Ja-ck's picture
Initial upload of medical findings binary classifier
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metadata
tags:
  - setfit
  - sentence-transformers
  - text-classification
  - generated_from_setfit_trainer
widget:
  - text: 경중등도 지방간으로 병적 소견이며  기능 저하 위험이 우려됩니다
  - text: 공복 혈당 상승으로 검사 이상이 확인되었습니다.
  - text: 위염(염증 소견), 담낭 용종, 갑상선 초음파의 불균일한 에코 의심 소견  임상적으로 의미 있는 이상 소견이 확인됩니다.
  - text: 유방에 결절이 관찰되어 병적 소견의 가능성이 있어 추적 관찰이 필요함
  - text: 확산강조영상(DWI)에서 뇌실질의 급성 뇌경색  특이소견이 관찰되지 않아 정상 소견으로 판단
metrics:
  - accuracy
pipeline_tag: text-classification
library_name: setfit
inference: true
base_model: BAAI/bge-m3
model-index:
  - name: SetFit with BAAI/bge-m3
    results:
      - task:
          type: text-classification
          name: Text Classification
        dataset:
          name: Unknown
          type: unknown
          split: test
        metrics:
          - type: accuracy
            value: 0.9976095617529881
            name: Accuracy

SetFit with BAAI/bge-m3

This is a SetFit model that can be used for Text Classification. This SetFit model uses BAAI/bge-m3 as the Sentence Transformer embedding model. A LogisticRegression instance is used for classification.

The model has been trained using an efficient few-shot learning technique that involves:

  1. Fine-tuning a Sentence Transformer with contrastive learning.
  2. Training a classification head with features from the fine-tuned Sentence Transformer.

Model Details

Model Description

  • Model Type: SetFit
  • Sentence Transformer body: BAAI/bge-m3
  • Classification head: a LogisticRegression instance
  • Maximum Sequence Length: 8192 tokens
  • Number of Classes: 2 classes

Model Sources

Model Labels

Label Examples
1
  • '공복 혈당 상승은 검사 이상으로 임상적으로 의미 있음(당뇨 가능성 확인 필요).'
  • 'CPK 상승으로 근손상 가능성 및 근육 질환 의심이 제시됨.'
  • '자궁경부세포검사에서 위축성 세포 변화가 확인되어 검사 이상 소견이 있음'
0
  • '소견에 구체적인 이상 소견이나 검사 결과가 명시되어 있지 않고, 결과를 별지참조라고 되어 있어 임상적 이상 여부를 판단할 수 없음.'
  • '전립선 석회화는 과거 염증의 흔적일 수 있으며 현재 이상 소견이 없어 임상적 의미 없음'
  • '폐경 후 상태에서 정상 소견이므로 임상적으로 이상 없음'

Evaluation

Metrics

Label Accuracy
all 0.9976

Uses

Direct Use for Inference

First install the SetFit library:

pip install setfit

Then you can load this model and run inference.

from setfit import SetFitModel

# Download from the 🤗 Hub
model = SetFitModel.from_pretrained("Ja-ck/setfit-medical-binary-classifier")
# Run inference
preds = model("공복 혈당 상승으로 검사 이상이 확인되었습니다.")

Training Details

Training Set Metrics

Training set Min Median Max
Word count 2 10.7004 50
Label Training Sample Count
0 1404
1 3613

Training Hyperparameters

  • batch_size: (32, 32)
  • num_epochs: (1, 16)
  • max_steps: 200
  • sampling_strategy: oversampling
  • body_learning_rate: (2e-05, 1e-05)
  • head_learning_rate: 0.01
  • loss: CosineSimilarityLoss
  • distance_metric: cosine_distance
  • margin: 0.25
  • end_to_end: False
  • use_amp: False
  • warmup_proportion: 0.1
  • l2_weight: 0.01
  • seed: 42
  • eval_max_steps: -1
  • load_best_model_at_end: False

Training Results

Epoch Step Training Loss Validation Loss
0.005 1 0.1863 -
0.25 50 0.0461 -
0.5 100 0.0011 -
0.75 150 0.0008 -
1.0 200 0.001 -

Framework Versions

  • Python: 3.12.3
  • SetFit: 1.1.3
  • Sentence Transformers: 5.1.2
  • Transformers: 4.57.1
  • PyTorch: 2.8.0+cu128
  • Datasets: 4.4.1
  • Tokenizers: 0.22.1

Citation

BibTeX

@article{https://doi.org/10.48550/arxiv.2209.11055,
    doi = {10.48550/ARXIV.2209.11055},
    url = {https://arxiv.org/abs/2209.11055},
    author = {Tunstall, Lewis and Reimers, Nils and Jo, Unso Eun Seo and Bates, Luke and Korat, Daniel and Wasserblat, Moshe and Pereg, Oren},
    keywords = {Computation and Language (cs.CL), FOS: Computer and information sciences, FOS: Computer and information sciences},
    title = {Efficient Few-Shot Learning Without Prompts},
    publisher = {arXiv},
    year = {2022},
    copyright = {Creative Commons Attribution 4.0 International}
}