webiacademic's picture
Fix: application vit attention map
26db8b7
Raw
History Blame Contribute Delete
9.86 kB
import gradio as gr
import torch
import torch.nn as nn
import numpy as np
from PIL import Image
import matplotlib.cm as cm
from transformers import AutoModelForImageClassification, AutoConfig
import torchvision.transforms as T
# ── Configuración ──────────────────────────────────────────────────────────────
CLASES = ["Glioma", "Meningioma", "No Tumor", "Pituitario"]
N_CLASES = 4
IMG_SIZE = 224
MEDIA = [0.485, 0.456, 0.406]
DESV = [0.229, 0.224, 0.225]
DEVICE = torch.device("cuda" if torch.cuda.is_available() else "cpu")
# Repositorios del usuario en Hugging Face
HF_REPO_VIT = "webiacademic/brain-tumor-vit"
HF_REPO_CONVNEXT = "webiacademic/brain-tumor-convnext"
# ── Transformación de entrada ──────────────────────────────────────────────────
transform = T.Compose([
T.Resize((IMG_SIZE, IMG_SIZE)),
T.ToTensor(),
T.Normalize(mean=MEDIA, std=DESV),
])
# ── Carga de modelos desde Hugging Face ─────────────────────────────────────────
print("Cargando modelos desde el Hub...")
# Cargamos ViT directamente desde tu repositorio
# Cargamos ViT directamente desde tu repositorio
modelo_vit = AutoModelForImageClassification.from_pretrained(
HF_REPO_VIT,
attn_implementation="eager" # <-- ¡ESTA ES LA CLAVE!
)
modelo_vit = modelo_vit.to(DEVICE).eval()
# Cargamos ConvNeXt directamente desde tu repositorio
modelo_convnext = AutoModelForImageClassification.from_pretrained(HF_REPO_CONVNEXT)
modelo_convnext = modelo_convnext.to(DEVICE).eval()
print("Modelos cargados con éxito.")
# ── Grad-CAM ───────────────────────────────────────────────────────────────────
class GradCAM:
def __init__(self, modelo, capa):
self.activaciones = None
self.gradientes = None
self._fwd = capa.register_forward_hook(
lambda m, i, o: setattr(self, "activaciones", o.detach())
)
self._bwd = capa.register_full_backward_hook(
lambda m, gi, go: setattr(self, "gradientes", go[0].detach())
)
def calcular(self, tensor, clase_idx):
pesos = self.gradientes.mean(dim=[0, 2, 3])
mapa = sum(p * a for p, a in zip(pesos, self.activaciones[0]))
mapa = torch.relu(mapa).cpu().numpy()
if mapa.max() > 0:
mapa = (mapa - mapa.min()) / (mapa.max() - mapa.min() + 1e-8)
return mapa
def liberar(self):
self._fwd.remove()
self._bwd.remove()
def attention_rollout(modelo, imagen_tensor):
"""
Calcula el mapa de atención por Attention Rollout de forma segura
y limpia para evitar mapas vacíos o grises.
"""
try:
modelo.eval()
# Forzar al modelo a devolver las matrices de atención
with torch.no_grad():
outputs = modelo(
imagen_tensor.unsqueeze(0).to(DEVICE),
output_attentions=True
)
atenciones = outputs.attentions
if atenciones is None:
print("El modelo no devolvió las atenciones.")
return None
# Clonamos y pasamos a CPU inmediatamente para asegurar estabilidad numérica
n_tokens = atenciones[0].shape[-1]
rollout = torch.eye(n_tokens, dtype=torch.float32)
# Replicamos el algoritmo exacto de tu entrenamiento en CPU
for att in atenciones:
# Quitamos gradientes, enviamos a cpu y promediamos las cabezas (dim=1)
att_media = att.detach().cpu().mean(dim=1)[0]
# Añadir conexiones residuales
att_media = att_media + torch.eye(n_tokens)
# Renormalizar filas
att_media = att_media / att_media.sum(dim=-1, keepdim=True)
# Multiplicación acumulativa (Rollout)
rollout = torch.matmul(att_media, rollout)
# Extraer atención del token CLS (0) hacia los parches (1 en adelante)
mapa = rollout[0, 1:]
# Cambiar el tamaño lineal a la cuadrícula de 14x14
mapa = mapa.reshape(14, 14).numpy()
# Evitar división por cero si el mapa es uniforme
rango = mapa.max() - mapa.min()
if rango < 1e-8:
return np.zeros((14, 14))
# Normalizar estrictamente entre 0 y 1
mapa = (mapa - mapa.min()) / rango
return mapa
except Exception as e:
print(f"Error crítico en Attention Rollout: {e}")
return None
def superponer_mapa(img_np, mapa_raw, size):
mapa_pil = Image.fromarray((mapa_raw * 255).astype(np.uint8)).resize(
(size, size), Image.BILINEAR
)
mapa_rgb = cm.jet(np.array(mapa_pil) / 255.0)[:, :, :3]
overlay = (0.55 * img_np + 0.45 * mapa_rgb).clip(0, 1)
return (overlay * 255).astype(np.uint8)
# ── Función principal de inferencia ───────────────────────────────────────────
def clasificar(imagen_pil: Image.Image):
if imagen_pil is None:
return {}, {}, None, None
imagen_pil = imagen_pil.convert("RGB")
tensor = transform(imagen_pil)
img_np = np.array(imagen_pil.resize((IMG_SIZE, IMG_SIZE))) / 255.0
# ── ViT: inferencia + Attention Rollout ───────────────────────────────────
with torch.no_grad():
logits_vit = modelo_vit(tensor.unsqueeze(0).to(DEVICE)).logits
probs_vit = torch.softmax(logits_vit, dim=1)[0].cpu().numpy()
mapa_vit = attention_rollout(modelo_vit, tensor)
img_vit = superponer_mapa(img_np, mapa_vit, IMG_SIZE) if mapa_vit is not None else (img_np * 255).astype(np.uint8)
# ── ConvNeXt: inferencia + Grad-CAM ───────────────────────────────────────
capa_obj = modelo_convnext.convnext.encoder.stages[-1].layers[-1]
gcam = GradCAM(modelo_convnext, capa_obj)
tensor_req = tensor.unsqueeze(0).to(DEVICE).requires_grad_(True)
logits_cnx = modelo_convnext(tensor_req).logits
probs_cnx = torch.softmax(logits_cnx, dim=1)[0].detach().cpu().numpy()
pred_cnx = int(probs_cnx.argmax())
modelo_convnext.zero_grad()
logits_cnx[0, pred_cnx].backward()
mapa_cnx = gcam.calcular(tensor_req, pred_cnx)
gcam.liberar()
img_cnx = superponer_mapa(img_np, mapa_cnx, IMG_SIZE)
# ── Formatear salidas para Gradio ─────────────────────────────────────────
out_vit = {CLASES[i]: float(probs_vit[i]) for i in range(N_CLASES)}
out_cnx = {CLASES[i]: float(probs_cnx[i]) for i in range(N_CLASES)}
return out_vit, out_cnx, Image.fromarray(img_vit), Image.fromarray(img_cnx)
# ── Interfaz Gradio ────────────────────────────────────────────────────────────
CSS = """
#titulo { text-align: center; font-size: 1.3em; font-weight: 700; color: #1a3a5c; margin-bottom: 4px; }
#subtitulo { text-align: center; color: #555; margin-bottom: 16px; font-size: 0.95em; }
.label-vit { color: #4f81bd !important; font-weight: 600; }
.label-cnx { color: #1a3a5c !important; font-weight: 600; }
"""
DESCRIPCION = """
Sube una imagen de resonancia magnética (MRI) cerebral y compara en tiempo real
la predicción de **ViT** (Vision Transformer) y **ConvNeXt**, junto con sus
mapas de interpretabilidad (Attention Rollout y Grad-CAM).
**Clases:** Glioma · Meningioma · No Tumor · Tumor Pituitario
"""
EJEMPLOS_INFO = """
> **Nota:** Para mejores resultados usa imágenes MRI en escala de grises,
> preferiblemente con contraste (CE-MRI). El modelo fue entrenado con el
> [Brain Tumor MRI Dataset](https://www.kaggle.com/datasets/masoudnickparvar/brain-tumor-mri-dataset).
"""
with gr.Blocks(css=CSS, theme=gr.themes.Soft()) as demo:
gr.Markdown("# Clasificación de Tumores Cerebrales en MRI", elem_id="titulo")
gr.Markdown(DESCRIPCION, elem_id="subtitulo")
with gr.Row():
with gr.Column(scale=1):
imagen_entrada = gr.Image(
type="pil",
label="Imagen MRI de entrada",
height=280,
)
btn = gr.Button("🔍 Clasificar", variant="primary", size="lg")
gr.Markdown(EJEMPLOS_INFO)
with gr.Column(scale=2):
with gr.Row():
with gr.Column():
gr.Markdown("### ViT — Vision Transformer", elem_classes="label-vit")
probs_vit = gr.Label(num_top_classes=4, label="Probabilidades por clase")
mapa_vit = gr.Image(label="Attention Rollout", height=220)
with gr.Column():
gr.Markdown("### ConvNeXt", elem_classes="label-cnx")
probs_cnx = gr.Label(num_top_classes=4, label="Probabilidades por clase")
mapa_cnx = gr.Image(label="Grad-CAM", height=220)
btn.click(
fn=clasificar,
inputs=[imagen_entrada],
outputs=[probs_vit, probs_cnx, mapa_vit, mapa_cnx],
)
gr.Markdown("""
---
**Proyecto final — Deep Learning (1INF52) · PUCP · 2026-1**
Modelos: `google/vit-base-patch16-224` · `facebook/convnext-base-224` · Fine-tuning
""")
demo.launch()