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test_metadata/Slide_B_DD1s1.one_1.tif.csv

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+18,PD1,3,3,1500.0,ms,Alexa Fluor 647,WideField,Epifluorescence,Fluorescence,653.0,nm,668.0,nm,#FFFF0000
+19,CD45,3,4,1500.0,ms,Alexa Fluor 750,WideField,Epifluorescence,Fluorescence,752.0,nm,779.0,nm,#FF00FFFF
+20,DAPI4,4,0,10.0,ms,DAPI,WideField,Epifluorescence,Fluorescence,353.0,nm,465.0,nm,#FF0000FF
+21,Vimentin,4,1,150.0,ms,FITC,WideField,Epifluorescence,Fluorescence,495.0,nm,519.0,nm,#FF00FF28
+22,AXL,4,2,1500.0,ms,Alexa Fluor 555,WideField,Epifluorescence,Fluorescence,553.0,nm,568.0,nm,#FFFFFF00
+23,PDL1,4,3,1500.0,ms,Alexa Fluor 647,WideField,Epifluorescence,Fluorescence,653.0,nm,668.0,nm,#FFFF0000
+24,FOXP3,4,4,1500.0,ms,Alexa Fluor 750,WideField,Epifluorescence,Fluorescence,752.0,nm,779.0,nm,#FF00FFFF
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+28,CD163,5,3,1500.0,ms,Alexa Fluor 647,WideField,Epifluorescence,Fluorescence,653.0,nm,668.0,nm,#FFFF0000
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+36,r7c2,7,1,20.0,ms,FITC,WideField,Epifluorescence,Fluorescence,495.0,nm,519.0,nm,#FF00FF28
+37,PDGFR,7,2,1500.0,ms,Alexa Fluor 555,WideField,Epifluorescence,Fluorescence,553.0,nm,568.0,nm,#FFFFFF00
+38,MMP9,7,3,1500.0,ms,Alexa Fluor 647,WideField,Epifluorescence,Fluorescence,653.0,nm,668.0,nm,#FFFF0000
+39,GATA3,7,4,1500.0,ms,Alexa Fluor 750,WideField,Epifluorescence,Fluorescence,752.0,nm,779.0,nm,#FF00FFFF
+40,DAPI8,8,0,10.0,ms,DAPI,WideField,Epifluorescence,Fluorescence,353.0,nm,465.0,nm,#FF0000FF
+41,r8c2,8,1,25.0,ms,FITC,WideField,Epifluorescence,Fluorescence,495.0,nm,519.0,nm,#FF00FF28
+42,CD11c,8,2,1500.0,ms,Alexa Fluor 555,WideField,Epifluorescence,Fluorescence,553.0,nm,568.0,nm,#FFFFFF00
+43,Sting,8,3,1000.0,ms,Alexa Fluor 647,WideField,Epifluorescence,Fluorescence,653.0,nm,668.0,nm,#FFFF0000
+44,CD11b,8,4,1500.0,ms,Alexa Fluor 750,WideField,Epifluorescence,Fluorescence,752.0,nm,779.0,nm,#FF00FFFF

test_metadata/full_to_short_column_names.csv

@@ -0,0 +1,109 @@
+full_name,short_name
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+AF555_Cell_Intensity_Average,AF555_Cell
+AF555_Cytoplasm_Intensity_Average,AF555_Cytoplasm
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+AF647_Cell_Intensity_Average,AF647_Cell
+AF647_Cytoplasm_Intensity_Average,AF647_Cytoplasm
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+AF750_Cell_Intensity_Average,AF750_Cell
+AF750_Cytoplasm_Intensity_Average,AF750_Cytoplasm
+AF750_Nucleus_Intensity_Average,AF750_Nucleus
+aSMA_Cell_Intensity_Average,aSMA_Cell
+aSMA_Cytoplasm_Intensity_Average,aSMA_Cytoplasm
+aSMA_Nucleus_Intensity_Average,aSMA_Nucleus
+AXL_Cell_Intensity_Average,AXL_Cell
+AXL_Cytoplasm_Intensity_Average,AXL_Cytoplasm
+AXL_Nucleus_Intensity_Average,AXL_Nucleus
+B7H4_Cell_Intensity_Average,B7H4_Cell
+B7H4_Cytoplasm_Intensity_Average,B7H4_Cytoplasm
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+CA9_Cell_Intensity_Average,CA9_Cell
+CA9_Cytoplasm_Intensity_Average,CA9_Cytoplasm
+CA9_Nucleus_Intensity_Average,CA9_Nucleus
+CD4_Cell_Intensity_Average,CD4_Cell
+CD4_Cytoplasm_Intensity_Average,CD4_Cytoplasm
+CD4_Nucleus_Intensity_Average,CD4_Nucleus
+CD8_Cell_Intensity_Average,CD8_Cell
+CD8_Cytoplasm_Intensity_Average,CD8_Cytoplasm
+CD8_Nucleus_Intensity_Average,CD8_Nucleus
+CD11b_Cell_Intensity_Average,CD11b_Cell
+CD11b_Cytoplasm_Intensity_Average,CD11b_Cytoplasm
+CD11b_Nucleus_Intensity_Average,CD11b_Nucleus
+CD11c_Cell_Intensity_Average,CD11c_Cell
+CD11c_Cytoplasm_Intensity_Average,CD11c_Cytoplasm
+CD11c_Nucleus_Intensity_Average,CD11c_Nucleus
+CD20_Cell_Intensity_Average,CD20_Cell
+CD20_Cytoplasm_Intensity_Average,CD20_Cytoplasm
+CD20_Nucleus_Intensity_Average,CD20_Nucleus
+CD31_Cell_Intensity_Average,CD31_Cell
+CD31_Cytoplasm_Intensity_Average,CD31_Cytoplasm
+CD31_Nucleus_Intensity_Average,CD31_Nucleus
+CD44_Cell_Intensity_Average,CD44_Cell
+CD44_Cytoplasm_Intensity_Average,CD44_Cytoplasm
+CD44_Nucleus_Intensity_Average,CD44_Nucleus
+CD45_Cell_Intensity_Average,CD45_Cell
+CD45_Cytoplasm_Intensity_Average,CD45_Cytoplasm
+CD45_Nucleus_Intensity_Average,CD45_Nucleus
+CD68_Cell_Intensity_Average,CD68_Cell
+CD68_Cytoplasm_Intensity_Average,CD68_Cytoplasm
+CD68_Nucleus_Intensity_Average,CD68_Nucleus
+CD163_Cell_Intensity_Average,CD163_Cell
+CD163_Cytoplasm_Intensity_Average,CD163_Cytoplasm
+CD163_Nucleus_Intensity_Average,CD163_Nucleus
+CKs_Cell_Intensity_Average,CKs_Cell
+CKs_Cytoplasm_Intensity_Average,CKs_Cytoplasm
+CKs_Nucleus_Intensity_Average,CKs_Nucleus
+ColVI_Cell_Intensity_Average,ColVI_Cell
+ColVI_Cytoplasm_Intensity_Average,ColVI_Cytoplasm
+ColVI_Nucleus_Intensity_Average,ColVI_Nucleus
+Desmin_Cell_Intensity_Average,Desmin_Cell
+Desmin_Cytoplasm_Intensity_Average,Desmin_Cytoplasm
+Desmin_Nucleus_Intensity_Average,Desmin_Nucleus
+Ecad_Cell_Intensity_Average,Ecad_Cell
+Ecad_Cytoplasm_Intensity_Average,Ecad_Cytoplasm
+Ecad_Nucleus_Intensity_Average,Ecad_Nucleus
+Fibronectin_Cell_Intensity_Average,Fibronectin_Cell
+Fibronectin_Cytoplasm_Intensity_Average,Fibronectin_Cytoplasm
+Fibronectin_Nucleus_Intensity_Average,Fibronectin_Nucleus
+FOXP3_Cell_Intensity_Average,FOXP3_Cell
+FOXP3_Cytoplasm_Intensity_Average,FOXP3_Cytoplasm
+FOXP3_Nucleus_Intensity_Average,FOXP3_Nucleus
+GATA3_Cell_Intensity_Average,GATA3_Cell
+GATA3_Cytoplasm_Intensity_Average,GATA3_Cytoplasm
+GATA3_Nucleus_Intensity_Average,GATA3_Nucleus
+HLA_Cell_Intensity_Average,HLA_Cell
+HLA_Cytoplasm_Intensity_Average,HLA_Cytoplasm
+HLA_Nucleus_Intensity_Average,HLA_Nucleus
+Ki67_Cell_Intensity_Average,Ki67_Cell
+Ki67_Cytoplasm_Intensity_Average,Ki67_Cytoplasm
+Ki67_Nucleus_Intensity_Average,Ki67_Nucleus
+MMP9_Cell_Intensity_Average,MMP9_Cell
+MMP9_Cytoplasm_Intensity_Average,MMP9_Cytoplasm
+MMP9_Nucleus_Intensity_Average,MMP9_Nucleus
+PD1_Cell_Intensity_Average,PD1_Cell
+PD1_Cytoplasm_Intensity_Average,PD1_Cytoplasm
+PD1_Nucleus_Intensity_Average,PD1_Nucleus
+PDGFR_Cell_Intensity_Average,PDGFR_Cell
+PDGFR_Cytoplasm_Intensity_Average,PDGFR_Cytoplasm
+PDGFR_Nucleus_Intensity_Average,PDGFR_Nucleus
+PDL1_Cell_Intensity_Average,PDL1_Cell
+PDL1_Cytoplasm_Intensity_Average,PDL1_Cytoplasm
+PDL1_Nucleus_Intensity_Average,PDL1_Nucleus
+r5c2_Cell_Intensity_Average,r5c2_Cell
+r5c2_Cytoplasm_Intensity_Average,r5c2_Cytoplasm
+r5c2_Nucleus_Intensity_Average,r5c2_Nucleus
+r7c2_Cell_Intensity_Average,r7c2_Cell
+r7c2_Cytoplasm_Intensity_Average,r7c2_Cytoplasm
+r7c2_Nucleus_Intensity_Average,r7c2_Nucleus
+r8c2_Cell_Intensity_Average,r8c2_Cell
+r8c2_Cytoplasm_Intensity_Average,r8c2_Cytoplasm
+r8c2_Nucleus_Intensity_Average,r8c2_Nucleus
+Sting_Cell_Intensity_Average,Sting_Cell
+Sting_Cytoplasm_Intensity_Average,Sting_Cytoplasm
+Sting_Nucleus_Intensity_Average,Sting_Nucleus
+Vimentin_Cell_Intensity_Average,Vimentin_Cell
+Vimentin_Cytoplasm_Intensity_Average,Vimentin_Cytoplasm
+Vimentin_Nucleus_Intensity_Average,Vimentin_Nucleus

test_metadata/immunecheckpoint_color_data.csv

@@ -0,0 +1,6 @@
+rgb,hex,immune_checkpoint
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+"(0.3126890019504329, 0.6928754610296064, 0.1923704830330379)",#50b131,PDL1
+"(0.23299120924703914, 0.639586552066035, 0.9260706093977744)",#3ba3ec,PD1
+"(0.6402432806212122, 0.56707501056059, 0.36409039926945397)",#a3915d,B7H4_PDL1
+"(0.5044925901631545, 0.5912455243957383, 0.5514171359788941)",#81978d,None

test_metadata/marker_intensity_metadata.csv

@@ -0,0 +1,109 @@
+Round,Target,Exp,Channel,target_lower,full_column,marker,localisation
+R0,AF488,300,c2,af488,AF488_Cell_Intensity_Average,AF488,cell
+R0,AF488,300,c2,af488,AF488_Cytoplasm_Intensity_Average,AF488,cytoplasm
+R0,AF488,300,c2,af488,AF488_Nucleus_Intensity_Average,AF488,nucleus
+R0,AF555,1500,c3,af555,AF555_Cell_Intensity_Average,AF555,cell
+R0,AF555,1500,c3,af555,AF555_Cytoplasm_Intensity_Average,AF555,cytoplasm
+R0,AF555,1500,c3,af555,AF555_Nucleus_Intensity_Average,AF555,nucleus
+R0,AF647,1500,c4,af647,AF647_Cell_Intensity_Average,AF647,cell
+R0,AF647,1500,c4,af647,AF647_Cytoplasm_Intensity_Average,AF647,cytoplasm
+R0,AF647,1500,c4,af647,AF647_Nucleus_Intensity_Average,AF647,nucleus
+R0,AF750,1500,c5,af750,AF750_Cell_Intensity_Average,AF750,cell
+R0,AF750,1500,c5,af750,AF750_Cytoplasm_Intensity_Average,AF750,cytoplasm
+R0,AF750,1500,c5,af750,AF750_Nucleus_Intensity_Average,AF750,nucleus
+R1,ColVI,300,c2,colvi,ColVI_Cell_Intensity_Average,ColVI,cell
+R1,ColVI,300,c2,colvi,ColVI_Cytoplasm_Intensity_Average,ColVI,cytoplasm
+R1,ColVI,300,c2,colvi,ColVI_Nucleus_Intensity_Average,ColVI,nucleus
+R1,CD31,1200,c3,cd31,CD31_Cell_Intensity_Average,CD31,cell
+R1,CD31,1200,c3,cd31,CD31_Cytoplasm_Intensity_Average,CD31,cytoplasm
+R1,CD31,1200,c3,cd31,CD31_Nucleus_Intensity_Average,CD31,nucleus
+R1,CD4,1500,c4,cd4,CD4_Cell_Intensity_Average,CD4,cell
+R1,CD4,1500,c4,cd4,CD4_Cytoplasm_Intensity_Average,CD4,cytoplasm
+R1,CD4,1500,c4,cd4,CD4_Nucleus_Intensity_Average,CD4,nucleus
+R1,Ecad,800,c5,ecad,Ecad_Cell_Intensity_Average,Ecad,cell
+R1,Ecad,800,c5,ecad,Ecad_Cytoplasm_Intensity_Average,Ecad,cytoplasm
+R1,Ecad,800,c5,ecad,Ecad_Nucleus_Intensity_Average,Ecad,nucleus
+R2,Desmin,300,c2,desmin,Desmin_Cell_Intensity_Average,Desmin,cell
+R2,Desmin,300,c2,desmin,Desmin_Cytoplasm_Intensity_Average,Desmin,cytoplasm
+R2,Desmin,300,c2,desmin,Desmin_Nucleus_Intensity_Average,Desmin,nucleus
+R2,B7H4,1500,c3,b7h4,B7H4_Cell_Intensity_Average,B7H4,cell
+R2,B7H4,1500,c3,b7h4,B7H4_Cytoplasm_Intensity_Average,B7H4,cytoplasm
+R2,B7H4,1500,c3,b7h4,B7H4_Nucleus_Intensity_Average,B7H4,nucleus
+R2,CD8,1500,c4,cd8,CD8_Cell_Intensity_Average,CD8,cell
+R2,CD8,1500,c4,cd8,CD8_Cytoplasm_Intensity_Average,CD8,cytoplasm
+R2,CD8,1500,c4,cd8,CD8_Nucleus_Intensity_Average,CD8,nucleus
+R2,CD20,1500,c5,cd20,CD20_Cell_Intensity_Average,CD20,cell
+R2,CD20,1500,c5,cd20,CD20_Cytoplasm_Intensity_Average,CD20,cytoplasm
+R2,CD20,1500,c5,cd20,CD20_Nucleus_Intensity_Average,CD20,nucleus
+R3,aSMA,50,c2,asma,aSMA_Cell_Intensity_Average,aSMA,cell
+R3,aSMA,50,c2,asma,aSMA_Cytoplasm_Intensity_Average,aSMA,cytoplasm
+R3,aSMA,50,c2,asma,aSMA_Nucleus_Intensity_Average,aSMA,nucleus
+R3,CD68,1500,c3,cd68,CD68_Cell_Intensity_Average,CD68,cell
+R3,CD68,1500,c3,cd68,CD68_Cytoplasm_Intensity_Average,CD68,cytoplasm
+R3,CD68,1500,c3,cd68,CD68_Nucleus_Intensity_Average,CD68,nucleus
+R3,PD1,1500,c4,pd1,PD1_Cell_Intensity_Average,PD1,cell
+R3,PD1,1500,c4,pd1,PD1_Cytoplasm_Intensity_Average,PD1,cytoplasm
+R3,PD1,1500,c4,pd1,PD1_Nucleus_Intensity_Average,PD1,nucleus
+R3,CD45,1500,c5,cd45,CD45_Cell_Intensity_Average,CD45,cell
+R3,CD45,1500,c5,cd45,CD45_Cytoplasm_Intensity_Average,CD45,cytoplasm
+R3,CD45,1500,c5,cd45,CD45_Nucleus_Intensity_Average,CD45,nucleus
+R4,Vimentin,150,c2,vimentin,Vimentin_Cell_Intensity_Average,Vimentin,cell
+R4,Vimentin,150,c2,vimentin,Vimentin_Cytoplasm_Intensity_Average,Vimentin,cytoplasm
+R4,Vimentin,150,c2,vimentin,Vimentin_Nucleus_Intensity_Average,Vimentin,nucleus
+R4,AXL,1500,c3,axl,AXL_Cell_Intensity_Average,AXL,cell
+R4,AXL,1500,c3,axl,AXL_Cytoplasm_Intensity_Average,AXL,cytoplasm
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+R4,PDL1,1500,c4,pdl1,PDL1_Cytoplasm_Intensity_Average,PDL1,cytoplasm
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+R4,FOXP3,1500,c5,foxp3,FOXP3_Cell_Intensity_Average,FOXP3,cell
+R4,FOXP3,1500,c5,foxp3,FOXP3_Cytoplasm_Intensity_Average,FOXP3,cytoplasm
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+R5,r5c2,20,c2,r5c2,r5c2_Cell_Intensity_Average,r5c2,cell
+R5,r5c2,20,c2,r5c2,r5c2_Cytoplasm_Intensity_Average,r5c2,cytoplasm
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+R5,CA9,1500,c3,ca9,CA9_Cell_Intensity_Average,CA9,cell
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+R5,CD163,1500,c4,cd163,CD163_Cell_Intensity_Average,CD163,cell
+R5,CD163,1500,c4,cd163,CD163_Cytoplasm_Intensity_Average,CD163,cytoplasm
+R5,CD163,1500,c4,cd163,CD163_Nucleus_Intensity_Average,CD163,nucleus
+R5,Ki67,1000,c5,ki67,Ki67_Cell_Intensity_Average,Ki67,cell
+R5,Ki67,1000,c5,ki67,Ki67_Cytoplasm_Intensity_Average,Ki67,cytoplasm
+R5,Ki67,1000,c5,ki67,Ki67_Nucleus_Intensity_Average,Ki67,nucleus
+R6,CKs,200,c2,cks,CKs_Cell_Intensity_Average,CKs,cell
+R6,CKs,200,c2,cks,CKs_Cytoplasm_Intensity_Average,CKs,cytoplasm
+R6,CKs,200,c2,cks,CKs_Nucleus_Intensity_Average,CKs,nucleus
+R6,Fibronectin,1500,c3,fibronectin,Fibronectin_Cell_Intensity_Average,Fibronectin,cell
+R6,Fibronectin,1500,c3,fibronectin,Fibronectin_Cytoplasm_Intensity_Average,Fibronectin,cytoplasm
+R6,Fibronectin,1500,c3,fibronectin,Fibronectin_Nucleus_Intensity_Average,Fibronectin,nucleus
+R6,CD44,1200,c4,cd44,CD44_Cell_Intensity_Average,CD44,cell
+R6,CD44,1200,c4,cd44,CD44_Cytoplasm_Intensity_Average,CD44,cytoplasm
+R6,CD44,1200,c4,cd44,CD44_Nucleus_Intensity_Average,CD44,nucleus
+R6,HLA,500,c5,hla,HLA_Cell_Intensity_Average,HLA,cell
+R6,HLA,500,c5,hla,HLA_Cytoplasm_Intensity_Average,HLA,cytoplasm
+R6,HLA,500,c5,hla,HLA_Nucleus_Intensity_Average,HLA,nucleus
+R7,r7c2,20,c2,r7c2,r7c2_Cell_Intensity_Average,r7c2,cell
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+R7,r7c2,20,c2,r7c2,r7c2_Nucleus_Intensity_Average,r7c2,nucleus
+R7,PDGFR,1500,c3,pdgfr,PDGFR_Cell_Intensity_Average,PDGFR,cell
+R7,PDGFR,1500,c3,pdgfr,PDGFR_Cytoplasm_Intensity_Average,PDGFR,cytoplasm
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+R7,MMP9,1500,c4,mmp9,MMP9_Cell_Intensity_Average,MMP9,cell
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+R7,GATA3,1500,c5,gata3,GATA3_Cytoplasm_Intensity_Average,GATA3,cytoplasm
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+R8,CD11b,1500,c5,cd11b,CD11b_Cell_Intensity_Average,CD11b,cell
+R8,CD11b,1500,c5,cd11b,CD11b_Cytoplasm_Intensity_Average,CD11b,cytoplasm
+R8,CD11b,1500,c5,cd11b,CD11b_Nucleus_Intensity_Average,CD11b,nucleus

test_metadata/not_intensities.csv

@@ -0,0 +1,12 @@
+Marker
+Cell_Size
+Nuc_X
+Nuc_Y_Inv
+ROI_index
+Nucleus_Size
+Nucleus_Roundness
+Sample_ID
+Round
+Exp
+Channel
+Target

test_metadata/round_color_data.csv

@@ -0,0 +1,10 @@
+rgb,hex,Round
+"(0.28685356234627135, 0.13009829239513535, 0.23110332132624437)",#49213b,R0
+"(0.36541462435986094, 0.2025447048359916, 0.37693310021636883)",#5d3460,R1
+"(0.40867533458903105, 0.2940761173840091, 0.5166711878800253)",#684b84,R2
+"(0.42890613750051265, 0.4082290173220481, 0.6335348887063806)",#6d68a2,R3
+"(0.4444462906865238, 0.5264664993764805, 0.7056321892616532)",#7186b4,R4
+"(0.47707206309601013, 0.6427061780374552, 0.7418477948908153)",#7aa4bd,R5
+"(0.5414454866716836, 0.7466759172596551, 0.7572905778378964)",#8abec1,R6
+"(0.6414710091647722, 0.8321551072276492, 0.7746773027952071)",#a4d4c6,R7
+"(0.7684256891219349, 0.8992667116749021, 0.8171383269422353)",#c4e5d0,R8

test_metadata/sample_color_data.csv

@@ -0,0 +1,5 @@
+rgb,hex,Sample_ID
+"(0.9677975592919913, 0.44127456009157356, 0.5358103155058701)",#f77189,DD3S1.csv
+"(0.5920891529639701, 0.6418467016378244, 0.1935069134991043)",#97a431,DD3S2.csv
+"(0.21044753832183283, 0.6773105080456748, 0.6433941168468681)",#36ada4,DD3S3.csv
+"(0.5019607843137255, 0.5019607843137255, 0.5019607843137255)",#808080,TMA.csv

test_metadata/short_to_full_column_names.csv

@@ -0,0 +1,109 @@
+short_name,full_name
+AF488_Cell,AF488_Cell_Intensity_Average
+AF488_Cytoplasm,AF488_Cytoplasm_Intensity_Average
+AF488_Nucleus,AF488_Nucleus_Intensity_Average
+AF555_Cell,AF555_Cell_Intensity_Average
+AF555_Cytoplasm,AF555_Cytoplasm_Intensity_Average
+AF555_Nucleus,AF555_Nucleus_Intensity_Average
+AF647_Cell,AF647_Cell_Intensity_Average
+AF647_Cytoplasm,AF647_Cytoplasm_Intensity_Average
+AF647_Nucleus,AF647_Nucleus_Intensity_Average
+AF750_Cell,AF750_Cell_Intensity_Average
+AF750_Cytoplasm,AF750_Cytoplasm_Intensity_Average
+AF750_Nucleus,AF750_Nucleus_Intensity_Average
+aSMA_Cell,aSMA_Cell_Intensity_Average
+aSMA_Cytoplasm,aSMA_Cytoplasm_Intensity_Average
+aSMA_Nucleus,aSMA_Nucleus_Intensity_Average
+AXL_Cell,AXL_Cell_Intensity_Average
+AXL_Cytoplasm,AXL_Cytoplasm_Intensity_Average
+AXL_Nucleus,AXL_Nucleus_Intensity_Average
+B7H4_Cell,B7H4_Cell_Intensity_Average
+B7H4_Cytoplasm,B7H4_Cytoplasm_Intensity_Average
+B7H4_Nucleus,B7H4_Nucleus_Intensity_Average
+CA9_Cell,CA9_Cell_Intensity_Average
+CA9_Cytoplasm,CA9_Cytoplasm_Intensity_Average
+CA9_Nucleus,CA9_Nucleus_Intensity_Average
+CD4_Cell,CD4_Cell_Intensity_Average
+CD4_Cytoplasm,CD4_Cytoplasm_Intensity_Average
+CD4_Nucleus,CD4_Nucleus_Intensity_Average
+CD8_Cell,CD8_Cell_Intensity_Average
+CD8_Cytoplasm,CD8_Cytoplasm_Intensity_Average
+CD8_Nucleus,CD8_Nucleus_Intensity_Average
+CD11b_Cell,CD11b_Cell_Intensity_Average
+CD11b_Cytoplasm,CD11b_Cytoplasm_Intensity_Average
+CD11b_Nucleus,CD11b_Nucleus_Intensity_Average
+CD11c_Cell,CD11c_Cell_Intensity_Average
+CD11c_Cytoplasm,CD11c_Cytoplasm_Intensity_Average
+CD11c_Nucleus,CD11c_Nucleus_Intensity_Average
+CD20_Cell,CD20_Cell_Intensity_Average
+CD20_Cytoplasm,CD20_Cytoplasm_Intensity_Average
+CD20_Nucleus,CD20_Nucleus_Intensity_Average
+CD31_Cell,CD31_Cell_Intensity_Average
+CD31_Cytoplasm,CD31_Cytoplasm_Intensity_Average
+CD31_Nucleus,CD31_Nucleus_Intensity_Average
+CD44_Cell,CD44_Cell_Intensity_Average
+CD44_Cytoplasm,CD44_Cytoplasm_Intensity_Average
+CD44_Nucleus,CD44_Nucleus_Intensity_Average
+CD45_Cell,CD45_Cell_Intensity_Average
+CD45_Cytoplasm,CD45_Cytoplasm_Intensity_Average
+CD45_Nucleus,CD45_Nucleus_Intensity_Average
+CD68_Cell,CD68_Cell_Intensity_Average
+CD68_Cytoplasm,CD68_Cytoplasm_Intensity_Average
+CD68_Nucleus,CD68_Nucleus_Intensity_Average
+CD163_Cell,CD163_Cell_Intensity_Average
+CD163_Cytoplasm,CD163_Cytoplasm_Intensity_Average
+CD163_Nucleus,CD163_Nucleus_Intensity_Average
+CKs_Cell,CKs_Cell_Intensity_Average
+CKs_Cytoplasm,CKs_Cytoplasm_Intensity_Average
+CKs_Nucleus,CKs_Nucleus_Intensity_Average
+ColVI_Cell,ColVI_Cell_Intensity_Average
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+ColVI_Nucleus,ColVI_Nucleus_Intensity_Average
+Desmin_Cell,Desmin_Cell_Intensity_Average
+Desmin_Cytoplasm,Desmin_Cytoplasm_Intensity_Average
+Desmin_Nucleus,Desmin_Nucleus_Intensity_Average
+Ecad_Cell,Ecad_Cell_Intensity_Average
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+Ecad_Nucleus,Ecad_Nucleus_Intensity_Average
+Fibronectin_Cell,Fibronectin_Cell_Intensity_Average
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+Fibronectin_Nucleus,Fibronectin_Nucleus_Intensity_Average
+FOXP3_Cell,FOXP3_Cell_Intensity_Average
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+GATA3_Cell,GATA3_Cell_Intensity_Average
+GATA3_Cytoplasm,GATA3_Cytoplasm_Intensity_Average
+GATA3_Nucleus,GATA3_Nucleus_Intensity_Average
+HLA_Cell,HLA_Cell_Intensity_Average
+HLA_Cytoplasm,HLA_Cytoplasm_Intensity_Average
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+Ki67_Cell,Ki67_Cell_Intensity_Average
+Ki67_Cytoplasm,Ki67_Cytoplasm_Intensity_Average
+Ki67_Nucleus,Ki67_Nucleus_Intensity_Average
+MMP9_Cell,MMP9_Cell_Intensity_Average
+MMP9_Cytoplasm,MMP9_Cytoplasm_Intensity_Average
+MMP9_Nucleus,MMP9_Nucleus_Intensity_Average
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+PDL1_Cell,PDL1_Cell_Intensity_Average
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+PDL1_Nucleus,PDL1_Nucleus_Intensity_Average
+r5c2_Cell,r5c2_Cell_Intensity_Average
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+r7c2_Cell,r7c2_Cell_Intensity_Average
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+r7c2_Nucleus,r7c2_Nucleus_Intensity_Average
+r8c2_Cell,r8c2_Cell_Intensity_Average
+r8c2_Cytoplasm,r8c2_Cytoplasm_Intensity_Average
+r8c2_Nucleus,r8c2_Nucleus_Intensity_Average
+Sting_Cell,Sting_Cell_Intensity_Average
+Sting_Cytoplasm,Sting_Cytoplasm_Intensity_Average
+Sting_Nucleus,Sting_Nucleus_Intensity_Average
+Vimentin_Cell,Vimentin_Cell_Intensity_Average
+Vimentin_Cytoplasm,Vimentin_Cytoplasm_Intensity_Average
+Vimentin_Nucleus,Vimentin_Nucleus_Intensity_Average