EphAsad commited on
Commit
aa60674
·
verified ·
1 Parent(s): d0a80fe

train: update extended schema, aliases, signals from gold tests

Browse files
Files changed (1) hide show
  1. data/field_weights.json +547 -759
data/field_weights.json CHANGED
@@ -1,1131 +1,919 @@
1
  {
2
  "global": {
3
- "rules": 0.9675628739806129,
4
- "extended": 0.031340584729431166,
5
- "llm": 0.0010965412899559338
6
  },
7
  "fields": {
8
  "Gram Stain": {
9
- "rules": 0.9979925678075948,
10
- "extended": 0.0010037160962025914,
11
- "llm": 0.0010037160962025914,
12
- "support": 15870
13
  },
14
  "Shape": {
15
- "rules": 0.9978811147170336,
16
- "extended": 0.0010594426414831995,
17
- "llm": 0.0010594426414831995,
18
- "support": 15891
19
  },
20
  "Catalase": {
21
- "rules": 0.9980003188487044,
22
- "extended": 0.0009998405756478238,
23
- "llm": 0.0009998405756478238,
24
- "support": 15498
25
  },
26
  "Coagulase": {
27
- "rules": 0.9976936853194924,
28
- "extended": 0.0011531573402537919,
29
- "llm": 0.0011531573402537919,
30
- "support": 6048
31
  },
32
  "Haemolysis Type": {
33
- "rules": 0.9966942701498223,
34
- "extended": 0.0016528649250888826,
35
- "llm": 0.0016528649250888826,
36
- "support": 8325
37
  },
38
  "Haemolysis": {
39
- "rules": 0.9967734669580199,
40
- "extended": 0.0016132665209900162,
41
- "llm": 0.0016132665209900162,
42
- "support": 8988
43
  },
44
  "Oxidase": {
45
- "rules": 0.9979936936233068,
46
- "extended": 0.001003153188346618,
47
- "llm": 0.001003153188346618,
48
- "support": 14346
49
  },
50
  "Indole": {
51
- "rules": 0.9979702110823561,
52
- "extended": 0.0010148944588219604,
53
- "llm": 0.0010148944588219604,
54
- "support": 13779
55
  },
56
  "Urease": {
57
- "rules": 0.9979771560514908,
58
- "extended": 0.0010114219742545943,
59
- "llm": 0.0010114219742545943,
60
- "support": 14043
61
  },
62
  "DNase": {
63
- "rules": 0.997935015697696,
64
- "extended": 0.0010324921511519723,
65
- "llm": 0.0010324921511519723,
66
- "support": 10233
67
  },
68
  "VP": {
69
- "rules": 0.9979066566509994,
70
- "extended": 0.0010466716745002878,
71
- "llm": 0.0010466716745002878,
72
- "support": 10173
73
  },
74
  "Methyl Red": {
75
- "rules": 0.9979114392782644,
76
- "extended": 0.001044280360867765,
77
- "llm": 0.001044280360867765,
78
- "support": 10011
79
  },
80
  "Citrate": {
81
- "rules": 0.9979385857089585,
82
- "extended": 0.001030707145520738,
83
- "llm": 0.001030707145520738,
84
- "support": 11148
85
  },
86
  "Glucose Fermentation": {
87
- "rules": 0.9978902821512862,
88
- "extended": 0.0010548589243569116,
89
- "llm": 0.0010548589243569116,
90
- "support": 15582
91
  },
92
  "Mannitol Fermentation": {
93
- "rules": 0.9979283947641756,
94
- "extended": 0.001035802617912212,
95
- "llm": 0.001035802617912212,
96
- "support": 11154
97
  },
98
  "Sucrose Fermentation": {
99
- "rules": 0.9979356888634676,
100
- "extended": 0.0010321555682661888,
101
- "llm": 0.0010321555682661888,
102
- "support": 12873
103
  },
104
  "Lactose Fermentation": {
105
- "rules": 0.9979198647946759,
106
- "extended": 0.0010400676026620743,
107
- "llm": 0.0010400676026620743,
108
- "support": 13839
109
  },
110
  "NaCl Tolerant (>=6%)": {
111
- "rules": 0.9828673641453712,
112
- "extended": 0.008566317927314398,
113
- "llm": 0.008566317927314398,
114
- "support": 10206
115
  },
116
  "Motility": {
117
- "rules": 0.9976198496805297,
118
- "extended": 0.0011900751597351462,
119
- "llm": 0.0011900751597351462,
120
- "support": 14829
121
  },
122
  "H2S": {
123
- "rules": 0.9979426244481245,
124
- "extended": 0.0010286877759377346,
125
- "llm": 0.0010286877759377346,
126
- "support": 10590
127
  },
128
  "Nitrate Reduction": {
129
- "rules": 0.9979865011402915,
130
- "extended": 0.0010067494298542368,
131
- "llm": 0.0010067494298542368,
132
- "support": 12309
133
  },
134
  "Oxygen Requirement": {
135
- "rules": 0.9977879548391024,
136
- "extended": 0.001106022580448768,
137
- "llm": 0.001106022580448768,
138
- "support": 13638
139
  },
140
  "Growth Temperature": {
141
- "rules": 0.9975753560082203,
142
- "extended": 0.0012123219958898523,
143
- "llm": 0.0012123219958898523,
144
- "support": 15507
145
  },
146
  "Xylose Fermentation": {
147
- "rules": 0.997940589446712,
148
- "extended": 0.0010297052766439548,
149
- "llm": 0.0010297052766439548,
150
- "support": 9558
151
  },
152
  "Arabinose Fermentation": {
153
- "rules": 0.9979425095024794,
154
- "extended": 0.0010287452487602725,
155
- "llm": 0.0010287452487602725,
156
- "support": 9543
157
  },
158
  "Raffinose Fermentation": {
159
- "rules": 0.9979227507489872,
160
- "extended": 0.0010386246255064114,
161
- "llm": 0.0010386246255064114,
162
- "support": 8862
163
  },
164
  "ONPG": {
165
- "rules": 0.9979783128101452,
166
- "extended": 0.0010108435949274031,
167
- "llm": 0.0010108435949274031,
168
- "support": 10020
169
  },
170
  "Lysine Decarboxylase": {
171
- "rules": 0.9978700623193356,
172
- "extended": 0.0010649688403321785,
173
- "llm": 0.0010649688403321785,
174
- "support": 9465
175
  },
176
  "Spore Formation": {
177
- "rules": 0.9955528170721619,
178
- "extended": 0.002223591463919055,
179
- "llm": 0.002223591463919055,
180
- "support": 10869
181
  },
182
  "Media Grown On": {
183
- "rules": 0.9961000815348193,
184
- "extended": 0.0019499592325903513,
185
- "llm": 0.0019499592325903513,
186
- "support": 10212
187
  },
188
  "Maltose Fermentation": {
189
- "rules": 0.9979262458527937,
190
- "extended": 0.001036877073603175,
191
- "llm": 0.001036877073603175,
192
- "support": 10617
193
  },
194
  "Rhamnose Fermentation": {
195
- "rules": 0.9979193929380458,
196
- "extended": 0.0010403035309771284,
197
- "llm": 0.0010403035309771284,
198
- "support": 8538
199
  },
200
  "Esculin Hydrolysis": {
201
- "rules": 0.998001675040904,
202
- "extended": 0.0009991624795480758,
203
- "llm": 0.0009991624795480758,
204
- "support": 10341
205
  },
206
  "Gelatin Hydrolysis": {
207
- "rules": 0.997957695633608,
208
- "extended": 0.00102115218319601,
209
- "llm": 0.00102115218319601,
210
- "support": 10527
211
  },
212
  "Colony Morphology": {
213
- "rules": 0.9781693825400556,
214
- "extended": 0.010915308729972172,
215
- "llm": 0.010915308729972172,
216
- "support": 11172
217
  },
218
  "Sorbitol Fermentation": {
219
- "rules": 0.9979304162566498,
220
- "extended": 0.0010347918716751235,
221
- "llm": 0.0010347918716751235,
222
- "support": 8961
223
  },
224
  "Capsule": {
225
- "rules": 0.9975030871628391,
226
- "extended": 0.0012484564185804487,
227
- "llm": 0.0012484564185804487,
228
- "support": 9228
229
  },
230
  "CAMP": {
231
- "rules": 0.0009980039920159682,
232
- "extended": 0.9980039920159682,
233
- "llm": 0.0009980039920159682,
234
- "support": 153
235
  },
236
  "Hippurate Hydrolysis": {
237
- "rules": 0.001034440793476938,
238
- "extended": 0.9979311184130462,
239
- "llm": 0.001034440793476938,
240
- "support": 132
241
  },
242
  "PYR": {
243
- "rules": 0.0009980039920159682,
244
- "extended": 0.9980039920159682,
245
- "llm": 0.0009980039920159682,
246
- "support": 195
247
  },
248
  "Optochin": {
249
- "rules": 0.0011639507815098106,
250
- "extended": 0.9976720984369803,
251
- "llm": 0.0011639507815098106,
252
- "support": 21
253
  },
254
  "Bile Solubility": {
255
- "rules": 0.003229011425732737,
256
- "extended": 0.9935419771485345,
257
- "llm": 0.003229011425732737,
258
- "support": 33
259
  },
260
  "Novobiocin": {
261
- "rules": 0.0014955134596211367,
262
- "extended": 0.9970089730807578,
263
- "llm": 0.0014955134596211367,
264
- "support": 18
265
  },
266
  "Bile Resistance": {
267
- "rules": 0.3333333333333333,
268
- "extended": 0.3333333333333333,
269
- "llm": 0.3333333333333333,
270
- "support": 12
271
  },
272
  "Lipase": {
273
- "rules": 0.777294011786429,
274
- "extended": 0.1219384093106018,
275
- "llm": 0.10076757890296914,
276
- "support": 3
277
  },
278
  "Lecithinase": {
279
- "rules": 0.0013534691551503064,
280
- "extended": 0.9972930616896993,
281
- "llm": 0.0013534691551503064,
282
- "support": 33
283
  },
284
  "Odour": {
285
- "rules": 0.3333333333333333,
286
- "extended": 0.3333333333333333,
287
- "llm": 0.3333333333333333,
288
- "support": 51
289
  },
290
  "Growth Factors": {
291
- "rules": 0.3333333333333333,
292
- "extended": 0.3333333333333333,
293
- "llm": 0.3333333333333333,
294
- "support": 9
295
  },
296
  "Fructose Fermentation": {
297
- "rules": 0.3333333333333333,
298
- "extended": 0.3333333333333333,
299
- "llm": 0.3333333333333333,
300
- "support": 99
301
  },
302
  "Glucose Oxidation": {
303
- "rules": 0.0010776722279875468,
304
- "extended": 0.9978446555440249,
305
- "llm": 0.0010776722279875468,
306
- "support": 258
307
  },
308
  "Glycerol Fermentation": {
309
- "rules": 0.777294011786429,
310
- "extended": 0.1219384093106018,
311
- "llm": 0.10076757890296914,
312
- "support": 3
313
  },
314
  "Fermentation Products": {
315
- "rules": 0.777294011786429,
316
- "extended": 0.1219384093106018,
317
- "llm": 0.10076757890296914,
318
- "support": 3
319
  },
320
  "Cellobiose Fermentation": {
321
- "rules": 0.777294011786429,
322
- "extended": 0.1219384093106018,
323
- "llm": 0.10076757890296914,
324
- "support": 3
325
  },
326
  "Arginine dihydrolase": {
327
- "rules": 0.9978618847032258,
328
- "extended": 0.0010690576483871077,
329
- "llm": 0.0010690576483871077,
330
- "support": 9150
331
  },
332
  "NaCl Tolerant (>=15%)": {
333
- "rules": 0.777294011786429,
334
- "extended": 0.1219384093106018,
335
- "llm": 0.10076757890296914,
336
- "support": 3
337
  },
338
  "Temperature Dependence": {
339
- "rules": 0.777294011786429,
340
- "extended": 0.1219384093106018,
341
- "llm": 0.10076757890296914,
342
- "support": 3
343
  },
344
  "Sulfur Utilization": {
345
- "rules": 0.777294011786429,
346
- "extended": 0.1219384093106018,
347
- "llm": 0.10076757890296914,
348
- "support": 3
349
  },
350
  "Acid Fast": {
351
- "rules": 0.3333333333333333,
352
- "extended": 0.3333333333333333,
353
- "llm": 0.3333333333333333,
354
- "support": 156
355
  },
356
  "NaCl Tolerant (>=10%)": {
357
- "rules": 0.777294011786429,
358
- "extended": 0.1219384093106018,
359
- "llm": 0.10076757890296914,
360
- "support": 3
361
  },
362
  "pH Range": {
363
- "rules": 0.777294011786429,
364
- "extended": 0.1219384093106018,
365
- "llm": 0.10076757890296914,
366
- "support": 3
367
  },
368
  "Fermentation Product": {
369
- "rules": 0.777294011786429,
370
- "extended": 0.1219384093106018,
371
- "llm": 0.10076757890296914,
372
- "support": 3
373
  },
374
  "Ornithine Decarboxylase": {
375
- "rules": 0.0013214187485128409,
376
- "extended": 0.9973571625029743,
377
- "llm": 0.0013214187485128409,
378
- "support": 9309
379
  },
380
  "Lipase Test": {
381
- "rules": 0.997894485020045,
382
- "extended": 0.0010527574899774944,
383
- "llm": 0.0010527574899774944,
384
- "support": 7056
385
- },
386
- "Arginine Hydrolysis": {
387
- "rules": 0.777294011786429,
388
- "extended": 0.1219384093106018,
389
- "llm": 0.10076757890296914,
390
- "support": 3
391
  },
392
  "Casein Hydrolysis": {
393
- "rules": 0.0009980039920159682,
394
- "extended": 0.9980039920159682,
395
- "llm": 0.0009980039920159682,
396
- "support": 9
397
  },
398
  "Tyrosine Hydrolysis": {
399
- "rules": 0.6775934129840339,
400
- "extended": 0.3213396069153923,
401
- "llm": 0.0010669801005739443,
402
- "support": 3
403
  },
404
  "Mannose Fermentation": {
405
- "rules": 0.3333333333333333,
406
- "extended": 0.3333333333333333,
407
- "llm": 0.3333333333333333,
408
- "support": 15
409
  },
410
  "Gas Production": {
411
- "rules": 0.001258189567228129,
412
- "extended": 0.9974836208655438,
413
- "llm": 0.001258189567228129,
414
- "support": 600
415
  },
416
  "Optochin Sensitivity": {
417
- "rules": 0.3333333333333333,
418
- "extended": 0.3333333333333333,
419
- "llm": 0.3333333333333333,
420
- "support": 27
421
  },
422
  "Inulin Fermentation": {
423
- "rules": 0.777294011786429,
424
- "extended": 0.1219384093106018,
425
- "llm": 0.10076757890296914,
426
- "support": 3
427
  },
428
  "Other Products": {
429
- "rules": 0.777294011786429,
430
- "extended": 0.1219384093106018,
431
- "llm": 0.10076757890296914,
432
- "support": 3
433
  },
434
  "Antibiotic Resistance": {
435
- "rules": 0.3333333333333333,
436
- "extended": 0.3333333333333333,
437
- "llm": 0.3333333333333333,
438
- "support": 51
439
  },
440
  "Metabolic Product": {
441
- "rules": 0.777294011786429,
442
- "extended": 0.1219384093106018,
443
- "llm": 0.10076757890296914,
444
- "support": 3
445
  },
446
  "Bacitracin": {
447
- "rules": 0.0009980039920159682,
448
- "extended": 0.9980039920159682,
449
- "llm": 0.0009980039920159682,
450
- "support": 9
451
  },
452
  "Bacitracin Sensitivity": {
453
- "rules": 0.3333333333333333,
454
- "extended": 0.3333333333333333,
455
- "llm": 0.3333333333333333,
456
- "support": 9
457
  },
458
  "Pigment Production": {
459
- "rules": 0.3333333333333333,
460
- "extended": 0.3333333333333333,
461
- "llm": 0.3333333333333333,
462
- "support": 477
463
  },
464
  "Indoxyl Acetate": {
465
- "rules": 0.3333333333333333,
466
- "extended": 0.3333333333333333,
467
- "llm": 0.3333333333333333,
468
- "support": 24
469
  },
470
  "Growth Requirements": {
471
- "rules": 0.3333333333333333,
472
- "extended": 0.3333333333333333,
473
- "llm": 0.3333333333333333,
474
- "support": 33
475
  },
476
  "Aerolysin Production": {
477
- "rules": 0.777294011786429,
478
- "extended": 0.1219384093106018,
479
- "llm": 0.10076757890296914,
480
- "support": 3
481
  },
482
  "Bile Esculin": {
483
- "rules": 0.3333333333333333,
484
- "extended": 0.3333333333333333,
485
- "llm": 0.3333333333333333,
486
- "support": 126
487
  },
488
  "Arrangement": {
489
- "rules": 0.3333333333333333,
490
- "extended": 0.3333333333333333,
491
- "llm": 0.3333333333333333,
492
- "support": 30
493
  },
494
  "Toxin A": {
495
- "rules": 0.777294011786429,
496
- "extended": 0.1219384093106018,
497
- "llm": 0.10076757890296914,
498
- "support": 3
499
  },
500
  "Toxin B": {
501
- "rules": 0.777294011786429,
502
- "extended": 0.1219384093106018,
503
- "llm": 0.10076757890296914,
504
- "support": 3
505
  },
506
  "Carbohydrate Utilisation": {
507
- "rules": 0.3333333333333333,
508
- "extended": 0.3333333333333333,
509
- "llm": 0.3333333333333333,
510
- "support": 57
511
  },
512
  "Novobiocin Sensitivity": {
513
- "rules": 0.3333333333333333,
514
- "extended": 0.3333333333333333,
515
- "llm": 0.3333333333333333,
516
- "support": 75
517
  },
518
  "Vancomycin Resistance": {
519
- "rules": 0.020613614573346116,
520
- "extended": 0.9587727708533077,
521
- "llm": 0.020613614573346116,
522
- "support": 126
523
  },
524
  "Nitrogen Fixation": {
525
- "rules": 0.3333333333333333,
526
- "extended": 0.3333333333333333,
527
- "llm": 0.3333333333333333,
528
- "support": 6
529
  },
530
  "Pseudohyphae": {
531
- "rules": 0.3333333333333333,
532
- "extended": 0.3333333333333333,
533
- "llm": 0.3333333333333333,
534
- "support": 6
535
  },
536
  "Germ Tube": {
537
- "rules": 0.3333333333333333,
538
- "extended": 0.3333333333333333,
539
- "llm": 0.3333333333333333,
540
- "support": 93
541
  },
542
  "Budding": {
543
- "rules": 0.777294011786429,
544
- "extended": 0.1219384093106018,
545
- "llm": 0.10076757890296914,
546
- "support": 3
547
  },
548
  "Hyphae": {
549
- "rules": 0.777294011786429,
550
- "extended": 0.1219384093106018,
551
- "llm": 0.10076757890296914,
552
- "support": 3
553
  },
554
  "Ethanol Production": {
555
- "rules": 0.3333333333333333,
556
- "extended": 0.3333333333333333,
557
- "llm": 0.3333333333333333,
558
- "support": 9
559
  },
560
  "Intracellular Lifestyle": {
561
- "rules": 0.3333333333333333,
562
- "extended": 0.3333333333333333,
563
- "llm": 0.3333333333333333,
564
- "support": 12
565
  },
566
  "Fermentation Substrate": {
567
- "rules": 0.777294011786429,
568
- "extended": 0.1219384093106018,
569
- "llm": 0.10076757890296914,
570
- "support": 3
571
  },
572
  "Morphology Detail": {
573
- "rules": 0.3333333333333333,
574
- "extended": 0.3333333333333333,
575
- "llm": 0.3333333333333333,
576
- "support": 9
577
  },
578
  "Toxin Production": {
579
- "rules": 0.3333333333333333,
580
- "extended": 0.3333333333333333,
581
- "llm": 0.3333333333333333,
582
- "support": 39
583
  },
584
  "Organic Acids Production": {
585
- "rules": 0.3333333333333333,
586
- "extended": 0.3333333333333333,
587
- "llm": 0.3333333333333333,
588
- "support": 198
589
  },
590
  "Butyrate Esterase": {
591
- "rules": 0.3333333333333333,
592
- "extended": 0.3333333333333333,
593
- "llm": 0.3333333333333333,
594
- "support": 6
595
  },
596
  "Dextran Production": {
597
- "rules": 0.3333333333333333,
598
- "extended": 0.3333333333333333,
599
- "llm": 0.3333333333333333,
600
- "support": 9
601
  },
602
  "Denitrification": {
603
- "rules": 0.3333333333333333,
604
- "extended": 0.3333333333333333,
605
- "llm": 0.3333333333333333,
606
- "support": 15
607
  },
608
  "Acid Tolerance": {
609
- "rules": 0.3333333333333333,
610
- "extended": 0.3333333333333333,
611
- "llm": 0.3333333333333333,
612
- "support": 33
613
  },
614
  "Special Metabolism": {
615
- "rules": 0.3333333333333333,
616
- "extended": 0.3333333333333333,
617
- "llm": 0.3333333333333333,
618
- "support": 18
619
  },
620
  "Galactose Fermentation": {
621
- "rules": 0.3333333333333333,
622
- "extended": 0.3333333333333333,
623
- "llm": 0.3333333333333333,
624
- "support": 12
625
  },
626
  "Desiccation Tolerance": {
627
- "rules": 0.3333333333333333,
628
- "extended": 0.3333333333333333,
629
- "llm": 0.3333333333333333,
630
- "support": 84
631
  },
632
  "UV Resistance": {
633
- "rules": 0.777294011786429,
634
- "extended": 0.1219384093106018,
635
- "llm": 0.10076757890296914,
636
- "support": 3
637
  },
638
  "Nalidixic Acid Resistance": {
639
- "rules": 0.777294011786429,
640
- "extended": 0.1219384093106018,
641
- "llm": 0.10076757890296914,
642
- "support": 3
643
  },
644
  "Bile Tolerance": {
645
- "rules": 0.3333333333333333,
646
- "extended": 0.3333333333333333,
647
- "llm": 0.3333333333333333,
648
- "support": 18
649
  },
650
  "Protease Production": {
651
- "rules": 0.777294011786429,
652
- "extended": 0.1219384093106018,
653
- "llm": 0.10076757890296914,
654
- "support": 3
655
  },
656
  "Aerotolerance": {
657
- "rules": 0.3333333333333333,
658
- "extended": 0.3333333333333333,
659
- "llm": 0.3333333333333333,
660
- "support": 12
661
  },
662
  "Phenylalanine Deaminase": {
663
- "rules": 0.3333333333333333,
664
- "extended": 0.3333333333333333,
665
- "llm": 0.3333333333333333,
666
- "support": 12
667
  },
668
  "Motility at 25C": {
669
- "rules": 0.3333333333333333,
670
- "extended": 0.3333333333333333,
671
- "llm": 0.3333333333333333,
672
- "support": 6
673
  },
674
  "Motility at 37C": {
675
- "rules": 0.3333333333333333,
676
- "extended": 0.3333333333333333,
677
- "llm": 0.3333333333333333,
678
- "support": 6
679
  },
680
  "Bipolar Staining": {
681
- "rules": 0.3333333333333333,
682
- "extended": 0.3333333333333333,
683
- "llm": 0.3333333333333333,
684
- "support": 6
685
  },
686
  "X Factor Requirement": {
687
- "rules": 0.3333333333333333,
688
- "extended": 0.3333333333333333,
689
- "llm": 0.3333333333333333,
690
- "support": 6
691
  },
692
  "V Factor Requirement": {
693
- "rules": 0.3333333333333333,
694
- "extended": 0.3333333333333333,
695
- "llm": 0.3333333333333333,
696
- "support": 6
697
  },
698
  "Satellite Phenomenon": {
699
- "rules": 0.777294011786429,
700
- "extended": 0.1219384093106018,
701
- "llm": 0.10076757890296914,
702
- "support": 3
703
  },
704
  "Cysteine Requirement": {
705
- "rules": 0.3333333333333333,
706
- "extended": 0.3333333333333333,
707
- "llm": 0.3333333333333333,
708
- "support": 6
709
  },
710
  "Iron Requirement": {
711
- "rules": 0.3333333333333333,
712
- "extended": 0.3333333333333333,
713
- "llm": 0.3333333333333333,
714
- "support": 6
715
  },
716
  "Niacin": {
717
- "rules": 0.777294011786429,
718
- "extended": 0.1219384093106018,
719
- "llm": 0.10076757890296914,
720
- "support": 3
721
- },
722
- "Catalase at 68C": {
723
- "rules": 0.777294011786429,
724
- "extended": 0.1219384093106018,
725
- "llm": 0.10076757890296914,
726
- "support": 3
727
  },
728
  "Carbohydrate Fermentation": {
729
- "rules": 0.3333333333333333,
730
- "extended": 0.3333333333333333,
731
- "llm": 0.3333333333333333,
732
- "support": 45
733
  },
734
  "Growth Rate": {
735
- "rules": 0.3333333333333333,
736
- "extended": 0.3333333333333333,
737
- "llm": 0.3333333333333333,
738
- "support": 24
739
  },
740
  "Cell Wall Lipids": {
741
- "rules": 0.777294011786429,
742
- "extended": 0.1219384093106018,
743
- "llm": 0.10076757890296914,
744
- "support": 3
745
  },
746
  "Chlamydospore Formation": {
747
- "rules": 0.777294011786429,
748
- "extended": 0.1219384093106018,
749
- "llm": 0.10076757890296914,
750
- "support": 3
751
  },
752
  "Metachromatic Granules": {
753
- "rules": 0.777294011786429,
754
- "extended": 0.1219384093106018,
755
- "llm": 0.10076757890296914,
756
- "support": 3
757
  },
758
  "Starch Hydrolysis": {
759
- "rules": 0.777294011786429,
760
- "extended": 0.1219384093106018,
761
- "llm": 0.10076757890296914,
762
- "support": 3
763
  },
764
  "Sugar Fermentation": {
765
- "rules": 0.777294011786429,
766
- "extended": 0.1219384093106018,
767
- "llm": 0.10076757890296914,
768
- "support": 3
769
  },
770
  "Special Features": {
771
- "rules": 0.777294011786429,
772
- "extended": 0.1219384093106018,
773
- "llm": 0.10076757890296914,
774
- "support": 3
775
  },
776
  "Lactate Fermentation": {
777
- "rules": 0.777294011786429,
778
- "extended": 0.1219384093106018,
779
- "llm": 0.10076757890296914,
780
- "support": 3
781
  },
782
  "Pyruvate Metabolism": {
783
- "rules": 0.777294011786429,
784
- "extended": 0.1219384093106018,
785
- "llm": 0.10076757890296914,
786
- "support": 3
787
  },
788
  "Lactate Utilisation": {
789
- "rules": 0.777294011786429,
790
- "extended": 0.1219384093106018,
791
- "llm": 0.10076757890296914,
792
- "support": 3
793
  },
794
  "Culture Requirement": {
795
- "rules": 0.3333333333333333,
796
- "extended": 0.3333333333333333,
797
- "llm": 0.3333333333333333,
798
- "support": 15
799
  },
800
  "Detection Method": {
801
- "rules": 0.3333333333333333,
802
- "extended": 0.3333333333333333,
803
- "llm": 0.3333333333333333,
804
- "support": 6
805
  },
806
  "Budding Type": {
807
- "rules": 0.777294011786429,
808
- "extended": 0.1219384093106018,
809
- "llm": 0.10076757890296914,
810
- "support": 3
811
  },
812
  "Inositol Assimilation": {
813
- "rules": 0.777294011786429,
814
- "extended": 0.1219384093106018,
815
- "llm": 0.10076757890296914,
816
- "support": 3
817
  },
818
  "Organism Type": {
819
- "rules": 0.777294011786429,
820
- "extended": 0.1219384093106018,
821
- "llm": 0.10076757890296914,
822
- "support": 3
823
  },
824
  "Stain Preference": {
825
- "rules": 0.777294011786429,
826
- "extended": 0.1219384093106018,
827
- "llm": 0.10076757890296914,
828
- "support": 3
829
  },
830
  "Flagella Type": {
831
- "rules": 0.777294011786429,
832
- "extended": 0.1219384093106018,
833
- "llm": 0.10076757890296914,
834
- "support": 3
835
  },
836
  "Intracellular": {
837
- "rules": 0.3333333333333333,
838
- "extended": 0.3333333333333333,
839
- "llm": 0.3333333333333333,
840
- "support": 6
841
  },
842
  "Developmental Cycle": {
843
- "rules": 0.777294011786429,
844
- "extended": 0.1219384093106018,
845
- "llm": 0.10076757890296914,
846
- "support": 3
847
  },
848
  "Metabolism": {
849
- "rules": 0.3333333333333333,
850
- "extended": 0.3333333333333333,
851
- "llm": 0.3333333333333333,
852
- "support": 6
853
  },
854
  "Substrate Utilisation": {
855
- "rules": 0.777294011786429,
856
- "extended": 0.1219384093106018,
857
- "llm": 0.10076757890296914,
858
- "support": 3
859
  },
860
  "Environmental Survival": {
861
- "rules": 0.777294011786429,
862
- "extended": 0.1219384093106018,
863
- "llm": 0.10076757890296914,
864
- "support": 3
865
  },
866
  "Thermophilic": {
867
- "rules": 0.3333333333333333,
868
- "extended": 0.3333333333333333,
869
- "llm": 0.3333333333333333,
870
- "support": 6
871
  },
872
  "Cephalothin Sensitivity": {
873
- "rules": 0.777294011786429,
874
- "extended": 0.1219384093106018,
875
- "llm": 0.10076757890296914,
876
- "support": 3
877
  },
878
  "Metabolic Products": {
879
- "rules": 0.3333333333333333,
880
- "extended": 0.3333333333333333,
881
- "llm": 0.3333333333333333,
882
- "support": 30
883
  },
884
  "UV Tolerance": {
885
- "rules": 0.777294011786429,
886
- "extended": 0.1219384093106018,
887
- "llm": 0.10076757890296914,
888
- "support": 3
889
  },
890
  "Heat Resistance": {
891
- "rules": 0.3333333333333333,
892
- "extended": 0.3333333333333333,
893
- "llm": 0.3333333333333333,
894
- "support": 6
895
  },
896
  "pH Tolerance": {
897
- "rules": 0.3333333333333333,
898
- "extended": 0.3333333333333333,
899
- "llm": 0.3333333333333333,
900
- "support": 12
901
  },
902
  "Vitamin B12 Production": {
903
- "rules": 0.777294011786429,
904
- "extended": 0.1219384093106018,
905
- "llm": 0.10076757890296914,
906
- "support": 3
907
  },
908
  "Enzyme Production": {
909
- "rules": 0.777294011786429,
910
- "extended": 0.1219384093106018,
911
- "llm": 0.10076757890296914,
912
- "support": 3
913
  },
914
  "Attachment Mechanism": {
915
- "rules": 0.777294011786429,
916
- "extended": 0.1219384093106018,
917
- "llm": 0.10076757890296914,
918
- "support": 3
919
  },
920
  "Secondary Metabolites": {
921
- "rules": 0.3333333333333333,
922
- "extended": 0.3333333333333333,
923
- "llm": 0.3333333333333333,
924
- "support": 18
925
  },
926
  "Ammonia Production": {
927
- "rules": 0.777294011786429,
928
- "extended": 0.1219384093106018,
929
- "llm": 0.10076757890296914,
930
- "support": 3
931
  },
932
  "Bioluminescence": {
933
- "rules": 0.3333333333333333,
934
- "extended": 0.3333333333333333,
935
- "llm": 0.3333333333333333,
936
- "support": 6
937
  },
938
  "Metabolism Type": {
939
- "rules": 0.3333333333333333,
940
- "extended": 0.3333333333333333,
941
- "llm": 0.3333333333333333,
942
- "support": 33
943
  },
944
  "Chromium Reduction": {
945
- "rules": 0.3333333333333333,
946
- "extended": 0.3333333333333333,
947
- "llm": 0.3333333333333333,
948
- "support": 6
949
  },
950
  "Metabolic Capability": {
951
- "rules": 0.3333333333333333,
952
- "extended": 0.3333333333333333,
953
- "llm": 0.3333333333333333,
954
- "support": 6
955
  },
956
  "Melibiose Fermentation": {
957
- "rules": 0.3333333333333333,
958
- "extended": 0.3333333333333333,
959
- "llm": 0.3333333333333333,
960
- "support": 9
961
  },
962
  "Radiation Resistance": {
963
- "rules": 0.777294011786429,
964
- "extended": 0.1219384093106018,
965
- "llm": 0.10076757890296914,
966
- "support": 3
967
  },
968
  "Growth Requirement": {
969
- "rules": 0.3333333333333333,
970
- "extended": 0.3333333333333333,
971
- "llm": 0.3333333333333333,
972
- "support": 48
973
  },
974
  "MacConkey Growth": {
975
- "rules": 0.3333333333333333,
976
- "extended": 0.3333333333333333,
977
- "llm": 0.3333333333333333,
978
- "support": 24
979
  },
980
  "Phenylalanine Deamination": {
981
- "rules": 0.3333333333333333,
982
- "extended": 0.3333333333333333,
983
- "llm": 0.3333333333333333,
984
- "support": 6
985
  },
986
  "Nitrite Reduction": {
987
- "rules": 0.3333333333333333,
988
- "extended": 0.3333333333333333,
989
- "llm": 0.3333333333333333,
990
- "support": 9
991
  },
992
  "Electron Acceptors": {
993
- "rules": 0.3333333333333333,
994
- "extended": 0.3333333333333333,
995
- "llm": 0.3333333333333333,
996
- "support": 21
997
  },
998
  "Lactate Utilization": {
999
- "rules": 0.3333333333333333,
1000
- "extended": 0.3333333333333333,
1001
- "llm": 0.3333333333333333,
1002
- "support": 24
1003
  },
1004
  "Glycyrrhizin Hydrolysis": {
1005
- "rules": 0.777294011786429,
1006
- "extended": 0.1219384093106018,
1007
- "llm": 0.10076757890296914,
1008
- "support": 3
1009
  },
1010
  "Pyrazinamidase": {
1011
- "rules": 0.777294011786429,
1012
- "extended": 0.1219384093106018,
1013
- "llm": 0.10076757890296914,
1014
- "support": 3
1015
  },
1016
  "Aromatic Compound Degradation": {
1017
- "rules": 0.777294011786429,
1018
- "extended": 0.1219384093106018,
1019
- "llm": 0.10076757890296914,
1020
- "support": 3
1021
  },
1022
  "Xylose Oxidation": {
1023
- "rules": 0.3333333333333333,
1024
- "extended": 0.3333333333333333,
1025
- "llm": 0.3333333333333333,
1026
- "support": 6
1027
  },
1028
  "Blood Agar Growth": {
1029
- "rules": 0.777294011786429,
1030
- "extended": 0.1219384093106018,
1031
- "llm": 0.10076757890296914,
1032
- "support": 3
1033
  },
1034
  "Beta-lactamase": {
1035
- "rules": 0.777294011786429,
1036
- "extended": 0.1219384093106018,
1037
- "llm": 0.10076757890296914,
1038
- "support": 3
1039
  },
1040
  "Mannitol Oxidation": {
1041
- "rules": 0.777294011786429,
1042
- "extended": 0.1219384093106018,
1043
- "llm": 0.10076757890296914,
1044
- "support": 3
1045
  },
1046
  "Colony Odour": {
1047
- "rules": 0.3333333333333333,
1048
- "extended": 0.3333333333333333,
1049
- "llm": 0.3333333333333333,
1050
- "support": 12
1051
  },
1052
  "Trehalose Fermentation": {
1053
- "rules": 0.9979337979484765,
1054
- "extended": 0.0010331010257617782,
1055
- "llm": 0.0010331010257617782,
1056
- "support": 9405
1057
  },
1058
  "Parasporal Crystal": {
1059
- "rules": 0.777294011786429,
1060
- "extended": 0.1219384093106018,
1061
- "llm": 0.10076757890296914,
1062
- "support": 3
1063
  },
1064
  "Lancefield Group": {
1065
- "rules": 0.3333333333333333,
1066
- "extended": 0.3333333333333333,
1067
- "llm": 0.3333333333333333,
1068
- "support": 9
1069
  },
1070
  "NaCl Requirement": {
1071
- "rules": 0.777294011786429,
1072
- "extended": 0.1219384093106018,
1073
- "llm": 0.10076757890296914,
1074
- "support": 3
1075
  },
1076
  "Fermentation Type": {
1077
- "rules": 0.777294011786429,
1078
- "extended": 0.1219384093106018,
1079
- "llm": 0.10076757890296914,
1080
- "support": 3
1081
  },
1082
  "Ribose Fermentation": {
1083
- "rules": 0.3333333333333333,
1084
- "extended": 0.3333333333333333,
1085
- "llm": 0.3333333333333333,
1086
- "support": 12
1087
  },
1088
  "Inositol Fermentation": {
1089
- "rules": 0.997924224494151,
1090
- "extended": 0.0010378877529245156,
1091
- "llm": 0.0010378877529245156,
1092
- "support": 8286
1093
  },
1094
  "Chlamydospore Production": {
1095
- "rules": 0.3333333333333333,
1096
- "extended": 0.3333333333333333,
1097
- "llm": 0.3333333333333333,
1098
- "support": 63
1099
  },
1100
  "Phenol Oxidase": {
1101
- "rules": 0.3333333333333333,
1102
- "extended": 0.3333333333333333,
1103
- "llm": 0.3333333333333333,
1104
- "support": 21
1105
- },
1106
- "Orнithine Decarboxylase": {
1107
- "rules": 0.777294011786429,
1108
- "extended": 0.1219384093106018,
1109
- "llm": 0.10076757890296914,
1110
- "support": 3
1111
- },
1112
- "Raffination Fermentation": {
1113
- "rules": 0.777294011786429,
1114
- "extended": 0.1219384093106018,
1115
- "llm": 0.10076757890296914,
1116
- "support": 3
1117
- },
1118
- "Raffinose": {
1119
- "rules": 0.777294011786429,
1120
- "extended": 0.1219384093106018,
1121
- "llm": 0.10076757890296914,
1122
- "support": 3
1123
  }
1124
  },
1125
  "meta": {
1126
- "total_samples": 5297,
1127
  "missing_penalty": 0.5,
1128
  "smoothing": 0.001,
1129
- "include_llm": true
1130
  }
1131
  }
 
1
  {
2
  "global": {
3
+ "rules": 0.9684492739005802,
4
+ "extended": 0.03155072609941975
 
5
  },
6
  "fields": {
7
  "Gram Stain": {
8
+ "rules": 0.9989953070011338,
9
+ "extended": 0.0010046929988661594,
10
+ "support": 10638
 
11
  },
12
  "Shape": {
13
+ "rules": 0.9989397921679791,
14
+ "extended": 0.0010602078320208837,
15
+ "support": 10652
 
16
  },
17
  "Catalase": {
18
+ "rules": 0.9989990727298705,
19
+ "extended": 0.001000927270129465,
20
+ "support": 10392
 
21
  },
22
  "Coagulase": {
23
+ "rules": 0.998848390313722,
24
+ "extended": 0.0011516096862780492,
25
+ "support": 4090
 
26
  },
27
  "Haemolysis Type": {
28
+ "rules": 0.9983325721932517,
29
+ "extended": 0.0016674278067483035,
30
+ "support": 5608
 
31
  },
32
  "Haemolysis": {
33
+ "rules": 0.9983735228118827,
34
+ "extended": 0.0016264771881172309,
35
+ "support": 6050
 
36
  },
37
  "Oxidase": {
38
+ "rules": 0.9989958708659553,
39
+ "extended": 0.0010041291340446919,
40
+ "support": 9622
 
41
  },
42
  "Indole": {
43
+ "rules": 0.9989841840137339,
44
+ "extended": 0.0010158159862661412,
45
+ "support": 9244
 
46
  },
47
  "Urease": {
48
+ "rules": 0.9989876388870617,
49
+ "extended": 0.001012361112938336,
50
+ "support": 9420
 
51
  },
52
  "DNase": {
53
+ "rules": 0.9989667519356145,
54
+ "extended": 0.001033248064385579,
55
+ "support": 6880
 
56
  },
57
  "VP": {
58
+ "rules": 0.9989526850656734,
59
+ "extended": 0.0010473149343266277,
60
+ "support": 6840
 
61
  },
62
  "Methyl Red": {
63
+ "rules": 0.9989550638602668,
64
+ "extended": 0.0010449361397332514,
65
+ "support": 6732
 
66
  },
67
  "Citrate": {
68
+ "rules": 0.9989684996763154,
69
+ "extended": 0.0010315003236845458,
70
+ "support": 7490
 
71
  },
72
  "Glucose Fermentation": {
73
+ "rules": 0.9989443705716097,
74
+ "extended": 0.0010556294283903687,
75
+ "support": 10446
 
76
  },
77
  "Mannitol Fermentation": {
78
+ "rules": 0.9989634365709491,
79
+ "extended": 0.0010365634290509505,
80
+ "support": 7494
 
81
  },
82
  "Sucrose Fermentation": {
83
+ "rules": 0.998967021932704,
84
+ "extended": 0.0010329780672959487,
85
+ "support": 8640
 
86
  },
87
  "Lactose Fermentation": {
88
+ "rules": 0.9989591305151586,
89
+ "extended": 0.0010408694848413693,
90
+ "support": 9284
 
91
  },
92
  "NaCl Tolerant (>=6%)": {
93
+ "rules": 0.9955916024012667,
94
+ "extended": 0.004408397598733298,
95
+ "support": 6862
 
96
  },
97
  "Motility": {
98
+ "rules": 0.9988045031624893,
99
+ "extended": 0.0011954968375107072,
100
+ "support": 9944
 
101
  },
102
  "H2S": {
103
+ "rules": 0.9989705186118537,
104
+ "extended": 0.0010294813881463337,
105
+ "support": 7118
 
106
  },
107
  "Nitrate Reduction": {
108
+ "rules": 0.9989922984121493,
109
+ "extended": 0.001007701587850664,
110
+ "support": 8264
 
111
  },
112
  "Oxygen Requirement": {
113
+ "rules": 0.9988935650987002,
114
+ "extended": 0.0011064349012998027,
115
+ "support": 9150
 
116
  },
117
  "Growth Temperature": {
118
+ "rules": 0.998782378825285,
119
+ "extended": 0.001217621174715027,
120
+ "support": 10396
 
121
  },
122
  "Xylose Fermentation": {
123
+ "rules": 0.9989695358580853,
124
+ "extended": 0.0010304641419146949,
125
+ "support": 6430
 
126
  },
127
  "Arabinose Fermentation": {
128
+ "rules": 0.9989704889930988,
129
+ "extended": 0.001029511006901172,
130
+ "support": 6420
 
131
  },
132
  "Raffinose Fermentation": {
133
+ "rules": 0.9989607498716675,
134
+ "extended": 0.0010392501283324623,
135
+ "support": 5970
 
136
  },
137
  "ONPG": {
138
+ "rules": 0.9989882470719493,
139
+ "extended": 0.00101175292805066,
140
+ "support": 6738
 
141
  },
142
  "Lysine Decarboxylase": {
143
+ "rules": 0.9989345882700906,
144
+ "extended": 0.001065411729909417,
145
+ "support": 6368
 
146
  },
147
  "Spore Formation": {
148
+ "rules": 0.9977576659141395,
149
+ "extended": 0.0022423340858605256,
150
+ "support": 7304
 
151
  },
152
  "Media Grown On": {
153
+ "rules": 0.9980272393851338,
154
+ "extended": 0.001972760614866144,
155
+ "support": 6866
 
156
  },
157
  "Maltose Fermentation": {
158
+ "rules": 0.9989623855006033,
159
+ "extended": 0.0010376144993966975,
160
+ "support": 7136
 
161
  },
162
  "Rhamnose Fermentation": {
163
+ "rules": 0.9989590741530393,
164
+ "extended": 0.001040925846960669,
165
+ "support": 5750
 
166
  },
167
  "Esculin Hydrolysis": {
168
+ "rules": 0.9989998479031373,
169
+ "extended": 0.0010001520968626566,
170
+ "support": 6952
 
171
  },
172
  "Gelatin Hydrolysis": {
173
+ "rules": 0.9989780027109636,
174
+ "extended": 0.0010219972890363567,
175
+ "support": 7076
 
176
  },
177
  "Colony Morphology": {
178
+ "rules": 0.9898285475551556,
179
+ "extended": 0.010171452444844376,
180
+ "support": 7506
 
181
  },
182
  "Sorbitol Fermentation": {
183
+ "rules": 0.9989645138234493,
184
+ "extended": 0.0010354861765506577,
185
+ "support": 6032
 
186
  },
187
  "Capsule": {
188
+ "rules": 0.9987462444189489,
189
+ "extended": 0.0012537555810511127,
190
+ "support": 6210
 
191
  },
192
  "CAMP": {
193
+ "rules": 0.0009990009990009992,
194
+ "extended": 0.9990009990009991,
195
+ "support": 102
 
196
  },
197
  "Hippurate Hydrolysis": {
198
+ "rules": 0.0010355119693001157,
199
+ "extended": 0.9989644880306999,
200
+ "support": 88
 
201
  },
202
  "PYR": {
203
+ "rules": 0.0009990009990009992,
204
+ "extended": 0.9990009990009991,
205
+ "support": 130
 
206
  },
207
  "Optochin": {
208
+ "rules": 0.001165307141668054,
209
+ "extended": 0.9988346928583319,
210
+ "support": 14
 
211
  },
212
  "Bile Solubility": {
213
+ "rules": 0.0032394717169200097,
214
+ "extended": 0.99676052828308,
215
+ "support": 22
 
216
  },
217
  "Novobiocin": {
218
+ "rules": 0.0014977533699450825,
219
+ "extended": 0.9985022466300549,
220
+ "support": 12
 
221
  },
222
  "Bile Resistance": {
223
+ "rules": 0.5,
224
+ "extended": 0.5,
225
+ "support": 8
 
226
  },
227
  "Lipase": {
228
+ "rules": 0.8279144917304062,
229
+ "extended": 0.17208550826959385,
230
+ "support": 2
 
231
  },
232
  "Lecithinase": {
233
+ "rules": 0.001355303516655967,
234
+ "extended": 0.9986446964833441,
235
+ "support": 22
 
236
  },
237
  "Odour": {
238
+ "rules": 0.5,
239
+ "extended": 0.5,
240
+ "support": 34
 
241
  },
242
  "Growth Factors": {
243
+ "rules": 0.5,
244
+ "extended": 0.5,
245
+ "support": 6
 
246
  },
247
  "Fructose Fermentation": {
248
+ "rules": 0.5,
249
+ "extended": 0.5,
250
+ "support": 66
 
251
  },
252
  "Glucose Oxidation": {
253
+ "rules": 0.0010788348583529788,
254
+ "extended": 0.998921165141647,
255
+ "support": 172
 
256
  },
257
  "Glycerol Fermentation": {
258
+ "rules": 0.8279144917304062,
259
+ "extended": 0.17208550826959385,
260
+ "support": 2
 
261
  },
262
  "Fermentation Products": {
263
+ "rules": 0.8279144917304062,
264
+ "extended": 0.17208550826959385,
265
+ "support": 2
 
266
  },
267
  "Cellobiose Fermentation": {
268
+ "rules": 0.8279144917304062,
269
+ "extended": 0.17208550826959385,
270
+ "support": 2
 
271
  },
272
  "Arginine dihydrolase": {
273
+ "rules": 0.9989305893080019,
274
+ "extended": 0.0010694106919980665,
275
+ "support": 6160
 
276
  },
277
  "NaCl Tolerant (>=15%)": {
278
+ "rules": 0.8279144917304062,
279
+ "extended": 0.17208550826959385,
280
+ "support": 2
 
281
  },
282
  "Temperature Dependence": {
283
+ "rules": 0.8279144917304062,
284
+ "extended": 0.17208550826959385,
285
+ "support": 2
 
286
  },
287
  "Sulfur Utilization": {
288
+ "rules": 0.8279144917304062,
289
+ "extended": 0.17208550826959385,
290
+ "support": 2
 
291
  },
292
  "Acid Fast": {
293
+ "rules": 0.5,
294
+ "extended": 0.5,
295
+ "support": 104
 
296
  },
297
  "NaCl Tolerant (>=10%)": {
298
+ "rules": 0.8279144917304062,
299
+ "extended": 0.17208550826959385,
300
+ "support": 2
 
301
  },
302
  "pH Range": {
303
+ "rules": 0.8279144917304062,
304
+ "extended": 0.17208550826959385,
305
+ "support": 2
 
306
  },
307
  "Fermentation Product": {
308
+ "rules": 0.8279144917304062,
309
+ "extended": 0.17208550826959385,
310
+ "support": 2
 
311
  },
312
  "Ornithine Decarboxylase": {
313
+ "rules": 0.0013180825411649427,
314
+ "extended": 0.9986819174588351,
315
+ "support": 6266
 
316
  },
317
  "Lipase Test": {
318
+ "rules": 0.9989468737450672,
319
+ "extended": 0.0010531262549328235,
320
+ "support": 4762
 
 
 
 
 
 
 
321
  },
322
  "Casein Hydrolysis": {
323
+ "rules": 0.0009990009990009992,
324
+ "extended": 0.9990009990009991,
325
+ "support": 6
 
326
  },
327
  "Tyrosine Hydrolysis": {
328
+ "rules": 0.6782141920301065,
329
+ "extended": 0.3217858079698936,
330
+ "support": 2
 
331
  },
332
  "Mannose Fermentation": {
333
+ "rules": 0.5,
334
+ "extended": 0.5,
335
+ "support": 10
 
336
  },
337
  "Gas Production": {
338
+ "rules": 0.001259774602490041,
339
+ "extended": 0.99874022539751,
340
+ "support": 400
 
341
  },
342
  "Optochin Sensitivity": {
343
+ "rules": 0.5,
344
+ "extended": 0.5,
345
+ "support": 18
 
346
  },
347
  "Inulin Fermentation": {
348
+ "rules": 0.8279144917304062,
349
+ "extended": 0.17208550826959385,
350
+ "support": 2
 
351
  },
352
  "Other Products": {
353
+ "rules": 0.8279144917304062,
354
+ "extended": 0.17208550826959385,
355
+ "support": 2
 
356
  },
357
  "Antibiotic Resistance": {
358
+ "rules": 0.5,
359
+ "extended": 0.5,
360
+ "support": 34
 
361
  },
362
  "Metabolic Product": {
363
+ "rules": 0.8279144917304062,
364
+ "extended": 0.17208550826959385,
365
+ "support": 2
 
366
  },
367
  "Bacitracin": {
368
+ "rules": 0.0009990009990009992,
369
+ "extended": 0.9990009990009991,
370
+ "support": 6
 
371
  },
372
  "Bacitracin Sensitivity": {
373
+ "rules": 0.5,
374
+ "extended": 0.5,
375
+ "support": 6
 
376
  },
377
  "Pigment Production": {
378
+ "rules": 0.5,
379
+ "extended": 0.5,
380
+ "support": 318
 
381
  },
382
  "Indoxyl Acetate": {
383
+ "rules": 0.5,
384
+ "extended": 0.5,
385
+ "support": 16
 
386
  },
387
  "Growth Requirements": {
388
+ "rules": 0.5,
389
+ "extended": 0.5,
390
+ "support": 22
 
391
  },
392
  "Aerolysin Production": {
393
+ "rules": 0.8279144917304062,
394
+ "extended": 0.17208550826959385,
395
+ "support": 2
 
396
  },
397
  "Bile Esculin": {
398
+ "rules": 0.5,
399
+ "extended": 0.5,
400
+ "support": 84
 
401
  },
402
  "Arrangement": {
403
+ "rules": 0.5,
404
+ "extended": 0.5,
405
+ "support": 20
 
406
  },
407
  "Toxin A": {
408
+ "rules": 0.8279144917304062,
409
+ "extended": 0.17208550826959385,
410
+ "support": 2
 
411
  },
412
  "Toxin B": {
413
+ "rules": 0.8279144917304062,
414
+ "extended": 0.17208550826959385,
415
+ "support": 2
 
416
  },
417
  "Carbohydrate Utilisation": {
418
+ "rules": 0.5,
419
+ "extended": 0.5,
420
+ "support": 38
 
421
  },
422
  "Novobiocin Sensitivity": {
423
+ "rules": 0.5,
424
+ "extended": 0.5,
425
+ "support": 50
 
426
  },
427
  "Vancomycin Resistance": {
428
+ "rules": 0.021047479197258932,
429
+ "extended": 0.9789525208027411,
430
+ "support": 84
 
431
  },
432
  "Nitrogen Fixation": {
433
+ "rules": 0.8279144917304062,
434
+ "extended": 0.17208550826959385,
435
+ "support": 4
 
436
  },
437
  "Pseudohyphae": {
438
+ "rules": 0.8279144917304062,
439
+ "extended": 0.17208550826959385,
440
+ "support": 4
 
441
  },
442
  "Germ Tube": {
443
+ "rules": 0.5,
444
+ "extended": 0.5,
445
+ "support": 62
 
446
  },
447
  "Budding": {
448
+ "rules": 0.8279144917304062,
449
+ "extended": 0.17208550826959385,
450
+ "support": 2
 
451
  },
452
  "Hyphae": {
453
+ "rules": 0.8279144917304062,
454
+ "extended": 0.17208550826959385,
455
+ "support": 2
 
456
  },
457
  "Ethanol Production": {
458
+ "rules": 0.5,
459
+ "extended": 0.5,
460
+ "support": 6
 
461
  },
462
  "Intracellular Lifestyle": {
463
+ "rules": 0.5,
464
+ "extended": 0.5,
465
+ "support": 8
 
466
  },
467
  "Fermentation Substrate": {
468
+ "rules": 0.8279144917304062,
469
+ "extended": 0.17208550826959385,
470
+ "support": 2
 
471
  },
472
  "Morphology Detail": {
473
+ "rules": 0.5,
474
+ "extended": 0.5,
475
+ "support": 6
 
476
  },
477
  "Toxin Production": {
478
+ "rules": 0.5,
479
+ "extended": 0.5,
480
+ "support": 26
 
481
  },
482
  "Organic Acids Production": {
483
+ "rules": 0.5,
484
+ "extended": 0.5,
485
+ "support": 132
 
486
  },
487
  "Butyrate Esterase": {
488
+ "rules": 0.8279144917304062,
489
+ "extended": 0.17208550826959385,
490
+ "support": 4
 
491
  },
492
  "Dextran Production": {
493
+ "rules": 0.5,
494
+ "extended": 0.5,
495
+ "support": 6
 
496
  },
497
  "Denitrification": {
498
+ "rules": 0.5,
499
+ "extended": 0.5,
500
+ "support": 10
 
501
  },
502
  "Acid Tolerance": {
503
+ "rules": 0.5,
504
+ "extended": 0.5,
505
+ "support": 22
 
506
  },
507
  "Special Metabolism": {
508
+ "rules": 0.5,
509
+ "extended": 0.5,
510
+ "support": 12
 
511
  },
512
  "Galactose Fermentation": {
513
+ "rules": 0.5,
514
+ "extended": 0.5,
515
+ "support": 8
 
516
  },
517
  "Desiccation Tolerance": {
518
+ "rules": 0.5,
519
+ "extended": 0.5,
520
+ "support": 56
 
521
  },
522
  "UV Resistance": {
523
+ "rules": 0.8279144917304062,
524
+ "extended": 0.17208550826959385,
525
+ "support": 2
 
526
  },
527
  "Nalidixic Acid Resistance": {
528
+ "rules": 0.8279144917304062,
529
+ "extended": 0.17208550826959385,
530
+ "support": 2
 
531
  },
532
  "Bile Tolerance": {
533
+ "rules": 0.5,
534
+ "extended": 0.5,
535
+ "support": 12
 
536
  },
537
  "Protease Production": {
538
+ "rules": 0.8279144917304062,
539
+ "extended": 0.17208550826959385,
540
+ "support": 2
 
541
  },
542
  "Aerotolerance": {
543
+ "rules": 0.5,
544
+ "extended": 0.5,
545
+ "support": 8
 
546
  },
547
  "Phenylalanine Deaminase": {
548
+ "rules": 0.5,
549
+ "extended": 0.5,
550
+ "support": 8
 
551
  },
552
  "Motility at 25C": {
553
+ "rules": 0.8279144917304062,
554
+ "extended": 0.17208550826959385,
555
+ "support": 4
 
556
  },
557
  "Motility at 37C": {
558
+ "rules": 0.8279144917304062,
559
+ "extended": 0.17208550826959385,
560
+ "support": 4
 
561
  },
562
  "Bipolar Staining": {
563
+ "rules": 0.8279144917304062,
564
+ "extended": 0.17208550826959385,
565
+ "support": 4
 
566
  },
567
  "X Factor Requirement": {
568
+ "rules": 0.8279144917304062,
569
+ "extended": 0.17208550826959385,
570
+ "support": 4
 
571
  },
572
  "V Factor Requirement": {
573
+ "rules": 0.8279144917304062,
574
+ "extended": 0.17208550826959385,
575
+ "support": 4
 
576
  },
577
  "Satellite Phenomenon": {
578
+ "rules": 0.8279144917304062,
579
+ "extended": 0.17208550826959385,
580
+ "support": 2
 
581
  },
582
  "Cysteine Requirement": {
583
+ "rules": 0.8279144917304062,
584
+ "extended": 0.17208550826959385,
585
+ "support": 4
 
586
  },
587
  "Iron Requirement": {
588
+ "rules": 0.8279144917304062,
589
+ "extended": 0.17208550826959385,
590
+ "support": 4
 
591
  },
592
  "Niacin": {
593
+ "rules": 0.8279144917304062,
594
+ "extended": 0.17208550826959385,
595
+ "support": 2
 
 
 
 
 
 
 
596
  },
597
  "Carbohydrate Fermentation": {
598
+ "rules": 0.5,
599
+ "extended": 0.5,
600
+ "support": 30
 
601
  },
602
  "Growth Rate": {
603
+ "rules": 0.5,
604
+ "extended": 0.5,
605
+ "support": 16
 
606
  },
607
  "Cell Wall Lipids": {
608
+ "rules": 0.8279144917304062,
609
+ "extended": 0.17208550826959385,
610
+ "support": 2
 
611
  },
612
  "Chlamydospore Formation": {
613
+ "rules": 0.8279144917304062,
614
+ "extended": 0.17208550826959385,
615
+ "support": 2
 
616
  },
617
  "Metachromatic Granules": {
618
+ "rules": 0.8279144917304062,
619
+ "extended": 0.17208550826959385,
620
+ "support": 2
 
621
  },
622
  "Starch Hydrolysis": {
623
+ "rules": 0.8279144917304062,
624
+ "extended": 0.17208550826959385,
625
+ "support": 2
 
626
  },
627
  "Sugar Fermentation": {
628
+ "rules": 0.8279144917304062,
629
+ "extended": 0.17208550826959385,
630
+ "support": 2
 
631
  },
632
  "Special Features": {
633
+ "rules": 0.8279144917304062,
634
+ "extended": 0.17208550826959385,
635
+ "support": 2
 
636
  },
637
  "Lactate Fermentation": {
638
+ "rules": 0.8279144917304062,
639
+ "extended": 0.17208550826959385,
640
+ "support": 2
 
641
  },
642
  "Pyruvate Metabolism": {
643
+ "rules": 0.8279144917304062,
644
+ "extended": 0.17208550826959385,
645
+ "support": 2
 
646
  },
647
  "Lactate Utilisation": {
648
+ "rules": 0.8279144917304062,
649
+ "extended": 0.17208550826959385,
650
+ "support": 2
 
651
  },
652
  "Culture Requirement": {
653
+ "rules": 0.5,
654
+ "extended": 0.5,
655
+ "support": 10
 
656
  },
657
  "Detection Method": {
658
+ "rules": 0.8279144917304062,
659
+ "extended": 0.17208550826959385,
660
+ "support": 4
 
661
  },
662
  "Budding Type": {
663
+ "rules": 0.8279144917304062,
664
+ "extended": 0.17208550826959385,
665
+ "support": 2
 
666
  },
667
  "Inositol Assimilation": {
668
+ "rules": 0.8279144917304062,
669
+ "extended": 0.17208550826959385,
670
+ "support": 2
 
671
  },
672
  "Organism Type": {
673
+ "rules": 0.8279144917304062,
674
+ "extended": 0.17208550826959385,
675
+ "support": 2
 
676
  },
677
  "Stain Preference": {
678
+ "rules": 0.8279144917304062,
679
+ "extended": 0.17208550826959385,
680
+ "support": 2
 
681
  },
682
  "Flagella Type": {
683
+ "rules": 0.8279144917304062,
684
+ "extended": 0.17208550826959385,
685
+ "support": 2
 
686
  },
687
  "Intracellular": {
688
+ "rules": 0.8279144917304062,
689
+ "extended": 0.17208550826959385,
690
+ "support": 4
 
691
  },
692
  "Developmental Cycle": {
693
+ "rules": 0.8279144917304062,
694
+ "extended": 0.17208550826959385,
695
+ "support": 2
 
696
  },
697
  "Metabolism": {
698
+ "rules": 0.8279144917304062,
699
+ "extended": 0.17208550826959385,
700
+ "support": 4
 
701
  },
702
  "Substrate Utilisation": {
703
+ "rules": 0.8279144917304062,
704
+ "extended": 0.17208550826959385,
705
+ "support": 2
 
706
  },
707
  "Environmental Survival": {
708
+ "rules": 0.8279144917304062,
709
+ "extended": 0.17208550826959385,
710
+ "support": 2
 
711
  },
712
  "Thermophilic": {
713
+ "rules": 0.8279144917304062,
714
+ "extended": 0.17208550826959385,
715
+ "support": 4
 
716
  },
717
  "Cephalothin Sensitivity": {
718
+ "rules": 0.8279144917304062,
719
+ "extended": 0.17208550826959385,
720
+ "support": 2
 
721
  },
722
  "Metabolic Products": {
723
+ "rules": 0.5,
724
+ "extended": 0.5,
725
+ "support": 20
 
726
  },
727
  "UV Tolerance": {
728
+ "rules": 0.8279144917304062,
729
+ "extended": 0.17208550826959385,
730
+ "support": 2
 
731
  },
732
  "Heat Resistance": {
733
+ "rules": 0.8279144917304062,
734
+ "extended": 0.17208550826959385,
735
+ "support": 4
 
736
  },
737
  "pH Tolerance": {
738
+ "rules": 0.5,
739
+ "extended": 0.5,
740
+ "support": 8
 
741
  },
742
  "Vitamin B12 Production": {
743
+ "rules": 0.8279144917304062,
744
+ "extended": 0.17208550826959385,
745
+ "support": 2
 
746
  },
747
  "Enzyme Production": {
748
+ "rules": 0.8279144917304062,
749
+ "extended": 0.17208550826959385,
750
+ "support": 2
 
751
  },
752
  "Attachment Mechanism": {
753
+ "rules": 0.8279144917304062,
754
+ "extended": 0.17208550826959385,
755
+ "support": 2
 
756
  },
757
  "Secondary Metabolites": {
758
+ "rules": 0.5,
759
+ "extended": 0.5,
760
+ "support": 12
 
761
  },
762
  "Ammonia Production": {
763
+ "rules": 0.8279144917304062,
764
+ "extended": 0.17208550826959385,
765
+ "support": 2
 
766
  },
767
  "Bioluminescence": {
768
+ "rules": 0.8279144917304062,
769
+ "extended": 0.17208550826959385,
770
+ "support": 4
 
771
  },
772
  "Metabolism Type": {
773
+ "rules": 0.5,
774
+ "extended": 0.5,
775
+ "support": 22
 
776
  },
777
  "Chromium Reduction": {
778
+ "rules": 0.8279144917304062,
779
+ "extended": 0.17208550826959385,
780
+ "support": 4
 
781
  },
782
  "Metabolic Capability": {
783
+ "rules": 0.8279144917304062,
784
+ "extended": 0.17208550826959385,
785
+ "support": 4
 
786
  },
787
  "Melibiose Fermentation": {
788
+ "rules": 0.5,
789
+ "extended": 0.5,
790
+ "support": 6
 
791
  },
792
  "Radiation Resistance": {
793
+ "rules": 0.8279144917304062,
794
+ "extended": 0.17208550826959385,
795
+ "support": 2
 
796
  },
797
  "Growth Requirement": {
798
+ "rules": 0.5,
799
+ "extended": 0.5,
800
+ "support": 32
 
801
  },
802
  "MacConkey Growth": {
803
+ "rules": 0.5,
804
+ "extended": 0.5,
805
+ "support": 16
 
806
  },
807
  "Phenylalanine Deamination": {
808
+ "rules": 0.8279144917304062,
809
+ "extended": 0.17208550826959385,
810
+ "support": 4
 
811
  },
812
  "Nitrite Reduction": {
813
+ "rules": 0.5,
814
+ "extended": 0.5,
815
+ "support": 6
 
816
  },
817
  "Electron Acceptors": {
818
+ "rules": 0.5,
819
+ "extended": 0.5,
820
+ "support": 14
 
821
  },
822
  "Lactate Utilization": {
823
+ "rules": 0.5,
824
+ "extended": 0.5,
825
+ "support": 16
 
826
  },
827
  "Glycyrrhizin Hydrolysis": {
828
+ "rules": 0.8279144917304062,
829
+ "extended": 0.17208550826959385,
830
+ "support": 2
 
831
  },
832
  "Pyrazinamidase": {
833
+ "rules": 0.8279144917304062,
834
+ "extended": 0.17208550826959385,
835
+ "support": 2
 
836
  },
837
  "Aromatic Compound Degradation": {
838
+ "rules": 0.8279144917304062,
839
+ "extended": 0.17208550826959385,
840
+ "support": 2
 
841
  },
842
  "Xylose Oxidation": {
843
+ "rules": 0.8279144917304062,
844
+ "extended": 0.17208550826959385,
845
+ "support": 4
 
846
  },
847
  "Blood Agar Growth": {
848
+ "rules": 0.8279144917304062,
849
+ "extended": 0.17208550826959385,
850
+ "support": 2
 
851
  },
852
  "Beta-lactamase": {
853
+ "rules": 0.8279144917304062,
854
+ "extended": 0.17208550826959385,
855
+ "support": 2
 
856
  },
857
  "Mannitol Oxidation": {
858
+ "rules": 0.8279144917304062,
859
+ "extended": 0.17208550826959385,
860
+ "support": 2
 
861
  },
862
  "Colony Odour": {
863
+ "rules": 0.5,
864
+ "extended": 0.5,
865
+ "support": 8
 
866
  },
867
  "Trehalose Fermentation": {
868
+ "rules": 0.9989661744192919,
869
+ "extended": 0.0010338255807080298,
870
+ "support": 6328
 
871
  },
872
  "Parasporal Crystal": {
873
+ "rules": 0.8279144917304062,
874
+ "extended": 0.17208550826959385,
875
+ "support": 2
 
876
  },
877
  "Lancefield Group": {
878
+ "rules": 0.5,
879
+ "extended": 0.5,
880
+ "support": 6
 
881
  },
882
  "NaCl Requirement": {
883
+ "rules": 0.8279144917304062,
884
+ "extended": 0.17208550826959385,
885
+ "support": 2
 
886
  },
887
  "Fermentation Type": {
888
+ "rules": 0.8279144917304062,
889
+ "extended": 0.17208550826959385,
890
+ "support": 2
 
891
  },
892
  "Ribose Fermentation": {
893
+ "rules": 0.5,
894
+ "extended": 0.5,
895
+ "support": 8
 
896
  },
897
  "Inositol Fermentation": {
898
+ "rules": 0.9989614794922925,
899
+ "extended": 0.0010385205077074813,
900
+ "support": 5582
 
901
  },
902
  "Chlamydospore Production": {
903
+ "rules": 0.5,
904
+ "extended": 0.5,
905
+ "support": 42
 
906
  },
907
  "Phenol Oxidase": {
908
+ "rules": 0.5,
909
+ "extended": 0.5,
910
+ "support": 14
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
911
  }
912
  },
913
  "meta": {
914
+ "total_samples": 5326,
915
  "missing_penalty": 0.5,
916
  "smoothing": 0.001,
917
+ "include_llm": false
918
  }
919
  }