Spaces:
Runtime error
Runtime error
Create app.py
Browse files
app.py
ADDED
|
@@ -0,0 +1,98 @@
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| 1 |
+
import gradio as gr
|
| 2 |
+
from transformers import AutoImageProcessor, AutoModelForImageSegmentation
|
| 3 |
+
from PIL import Image
|
| 4 |
+
import torch
|
| 5 |
+
import matplotlib.pyplot as plt
|
| 6 |
+
import numpy as np
|
| 7 |
+
|
| 8 |
+
# 1️⃣ โหลดโมเดล pre-trained จาก Hugging Face
|
| 9 |
+
model_name = "MLforHealthcare/sam2rad" # MedSAM2
|
| 10 |
+
processor = AutoImageProcessor.from_pretrained(model_name)
|
| 11 |
+
model = AutoModelForImageSegmentation.from_pretrained(model_name)
|
| 12 |
+
|
| 13 |
+
# 2️⃣ dictionary คำอธิบายอวัยวะ 50 ชิ้น
|
| 14 |
+
organ_desc = {
|
| 15 |
+
0: "สมอง 🧠: ควบคุมการทำงานของร่างกาย",
|
| 16 |
+
1: "หัวใจ ❤️: สูบฉีดเลือด",
|
| 17 |
+
2: "ปอด 💨: แลกเปลี่ยนก๊าซ",
|
| 18 |
+
3: "ตับ 🍵: กำจัดสารพิษ",
|
| 19 |
+
4: "ไต 💧: กรองของเสียในเลือด",
|
| 20 |
+
5: "กระเพาะอาหาร 🥘: ย่อยอาหาร",
|
| 21 |
+
6: "ลำไส้เล็ก 🌾: ดูดซึมอาหาร",
|
| 22 |
+
7: "ลำไส้ใหญ่ 🌽: ดูดซึมและขับถ่าย",
|
| 23 |
+
8: "ตับอ่อน 🍭: สร้างอินซูลิน",
|
| 24 |
+
9: "กระเพาะปัสสาวะ 💦: เก็บปัสสาวะ",
|
| 25 |
+
10: "ม้าม 🔴: กรองเลือดและระบบภูมิคุ้มกัน",
|
| 26 |
+
11: "หลอดเลือดแดงใหญ่ 🔴: นำเลือดจากหัวใจไปยังร่างกาย",
|
| 27 |
+
12: "หลอดเลือดดำใหญ่ 🔵: นำเลือดกลับสู่หัวใจ",
|
| 28 |
+
13: "กระดูกสันหลัง 🦴: รองรับร่างกายและปกป้องไขสันหลัง",
|
| 29 |
+
14: "กล้ามเนื้อแขน 💪: ขยับแขน",
|
| 30 |
+
15: "กล้ามเนื้อขา 🦵: ขยับขาและเดิน",
|
| 31 |
+
16: "ผิวหนัง 🩸: ปกป้องร่างกาย",
|
| 32 |
+
17: "ลูกตา 👁️: รับภาพ",
|
| 33 |
+
18: "หู 👂: ได้ยินและรักษาสมดุล",
|
| 34 |
+
19: "จมูก 👃: ดมกลิ่น",
|
| 35 |
+
20: "ลิ้น 👅: ชิมอาหาร",
|
| 36 |
+
21: "ฟัน 🦷: เคี้ยวอาหาร",
|
| 37 |
+
22: "หูชั้นกลาง 🔊: นำเสียงเข้าโสตประสาท",
|
| 38 |
+
23: "กล่องเสียง 🗣️: สร้างเสียงพูด",
|
| 39 |
+
24: "หลอดลม 🌬️: นำอากาศเข้าสู่ปอด",
|
| 40 |
+
25: "หลอดอาหาร 🍴: นำอาหารสู่กระเพาะ",
|
| 41 |
+
26: "ไส้เลื่อน/เนื้อเยื่อใต้ผิว 🔹: ปกป้องอวัยวะภายใน",
|
| 42 |
+
27: "ต่อมไทรอยด์ 🦋: ควบคุมเมตาบอลิซึม",
|
| 43 |
+
28: "ต่อมหมวกไต 🏔️: ผลิตฮอร์โมน",
|
| 44 |
+
29: "อัณฑะ/รังไข่ 🔵: สร้างเซลล์สืบพันธุ์",
|
| 45 |
+
30: "มดลูก/อวัยวะสืบพันธุ์หญิง 🌸: ตั้งครรภ์",
|
| 46 |
+
31: "หลอดน้ำเหลือง 💛: ระบบภูมิคุ้มกัน",
|
| 47 |
+
32: "ต่อมน้ำเหลือง 💚: กรองเชื้อโรค",
|
| 48 |
+
33: "กระดูกเชิงกราน 🦴: รองรับอวัยวะภายใน",
|
| 49 |
+
34: "หัวเข่า 🦵: ขยับขา",
|
| 50 |
+
35: "ข้อศอก 💪: ขยับแขน",
|
| 51 |
+
36: "ไส้ติ่ง 🔺: อวัยวะเสริมย่อยอาหาร",
|
| 52 |
+
37: "เนื้อเยื่อไขมัน 🟡: เก็บพลังงาน",
|
| 53 |
+
38: "กล้ามเนื้อหน้าอก 💪: ช่วยหายใจและขยับแขน",
|
| 54 |
+
39: "กระดูกหน้าอก 🦴: ปกป้องหัวใจและปอด",
|
| 55 |
+
40: "ขากรรไกร 👄: เคี้ยวอาหาร",
|
| 56 |
+
41: "หลอดเลือดฝอย 🔴🔵: แลกเปลี่ยนสารอาหารและออกซิเจน",
|
| 57 |
+
42: "กระดูกสันคอ 🦴: ปกป้องไขสันหลังส่วนคอ",
|
| 58 |
+
43: "เส้นประสาท 🧬: ส่งสัญญาณร่างกาย",
|
| 59 |
+
44: "เส้นเอ็น/เอ็นกล้ามเนื้อ 🔗: เชื่อมกล้ามเนื้อกับกระดูก",
|
| 60 |
+
45: "กล้ามเนื้อหน้าท้อง 💪: รองรับอวัยวะภายใน",
|
| 61 |
+
46: "ผนังช่องท้อง 🩻: ปกป้องอวัยวะในช่อ��ท้อง",
|
| 62 |
+
47: "ต่อมน้ำลาย 🟤: ผลิตน้ำลาย",
|
| 63 |
+
48: "ต่อมน้ำนม 🍼: สร้างน้ำนม (หญิง)",
|
| 64 |
+
49: "สมองน้อย 🧠: ควบคุมการทรงตัวและการเคลื่อนไหว"
|
| 65 |
+
}
|
| 66 |
+
|
| 67 |
+
# 3️⃣ ฟังก์ชันตรวจจับอวัยวะ
|
| 68 |
+
def detect_organs(img):
|
| 69 |
+
inputs = processor(images=img, return_tensors="pt")
|
| 70 |
+
with torch.no_grad():
|
| 71 |
+
outputs = model(**inputs)
|
| 72 |
+
seg_map = outputs.logits.argmax(dim=1).squeeze().cpu().numpy()
|
| 73 |
+
|
| 74 |
+
# วาด overlay
|
| 75 |
+
plt.figure(figsize=(6,6))
|
| 76 |
+
plt.imshow(img)
|
| 77 |
+
plt.imshow(seg_map, alpha=0.5, cmap='jet')
|
| 78 |
+
plt.axis('off')
|
| 79 |
+
plt.tight_layout()
|
| 80 |
+
plt.savefig("segmented.png", bbox_inches='tight', pad_inches=0)
|
| 81 |
+
segmented_img = Image.open("segmented.png")
|
| 82 |
+
|
| 83 |
+
# ดึงคำอธิบายอวัยวะที่พบ
|
| 84 |
+
detected_organs = np.unique(seg_map)
|
| 85 |
+
descriptions = [organ_desc.get(int(o), f"อวัยวะ {int(o)}") for o in detected_organs]
|
| 86 |
+
|
| 87 |
+
return segmented_img, "\n".join(descriptions)
|
| 88 |
+
|
| 89 |
+
# 4️⃣ สร้าง Gradio Interface
|
| 90 |
+
iface = gr.Interface(
|
| 91 |
+
fn=detect_organs,
|
| 92 |
+
inputs=gr.Image(type="pil"),
|
| 93 |
+
outputs=[gr.Image(type="pil"), gr.Textbox()],
|
| 94 |
+
title="ตรวจจับอวัยวะ 50 ชิ้นด้วย MedSAM2",
|
| 95 |
+
description="อัปโหลดภาพ → AI ตรวจจับอวัยวะ → วาดกรอบ → แสดงคำอธิบาย"
|
| 96 |
+
)
|
| 97 |
+
|
| 98 |
+
iface.launch()
|