Datasets:
Download metadata/pki_source_usage.csv from tim-shu/drug-affinity-multisource: direct link, hf CLI and curl.
- Browser
- Download file 1.68 kB
-
https://huggingface.co/datasets/tim-shu/drug-affinity-multisource/resolve/main/metadata/pki_source_usage.csv
- Command line
-
hf download hf://datasets/tim-shu/drug-affinity-multisource/metadata/pki_source_usage.csv
-
curl -L -o pki_source_usage.csv https://huggingface.co/datasets/tim-shu/drug-affinity-multisource/resolve/main/metadata/pki_source_usage.csv
1.68 kB
| source,total_pairs,used_for_training,validation_selection_pairs,prepared_observations,curated_pairs_all_targets,preparation,url,train_pairs,train_percent,validation_pairs,validation_percent,test_pairs,test_percent,diagnostic_validation_pairs,used_for_validation_selection | |
| ChEMBL,169341,True,15439,204676,204676,"Точные положительные Ki в нМ; тест связывания с отдельным человеческим белком, confidence 9, без аннотированной мутации. Пересчёт Ki → pKi.",https://www.ebi.ac.uk/chembl/,136079,80.35797591841315,15942,9.414140698354208,17320,10.22788338323265,503,True | |
| BindingDB,25690,True,0,103448,34107,Только Ki из статей и патентов; импорты ChEMBL исключены. Отдельный человеческий белок; последовательность экспериментального белка должна совпадать с участком канонической последовательности UniProt. Пересчёт Ki в нМ → pKi.,https://www.bindingdb.org/rwd/bind/chemsearch/marvin/Download.jsp,20653,80.39314908524717,2488,9.684702218762164,2549,9.922148695990657,2488,False | |
| DrugCentral,3223,True,0,5387,3999,"Соединение таблицы активностей со структурами SDF по STRUCT_ID; только человеческие мишени, ACT_TYPE=Ki и RELATION=""="". ACT_VALUE уже содержит pKi: повторный логарифм не нужен.",https://www.drugcentral.org/download,2668,82.78001861619609,210,6.5156686317095875,345,10.704312752094323,210,False | |