Spaces:
Sleeping
Sleeping
File size: 21,106 Bytes
cb3f8ef 559d0be cb3f8ef ad0e615 cb3f8ef 559d0be cb3f8ef 8c93583 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 cb3f8ef 4bddf84 cb3f8ef 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 061e077 3b4dfe5 559d0be cb3f8ef 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be cb3f8ef 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 cb3f8ef 3b4dfe5 cb3f8ef 3b4dfe5 cb3f8ef 559d0be cb3f8ef 3b4dfe5 559d0be cb3f8ef 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 559d0be cb3f8ef 559d0be 3b4dfe5 a86c1a8 3b4dfe5 4bddf84 559d0be 3b4dfe5 559d0be 3b4dfe5 | 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 | # ===================================================================================
# WAHIS SCRAPER - VERSION SANS PLAYWRIGHT (REQUESTS + HTTPX)
# ===================================================================================
import streamlit as st
import pandas as pd
import json
from datetime import datetime
from pathlib import Path
import requests
import httpx
import asyncio
from streamlit_folium import st_folium
import folium
import traceback
import logging
import time
import random
from typing import Dict, List, Optional, Tuple
# Configuration des logs
logging.basicConfig(level=logging.INFO)
logger = logging.getLogger(__name__)
# --- Configuration et Initialisation ---
st.set_page_config(layout="wide", page_title="WAHIS Animal Disease Dashboard")
class WAHISScraperHTTP:
"""Scraper WAHIS utilisant uniquement HTTP requests (sans navigateur)"""
def __init__(self):
self.logs = []
self.session = None
self.base_url = "https://wahis.woah.org"
# Headers pour simuler un navigateur réel
self.headers = {
'User-Agent': 'Mozilla/5.0 (Windows NT 10.0; Win64; x64) AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko) Chrome/120.0.0.0 Safari/537.36',
'Accept': 'application/json, text/plain, */*',
'Accept-Language': 'fr-FR,fr;q=0.9,en;q=0.8',
'Accept-Encoding': 'gzip, deflate, br',
'Connection': 'keep-alive',
'Sec-Fetch-Dest': 'empty',
'Sec-Fetch-Mode': 'cors',
'Sec-Fetch-Site': 'same-origin',
'sec-ch-ua': '"Not_A Brand";v="8", "Chromium";v="120", "Google Chrome";v="120"',
'sec-ch-ua-mobile': '?0',
'sec-ch-ua-platform': '"Windows"'
}
def log(self, message: str, level: str = "INFO"):
"""Logging avec niveaux"""
timestamp = datetime.now().strftime("%H:%M:%S")
formatted_message = f"[{timestamp}] {level}: {message}"
self.logs.append(formatted_message)
if level == "ERROR":
logger.error(message)
elif level == "WARNING":
logger.warning(message)
else:
logger.info(message)
def _create_session(self) -> requests.Session:
"""Crée une session HTTP avec les bons headers"""
session = requests.Session()
session.headers.update(self.headers)
# Configuration SSL et timeout
session.verify = True
session.timeout = 30
return session
def _get_api_headers(self) -> Dict[str, str]:
"""Headers spécifiques pour les API WAHIS"""
api_headers = self.headers.copy()
api_headers.update({
'Content-Type': 'application/json',
'clientid': 'OIEwebsite',
'env': 'PRD',
'security-token': 'token',
'type': 'REQUEST',
'Referer': 'https://wahis.woah.org/',
'Origin': 'https://wahis.woah.org'
})
return api_headers
def _make_api_request(self, url: str, payload: dict, retries: int = 3) -> Optional[dict]:
"""Fait une requête API avec retry logic"""
for attempt in range(retries):
try:
# Délai aléatoire pour éviter la détection
if attempt > 0:
delay = random.uniform(2, 5)
self.log(f"Tentative {attempt + 1}/{retries} après {delay:.1f}s de délai")
time.sleep(delay)
response = self.session.post(
url,
json=payload,
headers=self._get_api_headers(),
timeout=30
)
self.log(f"Statut HTTP: {response.status_code} pour {url}")
if response.status_code == 200:
return response.json()
elif response.status_code == 403:
self.log("Accès refusé (403) - possible blocage Cloudflare", "WARNING")
continue
elif response.status_code == 429:
self.log("Trop de requêtes (429) - attente prolongée", "WARNING")
time.sleep(10)
continue
else:
self.log(f"Erreur HTTP {response.status_code}: {response.text[:200]}", "WARNING")
continue
except requests.exceptions.Timeout:
self.log(f"Timeout sur tentative {attempt + 1}", "WARNING")
except requests.exceptions.ConnectionError as e:
self.log(f"Erreur de connexion: {str(e)}", "WARNING")
except Exception as e:
self.log(f"Erreur inattendue: {str(e)}", "WARNING")
self.log(f"Échec après {retries} tentatives pour {url}", "ERROR")
return None
def _initialize_session(self) -> bool:
"""Initialise la session en visitant d'abord la page principale"""
try:
self.log("🌐 Initialisation de la session HTTP")
self.session = self._create_session()
# Première visite pour établir la session
main_url = f"{self.base_url}/#/event-management"
response = self.session.get(main_url, timeout=15)
if response.status_code == 200:
self.log("✅ Session initialisée avec succès")
return True
else:
self.log(f"Erreur d'initialisation: {response.status_code}", "WARNING")
return False
except Exception as e:
self.log(f"Échec d'initialisation: {str(e)}", "ERROR")
return False
def run_extraction_sync(self) -> Tuple[List, List, List, str]:
"""Extraction principale en mode synchrone"""
self.log("🚀 Démarrage de l'extraction WAHIS (mode HTTP)")
try:
# Initialisation de la session
if not self._initialize_session():
raise Exception("Impossible d'initialiser la session HTTP")
# Attendre un peu pour simuler un utilisateur réel
time.sleep(2)
# ===== PHASE 1: Récupération des rapports =====
self.log("📋 PHASE 1: Récupération de la liste des rapports")
list_api_url = "https://wahis.woah.org/api/v1/pi/event/filtered-list?language=fr"
payload_list = {
"pageNumber": 1,
"pageSize": 100,
"sortColName": "REP_LAST_UPDATE",
"sortColOrder": "DESC",
"reportFilters": {},
"languageChanged": False
}
list_response = self._make_api_request(list_api_url, payload_list)
if not list_response:
raise Exception("Phase 1 échouée: Impossible de récupérer les rapports")
report_list = list_response.get('list', [])
if not report_list:
raise Exception("Phase 1 échouée: Liste de rapports vide")
self.log(f"✅ Phase 1 réussie: {len(report_list)} rapports récupérés")
# ===== PHASE 2: Données GPS des foyers =====
unique_event_ids = sorted(list(set(
item['eventId'] for item in report_list
if 'eventId' in item and item['eventId']
)))
self.log(f"🗺️ PHASE 2: Récupération GPS pour {len(unique_event_ids)} événements")
if not unique_event_ids:
self.log("Aucun ID d'événement trouvé", "WARNING")
return report_list, [], [], "\n".join(self.logs)
outbreaks_api_url = "https://wahis.woah.org/api/v1/pi/map-data/outbreaks-from-event-ids?language=fr"
all_outbreaks_data = self._make_api_request(outbreaks_api_url, unique_event_ids)
if not all_outbreaks_data:
self.log("Phase 2 échouée, mais continuation possible", "WARNING")
all_outbreaks_data = []
elif not isinstance(all_outbreaks_data, list):
all_outbreaks_data = []
self.log(f"✅ Phase 2: {len(all_outbreaks_data)} foyers récupérés")
# ===== PHASE 3: Détails épidémiologiques =====
unique_outbreak_ids = sorted(list(set(
item['outbreakId'] for item in all_outbreaks_data
if 'outbreakId' in item and item['outbreakId']
)))
additional_info_data = []
if unique_outbreak_ids:
self.log(f"📊 PHASE 3: Détails pour {len(unique_outbreak_ids)} foyers")
additional_info_api_url = "https://wahis.woah.org/api/v1/pi/outbreak/additional-information"
additional_info_data = self._make_api_request(additional_info_api_url, unique_outbreak_ids)
if not additional_info_data:
self.log("Phase 3 échouée (non critique)", "WARNING")
additional_info_data = []
elif not isinstance(additional_info_data, list):
additional_info_data = []
self.log(f"✅ Phase 3: {len(additional_info_data)} détails récupérés")
self.log("🎉 Extraction HTTP terminée avec succès!")
return report_list, all_outbreaks_data, additional_info_data, "\n".join(self.logs)
except Exception as e:
error_msg = f"Erreur critique pendant l'extraction HTTP: {str(e)}"
self.log(error_msg, "ERROR")
raise Exception(error_msg)
finally:
if self.session:
self.session.close()
self.log("🔒 Session HTTP fermée")
def process_data(reports: list, outbreaks: list, additional_infos: list) -> pd.DataFrame:
"""Traitement et fusion des données avec validation"""
if not outbreaks:
return pd.DataFrame()
# Validation et nettoyage des données additionnelles
valid_additional_infos = [
info for info in additional_infos
if isinstance(info, dict) and 'outbreakId' in info
]
additional_info_map = {
info['outbreakId']: info for info in valid_additional_infos
}
# Mapping des maladies depuis les rapports
report_map = {
report['eventId']: {
'disease': report.get('disease', 'N/A'),
'reportDate': report.get('reportDate'),
'country': report.get('country')
}
for report in reports if 'eventId' in report
}
# Enrichissement des données de foyers
enriched_outbreaks = []
for outbreak in outbreaks:
if not isinstance(outbreak, dict):
continue
# Copie de l'outbreak original
enriched_outbreak = outbreak.copy()
# Ajout des informations du rapport
event_id = outbreak.get('eventId')
if event_id in report_map:
event_info = report_map[event_id]
enriched_outbreak['diseaseName'] = event_info['disease']
enriched_outbreak['reportDate'] = event_info.get('reportDate')
if not enriched_outbreak.get('country'):
enriched_outbreak['country'] = event_info.get('country')
# Ajout des informations additionnelles
outbreak_id = outbreak.get('outbreakId')
if outbreak_id in additional_info_map:
additional_data = additional_info_map[outbreak_id]
enriched_outbreak.update(additional_data)
# Validation des coordonnées GPS
lat = enriched_outbreak.get('latitude')
lon = enriched_outbreak.get('longitude')
if lat is not None and lon is not None:
try:
lat_float = float(lat)
lon_float = float(lon)
if -90 <= lat_float <= 90 and -180 <= lon_float <= 180:
enriched_outbreak['latitude'] = lat_float
enriched_outbreak['longitude'] = lon_float
enriched_outbreaks.append(enriched_outbreak)
except (ValueError, TypeError):
# Ignorer les entrées avec des coordonnées invalides
continue
return pd.DataFrame(enriched_outbreaks)
# --- Interface Streamlit ---
st.title("🦠 Tableau de Bord WAHIS - Maladies Animales")
st.markdown("*Surveillance mondiale des maladies animales (OIE/WOAH) - Version HTTP*")
# Initialisation des données de session
if 'df_outbreaks' not in st.session_state:
st.session_state.df_outbreaks = pd.DataFrame()
st.session_state.logs = ""
st.session_state.last_update = None
# Bouton d'extraction
col1, col2 = st.columns([1, 2])
with col1:
extract_button = st.button("🚀 Extraire les données WAHIS", type="primary")
with col2:
if st.session_state.last_update:
st.success(f"Dernière mise à jour: {st.session_state.last_update}")
if extract_button:
with st.spinner("🔄 Extraction en cours via HTTP... (1-2 minutes)"):
progress_bar = st.progress(0)
status_text = st.empty()
try:
scraper = WAHISScraperHTTP()
status_text.text("Initialisation de la connexion...")
progress_bar.progress(20)
# Lancement de l'extraction
reports, outbreaks, additional, logs = scraper.run_extraction_sync()
progress_bar.progress(80)
status_text.text("Traitement des données...")
if reports:
st.session_state.df_outbreaks = process_data(reports, outbreaks, additional)
st.session_state.logs = logs
st.session_state.last_update = datetime.now().strftime("%d/%m/%Y %H:%M")
progress_bar.progress(100)
status_text.empty()
st.success(f"✅ Extraction HTTP réussie! {len(st.session_state.df_outbreaks)} foyers récupérés.")
st.rerun()
else:
progress_bar.empty()
status_text.empty()
st.error("❌ Échec de l'extraction. Consultez les logs pour plus de détails.")
st.session_state.logs = logs
except Exception as e:
progress_bar.empty()
status_text.empty()
st.error("❌ Erreur critique pendant l'extraction HTTP")
st.code(str(e))
# Afficher des solutions possibles
st.info("💡 Solutions possibles:")
st.markdown("""
- Le site WAHIS peut être temporairement inaccessible
- Cloudflare bloque peut-être les requêtes automatisées
- Essayez de relancer dans quelques minutes
- Vérifiez votre connexion internet
""")
# Affichage des données si disponibles
if not st.session_state.df_outbreaks.empty:
df = st.session_state.df_outbreaks
# Sidebar avec filtres
st.sidebar.header("🔍 Filtres de recherche")
# Statistiques rapides
st.sidebar.metric("Total foyers", len(df))
st.sidebar.metric("Pays affectés", df['country'].nunique() if 'country' in df.columns else 0)
st.sidebar.metric("Maladies détectées", df['diseaseName'].nunique() if 'diseaseName' in df.columns else 0)
# Filtres
all_diseases = ["Toutes"] + sorted(df['diseaseName'].dropna().unique().tolist())
all_countries = ["Tous"] + sorted(df['country'].dropna().unique().tolist()) if 'country' in df.columns else ["Tous"]
all_species = ["Toutes"] + sorted(df['species'].dropna().unique().tolist()) if 'species' in df.columns else ["Toutes"]
selected_disease = st.sidebar.selectbox("🦠 Maladie", all_diseases)
selected_country = st.sidebar.selectbox("🌍 Pays", all_countries)
selected_species = st.sidebar.selectbox("🐄 Espèce", all_species)
# Application des filtres
filtered_df = df.copy()
if selected_disease != "Toutes":
filtered_df = filtered_df[filtered_df['diseaseName'] == selected_disease]
if selected_country != "Tous" and 'country' in df.columns:
filtered_df = filtered_df[filtered_df['country'] == selected_country]
if selected_species != "Toutes" and 'species' in df.columns:
filtered_df = filtered_df[filtered_df['species'] == selected_species]
# Carte interactive
st.header(f"🗺️ Localisation de {len(filtered_df)} foyer(s)")
if filtered_df.empty:
st.warning("⚠️ Aucun foyer ne correspond aux filtres sélectionnés.")
elif not all(col in filtered_df.columns for col in ['latitude', 'longitude']):
st.warning("⚠️ Données GPS manquantes pour l'affichage de la carte.")
else:
# Calcul du centre de la carte
center_lat = filtered_df['latitude'].mean()
center_lon = filtered_df['longitude'].mean()
m = folium.Map(
location=[center_lat, center_lon],
zoom_start=4,
tiles='OpenStreetMap'
)
# Ajout des marqueurs avec clustering
from folium.plugins import MarkerCluster
marker_cluster = MarkerCluster().add_to(m)
for _, row in filtered_df.iterrows():
popup_content = f"""
<b>🏥 Foyer:</b> {row.get('locationName', 'Non spécifié')}<br>
<b>🦠 Maladie:</b> {row.get('diseaseName', 'N/A')}<br>
<b>🐄 Espèce:</b> {row.get('species', 'N/A')}<br>
<b>🌍 Pays:</b> {row.get('country', 'N/A')}<br>
<b>📅 Date:</b> {row.get('reportDate', 'N/A')}
"""
# Couleur selon le type de maladie
color = 'red' if 'influenza' in str(row.get('diseaseName', '')).lower() else 'blue'
folium.Marker(
location=[row['latitude'], row['longitude']],
popup=folium.Popup(popup_content, max_width=300),
tooltip=f"{row.get('diseaseName', 'N/A')} - {row.get('country', 'N/A')}",
icon=folium.Icon(color=color)
).add_to(marker_cluster)
st_folium(m, width='100%', height=500)
# Tableau des données
with st.expander("📊 Tableau détaillé des foyers", expanded=False):
if not filtered_df.empty:
# Sélection des colonnes importantes
display_columns = []
for col in ['diseaseName', 'country', 'locationName', 'species', 'reportDate', 'latitude', 'longitude']:
if col in filtered_df.columns:
display_columns.append(col)
if display_columns:
st.dataframe(
filtered_df[display_columns],
use_container_width=True,
height=400
)
# Bouton de téléchargement
csv = filtered_df.to_csv(index=False)
st.download_button(
label="📥 Télécharger les données (CSV)",
data=csv,
file_name=f"wahis_foyers_{datetime.now().strftime('%Y%m%d_%H%M')}.csv",
mime="text/csv"
)
else:
st.info("Aucune donnée à afficher avec les filtres actuels.")
# Logs et informations
with st.expander("🔧 Journal d'exécution", expanded=False):
if st.session_state.get('logs'):
st.text_area("Logs détaillés:", st.session_state.logs, height=400)
else:
st.info("Aucun log disponible. Lancez une extraction pour voir les détails.")
# Section d'aide
with st.expander("ℹ️ À propos de cette version", expanded=False):
st.markdown("""
### Version HTTP (sans Playwright)
Cette version utilise des requêtes HTTP directes au lieu d'un navigateur web:
**✅ Avantages:**
- Plus léger et rapide
- Fonctionne dans tous les environnements
- Pas de dépendances lourdes
**⚠️ Limitations:**
- Peut être bloqué par Cloudflare
- Moins robuste face aux changements du site
- Nécessite parfois plusieurs tentatives
**🔧 En cas de problème:**
- Relancez l'extraction après quelques minutes
- Le site WAHIS peut être temporairement indisponible
- Cloudflare peut bloquer les requêtes automatisées
""")
# Footer
st.markdown("---")
st.markdown(
"🔬 *Outil développé pour la surveillance des maladies animales - "
"Données issues de WAHIS (OIE/WOAH) - Version HTTP*"
) |