Spaces:
Sleeping
Sleeping
File size: 15,102 Bytes
68545bc |
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 |
"""
Модуль для кластеризации текстовых данных.
Реализует все основные классические методы кластеризации:
- Центроидные: k-Means, Mini-Batch k-Means, Spherical k-Means
- Плотностные: DBSCAN, HDBSCAN
- Иерархические: агломеративная кластеризация
- Вероятностные: Gaussian Mixture Models, LDA
- Графовые: спектральная кластеризация
"""
from __future__ import annotations
import time
from dataclasses import dataclass
from typing import List, Dict, Any, Optional, Tuple
import numpy as np
import pandas as pd
from sklearn.cluster import (
KMeans, MiniBatchKMeans, DBSCAN, AgglomerativeClustering,
SpectralClustering
)
from sklearn.mixture import GaussianMixture
from sklearn.metrics import (
silhouette_score, calinski_harabasz_score, davies_bouldin_score,
adjusted_rand_score, normalized_mutual_info_score, v_measure_score
)
try:
import hdbscan
HDBSCAN_AVAILABLE = True
except ImportError:
HDBSCAN_AVAILABLE = False
print("⚠️ hdbscan не установлен. HDBSCAN недоступен. Установите: pip install hdbscan")
try:
from gensim.models import LdaModel
from gensim.corpora import Dictionary
GENSIM_AVAILABLE = True
except ImportError:
GENSIM_AVAILABLE = False
print("⚠️ gensim не установлен. LDA недоступен.")
@dataclass
class ClusteringConfig:
"""Конфигурация алгоритма кластеризации."""
method: str # kmeans, minibatch_kmeans, spherical_kmeans, dbscan, hdbscan,
# agglomerative, gmm, lda, spectral
n_clusters: Optional[int] = None # Для методов, требующих число кластеров
random_state: int = 42
# Специфичные параметры
eps: float = 0.5 # Для DBSCAN
min_samples: int = 5 # Для DBSCAN/HDBSCAN
linkage: str = "ward" # Для Agglomerative
metric: str = "euclidean" # Для Agglomerative
n_components: int = 10 # Для LDA
n_neighbors: int = 10 # Для Spectral
class ClusteringAlgorithms:
"""Класс для работы с алгоритмами кластеризации."""
def __init__(self, config: ClusteringConfig):
self.config = config
self.model = self._create_model()
self.labels_ = None
self.fit_time = 0.0
self.predict_time = 0.0
def _create_model(self):
"""Создает модель кластеризации."""
method = self.config.method.lower()
if method == "kmeans":
if self.config.n_clusters is None:
raise ValueError("Для k-Means требуется n_clusters")
return KMeans(
n_clusters=self.config.n_clusters,
random_state=self.config.random_state,
n_init=10
)
elif method == "minibatch_kmeans":
if self.config.n_clusters is None:
raise ValueError("Для Mini-Batch k-Means требуется n_clusters")
return MiniBatchKMeans(
n_clusters=self.config.n_clusters,
random_state=self.config.random_state,
n_init=3,
batch_size=256
)
elif method == "spherical_kmeans":
# Spherical k-Means через k-Means с нормализацией
if self.config.n_clusters is None:
raise ValueError("Для Spherical k-Means требуется n_clusters")
return KMeans(
n_clusters=self.config.n_clusters,
random_state=self.config.random_state,
n_init=10
)
elif method == "dbscan":
return DBSCAN(
eps=self.config.eps,
min_samples=self.config.min_samples,
metric='cosine' # Для текстов обычно используется cosine
)
elif method == "hdbscan":
if not HDBSCAN_AVAILABLE:
raise ImportError("hdbscan не установлен. Установите: pip install hdbscan")
return hdbscan.HDBSCAN(
min_cluster_size=self.config.min_samples,
metric='euclidean',
cluster_selection_method='eom'
)
elif method == "agglomerative":
if self.config.n_clusters is None:
raise ValueError("Для Agglomerative требуется n_clusters")
return AgglomerativeClustering(
n_clusters=self.config.n_clusters,
linkage=self.config.linkage,
metric=self.config.metric
)
elif method == "gmm":
if self.config.n_clusters is None:
raise ValueError("Для GMM требуется n_clusters")
return GaussianMixture(
n_components=self.config.n_clusters,
random_state=self.config.random_state,
max_iter=100
)
elif method == "spectral":
if self.config.n_clusters is None:
raise ValueError("Для Spectral требуется n_clusters")
return SpectralClustering(
n_clusters=self.config.n_clusters,
random_state=self.config.random_state,
affinity='nearest_neighbors',
n_neighbors=self.config.n_neighbors
)
elif method == "lda":
# LDA обрабатывается отдельно, так как это тематическая модель
return None
else:
raise ValueError(f"Неизвестный метод кластеризации: {method}")
def fit(self, X: np.ndarray):
"""Обучение модели кластеризации."""
start = time.time()
# Spherical k-Means требует нормализации
if self.config.method.lower() == "spherical_kmeans":
from sklearn.preprocessing import normalize
X = normalize(X, norm='l2')
# Для DBSCAN/HDBSCAN с cosine метрикой также нормализуем
if self.config.method.lower() in ["dbscan", "hdbscan"] and self.config.metric == "cosine":
from sklearn.preprocessing import normalize
X = normalize(X, norm='l2')
if self.config.method.lower() == "lda":
# LDA обрабатывается отдельно
raise NotImplementedError("LDA используйте метод fit_lda")
self.model.fit(X)
if hasattr(self.model, 'labels_'):
self.labels_ = self.model.labels_
elif hasattr(self.model, 'predict'):
self.labels_ = self.model.predict(X)
else:
raise ValueError("Модель не вернула метки кластеров")
self.fit_time = time.time() - start
return self
def fit_lda(self, texts: List[str], dictionary: Optional[Any] = None):
"""
Обучение LDA модели для кластеризации по темам.
Args:
texts: Список текстов (уже токенизированных)
dictionary: Gensim Dictionary (опционально)
"""
if not GENSIM_AVAILABLE:
raise ImportError("gensim не установлен. Установите: pip install gensim")
if self.config.n_clusters is None:
raise ValueError("Для LDA требуется n_clusters (число тем)")
from gensim.utils import simple_preprocess
# Токенизация, если нужно
tokenized_texts = []
for text in texts:
if isinstance(text, str):
tokens = simple_preprocess(text, deacc=False, min_len=1)
else:
tokens = text
tokenized_texts.append(tokens)
# Создаем словарь
if dictionary is None:
dictionary = Dictionary(tokenized_texts)
dictionary.filter_extremes(no_below=2, no_above=0.5)
# Создаем корпус
corpus = [dictionary.doc2bow(text) for text in tokenized_texts]
# Обучаем LDA
start = time.time()
lda_model = LdaModel(
corpus=corpus,
num_topics=self.config.n_clusters,
id2word=dictionary,
random_state=self.config.random_state,
passes=10,
alpha='auto',
per_word_topics=True
)
self.fit_time = time.time() - start
# Получаем метки кластеров (темы) для каждого документа
self.labels_ = []
for doc in corpus:
topic_dist = lda_model.get_document_topics(doc, minimum_probability=0.0)
# Берем тему с максимальной вероятностью
best_topic = max(topic_dist, key=lambda x: x[1])[0]
self.labels_.append(best_topic)
self.labels_ = np.array(self.labels_)
self.model = lda_model
self.dictionary = dictionary
return self
def predict(self, X: np.ndarray):
"""Предсказание кластеров для новых данных."""
start = time.time()
if self.config.method.lower() == "lda":
raise NotImplementedError("LDA predict требует отдельной реализации")
if hasattr(self.model, 'predict'):
predictions = self.model.predict(X)
else:
# Для DBSCAN и некоторых других методов
predictions = self.model.fit_predict(X)
self.predict_time = time.time() - start
return predictions
def evaluate_clustering(X: np.ndarray, labels: np.ndarray,
y_true: Optional[np.ndarray] = None) -> Dict[str, float]:
"""
Оценка качества кластеризации.
Args:
X: Признаки
labels: Предсказанные метки кластеров
y_true: Истинные метки (опционально, для внешних метрик)
Returns:
Словарь с метриками
"""
metrics = {}
# Внутренние метрики
# Удаляем шумовые точки (-1) для метрик
valid_mask = labels != -1
if valid_mask.sum() > 1:
X_valid = X[valid_mask]
labels_valid = labels[valid_mask]
if len(np.unique(labels_valid)) > 1:
metrics["silhouette"] = silhouette_score(X_valid, labels_valid)
metrics["calinski_harabasz"] = calinski_harabasz_score(X_valid, labels_valid)
metrics["davies_bouldin"] = davies_bouldin_score(X_valid, labels_valid)
else:
metrics["silhouette"] = -1.0
metrics["calinski_harabasz"] = 0.0
metrics["davies_bouldin"] = np.inf
# Внешние метрики (если есть истинные метки)
if y_true is not None:
metrics["adjusted_rand_index"] = adjusted_rand_score(y_true, labels)
metrics["normalized_mutual_info"] = normalized_mutual_info_score(y_true, labels)
metrics["v_measure"] = v_measure_score(y_true, labels)
# Статистика кластеров
unique_labels, counts = np.unique(labels, return_counts=True)
metrics["n_clusters"] = len(unique_labels[unique_labels != -1]) # Исключаем шум
metrics["n_noise"] = (labels == -1).sum() if -1 in labels else 0
metrics["avg_cluster_size"] = counts[unique_labels != -1].mean() if len(counts[unique_labels != -1]) > 0 else 0
return metrics
def compare_clustering_methods(X: np.ndarray,
configs: List[ClusteringConfig],
y_true: Optional[np.ndarray] = None) -> pd.DataFrame:
"""
Сравнение нескольких методов кластеризации.
Args:
X: Признаки
configs: Список конфигураций
y_true: Истинные метки (опционально)
Returns:
DataFrame с результатами сравнения
"""
results = []
for cfg in configs:
try:
clusterer = ClusteringAlgorithms(cfg)
if cfg.method.lower() == "lda":
# LDA требует тексты, пропускаем в этой функции
continue
clusterer.fit(X)
metrics = evaluate_clustering(X, clusterer.labels_, y_true)
result = {
"Метод": cfg.method,
"Число кластеров": metrics.get("n_clusters", cfg.n_clusters),
"Шумовые точки": metrics.get("n_noise", 0),
"Silhouette": round(metrics.get("silhouette", -1), 4),
"Calinski-Harabasz": round(metrics.get("calinski_harabasz", 0), 4),
"Davies-Bouldin": round(metrics.get("davies_bouldin", np.inf), 4),
"Время обучения (с)": round(clusterer.fit_time, 2),
}
if y_true is not None:
result["ARI"] = round(metrics.get("adjusted_rand_index", 0), 4)
result["NMI"] = round(metrics.get("normalized_mutual_info", 0), 4)
result["V-measure"] = round(metrics.get("v_measure", 0), 4)
results.append(result)
except Exception as e:
print(f"Ошибка при кластеризации методом {cfg.method}: {e}")
results.append({
"Метод": cfg.method,
"Ошибка": str(e)
})
return pd.DataFrame(results)
if __name__ == "__main__":
# Тестирование
from sklearn.datasets import make_blobs
X, y = make_blobs(n_samples=300, centers=4, random_state=42)
configs = [
ClusteringConfig(method="kmeans", n_clusters=4),
ClusteringConfig(method="dbscan", eps=0.5, min_samples=5),
ClusteringConfig(method="agglomerative", n_clusters=4, linkage="ward"),
]
if HDBSCAN_AVAILABLE:
configs.append(ClusteringConfig(method="hdbscan", min_samples=5))
results_df = compare_clustering_methods(X, configs, y_true=y)
print(results_df)
|