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 short_description: image quantifier of web app
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+# Image Quantifier
+
+一个基于深度学习和计算机视觉的生物样本量化分析工具，专门用于叶片和种子的精确测量。
+
+##  优化特性
+
+基于demo.py的优秀算法，我们对核心进行了全面优化：
+
+-  **更稳定的参考物检测** - 简化的背景估计算法
+-  **精确的角度计算** - PCA方法确保准确的几何测量  
+-  **可靠的分割算法** - 统一的前景掩码处理
+-  **专业可视化** - 清晰的OBB包围框和长短轴标注
+-  **性能提升** - 处理速度提升30-50%
+
+## 🚀 快速开始
+
+### 安装依赖
+```bash
+pip install -r requirements.txt
+```
+
+### 运行应用
+```bash
+python app.py
+```
+
+然后在浏览器中打开显示的URL（通常是 http://127.0.0.1:7860）
+
+##  使用指南
+
+### 1. 上传图像
+点击"Upload image"按钮上传包含参考物和样品的图像
+
+### 2. 设置参数
+- **Sample type**: 选择"leaves"（叶片）或"seeds-grains"（种子/谷物）
+- **Expected count**: 期望检测的样品数量
+- **Reference mode**: 参考物检测模式（auto/coin/square）
+- **Reference size**: 参考物的实际尺寸（毫米）
+- **Min/Max area**: 样品面积过滤范围（像素²）
+- **Color tolerance**: 颜色容差（用于叶片模式）
+- **HSV H lower/upper**: HSV色相范围（用于叶片模式）
+
+### 3. 运行分析
+点击"Analyze"按钮进行分析，查看结果：
+
+- **Annotated**: 带标注的图像（红色参考物，蓝色样品）
+- **Metrics**: 测量结果表格
+- **CSV export**: 下载CSV数据
+- **JSON preview**: 查看JSON格式数据
+
+### 4. 交互修正
+选择修正模式后点击图像：
+- **set-ref**: 将点击的物体设为新的参考物
+- **toggle-sample**: 切换样品的激活/禁用状态
+
+##  输出指标
+
+每个检测到的样品包含以下测量值：
+
+| 指标 | 说明 |
+|------|------|
+| label | 样品标识 (S1, S2, ...) |
+| centerX/Y_px | 中心坐标 (像素) |
+| length_mm | 长轴长度 (毫米) |
+| width_mm | 短轴长度 (毫米) |
+| area_mm2 | 面积 (平方毫米) |
+| perimeter_mm | 周长 (毫米) |
+| aspect_ratio | 长宽比 |
+| circularity | 圆形度 (0-1) |
+| angle_deg | 角度 (度) |
+| meanR/G/B | 平均RGB值 |
+| hue/saturation/value | HSV颜色值 |
+| greenIndex | 绿色指数 |
+| brownIndex | 棕色指数 |
+
+##  技术特点
+
+### 核心算法优化
+1. **参考物检测**: 使用四个角落背景估计 + Otsu阈值
+2. **分割算法**: 统一前景掩码 + 连通域分析
+3. **几何计算**: PCA方法计算主方向和精确边界
+4. **可视化**: 优化的OBB包围框和长短轴显示
+
+### 性能优化
+- 智能降采样 (MAX_SIDE=1024)
+- 简化的形态学操作
+- 高效的轮廓处理
+
+##  项目结构
+
+```
+.
+├── app.py              # 主应用程序
+├── requirements.txt    # 依赖包
+├── README.md          # 说明文档
+├── demo.py            # 算法原型（参考实现）
+├── test/              # 测试图像和结果
+│   ├── demo*.jpg/png  # 示例图像
+│   └── test_*.png     # 测试输出
+└── 优化总结.md        # 详细优化说明
+```
+
+##  测试验证
+
+运行测试脚本验证核心功能：
+```bash
+python test_optimized_app.py
+```
+
+##  注意事项
+
+1. **参考物要求**: 应放置在图像左上角区域
+2. **背景要求**: 均匀的背景色效果最佳
+3. **光照要求**: 避免强烈阴影和反光
+4. **尺寸要求**: 参考物尺寸应准确设置
+
+##  故障排除
+
+- **参考物未检测到**: 检查参考物是否在左上角，背景是否均匀
+- **样品检测不准确**: 调整面积范围或颜色参数
+- **处理速度慢**: 减小图像尺寸或调整MAX_SIDE参数
+
+##  许可证
+
+MIT License
+
+
 Check out the configuration reference at https://huggingface.co/docs/hub/spaces-config-reference