SAMHI/scripts/train.sh

#/vol/data/miniconda3/envs/histo3.10/bin/python /home/ubuntu/thesis/SAMHI/scripts/train.py --loss diceCE --display_name "CoCaHis" --datasets CoCaHis --epochs 0 
#/vol/data/miniconda3/envs/histo3.10/bin/python /home/ubuntu/thesis/SAMHI/scripts/train.py --loss diceCE --display_name "default" --datasets Janowczyk --epochs 10 
# /vol/data/miniconda3/envs/histo3.10/bin/python /home/ubuntu/thesis/SAMHI/scripts/train.py --loss diceCE --shuffle True  --display_name "GlaS" --datasets GlaS --data_augmentations RandomResizedCrop HueSaturationValue D4 --random_nr_of_interactive_points True --max_nr_of_interactive_points 5 --only_positive_points True --lr 1e-5 --batch_size 2 --accumulate_grad_batches 4 --epochs 0 --prompt_type both --freeze "" --lora_rank 4
/vol/data/miniconda3/envs/histo3.10/bin/python /home/ubuntu/thesis/SAMHI/scripts/train.py --save_model True --loss diceCE --shuffle True --display_name "Big Run" --datasets CPM CoNIC CryoNuSeg GlaS Janowczyk Kumar NuClick SegPC PAIP2023 --use_holdout_testset True --test_datasets MoNuSeg CellSeg CRAG --data_augmentations RandomResizedCrop HueSaturationValue D4 --random_nr_of_interactive_points True --max_nr_of_interactive_points 5 --only_positive_points True --lr 1e-5 --batch_size 4 --accumulate_grad_batches 4 --epochs 20 --prompt_type both --freeze "" --lora_rank 4
# /vol/data/miniconda3/envs/histo3.10/bin/python /home/ubuntu/thesis/SAMHI/scripts/train.py --shuffle True --display_name "CoNIC" --datasets CoNIC --data_augmentations RandomResizedCrop HueSaturationValue D4 --lr 1e-5 --batch_size 4 --accumulate_grad_batches 4 --epochs 1 --prompt_type points
# /vol/data/miniconda3/envs/histo3.10/bin/python /home/ubuntu/thesis/SAMHI/scripts/train.py --shuffle True --display_name "CryoNuSeg" --datasets CryoNuSeg --data_augmentations RandomResizedCrop HueSaturationValue D4 --lr 1e-5 --batch_size 4 --accumulate_grad_batches 4 --epochs 1 --prompt_type points
# /vol/data/miniconda3/envs/histo3.10/bin/python /home/ubuntu/thesis/SAMHI/scripts/train.py --shuffle True --display_name "GlaS" --datasets GlaS --data_augmentations RandomResizedCrop HueSaturationValue D4 --lr 1e-5 --batch_size 4 --accumulate_grad_batches 4 --epochs 1 --prompt_type points
# /vol/data/miniconda3/envs/histo3.10/bin/python /home/ubuntu/thesis/SAMHI/scripts/train.py --shuffle True --display_name "Janowczyk" --datasets Janowczyk --data_augmentations RandomResizedCrop HueSaturationValue D4 --lr 1e-5 --batch_size 4 --accumulate_grad_batches 4 --epochs 1 --prompt_type points
# /vol/data/miniconda3/envs/histo3.10/bin/python /home/ubuntu/thesis/SAMHI/scripts/train.py --shuffle True --display_name "Kumar" --datasets Kumar --data_augmentations RandomResizedCrop HueSaturationValue D4 --lr 1e-5 --batch_size 4 --accumulate_grad_batches 4 --epochs 1 --prompt_type points
# /vol/data/miniconda3/envs/histo3.10/bin/python /home/ubuntu/thesis/SAMHI/scripts/train.py --shuffle True --display_name "SegPC" --datasets SegPC --data_augmentations RandomResizedCrop HueSaturationValue D4 --lr 1e-5 --batch_size 4 --accumulate_grad_batches 4 --epochs 1 --prompt_type points
# /vol/data/miniconda3/envs/histo3.10/bin/python /home/ubuntu/thesis/SAMHI/scripts/train.py --shuffle True --display_name "PAIP2023" --datasets PAIP2023 --data_augmentations RandomResizedCrop HueSaturationValue D4 --lr 1e-5 --batch_size 4 --accumulate_grad_batches 4 --epochs 1 --prompt_type points
# /vol/data/miniconda3/envs/histo3.10/bin/python /home/ubuntu/thesis/SAMHI/scripts/train.py --shuffle True --display_name "MoNuSeg" --datasets MoNuSeg --data_augmentations RandomResizedCrop HueSaturationValue D4 --lr 1e-5 --batch_size 4 --accumulate_grad_batches 4 --epochs 1 --prompt_type points
# /vol/data/miniconda3/envs/histo3.10/bin/python /home/ubuntu/thesis/SAMHI/scripts/train.py --shuffle True --display_name "CellSeg" --datasets CellSeg --data_augmentations RandomResizedCrop HueSaturationValue D4 --lr 1e-5 --batch_size 4 --accumulate_grad_batches 4 --epochs 1 --prompt_type points
# /vol/data/miniconda3/envs/histo3.10/bin/python /home/ubuntu/thesis/SAMHI/scripts/train.py --shuffle True --display_name "CRAG" --datasets CRAG --data_augmentations RandomResizedCrop HueSaturationValue D4 --lr 1e-5 --batch_size 4 --accumulate_grad_batches 4 --epochs 1 --prompt_type points