TARA-WorldModel-VICReg / results /phase4_latent_function_mapping.tsv
GreenGenomicsLab's picture
Upload results/phase4_latent_function_mapping.tsv with huggingface_hub
13c836d verified
Raw
History Blame Contribute Delete
21.4 kB
# Provenance:
# Script: /media/drn2/External/TARA-Oceans/03_analyses/WorldModelApp/scripts/t21_pfam_module_zspace_projection_20260127_130000.py
# Input1: /media/drn2/External/TARA-Oceans/03_analyses/WorldModelApp/results/phase2_embeddings.npz
# Input2: /media/drn2/External/TARA-Oceans/03_analyses/WorldModelApp/data/module_mapping.json
# Input3: /media/drn2/External/TARA-Oceans/03_analyses/ALGAGPT-based-analyses/env_pfam_manifold/data/pfam2go_mapping_20260124_101559.tsv
# Date: 2026-01-27 12:20:29
# Integrity Check: PASSED - Real data only
#
# Sections:
# module_embedding: Mean z_pfam for samples where module is abundant (20 modules x 32 dims)
# function_embedding: Weighted average of module embeddings per metabolic function (13 functions x 32 dims)
# dim_function_loading: Pearson r between module embeddings on each dim and function enrichment (32 dims x 13 categories)
# For dim_function_loading rows, dim_0..dim_12 correspond to: photosynthesis, carbon_fixation, electron_transport, nitrogen_metabolism, lipid_metabolism, carbohydrate_metabolism, amino_acid_metabolism, nucleotide_metabolism, signal_transduction, transport, ribosome_translation, protein_folding, iron_homeostasis
#
section entity_id n_pfams n_abundant_samples median_abundance top_functions dim_0 dim_1 dim_2 dim_3 dim_4 dim_5 dim_6 dim_7 dim_8 dim_9 dim_10 dim_11 dim_12 dim_13 dim_14 dim_15 dim_16 dim_17 dim_18 dim_19 dim_20 dim_21 dim_22 dim_23 dim_24 dim_25 dim_26 dim_27 dim_28 dim_29 dim_30 dim_31
module_embedding module_1 370 905 95.500000 photosynthesis=8; carbohydrate_metabolism=6; transport=6 0.407507 0.501369 0.437048 0.536964 0.609354 0.295566 0.573001 0.130418 0.095693 0.248442 0.102217 0.527052 0.418555 0.606575 0.552413 0.159161 0.311610 0.492396 0.452325 0.371705 0.597765 0.183879 0.215647 0.263849 0.398344 0.189950 0.508722 0.349042 0.120555 0.403450 0.419852 0.068442
module_embedding module_2 417 905 549.500000 transport=12; ribosome_translation=10; amino_acid_metabolism=9 0.313856 0.292447 0.347742 0.355261 0.470040 0.310987 0.474610 0.089715 0.147179 0.108442 0.158273 0.363429 0.343239 0.480272 0.401259 0.191549 0.173984 0.426698 0.470473 0.278420 0.526645 0.108341 0.337907 0.341463 0.429575 0.248602 0.416362 0.401197 0.151825 0.431246 0.252847 0.057364
module_embedding module_3 402 905 808.000000 electron_transport=10; nucleotide_metabolism=10; amino_acid_metabolism=9 0.274970 0.230609 0.300670 0.299040 0.414148 0.296549 0.424841 0.081045 0.181492 0.073311 0.196093 0.306114 0.351254 0.423871 0.347317 0.214253 0.137899 0.384735 0.440909 0.239662 0.477030 0.091397 0.418597 0.403915 0.419036 0.269264 0.367380 0.401356 0.172479 0.419983 0.197954 0.064705
module_embedding module_4 754 905 1985.000000 nucleotide_metabolism=20; amino_acid_metabolism=16; ribosome_translation=16 0.253170 0.201094 0.278604 0.264971 0.380335 0.278061 0.388727 0.077881 0.204414 0.058936 0.233944 0.276279 0.353755 0.387455 0.317819 0.242202 0.121983 0.357152 0.428221 0.217916 0.443869 0.079782 0.475507 0.452327 0.422616 0.302085 0.339188 0.418589 0.197269 0.421860 0.169571 0.075168
module_embedding module_5 1713 905 95.500000 nucleotide_metabolism=19; signal_transduction=19; amino_acid_metabolism=13 0.258086 0.339614 0.284128 0.352757 0.410128 0.161667 0.359109 0.118467 0.236798 0.143966 0.247562 0.355518 0.424186 0.396874 0.383100 0.270887 0.215946 0.293708 0.249966 0.250129 0.375957 0.139998 0.493767 0.462708 0.250788 0.263664 0.323902 0.266062 0.214067 0.254930 0.274002 0.113661
module_embedding module_6 334 900 29.000000 electron_transport=8; photosynthesis=4; ribosome_translation=4 0.279235 0.404131 0.298659 0.386596 0.419442 0.140468 0.344799 0.151697 0.245142 0.214840 0.254235 0.399746 0.485371 0.395966 0.415801 0.270300 0.279168 0.284286 0.204200 0.263833 0.347620 0.183799 0.503477 0.468667 0.218624 0.245662 0.334555 0.230397 0.219328 0.204060 0.321749 0.126378
module_embedding module_7 594 903 287.000000 nucleotide_metabolism=16; ribosome_translation=15; signal_transduction=13 0.267238 0.265494 0.287860 0.309532 0.399409 0.251811 0.385134 0.098341 0.206126 0.106920 0.229490 0.316218 0.385438 0.397154 0.350699 0.241729 0.169744 0.355666 0.385254 0.233046 0.433004 0.111478 0.466480 0.444883 0.376681 0.280924 0.340980 0.376519 0.195666 0.373687 0.214088 0.082769
module_embedding module_8 994 902 274.000000 ribosome_translation=16; transport=15; amino_acid_metabolism=13 0.293179 0.288893 0.320018 0.348458 0.453425 0.285496 0.444847 0.080233 0.170985 0.105837 0.182392 0.351834 0.360010 0.455937 0.387367 0.200751 0.174671 0.406774 0.434834 0.257058 0.501776 0.097105 0.397867 0.382052 0.403979 0.255199 0.382681 0.385151 0.164718 0.403425 0.237122 0.055747
module_embedding module_9 530 890 22.000000 nucleotide_metabolism=9; lipid_metabolism=7; amino_acid_metabolism=6 0.353421 0.553414 0.379837 0.517496 0.539982 0.136973 0.452076 0.166866 0.191184 0.296015 0.155546 0.528788 0.504983 0.521086 0.539270 0.202453 0.360687 0.352284 0.228183 0.342444 0.433534 0.225870 0.357215 0.343060 0.199906 0.172146 0.431040 0.190725 0.162983 0.181328 0.453268 0.108893
module_embedding module_10 765 905 2640.000000 ribosome_translation=31; nucleotide_metabolism=25; electron_transport=20 0.239146 0.194224 0.260132 0.249265 0.356397 0.250218 0.355774 0.082358 0.221041 0.057554 0.265104 0.262097 0.364459 0.360494 0.303659 0.270248 0.119198 0.322283 0.381795 0.207367 0.404236 0.084270 0.513662 0.486952 0.383600 0.308067 0.314207 0.388947 0.215626 0.382563 0.162615 0.090205
module_embedding module_11 622 905 473.500000 ribosome_translation=19; signal_transduction=16; electron_transport=11 0.212731 0.223854 0.244143 0.235168 0.320902 0.175413 0.293904 0.110757 0.254814 0.080674 0.308326 0.265050 0.395162 0.314563 0.294770 0.319700 0.150470 0.251210 0.274678 0.194048 0.322092 0.118490 0.560088 0.531030 0.296718 0.324158 0.281271 0.341098 0.252301 0.295761 0.180946 0.122923
module_embedding module_12 506 905 3049.500000 signal_transduction=22; nucleotide_metabolism=18; transport=15 0.220901 0.180233 0.237068 0.209311 0.304940 0.209318 0.293366 0.099874 0.256654 0.059057 0.320907 0.239557 0.390353 0.300831 0.272293 0.325632 0.119532 0.256450 0.314169 0.193130 0.329671 0.109004 0.578516 0.548397 0.334672 0.334529 0.282217 0.366829 0.255197 0.334923 0.155870 0.120460
module_embedding module_13 598 903 154.000000 electron_transport=16; nucleotide_metabolism=12; iron_homeostasis=9 0.176550 0.199200 0.171030 0.201693 0.209506 0.144779 0.157293 0.256553 0.413931 0.175611 0.381461 0.189710 0.470362 0.181537 0.204727 0.398787 0.221876 0.146067 0.128852 0.189442 0.168018 0.243019 0.631811 0.579543 0.180719 0.338572 0.192935 0.238438 0.319761 0.209763 0.203851 0.281597
module_embedding module_14 621 896 40.000000 signal_transduction=20; electron_transport=11; ribosome_translation=8 0.171826 0.209154 0.189363 0.217537 0.265430 0.146459 0.225651 0.142053 0.317749 0.089953 0.379853 0.227979 0.416424 0.248270 0.248579 0.396876 0.161802 0.190797 0.180907 0.168294 0.245015 0.143456 0.654610 0.601963 0.226256 0.346677 0.215508 0.270584 0.309147 0.240686 0.166090 0.182557
module_embedding module_15 375 902 64.000000 ribosome_translation=8; carbohydrate_metabolism=4; nucleotide_metabolism=4 0.226324 0.369773 0.245572 0.335088 0.343081 0.097561 0.265696 0.153503 0.291708 0.195397 0.334768 0.347915 0.497764 0.315231 0.355852 0.349736 0.260723 0.206167 0.130502 0.219781 0.252199 0.188063 0.602618 0.556798 0.166101 0.299371 0.265936 0.206733 0.269914 0.164020 0.289981 0.162008
module_embedding module_16 1809 902 132.000000 ribosome_translation=22; signal_transduction=18; electron_transport=17 0.221932 0.350376 0.241232 0.332854 0.351255 0.113647 0.279934 0.141037 0.278861 0.164371 0.316590 0.337363 0.463289 0.328485 0.348976 0.334120 0.233898 0.232514 0.157906 0.221235 0.284712 0.162283 0.574147 0.529122 0.179023 0.288437 0.268354 0.210948 0.259620 0.172679 0.279652 0.150244
module_embedding module_17 622 900 66.000000 nucleotide_metabolism=10; ribosome_translation=10; electron_transport=9 0.203329 0.252222 0.203472 0.265410 0.285390 0.162676 0.234843 0.228000 0.363185 0.179884 0.313418 0.248043 0.449011 0.264366 0.266786 0.337306 0.242993 0.224879 0.193088 0.211230 0.262971 0.214146 0.556937 0.514849 0.202732 0.295418 0.231037 0.231562 0.270398 0.220870 0.218078 0.237811
module_embedding module_18 903 904 77.000000 signal_transduction=38; transport=12; ribosome_translation=9 0.169909 0.220174 0.187054 0.210932 0.252847 0.122676 0.204941 0.151144 0.331983 0.095676 0.401548 0.233537 0.436167 0.235118 0.249410 0.419537 0.169331 0.155489 0.144713 0.166625 0.211617 0.158837 0.684257 0.626429 0.194806 0.359967 0.212179 0.264455 0.325212 0.227441 0.175738 0.197963
module_embedding module_19 756 905 1038.500000 signal_transduction=30; electron_transport=25; transport=22 0.160193 0.117823 0.154910 0.133336 0.188434 0.176228 0.174591 0.168622 0.348158 0.066642 0.405327 0.147394 0.408155 0.177560 0.173721 0.423801 0.113205 0.158071 0.205927 0.151622 0.193695 0.161730 0.673661 0.625608 0.257465 0.379352 0.189977 0.334480 0.328804 0.289844 0.121651 0.211633
module_embedding module_20 153 905 451.500000 signal_transduction=6; transport=6; electron_transport=3 0.142113 0.151046 0.129358 0.149802 0.152082 0.139202 0.114528 0.189470 0.379701 0.098151 0.443689 0.136229 0.434945 0.133590 0.148037 0.464815 0.135187 0.117031 0.121825 0.140813 0.121889 0.188008 0.723894 0.659087 0.175780 0.385914 0.141189 0.276842 0.360537 0.234064 0.158506 0.245071
function_embedding photosynthesis 53 -1 -1.000000 top_module=M1(w=0.022) 0.303004 0.357226 0.325805 0.383297 0.452100 0.233208 0.417721 0.129283 0.195839 0.170988 0.206110 0.386049 0.415219 0.445086 0.412350 0.236764 0.234453 0.363475 0.345756 0.278669 0.445052 0.156287 0.405859 0.399731 0.329580 0.249434 0.379827 0.322370 0.187624 0.331391 0.298189 0.103140
function_embedding carbon_fixation 18 -1 -1.000000 top_module=M12(w=0.006) 0.230177 0.248004 0.246697 0.266487 0.332622 0.190336 0.301315 0.131303 0.268282 0.115721 0.299607 0.279769 0.418093 0.321990 0.306431 0.311607 0.176828 0.263102 0.271922 0.212246 0.327283 0.141757 0.550696 0.516368 0.290121 0.308036 0.287324 0.316587 0.247081 0.293115 0.209277 0.138778
function_embedding electron_transport 189 -1 -1.000000 top_module=M19(w=0.033) 0.232205 0.250824 0.246696 0.273003 0.334622 0.199486 0.305427 0.141065 0.268818 0.121723 0.293335 0.279015 0.413545 0.325056 0.305259 0.311940 0.181590 0.270373 0.276200 0.216194 0.331927 0.149910 0.535603 0.503695 0.290076 0.304138 0.288327 0.315770 0.246797 0.300288 0.214913 0.146982
function_embedding nitrogen_metabolism 43 -1 -1.000000 top_module=M10(w=0.007) 0.231972 0.253859 0.247461 0.273693 0.335396 0.195214 0.305391 0.135648 0.265216 0.118962 0.295443 0.281170 0.413178 0.326131 0.307012 0.314028 0.178739 0.268119 0.273787 0.215424 0.330276 0.146722 0.538980 0.506736 0.287745 0.305955 0.288555 0.316801 0.247784 0.298510 0.217200 0.142975
function_embedding lipid_metabolism 141 -1 -1.000000 top_module=M12(w=0.022) 0.249428 0.265100 0.269226 0.291957 0.366912 0.213596 0.341973 0.123579 0.241198 0.117602 0.267422 0.303060 0.403963 0.360810 0.331919 0.286005 0.180534 0.299846 0.311943 0.228266 0.372305 0.136483 0.503212 0.477383 0.316473 0.292669 0.316489 0.331512 0.226641 0.320448 0.223053 0.122359
function_embedding carbohydrate_metabolism 123 -1 -1.000000 top_module=M19(w=0.022) 0.242932 0.260656 0.259182 0.286183 0.352539 0.210607 0.326284 0.133309 0.252314 0.121497 0.279184 0.292297 0.407370 0.344922 0.319367 0.299925 0.182117 0.288893 0.297651 0.224075 0.354810 0.145097 0.513763 0.487262 0.305043 0.298485 0.303632 0.325622 0.236412 0.314951 0.222052 0.135447
function_embedding amino_acid_metabolism 156 -1 -1.000000 top_module=M19(w=0.024) 0.240138 0.245260 0.257353 0.274806 0.348617 0.215820 0.327230 0.126506 0.250643 0.108773 0.277737 0.283599 0.399361 0.343063 0.312699 0.296504 0.169636 0.290055 0.308514 0.220094 0.358660 0.136296 0.515968 0.487703 0.315331 0.300633 0.303661 0.335193 0.234556 0.323740 0.210408 0.129782
function_embedding nucleotide_metabolism 225 -1 -1.000000 top_module=M12(w=0.036) 0.236730 0.247673 0.253117 0.273442 0.343040 0.207063 0.318071 0.130129 0.257521 0.112899 0.284743 0.282292 0.406113 0.335823 0.310439 0.302184 0.173627 0.281288 0.295421 0.217721 0.347511 0.139942 0.526868 0.496717 0.305267 0.302571 0.297254 0.327808 0.239118 0.313162 0.211172 0.134784
function_embedding signal_transduction 259 -1 -1.000000 top_module=M12(w=0.043) 0.219420 0.230514 0.234531 0.251004 0.315556 0.193315 0.288883 0.132112 0.272639 0.102314 0.314487 0.261741 0.407538 0.306702 0.287788 0.332028 0.163518 0.253232 0.267625 0.202804 0.314867 0.140893 0.564283 0.529169 0.287085 0.319723 0.274192 0.321856 0.260565 0.301136 0.196546 0.147557
function_embedding transport 174 -1 -1.000000 top_module=M20(w=0.039) 0.232581 0.240975 0.247373 0.265933 0.332405 0.207698 0.308322 0.132173 0.260586 0.109731 0.295458 0.273608 0.404123 0.325088 0.300406 0.315006 0.168873 0.273935 0.290057 0.213706 0.336856 0.142334 0.535552 0.505555 0.301961 0.310115 0.289989 0.330312 0.247768 0.315636 0.208042 0.140583
function_embedding ribosome_translation 227 -1 -1.000000 top_module=M10(w=0.041) 0.244478 0.261495 0.264432 0.288233 0.361577 0.210686 0.335895 0.123428 0.244851 0.115614 0.272408 0.298268 0.404157 0.354848 0.327001 0.289758 0.179226 0.295784 0.306929 0.223976 0.366708 0.135070 0.510802 0.483725 0.313211 0.295748 0.309980 0.329539 0.229439 0.317318 0.218407 0.124073
function_embedding protein_folding 25 -1 -1.000000 top_module=M3(w=0.010) 0.263135 0.268478 0.284191 0.305125 0.386821 0.238085 0.369268 0.118887 0.223030 0.116761 0.247252 0.312971 0.393197 0.383706 0.343670 0.269269 0.179377 0.326242 0.346088 0.238713 0.403626 0.133590 0.469172 0.451737 0.343026 0.285545 0.336266 0.348744 0.212673 0.349249 0.228623 0.112406
function_embedding iron_homeostasis 84 -1 -1.000000 top_module=M13(w=0.015) 0.246646 0.265538 0.265011 0.291644 0.360507 0.211254 0.333305 0.135361 0.251534 0.125457 0.270987 0.298989 0.408414 0.352669 0.326628 0.291144 0.187637 0.293377 0.300070 0.228635 0.362299 0.146512 0.503995 0.478070 0.306708 0.292700 0.310610 0.322806 0.230830 0.313270 0.226136 0.134245
dim_function_loading latent_dim_0 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.723) 0.723327 -0.156613 -0.276621 -0.232798 0.203428 0.020394 -0.056490 -0.169000 -0.549833 -0.225965 0.064272 0.301757 0.106588
dim_function_loading latent_dim_1 -1 -1 -1.000000 signal_transduction(r=-0.666) 0.564269 -0.224220 -0.429891 -0.312989 -0.204988 -0.308142 -0.499786 -0.533566 -0.665943 -0.500686 -0.273051 -0.075251 -0.169486
dim_function_loading latent_dim_2 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.684) 0.684187 -0.148824 -0.315803 -0.244690 0.231445 -0.019481 -0.058425 -0.179838 -0.531617 -0.254212 0.115626 0.306367 0.108852
dim_function_loading latent_dim_3 -1 -1 -1.000000 signal_transduction(r=-0.679) 0.661997 -0.238439 -0.392574 -0.313024 -0.065222 -0.186421 -0.346921 -0.426888 -0.679103 -0.437462 -0.136004 0.087563 -0.060778
dim_function_loading latent_dim_4 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.665) 0.664529 -0.178662 -0.347098 -0.275320 0.175507 -0.069121 -0.118413 -0.235639 -0.571172 -0.324616 0.089451 0.257030 0.059459
dim_function_loading latent_dim_5 -1 -1 -1.000000 protein_folding(r=+0.598) 0.436729 -0.054964 0.123087 0.009190 0.510870 0.473017 0.529221 0.356650 -0.033790 0.287012 0.443691 0.597857 0.383652
dim_function_loading latent_dim_6 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.640) 0.640212 -0.153685 -0.262439 -0.216322 0.314346 0.068902 0.072052 -0.074013 -0.454225 -0.184675 0.222764 0.382453 0.150322
dim_function_loading latent_dim_7 -1 -1 -1.000000 ribosome_translation(r=-0.493) -0.106474 -0.080362 0.191458 -0.007722 -0.473663 -0.109698 -0.334561 -0.237368 -0.123084 -0.117303 -0.492622 -0.332489 -0.017829
dim_function_loading latent_dim_8 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=-0.583) -0.583037 0.118800 0.263871 0.151763 -0.357242 -0.113787 -0.131117 0.016639 0.304890 0.070021 -0.281321 -0.392550 -0.103940
dim_function_loading latent_dim_9 -1 -1 -1.000000 signal_transduction(r=-0.675) 0.466428 -0.193305 -0.248878 -0.265734 -0.372822 -0.290971 -0.573251 -0.538939 -0.674937 -0.484630 -0.439964 -0.201448 -0.132086
dim_function_loading latent_dim_10 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=-0.637) -0.636640 0.165675 0.229518 0.222509 -0.284681 -0.052240 -0.071005 0.069168 0.561540 0.229802 -0.189178 -0.351530 -0.182516
dim_function_loading latent_dim_11 -1 -1 -1.000000 signal_transduction(r=-0.635) 0.633362 -0.192375 -0.421429 -0.315481 0.001226 -0.214548 -0.327365 -0.403476 -0.635146 -0.438239 -0.088458 0.092431 -0.062572
dim_function_loading latent_dim_12 -1 -1 -1.000000 amino_acid_metabolism(r=-0.646) -0.038687 0.007780 -0.150728 -0.135091 -0.521591 -0.431216 -0.645717 -0.470233 -0.325556 -0.421883 -0.528304 -0.473820 -0.301829
dim_function_loading latent_dim_13 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.654) 0.653628 -0.174384 -0.323262 -0.252407 0.229933 -0.023312 -0.046830 -0.176463 -0.528287 -0.273892 0.139435 0.300843 0.086863
dim_function_loading latent_dim_14 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.642) 0.641970 -0.179281 -0.400976 -0.304488 0.069665 -0.174879 -0.259629 -0.343802 -0.620041 -0.412569 -0.020428 0.144171 -0.022873
dim_function_loading latent_dim_15 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=-0.585) -0.585069 0.097047 0.212827 0.210730 -0.337786 -0.041900 -0.103487 0.011321 0.551920 0.234629 -0.264020 -0.354908 -0.194821
dim_function_loading latent_dim_16 -1 -1 -1.000000 signal_transduction(r=-0.697) 0.465977 -0.209479 -0.318985 -0.324164 -0.359579 -0.348227 -0.608905 -0.586442 -0.696625 -0.555029 -0.406162 -0.198864 -0.141962
dim_function_loading latent_dim_17 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.633) 0.633073 -0.146531 -0.182686 -0.182967 0.349449 0.164233 0.157883 0.010851 -0.424847 -0.101716 0.282731 0.422972 0.198283
dim_function_loading latent_dim_18 -1 -1 -1.000000 lipid_metabolism(r=+0.544) 0.444218 -0.031427 -0.003495 -0.032191 0.543706 0.357623 0.455034 0.310953 -0.114006 0.170702 0.479751 0.542203 0.310426
dim_function_loading latent_dim_19 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.724) 0.724179 -0.203363 -0.306644 -0.272226 0.077890 -0.065506 -0.176033 -0.286489 -0.639576 -0.326951 -0.064480 0.213736 0.077189
dim_function_loading latent_dim_20 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.606) 0.606007 -0.129691 -0.209236 -0.191387 0.377365 0.131958 0.163543 0.013301 -0.395464 -0.118169 0.303092 0.426194 0.197370
dim_function_loading latent_dim_21 -1 -1 -1.000000 ribosome_translation(r=-0.584) 0.108381 -0.139923 0.009875 -0.090541 -0.513518 -0.195427 -0.482448 -0.404946 -0.288532 -0.233493 -0.584238 -0.318414 -0.104901
dim_function_loading latent_dim_22 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=-0.707) -0.707145 0.197835 0.206185 0.208899 -0.261456 -0.117420 -0.068841 0.091560 0.536150 0.174339 -0.154223 -0.386799 -0.214421
dim_function_loading latent_dim_23 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=-0.685) -0.684910 0.205388 0.216914 0.221620 -0.246246 -0.076352 -0.056925 0.106899 0.575437 0.211319 -0.136329 -0.358617 -0.200658
dim_function_loading latent_dim_24 -1 -1 -1.000000 lipid_metabolism(r=+0.592) 0.353592 0.037348 0.078393 0.028731 0.591547 0.407989 0.527544 0.401047 0.019834 0.254565 0.542999 0.561661 0.345497
dim_function_loading latent_dim_25 -1 -1 -1.000000 signal_transduction(r=+0.722) -0.634515 0.209067 0.316791 0.309175 -0.058292 0.151740 0.194784 0.294799 0.721594 0.433772 0.046791 -0.151757 -0.049100
dim_function_loading latent_dim_26 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=+0.674) 0.674148 -0.137875 -0.272518 -0.220414 0.300225 0.037609 0.032213 -0.104637 -0.485892 -0.203099 0.170071 0.360676 0.153177
dim_function_loading latent_dim_27 -1 -1 -1.000000 amino_acid_metabolism(r=+0.644) 0.156344 0.103793 0.200435 0.185406 0.603244 0.501205 0.644478 0.545723 0.304768 0.469049 0.568866 0.526711 0.329851
dim_function_loading latent_dim_28 -1 -1 -1.000000 photosynthesis(r=-0.598) -0.598353 0.113067 0.232194 0.213089 -0.328319 -0.057753 -0.097138 0.025612 0.531828 0.219445 -0.256172 -0.367359 -0.180175
dim_function_loading latent_dim_29 -1 -1 -1.000000 protein_folding(r=+0.577) 0.323542 -0.001975 0.136332 0.083496 0.550834 0.483479 0.572233 0.430909 0.133989 0.370833 0.500631 0.577422 0.347426
dim_function_loading latent_dim_30 -1 -1 -1.000000 signal_transduction(r=-0.668) 0.600061 -0.232746 -0.374869 -0.268635 -0.210498 -0.255843 -0.451364 -0.503298 -0.668048 -0.441158 -0.320749 -0.045042 -0.122697
dim_function_loading latent_dim_31 -1 -1 -1.000000 lipid_metabolism(r=-0.431) -0.405507 0.012684 0.248290 0.115290 -0.431364 -0.071852 -0.207253 -0.089657 0.231094 0.064159 -0.393964 -0.360834 -0.084825