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main.py

@@ -0,0 +1,276 @@
+
+
+# Crawler
+
+import requests
+from bs4 import BeautifulSoup
+import re
+import time
+
+def crawl_website(url, max_depth=2, current_depth=0, visited=None):
+    if visited is None:
+        visited = set()
+    
+    if current_depth > max_depth or url in visited:
+        return []
+    
+    visited.add(url)
+    print(f"Crawling: {url} at depth {current_depth}")
+    
+    try:
+        response = requests.get(url, timeout=5)
+        response.raise_for_status()
+    except requests.RequestException as e:
+        print(f"Failed to retrieve {url}: {e}")
+        return []
+    
+    soup = BeautifulSoup(response.text, 'html.parser')
+    text = soup.get_text(separator='\n', strip=True)
+    
+    links = []
+    for link in soup.find_all('a', href=True):
+        href = link['href']
+        if href.startswith('http'):
+            links.append(href)
+        elif href.startswith('/'):
+            base_url = re.match(r'^(https?://[^/]+)', url)
+            if base_url:
+                links.append(base_url.group(1) + href)
+    
+    
+    for link in links:
+        text += '\n' + '\n'.join(crawl_website(link, max_depth, current_depth + 1, visited))
+    
+    return [text]
+
+if __name__ == "__main__":
+  urls = ['https://www.motion-lab.ch/'
+  ,'https://www.adus-klinik.ch/'
+  ,'https://www.medidranse.ch/'
+  ,'https://www.cliniclesalpes.com/'
+  ,'https://www.spitalmaennedorf.ch/notfall/'
+  ,'https://www.polepositif.ch'
+  ,'https://www.tellklinik.ch'
+  ,'https://www.swissmedical.net/fr/swiss-visio/centres/swiss-visio-palezieux'
+  ,'https://kinderklinik.insel.ch/de/'
+  ,'https://www.cmsatigny.ch/'
+  ,'https://www.spitalthun.ch/notfallzentrum'
+  ,'https://www.magellan.ch/centre/centre-imagerie-servette/'
+  ,'https://osteo7-7.ch'
+  ,'https://osteo7-7.ch'
+  ,'https://hochgebirgsklinik.ch/'
+  ,'https://www.sro.ch/'
+  ,'https://www.upk.ch/startseite.html'
+  ,'https://www.eoc.ch/Ospedali-e-Istituti/Ospedale-Regionale-di-Lugano/Civico-e-Italiano/Presentazione.html'
+  ,'https://www.gzo.ch/'
+  ,'https://www.rhne.ch'
+  ,'https://www.eoc.ch/Ospedali-e-Istituti/Ospedale-Regionale-di-Lugano/Civico-e-Italiano/Presentazione.html'
+  ,'https://www.spital-emmental.ch'
+  ,'https://www.genolier.net/'
+  ,'https://www.pdgr.ch/standorte/klinik-waldhaus-chur/'
+  ,'https://www.ilavigny.ch/'
+  ,'https://www.luks.ch'
+  ,'https://www.swsieber.ch/'
+  ,'https://www.lindenhofgruppe.ch/de/standorte/sonnenhof/'
+  ,'https://www.hirslanden.ch/de/klinik-beau-site/home.html'
+  ,'https://www.lasource.ch/'
+  ,'https://www.ksa.ch/'
+  ,'https://www.hirslanden.ch/'
+  ,'https://www.hug-ge.ch/'
+  ,'https://www.obach.ch/'
+  ,'https://www.lindenhofgruppe.ch/de/ueber-uns/standorte/'
+  ,'https://www.ehnv.ch/etablissements/hopital-dyverdon-les-bains'
+  ,'https://www.hug-ge.ch/hopital-loex'
+  ,'https://www.lindenhofgruppe.ch/de/standorte/lindenhof/'
+  ,'https://www.ehc-vd.ch/hopital-morges'
+  ,'https://www.kssg.ch/'
+  ,'https://www.herzzentrum.ch/'
+  ,'https://www.h-fr.ch/hfr/fr/pub/index.htm'
+  ,'https://www.hug.ch/lhopital-de-beau-sejour'
+  ,'https://www.hug-ge.ch/hopital-bellerive/'
+  ,'https://www.spital-oberengadin.ch/'
+  ,'https://nant.ch/'
+  ,'https://beritklinik.ch/berit-klinik-wattwil-landingpage/'
+  ,'https://www.ksw.ch/'
+  ,'https://www.lindberg.ch/'
+  ,'https://www.barmelweid.ch/'
+  ,'https://www.h-och.ch/ueber-uns/standorte/rorschach/'
+  ,'https://www.stgag.ch/fachbereiche/psychiatrische-klinik/psychiatrische-klinik-muensterlingen/'
+  ,'https://www.felixplatter.ch/'
+  ,'https://www.hopitalrivierachablais.ch'
+  ,'https://www.psychiatrie-sg.ch/'
+  ,'https://www.hohenegg.ch/'
+  ,'https://www.spitalmaennedorf.ch/'
+  ,'https://irides.ch/'
+  ,'https://www.hirslanden.ch/de/salem-spital/home.html'
+  ,'https://www.hug-ge.ch/hopital-psychiatrie'
+  ,'http://www.ksbl.ch/das-ksbl/standorte/der-standort-liestal'
+  ,'https://www.spital-emmental.ch/'
+  ,'https://www.unispital-basel.ch/ueber-uns/bereiche/medizinische-querschnittsfunktionen/kliniken-institute-abteilungen/institut-fuer-medizinische-genetik-und-pathologie/pathologie/'
+  ,'https://www.hopitalvs.ch/de/spital-wallis/standorte/spitalzentrum-oberwallis.html'
+  ,'https://www.pukzh.ch/standorte/?locationId=07956ecd-155d-0010-0152-012983939def'
+  ,'https://www.ghol.ch'
+  ,'https://www.eoc.ch/'
+  ,'https://www.ehc-vd.ch/centremedical-aubonne'
+  ,'https://www.csvp.ch'
+  ,'https://oberwaid.ch/'
+  ,'https://www.see-spital.ch/'
+  ,'https://www.insel.ch/'
+  ,'https://www.hopitalduvalais.ch/fr/lhopital-du-valais/sites/sion.html'
+  ,'https://www.spital-lachen.ch/'
+  ,'https://www.hug-ge.ch/crans-montana'
+  ,'www.spital-muri.ch'
+  ,'https://www.ehc-vd.ch/hopital-gilly/'
+  ,'https://spitalthun.ch/'
+  ,'https://www.hopital-broye.ch/'
+  ,'https://www.la-tour.ch/'
+  ,'https://www.spitaluster.ch'
+  ,'http://www.triemli.ch/'
+  ,'https://www.klinikbethanien.ch/'
+  ,'http://www.waidspital.ch/'
+  ,'https://www.spital-schwyz.ch/startseite.html'
+  ,'https://www.spital-einsiedeln.ch'
+  ,'https://www.usz.ch/'
+  ,'https://spitalstsag.ch/'
+  ,'https://www.ksgr.ch/frauenklinik'
+  ,'https://www.ksgr.ch/'
+  ,'https://www.lups.ch/standorte/'
+  ,'https://www.kispi.uzh.ch/rza/de/Seiten/default.aspx'
+  ,'https://www.ksgr.ch/'
+  ,'https://www.spital-limmattal.ch/'
+  ,'https://www.stgag.ch/'
+  ,'https://www.kantonsspitalbaden.ch/'
+  ,'https://adressverzeichnis.sozialearbeit.zhaw.ch/Detail/Index/Clienia_Schloessli_AG_-_Psychiatriezentrum_Uster-Alterstagesklinik-Uster-2ba9eb04-bc44-e311-8b4f-005056a606f6'
+  ,'https://www.gzdielsdorf.ch/'
+  ,'https://www.spital-linth.ch/'
+  ,'https://www.stgag.ch/patienten-besucher/kantonsspital-muensterlingen/besuchszeiten/'
+  ,'https://www.ghol.ch/jcms/ghol_5306/fr/votre-admission?portal=ghol_5842'
+  ,'https://www.vidymed.ch/centre-medical-de-vidy.html'
+  ,'https://www.hirslanden.ch/fr/clinique-bois-cerf/home.html'
+  ,'https://www.hirslanden.ch/fr/clinique-cecil/home.html'
+  ,'https://www.ehnv.ch/etablissements/hopital-de-la-vallee-de-joux'
+  ,'https://gmo.ch/'
+  ,'https://www.spitalzollikerberg.ch/'
+  ,'https://www.hopitalduvalais.ch/fr/lhopital-du-valais/sites/martigny.html'
+  ,'https://www.hopitalduvalais.ch/fr/lhopital-du-valais/sites/clinique-saint-ame.html?ct=0&cHash=58be177c5705953f44610229d3e65550'
+  ,'https://www.hopitalrivierachablais.ch/jcms/c_5020/fr/monthey'
+  ,'https://www.hopitalduvalais.ch/de/spital-wallis/standorte/visp.html'
+  ,'https://www.hopitalduvalais.ch/fr/lhopital-du-valais/sites/sierre.html'
+  ,'https://www.hopital-pae.ch/jcms/pae_10300/en/bienvenue'
+  ,'https://www.hirslanden.ch/de/klinik-permanence/home.html'
+  ,'https://www.unispital-basel.ch/'
+  ,'https://www.rehab.ch/home.html'
+  ,'https://www.kispisg.ch/de'
+  ,'https://geriatrie-sg.ch/'
+  ,'https://www.spitalbelp.ch/de/'
+  ,'https://bethesda-spital.ch/'
+  ,'https://www.hug-ge.ch/joli-mont'
+  ,'https://www.h-fr.ch/'
+  ,'https://www.daler.ch/'
+  ,'https://www.ksbl.ch/das-ksbl/standorte/der-standort-bruderholz'
+  ,'http://www.ksnw.ch'
+  ,'https://www.srft.ch/'
+  ,'https://www.reha-rheinfelden.ch/'
+  ,'https://vertpre.com/fr/'
+  ,'https://www.hug-ge.ch/psychiatrie-enfant-adolescent/unite-hospitalisation-jour'
+  ,'https://www.claraspital.ch/'
+  ,'https://merianiselin.ch/klinik/'
+  ,'https://www.adullam.ch/'
+  ,'https://srrws.ch/'
+  ,'https://www.hirslanden.ch/global/de/startseite/kliniken_zentren/klinik_am_rosenberg.html'
+  ,'https://www.luks.ch/'
+  ,'https://www.luks.ch/standorte/standort-sursee'
+  ,'https://www.klinik-adelheid.ch/'
+  ,'https://www.klinik-arlesheim.ch/'
+  ,'https://www.gzf.ch/startseite.html'
+  ,'https://www.h-fr.ch/hfr/de/pub/patienten/standorte/meyriez.htm'
+  ,'https://www.cliniquegenerale.ch/de/'
+  ,'https://www.eoc.ch/Ospedali-e-Istituti/Ospedale-Regionale-di-Bellinzona-e-Valli/Bellinzona/Presentazione.html'
+  ,'https://www.pdag.ch/'
+  ,'https://www.ksgl.ch'
+  ,'https://www.ksuri.ch/'
+  ,'https://www.santacroce.ch/index.php?view=1000'
+  ,'https://moncucco.ch/'
+  ,'https://www.clinicasantanna.ch/it/'
+  ,'https://www.csbregaglia.ch/'
+  ,'https://www.spitalthusis.ch/'
+  ,'https://www.csvm.ch/'
+  ,'https://www.spitaeler-sh.ch/Patienten-Besucher/Psychiatriezentrum/index.php'
+  ,'https://www.rehaclinic.ch'
+  ,'http://www.spitalleuggern.ch/'
+  ,'https://www.h-ju.ch/fr/L-Hopital-du-jura/Les-4-sites-de-l-hopital/Saignelegier/H-JU-site-de-Saignelegier.html'
+  ,'https://www.h-ne.ch/contact/le-locle'
+  ,'https://www.h-ne.ch/contact/val-de-ruz'
+  ,'https://www.hopital-providence.ch/'
+  ,'https://www.h-fr.ch/nos-sites-hospitaliers/hfr-tafers'
+  ,'https://www.spitalriggisberg.ch/de/'
+  ,'https://www.hirslanden.ch/de/klinik-linde/home.html'
+  ,'https://www.klinikhohmad.ch'
+  ,'https://www.rehaseewis.ch/home.html'
+  ,'https://www.srrws.ch/ueber-uns/organisation/spitaeler/spital-altstaetten.html'
+  ,'https://www.spitalverbund.ch/angebote-heiden-herisau/home-spital-heiden/'
+  ,'https://www.ehnv.ch/jcms/obr_5017/orbe'
+  ,'https://www.ehnv.ch/etablissements/hopital-de-chamblon'
+  ,'https://www.hopitalduvalais.ch/de/spital-wallis/standorte/malevoz.html'
+  ,'https://www.h-fr.ch/hfr/de/pub/dashfr/standorte/billens.htm'
+  ,'http://www.clinique-le-noirmont.ch/'
+  ,'https://www.h-ju.ch/'
+  ,'https://www.h-ju.ch/'
+  ,'https://www.rehabern.ch/'
+  ,'https://www.eoc.ch/Ospedali-e-Istituti/Ospedale-Regionale-di-Locarno/Presentazione.html'
+  ,'https://www.clinicasantachiara.ch/'
+  ,'https://www.arsmedica.ch/it/'
+  ,'https://www.spital-savognin.ch/'
+  ,'https://cseb.ch/'
+  ,'https://www.flurystiftung.ch/Startseite.20.0.html'
+  ,'https://www.stephanshorn.ch/'
+  ,'https://www.clienia.ch/de/standorte/standorte-stationaer/thurgau/littenheid'
+  ,'https://seeklinik-brunnen.ch/'
+  ,'https://www.paraplegie.ch/spz/de'
+  ,'https://www.spitalmenziken.ch/'
+  ,'https://www.gzf.ch/'
+  ,'https://www.hirslanden.ch/de/klinik-belair/home.html'
+  ,'https://klinik-schloss-mammern.ch/de/'
+  ,'https://www.upd.ch/'
+  ,'https://www.solothurnerspitaeler.ch/unsere-spitaeler/buergerspital-solothurn/'
+  ,'https://www.klinik-gais.ch/home/'
+  ,'https://www.usz.ch/standorte/usz-flughafen/'
+  ,'https://www.herz-zentrum.com/muensterlingen/klinik/standorte'
+  ,'https://www.ukbb.ch/'
+  ,'https://www.hopital-broye.ch'
+  ,'https://www.luks.ch/standorte/standort-luzern/kinderspital'
+  ,'https://www.solothurnerspitaeler.ch/unsere-spitaeler/spital-dornach/'
+  ,'https://www.zgks.ch/'
+  ,'https://www.lups.ch/erwachsenen-psychiatrie/allgemeinpsychiatrie/kliniken/'
+  ,'https://www.lups.ch'
+  ,'https://www.spitalaffoltern.ch'
+  ,'https://www.chuv.ch/'
+  ,'https://www.spitalbuelach.ch/'
+  ,'https://www.spitalfmi.ch/index.php?id=2217'
+  ,'https://www.spitaeler-sh.ch/Patienten-Besucher/Kantonsspital-SH/index.php'
+  ,'https://www.andreasklinik.ch/'
+  ,'https://www.siloah.ch'
+  ,'http://www.st-anna.ch'
+  ,'https://www.spitalzentrum-biel.ch'
+  ,'https://www.clienia.ch/'
+  ,'https://www.kispi.uzh.ch/'
+  ,'https://www.solothurnerspitaeler.ch/unsere-spitaeler/kantonsspital-olten/'
+  ,'https://www.ksow.ch/']
+  import sys
+  from tqdm import tqdm
+  count = sys.argv[1]
+  total = sys.argv[2]
+  for i, url in tqdm(enumerate(urls)):
+    if i % int(total) != int(count):
+      continue
+    print(f"Processing {i+1}/{len(urls)}: {url}")
+    time.sleep(2)  # Be polite and avoid overwhelming the server
+    documents = crawl_website(url, max_depth=1)
+    with open(f"/capstor/scratch/cscs/dshah/AI/HospitalData/{url}", 'w', encoding='utf-8') as f:
+      for doc in documents:
+        f.write(doc + "\n//\n")
+      # f.write("\n//\n".join(documents))
+      print(f"Saved {len(documents)} documents from {url}")
+      time.sleep(2)  # Be polite and avoid overwhelming the server
+      # break  # Remove this break to process all URLs
+  # print(documents)