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| # 快速启动脚本 - YuanSeq | |
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| # 设置工作目录：若当前目录无 app.R，则尝试上一级（便于在项目根或子目录运行） | |
| if (!file.exists("app.R")) { | |
| if (file.exists("../app.R")) setwd("..") else stop("请在 YuanSeq 项目根目录运行 launch_app.R") | |
| } | |
| # 加载必要的包 | |
| required_packages <- c("shiny", "clusterProfiler", "GseaVis", | |
| "enrichplot", "ggplot2", "dplyr", "DT") | |
| cat("正在检查和加载包...\n") | |
| for (pkg in required_packages) { | |
| if (!requireNamespace(pkg, quietly = TRUE)) { | |
| cat(sprintf("安装 %s...\n", pkg)) | |
| install.packages(pkg) | |
| } | |
| library(pkg, character.only = TRUE) | |
| cat(sprintf("✅ %s 已加载\n", pkg)) | |
| } | |
| # 启动应用 | |
| cat("\n========================================\n") | |
| cat("🚀 启动 YuanSeq 应用\n") | |
| cat("========================================\n\n") | |
| cat("应用将在浏览器中打开...\n") | |
| cat("URL: http://127.0.0.1:3838\n\n") | |
| cat("💡 提示:\n") | |
| cat(" • 使用Ctrl+C停止应用\n") | |
| cat(" • 查看R控制台获取调试信息\n") | |
| cat(" • GSEA分析中推荐使用SYMBOL作为ID类型\n\n") | |
| # 运行应用 | |
| shiny::runApp( | |
| appDir = getwd(), | |
| launch.browser = TRUE, | |
| port = 3838 | |
| ) | |