Spaces:
Running
Running
File size: 3,332 Bytes
06a8036 95d983b 06a8036 95d983b 06a8036 8f49763 7ae43e9 8f49763 7ae43e9 8f49763 | 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 | ---
title: SYNTAX-Video Inference
emoji: 🫀
colorFrom: indigo
colorTo: blue
sdk: gradio
sdk_version: 5.49.1
python_version: '3.11'
app_file: app.py
pinned: false
license: apache-2.0
tags:
- medical-imaging
- video
- pytorch
- dicom
- cardiology
---
# 🫀 SYNTAX-Video — Multi-study Inference
**SYNTAX-Video** — это интерфейс для автоматической оценки **SYNTAX-score** по видеозаписям коронарной ангиографии.
Модель анализирует DICOM-файлы левой и правой коронарной артерии, вычисляя вклад каждой и итоговый суммарный показатель.
---
## 🚀 Возможности
* Загрузка исследований в формате **DICOM**
* Поддержка **многомодельного ансамбля** (усреднение только по моделям)
* Обработка **нескольких клипов** одной артерии как единой последовательности
* Интерфейс для **множественных исследований** в одном сеансе
* Автоматическое определение весов модели (`weights/left`, `weights/right`)
---
## 🧭 Как использовать
1. Укажите **ID исследования** и при необходимости краткое **описание**.
2. Загрузите **DICOM-файлы** для **левой** и/или **правой** артерии.
3. Нажмите **“Add study”**, затем **“Run inference”**.
4. Результаты отобразятся в виде JSON-структуры с:
* предсказаниями по каждой модели,
* средним значением для каждой артерии,
* суммарным SYNTAX-score,
* пометкой «High-risk» при превышении порога.
---
## ⚙️ Технические детали
* **Backbone:** `r3d_18` (torchvision)
* **Head:** `lstm_mean` (возможно использование других вариантов: GRU, mean, BERT-head и др.)
* **Формат входа:** `(1, S, C, T, H, W)` — пакет клипов одной артерии
* **Нормализация:** стандарт ImageNet
* **Усреднение:** только по моделям ансамбля (без усреднения по клипам внутри исследования)
* **Пороговые значения:**
* левая артерия ≥ 15
* правая артерия ≥ 5
* общее исследование ≥ 22
---
## 🧩 Структура проекта
```
configs/
└── default.yaml # Основная конфигурация
src/syntax_pred/
├── model.py # Архитектура и загрузка весов
├── preprocess.py # Обработка DICOM и трансформации
├── data.py # Минималистичный датасет для инференса
├── utils.py # Поддержка: выбор устройства, поиск весов
app.py # Gradio-интерфейс
``` |