HeshamAI commited on
Commit
ce34862
·
verified ·
1 Parent(s): 5808397

Update app.py

Browse files
Files changed (1) hide show
  1. app.py +19 -58
app.py CHANGED
@@ -350,15 +350,11 @@ class DicomAnalyzer:
350
  except Exception as e:
351
  logger.error(f"Error adding formulas: {str(e)}")
352
 
353
- ########################################################################
354
- # نفس الدالة الأصلية، لكن نهاية الدالة تضع الجدول في الصف 35 بالشكل المطلوب
355
- ########################################################################
356
  def save_formatted_results(self, output_path):
357
  try:
358
  if not self.results:
359
  return None, "No results to save"
360
 
361
- # هنا كل شيء مثل كودك: تنشئ Workbook جديد، تصنع الشيت، تضع الهيدرز...
362
  wb = openpyxl.Workbook()
363
  ws = wb.active
364
  red_font = openpyxl.styles.Font(color="FF0000")
@@ -391,13 +387,11 @@ class DicomAnalyzer:
391
  '(4.5mm)', '(4mm)', '(3.5mm)', '(3mm)', '(2.5mm)'
392
  ]
393
 
394
- # كتابة أسماء الفانتوم باللون الأحمر في العمود A (قبل الصف الأول)
395
  for i, size in enumerate(phantom_sizes):
396
  header_cell = ws.cell(row=row_pairs[i][0]-1, column=1, value=size)
397
  header_cell.font = red_font
398
  header_cell.alignment = center_alignment
399
 
400
- # توزيع نتائج ROI في هذه الصفوف والأعمدة كما في كودك
401
  result_idx = 0
402
  current_col_group = 0
403
  current_row_pair = 0
@@ -426,7 +420,6 @@ class DicomAnalyzer:
426
  current_col_group = 0
427
  current_row_pair += 1
428
 
429
- # ضبط المحاذاة للخلايا التي كُتبت بالفعل
430
  for cols in column_groups:
431
  for col in cols:
432
  for row in range(2, 31):
@@ -434,24 +427,15 @@ class DicomAnalyzer:
434
  if cell.value is not None:
435
  cell.alignment = center_alignment
436
 
437
- ################################################################
438
- # وهنا بدلًا من وضع جداول STDDEV/Mean/CNR منفصلة،
439
- # نضع الجدول المدمج "1-AVG" من الصف 35 مثل الصورة التي أرسلتها
440
- ################################################################
441
-
442
- # سنستخدم نفس فكرة الجدول بالدمج من D35:E35, F35:G35, H35:I35
443
  start_row = 35
444
-
445
- # ضع عنوان "1-AVG" في C35
446
  ws['C35'] = "1-AVG"
447
  ws['C35'].alignment = center_alignment
448
 
449
- # ادمج الخلايا الخاصة بالعناوين
450
  ws.merge_cells('D35:E35')
451
  ws.merge_cells('F35:G35')
452
  ws.merge_cells('H35:I35')
453
 
454
- # ضع العناوين باللون الأحمر
455
  avg_headers = {
456
  'D35': 'AVG MEAN',
457
  'F35': 'AVG STDDEV',
@@ -462,81 +446,60 @@ class DicomAnalyzer:
462
  ws[c_ref].font = red_font
463
  ws[c_ref].alignment = center_alignment
464
 
465
- # نفس أسماء الفانتوم
466
  phantom_sizes2 = [
467
  '(7.0mm)', '(6.5mm)', '(6.0mm)', '(5.5mm)', '(5.0mm)',
468
  '(4.5mm)', '(4.0mm)', '(3.5mm)', '(3.0mm)', '(2.5mm)'
469
  ]
470
 
471
  for i, p_size in enumerate(phantom_sizes2):
472
- row = start_row + i + 1 # 36..45
473
 
474
- # ادمج لكل صف: D-E ، F-G ، H-I
475
  ws.merge_cells(f'D{row}:E{row}')
476
  ws.merge_cells(f'F{row}:G{row}')
477
  ws.merge_cells(f'H{row}:I{row}')
478
 
479
- # اكتب اسم الفانتوم باللون الأحمر في العمود C
480
  size_cell = ws[f'C{row}']
481
  size_cell.value = p_size
482
  size_cell.font = red_font
483
  size_cell.alignment = center_alignment
484
 
485
- # لكي نحسب الـAVG الحقيقي من الصفوف 2..3 إلخ،
486
- # نستخدم row_pairs[i] إن أردت. أو كما في المثال الأصلي:
487
  if i < len(row_pairs):
488
  (raw_row1, raw_row2) = row_pairs[i]
489
  else:
490
- continue # لو عندك 10 فقط
491
-
492
- # لنفترض أننا نقرأ من نفس الأعمدة اللي فيها mean & std
493
- # نفترض عندنا على الأقل عمود mean_col = cols[1], stddev_col = cols[2]
494
- # لكن عندك عدة col groups؛ إذا تريد تجمع من الأول فقط:
495
- # أو خذ فكرة snippetك السابق:
496
 
497
  mean_values = []
498
  stddev_values = []
499
  cnr_values = []
500
 
501
- # Example: لو تحب تجمع من نفس الـ column_groups الأولى بس
502
  for group in column_groups:
503
- mean_col = group[1] # 'C','I','O'...الخ
504
- std_col = group[2] # 'D','J','P'...الخ
505
 
506
- # raw_row1 = الصف الأول
507
- # raw_row2 = الصف الثاني
508
  m1 = ws[f"{mean_col}{raw_row1}"].value
509
  m2 = ws[f"{mean_col}{raw_row2}"].value
510
- std1 = ws[f"{std_col}{raw_row1}"].value
 
 
 
 
511
 
512
  try:
513
  m1 = float(m1) if m1 not in [None,''] else None
514
  m2 = float(m2) if m2 not in [None,''] else None
515
- std1 = float(std1) if std1 not in [None,''] else None
516
  except:
517
- m1,m2,std1 = None,None,None
518
- if (m1 is not None) and (m2 is not None) and (std1 is not None) and (std1!=0):
519
  mean_values.append(m1)
520
- stddev_values.append(std1)
521
- cnr_values.append((m1 - m2)/std1)
522
 
523
- # الآن نحسب المتوسط
524
- if len(mean_values) > 0:
525
- final_mean = sum(mean_values)/len(mean_values)
526
- else:
527
- final_mean = None
528
-
529
- if len(stddev_values) > 0:
530
- final_std = sum(stddev_values)/len(stddev_values)
531
- else:
532
- final_std = None
533
-
534
- if len(cnr_values) > 0:
535
- final_cnr = sum(cnr_values)/len(cnr_values)
536
- else:
537
- final_cnr = None
538
 
539
- # نكتبها في الخلايا المدمجة
540
  if final_mean is not None:
541
  ws[f'D{row}'].value = final_mean
542
  ws[f'D{row}'].alignment = center_alignment
@@ -552,7 +515,6 @@ class DicomAnalyzer:
552
  ws[f'H{row}'].alignment = center_alignment
553
  ws[f'H{row}'].number_format = '0.0000'
554
 
555
- # أخيراً، ضع الحدود حول C35..I45
556
  thin_side = openpyxl.styles.Side(style='thin')
557
  border = openpyxl.styles.Border(
558
  left=thin_side, right=thin_side, top=thin_side, bottom=thin_side
@@ -566,7 +528,6 @@ class DicomAnalyzer:
566
  except Exception as e:
567
  logger.error(f"Error saving formatted results: {str(e)}")
568
  return None, f"Error saving results: {str(e)}"
569
- ########################################################################
570
 
571
  def _write_result_to_cells(self, ws, result, cols, row):
572
  center_alignment = openpyxl.styles.Alignment(horizontal='center')
 
350
  except Exception as e:
351
  logger.error(f"Error adding formulas: {str(e)}")
352
 
 
 
 
353
  def save_formatted_results(self, output_path):
354
  try:
355
  if not self.results:
356
  return None, "No results to save"
357
 
 
358
  wb = openpyxl.Workbook()
359
  ws = wb.active
360
  red_font = openpyxl.styles.Font(color="FF0000")
 
387
  '(4.5mm)', '(4mm)', '(3.5mm)', '(3mm)', '(2.5mm)'
388
  ]
389
 
 
390
  for i, size in enumerate(phantom_sizes):
391
  header_cell = ws.cell(row=row_pairs[i][0]-1, column=1, value=size)
392
  header_cell.font = red_font
393
  header_cell.alignment = center_alignment
394
 
 
395
  result_idx = 0
396
  current_col_group = 0
397
  current_row_pair = 0
 
420
  current_col_group = 0
421
  current_row_pair += 1
422
 
 
423
  for cols in column_groups:
424
  for col in cols:
425
  for row in range(2, 31):
 
427
  if cell.value is not None:
428
  cell.alignment = center_alignment
429
 
430
+ # الآن نضع جدول 1-AVG من الصف 35 إلى 45
 
 
 
 
 
431
  start_row = 35
 
 
432
  ws['C35'] = "1-AVG"
433
  ws['C35'].alignment = center_alignment
434
 
 
435
  ws.merge_cells('D35:E35')
436
  ws.merge_cells('F35:G35')
437
  ws.merge_cells('H35:I35')
438
 
 
439
  avg_headers = {
440
  'D35': 'AVG MEAN',
441
  'F35': 'AVG STDDEV',
 
446
  ws[c_ref].font = red_font
447
  ws[c_ref].alignment = center_alignment
448
 
 
449
  phantom_sizes2 = [
450
  '(7.0mm)', '(6.5mm)', '(6.0mm)', '(5.5mm)', '(5.0mm)',
451
  '(4.5mm)', '(4.0mm)', '(3.5mm)', '(3.0mm)', '(2.5mm)'
452
  ]
453
 
454
  for i, p_size in enumerate(phantom_sizes2):
455
+ row = start_row + i + 1 # من 36..45
456
 
 
457
  ws.merge_cells(f'D{row}:E{row}')
458
  ws.merge_cells(f'F{row}:G{row}')
459
  ws.merge_cells(f'H{row}:I{row}')
460
 
 
461
  size_cell = ws[f'C{row}']
462
  size_cell.value = p_size
463
  size_cell.font = red_font
464
  size_cell.alignment = center_alignment
465
 
 
 
466
  if i < len(row_pairs):
467
  (raw_row1, raw_row2) = row_pairs[i]
468
  else:
469
+ continue
 
 
 
 
 
470
 
471
  mean_values = []
472
  stddev_values = []
473
  cnr_values = []
474
 
 
475
  for group in column_groups:
476
+ mean_col = group[1] # ex. 'C'
477
+ std_col = group[2] # ex. 'D'
478
 
 
 
479
  m1 = ws[f"{mean_col}{raw_row1}"].value
480
  m2 = ws[f"{mean_col}{raw_row2}"].value
481
+
482
+ # في السابق كانت:
483
+ # std2 = ws[f"{std_col}{raw_row2}"].value
484
+ # لكنك تريد أخذ stddev من الصف الأول (raw_row1):
485
+ std2 = ws[f"{std_col}{raw_row1}"].value # <-- التعديل هنا
486
 
487
  try:
488
  m1 = float(m1) if m1 not in [None,''] else None
489
  m2 = float(m2) if m2 not in [None,''] else None
490
+ std2 = float(std2) if std2 not in [None,''] else None
491
  except:
492
+ m1,m2,std2 = None,None,None
493
+ if (m1 is not None) and (m2 is not None) and (std2 is not None) and (std2!=0):
494
  mean_values.append(m1)
495
+ stddev_values.append(std2)
496
+ cnr_values.append((m1 - m2)/std2)
497
 
498
+ # نحسب المتوسط
499
+ final_mean = (sum(mean_values)/len(mean_values)) if mean_values else None
500
+ final_std = (sum(stddev_values)/len(stddev_values)) if stddev_values else None
501
+ final_cnr = (sum(cnr_values)/len(cnr_values)) if cnr_values else None
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
502
 
 
503
  if final_mean is not None:
504
  ws[f'D{row}'].value = final_mean
505
  ws[f'D{row}'].alignment = center_alignment
 
515
  ws[f'H{row}'].alignment = center_alignment
516
  ws[f'H{row}'].number_format = '0.0000'
517
 
 
518
  thin_side = openpyxl.styles.Side(style='thin')
519
  border = openpyxl.styles.Border(
520
  left=thin_side, right=thin_side, top=thin_side, bottom=thin_side
 
528
  except Exception as e:
529
  logger.error(f"Error saving formatted results: {str(e)}")
530
  return None, f"Error saving results: {str(e)}"
 
531
 
532
  def _write_result_to_cells(self, ws, result, cols, row):
533
  center_alignment = openpyxl.styles.Alignment(horizontal='center')