KDMSi / shared /preprocessing /base0_fold_context.json
leighv318's picture
Add files using upload-large-folder tool
fe72491 verified
Raw
History Blame Contribute Delete
14.4 kB
{"0-inter": {"pssm_as": [[0.646, 0.269, 0.295, 0.306, 0.305, 0.297, 0.288, 0.264, 0.28, 0.297, 0.256, 0.254, 0.273, 0.268, 0.339, 0.264, 0.26, 0.234, 0.244], [0.033, 0.169, 0.179, 0.205, 0.29, 0.179, 0.277, 0.282, 0.201, 0.215, 0.315, 0.228, 0.21, 0.192, 0.237, 0.218, 0.293, 0.223, 0.25], [0.041, 0.295, 0.171, 0.175, 0.183, 0.181, 0.193, 0.222, 0.306, 0.262, 0.201, 0.198, 0.209, 0.185, 0.193, 0.293, 0.187, 0.236, 0.302], [0.29, 0.236, 0.37, 0.334, 0.194, 0.352, 0.199, 0.254, 0.234, 0.247, 0.249, 0.288, 0.329, 0.352, 0.251, 0.246, 0.28, 0.319, 0.226], [0.018, 0.058, 0.012, 0.007, 0.055, 0.018, 0.071, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.06, 0.007, 0.03, 0.007, 0.007, 0.007, 0.016, 0.007]], "pssm_ss": [[0.228, 0.34, 0.245, 0.23, 0.272, 0.348, 0.336, 0.361, 0.235, 0.25, 0.255, 0.257, 0.241, 0.333, 0.256, 0.351, 0.35, 0.269, 0.329], [0.309, 0.218, 0.195, 0.31, 0.192, 0.202, 0.199, 0.19, 0.209, 0.282, 0.3, 0.201, 0.212, 0.205, 0.181, 0.176, 0.181, 0.272, 0.158], [0.252, 0.231, 0.314, 0.22, 0.217, 0.219, 0.23, 0.205, 0.307, 0.206, 0.205, 0.307, 0.293, 0.193, 0.295, 0.181, 0.178, 0.199, 0.155], [0.232, 0.231, 0.268, 0.261, 0.324, 0.251, 0.255, 0.265, 0.251, 0.283, 0.245, 0.256, 0.275, 0.29, 0.289, 0.313, 0.31, 0.28, 0.369], [0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.022, 0.007, 0.007, 0.007, 0.026, 0.007, 0.024, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.008, 0.007, 0.016]], "conc_log_mean": 0.3487913700767867, "conc_log_std": 1.1197284032970598}, "1-inter": {"pssm_as": [[0.645, 0.267, 0.299, 0.308, 0.307, 0.296, 0.288, 0.263, 0.281, 0.297, 0.259, 0.256, 0.275, 0.27, 0.338, 0.264, 0.258, 0.233, 0.244], [0.032, 0.168, 0.178, 0.205, 0.289, 0.179, 0.277, 0.282, 0.203, 0.215, 0.316, 0.227, 0.21, 0.194, 0.238, 0.219, 0.294, 0.223, 0.25], [0.041, 0.296, 0.172, 0.174, 0.183, 0.18, 0.193, 0.223, 0.303, 0.262, 0.2, 0.197, 0.21, 0.185, 0.193, 0.293, 0.187, 0.237, 0.3], [0.291, 0.238, 0.366, 0.334, 0.194, 0.354, 0.198, 0.253, 0.234, 0.247, 0.246, 0.287, 0.326, 0.35, 0.252, 0.245, 0.282, 0.318, 0.227], [0.018, 0.059, 0.012, 0.007, 0.054, 0.018, 0.071, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.061, 0.007, 0.029, 0.007, 0.007, 0.007, 0.016, 0.007]], "pssm_ss": [[0.228, 0.34, 0.245, 0.231, 0.274, 0.346, 0.338, 0.358, 0.232, 0.25, 0.252, 0.257, 0.24, 0.332, 0.258, 0.353, 0.346, 0.27, 0.326], [0.308, 0.219, 0.195, 0.311, 0.192, 0.203, 0.198, 0.189, 0.211, 0.282, 0.296, 0.201, 0.211, 0.204, 0.18, 0.175, 0.181, 0.271, 0.158], [0.253, 0.23, 0.315, 0.219, 0.217, 0.222, 0.23, 0.206, 0.308, 0.205, 0.207, 0.307, 0.293, 0.195, 0.294, 0.18, 0.179, 0.199, 0.155], [0.233, 0.232, 0.266, 0.26, 0.323, 0.25, 0.255, 0.269, 0.251, 0.284, 0.249, 0.255, 0.276, 0.29, 0.288, 0.313, 0.314, 0.281, 0.372], [0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.022, 0.007, 0.007, 0.007, 0.026, 0.007, 0.024, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.008, 0.007, 0.016]], "conc_log_mean": 0.34977448431516167, "conc_log_std": 1.1201386225342154}, "2-inter": {"pssm_as": [[0.644, 0.268, 0.296, 0.307, 0.306, 0.299, 0.287, 0.264, 0.281, 0.298, 0.255, 0.254, 0.276, 0.268, 0.337, 0.264, 0.263, 0.233, 0.244], [0.033, 0.167, 0.178, 0.206, 0.29, 0.178, 0.278, 0.283, 0.202, 0.214, 0.317, 0.23, 0.207, 0.193, 0.238, 0.22, 0.293, 0.224, 0.251], [0.041, 0.296, 0.172, 0.175, 0.184, 0.179, 0.194, 0.221, 0.306, 0.261, 0.201, 0.195, 0.209, 0.187, 0.194, 0.292, 0.188, 0.236, 0.3], [0.291, 0.238, 0.37, 0.332, 0.194, 0.354, 0.198, 0.253, 0.232, 0.247, 0.248, 0.288, 0.328, 0.351, 0.251, 0.245, 0.278, 0.318, 0.226], [0.018, 0.059, 0.012, 0.007, 0.054, 0.018, 0.071, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.061, 0.007, 0.029, 0.007, 0.007, 0.007, 0.016, 0.007]], "pssm_ss": [[0.227, 0.342, 0.244, 0.23, 0.271, 0.347, 0.336, 0.359, 0.235, 0.252, 0.251, 0.256, 0.24, 0.334, 0.256, 0.352, 0.347, 0.268, 0.329], [0.31, 0.219, 0.194, 0.309, 0.193, 0.202, 0.2, 0.191, 0.21, 0.279, 0.299, 0.201, 0.212, 0.202, 0.181, 0.175, 0.181, 0.274, 0.158], [0.252, 0.229, 0.316, 0.221, 0.216, 0.221, 0.23, 0.207, 0.307, 0.205, 0.207, 0.307, 0.293, 0.195, 0.296, 0.181, 0.179, 0.2, 0.155], [0.232, 0.231, 0.267, 0.261, 0.326, 0.251, 0.256, 0.264, 0.249, 0.284, 0.247, 0.257, 0.276, 0.291, 0.288, 0.314, 0.313, 0.279, 0.37], [0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.022, 0.007, 0.007, 0.007, 0.027, 0.007, 0.024, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.008, 0.007, 0.016]], "conc_log_mean": 0.3489646277490546, "conc_log_std": 1.119943220194186}, "3-inter": {"pssm_as": [[0.644, 0.266, 0.297, 0.307, 0.307, 0.295, 0.289, 0.264, 0.28, 0.296, 0.257, 0.256, 0.274, 0.27, 0.338, 0.265, 0.261, 0.235, 0.244], [0.032, 0.169, 0.178, 0.205, 0.29, 0.178, 0.277, 0.281, 0.202, 0.214, 0.316, 0.228, 0.212, 0.191, 0.238, 0.221, 0.293, 0.224, 0.252], [0.041, 0.295, 0.17, 0.174, 0.185, 0.181, 0.193, 0.223, 0.305, 0.262, 0.202, 0.195, 0.207, 0.186, 0.194, 0.292, 0.187, 0.236, 0.298], [0.292, 0.239, 0.37, 0.335, 0.192, 0.356, 0.198, 0.253, 0.234, 0.248, 0.246, 0.289, 0.328, 0.351, 0.251, 0.244, 0.28, 0.317, 0.227], [0.018, 0.059, 0.012, 0.007, 0.054, 0.018, 0.071, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.061, 0.007, 0.029, 0.007, 0.007, 0.007, 0.016, 0.007]], "pssm_ss": [[0.227, 0.34, 0.246, 0.23, 0.272, 0.346, 0.334, 0.361, 0.234, 0.25, 0.252, 0.258, 0.24, 0.333, 0.255, 0.354, 0.345, 0.27, 0.33], [0.308, 0.221, 0.192, 0.31, 0.192, 0.201, 0.2, 0.189, 0.208, 0.282, 0.299, 0.201, 0.211, 0.204, 0.181, 0.175, 0.183, 0.272, 0.157], [0.253, 0.23, 0.316, 0.221, 0.216, 0.221, 0.232, 0.204, 0.308, 0.206, 0.206, 0.306, 0.294, 0.193, 0.294, 0.181, 0.178, 0.199, 0.156], [0.232, 0.229, 0.267, 0.26, 0.325, 0.252, 0.255, 0.267, 0.252, 0.283, 0.248, 0.256, 0.275, 0.29, 0.29, 0.311, 0.314, 0.28, 0.368], [0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.022, 0.007, 0.007, 0.007, 0.026, 0.007, 0.024, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.008, 0.007, 0.016]], "conc_log_mean": 0.35010294503422285, "conc_log_std": 1.11968657746299}, "4-inter": {"pssm_as": [[0.645, 0.269, 0.296, 0.308, 0.306, 0.298, 0.286, 0.262, 0.281, 0.297, 0.256, 0.256, 0.276, 0.267, 0.338, 0.263, 0.258, 0.234, 0.244], [0.033, 0.168, 0.176, 0.206, 0.29, 0.177, 0.278, 0.284, 0.202, 0.214, 0.315, 0.23, 0.21, 0.194, 0.238, 0.219, 0.295, 0.222, 0.252], [0.041, 0.293, 0.172, 0.174, 0.184, 0.181, 0.192, 0.223, 0.304, 0.261, 0.201, 0.196, 0.207, 0.186, 0.193, 0.293, 0.188, 0.236, 0.299], [0.292, 0.24, 0.372, 0.333, 0.194, 0.354, 0.2, 0.252, 0.233, 0.249, 0.248, 0.286, 0.328, 0.351, 0.251, 0.245, 0.279, 0.32, 0.226], [0.018, 0.058, 0.012, 0.007, 0.054, 0.018, 0.071, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.06, 0.007, 0.03, 0.007, 0.007, 0.007, 0.016, 0.007]], "pssm_ss": [[0.226, 0.343, 0.244, 0.231, 0.272, 0.348, 0.335, 0.359, 0.235, 0.25, 0.254, 0.259, 0.24, 0.331, 0.258, 0.353, 0.347, 0.27, 0.331], [0.308, 0.217, 0.195, 0.309, 0.192, 0.202, 0.199, 0.189, 0.208, 0.281, 0.298, 0.2, 0.212, 0.205, 0.179, 0.175, 0.182, 0.271, 0.158], [0.253, 0.23, 0.317, 0.219, 0.219, 0.223, 0.232, 0.207, 0.308, 0.206, 0.206, 0.307, 0.293, 0.196, 0.297, 0.178, 0.178, 0.2, 0.154], [0.234, 0.231, 0.265, 0.261, 0.324, 0.248, 0.255, 0.266, 0.251, 0.284, 0.246, 0.255, 0.276, 0.29, 0.288, 0.314, 0.313, 0.279, 0.369], [0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.022, 0.007, 0.007, 0.007, 0.027, 0.007, 0.024, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.008, 0.007, 0.016]], "conc_log_mean": 0.3489828958138181, "conc_log_std": 1.1190009229840037}, "5-inter": {"pssm_as": [[0.645, 0.267, 0.296, 0.305, 0.307, 0.297, 0.288, 0.261, 0.28, 0.299, 0.256, 0.255, 0.273, 0.269, 0.339, 0.263, 0.258, 0.233, 0.244], [0.033, 0.169, 0.177, 0.206, 0.289, 0.177, 0.278, 0.283, 0.201, 0.214, 0.316, 0.227, 0.212, 0.193, 0.238, 0.219, 0.293, 0.223, 0.251], [0.041, 0.295, 0.171, 0.173, 0.184, 0.18, 0.193, 0.223, 0.306, 0.262, 0.2, 0.196, 0.209, 0.183, 0.193, 0.293, 0.188, 0.237, 0.3], [0.291, 0.238, 0.371, 0.336, 0.193, 0.356, 0.198, 0.254, 0.234, 0.246, 0.249, 0.289, 0.326, 0.353, 0.251, 0.246, 0.282, 0.319, 0.227], [0.018, 0.059, 0.012, 0.007, 0.054, 0.018, 0.071, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.061, 0.007, 0.03, 0.007, 0.007, 0.007, 0.016, 0.007]], "pssm_ss": [[0.23, 0.341, 0.245, 0.232, 0.273, 0.348, 0.336, 0.361, 0.234, 0.252, 0.253, 0.256, 0.241, 0.334, 0.256, 0.354, 0.347, 0.271, 0.331], [0.308, 0.219, 0.194, 0.31, 0.193, 0.202, 0.199, 0.187, 0.211, 0.281, 0.297, 0.202, 0.213, 0.204, 0.181, 0.175, 0.181, 0.271, 0.157], [0.252, 0.232, 0.315, 0.219, 0.217, 0.222, 0.23, 0.205, 0.308, 0.204, 0.207, 0.307, 0.292, 0.195, 0.295, 0.179, 0.178, 0.2, 0.154], [0.231, 0.23, 0.268, 0.259, 0.322, 0.249, 0.256, 0.267, 0.249, 0.283, 0.247, 0.257, 0.275, 0.289, 0.288, 0.313, 0.313, 0.278, 0.37], [0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.022, 0.007, 0.007, 0.007, 0.026, 0.007, 0.024, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.008, 0.007, 0.016]], "conc_log_mean": 0.3497540264451023, "conc_log_std": 1.1201495392433467}, "6-inter": {"pssm_as": [[0.645, 0.27, 0.296, 0.307, 0.307, 0.298, 0.286, 0.261, 0.279, 0.298, 0.258, 0.256, 0.274, 0.268, 0.338, 0.261, 0.26, 0.234, 0.243], [0.033, 0.168, 0.177, 0.206, 0.289, 0.177, 0.278, 0.284, 0.204, 0.215, 0.315, 0.229, 0.211, 0.193, 0.24, 0.221, 0.293, 0.222, 0.251], [0.041, 0.295, 0.172, 0.174, 0.182, 0.181, 0.192, 0.221, 0.305, 0.261, 0.201, 0.194, 0.207, 0.184, 0.192, 0.292, 0.188, 0.236, 0.301], [0.291, 0.237, 0.371, 0.334, 0.196, 0.354, 0.2, 0.255, 0.233, 0.247, 0.247, 0.288, 0.329, 0.353, 0.252, 0.246, 0.28, 0.32, 0.226], [0.018, 0.059, 0.012, 0.007, 0.054, 0.018, 0.071, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.06, 0.007, 0.029, 0.007, 0.007, 0.007, 0.016, 0.007]], "pssm_ss": [[0.228, 0.341, 0.245, 0.231, 0.272, 0.349, 0.337, 0.361, 0.236, 0.251, 0.251, 0.258, 0.24, 0.333, 0.257, 0.353, 0.35, 0.27, 0.329], [0.31, 0.22, 0.194, 0.309, 0.193, 0.202, 0.197, 0.19, 0.208, 0.278, 0.299, 0.199, 0.212, 0.204, 0.179, 0.175, 0.18, 0.272, 0.158], [0.252, 0.228, 0.316, 0.221, 0.218, 0.222, 0.232, 0.205, 0.307, 0.207, 0.207, 0.307, 0.295, 0.195, 0.296, 0.18, 0.178, 0.199, 0.154], [0.231, 0.232, 0.266, 0.26, 0.323, 0.248, 0.255, 0.265, 0.25, 0.285, 0.247, 0.256, 0.274, 0.289, 0.289, 0.313, 0.312, 0.28, 0.371], [0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.022, 0.007, 0.007, 0.007, 0.026, 0.007, 0.024, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.008, 0.007, 0.016]], "conc_log_mean": 0.34847545990988077, "conc_log_std": 1.1197957005345371}, "7-inter": {"pssm_as": [[0.645, 0.266, 0.298, 0.306, 0.307, 0.297, 0.289, 0.263, 0.28, 0.298, 0.257, 0.255, 0.275, 0.271, 0.337, 0.264, 0.26, 0.234, 0.244], [0.033, 0.168, 0.178, 0.205, 0.29, 0.178, 0.277, 0.281, 0.202, 0.216, 0.318, 0.228, 0.21, 0.193, 0.238, 0.22, 0.293, 0.224, 0.25], [0.041, 0.296, 0.171, 0.174, 0.184, 0.179, 0.193, 0.223, 0.305, 0.261, 0.202, 0.196, 0.207, 0.185, 0.193, 0.292, 0.186, 0.238, 0.3], [0.291, 0.239, 0.369, 0.335, 0.193, 0.355, 0.197, 0.254, 0.234, 0.246, 0.244, 0.288, 0.329, 0.35, 0.252, 0.245, 0.281, 0.315, 0.226], [0.018, 0.059, 0.012, 0.007, 0.054, 0.018, 0.071, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.061, 0.007, 0.029, 0.007, 0.007, 0.007, 0.016, 0.007]], "pssm_ss": [[0.228, 0.339, 0.245, 0.23, 0.273, 0.346, 0.337, 0.359, 0.234, 0.251, 0.25, 0.255, 0.241, 0.334, 0.255, 0.353, 0.346, 0.27, 0.329], [0.311, 0.219, 0.193, 0.312, 0.192, 0.201, 0.199, 0.189, 0.208, 0.281, 0.299, 0.2, 0.212, 0.205, 0.18, 0.174, 0.182, 0.273, 0.157], [0.251, 0.231, 0.316, 0.22, 0.217, 0.222, 0.231, 0.205, 0.308, 0.206, 0.208, 0.308, 0.292, 0.194, 0.296, 0.181, 0.177, 0.199, 0.155], [0.231, 0.232, 0.267, 0.259, 0.324, 0.252, 0.255, 0.268, 0.251, 0.283, 0.248, 0.257, 0.275, 0.288, 0.29, 0.313, 0.315, 0.279, 0.371], [0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.022, 0.007, 0.007, 0.007, 0.027, 0.007, 0.024, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.008, 0.007, 0.016]], "conc_log_mean": 0.34867578549313966, "conc_log_std": 1.1209431678582464}, "8-inter": {"pssm_as": [[0.644, 0.268, 0.295, 0.308, 0.306, 0.298, 0.289, 0.262, 0.28, 0.297, 0.255, 0.254, 0.277, 0.27, 0.338, 0.263, 0.26, 0.233, 0.244], [0.032, 0.169, 0.179, 0.205, 0.29, 0.178, 0.278, 0.281, 0.203, 0.215, 0.316, 0.23, 0.21, 0.193, 0.237, 0.219, 0.294, 0.224, 0.252], [0.041, 0.294, 0.171, 0.175, 0.185, 0.18, 0.191, 0.224, 0.305, 0.261, 0.202, 0.195, 0.207, 0.184, 0.194, 0.293, 0.187, 0.235, 0.299], [0.292, 0.237, 0.371, 0.332, 0.194, 0.355, 0.198, 0.254, 0.232, 0.248, 0.248, 0.288, 0.327, 0.353, 0.252, 0.246, 0.281, 0.32, 0.226], [0.018, 0.059, 0.012, 0.007, 0.053, 0.017, 0.071, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.06, 0.007, 0.029, 0.007, 0.007, 0.007, 0.016, 0.007]], "pssm_ss": [[0.227, 0.341, 0.245, 0.231, 0.273, 0.349, 0.336, 0.359, 0.234, 0.25, 0.252, 0.259, 0.24, 0.333, 0.256, 0.352, 0.348, 0.267, 0.33], [0.31, 0.218, 0.192, 0.309, 0.192, 0.202, 0.199, 0.188, 0.209, 0.279, 0.299, 0.2, 0.212, 0.206, 0.178, 0.176, 0.182, 0.272, 0.157], [0.252, 0.23, 0.316, 0.22, 0.218, 0.221, 0.229, 0.206, 0.307, 0.207, 0.208, 0.306, 0.295, 0.194, 0.297, 0.179, 0.178, 0.2, 0.155], [0.232, 0.231, 0.267, 0.26, 0.322, 0.249, 0.257, 0.268, 0.252, 0.285, 0.246, 0.256, 0.275, 0.288, 0.29, 0.313, 0.312, 0.282, 0.369], [0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.023, 0.007, 0.007, 0.007, 0.026, 0.007, 0.024, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.008, 0.007, 0.016]], "conc_log_mean": 0.3477286740583385, "conc_log_std": 1.1203425620409202}, "9-inter": {"pssm_as": [[0.644, 0.268, 0.297, 0.306, 0.307, 0.297, 0.29, 0.262, 0.282, 0.296, 0.257, 0.255, 0.273, 0.269, 0.338, 0.265, 0.26, 0.235, 0.244], [0.033, 0.169, 0.178, 0.206, 0.29, 0.177, 0.276, 0.282, 0.201, 0.214, 0.315, 0.229, 0.211, 0.194, 0.238, 0.218, 0.292, 0.222, 0.252], [0.04, 0.293, 0.171, 0.174, 0.185, 0.182, 0.192, 0.223, 0.304, 0.263, 0.203, 0.194, 0.207, 0.185, 0.193, 0.293, 0.188, 0.235, 0.297], [0.292, 0.239, 0.37, 0.335, 0.192, 0.354, 0.199, 0.253, 0.234, 0.248, 0.246, 0.288, 0.329, 0.349, 0.252, 0.245, 0.281, 0.319, 0.227], [0.018, 0.059, 0.012, 0.007, 0.054, 0.018, 0.071, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.061, 0.007, 0.03, 0.007, 0.007, 0.007, 0.016, 0.007]], "pssm_ss": [[0.229, 0.341, 0.246, 0.232, 0.271, 0.345, 0.338, 0.36, 0.234, 0.25, 0.253, 0.258, 0.24, 0.334, 0.257, 0.353, 0.345, 0.27, 0.332], [0.309, 0.219, 0.192, 0.309, 0.194, 0.202, 0.198, 0.189, 0.208, 0.281, 0.299, 0.201, 0.21, 0.204, 0.181, 0.176, 0.181, 0.273, 0.157], [0.25, 0.231, 0.316, 0.219, 0.217, 0.221, 0.23, 0.205, 0.308, 0.207, 0.206, 0.307, 0.293, 0.194, 0.292, 0.179, 0.179, 0.199, 0.154], [0.233, 0.23, 0.267, 0.262, 0.323, 0.252, 0.256, 0.266, 0.25, 0.283, 0.246, 0.254, 0.278, 0.289, 0.29, 0.313, 0.314, 0.279, 0.369], [0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.022, 0.007, 0.007, 0.007, 0.027, 0.007, 0.024, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.007, 0.008, 0.007, 0.016]], "conc_log_mean": 0.34937568715830186, "conc_log_std": 1.1205356569012397}}