deepamr-api / data_processed /patric /patric_gentamicin_metadata.json
hossainlab's picture
Deploy DeepAMR API backend
3255634
{
"feature_names": [
"AAAAAT",
"ATTTTT",
"TTTAAA",
"TTTTTA",
"TAAAAA",
"TTAAAA",
"TTTTAA",
"TATTTT",
"AAAAAA",
"TTTATT",
"AAAATA",
"TTTAAT",
"ATTAAA",
"TTTTTT",
"AATAAA",
"TTATTT",
"AAATAA",
"TTTTAT",
"ATAAAA",
"AAAATT",
"ATTTAA",
"TTAAAT",
"TAAAAT",
"ATTATT",
"ATTTTA",
"AATTTT",
"ATATTT",
"AATAAT",
"AATATT",
"AAATAT",
"TTAATT",
"ATTAAT",
"AATTAA",
"ATTTAT",
"GAAAAA",
"TGAAAA",
"AAATTA",
"TTTTCA",
"TTTTTC",
"AAATTT",
"ATAAAT",
"TAATTT",
"AAAAAG",
"CTTTTT",
"TTATTA",
"CATTTT",
"TATTTA",
"AAAATG",
"TAATAA",
"TAAATA",
"TGATTT",
"TATTAA",
"AAATCA",
"TTAATA",
"AATTTA",
"TAAATT",
"TTCTTT",
"AAAGAA",
"AAATGA",
"TCATTT",
"TTTCTT",
"TTGAAA",
"TTTCAA",
"AAGAAA",
"CAAAAA",
"TTTATC",
"TTTTTG",
"ATTGAT",
"GAAAAT",
"GATAAA",
"AATTAT",
"ATCAAT",
"TTTATA",
"AATGAT",
"TTCAAT",
"TTTCAT",
"ATTTTC",
"TATAAA",
"ATGAAA",
"ATTGAA",
"TTTGAT",
"ATCATT",
"ATAATT",
"TTCATT",
"TGAAAT",
"GTTTTT",
"AAAATC",
"AAAAAC",
"AAATTG",
"TCTTTT",
"TTTGAA",
"TTTGTT",
"TTTTGA",
"TGTTTT",
"CAAAAT",
"ATTTTG",
"AGAAAA",
"TTCAAA",
"AAAAGA",
"GATTTT",
"TTTTCT",
"CTTTAA",
"TTGATT",
"ATTTCA",
"TCAAAA",
"ATCAAA",
"CAATTT",
"AATGAA",
"CATTAA",
"TTAATG",
"TCTTTA",
"AATCAT",
"AAAACA",
"ATGATT",
"TGATGA",
"TATTAT",
"TTGTTT",
"TCATCA",
"TAAAGA",
"TTAAAG",
"ATAATA",
"TAATAT",
"TGATAA",
"ATATTA",
"AACAAA",
"CTTTAT",
"AATCAA",
"TTATCA",
"AAACAA",
"AATATA",
"ATAAAG",
"ATCTTT",
"TATATT",
"ATTGTT",
"AAAGAT",
"AATTGA",
"CAATAT",
"AACAAT",
"AATATC",
"TTGATA",
"GATATT",
"GAAATT",
"TTGATG",
"TCAATT",
"ATATTG",
"CATCAA",
"TCATTA",
"GATTTA",
"TTTTGT",
"ATATAA",
"AATTTC",
"TTATAT",
"TATCAA",
"TTGTTG",
"TAATGA",
"TAAAAC",
"TTTAAC",
"ACAAAA",
"TAAATC",
"GCAAAA",
"GATGAA",
"TTTTGC",
"TCAATA",
"GTTTTA",
"TTCATC",
"GTTAAA",
"TTATTG",
"CAATAA",
"CATCAT",
"ATGATG",
"TATTGA",
"GTAAAA",
"TTTTAC",
"AATTTG",
"ATTTCT",
"CAACAA",
"GCTTTT",
"CATTTA",
"TAAATG",
"CAAATT",
"ATTTGA",
"TTGCTG",
"AAAAGC",
"AGAAAT",
"TTATAA",
"TGCTTT",
"TAATTA",
"CAGCAA",
"TTCTTC",
"TTGAAT",
"ATTCAA",
"ATAATG",
"AATGTT",
"GAAGAA",
"CGCCAG",
"AACTTT",
"CATTAT",
"AAAGCA",
"ATTCAT",
"TCAAAT",
"TGAATT",
"ATGAAT",
"AACATT",
"TAATTG",
"AAAGTT",
"ATCATC",
"CTGGCG",
"ACTTTT",
"AAAAGT",
"CAATTA",
"AATTCA",
"TATTCA",
"ATTTGT",
"ATTATC",
"GATGAT",
"CTAAAA",
"CTTTTA",
"TGATAT",
"AATTGC",
"TTTTAG",
"TGAATA",
"CAGCAG",
"CTGAAA",
"TGGTTT",
"GCTTTA",
"TGAAGA",
"TAAAAG",
"CTGCTG",
"ATATCA",
"GATAAT",
"TCTTCA",
"GCAATT",
"GCCAGC",
"AAACCA",
"ATGTTT",
"GTATTT",
"GCTGGC",
"AATATG",
"GCATTT",
"CATATT",
"CCATTT",
"TTTCAG",
"ACATTT",
"TGTTGA",
"TGATTA",
"ATTGCT",
"GGTAAA",
"TAAAGC",
"AAATGT",
"TTTACC",
"CATAAA",
"AAATAC",
"AAACAT",
"CCAGCA",
"AAAACT",
"TTAAAC",
"TCAGCA",
"AATTGT",
"TTATCT",
"TTGAAG",
"ATATTC",
"GAATTT",
"CTTCAA",
"GTTTAA",
"AGTTTT",
"TGCTGA",
"TCAACA",
"AAATTC",
"TTTATG",
"GAATAT",
"ACAAAT",
"TTAACA",
"ATATAT",
"AAATGC",
"AAGAAG",
"ACAATT",
"AAATGG",
"TAATCA",
"CTTCTT",
"AGCAAT",
"TGTTAA",
"TATTTG",
"GTTGAT",
"TGCTGG",
"GTTATT",
"AGATAA",
"GTTTAT",
"GTAAAT",
"GCTGAA",
"TTCAGC",
"ATAAAC",
"TTTGCT",
"ATCAAC",
"TTGCTT",
"ACTTTA",
"AATAAC",
"ATTTAC",
"CAATTG",
"GTTGAA",
"TGCTGC",
"AGCAAA",
"GTTAAT",
"GCAGCA",
"TACTTT",
"TATTTC",
"ATGATA",
"TATCTT",
"TATCAT",
"TGATTG",
"CAAATA",
"TTCAAC",
"GATTAT",
"ATAATC",
"TGTTTA",
"GAAATA",
"CAATCA",
"ATTAAC",
"CGTTTT",
"AAGATA",
"ACCATT",
"TAAAGT",
"CATTTG",
"AAATCT",
"GCATTA",
"TGCAAT",
"AAAGTA",
"AGATTT",
"TTGTAA",
"AAGTTT",
"AAACTT",
"GATTAA",
"CTTCAT",
"TAATGC",
"GTTGTT",
"AAAACG",
"TAAACA",
"CCAGCG",
"AATGGT",
"TATAAT",
"TTAATC",
"AAGCAA",
"ATTGCA",
"AAGATG",
"TTTGTA",
"GCATCA",
"TTGTTA",
"CATCTT",
"TACAAA",
"AAAACC",
"TTACAA",
"CGCTGG",
"ATTTGC",
"GCAAAT",
"CAAATG",
"TGCAAA",
"CTGTTT",
"TGATGC",
"ATGAAG",
"TTACTT",
"CAACAT",
"TTCATA",
"AACAAC",
"GGTTTT",
"TATTGC",
"TCTAAA",
"TATGAA",
"ACCAAT",
"TAACAA",
"TTATTC",
"GCAATA",
"ATTATA",
"TTTGCA",
"TGATGT",
"ATTGGT",
"ATGTTG",
"TTTAGA",
"TAATTC",
"TGTTGT",
"TTTCAC",
"AATTAC",
"TGGCAA",
"AAGTAA",
"TGGTGA",
"TTTGGT",
"GCTGAT",
"TGCATT",
"ATCTTC",
"GAATTA",
"ATCAGC",
"TGTAAT",
"AAACAG",
"GAAGAT",
"TGTAAA",
"TTGCCA",
"TTGTTC",
"TAATGT",
"ACATCA",
"TTTACT",
"GAATAA",
"CAGCGC",
"TTTACA",
"TCATAT",
"ATTATG",
"TGTATT",
"GTGAAA",
"AATACA",
"CAGAAA",
"ATATGA",
"GTTTTG",
"AATACC",
"AATCTT",
"AATGCA",
"TTTCTG",
"ATTCTT",
"TTAACT",
"GTAATT",
"TCATAA",
"TCACCA",
"AGTTAA",
"ATTTAG",
"ACATTA",
"CAGCAT",
"GGTATT",
"TGTTGC",
"AGCATT",
"GCCATT",
"ATTACA",
"ACCAGC",
"TATTGT",
"GCTAAA",
"AGTAAA",
"TTTGCC",
"ACCAAA",
"TTTAGC",
"AATGGC",
"ATGCTG",
"AAGATT",
"GCTGGT",
"GGCAAA",
"TTATGA",
"ACAATA",
"ACAACA",
"CTTTTG",
"CATAAT",
"TAACTT",
"CTAAAT",
"CAAAAC",
"AAGAAT",
"TCGCCA",
"GAACAA",
"TGTTCA",
"GGAAAA",
"GTTTCA",
"AATGCT",
"GCGCTG",
"CACCAG",
"TTTTCC",
"CAAAAG",
"TAATAC",
"AAACTG",
"TTTCCA",
"TTGCAA",
"GCTGTT",
"GCAACA",
"AAGTTA",
"TGGTAA",
"TTCTAA",
"TTAGAA",
"GGTGAA",
"CAGTTT",
"CTGGTG",
"AGATGA",
"ATTACT",
"AGCTTT",
"GTAATA",
"TGGCGA",
"CTATTT",
"TGAACA",
"TATTAC",
"GTATTA",
"ATCGCC",
"TCATCT",
"CTTTCA",
"CTGCAA",
"TTTAGT",
"CCATCA",
"ATCATA",
"TGAAAG",
"TTATCG",
"TTCACC",
"GATGTT",
"TGGAAA",
"AAAGCT",
"CGCTTT",
"AACATC",
"CGATAA",
"TTGCAG",
"TGATGG",
"TATGAT",
"CTGATT"
],
"class_names": [
"Resistant",
"Susceptible"
],
"task_type": "binary",
"antibiotic": "gentamicin",
"k": 6,
"max_features": 500,
"n_samples": 252,
"n_features": 500,
"n_classes": 2
}