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Déploiement automatique depuis GitLab CI
223e22e verified
"""
API REST FastAPI pour les prédictions de rendement agricole.
Cette API charge un modèle MLflow (pipeline sklearn) au démarrage et expose des endpoints
pour effectuer des prédictions de rendement (hg/ha) à partir de variables explicatives.
"""
import asyncio
import os
from contextlib import asynccontextmanager
from typing import Dict, List
import httpx
import joblib
import numpy as np
import logfire
import pandas as pd
from dotenv import load_dotenv
from fastapi import FastAPI, HTTPException
from pydantic import BaseModel, Field
from config import FEATURE_COLUMNS, TARGET_COLUMN, MODEL_REL_PATH, DATA_REL_PATH, DEFAULT_FRONTEND_URL
# Charger les variables d'environnement depuis .env
load_dotenv()
# =======================================================================================================
# Configuration Logfire (cloud)
# =======================================================================================================
logfire.configure(
token=os.environ.get("LOGFIRE_TOKEN"),
service_name="crop-yield-api",
send_to_logfire="if-token-present",
)
# =======================================================================================================
# Chemins et variables globales
# =======================================================================================================
BASE_DIR = os.path.dirname(os.path.abspath(__file__))
# URL du frontend à réveiller toutes les 12h (variable d'env prioritaire, sinon valeur de config.py)
FRONTEND_URL = os.environ.get("FRONTEND_URL", DEFAULT_FRONTEND_URL)
# Chemin vers le modèle MLflow (pipeline sklearn complet avec préprocesseur)
MODEL_PATH = os.path.join(BASE_DIR, MODEL_REL_PATH)
# Chemin vers le fichier d'entraînement nettoyé (pour récupérer les cultures et pays disponibles)
DATA_PATH = os.path.join(BASE_DIR, DATA_REL_PATH)
# Variables globales chargées au démarrage
pipeline = None # Pipeline sklearn (préprocesseur + modèle)
available_items: List[str] = [] # Cultures disponibles
available_areas: List[str] = [] # Pays disponibles
available_items_per_area: Dict[str, List[str]] = {} # Cultures disponibles par pays
# =======================================================================================================
# Chargement des ressources au démarrage
# =======================================================================================================
def load_pipeline():
"""Charge le pipeline sklearn depuis le fichier model.pkl."""
try:
model_file = os.path.join(MODEL_PATH, "model.pkl")
model = joblib.load(model_file)
logfire.info("Pipeline chargé avec succès depuis {path}", path=model_file)
return model
except Exception as e:
logfire.error("Erreur lors du chargement du pipeline: {error}", error=str(e))
return None
def load_training_data():
"""Charge le CSV d'entraînement pour récupérer les listes de cultures et pays."""
try:
df = pd.read_csv(DATA_PATH, sep=";", usecols=["Item", "Area"])
missing_columns = {"Item", "Area"} - set(df.columns)
if missing_columns:
raise ValueError(
f"Colonnes manquantes dans le fichier d'entraînement: {sorted(missing_columns)}"
)
items = sorted(df["Item"].dropna().unique().tolist())
areas = sorted(df["Area"].dropna().unique().tolist())
# Construire le mapping cultures par pays
items_area_map = {}
for area in areas:
area_items = sorted(df[df["Area"] == area]["Item"].dropna().unique().tolist())
items_area_map[area] = area_items
logfire.info("Données d'entraînement chargées: {n_items} cultures, {n_areas} pays", n_items=len(items), n_areas=len(areas))
return items, areas, items_area_map
except FileNotFoundError:
logfire.error("Fichier de données introuvable: {path}", path=DATA_PATH)
return [], [], {}
except Exception as e:
logfire.error("Erreur lors du chargement des données: {error}", error=str(e))
return [], [], {}
@asynccontextmanager
async def lifespan(app: FastAPI):
"""Chargement des ressources au démarrage de l'API."""
global pipeline, available_items, available_areas, available_items_per_area
pipeline = load_pipeline()
available_items, available_areas, available_items_per_area = load_training_data()
logfire.info("API initialisée et prête")
# Lancement de la tâche keep-alive en arrière-plan
task = asyncio.create_task(keep_alive_task())
yield
task.cancel()
try:
await task
except asyncio.CancelledError:
pass
logfire.info("API arrêtée")
async def keep_alive_task():
"""
Tâche de keep-alive : ping le frontend toutes les 12h
afin de le maintenir actif sur les plateformes d'hébergement avec mise en veille.
"""
INTERVAL = 12 * 3600 # 12 heures en secondes
await asyncio.sleep(60) # Délai initial pour laisser le temps au démarrage complet
while True:
if FRONTEND_URL:
async with httpx.AsyncClient() as client:
try:
resp = await client.get(FRONTEND_URL, timeout=15)
logfire.info("Keep-alive frontend: réponse {status}", status=resp.status_code)
except Exception as e:
logfire.warning("Keep-alive frontend échoué: {error}", error=str(e))
else:
logfire.warning("Keep-alive: FRONTEND_URL non défini, aucun ping envoyé.")
await asyncio.sleep(INTERVAL)
# =======================================================================================================
# Initialisation de l'application FastAPI + instrumentation Logfire
# =======================================================================================================
app = FastAPI(
title="API de Prédiction de Rendement Agricole",
description="API pour prédire le rendement agricole (hg/ha) en fonction de la culture, du pays, de l'année et de variables climatiques.",
version="1.0.0",
lifespan=lifespan,
)
logfire.instrument_fastapi(app)
# =======================================================================================================
# Modèles Pydantic pour la validation des entrées / sorties
# =======================================================================================================
class PredictInput(BaseModel):
"""Données d'entrée pour une prédiction de rendement avec culture spécifiée."""
Area: str = Field(..., description="Pays (ex: 'France', 'Albania')")
Item: str = Field(..., description="Culture (ex: 'Wheat', 'Maize')")
Year: int = Field(..., ge=1990, le=2040, description="Année")
average_rain_fall_mm_per_year: float = Field(..., ge=40, le=4000, description="Précipitations moyennes annuelles (mm)")
pesticides_tonnes: float = Field(..., ge=0, le=400000, description="Quantité de pesticides utilisés (tonnes)")
avg_temp: float = Field(..., gt=0, le=35, description="Température moyenne (°C)")
class PredictionOutput(BaseModel):
"""Résultat d'une prédiction de rendement."""
Area: str = Field(..., description="Pays")
Item: str = Field(..., description="Culture")
Year: int = Field(..., description="Année")
predicted_yield: float = Field(..., description="Rendement prédit (hg/ha)")
class RecommendInput(BaseModel):
"""Données d'entrée pour la recommandation de cultures (sans Item)."""
Area: str = Field(..., description="Pays (ex: 'France', 'Albania')")
Year: int = Field(..., ge=1990, le=2040, description="Année")
average_rain_fall_mm_per_year: float = Field(..., ge=40, le=4000, description="Précipitations moyennes annuelles (mm)")
pesticides_tonnes: float = Field(..., ge=0, le=400000, description="Quantité de pesticides utilisés (tonnes)")
avg_temp: float = Field(..., gt=0, le=35, description="Température moyenne (°C)")
class RecommendOutput(BaseModel):
"""Résultat de la recommandation : prédictions pour toutes les cultures, triées par rendement décroissant."""
area: str
year: int
recommendations: List[PredictionOutput]
status: str = "success"
# =======================================================================================================
# Endpoints
# =======================================================================================================
@app.get("/health")
def health_check():
"""Vérification de l'état de santé de l'API."""
logfire.info("Health check")
return {
"status": "ok",
"model_loaded": pipeline is not None,
"available_items": len(available_items),
"available_areas": len(available_areas),
}
@app.get("/columns")
def get_columns():
"""Retourne la liste des colonnes (features) attendues par le modèle."""
logfire.info("Colonnes demandées")
return {
"columns": FEATURE_COLUMNS,
"target": TARGET_COLUMN,
"available_items": available_items,
"available_areas": available_areas,
"available_items_per_area": available_items_per_area,
}
@app.post("/predict", response_model=PredictionOutput)
def predict(input_data: PredictInput):
"""
Prédiction de rendement pour une culture et un ensemble de variables explicatives.
"""
logfire.info(
"Requête /predict reçue: {area} / {item} / {year}",
area=input_data.Area,
item=input_data.Item,
year=input_data.Year,
)
if pipeline is None:
logfire.error("Pipeline non chargé")
raise HTTPException(status_code=503, detail="Modèle non chargé. Réessayez plus tard.")
# Validation métier : vérifier que le pays est connu
if input_data.Area not in available_areas:
raise HTTPException(
status_code=422,
detail=f"Pays '{input_data.Area}' inconnu. Consultez GET /columns pour la liste des pays.",
)
# Validation métier : vérifier que la culture est produite dans le pays sélectionné
if input_data.Item not in available_items_per_area.get(input_data.Area, []):
available_for_area = available_items_per_area.get(input_data.Area, [])
raise HTTPException(
status_code=422,
detail=f"Culture '{input_data.Item}' non produite dans '{input_data.Area}'. Cultures disponibles pour ce pays : {available_for_area}",
)
try:
df = pd.DataFrame([input_data.model_dump()])
# Appliquer la transformation log1p sur pesticides_tonnes (cohérence avec l'EDA / entraînement)
df["pesticides_tonnes"] = np.log1p(df["pesticides_tonnes"])
prediction = pipeline.predict(df)[0]
logfire.info("Prédiction effectuée: {yield_pred:.2f} hg/ha", yield_pred=float(prediction))
return PredictionOutput(
Area=input_data.Area,
Item=input_data.Item,
Year=input_data.Year,
predicted_yield=round(float(prediction), 2),
)
except Exception as e:
logfire.error("Erreur lors de la prédiction: {error}", error=str(e))
raise HTTPException(status_code=400, detail=str(e))
@app.post("/recommend", response_model=RecommendOutput)
def recommend(input_data: RecommendInput):
"""
Recommandation de cultures : prédit le rendement pour les cultures disponibles
dans le pays sélectionné et les renvoie classées par rendement décroissant.
"""
logfire.info(
"Requête /recommend reçue: {area} / {year}",
area=input_data.Area,
year=input_data.Year,
)
if pipeline is None:
logfire.error("Pipeline non chargé")
raise HTTPException(status_code=503, detail="Modèle non chargé. Réessayez plus tard.")
if input_data.Area not in available_areas:
raise HTTPException(
status_code=422,
detail=f"Pays '{input_data.Area}' inconnu. Consultez GET /columns pour la liste des pays.",
)
area_items = available_items_per_area.get(input_data.Area, [])
if not area_items:
raise HTTPException(
status_code=422,
detail=f"Aucune culture disponible pour le pays '{input_data.Area}'.",
)
try:
# Construire un DataFrame avec une ligne par culture disponible dans le pays
base_data = input_data.model_dump()
rows = []
for item in area_items:
row = {**base_data, "Item": item}
rows.append(row)
df = pd.DataFrame(rows)
# Appliquer la transformation log1p sur pesticides_tonnes (cohérence avec l'EDA / entraînement)
df["pesticides_tonnes"] = np.log1p(df["pesticides_tonnes"])
predictions = pipeline.predict(df)
# Associer chaque culture à sa prédiction et trier par rendement décroissant
results = [
PredictionOutput(Area=input_data.Area, Item=item, Year=input_data.Year, predicted_yield=round(float(pred), 2))
for item, pred in zip(area_items, predictions)
]
results.sort(key=lambda x: x.predicted_yield, reverse=True)
logfire.info(
"Recommandation effectuée: meilleure culture = {best} ({yield_pred:.2f} hg/ha)",
best=results[0].Item,
yield_pred=results[0].predicted_yield,
)
return RecommendOutput(area=input_data.Area, year=input_data.Year, recommendations=results)
except Exception as e:
logfire.error("Erreur lors de la recommandation: {error}", error=str(e))
raise HTTPException(status_code=400, detail=str(e))