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| ��{ " o p e n a p i " : " 3 . 1 . 0 " , " i n f o " : { " t i t l e " : " B i o F l o w A P I " , " d e s c r i p t i o n " : " A I - P o w e r e d D r u g D i s c o v e r y P l a t f o r m A P I " , " v e r s i o n " : " 2 . 0 . 0 " } , " p a t h s " : { " / a p i / d p - s e a r c h " : { " p o s t " : { " t a g s " : [ " d e e p p u r p o s e " ] , " s u m m a r y " : " S e a r c h V e c t o r s " , " d e s c r i p t i o n " : " S e a r c h f o r s i m i l a r d r u g s / t a r g e t s u s i n g D e e p P u r p o s e e m b e d d i n g s . \ n \ n N o t e : U s e / a p i / s e a r c h f o r g e n e r a l e n h a n c e d s e a r c h w i t h M M R d i v e r s i f i c a t i o n . \ n T h i s e n d p o i n t i s s p e c i f i c a l l y f o r D e e p P u r p o s e m o d e l - b a s e d v e c t o r s e a r c h . " , " o p e r a t i o n I d " : " s e a r c h _ v e c t o r s _ a p i _ d p _ s e a r c h _ p o s t " , " r e q u e s t B o d y " : { " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / S e a r c h R e q u e s t " } } } , " r e q u i r e d " : t r u e } , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { } } } } , " 4 2 2 " : { " d e s c r i p t i o n " : " V a l i d a t i o n E r r o r " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H T T P V a l i d a t i o n E r r o r " } } } } } } } , " / a p i / p o i n t s " : { " g e t " : { " s u m m a r y " : " G e t P o i n t s " , " d e s c r i p t i o n " : " G e t p o i n t s f o r v i s u a l i z a t i o n . " , " o p e r a t i o n I d " : " g e t _ p o i n t s _ a p i _ p o i n t s _ g e t " , " p a r a m e t e r s " : [ { " n a m e " : " l i m i t " , " i n " : " q u e r y " , " r e q u i r e d " : f a l s e , " s c h e m a " : { " t y p e " : " i n t e g e r " , " d e f a u l t " : 5 0 0 , " t i t l e " : " L i m i t " } } , { " n a m e " : " v i e w " , " i n " : " q u e r y " , " r e q u i r e d " : f a l s e , " s c h e m a " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " d e f a u l t " : " c o m b i n e d " , " t i t l e " : " V i e w " } } ] , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { } } } } , " 4 2 2 " : { " d e s c r i p t i o n " : " V a l i d a t i o n E r r o r " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H T T P V a l i d a t i o n E r r o r " } } } } } } } , " / a p i / s t a t s " : { " g e t " : { " s u m m a r y " : " G e t S t a t s " , " d e s c r i p t i o n " : " G e t s y s t e m s t a t i s t i c s f o r t h e d a t a p a g e . " , " o p e r a t i o n I d " : " g e t _ s t a t s _ a p i _ s t a t s _ g e t " , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { } } } } } } } , " / " : { " g e t " : { " s u m m a r y " : " R o o t " , " d e s c r i p t i o n " : " H e a l t h c h e c k e n d p o i n t . " , " o p e r a t i o n I d " : " r o o t _ _ g e t " , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H e a l t h R e s p o n s e " } } } } } } } , " / h e a l t h " : { " g e t " : { " s u m m a r y " : " H e a l t h " , " d e s c r i p t i o n " : " H e a l t h c h e c k e n d p o i n t . " , " o p e r a t i o n I d " : " h e a l t h _ h e a l t h _ g e t " , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H e a l t h R e s p o n s e " } } } } } } } , " / a p i / d i s c o v e r y " : { " p o s t " : { " s u m m a r y " : " S t a r t D i s c o v e r y " , " d e s c r i p t i o n " : " S t a r t a d i s c o v e r y p i p e l i n e ( a s y n c ) . " , " o p e r a t i o n I d " : " s t a r t _ d i s c o v e r y _ a p i _ d i s c o v e r y _ p o s t " , " r e q u e s t B o d y " : { " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / D i s c o v e r y R e q u e s t " } } } , " r e q u i r e d " : t r u e } , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { } } } } , " 4 2 2 " : { " d e s c r i p t i o n " : " V a l i d a t i o n E r r o r " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H T T P V a l i d a t i o n E r r o r " } } } } } } } , " / a p i / d i s c o v e r y / { j o b _ i d } " : { " g e t " : { " s u m m a r y " : " G e t D i s c o v e r y S t a t u s " , " d e s c r i p t i o n " : " G e t s t a t u s o f a d i s c o v e r y j o b . " , " o p e r a t i o n I d " : " g e t _ d i s c o v e r y _ s t a t u s _ a p i _ d i s c o v e r y _ _ j o b _ i d _ _ g e t " , " p a r a m e t e r s " : [ { " n a m e " : " j o b _ i d " , " i n " : " p a t h " , " r e q u i r e d " : t r u e , " s c h e m a " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " J o b I d " } } ] , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { } } } } , " 4 2 2 " : { " d e s c r i p t i o n " : " V a l i d a t i o n E r r o r " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H T T P V a l i d a t i o n E r r o r " } } } } } } } , " / a p i / p r e d i c t " : { " p o s t " : { " s u m m a r y " : " P r e d i c t D t i " , " d e s c r i p t i o n " : " P r e d i c t d r u g - t a r g e t i n t e r a c t i o n . \ n U s e s D e e p P u r p o s e u n d e r t h e h o o d . " , " o p e r a t i o n I d " : " p r e d i c t _ d t i _ a p i _ p r e d i c t _ p o s t " , " r e q u e s t B o d y " : { " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / P r e d i c t R e q u e s t " } } } , " r e q u i r e d " : t r u e } , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { } } } } , " 4 2 2 " : { " d e s c r i p t i o n " : " V a l i d a t i o n E r r o r " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H T T P V a l i d a t i o n E r r o r " } } } } } } } , " / a p i / s e a r c h " : { " p o s t " : { " s u m m a r y " : " E n h a n c e d S e a r c h " , " d e s c r i p t i o n " : " E n h a n c e d s e m a n t i c s e a r c h w i t h M M R d i v e r s i f i c a t i o n a n d e v i d e n c e l i n k i n g . \ n \ n F e a t u r e s : \ n - M a x i m a l M a r g i n a l R e l e v a n c e ( M M R ) f o r d i v e r s e r e s u l t s \ n - E v i d e n c e l i n k s t o s o u r c e d a t a b a s e s ( P u b M e d , U n i P r o t , C h E M B L ) \ n - C i t a t i o n s a n d s o u r c e t r a c k i n g \ n - F i l t e r e d s e a r c h b y m o d a l i t y , s o u r c e , e t c . \ n \ n A c c e p t s b o t h o l d f o r m a t ( t y p e , l i m i t ) a n d n e w f o r m a t ( m o d a l i t y , t o p _ k ) . " , " o p e r a t i o n I d " : " e n h a n c e d _ s e a r c h _ a p i _ s e a r c h _ p o s t " , " r e q u e s t B o d y " : { " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " a d d i t i o n a l P r o p e r t i e s " : t r u e , " t y p e " : " o b j e c t " , " t i t l e " : " R e q u e s t " } } } } , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { } } } } , " 4 2 2 " : { " d e s c r i p t i o n " : " V a l i d a t i o n E r r o r " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H T T P V a l i d a t i o n E r r o r " } } } } } } } , " / a p i / s e a r c h / h y b r i d " : { " p o s t " : { " s u m m a r y " : " H y b r i d S e a r c h " , " d e s c r i p t i o n " : " H y b r i d s e a r c h c o m b i n i n g v e c t o r s i m i l a r i t y w i t h k e y w o r d m a t c h i n g . \ n \ n U s e f u l w h e n y o u w a n t r e s u l t s t h a t a r e b o t h s e m a n t i c a l l y s i m i l a r \ n A N D c o n t a i n s p e c i f i c k e y w o r d s . " , " o p e r a t i o n I d " : " h y b r i d _ s e a r c h _ a p i _ s e a r c h _ h y b r i d _ p o s t " , " r e q u e s t B o d y " : { " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H y b r i d S e a r c h R e q u e s t " } } } , " r e q u i r e d " : t r u e } , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { } } } } , " 4 2 2 " : { " d e s c r i p t i o n " : " V a l i d a t i o n E r r o r " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H T T P V a l i d a t i o n E r r o r " } } } } } } } , " / a p i / i n g e s t " : { " p o s t " : { " s u m m a r y " : " I n g e s t D a t a " , " d e s c r i p t i o n " : " I n g e s t d a t a i n t o v e c t o r d a t a b a s e . " , " o p e r a t i o n I d " : " i n g e s t _ d a t a _ a p i _ i n g e s t _ p o s t " , " r e q u e s t B o d y " : { " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / I n g e s t R e q u e s t " } } } , " r e q u i r e d " : t r u e } , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { } } } } , " 4 2 2 " : { " d e s c r i p t i o n " : " V a l i d a t i o n E r r o r " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H T T P V a l i d a t i o n E r r o r " } } } } } } } , " / a p i / m o l e c u l e s " : { " g e t " : { " s u m m a r y " : " L i s t M o l e c u l e s " , " d e s c r i p t i o n " : " L i s t m o l e c u l e s i n t h e d a t a b a s e . " , " o p e r a t i o n I d " : " l i s t _ m o l e c u l e s _ a p i _ m o l e c u l e s _ g e t " , " p a r a m e t e r s " : [ { " n a m e " : " l i m i t " , " i n " : " q u e r y " , " r e q u i r e d " : f a l s e , " s c h e m a " : { " t y p e " : " i n t e g e r " , " d e f a u l t " : 2 0 , " t i t l e " : " L i m i t " } } , { " n a m e " : " o f f s e t " , " i n " : " q u e r y " , " r e q u i r e d " : f a l s e , " s c h e m a " : { " t y p e " : " i n t e g e r " , " d e f a u l t " : 0 , " t i t l e " : " O f f s e t " } } ] , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { } } } } , " 4 2 2 " : { " d e s c r i p t i o n " : " V a l i d a t i o n E r r o r " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H T T P V a l i d a t i o n E r r o r " } } } } } } } , " / a p i / p r o t e i n s " : { " g e t " : { " s u m m a r y " : " L i s t P r o t e i n s " , " d e s c r i p t i o n " : " L i s t p r o t e i n s i n t h e d a t a b a s e . " , " o p e r a t i o n I d " : " l i s t _ p r o t e i n s _ a p i _ p r o t e i n s _ g e t " , " p a r a m e t e r s " : [ { " n a m e " : " l i m i t " , " i n " : " q u e r y " , " r e q u i r e d " : f a l s e , " s c h e m a " : { " t y p e " : " i n t e g e r " , " d e f a u l t " : 2 0 , " t i t l e " : " L i m i t " } } , { " n a m e " : " o f f s e t " , " i n " : " q u e r y " , " r e q u i r e d " : f a l s e , " s c h e m a " : { " t y p e " : " i n t e g e r " , " d e f a u l t " : 0 , " t i t l e " : " O f f s e t " } } ] , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { } } } } , " 4 2 2 " : { " d e s c r i p t i o n " : " V a l i d a t i o n E r r o r " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H T T P V a l i d a t i o n E r r o r " } } } } } } } , " / a p i / e x p l o r e r / e m b e d d i n g s " : { " g e t " : { " s u m m a r y " : " G e t E m b e d d i n g s " , " d e s c r i p t i o n " : " G e t 2 D p r o j e c t i o n s o f e m b e d d i n g s f o r v i s u a l i z a t i o n . " , " o p e r a t i o n I d " : " g e t _ e m b e d d i n g s _ a p i _ e x p l o r e r _ e m b e d d i n g s _ g e t " , " p a r a m e t e r s " : [ { " n a m e " : " d a t a s e t " , " i n " : " q u e r y " , " r e q u i r e d " : f a l s e , " s c h e m a " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " d e f a u l t " : " d e f a u l t " , " t i t l e " : " D a t a s e t " } } , { " n a m e " : " m e t h o d " , " i n " : " q u e r y " , " r e q u i r e d " : f a l s e , " s c h e m a " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " d e f a u l t " : " u m a p " , " t i t l e " : " M e t h o d " } } ] , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { } } } } , " 4 2 2 " : { " d e s c r i p t i o n " : " V a l i d a t i o n E r r o r " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H T T P V a l i d a t i o n E r r o r " } } } } } } } , " / a p i / e n c o d e " : { " p o s t " : { " s u m m a r y " : " E n c o d e C o n t e n t " , " d e s c r i p t i o n " : " E n c o d e c o n t e n t t o e m b e d d i n g v e c t o r . " , " o p e r a t i o n I d " : " e n c o d e _ c o n t e n t _ a p i _ e n c o d e _ p o s t " , " p a r a m e t e r s " : [ { " n a m e " : " c o n t e n t " , " i n " : " q u e r y " , " r e q u i r e d " : t r u e , " s c h e m a " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " C o n t e n t " } } , { " n a m e " : " m o d a l i t y " , " i n " : " q u e r y " , " r e q u i r e d " : f a l s e , " s c h e m a " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " d e f a u l t " : " a u t o " , " t i t l e " : " M o d a l i t y " } } ] , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { } } } } , " 4 2 2 " : { " d e s c r i p t i o n " : " V a l i d a t i o n E r r o r " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H T T P V a l i d a t i o n E r r o r " } } } } } } } , " / a p i / s i m i l a r i t y " : { " g e t " : { " s u m m a r y " : " C o m p u t e S i m i l a r i t y " , " d e s c r i p t i o n " : " C o m p u t e s i m i l a r i t y b e t w e e n q u e r y a n d c o m m a - s e p a r a t e d c a n d i d a t e s . " , " o p e r a t i o n I d " : " c o m p u t e _ s i m i l a r i t y _ a p i _ s i m i l a r i t y _ g e t " , " p a r a m e t e r s " : [ { " n a m e " : " q u e r y " , " i n " : " q u e r y " , " r e q u i r e d " : t r u e , " s c h e m a " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " Q u e r y " } } , { " n a m e " : " c a n d i d a t e s " , " i n " : " q u e r y " , " r e q u i r e d " : t r u e , " s c h e m a " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " C a n d i d a t e s " } } , { " n a m e " : " m o d a l i t y " , " i n " : " q u e r y " , " r e q u i r e d " : f a l s e , " s c h e m a " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " d e f a u l t " : " m o l e c u l e " , " t i t l e " : " M o d a l i t y " } } ] , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { } } } } , " 4 2 2 " : { " d e s c r i p t i o n " : " V a l i d a t i o n E r r o r " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H T T P V a l i d a t i o n E r r o r " } } } } } } } , " / a p i / c o l l e c t i o n s " : { " g e t " : { " s u m m a r y " : " L i s t C o l l e c t i o n s " , " d e s c r i p t i o n " : " L i s t a l l v e c t o r c o l l e c t i o n s . " , " o p e r a t i o n I d " : " l i s t _ c o l l e c t i o n s _ a p i _ c o l l e c t i o n s _ g e t " , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { } } } } } } } , " / a p i / a g e n t s / g e n e r a t e " : { " p o s t " : { " s u m m a r y " : " A g e n t G e n e r a t e " , " d e s c r i p t i o n " : " G e n e r a t e m o l e c u l e s f r o m t e x t p r o m p t o r s e e d S M I L E S . \ n \ n M o d e s : \ n - t e x t : G e n e r a t e f r o m n a t u r a l l a n g u a g e d e s c r i p t i o n \ n - m u t a t e : C r e a t e v a r i a n t s o f a s e e d m o l e c u l e \ n - s c a f f o l d : G e n e r a t e a r o u n d a c o r e s c a f f o l d " , " o p e r a t i o n I d " : " a g e n t _ g e n e r a t e _ a p i _ a g e n t s _ g e n e r a t e _ p o s t " , " r e q u e s t B o d y " : { " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / G e n e r a t e R e q u e s t " } } } , " r e q u i r e d " : t r u e } , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { } } } } , " 4 2 2 " : { " d e s c r i p t i o n " : " V a l i d a t i o n E r r o r " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H T T P V a l i d a t i o n E r r o r " } } } } } } } , " / a p i / a g e n t s / v a l i d a t e " : { " p o s t " : { " s u m m a r y " : " A g e n t V a l i d a t e " , " d e s c r i p t i o n " : " V a l i d a t e m o l e c u l e s f o r A D M E T a n d d r u g - l i k e n e s s p r o p e r t i e s . \ n \ n R e t u r n s v a l i d a t i o n s c o r e s , p r o p e r t y v a l u e s , a n d s t r u c t u r a l a l e r t s . " , " o p e r a t i o n I d " : " a g e n t _ v a l i d a t e _ a p i _ a g e n t s _ v a l i d a t e _ p o s t " , " r e q u e s t B o d y " : { " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / V a l i d a t e R e q u e s t " } } } , " r e q u i r e d " : t r u e } , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { } } } } , " 4 2 2 " : { " d e s c r i p t i o n " : " V a l i d a t i o n E r r o r " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H T T P V a l i d a t i o n E r r o r " } } } } } } } , " / a p i / a g e n t s / r a n k " : { " p o s t " : { " s u m m a r y " : " A g e n t R a n k " , " d e s c r i p t i o n " : " R a n k c a n d i d a t e s b a s e d o n m u l t i p l e c r i t e r i a . \ n \ n C o m b i n e s v a l i d a t i o n s c o r e s , c o n f i d e n c e , a n d o t h e r m e t r i c s . " , " o p e r a t i o n I d " : " a g e n t _ r a n k _ a p i _ a g e n t s _ r a n k _ p o s t " , " r e q u e s t B o d y " : { " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / R a n k R e q u e s t " } } } , " r e q u i r e d " : t r u e } , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { } } } } , " 4 2 2 " : { " d e s c r i p t i o n " : " V a l i d a t i o n E r r o r " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H T T P V a l i d a t i o n E r r o r " } } } } } } } , " / a p i / a g e n t s / w o r k f l o w " : { " p o s t " : { " s u m m a r y " : " R u n D i s c o v e r y W o r k f l o w " , " d e s c r i p t i o n " : " R u n f u l l d i s c o v e r y w o r k f l o w : G e n e r a t e � � � V a l i d a t e � � � R a n k . \ n \ n R e t u r n s t o p c a n d i d a t e s w i t h a l l v a l i d a t i o n a n d r a n k i n g m e t a d a t a . " , " o p e r a t i o n I d " : " r u n _ d i s c o v e r y _ w o r k f l o w _ a p i _ a g e n t s _ w o r k f l o w _ p o s t " , " r e q u e s t B o d y " : { " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / W o r k f l o w R e q u e s t " } } } , " r e q u i r e d " : t r u e } , " r e s p o n s e s " : { " 2 0 0 " : { " d e s c r i p t i o n " : " S u c c e s s f u l R e s p o n s e " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { } } } } , " 4 2 2 " : { " d e s c r i p t i o n " : " V a l i d a t i o n E r r o r " , " c o n t e n t " : { " a p p l i c a t i o n / j s o n " : { " s c h e m a " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / H T T P V a l i d a t i o n E r r o r " } } } } } } } } , " c o m p o n e n t s " : { " s c h e m a s " : { " D i s c o v e r y R e q u e s t " : { " p r o p e r t i e s " : { " q u e r y " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " Q u e r y " , " d e s c r i p t i o n " : " S M I L E S , F A S T A , o r n a t u r a l l a n g u a g e q u e r y " } , " s e a r c h _ t y p e " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " S e a r c h T y p e " , " d e s c r i p t i o n " : " s i m i l a r i t y | b i n d i n g | p r o p e r t i e s " , " d e f a u l t " : " s i m i l a r i t y " } , " d a t a b a s e " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " D a t a b a s e " , " d e s c r i p t i o n " : " T a r g e t d a t a b a s e " , " d e f a u l t " : " a l l " } , " l i m i t " : { " t y p e " : " i n t e g e r " , " m a x i m u m " : 1 0 0 . 0 , " m i n i m u m " : 1 . 0 , " t i t l e " : " L i m i t " , " d e f a u l t " : 1 0 } } , " t y p e " : " o b j e c t " , " r e q u i r e d " : [ " q u e r y " ] , " t i t l e " : " D i s c o v e r y R e q u e s t " , " d e s c r i p t i o n " : " R e q u e s t f o r d r u g d i s c o v e r y p i p e l i n e . " } , " G e n e r a t e R e q u e s t " : { " p r o p e r t i e s " : { " p r o m p t " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " P r o m p t " , " d e s c r i p t i o n " : " T e x t d e s c r i p t i o n o f d e s i r e d m o l e c u l e " } , " m o d e " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " M o d e " , " d e s c r i p t i o n " : " G e n e r a t i o n m o d e : t e x t , m u t a t e , s c a f f o l d " , " d e f a u l t " : " t e x t " } , " s m i l e s " : { " a n y O f " : [ { " t y p e " : " s t r i n g " } , { " t y p e " : " n u l l " } ] , " t i t l e " : " S m i l e s " , " d e s c r i p t i o n " : " S e e d S M I L E S f o r m u t a t e / s c a f f o l d m o d e " } , " n u m _ s a m p l e s " : { " t y p e " : " i n t e g e r " , " m a x i m u m " : 5 0 . 0 , " m i n i m u m " : 1 . 0 , " t i t l e " : " N u m S a m p l e s " , " d e s c r i p t i o n " : " N u m b e r o f m o l e c u l e s t o g e n e r a t e " , " d e f a u l t " : 5 } } , " t y p e " : " o b j e c t " , " r e q u i r e d " : [ " p r o m p t " ] , " t i t l e " : " G e n e r a t e R e q u e s t " , " d e s c r i p t i o n " : " R e q u e s t f o r m o l e c u l e g e n e r a t i o n . " } , " H T T P V a l i d a t i o n E r r o r " : { " p r o p e r t i e s " : { " d e t a i l " : { " i t e m s " : { " $ r e f " : " # / c o m p o n e n t s / s c h e m a s / V a l i d a t i o n E r r o r " } , " t y p e " : " a r r a y " , " t i t l e " : " D e t a i l " } } , " t y p e " : " o b j e c t " , " t i t l e " : " H T T P V a l i d a t i o n E r r o r " } , " H e a l t h R e s p o n s e " : { " p r o p e r t i e s " : { " s t a t u s " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " S t a t u s " } , " v e r s i o n " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " V e r s i o n " } , " t i m e s t a m p " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " T i m e s t a m p " } } , " t y p e " : " o b j e c t " , " r e q u i r e d " : [ " s t a t u s " , " v e r s i o n " , " t i m e s t a m p " ] , " t i t l e " : " H e a l t h R e s p o n s e " , " d e s c r i p t i o n " : " H e a l t h c h e c k r e s p o n s e . " } , " H y b r i d S e a r c h R e q u e s t " : { " p r o p e r t i e s " : { " q u e r y " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " Q u e r y " , " d e s c r i p t i o n " : " V e c t o r s e a r c h q u e r y " } , " k e y w o r d s " : { " i t e m s " : { " t y p e " : " s t r i n g " } , " t y p e " : " a r r a y " , " t i t l e " : " K e y w o r d s " , " d e s c r i p t i o n " : " K e y w o r d s t o m a t c h " } , " m o d a l i t y " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " M o d a l i t y " , " d e f a u l t " : " t e x t " } , " c o l l e c t i o n " : { " a n y O f " : [ { " t y p e " : " s t r i n g " } , { " t y p e " : " n u l l " } ] , " t i t l e " : " C o l l e c t i o n " } , " t o p _ k " : { " t y p e " : " i n t e g e r " , " m a x i m u m " : 1 0 0 . 0 , " m i n i m u m " : 1 . 0 , " t i t l e " : " T o p K " , " d e f a u l t " : 2 0 } , " v e c t o r _ w e i g h t " : { " t y p e " : " n u m b e r " , " m a x i m u m " : 1 . 0 , " m i n i m u m " : 0 . 0 , " t i t l e " : " V e c t o r W e i g h t " , " d e f a u l t " : 0 . 7 } } , " t y p e " : " o b j e c t " , " r e q u i r e d " : [ " q u e r y " , " k e y w o r d s " ] , " t i t l e " : " H y b r i d S e a r c h R e q u e s t " , " d e s c r i p t i o n " : " R e q u e s t f o r h y b r i d v e c t o r + k e y w o r d s e a r c h . " } , " I n g e s t R e q u e s t " : { " p r o p e r t i e s " : { " c o n t e n t " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " C o n t e n t " } , " m o d a l i t y " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " M o d a l i t y " , " d e s c r i p t i o n " : " s m i l e s | p r o t e i n | t e x t " , " d e f a u l t " : " s m i l e s " } , " m e t a d a t a " : { " a n y O f " : [ { " a d d i t i o n a l P r o p e r t i e s " : t r u e , " t y p e " : " o b j e c t " } , { " t y p e " : " n u l l " } ] , " t i t l e " : " M e t a d a t a " } } , " t y p e " : " o b j e c t " , " r e q u i r e d " : [ " c o n t e n t " ] , " t i t l e " : " I n g e s t R e q u e s t " , " d e s c r i p t i o n " : " R e q u e s t t o i n g e s t d a t a i n t o v e c t o r D B . " } , " P r e d i c t R e q u e s t " : { " p r o p e r t i e s " : { " d r u g _ s m i l e s " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " D r u g S m i l e s " , " d e s c r i p t i o n " : " S M I L E S s t r i n g o f d r u g " } , " t a r g e t _ s e q u e n c e " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " T a r g e t S e q u e n c e " , " d e s c r i p t i o n " : " P r o t e i n s e q u e n c e ( F A S T A ) " } } , " t y p e " : " o b j e c t " , " r e q u i r e d " : [ " d r u g _ s m i l e s " , " t a r g e t _ s e q u e n c e " ] , " t i t l e " : " P r e d i c t R e q u e s t " , " d e s c r i p t i o n " : " R e q u e s t f o r D T I p r e d i c t i o n . " } , " R a n k R e q u e s t " : { " p r o p e r t i e s " : { " c a n d i d a t e s " : { " i t e m s " : { " a d d i t i o n a l P r o p e r t i e s " : t r u e , " t y p e " : " o b j e c t " } , " t y p e " : " a r r a y " , " t i t l e " : " C a n d i d a t e s " , " d e s c r i p t i o n " : " C a n d i d a t e s w i t h s c o r e s " } , " w e i g h t s " : { " a n y O f " : [ { " a d d i t i o n a l P r o p e r t i e s " : { " t y p e " : " n u m b e r " } , " t y p e " : " o b j e c t " } , { " t y p e " : " n u l l " } ] , " t i t l e " : " W e i g h t s " , " d e s c r i p t i o n " : " C u s t o m s c o r e w e i g h t s " } , " t o p _ k " : { " a n y O f " : [ { " t y p e " : " i n t e g e r " } , { " t y p e " : " n u l l " } ] , " t i t l e " : " T o p K " , " d e s c r i p t i o n " : " R e t u r n t o p K c a n d i d a t e s " } } , " t y p e " : " o b j e c t " , " r e q u i r e d " : [ " c a n d i d a t e s " ] , " t i t l e " : " R a n k R e q u e s t " , " d e s c r i p t i o n " : " R e q u e s t f o r c a n d i d a t e r a n k i n g . " } , " S e a r c h R e q u e s t " : { " p r o p e r t i e s " : { " q u e r y " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " Q u e r y " } , " t y p e " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " T y p e " } , " l i m i t " : { " t y p e " : " i n t e g e r " , " t i t l e " : " L i m i t " , " d e f a u l t " : 2 0 } } , " t y p e " : " o b j e c t " , " r e q u i r e d " : [ " q u e r y " , " t y p e " ] , " t i t l e " : " S e a r c h R e q u e s t " } , " V a l i d a t e R e q u e s t " : { " p r o p e r t i e s " : { " s m i l e s " : { " i t e m s " : { " t y p e " : " s t r i n g " } , " t y p e " : " a r r a y " , " t i t l e " : " S m i l e s " , " d e s c r i p t i o n " : " L i s t o f S M I L E S t o v a l i d a t e " } , " c h e c k _ l i p i n s k i " : { " t y p e " : " b o o l e a n " , " t i t l e " : " C h e c k L i p i n s k i " , " d e s c r i p t i o n " : " C h e c k L i p i n s k i R u l e o f 5 " , " d e f a u l t " : t r u e } , " c h e c k _ a d m e t " : { " t y p e " : " b o o l e a n " , " t i t l e " : " C h e c k A d m e t " , " d e s c r i p t i o n " : " C h e c k A D M E T p r o p e r t i e s " , " d e f a u l t " : t r u e } , " c h e c k _ a l e r t s " : { " t y p e " : " b o o l e a n " , " t i t l e " : " C h e c k A l e r t s " , " d e s c r i p t i o n " : " C h e c k s t r u c t u r a l a l e r t s " , " d e f a u l t " : t r u e } } , " t y p e " : " o b j e c t " , " r e q u i r e d " : [ " s m i l e s " ] , " t i t l e " : " V a l i d a t e R e q u e s t " , " d e s c r i p t i o n " : " R e q u e s t f o r m o l e c u l e v a l i d a t i o n . " } , " V a l i d a t i o n E r r o r " : { " p r o p e r t i e s " : { " l o c " : { " i t e m s " : { " a n y O f " : [ { " t y p e " : " s t r i n g " } , { " t y p e " : " i n t e g e r " } ] } , " t y p e " : " a r r a y " , " t i t l e " : " L o c a t i o n " } , " m s g " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " M e s s a g e " } , " t y p e " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " E r r o r T y p e " } } , " t y p e " : " o b j e c t " , " r e q u i r e d " : [ " l o c " , " m s g " , " t y p e " ] , " t i t l e " : " V a l i d a t i o n E r r o r " } , " W o r k f l o w R e q u e s t " : { " p r o p e r t i e s " : { " q u e r y " : { " t y p e " : " s t r i n g " , " t i t l e " : " Q u e r y " , " d e s c r i p t i o n " : " T e x t d e s c r i p t i o n o f d e s i r e d m o l e c u l e " } , " n u m _ c a n d i d a t e s " : { " t y p e " : " i n t e g e r " , " m a x i m u m " : 5 0 . 0 , " m i n i m u m " : 1 . 0 , " t i t l e " : " N u m C a n d i d a t e s " , " d e s c r i p t i o n " : " N u m b e r o f c a n d i d a t e s t o g e n e r a t e " , " d e f a u l t " : 1 0 } , " t o p _ k " : { " t y p e " : " i n t e g e r " , " m a x i m u m " : 2 0 . 0 , " m i n i m u m " : 1 . 0 , " t i t l e " : " T o p K " , " d e s c r i p t i o n " : " N u m b e r o f t o p c a n d i d a t e s t o r e t u r n " , " d e f a u l t " : 5 } } , " t y p e " : " o b j e c t " , " r e q u i r e d " : [ " q u e r y " ] , " t i t l e " : " W o r k f l o w R e q u e s t " , " d e s c r i p t i o n " : " R e q u e s t f o r f u l l d i s c o v e r y w o r k f l o w . " } } } } | |