -49 T 0.043 -50 S 0.043 -51 T 0.041 -52 L 0.038 -53 M 0.036 -54 F 0.036 -55 V 0.038 -56 A 0.039 -57 G 0.039 -58 V 0.038 -59 V 0.040 -60 G 0.044 -61 N 0.048 -62 G 0.049 -63 L 0.048 -64 A 0.046 -65 L 0.047 -66 G 0.053 -67 I 0.060 -68 L 0.066 -69 G 0.073 -70 A 0.082 -71 R 0.094 -72 R 0.109 -73 R 0.129 -74 S 0.149 -75 H 0.155 -76 P 0.142 -77 S 0.119 -78 A 0.093 -79 F 0.067 -80 A 0.046 -81 V 0.036 -82 L 0.035 -83 V 0.041 -84 T 0.050 -85 G 0.054 -86 L 0.050 -87 A 0.043 -88 V 0.039 -89 T 0.040 -90 D 0.041 -91 L 0.039 -92 L 0.033 -93 G 0.027 -94 T 0.023 -95 C 0.021 -96 F 0.021 -97 L 0.023 -98 S 0.025 -99 P 0.025 -100 A 0.023 -101 V 0.021 -102 F 0.020 -103 V 0.021 -104 A 0.024 -105 Y 0.031 -106 A 0.042 -107 R 0.054 -108 N 0.063 -109 S 0.073 -110 S 0.084 -111 L 0.098 -112 L 0.112 -113 G 0.123 -114 L 0.129 -115 A 0.138 -116 H 0.155 -117 G 0.166 -118 G 0.153 -119 T 0.115 -120 M 0.075 -121 L 0.049 -122 C 0.037 -123 D 0.032 -124 T 0.031 -125 F 0.033 -126 A 0.037 -127 F 0.038 -128 A 0.036 -129 M 0.032 -130 T 0.028 -131 F 0.027 -132 F 0.028 -133 G 0.032 -134 L 0.036 -135 A 0.038 -136 S 0.038 -137 T 0.035 -138 L 0.033 -139 I 0.032 -140 L 0.030 -141 F 0.028 -142 A 0.028 -143 M 0.031 -144 A 0.037 -145 V 0.043 -146 E 0.047 -147 R 0.048 -148 C 0.047 -149 L 0.049 -150 A 0.056 -151 L 0.064 -152 S 0.065 -153 H 0.059 -154 P 0.050 -155 Y 0.045 -156 L 0.046 -157 Y 0.053 -158 A 0.062 -159 Q 0.071 -160 L 0.077 -161 D 0.075 -162 G 0.062 -163 P 0.046 -164 R 0.034 -165 C 0.031 -166 A 0.033 -167 R 0.037 -168 F 0.045 -169 A 0.055 -170 L 0.060 -171 P 0.059 -172 S 0.057 -173 I 0.056 -174 Y 0.053 -175 A 0.047 -176 F 0.043 -177 C 0.041 -178 C 0.041 -179 L 0.045 -180 F 0.054 -181 C 0.067 -182 S 0.079 -183 L 0.088 -184 P 0.095 -185 L 0.102 -186 L 0.113 -187 G 0.125 -188 L 0.135 -189 G 0.136 -190 E 0.128 -191 H 0.119 -192 Q 0.112 -193 Q 0.109 -194 Y 0.106 -195 C 0.103 -196 P 0.096 -197 G 0.081 -198 S 0.062 -199 W 0.049 -200 C 0.049 -201 F 0.062 -202 I 0.079 -203 R 0.095 -204 M 0.111 -205 R 0.133 -206 S 0.160 -207 A 0.184 -208 Q 0.198 -209 P 0.201 -210 G 0.188 -211 G 0.158 -212 C 0.118 -213 A 0.084 -214 F 0.064 -215 S 0.057 -216 L 0.058 -217 A 0.062 -218 Y 0.064 -219 A 0.064 -220 S 0.065 -221 L 0.067 -222 M 0.067 -223 A 0.061 -224 L 0.054 -225 L 0.051 -226 V 0.056 -227 T 0.063 -228 S 0.068 -229 I 0.063 -230 F 0.051 -231 F 0.042 -232 C 0.040 -233 N 0.044 -234 G 0.048 -235 S 0.053 -236 V 0.060 -237 T 0.068 -238 L 0.073 -239 S 0.068 -240 L 0.062 -241 Y 0.064 -242 H 0.068 -243 M 0.066 -244 Y 0.063 -245 R 0.069 -246 Q 0.085 -247 Q 0.108 -248 R 0.137 -249 R 0.177 -250 H 0.232 -251 H 0.290 -252 G 0.331 -253 S 0.347 -254 F 0.350 -255 V 0.351 -256 P 0.343 -257 T 0.316 -258 S 0.275 -259 R 0.234 -260 A 0.200 -261 R 0.166 -262 E 0.129 -263 D 0.099 -264 E 0.080 -265 V 0.069 -266 Y 0.058 -267 H 0.047 -268 L 0.041 -269 I 0.038 -270 L 0.036 -271 L 0.034 -272 A 0.031 -273 L 0.031 -274 M 0.033 -275 T 0.035 -276 V 0.037 -277 I 0.038 -278 M 0.035 -279 A 0.031 -280 V 0.027 -281 C 0.028 -282 S 0.031 -283 L 0.035 -284 P 0.034 -285 L 0.031 -286 M 0.028 -287 I 0.027 -288 R 0.028 -289 G 0.027 -290 F 0.025 -291 T 0.027 -292 Q 0.036 -293 A 0.058 -294 I 0.091 -295 A 0.125 -296 P 0.154 -297 D 0.176 -298 S 0.182 -299 R 0.167 -300 E 0.141 -301 M 0.122 -302 G 0.105 -303 D 0.082 -304 L 0.059 -305 L 0.049 -306 A 0.048 -307 F 0.052 -308 R 0.058 -309 F 0.066 -310 N 0.072 -311 A 0.076 -312 F 0.082 -313 N 0.087 -314 P 0.082 -315 I 0.068 -316 L 0.054 -317 D 0.044 -318 P 0.038 -319 W 0.034 -320 V 0.031 -321 F 0.025 -322 I 0.021 -323 L 0.019 -324 F 0.021 -325 R 0.025 -326 K 0.033 -327 A 0.042 -328 V 0.052 -329 F 0.063 -330 Q 0.075 -331 R 0.088 -332 L 0.096 -333 K 0.095 -334 F 0.086 -335 W 0.075 -336 L 0.067 -337 C 0.074 -338 C 0.107 -339 L 0.162 -340 C 0.230 -341 A 0.309 -342 R 0.407 -343 S 0.509 -344 V 0.586 -345 H 0.627 -346 G 0.641 -347 D 0.638 -348 L 0.625 -349 Q 0.615 -350 A 0.619 -351 P 0.633 -352 L 0.647 -353 S 0.660 -354 R 0.679 -355 P 0.706 -356 A 0.734 -357 S 0.753 -358 G 0.755 -359 R 0.737 -360 R 0.708 -361 D 0.685 -362 P 0.681 -363 P 0.699 -364 A 0.732 -365 P 0.765 -366 T 0.776 -367 S 0.744 -368 L 0.680 -369 Q 0.642 -370 A 0.671 -371 K 0.732 -372 E 0.769 -373 G 0.770 -374 S 0.748 -375 W 0.724 -376 V 0.710 -377 P 0.712 -378 L 0.723 -379 S 0.733 -380 S 0.739 -381 W 0.747 -382 G 0.766 -383 T 0.786 -384 G 0.795 -385 Q 0.790 -386 V 0.778 -387 A 0.769 -388 P 0.769 -389 L 0.776 -390 T 0.783 -391 A 0.785 -392 V 0.785 -393 P 0.788 -394 L 0.793 -395 T 0.798 -396 G 0.800 -397 G 0.799 -398 D 0.793 -399 G 0.782 -400 C 0.770 -401 S 0.762 -402 V 0.753 -403 G 0.732 -404 M 0.700 -405 P 0.662 -406 S 0.622 -407 K 0.584 -408 S 0.564 -409 E 0.562 -410 A 0.549 -411 I 0.511 -412 A 0.466 -413 A 0.430 -414 C 0.393 -415 S 0.346 -416 L 0.307 -417 C 0.289 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000043613.9_ENSMUST00000034497.9_GN:Mmp3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000043613.9_ENSMUST00000034497.9_GN:Mmp3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index c5121dca28a86ee4077c0f0b01ff5d3cd281548f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000043613.9_ENSMUST00000034497.9_GN:Mmp3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,478 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000043613.9|ENSMUST00000034497.9|GN:Mmp3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.379 -2 K 0.387 -3 G 0.400 -4 L 0.401 -5 P 0.370 -6 V 0.316 -7 L 0.282 -8 L 0.284 -9 W 0.293 -10 L 0.296 -11 C 0.306 -12 V 0.323 -13 V 0.337 -14 V 0.347 -15 C 0.356 -16 S 0.366 -17 S 0.388 -18 Y 0.424 -19 P 0.467 -20 L 0.497 -21 H 0.508 -22 D 0.504 -23 S 0.488 -24 A 0.459 -25 R 0.413 -26 D 0.356 -27 D 0.301 -28 D 0.255 -29 A 0.212 -30 G 0.162 -31 M 0.110 -32 E 0.072 -33 L 0.050 -34 L 0.039 -35 Q 0.033 -36 K 0.032 -37 Y 0.033 -38 L 0.034 -39 E 0.035 -40 N 0.039 -41 Y 0.055 -42 Y 0.089 -43 G 0.141 -44 L 0.200 -45 A 0.251 -46 K 0.280 -47 D 0.281 -48 V 0.264 -49 K 0.247 -50 Q 0.244 -51 F 0.251 -52 I 0.256 -53 K 0.253 -54 K 0.245 -55 K 0.227 -56 D 0.194 -57 S 0.148 -58 S 0.106 -59 L 0.079 -60 I 0.070 -61 V 0.073 -62 K 0.077 -63 K 0.075 -64 I 0.070 -65 Q 0.070 -66 E 0.072 -67 M 0.070 -68 Q 0.065 -69 K 0.064 -70 F 0.074 -71 L 0.094 -72 G 0.114 -73 L 0.125 -74 E 0.126 -75 M 0.123 -76 T 0.121 -77 G 0.122 -78 K 0.121 -79 L 0.106 -80 D 0.084 -81 S 0.067 -82 N 0.064 -83 T 0.069 -84 M 0.076 -85 E 0.085 -86 L 0.093 -87 M 0.094 -88 H 0.089 -89 K 0.085 -90 P 0.084 -91 R 0.086 -92 C 0.092 -93 G 0.105 -94 V 0.123 -95 P 0.143 -96 D 0.169 -97 V 0.201 -98 G 0.229 -99 G 0.243 -100 F 0.246 -101 S 0.245 -102 T 0.241 -103 F 0.228 -104 P 0.206 -105 G 0.177 -106 S 0.143 -107 P 0.105 -108 K 0.072 -109 W 0.051 -110 R 0.044 -111 K 0.044 -112 S 0.048 -113 H 0.051 -114 I 0.049 -115 T 0.046 -116 Y 0.048 -117 R 0.056 -118 I 0.067 -119 V 0.075 -120 N 0.076 -121 Y 0.074 -122 T 0.072 -123 P 0.075 -124 D 0.078 -125 L 0.076 -126 P 0.068 -127 R 0.061 -128 Q 0.061 -129 S 0.065 -130 V 0.072 -131 D 0.078 -132 S 0.080 -133 A 0.074 -134 I 0.063 -135 E 0.054 -136 K 0.052 -137 A 0.057 -138 L 0.064 -139 K 0.067 -140 V 0.060 -141 W 0.050 -142 E 0.045 -143 E 0.046 -144 V 0.048 -145 T 0.047 -146 P 0.043 -147 L 0.041 -148 T 0.038 -149 F 0.035 -150 S 0.032 -151 R 0.031 -152 I 0.035 -153 S 0.044 -154 E 0.053 -155 G 0.060 -156 E 0.063 -157 A 0.064 -158 D 0.063 -159 I 0.059 -160 M 0.053 -161 I 0.051 -162 S 0.058 -163 F 0.075 -164 A 0.095 -165 V 0.111 -166 G 0.117 -167 E 0.113 -168 H 0.105 -169 G 0.096 -170 D 0.091 -171 F 0.096 -172 V 0.108 -173 P 0.120 -174 F 0.127 -175 D 0.134 -176 G 0.144 -177 P 0.148 -178 G 0.142 -179 T 0.133 -180 V 0.128 -181 L 0.126 -182 A 0.123 -183 H 0.116 -184 A 0.107 -185 Y 0.097 -186 A 0.090 -187 P 0.091 -188 G 0.097 -189 P 0.108 -190 G 0.121 -191 I 0.135 -192 N 0.142 -193 G 0.140 -194 D 0.132 -195 A 0.127 -196 H 0.128 -197 F 0.138 -198 D 0.150 -199 D 0.152 -200 D 0.142 -201 E 0.127 -202 R 0.118 -203 W 0.118 -204 T 0.123 -205 E 0.129 -206 D 0.131 -207 V 0.132 -208 T 0.135 -209 G 0.140 -210 T 0.142 -211 N 0.138 -212 L 0.133 -213 F 0.138 -214 L 0.158 -215 V 0.185 -216 A 0.196 -217 A 0.182 -218 H 0.164 -219 E 0.158 -220 L 0.153 -221 G 0.133 -222 H 0.110 -223 S 0.101 -224 L 0.104 -225 G 0.107 -226 L 0.101 -227 Y 0.091 -228 H 0.086 -229 S 0.091 -230 A 0.104 -231 K 0.117 -232 A 0.128 -233 E 0.141 -234 A 0.153 -235 L 0.153 -236 M 0.136 -237 Y 0.109 -238 P 0.089 -239 V 0.082 -240 Y 0.084 -241 K 0.092 -242 S 0.109 -243 S 0.127 -244 T 0.135 -245 D 0.127 -246 L 0.112 -247 S 0.099 -248 R 0.091 -249 F 0.089 -250 H 0.094 -251 L 0.099 -252 S 0.096 -253 Q 0.086 -254 D 0.078 -255 D 0.077 -256 V 0.080 -257 D 0.081 -258 G 0.076 -259 I 0.067 -260 Q 0.063 -261 S 0.066 -262 L 0.074 -263 Y 0.088 -264 G 0.117 -265 T 0.170 -266 P 0.246 -267 T 0.338 -268 A 0.431 -269 S 0.509 -270 P 0.562 -271 D 0.590 -272 V 0.600 -273 L 0.598 -274 V 0.592 -275 V 0.593 -276 P 0.605 -277 T 0.620 -278 K 0.632 -279 S 0.637 -280 N 0.632 -281 S 0.613 -282 L 0.582 -283 E 0.541 -284 P 0.489 -285 E 0.432 -286 T 0.368 -287 S 0.298 -288 P 0.228 -289 M 0.171 -290 C 0.138 -291 S 0.122 -292 S 0.110 -293 T 0.096 -294 L 0.084 -295 F 0.077 -296 F 0.076 -297 D 0.076 -298 A 0.071 -299 V 0.061 -300 S 0.053 -301 T 0.054 -302 L 0.060 -303 R 0.062 -304 G 0.054 -305 E 0.039 -306 V 0.026 -307 L 0.023 -308 F 0.034 -309 F 0.052 -310 K 0.069 -311 D 0.077 -312 R 0.073 -313 H 0.061 -314 F 0.049 -315 W 0.042 -316 R 0.040 -317 K 0.046 -318 S 0.060 -319 L 0.080 -320 R 0.102 -321 T 0.123 -322 P 0.139 -323 E 0.143 -324 P 0.135 -325 E 0.119 -326 F 0.100 -327 Y 0.082 -328 L 0.066 -329 I 0.058 -330 S 0.061 -331 S 0.071 -332 F 0.079 -333 W 0.086 -334 P 0.091 -335 S 0.090 -336 L 0.083 -337 P 0.074 -338 S 0.068 -339 N 0.071 -340 M 0.082 -341 D 0.093 -342 A 0.094 -343 A 0.083 -344 Y 0.068 -345 E 0.062 -346 V 0.068 -347 T 0.078 -348 N 0.085 -349 R 0.081 -350 D 0.064 -351 T 0.042 -352 V 0.026 -353 F 0.024 -354 I 0.036 -355 F 0.058 -356 K 0.080 -357 G 0.094 -358 N 0.094 -359 Q 0.082 -360 F 0.066 -361 W 0.057 -362 A 0.058 -363 I 0.065 -364 R 0.073 -365 G 0.083 -366 H 0.095 -367 E 0.107 -368 E 0.116 -369 L 0.120 -370 A 0.116 -371 G 0.100 -372 Y 0.082 -373 P 0.069 -374 K 0.062 -375 S 0.060 -376 I 0.062 -377 H 0.072 -378 T 0.087 -379 L 0.100 -380 G 0.105 -381 L 0.102 -382 P 0.096 -383 A 0.089 -384 T 0.083 -385 V 0.078 -386 K 0.077 -387 K 0.085 -388 I 0.098 -389 D 0.106 -390 A 0.101 -391 A 0.084 -392 I 0.067 -393 S 0.060 -394 N 0.060 -395 K 0.062 -396 E 0.060 -397 K 0.053 -398 R 0.040 -399 K 0.026 -400 T 0.016 -401 Y 0.014 -402 F 0.022 -403 F 0.036 -404 V 0.051 -405 E 0.062 -406 D 0.065 -407 K 0.060 -408 Y 0.053 -409 W 0.049 -410 R 0.051 -411 F 0.056 -412 D 0.061 -413 E 0.064 -414 K 0.070 -415 K 0.076 -416 Q 0.084 -417 S 0.094 -418 M 0.104 -419 E 0.111 -420 P 0.109 -421 G 0.097 -422 F 0.081 -423 P 0.071 -424 R 0.066 -425 K 0.062 -426 I 0.059 -427 A 0.058 -428 E 0.059 -429 D 0.063 -430 F 0.074 -431 P 0.089 -432 G 0.098 -433 V 0.094 -434 D 0.085 -435 S 0.079 -436 R 0.084 -437 V 0.094 -438 D 0.099 -439 A 0.094 -440 V 0.081 -441 F 0.070 -442 E 0.067 -443 A 0.071 -444 F 0.074 -445 G 0.067 -446 F 0.050 -447 L 0.032 -448 Y 0.025 -449 F 0.036 -450 F 0.060 -451 S 0.085 -452 G 0.101 -453 S 0.102 -454 S 0.094 -455 Q 0.082 -456 L 0.074 -457 E 0.072 -458 F 0.075 -459 D 0.078 -460 P 0.081 -461 N 0.086 -462 A 0.094 -463 K 0.103 -464 K 0.106 -465 V 0.102 -466 T 0.099 -467 H 0.105 -468 I 0.116 -469 L 0.122 -470 K 0.119 -471 S 0.112 -472 N 0.105 -473 S 0.093 -474 W 0.081 -475 F 0.081 -476 N 0.099 -477 C 0.118 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000043613.9_ENSMUST00000034497.9_GN:Mmp3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000043613.9_ENSMUST00000034497.9_GN:Mmp3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid deleted file mode 100644 index 9fe13edf03f7158b98eb1e71077023120da67220..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000043613.9_ENSMUST00000034497.9_GN:Mmp3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:2.caid +++ /dev/null @@ -1,480 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000043613.9|ENSMUST00000034497.9|GN:Mmp3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:2 -1 M 0.363 -2 K 0.374 -3 M 0.395 -4 K 0.419 -5 G 0.439 -6 L 0.455 -7 P 0.465 -8 V 0.444 -9 L 0.379 -10 L 0.301 -11 W 0.260 -12 L 0.261 -13 C 0.277 -14 V 0.298 -15 V 0.330 -16 V 0.359 -17 C 0.369 -18 S 0.371 -19 S 0.387 -20 Y 0.423 -21 P 0.466 -22 L 0.500 -23 H 0.515 -24 D 0.512 -25 S 0.493 -26 A 0.461 -27 R 0.416 -28 D 0.361 -29 D 0.305 -30 D 0.258 -31 A 0.214 -32 G 0.163 -33 M 0.111 -34 E 0.072 -35 L 0.050 -36 L 0.038 -37 Q 0.033 -38 K 0.032 -39 Y 0.034 -40 L 0.035 -41 E 0.036 -42 N 0.040 -43 Y 0.055 -44 Y 0.090 -45 G 0.142 -46 L 0.201 -47 A 0.251 -48 K 0.280 -49 D 0.280 -50 V 0.262 -51 K 0.246 -52 Q 0.243 -53 F 0.250 -54 I 0.254 -55 K 0.252 -56 K 0.244 -57 K 0.227 -58 D 0.193 -59 S 0.148 -60 S 0.106 -61 L 0.079 -62 I 0.072 -63 V 0.077 -64 K 0.082 -65 K 0.079 -66 I 0.072 -67 Q 0.070 -68 E 0.071 -69 M 0.069 -70 Q 0.064 -71 K 0.063 -72 F 0.073 -73 L 0.093 -74 G 0.113 -75 L 0.124 -76 E 0.126 -77 M 0.122 -78 T 0.120 -79 G 0.122 -80 K 0.120 -81 L 0.106 -82 D 0.083 -83 S 0.067 -84 N 0.064 -85 T 0.070 -86 M 0.079 -87 E 0.089 -88 L 0.095 -89 M 0.095 -90 H 0.090 -91 K 0.085 -92 P 0.084 -93 R 0.085 -94 C 0.092 -95 G 0.105 -96 V 0.122 -97 P 0.143 -98 D 0.170 -99 V 0.201 -100 G 0.229 -101 G 0.244 -102 F 0.247 -103 S 0.246 -104 T 0.242 -105 F 0.229 -106 P 0.207 -107 G 0.178 -108 S 0.143 -109 P 0.105 -110 K 0.072 -111 W 0.051 -112 R 0.044 -113 K 0.044 -114 S 0.048 -115 H 0.051 -116 I 0.049 -117 T 0.046 -118 Y 0.048 -119 R 0.056 -120 I 0.067 -121 V 0.075 -122 N 0.076 -123 Y 0.074 -124 T 0.072 -125 P 0.075 -126 D 0.079 -127 L 0.076 -128 P 0.068 -129 R 0.061 -130 Q 0.060 -131 S 0.065 -132 V 0.072 -133 D 0.078 -134 S 0.081 -135 A 0.074 -136 I 0.063 -137 E 0.054 -138 K 0.052 -139 A 0.057 -140 L 0.065 -141 K 0.069 -142 V 0.062 -143 W 0.051 -144 E 0.045 -145 E 0.046 -146 V 0.048 -147 T 0.047 -148 P 0.044 -149 L 0.041 -150 T 0.038 -151 F 0.035 -152 S 0.032 -153 R 0.031 -154 I 0.035 -155 S 0.043 -156 E 0.053 -157 G 0.060 -158 E 0.063 -159 A 0.064 -160 D 0.063 -161 I 0.059 -162 M 0.053 -163 I 0.051 -164 S 0.058 -165 F 0.074 -166 A 0.094 -167 V 0.110 -168 G 0.116 -169 E 0.113 -170 H 0.105 -171 G 0.096 -172 D 0.091 -173 F 0.095 -174 V 0.107 -175 P 0.119 -176 F 0.126 -177 D 0.133 -178 G 0.143 -179 P 0.147 -180 G 0.141 -181 T 0.132 -182 V 0.128 -183 L 0.126 -184 A 0.123 -185 H 0.116 -186 A 0.107 -187 Y 0.097 -188 A 0.090 -189 P 0.090 -190 G 0.097 -191 P 0.107 -192 G 0.121 -193 I 0.135 -194 N 0.142 -195 G 0.139 -196 D 0.132 -197 A 0.126 -198 H 0.128 -199 F 0.138 -200 D 0.150 -201 D 0.152 -202 D 0.142 -203 E 0.127 -204 R 0.118 -205 W 0.118 -206 T 0.123 -207 E 0.129 -208 D 0.131 -209 V 0.132 -210 T 0.134 -211 G 0.140 -212 T 0.142 -213 N 0.138 -214 L 0.133 -215 F 0.138 -216 L 0.158 -217 V 0.184 -218 A 0.196 -219 A 0.182 -220 H 0.164 -221 E 0.157 -222 L 0.152 -223 G 0.133 -224 H 0.110 -225 S 0.101 -226 L 0.104 -227 G 0.106 -228 L 0.100 -229 Y 0.091 -230 H 0.086 -231 S 0.092 -232 A 0.104 -233 K 0.117 -234 A 0.128 -235 E 0.141 -236 A 0.152 -237 L 0.153 -238 M 0.135 -239 Y 0.108 -240 P 0.088 -241 V 0.081 -242 Y 0.083 -243 K 0.092 -244 S 0.108 -245 S 0.126 -246 T 0.135 -247 D 0.127 -248 L 0.112 -249 S 0.099 -250 R 0.091 -251 F 0.089 -252 H 0.094 -253 L 0.099 -254 S 0.096 -255 Q 0.086 -256 D 0.078 -257 D 0.077 -258 V 0.081 -259 D 0.083 -260 G 0.077 -261 I 0.068 -262 Q 0.063 -263 S 0.066 -264 L 0.073 -265 Y 0.088 -266 G 0.117 -267 T 0.170 -268 P 0.246 -269 T 0.338 -270 A 0.431 -271 S 0.509 -272 P 0.561 -273 D 0.590 -274 V 0.600 -275 L 0.597 -276 V 0.591 -277 V 0.593 -278 P 0.605 -279 T 0.620 -280 K 0.631 -281 S 0.636 -282 N 0.631 -283 S 0.612 -284 L 0.582 -285 E 0.540 -286 P 0.489 -287 E 0.431 -288 T 0.368 -289 S 0.298 -290 P 0.227 -291 M 0.171 -292 C 0.138 -293 S 0.121 -294 S 0.109 -295 T 0.096 -296 L 0.084 -297 F 0.077 -298 F 0.076 -299 D 0.076 -300 A 0.071 -301 V 0.061 -302 S 0.053 -303 T 0.054 -304 L 0.060 -305 R 0.062 -306 G 0.054 -307 E 0.039 -308 V 0.026 -309 L 0.023 -310 F 0.034 -311 F 0.052 -312 K 0.069 -313 D 0.077 -314 R 0.073 -315 H 0.061 -316 F 0.049 -317 W 0.042 -318 R 0.040 -319 K 0.046 -320 S 0.060 -321 L 0.080 -322 R 0.102 -323 T 0.123 -324 P 0.139 -325 E 0.143 -326 P 0.135 -327 E 0.119 -328 F 0.100 -329 Y 0.082 -330 L 0.066 -331 I 0.058 -332 S 0.061 -333 S 0.070 -334 F 0.079 -335 W 0.086 -336 P 0.090 -337 S 0.090 -338 L 0.083 -339 P 0.074 -340 S 0.068 -341 N 0.071 -342 M 0.082 -343 D 0.093 -344 A 0.094 -345 A 0.082 -346 Y 0.068 -347 E 0.062 -348 V 0.067 -349 T 0.078 -350 N 0.085 -351 R 0.081 -352 D 0.064 -353 T 0.042 -354 V 0.026 -355 F 0.024 -356 I 0.036 -357 F 0.058 -358 K 0.080 -359 G 0.093 -360 N 0.094 -361 Q 0.082 -362 F 0.066 -363 W 0.057 -364 A 0.058 -365 I 0.065 -366 R 0.073 -367 G 0.083 -368 H 0.095 -369 E 0.107 -370 E 0.116 -371 L 0.120 -372 A 0.115 -373 G 0.100 -374 Y 0.082 -375 P 0.068 -376 K 0.062 -377 S 0.060 -378 I 0.062 -379 H 0.072 -380 T 0.086 -381 L 0.099 -382 G 0.104 -383 L 0.102 -384 P 0.096 -385 A 0.089 -386 T 0.083 -387 V 0.078 -388 K 0.077 -389 K 0.085 -390 I 0.098 -391 D 0.106 -392 A 0.101 -393 A 0.084 -394 I 0.067 -395 S 0.059 -396 N 0.060 -397 K 0.062 -398 E 0.060 -399 K 0.053 -400 R 0.040 -401 K 0.026 -402 T 0.016 -403 Y 0.014 -404 F 0.022 -405 F 0.036 -406 V 0.051 -407 E 0.062 -408 D 0.065 -409 K 0.060 -410 Y 0.053 -411 W 0.049 -412 R 0.051 -413 F 0.056 -414 D 0.061 -415 E 0.066 -416 K 0.071 -417 K 0.078 -418 Q 0.085 -419 S 0.094 -420 M 0.104 -421 E 0.111 -422 P 0.109 -423 G 0.097 -424 F 0.081 -425 P 0.071 -426 R 0.066 -427 K 0.062 -428 I 0.059 -429 A 0.058 -430 E 0.058 -431 D 0.063 -432 F 0.074 -433 P 0.089 -434 G 0.098 -435 V 0.095 -436 D 0.085 -437 S 0.079 -438 R 0.084 -439 V 0.094 -440 D 0.099 -441 A 0.094 -442 V 0.081 -443 F 0.070 -444 E 0.067 -445 A 0.071 -446 F 0.074 -447 G 0.067 -448 F 0.050 -449 L 0.032 -450 Y 0.025 -451 F 0.036 -452 F 0.060 -453 S 0.085 -454 G 0.101 -455 S 0.102 -456 S 0.093 -457 Q 0.082 -458 L 0.074 -459 E 0.072 -460 F 0.076 -461 D 0.083 -462 P 0.090 -463 N 0.097 -464 A 0.103 -465 K 0.107 -466 K 0.107 -467 V 0.102 -468 T 0.099 -469 H 0.105 -470 I 0.116 -471 L 0.122 -472 K 0.119 -473 S 0.113 -474 N 0.106 -475 S 0.094 -476 W 0.081 -477 F 0.081 -478 N 0.099 -479 C 0.118 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000043787.9_ENSMUST00000062113.9_GN:Defb12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000043787.9_ENSMUST00000062113.9_GN:Defb12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 3923f8634b3559f133ae341e017270ce03f68d25..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000043787.9_ENSMUST00000062113.9_GN:Defb12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,79 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000043787.9|ENSMUST00000062113.9|GN:Defb12|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.379 -2 A 0.353 -3 L 0.312 -4 S 0.268 -5 R 0.227 -6 E 0.189 -7 V 0.158 -8 F 0.143 -9 Y 0.149 -10 F 0.171 -11 G 0.188 -12 F 0.184 -13 A 0.165 -14 L 0.145 -15 F 0.133 -16 F 0.137 -17 I 0.166 -18 V 0.218 -19 V 0.277 -20 E 0.336 -21 L 0.400 -22 P 0.479 -23 S 0.561 -24 G 0.619 -25 S 0.643 -26 W 0.653 -27 A 0.665 -28 G 0.675 -29 L 0.673 -30 E 0.663 -31 Y 0.656 -32 S 0.653 -33 Q 0.645 -34 S 0.631 -35 F 0.624 -36 P 0.628 -37 G 0.631 -38 G 0.610 -39 E 0.546 -40 I 0.447 -41 A 0.334 -42 V 0.232 -43 C 0.158 -44 E 0.114 -45 T 0.088 -46 C 0.075 -47 R 0.077 -48 L 0.091 -49 G 0.108 -50 R 0.116 -51 G 0.111 -52 K 0.100 -53 C 0.089 -54 R 0.081 -55 R 0.079 -56 T 0.085 -57 C 0.096 -58 I 0.104 -59 E 0.105 -60 S 0.101 -61 E 0.101 -62 K 0.106 -63 I 0.110 -64 A 0.106 -65 G 0.089 -66 W 0.067 -67 C 0.050 -68 K 0.045 -69 L 0.048 -70 N 0.051 -71 F 0.049 -72 F 0.045 -73 C 0.048 -74 C 0.065 -75 R 0.101 -76 E 0.152 -77 R 0.202 -78 I 0.232 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000043787.9_ENSMUST00000062113.9_GN:Defb12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000043787.9_ENSMUST00000062113.9_GN:Defb12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid deleted file mode 100644 index d5165c8dfc1058804249602cf69a61df06e3c5c3..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000043787.9_ENSMUST00000062113.9_GN:Defb12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:7.caid +++ /dev/null @@ -1,86 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000043787.9|ENSMUST00000062113.9|GN:Defb12|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:7 -1 M 0.491 -2 K 0.502 -3 N 0.526 -4 L 0.560 -5 P 0.593 -6 S 0.612 -7 N 0.606 -8 M 0.571 -9 A 0.508 -10 L 0.426 -11 S 0.341 -12 R 0.264 -13 E 0.205 -14 V 0.167 -15 F 0.147 -16 Y 0.145 -17 F 0.159 -18 G 0.175 -19 F 0.176 -20 A 0.164 -21 L 0.149 -22 F 0.141 -23 F 0.146 -24 I 0.175 -25 V 0.226 -26 V 0.285 -27 E 0.344 -28 L 0.409 -29 P 0.490 -30 S 0.575 -31 G 0.637 -32 S 0.666 -33 W 0.679 -34 A 0.692 -35 G 0.700 -36 L 0.697 -37 E 0.687 -38 Y 0.680 -39 S 0.676 -40 Q 0.665 -41 S 0.649 -42 F 0.639 -43 P 0.642 -44 G 0.645 -45 G 0.622 -46 E 0.558 -47 I 0.457 -48 A 0.342 -49 V 0.238 -50 C 0.163 -51 E 0.117 -52 T 0.089 -53 C 0.075 -54 R 0.076 -55 L 0.090 -56 G 0.107 -57 R 0.116 -58 G 0.111 -59 K 0.099 -60 C 0.088 -61 R 0.079 -62 R 0.077 -63 T 0.082 -64 C 0.093 -65 I 0.101 -66 E 0.101 -67 S 0.098 -68 E 0.099 -69 K 0.104 -70 I 0.109 -71 A 0.106 -72 G 0.090 -73 W 0.067 -74 C 0.050 -75 K 0.045 -76 L 0.048 -77 N 0.051 -78 F 0.048 -79 F 0.045 -80 C 0.048 -81 C 0.065 -82 R 0.101 -83 E 0.152 -84 R 0.203 -85 I 0.233 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044043.5_ENSMUST00000052387.5_GN:Pcdhb14_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044043.5_ENSMUST00000052387.5_GN:Pcdhb14_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 2636a61fda987fec05c39f06af001640ee6eba93..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044043.5_ENSMUST00000052387.5_GN:Pcdhb14_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,797 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000044043.5|ENSMUST00000052387.5|GN:Pcdhb14|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.322 -2 E 0.313 -3 T 0.307 -4 S 0.308 -5 L 0.302 -6 H 0.291 -7 K 0.301 -8 A 0.328 -9 P 0.335 -10 Q 0.319 -11 K 0.312 -12 R 0.317 -13 Q 0.307 -14 V 0.281 -15 T 0.256 -16 A 0.237 -17 I 0.218 -18 I 0.201 -19 F 0.190 -20 L 0.185 -21 L 0.186 -22 L 0.202 -23 L 0.234 -24 W 0.275 -25 E 0.321 -26 A 0.363 -27 G 0.384 -28 S 0.363 -29 A 0.299 -30 T 0.216 -31 I 0.142 -32 T 0.090 -33 Y 0.060 -34 S 0.046 -35 V 0.043 -36 L 0.049 -37 E 0.062 -38 E 0.075 -39 T 0.081 -40 D 0.078 -41 R 0.072 -42 G 0.069 -43 S 0.068 -44 L 0.067 -45 V 0.063 -46 G 0.058 -47 N 0.056 -48 L 0.058 -49 A 0.063 -50 K 0.072 -51 D 0.088 -52 L 0.109 -53 G 0.125 -54 L 0.125 -55 S 0.111 -56 L 0.094 -57 R 0.082 -58 E 0.077 -59 L 0.082 -60 I 0.093 -61 T 0.107 -62 R 0.114 -63 G 0.111 -64 A 0.098 -65 Q 0.085 -66 I 0.081 -67 L 0.087 -68 S 0.105 -69 K 0.132 -70 G 0.159 -71 N 0.173 -72 K 0.165 -73 Q 0.135 -74 L 0.101 -75 L 0.081 -76 Q 0.074 -77 L 0.072 -78 E 0.070 -79 Q 0.071 -80 K 0.080 -81 S 0.090 -82 G 0.092 -83 N 0.085 -84 L 0.079 -85 L 0.080 -86 L 0.088 -87 K 0.093 -88 E 0.090 -89 K 0.080 -90 L 0.068 -91 D 0.061 -92 R 0.063 -93 E 0.076 -94 E 0.091 -95 L 0.102 -96 C 0.111 -97 G 0.120 -98 S 0.121 -99 T 0.108 -100 N 0.089 -101 P 0.076 -102 C 0.074 -103 I 0.074 -104 L 0.071 -105 H 0.065 -106 F 0.058 -107 Q 0.054 -108 V 0.053 -109 L 0.053 -110 L 0.053 -111 K 0.053 -112 S 0.052 -113 P 0.055 -114 V 0.067 -115 Q 0.089 -116 F 0.115 -117 I 0.134 -118 Q 0.138 -119 G 0.132 -120 E 0.125 -121 I 0.129 -122 Q 0.147 -123 L 0.173 -124 Q 0.193 -125 D 0.198 -126 V 0.187 -127 N 0.170 -128 D 0.156 -129 H 0.151 -130 A 0.153 -131 P 0.161 -132 E 0.172 -133 F 0.181 -134 M 0.187 -135 E 0.187 -136 D 0.176 -137 E 0.150 -138 I 0.116 -139 L 0.086 -140 L 0.065 -141 K 0.052 -142 I 0.046 -143 L 0.049 -144 E 0.066 -145 S 0.089 -146 S 0.109 -147 L 0.115 -148 P 0.110 -149 G 0.103 -150 A 0.097 -151 V 0.094 -152 F 0.094 -153 P 0.095 -154 L 0.094 -155 K 0.091 -156 I 0.093 -157 A 0.105 -158 Q 0.123 -159 D 0.142 -160 L 0.161 -161 D 0.176 -162 V 0.181 -163 G 0.174 -164 S 0.162 -165 N 0.151 -166 T 0.141 -167 V 0.126 -168 Q 0.107 -169 N 0.095 -170 Y 0.093 -171 T 0.092 -172 I 0.087 -173 S 0.081 -174 T 0.078 -175 N 0.075 -176 A 0.066 -177 H 0.056 -178 F 0.049 -179 H 0.048 -180 L 0.055 -181 L 0.067 -182 T 0.081 -183 R 0.096 -184 N 0.111 -185 H 0.125 -186 S 0.132 -187 D 0.131 -188 G 0.123 -189 R 0.110 -190 K 0.093 -191 Y 0.076 -192 P 0.066 -193 E 0.065 -194 L 0.073 -195 V 0.086 -196 L 0.098 -197 D 0.102 -198 K 0.099 -199 A 0.091 -200 L 0.078 -201 D 0.065 -202 R 0.060 -203 E 0.064 -204 E 0.070 -205 Q 0.073 -206 A 0.073 -207 Q 0.073 -208 I 0.072 -209 R 0.068 -210 L 0.061 -211 T 0.052 -212 L 0.045 -213 T 0.042 -214 A 0.042 -215 M 0.044 -216 D 0.048 -217 S 0.051 -218 G 0.051 -219 S 0.049 -220 P 0.050 -221 P 0.056 -222 K 0.064 -223 T 0.072 -224 G 0.080 -225 T 0.087 -226 T 0.089 -227 Q 0.086 -228 V 0.082 -229 V 0.083 -230 I 0.091 -231 V 0.109 -232 V 0.133 -233 L 0.155 -234 D 0.166 -235 I 0.162 -236 N 0.148 -237 D 0.135 -238 N 0.125 -239 A 0.120 -240 P 0.118 -241 E 0.117 -242 F 0.113 -243 A 0.107 -244 Q 0.103 -245 G 0.097 -246 L 0.085 -247 Y 0.069 -248 E 0.054 -249 V 0.042 -250 Q 0.035 -251 V 0.033 -252 Q 0.038 -253 E 0.050 -254 N 0.067 -255 S 0.082 -256 P 0.091 -257 V 0.092 -258 G 0.090 -259 S 0.085 -260 L 0.078 -261 V 0.071 -262 L 0.070 -263 T 0.074 -264 V 0.082 -265 S 0.087 -266 A 0.090 -267 R 0.092 -268 D 0.099 -269 L 0.117 -270 D 0.137 -271 A 0.149 -272 G 0.154 -273 T 0.155 -274 H 0.153 -275 G 0.141 -276 E 0.118 -277 L 0.089 -278 S 0.067 -279 Y 0.060 -280 S 0.066 -281 L 0.080 -282 F 0.093 -283 Q 0.099 -284 S 0.094 -285 S 0.084 -286 N 0.072 -287 Q 0.064 -288 V 0.063 -289 L 0.062 -290 Q 0.056 -291 A 0.046 -292 F 0.042 -293 E 0.044 -294 V 0.049 -295 N 0.052 -296 T 0.055 -297 D 0.060 -298 T 0.066 -299 G 0.068 -300 E 0.065 -301 I 0.062 -302 R 0.065 -303 V 0.075 -304 R 0.087 -305 K 0.093 -306 L 0.089 -307 L 0.077 -308 D 0.064 -309 F 0.056 -310 E 0.057 -311 E 0.061 -312 I 0.062 -313 Q 0.061 -314 S 0.061 -315 Y 0.061 -316 R 0.057 -317 M 0.050 -318 E 0.045 -319 I 0.041 -320 E 0.038 -321 A 0.038 -322 S 0.045 -323 D 0.060 -324 G 0.081 -325 G 0.099 -326 G 0.105 -327 L 0.098 -328 S 0.085 -329 G 0.076 -330 K 0.076 -331 C 0.081 -332 T 0.086 -333 V 0.088 -334 V 0.091 -335 I 0.100 -336 H 0.119 -337 V 0.142 -338 M 0.161 -339 D 0.169 -340 V 0.167 -341 N 0.164 -342 D 0.164 -343 N 0.165 -344 A 0.163 -345 P 0.156 -346 E 0.146 -347 L 0.140 -348 T 0.144 -349 M 0.154 -350 S 0.158 -351 V 0.150 -352 L 0.130 -353 I 0.105 -354 S 0.083 -355 E 0.069 -356 I 0.064 -357 P 0.068 -358 E 0.081 -359 N 0.106 -360 S 0.133 -361 P 0.148 -362 E 0.144 -363 T 0.128 -364 I 0.110 -365 V 0.096 -366 A 0.087 -367 I 0.083 -368 F 0.085 -369 G 0.089 -370 I 0.095 -371 S 0.102 -372 D 0.115 -373 P 0.136 -374 D 0.158 -375 S 0.173 -376 G 0.178 -377 D 0.175 -378 N 0.166 -379 G 0.150 -380 K 0.127 -381 M 0.105 -382 V 0.091 -383 C 0.088 -384 S 0.095 -385 V 0.109 -386 Q 0.129 -387 D 0.142 -388 R 0.130 -389 L 0.098 -390 P 0.069 -391 F 0.061 -392 L 0.071 -393 L 0.085 -394 K 0.095 -395 P 0.102 -396 N 0.104 -397 E 0.100 -398 E 0.087 -399 N 0.067 -400 F 0.050 -401 Y 0.044 -402 T 0.046 -403 L 0.055 -404 V 0.067 -405 T 0.082 -406 E 0.096 -407 R 0.103 -408 A 0.100 -409 L 0.086 -410 D 0.070 -411 R 0.062 -412 E 0.063 -413 S 0.067 -414 R 0.068 -415 A 0.071 -416 E 0.076 -417 Y 0.078 -418 N 0.073 -419 I 0.063 -420 T 0.053 -421 I 0.045 -422 T 0.041 -423 V 0.041 -424 S 0.044 -425 D 0.052 -426 M 0.058 -427 G 0.058 -428 T 0.054 -429 P 0.053 -430 R 0.057 -431 L 0.061 -432 T 0.063 -433 T 0.069 -434 Q 0.079 -435 H 0.090 -436 T 0.095 -437 I 0.093 -438 T 0.089 -439 V 0.094 -440 Q 0.114 -441 V 0.144 -442 S 0.171 -443 D 0.184 -444 I 0.178 -445 N 0.163 -446 D 0.150 -447 N 0.142 -448 A 0.135 -449 P 0.128 -450 A 0.119 -451 F 0.108 -452 T 0.098 -453 H 0.095 -454 T 0.097 -455 S 0.096 -456 Y 0.087 -457 T 0.073 -458 M 0.060 -459 F 0.051 -460 V 0.049 -461 R 0.057 -462 E 0.073 -463 N 0.097 -464 N 0.122 -465 S 0.137 -466 P 0.139 -467 A 0.130 -468 L 0.118 -469 H 0.108 -470 I 0.103 -471 G 0.103 -472 T 0.105 -473 I 0.109 -474 S 0.113 -475 A 0.117 -476 T 0.121 -477 D 0.129 -478 S 0.144 -479 D 0.163 -480 S 0.178 -481 G 0.188 -482 S 0.192 -483 N 0.188 -484 A 0.175 -485 H 0.152 -486 I 0.125 -487 T 0.099 -488 Y 0.086 -489 S 0.093 -490 L 0.122 -491 L 0.168 -492 P 0.213 -493 P 0.237 -494 H 0.234 -495 D 0.218 -496 P 0.201 -497 Q 0.188 -498 L 0.174 -499 A 0.159 -500 L 0.139 -501 N 0.117 -502 S 0.098 -503 L 0.084 -504 I 0.078 -505 S 0.079 -506 I 0.083 -507 N 0.086 -508 A 0.085 -509 D 0.084 -510 N 0.086 -511 G 0.089 -512 Q 0.087 -513 L 0.085 -514 F 0.089 -515 A 0.102 -516 L 0.116 -517 R 0.123 -518 A 0.119 -519 L 0.105 -520 D 0.088 -521 Y 0.081 -522 E 0.087 -523 A 0.093 -524 L 0.090 -525 Q 0.082 -526 A 0.076 -527 F 0.070 -528 E 0.059 -529 F 0.050 -530 H 0.048 -531 V 0.052 -532 G 0.058 -533 A 0.065 -534 T 0.075 -535 D 0.086 -536 G 0.094 -537 G 0.091 -538 S 0.082 -539 P 0.080 -540 A 0.089 -541 L 0.098 -542 S 0.103 -543 S 0.103 -544 Q 0.103 -545 A 0.104 -546 L 0.104 -547 V 0.103 -548 R 0.104 -549 V 0.116 -550 V 0.142 -551 V 0.176 -552 L 0.205 -553 D 0.221 -554 D 0.219 -555 N 0.205 -556 D 0.186 -557 N 0.168 -558 A 0.150 -559 P 0.131 -560 F 0.115 -561 V 0.107 -562 L 0.115 -563 Y 0.153 -564 P 0.235 -565 M 0.341 -566 Q 0.420 -567 N 0.441 -568 A 0.413 -569 S 0.366 -570 A 0.323 -571 P 0.285 -572 C 0.244 -573 T 0.202 -574 E 0.165 -575 L 0.137 -576 L 0.122 -577 P 0.122 -578 R 0.130 -579 A 0.141 -580 A 0.153 -581 E 0.162 -582 P 0.160 -583 G 0.146 -584 Y 0.126 -585 L 0.113 -586 V 0.108 -587 T 0.107 -588 K 0.107 -589 V 0.109 -590 V 0.119 -591 A 0.139 -592 V 0.159 -593 D 0.173 -594 R 0.185 -595 D 0.195 -596 S 0.201 -597 G 0.201 -598 Q 0.195 -599 N 0.181 -600 A 0.155 -601 W 0.123 -602 L 0.097 -603 S 0.085 -604 F 0.087 -605 Q 0.095 -606 L 0.097 -607 L 0.091 -608 K 0.084 -609 T 0.084 -610 T 0.096 -611 E 0.116 -612 P 0.131 -613 G 0.125 -614 L 0.104 -615 F 0.085 -616 S 0.078 -617 V 0.080 -618 W 0.082 -619 A 0.081 -620 H 0.079 -621 N 0.079 -622 G 0.078 -623 E 0.075 -624 V 0.072 -625 R 0.077 -626 T 0.089 -627 T 0.105 -628 R 0.117 -629 L 0.125 -630 L 0.130 -631 S 0.136 -632 E 0.145 -633 R 0.153 -634 D 0.151 -635 V 0.140 -636 P 0.126 -637 K 0.117 -638 H 0.110 -639 R 0.099 -640 L 0.087 -641 L 0.077 -642 L 0.072 -643 L 0.072 -644 V 0.076 -645 K 0.079 -646 D 0.083 -647 N 0.086 -648 G 0.084 -649 E 0.079 -650 P 0.076 -651 P 0.079 -652 H 0.084 -653 S 0.089 -654 A 0.096 -655 S 0.102 -656 V 0.101 -657 T 0.092 -658 L 0.081 -659 H 0.078 -660 V 0.082 -661 L 0.096 -662 L 0.126 -663 V 0.174 -664 D 0.242 -665 G 0.323 -666 F 0.405 -667 S 0.476 -668 Q 0.532 -669 P 0.577 -670 Y 0.611 -671 L 0.637 -672 P 0.654 -673 L 0.647 -674 P 0.615 -675 E 0.597 -676 V 0.619 -677 A 0.651 -678 R 0.664 -679 D 0.665 -680 P 0.660 -681 A 0.645 -682 Q 0.622 -683 E 0.589 -684 D 0.541 -685 V 0.474 -686 L 0.399 -687 T 0.333 -688 L 0.295 -689 Y 0.297 -690 L 0.333 -691 V 0.386 -692 I 0.446 -693 A 0.505 -694 L 0.553 -695 A 0.580 -696 S 0.582 -697 V 0.566 -698 S 0.538 -699 S 0.495 -700 L 0.436 -701 F 0.384 -702 L 0.355 -703 V 0.332 -704 S 0.297 -705 V 0.267 -706 L 0.255 -707 L 0.247 -708 F 0.238 -709 V 0.235 -710 G 0.235 -711 V 0.230 -712 R 0.229 -713 L 0.249 -714 C 0.285 -715 R 0.333 -716 K 0.397 -717 A 0.466 -718 G 0.518 -719 E 0.548 -720 T 0.575 -721 S 0.610 -722 L 0.648 -723 G 0.676 -724 G 0.692 -725 C 0.695 -726 S 0.692 -727 V 0.696 -728 P 0.708 -729 E 0.717 -730 G 0.715 -731 H 0.709 -732 F 0.715 -733 P 0.740 -734 G 0.771 -735 H 0.793 -736 L 0.801 -737 V 0.798 -738 D 0.791 -739 V 0.783 -740 S 0.777 -741 G 0.777 -742 T 0.782 -743 G 0.788 -744 T 0.790 -745 L 0.785 -746 S 0.777 -747 Q 0.768 -748 S 0.758 -749 Y 0.753 -750 Q 0.758 -751 Y 0.774 -752 E 0.791 -753 V 0.799 -754 C 0.798 -755 L 0.793 -756 T 0.786 -757 G 0.782 -758 G 0.786 -759 T 0.796 -760 G 0.801 -761 T 0.797 -762 N 0.782 -763 E 0.760 -764 F 0.741 -765 K 0.730 -766 F 0.723 -767 L 0.716 -768 K 0.707 -769 P 0.700 -770 V 0.700 -771 L 0.708 -772 P 0.722 -773 N 0.734 -774 F 0.741 -775 L 0.744 -776 N 0.744 -777 E 0.742 -778 G 0.742 -779 G 0.746 -780 Y 0.752 -781 R 0.755 -782 N 0.750 -783 T 0.735 -784 E 0.723 -785 E 0.724 -786 N 0.729 -787 S 0.732 -788 N 0.733 -789 F 0.735 -790 R 0.738 -791 D 0.739 -792 S 0.730 -793 L 0.707 -794 G 0.674 -795 F 0.643 -796 S 0.623 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044043.5_ENSMUST00000052387.5_GN:Pcdhb14_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044043.5_ENSMUST00000052387.5_GN:Pcdhb14_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid deleted file mode 100644 index 01d5c51de49baebf8db2b3add26fd504e1aa16cb..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044043.5_ENSMUST00000052387.5_GN:Pcdhb14_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid +++ /dev/null @@ -1,809 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000044043.5|ENSMUST00000052387.5|GN:Pcdhb14|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:12 -1 M 0.230 -2 I 0.230 -3 I 0.236 -4 C 0.250 -5 C 0.262 -6 I 0.262 -7 F 0.262 -8 W 0.279 -9 S 0.309 -10 R 0.338 -11 G 0.356 -12 T 0.354 -13 M 0.328 -14 E 0.301 -15 T 0.307 -16 S 0.340 -17 L 0.358 -18 H 0.356 -19 K 0.365 -20 A 0.383 -21 P 0.379 -22 Q 0.360 -23 K 0.353 -24 R 0.354 -25 Q 0.337 -26 V 0.309 -27 T 0.292 -28 A 0.287 -29 I 0.275 -30 I 0.252 -31 F 0.229 -32 L 0.215 -33 L 0.210 -34 L 0.219 -35 L 0.243 -36 W 0.277 -37 E 0.317 -38 A 0.355 -39 G 0.375 -40 S 0.355 -41 A 0.293 -42 T 0.213 -43 I 0.140 -44 T 0.089 -45 Y 0.060 -46 S 0.047 -47 V 0.044 -48 L 0.050 -49 E 0.063 -50 E 0.076 -51 T 0.082 -52 D 0.079 -53 R 0.072 -54 G 0.069 -55 S 0.068 -56 L 0.066 -57 V 0.061 -58 G 0.056 -59 N 0.055 -60 L 0.058 -61 A 0.063 -62 K 0.071 -63 D 0.086 -64 L 0.106 -65 G 0.122 -66 L 0.122 -67 S 0.108 -68 L 0.092 -69 R 0.080 -70 E 0.076 -71 L 0.080 -72 I 0.090 -73 T 0.103 -74 R 0.111 -75 G 0.108 -76 A 0.095 -77 Q 0.082 -78 I 0.078 -79 L 0.084 -80 S 0.101 -81 K 0.126 -82 G 0.152 -83 N 0.167 -84 K 0.158 -85 Q 0.129 -86 L 0.097 -87 L 0.078 -88 Q 0.072 -89 L 0.070 -90 E 0.068 -91 Q 0.069 -92 K 0.077 -93 S 0.088 -94 G 0.091 -95 N 0.084 -96 L 0.077 -97 L 0.078 -98 L 0.086 -99 K 0.091 -100 E 0.087 -101 K 0.078 -102 L 0.067 -103 D 0.059 -104 R 0.061 -105 E 0.073 -106 E 0.088 -107 L 0.099 -108 C 0.107 -109 G 0.116 -110 S 0.117 -111 T 0.105 -112 N 0.087 -113 P 0.076 -114 C 0.074 -115 I 0.075 -116 L 0.072 -117 H 0.065 -118 F 0.058 -119 Q 0.054 -120 V 0.053 -121 L 0.053 -122 L 0.053 -123 K 0.053 -124 S 0.052 -125 P 0.055 -126 V 0.067 -127 Q 0.089 -128 F 0.114 -129 I 0.133 -130 Q 0.137 -131 G 0.130 -132 E 0.124 -133 I 0.129 -134 Q 0.147 -135 L 0.172 -136 Q 0.192 -137 D 0.198 -138 V 0.187 -139 N 0.171 -140 D 0.157 -141 H 0.152 -142 A 0.154 -143 P 0.162 -144 E 0.173 -145 F 0.182 -146 M 0.187 -147 E 0.188 -148 D 0.177 -149 E 0.151 -150 I 0.116 -151 L 0.085 -152 L 0.064 -153 K 0.051 -154 I 0.045 -155 L 0.048 -156 E 0.064 -157 S 0.088 -158 S 0.107 -159 L 0.113 -160 P 0.108 -161 G 0.101 -162 A 0.096 -163 V 0.093 -164 F 0.092 -165 P 0.093 -166 L 0.092 -167 K 0.089 -168 I 0.091 -169 A 0.104 -170 Q 0.122 -171 D 0.141 -172 L 0.160 -173 D 0.175 -174 V 0.180 -175 G 0.174 -176 S 0.162 -177 N 0.150 -178 T 0.139 -179 V 0.124 -180 Q 0.105 -181 N 0.093 -182 Y 0.090 -183 T 0.090 -184 I 0.085 -185 S 0.079 -186 T 0.077 -187 N 0.073 -188 A 0.065 -189 H 0.054 -190 F 0.048 -191 H 0.047 -192 L 0.054 -193 L 0.065 -194 T 0.079 -195 R 0.093 -196 N 0.108 -197 H 0.122 -198 S 0.129 -199 D 0.127 -200 G 0.120 -201 R 0.108 -202 K 0.091 -203 Y 0.075 -204 P 0.065 -205 E 0.064 -206 L 0.072 -207 V 0.085 -208 L 0.096 -209 D 0.100 -210 K 0.097 -211 A 0.089 -212 L 0.076 -213 D 0.064 -214 R 0.058 -215 E 0.062 -216 E 0.069 -217 Q 0.072 -218 A 0.071 -219 Q 0.070 -220 I 0.069 -221 R 0.066 -222 L 0.060 -223 T 0.051 -224 L 0.044 -225 T 0.041 -226 A 0.041 -227 M 0.043 -228 D 0.046 -229 S 0.050 -230 G 0.050 -231 S 0.048 -232 P 0.049 -233 P 0.055 -234 K 0.063 -235 T 0.071 -236 G 0.078 -237 T 0.085 -238 T 0.087 -239 Q 0.084 -240 V 0.081 -241 V 0.081 -242 I 0.089 -243 V 0.107 -244 V 0.131 -245 L 0.153 -246 D 0.164 -247 I 0.160 -248 N 0.147 -249 D 0.133 -250 N 0.124 -251 A 0.119 -252 P 0.118 -253 E 0.118 -254 F 0.114 -255 A 0.108 -256 Q 0.103 -257 G 0.097 -258 L 0.086 -259 Y 0.069 -260 E 0.054 -261 V 0.042 -262 Q 0.035 -263 V 0.033 -264 Q 0.038 -265 E 0.050 -266 N 0.067 -267 S 0.083 -268 P 0.092 -269 V 0.093 -270 G 0.091 -271 S 0.086 -272 L 0.078 -273 V 0.071 -274 L 0.069 -275 T 0.074 -276 V 0.081 -277 S 0.087 -278 A 0.090 -279 R 0.092 -280 D 0.100 -281 L 0.118 -282 D 0.138 -283 A 0.150 -284 G 0.155 -285 T 0.156 -286 H 0.153 -287 G 0.142 -288 E 0.119 -289 L 0.090 -290 S 0.068 -291 Y 0.061 -292 S 0.068 -293 L 0.082 -294 F 0.095 -295 Q 0.100 -296 S 0.095 -297 S 0.084 -298 N 0.073 -299 Q 0.065 -300 V 0.063 -301 L 0.062 -302 Q 0.056 -303 A 0.047 -304 F 0.042 -305 E 0.045 -306 V 0.049 -307 N 0.053 -308 T 0.056 -309 D 0.061 -310 T 0.067 -311 G 0.069 -312 E 0.066 -313 I 0.063 -314 R 0.065 -315 V 0.076 -316 R 0.088 -317 K 0.094 -318 L 0.090 -319 L 0.078 -320 D 0.064 -321 F 0.057 -322 E 0.059 -323 E 0.063 -324 I 0.063 -325 Q 0.062 -326 S 0.062 -327 Y 0.061 -328 R 0.057 -329 M 0.050 -330 E 0.045 -331 I 0.041 -332 E 0.038 -333 A 0.039 -334 S 0.045 -335 D 0.060 -336 G 0.081 -337 G 0.100 -338 G 0.106 -339 L 0.099 -340 S 0.085 -341 G 0.077 -342 K 0.077 -343 C 0.082 -344 T 0.086 -345 V 0.088 -346 V 0.091 -347 I 0.101 -348 H 0.119 -349 V 0.143 -350 M 0.162 -351 D 0.169 -352 V 0.168 -353 N 0.165 -354 D 0.165 -355 N 0.166 -356 A 0.164 -357 P 0.158 -358 E 0.148 -359 L 0.142 -360 T 0.146 -361 M 0.155 -362 S 0.160 -363 V 0.151 -364 L 0.131 -365 I 0.106 -366 S 0.084 -367 E 0.070 -368 I 0.065 -369 P 0.068 -370 E 0.081 -371 N 0.106 -372 S 0.134 -373 P 0.149 -374 E 0.145 -375 T 0.129 -376 I 0.111 -377 V 0.097 -378 A 0.088 -379 I 0.084 -380 F 0.086 -381 G 0.090 -382 I 0.095 -383 S 0.102 -384 D 0.116 -385 P 0.137 -386 D 0.159 -387 S 0.173 -388 G 0.177 -389 D 0.174 -390 N 0.165 -391 G 0.149 -392 K 0.127 -393 M 0.105 -394 V 0.091 -395 C 0.088 -396 S 0.095 -397 V 0.109 -398 Q 0.128 -399 D 0.141 -400 R 0.130 -401 L 0.097 -402 P 0.069 -403 F 0.061 -404 L 0.071 -405 L 0.085 -406 K 0.096 -407 P 0.102 -408 N 0.105 -409 E 0.101 -410 E 0.087 -411 N 0.068 -412 F 0.051 -413 Y 0.044 -414 T 0.047 -415 L 0.055 -416 V 0.067 -417 T 0.082 -418 E 0.096 -419 R 0.103 -420 A 0.100 -421 L 0.086 -422 D 0.070 -423 R 0.062 -424 E 0.063 -425 S 0.067 -426 R 0.069 -427 A 0.071 -428 E 0.076 -429 Y 0.078 -430 N 0.073 -431 I 0.064 -432 T 0.053 -433 I 0.046 -434 T 0.042 -435 V 0.041 -436 S 0.045 -437 D 0.052 -438 M 0.059 -439 G 0.059 -440 T 0.055 -441 P 0.054 -442 R 0.057 -443 L 0.061 -444 T 0.064 -445 T 0.069 -446 Q 0.080 -447 H 0.090 -448 T 0.095 -449 I 0.093 -450 T 0.089 -451 V 0.094 -452 Q 0.115 -453 V 0.145 -454 S 0.172 -455 D 0.184 -456 I 0.179 -457 N 0.164 -458 D 0.151 -459 N 0.143 -460 A 0.136 -461 P 0.128 -462 A 0.120 -463 F 0.109 -464 T 0.099 -465 H 0.095 -466 T 0.097 -467 S 0.096 -468 Y 0.087 -469 T 0.073 -470 M 0.060 -471 F 0.051 -472 V 0.049 -473 R 0.057 -474 E 0.074 -475 N 0.098 -476 N 0.123 -477 S 0.139 -478 P 0.141 -479 A 0.132 -480 L 0.119 -481 H 0.109 -482 I 0.105 -483 G 0.105 -484 T 0.107 -485 I 0.110 -486 S 0.114 -487 A 0.118 -488 T 0.122 -489 D 0.130 -490 S 0.145 -491 D 0.164 -492 S 0.179 -493 G 0.189 -494 S 0.193 -495 N 0.190 -496 A 0.176 -497 H 0.154 -498 I 0.126 -499 T 0.100 -500 Y 0.086 -501 S 0.093 -502 L 0.122 -503 L 0.168 -504 P 0.213 -505 P 0.237 -506 H 0.235 -507 D 0.219 -508 P 0.203 -509 Q 0.189 -510 L 0.176 -511 A 0.160 -512 L 0.139 -513 N 0.118 -514 S 0.098 -515 L 0.084 -516 I 0.078 -517 S 0.079 -518 I 0.084 -519 N 0.086 -520 A 0.085 -521 D 0.084 -522 N 0.086 -523 G 0.089 -524 Q 0.088 -525 L 0.085 -526 F 0.089 -527 A 0.102 -528 L 0.116 -529 R 0.122 -530 A 0.118 -531 L 0.104 -532 D 0.088 -533 Y 0.081 -534 E 0.086 -535 A 0.092 -536 L 0.089 -537 Q 0.081 -538 A 0.075 -539 F 0.069 -540 E 0.059 -541 F 0.050 -542 H 0.048 -543 V 0.052 -544 G 0.059 -545 A 0.066 -546 T 0.075 -547 D 0.086 -548 G 0.093 -549 G 0.090 -550 S 0.081 -551 P 0.080 -552 A 0.088 -553 L 0.098 -554 S 0.103 -555 S 0.104 -556 Q 0.104 -557 A 0.105 -558 L 0.105 -559 V 0.104 -560 R 0.105 -561 V 0.116 -562 V 0.142 -563 V 0.176 -564 L 0.205 -565 D 0.221 -566 D 0.219 -567 N 0.205 -568 D 0.186 -569 N 0.168 -570 A 0.150 -571 P 0.131 -572 F 0.115 -573 V 0.107 -574 L 0.115 -575 Y 0.153 -576 P 0.235 -577 M 0.340 -578 Q 0.420 -579 N 0.441 -580 A 0.413 -581 S 0.367 -582 A 0.324 -583 P 0.286 -584 C 0.245 -585 T 0.203 -586 E 0.165 -587 L 0.136 -588 L 0.122 -589 P 0.122 -590 R 0.130 -591 A 0.141 -592 A 0.153 -593 E 0.162 -594 P 0.161 -595 G 0.146 -596 Y 0.127 -597 L 0.114 -598 V 0.108 -599 T 0.107 -600 K 0.107 -601 V 0.109 -602 V 0.120 -603 A 0.139 -604 V 0.159 -605 D 0.174 -606 R 0.185 -607 D 0.196 -608 S 0.201 -609 G 0.201 -610 Q 0.196 -611 N 0.182 -612 A 0.156 -613 W 0.124 -614 L 0.098 -615 S 0.085 -616 F 0.087 -617 Q 0.095 -618 L 0.097 -619 L 0.091 -620 K 0.084 -621 T 0.084 -622 T 0.096 -623 E 0.117 -624 P 0.131 -625 G 0.126 -626 L 0.104 -627 F 0.085 -628 S 0.079 -629 V 0.081 -630 W 0.083 -631 A 0.082 -632 H 0.080 -633 N 0.079 -634 G 0.078 -635 E 0.075 -636 V 0.073 -637 R 0.077 -638 T 0.090 -639 T 0.106 -640 R 0.118 -641 L 0.125 -642 L 0.130 -643 S 0.137 -644 E 0.146 -645 R 0.153 -646 D 0.152 -647 V 0.140 -648 P 0.126 -649 K 0.117 -650 H 0.110 -651 R 0.100 -652 L 0.088 -653 L 0.077 -654 L 0.072 -655 L 0.073 -656 V 0.076 -657 K 0.080 -658 D 0.083 -659 N 0.086 -660 G 0.085 -661 E 0.079 -662 P 0.076 -663 P 0.078 -664 H 0.084 -665 S 0.089 -666 A 0.096 -667 S 0.102 -668 V 0.102 -669 T 0.092 -670 L 0.082 -671 H 0.078 -672 V 0.082 -673 L 0.096 -674 L 0.126 -675 V 0.175 -676 D 0.243 -677 G 0.325 -678 F 0.408 -679 S 0.478 -680 Q 0.535 -681 P 0.579 -682 Y 0.613 -683 L 0.638 -684 P 0.655 -685 L 0.647 -686 P 0.615 -687 E 0.597 -688 V 0.619 -689 A 0.651 -690 R 0.664 -691 D 0.664 -692 P 0.659 -693 A 0.644 -694 Q 0.621 -695 E 0.589 -696 D 0.541 -697 V 0.474 -698 L 0.399 -699 T 0.333 -700 L 0.295 -701 Y 0.297 -702 L 0.333 -703 V 0.386 -704 I 0.445 -705 A 0.505 -706 L 0.553 -707 A 0.579 -708 S 0.581 -709 V 0.564 -710 S 0.536 -711 S 0.494 -712 L 0.436 -713 F 0.383 -714 L 0.354 -715 V 0.331 -716 S 0.296 -717 V 0.267 -718 L 0.254 -719 L 0.246 -720 F 0.237 -721 V 0.233 -722 G 0.233 -723 V 0.228 -724 R 0.228 -725 L 0.246 -726 C 0.282 -727 R 0.330 -728 K 0.393 -729 A 0.460 -730 G 0.509 -731 E 0.537 -732 T 0.566 -733 S 0.606 -734 L 0.646 -735 G 0.675 -736 G 0.691 -737 C 0.694 -738 S 0.691 -739 V 0.696 -740 P 0.708 -741 E 0.717 -742 G 0.715 -743 H 0.708 -744 F 0.714 -745 P 0.739 -746 G 0.771 -747 H 0.793 -748 L 0.801 -749 V 0.798 -750 D 0.791 -751 V 0.783 -752 S 0.778 -753 G 0.777 -754 T 0.783 -755 G 0.789 -756 T 0.790 -757 L 0.785 -758 S 0.777 -759 Q 0.768 -760 S 0.758 -761 Y 0.753 -762 Q 0.758 -763 Y 0.774 -764 E 0.791 -765 V 0.799 -766 C 0.798 -767 L 0.792 -768 T 0.786 -769 G 0.782 -770 G 0.786 -771 T 0.795 -772 G 0.800 -773 T 0.796 -774 N 0.780 -775 E 0.758 -776 F 0.739 -777 K 0.728 -778 F 0.722 -779 L 0.715 -780 K 0.706 -781 P 0.698 -782 V 0.698 -783 L 0.706 -784 P 0.721 -785 N 0.733 -786 F 0.740 -787 L 0.743 -788 N 0.743 -789 E 0.741 -790 G 0.741 -791 G 0.745 -792 Y 0.751 -793 R 0.754 -794 N 0.748 -795 T 0.732 -796 E 0.720 -797 E 0.721 -798 N 0.728 -799 S 0.731 -800 N 0.733 -801 F 0.735 -802 R 0.739 -803 D 0.740 -804 S 0.730 -805 L 0.706 -806 G 0.673 -807 F 0.640 -808 S 0.619 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044217.19_ENSMUST00000169082.3_GN:Aqp5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044217.19_ENSMUST00000169082.3_GN:Aqp5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 6ca52f0b63ddd16da9b8240779fdf2f09b537b2d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044217.19_ENSMUST00000169082.3_GN:Aqp5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,266 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000044217.19|ENSMUST00000169082.3|GN:Aqp5|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.201 -2 K 0.176 -3 K 0.140 -4 E 0.108 -5 V 0.086 -6 C 0.071 -7 S 0.061 -8 V 0.056 -9 A 0.053 -10 F 0.047 -11 F 0.038 -12 K 0.033 -13 A 0.034 -14 V 0.036 -15 F 0.037 -16 A 0.040 -17 E 0.044 -18 F 0.046 -19 L 0.044 -20 A 0.044 -21 T 0.045 -22 L 0.043 -23 I 0.037 -24 F 0.030 -25 V 0.027 -26 F 0.029 -27 F 0.035 -28 G 0.047 -29 L 0.064 -30 G 0.083 -31 S 0.100 -32 A 0.116 -33 L 0.136 -34 K 0.158 -35 W 0.171 -36 P 0.171 -37 S 0.165 -38 A 0.159 -39 L 0.149 -40 P 0.128 -41 T 0.104 -42 I 0.085 -43 L 0.078 -44 Q 0.079 -45 I 0.081 -46 S 0.080 -47 I 0.080 -48 A 0.085 -49 F 0.093 -50 G 0.098 -51 L 0.102 -52 A 0.105 -53 I 0.100 -54 G 0.091 -55 T 0.088 -56 L 0.092 -57 A 0.093 -58 Q 0.087 -59 A 0.080 -60 L 0.079 -61 G 0.083 -62 P 0.097 -63 V 0.118 -64 S 0.137 -65 G 0.143 -66 G 0.136 -67 H 0.125 -68 I 0.113 -69 N 0.099 -70 P 0.085 -71 A 0.074 -72 I 0.070 -73 T 0.072 -74 L 0.078 -75 A 0.081 -76 L 0.083 -77 L 0.087 -78 I 0.096 -79 G 0.102 -80 N 0.096 -81 Q 0.081 -82 I 0.064 -83 S 0.050 -84 L 0.042 -85 L 0.041 -86 R 0.048 -87 A 0.052 -88 I 0.050 -89 F 0.049 -90 Y 0.059 -91 V 0.075 -92 A 0.085 -93 A 0.083 -94 Q 0.076 -95 L 0.071 -96 V 0.068 -97 G 0.064 -98 A 0.061 -99 I 0.060 -100 A 0.060 -101 G 0.062 -102 A 0.064 -103 G 0.066 -104 I 0.067 -105 L 0.066 -106 Y 0.061 -107 W 0.060 -108 L 0.070 -109 A 0.090 -110 P 0.108 -111 G 0.118 -112 N 0.117 -113 A 0.110 -114 R 0.109 -115 G 0.118 -116 N 0.129 -117 L 0.137 -118 A 0.147 -119 V 0.162 -120 N 0.177 -121 A 0.181 -122 L 0.173 -123 S 0.158 -124 N 0.141 -125 N 0.125 -126 T 0.108 -127 T 0.088 -128 P 0.069 -129 G 0.055 -130 K 0.053 -131 A 0.058 -132 V 0.064 -133 V 0.070 -134 V 0.075 -135 E 0.078 -136 L 0.071 -137 I 0.059 -138 L 0.048 -139 T 0.045 -140 F 0.046 -141 Q 0.050 -142 L 0.051 -143 A 0.049 -144 L 0.047 -145 C 0.045 -146 I 0.046 -147 F 0.052 -148 S 0.064 -149 S 0.078 -150 T 0.086 -151 D 0.089 -152 S 0.091 -153 R 0.095 -154 R 0.102 -155 T 0.110 -156 S 0.117 -157 P 0.121 -158 V 0.122 -159 G 0.117 -160 S 0.103 -161 P 0.085 -162 A 0.068 -163 L 0.059 -164 S 0.062 -165 I 0.072 -166 G 0.081 -167 L 0.087 -168 S 0.088 -169 V 0.086 -170 T 0.083 -171 L 0.083 -172 G 0.082 -173 H 0.077 -174 L 0.072 -175 V 0.071 -176 G 0.075 -177 I 0.079 -178 Y 0.084 -179 F 0.090 -180 T 0.097 -181 G 0.107 -182 C 0.122 -183 S 0.135 -184 M 0.138 -185 N 0.134 -186 P 0.126 -187 A 0.116 -188 R 0.103 -189 S 0.091 -190 F 0.084 -191 G 0.085 -192 P 0.088 -193 A 0.090 -194 V 0.089 -195 V 0.088 -196 M 0.090 -197 N 0.095 -198 R 0.105 -199 F 0.114 -200 S 0.115 -201 P 0.109 -202 S 0.098 -203 H 0.082 -204 W 0.066 -205 V 0.055 -206 F 0.048 -207 W 0.047 -208 V 0.052 -209 G 0.059 -210 P 0.062 -211 I 0.060 -212 V 0.057 -213 G 0.055 -214 A 0.052 -215 V 0.049 -216 L 0.047 -217 A 0.046 -218 A 0.042 -219 I 0.038 -220 L 0.038 -221 Y 0.039 -222 F 0.039 -223 Y 0.040 -224 L 0.045 -225 L 0.058 -226 F 0.083 -227 P 0.117 -228 S 0.148 -229 S 0.162 -230 L 0.155 -231 S 0.140 -232 L 0.129 -233 H 0.122 -234 D 0.114 -235 R 0.109 -236 V 0.111 -237 A 0.123 -238 V 0.141 -239 V 0.167 -240 K 0.205 -241 G 0.247 -242 T 0.281 -243 Y 0.307 -244 E 0.331 -245 P 0.356 -246 E 0.374 -247 E 0.371 -248 D 0.346 -249 W 0.311 -250 E 0.281 -251 D 0.258 -252 H 0.234 -253 R 0.209 -254 E 0.192 -255 E 0.188 -256 R 0.190 -257 K 0.200 -258 K 0.223 -259 T 0.253 -260 I 0.272 -261 E 0.283 -262 L 0.304 -263 T 0.329 -264 A 0.338 -265 H 0.333 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044217.19_ENSMUST00000169082.3_GN:Aqp5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:126.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044217.19_ENSMUST00000169082.3_GN:Aqp5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:126.caid deleted file mode 100644 index 58d9be8c395adede45f2cf3848712b55c992b7cf..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044217.19_ENSMUST00000169082.3_GN:Aqp5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:126.caid +++ /dev/null @@ -1,392 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000044217.19|ENSMUST00000169082.3|GN:Aqp5|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:126 -1 M 0.398 -2 R 0.422 -3 A 0.451 -4 T 0.462 -5 Q 0.451 -6 T 0.449 -7 A 0.487 -8 G 0.549 -9 P 0.592 -10 V 0.605 -11 Y 0.599 -12 T 0.584 -13 A 0.556 -14 A 0.509 -15 W 0.457 -16 V 0.422 -17 T 0.422 -18 W 0.459 -19 P 0.522 -20 G 0.592 -21 R 0.650 -22 V 0.692 -23 R 0.727 -24 R 0.754 -25 C 0.772 -26 A 0.775 -27 A 0.770 -28 G 0.764 -29 G 0.765 -30 P 0.775 -31 G 0.789 -32 V 0.801 -33 R 0.806 -34 G 0.807 -35 A 0.807 -36 G 0.805 -37 G 0.798 -38 C 0.780 -39 E 0.749 -40 R 0.707 -41 A 0.651 -42 P 0.594 -43 A 0.571 -44 R 0.603 -45 L 0.658 -46 A 0.698 -47 P 0.718 -48 C 0.719 -49 A 0.700 -50 L 0.671 -51 R 0.654 -52 W 0.664 -53 P 0.698 -54 L 0.741 -55 G 0.777 -56 A 0.793 -57 G 0.791 -58 A 0.778 -59 A 0.764 -60 P 0.756 -61 G 0.759 -62 P 0.773 -63 P 0.790 -64 A 0.796 -65 L 0.786 -66 C 0.767 -67 P 0.757 -68 P 0.760 -69 R 0.772 -70 G 0.778 -71 A 0.774 -72 R 0.770 -73 P 0.772 -74 L 0.775 -75 Y 0.770 -76 S 0.756 -77 A 0.739 -78 P 0.728 -79 L 0.726 -80 P 0.735 -81 G 0.750 -82 P 0.765 -83 R 0.773 -84 Q 0.772 -85 A 0.758 -86 A 0.720 -87 C 0.664 -88 H 0.633 -89 G 0.650 -90 V 0.665 -91 G 0.641 -92 T 0.621 -93 A 0.651 -94 R 0.703 -95 R 0.733 -96 A 0.740 -97 E 0.745 -98 P 0.752 -99 R 0.755 -100 R 0.749 -101 Q 0.740 -102 T 0.737 -103 P 0.742 -104 A 0.740 -105 A 0.706 -106 A 0.642 -107 S 0.598 -108 A 0.612 -109 A 0.660 -110 P 0.696 -111 T 0.705 -112 A 0.696 -113 A 0.678 -114 P 0.664 -115 R 0.658 -116 R 0.654 -117 S 0.646 -118 R 0.633 -119 C 0.618 -120 H 0.595 -121 R 0.569 -122 A 0.554 -123 P 0.548 -124 K 0.530 -125 A 0.476 -126 T 0.392 -127 M 0.303 -128 K 0.232 -129 K 0.177 -130 E 0.133 -131 V 0.098 -132 C 0.075 -133 S 0.062 -134 V 0.055 -135 A 0.052 -136 F 0.046 -137 F 0.038 -138 K 0.034 -139 A 0.035 -140 V 0.037 -141 F 0.038 -142 A 0.040 -143 E 0.043 -144 F 0.044 -145 L 0.042 -146 A 0.040 -147 T 0.041 -148 L 0.039 -149 I 0.033 -150 F 0.026 -151 V 0.023 -152 F 0.024 -153 F 0.030 -154 G 0.040 -155 L 0.055 -156 G 0.073 -157 S 0.089 -158 A 0.102 -159 L 0.118 -160 K 0.135 -161 W 0.146 -162 P 0.146 -163 S 0.144 -164 A 0.145 -165 L 0.141 -166 P 0.124 -167 T 0.101 -168 I 0.083 -169 L 0.075 -170 Q 0.076 -171 I 0.078 -172 S 0.078 -173 I 0.078 -174 A 0.083 -175 F 0.091 -176 G 0.097 -177 L 0.100 -178 A 0.102 -179 I 0.097 -180 G 0.089 -181 T 0.086 -182 L 0.090 -183 A 0.090 -184 Q 0.083 -185 A 0.076 -186 L 0.074 -187 G 0.080 -188 P 0.094 -189 V 0.118 -190 S 0.140 -191 G 0.148 -192 G 0.141 -193 H 0.129 -194 I 0.115 -195 N 0.099 -196 P 0.084 -197 A 0.074 -198 I 0.070 -199 T 0.073 -200 L 0.079 -201 A 0.081 -202 L 0.081 -203 L 0.084 -204 I 0.091 -205 G 0.096 -206 N 0.091 -207 Q 0.077 -208 I 0.061 -209 S 0.048 -210 L 0.040 -211 L 0.039 -212 R 0.046 -213 A 0.050 -214 I 0.047 -215 F 0.045 -216 Y 0.048 -217 V 0.055 -218 A 0.059 -219 A 0.061 -220 Q 0.064 -221 L 0.066 -222 V 0.066 -223 G 0.063 -224 A 0.061 -225 I 0.060 -226 A 0.061 -227 G 0.063 -228 A 0.065 -229 G 0.067 -230 I 0.068 -231 L 0.066 -232 Y 0.060 -233 W 0.058 -234 L 0.067 -235 A 0.086 -236 P 0.103 -237 G 0.111 -238 N 0.109 -239 A 0.104 -240 R 0.106 -241 G 0.117 -242 N 0.130 -243 L 0.137 -244 A 0.147 -245 V 0.163 -246 N 0.179 -247 A 0.185 -248 L 0.177 -249 S 0.161 -250 N 0.143 -251 N 0.126 -252 T 0.109 -253 T 0.090 -254 P 0.071 -255 G 0.058 -256 K 0.056 -257 A 0.062 -258 V 0.069 -259 V 0.075 -260 V 0.080 -261 E 0.081 -262 L 0.074 -263 I 0.061 -264 L 0.051 -265 T 0.047 -266 F 0.048 -267 Q 0.052 -268 L 0.053 -269 A 0.052 -270 L 0.049 -271 C 0.047 -272 I 0.047 -273 F 0.054 -274 S 0.067 -275 S 0.081 -276 T 0.090 -277 D 0.093 -278 S 0.095 -279 R 0.099 -280 R 0.107 -281 T 0.116 -282 S 0.124 -283 P 0.128 -284 V 0.129 -285 G 0.122 -286 S 0.106 -287 P 0.086 -288 A 0.068 -289 L 0.060 -290 S 0.064 -291 I 0.074 -292 G 0.084 -293 L 0.089 -294 S 0.091 -295 V 0.089 -296 T 0.088 -297 L 0.088 -298 G 0.087 -299 H 0.082 -300 L 0.077 -301 V 0.078 -302 G 0.082 -303 I 0.085 -304 Y 0.089 -305 F 0.094 -306 T 0.102 -307 G 0.114 -308 C 0.130 -309 S 0.142 -310 M 0.144 -311 N 0.138 -312 P 0.129 -313 A 0.119 -314 R 0.106 -315 S 0.094 -316 F 0.087 -317 G 0.087 -318 P 0.091 -319 A 0.092 -320 V 0.091 -321 V 0.092 -322 M 0.095 -323 N 0.103 -324 R 0.114 -325 F 0.123 -326 S 0.124 -327 P 0.118 -328 S 0.107 -329 H 0.091 -330 W 0.073 -331 V 0.061 -332 F 0.053 -333 W 0.051 -334 V 0.055 -335 G 0.062 -336 P 0.065 -337 I 0.063 -338 V 0.059 -339 G 0.057 -340 A 0.055 -341 V 0.052 -342 L 0.050 -343 A 0.048 -344 A 0.044 -345 I 0.040 -346 L 0.040 -347 Y 0.040 -348 F 0.040 -349 Y 0.042 -350 L 0.047 -351 L 0.060 -352 F 0.085 -353 P 0.120 -354 S 0.151 -355 S 0.165 -356 L 0.156 -357 S 0.140 -358 L 0.129 -359 H 0.122 -360 D 0.113 -361 R 0.107 -362 V 0.111 -363 A 0.121 -364 V 0.135 -365 V 0.157 -366 K 0.192 -367 G 0.232 -368 T 0.269 -369 Y 0.302 -370 E 0.337 -371 P 0.374 -372 E 0.402 -373 E 0.406 -374 D 0.380 -375 W 0.342 -376 E 0.310 -377 D 0.287 -378 H 0.263 -379 R 0.238 -380 E 0.224 -381 E 0.224 -382 R 0.231 -383 K 0.245 -384 K 0.281 -385 T 0.330 -386 I 0.366 -387 E 0.384 -388 L 0.398 -389 T 0.407 -390 A 0.398 -391 H 0.382 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044254.7_ENSMUST00000049507.6_GN:Pcsk9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044254.7_ENSMUST00000049507.6_GN:Pcsk9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 5b7b851b34e1656d554d1b38ce062fef37733502..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044254.7_ENSMUST00000049507.6_GN:Pcsk9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,695 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000044254.7|ENSMUST00000049507.6|GN:Pcsk9|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.317 -2 G 0.311 -3 T 0.308 -4 H 0.312 -5 C 0.305 -6 S 0.287 -7 A 0.284 -8 W 0.299 -9 L 0.312 -10 R 0.324 -11 W 0.349 -12 P 0.374 -13 L 0.381 -14 L 0.374 -15 P 0.360 -16 L 0.341 -17 L 0.319 -18 P 0.301 -19 P 0.278 -20 L 0.244 -21 L 0.210 -22 L 0.192 -23 L 0.187 -24 L 0.186 -25 L 0.195 -26 L 0.225 -27 L 0.276 -28 C 0.335 -29 P 0.398 -30 T 0.476 -31 G 0.560 -32 A 0.622 -33 G 0.647 -34 A 0.643 -35 Q 0.630 -36 D 0.620 -37 E 0.609 -38 D 0.595 -39 G 0.574 -40 D 0.539 -41 Y 0.492 -42 E 0.451 -43 E 0.435 -44 L 0.445 -45 M 0.467 -46 L 0.485 -47 A 0.496 -48 L 0.503 -49 P 0.511 -50 S 0.526 -51 Q 0.554 -52 E 0.591 -53 D 0.628 -54 G 0.656 -55 L 0.666 -56 A 0.660 -57 D 0.648 -58 E 0.639 -59 A 0.638 -60 A 0.644 -61 H 0.649 -62 V 0.634 -63 A 0.583 -64 T 0.487 -65 A 0.364 -66 T 0.250 -67 F 0.176 -68 R 0.146 -69 R 0.143 -70 C 0.150 -71 S 0.153 -72 K 0.147 -73 E 0.137 -74 A 0.126 -75 W 0.115 -76 R 0.104 -77 L 0.091 -78 P 0.073 -79 G 0.053 -80 T 0.036 -81 Y 0.027 -82 I 0.025 -83 V 0.031 -84 V 0.042 -85 L 0.054 -86 M 0.066 -87 E 0.073 -88 E 0.075 -89 T 0.070 -90 Q 0.065 -91 R 0.065 -92 L 0.065 -93 Q 0.060 -94 I 0.056 -95 E 0.060 -96 Q 0.063 -97 T 0.058 -98 A 0.048 -99 H 0.042 -100 R 0.044 -101 L 0.052 -102 Q 0.065 -103 T 0.075 -104 R 0.078 -105 A 0.076 -106 A 0.074 -107 R 0.075 -108 R 0.079 -109 G 0.083 -110 Y 0.079 -111 V 0.068 -112 I 0.056 -113 K 0.051 -114 V 0.050 -115 L 0.052 -116 H 0.055 -117 I 0.060 -118 F 0.063 -119 Y 0.066 -120 D 0.066 -121 L 0.061 -122 F 0.051 -123 P 0.041 -124 G 0.033 -125 F 0.029 -126 L 0.027 -127 V 0.027 -128 K 0.027 -129 M 0.028 -130 S 0.029 -131 S 0.031 -132 D 0.034 -133 L 0.035 -134 L 0.035 -135 G 0.036 -136 L 0.041 -137 A 0.047 -138 L 0.052 -139 K 0.053 -140 L 0.053 -141 P 0.050 -142 H 0.045 -143 V 0.043 -144 E 0.045 -145 Y 0.053 -146 I 0.068 -147 E 0.087 -148 E 0.108 -149 D 0.129 -150 S 0.148 -151 F 0.162 -152 V 0.169 -153 F 0.171 -154 A 0.178 -155 Q 0.190 -156 S 0.196 -157 I 0.183 -158 P 0.151 -159 W 0.118 -160 N 0.102 -161 L 0.102 -162 E 0.103 -163 R 0.106 -164 I 0.113 -165 I 0.123 -166 P 0.139 -167 A 0.166 -168 W 0.206 -169 H 0.252 -170 Q 0.294 -171 T 0.330 -172 E 0.360 -173 E 0.384 -174 D 0.400 -175 R 0.407 -176 S 0.410 -177 P 0.413 -178 D 0.411 -179 G 0.392 -180 S 0.342 -181 S 0.266 -182 Q 0.190 -183 V 0.134 -184 E 0.103 -185 V 0.087 -186 Y 0.077 -187 L 0.071 -188 L 0.068 -189 D 0.073 -190 T 0.089 -191 S 0.107 -192 I 0.115 -193 Q 0.113 -194 G 0.109 -195 A 0.103 -196 H 0.095 -197 R 0.088 -198 E 0.085 -199 I 0.084 -200 E 0.084 -201 G 0.086 -202 R 0.088 -203 V 0.091 -204 T 0.092 -205 I 0.095 -206 T 0.100 -207 D 0.113 -208 F 0.145 -209 N 0.194 -210 S 0.246 -211 V 0.284 -212 P 0.304 -213 E 0.313 -214 E 0.322 -215 D 0.332 -216 G 0.340 -217 T 0.350 -218 R 0.366 -219 F 0.386 -220 H 0.402 -221 R 0.409 -222 Q 0.399 -223 A 0.365 -224 S 0.310 -225 K 0.248 -226 C 0.193 -227 D 0.153 -228 S 0.131 -229 H 0.127 -230 G 0.136 -231 T 0.154 -232 H 0.169 -233 L 0.171 -234 A 0.156 -235 G 0.138 -236 V 0.128 -237 V 0.124 -238 S 0.125 -239 G 0.129 -240 R 0.132 -241 D 0.130 -242 A 0.124 -243 G 0.116 -244 V 0.112 -245 A 0.112 -246 K 0.119 -247 G 0.128 -248 T 0.133 -249 S 0.131 -250 L 0.126 -251 H 0.119 -252 S 0.111 -253 L 0.102 -254 R 0.097 -255 V 0.094 -256 L 0.089 -257 N 0.085 -258 C 0.085 -259 Q 0.089 -260 G 0.091 -261 K 0.088 -262 G 0.079 -263 T 0.065 -264 V 0.052 -265 S 0.047 -266 G 0.048 -267 T 0.051 -268 L 0.051 -269 I 0.048 -270 G 0.045 -271 L 0.042 -272 E 0.037 -273 F 0.034 -274 I 0.034 -275 R 0.034 -276 K 0.035 -277 S 0.037 -278 Q 0.042 -279 L 0.052 -280 I 0.068 -281 Q 0.086 -282 P 0.100 -283 S 0.104 -284 G 0.100 -285 P 0.088 -286 L 0.075 -287 V 0.064 -288 V 0.053 -289 L 0.046 -290 L 0.045 -291 P 0.052 -292 L 0.066 -293 A 0.086 -294 G 0.111 -295 G 0.129 -296 Y 0.127 -297 S 0.104 -298 R 0.078 -299 I 0.065 -300 L 0.068 -301 N 0.077 -302 A 0.079 -303 A 0.072 -304 C 0.059 -305 R 0.048 -306 H 0.041 -307 L 0.036 -308 A 0.034 -309 R 0.034 -310 T 0.038 -311 G 0.043 -312 V 0.047 -313 V 0.046 -314 L 0.044 -315 V 0.045 -316 A 0.053 -317 A 0.066 -318 A 0.081 -319 G 0.092 -320 N 0.097 -321 F 0.096 -322 R 0.092 -323 D 0.091 -324 D 0.090 -325 A 0.082 -326 C 0.068 -327 L 0.053 -328 Y 0.044 -329 S 0.042 -330 P 0.049 -331 A 0.065 -332 S 0.084 -333 A 0.094 -334 P 0.091 -335 E 0.081 -336 V 0.070 -337 I 0.060 -338 T 0.052 -339 V 0.047 -340 G 0.046 -341 A 0.049 -342 T 0.056 -343 N 0.070 -344 A 0.090 -345 Q 0.108 -346 D 0.122 -347 Q 0.136 -348 P 0.151 -349 V 0.169 -350 T 0.189 -351 L 0.204 -352 G 0.200 -353 T 0.177 -354 L 0.144 -355 G 0.119 -356 T 0.109 -357 N 0.115 -358 F 0.123 -359 G 0.124 -360 R 0.121 -361 C 0.118 -362 V 0.116 -363 D 0.111 -364 L 0.103 -365 F 0.095 -366 A 0.094 -367 P 0.111 -368 G 0.140 -369 K 0.168 -370 D 0.181 -371 I 0.183 -372 I 0.185 -373 G 0.189 -374 A 0.191 -375 S 0.188 -376 S 0.185 -377 D 0.185 -378 C 0.183 -379 S 0.182 -380 T 0.183 -381 C 0.187 -382 F 0.185 -383 M 0.174 -384 S 0.157 -385 Q 0.147 -386 S 0.150 -387 G 0.169 -388 T 0.206 -389 S 0.252 -390 Q 0.280 -391 A 0.268 -392 A 0.227 -393 A 0.183 -394 H 0.148 -395 V 0.121 -396 A 0.098 -397 G 0.080 -398 I 0.070 -399 V 0.064 -400 A 0.059 -401 R 0.052 -402 M 0.048 -403 L 0.047 -404 S 0.047 -405 R 0.047 -406 E 0.048 -407 P 0.047 -408 T 0.045 -409 L 0.043 -410 T 0.042 -411 L 0.041 -412 A 0.040 -413 E 0.041 -414 L 0.048 -415 R 0.059 -416 Q 0.065 -417 R 0.063 -418 L 0.055 -419 I 0.047 -420 H 0.041 -421 F 0.043 -422 S 0.052 -423 T 0.065 -424 K 0.077 -425 D 0.086 -426 V 0.088 -427 I 0.089 -428 N 0.099 -429 M 0.118 -430 A 0.143 -431 W 0.172 -432 F 0.203 -433 P 0.226 -434 E 0.233 -435 D 0.228 -436 Q 0.218 -437 Q 0.210 -438 V 0.206 -439 L 0.206 -440 T 0.205 -441 P 0.193 -442 N 0.170 -443 L 0.139 -444 V 0.109 -445 A 0.093 -446 T 0.109 -447 L 0.165 -448 P 0.247 -449 P 0.329 -450 S 0.392 -451 T 0.431 -452 H 0.449 -453 E 0.455 -454 T 0.455 -455 G 0.436 -456 G 0.381 -457 Q 0.298 -458 L 0.210 -459 L 0.141 -460 C 0.097 -461 R 0.081 -462 T 0.083 -463 V 0.090 -464 W 0.098 -465 S 0.115 -466 A 0.139 -467 H 0.158 -468 S 0.165 -469 G 0.160 -470 P 0.149 -471 T 0.137 -472 R 0.125 -473 T 0.114 -474 A 0.103 -475 T 0.089 -476 A 0.078 -477 T 0.071 -478 A 0.068 -479 R 0.069 -480 C 0.076 -481 A 0.086 -482 P 0.093 -483 E 0.094 -484 E 0.093 -485 E 0.090 -486 L 0.082 -487 L 0.071 -488 S 0.062 -489 C 0.063 -490 S 0.073 -491 S 0.087 -492 F 0.104 -493 S 0.124 -494 R 0.151 -495 S 0.184 -496 G 0.214 -497 R 0.240 -498 R 0.255 -499 R 0.250 -500 G 0.224 -501 D 0.191 -502 W 0.172 -503 I 0.172 -504 E 0.185 -505 A 0.205 -506 I 0.212 -507 G 0.189 -508 G 0.148 -509 Q 0.109 -510 Q 0.079 -511 V 0.057 -512 C 0.046 -513 K 0.044 -514 A 0.052 -515 L 0.068 -516 N 0.090 -517 A 0.118 -518 F 0.151 -519 G 0.180 -520 G 0.194 -521 E 0.181 -522 G 0.146 -523 V 0.105 -524 Y 0.073 -525 A 0.053 -526 V 0.041 -527 A 0.035 -528 R 0.034 -529 C 0.036 -530 C 0.045 -531 L 0.062 -532 V 0.079 -533 P 0.089 -534 R 0.090 -535 A 0.086 -536 N 0.083 -537 C 0.081 -538 S 0.082 -539 I 0.086 -540 H 0.095 -541 N 0.112 -542 T 0.140 -543 P 0.164 -544 A 0.171 -545 A 0.164 -546 R 0.151 -547 A 0.139 -548 G 0.129 -549 L 0.116 -550 E 0.102 -551 T 0.089 -552 H 0.079 -553 V 0.074 -554 H 0.071 -555 C 0.070 -556 H 0.077 -557 Q 0.089 -558 K 0.103 -559 D 0.116 -560 H 0.126 -561 V 0.127 -562 L 0.120 -563 T 0.109 -564 G 0.104 -565 C 0.109 -566 S 0.115 -567 F 0.119 -568 H 0.124 -569 W 0.139 -570 E 0.163 -571 V 0.189 -572 E 0.212 -573 D 0.230 -574 L 0.244 -575 S 0.259 -576 V 0.278 -577 R 0.303 -578 R 0.329 -579 Q 0.351 -580 P 0.360 -581 A 0.349 -582 L 0.319 -583 R 0.281 -584 S 0.248 -585 R 0.223 -586 R 0.207 -587 Q 0.197 -588 P 0.184 -589 G 0.164 -590 Q 0.140 -591 C 0.118 -592 V 0.101 -593 G 0.090 -594 H 0.086 -595 Q 0.085 -596 A 0.084 -597 A 0.081 -598 S 0.076 -599 V 0.068 -600 Y 0.059 -601 A 0.052 -602 S 0.047 -603 C 0.047 -604 C 0.053 -605 H 0.070 -606 A 0.092 -607 P 0.105 -608 G 0.105 -609 L 0.094 -610 E 0.083 -611 C 0.077 -612 K 0.078 -613 I 0.085 -614 K 0.100 -615 E 0.125 -616 H 0.157 -617 G 0.184 -618 I 0.196 -619 S 0.192 -620 G 0.178 -621 P 0.160 -622 S 0.139 -623 E 0.117 -624 Q 0.098 -625 V 0.086 -626 T 0.080 -627 V 0.078 -628 A 0.076 -629 C 0.079 -630 E 0.091 -631 A 0.104 -632 G 0.113 -633 W 0.115 -634 T 0.115 -635 L 0.113 -636 T 0.108 -637 G 0.106 -638 C 0.109 -639 N 0.124 -640 V 0.152 -641 L 0.185 -642 P 0.209 -643 G 0.214 -644 A 0.203 -645 S 0.187 -646 L 0.171 -647 T 0.156 -648 L 0.138 -649 G 0.118 -650 A 0.103 -651 Y 0.097 -652 S 0.095 -653 V 0.091 -654 D 0.081 -655 N 0.069 -656 L 0.059 -657 C 0.055 -658 V 0.059 -659 A 0.074 -660 R 0.103 -661 V 0.144 -662 H 0.197 -663 D 0.259 -664 T 0.317 -665 A 0.361 -666 R 0.390 -667 A 0.407 -668 D 0.418 -669 R 0.424 -670 T 0.424 -671 S 0.405 -672 G 0.359 -673 E 0.292 -674 A 0.222 -675 T 0.159 -676 V 0.108 -677 A 0.072 -678 A 0.053 -679 A 0.046 -680 I 0.046 -681 C 0.049 -682 C 0.054 -683 R 0.065 -684 S 0.083 -685 R 0.104 -686 P 0.122 -687 S 0.131 -688 A 0.129 -689 K 0.118 -690 A 0.102 -691 S 0.089 -692 W 0.089 -693 V 0.100 -694 Q 0.112 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044254.7_ENSMUST00000049507.6_GN:Pcsk9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:13.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044254.7_ENSMUST00000049507.6_GN:Pcsk9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:13.caid deleted file mode 100644 index bfac39d3af86aa6b27c820240e49daa1289ac747..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044254.7_ENSMUST00000049507.6_GN:Pcsk9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:13.caid +++ /dev/null @@ -1,708 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000044254.7|ENSMUST00000049507.6|GN:Pcsk9|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:13 -1 M 0.327 -2 S 0.339 -3 F 0.358 -4 P 0.365 -5 R 0.349 -6 P 0.330 -7 R 0.350 -8 A 0.407 -9 P 0.448 -10 L 0.442 -11 L 0.417 -12 A 0.419 -13 P 0.456 -14 M 0.484 -15 G 0.472 -16 T 0.438 -17 H 0.410 -18 C 0.376 -19 S 0.339 -20 A 0.335 -21 W 0.369 -22 L 0.405 -23 R 0.425 -24 W 0.441 -25 P 0.458 -26 L 0.467 -27 L 0.462 -28 P 0.440 -29 L 0.405 -30 L 0.372 -31 P 0.351 -32 P 0.332 -33 L 0.302 -34 L 0.264 -35 L 0.236 -36 L 0.220 -37 L 0.211 -38 L 0.211 -39 L 0.234 -40 L 0.280 -41 C 0.337 -42 P 0.405 -43 T 0.489 -44 G 0.578 -45 A 0.643 -46 G 0.669 -47 A 0.666 -48 Q 0.653 -49 D 0.642 -50 E 0.632 -51 D 0.618 -52 G 0.600 -53 D 0.571 -54 Y 0.532 -55 E 0.499 -56 E 0.485 -57 L 0.494 -58 M 0.512 -59 L 0.528 -60 A 0.537 -61 L 0.542 -62 P 0.545 -63 S 0.556 -64 Q 0.580 -65 E 0.613 -66 D 0.647 -67 G 0.671 -68 L 0.679 -69 A 0.672 -70 D 0.659 -71 E 0.649 -72 A 0.646 -73 A 0.651 -74 H 0.654 -75 V 0.638 -76 A 0.584 -77 T 0.486 -78 A 0.361 -79 T 0.246 -80 F 0.172 -81 R 0.141 -82 R 0.137 -83 C 0.143 -84 S 0.145 -85 K 0.140 -86 E 0.131 -87 A 0.122 -88 W 0.113 -89 R 0.103 -90 L 0.090 -91 P 0.072 -92 G 0.052 -93 T 0.035 -94 Y 0.026 -95 I 0.025 -96 V 0.030 -97 V 0.041 -98 L 0.052 -99 M 0.063 -100 E 0.070 -101 E 0.071 -102 T 0.067 -103 Q 0.062 -104 R 0.063 -105 L 0.063 -106 Q 0.059 -107 I 0.055 -108 E 0.059 -109 Q 0.063 -110 T 0.057 -111 A 0.048 -112 H 0.042 -113 R 0.043 -114 L 0.052 -115 Q 0.064 -116 T 0.074 -117 R 0.076 -118 A 0.074 -119 A 0.072 -120 R 0.073 -121 R 0.078 -122 G 0.083 -123 Y 0.080 -124 V 0.069 -125 I 0.057 -126 K 0.051 -127 V 0.050 -128 L 0.052 -129 H 0.055 -130 I 0.060 -131 F 0.063 -132 Y 0.065 -133 D 0.065 -134 L 0.060 -135 F 0.051 -136 P 0.041 -137 G 0.033 -138 F 0.028 -139 L 0.027 -140 V 0.026 -141 K 0.026 -142 M 0.027 -143 S 0.029 -144 S 0.031 -145 D 0.033 -146 L 0.035 -147 L 0.035 -148 G 0.036 -149 L 0.040 -150 A 0.046 -151 L 0.051 -152 K 0.052 -153 L 0.051 -154 P 0.049 -155 H 0.044 -156 V 0.042 -157 E 0.044 -158 Y 0.052 -159 I 0.066 -160 E 0.086 -161 E 0.107 -162 D 0.128 -163 S 0.147 -164 F 0.162 -165 V 0.168 -166 F 0.170 -167 A 0.176 -168 Q 0.188 -169 S 0.195 -170 I 0.183 -171 P 0.150 -172 W 0.117 -173 N 0.102 -174 L 0.101 -175 E 0.103 -176 R 0.105 -177 I 0.112 -178 I 0.122 -179 P 0.137 -180 A 0.165 -181 W 0.205 -182 H 0.251 -183 Q 0.292 -184 T 0.326 -185 E 0.355 -186 E 0.379 -187 D 0.395 -188 R 0.403 -189 S 0.406 -190 P 0.409 -191 D 0.408 -192 G 0.389 -193 S 0.339 -194 S 0.263 -195 Q 0.187 -196 V 0.133 -197 E 0.102 -198 V 0.086 -199 Y 0.077 -200 L 0.071 -201 L 0.068 -202 D 0.072 -203 T 0.088 -204 S 0.107 -205 I 0.114 -206 Q 0.112 -207 G 0.108 -208 A 0.103 -209 H 0.094 -210 R 0.087 -211 E 0.084 -212 I 0.083 -213 E 0.083 -214 G 0.085 -215 R 0.088 -216 V 0.090 -217 T 0.092 -218 I 0.094 -219 T 0.099 -220 D 0.113 -221 F 0.144 -222 N 0.193 -223 S 0.245 -224 V 0.283 -225 P 0.302 -226 E 0.311 -227 E 0.319 -228 D 0.328 -229 G 0.336 -230 T 0.346 -231 R 0.363 -232 F 0.384 -233 H 0.400 -234 R 0.407 -235 Q 0.397 -236 A 0.363 -237 S 0.308 -238 K 0.245 -239 C 0.190 -240 D 0.151 -241 S 0.130 -242 H 0.125 -243 G 0.135 -244 T 0.153 -245 H 0.169 -246 L 0.170 -247 A 0.156 -248 G 0.138 -249 V 0.127 -250 V 0.124 -251 S 0.124 -252 G 0.129 -253 R 0.132 -254 D 0.129 -255 A 0.122 -256 G 0.115 -257 V 0.111 -258 A 0.111 -259 K 0.118 -260 G 0.127 -261 T 0.132 -262 S 0.131 -263 L 0.126 -264 H 0.119 -265 S 0.111 -266 L 0.103 -267 R 0.097 -268 V 0.094 -269 L 0.089 -270 N 0.085 -271 C 0.085 -272 Q 0.089 -273 G 0.091 -274 K 0.088 -275 G 0.079 -276 T 0.065 -277 V 0.052 -278 S 0.047 -279 G 0.048 -280 T 0.051 -281 L 0.051 -282 I 0.049 -283 G 0.046 -284 L 0.042 -285 E 0.038 -286 F 0.035 -287 I 0.034 -288 R 0.034 -289 K 0.035 -290 S 0.037 -291 Q 0.042 -292 L 0.051 -293 I 0.068 -294 Q 0.086 -295 P 0.100 -296 S 0.104 -297 G 0.100 -298 P 0.088 -299 L 0.075 -300 V 0.064 -301 V 0.053 -302 L 0.046 -303 L 0.045 -304 P 0.051 -305 L 0.065 -306 A 0.086 -307 G 0.112 -308 G 0.130 -309 Y 0.127 -310 S 0.105 -311 R 0.079 -312 I 0.066 -313 L 0.069 -314 N 0.077 -315 A 0.080 -316 A 0.072 -317 C 0.059 -318 R 0.049 -319 H 0.041 -320 L 0.037 -321 A 0.035 -322 R 0.035 -323 T 0.038 -324 G 0.044 -325 V 0.047 -326 V 0.046 -327 L 0.044 -328 V 0.046 -329 A 0.053 -330 A 0.066 -331 A 0.081 -332 G 0.092 -333 N 0.098 -334 F 0.096 -335 R 0.092 -336 D 0.091 -337 D 0.090 -338 A 0.083 -339 C 0.068 -340 L 0.054 -341 Y 0.045 -342 S 0.043 -343 P 0.049 -344 A 0.066 -345 S 0.085 -346 A 0.095 -347 P 0.092 -348 E 0.082 -349 V 0.071 -350 I 0.061 -351 T 0.052 -352 V 0.047 -353 G 0.046 -354 A 0.049 -355 T 0.056 -356 N 0.070 -357 A 0.090 -358 Q 0.108 -359 D 0.122 -360 Q 0.135 -361 P 0.151 -362 V 0.168 -363 T 0.189 -364 L 0.204 -365 G 0.201 -366 T 0.177 -367 L 0.145 -368 G 0.119 -369 T 0.110 -370 N 0.116 -371 F 0.124 -372 G 0.125 -373 R 0.121 -374 C 0.118 -375 V 0.115 -376 D 0.111 -377 L 0.103 -378 F 0.095 -379 A 0.094 -380 P 0.111 -381 G 0.141 -382 K 0.168 -383 D 0.181 -384 I 0.184 -385 I 0.186 -386 G 0.190 -387 A 0.192 -388 S 0.189 -389 S 0.185 -390 D 0.184 -391 C 0.183 -392 S 0.181 -393 T 0.182 -394 C 0.186 -395 F 0.185 -396 M 0.174 -397 S 0.157 -398 Q 0.147 -399 S 0.150 -400 G 0.169 -401 T 0.207 -402 S 0.254 -403 Q 0.283 -404 A 0.271 -405 A 0.229 -406 A 0.184 -407 H 0.149 -408 V 0.121 -409 A 0.098 -410 G 0.081 -411 I 0.070 -412 V 0.064 -413 A 0.059 -414 R 0.053 -415 M 0.048 -416 L 0.047 -417 S 0.047 -418 R 0.047 -419 E 0.048 -420 P 0.047 -421 T 0.045 -422 L 0.043 -423 T 0.042 -424 L 0.041 -425 A 0.040 -426 E 0.041 -427 L 0.048 -428 R 0.059 -429 Q 0.066 -430 R 0.063 -431 L 0.055 -432 I 0.047 -433 H 0.042 -434 F 0.043 -435 S 0.052 -436 T 0.065 -437 K 0.077 -438 D 0.085 -439 V 0.087 -440 I 0.089 -441 N 0.099 -442 M 0.118 -443 A 0.143 -444 W 0.172 -445 F 0.203 -446 P 0.226 -447 E 0.233 -448 D 0.228 -449 Q 0.218 -450 Q 0.210 -451 V 0.206 -452 L 0.207 -453 T 0.206 -454 P 0.195 -455 N 0.171 -456 L 0.140 -457 V 0.110 -458 A 0.093 -459 T 0.109 -460 L 0.164 -461 P 0.245 -462 P 0.327 -463 S 0.390 -464 T 0.429 -465 H 0.447 -466 E 0.453 -467 T 0.453 -468 G 0.434 -469 G 0.380 -470 Q 0.297 -471 L 0.210 -472 L 0.140 -473 C 0.097 -474 R 0.081 -475 T 0.083 -476 V 0.090 -477 W 0.098 -478 S 0.115 -479 A 0.139 -480 H 0.159 -481 S 0.165 -482 G 0.160 -483 P 0.149 -484 T 0.136 -485 R 0.125 -486 T 0.114 -487 A 0.103 -488 T 0.090 -489 A 0.078 -490 T 0.072 -491 A 0.069 -492 R 0.070 -493 C 0.076 -494 A 0.086 -495 P 0.093 -496 E 0.094 -497 E 0.093 -498 E 0.090 -499 L 0.083 -500 L 0.071 -501 S 0.063 -502 C 0.063 -503 S 0.073 -504 S 0.087 -505 F 0.104 -506 S 0.124 -507 R 0.151 -508 S 0.184 -509 G 0.214 -510 R 0.240 -511 R 0.255 -512 R 0.250 -513 G 0.223 -514 D 0.191 -515 W 0.172 -516 I 0.171 -517 E 0.185 -518 A 0.206 -519 I 0.213 -520 G 0.190 -521 G 0.149 -522 Q 0.109 -523 Q 0.079 -524 V 0.057 -525 C 0.046 -526 K 0.044 -527 A 0.052 -528 L 0.067 -529 N 0.090 -530 A 0.118 -531 F 0.151 -532 G 0.180 -533 G 0.194 -534 E 0.181 -535 G 0.146 -536 V 0.105 -537 Y 0.073 -538 A 0.053 -539 V 0.041 -540 A 0.035 -541 R 0.034 -542 C 0.036 -543 C 0.045 -544 L 0.062 -545 V 0.079 -546 P 0.089 -547 R 0.090 -548 A 0.086 -549 N 0.083 -550 C 0.081 -551 S 0.082 -552 I 0.086 -553 H 0.095 -554 N 0.112 -555 T 0.139 -556 P 0.163 -557 A 0.171 -558 A 0.163 -559 R 0.151 -560 A 0.139 -561 G 0.128 -562 L 0.116 -563 E 0.102 -564 T 0.088 -565 H 0.079 -566 V 0.074 -567 H 0.070 -568 C 0.070 -569 H 0.076 -570 Q 0.089 -571 K 0.103 -572 D 0.116 -573 H 0.125 -574 V 0.127 -575 L 0.119 -576 T 0.108 -577 G 0.103 -578 C 0.108 -579 S 0.114 -580 F 0.117 -581 H 0.123 -582 W 0.138 -583 E 0.161 -584 V 0.187 -585 E 0.211 -586 D 0.228 -587 L 0.242 -588 S 0.257 -589 V 0.277 -590 R 0.301 -591 R 0.327 -592 Q 0.349 -593 P 0.358 -594 A 0.347 -595 L 0.317 -596 R 0.279 -597 S 0.246 -598 R 0.221 -599 R 0.205 -600 Q 0.195 -601 P 0.182 -602 G 0.162 -603 Q 0.139 -604 C 0.117 -605 V 0.100 -606 G 0.089 -607 H 0.085 -608 Q 0.085 -609 A 0.084 -610 A 0.081 -611 S 0.075 -612 V 0.068 -613 Y 0.059 -614 A 0.052 -615 S 0.047 -616 C 0.047 -617 C 0.053 -618 H 0.070 -619 A 0.092 -620 P 0.105 -621 G 0.104 -622 L 0.094 -623 E 0.082 -624 C 0.077 -625 K 0.077 -626 I 0.085 -627 K 0.100 -628 E 0.125 -629 H 0.156 -630 G 0.184 -631 I 0.196 -632 S 0.191 -633 G 0.177 -634 P 0.159 -635 S 0.138 -636 E 0.117 -637 Q 0.098 -638 V 0.086 -639 T 0.080 -640 V 0.078 -641 A 0.076 -642 C 0.079 -643 E 0.090 -644 A 0.104 -645 G 0.112 -646 W 0.115 -647 T 0.115 -648 L 0.113 -649 T 0.109 -650 G 0.106 -651 C 0.110 -652 N 0.125 -653 V 0.152 -654 L 0.185 -655 P 0.209 -656 G 0.214 -657 A 0.203 -658 S 0.187 -659 L 0.171 -660 T 0.156 -661 L 0.138 -662 G 0.118 -663 A 0.103 -664 Y 0.096 -665 S 0.095 -666 V 0.090 -667 D 0.081 -668 N 0.069 -669 L 0.059 -670 C 0.055 -671 V 0.059 -672 A 0.074 -673 R 0.103 -674 V 0.144 -675 H 0.196 -676 D 0.257 -677 T 0.315 -678 A 0.359 -679 R 0.387 -680 A 0.404 -681 D 0.415 -682 R 0.422 -683 T 0.423 -684 S 0.405 -685 G 0.359 -686 E 0.292 -687 A 0.222 -688 T 0.159 -689 V 0.108 -690 A 0.072 -691 A 0.053 -692 A 0.046 -693 I 0.046 -694 C 0.049 -695 C 0.054 -696 R 0.065 -697 S 0.083 -698 R 0.104 -699 P 0.121 -700 S 0.130 -701 A 0.129 -702 K 0.118 -703 A 0.101 -704 S 0.089 -705 W 0.089 -706 V 0.101 -707 Q 0.113 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044505.6_ENSMUST00000050975.6_GN:Lingo4_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044505.6_ENSMUST00000050975.6_GN:Lingo4_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index d96a6c1e596e1d446a8ebd72fec01c04967dc6b4..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044505.6_ENSMUST00000050975.6_GN:Lingo4_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,594 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000044505.6|ENSMUST00000050975.6|GN:Lingo4|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.348 -2 D 0.344 -3 A 0.351 -4 A 0.371 -5 T 0.387 -6 A 0.398 -7 P 0.403 -8 K 0.382 -9 Q 0.342 -10 A 0.333 -11 W 0.373 -12 L 0.427 -13 P 0.457 -14 W 0.463 -15 S 0.446 -16 P 0.395 -17 L 0.327 -18 L 0.288 -19 F 0.292 -20 L 0.307 -21 L 0.319 -22 L 0.343 -23 L 0.392 -24 P 0.455 -25 G 0.514 -26 G 0.548 -27 S 0.545 -28 I 0.499 -29 S 0.413 -30 S 0.307 -31 C 0.208 -32 P 0.131 -33 T 0.079 -34 V 0.052 -35 C 0.044 -36 D 0.050 -37 C 0.061 -38 T 0.072 -39 S 0.081 -40 Q 0.089 -41 T 0.092 -42 R 0.093 -43 A 0.093 -44 V 0.096 -45 F 0.098 -46 C 0.103 -47 A 0.109 -48 H 0.114 -49 R 0.114 -50 R 0.111 -51 L 0.105 -52 D 0.098 -53 T 0.092 -54 I 0.092 -55 P 0.096 -56 G 0.099 -57 G 0.098 -58 L 0.092 -59 P 0.092 -60 L 0.101 -61 D 0.113 -62 T 0.121 -63 E 0.126 -64 L 0.130 -65 L 0.134 -66 D 0.140 -67 L 0.145 -68 S 0.140 -69 G 0.121 -70 N 0.099 -71 R 0.090 -72 L 0.096 -73 W 0.111 -74 G 0.131 -75 L 0.146 -76 Q 0.151 -77 R 0.141 -78 G 0.119 -79 M 0.092 -80 L 0.072 -81 S 0.062 -82 R 0.060 -83 L 0.070 -84 G 0.088 -85 Q 0.105 -86 L 0.117 -87 Q 0.129 -88 E 0.136 -89 L 0.135 -90 D 0.129 -91 L 0.124 -92 S 0.119 -93 Y 0.109 -94 N 0.097 -95 Q 0.090 -96 L 0.094 -97 S 0.108 -98 T 0.131 -99 L 0.155 -100 E 0.169 -101 P 0.167 -102 G 0.147 -103 A 0.115 -104 F 0.090 -105 H 0.078 -106 G 0.077 -107 L 0.081 -108 Q 0.086 -109 S 0.090 -110 L 0.095 -111 L 0.106 -112 T 0.121 -113 L 0.134 -114 R 0.144 -115 L 0.152 -116 Q 0.150 -117 G 0.131 -118 N 0.104 -119 R 0.087 -120 L 0.088 -121 R 0.104 -122 I 0.129 -123 V 0.161 -124 G 0.188 -125 P 0.195 -126 G 0.173 -127 I 0.133 -128 F 0.098 -129 S 0.081 -130 G 0.077 -131 L 0.081 -132 T 0.089 -133 A 0.093 -134 L 0.093 -135 T 0.094 -136 L 0.105 -137 L 0.125 -138 D 0.152 -139 L 0.176 -140 R 0.182 -141 L 0.160 -142 N 0.126 -143 Q 0.103 -144 I 0.100 -145 V 0.111 -146 L 0.132 -147 F 0.155 -148 L 0.171 -149 D 0.174 -150 G 0.159 -151 A 0.130 -152 F 0.103 -153 S 0.088 -154 E 0.084 -155 L 0.085 -156 G 0.091 -157 S 0.097 -158 L 0.107 -159 Q 0.126 -160 Q 0.146 -161 L 0.157 -162 E 0.156 -163 V 0.152 -164 G 0.155 -165 D 0.156 -166 N 0.143 -167 H 0.124 -168 L 0.115 -169 V 0.127 -170 F 0.156 -171 V 0.186 -172 A 0.207 -173 P 0.213 -174 G 0.195 -175 A 0.156 -176 F 0.119 -177 A 0.100 -178 G 0.096 -179 L 0.097 -180 A 0.099 -181 K 0.098 -182 L 0.092 -183 S 0.090 -184 T 0.096 -185 I 0.106 -186 T 0.115 -187 L 0.123 -188 E 0.125 -189 R 0.117 -190 C 0.102 -191 N 0.090 -192 L 0.086 -193 S 0.091 -194 T 0.099 -195 V 0.104 -196 P 0.100 -197 G 0.094 -198 L 0.088 -199 A 0.081 -200 L 0.075 -201 A 0.074 -202 Q 0.080 -203 L 0.089 -204 P 0.096 -205 A 0.097 -206 L 0.094 -207 V 0.094 -208 A 0.099 -209 L 0.105 -210 R 0.113 -211 L 0.121 -212 R 0.126 -213 E 0.124 -214 L 0.113 -215 D 0.102 -216 I 0.103 -217 E 0.123 -218 R 0.157 -219 L 0.188 -220 P 0.201 -221 A 0.191 -222 G 0.162 -223 A 0.123 -224 L 0.092 -225 R 0.077 -226 G 0.075 -227 L 0.082 -228 G 0.095 -229 Q 0.107 -230 L 0.119 -231 K 0.135 -232 E 0.148 -233 L 0.147 -234 E 0.134 -235 I 0.116 -236 H 0.102 -237 H 0.100 -238 W 0.108 -239 P 0.115 -240 S 0.111 -241 L 0.104 -242 E 0.107 -243 A 0.123 -244 L 0.142 -245 D 0.154 -246 P 0.152 -247 G 0.135 -248 S 0.111 -249 L 0.095 -250 V 0.086 -251 G 0.075 -252 L 0.063 -253 N 0.057 -254 L 0.060 -255 S 0.072 -256 S 0.091 -257 L 0.108 -258 A 0.118 -259 I 0.118 -260 T 0.113 -261 R 0.106 -262 C 0.099 -263 N 0.092 -264 L 0.086 -265 S 0.083 -266 S 0.082 -267 V 0.079 -268 P 0.075 -269 F 0.070 -270 Q 0.067 -271 A 0.064 -272 L 0.062 -273 H 0.061 -274 H 0.062 -275 L 0.066 -276 S 0.073 -277 F 0.083 -278 L 0.097 -279 R 0.117 -280 I 0.133 -281 L 0.139 -282 D 0.137 -283 L 0.137 -284 S 0.137 -285 Q 0.131 -286 N 0.118 -287 P 0.105 -288 I 0.101 -289 S 0.107 -290 A 0.120 -291 I 0.132 -292 P 0.138 -293 A 0.138 -294 R 0.129 -295 R 0.116 -296 L 0.105 -297 S 0.096 -298 P 0.087 -299 L 0.084 -300 V 0.090 -301 R 0.100 -302 L 0.112 -303 Q 0.127 -304 E 0.142 -305 L 0.146 -306 R 0.139 -307 L 0.129 -308 S 0.117 -309 G 0.103 -310 A 0.090 -311 C 0.090 -312 L 0.105 -313 T 0.136 -314 S 0.173 -315 I 0.199 -316 A 0.203 -317 A 0.193 -318 H 0.172 -319 A 0.147 -320 F 0.130 -321 H 0.128 -322 G 0.133 -323 L 0.132 -324 T 0.118 -325 A 0.100 -326 F 0.090 -327 H 0.098 -328 L 0.125 -329 L 0.157 -330 D 0.181 -331 V 0.197 -332 A 0.202 -333 D 0.188 -334 N 0.161 -335 A 0.140 -336 L 0.136 -337 Q 0.147 -338 T 0.160 -339 L 0.161 -340 E 0.144 -341 E 0.119 -342 T 0.097 -343 A 0.083 -344 F 0.079 -345 P 0.092 -346 S 0.110 -347 P 0.123 -348 D 0.131 -349 K 0.141 -350 L 0.153 -351 V 0.166 -352 T 0.177 -353 L 0.185 -354 R 0.196 -355 L 0.212 -356 S 0.218 -357 G 0.195 -358 N 0.151 -359 P 0.110 -360 L 0.083 -361 T 0.066 -362 C 0.058 -363 D 0.060 -364 C 0.067 -365 R 0.071 -366 L 0.067 -367 L 0.055 -368 W 0.043 -369 L 0.035 -370 L 0.031 -371 R 0.030 -372 L 0.033 -373 R 0.039 -374 R 0.048 -375 R 0.059 -376 L 0.069 -377 D 0.081 -378 F 0.100 -379 G 0.124 -380 T 0.143 -381 S 0.144 -382 P 0.124 -383 P 0.096 -384 A 0.077 -385 C 0.070 -386 A 0.067 -387 G 0.060 -388 P 0.053 -389 Q 0.051 -390 H 0.052 -391 V 0.056 -392 Q 0.062 -393 G 0.068 -394 K 0.070 -395 S 0.069 -396 L 0.066 -397 R 0.064 -398 E 0.070 -399 F 0.082 -400 S 0.097 -401 D 0.113 -402 I 0.128 -403 L 0.141 -404 P 0.149 -405 P 0.148 -406 G 0.134 -407 H 0.115 -408 F 0.104 -409 T 0.101 -410 C 0.102 -411 K 0.103 -412 P 0.101 -413 A 0.098 -414 L 0.102 -415 I 0.115 -416 R 0.134 -417 K 0.154 -418 S 0.170 -419 G 0.177 -420 P 0.166 -421 R 0.140 -422 W 0.115 -423 V 0.097 -424 I 0.083 -425 A 0.076 -426 E 0.078 -427 E 0.084 -428 G 0.084 -429 G 0.079 -430 H 0.071 -431 A 0.068 -432 V 0.071 -433 F 0.081 -434 S 0.094 -435 C 0.104 -436 S 0.109 -437 G 0.116 -438 D 0.123 -439 G 0.122 -440 D 0.111 -441 P 0.102 -442 A 0.100 -443 P 0.094 -444 T 0.080 -445 V 0.064 -446 S 0.056 -447 W 0.057 -448 M 0.065 -449 R 0.079 -450 P 0.103 -451 Q 0.131 -452 G 0.153 -453 A 0.165 -454 W 0.171 -455 L 0.181 -456 G 0.189 -457 R 0.183 -458 V 0.159 -459 G 0.129 -460 R 0.107 -461 V 0.099 -462 R 0.100 -463 V 0.101 -464 L 0.102 -465 E 0.104 -466 D 0.105 -467 G 0.098 -468 T 0.083 -469 L 0.069 -470 E 0.061 -471 I 0.059 -472 R 0.061 -473 S 0.067 -474 V 0.073 -475 Q 0.079 -476 L 0.088 -477 R 0.098 -478 D 0.106 -479 R 0.107 -480 G 0.097 -481 A 0.075 -482 Y 0.055 -483 V 0.045 -484 C 0.047 -485 V 0.054 -486 V 0.059 -487 S 0.063 -488 N 0.074 -489 V 0.091 -490 A 0.106 -491 G 0.107 -492 N 0.097 -493 D 0.085 -494 S 0.076 -495 L 0.069 -496 R 0.061 -497 T 0.053 -498 W 0.049 -499 L 0.056 -500 E 0.082 -501 V 0.128 -502 I 0.194 -503 Q 0.277 -504 V 0.368 -505 E 0.456 -506 P 0.533 -507 P 0.598 -508 N 0.646 -509 G 0.672 -510 T 0.671 -511 L 0.653 -512 S 0.638 -513 D 0.636 -514 P 0.639 -515 N 0.637 -516 I 0.630 -517 T 0.632 -518 M 0.647 -519 P 0.668 -520 G 0.679 -521 I 0.677 -522 P 0.670 -523 G 0.671 -524 P 0.679 -525 F 0.678 -526 F 0.652 -527 L 0.610 -528 D 0.567 -529 S 0.529 -530 R 0.497 -531 G 0.474 -532 V 0.451 -533 A 0.429 -534 M 0.436 -535 V 0.477 -536 L 0.516 -537 A 0.523 -538 V 0.500 -539 G 0.459 -540 F 0.414 -541 L 0.381 -542 P 0.362 -543 F 0.348 -544 L 0.336 -545 T 0.335 -546 S 0.337 -547 V 0.320 -548 T 0.281 -549 L 0.244 -550 C 0.220 -551 F 0.208 -552 G 0.204 -553 L 0.201 -554 I 0.196 -555 A 0.199 -556 L 0.221 -557 W 0.261 -558 S 0.313 -559 K 0.376 -560 G 0.444 -561 K 0.505 -562 G 0.549 -563 R 0.574 -564 V 0.582 -565 K 0.570 -566 H 0.544 -567 H 0.520 -568 M 0.503 -569 T 0.486 -570 F 0.471 -571 D 0.463 -572 F 0.460 -573 V 0.463 -574 A 0.483 -575 P 0.524 -576 R 0.578 -577 P 0.632 -578 S 0.680 -579 G 0.716 -580 D 0.735 -581 K 0.740 -582 N 0.738 -583 S 0.729 -584 G 0.715 -585 G 0.692 -586 N 0.652 -587 R 0.603 -588 V 0.545 -589 T 0.472 -590 A 0.385 -591 K 0.307 -592 L 0.253 -593 F 0.226 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044505.6_ENSMUST00000050975.6_GN:Lingo4_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:25.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044505.6_ENSMUST00000050975.6_GN:Lingo4_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:25.caid deleted file mode 100644 index 95257ba8cac06b0f64a1806f77b23aa30654fcd6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044505.6_ENSMUST00000050975.6_GN:Lingo4_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:25.caid +++ /dev/null @@ -1,619 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000044505.6|ENSMUST00000050975.6|GN:Lingo4|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:25 -1 M 0.389 -2 G 0.403 -3 Q 0.426 -4 A 0.447 -5 P 0.447 -6 A 0.422 -7 L 0.385 -8 E 0.352 -9 R 0.330 -10 C 0.318 -11 S 0.320 -12 A 0.344 -13 Q 0.381 -14 L 0.401 -15 D 0.398 -16 A 0.396 -17 T 0.410 -18 P 0.423 -19 Q 0.433 -20 L 0.463 -21 L 0.507 -22 R 0.546 -23 P 0.577 -24 Q 0.603 -25 G 0.619 -26 M 0.622 -27 D 0.614 -28 A 0.584 -29 A 0.531 -30 T 0.496 -31 A 0.504 -32 P 0.522 -33 K 0.509 -34 Q 0.488 -35 A 0.490 -36 W 0.506 -37 L 0.517 -38 P 0.521 -39 W 0.522 -40 S 0.513 -41 P 0.480 -42 L 0.430 -43 L 0.390 -44 F 0.370 -45 L 0.361 -46 L 0.361 -47 L 0.377 -48 L 0.416 -49 P 0.475 -50 G 0.532 -51 G 0.564 -52 S 0.555 -53 I 0.502 -54 S 0.411 -55 S 0.303 -56 C 0.203 -57 P 0.127 -58 T 0.077 -59 V 0.050 -60 C 0.043 -61 D 0.048 -62 C 0.058 -63 T 0.069 -64 S 0.078 -65 Q 0.086 -66 T 0.090 -67 R 0.091 -68 A 0.091 -69 V 0.093 -70 F 0.096 -71 C 0.099 -72 A 0.105 -73 H 0.109 -74 R 0.108 -75 R 0.104 -76 L 0.098 -77 D 0.092 -78 T 0.086 -79 I 0.085 -80 P 0.088 -81 G 0.091 -82 G 0.090 -83 L 0.084 -84 P 0.084 -85 L 0.093 -86 D 0.104 -87 T 0.111 -88 E 0.115 -89 L 0.118 -90 L 0.122 -91 D 0.127 -92 L 0.131 -93 S 0.127 -94 G 0.110 -95 N 0.091 -96 R 0.081 -97 L 0.086 -98 W 0.100 -99 G 0.118 -100 L 0.133 -101 Q 0.137 -102 R 0.128 -103 G 0.107 -104 M 0.082 -105 L 0.065 -106 S 0.056 -107 R 0.054 -108 L 0.063 -109 G 0.080 -110 Q 0.097 -111 L 0.111 -112 Q 0.123 -113 E 0.130 -114 L 0.129 -115 D 0.126 -116 L 0.124 -117 S 0.121 -118 Y 0.112 -119 N 0.099 -120 Q 0.092 -121 L 0.094 -122 S 0.108 -123 T 0.132 -124 L 0.155 -125 E 0.170 -126 P 0.170 -127 G 0.152 -128 A 0.122 -129 F 0.098 -130 H 0.088 -131 G 0.089 -132 L 0.095 -133 Q 0.102 -134 S 0.106 -135 L 0.111 -136 L 0.122 -137 T 0.138 -138 L 0.153 -139 R 0.164 -140 L 0.172 -141 Q 0.167 -142 G 0.143 -143 N 0.113 -144 R 0.095 -145 L 0.094 -146 R 0.109 -147 I 0.135 -148 V 0.167 -149 G 0.195 -150 P 0.202 -151 G 0.181 -152 I 0.141 -153 F 0.106 -154 S 0.088 -155 G 0.084 -156 L 0.088 -157 T 0.095 -158 A 0.098 -159 L 0.096 -160 T 0.095 -161 L 0.103 -162 L 0.122 -163 D 0.148 -164 L 0.172 -165 R 0.177 -166 L 0.156 -167 N 0.123 -168 Q 0.101 -169 I 0.097 -170 V 0.107 -171 L 0.129 -172 F 0.154 -173 L 0.170 -174 D 0.171 -175 G 0.155 -176 A 0.126 -177 F 0.100 -178 S 0.086 -179 E 0.081 -180 L 0.082 -181 G 0.086 -182 S 0.092 -183 L 0.103 -184 Q 0.122 -185 Q 0.144 -186 L 0.155 -187 E 0.153 -188 V 0.149 -189 G 0.151 -190 D 0.152 -191 N 0.137 -192 H 0.116 -193 L 0.106 -194 V 0.116 -195 F 0.144 -196 V 0.177 -197 A 0.201 -198 P 0.207 -199 G 0.188 -200 A 0.150 -201 F 0.113 -202 A 0.095 -203 G 0.091 -204 L 0.092 -205 A 0.095 -206 K 0.094 -207 L 0.089 -208 S 0.087 -209 T 0.094 -210 I 0.104 -211 T 0.113 -212 L 0.121 -213 E 0.121 -214 R 0.110 -215 C 0.093 -216 N 0.080 -217 L 0.076 -218 S 0.082 -219 T 0.092 -220 V 0.097 -221 P 0.095 -222 G 0.089 -223 L 0.083 -224 A 0.076 -225 L 0.069 -226 A 0.068 -227 Q 0.073 -228 L 0.082 -229 P 0.090 -230 A 0.092 -231 L 0.090 -232 V 0.091 -233 A 0.095 -234 L 0.102 -235 R 0.110 -236 L 0.117 -237 R 0.122 -238 E 0.118 -239 L 0.107 -240 D 0.097 -241 I 0.100 -242 E 0.122 -243 R 0.156 -244 L 0.187 -245 P 0.200 -246 A 0.190 -247 G 0.160 -248 A 0.122 -249 L 0.093 -250 R 0.079 -251 G 0.077 -252 L 0.083 -253 G 0.096 -254 Q 0.109 -255 L 0.121 -256 K 0.136 -257 E 0.147 -258 L 0.145 -259 E 0.131 -260 I 0.114 -261 H 0.101 -262 H 0.101 -263 W 0.110 -264 P 0.118 -265 S 0.115 -266 L 0.108 -267 E 0.108 -268 A 0.121 -269 L 0.139 -270 D 0.152 -271 P 0.152 -272 G 0.137 -273 S 0.116 -274 L 0.101 -275 V 0.093 -276 G 0.082 -277 L 0.069 -278 N 0.062 -279 L 0.064 -280 S 0.076 -281 S 0.095 -282 L 0.114 -283 A 0.126 -284 I 0.128 -285 T 0.123 -286 R 0.117 -287 C 0.110 -288 N 0.103 -289 L 0.098 -290 S 0.097 -291 S 0.097 -292 V 0.094 -293 P 0.088 -294 F 0.082 -295 Q 0.078 -296 A 0.076 -297 L 0.073 -298 H 0.072 -299 H 0.074 -300 L 0.079 -301 S 0.086 -302 F 0.095 -303 L 0.107 -304 R 0.125 -305 I 0.141 -306 L 0.147 -307 D 0.147 -308 L 0.147 -309 S 0.146 -310 Q 0.139 -311 N 0.126 -312 P 0.114 -313 I 0.109 -314 S 0.115 -315 A 0.128 -316 I 0.139 -317 P 0.145 -318 A 0.146 -319 R 0.139 -320 R 0.126 -321 L 0.113 -322 S 0.103 -323 P 0.094 -324 L 0.090 -325 V 0.096 -326 R 0.107 -327 L 0.119 -328 Q 0.134 -329 E 0.149 -330 L 0.154 -331 R 0.147 -332 L 0.135 -333 S 0.122 -334 G 0.105 -335 A 0.090 -336 C 0.088 -337 L 0.105 -338 T 0.139 -339 S 0.179 -340 I 0.206 -341 A 0.210 -342 A 0.198 -343 H 0.176 -344 A 0.150 -345 F 0.132 -346 H 0.129 -347 G 0.135 -348 L 0.133 -349 T 0.119 -350 A 0.101 -351 F 0.092 -352 H 0.102 -353 L 0.130 -354 L 0.159 -355 D 0.181 -356 V 0.196 -357 A 0.202 -358 D 0.189 -359 N 0.162 -360 A 0.139 -361 L 0.134 -362 Q 0.143 -363 T 0.156 -364 L 0.157 -365 E 0.139 -366 E 0.114 -367 T 0.093 -368 A 0.078 -369 F 0.075 -370 P 0.086 -371 S 0.104 -372 P 0.117 -373 D 0.125 -374 K 0.133 -375 L 0.144 -376 V 0.157 -377 T 0.168 -378 L 0.180 -379 R 0.194 -380 L 0.213 -381 S 0.220 -382 G 0.197 -383 N 0.153 -384 P 0.111 -385 L 0.083 -386 T 0.066 -387 C 0.058 -388 D 0.059 -389 C 0.065 -390 R 0.069 -391 L 0.064 -392 L 0.053 -393 W 0.042 -394 L 0.035 -395 L 0.031 -396 R 0.030 -397 L 0.033 -398 R 0.039 -399 R 0.048 -400 R 0.058 -401 L 0.068 -402 D 0.080 -403 F 0.099 -404 G 0.125 -405 T 0.145 -406 S 0.145 -407 P 0.126 -408 P 0.098 -409 A 0.079 -410 C 0.072 -411 A 0.068 -412 G 0.062 -413 P 0.054 -414 Q 0.051 -415 H 0.053 -416 V 0.057 -417 Q 0.064 -418 G 0.069 -419 K 0.072 -420 S 0.071 -421 L 0.067 -422 R 0.065 -423 E 0.070 -424 F 0.081 -425 S 0.095 -426 D 0.111 -427 I 0.126 -428 L 0.140 -429 P 0.149 -430 P 0.148 -431 G 0.135 -432 H 0.117 -433 F 0.105 -434 T 0.102 -435 C 0.103 -436 K 0.104 -437 P 0.102 -438 A 0.100 -439 L 0.103 -440 I 0.116 -441 R 0.135 -442 K 0.154 -443 S 0.170 -444 G 0.178 -445 P 0.167 -446 R 0.141 -447 W 0.116 -448 V 0.098 -449 I 0.085 -450 A 0.077 -451 E 0.079 -452 E 0.084 -453 G 0.084 -454 G 0.079 -455 H 0.072 -456 A 0.069 -457 V 0.072 -458 F 0.083 -459 S 0.098 -460 C 0.108 -461 S 0.114 -462 G 0.121 -463 D 0.129 -464 G 0.128 -465 D 0.116 -466 P 0.106 -467 A 0.103 -468 P 0.097 -469 T 0.082 -470 V 0.066 -471 S 0.058 -472 W 0.060 -473 M 0.068 -474 R 0.082 -475 P 0.106 -476 Q 0.135 -477 G 0.158 -478 A 0.171 -479 W 0.177 -480 L 0.187 -481 G 0.194 -482 R 0.186 -483 V 0.161 -484 G 0.129 -485 R 0.106 -486 V 0.099 -487 R 0.099 -488 V 0.100 -489 L 0.101 -490 E 0.104 -491 D 0.106 -492 G 0.099 -493 T 0.085 -494 L 0.070 -495 E 0.062 -496 I 0.060 -497 R 0.063 -498 S 0.069 -499 V 0.074 -500 Q 0.080 -501 L 0.088 -502 R 0.097 -503 D 0.105 -504 R 0.107 -505 G 0.096 -506 A 0.076 -507 Y 0.055 -508 V 0.045 -509 C 0.047 -510 V 0.054 -511 V 0.060 -512 S 0.064 -513 N 0.074 -514 V 0.092 -515 A 0.107 -516 G 0.108 -517 N 0.098 -518 D 0.086 -519 S 0.076 -520 L 0.069 -521 R 0.061 -522 T 0.053 -523 W 0.049 -524 L 0.056 -525 E 0.081 -526 V 0.126 -527 I 0.192 -528 Q 0.274 -529 V 0.365 -530 E 0.453 -531 P 0.530 -532 P 0.594 -533 N 0.643 -534 G 0.670 -535 T 0.672 -536 L 0.656 -537 S 0.642 -538 D 0.640 -539 P 0.641 -540 N 0.638 -541 I 0.630 -542 T 0.632 -543 M 0.648 -544 P 0.669 -545 G 0.679 -546 I 0.675 -547 P 0.668 -548 G 0.668 -549 P 0.674 -550 F 0.670 -551 F 0.642 -552 L 0.600 -553 D 0.560 -554 S 0.525 -555 R 0.493 -556 G 0.468 -557 V 0.443 -558 A 0.420 -559 M 0.427 -560 V 0.468 -561 L 0.505 -562 A 0.512 -563 V 0.490 -564 G 0.451 -565 F 0.406 -566 L 0.373 -567 P 0.353 -568 F 0.338 -569 L 0.327 -570 T 0.323 -571 S 0.321 -572 V 0.302 -573 T 0.263 -574 L 0.228 -575 C 0.205 -576 F 0.194 -577 G 0.189 -578 L 0.186 -579 I 0.182 -580 A 0.187 -581 L 0.211 -582 W 0.252 -583 S 0.306 -584 K 0.371 -585 G 0.442 -586 K 0.503 -587 G 0.545 -588 R 0.569 -589 V 0.575 -590 K 0.558 -591 H 0.525 -592 H 0.495 -593 M 0.478 -594 T 0.463 -595 F 0.450 -596 D 0.443 -597 F 0.444 -598 V 0.452 -599 A 0.476 -600 P 0.520 -601 R 0.574 -602 P 0.628 -603 S 0.676 -604 G 0.712 -605 D 0.731 -606 K 0.738 -607 N 0.736 -608 S 0.727 -609 G 0.714 -610 G 0.690 -611 N 0.650 -612 R 0.597 -613 V 0.535 -614 T 0.455 -615 A 0.363 -616 K 0.284 -617 L 0.232 -618 F 0.206 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044664.8_ENSMUST00000035715.8_GN:Prss42_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044664.8_ENSMUST00000035715.8_GN:Prss42_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 6790a61fef522b53f2e14b9239f74b100aed9a77..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044664.8_ENSMUST00000035715.8_GN:Prss42_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,336 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000044664.8|ENSMUST00000035715.8|GN:Prss42|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.364 -2 A 0.375 -3 S 0.418 -4 G 0.494 -5 G 0.564 -6 G 0.594 -7 S 0.582 -8 L 0.538 -9 G 0.465 -10 L 0.384 -11 I 0.324 -12 V 0.288 -13 F 0.263 -14 L 0.254 -15 L 0.266 -16 L 0.293 -17 L 0.325 -18 Q 0.366 -19 P 0.418 -20 K 0.468 -21 P 0.503 -22 C 0.523 -23 E 0.529 -24 A 0.523 -25 W 0.512 -26 A 0.510 -27 A 0.534 -28 A 0.592 -29 S 0.652 -30 V 0.682 -31 L 0.693 -32 S 0.703 -33 T 0.711 -34 S 0.704 -35 G 0.686 -36 F 0.679 -37 P 0.695 -38 S 0.716 -39 G 0.712 -40 F 0.667 -41 S 0.602 -42 E 0.561 -43 A 0.573 -44 P 0.611 -45 R 0.632 -46 D 0.616 -47 N 0.571 -48 P 0.531 -49 P 0.531 -50 P 0.580 -51 P 0.651 -52 T 0.706 -53 R 0.732 -54 V 0.744 -55 R 0.756 -56 M 0.770 -57 S 0.782 -58 K 0.785 -59 A 0.775 -60 T 0.750 -61 T 0.712 -62 R 0.672 -63 S 0.646 -64 P 0.629 -65 F 0.603 -66 M 0.551 -67 N 0.471 -68 F 0.372 -69 S 0.271 -70 L 0.192 -71 V 0.145 -72 C 0.125 -73 G 0.125 -74 Q 0.133 -75 P 0.143 -76 F 0.147 -77 M 0.149 -78 K 0.157 -79 I 0.167 -80 M 0.173 -81 G 0.168 -82 G 0.158 -83 V 0.159 -84 D 0.174 -85 A 0.186 -86 E 0.176 -87 E 0.148 -88 G 0.117 -89 K 0.090 -90 W 0.066 -91 P 0.045 -92 W 0.030 -93 Q 0.022 -94 V 0.021 -95 S 0.024 -96 V 0.032 -97 R 0.042 -98 V 0.050 -99 R 0.059 -100 H 0.069 -101 M 0.071 -102 H 0.062 -103 V 0.045 -104 C 0.030 -105 G 0.024 -106 G 0.026 -107 S 0.034 -108 L 0.043 -109 I 0.047 -110 N 0.046 -111 S 0.040 -112 Q 0.032 -113 W 0.026 -114 V 0.021 -115 L 0.019 -116 T 0.018 -117 A 0.022 -118 A 0.030 -119 H 0.040 -120 C 0.048 -121 I 0.055 -122 Y 0.065 -123 S 0.082 -124 R 0.097 -125 I 0.096 -126 Q 0.075 -127 Y 0.049 -128 N 0.030 -129 V 0.023 -130 K 0.024 -131 V 0.029 -132 G 0.035 -133 D 0.040 -134 R 0.042 -135 S 0.041 -136 V 0.042 -137 Y 0.051 -138 R 0.071 -139 Q 0.094 -140 N 0.104 -141 T 0.095 -142 S 0.075 -143 L 0.058 -144 V 0.046 -145 I 0.038 -146 P 0.032 -147 I 0.027 -148 K 0.024 -149 T 0.023 -150 I 0.026 -151 F 0.032 -152 V 0.040 -153 H 0.046 -154 P 0.051 -155 K 0.058 -156 F 0.069 -157 S 0.082 -158 T 0.094 -159 T 0.106 -160 I 0.116 -161 V 0.125 -162 V 0.130 -163 K 0.124 -164 N 0.102 -165 D 0.071 -166 I 0.045 -167 A 0.029 -168 L 0.023 -169 L 0.022 -170 K 0.024 -171 L 0.028 -172 Q 0.033 -173 H 0.038 -174 P 0.047 -175 V 0.059 -176 N 0.074 -177 F 0.084 -178 T 0.083 -179 T 0.073 -180 N 0.061 -181 I 0.051 -182 Y 0.045 -183 P 0.042 -184 V 0.040 -185 C 0.043 -186 I 0.055 -187 P 0.071 -188 S 0.084 -189 E 0.086 -190 S 0.078 -191 F 0.068 -192 P 0.059 -193 V 0.056 -194 K 0.057 -195 A 0.059 -196 G 0.055 -197 T 0.044 -198 K 0.031 -199 C 0.022 -200 W 0.020 -201 V 0.022 -202 T 0.027 -203 G 0.034 -204 W 0.046 -205 G 0.063 -206 K 0.083 -207 L 0.105 -208 V 0.126 -209 P 0.141 -210 G 0.148 -211 A 0.153 -212 P 0.156 -213 D 0.156 -214 V 0.149 -215 P 0.132 -216 T 0.110 -217 E 0.093 -218 I 0.086 -219 L 0.084 -220 Q 0.079 -221 E 0.070 -222 V 0.059 -223 D 0.047 -224 Q 0.038 -225 N 0.035 -226 V 0.038 -227 I 0.044 -228 L 0.049 -229 Y 0.050 -230 E 0.046 -231 E 0.043 -232 C 0.049 -233 N 0.062 -234 E 0.075 -235 M 0.077 -236 L 0.075 -237 K 0.077 -238 K 0.091 -239 A 0.118 -240 T 0.152 -241 S 0.179 -242 S 0.191 -243 S 0.190 -244 V 0.180 -245 D 0.162 -246 L 0.139 -247 V 0.115 -248 K 0.090 -249 R 0.068 -250 G 0.052 -251 M 0.040 -252 V 0.034 -253 C 0.033 -254 G 0.040 -255 Y 0.052 -256 K 0.068 -257 E 0.085 -258 R 0.095 -259 G 0.094 -260 K 0.086 -261 D 0.077 -262 A 0.069 -263 C 0.063 -264 Q 0.063 -265 G 0.069 -266 D 0.076 -267 S 0.077 -268 G 0.073 -269 G 0.070 -270 P 0.066 -271 M 0.058 -272 S 0.047 -273 C 0.040 -274 E 0.040 -275 F 0.047 -276 E 0.057 -277 N 0.062 -278 K 0.059 -279 W 0.051 -280 V 0.044 -281 Q 0.043 -282 V 0.046 -283 G 0.049 -284 V 0.049 -285 V 0.048 -286 S 0.049 -287 W 0.055 -288 G 0.061 -289 I 0.063 -290 S 0.063 -291 C 0.067 -292 G 0.078 -293 R 0.089 -294 K 0.093 -295 G 0.089 -296 Y 0.080 -297 P 0.067 -298 G 0.058 -299 V 0.052 -300 Y 0.051 -301 T 0.052 -302 D 0.055 -303 V 0.058 -304 A 0.059 -305 F 0.059 -306 Y 0.061 -307 S 0.064 -308 K 0.063 -309 W 0.054 -310 L 0.044 -311 I 0.040 -312 A 0.047 -313 V 0.071 -314 V 0.114 -315 N 0.172 -316 Q 0.236 -317 A 0.294 -318 D 0.332 -319 C 0.343 -320 L 0.341 -321 H 0.333 -322 P 0.320 -323 V 0.301 -324 V 0.280 -325 F 0.264 -326 L 0.258 -327 V 0.257 -328 L 0.250 -329 L 0.245 -330 L 0.254 -331 C 0.277 -332 S 0.305 -333 L 0.329 -334 T 0.340 -335 S 0.340 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044664.8_ENSMUST00000035715.8_GN:Prss42_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044664.8_ENSMUST00000035715.8_GN:Prss42_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid deleted file mode 100644 index b628a663ab9d64adc59b5a995ccf27b7b99aa80d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000044664.8_ENSMUST00000035715.8_GN:Prss42_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid +++ /dev/null @@ -1,344 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000044664.8|ENSMUST00000035715.8|GN:Prss42|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:8 -1 M 0.440 -2 E 0.468 -3 G 0.501 -4 G 0.501 -5 L 0.453 -6 R 0.403 -7 D 0.412 -8 D 0.455 -9 M 0.458 -10 A 0.428 -11 S 0.448 -12 G 0.534 -13 G 0.621 -14 G 0.655 -15 S 0.639 -16 L 0.585 -17 G 0.505 -18 L 0.423 -19 I 0.358 -20 V 0.307 -21 F 0.267 -22 L 0.254 -23 L 0.270 -24 L 0.297 -25 L 0.327 -26 Q 0.367 -27 P 0.420 -28 K 0.471 -29 P 0.510 -30 C 0.536 -31 E 0.551 -32 A 0.552 -33 W 0.543 -34 A 0.535 -35 A 0.551 -36 A 0.605 -37 S 0.665 -38 V 0.699 -39 L 0.711 -40 S 0.719 -41 T 0.724 -42 S 0.715 -43 G 0.696 -44 F 0.688 -45 P 0.703 -46 S 0.728 -47 G 0.740 -48 F 0.737 -49 S 0.729 -50 E 0.719 -51 A 0.704 -52 P 0.689 -53 R 0.672 -54 D 0.641 -55 N 0.592 -56 P 0.549 -57 P 0.547 -58 P 0.596 -59 P 0.667 -60 T 0.722 -61 R 0.749 -62 V 0.760 -63 R 0.770 -64 M 0.783 -65 S 0.794 -66 K 0.796 -67 A 0.785 -68 T 0.759 -69 T 0.719 -70 R 0.679 -71 S 0.651 -72 P 0.632 -73 F 0.605 -74 M 0.551 -75 N 0.469 -76 F 0.369 -77 S 0.268 -78 L 0.188 -79 V 0.142 -80 C 0.123 -81 G 0.122 -82 Q 0.130 -83 P 0.138 -84 F 0.142 -85 M 0.144 -86 K 0.152 -87 I 0.164 -88 M 0.170 -89 G 0.166 -90 G 0.158 -91 V 0.159 -92 D 0.174 -93 A 0.186 -94 E 0.176 -95 E 0.147 -96 G 0.116 -97 K 0.089 -98 W 0.065 -99 P 0.044 -100 W 0.030 -101 Q 0.022 -102 V 0.021 -103 S 0.024 -104 V 0.032 -105 R 0.041 -106 V 0.050 -107 R 0.058 -108 H 0.068 -109 M 0.070 -110 H 0.061 -111 V 0.045 -112 C 0.030 -113 G 0.024 -114 G 0.026 -115 S 0.034 -116 L 0.043 -117 I 0.048 -118 N 0.046 -119 S 0.040 -120 Q 0.032 -121 W 0.026 -122 V 0.021 -123 L 0.018 -124 T 0.018 -125 A 0.022 -126 A 0.030 -127 H 0.040 -128 C 0.049 -129 I 0.056 -130 Y 0.066 -131 S 0.082 -132 R 0.097 -133 I 0.097 -134 Q 0.076 -135 Y 0.049 -136 N 0.031 -137 V 0.023 -138 K 0.024 -139 V 0.029 -140 G 0.035 -141 D 0.040 -142 R 0.042 -143 S 0.041 -144 V 0.043 -145 Y 0.052 -146 R 0.072 -147 Q 0.094 -148 N 0.104 -149 T 0.095 -150 S 0.075 -151 L 0.057 -152 V 0.046 -153 I 0.038 -154 P 0.032 -155 I 0.027 -156 K 0.024 -157 T 0.023 -158 I 0.026 -159 F 0.032 -160 V 0.039 -161 H 0.045 -162 P 0.050 -163 K 0.058 -164 F 0.069 -165 S 0.081 -166 T 0.093 -167 T 0.104 -168 I 0.115 -169 V 0.124 -170 V 0.129 -171 K 0.123 -172 N 0.101 -173 D 0.071 -174 I 0.045 -175 A 0.029 -176 L 0.022 -177 L 0.021 -178 K 0.024 -179 L 0.028 -180 Q 0.032 -181 H 0.038 -182 P 0.046 -183 V 0.059 -184 N 0.073 -185 F 0.083 -186 T 0.082 -187 T 0.073 -188 N 0.060 -189 I 0.050 -190 Y 0.045 -191 P 0.041 -192 V 0.040 -193 C 0.043 -194 I 0.054 -195 P 0.071 -196 S 0.084 -197 E 0.085 -198 S 0.077 -199 F 0.067 -200 P 0.058 -201 V 0.055 -202 K 0.057 -203 A 0.059 -204 G 0.055 -205 T 0.044 -206 K 0.031 -207 C 0.022 -208 W 0.020 -209 V 0.022 -210 T 0.027 -211 G 0.034 -212 W 0.046 -213 G 0.062 -214 K 0.082 -215 L 0.104 -216 V 0.125 -217 P 0.140 -218 G 0.147 -219 A 0.151 -220 P 0.153 -221 D 0.153 -222 V 0.147 -223 P 0.130 -224 T 0.108 -225 E 0.092 -226 I 0.085 -227 L 0.083 -228 Q 0.079 -229 E 0.070 -230 V 0.059 -231 D 0.047 -232 Q 0.038 -233 N 0.035 -234 V 0.038 -235 I 0.044 -236 L 0.049 -237 Y 0.049 -238 E 0.045 -239 E 0.043 -240 C 0.048 -241 N 0.061 -242 E 0.073 -243 M 0.076 -244 L 0.074 -245 K 0.077 -246 K 0.091 -247 A 0.118 -248 T 0.151 -249 S 0.179 -250 S 0.190 -251 S 0.189 -252 V 0.179 -253 D 0.161 -254 L 0.138 -255 V 0.114 -256 K 0.090 -257 R 0.068 -258 G 0.052 -259 M 0.040 -260 V 0.034 -261 C 0.033 -262 G 0.040 -263 Y 0.052 -264 K 0.069 -265 E 0.086 -266 R 0.096 -267 G 0.095 -268 K 0.086 -269 D 0.078 -270 A 0.070 -271 C 0.064 -272 Q 0.063 -273 G 0.069 -274 D 0.076 -275 S 0.077 -276 G 0.073 -277 G 0.070 -278 P 0.067 -279 M 0.058 -280 S 0.047 -281 C 0.040 -282 E 0.041 -283 F 0.048 -284 E 0.057 -285 N 0.063 -286 K 0.060 -287 W 0.051 -288 V 0.045 -289 Q 0.044 -290 V 0.047 -291 G 0.049 -292 V 0.049 -293 V 0.048 -294 S 0.049 -295 W 0.055 -296 G 0.062 -297 I 0.064 -298 S 0.064 -299 C 0.068 -300 G 0.079 -301 R 0.090 -302 K 0.094 -303 G 0.090 -304 Y 0.080 -305 P 0.068 -306 G 0.058 -307 V 0.052 -308 Y 0.051 -309 T 0.053 -310 D 0.056 -311 V 0.058 -312 A 0.059 -313 F 0.056 -314 Y 0.050 -315 S 0.042 -316 K 0.035 -317 W 0.032 -318 L 0.032 -319 I 0.036 -320 A 0.047 -321 V 0.071 -322 V 0.114 -323 N 0.172 -324 Q 0.236 -325 A 0.295 -326 D 0.333 -327 C 0.345 -328 L 0.342 -329 H 0.335 -330 P 0.322 -331 V 0.305 -332 V 0.291 -333 F 0.284 -334 L 0.284 -335 V 0.283 -336 L 0.274 -337 L 0.266 -338 L 0.269 -339 C 0.285 -340 S 0.308 -341 L 0.330 -342 T 0.341 -343 S 0.341 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000045107.6_ENSMUST00000059666.6_GN:Saysd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000045107.6_ENSMUST00000059666.6_GN:Saysd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 0a0548bb046dd2aee5f59f3b30fc659f468951a2..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000045107.6_ENSMUST00000059666.6_GN:Saysd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,189 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000045107.6|ENSMUST00000059666.6|GN:Saysd1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.282 -2 E 0.264 -3 Q 0.235 -4 R 0.206 -5 L 0.184 -6 A 0.172 -7 E 0.163 -8 F 0.155 -9 R 0.152 -10 E 0.159 -11 A 0.176 -12 R 0.203 -13 K 0.247 -14 R 0.314 -15 A 0.406 -16 S 0.511 -17 L 0.605 -18 V 0.667 -19 A 0.697 -20 Q 0.714 -21 P 0.737 -22 S 0.764 -23 T 0.782 -24 S 0.784 -25 S 0.778 -26 Q 0.762 -27 S 0.723 -28 V 0.668 -29 Q 0.644 -30 T 0.683 -31 S 0.749 -32 G 0.790 -33 A 0.799 -34 K 0.793 -35 A 0.784 -36 E 0.783 -37 P 0.792 -38 A 0.802 -39 A 0.805 -40 A 0.799 -41 T 0.792 -42 P 0.789 -43 K 0.785 -44 T 0.766 -45 A 0.717 -46 T 0.638 -47 G 0.536 -48 W 0.427 -49 L 0.342 -50 T 0.300 -51 R 0.305 -52 F 0.355 -53 L 0.448 -54 K 0.563 -55 R 0.665 -56 K 0.729 -57 A 0.756 -58 N 0.767 -59 P 0.780 -60 A 0.801 -61 I 0.817 -62 A 0.819 -63 Q 0.808 -64 A 0.795 -65 Q 0.787 -66 P 0.785 -67 N 0.789 -68 Q 0.794 -69 P 0.802 -70 Q 0.815 -71 E 0.830 -72 A 0.836 -73 G 0.828 -74 Q 0.814 -75 Q 0.806 -76 L 0.808 -77 P 0.815 -78 E 0.819 -79 S 0.811 -80 T 0.786 -81 A 0.748 -82 V 0.713 -83 P 0.688 -84 L 0.667 -85 P 0.644 -86 S 0.613 -87 S 0.572 -88 C 0.527 -89 R 0.485 -90 Q 0.442 -91 S 0.387 -92 F 0.336 -93 L 0.317 -94 T 0.329 -95 N 0.329 -96 I 0.286 -97 T 0.220 -98 F 0.171 -99 L 0.146 -100 K 0.134 -101 V 0.128 -102 L 0.127 -103 L 0.127 -104 W 0.124 -105 L 0.118 -106 V 0.111 -107 L 0.104 -108 L 0.098 -109 G 0.092 -110 L 0.086 -111 F 0.089 -112 V 0.106 -113 E 0.128 -114 L 0.140 -115 E 0.131 -116 F 0.109 -117 G 0.087 -118 L 0.069 -119 A 0.056 -120 Y 0.047 -121 F 0.042 -122 V 0.042 -123 L 0.044 -124 S 0.047 -125 M 0.048 -126 F 0.044 -127 Y 0.039 -128 W 0.038 -129 M 0.049 -130 Y 0.077 -131 V 0.122 -132 G 0.177 -133 T 0.243 -134 R 0.322 -135 G 0.405 -136 P 0.471 -137 E 0.505 -138 E 0.517 -139 K 0.527 -140 K 0.541 -141 E 0.557 -142 G 0.565 -143 E 0.561 -144 K 0.554 -145 S 0.548 -146 A 0.534 -147 Y 0.508 -148 S 0.486 -149 V 0.480 -150 F 0.495 -151 N 0.527 -152 P 0.569 -153 G 0.608 -154 C 0.640 -155 E 0.670 -156 A 0.697 -157 I 0.717 -158 Q 0.723 -159 G 0.707 -160 T 0.667 -161 L 0.613 -162 T 0.553 -163 A 0.490 -164 E 0.431 -165 Q 0.379 -166 L 0.333 -167 E 0.295 -168 Q 0.273 -169 E 0.273 -170 L 0.291 -171 Q 0.329 -172 L 0.392 -173 R 0.477 -174 P 0.568 -175 P 0.651 -176 Q 0.714 -177 G 0.750 -178 S 0.759 -179 R 0.745 -180 T 0.723 -181 S 0.711 -182 P 0.712 -183 S 0.717 -184 C 0.711 -185 S 0.683 -186 S 0.629 -187 Y 0.557 -188 P 0.502 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000045107.6_ENSMUST00000059666.6_GN:Saysd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000045107.6_ENSMUST00000059666.6_GN:Saysd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid deleted file mode 100644 index 7b5ec60cdff137243a242e40db799e06682be43e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000045107.6_ENSMUST00000059666.6_GN:Saysd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:32.caid +++ /dev/null @@ -1,221 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000045107.6|ENSMUST00000059666.6|GN:Saysd1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:32 -1 M 0.536 -2 Q 0.587 -3 R 0.658 -4 A 0.719 -5 G 0.755 -6 A 0.769 -7 T 0.773 -8 E 0.775 -9 G 0.774 -10 H 0.767 -11 V 0.757 -12 R 0.755 -13 R 0.765 -14 R 0.782 -15 T 0.797 -16 A 0.802 -17 A 0.798 -18 E 0.788 -19 D 0.776 -20 R 0.771 -21 P 0.775 -22 G 0.779 -23 H 0.779 -24 T 0.776 -25 P 0.777 -26 A 0.782 -27 S 0.782 -28 G 0.773 -29 R 0.750 -30 L 0.707 -31 R 0.636 -32 T 0.535 -33 M 0.417 -34 E 0.309 -35 Q 0.236 -36 R 0.200 -37 L 0.190 -38 A 0.195 -39 E 0.198 -40 F 0.191 -41 R 0.181 -42 E 0.184 -43 A 0.201 -44 R 0.229 -45 K 0.279 -46 R 0.362 -47 A 0.474 -48 S 0.589 -49 L 0.680 -50 V 0.731 -51 A 0.749 -52 Q 0.759 -53 P 0.779 -54 S 0.806 -55 T 0.824 -56 S 0.829 -57 S 0.825 -58 Q 0.809 -59 S 0.766 -60 V 0.703 -61 Q 0.672 -62 T 0.710 -63 S 0.777 -64 G 0.819 -65 A 0.827 -66 K 0.820 -67 A 0.811 -68 E 0.809 -69 P 0.817 -70 A 0.827 -71 A 0.830 -72 A 0.824 -73 T 0.816 -74 P 0.813 -75 K 0.808 -76 T 0.786 -77 A 0.734 -78 T 0.654 -79 G 0.555 -80 W 0.450 -81 L 0.366 -82 T 0.322 -83 R 0.324 -84 F 0.371 -85 L 0.463 -86 K 0.576 -87 R 0.675 -88 K 0.738 -89 A 0.765 -90 N 0.774 -91 P 0.786 -92 A 0.805 -93 I 0.820 -94 A 0.822 -95 Q 0.813 -96 A 0.800 -97 Q 0.791 -98 P 0.789 -99 N 0.792 -100 Q 0.798 -101 P 0.806 -102 Q 0.818 -103 E 0.832 -104 A 0.837 -105 G 0.828 -106 Q 0.813 -107 Q 0.804 -108 L 0.805 -109 P 0.810 -110 E 0.812 -111 S 0.802 -112 T 0.775 -113 A 0.737 -114 V 0.701 -115 P 0.674 -116 L 0.651 -117 P 0.624 -118 S 0.587 -119 S 0.541 -120 C 0.490 -121 R 0.446 -122 Q 0.404 -123 S 0.355 -124 F 0.311 -125 L 0.295 -126 T 0.305 -127 N 0.303 -128 I 0.263 -129 T 0.204 -130 F 0.161 -131 L 0.139 -132 K 0.130 -133 V 0.126 -134 L 0.127 -135 L 0.127 -136 W 0.123 -137 L 0.117 -138 V 0.109 -139 L 0.103 -140 L 0.098 -141 G 0.093 -142 L 0.088 -143 F 0.093 -144 V 0.111 -145 E 0.134 -146 L 0.145 -147 E 0.136 -148 F 0.113 -149 G 0.088 -150 L 0.070 -151 A 0.057 -152 Y 0.048 -153 F 0.043 -154 V 0.043 -155 L 0.046 -156 S 0.049 -157 M 0.049 -158 F 0.045 -159 Y 0.039 -160 W 0.038 -161 M 0.050 -162 Y 0.079 -163 V 0.123 -164 G 0.179 -165 T 0.247 -166 R 0.331 -167 G 0.422 -168 P 0.494 -169 E 0.531 -170 E 0.542 -171 K 0.550 -172 K 0.564 -173 E 0.579 -174 G 0.583 -175 E 0.572 -176 K 0.558 -177 S 0.547 -178 A 0.532 -179 Y 0.507 -180 S 0.487 -181 V 0.487 -182 F 0.506 -183 N 0.540 -184 P 0.582 -185 G 0.620 -186 C 0.649 -187 E 0.676 -188 A 0.702 -189 I 0.720 -190 Q 0.723 -191 G 0.705 -192 T 0.663 -193 L 0.609 -194 T 0.552 -195 A 0.495 -196 E 0.440 -197 Q 0.390 -198 L 0.342 -199 E 0.301 -200 Q 0.278 -201 E 0.278 -202 L 0.296 -203 Q 0.332 -204 L 0.392 -205 R 0.475 -206 P 0.566 -207 P 0.649 -208 Q 0.712 -209 G 0.749 -210 S 0.757 -211 R 0.743 -212 T 0.722 -213 S 0.710 -214 P 0.713 -215 S 0.719 -216 C 0.715 -217 S 0.690 -218 S 0.637 -219 Y 0.565 -220 P 0.510 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000045316.6_ENSMUST00000049642.7_GN:Fahd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000045316.6_ENSMUST00000049642.7_GN:Fahd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 00d6f50a900ea5609c7b1b4df3ecec774b8cd0e8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000045316.6_ENSMUST00000049642.7_GN:Fahd1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,222 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000045316.6|ENSMUST00000049642.7|GN:Fahd1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.357 -2 A 0.348 -3 S 0.337 -4 T 0.323 -5 K 0.294 -6 P 0.245 -7 L 0.189 -8 S 0.143 -9 R 0.111 -10 F 0.090 -11 W 0.073 -12 E 0.058 -13 W 0.046 -14 G 0.040 -15 K 0.039 -16 N 0.043 -17 I 0.047 -18 V 0.055 -19 C 0.067 -20 V 0.079 -21 G 0.084 -22 R 0.083 -23 N 0.082 -24 Y 0.081 -25 A 0.080 -26 D 0.081 -27 H 0.082 -28 V 0.083 -29 K 0.084 -30 E 0.090 -31 M 0.105 -32 R 0.129 -33 S 0.159 -34 T 0.179 -35 V 0.178 -36 L 0.160 -37 S 0.143 -38 E 0.135 -39 P 0.125 -40 V 0.105 -41 L 0.082 -42 F 0.068 -43 L 0.065 -44 K 0.068 -45 P 0.073 -46 S 0.080 -47 T 0.088 -48 A 0.098 -49 Y 0.107 -50 A 0.116 -51 P 0.125 -52 E 0.134 -53 G 0.140 -54 S 0.140 -55 P 0.135 -56 V 0.127 -57 L 0.120 -58 M 0.115 -59 P 0.107 -60 A 0.095 -61 Y 0.087 -62 C 0.081 -63 R 0.078 -64 N 0.079 -65 L 0.085 -66 H 0.093 -67 H 0.094 -68 E 0.085 -69 V 0.072 -70 E 0.060 -71 L 0.050 -72 G 0.044 -73 V 0.048 -74 L 0.060 -75 L 0.075 -76 G 0.087 -77 K 0.093 -78 R 0.097 -79 G 0.099 -80 E 0.101 -81 A 0.104 -82 I 0.106 -83 P 0.103 -84 E 0.096 -85 A 0.088 -86 A 0.075 -87 A 0.058 -88 M 0.046 -89 D 0.040 -90 Y 0.039 -91 V 0.041 -92 A 0.044 -93 G 0.048 -94 Y 0.048 -95 A 0.047 -96 L 0.046 -97 C 0.046 -98 L 0.048 -99 D 0.052 -100 M 0.054 -101 T 0.055 -102 A 0.055 -103 R 0.057 -104 D 0.060 -105 V 0.062 -106 Q 0.064 -107 E 0.069 -108 E 0.076 -109 C 0.087 -110 K 0.101 -111 K 0.114 -112 K 0.121 -113 G 0.122 -114 L 0.115 -115 P 0.101 -116 W 0.084 -117 T 0.073 -118 L 0.071 -119 A 0.075 -120 K 0.081 -121 S 0.091 -122 F 0.108 -123 T 0.121 -124 S 0.119 -125 S 0.103 -126 C 0.084 -127 P 0.068 -128 V 0.053 -129 S 0.043 -130 A 0.037 -131 F 0.037 -132 V 0.038 -133 P 0.036 -134 K 0.034 -135 E 0.036 -136 K 0.043 -137 I 0.050 -138 P 0.053 -139 D 0.053 -140 P 0.050 -141 H 0.046 -142 A 0.041 -143 L 0.036 -144 R 0.031 -145 L 0.027 -146 W 0.024 -147 L 0.024 -148 K 0.029 -149 V 0.037 -150 N 0.046 -151 G 0.056 -152 E 0.066 -153 L 0.071 -154 R 0.070 -155 Q 0.065 -156 E 0.062 -157 G 0.060 -158 K 0.061 -159 T 0.062 -160 S 0.063 -161 S 0.063 -162 M 0.060 -163 I 0.055 -164 F 0.053 -165 S 0.051 -166 I 0.049 -167 P 0.046 -168 Y 0.044 -169 I 0.041 -170 I 0.038 -171 S 0.035 -172 Y 0.035 -173 V 0.038 -174 S 0.041 -175 K 0.045 -176 I 0.051 -177 I 0.059 -178 T 0.064 -179 L 0.063 -180 E 0.058 -181 E 0.055 -182 G 0.058 -183 D 0.065 -184 L 0.069 -185 I 0.069 -186 L 0.067 -187 T 0.069 -188 G 0.077 -189 T 0.090 -190 P 0.101 -191 K 0.105 -192 G 0.100 -193 V 0.092 -194 G 0.085 -195 P 0.078 -196 I 0.071 -197 K 0.069 -198 E 0.070 -199 N 0.072 -200 D 0.071 -201 E 0.064 -202 I 0.055 -203 E 0.048 -204 A 0.046 -205 G 0.047 -206 I 0.047 -207 D 0.046 -208 G 0.043 -209 V 0.040 -210 V 0.036 -211 S 0.035 -212 M 0.034 -213 R 0.033 -214 F 0.033 -215 K 0.038 -216 V 0.049 -217 K 0.069 -218 R 0.098 -219 S 0.135 -220 E 0.168 -221 Y 0.189 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000045316.6_ENSMUST00000049642.7_GN:Fahd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000045316.6_ENSMUST00000049642.7_GN:Fahd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:6.caid deleted file mode 100644 index 944c0683e623f12884acce8e6ff7a72f4d01bd9e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000045316.6_ENSMUST00000049642.7_GN:Fahd1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:6.caid +++ /dev/null @@ -1,228 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000045316.6|ENSMUST00000049642.7|GN:Fahd1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:6 -1 M 0.360 -2 T 0.354 -3 Q 0.368 -4 S 0.414 -5 C 0.466 -6 T 0.489 -7 M 0.478 -8 A 0.441 -9 S 0.391 -10 T 0.343 -11 K 0.298 -12 P 0.247 -13 L 0.193 -14 S 0.144 -15 R 0.111 -16 F 0.090 -17 W 0.074 -18 E 0.059 -19 W 0.047 -20 G 0.041 -21 K 0.041 -22 N 0.044 -23 I 0.048 -24 V 0.055 -25 C 0.067 -26 V 0.079 -27 G 0.084 -28 R 0.083 -29 N 0.082 -30 Y 0.081 -31 A 0.080 -32 D 0.080 -33 H 0.082 -34 V 0.082 -35 K 0.083 -36 E 0.090 -37 M 0.105 -38 R 0.131 -39 S 0.160 -40 T 0.181 -41 V 0.180 -42 L 0.162 -43 S 0.144 -44 E 0.136 -45 P 0.126 -46 V 0.106 -47 L 0.083 -48 F 0.069 -49 L 0.066 -50 K 0.070 -51 P 0.075 -52 S 0.081 -53 T 0.090 -54 A 0.100 -55 Y 0.109 -56 A 0.118 -57 P 0.127 -58 E 0.136 -59 G 0.142 -60 S 0.143 -61 P 0.136 -62 V 0.128 -63 L 0.120 -64 M 0.114 -65 P 0.105 -66 A 0.094 -67 Y 0.086 -68 C 0.081 -69 R 0.077 -70 N 0.079 -71 L 0.085 -72 H 0.093 -73 H 0.094 -74 E 0.085 -75 V 0.072 -76 E 0.059 -77 L 0.049 -78 G 0.044 -79 V 0.048 -80 L 0.061 -81 L 0.077 -82 G 0.089 -83 K 0.095 -84 R 0.098 -85 G 0.099 -86 E 0.101 -87 A 0.104 -88 I 0.106 -89 P 0.103 -90 E 0.097 -91 A 0.089 -92 A 0.075 -93 A 0.059 -94 M 0.047 -95 D 0.040 -96 Y 0.039 -97 V 0.041 -98 A 0.044 -99 G 0.047 -100 Y 0.048 -101 A 0.047 -102 L 0.046 -103 C 0.046 -104 L 0.048 -105 D 0.052 -106 M 0.054 -107 T 0.054 -108 A 0.054 -109 R 0.057 -110 D 0.060 -111 V 0.062 -112 Q 0.064 -113 E 0.069 -114 E 0.076 -115 C 0.087 -116 K 0.101 -117 K 0.114 -118 K 0.122 -119 G 0.122 -120 L 0.116 -121 P 0.101 -122 W 0.084 -123 T 0.073 -124 L 0.072 -125 A 0.076 -126 K 0.082 -127 S 0.093 -128 F 0.110 -129 T 0.123 -130 S 0.121 -131 S 0.105 -132 C 0.086 -133 P 0.069 -134 V 0.054 -135 S 0.043 -136 A 0.038 -137 F 0.037 -138 V 0.038 -139 P 0.037 -140 K 0.035 -141 E 0.037 -142 K 0.043 -143 I 0.050 -144 P 0.054 -145 D 0.053 -146 P 0.051 -147 H 0.046 -148 A 0.041 -149 L 0.036 -150 R 0.031 -151 L 0.027 -152 W 0.024 -153 L 0.024 -154 K 0.029 -155 V 0.037 -156 N 0.046 -157 G 0.057 -158 E 0.066 -159 L 0.071 -160 R 0.070 -161 Q 0.065 -162 E 0.062 -163 G 0.061 -164 K 0.061 -165 T 0.062 -166 S 0.063 -167 S 0.063 -168 M 0.060 -169 I 0.055 -170 F 0.053 -171 S 0.052 -172 I 0.050 -173 P 0.047 -174 Y 0.044 -175 I 0.042 -176 I 0.038 -177 S 0.036 -178 Y 0.036 -179 V 0.038 -180 S 0.041 -181 K 0.045 -182 I 0.051 -183 I 0.059 -184 T 0.065 -185 L 0.064 -186 E 0.059 -187 E 0.056 -188 G 0.059 -189 D 0.065 -190 L 0.069 -191 I 0.069 -192 L 0.067 -193 T 0.069 -194 G 0.077 -195 T 0.090 -196 P 0.101 -197 K 0.105 -198 G 0.100 -199 V 0.092 -200 G 0.085 -201 P 0.079 -202 I 0.072 -203 K 0.070 -204 E 0.071 -205 N 0.074 -206 D 0.072 -207 E 0.065 -208 I 0.055 -209 E 0.048 -210 A 0.046 -211 G 0.047 -212 I 0.047 -213 D 0.046 -214 G 0.043 -215 V 0.040 -216 V 0.036 -217 S 0.035 -218 M 0.035 -219 R 0.033 -220 F 0.034 -221 K 0.038 -222 V 0.051 -223 K 0.072 -224 R 0.102 -225 S 0.140 -226 E 0.174 -227 Y 0.194 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000046345.6_ENSMUST00000093183.5_GN:Smco1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000046345.6_ENSMUST00000093183.5_GN:Smco1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index c56b3b421a529eb6823c2b96f77740b3e958700b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000046345.6_ENSMUST00000093183.5_GN:Smco1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,215 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000046345.6|ENSMUST00000093183.5|GN:Smco1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.395 -2 T 0.397 -3 H 0.404 -4 E 0.409 -5 T 0.403 -6 T 0.385 -7 T 0.350 -8 L 0.297 -9 I 0.241 -10 S 0.197 -11 L 0.169 -12 K 0.152 -13 E 0.144 -14 A 0.142 -15 M 0.141 -16 K 0.142 -17 R 0.147 -18 V 0.157 -19 D 0.164 -20 N 0.163 -21 K 0.156 -22 L 0.152 -23 R 0.155 -24 A 0.164 -25 L 0.174 -26 D 0.183 -27 T 0.195 -28 Q 0.207 -29 F 0.217 -30 K 0.225 -31 E 0.233 -32 L 0.240 -33 D 0.248 -34 V 0.262 -35 T 0.274 -36 K 0.270 -37 D 0.252 -38 N 0.226 -39 L 0.191 -40 T 0.155 -41 L 0.130 -42 R 0.121 -43 F 0.121 -44 E 0.124 -45 H 0.130 -46 H 0.138 -47 S 0.148 -48 K 0.163 -49 T 0.181 -50 L 0.200 -51 A 0.207 -52 S 0.197 -53 Q 0.177 -54 A 0.154 -55 A 0.131 -56 Q 0.111 -57 D 0.096 -58 E 0.081 -59 I 0.068 -60 W 0.059 -61 T 0.057 -62 A 0.059 -63 A 0.066 -64 L 0.079 -65 A 0.097 -66 L 0.110 -67 G 0.107 -68 F 0.089 -69 T 0.070 -70 S 0.058 -71 M 0.053 -72 E 0.050 -73 L 0.046 -74 N 0.042 -75 I 0.040 -76 V 0.038 -77 Y 0.035 -78 S 0.031 -79 Y 0.027 -80 V 0.024 -81 I 0.021 -82 E 0.019 -83 V 0.017 -84 L 0.016 -85 I 0.018 -86 C 0.024 -87 L 0.030 -88 H 0.034 -89 T 0.036 -90 R 0.035 -91 M 0.034 -92 L 0.037 -93 Q 0.046 -94 K 0.058 -95 L 0.065 -96 P 0.063 -97 D 0.055 -98 L 0.047 -99 V 0.042 -100 R 0.042 -101 S 0.050 -102 L 0.056 -103 P 0.052 -104 T 0.040 -105 L 0.029 -106 A 0.024 -107 S 0.024 -108 V 0.027 -109 L 0.033 -110 R 0.043 -111 R 0.053 -112 K 0.063 -113 A 0.075 -114 K 0.088 -115 N 0.094 -116 K 0.086 -117 H 0.067 -118 V 0.050 -119 R 0.041 -120 L 0.039 -121 V 0.037 -122 W 0.034 -123 E 0.032 -124 S 0.033 -125 V 0.034 -126 L 0.035 -127 Q 0.041 -128 E 0.052 -129 Y 0.064 -130 G 0.071 -131 L 0.065 -132 Q 0.051 -133 E 0.040 -134 R 0.036 -135 D 0.034 -136 V 0.031 -137 S 0.025 -138 A 0.020 -139 L 0.019 -140 C 0.019 -141 T 0.021 -142 F 0.025 -143 F 0.032 -144 I 0.042 -145 V 0.056 -146 H 0.072 -147 G 0.091 -148 N 0.107 -149 K 0.116 -150 G 0.114 -151 E 0.104 -152 H 0.091 -153 Y 0.080 -154 A 0.075 -155 A 0.073 -156 N 0.072 -157 V 0.068 -158 R 0.061 -159 R 0.054 -160 M 0.049 -161 Y 0.046 -162 I 0.043 -163 K 0.039 -164 D 0.035 -165 V 0.032 -166 S 0.032 -167 F 0.035 -168 M 0.042 -169 I 0.052 -170 T 0.062 -171 N 0.072 -172 M 0.084 -173 V 0.099 -174 K 0.112 -175 N 0.114 -176 Q 0.102 -177 A 0.084 -178 L 0.071 -179 Q 0.063 -180 D 0.061 -181 G 0.060 -182 L 0.058 -183 L 0.054 -184 R 0.051 -185 A 0.054 -186 V 0.067 -187 Q 0.079 -188 I 0.085 -189 I 0.088 -190 E 0.101 -191 K 0.128 -192 G 0.167 -193 K 0.217 -194 Q 0.268 -195 A 0.312 -196 Q 0.350 -197 D 0.385 -198 P 0.411 -199 E 0.431 -200 N 0.457 -201 S 0.489 -202 R 0.519 -203 A 0.542 -204 P 0.555 -205 L 0.553 -206 K 0.534 -207 E 0.501 -208 L 0.462 -209 M 0.438 -210 P 0.447 -211 P 0.476 -212 V 0.484 -213 K 0.455 -214 D 0.418 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000046345.6_ENSMUST00000093183.5_GN:Smco1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:37.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000046345.6_ENSMUST00000093183.5_GN:Smco1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:37.caid deleted file mode 100644 index 703eccf8c112b577695a48e00f2ba27cf7cf482f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000046345.6_ENSMUST00000093183.5_GN:Smco1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:37.caid +++ /dev/null @@ -1,252 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000046345.6|ENSMUST00000093183.5|GN:Smco1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:37 -1 M 0.379 -2 F 0.405 -3 P 0.448 -4 S 0.499 -5 P 0.548 -6 L 0.593 -7 P 0.635 -8 V 0.664 -9 A 0.672 -10 E 0.664 -11 W 0.664 -12 K 0.682 -13 T 0.707 -14 A 0.724 -15 E 0.734 -16 G 0.745 -17 L 0.754 -18 G 0.751 -19 S 0.736 -20 Q 0.719 -21 E 0.709 -22 C 0.701 -23 S 0.690 -24 S 0.672 -25 C 0.645 -26 C 0.614 -27 V 0.586 -28 P 0.558 -29 F 0.514 -30 P 0.444 -31 F 0.359 -32 L 0.284 -33 F 0.233 -34 L 0.206 -35 L 0.206 -36 Q 0.239 -37 K 0.301 -38 M 0.372 -39 T 0.432 -40 H 0.466 -41 E 0.476 -42 T 0.468 -43 T 0.451 -44 T 0.419 -45 L 0.364 -46 I 0.300 -47 S 0.250 -48 L 0.217 -49 K 0.194 -50 E 0.180 -51 A 0.177 -52 M 0.177 -53 K 0.179 -54 R 0.188 -55 V 0.197 -56 D 0.199 -57 N 0.191 -58 K 0.180 -59 L 0.173 -60 R 0.175 -61 A 0.184 -62 L 0.193 -63 D 0.202 -64 T 0.215 -65 Q 0.230 -66 F 0.242 -67 K 0.250 -68 E 0.258 -69 L 0.263 -70 D 0.267 -71 V 0.281 -72 T 0.293 -73 K 0.286 -74 D 0.261 -75 N 0.229 -76 L 0.193 -77 T 0.158 -78 L 0.135 -79 R 0.126 -80 F 0.126 -81 E 0.132 -82 H 0.141 -83 H 0.151 -84 S 0.161 -85 K 0.173 -86 T 0.189 -87 L 0.207 -88 A 0.216 -89 S 0.209 -90 Q 0.190 -91 A 0.166 -92 A 0.141 -93 Q 0.118 -94 D 0.098 -95 E 0.081 -96 I 0.067 -97 W 0.058 -98 T 0.055 -99 A 0.056 -100 A 0.061 -101 L 0.074 -102 A 0.093 -103 L 0.110 -104 G 0.110 -105 F 0.094 -106 T 0.074 -107 S 0.061 -108 M 0.056 -109 E 0.052 -110 L 0.049 -111 N 0.046 -112 I 0.045 -113 V 0.044 -114 Y 0.040 -115 S 0.036 -116 Y 0.031 -117 V 0.027 -118 I 0.024 -119 E 0.022 -120 V 0.019 -121 L 0.017 -122 I 0.018 -123 C 0.022 -124 L 0.028 -125 H 0.034 -126 T 0.039 -127 R 0.042 -128 M 0.043 -129 L 0.045 -130 Q 0.052 -131 K 0.064 -132 L 0.070 -133 P 0.065 -134 D 0.055 -135 L 0.046 -136 V 0.041 -137 R 0.043 -138 S 0.051 -139 L 0.056 -140 P 0.051 -141 T 0.038 -142 L 0.027 -143 A 0.023 -144 S 0.023 -145 V 0.027 -146 L 0.034 -147 R 0.044 -148 R 0.054 -149 K 0.064 -150 A 0.077 -151 K 0.093 -152 N 0.101 -153 K 0.094 -154 H 0.075 -155 V 0.056 -156 R 0.044 -157 L 0.039 -158 V 0.036 -159 W 0.034 -160 E 0.033 -161 S 0.033 -162 V 0.034 -163 L 0.035 -164 Q 0.041 -165 E 0.052 -166 Y 0.066 -167 G 0.074 -168 L 0.069 -169 Q 0.055 -170 E 0.043 -171 R 0.037 -172 D 0.035 -173 V 0.032 -174 S 0.027 -175 A 0.023 -176 L 0.022 -177 C 0.022 -178 T 0.023 -179 F 0.027 -180 F 0.036 -181 I 0.048 -182 V 0.060 -183 H 0.075 -184 G 0.093 -185 N 0.108 -186 K 0.115 -187 G 0.114 -188 E 0.105 -189 H 0.094 -190 Y 0.084 -191 A 0.078 -192 A 0.073 -193 N 0.069 -194 V 0.063 -195 R 0.057 -196 R 0.052 -197 M 0.049 -198 Y 0.047 -199 I 0.044 -200 K 0.039 -201 D 0.033 -202 V 0.031 -203 S 0.031 -204 F 0.033 -205 M 0.039 -206 I 0.049 -207 T 0.059 -208 N 0.069 -209 M 0.081 -210 V 0.098 -211 K 0.113 -212 N 0.116 -213 Q 0.103 -214 A 0.085 -215 L 0.073 -216 Q 0.067 -217 D 0.064 -218 G 0.062 -219 L 0.059 -220 L 0.055 -221 R 0.053 -222 A 0.056 -223 V 0.068 -224 Q 0.081 -225 I 0.087 -226 I 0.094 -227 E 0.112 -228 K 0.142 -229 G 0.187 -230 K 0.242 -231 Q 0.299 -232 A 0.346 -233 Q 0.385 -234 D 0.420 -235 P 0.450 -236 E 0.473 -237 N 0.499 -238 S 0.529 -239 R 0.558 -240 A 0.582 -241 P 0.600 -242 L 0.607 -243 K 0.595 -244 E 0.560 -245 L 0.513 -246 M 0.482 -247 P 0.493 -248 P 0.529 -249 V 0.543 -250 K 0.513 -251 D 0.473 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000046519.17_ENSMUST00000177390.8_GN:Golph3l_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000046519.17_ENSMUST00000177390.8_GN:Golph3l_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index b627a0b30717d70be68f4fb11d560523ca71436d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000046519.17_ENSMUST00000177390.8_GN:Golph3l_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,286 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000046519.17|ENSMUST00000177390.8|GN:Golph3l|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.404 -2 T 0.411 -3 T 0.431 -4 L 0.460 -5 T 0.487 -6 H 0.510 -7 R 0.539 -8 T 0.567 -9 R 0.569 -10 R 0.535 -11 T 0.492 -12 E 0.462 -13 V 0.440 -14 S 0.404 -15 K 0.371 -16 S 0.372 -17 S 0.396 -18 E 0.412 -19 K 0.424 -20 K 0.445 -21 I 0.463 -22 E 0.479 -23 S 0.514 -24 E 0.562 -25 E 0.599 -26 D 0.619 -27 T 0.622 -28 N 0.612 -29 Q 0.599 -30 E 0.586 -31 R 0.581 -32 S 0.590 -33 P 0.608 -34 D 0.616 -35 N 0.605 -36 E 0.583 -37 D 0.567 -38 P 0.560 -39 G 0.552 -40 D 0.526 -41 S 0.468 -42 K 0.383 -43 D 0.288 -44 I 0.201 -45 R 0.132 -46 L 0.086 -47 T 0.057 -48 L 0.040 -49 M 0.032 -50 E 0.028 -51 E 0.027 -52 V 0.026 -53 L 0.029 -54 L 0.040 -55 L 0.058 -56 G 0.074 -57 L 0.080 -58 K 0.080 -59 D 0.086 -60 K 0.104 -61 E 0.126 -62 G 0.140 -63 Y 0.140 -64 T 0.130 -65 S 0.120 -66 F 0.115 -67 W 0.112 -68 N 0.105 -69 D 0.092 -70 C 0.080 -71 I 0.071 -72 S 0.065 -73 S 0.065 -74 G 0.068 -75 L 0.068 -76 R 0.065 -77 G 0.066 -78 G 0.072 -79 I 0.074 -80 L 0.065 -81 I 0.055 -82 E 0.049 -83 L 0.048 -84 A 0.045 -85 M 0.044 -86 R 0.044 -87 G 0.044 -88 R 0.043 -89 I 0.044 -90 Y 0.056 -91 L 0.077 -92 E 0.102 -93 P 0.119 -94 P 0.125 -95 T 0.124 -96 M 0.122 -97 R 0.122 -98 K 0.120 -99 K 0.111 -100 R 0.096 -101 L 0.080 -102 L 0.065 -103 D 0.057 -104 R 0.056 -105 K 0.057 -106 V 0.056 -107 L 0.058 -108 L 0.062 -109 K 0.064 -110 S 0.066 -111 D 0.077 -112 S 0.095 -113 P 0.108 -114 T 0.110 -115 G 0.104 -116 D 0.091 -117 V 0.073 -118 L 0.060 -119 L 0.058 -120 D 0.059 -121 E 0.055 -122 T 0.049 -123 L 0.044 -124 K 0.042 -125 H 0.043 -126 I 0.046 -127 K 0.050 -128 A 0.052 -129 T 0.051 -130 E 0.047 -131 P 0.043 -132 T 0.042 -133 E 0.040 -134 T 0.039 -135 V 0.041 -136 Q 0.046 -137 T 0.053 -138 W 0.063 -139 I 0.074 -140 E 0.086 -141 L 0.102 -142 L 0.121 -143 T 0.136 -144 G 0.142 -145 E 0.140 -146 T 0.135 -147 W 0.132 -148 N 0.133 -149 P 0.133 -150 F 0.136 -151 K 0.145 -152 L 0.154 -153 Q 0.160 -154 Y 0.163 -155 Q 0.160 -156 L 0.147 -157 R 0.126 -158 N 0.103 -159 V 0.082 -160 R 0.066 -161 E 0.059 -162 R 0.060 -163 I 0.066 -164 A 0.072 -165 K 0.074 -166 N 0.072 -167 L 0.069 -168 V 0.070 -169 E 0.078 -170 K 0.089 -171 G 0.100 -172 I 0.109 -173 L 0.113 -174 T 0.115 -175 T 0.119 -176 E 0.130 -177 K 0.144 -178 Q 0.154 -179 N 0.156 -180 F 0.152 -181 L 0.143 -182 L 0.135 -183 F 0.136 -184 D 0.142 -185 M 0.143 -186 T 0.135 -187 T 0.123 -188 H 0.111 -189 P 0.104 -190 V 0.102 -191 T 0.104 -192 N 0.101 -193 T 0.091 -194 T 0.077 -195 E 0.066 -196 K 0.064 -197 Q 0.069 -198 R 0.072 -199 L 0.069 -200 M 0.063 -201 K 0.054 -202 K 0.046 -203 L 0.041 -204 Q 0.041 -205 D 0.046 -206 S 0.052 -207 V 0.057 -208 L 0.060 -209 E 0.063 -210 R 0.069 -211 W 0.080 -212 V 0.092 -213 N 0.100 -214 D 0.102 -215 P 0.099 -216 Q 0.097 -217 R 0.095 -218 M 0.086 -219 D 0.069 -220 R 0.051 -221 R 0.041 -222 T 0.038 -223 L 0.036 -224 A 0.035 -225 L 0.034 -226 L 0.036 -227 V 0.039 -228 L 0.042 -229 A 0.045 -230 H 0.047 -231 S 0.048 -232 S 0.048 -233 D 0.050 -234 V 0.053 -235 L 0.057 -236 E 0.062 -237 N 0.066 -238 V 0.067 -239 F 0.066 -240 S 0.067 -241 C 0.068 -242 L 0.067 -243 T 0.064 -244 D 0.059 -245 D 0.054 -246 K 0.050 -247 Y 0.050 -248 D 0.048 -249 V 0.047 -250 A 0.050 -251 M 0.060 -252 N 0.067 -253 R 0.065 -254 T 0.060 -255 K 0.060 -256 D 0.066 -257 L 0.078 -258 V 0.089 -259 E 0.094 -260 L 0.095 -261 D 0.095 -262 P 0.098 -263 E 0.108 -264 V 0.126 -265 E 0.147 -266 G 0.158 -267 T 0.156 -268 K 0.143 -269 H 0.127 -270 N 0.110 -271 A 0.094 -272 T 0.077 -273 E 0.061 -274 M 0.049 -275 I 0.042 -276 W 0.041 -277 A 0.043 -278 V 0.049 -279 L 0.056 -280 A 0.064 -281 A 0.078 -282 F 0.107 -283 N 0.151 -284 K 0.196 -285 S 0.225 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000046519.17_ENSMUST00000177390.8_GN:Golph3l_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:58.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000046519.17_ENSMUST00000177390.8_GN:Golph3l_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:58.caid deleted file mode 100644 index baa4a59cc7cacafa99fa9b12c94f8fde565ffaf7..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000046519.17_ENSMUST00000177390.8_GN:Golph3l_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:58.caid +++ /dev/null @@ -1,344 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000046519.17|ENSMUST00000177390.8|GN:Golph3l|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:58 -1 M 0.333 -2 C 0.361 -3 Y 0.410 -4 S 0.470 -5 L 0.524 -6 S 0.563 -7 A 0.590 -8 T 0.610 -9 K 0.623 -10 D 0.626 -11 Q 0.617 -12 E 0.591 -13 V 0.543 -14 C 0.468 -15 T 0.384 -16 L 0.318 -17 C 0.277 -18 V 0.251 -19 A 0.234 -20 E 0.226 -21 K 0.220 -22 F 0.224 -23 F 0.244 -24 T 0.270 -25 Y 0.290 -26 W 0.315 -27 N 0.366 -28 P 0.450 -29 P 0.551 -30 R 0.638 -31 V 0.693 -32 R 0.722 -33 E 0.741 -34 T 0.755 -35 G 0.759 -36 A 0.742 -37 L 0.696 -38 Q 0.633 -39 N 0.602 -40 E 0.632 -41 S 0.688 -42 A 0.721 -43 N 0.725 -44 C 0.714 -45 S 0.699 -46 L 0.684 -47 R 0.677 -48 P 0.675 -49 T 0.665 -50 A 0.635 -51 A 0.589 -52 Q 0.531 -53 E 0.474 -54 Q 0.450 -55 R 0.481 -56 Q 0.544 -57 V 0.604 -58 R 0.649 -59 M 0.678 -60 T 0.689 -61 T 0.682 -62 L 0.672 -63 T 0.672 -64 H 0.677 -65 R 0.682 -66 T 0.692 -67 R 0.705 -68 R 0.712 -69 T 0.710 -70 E 0.707 -71 V 0.709 -72 S 0.709 -73 K 0.700 -74 S 0.672 -75 S 0.612 -76 E 0.520 -77 K 0.438 -78 K 0.429 -79 I 0.476 -80 E 0.516 -81 S 0.540 -82 E 0.588 -83 E 0.652 -84 D 0.696 -85 T 0.709 -86 N 0.702 -87 Q 0.687 -88 E 0.669 -89 R 0.659 -90 S 0.662 -91 P 0.676 -92 D 0.683 -93 N 0.673 -94 E 0.653 -95 D 0.638 -96 P 0.633 -97 G 0.624 -98 D 0.590 -99 S 0.514 -100 K 0.404 -101 D 0.289 -102 I 0.191 -103 R 0.121 -104 L 0.077 -105 T 0.051 -106 L 0.037 -107 M 0.030 -108 E 0.026 -109 E 0.025 -110 V 0.024 -111 L 0.027 -112 L 0.037 -113 L 0.055 -114 G 0.070 -115 L 0.076 -116 K 0.076 -117 D 0.082 -118 K 0.100 -119 E 0.122 -120 G 0.136 -121 Y 0.133 -122 T 0.122 -123 S 0.113 -124 F 0.112 -125 W 0.111 -126 N 0.104 -127 D 0.090 -128 C 0.078 -129 I 0.069 -130 S 0.064 -131 S 0.063 -132 G 0.066 -133 L 0.066 -134 R 0.062 -135 G 0.063 -136 G 0.069 -137 I 0.071 -138 L 0.065 -139 I 0.055 -140 E 0.050 -141 L 0.049 -142 A 0.046 -143 M 0.045 -144 R 0.046 -145 G 0.046 -146 R 0.045 -147 I 0.047 -148 Y 0.058 -149 L 0.080 -150 E 0.103 -151 P 0.118 -152 P 0.123 -153 T 0.122 -154 M 0.120 -155 R 0.119 -156 K 0.116 -157 K 0.108 -158 R 0.094 -159 L 0.076 -160 L 0.061 -161 D 0.054 -162 R 0.054 -163 K 0.056 -164 V 0.055 -165 L 0.057 -166 L 0.061 -167 K 0.064 -168 S 0.069 -169 D 0.082 -170 S 0.103 -171 P 0.117 -172 T 0.118 -173 G 0.109 -174 D 0.094 -175 V 0.074 -176 L 0.061 -177 L 0.058 -178 D 0.060 -179 E 0.056 -180 T 0.049 -181 L 0.043 -182 K 0.042 -183 H 0.043 -184 I 0.045 -185 K 0.048 -186 A 0.050 -187 T 0.048 -188 E 0.045 -189 P 0.043 -190 T 0.042 -191 E 0.042 -192 T 0.041 -193 V 0.042 -194 Q 0.046 -195 T 0.054 -196 W 0.063 -197 I 0.073 -198 E 0.083 -199 L 0.098 -200 L 0.116 -201 T 0.128 -202 G 0.131 -203 E 0.125 -204 T 0.118 -205 W 0.114 -206 N 0.114 -207 P 0.116 -208 F 0.122 -209 K 0.133 -210 L 0.143 -211 Q 0.149 -212 Y 0.153 -213 Q 0.153 -214 L 0.141 -215 R 0.121 -216 N 0.098 -217 V 0.078 -218 R 0.063 -219 E 0.055 -220 R 0.056 -221 I 0.060 -222 A 0.066 -223 K 0.070 -224 N 0.069 -225 L 0.067 -226 V 0.068 -227 E 0.074 -228 K 0.083 -229 G 0.092 -230 I 0.100 -231 L 0.104 -232 T 0.107 -233 T 0.111 -234 E 0.120 -235 K 0.130 -236 Q 0.135 -237 N 0.136 -238 F 0.131 -239 L 0.123 -240 L 0.117 -241 F 0.117 -242 D 0.124 -243 M 0.127 -244 T 0.122 -245 T 0.113 -246 H 0.104 -247 P 0.098 -248 V 0.095 -249 T 0.095 -250 N 0.093 -251 T 0.084 -252 T 0.072 -253 E 0.063 -254 K 0.064 -255 Q 0.071 -256 R 0.075 -257 L 0.073 -258 M 0.065 -259 K 0.056 -260 K 0.048 -261 L 0.043 -262 Q 0.042 -263 D 0.045 -264 S 0.051 -265 V 0.056 -266 L 0.060 -267 E 0.063 -268 R 0.068 -269 W 0.077 -270 V 0.087 -271 N 0.094 -272 D 0.096 -273 P 0.095 -274 Q 0.094 -275 R 0.092 -276 M 0.082 -277 D 0.065 -278 R 0.049 -279 R 0.040 -280 T 0.037 -281 L 0.036 -282 A 0.034 -283 L 0.033 -284 L 0.035 -285 V 0.039 -286 L 0.042 -287 A 0.045 -288 H 0.047 -289 S 0.048 -290 S 0.049 -291 D 0.051 -292 V 0.055 -293 L 0.060 -294 E 0.066 -295 N 0.070 -296 V 0.071 -297 F 0.071 -298 S 0.071 -299 C 0.073 -300 L 0.072 -301 T 0.070 -302 D 0.064 -303 D 0.057 -304 K 0.052 -305 Y 0.050 -306 D 0.048 -307 V 0.047 -308 A 0.053 -309 M 0.063 -310 N 0.071 -311 R 0.069 -312 T 0.065 -313 K 0.066 -314 D 0.073 -315 L 0.084 -316 V 0.096 -317 E 0.103 -318 L 0.104 -319 D 0.103 -320 P 0.106 -321 E 0.117 -322 V 0.137 -323 E 0.160 -324 G 0.174 -325 T 0.172 -326 K 0.159 -327 H 0.142 -328 N 0.123 -329 A 0.102 -330 T 0.082 -331 E 0.065 -332 M 0.053 -333 I 0.046 -334 W 0.044 -335 A 0.046 -336 V 0.052 -337 L 0.060 -338 A 0.068 -339 A 0.082 -340 F 0.112 -341 N 0.157 -342 K 0.203 -343 S 0.233 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000047415.13_ENSMUST00000110066.8_GN:Gpr68_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000047415.13_ENSMUST00000110066.8_GN:Gpr68_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 5c46f5fb14b581e5e6156d4cdaef166eebb303fc..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000047415.13_ENSMUST00000110066.8_GN:Gpr68_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,366 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000047415.13|ENSMUST00000110066.8|GN:Gpr68|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.394 -2 G 0.414 -3 N 0.448 -4 I 0.484 -5 T 0.512 -6 T 0.533 -7 E 0.548 -8 N 0.551 -9 S 0.531 -10 S 0.488 -11 L 0.426 -12 S 0.354 -13 C 0.294 -14 P 0.256 -15 I 0.232 -16 D 0.202 -17 H 0.168 -18 T 0.139 -19 I 0.118 -20 H 0.100 -21 Q 0.083 -22 T 0.069 -23 L 0.062 -24 A 0.055 -25 P 0.045 -26 V 0.036 -27 V 0.032 -28 Y 0.032 -29 V 0.034 -30 T 0.034 -31 V 0.034 -32 L 0.036 -33 V 0.041 -34 V 0.048 -35 G 0.053 -36 F 0.051 -37 P 0.044 -38 A 0.038 -39 N 0.034 -40 C 0.033 -41 L 0.031 -42 S 0.026 -43 L 0.021 -44 Y 0.018 -45 F 0.016 -46 G 0.017 -47 Y 0.020 -48 L 0.027 -49 Q 0.039 -50 I 0.055 -51 K 0.069 -52 A 0.074 -53 R 0.072 -54 N 0.066 -55 E 0.058 -56 L 0.047 -57 G 0.037 -58 V 0.031 -59 Y 0.027 -60 L 0.028 -61 C 0.032 -62 N 0.036 -63 L 0.038 -64 T 0.040 -65 I 0.041 -66 A 0.044 -67 D 0.047 -68 L 0.045 -69 F 0.041 -70 Y 0.039 -71 I 0.042 -72 C 0.048 -73 S 0.055 -74 L 0.059 -75 P 0.056 -76 F 0.050 -77 W 0.045 -78 L 0.043 -79 Q 0.044 -80 Y 0.048 -81 V 0.051 -82 L 0.056 -83 Q 0.062 -84 H 0.070 -85 D 0.074 -86 D 0.072 -87 W 0.068 -88 S 0.065 -89 H 0.062 -90 G 0.058 -91 D 0.049 -92 L 0.039 -93 S 0.032 -94 C 0.029 -95 Q 0.028 -96 V 0.029 -97 C 0.032 -98 G 0.034 -99 I 0.033 -100 L 0.032 -101 L 0.034 -102 Y 0.040 -103 E 0.048 -104 N 0.051 -105 I 0.050 -106 Y 0.047 -107 I 0.045 -108 S 0.044 -109 V 0.044 -110 G 0.042 -111 F 0.037 -112 L 0.032 -113 C 0.028 -114 C 0.027 -115 I 0.030 -116 S 0.037 -117 I 0.045 -118 D 0.050 -119 R 0.052 -120 Y 0.051 -121 L 0.053 -122 A 0.060 -123 V 0.070 -124 A 0.077 -125 H 0.076 -126 P 0.073 -127 F 0.070 -128 R 0.069 -129 F 0.069 -130 H 0.065 -131 Q 0.059 -132 F 0.054 -133 R 0.048 -134 T 0.041 -135 L 0.033 -136 K 0.028 -137 A 0.027 -138 A 0.029 -139 V 0.034 -140 G 0.039 -141 V 0.042 -142 S 0.042 -143 V 0.039 -144 L 0.039 -145 I 0.040 -146 W 0.040 -147 A 0.038 -148 K 0.036 -149 E 0.035 -150 L 0.036 -151 L 0.038 -152 T 0.041 -153 S 0.044 -154 I 0.044 -155 Y 0.045 -156 F 0.049 -157 L 0.054 -158 N 0.057 -159 H 0.058 -160 K 0.061 -161 E 0.072 -162 V 0.092 -163 I 0.120 -164 E 0.148 -165 D 0.168 -166 E 0.177 -167 D 0.175 -168 Q 0.162 -169 H 0.140 -170 R 0.111 -171 V 0.087 -172 C 0.077 -173 F 0.085 -174 E 0.102 -175 H 0.119 -176 Y 0.127 -177 P 0.122 -178 I 0.101 -179 Q 0.075 -180 A 0.056 -181 W 0.049 -182 Q 0.048 -183 R 0.049 -184 S 0.048 -185 I 0.046 -186 N 0.042 -187 Y 0.038 -188 Y 0.033 -189 R 0.028 -190 F 0.026 -191 L 0.029 -192 V 0.033 -193 G 0.035 -194 F 0.036 -195 L 0.040 -196 F 0.045 -197 P 0.044 -198 I 0.038 -199 C 0.032 -200 L 0.029 -201 L 0.028 -202 L 0.027 -203 A 0.025 -204 S 0.023 -205 Y 0.024 -206 Q 0.028 -207 G 0.037 -208 I 0.048 -209 L 0.062 -210 R 0.073 -211 A 0.076 -212 V 0.076 -213 R 0.086 -214 R 0.116 -215 S 0.162 -216 H 0.207 -217 G 0.232 -218 T 0.229 -219 Q 0.203 -220 K 0.166 -221 S 0.128 -222 R 0.098 -223 K 0.082 -224 D 0.076 -225 Q 0.069 -226 I 0.058 -227 Q 0.048 -228 R 0.044 -229 L 0.044 -230 V 0.044 -231 L 0.046 -232 S 0.048 -233 T 0.047 -234 V 0.044 -235 V 0.041 -236 I 0.039 -237 F 0.036 -238 L 0.032 -239 A 0.030 -240 C 0.030 -241 F 0.032 -242 L 0.035 -243 P 0.034 -244 Y 0.030 -245 H 0.027 -246 V 0.027 -247 L 0.029 -248 L 0.028 -249 L 0.026 -250 V 0.024 -251 R 0.024 -252 S 0.029 -253 L 0.038 -254 W 0.053 -255 E 0.070 -256 R 0.082 -257 N 0.085 -258 C 0.083 -259 E 0.081 -260 F 0.078 -261 A 0.073 -262 K 0.069 -263 S 0.064 -264 I 0.056 -265 F 0.047 -266 N 0.041 -267 V 0.038 -268 Y 0.037 -269 H 0.037 -270 F 0.039 -271 S 0.042 -272 L 0.045 -273 L 0.050 -274 L 0.055 -275 T 0.059 -276 S 0.061 -277 F 0.063 -278 N 0.066 -279 C 0.068 -280 V 0.067 -281 A 0.065 -282 D 0.061 -283 P 0.054 -284 V 0.045 -285 L 0.036 -286 Y 0.031 -287 C 0.032 -288 F 0.039 -289 V 0.050 -290 S 0.063 -291 E 0.078 -292 T 0.093 -293 T 0.103 -294 H 0.106 -295 R 0.105 -296 D 0.100 -297 L 0.093 -298 A 0.088 -299 R 0.088 -300 L 0.095 -301 R 0.111 -302 G 0.132 -303 A 0.153 -304 C 0.172 -305 L 0.189 -306 A 0.199 -307 V 0.204 -308 L 0.218 -309 T 0.262 -310 C 0.344 -311 S 0.442 -312 R 0.522 -313 T 0.573 -314 S 0.603 -315 R 0.618 -316 A 0.621 -317 R 0.617 -318 E 0.608 -319 A 0.600 -320 Y 0.604 -321 P 0.625 -322 L 0.657 -323 G 0.683 -324 A 0.701 -325 P 0.717 -326 E 0.734 -327 A 0.745 -328 S 0.751 -329 G 0.754 -330 K 0.756 -331 S 0.756 -332 G 0.755 -333 A 0.750 -334 Q 0.739 -335 G 0.719 -336 E 0.689 -337 E 0.645 -338 P 0.585 -339 E 0.507 -340 L 0.425 -341 L 0.362 -342 T 0.340 -343 K 0.347 -344 L 0.349 -345 H 0.334 -346 S 0.327 -347 A 0.349 -348 F 0.394 -349 Q 0.452 -350 T 0.512 -351 P 0.550 -352 S 0.551 -353 S 0.552 -354 L 0.592 -355 G 0.652 -356 V 0.692 -357 G 0.707 -358 G 0.710 -359 P 0.710 -360 S 0.708 -361 T 0.705 -362 V 0.691 -363 G 0.643 -364 L 0.561 -365 A 0.489 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000047415.13_ENSMUST00000110066.8_GN:Gpr68_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000047415.13_ENSMUST00000110066.8_GN:Gpr68_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid deleted file mode 100644 index 1d0a29c8b94748aa4acc0495fcdd1563a2a11254..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000047415.13_ENSMUST00000110066.8_GN:Gpr68_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid +++ /dev/null @@ -1,376 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000047415.13|ENSMUST00000110066.8|GN:Gpr68|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:10 -1 M 0.317 -2 R 0.329 -3 N 0.351 -4 K 0.373 -5 A 0.391 -6 P 0.409 -7 S 0.433 -8 G 0.451 -9 P 0.447 -10 K 0.447 -11 M 0.488 -12 G 0.556 -13 N 0.605 -14 I 0.618 -15 T 0.614 -16 T 0.608 -17 E 0.605 -18 N 0.596 -19 S 0.572 -20 S 0.526 -21 L 0.456 -22 S 0.375 -23 C 0.310 -24 P 0.274 -25 I 0.251 -26 D 0.221 -27 H 0.184 -28 T 0.151 -29 I 0.126 -30 H 0.104 -31 Q 0.083 -32 T 0.069 -33 L 0.061 -34 A 0.054 -35 P 0.044 -36 V 0.036 -37 V 0.032 -38 Y 0.032 -39 V 0.034 -40 T 0.034 -41 V 0.035 -42 L 0.036 -43 V 0.041 -44 V 0.048 -45 G 0.053 -46 F 0.051 -47 P 0.044 -48 A 0.038 -49 N 0.034 -50 C 0.033 -51 L 0.031 -52 S 0.027 -53 L 0.021 -54 Y 0.018 -55 F 0.017 -56 G 0.017 -57 Y 0.020 -58 L 0.027 -59 Q 0.039 -60 I 0.055 -61 K 0.068 -62 A 0.074 -63 R 0.072 -64 N 0.066 -65 E 0.057 -66 L 0.047 -67 G 0.037 -68 V 0.030 -69 Y 0.027 -70 L 0.028 -71 C 0.032 -72 N 0.036 -73 L 0.038 -74 T 0.039 -75 I 0.041 -76 A 0.044 -77 D 0.046 -78 L 0.044 -79 F 0.040 -80 Y 0.038 -81 I 0.041 -82 C 0.047 -83 S 0.054 -84 L 0.058 -85 P 0.055 -86 F 0.049 -87 W 0.044 -88 L 0.042 -89 Q 0.043 -90 Y 0.045 -91 V 0.049 -92 L 0.054 -93 Q 0.061 -94 H 0.069 -95 D 0.073 -96 D 0.071 -97 W 0.067 -98 S 0.063 -99 H 0.061 -100 G 0.056 -101 D 0.048 -102 L 0.038 -103 S 0.031 -104 C 0.028 -105 Q 0.027 -106 V 0.028 -107 C 0.031 -108 G 0.033 -109 I 0.032 -110 L 0.031 -111 L 0.033 -112 Y 0.040 -113 E 0.048 -114 N 0.051 -115 I 0.049 -116 Y 0.046 -117 I 0.044 -118 S 0.044 -119 V 0.044 -120 G 0.042 -121 F 0.037 -122 L 0.032 -123 C 0.028 -124 C 0.027 -125 I 0.030 -126 S 0.037 -127 I 0.046 -128 D 0.051 -129 R 0.052 -130 Y 0.052 -131 L 0.054 -132 A 0.062 -133 V 0.072 -134 A 0.078 -135 H 0.078 -136 P 0.074 -137 F 0.072 -138 R 0.071 -139 F 0.071 -140 H 0.066 -141 Q 0.060 -142 F 0.055 -143 R 0.049 -144 T 0.041 -145 L 0.033 -146 K 0.028 -147 A 0.027 -148 A 0.030 -149 V 0.034 -150 G 0.039 -151 V 0.043 -152 S 0.042 -153 V 0.039 -154 L 0.039 -155 I 0.040 -156 W 0.041 -157 A 0.038 -158 K 0.036 -159 E 0.035 -160 L 0.036 -161 L 0.038 -162 T 0.041 -163 S 0.044 -164 I 0.045 -165 Y 0.045 -166 F 0.050 -167 L 0.055 -168 N 0.057 -169 H 0.057 -170 K 0.061 -171 E 0.072 -172 V 0.092 -173 I 0.120 -174 E 0.149 -175 D 0.169 -176 E 0.178 -177 D 0.175 -178 Q 0.163 -179 H 0.141 -180 R 0.111 -181 V 0.087 -182 C 0.077 -183 F 0.084 -184 E 0.101 -185 H 0.118 -186 Y 0.126 -187 P 0.120 -188 I 0.100 -189 Q 0.074 -190 A 0.055 -191 W 0.048 -192 Q 0.048 -193 R 0.049 -194 S 0.048 -195 I 0.046 -196 N 0.042 -197 Y 0.038 -198 Y 0.033 -199 R 0.028 -200 F 0.026 -201 L 0.029 -202 V 0.033 -203 G 0.036 -204 F 0.036 -205 L 0.040 -206 F 0.045 -207 P 0.044 -208 I 0.038 -209 C 0.032 -210 L 0.030 -211 L 0.028 -212 L 0.027 -213 A 0.025 -214 S 0.023 -215 Y 0.024 -216 Q 0.028 -217 G 0.037 -218 I 0.048 -219 L 0.062 -220 R 0.073 -221 A 0.076 -222 V 0.075 -223 R 0.085 -224 R 0.115 -225 S 0.159 -226 H 0.203 -227 G 0.228 -228 T 0.225 -229 Q 0.200 -230 K 0.164 -231 S 0.126 -232 R 0.097 -233 K 0.081 -234 D 0.075 -235 Q 0.069 -236 I 0.058 -237 Q 0.048 -238 R 0.044 -239 L 0.044 -240 V 0.045 -241 L 0.047 -242 S 0.049 -243 T 0.048 -244 V 0.044 -245 V 0.041 -246 I 0.039 -247 F 0.036 -248 L 0.032 -249 A 0.030 -250 C 0.030 -251 F 0.033 -252 L 0.035 -253 P 0.034 -254 Y 0.030 -255 H 0.027 -256 V 0.027 -257 L 0.028 -258 L 0.028 -259 L 0.026 -260 V 0.023 -261 R 0.024 -262 S 0.029 -263 L 0.038 -264 W 0.053 -265 E 0.071 -266 R 0.084 -267 N 0.087 -268 C 0.085 -269 E 0.083 -270 F 0.079 -271 A 0.074 -272 K 0.069 -273 S 0.065 -274 I 0.057 -275 F 0.048 -276 N 0.041 -277 V 0.039 -278 Y 0.037 -279 H 0.037 -280 F 0.039 -281 S 0.042 -282 L 0.046 -283 L 0.050 -284 L 0.056 -285 T 0.059 -286 S 0.062 -287 F 0.064 -288 N 0.067 -289 C 0.069 -290 V 0.068 -291 A 0.066 -292 D 0.061 -293 P 0.054 -294 V 0.045 -295 L 0.037 -296 Y 0.031 -297 C 0.032 -298 F 0.040 -299 V 0.051 -300 S 0.064 -301 E 0.079 -302 T 0.093 -303 T 0.103 -304 H 0.106 -305 R 0.105 -306 D 0.100 -307 L 0.093 -308 A 0.089 -309 R 0.089 -310 L 0.096 -311 R 0.112 -312 G 0.133 -313 A 0.154 -314 C 0.174 -315 L 0.191 -316 A 0.202 -317 V 0.208 -318 L 0.221 -319 T 0.266 -320 C 0.349 -321 S 0.448 -322 R 0.529 -323 T 0.581 -324 S 0.609 -325 R 0.624 -326 A 0.627 -327 R 0.623 -328 E 0.613 -329 A 0.604 -330 Y 0.607 -331 P 0.629 -332 L 0.660 -333 G 0.686 -334 A 0.704 -335 P 0.720 -336 E 0.737 -337 A 0.749 -338 S 0.755 -339 G 0.757 -340 K 0.758 -341 S 0.758 -342 G 0.757 -343 A 0.752 -344 Q 0.741 -345 G 0.721 -346 E 0.691 -347 E 0.649 -348 P 0.590 -349 E 0.513 -350 L 0.430 -351 L 0.367 -352 T 0.345 -353 K 0.354 -354 L 0.356 -355 H 0.340 -356 S 0.333 -357 A 0.354 -358 F 0.399 -359 Q 0.456 -360 T 0.517 -361 P 0.553 -362 S 0.554 -363 S 0.554 -364 L 0.594 -365 G 0.654 -366 V 0.695 -367 G 0.710 -368 G 0.714 -369 P 0.714 -370 S 0.714 -371 T 0.712 -372 V 0.698 -373 G 0.651 -374 L 0.569 -375 A 0.497 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000048240.16_ENSMUST00000118233.8_GN:Gng7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000048240.16_ENSMUST00000118233.8_GN:Gng7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 4d79174bb86996d4bd27ee6c2004a9fffb53d238..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000048240.16_ENSMUST00000118233.8_GN:Gng7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,69 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000048240.16|ENSMUST00000118233.8|GN:Gng7|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.499 -2 S 0.503 -3 G 0.502 -4 T 0.479 -5 N 0.425 -6 N 0.348 -7 V 0.272 -8 A 0.223 -9 Q 0.208 -10 A 0.210 -11 R 0.213 -12 K 0.223 -13 L 0.237 -14 V 0.247 -15 E 0.255 -16 Q 0.264 -17 L 0.268 -18 R 0.281 -19 I 0.320 -20 E 0.369 -21 A 0.404 -22 G 0.423 -23 I 0.426 -24 E 0.402 -25 R 0.356 -26 I 0.312 -27 K 0.274 -28 V 0.232 -29 S 0.196 -30 K 0.188 -31 A 0.202 -32 S 0.209 -33 S 0.203 -34 D 0.202 -35 L 0.205 -36 M 0.195 -37 G 0.175 -38 Y 0.161 -39 C 0.151 -40 E 0.136 -41 Q 0.123 -42 H 0.127 -43 A 0.156 -44 R 0.207 -45 N 0.263 -46 D 0.301 -47 P 0.309 -48 L 0.295 -49 L 0.287 -50 V 0.308 -51 G 0.356 -52 V 0.399 -53 P 0.413 -54 A 0.416 -55 S 0.436 -56 E 0.464 -57 N 0.468 -58 P 0.440 -59 F 0.403 -60 K 0.384 -61 D 0.392 -62 K 0.413 -63 K 0.429 -64 P 0.437 -65 C 0.451 -66 I 0.469 -67 I 0.471 -68 L 0.457 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000048240.16_ENSMUST00000118233.8_GN:Gng7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000048240.16_ENSMUST00000118233.8_GN:Gng7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid deleted file mode 100644 index 97b9fa8be43ded1189ac195241e9bfe3222efc80..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000048240.16_ENSMUST00000118233.8_GN:Gng7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid +++ /dev/null @@ -1,70 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000048240.16|ENSMUST00000118233.8|GN:Gng7|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:1 -1 M 0.476 -2 M 0.496 -3 S 0.519 -4 G 0.521 -5 T 0.488 -6 N 0.423 -7 N 0.342 -8 V 0.267 -9 A 0.221 -10 Q 0.208 -11 A 0.209 -12 R 0.212 -13 K 0.221 -14 L 0.233 -15 V 0.242 -16 E 0.252 -17 Q 0.263 -18 L 0.268 -19 R 0.280 -20 I 0.317 -21 E 0.364 -22 A 0.399 -23 G 0.419 -24 I 0.423 -25 E 0.400 -26 R 0.355 -27 I 0.312 -28 K 0.274 -29 V 0.232 -30 S 0.196 -31 K 0.188 -32 A 0.201 -33 S 0.208 -34 S 0.202 -35 D 0.201 -36 L 0.204 -37 M 0.194 -38 G 0.174 -39 Y 0.160 -40 C 0.150 -41 E 0.135 -42 Q 0.122 -43 H 0.125 -44 A 0.154 -45 R 0.205 -46 N 0.261 -47 D 0.299 -48 P 0.307 -49 L 0.294 -50 L 0.287 -51 V 0.308 -52 G 0.355 -53 V 0.397 -54 P 0.410 -55 A 0.413 -56 S 0.434 -57 E 0.463 -58 N 0.468 -59 P 0.441 -60 F 0.404 -61 K 0.385 -62 D 0.391 -63 K 0.412 -64 K 0.428 -65 P 0.435 -66 C 0.448 -67 I 0.466 -68 I 0.467 -69 L 0.454 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000048429.11_ENSMUST00000062125.11_GN:Timm29_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000048429.11_ENSMUST00000062125.11_GN:Timm29_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 9dda50d184d61566b3f6d5e536370c14d7ab8689..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000048429.11_ENSMUST00000062125.11_GN:Timm29_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,267 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000048429.11|ENSMUST00000062125.11|GN:Timm29|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.286 -2 V 0.281 -3 T 0.275 -4 A 0.269 -5 A 0.263 -6 L 0.255 -7 K 0.251 -8 R 0.261 -9 F 0.296 -10 W 0.368 -11 S 0.473 -12 G 0.580 -13 G 0.657 -14 H 0.700 -15 G 0.726 -16 E 0.744 -17 A 0.753 -18 G 0.752 -19 G 0.749 -20 E 0.752 -21 A 0.760 -22 G 0.768 -23 G 0.772 -24 A 0.771 -25 T 0.765 -26 T 0.754 -27 V 0.735 -28 A 0.707 -29 V 0.667 -30 K 0.611 -31 P 0.536 -32 G 0.447 -33 L 0.364 -34 W 0.308 -35 T 0.270 -36 R 0.230 -37 L 0.193 -38 S 0.175 -39 T 0.178 -40 W 0.186 -41 A 0.190 -42 G 0.191 -43 A 0.194 -44 L 0.202 -45 L 0.210 -46 R 0.218 -47 D 0.222 -48 Y 0.218 -49 A 0.215 -50 E 0.223 -51 A 0.240 -52 C 0.259 -53 G 0.272 -54 D 0.266 -55 A 0.237 -56 A 0.206 -57 A 0.189 -58 A 0.186 -59 A 0.184 -60 R 0.183 -61 A 0.183 -62 R 0.178 -63 P 0.163 -64 G 0.146 -65 R 0.134 -66 A 0.129 -67 A 0.123 -68 L 0.119 -69 Y 0.118 -70 V 0.116 -71 G 0.111 -72 L 0.109 -73 L 0.114 -74 G 0.125 -75 G 0.134 -76 A 0.137 -77 A 0.132 -78 A 0.119 -79 C 0.106 -80 C 0.101 -81 A 0.104 -82 L 0.112 -83 A 0.118 -84 P 0.117 -85 S 0.103 -86 E 0.084 -87 A 0.069 -88 A 0.061 -89 F 0.059 -90 E 0.061 -91 E 0.064 -92 A 0.068 -93 L 0.070 -94 L 0.076 -95 D 0.085 -96 A 0.095 -97 S 0.100 -98 G 0.099 -99 S 0.090 -100 L 0.082 -101 L 0.081 -102 L 0.091 -103 L 0.111 -104 A 0.128 -105 P 0.132 -106 A 0.123 -107 T 0.109 -108 R 0.097 -109 N 0.088 -110 R 0.080 -111 H 0.072 -112 S 0.065 -113 E 0.059 -114 A 0.056 -115 F 0.054 -116 L 0.052 -117 Q 0.050 -118 R 0.049 -119 L 0.048 -120 L 0.048 -121 W 0.051 -122 L 0.055 -123 R 0.061 -124 G 0.071 -125 R 0.083 -126 G 0.092 -127 R 0.098 -128 L 0.100 -129 R 0.100 -130 H 0.095 -131 V 0.087 -132 N 0.076 -133 L 0.066 -134 G 0.060 -135 F 0.058 -136 C 0.064 -137 S 0.074 -138 L 0.085 -139 V 0.095 -140 Y 0.108 -141 E 0.128 -142 A 0.154 -143 P 0.172 -144 F 0.175 -145 D 0.170 -146 A 0.168 -147 Q 0.170 -148 A 0.171 -149 S 0.165 -150 L 0.153 -151 Y 0.143 -152 Q 0.141 -153 A 0.146 -154 R 0.152 -155 C 0.158 -156 R 0.168 -157 Y 0.185 -158 L 0.204 -159 Q 0.211 -160 P 0.195 -161 R 0.163 -162 W 0.138 -163 V 0.133 -164 D 0.142 -165 F 0.145 -166 P 0.142 -167 G 0.153 -168 R 0.186 -169 I 0.211 -170 L 0.200 -171 D 0.165 -172 V 0.129 -173 G 0.100 -174 F 0.082 -175 V 0.074 -176 G 0.071 -177 R 0.065 -178 W 0.058 -179 W 0.056 -180 I 0.064 -181 L 0.082 -182 Q 0.105 -183 N 0.126 -184 R 0.150 -185 M 0.185 -186 H 0.239 -187 D 0.303 -188 C 0.361 -189 D 0.395 -190 I 0.398 -191 N 0.379 -192 D 0.349 -193 D 0.313 -194 E 0.270 -195 F 0.236 -196 L 0.220 -197 H 0.216 -198 L 0.216 -199 P 0.218 -200 A 0.224 -201 H 0.237 -202 L 0.260 -203 R 0.287 -204 V 0.309 -205 V 0.316 -206 A 0.315 -207 P 0.317 -208 H 0.333 -209 Q 0.373 -210 L 0.426 -211 H 0.455 -212 S 0.434 -213 E 0.382 -214 A 0.338 -215 N 0.316 -216 E 0.305 -217 R 0.298 -218 L 0.298 -219 F 0.296 -220 E 0.284 -221 E 0.275 -222 K 0.288 -223 Y 0.333 -224 K 0.405 -225 P 0.484 -226 I 0.535 -227 I 0.530 -228 L 0.479 -229 T 0.423 -230 D 0.383 -231 D 0.351 -232 Q 0.322 -233 V 0.300 -234 D 0.282 -235 Q 0.261 -236 A 0.239 -237 L 0.215 -238 W 0.193 -239 E 0.174 -240 E 0.158 -241 Q 0.144 -242 V 0.137 -243 L 0.140 -244 Q 0.145 -245 K 0.144 -246 E 0.142 -247 R 0.149 -248 K 0.164 -249 D 0.179 -250 R 0.191 -251 L 0.204 -252 A 0.223 -253 L 0.243 -254 S 0.263 -255 E 0.290 -256 A 0.319 -257 D 0.347 -258 S 0.377 -259 L 0.408 -260 V 0.425 -261 Q 0.422 -262 S 0.422 -263 D 0.431 -264 V 0.430 -265 S 0.406 -266 R 0.381 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000048429.11_ENSMUST00000062125.11_GN:Timm29_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:66.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000048429.11_ENSMUST00000062125.11_GN:Timm29_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:66.caid deleted file mode 100644 index c26b9fdb2cdec0e84cd91c7260544571f1d6ff98..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000048429.11_ENSMUST00000062125.11_GN:Timm29_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:66.caid +++ /dev/null @@ -1,333 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000048429.11|ENSMUST00000062125.11|GN:Timm29|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:66 -1 M 0.386 -2 R 0.420 -3 V 0.469 -4 R 0.509 -5 A 0.526 -6 A 0.524 -7 R 0.530 -8 L 0.562 -9 P 0.604 -10 F 0.634 -11 R 0.647 -12 A 0.652 -13 H 0.651 -14 P 0.653 -15 S 0.666 -16 P 0.690 -17 H 0.719 -18 N 0.747 -19 G 0.760 -20 N 0.748 -21 I 0.707 -22 R 0.649 -23 L 0.598 -24 G 0.576 -25 P 0.581 -26 F 0.595 -27 P 0.604 -28 I 0.605 -29 V 0.597 -30 F 0.572 -31 L 0.543 -32 W 0.526 -33 E 0.511 -34 T 0.468 -35 T 0.399 -36 S 0.345 -37 C 0.336 -38 I 0.360 -39 L 0.388 -40 R 0.409 -41 L 0.431 -42 R 0.455 -43 R 0.479 -44 I 0.500 -45 Y 0.527 -46 S 0.567 -47 P 0.616 -48 A 0.660 -49 F 0.689 -50 F 0.707 -51 I 0.720 -52 P 0.729 -53 T 0.728 -54 L 0.714 -55 C 0.691 -56 V 0.667 -57 S 0.645 -58 T 0.628 -59 R 0.620 -60 L 0.618 -61 R 0.618 -62 N 0.617 -63 R 0.610 -64 R 0.593 -65 E 0.557 -66 T 0.502 -67 M 0.437 -68 V 0.375 -69 T 0.322 -70 A 0.288 -71 A 0.277 -72 L 0.278 -73 K 0.276 -74 R 0.277 -75 F 0.307 -76 W 0.391 -77 S 0.514 -78 G 0.631 -79 G 0.707 -80 H 0.749 -81 G 0.774 -82 E 0.791 -83 A 0.799 -84 G 0.798 -85 G 0.794 -86 E 0.794 -87 A 0.800 -88 G 0.806 -89 G 0.813 -90 A 0.817 -91 T 0.816 -92 T 0.807 -93 V 0.786 -94 A 0.753 -95 V 0.709 -96 K 0.648 -97 P 0.570 -98 G 0.480 -99 L 0.397 -100 W 0.337 -101 T 0.293 -102 R 0.249 -103 L 0.209 -104 S 0.191 -105 T 0.193 -106 W 0.198 -107 A 0.196 -108 G 0.196 -109 A 0.203 -110 L 0.215 -111 L 0.222 -112 R 0.223 -113 D 0.220 -114 Y 0.210 -115 A 0.204 -116 E 0.207 -117 A 0.216 -118 C 0.223 -119 G 0.228 -120 D 0.222 -121 A 0.204 -122 A 0.185 -123 A 0.175 -124 A 0.171 -125 A 0.165 -126 R 0.160 -127 A 0.157 -128 R 0.152 -129 P 0.141 -130 G 0.130 -131 R 0.125 -132 A 0.122 -133 A 0.116 -134 L 0.109 -135 Y 0.106 -136 V 0.103 -137 G 0.097 -138 L 0.092 -139 L 0.094 -140 G 0.100 -141 G 0.104 -142 A 0.104 -143 A 0.100 -144 A 0.091 -145 C 0.085 -146 C 0.084 -147 A 0.090 -148 L 0.098 -149 A 0.104 -150 P 0.103 -151 S 0.092 -152 E 0.075 -153 A 0.060 -154 A 0.053 -155 F 0.050 -156 E 0.052 -157 E 0.058 -158 A 0.062 -159 L 0.065 -160 L 0.069 -161 D 0.076 -162 A 0.084 -163 S 0.092 -164 G 0.094 -165 S 0.089 -166 L 0.081 -167 L 0.080 -168 L 0.091 -169 L 0.112 -170 A 0.135 -171 P 0.145 -172 A 0.142 -173 T 0.132 -174 R 0.120 -175 N 0.106 -176 R 0.092 -177 H 0.081 -178 S 0.072 -179 E 0.066 -180 A 0.062 -181 F 0.059 -182 L 0.055 -183 Q 0.051 -184 R 0.048 -185 L 0.046 -186 L 0.045 -187 W 0.047 -188 L 0.052 -189 R 0.059 -190 G 0.069 -191 R 0.081 -192 G 0.090 -193 R 0.093 -194 L 0.092 -195 R 0.088 -196 H 0.082 -197 V 0.075 -198 N 0.067 -199 L 0.059 -200 G 0.055 -201 F 0.055 -202 C 0.060 -203 S 0.069 -204 L 0.078 -205 V 0.083 -206 Y 0.089 -207 E 0.103 -208 A 0.124 -209 P 0.140 -210 F 0.144 -211 D 0.141 -212 A 0.140 -213 Q 0.139 -214 A 0.136 -215 S 0.128 -216 L 0.115 -217 Y 0.105 -218 Q 0.101 -219 A 0.102 -220 R 0.104 -221 C 0.112 -222 R 0.128 -223 Y 0.153 -224 L 0.173 -225 Q 0.176 -226 P 0.157 -227 R 0.127 -228 W 0.108 -229 V 0.111 -230 D 0.126 -231 F 0.134 -232 P 0.131 -233 G 0.135 -234 R 0.154 -235 I 0.170 -236 L 0.166 -237 D 0.147 -238 V 0.122 -239 G 0.098 -240 F 0.083 -241 V 0.078 -242 G 0.075 -243 R 0.067 -244 W 0.056 -245 W 0.052 -246 I 0.059 -247 L 0.076 -248 Q 0.098 -249 N 0.118 -250 R 0.139 -251 M 0.171 -252 H 0.222 -253 D 0.283 -254 C 0.337 -255 D 0.367 -256 I 0.369 -257 N 0.353 -258 D 0.332 -259 D 0.304 -260 E 0.266 -261 F 0.233 -262 L 0.218 -263 H 0.216 -264 L 0.220 -265 P 0.226 -266 A 0.233 -267 H 0.247 -268 L 0.274 -269 R 0.308 -270 V 0.335 -271 V 0.341 -272 A 0.334 -273 P 0.333 -274 H 0.350 -275 Q 0.394 -276 L 0.453 -277 H 0.486 -278 S 0.469 -279 E 0.419 -280 A 0.377 -281 N 0.360 -282 E 0.354 -283 R 0.351 -284 L 0.352 -285 F 0.346 -286 E 0.329 -287 E 0.314 -288 K 0.327 -289 Y 0.378 -290 K 0.457 -291 P 0.542 -292 I 0.595 -293 I 0.592 -294 L 0.545 -295 T 0.490 -296 D 0.443 -297 D 0.401 -298 Q 0.363 -299 V 0.338 -300 D 0.318 -301 Q 0.295 -302 A 0.269 -303 L 0.239 -304 W 0.211 -305 E 0.189 -306 E 0.173 -307 Q 0.159 -308 V 0.151 -309 L 0.154 -310 Q 0.161 -311 K 0.164 -312 E 0.167 -313 R 0.177 -314 K 0.195 -315 D 0.209 -316 R 0.220 -317 L 0.235 -318 A 0.255 -319 L 0.273 -320 S 0.292 -321 E 0.315 -322 A 0.340 -323 D 0.363 -324 S 0.388 -325 L 0.418 -326 V 0.434 -327 Q 0.431 -328 S 0.430 -329 D 0.438 -330 V 0.433 -331 S 0.406 -332 R 0.378 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000049093.10_ENSMUST00000118364.2_GN:Il23r_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000049093.10_ENSMUST00000118364.2_GN:Il23r_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 82f2360ce70f537f7a962b5d98b6c8ccb78d0092..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000049093.10_ENSMUST00000118364.2_GN:Il23r_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,645 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000049093.10|ENSMUST00000118364.2|GN:Il23r|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.259 -2 S 0.241 -3 H 0.216 -4 L 0.196 -5 T 0.182 -6 L 0.169 -7 Q 0.158 -8 L 0.150 -9 H 0.144 -10 V 0.138 -11 V 0.129 -12 I 0.122 -13 A 0.116 -14 L 0.108 -15 Y 0.100 -16 V 0.096 -17 L 0.097 -18 F 0.108 -19 R 0.137 -20 W 0.186 -21 C 0.247 -22 H 0.309 -23 G 0.366 -24 G 0.401 -25 I 0.396 -26 T 0.355 -27 S 0.298 -28 I 0.241 -29 N 0.190 -30 C 0.150 -31 S 0.123 -32 G 0.103 -33 D 0.088 -34 M 0.076 -35 W 0.066 -36 V 0.058 -37 E 0.052 -38 P 0.050 -39 G 0.049 -40 E 0.048 -41 I 0.046 -42 F 0.048 -43 Q 0.054 -44 M 0.061 -45 G 0.063 -46 M 0.057 -47 N 0.048 -48 V 0.039 -49 S 0.030 -50 I 0.023 -51 Y 0.020 -52 C 0.021 -53 Q 0.025 -54 E 0.031 -55 A 0.035 -56 L 0.038 -57 K 0.041 -58 H 0.045 -59 C 0.049 -60 R 0.054 -61 P 0.057 -62 R 0.052 -63 N 0.043 -64 L 0.035 -65 Y 0.031 -66 F 0.035 -67 Y 0.045 -68 K 0.056 -69 N 0.066 -70 G 0.076 -71 F 0.083 -72 K 0.081 -73 E 0.071 -74 E 0.061 -75 F 0.053 -76 D 0.047 -77 I 0.041 -78 T 0.037 -79 R 0.036 -80 I 0.037 -81 N 0.035 -82 R 0.031 -83 T 0.025 -84 T 0.020 -85 A 0.017 -86 R 0.017 -87 I 0.020 -88 W 0.026 -89 Y 0.034 -90 K 0.041 -91 G 0.047 -92 F 0.053 -93 S 0.056 -94 E 0.055 -95 P 0.050 -96 H 0.042 -97 A 0.035 -98 Y 0.029 -99 M 0.025 -100 H 0.024 -101 C 0.026 -102 T 0.034 -103 A 0.047 -104 E 0.069 -105 C 0.092 -106 P 0.109 -107 G 0.118 -108 H 0.123 -109 F 0.123 -110 Q 0.118 -111 E 0.106 -112 T 0.088 -113 L 0.068 -114 I 0.052 -115 C 0.046 -116 G 0.052 -117 K 0.063 -118 D 0.073 -119 I 0.080 -120 S 0.092 -121 S 0.110 -122 G 0.127 -123 H 0.135 -124 P 0.135 -125 P 0.127 -126 D 0.110 -127 A 0.089 -128 P 0.075 -129 S 0.067 -130 N 0.060 -131 L 0.047 -132 T 0.033 -133 C 0.027 -134 V 0.026 -135 I 0.027 -136 Y 0.028 -137 E 0.030 -138 Y 0.035 -139 S 0.040 -140 G 0.039 -141 N 0.033 -142 M 0.028 -143 T 0.027 -144 C 0.030 -145 T 0.035 -146 W 0.042 -147 N 0.056 -148 T 0.076 -149 G 0.096 -150 K 0.109 -151 P 0.112 -152 T 0.108 -153 Y 0.104 -154 I 0.100 -155 D 0.088 -156 T 0.067 -157 K 0.044 -158 Y 0.028 -159 I 0.023 -160 V 0.024 -161 H 0.029 -162 V 0.034 -163 K 0.041 -164 S 0.051 -165 L 0.064 -166 E 0.083 -167 T 0.106 -168 E 0.127 -169 E 0.139 -170 E 0.138 -171 Q 0.124 -172 Q 0.105 -173 Y 0.089 -174 L 0.077 -175 A 0.065 -176 S 0.051 -177 S 0.038 -178 Y 0.031 -179 V 0.032 -180 K 0.040 -181 I 0.049 -182 S 0.057 -183 T 0.064 -184 D 0.075 -185 S 0.084 -186 L 0.091 -187 Q 0.097 -188 G 0.103 -189 S 0.100 -190 R 0.084 -191 K 0.061 -192 Y 0.040 -193 L 0.029 -194 V 0.024 -195 W 0.023 -196 V 0.025 -197 Q 0.027 -198 A 0.029 -199 V 0.033 -200 N 0.043 -201 S 0.057 -202 L 0.067 -203 G 0.069 -204 M 0.064 -205 E 0.058 -206 N 0.054 -207 S 0.054 -208 Q 0.055 -209 Q 0.054 -210 L 0.053 -211 H 0.053 -212 V 0.052 -213 H 0.051 -214 L 0.052 -215 D 0.053 -216 D 0.053 -217 I 0.054 -218 V 0.065 -219 I 0.086 -220 P 0.108 -221 S 0.118 -222 A 0.110 -223 S 0.090 -224 I 0.069 -225 I 0.056 -226 S 0.055 -227 R 0.065 -228 A 0.082 -229 E 0.103 -230 T 0.120 -231 T 0.134 -232 N 0.145 -233 D 0.148 -234 T 0.138 -235 V 0.114 -236 P 0.082 -237 K 0.055 -238 T 0.037 -239 I 0.027 -240 V 0.020 -241 Y 0.018 -242 W 0.021 -243 K 0.029 -244 S 0.039 -245 K 0.046 -246 T 0.050 -247 M 0.054 -248 I 0.057 -249 E 0.054 -250 K 0.048 -251 V 0.040 -252 F 0.032 -253 C 0.026 -254 E 0.023 -255 M 0.022 -256 R 0.022 -257 Y 0.024 -258 K 0.028 -259 T 0.035 -260 T 0.044 -261 T 0.054 -262 N 0.059 -263 Q 0.058 -264 T 0.052 -265 W 0.045 -266 S 0.040 -267 V 0.040 -268 K 0.042 -269 E 0.045 -270 F 0.048 -271 D 0.050 -272 A 0.051 -273 N 0.049 -274 F 0.042 -275 T 0.032 -276 Y 0.026 -277 V 0.023 -278 Q 0.025 -279 Q 0.030 -280 S 0.036 -281 E 0.041 -282 F 0.046 -283 Y 0.055 -284 L 0.069 -285 E 0.085 -286 P 0.095 -287 D 0.094 -288 S 0.083 -289 K 0.064 -290 Y 0.046 -291 V 0.033 -292 F 0.028 -293 Q 0.026 -294 V 0.026 -295 R 0.027 -296 C 0.032 -297 Q 0.043 -298 E 0.060 -299 T 0.078 -300 G 0.087 -301 K 0.086 -302 R 0.082 -303 N 0.078 -304 W 0.075 -305 Q 0.074 -306 P 0.071 -307 W 0.064 -308 S 0.059 -309 S 0.058 -310 P 0.061 -311 F 0.066 -312 V 0.076 -313 H 0.097 -314 Q 0.136 -315 T 0.201 -316 S 0.300 -317 Q 0.422 -318 E 0.536 -319 T 0.613 -320 G 0.642 -321 K 0.635 -322 R 0.606 -323 N 0.562 -324 W 0.515 -325 Q 0.479 -326 P 0.448 -327 W 0.415 -328 S 0.400 -329 S 0.418 -330 P 0.456 -331 F 0.502 -332 V 0.551 -333 H 0.599 -334 Q 0.636 -335 T 0.657 -336 S 0.665 -337 Q 0.672 -338 T 0.671 -339 V 0.643 -340 S 0.594 -341 Q 0.574 -342 V 0.616 -343 T 0.680 -344 A 0.709 -345 K 0.687 -346 S 0.627 -347 S 0.561 -348 H 0.522 -349 E 0.506 -350 P 0.471 -351 Q 0.425 -352 K 0.438 -353 M 0.530 -354 E 0.636 -355 M 0.700 -356 L 0.723 -357 S 0.731 -358 A 0.731 -359 T 0.726 -360 I 0.722 -361 F 0.725 -362 R 0.736 -363 G 0.745 -364 H 0.753 -365 P 0.763 -366 A 0.772 -367 S 0.777 -368 G 0.777 -369 N 0.772 -370 H 0.766 -371 Q 0.761 -372 D 0.753 -373 I 0.741 -374 G 0.722 -375 L 0.701 -376 L 0.677 -377 S 0.637 -378 G 0.583 -379 M 0.547 -380 V 0.542 -381 F 0.536 -382 L 0.499 -383 A 0.434 -384 I 0.356 -385 M 0.290 -386 L 0.254 -387 P 0.238 -388 I 0.223 -389 F 0.212 -390 S 0.214 -391 L 0.224 -392 I 0.231 -393 G 0.230 -394 I 0.219 -395 F 0.208 -396 N 0.203 -397 R 0.207 -398 S 0.216 -399 L 0.220 -400 R 0.220 -401 I 0.232 -402 G 0.259 -403 I 0.280 -404 K 0.276 -405 R 0.259 -406 K 0.248 -407 V 0.249 -408 L 0.258 -409 L 0.270 -410 M 0.280 -411 I 0.280 -412 P 0.270 -413 K 0.268 -414 W 0.286 -415 L 0.321 -416 Y 0.368 -417 E 0.435 -418 D 0.519 -419 I 0.595 -420 P 0.647 -421 N 0.678 -422 M 0.695 -423 E 0.697 -424 N 0.686 -425 S 0.669 -426 N 0.638 -427 V 0.579 -428 A 0.509 -429 K 0.468 -430 L 0.466 -431 L 0.477 -432 Q 0.503 -433 E 0.566 -434 K 0.645 -435 S 0.697 -436 V 0.720 -437 F 0.734 -438 E 0.753 -439 N 0.773 -440 D 0.784 -441 N 0.785 -442 A 0.782 -443 S 0.779 -444 E 0.779 -445 Q 0.776 -446 A 0.765 -447 L 0.744 -448 Y 0.725 -449 V 0.722 -450 D 0.733 -451 P 0.746 -452 V 0.753 -453 L 0.759 -454 T 0.768 -455 E 0.774 -456 I 0.774 -457 S 0.767 -458 E 0.755 -459 I 0.745 -460 S 0.743 -461 P 0.749 -462 L 0.754 -463 E 0.755 -464 H 0.753 -465 K 0.752 -466 P 0.758 -467 T 0.769 -468 D 0.777 -469 Y 0.779 -470 K 0.780 -471 E 0.784 -472 E 0.791 -473 R 0.800 -474 L 0.811 -475 T 0.825 -476 G 0.834 -477 L 0.832 -478 L 0.822 -479 E 0.809 -480 T 0.796 -481 R 0.784 -482 D 0.777 -483 C 0.779 -484 P 0.795 -485 L 0.819 -486 G 0.840 -487 M 0.847 -488 L 0.841 -489 S 0.830 -490 T 0.820 -491 S 0.811 -492 S 0.805 -493 S 0.802 -494 V 0.797 -495 V 0.785 -496 Y 0.767 -497 I 0.759 -498 P 0.766 -499 D 0.777 -500 L 0.784 -501 N 0.787 -502 T 0.786 -503 G 0.780 -504 Y 0.779 -505 K 0.790 -506 P 0.810 -507 Q 0.824 -508 V 0.824 -509 S 0.808 -510 N 0.785 -511 V 0.769 -512 P 0.775 -513 P 0.800 -514 G 0.828 -515 G 0.843 -516 N 0.839 -517 L 0.825 -518 F 0.815 -519 I 0.810 -520 N 0.802 -521 R 0.787 -522 D 0.766 -523 E 0.742 -524 R 0.723 -525 D 0.721 -526 P 0.733 -527 T 0.749 -528 S 0.760 -529 L 0.762 -530 E 0.753 -531 T 0.737 -532 T 0.717 -533 D 0.680 -534 D 0.613 -535 H 0.528 -536 F 0.460 -537 A 0.429 -538 R 0.422 -539 L 0.425 -540 K 0.431 -541 T 0.436 -542 Y 0.446 -543 P 0.457 -544 N 0.463 -545 F 0.470 -546 Q 0.489 -547 F 0.512 -548 S 0.526 -549 A 0.525 -550 S 0.504 -551 S 0.468 -552 M 0.443 -553 A 0.448 -554 L 0.467 -555 L 0.470 -556 N 0.447 -557 K 0.406 -558 T 0.371 -559 L 0.368 -560 I 0.393 -561 L 0.421 -562 D 0.427 -563 E 0.404 -564 L 0.368 -565 C 0.350 -566 L 0.358 -567 V 0.384 -568 L 0.422 -569 N 0.473 -570 Q 0.535 -571 G 0.597 -572 E 0.642 -573 F 0.666 -574 N 0.684 -575 S 0.702 -576 L 0.713 -577 D 0.720 -578 I 0.730 -579 K 0.742 -580 N 0.747 -581 S 0.745 -582 R 0.742 -583 Q 0.746 -584 E 0.755 -585 E 0.761 -586 T 0.759 -587 S 0.753 -588 I 0.746 -589 V 0.741 -590 L 0.738 -591 Q 0.733 -592 S 0.724 -593 D 0.710 -594 S 0.696 -595 P 0.686 -596 S 0.679 -597 E 0.674 -598 T 0.670 -599 I 0.669 -600 P 0.666 -601 A 0.658 -602 Q 0.642 -603 T 0.612 -604 L 0.572 -605 L 0.535 -606 S 0.506 -607 D 0.467 -608 E 0.406 -609 F 0.345 -610 V 0.312 -611 S 0.308 -612 C 0.327 -613 L 0.355 -614 A 0.373 -615 I 0.376 -616 G 0.373 -617 N 0.362 -618 E 0.341 -619 D 0.323 -620 L 0.316 -621 P 0.307 -622 S 0.278 -623 I 0.238 -624 N 0.204 -625 S 0.185 -626 Y 0.178 -627 F 0.181 -628 P 0.193 -629 Q 0.211 -630 N 0.217 -631 V 0.194 -632 L 0.157 -633 E 0.128 -634 S 0.114 -635 H 0.104 -636 F 0.096 -637 S 0.095 -638 R 0.098 -639 I 0.099 -640 S 0.097 -641 L 0.095 -642 F 0.094 -643 Q 0.095 -644 K 0.097 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000049093.10_ENSMUST00000118364.2_GN:Il23r_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000049093.10_ENSMUST00000118364.2_GN:Il23r_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid deleted file mode 100644 index 28ace642479aeaec215a5e58e5a36b40f721dc90..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000049093.10_ENSMUST00000118364.2_GN:Il23r_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:9.caid +++ /dev/null @@ -1,654 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000049093.10|ENSMUST00000118364.2|GN:Il23r|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:9 -1 M 0.329 -2 R 0.335 -3 G 0.336 -4 F 0.320 -5 Y 0.297 -6 Y 0.290 -7 I 0.309 -8 W 0.334 -9 D 0.342 -10 M 0.327 -11 S 0.297 -12 H 0.263 -13 L 0.236 -14 T 0.222 -15 L 0.215 -16 Q 0.204 -17 L 0.185 -18 H 0.164 -19 V 0.148 -20 V 0.140 -21 I 0.137 -22 A 0.133 -23 L 0.125 -24 Y 0.111 -25 V 0.096 -26 L 0.088 -27 F 0.094 -28 R 0.122 -29 W 0.170 -30 C 0.230 -31 H 0.293 -32 G 0.351 -33 G 0.388 -34 I 0.387 -35 T 0.348 -36 S 0.293 -37 I 0.237 -38 N 0.189 -39 C 0.151 -40 S 0.124 -41 G 0.105 -42 D 0.089 -43 M 0.076 -44 W 0.066 -45 V 0.058 -46 E 0.053 -47 P 0.050 -48 G 0.049 -49 E 0.046 -50 I 0.045 -51 F 0.048 -52 Q 0.054 -53 M 0.061 -54 G 0.063 -55 M 0.058 -56 N 0.048 -57 V 0.038 -58 S 0.030 -59 I 0.023 -60 Y 0.020 -61 C 0.020 -62 Q 0.025 -63 E 0.030 -64 A 0.034 -65 L 0.037 -66 K 0.040 -67 H 0.043 -68 C 0.047 -69 R 0.052 -70 P 0.055 -71 R 0.051 -72 N 0.042 -73 L 0.034 -74 Y 0.030 -75 F 0.033 -76 Y 0.043 -77 K 0.054 -78 N 0.064 -79 G 0.073 -80 F 0.080 -81 K 0.079 -82 E 0.070 -83 E 0.060 -84 F 0.053 -85 D 0.047 -86 I 0.040 -87 T 0.036 -88 R 0.036 -89 I 0.036 -90 N 0.035 -91 R 0.030 -92 T 0.025 -93 T 0.020 -94 A 0.017 -95 R 0.017 -96 I 0.019 -97 W 0.025 -98 Y 0.032 -99 K 0.039 -100 G 0.045 -101 F 0.051 -102 S 0.055 -103 E 0.055 -104 P 0.050 -105 H 0.042 -106 A 0.035 -107 Y 0.030 -108 M 0.026 -109 H 0.024 -110 C 0.027 -111 T 0.034 -112 A 0.048 -113 E 0.070 -114 C 0.093 -115 P 0.110 -116 G 0.120 -117 H 0.124 -118 F 0.125 -119 Q 0.120 -120 E 0.108 -121 T 0.090 -122 L 0.069 -123 I 0.053 -124 C 0.046 -125 G 0.052 -126 K 0.063 -127 D 0.073 -128 I 0.080 -129 S 0.091 -130 S 0.109 -131 G 0.126 -132 H 0.134 -133 P 0.135 -134 P 0.127 -135 D 0.110 -136 A 0.090 -137 P 0.075 -138 S 0.068 -139 N 0.060 -140 L 0.047 -141 T 0.033 -142 C 0.027 -143 V 0.027 -144 I 0.028 -145 Y 0.028 -146 E 0.030 -147 Y 0.035 -148 S 0.040 -149 G 0.039 -150 N 0.033 -151 M 0.028 -152 T 0.027 -153 C 0.030 -154 T 0.035 -155 W 0.043 -156 N 0.056 -157 T 0.076 -158 G 0.096 -159 K 0.109 -160 P 0.112 -161 T 0.108 -162 Y 0.104 -163 I 0.100 -164 D 0.088 -165 T 0.067 -166 K 0.044 -167 Y 0.028 -168 I 0.023 -169 V 0.024 -170 H 0.028 -171 V 0.034 -172 K 0.041 -173 S 0.051 -174 L 0.064 -175 E 0.082 -176 T 0.105 -177 E 0.127 -178 E 0.140 -179 E 0.139 -180 Q 0.125 -181 Q 0.105 -182 Y 0.088 -183 L 0.076 -184 A 0.064 -185 S 0.050 -186 S 0.038 -187 Y 0.031 -188 V 0.032 -189 K 0.040 -190 I 0.049 -191 S 0.056 -192 T 0.064 -193 D 0.074 -194 S 0.083 -195 L 0.090 -196 Q 0.096 -197 G 0.101 -198 S 0.099 -199 R 0.083 -200 K 0.060 -201 Y 0.040 -202 L 0.028 -203 V 0.024 -204 W 0.023 -205 V 0.025 -206 Q 0.027 -207 A 0.029 -208 V 0.033 -209 N 0.043 -210 S 0.057 -211 L 0.067 -212 G 0.069 -213 M 0.064 -214 E 0.058 -215 N 0.054 -216 S 0.054 -217 Q 0.054 -218 Q 0.053 -219 L 0.052 -220 H 0.052 -221 V 0.051 -222 H 0.050 -223 L 0.052 -224 D 0.053 -225 D 0.052 -226 I 0.054 -227 V 0.065 -228 I 0.086 -229 P 0.109 -230 S 0.119 -231 A 0.111 -232 S 0.091 -233 I 0.069 -234 I 0.057 -235 S 0.056 -236 R 0.065 -237 A 0.083 -238 E 0.103 -239 T 0.120 -240 T 0.134 -241 N 0.144 -242 D 0.148 -243 T 0.138 -244 V 0.114 -245 P 0.082 -246 K 0.055 -247 T 0.037 -248 I 0.027 -249 V 0.020 -250 Y 0.018 -251 W 0.021 -252 K 0.029 -253 S 0.039 -254 K 0.046 -255 T 0.050 -256 M 0.054 -257 I 0.057 -258 E 0.055 -259 K 0.048 -260 V 0.040 -261 F 0.032 -262 C 0.027 -263 E 0.024 -264 M 0.022 -265 R 0.022 -266 Y 0.024 -267 K 0.028 -268 T 0.035 -269 T 0.045 -270 T 0.054 -271 N 0.059 -272 Q 0.058 -273 T 0.052 -274 W 0.045 -275 S 0.040 -276 V 0.040 -277 K 0.043 -278 E 0.046 -279 F 0.048 -280 D 0.050 -281 A 0.051 -282 N 0.049 -283 F 0.042 -284 T 0.033 -285 Y 0.026 -286 V 0.024 -287 Q 0.026 -288 Q 0.030 -289 S 0.036 -290 E 0.041 -291 F 0.047 -292 Y 0.056 -293 L 0.070 -294 E 0.086 -295 P 0.096 -296 D 0.096 -297 S 0.084 -298 K 0.065 -299 Y 0.046 -300 V 0.034 -301 F 0.028 -302 Q 0.027 -303 V 0.026 -304 R 0.027 -305 C 0.032 -306 Q 0.044 -307 E 0.061 -308 T 0.079 -309 G 0.088 -310 K 0.087 -311 R 0.083 -312 N 0.080 -313 W 0.077 -314 Q 0.075 -315 P 0.072 -316 W 0.066 -317 S 0.060 -318 S 0.060 -319 P 0.062 -320 F 0.067 -321 V 0.078 -322 H 0.099 -323 Q 0.138 -324 T 0.204 -325 S 0.303 -326 Q 0.424 -327 E 0.539 -328 T 0.616 -329 G 0.645 -330 K 0.639 -331 R 0.611 -332 N 0.566 -333 W 0.519 -334 Q 0.482 -335 P 0.451 -336 W 0.419 -337 S 0.405 -338 S 0.423 -339 P 0.460 -340 F 0.504 -341 V 0.553 -342 H 0.601 -343 Q 0.637 -344 T 0.658 -345 S 0.668 -346 Q 0.675 -347 T 0.674 -348 V 0.645 -349 S 0.595 -350 Q 0.576 -351 V 0.617 -352 T 0.682 -353 A 0.712 -354 K 0.691 -355 S 0.631 -356 S 0.564 -357 H 0.525 -358 E 0.508 -359 P 0.473 -360 Q 0.427 -361 K 0.442 -362 M 0.535 -363 E 0.641 -364 M 0.705 -365 L 0.729 -366 S 0.736 -367 A 0.736 -368 T 0.731 -369 I 0.727 -370 F 0.730 -371 R 0.740 -372 G 0.749 -373 H 0.756 -374 P 0.765 -375 A 0.775 -376 S 0.779 -377 G 0.778 -378 N 0.773 -379 H 0.767 -380 Q 0.761 -381 D 0.753 -382 I 0.740 -383 G 0.719 -384 L 0.697 -385 L 0.673 -386 S 0.633 -387 G 0.580 -388 M 0.545 -389 V 0.542 -390 F 0.537 -391 L 0.500 -392 A 0.434 -393 I 0.355 -394 M 0.289 -395 L 0.253 -396 P 0.237 -397 I 0.222 -398 F 0.212 -399 S 0.213 -400 L 0.223 -401 I 0.230 -402 G 0.228 -403 I 0.217 -404 F 0.206 -405 N 0.202 -406 R 0.206 -407 S 0.215 -408 L 0.219 -409 R 0.218 -410 I 0.230 -411 G 0.257 -412 I 0.278 -413 K 0.275 -414 R 0.258 -415 K 0.248 -416 V 0.250 -417 L 0.259 -418 L 0.271 -419 M 0.282 -420 I 0.281 -421 P 0.272 -422 K 0.270 -423 W 0.289 -424 L 0.324 -425 Y 0.371 -426 E 0.437 -427 D 0.521 -428 I 0.596 -429 P 0.647 -430 N 0.679 -431 M 0.695 -432 E 0.697 -433 N 0.687 -434 S 0.669 -435 N 0.638 -436 V 0.580 -437 A 0.510 -438 K 0.469 -439 L 0.468 -440 L 0.479 -441 Q 0.506 -442 E 0.569 -443 K 0.647 -444 S 0.699 -445 V 0.721 -446 F 0.735 -447 E 0.754 -448 N 0.773 -449 D 0.783 -450 N 0.785 -451 A 0.781 -452 S 0.779 -453 E 0.778 -454 Q 0.776 -455 A 0.765 -456 L 0.744 -457 Y 0.725 -458 V 0.722 -459 D 0.733 -460 P 0.746 -461 V 0.754 -462 L 0.761 -463 T 0.769 -464 E 0.776 -465 I 0.776 -466 S 0.769 -467 E 0.758 -468 I 0.748 -469 S 0.747 -470 P 0.752 -471 L 0.757 -472 E 0.758 -473 H 0.756 -474 K 0.755 -475 P 0.761 -476 T 0.772 -477 D 0.780 -478 Y 0.783 -479 K 0.784 -480 E 0.788 -481 E 0.795 -482 R 0.804 -483 L 0.815 -484 T 0.829 -485 G 0.838 -486 L 0.836 -487 L 0.827 -488 E 0.814 -489 T 0.801 -490 R 0.790 -491 D 0.783 -492 C 0.785 -493 P 0.800 -494 L 0.823 -495 G 0.844 -496 M 0.851 -497 L 0.845 -498 S 0.834 -499 T 0.823 -500 S 0.815 -501 S 0.808 -502 S 0.805 -503 V 0.801 -504 V 0.789 -505 Y 0.772 -506 I 0.764 -507 P 0.771 -508 D 0.782 -509 L 0.788 -510 N 0.791 -511 T 0.790 -512 G 0.785 -513 Y 0.783 -514 K 0.794 -515 P 0.813 -516 Q 0.826 -517 V 0.826 -518 S 0.811 -519 N 0.788 -520 V 0.773 -521 P 0.778 -522 P 0.803 -523 G 0.831 -524 G 0.845 -525 N 0.841 -526 L 0.828 -527 F 0.818 -528 I 0.813 -529 N 0.806 -530 R 0.792 -531 D 0.771 -532 E 0.747 -533 R 0.729 -534 D 0.727 -535 P 0.738 -536 T 0.753 -537 S 0.765 -538 L 0.767 -539 E 0.759 -540 T 0.744 -541 T 0.725 -542 D 0.690 -543 D 0.626 -544 H 0.545 -545 F 0.481 -546 A 0.453 -547 R 0.450 -548 L 0.454 -549 K 0.457 -550 T 0.462 -551 Y 0.472 -552 P 0.483 -553 N 0.488 -554 F 0.494 -555 Q 0.511 -556 F 0.533 -557 S 0.545 -558 A 0.543 -559 S 0.523 -560 S 0.488 -561 M 0.462 -562 A 0.465 -563 L 0.481 -564 L 0.482 -565 N 0.458 -566 K 0.416 -567 T 0.384 -568 L 0.384 -569 I 0.412 -570 L 0.441 -571 D 0.447 -572 E 0.422 -573 L 0.386 -574 C 0.366 -575 L 0.373 -576 V 0.399 -577 L 0.436 -578 N 0.486 -579 Q 0.547 -580 G 0.607 -581 E 0.650 -582 F 0.672 -583 N 0.689 -584 S 0.705 -585 L 0.716 -586 D 0.723 -587 I 0.733 -588 K 0.744 -589 N 0.749 -590 S 0.747 -591 R 0.745 -592 Q 0.748 -593 E 0.757 -594 E 0.762 -595 T 0.761 -596 S 0.754 -597 I 0.747 -598 V 0.743 -599 L 0.741 -600 Q 0.737 -601 S 0.728 -602 D 0.714 -603 S 0.701 -604 P 0.692 -605 S 0.686 -606 E 0.680 -607 T 0.676 -608 I 0.675 -609 P 0.672 -610 A 0.666 -611 Q 0.651 -612 T 0.623 -613 L 0.584 -614 L 0.547 -615 S 0.515 -616 D 0.474 -617 E 0.414 -618 F 0.355 -619 V 0.323 -620 S 0.321 -621 C 0.340 -622 L 0.367 -623 A 0.384 -624 I 0.386 -625 G 0.381 -626 N 0.369 -627 E 0.350 -628 D 0.333 -629 L 0.329 -630 P 0.322 -631 S 0.293 -632 I 0.250 -633 N 0.213 -634 S 0.192 -635 Y 0.184 -636 F 0.187 -637 P 0.201 -638 Q 0.220 -639 N 0.226 -640 V 0.202 -641 L 0.163 -642 E 0.133 -643 S 0.117 -644 H 0.107 -645 F 0.098 -646 S 0.095 -647 R 0.097 -648 I 0.097 -649 S 0.096 -650 L 0.095 -651 F 0.096 -652 Q 0.098 -653 K 0.101 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000049241.7_ENSMUST00000164267.3_GN:Hcar1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000049241.7_ENSMUST00000164267.3_GN:Hcar1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 231a1488b70a7384e6da7a88a202a4e1400367d1..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000049241.7_ENSMUST00000164267.3_GN:Hcar1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,344 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000049241.7|ENSMUST00000164267.3|GN:Hcar1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.401 -2 D 0.401 -3 N 0.395 -4 G 0.371 -5 S 0.323 -6 C 0.270 -7 C 0.245 -8 L 0.261 -9 I 0.301 -10 E 0.331 -11 G 0.330 -12 E 0.297 -13 P 0.248 -14 I 0.198 -15 S 0.154 -16 Q 0.120 -17 V 0.096 -18 M 0.081 -19 P 0.067 -20 P 0.052 -21 L 0.042 -22 L 0.040 -23 I 0.040 -24 L 0.039 -25 V 0.037 -26 F 0.036 -27 V 0.036 -28 L 0.039 -29 G 0.042 -30 A 0.045 -31 L 0.047 -32 G 0.049 -33 N 0.052 -34 G 0.052 -35 I 0.049 -36 A 0.042 -37 L 0.034 -38 C 0.030 -39 G 0.028 -40 F 0.027 -41 C 0.030 -42 F 0.039 -43 H 0.050 -44 M 0.061 -45 K 0.067 -46 T 0.069 -47 W 0.067 -48 K 0.063 -49 S 0.056 -50 S 0.044 -51 T 0.034 -52 I 0.027 -53 Y 0.024 -54 L 0.024 -55 F 0.026 -56 N 0.028 -57 L 0.030 -58 A 0.031 -59 V 0.035 -60 A 0.044 -61 D 0.056 -62 F 0.060 -63 L 0.055 -64 L 0.046 -65 M 0.042 -66 I 0.042 -67 C 0.043 -68 L 0.045 -69 P 0.046 -70 L 0.048 -71 R 0.051 -72 T 0.054 -73 D 0.055 -74 Y 0.053 -75 Y 0.050 -76 L 0.048 -77 R 0.050 -78 R 0.054 -79 R 0.059 -80 H 0.061 -81 W 0.059 -82 I 0.058 -83 F 0.059 -84 G 0.058 -85 D 0.052 -86 I 0.045 -87 A 0.037 -88 C 0.032 -89 R 0.028 -90 L 0.026 -91 V 0.028 -92 L 0.033 -93 F 0.036 -94 K 0.036 -95 L 0.033 -96 A 0.032 -97 M 0.033 -98 N 0.036 -99 R 0.039 -100 A 0.042 -101 G 0.042 -102 S 0.039 -103 I 0.034 -104 V 0.029 -105 F 0.027 -106 L 0.026 -107 T 0.026 -108 V 0.026 -109 V 0.029 -110 A 0.036 -111 V 0.044 -112 D 0.047 -113 R 0.045 -114 Y 0.041 -115 F 0.040 -116 K 0.047 -117 V 0.063 -118 V 0.085 -119 H 0.107 -120 P 0.123 -121 H 0.134 -122 H 0.146 -123 M 0.160 -124 V 0.171 -125 N 0.170 -126 A 0.156 -127 I 0.130 -128 S 0.095 -129 N 0.063 -130 R 0.043 -131 T 0.038 -132 A 0.045 -133 A 0.057 -134 A 0.064 -135 T 0.058 -136 A 0.047 -137 C 0.039 -138 V 0.037 -139 L 0.039 -140 W 0.039 -141 T 0.038 -142 L 0.038 -143 V 0.041 -144 I 0.043 -145 L 0.044 -146 G 0.045 -147 T 0.045 -148 V 0.044 -149 Y 0.045 -150 L 0.051 -151 L 0.056 -152 M 0.062 -153 E 0.070 -154 S 0.078 -155 H 0.087 -156 L 0.102 -157 C 0.119 -158 V 0.132 -159 Q 0.141 -160 G 0.149 -161 T 0.154 -162 L 0.152 -163 S 0.138 -164 S 0.117 -165 C 0.102 -166 E 0.101 -167 S 0.115 -168 F 0.135 -169 I 0.154 -170 M 0.171 -171 E 0.192 -172 S 0.209 -173 A 0.206 -174 N 0.181 -175 G 0.144 -176 W 0.109 -177 H 0.082 -178 D 0.065 -179 V 0.053 -180 M 0.044 -181 F 0.037 -182 Q 0.031 -183 L 0.028 -184 E 0.028 -185 F 0.030 -186 F 0.035 -187 L 0.040 -188 P 0.043 -189 L 0.042 -190 T 0.042 -191 I 0.043 -192 I 0.041 -193 L 0.036 -194 F 0.031 -195 C 0.031 -196 S 0.033 -197 V 0.037 -198 N 0.042 -199 V 0.047 -200 V 0.053 -201 W 0.057 -202 S 0.056 -203 L 0.052 -204 R 0.054 -205 R 0.065 -206 R 0.082 -207 Q 0.100 -208 Q 0.115 -209 L 0.127 -210 T 0.139 -211 R 0.144 -212 Q 0.139 -213 A 0.126 -214 R 0.111 -215 M 0.098 -216 R 0.083 -217 R 0.069 -218 A 0.058 -219 T 0.054 -220 R 0.054 -221 F 0.054 -222 I 0.050 -223 M 0.043 -224 V 0.039 -225 V 0.039 -226 A 0.040 -227 S 0.041 -228 V 0.038 -229 F 0.032 -230 I 0.026 -231 T 0.023 -232 C 0.023 -233 Y 0.026 -234 L 0.029 -235 P 0.029 -236 S 0.026 -237 V 0.023 -238 L 0.021 -239 A 0.021 -240 R 0.022 -241 L 0.023 -242 Y 0.024 -243 F 0.027 -244 L 0.035 -245 W 0.052 -246 T 0.074 -247 V 0.095 -248 P 0.110 -249 T 0.119 -250 S 0.123 -251 A 0.122 -252 C 0.118 -253 D 0.112 -254 P 0.101 -255 S 0.088 -256 V 0.073 -257 H 0.059 -258 T 0.049 -259 A 0.044 -260 L 0.043 -261 H 0.044 -262 V 0.048 -263 T 0.051 -264 L 0.051 -265 S 0.049 -266 F 0.048 -267 T 0.050 -268 Y 0.056 -269 L 0.065 -270 N 0.070 -271 S 0.069 -272 M 0.063 -273 L 0.057 -274 D 0.053 -275 P 0.048 -276 L 0.041 -277 V 0.036 -278 Y 0.036 -279 Y 0.042 -280 F 0.058 -281 S 0.087 -282 S 0.125 -283 P 0.163 -284 S 0.187 -285 L 0.193 -286 P 0.189 -287 K 0.191 -288 F 0.206 -289 Y 0.224 -290 T 0.239 -291 K 0.250 -292 L 0.261 -293 T 0.275 -294 I 0.301 -295 C 0.348 -296 S 0.406 -297 L 0.456 -298 K 0.495 -299 P 0.533 -300 K 0.572 -301 R 0.609 -302 P 0.642 -303 G 0.658 -304 R 0.645 -305 T 0.610 -306 K 0.582 -307 T 0.571 -308 R 0.555 -309 R 0.542 -310 S 0.561 -311 E 0.595 -312 E 0.608 -313 M 0.601 -314 P 0.598 -315 I 0.602 -316 S 0.598 -317 N 0.572 -318 L 0.512 -319 C 0.431 -320 S 0.381 -321 K 0.406 -322 S 0.477 -323 S 0.527 -324 I 0.556 -325 D 0.605 -326 G 0.667 -327 A 0.704 -328 N 0.706 -329 R 0.691 -330 S 0.669 -331 Q 0.647 -332 R 0.639 -333 P 0.651 -334 S 0.673 -335 D 0.689 -336 G 0.685 -337 Q 0.660 -338 W 0.613 -339 D 0.552 -340 L 0.483 -341 Q 0.411 -342 V 0.345 -343 C 0.301 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000049241.7_ENSMUST00000164267.3_GN:Hcar1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000049241.7_ENSMUST00000164267.3_GN:Hcar1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid deleted file mode 100644 index 6c9e2741da2bbe4047dcb4ef75eff7bd02805c3b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000049241.7_ENSMUST00000164267.3_GN:Hcar1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:8.caid +++ /dev/null @@ -1,352 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000049241.7|ENSMUST00000164267.3|GN:Hcar1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:8 -1 M 0.366 -2 P 0.382 -3 V 0.407 -4 L 0.438 -5 S 0.477 -6 P 0.517 -7 T 0.545 -8 A 0.550 -9 M 0.529 -10 D 0.495 -11 N 0.456 -12 G 0.406 -13 S 0.340 -14 C 0.277 -15 C 0.246 -16 L 0.256 -17 I 0.284 -18 E 0.305 -19 G 0.302 -20 E 0.274 -21 P 0.234 -22 I 0.192 -23 S 0.151 -24 Q 0.118 -25 V 0.095 -26 M 0.081 -27 P 0.067 -28 P 0.052 -29 L 0.043 -30 L 0.041 -31 I 0.041 -32 L 0.040 -33 V 0.038 -34 F 0.036 -35 V 0.036 -36 L 0.038 -37 G 0.042 -38 A 0.045 -39 L 0.047 -40 G 0.049 -41 N 0.051 -42 G 0.052 -43 I 0.049 -44 A 0.042 -45 L 0.034 -46 C 0.030 -47 G 0.028 -48 F 0.027 -49 C 0.031 -50 F 0.039 -51 H 0.050 -52 M 0.059 -53 K 0.065 -54 T 0.066 -55 W 0.064 -56 K 0.061 -57 S 0.055 -58 S 0.044 -59 T 0.033 -60 I 0.026 -61 Y 0.024 -62 L 0.024 -63 F 0.026 -64 N 0.029 -65 L 0.030 -66 A 0.032 -67 V 0.036 -68 A 0.045 -69 D 0.056 -70 F 0.060 -71 L 0.054 -72 L 0.045 -73 M 0.041 -74 I 0.041 -75 C 0.041 -76 L 0.043 -77 P 0.045 -78 L 0.046 -79 R 0.049 -80 T 0.052 -81 D 0.053 -82 Y 0.050 -83 Y 0.048 -84 L 0.047 -85 R 0.048 -86 R 0.052 -87 R 0.056 -88 H 0.058 -89 W 0.057 -90 I 0.056 -91 F 0.057 -92 G 0.056 -93 D 0.051 -94 I 0.043 -95 A 0.036 -96 C 0.030 -97 R 0.026 -98 L 0.025 -99 V 0.027 -100 L 0.032 -101 F 0.036 -102 K 0.035 -103 L 0.033 -104 A 0.031 -105 M 0.033 -106 N 0.036 -107 R 0.039 -108 A 0.042 -109 G 0.042 -110 S 0.039 -111 I 0.034 -112 V 0.029 -113 F 0.026 -114 L 0.026 -115 T 0.026 -116 V 0.026 -117 V 0.029 -118 A 0.036 -119 V 0.044 -120 D 0.047 -121 R 0.045 -122 Y 0.041 -123 F 0.040 -124 K 0.047 -125 V 0.063 -126 V 0.085 -127 H 0.107 -128 P 0.122 -129 H 0.133 -130 H 0.145 -131 M 0.160 -132 V 0.171 -133 N 0.171 -134 A 0.158 -135 I 0.131 -136 S 0.096 -137 N 0.063 -138 R 0.043 -139 T 0.038 -140 A 0.045 -141 A 0.057 -142 A 0.064 -143 T 0.059 -144 A 0.047 -145 C 0.039 -146 V 0.037 -147 L 0.039 -148 W 0.039 -149 T 0.038 -150 L 0.038 -151 V 0.041 -152 I 0.043 -153 L 0.044 -154 G 0.045 -155 T 0.045 -156 V 0.043 -157 Y 0.045 -158 L 0.050 -159 L 0.056 -160 M 0.062 -161 E 0.069 -162 S 0.077 -163 H 0.086 -164 L 0.100 -165 C 0.116 -166 V 0.129 -167 Q 0.137 -168 G 0.145 -169 T 0.150 -170 L 0.148 -171 S 0.135 -172 S 0.115 -173 C 0.100 -174 E 0.101 -175 S 0.115 -176 F 0.135 -177 I 0.153 -178 M 0.170 -179 E 0.191 -180 S 0.207 -181 A 0.204 -182 N 0.178 -183 G 0.142 -184 W 0.107 -185 H 0.081 -186 D 0.064 -187 V 0.053 -188 M 0.044 -189 F 0.037 -190 Q 0.032 -191 L 0.028 -192 E 0.028 -193 F 0.030 -194 F 0.035 -195 L 0.040 -196 P 0.043 -197 L 0.042 -198 T 0.042 -199 I 0.043 -200 I 0.041 -201 L 0.036 -202 F 0.031 -203 C 0.031 -204 S 0.033 -205 V 0.037 -206 N 0.042 -207 V 0.047 -208 V 0.052 -209 W 0.056 -210 S 0.055 -211 L 0.051 -212 R 0.053 -213 R 0.063 -214 R 0.079 -215 Q 0.096 -216 Q 0.111 -217 L 0.123 -218 T 0.134 -219 R 0.140 -220 Q 0.135 -221 A 0.122 -222 R 0.108 -223 M 0.095 -224 R 0.081 -225 R 0.067 -226 A 0.057 -227 T 0.053 -228 R 0.054 -229 F 0.053 -230 I 0.050 -231 M 0.044 -232 V 0.040 -233 V 0.039 -234 A 0.040 -235 S 0.041 -236 V 0.039 -237 F 0.033 -238 I 0.027 -239 T 0.023 -240 C 0.023 -241 Y 0.026 -242 L 0.029 -243 P 0.028 -244 S 0.026 -245 V 0.023 -246 L 0.021 -247 A 0.021 -248 R 0.022 -249 L 0.023 -250 Y 0.024 -251 F 0.026 -252 L 0.034 -253 W 0.051 -254 T 0.073 -255 V 0.094 -256 P 0.110 -257 T 0.120 -258 S 0.123 -259 A 0.122 -260 C 0.118 -261 D 0.112 -262 P 0.101 -263 S 0.088 -264 V 0.074 -265 H 0.059 -266 T 0.050 -267 A 0.045 -268 L 0.044 -269 H 0.045 -270 V 0.048 -271 T 0.051 -272 L 0.051 -273 S 0.050 -274 F 0.049 -275 T 0.051 -276 Y 0.057 -277 L 0.065 -278 N 0.071 -279 S 0.069 -280 M 0.063 -281 L 0.057 -282 D 0.053 -283 P 0.048 -284 L 0.041 -285 V 0.036 -286 Y 0.036 -287 Y 0.043 -288 F 0.058 -289 S 0.087 -290 S 0.126 -291 P 0.163 -292 S 0.187 -293 L 0.193 -294 P 0.188 -295 K 0.190 -296 F 0.205 -297 Y 0.223 -298 T 0.238 -299 K 0.251 -300 L 0.262 -301 T 0.275 -302 I 0.300 -303 C 0.347 -304 S 0.406 -305 L 0.456 -306 K 0.496 -307 P 0.534 -308 K 0.573 -309 R 0.611 -310 P 0.644 -311 G 0.662 -312 R 0.653 -313 T 0.623 -314 K 0.599 -315 T 0.585 -316 R 0.564 -317 R 0.547 -318 S 0.566 -319 E 0.600 -320 E 0.612 -321 M 0.606 -322 P 0.604 -323 I 0.608 -324 S 0.606 -325 N 0.580 -326 L 0.520 -327 C 0.438 -328 S 0.385 -329 K 0.409 -330 S 0.480 -331 S 0.530 -332 I 0.558 -333 D 0.607 -334 G 0.670 -335 A 0.706 -336 N 0.709 -337 R 0.693 -338 S 0.671 -339 Q 0.649 -340 R 0.642 -341 P 0.654 -342 S 0.676 -343 D 0.691 -344 G 0.688 -345 Q 0.663 -346 W 0.617 -347 D 0.556 -348 L 0.488 -349 Q 0.416 -350 V 0.349 -351 C 0.304 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000049353.18_ENSMUST00000180463.3_GN:Rd3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000049353.18_ENSMUST00000180463.3_GN:Rd3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 809c4c01560dc40322849221d6b78c6e778bb5ab..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000049353.18_ENSMUST00000180463.3_GN:Rd3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,196 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000049353.18|ENSMUST00000180463.3|GN:Rd3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.408 -2 S 0.428 -3 L 0.455 -4 I 0.467 -5 P 0.462 -6 W 0.460 -7 L 0.483 -8 R 0.526 -9 W 0.562 -10 N 0.577 -11 D 0.574 -12 T 0.572 -13 P 0.591 -14 P 0.626 -15 R 0.651 -16 L 0.639 -17 S 0.575 -18 A 0.462 -19 R 0.330 -20 T 0.221 -21 P 0.158 -22 A 0.130 -23 E 0.118 -24 M 0.109 -25 V 0.097 -26 L 0.086 -27 E 0.083 -28 T 0.081 -29 L 0.074 -30 M 0.065 -31 M 0.060 -32 E 0.060 -33 L 0.065 -34 A 0.074 -35 G 0.082 -36 Q 0.084 -37 M 0.081 -38 R 0.080 -39 E 0.082 -40 V 0.085 -41 E 0.094 -42 R 0.107 -43 Q 0.119 -44 Q 0.130 -45 R 0.149 -46 E 0.180 -47 R 0.216 -48 R 0.246 -49 S 0.268 -50 A 0.292 -51 V 0.320 -52 R 0.347 -53 K 0.379 -54 I 0.419 -55 C 0.454 -56 T 0.459 -57 G 0.422 -58 V 0.352 -59 D 0.276 -60 Y 0.227 -61 S 0.217 -62 W 0.230 -63 L 0.251 -64 A 0.274 -65 N 0.298 -66 T 0.320 -67 P 0.328 -68 R 0.307 -69 P 0.257 -70 T 0.198 -71 Y 0.154 -72 D 0.131 -73 I 0.123 -74 S 0.127 -75 P 0.136 -76 G 0.136 -77 E 0.124 -78 R 0.108 -79 L 0.094 -80 Q 0.081 -81 L 0.069 -82 E 0.064 -83 D 0.063 -84 V 0.064 -85 C 0.068 -86 A 0.078 -87 K 0.088 -88 I 0.092 -89 H 0.090 -90 P 0.085 -91 S 0.081 -92 Y 0.079 -93 C 0.076 -94 G 0.069 -95 P 0.058 -96 A 0.047 -97 I 0.040 -98 L 0.038 -99 R 0.044 -100 F 0.056 -101 R 0.071 -102 Q 0.080 -103 L 0.077 -104 L 0.068 -105 A 0.065 -106 E 0.069 -107 R 0.079 -108 E 0.089 -109 P 0.092 -110 E 0.087 -111 V 0.075 -112 Q 0.064 -113 E 0.057 -114 V 0.058 -115 A 0.067 -116 R 0.077 -117 L 0.081 -118 F 0.081 -119 R 0.082 -120 S 0.082 -121 V 0.071 -122 L 0.055 -123 Q 0.045 -124 E 0.045 -125 A 0.052 -126 L 0.065 -127 E 0.079 -128 K 0.084 -129 M 0.089 -130 K 0.100 -131 Q 0.115 -132 E 0.132 -133 E 0.152 -134 E 0.177 -135 A 0.199 -136 H 0.213 -137 K 0.224 -138 L 0.239 -139 T 0.263 -140 R 0.298 -141 Q 0.348 -142 W 0.411 -143 S 0.471 -144 L 0.516 -145 R 0.556 -146 P 0.609 -147 R 0.669 -148 G 0.718 -149 S 0.741 -150 L 0.745 -151 S 0.740 -152 S 0.738 -153 F 0.745 -154 K 0.759 -155 T 0.774 -156 R 0.783 -157 A 0.783 -158 R 0.775 -159 I 0.761 -160 A 0.753 -161 P 0.759 -162 F 0.776 -163 A 0.792 -164 S 0.802 -165 D 0.808 -166 I 0.816 -167 R 0.825 -168 T 0.835 -169 I 0.840 -170 S 0.838 -171 E 0.833 -172 D 0.825 -173 V 0.813 -174 E 0.789 -175 R 0.744 -176 D 0.681 -177 A 0.617 -178 P 0.582 -179 P 0.594 -180 P 0.639 -181 P 0.687 -182 R 0.715 -183 T 0.714 -184 W 0.692 -185 S 0.670 -186 M 0.665 -187 P 0.672 -188 E 0.677 -189 F 0.675 -190 R 0.673 -191 A 0.678 -192 P 0.680 -193 Q 0.658 -194 A 0.607 -195 D 0.559 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000049353.18_ENSMUST00000180463.3_GN:Rd3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:115.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000049353.18_ENSMUST00000180463.3_GN:Rd3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:115.caid deleted file mode 100644 index 3e6fce08be16967398e60eccf1a39ddb4f9b961f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000049353.18_ENSMUST00000180463.3_GN:Rd3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:115.caid +++ /dev/null @@ -1,311 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000049353.18|ENSMUST00000180463.3|GN:Rd3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:115 -1 M 0.177 -2 L 0.175 -3 A 0.173 -4 C 0.169 -5 L 0.167 -6 Q 0.170 -7 V 0.179 -8 L 0.199 -9 Q 0.228 -10 G 0.251 -11 A 0.263 -12 V 0.280 -13 S 0.312 -14 Q 0.343 -15 L 0.366 -16 W 0.403 -17 G 0.467 -18 P 0.544 -19 T 0.600 -20 H 0.623 -21 T 0.630 -22 P 0.641 -23 Q 0.661 -24 T 0.682 -25 P 0.702 -26 A 0.716 -27 Q 0.716 -28 L 0.700 -29 G 0.678 -30 P 0.657 -31 S 0.620 -32 S 0.552 -33 S 0.476 -34 W 0.427 -35 C 0.414 -36 L 0.423 -37 Q 0.445 -38 Y 0.467 -39 N 0.477 -40 F 0.487 -41 S 0.514 -42 K 0.557 -43 R 0.602 -44 K 0.638 -45 S 0.661 -46 R 0.675 -47 K 0.686 -48 H 0.697 -49 R 0.706 -50 R 0.719 -51 Q 0.741 -52 P 0.772 -53 A 0.801 -54 V 0.817 -55 E 0.818 -56 E 0.807 -57 A 0.791 -58 E 0.777 -59 G 0.763 -60 G 0.744 -61 R 0.704 -62 G 0.639 -63 W 0.565 -64 S 0.506 -65 S 0.463 -66 L 0.416 -67 F 0.352 -68 N 0.289 -69 S 0.246 -70 C 0.225 -71 Q 0.218 -72 F 0.223 -73 A 0.238 -74 A 0.253 -75 Q 0.262 -76 L 0.263 -77 S 0.271 -78 T 0.298 -79 F 0.345 -80 P 0.400 -81 R 0.450 -82 K 0.491 -83 D 0.519 -84 Q 0.526 -85 G 0.511 -86 S 0.501 -87 L 0.516 -88 L 0.546 -89 L 0.577 -90 E 0.604 -91 C 0.605 -92 E 0.566 -93 A 0.504 -94 E 0.451 -95 S 0.409 -96 R 0.369 -97 T 0.330 -98 P 0.299 -99 T 0.277 -100 V 0.256 -101 I 0.225 -102 V 0.183 -103 A 0.142 -104 L 0.111 -105 K 0.088 -106 E 0.071 -107 V 0.059 -108 D 0.051 -109 L 0.050 -110 R 0.053 -111 R 0.061 -112 V 0.074 -113 W 0.086 -114 G 0.092 -115 A 0.096 -116 M 0.103 -117 S 0.117 -118 L 0.133 -119 I 0.140 -120 P 0.131 -121 W 0.115 -122 L 0.105 -123 R 0.109 -124 W 0.127 -125 N 0.155 -126 D 0.190 -127 T 0.229 -128 P 0.262 -129 P 0.277 -130 R 0.273 -131 L 0.261 -132 S 0.244 -133 A 0.213 -134 R 0.164 -135 T 0.116 -136 P 0.086 -137 A 0.076 -138 E 0.080 -139 M 0.087 -140 V 0.086 -141 L 0.075 -142 E 0.063 -143 T 0.057 -144 L 0.053 -145 M 0.050 -146 M 0.047 -147 E 0.046 -148 L 0.049 -149 A 0.055 -150 G 0.060 -151 Q 0.061 -152 M 0.060 -153 R 0.066 -154 E 0.075 -155 V 0.084 -156 E 0.093 -157 R 0.102 -158 Q 0.109 -159 Q 0.115 -160 R 0.126 -161 E 0.145 -162 R 0.166 -163 R 0.185 -164 S 0.201 -165 A 0.217 -166 V 0.236 -167 R 0.258 -168 K 0.281 -169 I 0.304 -170 C 0.318 -171 T 0.317 -172 G 0.297 -173 V 0.257 -174 D 0.208 -175 Y 0.173 -176 S 0.164 -177 W 0.173 -178 L 0.191 -179 A 0.215 -180 N 0.244 -181 T 0.271 -182 P 0.281 -183 R 0.267 -184 P 0.232 -185 T 0.190 -186 Y 0.157 -187 D 0.138 -188 I 0.130 -189 S 0.133 -190 P 0.143 -191 G 0.146 -192 E 0.138 -193 R 0.125 -194 L 0.112 -195 Q 0.096 -196 L 0.082 -197 E 0.076 -198 D 0.074 -199 V 0.074 -200 C 0.075 -201 A 0.078 -202 K 0.080 -203 I 0.081 -204 H 0.083 -205 P 0.086 -206 S 0.090 -207 Y 0.094 -208 C 0.095 -209 G 0.087 -210 P 0.071 -211 A 0.055 -212 I 0.045 -213 L 0.043 -214 R 0.050 -215 F 0.063 -216 R 0.077 -217 Q 0.084 -218 L 0.082 -219 L 0.075 -220 A 0.073 -221 E 0.077 -222 R 0.086 -223 E 0.093 -224 P 0.094 -225 E 0.088 -226 V 0.077 -227 Q 0.067 -228 E 0.061 -229 V 0.063 -230 A 0.072 -231 R 0.082 -232 L 0.085 -233 F 0.085 -234 R 0.085 -235 S 0.083 -236 V 0.072 -237 L 0.058 -238 Q 0.049 -239 E 0.048 -240 A 0.053 -241 L 0.067 -242 E 0.081 -243 K 0.090 -244 M 0.095 -245 K 0.105 -246 Q 0.119 -247 E 0.134 -248 E 0.152 -249 E 0.173 -250 A 0.190 -251 H 0.203 -252 K 0.217 -253 L 0.236 -254 T 0.263 -255 R 0.297 -256 Q 0.345 -257 W 0.403 -258 S 0.459 -259 L 0.501 -260 R 0.541 -261 P 0.596 -262 R 0.659 -263 G 0.709 -264 S 0.733 -265 L 0.736 -266 S 0.733 -267 S 0.732 -268 F 0.738 -269 K 0.750 -270 T 0.762 -271 R 0.767 -272 A 0.764 -273 R 0.754 -274 I 0.742 -275 A 0.736 -276 P 0.743 -277 F 0.759 -278 A 0.775 -279 S 0.785 -280 D 0.792 -281 I 0.799 -282 R 0.804 -283 T 0.797 -284 I 0.757 -285 S 0.694 -286 E 0.658 -287 D 0.686 -288 V 0.738 -289 E 0.760 -290 R 0.737 -291 D 0.686 -292 A 0.632 -293 P 0.604 -294 P 0.617 -295 P 0.660 -296 P 0.706 -297 R 0.733 -298 T 0.733 -299 W 0.714 -300 S 0.695 -301 M 0.689 -302 P 0.695 -303 E 0.698 -304 F 0.694 -305 R 0.690 -306 A 0.694 -307 P 0.696 -308 Q 0.676 -309 A 0.629 -310 D 0.584 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000050108.13_ENSMUST00000061699.12_GN:Bpifc_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000050108.13_ENSMUST00000061699.12_GN:Bpifc_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index e04c72c958ea00d1890e9944e11bffe017e9c103..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000050108.13_ENSMUST00000061699.12_GN:Bpifc_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,508 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000050108.13|ENSMUST00000061699.12|GN:Bpifc|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.325 -2 R 0.321 -3 T 0.322 -4 K 0.326 -5 Q 0.317 -6 V 0.284 -7 P 0.237 -8 V 0.193 -9 L 0.161 -10 W 0.141 -11 A 0.125 -12 C 0.111 -13 F 0.105 -14 L 0.107 -15 L 0.115 -16 W 0.125 -17 S 0.142 -18 L 0.168 -19 Y 0.207 -20 I 0.250 -21 A 0.290 -22 S 0.317 -23 S 0.326 -24 Q 0.308 -25 T 0.266 -26 V 0.208 -27 Y 0.152 -28 P 0.107 -29 G 0.077 -30 I 0.061 -31 T 0.054 -32 A 0.051 -33 R 0.048 -34 I 0.042 -35 T 0.037 -36 Q 0.032 -37 R 0.030 -38 A 0.030 -39 L 0.033 -40 D 0.038 -41 Y 0.045 -42 G 0.056 -43 L 0.066 -44 Q 0.071 -45 V 0.070 -46 G 0.070 -47 M 0.077 -48 K 0.084 -49 V 0.083 -50 L 0.078 -51 E 0.074 -52 Q 0.076 -53 L 0.087 -54 A 0.103 -55 K 0.116 -56 E 0.122 -57 I 0.123 -58 V 0.119 -59 I 0.111 -60 P 0.100 -61 D 0.090 -62 L 0.082 -63 N 0.081 -64 G 0.090 -65 S 0.108 -66 E 0.130 -67 S 0.150 -68 L 0.163 -69 K 0.170 -70 F 0.171 -71 L 0.166 -72 K 0.155 -73 I 0.140 -74 D 0.127 -75 Y 0.117 -76 V 0.108 -77 K 0.099 -78 Y 0.093 -79 N 0.093 -80 F 0.098 -81 S 0.111 -82 N 0.121 -83 I 0.121 -84 K 0.113 -85 I 0.101 -86 N 0.087 -87 A 0.073 -88 F 0.061 -89 S 0.059 -90 F 0.065 -91 P 0.069 -92 N 0.062 -93 T 0.047 -94 S 0.034 -95 L 0.029 -96 A 0.032 -97 F 0.042 -98 V 0.059 -99 P 0.076 -100 G 0.087 -101 V 0.082 -102 G 0.065 -103 I 0.048 -104 R 0.041 -105 A 0.044 -106 L 0.051 -107 S 0.058 -108 N 0.062 -109 H 0.064 -110 G 0.062 -111 T 0.057 -112 A 0.053 -113 N 0.049 -114 I 0.048 -115 S 0.047 -116 T 0.047 -117 N 0.047 -118 W 0.047 -119 S 0.050 -120 V 0.058 -121 K 0.071 -122 A 0.083 -123 P 0.088 -124 L 0.090 -125 F 0.094 -126 R 0.100 -127 D 0.107 -128 S 0.115 -129 G 0.121 -130 A 0.121 -131 A 0.113 -132 N 0.099 -133 L 0.084 -134 F 0.077 -135 L 0.080 -136 S 0.086 -137 G 0.086 -138 I 0.075 -139 Y 0.062 -140 F 0.055 -141 T 0.055 -142 G 0.056 -143 I 0.053 -144 V 0.049 -145 A 0.049 -146 F 0.056 -147 T 0.068 -148 R 0.084 -149 N 0.103 -150 D 0.120 -151 F 0.128 -152 G 0.122 -153 Y 0.106 -154 P 0.087 -155 A 0.072 -156 L 0.061 -157 E 0.053 -158 L 0.050 -159 Q 0.051 -160 D 0.053 -161 C 0.052 -162 H 0.050 -163 V 0.049 -164 Q 0.051 -165 V 0.057 -166 S 0.063 -167 H 0.063 -168 A 0.059 -169 R 0.057 -170 V 0.060 -171 S 0.067 -172 F 0.075 -173 F 0.086 -174 G 0.100 -175 S 0.111 -176 L 0.115 -177 S 0.111 -178 A 0.101 -179 L 0.092 -180 Y 0.091 -181 N 0.095 -182 S 0.098 -183 F 0.103 -184 A 0.114 -185 E 0.120 -186 P 0.115 -187 M 0.104 -188 E 0.098 -189 K 0.099 -190 P 0.100 -191 I 0.099 -192 L 0.102 -193 K 0.110 -194 N 0.111 -195 L 0.101 -196 N 0.089 -197 E 0.085 -198 M 0.084 -199 L 0.080 -200 C 0.078 -201 P 0.083 -202 I 0.090 -203 A 0.088 -204 I 0.081 -205 S 0.078 -206 Q 0.082 -207 V 0.087 -208 E 0.096 -209 Q 0.109 -210 F 0.117 -211 N 0.113 -212 V 0.102 -213 N 0.092 -214 I 0.084 -215 S 0.078 -216 A 0.075 -217 L 0.072 -218 E 0.066 -219 V 0.060 -220 L 0.060 -221 T 0.067 -222 K 0.079 -223 I 0.090 -224 D 0.096 -225 N 0.095 -226 Y 0.087 -227 T 0.080 -228 V 0.075 -229 L 0.073 -230 D 0.071 -231 C 0.073 -232 S 0.082 -233 L 0.094 -234 I 0.101 -235 S 0.097 -236 P 0.087 -237 P 0.078 -238 E 0.076 -239 I 0.079 -240 T 0.085 -241 E 0.088 -242 N 0.082 -243 H 0.068 -244 L 0.052 -245 D 0.043 -246 F 0.043 -247 N 0.054 -248 L 0.067 -249 K 0.077 -250 G 0.081 -251 A 0.081 -252 F 0.083 -253 Y 0.089 -254 P 0.097 -255 L 0.101 -256 E 0.099 -257 S 0.100 -258 L 0.108 -259 V 0.122 -260 D 0.135 -261 P 0.143 -262 P 0.148 -263 F 0.152 -264 T 0.159 -265 P 0.166 -266 A 0.165 -267 P 0.151 -268 F 0.128 -269 H 0.107 -270 L 0.094 -271 P 0.087 -272 E 0.085 -273 S 0.088 -274 R 0.095 -275 D 0.104 -276 S 0.107 -277 M 0.103 -278 L 0.098 -279 Y 0.094 -280 I 0.089 -281 G 0.080 -282 I 0.070 -283 S 0.064 -284 E 0.062 -285 Y 0.060 -286 F 0.054 -287 F 0.049 -288 K 0.053 -289 S 0.062 -290 A 0.066 -291 S 0.066 -292 F 0.065 -293 A 0.067 -294 H 0.072 -295 Y 0.083 -296 V 0.095 -297 S 0.101 -298 G 0.097 -299 A 0.089 -300 L 0.083 -301 G 0.079 -302 T 0.074 -303 T 0.066 -304 L 0.057 -305 S 0.050 -306 T 0.050 -307 R 0.054 -308 E 0.060 -309 I 0.069 -310 S 0.081 -311 N 0.099 -312 Y 0.127 -313 F 0.167 -314 S 0.214 -315 Q 0.255 -316 N 0.281 -317 V 0.289 -318 Q 0.279 -319 G 0.253 -320 F 0.221 -321 G 0.195 -322 S 0.174 -323 V 0.151 -324 L 0.133 -325 S 0.130 -326 K 0.141 -327 I 0.158 -328 A 0.177 -329 E 0.196 -330 I 0.212 -331 Y 0.218 -332 V 0.207 -333 L 0.181 -334 S 0.151 -335 Q 0.123 -336 P 0.099 -337 F 0.078 -338 I 0.065 -339 L 0.059 -340 Q 0.057 -341 M 0.061 -342 M 0.076 -343 A 0.103 -344 T 0.127 -345 G 0.134 -346 P 0.120 -347 P 0.095 -348 M 0.076 -349 V 0.073 -350 N 0.084 -351 L 0.103 -352 Q 0.121 -353 R 0.127 -354 N 0.117 -355 N 0.095 -356 F 0.074 -357 S 0.061 -358 L 0.060 -359 E 0.064 -360 F 0.065 -361 P 0.060 -362 A 0.051 -363 A 0.043 -364 V 0.039 -365 I 0.040 -366 M 0.045 -367 L 0.057 -368 T 0.082 -369 Q 0.119 -370 L 0.154 -371 D 0.177 -372 N 0.183 -373 S 0.175 -374 T 0.155 -375 I 0.132 -376 Q 0.118 -377 P 0.116 -378 I 0.118 -379 V 0.117 -380 S 0.113 -381 M 0.107 -382 D 0.098 -383 F 0.089 -384 V 0.085 -385 A 0.086 -386 S 0.088 -387 T 0.087 -388 S 0.086 -389 V 0.085 -390 G 0.084 -391 L 0.084 -392 A 0.086 -393 I 0.089 -394 L 0.090 -395 G 0.090 -396 Q 0.091 -397 K 0.092 -398 L 0.090 -399 I 0.084 -400 C 0.077 -401 S 0.069 -402 L 0.061 -403 S 0.053 -404 L 0.047 -405 N 0.043 -406 R 0.039 -407 F 0.036 -408 R 0.039 -409 L 0.055 -410 S 0.088 -411 L 0.137 -412 P 0.194 -413 E 0.245 -414 N 0.284 -415 S 0.304 -416 Q 0.307 -417 R 0.298 -418 D 0.282 -419 A 0.255 -420 K 0.219 -421 V 0.178 -422 V 0.142 -423 R 0.112 -424 F 0.088 -425 E 0.072 -426 N 0.063 -427 I 0.060 -428 L 0.061 -429 S 0.064 -430 S 0.067 -431 I 0.073 -432 L 0.083 -433 H 0.092 -434 F 0.094 -435 G 0.090 -436 V 0.085 -437 L 0.087 -438 P 0.092 -439 L 0.097 -440 A 0.099 -441 N 0.099 -442 T 0.098 -443 K 0.098 -444 L 0.099 -445 Q 0.104 -446 Q 0.107 -447 G 0.107 -448 F 0.109 -449 P 0.117 -450 L 0.127 -451 P 0.126 -452 N 0.117 -453 P 0.106 -454 Y 0.098 -455 N 0.094 -456 I 0.090 -457 S 0.092 -458 F 0.104 -459 I 0.122 -460 N 0.130 -461 S 0.125 -462 D 0.110 -463 I 0.095 -464 E 0.086 -465 V 0.088 -466 L 0.096 -467 E 0.097 -468 G 0.087 -469 Y 0.071 -470 L 0.059 -471 L 0.055 -472 V 0.056 -473 S 0.062 -474 S 0.068 -475 D 0.076 -476 L 0.091 -477 A 0.118 -478 Y 0.161 -479 D 0.219 -480 T 0.280 -481 S 0.333 -482 S 0.383 -483 K 0.435 -484 P 0.490 -485 Q 0.543 -486 P 0.583 -487 N 0.603 -488 L 0.604 -489 N 0.592 -490 S 0.574 -491 W 0.558 -492 G 0.552 -493 D 0.542 -494 L 0.511 -495 N 0.462 -496 L 0.414 -497 V 0.381 -498 H 0.361 -499 R 0.351 -500 P 0.348 -501 W 0.348 -502 R 0.354 -503 E 0.364 -504 Q 0.373 -505 P 0.376 -506 T 0.377 -507 H 0.380 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000050108.13_ENSMUST00000061699.12_GN:Bpifc_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:35.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000050108.13_ENSMUST00000061699.12_GN:Bpifc_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:35.caid deleted file mode 100644 index ad7496630a8233e274803f728409b4eb5ba66cdc..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000050108.13_ENSMUST00000061699.12_GN:Bpifc_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:35.caid +++ /dev/null @@ -1,543 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000050108.13|ENSMUST00000061699.12|GN:Bpifc|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:35 -1 M 0.199 -2 F 0.212 -3 R 0.237 -4 L 0.261 -5 L 0.275 -6 R 0.284 -7 L 0.300 -8 R 0.316 -9 S 0.326 -10 T 0.341 -11 A 0.362 -12 E 0.374 -13 N 0.382 -14 T 0.404 -15 P 0.429 -16 A 0.436 -17 S 0.439 -18 K 0.453 -19 V 0.467 -20 K 0.480 -21 G 0.505 -22 I 0.536 -23 E 0.555 -24 G 0.547 -25 T 0.501 -26 L 0.433 -27 Q 0.383 -28 L 0.369 -29 W 0.374 -30 T 0.390 -31 H 0.425 -32 P 0.476 -33 G 0.520 -34 L 0.538 -35 E 0.531 -36 M 0.510 -37 R 0.482 -38 T 0.448 -39 K 0.417 -40 Q 0.388 -41 V 0.353 -42 P 0.304 -43 V 0.249 -44 L 0.203 -45 W 0.171 -46 A 0.148 -47 C 0.133 -48 F 0.127 -49 L 0.127 -50 L 0.130 -51 W 0.136 -52 S 0.149 -53 L 0.175 -54 Y 0.213 -55 I 0.254 -56 A 0.292 -57 S 0.321 -58 S 0.332 -59 Q 0.316 -60 T 0.273 -61 V 0.214 -62 Y 0.156 -63 P 0.110 -64 G 0.080 -65 I 0.064 -66 T 0.058 -67 A 0.055 -68 R 0.051 -69 I 0.045 -70 T 0.039 -71 Q 0.034 -72 R 0.031 -73 A 0.032 -74 L 0.035 -75 D 0.039 -76 Y 0.043 -77 G 0.048 -78 L 0.052 -79 Q 0.053 -80 V 0.054 -81 G 0.061 -82 M 0.073 -83 K 0.080 -84 V 0.080 -85 L 0.074 -86 E 0.069 -87 Q 0.071 -88 L 0.081 -89 A 0.096 -90 K 0.108 -91 E 0.114 -92 I 0.114 -93 V 0.109 -94 I 0.101 -95 P 0.091 -96 D 0.081 -97 L 0.073 -98 N 0.073 -99 G 0.083 -100 S 0.099 -101 E 0.119 -102 S 0.136 -103 L 0.147 -104 K 0.151 -105 F 0.151 -106 L 0.149 -107 K 0.143 -108 I 0.134 -109 D 0.126 -110 Y 0.118 -111 V 0.109 -112 K 0.100 -113 Y 0.093 -114 N 0.091 -115 F 0.095 -116 S 0.105 -117 N 0.114 -118 I 0.114 -119 K 0.106 -120 I 0.093 -121 N 0.080 -122 A 0.067 -123 F 0.058 -124 S 0.056 -125 F 0.061 -126 P 0.064 -127 N 0.058 -128 T 0.044 -129 S 0.033 -130 L 0.028 -131 A 0.031 -132 F 0.042 -133 V 0.058 -134 P 0.076 -135 G 0.086 -136 V 0.082 -137 G 0.065 -138 I 0.049 -139 R 0.041 -140 A 0.044 -141 L 0.051 -142 S 0.058 -143 N 0.062 -144 H 0.064 -145 G 0.062 -146 T 0.057 -147 A 0.053 -148 N 0.050 -149 I 0.048 -150 S 0.047 -151 T 0.047 -152 N 0.046 -153 W 0.046 -154 S 0.049 -155 V 0.058 -156 K 0.071 -157 A 0.083 -158 P 0.088 -159 L 0.090 -160 F 0.093 -161 R 0.099 -162 D 0.106 -163 S 0.113 -164 G 0.118 -165 A 0.117 -166 A 0.109 -167 N 0.095 -168 L 0.081 -169 F 0.075 -170 L 0.079 -171 S 0.085 -172 G 0.085 -173 I 0.075 -174 Y 0.062 -175 F 0.055 -176 T 0.055 -177 G 0.056 -178 I 0.052 -179 V 0.048 -180 A 0.050 -181 F 0.057 -182 T 0.069 -183 R 0.085 -184 N 0.105 -185 D 0.122 -186 F 0.130 -187 G 0.123 -188 Y 0.106 -189 P 0.087 -190 A 0.070 -191 L 0.059 -192 E 0.052 -193 L 0.049 -194 Q 0.050 -195 D 0.052 -196 C 0.052 -197 H 0.050 -198 V 0.048 -199 Q 0.050 -200 V 0.055 -201 S 0.061 -202 H 0.062 -203 A 0.058 -204 R 0.056 -205 V 0.059 -206 S 0.065 -207 F 0.071 -208 F 0.079 -209 G 0.092 -210 S 0.103 -211 L 0.108 -212 S 0.105 -213 A 0.096 -214 L 0.087 -215 Y 0.086 -216 N 0.089 -217 S 0.093 -218 F 0.099 -219 A 0.109 -220 E 0.115 -221 P 0.110 -222 M 0.100 -223 E 0.094 -224 K 0.094 -225 P 0.095 -226 I 0.094 -227 L 0.097 -228 K 0.104 -229 N 0.106 -230 L 0.097 -231 N 0.087 -232 E 0.084 -233 M 0.083 -234 L 0.079 -235 C 0.076 -236 P 0.081 -237 I 0.087 -238 A 0.085 -239 I 0.078 -240 S 0.075 -241 Q 0.078 -242 V 0.084 -243 E 0.094 -244 Q 0.107 -245 F 0.115 -246 N 0.110 -247 V 0.100 -248 N 0.089 -249 I 0.082 -250 S 0.076 -251 A 0.074 -252 L 0.070 -253 E 0.064 -254 V 0.058 -255 L 0.058 -256 T 0.065 -257 K 0.076 -258 I 0.087 -259 D 0.093 -260 N 0.091 -261 Y 0.085 -262 T 0.078 -263 V 0.074 -264 L 0.072 -265 D 0.070 -266 C 0.072 -267 S 0.081 -268 L 0.092 -269 I 0.099 -270 S 0.095 -271 P 0.085 -272 P 0.076 -273 E 0.073 -274 I 0.076 -275 T 0.082 -276 E 0.086 -277 N 0.081 -278 H 0.067 -279 L 0.052 -280 D 0.043 -281 F 0.043 -282 N 0.053 -283 L 0.067 -284 K 0.077 -285 G 0.080 -286 A 0.080 -287 F 0.082 -288 Y 0.088 -289 P 0.096 -290 L 0.101 -291 E 0.100 -292 S 0.102 -293 L 0.111 -294 V 0.125 -295 D 0.138 -296 P 0.146 -297 P 0.150 -298 F 0.153 -299 T 0.161 -300 P 0.168 -301 A 0.168 -302 P 0.153 -303 F 0.130 -304 H 0.109 -305 L 0.095 -306 P 0.088 -307 E 0.086 -308 S 0.089 -309 R 0.096 -310 D 0.105 -311 S 0.108 -312 M 0.105 -313 L 0.099 -314 Y 0.095 -315 I 0.090 -316 G 0.082 -317 I 0.072 -318 S 0.067 -319 E 0.065 -320 Y 0.063 -321 F 0.056 -322 F 0.051 -323 K 0.055 -324 S 0.064 -325 A 0.068 -326 S 0.067 -327 F 0.066 -328 A 0.068 -329 H 0.073 -330 Y 0.084 -331 V 0.096 -332 S 0.101 -333 G 0.098 -334 A 0.090 -335 L 0.085 -336 G 0.081 -337 T 0.075 -338 T 0.067 -339 L 0.058 -340 S 0.052 -341 T 0.052 -342 R 0.057 -343 E 0.064 -344 I 0.073 -345 S 0.086 -346 N 0.105 -347 Y 0.134 -348 F 0.176 -349 S 0.223 -350 Q 0.264 -351 N 0.288 -352 V 0.295 -353 Q 0.284 -354 G 0.258 -355 F 0.227 -356 G 0.201 -357 S 0.179 -358 V 0.155 -359 L 0.137 -360 S 0.135 -361 K 0.147 -362 I 0.165 -363 A 0.184 -364 E 0.203 -365 I 0.218 -366 Y 0.222 -367 V 0.210 -368 L 0.184 -369 S 0.153 -370 Q 0.126 -371 P 0.101 -372 F 0.080 -373 I 0.067 -374 L 0.061 -375 Q 0.058 -376 M 0.062 -377 M 0.077 -378 A 0.102 -379 T 0.126 -380 G 0.133 -381 P 0.120 -382 P 0.095 -383 M 0.077 -384 V 0.074 -385 N 0.085 -386 L 0.105 -387 Q 0.123 -388 R 0.128 -389 N 0.117 -390 N 0.095 -391 F 0.073 -392 S 0.061 -393 L 0.060 -394 E 0.063 -395 F 0.065 -396 P 0.060 -397 A 0.051 -398 A 0.042 -399 V 0.038 -400 I 0.039 -401 M 0.044 -402 L 0.056 -403 T 0.081 -404 Q 0.117 -405 L 0.152 -406 D 0.175 -407 N 0.182 -408 S 0.174 -409 T 0.154 -410 I 0.132 -411 Q 0.118 -412 P 0.116 -413 I 0.118 -414 V 0.118 -415 S 0.114 -416 M 0.107 -417 D 0.098 -418 F 0.089 -419 V 0.085 -420 A 0.086 -421 S 0.088 -422 T 0.087 -423 S 0.085 -424 V 0.083 -425 G 0.083 -426 L 0.083 -427 A 0.085 -428 I 0.089 -429 L 0.092 -430 G 0.092 -431 Q 0.093 -432 K 0.095 -433 L 0.093 -434 I 0.087 -435 C 0.079 -436 S 0.071 -437 L 0.062 -438 S 0.054 -439 L 0.049 -440 N 0.045 -441 R 0.040 -442 F 0.037 -443 R 0.041 -444 L 0.057 -445 S 0.091 -446 L 0.141 -447 P 0.198 -448 E 0.250 -449 N 0.288 -450 S 0.308 -451 Q 0.310 -452 R 0.300 -453 D 0.283 -454 A 0.257 -455 K 0.220 -456 V 0.180 -457 V 0.144 -458 R 0.114 -459 F 0.090 -460 E 0.073 -461 N 0.063 -462 I 0.060 -463 L 0.062 -464 S 0.065 -465 S 0.068 -466 I 0.074 -467 L 0.085 -468 H 0.094 -469 F 0.095 -470 G 0.091 -471 V 0.087 -472 L 0.089 -473 P 0.095 -474 L 0.100 -475 A 0.100 -476 N 0.099 -477 T 0.098 -478 K 0.098 -479 L 0.101 -480 Q 0.106 -481 Q 0.110 -482 G 0.109 -483 F 0.111 -484 P 0.120 -485 L 0.130 -486 P 0.130 -487 N 0.120 -488 P 0.107 -489 Y 0.099 -490 N 0.094 -491 I 0.091 -492 S 0.093 -493 F 0.105 -494 I 0.122 -495 N 0.130 -496 S 0.125 -497 D 0.113 -498 I 0.099 -499 E 0.090 -500 V 0.091 -501 L 0.099 -502 E 0.100 -503 G 0.089 -504 Y 0.073 -505 L 0.061 -506 L 0.056 -507 V 0.058 -508 S 0.064 -509 S 0.072 -510 D 0.079 -511 L 0.093 -512 A 0.118 -513 Y 0.159 -514 D 0.213 -515 T 0.269 -516 S 0.317 -517 S 0.363 -518 K 0.413 -519 P 0.465 -520 Q 0.516 -521 P 0.556 -522 N 0.577 -523 L 0.578 -524 N 0.563 -525 S 0.541 -526 W 0.524 -527 G 0.521 -528 D 0.514 -529 L 0.479 -530 N 0.418 -531 L 0.357 -532 V 0.317 -533 H 0.297 -534 R 0.285 -535 P 0.279 -536 W 0.278 -537 R 0.283 -538 E 0.289 -539 Q 0.286 -540 P 0.274 -541 T 0.262 -542 H 0.256 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000050440.9_ENSMUST00000062620.9_GN:Hamp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000050440.9_ENSMUST00000062620.9_GN:Hamp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 0886af0ec63822c69c351d3d07aeb03998fee7aa..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000050440.9_ENSMUST00000062620.9_GN:Hamp_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,84 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000050440.9|ENSMUST00000062620.9|GN:Hamp|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.330 -2 A 0.299 -3 L 0.250 -4 S 0.203 -5 T 0.167 -6 R 0.143 -7 T 0.132 -8 Q 0.130 -9 A 0.132 -10 A 0.135 -11 C 0.137 -12 L 0.143 -13 L 0.148 -14 L 0.148 -15 L 0.146 -16 L 0.151 -17 L 0.170 -18 A 0.199 -19 S 0.233 -20 L 0.268 -21 S 0.305 -22 S 0.328 -23 T 0.325 -24 T 0.304 -25 Y 0.292 -26 L 0.305 -27 H 0.345 -28 Q 0.401 -29 Q 0.460 -30 M 0.514 -31 R 0.570 -32 Q 0.630 -33 T 0.684 -34 T 0.714 -35 E 0.719 -36 L 0.710 -37 Q 0.705 -38 P 0.715 -39 L 0.738 -40 H 0.760 -41 G 0.773 -42 E 0.777 -43 E 0.777 -44 S 0.776 -45 R 0.774 -46 A 0.773 -47 D 0.771 -48 I 0.766 -49 A 0.756 -50 I 0.740 -51 P 0.725 -52 M 0.711 -53 Q 0.691 -54 K 0.660 -55 R 0.629 -56 R 0.605 -57 K 0.584 -58 R 0.557 -59 D 0.521 -60 T 0.478 -61 N 0.431 -62 F 0.386 -63 P 0.335 -64 I 0.273 -65 C 0.209 -66 I 0.158 -67 F 0.123 -68 C 0.103 -69 C 0.097 -70 K 0.104 -71 C 0.117 -72 C 0.135 -73 N 0.154 -74 N 0.166 -75 S 0.163 -76 Q 0.151 -77 C 0.140 -78 G 0.135 -79 I 0.133 -80 C 0.133 -81 C 0.142 -82 K 0.161 -83 T 0.178 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000050440.9_ENSMUST00000062620.9_GN:Hamp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000050440.9_ENSMUST00000062620.9_GN:Hamp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid deleted file mode 100644 index cd6baad335f6de457aa0c3cf56114902227f7484..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000050440.9_ENSMUST00000062620.9_GN:Hamp_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:1.caid +++ /dev/null @@ -1,85 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000050440.9|ENSMUST00000062620.9|GN:Hamp|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:1 -1 M 0.385 -2 M 0.364 -3 A 0.323 -4 L 0.270 -5 S 0.217 -6 T 0.175 -7 R 0.150 -8 T 0.143 -9 Q 0.146 -10 A 0.148 -11 A 0.145 -12 C 0.146 -13 L 0.151 -14 L 0.154 -15 L 0.151 -16 L 0.147 -17 L 0.151 -18 L 0.170 -19 A 0.201 -20 S 0.234 -21 L 0.268 -22 S 0.305 -23 S 0.331 -24 T 0.330 -25 T 0.310 -26 Y 0.299 -27 L 0.313 -28 H 0.354 -29 Q 0.411 -30 Q 0.472 -31 M 0.526 -32 R 0.580 -33 Q 0.639 -34 T 0.690 -35 T 0.718 -36 E 0.722 -37 L 0.712 -38 Q 0.706 -39 P 0.716 -40 L 0.739 -41 H 0.761 -42 G 0.774 -43 E 0.779 -44 E 0.779 -45 S 0.777 -46 R 0.776 -47 A 0.775 -48 D 0.773 -49 I 0.768 -50 A 0.757 -51 I 0.741 -52 P 0.726 -53 M 0.712 -54 Q 0.692 -55 K 0.661 -56 R 0.628 -57 R 0.603 -58 K 0.581 -59 R 0.553 -60 D 0.517 -61 T 0.474 -62 N 0.430 -63 F 0.386 -64 P 0.337 -65 I 0.276 -66 C 0.212 -67 I 0.160 -68 F 0.124 -69 C 0.103 -70 C 0.098 -71 K 0.104 -72 C 0.116 -73 C 0.134 -74 N 0.153 -75 N 0.165 -76 S 0.163 -77 Q 0.151 -78 C 0.140 -79 G 0.136 -80 I 0.135 -81 C 0.134 -82 C 0.143 -83 K 0.162 -84 T 0.179 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000050853.4_ENSMUST00000217227.2_GN:Or10d3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000050853.4_ENSMUST00000217227.2_GN:Or10d3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 5e3e09ae1d3aedd1f08ed19d8838f45fbe0998da..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000050853.4_ENSMUST00000217227.2_GN:Or10d3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,313 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000050853.4|ENSMUST00000217227.2|GN:Or10d3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.393 -2 E 0.406 -3 I 0.419 -4 K 0.416 -5 N 0.388 -6 C 0.346 -7 S 0.301 -8 V 0.257 -9 V 0.211 -10 T 0.168 -11 E 0.138 -12 F 0.125 -13 I 0.125 -14 L 0.134 -15 L 0.157 -16 G 0.190 -17 I 0.219 -18 P 0.232 -19 H 0.227 -20 T 0.211 -21 E 0.188 -22 G 0.159 -23 F 0.126 -24 E 0.093 -25 T 0.066 -26 L 0.050 -27 L 0.045 -28 F 0.044 -29 V 0.042 -30 L 0.038 -31 F 0.036 -32 L 0.037 -33 P 0.040 -34 F 0.045 -35 Y 0.048 -36 A 0.050 -37 C 0.053 -38 T 0.058 -39 L 0.061 -40 V 0.061 -41 G 0.063 -42 N 0.066 -43 V 0.068 -44 S 0.067 -45 I 0.061 -46 L 0.054 -47 V 0.051 -48 A 0.054 -49 V 0.061 -50 I 0.072 -51 S 0.085 -52 S 0.093 -53 T 0.092 -54 R 0.086 -55 L 0.079 -56 H 0.071 -57 T 0.061 -58 P 0.048 -59 M 0.037 -60 Y 0.029 -61 F 0.025 -62 F 0.028 -63 L 0.036 -64 G 0.046 -65 N 0.053 -66 L 0.056 -67 S 0.055 -68 V 0.054 -69 F 0.061 -70 D 0.076 -71 M 0.090 -72 G 0.092 -73 F 0.083 -74 S 0.072 -75 S 0.068 -76 V 0.067 -77 T 0.067 -78 C 0.064 -79 P 0.058 -80 K 0.054 -81 M 0.052 -82 L 0.051 -83 F 0.049 -84 Y 0.053 -85 L 0.063 -86 M 0.075 -87 G 0.082 -88 L 0.081 -89 S 0.071 -90 R 0.058 -91 L 0.048 -92 I 0.043 -93 S 0.038 -94 Y 0.034 -95 Q 0.033 -96 D 0.033 -97 C 0.033 -98 V 0.032 -99 S 0.032 -100 Q 0.032 -101 L 0.031 -102 F 0.029 -103 F 0.026 -104 F 0.023 -105 H 0.024 -106 F 0.026 -107 L 0.030 -108 G 0.034 -109 S 0.039 -110 I 0.044 -111 E 0.044 -112 C 0.040 -113 F 0.035 -114 L 0.031 -115 Y 0.030 -116 T 0.030 -117 V 0.030 -118 M 0.032 -119 A 0.036 -120 Y 0.042 -121 D 0.048 -122 R 0.052 -123 F 0.052 -124 A 0.050 -125 A 0.048 -126 I 0.048 -127 C 0.051 -128 H 0.055 -129 P 0.056 -130 L 0.053 -131 R 0.049 -132 Y 0.047 -133 S 0.049 -134 V 0.054 -135 I 0.061 -136 M 0.067 -137 N 0.070 -138 S 0.071 -139 K 0.068 -140 I 0.061 -141 C 0.056 -142 V 0.061 -143 A 0.069 -144 L 0.069 -145 A 0.062 -146 V 0.059 -147 G 0.062 -148 T 0.067 -149 W 0.070 -150 L 0.071 -151 L 0.071 -152 G 0.068 -153 C 0.066 -154 F 0.066 -155 H 0.070 -156 S 0.074 -157 S 0.076 -158 V 0.081 -159 L 0.087 -160 T 0.089 -161 S 0.087 -162 L 0.084 -163 T 0.083 -164 F 0.087 -165 T 0.097 -166 L 0.108 -167 P 0.109 -168 Y 0.108 -169 C 0.112 -170 G 0.125 -171 P 0.141 -172 N 0.157 -173 E 0.171 -174 V 0.170 -175 D 0.149 -176 H 0.118 -177 F 0.092 -178 F 0.077 -179 C 0.074 -180 D 0.082 -181 I 0.100 -182 P 0.123 -183 A 0.142 -184 I 0.153 -185 L 0.160 -186 P 0.163 -187 L 0.165 -188 A 0.166 -189 S 0.169 -190 A 0.172 -191 D 0.168 -192 T 0.151 -193 S 0.126 -194 L 0.104 -195 A 0.093 -196 Q 0.089 -197 R 0.090 -198 V 0.092 -199 S 0.092 -200 F 0.089 -201 T 0.085 -202 N 0.081 -203 V 0.077 -204 G 0.075 -205 L 0.075 -206 V 0.076 -207 S 0.072 -208 L 0.067 -209 V 0.070 -210 C 0.082 -211 F 0.094 -212 L 0.097 -213 L 0.092 -214 I 0.080 -215 L 0.064 -216 L 0.049 -217 S 0.041 -218 Y 0.040 -219 T 0.043 -220 R 0.050 -221 I 0.063 -222 T 0.077 -223 I 0.088 -224 S 0.089 -225 I 0.085 -226 L 0.085 -227 S 0.096 -228 I 0.112 -229 Q 0.125 -230 S 0.128 -231 T 0.121 -232 E 0.110 -233 G 0.095 -234 R 0.080 -235 Q 0.069 -236 R 0.065 -237 A 0.065 -238 F 0.065 -239 S 0.066 -240 T 0.068 -241 C 0.071 -242 S 0.077 -243 A 0.081 -244 H 0.078 -245 L 0.070 -246 I 0.063 -247 A 0.058 -248 I 0.049 -249 L 0.038 -250 C 0.031 -251 A 0.032 -252 Y 0.039 -253 G 0.046 -254 P 0.047 -255 I 0.041 -256 I 0.035 -257 T 0.031 -258 I 0.034 -259 Y 0.047 -260 L 0.072 -261 Q 0.106 -262 P 0.144 -263 T 0.174 -264 P 0.182 -265 N 0.164 -266 P 0.129 -267 M 0.097 -268 L 0.077 -269 G 0.067 -270 T 0.063 -271 V 0.061 -272 V 0.057 -273 Q 0.052 -274 I 0.048 -275 L 0.051 -276 M 0.061 -277 N 0.073 -278 L 0.080 -279 V 0.081 -280 G 0.078 -281 P 0.076 -282 M 0.075 -283 L 0.074 -284 N 0.072 -285 P 0.068 -286 L 0.066 -287 I 0.066 -288 Y 0.067 -289 T 0.072 -290 L 0.084 -291 R 0.092 -292 N 0.085 -293 K 0.068 -294 E 0.055 -295 V 0.056 -296 K 0.068 -297 I 0.082 -298 A 0.088 -299 L 0.085 -300 K 0.086 -301 K 0.097 -302 I 0.124 -303 L 0.177 -304 H 0.262 -305 G 0.369 -306 K 0.473 -307 G 0.550 -308 S 0.593 -309 V 0.605 -310 S 0.584 -311 E 0.536 -312 G 0.490 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000050853.4_ENSMUST00000217227.2_GN:Or10d3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:11.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000050853.4_ENSMUST00000217227.2_GN:Or10d3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:11.caid deleted file mode 100644 index d181a280b8bd0e401d5da9eb460ed822cc8cb137..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000050853.4_ENSMUST00000217227.2_GN:Or10d3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:11.caid +++ /dev/null @@ -1,324 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000050853.4|ENSMUST00000217227.2|GN:Or10d3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:11 -1 M 0.340 -2 L 0.355 -3 L 0.383 -4 L 0.410 -5 P 0.416 -6 L 0.403 -7 L 0.396 -8 E 0.408 -9 L 0.427 -10 P 0.439 -11 F 0.441 -12 M 0.438 -13 E 0.433 -14 I 0.422 -15 K 0.400 -16 N 0.368 -17 C 0.331 -18 S 0.296 -19 V 0.259 -20 V 0.215 -21 T 0.170 -22 E 0.138 -23 F 0.122 -24 I 0.120 -25 L 0.127 -26 L 0.149 -27 G 0.182 -28 I 0.212 -29 P 0.225 -30 H 0.221 -31 T 0.206 -32 E 0.185 -33 G 0.158 -34 F 0.125 -35 E 0.092 -36 T 0.065 -37 L 0.049 -38 L 0.044 -39 F 0.043 -40 V 0.041 -41 L 0.038 -42 F 0.036 -43 L 0.037 -44 P 0.040 -45 F 0.045 -46 Y 0.049 -47 A 0.050 -48 C 0.053 -49 T 0.058 -50 L 0.060 -51 V 0.060 -52 G 0.062 -53 N 0.065 -54 V 0.068 -55 S 0.067 -56 I 0.061 -57 L 0.054 -58 V 0.051 -59 A 0.053 -60 V 0.060 -61 I 0.070 -62 S 0.082 -63 S 0.090 -64 T 0.089 -65 R 0.083 -66 L 0.077 -67 H 0.069 -68 T 0.058 -69 P 0.046 -70 M 0.035 -71 Y 0.028 -72 F 0.024 -73 F 0.027 -74 L 0.035 -75 G 0.045 -76 N 0.053 -77 L 0.056 -78 S 0.055 -79 V 0.054 -80 F 0.059 -81 D 0.074 -82 M 0.088 -83 G 0.090 -84 F 0.081 -85 S 0.071 -86 S 0.066 -87 V 0.065 -88 T 0.064 -89 C 0.060 -90 P 0.055 -91 K 0.051 -92 M 0.049 -93 L 0.047 -94 F 0.046 -95 Y 0.049 -96 L 0.058 -97 M 0.070 -98 G 0.079 -99 L 0.079 -100 S 0.070 -101 R 0.057 -102 L 0.048 -103 I 0.042 -104 S 0.037 -105 Y 0.033 -106 Q 0.032 -107 D 0.033 -108 C 0.032 -109 V 0.031 -110 S 0.031 -111 Q 0.032 -112 L 0.031 -113 F 0.028 -114 F 0.025 -115 F 0.023 -116 H 0.024 -117 F 0.026 -118 L 0.030 -119 G 0.034 -120 S 0.039 -121 I 0.043 -122 E 0.044 -123 C 0.040 -124 F 0.035 -125 L 0.032 -126 Y 0.030 -127 T 0.030 -128 V 0.030 -129 M 0.032 -130 A 0.036 -131 Y 0.041 -132 D 0.047 -133 R 0.051 -134 F 0.052 -135 A 0.050 -136 A 0.048 -137 I 0.048 -138 C 0.051 -139 H 0.055 -140 P 0.056 -141 L 0.053 -142 R 0.049 -143 Y 0.047 -144 S 0.049 -145 V 0.054 -146 I 0.062 -147 M 0.068 -148 N 0.070 -149 S 0.071 -150 K 0.069 -151 I 0.061 -152 C 0.056 -153 V 0.061 -154 A 0.069 -155 L 0.068 -156 A 0.060 -157 V 0.056 -158 G 0.058 -159 T 0.060 -160 W 0.060 -161 L 0.059 -162 L 0.061 -163 G 0.063 -164 C 0.064 -165 F 0.066 -166 H 0.070 -167 S 0.074 -168 S 0.077 -169 V 0.081 -170 L 0.087 -171 T 0.089 -172 S 0.087 -173 L 0.084 -174 T 0.083 -175 F 0.086 -176 T 0.096 -177 L 0.106 -178 P 0.107 -179 Y 0.104 -180 C 0.109 -181 G 0.120 -182 P 0.136 -183 N 0.153 -184 E 0.166 -185 V 0.165 -186 D 0.144 -187 H 0.115 -188 F 0.090 -189 F 0.076 -190 C 0.073 -191 D 0.081 -192 I 0.099 -193 P 0.121 -194 A 0.139 -195 I 0.151 -196 L 0.157 -197 P 0.161 -198 L 0.163 -199 A 0.164 -200 S 0.165 -201 A 0.168 -202 D 0.164 -203 T 0.148 -204 S 0.123 -205 L 0.101 -206 A 0.090 -207 Q 0.087 -208 R 0.087 -209 V 0.089 -210 S 0.090 -211 F 0.088 -212 T 0.084 -213 N 0.080 -214 V 0.077 -215 G 0.074 -216 L 0.075 -217 V 0.077 -218 S 0.073 -219 L 0.067 -220 V 0.070 -221 C 0.082 -222 F 0.093 -223 L 0.096 -224 L 0.091 -225 I 0.079 -226 L 0.063 -227 L 0.049 -228 S 0.041 -229 Y 0.040 -230 T 0.043 -231 R 0.050 -232 I 0.062 -233 T 0.077 -234 I 0.088 -235 S 0.089 -236 I 0.084 -237 L 0.085 -238 S 0.095 -239 I 0.111 -240 Q 0.124 -241 S 0.127 -242 T 0.120 -243 E 0.109 -244 G 0.095 -245 R 0.080 -246 Q 0.069 -247 R 0.065 -248 A 0.064 -249 F 0.064 -250 S 0.065 -251 T 0.067 -252 C 0.070 -253 S 0.076 -254 A 0.080 -255 H 0.077 -256 L 0.070 -257 I 0.064 -258 A 0.059 -259 I 0.050 -260 L 0.039 -261 C 0.031 -262 A 0.031 -263 Y 0.039 -264 G 0.046 -265 P 0.046 -266 I 0.041 -267 I 0.035 -268 T 0.031 -269 I 0.034 -270 Y 0.047 -271 L 0.072 -272 Q 0.107 -273 P 0.146 -274 T 0.176 -275 P 0.184 -276 N 0.165 -277 P 0.130 -278 M 0.098 -279 L 0.078 -280 G 0.068 -281 T 0.064 -282 V 0.062 -283 V 0.058 -284 Q 0.052 -285 I 0.048 -286 L 0.052 -287 M 0.062 -288 N 0.074 -289 L 0.081 -290 V 0.082 -291 G 0.080 -292 P 0.077 -293 M 0.076 -294 L 0.075 -295 N 0.072 -296 P 0.069 -297 L 0.067 -298 I 0.067 -299 Y 0.068 -300 T 0.073 -301 L 0.085 -302 R 0.093 -303 N 0.086 -304 K 0.068 -305 E 0.055 -306 V 0.056 -307 K 0.068 -308 I 0.082 -309 A 0.087 -310 L 0.085 -311 K 0.085 -312 K 0.096 -313 I 0.123 -314 L 0.176 -315 H 0.261 -316 G 0.369 -317 K 0.474 -318 G 0.551 -319 S 0.594 -320 V 0.605 -321 S 0.585 -322 E 0.536 -323 G 0.490 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000051726.7_ENSMUST00000170580.3_GN:Kcnf1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000051726.7_ENSMUST00000170580.3_GN:Kcnf1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index bbba22b3a956bab999df61859205783e731a7498..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000051726.7_ENSMUST00000170580.3_GN:Kcnf1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,494 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000051726.7|ENSMUST00000170580.3|GN:Kcnf1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.386 -2 D 0.384 -3 A 0.403 -4 S 0.452 -5 A 0.504 -6 E 0.531 -7 Q 0.534 -8 S 0.530 -9 L 0.529 -10 P 0.540 -11 E 0.569 -12 P 0.607 -13 G 0.635 -14 S 0.646 -15 Q 0.649 -16 D 0.654 -17 S 0.659 -18 V 0.653 -19 A 0.628 -20 G 0.574 -21 E 0.480 -22 D 0.349 -23 I 0.214 -24 E 0.112 -25 I 0.053 -26 V 0.028 -27 V 0.023 -28 N 0.026 -29 V 0.034 -30 G 0.043 -31 G 0.052 -32 V 0.055 -33 R 0.051 -34 Q 0.045 -35 V 0.039 -36 L 0.035 -37 Y 0.032 -38 G 0.031 -39 D 0.033 -40 L 0.035 -41 L 0.037 -42 S 0.039 -43 Q 0.041 -44 Y 0.043 -45 P 0.042 -46 E 0.038 -47 T 0.035 -48 R 0.033 -49 L 0.037 -50 A 0.042 -51 E 0.046 -52 L 0.048 -53 I 0.052 -54 N 0.064 -55 C 0.083 -56 L 0.106 -57 A 0.125 -58 G 0.129 -59 G 0.114 -60 Y 0.090 -61 D 0.071 -62 T 0.059 -63 I 0.053 -64 F 0.056 -65 S 0.064 -66 L 0.070 -67 C 0.072 -68 D 0.070 -69 D 0.070 -70 Y 0.070 -71 D 0.069 -72 P 0.069 -73 G 0.070 -74 K 0.068 -75 R 0.064 -76 E 0.060 -77 F 0.058 -78 Y 0.062 -79 F 0.073 -80 D 0.085 -81 R 0.093 -82 D 0.093 -83 P 0.085 -84 D 0.073 -85 A 0.064 -86 F 0.058 -87 K 0.053 -88 C 0.049 -89 V 0.047 -90 I 0.044 -91 E 0.041 -92 V 0.040 -93 Y 0.042 -94 Y 0.047 -95 F 0.054 -96 G 0.060 -97 E 0.061 -98 V 0.062 -99 H 0.067 -100 M 0.078 -101 K 0.088 -102 K 0.096 -103 G 0.102 -104 I 0.101 -105 C 0.087 -106 P 0.064 -107 I 0.046 -108 C 0.037 -109 F 0.034 -110 K 0.033 -111 N 0.033 -112 E 0.034 -113 M 0.036 -114 D 0.038 -115 F 0.037 -116 W 0.037 -117 K 0.042 -118 V 0.051 -119 D 0.061 -120 L 0.065 -121 K 0.061 -122 F 0.051 -123 L 0.041 -124 D 0.034 -125 D 0.033 -126 C 0.037 -127 C 0.048 -128 K 0.063 -129 S 0.072 -130 H 0.068 -131 L 0.061 -132 S 0.060 -133 E 0.063 -134 K 0.070 -135 R 0.081 -136 E 0.091 -137 E 0.091 -138 L 0.086 -139 E 0.084 -140 E 0.088 -141 I 0.096 -142 A 0.105 -143 R 0.113 -144 R 0.117 -145 V 0.117 -146 Q 0.121 -147 L 0.135 -148 I 0.154 -149 L 0.171 -150 D 0.187 -151 D 0.208 -152 L 0.238 -153 G 0.272 -154 V 0.294 -155 D 0.291 -156 A 0.266 -157 A 0.232 -158 E 0.195 -159 G 0.157 -160 R 0.120 -161 W 0.091 -162 R 0.074 -163 R 0.065 -164 C 0.060 -165 Q 0.058 -166 K 0.056 -167 C 0.054 -168 V 0.054 -169 W 0.055 -170 K 0.055 -171 F 0.053 -172 L 0.051 -173 E 0.059 -174 K 0.081 -175 P 0.107 -176 E 0.117 -177 S 0.104 -178 S 0.083 -179 C 0.066 -180 P 0.057 -181 A 0.053 -182 R 0.049 -183 V 0.045 -184 V 0.042 -185 A 0.040 -186 V 0.042 -187 L 0.052 -188 S 0.066 -189 F 0.076 -190 L 0.075 -191 L 0.064 -192 I 0.052 -193 L 0.048 -194 V 0.050 -195 S 0.056 -196 S 0.059 -197 V 0.061 -198 V 0.063 -199 M 0.066 -200 C 0.075 -201 M 0.088 -202 G 0.097 -203 T 0.099 -204 I 0.103 -205 P 0.116 -206 E 0.136 -207 L 0.156 -208 Q 0.175 -209 V 0.196 -210 V 0.224 -211 D 0.257 -212 S 0.285 -213 E 0.301 -214 G 0.306 -215 N 0.299 -216 R 0.283 -217 V 0.257 -218 E 0.220 -219 H 0.172 -220 P 0.124 -221 T 0.090 -222 L 0.075 -223 E 0.069 -224 N 0.071 -225 V 0.080 -226 E 0.086 -227 T 0.084 -228 A 0.077 -229 C 0.073 -230 I 0.069 -231 G 0.063 -232 W 0.058 -233 F 0.056 -234 T 0.053 -235 L 0.052 -236 E 0.053 -237 Y 0.055 -238 L 0.056 -239 L 0.056 -240 R 0.056 -241 L 0.058 -242 F 0.063 -243 S 0.070 -244 S 0.071 -245 P 0.064 -246 N 0.051 -247 K 0.041 -248 L 0.037 -249 H 0.039 -250 F 0.041 -251 A 0.041 -252 L 0.038 -253 S 0.036 -254 F 0.037 -255 M 0.040 -256 N 0.045 -257 I 0.050 -258 V 0.054 -259 D 0.056 -260 V 0.055 -261 L 0.053 -262 A 0.052 -263 I 0.049 -264 L 0.044 -265 P 0.039 -266 F 0.035 -267 Y 0.034 -268 V 0.037 -269 S 0.042 -270 L 0.044 -271 T 0.049 -272 L 0.061 -273 T 0.078 -274 H 0.102 -275 L 0.136 -276 G 0.178 -277 A 0.212 -278 R 0.232 -279 M 0.245 -280 M 0.257 -281 E 0.268 -282 L 0.268 -283 T 0.257 -284 N 0.239 -285 V 0.217 -286 Q 0.198 -287 Q 0.186 -288 A 0.181 -289 V 0.174 -290 Q 0.162 -291 A 0.150 -292 L 0.145 -293 R 0.148 -294 I 0.153 -295 M 0.159 -296 R 0.163 -297 I 0.168 -298 A 0.172 -299 R 0.176 -300 I 0.180 -301 F 0.183 -302 K 0.182 -303 L 0.174 -304 A 0.167 -305 R 0.166 -306 H 0.172 -307 S 0.174 -308 S 0.171 -309 G 0.164 -310 L 0.153 -311 Q 0.139 -312 T 0.125 -313 L 0.111 -314 T 0.101 -315 Y 0.102 -316 A 0.107 -317 L 0.106 -318 K 0.099 -319 R 0.095 -320 S 0.089 -321 F 0.078 -322 K 0.068 -323 E 0.067 -324 L 0.070 -325 G 0.073 -326 L 0.075 -327 L 0.079 -328 L 0.082 -329 M 0.083 -330 Y 0.079 -331 L 0.075 -332 A 0.068 -333 V 0.058 -334 G 0.048 -335 I 0.042 -336 F 0.037 -337 V 0.033 -338 F 0.031 -339 S 0.031 -340 A 0.033 -341 L 0.035 -342 G 0.036 -343 Y 0.039 -344 T 0.046 -345 M 0.058 -346 E 0.071 -347 Q 0.087 -348 S 0.109 -349 H 0.137 -350 P 0.158 -351 E 0.163 -352 T 0.154 -353 L 0.140 -354 F 0.127 -355 K 0.113 -356 S 0.098 -357 I 0.084 -358 P 0.074 -359 Q 0.068 -360 S 0.065 -361 F 0.060 -362 W 0.057 -363 W 0.063 -364 A 0.074 -365 I 0.079 -366 I 0.079 -367 T 0.080 -368 M 0.082 -369 T 0.088 -370 T 0.106 -371 V 0.134 -372 G 0.156 -373 Y 0.160 -374 G 0.150 -375 D 0.136 -376 I 0.121 -377 Y 0.108 -378 P 0.098 -379 K 0.086 -380 T 0.072 -381 T 0.059 -382 L 0.054 -383 G 0.057 -384 K 0.064 -385 L 0.075 -386 N 0.086 -387 A 0.089 -388 A 0.083 -389 I 0.076 -390 S 0.073 -391 F 0.073 -392 L 0.076 -393 C 0.083 -394 G 0.094 -395 V 0.106 -396 I 0.122 -397 A 0.139 -398 I 0.151 -399 A 0.161 -400 L 0.172 -401 P 0.177 -402 I 0.165 -403 H 0.144 -404 P 0.127 -405 I 0.116 -406 I 0.103 -407 N 0.088 -408 N 0.074 -409 F 0.061 -410 V 0.050 -411 R 0.044 -412 Y 0.045 -413 Y 0.050 -414 N 0.055 -415 K 0.059 -416 Q 0.064 -417 R 0.074 -418 V 0.087 -419 L 0.103 -420 E 0.118 -421 T 0.133 -422 A 0.145 -423 A 0.159 -424 K 0.180 -425 H 0.205 -426 E 0.221 -427 L 0.225 -428 E 0.226 -429 L 0.229 -430 M 0.231 -431 E 0.239 -432 L 0.263 -433 N 0.303 -434 S 0.350 -435 S 0.402 -436 S 0.455 -437 A 0.501 -438 E 0.536 -439 G 0.566 -440 K 0.596 -441 P 0.628 -442 G 0.658 -443 G 0.667 -444 S 0.641 -445 R 0.592 -446 S 0.566 -447 D 0.582 -448 L 0.595 -449 D 0.566 -450 T 0.528 -451 L 0.532 -452 P 0.580 -453 P 0.642 -454 E 0.700 -455 P 0.744 -456 A 0.769 -457 A 0.769 -458 R 0.753 -459 E 0.729 -460 G 0.706 -461 P 0.688 -462 S 0.673 -463 W 0.655 -464 G 0.635 -465 S 0.632 -466 R 0.658 -467 L 0.696 -468 K 0.725 -469 L 0.737 -470 S 0.736 -471 H 0.723 -472 S 0.705 -473 D 0.691 -474 T 0.682 -475 F 0.679 -476 I 0.684 -477 P 0.692 -478 L 0.686 -479 L 0.659 -480 T 0.622 -481 E 0.587 -482 E 0.552 -483 K 0.520 -484 H 0.500 -485 H 0.481 -486 R 0.450 -487 T 0.425 -488 R 0.425 -489 L 0.437 -490 Q 0.442 -491 S 0.450 -492 C 0.462 -493 K 0.469 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000051726.7_ENSMUST00000170580.3_GN:Kcnf1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000051726.7_ENSMUST00000170580.3_GN:Kcnf1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid deleted file mode 100644 index 176000cdd422941a6d431b969ca8445dfe4e0278..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000051726.7_ENSMUST00000170580.3_GN:Kcnf1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid +++ /dev/null @@ -1,506 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000051726.7|ENSMUST00000170580.3|GN:Kcnf1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:12 -1 M 0.411 -2 E 0.446 -3 P 0.491 -4 G 0.514 -5 L 0.499 -6 A 0.463 -7 S 0.448 -8 E 0.473 -9 P 0.497 -10 A 0.491 -11 G 0.485 -12 S 0.505 -13 M 0.523 -14 D 0.512 -15 A 0.499 -16 S 0.517 -17 A 0.547 -18 E 0.559 -19 Q 0.549 -20 S 0.532 -21 L 0.521 -22 P 0.530 -23 E 0.564 -24 P 0.609 -25 G 0.643 -26 S 0.657 -27 Q 0.657 -28 D 0.655 -29 S 0.653 -30 V 0.643 -31 A 0.618 -32 G 0.565 -33 E 0.471 -34 D 0.342 -35 I 0.210 -36 E 0.109 -37 I 0.052 -38 V 0.028 -39 V 0.023 -40 N 0.027 -41 V 0.034 -42 G 0.043 -43 G 0.051 -44 V 0.054 -45 R 0.051 -46 Q 0.045 -47 V 0.039 -48 L 0.035 -49 Y 0.032 -50 G 0.032 -51 D 0.034 -52 L 0.036 -53 L 0.039 -54 S 0.040 -55 Q 0.042 -56 Y 0.044 -57 P 0.043 -58 E 0.039 -59 T 0.035 -60 R 0.034 -61 L 0.036 -62 A 0.042 -63 E 0.045 -64 L 0.047 -65 I 0.051 -66 N 0.062 -67 C 0.081 -68 L 0.103 -69 A 0.122 -70 G 0.126 -71 G 0.111 -72 Y 0.087 -73 D 0.068 -74 T 0.056 -75 I 0.051 -76 F 0.053 -77 S 0.061 -78 L 0.068 -79 C 0.070 -80 D 0.069 -81 D 0.069 -82 Y 0.069 -83 D 0.069 -84 P 0.068 -85 G 0.069 -86 K 0.068 -87 R 0.064 -88 E 0.060 -89 F 0.059 -90 Y 0.063 -91 F 0.073 -92 D 0.085 -93 R 0.092 -94 D 0.091 -95 P 0.083 -96 D 0.072 -97 A 0.063 -98 F 0.058 -99 K 0.053 -100 C 0.049 -101 V 0.047 -102 I 0.044 -103 E 0.042 -104 V 0.041 -105 Y 0.042 -106 Y 0.047 -107 F 0.055 -108 G 0.061 -109 E 0.062 -110 V 0.063 -111 H 0.068 -112 M 0.079 -113 K 0.089 -114 K 0.097 -115 G 0.103 -116 I 0.102 -117 C 0.088 -118 P 0.065 -119 I 0.047 -120 C 0.038 -121 F 0.035 -122 K 0.034 -123 N 0.033 -124 E 0.035 -125 M 0.037 -126 D 0.038 -127 F 0.038 -128 W 0.038 -129 K 0.043 -130 V 0.052 -131 D 0.062 -132 L 0.067 -133 K 0.062 -134 F 0.052 -135 L 0.042 -136 D 0.035 -137 D 0.033 -138 C 0.037 -139 C 0.047 -140 K 0.061 -141 S 0.069 -142 H 0.066 -143 L 0.060 -144 S 0.058 -145 E 0.062 -146 K 0.069 -147 R 0.081 -148 E 0.090 -149 E 0.090 -150 L 0.085 -151 E 0.083 -152 E 0.087 -153 I 0.091 -154 A 0.096 -155 R 0.102 -156 R 0.109 -157 V 0.113 -158 Q 0.121 -159 L 0.137 -160 I 0.157 -161 L 0.174 -162 D 0.189 -163 D 0.209 -164 L 0.238 -165 G 0.271 -166 V 0.293 -167 D 0.291 -168 A 0.266 -169 A 0.230 -170 E 0.193 -171 G 0.155 -172 R 0.118 -173 W 0.090 -174 R 0.073 -175 R 0.064 -176 C 0.059 -177 Q 0.058 -178 K 0.056 -179 C 0.054 -180 V 0.054 -181 W 0.055 -182 K 0.055 -183 F 0.052 -184 L 0.050 -185 E 0.058 -186 K 0.080 -187 P 0.104 -188 E 0.114 -189 S 0.102 -190 S 0.080 -191 C 0.064 -192 P 0.056 -193 A 0.051 -194 R 0.048 -195 V 0.044 -196 V 0.041 -197 A 0.040 -198 V 0.042 -199 L 0.052 -200 S 0.066 -201 F 0.075 -202 L 0.074 -203 L 0.063 -204 I 0.052 -205 L 0.047 -206 V 0.050 -207 S 0.056 -208 S 0.059 -209 V 0.061 -210 V 0.063 -211 M 0.066 -212 C 0.074 -213 M 0.086 -214 G 0.095 -215 T 0.097 -216 I 0.101 -217 P 0.113 -218 E 0.132 -219 L 0.153 -220 Q 0.171 -221 V 0.192 -222 V 0.220 -223 D 0.253 -224 S 0.280 -225 E 0.297 -226 G 0.302 -227 N 0.296 -228 R 0.281 -229 V 0.256 -230 E 0.220 -231 H 0.172 -232 P 0.124 -233 T 0.090 -234 L 0.075 -235 E 0.070 -236 N 0.072 -237 V 0.081 -238 E 0.088 -239 T 0.085 -240 A 0.078 -241 C 0.074 -242 I 0.070 -243 G 0.064 -244 W 0.058 -245 F 0.056 -246 T 0.054 -247 L 0.052 -248 E 0.053 -249 Y 0.055 -250 L 0.056 -251 L 0.056 -252 R 0.057 -253 L 0.058 -254 F 0.064 -255 S 0.071 -256 S 0.072 -257 P 0.064 -258 N 0.052 -259 K 0.042 -260 L 0.038 -261 H 0.040 -262 F 0.043 -263 A 0.042 -264 L 0.039 -265 S 0.037 -266 F 0.038 -267 M 0.041 -268 N 0.046 -269 I 0.051 -270 V 0.054 -271 D 0.056 -272 V 0.056 -273 L 0.054 -274 A 0.053 -275 I 0.050 -276 L 0.045 -277 P 0.039 -278 F 0.035 -279 Y 0.034 -280 V 0.038 -281 S 0.043 -282 L 0.046 -283 T 0.050 -284 L 0.062 -285 T 0.080 -286 H 0.103 -287 L 0.138 -288 G 0.180 -289 A 0.216 -290 R 0.236 -291 M 0.248 -292 M 0.261 -293 E 0.270 -294 L 0.270 -295 T 0.259 -296 N 0.240 -297 V 0.217 -298 Q 0.197 -299 Q 0.186 -300 A 0.182 -301 V 0.176 -302 Q 0.165 -303 A 0.153 -304 L 0.147 -305 R 0.148 -306 I 0.153 -307 M 0.158 -308 R 0.162 -309 I 0.166 -310 A 0.171 -311 R 0.176 -312 I 0.181 -313 F 0.185 -314 K 0.184 -315 L 0.177 -316 A 0.169 -317 R 0.168 -318 H 0.173 -319 S 0.174 -320 S 0.171 -321 G 0.165 -322 L 0.154 -323 Q 0.140 -324 T 0.126 -325 L 0.112 -326 T 0.102 -327 Y 0.102 -328 A 0.107 -329 L 0.106 -330 K 0.099 -331 R 0.095 -332 S 0.090 -333 F 0.078 -334 K 0.068 -335 E 0.066 -336 L 0.070 -337 G 0.073 -338 L 0.075 -339 L 0.079 -340 L 0.082 -341 M 0.083 -342 Y 0.079 -343 L 0.074 -344 A 0.068 -345 V 0.058 -346 G 0.049 -347 I 0.042 -348 F 0.037 -349 V 0.033 -350 F 0.031 -351 S 0.031 -352 A 0.033 -353 L 0.034 -354 G 0.036 -355 Y 0.039 -356 T 0.046 -357 M 0.057 -358 E 0.070 -359 Q 0.085 -360 S 0.107 -361 H 0.134 -362 P 0.155 -363 E 0.160 -364 T 0.151 -365 L 0.138 -366 F 0.125 -367 K 0.111 -368 S 0.096 -369 I 0.082 -370 P 0.072 -371 Q 0.068 -372 S 0.065 -373 F 0.059 -374 W 0.057 -375 W 0.063 -376 A 0.074 -377 I 0.078 -378 I 0.079 -379 T 0.079 -380 M 0.080 -381 T 0.084 -382 T 0.100 -383 V 0.127 -384 G 0.149 -385 Y 0.155 -386 G 0.147 -387 D 0.134 -388 I 0.120 -389 Y 0.108 -390 P 0.098 -391 K 0.086 -392 T 0.071 -393 T 0.059 -394 L 0.054 -395 G 0.056 -396 K 0.064 -397 L 0.075 -398 N 0.086 -399 A 0.089 -400 A 0.083 -401 I 0.076 -402 S 0.073 -403 F 0.074 -404 L 0.076 -405 C 0.083 -406 G 0.094 -407 V 0.106 -408 I 0.122 -409 A 0.139 -410 I 0.150 -411 A 0.159 -412 L 0.170 -413 P 0.173 -414 I 0.161 -415 H 0.140 -416 P 0.124 -417 I 0.112 -418 I 0.100 -419 N 0.086 -420 N 0.073 -421 F 0.060 -422 V 0.050 -423 R 0.044 -424 Y 0.045 -425 Y 0.050 -426 N 0.055 -427 K 0.059 -428 Q 0.064 -429 R 0.073 -430 V 0.086 -431 L 0.101 -432 E 0.118 -433 T 0.132 -434 A 0.144 -435 A 0.158 -436 K 0.178 -437 H 0.202 -438 E 0.219 -439 L 0.226 -440 E 0.230 -441 L 0.235 -442 M 0.237 -443 E 0.246 -444 L 0.272 -445 N 0.313 -446 S 0.361 -447 S 0.413 -448 S 0.463 -449 A 0.506 -450 E 0.539 -451 G 0.566 -452 K 0.596 -453 P 0.629 -454 G 0.658 -455 G 0.667 -456 S 0.641 -457 R 0.593 -458 S 0.569 -459 D 0.595 -460 L 0.629 -461 D 0.629 -462 T 0.606 -463 L 0.596 -464 P 0.613 -465 P 0.654 -466 E 0.704 -467 P 0.746 -468 A 0.768 -469 A 0.768 -470 R 0.752 -471 E 0.729 -472 G 0.709 -473 P 0.695 -474 S 0.689 -475 W 0.692 -476 G 0.701 -477 S 0.713 -478 R 0.723 -479 L 0.732 -480 K 0.739 -481 L 0.743 -482 S 0.739 -483 H 0.726 -484 S 0.709 -485 D 0.697 -486 T 0.690 -487 F 0.687 -488 I 0.691 -489 P 0.698 -490 L 0.694 -491 L 0.669 -492 T 0.634 -493 E 0.601 -494 E 0.576 -495 K 0.561 -496 H 0.559 -497 H 0.566 -498 R 0.570 -499 T 0.569 -500 R 0.561 -501 L 0.549 -502 Q 0.539 -503 S 0.540 -504 C 0.549 -505 K 0.556 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000052146.17_ENSMUST00000114882.9_GN:Rps10_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000052146.17_ENSMUST00000114882.9_GN:Rps10_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 0cc05befb1ff9352f42a84de575469182055cb81..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000052146.17_ENSMUST00000114882.9_GN:Rps10_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,166 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000052146.17|ENSMUST00000114882.9|GN:Rps10|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.280 -2 L 0.253 -3 M 0.209 -4 P 0.158 -5 K 0.112 -6 K 0.077 -7 N 0.056 -8 R 0.046 -9 I 0.043 -10 A 0.041 -11 I 0.038 -12 Y 0.034 -13 E 0.031 -14 L 0.030 -15 L 0.027 -16 F 0.023 -17 K 0.021 -18 E 0.023 -19 G 0.025 -20 V 0.029 -21 M 0.035 -22 V 0.043 -23 A 0.052 -24 K 0.062 -25 K 0.073 -26 D 0.085 -27 V 0.095 -28 H 0.104 -29 M 0.115 -30 P 0.126 -31 K 0.131 -32 H 0.124 -33 P 0.109 -34 E 0.094 -35 L 0.086 -36 A 0.089 -37 D 0.100 -38 K 0.114 -39 N 0.123 -40 V 0.118 -41 P 0.100 -42 N 0.078 -43 L 0.061 -44 H 0.052 -45 V 0.048 -46 M 0.048 -47 K 0.049 -48 A 0.050 -49 M 0.050 -50 Q 0.050 -51 S 0.048 -52 L 0.045 -53 K 0.041 -54 S 0.038 -55 R 0.037 -56 G 0.035 -57 Y 0.032 -58 V 0.032 -59 K 0.034 -60 E 0.042 -61 Q 0.054 -62 F 0.066 -63 A 0.071 -64 W 0.066 -65 R 0.055 -66 H 0.041 -67 F 0.030 -68 Y 0.023 -69 W 0.021 -70 Y 0.023 -71 L 0.025 -72 T 0.026 -73 N 0.026 -74 E 0.028 -75 G 0.036 -76 I 0.050 -77 Q 0.062 -78 Y 0.066 -79 L 0.069 -80 R 0.075 -81 D 0.080 -82 Y 0.078 -83 L 0.077 -84 H 0.081 -85 L 0.090 -86 P 0.098 -87 P 0.103 -88 E 0.105 -89 I 0.106 -90 V 0.118 -91 P 0.150 -92 A 0.197 -93 T 0.256 -94 L 0.329 -95 R 0.415 -96 R 0.502 -97 S 0.569 -98 R 0.614 -99 P 0.647 -100 E 0.674 -101 T 0.689 -102 G 0.688 -103 R 0.682 -104 P 0.685 -105 R 0.702 -106 P 0.721 -107 K 0.735 -108 G 0.743 -109 P 0.749 -110 E 0.749 -111 G 0.740 -112 E 0.725 -113 R 0.716 -114 P 0.719 -115 A 0.730 -116 R 0.741 -117 F 0.753 -118 T 0.765 -119 R 0.772 -120 G 0.773 -121 E 0.767 -122 A 0.755 -123 D 0.735 -124 R 0.708 -125 D 0.680 -126 T 0.658 -127 Y 0.653 -128 R 0.671 -129 R 0.703 -130 S 0.728 -131 A 0.736 -132 V 0.739 -133 P 0.755 -134 P 0.786 -135 G 0.817 -136 A 0.833 -137 D 0.837 -138 K 0.838 -139 K 0.842 -140 A 0.845 -141 E 0.844 -142 A 0.838 -143 G 0.830 -144 A 0.825 -145 G 0.821 -146 S 0.815 -147 A 0.798 -148 T 0.765 -149 E 0.720 -150 F 0.682 -151 Q 0.668 -152 F 0.679 -153 R 0.700 -154 G 0.721 -155 G 0.738 -156 F 0.749 -157 G 0.756 -158 R 0.761 -159 G 0.767 -160 R 0.764 -161 G 0.746 -162 Q 0.715 -163 P 0.669 -164 P 0.607 -165 Q 0.557 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000052146.17_ENSMUST00000114882.9_GN:Rps10_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:95.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000052146.17_ENSMUST00000114882.9_GN:Rps10_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:95.caid deleted file mode 100644 index 7432314f1309c65ad49292694b80d28155b6f56e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000052146.17_ENSMUST00000114882.9_GN:Rps10_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:95.caid +++ /dev/null @@ -1,261 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000052146.17|ENSMUST00000114882.9|GN:Rps10|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:95 -1 M 0.524 -2 R 0.555 -3 T 0.587 -4 G 0.590 -5 L 0.562 -6 S 0.547 -7 A 0.572 -8 P 0.601 -9 S 0.594 -10 A 0.582 -11 C 0.607 -12 T 0.657 -13 P 0.695 -14 A 0.718 -15 P 0.733 -16 D 0.743 -17 T 0.748 -18 T 0.752 -19 H 0.756 -20 G 0.759 -21 L 0.756 -22 A 0.751 -23 I 0.746 -24 S 0.743 -25 R 0.743 -26 W 0.752 -27 G 0.767 -28 R 0.780 -29 G 0.789 -30 G 0.796 -31 G 0.800 -32 G 0.801 -33 G 0.801 -34 G 0.801 -35 K 0.802 -36 R 0.801 -37 S 0.798 -38 G 0.792 -39 M 0.787 -40 A 0.786 -41 R 0.787 -42 T 0.785 -43 C 0.779 -44 V 0.766 -45 L 0.749 -46 A 0.730 -47 P 0.718 -48 S 0.719 -49 P 0.729 -50 L 0.743 -51 L 0.759 -52 R 0.774 -53 H 0.785 -54 C 0.790 -55 R 0.791 -56 G 0.792 -57 H 0.797 -58 P 0.806 -59 R 0.818 -60 Q 0.825 -61 R 0.819 -62 A 0.801 -63 G 0.787 -64 P 0.785 -65 A 0.791 -66 G 0.793 -67 R 0.781 -68 R 0.748 -69 S 0.687 -70 R 0.610 -71 A 0.566 -72 A 0.575 -73 R 0.591 -74 K 0.580 -75 R 0.578 -76 R 0.623 -77 C 0.690 -78 A 0.729 -79 A 0.734 -80 H 0.722 -81 A 0.710 -82 P 0.707 -83 S 0.715 -84 F 0.730 -85 P 0.753 -86 A 0.776 -87 S 0.785 -88 A 0.770 -89 S 0.741 -90 D 0.713 -91 P 0.696 -92 A 0.684 -93 A 0.658 -94 A 0.598 -95 A 0.506 -96 M 0.401 -97 L 0.307 -98 M 0.231 -99 P 0.168 -100 K 0.115 -101 K 0.076 -102 N 0.052 -103 R 0.041 -104 I 0.038 -105 A 0.036 -106 I 0.034 -107 Y 0.030 -108 E 0.029 -109 L 0.027 -110 L 0.025 -111 F 0.021 -112 K 0.020 -113 E 0.021 -114 G 0.024 -115 V 0.027 -116 M 0.032 -117 V 0.039 -118 A 0.048 -119 K 0.057 -120 K 0.068 -121 D 0.079 -122 V 0.088 -123 H 0.098 -124 M 0.110 -125 P 0.122 -126 K 0.127 -127 H 0.121 -128 P 0.107 -129 E 0.093 -130 L 0.085 -131 A 0.085 -132 D 0.094 -133 K 0.107 -134 N 0.115 -135 V 0.111 -136 P 0.094 -137 N 0.072 -138 L 0.055 -139 H 0.047 -140 V 0.044 -141 M 0.043 -142 K 0.043 -143 A 0.044 -144 M 0.046 -145 Q 0.048 -146 S 0.048 -147 L 0.045 -148 K 0.041 -149 S 0.037 -150 R 0.035 -151 G 0.034 -152 Y 0.032 -153 V 0.031 -154 K 0.034 -155 E 0.042 -156 Q 0.053 -157 F 0.062 -158 A 0.066 -159 W 0.062 -160 R 0.052 -161 H 0.039 -162 F 0.028 -163 Y 0.022 -164 W 0.021 -165 Y 0.022 -166 L 0.024 -167 T 0.025 -168 N 0.026 -169 E 0.028 -170 G 0.036 -171 I 0.048 -172 Q 0.059 -173 Y 0.061 -174 L 0.057 -175 R 0.053 -176 D 0.052 -177 Y 0.056 -178 L 0.063 -179 H 0.075 -180 L 0.086 -181 P 0.094 -182 P 0.100 -183 E 0.102 -184 I 0.103 -185 V 0.113 -186 P 0.143 -187 A 0.190 -188 T 0.250 -189 L 0.325 -190 R 0.414 -191 R 0.502 -192 S 0.570 -193 R 0.616 -194 P 0.651 -195 E 0.681 -196 T 0.696 -197 G 0.694 -198 R 0.687 -199 P 0.691 -200 R 0.708 -201 P 0.729 -202 K 0.744 -203 G 0.753 -204 P 0.761 -205 E 0.763 -206 G 0.756 -207 E 0.744 -208 R 0.738 -209 P 0.743 -210 A 0.755 -211 R 0.767 -212 F 0.779 -213 T 0.790 -214 R 0.797 -215 G 0.796 -216 E 0.789 -217 A 0.776 -218 D 0.756 -219 R 0.729 -220 D 0.703 -221 T 0.685 -222 Y 0.683 -223 R 0.700 -224 R 0.727 -225 S 0.747 -226 A 0.753 -227 V 0.755 -228 P 0.770 -229 P 0.801 -230 G 0.832 -231 A 0.848 -232 D 0.852 -233 K 0.852 -234 K 0.855 -235 A 0.858 -236 E 0.857 -237 A 0.852 -238 G 0.847 -239 A 0.844 -240 G 0.841 -241 S 0.835 -242 A 0.817 -243 T 0.784 -244 E 0.740 -245 F 0.702 -246 Q 0.689 -247 F 0.700 -248 R 0.722 -249 G 0.744 -250 G 0.763 -251 F 0.776 -252 G 0.783 -253 R 0.787 -254 G 0.792 -255 R 0.789 -256 G 0.773 -257 Q 0.744 -258 P 0.702 -259 P 0.647 -260 Q 0.605 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000053483.16_ENSMUST00000111305.8_GN:Usp21_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000053483.16_ENSMUST00000111305.8_GN:Usp21_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 87619ade4fc1373edc6ff6e3748e0b069fe544f7..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000053483.16_ENSMUST00000111305.8_GN:Usp21_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,567 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000053483.16|ENSMUST00000111305.8|GN:Usp21|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.414 -2 P 0.443 -3 Q 0.476 -4 A 0.478 -5 S 0.436 -6 E 0.394 -7 H 0.418 -8 R 0.508 -9 L 0.600 -10 G 0.647 -11 R 0.644 -12 T 0.600 -13 R 0.538 -14 E 0.514 -15 P 0.560 -16 P 0.639 -17 V 0.694 -18 N 0.713 -19 V 0.714 -20 Q 0.719 -21 P 0.735 -22 R 0.756 -23 V 0.770 -24 G 0.768 -25 A 0.743 -26 K 0.697 -27 I 0.643 -28 P 0.601 -29 F 0.578 -30 P 0.563 -31 P 0.550 -32 R 0.563 -33 A 0.618 -34 R 0.681 -35 S 0.716 -36 K 0.728 -37 E 0.735 -38 R 0.741 -39 R 0.741 -40 N 0.737 -41 P 0.732 -42 V 0.730 -43 P 0.738 -44 G 0.753 -45 P 0.767 -46 N 0.768 -47 S 0.753 -48 M 0.732 -49 L 0.715 -50 R 0.705 -51 P 0.701 -52 L 0.698 -53 P 0.696 -54 P 0.699 -55 R 0.706 -56 P 0.709 -57 G 0.708 -58 P 0.712 -59 P 0.726 -60 D 0.738 -61 E 0.733 -62 R 0.705 -63 L 0.657 -64 K 0.606 -65 K 0.593 -66 L 0.642 -67 E 0.719 -68 L 0.775 -69 G 0.802 -70 R 0.812 -71 G 0.815 -72 R 0.816 -73 T 0.816 -74 S 0.811 -75 G 0.803 -76 S 0.793 -77 R 0.786 -78 P 0.785 -79 R 0.788 -80 G 0.792 -81 P 0.795 -82 L 0.797 -83 R 0.800 -84 A 0.804 -85 D 0.807 -86 H 0.806 -87 G 0.800 -88 V 0.792 -89 P 0.787 -90 L 0.787 -91 P 0.786 -92 G 0.774 -93 S 0.755 -94 P 0.747 -95 P 0.763 -96 P 0.792 -97 A 0.813 -98 V 0.813 -99 A 0.796 -100 L 0.773 -101 P 0.759 -102 L 0.761 -103 P 0.772 -104 S 0.782 -105 R 0.787 -106 T 0.790 -107 N 0.793 -108 L 0.791 -109 A 0.784 -110 R 0.776 -111 S 0.772 -112 K 0.767 -113 S 0.763 -114 V 0.763 -115 S 0.768 -116 S 0.777 -117 G 0.783 -118 D 0.781 -119 L 0.771 -120 R 0.769 -121 P 0.783 -122 M 0.805 -123 G 0.822 -124 I 0.826 -125 A 0.820 -126 L 0.811 -127 G 0.803 -128 G 0.801 -129 H 0.806 -130 R 0.813 -131 G 0.813 -132 A 0.802 -133 G 0.777 -134 E 0.734 -135 L 0.665 -136 G 0.581 -137 A 0.521 -138 A 0.512 -139 L 0.539 -140 S 0.576 -141 R 0.616 -142 L 0.652 -143 A 0.669 -144 L 0.658 -145 R 0.637 -146 P 0.632 -147 E 0.649 -148 P 0.679 -149 P 0.709 -150 T 0.734 -151 L 0.749 -152 R 0.744 -153 R 0.720 -154 S 0.690 -155 T 0.667 -156 S 0.642 -157 L 0.613 -158 R 0.613 -159 R 0.667 -160 L 0.738 -161 G 0.777 -162 G 0.779 -163 F 0.765 -164 P 0.755 -165 G 0.754 -166 P 0.764 -167 P 0.781 -168 T 0.795 -169 L 0.801 -170 L 0.799 -171 S 0.790 -172 I 0.774 -173 R 0.756 -174 T 0.739 -175 E 0.725 -176 P 0.723 -177 P 0.736 -178 T 0.757 -179 S 0.772 -180 H 0.776 -181 G 0.769 -182 S 0.757 -183 F 0.748 -184 H 0.747 -185 M 0.747 -186 I 0.738 -187 S 0.716 -188 A 0.688 -189 R 0.662 -190 P 0.647 -191 S 0.644 -192 E 0.647 -193 P 0.640 -194 F 0.612 -195 Y 0.569 -196 S 0.524 -197 D 0.488 -198 D 0.462 -199 K 0.440 -200 M 0.424 -201 A 0.414 -202 H 0.408 -203 H 0.401 -204 T 0.388 -205 L 0.368 -206 L 0.335 -207 L 0.294 -208 G 0.255 -209 S 0.221 -210 G 0.186 -211 H 0.147 -212 V 0.113 -213 G 0.094 -214 L 0.093 -215 R 0.102 -216 N 0.109 -217 L 0.106 -218 G 0.095 -219 N 0.084 -220 T 0.078 -221 C 0.075 -222 F 0.072 -223 L 0.069 -224 N 0.067 -225 A 0.067 -226 V 0.068 -227 L 0.068 -228 Q 0.064 -229 C 0.057 -230 L 0.049 -231 S 0.041 -232 S 0.035 -233 T 0.030 -234 R 0.026 -235 P 0.024 -236 L 0.023 -237 R 0.022 -238 D 0.023 -239 F 0.025 -240 C 0.028 -241 L 0.033 -242 R 0.038 -243 R 0.045 -244 D 0.053 -245 F 0.062 -246 R 0.074 -247 Q 0.095 -248 E 0.128 -249 V 0.166 -250 P 0.202 -251 G 0.229 -252 G 0.241 -253 G 0.233 -254 R 0.209 -255 A 0.170 -256 Q 0.123 -257 E 0.083 -258 L 0.061 -259 T 0.053 -260 E 0.050 -261 A 0.046 -262 F 0.041 -263 A 0.037 -264 D 0.037 -265 V 0.040 -266 I 0.043 -267 G 0.045 -268 A 0.046 -269 L 0.050 -270 W 0.060 -271 H 0.076 -272 P 0.093 -273 D 0.109 -274 S 0.118 -275 C 0.114 -276 E 0.103 -277 A 0.094 -278 V 0.088 -279 N 0.081 -280 P 0.071 -281 T 0.058 -282 R 0.048 -283 F 0.047 -284 R 0.054 -285 A 0.060 -286 V 0.054 -287 F 0.041 -288 Q 0.030 -289 K 0.025 -290 Y 0.026 -291 V 0.034 -292 P 0.046 -293 S 0.064 -294 F 0.086 -295 S 0.106 -296 G 0.117 -297 Y 0.120 -298 S 0.116 -299 Q 0.106 -300 Q 0.094 -301 D 0.085 -302 A 0.076 -303 Q 0.068 -304 E 0.064 -305 F 0.063 -306 L 0.062 -307 K 0.061 -308 L 0.063 -309 L 0.067 -310 M 0.066 -311 E 0.062 -312 R 0.061 -313 L 0.067 -314 H 0.076 -315 L 0.087 -316 E 0.100 -317 I 0.117 -318 N 0.144 -319 R 0.184 -320 R 0.239 -321 G 0.300 -322 R 0.358 -323 R 0.413 -324 A 0.466 -325 P 0.513 -326 P 0.552 -327 I 0.579 -328 L 0.587 -329 A 0.573 -330 S 0.549 -331 G 0.528 -332 P 0.517 -333 V 0.511 -334 P 0.511 -335 S 0.524 -336 P 0.554 -337 P 0.595 -338 C 0.631 -339 R 0.654 -340 G 0.661 -341 G 0.648 -342 G 0.617 -343 A 0.573 -344 L 0.531 -345 H 0.500 -346 E 0.479 -347 E 0.454 -348 P 0.408 -349 E 0.337 -350 L 0.263 -351 S 0.199 -352 D 0.147 -353 D 0.111 -354 D 0.091 -355 R 0.082 -356 A 0.080 -357 N 0.080 -358 L 0.081 -359 M 0.081 -360 W 0.083 -361 K 0.090 -362 R 0.097 -363 Y 0.102 -364 L 0.108 -365 E 0.115 -366 R 0.115 -367 E 0.106 -368 D 0.094 -369 S 0.085 -370 K 0.086 -371 I 0.094 -372 V 0.099 -373 D 0.095 -374 L 0.084 -375 F 0.072 -376 V 0.066 -377 G 0.066 -378 Q 0.068 -379 L 0.066 -380 K 0.059 -381 S 0.053 -382 C 0.051 -383 L 0.055 -384 K 0.064 -385 C 0.071 -386 Q 0.074 -387 A 0.079 -388 C 0.094 -389 G 0.114 -390 Y 0.128 -391 R 0.135 -392 S 0.136 -393 T 0.134 -394 T 0.124 -395 F 0.107 -396 E 0.091 -397 V 0.078 -398 F 0.067 -399 C 0.057 -400 D 0.050 -401 L 0.049 -402 S 0.059 -403 L 0.083 -404 P 0.119 -405 I 0.159 -406 P 0.195 -407 K 0.233 -408 K 0.274 -409 G 0.311 -410 F 0.335 -411 A 0.346 -412 G 0.343 -413 G 0.315 -414 K 0.262 -415 V 0.199 -416 S 0.144 -417 L 0.108 -418 R 0.090 -419 D 0.085 -420 C 0.085 -421 F 0.087 -422 S 0.096 -423 L 0.111 -424 F 0.126 -425 T 0.133 -426 K 0.134 -427 E 0.133 -428 E 0.132 -429 E 0.131 -430 L 0.130 -431 E 0.133 -432 S 0.142 -433 E 0.156 -434 N 0.164 -435 A 0.157 -436 P 0.134 -437 V 0.107 -438 C 0.085 -439 D 0.071 -440 R 0.069 -441 C 0.077 -442 R 0.092 -443 Q 0.107 -444 K 0.116 -445 T 0.118 -446 R 0.121 -447 S 0.128 -448 T 0.137 -449 K 0.137 -450 K 0.125 -451 L 0.104 -452 T 0.087 -453 V 0.084 -454 Q 0.087 -455 R 0.088 -456 F 0.082 -457 P 0.073 -458 R 0.065 -459 I 0.061 -460 L 0.057 -461 V 0.055 -462 L 0.054 -463 H 0.059 -464 L 0.071 -465 N 0.091 -466 R 0.116 -467 F 0.141 -468 S 0.169 -469 T 0.199 -470 S 0.227 -471 R 0.240 -472 G 0.234 -473 S 0.217 -474 I 0.203 -475 K 0.197 -476 K 0.198 -477 S 0.201 -478 S 0.199 -479 V 0.185 -480 G 0.161 -481 V 0.135 -482 D 0.116 -483 F 0.107 -484 P 0.100 -485 L 0.089 -486 Q 0.075 -487 R 0.065 -488 L 0.065 -489 S 0.070 -490 L 0.076 -491 G 0.079 -492 D 0.078 -493 F 0.082 -494 A 0.104 -495 S 0.143 -496 D 0.188 -497 K 0.221 -498 A 0.228 -499 G 0.208 -500 S 0.170 -501 P 0.130 -502 V 0.100 -503 Y 0.083 -504 Q 0.072 -505 L 0.062 -506 Y 0.057 -507 A 0.060 -508 L 0.069 -509 C 0.084 -510 N 0.107 -511 H 0.133 -512 S 0.153 -513 G 0.161 -514 S 0.155 -515 V 0.143 -516 H 0.136 -517 Y 0.139 -518 G 0.140 -519 H 0.124 -520 Y 0.095 -521 T 0.070 -522 A 0.056 -523 L 0.050 -524 C 0.048 -525 R 0.050 -526 C 0.058 -527 Q 0.067 -528 T 0.070 -529 G 0.065 -530 W 0.056 -531 H 0.046 -532 V 0.039 -533 Y 0.036 -534 N 0.037 -535 D 0.042 -536 S 0.050 -537 R 0.059 -538 V 0.067 -539 S 0.072 -540 P 0.072 -541 V 0.068 -542 S 0.066 -543 E 0.069 -544 N 0.072 -545 Q 0.070 -546 V 0.070 -547 A 0.079 -548 S 0.092 -549 S 0.097 -550 E 0.089 -551 G 0.073 -552 Y 0.057 -553 V 0.045 -554 L 0.037 -555 F 0.033 -556 Y 0.036 -557 Q 0.051 -558 L 0.088 -559 M 0.150 -560 Q 0.221 -561 E 0.274 -562 P 0.295 -563 L 0.290 -564 R 0.276 -565 C 0.265 -566 L 0.259 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000053483.16_ENSMUST00000111305.8_GN:Usp21_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000053483.16_ENSMUST00000111305.8_GN:Usp21_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid deleted file mode 100644 index ce739497b2f18f1714b36b2446cec3e28c08885d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000053483.16_ENSMUST00000111305.8_GN:Usp21_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid +++ /dev/null @@ -1,600 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000053483.16|ENSMUST00000111305.8|GN:Usp21|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:33 -1 M 0.290 -2 K 0.299 -3 K 0.311 -4 T 0.317 -5 A 0.308 -6 C 0.288 -7 M 0.271 -8 I 0.267 -9 A 0.271 -10 C 0.275 -11 I 0.282 -12 F 0.293 -13 S 0.300 -14 P 0.300 -15 F 0.304 -16 L 0.319 -17 I 0.336 -18 Q 0.357 -19 T 0.384 -20 L 0.402 -21 T 0.408 -22 L 0.417 -23 F 0.451 -24 S 0.508 -25 P 0.572 -26 Q 0.624 -27 V 0.655 -28 Q 0.669 -29 P 0.675 -30 V 0.677 -31 V 0.677 -32 P 0.674 -33 T 0.662 -34 M 0.630 -35 P 0.589 -36 Q 0.577 -37 A 0.608 -38 S 0.633 -39 E 0.620 -40 H 0.611 -41 R 0.653 -42 L 0.721 -43 G 0.766 -44 R 0.776 -45 T 0.763 -46 R 0.741 -47 E 0.727 -48 P 0.732 -49 P 0.753 -50 V 0.777 -51 N 0.787 -52 V 0.785 -53 Q 0.785 -54 P 0.795 -55 R 0.812 -56 V 0.824 -57 G 0.822 -58 A 0.803 -59 K 0.768 -60 I 0.726 -61 P 0.690 -62 F 0.666 -63 P 0.640 -64 P 0.610 -65 R 0.610 -66 A 0.662 -67 R 0.734 -68 S 0.780 -69 K 0.798 -70 E 0.803 -71 R 0.802 -72 R 0.796 -73 N 0.788 -74 P 0.781 -75 V 0.780 -76 P 0.788 -77 G 0.801 -78 P 0.813 -79 N 0.816 -80 S 0.807 -81 M 0.791 -82 L 0.778 -83 R 0.769 -84 P 0.762 -85 L 0.758 -86 P 0.754 -87 P 0.753 -88 R 0.753 -89 P 0.751 -90 G 0.745 -91 P 0.746 -92 P 0.754 -93 D 0.760 -94 E 0.751 -95 R 0.720 -96 L 0.667 -97 K 0.609 -98 K 0.590 -99 L 0.633 -100 E 0.705 -101 L 0.757 -102 G 0.782 -103 R 0.791 -104 G 0.793 -105 R 0.793 -106 T 0.792 -107 S 0.787 -108 G 0.779 -109 S 0.770 -110 R 0.764 -111 P 0.761 -112 R 0.764 -113 G 0.769 -114 P 0.774 -115 L 0.778 -116 R 0.780 -117 A 0.785 -118 D 0.789 -119 H 0.790 -120 G 0.782 -121 V 0.771 -122 P 0.764 -123 L 0.767 -124 P 0.770 -125 G 0.764 -126 S 0.748 -127 P 0.742 -128 P 0.756 -129 P 0.784 -130 A 0.806 -131 V 0.806 -132 A 0.789 -133 L 0.766 -134 P 0.752 -135 L 0.756 -136 P 0.770 -137 S 0.784 -138 R 0.793 -139 T 0.798 -140 N 0.803 -141 L 0.804 -142 A 0.800 -143 R 0.795 -144 S 0.791 -145 K 0.786 -146 S 0.782 -147 V 0.782 -148 S 0.787 -149 S 0.795 -150 G 0.802 -151 D 0.801 -152 L 0.795 -153 R 0.794 -154 P 0.807 -155 M 0.827 -156 G 0.843 -157 I 0.848 -158 A 0.844 -159 L 0.833 -160 G 0.824 -161 G 0.819 -162 H 0.821 -163 R 0.826 -164 G 0.825 -165 A 0.815 -166 G 0.793 -167 E 0.752 -168 L 0.683 -169 G 0.599 -170 A 0.539 -171 A 0.533 -172 L 0.563 -173 S 0.602 -174 R 0.643 -175 L 0.679 -176 A 0.692 -177 L 0.677 -178 R 0.655 -179 P 0.651 -180 E 0.672 -181 P 0.704 -182 P 0.736 -183 T 0.761 -184 L 0.775 -185 R 0.771 -186 R 0.749 -187 S 0.723 -188 T 0.713 -189 S 0.726 -190 L 0.749 -191 R 0.774 -192 R 0.797 -193 L 0.809 -194 G 0.808 -195 G 0.795 -196 F 0.779 -197 P 0.768 -198 G 0.765 -199 P 0.773 -200 P 0.788 -201 T 0.802 -202 L 0.808 -203 L 0.806 -204 S 0.797 -205 I 0.781 -206 R 0.765 -207 T 0.748 -208 E 0.736 -209 P 0.733 -210 P 0.744 -211 T 0.761 -212 S 0.773 -213 H 0.775 -214 G 0.768 -215 S 0.758 -216 F 0.751 -217 H 0.751 -218 M 0.752 -219 I 0.744 -220 S 0.724 -221 A 0.698 -222 R 0.675 -223 P 0.660 -224 S 0.654 -225 E 0.654 -226 P 0.648 -227 F 0.624 -228 Y 0.582 -229 S 0.536 -230 D 0.498 -231 D 0.470 -232 K 0.450 -233 M 0.435 -234 A 0.430 -235 H 0.427 -236 H 0.417 -237 T 0.398 -238 L 0.367 -239 L 0.328 -240 L 0.286 -241 G 0.249 -242 S 0.217 -243 G 0.183 -244 H 0.145 -245 V 0.111 -246 G 0.092 -247 L 0.091 -248 R 0.100 -249 N 0.107 -250 L 0.104 -251 G 0.093 -252 N 0.082 -253 T 0.076 -254 C 0.073 -255 F 0.070 -256 L 0.067 -257 N 0.065 -258 A 0.065 -259 V 0.067 -260 L 0.067 -261 Q 0.064 -262 C 0.057 -263 L 0.049 -264 S 0.041 -265 S 0.034 -266 T 0.029 -267 R 0.025 -268 P 0.023 -269 L 0.022 -270 R 0.022 -271 D 0.022 -272 F 0.024 -273 C 0.028 -274 L 0.032 -275 R 0.037 -276 R 0.044 -277 D 0.051 -278 F 0.060 -279 R 0.071 -280 Q 0.091 -281 E 0.122 -282 V 0.159 -283 P 0.195 -284 G 0.223 -285 G 0.236 -286 G 0.228 -287 R 0.205 -288 A 0.168 -289 Q 0.121 -290 E 0.081 -291 L 0.059 -292 T 0.051 -293 E 0.049 -294 A 0.046 -295 F 0.041 -296 A 0.038 -297 D 0.038 -298 V 0.040 -299 I 0.043 -300 G 0.045 -301 A 0.046 -302 L 0.050 -303 W 0.060 -304 H 0.076 -305 P 0.094 -306 D 0.111 -307 S 0.121 -308 C 0.118 -309 E 0.107 -310 A 0.097 -311 V 0.091 -312 N 0.083 -313 P 0.072 -314 T 0.059 -315 R 0.049 -316 F 0.047 -317 R 0.054 -318 A 0.060 -319 V 0.054 -320 F 0.041 -321 Q 0.029 -322 K 0.024 -323 Y 0.026 -324 V 0.033 -325 P 0.046 -326 S 0.065 -327 F 0.088 -328 S 0.108 -329 G 0.119 -330 Y 0.123 -331 S 0.119 -332 Q 0.108 -333 Q 0.096 -334 D 0.087 -335 A 0.078 -336 Q 0.070 -337 E 0.066 -338 F 0.065 -339 L 0.063 -340 K 0.061 -341 L 0.063 -342 L 0.067 -343 M 0.067 -344 E 0.063 -345 R 0.063 -346 L 0.069 -347 H 0.079 -348 L 0.090 -349 E 0.103 -350 I 0.120 -351 N 0.145 -352 R 0.185 -353 R 0.240 -354 G 0.301 -355 R 0.360 -356 R 0.416 -357 A 0.470 -358 P 0.518 -359 P 0.559 -360 I 0.586 -361 L 0.594 -362 A 0.578 -363 S 0.550 -364 G 0.526 -365 P 0.512 -366 V 0.506 -367 P 0.506 -368 S 0.520 -369 P 0.553 -370 P 0.595 -371 C 0.633 -372 R 0.656 -373 G 0.663 -374 G 0.649 -375 G 0.616 -376 A 0.572 -377 L 0.531 -378 H 0.500 -379 E 0.480 -380 E 0.455 -381 P 0.408 -382 E 0.337 -383 L 0.263 -384 S 0.200 -385 D 0.150 -386 D 0.114 -387 D 0.094 -388 R 0.085 -389 A 0.082 -390 N 0.082 -391 L 0.082 -392 M 0.082 -393 W 0.084 -394 K 0.091 -395 R 0.098 -396 Y 0.102 -397 L 0.108 -398 E 0.114 -399 R 0.115 -400 E 0.107 -401 D 0.095 -402 S 0.086 -403 K 0.087 -404 I 0.095 -405 V 0.100 -406 D 0.096 -407 L 0.085 -408 F 0.074 -409 V 0.068 -410 G 0.068 -411 Q 0.070 -412 L 0.067 -413 K 0.060 -414 S 0.054 -415 C 0.052 -416 L 0.056 -417 K 0.065 -418 C 0.072 -419 Q 0.075 -420 A 0.080 -421 C 0.094 -422 G 0.114 -423 Y 0.129 -424 R 0.136 -425 S 0.138 -426 T 0.136 -427 T 0.125 -428 F 0.109 -429 E 0.092 -430 V 0.079 -431 F 0.068 -432 C 0.058 -433 D 0.051 -434 L 0.050 -435 S 0.060 -436 L 0.084 -437 P 0.121 -438 I 0.160 -439 P 0.197 -440 K 0.236 -441 K 0.278 -442 G 0.315 -443 F 0.340 -444 A 0.351 -445 G 0.346 -446 G 0.318 -447 K 0.264 -448 V 0.200 -449 S 0.145 -450 L 0.109 -451 R 0.091 -452 D 0.087 -453 C 0.087 -454 F 0.089 -455 S 0.097 -456 L 0.113 -457 F 0.128 -458 T 0.135 -459 K 0.136 -460 E 0.135 -461 E 0.133 -462 E 0.132 -463 L 0.131 -464 E 0.134 -465 S 0.144 -466 E 0.159 -467 N 0.166 -468 A 0.158 -469 P 0.135 -470 V 0.108 -471 C 0.086 -472 D 0.072 -473 R 0.070 -474 C 0.079 -475 R 0.094 -476 Q 0.109 -477 K 0.119 -478 T 0.122 -479 R 0.124 -480 S 0.132 -481 T 0.140 -482 K 0.141 -483 K 0.128 -484 L 0.107 -485 T 0.090 -486 V 0.086 -487 Q 0.090 -488 R 0.091 -489 F 0.084 -490 P 0.075 -491 R 0.067 -492 I 0.062 -493 L 0.059 -494 V 0.056 -495 L 0.055 -496 H 0.061 -497 L 0.073 -498 N 0.094 -499 R 0.119 -500 F 0.145 -501 S 0.173 -502 T 0.203 -503 S 0.230 -504 R 0.243 -505 G 0.236 -506 S 0.219 -507 I 0.205 -508 K 0.199 -509 K 0.200 -510 S 0.203 -511 S 0.201 -512 V 0.188 -513 G 0.163 -514 V 0.136 -515 D 0.118 -516 F 0.109 -517 P 0.102 -518 L 0.091 -519 Q 0.077 -520 R 0.068 -521 L 0.066 -522 S 0.071 -523 L 0.077 -524 G 0.080 -525 D 0.079 -526 F 0.084 -527 A 0.105 -528 S 0.145 -529 D 0.190 -530 K 0.223 -531 A 0.230 -532 G 0.209 -533 S 0.171 -534 P 0.130 -535 V 0.101 -536 Y 0.084 -537 Q 0.073 -538 L 0.063 -539 Y 0.058 -540 A 0.062 -541 L 0.071 -542 C 0.087 -543 N 0.110 -544 H 0.137 -545 S 0.157 -546 G 0.165 -547 S 0.159 -548 V 0.147 -549 H 0.140 -550 Y 0.143 -551 G 0.143 -552 H 0.127 -553 Y 0.098 -554 T 0.071 -555 A 0.057 -556 L 0.051 -557 C 0.048 -558 R 0.051 -559 C 0.059 -560 Q 0.068 -561 T 0.071 -562 G 0.066 -563 W 0.056 -564 H 0.047 -565 V 0.040 -566 Y 0.037 -567 N 0.038 -568 D 0.043 -569 S 0.051 -570 R 0.060 -571 V 0.068 -572 S 0.072 -573 P 0.072 -574 V 0.068 -575 S 0.064 -576 E 0.065 -577 N 0.067 -578 Q 0.067 -579 V 0.069 -580 A 0.080 -581 S 0.094 -582 S 0.099 -583 E 0.091 -584 G 0.075 -585 Y 0.059 -586 V 0.047 -587 L 0.039 -588 F 0.035 -589 Y 0.037 -590 Q 0.051 -591 L 0.087 -592 M 0.145 -593 Q 0.213 -594 E 0.264 -595 P 0.282 -596 L 0.276 -597 R 0.263 -598 C 0.254 -599 L 0.250 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000053746.9_ENSMUST00000066352.6_GN:Ptrh1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000053746.9_ENSMUST00000066352.6_GN:Ptrh1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index f45181e0847e6325e31c9b3742dbdf520ef05a88..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000053746.9_ENSMUST00000066352.6_GN:Ptrh1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,205 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000053746.9|ENSMUST00000066352.6|GN:Ptrh1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.385 -2 R 0.384 -3 R 0.379 -4 S 0.361 -5 W 0.328 -6 A 0.300 -7 L 0.294 -8 S 0.304 -9 R 0.318 -10 Q 0.330 -11 V 0.331 -12 S 0.312 -13 E 0.286 -14 A 0.276 -15 R 0.282 -16 F 0.279 -17 P 0.248 -18 G 0.193 -19 K 0.130 -20 R 0.080 -21 W 0.052 -22 L 0.042 -23 V 0.042 -24 A 0.046 -25 G 0.051 -26 L 0.060 -27 G 0.074 -28 N 0.094 -29 H 0.121 -30 G 0.154 -31 M 0.183 -32 P 0.193 -33 G 0.181 -34 T 0.162 -35 R 0.146 -36 H 0.135 -37 S 0.123 -38 V 0.105 -39 G 0.084 -40 M 0.068 -41 A 0.061 -42 V 0.059 -43 L 0.056 -44 G 0.049 -45 Q 0.044 -46 I 0.048 -47 A 0.057 -48 R 0.061 -49 R 0.056 -50 L 0.048 -51 G 0.044 -52 V 0.046 -53 A 0.050 -54 E 0.052 -55 N 0.052 -56 W 0.052 -57 T 0.053 -58 R 0.054 -59 D 0.057 -60 S 0.061 -61 R 0.068 -62 C 0.070 -63 A 0.066 -64 A 0.055 -65 D 0.043 -66 L 0.034 -67 A 0.032 -68 L 0.039 -69 A 0.051 -70 P 0.060 -71 L 0.062 -72 G 0.062 -73 D 0.064 -74 A 0.062 -75 Q 0.055 -76 L 0.046 -77 V 0.042 -78 L 0.046 -79 L 0.057 -80 R 0.072 -81 P 0.087 -82 R 0.094 -83 R 0.095 -84 L 0.097 -85 M 0.101 -86 N 0.099 -87 V 0.087 -88 N 0.070 -89 G 0.057 -90 R 0.047 -91 S 0.039 -92 V 0.035 -93 A 0.034 -94 R 0.035 -95 A 0.042 -96 A 0.052 -97 E 0.060 -98 L 0.059 -99 F 0.055 -100 G 0.052 -101 L 0.049 -102 T 0.044 -103 A 0.039 -104 E 0.035 -105 E 0.029 -106 I 0.026 -107 Y 0.027 -108 L 0.032 -109 V 0.041 -110 H 0.050 -111 D 0.061 -112 E 0.073 -113 L 0.082 -114 D 0.087 -115 K 0.088 -116 P 0.086 -117 L 0.082 -118 G 0.079 -119 K 0.076 -120 L 0.077 -121 A 0.083 -122 L 0.096 -123 K 0.114 -124 L 0.132 -125 G 0.146 -126 G 0.156 -127 S 0.163 -128 A 0.165 -129 R 0.159 -130 G 0.147 -131 H 0.132 -132 N 0.119 -133 G 0.111 -134 V 0.109 -135 R 0.110 -136 S 0.112 -137 C 0.115 -138 I 0.119 -139 S 0.120 -140 C 0.112 -141 L 0.098 -142 N 0.091 -143 S 0.096 -144 N 0.109 -145 A 0.120 -146 M 0.119 -147 P 0.105 -148 R 0.089 -149 L 0.078 -150 L 0.073 -151 V 0.076 -152 G 0.090 -153 I 0.110 -154 G 0.131 -155 R 0.147 -156 P 0.155 -157 T 0.155 -158 H 0.151 -159 P 0.146 -160 N 0.140 -161 M 0.139 -162 V 0.142 -163 E 0.144 -164 N 0.141 -165 H 0.133 -166 V 0.128 -167 L 0.127 -168 G 0.123 -169 C 0.112 -170 F 0.094 -171 S 0.078 -172 P 0.068 -173 E 0.063 -174 E 0.065 -175 Q 0.072 -176 E 0.079 -177 L 0.077 -178 L 0.067 -179 S 0.055 -180 P 0.046 -181 L 0.040 -182 M 0.036 -183 D 0.035 -184 Q 0.039 -185 A 0.049 -186 T 0.061 -187 D 0.065 -188 L 0.057 -189 L 0.046 -190 L 0.040 -191 D 0.042 -192 H 0.049 -193 I 0.062 -194 R 0.086 -195 A 0.127 -196 R 0.187 -197 S 0.254 -198 Q 0.314 -199 G 0.364 -200 P 0.397 -201 L 0.409 -202 S 0.400 -203 G 0.380 -204 L 0.364 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000053746.9_ENSMUST00000066352.6_GN:Ptrh1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000053746.9_ENSMUST00000066352.6_GN:Ptrh1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid deleted file mode 100644 index 74b2fa964aa357732b1e183b8d2c03cef45a791f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000053746.9_ENSMUST00000066352.6_GN:Ptrh1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:14.caid +++ /dev/null @@ -1,219 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000053746.9|ENSMUST00000066352.6|GN:Ptrh1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:14 -1 M 0.419 -2 G 0.442 -3 V 0.475 -4 G 0.502 -5 T 0.513 -6 L 0.511 -7 K 0.503 -8 S 0.495 -9 G 0.474 -10 L 0.432 -11 F 0.384 -12 S 0.359 -13 P 0.362 -14 G 0.373 -15 M 0.370 -16 R 0.356 -17 R 0.335 -18 S 0.303 -19 W 0.261 -20 A 0.226 -21 L 0.213 -22 S 0.220 -23 R 0.237 -24 Q 0.256 -25 V 0.263 -26 S 0.252 -27 E 0.238 -28 A 0.241 -29 R 0.256 -30 F 0.259 -31 P 0.234 -32 G 0.183 -33 K 0.124 -34 R 0.076 -35 W 0.050 -36 L 0.041 -37 V 0.041 -38 A 0.045 -39 G 0.050 -40 L 0.059 -41 G 0.074 -42 N 0.094 -43 H 0.120 -44 G 0.152 -45 M 0.181 -46 P 0.190 -47 G 0.179 -48 T 0.159 -49 R 0.143 -50 H 0.132 -51 S 0.120 -52 V 0.102 -53 G 0.081 -54 M 0.067 -55 A 0.060 -56 V 0.059 -57 L 0.056 -58 G 0.049 -59 Q 0.045 -60 I 0.048 -61 A 0.056 -62 R 0.061 -63 R 0.055 -64 L 0.046 -65 G 0.042 -66 V 0.044 -67 A 0.048 -68 E 0.049 -69 N 0.049 -70 W 0.050 -71 T 0.051 -72 R 0.052 -73 D 0.055 -74 S 0.060 -75 R 0.066 -76 C 0.069 -77 A 0.064 -78 A 0.054 -79 D 0.041 -80 L 0.032 -81 A 0.030 -82 L 0.036 -83 A 0.047 -84 P 0.056 -85 L 0.059 -86 G 0.060 -87 D 0.061 -88 A 0.060 -89 Q 0.054 -90 L 0.046 -91 V 0.042 -92 L 0.046 -93 L 0.057 -94 R 0.072 -95 P 0.087 -96 R 0.094 -97 R 0.096 -98 L 0.098 -99 M 0.102 -100 N 0.099 -101 V 0.086 -102 N 0.069 -103 G 0.055 -104 R 0.045 -105 S 0.038 -106 V 0.034 -107 A 0.033 -108 R 0.034 -109 A 0.041 -110 A 0.051 -111 E 0.059 -112 L 0.058 -113 F 0.054 -114 G 0.052 -115 L 0.049 -116 T 0.044 -117 A 0.040 -118 E 0.035 -119 E 0.030 -120 I 0.026 -121 Y 0.027 -122 L 0.033 -123 V 0.041 -124 H 0.050 -125 D 0.061 -126 E 0.074 -127 L 0.083 -128 D 0.088 -129 K 0.089 -130 P 0.087 -131 L 0.083 -132 G 0.079 -133 K 0.077 -134 L 0.078 -135 A 0.084 -136 L 0.097 -137 K 0.114 -138 L 0.133 -139 G 0.148 -140 G 0.158 -141 S 0.165 -142 A 0.167 -143 R 0.161 -144 G 0.149 -145 H 0.134 -146 N 0.121 -147 G 0.113 -148 V 0.111 -149 R 0.111 -150 S 0.113 -151 C 0.117 -152 I 0.121 -153 S 0.121 -154 C 0.113 -155 L 0.100 -156 N 0.092 -157 S 0.097 -158 N 0.111 -159 A 0.121 -160 M 0.120 -161 P 0.106 -162 R 0.090 -163 L 0.078 -164 L 0.073 -165 V 0.077 -166 G 0.090 -167 I 0.111 -168 G 0.132 -169 R 0.149 -170 P 0.156 -171 T 0.156 -172 H 0.152 -173 P 0.147 -174 N 0.141 -175 M 0.139 -176 V 0.142 -177 E 0.143 -178 N 0.139 -179 H 0.132 -180 V 0.127 -181 L 0.126 -182 G 0.123 -183 C 0.111 -184 F 0.094 -185 S 0.078 -186 P 0.067 -187 E 0.063 -188 E 0.064 -189 Q 0.071 -190 E 0.078 -191 L 0.076 -192 L 0.066 -193 S 0.055 -194 P 0.046 -195 L 0.040 -196 M 0.036 -197 D 0.034 -198 Q 0.036 -199 A 0.043 -200 T 0.049 -201 D 0.049 -202 L 0.045 -203 L 0.040 -204 L 0.039 -205 D 0.043 -206 H 0.050 -207 I 0.062 -208 R 0.086 -209 A 0.128 -210 R 0.189 -211 S 0.255 -212 Q 0.316 -213 G 0.365 -214 P 0.400 -215 L 0.412 -216 S 0.404 -217 G 0.384 -218 L 0.368 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000054537.9_ENSMUST00000161306.2_GN:Tmprss11e_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000054537.9_ENSMUST00000161306.2_GN:Tmprss11e_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 578701dacef6bc178084281deeeed4c8ec6edc88..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000054537.9_ENSMUST00000161306.2_GN:Tmprss11e_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,424 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000054537.9|ENSMUST00000161306.2|GN:Tmprss11e|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.362 -2 Y 0.375 -3 R 0.400 -4 S 0.425 -5 C 0.437 -6 V 0.450 -7 V 0.487 -8 R 0.539 -9 A 0.583 -10 R 0.608 -11 K 0.619 -12 R 0.612 -13 T 0.571 -14 C 0.493 -15 V 0.398 -16 E 0.312 -17 P 0.251 -18 W 0.213 -19 V 0.194 -20 I 0.188 -21 G 0.184 -22 I 0.179 -23 I 0.176 -24 S 0.181 -25 F 0.189 -26 L 0.198 -27 S 0.200 -28 L 0.195 -29 I 0.190 -30 V 0.192 -31 L 0.195 -32 A 0.196 -33 V 0.198 -34 C 0.194 -35 I 0.179 -36 G 0.156 -37 L 0.135 -38 T 0.119 -39 V 0.105 -40 H 0.097 -41 Y 0.102 -42 V 0.124 -43 R 0.160 -44 Y 0.197 -45 N 0.216 -46 H 0.204 -47 R 0.164 -48 R 0.113 -49 T 0.068 -50 Y 0.038 -51 N 0.024 -52 Y 0.020 -53 Y 0.020 -54 S 0.021 -55 T 0.022 -56 L 0.024 -57 S 0.034 -58 F 0.052 -59 T 0.072 -60 S 0.084 -61 D 0.084 -62 K 0.077 -63 L 0.070 -64 Y 0.068 -65 S 0.074 -66 E 0.084 -67 F 0.093 -68 G 0.099 -69 R 0.101 -70 E 0.099 -71 A 0.095 -72 S 0.087 -73 K 0.082 -74 N 0.079 -75 F 0.074 -76 T 0.067 -77 E 0.064 -78 M 0.067 -79 S 0.075 -80 Q 0.078 -81 R 0.073 -82 I 0.066 -83 E 0.069 -84 T 0.075 -85 M 0.073 -86 V 0.060 -87 K 0.046 -88 H 0.038 -89 A 0.036 -90 F 0.038 -91 H 0.041 -92 K 0.043 -93 S 0.044 -94 P 0.048 -95 L 0.055 -96 R 0.060 -97 G 0.057 -98 Q 0.049 -99 L 0.039 -100 V 0.030 -101 K 0.024 -102 A 0.020 -103 H 0.018 -104 I 0.018 -105 I 0.020 -106 K 0.022 -107 F 0.027 -108 S 0.035 -109 K 0.041 -110 E 0.046 -111 D 0.052 -112 D 0.054 -113 G 0.050 -114 V 0.039 -115 L 0.028 -116 A 0.021 -117 H 0.018 -118 M 0.016 -119 L 0.015 -120 L 0.016 -121 I 0.020 -122 F 0.027 -123 R 0.040 -124 I 0.055 -125 R 0.068 -126 S 0.073 -127 T 0.069 -128 E 0.062 -129 D 0.054 -130 P 0.048 -131 E 0.047 -132 T 0.051 -133 V 0.061 -134 H 0.070 -135 K 0.071 -136 I 0.059 -137 I 0.044 -138 E 0.034 -139 Y 0.031 -140 V 0.032 -141 L 0.034 -142 H 0.038 -143 E 0.047 -144 K 0.061 -145 L 0.077 -146 K 0.097 -147 Y 0.121 -148 A 0.144 -149 T 0.157 -150 G 0.152 -151 P 0.139 -152 P 0.126 -153 N 0.120 -154 V 0.119 -155 D 0.114 -156 P 0.098 -157 E 0.072 -158 S 0.049 -159 V 0.037 -160 K 0.034 -161 I 0.039 -162 K 0.049 -163 K 0.062 -164 I 0.077 -165 N 0.097 -166 K 0.119 -167 T 0.143 -168 E 0.167 -169 S 0.189 -170 D 0.203 -171 N 0.205 -172 Y 0.192 -173 F 0.166 -174 N 0.137 -175 H 0.117 -176 C 0.108 -177 C 0.109 -178 G 0.115 -179 T 0.125 -180 R 0.143 -181 R 0.181 -182 N 0.247 -183 K 0.334 -184 S 0.417 -185 T 0.468 -186 V 0.475 -187 Q 0.454 -188 T 0.418 -189 S 0.376 -190 V 0.335 -191 R 0.303 -192 I 0.278 -193 V 0.251 -194 G 0.222 -195 G 0.199 -196 T 0.190 -197 P 0.188 -198 V 0.182 -199 E 0.163 -200 E 0.137 -201 E 0.111 -202 E 0.085 -203 W 0.060 -204 P 0.040 -205 W 0.028 -206 Q 0.022 -207 S 0.020 -208 S 0.024 -209 L 0.033 -210 R 0.046 -211 W 0.059 -212 D 0.069 -213 G 0.072 -214 S 0.068 -215 H 0.054 -216 R 0.038 -217 C 0.026 -218 G 0.022 -219 A 0.025 -220 T 0.032 -221 L 0.040 -222 I 0.043 -223 N 0.041 -224 N 0.036 -225 T 0.030 -226 W 0.026 -227 L 0.023 -228 V 0.020 -229 T 0.017 -230 A 0.018 -231 A 0.023 -232 H 0.030 -233 C 0.035 -234 F 0.037 -235 R 0.037 -236 T 0.039 -237 H 0.045 -238 K 0.054 -239 D 0.061 -240 P 0.059 -241 S 0.048 -242 R 0.034 -243 W 0.023 -244 S 0.017 -245 A 0.015 -246 T 0.016 -247 F 0.020 -248 G 0.027 -249 A 0.039 -250 T 0.051 -251 L 0.062 -252 Q 0.071 -253 P 0.077 -254 R 0.077 -255 K 0.071 -256 L 0.061 -257 T 0.050 -258 T 0.040 -259 G 0.035 -260 I 0.034 -261 R 0.035 -262 R 0.038 -263 I 0.042 -264 I 0.046 -265 V 0.049 -266 H 0.049 -267 E 0.049 -268 K 0.049 -269 Y 0.050 -270 K 0.049 -271 Y 0.052 -272 P 0.064 -273 S 0.083 -274 H 0.097 -275 D 0.098 -276 Y 0.083 -277 D 0.061 -278 I 0.040 -279 A 0.028 -280 L 0.024 -281 A 0.025 -282 E 0.029 -283 L 0.035 -284 S 0.042 -285 K 0.049 -286 P 0.059 -287 V 0.072 -288 P 0.088 -289 C 0.099 -290 T 0.097 -291 N 0.083 -292 A 0.064 -293 V 0.051 -294 H 0.044 -295 K 0.041 -296 V 0.044 -297 C 0.055 -298 L 0.076 -299 P 0.097 -300 D 0.106 -301 A 0.103 -302 N 0.093 -303 H 0.082 -304 E 0.072 -305 F 0.065 -306 Q 0.064 -307 P 0.067 -308 G 0.067 -309 Q 0.061 -310 R 0.050 -311 M 0.038 -312 F 0.030 -313 V 0.029 -314 T 0.034 -315 G 0.047 -316 F 0.067 -317 G 0.091 -318 A 0.112 -319 L 0.125 -320 K 0.140 -321 N 0.161 -322 D 0.184 -323 G 0.197 -324 F 0.192 -325 T 0.168 -326 Q 0.138 -327 N 0.116 -328 N 0.104 -329 L 0.097 -330 R 0.089 -331 Q 0.081 -332 V 0.074 -333 Q 0.067 -334 V 0.061 -335 D 0.058 -336 Y 0.059 -337 I 0.064 -338 D 0.067 -339 T 0.069 -340 Q 0.070 -341 T 0.070 -342 C 0.070 -343 N 0.080 -344 Q 0.098 -345 P 0.117 -346 Q 0.125 -347 S 0.124 -348 Y 0.123 -349 N 0.127 -350 G 0.134 -351 A 0.139 -352 I 0.133 -353 T 0.110 -354 P 0.081 -355 R 0.058 -356 M 0.045 -357 L 0.042 -358 C 0.047 -359 A 0.061 -360 G 0.079 -361 F 0.094 -362 L 0.103 -363 K 0.110 -364 G 0.114 -365 E 0.113 -366 K 0.107 -367 D 0.101 -368 A 0.094 -369 C 0.087 -370 Q 0.086 -371 G 0.093 -372 D 0.100 -373 S 0.098 -374 G 0.092 -375 G 0.091 -376 P 0.091 -377 L 0.083 -378 V 0.069 -379 T 0.061 -380 A 0.063 -381 D 0.069 -382 V 0.073 -383 R 0.075 -384 D 0.073 -385 I 0.067 -386 W 0.058 -387 Y 0.053 -388 L 0.055 -389 A 0.061 -390 G 0.064 -391 V 0.064 -392 V 0.064 -393 S 0.068 -394 W 0.076 -395 G 0.085 -396 D 0.089 -397 E 0.091 -398 C 0.096 -399 G 0.109 -400 Q 0.127 -401 P 0.137 -402 N 0.130 -403 K 0.109 -404 P 0.087 -405 G 0.072 -406 V 0.063 -407 Y 0.059 -408 T 0.060 -409 R 0.065 -410 V 0.072 -411 T 0.076 -412 A 0.074 -413 F 0.073 -414 R 0.074 -415 H 0.075 -416 W 0.073 -417 I 0.076 -418 A 0.087 -419 S 0.100 -420 N 0.111 -421 T 0.128 -422 G 0.154 -423 I 0.176 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000054537.9_ENSMUST00000161306.2_GN:Tmprss11e_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000054537.9_ENSMUST00000161306.2_GN:Tmprss11e_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid deleted file mode 100644 index 3fb70d16410a686cb6bba42d9d4d340ce72f5f5d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000054537.9_ENSMUST00000161306.2_GN:Tmprss11e_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:19.caid +++ /dev/null @@ -1,443 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000054537.9|ENSMUST00000161306.2|GN:Tmprss11e|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:19 -1 M 0.357 -2 N 0.348 -3 T 0.350 -4 L 0.376 -5 S 0.418 -6 H 0.471 -7 G 0.531 -8 P 0.576 -9 V 0.574 -10 T 0.536 -11 T 0.518 -12 G 0.547 -13 L 0.581 -14 V 0.573 -15 T 0.521 -16 C 0.444 -17 W 0.359 -18 S 0.297 -19 A 0.287 -20 M 0.325 -21 Y 0.379 -22 R 0.434 -23 S 0.495 -24 C 0.556 -25 V 0.597 -26 V 0.615 -27 R 0.625 -28 A 0.641 -29 R 0.659 -30 K 0.669 -31 R 0.660 -32 T 0.615 -33 C 0.529 -34 V 0.426 -35 E 0.338 -36 P 0.277 -37 W 0.239 -38 V 0.220 -39 I 0.214 -40 G 0.208 -41 I 0.197 -42 I 0.191 -43 S 0.192 -44 F 0.200 -45 L 0.208 -46 S 0.209 -47 L 0.202 -48 I 0.197 -49 V 0.198 -50 L 0.199 -51 A 0.199 -52 V 0.198 -53 C 0.193 -54 I 0.178 -55 G 0.155 -56 L 0.134 -57 T 0.119 -58 V 0.106 -59 H 0.099 -60 Y 0.106 -61 V 0.127 -62 R 0.160 -63 Y 0.192 -64 N 0.207 -65 H 0.194 -66 R 0.155 -67 R 0.107 -68 T 0.064 -69 Y 0.036 -70 N 0.023 -71 Y 0.019 -72 Y 0.019 -73 S 0.020 -74 T 0.020 -75 L 0.023 -76 S 0.032 -77 F 0.049 -78 T 0.068 -79 S 0.079 -80 D 0.079 -81 K 0.072 -82 L 0.066 -83 Y 0.064 -84 S 0.070 -85 E 0.080 -86 F 0.089 -87 G 0.095 -88 R 0.096 -89 E 0.094 -90 A 0.088 -91 S 0.081 -92 K 0.076 -93 N 0.074 -94 F 0.070 -95 T 0.064 -96 E 0.061 -97 M 0.065 -98 S 0.073 -99 Q 0.077 -100 R 0.071 -101 I 0.064 -102 E 0.066 -103 T 0.072 -104 M 0.070 -105 V 0.057 -106 K 0.044 -107 H 0.036 -108 A 0.034 -109 F 0.037 -110 H 0.039 -111 K 0.041 -112 S 0.043 -113 P 0.046 -114 L 0.053 -115 R 0.059 -116 G 0.056 -117 Q 0.048 -118 L 0.038 -119 V 0.029 -120 K 0.023 -121 A 0.019 -122 H 0.017 -123 I 0.017 -124 I 0.018 -125 K 0.021 -126 F 0.026 -127 S 0.033 -128 K 0.039 -129 E 0.044 -130 D 0.050 -131 D 0.053 -132 G 0.049 -133 V 0.038 -134 L 0.027 -135 A 0.021 -136 H 0.017 -137 M 0.015 -138 L 0.015 -139 L 0.016 -140 I 0.020 -141 F 0.027 -142 R 0.039 -143 I 0.055 -144 R 0.068 -145 S 0.072 -146 T 0.069 -147 E 0.062 -148 D 0.053 -149 P 0.047 -150 E 0.046 -151 T 0.051 -152 V 0.060 -153 H 0.069 -154 K 0.070 -155 I 0.058 -156 I 0.042 -157 E 0.033 -158 Y 0.030 -159 V 0.031 -160 L 0.032 -161 H 0.036 -162 E 0.045 -163 K 0.059 -164 L 0.075 -165 K 0.094 -166 Y 0.117 -167 A 0.139 -168 T 0.151 -169 G 0.146 -170 P 0.133 -171 P 0.122 -172 N 0.116 -173 V 0.115 -174 D 0.110 -175 P 0.094 -176 E 0.069 -177 S 0.047 -178 V 0.035 -179 K 0.032 -180 I 0.037 -181 K 0.047 -182 K 0.059 -183 I 0.075 -184 N 0.094 -185 K 0.116 -186 T 0.140 -187 E 0.164 -188 S 0.184 -189 D 0.198 -190 N 0.200 -191 Y 0.188 -192 F 0.164 -193 N 0.137 -194 H 0.117 -195 C 0.109 -196 C 0.110 -197 G 0.115 -198 T 0.124 -199 R 0.142 -200 R 0.180 -201 N 0.246 -202 K 0.333 -203 S 0.417 -204 T 0.467 -205 V 0.476 -206 Q 0.455 -207 T 0.419 -208 S 0.377 -209 V 0.335 -210 R 0.304 -211 I 0.280 -212 V 0.253 -213 G 0.223 -214 G 0.200 -215 T 0.190 -216 P 0.188 -217 V 0.182 -218 E 0.163 -219 E 0.138 -220 E 0.112 -221 E 0.086 -222 W 0.060 -223 P 0.041 -224 W 0.028 -225 Q 0.022 -226 S 0.020 -227 S 0.024 -228 L 0.033 -229 R 0.046 -230 W 0.059 -231 D 0.069 -232 G 0.072 -233 S 0.067 -234 H 0.054 -235 R 0.037 -236 C 0.025 -237 G 0.022 -238 A 0.025 -239 T 0.032 -240 L 0.040 -241 I 0.043 -242 N 0.041 -243 N 0.036 -244 T 0.030 -245 W 0.026 -246 L 0.023 -247 V 0.020 -248 T 0.017 -249 A 0.018 -250 A 0.023 -251 H 0.030 -252 C 0.035 -253 F 0.037 -254 R 0.037 -255 T 0.039 -256 H 0.045 -257 K 0.054 -258 D 0.061 -259 P 0.059 -260 S 0.048 -261 R 0.034 -262 W 0.023 -263 S 0.017 -264 A 0.015 -265 T 0.016 -266 F 0.020 -267 G 0.027 -268 A 0.039 -269 T 0.051 -270 L 0.062 -271 Q 0.071 -272 P 0.076 -273 R 0.076 -274 K 0.070 -275 L 0.061 -276 T 0.050 -277 T 0.041 -278 G 0.036 -279 I 0.035 -280 R 0.036 -281 R 0.038 -282 I 0.042 -283 I 0.047 -284 V 0.050 -285 H 0.050 -286 E 0.049 -287 K 0.050 -288 Y 0.051 -289 K 0.050 -290 Y 0.052 -291 P 0.064 -292 S 0.083 -293 H 0.098 -294 D 0.099 -295 Y 0.084 -296 D 0.061 -297 I 0.040 -298 A 0.028 -299 L 0.024 -300 A 0.025 -301 E 0.029 -302 L 0.035 -303 S 0.042 -304 K 0.050 -305 P 0.060 -306 V 0.073 -307 P 0.090 -308 C 0.101 -309 T 0.100 -310 N 0.085 -311 A 0.066 -312 V 0.052 -313 H 0.045 -314 K 0.042 -315 V 0.045 -316 C 0.057 -317 L 0.077 -318 P 0.098 -319 D 0.108 -320 A 0.104 -321 N 0.095 -322 H 0.084 -323 E 0.074 -324 F 0.066 -325 Q 0.065 -326 P 0.068 -327 G 0.069 -328 Q 0.063 -329 R 0.052 -330 M 0.040 -331 F 0.031 -332 V 0.030 -333 T 0.035 -334 G 0.048 -335 F 0.068 -336 G 0.093 -337 A 0.114 -338 L 0.128 -339 K 0.142 -340 N 0.164 -341 D 0.186 -342 G 0.199 -343 F 0.194 -344 T 0.170 -345 Q 0.140 -346 N 0.118 -347 N 0.106 -348 L 0.099 -349 R 0.091 -350 Q 0.082 -351 V 0.075 -352 Q 0.068 -353 V 0.061 -354 D 0.058 -355 Y 0.060 -356 I 0.064 -357 D 0.067 -358 T 0.070 -359 Q 0.071 -360 T 0.070 -361 C 0.070 -362 N 0.080 -363 Q 0.098 -364 P 0.117 -365 Q 0.125 -366 S 0.124 -367 Y 0.123 -368 N 0.126 -369 G 0.133 -370 A 0.138 -371 I 0.132 -372 T 0.110 -373 P 0.081 -374 R 0.059 -375 M 0.046 -376 L 0.042 -377 C 0.048 -378 A 0.062 -379 G 0.080 -380 F 0.094 -381 L 0.104 -382 K 0.111 -383 G 0.116 -384 E 0.114 -385 K 0.109 -386 D 0.102 -387 A 0.095 -388 C 0.088 -389 Q 0.087 -390 G 0.094 -391 D 0.101 -392 S 0.100 -393 G 0.094 -394 G 0.092 -395 P 0.092 -396 L 0.084 -397 V 0.070 -398 T 0.062 -399 A 0.063 -400 D 0.070 -401 V 0.074 -402 R 0.076 -403 D 0.074 -404 I 0.068 -405 W 0.058 -406 Y 0.053 -407 L 0.056 -408 A 0.062 -409 G 0.065 -410 V 0.066 -411 V 0.066 -412 S 0.069 -413 W 0.077 -414 G 0.086 -415 D 0.091 -416 E 0.092 -417 C 0.097 -418 G 0.111 -419 Q 0.129 -420 P 0.139 -421 N 0.132 -422 K 0.112 -423 P 0.089 -424 G 0.073 -425 V 0.065 -426 Y 0.060 -427 T 0.061 -428 R 0.066 -429 V 0.073 -430 T 0.077 -431 A 0.075 -432 F 0.074 -433 R 0.075 -434 H 0.076 -435 W 0.073 -436 I 0.075 -437 A 0.085 -438 S 0.097 -439 N 0.109 -440 T 0.127 -441 G 0.154 -442 I 0.176 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000056394.21_ENSMUST00000177588.10_GN:Lig1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000056394.21_ENSMUST00000177588.10_GN:Lig1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 873b1f21d37f543915894967ea1d206b28d97b10..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000056394.21_ENSMUST00000177588.10_GN:Lig1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,917 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000056394.21|ENSMUST00000177588.10|GN:Lig1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.275 -2 Q 0.276 -3 R 0.277 -4 S 0.275 -5 I 0.266 -6 M 0.256 -7 S 0.262 -8 F 0.289 -9 F 0.339 -10 Q 0.407 -11 P 0.477 -12 T 0.513 -13 K 0.509 -14 E 0.502 -15 G 0.515 -16 K 0.519 -17 A 0.492 -18 K 0.469 -19 K 0.481 -20 P 0.501 -21 E 0.492 -22 K 0.481 -23 E 0.508 -24 T 0.562 -25 P 0.607 -26 S 0.634 -27 S 0.644 -28 I 0.641 -29 R 0.629 -30 E 0.611 -31 K 0.580 -32 E 0.550 -33 P 0.539 -34 P 0.542 -35 P 0.540 -36 K 0.543 -37 V 0.568 -38 A 0.584 -39 L 0.567 -40 K 0.562 -41 E 0.607 -42 R 0.669 -43 N 0.702 -44 Q 0.705 -45 V 0.698 -46 V 0.693 -47 P 0.696 -48 E 0.704 -49 S 0.704 -50 D 0.694 -51 S 0.686 -52 P 0.696 -53 V 0.720 -54 K 0.738 -55 R 0.733 -56 T 0.696 -57 G 0.640 -58 R 0.607 -59 K 0.622 -60 V 0.637 -61 A 0.613 -62 Q 0.591 -63 V 0.615 -64 L 0.665 -65 S 0.707 -66 C 0.735 -67 E 0.756 -68 G 0.768 -69 E 0.771 -70 D 0.768 -71 E 0.760 -72 D 0.746 -73 E 0.733 -74 A 0.727 -75 P 0.724 -76 G 0.711 -77 T 0.671 -78 P 0.614 -79 K 0.586 -80 V 0.616 -81 Q 0.674 -82 K 0.722 -83 P 0.754 -84 V 0.780 -85 S 0.799 -86 D 0.805 -87 S 0.798 -88 E 0.780 -89 Q 0.756 -90 S 0.733 -91 S 0.720 -92 P 0.723 -93 P 0.739 -94 S 0.760 -95 P 0.778 -96 D 0.787 -97 T 0.786 -98 C 0.779 -99 P 0.775 -100 E 0.775 -101 N 0.774 -102 S 0.771 -103 P 0.770 -104 V 0.773 -105 F 0.776 -106 N 0.771 -107 C 0.759 -108 S 0.756 -109 S 0.769 -110 P 0.790 -111 M 0.798 -112 D 0.785 -113 I 0.755 -114 S 0.722 -115 P 0.696 -116 S 0.680 -117 G 0.673 -118 F 0.677 -119 P 0.693 -120 K 0.708 -121 R 0.712 -122 R 0.709 -123 T 0.710 -124 A 0.717 -125 R 0.719 -126 K 0.710 -127 Q 0.699 -128 L 0.696 -129 P 0.692 -130 K 0.669 -131 R 0.617 -132 T 0.546 -133 I 0.491 -134 Q 0.493 -135 D 0.547 -136 T 0.596 -137 L 0.610 -138 E 0.613 -139 E 0.632 -140 Q 0.656 -141 N 0.672 -142 E 0.678 -143 D 0.680 -144 K 0.676 -145 T 0.663 -146 K 0.641 -147 T 0.603 -148 A 0.553 -149 K 0.523 -150 K 0.532 -151 R 0.541 -152 K 0.524 -153 K 0.514 -154 E 0.546 -155 E 0.591 -156 E 0.619 -157 T 0.634 -158 P 0.656 -159 K 0.683 -160 E 0.704 -161 S 0.708 -162 L 0.701 -163 A 0.687 -164 E 0.663 -165 A 0.615 -166 E 0.553 -167 D 0.511 -168 V 0.493 -169 K 0.463 -170 Q 0.426 -171 K 0.449 -172 E 0.543 -173 E 0.645 -174 K 0.711 -175 E 0.746 -176 G 0.763 -177 D 0.770 -178 Q 0.770 -179 L 0.770 -180 I 0.768 -181 V 0.765 -182 P 0.764 -183 S 0.765 -184 E 0.765 -185 P 0.763 -186 T 0.761 -187 K 0.760 -188 S 0.758 -189 P 0.759 -190 E 0.765 -191 S 0.774 -192 V 0.779 -193 T 0.776 -194 L 0.772 -195 T 0.771 -196 K 0.770 -197 T 0.769 -198 E 0.767 -199 N 0.764 -200 I 0.762 -201 P 0.766 -202 V 0.776 -203 C 0.787 -204 K 0.793 -205 A 0.796 -206 G 0.795 -207 V 0.789 -208 K 0.779 -209 L 0.769 -210 K 0.769 -211 P 0.778 -212 Q 0.788 -213 E 0.793 -214 E 0.791 -215 E 0.781 -216 Q 0.762 -217 S 0.741 -218 K 0.731 -219 P 0.737 -220 P 0.756 -221 A 0.774 -222 R 0.780 -223 G 0.768 -224 A 0.742 -225 K 0.711 -226 T 0.681 -227 L 0.654 -228 S 0.627 -229 S 0.595 -230 F 0.569 -231 F 0.564 -232 T 0.586 -233 P 0.622 -234 R 0.657 -235 K 0.688 -236 P 0.715 -237 A 0.736 -238 V 0.745 -239 K 0.745 -240 T 0.744 -241 E 0.744 -242 V 0.743 -243 K 0.740 -244 Q 0.742 -245 E 0.749 -246 E 0.755 -247 S 0.755 -248 G 0.746 -249 T 0.728 -250 L 0.706 -251 R 0.689 -252 K 0.678 -253 E 0.667 -254 E 0.647 -255 T 0.617 -256 K 0.573 -257 G 0.511 -258 T 0.426 -259 L 0.327 -260 D 0.234 -261 P 0.168 -262 A 0.134 -263 N 0.124 -264 Y 0.121 -265 N 0.114 -266 P 0.105 -267 S 0.104 -268 K 0.113 -269 N 0.124 -270 N 0.124 -271 Y 0.110 -272 H 0.089 -273 P 0.077 -274 I 0.079 -275 E 0.089 -276 D 0.096 -277 A 0.097 -278 C 0.096 -279 W 0.093 -280 K 0.088 -281 H 0.086 -282 G 0.092 -283 Q 0.101 -284 K 0.099 -285 V 0.083 -286 P 0.060 -287 F 0.041 -288 L 0.033 -289 A 0.031 -290 V 0.029 -291 A 0.026 -292 R 0.024 -293 T 0.022 -294 F 0.024 -295 E 0.031 -296 K 0.040 -297 I 0.047 -298 E 0.053 -299 E 0.060 -300 V 0.070 -301 S 0.081 -302 A 0.092 -303 R 0.099 -304 L 0.101 -305 K 0.100 -306 M 0.097 -307 V 0.096 -308 E 0.094 -309 T 0.091 -310 L 0.083 -311 S 0.072 -312 N 0.062 -313 L 0.053 -314 L 0.044 -315 R 0.039 -316 S 0.036 -317 V 0.034 -318 V 0.035 -319 A 0.042 -320 L 0.048 -321 S 0.048 -322 P 0.043 -323 P 0.039 -324 D 0.039 -325 L 0.039 -326 L 0.040 -327 P 0.043 -328 V 0.049 -329 L 0.053 -330 Y 0.055 -331 L 0.055 -332 S 0.059 -333 L 0.065 -334 N 0.076 -335 R 0.087 -336 L 0.094 -337 G 0.095 -338 P 0.096 -339 P 0.108 -340 Q 0.134 -341 Q 0.166 -342 G 0.192 -343 L 0.206 -344 E 0.207 -345 L 0.198 -346 G 0.181 -347 V 0.161 -348 G 0.135 -349 D 0.107 -350 G 0.089 -351 V 0.082 -352 L 0.077 -353 L 0.069 -354 K 0.064 -355 A 0.068 -356 V 0.078 -357 A 0.086 -358 Q 0.094 -359 A 0.100 -360 T 0.099 -361 G 0.087 -362 R 0.069 -363 Q 0.052 -364 L 0.041 -365 E 0.036 -366 S 0.037 -367 I 0.045 -368 R 0.055 -369 A 0.061 -370 E 0.059 -371 V 0.054 -372 A 0.055 -373 E 0.060 -374 K 0.069 -375 G 0.079 -376 D 0.084 -377 V 0.080 -378 G 0.072 -379 L 0.067 -380 V 0.065 -381 A 0.065 -382 E 0.072 -383 N 0.087 -384 S 0.109 -385 R 0.140 -386 S 0.183 -387 T 0.229 -388 Q 0.258 -389 R 0.259 -390 L 0.245 -391 M 0.236 -392 L 0.238 -393 P 0.235 -394 P 0.211 -395 P 0.166 -396 P 0.117 -397 L 0.079 -398 T 0.056 -399 I 0.047 -400 S 0.046 -401 G 0.048 -402 V 0.050 -403 F 0.050 -404 T 0.046 -405 K 0.046 -406 F 0.054 -407 C 0.068 -408 D 0.084 -409 I 0.096 -410 A 0.106 -411 R 0.118 -412 L 0.136 -413 T 0.155 -414 G 0.171 -415 S 0.182 -416 A 0.184 -417 S 0.172 -418 M 0.145 -419 A 0.113 -420 K 0.091 -421 K 0.080 -422 M 0.078 -423 D 0.083 -424 I 0.086 -425 I 0.084 -426 K 0.079 -427 G 0.077 -428 L 0.075 -429 F 0.074 -430 V 0.079 -431 A 0.090 -432 C 0.105 -433 R 0.116 -434 H 0.118 -435 S 0.109 -436 E 0.092 -437 A 0.073 -438 R 0.059 -439 Y 0.053 -440 I 0.053 -441 A 0.056 -442 R 0.061 -443 S 0.068 -444 L 0.079 -445 S 0.092 -446 G 0.109 -447 R 0.126 -448 L 0.135 -449 R 0.129 -450 L 0.118 -451 G 0.110 -452 L 0.104 -453 A 0.097 -454 E 0.090 -455 Q 0.084 -456 S 0.079 -457 V 0.076 -458 L 0.074 -459 A 0.075 -460 A 0.076 -461 L 0.077 -462 A 0.077 -463 Q 0.078 -464 A 0.080 -465 V 0.084 -466 S 0.095 -467 L 0.110 -468 T 0.124 -469 P 0.136 -470 P 0.147 -471 G 0.149 -472 Q 0.139 -473 E 0.122 -474 F 0.108 -475 P 0.105 -476 T 0.113 -477 A 0.129 -478 V 0.150 -479 V 0.173 -480 D 0.192 -481 A 0.199 -482 G 0.191 -483 K 0.177 -484 G 0.162 -485 K 0.148 -486 T 0.134 -487 A 0.123 -488 E 0.116 -489 A 0.111 -490 R 0.102 -491 K 0.093 -492 M 0.090 -493 W 0.090 -494 L 0.085 -495 E 0.075 -496 E 0.068 -497 Q 0.066 -498 G 0.066 -499 M 0.070 -500 I 0.080 -501 L 0.089 -502 K 0.095 -503 Q 0.098 -504 T 0.095 -505 F 0.086 -506 C 0.078 -507 E 0.075 -508 V 0.073 -509 P 0.067 -510 D 0.059 -511 L 0.052 -512 D 0.045 -513 R 0.042 -514 I 0.041 -515 I 0.039 -516 P 0.037 -517 V 0.037 -518 L 0.038 -519 L 0.037 -520 E 0.036 -521 H 0.035 -522 G 0.035 -523 L 0.036 -524 E 0.038 -525 R 0.043 -526 L 0.051 -527 P 0.061 -528 E 0.072 -529 H 0.085 -530 C 0.098 -531 K 0.112 -532 L 0.125 -533 S 0.133 -534 P 0.133 -535 G 0.133 -536 V 0.137 -537 P 0.136 -538 L 0.127 -539 K 0.110 -540 P 0.094 -541 M 0.081 -542 L 0.073 -543 A 0.073 -544 H 0.082 -545 P 0.094 -546 T 0.104 -547 R 0.109 -548 G 0.106 -549 V 0.095 -550 S 0.081 -551 E 0.071 -552 V 0.070 -553 L 0.075 -554 K 0.080 -555 R 0.077 -556 F 0.071 -557 E 0.066 -558 E 0.063 -559 V 0.058 -560 D 0.053 -561 F 0.050 -562 T 0.048 -563 C 0.045 -564 E 0.038 -565 Y 0.033 -566 K 0.032 -567 Y 0.037 -568 D 0.044 -569 G 0.052 -570 Q 0.057 -571 R 0.055 -572 A 0.048 -573 Q 0.040 -574 I 0.035 -575 H 0.035 -576 V 0.043 -577 L 0.062 -578 E 0.089 -579 G 0.113 -580 G 0.121 -581 E 0.110 -582 V 0.085 -583 K 0.060 -584 I 0.044 -585 F 0.040 -586 S 0.046 -587 R 0.058 -588 N 0.072 -589 Q 0.087 -590 E 0.098 -591 D 0.101 -592 N 0.097 -593 T 0.092 -594 G 0.088 -595 K 0.080 -596 Y 0.071 -597 P 0.061 -598 D 0.050 -599 I 0.041 -600 I 0.035 -601 S 0.033 -602 R 0.034 -603 I 0.035 -604 P 0.036 -605 K 0.039 -606 I 0.044 -607 K 0.049 -608 H 0.056 -609 P 0.063 -610 S 0.067 -611 V 0.067 -612 T 0.064 -613 S 0.059 -614 F 0.057 -615 I 0.057 -616 L 0.057 -617 D 0.057 -618 T 0.058 -619 E 0.060 -620 A 0.062 -621 V 0.064 -622 A 0.064 -623 W 0.059 -624 D 0.052 -625 R 0.051 -626 E 0.055 -627 K 0.066 -628 K 0.081 -629 Q 0.094 -630 I 0.095 -631 Q 0.086 -632 P 0.077 -633 F 0.078 -634 Q 0.093 -635 V 0.113 -636 L 0.127 -637 T 0.131 -638 T 0.140 -639 R 0.156 -640 K 0.175 -641 R 0.194 -642 K 0.218 -643 E 0.247 -644 V 0.271 -645 D 0.278 -646 A 0.261 -647 S 0.234 -648 E 0.216 -649 I 0.208 -650 Q 0.202 -651 V 0.190 -652 Q 0.165 -653 V 0.128 -654 C 0.091 -655 L 0.063 -656 Y 0.045 -657 A 0.035 -658 F 0.030 -659 D 0.027 -660 L 0.027 -661 I 0.030 -662 Y 0.036 -663 L 0.046 -664 N 0.060 -665 G 0.075 -666 E 0.091 -667 S 0.101 -668 L 0.097 -669 V 0.079 -670 R 0.062 -671 Q 0.054 -672 P 0.051 -673 L 0.048 -674 S 0.045 -675 R 0.046 -676 R 0.053 -677 R 0.065 -678 Q 0.072 -679 L 0.069 -680 L 0.062 -681 R 0.056 -682 E 0.054 -683 N 0.052 -684 F 0.053 -685 V 0.060 -686 E 0.075 -687 T 0.088 -688 E 0.091 -689 G 0.080 -690 E 0.066 -691 F 0.058 -692 V 0.057 -693 F 0.055 -694 T 0.051 -695 T 0.045 -696 S 0.042 -697 L 0.041 -698 D 0.041 -699 T 0.045 -700 K 0.049 -701 D 0.053 -702 T 0.052 -703 E 0.051 -704 Q 0.053 -705 I 0.062 -706 A 0.075 -707 E 0.081 -708 F 0.076 -709 L 0.067 -710 E 0.059 -711 Q 0.054 -712 S 0.053 -713 V 0.056 -714 K 0.062 -715 D 0.073 -716 S 0.084 -717 C 0.093 -718 E 0.099 -719 G 0.106 -720 L 0.116 -721 M 0.123 -722 V 0.122 -723 K 0.114 -724 T 0.111 -725 L 0.120 -726 D 0.132 -727 V 0.138 -728 D 0.134 -729 A 0.125 -730 T 0.117 -731 Y 0.116 -732 E 0.122 -733 I 0.133 -734 A 0.146 -735 K 0.162 -736 R 0.173 -737 S 0.176 -738 H 0.168 -739 N 0.154 -740 W 0.137 -741 L 0.124 -742 K 0.122 -743 L 0.126 -744 K 0.133 -745 K 0.134 -746 D 0.132 -747 Y 0.140 -748 L 0.171 -749 D 0.230 -750 G 0.295 -751 V 0.330 -752 G 0.310 -753 D 0.250 -754 T 0.182 -755 L 0.132 -756 D 0.103 -757 L 0.088 -758 V 0.081 -759 V 0.079 -760 I 0.085 -761 G 0.096 -762 A 0.112 -763 Y 0.126 -764 L 0.135 -765 G 0.134 -766 R 0.131 -767 G 0.136 -768 K 0.150 -769 R 0.166 -770 A 0.178 -771 G 0.183 -772 R 0.178 -773 Y 0.163 -774 G 0.140 -775 G 0.114 -776 F 0.090 -777 L 0.074 -778 L 0.068 -779 A 0.073 -780 A 0.082 -781 Y 0.087 -782 D 0.089 -783 E 0.093 -784 E 0.102 -785 S 0.115 -786 E 0.126 -787 E 0.125 -788 L 0.108 -789 Q 0.084 -790 A 0.064 -791 I 0.052 -792 C 0.051 -793 K 0.061 -794 L 0.076 -795 G 0.088 -796 T 0.094 -797 G 0.096 -798 F 0.098 -799 S 0.100 -800 D 0.101 -801 E 0.098 -802 E 0.089 -803 L 0.078 -804 E 0.068 -805 E 0.063 -806 H 0.066 -807 H 0.078 -808 Q 0.089 -809 S 0.093 -810 L 0.088 -811 Q 0.080 -812 A 0.075 -813 L 0.079 -814 V 0.090 -815 L 0.106 -816 P 0.123 -817 T 0.138 -818 P 0.140 -819 R 0.128 -820 P 0.106 -821 Y 0.088 -822 V 0.081 -823 R 0.086 -824 I 0.101 -825 D 0.122 -826 G 0.141 -827 A 0.146 -828 V 0.139 -829 A 0.124 -830 P 0.107 -831 D 0.094 -832 H 0.092 -833 W 0.102 -834 L 0.119 -835 D 0.135 -836 P 0.145 -837 S 0.145 -838 I 0.138 -839 V 0.129 -840 W 0.124 -841 E 0.125 -842 V 0.126 -843 K 0.128 -844 C 0.134 -845 A 0.149 -846 D 0.169 -847 L 0.189 -848 S 0.201 -849 L 0.198 -850 S 0.177 -851 P 0.147 -852 I 0.123 -853 Y 0.115 -854 P 0.121 -855 A 0.131 -856 A 0.140 -857 R 0.149 -858 G 0.155 -859 L 0.154 -860 V 0.149 -861 D 0.149 -862 K 0.157 -863 E 0.171 -864 K 0.183 -865 G 0.184 -866 I 0.170 -867 S 0.145 -868 L 0.122 -869 R 0.112 -870 F 0.113 -871 P 0.112 -872 R 0.100 -873 F 0.083 -874 I 0.075 -875 R 0.081 -876 V 0.094 -877 R 0.107 -878 K 0.115 -879 D 0.119 -880 K 0.121 -881 Q 0.119 -882 P 0.118 -883 E 0.124 -884 Q 0.137 -885 A 0.145 -886 T 0.140 -887 T 0.123 -888 S 0.107 -889 N 0.098 -890 Q 0.093 -891 V 0.085 -892 A 0.076 -893 S 0.072 -894 L 0.071 -895 Y 0.073 -896 R 0.081 -897 K 0.101 -898 Q 0.140 -899 S 0.194 -900 Q 0.256 -901 I 0.321 -902 Q 0.388 -903 N 0.448 -904 Q 0.496 -905 Q 0.535 -906 S 0.568 -907 S 0.590 -908 D 0.598 -909 L 0.594 -910 D 0.581 -911 S 0.562 -912 D 0.538 -913 V 0.511 -914 E 0.477 -915 D 0.436 -916 Y 0.405 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000056394.21_ENSMUST00000177588.10_GN:Lig1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000056394.21_ENSMUST00000177588.10_GN:Lig1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid deleted file mode 100644 index 8af831d51a234898d3df3286aead85f3f7a17e25..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000056394.21_ENSMUST00000177588.10_GN:Lig1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid +++ /dev/null @@ -1,933 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000056394.21|ENSMUST00000177588.10|GN:Lig1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:16 -1 M 0.292 -2 R 0.296 -3 K 0.304 -4 K 0.312 -5 E 0.318 -6 Q 0.328 -7 E 0.351 -8 R 0.393 -9 K 0.439 -10 G 0.472 -11 E 0.490 -12 T 0.500 -13 S 0.503 -14 A 0.492 -15 A 0.475 -16 N 0.450 -17 M 0.408 -18 Q 0.361 -19 R 0.330 -20 S 0.312 -21 I 0.294 -22 M 0.279 -23 S 0.279 -24 F 0.300 -25 F 0.344 -26 Q 0.413 -27 P 0.497 -28 T 0.573 -29 K 0.623 -30 E 0.653 -31 G 0.668 -32 K 0.669 -33 A 0.658 -34 K 0.643 -35 K 0.625 -36 P 0.592 -37 E 0.543 -38 K 0.514 -39 E 0.537 -40 T 0.592 -41 P 0.642 -42 S 0.674 -43 S 0.684 -44 I 0.675 -45 R 0.655 -46 E 0.633 -47 K 0.604 -48 E 0.574 -49 P 0.557 -50 P 0.552 -51 P 0.547 -52 K 0.554 -53 V 0.587 -54 A 0.607 -55 L 0.591 -56 K 0.583 -57 E 0.626 -58 R 0.688 -59 N 0.726 -60 Q 0.735 -61 V 0.733 -62 V 0.730 -63 P 0.732 -64 E 0.738 -65 S 0.739 -66 D 0.731 -67 S 0.726 -68 P 0.736 -69 V 0.755 -70 K 0.767 -71 R 0.756 -72 T 0.713 -73 G 0.651 -74 R 0.617 -75 K 0.633 -76 V 0.648 -77 A 0.624 -78 Q 0.602 -79 V 0.628 -80 L 0.683 -81 S 0.726 -82 C 0.752 -83 E 0.768 -84 G 0.776 -85 E 0.776 -86 D 0.772 -87 E 0.764 -88 D 0.751 -89 E 0.738 -90 A 0.730 -91 P 0.725 -92 G 0.709 -93 T 0.667 -94 P 0.610 -95 K 0.582 -96 V 0.613 -97 Q 0.674 -98 K 0.724 -99 P 0.757 -100 V 0.782 -101 S 0.799 -102 D 0.804 -103 S 0.796 -104 E 0.779 -105 Q 0.757 -106 S 0.738 -107 S 0.726 -108 P 0.726 -109 P 0.738 -110 S 0.755 -111 P 0.770 -112 D 0.777 -113 T 0.774 -114 C 0.767 -115 P 0.762 -116 E 0.762 -117 N 0.762 -118 S 0.761 -119 P 0.762 -120 V 0.766 -121 F 0.771 -122 N 0.767 -123 C 0.758 -124 S 0.757 -125 S 0.772 -126 P 0.792 -127 M 0.800 -128 D 0.787 -129 I 0.758 -130 S 0.726 -131 P 0.701 -132 S 0.686 -133 G 0.679 -134 F 0.683 -135 P 0.700 -136 K 0.720 -137 R 0.727 -138 R 0.726 -139 T 0.727 -140 A 0.733 -141 R 0.735 -142 K 0.727 -143 Q 0.717 -144 L 0.713 -145 P 0.708 -146 K 0.683 -147 R 0.628 -148 T 0.553 -149 I 0.495 -150 Q 0.497 -151 D 0.553 -152 T 0.603 -153 L 0.616 -154 E 0.619 -155 E 0.639 -156 Q 0.663 -157 N 0.678 -158 E 0.685 -159 D 0.689 -160 K 0.687 -161 T 0.676 -162 K 0.653 -163 T 0.613 -164 A 0.560 -165 K 0.529 -166 K 0.539 -167 R 0.552 -168 K 0.535 -169 K 0.525 -170 E 0.557 -171 E 0.602 -172 E 0.629 -173 T 0.645 -174 P 0.666 -175 K 0.693 -176 E 0.712 -177 S 0.716 -178 L 0.707 -179 A 0.693 -180 E 0.670 -181 A 0.624 -182 E 0.564 -183 D 0.523 -184 V 0.507 -185 K 0.477 -186 Q 0.440 -187 K 0.460 -188 E 0.553 -189 E 0.655 -190 K 0.721 -191 E 0.754 -192 G 0.770 -193 D 0.777 -194 Q 0.779 -195 L 0.779 -196 I 0.778 -197 V 0.775 -198 P 0.774 -199 S 0.775 -200 E 0.774 -201 P 0.772 -202 T 0.768 -203 K 0.765 -204 S 0.762 -205 P 0.761 -206 E 0.765 -207 S 0.775 -208 V 0.781 -209 T 0.779 -210 L 0.775 -211 T 0.773 -212 K 0.774 -213 T 0.773 -214 E 0.771 -215 N 0.768 -216 I 0.765 -217 P 0.768 -218 V 0.777 -219 C 0.788 -220 K 0.795 -221 A 0.798 -222 G 0.798 -223 V 0.792 -224 K 0.782 -225 L 0.773 -226 K 0.774 -227 P 0.783 -228 Q 0.794 -229 E 0.798 -230 E 0.795 -231 E 0.785 -232 Q 0.768 -233 S 0.749 -234 K 0.740 -235 P 0.747 -236 P 0.764 -237 A 0.781 -238 R 0.786 -239 G 0.774 -240 A 0.750 -241 K 0.720 -242 T 0.689 -243 L 0.661 -244 S 0.631 -245 S 0.597 -246 F 0.567 -247 F 0.561 -248 T 0.584 -249 P 0.622 -250 R 0.659 -251 K 0.690 -252 P 0.718 -253 A 0.738 -254 V 0.748 -255 K 0.748 -256 T 0.746 -257 E 0.746 -258 V 0.744 -259 K 0.742 -260 Q 0.744 -261 E 0.750 -262 E 0.755 -263 S 0.755 -264 G 0.746 -265 T 0.728 -266 L 0.706 -267 R 0.689 -268 K 0.678 -269 E 0.668 -270 E 0.648 -271 T 0.616 -272 K 0.572 -273 G 0.510 -274 T 0.426 -275 L 0.327 -276 D 0.234 -277 P 0.168 -278 A 0.135 -279 N 0.126 -280 Y 0.123 -281 N 0.116 -282 P 0.107 -283 S 0.106 -284 K 0.116 -285 N 0.128 -286 N 0.127 -287 Y 0.112 -288 H 0.091 -289 P 0.078 -290 I 0.080 -291 E 0.090 -292 D 0.098 -293 A 0.098 -294 C 0.097 -295 W 0.094 -296 K 0.089 -297 H 0.087 -298 G 0.094 -299 Q 0.102 -300 K 0.101 -301 V 0.084 -302 P 0.060 -303 F 0.042 -304 L 0.033 -305 A 0.031 -306 V 0.030 -307 A 0.027 -308 R 0.024 -309 T 0.023 -310 F 0.025 -311 E 0.032 -312 K 0.041 -313 I 0.048 -314 E 0.054 -315 E 0.061 -316 V 0.071 -317 S 0.082 -318 A 0.093 -319 R 0.100 -320 L 0.102 -321 K 0.101 -322 M 0.098 -323 V 0.097 -324 E 0.096 -325 T 0.093 -326 L 0.084 -327 S 0.073 -328 N 0.064 -329 L 0.054 -330 L 0.046 -331 R 0.040 -332 S 0.037 -333 V 0.035 -334 V 0.036 -335 A 0.042 -336 L 0.049 -337 S 0.049 -338 P 0.044 -339 P 0.040 -340 D 0.039 -341 L 0.039 -342 L 0.040 -343 P 0.044 -344 V 0.050 -345 L 0.055 -346 Y 0.056 -347 L 0.056 -348 S 0.059 -349 L 0.066 -350 N 0.076 -351 R 0.087 -352 L 0.094 -353 G 0.095 -354 P 0.096 -355 P 0.108 -356 Q 0.134 -357 Q 0.166 -358 G 0.192 -359 L 0.206 -360 E 0.208 -361 L 0.198 -362 G 0.182 -363 V 0.162 -364 G 0.136 -365 D 0.108 -366 G 0.090 -367 V 0.083 -368 L 0.078 -369 L 0.070 -370 K 0.065 -371 A 0.069 -372 V 0.079 -373 A 0.087 -374 Q 0.095 -375 A 0.101 -376 T 0.100 -377 G 0.087 -378 R 0.069 -379 Q 0.053 -380 L 0.041 -381 E 0.036 -382 S 0.038 -383 I 0.046 -384 R 0.057 -385 A 0.063 -386 E 0.061 -387 V 0.055 -388 A 0.055 -389 E 0.060 -390 K 0.069 -391 G 0.079 -392 D 0.084 -393 V 0.081 -394 G 0.073 -395 L 0.068 -396 V 0.066 -397 A 0.066 -398 E 0.072 -399 N 0.087 -400 S 0.110 -401 R 0.141 -402 S 0.184 -403 T 0.231 -404 Q 0.260 -405 R 0.261 -406 L 0.246 -407 M 0.237 -408 L 0.239 -409 P 0.236 -410 P 0.211 -411 P 0.167 -412 P 0.118 -413 L 0.079 -414 T 0.056 -415 I 0.047 -416 S 0.046 -417 G 0.048 -418 V 0.051 -419 F 0.050 -420 T 0.047 -421 K 0.047 -422 F 0.055 -423 C 0.069 -424 D 0.085 -425 I 0.097 -426 A 0.107 -427 R 0.119 -428 L 0.137 -429 T 0.155 -430 G 0.172 -431 S 0.184 -432 A 0.186 -433 S 0.174 -434 M 0.146 -435 A 0.114 -436 K 0.092 -437 K 0.081 -438 M 0.079 -439 D 0.084 -440 I 0.087 -441 I 0.085 -442 K 0.081 -443 G 0.078 -444 L 0.076 -445 F 0.075 -446 V 0.080 -447 A 0.092 -448 C 0.106 -449 R 0.117 -450 H 0.119 -451 S 0.110 -452 E 0.093 -453 A 0.075 -454 R 0.060 -455 Y 0.054 -456 I 0.054 -457 A 0.058 -458 R 0.062 -459 S 0.069 -460 L 0.080 -461 S 0.093 -462 G 0.110 -463 R 0.127 -464 L 0.136 -465 R 0.130 -466 L 0.118 -467 G 0.110 -468 L 0.105 -469 A 0.098 -470 E 0.091 -471 Q 0.085 -472 S 0.080 -473 V 0.076 -474 L 0.075 -475 A 0.075 -476 A 0.077 -477 L 0.077 -478 A 0.077 -479 Q 0.078 -480 A 0.080 -481 V 0.084 -482 S 0.096 -483 L 0.111 -484 T 0.125 -485 P 0.137 -486 P 0.148 -487 G 0.151 -488 Q 0.141 -489 E 0.123 -490 F 0.110 -491 P 0.107 -492 T 0.115 -493 A 0.130 -494 V 0.151 -495 V 0.174 -496 D 0.194 -497 A 0.200 -498 G 0.193 -499 K 0.178 -500 G 0.163 -501 K 0.148 -502 T 0.135 -503 A 0.124 -504 E 0.117 -505 A 0.112 -506 R 0.104 -507 K 0.094 -508 M 0.091 -509 W 0.091 -510 L 0.086 -511 E 0.076 -512 E 0.069 -513 Q 0.067 -514 G 0.067 -515 M 0.071 -516 I 0.080 -517 L 0.090 -518 K 0.096 -519 Q 0.099 -520 T 0.096 -521 F 0.087 -522 C 0.079 -523 E 0.076 -524 V 0.074 -525 P 0.068 -526 D 0.060 -527 L 0.052 -528 D 0.046 -529 R 0.042 -530 I 0.041 -531 I 0.039 -532 P 0.037 -533 V 0.037 -534 L 0.038 -535 L 0.037 -536 E 0.036 -537 H 0.035 -538 G 0.035 -539 L 0.036 -540 E 0.038 -541 R 0.043 -542 L 0.051 -543 P 0.061 -544 E 0.072 -545 H 0.085 -546 C 0.099 -547 K 0.112 -548 L 0.126 -549 S 0.133 -550 P 0.133 -551 G 0.133 -552 V 0.137 -553 P 0.137 -554 L 0.127 -555 K 0.110 -556 P 0.094 -557 M 0.080 -558 L 0.072 -559 A 0.073 -560 H 0.081 -561 P 0.093 -562 T 0.103 -563 R 0.108 -564 G 0.106 -565 V 0.095 -566 S 0.081 -567 E 0.071 -568 V 0.070 -569 L 0.076 -570 K 0.080 -571 R 0.078 -572 F 0.071 -573 E 0.066 -574 E 0.063 -575 V 0.058 -576 D 0.053 -577 F 0.050 -578 T 0.048 -579 C 0.045 -580 E 0.039 -581 Y 0.033 -582 K 0.033 -583 Y 0.037 -584 D 0.045 -585 G 0.053 -586 Q 0.057 -587 R 0.055 -588 A 0.048 -589 Q 0.040 -590 I 0.035 -591 H 0.035 -592 V 0.043 -593 L 0.062 -594 E 0.089 -595 G 0.113 -596 G 0.121 -597 E 0.110 -598 V 0.085 -599 K 0.060 -600 I 0.044 -601 F 0.040 -602 S 0.046 -603 R 0.058 -604 N 0.072 -605 Q 0.087 -606 E 0.099 -607 D 0.101 -608 N 0.097 -609 T 0.093 -610 G 0.088 -611 K 0.081 -612 Y 0.072 -613 P 0.062 -614 D 0.051 -615 I 0.041 -616 I 0.035 -617 S 0.033 -618 R 0.034 -619 I 0.035 -620 P 0.036 -621 K 0.040 -622 I 0.044 -623 K 0.049 -624 H 0.056 -625 P 0.063 -626 S 0.068 -627 V 0.068 -628 T 0.064 -629 S 0.060 -630 F 0.058 -631 I 0.057 -632 L 0.057 -633 D 0.058 -634 T 0.059 -635 E 0.060 -636 A 0.062 -637 V 0.065 -638 A 0.064 -639 W 0.059 -640 D 0.053 -641 R 0.051 -642 E 0.055 -643 K 0.066 -644 K 0.082 -645 Q 0.094 -646 I 0.096 -647 Q 0.087 -648 P 0.078 -649 F 0.079 -650 Q 0.094 -651 V 0.114 -652 L 0.128 -653 T 0.133 -654 T 0.141 -655 R 0.158 -656 K 0.177 -657 R 0.196 -658 K 0.220 -659 E 0.248 -660 V 0.273 -661 D 0.279 -662 A 0.262 -663 S 0.235 -664 E 0.217 -665 I 0.209 -666 Q 0.203 -667 V 0.190 -668 Q 0.165 -669 V 0.129 -670 C 0.092 -671 L 0.064 -672 Y 0.046 -673 A 0.035 -674 F 0.030 -675 D 0.027 -676 L 0.027 -677 I 0.030 -678 Y 0.036 -679 L 0.046 -680 N 0.060 -681 G 0.075 -682 E 0.091 -683 S 0.101 -684 L 0.097 -685 V 0.080 -686 R 0.063 -687 Q 0.055 -688 P 0.052 -689 L 0.049 -690 S 0.045 -691 R 0.046 -692 R 0.054 -693 R 0.065 -694 Q 0.072 -695 L 0.070 -696 L 0.062 -697 R 0.057 -698 E 0.054 -699 N 0.052 -700 F 0.053 -701 V 0.061 -702 E 0.075 -703 T 0.089 -704 E 0.092 -705 G 0.081 -706 E 0.067 -707 F 0.058 -708 V 0.057 -709 F 0.056 -710 T 0.051 -711 T 0.045 -712 S 0.042 -713 L 0.041 -714 D 0.042 -715 T 0.045 -716 K 0.050 -717 D 0.053 -718 T 0.053 -719 E 0.051 -720 Q 0.053 -721 I 0.063 -722 A 0.075 -723 E 0.081 -724 F 0.076 -725 L 0.067 -726 E 0.059 -727 Q 0.054 -728 S 0.053 -729 V 0.056 -730 K 0.062 -731 D 0.073 -732 S 0.084 -733 C 0.093 -734 E 0.100 -735 G 0.106 -736 L 0.116 -737 M 0.124 -738 V 0.122 -739 K 0.114 -740 T 0.111 -741 L 0.119 -742 D 0.132 -743 V 0.138 -744 D 0.134 -745 A 0.125 -746 T 0.118 -747 Y 0.117 -748 E 0.123 -749 I 0.134 -750 A 0.147 -751 K 0.163 -752 R 0.174 -753 S 0.176 -754 H 0.169 -755 N 0.155 -756 W 0.138 -757 L 0.126 -758 K 0.123 -759 L 0.128 -760 K 0.134 -761 K 0.135 -762 D 0.133 -763 Y 0.141 -764 L 0.173 -765 D 0.232 -766 G 0.299 -767 V 0.333 -768 G 0.312 -769 D 0.250 -770 T 0.182 -771 L 0.132 -772 D 0.103 -773 L 0.088 -774 V 0.081 -775 V 0.079 -776 I 0.085 -777 G 0.097 -778 A 0.112 -779 Y 0.127 -780 L 0.135 -781 G 0.135 -782 R 0.133 -783 G 0.138 -784 K 0.151 -785 R 0.167 -786 A 0.179 -787 G 0.183 -788 R 0.179 -789 Y 0.163 -790 G 0.140 -791 G 0.114 -792 F 0.091 -793 L 0.074 -794 L 0.068 -795 A 0.073 -796 A 0.082 -797 Y 0.087 -798 D 0.089 -799 E 0.093 -800 E 0.102 -801 S 0.115 -802 E 0.126 -803 E 0.125 -804 L 0.108 -805 Q 0.085 -806 A 0.064 -807 I 0.052 -808 C 0.051 -809 K 0.061 -810 L 0.075 -811 G 0.088 -812 T 0.094 -813 G 0.096 -814 F 0.098 -815 S 0.100 -816 D 0.101 -817 E 0.098 -818 E 0.089 -819 L 0.078 -820 E 0.068 -821 E 0.063 -822 H 0.066 -823 H 0.078 -824 Q 0.089 -825 S 0.093 -826 L 0.088 -827 Q 0.080 -828 A 0.075 -829 L 0.078 -830 V 0.090 -831 L 0.105 -832 P 0.123 -833 T 0.137 -834 P 0.140 -835 R 0.128 -836 P 0.106 -837 Y 0.088 -838 V 0.081 -839 R 0.086 -840 I 0.100 -841 D 0.121 -842 G 0.140 -843 A 0.146 -844 V 0.139 -845 A 0.125 -846 P 0.107 -847 D 0.094 -848 H 0.092 -849 W 0.102 -850 L 0.119 -851 D 0.135 -852 P 0.145 -853 S 0.145 -854 I 0.138 -855 V 0.129 -856 W 0.124 -857 E 0.125 -858 V 0.126 -859 K 0.128 -860 C 0.134 -861 A 0.148 -862 D 0.168 -863 L 0.189 -864 S 0.201 -865 L 0.197 -866 S 0.177 -867 P 0.147 -868 I 0.123 -869 Y 0.115 -870 P 0.121 -871 A 0.131 -872 A 0.141 -873 R 0.149 -874 G 0.155 -875 L 0.154 -876 V 0.150 -877 D 0.149 -878 K 0.157 -879 E 0.170 -880 K 0.183 -881 G 0.184 -882 I 0.170 -883 S 0.145 -884 L 0.122 -885 R 0.112 -886 F 0.113 -887 P 0.112 -888 R 0.100 -889 F 0.082 -890 I 0.075 -891 R 0.081 -892 V 0.094 -893 R 0.107 -894 K 0.116 -895 D 0.120 -896 K 0.121 -897 Q 0.119 -898 P 0.118 -899 E 0.124 -900 Q 0.137 -901 A 0.146 -902 T 0.140 -903 T 0.123 -904 S 0.107 -905 N 0.099 -906 Q 0.095 -907 V 0.091 -908 A 0.089 -909 S 0.088 -910 L 0.084 -911 Y 0.080 -912 R 0.083 -913 K 0.102 -914 Q 0.141 -915 S 0.195 -916 Q 0.257 -917 I 0.321 -918 Q 0.388 -919 N 0.447 -920 Q 0.494 -921 Q 0.533 -922 S 0.566 -923 S 0.589 -924 D 0.598 -925 L 0.594 -926 D 0.581 -927 S 0.562 -928 D 0.538 -929 V 0.510 -930 E 0.475 -931 D 0.434 -932 Y 0.402 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000056426.4_ENSMUST00000070514.4_GN:Nat3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000056426.4_ENSMUST00000070514.4_GN:Nat3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index ecf30c07a67a7e8341af19e1d853a81288ac7c05..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000056426.4_ENSMUST00000070514.4_GN:Nat3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,291 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000056426.4|ENSMUST00000070514.4|GN:Nat3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.122 -2 D 0.096 -3 I 0.065 -4 E 0.044 -5 A 0.037 -6 Y 0.042 -7 F 0.053 -8 E 0.064 -9 R 0.066 -10 I 0.062 -11 G 0.060 -12 Y 0.063 -13 Q 0.070 -14 K 0.081 -15 S 0.092 -16 S 0.097 -17 N 0.092 -18 K 0.078 -19 L 0.064 -20 D 0.061 -21 L 0.067 -22 Q 0.072 -23 T 0.070 -24 L 0.064 -25 T 0.060 -26 E 0.061 -27 I 0.068 -28 L 0.075 -29 Q 0.078 -30 H 0.076 -31 Q 0.074 -32 I 0.073 -33 R 0.072 -34 A 0.069 -35 I 0.061 -36 P 0.053 -37 F 0.050 -38 E 0.054 -39 N 0.059 -40 L 0.064 -41 N 0.069 -42 I 0.076 -43 H 0.089 -44 C 0.105 -45 G 0.121 -46 K 0.133 -47 T 0.136 -48 M 0.126 -49 E 0.109 -50 L 0.092 -51 S 0.081 -52 L 0.075 -53 E 0.074 -54 D 0.076 -55 T 0.078 -56 F 0.077 -57 H 0.075 -58 Q 0.078 -59 I 0.083 -60 V 0.086 -61 R 0.087 -62 K 0.091 -63 K 0.096 -64 R 0.103 -65 G 0.104 -66 G 0.096 -67 W 0.086 -68 C 0.081 -69 L 0.087 -70 Q 0.095 -71 V 0.097 -72 N 0.089 -73 H 0.079 -74 L 0.070 -75 L 0.062 -76 Y 0.054 -77 W 0.047 -78 A 0.043 -79 L 0.041 -80 A 0.042 -81 M 0.045 -82 I 0.046 -83 G 0.046 -84 F 0.045 -85 E 0.045 -86 T 0.049 -87 T 0.057 -88 M 0.066 -89 L 0.070 -90 G 0.067 -91 G 0.061 -92 C 0.056 -93 V 0.053 -94 Y 0.052 -95 V 0.054 -96 P 0.058 -97 S 0.060 -98 A 0.060 -99 C 0.061 -100 K 0.070 -101 Y 0.082 -102 S 0.093 -103 N 0.100 -104 T 0.104 -105 M 0.101 -106 I 0.090 -107 H 0.073 -108 L 0.054 -109 L 0.038 -110 L 0.029 -111 Q 0.027 -112 V 0.028 -113 T 0.034 -114 I 0.044 -115 S 0.056 -116 G 0.063 -117 K 0.060 -118 T 0.048 -119 Y 0.037 -120 I 0.032 -121 V 0.034 -122 D 0.038 -123 S 0.041 -124 A 0.045 -125 F 0.049 -126 P 0.054 -127 F 0.061 -128 S 0.074 -129 C 0.088 -130 Q 0.094 -131 L 0.089 -132 W 0.083 -133 E 0.076 -134 P 0.067 -135 L 0.056 -136 E 0.049 -137 L 0.052 -138 T 0.062 -139 S 0.075 -140 G 0.080 -141 K 0.077 -142 D 0.070 -143 Q 0.066 -144 P 0.059 -145 Q 0.050 -146 V 0.043 -147 P 0.044 -148 A 0.048 -149 I 0.050 -150 F 0.047 -151 H 0.045 -152 L 0.045 -153 R 0.046 -154 E 0.048 -155 E 0.056 -156 N 0.065 -157 G 0.069 -158 T 0.063 -159 W 0.051 -160 Y 0.041 -161 L 0.038 -162 E 0.040 -163 Q 0.046 -164 T 0.056 -165 K 0.071 -166 R 0.087 -167 Q 0.103 -168 E 0.119 -169 Y 0.135 -170 V 0.153 -171 S 0.169 -172 N 0.181 -173 Q 0.184 -174 E 0.186 -175 F 0.191 -176 I 0.204 -177 D 0.224 -178 S 0.244 -179 N 0.247 -180 F 0.234 -181 L 0.215 -182 E 0.197 -183 K 0.176 -184 N 0.148 -185 T 0.117 -186 H 0.091 -187 R 0.071 -188 K 0.057 -189 I 0.047 -190 Y 0.041 -191 S 0.038 -192 F 0.041 -193 T 0.053 -194 L 0.072 -195 E 0.088 -196 P 0.093 -197 R 0.089 -198 T 0.088 -199 I 0.096 -200 E 0.103 -201 D 0.100 -202 F 0.089 -203 W 0.078 -204 S 0.076 -205 I 0.080 -206 S 0.085 -207 T 0.088 -208 Y 0.089 -209 Y 0.089 -210 Q 0.093 -211 V 0.104 -212 S 0.118 -213 R 0.133 -214 T 0.147 -215 S 0.151 -216 V 0.137 -217 M 0.114 -218 T 0.094 -219 N 0.079 -220 T 0.069 -221 S 0.065 -222 L 0.062 -223 C 0.056 -224 S 0.048 -225 L 0.042 -226 H 0.040 -227 T 0.041 -228 K 0.040 -229 D 0.041 -230 G 0.044 -231 V 0.046 -232 H 0.045 -233 G 0.041 -234 L 0.041 -235 M 0.044 -236 G 0.049 -237 T 0.052 -238 I 0.048 -239 L 0.041 -240 A 0.040 -241 Y 0.046 -242 K 0.057 -243 K 0.066 -244 F 0.071 -245 N 0.076 -246 Y 0.080 -247 K 0.085 -248 D 0.090 -249 N 0.093 -250 I 0.094 -251 D 0.095 -252 L 0.095 -253 V 0.091 -254 E 0.082 -255 F 0.070 -256 K 0.061 -257 T 0.056 -258 L 0.058 -259 K 0.066 -260 E 0.075 -261 E 0.076 -262 E 0.069 -263 I 0.063 -264 E 0.066 -265 E 0.070 -266 V 0.067 -267 L 0.060 -268 K 0.057 -269 S 0.054 -270 V 0.051 -271 F 0.049 -272 G 0.055 -273 I 0.068 -274 H 0.084 -275 L 0.100 -276 E 0.116 -277 T 0.131 -278 K 0.145 -279 L 0.161 -280 V 0.181 -281 P 0.200 -282 K 0.217 -283 C 0.232 -284 G 0.246 -285 N 0.256 -286 V 0.257 -287 F 0.248 -288 F 0.238 -289 T 0.233 -290 I 0.232 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000056426.4_ENSMUST00000070514.4_GN:Nat3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:51.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000056426.4_ENSMUST00000070514.4_GN:Nat3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:51.caid deleted file mode 100644 index 4600dddcfef86f514a8685327e799f091ce53bab..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000056426.4_ENSMUST00000070514.4_GN:Nat3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:51.caid +++ /dev/null @@ -1,342 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000056426.4|ENSMUST00000070514.4|GN:Nat3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:51 -1 M 0.319 -2 N 0.311 -3 K 0.311 -4 R 0.323 -5 C 0.322 -6 R 0.310 -7 R 0.316 -8 A 0.340 -9 T 0.347 -10 R 0.337 -11 V 0.336 -12 A 0.346 -13 V 0.356 -14 L 0.370 -15 Q 0.391 -16 P 0.408 -17 L 0.415 -18 V 0.436 -19 T 0.488 -20 G 0.546 -21 T 0.564 -22 I 0.540 -23 S 0.504 -24 L 0.481 -25 Q 0.480 -26 G 0.498 -27 P 0.522 -28 R 0.536 -29 H 0.531 -30 E 0.514 -31 R 0.516 -32 R 0.557 -33 V 0.605 -34 A 0.620 -35 D 0.607 -36 G 0.582 -37 Q 0.541 -38 A 0.486 -39 V 0.433 -40 A 0.393 -41 V 0.360 -42 R 0.329 -43 R 0.307 -44 L 0.295 -45 E 0.288 -46 R 0.287 -47 T 0.290 -48 Q 0.288 -49 L 0.269 -50 G 0.230 -51 T 0.176 -52 M 0.122 -53 D 0.078 -54 I 0.049 -55 E 0.034 -56 A 0.028 -57 Y 0.025 -58 F 0.026 -59 E 0.029 -60 R 0.035 -61 I 0.042 -62 G 0.048 -63 Y 0.053 -64 Q 0.059 -65 K 0.068 -66 S 0.077 -67 S 0.083 -68 N 0.080 -69 K 0.068 -70 L 0.055 -71 D 0.047 -72 L 0.046 -73 Q 0.048 -74 T 0.049 -75 L 0.049 -76 T 0.050 -77 E 0.053 -78 I 0.060 -79 L 0.067 -80 Q 0.069 -81 H 0.068 -82 Q 0.067 -83 I 0.066 -84 R 0.065 -85 A 0.061 -86 I 0.053 -87 P 0.046 -88 F 0.044 -89 E 0.047 -90 N 0.053 -91 L 0.058 -92 N 0.063 -93 I 0.070 -94 H 0.081 -95 C 0.095 -96 G 0.109 -97 K 0.118 -98 T 0.119 -99 M 0.111 -100 E 0.096 -101 L 0.083 -102 S 0.075 -103 L 0.071 -104 E 0.070 -105 D 0.069 -106 T 0.067 -107 F 0.063 -108 H 0.062 -109 Q 0.066 -110 I 0.071 -111 V 0.074 -112 R 0.076 -113 K 0.080 -114 K 0.087 -115 R 0.095 -116 G 0.097 -117 G 0.091 -118 W 0.081 -119 C 0.077 -120 L 0.082 -121 Q 0.091 -122 V 0.093 -123 N 0.085 -124 H 0.074 -125 L 0.065 -126 L 0.057 -127 Y 0.049 -128 W 0.042 -129 A 0.039 -130 L 0.038 -131 A 0.039 -132 M 0.041 -133 I 0.042 -134 G 0.042 -135 F 0.041 -136 E 0.042 -137 T 0.046 -138 T 0.053 -139 M 0.060 -140 L 0.064 -141 G 0.061 -142 G 0.056 -143 C 0.052 -144 V 0.050 -145 Y 0.049 -146 V 0.051 -147 P 0.054 -148 S 0.058 -149 A 0.059 -150 C 0.063 -151 K 0.073 -152 Y 0.086 -153 S 0.097 -154 N 0.105 -155 T 0.108 -156 M 0.105 -157 I 0.094 -158 H 0.077 -159 L 0.057 -160 L 0.039 -161 L 0.030 -162 Q 0.028 -163 V 0.030 -164 T 0.037 -165 I 0.047 -166 S 0.058 -167 G 0.064 -168 K 0.060 -169 T 0.049 -170 Y 0.037 -171 I 0.032 -172 V 0.033 -173 D 0.037 -174 S 0.040 -175 A 0.044 -176 F 0.047 -177 P 0.051 -178 F 0.058 -179 S 0.071 -180 C 0.085 -181 Q 0.091 -182 L 0.087 -183 W 0.080 -184 E 0.073 -185 P 0.065 -186 L 0.055 -187 E 0.048 -188 L 0.051 -189 T 0.061 -190 S 0.073 -191 G 0.078 -192 K 0.074 -193 D 0.068 -194 Q 0.063 -195 P 0.057 -196 Q 0.049 -197 V 0.042 -198 P 0.042 -199 A 0.046 -200 I 0.047 -201 F 0.045 -202 H 0.044 -203 L 0.044 -204 R 0.045 -205 E 0.047 -206 E 0.053 -207 N 0.061 -208 G 0.065 -209 T 0.061 -210 W 0.050 -211 Y 0.041 -212 L 0.039 -213 E 0.041 -214 Q 0.048 -215 T 0.060 -216 K 0.077 -217 R 0.095 -218 Q 0.112 -219 E 0.129 -220 Y 0.145 -221 V 0.162 -222 S 0.178 -223 N 0.190 -224 Q 0.194 -225 E 0.195 -226 F 0.200 -227 I 0.212 -228 D 0.234 -229 S 0.255 -230 N 0.259 -231 F 0.245 -232 L 0.223 -233 E 0.199 -234 K 0.173 -235 N 0.142 -236 T 0.111 -237 H 0.085 -238 R 0.066 -239 K 0.054 -240 I 0.045 -241 Y 0.040 -242 S 0.038 -243 F 0.041 -244 T 0.053 -245 L 0.072 -246 E 0.087 -247 P 0.091 -248 R 0.088 -249 T 0.087 -250 I 0.094 -251 E 0.102 -252 D 0.099 -253 F 0.088 -254 W 0.077 -255 S 0.074 -256 I 0.077 -257 S 0.082 -258 T 0.086 -259 Y 0.087 -260 Y 0.087 -261 Q 0.090 -262 V 0.101 -263 S 0.115 -264 R 0.131 -265 T 0.145 -266 S 0.150 -267 V 0.138 -268 M 0.117 -269 T 0.098 -270 N 0.084 -271 T 0.074 -272 S 0.070 -273 L 0.067 -274 C 0.060 -275 S 0.050 -276 L 0.044 -277 H 0.042 -278 T 0.041 -279 K 0.040 -280 D 0.041 -281 G 0.045 -282 V 0.048 -283 H 0.046 -284 G 0.043 -285 L 0.043 -286 M 0.046 -287 G 0.052 -288 T 0.054 -289 I 0.049 -290 L 0.043 -291 A 0.042 -292 Y 0.049 -293 K 0.061 -294 K 0.072 -295 F 0.079 -296 N 0.084 -297 Y 0.089 -298 K 0.093 -299 D 0.098 -300 N 0.102 -301 I 0.105 -302 D 0.107 -303 L 0.107 -304 V 0.103 -305 E 0.092 -306 F 0.078 -307 K 0.068 -308 T 0.062 -309 L 0.061 -310 K 0.061 -311 E 0.059 -312 E 0.054 -313 E 0.051 -314 I 0.055 -315 E 0.065 -316 E 0.072 -317 V 0.070 -318 L 0.063 -319 K 0.059 -320 S 0.057 -321 V 0.054 -322 F 0.052 -323 G 0.058 -324 I 0.072 -325 H 0.089 -326 L 0.106 -327 E 0.124 -328 T 0.141 -329 K 0.157 -330 L 0.175 -331 V 0.195 -332 P 0.215 -333 K 0.234 -334 C 0.253 -335 G 0.269 -336 N 0.279 -337 V 0.280 -338 F 0.271 -339 F 0.260 -340 T 0.252 -341 I 0.248 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000057278.9_ENSMUST00000089558.7_GN:Snrpg_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000057278.9_ENSMUST00000089558.7_GN:Snrpg_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 088b9fb0e22e2c8adfd0e0a9bb56427c72aa859f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000057278.9_ENSMUST00000089558.7_GN:Snrpg_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,77 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000057278.9|ENSMUST00000089558.7|GN:Snrpg|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.516 -2 S 0.517 -3 K 0.516 -4 A 0.501 -5 H 0.468 -6 P 0.413 -7 P 0.338 -8 E 0.252 -9 L 0.174 -10 K 0.117 -11 K 0.082 -12 F 0.065 -13 M 0.057 -14 D 0.053 -15 K 0.048 -16 K 0.040 -17 L 0.032 -18 S 0.028 -19 L 0.031 -20 K 0.039 -21 L 0.050 -22 N 0.060 -23 G 0.069 -24 G 0.074 -25 R 0.072 -26 H 0.066 -27 V 0.064 -28 Q 0.067 -29 G 0.068 -30 I 0.062 -31 L 0.056 -32 R 0.056 -33 G 0.064 -34 F 0.074 -35 D 0.080 -36 P 0.076 -37 F 0.064 -38 M 0.052 -39 N 0.045 -40 L 0.042 -41 V 0.041 -42 I 0.039 -43 D 0.036 -44 E 0.035 -45 C 0.036 -46 V 0.044 -47 E 0.060 -48 M 0.083 -49 A 0.107 -50 T 0.129 -51 S 0.145 -52 G 0.151 -53 Q 0.145 -54 Q 0.129 -55 N 0.111 -56 N 0.093 -57 I 0.078 -58 G 0.069 -59 M 0.068 -60 V 0.070 -61 V 0.069 -62 I 0.064 -63 R 0.058 -64 G 0.053 -65 N 0.049 -66 S 0.048 -67 I 0.050 -68 I 0.056 -69 M 0.062 -70 L 0.066 -71 E 0.070 -72 A 0.081 -73 L 0.104 -74 E 0.141 -75 R 0.180 -76 V 0.206 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000057278.9_ENSMUST00000089558.7_GN:Snrpg_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:45.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000057278.9_ENSMUST00000089558.7_GN:Snrpg_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:45.caid deleted file mode 100644 index a78f0d2d7c63f0f328e4077929c68a6739035d9f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000057278.9_ENSMUST00000089558.7_GN:Snrpg_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:45.caid +++ /dev/null @@ -1,122 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000057278.9|ENSMUST00000089558.7|GN:Snrpg|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:45 -1 M 0.468 -2 K 0.479 -3 G 0.487 -4 N 0.481 -5 V 0.458 -6 L 0.423 -7 R 0.389 -8 R 0.384 -9 R 0.412 -10 L 0.438 -11 A 0.447 -12 R 0.470 -13 A 0.529 -14 A 0.594 -15 V 0.636 -16 T 0.656 -17 S 0.661 -18 D 0.658 -19 T 0.650 -20 S 0.640 -21 A 0.628 -22 K 0.611 -23 P 0.589 -24 A 0.563 -25 L 0.535 -26 R 0.509 -27 A 0.488 -28 F 0.472 -29 L 0.467 -30 S 0.471 -31 L 0.477 -32 L 0.488 -33 T 0.514 -34 P 0.550 -35 S 0.590 -36 P 0.624 -37 L 0.647 -38 C 0.661 -39 R 0.670 -40 A 0.682 -41 R 0.697 -42 R 0.714 -43 G 0.732 -44 V 0.742 -45 A 0.740 -46 M 0.724 -47 S 0.695 -48 K 0.651 -49 A 0.590 -50 H 0.518 -51 P 0.442 -52 P 0.360 -53 E 0.272 -54 L 0.189 -55 K 0.126 -56 K 0.087 -57 F 0.066 -58 M 0.056 -59 D 0.051 -60 K 0.046 -61 K 0.038 -62 L 0.030 -63 S 0.027 -64 L 0.030 -65 K 0.038 -66 L 0.048 -67 N 0.058 -68 G 0.066 -69 G 0.070 -70 R 0.068 -71 H 0.063 -72 V 0.063 -73 Q 0.067 -74 G 0.069 -75 I 0.064 -76 L 0.059 -77 R 0.061 -78 G 0.070 -79 F 0.079 -80 D 0.084 -81 P 0.078 -82 F 0.066 -83 M 0.052 -84 N 0.044 -85 L 0.039 -86 V 0.038 -87 I 0.036 -88 D 0.034 -89 E 0.033 -90 C 0.035 -91 V 0.044 -92 E 0.061 -93 M 0.087 -94 A 0.118 -95 T 0.148 -96 S 0.169 -97 G 0.175 -98 Q 0.165 -99 Q 0.141 -100 N 0.114 -101 N 0.091 -102 I 0.075 -103 G 0.067 -104 M 0.066 -105 V 0.069 -106 V 0.068 -107 I 0.063 -108 R 0.056 -109 G 0.051 -110 N 0.048 -111 S 0.048 -112 I 0.052 -113 I 0.061 -114 M 0.069 -115 L 0.075 -116 E 0.080 -117 A 0.093 -118 L 0.121 -119 E 0.165 -120 R 0.212 -121 V 0.242 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000058729.14_ENSMUST00000192561.6_GN:Lin9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000058729.14_ENSMUST00000192561.6_GN:Lin9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 629fba7e5a00ac3c32e7cd47a683f6229dcc9820..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000058729.14_ENSMUST00000192561.6_GN:Lin9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,543 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000058729.14|ENSMUST00000192561.6|GN:Lin9|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.414 -2 A 0.455 -3 E 0.503 -4 L 0.519 -5 D 0.499 -6 Q 0.485 -7 L 0.519 -8 P 0.586 -9 D 0.640 -10 E 0.663 -11 S 0.661 -12 S 0.637 -13 S 0.577 -14 A 0.485 -15 K 0.418 -16 A 0.437 -17 L 0.528 -18 V 0.617 -19 S 0.661 -20 L 0.676 -21 K 0.686 -22 E 0.699 -23 G 0.702 -24 S 0.693 -25 L 0.678 -26 S 0.659 -27 N 0.622 -28 T 0.562 -29 W 0.494 -30 N 0.437 -31 E 0.403 -32 K 0.404 -33 Y 0.441 -34 S 0.497 -35 S 0.546 -36 L 0.568 -37 Q 0.571 -38 K 0.578 -39 T 0.602 -40 P 0.632 -41 V 0.656 -42 W 0.683 -43 K 0.718 -44 G 0.749 -45 R 0.765 -46 N 0.767 -47 A 0.763 -48 G 0.761 -49 P 0.763 -50 A 0.768 -51 V 0.766 -52 E 0.757 -53 M 0.746 -54 P 0.741 -55 F 0.743 -56 R 0.751 -57 N 0.756 -58 S 0.750 -59 K 0.745 -60 R 0.751 -61 S 0.762 -62 R 0.767 -63 L 0.770 -64 F 0.774 -65 S 0.777 -66 D 0.772 -67 E 0.751 -68 D 0.706 -69 D 0.645 -70 R 0.612 -71 Q 0.642 -72 I 0.701 -73 N 0.735 -74 T 0.735 -75 K 0.723 -76 S 0.722 -77 P 0.734 -78 K 0.742 -79 R 0.719 -80 N 0.667 -81 Q 0.636 -82 R 0.667 -83 V 0.726 -84 A 0.758 -85 M 0.755 -86 I 0.742 -87 P 0.743 -88 Q 0.755 -89 K 0.766 -90 F 0.772 -91 T 0.774 -92 A 0.762 -93 T 0.725 -94 M 0.675 -95 S 0.641 -96 T 0.642 -97 P 0.665 -98 D 0.685 -99 K 0.690 -100 K 0.682 -101 A 0.665 -102 S 0.637 -103 Q 0.588 -104 K 0.515 -105 I 0.426 -106 G 0.338 -107 F 0.263 -108 R 0.214 -109 L 0.192 -110 R 0.187 -111 N 0.189 -112 L 0.184 -113 L 0.166 -114 K 0.142 -115 L 0.120 -116 P 0.103 -117 K 0.091 -118 A 0.080 -119 H 0.068 -120 K 0.062 -121 W 0.068 -122 C 0.078 -123 I 0.079 -124 Y 0.072 -125 E 0.066 -126 W 0.062 -127 F 0.058 -128 Y 0.058 -129 S 0.068 -130 N 0.081 -131 I 0.093 -132 D 0.107 -133 K 0.130 -134 P 0.161 -135 L 0.197 -136 F 0.243 -137 E 0.293 -138 G 0.329 -139 D 0.332 -140 N 0.304 -141 D 0.254 -142 F 0.200 -143 C 0.158 -144 V 0.133 -145 C 0.114 -146 L 0.097 -147 K 0.084 -148 E 0.081 -149 S 0.090 -150 F 0.107 -151 P 0.123 -152 N 0.137 -153 L 0.150 -154 K 0.163 -155 T 0.177 -156 R 0.185 -157 K 0.178 -158 L 0.151 -159 T 0.116 -160 R 0.090 -161 V 0.076 -162 E 0.072 -163 W 0.074 -164 G 0.080 -165 K 0.087 -166 I 0.094 -167 R 0.103 -168 R 0.116 -169 L 0.139 -170 M 0.177 -171 G 0.224 -172 K 0.258 -173 P 0.265 -174 R 0.254 -175 R 0.235 -176 C 0.212 -177 S 0.186 -178 S 0.163 -179 A 0.142 -180 F 0.124 -181 F 0.111 -182 E 0.106 -183 E 0.107 -184 E 0.112 -185 R 0.115 -186 S 0.112 -187 A 0.107 -188 L 0.098 -189 K 0.084 -190 Q 0.068 -191 K 0.055 -192 R 0.047 -193 Q 0.042 -194 K 0.038 -195 I 0.035 -196 R 0.035 -197 L 0.040 -198 L 0.046 -199 Q 0.053 -200 Q 0.060 -201 R 0.065 -202 K 0.067 -203 V 0.068 -204 A 0.068 -205 D 0.073 -206 V 0.085 -207 S 0.102 -208 Q 0.121 -209 F 0.137 -210 K 0.148 -211 D 0.154 -212 L 0.155 -213 P 0.154 -214 D 0.153 -215 E 0.157 -216 I 0.169 -217 P 0.179 -218 L 0.171 -219 P 0.141 -220 L 0.103 -221 V 0.075 -222 I 0.063 -223 G 0.064 -224 T 0.068 -225 K 0.067 -226 V 0.062 -227 T 0.059 -228 A 0.066 -229 R 0.080 -230 L 0.094 -231 R 0.105 -232 G 0.109 -233 I 0.108 -234 H 0.106 -235 D 0.101 -236 G 0.091 -237 L 0.075 -238 F 0.058 -239 T 0.048 -240 G 0.044 -241 Q 0.044 -242 I 0.043 -243 D 0.041 -244 A 0.041 -245 V 0.042 -246 D 0.044 -247 T 0.045 -248 L 0.046 -249 N 0.044 -250 A 0.038 -251 T 0.030 -252 Y 0.026 -253 R 0.028 -254 V 0.031 -255 T 0.032 -256 F 0.034 -257 D 0.043 -258 R 0.057 -259 T 0.071 -260 G 0.080 -261 L 0.081 -262 G 0.076 -263 T 0.070 -264 H 0.067 -265 T 0.068 -266 I 0.064 -267 P 0.052 -268 D 0.038 -269 Y 0.032 -270 E 0.035 -271 V 0.045 -272 L 0.061 -273 S 0.083 -274 N 0.105 -275 E 0.121 -276 P 0.131 -277 H 0.139 -278 E 0.145 -279 T 0.143 -280 M 0.135 -281 P 0.132 -282 I 0.145 -283 S 0.167 -284 A 0.198 -285 F 0.256 -286 G 0.349 -287 Q 0.454 -288 K 0.536 -289 Q 0.580 -290 R 0.600 -291 P 0.607 -292 S 0.604 -293 R 0.588 -294 F 0.562 -295 F 0.533 -296 M 0.513 -297 T 0.519 -298 P 0.553 -299 P 0.597 -300 R 0.628 -301 L 0.630 -302 H 0.602 -303 Y 0.562 -304 T 0.545 -305 P 0.568 -306 P 0.612 -307 L 0.648 -308 Q 0.671 -309 S 0.693 -310 P 0.714 -311 I 0.733 -312 T 0.748 -313 D 0.755 -314 G 0.752 -315 D 0.742 -316 P 0.734 -317 L 0.733 -318 L 0.732 -319 G 0.720 -320 Q 0.690 -321 S 0.653 -322 P 0.628 -323 W 0.630 -324 R 0.659 -325 S 0.692 -326 K 0.713 -327 V 0.721 -328 S 0.718 -329 G 0.705 -330 S 0.679 -331 D 0.640 -332 T 0.581 -333 E 0.503 -334 T 0.420 -335 L 0.350 -336 G 0.292 -337 G 0.237 -338 F 0.183 -339 P 0.137 -340 V 0.104 -341 E 0.081 -342 F 0.064 -343 L 0.053 -344 I 0.046 -345 Q 0.045 -346 V 0.050 -347 T 0.060 -348 K 0.069 -349 L 0.072 -350 S 0.070 -351 K 0.062 -352 I 0.051 -353 L 0.045 -354 M 0.044 -355 I 0.044 -356 K 0.042 -357 K 0.041 -358 E 0.044 -359 H 0.052 -360 I 0.064 -361 K 0.072 -362 K 0.071 -363 L 0.066 -364 R 0.065 -365 E 0.065 -366 M 0.064 -367 N 0.062 -368 T 0.061 -369 E 0.059 -370 A 0.059 -371 E 0.064 -372 K 0.073 -373 L 0.084 -374 K 0.101 -375 S 0.124 -376 Y 0.147 -377 S 0.167 -378 M 0.179 -379 P 0.173 -380 I 0.145 -381 G 0.105 -382 I 0.072 -383 E 0.057 -384 F 0.058 -385 Q 0.070 -386 R 0.083 -387 R 0.088 -388 Y 0.087 -389 A 0.089 -390 T 0.090 -391 I 0.089 -392 V 0.091 -393 L 0.094 -394 E 0.090 -395 L 0.080 -396 E 0.069 -397 Q 0.060 -398 L 0.056 -399 N 0.056 -400 K 0.060 -401 D 0.064 -402 L 0.066 -403 N 0.067 -404 K 0.066 -405 V 0.071 -406 L 0.080 -407 H 0.082 -408 K 0.076 -409 V 0.071 -410 Q 0.068 -411 Q 0.064 -412 Y 0.062 -413 C 0.068 -414 Y 0.086 -415 E 0.118 -416 L 0.161 -417 A 0.208 -418 P 0.252 -419 D 0.292 -420 Q 0.328 -421 G 0.353 -422 L 0.357 -423 Q 0.354 -424 P 0.357 -425 A 0.358 -426 D 0.346 -427 Q 0.324 -428 P 0.301 -429 T 0.274 -430 D 0.241 -431 M 0.206 -432 R 0.175 -433 R 0.152 -434 R 0.136 -435 C 0.126 -436 E 0.124 -437 E 0.127 -438 E 0.126 -439 A 0.127 -440 Q 0.138 -441 E 0.159 -442 I 0.181 -443 V 0.199 -444 R 0.223 -445 Q 0.268 -446 A 0.336 -447 N 0.408 -448 S 0.461 -449 A 0.488 -450 S 0.503 -451 G 0.513 -452 Q 0.521 -453 P 0.526 -454 C 0.527 -455 V 0.511 -456 E 0.463 -457 N 0.383 -458 E 0.295 -459 N 0.221 -460 L 0.168 -461 T 0.131 -462 D 0.108 -463 L 0.098 -464 I 0.095 -465 S 0.097 -466 R 0.101 -467 L 0.102 -468 T 0.092 -469 A 0.078 -470 I 0.071 -471 L 0.076 -472 L 0.087 -473 Q 0.095 -474 I 0.096 -475 K 0.098 -476 C 0.110 -477 L 0.136 -478 A 0.173 -479 E 0.215 -480 G 0.257 -481 G 0.283 -482 D 0.277 -483 L 0.240 -484 N 0.192 -485 S 0.155 -486 F 0.137 -487 E 0.129 -488 F 0.123 -489 K 0.116 -490 S 0.113 -491 L 0.117 -492 T 0.129 -493 D 0.142 -494 S 0.149 -495 L 0.146 -496 N 0.139 -497 D 0.136 -498 I 0.143 -499 K 0.161 -500 N 0.180 -501 T 0.195 -502 I 0.207 -503 D 0.222 -504 A 0.238 -505 S 0.255 -506 N 0.274 -507 I 0.297 -508 S 0.326 -509 C 0.364 -510 F 0.408 -511 Q 0.453 -512 N 0.490 -513 N 0.508 -514 V 0.500 -515 E 0.457 -516 I 0.388 -517 H 0.316 -518 V 0.272 -519 A 0.274 -520 H 0.315 -521 I 0.369 -522 Q 0.416 -523 S 0.448 -524 G 0.468 -525 L 0.488 -526 S 0.517 -527 Q 0.557 -528 M 0.595 -529 G 0.616 -530 N 0.614 -531 L 0.599 -532 H 0.584 -533 A 0.581 -534 F 0.591 -535 A 0.613 -536 A 0.643 -537 N 0.673 -538 N 0.696 -539 T 0.708 -540 N 0.697 -541 R 0.663 -542 D 0.629 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000058729.14_ENSMUST00000192561.6_GN:Lin9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000058729.14_ENSMUST00000192561.6_GN:Lin9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid deleted file mode 100644 index aaa684a2e6d0d44b0b22a7c9f56b97d0f7af0989..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000058729.14_ENSMUST00000192561.6_GN:Lin9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:16.caid +++ /dev/null @@ -1,559 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000058729.14|ENSMUST00000192561.6|GN:Lin9|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:16 -1 M 0.367 -2 H 0.387 -3 R 0.421 -4 G 0.449 -5 G 0.458 -6 Q 0.464 -7 P 0.486 -8 L 0.502 -9 K 0.493 -10 K 0.497 -11 R 0.544 -12 R 0.604 -13 G 0.631 -14 S 0.623 -15 F 0.605 -16 K 0.582 -17 M 0.554 -18 A 0.554 -19 E 0.600 -20 L 0.655 -21 D 0.678 -22 Q 0.679 -23 L 0.686 -24 P 0.709 -25 D 0.733 -26 E 0.746 -27 S 0.744 -28 S 0.734 -29 S 0.722 -30 A 0.717 -31 K 0.723 -32 A 0.738 -33 L 0.751 -34 V 0.752 -35 S 0.744 -36 L 0.737 -37 K 0.737 -38 E 0.741 -39 G 0.738 -40 S 0.728 -41 L 0.716 -42 S 0.701 -43 N 0.664 -44 T 0.601 -45 W 0.532 -46 N 0.481 -47 E 0.462 -48 K 0.481 -49 Y 0.526 -50 S 0.580 -51 S 0.627 -52 L 0.652 -53 Q 0.658 -54 K 0.661 -55 T 0.673 -56 P 0.691 -57 V 0.711 -58 W 0.735 -59 K 0.765 -60 G 0.790 -61 R 0.803 -62 N 0.804 -63 A 0.800 -64 G 0.798 -65 P 0.800 -66 A 0.803 -67 V 0.799 -68 E 0.787 -69 M 0.775 -70 P 0.768 -71 F 0.768 -72 R 0.775 -73 N 0.778 -74 S 0.773 -75 K 0.767 -76 R 0.770 -77 S 0.777 -78 R 0.781 -79 L 0.783 -80 F 0.786 -81 S 0.789 -82 D 0.783 -83 E 0.763 -84 D 0.720 -85 D 0.661 -86 R 0.630 -87 Q 0.658 -88 I 0.713 -89 N 0.746 -90 T 0.747 -91 K 0.735 -92 S 0.732 -93 P 0.740 -94 K 0.744 -95 R 0.717 -96 N 0.663 -97 Q 0.632 -98 R 0.661 -99 V 0.718 -100 A 0.747 -101 M 0.742 -102 I 0.728 -103 P 0.729 -104 Q 0.740 -105 K 0.751 -106 F 0.756 -107 T 0.757 -108 A 0.744 -109 T 0.708 -110 M 0.659 -111 S 0.626 -112 T 0.628 -113 P 0.650 -114 D 0.668 -115 K 0.669 -116 K 0.659 -117 A 0.644 -118 S 0.620 -119 Q 0.578 -120 K 0.511 -121 I 0.427 -122 G 0.340 -123 F 0.266 -124 R 0.218 -125 L 0.195 -126 R 0.190 -127 N 0.194 -128 L 0.192 -129 L 0.174 -130 K 0.148 -131 L 0.124 -132 P 0.107 -133 K 0.094 -134 A 0.083 -135 H 0.071 -136 K 0.065 -137 W 0.071 -138 C 0.082 -139 I 0.082 -140 Y 0.074 -141 E 0.067 -142 W 0.063 -143 F 0.058 -144 Y 0.058 -145 S 0.067 -146 N 0.080 -147 I 0.093 -148 D 0.106 -149 K 0.128 -150 P 0.158 -151 L 0.193 -152 F 0.239 -153 E 0.288 -154 G 0.322 -155 D 0.322 -156 N 0.292 -157 D 0.241 -158 F 0.188 -159 C 0.149 -160 V 0.125 -161 C 0.107 -162 L 0.090 -163 K 0.078 -164 E 0.076 -165 S 0.086 -166 F 0.101 -167 P 0.117 -168 N 0.130 -169 L 0.143 -170 K 0.156 -171 T 0.167 -172 R 0.175 -173 K 0.168 -174 L 0.143 -175 T 0.110 -176 R 0.085 -177 V 0.071 -178 E 0.066 -179 W 0.068 -180 G 0.074 -181 K 0.082 -182 I 0.090 -183 R 0.101 -184 R 0.115 -185 L 0.137 -186 M 0.172 -187 G 0.213 -188 K 0.241 -189 P 0.247 -190 R 0.235 -191 R 0.218 -192 C 0.197 -193 S 0.174 -194 S 0.153 -195 A 0.134 -196 F 0.118 -197 F 0.106 -198 E 0.102 -199 E 0.104 -200 E 0.110 -201 R 0.112 -202 S 0.109 -203 A 0.104 -204 L 0.095 -205 K 0.081 -206 Q 0.066 -207 K 0.054 -208 R 0.046 -209 Q 0.042 -210 K 0.037 -211 I 0.034 -212 R 0.035 -213 L 0.039 -214 L 0.046 -215 Q 0.053 -216 Q 0.058 -217 R 0.063 -218 K 0.065 -219 V 0.066 -220 A 0.066 -221 D 0.071 -222 V 0.082 -223 S 0.099 -224 Q 0.118 -225 F 0.134 -226 K 0.144 -227 D 0.150 -228 L 0.151 -229 P 0.151 -230 D 0.151 -231 E 0.155 -232 I 0.165 -233 P 0.174 -234 L 0.166 -235 P 0.137 -236 L 0.101 -237 V 0.074 -238 I 0.062 -239 G 0.063 -240 T 0.067 -241 K 0.066 -242 V 0.061 -243 T 0.059 -244 A 0.065 -245 R 0.079 -246 L 0.093 -247 R 0.103 -248 G 0.107 -249 I 0.106 -250 H 0.103 -251 D 0.099 -252 G 0.089 -253 L 0.073 -254 F 0.057 -255 T 0.047 -256 G 0.044 -257 Q 0.044 -258 I 0.043 -259 D 0.042 -260 A 0.041 -261 V 0.043 -262 D 0.045 -263 T 0.046 -264 L 0.046 -265 N 0.044 -266 A 0.038 -267 T 0.030 -268 Y 0.026 -269 R 0.028 -270 V 0.030 -271 T 0.032 -272 F 0.034 -273 D 0.043 -274 R 0.058 -275 T 0.072 -276 G 0.081 -277 L 0.082 -278 G 0.078 -279 T 0.071 -280 H 0.068 -281 T 0.069 -282 I 0.066 -283 P 0.053 -284 D 0.039 -285 Y 0.033 -286 E 0.036 -287 V 0.045 -288 L 0.061 -289 S 0.083 -290 N 0.106 -291 E 0.122 -292 P 0.132 -293 H 0.140 -294 E 0.148 -295 T 0.146 -296 M 0.138 -297 P 0.137 -298 I 0.150 -299 S 0.172 -300 A 0.203 -301 F 0.260 -302 G 0.352 -303 Q 0.456 -304 K 0.537 -305 Q 0.581 -306 R 0.600 -307 P 0.606 -308 S 0.602 -309 R 0.585 -310 F 0.558 -311 F 0.528 -312 M 0.509 -313 T 0.517 -314 P 0.552 -315 P 0.597 -316 R 0.627 -317 L 0.629 -318 H 0.600 -319 Y 0.559 -320 T 0.541 -321 P 0.565 -322 P 0.610 -323 L 0.646 -324 Q 0.671 -325 S 0.694 -326 P 0.718 -327 I 0.739 -328 T 0.754 -329 D 0.763 -330 G 0.760 -331 D 0.750 -332 P 0.742 -333 L 0.741 -334 L 0.741 -335 G 0.727 -336 Q 0.697 -337 S 0.660 -338 P 0.635 -339 W 0.638 -340 R 0.667 -341 S 0.701 -342 K 0.721 -343 V 0.727 -344 S 0.723 -345 G 0.708 -346 S 0.681 -347 D 0.640 -348 T 0.581 -349 E 0.503 -350 T 0.420 -351 L 0.350 -352 G 0.292 -353 G 0.236 -354 F 0.180 -355 P 0.135 -356 V 0.102 -357 E 0.080 -358 F 0.065 -359 L 0.054 -360 I 0.047 -361 Q 0.045 -362 V 0.051 -363 T 0.061 -364 K 0.070 -365 L 0.073 -366 S 0.071 -367 K 0.063 -368 I 0.052 -369 L 0.045 -370 M 0.043 -371 I 0.043 -372 K 0.041 -373 K 0.040 -374 E 0.043 -375 H 0.051 -376 I 0.063 -377 K 0.071 -378 K 0.069 -379 L 0.064 -380 R 0.062 -381 E 0.062 -382 M 0.061 -383 N 0.060 -384 T 0.058 -385 E 0.055 -386 A 0.056 -387 E 0.061 -388 K 0.069 -389 L 0.079 -390 K 0.095 -391 S 0.117 -392 Y 0.139 -393 S 0.158 -394 M 0.169 -395 P 0.164 -396 I 0.138 -397 G 0.101 -398 I 0.070 -399 E 0.056 -400 F 0.057 -401 Q 0.070 -402 R 0.083 -403 R 0.088 -404 Y 0.087 -405 A 0.089 -406 T 0.091 -407 I 0.090 -408 V 0.091 -409 L 0.094 -410 E 0.091 -411 L 0.081 -412 E 0.070 -413 Q 0.062 -414 L 0.057 -415 N 0.058 -416 K 0.061 -417 D 0.065 -418 L 0.067 -419 N 0.068 -420 K 0.068 -421 V 0.073 -422 L 0.081 -423 H 0.083 -424 K 0.076 -425 V 0.071 -426 Q 0.068 -427 Q 0.063 -428 Y 0.061 -429 C 0.067 -430 Y 0.083 -431 E 0.112 -432 L 0.154 -433 A 0.203 -434 P 0.248 -435 D 0.289 -436 Q 0.327 -437 G 0.353 -438 L 0.360 -439 Q 0.357 -440 P 0.358 -441 A 0.358 -442 D 0.347 -443 Q 0.328 -444 P 0.305 -445 T 0.278 -446 D 0.244 -447 M 0.209 -448 R 0.178 -449 R 0.154 -450 R 0.137 -451 C 0.126 -452 E 0.125 -453 E 0.128 -454 E 0.128 -455 A 0.129 -456 Q 0.140 -457 E 0.161 -458 I 0.184 -459 V 0.204 -460 R 0.229 -461 Q 0.274 -462 A 0.342 -463 N 0.416 -464 S 0.471 -465 A 0.502 -466 S 0.519 -467 G 0.532 -468 Q 0.543 -469 P 0.551 -470 C 0.551 -471 V 0.533 -472 E 0.480 -473 N 0.396 -474 E 0.304 -475 N 0.228 -476 L 0.173 -477 T 0.135 -478 D 0.111 -479 L 0.101 -480 I 0.098 -481 S 0.098 -482 R 0.102 -483 L 0.101 -484 T 0.092 -485 A 0.079 -486 I 0.072 -487 L 0.078 -488 L 0.090 -489 Q 0.098 -490 I 0.099 -491 K 0.101 -492 C 0.114 -493 L 0.139 -494 A 0.175 -495 E 0.215 -496 G 0.255 -497 G 0.279 -498 D 0.271 -499 L 0.233 -500 N 0.185 -501 S 0.149 -502 F 0.132 -503 E 0.125 -504 F 0.119 -505 K 0.113 -506 S 0.111 -507 L 0.116 -508 T 0.127 -509 D 0.141 -510 S 0.148 -511 L 0.146 -512 N 0.140 -513 D 0.138 -514 I 0.145 -515 K 0.164 -516 N 0.184 -517 T 0.198 -518 I 0.209 -519 D 0.223 -520 A 0.239 -521 S 0.256 -522 N 0.274 -523 I 0.296 -524 S 0.325 -525 C 0.362 -526 F 0.408 -527 Q 0.454 -528 N 0.491 -529 N 0.510 -530 V 0.500 -531 E 0.457 -532 I 0.389 -533 H 0.317 -534 V 0.275 -535 A 0.279 -536 H 0.322 -537 I 0.379 -538 Q 0.426 -539 S 0.457 -540 G 0.476 -541 L 0.493 -542 S 0.521 -543 Q 0.560 -544 M 0.597 -545 G 0.614 -546 N 0.609 -547 L 0.592 -548 H 0.577 -549 A 0.574 -550 F 0.585 -551 A 0.608 -552 A 0.639 -553 N 0.670 -554 N 0.694 -555 T 0.705 -556 N 0.694 -557 R 0.658 -558 D 0.623 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000058799.17_ENSMUST00000218828.2_GN:Nap1l1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000058799.17_ENSMUST00000218828.2_GN:Nap1l1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 4b34a791b7cac5878848d08fc022c27c5f37c670..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000058799.17_ENSMUST00000218828.2_GN:Nap1l1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,392 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000058799.17|ENSMUST00000218828.2|GN:Nap1l1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.371 -2 A 0.393 -3 D 0.424 -4 I 0.448 -5 D 0.446 -6 N 0.414 -7 K 0.380 -8 E 0.370 -9 Q 0.378 -10 S 0.390 -11 E 0.397 -12 L 0.393 -13 D 0.379 -14 Q 0.378 -15 D 0.404 -16 L 0.446 -17 E 0.485 -18 D 0.515 -19 V 0.530 -20 E 0.533 -21 E 0.529 -22 V 0.523 -23 E 0.511 -24 E 0.495 -25 E 0.485 -26 E 0.481 -27 T 0.471 -28 G 0.439 -29 E 0.388 -30 E 0.344 -31 T 0.326 -32 K 0.324 -33 I 0.325 -34 K 0.321 -35 A 0.311 -36 R 0.296 -37 Q 0.277 -38 L 0.257 -39 T 0.240 -40 V 0.236 -41 Q 0.240 -42 M 0.244 -43 M 0.249 -44 Q 0.259 -45 N 0.262 -46 P 0.245 -47 Q 0.216 -48 I 0.191 -49 L 0.172 -50 A 0.161 -51 A 0.155 -52 L 0.156 -53 Q 0.165 -54 E 0.188 -55 R 0.227 -56 L 0.278 -57 D 0.330 -58 G 0.373 -59 L 0.406 -60 V 0.426 -61 D 0.433 -62 T 0.429 -63 P 0.417 -64 T 0.394 -65 G 0.354 -66 Y 0.296 -67 I 0.242 -68 E 0.221 -69 S 0.234 -70 L 0.244 -71 P 0.224 -72 K 0.185 -73 V 0.152 -74 V 0.132 -75 K 0.127 -76 R 0.138 -77 R 0.155 -78 V 0.170 -79 N 0.187 -80 A 0.203 -81 L 0.211 -82 K 0.216 -83 N 0.230 -84 L 0.252 -85 Q 0.266 -86 V 0.268 -87 K 0.268 -88 C 0.272 -89 A 0.279 -90 Q 0.288 -91 I 0.286 -92 E 0.260 -93 A 0.219 -94 K 0.181 -95 F 0.155 -96 Y 0.141 -97 E 0.135 -98 E 0.136 -99 V 0.137 -100 H 0.132 -101 D 0.125 -102 L 0.119 -103 E 0.111 -104 R 0.101 -105 K 0.093 -106 Y 0.091 -107 A 0.095 -108 V 0.106 -109 L 0.116 -110 Y 0.114 -111 Q 0.100 -112 P 0.085 -113 L 0.078 -114 F 0.075 -115 D 0.075 -116 K 0.077 -117 R 0.075 -118 F 0.070 -119 E 0.066 -120 I 0.069 -121 I 0.076 -122 N 0.085 -123 A 0.093 -124 I 0.101 -125 Y 0.114 -126 E 0.132 -127 P 0.151 -128 T 0.170 -129 E 0.195 -130 E 0.230 -131 E 0.260 -132 C 0.274 -133 E 0.274 -134 W 0.282 -135 K 0.310 -136 P 0.346 -137 D 0.371 -138 E 0.379 -139 E 0.373 -140 D 0.358 -141 E 0.338 -142 V 0.307 -143 S 0.269 -144 E 0.239 -145 E 0.232 -146 L 0.237 -147 K 0.242 -148 E 0.263 -149 K 0.313 -150 A 0.376 -151 K 0.429 -152 I 0.473 -153 E 0.510 -154 D 0.530 -155 E 0.532 -156 K 0.529 -157 K 0.532 -158 D 0.533 -159 E 0.522 -160 E 0.502 -161 K 0.473 -162 E 0.435 -163 D 0.391 -164 P 0.343 -165 K 0.295 -166 G 0.248 -167 I 0.199 -168 P 0.145 -169 E 0.094 -170 F 0.056 -171 W 0.039 -172 L 0.038 -173 T 0.047 -174 V 0.060 -175 F 0.073 -176 K 0.087 -177 N 0.096 -178 V 0.095 -179 D 0.084 -180 L 0.072 -181 L 0.066 -182 S 0.068 -183 D 0.072 -184 M 0.071 -185 V 0.064 -186 Q 0.056 -187 E 0.052 -188 H 0.052 -189 D 0.052 -190 E 0.049 -191 P 0.044 -192 I 0.041 -193 L 0.039 -194 K 0.038 -195 H 0.038 -196 L 0.040 -197 K 0.043 -198 D 0.043 -199 I 0.040 -200 K 0.038 -201 V 0.038 -202 K 0.043 -203 F 0.054 -204 S 0.072 -205 D 0.094 -206 A 0.111 -207 G 0.114 -208 Q 0.106 -209 P 0.091 -210 M 0.071 -211 S 0.051 -212 F 0.038 -213 V 0.033 -214 L 0.036 -215 E 0.043 -216 F 0.048 -217 H 0.050 -218 F 0.053 -219 E 0.058 -220 P 0.057 -221 N 0.051 -222 D 0.043 -223 Y 0.040 -224 F 0.046 -225 T 0.057 -226 N 0.072 -227 E 0.085 -228 V 0.089 -229 L 0.081 -230 T 0.070 -231 K 0.064 -232 T 0.066 -233 Y 0.077 -234 R 0.096 -235 M 0.118 -236 R 0.142 -237 S 0.176 -238 E 0.218 -239 P 0.253 -240 D 0.261 -241 D 0.240 -242 S 0.208 -243 D 0.184 -244 P 0.172 -245 F 0.169 -246 S 0.175 -247 F 0.185 -248 D 0.190 -249 G 0.188 -250 P 0.179 -251 E 0.162 -252 I 0.143 -253 M 0.134 -254 G 0.136 -255 C 0.143 -256 T 0.152 -257 G 0.159 -258 C 0.158 -259 Q 0.145 -260 I 0.125 -261 D 0.108 -262 W 0.103 -263 K 0.114 -264 K 0.134 -265 G 0.157 -266 K 0.180 -267 N 0.206 -268 V 0.233 -269 T 0.251 -270 L 0.258 -271 K 0.262 -272 T 0.271 -273 I 0.285 -274 K 0.302 -275 K 0.312 -276 K 0.312 -277 Q 0.302 -278 K 0.291 -279 H 0.294 -280 K 0.317 -281 G 0.350 -282 R 0.376 -283 G 0.386 -284 T 0.380 -285 V 0.372 -286 R 0.376 -287 T 0.391 -288 V 0.400 -289 T 0.390 -290 K 0.368 -291 T 0.352 -292 V 0.342 -293 S 0.319 -294 N 0.273 -295 D 0.215 -296 S 0.161 -297 F 0.125 -298 F 0.114 -299 N 0.120 -300 F 0.129 -301 F 0.141 -302 A 0.167 -303 P 0.202 -304 P 0.234 -305 E 0.253 -306 V 0.263 -307 P 0.278 -308 E 0.304 -309 N 0.329 -310 G 0.337 -311 D 0.319 -312 L 0.285 -313 D 0.248 -314 D 0.216 -315 D 0.190 -316 A 0.172 -317 E 0.163 -318 A 0.160 -319 I 0.155 -320 L 0.143 -321 A 0.129 -322 A 0.117 -323 D 0.106 -324 F 0.098 -325 E 0.093 -326 I 0.093 -327 G 0.093 -328 H 0.091 -329 F 0.087 -330 L 0.084 -331 R 0.084 -332 E 0.086 -333 R 0.088 -334 I 0.090 -335 I 0.086 -336 P 0.077 -337 R 0.067 -338 S 0.060 -339 V 0.057 -340 L 0.054 -341 Y 0.055 -342 F 0.067 -343 T 0.093 -344 G 0.139 -345 E 0.202 -346 A 0.279 -347 I 0.368 -348 E 0.465 -349 D 0.554 -350 D 0.614 -351 D 0.643 -352 D 0.656 -353 D 0.665 -354 Y 0.675 -355 D 0.689 -356 E 0.704 -357 E 0.714 -358 G 0.717 -359 E 0.714 -360 E 0.701 -361 A 0.663 -362 D 0.608 -363 E 0.579 -364 E 0.609 -365 G 0.665 -366 E 0.705 -367 E 0.724 -368 E 0.733 -369 G 0.736 -370 D 0.730 -371 E 0.711 -372 E 0.679 -373 N 0.640 -374 D 0.608 -375 P 0.581 -376 D 0.552 -377 Y 0.524 -378 D 0.514 -379 P 0.531 -380 K 0.565 -381 K 0.596 -382 D 0.611 -383 Q 0.616 -384 N 0.625 -385 P 0.646 -386 A 0.666 -387 E 0.670 -388 C 0.650 -389 K 0.603 -390 Q 0.537 -391 Q 0.484 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000058799.17_ENSMUST00000218828.2_GN:Nap1l1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:27.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000058799.17_ENSMUST00000218828.2_GN:Nap1l1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:27.caid deleted file mode 100644 index 0627d789de25d8d3944c7644495fa1624488cc30..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000058799.17_ENSMUST00000218828.2_GN:Nap1l1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:27.caid +++ /dev/null @@ -1,419 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000058799.17|ENSMUST00000218828.2|GN:Nap1l1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:27 -1 M 0.309 -2 F 0.318 -3 F 0.338 -4 L 0.363 -5 P 0.378 -6 L 0.374 -7 S 0.352 -8 N 0.317 -9 S 0.271 -10 V 0.227 -11 L 0.201 -12 F 0.189 -13 L 0.183 -14 T 0.179 -15 L 0.177 -16 S 0.175 -17 F 0.169 -18 F 0.161 -19 L 0.155 -20 V 0.158 -21 D 0.164 -22 I 0.167 -23 W 0.168 -24 S 0.179 -25 S 0.206 -26 Y 0.242 -27 K 0.281 -28 M 0.330 -29 A 0.384 -30 D 0.421 -31 I 0.428 -32 D 0.417 -33 N 0.405 -34 K 0.398 -35 E 0.392 -36 Q 0.389 -37 S 0.396 -38 E 0.406 -39 L 0.401 -40 D 0.383 -41 Q 0.381 -42 D 0.412 -43 L 0.459 -44 E 0.502 -45 D 0.539 -46 V 0.562 -47 E 0.567 -48 E 0.561 -49 V 0.551 -50 E 0.538 -51 E 0.525 -52 E 0.519 -53 E 0.519 -54 T 0.511 -55 G 0.484 -56 E 0.441 -57 E 0.403 -58 T 0.385 -59 K 0.385 -60 I 0.391 -61 K 0.389 -62 A 0.371 -63 R 0.342 -64 Q 0.311 -65 L 0.285 -66 T 0.269 -67 V 0.266 -68 Q 0.266 -69 M 0.259 -70 M 0.254 -71 Q 0.258 -72 N 0.259 -73 P 0.239 -74 Q 0.209 -75 I 0.183 -76 L 0.166 -77 A 0.156 -78 A 0.151 -79 L 0.150 -80 Q 0.158 -81 E 0.179 -82 R 0.217 -83 L 0.262 -84 D 0.306 -85 G 0.340 -86 L 0.367 -87 V 0.386 -88 D 0.395 -89 T 0.393 -90 P 0.381 -91 T 0.358 -92 G 0.320 -93 Y 0.268 -94 I 0.219 -95 E 0.199 -96 S 0.207 -97 L 0.214 -98 P 0.195 -99 K 0.161 -100 V 0.131 -101 V 0.115 -102 K 0.113 -103 R 0.124 -104 R 0.138 -105 V 0.149 -106 N 0.163 -107 A 0.177 -108 L 0.185 -109 K 0.190 -110 N 0.203 -111 L 0.222 -112 Q 0.234 -113 V 0.235 -114 K 0.236 -115 C 0.239 -116 A 0.243 -117 Q 0.247 -118 I 0.244 -119 E 0.224 -120 A 0.192 -121 K 0.162 -122 F 0.141 -123 Y 0.129 -124 E 0.125 -125 E 0.126 -126 V 0.126 -127 H 0.122 -128 D 0.115 -129 L 0.110 -130 E 0.104 -131 R 0.095 -132 K 0.088 -133 Y 0.086 -134 A 0.091 -135 V 0.101 -136 L 0.112 -137 Y 0.111 -138 Q 0.097 -139 P 0.083 -140 L 0.075 -141 F 0.071 -142 D 0.070 -143 K 0.071 -144 R 0.069 -145 F 0.065 -146 E 0.063 -147 I 0.066 -148 I 0.074 -149 N 0.083 -150 A 0.091 -151 I 0.098 -152 Y 0.110 -153 E 0.128 -154 P 0.147 -155 T 0.165 -156 E 0.191 -157 E 0.225 -158 E 0.257 -159 C 0.273 -160 E 0.276 -161 W 0.286 -162 K 0.314 -163 P 0.351 -164 D 0.378 -165 E 0.385 -166 E 0.378 -167 D 0.362 -168 E 0.341 -169 V 0.311 -170 S 0.271 -171 E 0.241 -172 E 0.233 -173 L 0.236 -174 K 0.242 -175 E 0.263 -176 K 0.315 -177 A 0.380 -178 K 0.435 -179 I 0.479 -180 E 0.517 -181 D 0.537 -182 E 0.539 -183 K 0.538 -184 K 0.540 -185 D 0.541 -186 E 0.530 -187 E 0.509 -188 K 0.478 -189 E 0.439 -190 D 0.393 -191 P 0.344 -192 K 0.296 -193 G 0.248 -194 I 0.199 -195 P 0.145 -196 E 0.093 -197 F 0.056 -198 W 0.039 -199 L 0.038 -200 T 0.047 -201 V 0.060 -202 F 0.073 -203 K 0.086 -204 N 0.096 -205 V 0.095 -206 D 0.084 -207 L 0.071 -208 L 0.065 -209 S 0.067 -210 D 0.070 -211 M 0.070 -212 V 0.063 -213 Q 0.055 -214 E 0.051 -215 H 0.051 -216 D 0.051 -217 E 0.048 -218 P 0.043 -219 I 0.040 -220 L 0.038 -221 K 0.037 -222 H 0.037 -223 L 0.039 -224 K 0.042 -225 D 0.043 -226 I 0.040 -227 K 0.037 -228 V 0.037 -229 K 0.042 -230 F 0.052 -231 S 0.069 -232 D 0.091 -233 A 0.107 -234 G 0.110 -235 Q 0.103 -236 P 0.089 -237 M 0.069 -238 S 0.050 -239 F 0.037 -240 V 0.033 -241 L 0.036 -242 E 0.043 -243 F 0.047 -244 H 0.049 -245 F 0.052 -246 E 0.056 -247 P 0.056 -248 N 0.050 -249 D 0.042 -250 Y 0.040 -251 F 0.045 -252 T 0.056 -253 N 0.071 -254 E 0.084 -255 V 0.088 -256 L 0.080 -257 T 0.069 -258 K 0.064 -259 T 0.066 -260 Y 0.077 -261 R 0.096 -262 M 0.117 -263 R 0.142 -264 S 0.174 -265 E 0.215 -266 P 0.249 -267 D 0.256 -268 D 0.235 -269 S 0.205 -270 D 0.182 -271 P 0.171 -272 F 0.169 -273 S 0.175 -274 F 0.185 -275 D 0.190 -276 G 0.188 -277 P 0.180 -278 E 0.163 -279 I 0.144 -280 M 0.135 -281 G 0.137 -282 C 0.144 -283 T 0.153 -284 G 0.161 -285 C 0.159 -286 Q 0.146 -287 I 0.126 -288 D 0.108 -289 W 0.103 -290 K 0.114 -291 K 0.134 -292 G 0.157 -293 K 0.180 -294 N 0.206 -295 V 0.232 -296 T 0.248 -297 L 0.253 -298 K 0.254 -299 T 0.260 -300 I 0.274 -301 K 0.292 -302 K 0.305 -303 K 0.309 -304 Q 0.302 -305 K 0.294 -306 H 0.299 -307 K 0.325 -308 G 0.360 -309 R 0.386 -310 G 0.394 -311 T 0.386 -312 V 0.376 -313 R 0.379 -314 T 0.394 -315 V 0.403 -316 T 0.393 -317 K 0.373 -318 T 0.359 -319 V 0.351 -320 S 0.328 -321 N 0.281 -322 D 0.222 -323 S 0.166 -324 F 0.129 -325 F 0.118 -326 N 0.124 -327 F 0.132 -328 F 0.145 -329 A 0.171 -330 P 0.206 -331 P 0.239 -332 E 0.258 -333 V 0.268 -334 P 0.282 -335 E 0.308 -336 N 0.334 -337 G 0.342 -338 D 0.324 -339 L 0.289 -340 D 0.252 -341 D 0.219 -342 D 0.193 -343 A 0.174 -344 E 0.164 -345 A 0.160 -346 I 0.155 -347 L 0.144 -348 A 0.130 -349 A 0.118 -350 D 0.108 -351 F 0.099 -352 E 0.095 -353 I 0.095 -354 G 0.095 -355 H 0.093 -356 F 0.089 -357 L 0.086 -358 R 0.085 -359 E 0.087 -360 R 0.089 -361 I 0.090 -362 I 0.086 -363 P 0.077 -364 R 0.067 -365 S 0.061 -366 V 0.057 -367 L 0.054 -368 Y 0.056 -369 F 0.067 -370 T 0.093 -371 G 0.138 -372 E 0.201 -373 A 0.278 -374 I 0.368 -375 E 0.466 -376 D 0.555 -377 D 0.615 -378 D 0.644 -379 D 0.657 -380 D 0.666 -381 Y 0.676 -382 D 0.689 -383 E 0.704 -384 E 0.714 -385 G 0.717 -386 E 0.714 -387 E 0.702 -388 A 0.665 -389 D 0.610 -390 E 0.582 -391 E 0.611 -392 G 0.667 -393 E 0.707 -394 E 0.727 -395 E 0.737 -396 G 0.739 -397 D 0.733 -398 E 0.713 -399 E 0.681 -400 N 0.642 -401 D 0.609 -402 P 0.582 -403 D 0.552 -404 Y 0.525 -405 D 0.515 -406 P 0.533 -407 K 0.567 -408 K 0.598 -409 D 0.613 -410 Q 0.617 -411 N 0.627 -412 P 0.647 -413 A 0.668 -414 E 0.673 -415 C 0.655 -416 K 0.610 -417 Q 0.546 -418 Q 0.493 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000059208.16_ENSMUST00000148178.8_GN:Hnrnpm_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000059208.16_ENSMUST00000148178.8_GN:Hnrnpm_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 53eac8db2a9d58aea9715d73d64543ca0461ee2d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000059208.16_ENSMUST00000148178.8_GN:Hnrnpm_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,730 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000059208.16|ENSMUST00000148178.8|GN:Hnrnpm|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.398 -2 A 0.432 -3 A 0.474 -4 G 0.486 -5 V 0.446 -6 E 0.389 -7 A 0.373 -8 A 0.399 -9 A 0.420 -10 E 0.431 -11 V 0.449 -12 A 0.456 -13 A 0.437 -14 T 0.424 -15 E 0.437 -16 P 0.460 -17 K 0.489 -18 M 0.534 -19 E 0.565 -20 E 0.560 -21 E 0.555 -22 S 0.590 -23 G 0.645 -24 A 0.685 -25 P 0.705 -26 C 0.714 -27 V 0.721 -28 P 0.733 -29 S 0.751 -30 G 0.768 -31 N 0.772 -32 G 0.763 -33 A 0.748 -34 P 0.739 -35 G 0.738 -36 P 0.741 -37 K 0.741 -38 G 0.734 -39 E 0.717 -40 E 0.694 -41 R 0.669 -42 P 0.641 -43 T 0.607 -44 Q 0.567 -45 N 0.529 -46 E 0.492 -47 K 0.463 -48 R 0.462 -49 K 0.491 -50 E 0.535 -51 K 0.582 -52 N 0.627 -53 I 0.659 -54 K 0.677 -55 R 0.690 -56 G 0.704 -57 G 0.713 -58 N 0.708 -59 R 0.686 -60 F 0.658 -61 E 0.638 -62 P 0.623 -63 Y 0.604 -64 S 0.573 -65 N 0.524 -66 P 0.451 -67 T 0.352 -68 K 0.244 -69 R 0.147 -70 Y 0.080 -71 R 0.045 -72 A 0.033 -73 F 0.033 -74 I 0.037 -75 T 0.045 -76 N 0.055 -77 I 0.060 -78 P 0.058 -79 F 0.051 -80 D 0.044 -81 V 0.037 -82 K 0.028 -83 W 0.020 -84 Q 0.018 -85 S 0.021 -86 L 0.031 -87 K 0.045 -88 D 0.054 -89 L 0.053 -90 V 0.046 -91 K 0.042 -92 E 0.041 -93 K 0.042 -94 V 0.043 -95 G 0.042 -96 E 0.040 -97 V 0.038 -98 T 0.039 -99 Y 0.041 -100 V 0.048 -101 E 0.059 -102 L 0.072 -103 L 0.088 -104 M 0.102 -105 D 0.111 -106 A 0.114 -107 E 0.114 -108 G 0.112 -109 K 0.103 -110 S 0.088 -111 R 0.072 -112 G 0.057 -113 C 0.042 -114 A 0.031 -115 V 0.025 -116 V 0.027 -117 E 0.035 -118 F 0.044 -119 K 0.046 -120 M 0.041 -121 E 0.036 -122 E 0.033 -123 S 0.031 -124 M 0.030 -125 K 0.029 -126 K 0.030 -127 A 0.031 -128 A 0.032 -129 E 0.035 -130 V 0.037 -131 L 0.037 -132 N 0.037 -133 K 0.040 -134 H 0.045 -135 S 0.051 -136 L 0.060 -137 S 0.073 -138 G 0.085 -139 R 0.088 -140 P 0.079 -141 L 0.065 -142 K 0.055 -143 V 0.055 -144 K 0.068 -145 E 0.093 -146 D 0.120 -147 P 0.133 -148 D 0.131 -149 G 0.121 -150 E 0.107 -151 H 0.093 -152 A 0.085 -153 R 0.089 -154 R 0.105 -155 A 0.131 -156 M 0.165 -157 Q 0.200 -158 K 0.232 -159 V 0.257 -160 M 0.288 -161 A 0.337 -162 T 0.406 -163 T 0.482 -164 G 0.555 -165 G 0.612 -166 M 0.642 -167 G 0.644 -168 M 0.635 -169 G 0.625 -170 P 0.617 -171 G 0.610 -172 G 0.595 -173 P 0.559 -174 G 0.493 -175 M 0.407 -176 I 0.324 -177 N 0.253 -178 I 0.195 -179 P 0.152 -180 P 0.130 -181 S 0.124 -182 I 0.129 -183 L 0.143 -184 N 0.165 -185 N 0.185 -186 P 0.189 -187 N 0.176 -188 I 0.149 -189 P 0.114 -190 N 0.082 -191 E 0.062 -192 I 0.052 -193 I 0.046 -194 H 0.043 -195 A 0.042 -196 L 0.045 -197 Q 0.056 -198 A 0.070 -199 G 0.081 -200 R 0.081 -201 L 0.072 -202 G 0.056 -203 S 0.039 -204 T 0.028 -205 V 0.023 -206 F 0.022 -207 V 0.024 -208 A 0.028 -209 N 0.036 -210 L 0.040 -211 D 0.040 -212 Y 0.035 -213 K 0.032 -214 V 0.029 -215 G 0.026 -216 W 0.022 -217 K 0.019 -218 K 0.017 -219 L 0.018 -220 K 0.019 -221 E 0.022 -222 V 0.024 -223 F 0.027 -224 S 0.031 -225 M 0.037 -226 A 0.044 -227 G 0.051 -228 V 0.056 -229 V 0.055 -230 V 0.051 -231 R 0.048 -232 A 0.049 -233 D 0.057 -234 I 0.072 -235 L 0.091 -236 E 0.107 -237 D 0.116 -238 K 0.120 -239 D 0.126 -240 G 0.131 -241 K 0.125 -242 S 0.106 -243 R 0.085 -244 G 0.065 -245 I 0.047 -246 G 0.033 -247 I 0.026 -248 V 0.028 -249 T 0.034 -250 F 0.040 -251 E 0.041 -252 Q 0.038 -253 S 0.034 -254 I 0.031 -255 E 0.030 -256 A 0.031 -257 V 0.033 -258 Q 0.035 -259 A 0.036 -260 I 0.034 -261 S 0.029 -262 M 0.024 -263 F 0.023 -264 N 0.025 -265 G 0.029 -266 Q 0.033 -267 L 0.035 -268 L 0.036 -269 F 0.040 -270 D 0.048 -271 R 0.054 -272 P 0.055 -273 M 0.051 -274 H 0.046 -275 V 0.045 -276 K 0.048 -277 M 0.060 -278 D 0.081 -279 E 0.107 -280 R 0.144 -281 A 0.201 -282 L 0.280 -283 P 0.372 -284 K 0.460 -285 G 0.523 -286 D 0.541 -287 F 0.526 -288 F 0.518 -289 P 0.544 -290 P 0.592 -291 E 0.639 -292 R 0.671 -293 P 0.690 -294 Q 0.698 -295 Q 0.701 -296 L 0.706 -297 P 0.715 -298 H 0.728 -299 G 0.739 -300 L 0.747 -301 G 0.755 -302 G 0.764 -303 I 0.773 -304 G 0.778 -305 M 0.775 -306 G 0.757 -307 L 0.731 -308 G 0.716 -309 P 0.717 -310 G 0.725 -311 G 0.731 -312 Q 0.736 -313 P 0.743 -314 I 0.748 -315 D 0.747 -316 A 0.742 -317 N 0.738 -318 H 0.740 -319 L 0.754 -320 S 0.774 -321 K 0.792 -322 G 0.805 -323 I 0.813 -324 G 0.817 -325 M 0.820 -326 G 0.817 -327 N 0.806 -328 L 0.791 -329 G 0.785 -330 P 0.795 -331 A 0.809 -332 G 0.811 -333 M 0.788 -334 G 0.733 -335 M 0.660 -336 E 0.621 -337 G 0.647 -338 I 0.702 -339 G 0.742 -340 F 0.761 -341 G 0.767 -342 I 0.769 -343 N 0.773 -344 K 0.783 -345 I 0.794 -346 G 0.800 -347 G 0.795 -348 M 0.783 -349 E 0.773 -350 G 0.769 -351 P 0.772 -352 F 0.782 -353 G 0.798 -354 G 0.808 -355 G 0.806 -356 M 0.799 -357 E 0.792 -358 N 0.783 -359 M 0.771 -360 G 0.763 -361 R 0.762 -362 F 0.766 -363 G 0.768 -364 S 0.755 -365 G 0.718 -366 M 0.667 -367 N 0.620 -368 M 0.583 -369 G 0.548 -370 R 0.504 -371 I 0.460 -372 N 0.428 -373 E 0.409 -374 I 0.401 -375 L 0.399 -376 S 0.396 -377 N 0.395 -378 A 0.403 -379 L 0.425 -380 K 0.468 -381 R 0.542 -382 G 0.630 -383 E 0.698 -384 I 0.730 -385 I 0.737 -386 A 0.736 -387 K 0.736 -388 Q 0.741 -389 G 0.751 -390 G 0.768 -391 G 0.788 -392 G 0.803 -393 A 0.810 -394 G 0.805 -395 G 0.791 -396 S 0.776 -397 V 0.770 -398 P 0.772 -399 G 0.774 -400 I 0.769 -401 E 0.758 -402 R 0.746 -403 M 0.740 -404 G 0.742 -405 P 0.751 -406 G 0.756 -407 I 0.748 -408 D 0.722 -409 R 0.677 -410 I 0.636 -411 S 0.626 -412 G 0.647 -413 A 0.670 -414 G 0.683 -415 M 0.695 -416 E 0.707 -417 R 0.702 -418 M 0.680 -419 G 0.666 -420 A 0.668 -421 G 0.676 -422 L 0.680 -423 G 0.680 -424 H 0.668 -425 G 0.643 -426 M 0.618 -427 D 0.588 -428 R 0.537 -429 V 0.463 -430 G 0.386 -431 S 0.324 -432 E 0.289 -433 I 0.278 -434 E 0.283 -435 R 0.293 -436 M 0.306 -437 G 0.316 -438 L 0.319 -439 V 0.324 -440 M 0.345 -441 D 0.376 -442 R 0.399 -443 M 0.415 -444 G 0.433 -445 S 0.453 -446 V 0.476 -447 E 0.505 -448 R 0.530 -449 M 0.551 -450 G 0.574 -451 S 0.595 -452 S 0.594 -453 I 0.563 -454 E 0.507 -455 R 0.435 -456 M 0.368 -457 G 0.337 -458 P 0.347 -459 L 0.376 -460 G 0.400 -461 L 0.406 -462 D 0.389 -463 H 0.361 -464 M 0.340 -465 A 0.333 -466 S 0.331 -467 S 0.331 -468 I 0.339 -469 E 0.348 -470 R 0.347 -471 M 0.332 -472 G 0.307 -473 Q 0.284 -474 T 0.289 -475 M 0.331 -476 E 0.377 -477 R 0.391 -478 I 0.386 -479 G 0.393 -480 S 0.411 -481 G 0.426 -482 V 0.443 -483 E 0.457 -484 R 0.450 -485 M 0.433 -486 G 0.448 -487 A 0.498 -488 G 0.549 -489 M 0.583 -490 G 0.610 -491 F 0.628 -492 G 0.634 -493 L 0.636 -494 E 0.641 -495 R 0.643 -496 M 0.632 -497 A 0.605 -498 A 0.564 -499 P 0.525 -500 I 0.502 -501 D 0.486 -502 R 0.451 -503 V 0.392 -504 G 0.327 -505 Q 0.276 -506 T 0.249 -507 I 0.253 -508 E 0.285 -509 R 0.336 -510 M 0.400 -511 G 0.465 -512 S 0.506 -513 G 0.511 -514 V 0.501 -515 E 0.488 -516 R 0.466 -517 M 0.446 -518 G 0.448 -519 P 0.466 -520 A 0.483 -521 I 0.501 -522 E 0.524 -523 R 0.544 -524 M 0.568 -525 G 0.599 -526 L 0.621 -527 S 0.623 -528 M 0.610 -529 D 0.579 -530 R 0.519 -531 M 0.447 -532 V 0.403 -533 P 0.411 -534 T 0.455 -535 G 0.508 -536 M 0.560 -537 G 0.606 -538 A 0.634 -539 S 0.640 -540 L 0.629 -541 E 0.602 -542 R 0.562 -543 M 0.525 -544 G 0.508 -545 P 0.509 -546 V 0.515 -547 M 0.523 -548 D 0.528 -549 R 0.520 -550 M 0.508 -551 A 0.505 -552 T 0.501 -553 G 0.501 -554 L 0.521 -555 E 0.549 -556 R 0.551 -557 M 0.527 -558 G 0.510 -559 A 0.513 -560 N 0.521 -561 N 0.522 -562 L 0.530 -563 E 0.554 -564 R 0.571 -565 M 0.563 -566 G 0.542 -567 L 0.538 -568 E 0.559 -569 R 0.582 -570 M 0.594 -571 G 0.609 -572 A 0.632 -573 N 0.643 -574 S 0.623 -575 L 0.597 -576 E 0.595 -577 R 0.607 -578 M 0.613 -579 G 0.617 -580 L 0.631 -581 E 0.645 -582 R 0.648 -583 M 0.651 -584 G 0.670 -585 A 0.696 -586 N 0.711 -587 S 0.711 -588 L 0.706 -589 E 0.699 -590 R 0.684 -591 M 0.670 -592 G 0.677 -593 P 0.703 -594 A 0.723 -595 M 0.727 -596 G 0.728 -597 P 0.735 -598 A 0.734 -599 L 0.703 -600 G 0.649 -601 A 0.619 -602 G 0.646 -603 I 0.701 -604 E 0.742 -605 R 0.761 -606 M 0.770 -607 G 0.774 -608 L 0.774 -609 A 0.772 -610 M 0.772 -611 G 0.778 -612 G 0.789 -613 A 0.800 -614 G 0.806 -615 G 0.806 -616 A 0.798 -617 S 0.780 -618 F 0.760 -619 D 0.748 -620 R 0.738 -621 A 0.721 -622 I 0.699 -623 E 0.690 -624 M 0.701 -625 E 0.720 -626 R 0.732 -627 G 0.735 -628 N 0.735 -629 F 0.739 -630 G 0.751 -631 G 0.761 -632 S 0.764 -633 F 0.763 -634 A 0.766 -635 G 0.771 -636 S 0.774 -637 F 0.776 -638 G 0.780 -639 G 0.783 -640 A 0.778 -641 G 0.761 -642 G 0.739 -643 H 0.721 -644 A 0.717 -645 P 0.721 -646 G 0.721 -647 V 0.694 -648 A 0.625 -649 R 0.513 -650 K 0.381 -651 A 0.258 -652 C 0.162 -653 Q 0.099 -654 I 0.067 -655 F 0.055 -656 V 0.056 -657 R 0.062 -658 N 0.070 -659 L 0.074 -660 P 0.072 -661 F 0.068 -662 D 0.065 -663 F 0.058 -664 T 0.046 -665 W 0.035 -666 K 0.029 -667 M 0.029 -668 L 0.034 -669 K 0.041 -670 D 0.047 -671 K 0.048 -672 F 0.049 -673 N 0.052 -674 E 0.056 -675 C 0.060 -676 G 0.065 -677 H 0.072 -678 V 0.076 -679 L 0.074 -680 Y 0.072 -681 A 0.073 -682 D 0.078 -683 I 0.085 -684 K 0.095 -685 M 0.110 -686 E 0.128 -687 N 0.142 -688 G 0.150 -689 K 0.145 -690 S 0.128 -691 K 0.109 -692 G 0.091 -693 C 0.075 -694 G 0.060 -695 V 0.051 -696 V 0.051 -697 K 0.058 -698 F 0.066 -699 E 0.070 -700 S 0.069 -701 P 0.065 -702 E 0.060 -703 V 0.055 -704 A 0.051 -705 E 0.051 -706 R 0.053 -707 A 0.056 -708 C 0.056 -709 R 0.056 -710 M 0.056 -711 M 0.058 -712 N 0.061 -713 G 0.068 -714 M 0.077 -715 K 0.082 -716 L 0.082 -717 S 0.083 -718 G 0.091 -719 R 0.099 -720 E 0.099 -721 I 0.089 -722 D 0.075 -723 V 0.066 -724 R 0.069 -725 I 0.084 -726 D 0.111 -727 R 0.146 -728 N 0.184 -729 A 0.210 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000059208.16_ENSMUST00000148178.8_GN:Hnrnpm_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:80.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000059208.16_ENSMUST00000148178.8_GN:Hnrnpm_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:80.caid deleted file mode 100644 index 199034f815703270c7523a8f6c60709ee802b2f6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000059208.16_ENSMUST00000148178.8_GN:Hnrnpm_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:80.caid +++ /dev/null @@ -1,810 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000059208.16|ENSMUST00000148178.8|GN:Hnrnpm|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:80 -1 M 0.411 -2 S 0.448 -3 D 0.498 -4 T 0.535 -5 Y 0.548 -6 L 0.550 -7 S 0.558 -8 P 0.579 -9 C 0.607 -10 P 0.634 -11 T 0.652 -12 T 0.656 -13 Q 0.650 -14 L 0.649 -15 Y 0.651 -16 L 0.645 -17 R 0.638 -18 T 0.649 -19 S 0.674 -20 G 0.693 -21 S 0.698 -22 E 0.685 -23 A 0.644 -24 C 0.575 -25 H 0.516 -26 W 0.490 -27 R 0.484 -28 R 0.496 -29 R 0.546 -30 G 0.615 -31 L 0.664 -32 T 0.686 -33 S 0.698 -34 R 0.704 -35 G 0.700 -36 R 0.693 -37 D 0.692 -38 P 0.700 -39 R 0.714 -40 R 0.733 -41 A 0.750 -42 G 0.756 -43 S 0.753 -44 G 0.742 -45 S 0.723 -46 R 0.700 -47 S 0.687 -48 P 0.689 -49 H 0.699 -50 K 0.713 -51 E 0.727 -52 A 0.734 -53 L 0.736 -54 L 0.743 -55 V 0.751 -56 V 0.750 -57 R 0.742 -58 G 0.733 -59 H 0.715 -60 V 0.670 -61 S 0.600 -62 A 0.530 -63 Q 0.488 -64 A 0.475 -65 Q 0.473 -66 L 0.471 -67 D 0.469 -68 R 0.472 -69 A 0.484 -70 R 0.513 -71 S 0.544 -72 L 0.553 -73 T 0.532 -74 Q 0.509 -75 S 0.517 -76 P 0.561 -77 D 0.615 -78 A 0.650 -79 E 0.663 -80 K 0.662 -81 M 0.657 -82 A 0.649 -83 A 0.637 -84 G 0.614 -85 V 0.585 -86 E 0.570 -87 A 0.577 -88 A 0.572 -89 A 0.544 -90 E 0.535 -91 V 0.568 -92 A 0.609 -93 A 0.626 -94 T 0.638 -95 E 0.666 -96 P 0.708 -97 K 0.747 -98 M 0.772 -99 E 0.781 -100 E 0.780 -101 E 0.776 -102 S 0.772 -103 G 0.767 -104 A 0.764 -105 P 0.763 -106 C 0.752 -107 V 0.712 -108 P 0.654 -109 S 0.633 -110 G 0.676 -111 N 0.741 -112 G 0.777 -113 A 0.780 -114 P 0.774 -115 G 0.771 -116 P 0.772 -117 K 0.771 -118 G 0.765 -119 E 0.752 -120 E 0.731 -121 R 0.705 -122 P 0.678 -123 T 0.651 -124 Q 0.624 -125 N 0.594 -126 E 0.560 -127 K 0.527 -128 R 0.516 -129 K 0.537 -130 E 0.573 -131 K 0.608 -132 N 0.640 -133 I 0.663 -134 K 0.675 -135 R 0.684 -136 G 0.695 -137 G 0.704 -138 N 0.697 -139 R 0.671 -140 F 0.641 -141 E 0.620 -142 P 0.602 -143 Y 0.578 -144 S 0.541 -145 N 0.490 -146 P 0.420 -147 T 0.329 -148 K 0.228 -149 R 0.138 -150 Y 0.074 -151 R 0.041 -152 A 0.029 -153 F 0.028 -154 I 0.031 -155 T 0.038 -156 N 0.048 -157 I 0.054 -158 P 0.053 -159 F 0.048 -160 D 0.043 -161 V 0.037 -162 K 0.029 -163 W 0.021 -164 Q 0.019 -165 S 0.022 -166 L 0.031 -167 K 0.045 -168 D 0.053 -169 L 0.050 -170 V 0.042 -171 K 0.037 -172 E 0.036 -173 K 0.039 -174 V 0.041 -175 G 0.042 -176 E 0.040 -177 V 0.038 -178 T 0.037 -179 Y 0.039 -180 V 0.045 -181 E 0.055 -182 L 0.068 -183 L 0.085 -184 M 0.101 -185 D 0.112 -186 A 0.114 -187 E 0.112 -188 G 0.109 -189 K 0.100 -190 S 0.083 -191 R 0.066 -192 G 0.051 -193 C 0.037 -194 A 0.027 -195 V 0.022 -196 V 0.024 -197 E 0.032 -198 F 0.040 -199 K 0.042 -200 M 0.037 -201 E 0.031 -202 E 0.027 -203 S 0.025 -204 M 0.024 -205 K 0.023 -206 K 0.024 -207 A 0.025 -208 A 0.026 -209 E 0.029 -210 V 0.031 -211 L 0.031 -212 N 0.030 -213 K 0.030 -214 H 0.033 -215 S 0.038 -216 L 0.046 -217 S 0.058 -218 G 0.068 -219 R 0.071 -220 P 0.064 -221 L 0.054 -222 K 0.047 -223 V 0.048 -224 K 0.061 -225 E 0.085 -226 D 0.109 -227 P 0.118 -228 D 0.112 -229 G 0.100 -230 E 0.087 -231 H 0.076 -232 A 0.070 -233 R 0.075 -234 R 0.090 -235 A 0.117 -236 M 0.153 -237 Q 0.193 -238 K 0.229 -239 V 0.257 -240 M 0.289 -241 A 0.339 -242 T 0.410 -243 T 0.487 -244 G 0.562 -245 G 0.621 -246 M 0.654 -247 G 0.659 -248 M 0.649 -249 G 0.636 -250 P 0.625 -251 G 0.615 -252 G 0.600 -253 P 0.564 -254 G 0.497 -255 M 0.409 -256 I 0.322 -257 N 0.248 -258 I 0.188 -259 P 0.146 -260 P 0.124 -261 S 0.119 -262 I 0.124 -263 L 0.139 -264 N 0.165 -265 N 0.187 -266 P 0.191 -267 N 0.176 -268 I 0.148 -269 P 0.114 -270 N 0.084 -271 E 0.064 -272 I 0.054 -273 I 0.048 -274 H 0.044 -275 A 0.042 -276 L 0.045 -277 Q 0.056 -278 A 0.071 -279 G 0.082 -280 R 0.082 -281 L 0.073 -282 G 0.057 -283 S 0.040 -284 T 0.029 -285 V 0.024 -286 F 0.023 -287 V 0.025 -288 A 0.030 -289 N 0.038 -290 L 0.044 -291 D 0.043 -292 Y 0.039 -293 K 0.035 -294 V 0.032 -295 G 0.029 -296 W 0.025 -297 K 0.021 -298 K 0.021 -299 L 0.025 -300 K 0.033 -301 E 0.038 -302 V 0.038 -303 F 0.036 -304 S 0.037 -305 M 0.042 -306 A 0.050 -307 G 0.058 -308 V 0.063 -309 V 0.062 -310 V 0.057 -311 R 0.052 -312 A 0.053 -313 D 0.062 -314 I 0.077 -315 L 0.097 -316 E 0.115 -317 D 0.125 -318 K 0.129 -319 D 0.136 -320 G 0.142 -321 K 0.135 -322 S 0.115 -323 R 0.091 -324 G 0.070 -325 I 0.051 -326 G 0.036 -327 I 0.029 -328 V 0.031 -329 T 0.038 -330 F 0.045 -331 E 0.046 -332 Q 0.042 -333 S 0.038 -334 I 0.035 -335 E 0.034 -336 A 0.035 -337 V 0.037 -338 Q 0.039 -339 A 0.039 -340 I 0.037 -341 S 0.032 -342 M 0.027 -343 F 0.025 -344 N 0.026 -345 G 0.030 -346 Q 0.035 -347 L 0.037 -348 L 0.038 -349 F 0.042 -350 D 0.051 -351 R 0.058 -352 P 0.059 -353 M 0.055 -354 H 0.050 -355 V 0.049 -356 K 0.053 -357 M 0.066 -358 D 0.088 -359 E 0.116 -360 R 0.154 -361 A 0.211 -362 L 0.291 -363 P 0.383 -364 K 0.471 -365 G 0.531 -366 D 0.546 -367 F 0.530 -368 F 0.523 -369 P 0.548 -370 P 0.598 -371 E 0.646 -372 R 0.678 -373 P 0.696 -374 Q 0.704 -375 Q 0.707 -376 L 0.711 -377 P 0.720 -378 H 0.733 -379 G 0.744 -380 L 0.751 -381 G 0.759 -382 G 0.768 -383 I 0.775 -384 G 0.780 -385 M 0.777 -386 G 0.758 -387 L 0.732 -388 G 0.717 -389 P 0.720 -390 G 0.729 -391 G 0.736 -392 Q 0.741 -393 P 0.747 -394 I 0.752 -395 D 0.752 -396 A 0.748 -397 N 0.744 -398 H 0.746 -399 L 0.759 -400 S 0.778 -401 K 0.795 -402 G 0.808 -403 I 0.816 -404 G 0.820 -405 M 0.823 -406 G 0.820 -407 N 0.808 -408 L 0.793 -409 G 0.789 -410 P 0.799 -411 A 0.812 -412 G 0.813 -413 M 0.790 -414 G 0.733 -415 M 0.661 -416 E 0.623 -417 G 0.650 -418 I 0.706 -419 G 0.746 -420 F 0.764 -421 G 0.771 -422 I 0.774 -423 N 0.779 -424 K 0.788 -425 I 0.800 -426 G 0.806 -427 G 0.802 -428 M 0.790 -429 E 0.780 -430 G 0.776 -431 P 0.779 -432 F 0.789 -433 G 0.805 -434 G 0.815 -435 G 0.813 -436 M 0.805 -437 E 0.798 -438 N 0.790 -439 M 0.779 -440 G 0.772 -441 R 0.771 -442 F 0.775 -443 G 0.777 -444 S 0.764 -445 G 0.730 -446 M 0.684 -447 N 0.643 -448 M 0.612 -449 G 0.582 -450 R 0.543 -451 I 0.502 -452 N 0.472 -453 E 0.453 -454 I 0.443 -455 L 0.441 -456 S 0.440 -457 N 0.440 -458 A 0.448 -459 L 0.472 -460 K 0.518 -461 R 0.588 -462 G 0.664 -463 E 0.721 -464 I 0.747 -465 I 0.753 -466 A 0.753 -467 K 0.752 -468 Q 0.753 -469 G 0.760 -470 G 0.774 -471 G 0.792 -472 G 0.807 -473 A 0.814 -474 G 0.810 -475 G 0.797 -476 S 0.784 -477 V 0.779 -478 P 0.781 -479 G 0.783 -480 I 0.778 -481 E 0.768 -482 R 0.757 -483 M 0.752 -484 G 0.755 -485 P 0.764 -486 G 0.769 -487 I 0.763 -488 D 0.740 -489 R 0.701 -490 I 0.664 -491 S 0.658 -492 G 0.680 -493 A 0.702 -494 G 0.713 -495 M 0.722 -496 E 0.732 -497 R 0.730 -498 M 0.715 -499 G 0.705 -500 A 0.707 -501 G 0.713 -502 L 0.716 -503 G 0.718 -504 H 0.708 -505 G 0.685 -506 M 0.660 -507 D 0.632 -508 R 0.582 -509 V 0.507 -510 G 0.426 -511 S 0.361 -512 E 0.325 -513 I 0.318 -514 E 0.328 -515 R 0.342 -516 M 0.356 -517 G 0.369 -518 L 0.374 -519 V 0.378 -520 M 0.399 -521 D 0.431 -522 R 0.456 -523 M 0.472 -524 G 0.487 -525 S 0.502 -526 V 0.523 -527 E 0.552 -528 R 0.580 -529 M 0.601 -530 G 0.623 -531 S 0.643 -532 S 0.643 -533 I 0.615 -534 E 0.560 -535 R 0.485 -536 M 0.413 -537 G 0.378 -538 P 0.387 -539 L 0.416 -540 G 0.440 -541 L 0.447 -542 D 0.434 -543 H 0.403 -544 M 0.366 -545 A 0.337 -546 S 0.324 -547 S 0.333 -548 I 0.359 -549 E 0.381 -550 R 0.383 -551 M 0.366 -552 G 0.336 -553 Q 0.311 -554 T 0.318 -555 M 0.367 -556 E 0.422 -557 R 0.445 -558 I 0.447 -559 G 0.462 -560 S 0.489 -561 G 0.509 -562 V 0.525 -563 E 0.539 -564 R 0.531 -565 M 0.512 -566 G 0.519 -567 A 0.560 -568 G 0.602 -569 M 0.630 -570 G 0.652 -571 F 0.666 -572 G 0.667 -573 L 0.665 -574 E 0.671 -575 R 0.675 -576 M 0.668 -577 A 0.645 -578 A 0.610 -579 P 0.575 -580 I 0.553 -581 D 0.535 -582 R 0.498 -583 V 0.438 -584 G 0.373 -585 Q 0.321 -586 T 0.298 -587 I 0.310 -588 E 0.351 -589 R 0.406 -590 M 0.470 -591 G 0.533 -592 S 0.572 -593 G 0.576 -594 V 0.564 -595 E 0.547 -596 R 0.522 -597 M 0.501 -598 G 0.503 -599 P 0.521 -600 A 0.536 -601 I 0.551 -602 E 0.572 -603 R 0.594 -604 M 0.618 -605 G 0.645 -606 L 0.663 -607 S 0.661 -608 M 0.645 -609 D 0.609 -610 R 0.543 -611 M 0.465 -612 V 0.419 -613 P 0.427 -614 T 0.474 -615 G 0.531 -616 M 0.589 -617 G 0.639 -618 A 0.668 -619 S 0.672 -620 L 0.658 -621 E 0.632 -622 R 0.598 -623 M 0.567 -624 G 0.554 -625 P 0.556 -626 V 0.561 -627 M 0.567 -628 D 0.568 -629 R 0.557 -630 M 0.543 -631 A 0.537 -632 T 0.533 -633 G 0.532 -634 L 0.550 -635 E 0.576 -636 R 0.578 -637 M 0.556 -638 G 0.541 -639 A 0.546 -640 N 0.553 -641 N 0.553 -642 L 0.561 -643 E 0.585 -644 R 0.605 -645 M 0.600 -646 G 0.581 -647 L 0.578 -648 E 0.596 -649 R 0.615 -650 M 0.625 -651 G 0.639 -652 A 0.660 -653 N 0.667 -654 S 0.647 -655 L 0.623 -656 E 0.623 -657 R 0.637 -658 M 0.643 -659 G 0.646 -660 L 0.656 -661 E 0.667 -662 R 0.669 -663 M 0.671 -664 G 0.688 -665 A 0.712 -666 N 0.725 -667 S 0.724 -668 L 0.719 -669 E 0.712 -670 R 0.699 -671 M 0.686 -672 G 0.692 -673 P 0.715 -674 A 0.734 -675 M 0.740 -676 G 0.741 -677 P 0.747 -678 A 0.744 -679 L 0.712 -680 G 0.657 -681 A 0.625 -682 G 0.652 -683 I 0.708 -684 E 0.748 -685 R 0.767 -686 M 0.776 -687 G 0.780 -688 L 0.780 -689 A 0.778 -690 M 0.778 -691 G 0.784 -692 G 0.794 -693 A 0.805 -694 G 0.811 -695 G 0.811 -696 A 0.803 -697 S 0.786 -698 F 0.767 -699 D 0.756 -700 R 0.748 -701 A 0.733 -702 I 0.713 -703 E 0.703 -704 M 0.713 -705 E 0.730 -706 R 0.740 -707 G 0.742 -708 N 0.741 -709 F 0.745 -710 G 0.756 -711 G 0.766 -712 S 0.769 -713 F 0.768 -714 A 0.771 -715 G 0.776 -716 S 0.779 -717 F 0.781 -718 G 0.786 -719 G 0.788 -720 A 0.782 -721 G 0.765 -722 G 0.744 -723 H 0.727 -724 A 0.722 -725 P 0.726 -726 G 0.724 -727 V 0.696 -728 A 0.626 -729 R 0.513 -730 K 0.380 -731 A 0.258 -732 C 0.163 -733 Q 0.100 -734 I 0.067 -735 F 0.056 -736 V 0.056 -737 R 0.061 -738 N 0.069 -739 L 0.072 -740 P 0.071 -741 F 0.067 -742 D 0.064 -743 F 0.057 -744 T 0.045 -745 W 0.034 -746 K 0.029 -747 M 0.031 -748 L 0.041 -749 K 0.055 -750 D 0.064 -751 K 0.062 -752 F 0.056 -753 N 0.055 -754 E 0.057 -755 C 0.060 -756 G 0.065 -757 H 0.071 -758 V 0.074 -759 L 0.073 -760 Y 0.070 -761 A 0.072 -762 D 0.077 -763 I 0.084 -764 K 0.094 -765 M 0.110 -766 E 0.128 -767 N 0.143 -768 G 0.151 -769 K 0.145 -770 S 0.128 -771 K 0.108 -772 G 0.090 -773 C 0.074 -774 G 0.060 -775 V 0.051 -776 V 0.051 -777 K 0.058 -778 F 0.066 -779 E 0.070 -780 S 0.069 -781 P 0.066 -782 E 0.061 -783 V 0.056 -784 A 0.052 -785 E 0.051 -786 R 0.053 -787 A 0.056 -788 C 0.056 -789 R 0.056 -790 M 0.056 -791 M 0.057 -792 N 0.059 -793 G 0.066 -794 M 0.075 -795 K 0.080 -796 L 0.081 -797 S 0.083 -798 G 0.090 -799 R 0.099 -800 E 0.100 -801 I 0.091 -802 D 0.076 -803 V 0.067 -804 R 0.069 -805 I 0.083 -806 D 0.109 -807 R 0.141 -808 N 0.174 -809 A 0.198 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000059355.14_ENSMUST00000079764.14_GN:Wdr83os_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000059355.14_ENSMUST00000079764.14_GN:Wdr83os_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 161eb93cd38a23aec8c21b44033779c7b4effb61..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000059355.14_ENSMUST00000079764.14_GN:Wdr83os_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,107 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000059355.14|ENSMUST00000079764.14|GN:Wdr83os|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.552 -2 S 0.568 -3 T 0.598 -4 N 0.631 -5 N 0.649 -6 M 0.644 -7 S 0.618 -8 D 0.581 -9 P 0.541 -10 R 0.516 -11 R 0.527 -12 P 0.570 -13 N 0.608 -14 K 0.619 -15 V 0.603 -16 L 0.568 -17 R 0.527 -18 Y 0.507 -19 K 0.522 -20 P 0.568 -21 P 0.622 -22 P 0.669 -23 S 0.699 -24 E 0.707 -25 C 0.695 -26 N 0.674 -27 P 0.658 -28 A 0.646 -29 L 0.625 -30 D 0.590 -31 D 0.553 -32 P 0.518 -33 T 0.476 -34 P 0.412 -35 D 0.320 -36 Y 0.223 -37 M 0.152 -38 N 0.117 -39 L 0.104 -40 L 0.097 -41 G 0.087 -42 M 0.073 -43 I 0.059 -44 F 0.054 -45 S 0.062 -46 M 0.071 -47 C 0.079 -48 G 0.087 -49 L 0.097 -50 M 0.105 -51 L 0.108 -52 K 0.105 -53 L 0.096 -54 K 0.083 -55 W 0.068 -56 C 0.055 -57 A 0.048 -58 W 0.048 -59 V 0.053 -60 A 0.061 -61 V 0.069 -62 Y 0.069 -63 C 0.059 -64 S 0.047 -65 F 0.044 -66 I 0.053 -67 S 0.068 -68 F 0.084 -69 A 0.105 -70 N 0.133 -71 S 0.164 -72 R 0.189 -73 S 0.201 -74 S 0.203 -75 E 0.196 -76 D 0.181 -77 T 0.157 -78 K 0.126 -79 Q 0.100 -80 M 0.082 -81 M 0.069 -82 S 0.058 -83 S 0.050 -84 F 0.044 -85 M 0.042 -86 L 0.042 -87 S 0.043 -88 I 0.043 -89 S 0.041 -90 A 0.038 -91 V 0.037 -92 V 0.038 -93 M 0.045 -94 S 0.060 -95 Y 0.086 -96 L 0.135 -97 Q 0.212 -98 N 0.306 -99 P 0.397 -100 Q 0.471 -101 P 0.516 -102 M 0.526 -103 T 0.502 -104 P 0.460 -105 P 0.411 -106 W 0.377 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000059355.14_ENSMUST00000079764.14_GN:Wdr83os_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:80.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000059355.14_ENSMUST00000079764.14_GN:Wdr83os_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:80.caid deleted file mode 100644 index c2d4d64063de256e829abdd1cc6bc7c60a5af5ee..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000059355.14_ENSMUST00000079764.14_GN:Wdr83os_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:80.caid +++ /dev/null @@ -1,187 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000059355.14|ENSMUST00000079764.14|GN:Wdr83os|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:80 -1 M 0.357 -2 T 0.374 -3 V 0.409 -4 L 0.460 -5 G 0.511 -6 I 0.539 -7 L 0.546 -8 K 0.549 -9 S 0.550 -10 P 0.545 -11 F 0.535 -12 S 0.517 -13 F 0.490 -14 F 0.468 -15 S 0.465 -16 L 0.467 -17 D 0.448 -18 F 0.405 -19 L 0.371 -20 L 0.383 -21 S 0.445 -22 R 0.519 -23 N 0.568 -24 C 0.588 -25 F 0.599 -26 G 0.601 -27 L 0.578 -28 F 0.535 -29 S 0.487 -30 F 0.439 -31 S 0.391 -32 F 0.346 -33 F 0.314 -34 W 0.313 -35 L 0.344 -36 R 0.393 -37 V 0.450 -38 V 0.519 -39 P 0.597 -40 L 0.673 -41 T 0.734 -42 A 0.771 -43 I 0.784 -44 G 0.787 -45 N 0.789 -46 R 0.788 -47 S 0.783 -48 A 0.775 -49 G 0.770 -50 Y 0.768 -51 W 0.766 -52 C 0.765 -53 Y 0.767 -54 S 0.766 -55 K 0.753 -56 S 0.728 -57 H 0.705 -58 P 0.694 -59 S 0.692 -60 F 0.688 -61 P 0.682 -62 R 0.686 -63 P 0.696 -64 E 0.699 -65 V 0.685 -66 A 0.657 -67 L 0.636 -68 L 0.643 -69 A 0.665 -70 V 0.676 -71 K 0.676 -72 E 0.686 -73 G 0.705 -74 R 0.714 -75 R 0.717 -76 G 0.716 -77 L 0.712 -78 Q 0.710 -79 F 0.717 -80 A 0.731 -81 M 0.748 -82 S 0.770 -83 T 0.787 -84 N 0.791 -85 N 0.774 -86 M 0.739 -87 S 0.691 -88 D 0.636 -89 P 0.578 -90 R 0.540 -91 R 0.547 -92 P 0.592 -93 N 0.638 -94 K 0.660 -95 V 0.654 -96 L 0.626 -97 R 0.586 -98 Y 0.559 -99 K 0.568 -100 P 0.613 -101 P 0.669 -102 P 0.714 -103 S 0.738 -104 E 0.742 -105 C 0.726 -106 N 0.704 -107 P 0.686 -108 A 0.670 -109 L 0.646 -110 D 0.610 -111 D 0.570 -112 P 0.530 -113 T 0.484 -114 P 0.418 -115 D 0.325 -116 Y 0.226 -117 M 0.153 -118 N 0.117 -119 L 0.104 -120 L 0.098 -121 G 0.092 -122 M 0.080 -123 I 0.066 -124 F 0.060 -125 S 0.065 -126 M 0.073 -127 C 0.080 -128 G 0.087 -129 L 0.096 -130 M 0.104 -131 L 0.109 -132 K 0.108 -133 L 0.100 -134 K 0.086 -135 W 0.069 -136 C 0.056 -137 A 0.049 -138 W 0.049 -139 V 0.052 -140 A 0.054 -141 V 0.054 -142 Y 0.049 -143 C 0.042 -144 S 0.037 -145 F 0.040 -146 I 0.051 -147 S 0.068 -148 F 0.087 -149 A 0.109 -150 N 0.136 -151 S 0.166 -152 R 0.189 -153 S 0.202 -154 S 0.206 -155 E 0.201 -156 D 0.185 -157 T 0.157 -158 K 0.124 -159 Q 0.097 -160 M 0.080 -161 M 0.069 -162 S 0.060 -163 S 0.054 -164 F 0.049 -165 M 0.045 -166 L 0.044 -167 S 0.044 -168 I 0.044 -169 S 0.043 -170 A 0.041 -171 V 0.040 -172 V 0.042 -173 M 0.049 -174 S 0.064 -175 Y 0.091 -176 L 0.138 -177 Q 0.211 -178 N 0.302 -179 P 0.392 -180 Q 0.469 -181 P 0.519 -182 M 0.531 -183 T 0.507 -184 P 0.463 -185 P 0.415 -186 W 0.382 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000059741.14_ENSMUST00000079784.12_GN:Myl3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000059741.14_ENSMUST00000079784.12_GN:Myl3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index f5783f983f9c436b4b9565b832c8d8d6475ed4fd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000059741.14_ENSMUST00000079784.12_GN:Myl3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,205 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000059741.14|ENSMUST00000079784.12|GN:Myl3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.424 -2 A 0.447 -3 P 0.484 -4 K 0.522 -5 K 0.554 -6 P 0.582 -7 E 0.613 -8 P 0.648 -9 K 0.677 -10 K 0.694 -11 D 0.698 -12 D 0.684 -13 A 0.641 -14 K 0.580 -15 A 0.543 -16 A 0.559 -17 A 0.603 -18 P 0.639 -19 K 0.654 -20 A 0.651 -21 A 0.638 -22 P 0.626 -23 A 0.617 -24 P 0.597 -25 A 0.558 -26 A 0.534 -27 A 0.559 -28 P 0.613 -29 A 0.654 -30 A 0.670 -31 A 0.677 -32 P 0.685 -33 A 0.690 -34 A 0.684 -35 A 0.665 -36 P 0.645 -37 E 0.632 -38 P 0.626 -39 E 0.624 -40 R 0.623 -41 P 0.623 -42 K 0.616 -43 E 0.588 -44 A 0.527 -45 E 0.439 -46 F 0.346 -47 D 0.271 -48 A 0.220 -49 S 0.195 -50 K 0.188 -51 I 0.179 -52 K 0.152 -53 I 0.115 -54 E 0.082 -55 F 0.061 -56 T 0.050 -57 P 0.043 -58 E 0.038 -59 Q 0.033 -60 I 0.030 -61 E 0.030 -62 E 0.031 -63 F 0.036 -64 K 0.046 -65 E 0.051 -66 A 0.046 -67 F 0.036 -68 L 0.030 -69 L 0.031 -70 F 0.038 -71 D 0.049 -72 R 0.067 -73 T 0.092 -74 P 0.120 -75 K 0.143 -76 G 0.152 -77 E 0.143 -78 M 0.124 -79 K 0.102 -80 I 0.080 -81 T 0.061 -82 Y 0.052 -83 G 0.054 -84 Q 0.059 -85 C 0.061 -86 G 0.063 -87 D 0.071 -88 V 0.082 -89 L 0.094 -90 R 0.112 -91 A 0.140 -92 L 0.170 -93 G 0.185 -94 Q 0.179 -95 N 0.161 -96 P 0.141 -97 T 0.122 -98 Q 0.102 -99 A 0.085 -100 E 0.070 -101 V 0.059 -102 L 0.053 -103 R 0.052 -104 V 0.058 -105 L 0.068 -106 G 0.078 -107 K 0.083 -108 P 0.080 -109 K 0.072 -110 Q 0.063 -111 E 0.057 -112 E 0.054 -113 L 0.054 -114 N 0.056 -115 S 0.060 -116 K 0.063 -117 M 0.063 -118 M 0.056 -119 D 0.043 -120 F 0.031 -121 E 0.025 -122 T 0.026 -123 F 0.028 -124 L 0.029 -125 P 0.032 -126 M 0.035 -127 L 0.038 -128 Q 0.046 -129 H 0.063 -130 I 0.087 -131 S 0.113 -132 K 0.147 -133 N 0.193 -134 K 0.240 -135 D 0.265 -136 T 0.253 -137 G 0.209 -138 T 0.156 -139 Y 0.118 -140 E 0.104 -141 D 0.100 -142 F 0.095 -143 V 0.094 -144 E 0.101 -145 G 0.107 -146 L 0.103 -147 R 0.091 -148 V 0.084 -149 F 0.086 -150 D 0.095 -151 K 0.112 -152 E 0.137 -153 G 0.160 -154 N 0.170 -155 G 0.163 -156 T 0.145 -157 V 0.120 -158 M 0.093 -159 G 0.076 -160 A 0.074 -161 E 0.083 -162 L 0.093 -163 R 0.103 -164 H 0.113 -165 V 0.127 -166 L 0.140 -167 A 0.148 -168 T 0.151 -169 L 0.155 -170 G 0.169 -171 E 0.186 -172 R 0.195 -173 L 0.189 -174 T 0.175 -175 E 0.160 -176 D 0.150 -177 E 0.140 -178 V 0.123 -179 E 0.102 -180 K 0.091 -181 L 0.091 -182 M 0.096 -183 A 0.102 -184 G 0.112 -185 Q 0.128 -186 E 0.140 -187 D 0.144 -188 S 0.146 -189 N 0.154 -190 G 0.157 -191 C 0.142 -192 I 0.113 -193 N 0.080 -194 Y 0.055 -195 E 0.045 -196 A 0.044 -197 F 0.046 -198 V 0.048 -199 K 0.054 -200 H 0.068 -201 I 0.091 -202 M 0.119 -203 A 0.151 -204 S 0.177 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000059741.14_ENSMUST00000079784.12_GN:Myl3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:31.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000059741.14_ENSMUST00000079784.12_GN:Myl3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:31.caid deleted file mode 100644 index 15df37c76eb392dda665ffc3856b193d864ebce0..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000059741.14_ENSMUST00000079784.12_GN:Myl3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:31.caid +++ /dev/null @@ -1,236 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000059741.14|ENSMUST00000079784.12|GN:Myl3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:31 -1 M 0.396 -2 S 0.414 -3 R 0.446 -4 I 0.484 -5 K 0.517 -6 P 0.543 -7 R 0.564 -8 V 0.582 -9 V 0.590 -10 V 0.586 -11 G 0.574 -12 L 0.552 -13 T 0.518 -14 Y 0.483 -15 L 0.465 -16 T 0.462 -17 L 0.458 -18 F 0.452 -19 S 0.462 -20 F 0.490 -21 P 0.524 -22 S 0.550 -23 S 0.562 -24 L 0.565 -25 L 0.570 -26 F 0.581 -27 V 0.587 -28 I 0.591 -29 T 0.601 -30 A 0.622 -31 P 0.646 -32 M 0.665 -33 A 0.682 -34 P 0.695 -35 K 0.706 -36 K 0.710 -37 P 0.714 -38 E 0.725 -39 P 0.744 -40 K 0.764 -41 K 0.777 -42 D 0.776 -43 D 0.752 -44 A 0.698 -45 K 0.624 -46 A 0.576 -47 A 0.588 -48 A 0.636 -49 P 0.678 -50 K 0.699 -51 A 0.697 -52 A 0.683 -53 P 0.670 -54 A 0.661 -55 P 0.639 -56 A 0.596 -57 A 0.567 -58 A 0.581 -59 P 0.601 -60 A 0.590 -61 A 0.580 -62 A 0.616 -63 P 0.679 -64 A 0.723 -65 A 0.730 -66 A 0.714 -67 P 0.692 -68 E 0.679 -69 P 0.674 -70 E 0.672 -71 R 0.672 -72 P 0.675 -73 K 0.670 -74 E 0.639 -75 A 0.571 -76 E 0.472 -77 F 0.368 -78 D 0.282 -79 A 0.223 -80 S 0.192 -81 K 0.183 -82 I 0.172 -83 K 0.146 -84 I 0.109 -85 E 0.079 -86 F 0.059 -87 T 0.048 -88 P 0.041 -89 E 0.035 -90 Q 0.031 -91 I 0.029 -92 E 0.028 -93 E 0.030 -94 F 0.036 -95 K 0.045 -96 E 0.052 -97 A 0.047 -98 F 0.037 -99 L 0.031 -100 L 0.031 -101 F 0.037 -102 D 0.048 -103 R 0.065 -104 T 0.089 -105 P 0.118 -106 K 0.141 -107 G 0.150 -108 E 0.141 -109 M 0.121 -110 K 0.098 -111 I 0.076 -112 T 0.057 -113 Y 0.049 -114 G 0.052 -115 Q 0.058 -116 C 0.060 -117 G 0.064 -118 D 0.072 -119 V 0.082 -120 L 0.093 -121 R 0.109 -122 A 0.135 -123 L 0.164 -124 G 0.181 -125 Q 0.177 -126 N 0.161 -127 P 0.143 -128 T 0.123 -129 Q 0.103 -130 A 0.085 -131 E 0.071 -132 V 0.060 -133 L 0.054 -134 R 0.053 -135 V 0.060 -136 L 0.073 -137 G 0.085 -138 K 0.092 -139 P 0.090 -140 K 0.081 -141 Q 0.071 -142 E 0.063 -143 E 0.058 -144 L 0.057 -145 N 0.059 -146 S 0.064 -147 K 0.069 -148 M 0.070 -149 M 0.062 -150 D 0.048 -151 F 0.034 -152 E 0.028 -153 T 0.028 -154 F 0.029 -155 L 0.030 -156 P 0.033 -157 M 0.036 -158 L 0.039 -159 Q 0.048 -160 H 0.066 -161 I 0.091 -162 S 0.119 -163 K 0.154 -164 N 0.201 -165 K 0.248 -166 D 0.270 -167 T 0.254 -168 G 0.209 -169 T 0.156 -170 Y 0.120 -171 E 0.107 -172 D 0.103 -173 F 0.098 -174 V 0.097 -175 E 0.105 -176 G 0.111 -177 L 0.105 -178 R 0.092 -179 V 0.085 -180 F 0.085 -181 D 0.094 -182 K 0.110 -183 E 0.135 -184 G 0.159 -185 N 0.170 -186 G 0.166 -187 T 0.149 -188 V 0.124 -189 M 0.096 -190 G 0.078 -191 A 0.076 -192 E 0.084 -193 L 0.093 -194 R 0.100 -195 H 0.108 -196 V 0.119 -197 L 0.131 -198 A 0.138 -199 T 0.141 -200 L 0.144 -201 G 0.157 -202 E 0.173 -203 R 0.182 -204 L 0.177 -205 T 0.165 -206 E 0.151 -207 D 0.142 -208 E 0.133 -209 V 0.116 -210 E 0.097 -211 K 0.086 -212 L 0.086 -213 M 0.091 -214 A 0.097 -215 G 0.107 -216 Q 0.122 -217 E 0.134 -218 D 0.137 -219 S 0.140 -220 N 0.150 -221 G 0.153 -222 C 0.138 -223 I 0.108 -224 N 0.076 -225 Y 0.053 -226 E 0.043 -227 A 0.043 -228 F 0.046 -229 V 0.047 -230 K 0.053 -231 H 0.067 -232 I 0.088 -233 M 0.117 -234 A 0.152 -235 S 0.180 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000060679.15_ENSMUST00000057208.13_GN:Mrps9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000060679.15_ENSMUST00000057208.13_GN:Mrps9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 1d4deb5f19a6a570e18c2b224d45c8722ea1679b..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000060679.15_ENSMUST00000057208.13_GN:Mrps9_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,391 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000060679.15|ENSMUST00000057208.13|GN:Mrps9|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.360 -2 A 0.388 -3 A 0.430 -4 P 0.457 -5 C 0.452 -6 V 0.433 -7 S 0.431 -8 C 0.446 -9 G 0.451 -10 R 0.451 -11 V 0.461 -12 L 0.466 -13 S 0.444 -14 L 0.408 -15 W 0.387 -16 F 0.395 -17 T 0.429 -18 P 0.484 -19 A 0.534 -20 V 0.546 -21 R 0.524 -22 A 0.510 -23 S 0.532 -24 L 0.561 -25 C 0.569 -26 Q 0.571 -27 R 0.591 -28 P 0.626 -29 G 0.650 -30 Y 0.643 -31 W 0.604 -32 T 0.554 -33 A 0.533 -34 S 0.562 -35 A 0.612 -36 V 0.646 -37 G 0.659 -38 W 0.663 -39 Q 0.662 -40 T 0.657 -41 G 0.649 -42 T 0.640 -43 R 0.627 -44 F 0.611 -45 Q 0.586 -46 L 0.541 -47 S 0.480 -48 K 0.437 -49 L 0.435 -50 I 0.460 -51 H 0.492 -52 T 0.532 -53 T 0.567 -54 V 0.572 -55 V 0.547 -56 T 0.524 -57 T 0.520 -58 K 0.533 -59 K 0.548 -60 N 0.549 -61 V 0.530 -62 Q 0.495 -63 A 0.455 -64 S 0.419 -65 R 0.391 -66 Q 0.360 -67 E 0.310 -68 S 0.246 -69 Y 0.187 -70 T 0.148 -71 E 0.127 -72 D 0.116 -73 F 0.112 -74 I 0.115 -75 K 0.124 -76 K 0.138 -77 Q 0.150 -78 I 0.158 -79 E 0.162 -80 E 0.163 -81 F 0.157 -82 N 0.141 -83 I 0.121 -84 G 0.105 -85 K 0.092 -86 R 0.085 -87 H 0.085 -88 L 0.091 -89 A 0.099 -90 N 0.109 -91 M 0.119 -92 M 0.124 -93 G 0.123 -94 E 0.120 -95 D 0.116 -96 P 0.107 -97 E 0.093 -98 T 0.082 -99 F 0.079 -100 A 0.082 -101 E 0.085 -102 E 0.086 -103 D 0.085 -104 I 0.086 -105 D 0.085 -106 R 0.082 -107 A 0.079 -108 I 0.081 -109 A 0.095 -110 Y 0.124 -111 L 0.161 -112 F 0.195 -113 P 0.223 -114 S 0.243 -115 G 0.249 -116 L 0.236 -117 F 0.217 -118 E 0.204 -119 K 0.210 -120 R 0.237 -121 A 0.277 -122 R 0.313 -123 P 0.331 -124 M 0.323 -125 M 0.290 -126 K 0.242 -127 H 0.200 -128 P 0.186 -129 E 0.198 -130 H 0.221 -131 I 0.240 -132 F 0.255 -133 P 0.277 -134 K 0.307 -135 Q 0.335 -136 R 0.349 -137 A 0.354 -138 T 0.362 -139 Q 0.374 -140 W 0.380 -141 G 0.377 -142 E 0.364 -143 D 0.343 -144 G 0.317 -145 R 0.283 -146 P 0.241 -147 F 0.200 -148 H 0.172 -149 F 0.161 -150 L 0.166 -151 F 0.187 -152 Y 0.216 -153 T 0.237 -154 G 0.238 -155 K 0.217 -156 Q 0.188 -157 S 0.165 -158 Y 0.152 -159 Y 0.142 -160 S 0.130 -161 L 0.119 -162 M 0.112 -163 H 0.110 -164 D 0.106 -165 V 0.098 -166 Y 0.092 -167 G 0.089 -168 K 0.084 -169 V 0.081 -170 M 0.085 -171 Q 0.089 -172 L 0.088 -173 E 0.088 -174 K 0.099 -175 H 0.122 -176 R 0.158 -177 G 0.203 -178 P 0.250 -179 L 0.288 -180 S 0.318 -181 A 0.339 -182 S 0.345 -183 A 0.336 -184 E 0.314 -185 S 0.285 -186 R 0.251 -187 D 0.217 -188 L 0.190 -189 I 0.174 -190 G 0.165 -191 S 0.156 -192 R 0.143 -193 W 0.131 -194 L 0.121 -195 I 0.107 -196 K 0.091 -197 E 0.078 -198 E 0.069 -199 L 0.065 -200 E 0.068 -201 E 0.075 -202 M 0.081 -203 L 0.089 -204 V 0.103 -205 E 0.123 -206 K 0.140 -207 L 0.144 -208 S 0.135 -209 D 0.120 -210 E 0.106 -211 D 0.095 -212 Y 0.087 -213 A 0.084 -214 Q 0.088 -215 F 0.094 -216 I 0.097 -217 R 0.096 -218 L 0.091 -219 L 0.090 -220 E 0.097 -221 K 0.107 -222 L 0.109 -223 L 0.107 -224 T 0.113 -225 L 0.125 -226 P 0.134 -227 C 0.135 -228 G 0.129 -229 P 0.118 -230 A 0.106 -231 E 0.093 -232 E 0.080 -233 E 0.071 -234 F 0.067 -235 V 0.064 -236 Q 0.059 -237 R 0.055 -238 F 0.058 -239 R 0.074 -240 R 0.105 -241 S 0.150 -242 V 0.205 -243 T 0.269 -244 I 0.336 -245 Q 0.394 -246 S 0.434 -247 K 0.449 -248 K 0.443 -249 Q 0.426 -250 L 0.403 -251 I 0.374 -252 E 0.335 -253 P 0.285 -254 V 0.233 -255 Q 0.195 -256 Y 0.180 -257 D 0.185 -258 E 0.203 -259 Q 0.221 -260 G 0.221 -261 M 0.198 -262 A 0.155 -263 F 0.109 -264 S 0.077 -265 T 0.062 -266 S 0.061 -267 E 0.064 -268 G 0.067 -269 R 0.068 -270 R 0.071 -271 K 0.080 -272 S 0.095 -273 A 0.105 -274 T 0.101 -275 A 0.086 -276 Q 0.069 -277 A 0.059 -278 V 0.059 -279 V 0.069 -280 Y 0.086 -281 E 0.107 -282 H 0.133 -283 G 0.160 -284 S 0.184 -285 G 0.197 -286 K 0.194 -287 I 0.179 -288 H 0.161 -289 V 0.148 -290 N 0.138 -291 G 0.127 -292 V 0.111 -293 D 0.092 -294 Y 0.076 -295 L 0.066 -296 I 0.062 -297 Y 0.063 -298 F 0.068 -299 P 0.076 -300 I 0.081 -301 T 0.079 -302 Q 0.073 -303 D 0.072 -304 R 0.077 -305 E 0.084 -306 Q 0.085 -307 L 0.079 -308 M 0.070 -309 F 0.066 -310 P 0.064 -311 F 0.064 -312 H 0.063 -313 F 0.063 -314 L 0.062 -315 D 0.061 -316 R 0.065 -317 L 0.073 -318 E 0.079 -319 R 0.081 -320 H 0.082 -321 D 0.083 -322 V 0.080 -323 T 0.075 -324 C 0.077 -325 T 0.086 -326 V 0.097 -327 S 0.105 -328 G 0.115 -329 G 0.130 -330 G 0.145 -331 R 0.153 -332 S 0.157 -333 A 0.162 -334 Q 0.165 -335 A 0.161 -336 G 0.153 -337 A 0.145 -338 I 0.138 -339 R 0.130 -340 L 0.123 -341 A 0.121 -342 M 0.120 -343 A 0.116 -344 R 0.107 -345 A 0.096 -346 L 0.085 -347 C 0.075 -348 S 0.069 -349 F 0.066 -350 V 0.065 -351 T 0.066 -352 E 0.071 -353 D 0.077 -354 E 0.084 -355 V 0.094 -356 E 0.106 -357 W 0.113 -358 M 0.115 -359 R 0.122 -360 Q 0.137 -361 A 0.149 -362 G 0.149 -363 L 0.146 -364 L 0.151 -365 T 0.163 -366 P 0.175 -367 D 0.184 -368 P 0.194 -369 R 0.208 -370 I 0.230 -371 R 0.256 -372 E 0.278 -373 R 0.291 -374 K 0.300 -375 K 0.306 -376 P 0.312 -377 G 0.329 -378 Q 0.361 -379 E 0.400 -380 G 0.424 -381 A 0.419 -382 R 0.397 -383 R 0.384 -384 K 0.389 -385 F 0.403 -386 T 0.418 -387 W 0.432 -388 K 0.445 -389 K 0.453 -390 R 0.457 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000060679.15_ENSMUST00000057208.13_GN:Mrps9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000060679.15_ENSMUST00000057208.13_GN:Mrps9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:6.caid deleted file mode 100644 index c3574f60b93a5ae37a633d8b2d967b70f66658fd..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000060679.15_ENSMUST00000057208.13_GN:Mrps9_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:6.caid +++ /dev/null @@ -1,397 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000060679.15|ENSMUST00000057208.13|GN:Mrps9|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:6 -1 M 0.333 -2 F 0.361 -3 L 0.409 -4 T 0.458 -5 A 0.483 -6 N 0.489 -7 M 0.503 -8 A 0.533 -9 A 0.548 -10 P 0.527 -11 C 0.485 -12 V 0.460 -13 S 0.464 -14 C 0.475 -15 G 0.471 -16 R 0.472 -17 V 0.496 -18 L 0.518 -19 S 0.506 -20 L 0.468 -21 W 0.434 -22 F 0.423 -23 T 0.441 -24 P 0.486 -25 A 0.533 -26 V 0.548 -27 R 0.529 -28 A 0.518 -29 S 0.540 -30 L 0.566 -31 C 0.565 -32 Q 0.557 -33 R 0.577 -34 P 0.619 -35 G 0.653 -36 Y 0.655 -37 W 0.627 -38 T 0.588 -39 A 0.575 -40 S 0.602 -41 A 0.645 -42 V 0.672 -43 G 0.680 -44 W 0.682 -45 Q 0.680 -46 T 0.673 -47 G 0.665 -48 T 0.657 -49 R 0.646 -50 F 0.633 -51 Q 0.612 -52 L 0.569 -53 S 0.508 -54 K 0.464 -55 L 0.465 -56 I 0.490 -57 H 0.520 -58 T 0.556 -59 T 0.587 -60 V 0.588 -61 V 0.561 -62 T 0.532 -63 T 0.524 -64 K 0.534 -65 K 0.547 -66 N 0.548 -67 V 0.529 -68 Q 0.495 -69 A 0.457 -70 S 0.422 -71 R 0.393 -72 Q 0.361 -73 E 0.309 -74 S 0.244 -75 Y 0.184 -76 T 0.146 -77 E 0.125 -78 D 0.114 -79 F 0.110 -80 I 0.113 -81 K 0.122 -82 K 0.136 -83 Q 0.149 -84 I 0.156 -85 E 0.160 -86 E 0.160 -87 F 0.153 -88 N 0.137 -89 I 0.118 -90 G 0.101 -91 K 0.089 -92 R 0.082 -93 H 0.083 -94 L 0.091 -95 A 0.102 -96 N 0.114 -97 M 0.122 -98 M 0.125 -99 G 0.123 -100 E 0.119 -101 D 0.116 -102 P 0.107 -103 E 0.093 -104 T 0.081 -105 F 0.079 -106 A 0.082 -107 E 0.086 -108 E 0.086 -109 D 0.085 -110 I 0.085 -111 D 0.084 -112 R 0.081 -113 A 0.078 -114 I 0.080 -115 A 0.094 -116 Y 0.123 -117 L 0.160 -118 F 0.194 -119 P 0.223 -120 S 0.243 -121 G 0.248 -122 L 0.236 -123 F 0.217 -124 E 0.205 -125 K 0.211 -126 R 0.237 -127 A 0.277 -128 R 0.313 -129 P 0.331 -130 M 0.322 -131 M 0.289 -132 K 0.240 -133 H 0.198 -134 P 0.183 -135 E 0.196 -136 H 0.220 -137 I 0.239 -138 F 0.254 -139 P 0.277 -140 K 0.308 -141 Q 0.335 -142 R 0.348 -143 A 0.353 -144 T 0.360 -145 Q 0.372 -146 W 0.377 -147 G 0.373 -148 E 0.360 -149 D 0.339 -150 G 0.314 -151 R 0.281 -152 P 0.240 -153 F 0.199 -154 H 0.171 -155 F 0.159 -156 L 0.163 -157 F 0.185 -158 Y 0.213 -159 T 0.234 -160 G 0.235 -161 K 0.215 -162 Q 0.187 -163 S 0.164 -164 Y 0.151 -165 Y 0.141 -166 S 0.130 -167 L 0.118 -168 M 0.111 -169 H 0.109 -170 D 0.105 -171 V 0.097 -172 Y 0.091 -173 G 0.088 -174 K 0.084 -175 V 0.081 -176 M 0.084 -177 Q 0.089 -178 L 0.088 -179 E 0.088 -180 K 0.098 -181 H 0.122 -182 R 0.157 -183 G 0.203 -184 P 0.249 -185 L 0.288 -186 S 0.318 -187 A 0.338 -188 S 0.344 -189 A 0.334 -190 E 0.312 -191 S 0.282 -192 R 0.248 -193 D 0.214 -194 L 0.188 -195 I 0.172 -196 G 0.163 -197 S 0.155 -198 R 0.142 -199 W 0.131 -200 L 0.121 -201 I 0.107 -202 K 0.091 -203 E 0.078 -204 E 0.069 -205 L 0.065 -206 E 0.068 -207 E 0.074 -208 M 0.080 -209 L 0.088 -210 V 0.101 -211 E 0.120 -212 K 0.137 -213 L 0.141 -214 S 0.133 -215 D 0.118 -216 E 0.105 -217 D 0.094 -218 Y 0.086 -219 A 0.083 -220 Q 0.088 -221 F 0.093 -222 I 0.097 -223 R 0.096 -224 L 0.091 -225 L 0.089 -226 E 0.096 -227 K 0.106 -228 L 0.108 -229 L 0.106 -230 T 0.112 -231 L 0.125 -232 P 0.134 -233 C 0.135 -234 G 0.128 -235 P 0.118 -236 A 0.106 -237 E 0.093 -238 E 0.079 -239 E 0.071 -240 F 0.067 -241 V 0.063 -242 Q 0.059 -243 R 0.055 -244 F 0.058 -245 R 0.074 -246 R 0.105 -247 S 0.149 -248 V 0.204 -249 T 0.268 -250 I 0.334 -251 Q 0.393 -252 S 0.432 -253 K 0.448 -254 K 0.442 -255 Q 0.425 -256 L 0.403 -257 I 0.374 -258 E 0.335 -259 P 0.285 -260 V 0.234 -261 Q 0.196 -262 Y 0.180 -263 D 0.185 -264 E 0.203 -265 Q 0.220 -266 G 0.221 -267 M 0.197 -268 A 0.155 -269 F 0.109 -270 S 0.076 -271 T 0.062 -272 S 0.061 -273 E 0.064 -274 G 0.066 -275 R 0.068 -276 R 0.071 -277 K 0.080 -278 S 0.095 -279 A 0.105 -280 T 0.101 -281 A 0.086 -282 Q 0.069 -283 A 0.059 -284 V 0.059 -285 V 0.069 -286 Y 0.086 -287 E 0.108 -288 H 0.133 -289 G 0.160 -290 S 0.184 -291 G 0.197 -292 K 0.195 -293 I 0.180 -294 H 0.162 -295 V 0.149 -296 N 0.139 -297 G 0.128 -298 V 0.112 -299 D 0.093 -300 Y 0.076 -301 L 0.066 -302 I 0.063 -303 Y 0.064 -304 F 0.069 -305 P 0.077 -306 I 0.081 -307 T 0.079 -308 Q 0.073 -309 D 0.072 -310 R 0.077 -311 E 0.085 -312 Q 0.086 -313 L 0.079 -314 M 0.071 -315 F 0.066 -316 P 0.065 -317 F 0.064 -318 H 0.064 -319 F 0.064 -320 L 0.062 -321 D 0.061 -322 R 0.066 -323 L 0.074 -324 E 0.080 -325 R 0.082 -326 H 0.083 -327 D 0.083 -328 V 0.080 -329 T 0.076 -330 C 0.077 -331 T 0.086 -332 V 0.097 -333 S 0.106 -334 G 0.115 -335 G 0.130 -336 G 0.146 -337 R 0.154 -338 S 0.158 -339 A 0.162 -340 Q 0.165 -341 A 0.162 -342 G 0.153 -343 A 0.145 -344 I 0.138 -345 R 0.130 -346 L 0.124 -347 A 0.121 -348 M 0.121 -349 A 0.117 -350 R 0.108 -351 A 0.097 -352 L 0.085 -353 C 0.075 -354 S 0.069 -355 F 0.066 -356 V 0.065 -357 T 0.066 -358 E 0.071 -359 D 0.077 -360 E 0.083 -361 V 0.094 -362 E 0.106 -363 W 0.113 -364 M 0.115 -365 R 0.122 -366 Q 0.137 -367 A 0.149 -368 G 0.150 -369 L 0.146 -370 L 0.152 -371 T 0.164 -372 P 0.176 -373 D 0.185 -374 P 0.194 -375 R 0.208 -376 I 0.230 -377 R 0.256 -378 E 0.278 -379 R 0.292 -380 K 0.300 -381 K 0.306 -382 P 0.312 -383 G 0.329 -384 Q 0.361 -385 E 0.400 -386 G 0.423 -387 A 0.418 -388 R 0.397 -389 R 0.383 -390 K 0.388 -391 F 0.403 -392 T 0.418 -393 W 0.432 -394 K 0.444 -395 K 0.453 -396 R 0.456 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000062683.12_ENSMUST00000185641.7_GN:Atp5mc2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000062683.12_ENSMUST00000185641.7_GN:Atp5mc2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 5492a12629fe074cc66894da4ac4e4b8a23dd154..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000062683.12_ENSMUST00000185641.7_GN:Atp5mc2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,147 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000062683.12|ENSMUST00000185641.7|GN:Atp5mc2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.431 -2 Y 0.454 -3 A 0.490 -4 C 0.528 -5 S 0.564 -6 K 0.594 -7 F 0.621 -8 V 0.650 -9 S 0.676 -10 T 0.687 -11 R 0.683 -12 S 0.679 -13 L 0.687 -14 I 0.704 -15 R 0.718 -16 S 0.721 -17 T 0.702 -18 S 0.653 -19 L 0.594 -20 R 0.571 -21 S 0.597 -22 T 0.617 -23 S 0.592 -24 Q 0.564 -25 L 0.580 -26 L 0.623 -27 S 0.655 -28 R 0.674 -29 P 0.696 -30 L 0.725 -31 S 0.748 -32 A 0.753 -33 V 0.741 -34 E 0.727 -35 L 0.723 -36 K 0.730 -37 R 0.738 -38 P 0.739 -39 Q 0.735 -40 M 0.733 -41 P 0.738 -42 T 0.744 -43 D 0.742 -44 E 0.728 -45 S 0.709 -46 L 0.697 -47 S 0.696 -48 S 0.700 -49 L 0.702 -50 A 0.699 -51 V 0.689 -52 R 0.679 -53 R 0.680 -54 P 0.694 -55 L 0.709 -56 T 0.714 -57 S 0.703 -58 L 0.685 -59 I 0.673 -60 P 0.672 -61 S 0.676 -62 R 0.678 -63 S 0.677 -64 F 0.670 -65 Q 0.648 -66 T 0.609 -67 S 0.564 -68 A 0.515 -69 I 0.457 -70 S 0.395 -71 R 0.353 -72 D 0.338 -73 I 0.326 -74 D 0.302 -75 T 0.279 -76 A 0.264 -77 A 0.247 -78 K 0.240 -79 F 0.262 -80 I 0.300 -81 G 0.325 -82 A 0.331 -83 G 0.325 -84 A 0.305 -85 A 0.273 -86 T 0.249 -87 V 0.242 -88 G 0.242 -89 V 0.246 -90 A 0.265 -91 G 0.301 -92 S 0.335 -93 G 0.343 -94 A 0.320 -95 G 0.289 -96 I 0.281 -97 G 0.296 -98 T 0.300 -99 V 0.276 -100 F 0.249 -101 G 0.238 -102 S 0.227 -103 L 0.196 -104 I 0.160 -105 I 0.139 -106 G 0.130 -107 Y 0.129 -108 A 0.133 -109 R 0.136 -110 N 0.129 -111 P 0.109 -112 S 0.085 -113 L 0.065 -114 K 0.052 -115 Q 0.051 -116 Q 0.060 -117 L 0.074 -118 F 0.085 -119 S 0.089 -120 Y 0.086 -121 A 0.079 -122 I 0.074 -123 L 0.074 -124 G 0.076 -125 F 0.072 -126 A 0.065 -127 L 0.064 -128 S 0.065 -129 E 0.065 -130 A 0.066 -131 M 0.069 -132 G 0.068 -133 L 0.060 -134 F 0.055 -135 C 0.062 -136 L 0.078 -137 M 0.089 -138 V 0.085 -139 A 0.071 -140 F 0.056 -141 L 0.053 -142 I 0.062 -143 L 0.079 -144 F 0.100 -145 A 0.124 -146 M 0.142 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000062683.12_ENSMUST00000185641.7_GN:Atp5mc2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:44.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000062683.12_ENSMUST00000185641.7_GN:Atp5mc2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:44.caid deleted file mode 100644 index 28ed3fa9cf071df534634065ecf6006874d6d244..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000062683.12_ENSMUST00000185641.7_GN:Atp5mc2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:44.caid +++ /dev/null @@ -1,191 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000062683.12|ENSMUST00000185641.7|GN:Atp5mc2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:44 -1 M 0.529 -2 E 0.562 -3 K 0.607 -4 S 0.645 -5 D 0.669 -6 S 0.678 -7 L 0.669 -8 A 0.627 -9 P 0.544 -10 A 0.466 -11 A 0.459 -12 H 0.514 -13 A 0.557 -14 Q 0.579 -15 S 0.619 -16 L 0.671 -17 P 0.704 -18 S 0.713 -19 R 0.705 -20 F 0.694 -21 P 0.691 -22 R 0.703 -23 P 0.725 -24 R 0.749 -25 P 0.770 -26 S 0.782 -27 L 0.785 -28 S 0.780 -29 S 0.770 -30 L 0.757 -31 P 0.748 -32 W 0.750 -33 E 0.762 -34 Q 0.776 -35 P 0.788 -36 S 0.793 -37 C 0.790 -38 L 0.782 -39 G 0.770 -40 P 0.758 -41 S 0.753 -42 P 0.755 -43 L 0.763 -44 K 0.773 -45 M 0.784 -46 Y 0.790 -47 A 0.790 -48 C 0.789 -49 S 0.791 -50 K 0.794 -51 F 0.797 -52 V 0.802 -53 S 0.807 -54 T 0.811 -55 R 0.812 -56 S 0.813 -57 L 0.818 -58 I 0.826 -59 R 0.833 -60 S 0.835 -61 T 0.830 -62 S 0.824 -63 L 0.822 -64 R 0.825 -65 S 0.827 -66 T 0.824 -67 S 0.815 -68 Q 0.806 -69 L 0.798 -70 L 0.786 -71 S 0.773 -72 R 0.767 -73 P 0.775 -74 L 0.794 -75 S 0.810 -76 A 0.811 -77 V 0.798 -78 E 0.782 -79 L 0.776 -80 K 0.779 -81 R 0.783 -82 P 0.783 -83 Q 0.780 -84 M 0.779 -85 P 0.782 -86 T 0.784 -87 D 0.779 -88 E 0.766 -89 S 0.750 -90 L 0.740 -91 S 0.738 -92 S 0.742 -93 L 0.744 -94 A 0.740 -95 V 0.731 -96 R 0.722 -97 R 0.722 -98 P 0.732 -99 L 0.742 -100 T 0.742 -101 S 0.728 -102 L 0.706 -103 I 0.691 -104 P 0.690 -105 S 0.698 -106 R 0.703 -107 S 0.701 -108 F 0.688 -109 Q 0.660 -110 T 0.616 -111 S 0.566 -112 A 0.512 -113 I 0.448 -114 S 0.381 -115 R 0.334 -116 D 0.317 -117 I 0.308 -118 D 0.290 -119 T 0.271 -120 A 0.257 -121 A 0.239 -122 K 0.229 -123 F 0.248 -124 I 0.284 -125 G 0.309 -126 A 0.314 -127 G 0.307 -128 A 0.287 -129 A 0.258 -130 T 0.236 -131 V 0.229 -132 G 0.230 -133 V 0.236 -134 A 0.258 -135 G 0.295 -136 S 0.328 -137 G 0.337 -138 A 0.316 -139 G 0.289 -140 I 0.287 -141 G 0.308 -142 T 0.317 -143 V 0.292 -144 F 0.262 -145 G 0.248 -146 S 0.237 -147 L 0.206 -148 I 0.170 -149 I 0.150 -150 G 0.143 -151 Y 0.141 -152 A 0.145 -153 R 0.148 -154 N 0.140 -155 P 0.118 -156 S 0.092 -157 L 0.071 -158 K 0.057 -159 Q 0.054 -160 Q 0.062 -161 L 0.075 -162 F 0.085 -163 S 0.088 -164 Y 0.086 -165 A 0.081 -166 I 0.076 -167 L 0.077 -168 G 0.080 -169 F 0.075 -170 A 0.068 -171 L 0.066 -172 S 0.068 -173 E 0.068 -174 A 0.068 -175 M 0.071 -176 G 0.068 -177 L 0.060 -178 F 0.055 -179 C 0.063 -180 L 0.079 -181 M 0.092 -182 V 0.090 -183 A 0.075 -184 F 0.060 -185 L 0.055 -186 I 0.063 -187 L 0.079 -188 F 0.099 -189 A 0.123 -190 M 0.141 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000063873.11_ENSMUST00000110007.8_GN:Slc24a3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000063873.11_ENSMUST00000110007.8_GN:Slc24a3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index d4d4853bde5e6f73a09a5bbcc0da8b755b4287bc..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000063873.11_ENSMUST00000110007.8_GN:Slc24a3_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,646 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000063873.11|ENSMUST00000110007.8|GN:Slc24a3|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.329 -2 P 0.346 -3 P 0.374 -4 P 0.397 -5 G 0.389 -6 D 0.336 -7 Q 0.263 -8 D 0.208 -9 C 0.183 -10 A 0.175 -11 R 0.174 -12 R 0.178 -13 R 0.182 -14 S 0.182 -15 R 0.171 -16 R 0.155 -17 R 0.142 -18 R 0.134 -19 R 0.127 -20 D 0.116 -21 L 0.101 -22 L 0.088 -23 L 0.087 -24 S 0.091 -25 Q 0.090 -26 L 0.080 -27 C 0.071 -28 F 0.066 -29 L 0.063 -30 A 0.061 -31 S 0.059 -32 V 0.054 -33 A 0.048 -34 L 0.046 -35 L 0.050 -36 L 0.058 -37 W 0.070 -38 S 0.085 -39 L 0.106 -40 S 0.135 -41 S 0.165 -42 L 0.186 -43 R 0.198 -44 E 0.211 -45 Q 0.231 -46 K 0.250 -47 E 0.261 -48 L 0.265 -49 D 0.263 -50 L 0.250 -51 M 0.233 -52 D 0.223 -53 L 0.225 -54 I 0.234 -55 G 0.248 -56 E 0.265 -57 D 0.274 -58 R 0.266 -59 K 0.249 -60 W 0.251 -61 M 0.282 -62 V 0.318 -63 G 0.337 -64 R 0.352 -65 K 0.386 -66 L 0.435 -67 M 0.485 -68 Q 0.532 -69 V 0.569 -70 N 0.593 -71 D 0.603 -72 T 0.604 -73 L 0.604 -74 T 0.617 -75 S 0.648 -76 E 0.685 -77 D 0.712 -78 A 0.722 -79 G 0.720 -80 L 0.712 -81 Q 0.697 -82 S 0.667 -83 S 0.618 -84 K 0.551 -85 N 0.478 -86 C 0.415 -87 T 0.376 -88 E 0.354 -89 P 0.339 -90 A 0.332 -91 L 0.330 -92 H 0.319 -93 E 0.301 -94 F 0.288 -95 P 0.280 -96 R 0.265 -97 D 0.234 -98 I 0.197 -99 F 0.172 -100 S 0.162 -101 N 0.156 -102 E 0.142 -103 D 0.122 -104 R 0.107 -105 R 0.103 -106 Q 0.106 -107 G 0.106 -108 A 0.097 -109 V 0.080 -110 V 0.062 -111 L 0.054 -112 H 0.058 -113 V 0.068 -114 L 0.075 -115 C 0.075 -116 A 0.071 -117 M 0.064 -118 Y 0.055 -119 M 0.045 -120 F 0.040 -121 Y 0.044 -122 A 0.052 -123 L 0.055 -124 A 0.054 -125 I 0.056 -126 V 0.061 -127 C 0.062 -128 D 0.062 -129 D 0.064 -130 F 0.066 -131 F 0.062 -132 V 0.054 -133 P 0.047 -134 S 0.043 -135 L 0.039 -136 E 0.034 -137 K 0.032 -138 I 0.031 -139 C 0.032 -140 E 0.038 -141 R 0.052 -142 L 0.069 -143 H 0.081 -144 L 0.082 -145 S 0.076 -146 E 0.070 -147 D 0.067 -148 V 0.067 -149 A 0.066 -150 G 0.065 -151 A 0.065 -152 T 0.064 -153 F 0.062 -154 M 0.062 -155 A 0.066 -156 A 0.071 -157 G 0.074 -158 S 0.079 -159 S 0.089 -160 A 0.098 -161 P 0.101 -162 E 0.100 -163 L 0.095 -164 F 0.091 -165 T 0.093 -166 S 0.098 -167 V 0.098 -168 I 0.096 -169 G 0.096 -170 V 0.100 -171 F 0.110 -172 I 0.124 -173 T 0.136 -174 K 0.140 -175 G 0.136 -176 D 0.127 -177 V 0.113 -178 G 0.095 -179 V 0.084 -180 G 0.085 -181 T 0.092 -182 I 0.098 -183 V 0.103 -184 G 0.111 -185 S 0.121 -186 A 0.122 -187 V 0.113 -188 F 0.100 -189 N 0.088 -190 I 0.074 -191 L 0.062 -192 C 0.056 -193 I 0.055 -194 I 0.053 -195 G 0.053 -196 V 0.057 -197 C 0.061 -198 G 0.065 -199 L 0.068 -200 F 0.073 -201 A 0.081 -202 G 0.088 -203 Q 0.095 -204 V 0.107 -205 V 0.119 -206 A 0.122 -207 L 0.112 -208 S 0.091 -209 S 0.068 -210 W 0.051 -211 C 0.044 -212 L 0.041 -213 L 0.041 -214 R 0.045 -215 D 0.053 -216 S 0.060 -217 I 0.062 -218 Y 0.062 -219 Y 0.064 -220 T 0.066 -221 L 0.068 -222 S 0.068 -223 V 0.065 -224 V 0.061 -225 A 0.058 -226 L 0.056 -227 I 0.054 -228 V 0.058 -229 F 0.072 -230 I 0.086 -231 Y 0.094 -232 D 0.101 -233 E 0.115 -234 K 0.128 -235 V 0.123 -236 S 0.100 -237 W 0.077 -238 W 0.072 -239 E 0.082 -240 S 0.091 -241 L 0.090 -242 V 0.089 -243 L 0.095 -244 V 0.100 -245 L 0.095 -246 M 0.078 -247 Y 0.060 -248 L 0.048 -249 I 0.043 -250 Y 0.041 -251 I 0.039 -252 V 0.038 -253 I 0.040 -254 M 0.044 -255 K 0.046 -256 Y 0.047 -257 N 0.049 -258 A 0.053 -259 C 0.057 -260 I 0.063 -261 H 0.069 -262 Q 0.073 -263 C 0.080 -264 F 0.095 -265 E 0.121 -266 R 0.158 -267 R 0.204 -268 T 0.256 -269 K 0.307 -270 G 0.356 -271 A 0.398 -272 G 0.427 -273 N 0.437 -274 M 0.435 -275 V 0.441 -276 N 0.454 -277 G 0.455 -278 L 0.445 -279 A 0.449 -280 N 0.474 -281 N 0.501 -282 A 0.518 -283 E 0.531 -284 I 0.545 -285 D 0.552 -286 D 0.544 -287 S 0.524 -288 S 0.499 -289 N 0.466 -290 C 0.421 -291 D 0.368 -292 A 0.314 -293 T 0.267 -294 V 0.233 -295 V 0.211 -296 L 0.193 -297 L 0.178 -298 K 0.171 -299 K 0.176 -300 A 0.189 -301 N 0.205 -302 F 0.220 -303 H 0.232 -304 R 0.240 -305 K 0.248 -306 A 0.253 -307 S 0.246 -308 V 0.223 -309 I 0.190 -310 M 0.151 -311 V 0.116 -312 D 0.095 -313 E 0.088 -314 L 0.087 -315 L 0.089 -316 S 0.094 -317 A 0.104 -318 Y 0.117 -319 P 0.126 -320 H 0.131 -321 Q 0.135 -322 L 0.137 -323 S 0.135 -324 F 0.126 -325 S 0.114 -326 E 0.101 -327 A 0.090 -328 G 0.082 -329 L 0.081 -330 R 0.084 -331 I 0.086 -332 M 0.082 -333 I 0.077 -334 T 0.075 -335 S 0.082 -336 H 0.096 -337 F 0.111 -338 P 0.122 -339 P 0.124 -340 K 0.122 -341 T 0.118 -342 R 0.117 -343 L 0.112 -344 S 0.099 -345 M 0.082 -346 A 0.070 -347 S 0.067 -348 R 0.070 -349 M 0.074 -350 L 0.076 -351 I 0.073 -352 N 0.069 -353 E 0.062 -354 R 0.055 -355 Q 0.056 -356 R 0.069 -357 L 0.095 -358 I 0.130 -359 N 0.169 -360 S 0.209 -361 R 0.252 -362 A 0.305 -363 Y 0.366 -364 T 0.429 -365 N 0.492 -366 G 0.546 -367 E 0.575 -368 S 0.579 -369 E 0.568 -370 V 0.550 -371 A 0.533 -372 I 0.526 -373 K 0.531 -374 I 0.546 -375 P 0.563 -376 I 0.585 -377 K 0.620 -378 H 0.665 -379 T 0.701 -380 V 0.718 -381 E 0.724 -382 N 0.721 -383 G 0.707 -384 T 0.692 -385 G 0.692 -386 P 0.704 -387 S 0.716 -388 S 0.727 -389 A 0.744 -390 P 0.765 -391 D 0.784 -392 R 0.796 -393 G 0.801 -394 V 0.799 -395 N 0.790 -396 G 0.775 -397 T 0.747 -398 R 0.687 -399 R 0.584 -400 D 0.485 -401 D 0.462 -402 I 0.503 -403 V 0.540 -404 A 0.559 -405 E 0.585 -406 T 0.596 -407 D 0.572 -408 N 0.555 -409 E 0.585 -410 T 0.640 -411 E 0.678 -412 N 0.681 -413 E 0.647 -414 N 0.592 -415 E 0.565 -416 D 0.594 -417 N 0.647 -418 E 0.680 -419 N 0.687 -420 N 0.683 -421 E 0.674 -422 N 0.661 -423 D 0.643 -424 E 0.625 -425 E 0.613 -426 E 0.609 -427 E 0.615 -428 E 0.628 -429 D 0.636 -430 E 0.631 -431 D 0.611 -432 D 0.572 -433 D 0.521 -434 E 0.467 -435 G 0.417 -436 P 0.370 -437 Y 0.323 -438 T 0.280 -439 P 0.251 -440 F 0.236 -441 D 0.227 -442 P 0.216 -443 P 0.199 -444 S 0.179 -445 G 0.153 -446 K 0.121 -447 L 0.095 -448 E 0.085 -449 T 0.092 -450 V 0.104 -451 K 0.114 -452 W 0.116 -453 A 0.112 -454 F 0.114 -455 T 0.125 -456 W 0.129 -457 P 0.117 -458 L 0.102 -459 S 0.094 -460 F 0.092 -461 V 0.095 -462 L 0.100 -463 Y 0.102 -464 F 0.105 -465 T 0.121 -466 V 0.150 -467 P 0.174 -468 N 0.183 -469 C 0.177 -470 N 0.164 -471 K 0.152 -472 P 0.146 -473 H 0.141 -474 W 0.127 -475 E 0.105 -476 K 0.082 -477 W 0.067 -478 F 0.058 -479 M 0.054 -480 V 0.058 -481 T 0.065 -482 F 0.072 -483 A 0.077 -484 S 0.084 -485 S 0.089 -486 T 0.091 -487 L 0.094 -488 W 0.097 -489 I 0.093 -490 A 0.079 -491 A 0.066 -492 F 0.060 -493 S 0.060 -494 Y 0.063 -495 M 0.067 -496 M 0.070 -497 V 0.069 -498 W 0.063 -499 M 0.057 -500 V 0.053 -501 T 0.053 -502 I 0.058 -503 I 0.066 -504 G 0.074 -505 Y 0.083 -506 T 0.100 -507 L 0.130 -508 G 0.158 -509 I 0.162 -510 P 0.141 -511 D 0.115 -512 V 0.099 -513 I 0.090 -514 M 0.077 -515 G 0.065 -516 I 0.058 -517 T 0.060 -518 F 0.067 -519 L 0.077 -520 A 0.088 -521 A 0.094 -522 G 0.094 -523 T 0.095 -524 S 0.101 -525 V 0.108 -526 P 0.110 -527 D 0.106 -528 C 0.093 -529 M 0.079 -530 A 0.068 -531 S 0.062 -532 L 0.059 -533 I 0.061 -534 V 0.070 -535 A 0.082 -536 R 0.097 -537 Q 0.116 -538 G 0.135 -539 M 0.141 -540 G 0.131 -541 D 0.118 -542 M 0.111 -543 A 0.108 -544 V 0.106 -545 S 0.107 -546 N 0.114 -547 S 0.122 -548 I 0.129 -549 G 0.141 -550 S 0.155 -551 N 0.155 -552 V 0.136 -553 F 0.108 -554 D 0.085 -555 I 0.071 -556 L 0.064 -557 I 0.059 -558 G 0.056 -559 L 0.053 -560 G 0.051 -561 L 0.050 -562 P 0.047 -563 W 0.044 -564 A 0.040 -565 L 0.039 -566 Q 0.041 -567 T 0.046 -568 L 0.057 -569 A 0.075 -570 V 0.100 -571 D 0.128 -572 Y 0.155 -573 G 0.174 -574 S 0.182 -575 Y 0.179 -576 I 0.169 -577 R 0.161 -578 L 0.163 -579 N 0.169 -580 S 0.170 -581 R 0.156 -582 G 0.127 -583 L 0.093 -584 I 0.068 -585 Y 0.059 -586 S 0.066 -587 V 0.080 -588 G 0.094 -589 L 0.102 -590 L 0.105 -591 L 0.102 -592 A 0.094 -593 S 0.083 -594 V 0.070 -595 F 0.059 -596 V 0.054 -597 T 0.055 -598 V 0.060 -599 F 0.066 -600 G 0.071 -601 V 0.073 -602 H 0.074 -603 L 0.076 -604 N 0.081 -605 K 0.086 -606 W 0.092 -607 Q 0.096 -608 L 0.092 -609 D 0.077 -610 K 0.060 -611 K 0.053 -612 L 0.057 -613 G 0.067 -614 C 0.078 -615 G 0.089 -616 C 0.098 -617 L 0.095 -618 F 0.086 -619 L 0.077 -620 Y 0.070 -621 G 0.062 -622 V 0.057 -623 F 0.056 -624 L 0.056 -625 C 0.053 -626 F 0.052 -627 S 0.054 -628 I 0.057 -629 M 0.060 -630 T 0.068 -631 E 0.078 -632 F 0.086 -633 N 0.091 -634 V 0.099 -635 F 0.113 -636 T 0.136 -637 F 0.167 -638 V 0.202 -639 N 0.231 -640 L 0.248 -641 P 0.257 -642 M 0.276 -643 C 0.315 -644 G 0.363 -645 D 0.395 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000063873.11_ENSMUST00000110007.8_GN:Slc24a3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:97.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000063873.11_ENSMUST00000110007.8_GN:Slc24a3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:97.caid deleted file mode 100644 index 205fefadf00bf589dd240ee185941d47d1a67f73..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000063873.11_ENSMUST00000110007.8_GN:Slc24a3_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:97.caid +++ /dev/null @@ -1,743 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000063873.11|ENSMUST00000110007.8|GN:Slc24a3|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:97 -1 M 0.317 -2 A 0.338 -3 R 0.365 -4 E 0.386 -5 Q 0.395 -6 E 0.396 -7 R 0.397 -8 D 0.388 -9 P 0.364 -10 E 0.342 -11 R 0.336 -12 R 0.333 -13 E 0.321 -14 A 0.316 -15 A 0.324 -16 V 0.325 -17 R 0.323 -18 A 0.353 -19 S 0.410 -20 G 0.453 -21 E 0.478 -22 E 0.510 -23 E 0.531 -24 E 0.521 -25 A 0.516 -26 A 0.553 -27 G 0.612 -28 E 0.655 -29 E 0.675 -30 G 0.679 -31 L 0.676 -32 S 0.676 -33 D 0.682 -34 S 0.689 -35 D 0.695 -36 E 0.705 -37 G 0.720 -38 D 0.730 -39 G 0.728 -40 V 0.719 -41 E 0.716 -42 T 0.718 -43 G 0.718 -44 S 0.714 -45 G 0.701 -46 R 0.664 -47 E 0.609 -48 E 0.578 -49 G 0.589 -50 K 0.595 -51 Q 0.565 -52 E 0.542 -53 A 0.569 -54 A 0.622 -55 A 0.653 -56 G 0.651 -57 W 0.628 -58 E 0.595 -59 R 0.560 -60 S 0.523 -61 E 0.487 -62 D 0.459 -63 A 0.458 -64 R 0.493 -65 L 0.539 -66 L 0.570 -67 R 0.590 -68 A 0.608 -69 G 0.619 -70 L 0.628 -71 P 0.648 -72 P 0.681 -73 A 0.712 -74 A 0.734 -75 V 0.746 -76 P 0.756 -77 A 0.764 -78 A 0.768 -79 A 0.757 -80 A 0.727 -81 R 0.686 -82 D 0.653 -83 P 0.639 -84 S 0.644 -85 G 0.659 -86 R 0.672 -87 R 0.685 -88 P 0.701 -89 P 0.714 -90 G 0.714 -91 T 0.703 -92 P 0.695 -93 P 0.697 -94 G 0.699 -95 C 0.688 -96 P 0.660 -97 R 0.624 -98 M 0.594 -99 P 0.583 -100 P 0.592 -101 P 0.605 -102 G 0.585 -103 D 0.512 -104 Q 0.411 -105 D 0.330 -106 C 0.285 -107 A 0.260 -108 R 0.246 -109 R 0.246 -110 R 0.252 -111 S 0.247 -112 R 0.224 -113 R 0.193 -114 R 0.166 -115 R 0.147 -116 R 0.133 -117 D 0.119 -118 L 0.103 -119 L 0.089 -120 L 0.084 -121 S 0.087 -122 Q 0.087 -123 L 0.080 -124 C 0.073 -125 F 0.068 -126 L 0.063 -127 A 0.059 -128 S 0.056 -129 V 0.052 -130 A 0.049 -131 L 0.049 -132 L 0.050 -133 L 0.054 -134 W 0.062 -135 S 0.073 -136 L 0.090 -137 S 0.115 -138 S 0.145 -139 L 0.167 -140 R 0.180 -141 E 0.195 -142 Q 0.219 -143 K 0.242 -144 E 0.256 -145 L 0.260 -146 D 0.258 -147 L 0.244 -148 M 0.226 -149 D 0.215 -150 L 0.214 -151 I 0.218 -152 G 0.225 -153 E 0.237 -154 D 0.244 -155 R 0.235 -156 K 0.218 -157 W 0.222 -158 M 0.251 -159 V 0.283 -160 G 0.302 -161 R 0.321 -162 K 0.359 -163 L 0.408 -164 M 0.458 -165 Q 0.512 -166 V 0.562 -167 N 0.598 -168 D 0.615 -169 T 0.617 -170 L 0.618 -171 T 0.630 -172 S 0.659 -173 E 0.693 -174 D 0.718 -175 A 0.726 -176 G 0.723 -177 L 0.714 -178 Q 0.697 -179 S 0.666 -180 S 0.618 -181 K 0.559 -182 N 0.495 -183 C 0.438 -184 T 0.397 -185 E 0.369 -186 P 0.346 -187 A 0.334 -188 L 0.329 -189 H 0.320 -190 E 0.305 -191 F 0.296 -192 P 0.292 -193 R 0.279 -194 D 0.246 -195 I 0.207 -196 F 0.178 -197 S 0.165 -198 N 0.155 -199 E 0.139 -200 D 0.118 -201 R 0.105 -202 R 0.103 -203 Q 0.106 -204 G 0.105 -205 A 0.096 -206 V 0.079 -207 V 0.062 -208 L 0.054 -209 H 0.058 -210 V 0.067 -211 L 0.074 -212 C 0.075 -213 A 0.070 -214 M 0.063 -215 Y 0.053 -216 M 0.043 -217 F 0.038 -218 Y 0.043 -219 A 0.051 -220 L 0.054 -221 A 0.054 -222 I 0.057 -223 V 0.062 -224 C 0.063 -225 D 0.062 -226 D 0.063 -227 F 0.064 -228 F 0.059 -229 V 0.052 -230 P 0.046 -231 S 0.043 -232 L 0.038 -233 E 0.033 -234 K 0.030 -235 I 0.029 -236 C 0.030 -237 E 0.035 -238 R 0.046 -239 L 0.062 -240 H 0.074 -241 L 0.075 -242 S 0.069 -243 E 0.063 -244 D 0.061 -245 V 0.062 -246 A 0.062 -247 G 0.061 -248 A 0.060 -249 T 0.058 -250 F 0.056 -251 M 0.056 -252 A 0.062 -253 A 0.067 -254 G 0.070 -255 S 0.076 -256 S 0.086 -257 A 0.094 -258 P 0.098 -259 E 0.098 -260 L 0.094 -261 F 0.089 -262 T 0.091 -263 S 0.095 -264 V 0.095 -265 I 0.092 -266 G 0.092 -267 V 0.095 -268 F 0.103 -269 I 0.116 -270 T 0.126 -271 K 0.129 -272 G 0.126 -273 D 0.119 -274 V 0.106 -275 G 0.090 -276 V 0.080 -277 G 0.082 -278 T 0.091 -279 I 0.099 -280 V 0.105 -281 G 0.113 -282 S 0.121 -283 A 0.123 -284 V 0.114 -285 F 0.101 -286 N 0.087 -287 I 0.072 -288 L 0.060 -289 C 0.054 -290 I 0.052 -291 I 0.051 -292 G 0.051 -293 V 0.054 -294 C 0.059 -295 G 0.062 -296 L 0.064 -297 F 0.069 -298 A 0.076 -299 G 0.081 -300 Q 0.087 -301 V 0.099 -302 V 0.113 -303 A 0.117 -304 L 0.109 -305 S 0.089 -306 S 0.066 -307 W 0.049 -308 C 0.042 -309 L 0.040 -310 L 0.040 -311 R 0.044 -312 D 0.052 -313 S 0.059 -314 I 0.061 -315 Y 0.062 -316 Y 0.064 -317 T 0.067 -318 L 0.069 -319 S 0.070 -320 V 0.067 -321 V 0.063 -322 A 0.060 -323 L 0.059 -324 I 0.058 -325 V 0.064 -326 F 0.080 -327 I 0.096 -328 Y 0.103 -329 D 0.108 -330 E 0.121 -331 K 0.133 -332 V 0.128 -333 S 0.103 -334 W 0.079 -335 W 0.073 -336 E 0.083 -337 S 0.092 -338 L 0.091 -339 V 0.091 -340 L 0.096 -341 V 0.100 -342 L 0.093 -343 M 0.077 -344 Y 0.060 -345 L 0.049 -346 I 0.044 -347 Y 0.042 -348 I 0.040 -349 V 0.040 -350 I 0.042 -351 M 0.047 -352 K 0.048 -353 Y 0.049 -354 N 0.052 -355 A 0.056 -356 C 0.060 -357 I 0.066 -358 H 0.072 -359 Q 0.077 -360 C 0.084 -361 F 0.099 -362 E 0.124 -363 R 0.160 -364 R 0.207 -365 T 0.262 -366 K 0.318 -367 G 0.371 -368 A 0.415 -369 G 0.442 -370 N 0.448 -371 M 0.442 -372 V 0.447 -373 N 0.461 -374 G 0.463 -375 L 0.455 -376 A 0.462 -377 N 0.489 -378 N 0.513 -379 A 0.524 -380 E 0.532 -381 I 0.545 -382 D 0.551 -383 D 0.541 -384 S 0.519 -385 S 0.494 -386 N 0.463 -387 C 0.421 -388 D 0.372 -389 A 0.322 -390 T 0.278 -391 V 0.245 -392 V 0.221 -393 L 0.200 -394 L 0.183 -395 K 0.176 -396 K 0.180 -397 A 0.188 -398 N 0.197 -399 F 0.207 -400 H 0.216 -401 R 0.222 -402 K 0.226 -403 A 0.226 -404 S 0.216 -405 V 0.193 -406 I 0.164 -407 M 0.133 -408 V 0.105 -409 D 0.087 -410 E 0.082 -411 L 0.081 -412 L 0.082 -413 S 0.084 -414 A 0.091 -415 Y 0.100 -416 P 0.106 -417 H 0.110 -418 Q 0.113 -419 L 0.118 -420 S 0.119 -421 F 0.114 -422 S 0.106 -423 E 0.096 -424 A 0.087 -425 G 0.080 -426 L 0.077 -427 R 0.075 -428 I 0.074 -429 M 0.072 -430 I 0.069 -431 T 0.070 -432 S 0.077 -433 H 0.091 -434 F 0.107 -435 P 0.118 -436 P 0.122 -437 K 0.120 -438 T 0.116 -439 R 0.113 -440 L 0.107 -441 S 0.092 -442 M 0.075 -443 A 0.062 -444 S 0.058 -445 R 0.059 -446 M 0.062 -447 L 0.063 -448 I 0.063 -449 N 0.060 -450 E 0.055 -451 R 0.051 -452 Q 0.054 -453 R 0.070 -454 L 0.099 -455 I 0.136 -456 N 0.178 -457 S 0.219 -458 R 0.264 -459 A 0.323 -460 Y 0.394 -461 T 0.465 -462 N 0.529 -463 G 0.575 -464 E 0.594 -465 S 0.590 -466 E 0.574 -467 V 0.552 -468 A 0.533 -469 I 0.528 -470 K 0.536 -471 I 0.553 -472 P 0.574 -473 I 0.602 -474 K 0.643 -475 H 0.691 -476 T 0.725 -477 V 0.739 -478 E 0.742 -479 N 0.739 -480 G 0.725 -481 T 0.710 -482 G 0.708 -483 P 0.717 -484 S 0.726 -485 S 0.736 -486 A 0.751 -487 P 0.770 -488 D 0.789 -489 R 0.801 -490 G 0.806 -491 V 0.803 -492 N 0.795 -493 G 0.782 -494 T 0.761 -495 R 0.722 -496 R 0.669 -497 D 0.636 -498 D 0.644 -499 I 0.647 -500 V 0.615 -501 A 0.586 -502 E 0.592 -503 T 0.598 -504 D 0.574 -505 N 0.555 -506 E 0.580 -507 T 0.630 -508 E 0.666 -509 N 0.671 -510 E 0.640 -511 N 0.589 -512 E 0.563 -513 D 0.593 -514 N 0.645 -515 E 0.678 -516 N 0.688 -517 N 0.686 -518 E 0.678 -519 N 0.664 -520 D 0.644 -521 E 0.624 -522 E 0.610 -523 E 0.606 -524 E 0.613 -525 E 0.626 -526 D 0.636 -527 E 0.635 -528 D 0.618 -529 D 0.583 -530 D 0.535 -531 E 0.482 -532 G 0.432 -533 P 0.383 -534 Y 0.334 -535 T 0.289 -536 P 0.257 -537 F 0.240 -538 D 0.232 -539 P 0.221 -540 P 0.204 -541 S 0.185 -542 G 0.159 -543 K 0.126 -544 L 0.099 -545 E 0.090 -546 T 0.098 -547 V 0.113 -548 K 0.124 -549 W 0.126 -550 A 0.120 -551 F 0.121 -552 T 0.131 -553 W 0.135 -554 P 0.124 -555 L 0.108 -556 S 0.100 -557 F 0.099 -558 V 0.101 -559 L 0.105 -560 Y 0.106 -561 F 0.109 -562 T 0.126 -563 V 0.155 -564 P 0.179 -565 N 0.188 -566 C 0.182 -567 N 0.168 -568 K 0.157 -569 P 0.151 -570 H 0.146 -571 W 0.132 -572 E 0.107 -573 K 0.082 -574 W 0.066 -575 F 0.057 -576 M 0.055 -577 V 0.060 -578 T 0.069 -579 F 0.076 -580 A 0.080 -581 S 0.087 -582 S 0.092 -583 T 0.095 -584 L 0.098 -585 W 0.101 -586 I 0.097 -587 A 0.084 -588 A 0.070 -589 F 0.063 -590 S 0.062 -591 Y 0.064 -592 M 0.068 -593 M 0.071 -594 V 0.070 -595 W 0.065 -596 M 0.059 -597 V 0.055 -598 T 0.055 -599 I 0.061 -600 I 0.070 -601 G 0.078 -602 Y 0.086 -603 T 0.103 -604 L 0.132 -605 G 0.159 -606 I 0.163 -607 P 0.142 -608 D 0.117 -609 V 0.102 -610 I 0.092 -611 M 0.080 -612 G 0.067 -613 I 0.061 -614 T 0.063 -615 F 0.070 -616 L 0.081 -617 A 0.091 -618 A 0.097 -619 G 0.096 -620 T 0.096 -621 S 0.103 -622 V 0.111 -623 P 0.115 -624 D 0.110 -625 C 0.098 -626 M 0.083 -627 A 0.072 -628 S 0.065 -629 L 0.062 -630 I 0.064 -631 V 0.073 -632 A 0.086 -633 R 0.100 -634 Q 0.120 -635 G 0.140 -636 M 0.146 -637 G 0.137 -638 D 0.124 -639 M 0.118 -640 A 0.115 -641 V 0.112 -642 S 0.112 -643 N 0.119 -644 S 0.127 -645 I 0.134 -646 G 0.145 -647 S 0.159 -648 N 0.160 -649 V 0.141 -650 F 0.112 -651 D 0.089 -652 I 0.074 -653 L 0.066 -654 I 0.061 -655 G 0.057 -656 L 0.053 -657 G 0.051 -658 L 0.049 -659 P 0.047 -660 W 0.043 -661 A 0.039 -662 L 0.038 -663 Q 0.040 -664 T 0.045 -665 L 0.055 -666 A 0.073 -667 V 0.096 -668 D 0.123 -669 Y 0.150 -670 G 0.169 -671 S 0.179 -672 Y 0.178 -673 I 0.170 -674 R 0.163 -675 L 0.164 -676 N 0.169 -677 S 0.169 -678 R 0.155 -679 G 0.127 -680 L 0.093 -681 I 0.068 -682 Y 0.059 -683 S 0.066 -684 V 0.081 -685 G 0.095 -686 L 0.104 -687 L 0.107 -688 L 0.103 -689 A 0.095 -690 S 0.084 -691 V 0.071 -692 F 0.060 -693 V 0.055 -694 T 0.057 -695 V 0.062 -696 F 0.068 -697 G 0.074 -698 V 0.076 -699 H 0.077 -700 L 0.079 -701 N 0.083 -702 K 0.089 -703 W 0.096 -704 Q 0.100 -705 L 0.095 -706 D 0.080 -707 K 0.062 -708 K 0.055 -709 L 0.059 -710 G 0.068 -711 C 0.079 -712 G 0.091 -713 C 0.099 -714 L 0.096 -715 F 0.086 -716 L 0.077 -717 Y 0.070 -718 G 0.062 -719 V 0.057 -720 F 0.056 -721 L 0.055 -722 C 0.052 -723 F 0.051 -724 S 0.053 -725 I 0.056 -726 M 0.059 -727 T 0.068 -728 E 0.078 -729 F 0.085 -730 N 0.088 -731 V 0.094 -732 F 0.108 -733 T 0.129 -734 F 0.156 -735 V 0.189 -736 N 0.218 -737 L 0.235 -738 P 0.243 -739 M 0.258 -740 C 0.292 -741 G 0.334 -742 D 0.364 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000063935.4_ENSMUST00000073528.4_GN:Zar1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000063935.4_ENSMUST00000073528.4_GN:Zar1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 30458468e8e6c04fbf5eda2aaa39c39828f41a3c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000063935.4_ENSMUST00000073528.4_GN:Zar1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,362 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000063935.4|ENSMUST00000073528.4|GN:Zar1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.471 -2 F 0.524 -3 P 0.599 -4 A 0.661 -5 S 0.690 -6 T 0.687 -7 F 0.668 -8 H 0.648 -9 P 0.629 -10 C 0.616 -11 P 0.616 -12 H 0.636 -13 P 0.671 -14 Y 0.718 -15 P 0.767 -16 Q 0.803 -17 A 0.821 -18 T 0.825 -19 K 0.824 -20 A 0.824 -21 G 0.826 -22 D 0.826 -23 G 0.825 -24 W 0.825 -25 R 0.829 -26 F 0.835 -27 G 0.837 -28 A 0.833 -29 R 0.824 -30 G 0.806 -31 C 0.780 -32 R 0.756 -33 P 0.740 -34 A 0.735 -35 P 0.738 -36 P 0.744 -37 S 0.748 -38 F 0.746 -39 L 0.741 -40 P 0.737 -41 G 0.731 -42 Y 0.722 -43 R 0.714 -44 Q 0.713 -45 L 0.716 -46 M 0.717 -47 A 0.713 -48 A 0.705 -49 E 0.690 -50 Y 0.653 -51 V 0.587 -52 D 0.512 -53 S 0.445 -54 H 0.383 -55 Q 0.322 -56 R 0.280 -57 A 0.273 -58 Q 0.297 -59 L 0.322 -60 M 0.329 -61 A 0.329 -62 L 0.345 -63 L 0.373 -64 S 0.397 -65 R 0.417 -66 M 0.451 -67 G 0.521 -68 P 0.623 -69 R 0.718 -70 S 0.776 -71 V 0.797 -72 S 0.804 -73 S 0.817 -74 R 0.838 -75 D 0.861 -76 A 0.877 -77 A 0.880 -78 V 0.872 -79 Q 0.856 -80 V 0.838 -81 N 0.825 -82 P 0.823 -83 R 0.832 -84 R 0.851 -85 D 0.871 -86 A 0.885 -87 S 0.890 -88 V 0.886 -89 Q 0.877 -90 C 0.868 -91 S 0.864 -92 L 0.865 -93 G 0.867 -94 R 0.866 -95 R 0.863 -96 T 0.855 -97 L 0.845 -98 Q 0.838 -99 P 0.840 -100 A 0.852 -101 G 0.861 -102 C 0.863 -103 R 0.856 -104 A 0.844 -105 S 0.832 -106 P 0.830 -107 D 0.838 -108 A 0.849 -109 R 0.858 -110 S 0.861 -111 G 0.858 -112 S 0.845 -113 C 0.829 -114 Q 0.818 -115 P 0.822 -116 R 0.836 -117 G 0.850 -118 H 0.857 -119 A 0.860 -120 G 0.857 -121 A 0.847 -122 G 0.828 -123 R 0.805 -124 S 0.790 -125 P 0.791 -126 R 0.799 -127 S 0.802 -128 W 0.803 -129 Q 0.807 -130 T 0.811 -131 V 0.807 -132 A 0.804 -133 P 0.809 -134 F 0.822 -135 S 0.833 -136 S 0.835 -137 V 0.831 -138 T 0.824 -139 F 0.820 -140 C 0.820 -141 G 0.824 -142 L 0.831 -143 S 0.837 -144 S 0.843 -145 S 0.846 -146 L 0.849 -147 E 0.853 -148 V 0.859 -149 A 0.862 -150 G 0.861 -151 G 0.858 -152 R 0.853 -153 Q 0.848 -154 T 0.846 -155 P 0.848 -156 T 0.855 -157 K 0.860 -158 G 0.859 -159 E 0.850 -160 G 0.834 -161 S 0.807 -162 P 0.760 -163 A 0.699 -164 S 0.670 -165 S 0.703 -166 G 0.759 -167 T 0.787 -168 R 0.779 -169 E 0.758 -170 P 0.746 -171 E 0.747 -172 P 0.745 -173 R 0.716 -174 E 0.664 -175 V 0.636 -176 A 0.664 -177 A 0.711 -178 R 0.731 -179 K 0.730 -180 A 0.735 -181 V 0.749 -182 P 0.767 -183 Q 0.790 -184 P 0.815 -185 R 0.836 -186 S 0.848 -187 E 0.853 -188 E 0.854 -189 G 0.854 -190 D 0.850 -191 V 0.830 -192 Q 0.778 -193 A 0.706 -194 A 0.667 -195 G 0.698 -196 Q 0.762 -197 A 0.802 -198 G 0.807 -199 W 0.794 -200 E 0.773 -201 Q 0.745 -202 Q 0.717 -203 P 0.708 -204 P 0.727 -205 P 0.760 -206 E 0.788 -207 D 0.803 -208 R 0.804 -209 N 0.786 -210 S 0.740 -211 V 0.678 -212 A 0.650 -213 A 0.687 -214 M 0.749 -215 Q 0.784 -216 S 0.794 -217 E 0.801 -218 P 0.812 -219 G 0.818 -220 S 0.810 -221 E 0.787 -222 E 0.759 -223 P 0.735 -224 C 0.715 -225 P 0.685 -226 A 0.643 -227 A 0.622 -228 E 0.642 -229 M 0.658 -230 A 0.634 -231 Q 0.615 -232 D 0.650 -233 P 0.717 -234 G 0.764 -235 D 0.774 -236 S 0.760 -237 D 0.740 -238 A 0.730 -239 P 0.737 -240 R 0.750 -241 D 0.753 -242 Q 0.739 -243 A 0.718 -244 S 0.703 -245 P 0.697 -246 Q 0.687 -247 S 0.659 -248 T 0.618 -249 E 0.573 -250 Q 0.525 -251 D 0.467 -252 K 0.397 -253 E 0.323 -254 R 0.251 -255 L 0.192 -256 R 0.152 -257 F 0.130 -258 Q 0.120 -259 F 0.119 -260 L 0.121 -261 E 0.117 -262 Q 0.103 -263 K 0.081 -264 Y 0.059 -265 G 0.044 -266 Y 0.035 -267 Y 0.030 -268 H 0.029 -269 C 0.029 -270 K 0.034 -271 D 0.044 -272 C 0.058 -273 K 0.074 -274 I 0.089 -275 R 0.099 -276 W 0.102 -277 E 0.097 -278 S 0.093 -279 A 0.092 -280 Y 0.092 -281 V 0.093 -282 W 0.094 -283 C 0.095 -284 V 0.096 -285 Q 0.099 -286 G 0.102 -287 T 0.102 -288 S 0.100 -289 K 0.097 -290 V 0.093 -291 Y 0.086 -292 F 0.078 -293 K 0.067 -294 Q 0.053 -295 F 0.042 -296 C 0.036 -297 R 0.036 -298 V 0.038 -299 C 0.041 -300 E 0.043 -301 K 0.044 -302 S 0.044 -303 Y 0.043 -304 N 0.045 -305 P 0.051 -306 Y 0.063 -307 R 0.083 -308 V 0.110 -309 E 0.128 -310 D 0.126 -311 I 0.103 -312 T 0.078 -313 C 0.063 -314 Q 0.061 -315 S 0.069 -316 C 0.084 -317 K 0.101 -318 R 0.121 -319 T 0.147 -320 R 0.174 -321 C 0.202 -322 A 0.230 -323 C 0.255 -324 P 0.272 -325 V 0.279 -326 R 0.282 -327 L 0.288 -328 R 0.291 -329 H 0.288 -330 V 0.280 -331 D 0.277 -332 P 0.281 -333 K 0.292 -334 R 0.302 -335 P 0.301 -336 H 0.288 -337 R 0.264 -338 Q 0.230 -339 D 0.194 -340 L 0.162 -341 C 0.136 -342 G 0.122 -343 R 0.123 -344 C 0.141 -345 K 0.169 -346 D 0.203 -347 K 0.250 -348 R 0.313 -349 L 0.369 -350 S 0.392 -351 C 0.384 -352 D 0.366 -353 S 0.352 -354 T 0.342 -355 F 0.340 -356 S 0.350 -357 F 0.373 -358 K 0.400 -359 Y 0.410 -360 I 0.390 -361 I 0.362 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000063935.4_ENSMUST00000073528.4_GN:Zar1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000063935.4_ENSMUST00000073528.4_GN:Zar1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid deleted file mode 100644 index 330406d1cdfe4eea0f67e76f30386216de7d42c0..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000063935.4_ENSMUST00000073528.4_GN:Zar1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:12.caid +++ /dev/null @@ -1,374 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000063935.4|ENSMUST00000073528.4|GN:Zar1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:12 -1 M 0.545 -2 A 0.594 -3 A 0.658 -4 W 0.710 -5 A 0.743 -6 G 0.760 -7 E 0.765 -8 A 0.764 -9 R 0.758 -10 D 0.750 -11 A 0.744 -12 P 0.744 -13 M 0.751 -14 F 0.764 -15 P 0.780 -16 A 0.789 -17 S 0.780 -18 T 0.752 -19 F 0.716 -20 H 0.688 -21 P 0.673 -22 C 0.668 -23 P 0.672 -24 H 0.690 -25 P 0.721 -26 Y 0.761 -27 P 0.799 -28 Q 0.828 -29 A 0.843 -30 T 0.847 -31 K 0.846 -32 A 0.845 -33 G 0.844 -34 D 0.843 -35 G 0.840 -36 W 0.837 -37 R 0.839 -38 F 0.844 -39 G 0.848 -40 A 0.846 -41 R 0.838 -42 G 0.822 -43 C 0.796 -44 R 0.769 -45 P 0.749 -46 A 0.740 -47 P 0.740 -48 P 0.745 -49 S 0.750 -50 F 0.751 -51 L 0.749 -52 P 0.746 -53 G 0.743 -54 Y 0.738 -55 R 0.734 -56 Q 0.732 -57 L 0.736 -58 M 0.738 -59 A 0.733 -60 A 0.720 -61 E 0.699 -62 Y 0.662 -63 V 0.604 -64 D 0.536 -65 S 0.473 -66 H 0.408 -67 Q 0.340 -68 R 0.290 -69 A 0.279 -70 Q 0.302 -71 L 0.328 -72 M 0.333 -73 A 0.326 -74 L 0.332 -75 L 0.350 -76 S 0.368 -77 R 0.385 -78 M 0.422 -79 G 0.498 -80 P 0.606 -81 R 0.704 -82 S 0.761 -83 V 0.781 -84 S 0.787 -85 S 0.800 -86 R 0.823 -87 D 0.848 -88 A 0.867 -89 A 0.872 -90 V 0.865 -91 Q 0.849 -92 V 0.830 -93 N 0.816 -94 P 0.812 -95 R 0.822 -96 R 0.841 -97 D 0.863 -98 A 0.880 -99 S 0.886 -100 V 0.882 -101 Q 0.872 -102 C 0.862 -103 S 0.858 -104 L 0.860 -105 G 0.861 -106 R 0.859 -107 R 0.854 -108 T 0.846 -109 L 0.834 -110 Q 0.826 -111 P 0.829 -112 A 0.841 -113 G 0.852 -114 C 0.853 -115 R 0.845 -116 A 0.833 -117 S 0.822 -118 P 0.822 -119 D 0.831 -120 A 0.843 -121 R 0.853 -122 S 0.859 -123 G 0.858 -124 S 0.848 -125 C 0.832 -126 Q 0.822 -127 P 0.825 -128 R 0.839 -129 G 0.852 -130 H 0.860 -131 A 0.862 -132 G 0.859 -133 A 0.850 -134 G 0.832 -135 R 0.810 -136 S 0.796 -137 P 0.798 -138 R 0.807 -139 S 0.811 -140 W 0.812 -141 Q 0.816 -142 T 0.819 -143 V 0.814 -144 A 0.809 -145 P 0.813 -146 F 0.825 -147 S 0.836 -148 S 0.838 -149 V 0.834 -150 T 0.828 -151 F 0.824 -152 C 0.824 -153 G 0.828 -154 L 0.833 -155 S 0.839 -156 S 0.844 -157 S 0.848 -158 L 0.851 -159 E 0.856 -160 V 0.861 -161 A 0.864 -162 G 0.863 -163 G 0.860 -164 R 0.855 -165 Q 0.850 -166 T 0.847 -167 P 0.850 -168 T 0.856 -169 K 0.862 -170 G 0.860 -171 E 0.851 -172 G 0.834 -173 S 0.807 -174 P 0.760 -175 A 0.699 -176 S 0.670 -177 S 0.702 -178 G 0.758 -179 T 0.785 -180 R 0.777 -181 E 0.758 -182 P 0.746 -183 E 0.747 -184 P 0.745 -185 R 0.716 -186 E 0.664 -187 V 0.637 -188 A 0.667 -189 A 0.720 -190 R 0.748 -191 K 0.752 -192 A 0.752 -193 V 0.758 -194 P 0.770 -195 Q 0.790 -196 P 0.814 -197 R 0.834 -198 S 0.846 -199 E 0.849 -200 E 0.850 -201 G 0.850 -202 D 0.846 -203 V 0.825 -204 Q 0.773 -205 A 0.702 -206 A 0.664 -207 G 0.695 -208 Q 0.759 -209 A 0.798 -210 G 0.802 -211 W 0.787 -212 E 0.765 -213 Q 0.737 -214 Q 0.710 -215 P 0.703 -216 P 0.722 -217 P 0.755 -218 E 0.783 -219 D 0.797 -220 R 0.797 -221 N 0.779 -222 S 0.733 -223 V 0.672 -224 A 0.644 -225 A 0.681 -226 M 0.742 -227 Q 0.778 -228 S 0.788 -229 E 0.795 -230 P 0.806 -231 G 0.812 -232 S 0.804 -233 E 0.782 -234 E 0.754 -235 P 0.730 -236 C 0.711 -237 P 0.681 -238 A 0.639 -239 A 0.619 -240 E 0.639 -241 M 0.654 -242 A 0.631 -243 Q 0.611 -244 D 0.647 -245 P 0.714 -246 G 0.760 -247 D 0.771 -248 S 0.756 -249 D 0.735 -250 A 0.724 -251 P 0.731 -252 R 0.745 -253 D 0.748 -254 Q 0.733 -255 A 0.711 -256 S 0.696 -257 P 0.689 -258 Q 0.677 -259 S 0.648 -260 T 0.605 -261 E 0.559 -262 Q 0.511 -263 D 0.453 -264 K 0.387 -265 E 0.315 -266 R 0.246 -267 L 0.189 -268 R 0.151 -269 F 0.130 -270 Q 0.121 -271 F 0.121 -272 L 0.123 -273 E 0.118 -274 Q 0.103 -275 K 0.081 -276 Y 0.059 -277 G 0.044 -278 Y 0.035 -279 Y 0.031 -280 H 0.029 -281 C 0.030 -282 K 0.035 -283 D 0.045 -284 C 0.060 -285 K 0.077 -286 I 0.093 -287 R 0.104 -288 W 0.105 -289 E 0.100 -290 S 0.096 -291 A 0.096 -292 Y 0.097 -293 V 0.098 -294 W 0.100 -295 C 0.101 -296 V 0.102 -297 Q 0.106 -298 G 0.108 -299 T 0.108 -300 S 0.106 -301 K 0.103 -302 V 0.099 -303 Y 0.092 -304 F 0.082 -305 K 0.070 -306 Q 0.056 -307 F 0.044 -308 C 0.038 -309 R 0.038 -310 V 0.040 -311 C 0.042 -312 E 0.044 -313 K 0.046 -314 S 0.045 -315 Y 0.045 -316 N 0.046 -317 P 0.052 -318 Y 0.063 -319 R 0.084 -320 V 0.110 -321 E 0.128 -322 D 0.125 -323 I 0.102 -324 T 0.077 -325 C 0.062 -326 Q 0.061 -327 S 0.069 -328 C 0.084 -329 K 0.100 -330 R 0.120 -331 T 0.144 -332 R 0.171 -333 C 0.197 -334 A 0.225 -335 C 0.249 -336 P 0.265 -337 V 0.271 -338 R 0.273 -339 L 0.278 -340 R 0.282 -341 H 0.278 -342 V 0.271 -343 D 0.268 -344 P 0.273 -345 K 0.284 -346 R 0.295 -347 P 0.295 -348 H 0.282 -349 R 0.259 -350 Q 0.227 -351 D 0.192 -352 L 0.161 -353 C 0.136 -354 G 0.121 -355 R 0.122 -356 C 0.140 -357 K 0.168 -358 D 0.202 -359 K 0.247 -360 R 0.307 -361 L 0.362 -362 S 0.386 -363 C 0.379 -364 D 0.362 -365 S 0.347 -366 T 0.336 -367 F 0.333 -368 S 0.342 -369 F 0.365 -370 K 0.391 -371 Y 0.401 -372 I 0.383 -373 I 0.358 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000066512.4_ENSMUST00000074359.4_GN:Klk1b5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000066512.4_ENSMUST00000074359.4_GN:Klk1b5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 0fbdc3c3fe993d08baefa87a0038ca9ae60d6829..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000066512.4_ENSMUST00000074359.4_GN:Klk1b5_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,262 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000066512.4|ENSMUST00000074359.4|GN:Klk1b5|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.309 -2 W 0.303 -3 F 0.301 -4 L 0.302 -5 I 0.292 -6 L 0.276 -7 F 0.285 -8 L 0.317 -9 A 0.349 -10 L 0.383 -11 S 0.438 -12 L 0.502 -13 G 0.550 -14 G 0.577 -15 I 0.591 -16 D 0.597 -17 A 0.589 -18 A 0.567 -19 P 0.537 -20 P 0.500 -21 V 0.453 -22 Q 0.395 -23 S 0.337 -24 R 0.287 -25 I 0.243 -26 F 0.201 -27 G 0.167 -28 G 0.144 -29 F 0.132 -30 N 0.127 -31 C 0.125 -32 E 0.125 -33 K 0.123 -34 N 0.115 -35 S 0.099 -36 Q 0.076 -37 P 0.055 -38 W 0.038 -39 Q 0.028 -40 V 0.023 -41 A 0.024 -42 V 0.029 -43 Y 0.034 -44 R 0.037 -45 F 0.036 -46 T 0.034 -47 K 0.033 -48 Y 0.030 -49 Q 0.025 -50 C 0.021 -51 G 0.020 -52 G 0.027 -53 V 0.040 -54 L 0.053 -55 L 0.057 -56 N 0.052 -57 A 0.042 -58 N 0.032 -59 W 0.025 -60 V 0.021 -61 L 0.018 -62 T 0.018 -63 A 0.021 -64 A 0.028 -65 H 0.040 -66 C 0.055 -67 H 0.070 -68 N 0.080 -69 D 0.078 -70 K 0.062 -71 Y 0.043 -72 Q 0.031 -73 V 0.026 -74 W 0.026 -75 L 0.029 -76 G 0.032 -77 K 0.035 -78 N 0.037 -79 N 0.039 -80 F 0.042 -81 F 0.047 -82 E 0.056 -83 D 0.066 -84 E 0.072 -85 P 0.071 -86 S 0.064 -87 A 0.053 -88 Q 0.041 -89 H 0.032 -90 R 0.026 -91 L 0.023 -92 V 0.022 -93 S 0.023 -94 K 0.028 -95 A 0.039 -96 I 0.055 -97 P 0.072 -98 H 0.082 -99 P 0.087 -100 D 0.093 -101 F 0.103 -102 N 0.119 -103 M 0.142 -104 S 0.179 -105 L 0.224 -106 L 0.262 -107 N 0.282 -108 E 0.287 -109 H 0.286 -110 T 0.281 -111 P 0.272 -112 Q 0.267 -113 P 0.268 -114 E 0.271 -115 D 0.271 -116 D 0.265 -117 Y 0.249 -118 S 0.212 -119 N 0.157 -120 D 0.099 -121 L 0.056 -122 M 0.033 -123 L 0.025 -124 L 0.025 -125 R 0.030 -126 L 0.039 -127 K 0.049 -128 K 0.060 -129 P 0.070 -130 A 0.081 -131 D 0.090 -132 I 0.094 -133 T 0.089 -134 D 0.077 -135 V 0.062 -136 V 0.050 -137 K 0.045 -138 P 0.046 -139 I 0.049 -140 D 0.049 -141 L 0.046 -142 P 0.043 -143 T 0.041 -144 E 0.043 -145 E 0.046 -146 P 0.049 -147 K 0.050 -148 L 0.050 -149 G 0.047 -150 S 0.042 -151 T 0.034 -152 C 0.027 -153 L 0.024 -154 A 0.026 -155 S 0.031 -156 G 0.039 -157 W 0.053 -158 G 0.069 -159 S 0.083 -160 I 0.090 -161 T 0.094 -162 P 0.097 -163 V 0.103 -164 I 0.115 -165 Y 0.133 -166 E 0.147 -167 P 0.149 -168 A 0.134 -169 D 0.112 -170 D 0.094 -171 L 0.080 -172 Q 0.068 -173 C 0.058 -174 V 0.049 -175 N 0.041 -176 F 0.038 -177 K 0.042 -178 L 0.051 -179 L 0.059 -180 P 0.059 -181 N 0.054 -182 E 0.048 -183 D 0.044 -184 C 0.044 -185 V 0.050 -186 K 0.062 -187 A 0.076 -188 H 0.088 -189 I 0.098 -190 E 0.107 -191 K 0.112 -192 V 0.105 -193 T 0.085 -194 D 0.062 -195 V 0.044 -196 M 0.033 -197 L 0.030 -198 C 0.035 -199 A 0.048 -200 G 0.064 -201 D 0.080 -202 M 0.097 -203 D 0.110 -204 G 0.115 -205 G 0.108 -206 K 0.094 -207 D 0.079 -208 T 0.066 -209 C 0.059 -210 M 0.059 -211 G 0.066 -212 D 0.071 -213 S 0.070 -214 G 0.067 -215 G 0.067 -216 P 0.066 -217 L 0.062 -218 I 0.057 -219 C 0.058 -220 D 0.066 -221 G 0.073 -222 V 0.071 -223 L 0.063 -224 H 0.055 -225 G 0.052 -226 I 0.051 -227 T 0.050 -228 S 0.054 -229 W 0.063 -230 G 0.070 -231 P 0.067 -232 S 0.056 -233 P 0.053 -234 C 0.064 -235 G 0.084 -236 K 0.102 -237 P 0.110 -238 N 0.104 -239 V 0.086 -240 P 0.066 -241 G 0.053 -242 I 0.047 -243 Y 0.046 -244 T 0.051 -245 K 0.061 -246 L 0.069 -247 I 0.070 -248 K 0.065 -249 F 0.063 -250 N 0.066 -251 S 0.067 -252 W 0.063 -253 I 0.064 -254 K 0.072 -255 D 0.078 -256 T 0.079 -257 I 0.085 -258 A 0.106 -259 K 0.135 -260 N 0.163 -261 A 0.180 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000066512.4_ENSMUST00000074359.4_GN:Klk1b5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:26.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000066512.4_ENSMUST00000074359.4_GN:Klk1b5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:26.caid deleted file mode 100644 index 3703b3d05aeb78799510a4d738b4ac18aef67187..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000066512.4_ENSMUST00000074359.4_GN:Klk1b5_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:26.caid +++ /dev/null @@ -1,288 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000066512.4|ENSMUST00000074359.4|GN:Klk1b5|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:26 -1 M 0.340 -2 R 0.352 -3 V 0.373 -4 F 0.396 -5 K 0.410 -6 V 0.409 -7 S 0.391 -8 L 0.357 -9 R 0.330 -10 S 0.346 -11 L 0.393 -12 N 0.427 -13 S 0.448 -14 S 0.483 -15 K 0.512 -16 L 0.510 -17 T 0.506 -18 A 0.532 -19 C 0.572 -20 S 0.602 -21 S 0.612 -22 W 0.596 -23 T 0.553 -24 A 0.510 -25 V 0.491 -26 T 0.467 -27 M 0.415 -28 W 0.361 -29 F 0.337 -30 L 0.330 -31 I 0.321 -32 L 0.321 -33 F 0.345 -34 L 0.385 -35 A 0.421 -36 L 0.457 -37 S 0.501 -38 L 0.553 -39 G 0.599 -40 G 0.628 -41 I 0.638 -42 D 0.632 -43 A 0.610 -44 A 0.573 -45 P 0.529 -46 P 0.484 -47 V 0.435 -48 Q 0.379 -49 S 0.322 -50 R 0.274 -51 I 0.233 -52 F 0.196 -53 G 0.165 -54 G 0.144 -55 F 0.133 -56 N 0.130 -57 C 0.130 -58 E 0.131 -59 K 0.127 -60 N 0.117 -61 S 0.099 -62 Q 0.076 -63 P 0.054 -64 W 0.038 -65 Q 0.028 -66 V 0.023 -67 A 0.023 -68 V 0.028 -69 Y 0.033 -70 R 0.035 -71 F 0.033 -72 T 0.031 -73 K 0.029 -74 Y 0.026 -75 Q 0.022 -76 C 0.018 -77 G 0.018 -78 G 0.025 -79 V 0.037 -80 L 0.049 -81 L 0.054 -82 N 0.049 -83 A 0.040 -84 N 0.031 -85 W 0.024 -86 V 0.020 -87 L 0.018 -88 T 0.017 -89 A 0.020 -90 A 0.027 -91 H 0.037 -92 C 0.051 -93 H 0.065 -94 N 0.074 -95 D 0.072 -96 K 0.058 -97 Y 0.041 -98 Q 0.030 -99 V 0.025 -100 W 0.025 -101 L 0.028 -102 G 0.031 -103 K 0.033 -104 N 0.034 -105 N 0.036 -106 F 0.038 -107 F 0.044 -108 E 0.054 -109 D 0.064 -110 E 0.070 -111 P 0.070 -112 S 0.063 -113 A 0.053 -114 Q 0.041 -115 H 0.032 -116 R 0.026 -117 L 0.023 -118 V 0.022 -119 S 0.023 -120 K 0.028 -121 A 0.039 -122 I 0.056 -123 P 0.073 -124 H 0.083 -125 P 0.088 -126 D 0.095 -127 F 0.106 -128 N 0.122 -129 M 0.144 -130 S 0.179 -131 L 0.222 -132 L 0.260 -133 N 0.281 -134 E 0.288 -135 H 0.289 -136 T 0.286 -137 P 0.280 -138 Q 0.274 -139 P 0.275 -140 E 0.278 -141 D 0.279 -142 D 0.274 -143 Y 0.257 -144 S 0.219 -145 N 0.161 -146 D 0.102 -147 L 0.058 -148 M 0.034 -149 L 0.025 -150 L 0.025 -151 R 0.030 -152 L 0.039 -153 K 0.049 -154 K 0.060 -155 P 0.072 -156 A 0.084 -157 D 0.093 -158 I 0.096 -159 T 0.091 -160 D 0.078 -161 V 0.063 -162 V 0.051 -163 K 0.046 -164 P 0.046 -165 I 0.049 -166 D 0.049 -167 L 0.047 -168 P 0.043 -169 T 0.041 -170 E 0.042 -171 E 0.046 -172 P 0.049 -173 K 0.050 -174 L 0.049 -175 G 0.047 -176 S 0.041 -177 T 0.033 -178 C 0.027 -179 L 0.024 -180 A 0.026 -181 S 0.031 -182 G 0.039 -183 W 0.052 -184 G 0.069 -185 S 0.082 -186 I 0.090 -187 T 0.093 -188 P 0.096 -189 V 0.101 -190 I 0.112 -191 Y 0.127 -192 E 0.141 -193 P 0.144 -194 A 0.131 -195 D 0.111 -196 D 0.094 -197 L 0.081 -198 Q 0.069 -199 C 0.058 -200 V 0.049 -201 N 0.041 -202 F 0.037 -203 K 0.041 -204 L 0.050 -205 L 0.058 -206 P 0.058 -207 N 0.052 -208 E 0.047 -209 D 0.043 -210 C 0.042 -211 V 0.047 -212 K 0.059 -213 A 0.073 -214 H 0.085 -215 I 0.094 -216 E 0.103 -217 K 0.108 -218 V 0.102 -219 T 0.083 -220 D 0.060 -221 V 0.043 -222 M 0.033 -223 L 0.030 -224 C 0.036 -225 A 0.048 -226 G 0.064 -227 D 0.080 -228 M 0.097 -229 D 0.110 -230 G 0.114 -231 G 0.107 -232 K 0.093 -233 D 0.078 -234 T 0.066 -235 C 0.058 -236 M 0.058 -237 G 0.064 -238 D 0.070 -239 S 0.070 -240 G 0.067 -241 G 0.067 -242 P 0.066 -243 L 0.062 -244 I 0.056 -245 C 0.057 -246 D 0.065 -247 G 0.072 -248 V 0.071 -249 L 0.063 -250 H 0.056 -251 G 0.053 -252 I 0.052 -253 T 0.051 -254 S 0.054 -255 W 0.064 -256 G 0.072 -257 P 0.068 -258 S 0.058 -259 P 0.055 -260 C 0.066 -261 G 0.086 -262 K 0.104 -263 P 0.113 -264 N 0.107 -265 V 0.089 -266 P 0.069 -267 G 0.055 -268 I 0.048 -269 Y 0.047 -270 T 0.052 -271 K 0.062 -272 L 0.071 -273 I 0.071 -274 K 0.066 -275 F 0.063 -276 N 0.066 -277 S 0.066 -278 W 0.063 -279 I 0.063 -280 K 0.072 -281 D 0.079 -282 T 0.080 -283 I 0.085 -284 A 0.105 -285 K 0.135 -286 N 0.164 -287 A 0.181 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000066735.9_ENSMUST00000051758.11_GN:Vkorc1l1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000066735.9_ENSMUST00000051758.11_GN:Vkorc1l1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 07c14cdd50353d3bbe33d4dfcd7db3d360f7f863..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000066735.9_ENSMUST00000051758.11_GN:Vkorc1l1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,177 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000066735.9|ENSMUST00000051758.11|GN:Vkorc1l1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.429 -2 A 0.441 -3 A 0.456 -4 P 0.463 -5 V 0.455 -6 L 0.428 -7 L 0.381 -8 R 0.325 -9 V 0.270 -10 S 0.218 -11 V 0.166 -12 P 0.116 -13 R 0.078 -14 W 0.057 -15 E 0.049 -16 R 0.048 -17 V 0.050 -18 A 0.052 -19 R 0.055 -20 Y 0.057 -21 A 0.058 -22 V 0.055 -23 C 0.053 -24 A 0.057 -25 A 0.064 -26 G 0.071 -27 I 0.076 -28 L 0.078 -29 L 0.071 -30 S 0.062 -31 I 0.057 -32 Y 0.057 -33 A 0.059 -34 Y 0.060 -35 H 0.061 -36 V 0.065 -37 E 0.073 -38 R 0.082 -39 E 0.091 -40 K 0.101 -41 E 0.118 -42 R 0.137 -43 D 0.154 -44 P 0.167 -45 E 0.180 -46 H 0.194 -47 R 0.200 -48 A 0.194 -49 L 0.183 -50 C 0.179 -51 D 0.179 -52 L 0.178 -53 G 0.172 -54 P 0.161 -55 W 0.146 -56 V 0.128 -57 K 0.109 -58 C 0.096 -59 S 0.101 -60 A 0.121 -61 A 0.143 -62 L 0.150 -63 A 0.140 -64 S 0.126 -65 R 0.121 -66 W 0.130 -67 G 0.148 -68 R 0.164 -69 G 0.169 -70 F 0.166 -71 G 0.156 -72 L 0.144 -73 L 0.140 -74 G 0.149 -75 S 0.162 -76 I 0.177 -77 F 0.200 -78 G 0.227 -79 K 0.246 -80 D 0.243 -81 G 0.228 -82 V 0.218 -83 L 0.217 -84 N 0.212 -85 Q 0.195 -86 P 0.168 -87 N 0.140 -88 S 0.117 -89 V 0.107 -90 F 0.113 -91 G 0.121 -92 L 0.116 -93 I 0.101 -94 F 0.089 -95 Y 0.080 -96 I 0.072 -97 L 0.064 -98 Q 0.055 -99 L 0.047 -100 L 0.046 -101 L 0.053 -102 G 0.063 -103 M 0.070 -104 T 0.078 -105 A 0.084 -106 S 0.082 -107 A 0.070 -108 V 0.055 -109 A 0.046 -110 A 0.042 -111 L 0.040 -112 V 0.038 -113 L 0.038 -114 M 0.042 -115 T 0.048 -116 S 0.054 -117 S 0.057 -118 I 0.057 -119 V 0.059 -120 S 0.060 -121 V 0.058 -122 V 0.056 -123 G 0.057 -124 S 0.057 -125 L 0.056 -126 Y 0.056 -127 L 0.055 -128 A 0.052 -129 Y 0.051 -130 I 0.057 -131 L 0.064 -132 Y 0.069 -133 F 0.074 -134 V 0.081 -135 L 0.085 -136 K 0.083 -137 E 0.076 -138 F 0.064 -139 C 0.052 -140 I 0.046 -141 I 0.047 -142 C 0.051 -143 V 0.056 -144 T 0.064 -145 T 0.069 -146 Y 0.067 -147 V 0.058 -148 L 0.049 -149 N 0.042 -150 F 0.037 -151 L 0.034 -152 L 0.032 -153 L 0.029 -154 I 0.026 -155 I 0.024 -156 N 0.023 -157 Y 0.024 -158 K 0.026 -159 R 0.029 -160 L 0.033 -161 V 0.037 -162 Y 0.043 -163 L 0.052 -164 N 0.064 -165 E 0.075 -166 A 0.084 -167 W 0.094 -168 K 0.115 -169 R 0.149 -170 Q 0.195 -171 L 0.250 -172 Q 0.308 -173 P 0.360 -174 K 0.393 -175 E 0.398 -176 D 0.389 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000066735.9_ENSMUST00000051758.11_GN:Vkorc1l1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:47.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000066735.9_ENSMUST00000051758.11_GN:Vkorc1l1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:47.caid deleted file mode 100644 index 9feb411a94a4cb2c0c7283307da9f58e0e8d4aca..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000066735.9_ENSMUST00000051758.11_GN:Vkorc1l1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:47.caid +++ /dev/null @@ -1,224 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000066735.9|ENSMUST00000051758.11|GN:Vkorc1l1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:47 -1 M 0.414 -2 G 0.454 -3 R 0.507 -4 G 0.544 -5 G 0.543 -6 G 0.514 -7 G 0.498 -8 G 0.506 -9 G 0.512 -10 G 0.517 -11 G 0.540 -12 G 0.560 -13 G 0.553 -14 G 0.554 -15 G 0.597 -16 G 0.657 -17 G 0.695 -18 G 0.706 -19 S 0.704 -20 G 0.694 -21 G 0.672 -22 G 0.634 -23 W 0.596 -24 V 0.580 -25 G 0.588 -26 P 0.609 -27 R 0.630 -28 R 0.651 -29 A 0.668 -30 A 0.675 -31 A 0.673 -32 S 0.678 -33 E 0.693 -34 V 0.712 -35 E 0.726 -36 A 0.736 -37 E 0.744 -38 G 0.750 -39 G 0.755 -40 G 0.758 -41 G 0.759 -42 G 0.760 -43 G 0.760 -44 G 0.758 -45 G 0.753 -46 G 0.742 -47 K 0.725 -48 M 0.702 -49 A 0.674 -50 A 0.643 -51 P 0.612 -52 V 0.584 -53 L 0.543 -54 L 0.475 -55 R 0.386 -56 V 0.301 -57 S 0.229 -58 V 0.170 -59 P 0.118 -60 R 0.080 -61 W 0.059 -62 E 0.051 -63 R 0.048 -64 V 0.048 -65 A 0.047 -66 R 0.045 -67 Y 0.042 -68 A 0.040 -69 V 0.042 -70 C 0.048 -71 A 0.057 -72 A 0.062 -73 G 0.061 -74 I 0.056 -75 L 0.051 -76 L 0.050 -77 S 0.050 -78 I 0.051 -79 Y 0.055 -80 A 0.058 -81 Y 0.058 -82 H 0.058 -83 V 0.061 -84 E 0.069 -85 R 0.078 -86 E 0.087 -87 K 0.098 -88 E 0.114 -89 R 0.131 -90 D 0.146 -91 P 0.157 -92 E 0.168 -93 H 0.180 -94 R 0.184 -95 A 0.177 -96 L 0.166 -97 C 0.162 -98 D 0.162 -99 L 0.162 -100 G 0.158 -101 P 0.150 -102 W 0.138 -103 V 0.122 -104 K 0.104 -105 C 0.093 -106 S 0.099 -107 A 0.121 -108 A 0.144 -109 L 0.151 -110 A 0.139 -111 S 0.124 -112 R 0.120 -113 W 0.132 -114 G 0.152 -115 R 0.166 -116 G 0.171 -117 F 0.168 -118 G 0.158 -119 L 0.145 -120 L 0.139 -121 G 0.144 -122 S 0.155 -123 I 0.168 -124 F 0.189 -125 G 0.217 -126 K 0.236 -127 D 0.236 -128 G 0.225 -129 V 0.220 -130 L 0.223 -131 N 0.218 -132 Q 0.198 -133 P 0.169 -134 N 0.140 -135 S 0.117 -136 V 0.106 -137 F 0.111 -138 G 0.117 -139 L 0.111 -140 I 0.097 -141 F 0.085 -142 Y 0.078 -143 I 0.071 -144 L 0.063 -145 Q 0.055 -146 L 0.047 -147 L 0.046 -148 L 0.054 -149 G 0.063 -150 M 0.071 -151 T 0.081 -152 A 0.089 -153 S 0.087 -154 A 0.074 -155 V 0.058 -156 A 0.048 -157 A 0.043 -158 L 0.041 -159 V 0.038 -160 L 0.038 -161 M 0.042 -162 T 0.049 -163 S 0.056 -164 S 0.059 -165 I 0.060 -166 V 0.061 -167 S 0.062 -168 V 0.060 -169 V 0.059 -170 G 0.060 -171 S 0.060 -172 L 0.059 -173 Y 0.058 -174 L 0.057 -175 A 0.054 -176 Y 0.053 -177 I 0.058 -178 L 0.065 -179 Y 0.070 -180 F 0.074 -181 V 0.081 -182 L 0.086 -183 K 0.085 -184 E 0.078 -185 F 0.066 -186 C 0.053 -187 I 0.048 -188 I 0.049 -189 C 0.053 -190 V 0.058 -191 T 0.065 -192 T 0.070 -193 Y 0.068 -194 V 0.059 -195 L 0.049 -196 N 0.042 -197 F 0.038 -198 L 0.034 -199 L 0.032 -200 L 0.028 -201 I 0.024 -202 I 0.022 -203 N 0.022 -204 Y 0.023 -205 K 0.026 -206 R 0.030 -207 L 0.034 -208 V 0.037 -209 Y 0.041 -210 L 0.047 -211 N 0.055 -212 E 0.065 -213 A 0.076 -214 W 0.088 -215 K 0.106 -216 R 0.137 -217 Q 0.185 -218 L 0.247 -219 Q 0.312 -220 P 0.368 -221 K 0.402 -222 E 0.407 -223 D 0.397 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000067604.9_ENSMUST00000088029.8_GN:Nms_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000067604.9_ENSMUST00000088029.8_GN:Nms_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 50625f472ff0bce5bc1c4573cb75c5157d922915..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000067604.9_ENSMUST00000088029.8_GN:Nms_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,154 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000067604.9|ENSMUST00000088029.8|GN:Nms|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.481 -2 K 0.503 -3 H 0.534 -4 P 0.560 -5 L 0.567 -6 P 0.547 -7 H 0.497 -8 Y 0.419 -9 S 0.319 -10 P 0.218 -11 I 0.147 -12 L 0.118 -13 F 0.118 -14 I 0.123 -15 Y 0.123 -16 C 0.121 -17 F 0.131 -18 C 0.166 -19 M 0.236 -20 L 0.335 -21 Q 0.447 -22 I 0.556 -23 P 0.651 -24 S 0.723 -25 S 0.765 -26 G 0.774 -27 A 0.759 -28 S 0.740 -29 P 0.741 -30 P 0.766 -31 L 0.793 -32 A 0.797 -33 D 0.780 -34 S 0.764 -35 P 0.768 -36 D 0.787 -37 G 0.801 -38 L 0.796 -39 D 0.766 -40 I 0.699 -41 V 0.588 -42 D 0.456 -43 P 0.344 -44 E 0.270 -45 R 0.227 -46 L 0.204 -47 A 0.203 -48 Y 0.220 -49 F 0.253 -50 L 0.305 -51 K 0.380 -52 Q 0.469 -53 R 0.546 -54 E 0.598 -55 I 0.628 -56 H 0.651 -57 S 0.670 -58 N 0.678 -59 Q 0.682 -60 P 0.699 -61 K 0.726 -62 E 0.739 -63 N 0.721 -64 Q 0.685 -65 D 0.648 -66 V 0.605 -67 Y 0.557 -68 K 0.526 -69 R 0.525 -70 F 0.536 -71 L 0.540 -72 F 0.538 -73 H 0.549 -74 Y 0.580 -75 S 0.626 -76 R 0.667 -77 T 0.693 -78 R 0.704 -79 K 0.717 -80 P 0.737 -81 T 0.761 -82 H 0.788 -83 P 0.816 -84 V 0.835 -85 S 0.840 -86 A 0.832 -87 E 0.817 -88 F 0.794 -89 A 0.765 -90 P 0.726 -91 V 0.677 -92 H 0.626 -93 P 0.587 -94 L 0.557 -95 M 0.530 -96 R 0.509 -97 L 0.489 -98 A 0.451 -99 A 0.405 -100 K 0.393 -101 L 0.436 -102 A 0.502 -103 S 0.543 -104 R 0.555 -105 R 0.567 -106 M 0.594 -107 K 0.626 -108 R 0.650 -109 L 0.662 -110 P 0.673 -111 R 0.692 -112 L 0.713 -113 L 0.728 -114 R 0.734 -115 L 0.740 -116 D 0.749 -117 S 0.762 -118 R 0.777 -119 M 0.791 -120 A 0.798 -121 T 0.792 -122 V 0.771 -123 D 0.749 -124 F 0.736 -125 P 0.734 -126 K 0.734 -127 K 0.731 -128 D 0.729 -129 P 0.733 -130 T 0.748 -131 T 0.762 -132 S 0.764 -133 L 0.751 -134 G 0.734 -135 R 0.724 -136 P 0.724 -137 F 0.731 -138 F 0.737 -139 L 0.732 -140 F 0.720 -141 R 0.714 -142 P 0.727 -143 R 0.752 -144 N 0.774 -145 G 0.783 -146 R 0.784 -147 Y 0.781 -148 T 0.773 -149 D 0.757 -150 N 0.730 -151 N 0.682 -152 F 0.611 -153 Q 0.552 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000067604.9_ENSMUST00000088029.8_GN:Nms_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:21.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000067604.9_ENSMUST00000088029.8_GN:Nms_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:21.caid deleted file mode 100644 index 9c8dc4515eb3f75f669be984503f3ef6476d419c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000067604.9_ENSMUST00000088029.8_GN:Nms_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:21.caid +++ /dev/null @@ -1,175 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000067604.9|ENSMUST00000088029.8|GN:Nms|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:21 -1 M 0.392 -2 L 0.414 -3 I 0.446 -4 T 0.478 -5 S 0.493 -6 L 0.487 -7 N 0.472 -8 R 0.457 -9 T 0.434 -10 Y 0.396 -11 L 0.371 -12 W 0.386 -13 S 0.422 -14 A 0.449 -15 K 0.482 -16 R 0.548 -17 I 0.627 -18 Q 0.683 -19 S 0.703 -20 L 0.696 -21 K 0.671 -22 M 0.648 -23 K 0.641 -24 H 0.650 -25 P 0.666 -26 L 0.677 -27 P 0.670 -28 H 0.631 -29 Y 0.550 -30 S 0.433 -31 P 0.310 -32 I 0.221 -33 L 0.180 -34 F 0.172 -35 I 0.171 -36 Y 0.169 -37 C 0.167 -38 F 0.175 -39 C 0.206 -40 M 0.273 -41 L 0.372 -42 Q 0.483 -43 I 0.588 -44 P 0.676 -45 S 0.743 -46 S 0.783 -47 G 0.793 -48 A 0.781 -49 S 0.767 -50 P 0.770 -51 P 0.795 -52 L 0.820 -53 A 0.824 -54 D 0.807 -55 S 0.791 -56 P 0.794 -57 D 0.811 -58 G 0.822 -59 L 0.818 -60 D 0.791 -61 I 0.730 -62 V 0.625 -63 D 0.496 -64 P 0.383 -65 E 0.306 -66 R 0.257 -67 L 0.230 -68 A 0.228 -69 Y 0.252 -70 F 0.300 -71 L 0.369 -72 K 0.450 -73 Q 0.527 -74 R 0.585 -75 E 0.621 -76 I 0.643 -77 H 0.664 -78 S 0.681 -79 N 0.687 -80 Q 0.688 -81 P 0.701 -82 K 0.726 -83 E 0.737 -84 N 0.716 -85 Q 0.677 -86 D 0.640 -87 V 0.600 -88 Y 0.557 -89 K 0.527 -90 R 0.521 -91 F 0.523 -92 L 0.516 -93 F 0.509 -94 H 0.518 -95 Y 0.553 -96 S 0.605 -97 R 0.652 -98 T 0.681 -99 R 0.695 -100 K 0.709 -101 P 0.730 -102 T 0.755 -103 H 0.782 -104 P 0.810 -105 V 0.828 -106 S 0.832 -107 A 0.823 -108 E 0.805 -109 F 0.781 -110 A 0.748 -111 P 0.704 -112 V 0.644 -113 H 0.581 -114 P 0.531 -115 L 0.495 -116 M 0.469 -117 R 0.456 -118 L 0.450 -119 A 0.438 -120 A 0.420 -121 K 0.417 -122 L 0.437 -123 A 0.468 -124 S 0.489 -125 R 0.499 -126 R 0.518 -127 M 0.557 -128 K 0.603 -129 R 0.638 -130 L 0.658 -131 P 0.673 -132 R 0.694 -133 L 0.718 -134 L 0.734 -135 R 0.740 -136 L 0.745 -137 D 0.753 -138 S 0.766 -139 R 0.781 -140 M 0.796 -141 A 0.806 -142 T 0.802 -143 V 0.784 -144 D 0.761 -145 F 0.747 -146 P 0.742 -147 K 0.740 -148 K 0.738 -149 D 0.735 -150 P 0.740 -151 T 0.754 -152 T 0.769 -153 S 0.771 -154 L 0.760 -155 G 0.744 -156 R 0.734 -157 P 0.735 -158 F 0.741 -159 F 0.746 -160 L 0.740 -161 F 0.726 -162 R 0.720 -163 P 0.732 -164 R 0.757 -165 N 0.779 -166 G 0.789 -167 R 0.788 -168 Y 0.784 -169 T 0.775 -170 D 0.759 -171 N 0.732 -172 N 0.682 -173 F 0.607 -174 Q 0.545 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068082.14_ENSMUST00000094715.9_GN:Grxcr1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068082.14_ENSMUST00000094715.9_GN:Grxcr1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index ecc1be90838c1e01fdf33788472f0b8aa2c44097..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068082.14_ENSMUST00000094715.9_GN:Grxcr1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,291 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000068082.14|ENSMUST00000094715.9|GN:Grxcr1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.392 -2 L 0.403 -3 R 0.436 -4 R 0.492 -5 E 0.547 -6 T 0.583 -7 K 0.609 -8 P 0.636 -9 E 0.657 -10 S 0.665 -11 D 0.664 -12 R 0.666 -13 P 0.681 -14 R 0.705 -15 K 0.730 -16 V 0.748 -17 R 0.756 -18 F 0.763 -19 R 0.771 -20 I 0.774 -21 A 0.766 -22 S 0.748 -23 S 0.729 -24 H 0.721 -25 S 0.726 -26 G 0.738 -27 R 0.748 -28 V 0.760 -29 L 0.771 -30 K 0.774 -31 E 0.769 -32 V 0.763 -33 Y 0.763 -34 E 0.767 -35 D 0.769 -36 G 0.764 -37 Q 0.756 -38 A 0.759 -39 P 0.777 -40 G 0.799 -41 S 0.811 -42 L 0.811 -43 D 0.803 -44 S 0.794 -45 E 0.786 -46 C 0.780 -47 A 0.774 -48 S 0.756 -49 I 0.712 -50 C 0.649 -51 A 0.620 -52 I 0.658 -53 D 0.726 -54 G 0.769 -55 L 0.770 -56 S 0.733 -57 D 0.672 -58 S 0.627 -59 E 0.616 -60 G 0.614 -61 Q 0.626 -62 Q 0.679 -63 N 0.751 -64 G 0.796 -65 H 0.798 -66 I 0.757 -67 G 0.691 -68 S 0.653 -69 E 0.680 -70 D 0.736 -71 N 0.771 -72 E 0.780 -73 Q 0.779 -74 E 0.780 -75 K 0.778 -76 D 0.773 -77 Q 0.763 -78 D 0.751 -79 N 0.737 -80 L 0.723 -81 L 0.714 -82 V 0.705 -83 L 0.690 -84 A 0.674 -85 R 0.672 -86 T 0.680 -87 A 0.681 -88 S 0.671 -89 E 0.661 -90 K 0.664 -91 A 0.677 -92 F 0.695 -93 G 0.714 -94 T 0.736 -95 R 0.760 -96 R 0.780 -97 V 0.790 -98 N 0.786 -99 I 0.770 -100 L 0.743 -101 S 0.719 -102 K 0.714 -103 N 0.731 -104 G 0.748 -105 T 0.757 -106 V 0.762 -107 R 0.766 -108 G 0.755 -109 V 0.724 -110 K 0.693 -111 Y 0.682 -112 K 0.682 -113 V 0.674 -114 S 0.653 -115 A 0.627 -116 G 0.598 -117 Q 0.562 -118 A 0.516 -119 L 0.463 -120 F 0.418 -121 N 0.389 -122 N 0.362 -123 L 0.329 -124 T 0.305 -125 K 0.308 -126 V 0.334 -127 L 0.367 -128 Q 0.398 -129 Q 0.420 -130 P 0.428 -131 S 0.418 -132 A 0.391 -133 D 0.350 -134 L 0.298 -135 E 0.237 -136 F 0.173 -137 D 0.114 -138 R 0.069 -139 V 0.042 -140 V 0.030 -141 I 0.027 -142 Y 0.029 -143 T 0.037 -144 T 0.053 -145 C 0.075 -146 L 0.098 -147 R 0.116 -148 V 0.124 -149 V 0.122 -150 R 0.115 -151 T 0.110 -152 T 0.107 -153 F 0.101 -154 E 0.089 -155 R 0.075 -156 C 0.062 -157 E 0.051 -158 L 0.047 -159 V 0.050 -160 R 0.057 -161 K 0.061 -162 I 0.055 -163 F 0.045 -164 Q 0.040 -165 N 0.042 -166 H 0.049 -167 R 0.055 -168 V 0.054 -169 K 0.044 -170 F 0.031 -171 E 0.023 -172 E 0.022 -173 K 0.026 -174 N 0.035 -175 I 0.044 -176 A 0.050 -177 L 0.050 -178 N 0.046 -179 G 0.039 -180 D 0.033 -181 Y 0.028 -182 G 0.026 -183 K 0.025 -184 E 0.027 -185 L 0.036 -186 D 0.050 -187 E 0.057 -188 R 0.053 -189 C 0.046 -190 R 0.045 -191 R 0.052 -192 V 0.070 -193 S 0.100 -194 E 0.135 -195 A 0.156 -196 P 0.146 -197 S 0.113 -198 L 0.079 -199 P 0.056 -200 V 0.043 -201 V 0.037 -202 F 0.035 -203 I 0.039 -204 D 0.046 -205 G 0.053 -206 H 0.055 -207 Y 0.054 -208 L 0.053 -209 G 0.052 -210 G 0.049 -211 A 0.044 -212 E 0.042 -213 K 0.044 -214 I 0.052 -215 L 0.063 -216 S 0.073 -217 M 0.077 -218 N 0.077 -219 E 0.074 -220 S 0.067 -221 G 0.057 -222 E 0.047 -223 L 0.044 -224 Q 0.045 -225 D 0.048 -226 L 0.049 -227 L 0.049 -228 T 0.050 -229 K 0.054 -230 I 0.063 -231 E 0.076 -232 R 0.098 -233 V 0.129 -234 Q 0.166 -235 H 0.197 -236 P 0.212 -237 H 0.211 -238 E 0.195 -239 C 0.172 -240 P 0.161 -241 S 0.171 -242 C 0.200 -243 G 0.240 -244 G 0.280 -245 F 0.303 -246 G 0.304 -247 F 0.288 -248 L 0.255 -249 P 0.210 -250 C 0.168 -251 S 0.150 -252 V 0.156 -253 C 0.169 -254 H 0.178 -255 G 0.180 -256 S 0.176 -257 K 0.177 -258 M 0.193 -259 S 0.225 -260 V 0.265 -261 F 0.310 -262 R 0.354 -263 N 0.382 -264 C 0.384 -265 F 0.365 -266 T 0.341 -267 D 0.318 -268 A 0.303 -269 F 0.295 -270 K 0.288 -271 A 0.271 -272 L 0.245 -273 K 0.216 -274 C 0.195 -275 T 0.193 -276 A 0.207 -277 C 0.218 -278 N 0.221 -279 E 0.232 -280 N 0.252 -281 G 0.264 -282 L 0.256 -283 Q 0.232 -284 R 0.204 -285 C 0.189 -286 K 0.196 -287 N 0.215 -288 C 0.231 -289 T 0.242 -290 C 0.248 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068082.14_ENSMUST00000094715.9_GN:Grxcr1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:6.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068082.14_ENSMUST00000094715.9_GN:Grxcr1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:6.caid deleted file mode 100644 index 589c8d4076fd82389b4ffdda4dbb969a07e31220..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068082.14_ENSMUST00000094715.9_GN:Grxcr1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:6.caid +++ /dev/null @@ -1,297 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000068082.14|ENSMUST00000094715.9|GN:Grxcr1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:6 -1 M 0.333 -2 W 0.386 -3 V 0.451 -4 E 0.478 -5 V 0.466 -6 T 0.463 -7 M 0.509 -8 L 0.578 -9 R 0.620 -10 R 0.622 -11 E 0.605 -12 T 0.587 -13 K 0.577 -14 P 0.580 -15 E 0.598 -16 S 0.619 -17 D 0.635 -18 R 0.653 -19 P 0.679 -20 R 0.711 -21 K 0.738 -22 V 0.754 -23 R 0.760 -24 F 0.767 -25 R 0.779 -26 I 0.785 -27 A 0.776 -28 S 0.753 -29 S 0.730 -30 H 0.721 -31 S 0.729 -32 G 0.739 -33 R 0.745 -34 V 0.749 -35 L 0.757 -36 K 0.760 -37 E 0.758 -38 V 0.757 -39 Y 0.761 -40 E 0.768 -41 D 0.770 -42 G 0.763 -43 Q 0.752 -44 A 0.753 -45 P 0.771 -46 G 0.795 -47 S 0.810 -48 L 0.814 -49 D 0.810 -50 S 0.804 -51 E 0.798 -52 C 0.792 -53 A 0.784 -54 S 0.766 -55 I 0.721 -56 C 0.656 -57 A 0.625 -58 I 0.662 -59 D 0.728 -60 G 0.769 -61 L 0.768 -62 S 0.728 -63 D 0.665 -64 S 0.617 -65 E 0.606 -66 G 0.606 -67 Q 0.619 -68 Q 0.673 -69 N 0.745 -70 G 0.789 -71 H 0.790 -72 I 0.749 -73 G 0.683 -74 S 0.644 -75 E 0.671 -76 D 0.728 -77 N 0.764 -78 E 0.774 -79 Q 0.773 -80 E 0.773 -81 K 0.770 -82 D 0.762 -83 Q 0.752 -84 D 0.738 -85 N 0.719 -86 L 0.704 -87 L 0.696 -88 V 0.685 -89 L 0.660 -90 A 0.636 -91 R 0.634 -92 T 0.645 -93 A 0.650 -94 S 0.644 -95 E 0.641 -96 K 0.649 -97 A 0.666 -98 F 0.687 -99 G 0.710 -100 T 0.735 -101 R 0.758 -102 R 0.776 -103 V 0.782 -104 N 0.775 -105 I 0.754 -106 L 0.719 -107 S 0.688 -108 K 0.681 -109 N 0.702 -110 G 0.726 -111 T 0.741 -112 V 0.750 -113 R 0.756 -114 G 0.748 -115 V 0.721 -116 K 0.693 -117 Y 0.682 -118 K 0.679 -119 V 0.667 -120 S 0.644 -121 A 0.619 -122 G 0.593 -123 Q 0.561 -124 A 0.520 -125 L 0.472 -126 F 0.430 -127 N 0.401 -128 N 0.371 -129 L 0.332 -130 T 0.304 -131 K 0.305 -132 V 0.329 -133 L 0.362 -134 Q 0.390 -135 Q 0.411 -136 P 0.419 -137 S 0.410 -138 A 0.386 -139 D 0.348 -140 L 0.297 -141 E 0.238 -142 F 0.174 -143 D 0.114 -144 R 0.069 -145 V 0.042 -146 V 0.030 -147 I 0.027 -148 Y 0.029 -149 T 0.037 -150 T 0.053 -151 C 0.076 -152 L 0.099 -153 R 0.118 -154 V 0.126 -155 V 0.123 -156 R 0.116 -157 T 0.111 -158 T 0.108 -159 F 0.101 -160 E 0.090 -161 R 0.075 -162 C 0.062 -163 E 0.051 -164 L 0.048 -165 V 0.051 -166 R 0.057 -167 K 0.061 -168 I 0.055 -169 F 0.045 -170 Q 0.040 -171 N 0.042 -172 H 0.049 -173 R 0.056 -174 V 0.055 -175 K 0.045 -176 F 0.032 -177 E 0.023 -178 E 0.022 -179 K 0.027 -180 N 0.036 -181 I 0.045 -182 A 0.050 -183 L 0.050 -184 N 0.046 -185 G 0.039 -186 D 0.033 -187 Y 0.028 -188 G 0.026 -189 K 0.025 -190 E 0.027 -191 L 0.036 -192 D 0.050 -193 E 0.057 -194 R 0.053 -195 C 0.046 -196 R 0.044 -197 R 0.051 -198 V 0.068 -199 S 0.099 -200 E 0.134 -201 A 0.154 -202 P 0.144 -203 S 0.112 -204 L 0.078 -205 P 0.056 -206 V 0.043 -207 V 0.037 -208 F 0.035 -209 I 0.039 -210 D 0.046 -211 G 0.052 -212 H 0.055 -213 Y 0.054 -214 L 0.053 -215 G 0.052 -216 G 0.048 -217 A 0.044 -218 E 0.041 -219 K 0.044 -220 I 0.051 -221 L 0.063 -222 S 0.073 -223 M 0.077 -224 N 0.077 -225 E 0.074 -226 S 0.067 -227 G 0.057 -228 E 0.047 -229 L 0.044 -230 Q 0.045 -231 D 0.048 -232 L 0.048 -233 L 0.048 -234 T 0.050 -235 K 0.054 -236 I 0.063 -237 E 0.077 -238 R 0.098 -239 V 0.130 -240 Q 0.168 -241 H 0.198 -242 P 0.213 -243 H 0.212 -244 E 0.196 -245 C 0.173 -246 P 0.161 -247 S 0.172 -248 C 0.201 -249 G 0.241 -250 G 0.281 -251 F 0.304 -252 G 0.305 -253 F 0.288 -254 L 0.256 -255 P 0.210 -256 C 0.168 -257 S 0.150 -258 V 0.156 -259 C 0.169 -260 H 0.178 -261 G 0.181 -262 S 0.177 -263 K 0.178 -264 M 0.195 -265 S 0.227 -266 V 0.267 -267 F 0.311 -268 R 0.355 -269 N 0.383 -270 C 0.384 -271 F 0.365 -272 T 0.341 -273 D 0.319 -274 A 0.304 -275 F 0.297 -276 K 0.289 -277 A 0.273 -278 L 0.247 -279 K 0.218 -280 C 0.196 -281 T 0.194 -282 A 0.207 -283 C 0.218 -284 N 0.222 -285 E 0.233 -286 N 0.253 -287 G 0.265 -288 L 0.258 -289 Q 0.233 -290 R 0.205 -291 C 0.190 -292 K 0.197 -293 N 0.216 -294 C 0.232 -295 T 0.242 -296 C 0.248 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068122.11_ENSMUST00000089188.9_GN:Agtr2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068122.11_ENSMUST00000089188.9_GN:Agtr2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index b40c301b1113f44f98384d197b9e1cdb64f5157f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068122.11_ENSMUST00000089188.9_GN:Agtr2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,364 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000068122.11|ENSMUST00000089188.9|GN:Agtr2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.292 -2 K 0.295 -3 D 0.301 -4 N 0.305 -5 F 0.302 -6 S 0.293 -7 F 0.283 -8 A 0.277 -9 A 0.276 -10 T 0.288 -11 S 0.320 -12 R 0.353 -13 N 0.368 -14 I 0.360 -15 T 0.346 -16 S 0.344 -17 S 0.363 -18 R 0.403 -19 P 0.463 -20 F 0.538 -21 D 0.612 -22 N 0.662 -23 L 0.684 -24 N 0.689 -25 A 0.691 -26 T 0.690 -27 G 0.682 -28 T 0.665 -29 N 0.641 -30 E 0.611 -31 S 0.566 -32 A 0.497 -33 F 0.413 -34 N 0.331 -35 C 0.272 -36 S 0.246 -37 H 0.245 -38 K 0.256 -39 P 0.262 -40 S 0.254 -41 D 0.233 -42 K 0.209 -43 H 0.183 -44 L 0.154 -45 E 0.124 -46 A 0.097 -47 I 0.076 -48 P 0.057 -49 V 0.042 -50 L 0.031 -51 Y 0.027 -52 Y 0.027 -53 M 0.028 -54 I 0.030 -55 F 0.031 -56 V 0.034 -57 I 0.040 -58 G 0.044 -59 F 0.044 -60 A 0.042 -61 V 0.041 -62 N 0.040 -63 I 0.039 -64 V 0.037 -65 V 0.035 -66 V 0.035 -67 S 0.035 -68 L 0.035 -69 F 0.035 -70 C 0.043 -71 C 0.063 -72 Q 0.092 -73 K 0.120 -74 G 0.135 -75 P 0.131 -76 K 0.117 -77 K 0.100 -78 V 0.082 -79 S 0.061 -80 S 0.044 -81 I 0.033 -82 Y 0.028 -83 I 0.027 -84 F 0.030 -85 N 0.034 -86 L 0.038 -87 A 0.041 -88 L 0.045 -89 A 0.053 -90 D 0.063 -91 L 0.065 -92 L 0.060 -93 L 0.055 -94 L 0.054 -95 A 0.056 -96 T 0.056 -97 L 0.056 -98 P 0.053 -99 L 0.047 -100 W 0.041 -101 A 0.035 -102 T 0.032 -103 Y 0.032 -104 Y 0.034 -105 S 0.038 -106 Y 0.042 -107 R 0.045 -108 Y 0.046 -109 D 0.046 -110 W 0.046 -111 L 0.047 -112 F 0.050 -113 G 0.052 -114 P 0.048 -115 V 0.040 -116 M 0.032 -117 C 0.028 -118 K 0.030 -119 V 0.035 -120 F 0.042 -121 G 0.047 -122 S 0.045 -123 F 0.039 -124 L 0.036 -125 T 0.039 -126 L 0.045 -127 N 0.048 -128 M 0.048 -129 F 0.045 -130 A 0.041 -131 S 0.038 -132 I 0.034 -133 F 0.029 -134 F 0.026 -135 I 0.025 -136 T 0.026 -137 C 0.026 -138 M 0.029 -139 S 0.034 -140 V 0.040 -141 D 0.047 -142 R 0.051 -143 Y 0.051 -144 Q 0.051 -145 S 0.054 -146 V 0.059 -147 I 0.067 -148 Y 0.075 -149 P 0.084 -150 F 0.096 -151 L 0.115 -152 S 0.141 -153 Q 0.163 -154 R 0.174 -155 R 0.171 -156 N 0.150 -157 P 0.116 -158 W 0.084 -159 Q 0.066 -160 A 0.057 -161 S 0.052 -162 Y 0.050 -163 V 0.051 -164 V 0.051 -165 P 0.048 -166 L 0.048 -167 V 0.050 -168 W 0.051 -169 C 0.049 -170 M 0.049 -171 A 0.051 -172 C 0.053 -173 L 0.057 -174 S 0.062 -175 S 0.065 -176 L 0.064 -177 P 0.060 -178 T 0.054 -179 F 0.049 -180 Y 0.044 -181 F 0.040 -182 R 0.036 -183 D 0.034 -184 V 0.035 -185 R 0.037 -186 T 0.041 -187 I 0.046 -188 E 0.053 -189 Y 0.065 -190 L 0.081 -191 G 0.094 -192 V 0.098 -193 N 0.089 -194 A 0.074 -195 C 0.064 -196 I 0.067 -197 M 0.080 -198 A 0.098 -199 F 0.112 -200 P 0.113 -201 P 0.099 -202 E 0.078 -203 K 0.059 -204 Y 0.048 -205 A 0.046 -206 Q 0.048 -207 W 0.050 -208 S 0.054 -209 A 0.057 -210 G 0.059 -211 I 0.057 -212 A 0.053 -213 L 0.048 -214 M 0.042 -215 K 0.037 -216 N 0.034 -217 I 0.035 -218 L 0.040 -219 G 0.043 -220 F 0.042 -221 I 0.042 -222 I 0.043 -223 P 0.043 -224 L 0.040 -225 I 0.039 -226 F 0.040 -227 I 0.039 -228 A 0.034 -229 T 0.029 -230 C 0.027 -231 Y 0.028 -232 F 0.032 -233 G 0.039 -234 I 0.049 -235 R 0.060 -236 K 0.067 -237 H 0.067 -238 L 0.065 -239 L 0.075 -240 K 0.104 -241 T 0.151 -242 N 0.204 -243 S 0.251 -244 Y 0.286 -245 G 0.305 -246 K 0.303 -247 N 0.280 -248 R 0.237 -249 I 0.181 -250 T 0.127 -251 R 0.090 -252 D 0.071 -253 Q 0.062 -254 V 0.053 -255 L 0.048 -256 K 0.047 -257 M 0.048 -258 A 0.047 -259 A 0.047 -260 A 0.050 -261 V 0.051 -262 V 0.050 -263 L 0.048 -264 A 0.045 -265 F 0.040 -266 I 0.034 -267 I 0.029 -268 C 0.030 -269 W 0.034 -270 L 0.038 -271 P 0.038 -272 F 0.033 -273 H 0.029 -274 V 0.027 -275 L 0.027 -276 T 0.027 -277 F 0.028 -278 L 0.030 -279 D 0.033 -280 A 0.038 -281 L 0.044 -282 T 0.053 -283 W 0.066 -284 M 0.083 -285 G 0.096 -286 I 0.100 -287 I 0.096 -288 N 0.093 -289 S 0.091 -290 C 0.090 -291 E 0.090 -292 V 0.088 -293 I 0.084 -294 A 0.079 -295 V 0.075 -296 I 0.073 -297 D 0.071 -298 L 0.069 -299 A 0.069 -300 L 0.065 -301 P 0.058 -302 F 0.052 -303 A 0.049 -304 I 0.049 -305 L 0.050 -306 L 0.052 -307 G 0.057 -308 F 0.065 -309 T 0.075 -310 N 0.080 -311 S 0.078 -312 C 0.072 -313 V 0.066 -314 N 0.060 -315 P 0.053 -316 F 0.044 -317 L 0.037 -318 Y 0.032 -319 C 0.031 -320 F 0.036 -321 V 0.045 -322 G 0.051 -323 N 0.051 -324 R 0.047 -325 F 0.045 -326 Q 0.049 -327 Q 0.062 -328 K 0.077 -329 L 0.089 -330 R 0.099 -331 S 0.113 -332 V 0.140 -333 F 0.182 -334 R 0.232 -335 V 0.277 -336 P 0.307 -337 I 0.319 -338 T 0.318 -339 W 0.318 -340 L 0.335 -341 Q 0.379 -342 G 0.437 -343 K 0.481 -344 R 0.496 -345 E 0.492 -346 T 0.485 -347 M 0.473 -348 S 0.454 -349 C 0.441 -350 R 0.447 -351 K 0.474 -352 G 0.506 -353 S 0.528 -354 S 0.527 -355 L 0.504 -356 R 0.487 -357 E 0.498 -358 M 0.521 -359 D 0.527 -360 T 0.519 -361 F 0.495 -362 V 0.447 -363 S 0.401 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068122.11_ENSMUST00000089188.9_GN:Agtr2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:30.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068122.11_ENSMUST00000089188.9_GN:Agtr2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:30.caid deleted file mode 100644 index a9ba232266cef491e8e11603d79c1f24e19d0ee0..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068122.11_ENSMUST00000089188.9_GN:Agtr2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:30.caid +++ /dev/null @@ -1,394 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000068122.11|ENSMUST00000089188.9|GN:Agtr2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:30 -1 M 0.139 -2 R 0.129 -3 E 0.117 -4 L 0.110 -5 S 0.108 -6 K 0.105 -7 L 0.097 -8 I 0.086 -9 Y 0.077 -10 D 0.072 -11 N 0.068 -12 C 0.067 -13 F 0.069 -14 K 0.074 -15 H 0.081 -16 W 0.088 -17 Q 0.095 -18 L 0.110 -19 K 0.139 -20 R 0.175 -21 C 0.202 -22 K 0.211 -23 N 0.209 -24 L 0.201 -25 E 0.189 -26 L 0.177 -27 L 0.174 -28 Q 0.180 -29 F 0.192 -30 N 0.204 -31 M 0.217 -32 K 0.239 -33 D 0.273 -34 N 0.306 -35 F 0.325 -36 S 0.326 -37 F 0.315 -38 A 0.296 -39 A 0.285 -40 T 0.303 -41 S 0.360 -42 R 0.429 -43 N 0.468 -44 I 0.461 -45 T 0.430 -46 S 0.411 -47 S 0.424 -48 R 0.469 -49 P 0.532 -50 F 0.602 -51 D 0.667 -52 N 0.710 -53 L 0.727 -54 N 0.731 -55 A 0.731 -56 T 0.729 -57 G 0.721 -58 T 0.707 -59 N 0.685 -60 E 0.654 -61 S 0.603 -62 A 0.528 -63 F 0.437 -64 N 0.348 -65 C 0.282 -66 S 0.251 -67 H 0.250 -68 K 0.262 -69 P 0.268 -70 S 0.258 -71 D 0.233 -72 K 0.205 -73 H 0.177 -74 L 0.147 -75 E 0.116 -76 A 0.090 -77 I 0.070 -78 P 0.053 -79 V 0.039 -80 L 0.030 -81 Y 0.026 -82 Y 0.026 -83 M 0.027 -84 I 0.028 -85 F 0.029 -86 V 0.032 -87 I 0.037 -88 G 0.042 -89 F 0.042 -90 A 0.040 -91 V 0.039 -92 N 0.038 -93 I 0.036 -94 V 0.034 -95 V 0.032 -96 V 0.031 -97 S 0.032 -98 L 0.032 -99 F 0.032 -100 C 0.039 -101 C 0.057 -102 Q 0.085 -103 K 0.113 -104 G 0.127 -105 P 0.124 -106 K 0.110 -107 K 0.094 -108 V 0.077 -109 S 0.058 -110 S 0.042 -111 I 0.032 -112 Y 0.027 -113 I 0.027 -114 F 0.030 -115 N 0.034 -116 L 0.038 -117 A 0.041 -118 L 0.046 -119 A 0.054 -120 D 0.063 -121 L 0.066 -122 L 0.061 -123 L 0.055 -124 L 0.053 -125 A 0.053 -126 T 0.053 -127 L 0.051 -128 P 0.049 -129 L 0.044 -130 W 0.039 -131 A 0.034 -132 T 0.032 -133 Y 0.031 -134 Y 0.033 -135 S 0.037 -136 Y 0.041 -137 R 0.045 -138 Y 0.047 -139 D 0.048 -140 W 0.047 -141 L 0.047 -142 F 0.050 -143 G 0.052 -144 P 0.049 -145 V 0.041 -146 M 0.032 -147 C 0.029 -148 K 0.030 -149 V 0.035 -150 F 0.042 -151 G 0.046 -152 S 0.044 -153 F 0.039 -154 L 0.035 -155 T 0.037 -156 L 0.042 -157 N 0.046 -158 M 0.046 -159 F 0.043 -160 A 0.040 -161 S 0.037 -162 I 0.033 -163 F 0.028 -164 F 0.025 -165 I 0.024 -166 T 0.024 -167 C 0.025 -168 M 0.027 -169 S 0.032 -170 V 0.039 -171 D 0.046 -172 R 0.050 -173 Y 0.051 -174 Q 0.051 -175 S 0.053 -176 V 0.059 -177 I 0.067 -178 Y 0.075 -179 P 0.084 -180 F 0.096 -181 L 0.116 -182 S 0.141 -183 Q 0.162 -184 R 0.171 -185 R 0.166 -186 N 0.144 -187 P 0.111 -188 W 0.080 -189 Q 0.062 -190 A 0.054 -191 S 0.049 -192 Y 0.047 -193 V 0.048 -194 V 0.048 -195 P 0.045 -196 L 0.045 -197 V 0.046 -198 W 0.046 -199 C 0.044 -200 M 0.043 -201 A 0.045 -202 C 0.048 -203 L 0.052 -204 S 0.057 -205 S 0.061 -206 L 0.060 -207 P 0.056 -208 T 0.051 -209 F 0.045 -210 Y 0.040 -211 F 0.036 -212 R 0.034 -213 D 0.032 -214 V 0.032 -215 R 0.033 -216 T 0.035 -217 I 0.038 -218 E 0.044 -219 Y 0.054 -220 L 0.069 -221 G 0.083 -222 V 0.088 -223 N 0.081 -224 A 0.068 -225 C 0.060 -226 I 0.062 -227 M 0.073 -228 A 0.090 -229 F 0.103 -230 P 0.106 -231 P 0.094 -232 E 0.073 -233 K 0.055 -234 Y 0.045 -235 A 0.043 -236 Q 0.044 -237 W 0.047 -238 S 0.051 -239 A 0.054 -240 G 0.054 -241 I 0.053 -242 A 0.050 -243 L 0.046 -244 M 0.041 -245 K 0.036 -246 N 0.034 -247 I 0.035 -248 L 0.039 -249 G 0.042 -250 F 0.041 -251 I 0.040 -252 I 0.041 -253 P 0.041 -254 L 0.039 -255 I 0.038 -256 F 0.039 -257 I 0.038 -258 A 0.034 -259 T 0.028 -260 C 0.026 -261 Y 0.027 -262 F 0.031 -263 G 0.038 -264 I 0.048 -265 R 0.059 -266 K 0.067 -267 H 0.066 -268 L 0.065 -269 L 0.075 -270 K 0.106 -271 T 0.154 -272 N 0.208 -273 S 0.257 -274 Y 0.292 -275 G 0.311 -276 K 0.308 -277 N 0.285 -278 R 0.241 -279 I 0.185 -280 T 0.129 -281 R 0.091 -282 D 0.073 -283 Q 0.063 -284 V 0.054 -285 L 0.048 -286 K 0.047 -287 M 0.047 -288 A 0.047 -289 A 0.048 -290 A 0.051 -291 V 0.053 -292 V 0.052 -293 L 0.049 -294 A 0.046 -295 F 0.041 -296 I 0.035 -297 I 0.031 -298 C 0.031 -299 W 0.036 -300 L 0.040 -301 P 0.040 -302 F 0.035 -303 H 0.030 -304 V 0.029 -305 L 0.029 -306 T 0.030 -307 F 0.030 -308 L 0.032 -309 D 0.036 -310 A 0.041 -311 L 0.047 -312 T 0.056 -313 W 0.070 -314 M 0.088 -315 G 0.103 -316 I 0.106 -317 I 0.103 -318 N 0.098 -319 S 0.095 -320 C 0.093 -321 E 0.093 -322 V 0.092 -323 I 0.088 -324 A 0.083 -325 V 0.080 -326 I 0.077 -327 D 0.074 -328 L 0.072 -329 A 0.071 -330 L 0.067 -331 P 0.059 -332 F 0.053 -333 A 0.050 -334 I 0.050 -335 L 0.051 -336 L 0.054 -337 G 0.059 -338 F 0.068 -339 T 0.077 -340 N 0.083 -341 S 0.081 -342 C 0.074 -343 V 0.068 -344 N 0.062 -345 P 0.054 -346 F 0.045 -347 L 0.038 -348 Y 0.032 -349 C 0.030 -350 F 0.035 -351 V 0.043 -352 G 0.050 -353 N 0.050 -354 R 0.046 -355 F 0.042 -356 Q 0.046 -357 Q 0.058 -358 K 0.073 -359 L 0.086 -360 R 0.097 -361 S 0.111 -362 V 0.138 -363 F 0.181 -364 R 0.231 -365 V 0.277 -366 P 0.307 -367 I 0.319 -368 T 0.317 -369 W 0.316 -370 L 0.334 -371 Q 0.380 -372 G 0.442 -373 K 0.493 -374 R 0.516 -375 E 0.518 -376 T 0.510 -377 M 0.493 -378 S 0.470 -379 C 0.455 -380 R 0.461 -381 K 0.488 -382 G 0.520 -383 S 0.541 -384 S 0.539 -385 L 0.514 -386 R 0.497 -387 E 0.513 -388 M 0.542 -389 D 0.552 -390 T 0.544 -391 F 0.518 -392 V 0.466 -393 S 0.417 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068129.6_ENSMUST00000089200.3_GN:Cst7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068129.6_ENSMUST00000089200.3_GN:Cst7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 1d378db2ea02728e225e32464e89bd0eadd1486c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068129.6_ENSMUST00000089200.3_GN:Cst7_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,145 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000068129.6|ENSMUST00000089200.3|GN:Cst7|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.294 -2 W 0.300 -3 L 0.306 -4 A 0.303 -5 I 0.283 -6 L 0.260 -7 L 0.257 -8 A 0.273 -9 L 0.283 -10 C 0.285 -11 C 0.301 -12 L 0.336 -13 T 0.373 -14 S 0.403 -15 D 0.437 -16 T 0.481 -17 H 0.529 -18 G 0.558 -19 A 0.551 -20 R 0.506 -21 P 0.443 -22 P 0.383 -23 D 0.333 -24 F 0.291 -25 C 0.261 -26 S 0.252 -27 K 0.269 -28 D 0.308 -29 L 0.350 -30 I 0.373 -31 S 0.368 -32 S 0.345 -33 V 0.310 -34 K 0.267 -35 P 0.225 -36 G 0.193 -37 F 0.169 -38 P 0.145 -39 K 0.116 -40 T 0.088 -41 I 0.067 -42 E 0.056 -43 T 0.054 -44 N 0.057 -45 N 0.057 -46 P 0.051 -47 G 0.042 -48 V 0.034 -49 L 0.027 -50 K 0.023 -51 A 0.022 -52 A 0.022 -53 R 0.021 -54 H 0.020 -55 S 0.020 -56 V 0.022 -57 E 0.027 -58 K 0.035 -59 F 0.047 -60 N 0.060 -61 N 0.072 -62 C 0.080 -63 T 0.079 -64 N 0.070 -65 D 0.060 -66 I 0.054 -67 F 0.054 -68 L 0.053 -69 F 0.047 -70 K 0.037 -71 E 0.027 -72 S 0.021 -73 H 0.018 -74 V 0.019 -75 S 0.021 -76 K 0.023 -77 A 0.026 -78 L 0.029 -79 V 0.033 -80 Q 0.038 -81 V 0.044 -82 V 0.047 -83 K 0.048 -84 G 0.047 -85 L 0.046 -86 K 0.045 -87 Y 0.047 -88 M 0.053 -89 L 0.061 -90 E 0.065 -91 V 0.063 -92 K 0.057 -93 I 0.052 -94 G 0.056 -95 R 0.065 -96 T 0.074 -97 T 0.075 -98 C 0.070 -99 R 0.063 -100 K 0.060 -101 T 0.067 -102 M 0.085 -103 H 0.102 -104 H 0.112 -105 Q 0.113 -106 L 0.107 -107 D 0.098 -108 N 0.089 -109 C 0.084 -110 D 0.083 -111 F 0.088 -112 Q 0.101 -113 T 0.120 -114 N 0.136 -115 P 0.138 -116 A 0.130 -117 L 0.119 -118 K 0.108 -119 R 0.095 -120 T 0.083 -121 L 0.071 -122 Y 0.060 -123 C 0.052 -124 Y 0.045 -125 S 0.040 -126 E 0.038 -127 V 0.039 -128 W 0.042 -129 V 0.048 -130 I 0.056 -131 P 0.062 -132 W 0.066 -133 L 0.069 -134 H 0.070 -135 S 0.070 -136 F 0.069 -137 E 0.071 -138 V 0.072 -139 P 0.069 -140 V 0.061 -141 L 0.054 -142 L 0.056 -143 C 0.067 -144 Q 0.080 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068129.6_ENSMUST00000089200.3_GN:Cst7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068129.6_ENSMUST00000089200.3_GN:Cst7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid deleted file mode 100644 index dd2c60eae5a37198343de81153367d0e2bfc5f63..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068129.6_ENSMUST00000089200.3_GN:Cst7_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid +++ /dev/null @@ -1,168 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000068129.6|ENSMUST00000089200.3|GN:Cst7|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:23 -1 M 0.387 -2 P 0.388 -3 W 0.389 -4 S 0.388 -5 W 0.383 -6 S 0.375 -7 C 0.368 -8 T 0.360 -9 C 0.359 -10 R 0.392 -11 A 0.459 -12 L 0.527 -13 G 0.571 -14 P 0.601 -15 L 0.629 -16 H 0.646 -17 A 0.640 -18 P 0.599 -19 C 0.522 -20 I 0.432 -21 S 0.365 -22 P 0.336 -23 A 0.329 -24 M 0.319 -25 W 0.297 -26 L 0.272 -27 A 0.262 -28 I 0.269 -29 L 0.278 -30 L 0.277 -31 A 0.270 -32 L 0.266 -33 C 0.272 -34 C 0.296 -35 L 0.340 -36 T 0.393 -37 S 0.446 -38 D 0.500 -39 T 0.555 -40 H 0.603 -41 G 0.625 -42 A 0.609 -43 R 0.556 -44 P 0.485 -45 P 0.420 -46 D 0.371 -47 F 0.337 -48 C 0.319 -49 S 0.329 -50 K 0.367 -51 D 0.421 -52 L 0.462 -53 I 0.467 -54 S 0.435 -55 S 0.387 -56 V 0.333 -57 K 0.279 -58 P 0.232 -59 G 0.197 -60 F 0.171 -61 P 0.145 -62 K 0.115 -63 T 0.087 -64 I 0.065 -65 E 0.054 -66 T 0.052 -67 N 0.054 -68 N 0.053 -69 P 0.048 -70 G 0.040 -71 V 0.032 -72 L 0.025 -73 K 0.022 -74 A 0.021 -75 A 0.020 -76 R 0.020 -77 H 0.019 -78 S 0.019 -79 V 0.021 -80 E 0.026 -81 K 0.034 -82 F 0.045 -83 N 0.056 -84 N 0.067 -85 C 0.074 -86 T 0.073 -87 N 0.065 -88 D 0.055 -89 I 0.050 -90 F 0.049 -91 L 0.049 -92 F 0.044 -93 K 0.034 -94 E 0.025 -95 S 0.019 -96 H 0.017 -97 V 0.018 -98 S 0.020 -99 K 0.022 -100 A 0.025 -101 L 0.028 -102 V 0.032 -103 Q 0.037 -104 V 0.043 -105 V 0.047 -106 K 0.047 -107 G 0.047 -108 L 0.046 -109 K 0.046 -110 Y 0.048 -111 M 0.055 -112 L 0.063 -113 E 0.067 -114 V 0.064 -115 K 0.057 -116 I 0.053 -117 G 0.055 -118 R 0.064 -119 T 0.073 -120 T 0.074 -121 C 0.069 -122 R 0.062 -123 K 0.059 -124 T 0.067 -125 M 0.085 -126 H 0.103 -127 H 0.113 -128 Q 0.114 -129 L 0.109 -130 D 0.099 -131 N 0.090 -132 C 0.085 -133 D 0.084 -134 F 0.088 -135 Q 0.099 -136 T 0.117 -137 N 0.133 -138 P 0.136 -139 A 0.130 -140 L 0.121 -141 K 0.110 -142 R 0.097 -143 T 0.084 -144 L 0.072 -145 Y 0.061 -146 C 0.053 -147 Y 0.046 -148 S 0.041 -149 E 0.040 -150 V 0.040 -151 W 0.043 -152 V 0.049 -153 I 0.058 -154 P 0.064 -155 W 0.068 -156 L 0.071 -157 H 0.072 -158 S 0.072 -159 F 0.071 -160 E 0.071 -161 V 0.072 -162 P 0.069 -163 V 0.061 -164 L 0.055 -165 L 0.057 -166 C 0.069 -167 Q 0.082 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068328.11_ENSMUST00000092618.10_GN:Aup1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068328.11_ENSMUST00000092618.10_GN:Aup1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 63f64c574dbe6082c9092accf6dd5862001ffdd5..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068328.11_ENSMUST00000092618.10_GN:Aup1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,411 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000068328.11|ENSMUST00000092618.10|GN:Aup1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.382 -2 E 0.396 -3 P 0.419 -4 P 0.439 -5 P 0.450 -6 A 0.451 -7 P 0.442 -8 G 0.422 -9 P 0.389 -10 E 0.343 -11 R 0.293 -12 L 0.250 -13 F 0.222 -14 D 0.212 -15 S 0.214 -16 H 0.222 -17 R 0.233 -18 L 0.245 -19 P 0.258 -20 S 0.263 -21 D 0.249 -22 G 0.212 -23 F 0.168 -24 L 0.128 -25 L 0.099 -26 L 0.082 -27 A 0.078 -28 L 0.078 -29 L 0.074 -30 L 0.071 -31 Y 0.071 -32 A 0.072 -33 P 0.073 -34 V 0.077 -35 G 0.084 -36 L 0.089 -37 C 0.084 -38 L 0.076 -39 L 0.067 -40 V 0.060 -41 L 0.055 -42 R 0.049 -43 L 0.043 -44 F 0.038 -45 L 0.038 -46 G 0.038 -47 L 0.038 -48 H 0.036 -49 V 0.035 -50 F 0.034 -51 L 0.036 -52 V 0.046 -53 S 0.063 -54 C 0.079 -55 A 0.093 -56 L 0.105 -57 P 0.112 -58 D 0.107 -59 S 0.088 -60 V 0.063 -61 L 0.046 -62 R 0.038 -63 R 0.037 -64 F 0.037 -65 V 0.039 -66 V 0.043 -67 R 0.048 -68 T 0.051 -69 M 0.053 -70 C 0.055 -71 A 0.059 -72 V 0.062 -73 L 0.065 -74 G 0.063 -75 L 0.055 -76 V 0.045 -77 A 0.042 -78 R 0.050 -79 Q 0.071 -80 E 0.097 -81 D 0.124 -82 S 0.146 -83 G 0.157 -84 L 0.152 -85 R 0.135 -86 D 0.110 -87 H 0.086 -88 R 0.068 -89 V 0.055 -90 R 0.049 -91 V 0.053 -92 L 0.069 -93 I 0.089 -94 S 0.098 -95 N 0.088 -96 H 0.068 -97 V 0.051 -98 T 0.041 -99 P 0.039 -100 F 0.040 -101 D 0.044 -102 H 0.049 -103 N 0.052 -104 I 0.051 -105 V 0.046 -106 N 0.043 -107 L 0.042 -108 L 0.045 -109 T 0.055 -110 T 0.074 -111 C 0.100 -112 S 0.122 -113 T 0.129 -114 P 0.120 -115 L 0.109 -116 L 0.104 -117 N 0.107 -118 S 0.116 -119 P 0.123 -120 P 0.124 -121 S 0.120 -122 F 0.118 -123 V 0.118 -124 C 0.113 -125 W 0.104 -126 S 0.098 -127 R 0.105 -128 G 0.117 -129 F 0.125 -130 M 0.126 -131 E 0.123 -132 M 0.116 -133 D 0.107 -134 R 0.097 -135 R 0.088 -136 V 0.079 -137 E 0.069 -138 L 0.064 -139 V 0.066 -140 E 0.067 -141 S 0.059 -142 L 0.047 -143 K 0.041 -144 K 0.041 -145 F 0.047 -146 C 0.060 -147 A 0.081 -148 S 0.102 -149 T 0.113 -150 R 0.117 -151 L 0.121 -152 P 0.128 -153 P 0.130 -154 T 0.127 -155 P 0.127 -156 L 0.136 -157 L 0.149 -158 L 0.152 -159 F 0.144 -160 P 0.138 -161 E 0.144 -162 E 0.154 -163 E 0.148 -164 A 0.127 -165 T 0.109 -166 N 0.103 -167 G 0.108 -168 R 0.118 -169 E 0.125 -170 G 0.121 -171 L 0.110 -172 L 0.097 -173 R 0.087 -174 F 0.075 -175 S 0.064 -176 S 0.057 -177 W 0.054 -178 P 0.053 -179 F 0.051 -180 S 0.049 -181 I 0.047 -182 Q 0.045 -183 D 0.045 -184 V 0.050 -185 V 0.056 -186 Q 0.061 -187 P 0.060 -188 L 0.053 -189 T 0.047 -190 L 0.046 -191 Q 0.052 -192 V 0.062 -193 Q 0.074 -194 R 0.086 -195 P 0.097 -196 L 0.108 -197 V 0.116 -198 S 0.117 -199 V 0.113 -200 T 0.108 -201 V 0.106 -202 S 0.109 -203 D 0.112 -204 A 0.108 -205 S 0.093 -206 W 0.072 -207 V 0.054 -208 S 0.046 -209 E 0.045 -210 L 0.048 -211 L 0.051 -212 W 0.055 -213 S 0.057 -214 L 0.058 -215 F 0.063 -216 V 0.073 -217 P 0.079 -218 F 0.078 -219 T 0.071 -220 V 0.064 -221 Y 0.057 -222 Q 0.049 -223 V 0.041 -224 R 0.035 -225 W 0.031 -226 L 0.030 -227 H 0.031 -228 P 0.034 -229 I 0.041 -230 R 0.053 -231 R 0.070 -232 Q 0.089 -233 L 0.103 -234 G 0.110 -235 E 0.108 -236 E 0.098 -237 S 0.085 -238 E 0.075 -239 E 0.070 -240 F 0.066 -241 A 0.063 -242 L 0.060 -243 R 0.058 -244 V 0.056 -245 Q 0.054 -246 Q 0.054 -247 L 0.058 -248 V 0.067 -249 A 0.078 -250 K 0.085 -251 E 0.089 -252 L 0.099 -253 G 0.119 -254 Q 0.137 -255 I 0.141 -256 G 0.132 -257 T 0.118 -258 R 0.108 -259 L 0.098 -260 T 0.089 -261 P 0.084 -262 A 0.082 -263 D 0.079 -264 K 0.075 -265 A 0.077 -266 E 0.086 -267 H 0.101 -268 M 0.119 -269 K 0.144 -270 R 0.181 -271 Q 0.239 -272 R 0.320 -273 H 0.411 -274 P 0.490 -275 R 0.543 -276 L 0.575 -277 R 0.597 -278 P 0.621 -279 Q 0.652 -280 S 0.680 -281 V 0.693 -282 Q 0.686 -283 S 0.666 -284 S 0.644 -285 F 0.624 -286 P 0.609 -287 S 0.599 -288 P 0.592 -289 P 0.592 -290 S 0.594 -291 P 0.581 -292 S 0.535 -293 S 0.459 -294 D 0.376 -295 V 0.301 -296 Q 0.231 -297 L 0.164 -298 T 0.111 -299 T 0.081 -300 L 0.074 -301 A 0.080 -302 H 0.086 -303 R 0.085 -304 V 0.079 -305 K 0.074 -306 E 0.070 -307 V 0.067 -308 L 0.070 -309 P 0.078 -310 H 0.087 -311 V 0.089 -312 P 0.084 -313 L 0.073 -314 N 0.062 -315 V 0.054 -316 I 0.050 -317 Q 0.052 -318 R 0.062 -319 D 0.076 -320 L 0.084 -321 A 0.081 -322 R 0.075 -323 T 0.074 -324 G 0.079 -325 C 0.083 -326 V 0.079 -327 D 0.070 -328 L 0.064 -329 T 0.066 -330 I 0.072 -331 T 0.077 -332 N 0.081 -333 L 0.089 -334 L 0.105 -335 E 0.134 -336 G 0.171 -337 A 0.209 -338 V 0.247 -339 A 0.290 -340 F 0.348 -341 M 0.425 -342 P 0.512 -343 E 0.593 -344 D 0.654 -345 V 0.692 -346 T 0.713 -347 E 0.721 -348 G 0.715 -349 S 0.690 -350 Q 0.655 -351 S 0.628 -352 P 0.626 -353 P 0.646 -354 A 0.671 -355 P 0.689 -356 S 0.697 -357 A 0.699 -358 P 0.704 -359 K 0.714 -360 F 0.728 -361 P 0.743 -362 S 0.755 -363 S 0.765 -364 G 0.769 -365 L 0.758 -366 A 0.734 -367 T 0.708 -368 P 0.693 -369 Q 0.691 -370 P 0.693 -371 T 0.688 -372 A 0.664 -373 L 0.625 -374 T 0.582 -375 F 0.544 -376 A 0.512 -377 K 0.484 -378 S 0.445 -379 S 0.386 -380 W 0.317 -381 A 0.262 -382 R 0.233 -383 Q 0.229 -384 E 0.236 -385 S 0.241 -386 L 0.237 -387 Q 0.221 -388 E 0.198 -389 R 0.177 -390 K 0.164 -391 Q 0.161 -392 A 0.161 -393 L 0.158 -394 Y 0.149 -395 E 0.138 -396 Y 0.131 -397 A 0.127 -398 R 0.128 -399 R 0.133 -400 R 0.139 -401 F 0.148 -402 R 0.157 -403 E 0.170 -404 R 0.184 -405 Q 0.204 -406 A 0.236 -407 Q 0.280 -408 E 0.321 -409 A 0.345 -410 E 0.352 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068328.11_ENSMUST00000092618.10_GN:Aup1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:29.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068328.11_ENSMUST00000092618.10_GN:Aup1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:29.caid deleted file mode 100644 index 8f2bdce1ff6816e786dd333594c3e9a86951a710..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068328.11_ENSMUST00000092618.10_GN:Aup1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:29.caid +++ /dev/null @@ -1,440 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000068328.11|ENSMUST00000092618.10|GN:Aup1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:29 -1 M 0.403 -2 P 0.429 -3 K 0.470 -4 D 0.506 -5 S 0.526 -6 A 0.534 -7 F 0.543 -8 P 0.552 -9 G 0.542 -10 A 0.496 -11 P 0.419 -12 A 0.340 -13 A 0.285 -14 L 0.254 -15 R 0.240 -16 R 0.238 -17 W 0.247 -18 R 0.263 -19 R 0.292 -20 Q 0.343 -21 R 0.406 -22 P 0.462 -23 R 0.510 -24 S 0.556 -25 P 0.597 -26 E 0.623 -27 A 0.628 -28 A 0.608 -29 A 0.562 -30 M 0.507 -31 E 0.469 -32 P 0.458 -33 P 0.467 -34 P 0.478 -35 A 0.482 -36 P 0.475 -37 G 0.458 -38 P 0.432 -39 E 0.394 -40 R 0.344 -41 L 0.292 -42 F 0.254 -43 D 0.237 -44 S 0.237 -45 H 0.245 -46 R 0.258 -47 L 0.273 -48 P 0.290 -49 S 0.301 -50 D 0.289 -51 G 0.247 -52 F 0.190 -53 L 0.142 -54 L 0.109 -55 L 0.092 -56 A 0.088 -57 L 0.088 -58 L 0.084 -59 L 0.080 -60 Y 0.080 -61 A 0.081 -62 P 0.082 -63 V 0.084 -64 G 0.093 -65 L 0.098 -66 C 0.095 -67 L 0.086 -68 L 0.077 -69 V 0.069 -70 L 0.060 -71 R 0.052 -72 L 0.045 -73 F 0.040 -74 L 0.039 -75 G 0.039 -76 L 0.038 -77 H 0.037 -78 V 0.036 -79 F 0.034 -80 L 0.035 -81 V 0.044 -82 S 0.059 -83 C 0.073 -84 A 0.085 -85 L 0.097 -86 P 0.104 -87 D 0.099 -88 S 0.081 -89 V 0.058 -90 L 0.042 -91 R 0.035 -92 R 0.034 -93 F 0.034 -94 V 0.036 -95 V 0.040 -96 R 0.044 -97 T 0.046 -98 M 0.047 -99 C 0.049 -100 A 0.052 -101 V 0.056 -102 L 0.059 -103 G 0.058 -104 L 0.051 -105 V 0.042 -106 A 0.040 -107 R 0.049 -108 Q 0.068 -109 E 0.094 -110 D 0.121 -111 S 0.144 -112 G 0.156 -113 L 0.153 -114 R 0.136 -115 D 0.112 -116 H 0.087 -117 R 0.067 -118 V 0.054 -119 R 0.048 -120 V 0.052 -121 L 0.068 -122 I 0.089 -123 S 0.098 -124 N 0.088 -125 H 0.068 -126 V 0.050 -127 T 0.041 -128 P 0.038 -129 F 0.040 -130 D 0.045 -131 H 0.050 -132 N 0.054 -133 I 0.052 -134 V 0.048 -135 N 0.044 -136 L 0.044 -137 L 0.047 -138 T 0.057 -139 T 0.076 -140 C 0.101 -141 S 0.123 -142 T 0.128 -143 P 0.119 -144 L 0.107 -145 L 0.103 -146 N 0.107 -147 S 0.116 -148 P 0.124 -149 P 0.126 -150 S 0.122 -151 F 0.120 -152 V 0.120 -153 C 0.115 -154 W 0.105 -155 S 0.098 -156 R 0.104 -157 G 0.115 -158 F 0.123 -159 M 0.125 -160 E 0.123 -161 M 0.117 -162 D 0.108 -163 R 0.097 -164 R 0.087 -165 V 0.077 -166 E 0.067 -167 L 0.062 -168 V 0.064 -169 E 0.065 -170 S 0.057 -171 L 0.045 -172 K 0.038 -173 K 0.039 -174 F 0.046 -175 C 0.059 -176 A 0.081 -177 S 0.104 -178 T 0.116 -179 R 0.120 -180 L 0.124 -181 P 0.128 -182 P 0.129 -183 T 0.125 -184 P 0.126 -185 L 0.135 -186 L 0.147 -187 L 0.151 -188 F 0.143 -189 P 0.137 -190 E 0.144 -191 E 0.154 -192 E 0.147 -193 A 0.126 -194 T 0.106 -195 N 0.099 -196 G 0.104 -197 R 0.115 -198 E 0.122 -199 G 0.120 -200 L 0.108 -201 L 0.095 -202 R 0.084 -203 F 0.073 -204 S 0.062 -205 S 0.056 -206 W 0.054 -207 P 0.052 -208 F 0.050 -209 S 0.048 -210 I 0.046 -211 Q 0.043 -212 D 0.043 -213 V 0.048 -214 V 0.055 -215 Q 0.060 -216 P 0.059 -217 L 0.053 -218 T 0.047 -219 L 0.045 -220 Q 0.049 -221 V 0.057 -222 Q 0.068 -223 R 0.079 -224 P 0.089 -225 L 0.099 -226 V 0.106 -227 S 0.108 -228 V 0.105 -229 T 0.100 -230 V 0.099 -231 S 0.101 -232 D 0.104 -233 A 0.100 -234 S 0.086 -235 W 0.067 -236 V 0.050 -237 S 0.043 -238 E 0.043 -239 L 0.046 -240 L 0.049 -241 W 0.053 -242 S 0.055 -243 L 0.056 -244 F 0.061 -245 V 0.070 -246 P 0.076 -247 F 0.076 -248 T 0.070 -249 V 0.063 -250 Y 0.056 -251 Q 0.049 -252 V 0.042 -253 R 0.036 -254 W 0.032 -255 L 0.031 -256 H 0.032 -257 P 0.034 -258 I 0.041 -259 R 0.053 -260 R 0.071 -261 Q 0.090 -262 L 0.104 -263 G 0.110 -264 E 0.108 -265 E 0.099 -266 S 0.085 -267 E 0.075 -268 E 0.069 -269 F 0.066 -270 A 0.063 -271 L 0.060 -272 R 0.057 -273 V 0.056 -274 Q 0.054 -275 Q 0.053 -276 L 0.057 -277 V 0.066 -278 A 0.077 -279 K 0.084 -280 E 0.087 -281 L 0.097 -282 G 0.117 -283 Q 0.136 -284 I 0.141 -285 G 0.132 -286 T 0.120 -287 R 0.110 -288 L 0.101 -289 T 0.092 -290 P 0.086 -291 A 0.085 -292 D 0.081 -293 K 0.077 -294 A 0.079 -295 E 0.089 -296 H 0.103 -297 M 0.123 -298 K 0.149 -299 R 0.186 -300 Q 0.244 -301 R 0.325 -302 H 0.416 -303 P 0.495 -304 R 0.549 -305 L 0.582 -306 R 0.606 -307 P 0.633 -308 Q 0.664 -309 S 0.691 -310 V 0.702 -311 Q 0.694 -312 S 0.674 -313 S 0.651 -314 F 0.631 -315 P 0.617 -316 S 0.607 -317 P 0.601 -318 P 0.601 -319 S 0.604 -320 P 0.593 -321 S 0.548 -322 S 0.473 -323 D 0.393 -324 V 0.318 -325 Q 0.245 -326 L 0.174 -327 T 0.118 -328 T 0.086 -329 L 0.078 -330 A 0.082 -331 H 0.087 -332 R 0.086 -333 V 0.081 -334 K 0.077 -335 E 0.072 -336 V 0.070 -337 L 0.073 -338 P 0.082 -339 H 0.090 -340 V 0.093 -341 P 0.087 -342 L 0.076 -343 N 0.065 -344 V 0.057 -345 I 0.052 -346 Q 0.055 -347 R 0.066 -348 D 0.080 -349 L 0.088 -350 A 0.084 -351 R 0.075 -352 T 0.073 -353 G 0.077 -354 C 0.081 -355 V 0.078 -356 D 0.070 -357 L 0.064 -358 T 0.065 -359 I 0.071 -360 T 0.076 -361 N 0.080 -362 L 0.087 -363 L 0.104 -364 E 0.132 -365 G 0.167 -366 A 0.203 -367 V 0.239 -368 A 0.282 -369 F 0.341 -370 M 0.421 -371 P 0.511 -372 E 0.595 -373 D 0.656 -374 V 0.693 -375 T 0.714 -376 E 0.723 -377 G 0.716 -378 S 0.692 -379 Q 0.657 -380 S 0.631 -381 P 0.629 -382 P 0.649 -383 A 0.674 -384 P 0.691 -385 S 0.697 -386 A 0.699 -387 P 0.703 -388 K 0.713 -389 F 0.728 -390 P 0.745 -391 S 0.758 -392 S 0.768 -393 G 0.771 -394 L 0.761 -395 A 0.737 -396 T 0.711 -397 P 0.696 -398 Q 0.694 -399 P 0.697 -400 T 0.691 -401 A 0.667 -402 L 0.626 -403 T 0.582 -404 F 0.541 -405 A 0.504 -406 K 0.472 -407 S 0.432 -408 S 0.374 -409 W 0.307 -410 A 0.254 -411 R 0.227 -412 Q 0.225 -413 E 0.234 -414 S 0.240 -415 L 0.236 -416 Q 0.220 -417 E 0.197 -418 R 0.177 -419 K 0.166 -420 Q 0.163 -421 A 0.163 -422 L 0.159 -423 Y 0.148 -424 E 0.137 -425 Y 0.127 -426 A 0.119 -427 R 0.114 -428 R 0.115 -429 R 0.124 -430 F 0.136 -431 R 0.150 -432 E 0.167 -433 R 0.187 -434 Q 0.210 -435 A 0.243 -436 Q 0.290 -437 E 0.336 -438 A 0.364 -439 E 0.373 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068407.4_ENSMUST00000227764.2_GN:Rnase12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068407.4_ENSMUST00000227764.2_GN:Rnase12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index d20348b27b27496f102e6291765758fc2d540d7c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068407.4_ENSMUST00000227764.2_GN:Rnase12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,146 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000068407.4|ENSMUST00000227764.2|GN:Rnase12|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.235 -2 V 0.208 -3 L 0.177 -4 M 0.160 -5 V 0.156 -6 V 0.156 -7 V 0.155 -8 F 0.153 -9 L 0.151 -10 L 0.153 -11 L 0.167 -12 L 0.193 -13 F 0.231 -14 W 0.277 -15 E 0.324 -16 N 0.358 -17 E 0.375 -18 L 0.382 -19 T 0.388 -20 E 0.392 -21 D 0.387 -22 V 0.368 -23 V 0.325 -24 L 0.261 -25 T 0.194 -26 S 0.139 -27 I 0.102 -28 E 0.082 -29 Q 0.071 -30 L 0.061 -31 H 0.052 -32 V 0.050 -33 D 0.055 -34 Y 0.065 -35 P 0.078 -36 Q 0.093 -37 N 0.106 -38 A 0.107 -39 V 0.095 -40 P 0.078 -41 L 0.066 -42 R 0.057 -43 Y 0.047 -44 C 0.038 -45 N 0.034 -46 Y 0.034 -47 M 0.036 -48 I 0.039 -49 L 0.044 -50 Q 0.055 -51 R 0.068 -52 V 0.082 -53 I 0.096 -54 R 0.107 -55 E 0.110 -56 P 0.106 -57 D 0.096 -58 H 0.085 -59 R 0.076 -60 C 0.067 -61 R 0.057 -62 K 0.052 -63 V 0.049 -64 H 0.046 -65 V 0.043 -66 F 0.043 -67 I 0.047 -68 H 0.054 -69 E 0.060 -70 R 0.064 -71 P 0.064 -72 Q 0.061 -73 K 0.056 -74 I 0.050 -75 N 0.044 -76 R 0.039 -77 V 0.034 -78 C 0.030 -79 T 0.030 -80 S 0.035 -81 S 0.041 -82 K 0.047 -83 K 0.054 -84 M 0.064 -85 S 0.080 -86 C 0.101 -87 P 0.124 -88 N 0.142 -89 D 0.148 -90 S 0.137 -91 D 0.111 -92 L 0.079 -93 F 0.055 -94 C 0.045 -95 F 0.050 -96 Q 0.064 -97 S 0.081 -98 E 0.093 -99 T 0.095 -100 K 0.088 -101 F 0.077 -102 R 0.067 -103 M 0.061 -104 T 0.059 -105 V 0.058 -106 C 0.058 -107 Q 0.063 -108 L 0.071 -109 I 0.081 -110 D 0.087 -111 G 0.084 -112 T 0.074 -113 T 0.060 -114 Y 0.052 -115 P 0.052 -116 A 0.058 -117 C 0.064 -118 R 0.070 -119 Y 0.079 -120 Q 0.090 -121 I 0.102 -122 S 0.113 -123 P 0.124 -124 I 0.134 -125 K 0.141 -126 G 0.144 -127 F 0.146 -128 V 0.143 -129 L 0.127 -130 V 0.098 -131 T 0.069 -132 C 0.052 -133 D 0.055 -134 D 0.074 -135 L 0.096 -136 G 0.106 -137 P 0.104 -138 V 0.095 -139 D 0.090 -140 L 0.090 -141 Q 0.099 -142 G 0.119 -143 Y 0.146 -144 V 0.172 -145 E 0.189 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068407.4_ENSMUST00000227764.2_GN:Rnase12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:24.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068407.4_ENSMUST00000227764.2_GN:Rnase12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:24.caid deleted file mode 100644 index a95d7d63b774a684ae0776d7670d303d8e54049c..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000068407.4_ENSMUST00000227764.2_GN:Rnase12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:24.caid +++ /dev/null @@ -1,170 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000068407.4|ENSMUST00000227764.2|GN:Rnase12|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:24 -1 M 0.357 -2 L 0.372 -3 S 0.399 -4 V 0.419 -5 R 0.424 -6 T 0.428 -7 R 0.440 -8 A 0.433 -9 K 0.416 -10 R 0.448 -11 A 0.538 -12 G 0.624 -13 V 0.660 -14 Q 0.659 -15 A 0.644 -16 R 0.623 -17 D 0.592 -18 V 0.549 -19 K 0.500 -20 G 0.442 -21 I 0.369 -22 L 0.290 -23 P 0.233 -24 L 0.207 -25 M 0.197 -26 V 0.186 -27 L 0.173 -28 M 0.163 -29 V 0.156 -30 V 0.150 -31 V 0.141 -32 F 0.126 -33 L 0.111 -34 L 0.103 -35 L 0.110 -36 L 0.133 -37 F 0.170 -38 W 0.221 -39 E 0.278 -40 N 0.330 -41 E 0.367 -42 L 0.392 -43 T 0.405 -44 E 0.404 -45 D 0.391 -46 V 0.365 -47 V 0.318 -48 L 0.250 -49 T 0.181 -50 S 0.127 -51 I 0.093 -52 E 0.074 -53 Q 0.066 -54 L 0.060 -55 H 0.053 -56 V 0.052 -57 D 0.057 -58 Y 0.067 -59 P 0.080 -60 Q 0.093 -61 N 0.104 -62 A 0.104 -63 V 0.091 -64 P 0.074 -65 L 0.062 -66 R 0.053 -67 Y 0.044 -68 C 0.035 -69 N 0.031 -70 Y 0.032 -71 M 0.034 -72 I 0.038 -73 L 0.043 -74 Q 0.052 -75 R 0.062 -76 V 0.073 -77 I 0.084 -78 R 0.095 -79 E 0.101 -80 P 0.100 -81 D 0.091 -82 H 0.081 -83 R 0.073 -84 C 0.064 -85 R 0.056 -86 K 0.051 -87 V 0.049 -88 H 0.046 -89 V 0.044 -90 F 0.044 -91 I 0.048 -92 H 0.055 -93 E 0.062 -94 R 0.065 -95 P 0.064 -96 Q 0.060 -97 K 0.055 -98 I 0.048 -99 N 0.043 -100 R 0.039 -101 V 0.034 -102 C 0.031 -103 T 0.031 -104 S 0.036 -105 S 0.043 -106 K 0.049 -107 K 0.056 -108 M 0.067 -109 S 0.082 -110 C 0.102 -111 P 0.124 -112 N 0.141 -113 D 0.147 -114 S 0.137 -115 D 0.112 -116 L 0.081 -117 F 0.057 -118 C 0.046 -119 F 0.050 -120 Q 0.064 -121 S 0.081 -122 E 0.092 -123 T 0.094 -124 K 0.086 -125 F 0.074 -126 R 0.064 -127 M 0.058 -128 T 0.057 -129 V 0.057 -130 C 0.057 -131 Q 0.062 -132 L 0.071 -133 I 0.081 -134 D 0.087 -135 G 0.084 -136 T 0.074 -137 T 0.061 -138 Y 0.053 -139 P 0.055 -140 A 0.062 -141 C 0.068 -142 R 0.074 -143 Y 0.083 -144 Q 0.095 -145 I 0.107 -146 S 0.119 -147 P 0.130 -148 I 0.139 -149 K 0.144 -150 G 0.146 -151 F 0.147 -152 V 0.143 -153 L 0.126 -154 V 0.098 -155 T 0.069 -156 C 0.052 -157 D 0.056 -158 D 0.074 -159 L 0.095 -160 G 0.106 -161 P 0.102 -162 V 0.094 -163 D 0.088 -164 L 0.088 -165 Q 0.097 -166 G 0.116 -167 Y 0.142 -168 V 0.167 -169 E 0.182 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000069516.9_ENSMUST00000092163.9_GN:Lyz2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000069516.9_ENSMUST00000092163.9_GN:Lyz2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 9f5563f228046aec1e072d0c4d728ee605697486..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000069516.9_ENSMUST00000092163.9_GN:Lyz2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,149 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000069516.9|ENSMUST00000092163.9|GN:Lyz2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.384 -2 K 0.394 -3 T 0.407 -4 L 0.401 -5 L 0.365 -6 T 0.328 -7 L 0.330 -8 G 0.362 -9 L 0.378 -10 L 0.375 -11 L 0.382 -12 L 0.404 -13 S 0.427 -14 V 0.448 -15 T 0.456 -16 A 0.429 -17 Q 0.360 -18 A 0.267 -19 K 0.184 -20 V 0.124 -21 Y 0.086 -22 E 0.063 -23 R 0.049 -24 C 0.041 -25 E 0.037 -26 F 0.039 -27 A 0.047 -28 R 0.053 -29 T 0.051 -30 L 0.046 -31 K 0.046 -32 R 0.051 -33 N 0.058 -34 G 0.066 -35 M 0.074 -36 A 0.082 -37 G 0.086 -38 Y 0.092 -39 Y 0.106 -40 G 0.123 -41 V 0.127 -42 S 0.114 -43 L 0.093 -44 A 0.074 -45 D 0.061 -46 W 0.054 -47 V 0.053 -48 C 0.056 -49 L 0.062 -50 A 0.068 -51 Q 0.069 -52 H 0.067 -53 E 0.071 -54 S 0.086 -55 N 0.108 -56 Y 0.128 -57 N 0.143 -58 T 0.157 -59 R 0.172 -60 A 0.180 -61 T 0.174 -62 N 0.157 -63 Y 0.139 -64 N 0.133 -65 R 0.140 -66 G 0.152 -67 D 0.159 -68 Q 0.155 -69 S 0.137 -70 T 0.109 -71 D 0.083 -72 Y 0.066 -73 G 0.062 -74 I 0.069 -75 F 0.081 -76 Q 0.090 -77 I 0.090 -78 N 0.085 -79 S 0.081 -80 R 0.081 -81 Y 0.085 -82 W 0.094 -83 C 0.113 -84 N 0.145 -85 D 0.181 -86 G 0.208 -87 K 0.217 -88 T 0.218 -89 P 0.221 -90 R 0.228 -91 A 0.230 -92 V 0.219 -93 N 0.195 -94 A 0.165 -95 C 0.144 -96 G 0.138 -97 I 0.140 -98 N 0.139 -99 C 0.138 -100 S 0.140 -101 A 0.143 -102 L 0.142 -103 L 0.137 -104 Q 0.131 -105 D 0.126 -106 D 0.118 -107 I 0.105 -108 T 0.092 -109 A 0.083 -110 A 0.076 -111 I 0.069 -112 Q 0.065 -113 C 0.064 -114 A 0.063 -115 K 0.061 -116 R 0.062 -117 V 0.064 -118 V 0.064 -119 R 0.064 -120 D 0.070 -121 P 0.083 -122 Q 0.093 -123 G 0.096 -124 I 0.093 -125 R 0.089 -126 A 0.083 -127 W 0.070 -128 V 0.055 -129 A 0.043 -130 W 0.037 -131 R 0.034 -132 A 0.036 -133 H 0.038 -134 C 0.042 -135 Q 0.050 -136 N 0.061 -137 R 0.071 -138 D 0.072 -139 L 0.065 -140 S 0.056 -141 Q 0.049 -142 Y 0.043 -143 I 0.040 -144 R 0.041 -145 N 0.048 -146 C 0.065 -147 G 0.090 -148 V 0.112 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000069516.9_ENSMUST00000092163.9_GN:Lyz2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:15.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000069516.9_ENSMUST00000092163.9_GN:Lyz2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:15.caid deleted file mode 100644 index 84d74986dad226c01c69d915f11798c07597f470..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000069516.9_ENSMUST00000092163.9_GN:Lyz2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:15.caid +++ /dev/null @@ -1,164 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000069516.9|ENSMUST00000092163.9|GN:Lyz2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:15 -1 M 0.348 -2 L 0.372 -3 S 0.405 -4 L 0.419 -5 V 0.396 -6 S 0.369 -7 Q 0.393 -8 Q 0.462 -9 L 0.518 -10 T 0.532 -11 Q 0.533 -12 P 0.544 -13 P 0.554 -14 V 0.553 -15 T 0.545 -16 M 0.534 -17 K 0.518 -18 T 0.497 -19 L 0.471 -20 L 0.440 -21 T 0.426 -22 L 0.452 -23 G 0.491 -24 L 0.504 -25 L 0.485 -26 L 0.458 -27 L 0.439 -28 S 0.436 -29 V 0.447 -30 T 0.450 -31 A 0.422 -32 Q 0.353 -33 A 0.262 -34 K 0.179 -35 V 0.120 -36 Y 0.083 -37 E 0.061 -38 R 0.048 -39 C 0.039 -40 E 0.034 -41 F 0.031 -42 A 0.032 -43 R 0.034 -44 T 0.036 -45 L 0.038 -46 K 0.042 -47 R 0.049 -48 N 0.057 -49 G 0.064 -50 M 0.072 -51 A 0.080 -52 G 0.085 -53 Y 0.091 -54 Y 0.104 -55 G 0.120 -56 V 0.124 -57 S 0.112 -58 L 0.091 -59 A 0.072 -60 D 0.059 -61 W 0.052 -62 V 0.051 -63 C 0.054 -64 L 0.060 -65 A 0.065 -66 Q 0.066 -67 H 0.064 -68 E 0.068 -69 S 0.083 -70 N 0.104 -71 Y 0.125 -72 N 0.141 -73 T 0.155 -74 R 0.169 -75 A 0.178 -76 T 0.171 -77 N 0.153 -78 Y 0.135 -79 N 0.129 -80 R 0.136 -81 G 0.149 -82 D 0.157 -83 Q 0.154 -84 S 0.136 -85 T 0.109 -86 D 0.082 -87 Y 0.066 -88 G 0.061 -89 I 0.068 -90 F 0.081 -91 Q 0.089 -92 I 0.089 -93 N 0.084 -94 S 0.080 -95 R 0.081 -96 Y 0.084 -97 W 0.094 -98 C 0.113 -99 N 0.144 -100 D 0.180 -101 G 0.206 -102 K 0.215 -103 T 0.216 -104 P 0.220 -105 R 0.228 -106 A 0.231 -107 V 0.220 -108 N 0.195 -109 A 0.165 -110 C 0.143 -111 G 0.137 -112 I 0.139 -113 N 0.138 -114 C 0.137 -115 S 0.139 -116 A 0.143 -117 L 0.141 -118 L 0.135 -119 Q 0.129 -120 D 0.124 -121 D 0.116 -122 I 0.103 -123 T 0.091 -124 A 0.083 -125 A 0.075 -126 I 0.068 -127 Q 0.064 -128 C 0.063 -129 A 0.062 -130 K 0.061 -131 R 0.062 -132 V 0.065 -133 V 0.065 -134 R 0.065 -135 D 0.071 -136 P 0.084 -137 Q 0.095 -138 G 0.098 -139 I 0.094 -140 R 0.090 -141 A 0.082 -142 W 0.069 -143 V 0.054 -144 A 0.042 -145 W 0.036 -146 R 0.034 -147 A 0.035 -148 H 0.038 -149 C 0.041 -150 Q 0.049 -151 N 0.061 -152 R 0.070 -153 D 0.071 -154 L 0.065 -155 S 0.056 -156 Q 0.048 -157 Y 0.042 -158 I 0.040 -159 R 0.040 -160 N 0.047 -161 C 0.064 -162 G 0.089 -163 V 0.110 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000070645.6_ENSMUST00000094556.3_GN:Ren1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000070645.6_ENSMUST00000094556.3_GN:Ren1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index dfa7a5cc971f99f9bc1e6ae2338232aa4f15ff1f..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000070645.6_ENSMUST00000094556.3_GN:Ren1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,403 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000070645.6|ENSMUST00000094556.3|GN:Ren1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.365 -2 D 0.356 -3 R 0.363 -4 R 0.395 -5 R 0.425 -6 M 0.429 -7 P 0.409 -8 L 0.374 -9 W 0.333 -10 A 0.303 -11 L 0.292 -12 L 0.292 -13 L 0.304 -14 L 0.335 -15 W 0.382 -16 S 0.429 -17 P 0.465 -18 C 0.482 -19 T 0.488 -20 F 0.496 -21 S 0.516 -22 L 0.543 -23 P 0.565 -24 T 0.569 -25 R 0.543 -26 T 0.478 -27 A 0.381 -28 T 0.276 -29 F 0.192 -30 E 0.139 -31 R 0.109 -32 I 0.095 -33 P 0.094 -34 L 0.102 -35 K 0.120 -36 K 0.144 -37 M 0.157 -38 P 0.147 -39 S 0.122 -40 V 0.104 -41 R 0.101 -42 E 0.105 -43 I 0.108 -44 L 0.110 -45 E 0.119 -46 E 0.140 -47 R 0.167 -48 G 0.185 -49 V 0.179 -50 D 0.156 -51 M 0.132 -52 T 0.124 -53 R 0.125 -54 L 0.128 -55 S 0.128 -56 A 0.131 -57 E 0.142 -58 W 0.166 -59 G 0.195 -60 V 0.219 -61 F 0.240 -62 T 0.265 -63 K 0.300 -64 R 0.337 -65 P 0.362 -66 S 0.367 -67 L 0.363 -68 T 0.364 -69 N 0.374 -70 L 0.381 -71 T 0.372 -72 S 0.352 -73 P 0.330 -74 V 0.303 -75 V 0.263 -76 L 0.208 -77 T 0.153 -78 N 0.115 -79 Y 0.098 -80 L 0.090 -81 N 0.081 -82 T 0.068 -83 Q 0.058 -84 Y 0.051 -85 Y 0.048 -86 G 0.047 -87 E 0.048 -88 I 0.052 -89 G 0.058 -90 I 0.064 -91 G 0.065 -92 T 0.063 -93 P 0.066 -94 P 0.075 -95 Q 0.083 -96 T 0.082 -97 F 0.071 -98 K 0.057 -99 V 0.048 -100 I 0.053 -101 F 0.073 -102 D 0.090 -103 T 0.092 -104 G 0.084 -105 S 0.078 -106 A 0.075 -107 N 0.074 -108 L 0.075 -109 W 0.077 -110 V 0.081 -111 P 0.084 -112 S 0.086 -113 T 0.088 -114 K 0.090 -115 C 0.091 -116 S 0.091 -117 R 0.089 -118 L 0.089 -119 Y 0.093 -120 L 0.101 -121 A 0.106 -122 C 0.105 -123 G 0.098 -124 I 0.092 -125 H 0.090 -126 S 0.091 -127 L 0.092 -128 Y 0.092 -129 E 0.095 -130 S 0.100 -131 S 0.104 -132 D 0.104 -133 S 0.101 -134 S 0.100 -135 S 0.100 -136 Y 0.102 -137 M 0.108 -138 E 0.121 -139 N 0.138 -140 G 0.146 -141 S 0.135 -142 D 0.110 -143 F 0.086 -144 T 0.071 -145 I 0.067 -146 H 0.068 -147 Y 0.070 -148 G 0.075 -149 S 0.084 -150 G 0.096 -151 R 0.109 -152 V 0.118 -153 K 0.119 -154 G 0.118 -155 F 0.118 -156 L 0.114 -157 S 0.106 -158 Q 0.091 -159 D 0.072 -160 S 0.052 -161 V 0.038 -162 T 0.033 -163 V 0.039 -164 G 0.057 -165 G 0.081 -166 I 0.100 -167 T 0.103 -168 V 0.091 -169 T 0.075 -170 Q 0.061 -171 T 0.050 -172 F 0.045 -173 G 0.047 -174 E 0.052 -175 V 0.059 -176 T 0.067 -177 E 0.074 -178 L 0.074 -179 P 0.067 -180 L 0.058 -181 I 0.055 -182 P 0.060 -183 F 0.070 -184 M 0.080 -185 L 0.089 -186 A 0.092 -187 K 0.089 -188 F 0.081 -189 D 0.074 -190 G 0.068 -191 V 0.064 -192 L 0.065 -193 G 0.068 -194 M 0.073 -195 G 0.081 -196 F 0.094 -197 P 0.107 -198 A 0.112 -199 Q 0.113 -200 A 0.119 -201 V 0.134 -202 G 0.152 -203 G 0.162 -204 V 0.152 -205 T 0.122 -206 P 0.088 -207 V 0.064 -208 F 0.055 -209 D 0.056 -210 H 0.060 -211 I 0.067 -212 L 0.077 -213 S 0.083 -214 Q 0.080 -215 G 0.072 -216 V 0.064 -217 L 0.059 -218 K 0.055 -219 E 0.052 -220 E 0.049 -221 V 0.046 -222 F 0.043 -223 S 0.042 -224 V 0.044 -225 Y 0.049 -226 Y 0.063 -227 N 0.084 -228 R 0.108 -229 G 0.125 -230 S 0.128 -231 H 0.123 -232 L 0.120 -233 L 0.118 -234 G 0.109 -235 G 0.096 -236 E 0.087 -237 V 0.084 -238 V 0.085 -239 L 0.091 -240 G 0.101 -241 G 0.110 -242 S 0.111 -243 D 0.102 -244 P 0.088 -245 Q 0.079 -246 H 0.080 -247 Y 0.088 -248 Q 0.100 -249 G 0.109 -250 N 0.111 -251 F 0.105 -252 H 0.098 -253 Y 0.093 -254 V 0.092 -255 S 0.090 -256 I 0.084 -257 S 0.071 -258 K 0.056 -259 T 0.044 -260 D 0.038 -261 S 0.038 -262 W 0.042 -263 Q 0.045 -264 I 0.048 -265 T 0.049 -266 M 0.047 -267 K 0.045 -268 G 0.046 -269 V 0.050 -270 S 0.058 -271 V 0.067 -272 G 0.074 -273 S 0.079 -274 S 0.085 -275 T 0.093 -276 L 0.100 -277 L 0.102 -278 C 0.099 -279 E 0.091 -280 E 0.077 -281 G 0.064 -282 C 0.054 -283 A 0.049 -284 V 0.049 -285 V 0.056 -286 V 0.070 -287 D 0.085 -288 T 0.093 -289 G 0.093 -290 S 0.088 -291 S 0.079 -292 F 0.074 -293 I 0.078 -294 S 0.090 -295 A 0.101 -296 P 0.100 -297 T 0.086 -298 S 0.069 -299 S 0.058 -300 L 0.052 -301 K 0.052 -302 L 0.058 -303 I 0.069 -304 M 0.083 -305 Q 0.095 -306 A 0.099 -307 L 0.097 -308 G 0.094 -309 A 0.093 -310 K 0.094 -311 E 0.096 -312 K 0.097 -313 R 0.094 -314 I 0.088 -315 E 0.083 -316 E 0.081 -317 Y 0.081 -318 V 0.081 -319 V 0.077 -320 N 0.067 -321 C 0.061 -322 S 0.064 -323 Q 0.076 -324 V 0.088 -325 P 0.097 -326 T 0.101 -327 L 0.098 -328 P 0.085 -329 D 0.064 -330 I 0.043 -331 S 0.029 -332 F 0.027 -333 D 0.035 -334 L 0.051 -335 G 0.069 -336 G 0.080 -337 R 0.076 -338 A 0.064 -339 Y 0.054 -340 T 0.054 -341 L 0.056 -342 S 0.054 -343 S 0.048 -344 T 0.043 -345 D 0.042 -346 Y 0.043 -347 V 0.050 -348 L 0.064 -349 Q 0.088 -350 Y 0.114 -351 P 0.136 -352 N 0.153 -353 R 0.167 -354 R 0.173 -355 D 0.164 -356 K 0.142 -357 L 0.116 -358 C 0.093 -359 T 0.076 -360 L 0.065 -361 A 0.058 -362 L 0.055 -363 H 0.058 -364 A 0.069 -365 M 0.086 -366 D 0.105 -367 I 0.121 -368 P 0.128 -369 P 0.127 -370 P 0.120 -371 T 0.111 -372 G 0.099 -373 P 0.088 -374 V 0.080 -375 W 0.074 -376 V 0.068 -377 L 0.063 -378 G 0.063 -379 A 0.067 -380 T 0.068 -381 F 0.061 -382 I 0.052 -383 R 0.048 -384 K 0.048 -385 F 0.046 -386 Y 0.045 -387 T 0.046 -388 E 0.049 -389 F 0.053 -390 D 0.058 -391 R 0.063 -392 H 0.067 -393 N 0.069 -394 N 0.071 -395 R 0.076 -396 I 0.082 -397 G 0.084 -398 F 0.086 -399 A 0.090 -400 L 0.099 -401 A 0.114 -402 R 0.128 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000070645.6_ENSMUST00000094556.3_GN:Ren1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000070645.6_ENSMUST00000094556.3_GN:Ren1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid deleted file mode 100644 index 64043c5e1df8f966ad49fd4b641fcc93c7a6e1e3..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000070645.6_ENSMUST00000094556.3_GN:Ren1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid +++ /dev/null @@ -1,426 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000070645.6|ENSMUST00000094556.3|GN:Ren1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:23 -1 M 0.295 -2 V 0.320 -3 C 0.352 -4 I 0.369 -5 K 0.372 -6 E 0.389 -7 G 0.436 -8 S 0.491 -9 G 0.512 -10 G 0.495 -11 L 0.468 -12 G 0.443 -13 Y 0.400 -14 T 0.349 -15 A 0.338 -16 L 0.375 -17 R 0.422 -18 K 0.456 -19 P 0.483 -20 W 0.516 -21 L 0.553 -22 N 0.577 -23 Q 0.577 -24 M 0.561 -25 D 0.544 -26 R 0.533 -27 R 0.524 -28 R 0.506 -29 M 0.480 -30 P 0.460 -31 L 0.453 -32 W 0.455 -33 A 0.453 -34 L 0.431 -35 L 0.394 -36 L 0.371 -37 L 0.384 -38 W 0.422 -39 S 0.473 -40 P 0.525 -41 C 0.559 -42 T 0.563 -43 F 0.554 -44 S 0.554 -45 L 0.567 -46 P 0.581 -47 T 0.580 -48 R 0.552 -49 T 0.484 -50 A 0.383 -51 T 0.275 -52 F 0.191 -53 E 0.138 -54 R 0.108 -55 I 0.096 -56 P 0.095 -57 L 0.104 -58 K 0.123 -59 K 0.149 -60 M 0.163 -61 P 0.153 -62 S 0.127 -63 V 0.108 -64 R 0.105 -65 E 0.109 -66 I 0.111 -67 L 0.113 -68 E 0.121 -69 E 0.140 -70 R 0.163 -71 G 0.176 -72 V 0.169 -73 D 0.144 -74 M 0.122 -75 T 0.114 -76 R 0.117 -77 L 0.120 -78 S 0.121 -79 A 0.124 -80 E 0.136 -81 W 0.160 -82 G 0.189 -83 V 0.213 -84 F 0.234 -85 T 0.260 -86 K 0.295 -87 R 0.335 -88 P 0.363 -89 S 0.371 -90 L 0.370 -91 T 0.374 -92 N 0.387 -93 L 0.395 -94 T 0.386 -95 S 0.365 -96 P 0.342 -97 V 0.313 -98 V 0.270 -99 L 0.212 -100 T 0.154 -101 N 0.114 -102 Y 0.096 -103 L 0.089 -104 N 0.079 -105 T 0.067 -106 Q 0.057 -107 Y 0.050 -108 Y 0.047 -109 G 0.046 -110 E 0.047 -111 I 0.050 -112 G 0.057 -113 I 0.063 -114 G 0.064 -115 T 0.062 -116 P 0.066 -117 P 0.076 -118 Q 0.084 -119 T 0.082 -120 F 0.071 -121 K 0.057 -122 V 0.048 -123 I 0.053 -124 F 0.072 -125 D 0.089 -126 T 0.091 -127 G 0.084 -128 S 0.078 -129 A 0.075 -130 N 0.074 -131 L 0.075 -132 W 0.078 -133 V 0.082 -134 P 0.085 -135 S 0.086 -136 T 0.088 -137 K 0.090 -138 C 0.092 -139 S 0.091 -140 R 0.089 -141 L 0.089 -142 Y 0.094 -143 L 0.101 -144 A 0.107 -145 C 0.105 -146 G 0.099 -147 I 0.094 -148 H 0.092 -149 S 0.093 -150 L 0.093 -151 Y 0.092 -152 E 0.093 -153 S 0.097 -154 S 0.101 -155 D 0.101 -156 S 0.100 -157 S 0.098 -158 S 0.098 -159 Y 0.100 -160 M 0.106 -161 E 0.119 -162 N 0.136 -163 G 0.144 -164 S 0.133 -165 D 0.109 -166 F 0.085 -167 T 0.071 -168 I 0.067 -169 H 0.069 -170 Y 0.071 -171 G 0.076 -172 S 0.084 -173 G 0.096 -174 R 0.109 -175 V 0.117 -176 K 0.118 -177 G 0.117 -178 F 0.116 -179 L 0.113 -180 S 0.104 -181 Q 0.090 -182 D 0.071 -183 S 0.051 -184 V 0.037 -185 T 0.032 -186 V 0.038 -187 G 0.055 -188 G 0.078 -189 I 0.095 -190 T 0.097 -191 V 0.086 -192 T 0.071 -193 Q 0.058 -194 T 0.049 -195 F 0.044 -196 G 0.046 -197 E 0.051 -198 V 0.057 -199 T 0.065 -200 E 0.071 -201 L 0.071 -202 P 0.064 -203 L 0.055 -204 I 0.053 -205 P 0.058 -206 F 0.068 -207 M 0.078 -208 L 0.087 -209 A 0.090 -210 K 0.087 -211 F 0.079 -212 D 0.072 -213 G 0.066 -214 V 0.062 -215 L 0.062 -216 G 0.065 -217 M 0.070 -218 G 0.078 -219 F 0.091 -220 P 0.103 -221 A 0.108 -222 Q 0.108 -223 A 0.114 -224 V 0.128 -225 G 0.145 -226 G 0.155 -227 V 0.146 -228 T 0.117 -229 P 0.084 -230 V 0.061 -231 F 0.053 -232 D 0.053 -233 H 0.057 -234 I 0.064 -235 L 0.074 -236 S 0.080 -237 Q 0.077 -238 G 0.067 -239 V 0.059 -240 L 0.055 -241 K 0.052 -242 E 0.050 -243 E 0.048 -244 V 0.045 -245 F 0.043 -246 S 0.041 -247 V 0.043 -248 Y 0.049 -249 Y 0.061 -250 N 0.081 -251 R 0.104 -252 G 0.121 -253 S 0.124 -254 H 0.120 -255 L 0.118 -256 L 0.117 -257 G 0.108 -258 G 0.095 -259 E 0.086 -260 V 0.083 -261 V 0.084 -262 L 0.091 -263 G 0.101 -264 G 0.110 -265 S 0.111 -266 D 0.103 -267 P 0.089 -268 Q 0.079 -269 H 0.080 -270 Y 0.089 -271 Q 0.101 -272 G 0.111 -273 N 0.113 -274 F 0.107 -275 H 0.100 -276 Y 0.095 -277 V 0.093 -278 S 0.092 -279 I 0.085 -280 S 0.072 -281 K 0.057 -282 T 0.044 -283 D 0.038 -284 S 0.038 -285 W 0.041 -286 Q 0.045 -287 I 0.047 -288 T 0.048 -289 M 0.046 -290 K 0.044 -291 G 0.045 -292 V 0.049 -293 S 0.056 -294 V 0.065 -295 G 0.073 -296 S 0.080 -297 S 0.087 -298 T 0.095 -299 L 0.101 -300 L 0.103 -301 C 0.100 -302 E 0.092 -303 E 0.080 -304 G 0.067 -305 C 0.057 -306 A 0.051 -307 V 0.051 -308 V 0.058 -309 V 0.072 -310 D 0.087 -311 T 0.096 -312 G 0.096 -313 S 0.090 -314 S 0.081 -315 F 0.075 -316 I 0.080 -317 S 0.093 -318 A 0.104 -319 P 0.103 -320 T 0.089 -321 S 0.072 -322 S 0.059 -323 L 0.053 -324 K 0.053 -325 L 0.059 -326 I 0.069 -327 M 0.083 -328 Q 0.094 -329 A 0.099 -330 L 0.098 -331 G 0.096 -332 A 0.096 -333 K 0.097 -334 E 0.097 -335 K 0.097 -336 R 0.094 -337 I 0.088 -338 E 0.084 -339 E 0.083 -340 Y 0.083 -341 V 0.083 -342 V 0.078 -343 N 0.068 -344 C 0.062 -345 S 0.065 -346 Q 0.077 -347 V 0.090 -348 P 0.098 -349 T 0.101 -350 L 0.098 -351 P 0.085 -352 D 0.064 -353 I 0.043 -354 S 0.030 -355 F 0.027 -356 D 0.035 -357 L 0.052 -358 G 0.070 -359 G 0.080 -360 R 0.076 -361 A 0.063 -362 Y 0.054 -363 T 0.053 -364 L 0.056 -365 S 0.054 -366 S 0.048 -367 T 0.043 -368 D 0.041 -369 Y 0.043 -370 V 0.049 -371 L 0.063 -372 Q 0.086 -373 Y 0.112 -374 P 0.134 -375 N 0.151 -376 R 0.166 -377 R 0.172 -378 D 0.163 -379 K 0.142 -380 L 0.115 -381 C 0.092 -382 T 0.075 -383 L 0.064 -384 A 0.058 -385 L 0.054 -386 H 0.057 -387 A 0.069 -388 M 0.086 -389 D 0.106 -390 I 0.122 -391 P 0.129 -392 P 0.128 -393 P 0.121 -394 T 0.112 -395 G 0.101 -396 P 0.089 -397 V 0.081 -398 W 0.075 -399 V 0.069 -400 L 0.064 -401 G 0.064 -402 A 0.068 -403 T 0.069 -404 F 0.062 -405 I 0.053 -406 R 0.049 -407 K 0.049 -408 F 0.047 -409 Y 0.046 -410 T 0.047 -411 E 0.050 -412 F 0.054 -413 D 0.058 -414 R 0.063 -415 H 0.066 -416 N 0.068 -417 N 0.071 -418 R 0.076 -419 I 0.082 -420 G 0.085 -421 F 0.087 -422 A 0.091 -423 L 0.100 -424 A 0.116 -425 R 0.130 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000073775.5_ENSMUST00000102738.4_GN:Kti12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000073775.5_ENSMUST00000102738.4_GN:Kti12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 2baae4934b83c7bd21ae1a20f062cf4882687a41..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000073775.5_ENSMUST00000102738.4_GN:Kti12_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,352 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000073775.5|ENSMUST00000102738.4|GN:Kti12|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.108 -2 P 0.091 -3 L 0.072 -4 V 0.060 -5 V 0.054 -6 V 0.053 -7 C 0.057 -8 G 0.064 -9 L 0.069 -10 P 0.070 -11 S 0.065 -12 S 0.058 -13 G 0.051 -14 K 0.043 -15 S 0.039 -16 Q 0.039 -17 R 0.043 -18 T 0.045 -19 E 0.043 -20 E 0.044 -21 L 0.053 -22 R 0.065 -23 R 0.070 -24 A 0.064 -25 L 0.057 -26 A 0.055 -27 S 0.060 -28 E 0.072 -29 G 0.082 -30 R 0.081 -31 A 0.068 -32 V 0.053 -33 Y 0.044 -34 V 0.044 -35 V 0.046 -36 D 0.046 -37 D 0.047 -38 A 0.052 -39 S 0.064 -40 V 0.081 -41 L 0.100 -42 G 0.120 -43 A 0.136 -44 Q 0.144 -45 D 0.141 -46 P 0.131 -47 T 0.119 -48 V 0.111 -49 Y 0.113 -50 G 0.119 -51 D 0.116 -52 S 0.103 -53 A 0.088 -54 G 0.076 -55 E 0.066 -56 K 0.059 -57 A 0.058 -58 L 0.062 -59 R 0.061 -60 A 0.057 -61 A 0.054 -62 L 0.059 -63 R 0.068 -64 A 0.069 -65 A 0.059 -66 V 0.046 -67 E 0.040 -68 R 0.039 -69 R 0.044 -70 L 0.052 -71 S 0.062 -72 R 0.074 -73 Q 0.091 -74 D 0.108 -75 V 0.116 -76 V 0.110 -77 I 0.091 -78 L 0.070 -79 D 0.057 -80 S 0.057 -81 V 0.067 -82 N 0.076 -83 Y 0.075 -84 I 0.064 -85 K 0.052 -86 G 0.043 -87 F 0.039 -88 R 0.036 -89 Y 0.033 -90 E 0.033 -91 L 0.037 -92 Y 0.042 -93 C 0.046 -94 L 0.048 -95 A 0.050 -96 R 0.057 -97 A 0.068 -98 A 0.082 -99 R 0.093 -100 T 0.097 -101 P 0.089 -102 L 0.073 -103 C 0.060 -104 L 0.056 -105 L 0.057 -106 Y 0.058 -107 C 0.059 -108 V 0.065 -109 R 0.076 -110 P 0.093 -111 N 0.116 -112 W 0.147 -113 P 0.183 -114 S 0.214 -115 R 0.231 -116 E 0.235 -117 L 0.245 -118 R 0.273 -119 E 0.314 -120 A 0.355 -121 S 0.394 -122 A 0.438 -123 S 0.483 -124 E 0.516 -125 N 0.530 -126 R 0.525 -127 D 0.504 -128 L 0.474 -129 A 0.446 -130 V 0.421 -131 S 0.400 -132 V 0.382 -133 S 0.372 -134 W 0.377 -135 R 0.403 -136 P 0.448 -137 R 0.501 -138 A 0.554 -139 E 0.601 -140 T 0.639 -141 G 0.666 -142 G 0.687 -143 K 0.701 -144 S 0.707 -145 Q 0.707 -146 A 0.706 -147 A 0.707 -148 G 0.706 -149 A 0.691 -150 V 0.649 -151 E 0.589 -152 E 0.556 -153 Q 0.573 -154 R 0.605 -155 A 0.616 -156 T 0.619 -157 S 0.639 -158 P 0.675 -159 V 0.708 -160 A 0.731 -161 N 0.742 -162 G 0.745 -163 G 0.736 -164 V 0.716 -165 L 0.694 -166 A 0.679 -167 A 0.662 -168 V 0.639 -169 S 0.624 -170 K 0.622 -171 E 0.621 -172 L 0.605 -173 D 0.580 -174 P 0.568 -175 E 0.575 -176 E 0.583 -177 I 0.579 -178 L 0.576 -179 P 0.587 -180 S 0.614 -181 N 0.645 -182 P 0.674 -183 S 0.699 -184 A 0.709 -185 V 0.694 -186 M 0.668 -187 T 0.659 -188 P 0.673 -189 G 0.693 -190 S 0.702 -191 E 0.700 -192 K 0.690 -193 S 0.672 -194 A 0.650 -195 E 0.631 -196 P 0.607 -197 A 0.558 -198 S 0.476 -199 C 0.378 -200 A 0.288 -201 F 0.216 -202 P 0.163 -203 P 0.124 -204 E 0.096 -205 V 0.079 -206 L 0.072 -207 E 0.072 -208 S 0.080 -209 L 0.092 -210 A 0.097 -211 L 0.092 -212 R 0.087 -213 F 0.089 -214 E 0.098 -215 S 0.107 -216 P 0.108 -217 D 0.102 -218 S 0.093 -219 R 0.089 -220 N 0.091 -221 R 0.093 -222 W 0.088 -223 D 0.075 -224 R 0.060 -225 P 0.049 -226 L 0.045 -227 F 0.044 -228 T 0.046 -229 V 0.052 -230 V 0.063 -231 G 0.076 -232 L 0.086 -233 E 0.088 -234 E 0.082 -235 P 0.070 -236 L 0.055 -237 P 0.040 -238 L 0.030 -239 A 0.026 -240 E 0.026 -241 I 0.028 -242 R 0.029 -243 S 0.030 -244 A 0.035 -245 L 0.045 -246 F 0.066 -247 E 0.096 -248 N 0.127 -249 R 0.151 -250 A 0.171 -251 P 0.197 -252 P 0.230 -253 P 0.267 -254 H 0.308 -255 Q 0.356 -256 S 0.408 -257 T 0.454 -258 Q 0.488 -259 S 0.514 -260 Q 0.526 -261 P 0.520 -262 L 0.497 -263 A 0.466 -264 S 0.426 -265 G 0.365 -266 S 0.285 -267 F 0.203 -268 L 0.141 -269 H 0.110 -270 Q 0.110 -271 L 0.124 -272 D 0.135 -273 Q 0.136 -274 A 0.126 -275 T 0.104 -276 S 0.080 -277 Q 0.065 -278 V 0.059 -279 L 0.057 -280 T 0.054 -281 A 0.053 -282 V 0.053 -283 M 0.054 -284 E 0.056 -285 A 0.059 -286 Q 0.063 -287 K 0.070 -288 S 0.081 -289 A 0.096 -290 V 0.108 -291 P 0.111 -292 G 0.105 -293 D 0.096 -294 F 0.093 -295 L 0.099 -296 K 0.110 -297 L 0.123 -298 P 0.134 -299 G 0.145 -300 T 0.156 -301 T 0.162 -302 E 0.157 -303 P 0.141 -304 L 0.124 -305 R 0.110 -306 F 0.099 -307 T 0.089 -308 R 0.078 -309 P 0.068 -310 L 0.059 -311 T 0.051 -312 L 0.046 -313 A 0.043 -314 E 0.044 -315 L 0.050 -316 S 0.058 -317 R 0.063 -318 L 0.058 -319 R 0.048 -320 R 0.040 -321 Q 0.037 -322 F 0.044 -323 I 0.057 -324 S 0.068 -325 Y 0.072 -326 T 0.075 -327 K 0.085 -328 M 0.103 -329 H 0.121 -330 P 0.133 -331 N 0.139 -332 N 0.141 -333 E 0.135 -334 N 0.121 -335 L 0.103 -336 P 0.088 -337 Q 0.073 -338 L 0.059 -339 A 0.049 -340 N 0.044 -341 M 0.044 -342 F 0.050 -343 L 0.061 -344 Q 0.069 -345 Y 0.068 -346 L 0.065 -347 N 0.065 -348 Q 0.069 -349 S 0.080 -350 L 0.096 -351 H 0.109 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000073775.5_ENSMUST00000102738.4_GN:Kti12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000073775.5_ENSMUST00000102738.4_GN:Kti12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid deleted file mode 100644 index 1fc46ecf1e7a51261539f3a78a208ebbe24ef893..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000073775.5_ENSMUST00000102738.4_GN:Kti12_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid +++ /dev/null @@ -1,357 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000073775.5|ENSMUST00000102738.4|GN:Kti12|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:5 -1 M 0.384 -2 P 0.365 -3 L 0.325 -4 E 0.266 -5 I 0.194 -6 M 0.127 -7 P 0.080 -8 L 0.057 -9 V 0.050 -10 V 0.049 -11 V 0.049 -12 C 0.054 -13 G 0.061 -14 L 0.066 -15 P 0.066 -16 S 0.061 -17 S 0.054 -18 G 0.048 -19 K 0.041 -20 S 0.038 -21 Q 0.039 -22 R 0.043 -23 T 0.045 -24 E 0.042 -25 E 0.043 -26 L 0.052 -27 R 0.065 -28 R 0.069 -29 A 0.063 -30 L 0.056 -31 A 0.055 -32 S 0.060 -33 E 0.071 -34 G 0.080 -35 R 0.078 -36 A 0.064 -37 V 0.050 -38 Y 0.043 -39 V 0.043 -40 V 0.045 -41 D 0.045 -42 D 0.046 -43 A 0.051 -44 S 0.063 -45 V 0.080 -46 L 0.099 -47 G 0.119 -48 A 0.135 -49 Q 0.145 -50 D 0.144 -51 P 0.134 -52 T 0.122 -53 V 0.114 -54 Y 0.116 -55 G 0.122 -56 D 0.120 -57 S 0.106 -58 A 0.090 -59 G 0.077 -60 E 0.066 -61 K 0.058 -62 A 0.058 -63 L 0.061 -64 R 0.060 -65 A 0.056 -66 A 0.053 -67 L 0.058 -68 R 0.067 -69 A 0.068 -70 A 0.058 -71 V 0.045 -72 E 0.038 -73 R 0.037 -74 R 0.042 -75 L 0.048 -76 S 0.056 -77 R 0.065 -78 Q 0.077 -79 D 0.090 -80 V 0.097 -81 V 0.094 -82 I 0.082 -83 L 0.066 -84 D 0.055 -85 S 0.055 -86 V 0.065 -87 N 0.074 -88 Y 0.073 -89 I 0.062 -90 K 0.050 -91 G 0.042 -92 F 0.038 -93 R 0.034 -94 Y 0.031 -95 E 0.032 -96 L 0.035 -97 Y 0.040 -98 C 0.044 -99 L 0.045 -100 A 0.048 -101 R 0.054 -102 A 0.066 -103 A 0.079 -104 R 0.091 -105 T 0.095 -106 P 0.087 -107 L 0.071 -108 C 0.057 -109 L 0.053 -110 L 0.055 -111 Y 0.056 -112 C 0.058 -113 V 0.064 -114 R 0.077 -115 P 0.095 -116 N 0.120 -117 W 0.152 -118 P 0.190 -119 S 0.222 -120 R 0.239 -121 E 0.243 -122 L 0.252 -123 R 0.281 -124 E 0.322 -125 A 0.363 -126 S 0.401 -127 A 0.443 -128 S 0.486 -129 E 0.520 -130 N 0.534 -131 R 0.530 -132 D 0.510 -133 L 0.481 -134 A 0.454 -135 V 0.430 -136 S 0.408 -137 V 0.389 -138 S 0.377 -139 W 0.382 -140 R 0.410 -141 P 0.458 -142 R 0.513 -143 A 0.566 -144 E 0.613 -145 T 0.648 -146 G 0.673 -147 G 0.693 -148 K 0.707 -149 S 0.712 -150 Q 0.712 -151 A 0.710 -152 A 0.710 -153 G 0.708 -154 A 0.693 -155 V 0.650 -156 E 0.590 -157 E 0.557 -158 Q 0.575 -159 R 0.608 -160 A 0.621 -161 T 0.624 -162 S 0.643 -163 P 0.677 -164 V 0.711 -165 A 0.734 -166 N 0.745 -167 G 0.747 -168 G 0.738 -169 V 0.718 -170 L 0.697 -171 A 0.683 -172 A 0.669 -173 V 0.648 -174 S 0.633 -175 K 0.631 -176 E 0.629 -177 L 0.611 -178 D 0.585 -179 P 0.572 -180 E 0.579 -181 E 0.589 -182 I 0.587 -183 L 0.583 -184 P 0.594 -185 S 0.620 -186 N 0.650 -187 P 0.678 -188 S 0.703 -189 A 0.712 -190 V 0.696 -191 M 0.669 -192 T 0.660 -193 P 0.675 -194 G 0.694 -195 S 0.703 -196 E 0.701 -197 K 0.691 -198 S 0.672 -199 A 0.650 -200 E 0.631 -201 P 0.607 -202 A 0.557 -203 S 0.476 -204 C 0.379 -205 A 0.289 -206 F 0.216 -207 P 0.163 -208 P 0.124 -209 E 0.096 -210 V 0.079 -211 L 0.071 -212 E 0.071 -213 S 0.079 -214 L 0.091 -215 A 0.096 -216 L 0.092 -217 R 0.086 -218 F 0.089 -219 E 0.098 -220 S 0.106 -221 P 0.108 -222 D 0.102 -223 S 0.093 -224 R 0.088 -225 N 0.089 -226 R 0.090 -227 W 0.085 -228 D 0.072 -229 R 0.058 -230 P 0.048 -231 L 0.044 -232 F 0.044 -233 T 0.047 -234 V 0.053 -235 V 0.064 -236 G 0.078 -237 L 0.088 -238 E 0.090 -239 E 0.083 -240 P 0.071 -241 L 0.055 -242 P 0.040 -243 L 0.029 -244 A 0.025 -245 E 0.026 -246 I 0.027 -247 R 0.028 -248 S 0.030 -249 A 0.034 -250 L 0.045 -251 F 0.065 -252 E 0.094 -253 N 0.123 -254 R 0.146 -255 A 0.167 -256 P 0.195 -257 P 0.231 -258 P 0.270 -259 H 0.312 -260 Q 0.361 -261 S 0.411 -262 T 0.455 -263 Q 0.487 -264 S 0.511 -265 Q 0.524 -266 P 0.518 -267 L 0.496 -268 A 0.467 -269 S 0.428 -270 G 0.368 -271 S 0.287 -272 F 0.204 -273 L 0.140 -274 H 0.110 -275 Q 0.109 -276 L 0.123 -277 D 0.134 -278 Q 0.136 -279 A 0.126 -280 T 0.105 -281 S 0.081 -282 Q 0.065 -283 V 0.060 -284 L 0.057 -285 T 0.055 -286 A 0.054 -287 V 0.054 -288 M 0.055 -289 E 0.057 -290 A 0.060 -291 Q 0.064 -292 K 0.071 -293 S 0.083 -294 A 0.097 -295 V 0.110 -296 P 0.113 -297 G 0.107 -298 D 0.098 -299 F 0.095 -300 L 0.100 -301 K 0.112 -302 L 0.125 -303 P 0.135 -304 G 0.146 -305 T 0.157 -306 T 0.163 -307 E 0.157 -308 P 0.142 -309 L 0.124 -310 R 0.110 -311 F 0.099 -312 T 0.089 -313 R 0.078 -314 P 0.067 -315 L 0.059 -316 T 0.051 -317 L 0.046 -318 A 0.043 -319 E 0.044 -320 L 0.050 -321 S 0.059 -322 R 0.063 -323 L 0.059 -324 R 0.049 -325 R 0.040 -326 Q 0.037 -327 F 0.043 -328 I 0.056 -329 S 0.067 -330 Y 0.071 -331 T 0.074 -332 K 0.085 -333 M 0.103 -334 H 0.121 -335 P 0.133 -336 N 0.139 -337 N 0.141 -338 E 0.135 -339 N 0.120 -340 L 0.102 -341 P 0.087 -342 Q 0.072 -343 L 0.058 -344 A 0.049 -345 N 0.044 -346 M 0.044 -347 F 0.050 -348 L 0.060 -349 Q 0.068 -350 Y 0.068 -351 L 0.065 -352 N 0.065 -353 Q 0.069 -354 S 0.079 -355 L 0.096 -356 H 0.109 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000074211.5_ENSMUST00000098586.5_GN:Sdhaf1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000074211.5_ENSMUST00000098586.5_GN:Sdhaf1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 4082d3fae9ef6557ebf956c7f4b3d175151ffb64..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000074211.5_ENSMUST00000098586.5_GN:Sdhaf1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,119 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000074211.5|ENSMUST00000098586.5|GN:Sdhaf1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.409 -2 S 0.392 -3 R 0.349 -4 P 0.278 -5 S 0.196 -6 R 0.128 -7 L 0.084 -8 Q 0.061 -9 R 0.051 -10 Q 0.048 -11 V 0.050 -12 L 0.055 -13 S 0.061 -14 L 0.062 -15 Y 0.061 -16 R 0.064 -17 E 0.067 -18 L 0.063 -19 L 0.058 -20 R 0.058 -21 A 0.069 -22 G 0.088 -23 R 0.109 -24 G 0.126 -25 T 0.130 -26 P 0.118 -27 G 0.097 -28 A 0.074 -29 E 0.057 -30 A 0.048 -31 R 0.046 -32 V 0.047 -33 R 0.046 -34 A 0.043 -35 E 0.043 -36 F 0.045 -37 R 0.047 -38 Q 0.051 -39 H 0.063 -40 A 0.086 -41 S 0.114 -42 L 0.138 -43 P 0.152 -44 R 0.154 -45 T 0.145 -46 D 0.125 -47 V 0.099 -48 L 0.077 -49 R 0.065 -50 I 0.058 -51 E 0.051 -52 Y 0.046 -53 L 0.050 -54 Y 0.061 -55 R 0.069 -56 R 0.067 -57 G 0.058 -58 R 0.049 -59 R 0.044 -60 Q 0.045 -61 L 0.051 -62 Q 0.064 -63 L 0.084 -64 L 0.113 -65 R 0.154 -66 S 0.208 -67 G 0.276 -68 H 0.343 -69 A 0.390 -70 T 0.407 -71 A 0.393 -72 M 0.363 -73 G 0.337 -74 T 0.331 -75 F 0.351 -76 V 0.395 -77 R 0.457 -78 P 0.522 -79 R 0.578 -80 G 0.622 -81 P 0.657 -82 A 0.683 -83 E 0.699 -84 E 0.709 -85 P 0.721 -86 G 0.736 -87 D 0.748 -88 A 0.750 -89 T 0.745 -90 A 0.745 -91 P 0.756 -92 G 0.772 -93 T 0.782 -94 R 0.781 -95 L 0.770 -96 D 0.755 -97 D 0.740 -98 G 0.726 -99 G 0.711 -100 A 0.703 -101 P 0.709 -102 K 0.724 -103 N 0.732 -104 S 0.724 -105 C 0.705 -106 E 0.692 -107 D 0.686 -108 T 0.666 -109 G 0.626 -110 A 0.605 -111 R 0.639 -112 E 0.697 -113 T 0.728 -114 R 0.721 -115 S 0.688 -116 D 0.635 -117 G 0.570 -118 R 0.520 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000074211.5_ENSMUST00000098586.5_GN:Sdhaf1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:89.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000074211.5_ENSMUST00000098586.5_GN:Sdhaf1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:89.caid deleted file mode 100644 index 99bc9501ba0eaf0cebf3136fc8374f4fb47a4323..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000074211.5_ENSMUST00000098586.5_GN:Sdhaf1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:89.caid +++ /dev/null @@ -1,208 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000074211.5|ENSMUST00000098586.5|GN:Sdhaf1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:89 -1 M 0.463 -2 L 0.501 -3 P 0.557 -4 L 0.608 -5 K 0.639 -6 F 0.651 -7 R 0.653 -8 N 0.648 -9 I 0.637 -10 Q 0.629 -11 D 0.631 -12 C 0.634 -13 K 0.629 -14 A 0.625 -15 L 0.637 -16 K 0.661 -17 N 0.686 -18 Y 0.705 -19 S 0.716 -20 L 0.713 -21 E 0.698 -22 W 0.688 -23 P 0.700 -24 G 0.729 -25 A 0.752 -26 P 0.759 -27 E 0.756 -28 T 0.755 -29 P 0.764 -30 P 0.784 -31 T 0.805 -32 S 0.819 -33 R 0.822 -34 A 0.817 -35 S 0.803 -36 Q 0.784 -37 D 0.760 -38 V 0.734 -39 L 0.705 -40 Q 0.674 -41 Y 0.651 -42 W 0.657 -43 P 0.700 -44 I 0.756 -45 R 0.800 -46 C 0.824 -47 G 0.836 -48 S 0.842 -49 A 0.847 -50 G 0.849 -51 E 0.852 -52 Q 0.854 -53 E 0.856 -54 A 0.856 -55 G 0.854 -56 L 0.850 -57 L 0.844 -58 A 0.835 -59 D 0.824 -60 V 0.818 -61 P 0.822 -62 V 0.828 -63 A 0.827 -64 L 0.821 -65 P 0.816 -66 V 0.814 -67 S 0.812 -68 F 0.809 -69 S 0.805 -70 A 0.799 -71 L 0.794 -72 C 0.797 -73 V 0.807 -74 G 0.813 -75 A 0.811 -76 V 0.804 -77 L 0.800 -78 P 0.805 -79 A 0.816 -80 S 0.819 -81 V 0.812 -82 G 0.804 -83 P 0.806 -84 H 0.814 -85 R 0.819 -86 D 0.817 -87 A 0.805 -88 A 0.780 -89 V 0.732 -90 M 0.656 -91 S 0.560 -92 R 0.450 -93 P 0.329 -94 S 0.216 -95 R 0.131 -96 L 0.083 -97 Q 0.060 -98 R 0.050 -99 Q 0.046 -100 V 0.046 -101 L 0.049 -102 S 0.053 -103 L 0.056 -104 Y 0.058 -105 R 0.062 -106 E 0.066 -107 L 0.062 -108 L 0.055 -109 R 0.055 -110 A 0.064 -111 G 0.079 -112 R 0.097 -113 G 0.114 -114 T 0.120 -115 P 0.109 -116 G 0.087 -117 A 0.066 -118 E 0.050 -119 A 0.042 -120 R 0.042 -121 V 0.044 -122 R 0.043 -123 A 0.041 -124 E 0.042 -125 F 0.044 -126 R 0.046 -127 Q 0.047 -128 H 0.056 -129 A 0.075 -130 S 0.099 -131 L 0.120 -132 P 0.132 -133 R 0.134 -134 T 0.128 -135 D 0.114 -136 V 0.093 -137 L 0.073 -138 R 0.061 -139 I 0.054 -140 E 0.047 -141 Y 0.042 -142 L 0.043 -143 Y 0.049 -144 R 0.053 -145 R 0.051 -146 G 0.046 -147 R 0.041 -148 R 0.038 -149 Q 0.039 -150 L 0.045 -151 Q 0.057 -152 L 0.074 -153 L 0.097 -154 R 0.127 -155 S 0.168 -156 G 0.223 -157 H 0.283 -158 A 0.330 -159 T 0.348 -160 A 0.336 -161 M 0.309 -162 G 0.291 -163 T 0.290 -164 F 0.308 -165 V 0.349 -166 R 0.410 -167 P 0.485 -168 R 0.560 -169 G 0.624 -170 P 0.673 -171 A 0.704 -172 E 0.720 -173 E 0.733 -174 P 0.750 -175 G 0.769 -176 D 0.783 -177 A 0.783 -178 T 0.776 -179 A 0.775 -180 P 0.787 -181 G 0.807 -182 T 0.822 -183 R 0.823 -184 L 0.812 -185 D 0.796 -186 D 0.782 -187 G 0.770 -188 G 0.759 -189 A 0.755 -190 P 0.764 -191 K 0.778 -192 N 0.772 -193 S 0.726 -194 C 0.655 -195 E 0.613 -196 D 0.630 -197 T 0.655 -198 G 0.643 -199 A 0.632 -200 R 0.669 -201 E 0.729 -202 T 0.761 -203 R 0.753 -204 S 0.721 -205 D 0.667 -206 G 0.599 -207 R 0.547 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000074340.10_ENSMUST00000000573.9_GN:Ovgp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000074340.10_ENSMUST00000000573.9_GN:Ovgp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index f7bd42c332d938cb2ab3b3c0d782f27ac8d40756..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000074340.10_ENSMUST00000000573.9_GN:Ovgp1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,722 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000074340.10|ENSMUST00000000573.9|GN:Ovgp1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.238 -2 G 0.220 -3 R 0.191 -4 L 0.166 -5 L 0.158 -6 L 0.166 -7 L 0.185 -8 A 0.206 -9 G 0.214 -10 L 0.209 -11 V 0.211 -12 L 0.233 -13 L 0.265 -14 M 0.297 -15 K 0.327 -16 H 0.360 -17 S 0.387 -18 D 0.391 -19 G 0.361 -20 T 0.296 -21 A 0.213 -22 Y 0.136 -23 K 0.084 -24 L 0.055 -25 V 0.041 -26 C 0.036 -27 Y 0.035 -28 F 0.035 -29 T 0.033 -30 N 0.035 -31 W 0.043 -32 A 0.056 -33 H 0.071 -34 S 0.089 -35 R 0.110 -36 P 0.130 -37 G 0.142 -38 P 0.146 -39 A 0.142 -40 S 0.129 -41 I 0.106 -42 M 0.082 -43 P 0.067 -44 H 0.065 -45 D 0.069 -46 L 0.072 -47 D 0.068 -48 P 0.063 -49 F 0.062 -50 L 0.067 -51 C 0.069 -52 T 0.063 -53 H 0.055 -54 L 0.050 -55 I 0.048 -56 F 0.047 -57 A 0.046 -58 F 0.047 -59 A 0.050 -60 S 0.055 -61 M 0.061 -62 S 0.067 -63 N 0.074 -64 N 0.080 -65 Q 0.084 -66 I 0.088 -67 V 0.094 -68 A 0.099 -69 K 0.095 -70 N 0.083 -71 L 0.072 -72 Q 0.070 -73 D 0.075 -74 E 0.082 -75 N 0.084 -76 V 0.078 -77 L 0.067 -78 Y 0.055 -79 P 0.049 -80 E 0.048 -81 F 0.045 -82 N 0.042 -83 K 0.044 -84 L 0.050 -85 K 0.056 -86 E 0.059 -87 R 0.061 -88 N 0.064 -89 R 0.067 -90 E 0.068 -91 L 0.068 -92 K 0.068 -93 T 0.068 -94 L 0.067 -95 L 0.068 -96 S 0.076 -97 I 0.093 -98 G 0.107 -99 G 0.109 -100 W 0.099 -101 N 0.086 -102 F 0.078 -103 G 0.072 -104 T 0.065 -105 S 0.058 -106 R 0.054 -107 F 0.055 -108 T 0.061 -109 A 0.070 -110 M 0.080 -111 L 0.085 -112 S 0.084 -113 T 0.077 -114 L 0.067 -115 A 0.059 -116 N 0.052 -117 R 0.046 -118 E 0.042 -119 K 0.040 -120 F 0.038 -121 I 0.035 -122 D 0.034 -123 S 0.040 -124 V 0.051 -125 I 0.062 -126 S 0.065 -127 F 0.057 -128 L 0.044 -129 R 0.036 -130 I 0.034 -131 H 0.039 -132 G 0.045 -133 F 0.050 -134 D 0.048 -135 G 0.041 -136 L 0.035 -137 D 0.032 -138 L 0.033 -139 F 0.039 -140 F 0.050 -141 L 0.066 -142 Y 0.085 -143 P 0.100 -144 G 0.107 -145 L 0.108 -146 R 0.110 -147 G 0.114 -148 S 0.113 -149 P 0.107 -150 P 0.100 -151 H 0.097 -152 D 0.094 -153 R 0.087 -154 W 0.080 -155 N 0.075 -156 F 0.070 -157 L 0.061 -158 F 0.055 -159 L 0.051 -160 I 0.048 -161 E 0.047 -162 E 0.052 -163 L 0.064 -164 Q 0.075 -165 F 0.078 -166 A 0.072 -167 F 0.066 -168 E 0.070 -169 R 0.075 -170 E 0.072 -171 A 0.066 -172 L 0.063 -173 L 0.067 -174 T 0.079 -175 Q 0.092 -176 H 0.101 -177 P 0.102 -178 R 0.093 -179 L 0.077 -180 L 0.063 -181 L 0.053 -182 S 0.048 -183 A 0.049 -184 A 0.056 -185 V 0.064 -186 S 0.070 -187 G 0.075 -188 I 0.077 -189 P 0.073 -190 S 0.065 -191 I 0.057 -192 I 0.050 -193 H 0.045 -194 T 0.044 -195 S 0.045 -196 Y 0.045 -197 D 0.043 -198 A 0.039 -199 L 0.037 -200 L 0.038 -201 L 0.041 -202 G 0.044 -203 R 0.050 -204 R 0.057 -205 L 0.060 -206 D 0.054 -207 F 0.045 -208 I 0.040 -209 N 0.044 -210 V 0.054 -211 L 0.067 -212 S 0.076 -213 Y 0.080 -214 D 0.082 -215 L 0.083 -216 H 0.076 -217 G 0.067 -218 S 0.061 -219 W 0.060 -220 E 0.064 -221 K 0.075 -222 F 0.090 -223 T 0.106 -224 G 0.119 -225 H 0.130 -226 N 0.145 -227 S 0.165 -228 P 0.178 -229 L 0.174 -230 F 0.157 -231 S 0.134 -232 L 0.113 -233 P 0.100 -234 E 0.096 -235 D 0.099 -236 S 0.107 -237 K 0.120 -238 S 0.131 -239 S 0.127 -240 A 0.108 -241 Y 0.089 -242 A 0.077 -243 M 0.069 -244 N 0.060 -245 Y 0.056 -246 W 0.061 -247 R 0.074 -248 K 0.085 -249 L 0.091 -250 G 0.094 -251 T 0.098 -252 P 0.100 -253 A 0.101 -254 D 0.101 -255 K 0.098 -256 L 0.094 -257 I 0.091 -258 M 0.092 -259 G 0.094 -260 F 0.094 -261 P 0.086 -262 T 0.075 -263 Y 0.067 -264 G 0.064 -265 R 0.065 -266 N 0.065 -267 F 0.067 -268 Y 0.073 -269 L 0.081 -270 L 0.086 -271 K 0.088 -272 E 0.096 -273 S 0.108 -274 K 0.119 -275 N 0.125 -276 G 0.127 -277 L 0.128 -278 Q 0.130 -279 T 0.134 -280 A 0.137 -281 S 0.143 -282 M 0.157 -283 G 0.177 -284 P 0.192 -285 A 0.199 -286 S 0.203 -287 P 0.200 -288 G 0.181 -289 K 0.148 -290 Y 0.120 -291 T 0.112 -292 K 0.120 -293 Q 0.132 -294 A 0.133 -295 G 0.119 -296 F 0.094 -297 L 0.070 -298 A 0.051 -299 Y 0.041 -300 Y 0.039 -301 E 0.039 -302 V 0.037 -303 C 0.034 -304 S 0.033 -305 F 0.036 -306 V 0.040 -307 Q 0.047 -308 R 0.058 -309 A 0.069 -310 K 0.070 -311 K 0.067 -312 H 0.066 -313 W 0.068 -314 I 0.067 -315 D 0.063 -316 Y 0.061 -317 Q 0.063 -318 Y 0.068 -319 V 0.070 -320 P 0.065 -321 Y 0.057 -322 A 0.051 -323 F 0.048 -324 K 0.050 -325 G 0.055 -326 K 0.060 -327 E 0.059 -328 W 0.053 -329 L 0.045 -330 G 0.043 -331 Y 0.050 -332 D 0.063 -333 D 0.072 -334 T 0.073 -335 I 0.068 -336 S 0.059 -337 F 0.050 -338 S 0.043 -339 Y 0.040 -340 K 0.039 -341 A 0.038 -342 M 0.035 -343 Y 0.033 -344 V 0.033 -345 K 0.037 -346 R 0.048 -347 E 0.066 -348 H 0.084 -349 F 0.089 -350 G 0.078 -351 G 0.064 -352 A 0.058 -353 M 0.058 -354 V 0.060 -355 W 0.062 -356 T 0.066 -357 L 0.070 -358 D 0.072 -359 M 0.073 -360 D 0.075 -361 D 0.081 -362 V 0.093 -363 R 0.107 -364 G 0.114 -365 T 0.107 -366 F 0.097 -367 C 0.094 -368 G 0.103 -369 N 0.113 -370 G 0.114 -371 P 0.104 -372 F 0.087 -373 P 0.071 -374 L 0.061 -375 V 0.057 -376 H 0.057 -377 I 0.059 -378 L 0.058 -379 N 0.058 -380 E 0.064 -381 L 0.079 -382 L 0.109 -383 V 0.161 -384 Q 0.238 -385 T 0.328 -386 E 0.404 -387 S 0.448 -388 N 0.465 -389 S 0.472 -390 T 0.477 -391 P 0.481 -392 L 0.476 -393 P 0.461 -394 Q 0.439 -395 F 0.416 -396 W 0.398 -397 F 0.396 -398 T 0.420 -399 S 0.470 -400 S 0.528 -401 V 0.569 -402 N 0.575 -403 A 0.551 -404 S 0.529 -405 G 0.542 -406 P 0.588 -407 G 0.640 -408 S 0.675 -409 E 0.691 -410 N 0.694 -411 T 0.693 -412 A 0.691 -413 L 0.688 -414 T 0.686 -415 E 0.689 -416 V 0.685 -417 L 0.672 -418 T 0.673 -419 T 0.697 -420 D 0.724 -421 T 0.725 -422 I 0.697 -423 K 0.655 -424 I 0.608 -425 L 0.579 -426 P 0.585 -427 P 0.624 -428 G 0.671 -429 G 0.701 -430 E 0.705 -431 A 0.686 -432 M 0.662 -433 T 0.653 -434 T 0.658 -435 E 0.654 -436 V 0.630 -437 H 0.597 -438 R 0.564 -439 R 0.522 -440 Y 0.482 -441 E 0.476 -442 N 0.515 -443 M 0.569 -444 T 0.607 -445 T 0.627 -446 V 0.635 -447 P 0.644 -448 S 0.664 -449 D 0.688 -450 G 0.702 -451 S 0.698 -452 V 0.684 -453 T 0.676 -454 P 0.675 -455 G 0.677 -456 G 0.671 -457 T 0.653 -458 A 0.628 -459 S 0.612 -460 P 0.618 -461 R 0.634 -462 K 0.644 -463 H 0.643 -464 A 0.634 -465 V 0.620 -466 T 0.615 -467 P 0.630 -468 E 0.657 -469 N 0.681 -470 N 0.691 -471 T 0.689 -472 M 0.687 -473 A 0.695 -474 A 0.705 -475 E 0.700 -476 A 0.676 -477 K 0.633 -478 T 0.576 -479 M 0.524 -480 S 0.491 -481 T 0.465 -482 L 0.429 -483 D 0.390 -484 F 0.362 -485 F 0.348 -486 S 0.352 -487 K 0.382 -488 T 0.426 -489 T 0.469 -490 T 0.505 -491 G 0.531 -492 V 0.529 -493 S 0.494 -494 K 0.462 -495 T 0.468 -496 T 0.501 -497 T 0.534 -498 G 0.555 -499 I 0.563 -500 S 0.558 -501 K 0.540 -502 T 0.521 -503 T 0.517 -504 T 0.530 -505 G 0.546 -506 V 0.559 -507 S 0.571 -508 K 0.578 -509 T 0.576 -510 T 0.575 -511 T 0.588 -512 G 0.614 -513 V 0.636 -514 S 0.638 -515 K 0.618 -516 A 0.589 -517 T 0.566 -518 A 0.546 -519 G 0.506 -520 I 0.442 -521 S 0.370 -522 K 0.304 -523 T 0.246 -524 I 0.203 -525 P 0.187 -526 E 0.203 -527 I 0.242 -528 S 0.287 -529 K 0.331 -530 A 0.381 -531 T 0.441 -532 A 0.504 -533 G 0.551 -534 V 0.576 -535 S 0.581 -536 K 0.572 -537 T 0.556 -538 T 0.549 -539 T 0.556 -540 G 0.564 -541 V 0.568 -542 S 0.565 -543 K 0.551 -544 T 0.533 -545 T 0.532 -546 T 0.546 -547 G 0.554 -548 I 0.548 -549 S 0.537 -550 K 0.515 -551 T 0.486 -552 I 0.477 -553 T 0.504 -554 G 0.548 -555 V 0.579 -556 S 0.585 -557 K 0.572 -558 T 0.556 -559 T 0.555 -560 T 0.569 -561 G 0.587 -562 I 0.601 -563 S 0.602 -564 K 0.583 -565 T 0.556 -566 T 0.550 -567 T 0.566 -568 G 0.585 -569 I 0.595 -570 S 0.592 -571 K 0.564 -572 T 0.525 -573 T 0.509 -574 T 0.517 -575 G 0.520 -576 V 0.502 -577 S 0.465 -578 K 0.418 -579 I 0.386 -580 T 0.398 -581 T 0.450 -582 G 0.511 -583 V 0.557 -584 S 0.577 -585 K 0.573 -586 T 0.562 -587 T 0.562 -588 T 0.574 -589 G 0.590 -590 I 0.603 -591 S 0.604 -592 K 0.586 -593 T 0.560 -594 T 0.551 -595 T 0.562 -596 G 0.579 -597 I 0.592 -598 S 0.593 -599 Q 0.567 -600 T 0.524 -601 T 0.494 -602 T 0.496 -603 G 0.518 -604 I 0.536 -605 S 0.541 -606 K 0.536 -607 T 0.521 -608 T 0.495 -609 T 0.473 -610 D 0.486 -611 I 0.541 -612 S 0.604 -613 K 0.640 -614 T 0.642 -615 T 0.625 -616 T 0.609 -617 G 0.595 -618 I 0.562 -619 S 0.509 -620 K 0.472 -621 T 0.478 -622 T 0.516 -623 P 0.569 -624 G 0.617 -625 I 0.634 -626 S 0.616 -627 K 0.590 -628 T 0.576 -629 T 0.579 -630 P 0.602 -631 G 0.636 -632 M 0.659 -633 T 0.667 -634 V 0.677 -635 I 0.696 -636 V 0.712 -637 Q 0.715 -638 T 0.708 -639 Q 0.695 -640 A 0.665 -641 N 0.620 -642 E 0.597 -643 A 0.617 -644 E 0.632 -645 T 0.608 -646 T 0.587 -647 A 0.613 -648 T 0.661 -649 M 0.690 -650 D 0.693 -651 H 0.683 -652 Q 0.669 -653 S 0.654 -654 V 0.645 -655 T 0.653 -656 P 0.678 -657 T 0.704 -658 E 0.707 -659 M 0.673 -660 D 0.611 -661 T 0.553 -662 T 0.520 -663 L 0.501 -664 F 0.485 -665 Y 0.480 -666 L 0.479 -667 K 0.460 -668 T 0.418 -669 M 0.383 -670 T 0.396 -671 P 0.454 -672 S 0.510 -673 E 0.524 -674 K 0.508 -675 E 0.493 -676 T 0.497 -677 S 0.506 -678 R 0.500 -679 K 0.488 -680 K 0.482 -681 T 0.480 -682 M 0.476 -683 V 0.467 -684 L 0.453 -685 E 0.429 -686 K 0.396 -687 A 0.363 -688 T 0.342 -689 V 0.349 -690 S 0.378 -691 P 0.405 -692 R 0.410 -693 E 0.400 -694 M 0.392 -695 S 0.387 -696 A 0.383 -697 T 0.390 -698 P 0.411 -699 N 0.433 -700 G 0.429 -701 Q 0.387 -702 S 0.325 -703 K 0.265 -704 T 0.215 -705 L 0.176 -706 K 0.149 -707 W 0.131 -708 A 0.121 -709 S 0.119 -710 L 0.123 -711 I 0.137 -712 T 0.160 -713 E 0.186 -714 V 0.202 -715 E 0.200 -716 T 0.182 -717 Y 0.161 -718 S 0.151 -719 Q 0.155 -720 D 0.167 -721 G 0.177 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000074340.10_ENSMUST00000000573.9_GN:Ovgp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000074340.10_ENSMUST00000000573.9_GN:Ovgp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid deleted file mode 100644 index e521176b77152a35f5b1477773d73976de6fb5cb..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000074340.10_ENSMUST00000000573.9_GN:Ovgp1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:23.caid +++ /dev/null @@ -1,745 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000074340.10|ENSMUST00000000573.9|GN:Ovgp1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:23 -1 M 0.160 -2 L 0.151 -3 Q 0.145 -4 V 0.149 -5 S 0.152 -6 Q 0.146 -7 L 0.139 -8 L 0.138 -9 L 0.145 -10 K 0.158 -11 S 0.171 -12 L 0.180 -13 E 0.184 -14 L 0.191 -15 H 0.201 -16 H 0.210 -17 Q 0.218 -18 S 0.224 -19 Y 0.222 -20 Q 0.221 -21 A 0.226 -22 V 0.230 -23 E 0.226 -24 M 0.215 -25 G 0.200 -26 R 0.181 -27 L 0.163 -28 L 0.154 -29 L 0.154 -30 L 0.161 -31 A 0.171 -32 G 0.175 -33 L 0.166 -34 V 0.153 -35 L 0.155 -36 L 0.181 -37 M 0.225 -38 K 0.275 -39 H 0.323 -40 S 0.360 -41 D 0.372 -42 G 0.347 -43 T 0.286 -44 A 0.206 -45 Y 0.131 -46 K 0.080 -47 L 0.052 -48 V 0.039 -49 C 0.034 -50 Y 0.033 -51 F 0.032 -52 T 0.031 -53 N 0.033 -54 W 0.041 -55 A 0.053 -56 H 0.066 -57 S 0.083 -58 R 0.103 -59 P 0.122 -60 G 0.134 -61 P 0.138 -62 A 0.134 -63 S 0.121 -64 I 0.098 -65 M 0.076 -66 P 0.064 -67 H 0.062 -68 D 0.065 -69 L 0.067 -70 D 0.063 -71 P 0.058 -72 F 0.058 -73 L 0.061 -74 C 0.063 -75 T 0.058 -76 H 0.051 -77 L 0.046 -78 I 0.044 -79 F 0.043 -80 A 0.042 -81 F 0.043 -82 A 0.045 -83 S 0.050 -84 M 0.055 -85 S 0.062 -86 N 0.069 -87 N 0.076 -88 Q 0.081 -89 I 0.085 -90 V 0.091 -91 A 0.095 -92 K 0.091 -93 N 0.078 -94 L 0.067 -95 Q 0.066 -96 D 0.071 -97 E 0.077 -98 N 0.079 -99 V 0.073 -100 L 0.062 -101 Y 0.051 -102 P 0.046 -103 E 0.044 -104 F 0.042 -105 N 0.040 -106 K 0.042 -107 L 0.047 -108 K 0.053 -109 E 0.055 -110 R 0.057 -111 N 0.060 -112 R 0.063 -113 E 0.065 -114 L 0.066 -115 K 0.067 -116 T 0.068 -117 L 0.067 -118 L 0.069 -119 S 0.078 -120 I 0.094 -121 G 0.108 -122 G 0.109 -123 W 0.097 -124 N 0.084 -125 F 0.077 -126 G 0.071 -127 T 0.065 -128 S 0.058 -129 R 0.055 -130 F 0.056 -131 T 0.063 -132 A 0.072 -133 M 0.081 -134 L 0.086 -135 S 0.084 -136 T 0.077 -137 L 0.067 -138 A 0.059 -139 N 0.053 -140 R 0.047 -141 E 0.043 -142 K 0.040 -143 F 0.038 -144 I 0.035 -145 D 0.034 -146 S 0.040 -147 V 0.050 -148 I 0.061 -149 S 0.065 -150 F 0.056 -151 L 0.044 -152 R 0.036 -153 I 0.035 -154 H 0.040 -155 G 0.047 -156 F 0.051 -157 D 0.049 -158 G 0.041 -159 L 0.035 -160 D 0.032 -161 L 0.033 -162 F 0.038 -163 F 0.048 -164 L 0.064 -165 Y 0.082 -166 P 0.097 -167 G 0.104 -168 L 0.107 -169 R 0.110 -170 G 0.114 -171 S 0.113 -172 P 0.106 -173 P 0.099 -174 H 0.096 -175 D 0.093 -176 R 0.086 -177 W 0.078 -178 N 0.073 -179 F 0.067 -180 L 0.059 -181 F 0.053 -182 L 0.050 -183 I 0.048 -184 E 0.048 -185 E 0.052 -186 L 0.063 -187 Q 0.074 -188 F 0.078 -189 A 0.072 -190 F 0.066 -191 E 0.069 -192 R 0.073 -193 E 0.071 -194 A 0.064 -195 L 0.061 -196 L 0.065 -197 T 0.076 -198 Q 0.089 -199 H 0.098 -200 P 0.098 -201 R 0.089 -202 L 0.074 -203 L 0.060 -204 L 0.050 -205 S 0.046 -206 A 0.047 -207 A 0.054 -208 V 0.062 -209 S 0.070 -210 G 0.076 -211 I 0.077 -212 P 0.073 -213 S 0.065 -214 I 0.056 -215 I 0.048 -216 H 0.043 -217 T 0.042 -218 S 0.044 -219 Y 0.044 -220 D 0.042 -221 A 0.039 -222 L 0.037 -223 L 0.038 -224 L 0.040 -225 G 0.043 -226 R 0.048 -227 R 0.054 -228 L 0.057 -229 D 0.052 -230 F 0.043 -231 I 0.039 -232 N 0.042 -233 V 0.053 -234 L 0.066 -235 S 0.075 -236 Y 0.078 -237 D 0.080 -238 L 0.080 -239 H 0.074 -240 G 0.065 -241 S 0.059 -242 W 0.059 -243 E 0.063 -244 K 0.074 -245 F 0.090 -246 T 0.106 -247 G 0.119 -248 H 0.131 -249 N 0.145 -250 S 0.164 -251 P 0.177 -252 L 0.173 -253 F 0.157 -254 S 0.135 -255 L 0.114 -256 P 0.100 -257 E 0.097 -258 D 0.100 -259 S 0.107 -260 K 0.121 -261 S 0.132 -262 S 0.128 -263 A 0.109 -264 Y 0.089 -265 A 0.077 -266 M 0.068 -267 N 0.060 -268 Y 0.056 -269 W 0.061 -270 R 0.073 -271 K 0.084 -272 L 0.090 -273 G 0.094 -274 T 0.098 -275 P 0.101 -276 A 0.103 -277 D 0.103 -278 K 0.100 -279 L 0.096 -280 I 0.093 -281 M 0.094 -282 G 0.097 -283 F 0.096 -284 P 0.087 -285 T 0.075 -286 Y 0.066 -287 G 0.063 -288 R 0.064 -289 N 0.064 -290 F 0.067 -291 Y 0.074 -292 L 0.082 -293 L 0.087 -294 K 0.090 -295 E 0.098 -296 S 0.110 -297 K 0.121 -298 N 0.127 -299 G 0.128 -300 L 0.129 -301 Q 0.133 -302 T 0.138 -303 A 0.142 -304 S 0.147 -305 M 0.163 -306 G 0.184 -307 P 0.199 -308 A 0.206 -309 S 0.209 -310 P 0.205 -311 G 0.185 -312 K 0.151 -313 Y 0.123 -314 T 0.114 -315 K 0.123 -316 Q 0.136 -317 A 0.138 -318 G 0.123 -319 F 0.097 -320 L 0.072 -321 A 0.053 -322 Y 0.043 -323 Y 0.040 -324 E 0.041 -325 V 0.038 -326 C 0.035 -327 S 0.034 -328 F 0.037 -329 V 0.041 -330 Q 0.048 -331 R 0.060 -332 A 0.070 -333 K 0.072 -334 K 0.068 -335 H 0.068 -336 W 0.070 -337 I 0.069 -338 D 0.066 -339 Y 0.064 -340 Q 0.066 -341 Y 0.070 -342 V 0.072 -343 P 0.067 -344 Y 0.059 -345 A 0.053 -346 F 0.050 -347 K 0.051 -348 G 0.057 -349 K 0.061 -350 E 0.061 -351 W 0.054 -352 L 0.046 -353 G 0.043 -354 Y 0.050 -355 D 0.063 -356 D 0.072 -357 T 0.074 -358 I 0.068 -359 S 0.060 -360 F 0.051 -361 S 0.044 -362 Y 0.041 -363 K 0.040 -364 A 0.039 -365 M 0.036 -366 Y 0.034 -367 V 0.033 -368 K 0.036 -369 R 0.047 -370 E 0.065 -371 H 0.084 -372 F 0.089 -373 G 0.079 -374 G 0.065 -375 A 0.058 -376 M 0.058 -377 V 0.060 -378 W 0.062 -379 T 0.066 -380 L 0.070 -381 D 0.072 -382 M 0.073 -383 D 0.075 -384 D 0.081 -385 V 0.093 -386 R 0.107 -387 G 0.113 -388 T 0.106 -389 F 0.096 -390 C 0.094 -391 G 0.103 -392 N 0.113 -393 G 0.115 -394 P 0.104 -395 F 0.087 -396 P 0.071 -397 L 0.061 -398 V 0.057 -399 H 0.057 -400 I 0.059 -401 L 0.059 -402 N 0.059 -403 E 0.065 -404 L 0.080 -405 L 0.110 -406 V 0.162 -407 Q 0.240 -408 T 0.332 -409 E 0.410 -410 S 0.453 -411 N 0.470 -412 S 0.476 -413 T 0.481 -414 P 0.483 -415 L 0.477 -416 P 0.459 -417 Q 0.436 -418 F 0.413 -419 W 0.396 -420 F 0.393 -421 T 0.417 -422 S 0.466 -423 S 0.522 -424 V 0.563 -425 N 0.570 -426 A 0.547 -427 S 0.527 -428 G 0.542 -429 P 0.590 -430 G 0.642 -431 S 0.677 -432 E 0.693 -433 N 0.695 -434 T 0.693 -435 A 0.692 -436 L 0.688 -437 T 0.687 -438 E 0.689 -439 V 0.685 -440 L 0.674 -441 T 0.676 -442 T 0.701 -443 D 0.727 -444 T 0.726 -445 I 0.698 -446 K 0.656 -447 I 0.611 -448 L 0.582 -449 P 0.590 -450 P 0.630 -451 G 0.675 -452 G 0.704 -453 E 0.707 -454 A 0.688 -455 M 0.665 -456 T 0.656 -457 T 0.660 -458 E 0.655 -459 V 0.630 -460 H 0.599 -461 R 0.566 -462 R 0.523 -463 Y 0.480 -464 E 0.471 -465 N 0.509 -466 M 0.562 -467 T 0.602 -468 T 0.623 -469 V 0.634 -470 P 0.647 -471 S 0.668 -472 D 0.694 -473 G 0.708 -474 S 0.704 -475 V 0.691 -476 T 0.683 -477 P 0.684 -478 G 0.685 -479 G 0.678 -480 T 0.659 -481 A 0.632 -482 S 0.617 -483 P 0.622 -484 R 0.638 -485 K 0.646 -486 H 0.645 -487 A 0.636 -488 V 0.623 -489 T 0.619 -490 P 0.634 -491 E 0.662 -492 N 0.686 -493 N 0.696 -494 T 0.695 -495 M 0.694 -496 A 0.702 -497 A 0.713 -498 E 0.710 -499 A 0.688 -500 K 0.647 -501 T 0.591 -502 M 0.539 -503 S 0.506 -504 T 0.478 -505 L 0.440 -506 D 0.399 -507 F 0.367 -508 F 0.350 -509 S 0.354 -510 K 0.383 -511 T 0.428 -512 T 0.474 -513 T 0.515 -514 G 0.545 -515 V 0.542 -516 S 0.505 -517 K 0.470 -518 T 0.473 -519 T 0.506 -520 T 0.540 -521 G 0.563 -522 I 0.571 -523 S 0.565 -524 K 0.545 -525 T 0.524 -526 T 0.521 -527 T 0.536 -528 G 0.555 -529 V 0.569 -530 S 0.580 -531 K 0.588 -532 T 0.586 -533 T 0.585 -534 T 0.598 -535 G 0.624 -536 V 0.644 -537 S 0.643 -538 K 0.620 -539 A 0.589 -540 T 0.567 -541 A 0.546 -542 G 0.507 -543 I 0.441 -544 S 0.367 -545 K 0.300 -546 T 0.244 -547 I 0.204 -548 P 0.188 -549 E 0.205 -550 I 0.244 -551 S 0.290 -552 K 0.336 -553 A 0.389 -554 T 0.451 -555 A 0.514 -556 G 0.561 -557 V 0.584 -558 S 0.589 -559 K 0.578 -560 T 0.560 -561 T 0.552 -562 T 0.559 -563 G 0.566 -564 V 0.570 -565 S 0.567 -566 K 0.554 -567 T 0.537 -568 T 0.536 -569 T 0.552 -570 G 0.561 -571 I 0.556 -572 S 0.545 -573 K 0.523 -574 T 0.495 -575 I 0.486 -576 T 0.514 -577 G 0.559 -578 V 0.590 -579 S 0.596 -580 K 0.583 -581 T 0.566 -582 T 0.564 -583 T 0.577 -584 G 0.595 -585 I 0.608 -586 S 0.609 -587 K 0.588 -588 T 0.561 -589 T 0.555 -590 T 0.574 -591 G 0.595 -592 I 0.607 -593 S 0.604 -594 K 0.577 -595 T 0.539 -596 T 0.522 -597 T 0.529 -598 G 0.533 -599 V 0.515 -600 S 0.478 -601 K 0.430 -602 I 0.398 -603 T 0.408 -604 T 0.459 -605 G 0.521 -606 V 0.566 -607 S 0.584 -608 K 0.578 -609 T 0.567 -610 T 0.568 -611 T 0.582 -612 G 0.600 -613 I 0.613 -614 S 0.615 -615 K 0.596 -616 T 0.569 -617 T 0.559 -618 T 0.570 -619 G 0.588 -620 I 0.600 -621 S 0.599 -622 Q 0.573 -623 T 0.530 -624 T 0.502 -625 T 0.506 -626 G 0.529 -627 I 0.547 -628 S 0.550 -629 K 0.542 -630 T 0.526 -631 T 0.500 -632 T 0.480 -633 D 0.495 -634 I 0.549 -635 S 0.610 -636 K 0.644 -637 T 0.645 -638 T 0.628 -639 T 0.614 -640 G 0.600 -641 I 0.567 -642 S 0.514 -643 K 0.477 -644 T 0.480 -645 T 0.517 -646 P 0.570 -647 G 0.618 -648 I 0.634 -649 S 0.616 -650 K 0.592 -651 T 0.580 -652 T 0.585 -653 P 0.609 -654 G 0.642 -655 M 0.663 -656 T 0.671 -657 V 0.681 -658 I 0.699 -659 V 0.713 -660 Q 0.716 -661 T 0.709 -662 Q 0.695 -663 A 0.665 -664 N 0.620 -665 E 0.598 -666 A 0.622 -667 E 0.648 -668 T 0.638 -669 T 0.623 -670 A 0.639 -671 T 0.670 -672 M 0.687 -673 D 0.686 -674 H 0.676 -675 Q 0.663 -676 S 0.650 -677 V 0.643 -678 T 0.652 -679 P 0.679 -680 T 0.709 -681 E 0.723 -682 M 0.718 -683 D 0.696 -684 T 0.658 -685 T 0.603 -686 L 0.542 -687 F 0.498 -688 Y 0.482 -689 L 0.478 -690 K 0.458 -691 T 0.416 -692 M 0.381 -693 T 0.395 -694 P 0.455 -695 S 0.513 -696 E 0.529 -697 K 0.512 -698 E 0.499 -699 T 0.507 -700 S 0.520 -701 R 0.521 -702 K 0.513 -703 K 0.509 -704 T 0.508 -705 M 0.504 -706 V 0.496 -707 L 0.480 -708 E 0.452 -709 K 0.414 -710 A 0.376 -711 T 0.353 -712 V 0.361 -713 S 0.395 -714 P 0.430 -715 R 0.444 -716 E 0.441 -717 M 0.434 -718 S 0.424 -719 A 0.413 -720 T 0.412 -721 P 0.429 -722 N 0.447 -723 G 0.440 -724 Q 0.395 -725 S 0.331 -726 K 0.270 -727 T 0.221 -728 L 0.184 -729 K 0.156 -730 W 0.136 -731 A 0.124 -732 S 0.121 -733 L 0.125 -734 I 0.140 -735 T 0.165 -736 E 0.191 -737 V 0.206 -738 E 0.203 -739 T 0.184 -740 Y 0.163 -741 S 0.153 -742 Q 0.156 -743 D 0.167 -744 G 0.177 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000074397.6_ENSMUST00000098837.3_GN:Foxr1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000074397.6_ENSMUST00000098837.3_GN:Foxr1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index af21fee849fab9f2ab4a13a188de80861e85d41e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000074397.6_ENSMUST00000098837.3_GN:Foxr1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,224 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000074397.6|ENSMUST00000098837.3|GN:Foxr1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.536 -2 G 0.537 -3 N 0.526 -4 E 0.485 -5 C 0.413 -6 F 0.336 -7 L 0.283 -8 T 0.256 -9 F 0.230 -10 T 0.194 -11 T 0.161 -12 T 0.148 -13 H 0.149 -14 L 0.144 -15 S 0.125 -16 E 0.102 -17 A 0.086 -18 E 0.079 -19 Q 0.080 -20 K 0.090 -21 L 0.105 -22 A 0.123 -23 L 0.142 -24 Y 0.160 -25 R 0.181 -26 L 0.199 -27 Q 0.209 -28 L 0.215 -29 V 0.235 -30 E 0.285 -31 P 0.366 -32 P 0.461 -33 K 0.548 -34 L 0.618 -35 P 0.669 -36 L 0.702 -37 E 0.721 -38 K 0.729 -39 K 0.729 -40 T 0.722 -41 N 0.710 -42 P 0.702 -43 D 0.697 -44 K 0.684 -45 D 0.662 -46 G 0.649 -47 P 0.650 -48 D 0.650 -49 I 0.635 -50 K 0.609 -51 P 0.589 -52 N 0.584 -53 L 0.582 -54 W 0.560 -55 M 0.513 -56 W 0.454 -57 V 0.393 -58 N 0.335 -59 P 0.292 -60 N 0.272 -61 M 0.272 -62 V 0.297 -63 Y 0.366 -64 P 0.483 -65 P 0.622 -66 G 0.734 -67 K 0.801 -68 L 0.834 -69 E 0.852 -70 V 0.862 -71 A 0.861 -72 V 0.852 -73 K 0.840 -74 E 0.829 -75 E 0.820 -76 D 0.809 -77 Q 0.798 -78 S 0.788 -79 A 0.777 -80 L 0.767 -81 S 0.755 -82 A 0.741 -83 F 0.733 -84 Q 0.741 -85 P 0.758 -86 A 0.761 -87 L 0.725 -88 K 0.664 -89 E 0.633 -90 E 0.668 -91 E 0.735 -92 D 0.782 -93 S 0.800 -94 C 0.805 -95 S 0.809 -96 E 0.814 -97 A 0.816 -98 S 0.815 -99 E 0.809 -100 V 0.793 -101 Q 0.768 -102 Q 0.741 -103 P 0.722 -104 L 0.716 -105 P 0.724 -106 P 0.738 -107 C 0.737 -108 R 0.699 -109 Q 0.632 -110 K 0.580 -111 R 0.567 -112 K 0.570 -113 Q 0.588 -114 R 0.642 -115 R 0.708 -116 S 0.744 -117 T 0.746 -118 V 0.735 -119 P 0.729 -120 L 0.733 -121 P 0.741 -122 L 0.750 -123 A 0.759 -124 P 0.765 -125 G 0.767 -126 R 0.754 -127 R 0.727 -128 A 0.691 -129 P 0.650 -130 L 0.599 -131 E 0.531 -132 N 0.446 -133 P 0.363 -134 W 0.308 -135 R 0.292 -136 L 0.306 -137 P 0.333 -138 Q 0.354 -139 A 0.345 -140 I 0.309 -141 S 0.272 -142 P 0.251 -143 E 0.240 -144 G 0.227 -145 R 0.213 -146 L 0.200 -147 W 0.181 -148 S 0.159 -149 R 0.145 -150 P 0.137 -151 P 0.120 -152 L 0.093 -153 H 0.065 -154 Y 0.046 -155 F 0.036 -156 H 0.034 -157 L 0.037 -158 I 0.043 -159 A 0.049 -160 L 0.055 -161 A 0.062 -162 L 0.068 -163 R 0.070 -164 N 0.071 -165 S 0.077 -166 P 0.091 -167 P 0.109 -168 C 0.122 -169 G 0.120 -170 L 0.101 -171 S 0.077 -172 V 0.058 -173 Q 0.046 -174 Q 0.042 -175 I 0.043 -176 Y 0.044 -177 S 0.043 -178 F 0.041 -179 T 0.044 -180 R 0.052 -181 Q 0.065 -182 N 0.081 -183 I 0.100 -184 C 0.121 -185 L 0.147 -186 L 0.185 -187 S 0.234 -188 A 0.285 -189 Q 0.326 -190 E 0.349 -191 H 0.354 -192 N 0.353 -193 H 0.353 -194 S 0.358 -195 Y 0.375 -196 P 0.401 -197 F 0.421 -198 A 0.418 -199 T 0.392 -200 Y 0.357 -201 N 0.332 -202 P 0.328 -203 A 0.341 -204 V 0.361 -205 P 0.378 -206 Q 0.383 -207 I 0.371 -208 P 0.345 -209 I 0.309 -210 L 0.272 -211 L 0.251 -212 G 0.253 -213 R 0.273 -214 Y 0.303 -215 S 0.334 -216 F 0.360 -217 S 0.382 -218 Y 0.409 -219 P 0.447 -220 V 0.489 -221 P 0.520 -222 K 0.523 -223 D 0.512 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000074397.6_ENSMUST00000098837.3_GN:Foxr1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:81.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000074397.6_ENSMUST00000098837.3_GN:Foxr1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:81.caid deleted file mode 100644 index 40c36c2a2809cfd9019d681bc535f447a9576785..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000074397.6_ENSMUST00000098837.3_GN:Foxr1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:81.caid +++ /dev/null @@ -1,305 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000074397.6|ENSMUST00000098837.3|GN:Foxr1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:81 -1 M 0.346 -2 S 0.338 -3 A 0.320 -4 S 0.288 -5 W 0.244 -6 M 0.199 -7 N 0.162 -8 P 0.136 -9 Q 0.117 -10 A 0.105 -11 I 0.098 -12 L 0.100 -13 S 0.115 -14 I 0.140 -15 C 0.169 -16 R 0.196 -17 G 0.220 -18 A 0.241 -19 A 0.266 -20 L 0.299 -21 L 0.330 -22 T 0.346 -23 A 0.345 -24 P 0.335 -25 T 0.324 -26 C 0.319 -27 D 0.324 -28 C 0.341 -29 P 0.368 -30 R 0.404 -31 F 0.443 -32 E 0.477 -33 E 0.502 -34 A 0.523 -35 P 0.553 -36 S 0.585 -37 T 0.598 -38 Q 0.578 -39 A 0.544 -40 S 0.525 -41 L 0.531 -42 S 0.544 -43 V 0.542 -44 S 0.513 -45 C 0.465 -46 T 0.423 -47 P 0.405 -48 H 0.404 -49 N 0.390 -50 S 0.349 -51 S 0.292 -52 P 0.241 -53 L 0.204 -54 A 0.180 -55 L 0.163 -56 K 0.146 -57 V 0.130 -58 D 0.120 -59 P 0.117 -60 K 0.113 -61 F 0.106 -62 Q 0.100 -63 D 0.099 -64 R 0.101 -65 N 0.098 -66 F 0.088 -67 W 0.080 -68 A 0.083 -69 S 0.097 -70 L 0.115 -71 H 0.134 -72 G 0.158 -73 Q 0.185 -74 V 0.201 -75 P 0.193 -76 G 0.164 -77 L 0.128 -78 L 0.103 -79 D 0.095 -80 W 0.104 -81 D 0.122 -82 M 0.139 -83 G 0.142 -84 N 0.127 -85 E 0.104 -86 C 0.083 -87 F 0.073 -88 L 0.072 -89 T 0.072 -90 F 0.068 -91 T 0.065 -92 T 0.067 -93 T 0.075 -94 H 0.084 -95 L 0.084 -96 S 0.077 -97 E 0.071 -98 A 0.069 -99 E 0.070 -100 Q 0.074 -101 K 0.084 -102 L 0.093 -103 A 0.097 -104 L 0.102 -105 Y 0.108 -106 R 0.116 -107 L 0.121 -108 Q 0.122 -109 L 0.128 -110 V 0.154 -111 E 0.206 -112 P 0.282 -113 P 0.364 -114 K 0.437 -115 L 0.506 -116 P 0.576 -117 L 0.634 -118 E 0.669 -119 K 0.684 -120 K 0.685 -121 T 0.674 -122 N 0.656 -123 P 0.639 -124 D 0.625 -125 K 0.603 -126 D 0.572 -127 G 0.548 -128 P 0.531 -129 D 0.506 -130 I 0.460 -131 K 0.399 -132 P 0.340 -133 N 0.287 -134 L 0.238 -135 W 0.193 -136 M 0.160 -137 W 0.144 -138 V 0.140 -139 N 0.144 -140 P 0.154 -141 N 0.173 -142 M 0.202 -143 V 0.249 -144 Y 0.329 -145 P 0.450 -146 P 0.588 -147 G 0.698 -148 K 0.761 -149 L 0.792 -150 E 0.810 -151 V 0.818 -152 A 0.816 -153 V 0.805 -154 K 0.793 -155 E 0.785 -156 E 0.777 -157 D 0.767 -158 Q 0.756 -159 S 0.743 -160 A 0.727 -161 L 0.712 -162 S 0.697 -163 A 0.682 -164 F 0.677 -165 Q 0.693 -166 P 0.723 -167 A 0.735 -168 L 0.705 -169 K 0.645 -170 E 0.615 -171 E 0.649 -172 E 0.715 -173 D 0.764 -174 S 0.784 -175 C 0.791 -176 S 0.794 -177 E 0.798 -178 A 0.799 -179 S 0.798 -180 E 0.792 -181 V 0.776 -182 Q 0.750 -183 Q 0.724 -184 P 0.705 -185 L 0.700 -186 P 0.707 -187 P 0.708 -188 C 0.669 -189 R 0.576 -190 Q 0.482 -191 K 0.460 -192 R 0.503 -193 K 0.545 -194 Q 0.577 -195 R 0.632 -196 R 0.695 -197 S 0.729 -198 T 0.731 -199 V 0.722 -200 P 0.718 -201 L 0.723 -202 P 0.733 -203 L 0.742 -204 A 0.749 -205 P 0.755 -206 G 0.755 -207 R 0.743 -208 R 0.715 -209 A 0.678 -210 P 0.634 -211 L 0.576 -212 E 0.502 -213 N 0.417 -214 P 0.338 -215 W 0.284 -216 R 0.267 -217 L 0.280 -218 P 0.308 -219 Q 0.329 -220 A 0.325 -221 I 0.296 -222 S 0.264 -223 P 0.246 -224 E 0.238 -225 G 0.230 -226 R 0.220 -227 L 0.209 -228 W 0.190 -229 S 0.165 -230 R 0.149 -231 P 0.140 -232 P 0.125 -233 L 0.100 -234 H 0.073 -235 Y 0.053 -236 F 0.043 -237 H 0.040 -238 L 0.044 -239 I 0.052 -240 A 0.059 -241 L 0.067 -242 A 0.076 -243 L 0.084 -244 R 0.085 -245 N 0.081 -246 S 0.085 -247 P 0.100 -248 P 0.121 -249 C 0.135 -250 G 0.131 -251 L 0.110 -252 S 0.085 -253 V 0.065 -254 Q 0.053 -255 Q 0.048 -256 I 0.047 -257 Y 0.047 -258 S 0.044 -259 F 0.043 -260 T 0.046 -261 R 0.055 -262 Q 0.067 -263 N 0.084 -264 I 0.102 -265 C 0.123 -266 L 0.151 -267 L 0.194 -268 S 0.249 -269 A 0.301 -270 Q 0.341 -271 E 0.361 -272 H 0.365 -273 N 0.363 -274 H 0.362 -275 S 0.368 -276 Y 0.387 -277 P 0.419 -278 F 0.444 -279 A 0.445 -280 T 0.418 -281 Y 0.382 -282 N 0.358 -283 P 0.359 -284 A 0.380 -285 V 0.407 -286 P 0.427 -287 Q 0.427 -288 I 0.408 -289 P 0.377 -290 I 0.338 -291 L 0.300 -292 L 0.278 -293 G 0.278 -294 R 0.295 -295 Y 0.320 -296 S 0.347 -297 F 0.372 -298 S 0.397 -299 Y 0.427 -300 P 0.465 -301 V 0.504 -302 P 0.529 -303 K 0.527 -304 D 0.512 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000078157.2_ENSMUST00000104962.2_GN:Fem1al_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000078157.2_ENSMUST00000104962.2_GN:Fem1al_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index a15938003466f90fa8108ca68af00c562ab3f147..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000078157.2_ENSMUST00000104962.2_GN:Fem1al_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,655 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000078157.2|ENSMUST00000104962.2|GN:Fem1al|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.183 -2 D 0.150 -3 L 0.109 -4 H 0.080 -5 T 0.066 -6 A 0.060 -7 V 0.061 -8 Y 0.065 -9 N 0.067 -10 A 0.061 -11 A 0.053 -12 H 0.051 -13 D 0.057 -14 G 0.064 -15 K 0.065 -16 L 0.057 -17 P 0.047 -18 L 0.043 -19 L 0.048 -20 Q 0.062 -21 K 0.073 -22 L 0.074 -23 L 0.068 -24 A 0.063 -25 S 0.064 -26 R 0.070 -27 G 0.078 -28 R 0.086 -29 E 0.088 -30 E 0.085 -31 L 0.086 -32 E 0.094 -33 E 0.102 -34 L 0.110 -35 L 0.115 -36 G 0.115 -37 E 0.108 -38 V 0.104 -39 A 0.110 -40 G 0.118 -41 G 0.117 -42 G 0.099 -43 T 0.074 -44 P 0.057 -45 L 0.053 -46 L 0.063 -47 I 0.076 -48 A 0.083 -49 A 0.079 -50 R 0.075 -51 R 0.076 -52 G 0.077 -53 H 0.073 -54 L 0.063 -55 D 0.054 -56 V 0.050 -57 V 0.046 -58 E 0.040 -59 Y 0.035 -60 L 0.036 -61 V 0.047 -62 D 0.062 -63 H 0.074 -64 C 0.081 -65 G 0.087 -66 A 0.093 -67 S 0.093 -68 V 0.092 -69 E 0.094 -70 A 0.094 -71 S 0.091 -72 G 0.090 -73 S 0.096 -74 V 0.113 -75 H 0.132 -76 F 0.148 -77 D 0.160 -78 G 0.164 -79 E 0.155 -80 T 0.137 -81 I 0.115 -82 E 0.092 -83 G 0.074 -84 A 0.060 -85 P 0.051 -86 P 0.046 -87 L 0.046 -88 W 0.053 -89 A 0.064 -90 A 0.073 -91 S 0.076 -92 A 0.080 -93 A 0.085 -94 G 0.085 -95 H 0.077 -96 L 0.065 -97 A 0.057 -98 V 0.055 -99 V 0.054 -100 R 0.051 -101 S 0.050 -102 L 0.058 -103 L 0.074 -104 H 0.088 -105 R 0.093 -106 G 0.094 -107 A 0.095 -108 S 0.093 -109 V 0.086 -110 N 0.078 -111 R 0.071 -112 T 0.066 -113 T 0.065 -114 C 0.065 -115 T 0.063 -116 N 0.059 -117 S 0.054 -118 T 0.052 -119 P 0.052 -120 L 0.053 -121 R 0.059 -122 A 0.071 -123 A 0.081 -124 C 0.084 -125 F 0.084 -126 N 0.085 -127 G 0.083 -128 H 0.074 -129 L 0.062 -130 D 0.054 -131 V 0.050 -132 V 0.048 -133 R 0.048 -134 C 0.053 -135 L 0.062 -136 V 0.074 -137 G 0.087 -138 E 0.094 -139 H 0.094 -140 K 0.096 -141 A 0.100 -142 D 0.102 -143 L 0.100 -144 E 0.097 -145 V 0.092 -146 A 0.090 -147 N 0.095 -148 R 0.102 -149 H 0.103 -150 G 0.095 -151 H 0.080 -152 T 0.065 -153 C 0.053 -154 L 0.044 -155 M 0.041 -156 I 0.041 -157 S 0.041 -158 C 0.042 -159 Y 0.047 -160 K 0.058 -161 G 0.068 -162 H 0.069 -163 R 0.062 -164 E 0.056 -165 I 0.054 -166 A 0.051 -167 R 0.045 -168 Y 0.043 -169 L 0.052 -170 L 0.070 -171 E 0.083 -172 R 0.088 -173 G 0.094 -174 A 0.101 -175 Q 0.100 -176 V 0.089 -177 N 0.078 -178 R 0.074 -179 R 0.077 -180 S 0.085 -181 A 0.093 -182 K 0.099 -183 G 0.096 -184 N 0.085 -185 T 0.069 -186 A 0.054 -187 L 0.045 -188 H 0.044 -189 D 0.049 -190 C 0.053 -191 A 0.056 -192 E 0.060 -193 S 0.068 -194 G 0.075 -195 S 0.074 -196 L 0.067 -197 E 0.060 -198 I 0.055 -199 L 0.050 -200 Q 0.044 -201 L 0.039 -202 L 0.040 -203 L 0.045 -204 S 0.054 -205 C 0.068 -206 H 0.084 -207 A 0.098 -208 R 0.101 -209 M 0.094 -210 E 0.086 -211 R 0.086 -212 D 0.090 -213 G 0.093 -214 Y 0.089 -215 G 0.081 -216 M 0.071 -217 T 0.062 -218 P 0.056 -219 L 0.055 -220 L 0.061 -221 A 0.072 -222 A 0.079 -223 S 0.077 -224 I 0.069 -225 T 0.064 -226 G 0.062 -227 H 0.059 -228 T 0.054 -229 N 0.052 -230 I 0.054 -231 V 0.055 -232 E 0.054 -233 Y 0.057 -234 L 0.069 -235 I 0.092 -236 Q 0.131 -237 E 0.192 -238 Q 0.267 -239 P 0.342 -240 S 0.406 -241 H 0.464 -242 E 0.514 -243 Q 0.553 -244 L 0.582 -245 S 0.606 -246 G 0.617 -247 T 0.614 -248 E 0.606 -249 L 0.607 -250 P 0.621 -251 G 0.638 -252 E 0.638 -253 G 0.603 -254 S 0.544 -255 S 0.506 -256 Q 0.520 -257 M 0.563 -258 A 0.598 -259 G 0.614 -260 N 0.615 -261 H 0.605 -262 C 0.588 -263 S 0.571 -264 T 0.563 -265 P 0.561 -266 E 0.566 -267 D 0.576 -268 A 0.592 -269 E 0.607 -270 Q 0.609 -271 Y 0.584 -272 E 0.526 -273 S 0.445 -274 C 0.374 -275 C 0.327 -276 P 0.289 -277 T 0.247 -278 S 0.203 -279 R 0.163 -280 E 0.129 -281 A 0.103 -282 A 0.085 -283 V 0.073 -284 E 0.064 -285 A 0.055 -286 L 0.051 -287 E 0.052 -288 L 0.054 -289 L 0.052 -290 G 0.044 -291 A 0.034 -292 T 0.028 -293 Y 0.028 -294 V 0.035 -295 D 0.049 -296 K 0.068 -297 K 0.084 -298 R 0.094 -299 D 0.097 -300 L 0.094 -301 L 0.088 -302 G 0.082 -303 A 0.074 -304 L 0.062 -305 K 0.053 -306 H 0.053 -307 W 0.056 -308 R 0.057 -309 R 0.060 -310 A 0.070 -311 M 0.083 -312 E 0.093 -313 L 0.096 -314 R 0.099 -315 H 0.114 -316 Q 0.145 -317 G 0.183 -318 G 0.208 -319 G 0.211 -320 F 0.207 -321 L 0.214 -322 P 0.234 -323 K 0.262 -324 P 0.292 -325 E 0.320 -326 P 0.342 -327 Q 0.350 -328 Q 0.332 -329 L 0.284 -330 V 0.223 -331 L 0.172 -332 A 0.139 -333 Y 0.124 -334 D 0.125 -335 Y 0.139 -336 S 0.158 -337 R 0.170 -338 E 0.169 -339 V 0.153 -340 T 0.130 -341 T 0.113 -342 P 0.107 -343 Q 0.102 -344 E 0.092 -345 L 0.080 -346 E 0.072 -347 A 0.070 -348 L 0.069 -349 I 0.069 -350 T 0.072 -351 D 0.077 -352 P 0.081 -353 D 0.084 -354 E 0.087 -355 M 0.092 -356 R 0.103 -357 M 0.114 -358 Q 0.117 -359 A 0.116 -360 L 0.116 -361 L 0.116 -362 I 0.112 -363 R 0.107 -364 E 0.109 -365 R 0.117 -366 I 0.128 -367 L 0.135 -368 G 0.139 -369 P 0.140 -370 S 0.136 -371 H 0.130 -372 P 0.125 -373 D 0.119 -374 T 0.104 -375 S 0.081 -376 Y 0.059 -377 Y 0.046 -378 I 0.040 -379 R 0.040 -380 Y 0.044 -381 R 0.047 -382 G 0.047 -383 A 0.043 -384 V 0.042 -385 Y 0.046 -386 A 0.057 -387 D 0.073 -388 S 0.088 -389 G 0.100 -390 N 0.103 -391 F 0.095 -392 E 0.082 -393 R 0.070 -394 C 0.062 -395 I 0.058 -396 R 0.056 -397 L 0.055 -398 W 0.056 -399 K 0.058 -400 Y 0.062 -401 A 0.065 -402 L 0.068 -403 D 0.069 -404 M 0.069 -405 Q 0.074 -406 Q 0.088 -407 N 0.105 -408 N 0.118 -409 L 0.127 -410 E 0.136 -411 P 0.143 -412 L 0.138 -413 S 0.122 -414 P 0.101 -415 M 0.083 -416 T 0.073 -417 A 0.065 -418 S 0.058 -419 S 0.054 -420 F 0.054 -421 L 0.054 -422 S 0.053 -423 F 0.051 -424 A 0.049 -425 E 0.047 -426 L 0.047 -427 F 0.049 -428 S 0.052 -429 Y 0.059 -430 V 0.070 -431 L 0.091 -432 Q 0.123 -433 D 0.164 -434 H 0.205 -435 S 0.242 -436 A 0.277 -437 K 0.308 -438 G 0.328 -439 N 0.324 -440 L 0.295 -441 G 0.247 -442 M 0.194 -443 Q 0.146 -444 L 0.108 -445 D 0.085 -446 F 0.073 -447 A 0.068 -448 D 0.067 -449 L 0.069 -450 I 0.067 -451 G 0.059 -452 V 0.050 -453 L 0.045 -454 S 0.042 -455 K 0.040 -456 G 0.045 -457 V 0.056 -458 R 0.064 -459 E 0.060 -460 V 0.052 -461 E 0.048 -462 R 0.052 -463 A 0.063 -464 L 0.084 -465 Q 0.114 -466 L 0.144 -467 P 0.163 -468 K 0.170 -469 E 0.172 -470 P 0.172 -471 D 0.164 -472 D 0.143 -473 S 0.111 -474 A 0.080 -475 Q 0.062 -476 F 0.057 -477 T 0.056 -478 K 0.055 -479 A 0.056 -480 I 0.055 -481 A 0.049 -482 I 0.043 -483 I 0.039 -484 L 0.036 -485 H 0.034 -486 L 0.035 -487 L 0.040 -488 Y 0.047 -489 L 0.054 -490 L 0.062 -491 E 0.069 -492 K 0.077 -493 V 0.087 -494 E 0.099 -495 C 0.110 -496 T 0.110 -497 P 0.102 -498 R 0.089 -499 Q 0.075 -500 E 0.062 -501 H 0.056 -502 L 0.056 -503 K 0.062 -504 H 0.068 -505 Q 0.068 -506 T 0.064 -507 V 0.060 -508 Y 0.058 -509 R 0.056 -510 L 0.059 -511 L 0.068 -512 K 0.076 -513 C 0.085 -514 A 0.093 -515 P 0.096 -516 R 0.095 -517 G 0.100 -518 K 0.117 -519 N 0.133 -520 G 0.130 -521 F 0.107 -522 T 0.079 -523 P 0.060 -524 L 0.051 -525 H 0.055 -526 M 0.069 -527 A 0.087 -528 V 0.104 -529 D 0.126 -530 K 0.158 -531 E 0.195 -532 T 0.228 -533 T 0.255 -534 N 0.276 -535 V 0.286 -536 G 0.284 -537 Q 0.271 -538 Y 0.252 -539 H 0.231 -540 V 0.207 -541 G 0.177 -542 V 0.150 -543 F 0.132 -544 P 0.121 -545 S 0.110 -546 L 0.096 -547 Q 0.084 -548 V 0.082 -549 V 0.085 -550 K 0.089 -551 V 0.090 -552 L 0.092 -553 L 0.093 -554 D 0.092 -555 C 0.098 -556 G 0.118 -557 A 0.144 -558 D 0.162 -559 P 0.163 -560 D 0.151 -561 S 0.133 -562 R 0.114 -563 D 0.107 -564 F 0.114 -565 D 0.120 -566 N 0.116 -567 N 0.104 -568 S 0.092 -569 P 0.082 -570 L 0.076 -571 H 0.077 -572 I 0.083 -573 A 0.088 -574 A 0.089 -575 Q 0.091 -576 N 0.099 -577 N 0.110 -578 C 0.117 -579 P 0.115 -580 A 0.112 -581 I 0.113 -582 M 0.112 -583 D 0.103 -584 A 0.094 -585 L 0.094 -586 I 0.104 -587 E 0.114 -588 A 0.115 -589 G 0.115 -590 A 0.119 -591 H 0.128 -592 M 0.136 -593 D 0.136 -594 A 0.129 -595 T 0.122 -596 N 0.121 -597 T 0.121 -598 F 0.116 -599 K 0.106 -600 K 0.095 -601 T 0.089 -602 A 0.092 -603 Y 0.100 -604 E 0.109 -605 L 0.120 -606 L 0.137 -607 D 0.159 -608 S 0.181 -609 K 0.200 -610 L 0.220 -611 L 0.247 -612 A 0.278 -613 K 0.303 -614 S 0.317 -615 T 0.323 -616 V 0.324 -617 Q 0.317 -618 P 0.301 -619 F 0.280 -620 N 0.256 -621 Y 0.226 -622 V 0.191 -623 T 0.162 -624 L 0.145 -625 Q 0.137 -626 C 0.140 -627 L 0.151 -628 A 0.160 -629 A 0.158 -630 R 0.155 -631 A 0.159 -632 L 0.165 -633 D 0.166 -634 R 0.164 -635 N 0.163 -636 K 0.164 -637 V 0.160 -638 P 0.155 -639 Y 0.157 -640 K 0.171 -641 G 0.191 -642 F 0.201 -643 I 0.194 -644 P 0.176 -645 E 0.157 -646 E 0.144 -647 L 0.134 -648 E 0.126 -649 A 0.122 -650 F 0.119 -651 I 0.120 -652 Q 0.133 -653 L 0.156 -654 H 0.176 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000078157.2_ENSMUST00000104962.2_GN:Fem1al_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:17.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000078157.2_ENSMUST00000104962.2_GN:Fem1al_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:17.caid deleted file mode 100644 index 7a628b80a622f1f6f6ceb6a64089c9516b58b0b6..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000078157.2_ENSMUST00000104962.2_GN:Fem1al_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:17.caid +++ /dev/null @@ -1,672 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000078157.2|ENSMUST00000104962.2|GN:Fem1al|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:17 -1 M 0.313 -2 S 0.320 -3 L 0.345 -4 A 0.390 -5 T 0.445 -6 G 0.495 -7 G 0.531 -8 P 0.536 -9 A 0.504 -10 R 0.472 -11 S 0.473 -12 S 0.490 -13 S 0.497 -14 E 0.491 -15 A 0.472 -16 S 0.427 -17 S 0.354 -18 M 0.267 -19 D 0.187 -20 L 0.126 -21 H 0.090 -22 T 0.074 -23 A 0.068 -24 V 0.067 -25 Y 0.068 -26 N 0.068 -27 A 0.061 -28 A 0.052 -29 H 0.050 -30 D 0.056 -31 G 0.064 -32 K 0.065 -33 L 0.056 -34 P 0.045 -35 L 0.041 -36 L 0.047 -37 Q 0.061 -38 K 0.072 -39 L 0.072 -40 L 0.065 -41 A 0.061 -42 S 0.061 -43 R 0.064 -44 G 0.068 -45 R 0.070 -46 E 0.069 -47 E 0.066 -48 L 0.068 -49 E 0.072 -50 E 0.079 -51 L 0.090 -52 L 0.102 -53 G 0.107 -54 E 0.103 -55 V 0.100 -56 A 0.104 -57 G 0.112 -58 G 0.110 -59 G 0.093 -60 T 0.069 -61 P 0.053 -62 L 0.050 -63 L 0.060 -64 I 0.073 -65 A 0.080 -66 A 0.077 -67 R 0.072 -68 R 0.072 -69 G 0.073 -70 H 0.069 -71 L 0.060 -72 D 0.052 -73 V 0.047 -74 V 0.044 -75 E 0.038 -76 Y 0.032 -77 L 0.033 -78 V 0.043 -79 D 0.056 -80 H 0.066 -81 C 0.072 -82 G 0.079 -83 A 0.085 -84 S 0.087 -85 V 0.086 -86 E 0.087 -87 A 0.087 -88 S 0.083 -89 G 0.080 -90 S 0.086 -91 V 0.100 -92 H 0.118 -93 F 0.135 -94 D 0.149 -95 G 0.156 -96 E 0.149 -97 T 0.133 -98 I 0.112 -99 E 0.091 -100 G 0.073 -101 A 0.060 -102 P 0.051 -103 P 0.046 -104 L 0.046 -105 W 0.052 -106 A 0.063 -107 A 0.072 -108 S 0.075 -109 A 0.078 -110 A 0.083 -111 G 0.083 -112 H 0.076 -113 L 0.066 -114 A 0.060 -115 V 0.059 -116 V 0.058 -117 R 0.054 -118 S 0.052 -119 L 0.060 -120 L 0.075 -121 H 0.089 -122 R 0.096 -123 G 0.100 -124 A 0.103 -125 S 0.103 -126 V 0.098 -127 N 0.090 -128 R 0.082 -129 T 0.077 -130 T 0.074 -131 C 0.073 -132 T 0.070 -133 N 0.064 -134 S 0.059 -135 T 0.056 -136 P 0.055 -137 L 0.055 -138 R 0.062 -139 A 0.073 -140 A 0.083 -141 C 0.086 -142 F 0.087 -143 N 0.089 -144 G 0.088 -145 H 0.078 -146 L 0.065 -147 D 0.056 -148 V 0.051 -149 V 0.048 -150 R 0.049 -151 C 0.054 -152 L 0.064 -153 V 0.077 -154 G 0.092 -155 E 0.099 -156 H 0.098 -157 K 0.099 -158 A 0.102 -159 D 0.103 -160 L 0.100 -161 E 0.096 -162 V 0.092 -163 A 0.090 -164 N 0.094 -165 R 0.101 -166 H 0.103 -167 G 0.095 -168 H 0.079 -169 T 0.063 -170 C 0.050 -171 L 0.042 -172 M 0.038 -173 I 0.038 -174 S 0.039 -175 C 0.039 -176 Y 0.045 -177 K 0.057 -178 G 0.067 -179 H 0.067 -180 R 0.060 -181 E 0.054 -182 I 0.052 -183 A 0.049 -184 R 0.043 -185 Y 0.041 -186 L 0.051 -187 L 0.068 -188 E 0.081 -189 R 0.086 -190 G 0.091 -191 A 0.097 -192 Q 0.096 -193 V 0.085 -194 N 0.075 -195 R 0.071 -196 R 0.074 -197 S 0.082 -198 A 0.091 -199 K 0.096 -200 G 0.094 -201 N 0.083 -202 T 0.067 -203 A 0.052 -204 L 0.044 -205 H 0.043 -206 D 0.048 -207 C 0.052 -208 A 0.055 -209 E 0.059 -210 S 0.065 -211 G 0.071 -212 S 0.071 -213 L 0.065 -214 E 0.059 -215 I 0.054 -216 L 0.049 -217 Q 0.043 -218 L 0.039 -219 L 0.038 -220 L 0.043 -221 S 0.051 -222 C 0.063 -223 H 0.079 -224 A 0.093 -225 R 0.096 -226 M 0.090 -227 E 0.083 -228 R 0.082 -229 D 0.085 -230 G 0.088 -231 Y 0.085 -232 G 0.078 -233 M 0.069 -234 T 0.061 -235 P 0.056 -236 L 0.055 -237 L 0.061 -238 A 0.071 -239 A 0.078 -240 S 0.076 -241 I 0.068 -242 T 0.062 -243 G 0.060 -244 H 0.058 -245 T 0.054 -246 N 0.052 -247 I 0.054 -248 V 0.055 -249 E 0.055 -250 Y 0.058 -251 L 0.070 -252 I 0.093 -253 Q 0.133 -254 E 0.194 -255 Q 0.271 -256 P 0.346 -257 S 0.411 -258 H 0.469 -259 E 0.519 -260 Q 0.558 -261 L 0.587 -262 S 0.612 -263 G 0.625 -264 T 0.623 -265 E 0.614 -266 L 0.612 -267 P 0.624 -268 G 0.641 -269 E 0.641 -270 G 0.608 -271 S 0.550 -272 S 0.513 -273 Q 0.528 -274 M 0.571 -275 A 0.604 -276 G 0.619 -277 N 0.618 -278 H 0.606 -279 C 0.586 -280 S 0.568 -281 T 0.558 -282 P 0.556 -283 E 0.561 -284 D 0.571 -285 A 0.586 -286 E 0.600 -287 Q 0.599 -288 Y 0.574 -289 E 0.516 -290 S 0.438 -291 C 0.369 -292 C 0.322 -293 P 0.285 -294 T 0.244 -295 S 0.201 -296 R 0.162 -297 E 0.129 -298 A 0.102 -299 A 0.084 -300 V 0.073 -301 E 0.063 -302 A 0.055 -303 L 0.051 -304 E 0.052 -305 L 0.055 -306 L 0.053 -307 G 0.045 -308 A 0.035 -309 T 0.029 -310 Y 0.029 -311 V 0.036 -312 D 0.051 -313 K 0.069 -314 K 0.086 -315 R 0.096 -316 D 0.099 -317 L 0.096 -318 L 0.091 -319 G 0.085 -320 A 0.075 -321 L 0.063 -322 K 0.054 -323 H 0.054 -324 W 0.057 -325 R 0.058 -326 R 0.061 -327 A 0.070 -328 M 0.083 -329 E 0.093 -330 L 0.096 -331 R 0.100 -332 H 0.114 -333 Q 0.144 -334 G 0.182 -335 G 0.206 -336 G 0.209 -337 F 0.206 -338 L 0.214 -339 P 0.235 -340 K 0.263 -341 P 0.293 -342 E 0.322 -343 P 0.345 -344 Q 0.354 -345 Q 0.336 -346 L 0.287 -347 V 0.226 -348 L 0.174 -349 A 0.141 -350 Y 0.124 -351 D 0.125 -352 Y 0.139 -353 S 0.157 -354 R 0.169 -355 E 0.168 -356 V 0.151 -357 T 0.129 -358 T 0.112 -359 P 0.105 -360 Q 0.101 -361 E 0.092 -362 L 0.079 -363 E 0.072 -364 A 0.069 -365 L 0.069 -366 I 0.069 -367 T 0.072 -368 D 0.076 -369 P 0.080 -370 D 0.083 -371 E 0.087 -372 M 0.092 -373 R 0.103 -374 M 0.114 -375 Q 0.118 -376 A 0.116 -377 L 0.117 -378 L 0.117 -379 I 0.113 -380 R 0.108 -381 E 0.109 -382 R 0.118 -383 I 0.127 -384 L 0.134 -385 G 0.138 -386 P 0.138 -387 S 0.134 -388 H 0.128 -389 P 0.123 -390 D 0.117 -391 T 0.102 -392 S 0.080 -393 Y 0.058 -394 Y 0.046 -395 I 0.040 -396 R 0.040 -397 Y 0.044 -398 R 0.048 -399 G 0.047 -400 A 0.044 -401 V 0.042 -402 Y 0.046 -403 A 0.057 -404 D 0.073 -405 S 0.089 -406 G 0.101 -407 N 0.104 -408 F 0.097 -409 E 0.084 -410 R 0.071 -411 C 0.063 -412 I 0.060 -413 R 0.057 -414 L 0.055 -415 W 0.056 -416 K 0.058 -417 Y 0.062 -418 A 0.067 -419 L 0.070 -420 D 0.070 -421 M 0.070 -422 Q 0.075 -423 Q 0.088 -424 N 0.104 -425 N 0.117 -426 L 0.128 -427 E 0.139 -428 P 0.147 -429 L 0.142 -430 S 0.125 -431 P 0.102 -432 M 0.085 -433 T 0.074 -434 A 0.066 -435 S 0.058 -436 S 0.054 -437 F 0.054 -438 L 0.054 -439 S 0.052 -440 F 0.050 -441 A 0.048 -442 E 0.047 -443 L 0.047 -444 F 0.050 -445 S 0.054 -446 Y 0.061 -447 V 0.074 -448 L 0.096 -449 Q 0.130 -450 D 0.172 -451 H 0.215 -452 S 0.252 -453 A 0.287 -454 K 0.318 -455 G 0.336 -456 N 0.332 -457 L 0.302 -458 G 0.253 -459 M 0.199 -460 Q 0.150 -461 L 0.111 -462 D 0.087 -463 F 0.075 -464 A 0.070 -465 D 0.069 -466 L 0.071 -467 I 0.069 -468 G 0.061 -469 V 0.052 -470 L 0.047 -471 S 0.044 -472 K 0.042 -473 G 0.046 -474 V 0.057 -475 R 0.064 -476 E 0.061 -477 V 0.053 -478 E 0.050 -479 R 0.053 -480 A 0.064 -481 L 0.086 -482 Q 0.116 -483 L 0.146 -484 P 0.165 -485 K 0.171 -486 E 0.173 -487 P 0.173 -488 D 0.165 -489 D 0.144 -490 S 0.112 -491 A 0.081 -492 Q 0.064 -493 F 0.059 -494 T 0.059 -495 K 0.058 -496 A 0.059 -497 I 0.058 -498 A 0.052 -499 I 0.045 -500 I 0.041 -501 L 0.037 -502 H 0.035 -503 L 0.036 -504 L 0.041 -505 Y 0.048 -506 L 0.055 -507 L 0.063 -508 E 0.069 -509 K 0.077 -510 V 0.086 -511 E 0.099 -512 C 0.109 -513 T 0.109 -514 P 0.101 -515 R 0.088 -516 Q 0.074 -517 E 0.062 -518 H 0.055 -519 L 0.055 -520 K 0.058 -521 H 0.060 -522 Q 0.058 -523 T 0.056 -524 V 0.057 -525 Y 0.058 -526 R 0.057 -527 L 0.061 -528 L 0.069 -529 K 0.077 -530 C 0.086 -531 A 0.094 -532 P 0.097 -533 R 0.096 -534 G 0.101 -535 K 0.118 -536 N 0.134 -537 G 0.132 -538 F 0.109 -539 T 0.081 -540 P 0.061 -541 L 0.052 -542 H 0.055 -543 M 0.069 -544 A 0.087 -545 V 0.105 -546 D 0.127 -547 K 0.158 -548 E 0.194 -549 T 0.226 -550 T 0.252 -551 N 0.273 -552 V 0.283 -553 G 0.282 -554 Q 0.269 -555 Y 0.250 -556 H 0.230 -557 V 0.205 -558 G 0.176 -559 V 0.149 -560 F 0.132 -561 P 0.121 -562 S 0.111 -563 L 0.096 -564 Q 0.084 -565 V 0.081 -566 V 0.085 -567 K 0.089 -568 V 0.091 -569 L 0.093 -570 L 0.093 -571 D 0.092 -572 C 0.098 -573 G 0.118 -574 A 0.144 -575 D 0.162 -576 P 0.163 -577 D 0.152 -578 S 0.133 -579 R 0.115 -580 D 0.108 -581 F 0.115 -582 D 0.121 -583 N 0.117 -584 N 0.105 -585 S 0.093 -586 P 0.083 -587 L 0.076 -588 H 0.077 -589 I 0.084 -590 A 0.089 -591 A 0.089 -592 Q 0.091 -593 N 0.099 -594 N 0.110 -595 C 0.117 -596 P 0.115 -597 A 0.113 -598 I 0.114 -599 M 0.113 -600 D 0.104 -601 A 0.095 -602 L 0.095 -603 I 0.105 -604 E 0.114 -605 A 0.116 -606 G 0.115 -607 A 0.120 -608 H 0.129 -609 M 0.137 -610 D 0.136 -611 A 0.130 -612 T 0.124 -613 N 0.123 -614 T 0.122 -615 F 0.117 -616 K 0.107 -617 K 0.095 -618 T 0.090 -619 A 0.092 -620 Y 0.100 -621 E 0.109 -622 L 0.121 -623 L 0.137 -624 D 0.159 -625 S 0.181 -626 K 0.200 -627 L 0.219 -628 L 0.245 -629 A 0.277 -630 K 0.301 -631 S 0.314 -632 T 0.319 -633 V 0.319 -634 Q 0.312 -635 P 0.296 -636 F 0.274 -637 N 0.250 -638 Y 0.222 -639 V 0.188 -640 T 0.160 -641 L 0.143 -642 Q 0.136 -643 C 0.139 -644 L 0.151 -645 A 0.159 -646 A 0.158 -647 R 0.154 -648 A 0.157 -649 L 0.163 -650 D 0.163 -651 R 0.161 -652 N 0.161 -653 K 0.161 -654 V 0.158 -655 P 0.152 -656 Y 0.153 -657 K 0.168 -658 G 0.189 -659 F 0.199 -660 I 0.193 -661 P 0.175 -662 E 0.156 -663 E 0.142 -664 L 0.132 -665 E 0.125 -666 A 0.120 -667 F 0.117 -668 I 0.118 -669 Q 0.130 -670 L 0.152 -671 H 0.172 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000079677.3_ENSMUST00000010348.7_GN:Fdx2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000079677.3_ENSMUST00000010348.7_GN:Fdx2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 7e5dfcb16ff0c73c4245ea0d2adee78257b78439..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000079677.3_ENSMUST00000010348.7_GN:Fdx2_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,175 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000079677.3|ENSMUST00000010348.7|GN:Fdx2|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.435 -2 A 0.433 -3 A 0.454 -4 S 0.505 -5 M 0.553 -6 A 0.575 -7 R 0.588 -8 G 0.614 -9 V 0.642 -10 S 0.658 -11 A 0.666 -12 R 0.672 -13 V 0.673 -14 L 0.668 -15 L 0.663 -16 R 0.664 -17 A 0.671 -18 A 0.677 -19 G 0.679 -20 G 0.679 -21 S 0.671 -22 W 0.660 -23 G 0.661 -24 P 0.675 -25 R 0.692 -26 A 0.700 -27 G 0.688 -28 H 0.648 -29 A 0.593 -30 A 0.567 -31 V 0.595 -32 T 0.640 -33 S 0.663 -34 R 0.671 -35 T 0.687 -36 F 0.712 -37 G 0.736 -38 T 0.749 -39 T 0.748 -40 G 0.739 -41 E 0.729 -42 R 0.726 -43 R 0.731 -44 A 0.738 -45 G 0.742 -46 E 0.740 -47 E 0.732 -48 A 0.715 -49 A 0.683 -50 D 0.638 -51 S 0.588 -52 P 0.534 -53 E 0.474 -54 L 0.406 -55 P 0.331 -56 R 0.254 -57 D 0.178 -58 V 0.113 -59 V 0.066 -60 N 0.039 -61 V 0.025 -62 V 0.021 -63 F 0.023 -64 V 0.030 -65 D 0.043 -66 R 0.058 -67 S 0.071 -68 G 0.077 -69 K 0.075 -70 R 0.067 -71 I 0.057 -72 P 0.046 -73 V 0.036 -74 R 0.030 -75 G 0.030 -76 K 0.036 -77 V 0.047 -78 G 0.055 -79 D 0.059 -80 N 0.062 -81 V 0.066 -82 L 0.068 -83 Y 0.067 -84 L 0.066 -85 A 0.065 -86 Q 0.065 -87 R 0.064 -88 H 0.068 -89 G 0.079 -90 V 0.097 -91 D 0.122 -92 L 0.148 -93 E 0.165 -94 G 0.166 -95 A 0.155 -96 C 0.141 -97 E 0.135 -98 A 0.134 -99 S 0.135 -100 L 0.139 -101 A 0.149 -102 C 0.153 -103 S 0.146 -104 T 0.132 -105 C 0.113 -106 H 0.091 -107 V 0.072 -108 Y 0.066 -109 V 0.068 -110 S 0.071 -111 E 0.068 -112 A 0.061 -113 H 0.057 -114 L 0.060 -115 D 0.067 -116 L 0.079 -117 L 0.096 -118 P 0.117 -119 P 0.133 -120 P 0.132 -121 E 0.113 -122 E 0.091 -123 R 0.077 -124 E 0.074 -125 D 0.078 -126 D 0.086 -127 M 0.095 -128 L 0.103 -129 D 0.106 -130 M 0.110 -131 A 0.115 -132 P 0.120 -133 L 0.124 -134 L 0.124 -135 Q 0.113 -136 E 0.092 -137 N 0.073 -138 S 0.061 -139 R 0.055 -140 L 0.049 -141 G 0.044 -142 C 0.042 -143 Q 0.042 -144 I 0.042 -145 V 0.041 -146 L 0.039 -147 T 0.040 -148 P 0.047 -149 E 0.058 -150 L 0.068 -151 E 0.074 -152 G 0.072 -153 V 0.066 -154 E 0.057 -155 F 0.054 -156 A 0.065 -157 L 0.087 -158 P 0.115 -159 K 0.148 -160 I 0.182 -161 T 0.212 -162 R 0.243 -163 N 0.281 -164 F 0.322 -165 Y 0.359 -166 V 0.396 -167 D 0.438 -168 G 0.477 -169 H 0.500 -170 I 0.504 -171 P 0.492 -172 K 0.469 -173 P 0.436 -174 H 0.409 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000079677.3_ENSMUST00000010348.7_GN:Fdx2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000079677.3_ENSMUST00000010348.7_GN:Fdx2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid deleted file mode 100644 index a95844239ab1bdaea0a959c3aa2808238df831e2..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000079677.3_ENSMUST00000010348.7_GN:Fdx2_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:10.caid +++ /dev/null @@ -1,185 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000079677.3|ENSMUST00000010348.7|GN:Fdx2|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:10 -1 M 0.484 -2 L 0.499 -3 G 0.524 -4 L 0.551 -5 P 0.571 -6 V 0.580 -7 T 0.588 -8 W 0.603 -9 P 0.623 -10 I 0.639 -11 M 0.653 -12 A 0.667 -13 A 0.674 -14 S 0.671 -15 M 0.668 -16 A 0.670 -17 R 0.678 -18 G 0.685 -19 V 0.683 -20 S 0.657 -21 A 0.609 -22 R 0.582 -23 V 0.614 -24 L 0.675 -25 L 0.719 -26 R 0.737 -27 A 0.739 -28 A 0.732 -29 G 0.724 -30 G 0.716 -31 S 0.703 -32 W 0.690 -33 G 0.688 -34 P 0.699 -35 R 0.712 -36 A 0.719 -37 G 0.708 -38 H 0.669 -39 A 0.612 -40 A 0.585 -41 V 0.613 -42 T 0.660 -43 S 0.685 -44 R 0.692 -45 T 0.705 -46 F 0.727 -47 G 0.748 -48 T 0.760 -49 T 0.760 -50 G 0.752 -51 E 0.745 -52 R 0.744 -53 R 0.749 -54 A 0.755 -55 G 0.757 -56 E 0.755 -57 E 0.748 -58 A 0.732 -59 A 0.700 -60 D 0.654 -61 S 0.602 -62 P 0.546 -63 E 0.483 -64 L 0.410 -65 P 0.332 -66 R 0.252 -67 D 0.176 -68 V 0.111 -69 V 0.065 -70 N 0.038 -71 V 0.025 -72 V 0.021 -73 F 0.022 -74 V 0.029 -75 D 0.041 -76 R 0.056 -77 S 0.069 -78 G 0.075 -79 K 0.072 -80 R 0.065 -81 I 0.055 -82 P 0.045 -83 V 0.035 -84 R 0.029 -85 G 0.029 -86 K 0.035 -87 V 0.045 -88 G 0.053 -89 D 0.056 -90 N 0.058 -91 V 0.062 -92 L 0.064 -93 Y 0.063 -94 L 0.062 -95 A 0.063 -96 Q 0.062 -97 R 0.062 -98 H 0.066 -99 G 0.077 -100 V 0.095 -101 D 0.120 -102 L 0.147 -103 E 0.164 -104 G 0.165 -105 A 0.153 -106 C 0.140 -107 E 0.134 -108 A 0.134 -109 S 0.134 -110 L 0.138 -111 A 0.147 -112 C 0.151 -113 S 0.144 -114 T 0.130 -115 C 0.111 -116 H 0.089 -117 V 0.071 -118 Y 0.065 -119 V 0.067 -120 S 0.069 -121 E 0.066 -122 A 0.060 -123 H 0.056 -124 L 0.059 -125 D 0.066 -126 L 0.078 -127 L 0.096 -128 P 0.117 -129 P 0.133 -130 P 0.132 -131 E 0.113 -132 E 0.091 -133 R 0.077 -134 E 0.074 -135 D 0.078 -136 D 0.086 -137 M 0.096 -138 L 0.103 -139 D 0.106 -140 M 0.110 -141 A 0.115 -142 P 0.120 -143 L 0.125 -144 L 0.125 -145 Q 0.113 -146 E 0.092 -147 N 0.073 -148 S 0.062 -149 R 0.055 -150 L 0.049 -151 G 0.044 -152 C 0.042 -153 Q 0.042 -154 I 0.042 -155 V 0.041 -156 L 0.039 -157 T 0.041 -158 P 0.047 -159 E 0.058 -160 L 0.068 -161 E 0.074 -162 G 0.073 -163 V 0.066 -164 E 0.057 -165 F 0.054 -166 A 0.065 -167 L 0.087 -168 P 0.115 -169 K 0.149 -170 I 0.182 -171 T 0.212 -172 R 0.243 -173 N 0.280 -174 F 0.319 -175 Y 0.355 -176 V 0.392 -177 D 0.434 -178 G 0.474 -179 H 0.497 -180 I 0.501 -181 P 0.489 -182 K 0.465 -183 P 0.432 -184 H 0.405 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000090125.4_ENSMUST00000053491.9_GN:Pou3f1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000090125.4_ENSMUST00000053491.9_GN:Pou3f1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index b2607fae8f3f3b553dff2761649acd04f1dbedf9..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000090125.4_ENSMUST00000053491.9_GN:Pou3f1_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,450 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000090125.4|ENSMUST00000053491.9|GN:Pou3f1|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.477 -2 A 0.519 -3 T 0.563 -4 T 0.572 -5 A 0.540 -6 Q 0.515 -7 Y 0.540 -8 L 0.603 -9 P 0.663 -10 R 0.706 -11 G 0.738 -12 P 0.765 -13 G 0.788 -14 G 0.803 -15 G 0.808 -16 A 0.804 -17 G 0.797 -18 G 0.790 -19 T 0.783 -20 G 0.776 -21 P 0.768 -22 L 0.748 -23 M 0.713 -24 H 0.670 -25 P 0.629 -26 D 0.582 -27 A 0.516 -28 A 0.442 -29 A 0.398 -30 A 0.399 -31 A 0.416 -32 A 0.422 -33 A 0.415 -34 A 0.415 -35 A 0.430 -36 E 0.450 -37 R 0.474 -38 L 0.505 -39 H 0.538 -40 A 0.555 -41 G 0.540 -42 A 0.487 -43 A 0.416 -44 Y 0.361 -45 R 0.337 -46 E 0.327 -47 V 0.315 -48 Q 0.309 -49 K 0.322 -50 L 0.359 -51 M 0.417 -52 H 0.486 -53 H 0.544 -54 E 0.585 -55 W 0.625 -56 L 0.677 -57 G 0.735 -58 A 0.780 -59 G 0.801 -60 A 0.805 -61 G 0.800 -62 H 0.800 -63 P 0.808 -64 V 0.819 -65 G 0.822 -66 L 0.811 -67 A 0.789 -68 H 0.771 -69 P 0.764 -70 Q 0.766 -71 W 0.774 -72 L 0.790 -73 P 0.813 -74 T 0.838 -75 G 0.855 -76 G 0.863 -77 G 0.864 -78 G 0.859 -79 G 0.850 -80 G 0.837 -81 D 0.823 -82 W 0.813 -83 A 0.811 -84 G 0.810 -85 G 0.808 -86 P 0.809 -87 H 0.816 -88 L 0.826 -89 E 0.836 -90 H 0.845 -91 G 0.853 -92 K 0.859 -93 A 0.864 -94 G 0.868 -95 G 0.870 -96 G 0.872 -97 G 0.873 -98 T 0.874 -99 G 0.873 -100 R 0.870 -101 A 0.864 -102 D 0.858 -103 D 0.852 -104 G 0.847 -105 G 0.843 -106 G 0.839 -107 G 0.831 -108 G 0.818 -109 G 0.798 -110 F 0.766 -111 H 0.714 -112 A 0.649 -113 R 0.615 -114 L 0.647 -115 V 0.713 -116 H 0.763 -117 Q 0.782 -118 G 0.785 -119 A 0.782 -120 A 0.780 -121 H 0.781 -122 A 0.787 -123 G 0.788 -124 A 0.780 -125 A 0.764 -126 W 0.754 -127 A 0.761 -128 Q 0.781 -129 G 0.801 -130 G 0.815 -131 T 0.819 -132 A 0.818 -133 H 0.815 -134 H 0.811 -135 L 0.809 -136 G 0.813 -137 P 0.822 -138 A 0.823 -139 M 0.814 -140 S 0.800 -141 P 0.790 -142 S 0.791 -143 P 0.802 -144 G 0.817 -145 A 0.827 -146 G 0.828 -147 G 0.819 -148 G 0.801 -149 H 0.779 -150 Q 0.758 -151 P 0.745 -152 Q 0.743 -153 P 0.752 -154 L 0.767 -155 G 0.782 -156 L 0.794 -157 Y 0.802 -158 A 0.810 -159 Q 0.812 -160 A 0.801 -161 A 0.783 -162 Y 0.773 -163 P 0.786 -164 G 0.813 -165 G 0.838 -166 G 0.848 -167 G 0.846 -168 G 0.838 -169 G 0.826 -170 L 0.818 -171 A 0.818 -172 G 0.825 -173 M 0.832 -174 L 0.840 -175 A 0.850 -176 A 0.857 -177 G 0.859 -178 G 0.857 -179 G 0.854 -180 G 0.846 -181 A 0.834 -182 G 0.821 -183 P 0.812 -184 G 0.797 -185 L 0.761 -186 H 0.711 -187 H 0.684 -188 A 0.704 -189 L 0.746 -190 H 0.779 -191 E 0.797 -192 D 0.808 -193 G 0.815 -194 H 0.821 -195 E 0.827 -196 A 0.829 -197 Q 0.822 -198 L 0.809 -199 E 0.792 -200 P 0.775 -201 S 0.759 -202 P 0.757 -203 P 0.774 -204 P 0.802 -205 H 0.827 -206 L 0.841 -207 G 0.847 -208 A 0.843 -209 H 0.822 -210 G 0.769 -211 H 0.695 -212 A 0.656 -213 H 0.688 -214 G 0.754 -215 H 0.799 -216 A 0.814 -217 H 0.814 -218 A 0.809 -219 G 0.797 -220 G 0.766 -221 L 0.708 -222 H 0.640 -223 A 0.612 -224 A 0.646 -225 A 0.703 -226 A 0.734 -227 H 0.736 -228 L 0.735 -229 H 0.746 -230 P 0.772 -231 G 0.803 -232 A 0.826 -233 G 0.838 -234 G 0.843 -235 G 0.846 -236 G 0.847 -237 S 0.846 -238 S 0.842 -239 V 0.835 -240 G 0.827 -241 E 0.816 -242 H 0.797 -243 S 0.767 -244 D 0.723 -245 E 0.672 -246 D 0.611 -247 A 0.531 -248 P 0.426 -249 S 0.312 -250 S 0.216 -251 D 0.151 -252 D 0.111 -253 L 0.088 -254 E 0.072 -255 Q 0.059 -256 F 0.048 -257 A 0.041 -258 K 0.038 -259 Q 0.037 -260 F 0.039 -261 K 0.043 -262 Q 0.050 -263 R 0.057 -264 R 0.063 -265 I 0.067 -266 K 0.072 -267 L 0.078 -268 G 0.080 -269 F 0.073 -270 T 0.061 -271 Q 0.052 -272 A 0.051 -273 D 0.056 -274 V 0.063 -275 G 0.069 -276 L 0.069 -277 A 0.065 -278 L 0.063 -279 G 0.067 -280 T 0.076 -281 L 0.091 -282 Y 0.115 -283 G 0.139 -284 N 0.147 -285 V 0.135 -286 F 0.111 -287 S 0.087 -288 Q 0.068 -289 T 0.058 -290 T 0.058 -291 I 0.065 -292 C 0.075 -293 R 0.089 -294 F 0.105 -295 E 0.117 -296 A 0.118 -297 L 0.116 -298 Q 0.117 -299 L 0.115 -300 S 0.105 -301 F 0.087 -302 K 0.072 -303 N 0.063 -304 M 0.059 -305 C 0.059 -306 K 0.062 -307 L 0.062 -308 K 0.055 -309 P 0.047 -310 L 0.041 -311 L 0.037 -312 N 0.033 -313 K 0.029 -314 W 0.028 -315 L 0.031 -316 E 0.038 -317 E 0.055 -318 T 0.087 -319 D 0.131 -320 S 0.181 -321 S 0.232 -322 S 0.283 -323 G 0.323 -324 S 0.336 -325 P 0.317 -326 T 0.278 -327 N 0.239 -328 L 0.211 -329 D 0.195 -330 K 0.191 -331 I 0.202 -332 A 0.237 -333 A 0.293 -334 Q 0.348 -335 G 0.385 -336 R 0.401 -337 K 0.401 -338 R 0.390 -339 K 0.371 -340 K 0.341 -341 R 0.305 -342 T 0.272 -343 S 0.244 -344 I 0.218 -345 E 0.187 -346 V 0.149 -347 G 0.111 -348 V 0.086 -349 K 0.076 -350 G 0.075 -351 A 0.076 -352 L 0.079 -353 E 0.085 -354 S 0.088 -355 H 0.083 -356 F 0.075 -357 L 0.070 -358 K 0.068 -359 C 0.068 -360 P 0.069 -361 K 0.072 -362 P 0.075 -363 S 0.077 -364 A 0.077 -365 H 0.074 -366 E 0.065 -367 I 0.057 -368 T 0.060 -369 G 0.076 -370 L 0.092 -371 A 0.095 -372 D 0.085 -373 S 0.071 -374 L 0.065 -375 Q 0.065 -376 L 0.064 -377 E 0.058 -378 K 0.054 -379 E 0.054 -380 V 0.055 -381 V 0.052 -382 R 0.044 -383 V 0.035 -384 W 0.028 -385 F 0.025 -386 C 0.023 -387 N 0.026 -388 R 0.032 -389 R 0.041 -390 Q 0.053 -391 K 0.070 -392 E 0.105 -393 K 0.166 -394 R 0.255 -395 M 0.368 -396 T 0.492 -397 P 0.604 -398 A 0.685 -399 A 0.729 -400 G 0.742 -401 A 0.731 -402 G 0.706 -403 H 0.681 -404 P 0.670 -405 P 0.674 -406 M 0.681 -407 D 0.684 -408 D 0.674 -409 V 0.654 -410 Y 0.645 -411 A 0.663 -412 P 0.701 -413 G 0.736 -414 E 0.754 -415 L 0.760 -416 G 0.767 -417 P 0.783 -418 G 0.804 -419 G 0.821 -420 G 0.825 -421 S 0.812 -422 A 0.787 -423 S 0.760 -424 P 0.746 -425 P 0.744 -426 S 0.737 -427 A 0.714 -428 P 0.679 -429 P 0.649 -430 P 0.640 -431 P 0.659 -432 P 0.701 -433 P 0.748 -434 A 0.777 -435 A 0.771 -436 L 0.723 -437 H 0.653 -438 H 0.615 -439 H 0.643 -440 H 0.703 -441 H 0.746 -442 H 0.764 -443 T 0.770 -444 L 0.771 -445 P 0.774 -446 G 0.770 -447 S 0.740 -448 V 0.677 -449 Q 0.619 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000090125.4_ENSMUST00000053491.9_GN:Pou3f1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:96.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000090125.4_ENSMUST00000053491.9_GN:Pou3f1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:96.caid deleted file mode 100644 index ef6274a6a92dc173b9d00f0804ab8f98a415389e..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000090125.4_ENSMUST00000053491.9_GN:Pou3f1_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:96.caid +++ /dev/null @@ -1,546 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000090125.4|ENSMUST00000053491.9|GN:Pou3f1|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:96 -1 M 0.452 -2 N 0.477 -3 E 0.507 -4 A 0.519 -5 P 0.512 -6 A 0.519 -7 A 0.553 -8 N 0.578 -9 Q 0.565 -10 H 0.555 -11 C 0.586 -12 R 0.635 -13 R 0.662 -14 A 0.669 -15 G 0.673 -16 P 0.682 -17 R 0.695 -18 E 0.707 -19 R 0.715 -20 D 0.719 -21 P 0.724 -22 I 0.734 -23 A 0.747 -24 S 0.755 -25 S 0.742 -26 G 0.697 -27 L 0.635 -28 Q 0.608 -29 A 0.648 -30 P 0.720 -31 A 0.773 -32 A 0.796 -33 G 0.802 -34 G 0.803 -35 H 0.802 -36 G 0.800 -37 G 0.791 -38 R 0.775 -39 R 0.758 -40 P 0.749 -41 G 0.751 -42 P 0.761 -43 G 0.768 -44 G 0.757 -45 G 0.711 -46 R 0.644 -47 R 0.612 -48 L 0.645 -49 R 0.707 -50 G 0.748 -51 Q 0.766 -52 P 0.780 -53 M 0.797 -54 G 0.813 -55 G 0.823 -56 G 0.828 -57 R 0.829 -58 G 0.827 -59 G 0.822 -60 A 0.816 -61 P 0.812 -62 E 0.812 -63 R 0.813 -64 P 0.812 -65 A 0.812 -66 G 0.815 -67 P 0.818 -68 G 0.818 -69 F 0.818 -70 K 0.823 -71 P 0.834 -72 A 0.844 -73 E 0.849 -74 R 0.848 -75 G 0.846 -76 G 0.841 -77 G 0.834 -78 A 0.826 -79 R 0.816 -80 R 0.808 -81 R 0.799 -82 S 0.787 -83 E 0.771 -84 A 0.755 -85 A 0.743 -86 A 0.734 -87 A 0.733 -88 A 0.745 -89 G 0.763 -90 R 0.778 -91 R 0.790 -92 R 0.799 -93 A 0.805 -94 R 0.808 -95 G 0.812 -96 G 0.818 -97 M 0.821 -98 A 0.820 -99 T 0.811 -100 T 0.793 -101 A 0.767 -102 Q 0.740 -103 Y 0.721 -104 L 0.717 -105 P 0.728 -106 R 0.745 -107 G 0.763 -108 P 0.780 -109 G 0.796 -110 G 0.809 -111 G 0.816 -112 A 0.817 -113 G 0.815 -114 G 0.810 -115 T 0.802 -116 G 0.794 -117 P 0.784 -118 L 0.763 -119 M 0.731 -120 H 0.696 -121 P 0.670 -122 D 0.648 -123 A 0.617 -124 A 0.583 -125 A 0.558 -126 A 0.538 -127 A 0.517 -128 A 0.495 -129 A 0.474 -130 A 0.462 -131 A 0.463 -132 E 0.469 -133 R 0.478 -134 L 0.493 -135 H 0.518 -136 A 0.542 -137 G 0.540 -138 A 0.497 -139 A 0.430 -140 Y 0.375 -141 R 0.350 -142 E 0.336 -143 V 0.314 -144 Q 0.291 -145 K 0.285 -146 L 0.301 -147 M 0.336 -148 H 0.381 -149 H 0.424 -150 E 0.466 -151 W 0.518 -152 L 0.587 -153 G 0.665 -154 A 0.729 -155 G 0.763 -156 A 0.771 -157 G 0.767 -158 H 0.766 -159 P 0.773 -160 V 0.784 -161 G 0.786 -162 L 0.774 -163 A 0.751 -164 H 0.733 -165 P 0.727 -166 Q 0.728 -167 W 0.734 -168 L 0.751 -169 P 0.780 -170 T 0.810 -171 G 0.833 -172 G 0.845 -173 G 0.847 -174 G 0.843 -175 G 0.833 -176 G 0.816 -177 D 0.796 -178 W 0.781 -179 A 0.776 -180 G 0.776 -181 G 0.777 -182 P 0.782 -183 H 0.791 -184 L 0.803 -185 E 0.815 -186 H 0.826 -187 G 0.837 -188 K 0.846 -189 A 0.852 -190 G 0.856 -191 G 0.860 -192 G 0.863 -193 G 0.866 -194 T 0.868 -195 G 0.868 -196 R 0.866 -197 A 0.862 -198 D 0.856 -199 D 0.849 -200 G 0.842 -201 G 0.836 -202 G 0.830 -203 G 0.823 -204 G 0.812 -205 G 0.795 -206 F 0.767 -207 H 0.720 -208 A 0.658 -209 R 0.624 -210 L 0.652 -211 V 0.715 -212 H 0.763 -213 Q 0.781 -214 G 0.783 -215 A 0.780 -216 A 0.779 -217 H 0.783 -218 A 0.790 -219 G 0.793 -220 A 0.785 -221 A 0.769 -222 W 0.759 -223 A 0.765 -224 Q 0.783 -225 G 0.799 -226 G 0.806 -227 T 0.805 -228 A 0.800 -229 H 0.795 -230 H 0.791 -231 L 0.790 -232 G 0.795 -233 P 0.802 -234 A 0.800 -235 M 0.789 -236 S 0.775 -237 P 0.768 -238 S 0.770 -239 P 0.782 -240 G 0.797 -241 A 0.808 -242 G 0.808 -243 G 0.800 -244 G 0.785 -245 H 0.763 -246 Q 0.740 -247 P 0.724 -248 Q 0.721 -249 P 0.728 -250 L 0.741 -251 G 0.753 -252 L 0.761 -253 Y 0.768 -254 A 0.773 -255 Q 0.772 -256 A 0.761 -257 A 0.744 -258 Y 0.738 -259 P 0.754 -260 G 0.785 -261 G 0.810 -262 G 0.820 -263 G 0.818 -264 G 0.810 -265 G 0.799 -266 L 0.789 -267 A 0.787 -268 G 0.791 -269 M 0.796 -270 L 0.803 -271 A 0.813 -272 A 0.820 -273 G 0.822 -274 G 0.820 -275 G 0.816 -276 G 0.808 -277 A 0.793 -278 G 0.781 -279 P 0.774 -280 G 0.771 -281 L 0.768 -282 H 0.765 -283 H 0.763 -284 A 0.758 -285 L 0.752 -286 H 0.751 -287 E 0.758 -288 D 0.768 -289 G 0.774 -290 H 0.779 -291 E 0.784 -292 A 0.786 -293 Q 0.780 -294 L 0.768 -295 E 0.752 -296 P 0.732 -297 S 0.715 -298 P 0.714 -299 P 0.736 -300 P 0.770 -301 H 0.797 -302 L 0.813 -303 G 0.820 -304 A 0.818 -305 H 0.798 -306 G 0.748 -307 H 0.677 -308 A 0.638 -309 H 0.670 -310 G 0.734 -311 H 0.777 -312 A 0.790 -313 H 0.789 -314 A 0.785 -315 G 0.773 -316 G 0.741 -317 L 0.682 -318 H 0.615 -319 A 0.585 -320 A 0.615 -321 A 0.670 -322 A 0.701 -323 H 0.705 -324 L 0.706 -325 H 0.721 -326 P 0.752 -327 G 0.784 -328 A 0.808 -329 G 0.820 -330 G 0.825 -331 G 0.826 -332 G 0.826 -333 S 0.826 -334 S 0.823 -335 V 0.817 -336 G 0.811 -337 E 0.801 -338 H 0.785 -339 S 0.759 -340 D 0.722 -341 E 0.677 -342 D 0.623 -343 A 0.549 -344 P 0.450 -345 S 0.338 -346 S 0.239 -347 D 0.169 -348 D 0.123 -349 L 0.095 -350 E 0.076 -351 Q 0.061 -352 F 0.050 -353 A 0.042 -354 K 0.039 -355 Q 0.039 -356 F 0.041 -357 K 0.046 -358 Q 0.053 -359 R 0.060 -360 R 0.066 -361 I 0.071 -362 K 0.078 -363 L 0.086 -364 G 0.090 -365 F 0.083 -366 T 0.069 -367 Q 0.058 -368 A 0.055 -369 D 0.060 -370 V 0.067 -371 G 0.070 -372 L 0.069 -373 A 0.066 -374 L 0.066 -375 G 0.073 -376 T 0.083 -377 L 0.099 -378 Y 0.123 -379 G 0.146 -380 N 0.154 -381 V 0.140 -382 F 0.116 -383 S 0.092 -384 Q 0.072 -385 T 0.061 -386 T 0.061 -387 I 0.068 -388 C 0.079 -389 R 0.093 -390 F 0.111 -391 E 0.123 -392 A 0.124 -393 L 0.121 -394 Q 0.120 -395 L 0.119 -396 S 0.109 -397 F 0.093 -398 K 0.079 -399 N 0.069 -400 M 0.064 -401 C 0.064 -402 K 0.066 -403 L 0.065 -404 K 0.058 -405 P 0.050 -406 L 0.045 -407 L 0.041 -408 N 0.036 -409 K 0.032 -410 W 0.031 -411 L 0.034 -412 E 0.042 -413 E 0.061 -414 T 0.094 -415 D 0.140 -416 S 0.192 -417 S 0.244 -418 S 0.292 -419 G 0.325 -420 S 0.330 -421 P 0.303 -422 T 0.263 -423 N 0.226 -424 L 0.200 -425 D 0.186 -426 K 0.181 -427 I 0.190 -428 A 0.223 -429 A 0.277 -430 Q 0.332 -431 G 0.371 -432 R 0.391 -433 K 0.396 -434 R 0.393 -435 K 0.381 -436 K 0.356 -437 R 0.322 -438 T 0.290 -439 S 0.262 -440 I 0.231 -441 E 0.193 -442 V 0.151 -443 G 0.113 -444 V 0.089 -445 K 0.079 -446 G 0.076 -447 A 0.077 -448 L 0.081 -449 E 0.088 -450 S 0.092 -451 H 0.089 -452 F 0.082 -453 L 0.078 -454 K 0.077 -455 C 0.077 -456 P 0.078 -457 K 0.081 -458 P 0.084 -459 S 0.085 -460 A 0.085 -461 H 0.082 -462 E 0.074 -463 I 0.066 -464 T 0.071 -465 G 0.086 -466 L 0.102 -467 A 0.104 -468 D 0.093 -469 S 0.080 -470 L 0.074 -471 Q 0.075 -472 L 0.074 -473 E 0.068 -474 K 0.063 -475 E 0.062 -476 V 0.063 -477 V 0.059 -478 R 0.051 -479 V 0.041 -480 W 0.033 -481 F 0.029 -482 C 0.028 -483 N 0.031 -484 R 0.038 -485 R 0.049 -486 Q 0.062 -487 K 0.083 -488 E 0.122 -489 K 0.189 -490 R 0.283 -491 M 0.394 -492 T 0.511 -493 P 0.615 -494 A 0.687 -495 A 0.723 -496 G 0.729 -497 A 0.713 -498 G 0.684 -499 H 0.658 -500 P 0.648 -501 P 0.654 -502 M 0.663 -503 D 0.663 -504 D 0.647 -505 V 0.621 -506 Y 0.608 -507 A 0.630 -508 P 0.675 -509 G 0.715 -510 E 0.735 -511 L 0.741 -512 G 0.747 -513 P 0.761 -514 G 0.782 -515 G 0.796 -516 G 0.793 -517 S 0.771 -518 A 0.736 -519 S 0.703 -520 P 0.686 -521 P 0.681 -522 S 0.670 -523 A 0.642 -524 P 0.608 -525 P 0.585 -526 P 0.587 -527 P 0.617 -528 P 0.667 -529 P 0.718 -530 A 0.751 -531 A 0.748 -532 L 0.704 -533 H 0.639 -534 H 0.602 -535 H 0.624 -536 H 0.670 -537 H 0.698 -538 H 0.704 -539 T 0.705 -540 L 0.707 -541 P 0.712 -542 G 0.715 -543 S 0.699 -544 V 0.661 -545 Q 0.627 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000090266.11_ENSMUST00000106370.10_GN:Mettl23_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000090266.11_ENSMUST00000106370.10_GN:Mettl23_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 226143e1887c814c74f827ad3d1c9ebb09d9a5f8..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000090266.11_ENSMUST00000106370.10_GN:Mettl23_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,254 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000090266.11|ENSMUST00000106370.10|GN:Mettl23|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.430 -2 D 0.429 -3 S 0.429 -4 V 0.428 -5 R 0.419 -6 P 0.405 -7 R 0.392 -8 A 0.371 -9 P 0.336 -10 W 0.301 -11 A 0.287 -12 P 0.298 -13 P 0.323 -14 P 0.349 -15 D 0.361 -16 P 0.367 -17 A 0.399 -18 S 0.464 -19 L 0.527 -20 D 0.558 -21 S 0.563 -22 P 0.559 -23 T 0.552 -24 C 0.540 -25 E 0.528 -26 P 0.512 -27 G 0.478 -28 L 0.422 -29 M 0.353 -30 A 0.279 -31 G 0.207 -32 T 0.143 -33 Q 0.093 -34 L 0.058 -35 F 0.039 -36 R 0.037 -37 F 0.051 -38 R 0.078 -39 E 0.117 -40 E 0.159 -41 P 0.199 -42 V 0.232 -43 P 0.261 -44 G 0.285 -45 G 0.289 -46 N 0.266 -47 R 0.220 -48 A 0.169 -49 V 0.127 -50 L 0.100 -51 E 0.087 -52 V 0.084 -53 R 0.085 -54 V 0.091 -55 P 0.100 -56 Q 0.114 -57 V 0.132 -58 L 0.146 -59 H 0.150 -60 V 0.146 -61 Q 0.143 -62 Y 0.146 -63 G 0.150 -64 M 0.150 -65 Y 0.141 -66 V 0.120 -67 W 0.094 -68 P 0.072 -69 C 0.061 -70 A 0.056 -71 V 0.053 -72 V 0.050 -73 L 0.046 -74 A 0.041 -75 Q 0.036 -76 Y 0.031 -77 L 0.030 -78 W 0.029 -79 F 0.026 -80 H 0.024 -81 R 0.027 -82 R 0.033 -83 S 0.046 -84 L 0.065 -85 P 0.081 -86 G 0.084 -87 K 0.075 -88 A 0.062 -89 V 0.049 -90 L 0.040 -91 E 0.036 -92 V 0.034 -93 G 0.032 -94 A 0.032 -95 G 0.033 -96 V 0.038 -97 S 0.044 -98 L 0.048 -99 P 0.046 -100 G 0.044 -101 I 0.045 -102 L 0.046 -103 A 0.047 -104 A 0.050 -105 K 0.064 -106 C 0.086 -107 G 0.105 -108 A 0.107 -109 K 0.092 -110 V 0.071 -111 I 0.053 -112 L 0.041 -113 S 0.038 -114 D 0.043 -115 S 0.053 -116 S 0.064 -117 E 0.072 -118 F 0.072 -119 P 0.063 -120 H 0.054 -121 C 0.055 -122 L 0.064 -123 D 0.068 -124 I 0.061 -125 C 0.050 -126 R 0.042 -127 Q 0.043 -128 S 0.051 -129 C 0.066 -130 Q 0.078 -131 M 0.078 -132 N 0.068 -133 N 0.057 -134 L 0.052 -135 P 0.052 -136 Q 0.055 -137 V 0.058 -138 E 0.062 -139 V 0.067 -140 V 0.071 -141 G 0.073 -142 L 0.072 -143 T 0.070 -144 W 0.072 -145 G 0.076 -146 H 0.075 -147 I 0.066 -148 S 0.055 -149 K 0.049 -150 D 0.050 -151 I 0.055 -152 L 0.062 -153 S 0.073 -154 L 0.085 -155 P 0.090 -156 P 0.085 -157 Q 0.073 -158 D 0.063 -159 I 0.053 -160 I 0.044 -161 L 0.037 -162 G 0.036 -163 S 0.042 -164 D 0.058 -165 V 0.079 -166 F 0.094 -167 F 0.097 -168 E 0.095 -169 P 0.092 -170 E 0.087 -171 D 0.079 -172 F 0.068 -173 E 0.059 -174 S 0.051 -175 I 0.045 -176 L 0.040 -177 A 0.037 -178 T 0.034 -179 V 0.032 -180 Y 0.031 -181 F 0.031 -182 L 0.033 -183 M 0.037 -184 Q 0.041 -185 K 0.047 -186 N 0.053 -187 P 0.055 -188 K 0.055 -189 V 0.049 -190 Q 0.041 -191 F 0.033 -192 W 0.029 -193 S 0.033 -194 T 0.043 -195 Y 0.054 -196 Q 0.063 -197 V 0.070 -198 R 0.080 -199 S 0.093 -200 A 0.107 -201 D 0.113 -202 W 0.108 -203 S 0.094 -204 L 0.079 -205 E 0.070 -206 G 0.066 -207 L 0.063 -208 L 0.058 -209 Y 0.052 -210 K 0.048 -211 W 0.045 -212 D 0.045 -213 M 0.044 -214 K 0.044 -215 C 0.046 -216 V 0.054 -217 H 0.065 -218 I 0.074 -219 P 0.076 -220 L 0.075 -221 E 0.072 -222 S 0.073 -223 F 0.082 -224 D 0.102 -225 A 0.126 -226 D 0.141 -227 K 0.144 -228 E 0.141 -229 D 0.144 -230 I 0.159 -231 A 0.180 -232 E 0.200 -233 S 0.219 -234 T 0.242 -235 L 0.261 -236 P 0.262 -237 G 0.238 -238 R 0.196 -239 H 0.147 -240 T 0.101 -241 V 0.068 -242 E 0.050 -243 M 0.042 -244 L 0.039 -245 I 0.041 -246 I 0.049 -247 S 0.071 -248 F 0.115 -249 A 0.176 -250 K 0.237 -251 D 0.281 -252 S 0.304 -253 F 0.312 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000090266.11_ENSMUST00000106370.10_GN:Mettl23_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:66.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000090266.11_ENSMUST00000106370.10_GN:Mettl23_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:66.caid deleted file mode 100644 index 98c9b68b82206490c94001753b4f41e09a949fe7..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000090266.11_ENSMUST00000106370.10_GN:Mettl23_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:66.caid +++ /dev/null @@ -1,320 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000090266.11|ENSMUST00000106370.10|GN:Mettl23|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:66 -1 M 0.373 -2 R 0.384 -3 S 0.428 -4 A 0.503 -5 I 0.569 -6 G 0.596 -7 L 0.596 -8 S 0.584 -9 D 0.558 -10 L 0.518 -11 P 0.484 -12 D 0.473 -13 P 0.479 -14 P 0.487 -15 S 0.477 -16 C 0.457 -17 T 0.461 -18 P 0.498 -19 I 0.531 -20 G 0.528 -21 R 0.520 -22 H 0.541 -23 V 0.564 -24 G 0.556 -25 K 0.540 -26 V 0.547 -27 A 0.561 -28 S 0.561 -29 P 0.557 -30 T 0.560 -31 P 0.571 -32 C 0.585 -33 P 0.595 -34 S 0.592 -35 L 0.576 -36 L 0.551 -37 W 0.527 -38 P 0.511 -39 T 0.501 -40 Q 0.488 -41 H 0.477 -42 F 0.488 -43 R 0.527 -44 L 0.585 -45 R 0.642 -46 V 0.682 -47 A 0.696 -48 S 0.687 -49 L 0.664 -50 R 0.646 -51 S 0.649 -52 P 0.672 -53 S 0.704 -54 G 0.731 -55 R 0.745 -56 A 0.747 -57 R 0.743 -58 C 0.729 -59 G 0.702 -60 L 0.664 -61 R 0.631 -62 L 0.616 -63 P 0.615 -64 V 0.620 -65 F 0.627 -66 A 0.629 -67 M 0.620 -68 D 0.598 -69 S 0.563 -70 V 0.523 -71 R 0.484 -72 P 0.455 -73 R 0.441 -74 A 0.425 -75 P 0.392 -76 W 0.358 -77 A 0.350 -78 P 0.372 -79 P 0.419 -80 P 0.476 -81 D 0.522 -82 P 0.551 -83 A 0.581 -84 S 0.614 -85 L 0.638 -86 D 0.647 -87 S 0.646 -88 P 0.642 -89 T 0.631 -90 C 0.613 -91 E 0.588 -92 P 0.554 -93 G 0.503 -94 L 0.432 -95 M 0.351 -96 A 0.270 -97 G 0.195 -98 T 0.133 -99 Q 0.086 -100 L 0.054 -101 F 0.036 -102 R 0.033 -103 F 0.045 -104 R 0.071 -105 E 0.106 -106 E 0.145 -107 P 0.179 -108 V 0.206 -109 P 0.230 -110 G 0.253 -111 G 0.263 -112 N 0.246 -113 R 0.205 -114 A 0.157 -115 V 0.117 -116 L 0.091 -117 E 0.078 -118 V 0.072 -119 R 0.071 -120 V 0.073 -121 P 0.077 -122 Q 0.084 -123 V 0.097 -124 L 0.111 -125 H 0.119 -126 V 0.122 -127 Q 0.125 -128 Y 0.131 -129 G 0.138 -130 M 0.139 -131 Y 0.130 -132 V 0.110 -133 W 0.085 -134 P 0.066 -135 C 0.056 -136 A 0.052 -137 V 0.048 -138 V 0.044 -139 L 0.040 -140 A 0.035 -141 Q 0.031 -142 Y 0.027 -143 L 0.026 -144 W 0.026 -145 F 0.024 -146 H 0.023 -147 R 0.025 -148 R 0.033 -149 S 0.046 -150 L 0.064 -151 P 0.079 -152 G 0.081 -153 K 0.072 -154 A 0.060 -155 V 0.049 -156 L 0.039 -157 E 0.034 -158 V 0.032 -159 G 0.031 -160 A 0.031 -161 G 0.033 -162 V 0.039 -163 S 0.046 -164 L 0.050 -165 P 0.047 -166 G 0.044 -167 I 0.045 -168 L 0.046 -169 A 0.046 -170 A 0.051 -171 K 0.066 -172 C 0.090 -173 G 0.112 -174 A 0.113 -175 K 0.096 -176 V 0.073 -177 I 0.054 -178 L 0.041 -179 S 0.037 -180 D 0.041 -181 S 0.051 -182 S 0.063 -183 E 0.072 -184 F 0.073 -185 P 0.064 -186 H 0.054 -187 C 0.053 -188 L 0.060 -189 D 0.065 -190 I 0.059 -191 C 0.049 -192 R 0.042 -193 Q 0.043 -194 S 0.052 -195 C 0.066 -196 Q 0.076 -197 M 0.074 -198 N 0.063 -199 N 0.051 -200 L 0.045 -201 P 0.045 -202 Q 0.047 -203 V 0.049 -204 E 0.052 -205 V 0.057 -206 V 0.062 -207 G 0.065 -208 L 0.064 -209 T 0.063 -210 W 0.065 -211 G 0.069 -212 H 0.066 -213 I 0.056 -214 S 0.045 -215 K 0.040 -216 D 0.040 -217 I 0.044 -218 L 0.051 -219 S 0.062 -220 L 0.073 -221 P 0.079 -222 P 0.074 -223 Q 0.064 -224 D 0.055 -225 I 0.048 -226 I 0.041 -227 L 0.036 -228 G 0.035 -229 S 0.040 -230 D 0.054 -231 V 0.072 -232 F 0.084 -233 F 0.086 -234 E 0.084 -235 P 0.082 -236 E 0.078 -237 D 0.071 -238 F 0.062 -239 E 0.053 -240 S 0.046 -241 I 0.040 -242 L 0.037 -243 A 0.034 -244 T 0.032 -245 V 0.030 -246 Y 0.029 -247 F 0.029 -248 L 0.030 -249 M 0.033 -250 Q 0.037 -251 K 0.042 -252 N 0.046 -253 P 0.049 -254 K 0.049 -255 V 0.045 -256 Q 0.038 -257 F 0.031 -258 W 0.028 -259 S 0.032 -260 T 0.040 -261 Y 0.050 -262 Q 0.058 -263 V 0.064 -264 R 0.072 -265 S 0.085 -266 A 0.099 -267 D 0.106 -268 W 0.101 -269 S 0.089 -270 L 0.076 -271 E 0.068 -272 G 0.064 -273 L 0.062 -274 L 0.058 -275 Y 0.053 -276 K 0.049 -277 W 0.047 -278 D 0.046 -279 M 0.045 -280 K 0.045 -281 C 0.048 -282 V 0.055 -283 H 0.066 -284 I 0.074 -285 P 0.076 -286 L 0.075 -287 E 0.073 -288 S 0.074 -289 F 0.083 -290 D 0.104 -291 A 0.128 -292 D 0.144 -293 K 0.147 -294 E 0.143 -295 D 0.145 -296 I 0.159 -297 A 0.181 -298 E 0.202 -299 S 0.223 -300 T 0.249 -301 L 0.271 -302 P 0.275 -303 G 0.253 -304 R 0.209 -305 H 0.157 -306 T 0.108 -307 V 0.072 -308 E 0.052 -309 M 0.044 -310 L 0.042 -311 I 0.045 -312 I 0.054 -313 S 0.078 -314 F 0.123 -315 A 0.186 -316 K 0.247 -317 D 0.290 -318 S 0.312 -319 F 0.319 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000096630.3_ENSMUST00000032238.5_GN:Vmn2r26_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000096630.3_ENSMUST00000032238.5_GN:Vmn2r26_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index 0224103955b9482567aff3116ce30e0d0036080d..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000096630.3_ENSMUST00000032238.5_GN:Vmn2r26_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,856 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000096630.3|ENSMUST00000032238.5|GN:Vmn2r26|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.206 -2 K 0.195 -3 L 0.184 -4 L 0.181 -5 T 0.188 -6 A 0.200 -7 F 0.210 -8 S 0.205 -9 P 0.187 -10 L 0.165 -11 V 0.151 -12 V 0.146 -13 L 0.149 -14 I 0.157 -15 L 0.168 -16 F 0.183 -17 Q 0.203 -18 E 0.223 -19 Q 0.232 -20 I 0.225 -21 S 0.211 -22 C 0.198 -23 Y 0.187 -24 Y 0.176 -25 L 0.171 -26 T 0.176 -27 K 0.188 -28 Y 0.197 -29 A 0.193 -30 S 0.172 -31 S 0.141 -32 G 0.112 -33 Y 0.094 -34 Y 0.090 -35 Q 0.096 -36 D 0.104 -37 A 0.103 -38 D 0.090 -39 F 0.075 -40 V 0.064 -41 I 0.059 -42 G 0.057 -43 G 0.061 -44 L 0.068 -45 F 0.081 -46 S 0.106 -47 L 0.144 -48 R 0.195 -49 V 0.268 -50 T 0.375 -51 D 0.505 -52 G 0.620 -53 D 0.688 -54 T 0.706 -55 F 0.696 -56 I 0.682 -57 S 0.679 -58 R 0.687 -59 S 0.695 -60 G 0.692 -61 V 0.671 -62 E 0.640 -63 D 0.610 -64 T 0.585 -65 S 0.565 -66 H 0.547 -67 I 0.513 -68 A 0.447 -69 E 0.360 -70 Y 0.282 -71 V 0.229 -72 F 0.193 -73 A 0.161 -74 D 0.131 -75 L 0.105 -76 I 0.086 -77 K 0.074 -78 Y 0.070 -79 Y 0.072 -80 Q 0.075 -81 H 0.075 -82 I 0.073 -83 L 0.071 -84 A 0.071 -85 M 0.070 -86 V 0.063 -87 F 0.054 -88 A 0.049 -89 I 0.048 -90 E 0.050 -91 K 0.056 -92 I 0.064 -93 N 0.071 -94 K 0.076 -95 D 0.083 -96 P 0.087 -97 N 0.086 -98 I 0.080 -99 L 0.077 -100 F 0.085 -101 N 0.099 -102 K 0.111 -103 S 0.112 -104 L 0.106 -105 G 0.098 -106 F 0.090 -107 F 0.083 -108 L 0.079 -109 F 0.081 -110 N 0.087 -111 V 0.095 -112 N 0.102 -113 F 0.105 -114 I 0.101 -115 E 0.089 -116 M 0.073 -117 K 0.059 -118 A 0.055 -119 A 0.060 -120 E 0.071 -121 G 0.083 -122 S 0.100 -123 M 0.121 -124 A 0.139 -125 L 0.158 -126 L 0.183 -127 S 0.209 -128 G 0.221 -129 E 0.217 -130 S 0.211 -131 P 0.223 -132 P 0.256 -133 I 0.288 -134 P 0.304 -135 N 0.302 -136 Y 0.282 -137 S 0.255 -138 C 0.240 -139 R 0.238 -140 P 0.236 -141 E 0.224 -142 K 0.204 -143 T 0.178 -144 D 0.148 -145 K 0.121 -146 L 0.099 -147 V 0.081 -148 A 0.068 -149 V 0.057 -150 I 0.051 -151 G 0.055 -152 G 0.071 -153 I 0.092 -154 S 0.106 -155 T 0.107 -156 S 0.099 -157 I 0.087 -158 S 0.075 -159 I 0.066 -160 Q 0.065 -161 I 0.067 -162 S 0.067 -163 R 0.063 -164 V 0.059 -165 L 0.057 -166 S 0.056 -167 L 0.057 -168 Y 0.060 -169 N 0.066 -170 V 0.072 -171 P 0.077 -172 Q 0.077 -173 I 0.076 -174 S 0.079 -175 Y 0.092 -176 A 0.114 -177 P 0.130 -178 F 0.132 -179 D 0.131 -180 Q 0.144 -181 I 0.176 -182 L 0.219 -183 G 0.258 -184 T 0.283 -185 R 0.295 -186 V 0.300 -187 Q 0.299 -188 L 0.292 -189 Q 0.284 -190 S 0.273 -191 P 0.247 -192 Y 0.208 -193 Q 0.174 -194 F 0.159 -195 S 0.159 -196 M 0.160 -197 H 0.147 -198 T 0.119 -199 A 0.090 -200 A 0.069 -201 L 0.058 -202 Y 0.052 -203 Q 0.047 -204 G 0.044 -205 I 0.041 -206 V 0.038 -207 Q 0.034 -208 L 0.032 -209 L 0.033 -210 L 0.036 -211 Y 0.039 -212 F 0.041 -213 T 0.038 -214 W 0.033 -215 I 0.030 -216 W 0.030 -217 V 0.031 -218 G 0.034 -219 L 0.040 -220 V 0.050 -221 V 0.059 -222 P 0.063 -223 D 0.060 -224 D 0.053 -225 M 0.044 -226 R 0.037 -227 G 0.032 -228 E 0.032 -229 L 0.036 -230 Y 0.045 -231 L 0.056 -232 R 0.062 -233 D 0.059 -234 I 0.055 -235 T 0.058 -236 K 0.060 -237 E 0.055 -238 M 0.050 -239 I 0.056 -240 S 0.065 -241 H 0.066 -242 G 0.057 -243 I 0.046 -244 C 0.037 -245 F 0.031 -246 A 0.030 -247 F 0.031 -248 A 0.034 -249 E 0.039 -250 K 0.045 -251 V 0.053 -252 T 0.067 -253 E 0.087 -254 Y 0.110 -255 S 0.126 -256 S 0.125 -257 M 0.110 -258 D 0.089 -259 T 0.072 -260 V 0.056 -261 N 0.041 -262 W 0.029 -263 K 0.024 -264 H 0.027 -265 F 0.036 -266 M 0.049 -267 E 0.058 -268 R 0.057 -269 L 0.049 -270 T 0.043 -271 L 0.039 -272 T 0.039 -273 P 0.040 -274 V 0.038 -275 I 0.035 -276 I 0.031 -277 T 0.031 -278 V 0.035 -279 G 0.041 -280 D 0.044 -281 T 0.041 -282 H 0.035 -283 S 0.030 -284 L 0.028 -285 L 0.025 -286 R 0.023 -287 I 0.022 -288 V 0.022 -289 Y 0.020 -290 F 0.018 -291 V 0.018 -292 I 0.020 -293 F 0.023 -294 Y 0.027 -295 N 0.034 -296 L 0.045 -297 S 0.056 -298 G 0.060 -299 N 0.055 -300 V 0.044 -301 W 0.036 -302 I 0.032 -303 T 0.033 -304 T 0.039 -305 S 0.050 -306 D 0.060 -307 W 0.065 -308 Y 0.065 -309 I 0.066 -310 T 0.076 -311 T 0.095 -312 L 0.115 -313 P 0.130 -314 F 0.137 -315 E 0.136 -316 Q 0.125 -317 N 0.108 -318 L 0.089 -319 I 0.075 -320 Y 0.067 -321 T 0.064 -322 H 0.068 -323 F 0.079 -324 G 0.091 -325 G 0.095 -326 G 0.090 -327 L 0.084 -328 S 0.083 -329 F 0.088 -330 S 0.098 -331 F 0.113 -332 H 0.130 -333 M 0.148 -334 D 0.159 -335 E 0.157 -336 I 0.142 -337 L 0.119 -338 G 0.099 -339 F 0.088 -340 K 0.086 -341 D 0.087 -342 F 0.083 -343 L 0.078 -344 R 0.075 -345 S 0.073 -346 V 0.072 -347 Q 0.069 -348 P 0.066 -349 R 0.064 -350 K 0.067 -351 Y 0.074 -352 P 0.078 -353 H 0.074 -354 D 0.062 -355 I 0.047 -356 F 0.036 -357 I 0.030 -358 R 0.030 -359 H 0.034 -360 V 0.042 -361 W 0.050 -362 S 0.058 -363 S 0.068 -364 L 0.085 -365 F 0.119 -366 G 0.177 -367 C 0.248 -368 P 0.305 -369 H 0.329 -370 Y 0.327 -371 Y 0.316 -372 Q 0.301 -373 H 0.281 -374 R 0.261 -375 L 0.250 -376 W 0.248 -377 D 0.245 -378 L 0.238 -379 S 0.228 -380 Q 0.218 -381 C 0.201 -382 E 0.181 -383 P 0.170 -384 N 0.177 -385 G 0.192 -386 S 0.204 -387 L 0.209 -388 S 0.210 -389 T 0.209 -390 R 0.204 -391 P 0.194 -392 L 0.183 -393 H 0.170 -394 A 0.157 -395 W 0.147 -396 D 0.142 -397 M 0.142 -398 N 0.139 -399 T 0.128 -400 S 0.113 -401 P 0.101 -402 Y 0.099 -403 S 0.105 -404 Y 0.120 -405 K 0.140 -406 V 0.155 -407 Y 0.162 -408 A 0.161 -409 A 0.152 -410 V 0.136 -411 Y 0.121 -412 A 0.110 -413 I 0.096 -414 A 0.077 -415 Q 0.061 -416 A 0.053 -417 L 0.050 -418 H 0.050 -419 E 0.055 -420 E 0.069 -421 L 0.094 -422 S 0.131 -423 L 0.180 -424 R 0.238 -425 V 0.296 -426 E 0.346 -427 G 0.381 -428 D 0.395 -429 S 0.387 -430 S 0.361 -431 N 0.324 -432 K 0.287 -433 C 0.258 -434 L 0.237 -435 L 0.213 -436 Q 0.179 -437 A 0.144 -438 P 0.112 -439 L 0.087 -440 P 0.070 -441 W 0.063 -442 K 0.063 -443 L 0.066 -444 H 0.066 -445 P 0.067 -446 F 0.077 -447 L 0.100 -448 Q 0.131 -449 K 0.172 -450 G 0.221 -451 Q 0.272 -452 L 0.325 -453 G 0.383 -454 R 0.441 -455 S 0.483 -456 T 0.499 -457 N 0.492 -458 E 0.476 -459 E 0.459 -460 N 0.445 -461 T 0.434 -462 V 0.425 -463 N 0.409 -464 K 0.379 -465 E 0.337 -466 V 0.284 -467 S 0.224 -468 A 0.163 -469 I 0.112 -470 K 0.075 -471 L 0.056 -472 D 0.050 -473 I 0.050 -474 F 0.057 -475 N 0.072 -476 Y 0.095 -477 Q 0.124 -478 S 0.158 -479 L 0.188 -480 Q 0.206 -481 S 0.206 -482 G 0.191 -483 T 0.169 -484 E 0.148 -485 A 0.129 -486 H 0.114 -487 V 0.105 -488 K 0.101 -489 V 0.098 -490 G 0.091 -491 E 0.080 -492 F 0.071 -493 V 0.071 -494 F 0.088 -495 D 0.114 -496 S 0.133 -497 H 0.139 -498 S 0.134 -499 V 0.125 -500 Q 0.114 -501 H 0.105 -502 L 0.102 -503 S 0.104 -504 L 0.107 -505 N 0.107 -506 D 0.104 -507 K 0.104 -508 I 0.103 -509 I 0.099 -510 T 0.097 -511 W 0.101 -512 G 0.107 -513 K 0.106 -514 H 0.099 -515 R 0.095 -516 S 0.105 -517 Q 0.128 -518 T 0.153 -519 P 0.171 -520 L 0.183 -521 S 0.200 -522 V 0.223 -523 C 0.245 -524 S 0.256 -525 Q 0.250 -526 S 0.227 -527 C 0.199 -528 P 0.178 -529 F 0.159 -530 G 0.143 -531 F 0.139 -532 S 0.152 -533 K 0.172 -534 T 0.187 -535 A 0.199 -536 V 0.212 -537 E 0.220 -538 G 0.217 -539 K 0.208 -540 P 0.199 -541 F 0.190 -542 C 0.185 -543 C 0.185 -544 F 0.190 -545 D 0.195 -546 C 0.194 -547 V 0.186 -548 P 0.179 -549 C 0.182 -550 P 0.195 -551 D 0.201 -552 G 0.194 -553 E 0.191 -554 I 0.205 -555 A 0.232 -556 N 0.262 -557 K 0.287 -558 T 0.293 -559 D 0.276 -560 M 0.251 -561 D 0.238 -562 Q 0.232 -563 C 0.220 -564 I 0.199 -565 K 0.178 -566 C 0.164 -567 P 0.156 -568 E 0.147 -569 D 0.135 -570 Q 0.124 -571 Y 0.118 -572 P 0.120 -573 N 0.130 -574 K 0.141 -575 Q 0.144 -576 R 0.148 -577 N 0.166 -578 Q 0.199 -579 C 0.230 -580 L 0.249 -581 P 0.250 -582 K 0.237 -583 I 0.216 -584 M 0.194 -585 V 0.178 -586 F 0.169 -587 L 0.168 -588 A 0.171 -589 H 0.166 -590 E 0.149 -591 D 0.125 -592 P 0.104 -593 L 0.092 -594 G 0.086 -595 T 0.086 -596 V 0.092 -597 L 0.103 -598 V 0.113 -599 S 0.118 -600 L 0.122 -601 A 0.127 -602 I 0.130 -603 S 0.127 -604 L 0.123 -605 S 0.122 -606 A 0.119 -607 F 0.114 -608 S 0.110 -609 A 0.111 -610 M 0.114 -611 I 0.112 -612 L 0.102 -613 G 0.089 -614 L 0.077 -615 F 0.066 -616 I 0.057 -617 C 0.052 -618 Y 0.050 -619 R 0.053 -620 E 0.064 -621 T 0.081 -622 P 0.102 -623 I 0.111 -624 V 0.100 -625 R 0.080 -626 A 0.067 -627 N 0.061 -628 N 0.054 -629 R 0.049 -630 N 0.048 -631 L 0.053 -632 S 0.058 -633 Y 0.063 -634 L 0.066 -635 L 0.070 -636 L 0.076 -637 I 0.080 -638 S 0.082 -639 L 0.084 -640 K 0.085 -641 L 0.085 -642 C 0.092 -643 F 0.108 -644 S 0.129 -645 C 0.143 -646 S 0.147 -647 L 0.141 -648 M 0.125 -649 F 0.109 -650 I 0.108 -651 G 0.122 -652 Q 0.136 -653 P 0.133 -654 R 0.114 -655 T 0.090 -656 V 0.070 -657 T 0.059 -658 C 0.053 -659 V 0.048 -660 L 0.044 -661 R 0.042 -662 Q 0.043 -663 I 0.047 -664 I 0.053 -665 F 0.061 -666 G 0.070 -667 I 0.074 -668 V 0.071 -669 F 0.064 -670 S 0.059 -671 I 0.056 -672 V 0.054 -673 I 0.054 -674 S 0.054 -675 A 0.057 -676 I 0.062 -677 L 0.066 -678 A 0.067 -679 K 0.067 -680 T 0.065 -681 F 0.065 -682 I 0.065 -683 V 0.065 -684 V 0.063 -685 M 0.066 -686 A 0.078 -687 F 0.101 -688 K 0.135 -689 A 0.176 -690 I 0.223 -691 K 0.272 -692 P 0.313 -693 G 0.336 -694 S 0.337 -695 I 0.325 -696 L 0.307 -697 K 0.290 -698 M 0.275 -699 G 0.255 -700 M 0.221 -701 V 0.179 -702 T 0.138 -703 R 0.105 -704 L 0.086 -705 S 0.082 -706 N 0.087 -707 A 0.091 -708 I 0.088 -709 V 0.079 -710 C 0.074 -711 C 0.080 -712 G 0.095 -713 S 0.109 -714 I 0.112 -715 I 0.108 -716 Q 0.104 -717 V 0.103 -718 C 0.102 -719 I 0.098 -720 C 0.092 -721 A 0.085 -722 V 0.080 -723 W 0.081 -724 L 0.087 -725 G 0.096 -726 T 0.109 -727 Y 0.124 -728 P 0.144 -729 P 0.167 -730 F 0.191 -731 P 0.213 -732 D 0.225 -733 V 0.221 -734 D 0.207 -735 M 0.195 -736 H 0.196 -737 S 0.210 -738 E 0.229 -739 F 0.241 -740 G 0.246 -741 Q 0.244 -742 I 0.236 -743 I 0.223 -744 L 0.206 -745 W 0.192 -746 C 0.189 -747 N 0.200 -748 E 0.214 -749 G 0.210 -750 S 0.176 -751 T 0.131 -752 L 0.100 -753 A 0.089 -754 F 0.089 -755 Y 0.097 -756 C 0.113 -757 V 0.126 -758 L 0.128 -759 G 0.130 -760 Y 0.138 -761 L 0.144 -762 G 0.138 -763 F 0.129 -764 L 0.125 -765 A 0.127 -766 S 0.129 -767 L 0.130 -768 S 0.128 -769 L 0.124 -770 L 0.120 -771 I 0.114 -772 A 0.106 -773 F 0.105 -774 L 0.118 -775 A 0.138 -776 R 0.153 -777 R 0.165 -778 L 0.179 -779 P 0.190 -780 D 0.188 -781 S 0.178 -782 F 0.168 -783 N 0.157 -784 E 0.143 -785 A 0.130 -786 K 0.120 -787 T 0.116 -788 I 0.111 -789 T 0.104 -790 F 0.099 -791 S 0.099 -792 M 0.101 -793 L 0.102 -794 V 0.100 -795 F 0.093 -796 C 0.085 -797 S 0.078 -798 V 0.077 -799 W 0.080 -800 I 0.078 -801 S 0.073 -802 F 0.071 -803 V 0.078 -804 P 0.088 -805 A 0.099 -806 Y 0.110 -807 L 0.124 -808 S 0.143 -809 S 0.165 -810 K 0.184 -811 G 0.192 -812 K 0.185 -813 T 0.171 -814 M 0.159 -815 V 0.154 -816 A 0.154 -817 V 0.152 -818 E 0.146 -819 I 0.141 -820 L 0.141 -821 S 0.143 -822 I 0.139 -823 L 0.131 -824 A 0.126 -825 S 0.125 -826 S 0.123 -827 A 0.120 -828 G 0.118 -829 L 0.112 -830 L 0.100 -831 G 0.087 -832 C 0.077 -833 I 0.068 -834 F 0.063 -835 L 0.068 -836 P 0.075 -837 K 0.078 -838 C 0.076 -839 Y 0.080 -840 V 0.094 -841 I 0.117 -842 L 0.155 -843 L 0.215 -844 K 0.291 -845 S 0.365 -846 G 0.419 -847 G 0.446 -848 H 0.446 -849 S 0.432 -850 R 0.418 -851 K 0.408 -852 K 0.395 -853 F 0.378 -854 F 0.365 -855 K 0.359 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000096630.3_ENSMUST00000032238.5_GN:Vmn2r26_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000096630.3_ENSMUST00000032238.5_GN:Vmn2r26_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid deleted file mode 100644 index ee25ea05fccdd266aba51a15db07abd0c35e0090..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000096630.3_ENSMUST00000032238.5_GN:Vmn2r26_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:33.caid +++ /dev/null @@ -1,889 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000096630.3|ENSMUST00000032238.5|GN:Vmn2r26|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:33 -1 M 0.100 -2 F 0.097 -3 Y 0.099 -4 L 0.109 -5 F 0.122 -6 V 0.138 -7 D 0.161 -8 V 0.187 -9 L 0.207 -10 S 0.221 -11 E 0.239 -12 S 0.268 -13 I 0.303 -14 S 0.337 -15 P 0.362 -16 R 0.370 -17 F 0.357 -18 S 0.338 -19 T 0.337 -20 E 0.364 -21 Q 0.392 -22 I 0.391 -23 S 0.364 -24 G 0.337 -25 S 0.307 -26 Y 0.265 -27 R 0.217 -28 L 0.183 -29 F 0.168 -30 I 0.166 -31 N 0.170 -32 V 0.179 -33 S 0.184 -34 M 0.182 -35 K 0.182 -36 L 0.188 -37 L 0.197 -38 T 0.205 -39 A 0.210 -40 F 0.210 -41 S 0.200 -42 P 0.182 -43 L 0.166 -44 V 0.155 -45 V 0.150 -46 L 0.151 -47 I 0.161 -48 L 0.178 -49 F 0.199 -50 Q 0.221 -51 E 0.241 -52 Q 0.250 -53 I 0.243 -54 S 0.226 -55 C 0.205 -56 Y 0.181 -57 Y 0.161 -58 L 0.151 -59 T 0.158 -60 K 0.176 -61 Y 0.194 -62 A 0.198 -63 S 0.181 -64 S 0.150 -65 G 0.122 -66 Y 0.105 -67 Y 0.100 -68 Q 0.105 -69 D 0.113 -70 A 0.112 -71 D 0.098 -72 F 0.080 -73 V 0.067 -74 I 0.059 -75 G 0.056 -76 G 0.059 -77 L 0.067 -78 F 0.080 -79 S 0.104 -80 L 0.139 -81 R 0.184 -82 V 0.247 -83 T 0.346 -84 D 0.473 -85 G 0.592 -86 D 0.668 -87 T 0.697 -88 F 0.695 -89 I 0.687 -90 S 0.686 -91 R 0.696 -92 S 0.705 -93 G 0.699 -94 V 0.676 -95 E 0.644 -96 D 0.614 -97 T 0.590 -98 S 0.569 -99 H 0.551 -100 I 0.520 -101 A 0.460 -102 E 0.375 -103 Y 0.296 -104 V 0.238 -105 F 0.197 -106 A 0.160 -107 D 0.127 -108 L 0.100 -109 I 0.081 -110 K 0.070 -111 Y 0.067 -112 Y 0.068 -113 Q 0.070 -114 H 0.071 -115 I 0.069 -116 L 0.068 -117 A 0.069 -118 M 0.068 -119 V 0.060 -120 F 0.051 -121 A 0.046 -122 I 0.045 -123 E 0.047 -124 K 0.053 -125 I 0.061 -126 N 0.068 -127 K 0.074 -128 D 0.079 -129 P 0.084 -130 N 0.083 -131 I 0.078 -132 L 0.075 -133 F 0.082 -134 N 0.097 -135 K 0.107 -136 S 0.108 -137 L 0.102 -138 G 0.095 -139 F 0.088 -140 F 0.082 -141 L 0.078 -142 F 0.079 -143 N 0.086 -144 V 0.095 -145 N 0.103 -146 F 0.106 -147 I 0.102 -148 E 0.089 -149 M 0.071 -150 K 0.056 -151 A 0.051 -152 A 0.056 -153 E 0.065 -154 G 0.076 -155 S 0.092 -156 M 0.111 -157 A 0.131 -158 L 0.152 -159 L 0.178 -160 S 0.206 -161 G 0.222 -162 E 0.220 -163 S 0.215 -164 P 0.227 -165 P 0.259 -166 I 0.291 -167 P 0.308 -168 N 0.305 -169 Y 0.284 -170 S 0.257 -171 C 0.244 -172 R 0.245 -173 P 0.245 -174 E 0.231 -175 K 0.208 -176 T 0.178 -177 D 0.146 -178 K 0.118 -179 L 0.096 -180 V 0.078 -181 A 0.065 -182 V 0.054 -183 I 0.048 -184 G 0.051 -185 G 0.066 -186 I 0.086 -187 S 0.101 -188 T 0.103 -189 S 0.095 -190 I 0.083 -191 S 0.070 -192 I 0.061 -193 Q 0.059 -194 I 0.061 -195 S 0.061 -196 R 0.058 -197 V 0.054 -198 L 0.052 -199 S 0.052 -200 L 0.053 -201 Y 0.056 -202 N 0.061 -203 V 0.067 -204 P 0.072 -205 Q 0.073 -206 I 0.073 -207 S 0.075 -208 Y 0.088 -209 A 0.109 -210 P 0.125 -211 F 0.127 -212 D 0.127 -213 Q 0.140 -214 I 0.170 -215 L 0.212 -216 G 0.248 -217 T 0.271 -218 R 0.285 -219 V 0.293 -220 Q 0.294 -221 L 0.288 -222 Q 0.281 -223 S 0.269 -224 P 0.244 -225 Y 0.204 -226 Q 0.169 -227 F 0.152 -228 S 0.152 -229 M 0.153 -230 H 0.140 -231 T 0.115 -232 A 0.087 -233 A 0.068 -234 L 0.057 -235 Y 0.051 -236 Q 0.047 -237 G 0.043 -238 I 0.040 -239 V 0.036 -240 Q 0.033 -241 L 0.031 -242 L 0.032 -243 L 0.034 -244 Y 0.037 -245 F 0.038 -246 T 0.035 -247 W 0.031 -248 I 0.028 -249 W 0.028 -250 V 0.029 -251 G 0.032 -252 L 0.038 -253 V 0.048 -254 V 0.057 -255 P 0.061 -256 D 0.058 -257 D 0.051 -258 M 0.042 -259 R 0.034 -260 G 0.031 -261 E 0.030 -262 L 0.034 -263 Y 0.043 -264 L 0.054 -265 R 0.061 -266 D 0.058 -267 I 0.054 -268 T 0.057 -269 K 0.059 -270 E 0.054 -271 M 0.049 -272 I 0.054 -273 S 0.062 -274 H 0.062 -275 G 0.055 -276 I 0.044 -277 C 0.035 -278 F 0.030 -279 A 0.029 -280 F 0.030 -281 A 0.033 -282 E 0.039 -283 K 0.045 -284 V 0.054 -285 T 0.067 -286 E 0.088 -287 Y 0.112 -288 S 0.129 -289 S 0.129 -290 M 0.113 -291 D 0.091 -292 T 0.073 -293 V 0.058 -294 N 0.042 -295 W 0.029 -296 K 0.024 -297 H 0.027 -298 F 0.036 -299 M 0.049 -300 E 0.057 -301 R 0.056 -302 L 0.049 -303 T 0.042 -304 L 0.039 -305 T 0.039 -306 P 0.040 -307 V 0.039 -308 I 0.034 -309 I 0.030 -310 T 0.030 -311 V 0.034 -312 G 0.040 -313 D 0.042 -314 T 0.040 -315 H 0.034 -316 S 0.029 -317 L 0.026 -318 L 0.024 -319 R 0.022 -320 I 0.021 -321 V 0.021 -322 Y 0.019 -323 F 0.018 -324 V 0.018 -325 I 0.019 -326 F 0.022 -327 Y 0.026 -328 N 0.034 -329 L 0.045 -330 S 0.057 -331 G 0.061 -332 N 0.055 -333 V 0.045 -334 W 0.036 -335 I 0.032 -336 T 0.034 -337 T 0.041 -338 S 0.052 -339 D 0.062 -340 W 0.067 -341 Y 0.067 -342 I 0.069 -343 T 0.079 -344 T 0.099 -345 L 0.120 -346 P 0.135 -347 F 0.142 -348 E 0.138 -349 Q 0.125 -350 N 0.107 -351 L 0.088 -352 I 0.074 -353 Y 0.066 -354 T 0.064 -355 H 0.069 -356 F 0.080 -357 G 0.091 -358 G 0.094 -359 G 0.089 -360 L 0.083 -361 S 0.081 -362 F 0.087 -363 S 0.098 -364 F 0.114 -365 H 0.132 -366 M 0.149 -367 D 0.159 -368 E 0.156 -369 I 0.141 -370 L 0.119 -371 G 0.099 -372 F 0.089 -373 K 0.088 -374 D 0.089 -375 F 0.085 -376 L 0.080 -377 R 0.076 -378 S 0.074 -379 V 0.072 -380 Q 0.069 -381 P 0.066 -382 R 0.065 -383 K 0.068 -384 Y 0.075 -385 P 0.079 -386 H 0.074 -387 D 0.062 -388 I 0.047 -389 F 0.035 -390 I 0.030 -391 R 0.030 -392 H 0.034 -393 V 0.042 -394 W 0.050 -395 S 0.058 -396 S 0.068 -397 L 0.086 -398 F 0.120 -399 G 0.180 -400 C 0.253 -401 P 0.313 -402 H 0.338 -403 Y 0.336 -404 Y 0.323 -405 Q 0.306 -406 H 0.284 -407 R 0.263 -408 L 0.252 -409 W 0.250 -410 D 0.247 -411 L 0.239 -412 S 0.229 -413 Q 0.219 -414 C 0.202 -415 E 0.182 -416 P 0.171 -417 N 0.178 -418 G 0.194 -419 S 0.207 -420 L 0.213 -421 S 0.214 -422 T 0.212 -423 R 0.205 -424 P 0.194 -425 L 0.183 -426 H 0.170 -427 A 0.158 -428 W 0.148 -429 D 0.144 -430 M 0.143 -431 N 0.139 -432 T 0.128 -433 S 0.112 -434 P 0.100 -435 Y 0.098 -436 S 0.105 -437 Y 0.120 -438 K 0.139 -439 V 0.154 -440 Y 0.160 -441 A 0.159 -442 A 0.151 -443 V 0.136 -444 Y 0.121 -445 A 0.110 -446 I 0.095 -447 A 0.076 -448 Q 0.060 -449 A 0.052 -450 L 0.049 -451 H 0.049 -452 E 0.054 -453 E 0.068 -454 L 0.092 -455 S 0.128 -456 L 0.177 -457 R 0.236 -458 V 0.294 -459 E 0.344 -460 G 0.380 -461 D 0.395 -462 S 0.388 -463 S 0.362 -464 N 0.324 -465 K 0.284 -466 C 0.254 -467 L 0.233 -468 L 0.208 -469 Q 0.174 -470 A 0.138 -471 P 0.107 -472 L 0.082 -473 P 0.066 -474 W 0.060 -475 K 0.061 -476 L 0.064 -477 H 0.064 -478 P 0.065 -479 F 0.076 -480 L 0.098 -481 Q 0.130 -482 K 0.170 -483 G 0.219 -484 Q 0.270 -485 L 0.323 -486 G 0.380 -487 R 0.437 -488 S 0.478 -489 T 0.491 -490 N 0.482 -491 E 0.465 -492 E 0.449 -493 N 0.436 -494 T 0.426 -495 V 0.417 -496 N 0.402 -497 K 0.375 -498 E 0.337 -499 V 0.286 -500 S 0.227 -501 A 0.166 -502 I 0.113 -503 K 0.077 -504 L 0.057 -505 D 0.051 -506 I 0.051 -507 F 0.058 -508 N 0.072 -509 Y 0.094 -510 Q 0.122 -511 S 0.154 -512 L 0.183 -513 Q 0.201 -514 S 0.202 -515 G 0.187 -516 T 0.165 -517 E 0.144 -518 A 0.125 -519 H 0.111 -520 V 0.103 -521 K 0.100 -522 V 0.097 -523 G 0.090 -524 E 0.079 -525 F 0.070 -526 V 0.071 -527 F 0.087 -528 D 0.112 -529 S 0.132 -530 H 0.137 -531 S 0.132 -532 V 0.124 -533 Q 0.113 -534 H 0.104 -535 L 0.102 -536 S 0.104 -537 L 0.107 -538 N 0.107 -539 D 0.106 -540 K 0.105 -541 I 0.103 -542 I 0.099 -543 T 0.097 -544 W 0.102 -545 G 0.108 -546 K 0.107 -547 H 0.099 -548 R 0.095 -549 S 0.105 -550 Q 0.128 -551 T 0.153 -552 P 0.171 -553 L 0.185 -554 S 0.203 -555 V 0.227 -556 C 0.248 -557 S 0.259 -558 Q 0.253 -559 S 0.229 -560 C 0.201 -561 P 0.179 -562 F 0.161 -563 G 0.145 -564 F 0.141 -565 S 0.155 -566 K 0.175 -567 T 0.190 -568 A 0.202 -569 V 0.214 -570 E 0.222 -571 G 0.220 -572 K 0.211 -573 P 0.203 -574 F 0.194 -575 C 0.189 -576 C 0.188 -577 F 0.192 -578 D 0.197 -579 C 0.196 -580 V 0.189 -581 P 0.181 -582 C 0.185 -583 P 0.199 -584 D 0.205 -585 G 0.198 -586 E 0.195 -587 I 0.209 -588 A 0.235 -589 N 0.265 -590 K 0.291 -591 T 0.298 -592 D 0.280 -593 M 0.255 -594 D 0.241 -595 Q 0.235 -596 C 0.222 -597 I 0.201 -598 K 0.179 -599 C 0.164 -600 P 0.156 -601 E 0.147 -602 D 0.136 -603 Q 0.124 -604 Y 0.119 -605 P 0.122 -606 N 0.132 -607 K 0.142 -608 Q 0.146 -609 R 0.149 -610 N 0.167 -611 Q 0.200 -612 C 0.231 -613 L 0.250 -614 P 0.250 -615 K 0.236 -616 I 0.215 -617 M 0.194 -618 V 0.177 -619 F 0.169 -620 L 0.168 -621 A 0.171 -622 H 0.167 -623 E 0.150 -624 D 0.125 -625 P 0.104 -626 L 0.091 -627 G 0.085 -628 T 0.085 -629 V 0.090 -630 L 0.101 -631 V 0.110 -632 S 0.115 -633 L 0.119 -634 A 0.126 -635 I 0.129 -636 S 0.125 -637 L 0.118 -638 S 0.113 -639 A 0.110 -640 F 0.106 -641 S 0.106 -642 A 0.110 -643 M 0.113 -644 I 0.111 -645 L 0.101 -646 G 0.088 -647 L 0.076 -648 F 0.065 -649 I 0.057 -650 C 0.051 -651 Y 0.050 -652 R 0.053 -653 E 0.063 -654 T 0.080 -655 P 0.101 -656 I 0.110 -657 V 0.099 -658 R 0.080 -659 A 0.067 -660 N 0.060 -661 N 0.054 -662 R 0.048 -663 N 0.048 -664 L 0.053 -665 S 0.059 -666 Y 0.063 -667 L 0.066 -668 L 0.070 -669 L 0.075 -670 I 0.079 -671 S 0.081 -672 L 0.083 -673 K 0.084 -674 L 0.085 -675 C 0.091 -676 F 0.107 -677 S 0.126 -678 C 0.140 -679 S 0.145 -680 L 0.139 -681 M 0.124 -682 F 0.109 -683 I 0.108 -684 G 0.122 -685 Q 0.136 -686 P 0.133 -687 R 0.114 -688 T 0.090 -689 V 0.070 -690 T 0.058 -691 C 0.052 -692 V 0.047 -693 L 0.043 -694 R 0.041 -695 Q 0.042 -696 I 0.046 -697 I 0.052 -698 F 0.061 -699 G 0.070 -700 I 0.073 -701 V 0.070 -702 F 0.064 -703 S 0.059 -704 I 0.056 -705 V 0.054 -706 I 0.053 -707 S 0.054 -708 A 0.057 -709 I 0.062 -710 L 0.066 -711 A 0.067 -712 K 0.067 -713 T 0.065 -714 F 0.064 -715 I 0.064 -716 V 0.063 -717 V 0.062 -718 M 0.064 -719 A 0.076 -720 F 0.100 -721 K 0.133 -722 A 0.173 -723 I 0.220 -724 K 0.269 -725 P 0.311 -726 G 0.334 -727 S 0.337 -728 I 0.325 -729 L 0.308 -730 K 0.291 -731 M 0.276 -732 G 0.255 -733 M 0.221 -734 V 0.178 -735 T 0.137 -736 R 0.103 -737 L 0.084 -738 S 0.081 -739 N 0.086 -740 A 0.090 -741 I 0.087 -742 V 0.079 -743 C 0.074 -744 C 0.079 -745 G 0.094 -746 S 0.108 -747 I 0.112 -748 I 0.108 -749 Q 0.104 -750 V 0.102 -751 C 0.102 -752 I 0.098 -753 C 0.092 -754 A 0.084 -755 V 0.080 -756 W 0.080 -757 L 0.087 -758 G 0.096 -759 T 0.109 -760 Y 0.125 -761 P 0.145 -762 P 0.168 -763 F 0.192 -764 P 0.214 -765 D 0.225 -766 V 0.222 -767 D 0.207 -768 M 0.195 -769 H 0.196 -770 S 0.212 -771 E 0.232 -772 F 0.245 -773 G 0.249 -774 Q 0.248 -775 I 0.239 -776 I 0.225 -777 L 0.207 -778 W 0.193 -779 C 0.189 -780 N 0.200 -781 E 0.214 -782 G 0.210 -783 S 0.176 -784 T 0.131 -785 L 0.100 -786 A 0.088 -787 F 0.088 -788 Y 0.096 -789 C 0.112 -790 V 0.125 -791 L 0.127 -792 G 0.129 -793 Y 0.137 -794 L 0.142 -795 G 0.136 -796 F 0.127 -797 L 0.124 -798 A 0.125 -799 S 0.127 -800 L 0.128 -801 S 0.126 -802 L 0.122 -803 L 0.118 -804 I 0.112 -805 A 0.104 -806 F 0.104 -807 L 0.117 -808 A 0.136 -809 R 0.151 -810 R 0.162 -811 L 0.177 -812 P 0.187 -813 D 0.186 -814 S 0.177 -815 F 0.167 -816 N 0.156 -817 E 0.142 -818 A 0.129 -819 K 0.119 -820 T 0.115 -821 I 0.111 -822 T 0.103 -823 F 0.098 -824 S 0.098 -825 M 0.100 -826 L 0.100 -827 V 0.098 -828 F 0.092 -829 C 0.084 -830 S 0.078 -831 V 0.076 -832 W 0.078 -833 I 0.076 -834 S 0.071 -835 F 0.069 -836 V 0.076 -837 P 0.086 -838 A 0.097 -839 Y 0.108 -840 L 0.122 -841 S 0.141 -842 S 0.165 -843 K 0.184 -844 G 0.192 -845 K 0.186 -846 T 0.172 -847 M 0.159 -848 V 0.155 -849 A 0.154 -850 V 0.152 -851 E 0.146 -852 I 0.141 -853 L 0.141 -854 S 0.143 -855 I 0.138 -856 L 0.130 -857 A 0.126 -858 S 0.125 -859 S 0.123 -860 A 0.120 -861 G 0.118 -862 L 0.112 -863 L 0.099 -864 G 0.086 -865 C 0.076 -866 I 0.067 -867 F 0.062 -868 L 0.066 -869 P 0.074 -870 K 0.077 -871 C 0.075 -872 Y 0.079 -873 V 0.093 -874 I 0.116 -875 L 0.154 -876 L 0.215 -877 K 0.292 -878 S 0.366 -879 G 0.421 -880 G 0.448 -881 H 0.448 -882 S 0.434 -883 R 0.420 -884 K 0.409 -885 K 0.395 -886 F 0.378 -887 F 0.364 -888 K 0.358 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000118506.3_ENSMUST00000238911.2_GN:Cfap141_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000118506.3_ENSMUST00000238911.2_GN:Cfap141_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid deleted file mode 100644 index aecd6c039939dad90dd61354a8437315d81198bb..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000118506.3_ENSMUST00000238911.2_GN:Cfap141_species:mus_musculus_type:baseline_n_term:0.caid +++ /dev/null @@ -1,102 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000118506.3|ENSMUST00000238911.2|GN:Cfap141|species:mus_musculus|type:baseline|n_term:0 -1 M 0.236 -2 S 0.235 -3 A 0.231 -4 E 0.221 -5 K 0.206 -6 M 0.184 -7 T 0.155 -8 K 0.126 -9 L 0.106 -10 E 0.095 -11 E 0.089 -12 N 0.086 -13 L 0.083 -14 Q 0.080 -15 R 0.078 -16 A 0.080 -17 V 0.089 -18 A 0.098 -19 L 0.096 -20 K 0.084 -21 K 0.075 -22 T 0.078 -23 V 0.088 -24 D 0.097 -25 R 0.102 -26 W 0.105 -27 R 0.105 -28 N 0.097 -29 F 0.083 -30 H 0.069 -31 I 0.065 -32 H 0.073 -33 C 0.090 -34 M 0.106 -35 W 0.115 -36 Q 0.119 -37 T 0.121 -38 T 0.124 -39 L 0.124 -40 D 0.121 -41 Q 0.120 -42 R 0.121 -43 R 0.118 -44 N 0.110 -45 L 0.102 -46 F 0.101 -47 A 0.108 -48 A 0.123 -49 L 0.142 -50 R 0.163 -51 M 0.186 -52 K 0.203 -53 D 0.209 -54 T 0.207 -55 K 0.206 -56 E 0.215 -57 Q 0.230 -58 E 0.233 -59 L 0.217 -60 A 0.196 -61 L 0.186 -62 S 0.185 -63 N 0.179 -64 K 0.166 -65 Q 0.158 -66 L 0.162 -67 L 0.164 -68 V 0.153 -69 V 0.133 -70 R 0.116 -71 Q 0.103 -72 A 0.095 -73 A 0.090 -74 L 0.086 -75 H 0.078 -76 E 0.067 -77 L 0.060 -78 F 0.059 -79 E 0.059 -80 K 0.062 -81 E 0.068 -82 Y 0.070 -83 Q 0.065 -84 Q 0.061 -85 Y 0.067 -86 Q 0.080 -87 Q 0.089 -88 E 0.090 -89 L 0.086 -90 N 0.082 -91 Q 0.082 -92 M 0.089 -93 G 0.103 -94 K 0.121 -95 A 0.137 -96 F 0.146 -97 Y 0.154 -98 E 0.172 -99 E 0.196 -100 R 0.212 -101 L 0.216 diff --git a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000118506.3_ENSMUST00000238911.2_GN:Cfap141_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid b/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000118506.3_ENSMUST00000238911.2_GN:Cfap141_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid deleted file mode 100644 index f6040e31dcceb711f18ed1bd206f038ebc287622..0000000000000000000000000000000000000000 --- a/havana_hard_negatives/prott5/ENSMUSG00000118506.3_ENSMUST00000238911.2_GN:Cfap141_species:mus_musculus_type:n_terminal_n_term:5.caid +++ /dev/null @@ -1,107 +0,0 @@ ->ENSMUSG00000118506.3|ENSMUST00000238911.2|GN:Cfap141|species:mus_musculus|type:n_terminal|n_term:5 -1 M 0.378 -2 S 0.379 -3 V 0.379 -4 V 0.362 -5 D 0.323 -6 M 0.271 -7 S 0.223 -8 A 0.184 -9 E 0.155 -10 K 0.137 -11 M 0.127 -12 T 0.114 -13 K 0.104 -14 L 0.102 -15 E 0.105 -16 E 0.104 -17 N 0.097 -18 L 0.088 -19 Q 0.080 -20 R 0.076 -21 A 0.078 -22 V 0.088 -23 A 0.096 -24 L 0.094 -25 K 0.083 -26 K 0.074 -27 T 0.076 -28 V 0.087 -29 D 0.097 -30 R 0.104 -31 W 0.106 -32 R 0.104 -33 N 0.095 -34 F 0.081 -35 H 0.068 -36 I 0.065 -37 H 0.075 -38 C 0.093 -39 M 0.110 -40 W 0.119 -41 Q 0.121 -42 T 0.123 -43 T 0.126 -44 L 0.127 -45 D 0.125 -46 Q 0.123 -47 R 0.122 -48 R 0.119 -49 N 0.112 -50 L 0.105 -51 F 0.103 -52 A 0.110 -53 A 0.124 -54 L 0.142 -55 R 0.163 -56 M 0.185 -57 K 0.202 -58 D 0.207 -59 T 0.205 -60 K 0.205 -61 E 0.214 -62 Q 0.228 -63 E 0.232 -64 L 0.214 -65 A 0.191 -66 L 0.179 -67 S 0.177 -68 N 0.171 -69 K 0.159 -70 Q 0.151 -71 L 0.152 -72 L 0.152 -73 V 0.140 -74 V 0.123 -75 R 0.109 -76 Q 0.098 -77 A 0.090 -78 A 0.086 -79 L 0.084 -80 H 0.077 -81 E 0.067 -82 L 0.060 -83 F 0.058 -84 E 0.059 -85 K 0.064 -86 E 0.072 -87 Y 0.075 -88 Q 0.068 -89 Q 0.062 -90 Y 0.068 -91 Q 0.080 -92 Q 0.088 -93 E 0.087 -94 L 0.083 -95 N 0.078 -96 Q 0.076 -97 M 0.079 -98 G 0.089 -99 K 0.104 -100 A 0.117 -101 F 0.128 -102 Y 0.140 -103 E 0.164 -104 E 0.193 -105 R 0.210 -106 L 0.213