pirelli1453's picture
Upload 3 files
941e967 verified
Raw
History Blame Contribute Delete
9.22 kB
#!/usr/bin/env python3
"""
Sismik Sınıflandırma - HuggingFace Space (Gradio)
===================================================
RandomForest modeliyle MSEED dosyalarını DEPREM / NOISE olarak sınıflandırır.
HF Spaces kurulumu:
1. huggingface.co/new-space -> SDK: Gradio, Hardware: CPU basic (ücretsiz)
2. Bu dosyayı app.py olarak yükle
3. requirements.txt'i yükle
4. rf_model.pkl dosyasını da Space'e yükle (aynı dizine)
"""
import os
import json
import tempfile
import warnings
warnings.filterwarnings("ignore")
import numpy as np
import joblib
import gradio as gr
from obspy import read
from obspy.signal.trigger import classic_sta_lta, trigger_onset
from obspy.signal.filter import envelope as obspy_envelope
from scipy import signal as scipy_signal
from scipy.stats import kurtosis, skew
import matplotlib
matplotlib.use("Agg")
import matplotlib.pyplot as plt
# ---------------------------------------------------------------------------
# Özellik çıkarımı — train_rf2.py ile BİREBİR AYNI
# ---------------------------------------------------------------------------
BANDPASS = (0.5, 15.0)
STA_S = 2.0
LTA_S = 20.0
MIN_NPTS = 200
MODEL_PATH = "rf_model.pkl"
def extract_features(tr) -> dict:
data = tr.data.astype(np.float64)
n = len(data)
df = tr.stats.sampling_rate
if n < MIN_NPTS:
return None
data -= np.mean(data)
sos = scipy_signal.butter(4, BANDPASS, btype="bandpass", fs=df, output="sos")
fdata = scipy_signal.sosfiltfilt(sos, data)
rms = np.sqrt(np.mean(fdata**2))
if rms < 1e-10:
return None
max_amp = np.max(np.abs(fdata))
peak_rms = max_amp / rms
zcr = ((fdata[:-1] * fdata[1:]) < 0).sum() / n
env = obspy_envelope(fdata)
env_smooth = scipy_signal.savgol_filter(env, min(51, n // 4 * 2 + 1), 3)
env_smoothness = np.std(np.diff(env_smooth)) / (np.mean(env_smooth) + 1e-10)
cum_e = np.cumsum(env ** 2)
idx90 = np.searchsorted(cum_e, 0.9 * cum_e[-1])
dur90 = idx90 / df
kurt_val = kurtosis(fdata)
skew_val = skew(fdata)
try:
cft = classic_sta_lta(fdata, int(STA_S * df), int(LTA_S * df))
sta_lta_max = np.max(cft)
sta_lta_mean = np.mean(cft)
triggers = trigger_onset(cft, 4.0, 1.5)
num_triggers = len(triggers)
except Exception:
cft = np.zeros_like(fdata)
sta_lta_max, sta_lta_mean, num_triggers = 0.0, 0.0, 0
nperseg = min(256, n // 2)
freqs, psd = scipy_signal.welch(fdata, df, nperseg=nperseg)
total_power = np.sum(psd) + 1e-30
def band_ratio(f_low, f_high):
mask = (freqs >= f_low) & (freqs < f_high)
return np.sum(psd[mask]) / total_power
low_ratio = band_ratio(0.5, 2.0)
mid1_ratio = band_ratio(2.0, 5.0)
mid2_ratio = band_ratio(5.0, 10.0)
high_ratio = band_ratio(10.0, 25.0)
dom_freq_idx = np.argmax(psd[freqs <= 25])
dom_freq = freqs[dom_freq_idx]
psd_norm = psd / total_power
spec_entropy = -np.sum(psd_norm * np.log(psd_norm + 1e-30))
spec_mean_freq = np.sum(freqs * psd_norm)
spec_bandwidth = np.sqrt(np.sum(((freqs - spec_mean_freq) ** 2) * psd_norm))
is_rf9f7 = 1 if "RF9F7" in (tr.stats.station or "").upper() else 0
feats = {
"peak_rms": peak_rms,
"zcr": zcr,
"kurt": kurt_val,
"skewness": skew_val,
"env_smoothness": env_smoothness,
"dur90_s": dur90,
"sta_lta_max": sta_lta_max,
"sta_lta_mean": sta_lta_mean,
"num_triggers": num_triggers,
"dom_freq": dom_freq,
"low_ratio": low_ratio,
"mid1_ratio": mid1_ratio,
"mid2_ratio": mid2_ratio,
"high_ratio": high_ratio,
"spec_entropy": spec_entropy,
"spec_bandwidth": spec_bandwidth,
"is_rf9f7": is_rf9f7,
}
# Grafik için ek veriler (feature dict'ine karışmaması için ayrı döndürülür)
return feats, fdata, cft, df
# ---------------------------------------------------------------------------
# Model yükleme (bir kere, global)
# ---------------------------------------------------------------------------
_bundle = None
def get_model():
global _bundle
if _bundle is None:
_bundle = joblib.load(MODEL_PATH)
return _bundle
def make_plot(fdata, cft, df, label, deprem_proba):
t = np.arange(len(fdata)) / df
fig, axes = plt.subplots(2, 1, figsize=(9, 5), sharex=True)
color = "#d64545" if label == "DEPREM" else "#3b6fd6"
axes[0].plot(t, fdata, color=color, linewidth=0.6)
axes[0].set_ylabel("Genlik (filtrelenmiş)")
axes[0].set_title(f"Tahmin: {label} (DEPREM olasılığı: %{deprem_proba*100:.1f})")
axes[1].plot(t, cft, color="purple", linewidth=0.8)
axes[1].axhline(4.0, color="black", linestyle=":", linewidth=1, label="Tetik eşiği")
axes[1].set_ylabel("STA/LTA")
axes[1].set_xlabel("Zaman (s)")
axes[1].legend(loc="upper right", fontsize=8)
plt.tight_layout()
return fig
def predict_mseed(file_obj, threshold):
if file_obj is None:
return "Lütfen bir MSEED dosyası yükleyin.", None, None
# Gradio 5.x'te gr.File genellikle doğrudan dosya yolu (str) döndürür,
# eski sürümlerde .name attribute'lu bir obje döndürüyordu — ikisini de destekle
filepath = file_obj if isinstance(file_obj, str) else getattr(file_obj, "name", None)
if not filepath:
return "Dosya yolu okunamadı.", None, None
try:
st = read(filepath)
except Exception as e:
return f"Dosya okunamadı: {e}", None, None
tr = None
for cha in ["EHZ", "HHZ", "BHZ", "EHN"]:
sel = st.select(channel=cha)
if len(sel) > 0:
tr = sel[0]
break
if tr is None:
tr = st[0]
result = extract_features(tr)
if result is None:
return f"Özellik çıkarılamadı (dosya çok kısa, min {MIN_NPTS} örnek gerekli).", None, None
feats, fdata, cft, df = result
bundle = get_model()
model, le, feature_cols = bundle["model"], bundle["le"], bundle["meta"]["feature_cols"]
X = np.array([[feats.get(c, 0.0) for c in feature_cols]])
X = np.where(~np.isfinite(X), 0.0, X)
proba = model.predict_proba(X)[0]
deprem_idx = list(le.classes_).index("DEPREM")
deprem_p = float(proba[deprem_idx])
label = "DEPREM" if deprem_p >= threshold else "NOISE"
emoji = "🔴 DEPREM" if label == "DEPREM" else "🔵 NOISE"
summary = (
f"## {emoji}\n\n"
f"**DEPREM olasılığı:** %{deprem_p*100:.1f}\n\n"
f"**NOISE olasılığı:** %{(1-deprem_p)*100:.1f}\n\n"
f"**Kanal:** {tr.stats.network}.{tr.stats.station}.{tr.stats.location}.{tr.stats.channel}\n\n"
f"**Başlangıç:** {tr.stats.starttime}\n\n"
f"**Süre:** {tr.stats.npts/tr.stats.sampling_rate:.1f} sn"
)
feat_table = "| Özellik | Değer |\n|---|---|\n"
for k, v in feats.items():
feat_table += f"| {k} | {v:.4f} |\n"
fig = make_plot(fdata, cft, df, label, deprem_p)
return summary, feat_table, fig
# ---------------------------------------------------------------------------
# Gradio arayüzü
# ---------------------------------------------------------------------------
with gr.Blocks(title="Sismik Sınıflandırma") as demo:
gr.Markdown(
"# 🌍 Sismik Sinyal Sınıflandırma (Marmara / RaspberryShake)\n"
"MSEED dosyası yükleyin, RandomForest modeli DEPREM veya NOISE olarak sınıflandırsın.\n\n"
"*Not: Model şu an sınırlı (Marmara bölgesi, RaspberryShake istasyonları) veriyle eğitildi, "
"gelişim aşamasındadır.*"
)
with gr.Row():
with gr.Column(scale=1):
file_input = gr.File(label="MSEED Dosyası (.mseed)", file_types=[".mseed", ".miniseed", ".seed"])
threshold_slider = gr.Slider(
minimum=0.1, maximum=0.9, value=0.5, step=0.05,
label="DEPREM karar eşiği",
info="Düşürürsen daha hassas (recall↑), yükseltirsen daha seçici (precision↑)"
)
submit_btn = gr.Button("Analiz Et", variant="primary")
with gr.Column(scale=1):
result_md = gr.Markdown(label="Sonuç")
with gr.Row():
plot_output = gr.Plot(label="Dalga Formu + STA/LTA")
with gr.Accordion("Detaylı özellik değerleri", open=False):
feat_output = gr.Markdown()
submit_btn.click(
fn=predict_mseed,
inputs=[file_input, threshold_slider],
outputs=[result_md, feat_output, plot_output],
api_name="predict",
)
gr.Markdown(
"---\n"
"**API kullanımı:** Bu Space'e programatik erişim için `gradio_client` kütüphanesini kullanabilirsiniz:\n"
"```python\n"
"from gradio_client import Client, file\n"
"client = Client(\"KULLANICI_ADI/SPACE_ADI\")\n"
"result = client.predict(file(\"ornek.mseed\"), 0.5, api_name=\"/predict\")\n"
"```"
)
if __name__ == "__main__":
demo.queue()
demo.launch(show_api=False)