diff --git "a/data/archiveII/archiveII.lst" "b/data/archiveII/archiveII.lst" deleted file mode 100644--- "a/data/archiveII/archiveII.lst" +++ /dev/null @@ -1,3966 +0,0 @@ -data/archiveII/RNaseP_CPB80.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-coelicolor-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Chlo.tepi._TRW-194439_1-404.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000122-Codium_fragile-3133-Gly-UCC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Ther.neap._TRW-309803_1-357.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.hollandica.bpseq -data/archiveII/5s_Farysia-thuemenii-1.bpseq -data/archiveII/5s_Lycoperdon-pyriforme-1.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudomonas-syringae-3.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221932.102-549.bpseq -data/archiveII/5s_Xanthomonas-oryzae-1.bpseq -data/archiveII/5s_Renobacter-vaculatum-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_T.tumescens.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000095-Drosophila_melanogaster-7227-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/srp_Shew.putr._CP000681.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000395-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Ser-GCU.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-cerealis-6.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A3355.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000373-Triticum_aestivum-4565-Arg-ICG.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Acti.naes._TRW-240017_1-371.bpseq -data/archiveII/srp_Toxo.gond._GSP-398031.bpseq -data/archiveII/srp_Sino.medi._CP000738.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000566-Homo_sapiens-9606-Tyr-9PA.bpseq -data/archiveII/5s_Methanococcus-voltae-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000370-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Arg-1CU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000363-Ascaris_suum-6253-Arg-PCU.bpseq -data/archiveII/tmRNA_List.inno._TRW-1642-2_1-370.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPB75.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P126.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000484-Escherichia_coli-562-Trp-CCA.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-purpureus-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000372-Triticum_aestivum-4565-Arg-CCG.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-parahaemolyticus-4.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-roseoverticillatus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Oryz.sati._AC079888.bpseq -data/archiveII/srp_Anop.gamb._SDB-377271.bpseq -data/archiveII/srp_Meth.ther._AE000666.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-cerealis-2.bpseq -data/archiveII/srp_Salm.ente._AE017220.bpseq -data/archiveII/5s_Agrobacterium-tumefaciens-2.bpseq -data/archiveII/5s_Enterococcus-faecalis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Dani.reri._EH487580.bpseq -data/archiveII/RNaseP_B.burgdorferi-g.bpseq -data/archiveII/5s_Thermoplasma-acidophilum-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000338-Tetrahymena_thermophila-5911-Gln-JUA.bpseq -data/archiveII/srp_Lyco.escu._Z29260.bpseq -data/archiveII/5s_Haloferax-volcanii-3.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Xyle.fast._AE003849_1-355.bpseq -data/archiveII/5s_Paenibacillus-popilliae-1.bpseq -data/archiveII/srp_Chro.viol._AE016918.bpseq -data/archiveII/5s_Xanthomonas-axonopodis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-lunulosporum-2.bpseq -data/archiveII/srp_Chla.trac._CP000051.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Acid.caps._TRW-240015_1-352.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Yers.fred._TRW-349966_1-363.bpseq -data/archiveII/srp_Chla.rein._SDB-3055.bpseq -data/archiveII/RNaseP_H.aurantiacus.bpseq -data/archiveII/5s_Itersonilia-perplexans-1.bpseq -data/archiveII/srp_Lact.john._AE017198.bpseq -data/archiveII/srp_Halo.spec._AE004437.bpseq -data/archiveII/16s_M.polymorpha_domain1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.diphtheriae.bpseq -data/archiveII/5s_Erwinia-carotovora-2.bpseq -data/archiveII/5s_Mycobacterium-bovis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.dono._AY781793.bpseq -data/archiveII/5s_Medicago-sativa-1.bpseq -data/archiveII/5s_Euglena-gracilis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Eurypelma-californica-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Shew.spec._CP000446_1-355.bpseq -data/archiveII/5s_Erwinia-carotovora-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Gemm.obsc._TRW-214688_1-412.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.aure._BX571856.bpseq -data/archiveII/srp_Ther.elon._BA000039.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Salm.ente._AE014613_1-363.bpseq -data/archiveII/5s_Planctomyces-brasiliensis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Batrachospermum-ectocarpum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Araneus-diadematus-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000397-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Ser-UGA.bpseq -data/archiveII/srp_Bruc.meli._AE009624.bpseq -data/archiveII/5s_Anaplasma-phagocytophilum-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.marinus-2.bpseq -data/archiveII/srp_Thal.pseu._GSP-296543.bpseq -data/archiveII/5s_Bacteroides-thetaiotaomicron-1.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221923.106-554.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Nocardiodes-NSP41.bpseq -data/archiveII/5s_Rhodopirellula-baltica-1.bpseq -data/archiveII/5s_Saccharopolyspora-gregorii-1.bpseq -data/archiveII/5s_Acidiphilium-cryptum-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Clos.diff._TRW-367459_1-350.bpseq -data/archiveII/5s_Bifidobacterium-longum-3.bpseq -data/archiveII/5s_Pedobacter-heparinus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Candidatus-Tremblaya-princeps-2.bpseq -data/archiveII/srp_Haem.ducr._AE017143.bpseq -data/archiveII/srp_Chlo.tepi._AE006470.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A5888.bpseq -data/archiveII/srp_Chla.pneu._AE001624.bpseq -data/archiveII/5s_Mycobacterium-smegmatis-3.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000560-Lupinus_luteus-3873-Tyr-GPA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000099-Mus_musculus-10090-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/RNaseP_LGW116.bpseq -data/archiveII/RNaseP_ESH21b-4.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000561-Nicotiana_rustica-4093-Tyr-GPA.bpseq -data/archiveII/5s_Bacteroides-fragilis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Lact.john._AX926712.bpseq -data/archiveII/5s_Rana-pipiens-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000336-Aedes_albopictus-7160-Gln-NUG.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000588-Aeropyrum_pernix-56636-Asp-GUC.bpseq -data/archiveII/srp_Prun.arme._CB819242.bpseq -data/archiveII/5s_Akkesiphycus-lubricum-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000278-Scenedesmus_obliquus-3088-Met-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Paracoccus-denitrificans-2.bpseq -data/archiveII/srp_Anop.gamb._CD747410.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Onchorhynchus-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000174-Mus_musculus-10090-Ile-IAU.bpseq -data/archiveII/5s_Haloarcula-marismortui-2.bpseq -data/archiveII/srp_Lyco.escu._X13958.bpseq -data/archiveII/5s_Methanothermobacter-thermautotrophicus-2.bpseq -data/archiveII/5s_Kibdelosporangium-aridum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-lunulosporum-7.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000351-Haloferax_volcanii-2246-Arg-NCG.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-coelicolor-3.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-natriegens-1.bpseq -data/archiveII/5s_Rhodococcus-fascians-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000565-Bos_taurus-9913-Tyr-9PA.bpseq -data/archiveII/5s_Tilletiaria-anomala-1.bpseq -data/archiveII/5s_Burkholderia-pseudomallei-1.bpseq -data/archiveII/5s_Ephedra-kokanica-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.pneu._TRW-216600_1-348.bpseq -data/archiveII/5s_Drosophila-takahashii-1.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-cerealis-4.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.arth._TRW-243272_1-394.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000348-Halobacterium_salinarum-2242-Arg-GCG.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.pulm._U06833.bpseq -data/archiveII/5s_Fusobacterium-nucleatum-5.bpseq -data/archiveII/srp_Rhod.rubr._CP000230.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000236-Neurospora_crassa-5141-Leu-UAG.bpseq -data/archiveII/5s_Fusobacterium-nucleatum-4.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-cholerae-3.bpseq -data/archiveII/5s_Comamonas-terrigena-2.bpseq -data/archiveII/5s_Thermococcus-celer-1.bpseq -data/archiveII/5s_Salmonella-typhimurium-3.bpseq -data/archiveII/srp_Tetr.ther._X56981.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-parahaemolyticus-6.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000544-Bacillus_subtilis-1423-Tyr-QUA.bpseq -data/archiveII/5s_Streptococcus-thermophilus-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Haem.infl._CP000057_1-366.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000447-Halobacterium_salinarum-2242-Val-CAC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Xyle.fast._AE004078_1-355.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.myco._BX842642.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Heli.pylo._AE000590_1-383.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Nitr.euro._BX321865_1-360.bpseq -data/archiveII/5s_Actinia-equina-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.capr._D13067_1-411.bpseq -data/archiveII/srp_Crit.fasc._AY781797.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-megaterium-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Acid.ferr._TRW-243159_1-364.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.syno._AE017245.bpseq -data/archiveII/5s_Gelidium-amansii-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000313-Haloferax_volcanii-2246-Pro-UGG.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.capr._CP000123.bpseq -data/archiveII/5s_Geobacillus-stearothermophilus-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Geob.meta._CP000148_1-356.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.pneu._CP000410.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000345-Homo_sapiens-9606-Gln-NUG.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stap.epid._AF375586_1-311.bpseq -data/archiveII/5s_Xenopus-borealis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Acidovorax-facilis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Trop.whip._AE016852.bpseq -data/archiveII/5s_Neurospora-intermedia-3.bpseq -data/archiveII/5s_Mycobacterium-tuberculosis-3.bpseq -data/archiveII/srp_Enta.mosh._GSP-41668.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-coelicolor-1.bpseq -data/archiveII/5s_Coemansia-mojavensis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._AL627171.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.fulgidus.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000135-Homo_sapiens-9606-Gly-CCC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Shew.amaz._CP000507_1-356.bpseq -data/archiveII/5s_Pichia-jadinii-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.tube._TRW-1773_1-368.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-sp.-1.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.brev._D14472.bpseq -data/archiveII/RNaseP_LGA6.bpseq -data/archiveII/5s_Haloferax-volcanii-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000385-Mycoplasma_capricolum-2095-Ser-UGA.bpseq -data/archiveII/5s_Sepia-officinalis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-lunulosporum-8.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000350-Haloferax_volcanii-2246-Arg-GCG.bpseq -data/archiveII/srp_Meso.flor._AE017263.bpseq -data/archiveII/5s_Bacteroides-fragilis-6.bpseq -data/archiveII/5s_Esch_coli5B.bpseq -data/archiveII/RNaseP_H.volcanii.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._BE083383.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Nostoc-PCC7107.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudonocardia-hydrocarbonoxydans-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000428-Homo_sapiens-9606-Ser-UGA.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPB149.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Haem.infl._AY599475_1-366.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.aerogenes.bpseq -data/archiveII/23s_T.thermophilus_domain3.bpseq -data/archiveII/srp_Yers.pest._AJ414155.bpseq -data/archiveII/5s_Saccharomonospora-cyanea-1.bpseq -data/archiveII/srp_Gynu.aura._SDB-109565.bpseq -data/archiveII/5s_Flexibacter-sp.-1.bpseq -data/archiveII/5s_Ectothiorhodospira-shaposhnikovii-1.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._BU566906.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000360-Codium_fragile-3133-Arg-ICG.bpseq -data/archiveII/srp_Sacc.mika._BN000249.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221928.95-476.bpseq -data/archiveII/srp_Arab.tha._X55111.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000167-Aedes_albopictus-7160-Ile-GAU.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Prop.acne._TRW-1747-2_1-353.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.spec._CP000518.bpseq -data/archiveII/5s_Clostridium-acetobutylicum-5.bpseq -data/archiveII/RNaseP_purpleX.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.sporogenes.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.pyog._CP000260.bpseq -data/archiveII/5s_Rhodococcus-rhodochrous-1.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-pseudograminearum-7.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.flocculare.bpseq -data/archiveII/5s_Agrobacterium-tumefaciens-1.bpseq -data/archiveII/srp_Meth.mari._CP000609.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-thuringiensis-3.bpseq -data/archiveII/srp_Sene.crue._SDB-189209.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-cereus-5.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000287-Oryctolagus_cuniculus-9986-Met-BAU.bpseq -data/archiveII/5s_Starkeya-novella-1.bpseq -data/archiveII/srp_Esch.coli._U00096.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Fran.tula._AM233362_1-421.bpseq -data/archiveII/5s_Plagiomnium-trichomanes-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Fran.tula._AJ749949_1-421.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000541-Haloferax_volcanii-2246-Tyr-GUA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000249-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Leu-CAA.bpseq -data/archiveII/5s_Saccharopolyspora-hordei-1.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.dono._AY722733.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.braz._SDB-87235.bpseq -data/archiveII/srp_Syne.spec._CP000097.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000108-Haloferax_volcanii-2246-Gly-GCC.bpseq -data/archiveII/RNaseP_V.cholera.bpseq -data/archiveII/srp_Rhod.palu._CP000283.bpseq -data/archiveII/5s_Mytilus-edulis-2.bpseq -data/archiveII/5s_Hyphodontia-paradoxa-1.bpseq -data/archiveII/srp_Ajel.caps._CV620298.bpseq -data/archiveII/5s_Wigglesworthia-glossinidia-1.bpseq -data/archiveII/srp_Vibr.para._BA000031.bpseq -data/archiveII/srp_Bras.napu._EE537348.bpseq -data/archiveII/srp_Plas.berg._GSP-5823.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000197-Rattus_norvegicus-10116-Lys-3UU.bpseq -data/archiveII/srp_Shew.deni._CP000302.bpseq -data/archiveII/srp_Bras.napu._EE411352.bpseq -data/archiveII/srp_Nitr.eutr._CP000450.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-sporotrichioides-1.bpseq -data/archiveII/5s_Saccharomonospora-azurea-1.bpseq -data/archiveII/5s_Onchocerca-volvulus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Legionella-dumoffii-1.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.gall._AE016968.bpseq -data/archiveII/5s_Protomyces-inundatus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.infa._SDB-5671.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Camp.jeju._AX048472_1-359.bpseq -data/archiveII/5s_Lycopersicon-esculentum-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.malidevorans.bpseq -data/archiveII/5s_Dicyema-misakiense-1.bpseq -data/archiveII/srp_Yers.pest._CP000668.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000117-Escherichia_coli-562-Gly-CCC.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000021-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Cys-GCA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000196-Rattus_norvegicus-10116-Lys-CUN.bpseq -data/archiveII/srp_Phot.prof._CR378666.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._X01037.bpseq -data/archiveII/5s_Candida-melibiosica-1.bpseq -data/archiveII/srp_Symb.ther._AP006840.bpseq -data/archiveII/srp_Salm.ente._AE014613.bpseq -data/archiveII/5s_Haloferax-mediterranei-2.bpseq -data/archiveII/5s_Micrococcus-luteus-4.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Pedi.pent._CP000422_1-369.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000036-Euglena_gracilis-3039-Asp-GUC.bpseq -data/archiveII/srp_Shew.onei._AE014299.bpseq -data/archiveII/srp_Rhod.palu._CP000301.bpseq -data/archiveII/5s_Rattus-norvegicus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Neis.gono._DD110233.bpseq -data/archiveII/5s_Micrococcus-luteus-2.bpseq -data/archiveII/srp_Dein.geot._CP000359.bpseq -data/archiveII/srp_Neis.meni._AM421808.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Bact.thet._AE015928_1-397.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Psyc.cryo._CP000323_1-359.bpseq -data/archiveII/16s_B.burgdorferi_domain3.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.caesia-SB22.bpseq -data/archiveII/5s_Gnetum-gnemon-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Nost.punc._TRW-63737_1-390.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000547-Geobacillus_stearothermophilus-1422-Tyr-QUA.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-thuringiensis-4.bpseq -data/archiveII/srp_Hist.caps._GSP-278162.bpseq -data/archiveII/5s_Erythromicrobium-hydrolyticum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Saccharomyces-cerevisiae-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.pyog._TRW-1314-1_1-348.bpseq -data/archiveII/grp1_b.I1.e.T.thermophila.C1.LSU.1925.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-asiaticum-3.bpseq -data/archiveII/5s_Chordaria-flagelliformis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Tinca-tinca-2.bpseq -data/archiveII/srp_Shew.balt._CP000563.bpseq -data/archiveII/srp_Medi.trun._AC136507-1.bpseq -data/archiveII/srp_Plas.yoel._GSP-352914.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000098-Xenopus_laevis-8355-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/srp_Medi.trun._AC136507-2.bpseq -data/archiveII/5s_Zea-mays-1.bpseq -data/archiveII/srp_Schi.pomb._AU010514.bpseq -data/archiveII/5s_Caenorhabditis-elegans-1.bpseq -data/archiveII/srp_Pseu.aeru._CP000744.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Saccharomonospora-K180.bpseq -data/archiveII/5s_Hydrurus-foetidus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Bloc.flor._BX248583.bpseq -data/archiveII/5s_Myxococcus-coralloides-1.bpseq -data/archiveII/5s_Rhodospirillum-rubrum-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000078-Ascaris_suum-6253-Phe-GAA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000516-Spinacia_oleracea-3562-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/srp_Meth.acet._AE010299.bpseq -data/archiveII/srp_Ther.cele._X17240.bpseq -data/archiveII/RNaseP_WB3.bpseq -data/archiveII/srp_Medi.trun._BE941271.bpseq -data/archiveII/5s_Mycobacterium-bovis-2.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.pyog._BA000034.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Desu.psyc._CR522870_1-366.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000173-Bombyx_mori-7091-Ile-IAU.bpseq -data/archiveII/5s_Lactococcus-lactis-5.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A2743.bpseq -data/archiveII/srp_Zea.mays._CK327537.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Mxa1.bpseq -data/archiveII/srp_Ther.mari._AE000512.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000057-Hordeum_vulgare-4513-Glu-CPC.bpseq -data/archiveII/srp_Schi.pomb._M20836.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Clos.perf._TRW-195102_1-361.bpseq -data/archiveII/5s_Gelidium-amansii-1.bpseq -data/archiveII/srp_Urea.parv._AE002112.bpseq -data/archiveII/tmRNA_envi.sequ._TRW-351057-3_1-355.bpseq -data/archiveII/srp_Humu.lupu._AJ236706.bpseq -data/archiveII/5s_Ganoderma-applanatum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Mycoplasma-gallisepticum-3.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000139-Mycoplasma_capricolum-2095-His-GUK.bpseq -data/archiveII/5s_Aquaspirillum-serpens-1.bpseq -data/archiveII/5s_Neisseria-meningitidis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Artemia-salina-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_T.luteus.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Oeno.oeni._TRW-203123_1-350.bpseq -data/archiveII/srp_Bos.taur._GSP-6282.bpseq -data/archiveII/5s_Mycobacterium-smegmatis-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000518-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Calanus-finmarchicus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Symbiobacterium-thermophilum-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_B.halodurans.bpseq -data/archiveII/5s_Cerastoderma-edule-1.bpseq -data/archiveII/5s_Brassica-napus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Plas.viva._GSP-31273.bpseq -data/archiveII/5s_Fusobacterium-nucleatum-1.bpseq -data/archiveII/16s_C.reinhardtii.mito_domain2.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.pyogenes.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Xyle.fast._TRW-155920_1-355.bpseq -data/archiveII/srp_Geob.sulf._AE017180.bpseq -data/archiveII/5s_Chlamydomonas-reinhardtii-2.bpseq -data/archiveII/5s_Schizosaccharomyces-pombe-4.bpseq -data/archiveII/5s_Thermotoga-sp.-2.bpseq -data/archiveII/5s_Thiomonas-cuprina-1.bpseq -data/archiveII/srp_Clos.botu._CP000726.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.sapr._AP008934.bpseq -data/archiveII/RNaseP_EM14b-11.bpseq -data/archiveII/5s_Vitreoscilla-beggiatoides-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Chla.trac._TRW-813-2_1-420.bpseq -data/archiveII/5s_Corynebacterium-diphtheriae-1.bpseq -data/archiveII/5s_Agaricus-edulis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Hyphomicrobium-vulgare-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000475-Mus_musculus-10090-Val-IAC.bpseq -data/archiveII/5s_Coxiella-burnetii-1.bpseq -data/archiveII/5s_Bufo-americanus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Phleogena-faginea-1.bpseq -data/archiveII/srp_Caen.eleg._U41993.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000019-Mycoplasma_capricolum-2095-Cys-GCA.bpseq -data/archiveII/5s_Thiomonas-perometabolis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-brasiliensis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Haemophilus-aegyptius-1.bpseq -data/archiveII/5s_Flavobacterium-hydatis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Cand.glab._CR380957.bpseq -data/archiveII/5s_Lentinula-edodes-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Ther.yell._TRW-289376_1-350.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-cerealis-9.bpseq -data/archiveII/5s_Hyphomonas-oligotropha-1.bpseq -data/archiveII/srp_Yers.pest._AE017042.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000437-Escherichia_coli-562-Thr-GGU.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Pant.stew._TRW-66269_1-363.bpseq -data/archiveII/5s_Mycoplasma-hyopneumoniae-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000330-Haloferax_volcanii-2246-Gln-MUG.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.aeth._AY722731.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-subtilis-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.typhimurium.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.truei.bpseq -data/archiveII/5s_Euplotes-octocarinatus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudomonas-denitrificans-1.bpseq -data/archiveII/srp_Lyco.escu._Z29109.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Pelo.carb._CP000142_1-358.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Yers.pest._AL590842_1-364.bpseq -data/archiveII/5s_Gymnosporangium-sabinae-1.bpseq -data/archiveII/5s_Fusobacterium-nucleatum-3.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000473-Drosophila_melanogaster-7227-Val-CAC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Syne.spec._TRW-32049_1-396.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-nodosus-2.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._BF909560.bpseq -data/archiveII/5s_Lactococcus-lactis-4.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000232-Phaseolus_vulgaris-3885-Leu-NAA.bpseq -data/archiveII/RNaseP_N.luteus.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stap.aure._BA000033_1-362.bpseq -data/archiveII/srp_Dani.reri._BX649540.bpseq -data/archiveII/5s_Salmonella-enterica-4.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-mimicus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Rickettsia-moozeri-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_N.meningtidis-MC58.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000051-Triticum_aestivum-4565-Glu-SPC.bpseq -data/archiveII/5s_Lineus-geniculatus-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Pseu.atla._CP000388_1-357.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.epid._AF269814.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000323-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Pro-NGG.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Borr.burg._AE001118_1-359.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000025-Thermus_thermophilus-274-Asp-GUC.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000144-Saccharomyces_cerevisiae-4932-His-GUG.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.T.pigmentosa.C1.LSU.1925.bpseq -data/archiveII/RNaseP_E.coli-g.bpseq -data/archiveII/16s_G.intestinalis_domain3.bpseq -data/archiveII/5s_Acanthamoeba-castellanii-1.bpseq -data/archiveII/srp_Ther.teng._AE012978.bpseq -data/archiveII/5s_Streptococcus-pyogenes-4.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000316-Bacillus_subtilis-1423-Pro-5GG.bpseq -data/archiveII/16s_P.occultum_domain3.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000386-Mycoplasma_mycoides-2102-Ser-UGA.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Fuso.nucl._AE009951_1-344.bpseq -data/archiveII/5s_Leptospira-interrogans-1.bpseq -data/archiveII/23s_E.coli_domain6.bpseq -data/archiveII/srp_Heli.pylo._AE000511.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Synechocystis-PCC6803.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000483-Bacillus_subtilis-1423-Trp-CCA.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221916.94-481.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000210-Enterobacteria_phage_T5-10726-Leu-UAG.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-subtilis-6.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.glauca-K202.bpseq -data/archiveII/RNaseP_EF.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.spec._CP000384.bpseq -data/archiveII/srp_Sili.spec._CP000377.bpseq -data/archiveII/5s_Geodermatophilus-obscurus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Erythromicrobium-ezovicum-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000064-Mycoplasma_capricolum-2095-Phe-GAA.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Bord.pert._TRW-257313_1-387.bpseq -data/archiveII/5s_Pythium-hydnosporum-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.horikoshi.bpseq -data/archiveII/5s_Artemia-sp.-1.bpseq -data/archiveII/5s_Escherichia-coli-14.bpseq -data/archiveII/5s_Methylococcus-capsulatus-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000020-Escherichia_coli-562-Cys-GCA.bpseq -data/archiveII/16s_P.staleyi_domain2.bpseq -data/archiveII/5s_Blastocladiella-simplex-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Vibr.vuln._AE016795_1-367.bpseq -data/archiveII/srp_Chla.cavi._AE015925.bpseq -data/archiveII/srp_Yers.pest._CP000305.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.C.saxonicum.C1.SSU.1506.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000444-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Thr-IGU.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-lunulosporum-10.bpseq -data/archiveII/5s_Helicobacter-pylori-3.bpseq -data/archiveII/RNaseP_T.volcanum.bpseq -data/archiveII/5s_Oceanobacillus-iheyensis-4.bpseq -data/archiveII/srp_Neph.oliv._AF137379.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.B.yamatoana.JCM2896.C1.SSU.1506.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Thal.weis._AF049491_1-348.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000001-Halobacterium_salinarum-2242-Ala-CGC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Fran.tula._AM286280_1-421.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000411-Candida_cylindracea-44322-Ser-IGA.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.unisporus.bpseq -data/archiveII/srp_Nitr.euro._AL954747.bpseq -data/archiveII/5s_Iguana-iguana-1.bpseq -data/archiveII/srp_Proc.mari._CP000552.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000465-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Val-CAC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_List.seel._AF440350_1-321.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A2135.bpseq -data/archiveII/RNaseP_N.simplex.bpseq -data/archiveII/5s_Bradyrhizobium-japonicum-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Haem.infl._L42023_1-366.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000038-Rattus_norvegicus-10116-Asp-8UC.bpseq -data/archiveII/srp_Humu.lupu._AJ236705.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Nitr.mult._CP000103_1-362.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-anthracis-4.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.cere._AE016998.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000432-Haloferax_volcanii-2246-Thr-GGU.bpseq -data/archiveII/5s_Buchnera-aphidicola-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SLC.bpseq -data/archiveII/5s_Filobasidium-floriforme-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000467-Pichia_jadinii-4903-Val-IAC.bpseq -data/archiveII/5s_Streptococcus-agalactiae-2.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.erythreum.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Salm.bong._TRW-218493_1-363.bpseq -data/archiveII/srp_Legi.pneu._CR628336.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-nereis-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Heli.must._DQ250625_1-366.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Shig.sonn._CP000038_1-363.bpseq -data/archiveII/srp_Enta.disp._GSP-370354.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-pseudograminearum-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Burk.pseu._TRW-28450_1-370.bpseq -data/archiveII/srp_Aspe.flav._GSP-332952.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Ente.faec._BD193796_1-367.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-diastaticus-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000243-Rattus_norvegicus-10116-Leu-UAG.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000494-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Trp-BCA.bpseq -data/archiveII/5s_Ustilentyloma-fluitans-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000063-Haloferax_volcanii-2246-Phe-GAA.bpseq -data/archiveII/srp_Bras.napu._EE409827.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000435-Mycoplasma_mycoides-2102-Thr-UGU.bpseq -data/archiveII/srp_Dani.reri._CR854846.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.mutans.bpseq -data/archiveII/5s_Thraustochytrium-visurgense-2.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.caesia-K200.bpseq -data/archiveII/5s_Bos-taurus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Lyco.escu._Z29106.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.versatilis.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000514-Scenedesmus_obliquus-3088-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/srp_Dich.nodo._CP000513.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000356-Escherichia_coli-562-Arg-ICG.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Meth.flag._CP000284_1-361.bpseq -data/archiveII/5s_Pedinomonas-minor-1.bpseq -data/archiveII/5s_Homo-sapiens-1.bpseq -data/archiveII/5s_Euplotes-vannus-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000252-Pichia_jadinii-4903-Leu-BAA.bpseq -data/archiveII/5s_Dipsacomyces-acuminosporus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Ehrl.cani._CP000107.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-firmus-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.pneu._AE008453_1-348.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.thur._D11412.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000191-Mesocricetus_auratus-10036-Lys-NUU.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Xant.camp._AE012247_1-397.bpseq -data/archiveII/16s_C.elegans_domain4.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-pseudograminearum-5.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.aviu._TRW-243243_1-368.bpseq -data/archiveII/srp_Nitr.wino._CP000115.bpseq -data/archiveII/srp_Acti.succ._CP000746.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Baci.cere._TRW-288681_1-355.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Rr368.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.shibatae.bpseq -data/archiveII/16s_H.volcanii_domain2.bpseq -data/archiveII/srp_Rals.sola._AL646052.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Meso.flor._AE017263_1-408.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Chro.viol._AE016825_1-365.bpseq -data/archiveII/5s_Porphyromonas-gingivalis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Caen.brig._AC084446.bpseq -data/archiveII/srp_Humu.lupu._X65983.bpseq -data/archiveII/5s_Bacteroides-fragilis-4.bpseq -data/archiveII/5s_Spirocodon-saltatrix-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Lept.inte._AE016823_1-350.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Bord.bron._TRW-257310_1-387.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.hyop._AE017243.bpseq -data/archiveII/srp_Pyro.hori._BA000001.bpseq -data/archiveII/5s_Plasmodium-falciparum-1.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.L.dispersa.UNK.SSU.1046.bpseq -data/archiveII/5s_Ascobolus-immersus-2.bpseq -data/archiveII/RNaseP_LGA8.bpseq -data/archiveII/srp_Meth.maze._AE008384.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000595-Escherichia_coli-562-Leu-BAA.bpseq -data/archiveII/srp_Ther.koda._AP006878.bpseq -data/archiveII/5s_Cellulomonas-biazotea-1.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-halodurans-4.bpseq -data/archiveII/16s_B.burgdorferi_domain4.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudomonas-putida-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Neis.meni._AE002452_1-360.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Heli.pylo._TRW-85962_1-386.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.Staurastrum.sp.M752.C1.SSU.1506.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.azurea-K161T.bpseq -data/archiveII/srp_Kluy.yarr._479647571.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Idio.loih._AE017340_1-359.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.suis._CP000408.bpseq -data/archiveII/srp_Cory.jeik._CR931997.bpseq -data/archiveII/5s_Perkinsus-andrewsi-2.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.M.caldariorum.C1.SSU.1506.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000326-Lupinus_luteus-3873-Pro-IGG.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Rumi.albu._TRW-246199_1-354.bpseq -data/archiveII/5s_Tetrahymena-thermophila-1.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-asiaticum-4.bpseq -data/archiveII/5s_Nocardioides-albus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Cand.trop._GSP-294747.bpseq -data/archiveII/5s_Brugia-malayi-1.bpseq -data/archiveII/srp_Phyt.soja._GSP-67593.bpseq -data/archiveII/5s_Lethenteron-japonicum-2.bpseq -data/archiveII/5s_Nicotiana-tabacum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-halodurans-6.bpseq -data/archiveII/srp_Onch.volv._BF727619.bpseq -data/archiveII/RNaseP_ESH26-4.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Meth.caps._AE017282_1-356.bpseq -data/archiveII/5s_Halorubrum-distributum-5.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000103-Homo_sapiens-9606-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000431-Haloferax_volcanii-2246-Thr-CGU.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Wolbachia-sp.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Pseu.syri._CP000058_1-388.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.D.salina.C1.SSU.943.bpseq -data/archiveII/5s_Xenopus-laevis-2.bpseq -data/archiveII/5s_Chlorobium-tepidum-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_T.delbrueckii.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-griseus-1.bpseq -data/archiveII/16s_C.psittaci_domain2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Clos.acet._AE007587_1-356.bpseq -data/archiveII/tmRNA_uncu.bact._TRW-72274-2_1-359.bpseq -data/archiveII/5s_Mycoplasma-flocculare-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Woli.succ._BX571661_1-369.bpseq -data/archiveII/srp_Podo.anse._GSP-5145.bpseq -data/archiveII/5s_Cyclidiopsis-acus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Dros.erec._GSP-7220.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000066-Thermus_thermophilus-274-Phe-GAA.bpseq -data/archiveII/5s_Drosophila-mauritiana-1.bpseq -data/archiveII/5s_Alcaligenes-faecalis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.subt._X06803.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000207-Mus_musculus-10090-Lys-CUU.bpseq -data/archiveII/srp_Shew.spec._CP000444.bpseq -data/archiveII/srp_Dech.arom._CP000089.bpseq -data/archiveII/srp_Psyc.arct._CP000082.bpseq -data/archiveII/grp1_s.I1.e.T.thermophila.C1.LSU.1925.schem.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Baci.clau._AP006627_1-355.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000488-Tetrahymena_thermophila-5911-Trp-CA.bpseq -data/archiveII/srp_Lott.giga._GSP-225164.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.carlsbergensis.bpseq -data/archiveII/srp_Thei.parv._GSP-333668.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stap.aure._BX571857_1-362.bpseq -data/archiveII/5s_Shigella-flexneri-3.bpseq -data/archiveII/5s_Filobasidium-capsuligenum-1.bpseq -data/archiveII/srp_Meth.caps._AE017282.bpseq -data/archiveII/5s_Perinereis-brevicirris-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A4065.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.G.spirotaenia.C1.SSU.1506.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.myco._BX842642_1-411.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.furiosus-2.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A6090.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.trop._AY722723.bpseq -data/archiveII/RNaseP_ESH17b-7.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000009-Escherichia_coli-562-Ala-VGC.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.infa._AY781792.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-nodosus-3.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.pneu._AE000044.bpseq -data/archiveII/5s_Hyphomicrobium-sp.-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000340-Nicotiana_rustica-4093-Gln-JUG.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.P.inouyei.C1.SSU.943.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.coll._AY485228_1-386.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000510-Escherichia_coli-562-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000612-Sinorhizobium_meliloti-382-Trp-CCA.bpseq -data/archiveII/srp_Lact.acid._CP000033.bpseq -data/archiveII/srp_Syne.spec._BX569693.bpseq -data/archiveII/srp_Esch.coli._U82664.bpseq -data/archiveII/16s_P.staleyi_domain4.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000417-Nicotiana_rustica-4093-Ser-GCU.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Acid.ferr._TRW-920_1-341.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPA56.bpseq -data/archiveII/5s_Aspergillus-niger-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000003-Haloferax_volcanii-2246-Ala-GGC.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.cyanea-K168T.bpseq -data/archiveII/srp_Mono.dome._GSP-13616.bpseq -data/archiveII/srp_Humu.lupu._AJ236703.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudomonas-aeruginosa-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Chla.trac._TRW-813-1_1-420.bpseq -data/archiveII/srp_Toxo.gond._CO743022.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000587-Aeropyrum_pernix-56636-Met-CAU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000062-Homo_sapiens-9606-Glu-CUC.bpseq -data/archiveII/srp_Sacc.cere._M28116.bpseq -data/archiveII/5s_Staphylococcus-epidermidis-2.bpseq -data/archiveII/RNaseP_V.spinosum.bpseq -data/archiveII/srp_Heli.hepa._AE017149.bpseq -data/archiveII/23s_T.thermophilus_domain6.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Ente.faec._TRW-1352_1-367.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.A.capsulatus.CBS213.53.C1.SSU.943.bpseq -data/archiveII/srp_Leif.xyli._AE016822.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000403-Bos_taurus-9913-Ser-UGA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000151-Haloferax_volcanii-2246-Ile-GAU.bpseq -data/archiveII/5s_Pyrococcus-horikoshii-2.bpseq -data/archiveII/5s_Methanosarcina-mazei-1.bpseq -data/archiveII/5s_Cryptomonas-paramecium-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPB74.bpseq -data/archiveII/5s_Ascobolus-immersus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.aviu._CP000479.bpseq -data/archiveII/srp_Arth.aure._CP000474.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221936.98-540.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.obstetricans.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000542-Mycoplasma_capricolum-2095-Tyr-GUA.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Lact.acid._CP000033_1-369.bpseq -data/archiveII/srp_Burk.pseu._CP000570.bpseq -data/archiveII/5s_Brevibacterium-linens-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.vulgaris.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.mississippiensis.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000179-Bacillus_subtilis-1423-Lys-UU.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.pygmaeus.bpseq -data/archiveII/srp_Azoa.spec._CR555306.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-halodurans-3.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Aqui.aeol._TRW-63363_1-347.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000246-Bos_taurus-9913-Leu-NAA.bpseq -data/archiveII/23s_S.aureus_domain6.bpseq -data/archiveII/5s_Saccharomonospora-glauca-1.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-fischeri-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Lact.sake._AF400065_1-370.bpseq -data/archiveII/5s_Pleurotus-ostreatus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Drosophila-simulans-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.acidocaldarius.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.pumi._D11415.bpseq -data/archiveII/5s_Photobacterium-angustum-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Onchorhynchus-sp-2.bpseq -data/archiveII/srp_Wolb.endo._AE017196.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000010-Escherichia_coli-562-Ala-VGC.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.fervidus.bpseq -data/archiveII/5s_Caenorhabditis-elegans-3.bpseq -data/archiveII/5s_Spirogyra-grevilleana-1.bpseq -data/archiveII/srp_Oryz.sati._AP008207.bpseq -data/archiveII/srp_Magn.magn._AP007255.bpseq -data/archiveII/srp_Geob.ther._CP000557.bpseq -data/archiveII/srp_Buch.aphi._AE013218.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Xant.axon._AE011783_1-397.bpseq -data/archiveII/srp_Heli.acin._AM260522.bpseq -data/archiveII/5s_Shigella-flexneri-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000145-Saccharomyces_cerevisiae-4932-His-GUG.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.avium.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.circ._D11419.bpseq -data/archiveII/5s_Acholeplasma-laidlawii-2.bpseq -data/archiveII/srp_Vibr.vuln._BA000037.bpseq -data/archiveII/srp_Acin.baum._CP000521.bpseq -data/archiveII/srp_Fran.spec._CP000249.bpseq -data/archiveII/RNaseP_UK2.bpseq -data/archiveII/RNaseP_H.mobilis.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.thermoautotrophicumDH-2.bpseq -data/archiveII/5s_Dichelobacter-nodosus-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000084-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000155-Mycoplasma_mycoides-2102-Ile-GAU.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Haem.infl._TRW-262727_1-366.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000333-Escherichia_coli-562-Gln-NUG.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Thal.pseu._TRW-296543_1-344.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000228-Glycine_max-3847-Leu-BAA.bpseq -data/archiveII/5s_Thermotoga-sp.-3.bpseq -data/archiveII/srp_Meso.viri._AF166114.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-sporotrichioides-5.bpseq -data/archiveII/srp_Ther.ther._AE017221.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-anthracis-7.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SL1-1.bpseq -data/archiveII/srp_Zea.mays._AY108846.bpseq -data/archiveII/srp_Cory.glut._AP009044.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stap.aure._AC074317_1-359.bpseq -data/archiveII/srp_Halo.volc._AF395888.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000065-Bacillus_subtilis-1423-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000455-Escherichia_coli-562-Val-GAC.bpseq -data/archiveII/5s_Brevibacterium-casei-1.bpseq -data/archiveII/5s_Kutzneria-albida-1.bpseq -data/archiveII/srp_Borr.burg._AE000783.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.dono._AY781795.bpseq -data/archiveII/5s_Asellus-aquaticus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Mycobacterium-tuberculosis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.halo._BA000004.bpseq -data/archiveII/srp_Sali.trop._CP000667.bpseq -data/archiveII/5s_Blepharisma-japonicum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Saprolegnia-ferax-1.bpseq -data/archiveII/srp_Idio.loih._AE017340.bpseq -data/archiveII/RNaseP_LGB27.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000463-Bos_taurus-9913-Val-UAC.bpseq -data/archiveII/RNaseP_ESH183D.bpseq -data/archiveII/srp_Synt.wolf._CP000448.bpseq -data/archiveII/RNaseP_ESH46a-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_L.acidophilus.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Shew.spec._CP000444_1-355.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.miti._TRW-246201_1-348.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-vulnificus-4.bpseq -data/archiveII/srp_Cyan.mero._AB002583.bpseq -data/archiveII/RNaseP_D.jeanneae.bpseq -data/archiveII/5s_Alcaligenes-faecalis-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000028-Hordeum_vulgare-4513-Asp-QUC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Phot.lumi._BX571870_1-364.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000343-Mus_musculus-10090-Gln-CUG.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudomonas-fluorescens-4.bpseq -data/archiveII/srp_Proc.spec._AJ011025.bpseq -data/archiveII/5s_Geobacillus-kaustophilus-4.bpseq -data/archiveII/RNaseP_ESH20b-1.bpseq -data/archiveII/5s_Xanthomonas-campestris-1.bpseq -data/archiveII/srp_Alka.meta._CP000724.bpseq -data/archiveII/srp_Proc.mari._AE017165.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Yers.moll._TRW-349967_1-381.bpseq -data/archiveII/5s_Thermotoga-sp.-1.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.c.A.cherimola.C3.tLEU.bpseq -data/archiveII/srp_Haem.somn._CP000436.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.geni._L43967.bpseq -data/archiveII/5s_Acholeplasma-laidlawii-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000180-Bacillus_subtilis-1423-Lys-UU.bpseq -data/archiveII/RNaseP_ESH183A.bpseq -data/archiveII/5s_Bifidobacterium-longum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Pteridium-aquilinum-1.bpseq -data/archiveII/srp_List.mono._AE017262.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.agal._AL766845.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-cholerae-4.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000299-Asterias_amurensis-7602-Asn-GPU.bpseq -data/archiveII/srp_Pris.paci._GSP-54126.bpseq -data/archiveII/5s_Tilletia-controversa-1.bpseq -data/archiveII/srp_Nect.haem._GSP-71109.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.abyssi.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000308-Moloney_murine_leukemia_virus-11801-Pro-NGG.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000472-Drosophila_melanogaster-7227-Val-IAC.bpseq -data/archiveII/5s_Grimontia-hollisae-1.bpseq -data/archiveII/srp_Pedi.pent._CP000422.bpseq -data/archiveII/srp_Neur.cras._AL669999.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.mega._D11414.bpseq -data/archiveII/5s_Bombyx-mori-1.bpseq -data/archiveII/srp_Cand.albi._GSP-237561.bpseq -data/archiveII/srp_Humu.lupu._X65985.bpseq -data/archiveII/5s_Porphyra-umbilicalis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Humu.japo._X65990.bpseq -data/archiveII/RNaseP_N.pyridinolyticus.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000031-Rattus_norvegicus-10116-Asp-QUC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.uber._TRW-218495_1-350.bpseq -data/archiveII/5s_Erysipelothrix-tonsillarum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Parachlamydia-sp.-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000498-Gallus_gallus-9031-Trp-BCA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000480-Mycoplasma_capricolum-2095-Trp-CA.bpseq -data/archiveII/srp_Carb.hydr._CP000141.bpseq -data/archiveII/5s_Streptococcus-pneumoniae-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_K.pneumoniae.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000070-Geobacillus_stearothermophilus-1422-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.C.merochlorophea.UNK.SSU.1210.bpseq -data/archiveII/srp_Pseu.aeru._CP000438.bpseq -data/archiveII/16s_D.melanogaster_domain4.bpseq -data/archiveII/5s_Mycoplasma-penetrans-1.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-sporotrichioides-4.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221939.99-544.bpseq -data/archiveII/srp_Camp.jeju._CP000538.bpseq -data/archiveII/5s_Chlamydophila-pneumoniae-2.bpseq -data/archiveII/5s_Euglena-gracilis-2.bpseq -data/archiveII/16s_C.reinhardtii.chloro_domain1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.gord._TRW-29390_1-349.bpseq -data/archiveII/5s_Bombyx-mori-4.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.octosporus.bpseq -data/archiveII/RNaseP_LGA2.bpseq -data/archiveII/srp_Nitr.hamb._CP000319.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221935.112-602.bpseq -data/archiveII/5s_Acidovorax-temperans-1.bpseq -data/archiveII/5s_Mycoplasma-capricolum-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.putida.bpseq -data/archiveII/5s_Xylella-fastidiosa-2.bpseq -data/archiveII/RNaseP_H.sapiens.bpseq -data/archiveII/5s_Thiovulum-sp.-1.bpseq -data/archiveII/5s_Exobasidium-vaccinii-1.bpseq -data/archiveII/srp_Desu.vulg._AE017285.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.ther._CP000024_1-350.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-halodurans-2.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.pneumoniae.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000371-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Arg-1CU.bpseq -data/archiveII/5s_Colwellia-psychrerythraea-3.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000438-Escherichia_coli-562-Thr-GGU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000591-Ascaris_suum-6253-Lys-UU.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.polymorpha.bpseq -data/archiveII/srp_Cory.diph._BX248354.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Chla.pneu._AE002224_1-423.bpseq -data/archiveII/srp_Cryp.parv._AA532232.bpseq -data/archiveII/srp_Wigg.glos._BA000021.bpseq -data/archiveII/srp_Plas.know._GSP-5851.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000492-Rattus_norvegicus-10116-Trp-NCA.bpseq -data/archiveII/RNaseP_ERE.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.S.paniceum.UNK.SSU.287.bpseq -data/archiveII/5s_Saccoglossus-kowalevskii-1.bpseq -data/archiveII/srp_Anab.vari._CP000117.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.pneu._AE005672.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000546-Escherichia_coli-562-Tyr-QUA.bpseq -data/archiveII/5s_Lupinus-angustifolius-1.bpseq -data/archiveII/5s_Erysipelothrix-rhusiopathiae-1.bpseq -data/archiveII/srp_Phyt.ramo._GSP-164328.bpseq -data/archiveII/5s_Neurospora-crassa-11.bpseq -data/archiveII/RNaseP_E.coli.bpseq -data/archiveII/5s_Prasinocladus-sp.-1.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-tubiashii-1.bpseq -data/archiveII/5s_Thiomicrospira-sp.-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.solfataricus.bpseq -data/archiveII/5s_Halobacterium-salinarum-1.bpseq -data/archiveII/srp_Pyro.isla._CP000504.bpseq -data/archiveII/5s_Porphyromonas-gingivalis-2.bpseq -data/archiveII/srp_Lyco.escu._Z46745.bpseq -data/archiveII/srp_Hypo.jeco._GSP-334564-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stap.aure._TRW-1280_1-362.bpseq -data/archiveII/RNaseP_N.gregoryi.bpseq -data/archiveII/5s_Rhizoctonia-globularis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Dros.moja._GSP-7230.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Azoa.spec._TRW-62928_1-378.bpseq -data/archiveII/srp_Caen.eleg._Z30973.bpseq -data/archiveII/srp_Pseu.ento._CT573326.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000347-Enterobacteria_phage_T4-10665-Arg-NCU.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-pseudograminearum-8.bpseq -data/archiveII/5s_Proteus-vulgaris-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Odon.sine._Z67753_1-368.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.braz._AY781791.bpseq -data/archiveII/srp_Xant.camp._AM039952.bpseq -data/archiveII/grp1_b.I1.e.M.anisopliae.2.C1.LSU.1921.bpseq -data/archiveII/srp_Call.jacc._GSP-9483.bpseq -data/archiveII/srp_Sacc.degr._CP000282.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Borr.burg._TRW-224326_1-362.bpseq -data/archiveII/5s_Gallus-gallus-2.bpseq -data/archiveII/5s_Cyanophora-paradoxa-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPA61.bpseq -data/archiveII/srp_Tric.spir._GSP-6334.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000410-Candida_cylindracea-44322-Ser-GA.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Dein.radi._AE001939_1-346.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.dysg._AJ489606.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Sulf.azor._TRW-204536_1-351.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.capr._D00560.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Chla.muri._AE002296_1-418.bpseq -data/archiveII/5s_Diatoma-tenue-1.bpseq -data/archiveII/srp_Fran.tula._AJ749949.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000361-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Arg-ACG.bpseq -data/archiveII/5s_Octopus-vulgaris-1.bpseq -data/archiveII/5s_Penicillium-chrysogenum-1.bpseq -data/archiveII/16s_B.subtilis_domain1.bpseq -data/archiveII/srp_Azoa.spec._AM406670.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.opuntiae.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Anabaena-ATCC29413.bpseq -data/archiveII/16s_A.fulgidus_domain1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000430-Halobacterium_salinarum-2242-Thr-GGU.bpseq -data/archiveII/5s_Psilotum-nudum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Artemia-sp.-4.bpseq -data/archiveII/5s_Escherichia-coli-13.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stap.aure._BA000017_1-362.bpseq -data/archiveII/5s_Bordetella-parapertussis-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Yers.inte._TRW-349965_1-381.bpseq -data/archiveII/5s_Halorubrum-distributum-7.bpseq -data/archiveII/5s_Cystobacter-fuscus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Bras.napu._EE412262.bpseq -data/archiveII/5s_Thermotoga-neapolitana-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000110-Methanobacterium_thermaggregans-83982-Gly-GCC.bpseq -data/archiveII/srp_Agro.tume._AE007951.bpseq -data/archiveII/16s_M.polymorpha_domain4.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000590-Ascaris_suum-6253-Glu-UC.bpseq -data/archiveII/RNaseP_F.yabuuchiae.bpseq -data/archiveII/srp_Xant.oryz._AE013598.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPB139.bpseq -data/archiveII/srp_Dani.rrer._BX470258.bpseq -data/archiveII/srp_Lyco.escu._Z29104.bpseq -data/archiveII/5s_Colwellia-psychrerythraea-2.bpseq -data/archiveII/srp_Burk.mall._CP000010.bpseq -data/archiveII/5s_Beggiatoa-alba-1.bpseq -data/archiveII/5s_Neurospora-intermedia-1.bpseq -data/archiveII/5s_Mycobacterium-tuberculosis-4.bpseq -data/archiveII/5s_Prosthecomicrobium-enhydrum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Neurospora-crassa-12.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.suis._TRW-218494_1-354.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-halodurans-5.bpseq -data/archiveII/5s_Geobacillus-kaustophilus-6.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPA49.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.tumefaciens.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.C.mirabilis.C1.SSU.1506.bpseq -data/archiveII/5s_Euplotes-eurystomus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Christiansenia-pallida-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.stutzeri.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.luteus.bpseq -data/archiveII/5s_Methylomicrobium-clara-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000572-Leishmania_tarentolae-5689-Lys-1UU.bpseq -data/archiveII/srp_Bras.napu._EE400505.bpseq -data/archiveII/RNaseP_PS33.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Ocea.ihey._BA000028_1-364.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Yers.berc._TRW-349968_1-381.bpseq -data/archiveII/RNaseP_TP1.bpseq -data/archiveII/srp_Clos.botu._CP000728.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.c.P.thunbergii.C3.tLEU.bpseq -data/archiveII/5s_Halorhodospira-halophila-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Pseu.fluo._TRW-216595_1-397.bpseq -data/archiveII/5s_Emericella-heterothallica-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.cerevisiae.bpseq -data/archiveII/5s_Candida-cylindracea-1.bpseq -data/archiveII/srp_Clos.kluy._CP000673.bpseq -data/archiveII/5s_Eisenia-bicyclis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Symbiobacterium-thermophilum-4.bpseq -data/archiveII/5s_Photobacterium-profundum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Chlorobium-phaeobacteroides-1.bpseq -data/archiveII/srp_Medi.trun._CT485797.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Prev.rumi._TRW-264731_1-401.bpseq -data/archiveII/23s_S.aureus_domain3.bpseq -data/archiveII/srp_Lyco.escu._Z29105.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Ther.teng._AE013063_1-351.bpseq -data/archiveII/srp_Chla.rein._X71484.bpseq -data/archiveII/5s_Marchantia-polymorpha-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000535-Xenopus_laevis-8355-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Pleurodeles-waltl-3.bpseq -data/archiveII/srp_Tryp.viva._SDB-5699.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000086-Euglena_gracilis-3039-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000165-Solanum_tuberosum-4113-Ile-AU.bpseq -data/archiveII/RNaseP_I.calvum.bpseq -data/archiveII/RNaseP_L.weilii.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Camp.lari._TRW-306263_1-359.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.aure._AF368293.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000556-Schizosaccharomyces_pombe-4896-Tyr-GPA.bpseq -data/archiveII/srp_Zymo.mobi._AE008692.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-gazogenes-1.bpseq -data/archiveII/srp_Burk.cepa._CP000440.bpseq -data/archiveII/RNaseP_ESH210B.bpseq -data/archiveII/5s_Halococcus-morrhuae-2.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.S.paniceum.UNK.SSU.1052.bpseq -data/archiveII/5s_Alcaligenes-faecalis-3.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-anthracis-3.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.P.pachydermus.C1.SSU.943.bpseq -data/archiveII/srp_Pseu.aeru._AE004091.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Leuc.mese._CP000414_1-358.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-methanolicus-9.bpseq -data/archiveII/5s_Samia-cynthia-1.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-avermitilis-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.aviu._AE016958_1-368.bpseq -data/archiveII/5s_Hymeniacidon-sanguinea-1.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._BF909438.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Borr.gari._CP000013_1-363.bpseq -data/archiveII/5s_Ceratobasidium-cornigerum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Photobacterium-damselae-1.bpseq -data/archiveII/5s_Acyrthosiphon-magnoliae-1.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221929.92-517.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Synechococcus-PCC7003.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000394-Escherichia_coli-562-Ser-VGA.bpseq -data/archiveII/srp_Ther.ther._AP008226.bpseq -data/archiveII/16s_T.gondii_domain2.bpseq -data/archiveII/5s_Photorhabdus-luminescens-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000500-Haloferax_volcanii-2246-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221919.107-614.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.hyopneumoniae.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Coxi.burn._AE016828_1-360.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.pyog._CP000056.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-pseudograminearum-6.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Neph.oliv._AF137379-1_1-327.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPB147.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A1932.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Heli.pylo._TRW-85963_1-386.bpseq -data/archiveII/5s_Acremonium-chrysogenum-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_N.albus.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.thur._AE017355.bpseq -data/archiveII/srp_Esch.coli._AP009048.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000264-Caenorhabditis_elegans-6239-Leu-IAG.bpseq -data/archiveII/16s_B.subtilis_domain2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Shew.onei._AX048560_1-355.bpseq -data/archiveII/5s_Nemopsis-dofleini-1.bpseq -data/archiveII/5s_Pichia-membranifaciens-1.bpseq -data/archiveII/srp_Onch.volv._GSP-6282.bpseq -data/archiveII/5s_Xenopus-laevis-3.bpseq -data/archiveII/5s_Colwellia-hadaliensis-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_E.eschscholtzii-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Clos.botu._TRW-36826_1-355.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000045-Escherichia_coli-562-Glu-SUC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Shew.deni._CP000302_1-355.bpseq -data/archiveII/5s_Saccharopolyspora-hirsuta-1.bpseq -data/archiveII/5s_Tulasnella-violea-1.bpseq -data/archiveII/srp_Mann.succ._AE016827.bpseq -data/archiveII/srp_Arab.thal._X69901.bpseq -data/archiveII/srp_Dros.mela._AC002512.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Pseu.syri._CP000075_1-392.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.L.dispersa.UNK.SSU.114.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Ente.saka._TRW-28141_1-364.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.C.ellipsoidea.211-1a.C1.SSU.1506.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000265-Bos_taurus-9913-Leu-IAG.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-anthracis-6.bpseq -data/archiveII/srp_Xant.oryz._AP008229.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Shig.flex._AE014073_1-363.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Fuso.nucl._TRW-393480_1-344.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.phosphovorus-JCM9379.bpseq -data/archiveII/5s_Euplotes-aediculatus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Ther.ther._X12643.bpseq -data/archiveII/5s_Sandaracinobacter-sibiricus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-cinereus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Oxyt.trif._GSP-99928.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000610-Caulobacter_crescentus_CB15-190650-His-GUG.bpseq -data/archiveII/srp_Heli.annu._AJ828095.bpseq -data/archiveII/5s_Linderina-macrospora-1.bpseq -data/archiveII/srp_Scle.scle._GSP-325569.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.gingivalis.bpseq -data/archiveII/RNaseP_LGB41.bpseq -data/archiveII/5s_Beta-vulgaris-1.bpseq -data/archiveII/srp_Mus.musc._AC099934.bpseq -data/archiveII/tmRNA_List.inno._TRW-1642-1_1-370.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Shew.spec._CP000469_1-355.bpseq -data/archiveII/5s_Aplysia-kurodai-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000486-Phaseolus_vulgaris-3885-Trp-BCA.bpseq -data/archiveII/RNaseP_R.norvegicus.bpseq -data/archiveII/RNaseP_LGB23.bpseq -data/archiveII/5s_Finegoldia-magna-2.bpseq -data/archiveII/srp_Shew.spec._CP000446.bpseq -data/archiveII/srp_Tetr.nigr._GSP-99883.bpseq -data/archiveII/5s_Bifidobacterium-longum-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000162-Spinacia_oleracea-3562-Ile-GAU.bpseq -data/archiveII/srp_Arth.sp.._CP000454.bpseq -data/archiveII/5s_Legionella-pneumophila-2.bpseq -data/archiveII/srp_Citr.sine._CN181544.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Salm.ente._TRW-59204_1-363.bpseq -data/archiveII/5s_Schizophyllum-commune-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000408-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Ser-IGA.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-mediterranei-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000050-Hordeum_vulgare-4513-Glu-SPC.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A2033.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Lact.lact._AF176556_1-359.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000033-Didelphis_virginiana-9267-Asp-QUC.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000181-Escherichia_coli-562-Lys-SUU.bpseq -data/archiveII/5s_Idiomarina-loihiensis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Paracentrotus-lividus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-coelicolor-4.bpseq -data/archiveII/5s_Bartonella-quintana-2.bpseq -data/archiveII/5s_Geobacillus-kaustophilus-3.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-parahaemolyticus-5.bpseq -data/archiveII/5s_Tricharina-hiemalis-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000048-Synechocystis_sp.-1143-Glu-NUC.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Synechococcus-PCC7001.bpseq -data/archiveII/5s_Roseococcus-thiosulfatophilus-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000621-Nicotiana_rustica-4093-Cys-GCA.bpseq -data/archiveII/srp_Cory.glut._BA000036.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000320-Spinacia_oleracea-3562-Pro-NGG.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.thermoautotrophicumDH-g.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-ambofaciens-1.bpseq -data/archiveII/srp_Plas.gall._GSP-5849.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.nidulans.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.P.clavariiformis.C1.SSU.943.bpseq -data/archiveII/srp_Burk.pseu._CP000572.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Aero.hydr._CP000462_1-360.bpseq -data/archiveII/5s_Perkinsus-olseni-1.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.aure._CP000703.bpseq -data/archiveII/5s_Wolbachia-pipientis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Syne.spec._BA000022.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-licheniformis-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000376-Bos_taurus-9913-Arg-3CP.bpseq -data/archiveII/5s_Mycobacterium-leprae-2.bpseq -data/archiveII/srp_Plas.falc._EF690554.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.b.Synechococcus.sp2.C3.tLEU.bpseq -data/archiveII/5s_Drosophila-melanogaster-2.bpseq -data/archiveII/5s_Escherichia-coli-2.bpseq -data/archiveII/srp_Lotu.corn._AP006123.bpseq -data/archiveII/5s_Coleosporium-tussilaginis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Hyphomicrobium-sp.-7.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.thermoautotrphicumMarb.bpseq -data/archiveII/5s_Filobasidiella-depauperata-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A1831.bpseq -data/archiveII/RNaseP_B.pertussis.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000295-Escherichia_coli-562-Asn-QUU.bpseq -data/archiveII/5s_Ureaplasma-urealyticum-3.bpseq -data/archiveII/srp_Prop.acne._AE017283.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Vibr.fisc._CP000020_1-367.bpseq -data/archiveII/srp_Xant.camp._DQ256493.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000414-Lupinus_luteus-3873-Ser-CGA.bpseq -data/archiveII/RNaseP_F.mortiferum.bpseq -data/archiveII/srp_Alca.bork._AM286690.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.aure._CP000255.bpseq -data/archiveII/srp_Camp.jeju._CP000025.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000237-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Leu-AA.bpseq -data/archiveII/5s_Shewanella-hanedai-1.bpseq -data/archiveII/5s_Agrobacterium-tumefaciens-3.bpseq -data/archiveII/srp_Bras.napu._EE416381.bpseq -data/archiveII/5s_Lycopodium-clavatum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Drosophila-erecta-1.bpseq -data/archiveII/srp_Pseu.syri._CP000075.bpseq -data/archiveII/5s_Halorubrum-saccharovorum-1.bpseq -data/archiveII/srp_Fran.tula._CP000803.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-sp.-3.bpseq -data/archiveII/5s_Halobacterium-sp.-1.bpseq -data/archiveII/5s_Chlamydophila-pneumoniae-1.bpseq -data/archiveII/srp_Phak.meib._GSP-169999.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SMB-A3.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Desu.vulg._AE017285_1-352.bpseq -data/archiveII/RNaseP_N.jensenii.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000393-Escherichia_coli-562-Ser-GGA.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-vulnificus-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000582-Aeropyrum_pernix-56636-Tyr-GUA.bpseq -data/archiveII/srp_Dros.anan._GSP-7217.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Desu.acet._TRW-281689_1-353.bpseq -data/archiveII/srp_Schi.pomb._X15220.bpseq -data/archiveII/srp_Lyco.escu._Z29101.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000460-Aedes_albopictus-7160-Val-UAC.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.m.S.luteus.A1.LSU.2504.bpseq -data/archiveII/5s_Arabidopsis-thaliana-1.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.cere._CP000764.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000221-Escherichia_coli-562-Leu-CAG.bpseq -data/archiveII/RNaseP_LGW23.bpseq -data/archiveII/5s_Salmonella-enterica-5.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000481-Spiroplasma_citri-2133-Trp-NCA.bpseq -data/archiveII/5s_Fellomyces-penicillatus-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Onchorhynchus-sp-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000607-Lupinus_luteus-3873-Leu-IAG.bpseq -data/archiveII/srp_Lact.lact._CP000425.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-culmorum-3.bpseq -data/archiveII/srp_Fran.tula._CP000439.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.capr._S67588.bpseq -data/archiveII/5s_Acheta-domesticus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.aure._AC025951.bpseq -data/archiveII/5s_Thermus-thermophilus-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.vinlandii-CA.bpseq -data/archiveII/5s_Staphylococcus-aureus-3.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.cultripes.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Burk.ceno._CP000378_1-370.bpseq -data/archiveII/srp_Ther.ther._AE017306.bpseq -data/archiveII/srp_Bifi.long._AE014295.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-diazotrophicus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Aspergillus-unguis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Hyphomicrobium-sp.-4.bpseq -data/archiveII/srp_Trit.aest._BE424647.bpseq -data/archiveII/5s_Lethenteron-japonicum-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000429-Enterobacteria_phage_T4-10665-Thr-NGU.bpseq -data/archiveII/5s_Streptococcus-pneumoniae-2.bpseq -data/archiveII/5s_Pythium-pachycaule-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_H.pylori-RU1.bpseq -data/archiveII/srp_Burk.ceno._CP000458.bpseq -data/archiveII/5s_Listeria-innocua-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Heli.hepa._AE017125_1-369.bpseq -data/archiveII/srp_Meth.ferv._M32222.bpseq -data/archiveII/RNaseP_PS8.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000132-Lupinus_luteus-3873-Gly-GCC.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-clausii-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000194-Triticum_aestivum-4565-Lys-CUU.bpseq -data/archiveII/5s_Streptococcus-mutans-2.bpseq -data/archiveII/srp_Lyco.escu._Z29099.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000006-Mycoplasma_mycoides-2102-Ala-UGC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.pyog._AE006568_1-345.bpseq -data/archiveII/RNaseP_H.pylori-48K.bpseq -data/archiveII/5s_Crithidia-fasciculata-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Bact.frag._TRW-817_1-398.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Shig.flex._CP000266_1-363.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Dein.radi._TRW-243230_1-349.bpseq -data/archiveII/srp_Pan.trog._GSP-37010.bpseq -data/archiveII/5s_Corynebacterium-jeikeium-1.bpseq -data/archiveII/5s_Caulobacter-crescentus-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPA59.bpseq -data/archiveII/5s_Methanobacterium-formicicum-1.bpseq -data/archiveII/srp_Vibr.vuln._AE016795.bpseq -data/archiveII/srp_Heli.pylo._AE001441.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Chla.trac._TRW-272561_1-420.bpseq -data/archiveII/5s_Yersinia-pseudotuberculosis-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000277-Codium_fragile-3133-Met-CAU.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.pneu._AE007319.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-lividans-1.bpseq -data/archiveII/16s_H.volcanii_domain4.bpseq -data/archiveII/5s_Calliphora-vicina-1.bpseq -data/archiveII/5s_Brucella-melitensis-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.douglassii.bpseq -data/archiveII/5s_Schizosaccharomyces-pombe-2.bpseq -data/archiveII/5s_Staphylococcus-epidermidis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Xenopus-laevis-5.bpseq -data/archiveII/16s_C.reinhardtii.mito_domain3.bpseq -data/archiveII/5s_Mycobacterium-smegmatis-2.bpseq -data/archiveII/srp_Camp.jeju._CP000768.bpseq -data/archiveII/5s_Photobacterium-sp.-1.bpseq -data/archiveII/srp_Yers.pest._CP000308.bpseq -data/archiveII/5s_Phycomyces-blakesleeanus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Psyc.ingr._CP000510.bpseq -data/archiveII/srp_Enta.inva._GSP-370355.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Prot.mira._TRW-584_1-367.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000286-Lupinus_luteus-3873-Met-BAU.bpseq -data/archiveII/16s_T.gondii_domain3.bpseq -data/archiveII/srp_Borr.afze._CP000395.bpseq -data/archiveII/srp_Trep.dent._AE017226.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Azot.vine._TRW-354_1-352.bpseq -data/archiveII/5s_Corynebacterium-variabile-1.bpseq -data/archiveII/srp_Sulf.solf._X17239.bpseq -data/archiveII/tmRNA_uncu.bact._TRW-80840-1_1-378.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000506-Streptomyces_griseus-1911-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Flavobacterium-johnsoniae-1.bpseq -data/archiveII/srp_Stro.purp._GSP-7668.bpseq -data/archiveII/5s_Metasequoia-glyptostroboides-1.bpseq -data/archiveII/srp_Shig.flex._CP000266.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.A.adeninivorans.C1.LSU.2449.bpseq -data/archiveII/5s_Acidithiobacillus-thiooxidans-1.bpseq -data/archiveII/5s_Laccaria-bicolor-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_R.prowazekii.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.acetobutylicum.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Baci.subt._TRW-1423_1-363.bpseq -data/archiveII/srp_Gald.sulp._GSP-130081.bpseq -data/archiveII/5s_Mycoplasma-pneumoniae-1.bpseq -data/archiveII/srp_Arab.thal._X72229.bpseq -data/archiveII/srp_Cion.savi._BW551179.bpseq -data/archiveII/5s_Coleochaete-scutata-1.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.D.parva.C1.SSU.1512.bpseq -data/archiveII/16s_C.reinhardtii.chloro_domain4.bpseq -data/archiveII/5s_Acetobacter-sp.-1.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221927.113-556.bpseq -data/archiveII/5s_Shewanella-oneidensis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-cereus-7.bpseq -data/archiveII/5s_Methylomicrobium-album-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000413-Candida_cylindracea-44322-Ser-GCU.bpseq -data/archiveII/srp_Cory.glut._BX927148.bpseq -data/archiveII/23s_E.coli_domain1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Pseu.fluo._CP000076_1-394.bpseq -data/archiveII/srp_Sola.tube._DR037646.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000619-Toxoplasma_gondii-5811-Met-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Saccharomyces-cerevisiae-3.bpseq -data/archiveII/srp_Clos.diff._AM180355.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Sacc.degr._CP000282_1-389.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.laidlawii.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-sp.-2.bpseq -data/archiveII/5s_Halorubrum-terrestre-2.bpseq -data/archiveII/5s_Agrobacterium-tumefaciens-6.bpseq -data/archiveII/RNaseP_VSDW.bpseq -data/archiveII/5s_Seliberia-stellata-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Thio.deni._CP000116_1-367.bpseq -data/archiveII/5s_Rhodobacter-capsulatus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Mannheimia-succiniciproducens-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_envi.sequ._TRW-300695-2_1-345.bpseq -data/archiveII/srp_Meth.bark._CP000099.bpseq -data/archiveII/5s_Nadsonia-fulvescens-1.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.C.merochlorophea.UNK.SSU.1516.bpseq -data/archiveII/5s_Chlamydophila-abortus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Ratt.norv._AC091616.bpseq -data/archiveII/5s_Emericella-nidulans-5.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000189-Rattus_norvegicus-10116-Lys-NUU.bpseq -data/archiveII/5s_Vitreoscilla-stercoraria-1.bpseq -data/archiveII/srp_Chla.pneu._AE001363.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000087-Hordeum_vulgare-4513-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.purpurea-chloroplast.bpseq -data/archiveII/5s_Mycobacterium-phlei-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000288-Mus_musculus-10090-Met-BAU.bpseq -data/archiveII/srp_Xant.axon._AE011739.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000193-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Lys-UU.bpseq -data/archiveII/srp_Nitr.mult._CP000103.bpseq -data/archiveII/srp_Esch.coli._AE005174.bpseq -data/archiveII/5s_Leifsonia-aquatica-1.bpseq -data/archiveII/23s_H.pylori_domain1.bpseq -data/archiveII/5s_Thermus-sp.-2.bpseq -data/archiveII/5s_Caulobacter-crescentus-2.bpseq -data/archiveII/5s_Chlamydophila-pneumoniae-3.bpseq -data/archiveII/srp_Arab.thal._X72228.bpseq -data/archiveII/5s_Andrias-japonicus-2.bpseq -data/archiveII/srp_Dros.mela._AE014297.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Chro.sale._CP000285_1-380.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Rals.meta._CP000352_1-360.bpseq -data/archiveII/5s_Staphylococcus-aureus-2.bpseq -data/archiveII/RNaseP_H.trapanicum.bpseq -data/archiveII/5s_Thiomicrospira-pelophila-1.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221914.112-589.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000022-Enterobacteria_phage_T5-10726-Asp-GUC.bpseq -data/archiveII/srp_Yers.pseu._CP000720.bpseq -data/archiveII/5s_F_florifoWE.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000285-Triticum_aestivum-4565-Met-BAU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000490-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Trp-CA.bpseq -data/archiveII/srp_Micr.lyso._M31831.bpseq -data/archiveII/RNaseP_E.eschscholtzii-1.bpseq -data/archiveII/srp_Yarr.lipo._CR382130.bpseq -data/archiveII/5s_Meloidogyne-artiellia-1.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.braz._AY722726.bpseq -data/archiveII/5s_Agrobacterium-vitis-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000115-Staphylococcus_epidermidis-1282-Gly-UCC.bpseq -data/archiveII/5s_Streptococcus-mutans-3.bpseq -data/archiveII/srp_Halo.halo._X01698.bpseq -data/archiveII/5s_Filobasidium-floriforme-2.bpseq -data/archiveII/5s_Haloferax-mediterranei-1.bpseq -data/archiveII/srp_Ratt.norv._AA923995.bpseq -data/archiveII/srp_Perk.mari._GSP-31276.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000563-Lupinus_albus-3870-Tyr-GPA.bpseq -data/archiveII/tmRNA_envi.sequ._TRW-2-2_1-356.bpseq -data/archiveII/5s_Escherichia-coli-8.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.psittaci.bpseq -data/archiveII/5s_Emericella-nidulans-8.bpseq -data/archiveII/srp_Rhod.spha._CP000661.bpseq -data/archiveII/5s_Bartonella-bacilliformis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Leptothrix-discophora-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_N.flavus.bpseq -data/archiveII/5s_Deinococcus-radiophilus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Candida-rugopelliculosa-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_B.stearothermophilus.bpseq -data/archiveII/5s_Wolbachia-endosymbiont-of-D.-melanogaster-1.bpseq -data/archiveII/srp_Lact.sali._CP000233.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Burk.spec._CP000151_1-370.bpseq -data/archiveII/5s_Nephila-clavipes-1.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.B.ciliata.JCM6865.C1.SSU.943.bpseq -data/archiveII/16s_E.coli_domain2.bpseq -data/archiveII/srp_Bras.oler._GSP-109376.bpseq -data/archiveII/5s_Caenorhabditis-briggsae-1.bpseq -data/archiveII/srp_Sacc.baya._BN000171.bpseq -data/archiveII/srp_Kluy.walt._AADM01000319.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Rubr.gela._TRW-279263_1-372.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.epid._AF269831.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000059-Rattus_norvegicus-10116-Glu-3UC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Neis.meni._TRW-122586_1-363.bpseq -data/archiveII/5s_Enterococcus-faecalis-2.bpseq -data/archiveII/5s_Thraustochytrium-visurgense-1.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.aeth._AY722732.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000026-Escherichia_coli-562-Asp-QUC.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000617-Nanoarchaeum_equitans-160232-Gln-UUG.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._BU566619.bpseq -data/archiveII/23s_T.thermophilus_domain1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Leif.xyli._AE016822_1-394.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.pastorianus.bpseq -data/archiveII/5s_Natronomonas-pharaonis-1.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221918.97-547.bpseq -data/archiveII/srp_Tryp.bruc._M80262.bpseq -data/archiveII/5s_Methanothermobacter-thermautotrophicus-3.bpseq -data/archiveII/srp_List.mono._AE017331.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000216-Mycoplasma_capricolum-2095-Leu-BAA.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A4775.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Salm.ente._CP000026_1-363.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Fischerella-UTEX1829.bpseq -data/archiveII/5s_Shewanella-putrefaciens-1.bpseq -data/archiveII/srp_Aede.aegy._DW714815.bpseq -data/archiveII/srp_Nost.spec._BA000019.bpseq -data/archiveII/srp_Chae.glob._GSP-306901.bpseq -data/archiveII/5s_Scenedesmus-obliquus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-griseus-3.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Mann.haem._TRW-272629_1-367.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000416-Nicotiana_rustica-4093-Ser-CGA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000205-Loligo_bleekeri-6617-Lys-NUU.bpseq -data/archiveII/RNaseP_E.faecalis.bpseq -data/archiveII/16s_C.psittaci_domain3.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A4674.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SMB-A5.bpseq -data/archiveII/5s_Thermococcus-celer-2.bpseq -data/archiveII/5s_Arthrobacter-polychromogenes-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.capricolum.bpseq -data/archiveII/5s_Filobasidiella-neoformans-1.bpseq -data/archiveII/5s_Candida-glabrata-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000474-Drosophila_melanogaster-7227-Val-NAC.bpseq -data/archiveII/5s_Ralstonia-pickettii-1.bpseq -data/archiveII/5s_Thermus-sp.-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.micr._TRW-1806-1_1-368.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000272-Thermoplasma_acidophilum-2303-Met-CAU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000297-Azospirillum_lipoferum-193-Asn-QUU.bpseq -data/archiveII/5s_Candida-magnoliae-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Haem.ducr._AE017143_1-367.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-nodosus-4.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-pseudograminearum-1.bpseq -data/archiveII/srp_Dein.radi._AE000513.bpseq -data/archiveII/5s_Saccharomyces-cerevisiae-4.bpseq -data/archiveII/tmRNA_envi.sequ._TRW-32045-3_1-350.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Esch.coli._U36840_1-363.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPB7776.bpseq -data/archiveII/5s_Streptococcus-agalactiae-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Sali.rube._CP000159_1-369.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000014-Bombyx_mori-7091-Ala-IGC.bpseq -data/archiveII/srp_Sacc.baya._BN000250.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Spir.citr._AM285321_1-424.bpseq -data/archiveII/srp_Erwi.caro._BX950851.bpseq -data/archiveII/5s_Lophocolea-heterophylla-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPB69.bpseq -data/archiveII/srp_Dani.rrer._BX469912.bpseq -data/archiveII/RNaseP_BH145.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.cere._D11413.bpseq -data/archiveII/5s_Escherichia-coli-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_B.megaterium.bpseq -data/archiveII/srp_Pyro.abys._AJ248283.bpseq -data/archiveII/5s_Weissella-viridescens-2.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-culmorum-7.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-lunulosporum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Calyptogena-magnifica-1.bpseq -data/archiveII/5s_Mycoplasma-sp.-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_envi.sequ._TRW-204433_1-356.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000537-Mus_musculus-10090-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Phaseolus-vulgaris-2.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A1214.bpseq -data/archiveII/srp_Phae.nodo._GSP-321614.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.D.parva.C1.SSU.943.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000118-Escherichia_coli-562-Gly-GCC.bpseq -data/archiveII/srp_Bran.flor._GSP-7739.bpseq -data/archiveII/5s_Saccharomyces-cerevisiae-6.bpseq -data/archiveII/5s_Daphnia-magna-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_N.gonnorhoeae.bpseq -data/archiveII/srp_Buch.aphi._BA000003.bpseq -data/archiveII/5s_Cryptobranchus-alleganiensis-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Cyan.para._TRW-2762_1-294.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Clos.perf._CP000312_1-361.bpseq -data/archiveII/5s_Toxoplasma-gondii-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000519-Phaseolus_vulgaris-3885-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Lact.plan._AL935259_1-372.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000156-Bacillus_subtilis-1423-Ile-AU.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Dein.geot._CP000359_1-348.bpseq -data/archiveII/srp_Schi.mans._GSP-6183.bpseq -data/archiveII/5s_Scytosiphon-lomentaria-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000521-Bos_taurus-9913-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-thuringiensis-2.bpseq -data/archiveII/5s_Branchiostoma-belcheri-1.bpseq -data/archiveII/5s_Caulobacter-sp.-7.bpseq -data/archiveII/5s_Amycolatopsis-mediterranei-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_uncu.bact._TRW-80840-3_1-379.bpseq -data/archiveII/RNaseP_H.cutirubrum.bpseq -data/archiveII/RNaseP_T.commune.bpseq -data/archiveII/srp_Haem.infl._CP000672.bpseq -data/archiveII/5s_Isosphaera-pallida-1.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.vanb._CP000511.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000116-Bacillus_subtilis-1423-Gly-CC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Camp.upsa._TRW-306264_1-359.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Laws.intr._AM180252_1-376.bpseq -data/archiveII/RNaseP_H.chlorum-partial.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-cerealis-5.bpseq -data/archiveII/srp_Agro.tume._AE007869.bpseq -data/archiveII/5s_Listeria-ivanovii-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_T.littoralis.bpseq -data/archiveII/srp_Ther.petr._CP000702.bpseq -data/archiveII/srp_Chla.muri._AE002321.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000254-Candida_cylindracea-44322-Leu-IAG.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000616-Nanoarchaeum_equitans-160232-Lys-CUU.bpseq -data/archiveII/5s_Haemophilus-influenzae-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000594-Ascaris_suum-6253-Leu-AA.bpseq -data/archiveII/5s_Bordetella-bronchiseptica-1.bpseq -data/archiveII/srp_Fran.tula._CP000437.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-licheniformis-2.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.difficile.bpseq -data/archiveII/5s_Lupinus-luteus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Smittium-culisetae-1.bpseq -data/archiveII/srp_Gibb.moni._GSP-334819.bpseq -data/archiveII/5s_Bacteroides-fragilis-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.pene._BA000026_1-405.bpseq -data/archiveII/5s_Shigella-flexneri-2.bpseq -data/archiveII/srp_Cion.inte._GSP-7719.bpseq -data/archiveII/5s_Delftia-acidovorans-1.bpseq -data/archiveII/5s_Pyrococcus-furiosus-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000096-Bos_taurus-9913-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Porp.purp._TRW-2787_1-323.bpseq -data/archiveII/srp_Proc.mari._CP000576.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.C.grayi.UNK.SSU.1046.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Burk.viet._TRW-269482_1-370.bpseq -data/archiveII/srp_Arab.thal._AL161495.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Nocardiodes-ATCC39419.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.lich._AE017333.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Prop.acne._TRW-1747-1_1-371.bpseq -data/archiveII/5s_Diplonema-papillatum-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000008-Escherichia_coli-562-Ala-GGC.bpseq -data/archiveII/5s_Geobacillus-kaustophilus-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000419-Nicotiana_rustica-4093-Ser-IGA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000398-Ascaris_suum-6253-Ser-UCU.bpseq -data/archiveII/srp_Babe.bige._GSP-5866.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Guil.thet._TRW-55529_1-330.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Mari.aqua._TRW-351348_1-366.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.amyl._D11416.bpseq -data/archiveII/srp_Neis.meni._AL157959.bpseq -data/archiveII/5s_Andrias-japonicus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Pseu.aeru._AE004581.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A3761.bpseq -data/archiveII/5s_Frankia-sp.-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.epidermidis.bpseq -data/archiveII/5s_Burkholderia-cepacia-1.bpseq -data/archiveII/5s_Mycoplasma-gallisepticum-2.bpseq -data/archiveII/5s_Neurospora-crassa-2.bpseq -data/archiveII/5s_Thiobacillus-thioparus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Ehrlichia-ruminantium-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000558-Triticum_aestivum-4565-Tyr-QPA.bpseq -data/archiveII/5s_Kondoa-malvinella-1.bpseq -data/archiveII/5s_Meloidogyne-arenaria-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Trem.prin._AF481102_1-264.bpseq -data/archiveII/srp_Meth.mari._BX957223.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000365-Aedes_albopictus-7160-Arg-UCG.bpseq -data/archiveII/5s_Salmonella-enterica-8.bpseq -data/archiveII/srp_Lyco.escu._Z29112.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000247-Bos_taurus-9913-Leu-UAG.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.canadensis.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Z.rouxii.bpseq -data/archiveII/5s_Scyliorhinus-canicula-1.bpseq -data/archiveII/5s_Hyphomicrobium-sp.-6.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Clos.diff._AM180355_1-350.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-cyclosites-1.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.anth._AE016879.bpseq -data/archiveII/5s_Microstroma-juglandis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Soda.glos._AP008232.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.A.capsulatus.FLs1.C1.SSU.bpseq -data/archiveII/srp_Burk.mall._CP000526.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.acanthamoebae.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221926.103-507.bpseq -data/archiveII/5s_Campylobacter-jejuni-3.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.majo._SDB-347515.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000169-Homo_sapiens-9606-Ile-GAU.bpseq -data/archiveII/srp_Chla.pneu._BA000008.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Synechococcus-PCC7942.bpseq -data/archiveII/tmRNA_envi.sequ._TRW-32045-1_1-355.bpseq -data/archiveII/RNaseP_PS4.bpseq -data/archiveII/srp_Caen.eleg._AY948607.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Citr.rode._TRW-67825_1-365.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.majo._AY722714.bpseq -data/archiveII/5s_Streptococcus-pyogenes-3.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000362-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Arg-NCU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000433-Mycoplasma_capricolum-2095-Thr-AGU.bpseq -data/archiveII/srp_Camp.curv._CP000767.bpseq -data/archiveII/srp_Grac.tenu._AY673996.bpseq -data/archiveII/5s_Bacteroides-fragilis-5.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000235-Neurospora_crassa-5141-Leu-NAA.bpseq -data/archiveII/srp_Trop.whip._BX251412.bpseq -data/archiveII/srp_Mus.musc._DQ285765.bpseq -data/archiveII/srp_Aspe.clav._GSP-344612.bpseq -data/archiveII/srp_Meth.volt._M22560.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000039-Oryctolagus_cuniculus-9986-Asp-8UC.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A0911.bpseq -data/archiveII/srp_Thio.deni._CP000116.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Chla.trac._AE001276_1-417.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A5584.bpseq -data/archiveII/5s_Samia-cynthia-ricini-1.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.aver._BA000030.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000079-Rattus_norvegicus-10116-Phe-GAA.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.glauca-L169T.bpseq -data/archiveII/5s_T_cruziE.bpseq -data/archiveII/5s_Natrinema-sp.-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000310-Enterobacteria_phage_T5-10726-Pro-UGG.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Aste.yell._TRW-322098_1-426.bpseq -data/archiveII/srp_Mus.musc._AC157822.bpseq -data/archiveII/5s_Proasellus-coxalis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Xenopus-laevis-9.bpseq -data/archiveII/RNaseP_T.roseum.bpseq -data/archiveII/srp_Para.symb._BX908798.bpseq -data/archiveII/5s_Magnolia-kobus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Leuconostoc-mesenteroides-1.bpseq -data/archiveII/5s_Pyrococcus-abyssi-1.bpseq -data/archiveII/5s_Bursaphelenchus-xylophilus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Listonella-anguillarum-1.bpseq -data/archiveII/srp_Rals.sola._AL646063.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-parahaemolyticus-3.bpseq -data/archiveII/5s_Samia-cynthia-ricini-x-Bombyx-mori-1.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.pulm._AL445565.bpseq -data/archiveII/srp_Noca.farc._AP006618.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Acti.pleu._TRW-44294_1-366.bpseq -data/archiveII/5s_Stilbum-vulgare-1.bpseq -data/archiveII/5s_Sphacelotheca-polygoni-persicariae-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.caesia-K182.bpseq -data/archiveII/srp_Clos.perf._CP000312.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._AL139099.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.negevensis.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.trachomatis-2.bpseq -data/archiveII/5s_Aeromonas-salmonicida-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Clav.mich._TRW-31964_1-376.bpseq -data/archiveII/RNaseP_LGB21.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.muta._AE014879.bpseq -data/archiveII/srp_Pseu.fluo._CP000094.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPB72.bpseq -data/archiveII/5s_Candida-rugosa-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.trachomatis-D.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-culmorum-6.bpseq -data/archiveII/5s_Porphyra-yezoensis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Lyco.escu._Z46744.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._AB061847.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000331-Mycoplasma_capricolum-2095-Gln-UG.bpseq -data/archiveII/srp_Zymo.mobi._AF203881.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.Staurastrum.sp.M753.C1.SSU.1506.bpseq -data/archiveII/srp_Clos.beij._CP000721.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000359-Escherichia_coli-562-Arg-CCG.bpseq -data/archiveII/RNaseP_ESH30-3.bpseq -data/archiveII/5s_Menoidium-pellucidum-1.bpseq -data/archiveII/grp1_b.I1.e.A.griffini.2.C1.SSU.516.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Acin.spec._CR543861_1-360.bpseq -data/archiveII/5s_Polyangium-cellulosum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-cereus-10.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A01.bpseq -data/archiveII/srp_Lact.delb._AF496545.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.tube._TRW-164513_1-368.bpseq -data/archiveII/srp_Yers.pest._AE017129.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Baci.lich._CP000002_1-356.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221920.99-541.bpseq -data/archiveII/srp_List.wels._AM263198.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221911.104-513.bpseq -data/archiveII/srp_Chlo.vulg._AB001684.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000161-Zea_mays-4577-Ile-GAU.bpseq -data/archiveII/srp_Arch.fulg._X17237.bpseq -data/archiveII/5s_Escherichia-coli-6.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Urea.parv._AE002154_1-413.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000583-Aeropyrum_pernix-56636-Cys-GCA.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Clos.perf._AP003190_1-358.bpseq -data/archiveII/5s_Haemophilus-influenzae-6.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.tuberculosis-g.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Lact.john._TRW-257314_1-367.bpseq -data/archiveII/RNaseP_T.pallidum.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Shew.putr._TRW-319224_1-356.bpseq -data/archiveII/srp_Dros.yaku._GSP-7245.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-harveyi-2.bpseq -data/archiveII/5s_Corynebacterium-xerosis-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Cyto.hutc._CP000383_1-404.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.muta._AE014133.bpseq -data/archiveII/srp_Pers.amer._X65992.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000002-Haloferax_volcanii-2246-Ala-CGC.bpseq -data/archiveII/5s_Aspergillus-versicolor-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000056-Hordeum_vulgare-4513-Glu-UPC.bpseq -data/archiveII/srp_Meth.kand._AE010387.bpseq -data/archiveII/5s_Lactobacillus-plantarum-2.bpseq -data/archiveII/srp_Cocc.posa._GSP-222929.bpseq -data/archiveII/5s_Methanococcus-maripaludis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Lytechinus-variegatus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Oceanobacillus-iheyensis-3.bpseq -data/archiveII/srp_Shig.flex._AE005674.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000271-Haloferax_volcanii-2246-Met-BAU.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-anthracis-10.bpseq -data/archiveII/srp_Loxo.afri._GSP-9785.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.subt._D26185.bpseq -data/archiveII/5s_Halorubrum-distributum-6.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A06.bpseq -data/archiveII/5s_Saccharomyces-pastorianus-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000622-Nicotiana_rustica-4093-Cys-GCA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000157-Thermus_thermophilus-274-Ile-GAU.bpseq -data/archiveII/srp_Sili.pome._CP000031.bpseq -data/archiveII/5s_Methanothermus-fervidus-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_T.celerAL1-2.bpseq -data/archiveII/5s_Acidithiobacillus-ferrooxidans-2.bpseq -data/archiveII/5s_Mycobacterium-phlei-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.testosteroni.bpseq -data/archiveII/5s_Corynebacterium-diphtheriae-2.bpseq -data/archiveII/5s_Ustilago-maydis-1.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.c.S.alterniflora.C3.tLEU.bpseq -data/archiveII/5s_Lentinula-edodes-1.bpseq -data/archiveII/5s_Acinetobacter-sp.-1.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-clausii-3.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.C.saccatum.C1.SSU.1512.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Haem.infl._TRW-262728_1-366.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.mari._TRW-1781-1_1-368.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Carb.hydr._CP000141_1-359.bpseq -data/archiveII/srp_Tryp.bruc._X57047.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Mora.cata._AX067460_1-359.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Ther.ther._TRW-300852_1-349.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Baci.G._TRW-12333_1-312.bpseq -data/archiveII/5s_Escherichia-coli-4.bpseq -data/archiveII/5s_Candida-antarctica-1.bpseq -data/archiveII/5s_Thermomicrobium-roseum-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Clos.perf._CP000246_1-361.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-fischeri-1.bpseq -data/archiveII/5s_Methanolobus-tindarius-2.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-aestuarianus-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.solfataricus-P2.bpseq -data/archiveII/5s_Sabellastarte-japonica-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000159-Escherichia_coli-562-Ile-GAU.bpseq -data/archiveII/5s_Lemna-minor-1.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.dono._AY722735.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.L.dispersa.UNK.SSU.287.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-metschnikovii-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000212-Haloferax_volcanii-2246-Leu-CAG.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.epid._CP000029.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000309-Enterobacteria_phage_T4-10665-Pro-NGG.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000112-Mycoplasma_mycoides-2102-Gly-UCC.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.vannielli.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Fran.spec._TRW-298653_1-375.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A1012.bpseq -data/archiveII/5s_Artemia-sp.-3.bpseq -data/archiveII/5s_Kluyveromyces-delphensis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-thuringiensis-6.bpseq -data/archiveII/srp_Gloe.viol._BA000045.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000058-Lupinus_luteus-3873-Glu-CUC.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000527-Schizosaccharomyces_pombe-4896-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Planococcus-kocurii-1.bpseq -data/archiveII/5s_Ancylobacter-aquaticus-1.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.m.S.luteus.B4.LSU.1923.bpseq -data/archiveII/5s_Uthatobasidium-fusisporum-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Bact.mari._TRW-97084_1-385.bpseq -data/archiveII/srp_Haem.infl._CP000057.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Esch.coli._CP000247_1-363.bpseq -data/archiveII/srp_Neis.meni._AE002098.bpseq -data/archiveII/5s_Methanospirillum-hungatei-1.bpseq -data/archiveII/5s_Photobacterium-leiognathi-1.bpseq -data/archiveII/srp_Pich.guil._GSP-294746.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000533-Drosophila_melanogaster-7227-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/srp_Burk.ceno._CP000380.bpseq -data/archiveII/5s_Neisseria-gonorrhoeae-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Spir.kunk._TRW-273035_1-424.bpseq -data/archiveII/5s_Salmonella-typhimurium-2.bpseq -data/archiveII/5s_Desulfovibrio-vulgaris-1.bpseq -data/archiveII/5s_Thiothrix-sp.-1.bpseq -data/archiveII/srp_Giar.lamb._GSP-184922.bpseq -data/archiveII/5s_Lingula-anatina-2.bpseq -data/archiveII/5s_Caulobacter-sp.-6.bpseq -data/archiveII/5s_Ascobolus-immersus-4.bpseq -data/archiveII/5s_Acholeplasma-laidlawii-3.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.phosphovorus-JCM9380.bpseq -data/archiveII/srp_Buch.aphi._AE014017.bpseq -data/archiveII/5s_Azospirillum-lipoferum-1.bpseq -data/archiveII/srp_Proc.mari._CP000551.bpseq -data/archiveII/5s_Emericella-nidulans-6.bpseq -data/archiveII/5s_Ureaplasma-parvum-2.bpseq -data/archiveII/5s_Xenopus-laevis-7.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.trop._AY722722.bpseq -data/archiveII/5s_Xenopus-tropicalis-2.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-asiaticum-8.bpseq -data/archiveII/5s_Erythromicrobium-ramosum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Urocystis-primulicola-1.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-anthracis-8.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000111-Mycoplasma_capricolum-2095-Gly-UCC.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000233-Phaseolus_vulgaris-3885-Leu-UA7.bpseq -data/archiveII/5s_Xenopus-laevis-8.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.pecorum-IPA.bpseq -data/archiveII/5s_Ralstonia-solanacearum-1.bpseq -data/archiveII/srp_Nitr.euro._BX321857.bpseq -data/archiveII/srp_Chla.abor._CR848038.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.aviu._AE017228.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Lact.sake._TRW-314315_1-370.bpseq -data/archiveII/5s_Microbotryum-violaceum-1.bpseq -data/archiveII/srp_Sacc.cere._U18917.bpseq -data/archiveII/5s_Zygoascus-hellenicus-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.equi._TRW-1336_1-349.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Phot.prof._CR378665_1-368.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221913.109-520.bpseq -data/archiveII/5s_Clostridium-pasteurianum-1.bpseq -data/archiveII/grp1_b.I1.e.M.anisopliae.3.C1.LSU.1921.bpseq -data/archiveII/5s_Candidatus-Portiera-aleyrodidarum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Vicia-faba-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A5382.bpseq -data/archiveII/srp_Lyco.escu._Z29111.bpseq -data/archiveII/srp_Aqui.aeol._AE000657.bpseq -data/archiveII/srp_Colw.psyc._CP000083.bpseq -data/archiveII/srp_Rhod.spha._CP000577.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Neis.meni._TRW-122587_1-363.bpseq -data/archiveII/tmRNA_List.gray._AF440336_1-321.bpseq -data/archiveII/5s_Oryctolagus-cuniculus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Yers.ente._AM286415.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A04.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Shew.frig._CP000447_1-356.bpseq -data/archiveII/RNaseP_PF101.bpseq -data/archiveII/srp_Pseu.puti._CP000712.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000230-Glycine_max-3847-Leu-UA7.bpseq -data/archiveII/srp_Tric.vagi._GSP-5722-2.bpseq -data/archiveII/srp_Kleb.pneu._CP000647.bpseq -data/archiveII/5s_Helix-pomatia-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000100-Mus_musculus-10090-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-pseudograminearum-3.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stap.epid._TRW-1282-2_1-362.bpseq -data/archiveII/5s_Spirobolus-sp-1.bpseq -data/archiveII/16s_C.psittaci_domain4.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000387-Bacillus_subtilis-1423-Ser-5GA.bpseq -data/archiveII/srp_Caul.cres._U49738.bpseq -data/archiveII/5s_Agaricostilbum-pulcherrimum-2.bpseq -data/archiveII/5s_C_paradoxE.bpseq -data/archiveII/5s_Gracilaria-compressa-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000184-Asterias_amurensis-7602-Lys-CUU.bpseq -data/archiveII/srp_Schi.pomb._Z99259.bpseq -data/archiveII/5s_Puccinia-poarum-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Cald.sacc._TRW-351627_1-368.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.troglodytes.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000578-Leishmania_tarentolae-5689-Glu-3UC.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000334-Hordeum_vulgare-4513-Gln-UG.bpseq -data/archiveII/5s_Candida-albicans-1.bpseq -data/archiveII/5s_Pinus-silvestris-1.bpseq -data/archiveII/srp_Neis.gono._AE004969.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.agal._AE014233_1-350.bpseq -data/archiveII/srp_Meth.acet._X17238.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000226-Synechococcus_elongatus_PCC_6301-269084-Leu-CAG.bpseq -data/archiveII/5s_Haemophilus-influenzae-4.bpseq -data/archiveII/RNaseP_ESH7-4.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Esch.coli._CP000243_1-363.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000029-Asterias_amurensis-7602-Asp-QUC.bpseq -data/archiveII/5s_Shewanella-oneidensis-2.bpseq -data/archiveII/srp_Trit.aest._CA626434.bpseq -data/archiveII/5s_Neurospora-crassa-9.bpseq -data/archiveII/srp_Xyle.fast._AE012554.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._BF908765.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.agal._CP000114.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.maris.bpseq -data/archiveII/srp_Lact.delb._CP000412.bpseq -data/archiveII/srp_Esch.coli._CP000247.bpseq -data/archiveII/srp_Phak.pach._GSP-170000-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000199-Oryctolagus_cuniculus-9986-Lys-CUU.bpseq -data/archiveII/srp_Proc.mari._CP000111.bpseq -data/archiveII/srp_Meso.loti._BA000012.bpseq -data/archiveII/5s_Planobispora-longispora-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000477-Avian_myeloblastosis_virus-11866-Trp-BCA.bpseq -data/archiveII/5s_Chlamydia-muridarum-2.bpseq -data/archiveII/srp_Vibr.chol._AE004188.bpseq -data/archiveII/16s_A.pyrophilus_domain3.bpseq -data/archiveII/5s_Helicobasidium-purpureum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Aeromonas-hydrophila-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Cyan.mero._TRW-45157_1-236.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Pseu.aeru._AE004091_1-353.bpseq -data/archiveII/srp_Lact.lact._AE006305.bpseq -data/archiveII/5s_Halichondria-panicea-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000579-Aeropyrum_pernix-56636-Pro-CGG.bpseq -data/archiveII/16s_H.sapiens.mito_domain2.bpseq -data/archiveII/srp_Wolb.endo._AE017321.bpseq -data/archiveII/5s_Moniliella-acetoabutans-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.putrefaciens.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPA62.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.pyog._AE004092.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Burk.mall._CP000010_1-370.bpseq -data/archiveII/16s_C.elegans_domain3.bpseq -data/archiveII/5s_Mycoplasma-haemofelis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Oryza-sativa-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Neis.meni._TRW-272831_1-363.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000575-Leishmania_tarentolae-5689-Thr-CGU.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Rr327.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Magn.spec._CP000471_1-366.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000315-Mycoplasma_mycoides-2102-Pro-UGG.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-proteolyticus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Aspergillus-flavus-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.kluyveri.bpseq -data/archiveII/23s_E.coli_domain4.bpseq -data/archiveII/5s_Gluconobacter-oxydans-3.bpseq -data/archiveII/srp_Popu.bals._GSP-73824.bpseq -data/archiveII/RNaseP_T.thioparus.bpseq -data/archiveII/5s_Listeria-monocytogenes-3.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Ther.fusc._CP000088_1-372.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Pola.spec._CP000316_1-387.bpseq -data/archiveII/5s_Treponema-denticola-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000055-Schizosaccharomyces_pombe-4896-Glu-3UC.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-thuringiensis-5.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000526-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/srp_Picr.torr._AE017261.bpseq -data/archiveII/5s_Natronomonas-pharaonis-2.bpseq -data/archiveII/5s_Shewanella-colwelliana-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000479-Mycoplasma_capricolum-2095-Trp-BCA.bpseq -data/archiveII/5s_Mycoplasma-mobile-1.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.spha._D11418.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-ordalii-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000090-Lupinus_luteus-3873-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPB144.bpseq -data/archiveII/5s_Methanopyrus-kandleri-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Shig.flex._AE005674_1-363.bpseq -data/archiveII/5s_Rhodobacter-sphaeroides-3.bpseq -data/archiveII/5s_Chlorella-pyrenoidosa-1.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.P.inouyei.C1.SSU.1506.bpseq -data/archiveII/5s_Pyrenophora-graminea-1.bpseq -data/archiveII/srp_Haem.ducr._AE017154.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000153-Mycoplasma_capricolum-2095-Ile-AU.bpseq -data/archiveII/5s_Methylobacterium-organophilum-1.bpseq -data/archiveII/srp_Sacc.cere._X17308.bpseq -data/archiveII/srp_Sacc.kluy._SKAA0027M04.b1.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-lunulosporum-9.bpseq -data/archiveII/srp_Lact.brev._CP000416.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Exig.sibi._TRW-262543_1-359.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000217-Mycoplasma_capricolum-2095-Leu-AA.bpseq -data/archiveII/5s_Candidatus-Tremblaya-princeps-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000080-Bos_taurus-9913-Phe-GAA.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-subtilis-4.bpseq -data/archiveII/srp_Sphi.alas._CP000356.bpseq -data/archiveII/RNaseP_WC1.bpseq -data/archiveII/srp_Salm.ente._CP000026.bpseq -data/archiveII/5s_Asellus-aquaticus-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Mann.succ._AE016827_1-367.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-licheniformis-6.bpseq -data/archiveII/srp_Burk.mall._CP000548.bpseq -data/archiveII/5s_Methanocaldococcus-jannaschii-2.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-vulnificus-3.bpseq -data/archiveII/5s_Pyrococcus-furiosus-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Esch.coli._D90888_1-363.bpseq -data/archiveII/5s_Entosiphon-sulcatum-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Lact.gass._TRW-1596_1-366.bpseq -data/archiveII/telomerase_AY312571.605-1069.bpseq -data/archiveII/16s_E.coli_domain1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.psittaci-R54.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000121-Salmonella_typhimurium-602-Gly-NCC.bpseq -data/archiveII/srp_Salm.typh._AE008717.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000225-Synechococcus_elongatus_PCC_6301-269084-Leu-CAA.bpseq -data/archiveII/srp_Deba.hans._CR382138.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-cereus-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000218-Mycoplasma_capricolum-2095-Leu-UAG.bpseq -data/archiveII/5s_Erysipelothrix-rhusiopathiae-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000177-Mycoplasma_capricolum-2095-Lys-CUU.bpseq -data/archiveII/5s_Corynebacterium-efficiens-1.bpseq -data/archiveII/5s_Chlorobium-limicola-1.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.P.macrosporus.C1.SSU.1506.bpseq -data/archiveII/RNaseP_LGB32.bpseq -data/archiveII/5s_Curtobacterium-citreum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Rhodopseudomonas-palustris-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000422-Rattus_norvegicus-10116-Ser-GCU.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-cerealis-8.bpseq -data/archiveII/5s_Desulfurococcus-mobilis-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000439-Spinacia_oleracea-3562-Thr-GGU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000553-Asterias_amurensis-7602-Tyr-GUA.bpseq -data/archiveII/srp_Moor.ther._CP000232.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Dict.ther._TRW-14_1-350.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.C.merochlorophea.UNK.SSU.1046.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Shew.spec._TRW-323850_1-356.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Pseu.fluo._CP000094_1-390.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000175-Haloferax_volcanii-2246-Lys-NUU.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A3153.bpseq -data/archiveII/srp_Halo.halo._CP000544.bpseq -data/archiveII/srp_Heli.exil._EE659686.bpseq -data/archiveII/5s_Bartonella-henselae-1.bpseq -data/archiveII/5s_Azoarcus-sp.-1.bpseq -data/archiveII/5s_Corynebacterium-xerosis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Xeno.laev._X01055.bpseq -data/archiveII/5s_Tinca-tinca-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Prop.acne._TRW-1747-3_1-353.bpseq -data/archiveII/srp_Rhod.balt._BX294144.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000013-Pichia_jadinii-4903-Ala-IGC.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000606-Lupinus_luteus-3873-Leu-IAG.bpseq -data/archiveII/srp_Tryp.bruc._AC159431.bpseq -data/archiveII/srp_Spra.loph._GSP-51541.bpseq -data/archiveII/5s_Thermococcus-kodakarensis-2.bpseq -data/archiveII/RNaseP_H.pylori-J99.bpseq -data/archiveII/5s_Drosophila-melanogaster-1.bpseq -data/archiveII/5s_Capniomyces-stellatus-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Trep.dent._AE017226_1-351.bpseq -data/archiveII/16s_C.reinhardtii.chloro_domain3.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.aure._AP009351.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.crescentus.bpseq -data/archiveII/5s_Haliclona-oculata-1.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-licheniformis-5.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Emil.huxl._TRW-280463_1-291.bpseq -data/archiveII/srp_Caul.cres._U22036.bpseq -data/archiveII/5s_Clostridium-acetobutylicum-4.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Baci.halo._BA000004_1-361.bpseq -data/archiveII/RNaseP_D.radiodurans.bpseq -data/archiveII/srp_Medi.trun._AC136507.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-clausii-2.bpseq -data/archiveII/5s_S_kowalev2E.bpseq -data/archiveII/srp_Aspe.terr._GSP-341663.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.S.paniceum.UNK.SSU.1506.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.viridis-K73T.bpseq -data/archiveII/5s_Ligia-oceanica-1.bpseq -data/archiveII/5s_Chlamydomonas-reinhardtii-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.fluorescens.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000223-Salmonella_typhimurium-602-Leu-CAG.bpseq -data/archiveII/23s_B.subtilis_domain6.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.maripaludus.bpseq -data/archiveII/srp_Pyro.aero._AE009852.bpseq -data/archiveII/srp_Agro.tume._AE008984.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.agal._AE014209.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221906.96-545.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Rubr.xyla._CP000386_1-360.bpseq -data/archiveII/srp_Bord.pert._BX640415.bpseq -data/archiveII/16s_C.reinhardtii.mito_domain1.bpseq -data/archiveII/5s_Finegoldia-magna-1.bpseq -data/archiveII/srp_Guil.thet._AF041468.bpseq -data/archiveII/5s_Emplectonema-gracile-2.bpseq -data/archiveII/5s_Xanthobacter-viscosus-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000224-Rhodospirillum_rubrum-1085-Leu-CAA.bpseq -data/archiveII/srp_Chla.cavi._AE016995.bpseq -data/archiveII/tmRNA_uncu.bact._TRW-32045-4_1-369.bpseq -data/archiveII/srp_Pyro.furi._AE010126.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A2642.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Halobacterium-NRC1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Esch.coli._BA000007_1-363.bpseq -data/archiveII/srp_Dros.mela._X00952.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.G.planctonica.C1.SSU.943.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.aure._CP000046.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.majo._AY722713.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000322-Phaseolus_vulgaris-3885-Pro-UGG.bpseq -data/archiveII/srp_Popu.trem._DN498769.bpseq -data/archiveII/srp_Ente.faec._AE016953.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Thio.crun._CP000109_1-358.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.fastidiosum.bpseq -data/archiveII/srp_Geob.kaus._BA000043.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudomonas-syringae-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.viridis-K185.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000263-Rattus_norvegicus-10116-Leu-AA.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Aste.yell._CP000061_1-426.bpseq -data/archiveII/5s_Legionella-longbeachae-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A05.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000030-Aedes_albopictus-7160-Asp-GUC.bpseq -data/archiveII/5s_Amycolatopsis-orientalis-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000317-Salmonella_typhimurium-602-Pro-CGG.bpseq -data/archiveII/srp_Trit.aest._X13915.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Onio.yell._AP006628_1-423.bpseq -data/archiveII/srp_Lotu.japo._BW598799.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Rubr.xyla._TRW-266117_1-360.bpseq -data/archiveII/srp_Sulf.acid._CP000077.bpseq -data/archiveII/srp_Desu.vulg._CP000527.bpseq -data/archiveII/5s_Lactobacillus-plantarum-3.bpseq -data/archiveII/5s_Ambystoma-salmoides-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SMB-B3.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.cere._AE017264.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.thermoautotrophicum-DH.bpseq -data/archiveII/5s_Natrialba-magadii-1.bpseq -data/archiveII/srp_Yers.pest._AE009952.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Dich.nodo._TRW-35819_1-352.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.cere._CP000001.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000538-Asterina_amurensis-69830-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/RNaseP_UK5.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.S.sclerotiorum_1837.C1.LSU.798.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-megaterium-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000113-Streptomyces_coelicolor_A32-100226-Gly-CCC.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000291-Halobacterium_salinarum-2242-Asn-GUU.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.muridarum-g.bpseq -data/archiveII/srp_Chro.sale._CP000285.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Burk.ceno._TRW-216591_1-370.bpseq -data/archiveII/5s_Dactylosporangium-aurantiacum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Leptospira-biflexa-1.bpseq -data/archiveII/srp_Dasy.nove._GSP-9361.bpseq -data/archiveII/5s_Agaricostilbum-pulcherrimum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Cycas-revoluta-1.bpseq -data/archiveII/5s_Thermoactinomyces-vulgaris-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Deha.ethe._CP000027_1-352.bpseq -data/archiveII/5s_Gymnosporangium-clavariaeforme-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Lact.gass._CP000413_1-366.bpseq -data/archiveII/23s_S.aureus_domain1.bpseq -data/archiveII/5s_Gracilaria-compressa-2.bpseq -data/archiveII/5s_Caulobacter-sp.-5.bpseq -data/archiveII/5s_Deinococcus-radiodurans-3.bpseq -data/archiveII/5s_Candida-diversa-1.bpseq -data/archiveII/srp_Plas.berg._DC223613.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000244-Rattus_norvegicus-10116-Leu-UAG.bpseq -data/archiveII/5s_Helianthus-annuus-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Burk.thai._CP000086_1-370.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000543-Bacillus_subtilis-1423-Tyr-QUA.bpseq -data/archiveII/5s_Arion-rufus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Crit.luci._AY781798.bpseq -data/archiveII/srp_Dani.rrer._CR925739.bpseq -data/archiveII/5s_Frankia-sp.-3.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.lepr._AL583925.bpseq -data/archiveII/srp_Ente.faec._AE016830.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.glauca-K194.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000136-Homo_sapiens-9606-Gly-GCC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.ther._CP000419_1-350.bpseq -data/archiveII/16s_A.fulgidus_domain3.bpseq -data/archiveII/srp_Plas.reic._GSP-5854.bpseq -data/archiveII/5s_Saccharothrix-mutabilis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-alginolyticus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Methanococcus-voltae-2.bpseq -data/archiveII/5s_Neurospora-crassa-10.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000549-Tetrahymena_pyriformis-5908-Tyr-QUA.bpseq -data/archiveII/RNaseP_DU1.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-avermitilis-2.bpseq -data/archiveII/5s_Photorhabdus-luminescens-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000509-Thermus_thermophilus-274-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000041-Xenopus_laevis-8355-Asp-8UC.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.equi-g.bpseq -data/archiveII/5s_Achromobacter-denitrificans-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000301-Lupinus_luteus-3873-Asn-UU.bpseq -data/archiveII/5s_Chlamydomonas-sp.-1.bpseq -data/archiveII/5s_Neurospora-crassa-13.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.trop._AY781789.bpseq -data/archiveII/5s_Sporolactobacillus-nakayamae-1.bpseq -data/archiveII/5s_Spirosoma-sp.-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_L.ferrooxidans-MK.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Ther.comm._TRW-289377_1-355.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Leuc.mese._TRW-1245_1-358.bpseq -data/archiveII/srp_Lyco.escu._Z29110.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000222-Escherichia_coli-562-Leu-GAG.bpseq -data/archiveII/srp_Lact.john._AE017201.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.T.hyperangularis.C1.LSU.1925.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Erwi.chry._TRW-198628_1-381.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.innocuum.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.L.dispersa.UNK.SSU.1516.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A02.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Fran.spec._CP000249_1-374.bpseq -data/archiveII/RNaseP_L.japonicus-IFO12422.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000102-Bos_taurus-9913-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/srp_Syne.elon._AP008231.bpseq -data/archiveII/srp_Phyt.infe._CV911012.bpseq -data/archiveII/grp1_b.I1.e.A.griffini.1.C1.SSU.516.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A3254.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000047-Escherichia_coli-562-Glu-SUC.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.M.scalaris.C1.SSU.1506.bpseq -data/archiveII/srp_Lact.case._CP000423.bpseq -data/archiveII/srp_Ocea.ihey._BA000028.bpseq -data/archiveII/5s_Ginkgo-biloba-1.bpseq -data/archiveII/5s_Mycoplasma-gallisepticum-4.bpseq -data/archiveII/RNaseP_E1B.bpseq -data/archiveII/5s_Halorubrum-terrestre-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.jannaschii.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Chlo.aura._AY040836_1-361.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.formicicum.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000067-Escherichia_coli-562-Phe-GAA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000034-Mesocricetus_auratus-10036-Asp-GUC.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000152-Haloferax_volcanii-2246-Ile-NAU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000522-Bos_taurus-9913-Ini-AU.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.shigelloides.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000615-Nanoarchaeum_equitans-160232-Trp-CCA.bpseq -data/archiveII/5s_Chrysaora-quinquecirrha-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Camp.fetu._AY211269_1-361.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000105-Halobacterium_salinarum-2242-Gly-GCC.bpseq -data/archiveII/5s_Micrococcus-luteus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Emericella-nidulans-1.bpseq -data/archiveII/srp_Bruc.abor._AE017223.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000046-Escherichia_coli-562-Glu-SUC.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000349-Haloferax_volcanii-2246-Arg-CCG.bpseq -data/archiveII/5s_Burkholderia-cepacia-2.bpseq -data/archiveII/srp_Tetr.rost._SDB-5909.bpseq -data/archiveII/16s_P.occultum_domain2.bpseq -data/archiveII/5s_Tremella-mesenterica-1.bpseq -data/archiveII/5s_Verrucomicrobium-spinosum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Acremonium-persicinum-2.bpseq -data/archiveII/5s_Lactococcus-lactis-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000114-Staphylococcus_epidermidis-1282-Gly-UCC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Baci.thur._AE017355_1-355.bpseq -data/archiveII/5s_Spirogyra-sp.-1.bpseq -data/archiveII/5s_Pinus-contorta-1.bpseq -data/archiveII/srp_Unci.rees._GSP-336963.bpseq -data/archiveII/5s_Vitreoscilla-filiformis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Halorubrum-distributum-4.bpseq -data/archiveII/srp_Eime.tene._GSP-413949.bpseq -data/archiveII/srp_Bdel.bact._BX842656.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.alcalifaciens.bpseq -data/archiveII/5s_Rana-catesbeiana-1.bpseq -data/archiveII/srp_Chla.muri._AE002160.bpseq -data/archiveII/5s_Meloidogyne-arenaria-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.gall._AE015450_1-408.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Salm.ente._AL627276_1-363.bpseq -data/archiveII/5s_Mycoplasma-mycoides-3.bpseq -data/archiveII/RNaseP_H.pylori-26695.bpseq -data/archiveII/srp_Bruc.ovis._CP000708.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.fermentans.bpseq -data/archiveII/5s_Bacteroides-capillosus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Camp.jeju._AL111168.bpseq -data/archiveII/16s_M.polymorpha_domain3.bpseq -data/archiveII/srp_Neis.gono._AF482014.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-culmorum-4.bpseq -data/archiveII/5s_Mycobacterium-flavescens-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Heli.pylo._AE000511_1-386.bpseq -data/archiveII/srp_Ence.cuni._AL590449.bpseq -data/archiveII/srp_Ente.faec._BD193435.bpseq -data/archiveII/5s_Frankia-sp.-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000374-Bos_taurus-9913-Arg-CCG.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A07.bpseq -data/archiveII/5s_Pyrococcus-horikoshii-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Rals.sola._AL646052_1-360.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000400-Loligo_bleekeri-6617-Ser-7CU.bpseq -data/archiveII/srp_Bifi.long._AX492782.bpseq -data/archiveII/5s_Tropheryma-whipplei-1.bpseq -data/archiveII/srp_Kine.radi._CP000750.bpseq -data/archiveII/tmRNA_envi.sequ._TRW-32045-2_1-345.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221915.120-667.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Burk.xeno._CP000270_1-370.bpseq -data/archiveII/5s_Streptococcus-mutans-1.bpseq -data/archiveII/5s_Zymomonas-mobilis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Methanosarcina-acetivorans-1.bpseq -data/archiveII/5s_Chlorobium-limicola-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000281-Phaseolus_vulgaris-3885-Met-CAU.bpseq -data/archiveII/srp_Zea.mays._CK700970.bpseq -data/archiveII/5s_Bursaphelenchus-mucronatus-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Yers.pest._CP000305_1-364.bpseq -data/archiveII/5s_Ulva-pertusa-1.bpseq -data/archiveII/srp_Brad.japo._BA000040.bpseq -data/archiveII/srp_Coxi.burn._CP000733.bpseq -data/archiveII/5s_Flectobacillus-major-1.bpseq -data/archiveII/srp_Arab.thal._AC005662.bpseq -data/archiveII/5s_Acremonium-persicinum-3.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.japonicus.bpseq -data/archiveII/5s_Gallus-gallus-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Esch.coli._D12501_1-363.bpseq -data/archiveII/srp_Fran.tula._CP000608.bpseq -data/archiveII/srp_Bloc.flor._BX248585.bpseq -data/archiveII/5s_Halobacterium-sp.-2.bpseq -data/archiveII/5s_Fusobacterium-mortiferum-2.bpseq -data/archiveII/16s_Z.mays_domain1.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.suis._CP000407.bpseq -data/archiveII/5s_Puccinia-suaveolens-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Carn.malt._AF275938_1-366.bpseq -data/archiveII/5s_Euplotes-woodruffi-1.bpseq -data/archiveII/srp_Bord.para._BX640426.bpseq -data/archiveII/RNaseP_N.europaea.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000381-Haloferax_volcanii-2246-Ser-GCU.bpseq -data/archiveII/5s_Lactobacillus-delbrueckii-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Alka.meta._TRW-293826_1-355.bpseq -data/archiveII/tmRNA_uncu.bact._TRW-45456_1-408.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000407-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Ser-IGA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000290-Enterobacteria_phage_T5-10726-Asn-GUU.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.P.carinii.Pc2.C1.LSU.1921.bpseq -data/archiveII/5s_Cerastoderma-glaucum-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Ther.elon._BA000039_1-386.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.B.ciliata.JCM6865.C1.SSU.1506.bpseq -data/archiveII/5s_Methylobacterium-sp.-1.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.c.S.anglica.C3.tLEU.bpseq -data/archiveII/srp_Bruc.suis._AE014291.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Xant.camp._AM039952_1-397.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000446-Halobacterium_salinarum-2242-Val-CAC.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.geni._U39706.bpseq -data/archiveII/srp_Yarr.lipo._CR382127.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000584-Aeropyrum_pernix-56636-Pro-GGG.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000049-Chlamydomonas_reinhardtii-3055-Glu-NUC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Ther.ther._Y15063_1-349.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Verr.spin._TRW-240016_1-356.bpseq -data/archiveII/5s_Cellulosimicrobium-cellulans-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000508-Thermus_thermophilus-274-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Tetrahymena-thermophila-3.bpseq -data/archiveII/srp_Wolb.endo._AB080664.bpseq -data/archiveII/5s_Gastrotheca-riobambae-1.bpseq -data/archiveII/5s_Prauserella-rugosa-1.bpseq -data/archiveII/5s_Salmonella-typhimurium-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Aqui.aeol._AE000749_1-344.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.c.G.prostrata.C3.tLEU.bpseq -data/archiveII/srp_Burk.pseu._CP000124.bpseq -data/archiveII/RNaseP_R.capsulatus.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.brierleyi.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A1726.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Prochlorococcus-PAC1B.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000209-Enterobacteria_phage_T4-10665-Leu-NAA.bpseq -data/archiveII/5s_Meloidogyne-arenaria-4.bpseq -data/archiveII/5s_Brucella-melitensis-3.bpseq -data/archiveII/5s_Fluoribacter-bozemanae-1.bpseq -data/archiveII/5s_Blakeslea-trispora-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_LGB5.bpseq -data/archiveII/5s_Thermotoga-maritima-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Psyc.arct._CP000082_1-359.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Kleb.pneu._TRW-272620_1-363.bpseq -data/archiveII/5s_Neurospora-crassa-1.bpseq -data/archiveII/16s_P.occultum_domain1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Neis.lact._TRW-486_1-362.bpseq -data/archiveII/srp_Chla.pneu._AE002198.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000466-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Val-AC.bpseq -data/archiveII/srp_Taen.gutt._CK235759.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Yers.pest._CP000308_1-364.bpseq -data/archiveII/srp_Mari.aqua._CP000514.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-thuringiensis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Trichoplax-adhaerens-1.bpseq -data/archiveII/srp_Trit.aest._CD897082.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Vibr.spec._TRW-345075_1-368.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Pseu.aeru._CP000438_1-353.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000504-Mycoplasma_capricolum-2095-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/srp_Plas.chab._GSP-31271.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.coel._AL939118.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-anthracis-5.bpseq -data/archiveII/5s_Clostridium-innocuum-1.bpseq -data/archiveII/16s_H.volcanii_domain1.bpseq -data/archiveII/5s_Septobasidium-carestianum-1.bpseq -data/archiveII/srp_Clos.ther._CP000568.bpseq -data/archiveII/srp_Tric.rees._GSP-334564-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000531-Phaseolus_vulgaris-3885-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-lunulosporum-3.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-lunulosporum-4.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Croc.wats._TRW-165597_1-386.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000580-Aeropyrum_pernix-56636-Lys-UUU.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Para.symb._BX908798_1-405.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.staleyi.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000576-Leishmania_tarentolae-5689-Asp-GUC.bpseq -data/archiveII/5s_Brachionus-plicatilis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-lunulosporum-6.bpseq -data/archiveII/5s_Herpetosiphon-aurantiacus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Cand.dubl._GSP-42374.bpseq -data/archiveII/srp_Vibr.fisc._CP000020.bpseq -data/archiveII/5s_Ureaplasma-urealyticum-2.bpseq -data/archiveII/srp_Vibr.chol._AE003852.bpseq -data/archiveII/5s_Geobacillus-stearothermophilus-4.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.myco._BX293980.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000368-Mesocricetus_auratus-10036-Arg-UCG.bpseq -data/archiveII/RNaseP_H.morrhuae.bpseq -data/archiveII/srp_Sacc.cast._AJ550804.bpseq -data/archiveII/5s_Methanosarcina-vacuolata-1.bpseq -data/archiveII/srp_Bart.quin._BX897700.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._AA559987.bpseq -data/archiveII/23s_B.subtilis_domain4.bpseq -data/archiveII/5s_Thermoplasma-volcanium-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_LGW18.bpseq -data/archiveII/5s_Haloarcula-marismortui-3.bpseq -data/archiveII/RNaseP_B.calamita.bpseq -data/archiveII/16s_P.staleyi_domain1.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.aure._BA000033.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Prochlorococcus-TATL2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000344-Mus_musculus-10090-Gln-JUG.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudomonas-fluorescens-2.bpseq -data/archiveII/5s_Pasteurella-multocida-2.bpseq -data/archiveII/RNaseP_E.faecalis-2.bpseq -data/archiveII/5s_Loofah-witches-broom-phytoplasma-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_X.fastidiosa.bpseq -data/archiveII/16s_A.fulgidus_domain4.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Sten.malt._TRW-40324_1-354.bpseq -data/archiveII/srp_Rals.eutr._CP000090.bpseq -data/archiveII/RNaseP_R.palustris.bpseq -data/archiveII/5s_Salmonella-typhimurium-4.bpseq -data/archiveII/5s_Yersinia-pseudotuberculosis-3.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Cory.effi._BA000035_1-376.bpseq -data/archiveII/5s_Taphrina-deformans-1.bpseq -data/archiveII/srp_Anto.locu._GSP-278021.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.c.S.x.townsendii.C3.tLEU.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221917.99-542.bpseq -data/archiveII/5s_Yersinia-pseudotuberculosis-5.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Xant.oryz._AE013598_1-397.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.tuberculosis.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.A.capsulatus.G184B.C1.SSU.bpseq -data/archiveII/srp_Gall.gall._AB073218.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000082-Neurospora_crassa-5141-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/srp_Brev.brev._D12926.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000262-Rattus_norvegicus-10116-Leu-AA.bpseq -data/archiveII/5s_Sporosarcina-pasteurii-1.bpseq -data/archiveII/srp_Brug.mala._GSP-6279.bpseq -data/archiveII/5s_Cupriavidus-necator-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_envi.sequ._TRW-363179_1-348.bpseq -data/archiveII/16s_S.cerevisiae_domain2.bpseq -data/archiveII/srp_Asco.apis._GSP-392613.bpseq -data/archiveII/16s_B.burgdorferi_domain1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000172-Lupinus_luteus-3873-Ile-IAU.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-coelicolor-6.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Buch.aphi._AE013218_1-376.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Bord.para._TRW-257311_1-387.bpseq -data/archiveII/5s_Exidia-glandulosa-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPB73.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.subt._X06802.bpseq -data/archiveII/23s_E.coli_domain3.bpseq -data/archiveII/5s_Fusobacterium-nucleatum-2.bpseq -data/archiveII/5s_Secale-cereale-2.bpseq -data/archiveII/5s_Emericella-nidulans-7.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.globosus.bpseq -data/archiveII/RNaseP_B.anthracis.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.tepidum.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A1621.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000148-Ovis_aries-9940-His-QUG.bpseq -data/archiveII/5s_Amycolatopsis-methanolica-1.bpseq -data/archiveII/5s_Paracoccus-denitrificans-1.bpseq -data/archiveII/srp_Lyco.escu._Z29100.bpseq -data/archiveII/5s_Helicobacter-pylori-2.bpseq -data/archiveII/srp_Proc.mari._CP000554.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000171-Pichia_jadinii-4903-Ile-IAU.bpseq -data/archiveII/srp_Bruc.meli._AM040264.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000339-Tetrahymena_thermophila-5911-Gln-JUG.bpseq -data/archiveII/5s_Amphibacillus-xylanus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudomonas-stutzeri-1.bpseq -data/archiveII/srp_Chro.viol._AE016825.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000396-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Ser-UGA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000276-Escherichia_coli-562-Met-MAU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000296-Azospirillum_lipoferum-193-Asn-QUU.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-avermitilis-4.bpseq -data/archiveII/5s_Mus-musculus-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.geni._TRW-243273_1-388.bpseq -data/archiveII/RNaseP_T.maritima.bpseq -data/archiveII/srp_Caen.eleg._AY948608.bpseq -data/archiveII/5s_Renibacterium-salmoninarum-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.gordonii.bpseq -data/archiveII/srp_Meth.flag._CP000284.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SMB-B2.bpseq -data/archiveII/5s_Pneumocystis-carinii-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000274-Bacillus_subtilis-1423-Met-CAU.bpseq -data/archiveII/RNaseP_PS22.bpseq -data/archiveII/16s_Z.mays_domain2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000342-Bos_taurus-9913-Gln-CUG.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Clos.teta._AE015927_1-355.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000469-Rattus_norvegicus-10116-Val-IAC.bpseq -data/archiveII/srp_Cion.inte._BW230361.bpseq -data/archiveII/5s_Mytilus-edulis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Dehalococcoides-ethenogenes-1.bpseq -data/archiveII/5s_Cancer-pagurus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Caulobacter-sp.-3.bpseq -data/archiveII/5s_Thiobacillus-sp.-1.bpseq -data/archiveII/srp_Oryc.cuni._AB021174.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudomonas-putida-1.bpseq -data/archiveII/srp_Para.bras._EH655308.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000337-Tetrahymena_thermophila-5911-Gln-CUA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000609-Chlamydomonas_reinhardtii-3055-Leu-UA7.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._M20910.bpseq -data/archiveII/5s_Candidatus-Pelagibacter-ubique-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Esch.coli._U00096_1-363.bpseq -data/archiveII/5s_Brevibacterium-linens-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000032-Rattus_norvegicus-10116-Asp-GUC.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000314-Mycoplasma_capricolum-2095-Pro-UGG.bpseq -data/archiveII/5s_Methanocaldococcus-jannaschii-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.uvarum.bpseq -data/archiveII/srp_Sacc.eryt._AM420293.bpseq -data/archiveII/srp_Zea.mays._CB179518.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Wigg.glos._BA000021_1-365.bpseq -data/archiveII/5s_Rhodobacter-capsulatus-3.bpseq -data/archiveII/5s_Arthrobacter-globiformis-2.bpseq -data/archiveII/5s_Hemicentrotus-sp.-1.bpseq -data/archiveII/5s_Neurospora-crassa-15.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000335-Nicotiana_rustica-4093-Gln-NUG.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Yers.pseu._AR948532_1-364.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Prochlorococcus-TATL2-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000346-Homo_sapiens-9606-Gln-NUG.bpseq -data/archiveII/srp_Trit.aest._BQ167677.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000293-Methanobacterium_thermaggregans-83982-Asn-UU.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.haem._AP006716.bpseq -data/archiveII/srp_Trit.aest._CA718249.bpseq -data/archiveII/5s_Yersinia-pestis-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000198-Oryctolagus_cuniculus-9986-Lys-CUU.bpseq -data/archiveII/5s_Candidatus-Tremblaya-princeps-5.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-fischeri-3.bpseq -data/archiveII/5s_Ehrlichia-chaffeensis-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000083-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Shig.dyse._TRW-358708_1-363.bpseq -data/archiveII/srp_Meth.mari._CP000745.bpseq -data/archiveII/5s_Acidiphilium-acidophilum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-halodurans-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000495-Triticum_aestivum-4565-Trp-BCA.bpseq -data/archiveII/srp_Proc.mari._AE017126.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Salm.typh._AY319520_1-363.bpseq -data/archiveII/16s_E.coli_domain4.bpseq -data/archiveII/5s_Haemonchus-contortus-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Baci.cere._AE017194_1-355.bpseq -data/archiveII/5s_Neurospora-africana-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Lept.spec._TRW-261385_1-359.bpseq -data/archiveII/RNaseP_E.eschsholtzii.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000164-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Ile-GAU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000332-Escherichia_coli-562-Gln-CUG.bpseq -data/archiveII/5s_Anaerorhabdus-furcosa-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000456-Escherichia_coli-562-Val-VAC.bpseq -data/archiveII/16s_S.cerevisiae_domain3.bpseq -data/archiveII/RNaseP_EM14b-9.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.aeth._AY722730.bpseq -data/archiveII/srp_Cani.spec._SDB-9616.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A1315.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Emil.huxl._AY741371_1-291.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.servazzii.bpseq -data/archiveII/srp_Psyc.cryo._CP000323.bpseq -data/archiveII/srp_Buch.aphi._AE016826.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.braz._AY781790.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Bloc.penn._CP000016_1-392.bpseq -data/archiveII/5s_Lactobacillus-acidophilus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Meth.jann._L77117.bpseq -data/archiveII/5s_Porphyra-tenera-1.bpseq -data/archiveII/srp_Sulf.toko._BA000023.bpseq -data/archiveII/5s_Gloiopeltis-complanata-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000564-Drosophila_melanogaster-7227-Tyr-QPA.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Haem.infl._U32808_1-366.bpseq -data/archiveII/srp_Fuso.nucl._AE009951.bpseq -data/archiveII/16s_M.polymorpha_domain2.bpseq -data/archiveII/srp_Lyco.escu._Z46746.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Copr.prot._TRW-351627_1-353.bpseq -data/archiveII/5s_uncultured-euryarchaeote-37F11-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000548-Scenedesmus_obliquus-3088-Tyr-GUA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000127-Halocynthia_roretzi-7729-Gly-UCU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000187-Loligo_bleekeri-6617-Lys-CUU.bpseq -data/archiveII/5s_Acinetospora-crinita-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000529-Triticum_aestivum-4565-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Graphiola-phoenicis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._BF908693.bpseq -data/archiveII/5s_Methanobrevibacter-ruminantium-1.bpseq -data/archiveII/16s_H.sapiens.mito_domain1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A2946.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SL2D.bpseq -data/archiveII/srp_Arab.thal._AL161496.bpseq -data/archiveII/5s_Bullera-alba-1.bpseq -data/archiveII/5s_Halorubrum-distributum-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000551-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Tyr-GUA.bpseq -data/archiveII/5s_Actinokineospora-riparia-1.bpseq -data/archiveII/5s_Tenebrio-molitor-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000012-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Ala-IGC.bpseq -data/archiveII/srp_Bras.napu._EE410150.bpseq -data/archiveII/tmRNA_envi.sequ._TRW-259291_1-355.bpseq -data/archiveII/5s_Rhodobacter-sphaeroides-2.bpseq -data/archiveII/5s_Comamonas-terrigena-1.bpseq -data/archiveII/5s_Xenopus-borealis-3.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-violaceus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudocentrotus-depressus-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.limicola.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000451-Mycoplasma_capricolum-2095-Val-UAC.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-culmorum-1.bpseq -data/archiveII/srp_Rhod.palu._CP000463.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.hyop._TRW-262719_1-433.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.fibuligera.bpseq -data/archiveII/5s_Pleurodeles-waltl-1.bpseq -data/archiveII/16s_F.ananassa_domain3.bpseq -data/archiveII/5s_Lactococcus-lactis-3.bpseq -data/archiveII/5s_Eimeria-tenella-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Clos.ther._TRW-203119_1-387.bpseq -data/archiveII/5s_Bacteroides-fragilis-3.bpseq -data/archiveII/srp_Ferv.nodo._CP000771.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000420-Spinacia_oleracea-3562-Ser-IGA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000289-Homo_sapiens-9606-Met-BAU.bpseq -data/archiveII/srp_Clos.novy._CP000382.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Bifi.long._TRW-206672_1-397.bpseq -data/archiveII/5s_Rhodobacter-sphaeroides-1.bpseq -data/archiveII/5s_Bjerkandera-adusta-1.bpseq -data/archiveII/srp_Haem.infl._BD426631.bpseq -data/archiveII/5s_Candidatus-Tremblaya-princeps-6.bpseq -data/archiveII/5s_Physarum-polycephalum-1.bpseq -data/archiveII/srp_Woli.succ._BX571662.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-pseudograminearum-4.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Onchorhynchus-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_B.thetaiotaomicron.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.sobr._TRW-246202_1-349.bpseq -data/archiveII/srp_Pseu.puti._AE016790.bpseq -data/archiveII/srp_Rick.cono._AE008680.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000219-Bacillus_subtilis-1423-Leu-CAG.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000061-Mus_musculus-10090-Glu-CUC.bpseq -data/archiveII/RNaseP_B.bronchiseptica.bpseq -data/archiveII/16s_P.occultum_domain4.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Camp.coli._TRW-306254_1-359.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Chla.abor._CR848038_1-425.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stap.aure._BA000018_1-362.bpseq -data/archiveII/5s_Bugula-neritina-1.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.sang._CP000387.bpseq -data/archiveII/5s_Chlamydia-trachomatis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Halorubrum-distributum-3.bpseq -data/archiveII/srp_Dros.will._GSP-7260.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Syne.spec._D90916_1-396.bpseq -data/archiveII/RNaseP_B.hermsii.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Pseu.ento._CT573326_1-392.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stap.aure._BX571856_1-362.bpseq -data/archiveII/5s_Borrelia-burgdorferi-1.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-adaptatus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Thiobacillus-sp.-2.bpseq -data/archiveII/5s_Meloidogyne-chitwoodi-1.bpseq -data/archiveII/5s_Leptospira-interrogans-2.bpseq -data/archiveII/srp_Pseu.aeru._X14404.bpseq -data/archiveII/RNaseP_T.celerAL1.bpseq -data/archiveII/srp_Camp.jeju._AL139074.bpseq -data/archiveII/srp_Caen.eleg._AY948606.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000536-Salmo_salar-8030-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Fuso.nucl._TRW-209882_1-344.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Past.mult._AE006115_1-367.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.guya._AY722728.bpseq -data/archiveII/srp_Lyco.escu._Z29107.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-sp.-1.bpseq -data/archiveII/5s_Archaeoglobus-fulgidus-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_T.neapolitana.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Lept.spec._TRW-261386_1-359.bpseq -data/archiveII/srp_Tryp.cong._SDB-5692.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000485-Nicotiana_tabacum-4097-Trp-BCA.bpseq -data/archiveII/5s_Rhabdomonas-costata-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Heli.pylo._AE001503_1-383.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221910.112-554.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.P.sarcinoidea.C1.SSU.943.bpseq -data/archiveII/5s_Sphingomonas-ursincola-1.bpseq -data/archiveII/5s_Hyphomicrobium-sp.-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_R.americana-mito.bpseq -data/archiveII/srp_Acin.spec._CR543861.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.subt._X14796.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000202-Drosophila_melanogaster-7227-Lys-UU.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-cereus-4.bpseq -data/archiveII/5s_Methanococcus-vannielii-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.geni._U39713_1-385.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-culmorum-5.bpseq -data/archiveII/5s_Andrias-davidianus-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000443-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Thr-IGU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000341-Rattus_norvegicus-10116-Gln-CUG.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.amyl._D13041.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-fluvialis-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.xanthus.bpseq -data/archiveII/5s_Legionella-pneumophila-3.bpseq -data/archiveII/srp_Orni.anat._GSP-9258.bpseq -data/archiveII/srp_Plas.falc._AE014819.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000355-Escherichia_coli-562-Arg-ICG.bpseq -data/archiveII/5s_Thermus-thermophilus-2.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.subt._X12642.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Pseu.puti._AE015451_1-399.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.salinestris-184.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-sp.-4.bpseq -data/archiveII/5s_Nocardiopsis-dassonvillei-1.bpseq -data/archiveII/srp_Borr.gari._CP000013.bpseq -data/archiveII/5s_Methanosarcina-mazei-2.bpseq -data/archiveII/srp_Shew.loih._CP000606.bpseq -data/archiveII/RNaseP_PS6.bpseq -data/archiveII/5s_Equisetum-arvense-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000471-Oryctolagus_cuniculus-9986-Val-IAC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.lepr._TRW-272631_1-369.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.ferrooxidans-g.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221924.105-538.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000229-Glycine_max-3847-Leu-JAA.bpseq -data/archiveII/5s_Ureaplasma-parvum-3.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221933.121-679.bpseq -data/archiveII/5s_Dryopteris-acuminata-1.bpseq -data/archiveII/srp_Thei.annu._NW_001091934.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000523-Tetrahymena_thermophila-5911-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/srp_Schi.pomb._M20264.bpseq -data/archiveII/5s_Halobacterium-salinarum-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Xyle.fast._AE009442_1-355.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.typhi.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Yers.pest._AE009952_1-364.bpseq -data/archiveII/srp_Haem.infl._CP000671.bpseq -data/archiveII/srp_Sacc.baya._AJ550801.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000037-Rattus_norvegicus-10116-Asp-GUC.bpseq -data/archiveII/srp_Brad.spec._CU234118.bpseq -data/archiveII/srp_Cyan.cald._AF022186.bpseq -data/archiveII/5s_Rhabditis-tokai-1.bpseq -data/archiveII/5s_Chlamydia-muridarum-1.bpseq -data/archiveII/srp_Haem.ducr._U32175.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000133-Bombyx_mori-7091-Gly-GCC.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000128-Halocynthia_roretzi-7729-Gly-GCU.bpseq -data/archiveII/srp_Lyco.escu._Z29103.bpseq -data/archiveII/5s_Mycoplasma-hyopneumoniae-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Chla.muri._TRW-83560_1-421.bpseq -data/archiveII/5s_Triticum-aestivum-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A2539.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000562-Nicotiana_rustica-4093-Tyr-GPA.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-anthracis-2.bpseq -data/archiveII/srp_Para.bras._CN240152.bpseq -data/archiveII/srp_Wolb.endo._AE017259.bpseq -data/archiveII/srp_Bart.hens._BX897699.bpseq -data/archiveII/srp_Zea.mays._CF602412.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.marcescens.bpseq -data/archiveII/5s_Deinococcus-radiodurans-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000585-Aeropyrum_pernix-56636-Thr-CGU.bpseq -data/archiveII/srp_Schi.japo._GSP-402676.bpseq -data/archiveII/5s_Lactococcus-lactis-2.bpseq -data/archiveII/5s_Xenopus-borealis-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.pyog._TRW-1314-2_1-350.bpseq -data/archiveII/5s_Aeromonas-media-1.bpseq -data/archiveII/5s_Locusta-migratoria-1.bpseq -data/archiveII/srp_Para.bras._GSP-121759.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Geob.stea._TRW-1422_1-352.bpseq -data/archiveII/srp_Clos.teta._AE015936.bpseq -data/archiveII/5s_Staphylococcus-haemolyticus-2.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.pneu._U00089.bpseq -data/archiveII/5s_Tricholoma-matsutake-1.bpseq -data/archiveII/srp_Bord.aviu._AM167904.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221937.99-545.bpseq -data/archiveII/5s_Yersinia-pestis-5.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-asiaticum-6.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.m.S.pombe.B1.OX1.bpseq -data/archiveII/srp_Cory.effi._BA000035.bpseq -data/archiveII/tmRNA_uncu.bact._TRW-383630-1_1-364.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000559-Triticum_aestivum-4565-Tyr-GPA.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.mobi._AE017308.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Oscillatoria-PCC7515.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._BF909425.bpseq -data/archiveII/5s_Auricularia-auricula-judae-1.bpseq -data/archiveII/5s_Mycoplasma-gallisepticum-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000611-Sinorhizobium_meliloti-382-His-GUG.bpseq -data/archiveII/srp_Heli.pylo._CP000241.bpseq -data/archiveII/5s_Brucella-suis-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Fuso.nucl._AE010567_1-341.bpseq -data/archiveII/5s_Hyphomicrobium-sp.-5.bpseq -data/archiveII/srp_Cryp.homi._GSP-353151.bpseq -data/archiveII/5s_Propionibacterium-acnes-1.bpseq -data/archiveII/5s_Deinococcus-radiodurans-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_uncu.bact._TRW-80840-2_1-379.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000089-Brassica_napus-3708-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000280-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Met-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Buchnera-aphidicola-3.bpseq -data/archiveII/srp_Neis.meni._DD001104.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000461-Rattus_norvegicus-10116-Val-UAC.bpseq -data/archiveII/srp_Pyro.arse._CP000660.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.ther._CP000024.bpseq -data/archiveII/5s_Saccharomyces-cerevisiae-5.bpseq -data/archiveII/5s_Palmaria-palmata-1.bpseq -data/archiveII/5s_Ureaplasma-urealyticum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudomonas-stutzeri-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000392-Escherichia_coli-562-Ser-GGA.bpseq -data/archiveII/srp_Oryz.sati._AP003333.bpseq -data/archiveII/5s_Escherichia-coli-3.bpseq -data/archiveII/RNaseP_L.muta-2.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.thur._CP000485.bpseq -data/archiveII/5s_Saccharomyces-cerevisiae-7.bpseq -data/archiveII/RNaseP_B.brevis.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-cholerae-2.bpseq -data/archiveII/16s_H.sapiens_domain3.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Camp.coli._AL111168_1-359.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.aureus-2.bpseq -data/archiveII/5s_Solemya-velum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Endophyllum-sempervivi-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myxo.xant._TRW-34_1-366.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.epid._AX145149.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Nitr.ocea._CP000127_1-361.bpseq -data/archiveII/srp_Shig.flex._AE016979.bpseq -data/archiveII/5s_Salmonella-enterica-6.bpseq -data/archiveII/5s_Candida-zeylanoides-1.bpseq -data/archiveII/srp_Pseu.syri._AE016853.bpseq -data/archiveII/srp_Geob.uran._CP000698.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000436-Bacillus_subtilis-1423-Thr-5GU.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Calothrix-PCC7601.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-methanolicus-8.bpseq -data/archiveII/5s_Wuchereria-bancrofti-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000406-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Ser-NGA.bpseq -data/archiveII/5s_Phlyctochytrium-irregulare-1.bpseq -data/archiveII/srp_Plas.berg._DC223490.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A6296.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.bovi._BX248347.bpseq -data/archiveII/16s_C.elegans_domain1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Geob.sulf._AE017180_1-356.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000534-Euphausia_superba-6819-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Arthrobacter-globiformis-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_List.ivan._AF440342_1-321.bpseq -data/archiveII/5s_Amoebidium-parasiticum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Phacus-curvicauda-1.bpseq -data/archiveII/5s_Geobacillus-kaustophilus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Caen.eleg._Z34533.bpseq -data/archiveII/RNaseP_U.stanburiana.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000319-Salmonella_typhimurium-602-Pro-VGG.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.A.stipitatus.C1.SSU.1046.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.thermolithotrophicus.bpseq -data/archiveII/srp_Shig.flex._AE014073.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000367-Bos_taurus-9913-Arg-UCG.bpseq -data/archiveII/srp_Ther.volc._BA000011.bpseq -data/archiveII/srp_Popu.trem._DN489028.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.b.Phormidium.sp.N182.C3.tLEU.bpseq -data/archiveII/srp_Shew.spec._CP000503.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000060-Drosophila_melanogaster-7227-Glu-2UC.bpseq -data/archiveII/16s_P.staleyi_domain3.bpseq -data/archiveII/5s_Terrapene-carolina-1.bpseq -data/archiveII/5s_Mytilus-galloprovincialis-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000515-Phaseolus_vulgaris-3885-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Cyan.para._U30821_1-291.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-methanolicus-7.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000125-Bos_taurus-9913-Gly-UCC.bpseq -data/archiveII/23s_T.thermophilus_domain5.bpseq -data/archiveII/srp_Tric.vagi._GSP-5722-1.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.guya._AY722727.bpseq -data/archiveII/5s_Rhodococcus-erythropolis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Staphylococcus-haemolyticus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Heli.pylo._AE001439.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Serr.marc._TRW-273526_1-364.bpseq -data/archiveII/5s_Clavispora-opuntiae-3.bpseq -data/archiveII/5s_Urechis-unicinctus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Cryptococcus-neoformans-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000245-Rattus_norvegicus-10116-Leu-UAG.bpseq -data/archiveII/5s_Ustilago-longissima-1.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.aure._E36052.bpseq -data/archiveII/srp_Citr.sine._CN181543.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000426-Drosophila_melanogaster-7227-Ser-CGA.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.majo._AY722715.bpseq -data/archiveII/5s_Clostridium-acetobutylicum-2.bpseq -data/archiveII/5s_Acetobacter-aceti-2.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Z.bailii.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.sedula.bpseq -data/archiveII/5s_Rickettsia-prowazekii-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Thal.pseu._EF067921_1-344.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.bikiniensis.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.guilliermondii.bpseq -data/archiveII/srp_Rals.meta._CP000352.bpseq -data/archiveII/5s_Asterias-vulgaris-1.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-asiaticum-5.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Rals.eutr._CP000090_1-360.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.jejuni.bpseq -data/archiveII/5s_Trimorphomyces-papilionaceus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Diplonema-papillatum-1.bpseq -data/archiveII/srp_Ther.acid._AL445063.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000384-Mycoplasma_capricolum-2095-Ser-GCU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000273-Mycoplasma_capricolum-2095-Met-CAU.bpseq -data/archiveII/16s_C.reinhardtii.mito_domain4.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Nostoc-PCC6705.bpseq -data/archiveII/5s_Dictyostelium-discoideum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Silicibacter-pomeroyi-1.bpseq -data/archiveII/5s_Streptococcus-pyogenes-2.bpseq -data/archiveII/5s_Esch_coli2B.bpseq -data/archiveII/5s_Toxoplasma-gondii-2.bpseq -data/archiveII/5s_Penicillium-griseofulvum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Plesiomonas-shigelloides-1.bpseq -data/archiveII/srp_Para.deni._CP000489.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.Bxz1._AY129337_1-437.bpseq -data/archiveII/srp_Rhiz.etli._CP000133.bpseq -data/archiveII/5s_Idiomarina-loihiensis-2.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221908.136-584.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Salm.ente._AE017220_1-363.bpseq -data/archiveII/srp_Para.bras._CN238860.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Rhod.balt._BX294141_1-380.bpseq -data/archiveII/5s_Ureaplasma-parvum-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Acti.succ._TRW-339671_1-367.bpseq -data/archiveII/srp_Arab.thal._AF069442.bpseq -data/archiveII/srp_Sacc.kluy._AJ550805.bpseq -data/archiveII/RNaseP_H.influenza.bpseq -data/archiveII/srp_Mono.brev._GSP-81824.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.aure._CP000253.bpseq -data/archiveII/5s_Drosophila-yakuba-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000074-Tetrahymena_pyriformis-5908-Phe-GAA.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-anthracis-9.bpseq -data/archiveII/srp_Arab.thal._AC005311.bpseq -data/archiveII/srp_Meth.burt._CP000300.bpseq -data/archiveII/srp_Cypr.carp._CF662133.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Soda.glos._AP008232_1-384.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000497-Bos_taurus-9913-Trp-BCA.bpseq -data/archiveII/RNaseP_L.ferrooxidans-CF.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Lact.delb._AF440335_1-316.bpseq -data/archiveII/srp_Lodd.elon._GSP-379508.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.paradoxa-cyanelle.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.S.paniceum.UNK.SSU.114.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000170-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Ile-IAU.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.lich._CP000002.bpseq -data/archiveII/tmRNA_List.mono._AL591983_1-370.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.tube._AE000516.bpseq -data/archiveII/srp_Clos.botu._AM412317.bpseq -data/archiveII/5s_Crossiella-cryophila-1.bpseq -data/archiveII/5s_Pirellula-sp.-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000213-Haloferax_volcanii-2246-Leu-GAG.bpseq -data/archiveII/5s_Clostridium-acetobutylicum-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000042-Haloferax_volcanii-2246-Glu-MUC.bpseq -data/archiveII/5s_Rhodobacter-capsulatus-2.bpseq -data/archiveII/5s_Dugesia-japonica-2.bpseq -data/archiveII/RNaseP_LGW113.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.agal._TRW-1311_1-350.bpseq -data/archiveII/5s_Tremella-encephala-1.bpseq -data/archiveII/srp_Geob.meta._CP000148.bpseq -data/archiveII/16s_G.intestinalis_domain2.bpseq -data/archiveII/srp_Pseu.halo._CR954246.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudomonas-aeruginosa-1.bpseq -data/archiveII/srp_Synt.fuma._CP000478.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000007-Bacillus_subtilis-1423-Ala-5GC.bpseq -data/archiveII/grp1_b.I1.e.C.saccharophila.C1.SSU.156.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Buchnera-APS.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000109-Haloferax_volcanii-2246-Gly-NCC.bpseq -data/archiveII/srp_Porp.purp._U38804.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000489-Neurospora_crassa-5141-Trp-NCA.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.aurantiacus.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.aure._BX571857.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221930.94-546.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.pyog._CP000261.bpseq -data/archiveII/16s_G.intestinalis_domain4.bpseq -data/archiveII/5s_Anaplasma-marginale-1.bpseq -data/archiveII/srp_Thal.pseu._EF067921.bpseq -data/archiveII/5s_Actinomadura-madurae-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.pyog._AE010048_1-348.bpseq -data/archiveII/5s_Halobacterium-salinarum-3.bpseq -data/archiveII/RNaseP_LGW17.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.pneu._AE000035_1-384.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.aure._BA000017.bpseq -data/archiveII/5s_Clostridium-acetobutylicum-3.bpseq -data/archiveII/srp_Sacc.cere._U18916.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000201-Drosophila_melanogaster-7227-Lys-CUU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000311-Haloferax_volcanii-2246-Pro-MGG.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudomonas-aeruginosa-3.bpseq -data/archiveII/16s_T.maritima_domain3.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudonocardia-halophobica-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000131-Triticum_aestivum-4565-Gly-GCC.bpseq -data/archiveII/5s_Photobacterium-damselae-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000141-Salmonella_typhimurium-602-His-QUG.bpseq -data/archiveII/srp_Anap.marg._CP000030.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000214-Haloferax_volcanii-2246-Leu-UAA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000176-Haloferax_volcanii-2246-Lys-MUU.bpseq -data/archiveII/srp_Haem.infl._L42023.bpseq -data/archiveII/srp_Yarr.lipo._M20837.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000325-Pichia_jadinii-4903-Pro-GG.bpseq -data/archiveII/5s_Brucella-abortus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Trep.pall._AE001187.bpseq -data/archiveII/16s_A.fulgidus_domain2.bpseq -data/archiveII/16s_B.subtilis_domain4.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000072-Phaseolus_vulgaris-3885-Phe-GAA.bpseq -data/archiveII/5s_E_glandulE.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000567-Homo_sapiens-9606-Tyr-9PA.bpseq -data/archiveII/5s_Spirochaeta-aurantia-1.bpseq -data/archiveII/5s_Saccharomonospora-sp.-1.bpseq -data/archiveII/srp_Clos.acet._AE007525.bpseq -data/archiveII/5s_Burkholderia-caryophylli-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Bdel.bact._BX842656_1-346.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000318-Salmonella_typhimurium-602-Pro-GGG.bpseq -data/archiveII/srp_Bras.napu._EE416873.bpseq -data/archiveII/tmRNA_uncu.bact._TRW-72274-1_1-359.bpseq -data/archiveII/5s_Nitrobacter-winogradskyi-1.bpseq -data/archiveII/srp_Ther.fusc._CP000088.bpseq -data/archiveII/5s_Aquifex-aeolicus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Erysipelothrix-rhusiopathiae-3.bpseq -data/archiveII/srp_Volv.cart._GSP-51971-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000300-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Asn-GUU.bpseq -data/archiveII/srp_Sulf.solf._Y08257.bpseq -data/archiveII/RNaseP_ESH20b-4.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-parahaemolyticus-2.bpseq -data/archiveII/5s_Russula-cyanoxantha-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Desu.desu._CP000112_1-360.bpseq -data/archiveII/5s_Escherichia-coli-11.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000586-Aeropyrum_pernix-56636-Met-CAU.bpseq -data/archiveII/srp_Past.mult._AE006092.bpseq -data/archiveII/5s_Methanothermobacter-thermautotrophicus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Neos.fisc._GSP-331117.bpseq -data/archiveII/16s_H.sapiens_domain4.bpseq -data/archiveII/RNaseP_PS31.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000375-Bos_taurus-9913-Arg-CCU.bpseq -data/archiveII/RNaseP_L.muta-1.bpseq -data/archiveII/srp_Eime.tene._CD666347.bpseq -data/archiveII/srp_Xant.camp._AE012197.bpseq -data/archiveII/srp_Burk.spec._CP000151.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000608-Lupinus_luteus-3873-Leu-UAA.bpseq -data/archiveII/5s_Sporidiobolus-salmonicolor-1.bpseq -data/archiveII/5s_Methanothermococcus-thermolithotrophicus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Schizochytrium-aggregatum-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_List.mono._TRW-1639-1_1-370.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000468-Lupinus_luteus-3873-Val-IAC.bpseq -data/archiveII/srp_Heli.pylo._AE000524.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000005-Mycoplasma_capricolum-2095-Ala-UGC.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000068-Rhodospirillum_rubrum-1085-Phe-GAA.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Soli.usit._CP000473_1-352.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudomonas-syringae-2.bpseq -data/archiveII/5s_Rhodococcus-fascians-1.bpseq -data/archiveII/5s_Hyphomicrobium-sp.-3.bpseq -data/archiveII/5s_Rumex-acetosa-1.bpseq -data/archiveII/5s_Acanthamoeba-castellanii-2.bpseq -data/archiveII/srp_Zygo.roux._BN000170.bpseq -data/archiveII/srp_Hahe.chej._CP000155.bpseq -data/archiveII/srp_Salm.ente._AL627266.bpseq -data/archiveII/RNaseP_D.vulgaris.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Acti.pleu._TRW-228399_1-366.bpseq -data/archiveII/5s_Burkholderia-cepacia-3.bpseq -data/archiveII/5s_Xenopus-laevis-4.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Geob.kaus._BA000043_1-352.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000369-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Arg-ICG.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.caesia-K76T.bpseq -data/archiveII/5s_Phascolopsis-gouldii-1.bpseq -data/archiveII/5s_Mycobacterium-leprae-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Salm.ente._TRW-321314_1-363.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Camp.jeju._AL139078_1-356.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-asiaticum-2.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.subt._Z99104.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000220-Escherichia_coli-562-Leu-HAA.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.anth._AE017334.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.pneu._TRW-1313_1-348.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000123-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Gly-NCC.bpseq -data/archiveII/23s_B.subtilis_domain3.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.aure._AY616521_1-382.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.psittaci-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000613-Nanoarchaeum_equitans-160232-Glu-CUC.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.U.maydis.C1.SSU.943.bpseq -data/archiveII/16s_C.elegans_domain2.bpseq -data/archiveII/5s_Legionella-pneumophila-1.bpseq -data/archiveII/srp_Borr.burg._AE001151.bpseq -data/archiveII/srp_Onch.volv._AI249203.bpseq -data/archiveII/RNaseP_ERH.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.smeg._CP000480.bpseq -data/archiveII/srp_Vibr.harv._CP000789.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Noca.farc._AP006618_1-368.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.pombe.bpseq -data/archiveII/srp_Volv.cart._GSP-51971-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Esch.coli._AP009048_1-363.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Anabaena-PCC7120.bpseq -data/archiveII/srp_Cion.inte._BW223536.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000027-Hordeum_vulgare-4513-Asp-GUC.bpseq -data/archiveII/5s_Mycoplasma-genitalium-1.bpseq -data/archiveII/5s_Geobacillus-stearothermophilus-2.bpseq -data/archiveII/srp_Proc.mari._BX572096.bpseq -data/archiveII/5s_Sargassum-fulvellum-1.bpseq -data/archiveII/srp_Lotu.corn._AP006364.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.L.dispersa.UNK.SSU.1210.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000539-Ovis_aries-9940-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.b.Dermocarpa.sp.ATCC29371.C3.tMET.bpseq -data/archiveII/5s_Listonella-pelagia-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.viridis-K197.bpseq -data/archiveII/5s_Staphylococcus-epidermidis-3.bpseq -data/archiveII/5s_Herbidospora-cretacea-1.bpseq -data/archiveII/5s_Rickettsia-felis-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000106-Haloferax_volcanii-2246-Gly-CCC.bpseq -data/archiveII/srp_Aede.aegy._GSP-7159.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Lact.lact._AE006373_1-359.bpseq -data/archiveII/5s_Coprinopsis-radiata-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000453-Bacillus_subtilis-1423-Val-5AC.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000120-Salmonella_typhimurium-602-Gly-CCC.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000283-Gallus_gallus-9031-Met-AU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000593-Ascaris_suum-6253-Trp-CA.bpseq -data/archiveII/srp_Trep.dent._AE017246.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Odon.sine._TRW-2839_1-371.bpseq -data/archiveII/5s_Hyphomonas-polymorpha-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_T.aquaticus.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.bovis.bpseq -data/archiveII/5s_Geobacillus-stearothermophilus-3.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000023-Haloferax_volcanii-2246-Asp-GUC.bpseq -data/archiveII/5s_Rhodopseudomonas-palustris-3.bpseq -data/archiveII/5s_Clostridium-butyricum-2.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.dono._AY781794.bpseq -data/archiveII/srp_Dani.reri._EH513970.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000354-Bacillus_subtilis-1423-Arg-ICG.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Camp.jeju._CP000025_1-359.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000234-Spinacia_oleracea-3562-Leu-UA7.bpseq -data/archiveII/srp_Esch.coli._AE016756.bpseq -data/archiveII/srp_List.inno._AL596173.bpseq -data/archiveII/5s_Natronococcus-occultus-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000618-Candida_albicans-5476-Leu-CAG.bpseq -data/archiveII/srp_Caul.cres._AE005700.bpseq -data/archiveII/srp_Lact.lact._AM406671.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000399-Aedes_albopictus-7160-Ser-GCU.bpseq -data/archiveII/5s_Lethenteron-reissneri-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000178-Mycoplasma_capricolum-2095-Lys-UU.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Vibr.chol._AE004170_1-367.bpseq -data/archiveII/srp_Pseu.aeru._X12644.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000149-Homo_sapiens-9606-His-GUG.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._CK004881.bpseq -data/archiveII/5s_Buchnera-aphidicola-2.bpseq -data/archiveII/5s_Paracoccus-versutus-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_LGA1.bpseq -data/archiveII/srp_Phot.lumi._BX571872.bpseq -data/archiveII/srp_Mari.mari._CP000449.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.pyog._AE009969.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-culmorum-2.bpseq -data/archiveII/5s_Bombyx-mori-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Cyan.cald._AF022186_1-254.bpseq -data/archiveII/5s_Emericella-nidulans-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000124-Aedes_albopictus-7160-Gly-UCC.bpseq -data/archiveII/srp_Haem.infl._U32795.bpseq -data/archiveII/5s_Misgurnus-fossilis-14.bpseq -data/archiveII/srp_Xyle.fast._AE009442.bpseq -data/archiveII/srp_Tric.eryt._CP000393.bpseq -data/archiveII/RNaseP_E.asper.bpseq -data/archiveII/23s_B.subtilis_domain1.bpseq -data/archiveII/23s_H.pylori_domain6.bpseq -data/archiveII/5s_Thermococcus-kodakarensis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Cryptococcus-humicola-1.bpseq -data/archiveII/23s_T.thermophilus_domain4.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.scab._TRW-1883_1-402.bpseq -data/archiveII/5s_Sterkiella-nova-1.bpseq -data/archiveII/srp_Pseu.mend._CP000680.bpseq -data/archiveII/srp_Legi.pneu._CP000675.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Haem.somn._CP000436_1-367.bpseq -data/archiveII/5s_Thermomonospora-chromogena-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000557-Pichia_jadinii-4903-Tyr-GPA.bpseq -data/archiveII/RNaseP_N.meningitidis-Z2491.bpseq -data/archiveII/16s_Z.mays_domain3.bpseq -data/archiveII/RNaseP_L.borgpetersenii.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000383-Haloferax_volcanii-2246-Ser-GGA.bpseq -data/archiveII/srp_Chla.trac._AE001298.bpseq -data/archiveII/5s_Pyrococcus-woesei-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.aeruginosa.bpseq -data/archiveII/srp_Bras.napu._EE411418.bpseq -data/archiveII/srp_Fugu.rubr._U40756.bpseq -data/archiveII/srp_Sacc.kudr._AJ550803.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Chla.cavi._AE015925_1-425.bpseq -data/archiveII/srp_Rick.prow._AJ235273.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000270-Avian_myeloblastosis_virus-11866-Met-BAU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000493-Bos_taurus-9913-Trp-NCA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000294-Mycoplasma_capricolum-2095-Asn-GUU.bpseq -data/archiveII/5s_Streptosporangium-roseum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Moritella-marina-1.bpseq -data/archiveII/srp_Esch.coli._CP000243.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000513-Synechococcus_elongatus_PCC_6301-269084-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/srp_Dros.mela._AE001572.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000528-Pichia_jadinii-4903-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.bovi._TRW-1765_1-368.bpseq -data/archiveII/tmRNA_envi.sequ._TRW-259292_1-355.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.ferrooxidans.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.cere._AE016877.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-culmorum-8.bpseq -data/archiveII/5s_Sulfolobus-tokodaii-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000206-Loligo_bleekeri-6617-Lys-UUU.bpseq -data/archiveII/5s_Halocynthia-roretzi-1.bpseq -data/archiveII/srp_Medi.trun._AJ846712.bpseq -data/archiveII/5s_Phaffia-rhodozyma-1.bpseq -data/archiveII/5s_Methanothermobacter-thermautotrophicus-7.bpseq -data/archiveII/srp_Batr.dend._GSP-403673.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Acid.ferr._TRW-133824_1-364.bpseq -data/archiveII/5s_Mannheimia-succiniciproducens-3.bpseq -data/archiveII/srp_Bras.napu._EE411027.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.macrocytogenes123.bpseq -data/archiveII/srp_Arch.fulg._AE000782.bpseq -data/archiveII/5s_Magnolia-stellata-1.bpseq -data/archiveII/srp_Lact.plan._AL935253.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000353-Mycoplasma_capricolum-2095-Arg-CU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000279-Spinacia_oleracea-3562-Met-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Photorhabdus-luminescens-3.bpseq -data/archiveII/5s_Salmonella-typhi-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000147-Drosophila_melanogaster-7227-His-GUG.bpseq -data/archiveII/5s_Cryptosporidium-parvum-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Shew.balt._TRW-325240_1-356.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000540-Homo_sapiens-9606-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Neurospora-intermedia-2.bpseq -data/archiveII/5s_Photobacterium-profundum-2.bpseq -data/archiveII/5s_Wolinella-succinogenes-1.bpseq -data/archiveII/5s_Symbiobacterium-thermophilum-3.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPB141.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000255-Candida_cylindracea-44322-Leu-IAG.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Cory.glut._BX927150_1-377.bpseq -data/archiveII/srp_Proc.mari._AJ237851.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000364-Ascaris_suum-6253-Arg-ACG.bpseq -data/archiveII/5s_Ascaris-lumbricoides-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P131.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Moor.ther._CP000232_1-358.bpseq -data/archiveII/5s_Acidithiobacillus-ferrooxidans-1.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.hyop._AE017244.bpseq -data/archiveII/5s_Juniperus-media-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPA54.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Prochlorococcus-PAC1A.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-vulnificus-5.bpseq -data/archiveII/16s_G.intestinalis_domain1.bpseq -data/archiveII/srp_Sus.scro._BP459377.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.m.M.grisea.B2.ND1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000421-Rattus_norvegicus-10116-Ser-IGA.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Syne.elon._TRW-32046_1-394.bpseq -data/archiveII/tmRNA_envi.sequ._TRW-2-1_1-365.bpseq -data/archiveII/srp_Trep.pall._AE000520.bpseq -data/archiveII/srp_Tryp.bruc._AF047723.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Esch.coli._AE005491_1-363.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.P.carinii.Pc1.C1.LSU.1921.bpseq -data/archiveII/srp_Humu.japo._X65991.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000094-Bombyx_mori-7091-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/5s_Clavibacter-michiganensis-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.pulm._AL445565_1-387.bpseq -data/archiveII/srp_Cion.savi._BW520975.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.equi._TRW-40041_1-349.bpseq -data/archiveII/5s_Pimelobacter-simplex-1.bpseq -data/archiveII/srp_Gluc.oxyd._CP000009.bpseq -data/archiveII/5s_Photobacterium-profundum-3.bpseq -data/archiveII/telomerase_AY058901.1-397.bpseq -data/archiveII/5s_Distigma-proteus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Saprospira-grandis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Dict.disc._BJ360333.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.azotoformans.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000088-Triticum_aestivum-4565-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.hyop._AE017332.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Y.pestis.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A3862.bpseq -data/archiveII/RNaseP_LGA10.bpseq -data/archiveII/grp1_b.I1.e.H.rubra.1.C1.SSU.1506.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-sp.-2.bpseq -data/archiveII/16s_C.psittaci_domain1.bpseq -data/archiveII/5s_Erythrobacter-longus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Haloferax-volcanii-1.bpseq -data/archiveII/5s_Perkinsus-andrewsi-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Prochlorococcus-PCC9511.bpseq -data/archiveII/srp_Pseu.puti._AE015451.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SMB-B1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000507-Bacillus_subtilis-1423-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.lepr._AL583919_1-366.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._NR_002715.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.pyog._AM295007.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Trep.pall._TRW-243276_1-354.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000379-Enterobacteria_phage_T4-10665-Ser-NGA.bpseq -data/archiveII/srp_Zea.mays._X14661.bpseq -data/archiveII/5s_Drosophila-teissieri-1.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.B.yamatoana.JCM2896.C1.SSU.943.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.barkeri.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.braz._AY722725.bpseq -data/archiveII/5s_Xenopus-borealis-4.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Arth.spec._CP000454_1-369.bpseq -data/archiveII/srp_Aspe.fumi._GSP-41122.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Acti.acti._TRW-272556_1-366.bpseq -data/archiveII/5s_Methylobacterium-extorquens-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.castellii.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000192-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Lys-CUU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000327-Enterobacteria_phage_T4-10665-Gln-NUG.bpseq -data/archiveII/srp_Sino.meli._AL591782.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Baci.anth._AE016879_1-355.bpseq -data/archiveII/5s_Emericella-nidulans-4.bpseq -data/archiveII/5s_Xenopus-tropicalis-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000412-Candida_cylindracea-44322-Ser-CGA.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-asiaticum-7.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000358-Escherichia_coli-562-Arg-CU.bpseq -data/archiveII/5s_Xenopus-laevis-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_D.radiodurans-g.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000054-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Glu-3UC.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.faciem.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000261-Cucumis_sativus-3659-Leu-NAA.bpseq -data/archiveII/srp_Psyc.sp.._CP000713.bpseq -data/archiveII/5s_Brevibacterium-helvolum-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.lividans.bpseq -data/archiveII/5s_Paracoccus-sp.-1.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.pyog._AE006489.bpseq -data/archiveII/5s_Cunninghamella-elegans-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Legi.pneu._CR628337_1-406.bpseq -data/archiveII/5s_Nocardia-asteroides-1.bpseq -data/archiveII/5s_Bartonella-henselae-2.bpseq -data/archiveII/5s_Mycoplasma-mycoides-1.bpseq -data/archiveII/srp_Esch.coli._BA000007.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A1113.bpseq -data/archiveII/tmRNA_uncu.bact._TRW-32033-1_1-354.bpseq -data/archiveII/RNaseP_ESH212C.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000389-Bacillus_subtilis-1423-Ser-GGA.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudomonas-syringae-4.bpseq -data/archiveII/5s_Methanococcus-vannielii-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Prochlorococcus-TAK9803-2.bpseq -data/archiveII/5s_Ralstonia-solanacearum-2.bpseq -data/archiveII/5s_Escherichia-coli-15.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.C.grayi.UNK.SSU.1516.bpseq -data/archiveII/5s_Leifsonia-xyli-1.bpseq -data/archiveII/srp_Caul.cres._AE005673.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-cereus-8.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Lact.brev._CP000416_1-372.bpseq -data/archiveII/5s_Tuberoidobacter-mutans-1.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.pneu._AE008386.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.b.S.hofmanii.C3.tMET.bpseq -data/archiveII/RNaseP_W.fluorescens.bpseq -data/archiveII/srp_Dani.rrer._CU179657.bpseq -data/archiveII/srp_Meth.vann._CP000742.bpseq -data/archiveII/RNaseP_F.antarctica.bpseq -data/archiveII/5s_Anthopleura-japonica-1.bpseq -data/archiveII/5s_Thermotoga-neapolitana-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Tric.eryt._CP000393_1-398.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.bovis.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221909.98-496.bpseq -data/archiveII/RNaseP_K.polysporus.bpseq -data/archiveII/RNaseP_PS24.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-subtilis-5.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000450-Haloferax_volcanii-2246-Val-GAC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Synt.acid._CP000252_1-356.bpseq -data/archiveII/RNaseP_ESH7-16.bpseq -data/archiveII/16s_T.gondii_domain4.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.C.ellipsoidea.IAMC-87.C1.SSU.1506.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-avermitilis-3.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-cerealis-7.bpseq -data/archiveII/5s_Chlorella-sp.-1.bpseq -data/archiveII/srp_Clos.botu._CP000727.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Porp.ging._TRW-242619_1-407.bpseq -data/archiveII/5s_Methanothermobacter-thermautotrophicus-5.bpseq -data/archiveII/5s_Emericella-nidulans-3.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000043-Haloferax_volcanii-2246-Glu-NUC.bpseq -data/archiveII/5s_Desulfovibrio-vulgaris-2.bpseq -data/archiveII/5s_Pythium-torulosum-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Lact.case._CP000423_1-364.bpseq -data/archiveII/srp_Dros.mela._AC095014.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000140-Escherichia_coli-562-His-QUG.bpseq -data/archiveII/srp_Ther.mela._CP000716.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-lunulosporum-5.bpseq -data/archiveII/srp_Popu.trem._BU866844.bpseq -data/archiveII/16s_Z.mays_domain4.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Neis.gono._TRW-242231_1-363.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000382-Haloferax_volcanii-2246-Ser-MGA.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Vibr.chol._U39068_1-367.bpseq -data/archiveII/5s_Mycoplasma-pulmonis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Rick.typh._AE017197.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A2237.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.pyog._CP000017.bpseq -data/archiveII/5s_Ustilago-hordei-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000499-Halobacterium_salinarum-2242-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Chaetomorpha-moniligera-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000266-Bos_taurus-9913-Leu-AA.bpseq -data/archiveII/srp_Oryz.sati._AP003253.bpseq -data/archiveII/5s_Mannheimia-succiniciproducens-2.bpseq -data/archiveII/srp_Meth.ther._X15364.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.capr._S67602_1-408.bpseq -data/archiveII/5s_Thiomonas-intermedia-1.bpseq -data/archiveII/5s_Aurelia_aurita-1.bpseq -data/archiveII/5s_Bombyx-mori-3.bpseq -data/archiveII/5s_Atractiella-solani-1.bpseq -data/archiveII/5s_Sinorhizobium-meliloti-1.bpseq -data/archiveII/srp_Clos.perf._D49784.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Brev.line._TRW-321955_1-377.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.A.capsulatus.G186B.C1.SSU.bpseq -data/archiveII/RNaseP_E.coli-JM109.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000227-Geobacillus_stearothermophilus-1422-Leu-BAA.bpseq -data/archiveII/srp_Pyro.occu._M21085.bpseq -data/archiveII/5s_Rhcoc_fas1B.bpseq -data/archiveII/5s_Cryptosporidium-parvum-2.bpseq -data/archiveII/5s_Mycobacterium-tuberculosis-2.bpseq -data/archiveII/5s_Mortierella-formosensis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Mycoplasma-mycoides-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Xyle.fast._TRW-155919_1-355.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-sclerotialus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-cerealis-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_T.syrichta.bpseq -data/archiveII/5s_Staphylococcus-aureus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Hype.buty._CP000493.bpseq -data/archiveII/5s_Halothiobacillus-neapolitanus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-vulnificus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Enta.terr._GSP-110771.bpseq -data/archiveII/5s_Bartonella-quintana-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.ambivalens.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-cereus-9.bpseq -data/archiveII/5s_Microtetraspora-glauca-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_E.thermomarinus.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000017-Homo_sapiens-9606-Ala-IGC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Pseu.halo._CR954246_1-357.bpseq -data/archiveII/5s_Pneumocystis-carinii-1.bpseq -data/archiveII/5s_Pasteurella-multocida-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.muta._TRW-210007_1-349.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A1417.bpseq -data/archiveII/srp_Rhod.spec._CP000431.bpseq -data/archiveII/telomerase_U85256.1-451.bpseq -data/archiveII/16s_H.sapiens.mito_domain4.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000517-Neurospora_crassa-5141-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudomonas-fluorescens-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.tepidum-g.bpseq -data/archiveII/RNaseP_K.thermotolerans.bpseq -data/archiveII/srp_Para.bras._EH652573.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-asiaticum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Mesorhizobium-loti-1.bpseq -data/archiveII/5s_Asterina-pectinifera-1.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-griseus-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Vibr.para._BA000031_1-368.bpseq -data/archiveII/srp_Vibr.vuln._AE016807.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000154-Mycoplasma_capricolum-2095-Ile-GAU.bpseq -data/archiveII/5s_Thermomyces-lanuginosus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Bordetella-pertussis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Agrobacterium-tumefaciens-8.bpseq -data/archiveII/srp_Lact.delb._CR954253.bpseq -data/archiveII/16s_C.reinhardtii.chloro_domain2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.aver._BA000030_1-389.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000605-Lupinus_luteus-3873-Leu-CAG.bpseq -data/archiveII/srp_Caen.rema._GSP-31234.bpseq -data/archiveII/srp_List.mono._U15684.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Erwi.amyl._TRW-552_1-381.bpseq -data/archiveII/srp_Medi.trun._CX540689.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000573-Leishmania_tarentolae-5689-Gln-3UG.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000158-Escherichia_coli-562-Ile-GAU.bpseq -data/archiveII/5s_Neurospora-africana-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.marinus.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000457-Geobacillus_stearothermophilus-1422-Val-GAC.bpseq -data/archiveII/srp_Chla.pneu._AE002161.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000352-Mycoplasma_capricolum-2095-Arg-ICG.bpseq -data/archiveII/5s_Acidovorax-delafieldii-1.bpseq -data/archiveII/5s_Lingula-anatina-1.bpseq -data/archiveII/srp_Neis.meni._AL162755.bpseq -data/archiveII/srp_Rhod.palu._CP000250.bpseq -data/archiveII/5s_Sporolactobacillus-inulinus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Para.bras._CN241137.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221921.98-548.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000482-Spiroplasma_citri-2133-Trp-CCA.bpseq -data/archiveII/5s_Clostridium-butyricum-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000614-Nanoarchaeum_equitans-160232-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Chlo.chlo._CP000108_1-401.bpseq -data/archiveII/5s_Pirellula-sp.-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_uncu.bact._TRW-135621-1_1-397.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stre.suis._TRW-286604_1-348.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A3048.bpseq -data/archiveII/srp_Cand.Bloc._CP000016.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.pneumoniae-AR39.bpseq -data/archiveII/5s_Rickettsia-conorii-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000097-Bos_taurus-9913-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/5s_Corynebacterium-glutamicum-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Ther.rose._TRW-309801_1-353.bpseq -data/archiveII/5s_Geobacillus-kaustophilus-7.bpseq -data/archiveII/5s_Limulus-polyphemus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.amyl._CP000560.bpseq -data/archiveII/5s_Thermotoga-petrophila-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Ther.mari._TRW-243274-1_1-356.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.c.S.maritima.C3.tLEU.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.liquefaciens.bpseq -data/archiveII/5s_Lactuca-sativa-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.bayanus.bpseq -data/archiveII/5s_Empedobacter-brevis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.pyog._CP000262.bpseq -data/archiveII/5s_Planococcus-citreus-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000312-Haloferax_volcanii-2246-Pro-GGG.bpseq -data/archiveII/5s_Candida-azyma-1.bpseq -data/archiveII/5s_Achromobacter-cycloclastes-1.bpseq -data/archiveII/5s_Methanolobus-tindarius-1.bpseq -data/archiveII/srp_Lept.coll._AF006750.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.caesia-SB01.bpseq -data/archiveII/5s_Fusobacterium-mortiferum-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000478-Haloferax_volcanii-2246-Trp-BCA.bpseq -data/archiveII/5s_Cyanidium-caldarium-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Bord.aviu._AM167904_1-406.bpseq -data/archiveII/srp_Yarr.lipo._X51658.bpseq -data/archiveII/srp_Rals.eutr._AM260479.bpseq -data/archiveII/5s_Chlamydophila-caviae-1.bpseq -data/archiveII/5s_Acidithiobacillus-ferrooxidans-3.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.mobi._TRW-267748_1-376.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000142-Saccharomyces_cerevisiae-4932-His-GUG.bpseq -data/archiveII/5s_Halichondria-japonica-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Cory.diph._BX248356_1-385.bpseq -data/archiveII/RNaseP_N.plantarum.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000160-Escherichia_coli-562-Ile-AU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000298-Asterias_amurensis-7602-Asn-GUU.bpseq -data/archiveII/RNaseP_T.acidophilum.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-cereus-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.furiosus.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000366-Rattus_norvegicus-10116-Arg-UCG.bpseq -data/archiveII/5s_Salmonella-enterica-1.bpseq -data/archiveII/srp_Buch.aphi._AE014122.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-cholerae-1.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-anthracis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Methylococcus-capsulatus-3.bpseq -data/archiveII/5s_Bresslaua-vorax-1.bpseq -data/archiveII/5s_Ascaris-suum-1.bpseq -data/archiveII/srp_Xant.camp._CP000050.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000015-Bombyx_mori-7091-Ala-IGC.bpseq -data/archiveII/5s_Paramecium-tetraurelia-1.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.C.botrytis.C1.SSU.1506.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000138-Haloferax_volcanii-2246-His-GUG.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-cereus-6.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stap.epid._TRW-176280_1-361.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000424-Drosophila_melanogaster-7227-Ser-GCU.bpseq -data/archiveII/srp_Pseu.aeru._M31829.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000134-Bombyx_mori-7091-Gly-CC.bpseq -data/archiveII/5s_Platymonas-subcordiformis-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000574-Leishmania_tarentolae-5689-Trp-CCA.bpseq -data/archiveII/5s_Neurospora-crassa-14.bpseq -data/archiveII/srp_Fran.tula._AM286280.bpseq -data/archiveII/16s_B.burgdorferi_domain2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000053-Bos_taurus-9913-Glu-NUC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Neis.meni._AL162755_1-360.bpseq -data/archiveII/5s_Salmonella-enterica-7.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-sporotrichioides-3.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000415-Nicotiana_rustica-4093-Ser-GA.bpseq -data/archiveII/16s_E.coli_domain3.bpseq -data/archiveII/5s_Ectothiorhodospira-mobilis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Taxus-baccata-1.bpseq -data/archiveII/srp_Enta.hist._BK005670.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000454-Escherichia_coli-562-Val-GAC.bpseq -data/archiveII/5s_Thermus-thermophilus-3.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Yers.pest._AE017042_1-364.bpseq -data/archiveII/5s_Xenopus-laevis-6.bpseq -data/archiveII/23s_H.pylori_domain3.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Prochlorococcus-NATL1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_N.olivacea-chloroplast.bpseq -data/archiveII/srp_Heli.pylo._BD010626.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-nodosus-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_uncu.mari._TRW-363180_1-347.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000275-Thermus_thermophilus-274-Met-CAU.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Kine.radi._TRW-266940_1-366.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Anab.vari._CP000117_1-390.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Salm.ente._TRW-149539_1-363.bpseq -data/archiveII/5s_Tremella-mesenterica-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000016-Homo_sapiens-9606-Ala-IGC.bpseq -data/archiveII/23s_S.aureus_domain4.bpseq -data/archiveII/srp_Pseu.stut._CP000304.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Fibr.succ._TRW-59374_1-361.bpseq -data/archiveII/RNaseP_R.rubrum.bpseq -data/archiveII/16s_A.pyrophilus_domain4.bpseq -data/archiveII/srp_Cocc.immi._GSP-396776.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.E.dermatitidis.C1.SSU.943.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudonocardia-thermophila-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Nost.spec._BA000019_1-390.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.equi.bpseq -data/archiveII/5s_Schizosaccharomyces-pombe-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000168-Bos_taurus-9913-Ile-GAU.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221925.98-540.bpseq -data/archiveII/5s_Schizosaccharomyces-pombe-3.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000044-Mycoplasma_capricolum-2095-Glu-UC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Grac.tenu._AY673996_1-396.bpseq -data/archiveII/srp_Ento.sulc._AF095839.bpseq -data/archiveII/5s_Streptococcus-thermophilus-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_L.japonicus-IFO15385.bpseq -data/archiveII/5s_Thiothrix-nivea-1.bpseq -data/archiveII/5s_Meloidogyne-arenaria-3.bpseq -data/archiveII/srp_Clos.teta._AE015927.bpseq -data/archiveII/srp_Burk.mall._CP000546.bpseq -data/archiveII/srp_Rick.feli._CP000053.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.eutrophus.bpseq -data/archiveII/5s_Prosthecochloris-aestuarii-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000204-Loligo_bleekeri-6617-Lys-CUU.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.L.dispersa.UNK.SSU.789.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000503-Thermoplasma_acidophilum-2303-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Oceanobacillus-iheyensis-2.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Synechococcus-MINOS1.bpseq -data/archiveII/5s_Salmonella-enterica-3.bpseq -data/archiveII/srp_Trit.aest._CJ572413.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.clau._AP006627.bpseq -data/archiveII/srp_Shew.spec._CP000469.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Esch.coli._CP000468_1-363.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-sp.-1.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.T.malaccensis.C1.LSU.1925.bpseq -data/archiveII/5s_Brucella-suis-2.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.pyog._CP000259.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Bifi.long._TRW-205913_1-397.bpseq -data/archiveII/srp_Lemu.catt._GSP-9447.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000284-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Met-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Caulobacter-sp.-4.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000011-Neurospora_crassa-5141-Ala-UGC.bpseq -data/archiveII/5s_Spiroplasma-melliferum-1.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.poly._D11421.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Buch.aphi._BD061520_1-369.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000452-Mycoplasma_mycoides-2102-Val-UAC.bpseq -data/archiveII/srp_Clos.perf._CP000246.bpseq -data/archiveII/16s_F.ananassa_domain4.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000357-Escherichia_coli-562-Arg-CU.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.P.carinii.C1.SSU.1506.bpseq -data/archiveII/5s_Gossypium-hirsutum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Planocera-reticulata-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A4876.bpseq -data/archiveII/srp_Trit.aest._CJ679223.bpseq -data/archiveII/srp_Bifi.adol._AP009256.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Trop.whip._BX251411_1-369.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.P.carinii.Pc3.C1.LSU.1921.bpseq -data/archiveII/5s_Oerskovia-turbata-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000496-Nicotiana_tabacum-4097-Trp-BCA.bpseq -data/archiveII/5s_Methanosarcina-barkeri-1.bpseq -data/archiveII/srp_Shew.onei._AE015625.bpseq -data/archiveII/srp_Para.bras._CN239248.bpseq -data/archiveII/srp_Pseu.syri._CP000058.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000104-Enterobacteria_phage_T4-10665-Gly-NCC.bpseq -data/archiveII/5s_Cryptococcus-albidus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Candidatus-Phytoplasma-asteris-1.bpseq -data/archiveII/srp_Halo.mari._AY596297.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPA63.bpseq -data/archiveII/5s_Xylella-fastidiosa-1.bpseq -data/archiveII/5s_Mycoplasma-sp.-1.bpseq -data/archiveII/5s_Homarus-gammarus-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000267-Bos_taurus-9913-Leu-IAG.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000093-Bombyx_mori-7091-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._X04249.bpseq -data/archiveII/5s_Mycobacterium-bovis-3.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000520-Aedes_albopictus-7160-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Oceanobacillus-iheyensis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Arthrobacter-luteus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Heli.hepa._AE017125.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.paspali.bpseq -data/archiveII/5s_Streptococcus-pyogenes-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.smeg._CP000480_1-369.bpseq -data/archiveII/srp_Kluy.lact._CR382126.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000532-Oryctolagus_cuniculus-9986-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Nocardia-farcinica-1.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.S.paniceum.UNK.SSU.1210.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudomonas-fluorescens-3.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Jako.libe._TRW-143017_1-102.bpseq -data/archiveII/5s_Methylophilus-methylotrophus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Esch.coli._AE014075.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000581-Aeropyrum_pernix-56636-Lys-CUU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000092-Oryctolagus_cuniculus-9986-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000146-Lupinus_luteus-3873-His-GUG.bpseq -data/archiveII/5s_Methanothermobacter-thermautotrophicus-6.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.pneumoniae-CWL029.bpseq -data/archiveII/srp_Odon.sine._Z67753.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Buch.aphi._AE016826_1-367.bpseq -data/archiveII/5s_Carpopeltis-crispata-1.bpseq -data/archiveII/16s_H.volcanii_domain3.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Colw.psyc._CP000083_1-350.bpseq -data/archiveII/RNaseP_B.subtilis-g.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Bloc.flor._BX248583_1-393.bpseq -data/archiveII/5s_Oryza-sativa-2.bpseq -data/archiveII/5s_Escherichia-coli-5.bpseq -data/archiveII/RNaseP_U.stansburiana.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000620-Toxoplasma_gondii-5811-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/srp_Yers.pest._AL590842.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.subt._D11417.bpseq -data/archiveII/5s_Rhodosporidium-toruloides-1.bpseq -data/archiveII/5s_P_cynthiaE.bpseq -data/archiveII/srp_Vibr.chol._CP000627.bpseq -data/archiveII/srp_Prun.arme._CV045835.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPA58.bpseq -data/archiveII/5s_Efibulobasidium-albescens-1.bpseq -data/archiveII/16s_F.ananassa_domain2.bpseq -data/archiveII/srp_Aqui.aeol._AE000759.bpseq -data/archiveII/5s_Bacteroides-veroralis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-avermitilis-5.bpseq -data/archiveII/5s_Nannocystis-exedens-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.afri._TRW-33894_1-368.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000024-Mycoplasma_capricolum-2095-Asp-GUC.bpseq -data/archiveII/5s_Planctomyces-limnophilus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.lepr._AL023596.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.innocua.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A4977.bpseq -data/archiveII/5s_Roseococcus-thiosulfatophilus-1.bpseq -data/archiveII/16s_H.sapiens.mito_domain3.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000200-Oryctolagus_cuniculus-9986-Lys-3UU.bpseq -data/archiveII/srp_Aede.aegy._DW714804.bpseq -data/archiveII/srp_Cryp.parv._XM_626716.bpseq -data/archiveII/srp_Pseu.fluo._CP000076.bpseq -data/archiveII/16s_A.pyrophilus_domain1.bpseq -data/archiveII/srp_Humu.lupu._X65984.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Syne.spec._AB003477_1-394.bpseq -data/archiveII/RNaseP_G.gorilla.bpseq -data/archiveII/5s_Phaseolus-vulgaris-1.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.T.cosmopolitanis.C1.LSU.1925.bpseq -data/archiveII/5s_Cryptococcus-bacillisporus-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Chla.pneu._TRW-83558_1-426.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPB86.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Stap.epid._TRW-1282-1_1-361.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.mace._D11420.bpseq -data/archiveII/5s_Lactobacillus-johnsonii-1.bpseq -data/archiveII/5s_Haloarcula-marismortui-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Aero.hydr._AY442269_1-360.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.leprae.bpseq -data/archiveII/16s_T.maritima_domain4.bpseq -data/archiveII/srp_Sacc.para._BN000251.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000251-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Leu-UAA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000035-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Asp-GUC.bpseq -data/archiveII/16s_B.subtilis_domain3.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000445-Bos_taurus-9913-Thr-IGU.bpseq -data/archiveII/srp_Gibb.zeae._GSP-229533.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000321-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Pro-UGG.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000004-Haloferax_volcanii-2246-Ala-UGC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Burk.fung._TRW-266265_1-370.bpseq -data/archiveII/srp_Sola.tube._DR037645.bpseq -data/archiveII/5s_Dirofilaria-immitis-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Fran.tula._CP000437_1-421.bpseq -data/archiveII/5s_Corynebacterium-jeikeium-2.bpseq -data/archiveII/srp_Trop.whip._AE014184.bpseq -data/archiveII/5s_Gemm_obscuB.bpseq -data/archiveII/srp_Lact.gass._CP000413.bpseq -data/archiveII/RNaseP_N.fulvus-KCTC9580.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Guil.thet._AF041468_1-327.bpseq -data/archiveII/5s_Fusobacterium-varium-1.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-logei-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000418-Nicotiana_rustica-4093-Ser-IGA.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-cincinnatiensis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Coprinopsis-cinerea-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_vHge2.bpseq -data/archiveII/5s_Comamonas-testosteroni-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000550-Neurospora_crassa-5141-Tyr-GUA.bpseq -data/archiveII/5s_Anthoceros-punctatus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.muta._AF132127.bpseq -data/archiveII/srp_Yers.pseu._BX936398.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000119-Escherichia_coli-562-Gly-NCC.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Synechococcus-PCC6717.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000462-Rattus_norvegicus-10116-Val-UAC.bpseq -data/archiveII/5s_Amycolatopsis-lactamdurans-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000391-Escherichia_coli-562-Ser-GCU.bpseq -data/archiveII/23s_H.pylori_domain4.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.gall._AE015450.bpseq -data/archiveII/srp_Para.bras._CN240538.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.hydrogenoformans.bpseq -data/archiveII/16s_S.cerevisiae_domain4.bpseq -data/archiveII/5s_Crypthecodinium-cohnii-1.bpseq -data/archiveII/srp_Phyt.infe._CV919934.bpseq -data/archiveII/5s_Onchocerca-cervicalis-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000250-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Leu-UAG.bpseq -data/archiveII/srp_Fran.tula._AM233362.bpseq -data/archiveII/5s_Methanothermobacter-thermautotrophicus-4.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.braz._AY722724.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000440-Neurospora_crassa-5141-Thr-UGU.bpseq -data/archiveII/5s_Blastopirellula-marina-1.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.pyog._AE014139.bpseq -data/archiveII/16s_T.maritima_domain1.bpseq -data/archiveII/srp_Dros.anan._CJ969290.bpseq -data/archiveII/5s_Colwellia-psychrerythraea-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.caesia-K163.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000324-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Pro-NGG.bpseq -data/archiveII/srp_Tryp.bruc._S56681.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Neph.oliv._AF137379-2_1-327.bpseq -data/archiveII/RNaseP_ESH7-9.bpseq -data/archiveII/5s_Rubrivivax-gelatinosus-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000377-Mus_musculus-10090-Arg-ICG.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000195-Rattus_norvegicus-10116-Lys-CUN.bpseq -data/archiveII/srp_Ochr.anth._CP000758.bpseq -data/archiveII/5s_Agrobacterium-tumefaciens-4.bpseq -data/archiveII/RNaseP_PS2.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A03.bpseq -data/archiveII/srp_Pyro.cali._CP000561.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.anth._AE017024.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.pneumoniae.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000282-Ascaris_suum-6253-Met-AU.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Prop.acne._AE017283_1-371.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.livi._AY081854.bpseq -data/archiveII/5s_Sporosarcina-ureae-1.bpseq -data/archiveII/5s_Basidiobolus-magnus-1.bpseq -data/archiveII/16s_T.maritima_domain2.bpseq -data/archiveII/srp_Maca.mula._GSP-9544.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.aureus.bpseq -data/archiveII/5s_Halococcus-morrhuae-1.bpseq -data/archiveII/5s_Streptococcus-salivarius-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.glauca-K195.bpseq -data/archiveII/srp_Dros.mela._X01056.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000511-Escherichia_coli-562-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.aure._CP000736.bpseq -data/archiveII/5s_Pichia-jadinii-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.diastaticus.bpseq -data/archiveII/srp_Pich.stip._CP000502.bpseq -data/archiveII/RNaseP_PS26.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._X02067.bpseq -data/archiveII/srp_Zea.mays._CF974802.bpseq -data/archiveII/srp_Rhod.spha._CP000143.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.braz._AM494942.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-rimosus-2.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.pernix.bpseq -data/archiveII/srp_Clav.lusi._GSP-306902.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A5179.bpseq -data/archiveII/5s_Alcaligenes-sp.-1.bpseq -data/archiveII/srp_Clos.acet._AE001437.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.chroococcum.bpseq -data/archiveII/srp_Porp.yezo._AP006715.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000380-Halobacterium_salinarum-2242-Ser-MGA.bpseq -data/archiveII/5s_Saccharothrix-australiensis-1.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221934.121-565.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000069-Synechococcus_sp._PCC_7002-32049-Phe-GAA.bpseq -data/archiveII/5s_Sulfurococcus-mirabilis-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Pseu.syri._AE016853_1-388.bpseq -data/archiveII/srp_Para.bras._CN241909.bpseq -data/archiveII/RNaseP_ESH167F.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-cerealis-3.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.trachomatis.bpseq -data/archiveII/5s_Saccharopolyspora-rectivirgula-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_PS27.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000589-Aeropyrum_pernix-56636-Arg-UCU.bpseq -data/archiveII/RNaseP_B.subtilis.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-amyloliquefaciens-1.bpseq -data/archiveII/5s_Kutzneria-viridogrisea-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000182-Codium_fragile-3133-Lys-NUU.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-cereus-11.bpseq -data/archiveII/5s_Saccharopolyspora-erythraea-1.bpseq -data/archiveII/5s_Fusarium-sporotrichioides-2.bpseq -data/archiveII/5s_Notophthalmus-viridescens-1.bpseq -data/archiveII/5s_Enchytraeus-albidus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Ferr.acid._GSP-333146.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000211-Haloferax_volcanii-2246-Leu-CAA.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Salm.typh._AY316313_1-363.bpseq -data/archiveII/16s_H.sapiens_domain2.bpseq -data/archiveII/srp_Dict.disc._AJ699381.bpseq -data/archiveII/5s_Azotobacter-vinelandii-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Synechocystis-PCC6308.bpseq -data/archiveII/5s_Clostridium-carnis-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000101-Mus_musculus-10090-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/RNaseP_PS1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_U.urealyticum.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221931.99-541.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000623-Escherichia_coli-562-Pro-CGG.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.L.dispersa.UNK.SSU.516.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000231-Phaseolus_vulgaris-3885-Leu-BAA.bpseq -data/archiveII/srp_Mus.musc._AC126244.bpseq -data/archiveII/srp_Rhod.palu._BX572594.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Shig.boyd._CP000036_1-363.bpseq -data/archiveII/srp_Aply.cali._GSP-6500.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000464-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Val-IAC.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000434-Mycoplasma_capricolum-2095-Thr-UGU.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Shig.dyse._CP000034_1-363.bpseq -data/archiveII/5s_Burkholderia-mallei-1.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.alca._D11422.bpseq -data/archiveII/srp_Esch.coli._CP000468.bpseq -data/archiveII/srp_Sorg.bico._BE594178.bpseq -data/archiveII/5s_Ustilago-scabiosae-1.bpseq -data/archiveII/srp_Brad.spec._CP000494.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000524-Scenedesmus_obliquus-3088-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Hyphomicrobium-vulgare-1.bpseq -data/archiveII/5s_Lactobacillus-delbrueckii-2.bpseq -data/archiveII/srp_Shew.balt._CP000753.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Paen.larv._TRW-1464_1-367.bpseq -data/archiveII/5s_Corynebacterium-glutamicum-2.bpseq -data/archiveII/5s_Dugesia-japonica-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000215-Haloferax_volcanii-2246-Leu-5AG.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221940.103-499.bpseq -data/archiveII/5s_Colacogloea-peniophorae-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_D.desulfuricans.bpseq -data/archiveII/srp_Dros.viri._GSP-7244.bpseq -data/archiveII/5s_Genistelloides-hibernus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._BF875598.bpseq -data/archiveII/tmRNA_envi.sequ._TRW-356-1_1-289.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Pseudoanabaena-PCC6903.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.dairensis.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-parahaemolyticus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Coxiella-burnetii-2.bpseq -data/archiveII/5s_Caulobacter-sp.-1.bpseq -data/archiveII/srp_Fran.alni._CT573213.bpseq -data/archiveII/srp_Sphi.witt._CP000699.bpseq -data/archiveII/RNaseP_H.chlorum.bpseq -data/archiveII/srp_Xyle.fast._AE003849.bpseq -data/archiveII/RNaseP_N.fulvus-JCM3335.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000592-Ascaris_suum-6253-Gln-UG.bpseq -data/archiveII/srp_Legi.pneu._AE017354.bpseq -data/archiveII/5s_Brevibacillus-brevis-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000409-Candida_cylindracea-44322-Ser-CAG.bpseq -data/archiveII/5s_Artemia-sp.-2.bpseq -data/archiveII/srp_Aspe.nidu._GSP-227321.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000143-Asterias_amurensis-7602-His-QUG.bpseq -data/archiveII/5s_Brucella-melitensis-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Yers.ente._TRW-34054_1-381.bpseq -data/archiveII/RNaseP_T.maritima-g.bpseq -data/archiveII/srp_Aspe.oryz._AP007169.bpseq -data/archiveII/srp_Xyle.fast._AE003940.bpseq -data/archiveII/5s_Symbiobacterium-thermophilum-2.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000091-Pisum_sativum-3888-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/srp_Novo.arom._CP000248.bpseq -data/archiveII/srp_Ashb.goss._AE016819.bpseq -data/archiveII/RNaseP_ESH167E.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Salm.ente._TRW-295319_1-363.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000307-Moloney_murine_leukemia_virus-11801-Pro-IGG.bpseq -data/archiveII/5s_Caulobacter-spinosum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Clavispora-opuntiae-1.bpseq -data/archiveII/5s_Trichosporonoides-oedocephalis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Rhiz.legu._AM236080.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000190-Bos_taurus-9913-Lys-NUU.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.myco._X53678.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000129-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Gly-GCC.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.aviu._AE016958.bpseq -data/archiveII/RNaseP_G.sulfurreducens.bpseq -data/archiveII/srp_Phak.pach._GSP-170000-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Z.florentinus.bpseq -data/archiveII/5s_Thermus-aquaticus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Trichostrongylus-colubriformis-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_B.burgdorferi.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000505-Mycoplasma_mycoides-2102-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Agrobacterium-tumefaciens-7.bpseq -data/archiveII/5s_Acremonium-persicinum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Ascobolus-immersus-3.bpseq -data/archiveII/RNaseP_E.agglomerulans.bpseq -data/archiveII/srp_Meth.ferv._S49762.bpseq -data/archiveII/RNaseP_vHge3-5.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Baci.subt._Z99121_1-360.bpseq -data/archiveII/RNaseP_CPB70.bpseq -data/archiveII/5s_Klebsormidium-flaccidum-1.bpseq -data/archiveII/srp_Dros.simu._GSP-7240.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000555-Saccharomyces_cerevisiae-4932-Tyr-GPA.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.P.macrosporus.C1.SSU.943.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000107-Haloferax_volcanii-2246-Gly-GCC.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Cyan.mero._AY286123_1-236.bpseq -data/archiveII/srp_Enta.hist._AF487684.bpseq -data/archiveII/srp_Legi.pneu._M31830.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Rals.sola._AL646061_1-357.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.c.S.bicolor.C3.tLEU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000126-Halocynthia_roretzi-7729-Gly-NCU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000203-Loligo_bleekeri-6617-Lys-NUU.bpseq -data/archiveII/5s_Arthrobacter-oxydans-1.bpseq -data/archiveII/srp_Clos.perf._BA000016.bpseq -data/archiveII/srp_Proc.mari._BX572093.bpseq -data/archiveII/RNaseP_S.viridis-K191.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.spec._CP000580.bpseq -data/archiveII/5s_Nanoarchaeum-equitans-1.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.epid._AE015929.bpseq -data/archiveII/srp_Stre.pyog._CP000003.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._BF909563.bpseq -data/archiveII/5s_Caulobacter-sp.-2.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.c.N.tabacum.C3.tLEU.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Prochlorococcus-NATL2.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.pneu._S76009.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.infa._AM502223.bpseq -data/archiveII/srp_Leis.dono._AY722734.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000427-Gallus_gallus-9031-Ser-UGA.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Baci.cere._TRW-226900_1-355.bpseq -data/archiveII/RNaseP_C.vinosum.bpseq -data/archiveII/5s_Helicobacter-hepaticus-1.bpseq -data/archiveII/srp_Trit.aest._CA694528.bpseq -data/archiveII/RNaseP_P.strasburgensis.bpseq -data/archiveII/5s_Mytilus-galloprovincialis-3.bpseq -data/archiveII/5s_Lactobacillus-brevis-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_T.thermophilus.bpseq -data/archiveII/RNaseP_A.telluris.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000577-Leishmania_tarentolae-5689-Glu-CUC.bpseq -data/archiveII/5s_Neurospora-crassa-6.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Bact.frag._CR626927_1-398.bpseq -data/archiveII/srp_Nema.vect._GSP-45351.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.P.yezoensis.C1.SSU.516.bpseq -data/archiveII/5s_Bacillus-subtilis-2.bpseq -data/archiveII/5s_Drosophila-sechellia-1.bpseq -data/archiveII/srp_Desu.vulg._AE017311.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Clos.acet._AE001437_1-359.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF147806.247-692.bpseq -data/archiveII/srp_Sacc.mika._AJ550802.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000390-Escherichia_coli-562-Ser-CGA.bpseq -data/archiveII/5s_Tetrahymena-pyriformis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Vibrio-harveyi-1.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.pene._BA000026.bpseq -data/archiveII/16s_A.pyrophilus_domain2.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.C.merochlorophea.UNK.SSU.1389.bpseq -data/archiveII/5s_Achromobacter-xylosoxidans-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000512-Mycobacterium_smegmatis-1772-Ini-CAU.bpseq -data/archiveII/5s_Illex-illecebrosus-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000052-Aedes_albopictus-7160-Glu-NUC.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000378-Mus_musculus-10090-Arg-ICG.bpseq -data/archiveII/srp_Aero.pern._BA000002.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Meso.viri._AF166114_1-359.bpseq -data/archiveII/srp_Dein.radi._AE002056.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000292-Haloferax_volcanii-2246-Asn-GUU.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000545-Escherichia_coli-562-Tyr-QUA.bpseq -data/archiveII/telomerase_AF221912.98-564.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.aure._BA000018.bpseq -data/archiveII/RNaseP_T.album.bpseq -data/archiveII/5s_Mycobacterium-avium-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Phot.asym._TRW-291112_1-364.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Dermocarpa-PCC7437.bpseq -data/archiveII/RNaseP_WA1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000448-Halobacterium_salinarum-2242-Val-GAC.bpseq -data/archiveII/5s_Gluconacetobacter-xylinus-1.bpseq -data/archiveII/5s_Cryptococcus-neoformans-2.bpseq -data/archiveII/srp_Arab.thal._AC005275.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.pneumoniae.bpseq -data/archiveII/telomerase_AC121792.109554-109950.bpseq -data/archiveII/srp_Esch.coli._X01074.bpseq -data/archiveII/5s_Candida-parapsilosis-1.bpseq -data/archiveII/srp_Cyan.mero._AY286123.bpseq -data/archiveII/srp_Zea.mays._CF919998.bpseq -data/archiveII/srp_Homo.sapi._BF908767.bpseq -data/archiveII/RNaseP_M.genitalium.bpseq -data/archiveII/srp_Myco.geni._BD439871.bpseq -data/archiveII/5s_Lactobacillus-plantarum-1.bpseq -data/archiveII/5s_Nitella-flexilis-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000449-Haloferax_volcanii-2246-Val-CAC.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000459-Neurospora_crassa-5141-Val-UAC.bpseq -data/archiveII/srp_Medi.trun._AC146941.bpseq -data/archiveII/5s_Oenococcus-oeni-1.bpseq -data/archiveII/5s_Escherichia-coli-10.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Erwi.caro._BX950851_1-363.bpseq -data/archiveII/5s_Methanosarcina-acetivorans-2.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.cere._AE017194.bpseq -data/archiveII/RNaseP_Nostoc-PCC7413.bpseq -data/archiveII/srp_Baci.anth._AE017225.bpseq -data/archiveII/5s_Stella-humosa-1.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000085-Schizosaccharomyces_pombe-4896-Phe-AA.bpseq -data/archiveII/srp_Salm.ente._AE016842.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000253-Candida_cylindracea-44322-Leu-BAA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000423-Rattus_norvegicus-10116-Ser-IGA.bpseq -data/archiveII/tmRNA_List.wels._AF440351_1-321.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Syne.spec._TRW-1131_1-399.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000328-Enterobacteria_phage_T5-10726-Gln-UUG.bpseq -data/archiveII/5s_Candidatus-Fritschea-bemisiae-1.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.S.granulatum.C1.SSU.1506.bpseq -data/archiveII/5s_Weissella-viridescens-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SMB-B4.bpseq -data/archiveII/5s_Wolbachia-endosymbiont-of-B.-malayi-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Leuc.mese._AF375574_1-307.bpseq -data/archiveII/srp_Coxi.burn._AE016828.bpseq -data/archiveII/5s_Rhodococcus-erythropolis-2.bpseq -data/archiveII/tmRNA_List.mono._TRW-169963_1-370.bpseq -data/archiveII/srp_Stap.epid._AE016751.bpseq -data/archiveII/5s_Spinacia-oleracea-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Prev.inte._TRW-246198_1-400.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000425-Drosophila_melanogaster-7227-Ser-IGA.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000073-Spinacia_oleracea-3562-Phe-GAA.bpseq -data/archiveII/5s_Pichia-angusta-1.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Esch.coli._TRW-331111_1-363.bpseq -data/archiveII/RNaseP_LGW46.bpseq -data/archiveII/tRNA_tdbR00000208-Mus_musculus-10090-Lys-CUN.bpseq -data/archiveII/srp_Cion.inte._BW088710.bpseq -data/archiveII/5s_Paracentrotus-lividus-2.bpseq -data/archiveII/5s_Listeria-monocytogenes-2.bpseq -data/archiveII/srp_Anae.sp.._CP000769.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Lact.delb._TRW-321956_1-362.bpseq -data/archiveII/5s_Streptomyces-coelicolor-5.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Myco.hyop._TRW-295358_1-424.bpseq -data/archiveII/srp_Desu.psyc._CR522870.bpseq -data/archiveII/srp_Legi.pneu._CR628337.bpseq -data/archiveII/5s_Cryptococcus-laurentii-1.bpseq -data/archiveII/5s_Antheraea-pernyi-1.bpseq -data/archiveII/srp_Zygo.roux._AJ564197.bpseq -data/archiveII/5s_Harpalus-rufipes-1.bpseq -data/archiveII/5s_Pseudonocardia-compacta-1.bpseq -data/archiveII/RNaseP_B.bufo.bpseq -data/archiveII/5s_Misgurnus-fossilis-1.bpseq -data/archiveII/5s_Candidatus-Tremblaya-princeps-3.bpseq -data/archiveII/srp_Schm.medi._GSP-79327.bpseq -data/archiveII/5s_Clostridium-tyrobutyricum-4.bpseq -data/archiveII/RNaseP_SM-A1519.bpseq -data/archiveII/tmRNA_Tann.fors._TRW-203275_1-400.bpseq -data/archiveII/srp_List.mono._AL591984.bpseq -data/archiveII/5s_Microbacterium-testaceum-1.bpseq -data/archiveII/23s_B.subtilis_domain5.bpseq -data/archiveII/16s_F.ananassa_domain1.bpseq -data/archiveII/grp2_a.I2.c.N.tabacum.A.L2.i1.bpseq -data/archiveII/16s_C.reinhardtii.mito.bpseq -data/archiveII/16s_T.gondii_domain1.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.m.S.luteus.A1.LSU.2449.bpseq -data/archiveII/16s_T.gondii.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.m.S.luteus.B4.LSU.2500.bpseq -data/archiveII/23s_S.aureus_domain2.bpseq -data/archiveII/23s_E.coli_domain2.bpseq -data/archiveII/23s_H.pylori_domain5.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.m.S.luteus.C2.LSU.1685.bpseq -data/archiveII/16s_E.coli.bpseq -data/archiveII/grp2_a.I2.c.N.tabacum.B.RPC1.i1.bpseq -data/archiveII/16s_A.fulgidus.bpseq -data/archiveII/16s_H.volcanii.bpseq -data/archiveII/23s_T.thermophilus_domain2.bpseq -data/archiveII/16s_D.melanogaster_domain1.bpseq -data/archiveII/16s_C.reinhardtii.chloro.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.m.S.luteus.C2.LSU.1949.bpseq -data/archiveII/16s_S.cerevisiae.bpseq -data/archiveII/grp2_a.I2.c.N.tabacum.A.trnV.i1.bpseq -data/archiveII/16s_G.intestinalis.bpseq -data/archiveII/grp2_a.I2.c.N.tabacum.A.A6.i1.bpseq -data/archiveII/16s_A.pyrophilus.bpseq -data/archiveII/16s_H.sapiens.mito.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.b.coliphage.T4.A2.NRDB.bpseq -data/archiveII/16s_P.staleyi.bpseq -data/archiveII/grp2_a.I2.c.N.tabacum.B.pD.i1.bpseq -data/archiveII/grp2_a.I2.c.N.tabacum.A.trnI.i1.bpseq -data/archiveII/grp2_a.I2.m.S.obliquus.B.LSU.2455.bpseq -data/archiveII/23s_B.subtilis_domain2.bpseq -data/archiveII/16s_B.burgdorferi.bpseq -data/archiveII/23s_E.coli_domain5.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.m.S.luteus.B2.LSU.1974.bpseq -data/archiveII/23s_S.aureus_domain5.bpseq -data/archiveII/16s_T.maritima.bpseq -data/archiveII/grp2_a.I2.c.N.tabacum.B.pB.i1.bpseq -data/archiveII/16s_D.melanogaster_domain2.bpseq -data/archiveII/16s_P.occultum.bpseq -data/archiveII/16s_D.melanogaster_domain3.bpseq -data/archiveII/16s_S.cerevisiae_domain1.bpseq -data/archiveII/16s_B.subtilis.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.C.parasitica.E.SSU.1199.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.e.Z.circumcarinata.C1.SSU.1506.bpseq -data/archiveII/23s_H.pylori_domain2.bpseq -data/archiveII/grp2_a.I2.c.N.tabacum.A.S12.i2.bpseq -data/archiveII/grp1_b.I1.e.P.leucosticta.C1.SSU.516.bpseq -data/archiveII/grp1_a.I1.b.S.negevensis.B4.LSU.1931.bpseq -data/archiveII/grp2_a.I2.c.N.tabacum.B.trnG.i1.bpseq -data/archiveII/16s_C.elegans.bpseq -data/archiveII/16s_H.sapiens_domain1.bpseq -data/archiveII/16s_C.psittaci.bpseq -data/archiveII/grp2_a.I2.c.N.tabacum.B.ND2.i1.bpseq -data/archiveII/16s_Z.mays.bpseq