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|
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LC706864.1
|
Merbecovirus sp.
|
Murakami,S., Kitamura,T., Matsugo,H., Yamamoto,T., Mineshita,K., Sakuyama,M., Sasaki,R., Takenaka-Uema,A., Horimoto,T.
|
Laboratory of Veterinary Microbiology; 1-1-1 Yayoi, Bunkyo-ku, Tokyo 113-8657
|
Japan
|
2022-09-21
| null |
Merbecovirus sp.
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 29,736
|
GenBank
| 1
|
Japan
|
Japan
|
Vespertilio sinensis
|
feces
|
2016
| null | null |
Merbecovirus sp. VsCoV-a7 RNA, complete genome
|
TCCGTCTGGTGCGTGACAATCCGGGGCACATCATGTCTTCCGTGGCTGGTGTGGTCGCGCAAGGTGCGCGCGACATGTATCGAGCAGCGCTCAACAATGAAAAACGTCAAGACCACGTGTCTCAAACTGTGTCATTCTGTGGCGCAGGAGACCTGGCTATGAAACTTTCACCTTGGTTTGCGGATGGCGAAACAGCCTGCAATACGGTGAGAGCAACTCTTAAGAACAAAGGGAAAATTCTCTTTGTGCCGGTCAAATTGGCCAGCTTTGTTAAGCATCTCCCAGGCCCTCGTGTCTACCTGGTTGAGAGGCTCACGGGTGGGAACTATTCCGACCCATTCATGGTTAGCCAACTGGCGTATAGCTCTAGTGCACGCGATGCCATTGTCGGCACTACCCTGCAGGGCAAGCCAGTTGGTTACTTCTTCCCTTATGACCCTGCACTTGAGACTGGTGACTACACCTTTCTCCTGCGCAAGGATGGATTCGGAGGTAATTACTTCCGCAAACCTCGTCCTAACCCGGATGAGGAAATTCCTTTTGAACTCTTGGATGACCTCGAGGGCAACCCTAAGGGGAAGTATGCCAAGGGCCTGCTTAAGAAGTTGGTTGGTGGGGATTTTATTCCTATTGACCAGTTCATGTGTGGTAAGGACGGTGCACCTGTGCCTGACTATGCCACTCTGGCTGCTAGTGAGAATTTAATCTCACTGGCTGACGTTGCAACCGATGTTTCAGCTCGCGCTGATTCTGATGGTTACATCGATTTCAAGAGCAAACTTTACAGGATTGTTTGGCATGTTGAGCGTAAGAACGTTCCGTATGCCAAGCAAACCATCTTTACTATTAACAGTGTGGTTCAACGTGATGGCATTGAAGATGTGCCACCCCACACGTTTACTCTGGGAGGTAAGGTTGACCTGATTGTCCCACGTAACAAGTGGACAGGCAAGACAGCGCTTAACCTCAAACAGAAGATCCTTTACACCTTTTATGGAAAGGATGCTCTTGATAACCACTCTTACATCTACCATTCCGCCTATGCAGATTGCACTAGTTGTGGTAAGGGTAGTTGGCTCACAGGTAATGCTGTGCAAGGCTTTGCATGCGATTGTGGTGCACAATACTCGGCAAATGATGTCGAGCTTCAGTCTTCTGGAGTTGTTAACCCCAATGCTATCTTTTGTGCTACTTGCCCATTCGCAAAGGGTGATAGCTGCTCTTCCTCGTGCAAACATACTTTGGCTCAAATGGTTAGTCAACTGTCTGAGAAGTGTGATGTTGCACCTGATGGTAAATCCTTCACTCTGGCCTTTGGTGGCGTCGTTTACGCATACCTGGGCTGTCTTGACGGTACTATGTACTTTATTCCTCGTGCTAAATCCATTGTCTCAAAGGTGGGTGATGCCATCTTCACTGGATGTGTAGGCACGTGGTCTAAGGTTGCTACTATCGCAAGCCTTTTCTTGGAGCAAACACAGCGTTCCTTGAATTTTGTTGGAGAGTTTGTGCTTAACGATGTCGTTCTTGCTATTCTCTCTGGCACCACCACTAATGTGGACAAGCTCCGTAATCTTGTTAAGCATCTAGATGTTGACAAGTTACGTGAGTATCTTGCTGGCTATGACATTGCTGTCACAGTTGGACCCTACCTTGATGGTGCCATTAATGTTGGTAAGCAAGGACTACAGTTTGCTGCCATTACAGCACCTTTTGTTGTTCTCACTGGTCTTGGTGAGTCCTTTAAGAAAGTTGCAGCCATTCCGTATAAGGCATGCAAATCTATTAAAGAAACTCTGTTGTATTATGCTGAAAGCATTTTATACAGAGTTTTTCCGTATGAGATCTCGTCTGATGTCTCTACTTTTTCTGAACTGCTGTTAGACTGTGTTGGTTTTACAGCAGCATCATGCTATTTTGTAGTGCGACTGCTGGATGAGAAAGCTGAAGCACTTTTGTCCACTGTATTCTCTTCTTGTCAGGCTGCAGTTTCGAAGTTTCTTAATGGATGCTTCGAGGCTACAACTGCAACTGTCAACTTTCTTTTAGACCTTGCAAACCTTTTTAAGATCTTTCTTACGCAGGCCTATGTCTATACGACAACTGGCTTTGTTGCTGTAGGTTGCAAGGTTTCAAATCTTACTAAGCAGCTCTTGGAGATTCTGTCTAAAGCTATGCAGCTTTTACACACAAAGGTCTCCTGGGCTGGTGCTAAAGTTAAGGCTGTTGTTTACAACAGTAGGGAATCGCTTGTTTTCCCTTCAGGTACCTATTATTGTGTGGCTGCTCGTGCTAATGCTGTGCAACAAGAGTTTAGCGCAGTATTGCCTGGGGAGCTTGCAAAGAAGCAATTAGGTTTGCTTGAACCTGTTCGCCATGCTACCACCGTGGATGTGCAAGTCCAAAATAAAGTGGTAGATGTAGTTGTTGGCCAACTTGAAGAAACTAATATGCATAGCCCAGACCTCATTGTAGGCGACTATGTTGTTATTAGTGATAAGCTTTTTGTGCGTTGTGAAGAGGATGGTCAGACTGTCTTTTATCCAATGTGCACTAATGGCCAAGCTGTTCCTACCTTATTCAGACTTAAGGGCGGAGCACCTATTAAGAAAGTCACTTTTGGCGATGAAGAAGTACATGAAGTGGCTGCAACAAGAAGTGTTACAGTCAAGTACAACATTCATGCTGTGCTAGACGCGCTGCTTTCAAATTCTAATCTTAGAACTTTCTCTGTTGACAAGTCTCTTACTGTCGAGGATTTTGTTGATGTCGTGAAGGACGAGGTTTGTGAGTTGCTCACTAAGCTTCTGCGCGGCGTTGCATTAGATGACTTTGACTTGGAGACTTTTATTGATACTCCATGTTACTGTTTTAACCAGGATGGTGATGTACAGTGGAGTTCTACTATGTTCTTTTCAACACACCCTGTAGAGTGTGATGATGAGAATGAGGAAGAGCCTGCAGATGATGAGGCTGAGGATTTTGAAGAGTGTTCAGGTGACGAAGCCTGGGCTAGTCTTGTTGATGAGGCATTTCCTATGGATGACGATGAGGAGTCCATTGTAGATGAGCCTAAGCCTATTCAGCTCTGTACTGCTACAGAGCAACAAATTACTGTACAGGTGTTTGAGGCTAAAGCCTTTGAAACACCGGCAGTCAATTTTTGTAATGCTGTTAGTGTAGTCATTGACACACATACTGCTGATGTTATAGTTCGGGATGTAAAAATTGCACCCGAGCCACCAAAGCTGGAACAACCGCAAGTGTCAGCTGTGCAGGTTGAGGGCGACGCGTACGTACGGGTTCAGGCTAAGTCTGAACCTGGACAGGCCGCTCTACCTGAGCCTGTTATGGCTGAGGATGGTGTTACAGCAGTTACTAAGCCTAAAGAGTCGCAAGAGCTTGCCATGCGGTCTCAGGGTGATGCATCAACGCAGGTTCAGGCTCAGCCTCAATCTGTTGCTGCCGCACAACCTGAGGTACCTGTGGGAGCCGTGACTCCAGCAGCTACTGCTAAACCGGAAATTCCGGCTTCTAGCAACTATGAAGCTGACGTGGAGGTTGAACAACCAGTTGTGCGACCTAAGGTAAAGACACCTAAGAAGCGCACTACTAAAGGTGTTTCGGCCGCTGCTAGTGATAGCGATACGTCAGTTGATCCTTTAGTAGCTTTTAAGCACAAGGTTTGCACTGATAGTGTTACACTTGTTTTGTGTGACGCTATTAAGCTAGCCAAGTGCTTTAAAGATTGTGTGTTGGTTAATGCTGCTAACACACATCTTAAACATGGTGGTGGTATTGCTGCTGCTATAAATAAGGCATCTCATGGCTCAGTGCAAATGGAGTCTGATGAGTATGTTAACTCAAAAGGCCCATTGCAGGTTGGTGATGCTGTATTATTAAAGGGGCATGGTTTAGCCAAAAATATCCTCCATGTTGTTGGACCGGATATGCGTTCTAAACAAGATGTTTCTTTGCTTACTAAGTGTTACAAGGCTATGAATTCATACCCTTTAATTGTGACACCACTTGTATCTGCAGGCATTTTTGGAGTTGATCCTAAGGTGTCATTTGAGTATCTTCAGCGTGAGGCTAAGACGAGAATTCTGGTCGCCACCAATTCTGAAGATGTTTTTAACAAGCTTACAGAAGTTAAAGTGCCAGTTGGCTTAACTTTTTCTTATGATGGTCTTAAAGGCGGTATACGTAAGGCTAAAGATTATGGCTTTACGGTATTTGTCTGTATTGATAATTCTGCTAATACCAAGATCCTGCGTAGTAAGGGTGTTGATTACACTAAAAAGCAAGTTACAGTGGGCGGTGTCCATTACTATTGTTATAGTTCAAAGGACTTTCTGCCTGAACTTGTTTCTGCAGCTAATAGTACTAGAGGAATAATAGCTCATCCATTGGGATATATATCTCATGGTTTAGATCTTATGCAGGCTAGAGCTTTTGTTAAAATGGTACGTGTACCATATGTCTGCCTGCTTACTAATAAAGAGCAAGCTCTAGTTCTTACATCCACTGGTGAGCGTCTCTCTCCTGTAGATGAGTTTATAAAGCATGTTCAAGAGGAGGGCTCTTTTCATCATTGGCATCTTGTCAAGGGTGAGATCCTCCTTAACAATGCTATATATAATAAGTTGTTGCATTGGTCTGATCAAACCATTTGCTACAAAGACCAACAGCTCTTCGTGTTAAAGAATGGTTGTGCTTTACCATTTGAAGACCTTAATAAGTGTCGGACCTATTTGACTTCAAGGACGGCTCAGCAATTAACAATCGAAGTACTTGTTACGGTCGATGGTGTTAATTTTCGGACATGTGTCCTTAATAATCAAAGCACATACAGAGCACAACTCGGTTGTGTTTTTCTTGATGGTGCCGATATATCCGATACCATTCCGGATGAAAAGCAGAATGGTTTGGGTTTGTTTTTAGCCGACAATTTGTCTGCAGCTGAGAAGGATGTGCTTAAACAGTTATATGGTACTCCT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CGGCTACTTCGTTCTCAATTCTACAACTACTCGTGCTGCTGACCAGGAATGGTATTACACTGGTAGTTCTTTCTTTAGCCCTGAGCCTATTACGATGGCGAATGCTCGTTATGTTTCGCCAGATACTAAGTACGAGCAACTCGATAATAAACTTCCACCTCCTCTGCTTAGCAATCAGACAGATCAAGATTTCAAAGAAGAGCTGGAGGAGTTCTTTAAGAATGTTTCTTCTCAAGGTCCTAACTTTCAGGAGATATCAAAAATAAATGCTACCTTGCTGGATCTATCAGGAGAGATGAAGATCCTTAACGAGGTTGTCAAGCAACTTAATGAGTCATACATTGACCTTAAGGAGCTTGGAAATTATACCTATTACCAGAAATGGCCTTGGTACATCTGGTTGGGTTTCATTGCAGGACTTGTGGCTCTAGCCCTGTGTGTTTTCTTCTTGCTTTGCTGTACTGGCTGTGGTACCAACTGCATGGGCAAGCTTAAGTGTAATCGTTGCTGTGACAAGTACGATGATTATGATGTTGAGCCACATAAGATTCATGTCCATTAACGAACTTAGTTATGAGAGTGCAGAGACCTCCAACTTTGTTGTTGTTAATCGCACTTTCACTCTTTGCTAATGCATTCTCCAGACCTACTGTTGCTTATATACCTGAGCATTGTCAGTCCTATACTGGCAAAATGCTCAAGGCTTGCATCGCACAGACTAAGTTTGACACTGCTGGCATGTACACCAACCGTGTCATCTCAGTTCCTGTCGCTACTGGTGCTTTCGAGCTTACTGTTGACCGTGACACACAAACTGGCCATGGTGATTTTTATGATCAGTCTGTTGCCACGACTCTGGTGAACGTTGATCCTGACCAGGATTAACGAACTTTATGGATTACGTGTCTTTGCTTAACCAGGTTTGGCAGCAATACACTAATTCTGCAGTTATTACTGGTACCTACGTTCCACCACCAGCTGTTGCTTTCACACCTGTCACTGGTACTTCATTGCACCCCGTGCAGTGGCAGTGTCAGCTAACCTTTGACGGGTTTACTGGACTGGCTGTGAATAGCACTAAGGCATTAGCAAAGCAGGATGCAGCACAACAGGTTGCCTGGCAATTGCATCGCCACGGCAAGCTGTCAGGCTTCAGCCTTCGATGGCGTTGTGTTTAATCGCAAACGCCATCACAATCCTGATTCGAAACTACGTTATGCTAAACGTAGATTCTCTCCTCTTAAACCATCAGATGTAATGGACATCGACCCACATCCGGGCCCTACTCATTACCTGAGAGTTATCTTTGACCCTTCTCACACTTGGCATGTGAGTTCTGGTCATATGCTTGATGATGTTCAGAAGTGGCTGCAACCTTATGGTGCTAAGCCTATTACTGAGTATCATATTACACTTGCTCTTCTATGTTGTAAACCAGACGAGCAATTTCATGATCTCACTCCAGTTGCAAACATGCTCAAAGATGTGCTCTTTGAGCTGAGTGATTTCAATGTCTTGGGCAGAACATTAGTTCTGAATGCTCATGAGCTGCAGCGCTATGGCATGACCAGGCCTGTTAACATGGCAGTCCCCCATATTAAGGAGTGGCTTAAAATTCATGGGTATACCATTTATAATAGCCACCTTCCTCTACATCTTTCTGTTTCTAAGCTGCATGACCTAGATGAGGCTACACGCTCTTATATAGGTACTCGTGCATATTTCAAGCAGTATGTCACCCGCATTATAGTGGCACCCCGCTCTCTAGAGCTTGTCACTATACGCGGTTCTCCTAACAATCCTAAGCAGATTGTCAAGTCTTTACCAATACCAGCCAGTGTTTGGTAACGAACTATGGCTTTCTCTGCTTCTTTGTTTCGTCCTATTCAACTTCTTTCTGCTTTTCCTCACATTGATGAGGATACAGATGCAGTAGGACGGCAAGCTGAGGAGCCTCAAGTTATATTATCATGCATTCCCACTGTAGGTTACAGTGCAGCTTTGGCTGTTAATGCATGCCTTATTCCACTCATACTTTGTCTTAATCAGGACACTTGTATGCGTAGTATAGTTAAGACCCTAATTCTTTATGGTCTCATGCTTTATAATTTTATCCTATCGGCCATTTTGGTCAGTGGGACTCATATGCCACTAGGTAGCTGCTTGCTAACCTTCGTTGTGGTACTATCCATACTTTGGTTTGTTGACAGAGTTCGTTTCTGTCTCATGCTGAGGTCTTATATTCCACTTATTGACATGCGCTCTCATTTTGTGCGTGTCACTACGTGCTCTTCACAGGGTCTTGTTGCCGTTAATAACAGCAAACCCTATTTCATACGAAACTTTGAACAGCAATGTCGCTGCTCTCGTTGTTTCTACGTGCATTCTGTTGCTTACATTGAGTGCACTTATATTAGTCGTTTCAGCAAAGTACAGCTTGTGTCTGTAACTGAATTTTCGCTGAACAACCATCGATCTACTGTCTTCGTGCCTGCTGTGCGCGACTCAGTACCTCTTCACATAATCGCACCAAGCGTGCTTTCGGTTTAAGCTCGCTTAGCGCTTCTATGGTCCCATGTAGAGGCTCCTGCCATATATGTTTATAACACTGGACGTTCAGTCTATGTGAGGTTTCAAGAGAGTAAGCCCCCACTACCCCCTGATGAGTGGGTTTAACGAACTCTCTAATCATGTCTAACTCTTCGCTCTCCAGTGAGCAAATTGTTGCTATTGTTAAAGACTGGAACTTTGCATGGTCCATTATCTTTCTTTTAATAACTATCGTGCTACAATATGGTTACCCATCTCGTAGCATGACAGTATATGTTTTCAAAATGCTAGTACTATGGCTTCTTTGGCCTGCTTCAATGGCGCTGTCCATTTTCAGTGCAATCTACCCAGTAGACTTGTCAACCCAGATCATCTCTGGCATAATAGCTTTCATCTCTGCATGCATGTGGATTTCCTACTTCGTGCAGAGTATCAGGCTGTTTATGCGGACAGGCTCTTGGTGGTCCTTCAACCCCGAAACTAATTGCCTCTTGAATGTTCCAATTGGCGGCACTACCGTTGTCAGACCCCTCGTTGAAGACTCAACAAGTGTGACAGCTGTTGTCACCAATGGCTACCTCAAGATCGCAGGGATGCACTTTGGCCAGTGCGACTACCGCTCGCTTCCCAACGAAGTGACCGTCGCCAAACCCAATGTACTAATAGCTTTGAAAATGGTAAAGAGACAAGACTACGGAACAAACTCCGGTGTGGCTATTTACCACAGATACAAGGCTGGTAACTACAGACGTCCGGCAATTGTGCCAGACGCCGAACTTGCACTGCTGCGAGCGTAAGCTCATTAGTAAGAGTATGATTTAAAATCATTAACGAATCTTAATTTTCATTGTTATGGCCACCCCTGCAGCGCCCCGTGCTGTGACCTTCGGTGACAACAATGACAACAATACCAACACTCAGCAGTCTAGAGGCCGAGGAAGAACTCCTAAGCCTAGACCAGCTCCCAATAACACCGTCTCCTGGTACACTGGCCTTACCCAACACGGGAAGGTCCCTCTTTCCTTTCCACCTGGACAGGGCGTACCTCTTAATGCCAATTCAACCCCTGCACAAAATGCTGGGTATTGGCGGAGACAGGACCGAAAGATTAATACAGGAAATGGAACAAAGCAGCTGGCTCCCAGGTGGTTCTTCTACTACACTGGAACCGGGCCTGAAGCTAACCTCCCTTTCAGAGCTGTCAAGGATGGAATCGTCTGGGTACACGAAGAAGGTGCTACAGACGCTCCCTCCACTTTTGGGACGCGTAACCCTAACAACGATGCGGCTATTGTTACACAGTTCGCTCCAGGTACTAGGCTTCCTAAAAACTTCCACATTGAGGGCACTGGAGGCAACAGTCAGTCATCTTCAAGAGCATCTAGCGCCAGCAGAGGCTCTTCAAGATCTAGCTCAAGAGGTGCTCGTTCCGGAAATTCATCCAGAAGTGCTTCCCCAGGTCCAGCTGGAATCGGAGCTGTAGGTGGCGACGCTTCCAGTATTCTCTACCTGAGTTTGCTGAAGAGGCTCGAAGACCTTGAGGCCGGTAAATCTAAATCAGCACCTAAGGTTGTCACCAAGAAGGATGCTGCTGCTGCTAAAAACAAGATGCGCCACAAGCGCGTCGCCACCAAAAGTTTCAACATGGTTCAGGCGTTTGGACGTCGGGGACCAGGCGACCTCCAGGGAAACTTTGGTGACCTACAGTTGAACAAGCTCGGCACAGAAGACCCTCGCTGGCCTCAGATTGCTGAACTCGCTCCCTCAGCCAGCGCTTTCATGGGTATGTCTCAGTTTAAACTAACCCACCAAAGCAATGATGCTGATGGTTCCCCCGTGTACTTTCTCAGATACAGTGGAGCCATAAAACTTGATCCCAAGAACCCCAACTACCAGAAGTGGATGGAGCTGCTTGAGGCAAACATTGATGCCTACAAATCTTTCCCAGTTAAGGAGAAGAAACAAAAGGCTGATGATAACAAACAGGATTCCACTGAAGACAGTGGTGACCTCTTTGCCGAAGTCGTTGCTTCGGCGATGGCTTCACAATCTCAACCACAGCGAGCGCCTAAGGGTTCTATCACCCAGCGCTCTCGTGCTCCCAGAGCTCCTGTGAGTCAGATGGAAGACGTGAATCAGACCGATGACCGTCAGTAAATGTAACAAGAGTAAGGCAACCGCTAGTG
| 24,359
|
LC706865.1
|
Merbecovirus sp.
|
Murakami,S., Kitamura,T., Matsugo,H., Yamamoto,T., Mineshita,K., Sakuyama,M., Sasaki,R., Takenaka-Uema,A., Horimoto,T.
|
Laboratory of Veterinary Microbiology; 1-1-1 Yayoi, Bunkyo-ku, Tokyo 113-8657
|
Japan
|
2022-09-21
| null |
Merbecovirus sp.
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,085
|
GenBank
| 1
|
Japan
|
Japan
|
Eptesicus japonensis
|
feces
|
2016-07
| null | null |
Merbecovirus sp. EjCoV-3 RNA, complete genome
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GCCCCCTGGGAAGAGCTCTACAGTGTGAAATGTAAATAAAAATAGCTGTTATTCAATTAGATTAGGCGATTAGATGATTAACAAA
| 24,360
|
PP002150.1
|
Mercurialis orthotospovirus 1
|
Mahillon,M.
|
Agroscope, Plant protection
|
Switzerland
|
2024-01-19
|
CH
|
Mercurialis orthotospovirus 1
|
Orthotospovirus
|
Tospoviridae
|
ssRNA(+/-)
| 8,964
|
GenBank
| null |
Switzerland
|
Switzerland
|
Mercurialis annua
| null |
2021
| null | null |
Mercurialis orthotospovirus 1 isolate CH segment RNA 1, complete sequence
|
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| 9,586
|
OL471964.1
|
Mercurialis orthotospovirus 1
|
Rivarez,M.P.S., Bacnik,K., Kogej,Z., Lengar,Z., Maksimovic Carvalho Ferreira,O., Pecman,A., Seljak,G., Vucurovic,A., Mehle,N., Gutierrez-Aguirre,I., Ravnikar,M., Kutnjak,D.
|
National Institute of Biology, Department of Biotechnology and Systems Biology
|
Slovenia
|
2022-06-27
|
KOP20SW
|
Mercurialis orthotospovirus 1
|
Orthotospovirus
|
Tospoviridae
|
ssRNA(+/-)
| 8,976
|
GenBank
| null |
Slovenia
|
Slovenia
|
Mercurialis annua
| null |
2020-08
|
SAMN22357975
|
PRJNA772045
|
MAG: Mercurialis orthotospovirus 1 isolate KOP20SW segment L, complete sequence
|
GAGCAATCGAGCAACGAAAATAAAAAATCACAATGAATCTTCAATCAATTAACAGTTTCCTAGAAATAACCACCCAAATTACCGCATCTCTAGATACCCTGAGAGAGCAATTGCTTCTCCTATCCAATGTGGTTCAATATTCCTATAAGAATGGGAATGAAGCTGTTGCATCTGGCCTCAAAGCAATAATGAGCATGCTATGCATTATAGAAGAAATTGAAGAAATGAAGACTTCATATTACCAGAGCACTATGTCAATGGACCAAAAAGAAATGGAAAAAAAGATATTTCTTTTTATAGATAGATATAAAGAATTAGAATTAATGAGACATGACTTGTTTGGAGTCATGGCTAGTACAAAACTCCATTTTGCACCGAAACATAGGAATGACGTCGTTATGAAAGATTGTTTGATGACATACTTAGAATACTGTGCTAAAACAGAAGGCATCTTGAACCCAATAACTGATCTCGACAGCATCACATCCAAGCTAATCTTTCAGCACCAAACACCAGACAACTTTGTAATTTATAATGAAACCAAAGGTGAAAGAGCATGTTTGATGATATATGATTGGAAAGTTTCTGTCGATACAATGACAGAAAACAAAACATCAGAGAACTACTACAAAAGCATATGGAAAACATTTAAAGATGTAATAGTTGATGGTGAACCATTCCTCCAAAGGCATCCAATATTTGTCACTATTGTTATTCTGCAACCAATGAATAATATGCCAATAATTGCAACTACCTGCCGTGTACTAGAAGAAATGAGAAATTCTCCTTATAGAACATATAATGACAGAAAAATTGCTGCAGAAAGGGTCAAAACAATCTCTGCGAGGAGCTTAAAGCAACTTGCTGGGATAAATGGAACTCAATTTGTGACATTCTATTCTGAATGTCAAGCATTCAAAAATCTGCTGATGTCTAAAATAGGAGACCACATGAACAGAACAAATGAAGTGTTTTTCAGTCATTGGTCCTTTGAATACAAAGATTCTTTTTTAACTGACAATCTGATGAGCCAAGATGTTATCAATATTATAGAAGCATTACCTAATGATGTGATAGACCGAACACTCTTGGTTCATTTTCTTTTTGGAAATTACATATTATTTTCTAAGACAATGAGCGATTTGCACTTAAAAGATAGGTTTGAAGGTTATAAGTTAGGTTGCAAAATGATGAATGTTAAGGCTTATGAAAGAGAAGAAGATTTAAAAGTCTATTTAGAAGACAATGAGTCTAAATTTGAAAAGTTATATGAAAGCCATTTGGACAAGATGAAATTAGGAATGTTGACTAAAAAAAGCAAAGAAAAAGAAATACCTTCAATAGAACAAGCATTCAATGTGAATGCAGAAAATTACCAAAAAGAATATCCAGGTTGTTTCACAAATGATCTACAAGAAACTAAAACAAACTTTTCTGTTTGTTGGTCACCGGCAACAGAAAAAATAACCATGGGAAACAAGAATTATAATAATGCTATAATACATGATTTCAGAACCAGTTTCATGGAAGAAGTTTCTTTGATACATCATAGAAGTTATGGTGGCCCTAAAATGGATTATGACTTTTCTAATTCACTTTTCAGGTTGGTAAAATCATGTTTAACAAAATTGAGCACAGATACAACTGGTCAATCAAAAATTAGAGCCGAAGATGTTGTGGACATCAAAGATGGTAGCATTAAAATATCTAGAGGTGATAAAGACAAAAACTGGGTAGATATAGGGAATGTAAGGACTAGAAATGGAAATGAATTTAATGTTTGTGAAAAAAGTGATCGAGAAAGCAAAACGAACTTCTTCCGAGGACTGACACTAATGAACATAGACATGGGGAAAAAGCGCAAAATGGAAGGGAAGAGAGAGTTGCAAGAAAAACTGAAATTATCTAAATCTAGAAATGACAATGAAATTAAAGATGGAGAATATGATCCATCCAAACCAGAAGACATCATGAATGAGTCTATAGGACAAATATCACACAATAAGAAACTGATTAGACATGACAACCCAAATGTAGCCTATTTCTGTGATGCTATGATACAAAGCATGTTTGCCTTGCATGGATTTGACAGTAGAACAGAGGATGAGGGGAAGATCAACAAAGTATTTTCTGAATACTGCAAAGATCCAGAGCTCTTATTCTCTAAAGGTCAATTGATTGAATCTGAAATGAAAGCATCAAAAAATATACATAAGCTGTCACAATCTCTGGCAGTGTATTCGTATAGTGATGATATGATGCAACTAGCCAAAGGCTTAATGGTCGCTGACAGATTCATGAGAAAGACAGATTTTAAAATATTGACATGCGCCAACACAAGTATGATATGTTTAGCATTTAAAGGAGATGGATTGAACACCGGCAAATCTGGGGTCCCATACATAACTGTACATAAAGTCCAAGAGCTGCTCCAACCGCATTTTGCATCATTGTACACAAAAGAACTGATTGTGTCATTTAAATCTGGTGAATATTACATTAATATAATGAAACCTCAAAGGTTGAACCAAGTCAGATTACTAAGCCTATTCAAATCTCCTAGCAAAGTACCAGTGTGTTTTTCTCAATATTGTTTGCTAAGCAAAGAAGTGAAAAGCTGGTTGACTAGAAGAGAAACTAATATTCTAGACTGCCCACCTTCTATACTACCTTTTGTAAAAAACGTCTTGTTTTCTTCTGTGATCATAGGCACAGTAACAAATCTAAACAGAATGGGAATTTTTGATTTCATGAGGTACGCTGGGTTTTTACCGTTATCTGATTATTCTAACATTAAAGAATACATTGCAGAGAAATTTGACCCAGATATAACTAATGTTATTGATTGTTATTTTGTTTCTGGTATCAAAACCCTACTTTTGAAAATGGAGGGGATCAACTTAAGTAGTAGTATCAAACCTCTAACTATTGACCAGGAGAATGACATGTCTGGAGGGATAAAAGACTTAAACATAATTTGTCCTATAACAGGTTCTACTCTCAGAACAATCGAATGTCTTTACAATAATGTGTATCTAGCCATTTACATGATGCCAAAATCATTACACACACACATACACAACCTAACAAGCCTGTTGAATGTGCCAGCAGAATGGGAAGTTAAATTTAGAGAAAAGATGGGTTTTAACTTGACAGAAGAGATCATTCCTAAGCCAAACATGTTCAATGATTCTGGTCCATTTTCTATTGATGGAATGCTAAACATTAAAACTTTATTTGATTATTACACAAAAACAATAGATAATGTAAGCTCAACAAGATCAAACATTGAGTCCAAAGAAGACTTCTTGTCAGCTCCTTACAAGATAAAAACATTAACATCATCTAAGAAATGTTCAAAAGCTGAAATAATAAAGAATTCTGAGATTAAGAGTAGTCTAGAGAACTGTTTGAACAAACAAGCTGAAGACATACAAGGCAGAGATTTATATATCTTAAAAGGGGTTCTTAAATGCTTTATAGAAGATAGAGATGCATTGAGCAATTTTATGATGCTAGAAGATCTAGACGAAGAAAGCTACTACCATTTCTTTAACTCAATGACCTCAGGAGAAAACAGAACTTTAATGAAGACAAGCTATGATAAATTCTACTACAATAGCCATCCATTGACAGTTGAATCATTCATAAAGGTTAGATATGGACATGTATCTACAACGACAGTTTTAAAATCAAAAAAAGTAAGTGAAGAATTATATGATCTAGTCAAGGAGTATAATAAGATCACTGAAATAGATCTTGATGCTCTAGAAAACATGGGGAGAGGGTTATCAGGAAGCAAAATGACTTTCATTCAACTATTGGAGTTTATTCTTTTGAAAACAAGAACAAATGCTGGGAACACAGATTTTTTAGTCTCAGTCTTTGAAAAGTTACAAAGAACTAAAATGGACAGAGAAATCTATTTAATGAGTATGAAAACAAAGATGATGCTATATTTCATTGAGCATACTTACAAACATATTGCTCAATCTGATCCATCAGAGGCTATATCCATCTCTGGAGATTACAAAATAAAGACATTGGCATCTTTATCTTATGATACTATAACTAATTATAATACTGCTTTGCAGAAAGGCACAGAGTGCAAAATGGCATTTTTGTCAGCTGATCAGTCTAAATGGTCAGCATCTGATTTGACATATAAATATATCTTAGCAGTTCTTATGAATCCAGTGCTGACAACTGGAGAGATAAACATGATGTGTGAATGCATATTAATGTATGTTAAACTGAAGCGTGTCTGCATTCCAACTGATGTCTTTTTAAACTTAAAGAGAGGTCAAATGAATTATGGTTCATATGGAACAGCTATTTCCATGCTTACCAACAACTTAGAAACAAATACATTTCCTGTAACAATGAATTGGCTTCAAGGAAATCTGAACTATTTATCATCTGTTTATCATTCTTGTGCCATGCTAGGATTTGAAAAAGCACTGAAAACCAAGGAAAATTATGATTTCACTCTAAGATGGATGGTGCATTCTGATGATAATGCCACATCATTAGTGGTTAAAGGGAACATAAAGAGGTTGTTGTCTGAATTCAACTGTTCTAACCTTTCGGAATTTCTGTTCCGGAGCATACAATCACATTTCAAAAGTTATTGTATTACACTAAATCCAAAGAAGAGTTATGCTTCTGAGTCAGAAGTGGAGTTTATTTCAGAGAGAATAATCAATGGAGCAGTAATACCACTATACTGCAGACATTTAGCTAATTGCTGCACAGAATCATCCCACAATAGCTATTTTGATGATTTAATGTCATTGTCTACACACATTACTATGCTGTTAAGAAAAGGGTGTCCCAATGAAATGATACCTTTTGCATATGCAGCTATACAATGCCAAGCTTTGAGCATTTACTCAATGCTTCCTGGTGAAGAAAATGACATAATGTCGATCAGTAAGTCTGTAAAGTTTCCTCTGGAAATGAGAGAAATACCGACTTGTGCAGGTGGATGGATGACAGCT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|
OL471967.1
|
Mercurialis orthotospovirus 1
|
Rivarez,M.P.S., Bacnik,K., Kogej,Z., Lengar,Z., Maksimovic Carvalho Ferreira,O., Pecman,A., Seljak,G., Vucurovic,A., Mehle,N., Gutierrez-Aguirre,I., Ravnikar,M., Kutnjak,D.
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National Institute of Biology, Department of Biotechnology and Systems Biology
|
Slovenia
|
2022-06-27
|
KOP19SW
|
Mercurialis orthotospovirus 1
|
Orthotospovirus
|
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|
GenBank
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Slovenia
|
Slovenia
|
Mercurialis annua
| null |
2019-08
|
SAMN22357975
|
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|
MAG: Mercurialis orthotospovirus 1 isolate KOP19SW segment L, complete sequence
|
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| 29,265
|
OL471970.1
|
Mercurialis orthotospovirus 1
|
Rivarez,M.P.S., Bacnik,K., Kogej,Z., Lengar,Z., Maksimovic Carvalho Ferreira,O., Pecman,A., Seljak,G., Vucurovic,A., Mehle,N., Gutierrez-Aguirre,I., Ravnikar,M., Kutnjak,D.
|
National Institute of Biology, Department of Biotechnology and Systems Biology
|
Slovenia
|
2022-06-27
|
PAR19SW
|
Mercurialis orthotospovirus 1
|
Orthotospovirus
|
Tospoviridae
|
ssRNA(+/-)
| 9,055
|
GenBank
| null |
Slovenia
|
Slovenia
|
Mercurialis annua
| null |
2019-08
|
SAMN22357975
|
PRJNA772045
|
MAG: Mercurialis orthotospovirus 1 isolate PAR19SW segment L, complete sequence
|
TGTAATCCGAGTACAACCAGATGAAGCTATCTATTTAAAGATCAATAACAAGGTCCCTGGCTTGGGAATGAGATTGGATCGGAGCAATCTAAATCTTCACTATGCAGCAAGCAATCGAGCAACGAAAATAAAAAATCACAATGAATCTTCAATCAATTAACAGTTTCCTAGAAATAACCACCCAAATTACCGCATCTCTAGATACCCTGAGAGAGCAACTGCTTCTCCTATCTAATGTGGTTCAATATTCCTATAAGAATGGGAATGAAGCTGTCGCATCTGGCCTCAAAGCAATAATGAGCATGCTATGCATTATAGAAGAAATTGAAGAAATGAAGACTTCATATTACCAGAGCACTATGTCAATGGACCAAAAAGAAATGGAAAAAAAGATATTTCTTTTTATAGATAGATATAAAGAATTAGAATTAATGAGACATGACTTGTTTGGAGTCATGGCTAGTACAAAACTCCATTTTGCACCGAAACATAGGAATGACGTCGTCATGAAGGATTGTTTGATGACATACTTAGAATACTGTGCTAAAACAGAAGGCATCTTGAACCCAATAACTGATCTCGACAGCATCACATCCAAGCTAATCTTTCAGCACCAAACACCAGACAACTTTGTAATTTACAATGAAACCAAAGGTGAAAGAGCATGTTTGATGATATATGATTGGAAAGTTTCTGTCGATACAATGACAGAAAACAAAACATCAGAGAACTACTACAAAAGCATATGGAAAACATTTAAAGATGTAATAGTTGATGGTGAGCCATTCCTCCAAAGGCATCCAATATTTGTCACTATTGTTATTCTGCAACCAATGAATAATATGCCAATAATTGCAACTACCTGCCGTGTACTAGAAGAGATGAGAAATTCTCCTTATAGAACATATAATGACAGAAAAATTGCTGCAGAAAGGGTCAAAACAATCTCTGCGAGGAGCTTAAAGCAGCTTGCTGGGATAAATGGAACTCAATTTGTGACATTCTATTCTGAATGCCAAGCATTCAAAAATCTGCTGATGTCTAAAATAGGAGACCACATGAACAGAACAAATGAAGTGTTTTTCAGCCATTGGTCCTTTGAATACAAAGATTCTTTTTTAACTGACAATATGATGAGCCAAGATGTTATCAATATTATAGAAGCATTACCTAATGATGTGATAGACCGAACACTCTTGGTTCATTTTCTTTTTGGAAATTACATATTATTTTCAAAGACAATGAGCGATTTGCACTTAAAAGATAGGTTTGAAGGTTATAAGTTAGGTTGCAAAATGATGAATGTTAAGGCTTATGAAAGAGAAGAAGATTTAAAAGTCTATTTAGAAGATAATGAGTCTAAATTTGAAAAGTTATATGAAAGCCATTTGGACAAGATGAAATTGGGAATGTTGACTAAAAAAAGCAAAGAAAAAGAAATACCTTCAATAGAACAAGCATTCAATGTGAATGCAGAAAATTACCAAAAAGAATATCCAGGCTGTTTCACAAATGATCTACAAGAAACTAAAACAAACTTTTCTGTTTGTTGGTCACCGGCAACAGAAAAAATAACCATGGGAAACAAGAATTATAATAATGCTATAATACATGATTTCAGAACTAGTTTCATGGAAGAAGTCTCTTTGATACATCATAGAAGTTATGGTGGCCCTAAAATGGATTATGACTTTTCTAATTCACTTTTCAGGTTGGTAAAATCATGTTTAACAAAATTGAGCACAGATACAACTGGTCAATCAAAAATTAGAGCCGAAGATGTTGTGGACATCAAAGATGGTAGCATTAAAATATCTAGAGGTGATAAAGACAAAAACTGGGTAGATATAGGGAATGTAAGGACTAGAAATGGAAATGAATTTAATGTTTGTGAAAAAAGTGATCGAGAAAGCAAAACGAACTTCTTCCGAGGACTGACACTAATGAACATAGACATGGGAAAAAAGCGCAAAATGGAAGGGAAGAGAGAGTTGCAAGAAAAACTGAAATTATCTAAATCTAGGAATGACAATGAAATTAAAGATGGAGAATATGATCCATCCAAACCAGAAGACATCATGAATGAGTCTATAGGGCAAATATCACACAATAAGAAACTGATTAGACATGACAACCCAAATGTAGCCTATTTCTGTGATGCTATGATACAAAGCATGTTTGCCTTGCATGGATTTGACAGTAGAACAGAGGATGAGGGGAAGATCAACAAAGTATTTTCTGAATACTGCAAAGATCCAGAGCTCTTATTCTCTAAAGGTCAATTGATTGAATCTGAAATGAAAGCATCAAAAAATATACATAAGCTATCACAATCTCTGGCAGTGTATTCGTATAGTGATGATATGATGCAACTAGCCAAAGGCTTAATGGTCGCTGACAGATTCATGAGAAAGACCGATTTTAAAATATTGACATGCGCCAACACAAGTATGATATGTTTAGCATTTAAAGGAGATGGATTGAACACCGGTAAATCTGGGGTCCCATACATAACTGTACATAAAGTCCAAGAGCTGCTCCAACCGCATTTTGCATCATTGTACACAAAAGAACTGATTGTGTCATTTAAATCTGGTGAATATTACATTAATATAATGAAACCTCAAAGGTTGAACCAAGTCAGATTACTAAGCCTATTCAAATCTCCTAGCAAAGTACCAGTGTGTTTTTCTCAATACTGTTTGCTAAGCAAAGAAGTGAAAAGCTGGTTGACTAGAAGAGAAACTAATATTCTGGACTGCCCACCTTCTATACTACCTTTTGTAAAAAACGTCTTGTTTTCTTCTGTGATCATAGGCACAGTAACAAATCTAAACAGAATGGGAATTTTTGATTTCATGAGGTACGCTGGGTTTTTGCCGTTATCTGATTATTCTAACATTAAAGAATACATTGCAGAGAAATTTGACCCAGATATAACTAATGTTATTGATTGTTATTTTGTTTCTGGTATCAAAACCCTACTTTTGAAAATGGAGGGGATCAACTTAAGTAGTAGTATCAAACCTCTAACTATTGATCAGGAGAATGACATGTCTGGAGGGATAAAAGACTTAAACATAATTTGCCCTATAACAGGTTCTACTCTTAGAACAATTGAATGTCTTTACAATAATGTGTATCTAGCCATTTACATGATGCCAAAATCATTACACACACACATACACAACCTAACAAGCCTGTTGAATGTGCCAGCTGAATGGGAAGTTAAATTTAGAGAAAAGATGGGTTTTAACTTGACAGAAGAGATCATTCCTAAGCCAAACATGTTTAATGATTCTGGTCCATTTTCCATTGATGGAATGCTAAACATTAAAACTTTATTTGATTATTACACAAAAACAATAGATAATGTGAGCTCAACAAGATCAAACATTGAGTCCAAAGAAGACTTCTTGTCAGCTCCTTACAAGATAAAAACATTAACATCATCTAAGAAATGTTCAAAAGCTGAAATAATAAAGAATTCTGAGATCAAGAGTAGTCTAGAGAACTGTTTGAACAAACAAGCTGAAGACATACAAGGCAGAGATTTATATATCTTAAAAGGGGTTCTTAAATGCTTTATAGAAGATAGAGATGCATTGAGCAATTTTATGATGCTAGAAGATCTAGACGAAGAAAGCTACTACCATTTCTTTAACTCAATGACCTCAGGAGAAAACAGAACTTTAATGAAGACAAGCTATGATAAATTCTACTACAATAGCCATCCATTGACAGTTGAATCATTCATAAAGGTTAGATATGGACATGTATCTACAACGACAGTTTTAAAATCAAAAAAAGTGAGTGAAGAATTATATGATCTAGTCAAGGAGTATAATAAGATCACTGAAATAGATCTTGGTGCTCTAGAAAACATGGGGAGAGGGTTATCAGGGAGCAAAATGACTTTCATTCAACTATTGGAGTTTATTCTTTTGAAAACAAGAACGAATGCTGGGAACACAGATTTTTTAGTCTCAGTCTTTGAAAAATTACAAAGAACTAAAATGGACAGAGAAATCTATTTAATGAGTATGAAAACAAAGATGATGTTATATTTCATTGAGCATACTTACAAACATATTGCTCAATCTGATCCATCAGAGGCTATATCCATCTCTGGAGATTACAAAATAAAGACATTGGCATCTTTATCTTATGATACTATAACTAATTATAATACTGCTTTGCAGAAAGGCACAGAGTGCAAAATGGCATTTTTGTCAGCTGACCAGTCCAAATGGTCAGCATCTGATTTGACATATAAATATATCTTAGCAGTTCTTATGAATCCAGTGCTGACAACTGGAGAGATAAACATGATGTGTGAATGCATATTAATGTATGTCAAACTGAAGCGTGTCTGCATTCCAACCGATGTCTTTTTAAACTTAAAGAGAGGTCAAATGAATTATGGTTCATATGGAACAGCTATTTCCATGCTTACCAACAACTTAGAAACAAATACATTTCCTGTGACAATGAATTGGCTTCAAGGAAATCTGAACTATTTATCATCTGTTTATCATTCTTGTGCCATGCTAGGATTTGAAAAAGCACTGAAAACTAAGGAAAATTATGATTTCACTCTAAGATGGATGGTGCATTCTGATGATAATGCCACATCATTAGTGGTTAAAGGGAACATAAAGAGGTTGTTGTCTGAATTCAACTGTTCTAACCTTTCGGAATTTCTGTTCCGGAGCATACAATCACATTTCAAAAGTTATTGTATTACACTAAATCCAAAGAAGAGTTATGCTTCTGAGTCAGAAGTGGAGTTTATTTCAGAGAGAATAATCAATGGAGCAGTAATACCACTATACTGCAGACATTTAGCTAATTGCTGCACAGAATCATCCCACAATAGCTATTTTGATGATTTAATGTCATTGTCTACACACATTACTATGCTATTAAGAAAAGGGTGTCCCAATGAAATGATACCTTTTGCGTATGCAGCTATACAATGCCAAGCTTTGAGCATTTAC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| 29,266
|
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|
Mercurialis orthotospovirus 1
|
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National Institute of Biology, Department of Biotechnology and Systems Biology
|
Slovenia
|
2022-06-27
|
BOL19SW
|
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|
Orthotospovirus
|
Tospoviridae
|
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|
GenBank
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Slovenia
|
Slovenia
|
Mercurialis annua
| null |
2019-08
|
SAMN22357975
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|
MAG: Mercurialis orthotospovirus 1 isolate BOL19SW segment L, complete sequence
|
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| 29,267
|
NC_010277.2
|
Merkel cell polyomavirus
|
Schowalter,R.M., Pastrana,D.V., Pumphrey,K.A., Moyer,A.L., Buck,C.B.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2008-01-21
|
R17b
|
Alphapolyomavirus quintihominis
|
Alphapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,387
|
RefSeq
| 1
|
USA
|
USA
|
Homo sapiens
|
skin
|
2009
| null |
PRJNA485481
|
Merkel cell polyomavirus isolate R17b, complete genome
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| 7,888
|
OQ616757.1
|
Merkel cell polyomavirus
|
Jin,H.-T., Choi,E.-K., Kim,Y.-S.
|
Hallym University, Ilsong Institute of Life Science
|
South Korea
|
2023-07-18
|
KLC
|
Alphapolyomavirus quintihominis
|
Alphapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,417
|
GenBank
| null |
South Korea
|
South Korea
|
Homo sapiens
| null | null | null | null |
Merkel cell polyomavirus isolate KLC, complete genome
|
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| 14,661
|
MK561422.1
|
Merkel cell polyomavirus
|
Jin,H.T., Park,S.J., Choi,E.K., Kim,Y.S., Jin,H.-T., Park,S.-J., Choi,E.-K., Kim,Y.-S.
|
Hallym University, Ilsong Institute of Life Science
|
South Korea
|
2019-04-07
|
KIB
|
Alphapolyomavirus quintihominis
|
Alphapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,417
|
GenBank
| 1
| null | null | null | null | null | null | null |
Merkel cell polyomavirus isolate KIB, complete genome
|
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|
MG241579.1
|
Merkel cell polyomavirus
|
Torres,C., Barrios,M.E., Cammarata,R.V., Victoria,M., Fernandez-Cassi,X., Bofill-Mas,S., Colina,R., Blanco Fernandez,M.D., Mbayed,V.A.
|
Universidad de Buenos Aires, Facultad de Farmacia y Bioquimica, Catedra de Virologia
|
Argentina
|
2018-05-06
|
M-cg-9-11.1
|
Alphapolyomavirus quintihominis
|
Alphapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,393
|
GenBank
| 1
|
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
| null |
2013
| null | null |
Merkel cell polyomavirus isolate M-cg-9-11.1, complete genome
|
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| 70,852
|
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|
Merkel cell polyomavirus
|
Torres,C., Barrios,M.E., Cammarata,R.V., Victoria,M., Fernandez-Cassi,X., Bofill-Mas,S., Colina,R., Blanco Fernandez,M.D., Mbayed,V.A.
|
Universidad de Buenos Aires, Facultad de Farmacia y Bioquimica, Catedra de Virologia
|
Argentina
|
2018-05-06
|
M-cg-9-11.3
|
Alphapolyomavirus quintihominis
|
Alphapolyomavirus
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Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,392
|
GenBank
| 1
|
Argentina
|
Argentina
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Homo sapiens
| null |
2013
| null | null |
Merkel cell polyomavirus isolate M-cg-9-11.3, complete genome
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|
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|
Merkel cell polyomavirus
|
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|
Universidad de Buenos Aires, Facultad de Farmacia y Bioquimica, Catedra de Virologia
|
Argentina
|
2018-05-06
|
M-cg-28-8.1
|
Alphapolyomavirus quintihominis
|
Alphapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
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| 5,386
|
GenBank
| 1
|
Argentina
|
Argentina
|
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| null |
2013
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Merkel cell polyomavirus isolate M-cg-28-8.1, complete genome
|
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|
MG241582.1
|
Merkel cell polyomavirus
|
Torres,C., Barrios,M.E., Cammarata,R.V., Victoria,M., Fernandez-Cassi,X., Bofill-Mas,S., Colina,R., Blanco Fernandez,M.D., Mbayed,V.A.
|
Universidad de Buenos Aires, Facultad de Farmacia y Bioquimica, Catedra de Virologia
|
Argentina
|
2018-05-06
|
M-cg-28-8.16
|
Alphapolyomavirus quintihominis
|
Alphapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,385
|
GenBank
| 1
|
Argentina
|
Argentina
|
Homo sapiens
| null |
2013
| null | null |
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|
AAGAATAAAGCACTGATAGCAAAAACACTCTCCCCACGTCAGACAGTTTTTTTGCTTTAAAGTTTTTAGACTACAATGCTGGCGAGACAACTTACAGCTAATACAAGCGCACTTAGAATCTCTAAGTTGCTTAAGCATGCACCCAGGACCTCTGCAAAATCTAGCATTATATCCACTTTGCATATAATCCTTTAAAGTTCCATATTCTTCCCAAGGAAATTTTGTACTGACCTCATCAAACATAGAGAAGTCACTTCTGAGCTTGTGGATATTTTGCTGGAATTTGCTCCAAAGGGTGTTCAATTCCATCATTATAACAGGATTTCCCCCTTTATCAGGGTGATGCTTTAAGCAGCTTCTTTTGAAAGCAGCTTTCATCAGAGGGATGTTGCCATAACAATTAGGAGCAATCTCTAAAAGCTTGCAGAGAGCCTCTCTTTCTTTCCTATTTAGGACCAAATCCATCTTGTCTATATGCAGAAGGAGTTTGCAGAAAGAGCAGGGGAGCAAATGAGCTACCTCACTAAGGAGTGGTTTTTATACTGCAGTTTCCCGCCCTTGGGATCTGCCCTTAGATACTGCCTTTTTTGCTAATTAAGCCTCTTAAGCCTCAGAGGCCTCTCTCTTTTTTTTCCAGAGGCCTCGGAGGCTAGGAGCCCCAAGCCTCTGCCAACTTGAAAAAAAAAGTCACCTAGGCAGCCAAGTTGTGGTTACATGATTGAACTTTTATTGCTGCAGGGTTTCTGGCATTGACTCATTTCCTGGAGAGGCGGAGTTTGACTGATAAACAAAACTTTTTTTCTTTCTGTTTGGGAGGGAGACGGAAGACTCTTAACTTTTTTTCAACAAGGGAGGCCCGGAGGCTTTTTTTTCTCTTACAAAGGGAGGAGGACATTAAAAGAGTAAGTATCCTTATTTATTTTTCAGGATGGGGGGCATCATCACACTGCTGGCCAATATTGGTGAAATTGCTACTGAACTAAGTGCCACCACAGGAGTAACTTTGGAAGCTATTCTTACAGGAGAAGCTTTAGCAGCTTTGGAAGCAGAGATCTCCAGTTTAATGACAATTGAGGGTATTTCTGGCATTGAGGCTTTAGCTCAACTTGGGTTCACAGCTGAACAGTTTTCAAATTTCTCATTAGTGGCTTCTTTGGTTAACCAAGGTTTAACTTATGGCTTCATTCTCCAAACTGTTAGTGGTATAGGCTCTCTAATAACTGTGGGGGTGAGGTTGTCACGCGAGCAAGTGTCACTTGTAAAGAGGGATGTTTCGTGGGTAGGTAGTAATGAGGTTTTGAGGCATGCACTTATGGCCTTTAGCCTAGATCCTCTGCAGTGGGAAAATAGCTTGCTGCATTCTGTGGGGCAAGATATTTTTAATTCTTTATCTCCTACCTCTAGGCTGCAGATACAATCAAACCTAGTGAATCTGATACTAAATAGCCGGTGGGTCTTTCAGACAACTGCTTCTCAGAATCAGGGCCTTTTATCAGGAGAGGCTATATTAATTCCTGAACATATAGGAGGAACTCTGCAGCAGCAAACTCCAGATTGGCTTCTTCCTCTGGTACTAGGCCTTAGTGGATATATTTCTCCTGAATTACAAGTAATTGAAGATGGCACCAAAAAGAAAAGCATCATCCACCTGTAAAACACCCAAAAGGCAATGTATACCTAAGCCGGGATGCTGCCCTAATGTTGCCTCAGTTCCAAAACTGCTTGTTAAAGGAGGAGTGGAAGTATTATCTGTGGTTACTGGAGAAGATAGCATTACCCAAATTGAGTTGTATTTGAATCCAAGAATGGGAGTTAATTCCCCTGATCTTCCTACTACTTCAAACTGGTATACTTATACTTATGACCTGCAGCCAAAGGGATCATCTCCAGATCAGCCCATCAAGGAAAATTTGCCAGCTTACAGTGTGGCAAGAGTGTCTCTGCCAATGCTAAATGAGGATATTACCTGTGACACATTGCAGATGTGGGAGGCAATATCTGTTAAAACAGAAGTAGTTGGAATAAGTTCTTTAATTAATGTTCATTATTGGGACATGAAAAGAGTTCATGATTATGGTGCTGGTATTCCTGTGTCAGGGGTAAATTACCATATGTTTGCCATTGGGGGAGAACCTCTGGATTTGCAAGGCCTAGTTTTAGATTACCAGACTGAGTATCCAAAAACTACAAATGGTGGGCCTATTACAATTGAAACTGTATTGGGAAGAAAAATGACACCTAAAAATCAGGGCCTAGATCCACAAGCTAAAGCAAAATTAGATAAAGATGGAAATTATCCTATAGAAGTATGGTGTCCTGATCCTTCTAAAAATGAAAACAGTAGATACTATGGGTCTATTCAGACAGGCTCTCAGACTCCTACAGTTCTTCAATTTAGTAATACTCTAACTACTGTCCTTTTAGATGAGAATGGAGTGGGCCCTCTATGCAAAGGAGATGGCCTATTTATTAGCTGTGCAGACATAGTGGGGTTTCTGTTTAAAACCAGTGGAAAAATGGCTCTTCATGGGTTGCCTAGATATTTTAATGTTACTTTGAGAAAAAGATGGGTGAAAAACCCCTACCCAGTAGTTAATTTAATAAACTCACTCTTCAGCAACTTAATGCCAAAAGTGTCAGGCCAACCTATGGAAGGAAAAGATAATCAGGTAGAAGAGGTTAGAATATATGAGGGGTCAGAACAATTACCTGGTGATCCTGATATTGTCAGATTTTTAGATAAATTTGGGCAGGAGAAAACTGTTTACCCAAAGCCCTCTGTTGCCCCAGCAGCAGTAACATTCCAAAGTAATCAGCAGGATAAGGGCAAGGCGCCACTGAAAGGACCTCAAAAGGCCTCTCAAAAAGAAAGCCAAACACAAGAATTATGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATTGAGAAAAAGTACCAGAATCTTGGGTTTCTTCAGTTTCCTCAGGGCCCTCTTCCTCAATAAGAATATTGAGCAGAGGGTCCTGACCAGCTTCTACATTTTCTATCATTTGACAAAATTTACCATATGATATTTCACTCTGTAAAATTTGCTTCCAGTTTTTAATTTCTTCTTGTAAGCAAGGCTTAAAGGTTGTATCAGGCAAGCACCAAATAAGACAAAGCAATAAAGTGGTTCCACTTTGAAGAATTCTTCTTTTTCTTATTTCCATGTTCTGATCCAGGGAATCTCTTAGATTTGCCTTTGGGGAAAAGTGTAAAGTATAACTAAATCTTGCTATTAATGTTTTGGGAATAAAATAATCATTAGCAGTAACAATACAAGGAGGAAAAATCTGATGCTTTTTATTCACATGCTTCTTCTCTAAGCTTACAGCTACAGCACCATCTAGATGATCTCTTAAGTCATCAAGGTTATTTATTCCTTGCCCTGGTTGCAGATCTTTATTTAGGCTATTTTACCCTTTCACATCCTCAAAAACAACCATAAATTTATCCAAAGCACATCCTAGTTCAAAAGGCAGTTTATCAGATGGACAGTTTATATTCAAGGCCTTCCCTTCTAGCAAATCTATTAAGGCTGCAGCAAAGCTTGTTTTTCCACTGTTAATAGGCCCTTTAAACCAGATGTTTCTATACTTAGGTATATTCTCTGTTAATAATTGAATAATTTTCTGCAGCTTCTTTTCAAACTCTTCAAATAAGCAGCAGTACCAGGCCACACCACCCATATAATACAGTAGATCTATTGTATCTAAATCTCTTAATCTCTCTAGGTGCTTCTTAAACTTCTTACATAGCATTTCTGTCCTGGTCATTTCCAGCATCTCTAACCTCCTTTTGGCTAGAACAGTGTCTGCGGCTTGTTGGCAAATGGTTTTCTGAGATTTAGATTCATAAAATAGCTTAGCATTAGAATGATGAGCCTCATGAGCCTTGTGAGGTTTGAGGCGAGATCTGTTTTCACACTTTTGGCAAGGAAATGGTTTTGCAAAGTCTAGATAATGGGCTAAGATAATAAAGTGGTCGTCTAGCTCATATTCACAAGCAAATTCAGCAACTAAATTCCAATTACAGCTGGCCTCTTTTTCTTTTTCTTGAAATTCATAATTGAGCAGTGGCTTATTCTCTTGCAGTAATTTGTAAGGGGGCTTGCATAAATTATTATACATTTCAGGCATCTTATTCACTCCCTTACAAATTAAAAAGCTTATAGTGCAGAAGGTAGAGCAAAAATTCTTAATAGCAGATACTCTATGCTTTGATAAAGTTATAAACAATAGAATACATCCTAATTCACAGGCATGCCTGCTTTTAAAATCAACTTTAAATTTCTCAATCTTATCATATAACTCTATAGCTTTATCAGAAGTAGTATAAATGGCAAAACAACTTACTGTTTTATTACTATATACAGCATGGCTAAGATAATCAGAAAGATCAATAGGAAAATCAGTAGGAACAGGAGTTTCTCTGTTCTTTTTTGGCTTTGGTGGAGTGCTTGTAAAACTTGCTGAACTAGCAGAGCTTGCAGAGCTTCGGGACCCCCCAAATTTTCGCTTTCTTGAGAATGGAGGAGGGGTCTTCGGGGTGGTGAAGGAGGAGGATCTGTATTCCTCATCTGTAAACTGAGATGACGAGGCCTCCTCGGCAGAGGAAGACGGGGGCTGCCGGGGCGAGCTTCTTGAGGAGGGGGGCTCCCCAGGCTCCTCAGAGGACGAGGGAGGCTCAGGGGAGGAAAGTGATTCATCGCAGAAGAGATCCTCCCAGGTGCCATCCGTTCTGGAAGAATTTCTAGGTACACTGGTTCCATTGGGTGTGCTGGATTCTCTTCCTGAATTGGTGGTCTCTCTCTGCTANNNNNTCCAGAGGATGAGGTGGGTTCCTCATGGTGTTCGGGAGGTATATCGGGTCCTCTGGACTGGGAGTCTGAAGCCTGGGACGCTGAGAAGGACCCATACCCAGAGGAAGAG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| 70,855
|
KX781279.1
|
Merkel cell polyomavirus
|
Nguyen,K.D., Lee,E.E., Yue,Y., Stork,J., Pock,L., North,J.P., Vandergriff,T., Cockerell,C., Hosler,G.A., Pastrana,D.V., Buck,C.B., Wang,R.C.
|
UT Southwestern Medical Center in Dallas, Dermatology
|
USA
|
2017-02-15
|
DyskA
|
Alphapolyomavirus quintihominis
|
Alphapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,387
|
GenBank
| 1
|
Czechoslovakia
|
Czechoslovakia
| null |
skin
|
2016-07
| null | null |
Merkel cell polyomavirus isolate DyskA, complete genome
|
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| 78,114
|
KX827417.1
|
Merkel cell polyomavirus
|
Gyarmati,P., Song,Y.
|
University of Illinois, Cancer Biology and Pharmacology
|
USA
|
2016-11-06
|
MCPyV_124/Sweden
|
Alphapolyomavirus quintihominis
|
Alphapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,387
|
GenBank
| null |
Sweden
|
Sweden
|
Homo sapiens
| null |
2014-01-30
| null | null |
Merkel cell polyomavirus isolate MCPyV_124/Sweden, complete genome
|
CTTGTCTATATGCAGAAGGAGTTTGCAGAAAGAGCAGAGGAGCAAATGAGCTACCTCACTAAGGAGTGGTTTTTATACTGCAGTTTCCCGCCCTTGGGATCTGCCCTTAGATACTGCCTTTTTTGCTAATTAAGCCTCTTAAGCCTCAGAGGCCTCTCTCTTTTTTTTCCAGAGGCCTCGGAGGCTAGGAGCCCCAAGCCTCTGCCAACTTGAAAAAAAAAAGTCACCTAGGCAGCCAAGTTGTGGTTACATGATTGAACTTTTATTGCTGCAGGGTTTCTGGCATTGACTCATTTCCTGGAGAGGCGGAGTTTGACTGATAAACAAAACTTTTTTTCTTTCTGTTTGGGAGGGAGACGGAAGACTCTTAACTTTTTTTCAACAAGGGAGGCCCGGAGGCTTTTTTTTCTCTTACAAAGGGAGGAGGACATTAAAAGAGTAAGTATCCTTATTTATTTTTCAGGATGGGGGGCATCATCACACTGCTGGCCAATATTGGTGAAATTGCTACTGAACTAAGTGCCACCACAGGAGTAACTTTGGAAGCTATTCTTACAGGAGAAGCTTTAGCAGCTTTGGAAGCAGAGATCTCCAGTTTAATGACAATTGAGGGTATTTCTGGCATTGAGGCTTTAGCTCAACTTGGGTTCACAGCTGAACAGTTTTCAAATTTCTCATTAGTGGCTTCTTTGGTTAACCAAGGTTTAACTTATGGCTTCATTCTCCAAACTGTTAGTGGTATAGGCTCTCTAATAACTGTGGGGGTGAGGTTGTCACGCGAGCAAGTGTCACTTGTAAAGAGGGATGTTTCGTGGGTAGGTAGTAATGAGGTTTTGAGGCATGCACTTATGGCCTTTAGCCTAGATCCTCTGCAGTGGGAAAATAGCTTGCTGCATTCTGTGGGGCAAGATATTTTTAATTCTTTATCTCCTACCTCTAGGCTGCAGATACAATCAAACCTAGTGAATCTGATACTAAATAGCCGGTGGGTCTTTCAGACAACTGCTTCTCAGAATCAGGGCCTTTTATCAGGAGAGGCTATATTAATTCCTGAACATATAGGAGGAACTCTGCAGCAGCAAACTCCAGATTGGCTTCTTCCTCTGGTACTAGGCCTTAGTGGATATATTTCTCCTGAATTACAAGTAATTGAAGATGGCACCAAAAAGAAAAGCATCATCCACCTGTAAAACACCCAAAAGGCAATGTATATCTAAGCCGGGATGCTGCCCTAATGTTGCCTCAGTTCCAAAACTGCTTGTTAAAGGAGGAGTGGAAGTATTATCTGTGGTTACTGGAGAAGATAGCATTACCCAAATTGAGTTGTATTTGAATCCAAGAATGGGAGTTAATTCCCCTGATCTTCCTACTACTTCAAACTGGTATACTTATACTTATGACCTGCAGCCAAAGGGATCATCTCCAGATCAGCCCATCAAGGAAAATTTGCCAGCTTACAGTGTGGCAAGAGTGTCTCTGCCAATGCTAAATGAGGATATTACCTGTGACACATTGCAGATGTGGGAGGCAATATCTGTTAAAACAGAAGTAGTTGGAATAAGTTCTTTAATTAATGTTCATTATTGGGACATGAAAAGAGTTCATGATTATGGTGCTGGTATTCCTGTGTCAGGGGTAAATTACCATATGTTTGCCATTGGGGGAGAACCTCTGGATTTGCAAGGCCTAGTTTTAGATTACCAGACTGAGTATCCAAAAACTACAAATGGTGGGCCTATTACAATTGAAACTGTATTGGGAAGAAAAATGACACCTAAAAATCAGGGCCTAGATCCACAAGCTAAAGCAAAATTAGATAAAGATGGAAATTATCCTATAGAAGTATGGTGTCCTGATCCTTCTAAAAATGAAAACAGTAGATACTATGGGTCTATTCAGACAGGCTCTCAGACTCCTACAGTTCTTCAATTTAGTAATACTCTAACTACTGTCCTTTTAGATGAGAATGGAGTGGGCCCTCTATGCAAAGGAGATGGCCTATTTATTAGCTGTGCAGACATAGTGGGGTTTCTCTTTAAAACCAGTGGAAAAATGGCTCTTCATGGGTTGCCTAGATATTTTAATGTAACTTTGAGAAAAAGATGGGTGAAAAACCCCTACCCAGTAGTTAATTTAATAAACTCACTCTTCAGCAACTTAATGCCAAAAGTGTCAGGCCAACCTATGGAAGGAAAAGATAATCAGGTAGAAGAGGTTAGAATATATGAGGGGTCAGAACAATTACCTGGTGATCCTGATATTGTCAGATTTTTAGATAAATTTGGGCAGGAGAAAACTGTTTACCCAAAGCCCTCTGTTGCCCCAGCAGCAGTAACATTCCAAAGTAATCAGCAGGATAAGGGCAAGGCGCCACTGAAAGGACCTCAAAAGGCCTCTCAAAAAGAAAGCCAAACACAAGAATTATGAGAATTATTTCATGCATTCCTATTCAGTTAAGTAGGCCCCAGAAAAACAAACACAGGAAATATGAAGCAGATGCCTTTATTGAGAAAAAGTACCAGAATCTTGGGTTTCTTCAGTTTCCTCAGGGCCCTCTTCCTCAATAAGAATATTGAGCAGAGGGTCCTGACCAGCTTCTACATTTTCTATCATTTGACAAAATTTACCATATGATATTTCACTCTGTAAAATTTGCTTCCAGTTTTTAATTTCTTCTTGTAAGCAAGGCTTAAAGGTTGTATCAGGCAAGCACCAAATAAGACAAAGCAATAAAGTGGTTCCACTTTGAAGAATTCTTCTTTTTCTTATTTCCATGTTCTGATCCAGGGAATCTCTTAGATTTGCCTTTGGGGAAAAGTGTAAAGTATAACTAAATCTTGCTATTAATGTTTTGGGAATAAAATAATCATTAGCAGTAACAATACAAGGAGGAAAAATCTGATGCTTTTTATTCACATGCTTCTTCTCTAAGCTTACAGCTACAGCACCATCTAGATGATCTCTTAAGTTATCAAGGTTATTTATTCCTTGCCCTGGTTGCAGATCTTTATTTAGGCTATTTTGCCCTTTCACATCCTCAAAAACAACCATAAATTTATCCAAAGCACATCCTAGTTCAAAAGGCAGTTTATCAGATGGACAGTTTATATTCAAGGCCTTCCCTTCTAGCAAATCTATTAAGGCTGCAGCAAAGCTTGTTTTTCCACTGTTAATAGGCCCTTTAAACCAGATGTTTCTATACTTAGGTATATTCTCTGTTAATAATTGAATAATTTTCTGCAGCTTCTTTTCAAACTCTTCAAATAAGCAGCAGTACCAGGCCACACCACCCATATAATACAGTAGATCTATTGTATCTAAATCTCTTAATCTCTCTAGGTGCTTCTTAAACTTCTTACATAGCATTTCTGTCCTGGTCATTTCCAGCATCTCTAACCTCCTTTTGGCTAGAACAGTGTCTGCGGCTTGTTGGCAAATGGTTTTCTGAGATTTAGATTCATAAAATAGCTTAGCATTAGAATGATGAGCCTCATGAGCCTTGTGAGGTTTGAGGCGAGATCTGTTTTCACACTTTTGGCAAGGAAATGGTTTTGCAAAGTCTAGATAATGGGCTAAGATAATAAAGTGGTCGTCTAGCTCATATTCACAAGCAAATTCAGCAACTAAATTCCAATTACAGCTGGCCTCTTTTTCTTTTTCTTGAAATTCATAATTGAGCAGTGGCTTATTCTCTTGCAGTAATTTGTAAGGGGGCTTGCATAAATTATTATACATTTCAGGCATCTTATTCACTCCTTTACAAATTAAAAAGCTTATAGTGCAGAAGGTAGAGCAAAAATTCTTAATAGCAGATACTCTATGCTTTGATAAAGTTATAAACAATAAAATACATCCTAATTCACAGGCATGCCTGCTTTTAAAATCAACTTTAAATTTCTCAATCTTATCATATAACTCTATAGCTTTATCAGAAGTAGTATAAATGGCAAAACAACTTACTGTTTTATTACTATATACAGCATGGCTAAGATAATCAGAAAGATCAATAGGAAAATCAGTAGGAACAGGAGTTTCTCTGTTCTTTTTTGGCTTTGGTGGAGTGCTTGTAAAACTTGCTGAACTAGCAGAGCTTGCAGAGCTTCGGGACCCCCCAAATTTTCGCTTTCTTGAGAATGGAGGAGGGGTCTTCGGGGTGGTGAAGGAGGAGGATCTGTATTCCTCATCTGTAAACTGAGATGACGAGGCCTCCTCGGCAGAGGAAGACGGGGGCTGCCGGGGCGAGCTTCTTGAGGAGGGGGGCTCCTCAGGCTCCTCAGAGGACGAGGGAGGCTCAGGGGAGGAAAGTGATTCATCGCAGAAGAGATCCTCCCAGGTGCCATCCGTTCTGGAAGAATTTCTAGGTACACTGGTTCCATTGGGTGTGCTGGATTCTCTTCCTGAATTGGTGGTCTCCTCTCTGCTACTGGATCCAGAGGATGAGGTGGGTTCCTCATGGTGTTCGGGAGGTATATCGGGTCCTCTGGACTGGGAGTCTGAAGCCTGGGACGCTGAGAAGGACCCATACCCAGAGGAAGAGCTCTGGCTGTGGGGTGGTGAGCTTCCACTGGGGGCTCCCCTGGATGCATTGGAGGAAGGCTTTCTGGATCTTGAGTTGGTCCCGTGTGGATTGGGCCCATATTCGTATGCCTTCCCGAAGCTGAATCCTCCTGATCTCCACCATTCTTTGAATTTAGTGGTCCCATATATAGGGGCCTCGTCAACCTAGATGGGAAAGTACAGAAAATCTGTCATAAATAACCTTTCTTTGATATTTTGCCTTATAGACTTTTCCATATCTAATACTTACAGAGGAAGGAAGTAGGAGTCTAGAAAAGGTGCAGATGCAGTAAGCAGTAGTCAGTTTCTTCTAAAGTTTTTTGCCACCAGTCAAAACTTTCCCAAGTAGGAGGAAATCCAAACCAAAGAATAAAGCACTGATAGCAAAAACACTCTCCCCACGTCAGACAGTTTTTTTGCTTTAAAGTTTTTAGACTACAATG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| 79,464
|
KF266963.1
|
Merkel cell polyomavirus
|
Martel-Jantin,C., Filippone,C., Tortevoye,P., Afonso,P.V., Betsem,E., Descorps-Declere,S., Nicol,J.T., Touze,A., Coursaget,P., Crouzat,M., Berthet,N., Cassar,O., Gessain,A.
|
Institut Pasteur, Virology
|
France
|
2014-04-16
| null |
Alphapolyomavirus quintihominis
|
Alphapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,386
|
GenBank
| 1
|
France
|
France
|
Homo sapiens
|
skin
|
2012
| null | null |
Merkel cell polyomavirus strain EurCauC1, complete genome
|
CTTGTCTATATGCAGAAGGAGTTTGCAGAAAGAGCAGAGGAGCAAATGAGCTACCTCACTAAGGAGTGGTTTTTATACTGCAGTTTCCCGCCCTTGGGATCTGCCCTTAGATACTGCCTTTTTTGCTAATTAAGCCTCTTAAGCCTCAGAGGCCTCTCTCTTTTTTTTCCAGAGGCCTCGGAGGCTAGGAGCCCCAAGCCTCTGCCAACTTGAAAAAAAAAAGTCACCTAGGCAGCCAAGTTGTGGTTACATGATTGAACTTTTATTGCTGCAGGGTTTCTGGCATTGACTCATTTCCTGGAGAGGCGGAGTTTGACTGATAAACAAAACTTTTTTTCTTTCTGTTTGGGAGGGAGACGGAAAACTCTTAACTTTTTTTCAACAAGGGAGGCCCGGAGGCTTTTTTTTCTCTTACAAAGGGAGGAGGACATTAAAAGAGTAAGTATCCTTATTTATTTTTCAGATGGGGGGCATCATCACACTGCTGGCCAATATTGGTGAAATTGCTACTGAACTAAGTGCCACCACAGGAGTAACTTTGGAAGCTATTCTTACAGGAGAAGCTTTAGCAGCTTTGGAAGCAGAGATCTCCAGTTTAATGACAATTGAGGGTATTTCTGGCATTGAGGCTTTAGCTCAACTTGGGTTCACAGCTGAACAGTTTTCAAATTTCTCATTAGTGGCTTCTTTGGTTAACCAAGGTTTAACTTATGGCTTCATTCTCCAAACTGTTAGTGGTATAGGCTCTCTAATAACTGTGGGGGTGAGGTTGTCACGCGAGCAAGTGTCACTTGTAAAGAGGGATGTTTCGTGGGTAGGTAGTAATGAGGTTTTGAGGCATGCACTTATGGCCTTTAGCCTAGATCCTCTGCAGTGGGAAAATAGCTTGCTGCATTCTGTGGGGCAAGATATTTTTAATTCTTTATCTCCTACCTCTAGGCTGCAGATACAATCAAACCTAGTGAATCTGATACTAAATAGCCGGTGGGTCTTTCAGACAACTGCTTCTCAGAATCAGGGCCTTTTATCAGGAGAGGCTATATTAATTCCTGAACATATAGGAGGAACTCTGCAGCAGCAAACTCCAGATTGGCTTCTTCCTCTGGTACTAGGCCTTAGTGGATATATTTCTCCTGAATTACAAGTAATTGAAGATGGCACCAAAAAGAAAAGCATCATCCACCTGTAAAACACCCAAAAGGCAATGTATACCTAAGCCGGGATGCTGCCCTAATGTTGCCTCAGTTCCAAAACTGCTTGTTAAAGGAGGAGTGGAAGTATTATCTGTGGTTACTGGAGAAGATAGCATTACCCAAATTGAGTTGTATTTGAATCCAAGAATGGGAGTTAATTCCCCTGATCTTCCTACTACTTCAAACTGGTATACTTATACTTATGACCTGCAGCCAAAGGGATCATCTCCAGATCAGCCCATCAAGGAAAATTTGCCAGCTTACAGTGTGGCAAGAGTGTCTCTGCCAATGCTAAATGAGGATATTACCTGTGACACATTGCAGATGTGGGAGGCAATATCTGTTAAAACAGAAGTAGTTGGAATAAGTTCTTTAATTAATGTTCATTATTGGGACATGAAAAGAGTTCATGATTATGGTGCTGGTATTCCTGTGTCAGGGGTAAATTACCATATGTTTGCCATTGGGGGAGAACCTCTGGATTTGCAAGGCCTAGTTTTAGATTACCAGACTGAGTATCCAAAAACTACAAATGGTGGGCCTATTACAATTGAAACTGTATTGGGAAGAAAAATGACACCTAAAAATCAGGGCCTAGATCCACAAGCTAAAGCAAAATTAGATAAAGATGGAAATTATCCTATAGAAGTATGGTGTCCTGATCCTTCTAAAAATGAAAACAGTAGATACTATGGGTCTATTCAGACAGGCTCTCAGACTCCTACAGTTCTTCAATTTAGTAATACTCTAACTACTGTCCTTTTAGATGAGAATGGAGTGGGCCCTCTATGCAAAGGAGATGGCCTATTTATTAGCTGTGCAGACATAGTGGGGTTTCTGTTTAAAACCAGTGGAAAAATGGCTCTTCATGGGTTGCCTAGATATTTTAATGTTACTTTGAGAAAAAGATGGGTGAAAAACCCCTACCCAGTAGTTAATTTAATAAACTCACTCTTCAGCAACTTAATGCCAAAAGTGTCAGGCCAACCTATGGAAGGAAAAGATAATCAGGTAGAAGAGGTTAGAATATATGAGGGGTCAGAACAATTACCTGGTGATCCTGATATTGTCAGATTTTTAGATAAATTTGGGCAGGAGAAAACTGTTTACCCAAAGCCCTCTGTTGCCCCAGCAGCAGTAACATTCCAAAGTAATCAGCAGGATAAGGGCAAGGCGCCACTGAAAGGACCTCAAAAGGCCTCTCAAAAAGAAAGCCAAACACAAGAATTATGAGAATTATTTCATGCATTCCTATTCAGTTAAGTAGGCCCCAGAAAAACAAACACAGGAAATATGAAGCAGATGCCTTTATTGAGAAAAAGTACCAGAATCTTGGGTTTCTTCAGTTTCCTCAGGGCCCTCTTCCTCAATAAGAATATTGAGCAGAGGGTCCTGACCAGCTTCTACATTTTCTATCATTTGACAAAATTTACCATATGATATTTCACTCTGTAAAATTTGCTTCCAGTTTTTAATTTCTTCTTGTAAGCAAGGCTTAAAGGTTGTATCAGGCAAGCACCAAATAAGACAAAGCAATAAAGTGGTTCCACTTTGAAGAATTCTTCTTTTTCTTATTTCCATGTTCTGATCCAGGGAATCTCTTAGATTTGCCTTTGGGGAAAAGTGTAAAGTATAACTAAATCTTGCTATTAATGTTTTGGGAATAAAATAATCATTAGCAGTAACAATACAAGGAGGAAAAATCTGATGCTTTTTATTCACATGCTTCTTCTCTAAGCTTACAGCTACAGCACCATCTAGATGATCTCTTAAGTTATCAAGGTTATTTATTCCTTGCCCTGGTTGCAGATCTTTATTTAGGCTATTTTGCCCTTTCACATCCTCAAAAACAACCATAAATTTATCCAAAGCACATCCTAGTTCAAAAGGAAGTTTATCAGATGGACAGTTTATATTCAAGGCCTTCCCTTCTAGCAAATCTATTAAGGCTGCAGCAAAGCTTGTTTTTCCACTGTTAATAGGCCCTTTAAACCAAATGTTTCTATACTTAGGTATATTCTCTGTTAATAATTGAATAATTTTCTGCAGCTTCTTTTCAAACTCTTCAAATAAGCAGCAGTACCAGGCCACACCACCCATATAATACAGTAGATCTATTGTATCTAAATCTCTTAATCTCTCTAGGTGCTTCTTAAACTTCTTACATAGCATTTCTGTCCTGGTCATTTCCAGCATCTCTAACCTCCTTTTGGCTAGAACAGTGTCTGCGGCTTGTTGGCAAATGGTTTTCTGAGATTTAGATTCATAAAATAGCTTAGCATTAGAATGATGAGCCTCATGAGCCTTGTGAGGTTTGAGGCGAGATCTGTTTTCACACTTTTGGCAAGGAAATGGTTTTGCAAAGTCTAGATAATGGGCTAAGATAATAAAGTGGTCGTCTAGCTCATATTCACAAGCAAATTCAGCAACTAAATTCCAATTACAGCTGGCCTCTTTTTCTTTTTCTTGAAATTCATAATTGAGCAGTGGCTTATTCTCTTGCAGTAATTTGTAAGGGGGCTTGCATAAATTATTATACATTTCAGGCATCTTATTCACTCCTTTACAAATTAAAAAGCTTATAGTGCAGAAGGTAGAGCAAAAATTCTTAATAGCAGATACTCTATGCTTTGATAAAGTTATAAACAATAAAATACATCCTAATTCACAGGCATGCCTGCTTTTAAAATCAACTTTAAATTTCTCAATCTTATCATATAACTCTATAGCTTTATCAGAAGTAGTATAAATGGCAAAACAACTTACTGTTTTATTACTATATACAGCATGGCTAAGATAATCAGAAAGATCAATAGGAAAATCAGTAGGAACAGGAGTTTCTCTGTTCTTTTTTGGCTTTGGTGGAGTGCTTGTAAAACTTGCTGAACTAGCAGAGCTTGCAGAGCTTCGGGACCCCCCAAATTTTCGCTTTCTTGAGAATGGAGGAGGGGTCTTCGGGGTGGTGAAGGAGGAGGATCTGTATTCCTCATCTGTAAACTGAGATGACGAGGCCTCCTCGGCAGAGGAAGACGGGGGCTGCCGGGGCGAGCTTCTTGAGGAGGGGGGCTCCTCAGGCTCCTCAGAGGACGAGGGAGGCTCAGGGGAGGAAAGTGATTCATCGCAGAAGAGATCCTCCCAGGTGCCATCCGTTCTGGAAGAATTTCTAGGTACACTGGTTCCATTGGGTGTGCTGGATTCTCTTCCTGAATTGGTGGTCTCCTCTCTGCTACTGGATCCAGAGGATGAGGTGGGTTCCTCATGGTGTTCGGGAGGTATATCGGGTCCTCTGGACTGGGAGTCTGAAGCCTGGGACGCTGAGAAGGACCCATACCCAGAGGAAGAGCTCTGGCTGTGGGGTGGTGAGCTTCCACTGGGGGCTCCCCTGGATGCATTGGAGGAAGGCTTTCTGGATCTTGAGTTGGTCCCGTGTGGATTGGGCCCATATTCATATGCCTTCCCGAAGCTGAATCCTCCTGATCTCCACCATTCTTTGAATTTAGTGGTCCCATATATAGGGGCCTCGTCAACCTAGATGGGAAAGTACAGAAAATCTGTCATAAATAACCTTTCTTTGATATTTTGCCTTATAGACTTTTCCATATCTAATACTTACAGAGGAAGGAAGTAGGAGTCTAGAAAAGGTGCAGATGCAGTAAGCAGTAGTCAGTTTCTTCTAAAGTTTTTTGCCACCAGTCAAAACTTTCCCAAGTAGGAGGAAATCCAAACCAAAGAATAAAGCACTGATAGCAAAAACACTCTCCCCACGTCAGACAGTTTTTTTGCTTTAAAGTTTTTAGACTACAATGC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| 90,913
|
KF266964.1
|
Merkel cell polyomavirus
|
Martel-Jantin,C., Filippone,C., Tortevoye,P., Afonso,P.V., Betsem,E., Descorps-Declere,S., Nicol,J.T., Touze,A., Coursaget,P., Crouzat,M., Berthet,N., Cassar,O., Gessain,A.
|
Institut Pasteur, Virology
|
France
|
2014-04-16
| null |
Alphapolyomavirus quintihominis
|
Alphapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,381
|
GenBank
| 1
|
New Caledonia
|
New Caledonia
|
Homo sapiens
|
skin
|
2012
| null | null |
Merkel cell polyomavirus strain OcepolW1, complete genome
|
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| 90,914
|
KF266965.1
|
Merkel cell polyomavirus
|
Martel-Jantin,C., Filippone,C., Tortevoye,P., Afonso,P.V., Betsem,E., Descorps-Declere,S., Nicol,J.T., Touze,A., Coursaget,P., Crouzat,M., Berthet,N., Cassar,O., Gessain,A.
|
Institut Pasteur, Virology
|
France
|
2014-04-16
| null |
Alphapolyomavirus quintihominis
|
Alphapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,387
|
GenBank
| 1
|
French Guiana
|
French Guiana
|
Homo sapiens
|
skin
|
2012
| null | null |
Merkel cell polyomavirus strain AmePI, complete genome
|
CTTGTCTATATGCAGAAGGAGTTTGCAGAAAGAGCAGAGGAGCAAATGAGCTACCTCACTAAGGAGTGGTTTTTATACTGCAGTTTCCCGCCCTTGGGATCTGCCCTTAGATACTGCCTTTTTTGCTAATTAAGCCTCTTAAGCCTCAGAGGCCTCTCTCTTTTTTTTCCAGAGGCCTCGGAGGCTAGGAGCCCCAAGCCTCTGCCAACTTGAAAAAAAAAAGTCACCTAGGCAGCCAAGTTGTGGTTACATGATTGAACTTTTATTGCTGCAGGGTTTCTGGCATTGACTCATTTCCTGGAGAGGCGGAGTTTGACTGATAAACAAAACTTTTTTTCTTTCTGTTTGGGAGGGAGACGGAAGACTCTTAACTTTTTTCAACAAGGGAGGCCCGGAGGCTTTTTTTTTCTCTTACAAAGGGAGGAGGACATTAAAAGAGTAAGTATCCCTATTTATTTTTCAGGATGGGGGGCATCATCACACTGCTGGCCAATATTGGTGAAATTGCTACTGAACTAAGTGCCACCACAGGAGTAACTTTGGAAGCTATACTTACAGGAGAAGCTTTAGCAGCTTTGGAAGCAGAGATCTCCAGTTTAATGACAATTGAGGGTATTTCTGGCATTGAGGCTTTAGCTCAACTTGGGTTTACAGCTGAACAGTTTTCAAATTTCTCATTAGTGGCTTCTTTGGTTAACCAAGGTTTAACTTATGGCTTCACTCTCCAAACTGTTAGTGGTATAGGCTCTCTAATAACTGTGGGGGTGAGGTTGTCACGCGAGCAAGTGTCACTTGTAAAGAGGGATGTTTCGTGGGTAGGTAGTAATGAGGTTTTGAGGCATGCACTTATGGCCTTTAGCCTAGATCCTCTGCAGTGGGAAAATAGCTTGCTGCATTCTGTGGGGCAAGATATTTTTAATTCTTTATCTCCTATCTCCAGGCTGCAGATACAATCAAACCTAGTGAATCTGATACTAAATAGCCGGTGGGTCTTTCAGACAACTGCTTCTCAGAATCAGGGCCTTTTATCAGGAGAGGCTATATTAATTCCTGAACATATAGGAGGAACTCTGCAGCAGCAAACTCCAGATTGGCTTCTTCCTCTGGTACTAGGCCTTAGTGGATATATTTCTCCTGAATTACAAGTAATTGAAGATGGCACCCAAAAGAAAAGCATCATCCACTTGTAAAACAACCAAAAGGCAATGTATACCTAAGCCTGGATGCTGCCCTAATGTTGCTTCAGTTCCAAAACTGCTTGTTAAAGGAGGAGTGGAAGTGTTATCTGTGGTTACTGGAGAAGATAGCATTACCCAAATTGAGTTGTATTTGAATCCAAGAATGGGAGTTAATTCCCCTGATCTTCCTACTATTTCAAAATGGTATACTTATACTTATGACCTGCAGCCAAAAGGATCATCTCCAGATCAGCCCATCAAGGAAAATTTGCCAGCTTACAGTGTGGCAAGAGTGTCTCTGCCAATGCTAAATGAGGATATTACCTGTGACACATTGCAGATGTGGGAGGCAATATCTGTTAAAACAGAAGTAGTTGGAATAAGTTCTTTAATTAATGTTCATTATTGGGACATGAAAAGAGTACATGATTATGGTGCTGGTATTCCTGTGTCAGGGGTAAATTACCATATGTTTGCCATTGGGGGAGAACCTCTGGATTTGCAAGGCCTAGTTTTAGATTACCAGACTGAATATCCACAAACTACAAATGGTGGGCCTATTACAATTGAAACTGTATTGGGAAGAAAAATGACACCTAAAAATCAGGGCCTAGATCCACAAGCTAAAGCAAAATTAGATAAAGATGGAAATTATCCTGTAGAAGTATGGTGTCCTGATCCTTCTAAAAATGAAAACAGTAGATACTATGGGTCTATTCAGACAGGCTCTCAGACTCCTACAGTTCTTCAATTCAGTAATACTTTAACTACTGTCCTTTTAGATGAGAATGGAGTGGGCCCTCTATGCAAAGGAGATGGCCTATTTATTAGCTGTGCAGACATAGTGGGGTTTCTGTTTAAAACCAGTGGAAAAATGGCTCTTCATGGGCTGCCTAGATATTTTAATGTTACTTTGAGAAAAAGATGGGTGAAAAATCCTTACCCAGTAGTTAATTTAATAAACTCACTCTTCAGCAACTTAATGCCAAAAGTGTCAGGCCAACCTATGGAAGGAAAAGATAATCAGGTAGAAGAGGTTAGAATATATGAGGGGTCAGAACAATTACCTGGTGATCCTGATATTGTCAGATTTTTAGATAAATTTGGGCAGGAGAAAACTGTTTACCCAAAGCCCTCTGTTGCCCCAGCAGCAGTAACATTCCAAAGTAATCAGCAGGATAAGAGCAAGGCGCCACTGAAAGGACCTCAAAAGGCCTCTCAAAAAGAAAGCCAAACACAAGAATTATGAGAATTATTTCATGCATTCCTATTCAGTTAAGTAGGCCCCAGAAAAACAAACACAGGAAATATGAAGCAGATGTCTTTATTGAGAAAAAGTGCCAGAATCTTGGGTTTCTTCAGTTTCCTCAGGGCCCTCTTCCTCAATAAGAATATTGAGCAGAGGGTCCTGACCAGCTTCTACATTCTCTATCATTTGACAAAATTTACCATATGATATCTCACTCTGTAAAATTTGCTTCCAGTTTTTAATTTCTTCTTGTAAGCAAGGCTTAAAGGTTGTATCAGGCAAGCACCAAATAAGACAAAGCAATAAAGTGGTTCCACTTTGAAGAATTCTTCTTTTTCTTATTTCCATGTTCTGATCCAGGGAATCTCTTAGATTTGCCTTTGGGGAAAAGTGTAAAGTATAACTAAATCTTGCTATTAAAGTTTTGGGAATAAAATAATCATTAGCAGTAACAATACAAGGAGGAAAAATCTGATGCTTTTTATTCACATGCTTCTTCTCTAAGCTTACAGCTACAGCACCATCTAGATGATCTCTTAAGTTATCAAGGTTATTTATTCCTTGCCCTGGTTGCAGATCTTTATTTAGGCTGTTTTGCCCTTTCACATCCTCAAAAACAACCATAAATTTATCCAAAGCACATCCTAGTTCAAAAGGTAGTTTATCTGATGGACAGTTTATATTCAAGGCCTTCCCTTCTAGCAAATCTATTAAGGCTGCAGCAAAGCTTGTTTTTCCACTGTTAATAGGCCCTTTAAACCAAATGTTTCTATATTTAGGTATATTCTCTGTTAATAATTGAATAATTTTCTGCAGCTTCTTTTCAAACTCTTCAAATAAGCAGCAGTACCAAGCCACACCACCCATATAATACAACAGATCTATTGTATCTAAATCTCTTAATCTCTCTAGGTGCTTCTTAAACTTCTTACAGAGCATTTCTGTCCTGGTCATTTCCAGCATCTCTAACCTCCTTTTGGCTAGAACAGTGTCTGCGGCTTGTTGGCAAATGGTTTTCTGAGATTTAGATTCATAAAATAGCTTAGCATTAGAATGATGAGCCTCATGAGCCTTGTGAGGTTTGAGGCAAGATCTGTTTTCACACTTTTGGCAAGGAAATGGTTTTGCAAAGTCTAGATAATGGGCTAAGATAATAAAGTGGTCGTCTAGCTCATATTCACAAGCAAATTCAGCAACTAAATTCCAATTACAGCTGGCCTCTTTTTCTTTTTCTTGAAATTCATAATTGAGCAGTGGCTTATTCTCTTGCAGTAATTTGTAAGGGGGCTTACATAAATTATTATACATTTCAGGCATCTTATTCACTCCTTTACAGATTAAAAAGCTTATAGTGCAGAAGGTAGAGCAAAAATTCTTAATAGCAGATACTCTATGCTTTGATAAAGTTATAAACAATAAAATACATCCTAATTCACAGGCATGCCTGCTTTTAAAATCAACTTTAAATTTCTCAATCTTATCATATAACTCTATAGCTTTATCAGAAGTAGTATAAATGGCAAAACAACTTACTGTTTTATTACTATATACAGCATGGCTAAGATAATCAGAAAGATCAATAGGAAAATCAGTAGGAACAGGAGTTTCTCTGTTCTTTTTTGGCTTTGGTGGAGTGCTTGTAAAACTTGCTGAACTAGCAGAGCTTGCAGAGCTTCGAGACCCCCCAAATTTTCGCTTTCTTGAGAATGGAGGAGGGGTCTTCGGGGTGGTGAAGGAGGAGGATCTGTATTCCTCATCTGTAAACTGAGATGACGAGGCCTCCTCGGCAGAGGAAGACGGGGGCTGCCGGGGCGAGCTTCTTGAGGAGGGGGGCTCCTCAGGCTCCTCAGAGGACGAGGGAGGCTCAGGGGAGGAAAGCGATTCATCGCAGAAGAGATCCTCCCAGGTGCCATCAGTTCTGGAAGAATTTCTAGGTACACTGGTTCCATTTGGTGTGCTGGATTCTCTTCCTGAATTGGTGGTCTCCTCTCTGCTACTGGATCCAGAGGATGAGGTGGGTTCCTCATGGTGTTCGGGAGGTATATCGGGTCCTCTGGACTGGGAGTCTGAAGCCTGGGACGCTGAGAAGGACCCATACCCAGAGGAAGAGCTCTGGCTGTGGGGTGGTGAGCTTCCACTGGGGGCTCCCCTGGATGCATTGGAGGAAGGCTTTCTGGATCTTGAGTTGGTCCCGTGTGGATTGGGCCCATATTCATATGCCTTCCCGAAGCTGAATCCTCCTGATCTCCACCATTCTTTGAATTTAGTGGTCCCATATATAGGGGCCTCGTCAACCTAGATGGGAAAGTACAGAAAATCTGTCATAAATAACCTTTCTTTGATATTTTGCCTTATAGACTTTTCCATATCTAATACTTACAGAGGAAGGAAGTAGGAGTCTAGAAAAGGTGCAGATGCAGTAAGCAGTAGTCAGTTTCTTCTAAAGTTTTTTGCCACCAGTCAAAACTTTCCCAAGTAGGAGGAAATCCAAACCAAAGAATAAAGCACTGATAGCAAAAACACTCTCCCCACGTCAGACAGTTTTTTTGCTTTAAAGTTTTTAGACTACAATGCTGGCGAGACAACTTACAGCTAATACAAGCGCACTTAGAATCTCTAAGTTGCTTAAGCATGCACCCAGGACCTCTGCAAAATCTAGCATTATATCCACTTTGCATATAATCCTTTAAAGTTCCATATTCTTCCCAAGGAAATTTTGTACTGACCTCATCAAACATAGAGAAGTCACTTCTGAGCTTGTGGATATTTTGCTGGAATTTGCTCCAAAGGGTGTTCAATTCCATCATTATAACAGGATTTCCCCCTTTATCAGGGTGATGCTTTAAGCAGCTTCTTTTGAAAGCAGCTTTCATCAGAGGGATGTTCCCATAACAACTAGGAGCAATTTCTAAAAGCTTGCAGAGAGCCTCTCTTTCTTTCCTATTTAGGACTAAATCCAT
| 90,915
|
KC571692.1
|
Merkel cell polyomavirus
|
Li,K., Guo,J., Zhao,R., Xue,Y., Chen,L., Yang,J., Peng,J., Jin,Q.
|
Institute of Pathogen Biology, Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College, MOH Key Laboratory of Systems Biology of Pathogens
| null |
2014-02-28
|
HB039C
|
Alphapolyomavirus quintihominis
|
Alphapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,418
|
GenBank
| null |
China
|
China
|
Homo sapiens
| null |
2011
| null | null |
Merkel cell polyomavirus isolate HB039C, complete genome
|
GGGGCTCCTAGCCTCCGAGGCCTCTGGAAAAAAAAGAGAGAGGCCTCTGAGGCTTAAGAGGCTTAATTAGCAAAAAAGGCAGTATCTAAGGGCAGATCCCAAGGGCGGGAAACTGCAGTATAAAAACCACTCCTTAGTGAGGTAGCTCATTTGCTCCTCTGCTCTTTCTGCAAACTCCTTCTGCATATAGACAAGATGGATTTAGTCCTAAATAGGAAAGAAAGAGAGGCTCTCTGCAAGCTTTTAGAGATTGCTCCTAATTGTTATGGCAACATCCCTCTGATGAAAGCTGCTTTCAAAAGAAGCTGCTTAAAGCATCACCCTGATAAAGGGGGAAATCCTGTTATAATGATGGAATTGAACACCCTTTGGAGCAAATTCCAGCAAAATATCCACAAGCTCAGAAGTGACTTCTCTATGTTTGATGAGGTCAGTACAAAATTTCCTTGGGAAGAATATGGAACTTTAAAGGATTATATGCAAAGTGGATATAATGCTAGATTTTGCAGAGGTCCTGGGTGCATGCTTAAGCAACTTAGAGATTCTAAGTGCGCTTGTATTAGCTGTAAGTTGTCTCGCCAGCATTGTAGTCTAAAAACTTTAAAGCAAAAAAACTGTCTGACGTGGGGAGAGTGTTTTTGCTATCAGTGCTTTATTCTTTGGTTTGGATTTCCTCCTACTTGGGAAAGTTTTGACTGGTGGCAAAAAACTTTAGAAGAAACTGACTACTGCTTACTGCATCTGCACCTTTTCTAGACTCCTACTTCCTTCCTGTAAGTATTAGATATGGAAAAGTCTATAAGGCAAAATATCAAAGAAAGGTTATTTATGACAGATTTTCTGTACTTTCCCATCTAGGTTGACGAGGCCCCTATATATGGGACCACTAAATTCAAAGAATGGTGGAGATCAGGAGGATTCAGCTTCGGGAAGGCATACGAATATGGGCCCAATCCATACGGGACCAACTCAAGATCCAGAAAGCCTTCCTCCAATGCATCCAGGGGAGCCCCCAGTGGAAGCTCACCACCCCACAGCCAGAGCTCTTCCTCTGGGTATGGGTCCTTCTCAGCGTCCCAGGCTTCAGACTCCCAGTCCAGAGGACCCGATATACCTCCCGAACACCATGAGGAACCCACCTCATCCTCTGGATCCAGTAGCAGAGAGGAGACCACCAATTCAGGAAGAGAATCCAGCACACCAAATGGAACCAGTGTACCTAGAAATTCTTCCAGAACGGATGGCACCTGGGAGGATCTCTTCTGCGATGAATCACTTTCCTCCCCTGAGCCTCCCTCGTCCTCTGAGGAGCCTGAGGAGCCCCCCTCCTCAAGAAGCTCGCCCCGGCAGCCCCCGTCTTCCTCTGCCGAGGAGGCCTCGTCATCTCAGTTTACAGATGAGGAATACAGATCCTCCTCCTTCACCACCCCGAAGACCCCTCCTCCATTCTCAAGAAAGCGAAAATTTGGGGGGGTCCCGAAGCTCTGCAAGCTCTGCTAGTTCAGCAAGTTTTACAAGCACTCCACCAAAGCCAAAAAAGAACAGAGAAACTCCTGTTCCTACTGATTTTCCTATTGATCTTTCTGATTATCTTAGCCATGCTGTATATAGTAATAAAACAGTAAGTTGTTTTGCCATTTATACTACTTCTGATAAAGCTATAGAGTTATATGATAAGATTGAGAAATTTAAAGTTGATTTTAAAAGCAGGCATGCCTGTGAATTAGGATGTATTTTATTGTTCATAACTTTATCAAAGCATAGAGTATCTGCTATTAAGAATTTTTGCTCTACCTTCTGCACTATAAGCTTTTTAATCTGTAAAGGAGTGAATAAGATGCCTGAAATGTATAATAATTTATGTAAGCCCCCTTACAAATTACTGCAAGAGAATAAGCCACTGCTCAATTATGAATTTCAAGAAAAAGAAAAAGAGGCCAGCTGTAATTGGAATTTAGTTGCTGAATTTGCTTGTGAATATGAGCTAGACGACCACTTTATTATCTTAGCCCATTATCTAGACTTTGCAAAACCATTTCCTTGCCAAAAGTGTGAAAACAGATCTCGCCTCAAACCTCACAAGGCTCATGAGGCTCATCATTCTAATGCTAAGCTATTTTATGAATCTAAATCTCAGAAAACCATTTGCCAACAAGCCGCAGACACTGTTCTAGCCAAAAGGAGGTTAGAGATGCTGGAAATGACCAGAACAGAAATGCTATGTAAGAAGTTTAAGAAGCACCTAGAGAGATTAAGAGATTTAGATACAATAGATTTATTGTATTATATGGGTGGTGTGGCTTGGTACTGCTGCTTATTTGAAGAGTTTGAAAAGAAGCTGCAGAAAATTATTCAATTATTAACAGAGAATATACCTAAGTATAGAAACATTTGGTTTAAAGGGCCTATTAACAGTGGAAAAACAAGCTTTGCTGCAGCCTTAATAGATTTGCTAGAAGGGAAGGCCTTGAATATAAACTGTCCATCAGATAAACTACCTTTTGAACTAGGATGTGCTTTGGATAAATTTATGGTTGTTTTTGAGGATGTGAAAGGGCAAAATAGCCTAAATAAAGATCTGCAACCAGGGCAAGGAATAAATAACCTTGATAACTTAAGAGATCATCTAGATGGTGCTGTAGCTGTAAGCTTAGAGAAGAAGCATGTGAATAAAAAGCATCAGATTTTTCCTCCTTGTATTGTTACTGCTAATGATTACTTTATTCCCAAAACATTAATAGCAAGATTTAGTTATACTTTACACTTTTCCCCAAAGGCAAATCTAAGAGATTCCCTGGATCAGAACATGGAAATAAGAAAAAGAAGAATTCTTCAAAGTGGAACCACTTTATTGCTTTGTCTTATTTGGTGCTTGCCTGATACAACCTTTAAGCCTTGCTTACAAGAAGAAATTAAAAACTGGAAGCAAATTTTACAGAGTGAGATATCATATGGTAAATTTTGTCAAATGATAGAAAATGTAGAAGCTGGTCAGGACCCTCTGCTCAATATTCTTATTGAGGAAGAGGGCCCTGAGGAAACTGAAGAAACCCAAGATTCTGGTACTTTTTCTCAATAAAAACATCTGCTTCATATTTCCTGTGTTTGTTTTTCTGGGGCCTACTTAACTGAATAGGAATGCATGAAATAATTCTCATAATTCTTGTGTTTGGCTTTCTTTTTGAGAGGGCTTTTGAGGTCCTTTCAGTGGCGCCTTGCCCTTATCCTGCTGATTACTTTGGAATGTTACTGCTGCTGGGGCAACAGAGGACTTTGGGTAAACAGTTTTCTCCTGCCCAAATTTATCTAAAAATCTGACAATATCAGGATCACCAGGTAATTGTTCTGACCCCTCATATATTCTAACCTCTTCTACCTGATTATCTTTTCCTTCCATAGGTTGGCCTGACACTTTTGGCATTAAGTTGCTGAAGAGTGAGTTTATTAAATTAACTACTGGGTAGGGATTTTTCACCCATCTTTTTCTCAAAGTAACATTAAAATATCTAGGCAGCCCATGAAGAGCCATTTTTCCACTGGTTTTAAACAGAAATCCCACTATGTCTGCACAGCTAATAAATAGGCCATCTCCTTTGCATAGAGGGCCCACTCCATTCTCATCTAAAAGGACAGTAGTTAAAGTATTACTGAATTGAAGAACTGTAGGAGTCTGAGAACCTGTCTGAATAGACCCATAGTATCTACTGTTTTCATTTTTAGAAGGATCAGGACACCATACTTCTATAGGATAATTTCCATCTTTATCTAATTTTGCTTTAGCTTGTGGATCTAGGCCCTGATTTTTAGGTGTCATTTTTCTTCCCAATACTGTTTCAATTGTAATAGGCCCACCATTTGTAGTTTTTGGATATTCAGTCTGGTAATCTAAAACTAGGCCTTGCAAATCCAGAGGTTCTCCCCCAATGGCAAACATATGGTAATTTACCCCTGACACAGGAATACCAGCACCATAATCATGAACTCTTTTCATGTCCCAATAATGAACATTAATTAAAGAACTTATTCCAACTACTTCTGTTTTAACAGATATTGCCTCCCACATCTGCAATGTGTCACAGGTAATATCCTCATTTAGCATTGGCAGAGACACTCTTGCCACACTGTAAGCTGGCAAATTTTCCTTGATGGGCTGATCTGGAGATGATCCCTTTGGCTGCAGGTCATAAGTATAAGTATACCAGTTTGAAGTAGTAGGAAGATCAGGGGAATTAACTCCCATTCTTGGATTCAAATACAACTCAATTTGGGTAATGCTATCTTCTCCAGTAACCACAGATAACACTTCCACTCCTCCTTTAACAAGCAGTTTTGGAACTGAGGCAACATTAGGGCAGCATCCAGACTTAGATATACATTGCCTTTTGGGTGTTTTACAGGTGGATGATGCTTTTCTTTTGGGTGCCATCTTCAATTACTTGTAATTCAGGAGAAATATATCCACTAAGGCCTAGTACCAGAGGAAGAAGCCAATCTGGAGTTTGCTGCTGCAGAGTTCCTCCTATATGTTCAGGAATTAATATAGCCTCTCCTGATAAAAGGCCCTGATTCTGAGAAGCAGTTGTCTGAGAGACCCACCGGCTATTTAGTATCAGATTCACTAGGTTTGATTGTATCTGCAGCCTAGAGGTAGGAGATAAAGAATTAAAAATATCTTGCCCCACAGAATGCAGCAAGCTATTTTCCCACTGCAGAGGATCTAGGCTAAAGGCCATAAGTGCATGCCTCAAAACCTCATTACTACCTGCCCACGAAACATCCCTCTTTACAAGTGACACTTGCTCGCGTGACAACCTCACCCCCACAGTTATTAGAGAGCCTATACCACTAACAGTTTGGAGAATGAAGCCATAAGTCAAACCTTGGTTAACCAAAGAAGCCACTAATGAGAAATTTGAAAACTGTTCAGCTGTAAACCCAAGTTGAGCTAAAGCCTCAATGCCAGAAATACCCTCAATTGTCATTAAACTGGAGATCTCTGCTTCCAAAGCTGCTAAAGCTTCTCCTGTAAGTATAGCTTCCAAAGTTACTCCTGTGGTGGCACTTAGTTCAGTAGCAATTTCACCAATATTGGCCAGCAGTGTGATGATGCCCCCCATCCTGAAAAATAAATAGGGATACTTACTCTTTTAATGTCCTCCTCCCTTTGTAAGAGAAATGTCCTCCTCCCTTTGTAAGAGAAAAAAAAGCCTCCGGGCCTCCCTTTTGTTGAAAAAAAGTTGAGTTAAGAGTCTTCCGTCTCCCTCCCAAACAGAAAGAAAAAAAGTTTTGTTTATCAGTCAAACTCCGCCTCTCCAGGAAATGAGTCAATGCCAGAAACCCTGCAGCAATAAAAGTTCAATCATGTAACCACAACTTGGCAGCCTAGGTGACTTTTTTTTTTCAAGTTGGCAGAGGCTT
| 91,574
|
KC202810.1
|
Merkel cell polyomavirus
|
Horvath,K.B., Pankovics,P., Battyani,Z., Kalman,E., Reuter,G.
|
ANTSZ Baranya County Institute of State Public Health Service, Regional Laboratory of Virology
|
Hungary
|
2012-12-18
| null |
Alphapolyomavirus quintihominis
|
Alphapolyomavirus
|
Polyomaviridae
|
dsDNA
| 5,392
|
GenBank
| 1
|
Hungary
|
Hungary
|
Homo sapiens
|
lymph
|
2011-05-09
| null | null |
Merkel cell polyomavirus strain 7673/2011/HUN, complete genome
|
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Institut Pasteur, Laboratory for Urgent Response to Biological Threats (CIBU)
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France
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2012-07-01
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Polyomaviridae
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France
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France
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Institut Pasteur, Laboratory for Urgent Response to Biological Threats (CIBU)
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915F 06 004 BG1
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Alphapolyomavirus quintihominis
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Institut Pasteur, Laboratory for Urgent Response to Biological Threats (CIBU)
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France
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2012-07-01
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Alphapolyomavirus
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Polyomaviridae
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France
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France
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Institut Pasteur, Laboratory for Urgent Response to Biological Threats (CIBU)
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France
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2012-07-01
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915F 06 008 CG4
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Alphapolyomavirus
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France
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France
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Homo sapiens
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2009-05
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Merkel cell polyomavirus isolate 915F 06 008 CG4, complete genome
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| 96,859
|
LC769208.1
|
Metapneumovirus hominis
|
Sugimoto,S., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Hosoya,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
|
Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-05-30
|
hMPV_Fukushima_H377_2018_A2b
|
Metapneumovirus hominis
|
Metapneumovirus
|
Pneumoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,440
|
GenBank
| null |
Japan: Fukushima
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2018
| null | null |
Metapneumovirus hominis hMPV_Fukushima_H377_2018_A2b RNA, nearly complete genome
|
AAAAAAACGCGTATAAATTAAGTTACAAAAAAACATGGGACAAGTGAAAATGTCTCTTCAGGGGATTCACCTGAGTGATCTATCATACAAGCATGCTATATTAAAAGAGTCTCAGTACACAATAAAGAGAGATGTAGGCACAACAACAGCAGTGACACCCTCATCATTGCAACAAGAAATAACACTGTTGTGTGGAGAAATTCTATATGCTAAACATACTGATTACAAATATGCTGCAGAAGTAGGAATACAATATATCAGCACAGCTCTAGGGTCAGAGAGAGTACAGCAGATTCTAAGAAACTCAGGTAGTGAAGTTCAAGCGATTTTAACCAGAACGTACTCTTTGGGGAAAGTTAAAAACAATAAAGGAGAAGATTTGCAGATGCTAGACATACATGGAGTAGAAAAAAGCTGGGTGGAAGAGATAGACAAAGAAGCAAGAAAAACAATGGCAACTTTACTTAAAGAATCATCAGGCAATATCCCACAAAATCAGAGGCCTTCAGCACCAGACACACCTATAATCTTATTATGTGTAGGTGCCTTAATATTCACCAAACTAGCATCAACTATAGAAGTGGGATTAGAGACCACAGTCAGAAGAGCTAACCGTGTGCTAAGTGATGCACTCAAAAGATACCCCAGAATGGACATACCAAAAATCGCTAGATCCTTCTATGACTTATTTGAACAAAAAGTGTATTACAGAAGTTTGTTCATTGAGTATGGCAAAGCATTAGGCTCATCCTCTACAGGCAGCAAAGCAGAAAGTTTATTCGTTAATATATTCATGCAAGCATATGGTGCTGGTCAAACAATGCTGAGGTGGGGGGTCATCGCCAGATCATCTAACAATATAATGTTAGGACATGTATCTGTACAGGCTGAGTTAAAACAGGTCACAGAAGTCTATGATCTAGTGCGAGAAATGGGCCCAGAATCTGGGCTTCTACATTTAAGGCAAAGCCCAAAAGCTGGACTGTTATCCTTAGCCAATTGTCCCAACTTTGCAAGTGTTGTTCTCGGCAATGCCTCAGGCTTAGGCATAATAGGTATGTATCGAGGGAGAGTGCCAAACACAGAACTATTTTCAGCAGCAGAAAGCTATGCCAAGAGTTTGAAAGAAAGTAATAAAATCAACTTTTCTTCATTAGGACTCACAGATGAAGAAAAAGAGGCTGCAGAACACTTTCTAAATGTGAGTGACGACAGTCAAAATGATTATGAGTAATTAAAAAAGTGGGACAAGTCAAAATGTCGTTCCCTGAAGGAAAAGATATTCTTTTCATGGGTAATGAAGCAGCAAAATTGGCAGAAGCTTTCCAGAAATCATTAAGAAAACCTAGTCATAAAAGATCTCAATCTATTATAGGAGAAAAAGTGAGCACTGTATCTGAAACATTGGAATTACCTACTATCAGTAGACCTACCAAACCAACCATATTGTCAGAGCCGAAGTTAGCATGGACAGACAAAGGTGGGGCAATCAGAACTGAAGTAAAGCAAACAATCAAAATTATGGATCCTATTGAAGAAGAAGAATCTACTGAGAAAAAGGTGCTACCCTCTAGTGACGGGAAAACTCCTGCAGAAAAAAAGTTGAAACCACCAACCAACACTAAAAAGAAAGTTTCATTTACACCGAATGAACCAGGAAAATACACAAAGTTGGAGAAAGATGCTCTAGACTTGCTTTCAGATAATGAAGAGGAAGATGCAGAATCTTCAATCTTAACCTTCGAAGAAAGAGATACTTCATCATTAAGCATTGAGGCCAGACTAGAATCGATTGAGGAGAAATTAAGCATGATACTAGGGCTATTAAGAACACTCAACATTGCCACAGCAGGACCCACAGCAGCAAGAGATGGGATCAGAGATGCAATGATTGGCATAAGGGAAGAACTAATAGCAGACATAATAAAAGAAGCCAAGGGAAAAGCAGCAGAAATGATGGAAGAGGAAATGAACCAACGGACAAAAATAGGAAATGGTAGTGTTAAATTAACTGAAAAGGCAAAGGAGCTCAACAAAATTGTTGAAGATGAAAGCACAAGTGGAGAATCTGAAGAAGAAGAAGAACCAAAAGACCTACAGGATAATAATCAGGAAGATGACATTTACCAGTTAATTATGTAGTTTAATAAAAATAAACAATGGGACAAGTAAAAATGGAGTCCTATCTGGTAGACACCTATCAGGGCATCCCTTACACAGCAGCTGTTCAAGTTGATCTAGTAGAAAAAGACCTGTTACCTGCAAGCCTAACAATATGGTTTCCTTTGTTTCAGGCCAATACACCACCAGCAGTTCTGCTTGATCAGCTAAAGACTCTGACAATAACTACTCTGTATGCTGCGTCACAAAGTGGTCCAATACTAAAAGTGAATGCATCAGCCCAAGGTGCAGCAATGTCTGTACTTCCCAAAAGGTTTGAAGTCAATGCGACTGTAGCACTTGACGAATATAGTAAATTAGAATTTGACAAACTCACAGTCTGTGAGGTAAAAACAGTTTACTTAACAACTATGAAACCATATGGGATGGTATCAAAATTTGTGAGCTCAGCCAAATCAGTTGGTAAAAAAACACATGATCTAATTGCATTATGTGATTTTATGGATCTAGAAAAGAACACACCAGTTACAATACCAGCATTTATCAAATCAGTTTCTATCAAAGAGAGTGAATCAGCCACTGTTGAAGCTGCAATAAGCAGTGAAGCAGACCAAGCTCTAACACAAGCCAAAATTGCACCTTATGCGGGGCTGATCATGATTATGACCATGAACAATCCCAAAGGCATATTCAAGAAGCTTGGAGCTGGGACACAAGTTATAGTGGAACTAGGGGCATATGTCCAGGCTGAAAGCATAAGTAAAATATGCAAGACTTGGAGCCATCAAGGGACAAGATATGTGCTGAAGTCCAGATAACAACCAAGCAACCTGACCAAGAGCTATCAACTCTATTCTATAGACTAAAAAGTTGCTGTTTTAGTTATATAAAAATCAAGTTAGAGTAAGAATCAAATCAATCAAGAGTGGGACAAATAAAAATGTCTTGGAAAGTGGTGATTATTTTTTCATTGCTAATAACACCTCAACACGGTCTTAAAGAGAGCTACTTAGAAGAATCATGTAGCACTATAACTGAGGGTTATCTCAGTGTTCTGAGGACAGGTTGGTATACCAACGTTTTTACATTAGAGGTGGGTGATGTAGAAAACCTCACATGTGCTGATGGACCTAGCCTAATAAAAACAGAATTAGATCTGACCAAAAGTGCACTAAGAGAGCTCAAAACAGTTTCTGCTGACCAGTTGGCAAGAGAGGAACAAATTGAAAATCCCAGACAATCTAGATTTGTTCTAGGAGCAATAGCACTCGGTGTTGCAACAGCAGCTGCAGTTACAGCAGGTGTTGCAATTGCAAAAACCATCCGGCTTGAGAGTGAAGTTACAGCAATTAAGAATGCCCTTAAAAAGACCAATGAAGCAGTGTCTACATTGGGGAATGGGGTTCGAGTGTTAGCAACCGCAGTGAGAGAACTGAAAGATTTTGTGAGCAGGAATTTAACTCGTGCAATCAACAAAAACAAGTGCGACATTGATGACCTAAAAATGGCCGTTAGTTTCAGTCAATTCAACAGAAGGTTTCTAAATGTTGTGCGGCAATTTTCAGACAATGCTGGAATAACACCAGCAATATCTTTAGACTTAATGACAGATGCTGAACTAGCCAGAGCTGTTTCCAACATGCCGACATCTGCAGGACAAATAAAATTGATGTTGGAAAACCGTGCAATGGTGCGGAGGAAGGGGTTTGGAATCCTGATAGGGGTCTACGGGAGCTCCGTAATTTACATGGTGCAGCTGCCAATCTTTGGCGTTATAGATACGCCTTGCTGGATAGTGAAAGCAGCCCCTTCTTGCTCTGAAAAAAAAGGAAACTATGCTTGCCTCCTAAGAGAAGACCAGGGGTGGTATTGTCAGAATGCAGGGTCAACTGTCTACTACCCAAATGAGAAGGACTGTGAAACAAGAGGAGATCATGTCTTTTGCGACACAGCAGCAGGAATTAATGTTGCTGAGCAATCAAAGGAGTGCAACATCAACATATCCACTACAAATTACCCATGCAAAGTCAGCACAGGAAGGCATCCTATCAGTATGGTTGCACTGTCCCCTCTTGGGGCTCTGGTTGCTTGTTACAAAGGAGTAAGCTGTTCCATTGGCAGCAATAGAGTAGGGATCATCAAGCAGCTGAACAAAGGTTGCTCTTATATTACCAACCAAGATGCAGACACAGTGACAATAGACAATACTGTATATCAGCTAAGCAAAGTTGAGGGTGAACAGCATGTTATAAAAGGCAGACCAGTGTCAAGCAGCTTTGATCCAGTCAAATTTCCTGAAGATCAGTTCAATGTTGCACTTGACCAAGTTTTTGAGAACATTGAAAACAGCCAGGCCTTGGTAGATCAATCAAACAGAATCCTAAGCAGTGCAGAGAAAGGGAACACTGGCTTCATCATTGTGATAATTCTAATTGCTGTCCTTGGCTCTAGTATGATCCTAGTGAGCATCTTCATCATAATCAAGAAAACAAGGAAACCAACAGGAGCACCTCCAGAGCTGAGTGGTGTCACAAACAACGGCTTCATACCACACAGTTAGTTAATTAAAAATAAAACAAAATTTGGGACAAATCATAATGTCTCGCAAGGCTCCATGCAAATATGAAGTGCGGGGCAAATGCAATAGAGGAAGTGAGTGTAAGTTTAACCACAATTACTGGAGTTGGCCAGATAGATACTTATTAATAAGATCAAATTATCTATTAAATCAGCTTTTAAGGAACACTGATAGAGCTGATGGCCTATCAATAATATCAGGCGCAGGCAGAGAAGACAGAACGCAAGATTTTGTTCTAGGTTCCACCAATGTGGTTCAAGGTTATATTGATGATAACCAAAGCATAACAAAGGCTGCAGCC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GAGGAGATCCAGTAGTCTTCTATAGATCTTTCTATAGAAGAACTCCTGATTTTTTAACTGAGGCAATCAGCCATGTGGATATTCTGTTAAAAATATCAACTAACATAAAAAATGAAACAAAAATAAGTTTTTTCAAAGCCTTACTATCAATAGAGAAAAATGAGCGTGCTACACTGACAACACTAATGAGAGATCCTCAGGCTGTTGGATCAGAACGACAAGCAAAAGTAACAAGTGATATCAATAGAACAGCAGTCACCAGTATCTTAAGTCTTTCCCCAAATCAACTTTTCAGTGATAGTGCTATACATTACAGCAGAAATGAAGAAGAAGTAGGAATCATTGCAGAAAACATAACACCCGTTTATCCTCATGGGCTAAGAGTTTTATATGAATCATTACCCTTTCACAAAGCTGAAAAAGTTGTAAACATGATATCAGGGACAAAATCTATAACTAACTTATTACAGAGAACATCTGCTATTAATGGTGAAGATATTGACAGGGCTGTATCTATGATGTTGGAGAATCTAGGATTATTATCTAGAATATTGTCAATAGTTGTTGATAATATAGAAATTCCAACCAAATCTAATGGTAGGCTGATATGTTGTCAAATTTCTAGGACTTTAAGAGAGACATCATGGAATAATATGGAAATAGTTGGAGTAACATCTCCTAGCATCACTACATGCATGGATGTCATATATGCAACTAGTTCTCATTTGAAGGGGATAATTATTGAGAAGTTCAGCACTGACAGAACTACAAGAGGTCAAAGAGGTCCAAAAAGCCCTTGGGTAGGGTCGAGTACTCAAGAGAAAAAATTAGTACCTGTTTATAACAGACAAATTCTCTCAAAACAACAAAGAGAACAGTTAGAAGCAATTGGAAAAATGAGATGGGTGTATAAAGGAACACCAGGCTTGCGGCGATTACTCAACAAGATCTGTCTTGGGAGTTTAGGCATTAGTTACAAGTGTGTAAAACCTTTATTACCTAGATTTATGAGTGTAAATTTCTTACATAGATTATCTGTCAGTAGTAGACCTATGGAATTCCCAGCATCAGTTCCAGCTTATAGAACAACAAATTACCATTTTGACACTAGTCCCATTAATCAAGCACTAAGTGAGAGATTTGGGAATGAAGATATTAACTTGGTCTTCCAAAATGCAATCAGCTGTGGTATTAGCATAATGAGTGTAGTAGAACAATTAACAGGTAGGAGCCCAAAACAGTTAGTTTTAATACCCCAACTAGAGGAAATAGACATTATGCCACCACCAGTGTTTCAAGGAAAATTCAATTATAAACTAGTAGATAAGATAACTTCTGATCAACATATCTTCAGTCCGGACAAAATAGATATGTTAACATTAGGGAAAATGCTCATGCCCACTATAAAGGGTCAGAAAACAGATCAGTTCTTAAATAAGAGAGAGAATTATTTCCATGGAAATAATCTTATTGAGTCTTTATCAGCAGCATTAGCATGCCATTGGTGTGGGATATTAACAGAACAATGCATAGAAAATAATATTTTCAAGAAAGACTGGGGTGATGGGTTTATATCAGATCATGCTTTTATGGACTTCAAAATATTCTTATGTGTCTTTAAAACTAAACTTTTATGTAGTTGGGGATCCCAAGGGAAAAACATTAAAGATGAAGATATAATAGATGAATCAATAGATAAATTGTTAAGGATTGATAATACTTTTTGGAGAATGTTCAGCAAGGTTATGTTTGAACCAAAAGTTAAGAAGAGGATAATGTTATATGATGTAAAATTCTTATCACTAGTAGGTTACATAGGGTTTAAGAACTGGTTTATAGAGCAGTTGAGGTCAGCTGAGTTGCATGAAATACCTTGGATTGTCAATGCAGAAGGTGACTTGGTTGAGATCAAGTCAATTAAGATCTATTTGCAGCTGATAGAACAAAGCTTATTTTTGAGAATAACTGTTCTGAACTATACAGATATGGCACATGCTCTCACACGATTAATCAGAAAGAAGTTGATGTGTGATAATGCACTGTTAACCCCAATTTCATCTCCAATTGTTAACTTAACTCAAGTTATTGATCCAACAACACAGTTAGATTACTTCCCCAAGATAACATTCGAAAGGCTAAAAAATTATGACACAAGTTCAAATTATGCTAAAGGGAAGCTAACAAGAAATTACATGATACTGCTGCCATGGCAGCATGTTAATAGATATAACTTTGTCTTTAGTTCTACTGGATGTAAAGTTAGTCTGAAAACATGTATTGGAAAACTTATGAAAGACTTAAATCCTAAAGTTTTGTACTTTATTGGAGAAGGAGCAGGAAATTGGATGGCCAGAACAGCATGTGAATATCCTGATATCAAGTTTGTATATAGAAGTCTGAAAGATGACCTTGATCATCATTACCCTTTAGAATACCAGAGAGTGATAGGTGAATTAAGCAGAATCATAGATAGTGGTGAAGGGCTTTCAATGGAAACAACAGACGCAACTCAAAAAACTCATTGGGATTTGATACACAGAGTAAGCAAAGATGCTTTATTAATAACTTTATGTGATGCAGAATTTAAGGACAGAGATGATTTTTTTAAGATGGTAATTCTGTGGAGAAAACATGTATTATCATGCAGAATTTGCACTACTTATGGGACAGACCTCTATTTATTCGCAAAGTATCACGCTAAAGACTGCAATGTAAAATTACCCTTTTTTGTGAGATCAGTTGCTACTTTTATTATGCAGGGTAGTAAGCTGTCAGGCTCAGAATGCTACATACTCTTAACACTAGGCCATCACAACAGTTTACCTTGCCATGGAGAAATACAAAATTCTAAAATGAAAATAGCAGTGTGTAATGATTTTTATGCTGCAAAGAAACTCGACAATAAATCGATTGAAGCTAATTGTAAATCACTTCTGTCAGGGCTAAGGATACCTATAAATAAGAAGGAACTAGATAGACAGAGAAGGTTATTAACACTACAAAGCAACCATTCTTCTGTAGCAACAGTTGGTGGCAGCAAGATCATAGAGTCTAAATGGCTAACAAACAAAGCAAGTACAATAATTGATTGGTTAGAGCATATTTTAAATTCTCCAAAAGGCGAATTAAATTATGATTTTTTTGAAGCATTAGAGAACACTTACCCTAATATGATTAAGCTAATAGATAACTTAGGGAATGCAGAGATTAAAAAATTGATCAAAGTAACTGGATACATGCTTGTAAGTAAGAAATGAGAAATGATGAAGATGATAAAATAGATGACAAATTCATACCATTCTAAAGTAATTGTTTGATTATGCAATTATATGGTAGTTAATTAAAAATTAAAATTAAAAATCAAAAATTAAAGTTTAAAACCTATCATTAAGTTTATTAAAAATAAGAAACTATAATTGAATGTATACGGTTTTAATGCC
| 15,502
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LC769209.1
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Metapneumovirus hominis
|
Sugimoto,S., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Hosoya,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
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Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
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2023-05-30
|
hMPV_Fukushima_H585_2019_A2b
|
Metapneumovirus hominis
|
Metapneumovirus
|
Pneumoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,438
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GenBank
| null |
Japan: Fukushima
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2019
| null | null |
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Metapneumovirus hominis
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Sugimoto,S., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Hosoya,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
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Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
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Japan
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2023-05-30
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Metapneumovirus hominis
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Metapneumovirus
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Pneumoviridae
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ssRNA(-)
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GenBank
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Japan
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Homo sapiens
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2018
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Metapneumovirus hominis hMPV_Fukushima_O53_2018_B1 RNA, nearly complete genome
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| 15,504
|
LC769211.1
|
Metapneumovirus hominis
|
Sugimoto,S., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Hosoya,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
|
Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-05-30
|
hMPV_Fukushima_O219_2018_B1
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Metapneumovirus hominis
|
Metapneumovirus
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Pneumoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,248
|
GenBank
| null |
Japan: Fukushima
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2018
| null | null |
Metapneumovirus hominis hMPV_Fukushima_O219_2018_B1 RNA, nearly complete genome
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| 15,505
|
LC769212.1
|
Metapneumovirus hominis
|
Sugimoto,S., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Hosoya,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
|
Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-05-30
|
hMPV_Fukushima_O231_2018_B1
|
Metapneumovirus hominis
|
Metapneumovirus
|
Pneumoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,251
|
GenBank
| null |
Japan: Fukushima
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2018
| null | null |
Metapneumovirus hominis hMPV_Fukushima_O231_2018_B1 RNA, nearly complete genome
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TTCCAAACAAAACGGGACAAATAAAAATGTCTCTTCAAGGGATTCACCTAAGTGATCTGTCATACAAACATGCTATATTAAAAGAGTCTCAATACACAATAAAAAGAGATGTAGGCACAACAACTGCAGTGACACCTTCATCATTGCAACAAGAAATAACACTTTTGTGTGGAGAAATTCTTTACACTAAACACACTGACTACAAATATGCTGCTGAGATAGGAATGCAATATATTTGCACAGCTCTAGGATCAGAAAGAGTACAACAGATTTTGAGAAACTCAGGTAGTGAAGTTCAGGTGGTTCTAACCAAAACATACTCCTTAGGGAAAGGTAAAAACAGTAAAGGGGAAGAGCTGCAGATGTTAGATATACATGGAGTAGAAAAGAGTTGGGTAGAAGAAATAGACAAAGAGGCAAGAAAGACAATGGTAACTTTGCTTAAAGAGTCATCAGGTAACATCCCACAAAACCAGAGACCTTCAGCACCAGACACACCAATAATTTTATTATGTGTAGGTGCCTTAATATTCACTAAACTAGCATCAACAATAGAAGTTGGATTAGAGACTACAGTTAGAAGAGCTAATAGAGTGCTAAGTGATGCACTCAAAAGATACCCTAGGGTAGATATACCAAAGATTGCTAGATCCTTTTATGAACTATTTGAACAAAAAGTGTACTACAGAAGTTTATTCATTGAGTACGGAAAAGCTTTAGGCTCATCTTCAACAGGGAGCAAAGCAGAAAGTTTGTTTGTAAATATATTTATGCAAGCTTATGGAGCTGGTCAAACACTGCTAAGGTGGGGTGTCATTGCCAGATCATCCAACAACATAATGCTAGGGCATGTGTCTGTGCAATCTGAATTGAAGCAAGTTACAGAGGTTTATGACCTGGTGAGAGAAATGGGTCCTGAATCTGGGCTCTTACATCTAAGACAAAGTCCAAAGGCAGGGCTGTTATCATTGGCCAATTGTCCCAATTTTGCCAGTGTTGTCCTTGGCAATGCTTCAGGTCTAGGCATAATAGGAATGTACAGAGGGAGAGTACCAAACACAGAGCTATTTTCTGCAGCAGAAAGTTATGCCAGAAGCTTGAAAGAGAGCAATAAAATCAATTTCTCTTCGTTAGGGCTTACAGATGAAGAAAAAGAAGCTGCAGAACACTTCTTAAACATGAGTGGTGACAATCAAGATGATTATGAGTAATTAAAAAACTGGGACAAGTCAAAATGTCATTCCCTGAAGGAAAGGATATCCTGTTCATGGGTAATGAAGCAGCAAAAATAGCCGAAGCTTTCCAGAAATCACTAAAAAAATCAGGTCACAAGAGAACTCAATCCATTGTAGGAGAAAAAGTAAATACTATATCAGAAACTCTAGAACTACCCACCATCAGCAAACCCGCACGATCATCCACACTGCTGGAGCCAAAATTGGCATGGGCAGACAACAGCGGAATCACCAAAATCACAGAAAAACCAGCAACCAAAACAACAGATCCTGTTGAAGAAGAGGAATTCAACGAAAAGAAAGTATTGCCTTCCAGTGATGGGAAGACCCCCGCAGAGAAAAAATCAAAGTTTTCAACCAGTGTAAAGAAGAAAGTTTCCTTTACATCAAATGAACCAGGGAAATACACCAAACTAGAGAGAGATGCCCTAGACTTGCTCTCAGACAATGAGGACGAAGACGCAGAATCCTCAATCCTAACCTTTGAAGAGAAAGATACATCATCACTAAGCATTGAAGCTAGACTAGAATCTATAGAAGAGAAGTTGAGCATGATATTAGGACTGCTTCGTACACTTAACATTGCAACAGCAGGACCAACAGCTGCACGAGATGGAATCAGAGATGCAATGATTGGCATAAGAGAAGAACTAATAGCAGAGATAATCAAAGAAGCCAAAGGAAAAGCAGCTGAGATGATGGAAGAAGAAATGAATCAAAGATCTAAAATAGGAAATGGCAGTGTAAAACTAACCGAGAAGGCAAAAGAGCTCAACAAAATTGTTGAAGACGAGAGCACAAGCGGTGAATCAGAAGAAGAAGAAGAATCAAAAGAAACTCAGGACAACAATCAGGGAGAAGATATTTATCAATTAATCATGTAGTTTAATAAAAATAAACAATGGGACAAGTCAAGATGGAGTCCTATCTAGTGGACACTTATCAAGGCATTCCATATACAGCCGCTGTCCAAGTTGACCTGGTAGAAAAAGATTTACTGCCAGCAAGTTTGACAATATGGTTTCCTTTATTTCAGGCCAACACACCACCAGCAGTTTTGCTTGATCAGCTAAAAACCTTAACAATAACAACTCTATATGCTGCATCACAGAACGGTCCAATACTCAAGGTAAATGCATCTGCCCAAGGTGCTGCCATGTCTGTACTTCCCAAAAAATTTGAAGTAAATGCAACTGTGGCACTTGATGAATACAGTAAACTTGATTTTGACAAGCTGACGGTTTGTGATGTTAAAACAGTTTATTTGACAACTATGAAACCGTACGGGATGGTGTCAAAATTTGTGAGTTCAGCCAAATCAGTTGGCAAAAAAACACATGATCTAATTGCACTATGTGACTTCATGGACCTAGAGAAAAACATACCTGTGACAATACCAGCATTCATAAAGTCAGTTTCAATCAAAGAGAGTGAGTCAGCCACTGTTGAAGCTGCAATAAGCAGCGAGGCCGACCAAGCCTTGACACAAGCCAAGATTGCACCTTATGCAGGACTAATTATGATCATGACCATGAATAATCCAAAAGGTATATTCAAGAAACTAGGGGCTGGAACACAAGTGATAGTAGAGCTGGGGGCATATATCCAGGCTGAGAGCATCAGTAGAATCTGCAAGAGCTGGAGTCACCAAGGAACAAGATACGTACTAAAATCCAGATAAAAATAACTGTCTTAATCAACAATTGCCTATATAACTCTAGAGATTAATAAGCTTATTATTATAGTTATATAAAAATAAATTAGAATTATAAGGGCATCAATAGCAAGTGGGACAAATAAAAATGTCTTGGAAAGTGATGATCATCATTTCGTTACTTATAACACCCCAGCACGGGCTAAAGGAGAGCTATTTGGAAGAATCATGCAGTACTATAACTGAGGGATACCTCAGTGTTTTAAGAACAGGCTGGTATACTAATGTCTTCACATTAGAAGTTGGTGATGTTGAAAATCTTACATGTACTGATGGACCTAGCTTAATCAAAACAGAACTTGACCTAACAAAAAGTGCTTTAAGGGAACTCAAAACAGTCTCTGCCGATCAGTTAGCGAGAGAGGAGCAAATTGAAAATCCCAGACAATCAAGGTTTGTCCTAGGTGCAATAGCTCTTGGAGTTGCTACAGCAGCAGCAGTCACAGCAGGCATTGCAATAGCCAAAACCATAAGGCTTGAGAGTGAGGTGAATGCAATTAAAGGTGCTCTCAAACAAACCAATGAAGCAGTATCCACATTAGGAAATGGTGTGCGGGTCCTAGCCACTGCAGTGAGAGAGCTAAAAGAATTTGTGAGCAAAAATCTGACTAGTGCAATCAACAGGAACAAATGTGACATTGCTGATCTGAAGATGGCTGTCAGCTTCAGTCAATTCAACAGAAGATTTCTAAATGTTGTGCGGCAGTTTTCAGACAATGCAGGGATAACACCAGCAATATCATTGGACTTAATGACTGATGCTGAACTGGCCAGAGCTGTATCATACATGCCAACATCTGCAGGACAGATAAAACTGATGTTGGAGAACCGTGCAATGGTAAGGAGAAAAGGATTTGGAATCCTAATAGGGGTCTACGGAAGCTCCGTGATTTACATGGTTCAATTGCCGATCTTTGGTGTCATAGATACACCTTGCTGGATAATCAAAGCAGCCCCCTCTTGCTCAGAAAAAAACGGGAATTATGCTTGCCTCTTAAGAGAAGATCAAGGATGGTATTGTAAAAATGCAGGATCTACTGTGTACTACCCAAACGAAAAAGACTGTGAAACAAGAGGTGATCATGTTTTTTGTGACACAGCAGCAGGGATCAATGTTGCTGAGCAGTCGAGAGAATGCAACATTAACATATCTACTACCAACTACCCGTGCAAAGTCAGCACAGGAAGACACCCCATAAGCATGGTTGCACTATCACCTCTCGGTGCTTTGGTGGCTTGCTATAAAGGGGTAAGCTGCTCGATTGGCAGCAATCGGGTTGGAATCATCAAACAATTACCCAAAGGCTGCTCATACATAACTAACCAGGATGCAGACACTGTAACAATTGACAATACTGTGTATCAACTAAGCAAAGTTGAAGGTGAACAGCATGTAATAAAAGGGAGACCAGTTTCAAGCAGTTTTGATCCAATCAGGTTTCCTGAGGATCAGTTCAATGTTGCGCTTGATCAAGTCTTCGAAAGCATTGAGAACAGTCAGGCACTGGTGGAACAGTCAAACAAAATTCTAAACAGTGCAGAAAAAGGAAACACTGGTTTCATTATTGTAATAATCTTGGTTGCTGTTCTTGGTTTAACCATGATTTCAGTGAGCATCATCATCATAATCAAGAAAACAAGGAAGCCCACAGGAGCACCTCCAGAGCTGAATGGTGTCACCAACGGTGGCTTCATACCACATAGTTAGTTAATTAAAAAATGGGACAAATCATCATGTCTCGTAAGGCTCCATGCAAATATGAAGTGCGGGGCAAATGCAACAGAGGGAGTGATTGCAAATTCAATCACAATTACTGGAGTTGGCCTGATAGATATTTATTGTTAAGATCAAATTATCTCTTAAATCAGCTTTTAAGAAACACCGATAAGGCTGATGGTTTGTCAATAATATCAGGAGCAGGTAGAGAAGATAGAACTCAAGACTTTGTTCTTGGTTCTACTAATGTGGTTCAAGGGTATATTGATGACAATCAAGGAATAACCAAGGCTGCAGCTTGCTATAGTCTACACAACATAATTAAGCAGCTACA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| 15,506
|
LC769213.1
|
Metapneumovirus hominis
|
Sugimoto,S., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Hosoya,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
|
Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-05-30
|
hMPV_Fukushima_O639_2019_A2b
|
Metapneumovirus hominis
|
Metapneumovirus
|
Pneumoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,439
|
GenBank
| null |
Japan: Fukushima
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2019
| null | null |
Metapneumovirus hominis hMPV_Fukushima_O639_2019_A2b RNA, nearly complete genome
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GAAAAAAACGCGTATAAATTAAGTTACAAAAAAACATGGGACAAGTGAAAATGTCTCTTCAGGGGATTCACCTGAGTGATCTATCATACAAGCATGCTATATTAAAAGAGTCTCAGTACACAATAAAGAGAGATGTAGGCACAACAACAGCAGTGACACCCTCATCATTGCAACAAGAAATAACACTGTTGTGTGGAGAAGTTCTATATGCTAAACATACTGATTACAAATATGCTGCAGAAGTAGGAATACAATATATCAGCACAGCTCTAGGGTCAGAGAGAGTACAGCAGATTCTAAGAAACTCAGGCAGTGAAGTTCAAGCGATTTTAACCAGAACGTACTCTTTGGGGAAAGTTAAAAACAATAAAGGAGAAGATTTGCAGATGCTAGACATACATGGAGTAGAAAAAAGCTGGGTGGAAGAGATAGACAAAGAAGCAAGAAAAACAATGGCAACTTTACTTAAAGAATCATCAGGCAATATCCCACAAAATCAGAGGCCTTCAGCACCAGACACACCTATAATCTTATTATGTGTAGGTGCCTTAATATTCACCAAACTAGCATCAACTATAGAAGTGGGATTAGAGACCACAGTCAGAAGAGCTAACCGTGTGCTAAGTGATGCACTCAAAAGATACCCCAGAATGGACATACCAAAAATCGCTAGATCCTTCTATGACTTATTTGAACAAAAAGTGTATTACAGAAGTTTGTTCATTGAGTATGGCAAAGCATTAGGCTCATCCTCTACAGGCAGCAAAGCAGAAAGTTTATTCGTTAATATATTCATGCAAGCATATGGTGCTGGTCAAACAATGCTGAGGTGGGGGGTCATCGCCAGATCATCTAACAATATAATGTTAGGACATGTATCTGTACAGGCTGAGTTAAAACAGGTCACAGAAGTCTATGATCTAGTGCGAGAAATGGGCCCAGAATCTGGGCTTCTACATTTAAGGCAAAGCCCAAAAGCTGGACTGTTATCCTTAGCCAATTGTCCCAACTTTGCAAGTGTTGTTCTCGGCAATGCCTCAGGCTTAGGCATAATAGGTATGTATCGAGGGAGAGTGCCAAACACAGAACTATTTTCAGCAGCAGAAAGCTATGCCAAGAGTTTGAAAGAAAGTAATAAAATCAACTTTTCTTCATTAGGACTCACAGATGAAGAAAAAGAGGCTGCAGAACACTTTCTAAATGTGAGTGACGACAGTCAAAATGATTATGAGTAATTAAAAAAGTGGGACAAGTCAAAATGTCGTTCCCTGAAGGAAAAGATATTCTTTTCATGGGTAATGAAGCAGCAAAATTGGCAGAAGCTTTCCAGAAATCATTAAGAAAACCTAGTCATAAAAGATCTCAATCTATTATAGGAGAAAAAGTGAGCACTGTATCTGAAACATTGGAATTACCTACTATCAGTAGACCTACCAAACCAACCATATTGTCAGAGCCGAAGTTAGCATGGACAGACAAAGGTGGGGCAATCAGGACTGAAGTAAAGCAAACAATCAAAATTATGGATCCTATTGAAGAAGAAGAATCTACTGAGAAAAAGGTGCTACCCTCTAGTGACGGGAAAACTCCTGCAGAAAAAAAGTTGAAACCACCAACCAACACTAAAAAGAAAGTTTCATTTACACCGAATGAGCCAGGAAAATACACAAAGTTGGAGAAAGATGCTCTAGACTTGCTTTCAGATAATGAAGAGGAAGATGCAGAATCTTCAATCTTAACCTTCGAAGAAAGAGATACTTCATCATTAAGCATTGAGGCCAGACTAGAATCGATTGAGGAGAAATTAAGCATGATACTAGGGCTATTAAGAACACTCAACATTGCCACAGCAGGACCCACAGCAGCAAGAGATGGGATCAGAGATGCAATGATTGGCATAAGGGAAGAACTAATAGCAGACATAATAAAAGAAGCCAAAGGAAAAGCAGCAGAAATGATGGAAGAGGAAATGAACCAACGGACAAAAATAGGAAATGGTAGTGTTAAATTAACTGAAAAGGCAAAGGAGCTCAACAAAATTGTTGAAGATGAAAGCACAAGTGGAGAATCTGAAGAAGAAGAAGAACCAAAAGACCTACAGGATAATAATCAGGAAGATGACATTTACCAGTTAATTATGTAGTTTAATAAAAATAAACAATGGGACAAGTAAAAATGGAGTCCTATCTGGTAGACACCTATCAGGGCATCCCTTACACAGCAGCTGTTCAAGTTGATCTAGTAGAAAAAGACCTGTTACCTGCAAGCCTAACAATATGGTTTCCTTTGTTTCAGGCCAATACACCACCAGCAGTTCTGCTTGATCAGCTAAAGACTCTGACAATAACTACTCTGTATGCTGCGTCACAAAGTGGTCCAATACTAAAAGTGAATGCATCAGCCCAAGGTGCAGCAATGTCTGTACTTCCCAAAAGGTTTGAAGTCAATGCGACTGTAGCACTTGACGAATATAGTAAATTAGAATTTGACAAACTCACAGTCTGTGAGGTAAAAACAGTTTACTTAACAACTATGAAACCATATGGGATGGTATCAAAATTTGTGAGCTCAGCCAAATCAGTTGGTAAAAAAACACATGATCTAATTGCATTATGTGATTTTATGGATCTAGAAAAGAACACACCAGTTACAATACCAGCATTTATCAAATCAGTTTCTATCAAAGAGAGTGAATCAGCCACTGTTGAAGCTGCAATAAGCAGTGAAGCAGACCAAGCTCTAACACAAGCCAAAATTGCACCTTATGCGGGGCTGATCATGATTATGACCATGAACAATCCCAAAGGCATATTCAAGAAGCTTGGAGCTGGGACACAAGTTATAGTGGAACTAGGGGCATATGTCCAGGCTGAAAGCATAAGTAAAATATGCAAGACTTGGAGCCATCAAGGGACAAGATATGTGCTGAAATCCAGATAACAACCAAGCAACCTGACCAAGAACTATCAACTCTATTCTATAGACTAAAAAGTTGCTGTTTTAGTTATATAAAAATCAAGTTAGAGTAAGAATCAAATCAATCAAGAGTGGGACAAATAAAAATGTCTTGGAAAGTGGTGATTATTTTTTCATTGCTAATAACACCTCAACACGGTCTTAAAGAGAGCTACTTAGAAGAATCATGTAGCACTATAACTGAGGGTTATCTCAGTGTTCTGAGGACAGGTTGGTATACCAACGTTTTTACATTAGAGGTGGGTGATGTAGAAAACCTCACATGTGCTGATGGACCTAGCCTAATAAAAACAGAATTAGATCTGACCAAAAGTGCACTAAGAGAGCTCAAAACAGTTTCTGCTGACCAGTTGGCAAGAGAGGAACAAATTGAAAATCCCAGACAATCTAGATTTGTTCTAGGAGCAATAGCACTCGGTGTTGCAACAGCAGCTGCAGTTACAGCAGGTGTTGCAATTGCAAAAACCATCCGGCTTGAGAGTGAAGTTACAGCAATTAAGAATGCCCTTAAAAAGACCAATGAAGCAGTGTCTACATTGGGGAATGGGGTTCGAGTGTTAGCGACCGCAGTGAGAGAACTGAAAGATTTTGTGAGCAGGAATTTAACTCGTGCAATCAACAAAAACAAGTGCGACATTGATGACCTAAAAATGGCCGTTAGTTTCAGTCAATTCAACAGAAGGTTTCTAAATGTTGTGCGGCAATTTTCAGACAATGCTGGAATAACACCAGCAATATCTTTAGACTTAATGACAGATGCTGAACTAGCCAGAGCTGTTTCCAACATGCCGACATCTGCAGGACAAATAAAACTGATGTTGGAAAACCGTGCAATGGTGCGGAGGAAGGGGTTTGGAATCCTGATAGGGGTCTACGGGAGCTCCGTAATTTACATGGTGCAGCTGCCAATCTTTGGCGTTATAGATACGCCTTGCTGGATAGTGAAAGCAGCCCCTTCTTGCTCTGAAAAAAAGGGAAACTATGCTTGCCTCCTAAGAGAAGACCAGGGGTGGTATTGTCAGAATGCAGGGTCAACTGTCTACTACCCAAATGAGAAGGACTGTGAAACAAGAGGAGATCATGTCTTTTGCGACACAGCAGCAGGAATTAATGTTGCTGAGCAATCAAAGGAGTGCAACATCAACATATCCACTACAAATTACCCATGCAAAGTCAGCACAGGAAGGCATCCTATCAGTATGGTTGCACTGTCCCCTCTTGGGGCTCTGGTTGCTTGTTACAAAGGAGTAAGCTGTTCCATTGGCAGCAATAGAGTAGGGATCATCAAGCAGCTGAACAAAGGTTGCTCTTATATTACCAACCAAGATGCAGACACAGTGACAATAGACAATACTGTATATCAGCTAAGCAAAGTTGAGGGTGAACAGCATGTTATAAAAGGCAGACCAGTGTCAAGCAGCTTTGATCCAGTCAAATTTCCTGAAGATCAGTTCAATGTTGCACTTGACCAAGTTTTTGAGAACATTGAAAACAGCCAGGCTTTGGTAGATCAATCAAACAGAATCCTAAGCAGTGCAGAGAAAGGGAACACTGGCTTCATCATTGTGATAATTCTAATTGCTGTCCTTGGCTCTAGTATGATCCTAGTGAGCATCTTCATCATAATCAAGAAAACAAGGAAACCAACAGGAGCACCTCCAGAGCTGAGTGGTGTCACAAACAACAGCTTCATACCACACAGTTAGTTAATTAAAAATAAAACAAAATTTGGGACAAATCATAATGTCTCGCAAGGCTCCATGCAAATATGAAGTGCGGGGCAAATGCAATAGAGGAAGTGAGTGTAAGTTTAACCACAATTACTGGAGTTGGCCAGATAGATACTTATTAATAAGATCAAATTATCTATTAAATCAGCTTTTAAGGAACACTGATAGAGCTGATGGCCTATCAATAATATCAGGCGCAGGCAGAGAAGACAGAACGCAAGATTTTGTTCTAGGTTCCACCAATGTGGTTCAAGGTTATATTGATGATAACCAAAGCATAACAAAGGCTGCAGC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| 15,507
|
LC769214.1
|
Metapneumovirus hominis
|
Sugimoto,S., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Hosoya,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
|
Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-05-30
|
hMPV_Fukushima_O700_2019_A2b
|
Metapneumovirus hominis
|
Metapneumovirus
|
Pneumoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,439
|
GenBank
| null |
Japan: Fukushima
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2019
| null | null |
Metapneumovirus hominis hMPV_Fukushima_O700_2019_A2b RNA, nearly complete genome
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GAAAAAAACGCGTATAAATTAAGTTACAAAAAAACATGGGACAAGTGAAAATGTCTCTTCAGGGGATTCACCTGAGTGATCTATCATACAAGCATGCTATATTAAAAGAGTCTCAGTACACAATAAAGAGAGATGTAGGCACAACAACAGCAGTGACACCCTCATCATTGCAACAAGAAATAACACTGTTGTGTGGAGAAGTTCTATATGCTAAACATACTGATTACAAATATGCTGCAGAAGTAGGAATACAATATATCAGCACAGCTCTAGGGTCAGAGAGAGTACAGCAGATTCTAAGAAACTCAGGCAGTGAAGTTCAAGCGATTTTAACCAGAACGTACTCTTTGGGGAAAGTTAAAAACAATAAAGGAGAAGATTTGCAGATGCTAGACATACATGGAGTAGAAAAAAGCTGGGTGGAAGAGATAGACAAAGAAGCAAGAAAAACAATGGCAACTTTACTTAAAGAATCATCAGGCAATATCCCACAAAATCAGAGGCCTTCAGCACCAGACACACCTATAATCTTATTATGTGTAGGTGCCTTAATATTCACCAAACTAGCATCAACTATAGAAGTGGGATTAGAGACCACAGTCAGAAGAGCTAACCGTGTGCTAAGTGATGCACTCAAAAGATACCCCAGAATGGACATACCAAAAATCGCTAGATCCTTCTATGACTTATTTGAACAAAAAGTGTATTACAGAAGTTTGTTCATTGAGTATGGCAAAGCATTAGGCTCATCCTCTACAGGCAGCAAAGCAGAAAGTTTATTCGTTAATATATTCATGCAAGCATATGGTGCTGGTCAAACAATGCTGAGGTGGGGGGTCATCGCCAGATCATCTAACAATATAATGTTAGGACATGTATCTGTACAGGCTGAGTTAAAACAGGTCACAGAAGTCTATGATCTAGTGCGAGAAATGGGCCCAGAATCTGGGCTTCTACATTTAAGGCAAAGCCCAAAAGCTGGACTGTTATCCTTAGCCAATTGTCCCAACTTTGCAAGTGTTGTTCTCGGCAATGCCTCAGGCTTAGGCATAATAGGTATGTATCGAGGGAGAGTGCCAAACACAGAACTATTTTCAGCAGCAGAAAGCTATGCCAAGAGTTTGAAAGAAAGTAATAAAATCAACTTTTCTTCATTAGGACTCACAGATGAAGAAAAAGAGGCTGCAGAACACTTTCTAAATGTGAGTGACGACAGTCAAAATGATTATGAGTAATTAAAAAAGTGGGACAAGTCAAAATGTCGTTCCCTGAAGGAAAAGATATTCTTTTCATGGGTAATGAAGCAGCAAAATTGGCAGAAGCTTTCCAGAAATCATTAAGAAAACCTAGTCATAAAAGATCTCAATCTATTATAGGAGAAAAAGTGAGCACTGTATCTGAAACATTGGAATTACCTACTATCAGTAGACCTACCAAACCAACCATATTGTCAGAGCCGAAGTTAGCATGGACAGACAAAGGTGGGGCAATCAGGACTGAAGTAAAGCAAACAATCAAAATTATGGATCCTATTGAAGAAGAAGAATCTACTGAGAAAAAGGTGCTACCCTCTAGTGACGGGAAAACTCCTGCAGAAAAAAAGTTGAAACCACCAACCAACACTAAAAAGAAAGTTTCATTTACACCGAATGAGCCAGGAAAATACACAAAGTTGGAGAAAGATGCTCTAGACTTGCTTTCAGATAATGAAGAGGAAGATGCAGAATCTTCAATCTTAACCTTCGAAGAAAGAGATACTTCATCATTAAGCATTGAGGCCAGACTAGAATCGATTGAGGAGAAATTAAGCATGATACTAGGGCTATTAAGAACACTCAACATTGCCACAGCAGGACCCACAGCAGCAAGAGATGGGATCAGAGATGCAATGATTGGCATAAGGGAAGAACTAATAGCAGACATAATAAAAGAAGCCAAAGGAAAAGCAGCAGAAATGATGGAAGAGGAAATGAACCAACGGACAAAAATAGGAAATGGTAGTGTTAAATTAACTGAAAAGGCAAAGGAGCTCAACAAAATTGTTGAAGATGAAAGCACAAGTGGAGAATCTGAAGAAGAAGAAGAACCAAAAGACCTACAGGATAATAATCAGGAAGATGACATTTACCAGTTAATTATGTAGTTTAATAAAAATAAACAATGGGACAAGTAAAAATGGAGTCCTATCTGGTAGACACCTATCAGGGCATCCCTTACACAGCAGCTGTTCAAGTTGATCTAGTAGAAAAAGACCTGTTACCTGCAAGCCTAACAATATGGTTTCCTTTGTTTCAGGCCAATACACCACCAGCAGTTCTGCTTGATCAGCTAAAGACTCTGACAATAACTACTCTGTATGCTGCGTCACAAAGTGGTCCAATACTAAAAGTGAATGCATCAGCCCAAGGTGCAGCAATGTCTGTACTTCCCAAAAGGTTTGAAGTCAATGCGACTGTAGCACTTGACGAATATAGTAAATTAGAATTTGACAAACTCACAGTCTGTGAGGTAAAAACAGTTTACTTAACAACTATGAAACCATATGGGATGGTATCAAAATTTGTGAGCTCAGCCAAATCAGTTGGTAAAAAAACACATGATCTAATTGCATTATGTGATTTTATGGATCTAGAAAAGAACACACCAGTTACAATACCAGCATTTATCAAATCAGTTTCTATCAAAGAGAGTGAATCAGCCACTGTTGAAGCTGCAATAAGCAGTGAAGCAGACCAAGCTCTAACACAAGCCAAAATTGCACCTTATGCGGGGCTGATCATGATTATGACCATGAACAATCCCAAAGGCATATTCAAGAAGCTTGGAGCTGGGACACAAGTTATAGTGGAACTAGGGGCATATGTCCAGGCTGAAAGCATAAGTAAAATATGCAAGACTTGGAGCCATCAAGGGACAAGATATGTGCTGAAGTCCAGATAACAACCAAGCAACCTGACCAAGAACTATCAACTCTATTCTATAGACTAAAAAGTTGCTGTTTTAGTTATATAAAAATCAAGTTAGAGTAAGAATCAAATCAATCAAGAGTGGGACAAATAAAAATGTCTTGGAAAGTGGTGATTATTTTTTCATTGCTAATAACACCTCAACACGGTCTTAAAGAGAGCTACTTAGAAGAATCATGTAGCACTATAACTGAGGGTTATCTCAGTGTTCTGAGGACAGGTTGGTATACCAACGTTTTTACATTAGAGGTGGGTGATGTAGAAAACCTCACATGTGCTGATGGACCTAGCCTAATAAAAACAGAATTAGATCTGACCAAAAGTGCACTAAGAGAGCTCAAAACAGTTTCTGCTGACCAGTTGGCAAGAGAGGAACAAATTGAAAATCCCAGACAATCTAGATTTGTTCTAGGAGCAATAGCACTCGGTGTTGCAACAGCAGCTGCAGTTACAGCAGGTGTTGCAATTGCAAAAACCATCCGGCTTGAGAGTGAAGTTACAGCAATTAAGAATGCCCTTAAAAAGACCAATGAAGCAGTGTCTACATTGGGGAATGGGGTTCGAGTGTTAGCGACCGCAGTGAGAGAACTGAAAGATTTTGTGAGCAGGAATTTAACTCGTGCAATCAACAAAAACAAGTGCGACATTGATGACCTAAAAATGGCCGTTAGTTTCAGTCAATTCAACAGAAGGTTTCTAAATGTTGTGCGGCAATTTTCAGACAATGCTGGAATAACACCAGCAATATCTTTAGACTTAATGACAGATGCTGAACTAGCCAGAGCTGTTTCCAACATGCCGACATCTGCAGGACAAATAAAACTGATGTTGGAAAACCGTGCAATGGTGCGGAGGAAGGGGTTCGGAATCCTGATAGGGGTCTACGGGAGCTCCGTAATTTACATGGTGCAGCTGCCAATCTTTGGCGTTATAGATACGCCTTGCTGGATAGTGAAAGCAGCCCCTTCTTGCTCTGAAAAAAAGGGAAACTATGCTTGCCTCCTAAGAGAAGACCAGGGGTGGTATTGTCAGAATGCAGGGTCAACTGTCTACTACCCAAATGAGAAGGACTGTGAAACAAGAGGAGATCATGTCTTTTGCGACACAGCAGCAGGAATTAATGTTGCTGAGCAATCAAAGGAGTGCAACATCAACATATCCACTACAAATTACCCATGCAAAGTCAGCACAGGAAGGCATCCTATCAGTATGGTTGCACTGTCCCCTCTTGGGGCTCTGGTTGCTTGTTACAAAGGAGTAAGCTGTTCCATTGGCAGCAATAGAGTAGGGATCATCAAGCAGCTGAACAAAGGTTGCTCTTATATTACCAACCAAGATGCAGACACAGTGACAATAGACAATACTGTATATCAGCTAAGCAAAGTTGAGGGTGAACAGCATGTTATAAAAGGCAGACCAGTGTCAAGCAGCTTTGATCCAGTCAAATTTCCTGAAGATCAGTTCAATGTTGCACTTGACCAAGTTTTTGAGAACATTGAAAACAGCCAGGCTTTGGTAGATCAATCAAACAGAATCCTAAGCAGTGCAGAGAAAGGGAACACTGGCTTCATCATTGTGATAATTCTAATTGCTGTCCTTGGCTCTAGTATGATCCTAGTGAGCATCTTCATCATAATCAAGAAAACAAGGAAACCAACAGGAGCACCTCCAGAGCTGAGTGGTGTCACAAACAACAGCTTCATACCACACAGTTAGTTAATTAAAAATAAAACAAAATTTGGGACAAATCATAATGTCTCGCAAGGCTCCATGCAAATATGAAGTGCGGGGCAAATGCAATAGAGGAAGTGAGTGTAAGTTTAACCACAATTACTGGAGTTGGCCAGATAGATACTTATTAATAAGATCAAATTATCTATTAAATCAGCTTTTAAGGAACACTGATAGAGCTGATGGCCTATCAATAATATCAGGCGCAGGCAGAGAAGACAGAACGCAAGATTTTGTTCTAGGTTCCACCAATGTGGTTCAAGGTTATATTGATGATAACCAAAGCATAACAAAGGCTGCAGC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| 15,508
|
LC769215.1
|
Metapneumovirus hominis
|
Sugimoto,S., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Hosoya,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
|
Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-05-30
|
hMPV_Fukushima_O937_2019_A2b
|
Metapneumovirus hominis
|
Metapneumovirus
|
Pneumoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,443
|
GenBank
| null |
Japan: Fukushima
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2019
| null | null |
Metapneumovirus hominis hMPV_Fukushima_O937_2019_A2b RNA, nearly complete genome
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GAAAAAAACGCGTATAAATTAAATTACAAAAAAACATGGGACAAGTGAAAATGTCTCTTCAGGGGATTCACCTGAGTGATCTATCATACAAGCATGCTATATTAAAAGAGTCTCAGTACACAATAAAGAGAGATGTAGGCACAACAACAGCAGTGACACCCTCATCATTGCAACAAGAAATAACACTGTTGTGTGGAGAAATTCTATATGCTAAGCATACTGATTACAAATATGCTGCAGAAATAGGAATACAATATATCAGCACAGCTCTAGGGTCAGAGAGAGTACAGCAGATTCTAAGAAACTCAGGCAGTGAAGTTCAAGCGGTTTTAACCAGAACATACTCTTTGGGGAAAGTTAAAAACAATAAAGGAGAAGATTTACAGATGCTAGACATACATGGAGTGGAAAAAAGCTGGGTGGAAGAGATAGACAAAGAAGCAAGAAAAACAATGGCAACTTTACTTAAAGAATCATCAGGCAATATCCCACAAAATCAGAGGCCTTCAGCACCAGACACACCTATAATCTTATTATGTGTAGGTGCCTTAATATTTACCAAACTAGCCTCAACTATAGAAGTGGGATTAGAGACCACAGTCAGAAGAGCTAACCGTGTGCTAAGTGATGCACTCAAAAGATACCCTAGAATGGACATACCAAAAATCGCTAGATCCTTCTATGACTTATTTGAACAAAAAGTGTATTACAGAAGTTTGTTCATTGAGTATGGCAAAGCATTAGGCTCATCCTCTACAGGCAGCAAAGCAGAAAGTTTATTCGTTAATATATTCATGCAAGCTTATGGTGCTGGTCAAACAATGCTGAGGTGGGGGGTCATCGCCAGATCATCTAACAATATAATGTTGGGACATGTATCTGTACAGGCTGAGTTAAAACAGGTCACAGAAGTCTATGATCTAGTGCGAGAAATGGGCCCAGAATCTGGGCTCCTACATTTAAGGCAAAGCCCAAAAGCTGGACTGTTATCCTTAGCCAATTGTCCCAACTTTGCAAGTGTTGTTCTCGGCAATGCCTCAGGCTTAGGCATAATAGGTATGTATCGAGGGAGAGTGCCAAACACAGAACTATTTTCAGCAGCAGAAAGCTATGCCAAGAGTTTGAAAGAAAGTAATAAAATCAACTTTTCTTCATTAGGACTCACAGATGAAGAAAAAGAGGCTGCAGAACACTTTCTAAATGTGAGTGACGACAGTCAAAATGATTATGAGTAATTAAAAAAGTGGGACAAGTCAAAATGTCGTTCCCTGAAGGAAAAGATATTCTTTTCATGGGTAATGAAGCAGCAAAATTGGCAGAAGCTTTCCAGAAATCATTAAGAAAACCTAGTCATAAAAGATCTCAATCTATTATAGGAGAAAAAGTGAGCACTGTATCTGAAACATTGGAATTACCTACTATCAGTAGACCTACCAAACCAACCATATTGTCAGAGCCGAAGTTAGCATGGACAGACAAAGGTGGGGCAATCAGAACTGAAGTAAAGCAAACAATCAAAATTATGGATCCTATTGAAGAAGAAGAATCTACTGAGAAAAAGGTGCTACCCTCTAGTGACGGGAAAACTCCTGCAGAAAAGAAGCTGAAACCATCAACCAACACTAAAAAGAAAGTTTCATTTACACCGAATGAACCAGGAAAATACACAAAGTTGGAGAAAGATGCTCTAGACTTGCTTTCAGACAATGAAGAGGAAGATGCAGAATCTTCAATCTTAACCTTCGAAGAAAGAGATACCTCATCATTAAGCATTGAGGCCAGACTAGAATCGATTGAGGAAAAATTAAGCATGATACTAGGACTATTAAGAACACTCAACATTGCCACAGCAGGACCCACAGCAGCAAGAGATGGGATCAGAGATGCAATGATTGGCATAAGGGAAGAACTAATAGCAGACATAATAAAAGAAGCCAAGGGAAAAGCAGCAGAAATGATGGAAGAGGAAATGAACCAACGGACAAAAATAGGAAATGGTAGTGTTAAATTAACTGAAAAGGCAAAAGAGCTCAACAAAATTGTTGAAGATGAAAGCACAAGTGGAGAATCTGAAGAAGAAGAAGAACCAAAAGACCTACAGGACAATAATCAGGAAGATGACATTTACCAGTTAATTATGTAGTTTAATAAAAATAAACAATGGGACAAGTAAAAATGGAGTCCTATCTGGTAGACACCTATCAGGGCATCCCTTACACAGCAGCTGTTCAAGTTGATCTAGTAGAAAAAGACCTGTTACCTGCAAGCCTCACAATATGGTTTCCTTTGTTTCAGGCCAATACACCACCAGCAGTTCTGCTTGATCAGCTAAAGACTCTGACAATAACTACTCTGTATGCTGCATCACAAAGTGGTCCAATACTAAAGGTGAATGCATCAGCCCAAGGTGCAGCAATGTCTGTACTTCCCAAAAGGTTTGAAGTCAATGCAACTGTAGCACTTGACGAATATAGTAAATTAGAATTTGACAAACTCACAGTTTGTGAGGTAAAAACAGTTTACTTAACAACTATGAAACCATATGGGATGGTATCAAAATTTGTGAGCTCAGCCAAATCAGTTGGCAAAAAAACACATGATCTAATTGCATTATGTGATTTTATGGATCTAGAAAAGAACACACCAGTTACAATACCAGCATTTATCAAATCAGTTTCTATCAAAGAGAGTGAATCAGCCACTGTTGAAGCTGCAATAAGCAGTGAAGCAGACCAAGCTCTAACACAAGCCAAAATTGCACCTTATGCGGGGCTGATCATGATTATGACCATGAACAATCCCAAAGGCATATTCAAGAAGCTTGGAGCTGGGACACAAGTTATAGTGGAACTAGGAGCATATGTCCAGGCTGAAAGCATAAGTAAAATATGCAAGACTTGGAGCCATCAAGGGACAAGATATGTGCTGAAGTCCAGATAACAACCAAGCAACCTGACCAAGAACTATCAACTCTATTCTATAGACTAAAAAGTTGCTGTTTTAGTTATATAAAAATCAAGTTAGAGTAAGAATTAAATCAATCAAGAGTGGGACAAATAAAAATGTCTTGGAAAGTGGTGATTATTTTTTCATTGCTAATAACACCTCAACACGGTCTTAAAGAGAGCTACTTAGAAGAATCATGTAGCACTATAACTGAGGGTTATCTCAGTGTTCTGAGGACAGGTTGGTATACCAACGTTTTTACATTAGAGGTGGGTGATGTAGAAAACCTCACATGTGCTGATGGACCTAGCCTAATAAAAACAGAATTAGATCTGACCAAAAGTGCACTAAGAGAGCTCAAAACAGTTTCTGCTGACCAGTTGGCAAGAGAGGAACAAATTGAAAATCCCAGACAATCTAGATTTGTTCTAGGAGCAATAGCACTCGGTGTTGCAACAGCAGCTGCAGTTACGGCAGGTGTTGCAATTGCAAAAACCATCCGGCTTGAGAGTGAAGTTACAGCAATTAAGAATGCCCTTAAAAAAACCAATGAAGCAGTGTCTACATTGGGGAATGGGGTTCGAGTGTTAGCGACCGCAGTGAGAGAACTGAAAGATTTTGTGAGCAAGAATTTAACTCGTGCAATCAACAAAAACAAGTGCGACATTGATGACCTAAAAATGGCCGTTAGCTTCAGTCAATTCAACAGAAGGTTTCTAAATGTTGTGCGGCAATTTTCAGACAATGCTGGAATAACACCAGCAATATCTTTAGACTTAATGACAGATGCTGAACTAGCCAGAGCTGTTTCCAACATGCCGACATCTGCAGGACAAATAAAATTGATGTTGGAAAACCGTGCAATGGTGCGGAGGAAGGGGTTTGGAATCCTGATAGGGGTCTACGGGAGCTCCGTAATTTACATGGTGCAGCTGCCAATCTTTGGCGTTATAGATACGCCTTGCTGGATAGTGAAAGCAGCCCCTTCTTGCTCTGAAAAGAAGGGAAACTATGCTTGCCTCCTAAGAGAAGACCAGGGGTGGTATTGTCAGAATGCAGGGTCAACTGTCTACTACCCAAATGAGAAGGACTGTGAAACAAGGGGAGATCATGTCTTTTGCGACACAGCAGCAGGAATTAATGTTGCTGAGCAATCAAAGGAGTGCAACATCAACATATCCACTACAAATTACCCATGCAAAGTCAGCACAGGAAGGCATCCTATCAGTATGGTTGCACTGTCCCCTCTTGGGGCTCTGGTTGCTTGTTACAAAGGAGTAAGCTGTTCCATTGGCAGCAATAGAGTAGGGATCATCAAGCAGCTGAACAAAGGTTGCTCTTATATTACCAACCAAGATGCAGACACAGTGACAATAGACAACACTGTATATCAGCTAAGCAAAGTTGAGGGTGAACAGCATGTTATAAAAGGCAGACCAGTGTCAAGCAGCTTTGATCCAGTCAAATTTCCTGAAGATCAGTTCAATGTTGCACTGGACCAAGTTTTTGAGAACATTGAAAACAGCCAGGCCTTGGTAGATCAATCAAACAGAATCCTAAGCAGTGCAGAGAAAGGGAACACTGGCTTCATCATTGTGATAATTCTAATTGCTGTCCTTGGCTCCAGTATGATCCTAGTGAGCATCTTCATTATAATCAAGAAAACAAGGAAACCAACAGGAGCACCTCCAGAGCTGAGTGGTGTCACAAACAACGGCTTCATACCACACAGTTAGTTAATTAAAAATAAAACAAAATTTGGGACAAATCATAATGTCTCGCAAGGCTCCATGCAAATATGAAGTGCGGGGCAAATGCAATAGAGGAAGTGAGTGTAAGTTTAACCACAATTACTGGAGTTGGCCAGATAGATACTTATTAATAAGATCAAATTATCTATTAAATCAGCTTTTAAGGAACACTGATAGAGCTGATGGCCTATCAATAATATCAGGCGCAGGCAGAGAAGACAGAACGCAAGATTTTGTTCTAGGTTCCACCAATGTGGTTCAAGGTTATATTGATGATAACCAAAGCATAACAAAGGCTGCAGC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| 15,509
|
LC769216.1
|
Metapneumovirus hominis
|
Sugimoto,S., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Hosoya,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
|
Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-05-30
|
hMPV_Fukushima_O962_2019_A2b
|
Metapneumovirus hominis
|
Metapneumovirus
|
Pneumoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,440
|
GenBank
| null |
Japan: Fukushima
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2019
| null | null |
Metapneumovirus hominis hMPV_Fukushima_O962_2019_A2b RNA, nearly complete genome
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AAAAAAACGCGTATAAATTAAGTTACAAAAAAACATGGGACAAGTGAAAATGTCTCTTCAGGGGATTCACCTGAGTGATCTATCATACAAGCATGCTATATTAAAAGAGTCTCAGTACACAATAAAGAGAGATGTAGGCACAACAACAGCAGTGACACCCTCATCATTGCAACAAGAAATAACACTGTTGTGTGGAGAAATTCTATATGCTAAGCATACTGATTACAAATATGCTGCAGAAATAGGAATACAATATATCAGCACAGCTCTAGGGTCAGAGAGAGTACAGCAGATTCTAAGAAACTCAGGCAGTGAAGTTCAAGCGGTTTTAACCAGAACATACTCTTTGGGGAAAGTTAAAAACAATAAAGGAGAAGATTTACAGATGCTAGACATACATGGAGTGGAAAAAAGCTGGGTGGAAGAGATAGACAAAGAAGCAAGAAAAACAATGGCAACTTTACTTAAAGAATCATCAGGCAATATCCCACAAAATCAGAGGCCTTCAGCACCAGACACACCTATAATCTTATTATGTGTAGGTGCCTTAATATTTACCAAACTAGCCTCAACTATAGAAGTGGGATTAGAGACCACAGTCAGAAGAGCTAACCGTGTGCTAAGTGATGCACTCAAAAGATACCCTAGAATGGACATACCAAAAATCGCTAGATCCTTCTATGACTTATTTGAACAAAAAGTGTATTACAGAAGTTTGTTCATTGAGTATGGCAAAGCATTAGGCTCATCCTCTACAGGCAGCAAAGCAGAAAGTTTATTCGTTAATATATTCATGCAAGCTTATGGTGCTGGTCAAACAATGCTGAGGTGGGGGGTCATCGCCAGATCATCTAACAATATAATGTTAGGACATGTATCTGTACAGGCTGAGTTAAAACAGGTCACAGAAGTCTATGATCTAGTGCGAGAAATGGGCCCAGAATCTGGGCTCCTACATTTAAGGCAAAGCCCAAAAGCTGGACTGTTATCCTTAGCCAATTGTCCCAACTTTGCAAGTGTTGTTCTCGGCAATGCCTCAGGCTTAGGCATAATAGGTATGTATCGAGGGAGAGTGCCAAACACAGAACTATTTTCAGCAGCAGAAAGCTATGCCAAGAGTTTGAAAGAAAGTAATAAAATCAACTTTTCTTCATTAGGACTCACAGATGAAGAAAAAGAGGCTGCAGAACACTTTCTAAATGTGAGTGACGACAGTCAAAATGATTATGAGTAATTAAAAAAGTGGGACAAGTCAAAATGTCGTTCCCTGAAGGAAAAGATATTCTTTTCATGGGTAATGAAGCAGCAAAATTGGCAGAAGCTTTCCAGAAATCATTAAGAAAACCTAGTCATAAAAGATCTCAATCTATTATAGGAGAAAAAGTGAGCACTGTATCTGAAACATTGGAATTACCTACTATCAGTAGACCTACCAAACCAACCATATTGTCAGAGCCGAAGTTAGCATGGACAGACAAAGGTGGGGCAATCAGAACTGAAGTAAAGCAAACAATCAAAATGATGGATCCTATTGAAGAAGAAGAATCTACTGAGAAAAAGGTGCTACCCTCTAGTGACGGGAAAACTCCTGCAGAAAAGAAGTTGAAACCATCAACCAACACTAAAAAGAAAGTTTCATTTACACCGAATGAACCAGGAAAATACACAAAGTTGGAGAAAGATGCTCTAGACTTGCTTTCAGACAATGAAGAGGAAGATGCAGAATCTTCAATCTTAACCTTCGAAGAAAGAGATACCTCATCATTAAGCATTGAGGCCAGACTAGAATCGATTGAGGAGAAATTAAGCATGATACTAGGGCTATTAAGAACACTCAACATTGCCACAGCAGGACCCACAGCAGCAAGAGATGGGATCAGAGATGCAATGATTGGCATAAGGGAAGAACTAATAGCAGACATAATAAAAGAAGCCAAGGGAAAAGCAGCAGAAATGATGGAAGAGGAAATGAACCAACGGACAAAAATAGGAAATGGTAGTGTTAAATTAACTGAAAAGGCAAAGGAGCTCAACAAAATTGTTGAAGATGAAAGCACAAGTGGAGAATCTGAAGAAGAAGAAGAACCAAAAGACCTACAGGACAATAATCAGGAAGATGACATTTACCAGTTAATTATGTAGTTTAATAAAAATAAACAATGGGACAAGTAAAAATGGAGTCCTATCTGGTAGACACCTATCAGGGCATCCCTTACACAGCAGCTGTTCAAGTTGATCTAGTAGAAAAAGACCTGTTACCTGCAAGCCTAACAATATGGTTTCCTTTGTTTCAGGCCAATACACCACCAGCAGTTCTGCTTGATCAGCTAAAGACTCTGACAATAACTACTCTGTATGCTGCATCACAAAGTGGTCCAATACTAAAGGTGAATGCATCAGCCCAAGGTGCAGCAATGTCTGTACTTCCCAAAAGGTTTGAAGTCAATGCGACTGTAGCACTTGACGAATATAGTAAATTAGAATTTGACAAACTAACAGTTTGTGAGGTAAAAACAGTTTACTTAACAACTATGAAACCATATGGGATGGTATCAAAATTTGTGAGCTCAGCCAAATCAGTTGGCAAAAAAACACATGATCTAATTGCATTATGTGATTTTATGGATCTAGAAAAGAACACACCAGTTACAATACCAGCATTTATCAAATCAGTTTCTATCAAAGAGAGTGAATCAGCCACTGTTGAAGCTGCAATAAGCAGTGAAGCAGACCAAGCTCTAACACAAGCCAAAATTGCACCTTATGCGGGGCTGATCATGATTATGACCATGAACAATCCCAAAGGCATATTCAAGAAGCTTGGAGCTGGGACACAAGTTATAGTGGAACTAGGAGCATATGTCCAGGCTGAAAGCATAAGTAAAATATGCAAGACTTGGAGCCATCAAGGGACAAGATATGTGCTGAAGTCCAGATAACAACCAAGCAACCTGATCAAGAACTATCAACTCTATTCTATAGACTAAAAAGTTGCTGTTTTAGTTATATAAAAATCAAGTTAGAGTAAGAATTAAATCAATCAAGAGTGGGACAAATAAAAATGTCTTGGAAAGTGGTGATTATTTTTTCATTGCTAATAACACCTCAACACGGTCTTAAAGAGAGCTACTTAGAAGAATCATGTAGCACTATAACTGAGGGTTATCTCAGTGTTCTGAGGACAGGTTGGTATACCAACGTCTTTACATTAGAGGTGGGTGATGTAGAAAACCTCACATGTGCTGATGGACCTAGCCTAATAAAAACAGAATTAGATCTGACCAAAAGTGCATTAAGAGAGCTCAAAACAGTTTCTGCTGACCAGTTGGCAAGAGAGGAACAAATTGAAAATCCCAGACAATCTAGATTTGTTCTAGGAGCAATAGCACTTGGTGTTGCAACAGCAGCTGCAGTTACGGCAGGTGTTGCAATTGCAAAAACCATCCGGCTTGAGAGTGAAGTTACAGCAATTAAGAATGCCCTTAAAAAGACCAATGAAGCAGTGTCTACATTGGGGAATGGGGTTCGAGTGTTAGCAACTGCAGTGAGAGAACTGAAAGATTTTGTGAGCAAGAATTTAACTCGTGCAATCAACAAAAACAAGTGCGACATTGATGACCTAAAAATGGCCGTTAGCTTCAGTCAATTCAACAGAAGGTTTCTAAATGTTGTGCGGCAATTTTCAGACAATGCTGGAATAACACCAGCAATATCTTTAGACTTAATGACAGATGCTGAACTAGCCAGAGCTGTTTCCAACATGCCGACATCTGCAGGACAAATAAAATTGATGTTGGAAAACCGTGCAATGGTGCGGAGGAAGGGGTTTGGAATCCTGATAGGGGTCTACGGGAGCTCCGTAATTTACATGGTGCAGCTGCCAATCTTTGGCGTTATAGATACGCCTTGCTGGATAGTGAAAGCAGCCCCCTCTTGCTCTGAAAAGAAGGGAAACTATGCTTGCCTCCTAAGAGAAGACCAGGGGTGGTATTGTCAGAATGCAGGGTCAACTGTCTACTACCCAAATGAGAAGGACTGTGAAACAAGGGGAGATCATGTCTTTTGCGACACAGCAGCAGGAATTAATGTTGCTGAGCAATCAAAGGAGTGCAACATCAACATATCCACTACAAATTACCCATGCAAAGTCAGCACAGGAAGGCATCCTATCAGTATGGTTGCACTGTCCCCTCTTGGAGCTCTGGTTGCTTGTTACAAAGGAGTAAGCTGTTCCATTGGCAGCAATAGAGTAGGGATCATCAAGCAGCTGAACAAAGGTTGCTCTTATATTACCAACCAAGATGCAGACACAGTGACAATAGACAACACTGTATATCAGCTAAGCAAAGTCGAGGGTGAACAGCATGTTATAAAAGGCAGACCAGTGTCAAGCAGCTTTGATCCAGTCAAATTTCCTGAAGATCAGTTCAATGTTGCACTGGACCAAGTTTTTGAGAACATTGAAAACAGCCAGGCCTTGGTAGATCAATCAAACAGAATCCTAAGCAGTGCAGAGAAAGGGAACACTGGCTTCATCATTGTGATAATTCTAATTGCTGTCCTTGGCTCCAGTATGATCCTAGTGAGCATCTTCATTATAATCAAGAAAACAAGGAAACCAACAGGAGCACCTCCAGAGCTGAGTGGTGTCACAAACAACGGCTTCATACCACACAGTTAGTTAATTAAAAATAAAACAAAATTTGGGACAAATCATAATGTCTCGCAAGGCTCCATGCAAATATGAAGTGCGGGGCAAATGCAATAGAGGAAGTGAGTGTAAGTTTAACCACAATTACTGGAGTTGGCCAGATAGATACTTATTAATAAGATCAAATTATCTATTAAATCAGCTTTTAAGGAACACTGATAGGGCTGATGGCCTATCAATAATATCAGGCGCAGGCAGAGAAGACAGAACGCAAGATTTTGTTCTAGGTTCCACCAATGTGGTTCAAGGTTATATTGATGATAACCAAAGCATAACAAAGGCTGCAGCC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| 15,510
|
LC769217.1
|
Metapneumovirus hominis
|
Sugimoto,S., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Hosoya,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
|
Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-05-30
|
hMPV_Fukushima_OR642_2022_B2
|
Metapneumovirus hominis
|
Metapneumovirus
|
Pneumoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,261
|
GenBank
| null |
Japan: Fukushima
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2022
| null | null |
Metapneumovirus hominis hMPV_Fukushima_OR642_2022_B2 RNA, nearly complete genome
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ATTCCAAACAAAACGGGACAAATAAAAATGTCTCTTCAAGGGATTCACCTAAGTGATCTGTCATATAAACATGCTATATTAAAAGAATCTCAATACACAATAAAAAGAGATGTAGGCACCACAACTGCAGTGACACCTTCATCATTGCAGCAAGAGATAACACTTTTGTGTGGAGAGATTCTTTACACTAAACATACTGATTACAAATATGCTGCAGAGATAGGGATACAATATATTTGCACGGCTCTAGGATCAGAAAGAGTACAACAGATTTTAAGAAATTCAGGTAGTGAAGTTCAGGTGGTTCTAACCAAGACATACTCCTTAGGGAAAGGTAAAAATAGTAAAGGGGAAGAGTTACAAATGTTAGACATACATGGAGTGGAAAAGAGCTGGGTAGAAGAAATAGACAAAGAGGCAAGAAAGACAATGGTGACTTTGCTAAAGGAATCATCAGGCAACATCCCACAAAACCAGAGGCCTTCAGCACCAGACACACCAATAATTTTATTATGTGTAGGTGCTTTAATATTCACTAAACTAGCATCAACAATAGAGGTTGGACTAGAGACTACAGTTAGAAGAGCCAACAGAGTGCTAAGTGATGCGCTCAAAAGATACCCTAGGGTAGATATACCAAAGATTGCTAGATCCTTTTATGAACTATTTGAGCAGAAAGTGTATTACAGGAGTCTATTCATTGAGTATGGGAAAGCTTTAGGCTCATCTTCAACAGGAAGCAAAGCAGAAAGTTTATTTGTAAATATATTTATGCAAGCTTATGGAGCCGGTCAAACAATGCTAAGGTGGGGTGTCATTGCCAGATCATCTAACAACATAATGCTAGGGCATGTATCTGTGCAAGCTGAACTGAAACAAGTTACAGAGGTTTATGATTTGGTGAGAGAAATGGGTCCTGAATCTGGGCTTTTACATCTAAGACAAAGTCCAAAAGCAGGACTGTTGTCGTTGGCTAATTGCCCCAATTTTGCTAGTGTTGTTCTTGGTAACGCTTCAGGCCTAGGTATAATCGGAATGTACAGAGGAAGAGTGCCAAACACAGAGCTATTTTCTGCAGCAGAAAGTTATGCCAGAAGCTTAAAAGAAAGTAACAAAATCAACTTCTCCTCACTAGGGCTCACAGATGAAGAAAAAGAAGCTGCAGAACACTTCTTAAACATGAGTGATGACAATCAAGATGATTATGAGTAATTAAAAAACTGGGACAAGTCAAAATGTCATTCCCTGAAGGAAAAGATATCCTGTTCATGGGTAATGAAGCAGCAAAAATAGCAGAAGCTTTCCAGAAATCACTAAAAAGATCAGGTCACAAAAGAACCCAGTCCATTGTAGGAGAAAGAGTAACCACTATATCAGAAACTCTGGAGCTACCTACCATCAGCAAACCTGCACGATCATCTACACCGCTAGAACCAAAATTGGCATGGGCAGACAGTAGCGGAGCCACCAAAACCACAGAAAAACAAACAACCAAAACAACAGATCCTGTTGAAGAAGAGGAACTCAATGAAAAGAAGGTATCACCTTCCAGTGATGGGAGGACTCCCGCAGAGAAAAAATCAAAATCTCCAATCAATGTAAAGAAGAAAGTTTCCTTCACATCAAATGAACCAGGGAAATACACCAAACTAGAAAAAGATGCCCTAGATTTGCTCTCAGACAATGAGGAAGAAGATGCAGAGTCCTCAATCCTAACCTTTGAGGAGAGAGACACATCATCACTAAGCATCGAAGCCAGACTAGAATCAATAGAAGAGAAGCTAAGCATGATACTAGGCCTGCTTCGTACACTTAACATTGCAACAGCAGGACCAACGGCCGCAAGAGATGGAATCAGAGATGCAATGATTGGCATAAGAGAAGAACTAATTGCAGAAATAATAAAAGAAGCAAAGGGAAAAGCAGCCGAAATGATGGAAGAGGAAATGAATCAAAGGTCAAAAATAGGCAATGGCAGTGTAAAACTAACCGAGAAGGCAAAAGAACTCAATAAAATCGTTGAAGACGAGAGCACAAGCGGTGAATCAGAAGAAGAAGAAGAACCAAAAGAAACTCAGGATAACAATCAAGGAGAAGATATCTACCAGTTAATCATGTAGTTTAATAAAAATAAACAATGGGACAAGTCAAGATGGAGTCCTATCTAGTGGACACTTATCAGGGCATTCCCTACACAGCTGCTGTTCAAGTTGATCTGGTAGAAAAAGACTTACTACCAGCAAGTTTGACAATATGGTTTCCTCTATTCCAAGCCAACACACCACCAGCGGTTTTGCTCGATCAGCTAAAAACCTTGACAATAACAACTCTGTATGCTGCATCACAGAATGGTCCAATACTCAAGGTAAATGCATCAGCTCAGGGTGCTGCTATGTCTGTACTTCCCAAAAAATTCGAAGTAAATGCAACTGTGGCACTTGATGAATACAGCAAACTTGATTTTGACAAGTTAACGGTTTGCGATGTTAAAACAGTTTATTTGACAACCATGAAGCCATATGGGATGGTGTCAAAATTTGTGAGTTCAGCCAAATCAGTTGGCAAAAAGACACATGATCTAATTGCACTGTGTGACTTCATGGACCTAGAGAAAAATATACCTGTGACAATACCAGCATTCATAAAGTCAGTTTCAATCAAAGAGAGTGAGTCAGCTACTGTTGAAGCTGCAATAAGCAGTGAGGCCGATCAAGCATTAACACAAGCCAAAATTGCACCCTATGCAGGACTAATCATGATAATGACCATGAACAATCCAAAAGGTATATTCAAGAAACTAGGAGCTGGAACACAAGTGATAGTAGAGCTAGGGGCATATGTTCAAGCCGAGAGCATCAGCAGGATCTGCAAGAGCTGGAGTCACCAAGGAACAAGATATGTACTAAAATCCAGATAAAATTAACTGTCCTAATCAATAATTGTTTATATAATCCTAAAGATCAATAAGCTTATTATTATAGTTATATAAAAATAATTTAGAACTAGAAAGGTATTAATAGAGAGCGGGACAAGTAAAAATGTCTTGGAAAGTGATGATTATCATTTCGTTACTCATAACACCTCAGCATGGACTAAAAGAAAGTTATTTAGAAGAATCATGTAGTACTATAACTGAAGGATATCTCAGTGTTTTAAGAACAGGTTGGTACACCAATGTCTTTACATTAGAAGTTGGTGATGTTGAAAATCTTACATGTACTGATGGACCTAGCTTAATCAAAACAGAACTTGACCTAACCAAAAGTGCTTTAAGAGAACTCAAAACAGTTTCTGCTGATCAGTTAGCGAGAGAAGAACAAATTGAAAATCCCAGACAATCAAGGTTTGTCCTAGGTGCAATAGCTCTTGGAGTTGCCACAGCAGCAGCAGTCACAGCAGGCATTGCAATAGCCAAAACTATAAGGCTTGAGAGTGAAGTAAATGCAATCAAAGGTGCTCTAAAAACAACCAATGAGGCAGTATCAACACTAGGGAATGGAGTGCGGGTCCTAGCCACTGCAGTAAGAGAGCTGAAAGAATTTGTGAGCAAAAACCTGACTAGTGCGATCAACAAGAACAAATGTGACATTGCTGATTTGAAGATGGCTGTCAGCTTTAGTCAGTTCAACAGAAGATTCCTAAATGTTGTGCGGCAGTTTTCAGACAATGCAGGGATAACACCGGCAATATCATTGGACCTGATGAATGATGCTGAGCTGGCCAGAGCTGTATCATACATGCCAACATCTGCAGGACAAATAAAACTAATGTTAGAGAACCGTGCAATGGTGAGGAGAAAAGGATTTGGAATCCTGATAGGGGTCTACGGAAGCTCTGTGATTTACATGGTCCAGCTGCCGATCTTTGGTGTCATAAATACACCTTGTTGGATAATCAAGGCAGCTCCCTCTTGTTCAGAAAAAGATGGAAATTATGCTTGCCTCCTAAGAGAGGATCAAGGGTGGTATTGTAAAAATGCAGGATCCACTGTTTACTACCCAAATGAAAAAGACTGCGAAACAAGAGGTGATCATGTTTTTTGTGACACAGCTGCAGGGATCAATGTTGCTGAGCAATCAAGAGAATGCAACATCAACATATCTACCACCAACTACCCATGCAAAGTCAGCACAGGAAGACACCCTATCAGCATGGTTGCACTATCACCTCTCGGTGCTTTGGTAGCTTGCTACAAAGGAGTTAGCTGCTCGACTGGCAGTAATCAGGTTGGAATAATCAAACAACTACCTAAAGGCTGCTCATACATAACTAACCAGGACGCAGACACTGTAACAATTGACAACACTGTGTATCAACTAAGCAAAGTTGAGGGTGAACAGCATGTAATAAAAGGGAGACCAGTTTCAAACAGTTTTGATCCAATCAGGTTTCCTGAGGATCAGTTCAATGTTGCGCTTGATCAAGTCTTTGAAAGCATTGAAAACAGTCAAGCATTAGTGGACCAGTCAAACAAAATCCTGAACAGTGCAGAAAAAGGAAACACTGGTTTCATTATTGTAATAATTTTGATTGCTGTTCTTGGGTTAACCATGATTTCAGTGAGCATCATCATCATAATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGCAGGGGCACCTCCAGAGCTGAATGGTGTTACCAACGGCGGTTTTATACCGCATAGTTAGTTAATTAAAAAATGGGACAAATCATCATGTCTCGTAAAGCTCCATGCAAATATGAAGTACGGGGCAAGTGCAACAGGGGAAGTGAGTGCAAATTCAACCACAATTACTGGAGTTGGCCTGATAGATATTTATTGTTAAGATCAAATTATCTCTTGAATCAGCTTTTAAGAAACACTGATAAAGCTGATGGTTTGTCAATAATATCAGGAGCAGGTAGAGAAGACAGGACTCAGGACTTTGTTCTTGGTTCTACTAATGTGGTTCAAGGGTATATTGATGATAATCAAGGAATAACAAAGGCTGCAGCTTGCTATAGTCTGCATAACATAATAAAACAGCTAC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| 15,511
|
LC769218.1
|
Metapneumovirus hominis
|
Sugimoto,S., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Hosoya,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
|
Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-05-30
|
hMPV_Fukushima_OR677_2022_B1
|
Metapneumovirus hominis
|
Metapneumovirus
|
Pneumoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,250
|
GenBank
| null |
Japan: Fukushima
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2022
| null | null |
Metapneumovirus hominis hMPV_Fukushima_OR677_2022_B1 RNA, nearly complete genome
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AAACAAAACGGGACAAATAAAAATGTCTCTTCAAGGGATTCACCTAAGTGATCTGTCATACAAACATGCTATATTAAAAGAGTCTCAATACACAATAAAAAGAGATGTAGGCACAACAACTGCAGTGACACCTTCATCATTGCAACAAGAAATAACACTTTTGTGTGGAGAAATTCTTTACACTAAACACACTGACTACAAATATGCTGCTGAGATAGGAATGCAATATATTTGCACAGCTCTAGGATCAGAAAGAGTACAACAGATTTTGAGAAACTCAGGTAGTGAAGTTCAGGTGGTTCTAACCAAAACATACTCCTTAGGGAAAGGTAAAAATAGTAAAGGGGAAGAGCTGCAGATGTTAGATATACATGGAGTGGAGAAGAGTTGGGTAGAAGAAATAGACAAAGAGGCAAGAAAGACAATGGTAACTTTGCTTAAAGAGTCATCAGGTAACATCCCACAAAACCAGAGACCTTCAGCACCAGACACACCAATAATTTTATTATGTGTAGGTGCCTTAATATTCACTAAACTAGCATCAACAATAGAAGTTGGATTAGAGACTACAGTTAGAAGAGCTAATAGAGTGCTAAGTGATGCACTCAAAAGATACCCTAGGGTAGATATACCAAAGATTGCTAGATCCTTTTATGAGCTATTTGAACAAAAAGTGTACTACAGAAGTTTATTCATTGAGTACGGAAAAGCTTTAGGCTCATCTTCAACAGGGAGTAAAGCAGAAAGTTTGTTTGTAAATATATTTATGCAAGCTTATGGAGCTGGTCAAACACTGCTAAGGTGGGGTGTCATTGCCAGATCATCCAACAACATAATGCTAGGGCATGTGTCTGTGCAATCTGAATTGAAGCAAGTTACAGAGGTTTATGACCTGGTGAGAGAAATGGGCCCTGAATCTGGGCTTTTACATCTAAGACAAAGTCCAAAAGCAGGGCTGTTATCATTGGCCAACTGTCCCAATTTTGCCAGTGTTGTCCTTGGCAATGCTTCAGGTTTAGGCATAATCGGAATGTACAGAGGGAGAGTACCAAACACAGAGCTATTTTCTGCAGCAGAAAGTTATGCCAGAAGCTTGAAAGAGAGCAATAAAATCAATTTCTCTTCGTTAGGGCTTACAGATGAAGAAAAAGAAGCTGCAGAACACTTCCTAAACATGAGTGGTGACAATCAAGATGATTATGAGTAATTAAAAAATTGGGACAAGTCAAAATGTCATTCCCTGAAGGAAAGGATATCCTGTTCATGGGTAATGAAGCAGCAAAAATAGCCGAAGCTTTCCAGAAATCACTAAAAAAATCAGGTCACAAGAGAACTCAATCCATTGTAGGAGAAAAAGTGAATACTATATCAGAAACTCTAGAACTACCCACCATCAGCAAACCCGCACGATCATCCACACTGCTGGAGCCAAAATTGGCATGGGCAGACAACAGCGGAATCACCAAAATCACAGAAAAACCAGCAACCAAAACAACAGATCTTGTTGAAGAAGATGAATTCAACGAAAAGAAAGTATTGCCTTCCAGTGATGGGAAGACTCCCGCAGAGAAAAAATCAAAGTTTTCAACCAGTGTAAAGAAGAAAGTTTCCTTTACATCAAATGAACCAGGGAAATATACCAAACTAGAGAAAGATGCCCTAGACTTGCTCTCAGACAATGAGGACGAAGACGCAGAATCCTCAATCCTAACTTTTGAAGAGAAAGATACATCATCACTAAGCATTGAAGCTAGACTAGAATCTATAGAAGAGAAGTTGAGCATGATATTAGGACTGCTTCGTACACTTAACATTGCAACAGCAGGACCAACAGCTGCACGAGATGGAATCAGAGATGCAATGATTGGCATAAGAGAAGAACTAATAGCAGAAATAATCAAAGAAGCCAAAGGAAAAGCAGCTGAGATGATGGAAGAAGAGATGAATCAAAGATCTAAAATAGGAAATGGCAGTGTAAAACTAACCGAGAAGGCAAAAGAGCTCAACAAAATTGTTGAAGACGAGAGCACAAGCGGTGAATCAGAAGAAGAAGAAGAATCAAAAGAAACGCAGGACAACAATCAGGGAGAAGATATTTATCAGTTAATCATGTAGTTTAATAAAAATAAACAATGGGACAAGTCAAGATGGAGTCCTATCTAGTGGACACTTATCAAGGCATTCCATATACAGCCGCTGTCCAAGTTGACCTGGTAGAAAAAGATTTACTACCAGCAAGTTTGACAATATGGTTTCCTTTGTTTCAGGCCAACACACCACCAGCAGTTTTGCTTGATCAGCTAAAAACCTTAACAATAACAACTCTATATGCTGCATCACAGAACGGTCCAATACTCAAGGTAAATGCATCTGCCCAAGGTGCTGCCATGTCTGTACTTCCCAAAAAATTTGAAGTAAATGCAACTGTAGCACTTGATGAATACAGTAAACTTGATTTTGACAAGCTAACGGTTTGTGATGTTAAAACAGTTTATTTGACAACTATGAAACCGTACGGGATGGTGTCAAAATTTGTGAGTTCAGCCAAATCAGTTGGCAAAAAAACACATGATCTAATTGCACTATGTGACTTCATGGACCTAGAGAAAAACATACCTGTGACAATACCAGCATTCATAAAGTCAGTTTCAATCAAAGAGAGTGAGTCAGCCACTGTTGAAGCTGCAATAAGCAGCGAAGCCGACCAAGCCTTGACACAAGCCAAGATTGCACCTTATGCAGGACTAATTATGATCATGACCATGAATAATCCAAAAGGTATATTCAAGAAACTAGGAGCTGGAACACAAGTGATAGTAGAGCTGGGGGCATATGTCCAGGCTGAGAGCATCAGCAGAATCTGCAAGAGCTGGAGTCACCAAGGAACAAGATACGTACTAAAATCCAGATAAAAATAACTGTCTTAATCAACAATTGCCTATATAACTCTAGAGATTAATAAGCTTATTGTTATAGTTATATAAAAATAAATTAGAATTATAAGGGCATCAATAGAAAGTGGGACAAATAAAAATGTCTTGGAAAGTGATGATCATCATTTCGTTACTTATAACACCCCAGCACGGGCTAAAGGAGAGCTATTTGGAAGAATCATGCAGTACTATAACTGAGGGATACCTCAGTGTTTTAAGAACAGGCTGGTATACTAATGTCTTCACATTAGAAGTTGGTGATGTTGAAAATCTTACATGTACTGATGGACCTAGCTTAATCAAAACAGAACTTGACCTAACAAAAAGTGCTTTAAGGGAACTCAAAACAGTCTCTGCTGATCAGTTAGCAAGAGAGGAGCAAATTGAAAATCCCAGACAATCAAGGTTTGTCCTAGGTGCAATAGCTCTTGGAGTTGCTACAGCAGCAGCAGTCACAGCAGGCATTGCAATAGCCAAAACCATAAGGCTTGAGAGTGAGGTGAATGCAATTAAAGGTGCTCTCAAACAAACCAATGAAGCAGTATCCACATTAGGAAATGGTGTGCGGGTCCTAACTACTGCAGTAAGAGAGCTAAAAGAATTTGTGAGCAAAAATCTGACTAGTGCAATCAACAGGAACAAATGTGACATTGCTGATCTGAAGATGGCTGTCAGCTTCAGTCAATTCAACAGAAGATTTCTAAATGTTGTGCGGCAGTTTTCAGACAATGCAGGGATAACACCAGCAATATCATTGGACTTAATGACTGATGCTGAACTGGCCAGAGCTGTATCATACATGCCAACATCTGCAGGACAGATAAAACTGATGTTGGAGAACCGTGCAATGGTAAGGAGAAAAGGATTTGGAATCCTAATAGGGGTCTACGGAAGCTCCGTGATTTACATGGTTCAATTGCCGATCTTTGGTGTCATAGATACACCTTGCTGGATAATCAAAGCAGCCCCCTCTTGCTCAGAAAAAAACGGGAATTATGCTTGCCTCCTAAGAGAAGATCAAGGGTGGTATTGTAAAAATGCAGGATCTACTGTTTACTACCCAAACGAAAAAGACTGCGAAACAAGAGGTGATCATGTTTTTTGTGACACAGCAGCAGGGATCAATGTGGCTGAGCAGTCGAGAGAATGCAACATCAACATATCTACCACCAACTACCCGTGCAAAGTCAGCACAGGAAGACACCCCATAAGCATGGTTGCACTATCACCTCTCGGTGCTTTGGTGGCTTGCTATAAAGGGGTAAGCTGCTCGATTGGTAGCAATCGGGTTGGAATCATCAAACAATTACCCAAAGGCTGCTCATACATAACTAACCAGGATGCAGACACTGTAACAATTGACAATACCGTGTATCAACTAAGCAAAGTTGAAGGTGAACAGCATGTAATAAAAGGGAGACCAGTTTCAAGCAGTTTTGATCCAATCAGGTTTCCTGAGGATCAGTTCAATGTTGCGCTTGATCAAGTCTTCGAAAGCATTGAGAACAGTCAGGCACTGGTGGAACAGTCAAACAAAATTCTAAACAGTGCAGAAAAAGGAAACACTGGTTTCATTATTGTAATAATCTTGGTTGCTGTTCTTGGTTTAACCATGATTTCAGTGAGCATCATCATCATAATCAAGAAAACAAGGAAGCCCACAGGAGCACCTCCAGAGCTGAATGGTGTCACCAACGGTGGCTTCATACCACATAGTTAGTTAATTAAAAAATGGGACAAATCATCATGTCTCGTAAGACTCCATGCAAATATGAAGTGCGGGGCAAATGCAACAGAGGGAGTGATTGCAAATTCAATCACAATTACTGGAGTTGGCCTGATAGATATTTATTGTTAAGATCAAATTATCTCTTAAATCAGCTTTTAAGAAACACCGATAAGGCTGATGGTTTGTCAATAATATCAGGAGCAGGTAGAGAAGATAGAACTCAAGATTTTGTTCTTGGTTCTAATAATGTGGTTCAAGGGTATATTGATGACAATCAAGGAATAACCAAGGCTGCAGCTTGCTATAGTCTACACAATATAATTAAGCAGCTACAAGAA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| 15,512
|
LC769219.1
|
Metapneumovirus hominis
|
Sugimoto,S., Kume,Y., Suwa,R., Kawase,M., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Hosoya,M., Hashimoto,K., Shirato,K.
|
Department of Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-05-30
|
hMPV_Fukushima_O709_2019_A2b
|
Metapneumovirus hominis
|
Metapneumovirus
|
Pneumoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,423
|
GenBank
| null |
Japan: Fukushima
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2019
| null | null |
Metapneumovirus hominis hMPV_Fukushima_O709_2019_A2b RNA, nearly complete genome
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ACGCGTATAAATTAAGTTACAAAAAAACATGGGACAAGTGAAAATGTCTCTTCAGGGGATTCACCTGAGTGATCTATCATACAAGCATGCTATATTAAAAGAGTCTCAGTACACAATAAAGAGAGATGTAGGCACAACAACAGCAGTGACACCCTCATCATTGCAACAAGAAATAACACTGTTGTGTGGAGAAGTTCTATATGCTAAACATACTGATTACAAATATGCTGCAGAAGTAGGAATACAATATATCAGCACAGCTCTAGGGTCAGAGAGAGTACAGCAGATTCTAAGAAACTCAGGCAGTGAAGTTCAAGCGATTTTAACCAGAACGTACTCTTTGGGGAAAGTTAAAAACAATAAAGGAGAAGATTTGCAGATGCTAGACATACATGGAGTAGAAAAAAGCTGGGTGGAAGAGATAGACAAAGAAGCAAGAAAAACAATGGCAACTTTACTTAAAGAATCATCAGGCAATATCCCACAAAATCAGAGGCCTTCAGCACCAGACACACCTATAATCTTATTATGTGTAGGTGCCTTAATATTCACCAAACTAGCATCAACTATAGAAGTGGGATTAGAGACCACAGTCAGAAGAGCTAACCGTGTGCTAAGTGATGCACTCAAAAGATACCCCAGAATGGACATACCAAAAATCGCTAGATCCTTCTATGACTTATTTGAACAAAAAGTGTATTACAGAAGTTTGTTCATTGAGTATGGCAAAGCATTAGGCTCATCCTCTACAGGCAGCAAAGCAGAAAGTTTATTCGTTAATATATTCATGCAAGCATATGGTGCTGGTCAAACAATGCTGAGGTGGGGGGTCATCGCCAGATCATCTAACAATATAATGTTAGGACATGTATCTGTACAGGCTGAGTTAAAACAGGTCACAGAAGTCTATGATCTAGTGCGAGAAATGGGCCCAGAATCTGGGCTTCTACATTTAAGGCAAAGCCCAAAAGCTGGACTGTTATCCTTAGCCAATTGTCCCAACTTTGCAAGTGTTGTTCTCGGCAATGCCTCAGGCTTAGGCATAATAGGTATGTATCGAGGGAGAGTGCCAAACACAGAACTATTTTCAGCAGCAGAAAGCTATGCCAAGAGTTTGAAAGAAAGTAATAAAATCAACTTTTCTTCATTAGGACTCACAGATGAAGAAAAAGAGGCTGCAGAACACTTTCTAAATGTGAGTGACGACAGTCAAAATGATTATGAGTAATTAAAAAAGTGGGACAAGTCAAAATGTCGTTCCCTGAAGGAAAAGATATTCTTTTCATGGGTAATGAAGCAGCAAAATTGGCAGAAGCTTTCCAGAAATCATTAAGAAAACCTAGTCATAAAAGATCTCAATCTATTATAGGAGAAAAAGTGAGCACTGTATCTGAAACATTGGAATTACCTACTATCAGTAGACCTACCAAACCAACCATATTGTCAGAGCCGAAGTTAGCATGGACAGACAAAGGTGGGGCAATCAGGACTGAAGTAAAGCAAACAATCAAAATTATGGATCCTATTGAAGAAGAAGAATCTACTGAGAAAAAGGTGCTACCCTCTAGTGACGGGAAAACTCCTGCAGAAAAAAAGTTGAAACCACCAACCAACACTAAAAAGAAAGTTTCATTTACACCGAATGAGCCAGGAAAATACACAAAGTTGGAGAAAGATGCTCTAGACTTGCTTTCAGATAATGAAGAGGAAGATGCAGAATCTTCAATCTTAACCTTCGAAGAAAGAGATACTTCATCATTAAGCATTGAGGCCAGACTAGAATCGATTGAGGAGAAATTAAGCATGATACTAGGGCTATTAAGAACACTCAACATTGCCACAGCAGGACCCACAGCAGCAAGAGATGGGATCAGAGATGCAATGATTGGCATAAGGGAAGAACTAATAGCAGACATAATAAAAGAAGCCAAAGGAAAAGCAGCAGAAATGATGGAAGAGGAAATGAACCAACGGACAAAAATAGGAAATGGTAGTGTTAAATTAACTGAAAAGGCAAAGGAGCTCAACAAAATTGTTGAAGATGAAAGCACAAGTGGAGAATCTGAAGAAGAAGAAGAACCAAAAGACCTACAGGATAATAATCAGGAAGATGACATTTACCAGTTAATTATGTAGTTTAATAAAAATAAACAATGGGACAAGTAAAAATGGAGTCCTATCTGGTAGACACCTATCAGGGCATCCCTTACACAGCAGCTGTTCAAGTTGATCTAGTAGAAAAAGACCTGTTACCTGCAAGCCTAACAATATGGTTTCCTTTGTTTCAGGCCAATACACCACCAGCAGTTCTGCTTGATCAGCTAAAGACTCTGACAATAACTACTCTGTATGCTGCGTCACAAAGTGGTCCAATACTAAAAGTGAATGCATCAGCCCAAGGTGCAGCAATGTCTGTACTTCCCAAAAGGTTTGAAGTCAATGCGACTGTAGCACTTGACGAATATAGTAAATTAGAATTTGACAAACTCACAGTCTGTGAGGTAAAAACAGTTTACTTAACAACTATGAAACCATATGGGATGGTATCAAAATTTGTGAGCTCAGCCAAATCAGTTGGTAAAAAAACACATGATCTAATTGCATTATGTGATTTTATGGATCTAGAAAAGAACACACCAGTTACAATACCAGCATTTATCAAATCAGTTTCTATCAAAGAGAGTGAATCAGCCACTGTTGAAGCTGCAATAAGCAGTGAAGCAGACCAAGCTCTAACACAAGCCAAAATTGCACCTTATGCGGGGCTGATCATGATTATGACCATGAACAATCCCAAAGGCATATTCAAGAAGCTTGGAGCTGGGACACAAGTTATAGTGGAACTAGGGGCATATGTCCAGGCTGAAAGCATAAGTAAAATATGCAAGACTTGGAGCCATCAAGGGACAAGATATGTGCTGAAGTCCAGATAACAACCAAGCAACCTGACCAAGAACTATCAACTCTATTCTATAGACTAAAAAGTTGCTGTTTTAGTTATATAAAAATCAAGTTAGAGTAAGAATCAAATCAATCAAGAGTGGGACAAATAAAAATGTCTTGGAAAGTGGTGATTATTTTTTCATTGCTAATAACACCTCAACACGGTCTTAAAGAGAGCTACTTAGAAGAATCATGTAGCACTATAACTGAGGGTTATCTCAGTGTTCTGAGGACAGGTTGGTATACCAACGTTTTTACATTAGAGGTGGGTGATGTAGAAAACCTCACATGTGCTGATGGACCTAGCCTAATAAAAACAGAATTAGATCTGACCAAAAGTGCACTAAGAGAGCTCAAAACAGTTTCTGCTGACCAGTTGGCAAGAGAGGAACAAATTGAAAATCCCAGACAATCTAGATTTGTTCTAGGAGCAATAGCACTCGGTGTTGCAACAGCAGCTGCAGTTACAGCAGGTGTTGCAATTGCAAAAACCATCCGGCTTGAGAGTGAAGTTACAGCAATTAAGAATGCCCTTAAAAAGACCAATGAAGCAGTGTCTACATTGGGGAATGGGGTTCGAGTGTTAGCGACCGCAGTGAGAGAACTGAAAGATTTTGTGAGCAGGAATTTAACTCGTGCAATCAACAAAAACAAGTGCGACATTGATGACCTAAAAATGGCCGTTAGTTTCAGTCAATTCAACAGAAGGTTTCTAAATGTTGTGCGGCAATTTTCAGACAATGCTGGAATAACACCAGCAATATCTTTAGACTTAATGACAGATGCTGAACTAGCCAGAGCTGTTTCCAACATGCCGACATCTGCAGGACAAATAAAACTGATGTTGGAAAACCGTGCAATGGTGCGGAGGAAGGGGTTCGGAATCCTGATAGGGGTCTACGGGAGCTCCGTAATTTACATGGTGCAGCTGCCAATCTTTGGCGTTATAGATACGCCTTGCTGGATAGTGAAAGCAGCCCCTTCTTGCTCTGAAAAAAAGGGAAACTATGCTTGCCTCCTAAGAGAAGACCAGGGGTGGTATTGTCAGAATGCAGGGTCAACTGTCTACTACCCAAATGAGAAGGACTGTGAAACAAGAGGAGATCATGTCTTTTGCGACACAGCAGCAGGAATTAATGTTGCTGAGCAATCAAAGGAGTGCAACATCAACATATCCACTACAAATTACCCATGCAAAGTCAGCACAGGAAGGCATCCTATCAGTATGGTTGCACTGTCCCCTCTTGGGGCTCTGGTTGCTTGTTACAAAGGAGTAAGCTGTTCCATTGGCAGCAATAGAGTAGGGATCATCAAGCAGCTGAACAAAGGTTGCTCTTATATTACCAACCAAGATGCAGACACAGTGACAATAGACAATACTGTATATCAGCTAAGCAAAGTTGAGGGTGAACAGCATGTTATAAAAGGCAGACCAGTGTCAAGCAGCTTTGATCCAGTCAAATTTCCTGAAGATCAGTTCAATGTTGCACTTGACCAAGTTTTTGAGAACATTGAAAACAGCCAGGCTTTGGTAGATCAATCAAACAGAATCCTAAGCAGTGCAGAGAAAGGGAACACTGGCTTCATCATTGTGATAATTCTAATTGCTGTCCTTGGCTCTAGTATGATCCTAGTGAGCATCTTCATCATAATCAAGAAAACAAGGAAACCAACAGGAGCACCTCCAGAGCTGAGTGGTGTCACAAACAACAGCTTCATACCACACAGTTAGTTAATTAAAAATAAAACAAAATTTGGGACAAATCATAATGTCTCGCAAGGCTCCATGCAAATATGAAGTGCGGGGCAAATGCAATAGAGGAAGTGAGTGTAAGTTTAACCACAATTACTGGAGTTGGCCAGATAGATACTTATTAATAAGATCAAATTATCTATTAAATCAGCTTTTAAGGAACACTGATAGAGCTGATGGCCTATCAATAATATCAGGCGCAGGCAGAGAAGACAGAACGCAAGATTTTGTTCTAGGTTCCACCAATGTGGTTCAAGGTTATATTGATGATAACCAAAGCATAACAAAGGCTGCAGCCTGCTAC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| 15,513
|
LC756671.1
|
Metapneumovirus hominis
|
Shirato,K., Suwa,R., Kawase,M., Kume,Y., Ono,T., Chishiki,M., Okabe,H., Norito,S., Sato,M., Sakuma,H., Suzuki,S., Hosoya,M., Hashimoto,K., Kawase,Y., Kume,M., Okabe,T.
|
Virology III; 4-7-1 Gakuen, Musashimurayama, Tokyo 208-0011
|
Japan
|
2023-02-22
|
hMPV_Fukushima_O230_2018_B1
|
Metapneumovirus hominis
|
Metapneumovirus
|
Pneumoviridae
|
ssRNA(-)
| 13,214
|
GenBank
| null |
Japan: Fukushima
|
Japan
|
Homo sapiens
| null |
2018
| null | null |
Metapneumovirus hominis hMPV_Fukushima_O230_2018_B1 RNA, nearly complete genome
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| 17,896
|
OQ709394.1
|
Microviridae sp.
|
Cao,L., Wang,X.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2023-11-06
|
SHu7-1
|
Microviridae sp.
| null |
Microviridae
|
ssDNA(+)
| 6,223
|
GenBank
| null |
China: Zhenjiang, Jiangsu
|
China
| null |
feces
|
2019-12
|
SAMN33735046
|
PRJNA944100
|
MAG: Microviridae sp. isolate SHu7-1, complete genome
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|
Jiangsu University, School of Medicine
|
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|
2023-05-02
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Microviridae
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|
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2019-12
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|
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|
Cao,L., Wang,X.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
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|
2023-05-02
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2023-05-02
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2019-12
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|
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|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2023-05-02
|
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|
Microviridae sp.
| null |
Microviridae
|
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|
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|
China
| null |
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|
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|
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|
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| 16,225
|
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|
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|
Cao,L., Wang,X.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
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|
2023-05-02
|
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|
Microviridae sp.
| null |
Microviridae
|
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| 6,427
|
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|
China
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feces
|
2019-12
|
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|
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|
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|
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| 16,226
|
OQ709385.1
|
Microviridae sp.
|
Cao,L., Wang,X.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2023-05-02
|
SHu4-1
|
Microviridae sp.
| null |
Microviridae
|
ssDNA(+)
| 5,888
|
GenBank
| null |
China: Zhenjiang, Jiangsu
|
China
| null |
feces
|
2019-12
|
SAMN33735046
|
PRJNA944100
|
MAG: Microviridae sp. isolate SHu4-1, complete genome
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Microviridae
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Jiangsu University, School of Medicine
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Microviridae sp.
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Microviridae
|
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GenBank
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|
China
| null |
feces
|
2019-12
|
SAMN33735046
|
PRJNA944100
|
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Jiangsu University, School of Medicine
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2023-05-02
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Microviridae
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China
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|
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Microviridae sp.
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Cao,L., Wang,X.
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Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2023-05-02
|
SHu5-4
|
Microviridae sp.
| null |
Microviridae
|
ssDNA(+)
| 6,131
|
GenBank
| null |
China: Zhenjiang, Jiangsu
|
China
| null |
feces
|
2019-12
|
SAMN33735046
|
PRJNA944100
|
MAG: Microviridae sp. isolate SHu5-4, complete genome
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Microviridae
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2019-12
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| 16,238
|
OQ709399.1
|
Microviridae sp.
|
Cao,L., Wang,X.
|
Jiangsu University, School of Medicine
|
China
|
2023-05-02
|
SHu8-3
|
Microviridae sp.
| null |
Microviridae
|
ssDNA(+)
| 6,127
|
GenBank
| null |
China: Zhenjiang, Jiangsu
|
China
| null |
feces
|
2019-12
|
SAMN33735046
|
PRJNA944100
|
MAG: Microviridae sp. isolate SHu8-3, complete genome
|
ATGAGTGATTTTAATCCGCTAGACCGAGCGAAAGTTGCCGTTCATCGCTCCTCCTTTGATTTGTCTAGTAAAAAATTATTTACGGCAAAAATTGGAGAGATTCTTCCTTGTTATTGGCAGATTGCTATTCCTGGTAACAAGTATCGTATTTCTTCCGACTGGTTTACTCGTACCGTTCCCGTTAATACGGCCGCATATACCCGTATCAAGGAGTATTATGACTTTTACGCTGTGCCGTTACGCTTGATTTCTCGTGCTCTTCCTCAGGCGTTTACCCAGATGTCGGATTATATGACGTCTGCCGCTTCTAATTCTGCTAATACGGAGCAATTGTCTAGCGTTCCTTATGCACCTGTTGGTAATATTTCTGCCGAGATTCAGGCCCGTGTAACTGCTGGTACTGTTGATGATTCTGGTTTCGGCTTTGCTTATGGTTCTTGTAAGTTGCTTGATATGCTTGGTTATGGTTCATTCATTGGCACTGGTAATGTTAAGAAAAAGGATATTACTATGCAATATCTTGGCCTTGATACTGATTCACTGGCTGATGGTCAAAATCCTCTTATTTATGGTACTAGTGTTAATTTGAATCTCCTTCCTATTTTCGCTTATCAGAAGATTTATTTCGATTTCTATTCTAACTCCCAATGGGAGAAACATTTGGCTTATGCTTATAATGTTGACTATTGGAATGGTAAGGGTTCTATTGAAATTTCTGCTGATATGATTAAACTTCGCTATGCGAATTATCCTAAGGATTATTTCCTCGGTGTTCTTCCTTCTTCTCAGTATGGTTCGGTAGCTAGTTTGCCGTCTGTTCACTCTCAAACTGAGGACCCTACTAGAATATTCGTTTTTTCTCCTAAATCTGCTCCTTATAATGGCTTACTTCAGAACGAGCCGAATACCTCTGATGTTACTGTTAATAATCAGAATAAATCTAATGTTCGTTATGCGACGCTTAACTCTGACCTCTCCGCTCTTTCACTCCGTGCAACGGAGTATTTACAGCGCTGGAAAGAAGTAGTTCAATTTAGTAGTAAGGACTATTCAGACCAGATGGCCGCCCAGTTTGGCATTAAGGCTCCCGAATATATGGGTAATCATTCTCATTATATTGGAGGTTGGTCTAATGTTATCAATATTAATGAGGTTCTGAATACTAACTTGACTGCTGATAACTCTCAAGCTGTTATTGCTGGTAAAGGTGTTGGTTCTAAGTCTGGTCATGTTATTAATTATGATTGTGGTGCTGAACATCAGGTAATTATGTGTGTTTACCATGCTGTTCCTTTGCTCGACTGGTCTCTTAAAGGCCATAATCCTCAGTTACTATGCACATCTGTTTCTGATTTTCCCCAGCCTGCTTTTGACCAGTTAGGTATGCAACCTGTTCCTTCTCTGGCGCTTAATAACAGTCCGTCTTCTCCTACTGGTAATATTGGCTATAATCTTCGTTATTGGCAGTGGAAATCTGCTGTTGATACGGTTCACGGTGCATTTCGTCCTGCTGCTGCTTATCAATCTTGGGTTGCGCCGCTTCAAGGTTCTCAGGTTCAGGTTTCTGGTCAGTCTTCATTTAGTTATCAGTCATTTAAGATTCGTCCTCAGCAGCTGAATTCTATTTTTGAGCCGCAGATTACTACTAGTAATTATAATGTGGCTTATGACCAGTTATTATGTAATGTTAACTTCCAAGTGTATGCTGTGCAGAACTTGGACAGAAATGGTTTACCTTATTAATTTGTGTTGTTATGAGAAGTTTTGCTTATTTGAATCCTGATTTTGAGCAGGATAGTGTAGTTCCTGAATTGGTTGAGGGAAATCCCTGTTACGAAGCTAGTGTATATGATTCGGTTATGCTGGAGGAATTGTCTGACGGCTCGTATATGTATATGGATATGACTTCTATTCTTCTTAATCAGGAGAAGTATCGTCGTCTTCTTGGCGATATGAATGTGAATAATATTTTAGCTCAGATGCATCCTACTCAGTCTACTGCTATGGATAATATGACTGATGAGGAACGATTTAACTGTGTCATTTCTCGACACTGTCAAACTATGTCCGAAAGGCAAGCTGTTCTTCAACAGTTAGCTAGTGAGAAGTCTGAATTGTCTGCTTTTGCTGAATCTATGTTGGCAGAGACTAAGGCAGCGCCATCCTCGGATTCCGCACCTGCCTCTAGTGCTCAATGATTGGTTCAATGTTTGGTAGCATGATTAATGCTATGTCGCAGTCCAATGCGAATGCGTCCAATGAATTAATTGCTACACAGAATCGTCAGGCTGCCCAGCATGAAGCCTATTTGTCTCGGCAATGGCAGAAGTATATGGTTGATTATCAGAATCAGTACAATTCTCCTGCTGCTCAGATTGCTCGAGGTTTGAATCCATTTGTTAATTCCACTGGTGCGGGTACTTCTGCTTCTCCTGGTTCTTCTCCTCAGGCCACTATTCCCTCTACTCCTGCTATGCAAGGTGTCCATGTAGATTTGTCCGGTATTGACTCTGCATTGGCGACGTTTGCCCAGGCTCGGAAAGCTATATCTGAATCTAATCAGGTTAATACTCTTACTCCCCTCTTAGCTAGAAAAATTATGGGAGACACTAATTATAAAAATATTGGTGTAGGTGAGTCTGGTTATTGGGACTCTAATACTGGTCGTATTTCTGCTGAGCTGGACCAGTCTAGAGAACGTCAGGAGCTTGAAAATGCGGTTGCTGCCGGTAAGTTGTCTGCCGCTCAGACGTCGCATATTTACCTACAGGCTGATGCTCAACATATTCTTAATAAGTATATGGATTCTCAGCAGCAAGCGGATTTGCTTACTAAATCTCAGTATTTGTATAATCTTGTTCAACAAGGTGCTCTAACCGAGAAACAAGTTAAGACTGAAATTCAACGTGCAATCCTGATAGCTGCTCAGGCCCAAGGTCAGAAGATTTCCAATGAGATAGCCTCTGGTACTGCTGACGCCCTGATTTCTGCTACGAATATGGCTTTCTATACACAGTATTATGATTCTCTCTGGGATTACAAGAATGTCAATAATCGTAAAAATATGCAGTATTCTAAGGATAAAGCTATTCGTGATTATTACAAGTGGTCTGCTGGTAATGCTAAGAAAGATTTTGATTCTTATGGCCTGCGTAATGCCGTGGATTATACATCTCGTATTTTTCAAGGTGCTGGTAATATAATTGGAGCTATGCGTCCTGGTGCTCAGATTTTCCGTAATGATTACGGTCCTCGTAACACTACTATTTATAATGGCTCTAATGGTATTGGTTATTAGCTGTTAACGTACTTTAGGACTAAGAGCCCATCGCGGCTCTGGAGCGATATACACCCGCCGCCTGCGTAAGGCCTGGTATAAAATGGAGCGGAGCGACTTCCTTAGAGAAGCGTTCCGCTTCGGTATTTTAGCACGTAGGTGCGCAAAGGCAGGTTCTATCTGACCTGCCGTGCCTATACACCCTGTTTACATCTACTTTTAATCATGCGAAGCCCCTAGTTGTGTCCGAAGGAAATTTGAGTTATCATCTCAAATTCGACCCCCTCTTGTCTATAAACGCACAACTCACACTCTAACCGTAGAATAAAAAAACTCCGAAATATTTTGTTTATTCAAAAATAATTCTTTCCTTTGCCCCTGTAGAAACCAACTCATTAAATTATTAACATTTAAAATCTTACAATTATGCAGAAATTCATTATTTCTTTAAAAGAAAAACAAACTGGCCGTGATGTTATGCCGCCTTATATTGTCAATTCTCTGGATGGTCTTGGAAACTATTCTGAGCGAGTTTCTCCGTTGGGTCTTATTGTTATTGTGGATTCAATTAAAGAGGAAAATAATTTCGTGGAACTTAAATCTCAATCTGATGAAAAGTAATAATATTTGGAAGATTATTATAGGTGCTGTTTCTGCTGCTCTTGGTTACGTACTTAATGCTATTGGACTATGAACTATACTCTTATGCATTTTCTTGAGTACTTGTTGTATTCTAATGTTCATTTTTCCGTAACTAGTGCCAGGCGTACTCCTGAGCAGAATAAAGCTTGCAATGGTGCTCCGAATTCTCAGCATCTTGTAGGTGAAGCTGTTGATATTAAGCCTTATGGTTCTACTACGTTTAATAAGTTGCTTGAAGAGATTCATTTTTTCTCTGATAATGTTTCGCCATTCGACCAGCTTATTATATATCCGACATTTATTCATGTTTCATTCTGCTCTCGTAATCGTCGGCAGGTGATAGATAAACGTAAATAATTATGAAATACTCGCCAGAATTGCTTAAAGCTGCTGATTACTGTCAGCATCGCTCATTTATTACCAACAAATATACTGGTAAGCGTATCGCTGTAGATTGCGGTCAATGTGACTACTGTATCCACAAGCGAGCTCAAAAGGCGTCCATGCGCGTGAAGACCGCTGGAAGTGCCTTCGAACATTGTTGGTTTGTTACGCTCACCTATGATAACGAGCACATTCCGTTGTTTAATTGCGAGGTGTACCACTCTGAATACGACGATGTTTTAAGTGATTCTGGCGTTGTTTATGGTTATGAAAAACATTCTTATACCCCTGTTTCTGACTATCAACCTGAGGATTCTTCCCTTTTACGTCATATATTCTTCACGCAAGTTCAAGGTACAGTGCCGTTTGACCGTGAGAGCAAGGAATATGTTCCTGTTAAGGATAATTGGTTTCTTAGTATGGATGCTATTCGTAGTTTTATCTGTAAAACGCAGGCCGTTGACAATTCAGTATATCCCGTTGCTGAAAAATACGGTGTTGATAACCTTATACCCTTTCTAAATTATGTTGATGTTCAGAACTATATTAAACGCTTACGTAAACATTTGTATCAAATTTTAGGTTCTTATGAAACGTTACACTTCTACGCTGTGGGTGAATACGGACCAGTCCATTTCCGCCCGCATTATCATATCTTATTATTCTCAAACTCGAAAAAAGTCTCGGAGGTATTACGACAGTGTCATGATAAGAGTTGGAAACTCGGTCGTTCAGATTTCCAGATTGCCCGTGGTGGAGCTTCATCATACGTTGCGAGTTATGTTAACAGCCTTAGTTCTGCTCCCTTATTATATCGAGCATGCAGCTCATTTAAACCCCGACAAAGAGCGTCTCTTGGATTTTTTGAAAAAGGCGAGGTTTACGAGGAAGGTGAAGACGTCTATCATGCGATTGAGCAAAAAATCGATTCTGTCATTAATGGACGAATCTATAACTTCAACGGGATTAGTGTTAAGTCAACTCCCCCCTTGTCGTATATCCGTACCTTATTGCCCCGATTCTCAAGTGCTCGCTATGACGATGCTGTTGCGATTGCTAGAATTATTCGAGCTGTTGCAGATGCGCCAAAAAGAATCGCAAGGTTTGGTATTATAGATTATAATTCCGATTCTACCCTTTCTATTGTTCGTGCTTATTATCAATATATTACCTTAAATCATCATTTAACTAATGAAGACGAAATTGTTTTACATTCTGCTCGGTGTCTTACTAGGCTCTGTAACAGTTCTTCTGATGTCGATATTAAATCTTATATTAATAAGTTATATCGGCTATTCCTTTATGTCAGTAAGTTCTTTAGGAATTGGCATCTGCCTCCCATCGGTGGTAATCTTGATTCTTATGCCAATCGTATTAATTTTATCATTAAAACAGGTATAGAGTATGAAAAAAAAGCGGACTATGTACGAATGTGTGATTCGTTGCGAATACAAGCGGCATGTGAATTCCCTTTATTGCGATATTTTTACTTACCAGCCTCAGGATGTGAGAGGTCAATCGTTAAAGAGGAAGAAGATGGAACATTTTCCACGTACACTATTCGAGACAGAATGGCAGGAATCAAGCCAGTCGTCTTACATTTTGATGACCCCCGAAAATTATTACTTTCCCCAGCTCTTTCTCGTCTGGTCGGACCATCCTTTAAAGCCTCGCAACCTTCAAATTACAACGATATGTGCGACGACTTACAAAGGTGTCTGGATAACCGTGCATCGACATACTGCCGTGATATGATTAAACACAAGAAGTTAAATGACGCTAATAATATATTTAACCGTATGGTCTAATTTAAATTAATTAATT
| 16,239
|
OP971936.1
|
Microviridae sp.
|
Demoliner,M., Filippi,M., Gularte,J.S., Silva,M.S., Almeida,P.R., Pereira,V.M.A.G., Spilki,F.R.
|
Feevale University, Laboratorio de Microbiologia Molecular
| null |
2023-01-24
|
LMM67716
|
Microviridae sp.
| null |
Microviridae
|
ssDNA(+)
| 5,253
|
GenBank
| null |
Brazil
|
Brazil
| null |
feces
|
2022-08
| null | null |
Microviridae sp. isolate LMM67716, complete genome
|
ATGAACAGAAACACCGAATCCCATTTCAGTTTGTCCCCCCATGTAGATATCTCCCGTTCTCGCTTTGATCGTTCCGCTTCCCTGAAGACCTCGTTTAATGCTGGTGATGTAGTCCCTTTTTTCCTCGAAGAAGTGCTTCCCGGCGATACGTTCAGCGTAGATACGTCCAAGGTTGTCCGKATGCAGACTYTKCTCACSCCTATGATGGACAATGTCTATCTGGATACCTACTATTTCTTTGTCCCCAACCGGCTTGTTTGGGATCATTGGAAGGAGTTCTGTGGTGAGAAYACYGAAAGCGCATGGATTCCGCAGACTRMGTACTCTATGCCCCAGATTACAAGCCCAGCTGGTCAAGGATGGAGTGTTGGAACTCTTGCTGACTATTTTGGCATCCCAACTGGCGTTGCTGGTCTCTCTGTGTCTGCTTTGCCCTTTAGAGCCTATGCCTTGATCATAAATGAGTGGTTCCGTGACCAGAACCTCCAAGACCCTCTTGTTGTTCCCACGGATGATAGTACCGTGGCCGGTGTCAACTCTGGCACATTCGTGACAGATGTGGCCAAGGGCGGTAAGCCCTTCATCGCCGCCAAGTACCATGACTATTTCACTTCTGCTCTCCCTGCTCCTCAGAAAGGCCCTGATGTAACGATTCCTGTTGCTACTGGTGGAAATATTAACATCGTTGGTAATGGTAAGGCTCTTGCTATTACTGATGGTACTGCTTTAGGTTCTTGGGCTGGTCTTAGAGATAGCCGTTATAGTGTTAATTATGCTGTGAATCTTGGTTTAGATGTTGGTTCTGTTTCTTCTGATAATGGTGGTTTTGCTATGGTTGATGCTGGTAAGGCTGTTGGTGTTCCAACTCTTGATCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTCTGGTTTGAYTGKTRWYSAKKSTKCTRTTKCYNNNGYYGCTACSATYAAYCAGCTTCGTHYTGCTTTCCAGATTCAGAAGTTTTATGAACRGCAGGCCCGTGGCGGTTCTCGTTATACTGAGRTTGTYCGCTCTTTCTTCGGTGTAACGTCTCCCGATGCACGTCTTCAGCGCCCTGAATATCTTGGCGGTAACAGAGTTCCTATTAACATCAATCAGATTGTCCAGCAGTCTGGCACGGAATCTTCTGGTACGCCGCAAGGTACCGTTGTTGGTCAGTCTCTTACTACCGATAATCATTCCGACTTTACTAAGTCTTTCACGGAGCATGGYTTKATCATYGGCGTTATGGTTGCTCGGTATGATCATACCTATCAGCAGGGCCTCAATCGGCTCTGGTCTCGCAAGGATAAGTTTGATTTCTATTGGCCCGTTTTTGCTAATATTGGCGAACAGGCTATCAAGAACAAGGAAATCTTTGCACAAGGTACGGATAAGGATAATGAAGTCTTTGGCTATCAAGAAGCTTGGGCCGAATATCGTTACAAGCCCAATATGGTGACCGGTGAAATGAGGTCTTCTTATGCTCAGTCTTTGGACGTTTGGCATTTGGCTGATGATTACAGCACCCTTCCTTCTTTATCTGATTCGTGGATCAGAGAGGACAAGGCAAACATTGATCGTGTTTTGGCTGTTACATCTGCTGTTAGTAATCAGTTTTTTGCTGACATCTATGTGAAGAACTATTGTACCCGGCCCATGCCCATGTACAGCGTCCCCGGCCTGATTGATCATCATTGATTCATAGAGGGGGCTTTTGSCCCCYCTTGTTTTWTYYGAAAGGAGTNGTTATAATGGCWTTTGGTACMACTACKASYGCTTAYGARATGGATGGTGTTGGAGYAGCTCCGNNNGCTGTTAATAATGCCGCTGACCAAATTGCTCGCTTGAAAGGTGTTGCGCAGTCTAATTCTGCTTTTAATGCTGAGCARGCAAAAGTGCAACGTGATTGGACAGAGCAAATGACTGCTAAACAGATGGAGTTTAACTCTGCCGAAGCCGCTAAAAATCGTCAGTGGCAAGAAATGATGTCYRATACTGCKCAYCARCGTGARGTKCGTGAYCTTATGGCCGCYGGTYTKAATCCTGTTCTTTCTGCTATGAATGGCAACGGTGCCGCTGTTGGTTCTGGTGCGACCGCTTCAGCGTCCCTTGGAAGCGGTTCTAAGGCTGACGCAGATACAGCCGCCTCTGGTGCTATTGCTAACTTGCTTGGCTCTATCTTGGGCGCTCAGACGGCGTTACAGAGTGCAAATATTAACGCCCGTACACAGGAAGCCGTTGCAGACAAGTATACTGCTATGGAGCATATTGTTGCTCAGATCGCCGCCGCCGCTGGTATTAAGCAAGCTGGCATTCACGCCGGTGCTACTCGTGATGCCGCCGCTATGAGTTCTTCTGCCACTCGTTATGCTGCTGGTCAGGCTGCTTTAGCGTCTATCTTTGGTTCTTCGGTTAATTCTGCTGCTACTCGGTATTCTGCTGATCAACATTTATCTGGTACAAAGTATGGAGCAGATAAGTCCTATGACGCTTCCAAGTATGCTTCTGATATCAATTGGGATAAGGCCGTTCATTTTGGTAACGGTAGTTTGTTGAATCAGCTTGCCGGTAATATTGGTTTGTCGCTTGAAAGTCTTTTAAAAATGATTGGAGGTTAAATATGGAAAGTATCATCATGGTTTTGTCTTTGTCCGTAGTTACGGCCGCTACTCTAAAAATCATAAAAGAAATTTTTTCTTAAAAAGCGGCGTCAGCCGCCAAAAGAGACCCACGGTCTAAACGCCGTGGGTCTCCGCCTGTACGTCCATTTACATTAGGCGTACACTCAGCACAGTTAACTCTCTTGATGTTAACTGTGCTGAGTGACACCAAAGGTCMCTTTGCGTGTCATAGTAATAAGTTGCTTGCACATGTCTAGAACGTATGCAGTATTTCAAGATAAAATGTTTAGTAGGAGACCCCCGTAGGATACAAGTTCCTAAAAAATAATAGATAATAAAGCCTAAAATTTAATGGTAAACTGAAATAGAAGTATATTCTTGGTTTCGTGCACATTTGTGCATTTAGCCTAGAACTAGGCCGAAATCTTTAGTAAATAAGCAAATTGATATTTTTGTTCAATTGTACTATTATCGCCTTATAGGAGGTGANTTTTTTTATGCGTCCCCGTCTTGTGCGTTATTACGGCCCTGATTATGACAATCTTAAACATGGTCACGTCTATCAGGTACACTGTCTTTATTCCCATGGCTTCATGCTCATTGATGACTACCATGAACAGGCATATGTTTATGCCGGAAATTGTGAGGTGCTATGAGTGCCTTGTTATCATCCCATTTACGCCGTCCGTATCGGCACTAAGGAAAACGGAAAAGCTGAGTTAAAAATGCTTGGCTATACCCCGGATGACCGTGAAACCTATGTCGAGTGGCACAATCACCGCTATCCTCGTTCCGCTCTCGTTCCACTGCCCTGTGGTCAGTGTATCGGATGCCGCATTGACTATTCAAGGCAATGGGCAAACCGTTGTTTGCTTGAACTTAAGTACCATGATTCCGCTTGGTTCTGCACTTTCACCTATGATGATGACCACGTCCCTCGTACTTATTACCCTGATCCTGAAACTGGTGAAGCTATTCCAGCTTTGACCTTACAGAAGCGTGATTTCCAACTTTTGATGAAACGTATTCGGAAAAAATTCGAAGATGATAAAATTAGGTTCTTTGCGTCCGGCGAGTACGGTTCTAAGACGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGTTTACACCTTGATGATCTTCAGCCCTACAAGACCGTCAAGGAAGGAGGTGAGTATTACACTTACTATAACAGTCCCTCGCTCCAAGAGTGTTGGCCTTATGGCTTTGTAGTTGTTGGTGAAGTTACTTGGGAATCTTGTGCTTATACTGCTCGCTACGTTATGAAAAAGTTGAAAGGAAAGGAAGCTAAGTTTTATGTAGACCACAATATTCAGCCTGAGTTTACACTCATGTCCCGAAAGCCTGGTATTGCACGTCAGTATTTCGACGAAAATCCTCAGTGTGTTGAAGAACAGTATATCAACGTTTCTACGCCGAAAGGCGGCAAGAAGTTCCGTCCGCCGAGGTACTATGACAAACTCTTCGACATTGAATGTCCAGAAAAGTCAGCAGAGTTAAAAGCCCTTCGTGCTAAGTTGGCCCAACAGGCCATGGAAGCTAAATTGTCTAATACGTCCCTCGATTCCTACGAACTGCGGGACGTTGAAGAAGAAAAACAGACCAACCGTTTAAAATCTTTAAGGAGGAATTTGTAATGAAGATGCTCAAGCGTAAAGACAAGAAGGTGTTTTCTCGAACCGCCGCCAAGTCTAAGAAAATCAACATCGCCCCTAAGATTTTCCGTGGAGGTATCCGGCTGTGAGTTTTGAWKNTAATTGTTCTTGTTGATGGGAACTGAGTTGCTATTGTTCCCTTGTGGATGGTCAAACATGCTATTGAGGATTCTGTTGCTCAGTATCCTGATAAACAAATTATTTTGGAGGTTTCAAGNNNATGATTACCGGTATCTATGCTATTAAGGACGCCAAGTCTACGTTCATGCCCTGCACCGTCGATGTAAATGATGCTACCGCTGTCCGTAACTTTGAACATGCTGTTAGACAGTCTGATTCCTTGCTCGCTTCGCATCCCAACGATTTCGCTTTGTATAAGCTCGCTACCTACGATAACGTCGGCGGCTATATTGAGCCGCTTAACCCCCCTTGCCAGCTTTGTGACGCCGCCCAGTGTCTTGTAAAGGAGTGATTTGATGGAGTTTAAAACCCAGTATGATGCCCGTGACCGCATTTTTTCTGACCCCGGTTCTCCTGAGCATATCACCTATGCCGGCCACTATGACGAAAAAGGCCGTGTAGTCCTTGAAGAATCTGGCCGTGAAAATCTGTATGACTATATTCAGTCCTATGCTGAAAGCTGTGATATTCATGTTCTCATGAAGCGCTATGCTAACGGCGATGTTGACGCTTTGTCTCAGAAGCAAGGTTTCTATGGTGATTTTCTCGACTTCCCGAAGACCTACGCCGAAGCCCTCAACCACATGAATGAAATGGAACGTCAGTTTATGGCTCTGCCTGTGGAAACTCGTGAGAAGTTCGGCAACAGCTTTACTGAGTTTCTTGCCGCTTCTGGTGAAGCTGATTTCCTCGAGCGGCTCGGAATCAAGAAAGAACCTGTTGTTGAGCCTGTCTCTGCTATTTCTCATGTTGAAACTAAGGAGGTTNACGAATGA
| 19,198
|
OX614181.1
|
Microvirus sp.
|
Roach,M.
|
Flinders Accelerator for Microbiome Exploration, Edwards lab, Sturt Road, BEDFORD PARK, 5042, SA
|
Australia
|
2023-05-31
| null |
Microvirus sp.
| null |
Microviridae
|
ssDNA(+)
| 6,089
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
| null | null |
2016
|
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|
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|
Flinders Accelerator for Microbiome Exploration, Edwards lab, Sturt Road, BEDFORD PARK, 5042, SA
|
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|
2023-05-31
| null |
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|
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USA
|
USA
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|
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|
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2023-05-31
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Microviridae
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USA
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Flinders Accelerator for Microbiome Exploration, Edwards lab, Sturt Road, BEDFORD PARK, 5042, SA
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Australia
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2023-05-31
| null |
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GenBank
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2016
|
SAMEA113429703
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PRJEB62024
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AATGAATCGTAATGTTGAATCGCATTTCGCGTTGAATCCCACCCGCATTGATATGTCTCGCTCGACGTTCGATCGTTCGGCCTCTGTTAAGACCTCTTTCAATGTCGGTGATATTGTCCCTTTTTTCCTCGAAGAGGTGCTTCCCGGCGATACGTTCAATGTACGTACTTCCAAAGTTGTGCGTATGCAGACCCTTCTTACGCCGTTGATGGACAATGTCTACCTTGATACGTATTATTTCTTTGTGCCGAACCGCTTGGTTTGGAATCATTGGAAGGAGTTTAACGGTGAAAACACTGAAAGCGCGTGGATACCCACGACGGAGTATTCTGTTCCTCAGATTACGTCGCCTTCCGCTGGTTGGTCTGTTGGTACTCTTGCCGATTATTTCGGCCTTCCTACAGGTGTCGGCGGTTTGAGCGTTTCCGCTCTGCCTTTTAGAGCATATGCTCTCGTGATGAATGAGTGGTTTCGCGATCAGAATTTGCAAGACCCGCTTGTTGTGCCGGTTGATGACGCTACGGTCGTTGGCGTCAATACCGGACATTTCGTGACCGATTGTGCTAAAGGCGGTCTTCCCTTTATTGCCGCCAAGTACCACGATTATTTCACAAGCTGTCTTCCTAGTCCGCAAAAAGGTCCTGATGTGACGTTGTCGGTTGCGTCTCGTTCTAATCTTCCTGTTGTTTCTCTGGCTGATAAAGTTGATTCTTCGCTTTTGACTGAGCCGGTTTCTTTCACTTGGCCGGCGTCTGATCGTAAAGTTCGTGCTTTGGCTGTTAATGCTAATGGTACTTCGTCTACGCTTGTTCTCAATAGTACTTCGGAGATTACTGATGGCGGTTTTACTGGCGCTAAGTTTAATAATCTTTGGGCTGTTGACTCTGGTAATGCTGTTGTTGCTACTATTAATCAGCTTCGTATGGCATTCCAGATTCAGAAACTCTATGAGCGTGACGCCCGTGGCGGTACTCGTTATATCGAGGTTCTTAAGTCTCATTTCGGTGTTACGTCTCCGGATGCTCGTTTGCAGCGTCCTGAGTATCTCGGTGGTAACCGTGTTCCGATCAATGTCAATCAGGTTATTCAGCAGTCCGGTACCGGCGCCGGTGCCGATACTCCGCAAGGTACCGTTGTTGGTATGTCTCAGACTACGGATAGTAACCATGACTTCATGAAGTCTTTCACTGAGCACGGTTATATCATCGGTGTTATGGTTGCCCGTTATGATCATACGTATCAGCAGGGTATCGAGCGCCATTGGTCGCGTAAGACGCGCTTTGACTACTATTGGCCGGTCTTCGCTAATATCGGCGAGCAGGCTGTGCTTAATAAGGAAATCTTTGCGCAGGGTAACGCAAAGGATAATGAGGTTTTCGGCTATCAAGAAGCTTGGTCCGATTACCGTTATAAGCCTAATCGTGTGACCGGTGAGATGCGTTCTGCCTATGAACAGTCTCTTGATGTCTGGCATTTGGCGGATGACTATTCTAGTCTTCCGTCACTGTCTGATAGTTGGATTCGTGAGGATAAGGATACGGTTGACCGTGTTCTCGCGGTGAAGTCCTCTGTCTCCAATCAGTTGTTTGCTGATATCTACGTCCAGAATCGCGCTACTCGCCCGATGCCTATGTATAGTGTGCCTGGTCTTATTGATCACCACTAAAACATTTGATATAGTGGGGGCAGTTGCCCCCACTATTATTTTTGAAAGGGGATATTATGTCTGATTTTGATGAAGCCTTAAATGCTGGTGCTCAGCAGATTTCTGAGATGAAAGGTATTGCTCAGGCAAATAATGCATGGTCTGCCGAACAAGCTTCTATTCAACGTGAATGGCAGGAGAAACAGAATGCTAAAGCTATGACGTTTAATTCTGATGAAGCTGCTAAGAATCGTAATTGGCAAGAGCTTATGTCTAATACTGCTCATCAGCGTGAGGTTAAAGATCTTATGGCCGCTGGTCTTAATCCGGTGTTGTCTGCTATGAATGGTAACGGTGCATCTACTGGAAGTGGCGCTACGGCCTCTGGCGTGACCTCTGCCGGTGCTAAAGGTGATACGGATACATCTACTTCCGGTGCTATCGCTAACCTTTTGGGATCTATTCTCTCTGCTCAGACTCAGATTGAAGCCGCAAATATCAATGCAAAGACTCAGGAAGCCGTCGCTGATAAGTATACTGCTATGGAACATATTGTTGCTTCTATTGCTGCTGATGCTTCCCGCTATGGTGCAGATACTTCTGCTTCCGCTTCCCGCTATCATTCCGATAAGAGTTATGAAGCTTCTAAGTATGGTTCCGATCGTTCTGCTATGGCTTCTATGTTTGGTTCTTCTCAAATGGCTTCCGCCTCTCGTTATAGTGCCGAGCAAGCTGCTTCTGCTTCTCGTTATAGTTCCGATATGTCTTATAAGCAGCTTAATGATTTTGGTCGCGGTGAGACATCGTCTATGATTGGTATGATTGCCAATCGTTTGCCCGGTATTTTAGATGCTGCTCACAAGCGTACTGGTTTTTTTGGTAATAAGACTTTCGGAAAAGATAAGAAACGTGTTGGAGGTTTTAAGTGAGATAAGTTCTCGTCATGGTTTTTTGCTTTTGGTTGTTCTTGTATGTCCTTCGGTTTCTTTTGTTGCCGTTGTGATCGCTGTTATGCGATGGCTTATTAGACATTAAGAATATAATTATTTTTTAAAAGGAAGCGAAGCGAGTCGCGCCCCTGCGCCAAGCTCCGCTTCTTTTTTGCATTCCTTGCCAAAATGGTATGCAGTCTCAGACTGCATAAAATTTCGGCTGCCGTATCGCATGCCGAACTCGTGCCCATTACCTCTCTTGATGTAATGGGCACGAGTGACACCAAGACACGCAAACTTTCGTTTATAATTCCTAAATAGCTACCTAAATTATTTAATAAATATACGAATATACGCTAAATTTATATTGACAGTAAAAATAGAATAGTTTATAATACAAATAAAGTTATAAAAGTACTTGAAAATTAAGAGGATATCGCATCCCCTTAGTGAGGTGTTTGCTTTGTGTCTTGCTTTCATCCCATGTTGGCCGTTAGTACTGGACTAAATTCTAATGGTAAGCGTGATATTAAATTTGTTGCTGGCCCTACTGATTGGGAATCTTATCCGCCTGCTGCTCGTTTGAAGATTCCCTGCGGTCGCTGTGTTGGTTGCCGCCTTGAGCGCTCCCGTCAATGGGCTAATCGTTGTATGCTTGAATTGCAGTATCACGACTCAAGTTATTTTGTAACGCTGACGTATGATGATGATCATGTGCCTGTGACGTATTATTCTGAGAATGATGATGGTGAGGCTCGTTCTGGTCTTACTCTTCGTTCTCGTGATCTTCAGTTATTTTTGAAACGTTTACGAAAGGAGCATTCTGATGAGCGTATTCGGTTCTTCGCTTGCGGTGAGTATGGCGCTACTACTTATCGCCCTCATTATCACGCAATTATTTTTGGACTCACTCTCGACGATCTGCGACCCTACAAACGTAGCCCCCAAAACTATGATTATTTCGTTAGTGATTCTCTTACTAAGTGTTGGGGTCTCGGCTATGTTGTGGTCGGTGCCGTAACTTGGGATACCTGCGCATATACTGCCCGTTACATCATGAAGAAAGCTCTTGGTCAAGGTGCTGAGGTATATGAGCGCTTTAACATCGAACCTGAGTTTGTTCGCATGTCTCGCAAGCCTGGTATTGCATATCAGTATTATGCCGATCATCCTGATTTGTATAAGTATGAGTATATCAATCTTCCGACCGATAAAGGTCAGCTTAAATTCCGCCCGCCTCGTTATTATGACCGGCTTTTTGATGTTGACAATCCTGAGCAGATGAAAAAGATAAAGGCAAAGCGTCAGCATGCAGCGCTGGTTGATGCCCATAACAAGTCCCTGCAAACGTCCCTTATTGAGCCTGACCGTTTGGCAGTTGAAGAAGCTGTTCTTACGGCTCGCATAAAATCTCTTGAAAGGAAGTTGTAAAATGCGTAAGAAGACAAAACCGAAGTTGGACAACAAGATTTTCCGTCGCACCGCTGCCCACAGCAAGAAGATCAATATCGACCCTAAAATTTTTCGTGGAGGTATCAGATTATGAAACTCGGACTTTATTCTATCAAGGACGCTAAGACCGGCTTTATGACTCCTGTGCTTGAGCAGGGTGACCCCGCTGCTCTCCGTAACTTTGCCCATGCTGTTAATCAGCCGGACAGCATCATGCATGATTGTCCCAATGACTTCTCCCTTTTCAAGGTTGCGAACTTCGATACTGATGAAGGTATCGATCCTGTTCTTAACCCTATTTTGATTTCCGATGCTTCTGAGGTACTGCGCAATGTGTAATTGTTCGGCCAAAGAAGCTTTTGTTGCCCTGCAGCAGATGCTCGCTTTACTTCCTTGTGATACTTTGCTCTGGCTGCGTAATTTGTTAGATGAGGAGTTAAAAGAAGATGTTTGATACGCAGTACACCCCGCGTAATCGTATTTTTGCTAATCCCGGCTCGCCTGTCAAGGTGCTTTACGGCGGTAAGTATGATGCTAACGGTCGTGTTGTGCTTGAGAAGAAAGGTGAAGAGAATCTATATGACTATATCCAGTCTTTTCGTGACTCGGTTGATCTCAACGTTATCCTCGCCCGCTTTACCAACGGCGACGTGGAAGCCCTTAATAAGGCTCAGGGCTTTTATGCAGACGTGACCGATTTTCCGAAGAATATGGCCGATGCCCTTAACCGTATCAATCAGGCCGAAGAGATGTTCAAGGCCCTCCCGCTCGAGACTCGTCAGAAGTTTGATTGTTCTTTTGAACAGTTCCTTGCTCAGTCCGGTACTGAGGATTGGCTTTCCAAGATGGGTTTTGAAACTTCCGCGCCGGTAGAGCCCGAGACCCCACCTGCGCAGGTTGCCCCCCCTGTTGTAAAGGAGATTAAGAATGAATCGTAATGTTGAATCGCATTTCGCGTTGAATCCCACCCG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| 15,417
|
OX614318.1
|
Microvirus sp.
|
Roach,M.
|
Flinders Accelerator for Microbiome Exploration, Edwards lab, Sturt Road, BEDFORD PARK, 5042, SA
|
Australia
|
2023-05-31
| null |
Microvirus sp.
| null |
Microviridae
|
ssDNA(+)
| 5,162
|
GenBank
| null |
USA
|
USA
| null | null |
2016
|
SAMEA113429728
|
PRJEB62024
|
Microvirus sp. genome assembly, chromosome: 1
|
ATGGGACGAAATTATAAGTACCAGTAGGAGATTCAGAACTAGTCTTACCATTAAAACCAACAATCTGATGATCAGCAAAACCATCAGAAACACCAATAGCAGTACCATCAAAAGTAGTAGCAGGAAGAGAACCGGACTGAGTAGTAGACCAACCAAGCTGAGGGGTATTCTGCGAATTCGTATAGAGTCTCAGAACATCATTACTCCACGAATCAGGCCGAGTGATGACGGGCATAGTACCAGAAAGGGGAATAGAAACTGGAGTGCCTTTCTGAGGCTGAGGAAGACAAGAAGTGAAATAATCATGATATTTATTAGCCTTAAAAAGGCTACCTCCATAACAAACTTCACCAGTATCCGAACCCTGAGAAGTAGCATCATCAGTAGGAACAAGTAGAGGATCCTGCAGATTCTGATCCCGGAACCAGTCATCACACAACTTCGCATAAGAGCGGAACGGAAGAGCATTAACAGTAAAGGAATCAGCTACTTTAAAACCGTCGGATTTATCATTAGGAGGAACACCAAGATAGTCAGCAAGGGAGCCAAACTTCCAGCCAGCATAACCATTAGCATCAACAGGAGCTTTAATCTGAGGAATAGAATACTCAATAGAAGGAGTCCAAGCCTGATTAGATTCACCGCAAAATTCCTGCCAATGATCCCATACAAGACGATGAGGAACAAAGAAGTAATAGGTATCGAGATAAAGATTATCCATAACAGGCGACAGAAGAGTCTGGAGCCGAACAACTTTCGAAGTGGACACATCAAAAGTATCACCTGGAAGAACCTCAGAGAGATAGAAAGGAACAAGCTCACCAACATTAAATGTCAGCGTATTCTTATGAGAGCGATCGAACTGAGAACGCTGAAAATCAACATCAGCAGGAGCAACGGCAAAATGGGATTCAGCATTAACATTCATTCTTTATCACCACCAACAGAAGATTCTCCATGATCGGGATTATCAGTAGACCAGTCAAGAACGCAACGGGGGAAAAGAGCCAGCCAATTGCAGAAACAACGCAAGCGATGACCAGCACGACGAAAAATCACAAGGACTTTATCAACAGTATTAATTATTAACACCTCCAACGGATACAGAAGAAGATACAGGGTCGACAACAGGAGCAGGAGTATCAACAGGTTCAATAGTAAGCTTATCATCATTGCCGGGTATGGTAGTCTTATCAGAGAACATCGAAACAAAAAACTTATTAAAATCATTATCATACTCAGCACGTTTATCAGCAGGAAGAGACTCAAACGTACGACGAACAGTAGCCATAGTATTAAGCATATCAATAGGAGTCTTAGGAGCGCCTACATTATCAATATACATAGGGCTATCAGCACGCACAGCAGAAGGATCACCGAGCATACAACGTCGGGCAAGCGAAACAATATCAGCTCCAGCGGCATGACTCTGGATAAGCTGATCAATATTATCAGTGCCAACAGTCCGGAGACAAAGAGCTCCGGACGAATCATAAAAACTCTCGCGGACGGCTCGAAACGGAGAACCGGGATTAGAAAAAAATCTGGGCATATCAAACACCTCTGAAAAGCAGAATGGGCATATCTTCAGGAATAAACTTAGCTGTAACAGTATCAAATTCGCCGAGGCGGTAAAGCTCATAATCGGACGCATTCGCGCCAACAACAGAATCACCAGCAAGGGAAAATTTAAAATTGCGAATAGCCGTATTGTCATTAACGTCAACCATGGGAGCGGAATAACCATTCAAGACATCACGAATGGAAAACACGGGCATTTTCATAATATAACATATCCTTTCTGTTGCACATGCAACGAGCGCACAAGGCGCAATCTACAAATAGTAATTAAGAAGAGGGGGATAGGCGGTCACAGACGAATGCCACCACGAAATATAATGGTACCTAGATTTATCTTTTTGCCGACAGCGGCAGTGTTGCGAAACACATTAACATCAGTACCAACGGGAAGCCTACGGCGCATCATAAAGAATCACCTCACAATAACAATAAATTAGGTTGATCACGTGCACGATAAGATTGTTGCACAATATCACCTCACAAATCAGTGTTTAGGTCACGACGGTCAAGAGTCTCCGTGCGATGAGAAAAGTTATACTCACAATCTTTGAGATAATCCAAATAAGGCTTCTTAAGAGACTTAATAAGAGTCTCCGTACGGACATTAGCACGCTCTTTAAGGTCAGCGGCGTACTCCTCATAATCTGCAGGGTCAAAACGCTCATACAAGTTCTTAAGATACTTAGGAGGGGTTATCTTGCGGCCAGCAAGATAAATGTACTCCTGGTCAAACAAGGCAGGGGAGTAGGCATCGCCGCCGATGCCAGGACGACGAGACATCAAAGAAAACGGCGGAAGGATGCCAAGCTCATCATAAAGCAAGCCATCATTGCCTTTGAGCTTTTTAAGCGTATAACGGGCGGTATAACTCATGGTCTCCCAAGATGCAGGAGAGACAACAACAAAGCCTTTTGGACAGCCATCAGAGTCAGTCCAACAACGAGACAGACTAGAAGAGTTATAAAGCGGATAGCCATGCTTAGACAAGCGATAAAACTGGAGATCATTAAGATGAAGACCAAAAACAATCATATGATAATGCGGCCTAAAAGTCGTATCACCATATTCACCAGCCGCAAAAAAACGGACGCGATCATCTTCATGGGCACGGCGCACGCGCTTAAGATAAAGCTGCACATCACGCTTTACAAGCGTAGGATTGCCAGACTCAGCAAACGGCAAATGCTCATCATCATAAGTCAAGGTCAAAAACCAACAACTATCATCGGGACTAAAAGCGGCTTCCAAAAACATCCTATTAGCCCAATCACGGGCATAATCAAGACGACAGCCTCGACACTTACCGCAAGGGATATCGGTATACTGATAGTCAGGGCTCCGCATCTCAAGCGGAACCCATGACGTTACAAAACCGTTATACTTGCCAGTATCAGGGTTAATATTCGCGGGGTCGGGATAGACGACGCGAGTTAAAGGATGATAACAACTCATCATCAATAAACCTACAGAGCATAAAGTCAGGTATCATAATCTTGATCAGAGACAAAACGTGAAGAAGAGTTAATATTAAACATGAGAAAACCTCCTTTATAAGTATACCTAATTATAACAAATAAAACAAGCTTGTCAATACTGCCAAGCAAATAATATACTGCCACACGGGATAGCGGTGTCAGTTAGCCCCTATACAACAAGAGGGTATAGGGGCTAACTGCCGAGTGCGGCAGTAAACATCAGGTGCGGCAAAGCCTGACCACCTGATAAAAGAGCGGCTTACAGCCGCGACCAAAAATAAAGCCGACACACAGGCGCGCACGCGCGCGATAAATACCGCGCGCACGCACACCCGTGAGCCGGCCATTTTAATTGTAACACGACTTATTCAAACAACGTCATTCTAAGATTTCGGTCAAACCTTCTAAAACAGTCTTAGCAGCATTTGCACGCCTAGGAGCAAAGAGACCGACGATGCCAGCGGCAACTTTGCCAATGGCAGAAATAGAACTTGCCGAATGCTCAGGCGGAGCAATAGAAGAATACACAGAGGCATTACCAGAAGTGGTACCAGCACCAGAACCGGAAATACCAAGAACTGGATTTAAGCCAGCAGCACGAAGATCAGCTACATTTCGCTGATGAGCAGTGTTAGCCATCTCTTCGGCAAAAGCCGTGGAGGAGTCCATACCATACTTAGTAGACAGCGGCGCGTCAGCATAAAAAGGAGCAGACTGCGCAGAAGAAAAGCGCGCACCACCAGAAACGGAACGAGAACCGGAACCAACACCAGAAGCAAGTTCTTTTGCAGATGCAACAGCATCAGAAACAACATTTTTAAAAGATTTAGGATCATCGCCGTAAAAATCACGTAAAACTTTGCCAGAATACCTATCTACATAACGAGTATAACCATTACCATATTCATATTTATACCAAAAAGGGTTAAGCTGATTATTCCAAAAATGTTTATTAAAAACATCATTAACGCCTTTATAATGAGTAACACGACCAGCATTGCCAGAATCAGAAAGAATAGTACTAGGCAAAAAATCACTTCCTTTTAAGAAAAGGAGGGCTAGCGCCCTCCTATGTTTAGTTATGGTCAACCAGACCGGGTACAGAATAAGTAGGCATAACGCGAGAAGTATGATCCTGAATATACACGTCAAGAAGAATCTGATTGCTGACAGCGGAAGTCACGGCAAGCGTACGATCAATATTAGACTTTTCTTCGGCAAGCCAAGACTCAGAAAGAGTAGGCTGAGTTACATAATCATCGGCAAAATTCCAGCTAGCGAGCGTCTGAGGATGGTTAGGACGCATTTCACCGGAAACACGATTAGGAGAGTAACGATACTCAGCCCAAGCTTCCTGATAGCCGAAAACACTTTTAGAAGAAGCAGGAGAAAACATAATCTCATCCTTGTATACGGCCTGTTCCGAAAGATGTGCAAACACTGGCCAATAGAACGACTCACGAGAGGAACGAGTCCAAAGACGGTCAAGTCCCTGCGGATAACTATGATCATAACGAGCAACACAAACACCGATCACATAACCATGCTCAACAAAGGACTTAATAAAATCTCCATTATAATCAGTCGTATGAGCGAAAGCACCAAGATTACCGAGAAAACCAGTCTCAGACTGAGCATTGTTAGTAACCTCGTGGACAGTGATGGGAACACGATTACCGCCAAGATATTCAGAGCGCTGCAAACGAGCATCGGGAGAAGTCACGCCAAACATAGACTTGAGTATCTCAATGTAACGAGAACCACCACGAGCAAGACGTTCCATAAAGCGCTGCATCTGAAAAGCAAAGCGAAGAGCAGAAACATCTATACCAATAAAAGAGCCTGCGCCAGTCTGGTCACCAGTAAAGGCAACAAGATTAGATGGGACGAAATTATAAGTACCAGTAGGAGATTCAGAACTAGTCTTACCATTAAAACCAACAATCTGATGATCAGCAAAACCATCAGAAACACCAATAGCAGTACCATCAAAAGTAGTAGCAGGAAGAGAACCGGACTGAGTAGTAGACCAACCAAGCTGAGGGGTATTCTGCGAATTCGTATAGAGTCTCAGAACATCATTACTCCACGAATCAGGCCGAGTGA
| 15,418
|
NC_024887.1
|
Middelburg virus
|
Tricou,V., Berthet,N., Descorps-Declere,S., Nakoune,E., Kazanji,M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2014-09-17
|
ArB-8422
|
Middelburg virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,550
|
RefSeq
| 1
|
Central African Republic: Bozo
|
Central African Republic
|
Aedes vittatus
| null |
1977-08-23
| null |
PRJNA485481
|
Middelburg virus isolate ArB-8422, complete genome
|
ATTGGTGGTTACGTACACGTGCCACCACCCCCCACCCTCCAAGCGATCCAAAATGGCGCGCCCTGTTGTGAAGATAGACGTTGAGGCCGAAAGCCCATTTGTCAAGTCTCTACAGAAGGCGTTTCCACAATTTGAGATCGAAGCAGAGCAGGTCACATCGAATGACCATGCTAACGCGAGGGCGTTTTCGCACCTTGCCAGTAAACTAATAGAAGGAGAGGTGGAAGTGGGCACAACCATCCTGGATATAGGCAGCGCGCCGGCCAGGAGGATGATGTCCAAACATGCATACCACTGCGTCTGCCCGCTGAGGAGTGCAGAAGACCCAGAACGATTAGCGGGATACGCGAAGAAGCTTATGAGTGCAGCCGGAAACGTTACTGATCTCAACATCTCGGGAAAGATCACGGACTTAAAGAACGTGATAGCTATACCTGACCTTGAGACACCTACATTCTGCCTGCACACAGACCAGACCTGCCGCTATAATGCCGATGTGGCTATCTATCAGGACGTCTACGCTGTCCACGCGCCCACATCGCTTTACCATCAAGCGTTAAAAGGGGTCAGGGTCGTGTACTGGATCGGCTTCGATACTACGCCGTTTATGTTTGACGTAATGGCGGGAGCGTACCCAAGCTATTCTACGAACTGGGCAGACGAACTGGTGCTGCAGGCCAGAAACATCGGCCTGTGCAGCTCCAGATTGAGTGAGGGGAGAAGCAGAGGGCTATCCATTATGAGAAAGAAAGCCTTCAGACCAAGCGACCGAGTCATGTTCTCGGTAGGTTCGACGTTGTATACGGAGAGCCGCTCGCTACTGAAAAGCTGGCACCTGCCGTCGACTTTTCATCTAAAGGGTAAGGACTCCTACACATGTAGATGTGACACCATAGTCAGTTGCGAGGGATACGTCGTAAAGAAGATCACGATGAGCCCAGGCCTATTCGGGAAGCCAGTACCGTACGCCGTCACCCATCATGCTGACGGCTTCCTCGTGTGCAAGACCACGGACACGGTCAAAGGGGAGAGGGTTTCCTTCCCCGTATGTACGTATGTCCCAGCGACGATTTGTGACCAGATGACTGGGATCTTAGCCACGGATGTGACGCCTGATGATGCTCAGAAGTTACTGGTGGGCCTGAACCAGCGGATCGTGGTCAATGGGCGCACGCAGAGAAATGTAAATACCATGAAAAATTACCTGCTACCTGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGCAAGTGGGCGAAAGAGTATAAAGCCGACTTGGAAGACGAGAAACCGTTGGGGGTCAGAGAACGCAACTTGACTATGTGTTGCTTGTGGGCCTTCCGAACTAGGAAGACCCACACCCTGTACAAGAAGCCGGACACGCAGACTATAGTGAAAGTCCCTTCTGAATATACCTCCTTACTCATCCCGAGTCTATGGACGAGCGGGATCTCCATGACTCTGAGGAGACGGCTGAAAGTGCTGTTGACTGCCCGACTGAACCAGAAATTGACGTGCCCTTTGGACGCGGTGACAGCAAAGATTGCGGAGGACAATGATCGTGAGGCGCGTGAAGCAGAGTTAACTAGAGAGGCGCTACCTCCTTTGACTGCTACCGAGCCAGCCGGCGACGATATACAGGTCGACATCGAGGAGCTTGACGCTAGGGCGGGTGCGGGAGTAGTGAACACACCCCGCAACGCCGTCCGAGTCACCGCTCAGAGCGGTGACACGTTGGTTGGCAGCTATCTGGTGCTCAGCCCGCAGACTGTATTGCGCAGTGACAAACTACGCTTGATCCACGAACTGGCAGAACAAGTGAAAATTATCACGCATTCAGGTAGGGCCGGTAGATATCCTGTTGAAGGCTATGACGGACGTGTGCTGGTACCTACTGGCAGCGCTCTGAGTTTCGCCGATTTCCAGGCGCTTAGTGAGAGTGCCACAATGGTATACAACGAACGAGAGTTCATGAACAGGAAACTCTACCACATTGCCACGCACGGCCCGGCTCTGAACACAGACGAGGAGAACTACGAGAAGGTGAGAGCGGAAAGGAGTGACGCCGAGTACGTGTTCGACGTGGACGCACGGAAGTGCGTCAAACGCGAGCAGGCGTCGGGAATAGTGTTAGTGGGAGACGCGATCAATCCGCCTTACCATGAGTTCGCCTTTGAAGGCCTAAAAACACGCCCTTCGGTGCCCTATAAAGTACCGACTATCGGTGTGTTTGGAGTTCCGGGATCAGGCAAATCGGCCATTATTAAGTCTGTGGTCACCAGACGTGACCTAGTCACCAGCGGCAAGAAAGAGAATTGCAATGAGATCATGACCGACGTCAAGAAGCAGAGAGGATTGGATATTGTAGCCAAGACGGTGGACTCTATCCTATTAAACGGTTGCAAACACAGCCCTGAGGTGTTGTTCGTAGACGAGGCGTTTGCCTGCCATGCAGGCACTCTGCTCGCGCTCATTGCGATCGTGAGACCCACCAAGAAAGTTGTGTTATGCGGCGATCCGAAGCAATGCGGCTTCTTTAACATGATGCAACTAAAAGTCAATTACAATCATGACATATGCACTGAAGTGCATCACAAAAGCATCTCCCGCCGATGCACAATACCGGTTACATCCATCGTCTCTACACTGCACTACGGAGGCAGGATGCGCACTACGAACCCGCGCAACGACCCTATCGAAATTGACATCACCAGTAGCACCAAACCCAAGCCCGGAGACATCGTGTTAACATGTTTTCGTGGCTGGGTTAAACAGCTGCAGTTGGACTATCGTGGACACGAAGTCATGACTGCGGCAGCGTCGCAAGGCTTGACCAGGAAAGGAGTATATGCAGTGAGGATGAAAGTCAATGAGAACCCACTATATGCCCCGGCTTCCGAACACGTCAATGTCTTGCTGACACGCACGGAGGGAAGGCTAGTGTGGAAAACGCTGGCCGGAGACCCGTGGATCAAGGTGCTAACTAACGTACCCAAAGGAAACTTCACAGCCACCATTGACGAGTGGCAGGAGGAGCACGACAACATCATGAACGCCATAAGAGGGGAAGTGGCGCCGACCGACCCTTTCCAAAACAAAGCAAATGTTTGTTGGGCAAAAGCCCTGGAACCAGTCCTTGCTACCGCTGGCATCCGACTCAGCGCAGCGGAGTGGAGCGACTTGATAGTCGCTTTCAAGGAAGATAAAGCATACTCGCCCGAGGTCGCGCTGAATGAGATCTGCACCAGAATGTACGGGTTTGACCTAGATAGCGGCTTGTTTTCGGCTCCGCTGGTATCCATGAGATATGAGAACCATCACTGGGACAACTCACCGGGAGGAAAGATGTACGGATTCAACACTCAGGCAGCCAGCAGGTTGGAGCGCAGATACCCCTTCCTGCAAGGAAAATGGAGACTGAACCAGCAGGTCCTTTTATCGGAGAGGAGGACGCAACCAGTGAGCTCATCCGCTAACATAGTTCCCATTAATCGTAGGCTGCCCCACACTCTGGTGCTGGAACACGTCAAGCTACCCGGGGACCGCGTAGAGCGGATCGTGATGCAAATTCGTGCGCATCACGTGCTGCTAGTGGGTGAGTATAACCTCCACCTGCCTTTGCGGCGTGTTACCTGGATCGCCCCTCCCTATATACGGGGCGCAGACCGCGTCTACGACCTGAGCTTAGGGTTGCCAACTGACCTGGGCAGGTATGATCTGGCGTTCATAAATGTACATACAGAATTCCGCAACCACCACTACCAGCAGTGTGAGGACCATGCAATGAAGTTGCAGATGCTAGGAGGTGATGCCCTACGCCACCTGAAACCGGGCGGATGCCTGCTGATGCGTGCCTATGGGTACGCAGACAGGACCAGCGAGATGGTGGTGAATGCGCTAGCGCGTAAATTCGCATCAATACGCGTACTGCGACCAGCGTGTGTGGCCTCTAACACTGAAGTCTTACTGCTGCTGTCGGGCTTTGACAACGGGAAACGCCAACTGACAATGCACACATCTAACCTGAGACTCTCCAGCGTTTACTCGGGCAACGCGCTACACACGGCAGGGTGTGCACCATCATATAGAGTCGTAAGAGGCAATATCACCGACTCCGACGCCGATGTGCTAGTAAATCAGTTGGGCGTGAACAACAAGGTCTGCGACGGAGTTTGTAGGGCCATGGTCAAGAAGTGGCCTTCCTGTCTACCAACGACAAATGGAAAAGTAGGCGACGCCGTACTGACCACTGAGCCTCGAAAAATCGTGCACGCTTACTGTCCTAATTTCGGAACCAGTAGAGAGGAGGTTGCCGATGCCGACCTAGCAGCTGTGTATAGAGCCGTGGCGTCCTTGGCTGACGAGACAGTCCGCACAATGGCCATACCACTCCTGTCAACGGGGACGTTCGCTGGGGGAAAGGACCGCGTGTTGCAGTCGTTGAACCACCTATTTACGGCCCTGGACACCACGGACGTCGATGTAACGATATACTGCCGGGATAAGTCGTGGGAAAAGAAAATCCAAGAGGCCATTGATATGAGGACGGCAACCGAACTGCTAGATGACGACACAACGGTTATGAAAGAGCTAACCAGGGTGCATCCTGATAGCTGCCTAGTGGGGCGCAGTGGATTCAGTACGGTGGACGGACGGCTGCATTCGTACCTTGAAGGAACTAGGTTCCACCAGACTGCTGTCGACGTGGCAGAAATAGCCACTCTGTGGCCAAGGAGAGAGGAAGCGAACGAGCAGATAACACACTATGTCCTTGGCGAATCCATGGAGGCCATAAGAACCAAATGCCCGGTGGATGATACCGATTCGTCGGCACCGCCATGCACCGTCCCTTGCCTTTGCCGCTACGCCATGACCCCCGAGCGCATACATAGATTGCGCGCCGCGCAGGTGAAGCAGTTCACAGTCTGCTCCTCGTTCCCTCTGCCGAAGTACAAGATACCAGGCGTGCAGAGAGTGGCGTGTTCGGCTGTAATGTTGTTTAATCACGACGTTC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| 6,419
|
MW074912.1
|
Middelburg virus
|
Mikryukova,T.P., Ternovoy,V.A., Protopopova,E.V., Horoshavin,Y.A., Shvalov,A.N., Loktev,V.B.
|
State Research Center of Virology and Biotechnology Vector, Molecular Biology of Flaviviruses and Viral Hepatitis
| null |
2022-01-19
| null |
Middelburg virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,564
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Ochlerotatus caballus
| null |
1957
| null | null |
Middelburg virus strain Ar-749, complete genome
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CCACCATCCAAGCGATCCAAAATGGCGCGCCCTGTTGTGAAGATAGACGTTGAGGCCGAAAGCCCATTTGTCAAGTCTCTACAGAAGGCGTTTCCACAATTTGAGATCGAAGCAGAGCAGGTCACACCGAATGACCATGCTAACGCGAGGGCGTTTTCGCACCTTGCCAGTAAACTAATTGAAGGAGAGGTGGAAGTGGGCACAACCATCCTGGACATAGGCAGCGCGCCGGCCAGGAGGATGATGTCCAAACATGCATACCACTGCGTCTGCCCACTGAGGAGTGCAGAAGACCCAGAACGATTAGCGGGATACGCGAAGAAGCTTATGAGTGCAGCCGGAAACGTTACTGATCTCAACATCTCGGGAAAGATCACGGACTTAAAGAACGTGATAGCTATACCCGACCTTGAGACACCTACATTCTGCCTGCACACAGACCAGACCTGCCGCTACAATGCCGATGTGGCCATCTATCAGGACGTCTACGCTGTCCACGCGCCCACATCGCTTTACCATCAAGCGTTAAAAGGGGTCAGGGTCGTGTACTGGATCGGCTTCGATACTACGCCGTTTATGTTTGACGTAATGGCGGGAGCGTACCCAAGCTATTCTACGAACTGGGCAGACGAACTGGTGCTGCAGGCCAGAAACATCGGCCTGTGCAGCTCCAGATTGAGTGAGGGGAGAAGCAGAGGGCTATCCATTATGAGAAAGAAAGCCTTCAGACCAAGCGACCGAGTTATGTTCTCGGTAGGTTCGACGTTGTATACGGAGAGCCGCTCGCTACTGAAAAGCTGGCACCTGCCGTCGACTTTTCATCTAAAGGGTAAGGACTCCTACACATGTAGATGTGACACCATAGTCAGTTGCGAGGGGTACGTCGTAAAGAAGATCACGATGAGCCCAGGCCTATTCGGGAAGCCAGTACCGTACGCCGTCACCCATCATGCCGACGGCTTCCTCGTGTGCAAGACCACGGACACGGTCAAAGGGGAGAGGGTTTCCTTCCCCGTATGTACGTATGTCCCAGCAACGATTTGTGACCAGATGACTGGGATCTTAGCCACGGATGTGACGCCTGATGATGCTCAGAAGTTACTGGTGGGCCTGAACCAGCGGATCGTGGTCAATGGGCGCACGCAGAGAAATGTAAATACCATGAAAAATTACCTGCTACCTGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGCAAGTGGGCGAAAGAGTATAAAGCCGACTTGGAAGACGAGAAACCGCTGGGGGTCAGAGAACGCAACTTGACTATGTGTTGCTTGTGGGCCTTCCGAACCAGGAAGACCCACACCCTGTACAAGAAGCCGGACACGCAGACTATAGTGAAAGTCCCTTCTGAATACACCTCCTTACTCATCCAGAGTCTATGGACGAGCGGGATCTCCATGACTCTGAGGAGACGGCTGAAAGTGCTGTTGACTGCCCGACTGAACCAGAAATTGACGTGCCCTTTGGACGCGGTGACAGCAAAGATTGCAGAGGACGATGATCGTGAGGCGCGTGAAGCTGAGTTAACTAGAGAGGCGCTACCTCCTTTGACTGCTACCGAGCCAACCGGTGACGACATACAGGTCGACATCGAGGAGCTTGACGCTAGGGCGGGTGCGGGAGTAGTGAACACACCCCGCAACGCCGTCCGAGTCACCGCTCAGAGTGGTGACACGTTGGTTGGCAGCTATCTGGTGCTCAGCCCGCAGACTGTATTGCGCAGTGACAAACTACGCTTGATCCACGAACTGGCAGAACAAGTGAAGATTATCACGCATTCAGGTAGGGCCGGTAGATATCCTGTTGAAGGCTATGATGGACGTGTGCTGGTACCTACTGGCAGCGCTCTGAGTTTCGCCGATTTCCAGGCGCTTAGTGAGAGTGCCACAATGGTATACAACGAGCGAGAGTTCATGAACAGGAAACTCTACCACATTGCCACGCACGGCCCGGCTCTGAACACAGACGAGGAGAACTACGAGAAGGTGAGAGCGGAAAGGAGTGACGCCGAGTACGTGTTCGACGTGGACGCACGGAAGTGCGTCAAACGCGAGCAGGCATCGGGAATAGTGTTAGTGGGAGACGCGATCAATCCGCCTTACCATGAGTTCGCCTTTGAAGGCCTAAAAACACGCCCTTCGGTGCCCTATAAAGTACCGACTATCGGTGTGTTTGGAGTTCCGGGATCAGGCAAATCGGCCATTATCAAGTCTGTGGTCACCAGACGTGACCTAGTCACTAGCGGCAAGAAAGAGAACTGCAATGAGATCATGACCGACGTCAAGAAGCAGAGAGGATTGGATATCGTAGCCAAGACGGTGGACTCTATCCTATTAAACGGTTGCAAACACAGCCCTGAGGTGTTGTTCGTAGACGAGGCGTTTGCCTGCCATGCAGGCACTCTGCTCGCGCTCATTGCGATCGTGAGACCCACCAAGAAAGTTGTGTTATGCGGAGATCCGAAGCAATGCGGCTTCTTTAACATGATGCAACTAAAAGTCAATTACAATCATGACATATGCACTGAAGTGCATCACAAAAGCATCTCCCGCCGATGCACAATACCGGTTACATCCATTGTCTCTACACTGCACTACGGAGGCAGGATGCGCACTACGAACCCGCGCAACGACCCTATCGAAATTGACATCACCAGTAGCACCAAACCCAAGCCCGGAGACATCGTGTTAACATGTTTTCGTGGCTGGGTTAAACAGCTGCAGCTGGACTATCGTGGACACGAAGTCATGACTGCGGCAGCGTCGCAAGGCTTGACCAGGAAAGGAGTATATGCAGTGAGGATGAAAGTCAATGAGAACCCACTATATGCTCCAGCTTCCGAACACGTCAATGTCTTGTTGACACGCACGGAGGGAAGGCTAGTGTGGAAAACGCTGGCCGGAGATCCGTGGATCAAGGTGCTAACTAACGTACCCAAAGGAAACTTCACAGCCACCATTGACGAGTGGCAGGAGGAGCATGACAACATCATGAACGCCATAAGAGGGGAAGTGGCGCCGACCGACCCTTTCCAAAACAAAGCAAATGTTTGTTGGGCAAAAGCTCTGGAACCAGTCCTTGCTACCGCTGGCATCCGACTCAGCGCAGCGGAGTGGAGCGACTTGATAGTCGCTTTCAAGGAAGATAAAGCATACTCGCCCGAGGTCGCGCTGAATGAGATCTGCACCAGAATGTACGGGTTTGACCTAGATAGCGGCTTGTTTTCGGCTCCGCTGGTATCCATGAGATATGAGAACCATCACTGGGACAACTCACCGGGAGGAAAGATGTATGGATTCAACACACAGGCAGCCAGCAGGTTGGAGCGCAGATACCCCTTCCTGCAAGGAAAATGGAGACTGAACCAGCAGATCCTTTTATCGGAGAGGAGGACGCAACCAGTGAGCTCATCCGCTAACATAGTTCCCATTAATCGTAGGCTGCCGCACACTCTGGTGCTGGAACACGTCAAGCTACCCGGGGACCGCGTAGAGCGGATCGTGATGCAAATTCGCGCGCATCACGTGCTGCTAGTGGGTGAGTATAACCTCCACCTGCCTTTACGGCGTGTTACCTGGATCGCCCCTCCCTATATACGGGGCGCAGACCGCATCTACGACCTGAGCTTAGGGTTGCCAACTGACCTGGGCAGGTATGATCTGGCGTTCATAAATGTACATACAGAATTCCGCAACCACCACTACCAGCAGTGTGAGGACCATGCAATGAAGTTGCAGATGCTAGGAGGTGATGCCCTACGCCACCTGAAACCGGGCGGATGCCTGCTGATGCGTGCCTATGGGTACGCAGACAGGACCAGCGAGATGGTGGTGAATGCGCTAGCGCGTAAATTTGCATCAATACGCGTACTGCGACCAGCGTGTGTGGCCTCTAACACTGAAGTCTTACTGCTGCTGTCGGGCTTTGACAACGGGAAACGCCAACTGACAATGCACACATCTAACCTGAGACTCTCCAGCGTTTACTCGGGCAACGCACTACACACGGCAGGGTGTGCACCATCATATAGAGTCGTAAGAGGTAATATCACCGACTCCGACGCCGATGTGTTAGTAAATCAGTTGGGCGTGAACAACAAGGTCTGCGACGGAGTTTGTAGGGCCATGGTCAAGAAGTGGCCTTCCTGCCTACCAACGACAACTGGAAAAGTAGGCGACGCCGTACTGACCACTGAGCCTCGAAAAATCGTGCACGCTTACTGTCCTAATTTCGGAACCAGTAGAGAGGAGGTTGCCGATGCCGACCTAGCAGCTGTGTATAGAGCCGTGGCGTCCTTGGCTGACGAGACAGTCCGCACAATGGCCATACCACTCCTGTCAACGGGGACGTTCGCTGGGGGAAAGGACCGCGTGTTGCAGTCGTTGAACCACCTATTTACGGCCCTGGACACCACGGACGTCGATGTGACGATATACTGCCGGGATAAGTCGTGGGAAAAGAAAATCCAAGAGGCCATTGATATGAGGACGGCAACCGAACTGCTAGATGACGACACAACGGTTATGAAAGAGCTAACCAGGGTGCATCCTGATAGCTGCCTAGTGGGGCGCAGTGGATTCAGCACGGTGGACGGACGGCTGCATTCGTACCTTGAAGGAACTAGGTTCCACCAGACTGCTGTCGACGTGGCAGAAATAGCCACTTTGTGGCCAAGGAGAGAGGAAGCGAACGAGCAGATAACACACTACGTCCTTGGCGAATCCATGGAGGCCATAAGAACCAAATGCCCGGTGGATGATACCGACTCGTCAGCACCACCATGCACCGTCCCGTGCCTTTGCCGCTACGCCATGACCCCCGAGCGCGTACATAGATTGCGCGCCGCGCAGGTGAAGCAGTTCACAGTCTGCTCCTCGTTCCCGCTGCCAAAGTACAGGATACCAGGCGTGCAGAGAGTGGCGTGTTCGGCTGTAATGTTGTTTAATCACGACGTTCCAGCGCTGGTAAGCCCTCGCAAGTACAGGGA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TACACCGGCGTCTACCCCTTTTTGTGGGGCGGTGCCTACTGCTTTTGCGATTCGGAAAACACTCAGCTGAGCGAAGCTTATGTTGAGCGGAGCGAGGTGTGCAAACACGATCACGCAGCGGCGTATCGCGCTCATACAGCCGCATTGAAGGCTAAAATCAGAGTGACCTACGGTTCCACGAACGGGACGGCTGAGGCGTTTGTCAACGGAGAGAGCACCGCACGAATTGGAGACCTGAAAATGATCCTAGGTCCCATATCCACCGCGTGGAGCCCCTTTGACCCAAAGATCGTCGTCTACAAGGACGAAGTCTACAATCAGGATTATCCACCGTACGGATCCGGGCAACCGGGTAGATTTGGGGACTTACAGAGCAGGACCACCGAGAGTAACGATGTGTACGCCAATACTGCACTGAAGCTGGCTCGCCCATCTGCCGGCACGGTGCACGTTCCATATACCCAGACGCCGTCCGGGTTTAAGTATTGGCTAAAAGAAAAAGGGGACGCATTGAACCACAAGGCTCCTTTCGGCTGCATCATCAAGACGAACCCCGTAAGGGCAGAAAATTGTGCAGTCGGAAACATACCAGTGTCTCTAGACATTCCCGACGCGGCTTTTACACGCATAGTCGACGCACCATCGCTAACCGGCCTGAAGTGCGAGGTGGCGACTTGCACGCACTCATCGGACTTTGGAGGCACTTTGGTGGTGGAGTACAAGACCGACAAAGTGGGGACGTGCGCCGTCCACTCAGAATCCAACACGGCTGTTATGCAGGAGACGAGTCTGTCCGTGACGATGGACGGCCGAGGTACGTTGCATTTCTCCACCGCCTCAGCCTCACCGTCCTTCGTACTGAAAGTGTGCAGTAGCAAAACCACTTGCACAGCAAAGTGCGTGCCGCCGAAGGACCACGTCGTCCCTTTTCCTGCCAACCACAACAATGTTGTGTTCCCGGACTTTTCCAGTACTGCAGTGTCTTGGCTCACCCACACTATGGGCGGAGCTACTGTGGTGATTGCTATTGGGATCACCATATTCTTAATAGTTACTTGCATAGCTTTTAGTAGGCACTAGATATAGTAGAACGGAAAATGGAAAACTAGAAAAATAGTAGGGTAGGCAAAGGCATCATTAATCATCATACTAAGCAGCATACACTTATATAACCTCAAATACAACCTACAATTACACTAACTGAGTAGAAAAACAAGAAAACCCATAAAAAGTAGAGTAAGCAATGACATTAACCCTATAATTACTAACACGTATACTAACAGACTAGAAAAAGAGAAAATTACAGAAAAAATAGAGTAGGCAATGGCATTATTACATATTAACATATATAACACTACAATATAACTTACAACACCATATAGAAGGGCCTTGCCACAGGCCGCCATAATTGTAAACAGAACTAATTGGCAGAACTAATTGGATACTAATAATTGGATTAAACAGAACTAATTGGCAGAACTAATTGGATACTAATAATTGGATTATTTATGATTTGGAAATAATATCGCGACGATTGGCTAGTCGCAATTGGTTTTAATATTCC
| 33,643
|
MT015688.1
|
Middelburg virus
|
Fourie,I.
|
University of Pretoria, Medical Virology
|
South Africa
|
2020-11-25
|
ZRU103/17
|
Middelburg virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,673
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Equus caballus
| null | null | null | null |
Middelburg virus isolate ZRU103/17, complete genome
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ATTGGTGGTTACGTACACGTGCCACCACCCCCACCATCCAAGCGATCCAAAATGGCGCGCCCTGTTGTGAAGATAGACGTTGAGGCCGAAAGCCCATTTGTCAAGTCTCTACAGAAGGCGTTTCCACAATTTGAGATCGAAGCAGAGCAGGTCACACCGAATGACCATGCTAACGCGAGGGCGTTTTCGCACCTTGCCAGTAAACTAATTGAAGGAGAGGTGGAAGTGGGCACAACCATCCTGGACATAGGCAGCGCGCCGGCCAGGAGGATGATGTCCAAACATGCATACCACTGCGTCTGCCCACTGAGGAGTGCAGAAGACCCAGAACGATTAGCGGGATACGCGAAGAAGCTTATGAGTGCAGCCGGAAATGTTACTGATCTCAACATCTCGGGAAAGATCACGGACTTAAAGAACGTGATAGCTATACCCGACCTTGAGACACCTACATTCTGCCTGCACACAGACCAGACCTGCCGCTATAATGCCGATGTGGCCATCTATCAGGACGTCTACGCTGTCCACGCGCCCACATCGCTTTACCATCAAGCGTTAAAAGGGGTCAGGGTCGTGTACTGGATCGGCTTCGATACTACGCCGTTTATGTTTGACGTAATGGCGGGAGCGTACCCAAGCTATTCTACGAATTGGGCAGACGAACTGGTGCTGCAGGCCAGAAACATCGGCCTGTGCAGCTCCAGATTGAGTGAGGGGAGAAGCAGAGGGCTATCCATTATGAGAAAGAAAGCCCTCAGACCAAGCGACCGAGTTATGTTCTCGGTAGGTTCGACGTTGTATACGGAGAGCCGCTCGCTACTGAAAAGCTGGCACCTGCCGTCGACTTTTCATCTAAAGGGTAAGGACTCCTACACATGTAGATGCGACACCATAGTCAGCTGCGAGGGATACGTCGTAAAGAAGATCACGATGAGCCCAGGCCTATTCGGGAAGCCAGTACCGTACGCCGTCACCCACCATGCCGACGGCTTCCTCGTTTGCAAGACCACGGACACGGTCAAAGGGGAGAGGGTTTCTTTCCCCGTATGTACGTATGTCCCAGCGACGATTTGCGACCAGATGACTGGGATCTTAGCCACGGATGTGACGCCTGATGATGCTCAGAAGTTACTGGTGGGCCTGAACCAGCGGATTGTGGTCAATGGGCGCACGCAGAGAAATGTAAATACCATGAAAAATTACCTGCTACCTGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGCAAGTGGGCGAAAGAGTATAAAGCCGACTTGGAAGACGAGAAACCGCTGGGGGTCAGAGAACGCAACTTGACTATGTGTTGCTTGTGGGCCTTCCGAACCAGGAAGACCCACACCTTGTACAAGAAGCCGGACACGCAGACTATAGTGAAAGTCCCTTCTGAATACACCTCCTTACTCATCCCGAGTCTATGGACGAGCGGGATCTCCATGACTCTGAGGAGACGGCTGAAAGTGCTGCTGACTGCCCGACTGAATCAGAAATTGACGTGCCCTTTGGACGCGGTGACAGCAAAGATTGCAGAGGACGATGATCGCGAGGCGCGTGAAGCTGAGTTAACTAGAGAGGCGCTACCTCCTTTGACTGCTACCGAGCCAACCGGCGACGACATACAGGTCGACATCGAGGAGCTTGACGCTAGGGCGGGTGCGGGAGTAGTGAACACACCCCGCAACGCCGTCCGAGTCACCGCTCAGAGTGGTGACACGTTGGTTGGCAGCTATCTGGTGCTCAGCCCGCAGACTGTATTGCGCAGTGACAAACTACGCTTGATCCACGAACTGGCAGAACAAGTGAAGATTATCACGCATTCGGGTAGGGCCGGTAGATATCCTGTTGAAGGCTATGACGGACGTGTGCTGGTACCAACTGGCAGCGCTCTGAGTTTCGCCGATTTCCAGGCGCTTAGTGAGAGTGCCACAATGGTATACAACGAGCGAGAGTTCATGAACAGGAAACTCTACCACATTGCCACGCACGGCCCCGCCCTGAACACGGACGAGGAGAACTACGAGAAGGTGAGAGCGGAAAGGAGTGACGCCGAGTACGTGTTCGACGTGGACGCACGGAAGTGCGTCAAACGCGAGCAGGCGTCGGGAATAGTGTTAGTGGGAGACGCGATCAATCCGCCTTACCATGAGTTCGCCTTTGAAGGCCTAAAAACACGCCCTTCGGTGCCCTACAAAGTACCGACCATCGGTGTGTTTGGAGTTCCGGGATCAGGCAAATCGGCCATCATTAAGTCTGTGGTCACTAGACGTGACCTAGTCACTAGCGGCAAGAAAGAGAACTGCAATGAGATCATGACCGACGTCAAGAAGCAGAGAGGATTGGATATCGTAGCCAAGACGGTGGACTCTATCCTATTAAACGGTTGCAAACACAGCCCTGAGGTGTTGTTCGTTGACGAGGCGTTTGCCTGCCATGCAGGCACTCTGCTCGCGCTCATCGCAATCGTGAGACCCACCAAGAAAGTTGTGTTATGCGGCGATCCGAAGCAATGCGGCTTCTTTAACATGATGCAATTAAAAGTCAATTACAATCATGACATATGCACTGAAGTGCATCATAAAAGCATCTCCCGCCGATGCACAATACCGGTTACATCCATTGTCTCTACACTGCACTACGGAGGCAGGATGCGCACTACGAACCCGCGCAACGACCCTATCGAAATTGACATCACCAGTAGCACCAAACCCAAGCCCGGAGACATCGTGTTAACGTGTTTTCGTGGCTGGGTTAAACAGCTGCAGTTGGACTATCGTGGACACGAAGTCATGACTGCGGCAGCGTCGCAAGGCTTGACCAGGAAAGGAGTATATGCAGTGAGGATGAAAGTCAATGAGAACCCACTATATGCTCCAGCTTCCGAACATGTCAATGTCTTGTTGACACGCACGGAGGGAAGGCTGGTGTGGAAAACGCTGGCCGGAGACCCGTGGATCAAGGTGCTAACTAACGTACCCAAAGGAAACTTCACAGCCACCATTGACGAGTGGCAGGAGGAGCACGACAACATCATGAACGCCATAAGAGGGGAAGTGGCGCCGACTGACCCTTTCCAAAACAAAGCAAATGTTTGTTGGGCAAAAGCTCTGGAACCCGTCCTTGCTACCGCTGGCATCCGACTCAGTGCAGCAGAGTGGAGCGACTTGATAGTCGCCTTCAAGGAAGACAAAGCATACTCGCCCGAGGTTGCGCTGAATGAGATCTGCACCAGAATGTACGGGTTTGACCTAGATAGCGGCCTGTTTTCGGCTCCGCTGGTATCCATGAGATATGAGAACCATCACTGGGACAACTCACCTGGAGGAAAGATGTATGGATTCAACACGCAGGCAGCCAGCAGGCTAGAGCGCAGATACCCCTTCCTGCAAGGAAAATGGAGACTGAACCAGCAGATCCTTTTATCGGAGAGGAGAACGCAACCAGTGAGCTCATCCGCTAACATAGTTCCCATTAATCGTAGGCTGCCGCATACTCTGGTGCTGGAACACGTCAAACTACCCGGAGACCGCGTAGAGCGGATCGTGATGCAAATTCGCGCGCATCACGTGCTGCTAGTGGGTGAATATAACCTCCACCTGCCTTTACGGCGTGTTACCTGGATCGCCCCTCCCTATATACGGGGCGCAGACCGCATCTACGACCTGAGCTTAGGGTTGCCAACTGACCTGGGCAGGTATGATCTGGCGTTCATAAATGTACATACAGAATTCCGCAACCACCACTACCAGCAGTGTGAGGACCATGCAATGAAGTTGCAGATGCTAGGAGGTGATGCCCTACGCCACCTGAAACCGGGCGGATGCCTGCTGATGCGTGCCTATGGGTACGCAGACAGGACCAGCGAGATGGTGGTGAATGCGCTAGCGCGTAAATTCGCATCAATACGCGTACTGCGACCAGCGTGTGTGGCCTCTAACACTGAAGTCTTACTGCTGCTGTCGGGCTTTGACAACGGGAAACGCCAACTGACAATGCACACATCCAATCTGAGACTCTCCAGCGTTTACTCGGGAAACGCACTACACACGGCAGGGTGTGCACCATCATATAGAGTCGTAAGAGGCAATATCACCGACTCCGACGCCGATGTGCTAGTAAATCAATTGGGCGTGAACAATAAGGTCTGCGACGGAGTTTGTAGGGCCATGGTCAAGAAGTGGCCTTCCTGCCTACCGACGACAACTGGAAAAGTAGGCGACGCCGTACTGACCATTGAGCCCCGAAAGATCGTGCATGCTTACTGTCCTAATTTCGGAACCAGTAGAGAGGAGGCTGCCGATGCCGACCTAGCAGCTGTGTATAGAGCCGTGGCGTCCTTGGCTGATGAGACAGTCCGTACAATGGCCATACCACTCCTGTCAACGGGGACGTTCGCTGGGGGAAAAGACCGCGTGCTGCAGTCGTTGAACCACCTATTTACGGCCCTGGACACCACGGACGTCGATGTAACGATATACTGCCGGGATAAGTCGTGGGAAAAGAAAATCCAAGAGGCCATTGATATGAGGACGGCAACCGAACTGCTAGATGACGACACAACGGTTATGAAAGAGCTAACCAGGGTGCATCCTGATAGCTGCCTAGTGGGGCGCAGTGGATTCAGCACGGTGGACGGACGGCTGCATTCGTACCTTGAAGGAACTAGGTTCCACCAGACTGCTGTCGACGTGGCAGAAATAGCCACTCTGTGGCCAAGGAGAGAAGAAGCGAACGAGCAGATAACACACTACGTCCTTGGCGAATCCATGGAGGCCATAAGAACCAAATGCCCGGTGGATGACACCGATTCGTCGGCACCACCATGCACCGTCCCGTGCCTTTGCCGCTACGCCATGACCCCCGAGCGCGTACATAGATTGCGCGCCGCGCAGGTGAAGCAGTTCACGGTTTGCTCATCGTTCCCGCTGCCAAAGTACAAGATACCAGGCGTGCAGAGAGTGGCGTGTTCGGCTGTGATGTTGTTTAATCACGACGTTCC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CAGCAAAAAGCGGACTTTCAATGTAAAGTCTACACCGGCGTCTACCCCTTCTTGTGGGGCGGTGCCTACTGCTTTTGCAATTCGGAAAACACTCAGCTGAGCGAAGCTTATGTTGAGCGGAGCGAGGTGTGCAAACACGACCACGCAGCGGCGTATCGCGCTCATACAGCCGCATTGAAAGCTAAAATCAGAGTGACCTACGGTTCCACGAACGGGACAGCTGAGGCGTTTGTCAACGGAGAGAGCACCGCACGAATCGGAGACCTGAAAATGATCCTTGGTCCCATATCCACCGCGTGGAGCCCCTTTGACCCAAAGATCGTCGTCTACAAGGACGAAGTCTACAATCAGGATTATCCGCCGTACGGATCCGGGCAACCGGGTAGATTTGGGGACCTACAGAGCAGGACCACCGAGAGCAATGATGTGTACGCCAATACTGCACTGAAGCTGGCTCGTCCATCTGCCGGCACGGTGCACGTTCCATATACCCAGACGCCGTCCGGGTTTAAGTATTGGCTAAAAGAAAAAGGGGACGCGTTGAACCACAAGGCTCCTTTCGGCTGCATCATCAAGACGAACCCCGTAAGGGCGGAAAATTGTGCAGTCGGAAACATACCAGTGTCTCTAGACATTCCCGACGCGGCTTTTACACGCATAGTCGACGCACCATCGCTAACCGGCCTGAAGTGCGAGGTGGCGACTTGCACGCACTCATCGGACTTTGGAGGCACTCTGGTGGTGGAGTACAAGACCGACAAAGTGGGGACGTGCGCCGTCCATTCGGAATCCAACACGGCTGTCATGCAGGAGACGAGTCTGTCCGTGACGATGGACGGCCGAGGTACGTTGCATTTCTCCACCGCCTCAGCCTCACCGTCCTTCGTATTGAAAGTGTGCAGTAGCAAAACCACTTGCACAGCAAAGTGCGTGCCGCCGAAGGACCACGTCGTCCCTTTTCCTGCCAACCACAACAATGTTGTGTTCCCGGACTTTTCCAGTACTGCAGTGTCCTGGCTCACCCACACTATGGGCGGAGCTACTGTGGTGATTGCTATTGGGATCATCATATTCCTAATAGTTACTTGCATAGCTTTTAGTAGGCACTAGATATAGTAGAACGGAAAATGGAAAACTAGAAAAATAGTAGGGTAGGCAAAGGCATCGTTAATCATTATACTAAGCAGTGTACACTTATATAACCTCAAATACAACCTATAATCACACTAACTGAGTAGAAAAACAAGAAAACCCATAAAAAGTAGAGTAAGCAATGACATTAACCCTATAATTACTAACACGTATACTAACAGACTAGAAAAAGAGAAAATTACAGAAAAAGTAGAGTAGGCAATGGCATTATTACATATTAACATATATAACACTACAATAGTAAGCAATGACATTAACCCTATAATTACTAACACGTATACTAACAGACTAGAAAAAGAGAAAATTACAGAAAAGTAGAGTAGGCAATGGCATTATTACATATTAACATATATAACACTACAATATAACTTACAACACCATATAGAAGGGCCTTGCCACAGGCCGCCATAATTATAAACAGAACTAATTGGCAGAATTAATTGGATACTAATAATTGGATTATTTATGATTTGGAAATAATACCGCGACGATTGGCTAGTCGCAATTGGTTTTAATATTCC
| 45,592
|
MT015689.1
|
Middelburg virus
|
Fourie,I.
|
University of Pretoria, Medical Virology
|
South Africa
|
2020-11-25
|
ZRU075/17
|
Middelburg virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,673
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Equus caballus
| null | null | null | null |
Middelburg virus isolate ZRU075/17, complete genome
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ATTGGTGGTTACGTACACGTGCCACCACTCCCACCATCCAAGCGATCCAAAATGGCGCGCCCTGTTGTGAAGATAGACGTTGAGGCCGAAAGCCCATTTGTCAAGTCTCTACAGAAGGCGTTTCCACAATTTGAGATCGAAGCAGAGCAGGTCACACCGAATGACCATGCTAACGCGAGGGCGTTTTCGCACCTTGCCAGTAAACTAATTGAAGGAGAGGTGGAAGTGGGCACAACCATCCTGGACATAGGCAGCGCGCCGGCCAGGAGGATGATGTCCAAACATGCATACCACTGCGTCTGCCCACTGAGGAGTGCAGAAGACCCAGAACGATTAGCGGGATACGCGAAGAAGCTTATGAGTGCAGCCGGAAATGTTACTGATCTCAACATCTCGGGAAAGATCACGGACTTAAAGAACGTGATAGCTATACCCGACCTTGAGACACCTACATTCTGCCTGCACACAGACCAGACCTGCCGCTATAATGCCGATGTGGCCATCTATCAGGACGTCTACGCTGTCCACGCGCCCACATCGCTTTACCATCAAGCGTTAAAAGGGGTCAGGGTCGTGTACTGGATCGGCTTCGATACTACGCCGTTTATGTTTGACGTAATGGCGGGAGCGTACCCAAGCTATTCTACGAATTGGGCAGACGAACTGGTGCTGCAGGCCAGAAACATCGGCCTGTGCAGCTCCAGATTGAGTGAGGGGAGAAGCAGAGGGCTATCCATTATGAGAAAGAAAGCCCTCAGACCAAGCGACCGAGTTATGTTCTCGGTAGGTTCGACGTTGTATACGGAGAGCCGCTCGCTACTGAAAAGCTGGCACCTGCCGTCGACTTTTCATCTAAAGGGTAAGGACTCCTACACATGTAGATGCGACACCATAGTCAGCTGCGAGGGATACGTCGTAAAGAAGATCACGATGAGCCCAGGCCTATTCGGGAAGCCAGTACCGTACGCCGTCACCCACCATGCCGACGGCTTCCTCGTTTGCAAGACCACGGACACGGTCAAAGGGGAGAGGGTTTCTTTCCCCGTATGTACGTATGTCCCAGCGACGATTTGCGACCAGATGACTGGGATCTTAGCCACGGATGTGACGCCTGATGATGCTCAGAAGTTACTGGTGGGCCTGAACCAGCGGATTGTGGTCAATGGGCGCACGCAGAGAAATGTAAATACCATGAAAAATTACCTGCTACCTGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGCAAGTGGGCGAAAGAGTATAAAGCCGACTTGGAAGACGAGAAACCGCTGGGGGTCAGAGAACGCAACTTGACTATGTGTTGCTTGTGGGCCTTCCGAACCAGGAAGACCCACACCTTGTACAAGAAGCCGGACACGCAGACTATAGTGAAAGTCCCTTCTGAATACACCTCCTTACTCATCCCGAGTCTATGGACGAGCGGGATCTCCATGACTCTGAGGAGACGGCTGAAAGTGCTGCTGACTGCCCGACTGAATCAGAAATTGACGTGCCCTTTGGACGCGGTGACAGCAAAGATTGCAGAGGACGATGATCGCGAGGCGCGTGAAGCTGAGTTAACTAGAGAGGCGCTACCTCCTTTGACTGCTACCGAGCCAACCGGCGACGACATACAGGTCGACATCGAGGAGCTTGACGCTAGGGCGGGTGCGGGAGTAGTGAACACACCCCGCAACGCCGTCCGAGTCACCGCTCAGAGTGGTGACACGTTGGTTGGCAGCTATCTGGTGCTCAGCCCGCAGACTGTATTGCGCAGTGACAAACTACGCTTGATCCACGAACTGGCAGAACAAGTGAAGATTATCACGCATTCGGGTAGGGCCGGTAGATATCCTGTTGAAGGCTATGACGGACGTGTGCTGGTACCAACTGGCAGCGCTCTGAGTTTCGCCGATTTCCAGGCGCTTAGTGAGGGTGCCACAATGGTATACAACGAGCGAGAGTTCATGAACAGGAAACTCTACCACATTGCCACGCACGGCCCCGCCCTGAACACGGACGAGGAGAACTACGAGAAGGTGAGAGCGGAAAGGAGTGACGCCGAGTACGTGTTCGACGTGGACGCACGGAAGTGCGTCAAACGCGAGCAGGCGTCGGGAATAGTGTTAGTGGGAGACGCGATCAATCCGCCTTACCATGAGTTCGCCTTTGAAGGCCTAAAAACACGCCCTTCGGTGCCCTACAAAGTACCGACCATCGGTGTGTTTGGAGTTCCGGGATCAGGCAAATCGGCCATCATTAAGTCTGTGGTCACTAGACGTGACCTAGTCACTAGCGGCAAGAAAGAGAACTGCAATGAGATCATGACCGACGTCAAGAAGCAGAGAGGATTGGATATCGTAGCCAAGACGGTGGACTCTATCCTATTAAACGGTTGCAAACACAGCCCTGAGGTGTTGTTCGTTGACGAGGCGTTTGCCTGCCATGCAGGCACTCTGCTCGCGCTCATCGCAATCGTGAGACCCACCAAGAAAGTTGTGTTATGCGGCGATCCGAAGCAATGCGGCTTCTTTAACATGATGCAATTAAAAGTCAATTACAATCATGACATATGCACTGAAGTGCATCATAAAAGCATCTCCCGCCGATGCACAATACCGGTTACATCCATTGTCTCTACACTGCACTACGGAGGCAGGATGCGCACTACGAACCCGCGCAACGACCCTATCGAAATTGACATCACCAGTAGCACCAAACCCAAGCCCGGAGACATCGTGTTAACGTGTTTTCGTGGCTGGGTTAAACAGCTGCAGTTGGACTATCGTGGACACGAAGTCATGACTGCGGCAGCGTCGCAAGGCTTGACCAGGAAAGGAGTATATGCAGTGAGGATGAAAGTCAATGAGAACCCACTATATGCTCCAGCTTCCGAACATGTCAATGTCTTGTTGACACGCACGGAGGGAAGGCTGGTGTGGAAAACGCTGGCCGGAGACCCGTGGATCAAGGTGCTAACTAACGTACCCAAAGGAAACTTCACAGCCACCATTGACGAGTGGCAGGAGGAGCACGACAACATCATGAACGCCATAAGAGGGGAAGTGGCGCCGACTGACCCTTTCCAAAACAAAGCAAATGTTTGTTGGGCAAAAGCTCTGGAACCCGTCCTTGCTACCGCTGGCATCCGACTCAGTGCAGCAGAGTGGAGCGACTTGATAGTCGCCTTCAAGGAAGACAAAGCATACTCGCCCGAGGTTGCGCTGAATGAGATCTGCACCAGAATGTACGGGTTTGACCTAGATAGCGGCCTGTTTTCGGCTCCGCTGGTATCCATGAGATATGAGAACCATCACTGGGACAACTCACCTGGAGGAAAGATGTATGGATTCAACACGCAGGCAGCCAGCAGGCTAGAGCGCAGATACCCCTTCCTGCAAGGAAAATGGAGACTGAACCAGCAGATCCTTTTATCGGAGAGGAGAACGCAACCAGTGAGCTCATCCGCTAACATAGTTCCCATTAATCGTAGGCTGCCGCATACTCTGGTGCTGGAACACGTCAAACTACCCGGAGACCGCGTAGAGCGGATCGTGATGCAAATTCGCGCGCATCACGTGCTGCTAGTGGGTGAATATAACCTCCACCTGCCTTTACGGCGTGTTACCTGGATCGCCCCTCCCTATATACGGGGCGCAGACCGCATCTACGACCTGAGCTTAGGGTTGCCAACTGACCTGGGCAGGTATGATCTGGCGTTCATAAATGTACATACAGAATTCCGCAACCACCACTACCAGCAGTGTGAGGACCATGCAATGAAGTTGCAGATGCTAGGAGGTGATGCCCTACGCCACCTGAAACCGGGCGGATGCCTGCTGATGCGTGCCTATGGGTACGCAGACAGGACCAGCGAGATGGTGGTGAATGCGCTAGCGCGTAAATTCGCATCAATACGCGTACTGCGACCAGCGTGTGTGGCCTCTAACACTGAAGTCTTACTGCTGCTGTCGGGCTTTGACAACGGGAAACGCCAACTGACAATGCACACATCCAATCTGAGACTCTCCAGCGTTTACTCGGGAAACGCACTACACACGGCAGGGTGTGCACCATCATATAGAGTCGTAAGAGGCAATATCACCGACTCCGACGCCGATGTGCTAGTAAATCAATTGGGCGTGAACAATAAGGTCTGCGACGGAGTTTGTAGGGCCATGGTCAAGAAGTGGCCTTCCTGCCTACCGACGACAACTGGAAAAGTAGGCGACGCCGTACTGACCATTGAGCCCCGAAAGATCGTGCATGCTTACTGTCCTAATTTCGGAACCAGTAGAGAGGAGGCTGCCGATGCCGACCTAGCAGCTGTGTATAGAGCCGTGGCGTCCTTGGCTGATGAGACAGTCCGTACAATGGCCATACCACTCCTGTCAACGGGGACGTTCGCTGGGGGAAAAGACCGCGTGCTGCAGTCGTTGAACCACCTATTTACGGCCCTGGACACCACGGACGTCGATGTAACGATATACTGCCGGGATAAGTCGTGGGAAAAGAAAATCCAAGAGGCCATTGATATGAGGACGGCAACCGAACTGCTAGATGACGACACAACGGTTATGAAAGAGCTAACCAGGGTGCATCCTGATAGCTGCCTAGTGGGGCGCAGTGGATTCAGCACGGTGGACGGACGGCTGCATTCGTACCTTGAAGGAACTAGGTTCCACCAGACTGCTGTCGACGTGGCAGAAATAGCCACTCTGTGGCCAAGGAGAGAAGAAGCGAACGAGCAGATAACACACTACGTCCTTGGCGAATCCATGGAGGCCATAAGAACCAAATGCCCGGTGGATGACACCGATTCGTCGGCACCACCATGCACCGTCCCGTGCCTTTGCCGCTACGCCATGACCCCCGAGCGCGTACATAGATTGCGCGCCGCGCAGGTGAAGCAGTTCACGGTTTGCTCATCGTTCCCGCTGCCAAAGTACAAGATACCAGGCGTGCAGAGAGTGGCGTGTTCGGCTGTGATGTTGTTTAATCACGACGTTCC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CAGCAAAAAGCGGACTTTCAATGTAAAGTCTACACCGGCGTCTACCCCTTCTTGTGGGGCGGTGCCTACTGCTTTTGCAATTCGGAAAACACTCAGCTGAGCGAAGCTTATGTTGAGCGGAGCGAGGTGTGCAAACACGACCACGCAGCGGCGTATCGCGCTCATACAGCCGCATTGAAAGCTAAAATCAGAGTGACCTACGGTTCCACGAACGGGACAGCTGAGGCGTTTGTCAACGGAGAGAGCACCGCACGAATCGGAGACCTGAAAATGATCCTTGGTCCCATATCCACCGCGTGGAGCCCCTTTGACCCAAAGATCGTCGTCTACAAGGACGAAGTCTACAATCAGGATTATCCGCCGTACGGATCCGGGCAACCGGGTAGATTTGGGGACCTACAGAGCAGGACCACCGAGAGCAATGATGTGTACGCCAATACTGCACTGAAGCTGGCTCGTCCATCTGCCGGCACGGTGCACGTTCCATATACCCAGACGCCGTCCGGGTTTAAGTATTGGCTAAAAGAAAAAGGGGACGCGTTGAACCACAAGGCTCCTTTCGGCTGCATCATCAAGACGAACCCCGTAAGGGCGGAAAATTGTGCAGTCGGAAACATACCAGTGTCTCTAGACATTCCCGACGCGGCTTTTACACGCATAGTCGACGCACCATCGCTAACCGGCCTGAAGTGCGAGGTGGCGACTTGCACGCACTCATCGGACTTTGGAGGCACTCTGGTGGTGGAGTACAAGACCGACAAAGTGGGGACGTGCGCCGTCCATTCGGAATCCAACACGGCTGTCATGCAGGAGACGAGTCTGTCCGTGACGATGGACGGCCGAGGTACGTTGCATTTCTCCACCGCCTCAGCCTCACCGTCCTTCGTATTGAAAGTGTGCAGTAGCAAAACCACTTGCACAGCAAAGTGCGTGCCGCCGAAGGACCACGTCGTCCCTTTTCCTGCCAACCACAACAATGTTGTGTTCCCGGACTTTTCCAGTACTGCAGTGTCCTGGCTCACCCACACTATGGGCGGAGCTACTGTGGTGATTGCTATTGGGATCATCATATTCCTAATAGTTACTTGCATAGCTTTTAGTAGGCACTAGATATAGTAGAACGGAAAATGGAAAACTAGAAAAATAGTAGGGTAGGCAAAGGCATCGTTAATCATTATACTAAGCAGTGTACACTTATATAACCTCAAATACAACCTATAATCACACTAACTGAGTAGAAAAACAAGAAAACCCATAAAAAGTAGAGTAAGCAATGACATTAACCCTATAATTACTAACACGTATACTAACAGACTAGAAAAAGAGAAAATTACAGAAAAAGTAGAGTAGGCAATGGCATTATTACATATTAACATATATAACACTACAATAGTAAGCAATGACATTAACCCTATAATTACTAACACGTATACTAACAGACTAGAAAAAGAGAAAATTACAGAAAAGTAGAGTAGGCAATGGCATTATTACATATTAACATATATAACACTACAATATAACTTACAACACCATATAGAAGGGCCTTGCCACAGGCCGCCATAATTATAAACAGAACTAATTGGCAGAATTAATTGGATACTAATAATTGGATTATTTATGATTTGGAAATAATACCGCGATGATTGGCTAGTCGCAATTGGTTTTAATATTCC
| 45,593
|
MT015690.1
|
Middelburg virus
|
Fourie,I.
|
University of Pretoria, Medical Virology
|
South Africa
|
2020-11-25
|
ZRU059/17/1
|
Middelburg virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,675
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Equus caballus
| null | null | null | null |
Middelburg virus isolate ZRU059/17/1, complete genome
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ATTGGTGGTTACGTACACGTGCCACCACCCCCACCATCCAAGCGATCCAAAATGGCGCGCCCTGTTGTGAAGATAGACGTTGAGGCCGAAAGCCCATTTGTCAAGTCTCTACAGAAGGCGTTTCCACAATTTGAGATCGAAGCAGAGCAGGTCACACCGAATGACCATGCTAACGCGAGGGCGTTTTCGCACCTTGCCAGTAAACTAATTGAAGGAGAGGTGGAAGTGGGCACAACCATCCTGGACATAGGCAGCGCGCCGGCCAGGAGGATGATGTCCAAACATGCATACCACTGCGTCTGCCCACTGAGGAGTGCAGAAGACCCAGAACGATTAGCGGGATACGCGAAGAAGCTTATGAGTGCAGCCGGAAATGTTACTGATCTCAACATCTCGGGAAAGATCACGGACTTAAAGAACGTGATAGCCATACCCGACCTTGAGACACCTACATTCTGCCTGCACACAGACCAGACCTGCCGCTATAATGCCGATGTGGCCATCTATCAGGACGTCTACGCTGTCCACGCGCCCACATCGCTTTACCATCAAGCGTTAAAAGGGGTCAGGGTCGTGTACTGGATCGGCTTCGATACTACGCCGTTTATGTTTGACGTAATGGCGGGAGCGTACCCAAGCTATTCTACGAATTGGGCAGACGAACTGGTGCTGCAGGCCAGAAACATCGGCCTGTGCAGCTCCAGATTGAGTGAGGGGAGAAGCAGAGGGCTATCCATTATGAGAAAGAAAGCCCTCAGACCAAGCGACCGAGTTATGTTCTCGGTAGGTTCGACGTTGTATACGGAGAGCCGCTCGCTACTGAAAAGCTGGCACCTGCCGTCGACTTTTCATCTAAAGGGTAAGGACTCCTACACATGTAGATGCGACACCATAGTCAGCTGCGAGGGATACGTCGTAAAGAAGATCACGATGAGCCCAGGCCTATTCGGGAAGCCAGTACCGTACGCCGTCACCCACCATGCCGACGGCTTCCTCGTTTGCAAGACCACGGACACGGTCAAAGGGGAGAGGGTTTCTTTCCCCGTATGTACGTATGTCCCAGCGACGATTTGCGACCAGATGACTGGGATCTTAGCCACGGATGTGACGCCTGATGATGCTCAGAAGTTACTGGTGGGCCTGAACCAGCGGATTGTGGTCAATGGGCGCACGCAGAGAAATGTAAATACCATGAAAAATTACCTGCTACCTGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGCAAGTGGGCGAAAGAGTATAAAGCCGACTTGGAAGACGAGAAACCGCTGGGGGTCAGAGAACGCAACTTGACTATGTGTTGCTTGTGGGCCTTCCGAACCAGGAAGACCCACACCTTGTACAAGAAGCCGGACACGCAGACTATAGTGAAAGTCCCTTCTGAATACACCTCCTTACTCATCCCGAGTCTATGGACGAGCGGGATCTCCATGACTCTGAGGAGACGGCTGAAAGTGCTGCTGACTGCCCGACTGAATCAGAAATTGACGTGCCCTTTGGACGCGGTGACAGCAAAGATTGCAGAGGACGATGATCGCGAGGCGCGTGAAGCTGAGTTAACTAGAGAGGCGCTACCTCCTTTGACTGCTACCGAGCCAACCGGCGACGACATACAGGTCGACATCGAGGAGCTTGACGCTAGGGCGGGTGCGGGAGTAGTGAACACACCCCGCAACGCCGTCCGAGTCACCGCTCAGAGTGGTGACACGTTGGTTGGCAGCTATCTGGTGCTCAGCCCGCAGACTGTATTGCGCAGTGACAAACTACGCTTGATCCACGAACTGGCAGAACAAGTGAAGATTATCACGCATTCGGGTAGGGCCGGTAGATATCCTGTTGAAGGCTATGACGGACGTGTGCTGGTACCAACTGGCAGCGCTCTGAGTTTCGCCGATTTCCAGGCGCTTAGTGAGAGTGCCACAATGGTATACAACGAGCGAGAGTTCATGAACAGGAAACTCTACCACATTGCCACGCACGGCCCCGCCCTGAACACGGACGAGGAGAACTACGAGAAGGTGAGAGCGGAAAGGAGTGACGCCGAGTACGTGTTCGACGTGGACGCACGGAAGTGCGTCAAACGCGAGCAGGCGTCGGGAATAGTGTTAGTGGGAGACGCGATCAATCCGCCTTACCATGAGTTCGCCTTTGAAGGCCTAAAAACACGCCCTTCGGTGCCCTACAAAGTACCGACCATCGGTGTGTTTGGAGTTCCGGGATCAGGCAAATCGGCCATCATTAAGTCTGTGGTTACTAGACGTGACCTAGTCACTAGCGGCAAGAAAGAGAACTGCAATGAGATCATGACCGACGTCAAGAAGCAGAGAGGATTGGATATCGTAGCCAAGACGGTGGACTCTATCCTATTAAACGGTTGCAAACACAGCCCTGAGGTGTTGTTCGTTGACGAGGCGTTTGCCTGCCATGCAGGCACTCTGCTCGCGCTCATCGCAATCGTGAGACCCACCAAGAAAGTTGTGTTATGCGGCGATCCGAAGCAATGCGGCTTCTTTAACATGATGCAATTAAAAGTCAATTACAATCATGACATATGCACTGAAGTGCATCATAAAAGCATCTCCCGCCGATGCACAATACCGGTTACATCCATTGTCTCTACACTGCACTACGGAGGCAGGATGCGCACTACGAACCCGCGCAACGACCCTATCGAAATTGACATCACCAGTAGCACCAAACCCAAGCCCGGAGACATCGTGTTAACGTGTTTTCGTGGCTGGGTTAAACAGCTGCAGTTGGACTATCGTGGACACGAAGTCATGACTGCGGCAGCGTCGCAAGGCTTGACCAGGAAAGGAGTATATGCAGTGAGGATGAAAGTCAATGAGAACCCACTATATGCTCCAGCTTCCGAACATGTCAATGTCTTGTTGACACGCACGGAGGGAAGGCTGGTGTGGAAAACGCTGGCCGGAGACCCGTGGATCAAGGTGCTAACTAACGTACCCAAAGGAAACTTCACAGCCACCATTGACGAGTGGCAGGAGGAGCACGACAACATCATGAACGCCATAAGAGGGGAAGTGGCGCCGACTGACCCTTTCCAAAACAAAGCAAATGTTTGTTGGGCAAAAGCTCTGGAACCCGTCCTTGCTACCGCTGGCATCCGACTCAGTGCAGCAGAGTGGAGCGACTTGATAGTCGCCTTCAAGGAAGACAAAGCATACTCGCCCGAGGTTGCGCTGAATGAGATCTGCACCAGAATGTACGGGTTTGACCTAGATAGCGGCCTGTTTTCGGCTCCGCTGGTATCCATGAGATATGAGAACCATCACTGGGACAACTCACCTGGAGGAAAGATGTATGGATTCAACACGCAGGCAGCCAGCAGGCTAGAGCGCAGATACCCCTTCCTGCAAGGAAAATGGAGACTGAACCAGCAGATCCTTTTATCGGAGAGGAGAACGCAACCAGTGAGCTCATCCGCTAACATAGTTCCCATTAATCGTAGGCTGCCGCATACTCTGGTGCTGGAACACGTCAAACTACCCGGAGACCGCGTAGAGCGGATCGTGATGCAAATTCGCGCGCATCACGTGCTGCTAGTGGGTGAGTATAACCTCCACCTGCCTTTACGGCGTGTTACCTGGATCGCCCCTCCCTATATACGGGGCGCAGACCGCATCTACGACCTGAGCTTAGGGTTGCCAACTGACCTGGGCAGGTATGATCTGGCGTTCATAAATGTACATACAGAATTCCGCAACCACCACTACCAGCAGTGTGAGGACCATGCAATGAAGTTGCAGATGCTAGGAGGTGATGCCCTACGCCACCTGAAACCGGGCGGATGCCTGCTGATGCGTGCCTATGGGTACGCAGACAGGACCAGCGAGATGGTGGTGAATGCGCTAGCGCGTAAATTCGCATCAATACGCGTACTGCGACCAGCGTGTGTGGCCTCTAACACTGAAGTCTTACTGCTGCTGTCGGGCTTTGACAACGGGAAACGCCAACTGACAATGCACACATCCAATCTGAGACTCTCCAGCGTTTACTCGGGAAACGCACTACACACGGCAGGGTGTGCACCATCATATAGAGTCGTAAGAGGCAATATCACCGACTCCGACGCCGATGTGCTAGTAAATCAATTGGGCGTGAACAATAAGGTCTGCGACGGAGTTTGTAGGGCCATGGTCAAGAAGTGGCCTTCCTGCCTACCGACGACAACTGGAAAAGTAGGCGACGCCGTACTGACCATTGAGCCCCGAAAGATCGTGCATGCTTACTGTCCTAATTTCGGAACCAGTAGAGAGGAGGCTGCCGATGCCGACCTAGCAGCTGTGTATAGAGCCGTGGCGTCCTTGGCTGATGAGACAGTCCGTACAATGGCCATACCACTCCTGTCAACGGGGACGTTCGCTGGGGGAAAAGACCGCGTGCTGCAGTCGTTGAACCACCTATTTACGGCCCTGGACACCACGGACGTCGATGTAACGATATACTGCCGGGATAAGTCGTGGGAAAAGAAAATCCAAGAGGCCATTGATATGAGGACGGCAACCGAACTGCTAGATGACGACACAACGGTTATGAAAGAGCTAACCAGGGTGCATCCTGATAGCTGCCTAGTGGGGCGCAGTGGATTCAGCACGGTGGACGGACGGCTGCATTCGTACCTTGAAGGAACTAGGTTCCACCAGACTGCTGTCGACGTGGCAGAAATAGCCACTCTGTGGCCAAGGAGAGAAGAAGCGAACGAGCAGATAACACACTACGTCCTTGGCGAATCCATGGAGGCCATAAGAACCAAATGCCCGGTGGATGACACCGATTCGTCGGCACCACCATGCACCGTCCCGTGCCTTTGCCGCTACGCCATGACCCCCGAGCGCGTACATAGATTGCGCGCCGCGCAGGTGAAGCAGTTCACGGTTTGCTCATCGTTCCCGCTGCCAAAGTACAAGATACCAGGCGTGCAGAGAGTGGCGTGTTCGGCTGTGATGTTGTTTAATCACGACGTTCC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CAGCAAAAAGCGGACTTTCAATGTAAAGTCTACACCGGCGTCTACCCCTTCTTGTGGGGCGGTGCCTACTGCTTTTGCAATTCGGAAAACACTCAGCTGAGCGAAGCTTATGTTGAGCGGAGCGAGGTGTGCAAACACGACCACGCAGCGGCGTATCGCGCTCATACAGCCGCATTGAAAGCTAAAATCAGAGTGACCTACGGTTCCACGAACGGGACAGCTGAGGCGTTTGTCAACGGAGAGAGCACCGCACGAATCGGAGACCTGAAAATGATCCTTGGTCCCATATCCACCGCGTGGAGCCCCTTTGACCCAAAGATCGTCGTCTACAAGGACGAAGTCTACAATCAGGATTATCCGCCGTACGGATCCGGGCAACCGGGTAGATTTGGGGACCTACAGAGCAGGACCACCGAGAGCAATGATGTGTACGCCAATACTGCACTGAAGCTGGCTCGTCCATCTGCCGGCACGGTGCACGTTCCATATACCCAGACGCCGTCCGGGTTTAAGTATTGGCTAAAAGAAAAAGGGGACGCGTTGAACCACAAGGCTCCTTTCGGCTGCATCATCAAGACGAACCCCGTAAGGGCGGAAAATTGTGCAGTCGGAAACATACCAGTGTCTCTAGACATTCCCGACGCGGCTTTTACACGCATAGTCGACGCACCATCGCTAACCGGCCTGAAGTGCGAGGTGGCGACTTGCACGCACTCATCGGACTTTGGAGGCACTCTGGTGGTGGAGTACAAGACCGACAAAGTGGGGACGTGCGCCGTCCATTCGGAATCCAACACGGCTGTCATGCAGGAGACGAGTCTGTCCGTGACGATGGACGGCCGAGGTACGTTGCATTTCTCCACCGCCTCAGCCTCACCGTCCTTCGTATTGAAAGTGTGCAGTAGCAAAACCACTTGCACAGCAAAGTGCGTGCCGCCGAAGGACCACGTCGTCCCTTTTCCTGCCAACCACAACAATGTTGTGTTCCCGGACTTTTCCAGTACTGCAGTGTCCTGGCTCACCCACACTATGGGCGGAGCTACTGTGGTGATTGCTATTGGGATCATCATATTCCTAATAGTTACTTGCATAGCTTTTAGTAGGCACTAGATATAGTAGAACGGAAAATGGAAAACTAGAAAAATAGTAGGGTAGGCAAAGGCATCGTTAATCATTATACTAAGCAGTGTACACTTATATAACCTCAAATACAACCTATAATCACACTAACTGAGTAGAAAAAACAAGAAAACCCATAAAAAGTAGAGTAAGCAATGACATTAACCCTATAATTACTAACACGTATACTAACAGACTAGAAAAAGAGAAAATTACAGAAAAAGTAGAGTAGGCAATGGCATTATTACATATTAACATATATAACACTACAATAGTAAGCAATGACATTAACCCTATAATTACTAACACGTATACTAACAGACTAGAAAAAGAGAAAATTACAGAAAAGTAGAGTAGGCAATGGCATTATTACATATTAACATATATAACACTACAATATAACTTACAACACCATATAGAAGGGCCTTGCCACAGGCCGCCATAATTATAAACAGAACTAATTGGCAGAATTAATTGGATACTAATAATTGGATTATTTATGATTTGGAAACAATACCGCGACGATATGGCTAGTCGCAATTGGTTTTAATATTCC
| 45,594
|
MT015691.1
|
Middelburg virus
|
Fourie,I.
|
University of Pretoria, Medical Virology
|
South Africa
|
2020-11-25
|
ZRU044/17
|
Middelburg virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,675
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Equus caballus
| null | null | null | null |
Middelburg virus isolate ZRU044/17, complete genome
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ATTGGTGGTTACGTACACGTGCCACCACCCCCACCATCCAAGCGATCCAAAATGGCGCGCCCTGTTGTGAAGATAGACGTTGAGGCCGAAAGCCCATTTGTCAAGTCTCTACAGAAGGCGTTTCCACAATTTGAGATCGAAGCAGAGCAGGTCACACCGAATGACCATGCTAACGCGAGGGCGTTTTCGCACCTTGCCAGTAAACTAATTGAAGGAGAGGTGGAAGTGGGCACAACCATCCTGGACATAGGCAGCGCGCCGGCCAGGAGGATGATGTCCAAACATGCATACCACTGCGTCTGCCCACTGAGGAGTGCAGAAGACCCAGAACGATTAGCGGGATACGCGAAGAAGCTTATGAGTGCAGCCGGAAATGTTACTGATCTCAACATCTCGGGAAAGATCACGGACTTAAAGAACGTGATAGCCATACCCGACCTTGAGACACCTACATTCTGCCTGCACACAGACCAGACCTGCCGCTATAATGCCGATGTGGCCATCTATCAGGACGTCTACGCTGTCCACGCGCCCACATCGCTTTACCATCAAGCGTTAAAAGGGGTCAGGGTCGTGTACTGGATCGGCTTCGATACTACGCCGTTTATGTTTGACGTAATGGCGGGAGCGTACCCAAGCTATTCTACGAATTGGGCAGACGAACTGGTGCTGCAGGCCAGAAACATCGGCCTGTGCAGCTCCAGATTGAGTGAGGGGAGAAGCAGAGGGCTATCCATTATGAGAAAGAAAGCCCTCAGACCAAGCGACCGAGTTATGTTCTCGGTAGGTTCGACGTTGTATACGGAGAGCCGCTCGCTACTGAAAAGCTGGCACCTGCCGTCGACTTTTCATCTAAAGGGTAAGGACTCCTACACATGTAGATGCGACACCATAGTCAGCTGCGAGGGATACGTCGTAAAGAAGATCACGATGAGCCCAGGCCTATTCGGGAAGCCAGTACCGTACGCCGTCACCCACCATGCCGACGGCTTCCTCGTTTGCAAGACCACGGACACGGTCAAAGGGGAGAGGGTTTCTTTCCCCGTATGTACGTATGTCCCAGCGACGATTTGCGACCAGATGACTGGGATCTTAGCCACGGATGTGACGCCTGATGATGCTCAGAAGTTACTGGTGGGCCTGAACCAGCGGATTGTGGTCAATGGGCGCACGCAGAGAAATGTAAATACCATGAAAAATTACCTGCTACCTGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGCAAGTGGGCGAAAGAGTATAAAGCCGACTTGGAAGACGAGAAACCGCTGGGGGTCAGAGAACGCAACTTGACTATGTGTTGCTTGTGGGCCTTCCGAACCAGGAAGACCCACACCTTGTACAAGAAGCCGGACACGCAGACTATAGTGAAAGTCCCTTCTGAATACACCTCCTTACTCATCCCGAGTCTATGGACGAGCGGGATCTCCATGACTCTGAGGAGACGGCTGAAAGTGCTGCTGACTGCCCGACTGAATCAGAAATTGACGTGCCCTTTGGACGCGGTGACAGCAAAGATTGCAGAGGACGATGATCGCGAGGCGCGTGAAGCTGAGTTAACTAGAGAGGCGCTACCTCCTTTGACTGCTACCGAGCCAACCGGCGACGACATACAGGTCGACATCGAGGAGCTTGACGCTAGGGCGGGTGCGGGAGTAGTGAACACACCCCGCAACGCCGTCCGAGTCACCGCTCAGAGTGGTGACACGTTGGTTGGCAGCTATCTGGTGCTCAGCCCGCAGACTGTATTGCGCAGTGACAAACTACGCTTGATCCACGAACTGGCAGAACAAGTGAAGATTATCACGCATTCGGGTAGGGCCGGTAGATATCCTGTTGAAGGCTATGACGGACGTGTGCTGGTACCAACTGGCAGCGCTCTGAGTTTCGCCGATTTCCAGGCGCTTAGTGAGAGTGCCACAATGGTATACAACGAGCGAGAGTTCATGAACAGGAAACTCTACCACATTGCCACGCACGGCCCCGCCCTGAACACGGACGAGGAGAACTACGAGAAGGTGAGAGCGGAAAGGAGTGACGCCGAGTACGTGTTCGACGTGGACGCACGGAAGTGCGTCAAACGCGAGCAGGCGTCGGGAATAGTGTTAGTGGGAGACGCGATCAATCCGCCTTACCATGAGTTCGCCTTTGAAGGCCTAAAAACACGCCCTTCGGTGCCCTACAAAGTACCGACCATCGGTGTGTTTGGAGTTCCGGGATCAGGCAAATCGGCCATCATTAAGTCTGTGGTTACTAGACGTGACCTAGTCACTAGCGGCAAGAAAGAGAACTGCAATGAGATCATGACCGACGTCAAGAAGCAGAGAGGATTGGATATCGTAGCCAAGACGGTGGACTCTATCCTATTAAACGGTTGCAAACACAGCCCTGAGGTGTTGTTCGTTGACGAGGCGTTTGCCTGCCATGCAGGCACTCTGCTCGCGCTCATCGCAATCGTGAGACCCACCAAGAAAGTTGTGTTATGCGGCGATCCGAAGCAATGCGGCTTCTTTAACATGATGCAATTAAAAGTCAATTACAATCATGACATATGCACTGAAGTGCATCATAAAAGCATCTCCCGCCGATGCACAATACCGGTTACATCCATTGTCTCTACACTGCACTACGGAGGCAGGATGCGCACTACGAACCCGCGCAACGACCCTATCGAAATTGACATCACCAGTAGCACCAAACCCAAGCCCGGAGACATCGTGTTAACGTGTTTTCGTGGCTGGGTTAAACAGCTGCAGTTGGACTATCGTGGACACGAAGTCATGACTGCGGCAGCGTCGCAAGGCTTGACCAGGAAAGGAGTATATGCAGTGAGGATGAAAGTCAATGAGAACCCACTATATGCTCCAGCTTCCGAACATGTCAATGTCTTGTTGACACGCACGGAGGGAAGGCTGGTGTGGAAAACGCTGGCCGGAGACCCGTGGATCAAGGTGCTAACTAACGTACCCAAAGGAAACTTCACAGCCACCATTGACGAGTGGCAGGAGGAGCACGACAACATCATGAACGCCATAAGAGGGGAAGTGGCGCCGACTGACCCTTTCCAAAACAAAGCAAATGTTTGTTGGGCAAAAGCTCTGGAACCCGTCCTTGCTACCGCTGGCATCCGACTCAGTGCAGCAGAGTGGAGCGACTTGATAGTCGCCTTCAAGGAAGACAAAGCATACTCGCCCGAGGTTGCGCTGAATGAGATCTGCACCAGAATGTACGGGTTTGACCTAGATAGCGGCCTGTTTTCGGCTCCGCTGGTATCCATGAGATATGAGAACCATCACTGGGACAACTCACCTGGAGGAAAGATGTATGGATTCAACACGCAGGCAGCCAGCAGGCTAGAGCGCAGATACCCCTTCCTGCAAGGAAAATGGAGACTGAACCAGCAGATCCTTTTATCGGAGAGGAGAACGCAACCAGTGAGCTCATCCGCTAACATAGTTCCCATTAATCGTAGGCTGCCGCATACTCTGGTGCTGGAACACGTCAAACTACCCGGAGACCGCGTAGAGCGGATCGTGATGCAAATTCGCGCGCATCACGTGCTGCTAGTGGGTGAGTATAACCTCCACCTGCCTTTACGGCGTGTTACCTGGATCGCCCCTCCCTATATACGGGGCGCAGACCGCATCTACGACCTGAGCTTAGGGTTGCCAACTGACCTGGGCAGGTATGATCTGGCGTTCATAAATGTACATACAGAATTCCGCAACCACCACTACCAGCAGTGTGAGGACCATGCAATGAAGTTGCAGATGCTAGGAGGTGATGCCCTACGCCACCTGAAACCGGGCGGATGCCTGCTGATGCGTGCCTATGGGTACGCAGACAGGACCAGCGAGATGGTGGTGAATGCGCTAGCGCGTAAATTCGCATCAATACGCGTACTGCGACCAGCGTGTGTGGCCTCTAACACTGAAGTCTTACTGCTGCTGTCGGGCTTTGACAACGGGAAACGCCAACTGACAATGCACACATCCAATCTGAGACTCTCCAGCGTTTACTCGGGAAACGCACTACACACGGCAGGGTGTGCACCATCATATAGAGTCGTAAGAGGCAATATCACCGACTCCGACGCCGATGTGCTAGTAAATCAATTGGGCGTGAACAATAAGGTCTGCGACGGAGTTTGTAGGGCCATGGTCAAGAAGTGGCCTTCCTGCCTACCGACGACAACTGGAAAAGTAGGCGACGCCGTACTGACCATTGAGCCCCGAAAGATCGTGCATGCTTACTGTCCTAATTTCGGAACCAGTAGAGAGGAGGCTGCCGATGCCGACCTAGCAGCTGTGTATAGAGCCGTGGCGTCCTTGGCTGATGAGACAGTCCGTACAATGGCCATACCACTCCTGTCAACGGGGACGTTCGCTGGGGGAAAAGACCGCGTGCTGCAGTCGTTGAACCACCTATTTACGGCCCTGGACACCACGGACGTCGATGTAACGATATACTGCCGGGATAAGTCGTGGGAAAAGAAAATCCAAGAGGCCATTGATATGAGGACGGCAACCGAACTGCTAGATGACGACACAACGGTTATGAAAGAGCTAACCAGGGTGCATCCTGATAGCTGCCTAGTGGGGCGCAGTGGATTCAGCACGGTGGACGGACGGCTGCATTCGTACCTTGAAGGAACTAGGTTCCACCAGACTGCTGTCGACGTGGCAGAAATAGCCACTCTGTGGCCAAGGAGAGAAGAAGCGAACGAGCAGATAACACACTACGTCCTTGGCGAATCCATGGAGGCCATAAGAACCAAATGCCCGGTGGATGACACCGATTCGTCGGCACCACCATGCACCGTCCCGTGCCTTTGCCGCTACGCCATGACCCCCGAGCGCGTACATAGATTGCGCGCCGCGCAGGTGAAGCAGTTCACGGTTTGCTCATCGTTCCCGCTGCCAAAGTACAAGATACCAGGCGTGCAGAGAGTGGCGTGTTCGGCTGTGATGTTGTTTAATCACGACGTTCC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CAGCAAAAAGCGGACTTTCAATGTAAAGTCTACACCGGCGTCTACCCCTTCTTGTGGGGCGGTGCCTACTGCTTTTGCAATTCGGAAAACACTCAGCTGAGCGAAGCTTATGTTGAGCGGAGCGAGGTGTGCAAACACGACCACGCAGCGGCGTATCGCGCTCATACAGCCGCATTGAAAGCTAAAATCAGAGTGACCTACGGTTCCACGAACGGGACAGCTGAGGCGTTTGTCAACGGAGAGAGCACCGCACGAATCGGAGACCTGAAAATGATCCTTGGTCCCATATCCACCGCGTGGAGCCCCTTTGACCCAAAGATCGTCGTCTACAAGGACGAAGTCTACAATCAGGATTATCCGCCGTACGGATCCGGGCAACCGGGTAGATTTGGGGACCTACAGAGCAGGACCACCGAGAGCAATGATGTGTACGCCAATACTGCACTGAAGCTGGCTCGTCCATCTGCCGGCACGGTGCACGTTCCATATACCCAGACGCCGTCCGGGTTTAAGTATTGGCTAAAAGAAAAAGGGGACGCGTTGAACCACAAGGCTCCTTTCGGCTGCATCATCAAGACGAACCCCGTAAGGGCGGAAAATTGTGCAGTCGGAAACATACCAGTGTCTCTAGACATTCCCGACGCGGCTTTTACACGCATAGTCGACGCACCATCGCTAACCGGCCTGAAGTGCGAGGTGGCGACTTGCACGCACTCATCGGACTTTGGAGGCACTCTGGTGGTGGAGTACAAGACCGACAAAGTGGGGACGTGCGCCGTCCATTCGGAATCCAACACGGCTGTCATGCAGGAGACGAGTCTGTCCGTGACGATGGACGGCCGAGGTACGTTGCATTTCTCCACCGCCTCAGCCTCACCGTCCTTCGTATTGAAAGTGTGCAGTAGCAAAACCACTTGCACAGCAAAGTGCGTGCCGCCGAAGGACCACGTCGTCCCTTTTCCTGCCAACCACAACAATGTTGTGTTCCCGGACTTTTCCAGTACTGCAGTGTCCTGGCTCACCCACACTATGGGCGGAGCTACTGTGGTGATTGCTATTGGGATCATCATATTCCTAATAGTTACTTGCATAGCTTTTAGTAGGCACTAGATATAGTAGAACGGAAAATGGAAAACTAGAAAAATAGTAGGGTAGGCAAAGGCATCGTTAATCATTATACTAAGCAGTGTACACTTATATAACCTCAAATACAACCTATAATCACACTAACTGAGTAGAAAAAACAAGAAAACCCATAAAAAGTAGAGTAAGCAATGACATTAACCCTATAATTACTAACACGTATACTAACAGACTAGAAAAAGAGAAAATTACAGAAAAAGTAGAGTAGGCAATGGCATTATTACATATTAACATATATAACACTACAATAGTAAGCAATGACATTAACCCTATAATTACTAACACGTATACTAACAGACTAGAAAAAGAGAAAATTACAGAAAAGTAGAGTAGGCAATGGCATTATTACATATTAACATATATAACACTACAATATAACTTACAACACCATATAGAAGGGCCTTGCCACAGGCCGCCATAATTATAAACAGAACTAATTGGCAGAATTAATTGGATACTAATAATTGGATTATTTATGATTTGGAAACAATACCGCGACGATATGGCTAGTCGCAATTGGTTTTAATATTCC
| 45,595
|
MT015692.1
|
Middelburg virus
|
Fourie,I.
|
University of Pretoria, Medical Virology
|
South Africa
|
2020-11-25
|
ZRU089/14
|
Middelburg virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,643
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Equus caballus
| null | null | null | null |
Middelburg virus isolate ZRU089/14, complete genome
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CCACCATCCAAGCGATCCAAAATGGCGCGCCCTGTTGTGAAGATAGACGTTGAGGCCGAAAGCCCATTTGTCAAGTCTCTACAGAAGGCGTTTCCACAATTTGAGATCGAAGCAGAGCAGGTCACACCGAATGACCATGCTAACGCGAGGGCGTTTTCGCACCTTGCCAGTAAACTAATTGAAGGAGAGGTGGAAGTGGGCACAACCATCCTGGACATAGGCAGCGCGCCGGCCAGGAGGATGATGTCCAAACATGCATACCACTGCGTCTGCCCACTGAGGAGTGCAGAAGACCCAGAACGATTAGCGGGATACGCGAAGAAGCTTATGAGTGCAGCCGGAAACGTTACTGATCTCAACATCTCGGGAAAGATCACGGACTTAAAGAACGTGATAGCCATACCCGACCTTGAGACACCTACATTCTGCCTGCACACAGACCAGACCTGCCGCTATAATGCCGATGTGGCCATCTATCAGGACGTCTACGCTGTCCACGCGCCCACATCGCTTTACCATCAAGCATTAAAAGGGGTCAGGGTCGTGTACTGGATCGGCTTCGATACTACGCCGTTTATGTTTGACGTAATGGCGGGAGCGTACCCAAGCTATTCTACGAATTGGGCAGACGAACTGGTGCTGCAGGCCAGAAACATCGGCCTGTGCAGCTCCAGATTGAGTGAGGGGAGAAGCAGAGGGCTATCCATTATGAGAAAGAAAGCCCTCAGACCAAGCGACCGAGTTATGTTCTCGGTAGGTTCGACGTTGTATACGGAGAGCCGCTCGCTACTGAAAAGCTGGCACCTGCCGTCGACTTTTCATCTAAAGGGTAAGGACTCCTACACATGTAGATGCGACACCATAGTCAGCTGCGAGGGATACGTCGTAAAGAAGATCACGATGAGCCCAGGCCTATTCGGGAAGCCAGTACCGTACGCCGTCACCCATCATGCCGACGGCTTCCTCGTTTGCAAGACCACGGACACGGTCAAAGGGGAGAGGGTTTCTTTCCCCGTATGTACGTATGTCCCAGCGACGATTTGCGACCAGATGACTGGGATCCTAGCCACGGATGTGACGCCTGATGATGCTCAGAAGTTACTGGTGGGCCTGAACCAGCGGATCGTGGTCAATGGGCGCACGCAGAGAAATGTAAATACCATGAAAAATTACCTGCTACCTGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGCAAGTGGGCGAAAGAGTATAAAGCCGACTTGGAAGACGAGAAACCACTGGGGGTCAGAGAACGCAACTTGACTATGTGTTGCTTGTGGGCCTTCCGAACCAGGAAGACCCACACCTTGTACAAGAAGCCGGACACGCAGACTATAGTGAAAGTCCCTTCTGAATACACCTCCTTACTCATCCCGAGTCTATGGACGAGCGGGATCTCCATGACTCTGAGGAGACGGCTGAAAGTGCTGTTGACTGCCCGACTGAATCAGAAATTGACGTGCCCTTTGGACGCGGTGACAGCAAAGATCGCAGAGGACGATGATCGTGAGGCGCGTGAAGCTGAGTTAACTAGAGAGGCGCTACCTCCTTTGACTGCTACCGAGCCAACCGGCGACGATATACAGGTCGACATCGAGGAGCTTGACGCTAGGGCGGGTGCGGGAGTAGTGAACACACCCCGCAACGCCGTCCGAGTCACCGCTCAGAGTGGTGACACGTTGGTTGGCAGCTATCTGGTGCTCAGCCCGCAGACTGTATTGCGCAGTGACAAACTACGCTTGATTCACGAACTGGCAGAACAAGTGAAGATTATCACGCATTCGGGTAGGGCCGGTAGATATCCTGTTGAAGGCTATGACGGACGTGTGCTGGTACCGACTGGCAGCGCTCTGAGTTTCGCCGATTTCCAGGCGCTTAGTGAGAGTGCCACAATGGTATACAACGAGCGAGAGTTCGTGAACAGGAAACTCTACCACATTGCCACGCACGGCCCCGCCCTGAACACGGACGAGGAGAACTACGAGAAGGTGAGAGCGGAAAGGAGTGACGCCGAGTACGTGTTCGACGTGGACGCACGGAAGTGCGTCAAACGCGAGCAGGCGTCGGGAATAGTGTTAGTGGGAGACGCGATCAATCCGCCTTACCATGAGTTCGCCTTTGAAGGCCTAAAAACACGCCCATCGGTGCCCTACAAAGTACCGACCATCGGTGTGTTTGGAGTTCCGGGATCAGGCAAATCGGCCATCATTAAGTCTGTGGTCACTAGACGTGACCTAGTCACTAGCGGCAAGAAAGAGAACTGCAATGAGATCATGACCGACGTCAAGAAGCAGAGAGGATTGGATATCGTAGCCAAGACGGTGGACTCTATCCTATTAAACGGTTGCAAACACAGCCCTGAGGTGTTGTTCGTTGACGAGGCGTTTGCCTGCCATGCAGGCACTCTGCTCGCGCTCATCGCAATCGTGAGACCCACCAAGAAAGTTGTGTTATGCGGCGATCCGAAGCAATGCGGCTTCTTTAACATGATGCAATTAAAAGTCAATTACAATCATGACATATGCACTGAAGTGCATCACAAAAGCATCTCCCGCCGATGCACAATACCGGTTACATCCATTGTCTCTACACTGCACTACGGAGGCAGGATGCGCACTACGAACCCGCGCAACGACCCTATCGAAATTGACATCACCAGTAGTACCAAACCCAAGCCCGGAGACATTGTGTTAACATGTTTTCGTGGCTGGGTTAAACAGCTGCAGTTGGACTATCGTGGACACGAAGTCATGACTGCGGCAGCGTCGCAAGGCTTGACCAGGAAAGGAGTATATGCAGTGAGGATGAAAGTCAATGAGAACCCACTATATGCTCCAGCTTCCGAACACGTCAATGTCTTGTTGACACGCACGGAGGGAAGGCTAGTGTGGAAAACGCTGGCCGGAGACCCGTGGATCAAGGTGCTAACTAACGTACCCAAAGGAAACTTCACAGCCACCATTGACGAGTGGCAGGAGGAGCACGACAACATCATGAACGCCATAAGAGGGGAAGTGGCGCCGACTGACCCTTTCCAAAACAAAGCAAATGTTTGTTGGGCAAAAGCTCTAGAACCCGTCCTTGCTACCGCTGGCATCCGACTCAGTGCAGCAGAGTGGAGCGACTTGATAGTCGCCTTCAAGGAAGACAAAGCATACTCGCCCGAGGTTGCGCTGAATGAGATCTGCACCAGAATGTACGGGTTTGACCTAGATAGCGGCCTGTTTTCGGCTCCGCTGGTATCCATGAGATATGAGAACCATCACTGGGACAACTCACCGGGAGGAAAGATGTATGGATTCAACACACAGGCAGCCAGCAGGCTAGAGCGCAGATACCCCTTCCTGCAAGGAAAATGGAGACTGAACCAGCAGATCCTTTTATCGGAGAGGAGAACGCAACCAGTGAGCTCATCCGCTAACATAGTTCCCATTAATCGTAGGCTGCCGCATACTCTGGTGCTGGAACACGTCAAGCTACCCGGAGACCGCGTAGAGCGGATCGTGATGCAAATTCGTGCGCATCACGTGCTGCTAGTGGGTGAGTATAACCTCCACCTGCCTTTACGGCGTGTTACCTGGATCGCCCCTCCCTATATACGGGGCGCAGACCGCATCTACGACCTGAGCTTAGGGTTGCCAACTGACCTGGGCAGGTATGATCTGGCGTTCATAAATGTACATACAGAATTCCGCAACCACCACTACCAGCAGTGTGAGGACCACGCAATGAAGTTGCAGATGCTAGGAGGTGATGCCCTACGCCACCTGAAACCGGGCGGATGCCTGCTGATGCGTGCCTATGGGTACGCAGACAGGACCAGCGAGATGGTGGTGAATGCGCTAGCGCGTAAATTCGCATCAATACGCGTACTGCGACCAGCGTGTGTGGCCTCTAACACCGAAGTCTTACTGCTGCTGTCGGGCTTTGACAACGGGAAACGCCAACTGACAATGCACACATCCAATCTGAGACTCTCCAGCGTTTACTCGGGAAACGCACTACACACGGCAGGGTGTGCACCATCATATAGAGTCGTAAGAGGCAATATCACCGACTCCGACGCCGATGTGCTAGTAAATCAATTGGGCGTGAACAATAAGGTCTGCGACGGAGTTTGTAGGGCCATGGTCAAGAAGTGGCCTTCCTGCCTACCAACGACAACTGGAAAAGTAGGCGACGCCGTACTGACCACTGAGCCCCGAAAGATCGTGCACGCTTACTGTCCTAATTTCGGAACCAGTAGAGAGGAGGCTGCCGATGCCGACCTAGCAGCTGTGTATAGAGCCGTAGCGTCCTTGGCTGATGAGACAGTCCGCACAATGGCCATACCACTCCTGTCAACGGGGACGTTCGCTGGGGGAAAGGACCGCGTGCTGCAGTCGTTGAACCACCTATTTACGGCCCTGGACACCACGGACGTCGATGTAACGATATACTGCCGGGATAAGTCGTGGGAAAAGAAAATCCAAGAGGCCATTGATATGAGGACGGCAACCGAACTGCTAGATGACGACACAACGGTTATGAAAGAGCTAACCAGGGTGCATCCTGATAGCTGCCTAGTGGGGCGCAGTGGATTCAGCACGGTGGACGGACGGCTGCATTCGTACCTTGAAGGAACTAGGTTCCACCAGACTGCTGTCGACGTGGCAGAAATAGCCACTCTGTGGCCAAGGAGAGAAGAAGCGAACGAGCAGATAACACACTACGTCCTTGGCGAATCCATGGAGGCCATAAGAACCAAATGCCCGGTGGATGACACCGATTCGTCGGCACCACCATGCACCGTCCCGTGCCTTTGCCGCTACGCCATGACCCCCGAGCGCGTACATAGATTGCGCGCCGCGCAGGTGAAGCAGTTCACGGTTTGCTCCTCGTTCCCGCTTCCAAAGTACAAGATACCAGGCGTGCAGAGAGTGGCGTGTTCGGCTGTAATGTTGTTTAATCACGACGTTCCAGCGCTGGTAAGCCCTCGCAAGTACAGGGA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TACACCGGCGTCTACCCCTTCTTGTGGGGCGGTGCCTACTGCTTTTGCAATTCGGAAAACACTCAGCTGAGCGAAGCTTATGTTGAGCGGAGCGAGGTGTGCAAACACGACCACGCAGCGGCGTATCGCGCTCATACAGCCGCATTGAAAGCTAAAATCAGAGTGACCTACGGTTCCACGAACGGGACAGCTGAGGCGTTTGTCAACGGAGAGAGCACCGCACGAATCGGAGACCTGAAAATGATCCTTGGTCCCATATCCACCGCGTGGAGCCCCTTTGACCCAAAGATCGTCGTCTACAAGGACGAAGTCTACAATCAGGATTATCCGCCGTACGGATCCGGGCAACCGGGTAGATTTGGGGACCTACAGAGCAGGACCACCGAGAGCAATGATGTGTACGCCAATACTGCACTGAAGCTGGCTCGTCCATCTGCCGGCACGGTGCACGTTCCATATACCCAGACGCCGTCCGGGTTTAAGTATTGGCTAAAAGAAAAAGGGGACGCGTTGAACCACAAGGCTCCTTTCGGCTGCATCATCAAGACGAACCCCGTAAGGGCGGAAAATTGTGCAGTCGGAAACATACCAGTGTCTCTAGACATTCCCGACGCGGCTTTTACACGCATAGTCGACGCACCATCGCTAACCGGCCTGAAGTGCGAGGTGGCGACTTGCACGCACTCATCGGACTTTGGAGGCACTCTGGTGGTGGAGTACAAGACCGACAAAGTGGGGACGTGCGCCGTCCACTCGGAATCCAACACGGCTGTCATGCAGGAGACGAGTCTGTCCGTGACGATGGACGGCCGAGGTACGTTGCATTTCTCCACCGCCTCAGCCTCACCGTCCTTCGTATTGAAAGTGTGCAGTAGCAAAACCACTTGCACAGCAAAGTGCGTGCCGCCGAAGGACCACGTCGTCCCTTTTCCTGCCAACCACAACAATGTTGTGTTCCCGGACTTTTCCAGTACTGCAGTGTCCTGGCTCACCCACACTATGGGCGGAGCTACTGTGGTGATTGCTATTGGGATCATCATATTCCTAATAGTTACTTGCATAGCTTTTAGTAGGCACTAGATATAGTAGAACGGAAAATGGAAAACTAGAAAAATAGTAGGGTAGGCAAAGGCATCGTTAATCATTATACTAAGCAGTATACACTTATATAACCTCAAATACAACCTATAATTACACTAACTGAGTAGAAAAACAAGAAAACCCATAAAAAGTAGAGTAAGCAATGACATTAACCCTATAATTACTAACACGTATACTAACAGACTAGAAAAAGAGAAAATTACAGAAAAAGTAGAGTAGGCAATGGCATTATTACATATTAACATATATAACACTACAATAGTAAGCAATGACATTAACCCTATAATTACTAACACGTATACTAACAGACTAGAAAAAGAGAAAATTACAGAAAAGTAGAGTAGGCAATGGCATTATTACATATTAACATATATAACACTACAATATAACTTACAACACCATATAGAAGGGCCTTGCCACAGGCCGCCATAATTATAAACAGAACTAATTGGCAGAATTAATTGGATACTAATAATTGGATTATTTATGATTTGGAAATAATACCGCGACGATTGGCTAGTCGCAATTGGTTTTAATATTCC
| 45,596
|
MT015693.1
|
Middelburg virus
|
Fourie,I.
|
University of Pretoria, Medical Virology
|
South Africa
|
2020-11-25
|
ZRU080/14
|
Middelburg virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,674
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Equus caballus
| null | null | null | null |
Middelburg virus isolate ZRU080/14, complete genome
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ATTGGTGGTTACGTACACGTGCCACCACCCCCCACCATCCAAGCGATCCAAAATGGCGCGCCCTGTTGTGAAGATAGACGTTGAGGCCGAAAGCCCATTTGTCAAGTCTCTACAGAAGGCGTTTCCACAATTTGAGATCGAAGCAGAGCAGGTCACACCGAATGACCATGCTAACGCGAGGGCGTTTTCGCACCTTGCCAGTAAACTAATTGAAGGAGAGGTGGAAGTGGGCACAACCATCCTGGACATAGGCAGCGCGCCGGCCAGGAGGATGATGTCCAAACATGCATACCACTGCGTCTGCCCACTGAGGAGTGCAGAAGACCCAGAACGATTAGCGGGATACGCGAAGAAGCTTATGAGTGCAGCCGGAAACGTTACTGATCTCAACATCTCGGGAAAGATCACGGACTTAAAGAACGTGATAGCTATACCCGACCTTGAGACACCTACATTCTGCCTGCACACAGACCAGACCTGCCGCTATAATGCCGATGTGGCCATCTATCAGGACGTCTACGCTGTCCACGCGCCCACATCGCTTTACCATCAAGCGTTAAAAGGGGTCAGGGTCGTGTACTGGATCGGCTTCGATACTACGCCGTTTATGTTTGACGTAATGGCGGGAGCGTACCCAAGCTATTCTACGAATTGGGCAGACGAACTGGTGCTGCAGGCCAGAAACATCGGCCTGTGCAGCTCCAGATTGAGTGAGGGGAGAAGCAGAGGGCTATCCATTATGAGAAAGAAAGCCCTCAGACCAAGCGACCGAGTTATGTTCTCGGTAGGTTCGACGTTGTATACGGAGAGCCGCTCGCTACTGAAAAGCTGGCACCTGCCGTCGACTTTTCATCTAAAGGGTAAGGACTCCTACACATGTAGATGCGACACCATAGTCAGCTGCGAGGGATACGTCGTAAAGAAGATCACGATGAGCCCAGGCCTATTCGGGAAGCCAGTACCGTACGCCGTCACCCACCATGCCGACGGCTTCCTCGTTTGCAAGACCACGGACACGGTCAAAGGGGAGAGGGTTTCTTTCCCCGTATGTACGTATGTCCCAGCGACGATTTGCGACCAGATGACTGGGATCCTAGCCACGGATGTGACGCCTGATGATGCTCAGAAGTTACTGGTGGGCCTGAACCAGCGGATCGTGGTCAATGGGCGCACGCAGAGAAATGTAAATACCATGAAAAATTACCTGCTACCTGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGCAAGTGGGCGAAAGAGTATAAAGCCGACTTGGAAGACGAGAAACCACTGGGGGTCAGAGAACGCAACTTGACTATGTGTTGCTTGTGGGCCTTCCGAACCAGGAAGACCCACACCTTGTACAAGAAGCCGGACACGCAGACTATAGTGAAAGTCCCTTCTGAATACACCTCCTTACTCATCCCGAGTCTATGGACGAGCGGGATCTCCATGACTCTGAGGAGACGGCTGAAAGTGCTGCTGACTGCCCGACTGAATCAGAAATTGACGTGCCCTTTGGACGCGGTGACAGCAAAGATCGCAGAGGACGATGATCGTGAGGCGCGTGAAGCTGAGTTAACTAGAGAGGCGCTACCTCCTTTGACTGCTACCGAGCCAACCGGCGACGATATACAGGTCGACATCGAGGAGCTTGACGCTAGGGCGGGTGCGGGAGTAGTGAACACACCCCGCAACGCCGTCCGAGTCACCGCTCAGAGTGGTGACACGTTGGTTGGCAGCTATCTGGTGCTCAGCCCGCAGACTGTATTGCGCAGTGACAAACTACGCTTGATTCACGAACTGGCAGAACAAGTGAAGATTATCACGCATTCGGGTAGGGCCGGTAGATATCCTGTTGAAGGCTATGACGGACGTGTGCTGGTACCGACTGGCAGCGCTCTGAGTTTCGCCGATTTCCAGGCGCTTAGTGAGAGTGCCACAATGGTATACAACGAGCGAGAGTTCGTGAACAGGAAACTCTACCACATTGCCACGCACGGCCCCGCCCTGAACACAGACGAGGAGAACTACGAGAAGGTGAGAGCGGAAAGGAGTGACGCCGAGTACGTGTTCGACGTGGACGCACGGAAGTGCGTCAAACGCGAGCAGGCGTCGGGAATAGTGTTAGTGGGAGACGCGATCAATCCGCCTTACCATGAGTTCGCCTTTGAAGGCCTAAAAACACGCCCATCGGTGCCCTATAAAGTACCGACCATCGGTGTGTTTGGAGTTCCGGGATCAGGCAAATCGGCCATCATTAAGTCTGTGGTCACTAGACGTGACCTAGTCACTAGCGGCAAGAAAGAGAACTGCAATGAGATCATGACCGACGTCAAGAAGCAGAGAGGATTGGATATCGTAGCCAAGACGGTGGACTCTATCCTATTAAACGGTTGCAAACACAGCCCTGAGGTGTTGTTCGTTGACGAGGCGTTTGCCTGCCATGCAGGCACTCTGCTCGCGCTCATCGCAATCGTGAGACCCACCAAGAAAGTTGTGTTATGCGGCGATCCGAAGCAATGCGGCTTCTTTAACATGATGCAATTAAAAGTCAATTACAATCATGACATATGCACTGAAGTGCATCACAAAAGCATCTCCCGCCGATGCACAATACCGGTTACATCCATTGTCTCTACACTGCACTACGGAGGCAGGATGCGCACTACGAACCCGCGCAACGACCCTATCGAAATTGACATCACCAGTAGTACCAAACCCAAGCCCGGAGACATTGTGTTAACATGTTTTCGTGGCTGGGTTAAACAGCTGCAGTTGGACTATCGTGGACACGAAGTCATGACTGCGGCAGCGTCGCAAGGCTTGACCAGGAAAGGAGTATATGCAGTGAGGATGAAAGTCAATGAGAACCCACTATATGCTCCAGCTTCCGAACACGTCAATGTCTTGTTGACACGCACGGAGGGAAGGCTAGTGTGGAAAACGCTGGCCGGAGACCCGTGGATCAAGGTGCTAACTAACGTACCCAAAGGAAACTTCACAGCCACCATTGACGAGTGGCAGGAGGAGCACGACAACATCATGAACGCCATAAGAGGGGAAGTGGCGCCGACTGACCCTTTCCAAAACAAAGCAAATGTTTGTTGGGCAAAAGCTCTAGAACCCGTCCTTGCTACCGCTGGCATCCGACTCAGTGCAGCGGAGTGGAGCGACTTGATAGTCGCCTTCAAGGAAGACAAAGCATACTCGCCCGAGGTTGCGCTGAACGAGATCTGCACCAGAATGTACGGGTTTGACCTAGATAGCGGCTTGTTTTCGGCTCCGCTGGTATCCATGAGATATGAGAACCATCACTGGGACAACTCACCGGGAGGAAAGATGTATGGATTCAACACACAGGCAGCCAGCAGGCTAGAGCGCAGATACCCCTTCCTGCAAGGAAAATGGAGACTGAACCAGCAGATCCTTTTATCGGAGAGGAGAACGCAACCAGTGAGCTCATCCGCTAACATAGTTCCCATTAATCGTAGGCTGCCGCATACTCTGGTGCTGGAACACGTCAAGCTACCCGGAGACCGCGTAGAGCGGATCGTGATGCAAATTCGCGCGCATCACGTGCTGCTAGTGGGTGAGTATAACCTCCACCTGCCTTTACGGCGTGTTACCTGGATCGCCCCTCCCTATATACGGGGCGCAGACCGCATCTACGACCTGAGCTTAGGGTTGCCAACTGACCTGGGCAGGTATGATCTGGCGTTCATAAATGTACATACAGAATTCCGCAACCACCACTACCAGCAGTGTGAGGACCACGCAATGAAGTTGCAGATGCTAGGAGGTGATGCCCTACGCCACCTGAAACCGGGCGGATGCCTGCTGATGCGTGCCTATGGGTACGCAGACAGGACCAGCGAGATGGTGGTGAATGCGCTAGCGCGTAAATTCGCATCAATACGCGTACTGCGACCAGCGTGTGTGGCCTCTAACACCGAAGTCTTACTGCTGCTGTCGGGCTTTGACAACGGGAAACGCCAACTGACAATGCACACATCCAATCTGAGACTCTCCAGCGTTTACTCGGGAAACGCACTACACACGGCAGGGTGTGCACCATCATATAGAGTCGTAAGAGGCAATATCACCGACTCCGACGCCGATGTGCTAGTAAATCAATTGGGCGTGAACAATAAGGTCTGCGACGGAGTTTGTAGGGCCATGGTCAAGAAGTGGCCTTCCTGCCTACCAACGACAACTGGAAAAGTAGGCGACGCCGTACTGACCACTGAGCCCCGAAAGATCGTGCACGCTTACTGTCCTAATTTCGGAACCAGTAGAGAGGAGGCTGCCGATGCCGACCTAGCAGCTGTGTATAGAGCCGTAGCGTCCTTGGCTGATGAGACAGTCCGCACAATGGCCATACCACTCCTGTCAACGGGGACGTTCGCTGGGGGAAAGGACCGCGTGCTGCAGTCGTTGAACCACCTATTTACGGCCCTGGACACCACGGACGTCGATGTAACGATATACTGCCGGGATAAGTCGTGGGAAAAGAAAATCCAAGAGGCCATTGATATGAGGACGGCAACCGAACTGCTAGATGACGACACAACGGTTATGAAAGAGCTAACCAGGGTGCATCCTGATAGCTGCCTAGTGGGGCGCAGTGGATTCAGCACGGTGGACGGACGGCTGCATTCGTACCTTGAAGGAACTAGGTTCCACCAGACTGCTGTCGACGTGGCAGAAATAGCCACTCTGTGGCCAAGGAGAGAAGAAGCGAACGAGCAGATAACACACTACGTCCTTGGCGAATCCATGGAGGCCATAAGAACCAAATGCCCGGTGGATGACACCGATTCGTCGGCACCACCATGCACCGTCCCGTGCCTTTGCCGCTACGCCATGACCCCCGAGCGCGTACATAGATTGCGCGCCGCGCAGGTGAAGCAGTTCACGGTTTGCTCCTCGTTCCCGCTTCCAAAGTACAAGATACCAGGCGTGCAGAGAGTGGCGTGTTCGGCTGTAATGTTGTTTAATCACGACGTTC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| 45,597
|
MN967313.1
|
Middelburg virus
|
Fourie,I.
|
University of Pretoria, Medical Virology
|
South Africa
|
2020-11-11
|
ZRUH399/17
|
Middelburg virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,673
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Homo sapiens
|
cerebrospinal fluid
|
2017-04-04
| null | null |
Middelburg virus isolate ZRUH399/17, complete genome
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ATTGGTGGTTACGTACACGTGCCACCACCCCCCACCATCCAAGCGATCCAAAATGGCGCGCCCTGTTGTGAAGATAGACGTTGAGGCCGAAAGCCCATTTGTCAAGTCTCTACAGAAGGCGTTTCCACAATTTGAGATCGAAGCAGAGCAGGTCACACCGAATGACCATGCTAACGCGAGGGCGTTTTCGCACCTTGCCAGTAAACTAATTGAAGGAGAGGTGGAAGTGGGCACAACCATCCTGGACATAGGCAGCGCGCCGGCCAGGAGGATGATGTCCAAACATGCATACCACTGCGTCTGCCCACTGAGGAGTGCAGAAGACCCAGAACGATTAGCGGGATACGCGAAGAAGCTTATGAGTGCAGCCGGAAACGTTACTGATCTCAACATCTCGGGAAAGATCACGGACTTAAAGAACGTGATAGCTATACCCGACCTTGAGACACCTACATTCTGCCTGCACACAGACCAGACCTGCCGCTATAATGCCGATGTGGCCATCTATCAGGACGTCTACGCTGTCCACGCGCCCACATCGCTTTACCATCAAGCATTAAAAGGGGTCAGGGTCGTGTACTGGATCGGCTTCGATACTACGCCGTTTATGTTTGACGTAATGGCGGGAGCGTACCCAAGCTATTCTACGAATTGGGCAGACGAACTGGTGCTGCAGGCCAGAAACATCGGTCTGTGCAGCTCCAGATTGAGTGAGGGGAGAAGCAGAGGGCTATCCATTATGAGAAAGAAAGCCCTCAGACCAAGCGACCGAGTTATGTTCTCGGTAGGTTCGACGTTGTATACGGAGAGCCGCTCGCTACTGAAAAGCTGGCACCTGCCGTCGACTTTTCATCTAAAGGGTAAGGACTCCTACACATGTAGATGCGACACCATAGTCAGTTGCGAGGGATACGTCGTAAAGAAGATCACGATGAGCCCAGGCCTATTCGGGAAGCCAGTACCGTACGCCGTCACCCACCATGCCGACGGCTTCCTCGTTTGCAAGACCACGGACACGGTCAAAGCGGAGAGGGTTTCCTTCCCCGTATGTACGTATGTCCCTGCGACGATTTGTGACCAGATGACTGGGATCTTAGCCACGGACGTGACGCCCGATGATGCTCAGAAGTTACTGGTGGGCCTGAACCAGCGGATCGTGGTCAATGGGCGCACGCAGAGAAATGTAAATACCATGAAAAATTACCTGCTACCTGTGGTCGCACAGGCCTTCAGCAAGTGGGCGAAAGAGTATAAAGCCGACTTGGAAGACGAGAAACCGCTGGGGGTCAGAGAACGCAACTTGACTATGTGTTGCTTGTGGGCCTTCCGAACCAGGAAGACCCACACCTTGTACAAGAAGCCGGACACGCAGACTATAGTGAAAGTCCCTTCTGAATACACCTCCTTACTCATCCCGAGTCTATGGACGAGCGGGATCTCCATGACTCTGAGGAGACGGCTGAAAGTGCTGCTGACTGCCCGACTGAATCAGAAATTGACGTGCCATTTGGACGCGGTGACAGCAAAGATCGCAGAAGACGATGATCGTGAGGCGCGTGAAGCTGAGTTAACTAGAGAGGCGCTACATCCTTTGTCTGCTACCGAGCCAACCGGCGACGATATACAGGTCGACATCGAGGAGCTTGATGCTAGGGCGGGTGCGGGAGTAGTGAACACACCCCGCAACGCCGTCCGAGTCACCGCTCAGAGTGGTGACACGTTGGTTGGCAGCTATCTGGTGCTCAGCCCGCAGACTGTATTGCGCAGTGACAAACTACGCTTGATTCACGAACTGGCAGAACAAGTGAAGATTATCACGCATTCGGGTAGGGCCGGTAGATATCCTGTTGAAGGCTATGACGGACGTGTGCTGGTACCGACTGGCAGCGCTCTGAGTTTCGCCGATTTCCAGGCGCTTAGTGAGAGTGCCACAATGGTATACAACGAGCGAGAGTTCGTGAACAGGAAACTCTACCACATTGCCACGCACGGCCCCGCCCTGAACACAGACGAGGAGAACTACGAGAAGGTGAGAGCGGAAAGGAGTGACGCCGAGTACGTGTTCGACGTGGACGCACGGAAGTGCGTCAAACGCGAGCAGGCGTCGGGAATAGTGTTAGTGGGAGACGCGATCAATCCGCCTTACCATGAGTTCGCCTTTGAAGGCCTAAAAACACGCCCATCGGTGCCCTATAAAGTACCGACCATCGGTGTGTTTGGAGTTCCGGGATCAGGCAAATCGGCCATCATTAAGTCTGTGGTCACTAGACGTGACCTAGTCACTAGCGGCAAGAAAGAGAACTGCAATGAGATCATGACCGACGTCAAGAAGCAGAGAGGATTGGATATCGTAGCCAAGACGGTGGACTCTATCCTATTAAACGGTTGCAAACACAGCCCTGAGGTGTTGTTCGTTGACGAGGCGTTTGCCTGCCATGCAGGCACCCTGCTCGCGCTCATTGCGATCGTGAGACCCACCAAGAAAGTTGTGCTATGCGGCGATCCGAAGCAATGCGGCTTCTTTAACATGATGCAATTAAAAGTCAATTACAATCATGACATATGCACTGAAGTGCATCACAAAAGCATCTCCCGCCGATGCACAATACCGGTTACATCCATTGTCTCTACACTGCACTACGGAGGCAGGATGCGCACTACGAACCCGCGCAACGACCCTATCGAAATTGACATCACCAGTAGTACCAAACCCAAGCCCGGAGACATTGTGTTAACATGTTTTCGTGGCTGGGTTAAACAGCTGCAGTTGGACTATCGTGGACACGAAGTCATGACTGCGGCAGCGTCGCAAGGCTTGACCAGGAAAGGAGTATATGCAGTGAGGATGAAAGTCAATGAGAACCCACTATATGCTCCAGCTTCTGAACACGTCAATGTCTTGCTGACACGCACGGAGGGAAGGCTAGTGTGGAAAACGCTGGCCGGAGACTCGTGGATCAAGGTGCTAACTAACGTACCCAAAGGAAACTTCACAGCCACCATTGACGAGTGGCAGGAGGAGCACGACAACATCATGAACGCCATAAGAGGTGAAGTGGCGCCGACTGACCATTTCCAAAACAAAGCAAATGTTTGTTGGGCAAAAGCTCTAGAACCCGTCCTTGCTACCGCTGGCATCCGACTCAGTGCAGCGGAGTGGAGCGACTTGATAGTCGCCTTCAAGGAAGATAAAGCATACTCGCACGAGGTTGCGCTGAACGAGATCTGCACCAGAATGTACGGGTTTGACCTAGATAGCGGCTTGTTTTCGGCTCCGCTGGTATCCATGAGATATGAGAACCATCACTGGGACAACTCACCGGGAGGAAAGATGTATGGATTCAACACACAGGCAGCCAGCAGGCTAGAGCGCAGATACCCCTTCCTGCAAGGAAAATGGAGACTGAACCAGCAGATCCTTTTATCGGAGAGGAGAACGCAACCAGTGAGCTCATCCGCTAACATAGTTCCCATTAATCGTAGGCTGCCGCATACTCTGGTGCTGGAACACGTCAAGCTACCCGGAGACCGAGTAGAGCGGATCGTGATGCAAATTCGCGCGCATCACGTGCTGCTAGTGGGTGAGTATAACCTCCACCTGCCTTTACGGCGTGTTACCTGGATCGCCCCTCCCTATATACGGGGCGCAGATCGCATCTACGACCTGAGCTTAGGGTTGCCAACTGACCTGGGCAGTTATGATCTGGCGTTCATAAATGTACATACAGAATTCCGCAACCACCACTACCAGCAGTGTGAGGACCACGCAATGAAGTTGCAGATGCTAGGAGGTGATGCCCTACGCCACCTGAAACCGGACGGATGTCTGCTGATGCGTGCCTATGGGTACGCAGACAGGACCAGCGAGATGGTGGTGAATGCGCTAGCGCGTAAATTCGCATCAATACGCGTACTGCGACCAGCGTGTATGGCCTCTAACACCGAAGTCTTACTGCTGCTGTCGGGCTTCGATAACGGGAAACGCCAACTGACAATGCACACATCCAATCTGAGACTCTCCAGCGTTTACTCGGGAAACGCACTACACACGGCAGGGTGTGCACCATCATATAGAGTCGTAAGAGGCAATATCACCGACTCCGACGCCGATGTGCTAGTAAATCAGTTGGGCGTGAACAATAAGGTCTGCGACGGAGTTTGTAGGGCCATGGTCAAGAAGTGGCCTTCCTGCCTACCAACGACAACTGGAAAAGTAGGCGACGCCGTACTGACCACTGAGCCCCGGAAAATCGTGCACGCTTACTGTCCTAATTTCGGAACCAGTAGAGAGGAGGTTGCCGATGCCGACCTAGCAGCTGTGTATAGAGCCGTAGCGTCCTTGGCTGATGAGACAGTCCGCACAATGGCCATACCACTCCTGTCAACGGGGACGTTCGCTGGGGGAAAGGACCGCGTGCTGCAGTCGTTGAACCACCTATTTACGGCCCTGGACACCACGGACGTCGATGTAACGATATACTGCCGGGATAAGTCGTGGGAAAAGAAAATCCAAGAGGCCATTGATATGAGGACGGCAACCGAACTGCTAGATGACGACACAACGGTTATGAAAGAGCTAACCAGGGTGCATCCTGATAGCTGCCTAGTGGGGCGCAGTGGATTCAGCACGGTGGACGGACGGCTGCATTCGTACCTTGAAGGAACTAGGTTCCACCAGACTGCTGTCGACGTGGCAGAAATAGCCACTCTGTGGCCAAGGAGAGAAGAAGCGAACGAGCAGATAACACACTACGTCCTTGGCGAATCCATGGAGGCCATAAGAACCAAATGCCCGGTGGATGACAACGATTCGTCGGCACCACCATGCACCGTCCCGTGCCTTTGCCGCTACGCCATGACCCCCGAGCGCGTACATAGACTGCGCGCCGCGCAGGTGAAGCAGTTCACAGTCTGCTCCTCGTTCCCGCTGCCAAAGTACAAGATACCAGGCGTGCAGAGAGTGGCGTGTTCGGCTGTAATGTTGTTTAACCACGACGTTC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| 45,987
|
MN967314.1
|
Middelburg virus
|
Fourie,I.
|
University of Pretoria, Medical Virology
|
South Africa
|
2020-11-11
|
ZRU099/17
|
Middelburg virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,673
|
GenBank
| null |
South Africa
|
South Africa
|
Homo sapiens
|
blood
|
2017-03-16
| null | null |
Middelburg virus isolate ZRU099/17, complete genome
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ATTGGTGGTTACGTACACGTGCCACCACCCCCCACCATCCAAGCGATCCAAAATGGCGCGCCCTGTTGTGAAGATAGACGTTGAGGCCGAAAGCCCATTTGTCAAGTCTCTACAGAAGGCGTTTCCACAATTTGAGATCGAAGCAGAGCAGGTCACACCGAATGACCATGCTAACGCGAGGGCGTTTTCGCACCTTGCCAGTAAACTAATTGAAGGAGAGGTGGAAGTAGGCACAACCATCCTGGACATAGGCAGCGCGCCGGCCAGGAGGATGATGTCCAAACATGCATACCACTGCGTCTGCCCACTGAGGAGTGCAGAAGACCCAGAACGATTAGCGGGATACGCGAAGAAGCTTATGAGTGCAGCCGGAAACGTTACTGATCTCAACATCTCGGGAAAGATCACGGACTTAAAGAACGTGATAGCTATACCCGACCTTGAGACACCTACATTCTGCCTGCACACAGACCAGACCTGCCGCTATAATGCCGATGTGGCCATCTATCAGGACGTCTACGCTGTCCACGCGCCCACATCGCTTTACCATCAAGCATTAAAAGGGGTCAGGGTCGTGTACTGGATCGGCTTCGATACTACGCCGTTTATGTTTGACGCAATGGCGGGAGCGTACCCAAGCTATTCTACGAACTGGGCAGACGAACTGGTGCTGCAGGCCAGAAACATCGGTCTGTGCAGCTCCAGATTGAGTGAGGGGAGAAGCAGAGGGCTATCCATTATGAGAAAGAAAGCCCTCAGACCAAGCGACCGAGTTATGTTCTCGGTAGGTTCGACGTTGTATACGGAGAGCCGCTCGCTACTGAAAAGCTGGCACCTGCCGTCGACTTTTCATCTAAAGGGTAAGGACTCCTACACATGTAGATGCGACACCATAGTCAGTTGCGAGCGATACGTCGTAAAGAAGATCACGATGAGCCCAGGCCTATTCGGGAAGCCAGTACCGTATGCCGTCACCCACCATGCCGACGGCTTCCTCGTTTGCAAGACCACGGACACGGTCAAAGGGGAGAGGGTTTCCTTCCCCGTATGTACGTATGTCCCTGCGACGATTTGTGACCAGATGACTGGGATCCTAGCCACGGACGTGACGCCTGATGATGCTCAGAAGTTACTGGTGGGCCTGAACCAGCGGATCGTGGTCAATGGGCGCACGCAGAGAAATGTAAATACCATGAAAAATTACCTGCTACCTGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGCAAGTGGGCGAAAGAGTATAAAGCCGACTTGGAAGACGAGAAACCACTGGGGGTCAGAGAACGCAACTTGACTATGTGTTGCTTGTGGGCCTTCCGAACCAGGAAGACCCACACCTTGTACAAGAAGCCGGACACGCAGACTATAGTGAAAGTCCCTTCTGAATACACCTCCTTACTCATCCCGAGTCTATGGACGAGCGGGATCTCCATGACTCTGAGGAGACGGCTGAAAGTGCTGCTGACTGCCCGACTGAATCAGAAATTGACGTGCCCTTTGGACGCGGTGACAGCAAAGATCGCAGAGGACGATGATCGTGAGGCGCGTGAAGCTGAGTTAACTAGAGAGGCGCTACCTCCTTTGACTGCTACCGAGCCAACCGGCGACGATATACAGGTCGACATCGAGGAGCTTGAGGCTAGGGCGGGTGCGGGAGTAGTGAACACACCCCGCAACGCCGTCCGAGTCACCGCTCAGAGTGGTGACACGTTGGTTGGCAGCTATCTGGTGCTCAGCCCGCAGACTGTATTGCGCAGTGACAAACTACGCTTGATTCACGAACTGGCAGAACAAGTGAAGATTATCACGCATTCGGGTAGGGCCGGTAGATATCCTGTTGAAGGCTATGACGGACGTGTGCTGGTACCGACTGGCAGCGCTCTGAGTTTCGCCGATTTCCAGGCGCTTAGTGAGAGTGCCACAATGGTATACAACCAGCGAGAGTTCGTGAACAGGAAACTCTACCACATTGCCACGCACGGCCCCGCCCTGAACACAGACGAGGAGAACTACGAGAAGGTGAGAGCGGAAAGGAGTGACGCCGAGTACGTGTTCGACGTGGACGCACGGAAGTGCGTCAAACGCGAGCAGGCGTCGGGAATAGTGTTAGTGGGAGACGCGATCAATCCGCCTTACCATGAGTTCGCCTTTGAAGGCCTAAAAACACGCCCTTCGGTGCCCTATAAAGTACCGACCATCGGTGTGTTTGGAGTTCCGGGATCAGGCAAATCGGCCATCATTAAGTCTGTGGTCACTAGACGTGACCTAGTCACTAGCGGCAAGAAAGAGAACTGCAATGAGATCATGACCGACGTCAAGAAGCAGAGAGGATTGGATATCGTAGCCAAGACGGTGGACTCTATCCTATTAAACGGTTGCAAACACAGCCCTGAGGTGTTGTTCGTTGACGAGGCGTTTGCCTGCCATGCAGGCACCCTGCTCGCGCTCATTGCGATCATGAGACCCACCAAGAAAGTTGTGCTATGCGGCGATCCGAAGCAATGCGGCTTCTTTAACATGATGCAATTAAAAGTCAATTACAATCATGACATATGCACTGAAGTGCATCACAAAAGCATCTCCCGCCGATGCACAATACCGGTTACATCCATTGTCTCTAAACTGCACTACGGAGGCAGGATGCGCACTACGAACCCGCGCAACGACCCTATCGAAATTGACATCACCAGTAGTACCAAACCCAAGCCCGGAGACATTGTGTTAACATGTTTTCGTGGCTGGGTTAAACAGCTGCAGTTGGACTATCGTGGACACGAAGTCATGACTGCGGCAGCGTCGCAAGGCTTGACCAGGAAAGGAGTATATGCAGTGAGGATGAAAGTCAATGAGAACCCACTATATGCTCCAGCTTCTGAACACGTCAATGTCTTGCTGACACGCACGGAGGGAAGGCTAGTGTGGAAAACGCTGGCCGGAGACCCGTGGATCAAGGTGCTAACTAACGTACCCAAAGGAAACTTCACAGCCACCATTGACGAGTGGCAGGAGGAGCATGACAACATCATGAACGCCATAAGAGGGGAAGTGGCGCCGACTGACCCTTTCCAAAACAAAGCAAATGTTTGTTGGGCAAAAGCTCTAGAACCCGTCCTTGCTACCGCTGGCATCCGACTCAGTGCAGCGGAGTGGAGCGACTTGATAGTCGCCTTCAAGGAAGATAAAGCATACTCGCCCGAGGTTGCGCTGAACGAGATCTGCACCAGAATGTACGGGTTTGACCTAGATAGCGGCTTGTTTTCGGCTCCGCTGGTATCCATGAGATATGAGAACCATCACTGGGACAACTCACCGGGAGGAAAGATGTATGGATTCAACACACAGGCAGCCAGCAGGCTAGAGCGCAGATACCCCTTCCTGCAAGGAAAATGGAGACTGAACCAGCAGATCCTTTTATCGGAGAGGAGAACGCAACCAGTGAGCTCATCCGCTAACATAGTTCCCATTAATCGTAGGCTGCCGCATACTCTGGTGCTGGAACACGTCAAGCTACCCGGAGACCGAGTAGAGCGGATCGTGATGCAAATTCGCGCGCATCACGTGCTGCTAGTGGGTGAGTATAACCTCCACCTGCCTTTACGGCGTGTTACCTGGATCGCCCCTCCCTATATACGGGGCGCAGATCGCATCTACGACCTGAGCTTAGGGTTGCCAACTGACCTGGGCAGGTATGATCTGGCGTTCATAAATGTACATACAGAATTCCGCAACCACCACTACCAGCAGTGTGAGGACCACGCAATGAAGTTGCAGATGCTAGGAGGTGATGCCCTACGCCACCTGAAACCGGGCGGATGTCTGCTGATGCGTGCCTATGGGTACGCAGACAGGACCAGCGAGATGGTGGTGAATGCGCTAGCGCGTAAATTCGCATCAATACGCGTACTGCGACCAGCGTGTGTGGCCTCTAACACCGAAGTCTTACTGCTGCTGTCGGGCTTTGATAACGGGAAACGCCAACTGACAATGCACACATCCAATCTGAGACTCTCCAGCGTTTACTCGAGAAACGCACTACACACGGCAGGGTGTGCACCATCATATAGAGTCGTAAGAGGCAATATCACCGACTCCGACGCCGATGTGCTAGTAAATCAGTTGGGCGTGAACAATAAGGTCTGCGACGGAGTTTGTAGGGCCATGGTCAAGAAGTGGCCTTCCTGCCTACCAACGACAACTGGAAAAGTAGGCGACGCCGTACTGACCACTGAGCCCCGGAAAATCGTGCACGCTTACTGTCCTAATTTCGGAACCAGTAGAGAGGAGGTTGCCGATGCCGACCTAGCAGCTGTGTATAGAGCCGTGGCGTCCTTGGCTGATGAGACAGTCCGCACAATGGCCATACCACTCCTGTCAACGGGGACGTTCGCTGGGGGAAAGGACCGCGTGCTGCAGTCGTTGAACCACCTATTTACGGCCCTGGACACCACGGACGTCGATGTAACGATATACTGCCGGGATAAGTCGTGGGAAAAGAAAATCCAAGAGGCCATTGATATGAGGACGGCAACCGAACTGCTAGATGACGACACAACGGTTATGAAAGAGCTAACCAGGGTGCATCCTGATAGCTGCCTAGTGGGGCGCAGTGGATTCAGCACGGTGGACGGACGGCTGCATTCGTACCTTGAAGGAACTAGGTTCCACCAGACTGCTGTCGACGTGGCAGAAATAGCCACTCTGTGGCCAAGGAGAGAAGAAGCAAACGAGCAGATAACACACTACGTCCTTGGCGAATCCATGGAGGCCATAAGAACCAAATGCCCGGTGGATGACACCGATTCGTCGGCACCACCATGCACCGTCCCGTGCCTTTGCCGCTACGCCATGACCCCCGAGCGCGTACATAGACTGCGCGCCGCGCAGGTGAAGCAGTTCACAGTCTGCTCCTCGTTCCCGCTTCCAAAGTACAAGATACCAGGCGTGCAGAGAGTGGCGTGTTCGGCTGTAATGTTGTTTAATCACGACGTTC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CCAGCAAAAAGCGGACTTTCAATGCAAAGTCTACACCGGCGTCTACCCTTTTTTGTGGGGCGGTGCCTACTGCTTTTGCAATTCGGAAAACACTCAGCTGAGCGAAGCTTATGTTGAGCGGAGCGAGGTGTGCAAACACGATCACGCAGCGGCATATCGCGCTCATACAGCAGCATTGAAAGCTAAAATCAGAGTGACCTACGGTTCCACGAACGGGACGGCTGAGGCGTTTGTCAACGGAGAGAGCACCGCACGAATCGGAGACCTGAAAATGATCCTTGGTCCCATATCCACCGCGTGGAGCCCCTTTGACCCAAAGATCGTCGTCTACAAGGACGAAGTCTACAATCAGGATTATCCACCGTACGGATCCGGGCAACCGGGTAGATTTGGGGACTTACAGAGCAGGACCACCGAGAGTAATGACGTGTACGCCAATACTGCACTGAAGCTGGCTCGTCCATCTGCCGGCACGGTGCACGTTCCATATACCCAGACGCCGTCCGGGTTTAAGTATTGGCTAAAAGAAAAAGGGGACGCATTGAACCACAAGGCTCCTTTCGGCTGCATCATCAAGACGAACCCCGTAAGGGCGGAAAATTGTGCAGTCGGAAACATACCAGTGTCTCTAGACATTCCCGACGCGGCTTTTACACGCATAGTCGACGCACCATCGCTAACCGGCCTGAAGTGCGAGGTGGCGACTTGCACGCACTCATCGGACTTTGGAGGCACTTTGGTGGTGGAGTACAAGACCGACAAAGTGGGGACGTGCGCCGTCCATTCGGAATCCAACACGGCTGTCATGCAGGAGACGAGTCTGTCCGTGACGATGGACGGCCGAGGTACGTTGCATTTCTCCACCGCCTCAGCCTCACCGTCCTTCGTATTGAAAGTGTGCAGCAGCAAAACCACTTGCAAAGCAAAGTGCGTGCCGCCGAAGGACCACGTCGTCCCTTTTCCTGCCAACCACAACAATGTTGTGTTCCCGGACTTTTCCAGTACTGCAGTGTCCTGGCTCACCCACACTATGGGCGGAGCTACTGTGGTGATTGCTATTGGGATCACCATATTCTTAATAGTTACTTGCATAGCTTTTAGTAGGCACTAGATATAGTAGAACGGAAAATGGAAAACTAGAAAAACAGTAGGGTAGGCAGAGGCATCATTAATCATTATACTAAGCAGTATACACTTATATAATCTCAAATACAACCTATAATTACACTAACTGAGTAGAAAAACAAGAAAACCCATAAAAAGTAGAGTAAGCAATGACATTAACCCTATAATTACTAACACGTATACTAACAGACTAGAAAAAAGAAAATTACAGAAAAAGTAGAGTAGGCAATGGCATTATTACATATTAACATGTATAACACTACAGTAGTAAGCAATGACATTAACCCTATAATTACTAACACGTATACTAACAGACTAGAAAAAGAGAAAATTACAGAAAAGTAGAGTAGGCAATGGCATTACTACATATTAACATATATAACATTACAATATAACTTACAACACCATATAGAAGGGCCTTGCCACAGGCCGCCATAATTATAAACAGAACTAATTGGCAGAATTAATTGGATACTAATAATTGGATTATTTATGATTTGGAAATAATATCGCGACGATTGGCTAGTCGCAATTGGTTTTAATATTCC
| 45,988
|
KF680222.1
|
Middelburg virus
|
van Niekerk,S., Human,S., Williams,J., van Wilpe,E., Pretorius,M., Swanepoel,R., Venter,M., Steyl,J.
|
University of Pretoria, Medical Virology
|
South Africa
|
2015-06-01
|
SAE25_11
|
Middelburg virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,674
|
GenBank
| 1
|
South Africa
|
South Africa
|
Equus caballus
| null |
2011
| null | null |
Middelburg virus isolate SAE25_11, complete genome
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ATTGGTGGTTACGTACACGTGCCACCACCCCCCACCATCCAAGCGATCCAAAATGGCGCGCCCTGTTGTGAAGATAGACGTTGAGGCCGAAAGCCCATTTGTCAAGTCTCTACAGAAGGCGTTTCCACAATTTGAGATCGAAGCAGAGCAGGTCACACCGAATGACCATGCTAACGCGAGGGCGTTTTCGCACCTTGCCAGTAAACTAATTGAAGGAGAGGTGGAAGTGGGCACAACCATCCTGGACATAGGCAGCGCGCCGGCCAGGAGGATGATGTCCAAACATGCATACCACTGCGTCTGCCCACTGAGGAGTGCAGAAGACCCAGAACGATTAGCGGGATACGCGAAGAAGCTTATGAGTGCAGCCGGAAACGTTACTGATCTCAACATCTCGGGAAAGATCACGGACTTAAAGAACGTGATAGCTATACCCGACCTTGAGACACCTACATTCTGCCTGCACACAGACCAGACCTGCCGCTATAGTGCCGATGTGGCCATCTATCAGGACGTCTACGCTGTCCACGCGCCCACATCGCTTTACCATCAAGCATTAAAAGGGGTCAGGGTCGTGTACTGGATCGGCTTCGATACTACGCCGTTTATGTTTGACGTAATGGCGGGAGCGTACCCAAGCTATTCTACGAATTGGGCAGACGAACTGGTGCTGCAGGCCAGAAACATCGGTCTGTGCAGCTCCAGATTGAGTGAGGGGAGAAGCAGAGGGCTATCCATTATGAGAAAGAAAGCCCTCAGACCAAGCGACCGAGTTATGTTCTCGGTAGGTTCGACGTTGTATACGGAGAGCCGCTCGCTACTGAAAAGCTGGCACCTGCCGTCGACTTTTCATCTAAAGGGTAAGGACTCCTACACATGTAGATGCGACACCATAGTCAGTTGCGAGGGATACGTCGTAAAGAAGATCACGATGAGCCCGGGCCTATTCGGGAAGCCAGTACCGTATGCCGTCACCCACCATGCCGACGGCTTCCTCGTTTGCAAGACCACGGACACGGTCAAAGGGGAGAGGGTTTCCTTCCCCGTATGTACGTATGTCCCTGCGACGATTTGTGACCAGATGACTGGGATCCTAGCCACGGACGTGACGCCCGATGATGCTCAGAAGTTACTGGTGGGCCTGAACCAGCGGATCGTGGTCAATGGGCGCACGCAGAGAAATGTAAATACCATGAAAAATTACCTGCTACCTGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGCAAGTGGGCGAAAGAGTATAAAGCCGACTTGGAAGACGAGAAACCACTGGGGGTCAGAGAACGCAACTTGACTATGTGTTGCTTGTGGGCCTTCCGAACCAGGAAGACCCACACCTTGTACAAGAAGCCGGACACGCAGACTATAGTGAAAGTCCCTTCTGAATACACCTCCTTACTCATCCCGAGTCTATGGACGAGCGGGATCTCCATGACTCTGAGGAGACGGCTGAAAGTGCTGCTGACTGCCCGACTGAATCAGAAATTGACGTGCCCTTTGGACGCGGTGACAGCAAAGATCGCAGAGGACGATGATCGTGAGGCGCGTGAAGCTGAGTTAACTAGAGAGGCGCTACCTCCTTTGTCTGCTACCGAGCCAACCGGCGACGATATACAGGTCGACATCGAGGAGCTTGATGCTAGGGCGGGTGCGGGAGTAGTGAACACACCCCGCAACGCCGTCCGAGTCACCGCTCAGAGTGGTGACACGTTGGTTGGCAGCTATCTGGTGCTCAGCCCGCAGACTGTATTGCGCAGTGACAAACTACGCTTGATTCACGAACTGGCAGAACAAGTGAAGATTATCACGCATTCGGGTAGGGCCGGTAGATATCCTGTTGAAGGCTATGACGGACGTGTGCTGGTACCGACTGGCAGCGCTCTGAGTTTCGCCGATTTCCAGGCGCTTAGTGAGAGTGCCACAATGGTATACAACGAGCGAGAGTTCGTGAACAGGAAACTCTACCACATTGCCACGCACGGCCCCGCCCTGAACACAGACGAGGAGAACTACGAGAAGGTGAGAGCGGAAAGGAGTGACGCCGAGTACGTGTTCGACGTGGACGCACGGAAGTGCGTCAAACGCGAGCAGGCGTCGGGAATAGTGTTAGTGGGAGACGCGATCAATCCGCCTTACCATGAGTTCGCCTTTGAAGGCCTAAAAACACGCCCATCGGTGCCCTATAAAGTACCGACCATCGGTGTGTTTGGAGTTCCGGGATCAGGCAAATCGGCCATCATTAAGTCTGTGGTCACTAGACGTGACCTAGTCACTAGCGGCAAGAAAGAGAACTGCAATGAGATCATGACCGACGTCAAGAAGCAGAGAGGATTGGATATCGTAGCCAAGACGGTGGACTCTATCCTATTAAACGGTTGCAAACACAGCCCTGAGGTGTTGTTCGTTGACGAGGCGTTTGCCTGCCATGCAGGCACCCTGCTCGCGCTCATTGCGATCGTGAGACCCACCAAGAAAGTTGTGCTATGCGGCGATCCGAAGCAATGCGGCTTCTTTAACATGATGCAATTAAAAGTCAATTACAATCATGACATATGCACTGAAGTGCATCACAAAAGCATCTCCCGCCGATGCACAATACCGGTTACATCCATTGTCTCTACACTGCACTACGGAGGCAGGATGCGCACTACGAACCCGCGCAACGACCCTATCGAAATTGACATCACCAGTAGTACCAAACCCAAGCCCGGAGACATTGTGTTAACATGTTTTCGTGGCTGGGTTAAACAGCTGCAGTTGGACTATCGTGGACACGAAGTCATGACTGCGGCAGCGTCGCAAGGCTTGACCAGGAAAGGAGTATATGCAGTGAGGATGAAAGTCAATGAGAACCCACTATATGCTCCAGCTTCTGAACACGTCAATGTCTTGCTGACACGCACGGAGGGAAGGCTAGTGTGGAAAACGCTGGCCGGAGACCCGTGGATCAAGGTGCTAACTAACGTACCCAAAGGAAACTTCACAGCCACCATTGACGAGTGGCAGGAGGAGCACGACAACATCATGAACGCCATAAGAGGGGAAGTGGCGCCGACTGACCCTTTCCAAAACAAAGCAAATGTTTGTTGGGCAAAAGCTCTAGAACCCGTCCTTGCTACCGCTGGCATCCGACTCAGTGCAGCGGAGTGGAGCGACTTGATAGTCGCCTTCAAGGAAGATAAAGCATACTCGCCCGAGGTTGCGCTGAACGAGATCTGCACCAGAATGTACGGGTTTGACCTAGATAGCGGCTTGTTTTCGGCTCCGCTGGTATCCATGAGATATGAGAACCATCACTGGGACAACTCACCGGGAGGAAAGATGTATGGATTCAACACACAGGCAGCCAGCAGGCTAGAGCGCAGATACCCCTTCCTGCAAGGAAAATGGAGACTGAACCAGCAGATCCTTTTATCGGAGAGGAGAACGCAACCAGTGAGCTCATCCGCTAACATAGTTCCCATTAATCGTAGGCTGCCGCATACTCTGGTGCTGGAACACGTCAAGCTACCCGGAGACCGAGTAGAGCGGATCGTGATGCAAATTCGCGCGCATCACGTGCTGCTAGTGGGTGAGTATAACCTCCACCTGCCTTTACGGCGTGTTACCTGGATCGCCCCTCCCTATATACGGGGCGCAGATCGCATCTACGACCTGAGCTTAGGGTTGCCAACTGACCTGGGCAGGTATGATCTGGCGTTCATAAATGTACATACAGAATTCCGCAACCACCACTACCAGCAGTGTGAGGACCACGCAATGAAGTTGCAGATGCTAGGAGGTGATGCCCTACGCCACCTGAAACCGGGCGGATGTCTGCTGATGCGTGCCTATGGGTACGCAGACAGGACCAGCGAGATGGTGGTGAATGCGCTAGCGCGTAAATTCGCATCAATACGCGTACTGCGACCAGCGTGTGTGGCCTCTAACACCGAAGTCTTACTGCTGCTGTCGGGCTTCGATAACGGGAAACGCCAACTGACAATGCACACATCCAATCTGAGACTCTCCAGCGTTTACTCGGGAAACGCACTACACACGGCAGGGTGTGCACCATCATATAGAGTCGTAAGAGGCAATATCACCGACTCCGACGCCGATGTGCTAGTAAATCAGTTGGGCGTGAACAATAAGGTCTGCGACGGAGTTTGTAGGGCCATGGTCAAGAAGTGGCCTTCCTGCCTACCAACGACAACTGGAAAAGTAGGCGACGCCGTACTGACCACTGAGCCCCGGAAAATCGTGCACGCTTACTGTCCTAATTTCGGAACCAGTAGAGAGGAGGTTGCCGATGCCGACCTAGCAGCTGTGTATAGAGCCGTAGCGTCCTTGGCTGATGAGACAGTCCGCACAATGGCCATACCACTCCTGTCAACGGGGACGTTCGCTGGGGGAAAGGACCGCGTGCTGCAGTCGTTGAACCACCTATTTACGGCCCTGGACACCACGGACGTCGATGTAACGATATACTGCCGGGATAAGTCGTGGGAAAAGAAAATCCAAGAGGCCATTGATATGAGGACGGCAACCGAACTGCTAGATGACGACACAACGGTTATGAAAGAGCTAACCAGGGTGCATCCTGATAGCTGCCTAGTGGGGCGCAGTGGATTCAGCACGGTGGACGGACGGCTGCATTCGTACCTTGAAGGAACTAGGTTCCACCAGACTGCTGTCGACGTGGCAGAAATAGCCACTCTGTGGCCAAGGAGAGAAGAAGCGAACGAGCAGATAACACACTACGTCCTTGGCGAATCCATGGAGGCCATAAGAACCAAATGCCCGGTGGATGACACCGATTCGTCGGCACCACCATGCACCGTCCCGTGCCTTTGCCGCTACGCCATGACCCCCGAGCGCGTACATAGACTGCGCGCCGCGCAGGTGAAGCAGTTCACAGTCTGCTCCTCGTTCCCGCTTCCAAAGTACAAGATACCAGGCGTGCAGAGAGTGGCGTGTTCGGCTGTAATGTTGTTTAACCACGACGTTC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| 86,969
|
KM115530.1
|
Middelburg virus
|
Tricou,V., Berthet,N., Descorps-Declere,S., Nakoune,E., Kazanji,M.
|
Institut Pasteur de Bangui, Department of Virology
|
Central African Republic
|
2014-09-10
|
ArB-8422
|
Middelburg virus
|
Alphavirus
|
Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,550
|
GenBank
| 1
|
Central African Republic: Bozo
|
Central African Republic
|
Aedes vittatus
| null |
1977-08-23
| null | null |
Middelburg virus isolate ArB-8422, complete genome
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ATTGGTGGTTACGTACACGTGCCACCACCCCCCACCCTCCAAGCGATCCAAAATGGCGCGCCCTGTTGTGAAGATAGACGTTGAGGCCGAAAGCCCATTTGTCAAGTCTCTACAGAAGGCGTTTCCACAATTTGAGATCGAAGCAGAGCAGGTCACATCGAATGACCATGCTAACGCGAGGGCGTTTTCGCACCTTGCCAGTAAACTAATAGAAGGAGAGGTGGAAGTGGGCACAACCATCCTGGATATAGGCAGCGCGCCGGCCAGGAGGATGATGTCCAAACATGCATACCACTGCGTCTGCCCGCTGAGGAGTGCAGAAGACCCAGAACGATTAGCGGGATACGCGAAGAAGCTTATGAGTGCAGCCGGAAACGTTACTGATCTCAACATCTCGGGAAAGATCACGGACTTAAAGAACGTGATAGCTATACCTGACCTTGAGACACCTACATTCTGCCTGCACACAGACCAGACCTGCCGCTATAATGCCGATGTGGCTATCTATCAGGACGTCTACGCTGTCCACGCGCCCACATCGCTTTACCATCAAGCGTTAAAAGGGGTCAGGGTCGTGTACTGGATCGGCTTCGATACTACGCCGTTTATGTTTGACGTAATGGCGGGAGCGTACCCAAGCTATTCTACGAACTGGGCAGACGAACTGGTGCTGCAGGCCAGAAACATCGGCCTGTGCAGCTCCAGATTGAGTGAGGGGAGAAGCAGAGGGCTATCCATTATGAGAAAGAAAGCCTTCAGACCAAGCGACCGAGTCATGTTCTCGGTAGGTTCGACGTTGTATACGGAGAGCCGCTCGCTACTGAAAAGCTGGCACCTGCCGTCGACTTTTCATCTAAAGGGTAAGGACTCCTACACATGTAGATGTGACACCATAGTCAGTTGCGAGGGATACGTCGTAAAGAAGATCACGATGAGCCCAGGCCTATTCGGGAAGCCAGTACCGTACGCCGTCACCCATCATGCTGACGGCTTCCTCGTGTGCAAGACCACGGACACGGTCAAAGGGGAGAGGGTTTCCTTCCCCGTATGTACGTATGTCCCAGCGACGATTTGTGACCAGATGACTGGGATCTTAGCCACGGATGTGACGCCTGATGATGCTCAGAAGTTACTGGTGGGCCTGAACCAGCGGATCGTGGTCAATGGGCGCACGCAGAGAAATGTAAATACCATGAAAAATTACCTGCTACCTGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGCAAGTGGGCGAAAGAGTATAAAGCCGACTTGGAAGACGAGAAACCGTTGGGGGTCAGAGAACGCAACTTGACTATGTGTTGCTTGTGGGCCTTCCGAACTAGGAAGACCCACACCCTGTACAAGAAGCCGGACACGCAGACTATAGTGAAAGTCCCTTCTGAATATACCTCCTTACTCATCCCGAGTCTATGGACGAGCGGGATCTCCATGACTCTGAGGAGACGGCTGAAAGTGCTGTTGACTGCCCGACTGAACCAGAAATTGACGTGCCCTTTGGACGCGGTGACAGCAAAGATTGCGGAGGACAATGATCGTGAGGCGCGTGAAGCAGAGTTAACTAGAGAGGCGCTACCTCCTTTGACTGCTACCGAGCCAGCCGGCGACGATATACAGGTCGACATCGAGGAGCTTGACGCTAGGGCGGGTGCGGGAGTAGTGAACACACCCCGCAACGCCGTCCGAGTCACCGCTCAGAGCGGTGACACGTTGGTTGGCAGCTATCTGGTGCTCAGCCCGCAGACTGTATTGCGCAGTGACAAACTACGCTTGATCCACGAACTGGCAGAACAAGTGAAAATTATCACGCATTCAGGTAGGGCCGGTAGATATCCTGTTGAAGGCTATGACGGACGTGTGCTGGTACCTACTGGCAGCGCTCTGAGTTTCGCCGATTTCCAGGCGCTTAGTGAGAGTGCCACAATGGTATACAACGAACGAGAGTTCATGAACAGGAAACTCTACCACATTGCCACGCACGGCCCGGCTCTGAACACAGACGAGGAGAACTACGAGAAGGTGAGAGCGGAAAGGAGTGACGCCGAGTACGTGTTCGACGTGGACGCACGGAAGTGCGTCAAACGCGAGCAGGCGTCGGGAATAGTGTTAGTGGGAGACGCGATCAATCCGCCTTACCATGAGTTCGCCTTTGAAGGCCTAAAAACACGCCCTTCGGTGCCCTATAAAGTACCGACTATCGGTGTGTTTGGAGTTCCGGGATCAGGCAAATCGGCCATTATTAAGTCTGTGGTCACCAGACGTGACCTAGTCACCAGCGGCAAGAAAGAGAATTGCAATGAGATCATGACCGACGTCAAGAAGCAGAGAGGATTGGATATTGTAGCCAAGACGGTGGACTCTATCCTATTAAACGGTTGCAAACACAGCCCTGAGGTGTTGTTCGTAGACGAGGCGTTTGCCTGCCATGCAGGCACTCTGCTCGCGCTCATTGCGATCGTGAGACCCACCAAGAAAGTTGTGTTATGCGGCGATCCGAAGCAATGCGGCTTCTTTAACATGATGCAACTAAAAGTCAATTACAATCATGACATATGCACTGAAGTGCATCACAAAAGCATCTCCCGCCGATGCACAATACCGGTTACATCCATCGTCTCTACACTGCACTACGGAGGCAGGATGCGCACTACGAACCCGCGCAACGACCCTATCGAAATTGACATCACCAGTAGCACCAAACCCAAGCCCGGAGACATCGTGTTAACATGTTTTCGTGGCTGGGTTAAACAGCTGCAGTTGGACTATCGTGGACACGAAGTCATGACTGCGGCAGCGTCGCAAGGCTTGACCAGGAAAGGAGTATATGCAGTGAGGATGAAAGTCAATGAGAACCCACTATATGCCCCGGCTTCCGAACACGTCAATGTCTTGCTGACACGCACGGAGGGAAGGCTAGTGTGGAAAACGCTGGCCGGAGACCCGTGGATCAAGGTGCTAACTAACGTACCCAAAGGAAACTTCACAGCCACCATTGACGAGTGGCAGGAGGAGCACGACAACATCATGAACGCCATAAGAGGGGAAGTGGCGCCGACCGACCCTTTCCAAAACAAAGCAAATGTTTGTTGGGCAAAAGCCCTGGAACCAGTCCTTGCTACCGCTGGCATCCGACTCAGCGCAGCGGAGTGGAGCGACTTGATAGTCGCTTTCAAGGAAGATAAAGCATACTCGCCCGAGGTCGCGCTGAATGAGATCTGCACCAGAATGTACGGGTTTGACCTAGATAGCGGCTTGTTTTCGGCTCCGCTGGTATCCATGAGATATGAGAACCATCACTGGGACAACTCACCGGGAGGAAAGATGTACGGATTCAACACTCAGGCAGCCAGCAGGTTGGAGCGCAGATACCCCTTCCTGCAAGGAAAATGGAGACTGAACCAGCAGGTCCTTTTATCGGAGAGGAGGACGCAACCAGTGAGCTCATCCGCTAACATAGTTCCCATTAATCGTAGGCTGCCCCACACTCTGGTGCTGGAACACGTCAAGCTACCCGGGGACCGCGTAGAGCGGATCGTGATGCAAATTCGTGCGCATCACGTGCTGCTAGTGGGTGAGTATAACCTCCACCTGCCTTTGCGGCGTGTTACCTGGATCGCCCCTCCCTATATACGGGGCGCAGACCGCGTCTACGACCTGAGCTTAGGGTTGCCAACTGACCTGGGCAGGTATGATCTGGCGTTCATAAATGTACATACAGAATTCCGCAACCACCACTACCAGCAGTGTGAGGACCATGCAATGAAGTTGCAGATGCTAGGAGGTGATGCCCTACGCCACCTGAAACCGGGCGGATGCCTGCTGATGCGTGCCTATGGGTACGCAGACAGGACCAGCGAGATGGTGGTGAATGCGCTAGCGCGTAAATTCGCATCAATACGCGTACTGCGACCAGCGTGTGTGGCCTCTAACACTGAAGTCTTACTGCTGCTGTCGGGCTTTGACAACGGGAAACGCCAACTGACAATGCACACATCTAACCTGAGACTCTCCAGCGTTTACTCGGGCAACGCGCTACACACGGCAGGGTGTGCACCATCATATAGAGTCGTAAGAGGCAATATCACCGACTCCGACGCCGATGTGCTAGTAAATCAGTTGGGCGTGAACAACAAGGTCTGCGACGGAGTTTGTAGGGCCATGGTCAAGAAGTGGCCTTCCTGTCTACCAACGACAAATGGAAAAGTAGGCGACGCCGTACTGACCACTGAGCCTCGAAAAATCGTGCACGCTTACTGTCCTAATTTCGGAACCAGTAGAGAGGAGGTTGCCGATGCCGACCTAGCAGCTGTGTATAGAGCCGTGGCGTCCTTGGCTGACGAGACAGTCCGCACAATGGCCATACCACTCCTGTCAACGGGGACGTTCGCTGGGGGAAAGGACCGCGTGTTGCAGTCGTTGAACCACCTATTTACGGCCCTGGACACCACGGACGTCGATGTAACGATATACTGCCGGGATAAGTCGTGGGAAAAGAAAATCCAAGAGGCCATTGATATGAGGACGGCAACCGAACTGCTAGATGACGACACAACGGTTATGAAAGAGCTAACCAGGGTGCATCCTGATAGCTGCCTAGTGGGGCGCAGTGGATTCAGTACGGTGGACGGACGGCTGCATTCGTACCTTGAAGGAACTAGGTTCCACCAGACTGCTGTCGACGTGGCAGAAATAGCCACTCTGTGGCCAAGGAGAGAGGAAGCGAACGAGCAGATAACACACTATGTCCTTGGCGAATCCATGGAGGCCATAAGAACCAAATGCCCGGTGGATGATACCGATTCGTCGGCACCGCCATGCACCGTCCCTTGCCTTTGCCGCTACGCCATGACCCCCGAGCGCATACATAGATTGCGCGCCGCGCAGGTGAAGCAGTTCACAGTCTGCTCCTCGTTCCCTCTGCCGAAGTACAAGATACCAGGCGTGCAGAGAGTGGCGTGTTCGGCTGTAATGTTGTTTAATCACGACGTTC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| 89,030
|
KM115531.1
|
Middelburg virus
|
Tricou,V., Berthet,N., Descorps-Declere,S., Nakoune,E., Kazanji,M.
|
Institut Pasteur de Bangui, Department of Virology
|
Central African Republic
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2014-09-10
|
ArTB-5290
|
Middelburg virus
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Alphavirus
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Togaviridae
|
ssRNA(+)
| 11,468
|
GenBank
| 1
|
Central African Republic: Bangui
|
Central African Republic
|
Amblyomma variegatum
| null |
1984-07-24
| null | null |
Middelburg virus isolate ArTB-5290, complete genome
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ATTGGTGGTTACGTACACGTGCCACCACCCCCCACCATCCAAGCGATCCAAAATGGCGCGCCCTGTTGTGAAGATAGACGTTGAGGCCGAAAGCCCATTTGTCAAGTCTCTACAGAAGGCGTTTCCACAATTTGAGATCGAAGTAGAGCAGGTCACACCGAATGACCATGCTAACGCGAGGGCGTTTTCGCACCTTGCCAGTAAACTAATTGAAGGAGAGGTGGAAGTGGGCACAACCATCCTGGACATAGGCAGCGCGCCGGCCAGGAGGATGATGTCCAAACATACATACCACTGCGTCTGCCCACTGAGGAGTGCAGAAGACCCAGAACGATTAGCGGGATACGCGAAGAAGCTTATGAGTGCAGCCGGAAACGTTACTGATCTCAACATCTCGGGAAAGATCACGGACTTAAAGAACGTGATAGCTATACCCGACCTTGAGACACCTACATTCTGCCTGCACACAGACCAGACCTGCCGCTATAATGCCGATGTGGCCATCTATCAGGACGTCTACGCTGTCCACGCGCCCACATCGCTTTACCATCAAGCGTTAAAAGGGGTCAGGGTCGTGTACTGGATCGGCTTCGATACTACGCCGTTTATGTTTGACGTAATGGCGGGAGCGTACCCAAGCTACTCTACGAACTGGGCAGACGAACTGGTGCTGCAGGCCAGAAACATCGGCCTGTGCAGCTCCAGATTGAGTGAGGGGAGAAGCAGAGGGCTATCCATTATGAGAAAGAAAGCCCTCAGACCAAGCGACCGAGTTATGTTCTCGGTAGGTTCGACGTTGTATACGGAGAGCCGCTCGCTACTGAAAAGCTGGCACCTGCCGTCGACTTTTCATCTAAAGGGTAAGGACTCCTACACATGTAGATGCGACACCATAGTCAGTTGTGAGGGATACGTCGTAAAGAAGATCACGATGAGCCCAGGCCTATTCGGGAAGCCAGTACCGTACGCCGTCACCCACCATGCCGACGGCTTCCTCGTGTGCAAGACCACGGACACGGTCAAAGGGGAGAGGGTTTCCTTCCCCGTATGTACGTATGTCCCAGCGACGATTTGTGACCAGATGACTGGGATCTTAGCCACGGATGTGACGCCTGATGATGCTCAGAAGTTACTGGTGGGCCTGAACCAGCGGATCGTGGTTAATGGGCGCACGCAGAGAAATGTAAATACCATGAAAAATTACCTGCTACCTGTGGTCGCCCAGGCCTTCAGCAAGTGGGCGAAAGAGTATAAAGCCGACTTGGAAGACGAGAAACCGCTGGGGGTCAGAGAACGCAACTTGACTATGTGTTGCTTGTGGGCCTTCCGAACCAGGAAGACCCACACCCTGTACAAGAAGCCGGACACGCAGACTATAGTGAAAGTCCCTTCTGAATACACCTCCTTACTCATCCCGAGTCTATGGACGAGCTGGATCTCCATGACTCTGAGGAGACGGCTGAAAGTGCTGTTGACTGCCCGACTGAATCAGAAATTGACGTGCCCTTTGGACGCGGTGACAGCAAAGATTGCAGAGGACGATGATCGTGAGGCGCGTGAAGCTGAGTTAACTAGAGAGGCGCTACCTCCTTTGACTGCTACCGAGCCAACCGGCGACGACATACAGGTCGACATCGAGGAGCTTGACGCTAGGGCGGGTGCGGGAGTAGTGAACACACCCCGCAACGCCGTCCGAGTCACCGCTCAGAGTGGTGACATGTTGGTTGGCAGCTATCTGGTGCTCAGCCCGCAGACTGTATTGCGCAGTGACAAACTACGCTTGATCCACGAACTGGCAGAACAAGTGAAGATTATCACGCATTCGGGTAGGGCCGGTAGATATCCTGTTGAAGGCTATGACGGACGTGTGCTGGTACCAACTGGCAGCGCCCTGAGTTTCGCCGATTTCCAGGCGCTTAGTGAGAGTGCCACAATGGTATACAACGAGCGAGAGTTCATGAACAGGAAACTCTACCACATTGCCACGCACGGCCCCGCCCTGAACACAGACGAGGAGAACTACGAGAAGGTGAGAGCGGAAAGGAGTGACGCCGAGTACGTGTTCGACGTGGACGCACGGAAGTGCGTCAAACGCGAGCAGGCGTCGGGAATAGTGTTAGTGGGAGACGCGATCAATCCGCCTTACCATGAGTTCGCCTTTGAAGGCCTAAAAACACGCCCTTCGGTGCCCTATAAAGTACCGACCATCGGTGTGTTTGGAGTTCCGGGATCAGGCAAATCGGCCATCATTAAGTCTGTGGTCACCAGACGTGACCTAGTCACTAGCGGCAAGAAAGAGAACTGCAATGAGATCATGACCGACGTCAAGAAGCAGAGAGGATTGGATATCGTAGCCAAGACGGTGGACTCTATCCTATTAAACGGTTGCAAACACAGCCCTGAGGTGCTGTTCGTTGACGAGGCGTTTGCCTGCCATGCAGGCACTCTGCTCGCGCTCATTGCGATCGTGAGACCCACCAAGAAAGTTGTGTTATGCGGCGATCCGAAGCAATGCGGCTTCTTTAACATGATGCAATTAAAAGTCAATTACAATCATGACATATGCACTGAAGTGCATCACAAAAGCATCTCCCGCCGATGCACAATACCGGTTACATCCATTGTCTCTACACTGCACTACGGAGGCAGGATGCGCACTACGAACCCGCGCAACGACCCTATCGAAATTGACATCACCAGTAGCACCAAACCCAAGCCCGGAGACATCGTGTTAACATGTTTTCGTGGCTGGGTTAAACAGCTGCAGTTGGACTATCGTGGACACGAAGTCATGACTGCGGCAGCGTCGCAAGGCTTGACCAGGAAAGGAGTATATGCAGTGAGGATGAAAGTCAATGAGAACCCACTATATGCTCCAGCTTCCGAACACGTCAATGTCTTGTTGACACGCACGGAGGGAAGGCTAGTGTGGAAAACGCTGGCCGGAGACCCGTGGATCAAGGTGCTAACCAACGTACCCAAAGGAAACTTCACAGCCACCATTGACGAGTGGCAGGAGGAGCACGACAACATCATGAACGCCATAAGAGGGGAAGTGGCGCCGACTGACCCTTTCCAAAACAAAGCAAATGTTTGTTGGGCAAAAGCTCTGGAACCCGTCCTTGCTACCGCTGGCATCCGACTCAGTGCAGCGGAGTGGAGCGACTTGATAGTCGCTTTCAAGGAAGATAAAGCATACTCGCCCGAGGTTGCGCTGAATGAGATCTGCACCAGAATGTACGGGTTTGACCTAGATAGCGGCTTGTTTTCGGCTCCGCTGGTATCCATGAGATATGAGAACCATCACTGGGACAACTCACCGGGAGGAAAGATGTATGGATTCAACACACAGGCGGCCAGCAGGCTAGAGCGCAGATACCCCTTCCTGCAAGGAAAATGGAGACTGAACCAGCAGATCCTTTTATCGGAGAGGAGAACGCAACCAGTGAGCTCATCCGCTAACATAGTTCCCATTAATCGTAGGCTGCCGCACACTCTGGTGCTGGAACACGTCAAGCTACCCGGAGACCGCGTAGAGCGGATCGTGATGCAAATTCGCGCGCATCACGTGCTGCTAGTGGGTGAGTATAACCTCCACCTGCCTTTACGGCGTGTTACCTGGATCGCCCCTCCCTATATACGGGGCGCAGACCGCATCTACGACCTGAGCTTAGGGTTGCCAACTGACCTGGGCAGGTATGATCTGGCGTTCATAAATGTACATACAGAATTCCGCAACCACCACTACCAGCAGTGTGAGGACCATGCAATGAAGTTGCAGATGCTAGGAGGTGATGCCCTACGCCACCTGAAACCGGGCGGATGCCTGCTGATGCGTGCCTATGGGTACGCAGACAGGACCAGCGAGATGGTGGTGAATGCGCTAGCGCGTAAATTCGCATCAATACGCGTACTGCGACCAGCGTGTGTGGCCTCTAACACTGAAGTCTTGCTGCTGCTGTCGGGCTTTGACAACGGGAAACGCCAACTGACAATGCACACATCCAATCTGAGACTCTCCAGCGTTTACTCGGGAAACGCACTACACACGGCAGGGTGTGCACCATCATATAGAGTCGTAAGAGGCAATATCACCGACTCCGACGCCGATGTGCTAGTAAATCAGTTGGGCGTGAACAATAAGGTCTGCGACGGAGTTTGTAGGGCCATGGTCAAGAAGTGGCCTTCCTGCCTACCAACGACGACTGGAAAAGTAGGCGACGCCGTACTGACCACTGAGCCCCGAAAAATCGTGCACGCTTACTGTCCTAATTTCGGAACCAGTAGAGAGGAGGTTGCCGATGCCGACCTAGCAGCTGTGTATAGAGCCGTGGCGTCCTTGGCTGATGAGACAGTCCGCACAATGGCCATACCACTCCTGTCAACGGGGACGTTCGCTGGGGGAAAGGACCGCGTGTTGCAGTCGTTGAACCACCTATTTACGGCCCTGGACACCACGGACGTCGATGTAACGATATACTGCCGGGATAAGTCGTGGGAAAAGAAAATCCAAGAGGCCATTGATATGAGGACGGCAACCGAACTGCTAGATGACGACACAACGGTTATGAAAGAGCTAACCAGGGTGCATCCTGATAGCTGCCTAGTGGGGCGCAGTGGATTCAGCACGGTGGACGGACGGCTGCATTCGTACCTTGAAGGAACTAGGTTCCACCAGACTGCTGTCGACGTGGCAGAAATAGCCACTCTGTGGCCAAGGAGAGAAGAAGCGAACGAGCAGATAACACACTACGTCCTTGGCGAATCCATGGAGGCCATAAGAACCAAATGCCCGGTGGATGACACCGATTCGTCGGCACCACCATGCACCGTCCCGTGCCTTTGCCGCTACGCCATGACCCCCGAGCGCGTACATAGATTGCGCGCCGCGCAGGTGAAGCAGTTCACAGTCTGCTCCTCGTTCCCTCTGCCAAAGTACAAGATACCAGGCGTGCAGAGAGTGGCGTGTTCGGCTGTAATGTTGTTTAATCACGACGTTC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| 89,031
|
NC_019843.3
|
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus
|
Zaki,A.M., van Boheemen,S., Bestebroer,T.M., Osterhaus,A.D., Fouchier,R.A., de Graaf,M., Lauber,C., Raj,V.S., Haagmans,B.L., Gorbalenya,A.E., Snijder,E.J., Victor,S.R., Osterhaus,A.D.M.E., Fouchier,R.A.M.
|
National Center for Biotechnology Information, NIH
|
USA
|
2012-12-13
|
HCoV-EMC/2012
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus
|
Betacoronavirus
|
Coronaviridae
|
ssRNA(+)
| 30,119
|
RefSeq
| 2
| null | null |
Homo sapiens
| null |
2012-06-13
| null |
PRJNA485481
|
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus isolate HCoV-EMC/2012, complete genome
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CTGCTTGATTGCAAGTGAACAGTGCCCCCCGGGAAGAGCTCTACAGTGTGAAATGTAAATAAAAAATAGCTATTATTCAATTAGATTAGGCTAATTAGATGATTTGCAAAAAAAAAAAA
| 7,099
|
OP866274.1
|
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus
|
Zhou,Z., Ali,A., Walelign,E., Demissie,G.F., Masry,I.E., Abayneh,T., Getachew,B., Krishnan,P., Ng,D.Y.M., Gardner,E., Makonnen,Y., Miguel,E., Chevalier,V., Chu,D.K., So,R.T.Y., Von Dobschuetz,S., Mamo,G., Poon,L.L.M., Peiris,M., Masry,I., Dobschuetz,S., Poon,L.
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The University of Hong Kong, School of Public Health
|
China
|
2023-01-28
|
Camel/Ethiopia/Amibara/CAC4366/2017
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 30,054
|
GenBank
| 1
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Ethiopia
|
Ethiopia
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Camelus dromedarius
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oronasopharynx
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2017-01-12
| null | null |
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus isolate Camel/Ethiopia/Amibara/CAC4366/2017, complete genome
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CCCCCCGGGAAGAGCTCTACAGTGTGAAATGTAAATAAAAATAGCTATTATTCG
| 19,088
|
OP866275.1
|
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus
|
Zhou,Z., Ali,A., Walelign,E., Demissie,G.F., Masry,I.E., Abayneh,T., Getachew,B., Krishnan,P., Ng,D.Y.M., Gardner,E., Makonnen,Y., Miguel,E., Chevalier,V., Chu,D.K., So,R.T.Y., Von Dobschuetz,S., Mamo,G., Poon,L.L.M., Peiris,M., Masry,I., Dobschuetz,S., Poon,L.
|
The University of Hong Kong, School of Public Health
|
China
|
2023-01-28
|
Camel/Ethiopia/Amibara/CAC4459/2017
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 30,047
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GenBank
| 1
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Ethiopia
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Ethiopia
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Camelus dromedarius
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oronasopharynx
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2017-01-18
| null | null |
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus isolate Camel/Ethiopia/Amibara/CAC4459/2017, complete genome
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GTGATTGCAAGTGAACAGTGCCCCCCGGGAAGAGCTCTACAGTGTGA
| 19,089
|
OP866276.1
|
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus
|
Zhou,Z., Ali,A., Walelign,E., Demissie,G.F., Masry,I.E., Abayneh,T., Getachew,B., Krishnan,P., Ng,D.Y.M., Gardner,E., Makonnen,Y., Miguel,E., Chevalier,V., Chu,D.K., So,R.T.Y., Von Dobschuetz,S., Mamo,G., Poon,L.L.M., Peiris,M., Masry,I., Dobschuetz,S., Poon,L.
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The University of Hong Kong, School of Public Health
|
China
|
2023-01-28
|
Camel/Ethiopia/Chifra/CAC4749/2017
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 30,048
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GenBank
| 1
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Ethiopia
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Ethiopia
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Camelus dromedarius
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oronasopharynx
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2017-12-07
| null | null |
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus isolate Camel/Ethiopia/Chifra/CAC4749/2017, complete genome
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GGGAAGAGCTCTACAGTGTGAAATGTAAATAAAAAATAGCTATTATTC
| 19,090
|
OP866277.1
|
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus
|
Zhou,Z., Ali,A., Walelign,E., Demissie,G.F., Masry,I.E., Abayneh,T., Getachew,B., Krishnan,P., Ng,D.Y.M., Gardner,E., Makonnen,Y., Miguel,E., Chevalier,V., Chu,D.K., So,R.T.Y., Von Dobschuetz,S., Mamo,G., Poon,L.L.M., Peiris,M., Masry,I., Dobschuetz,S., Poon,L.
|
The University of Hong Kong, School of Public Health
|
China
|
2023-01-28
|
Camel/Ethiopia/Chifra/CAC4752/2017
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 30,093
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GenBank
| 1
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Ethiopia
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Ethiopia
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Camelus dromedarius
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oronasopharynx
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2017-12-07
| null | null |
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus isolate Camel/Ethiopia/Chifra/CAC4752/2017, complete genome
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TCTGCGTGATTGCAAGTGAACAGTGCCCCCCGGGAAGAGCTCTACAGTGTGAAATGTAAATAAAAATAGCTATTATTCAATTAGATTAGGCTA
| 19,091
|
OP866278.1
|
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus
|
Zhou,Z., Ali,A., Walelign,E., Demissie,G.F., Masry,I.E., Abayneh,T., Getachew,B., Krishnan,P., Ng,D.Y.M., Gardner,E., Makonnen,Y., Miguel,E., Chevalier,V., Chu,D.K., So,R.T.Y., Von Dobschuetz,S., Mamo,G., Poon,L.L.M., Peiris,M., Masry,I., Dobschuetz,S., Poon,L.
|
The University of Hong Kong, School of Public Health
|
China
|
2023-01-28
|
Camel/Ethiopia/Chifra/CAC4753/2017
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 30,086
|
GenBank
| 1
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Ethiopia
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Ethiopia
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Camelus dromedarius
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oronasopharynx
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2017-12-07
| null | null |
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus isolate Camel/Ethiopia/Chifra/CAC4753/2017, complete genome
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TCTGCGTGATTGCAAGTGAACAGTGCCCCCCGGGAAGAGCTCTACAGTGTGAAATGTAAATAAAAATAGCTATTATTCAATTAGAT
| 19,092
|
OP866279.1
|
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus
|
Zhou,Z., Ali,A., Walelign,E., Demissie,G.F., Masry,I.E., Abayneh,T., Getachew,B., Krishnan,P., Ng,D.Y.M., Gardner,E., Makonnen,Y., Miguel,E., Chevalier,V., Chu,D.K., So,R.T.Y., Von Dobschuetz,S., Mamo,G., Poon,L.L.M., Peiris,M., Masry,I., Dobschuetz,S., Poon,L.
|
The University of Hong Kong, School of Public Health
|
China
|
2023-01-28
|
Camel/Ethiopia/Gewane/CAC4791/2017
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Middle East respiratory syndrome-related coronavirus
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Betacoronavirus
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Coronaviridae
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ssRNA(+)
| 30,064
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GenBank
| 1
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Ethiopia
|
Ethiopia
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Camelus dromedarius
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oronasopharynx
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2017-12-27
| null | null |
Middle East respiratory syndrome-related coronavirus isolate Camel/Ethiopia/Gewane/CAC4791/2017, complete genome
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