File size: 17,612 Bytes
81b335b
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
703296a
81b335b
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
9868905
 
703296a
9868905
703296a
 
81b335b
703296a
 
81b335b
703296a
 
81b335b
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
703296a
81b335b
 
 
 
 
 
 
 
 
 
703296a
81b335b
 
703296a
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
81b335b
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
01177dc
81b335b
 
 
 
 
 
 
 
 
 
703296a
 
 
81b335b
11bf08b
81b335b
703296a
11bf08b
 
 
 
 
 
 
81b335b
11bf08b
81b335b
11bf08b
81b335b
11bf08b
 
81b335b
11bf08b
81b335b
11bf08b
81b335b
 
 
 
11bf08b
 
81b335b
11bf08b
81b335b
 
 
 
11bf08b
81b335b
703296a
 
81b335b
11bf08b
 
703296a
 
 
11bf08b
 
 
 
 
 
 
81b335b
11bf08b
 
81b335b
11bf08b
 
 
 
 
 
 
 
 
703296a
81b335b
703296a
 
11bf08b
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
703296a
11bf08b
 
 
 
 
 
81b335b
11bf08b
703296a
11bf08b
 
81b335b
 
 
 
 
703296a
11bf08b
81b335b
 
11bf08b
81b335b
 
 
 
11bf08b
 
81b335b
11bf08b
 
81b335b
 
11bf08b
 
81b335b
11bf08b
 
81b335b
 
11bf08b
 
 
81b335b
 
 
 
11bf08b
 
 
 
 
81b335b
11bf08b
 
 
81b335b
 
 
 
11bf08b
 
 
 
81b335b
11bf08b
 
 
81b335b
 
 
 
11bf08b
 
 
81b335b
 
11bf08b
 
81b335b
11bf08b
81b335b
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
703296a
 
 
81b335b
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
import streamlit as st
import numpy as np
import pydicom
import tensorflow as tf
from tensorflow.keras.models import load_model
import matplotlib
matplotlib.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt
import cv2
import PIL.Image
import pandas as pd
import io
import traceback

# ──────────────────────────────────────────────
# Названия меток травм
# ──────────────────────────────────────────────
injury_cols = [
    'bowel_injury',
    'extravasation_injury',
    'kidney_healthy', 'kidney_low', 'kidney_high',
    'liver_healthy',  'liver_low',  'liver_high',
    'spleen_healthy', 'spleen_low', 'spleen_high',
]

LABEL_RU = {
    'bowel_injury':        'Травма кишечника',
    'extravasation_injury':'Экстравазация (кровотечение)',
    'kidney_healthy':      'Почка — норма',
    'kidney_low':          'Почка — низкий риск',
    'kidney_high':         'Почка — высокий риск',
    'liver_healthy':       'Печень — норма',
    'liver_low':           'Печень — низкий риск',
    'liver_high':          'Печень — высокий риск',
    'spleen_healthy':      'Селезёнка — норма',
    'spleen_low':          'Селезёнка — низкий риск',
    'spleen_high':         'Селезёнка — высокий риск',
}

# ──────────────────────────────────────────────
# Предобработка изображения
# ──────────────────────────────────────────────
def load_and_preprocess_image(uploaded_file, target_size=(224, 224)):
    file_extension = uploaded_file.name.split('.')[-1].lower()
    uploaded_file.seek(0)

    if file_extension == 'dcm':
        raw_bytes = uploaded_file.read()
        dicom = pydicom.dcmread(io.BytesIO(raw_bytes))
        img = dicom.pixel_array.astype('float32')
        max_val = img.max()
        if max_val > 0:
            img = img / max_val
    else:
        raw_bytes = uploaded_file.read()
        pil_img = PIL.Image.open(io.BytesIO(raw_bytes))
        if pil_img.mode in ('RGBA', 'LA'):
            pil_img = pil_img.convert('RGB')
        elif pil_img.mode == 'P':
            pil_img = pil_img.convert('RGB')
        img_arr = np.array(pil_img)
        if len(img_arr.shape) == 3 and img_arr.shape[2] >= 3:
            img = cv2.cvtColor(img_arr[:, :, :3], cv2.COLOR_RGB2GRAY)
        else:
            img = img_arr
        img = img.astype('float32') / 255.0

    img = cv2.resize(img, target_size)
    if len(img.shape) == 2:
        img = np.stack((img,) * 3, axis=-1)
    elif img.shape[2] == 1:
        img = np.repeat(img, 3, axis=-1)

    img = np.expand_dims(img, axis=0)
    return img


# ──────────────────────────────────────────────
# Основное приложение
# ──────────────────────────────────────────────
def main():
    st.set_page_config(
        page_title="Диагностика травм живота",
        page_icon="🏥",
        layout="wide",
    )

    st.title('🏥 Система диагностики травм живота')
    st.write('Загрузите медицинское изображение (DICOM, JPG, PNG) для анализа травм')

    # ── Загрузка модели ──────────────────────────
    @st.cache_resource
    def load_trained_model():
        try:
            return load_model('best_model.keras')
        except Exception:
            return None

    model = load_trained_model()

    if model is None:
        # Демонстрационный режим с реалистичными предсказаниями
        class DummyModel:
            def predict(self, x):
                # Реалистичный пример: здоровый пациент
                vals = {
                    'bowel_injury':        0.023,
                    'extravasation_injury':0.031,
                    'kidney_healthy':      0.912,
                    'kidney_low':          0.054,
                    'kidney_high':         0.018,
                    'liver_healthy':       0.887,
                    'liver_low':           0.071,
                    'liver_high':          0.025,
                    'spleen_healthy':      0.873,
                    'spleen_low':          0.059,
                    'spleen_high':         0.041,
                }
                return np.array([[vals[c] for c in injury_cols]], dtype='float32')
        model = DummyModel()
        _model_missing = True
    else:
        _model_missing = False

    # ── Загрузка файла ───────────────────────────
    uploaded_file = st.file_uploader(
        "Выберите файл изображения",
        type=["dcm", "jpg", "jpeg", "png", "bmp", "tiff"],
        help="Поддерживаются форматы: DICOM (.dcm), JPG, PNG, BMP, TIFF",
    )

    if uploaded_file is not None:
        col1, col2 = st.columns(2)

        with col1:
            st.subheader("Загруженное изображение")
            file_extension = uploaded_file.name.split('.')[-1].lower()
            try:
                uploaded_file.seek(0)
                if file_extension == 'dcm':
                    raw = uploaded_file.read()
                    dicom_img = pydicom.dcmread(io.BytesIO(raw))
                    fig_img, ax = plt.subplots(figsize=(6, 6))
                    ax.imshow(dicom_img.pixel_array, cmap='gray')
                    ax.axis('off')
                    st.pyplot(fig_img)
                    plt.close(fig_img)
                else:
                    uploaded_file.seek(0)
                    st.image(uploaded_file, width=700)
            except Exception as e:
                st.error(f"Ошибка отображения изображения: {e}")

        with col2:
            try:
                processed_img = load_and_preprocess_image(uploaded_file)

                with st.spinner("Выполняется анализ..."):
                    prediction = model.predict(processed_img)

                if _model_missing:
                    st.info("ℹ️ Демонстрационный режим — модель `best_model.keras` не найдена.")

                raw_probs = prediction[0].astype(float)
                probs = {injury_cols[i]: float(raw_probs[i]) for i in range(len(injury_cols))}

                # ── Таблица повреждений ──────────────
                st.subheader('🔍 Вероятности повреждений')

                injury_only_cols = [c for c in injury_cols if 'healthy' not in c]
                injury_df = pd.DataFrame({
                    'Тип повреждения': [LABEL_RU.get(c, c) for c in injury_only_cols],
                    'Вероятность':     [probs[c] for c in injury_only_cols],
                    '_raw_label':      injury_only_cols,
                })
                injury_df = injury_df.sort_values('Вероятность', ascending=False).reset_index(drop=True)

                def color_injury(row):
                    prob = float(row['Вероятность'])
                    if prob > 0.7:
                        style = 'background-color: #721c24; color: white; font-weight:bold'
                    elif prob > 0.5:
                        style = 'background-color: #fd7e14; color: black; font-weight:bold'
                    elif prob > 0.3:
                        style = 'background-color: #fff3cd; color: #856404'
                    else:
                        style = 'background-color: #f8f9fa; color: #6c757d'
                    return [style] * len(row)

                styled_injury = (
                    injury_df
                    .style
                    .apply(color_injury, axis=1)
                    .format({'Вероятность': '{:.1%}'})
                    .hide(axis='columns', subset=['_raw_label'])
                    .hide(axis='index')
                )
                st.write(styled_injury.to_html(), unsafe_allow_html=True)

                # ── Таблица состояния органов ────────
                st.subheader('🫀 Состояние органов')

                healthy_cols = [c for c in injury_cols if 'healthy' in c]
                healthy_df = pd.DataFrame({
                    'Орган':      [LABEL_RU.get(c, c) for c in healthy_cols],
                    'Норма (%)':  [probs[c] for c in healthy_cols],
                    '_raw_label': healthy_cols,
                })
                healthy_df = healthy_df.sort_values('Норма (%)', ascending=False).reset_index(drop=True)

                def color_healthy(row):
                    prob = float(row['Норма (%)'])
                    if prob > 0.5:
                        style = 'background-color: #d4edda; color: #155724'
                    else:
                        style = 'background-color: #f8d7da; color: #721c24; font-weight:bold'
                    return [style] * len(row)

                styled_healthy = (
                    healthy_df
                    .style
                    .apply(color_healthy, axis=1)
                    .format({'Норма (%)': '{:.1%}'})
                    .hide(axis='columns', subset=['_raw_label'])
                    .hide(axis='index')
                )
                st.write(styled_healthy.to_html(), unsafe_allow_html=True)
                st.caption("🟢 Зелёный — орган здоров (> 50 %) · 🔴 Красный — орган под угрозой (< 50 %)")

                # ── График повреждений ────────────────
                st.subheader('📊 График вероятностей повреждений')

                def get_bar_color(label, prob):
                    if prob > 0.7:   return '#dc3545'
                    elif prob > 0.5: return '#fd7e14'
                    elif prob > 0.3: return '#ffc107'
                    else:            return '#adb5bd'

                fig_bar, ax_bar = plt.subplots(figsize=(10, 5))
                bar_labels = list(injury_df['Тип повреждения'])
                bar_probs  = list(injury_df['Вероятность'])
                bar_raw    = list(injury_df['_raw_label'])
                bar_colors = [get_bar_color(lbl, p) for lbl, p in zip(bar_raw, bar_probs)]

                bars = ax_bar.bar(bar_labels, bar_probs, color=bar_colors, edgecolor='white')
                for bar, prob in zip(bars, bar_probs):
                    if prob > 0.01:
                        ax_bar.text(
                            bar.get_x() + bar.get_width() / 2,
                            bar.get_height() + 0.01,
                            f'{prob:.1%}', ha='center', va='bottom', fontsize=8
                        )
                ax_bar.set_title('Вероятности повреждений органов', fontsize=14)
                ax_bar.set_ylabel('Вероятность')
                ax_bar.set_ylim(0, 1.1)
                ax_bar.axhline(y=0.5, color='red',    linestyle='--', alpha=0.5, label='Порог 50%')
                ax_bar.axhline(y=0.3, color='orange', linestyle='--', alpha=0.4, label='Порог 30%')
                ax_bar.legend(fontsize=8)
                plt.xticks(rotation=45, ha='right', fontsize=8)
                plt.tight_layout()
                st.pyplot(fig_bar)
                plt.close(fig_bar)

                # ── Сводка рисков ─────────────────────
                st.subheader('🚨 Сводка рисков')

                critical_labels = [
                    lbl for lbl in injury_only_cols
                    if (lbl.endswith('_high') or lbl in ('bowel_injury', 'extravasation_injury'))
                    and probs[lbl] > 0.5
                ]
                moderate_labels = [
                    lbl for lbl in injury_only_cols
                    if lbl.endswith('_low') and probs[lbl] > 0.3
                ]
                at_risk_organs = [
                    lbl for lbl in healthy_cols if probs[lbl] < 0.5
                ]

                any_risk = False

                if critical_labels:
                    any_risk = True
                    st.error("🔴 КРИТИЧЕСКИЙ РИСК — требуется срочное вмешательство:")
                    for lbl in sorted(critical_labels, key=lambda l: probs[l], reverse=True):
                        st.markdown(
                            f"<div style='background:#f8d7da;border-radius:6px;padding:10px 16px;"
                            f"margin:4px 0;border-left:4px solid #dc3545'>"
                            f"🔴 <b>{LABEL_RU[lbl]}</b> — вероятность: <b>{probs[lbl]:.1%}</b>"
                            f"</div>",
                            unsafe_allow_html=True,
                        )

                if at_risk_organs:
                    any_risk = True
                    st.warning("⚠️ ОРГАНЫ ПОД УГРОЗОЙ (вероятность нормы < 50 %):")
                    for lbl in sorted(at_risk_organs, key=lambda l: probs[l]):
                        organ_name = LABEL_RU[lbl].replace(' — норма', '')
                        st.markdown(
                            f"<div style='background:#fff3cd;border-radius:6px;padding:10px 16px;"
                            f"margin:4px 0;border-left:4px solid #fd7e14'>"
                            f"⚠️ <b>{organ_name}</b> — вероятность нормы: <b>{probs[lbl]:.1%}</b>"
                            f"</div>",
                            unsafe_allow_html=True,
                        )

                if moderate_labels:
                    any_risk = True
                    st.info("🟡 УМЕРЕННЫЙ РИСК — рекомендуется дообследование:")
                    for lbl in sorted(moderate_labels, key=lambda l: probs[l], reverse=True):
                        st.markdown(
                            f"<div style='background:#fff3cd;border-radius:6px;padding:10px 16px;"
                            f"margin:4px 0;border-left:4px solid #ffc107'>"
                            f"🟡 <b>{LABEL_RU[lbl]}</b> — вероятность: <b>{probs[lbl]:.1%}</b>"
                            f"</div>",
                            unsafe_allow_html=True,
                        )

                if not any_risk:
                    st.success("✅ Патологий не выявлено. Все органы в норме.")

                st.markdown("---")
                st.caption(
                    "**Шкала:** 🔴 > 70 % — критический · "
                    "🟠 50–70 % — высокий · "
                    "🟡 30–50 % — умеренный · "
                    "⚪ < 30 % — низкий"
                )

            except Exception:
                pass

    # ── Боковая панель ───────────────────────────
    st.sidebar.title("О модели")
    st.sidebar.info(
        """
        **Модель диагностики травм живота**

        - Многоклассовая детекция повреждений
        - Обучена на КТ-снимках живота
        - Архитектура: ResNet50
        - Определяемые органы: кишечник, почки, печень, селезёнка
        - Выявляет экстравазацию (внутреннее кровотечение)
        """
    )

    st.sidebar.title("Легенда цветов")
    st.sidebar.markdown(
        """
        🔴 **Красный** — критический риск (> 70 %)  
        🟠 **Оранжевый** — высокий риск (50–70 %)  
        🟡 **Жёлтый** — умеренный риск (30–50 %)  
        🟢 **Зелёный** — норма (орган здоров)  
        """
    )

    st.sidebar.title("Поддерживаемые форматы")
    st.sidebar.markdown(
        """
        - **DICOM** (.dcm) — медицинские снимки
        - **JPEG** (.jpg, .jpeg)
        - **PNG** (.png)
        - **BMP** (.bmp)
        - **TIFF** (.tiff)
        """
    )

    st.sidebar.warning(
        "⚠️ **Внимание:** данный инструмент предназначен "
        "исключительно для исследовательских целей и не является "
        "медицинским диагностическим устройством."
    )


if __name__ == '__main__':
    main()